AS 55 302

CO CL1Contig1 715 6 1 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAGTAGACCA
AGAAAGAGAAAAAAAGAGTTTCAAAGAAAAATGGATCCGAGCATGATGGCTGGACTCGAT
GGTCTTGGTGCAGAAGACCAAGCGAAAATGGCCTCCATGATCGATCAGCTTCAGCTACGT
GATAGTTTGAGGATGTGCAATTCGCTGGTGGAGAGGTGTTTCGTGGACTGTGTAGATTCG
TTTACGCGCAAGACTCTGCAGAAACAAGAGGAGACTTGTGTCTTACGGTGCGCCGAGAAG
TTCCTCAAGCACACGATGCGTGTAGGTCAGCGTTTTGGTGAGCTCAACCAGAACGCACCA
ACTCAAGACTGAAGTCTCTCTACTTGTGTTGGTTTTGTTTTTTTTTTAGTCCGGTTTATG
TGTTGGATCCCTGAATAAACCGGTTTTTTAGTGGTTCAGACAACTGCTCAATACTCTGTT
CTTTGAGAATGATACTCGTGTATTTTGAAGTTATTTTGCGTCTGATTTTTAATATTGGAT
ATGATTTGTACTTCAGAAGGGTCTATGAATAATCATTTCATAAAAAAAAAAAAAAAAAAG
GCCGCCTCGGCCCTCGAGAAGCTTTCTAGACCATTCGTTTGGCGCGCGGGCCCAGTAGGT
AAGTGAACATGGTCATAGCTGTTTCCTAGGAGATCCTGGTCATGACTAGTGCTTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 5 5 20 5 5 5 5 5 5 5 20 5 20 5 20 5 20 5 5 5 5 5 20 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1FE89TF U 26
AF RS1D507TF U 39
AF RS1A017JQ C 50
AF RS1A017TR C 50
AF RS1A017TF U 1
AF RS1A017TV U 1
BS 1 715 RS1A017TF

RD RS1FE89TF 562 0 0
GGCGACGAACGAACTGCTGTTTCTTTAGTAGACCAAGAAAGAGAAAAAAAGAGTTTCAAA
GAAAAATGGATCCGAGCATGATGGCTGGACTCGATGGTCTTGGTGCAGAAGACCAAGCGA
AAATGGCCTCCATGATCGATCAGCTTCAGCTACGTGATAGTTTGAGGATGTACGATTCGC
TGGTGGAGAGGTGTTTCGTGGACTGTGTAGATTCGTTTACGCGCAAGACTCTGCAGAAAC
AAGAGGAGACTTGTGTCTTACGGTGCGCCGAGAAGTTCCTCAAGCACACGATGCGTGTAG
GTCAGCGTTTTGGTGAGCTCAATCAGAACGCACCAACTCAAGACTGAAGTCTCTCTACTT
GTGTTGGTTTTGTTTTTTTTTTAGTCCGGTTTATGTGTTGGATCCCTGAATAAACCGGTT
TTTTAGTGGTTCAGACAACTGCTCAATACTCTGTTCTTTGAGAATGATACTCGTGTATTT
TGAAGTTATTTTGCTTCTGATTTTTAATATTGGATATGATTTGTATTTCAGAAGGGTCTA
TGAATAATCATTTCATA
TCGGT

QA 1 557 1 557
DS 

RD RS1D507TF 540 0 0
GGGCTGTTTCTTT
AGTAGACCAAGAAAGAGAAAAAAAGAGTTTCAAAGAAAAATGGATCCGAGCATGATGGCT
GGACTCGATGGTCTTGGTGCAGAAGACCAAGCGAAAATGGCCTCCATGATCGATCAGCTT
CAGCTACGTGATAGTTTGAGGATGTACAATTCTCTGGTGGAGAGGTGTTTCGTGGACTGT
GTAGATTCGTTTACGCGCAAGACTCTGCAGAAACAAGAGGAGACTTGTGTCTTACGGTGC
GCCGAGAAGTTCCTCAAGCACACGATGCGTGTAGGTCAGCGTTTTGGTGAGCTCAATCAG
AACGCACCAACTCAAGACTGAAGTCTCTCTACTTGTGTTGGTTTTGTTTTTTTTTTAGTC
CGGTTTATGTGTTGGATCCCTGAATAAACCGGTTTTTTAGTGGTTCAGACAACTGCTCAA
TACTCTGTTCTTTGAGAATGATACTCGTGTATTTTGAAGTTATTTTGCGTCTGATTTTTA
ATATTGGATATGATTTGTATTTCAGAAGGGTCTATGAATAATCATTT

QA 14 540 14 540
DS 

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CTGGACTCGATGGTCTTGGTGCAGAAGACCAAGCGAAAATGGCCTCCATGATCGATCAGC
TTCAGCTACGTGATAGTTTGAGGATGTGCAATTCGCTGGTGGAGAGGTGTTTCGTGGACT
GTGTAGATTCGTTTACGCGCAAGACTCTGCAGAAACAAGAGGAGACTTGTGTCTTACGGT
GCGCCGAGAAGTTCCTCAAGCACACGATGCGTGTAGGTCAGCGTTTTGGTGAGCTCAACC
AGAACGCACCAACTCAAGACTGAAGTCTCTCTACTTGTGTTGGTTTTGTTTTTTTTTTAG
TCCGGTTTATGTGTTGGATCCCTGAATAAACCGGTTTTTTAGTGGTTCAGACAACTGCTC
AATACTCTGTTCTTTGAGAATGATACTCGTGTATTTTGAAGTTATTTTGCGTCTGATTTT
TAATATTGGATATGATTTGTACTTCAGAAGGGTCTATGAATAATCATTTCAT

QA 1 532 1 532
DS 

RD RS1A017TR 532 0 0
GGAGTAGACCAAGAAAGAGAAAAAAAGAGTTTCAAAGAAAAATGGATCCGAGCATGATGG
CTGGACTCGATGGTCTTGGTGCAGAAGACCAAGCGAAAATGGCCTCCATGATCGATCAGC
TTCAGCTACGTGATAGTTTGAGGATGTGCAATTCGCTGGTGGAGAGGTGTTTCGTGGACT
GTGTAGATTCGTTTACGCGCAAGACTCTGCAGAAACAAGAGGAGACTTGTGTCTTACGGT
GCGCCGAGAAGTTCCTCAAGCACACGATGCGTGTAGGTCAGCGTTTTGGTGAGCTCAACC
AGAACGCACCAACTCAAGACTGAAGTCTCTCTACTTGTGTTGGTTTTGTTTTTTTTTTAG
TCCGGTTTATGTGTTGGATCCCTGAATAAACCGGTTTTTTAGTGGTTCAGACAACTGCTC
AATACTCTGTTCTTTGAGAATGATACTCGTGTATTTTGAAGTTATTTTGCGTCTGATTTT
TAATATTGGATATGATTTGTACTTCAGAAGGGTCTATGAATAATCATTTCAT

QA 1 532 1 532
DS 

RD RS1A017TF 715 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAGTAGACCA
AGAAAGAGAAAAAAAGAGTTTCAAAGAAAAATGGATCCGAGCATGATGGCTGGACTCGAT
GGTCTTGGTGCAGAAGACCAAGCGAAAATGGCCTCCATGATCGATCAGCTTCAGCTACGT
GATAGTTTGAGGATGTGCAATTCGCTGGTGGAGAGGTGTTTCGTGGACTGTGTAGATTCG
TTTACGCGCAAGACTCTGCAGAAACAAGAGGAGACTTGTGTCTTACGGTGCGCCGAGAAG
TTCCTCAAGCACACGATGCGTGTAGGTCAGCGTTTTGGTGAGCTCAACCAGAACGCACCA
ACTCAAGACTGAAGTCTCTCTACTTGTGTTGGTTTTGTTTTTTTTTTAGTCCGGTTTATG
TGTTGGATCCCTGAATAAACCGGTTTTTTAGTGGTTCAGACAACTGCTCAATACTCTGTT
CTTTGAGAATGATACTCGTGTATTTTGAAGTTATTTTGCGTCTGATTTTTAATATTGGAT
ATGATTTGTACTTCAGAAGGGTCTATGAATAATCATTTCATAAAAAAAAAAAAAAAAAAG
GCCGCCTCGGCCCTCGAGAAGCTTTCTAGACCATTCGTTTGGCGCGCGGGCCCAGTAGGT
AAGTGAACATGGTCATAGCTGTTTCCTAGGAGATCCTGGTCATGACTAGTGCTTG

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1A017TV 715 0 0
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AGAAAGAGAAAAAAAGAGTTTCAAAGAAAAATGGATCCGAGCATGATGGCTGGACTCGAT
GGTCTTGGTGCAGAAGACCAAGCGAAAATGGCCTCCATGATCGATCAGCTTCAGCTACGT
GATAGTTTGAGGATGTGCAATTCGCTGGTGGAGAGGTGTTTCGTGGACTGTGTAGATTCG
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TTCCTCAAGCACACGATGCGTGTAGGTCAGCGTTTTGGTGAGCTCAACCAGAACGCACCA
ACTCAAGACTGAAGTCTCTCTACTTGTGTTGGTTTTGTTTTTTTTTTAGTCCGGTTTATG
TGTTGGATCCCTGAATAAACCGGTTTTTTAGTGGTTCAGACAACTGCTCAATACTCTGTT
CTTTGAGAATGATACTCGTGTATTTTGAAGTTATTTTGCGTCTGATTTTTAATATTGGAT
ATGATTTGTACTTCAGAAGGGTCTATGAATAATCATTTCATAAAAAAAAAAAAAAAAAAG
GCCGCCTCGGCCCTCGAGAAGCTTTCTAGACCATTCGTTTGGCGCGCGGGCCCAGTAGGT
AAGTGAACATGGTCATAGCTGTTTCCTAGGAGATCCTGGTCATGACTAGTGCTTG

QA 1 715 1 715
DS 



CO CL1Contig2 814 4 3 U
CAAGCACTAGTCATGACCAGGATCTCCTAGGAAACAGCTATGACCATGTTCACTTACTAC
TGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTTT
TTTTTTTTTTTTTGTAAAGGCTTTTTAATTCATTTGGCAACCATCACAAACTGTTGTTCT
TTTACCAGACACTGAGAAAACACTAAAGACTGTTCTTGCAATTTCCAACAGATAGATAGA
TACTAGAATACAAAGGCAAATGTCTAACAGGACTTGCCTGGTTTTTTGGATAAAAGATTA
ATCGTCTCGGTAGTTAAACTTCCTTTTGACAGACACACGGTCATCTTCCTCTTCGTCTCC
TTCTTCCTCTTCTTCACAAACTTCTTCTTCTTCAGCTTCCTCTTCTTGCTCAACATCATC
TTCCACAGTGTTAACCCTCTCGCACTCGTCAATCCATTCACTATAGATGTCTATAGCTTC
ACTCAAAGCTGTAATAGTTGTGCTAAAGCTTTCTTCACAGATTCTACAAGTTGCAATACC
AATCATCTCCTTCATATTAATTTGGCATTCGACACTAGAGCCGTGATTGCAGAAAGGACA
ACTAAAGACAGTGTCAAGCTTGTCCATACGCTTCGTTGTAGCAGGCTTTGCCCTTGACTT
CCTTTTCCCCATTGCTGTAACTGCGCAAGATCGATTCCTCGAGGAAGAGCGAAATACGAA
ACCCTAAGATAGTGCGACGAAGAGGTCCAATTTGGGGGAAAACCCCCCGGCCGTAATGGC
CGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A057JQ U 147
AF RS1A057TR U 288
AF RS1A057TV C 1
AF RS1A057TF C 147
BS 1 146 RS1A057TV
BS 147 765 RS1A057JQ
BS 766 814 RS1A057TV

RD RS1A057JQ 619 0 0
AATTCATTTGGCAACCATCACAAACTGTTGTTCTTTTACCAGACACTGAGAAAACACTAA
AGACTGTTCTTGCAATTTCCAACAGATAGATAGATACTAGAATACAAAGGCAAATGTCTA
ACAGGACTTGCCTGGTTTTTTGGATAAAAGATTAATCGTCTCGGTAGTTAAACTTCCTTT
TGACAGACACACGGTCATCTTCCTCTTCGTCTCCTTCTTCCTCTTCTTCACAAACTTCTT
CTTCTTCAGCTTCCTCTTCTTGCTCAACATCATCTTCCACAGTGTTAACCCTCTCGCACT
CGTCAATCCATTCACTATAGATGTCTATAGCTTCACTCAAAGCTGTAATAGTTGTGCTAA
AGCTTTCTTCACAGATTCTACAAGTTGCAATACCAATCATCTCCTTCATATTAATTTGGC
ATTCGACACTAGAGCCGTGATTGCAGAAAGGACAACTAAAGACAGTGTCAAGCTTGTCCA
TACGCTTCGTTGTAGCAGGCTTTGCCCTTGACTTCCTTTTCCCCATTGCTGTAACTGCGC
AAGATCGATTCCTCGAGGAAGAGCGAAATACGAAACCCTAAGATAGTGCGACGAAGAGGT
CCAATTTGGGGGAAAACCC

QA 1 619 1 619
DS 

RD RS1A057TR 478 0 0
GGATAAAAGATTAATCGTCTCGGTAGTTAAACTTCCTTTTGACAGACACACGGTCATCTT
CCTCTTCGTCTCCTTCTTCCTCTTCTTCACAAACTTCTTCTTCTTCAGCTTCCTCTTCTT
GCTCAACATCATCTTCCACAGTGTTAACCCTCTCGCACTCGTCAATCCATTCACTATAGA
TGTCTATAGCTTCACTCAAAGCTGTAATAGTTGTGCTAAAGCTTTCTTCACAGATTCTAC
AAGTTGCAATACCAATCATCTCCTTCATATTAATTTGGCATTCGACACTAGAGCCGTGAT
TGCAGAAAGGACAACTAAAGACAGTGTCAAGCTTGTCCATACGCTTCGTTGTAGCAGGCT
TTGCCCTTGACTTCCTTTTCCCCATTGCTGTAACTGCGCAAGATCGATTCCTCGAGGAAG
AGCGAAATACGAAACCCTAAGATAGTGCGACGAAGAGGTCCAATTTGGGGGAAAACCC

QA 1 478 1 478
DS 

RD RS1A057TV 814 0 0
CAAGCACTAGTCATGACCAGGATCTCCTAGGAAACAGCTATGACCATGTTCACTTACTAC
TGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTTT
TTTTTTTTTTTTTGTAAAGGCTTTTTAATTCATTTGGCAACCATCACAAACTGTTGTTCT
TTTACCAGACACTGAGAAAACACTAAAGACTGTTCTTGCAATTTCCAACAGATAGATAGA
TACTAGAATACAAAGGCAAATGTCTAACAGGACTTGCCTGGTTTTTTGGATAAAAGATTA
ATCGTCTCGGTAGTTAAACTTCCTTTTGACAGACACACGGTCATCTTCCTCTTCGTCTCC
TTCTTCCTCTTCTTCACAAACTTCTTCTTCTTCAGCTTCCTCTTCTTGCTCAACATCATC
TTCCACAGTGTTAACCCTCTCGCACTCGTCAATCCATTCACTATAGATGTCTATAGCTTC
ACTCAAAGCTGTAATAGTTGTGCTAAAGCTTTCTTCACAGATTCTACAAGTTGCAATACC
AATCATCTCCTTCATATTAATTTGGCATTCGACACTAGAGCCGTGATTGCAGAAAGGACA
ACTAAAGACAGTGTCAAGCTTGTCCATACGCTTCGTTGTAGCAGGCTTTGCCCTTGACTT
CCTTTTCCCCATTGCTGTAACTGCGCAAGATCGATTCCTCGAGGAAGAGCGAAATACGAA
ACCCTAAGATAGTGCGACGAAGAGGTCCAATTTGGGGGAAAACCCCCCGGCCGTAATGGC
CGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 814 1 814
DS 

RD RS1A057TF 668 0 0
AATTCATTTGGCAACCATCACAAACTGTTGTTCTTTTACCAGACACTGAGAAAACACTAA
AGACTGTTCTTGCAATTTCCAACAGATAGATAGATACTAGAATACAAAGGCAAATGTCTA
ACAGGACTTGCCTGGTTTTTTGGATAAAAGATTAATCGTCTCGGTAGTTAAACTTCCTTT
TGACAGACACACGGTCATCTTCCTCTTCGTCTCCTTCTTCCTCTTCTTCACAAACTTCTT
CTTCTTCAGCTTCCTCTTCTTGCTCAACATCATCTTCCACAGTGTTAACCCTCTCGCACT
CGTCAATCCATTCACTATAGATGTCTATAGCTTCACTCAAAGCTGTAATAGTTGTGCTAA
AGCTTTCTTCACAGATTCTACAAGTTGCAATACCAATCATCTCCTTCATATTAATTTGGC
ATTCGACACTAGAGCCGTGATTGCAGAAAGGACAACTAAAGACAGTGTCAAGCTTGTCCA
TACGCTTCGTTGTAGCAGGCTTTGCCCTTGACTTCCTTTTCCCCATTGCTGTAACTGCGC
AAGATCGATTCCTCGAGGAAGAGCGAAATACGAAACCCTAAGATAGTGCGACGAAGAGGT
CCAATTTGGGGGAAAACCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTAC
CGTCGACT

QA 1 668 1 668
DS 



CO CL1Contig3 604 4 3 U
CAAGCACTAGTCATGACCAGGATCTCCTAGGAAACAGCTATGACCATGTTCACTTACCTA
CTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTT
TTTTTTTTTTTTTTATTTGAACAAAACTTCAAATTATTATATAATAAAAATGAATAGAAA
CATCATTTTGCAACACACATTAATGTTTACATGCTTTCAGTTACTTTTACACACTCTGCA
AATACAACAATTCAATACGACATACATACAGATATAAAATTTTCGTTTGTATAAGTTCTA
CAGGGAGTCGGGGAGGACAACCCCTAAAGAAAAATAGCACACTTATTACGTAAACACTTG
TCTTGTCTTCCCCATTTGCAAACAGAGCCAGGGATGATACAGCCAGCAGAACAAGGATAA
ACACTGAAACGCTCCGGATTGTCACCATAGCTTATACACGGCTGCAATGCTGCTCAGCTA
GATCCAGAGAGAGATTGAGAAAAACTTTCTTTTTTTTTGTTTTGCTTCGTTGCCGAACAA
TTAAGAGATTCTCCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTC
GACT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 

AF RS1A070JQ U 150
AF RS1A070TR U 231
AF RS1A070TF C 1
AF RS1A070TV C 1
BS 1 149 RS1A070TF
BS 150 555 RS1A070JQ
BS 556 604 RS1A070TF

RD RS1A070JQ 406 0 0
CAAATTATTATATAATAAAAATGAATAGAAACATCATTTTGCAACACACATTAATGTTTA
CATGCTTTCAGTTACTTTTACACACTCTGCAAATACAACAATTCAATACGACATACATAC
AGATATAAAATTTTCGTTTGTATAAGTTCTACAGGGAGTCGGGGAGGACAACCCCTAAAG
AAAAATAGCACACTTATTACGTAAACACTTGTCTTGTCTTCCCCATTTGCAAACAGAGCC
AGGGATGATACAGCCAGCAGAACAAGGATAAACACTGAAACGCTCCGGATTGTCACCATA
GCTTATACACGGCTGCAATGCTGCTCAGCTAGATCCAGAGAGAGATTGAGAAAAACTTTC
TTTTTTTTTGTTTTGCTTCGTTGCCGAACAATTAAGAGATTCTCCC

QA 1 406 1 406
DS 

RD RS1A070TR 325 0 0
ACACTCTGCAAATACAACAATTCAATACGACATACATACAGATATAAAATTTTCGTTTGT
ATAAGTTCTACAGGGAGTCGGGGAGGACAACCCCTAAAGAAAAATAGCACACTTATTACG
TAAACACTTGTCTTGTCTTCCCCATTTGCAAACAGAGCCAGGGATGATACAGCCAGCAGA
ACAAGGATAAACACTGAAACGCTCCGGATTGTCACCATAGCTTATACACGGCTGCAATGC
TGCTCAGCTAGATCCAGAGAGAGATTGAGAAAAACTTTCTTTTTTTTTGTTTTGCTTCGT
TGCCGAACAATTAAGAGATTCTCCC

QA 1 325 1 325
DS 

RD RS1A070TF 604 0 0
CAAGCACTAGTCATGACCAGGATCTCCTAGGAAACAGCTATGACCATGTTCACTTACCTA
CTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTT
TTTTTTTTTTTTTTATTTGAACAAAACTTCAAATTATTATATAATAAAAATGAATAGAAA
CATCATTTTGCAACACACATTAATGTTTACATGCTTTCAGTTACTTTTACACACTCTGCA
AATACAACAATTCAATACGACATACATACAGATATAAAATTTTCGTTTGTATAAGTTCTA
CAGGGAGTCGGGGAGGACAACCCCTAAAGAAAAATAGCACACTTATTACGTAAACACTTG
TCTTGTCTTCCCCATTTGCAAACAGAGCCAGGGATGATACAGCCAGCAGAACAAGGATAA
ACACTGAAACGCTCCGGATTGTCACCATAGCTTATACACGGCTGCAATGCTGCTCAGCTA
GATCCAGAGAGAGATTGAGAAAAACTTTCTTTTTTTTTGTTTTGCTTCGTTGCCGAACAA
TTAAGAGATTCTCCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTC
GACT

QA 1 604 1 604
DS 

RD RS1A070TV 604 0 0
CAAGCACTAGTCATGACCAGGATCTCCTAGGAAACAGCTATGACCATGTTCACTTACCTA
CTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTT
TTTTTTTTTTTTTTATTTGAACAAAACTTCAAATTATTATATAATAAAAATGAATAGAAA
CATCATTTTGCAACACACATTAATGTTTACATGCTTTCAGTTACTTTTACACACTCTGCA
AATACAACAATTCAATACGACATACATACAGATATAAAATTTTCGTTTGTATAAGTTCTA
CAGGGAGTCGGGGAGGACAACCCCTAAAGAAAAATAGCACACTTATTACGTAAACACTTG
TCTTGTCTTCCCCATTTGCAAACAGAGCCAGGGATGATACAGCCAGCAGAACAAGGATAA
ACACTGAAACGCTCCGGATTGTCACCATAGCTTATACACGGCTGCAATGCTGCTCAGCTA
GATCCAGAGAGAGATTGAGAAAAACTTTCTTTTTTTTTGTTTTGCTTCGTTGCCGAACAA
TTAAGAGATTCTCCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTC
GACT

QA 1 604 1 604
DS 



CO CL1Contig4 316 2 4 U
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CTCCCGCAATGCTACCATGTAACACGTGCCGGAAAAGGCCACAATCCCAGTAGTCAACAA
GCCACCAAAAATGTTGGGATATTTAGTGCTAGGAGCAAAAACAAGAGCTGCAGTGTGAAC
CAAATGGTAAAAAAAAGCCGTTTGCCACACCTGTTTGTAAAAAGGGTTTTCTGGCTTAAA
GACATGAGCACCGTAAGTTCCTAAACCAAGAGCAGCCATGCCAGAAACGGCGGCGACTTT
GTGCCATATCCGAGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1A086TR U 1
AF RS1A086JQ U 43
BS 1 108 RS1A086TR
BS 109 109 RS1A086JQ
BS 110 313 RS1A086TR
BS 314 316 RS1A086JQ

RD RS1A086TR 313 0 0
TGCCCATGCAGCAATGAACGCAAAGCCTCCGAATGGGGCCAGGGGAAAAAACTTCCTGTC
CTCCCGCAATGCTACCATGTAACACGTGCCGGAAAAGGCCACAATCCCCGTAGTCAACAA
GCCACCAAAAATGTTGGGATATTTAGTGCTAGGAGCAAAAACAAGAGCTGCAGTGTGAAC
CAAATGGTAAAAAAAAGCCGTTTGCCACACCTGTTTGTAAAAAGGGTTTTCTGGCTTAAA
GACATGAGCACCGTAAGTTCCTAAACCAAGAGCAGCCATGCCAGAAACGGCGGCGACTTT
GTGCCATATCCGA

QA 1 313 1 313
DS 

RD RS1A086JQ 274 0 0
GGGAA
AAAACTTCCTGTCCTCCCGCAATGCTACCATGTAACACGTGCCGGAAAAGGCCACAATCC
CAGTAGTCAACAAGCCACCAAAAATGTTGGGATATTTAGTGCTAGGAGCAAAAACAAGAG
CTGCAGTGTGAACCAAATGGTAAAGAAAAGCCGTTTGCCACACCTGTTTGTAAAAAGGGT
TTTCTGGCTTAAAGACATGAGCACCGTAAGTTCCTAAACCAAGAGCAGCCATGCCAGAAA
CGGCGGCGACTTTGTGCCATATCCGAGGA

QA 6 274 6 274
DS 



CO CL1Contig5 775 6 20 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGGGAAATTG
CGTCAGAAGCAACCTAAGAGATTTCAGAGGAAGACAATCGATGGATCCTCGGATATGGCA
CAAAGTCGCCGCCGTTTCTGGCATGGCTGCTCTTGGTTTAGGAACTTATGGTGCTCATGT
CTTTAAGCCAGAAAACCCTTCTTACAAACAGGTGTGGCAGACGGCTTCTCTTTACCATTT
GGTTCACACTGCAGCTCTTGTTTCTGCTCCTAGCACTAAATATCCCAACATTTTTGGTGG
CTTGTTGACTACTGGGATTGTGGCCTTTTCCGGCACGTGTTACATGGTAGCATTGCGCGA
GGACAGGAAGTTTTCTACCCTGGCACCATTCGGAGGCTTTGCGTTTATTGCTGCATGGGC
AACTCTACTTTTTTAAAGAATTTCAAATCATTTTTACTGTCAATTTGTGGTCATTCTTCT
GC*TTATCCTACCTATGAACTCAATGTTTTCTCTTCAAAGATTGCTTAATATTTAAATGT
AATGACCAGATTATGTTAACTATATGCTTCGCTTGTTGAATTTGTTGCTGGAAATATTAT
ATATGTAATTGATCAGATTAATGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCAAAAAAAAAAAAA
AAGGCCGCCTCGGCCCTCGAGAAGCTTTCTAGACCATTCGTTTGGCGCGCGGGCCCAGTA
GTAAGTGAACATGGTCATAGCTGTTTCCTAGGAGATCCTGGTCATGACTAGTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 15 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FT29JQ C 49
AF RS1FT29TF U 49
AF RS1A086TV U 1
AF RS1AF47JQ C 109
AF RS1AF47TF U 50
AF RS1A086TF U 142
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BS 221 405 RS1A086TV
BS 406 406 RS1AF47TF
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BS 469 482 RS1A086TV
BS 483 483 RS1AF47TF
BS 484 563 RS1A086TV
BS 564 564 RS1AF47TF
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BS 571 624 RS1A086TV
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G
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GGTGCTCATGTCTTTAAGCCAGAAAACCCTTCTTACAAACAGGTGTGGCAGACGGCTTCT
CTTTACCATTTGGTTCACACTGCAGCTCTTGTTTCTGCTCCTAGCACTAAATATCCCAAC
ATTTTTGGTGGCTTGTTGACTACTGGGATTGTGGCCTTTTCCGGCACGTGTTACATGGTA
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GCTGCATGGGCAACTCTACTTTTTTAAAGAATTTCAAATCATTTTTACTGTCAATTTGTG
GTCATTCTTCTGC*TTATCCTACCTATGAACTCAATGTTTTCTCTTCAAAGATTGCTTAA
TATTTAAATGTAATGACCAGATTATGTTAACTATATGCTTCGCTTGTTG

QA 2 530 2 530
DS 

RD RS1FT29TF 530 0 0
G
GGGGGAAATTGCGTCAGAAGCAACCTAAGAGATTTCAGAGGAAGACAATCGATGGATCCT
CGGATATGGCACAAAGTCGCCGCCGTTTCTGGCATGGCTGCTCTTGGTTTAGGAACTTAT
GGTGCTCATGTCTTTAAGCCAGAAAACCCTTCTTACAAACAGGTGTGGCAGACGGCTTCT
CTTTACCATTTGGTTCACACTGCAGCTCTTGTTTCTGCTCCTAGCACTAAATATCCCAAC
ATTTTTGGTGGCTTGTTGACTACTGGGATTGTGGCCTTTTCCGGCACGTGTTACATGGTA
GCATTGCGCGAGGACAGGAAGTTTTCTACCCTGGCACCATTCGGAGGCTTTGCGTTTATT
GCTGCATGGGCAACTCTACTTTTTTAAAGAATTTCAAATCATTTTTACTGTCAATTTGTG
GTCATTCTTCTGC*TTATCCTACCTATGAACTCAATGTTTTCTCTTCAAAGATTGCTTAA
TATTTAAATGTAATGACCAGATTATGTTAACTATATGCTTCGCTTGTTG

QA 2 530 2 530
DS 

RD RS1A086TV 624 0 0
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CGTAAGAAGCAACCTAAGAGATTTCAGAGGAAGACGATCGATGGATCCTCGGATATGGCA
CAAAGTCGCCGCCGTTTCTGGCATGGCTGCTCTTGGTTTAGGAACTTACGGTGCTCATGT
CTTTAAGCCAGAAAACCCTTCTTACAAACAGGTGTGGCAAACGGCTTCTCTTTACCATTT
GGTTCACACTGCAGCTCTTGTTTCTGCTCCTAGCACTAAATATCCCAACATTTTTGGTGG
CTTGTTGACTACTGGGATTGTGGCCTTTTCCGGCACGTGTTACATGGTAGCATTGCGCGA
GGACAGGAAGTTTTCTACCCTGGCACCATTCGGAGGCTTTGCGTTCATTGCTGCATGGGC
AACTCTACTTTTTTAAAGAATTTCAAATCATTTTTACTGTCAAT****GGTCATTCTTCT
GCCTTATCCTACCTATGAACTCAATGTTTTCTCTTCAAAGATTGCTTAATATTTAAATGT
AATGACCAGATTATGTTAACTATGTGCTTTGCTTGTTGAATTTGTTGCTGGAAATATTAT
ATATGTAATTGATCAGATTAATGC

QA 1 624 1 624
DS 

RD RS1AF47JQ 497 0 0
TCGGATATGGCACAAAGTCGCCGCCGTTTCTGGCATGGCTGCTCTTGGTTTAGGAACTTA
TGGTGCTCATGTCTTTAAGCCAGAAAACCCTTCTTACAAACAGGTGTGGCAGACGGCTTC
TCTTTACCATTTGGTTCACACTGCAGCTCTTGTTTCTGCTCCTAGCACTAAATATCCCAA
CATTTTTGGTGGCTTGTTGACTACTGGGATTGTGGCCTTTTCCGGCACGTGTTACATGGT
AGCATTGCGCGAGGACAGGAAGTTTTCTACCCTGGCACCATTCGGAGGCTTTGCGTTTAT
TGCTGCATGGGCAACTCTACTTTTTTAAAGAATTTCAAATCATTTTTACTGTCAATTTGT
GGTCATTCTTCTGC*TTATCCTACCTATGAACTCAATGTTTTCTCTTCAAAGATTGCTTA
ATATTTAAATGTAATGACCAGATTATGTTAACTATATGCTTCGCTTGTTGAATTTGTTGC
TGGAAATATTATATATG

QA 1 497 1 497
DS 

RD RS1AF47TF 556 0 0
GGGGGAAATTGCGTCAGAAGCAACCTAAGAGATTTCAGAGGAAGACAACCGATGGATCCT
CGGATATGGCACAAAGTCGCCGCCGTTTCTGGCATGGCTGCTCTTGGTTTAGGAACTTAT
GGTGCTCATGTCTTTAAGCCAGAAAACCCTTCTTACAAACAGGTGTGGCAGACGGCTTCT
CTTTACCATTTGGTTCACACTGCAGCTCTTGTTTCTGCTCCTAGCACTAAATATCCCAAC
ATTTTTGGTGGCTTGTTGACTACTGGGATTGTGGCCTTTTCCGGCACGTGTTACATGGTA
GCATTGCGCGAGGACAGGAAGTTTTCTACCCTGGCACCATTCGGAGGCTTTGCGTTTATT
GCTGCATGGGCAACTCTACTTTTTTAAAGAATTTCAAATCATTTTTACTGTCAATTTGTG
GTCATTCTTCTGC*TTATCCTACCTATGAACTCAATGTTTTCTCTTCAAAGATTGCTTAA
TATTTAAATGTAATGACCAGATTATGTTAACTATATGCTTCGCTTGTTGAATTTGTTGCT
GGAAATATTATATATG

QA 1 556 1 556
DS 

RD RS1A086TF 634 0 0
CATGGCTGCTCTTGGTTTAGGAACTTACGGTGCTCATGTCTTTAAGCCAGAAAACCCTTC
TTACAAACAGGTGTGGCAAACGGCTTCTCTTTACCATTTGGTTCACACTGCAGCTCTTGT
TTCTGCTCCTAGCACTAAATATCCCAACATTTTTGGTGGCTTGTTGACTACTGGGATTGT
GGCCTTTTCCGGCACGTGTTACATGGTAGCATTGCGCGAGGACAGGAAGTTTTCTACCCT
GGCACCATTCGGAGGCTTTGCGTTCATTGCTGCATGGGCAACTCTACTTTTTTAAAGAAT
TTCAAATCATTTTTACTGTCAAT****GGTCATTCTTCTGCCTTATCCTACCTATGAACT
CAATGTTTTCTCTTCAAAGATTGCTTAATATTTAAATGTAATGACCAGATTATGTTAACT
ATGTGCTTTGCTTGTTGAATTTGTTGCTGGAAATATTATATATGTAATTGATCAGATTAA
TGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCAAAAAAAAAAAAAAAGGCCGCCTCGGCCCTCGAG
AAGCTTTCTAGACCATTCGTTTGGCGCGCGGGCCCAGTAGTAAGTGAACATGGTCATAGC
TGTTTCCTAGGAGATCCTGGTCATGACTAGTGCT

QA 1 634 1 634
DS 



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TGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTTT
TTTTTTTTTTTTGCTAAACCTTTTTTTATTAAGATGGTGGAAATTAACAACACATTTGAA
GAAACAATAAGCTGAGATTTAAAAAAAACACTTTAGTGGAGCTTAAGAAAATTAGAAGAC
ATCTGTAAACACGTGAATGTAATGATTACTAATAAGTTTTAATTGTGGTAGAAGTTGCAA
ACATGGTCCACGAACTGACGAACCCAAAAATGTGATTCCACCCTCCTGTCCACTGTATCC
ATCAATAGCTTGTCCGGTATATCTGTAGATCTTCCAATCATAGATTCGAAACATAAATCA
TCAAGACAAACCCTTTCAAGAAGCAGAAGATGTTTCCAAATATGATTTTGTGAAGGATTT
TTTTTGGTGAGATTCGTGAAGACTGAATAGAAATCCAATACATGGAAGGATTAATGGTAA
AAATATAGTCGTCAGAGACGGTGTGATCTGAAAAGGCATGACGTTTCTGTTCTCCATCTC
CATTATCGAGAAGGAAGAAACCTAACATTGGGTTTATTTGCACAGACAGTATAAAACCCA
ATTAATTTCTCAGAAACCGTCTGGCCCATCCAAGAAAATCGAGCAACCAAAAAAGAAATT
TATCAGCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A106TV C 1
AF RS1A106JQ U 133
AF RS1A106TR U 133
AF RS1A106TF C 133
BS 1 132 RS1A106TV
BS 133 703 RS1A106JQ
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RD RS1A106TV 703 0 0
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TGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTTT
TTTTTTTTTTTTGCTAAACCTTTTTTTATTAAGATGGTGGAAATTAACAACACATTTGAA
GAAACAATAAGCTGAGATTTAAAAAAAACACTTTAGTGGAGCTTAAGAAAATTAGAAGAC
ATCTGTAAACACGTGAATGTAATGATTACTAATAAGTTTTAATTGTGGTAGAAGTTGCAA
ACATGGTCCACGAACTGACGAACCCAAAAATGTGATTCCACCCTCCTGTCCACTGTATCC
ATCAATAGCTTGTCCGGTATATCTGTAGATCTTCCAATCATAGATTCGAAACATAAATCA
TCAAGACAAACCCTTTCAAGAAGCAGAAGATGTTTCCAAATATGATTTTGTGAAGGATTT
TTTTTGGTGAGATTCGTGAAGACTGAATAGAAATCCAATACATGGAAGGATTAATGGTAA
AAATATAGTCGTCAGAGACGGTGTGATCTGAAAAGGCATGACGTTTCTGTTCTCCATCTC
CATTATCGAGAAGGAAGAAACCTAACATTGGGTTTATTTGCACAGACAGTATAAAACCCA
ATTAATTTCTCAGAAACCGTCTGGCCCATCCAAGAAAATCGAG

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1A106JQ 576 0 0
GCTAAACCTTTTTTTATTAAGATGGTGGAAATTAACAACACATTTGAAGAAACAATAAGC
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AACTGACGAACCCAAAAATGTGATTCCACCCTCCTGTCCACTGTATCCATCAATAGCTTG
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GGAAGAAACCTAACATTGGGTTTATTTGCACAGACAGTATAAAACCCAATTAATTTCTCA
GAAACCGTCTGGCCCATCCAAGAAAATCGAG
CAACC

QA 1 571 1 571
DS 

RD RS1A106TR 576 0 0
GCTAAACCTTTTTTTATTAAGATGGGGGAAATTAACAACACATTTGAAGAAACAATAAGC
TGAGATTTAAAAAAAACACTTTAGTGGAGCTTAAGAAAATTAGAAGACATCTGTAAACAC
GTGAATGTAATGATTACTAATAAGTTTTAATTGTGGTAGAAGTTGCAAACATGGTCCACG
AACTGACGAACCCAAAAATGTGATTCCACCCTCCTGTCCACTGTATCCATCAATAGCTTG
TCCGGTATATCTGTAGATCTTCCAATCATAGATTCGAAACATAAATCATCAAGACAAACC
CTTTCAAGAAGCAGAAGATGTTTCCAAATATGATTTTGTGAAGGATTTTTTTTGGTGAGA
TTCGTGAAGACTGAATAGAAATCCAATACATGGAAGGATTAATGGTAAAAATATAGTCGT
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GGAAGAAACCTAACATTGGGTTTATTTGCACAGACAGTATAAAACCCAATTAATTTCTCA
GAAACCGTCTGGCCCATCCAAGAAAATCGAG
CAACC

QA 1 571 1 571
DS 

RD RS1A106TF 645 0 0
GCTAAACCTTTTTTTATTAAGATGGTGGAAATTAACAACACATTTGAAGAAACAATAAGC
TGAGATTTAAAAAAAACACTTTAGTGGAGCTTAAGAAAATTAGAAGACATCTGTAAACAC
GTGAATGTAATGATTACTAATAAGTTTTAATTGTGGTAGAAGTTGCAAACATGGTCCACG
AACTGACGAACCCAAAAATGTGATTCCACCCTCCTGTCCACTGTATCCATCAATAGCTTG
TCCGGTATATCTGTAGATCTTCCAATCATAGATTCGAAACATAAATCATCAAGACAAACC
CTTTCAAGAAGCAGAAGATGTTTCCAAATATGATTTTGTGAAGGATTTTTTTTGGTGAGA
TTCGTGAAGACTGAATAGAAATCCAATACATGGAAGGATTAATGGTAAAAATATAGTCGT
CAGAGACGGTGTGATCTGAAAAGGCATGACGTTTCTGTTCTCCATCTCCATTATCGAGAA
GGAAGAAACCTAACATTGGGTTTATTTGCACAGACAGTATAAAACCCAATTAATTTCTCA
GAAACCGTCTGGCCCATCCAAGAAAATCGAGCAACCAAAAAAGAAATTTATCAGCCCCCG
GCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 645 1 645
DS 



CO CL1Contig7 893 6 3 U
CACTAGTCATGACCAGGATCTCCTAGGAAACAGCTATGACCATGTTCACTTACTACTGGG
CCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTTTTTTT
TTTTTTTTTTGAATGAAACCAAATTAAAATTTCACTACAAAACCCAAAAGAGACAGTAAC
ATCGTAACTTTGCAAGAGCTCTACATAGGACAGAGAGCACAAAAACAGAGAATAAGTAAC
AACTTTGCGAAAGTGTTTTGTGTTCTTCTTTTCTTTTCAAGTAGTAGCTTCAACTTCTGC
ATCAGTTTCGACAGGGGAGGTAGAACTCTTCTTCCCTCGACCTCTTAAACGCGAAGAGAC
ATTATCAATAGCCGAGTTAAGCTGTCCAATCTTCTCGTTCAAAGTCTCCCTTGTTTTCTC
CAAACCTTCGTCGTAGTAACTTGGTTGCTCTGGCTTCTTGAATCCATACTCATCTTCTTC
ACTCATTATCGATCTTCGGATCTGTGGAGCAAAGATGTAGGCGGCAGCGCCAAACAAAGC
ACCTCCAAGAAGAAAACCAGCTACGAAATCACCACCACCACCACCGCTTCCTCTCCTTCT
CCCATACTCTGCACAAACTGAAAAGTTGCGAGTCCGGTTTGATTT*CTTCTGGATACTCA
ATGCAGAGGATTTACAGATCGAATTGAGCTTTGCGGTGGACAGTCCATTTGCATTCACGT
AATGAGATTGAGAACCACCTGAGAGAGAAAGATGAGGAACACAAGAGGACGCCATTTTGG
AAATGTAAAAACGAAGAGATCTGATCTAATCTCTCTAATCTAATGAACACTCTGAAGAAT
ATCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AA08JQ U 140
AF RS1A108TV C 1
AF RS1A108TR U 594
AF RS1AA08TF C 658
AF RS1A108JQ U 131
AF RS1A108TF C 131
BS 1 134 RS1A108TV
BS 135 844 RS1A108JQ
BS 845 893 RS1A108TF

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CAAG
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CATAGGACAGAGAGCACAAAAACAGAGAATAAGTAACAACTTTGCGAAAGTGTTTTGTGT
TCTTCTTTTCTTTTCAAGTAGTAGCTTCAACTTCTGCATCAGTTTCGACAGGGGAGGTAG
AACTCTTCTTCCCTCGACCTCTTAAACGCGAAGAGACATTATCAATAGCCGAGTTAAGCT
GTCCAATCTTCTCGTCCAAAGTCTCCCTTGTTTTCTCCAAACCTTCGTCGTAGTAACTTG
GTTGCTCTGGCTTCTTGAATCCATACTCATCTTC

QA 5 338 5 338
DS 

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TTTTTTTTTTGAATGAAACCAAATTAAAATTTCACTACAAAACCCAAAAGAGACAGTAAC
ATCGTAACTTTGCAAGAGCTCTACATAGGACAGAGAGCACAAAAACAGAGAATAAGTAAC
AACTTTGCGAAAGTGTTTTGTGTTCTTCTTTTCTTTTCAAGTAGTAGCTTCAACTTCTGC
ATCAGTTTCGACAGGGGAGGTAGAACTCTTCTTCCCTCGACCTCTTAAACGCGAAGAGAC
ATTATCAATAGCCGAGTTAAGCTGTCCAATCTTCTCGTTCAAAGTCTCCCTTGTTTTCTC
CAAACCTTCGTCGTAGTAACTTGGTTGCTCTGGCTTCTTGAATCCATACTCATCTTCTTC
ACTCATTATCGATCTTCGGATCTGTGGAGCAAAGATGTAGGCGGCAGCGCCAAACAAAGC
ACCTCCAAGAAGAAAACCAGCTACGAAATCACCACCACCACCACCGCTTCCTCTCCTTCT
CCCATACTCTGCACAAACTGAAAAGTTGCGAGTCCGGTTTGATTT*CTTCTGGATACTCA
ATGCAGAGGATTTACAGATCGAATTGAGCTTTGCGGTGGACAGTCCATTTGCATTCACGT

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DS 

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TCCTTCTCCCATACTCTGCACAAACTGAAAAGTTGCGAGTCCGGTTTGATTTTCTTCTGG
ATACTCAATGCAGAGGATTTACAGATCGAATTGAGCTTTGCGGTGGACAGTCC

QA 1 113 1 113
DS 

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CGTAATGAGATTGAGAACCACCTGAGAGAGAAAGATGAGGAACACAAGAGGACGCCATT
TTGGAAATGT

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DS 

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GAAT
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AGAGCTCTACATAGGACAGAGAGCACAAAAACAGAGAATAAGTAACAACTTTGCGAAAGT
GTTTTGTGTTCTTCTTTTCTTTTCAAGTAGTAGCTTCAACTTCTGCATCAGTTTCGACAG
GGGAGGTAGAACTCTTCTTCCCTCGACCTCTTAAACGCGAAGAGACATTATCAATAGCCG
AGTTAAGCTGTCCAATCTTCTCGTTCAAAGTCTCCCTTGTTTTCTCCAAACCTTCGTCGT
AGTAACTTGGTTGCTCTGGCTTCTTGAATCCATACTCATCTTCTTCACTCATTATCGATC
TTCGGATCTGTGGAGCAAAGATGTAGGCGGCAGCGCCAAACAAAGCACCTCCAAGAAGAA
AACCAGCTACGAAATCACCACCACCACCACCGCTTCCTCTCCTTCTCCCATACTCTGCAC
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CCACCTGAGAGAGAAAGATGAGGAACACAAGAGGACGCCATTTTGGAAATGTAAAAACGA
AGAGATCTGATCTAATCTCTCTAATCTAATGAACACTCTGAAGAATATCC

QA 5 714 5 714
DS 

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GAAT
GAAACCAAATTAAAATTTCACTACAAAACCCAAAAGAGACAGTAACATCGTAACTTTGCA
AGAGCTCTACATAGGACAGAGAGCACAAAAACAGAGAATAAGTAACAACTTTGCGAAAGT
GTTTTGTGTTCTTCTTTTCTTTTCAAGTAGTAGCTTCAACTTCTGCATCAGTTTCGACAG
GGGAGGTAGAACTCTTCTTCCCTCGACCTCTTAAACGCGAAGAGACATTATCAATAGCCG
AGTTAAGCTGTCCAATCTTCTCGTTCAAAGTCTCCCTTGTTTTCTCCAAACCTTCGTCGT
AGTAACTTGGTTGCTCTGGCTTCTTGAATCCATACTCATCTTCTTCACTCATTATCGATC
TTCGGATCTGTGGAGCAAAGATGTAGGCGGCAGCGCCAAACAAAGCACCTCCAAGAAGAA
AACCAGCTACGAAATCACCACCACCACCACCGCTTCCTCTCCTTCTCCCATACTCTGCAC
AAACTGAAAAGTTGCGAGTCCGGTTTGATTT*CTTCTGGATACTCAATGCAGAGGATTTA
CAGATCGAATTGAGCTTTGCGGTGGACAGTCCATTTGCATTCACGTAATGAGATTGAGAA
CCACCTGAGAGAGAAAGATGAGGAACACAAGAGGACGCCATTTTGGAAATGTAAAAACGA
AGAGATCTGATCTAATCTCTCTAATCTAATGAACACTCTGAAGAATATCCCCCGGCCGTA
ATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 5 763 5 763
DS 



CO CL1Contig8 864 12 2 U
ATGTGAGATCAAGCACTAGTCATGACCAGGATCTCTAGGAAACAGCTATGACCATGTTCA
CTTACTACTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCG
GCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAATAGCTTAAATCTTTATTTGGTTTCATGTAAATGT
TTTACAGGGTAGACGCATCCACCTTAGTAATTTCTGAGTTCAGCTATTACTGATAAACAT
AAACACCTCACTCTGAGGTTGAAAAACTGGTTAAACAGACTAAGATTCGGCAGACGAGGC
TGCGTCATCTTTGTGCTTAATCATACCCGAGTCCACAAGAATTGGAATCTCTGCAGCAAG
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TATCGAACTGGAGATCGAACTCGTACTTGAGGAGGTTGTGAACGTACCAGCACTTGCCAG
TCCAGCGGGTACCTTCGGGATTGGAGGCGGAGATGCGGAACCAGTCGTTGTCGTTGGACT
TGTTCATCTGTGTGTACGCGATCAGAGATTTGTACTCTTCTTTCAGCCTCTGTTTCCATG
CGTCGCCGTCTCGTGGTCCCGCCTTTGTGGTTAGAAGAGGGATTCGCGTTAGGGTCGATT
TGGTGCTCGGATCCCATCCTTCCATTTTTGTTTTCTCTTTCTCGCCGATTTTGGGCGTAA
GTGTTAAGACTTTTGATCGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 40 40 40 40 40 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 
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65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1GN93JQ U 130
AF RS1A113TV C 1
AF RS1A113TR U 174
AF RS1A113TF C 143
AF RS1GV21TF C 207
AF RS1BH66TF C 141
AF RS1CH58JQ U 148
AF RS1CH58TF C 148
AF RS1GV21JQ U 147
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AF RS1GN93TF C 347
AF RS1A113JQ U 143
BS 1 140 RS1A113TV
BS 141 864 RS1D341JQ

RD RS1GN93JQ 521 0 0
AGAAAAAAACA
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ACCTTAGTAATTTCTGAGTTCAGCTATTACTGATAAACATAAACACCTCACTCTGAGGTT
GAAAAACTGGTTAAACAGACTAAGATTCGGCAGACGAGGCTGCGTCATCTTTGTGCTTAA
TCATACCCGAGTCCACAAGAATTGGAATCTCTGCAGCAAGCCACGGAGCCAGCCCCAAAC
AAAGTGCATGCGCTATACCAAACCTAGGGCAGTTTTTAGCCCAGAGCGGCTTGAAATGCA
CAGTCAGACAAATCTTCCCACCTCGATACATCTTTTGTGTTTTGCCGTCAATCTCAGGCA
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TTGGAGGCGGAGATGCGGAACCAGTCGTTG

QA 12 521 12 521
DS 

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GCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAATAGCTTAAATCTTTATTTGGTTTCATGTAAATGT
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AAACACCTCACTCTGAGGTTGAAAAACTGGTTAAACAGACTAAGATTCGGCAGACGAGGC
TGCGTCATCTTTGTGCTTAATCATACCCGAGTCCACAAGAATTGGAATCTCTGCAGCAAG
CCACGGAGCCAGCCCCAAACAAAGTGCATGCGCTATACCAAACCTACGGCAGTTTTTAGC
CCAGAGCGGCTTGAAATGCACAGTCAGACAAATCTTCCCACCTCGATACATCTTTTGTGT
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TATCGAACTGGAGATCGAACTCGTACTTGAGGAGGTTGTGAACGTACCAGCACTTGCCAG
TCCAGCGGGTACCTTCGGGATTGGAGGCGGAGATGCGGAACCAGTCGTTGTCGTTGGACT
TGTTCATCTGTGTGTACGCGATCAGAGATTTGTACTCTTCTTTCAGCCTCTGTTTCCATG
CGTCGCCGTCTCGTGGTCCCGCCTTTGTGGTTAGAAGAGGGATTCGCGTTAGG

QA 1 773 1 773
DS 

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TAAATGTTTTACAGGGTAGACGCATCCACCTTAGTAATTTCTGAGTTCAGCTATTACTGA
TAAACATAAACACCTCACTCTGAGGTTGAAAAACTGGTTAAACAGACTAAGATTCGGCAG
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CAGCAAGCCACGGAGCCAGCCCCAAACAAAGTGCATGCGCTATACCAAACCTACGGCAGT
TTTTAGCCCAGAGCGGCTTGAAATGCACAGTCAGACAAATCTTCCCACCTCGATACATCT
TTTGTGTTTTGCCGTCAATCTCAGGCAACTCAAGCTCGGGAGCAGTGG*CGGGGTACGTG
ATGGGGATATCGAACTGGAGATCGAACTCGTACTTGAGGAGGTTGTGAACGTACCAGCAC
TTGCCAGTCCAGCGGGTACCTTCGGGATTGGAGGCGGAGATGCGGAACCAGTCGTTGTCG
TTGGACTTGTTCATCTGTGTGTACGCGATCAGAAATTTGTACTCTTCTTTCAGCCTCTGT
TTCCATGCGTCGCCGTCTCGTGGTCCCGCCTTTGTGGTTAGAAGAGGGA

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1A113TF 614 0 0
GCAATAGCTTAAATCTTTATTTGGTTTCATGTAAATGTTTTACAGGGTAGACGCATCCAC
CTTAGTAATTTCTGAGTTCAGCTATTACTGATAAACATAAACACCTCACTCTGAGGTTGA
AAAACTGGTTAAACAGACTAAGATTCGGCAGACGAGGCTGCGTCATCTTTGTGCTTAATC
ATACCCGAGTCCACAAGAATTGGAATCTCTGCAGCAAGCCACGGAGCCAGCCCCAAACAA
AGTGCATGCGCTATACCAAACCTACGGCAGTTTTTAGCCCAGAGCGGCTTGAAATGCACA
GTCAGACAAATCTTCCCACCTCGATACATCTTTTGTGTTTTGCCGTCAATCTCAGGCAAC
TCAAGCTCGGGAGCAGTGGGCGGGGTACGTGATGGGGATATCGAACTGGAGATCGAACTC
GTACTTGAGGAGGTTGTGAACGTACCAGCACTTGCCAGTCCAGCGGGTACCTTCGGGATT
GGAGGCGGAGATGCGGAACCAGTCGTTGTCGTTGGACTTGTTCATCTGTGTGTACGCGAT
CAGAGATTTGTACTCTTCTTTCAGCCTCTGTTTCCATGCGTCGCCGTCTCGTGGTCCCGC
CTTTGTGGTTAGAA

QA 1 614 1 614
DS 

RD RS1GV21TF 622 0 0
GTAATTTCTGAGTTCAGCTATTACTGATAAACATAAACACCTCACTCTGAGGTTGAAAAA
CTGGTTAAACAGACTAAGATTCGGCAGACGAGGCTGCGTCATCTTTGTGCTTAATCATAC
CCGAGTCCACAAGAATTGGAATCTCTGCAGCAAGCCACGGAGCCAGCCCCAAACAAAGTG
CATGCGCTATACCAAACCTAGGGCAGTTTTTAGCCCAGAGCGGCTTGAAATGCACAGTCA
GACAAATCTTCCCACCTCGATACATCTTTTGTGTTTTGCCGTCAATCTCAGGCAACTCAA
GCTCGGGAGCAGTGG*CGGGGTACGTGATGGGGATATCGAACTGGAGATCGAACTCGTAC
TTGAGGAGGTTGTGAACGTACCAGCACTTGCCAGTCCAGCGGGTACCTTCGGGATTGGAG
GCGGAGATGCGGAACCAGTCGTTGTCGTTGGACTTGTTCATCTGTGTGTACGCGATCAGA
GATTTGTACTCTTCTTTCAGCCTCTGTTTCCATGCGTCGCCGTCTCGTGGTCCCGCCTTT
GTGGTTAGAAGAGGGATTCGCGTTAGGGTCGATTTGGTGCTCGGATCCCATCCTTCCATT
TTTGTTTTCTCTTTCTCGCC
CC

QA 1 620 1 620
DS 

RD RS1BH66TF 686 0 0
TTGCAATAGCTTAAATCTTTATTTGGTTTCATGTAAATGTTTTACAGGGTAGACGCATCC
ACCTTAGTAATTTCCGAGTTCAGCTATTACTGATAAACATAAACACCTCACTCTGAGGTT
GAAAAACCGGTTAAACAGACTAAGATTCGGCAGACGAGGCTGCGTCATCTTTGTGCTTAA
TCATACCCGAGTCCACAAGAATTGGAATCTCTGCAGCAAGCCACGGAGCCAGCCCCAAAC
AAAGTGCATGCGCTATACCAAACCTAGGGCAGTTTTTAGCCCAGAGCGGCTTGAAATGCA
CAGTCAGACAAATCTTCCCACCTCGATACATCTTTTGTGTTTTGCCGTCAATCTCAGGCA
ACTCAAGCTCGGGAGCAGTGG*CGGGGTACGTGATGGGGATATCGAACTGGAGATCGAAC
TCGTACTTGAGGAGGTTGTGAACGTACCAGCACTCGCCAGTCCAGCGGGTACCTTCGGGA
TTGGAGGCGGAGATGCGGAACCAGTCGTTGTCGTTGGACTTGTTCATCTGTGTGTACGCG
ATCAGAGATTTGTACTCTTCTTTCAGCCTCTGTTTCCATGCGTCGCCGTCTCGTGGTCCC
GCCTTTGTGGTTAGAAGAGGGATTCGCGTTAGGGTCGATTTGGTGCTCGGATCCCATCCT
TCCACTTTTGTTTTCTCTTTCTC
CCC

QA 1 683 1 683
DS 

RD RS1CH58JQ 679 0 0
AGCTTAAATCTTTATTTGGTTTCATGTAAATGTTTTACAGGGTAGACGCATCCACCTTAG
TAATTTCTGAGTTCAGCTATTACTGATAAACATAAACACCTCACTCTGAGGTTGAAAAAC
TGGTTAAACAGACTAAGATTCGACAGACGAGGCTGCGTCATCTTTGTGCTTAATCATACC
CGAGTCAACAAGAATTGGAATCTCTGCAGCAAGCCACGGAGCCAGCCCCAAACAAAGTGC
ATGCGCTATACCAAACCTAGGGCAGTTTTTAGCCCAGAGCGGCTTGAAATGCACAGTCAG
ACAAATCTTCCCACCTCGATACATCTTTTGTGTTTTGCCGTCAATCTCAGGCAACTCAAG
CTCGGGAGCAGTGG*CGGGGTACGTGATGGGGATATCGAACTGGAGATCGAACTCGTACT
TGAGGAGGTTGTGAACGTACCAGCACTTGCCAGTCCAGCGGGTACCTTCGGGATTGGAGG
CGGAGATGCGGAACCAGTCGTTGTCGTTGGACTTGTTCATCTGTGTGTACGCGATCAGAG
ATTTGTACTCTTCTTTCAGCCTCTGTTTCCATGCGTCGCCGTCTCGTGGTCCCGCCTTTG
TGGTTAGAAGAGGGATTCGCGTTAGGGTCGATTTGGTGCTCGGATCCCATCCTTCCATTT
TTGTTTTCTCTTTCTC
CAC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1CH58TF 679 0 0
AGCTTAAATCTTTATTTGGTTTCATGTAAATGTTTTACAGGGTAGACGCATCCACCTTAG
TAATTTCTGAGTTCAGCTATTACTGATAAACATAAACACCTCACTCTGAGGTTGAAAAAC
TGGTTAAACAGACTAAGATTCGACAGACGAGGCTGCGTCATCTTTGTGCTTAATCATACC
CGAGTCAACAAGAATTGGAATCTCTGCAGCAAGCCACGGAGCCAGCCCCAAACAAAGTGC
ATGCGCTATACCAAACCTAGGGCAGTTTTTAGCCCAGAGCGGCTTGAAATGCACAGTCAG
ACAAATCTTCCCACCTCGATACATCTTTTGTGTTTTGCCGTCAATCTCAGGCAACTCAAG
CTCGGGAGCAGTGG*CGGGGTACGTGATGGGGATATCGAACTGGAGATCGAACTCGTACT
TGAGGAGGTTGTGAACGTACCAGCACTTGCCAGTCCAGCGGGTACCTTCGGGATTGGAGG
CGGAGATGCGGAACCAGTCGTTGTCGTTGGACTTGTTCATCTGTGTGTACGCGATCAGAG
ATTTGTACTCTTCTTTCAGCCTCTGTTTCCATGCGTCGCCGTCTCGTGGTCCCGCCTTTG
TGGTTAGAAGAGGGATTCGCGTTAGGGTCGATTTGGTGCTCGGATCCCATCCTTCCATTT
TTGTTTTCTCTTTCTC
CAC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1GV21JQ 682 0 0
CT
GCTTAAATCTTTATTTGGTTTCATGTAAATGTTTTACAGGGTAGACGCATCCACCTTAGT
AATTTCTGAGTTCAGCTATTACTGATAAACATAAACACCTCACTCTGAGGTTGAAAAACT
GGTTAAACAGACTAAGATTCGGCAGACGAGGCTGCGTCATCTTTGTGCTTAATCATACCC
GAGTCCACAAGAATTGGAATCTCTGCAGCAAGCCACGGAGCCAGCCCCAAACAAAGTGCA
TGCGCTATACCAAACCTAGGGCAGTTTTTAGCCCAGAGCGGCTTGAAATGCACAGTCAGA
CAAATCTTCCCACCTCGATACATCTTTTGTGTTTTGCCGTCAATCTCAGGCAACTCAAGC
TCGGGAGCAGTGG*CGGGGTACGTGATGGGGATATCGAACTGGAGATCGAACTCGTACTT
GAGGAGGTTGTGAACGTACCAGCACTTGCCAGTCCAGCGGGTACCTTCGGGATTGGAGGC
GGAGATGCGGAACCAGTCGTTGTCGTTGGACTTGTTCATCTGTGTGTACGCGATCAGAGA
TTTGTACTCTTCTTTCAGCCTCTGTTTCCATGCGTCGCCGTCTCGTGGTCCCGCCTTTGT
GGTTAGAAGAGGGATTCGCGTTAGGGTCGATTTGGTGCTCGGATCCCATCCTTCCATTTT
TGTTTTCTCTTTCTCGCC
CC

QA 3 680 3 680
DS 

RD RS1D341JQ 737 0 0
CTAGAAAAAAACA
TTGCAATAGCTTAAATCTTTATTTGGTTTCATGTAAATGTTTTACAGGGTAGACGCATCC
ACCTTAGTAATTTCTGAGTTCAGCTATTACTGATAAACATAAACACCTCACTCTGAGGTT
GAAAAACTGGTTAAACAGACTAAGATTCGGCAGACGAGGCTGCGTCATCTTTGTGCTTAA
TCATACCCGAGTCCACAAGAATTGGAATCTCTGCAGCAAGCCACGGAGCCAGCCCCAAAC
AAAGTGCATGCGCTATACCAAACCTAGGGCAGTTTTTAGCCCAGAGCGGCTTGAAATGCA
CAGTCAGACAAATCTTCCCACCTCGATACATCTTTTGTGTTTTGCCGTCAATCTCAGGCA
ACTCAAGCTCGGGAGCAGTGG*CGGGGTACGTGATGGGGATATCGAACTGGAGATCGAAC
TCGTACTTGAGGAGGTTGTGAACGTACCAGCACTTGCCAGTCCAGCGGGTACCTTCGGGA
TTGGAGGCGGAGATGCGGAACCAGTCGTTGTCGTTGGACTTGTTCATCTGTGTGTACGCG
ATCAGAGATTTGTACTCTTCTTTCAGCCTCTGTTTCCATGCGTCGCCGTCTCGTGGTCCC
GCCTTTGTGGTTAGAAGAGGGATTCGCGTTAGGGTCGATTTGGTGCTCGGATCCCATCCT
TCCATTTTTGTTTTCTCTTTCTCGCCGATTTTGGGCGTAAGTGTTAAGACTTTTGATCGA
TTCC

QA 14 737 14 737
DS 

RD RS1GN93TF 518 0 0
ATCTCTGCAGCAAGCCACGGAGCCAGCCCCAAACAAAGTGCATGCGCTATACCAAACCTA
GGGCAGTTTTTAGCCCAGAGCGGCTTGAAATGCACAGTCAGACAAATCTTCCCACCTCGA
TACATCTTTTGTGTTTTGCCGTCAATCTCAGGCAACTCAAGCTCGGGAGCAGTGG*CGGG
GTACGTGATGGGGATATCGAACTGGAGATCGAACTCGTACTTGAGGAGGTTGTGAACGTA
CCAGCACTTGCCAGTCCAGCGGGTACCTTCGGGATTGGAGGCGGAGATGCGGAACCAGTC
GTTGTCGTTGGACTTGTTCATCTGTGTGTACGCGATCAGAGATTTGTACTCTTCTTTCAG
CCTCTGTTTCCATGCGTCGCCGTCTCGTGGTCCCGCCTTTGTGGTTAGAAGAGGGATTCG
CGTTAGGGTCGATTTGGTGCTCGGATCCCATCCTTCCATTTTTGTTTTCTCTTTCTCGCC
GATTTTGGGCGTAAGTGTTAAGACTTTTGATCGATTCC

QA 1 518 1 518
DS 

RD RS1A113JQ 722 0 0
GCAATAGCTTAAATCTTTATTTGGTTTCATGTAAATGTTTTACAGGGTAGACGCATCCAC
CTTAGTAATTTCTGAGTTCAGCTATTACTGATAAACATAAACACCTCACTCTGAGGTTGA
AAAACTGGTTAAACAGACTAAGATTCGGCAGACGAGGCTGCGTCATCTTTGTGCTTAATC
ATACCCGAGTCCACAAGAATTGGAATCTCTGCAGCAAGCCACGGAGCCAGCCCCAAACAA
AGTGCATGCGCTATACCAAACCTACGGCAGTTTTTAGCCCAGAGCGGCTTGAAATGCACA
GTCAGACAAATCTTCCCACCTCGATACATCTTTTGTGTTTTGCCGTCAATCTCAGGCAAC
TCAAGCTCGGGAGCAGTGG*CGGGGTACGTGATGGGGATATCGAACTGGAGATCGAACTC
GTACTTGAGGAGGTTGTGAACGTACCAGCACTTGCCAGTCCAGCGGGTACCTTCGGGATT
GGAGGCGGAGATGCGGAACCAGTCGTTGTCGTTGGACTTGTTCATCTGTGTGTACGCGAT
CAGAGATTTGTACTCTTCTTTCAGCCTCTGTTTCCATGCGTCGCCGTCTCGTGGTCCCGC
CTTTGTGGTTAGAAGAGGGATTCGCGTTAGGGTCGATTTGGTGCTCGGATCCCATCCTTC
CATTTTTGTTTTCTCTTTCTCGCCGATTTTGGGCGTAAGTGTTAAGACTTTTGATCGATT
CC

QA 1 722 1 722
DS 



CO CL1Contig9 708 6 1 U
CATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATCAGTCGACGGTACCGGACATATGCC
CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGACAAAAAAAAACACACTAAACATTTATTTAAAG
TGGAGAGTTACAATGTCGGCATCCAAAGTTGCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTC
GCTAGTCTTCATGAATGTGCCAGCCCTCAAAGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGAA
CCAAAGTTTGGTTGGTGTTGCAGCTCCACTACACAATGCCGAAGCACCAAAGCGGAATGT
GACAAACATTGTATCTATTAGCATCTGGGGCCGTTGAATATTTATGAAGAGAATTTCCAT
AATTATATGTTCCAAATATTTTCATACTTCATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATAA
TTCCTAATCCATAGGAGGAGCAGGTAGTATTATGTCCTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGA
AAGTTCAATAAATAGTTATTTTCTGAGTTTCTTCAATTGTATTTAAGAATTTTATAAATG
TTACATAAAATGAGAATAAACCCATTTAAGACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCGCCT
CGGCCCTCGAGAAGCTTTCTAGACCATTCGTTTGGCGCGCGGGCCCAGTAGGTAAGTGAA
CATGGTCATAGCTGTTTCCTAGGAGATCCTGGTCATGACTAGTGCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1E587TF U 84
AF RS1AP94TFB U 86
AF RS1A115JQ C 86
AF RS1A115TR C 86
AF RS1A115TF U 1
AF RS1A115TV U 74
BS 1 708 RS1A115TF

RD RS1E587TF 116 0 0
GGCT
ACAAAAAAAAACACACTAAACATTTATTTAATGTGGAGAGTTACAATGTCGGCATCCAAA
GTTGCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTG

QA 5 116 5 116
DS 

RD RS1AP94TFB 300 0 0
GGACAAAAAAAAACACACTAAACATTTATTTAATGTGGAGAGTTACAATGTCGGCATCCA
AAGTTGCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAGCC
CTCAAAGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGAACCAAAGTTTGGTTGGTGTTGCAGCT
CCACTACACAATGCCGAAGCACCAAAGCGGAATGTGACAAACATTGTATCTATTAGCATC
TGGGGCCGTTGAATTTTTCTGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTCAT

QA 1 300 1 300
DS 

RD RS1A115JQ 488 0 0
GGACAAAAAAAAACACACTAAACATTTATTTAAAGTGGAGAGTTACAATGTCGGCATCCA
AAGTTGCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTCGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAGCC
CTCAAAGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGAACCAAAGTTTGGTTGGTGTTGCAGCT
CCACTACACAATGCCGAAGCACCAAAGCGGAATGTGACAAACATTGTATCTATTAGCATC
TGGGGCCGTTGAATATTTATGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTCAT
ACTTCATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATAATTCCTAATCCATAGGAGGAGCAGGT
AGTATTATGTCCTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGAAAGTTCAATAAATAGTTATTTTCTG
AGTTTCTTCAATTGTATTTAAGAATTTTATAAATGTTACATAAAATGAGAATAAACCCAT
TTAAGACT

QA 1 488 1 488
DS 

RD RS1A115TR 488 0 0
GGACAAAAAAAAACACACTAAACATTTATTTAAAGTGGAGAGTTACAATGTCGGCATCCA
AAGTTGCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTCGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAGCC
CTCAAAGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGAACCAAAGTTTGGTTGGTGTTGCAGCT
CCACTACACAATGCCGAAGCACCAAAGCGGAATGTGACAAACATTGTATCTATTAGCATC
TGGGGCCGTTGAATATTTATGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTCAT
ACTTCATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATAATTCCTAATCCATAGGAGGAGCAGGT
AGTATTATGTCCTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGAAAGTTCAATAAATAGTTATTTTCTG
AGTTTCTTCAATTGTATTTAAGAATTTTATAAATGTTACATAAAATGAGAATAAACCCAT
TTAAGACT

QA 1 488 1 488
DS 

RD RS1A115TF 708 0 0
CATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATCAGTCGACGGTACCGGACATATGCC
CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGACAAAAAAAAACACACTAAACATTTATTTAAAG
TGGAGAGTTACAATGTCGGCATCCAAAGTTGCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTC
GCTAGTCTTCATGAATGTGCCAGCCCTCAAAGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGAA
CCAAAGTTTGGTTGGTGTTGCAGCTCCACTACACAATGCCGAAGCACCAAAGCGGAATGT
GACAAACATTGTATCTATTAGCATCTGGGGCCGTTGAATATTTATGAAGAGAATTTCCAT
AATTATATGTTCCAAATATTTTCATACTTCATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATAA
TTCCTAATCCATAGGAGGAGCAGGTAGTATTATGTCCTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGA
AAGTTCAATAAATAGTTATTTTCTGAGTTTCTTCAATTGTATTTAAGAATTTTATAAATG
TTACATAAAATGAGAATAAACCCATTTAAGACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCGCCT
CGGCCCTCGAGAAGCTTTCTAGACCATTCGTTTGGCGCGCGGGCCCAGTAGGTAAGTGAA
CATGGTCATAGCTGTTTCCTAGGAGATCCTGGTCATGACTAGTGCTTG

QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1A115TV 635 0 0
ATTACGGCCGGGGGACAAAAAAAAACACACTAAACATTTATTTAAAGTGGAGAGTTACAA
TGTCGGCATCCAAAGTTGCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTCGCTAGTCTTCATG
AATGTGCCAGCCCTCAAAGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGAACCAAAGTTTGGTT
GGTGTTGCAGCTCCACTACACAATGCCGAAGCACCAAAGCGGAATGTGACAAACATTGTA
TCTATTAGCATCTGGGGCCGTTGAATATTTATGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCC
AAATATTTTCATACTTCATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATAATTCCTAATCCATA
GGAGGAGCAGGTAGTATTATGTCCTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGAAAGTTCAATAAAT
AGTTATTTTCTGAGTTTCTTCAATTGTATTTAAGAATTTTATAAATGTTACATAAAATGA
GAATAAACCCATTTAAGACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCGCCTCGGCCCTCGAGAA
GCTTTCTAGACCATTCGTTTGGCGCGCGGGCCCAGTAGGTAAGTGAACATGGTCATAGCT
GTTTCCTAGGAGATCCTGGTCATGACTAGTGCTTG

QA 1 635 1 635
DS 



CO CL1Contig10 717 3 2 U
CAAGCACTAGTCATGACCAGGATCTCCTAGGAAACAGCTATGACCATGTTCACTTACCTA
CTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTT
TTTTTTTTTTTTTTTGGTACATGAAGGCTTACTCATAAACTCAAGGAAGATTACATATAT
ATCTCTTCGTTACAAGGTTTCCGTGGTAATATACAAACAAAAGATCTCTCTGATAGTTCT
CTCTGGCTTTTTTAAACAGACATGGTCTGTTCTGAAACAGAAGCCAAACCATGCATTAAC
CTGACAATTTCAGTAATGTCATCCAGGTAATACTTAGCTTTGCTAGGCTTCTGACCAACG
GTACAGGCGAAGACCTCAGCTCTAGGGGCAATCCAAGGGCCTACAGTGGAACTACATATA
ACTTCAAACATGTCTTCATCAGACCGGTCATCTCCAATACACAGAACAAACTCAGGAGGT
GTTCCTTTTTCTTGCATCATCGAAAGCATCCTTCTCGCTATAAGTCCTTTGCTCACCCCC
TGCGGCTTGACCTCAACATAGTTCTGTCCTCTCTTGACCGTTACAGGTTCATTGGCAAGG
ACACTTTCAAGATGGTCTAGAAGCTCTTTAGCTTGACATGAGCCGAAGTCAGGGTCAGCA
TCCTCATAGCTCCACACCAGAGCCGTCTCCTTGTCCTCTATCGTTGATCCATCTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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BQ
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GAGCTCATCCTTGGAATCGGAGAAATACGAGAGGACGTACGGAACGGCGCGGATAGCGAC
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BQ
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AF RS1EW27TF C 121
AF RS1A129TF C 1
AF RS1EW27JQ U 121
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GGAATCAGAAGA
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AAAAAAAGATAAAAAGAAAAATGACTCTTTTTCACCCACAAGAACGCTCGTAGTTGAGTC
TAGCCTTGTCTTGTCAATCCTCATCCTCGTGCAAGGTTCCCAAGACGTCCTCATCCCGGA
AGAGATGGTACTCGTTATCGCCGAGTTTGACCTGAGTACCACCGTACTCTGGAAGAAGAA
CGGTGTCGCCTTCCTTGACAGAGACCGGAATCAAATTCCCGTCATTATCCCTTGAACCAG
GTCCCACTGCTATCACCTTTCCCGAGTTCAAAGAGGAGGCTTTCTCTGGAAGGAGGATGC
CGCTTTCGGTTTTTGCAGGCTGGATGACTCTCTTCACCAGGATGCGGTTGAACGTTGGCA
CCAGACGCTTCATCATTTCT

QA 13 452 13 452
DS 

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TTTTTTTTTTTTTGCATCGTTTAAGATTGATGTCTAAATTTCAATGATAATCAACAGAGT
CCAACCTCATATAAAAAAAGATAAAAAGAAAAATGACTCTTTTTCACCCACAAGAACGCT
CGTAGTTGAGTCTAGCCTTGTCTTGTCAATCCTCATCCTCGTGCAAGGTTCCCAAGACGT
CCTCATCCCGGAAGAGATGGTACTCGTTATCGCCGAGTTTGACCTGAGTACCACCGTACT
CTGGAAGAAGAACGGTGTCGCCTTCCTTGACAGAGACCGGAATCAAATTCCCGTCCTTAT
CCCTTGAACCAGGTCCCACTGCTATCACCTTTCCCGAGTTCAAAGAGGAGGCTTTCTCTG
GAAGGAGGATGCCGCTTTCGGTTTTTGCAGGCTG*ATGACTCTCTTCACCAGGATGCGGT
TGAACGTTGGCACCAGACGCTTCATCATTTCTCTCGATTCTATTCTCTCGGAAGAGGTGA
GTGTTAATTCTA

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DS 

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GGAATCAGAAGA
TGCATCGTTTAAGATTGATGTCTAAATTTCAATGATAATCAACAGAGTCCAACCTCATAT
AAAAAAAGATAAAAAGAAAAATGACTCTTTTTCACCCACAAGAACGCTCGTAGTTGAGTC
TAGCCTTGTCTTGTCAATCCTCATCCTCGTGCAAGGTTCCCAAGACGTCCTCATCCCGGA
AGAGATGGTACTCGTTATCGCCGAGTTTGACCTGAGTACCACCGTACTCTGGAAGAAGAA
CGGTGTCGCCTTCCTTGACAGAGACCGGAATCAAATTCCCGTCATTATCCCTTGAACCAG
GTCCCACTGCTATCACCTTTCCCGAGTTCAAAGAGGAGGCTTTCTCTGGAAGGAGGATGC
CGCTTTCGGTTTTTGCAGGCTGGATGACTCTCTTCACCAGGATGCGGTTGAACGTTGGCA
CCAGACGCTTCATCATTTCTCTCGATTCTATTCTCTCGGAAGAGGTGAGTGTTAATTCTA
GGGTTCCTCTTGGGCCC

QA 13 509 13 509
DS 

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AAAAAAGATAAAAAGAAAAATGACTCTTTTTCACCCACAAGAACGCTCGTAGTTGAGTCT
AGCCTTGTCTTGTCAATCCTCATCCTCGTGCAAGGTTCCCAAGACGTCCTCATCCCGGAA
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GGTGTCGCCTTCCTTGACAGAGACCGGAATCAAATTCCCGTCCTTATCCCTTGAACCAGG
TCCCACTGCTATCACCTTTCCCGAGTTCAAAGAGGAGGCTTTCTCTGGAAGGAGGATGCC
GCTTTCGGTTTTTGCAGGCTGGATGACTCTCTTCACCAGGATGCGGTTGAACGTTGGCAC
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GGTTCCTCTT
CC

QA 1 490 1 490
DS 

RD RS1A129TR 492 0 0
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AAAAAAGATAAAAAGAAAAATGACTCTTTTTCACCCACAAGAACGCTCGTAGTTGAGTCT
AGCCTTGTCTTGTCAATCCTCATCCTCGTGCAAGGTTCCCAAGACGTCCTCATCCCGGAA
GAGATGGTACTCGTTATCGCCGAGTTTGACCTGAGTACCACCGTACTCTGGAAGAAGAAC
GGTGTCGCCTTCCTTGACAGAGACCGGAATCAAATTCCCGTCCTTATCCCTTGAACCAGG
TCCCACTGCTATCACCTTTCCCGAGTTCAAAGAGGAGGCTTTCTCTGGAAGGAGGATGCC
GCTTTCGGTTTTTGCAGGCTGGATGACTCTCTTCACCAGGATGCGGTTGAACGTTGGCAC
CAGACGCTTCATCATTTCTCTCGATTCTATTCTCTCGGAAGAGGTGAGTGTTAATTCTAG
GGTTCCTCTT
CC

QA 1 490 1 490
DS 



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TGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTTT
TTTTTTTTTTTTAAACCAACATAACCATTAGGCAAACTGCTTTGACAAGGTCTCTTTGCT
TCCAAGAAATGATTCTTGGTCCAGAACTGGAAGGCATCTATACCAAATAGAAGTAAAATC
CTAGGTTCTGTTTTTGTTTTCTTTCTCCTACTACAAGGGTTGGACCTAAATTATAACTCG
AAGTTGAACTTTTCGGCTAATCACCAGTGAGAGCTCGAGGGCTATGTTCAATGGTGGAGA
GAGACATGGCAGACTGAGCCACGGCTCTGACAAACCCCATGTTTGCAGTCAACGTAGGAG
CTCCCCATCTATCACCTGTCCCAAACACAATCTTGTTCTTCATTGCTAACTTCCTCGTTG
TTGGGAGTCCCATCACACGCTCTGTAGGATTGTCATTCACCACTATTAGTCTCTTCAACA
ACTGCTCAGCTCTTTGCTTCTCACTGTGTCCAGCATACATAGACACCAACTCATTAAACT
CTGAAACAACACTCTCACATACAATCCCTCGCTTCCCTGACAACACATCTCTCATTCTAT
CAAGAACCGAGTTCTCAACTTCAGATCTCGCCTGAGCAATCGCGAAGACAGTATTCCCTT
TGAACTTCTCCTCCAACACGCTCTCATCCATCTCCAATAACCTCTCTGCACATCCCCCCG
GCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACTGATAACTTCGTATAA
TGTATGCTATACGAAGTTATG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A136TV C 1
AF RS1A136JQ U 133
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BS 1 132 RS1A136TV
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TGAACTTCTCCTCCAACACGCTCTCATC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RS1A136JQ 644 0 0
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TCTCAACTTCAGATCTCGCCTGAGCAATCGCGAAGACAGTATTCCCTTTGAACTTCTCCT
CCAACACGCTCTCATCCATCTCCAATAACCTCTCTGCACATCCC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1A136TR 644 0 0
AAACCAACATAACCATTAGGCAAACTGCTTTGACAAGGTCTCTTTGCTTCCAAGAAATGA
TTCTTGGTCCAGAACTGGAAGGCATCTATACCAAATAGAAGTAAAATCCTAGGTTCTGTT
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TCGGCTAATCACCAGTGAGAGCTCGAGGGCTATGTTCAATGGTGGAGAGAGACATGGCAG
ACTGAGCCACGGCTCTGACAAACCCCATGTTTGCAGTCAACGTAGGAGCTCCCCATCTAT
CACCTGTCCCAAACACAATCTTGTTCTTCATTGCTAACTTCCTCGTTGTTGGGAGTCCCA
TCACACGCTCTGTAGGATTGTCATTCACCACTATTAGTCTCTTCAACAACTGCTCAGCTC
TTTGCTTCTCACTGTGTCCAGCATACATAGACACCAACTCATTAAACTCTGAAACAACAC
TCTCACATACAATCCCTCGCTTCCCTGACAACACATCTCTCATTCTATCAAGAACCGAGT
TCTCAACTTCAGATCTCGCCTGAGCAATCGCGAAGACAGTATTCCCTTTGAACTTCTCCT
CCAACACGCTCTCATCCATCTCCAATAACCTCTCTGCACATCCC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1A136TF 729 0 0
AAACCAACATAACCATTAGGCAAACTGCTTTGACAAGGTCTCTTTGCTTCCAAGAAATGA
TTCTTGGTCCAGAACTGGAAGGCATCTATACCAAATAGAAGTAAAATCCTAGGTTCTGTT
TTTGTTTTCTTTCTCCTACTACAAGGGTTGGACCTAAATTATAACTCGAAGTTGAACTTT
TCGGCTAATCACCAGTGAGAGCTCGAGGGCTATGTTCAATGGTGGAGAGAGACATGGCAG
ACTGAGCCACGGCTCTGACAAACCCCATGTTTGCAGTCAACGTAGGAGCTCCCCATCTAT
CACCTGTCCCAAACACAATCTTGTTCTTCATTGCTAACTTCCTCGTTGTTGGGAGTCCCA
TCACACGCTCTGTAGGATTGTCATTCACCACTATTAGTCTCTTCAACAACTGCTCAGCTC
TTTGCTTCTCACTGTGTCCAGCATACATAGACACCAACTCATTAAACTCTGAAACAACAC
TCTCACATACAATCCCTCGCTTCCCTGACAACACATCTCTCATTCTATCAAGAACCGAGT
TCTCAACTTCAGATCTCGCCTGAGCAATCGCGAAGACAGTATTCCCTTTGAACTTCTCCT
CCAACACGCTCTCATCCATCTCCAATAACCTCTCTGCACATCCCCCCGGCCGTAATGGCC
GAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACTGATAACTTCGTATAATGTATGCTATAC
GAAGTTATG

QA 1 729 1 729
DS 



CO CL1Contig14 825 4 3 U
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TTTTTTTTTTTGGCCAAGTTTTTTGGATACTAATTGCATCAAAAGTCAAGCTACTTATTT
TTTTGAAATGACAATATGCTCTGTCATAAGGCTAAGATCATTGCCTTATGACTCATCAAA
CAACATCATCGAATGACAAGGCCACAGAAACATCAGCTTTCCCCTTCTCCAACTCAGCTA
ACAGCTTTGATAACTTCTGCTTCAACTTGTTCATCTTTTTCTCACCAGCTTCTTGCTTCT
TCTTCTTTTCTGTGATTTCTTCCAATTTCTCTTGTAACCAATCGACATCCAACCCTGCAT
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TTGACAGGCATAGCGTGTTGATTAGGCTAAGGAGGACGTTGATGTAAGCTGTCCTCAGAT
GCCGATTCATAGGACGGAACTGTGATGCAATGTCAGGGTGTTTTTCAAATATACGCCTCA
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AACGCGTGGAAGCGGGAATCATTGAGGTTTCGTACGCGTCGAAGCTCTGAGTCCCCCCCG
GCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A140TV C 1
AF RS1A140JQ U 132
AF RS1A140TR U 132
AF RS1A140TF C 132
BS 1 131 RS1A140TV
BS 132 776 RS1A140JQ
BS 777 825 RS1A140TF

RD RS1A140TV 699 0 0
CAAGCACTAGTCATGACCAGGATCTCTAGGAAACAGCTATGACCATGTTCACTTACTACT
GGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTTTT
TTTTTTTTTTTGGCCAAGTTTTTTGGATACTAATTGCATCAAAAGTCAAGCTACTTATTT
TTTTGAAATGACAATATGCTCTGTCATAAGGCTAAGATCATTGCCTTATGACTCATCAAA
CAACATCATCGAATGACAAGGCCACAGAAACATCAGCTTTCCCCTTCTCCAACTCAGCTA
ACAGCTTTGATAACTTCTGCTTCAACTTGTTCATCTTTTTCTCACCAGCTTCTTGCTTCT
TCTTCTTTTCTGTGATTTCTTCCAATTTCTCTTGTAACCAATCGACATCCAACCCTGCAT
CTGTCAAGTCCGCAAGAGAAATATGTGCGTATCGCAGATCATCCTTGGAGAGCTCCTGAG
TTGACAGGCATAGCGTGTTGATTAGGCTAAGGAGGACGTTGATGTAAGCTGTCCTCAGAT
GCCGATTCATAGGACGGAACTGTGATGCAATGTCAGGGTGTTTTTCAAATATACGCCTCA
TGGATTCGACCTGTGAAGGAAGAACTCGGAAGCCATTGACGTCCATGCTTTCATTTGCTG
AAAGTTCAAGAAGACCACTAGCCTCCACACGACCATCTC

QA 1 699 1 699
DS 

RD RS1A140JQ 645 0 0
GGCCAAGTTTTTTGGATACTAATTGCATCAAAAGTCAAGCTACTTATTTTTTTGAAATGA
CAATATGCTCTGTCATAAGGCTAAGATCATTGCCTTATGACTCATCAAACAACATCATCG
AATGACAAGGCCACAGAAACATCAGCTTTCCCCTTCTCCAACTCAGCTAACAGCTTTGAT
AACTTCTGCTTCAACTTGTTCATCTTTTTCTCACCAGCTTCTTGCTTCTTCTTCTTTTCT
GTGATTTCTTCCAATTTCTCTTGTAACCAATCGACATCCAACCCTGCATCTGTCAAGTCC
GCAAGAGAAATATGTGCGTATCGCAGATCATCCTTGGAGAGCTCCTGAGTTGACAGGCAT
AGCGTGTTGATTAGGCTAAGGAGGACGTTGATGTAAGCTGTCCTCAGATGCCGATTCATA
GGACGGAACTGTGATGCAATGTCAGGGTGTTTTTCAAATATACGCCTCATGGATTCGACC
TGTGAAGGAAGAACTCGGAAGCCATTGACGTCCATGCTTTCATTTGCTGAAAGTTCAAGA
AGACCACTAGCCTCCACACGACCATCTCCACACTTGTTATCTCTGTTCGAACGCGTGGAA
GCGGGAATCATTGAGGTTTCGTACGCGTCGAAGCTCTGAGTCCCC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1A140TR 645 0 0
GGCCAAGTTTTTTGGATACTAATTGCATCAAAAGTCAAGCTACTTATTTTTTTGAAATGA
CAATATGCTCTGTCATAAGGCTAAGATCATTGCCTTATGACTCATCAAACAACATCATCG
AATGACAAGGCCACAGAAACATCAGCTTTCCCCTTCTCCAACTCAGCTAACAGCTTTGAT
AACTTCTGCTTCAACTTGTTCATCTTTTTCTCACCAGCTTCTTGCTTCTTCTTCTTTTCT
GTGATTTCTTCCAATTTCTCTTGTAACCAATCGACATCCAACCCTGCATCTGTCAAGTCC
GCAAGAGAAATATGTGCGTATCGCAGATCATCCTTGGAGAGCTCCTGAGTTGACAGGCAT
AGCGTGTTGATTAGGCTAAGGAGGACGTTGATGTAAGCTGTCCTCAGATGCCGATTCATA
GGACGGAACTGTGATGCAATGTCAGGGTGTTTTTCAAATATACGCCTCATGGATTCGACC
TGTGAAGGAAGAACTCGGAAGCCATTGACGTCCATGCTTTCATTTGCTGAAAGTTCAAGA
AGACCACTAGCCTCCACACGACCATCTCCACACTTGTTATCTCTGTTCGAACGCGTGGAA
GCGGGAATCATTGAGGTTTCGTACGCGTCGAAGCTCTGAGTCCCC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1A140TF 694 0 0
GGCCAAGTTTTTTGGATACTAATTGCATCAAAAGTCAAGCTACTTATTTTTTTGAAATGA
CAATATGCTCTGTCATAAGGCTAAGATCATTGCCTTATGACTCATCAAACAACATCATCG
AATGACAAGGCCACAGAAACATCAGCTTTCCCCTTCTCCAACTCAGCTAACAGCTTTGAT
AACTTCTGCTTCAACTTGTTCATCTTTTTCTCACCAGCTTCTTGCTTCTTCTTCTTTTCT
GTGATTTCTTCCAATTTCTCTTGTAACCAATCGACATCCAACCCTGCATCTGTCAAGTCC
GCAAGAGAAATATGTGCGTATCGCAGATCATCCTTGGAGAGCTCCTGAGTTGACAGGCAT
AGCGTGTTGATTAGGCTAAGGAGGACGTTGATGTAAGCTGTCCTCAGATGCCGATTCATA
GGACGGAACTGTGATGCAATGTCAGGGTGTTTTTCAAATATACGCCTCATGGATTCGACC
TGTGAAGGAAGAACTCGGAAGCCATTGACGTCCATGCTTTCATTTGCTGAAAGTTCAAGA
AGACCACTAGCCTCCACACGACCATCTCCACACTTGTTATCTCTGTTCGAACGCGTGGAA
GCGGGAATCATTGAGGTTTCGTACGCGTCGAAGCTCTGAGTCCCCCCCGGCCGTAATGGC
CGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 694 1 694
DS 



CO CL1Contig15 862 5 1 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGAGGGACTCCGACG
GGGAAATTAATGGGAAGCGAACGGAGCTCGATGGAGAAGAAGAGGAGCAGAGCACGGAGC
GAAGATCCTTCTTCGTCTTCCGAGAATGAAGAAAGAGTTAAGAGGCATAGAGGAACAGAT
AAAGATGATGAGAGGAGAAGTAGTAGGAGAAGTGAGAAGAAGAAGGAGAAGAAATCTCAC
AAGCACCACCGATCGAGTACATCAAAGAAGTTGAAGGATGATAAGCACAAAAAGAAAGAA
GCAGAAGTTGACCACAAGCTTAAAGAGGGGATCCCAGAGTTGTCAAGTGAGGACTACTTC
TCTAAGAACAACGAGTTTGCCACATGGCTGAAAGAGAAGAAGCGCACTTACTTCAATGAT
CTCACGACCGAGTCTGCAAGGGAATTGTTTTCTCGCTTTGTCAAGGCATGGAGCAGAGGG
AAACTCGAGTCCCGATACTACGAGGGAATCGCTACTGCCCCACGAACAGCTCACAACTGG
AAGATCAAGCAGAAGTGAAAACAAGAAGCAAAACCTTCCTCTGCTTAACACTCTACTTGA
CTACTTGCTTCTTGAATGTTTGGAGGTTGATGATAAAAAAGATACCTTCTTCAGTTCGTT
CTATTAAGAGCTCTTGTTGCGAAACTTGTTAGATAGATTGTGGTTGAGACGCGTTTGTAG
TTGGTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCGCCTCGGCCCTCGAGAAGCTTTCTAGACC
ATTCGTTTGGCGCGCGGGCCCAGTAGTAAGTGAACATGGTCATAGCTGTTTCCTAGGAGA
TCCTGGTCATGACTAGTGCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FR84TF U 51
AF RS1A145TR C 133
AF RS1A145JQ C 48
AF RS1A145TF U 49
AF RS1A145TV U 1
BS 1 862 RS1A145TV

RD RS1FR84TF 243 0 0
GACTCCGACGGGGAAATTAATGGGAAGCGAACGGAGCTCGATGGAGAAGAAGAGGAGCAG
AGCACGGAGCGAAGATCCTTCTTCGTCTTCCGAGAATGAAGAAAGAGTTAAG**GCATAG
AGGAACAGATAAAGATGATGAGAGGAGAAGTAGTAGGAGAAGTGAGAAGAAGAAGGAGAA
GAAATCTCACAAGCACCACCGATCGAGTACATCAAAGAAGTTGAAGGATGATAAGCACAA
AAA

QA 1 243 1 243
DS 

RD RS1A145TR 394 0 0
TCGTCTTCCGAGAATGAAGAAAGAGTTAAGAGGCATAGAGGAACAGATAAAGATGATGAG
AGGAGAAGTAGTAGGAGAAGTGAGAAGAAGAAGGAGAAGAAATCTCACAAGCACCACCGA
TCGAGTACATCAAAGAAGTTGAAGGATGATAAGCACAAAAAGAAAGAAGCAGAAGTTGAC
CACAAGCTTAAAGAGGGGATCCCAGAGTTGTCAAGTGAGGACTACTTCTCTAAGAACAAC
GAGTTTGCCACATGGCTGAAAGAGAAGAAGCGCACTTACTTCAATGATCTCACGACCGAG
TCTGCAAGGGAATTGTTTTCTCGCTTTGTCAAGGCATGGAGCAGAGGGAAACTCGAGTCC
CGATACTACGAGGGAATCGCTACTGCCCCACGAA

QA 1 394 1 394
DS 

RD RS1A145JQ 680 0 0
AGG
GACTCCGACGGGGAAATTAATGGGAAGCGAACGGAGCTCGATGGAGAAGAAGAGGAGCAG
AGCACGGAGCGAAGATCCTTCTTCGTCTTCCGAGAATGAAGAAAGAGTTAAGAGGCATAG
AGGAACAGATAAAGATGATGAGAGGAGAAGTAGTAGGAGAAGTGAGAAGAAGAAGGAGAA
GAAATCTCACAAGCACCACCGATCGAGTACATCAAAGAAGTTGAAGGATGATAAGCACAA
AAAGAAAGAAGCAGAAGTTGACCACAAGCTTAAAGAGGGGATCCCAGAGTTGTCAAGTGA
GGACTACTTCTCTAAGAACAACGAGTTTGCCACATGGCTGAAAGAGAAGAAGCGCACTTA
CTTCAATGATCTCACGACCGAGTCTGCAAGGGAATTGTTTTCTCGCTTTGTCAAGGCATG
GAGCAGAGGGAAACTCGAGTCCCGATACTACGAGGGAATCGCTACTGCCCCACGAACAGC
TCACAACTGGAAGATCAAGCAGAAGTGAAAACAAGAAGCAAAACCTTCCTCTGCTTAACA
CTCTACTTGACTACTTGCTTCTTGAATGTTTGGAGGTTGATGATAAAAAAGATACCTTCT
TCAGTTCGTTCTATTAAGAGCTCTTGTTGCGAAACTTGTTAGATAGATTGTGGTTGAGAC
GCGTTTGTAGTTGGTT
T

QA 4 679 4 679
DS 

RD RS1A145TF 678 0 0
GG
GACTCCGACGGGGAAATTAATGGGAAGCGAACGGAGCTCGATGGAGAAGAAGAGGAGCAG
AGCACGGAGCGAAGATCCTTCTTCGTCTTCCGAGAATGAAGAAAGAGTTAAGAGGCATAG
AGGAACAGATAAAGATGATGAGAGGAGAAGTAGTAGGAGAAGTGAGAAGAAGAAGGAGAA
GAAATCTCACAAGCACCACCGATCGAGTACATCAAAGAAGTTGAAGGATGATAAGCACAA
AAAGAAAGAAGCAGAAGTTGACCACAAGCTTAAAGAGGGGATCCCAGAGTTGTCAAGTGA
GGACTACTTCTCTAAGAACAACGAGTTTGCCACATGGCTGAAAGAGAAGAAGCGCACTTA
CTTCAATGATCTCACGACCGAGTCTGCAAGGGAATTGTTTTCTCGCTTTGTCAAGGCATG
GAGCAGAGGGAAACTCGAGTCCCGATACTACGAGGGAATCGCTACTGCCCCACGAACAGC
TCACAACTGGAAGATCAAGCAGAAGTGAAAACAAGAAGCAAAACCTTCCTCTGCTTAACA
CTCTACTTGACTACTTGCTTCTTGAATGTTTGGAGGTTGATGATAAAAAAGATACCTTCT
TCAGTTCGTTCTATTAAGAGCTCTTGTTGCGAAACTTGTTAGATAGATTGTGGTTGAGAC
GCGTTTGTAGTTGGTT

QA 3 678 3 678
DS 

RD RS1A145TV 862 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGAGGGACTCCGACG
GGGAAATTAATGGGAAGCGAACGGAGCTCGATGGAGAAGAAGAGGAGCAGAGCACGGAGC
GAAGATCCTTCTTCGTCTTCCGAGAATGAAGAAAGAGTTAAGAGGCATAGAGGAACAGAT
AAAGATGATGAGAGGAGAAGTAGTAGGAGAAGTGAGAAGAAGAAGGAGAAGAAATCTCAC
AAGCACCACCGATCGAGTACATCAAAGAAGTTGAAGGATGATAAGCACAAAAAGAAAGAA
GCAGAAGTTGACCACAAGCTTAAAGAGGGGATCCCAGAGTTGTCAAGTGAGGACTACTTC
TCTAAGAACAACGAGTTTGCCACATGGCTGAAAGAGAAGAAGCGCACTTACTTCAATGAT
CTCACGACCGAGTCTGCAAGGGAATTGTTTTCTCGCTTTGTCAAGGCATGGAGCAGAGGG
AAACTCGAGTCCCGATACTACGAGGGAATCGCTACTGCCCCACGAACAGCTCACAACTGG
AAGATCAAGCAGAAGTGAAAACAAGAAGCAAAACCTTCCTCTGCTTAACACTCTACTTGA
CTACTTGCTTCTTGAATGTTTGGAGGTTGATGATAAAAAAGATACCTTCTTCAGTTCGTT
CTATTAAGAGCTCTTGTTGCGAAACTTGTTAGATAGATTGTGGTTGAGACGCGTTTGTAG
TTGGTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCGCCTCGGCCCTCGAGAAGCTTTCTAGACC
ATTCGTTTGGCGCGCGGGCCCAGTAGTAAGTGAACATGGTCATAGCTGTTTCCTAGGAGA
TCCTGGTCATGACTAGTGCTTG

QA 1 862 1 862
DS 



CO CL1Contig16 785 6 29 U
CAAGCACTAGTCATGACCAGGATCTCCTAGGAAACAGCTATGACCATGTTCACTTACCTA
CTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTT
TTTTTTTTTTTTTTCCAGAACCTCAATGTGATAACAACCATGTTCCAAAATCCAAAACAG
GACAAGTCTTAGCAAAAAATTCAAAAACAAAAAGCAAAAATAAAAAGATAAATTCGCGAT
AAACCTAAGCAGTGAGCACAACAGCACCACCAGCTTCCTTGATCTTCTTCTCAGCAGTCT
TCGAGATCAACTTCGCCTTCACCACAAACGGCTTGCCCTCAGGCAAATGACCTTTCCCGA
GCACCTTAAAGAACCCATGCTGCGTCACGTCAATCATCGGCACCTTATCCTTGGTAGCCT
TGGCCTTCACATCCTCGGGAACAAGCGACCAGAGCCTGTCGAGGTTAACGATCGGGTTGT
AGAACTTGTTGCGAAGCTTGTGGAAGTACCTCATACCGACTTTACCGAAGTAACCAGGAT
GGTACTTGTCGAAGAGGATCCTGTGGTGGTGCATACCTCCGGCGTTACCTCGACCTCCGG
GATGCTTGCGGTGCTTCCCGATACGACCGTGTCCGGCGCTGACGTGACCGCGCTTCTTCC
TGTTCTTCCTGAGTCTGGTCGTCATTTCTCGGCGATCTCTCTCGACAACTTCTTTTCCTC
CTGCGTGCGGCTAGCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGT
CGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1A147TV C 1
AF RS1B930JQ U 120
AF RS1A147JQ U 135
AF RS1A147TR U 574
AF RS1B930TF C 120
AF RS1A147TF C 135
BS 1 132 RS1A147TV
BS 133 388 RS1B930JQ
BS 389 389 RS1A147JQ
BS 390 391 RS1B930JQ
BS 392 392 RS1A147JQ
BS 393 415 RS1B930JQ
BS 416 416 RS1A147JQ
BS 417 436 RS1B930JQ
BS 437 437 RS1A147JQ
BS 438 442 RS1B930JQ
BS 443 443 RS1A147JQ
BS 444 460 RS1B930JQ
BS 461 461 RS1A147JQ
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BS 467 467 RS1A147JQ
BS 468 493 RS1B930JQ
BS 494 494 RS1A147JQ
BS 495 523 RS1B930JQ
BS 524 524 RS1A147JQ
BS 525 535 RS1B930JQ
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BS 537 553 RS1B930JQ
BS 554 554 RS1A147TV
BS 555 580 RS1B930JQ
BS 581 581 RS1A147JQ
BS 582 589 RS1B930JQ
BS 590 590 RS1A147JQ
BS 591 736 RS1B930JQ
BS 737 785 RS1A147TF

RD RS1A147TV 731 0 0
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CTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTT
TTTTTTTTTTTTTTCCAGAACCTCAATGTGATAACAACCATGTTCCAAAATCCAAAACAG
GACAAGTCTTAGCAAAAAATTCAAAAACAAAAAGCAAAAATAAAAAGATAAATTCGCGAT
AAACCTAAGCAGTGAGCACAACAGCACCACCAGCTTCCTTGATCTTCTTCTCAGCAGTCT
TCGAGATCAACTTCGCCTTCACCACAAACGGCTTGCCCTCAGGCAAATGACCTTTCCCGA
GCACCTTAAAGAACCCATGCTGCGTCACGTCAATCATCGGCACCTTATCCTTGGTAGCCT
TGGCCTTCACATCCTCGGGAACAAGCGACCAGAGCCTGTCGAGGTTAACGATCGGGTTGT
AGAACTTGTTGCGAAGCTTGTGGAAGTACCTCATACCGACTTTACCGAAGTAACCAGGAT
GGTACTTGTCGAAGAGGATCCTGTGGTGGTGCATACCTCCGGCGTTACCTCGACCTCCGG
GATGCTTGCGGTGCTTCCCGATACGACCGTGTCCGGCGCTGACGTGACCGCGCTTCTTCC
TGTTCTTCCTGAGTCTGGTCGTCATTTCTCGGCGATCTCTCTCGACAACTTCTTTTCCTC
CTGCGTGCGGC

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DS 

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TTCCAGAACCTCAATGTGATAACAACCATGTTCCAAAATCCAAAACAGGACAAGTCTTAG
CAAAAAATTCAAAAACAAAAAGCAAAAATAAAAAGATAAATTCGCGATAAACCTAAGCAG
TGAGCACAACAGCACCACCAGCTTCCTTGATCTTCTTCTCAGCAGTCTTCGAGATCAACT
TCGCCTTCACCACAAACGGCTTGCCCTCAGGCAAATGACCTTTCCCGAGCACCTTAAAGA
ACCCATGCTGCGTCACATCGATCATCGGCACCTTATCCTTGGTGGCCTTGGCCTTCACAT
CCTCAGGAACCAGCGACCAGAGCCTGTCAAGGTTGACGATCGGGTTGTAGAACTTGTTGC
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AGCC
C

QA 14 617 14 617
DS 

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AAAAATTCAAAAACAAAAAGCAAAAATAAAAAGATAAATTCGCGATAAACCTAAGCAGTG
AGCACAACAGCACCACCAGCTTCCTTGATCTTCTTCTCAGCAGTCTTCGAGATCAACTTC
GCCTTCACCACAAACGGCTTGCCCTCAGGCAAATGACCTTTCCCGAGCACCTTAAAGAAC
CCATGCTGCGTCACGTCAATCATCGGCACCTTATCCTTGGTAGCCTTGGCCTTCACATCC
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AGCTTGTGGAAGTACCTCATACCGACTTTACCGAAGTAACCAGGATGGTACTTGTCGAAA
AGGATCCTGTGGTGGTGCATACCTCCGGCGTTACCTCGACCTCCGGGATGCTTGCGGTGC
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CTGGTCGTCATTTCTCGGCGATCTCTCTCGACAACTTCTTTTCCTCCTGCGTGCGGCTAG
CC

QA 1 602 1 602
DS 

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DS 

RD RS1B930TF 618 0 0
GGCAAGGCAAAAA
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CAAAAAATTCAAAAACAAAAAGCAAAAATAAAAAGATAAATTCGCGATAAACCTAAGCAG
TGAGCACAACAGCACCACCAGCTTCCTTGATCTTCTTCTCAGCAGTCTTCGAGATCAACT
TCGCCTTCACCACAAACGGCTTGCCCTCAGGCAAATGACCTTTCCCGAGCACCTTAAAGA
ACCCATGCTGCGTCACATCGATCATCGGCACCTTATCCTTGGTGGCCTTGGCCTTCACAT
CCTCAGGAACCAGCGACCAGAGCCTGTCAAGGTTGACGATCGGGTTGTAGAACTTGTTGC
GGAGCTTGTGGAAGTACCTCATACCGACTTTGCCGAAGTAACCGGGATGGTACTTGTCGA
AGAGGATCCTGTGGTGGTGCATACCTCCTGCGTTACCGCGACCTCCGGGATGCTTGCGGT
GCTTCCCGATACGACCGTGTCCGGCGCTGACGTGACCGCGCTTCTTCCTGTTCTTCCTGA
GTCTGGTCGTCATTTCTCGGCGATCTCTCTCGACAACTTCTTTTCCTCCTGCGTGCGGCT
AGCC
C

QA 14 617 14 617
DS 

RD RS1A147TF 651 0 0
CCAGAACCTCAATGTGATAACAACCATGTTCCAAAATCCAAAACAGGACAAGTCTTAGCA
AAAAATTCAAAAACAAAAAGCAAAAATAAAAAGATAAATTCGCGATAAACCTAAGCAGTG
AGCACAACAGCACCACCAGCTTCCTTGATCTTCTTCTCAGCAGTCTTCGAGATCAACTTC
GCCTTCACCACAAACGGCTTGCCCTCAGGCAAATGACCTTTCCCGAGCACCTTAAAGAAC
CCATGCTGCGTCACGTCAATCATCGGCACCTTATCCTTGGTAGCCTTGGCCTTCACATCC
TCGGGAACAAGCGACCAGAGCCTGTCGAGGTTAACGATCGGGTTGTAGAACTTGTTGCGA
AGCTTGTGGAAGTACCTCATACCGACTTTACCGAAGTAACCAGGATGGTACTTGTCGAAG
AGGATCCTGTGGTGGTGCATACCTCCGGCGTTACCTCGACCTCCGGGATGCTTGCGGTGC
TTCCCGATACGACCGTGTCCGGCGCTGACGTGACCGCGCTTCTTCCTGTTCTTCCTGAGT
CTGGTCGTCATTTCTCGGCGATCTCTCTCGACAACTTCTTTTCCTCCTGCGTGCGGCTAG
CCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 651 1 651
DS 



CO CL1Contig17 688 4 4 U
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CTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTT
TTTTTTTTTTTCAAACGCACAACGATTACGTGTCTCTACTCAGAAACAACCCGAAGTTTG
TTAAAAGAGAAGCAAAACGATCTGCTTTCACAAGTCACTTGCCTCTAAAGCCAATTAAAA
GACAGCTAAAAGAGCTATATCGTAGTGGCAACAGCTTCAGGTTGATGAGGAAGTATCTTA
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ACCGGTGTCACTTTCTTCCTCGAGGACTCCGGGAGAACTTTCCTCACCTCGTTCGCCAGC
TCTATAACATAATCCTCCTCATGCCCGATGTCGTGAATTGCCTTCTCTAGCAGGAAGAGA
TAATCTCTGTTGTTACCACATGGTCCATTGGCTGTCGCAATTTGTCTTGCCATGTCTTCT
AATGGCGCAGGTCCAAGGTAATACTTGTTGGAGACCTTGTCTGGAGTAGAAGTGAATACT
ATCACTCCAGTTACAGATGGCTTCAGGGGATCATCTTCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATT
CCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A159TR U 136
AF RS1A159JQ U 132
AF RS1A159TF C 1
AF RS1A159TV C 1
BS 1 131 RS1A159TF
BS 132 135 RS1A159JQ
BS 136 639 RS1A159TR
BS 640 688 RS1A159TF

RD RS1A159TR 504 0 0
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TTGTTCTTGGACTTGTTAGCTACACGGCTCGCTCTTGGTTCCTTCACCGGTGTCACTTTC
TTCCTCGAGGACTCCGGGAGAACTTTCCTCACCTCGTTCGCCAGCTCTATAACATAATCC
TCCTCATGCCCGATGTCGTGAATTGCCTTCTCTAGCAGGAAGAGATAATCTCTGTTGTTA
CCACATGGTCCATTGGCTGTCGCAATTTGTCTTGCCATGTCTTCTAATGGCGCAGGTCCA
AGGTAATACTTGTTGGAGACCTTGTCTGGAGTAGAAGTGAATACTATCACTCCAGTTACA
GATGGCTTCAGGGGATCATCTTCC

QA 1 504 1 504
DS 

RD RS1A159JQ 508 0 0
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GAGCTATATCGTAGTGGCAACAGCTTCAGGTTGATGAGGAAGTATCTTATGAGCCGTGGG
GACATTGTTCTTGGACTTGTTAGCTACACGGCTCGCTCTTGGTTCCTTCACCGGTGTCAC
TTTCTTCCTCGAGGACTCCGGGAGAACTTTCCTCACCTCGTTCGCCAGCTCTATAACATA
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TCCAAGGTAATACTTGTTGGAGACCTTGTCTGGAGTAGAAGTGAATACTATCACTCCAGT
TACAGATGGCTTCAGGGGATCATCTTCC

QA 1 508 1 508
DS 

RD RS1A159TF 688 0 0
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CTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTT
TTTTTTTTTTTCAAACGCACAACGATTACGTGTCTCTACTCAGAAACAACCCGAAGTTTG
TTAAAAGAGAAGCAAAACGATCTGCTTTCACAAGTCACTTGCCTCTAAAGCCAATTAAAA
GACAGCTAAAAGAGCTATATCGTAGTGGCAACAGCTTCAGGTTGATGAGGAAGTATCTTA
TGAGCCGTGGGGACATTGTTCTTGGACTTGTTAGCTACACGGCTCGCTCTTGGTTCCTTC
ACCGGTGTCACTTTCTTCCTCGAGGACTCCGGGAGAACTTTCCTCACCTCGTTCGCCAGC
TCTATAACATAATCCTCCTCATGCCCGATGTCGTGAATTGCCTTCTCTAGCAGGAAGAGA
TAATCTCTGTTGTTACCACATGGTCCATTGGCTGTCGCAATTTGTCTTGCCATGTCTTCT
AATGGCGCAGGTCCAAGGTAATACTTGTTGGAGACCTTGTCTGGAGTAGAAGTGAATACT
ATCACTCCAGTTACAGATGGCTTCAGGGGATCATCTTCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATT
CCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RS1A159TV 688 0 0
CAAGCACTAGTCATGACCAGGATCTCCTAGGAAACAGCTATGACCATGTTCACTTACCTA
CTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTT
TTTTTTTTTTTCAAACGCACAACGATTACGTGTCTCTACTCAGAAACAACCCGAAGTTTG
TTAAAAGAGAAGCAAAACGATCTGCTTTCACAAGTCACTTGCCTCTAAAGCCAATTAAAA
GACAGCTAAAAGAGCTATATCGTAGTGGCAACAGCTTCAGGTTGATGAGGAAGTATCTTA
TGAGCCGTGGGGACATTGTTCTTGGACTTGTTAGCTACACGGCTCGCTCTTGGTTCCTTC
ACCGGTGTCACTTTCTTCCTCGAGGACTCCGGGAGAACTTTCCTCACCTCGTTCGCCAGC
TCTATAACATAATCCTCCTCATGCCCGATGTCGTGAATTGCCTTCTCTAGCAGGAAGAGA
TAATCTCTGTTGTTACCACATGGTCCATTGGCTGTCGCAATTTGTCTTGCCATGTCTTCT
AATGGCGCAGGTCCAAGGTAATACTTGTTGGAGACCTTGTCTGGAGTAGAAGTGAATACT
ATCACTCCAGTTACAGATGGCTTCAGGGGATCATCTTCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATT
CCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 688 1 688
DS 



CO CL1Contig18 892 6 5 U
CAAGCACTAGTCATGACCAGGATCTCCTAGGAAACAGCTATGACCATGTTCACTTACCTA
CTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTT
TTTTTTTTTTTTTTTCTGACAGACACAGACGTAACAATCAAATTTTGATTCTTGATTGGA
TTTGTCGAACAAAATATTAACCTCTTTTTTAATTCCTTCAGATTAGTTATTCAATTGAAG
AATAAGTCTATTTTTTTCTGGTTCTAAGGCTAGTAGTTCTAGGGGTCGACTCACTTCTCT
CAAATTGTTTCTGATTATTAAGAAAAGGTAACAAAGATAAAATACGAGCTTGTTTTATAG
CAATAGTAATTAATCGTTGTTGTTTTAAAGTTACTCTATTCACCCGTCTAGATAATATTT
TTCCTTGTTCACTAATAAATCGACTAATTAAACTCATGTTTCTATAATCAATTCGATCCC
CCGATTGGATCGGGGGCAAACGCCGACGAAAAGATCGCTTGGATTTAGTAAAAGGTCGCT
TAGATTTATTCATAATTTTTTTATTCCTTACCTCTAAAATCCTATTTTGATCGGATCAAA
ATAAAAACGATTTCTATTTCTATATAGGATAGAGTTTCTATATAGAATTAAGAATATAGG
ATTTTATTTCTTTCTATTATTTTATTTGTTTATATTTATATATATGTAATAATACGTAGA
TACTCTCATTATTCCTGTTCTTAAAATAAAATTTGACATACAAGGACTCAATTTTATCTA
TTTCTTGATTTCCCCATGAATTGTATGTTTATAACTAGAATTAAAAAAAGGGAAATGTTA
ATGCATCTGGAAATAAACGATTAATCTCTATTAATAAACCTGCTAACGAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A173TF C 1
AF RS1A173JQ U 136
AF RS1A173TR U 136
AF RS1CF90JQ U 258
AF RS1CF90TF C 258
AF RS1EO33JQ U 138
BS 1 135 RS1A173TF
BS 136 292 RS1A173JQ
BS 293 293 RS1EO33JQ
BS 294 639 RS1A173JQ
BS 640 892 RS1EO33JQ

RD RS1A173TF 588 0 0
CAAGCACTAGTCATGACCAGGATCTCCTAGGAAACAGCTATGACCATGTTCACTTACCTA
CTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTT
TTTTTTTTTTTTTTTCTGACAGACACAGACGTAACAATCAAATTTTGATTCTTGATTGGA
TTTGTCGAACAAAATATTAACCTCTTTTTTAATTCCTTCAGATTAGTTATTCAATTGAAG
AATAAGTCTATTTTTTTCTGGTTCTAAGGCTAGTAGTTCTAGGGGTCGACTCGCTTCTCT
CAAATTGTTTCTGATTATTAAGAAAAGGTAACAAAGATAAAATACGAGCTTGTTTTATAG
CAATAGTAATTAATCGTTGTTGTTTTAAAGTTACTCTATTCACCCGTCTAGATAATATTT
TTCCTTGTTCACTAATAAATCGACTAATTAAACTCATGTTTCTATAATCAATTCGATCCC
CCGATTGGATCGGGGGCAAACGCCGACGAAAAGATCGCTTGGATTTAGTAAAAGGTCGCT
TAGATTTATTCATAATTTTTTTATTCCTTACCTCTAAAATCCTATTTT

QA 1 588 1 588
DS 

RD RS1A173JQ 504 0 0
CTGACAGACACAGACGTAACAATCAAATTTTGATTCTTGATTGGATTTGTCGAACAAAAT
ATTAACCTCTTTTTTAATTCCTTCAGATTAGTTATTCAATTGAAGAATAAGTCTATTTTT
TTCTGGTTCTAAGGCTAGTAGTTCTAGGGGTCGACTCGCTTCTCTCAAATTGTTTCTGAT
TATTAAGAAAAGGTAACAAAGATAAAATACGAGCTTGTTTTATAGCAATAGTAATTAATC
GTTGTTGTTTTAAAGTTACTCTATTCACCCGTCTAGATAATATTTTTCCTTGTTCACTAA
TAAATCGACTAATTAAACTCATGTTTCTATAATCAATTCGATCCCCCGATTGGATCGGGG
GCAAACGCCGACGAAAAGATCGCTTGGATTTAGTAAAAGGTCGCTTAGATTTATTCATAA
TTTTTTTATTCCTTACCTCTAAAATCCTATTTTGATCGGATCAAAATAAAAACGATTTCT
ATTTCTATATAGGATAGAGTTTCT

QA 1 504 1 504
DS 

RD RS1A173TR 504 0 0
CTGACAGACACAGACGTAACAATCAAATTTTGATTCTTGATTGGATTTGTCGAACAAAAT
ATTAACCTCTTTTTTAATTCCTTCAGATTAGTTATTCAATTGAAGAATAAGTCTATTTTT
TTCTGGTTCTAAGGCTAGTAGTTCTAGGGGTCGACTCGCTTCTCTCAAATTGTTTCTGAT
TATTAAGAAAAGGTAACAAAGATAAAATACGAGCTTGTTTTATAGCAATAGTAATTAATC
GTTGTTGTTTTAAAGTTACTCTATTCACCCGTCTAGATAATATTTTTCCTTGTTCACTAA
TAAATCGACTAATTAAACTCATGTTTCTATAATCAATTCGATCCCCCGATTGGATCGGGG
GCAAACGCCGACGAAAAGATCGCTTGGATTTAGTAAAAGGTCGCTTAAATTTATTCATAA
TTTTTTTATTCCTTACCTCTAAAATCCTATTTTGATCGGATCAAAATAAAAACGATTTCT
ATTTCTATATAGGATAGAGTTTCT

QA 1 504 1 504
DS 

RD RS1CF90JQ 436 0 0
CTGGTTCTAAGGCTAGTAGTTCTAGGGGTCGACTCACTTCTCTCAAATTGTTTCTGATTA
TTAAGAAAAGGTAACAAAGATAAAATACGAGCTTGTTTTATAGCAATAGTAATTAATCGT
TGTTGTTTTAAAGTTACTCTATTCACCCGTCTAGATAATATTTTTCCTTGTTCACTAATA
AATCGACTAATTAAACTCATGTTTCTATAATCAATTCGATCCCCCGATTGGATCGGGGGC
AAACGCCGACGAAAAGATCGCTTGGATTTAGTAAAAGGTCGCTTAGATTTATTCATAATT
TTTT*ATTCCTTACCTCTAAAATCCTATTTTGATCGGATCAAAATAAAAACGATTTCTAT
TTCTATATAGGATAGAGTTTCTATATAGAATTAAGAATATAGGATTTTATTTCTTTCTAT
TATTTTATTTGTTTA
C

QA 1 435 1 435
DS 

RD RS1CF90TF 436 0 0
CTGGTTCTAAGGCTAGTAGTTCTAGGGGTCGACTCACTTCTCTCAAATTGTTTCTGATTA
TTAAGAAAAGGTAACAAAGATAAAATACGAGCTTGTTTTATAGCAATAGTAATTAATCGT
TGTTGTTTTAAAGTTACTCTATTCACCCGTCTAGATAATATTTTTCCTTGTTCACTAATA
AATCGACTAATTAAACTCATGTTTCTATAATCAATTCGATCCCCCGATTGGATCGGGGGC
AAACGCCGACGAAAAGATCGCTTGGATTTAGTAAAAGGTCGCTTAGATTTATTCATAATT
TTTT*ATTCCTTACCTCTAAAATCCTATTTTGATCGGATCAAAATAAAAACGATTTCTAT
TTCTATATAGGATAGAGTTTCTATATAGAATTAAGAATATAGGATTTTATTTCTTTCTAT
TATTTTATTTGTTTA
C

QA 1 435 1 435
DS 

RD RS1EO33JQ 755 0 0
GACAGACACAGACGTAACAATCAAATTTTGATTCTTGATTGGATTTGTCGAACAAAATAT
TAACCTCTTTTTTAATTCCTTCAGATTAGTTATTCAATTGAAGAATAAGTCTATTTTTTT
CTGGTTCTAAGGCTAGTAGTTCTAGGGGTCGACTCACTTCTCTCAAATTGTTTCTGATTA
TTAAGAAAAGGTAACAAAGATAAAATACGAGCTTGTTTTATAGCAATAGTAATTAATCGT
TGTTGTTTTAAAGTTACTCTATTCACCCGTCTAGATAATATTTTTCCTTGTTCACTAATA
AATCGACTAATTAAACCCATGTTTCTATAATCAATTCGATCCCCCGATTGGATCGGGGGC
AAACGCCGACGAAAAGATCGCTTGGATTTAGTAAAAGGTCGCTTAGATTTATTCATAATT
TTTT*ATTCCTTACCTCTAAAATCCTATTTTGATCGGATCAAAATAAAAACGATTTCTAT
TTCTATATAGGATAGAGTTTCTATATAGAATTAAGAATATAGGATTTTATTTCTTTCTAT
TATTTTATTTGTTTATATTTATATATATGTAATAATACGTAGATACTCTCATTATTCCTG
TTCTTAAAATAAAATTTGACATACAAGGACTCAATTTTATCTATTTCTTGATTTCCCCAT
GAATTGTATGTTTATAACTAGAATTAAAAAAAGGGAAATGTTAATGCATCTGGAAATAAA
CGATTAATCTCTATTAATAAACCTGCTAACGAAAC

QA 1 755 1 755
DS 



CO CL1Contig19 640 4 1 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAAGAGCATC
GAGACTTACAAGATCTACATCTTCAAGGTGCTGAAACAGGTCCACCCGGTCATCGGGATC
TCGAGCAAGGCCATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACATCTTCGAGAAGCTCGCC
CAGGAGGCCTCCAAGCTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCGACCATCACCTCGAGGGAGATC
CAGACCGCTGTCAGGCTTGTTCTGCCCGGGGAGCTCGCTAAGCACGCCGTCTCTGAGGGC
ACTAAGGCTGTTACTAAGTTTACTAGCTCTTGAATCGTGTCGTGTTGGGTTTGGCTTAGG
GATCTAGATCTGGTCGCTTTTGGTTTTTATCTACTAAGAAAAAGTCGTATTGGTTATGCT
TTATCTAGTTTTTTTTAATGATTTGGTTTGTAATTGTCGGAAGAACATATGTTATGGTTT
TAATGAATCTCAATCCCTCTTGTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCGCCTCGGCCCTC
GAGAAGCTTTCTAGACCATTCGTTTGGCGCGCGGGCCCAGTAGGTAAGTGAACATGGTCA
TAGCTGTTTCCTAGGAGATCCTGGTCATGACTAGTGCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A177JQ C 50
AF RS1A177TR C 50
AF RS1A177TV U 1
AF RS1A177TF U 92
BS 1 640 RS1A177TV

RD RS1A177JQ 456 0 0
G
GAAGAGCATCGAGACTTACAAGATCTACATCTTCAAGGTGCTGAAACAGGTCCACCCGGT
CATCGGGATCTCGAGCAAGGCCATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACATCTTCGA
GAAGCTCGCCCAGGAGGCCTCCAAGCTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCGACCATCACCTC
GAGGGAGATCCAGACCGCTGTCAGGCTTGTTCTGCCCGGGGAGCTCGCTAAGCACGCCGT
CTCTGAGGGCACTAAGGCTGTTACTAAGTTTACTAGCTCTTGAATCGTGTCGTGTTGGGT
TTGGCTTAGGGATCTAGATCTGGTCGCTTTTGGTTTTTATCTACTAAGAAAAAGTCGTAT
TGGTTATGCTTTATCTAGTTTTTTTTAATGATTTGGTTTGTAATTGTCGGAAGAACATAT
GTTATGGTTTTAATGAATCTCAATCCCTCTTGTTC

QA 2 456 2 456
DS 

RD RS1A177TR 456 0 0
G
GAAGAGCATCGAGACTTACAAGATCTACATCTTCAAGGTGCTGAAACAGGTCCACCCGGT
CATCGGGATCTCGAGCAAGGCCATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACATCTTCGA
GAAGCTCGCCCAGGAGGCCTCCAAGCTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCGACCATCACCTC
GAGGGAGATCCAGACCGCTGTCAGGCTTGTTCTGCCCGGGGAGCTCGCTAAGCACGCCGT
CTCTGAGGGCACTAAGGCTGTTACTAAGTTTACTAGCTCTTGAATCGTGTCGTGTTGGGT
TTGGCTTAGGGATCTAGATCTGGTCGCTTTTGGTTTTTATCTACTAAGAAAAAGTCGTAT
TGGTTATGCTTTATCTAGTTTTTTTTAATGATTTGGTTTGTAATTGTCGGAAGAACATAT
GTTATGGTTTTAATGAATCTCAATCCCTCTTGTTC

QA 2 456 2 456
DS 

RD RS1A177TV 640 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAAGAGCATC
GAGACTTACAAGATCTACATCTTCAAGGTGCTGAAACAGGTCCACCCGGTCATCGGGATC
TCGAGCAAGGCCATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACATCTTCGAGAAGCTCGCC
CAGGAGGCCTCCAAGCTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCGACCATCACCTCGAGGGAGATC
CAGACCGCTGTCAGGCTTGTTCTGCCCGGGGAGCTCGCTAAGCACGCCGTCTCTGAGGGC
ACTAAGGCTGTTACTAAGTTTACTAGCTCTTGAATCGTGTCGTGTTGGGTTTGGCTTAGG
GATCTAGATCTGGTCGCTTTTGGTTTTTATCTACTAAGAAAAAGTCGTATTGGTTATGCT
TTATCTAGTTTTTTTTAATGATTTGGTTTGTAATTGTCGGAAGAACATATGTTATGGTTT
TAATGAATCTCAATCCCTCTTGTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCGCCTCGGCCCTC
GAGAAGCTTTCTAGACCATTCGTTTGGCGCGCGGGCCCAGTAGGTAAGTGAACATGGTCA
TAGCTGTTTCCTAGGAGATCCTGGTCATGACTAGTGCTTG

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1A177TF 549 0 0
TGAAACAGGTCCACCCGGTCATCGGGATCTCGAGCAAGGCCATGGGGATCATGAACAGCT
TCATCAACGACATCTTCGAGAAGCTCGCCCAGGAGGCCTCCAAGCTCGCTAGGTACAACA
AGAAGCCGACCATCACCTCGAGGGAGATCCAGACCGCTGTCAGGCTTGTTCTGCCCGGGG
AGCTCGCTAAGCACGCCGTCTCTGAGGGCACTAAGGCTGTTACTAAGTTTACTAGCTCTT
GAATCGTGTCGTGTTGGGTTTGGCTTAGGGATCTAGATCTGGTCGCTTTTGGTTTTTATC
TACTAAGAAAAAGTCGTATTGGTTATGCTTTATCTAGTTTTTTTTAATGATTTGGTTTGT
AATTGTCGGAAGAACATATGTTATGGTTTTAATGAATCTCAATCCCTCTTGTTCAAAAAA
AAAAAAAAAAAAAGGCCGCCTCGGCCCTCGAGAAGCTTTCTAGACCATTCGTTTGGCGCG
CGGGCCCAGTAGGTAAGTGAACATGGTCATAGCTGTTTCCTAGGAGATCCTGGTCATGAC
TAGTGCTTG

QA 1 549 1 549
DS 



CO CL1Contig20 801 5 2 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGCTTCAGTT
TGCTTCAGTTCCTACACCCTAACATCGTCGGTGATTTAGAGCTGAGCTAAGGTTTGCAAA
ACAATGGAACCCGTGCGACGTATTGAGGATGAGACAGAGCGGAGAAGAGCGTGTGGCATG
ATGTCGTATGACCTGACTCGTGATGTGGCACCTAAACTGGAACAAACTGGTGCGAAAGTA
GGGGCCGTTGTTGTCTCTGATACTGGAAGAGAATATAATTCTTTTAGAGCATTTAGGACG
TTTGGACAGCATGGTTATGAGCATAGGAATGCCTTGATCAATTTCCGAGTAACACCAGAT
CCAAATGTTAGGGAGCTTGATGATGCGCAACTGGCTCTGTTGGTGCAGCAGACCGATTCT
GCCCGAGCAGCCATCGAGGCAGAGCAGAACCGCCGCGGCAACAACTGAGCAGGATTGGTT
GTTGTATGTGTGCAAGCGTAAGAACTTGTGTGGTTCTATTGCTTTATCGTAGTTTATTGT
CCTAGTGTTTTATTCGAGTGTGTAAGCTACCTGTTTAATTCGAAGTCTGATTAAACTTCT
TGTTGTTCTATCACTTCTTTTATTTCCTTGTAGAATGAGTATCCCGTAAAACGTTTTAAG
ACTAATACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCCGCCTCGGCCCTCGAGAAGCTTTCTAGACC
ATTCGTTTGGCGCGCGGGCCCAGTAGTAAGTGAACATGGTCATAGCTGTTTCCTAGAGAT
CCTGGTCATGACTAGTGCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CE46TF U 94
AF RS1A185TV U 1
AF RS1A185TR C 50
AF RS1A185JQ C 50
AF RS1A185TF U 28
BS 1 669 RS1A185TV
BS 670 801 RS1A185TF

RD RS1CE46TF 264 0 0
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ACAGAGCGGAGAAGAGCGTGTGGCATGATGTCGTATGACCTGACTCGTGATGTGGCACCT
AAACTGGAACAAACTGGTGCGAAAGTAGGGGCCGTTGTTGTCTCTGATACTGGAAGAGAA
TATAATTCTTTTAGAGCATTTAGGACGTTTGGACAGCATGGTTATGAGCATAGGAATGCC
TTGATCAATTTCCGAGTAACACCA

QA 1 264 1 264
DS 

RD RS1A185TV 669 0 0
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TGCTTCAGTTCCTACACCCTAACATCGTCGGTGATTTAGAGCTGAGCTAAGGTTTGCAAA
ACAATGGAACCCGTGCGACGTATTGAGGATGAGACAGAGCGGAGAAGAGCGTGTGGCATG
ATGTCGTATGACCTGACTCGTGATGTGGCACCTAAACTGGAACAAACTGGTGCGAAAGTA
GGGGCCGTTGTTGTCTCTGATACTGGAAGAGAATATAATTCTTTTAGAGCATTTAGGACG
TTTGGACAGCATGGTTATGAGCATAGGAATGCCTTGATCAATTTCCGAGTAACACCAGAT
CCAAATGTTAGGGAGCTTGATGATGCGCAACTGGCTCTGTTGGTGCAGCAGACCGATTCT
GCCCGAGCAGCCATCGAGGCAGAGCAGAACCGCCGCGGCAACAACTGAGCAGGATTGGTT
GTTGTATGTGTGCAAGCGTAAGAACTTGTGTGGTTCTATTGCTTTATCGTAGTTTATTGT
CCTAGTGTTTTATTCGAGTGTGTAAGCTACCTGTTTAATTCGAAGTCTGATTAAACTTCT
TGTTGTTCTATCACTTCTTTTATTTCCTTGTAGAATGAGTATCCCGTAAAACGTTTTAAG
ACTAATACC

QA 1 669 1 669
DS 

RD RS1A185TR 620 0 0
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AGGTTTGCAAAACAATGGAACCCGTGCGACGTATTGAGGATGAGACAGAGCGGAGAAGAG
CGTGTGGCATGATGTCGTATGACCTGACTCGTGATGTGGCACCTAAACTGGAACAAACTG
GTGCGAAAGTAGGGGCCGTTGTTGTTTCTGATACTGGAAGAGAATATAATTCTTTTAGAG
CATTTAGGACGTTTGGACAGCATGGTTATGAGCATAGGAATGCCTTGATCAATTTCCGAG
TAACACCAGATCCAAATGTTAGGGAGCTTGATGATGCGCAACTGGCTCTGTTGGTGCAGC
AGACCGATTCTGCCCGAGCAGCCATCGAGGCAGAGCAGAACCGCCGCGGCAACAACTGAG
CAGGATTGGTTGTTGTATGTGTGCAAGCGTAAGAACTTGTGTGGTTCTATTGCTTTATCG
TAGTTTATTGTCCTAGTGTTTTATTCGAGTGTGTAAGCTACCTGTTTAATTCGAAGTCTG
ATTAAACTTCTTGTTGTTCTATCACTTCTTTTATTTCCTTGTAGAATGAGTATCCCGTAA
AACGTTTTAAGACTAATACC

QA 1 620 1 620
DS 

RD RS1A185JQ 620 0 0
GGGCTTCAGTTTGCTTCAGTTCCTACACCCTAACATCGTCGGTGATTTAGAGCTGAGCTA
AGGTTTGCAAAACAATGGAACCCGTGCGACGTATTGAGGATGAGACAGAGCGGAGAAGAG
CGTGTGGCATGATGTCGTATGACCTGACTCGTGATGTGGCACCTAAACTGGAACAAACTG
GTGCGAAAGTAGGGGCCGTTGTTGTCTCTGATACTGGAAGAGAATATAATTCTTTTAGAG
CATTTAGGACGTTTGGACAGCATGGTTATGAGCATAGGAATGCCTTGATCAATTTCCGAG
TAACACCAGATCCAAATGTTAGGGAGCTTGATGATGCGCAACTGGCTCTGTTGGTGCAGC
AGACCGATTCTGCCCGAGCAGCCATCGAGGCAGAGCAGAACCGCCGCGGCAACAACTGAG
CAGGATTGGTTGTTGTATGTGTGCAAGCGTAAGAACTTGTGTGGTTCTATTGCTTTATCG
TAGTTTATTGTCCTAGTGTTTTATTCGAGTGTGTAAGCTACCTGTTTAATTCGAAGTCTG
ATTAAACTTCTTGTTGTTCTATCACTTCTTTTATTTCCTTGTAGAATGAGTATCCCGTAA
AACGTTTTAAGACTAATACC

QA 1 620 1 620
DS 

RD RS1A185TF 774 0 0
GAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGCTTCAGTTTGCTTCAGTTCCTACACCCTAACATCG
TCGGTGATTTAGAGCTGAGCTAAGGTTTGCAAAACAATGGAACCCGTGCGACGTATTGAG
GATGAGACAGAGCGGAGAAGAGCGTGTGGCATGATGTCGTATGACCTGACTCGTGATGTG
GCACCTAAACTGGAACAAACTGGTGCGAAAGTAGGGGCCGTTGTTGTCTCTGATACTGGA
AGAGAATATAATTCTTTTAGAGCATTTAGGACGTTTGGACAGCATGGTTATGAGCATAGG
AATGCCTTGATCAATTTCCGAGTAACACCAGATCCAAATGTTAGGGAGCTTGATGATGCG
CAACTGGCTCTGTTGGTGCAGCAGACCGATTCTGCCCGAGCAGCCATCGAGGCAGAGCAG
AACCGCCGCGGCAACAACTGAGCAGGATTGGTTGTTGTATGTGTGCAAGCGTAAGAACTT
GTGTGGTTCTATTGCTTTATCGTAGTTTATTGTCCTAGTGTTTTATTCGAGTGTGTAAGC
TACCTGTTTAATTCGAAGTCTGATTAAACTTCTTGTTGTTCTATCACTTCTTTTATTTCC
TTGTAGAATGAGTATCCCGTAAAACGTTTTAAGACTAATACCAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AGCCGCCTCGGCCCTCGAGAAGCTTTCTAGACCATTCGTTTGGCGCGCGGGCCCAGTAGT
AAGTGAACATGGTCATAGCTGTTTCCTAGAGATCCTGGTCATGACTAGTGCTTG

QA 1 774 1 774
DS 



CO CL1Contig21 800 19 19 U
AGTCGACGGTACCGGACATAAGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGACAACAAAACT
CAAAACACACATTATCTTCATTATCTTCATTGAGTTCTCTCATATTATAATCATCTCGAG
AAATATGGCGATTTCAAAAGCCCTTATTGCTTCTCTTCTCATATCACTTATTGTTCTCCA
ACTCGTCCAGGCCGATGTGGAAAACTCAAACAAAAAGAAGGGTTACGGCAGTAAAATTGA
TTGTGGAAGTGCTTGTGTAGCAAGGTGCAGGCTCTCAAGTAGACCTAACCTTTGCCACAG
AGCCTGCGGGACTTGTTGCGCAAGATGCAACTGTGTGCCACCTGGTACGTATGGAAACTA
CGACAAGTGTGAGTGCTACGCTACCCTCACCACCCACGGTGGTCGCCGCAAGTGCCCTTA
AGTAAATTTAACACTCTCAAATTGCTGCGGATGTTGAATTTCGATACTATGTCGTTTTAC
TTGTTAGTACTTGTTTGCATATATTTGTATGTGGATCAAATAAGTCATGAGAACCGTACG
GCGTCTTTGTGTGTGGTGCTGTTTTATTAATTGGTCTATTTGTTGCAAGTTTTTTTATTT
TTCATTTGTTGCGTGAAATAATCCCCTTGTATTATTTCGTTTTCTAAATAAAGTTATGAT
GCTTTTATAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCGCCTCGGCCCTCGAGAAGCTTTCTAGACCA
TTCGTTTGGCGCGCGGGCCCAGTAGTAAGTGAACATGGTCATAGCTGTTTCCTAGAGATC
CTGGTCATGACTAGTGCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 55 55 35 35 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 30 30 30 30 30 30 30 30 30 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 30 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 30 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 75 97 97 97 25 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 0 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 15 95 
95 95 95 95 45 45 65 0 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CG12JQ C 48
AF RS1CG12TF U 48
AF RS1DB63JQ C 48
AF RS1DG76JQ C 48
AF RS1DG76TF U 48
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AF RS1E210TF U 48
AF RS1DB63TF U 48
AF RS1DA72JQ C 46
AF RS1DA72TF U 46
AF RS1EK06JQ C 50
AF RS1EK06TF U 50
AF RS1B673JQ C 34
AF RS1H176TF U 419
AF RS1B673TF U 34
AF RS1A189JQ C 50
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QA 5 623 5 623
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AAATC

QA 3 619 3 619
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GT

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GT

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QA 1 800 1 800
DS 



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AA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 45 45 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 30 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1A207JQ C 50
AF RS1D934JQ C 114
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AF RS1A207TF U 196
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CTCAAGACGGGAGCTTTGTCGTTTCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAAGGGGGTATCA
GATTCAT

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DS 

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GG
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CTGACTCTCAGGTGTTCCTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCATTACTTTCATAACAAAC
TGAAGCCTTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCACAAGAAGGATGCAG
CTCAAGAAGCTGTCAAGAAGAGGAGACGTGCTACCAAGAAGCCTTACTCAAGGTCGATTG
TTGGTGCTACCTTGGAAGTGATCCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCTGAAGTTCGTGATG
CCGCAAGAGAAGCTGCTCTCCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGACCAAGGATGAGA
AGAAGGCAAAGAAGGCTGAATTTGCCTCTAAGCAACAGAAGATTCAGGCTAAGGTCCCCA
AGGCTGCTGCAAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGG*TGG*TGGTGGCAAACGCTGAAGAGC
CCAAACCCATTTTATCTTT*ACTC*TTTTGTTAGTTATATGTTGAACTCGGAATATTCTG
CCGAACG

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DS 

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TGAGAAAAGGAGGAAGAAGAG*GAGCAGCAGAAACACGCCACCATGGTTCTCAAGACGG*
AGCTTTGTCGTTTCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAAGGGG*TATCAGATTCATCCGA
TCTGACTCTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCATTACTTTCATAACAAA
CTGAAGCCTTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCGCAAGAAGGATGCA
GCTCAAGAAGCTGTCAAGAAGAGGAGACGTGCTACCAAGAAGCCTTACTCAAGGTCTATT
GTTGGTGCTACCTTGGAAGTGATCCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCTGAAGTTCGTGAT
GCCGCAAGAGAAGCTGCTCTCCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGACCAAGGATGAG
AAGAAGGCAAAGAAAGCTGAATTTGCCTCTAAGCAACAGAAGATTCAGGCTAAGGTCCCC
AAGGCTGCTGCAAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGG*TGG*TGGTGGCAAACGCTGAAGAG
CCCAAACCCATTTTATCTTT*ACTC*ATTTGTTAGTTATATGTTGAACTCGGGATATTCT
GCCGAACGTAAACCTTTTGTTGTTGCCGTTTGTCTTTTTCCTTTTGCAACTC**GTAATC
TCAGACTTGAGAATTTTGGTGCTTATCAACTTCATTTCACT

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DS 

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GG
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CTCAAGACGG*AGCTTTGTCGTTTCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAAGGGG*AATCA
GATTCATCCGATCTGACTCTCAGGTGTTCTTGTTTATCAACTCAAAGTGTAAGCATTACT
TTCATAACAAACTGAAGCCTTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCACA
AGAAGGATGCAGCTCAAGAAGCTGTCAAGAAGAGGAGACGTGCTACCAAGAAGCCTTACT
CAAGGTCGATTGTTGGTGCTACCTTGGAAGTGATCCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCTG
AAGTTCGTGATGCCGCAAGAGAAGCTGCTCTCCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGA
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CTAAGGTCCCAAAGGCTGCTGCAAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGG*TGG*TGGTGGCAA
ACGCTGAAGAGCCCAAAGCCATTTTATCTTT*ACTC*TTTTGTTAGTTATATGCTGAACT
CGGAATATTCTGCCGAACGTAAACCTTTTGTTGTTGCCGTTTGTCTTTTTCCTTTTGCAA
CTC**GTAATCTCAGACTTGAG

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DS 

RD RS1DY08TF 684 0 0
GG
GGGCAGCAGCTTGAGAAAAGGAGGTAGAAGAG*GAGCAGCAGAAACACGCCACCATGGTT
CTCAAGACGG*AGCTTTGTCGTTTCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAAGGGG*AATCA
GATTCATCCGATCTGACTCTCAGGTGTTCTTGTTTATCAACTCAAAGTGTAAGCATTACT
TTCATAACAAACTGAAGCCTTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCACA
AGAAGGATGCAGCTCAAGAAGCTGTCAAGAAGAGGAGACGTGCTACCAAGAAGCCTTACT
CAAGGTCGATTGTTGGTGCTACCTTGGAAGTGATCCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCTG
AAGTTCGTGATGCCGCAAGAGAAGCTGCTCTCCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGA
CCAAGGATGAGAAGAAGGCAAAGAAAGCCGAATTTGCCTCAAAGCAACAGAAGATTCAGG
CTAAGGTCCCAAAGGCTGCTGCAAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGG*TGG*TGGTGGCAA
ACGCTGAAGAGCCCAAAGCCATTTTATCTTT*ACTC*TTTTGTTAGTTATATGCTGAACT
CGGAATATTCTGCCGAACGTAAACCTTTTGTTGTTGCCGTTTGTCTTTTTCCTTTTGCAA
CTC**GTAATCTCAGACTTGAG

QA 3 684 3 684
DS 

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GGGCAGCAGCTTGAGAAAAGGAGGAAGAAGAG*GAGCAGCAGAAACACGCCACCATGGTT
CTCAAGACGG*AGCTTTGTCGTTTCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAAGGGG*TATCA
GATTCATCCGATCTGACTCTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCATTACT
TTCATAACAAACTGAAGCCTTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCGCA
AGAAGGATGCAGCTCAAGAAGCTGTCAAGAAGAGGAGACGTGCTACCAAGAAGCCTTACT
CAAGGTCTATTGTTGGTGCTACCTTGGAAGTGATCCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCTG
AAGTTCGTGATGCCGCAAGAGAAGCTGCTCTCCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGA
CCAAGGATGAGAAGAAGGCAAAGAAAGCTGAATTTGCCTCTAAGCAACAGAAGATTCAGG
CTAAGGTCCCCAAGGCTGCTGCAAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGG*TGG*TGGTGGCAA
ACGCTGAAGAGCCCAAACCCATTTTATCTTT*ACTC*ATTTGTTAGTTATATGTTGAACT
CGGGATATTCTGCCGAACGTAAACCTTTTGTTGTTGCCGTTTGTCTTTTTCCTTTTGCAA
CTC**GTAATCTCAGACTTGAGAATTTTGGTGCTTATCAACTTCATTTCACT

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DS 

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CATCCGATCTGACTCTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCATTACTTTCA
CAACAAACTGAAGCCTTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCACAAGAA
GGATGCAGCGCAAGAAGCTGTCAAGAAGAGGAGACGTGCCACCAAGAAGCCTTACTCAAG
GTCTATTGTTGGTGCTACCTTGGAAGTGATCCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCTGAAGT
TCGTGATGCCGCAAGAGAAGCTGCTCTCCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGACCAA
GGATGAGAAGAAGGCAAAGAAAGCTGAATTTGCCTTTAAGCAACAGAAGATTCAGGCTAA
GGTCCCAAAGGCTGCTGCAAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGG*TGG*TGGTGGCAAACGC
TGAAGAGCCCAAAGCCATTTTATCTTTTACTC*TTTTGTTAGTTAAATGTTGAACTCGGA
ATATTCTGCCGAACGTAAACCTTTTGTTGTTGCCGTTTGTCTTTTTCCTTTTGCAACTCT
CGTAATTTCAGACTTGAGAATTTTGGTGCTTATCAACTTCATTTCAC
C

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DS 

RD RS1C720TF 694 0 0
GG
AAGGAGGTAGAAGAG*GAGCAGCAGAAACACGCCACCATGGTTCTCAAGACGG*AGCTTT
GTCGGTTCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAAGGGG*TATCAGATTCATCCGATCTGAC
TCTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCATTACTTTCACAACAAACTGAAG
CCTTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCACAAGAAGGATGCAGCGCAA
GAAGCTGTCAAGAAGAGGAGACGTGCCACCAAGAAGCCTTACTCAAGGTCTATTGTTGGT
GCTACCTTGGAAGTGATCCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCTGAAGTTCGTGATGCCGCA
AGAGAAGCTGCTCTCCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGACCAAGGATGAGAAGAAG
GCAAAGAAAGCTGAATTTGCCTCTAAGCAACAGAAGATTCAGGCTAAGGTCCCAAAGGCT
GCTGCAAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGGGTGG*TGGTGGCAAACGCTGAAGAGCCCAAA
GCCATTTTATCTTTTACTC*TTTTGTTAGTTAAATGTTGAACTCGGAATATTCTGCCGAA
CGTAAACCTTTTGTTGTTGCCGTTTGTCTTTTTCCTTTTGCAACTCTCGTAATCTCAGAC
TTGAGAATTTTGGTGCTTATCAACTTCATTTC

QA 3 694 3 694
DS 

RD RS1D934TF 708 0 0
GGCAGCAGCTTGAGAAAAGGAGGTAGAAGAG*GAGCAGCAGAAACACGCCACCATGGTTC
TCAAGACGG*AGCTTTGTCGGTTCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAAGGGG*TATCAG
ATTCATCCGATCTGACTCTCAGGTGTTCTTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCATTACTT
TCACAACAAACTGAAGCCTTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCACAA
GAAGGATGCAGCGCAAGAAGCTGTCAAGAAGAGGAGACGTGCCACCAAGAAGCCTTACTC
AAGGTCTATTGTTGGTGCTACCTTGGAAGTGATCCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCTGA
AGTTCGTGATGCCGCAAGAGAAGCTGCTCTCCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGAC
CAAGGATGAGAAGAAGGCAAAGAAAGCTGAATTTGCCTCTAAGCAACAGAAGATTCAGGC
TAAGGTCCCAAAGGCTGCTGCAAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGG*TGG*TGGTGGCAAA
CGCTGAAGAGCCCAAAGCCATTTTATCTTTTACTC*TTTTGTTAGTTAAATGTTGAACTC
GGAATATTCTGCCGAACGTAAACCTTTTGTTGTTGCCGTTTGTCTTTTTCCTTTTGCAAC
TCTCGTAATCTCAGACTTGAGAATTTTGGTGCTTATCAACTTCATTTC

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DS 

RD RS1B327JQ 698 0 0
GAAAAGGAGGAAGAAGAGAGAGCAGCAGAAACACGCCACCATGGTTCTCAAGACGG*AGC
TTTGTCGTTTCAGTGGCCACAAGATTTACCCAGGAAGGGG*AATCAGATTCATCCGATCT
GACTCTCAGGTGTTCCTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCATTACTTTCATAACAAACTG
AAGCCTTCCAAGCTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCACAAGAAGGATGCAGCT
CAAGAAGCTGTCAAGAAGAGGAGACGTGCTACCAAGAAGCCTTACTCAAGGTCGATTGTT
GGTGCTACCTTGGAAGTGATCCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCTGAAGTTCGTGATGCC
GCAAGAGAAGCTGCTCTCCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGACCAAGGATGAGAAG
AAGGCAAAGAAGGCTGAATTTGCCTTTAAGCAACAGAAGATTCAGGCTAAGGTCCCCAAG
GCTGCTGCAAAGGGAGGTCCTAAGTTGGGAGG*TGG*TGGTGGCAAACGCTGAAGAGCCC
AAACCCATTTTATCTTT*ACTC*TTTTGTTAGTTATATGTTGAACTCGGAATATTCTGCC
GAACGTAAACCTTTTGTTGTTGCCGTTTGTCTTTTTCCTTTTGCAACTC**GTAATTTCA
GACTTGAGAATTTTGGTGCTTATCAACTTCATTTCAC
C

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DS 

RD RS1A207TF 647 0 0
TTCTTGTTCATCAACTCAAAGTGTAAGCATTACTTTCATAACAAACTGAAGCCTTCCAAG
CTTTGTTGGACTACCATGTACAGAAAGCAGCGCAAGAAGGATGCAGCTCAAGAAGCTGTC
AAGAAGAGGAGACGTGCTACCAAGAAGCCTTACTCAAGGTCTATTGTTGGTGCTACCTTG
GAAGTGATCCAGAAGAAGAGAGCTGAGAAGCCTGAAGTTCGTGATGCCGCAAGAGAAGCT
GCTCTCCGTGATATCAAGGAGAGAATCAAGAAGACCAAGGATGAGAAGAAGGCAAAGAAA
GCTGAATTTGCCTCTAAGCAACAGAAGATTCAGGCTAAGGTCCCCAAGGCTGCTGCAAAG
GGAGGTCCTAAGTTGGGAGGGTGGGTGGTGGCAAACGCTGAAGAGCCCAAACCCATTTTA
TCTTT*ACTCATTTTGTTAGTTATATGTTGAACTCGGGATATTCTGCCGAACGTAAACCT
TTTGTTGTTGCCGTTTGTCTTTTTCCTTTTGCAACTC**GTAATCTCAGACTTGAGAATT
TTGGTGCTTATCAACTTCATTTCACTAAAAAAAAAAAAAAAGCCGCCTCGGCCCTCGAGA
AGCTTTCTAGACCATTCGTTTGGCGCGCGGGCCCAGTAGTAAGTGAA

QA 1 647 1 647
DS 



CO CL1Contig23 753 2 2 U
CATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATCAGTCGACGGTACCGGACATATGCC
CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGACTCTGTTTTATCTCAGGAAGAGAAGGAAAGAC
TCTCTTCTTCAGAGCGATTAAAGCAAGCGTAGATCAGATGGCAGCACCTTTCACGTTGAG
GAAGATCGGAGTTCCGCCGAACTCAGCTAACCTGACTGAAGCTCGCCGCCGTGTTTTCGA
TTACTTCAGAGCTGCATGTAGATCCATCCCCACCATCATGGACATTTATAATCTACAAGA
CGTCGTCGCCCCTTCTCAGCTACGTTTTGCAATCTCTGCTCAGATTCGTAAAAACGCTCA
CGCCACCGATCCTAAGGTGATTGATCTTCCTATTCAAAGGAATGGAAGAGCTGACTGACA
TAGTGGATCACGCAAAGCAGCGTCACCACATTATTGGTCAATACGTTGTGGGTGAAGGGC
TCGTCCAGAATACCGGAAGCAAGGATCAAGGGAAGTCTGATTTTCTCAAGAACTTCTACA
CCAGCAACTACTTTTGAGGCTGATGATTGTTTTCTCTACTGGCTATGTCATGCTACCAAG
TTCTTGCATAAGTCTTTTTGACTTTTCCAGTATTGTATTTTCGATTTAGGAAGAAGTCTT
CTTCCTGAGAATAATTTGTATGAATTTCGCCAAACCTCTCTTTAAGTTGTAGCTGTGACA
GTGTTTGCTGTGCAAATATTGCTATGATTCCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RS1A209TF U 1
AF RS1A209TV U 37
BS 1 749 RS1A209TF
BS 750 753 RS1A209TV

RD RS1A209TF 749 0 0
CATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATCAGTCGACGGTACCGGACATATGCC
CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGACTCTGTTTTATCTCAGGAAGAGAAGGAAAGAC
TCTCTTCTTCAGAGCGATTAAAGCAAGCGTAGATCAGATGGCAGCACCTTTCACGTTGAG
GAAGATCGGAGTTCCGCCGAACTCAGCTAACCTGACTGAAGCTCGCCGCCGTGTTTTCGA
TTACTTCAGAGCTGCATGTAGATCCATCCCCACCATCATGGACATTTATAATCTACAAGA
CGTCGTCGCCCCTTCTCAGCTACGTTTTGCAATCTCTGCTCAGATTCGTAAAAACGCTCA
CGCCACCGATCCTAAGGTGATTGATCTTCCTATTCAAAGGAATGGAAGAGCTGACTGACA
TAGTGGATCACGCAAAGCAGCGTCACCACATTATTGGTCAATACGTTGTGGGTGAAGGGC
TCGTCCAGAATACCGGAAGCAAGGATCAAGGGAAGTCTGATTTTCTCAAGAACTTCTACA
CCAGCAACTACTTTTGAGGCTGATGATTGTTTTCTCTACTGGCTATGTCATGCTACCAAG
TTCTTGCATAAGTCTTTTTGACTTTTCCAGTATTGTATTTTCGATTTAGGAAGAAGTCTT
CTTCCTGAGAATAATTTGTATGAATTTCGCCAAACCTCTCTTTAAGTTGTAGCTGTGACA
GTGTTTGCTGTGCAAATATTGCTATGATT

QA 1 749 1 749
DS 

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TATCTCAGGAAGAGAAGGAAAGACTCTCTTCTTCAGAGCGATTAAAGCAAGCGTAGATCA
GATGGCAGCACCTTTCACGTTGAGGAAGATCGGAGTTCCGCCGAACTCAGCTAACCTGAC
TGAAGCTCGCCGCCGTGTTTTCGATTACTTCAGAGCTGCATGTAGATCCATCCCCACCAT
CATGGACATTTATAATCTACAAGACGTCGTCGCCCCTTCTCAGCTACGTTTTGCAATCTC
TGCTCAGATTCGTAAAAACGCTCACGCCACCGATCCTAAGGTGATTGATCTTCCTATTCA
AAGGAATGGAAGAGCTGACTGACATAGTGGATCACGCAAAGCAGCGTCACCACATTATTG
GTCAATACGTTGTGGGTGAAGGGCTCGTCCAGAATACCGGAAGCAAGGATCAAGGGAAGT
CTGATTTTCTCAAGAACTTCTACACCAGCAACTACTTTTGAGGCTGATGATTGTTTTCTC
TACTGGCTATGTCATGCTACCAAGTTCTTGCATAAGTCTTTTTGACTTTTCCAGTATTGT
ATTTTCGATTTAGGAAGAAGTCTTCTTCCTGAGAATAATTTGTATGAATTTCGCCAAACC
TCTCTTTAAGTTGTAGCTGTGACAGTGTTTGCTGTGCAAATATTGCTATGATTCCAG

QA 1 717 1 717
DS 



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CTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTT
TTTTTTTTTTTTAAAAATCAAGAGTTATACATTTATTGAAAGTTTTCGAGTTTGAAAGGA
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ATGTAAATATGTTTAACGCTGTGACACAGATTCAGCAGAGAAGAGGTACTTGACACGGGA
GAGAACCGAATCATGAGCAGGATCATAGGGATGGTCCTTGGAAGGGATCTCCAGAATCGC
AGGCACTGGCTTGTTGTAGCTATCCACCAAGAAACGGATCATATTGGCAACGTATTGGCT
GATGAGGATGATAGCAATATCATCTCTCGATGAGAATTCCTTGAAAGCATCCTCAATTTG
TCTCACAGTTGTCTTTGAATCCACGATGAGGTAGTTAGTCTTCCTCCTGATGTCAACATT
ACCAACTCCAGCCATCAAGAATCCAACTACGGTGTCCTCGTCGGCGATCATAGCGATGAG
GGCAGAGTTGTGAGCAGGGATCGAAGCTCTCCCAGCCATTTTGATTCAACTTCTCTTCTC
TGTTTCTTCGATTTGAAT**GATTAATTTGGATTCGTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGT
CGACT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 25 10 10 10 10 25 10 25 10 25 10 10 10 10 10 10 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1A218TV C 1
AF RS1GW32JQ U 134
AF RS1GW32TF C 134
AF RS1A218JQ U 133
AF RS1A218TR U 133
AF RS1A218TF C 1
BS 1 132 RS1A218TF
BS 133 133 RS1A218JQ
BS 134 279 RS1GW32JQ
BS 280 280 RS1A218JQ
BS 281 610 RS1GW32JQ
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BS 612 699 RS1GW32JQ
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RD RS1A218TV 658 0 0
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GATGAGGATGATAGCAATATCATCTCTCGATGAGAATTCCTTGAAAGCATCCTCAATTTG
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QA 1 658 1 658
DS 

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TGAAT**GATTAATTTGGATTCGTCC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RS1GW32TF 566 0 0
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TGAGCAGGATCATAGGGATGGTCCTTGGAAGGGATCTCCAGAATCGCAGGCACTGGCTTG
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GCAGGGATCGAAGCTCTCCCAGCCATTTTGATTCAACTTCTCTTCTCTGTTTCTTCGATT
TGAAT**GATTAATTTGGATTCGTCC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RS1A218JQ 544 0 0
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TT
CC

QA 1 542 1 542
DS 

RD RS1A218TR 544 0 0
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TGTCAAAAACAAACAAATGATATATAGAGGTTCAAGCAAGCTTGCAGAATGTAAATATGT
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ATGAGCAGGATCATAGGGATGGTCCTTGGAAGGGATCTCCAGAATCGCAGGCACTGGCTT
GTTGTAGCTATCCACCAAGAAACGGATCATATTGGCAACGTATTGGCTGATGAGGATGAT
AGCAATATCATCTCTCGATGAGAATTCCTTGAAAGCATCCTCAATTTGTCTCACAGTTGT
CTTTGAATCCACGATGAGGTAGTTAGTCTTCCTCCTGATGTCAACATTACCAACTCCAGC
CATCAAGAATCCAACTACGGTGTCCTCGTCGGCGATCATAGCGATGAGGGCAGAGTTGTG
AGCAGGGATCGAAGCTCTCCCAGCCATTTTGATTCAACTTCTCTTCTCTGTTTCTTCGAT
TT
CC

QA 1 542 1 542
DS 

RD RS1A218TF 725 0 0
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ATGTAAATATGTTTAACGCTGTGACACAGATTCAGCAGAGAAGAGGTACTTGACACGGGA
GAGAACCGAATCATGAGCAGGATCATAGGGATGGTCCTTGGAAGGGATCTCCAGAATCGC
AGGCACTGGCTTGTTGTAGCTATCCACCAAGAAACGGATCATATTGGCAACGTATTGGCT
GATGAGGATGATAGCAATATCATCTCTCGATGAGAATTCCTTGAAAGCATCCTCAATTTG
TCTCACAGTTGTCTTTGAATCCACGATGAGGTAGTTAGTCTTCCTCCTGATGTCAACATT
ACCAACTCCAGCCATCAAGAATCCAACTACGGTGTCCTCGTCGGCGATCATAGCGATGAG
GGCAGAGTTGTGAGCAGGGATCGAAGCTCTCCCAGCCATTTTGATTCAACTTCTCTTCTC
TGTTTCTTCGATTTCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGT
CGACT

QA 1 725 1 725
DS 



CO CL1Contig25 788 10 12 U
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TGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCGGGAC
ATGAAAATTTTGATGGATAAAGGGAGATACATTGTTGTTGGGGGTGGGTTTATATAAGAA
TGAATAACAAACAACAAACAGACTTCTTCACCATTTCCAGAAAACATTGGAACCACACTT
GTACTTGTCTTTGCCTTCGCATTCCAACGCCAAATCTTCAGAGATAAATGGGACTTTCTT
TTGCTTGGCGAGATCTTGGCAACCAGTGAAATTCTCAGGGAACTTGCAGCTTCCGAATTG
GACAGTGAATGCTCTCGCAAAGTTTGCTCCACTTGTTGCCAATCTCTTCTTATCGTTCAG
TTCTTTGTTGGCCTTGCTCTTCTCGAGGTATTCATCGAAGACGCTAGCATTAGCAGAAGC
AGACACAGCAGCAGAGGAGAAGAGGGTAGCCGCTAAGAACAACATGGCTGATCTTCTTCC
ATTAGACCCATCAACATCATCACCACCAGCTCGTTGAGCTTTGATCACAGGAAACGTCTG
TTTCTTCTGACCAAACCCAACTGATGAACTCACTTTCTGGTTTAGCTCTACTGAGCCAGC
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TTTGGAGGGGTTTGATTGGCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTAC
CGTCGACT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 5 5 20 5 5 5 5 5 15 15 15 15 
15 40 15 15 15 15 15 40 40 40 40 15 15 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DF16JQ U 116
AF RS1DF16TF C 147
AF RS1A757JQ U 164
AF RS1A757TF C 106
AF RS1CP13JQ U 117
AF RS1CP13TF C 117
AF RS1A226JQ U 135
AF RS1A226TR U 135
AF RS1A226TV C 1
AF RS1A226TF C 1
BS 1 115 RS1A226TF
BS 116 396 RS1DF16JQ
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BS 496 496 RS1A757JQ
BS 497 501 RS1DF16JQ
BS 502 545 RS1A757JQ
BS 546 546 RS1CP13JQ
BS 547 714 RS1A757JQ
BS 715 715 RS1CP13JQ
BS 716 739 RS1A757JQ
BS 740 788 RS1A226TF

RD RS1DF16JQ 386 0 0
GGGACATGAAAATTTTGATGGATAAAGGGAGATACATTGTTGTTGGGGGTGGGTTTATAT
AAGAATGAATAACAAACAACAAACAGACTTCTTCACCATTTCCAGAAAACATTGGAACCA
CACTTGTACTTGTCTTTGCCTTCGCATTCCAACGCCAAATCTTCAGAGATAAATGGGACT
TTCTTTTGCTTGGCGAGATCTTGGCAACCAGTGAAATTCTCAGGGAACTTGCAGCTTCCG
AATTGGACAGTGAATGCTCTCGCAAAGTTTGCTCCACTTGTCGCCAATCTCTTCTTATCG
TTCAGTTCTTTGTTGGCCTTGCTCTTCTCGAGGTATTCATCGAAGACGCTAGCATTAGCA
GAAGCAGACACAGCAGCAGAAGAGAA

QA 1 386 1 386
DS 

RD RS1DF16TF 565 0 0
ATACATTGTTGTTGGGGGTGGGTTTATATAAGAATGAATAACAAACAACAAACAGACTTC
TTCACCATTTCCAGAAAACATTGGAACCACACTTGTACTTGTCTTTGCCTTCGCATTCCA
ACGCCAAATCTTCAGAGATAAATGGGACTTTCTTTTGCTTGGCGAGATCTTGGCAACCAG
TGAAATTCTCAGGGAACTTGCAGCTTCCGAATTGGACAGTGAATGCTCTCGCAAAGTTTG
CTCCACTTGTCGCCAATCTCTTCTTATCGTTCAGTTCTTTGTTGGCCTTGCTCTTCTCGA
GGTATTCATCGAAGACGCTAGCATTAGCAGAAGCAGACACAGCAGCAGAGGAGAAGAGGG
TAGCCGCTAAGAACAACATGGCTGATCTTCTTCCATTAGACCCATCAACATCATCACCAC
CAGCTCGTTGAGCTTTGATCACAGGAAACGTCTGTTTCTTCTGACCAAACCCAACTGATG
AACTCACTTTCTGGTTTAGCTCTACTGAGCCAGCACCAGAGATTGCGTAGCTGCAGGTGA
GAACACTTGAGTTCATGGCTGCC
CC

QA 1 563 1 563
DS 

RD RS1A757JQ 578 0 0
GG
GGGTTTATATAAGAATGAATAACAAACAACAAACAGACTTCTTCACCATTTCCAGAAAAC
ATTGGAACCACACTTGTACTTGTCTTTGCCTTCGCATTCCAACGCCAAATCTTCAGAGAT
AAATGGGACTTTCTTTTGCTTGGCGAGATCTTGGCAACCAGTGAAATTCTCAGGGAACTT
GCAGCTTCCGAATTGGACAGTGAATGCTCTCGCAAAGTTTGCTCCACTTGTTGCCAATCT
CTTCTTATCGTTCAGTTCTTTGTTGGCCTTGCTCTTCTCGAGGTATTCATCGAAAACGCT
AGCATTAGCAGAAGCAGACACAGCAGCAGAGGAGAAGAGGGTAGCCGCTAAGAACAACAT
GGCTGATCTTCTTCCATTAGGCCCATCAACATCATCACCACCAGCTCGTTGAGCTTTGAT
CACAGGAAACGTCTGTTTCTTCTGACCAAACCCAACTGATGAACTCACTTTCTGGTTTAG
CTCTACTGAGCCAGCACCAGAGATTGCGTAGCTGCAGGTGAGAACACTTGAGTTCATGGC
TGCCATTAAAAGTTTTTTGGAGGGGTTTGATTGG
TC

QA 3 576 3 576
DS 

RD RS1A757TF 636 0 0
C
GATTCAAATGGGACATGAAAATTTTGATGGATAAAGGGAGATACATTGTTGTTGGGGGTG
G*TTTATATAAGAATGAATAACAAACAACAAACAGACTTCTTCACCATTTCCAGAAAACA
TTGGAACCACACTTGTACTTGTCTTTGCCTTCGCATTCCAACGCCAAATCTTCAGAGATA
AATGGGACTTTCTTTTGCTTGGCGAGATCTTGGCAACCAGTGAAATTCTCAGGGAACTTG
CAGCTTCCGAATTGGACAGTGAATGCTCTCGCAAAGTTTGCTCCACTTGTTGCCAATCTC
TTCTTATCGTTCAGTTCTTTGTTGGCCTTGCTCTTCTCGAGGTATTCATCGAAGACGCTA
GCATTAGCAGAAGCAGACACAGCAGCAGAGGAGAAGAGGGTAGCCGCTAAGAACAACATG
GCTGATCTTCTTCCATTAGGCCCATCAACATCATCACCACCAGCTCGTTGAGCTTTGATC
ACAGGAAACGTCTGTTTCTTCTGACCAAACCCAACTGATGAACTCACTTTCTGGTTTAGC
TCTACTGAGCCAGCACCAGAGATTGCGTAGCTGCAGGTGAGAACACTTGAGTTCATGGCT
GCCATTAAGAGTTTTTTGGAGGGGTTTGATTGG
TC

QA 2 634 2 634
DS 

RD RS1CP13JQ 626 0 0
GGACATGAAAATTTTGATGGATAAAGGGAGATACATTGTTGTTGGGGGTGGGTTTATATA
AGAATGAATAACAAACAACAAACAGACTTCTTCACCATTTCCAGAAAACATTGGAACCAC
ACTTGTACTTGTCTTTGCCTTCGCATTCCAACGCCAAATCTTCAGAGATAAATGGGACTT
TCTTTTGCTTGGCGAGATCTTGGCAACCAGTGAAATTCTCAGGGAACTTGCAGCTTCCGA
ATTGGACAGTGAATGCTCTCGCAAAGTTTGCTCCACTTGTTGCCAATCTCTTCTTATCGT
TCAGTTCTTTGTTGGCCTTGCTCTTCTCGAGGTATTCATCGAAGACGCTAGCATTAGCAG
AAGCAGACACAGCAGCAGAGGAGAAGAGGGTAGCCGCTAAGAACAACATGGCTGATCTTC
TTCCATTAGACCCATCAACATCATCACCACCAGCTCGTTGAGCTTTGATCACAGGAAACG
TCTGTTTCTTCTGACCAAACCCAACTGATGAACTCACTTTCTGGTTTAGCTCTACTGAGC
CAGCACCAGAAATTGCGTAGCTGCAGGTGAGAACACTTGAGTTCATGGCTGCCATTAAGA
GTTTTTTGGAGGGGTTTGATTGG
ACC

QA 1 623 1 623
DS 

RD RS1CP13TF 626 0 0
GGACATGAAAATTTTGATGGATAAAGGGAGATACATTGTTGTTGGGGGTGGGTTTATATA
AGAATGAATAACAAACAACAAACAGACTTCTTCACCATTTCCAGAAAACATTGGAACCAC
ACTTGTACTTGTCTTTGCCTTCGCATTCCAACGCCAAATCTTCAGAGATAAATGGGACTT
TCTTTTGCTTGGCGAGATCTTGGCAACCAGTGAAATTCTCAGGGAACTTGCAGCTTCCGA
ATTGGACAGTGAATGCTCTCGCAAAGTTTGCTCCACTTGTTGCCAATCTCTTCTTATCGT
TCAGTTCTTTGTTGGCCTTGCTCTTCTCGAGGTATTCATCGAAGACGCTAGCATTAGCAG
AAGCAGACACAGCAGCAGAGGAGAAGAGGGTAGCCGCTAAGAACAACATGGCTGATCTTC
TTCCATTAGACCCATCAACATCATCACCACCAGCTCGTTGAGCTTTGATCACAGGAAACG
TCTGTTTCTTCTGACCAAACCCAACTGATGAACTCACTTTCTGGTTTAGCTCTACTGAGC
CAGCACCAGAGATTGCGTAGCTGCAGGTGAGAACACTTGAGTTCATGGCTGCCATTAAGA
GTTTTTTGGAGGGGTTTGATTGG
ACC

QA 1 623 1 623
DS 

RD RS1A226JQ 605 0 0
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CTTCGCATTCCAACGCCAAATCTTCAGAGATAAATGGGACTTTCTTTTGCTTGGCGAGAT
CTTGGCAACCAGTGAAATTCTCAGGGAACTTGCAGCTTCCGAATTGGACAGTGAATGCTC
TCGCAAAGTTTGCTCCACCTGTTGCCAATCTCTTCTTATCGTTCAGTTCTTTGTTGGCCT
TGCTCTTCTCGAGGTATTCATCGAAGACGCTAGCATTAGCAGAAGCAGACACAGCAGCAG
AGGAGAAGAGGGTAGCCGCTAAGAACAACATGGCTGATCTTCTTCCATTAGACCCATCAA
CATCATCACCACCAGCTCGTTGAGCTTTGATCACAGGAAACGTCTGTTTCTTCTGACCAA
ACCCAACTGATGAACTCACTTTCTGGTTTAGCTCTACTGAGCCAGCACCAGAGATTACGT
AGCTGCAGGTGAGAACACTTGAGTTCATGGCTGCCATTAAGAGTTTTTTGGAGGGGTTTG
ATT
CC

QA 1 603 1 603
DS 

RD RS1A226TR 605 0 0
GGATAAAGGGAGATACATTGTTGTTGGGGGTGGGTTTATATAAGAATGAATAACAAACAA
CAAACAGACTTCTTCACCATTTCCAGAAAACATTGGAACCACACTTGTACTTGTCTTTGC
CTTCGCATTCCAACGCCAAATCTTCAGAGATAAATGGGACTTTCTTTTGCTTGGCGAGAT
CTTGGCAACCAGTGAAATTCTCAGGGAACTTGCAGCTTCCGAATTGGACAGTGAATGCTC
TCGCAAAGTTTGCTCCACCTGTTGCCAATCTCTTCTTATCGTTCAGTTCTTTGTTGGCCT
TGCTCTTCTCGAGGTATTCATCGAAAACGCTAGCATTAGCAGAAGCAGACACAGCAGCAG
AGGAGAAGAGGGTAGCCGCTAAGAACAACATGGCTGATCTTCTTCCATTAGACCCATCAA
CATCATCACCACCAGCTCGTTGAGCTTTGATCACAGGAAACGTCTGTTTCTTCTGACCAA
ACCCAACTGATGAACTCACTTTCTGGTTTAGCTCTACTGAGCCAGCACCAGAGATTACGT
AGCTGCAGGTGAGAACACTTGAGTTCATGGCTGCCATTAAGAGTTTTTTGGAGGGGTTTG
ATT
CC

QA 1 603 1 603
DS 

RD RS1A226TV 733 0 0
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TGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTTT
TTTTTTTTTTTTTTGGATAAAGGGAGATACATTGTTGTTGGGGGTGGGTTTATATAAGAA
TGAATAACAAACAACAAACAGACTTCTTCACCATTTCCAGAAAACATTGGAACCACACTT
GTACTTGTCTTTGCCTTCGCATTCCAACGCCAAATCTTCAGAGATAAATGGGACTTTCTT
TTGCTTGGCGAGATCTTGGCAACCAGTGAAATTCTCAGGGAACTTGCAGCTTCCGAATTG
GACAGTGAATGCTCTCGCAAAGTTTGCTCCACCTGTTGCCAATCTCTTCTTATCGTTCAG
TTCTTTGTTGGCCTTGCTCTTCTCGAGGTATTCATCGAAGACGCTAGCATTAGCAGAAGC
AGACACAGCAGCAGAGGAGAAGAGGGTAGCCGCTAAGAACAACATGGCTGATCTTCTTCC
ATTAGACCCATCAACATCATCACCACCAGCTCGTTGAGCTTTGATCACAGGAAACGTCTG
TTTCTTCTGACCAAACCCAACTGATGAACTCACTTTCTGGTTTAGCTCTACTGAGCCAGC
ACCAGAGATTACGTAGCTGCAGGTGAGAACACTTGAGTTCATGGCTGCCATTAAGAGTTT
TTTGGAGGGGTTT

QA 1 733 1 733
DS 

RD RS1A226TF 788 0 0
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TGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTTT
TTTTTTTTTTTTTTGGATAAAGGGAGATACATTGTTGTTGGGGGTGGGTTTATATAAGAA
TGAATAACAAACAACAAACAGACTTCTTCACCATTTCCAGAAAACATTGGAACCACACTT
GTACTTGTCTTTGCCTTCGCATTCCAACGCCAAATCTTCAGAGATAAATGGGACTTTCTT
TTGCTTGGCGAGATCTTGGCAACCAGTGAAATTCTCAGGGAACTTGCAGCTTCCGAATTG
GACAGTGAATGCTCTCGCAAAGTTTGCTCCACCTGTTGCCAATCTCTTCTTATCGTTCAG
TTCTTTGTTGGCCTTGCTCTTCTCGAGGTATTCATCGAAGACGCTAGCATTAGCAGAAGC
AGACACAGCAGCAGAGGAGAAGAGGGTAGCCGCTAAGAACAACATGGCTGATCTTCTTCC
ATTAGACCCATCAACATCATCACCACCAGCTCGTTGAGCTTTGATCACAGGAAACGTCTG
TTTCTTCTGACCAAACCCAACTGATGAACTCACTTTCTGGTTTAGCTCTACTGAGCCAGC
ACCAGAGATTACGTAGCTGCAGGTGAGAACACTTGAGTTCATGGCTGCCATTAAGAGTTT
TTTGGAGGGGTTTGATTCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTAC
CGTCGACT

QA 1 788 1 788
DS 



CO CL1Contig26 719 4 3 U
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CTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTT
TTTTTTTTTTTTTGCCTTGTAGTAGACCCCAAGTACCAAGGGCCAACGCAGGAGCACAAC
ATATAGCTGCGTTAAGTCGTCCATCTGCGTCTTGTTTCTTTACCATATTCTCTAATGGTT
TACAGTTTTTTAGAGTCTCGCCGCCGGGAAGCCCTCCCTTTTTACCAATCAAATATTTAA
TAATAGCAAAATAATTATCAAGCAAACATGAGAAGCAAGCAATAATCTATCGAGAGACTT
ACAGGGAGCACAATAAGGTCGAAAATAGAATCGGTAATATCAGAGAGGAGAGTATCAGCG
ACCATCTTGATACCATGACAAGCATCGACGCCAACCTGAGTCTCGACGGACGCCACCGTC
ACGTGAGCGCCACCTCGCCGTAACGTGGTGATCATCGCCACCGCTTCTAGAGGCTCCGTA
CCGTGCGCAATAGGGATCAAAACCGTCTTCGTAGATGGAGCCATGTTTGCCAGGAAGATG
GTGAAGTAGAAGAAGAGAACTATGGAGTTTAGTCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGG
GCATATGTCCGGTACCGTCGACTGATAACTTCGTATAATGTATGCTATACGAAGTTATG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A228JQ U 134
AF RS1A228TR U 134
AF RS1A228TF C 1
AF RS1A228TV C 1
BS 1 133 RS1A228TF
BS 134 634 RS1A228JQ
BS 635 719 RS1A228TF

RD RS1A228JQ 501 0 0
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TAAGGTCGAAAATAGAATCGGTAATATCAGAGAGGAGAGTATCAGCGACCATCTTGATAC
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CTCGCCGTAACGTGGTGATCATCGCCACCGCTTCTAGAGGCTCCGTACCGTGCGCAATAG
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AGAGAACTATGGAGTTTAGTC

QA 1 501 1 501
DS 

RD RS1A228TR 501 0 0
GCCTTGTAGTAGACCCCAAGTACCAAGGGCCAACGCAGGAGCACAACATATAGCTGCGTT
AAGTCGTCCATCTGCGTCTTGTTTCTTTACCATATTCTCTAATGGTTTACAGTTTTTTAG
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ATTATCAAGCAAACATGAGAAGCAAGCAATAATCTATCGAGAGACTTACAGGGAGCACAA
TAAGGTCGAAAATAGAATCGGTAATATCAGAGAGGAGAGTATCAGCGACCATCTTGATAC
CATGACAAGCATCGACGCCAACCTGAGTCTCGACGGACGCCACCGTCACGTGAGCGCCAC
CTCGCCGTAACGTGGTGATCATCGCCACCGCTTCTAGAGGCTCCGTACCGTGCGCAATAG
GGATCAAAACCGTCTTCGTAGATGGAGCCATGTTTGCCAGGAAGATGGTGAAGTAGAAGA
AGAGAACTATGGAGTTTAGTC

QA 1 501 1 501
DS 

RD RS1A228TF 719 0 0
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CTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTT
TTTTTTTTTTTTTGCCTTGTAGTAGACCCCAAGTACCAAGGGCCAACGCAGGAGCACAAC
ATATAGCTGCGTTAAGTCGTCCATCTGCGTCTTGTTTCTTTACCATATTCTCTAATGGTT
TACAGTTTTTTAGAGTCTCGCCGCCGGGAAGCCCTCCCTTTTTACCAATCAAATATTTAA
TAATAGCAAAATAATTATCAAGCAAACATGAGAAGCAAGCAATAATCTATCGAGAGACTT
ACAGGGAGCACAATAAGGTCGAAAATAGAATCGGTAATATCAGAGAGGAGAGTATCAGCG
ACCATCTTGATACCATGACAAGCATCGACGCCAACCTGAGTCTCGACGGACGCCACCGTC
ACGTGAGCGCCACCTCGCCGTAACGTGGTGATCATCGCCACCGCTTCTAGAGGCTCCGTA
CCGTGCGCAATAGGGATCAAAACCGTCTTCGTAGATGGAGCCATGTTTGCCAGGAAGATG
GTGAAGTAGAAGAAGAGAACTATGGAGTTTAGTCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGG
GCATATGTCCGGTACCGTCGACTGATAACTTCGTATAATGTATGCTATACGAAGTTATG

QA 1 719 1 719
DS 

RD RS1A228TV 683 0 0
CAAGCACTAGTCATGACCAGGATCTCCTAGGAAACAGCTATGACCATGTTCACTTACCTA
CTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTT
TTTTTTTTTTTTTGCCTTGTAGTAGACCCCAAGTACCAAGGGCCAACGCAGGAGCACAAC
ATATAGCTGCGTTAAGTCGTCCATCTGCGTCTTGTTTCTTTACCATATTCTCTAATGGTT
TACAGTTTTTTAGAGTCTCGCCGCCGGGAAGCCCTCCCTTTTTACCAATCAAATATTTAA
TAATAGCAAAATAATTATCAAGCAAACATGAGAAGCAAGCAATAATCTATCGAGAGACTT
ACAGGGAGCACAATAAGGTCGAAAATAGAATCGGTAATATCAGAGAGGAGAGTATCAGCG
ACCATCTTGATACCATGACAAGCATCGACGCCAACCTGAGTCTCGACGGACGCCACCGTC
ACGTGAGCGCCACCTCGCCGTAACGTGGTGATCATCGCCACCGCTTCTAGAGGCTCCGTA
CCGTGCGCAATAGGGATCAAAACCGTCTTCGTAGATGGAGCCATGTTTGCCAGGAAGATG
GTGAAGTAGAAGAAGAGAACTATGGAGTTTAGTCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGG
GCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 683 1 683
DS 



CO CL1Contig27 780 8 8 U
CAAGCACTAGTCATGACCAGGATCTCCTAGGAAACAGCTATGACCATGTTCACTTACCTA
CTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTT
TTTTTTTTTTTTTTTCGTAAGAGAAAGACAAAGTGTTATTCCTGATGGTACTTTACGTTT
ACATACATCAAAGCGCCGAAAAAGAGAGAGAGATCTCCTTATCGTTATTACTTATTTACC
ATATGAAATGGATGGTTACATAATAAGAAACTCAAGTCATATAATAGAAAATAGCAGCAG
AATCATTATTATTTAGGTTAAAGGCTGGCCAACTTTGATTATTCGTTCGTACATCTCTAG
CCTCCTTCACACGGCAATCAAATCGAAATACTGTCACAATTGGTGTTGAAACCAATGGGG
TATGAAAGTGAAACACCACAAGTGGTAGGGAGTGTGGCCACAAGGTCGATATTGAGGCCT
TTAATTTCCTTACCGGCTGATTTAAGGCACTCACATACTTGTCGACGATCCGGTGTGGTC
TGAGCCATTTGGTTCAATGATTTGACTGCCACACAGCAGCTTGACGGCAATGGACCACCG
TTGGTCAAGTAGCTGATGCACTGTGCCATTGTGCTTGACACTGTCCCACACGTTATGTGC
GACTCTGTTGGAGTGGCAATGTAGATCGCAAGGATGAGGAGGCATGTGATGATCTTTGAA
GCAAACGCCATTTTTGTTTTAATTGTTTTTGAATTTGATTGTTTTTCCCCCGGCCGTAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E106JQ U 139
AF RS1E106TF C 139
AF RS1A242TV C 1
AF RS1GL40JQ U 139
AF RS1GL40TF C 139
AF RS1A242JQ U 136
AF RS1FY52TF C 166
AF RS1A242TR U 136
BS 1 135 RS1A242TV
BS 136 138 RS1A242JQ
BS 139 304 RS1E106JQ
BS 305 736 RS1GL40JQ
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BS 738 755 RS1GL40JQ
BS 756 768 RS1A242JQ
BS 769 780 RS1A242TV

RD RS1E106JQ 167 0 0
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AAAAAGAGAGAGAGATCTCCTTATCGTTATTACTTATTTACCATATGAAATGGATGGTTA
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C

QA 1 166 1 166
DS 

RD RS1E106TF 167 0 0
AAGAGAAAGACAAAGTGTTATTCCTGATGGTACTTTACGTTTACATACATCAAAGCGCCG
AAAAAGAGAGAGAGATCTCCTTATCGTTATTACTTATTTACCATATGAAATGGATGGTTA
CATAATAAGAAACTCAAGTCATATAATAGAAAATAGCAGCAGAATC
C

QA 1 166 1 166
DS 

RD RS1A242TV 780 0 0
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CTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTT
TTTTTTTTTTTTTTTCGTAAGAGAAAGACAAAGTGTTATTCCTGATGGTACTTTACGTTT
ACATACATCAAAGCGCCGAAAAAGAGAGAGAGATCTCCTTATCGTTATTACTTATTTACC
ATATGAAATGGATGGTTACATAATAAGAAACTCAAGTCATATAATAGAAAATAGCAGCAG
AATCATTATTATTTAGGTTAAAGGCTGGCCAACTTTGATTATTCGTTCGTACATCTCTAG
CCTCCTTCCCACGGCAATCAAATCGAAATACTGTCACAATTGGTGTTGAAACCAATGGGG
TATGAAAGTGAAACACCACAAGTGGTAGGGAGTGTGGCCACAAGGTCGATATTGAGGCCT
TTAATTTCCTTACCGGCTGATTTAAGGCACTCACATACTTGTCGACGATCCGGTGTGGTC
TGAGCCATTTGGTTCAATGATTTGACTGCCACACAGCAGCTTGACGGCAATGGACCACCG
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GACTCTGTTGGAGTGGCAATGTAGATCGCAAGGATGAGGAGGCATGTGATGATCTTTGAA
GCAAACGCCATTTTTGTTTTAATTGTTTTTGAATTTGATTGTTTTTCCCCCGGCCGTAAT

QA 1 780 1 780
DS 

RD RS1GL40JQ 619 0 0
AG
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AAAGAGAGAGAGATCTCCTTATCGTTATTACTTATTTACCATATGAAATGGATGGTTACA
TAATAAGAAACTCAAGTCATATAATAGAAAATAGCAGCAGAATCATTATTATTTAGGTTA
AAGGCTGGCCAACTTTGATTATTCGTTCGTACATCTCTAGCCTCCTTCACACGGCAATCA
AATCGAAATACTGTCACAATTGGTGTTGAAACCAATGGGGTATGAAAGTGAAACACCACA
AGTGGTAGGGAGTGTGGCCACAAGGTCGATATTGAGGCCTTTAATTTCCTTACCGGCTGA
TTTAAGGCACTCACATACTTGTCGACGATCCGGTGTGGTCTGAGCCATTTGGTTCAATGA
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CTGTGCCATTGTGCTTGACACTGTCCCACACGTTATGTGCGACTCTGTTGGAGTGGCAAT
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AATTGTTTTTGAATT
CC

QA 3 617 3 617
DS 

RD RS1GL40TF 619 0 0
AG
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AAAGAGAGAGAGATCTCCTTATCGTTATTACTTATTTACCATATGAAATGGATGGTTACA
TAATAAGAAACTCAAGTCATATAATAGAAAATAGCAGCAGAATCATTATTATTTAGGTTA
AAGGCTGGCCAACTTTGATTATTCGTTCGTACATCTCTAGCCTCCTTCACACGGCAATCA
AATCGAAATACTGTCACAATTGGTGTTGAAACCAATGGGGTATGAAAGTGAAACACCACA
AGTGGTAGGGAGTGTGGCCACAAGGTCGATATTGAGGCCTTTAATTTCCTTACCGGCTGA
TTTAAGGCACTCACATACTTGTCGACGATCCGGTGTGGTCTGAGCCATTTGGTTCAATGA
TTTGACTGCCACACAGCAGCTTGACGGCAATGGACCACCGTTGGTCAAGTAGCTGATGCA
CTGTGCCATTGTGCTTGACACTGTCCCACACGTTATGTGCGACTCTGTTGGAGTGGCAAT
GTAGATCGCAAGGATGAGGAGGCATGTGATGATCTTTGAAGCAAACGCCATTTTTGCTTT
AATTGTTTTTGAATT
CC

QA 3 617 3 617
DS 

RD RS1A242JQ 633 0 0
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CCGAAAAAGAGAGAGAGATCTCCTTATCGTTATTACTTATTTACCATATGAAATGGATGG
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GGTTAAAGGCTGGCCAACTTTGATTATTCGTTCGTACATCTCTAGCCTCCTTCCCACGGC
AATCAAATCGAAATACTGTCACAATTGGTGTTGAAACCAATGGGGTATGAAAGTGAAACA
CCACAAGTGGTAGGGAGTGTGGCCACAAGGTCGATATTGAGGCCTTTAATTTCCTTACCG
GCTGATTTAAGGCACTCACATACTTGTCGACGATCCGGTGTGGTCTGAGCCATTTGGTTC
AATGATTTGACTGCCACACAGCAGCTTGACGGCAATGGACCACCGTTGGTCAAGTAGCTG
ATGCACTGTGCCATTGTGCTTGACACTGTCCCACACGTTATGTGCGACTCTGTTGGAGTG
GCAATGTAGATCGCAAGGATGAGGAGGCATGTGATGATCTTTGAAGCAAACGCCATTTTT
GTTTTAATTGTTTTTGAATTTGATTGTTTTTCC

QA 1 633 1 633
DS 

RD RS1FY52TF 603 0 0
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TATTACTTATTTACCATATGAAATGGATGGTTACATAATAAGAAACTCAAGTCATATAAT
AGAAAATAGCAGCAGAATCATTATTATTTAGGTTAAAGGCTGGCC***TTTGATTATTCG
TTCGTACATCTCTAGCCTCCTTCACACGGCAATCAAATCGAAATACTGTCACAATTGGTG
TTGAAACCAACGGGGTATGAAAGTGAAACACCACAAGTGGTAGGGAGTGTGGCCACAAGG
TCGATATTGAGGCCTTTAATTTCCTTACCGGCTGATTTAAGGCACTCACATACTTGTCGA
CGATCCGGTGTGGTCTGAGCCATTTGGTTCAATGATTTGACTGCCACACAGCAGCTTGAC
GGCAATGGACCACCGTTGGTCAAGTAGCTGATGCACTGTGCCATTGTGCTTGACACTGTC
CCACACGTTATGTGCGACTCTGTTGGAGTGGCAATGTAGATCGCAAGGATGAGGAGGCAT
GTGATGATCTTTGAAGCAAACGCCATTTTTGTTTTAATTGTTTTTGAATTTGATTGTTTT
TCC

QA 1 603 1 603
DS 

RD RS1A242TR 633 0 0
CGTAAGAGAAAGACAAAGTGTTATTCCTGATGGTACTTTACGTTTACATACATCAAAGCG
CCGAAAAAGAGAGAGAGATCTCCTTATCGTTATTACTTATTTACCATATGAAATGGATGG
TTACATAATAAGAAACTCAAGTCATATAATAGAAAATAGCAGCAGAATCATTATTATTTA
GGTTAAAGGCTGGCCAACTTTGATTATTCGTTCGTACATCTCTAGCCTCCTTCCCACGGC
AATCAAATCGAAATACTGTCACAATTGGTGTTGAAACCAATGGGGTATGAAAGTGAAACA
CCACAAGTGGTAGGGAGTGTGGCCACAAGGTCGATATTGAGGCCTTTAATTTCCTTACCG
GCTGATTTAAGGCACTCACATACTTGTCGACGATCCGGTGTGGTCTGAGCCATTTGGTTC
AATGATTTGACTGCCACACAGCAGCTTGACGGCAATGGACCACCGTTGGTCAAGTAGCTG
ATGCACTGTGCCATTGTGCTTGACACTGTCCCACACGTTATGTGCGACTCTGTTGGAGTG
GCAATGTAGATCGCAAGGATGAGGAGGCATGTGATGATCTTTGAAGCAAACGCCATTTTT
GTTTTAATTGTTTTTGAATTTGATTGTTTTTCC

QA 1 633 1 633
DS 



CO CL1Contig28 628 4 2 U
CAAGCACTAGTCATGACCAGGATCTCCTAGGAAACAGCTATGACCATGTTCACTTACCTA
CTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTT
TTTTTTTTTTTTTTTTACGAAAACGATATTAATAGATGTGTCATAAGTATTAAACCCAAC
CAAACAACAGACCAAGTTTAAAAAAGAAAACACTTTCTCATTATTTAAAATGCTTTTATT
TTATTCTCATTGTCTTTTGCAGACCAAACTCCCCAAATCCTCGGAACTGACCGTTGCTGG
AACTAGGCACAGCACTTATATGGTTATACCACAATCTAAAGAGGGGAGGTTACAAGTAGT
GGTAAACGTGGTGGCTGCTCGAAGAGCGTTACATATACAATCTTTGTTAGTTGCTTGGAG
AGCGATGCAGCAATTTGAATTCGGGGCTGGATTGACCGCACCAGGCAGAACCAGCGGCGC
ACACACTTGCATATTGCTCAGATTGTCTAGGCATTGTTGAGCACGAACCATAGGTCCGGT
CTCTAGAGCGCTCATTGCCAGAAACATTACAAAGAGAATAGTTGCAAAGGATTTGAGAAA
TTCCATTTTGTTTAGATAATATATTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 

AF RS1GP79TF C 335
AF RS1A243TF C 1
AF RS1A243JQ U 137
AF RS1A243TR U 137
BS 1 136 RS1A243TF
BS 137 628 RS1A243JQ

RD RS1GP79TF 216 0 0
TCTAAAGAGGGGAGGTTACAAGTAGTGGTAAACGTGGTGGCTGCTCGAAGAGCGTTACAT
ATACAATCTTTGTTAGTTGCCTGGAGAGCGATGCAGCAATTTGAATTCGGGGCTGGATTG
ACCGCACCAGGCAGAACCAGCGGCGCACACACTTGCATATTGCTCAGATTGTCTAGGCAT
TGTTGAGCACGAACCATAGGTCCGGTCTCTAGAGCG

QA 1 216 1 216
DS 

RD RS1A243TF 638 0 0
CAAGCACTAGTCATGACCAGGATCTCCTAGGAAACAGCTATGACCATGTTCACTTACCTA
CTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTT
TTTTTTTTTTTTTTTTACGAAAACGATATTAATAGATGTGTCATAAGTATTAAACCCAAC
CAAACAACAGACCAAGTTTAAAAAAGAAAACACTTTCTCATTATTTAAAATGCTTTTATT
TTATTCTCATTGTCTTTTGCAGACCAAACTCCCCAAATCCTCGGAACTGACCGTTGCTGG
AACTAGGCACAGCACTTATATGGTTATACCACAATCTAAAGAGGGGAGGTTACAAGTAGT
GGTAAACGTGGTGGCTGCTCGAAGAGCGTTACATATACAATCTTTGTTAGTTGCTTGGAG
AGCGATGCAGCAATTTGAATTCGGGGCTGGATTGACCGCACCAGGCAGAACCAGCGGCGC
ACACACTTGCATATTGCTCAGATTGTCTAGGCATTGTTGAGCACGAACCATAGGTCCGGT
CTCTAGAGCGCTCATTGCCAGAAACATTACAAAGAGAATAGTTGCAAAGGATTTGAGAAA
TTCCATTTTGTTTAGATAATATATTTG
CCCCGGCCGTA

QA 1 627 1 627
DS 

RD RS1A243JQ 492 0 0
ACGAAAACGATATTAATAGATGTGTCATAAGTATTAAACCCAACCAAACAACAGACCAAG
TTTAAAAAAGAAAACACTTTCTCATTATTTAAAATGCTTTTATTTTATTCTCATTGTCTT
TTGCAGACCAAACTCCCCAAATCCTCGGAACTGACCGTTGCTGGAACTAGGCACAGCACT
TATATGGTTATACCACAATCTAAAGAGGGGAGGTTACAAGTAGTGGTAAACGTGGTGGCT
GCTCGAAGAGCGTTACATATACAATCTTTGTTAGTTGCTTGGAGAGCGATGCAGCAATTT
GAATTCGGGGCTGGATTGACCGCACCAGGCAGAACCAGCGGCGCACACACTTGCATATTG
CTCAGATTGTCTAGGCATTGTTGAGCACGAACCATAGGTCCGGTCTCTAGAGCGCTCATT
GCCAGAAACATTACAAAGAGAATAGTTGCAAAGGATTTGAGAAATTCCATTTTGTTTAGA
TAATATATTTGC

QA 1 492 1 492
DS 

RD RS1A243TR 492 0 0
ACGAAAACGATATTAATAGATGTGTCATAAGTATTAAACCCAACCAAACAACAGACCAAG
TTTAAAAAAGAAAACACTTTCTCATTATTTAAAATGCTTTTATTTTATTCTCATTGTCTT
TTGCAGACCAAACTCCCCAAATCCTCGGAACTGACCGTTGCTGGAACTAGGCACAGCACT
TATATGGTTATACCACAATCTAAAGAGGGGAGGTTACAAGTAGTGGTAAACGTGGTGGCT
GCTCGAAGAGCGTTACATATACAATCTTTGTTAGTTGCTTGGAGAGCGATGCAGCAATTT
GAATTCGGGGCTGGATTGACCGCACCAGGCAGAACCAGCGGCGCACACACTTGCATATTG
CTCAGATTGTCTAGGCATTGTTGAGCACGAACCATAGGTCCGGTCTCTAGAGCGCTCATT
GCCAGAAACATTACAAAGAGAATAGTTGCAAAGGATTTGAGAAATTCCATTTTGTTTAGA
TAATATATTTGC

QA 1 492 1 492
DS 



CO CL1Contig29 646 5 3 U
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CTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTT
TTTTTTTTTTTTGGTGAAATTAAATTTTTCTCTTTGGCTATCTGAAAAGCTGATAGTTGA
TCGAACAAAAAGAGAGAGGGGAATGGATATTTGAAACAAGCAAAAACAGCGCTAATAGTC
TTTAAGTTCCTTTATGGTGGCAATGGTTAAACACTTATCAGTACGACCGAAGTCATTAAA
CAAAAGAAACATTTAACTTAAAATCACATCCTCCACAGCAAAAATGACCAAACAGCACAA
CCCTTCTCTCTCTCCATCTATCGTTGTCTCTTCCTCCTCCGCGTTATCTGCGGGAACTGG
AGAGGAACCGGCAACGTCGCAAAACGAATCGAGTTCTCAACCGAGAATTTACACCCAAGG
TTCTCAAAATGCCTCCTCACATCCATCGAGCTCATCCTCAGATCCTTTGCAATGTCTTCA
AAGTCGGTCTTGAACTTATCCACGTGAAGGCTGAGCACAAGAACGTAGCTTATCACCCCC
GGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1BS91JQ U 318
AF RS1A285JQ U 133
AF RS1A285TR U 176
AF RS1A285TF C 1
AF RS1A285TV C 1
BS 1 132 RS1A285TF
BS 133 597 RS1A285JQ
BS 598 646 RS1A285TF

RD RS1BS91JQ 202 0 0
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CTATCGTTGTCTCTTCCTCCTCCGCGTTATCTGCGGGAACTGGAGAGGAACCGGCAACGT
CGCAAAGCGAATCGAGTTCTCAACCGAGAATTTACACCCAAGGTTCTCAAAATGCCTCCT
CACATCCATCGAGCTCATCCTC

QA 1 202 1 202
DS 

RD RS1A285JQ 465 0 0
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AGAGAGGGGAATGGATATTTGAAACAAGCAAAAACAGCGCTAATAGTCTTTAAGTTCCTT
TATGGTGGCAATGGTTAAACACTTATCAGTACGACCGAAGTCATTAAACAAAAGAAACAT
TTAACTTAAAATCACATCCTCCACAGCAAAAATGACCAAACAGCACAACCCTTCTCTCTC
TCCATCTATCGTTGTCTCTTCCTCCTCCGCGTTATCTGCGGGAACTGGAGAGGAACCGGC
AACGTCGCAAAACGAATCGAGTTCTCAACCGAGAATTTACACCCAAGGTTCTCAAAATGC
CTCCTCACATCCATCGAGCTCATCCTCAGATCCTTTGCAATGTCTTCAAAGTCGGTCTTG
AACTTATCCACGTGAAGGCTGAGCACAAGAACGTAGCTTATCACC

QA 1 465 1 465
DS 

RD RS1A285TR 422 0 0
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TAGTCTTTAAGTTCCTTTATGGTGGCAATGGTTAAACACTTATCAGTACGACCGAAGTCA
TTAAACAAAAGAAACATTTAACTTAAAATCACATCCTCCACAGCAAAAATGACCAAACAG
CACAACCCTTCTCTCTCTCCATCTATCGTTGTCTCTTCCTCCTCCGCGTTATCTGCGGGA
ACTGGAGAGGAACCGGCAACGTCGCAAAACGAATCGAGTTCTCAACCGAGAATTTACACC
CAAGGTTCTCAAAATGCCTCCTCACATCCATCGAGCTCATCCTCAGATCCTTTGCAATGT
CTTCAAAGTCGGTCTTGAACTTATCCACGTGAAGGCTGAGCACAAGAACGTAGCTTATCA
CC

QA 1 422 1 422
DS 

RD RS1A285TF 646 0 0
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CTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTT
TTTTTTTTTTTTGGTGAAATTAAATTTTTCTCTTTGGCTATCTGAAAAGCTGATAGTTGA
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CAAAAGAAACATTTAACTTAAAATCACATCCTCCACAGCAAAAATGACCAAACAGCACAA
CCCTTCTCTCTCTCCATCTATCGTTGTCTCTTCCTCCTCCGCGTTATCTGCGGGAACTGG
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AAGTCGGTCTTGAACTTATCCACGTGAAGGCTGAGCACAAGAACGTAGCTTATCACCCCC
GGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 646 1 646
DS 

RD RS1A285TV 646 0 0
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CTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTT
TTTTTTTTTTTTGGTGAAATTAAATTTTTCTCTTTGGCTATCTGAAAAGCTGATAGTTGA
TCGAACAAAAAGAGAGAGGGGAATGGATATTTGAAACAAGCAAAAACAGCGCTAATAGTC
TTTAAGTTCCTTTATGGTGGCAATGGTTAAACACTTATCAGTACGACCGAAGTCATTAAA
CAAAAGAAACATTTAACTTAAAATCACATCCTCCACAGCAAAAATGACCAAACAGCACAA
CCCTTCTCTCTCTCCATCTATCGTTGTCTCTTCCTCCTCCGCGTTATCTGCGGGAACTGG
AGAGGAACCGGCAACGTCGCAAAACGAATCGAGTTCTCAACCGAGAATTTACACCCAAGG
TTCTCAAAATGCCTCCTCACATCCATCGAGCTCATCCTCAGATCCTTTGCAATGTCTTCA
AAGTCGGTCTTGAACTTATCCACGTGAAGGCTGAGCACAAGAACGTAGCTTATCACCCCC
GGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 646 1 646
DS 



CO CL1Contig30 859 6 3 U
CACTAGTCATGACCAGGATCTCCTAGGAAACAGCTATGACCATGTTCACTTACTACTGGG
CCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTTTTTTT
TTTTTTTTCAAGCCAAAGAAACATTCAGTTTACATTTGAAGAAAAAAGAGCTGATTATGT
ATCTTGGAATCATAGCAATATTTGCACAGCAAACACTGTCACAGCTACAACTTAAAGAGA
AGTTTGGCGAAATTCATACAAATTATTCTCAGGAAGAAGACTTCTTCCTAAATCGAAAAT
ACAATACTGGAAAAGTCAAAAAGACTTATGCAAGAACTTGGTAGCATGACATAGCCAGTA
GAGAAAACAATCATCAGCCTCAAAAGTAGTTGCTGGTGTAGAAGTTCTTGAGAAAATCAG
ACTTCCCTTGATCCTTGCTTCCGGTATTCTGGACGAGCCCTTCACCCACAACGTATTGAC
CAATAATGTGGTGACGCTGCTTTGCGTGATCCACTATGTCAGTCGGCTCTTCCATTCCTT
TGAATAGAAGAAGATCAATCACCTTAGGATCGGTGACGTGAGCGTTTTTACGAATCTGAG
CAGAGATTGCAAAACGTAGCTGAGAAGGGGCGACGACGTCTTGTAGATTATAAATGTCCA
TGATGGTGGGGATGGATCTACATGCAGCTCTGAAGTAATCGAAAACACGGCGGCGAGCTT
CAGTCAGGTTAGCTGAGTTCGGCGGAACTCCGATCTTCCTCAACGTGAAAGGTGCTGCCA
TCTGATCTACGCTTGCTTTAATCGCCCTCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCAT
ATGTCCGGTACCGTCGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1CU22JQ U 187
AF RS1A289JQ U 129
AF RS1CU22TF C 166
AF RS1A289TR U 133
AF RS1A289TV C 1
AF RS1A289TF C 129
BS 1 132 RS1A289TV
BS 133 810 RS1A289JQ
BS 811 859 RS1A289TV

RD RS1CU22JQ 412 0 0
GAATCATAGCAATATTTGCACAGCAAACACTGTCACAGCTACAACTTAAAGAGAGGTTTG
GCGAAATTCATACAAATTATTCTCAGGAAAAAAACTTCTTCCTAAATCGAAAATACAATA
CTGGAAAAGTCAAAAAAACTTATGCAAGAACTTGGTAGCATGACATAGCCAGTAAAGAAA
ACAATCATCAGCCTCAAAAGTAGTTGCTGGTGTAAAAGTTCTTGAAAAAATCAAACTTCC
CTTGATCCTTGCTTCCGGTATTCTGGACGAGCCCTTCACCCACAACGTATTGACCAATAA
TGTGGTGACCCTGCTTTGCGTGATCCACTATGTCAGTCAGCTCTTCCATTCCTTTGAATA
AAAAAAAATCAATCACCTTAGGATCGGTGACGTGAGCGTTTTTACGAATCTG

QA 1 412 1 412
DS 

RD RS1A289JQ 682 0 0
CAAG
CCAAAGAAACATTCAGTTTACATTTGAAGAAAAAAGAGCTGATTATGTATCTTGGAATCA
TAGCAATATTTGCACAGCAAACACTGTCACAGCTACAACTTAAAGAGAAGTTTGGCGAAA
TTCATACAAATTATTCTCAGGAAGAAGACTTCTTCCTAAATCGAAAATACAATACTGGAA
AAGTCAAAAAGACTTATGCAAGAACTTGGTAGCATGACATAGCCAGTAGAGAAAACAATC
ATCAGCCTCAAAAGTAGTTGCTGGTGTAGAAGTTCTTGAGAAAATCAGACTTCCCTTGAT
CCTTGCTTCCGGTATTCTGGACGAGCCCTTCACCCACAACGTATTGACCAATAATGTGGT
GACGCTGCTTTGCGTGATCCACTATGTCAGTCGGCTCTTCCATTCCTTTGAATAGAAGAA
GATCAATCACCTTAGGATCGGTGACGTGAGCGTTTTTACGAATCTGAGCAGAGATTGCAA
AACGTAGCTGAGAAGGGGCGACGACGTCTTGTAGATTATAAATGTCCATGATGGTGGGGA
TGGATCTACATGCAGCTCTGAAGTAATCGAAAACACGGCGGCGAGCTTCAGTCAGGTTAG
CTGAGTTCGGCGGAACTCCGATCTTCCTCAACGTGAAAGGTGCTGCCATCTGATCTACGC
TTGCTTTAATCGCCCTCC

QA 5 682 5 682
DS 

RD RS1CU22TF 645 0 0
AAGAGCTGATTATGTATCTTGGAATCATAGCAATATTTGCACAGCAAACACTGTCACAGC
TACAACTTAAAGAGAGGTTTGGCGAAATTCATACAAATTATTCTCAGGAAGAAGACTTCT
TCCTAAATCGAAAATACAATACTGGAAAAGTCAAAAAGACTTATGCAAGAACTTGGTAGC
ATGACATAGCCAGTAGAGAAAACAATCATCAGCCTCAAAAGTAGTTGCTGGTGTAGAAGT
TCTTGAGAAAATCAGACTTCCCTTGATCCTTGCTTCCGGTATTCTGGACGAGCCCTTCAC
CCACAACGTATTGACCAATAATGTGGTGACGCTGCTTTGCGTGATCCACTATGTCAGTCA
GCTCTTCCATTCCTTTGAATAGAAGAAGATCAATCACCTTAGGATCGGTGACGTGAGCGT
TTTTACGAATCTGAGCAGAGATTGCAAAACGTAGCTGAGAAGGGGCGACGACGTCTTGTA
GATTATAAATGTCCATGATGGTGGGGATGGATCTACATGCAGCTCTGAAGTAATCGAAAA
CACGGCGGCGAGCTTCAGTCAGGTTAGCTGAGTTCGGCGGAACTCCGATCTTCCTCAACG
TGAAAGGTGCTGCCATCTGATCTACGCTTGCTTTAATCGCTCTCC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1A289TR 678 0 0
CCAAAGAAACATTCAGTTTACATTTGAAGAAAAAAGAGCTGATTATGTATCTTGGAATCA
TAGCAATATTTGCACAGCAAACACTGTCACAGCTACAACTTAAAGAGAAGTTTGGCGAAA
TTCATACAAATTATTCTCAGGAAGAAGACTTCTTCCTAAATCGAAAATACAATACTGGAA
AAGTCAAAAAGACTTATGCAAGAACTTGGTAGCATGACATAGCCAGTAGAGAAAACAATC
ATCAGCCTCAAAAGTAGTTGCTGGTGTAGAAGTTCTTGAGAAAATCAGACTTCCCTTGAT
CCTTGCTTCCGGTATTCTGGACGAGCCCTTCACCCACAACGTATTGACCAATAATGTGGT
GACGCTGCTTTGCGTGATCCACTATGTCAGTCGGCTCTTCCATTCCTTTGAATAGAAGAA
GATCAATCACCTTAGGATCGGTGACGTGAGCGTTTTTACGAATCTGAGCAGAGATTGCAA
AACGTAGCTGAAAAGGGGCGACGACGTCTTGTAGATTATAAATGTCCATGATGGTGGGGA
TGGATCTACATGCAGCTCTGAAGTAATCGAAAACACGGCGGCGAGCTTCAGTCAGGTTAG
CTGAGTTCGGCGGAACTCCGATCTTCCTCAACGTGAAAGGTGCTGCCATCTGATCTACGC
TTGCTTTAATCGCCCTCC

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1A289TV 859 0 0
CACTAGTCATGACCAGGATCTCCTAGGAAACAGCTATGACCATGTTCACTTACTACTGGG
CCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTTTTTTT
TTTTTTTTCAAGCCAAAGAAACATTCAGTTTACATTTGAAGAAAAAAGAGCTGATTATGT
ATCTTGGAATCATAGCAATATTTGCACAGCAAACACTGTCACAGCTACAACTTAAAGAGA
AGTTTGGCGAAATTCATACAAATTATTCTCAGGAAGAAGACTTCTTCCTAAATCGAAAAT
ACAATACTGGAAAAGTCAAAAAGACTTATGCAAGAACTTGGTAGCATGACATAGCCAGTA
GAGAAAACAATCATCAGCCTCAAAAGTAGTTGCTGGTGTAGAAGTTCTTGAGAAAATCAG
ACTTCCCTTGATCCTTGCTTCCGGTATTCTGGACGAGCCCTTCACCCACAACGTATTGAC
CAATAATGTGGTGACGCTGCTTTGCGTGATCCACTATGTCAGTCGGCTCTTCCATTCCTT
TGAATAGAAGAAGATCAATCACCTTAGGATCGGTGACGTGAGCGTTTTTACGAATCTGAG
CAGAGATTGCAAAACGTAGCTGAGAAGGGGCGACGACGTCTTGTAGATTATAAATGTCCA
TGATGGTGGGGATGGATCTACATGCAGCTCTGAAGTAATCGAAAACACGGCGGCGAGCTT
CAGTCAGGTTAGCTGAGTTCGGCGGAACTCCGATCTTCCTCAACGTGAAAGGTGCTGCCA
TCTGATCTACGCTTGCTTTAATCGCCCTCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCAT
ATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 859 1 859
DS 

RD RS1A289TF 731 0 0
CAAG
CCAAAGAAACATTCAGTTTACATTTGAAGAAAAAAGAGCTGATTATGTATCTTGGAATCA
TAGCAATATTTGCACAGCAAACACTGTCACAGCTACAACTTAAAGAGAAGTTTGGCGAAA
TTCATACAAATTATTCTCAGGAAGAAGACTTCTTCCTAAATCGAAAATACAATACTGGAA
AAGTCAAAAAGACTTATGCAAGAACTTGGTAGCATGACATAGCCAGTAGAGAAAACAATC
ATCAGCCTCAAAAGTAGTTGCTGGTGTAGAAGTTCTTGAGAAAATCAGACTTCCCTTGAT
CCTTGCTTCCGGTATTCTGGACGAGCCCTTCACCCACAACGTATTGACCAATAATGTGGT
GACGCTGCTTTGCGTGATCCACTATGTCAGTCGGCTCTTCCATTCCTTTGAATAGAAGAA
GATCAATCACCTTAGGATCGGTGACGTGAGCGTTTTTACGAATCTGAGCAGAGATTGCAA
AACGTAGCTGAGAAGGGGCGACGACGTCTTGTAGATTATAAATGTCCATGATGGTGGGGA
TGGATCTACATGCAGCTCTGAAGTAATCGAAAACACGGCGGCGAGCTTCAGTCAGGTTAG
CTGAGTTCGGCGGAACTCCGATCTTCCTCAACGTGAAAGGTGCTGCCATCTGATCTACGC
TTGCTTTAATCGCCCTCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACC
GTCGACT

QA 5 731 5 731
DS 



CO CL1Contig31 479 3 1 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGATGCGGAGCT
GAGAGTTGATGGAGATGGGAAGGCTTATGTTACGGATAATAGTAATTATATTATTGATTT
GTATTTTAAGGAGCCGTTGAAGGATGGGTTCGCTGCAGGGAGGGAGATCGGGAAGTTTGA
AGGTGTGGTGGAGCATGGTTTGTTTCTTGGTATGGCTACGAGTGTGATTATCGCCGGGAA
GAATGGTGTTCAAGTTATGAACAAGTGAGGAAGTTGTTTGAAAGCTTTTTTTTTCTCCTT
TGTAAAATTTCAAAATAAGAACTCCTTTTTAATTTCGAAACGAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAGGCCGCCTCGGCCCTCGAGAAGCTTTCTAGACCATTCGTTTGGCGCGCGGGCCCAGT
AGGTAAGTGAACATGGTCATAGCTGTTTCCTAGGAGATCCTGGTCATGACTAGTGCTTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A324JQ C 50
AF RS1A324TF U 1
AF RS1A324TV U 1
BS 1 479 RS1A324TF

RD RS1A324JQ 293 0 0
GATGCGGAGCTGAGAGTTGATGGAGATGGGAAGGCTTATGTTACGGATAATAGTAATTAT
ATTATTGATTTGTATTTTAAGGAGCCGTTGAAGGATGGGTTCGCTGCAGGGAGGGAGATC
GGGAAGTTTGAAGGTGTGGTGGAGCATGGTTTGTTTCTTGGTATGGCTACGAGTGTGATT
ATCGCCGGGAAGAATGGTGTTCAAGTTATGAACAAGTGAGGAAGTTGTTTGAAAGCTTTT
TTTTTCTCCTTTGTAAAATTTCAAAATAAGAACTCCTTTTTAATTTCGAAACG

QA 1 293 1 293
DS 

RD RS1A324TF 479 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGATGCGGAGCT
GAGAGTTGATGGAGATGGGAAGGCTTATGTTACGGATAATAGTAATTATATTATTGATTT
GTATTTTAAGGAGCCGTTGAAGGATGGGTTCGCTGCAGGGAGGGAGATCGGGAAGTTTGA
AGGTGTGGTGGAGCATGGTTTGTTTCTTGGTATGGCTACGAGTGTGATTATCGCCGGGAA
GAATGGTGTTCAAGTTATGAACAAGTGAGGAAGTTGTTTGAAAGCTTTTTTTTTCTCCTT
TGTAAAATTTCAAAATAAGAACTCCTTTTTAATTTCGAAACGAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAGGCCGCCTCGGCCCTCGAGAAGCTTTCTAGACCATTCGTTTGGCGCGCGGGCCCAGT
AGGTAAGTGAACATGGTCATAGCTGTTTCCTAGGAGATCCTGGTCATGACTAGTGCTTG

QA 1 479 1 479
DS 

RD RS1A324TV 479 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGATGCGGAGCT
GAGAGTTGATGGAGATGGGAAGGCTTATGTTACGGATAATAGTAATTATATTATTGATTT
GTATTTTAAGGAGCCGTTGAAGGATGGGTTCGCTGCAGGGAGGGAGATCGGGAAGTTTGA
AGGTGTGGTGGAGCATGGTTTGTTTCTTGGTATGGCTACGAGTGTGATTATCGCCGGGAA
GAATGGTGTTCAAGTTATGAACAAGTGAGGAAGTTGTTTGAAAGCTTTTTTTTTCTCCTT
TGTAAAATTTCAAAATAAGAACTCCTTTTTAATTTCGAAACGAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAGGCCGCCTCGGCCCTCGAGAAGCTTTCTAGACCATTCGTTTGGCGCGCGGGCCCAGT
AGGTAAGTGAACATGGTCATAGCTGTTTCCTAGGAGATCCTGGTCATGACTAGTGCTTG

QA 1 479 1 479
DS 



CO CL1Contig32 720 4 7 U
CAAGCACTAGTCATGACCAGGATCTCCTAGGAAACAGCTATGACCATGTTCACTTACCTA
CTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTT
TTTTTTTTTTTTTTTGAAGTTGAAGAACAATACATATCATAAACACCTAAATTTTGTAGT
TAAAACAATGTATGATGAAAACAGAAAATAAAATTCCCACAAAAGCAAACATATGATGTA
CATTCTCAACACAACCCACAAACACTAACTATAAAGATAGATGGTGAAACATTGTAGAGT
GATGATCATCAATGGCCTTCTTTGCTTCCACCACATGATCATTCAATCATCTTTTCCACT
CTACAGGAGTTGTCTTCCCGTTAAGAAGAGGCTGGATAGAGTTCTCAACTACAGGATTAT
GCACTTTCCTCAACCCACGTTTCACTTTCTCTAGATCAACTTGAGGACTCTCCGCTGCTC
CTGGTGGTAGTTCTAAAGACTGGCTTGTAGAAAACTTGCGGAAGCTGGTGCGTTTCGGTT
TCTCGGACTCGAATGATGTCTGTGCATCAGAGGGATTGTCGAGAACCTTGCGAACACTCT
TCTTTGGTTTACCATAATCTCCCTCGACGACTATCTGAGAGTTACTGGCAAACTTCTTCT
GAGTTTTCTTCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A333TF C 1
AF RS1A333JQ U 136
AF RS1A333TR U 133
AF RS1A333TV C 1
BS 1 135 RS1A333TF
BS 136 638 RS1A333JQ
BS 639 639 RS1A333TR
BS 640 671 RS1A333JQ
BS 672 708 RS1A333TF
BS 709 709 RS1A333TV
BS 710 720 RS1A333TF

RD RS1A333TF 720 0 0
CAAGCACTAGTCATGACCAGGATCTCCTAGGAAACAGCTATGACCATGTTCACTTACCTA
CTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTT
TTTTTTTTTTTTTTTGAAGTTGAAGAACAATACATATCATAAACACCTAAATTTTGTAGT
TAAAACAATGTATGATGAAAACAGAAAATAAAATTCCCACAAAAGCAAACATATGATGTA
CATTCTCAACACAACCCACAAACACTAACTATAAAGATAGATGGTGAAACATTGTAGAGT
GATGATCATCAATGGCCTTCTTTGCTTCCACCACATGATCATTCAATCATCTTTTCCACT
CTACAGGAGTTGTCTTCCCGTTAAGAAGAGGCTGGATAGAGTTCTCAACTACAGGATTAT
GCACTTTCCTCAACCCACGTTTCACTTTCTCTAGATCAACTTGAGGACTCTCCGCTGCTC
CTGGTGGTAGTTCTAAAGACTGGCTTGTAGAAAACTTGCGGAAGCTGGTGCGTTTCGGTT
TCTCGGACTCGAATGATGTCTGTGCATCAGAGGGATTGTCGAGAACCTTGCGAACACTCT
TCTTTGGTTTACCATAATCTCCCTCGACGACTATCTGAGAGTTACTGGCAAACTTCTTCT
GAGTTTTCTTCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCG*TACCGTCGACT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RS1A333JQ 536 0 0
GAAGTTGAAGAACAATACATATCATAAACACCTAAATTTTGTAGTTAAAACAATGTATGA
TGAAAACAGAAAATAAAATTCCCACAAAAGCAAACATATGATGTACATTCTCAACACAAC
CCACAAACACTAACTATAAAGATAGATGGTGAAACATTGTAGAGTGATGATCATCAATGG
CCTTCTTTGCTTCCACCACATGATCATTCAATCATCTTTTCCACTCTACAGGAGTTGTCT
TCCCGTTAAGAAGAGGCTGGATAGAGTTCTCAACTACAGGATTATGCACTTTCCTCAACC
CACGTTTCACTTTCTCTAGATCAACTTGAGGACTCTCCGCTGCTCCTGGTGGTAGTTCTA
AAGACTGGCTTGTAGAAAACTTGCGGAAGCTGGTGCGTTTCGGTTTCTCGGACTCGAATG
ATGTCTGTGCATCAGAGGGATTGTCGAGAACCTTGCGAACACTCTTCTTTGGTTTACCAT
AATCTCCCTCGACGACTATCTGAAAGTTACTGGCAAACTTCTTCTGAGTTTTCTTC

QA 1 536 1 536
DS 

RD RS1A333TR 539 0 0
TTT
GAAGTTGAAGAACAATACATATCATAAACACCTAAATTTTGTAGTTAAAACAATGTATGA
TGAAAACAGAAAATAAAATTCCCACAAAAGCAAACATATGATGTACATTCTCAACACAAC
CCACAAACACTAACTATAAAGATAGATGGTGAAACATTGTAGAGTGATGATCATCAATGG
CCTTCTTTGCTTCCACCACATGATCATTCAATCATCTTTTCCACTCTACAGGAGTTGTCT
TCCCGTTAAGAAGAGGCTGGATAGAGTTCTCAACTACAGGATTATGCACTTTCCTCAACC
CACGTTTCACTTTCTCTAGATCAACTTGAGGACTCTCCGCTGCTCCTGGTGGTAGTTCTA
AAGACTGGCTTGTAGAAAACTTGCGGAAGCTGGTGCGTTTCGGTTTCTCGGACTCGAATG
ATGTCTGTGCATCAGAGGGATTGTCGAGAACCTTGCGAACACTCTTCTTTGGTTTACCAT
AATCTCCCTCGACGACTATCTGAGAGTTACTGGCAAACTTCTTCTGAGTTTTCTTC

QA 4 539 4 539
DS 

RD RS1A333TV 720 0 0
CAAGCACTAGTCATGACCAGGATCTCCTAGGAAACAGCTATGACCATGTTCACTTACCTA
CTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTT
TTTTTTTTTTTTTTTGAAGTTGAAGAACAATACATATCATAAACACCTAAATTTTGTAGT
TAAAACAATGTATGATGAAAACAGAAAATAAAATTCCCACAAAAGCAAACATATGATGTA
CATTCTCAACACAACCCACAAACACTAACTATAAAGATAGATGGTGAAACATTGTAGAGT
GATGATCATCAATGGCCTTCTTTGCTTCCACCACATGATCATTCAATCATCTTTTCCACT
CTACAGGAGTTGTCTTCCCGTTAAGAAGAGGCTGGATAGAGTTCTCAACTACAGGATTAT
GCACTTTCCTCAACCCACGTTTCACTTTCTCTAGATCAACTTGAGGACTCTCCGCTGCTC
CTGGTGGTAGTTCTAAAGACTGGCTTGTAGAAAACTTGCGGAAGCTGGTGCGTTTCGGTT
TCTCGGACTCGAATGATGTCTGTGCATCAGAGGGATTGTCGAGAACCTTGCGAACACTCT
TCTTTGGTTTACCATAATCTCCCTCGACGACTATCTGAGAGTTACTGGCAAACTTCTTCT
GAGTTTTCTTCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 720 1 720
DS 



CO CL1Contig33 687 2 1 U
CCATTACGGCCGGGGGAACACATTCAACTCTCTCCTCTAATTTTAAATAAGAATACAAAG
ATGGAGTTCTCAAAAATCCTTTTGTTAGTGATTTCTCTTGTGGCTGCAACTTGTTTCTTG
CAAGCCAAGGCAGCTGGTGTTTACTGTAGCAACCCTTACTCTAGGTGCTACTACAAGTAC
ATTCAATGTCCAGAAGAATGTCCAAGCACAACCGCTATGAACTCAAAGAACAAAGTTTGC
TACGCCGATTGCGATAGTCCCACTTGCAAATCCCATTGCCGCATGAGGAAACCGAACTGC
AACAAACCTGGATCGGCTTGTTATGACCCTAGGTTCATTGGAGGAGACGGCACTGTGTTC
TACTTCCATGGAAAAAGCAATGAAGAGTTCAGCCTCGTCTCTGACTCTGACATTCAGATC
AATGGTAGGTTCATTGGCCACAGACCCGCTGGTCGCGCCAGAGACTTTACATGGATTCAA
GCTCTCGGATTCCTCTTCAACTCCCACAAATTCTCTCTCGATGCCGCTAAATCCGCCACA
TGGGACAGTGAAGTAGACCATCTCAAGTTCTCTTTCGACGGCCAAGATCTATCTGTCCCC
GAAGAAACTCTTGCCACCTGGTATTCACCAGACAAAGACATCAAGATCGAGAGAGTGACT
TTGAGAAACAGCGTGATCGTGACAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1A350TV U 1
AF RS1A350JQ C 15
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RD RS1A350TV 687 0 0
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TACGCCGATTGCGATAGTCCCACTTGCAAATCCCATTGCCGCATGAGGAAACCGAACTGC
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TACTTCCATGGAAAAAGCAATGAAGAGTTCAGCCTCGTCTCTGACTCTGACATTCAGATC
AATGGTAGGTTCATTGGCCACAGACCCGCTGGTCGCGCCAGAGACTTTACATGGATTCAA
GCTCTCGGATTCCTCTTCAACTCCCACAAATTCTCTCTCGATGCCGCTAAATCCGCCACA
TGGGACAGTGAAGTAGACCATCTCAAGTTCTCTTTCGACGGCCAAGATCTATCTGTCCCC
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TTGAGAAACAGCGTGATCGTGACAATC

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DS 

RD RS1A350JQ 673 0 0
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AATCCTTTTGTTAGTGATTTCTCTTGTGGCTGCAACTTGTTTCTTGCAAGCCAAGGCAGC
TGGTGTTTACTGTAGCAACCCTTACTCTAGGTGCTACTACAAGTACATTCAATGTCCAGA
AGAATGTCCAAGCACAACCGCTATGAACTCAAAGAACAAAGTTTGCTACGCCGATTGCGA
TAGTCCCACTTGCAAATCCCATTGCCGCATGAGGAAACCGAACTGCAACAAACCTGGATC
GGCTTGTTATGACCCTAGGTTCATTGGAGGAGACGGCACTGTGTTCTACTTCCATGGAAA
AAGCAATGAAGAGTTCAGCCTCGTCTCTGACTCTGACATTCAGATCAATGGTAGGTTCAT
TGGCCACAGACCCGCTGGTCGCGCCAGAGACTTTACATGGATTCAAGCTCTCGGATTCCT
CTTCAACTCCCACAAATTCTCTCTCGATGCCGCTAAATCCGCCACATGGGACAGTGAAGT
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GATCGTGACAATC

QA 1 673 1 673
DS 



CO CL1Contig34 772 15 25 U
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CTTTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAAAAAAATAAACC
TCATGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCCTAATGTAAGAAGTTTATATTTA
ACTTCGAAATTTGTTAAGCTTTCTAGACCATTCGTTTGGCGCGCGGGCCCAGTAGGTAAG
TGAACATGGTCATAGCTGTTTCCTAGGAGATCCTGGTCATGACTAGTGCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 50 50 50 50 50 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 25 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 30 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
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55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 35 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 80 80 80 80 80 80 30 35 35 10 10 10 25 25 10 25 25 10 10 10 10 25 10 25 10 10 10 10 10 25 
10 25 25 25 10 10 10 10 25 10 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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G
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TG

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ATCTCACTCCTGACAGAGAGGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGCGCATCTGTCTTCCTTTGT
TATTTAATTTTCTTTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAA
AAAAATAAACCTCATGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCC
C

QA 1 589 1 589
DS 

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AGAGATGGCAGGAATCATCAACAAGATCGGAGATGCTCTCCATATCGGAGGAGGCCACAA
GGAAGATGAGCACAAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAAGAAACACGCCGACGA
GCACAAGAGTGGTGAGCACAAAGAAGGTATCGTTGACAAGATCAAAGACAAGATCCACGG
TGGAGAAGGCCACAGCAGCGGAGACCACAAACACGATGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGA
CAAGAAGGAGAAGAAACACCATGACGATGGTCACCACAGCAGCAGCAGTGACAGCGACAG
CGATTAAG*GCAAGGAGGATGTGAGGAGGACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATC
ATCTCACTCCTGACAGAGAGGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGCGCATCTGTCTTCCTTTGT
TATCTAATTTTCTTTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAA
AAAAATAAACCTCATGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCC
C

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1A356JQ 590 0 0
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AGAGATGGCAGGAATCATCAACAAGATCGGAGATGCTCTCCATATCGGAGGAGGCCACAA
GGAAGATGAGCACAAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAAGAAACACGCCGACGA
GCACAAGAGTGGTGAGCGCAAAGAAGGTATCGTTGACAAGATCAAAGACAAGATCCACGG
TGGAGAAGGCCACAGCAGCGGAGACCACAAACACGATGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGA
CAAGAAGGAGAAGAAACACCATGACGATGGTCACCACAGCAGCAGCAGTGACAGCGACAG
CGATTAAG*GCAAGGAGGATGTGAGGAGGACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATC
ATCTCACTCCTGACAGAGAGGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCTGTCTTCCTTTGT
TATCTAATTTTCTTTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAA
AAAAATAAACCTCATGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCC
G

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1GT17TF 249 0 0
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AAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATCATCTCACTCCTGACAGAGAGGGGTGAATGGAAAA
AGAAGAGTGCATCTGTCTTCCTTTGTTATCTAATTTTCTTTTAACTGTCATTTTCACCTC
TTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAAAAAAATAAACCTCATGTATCGTAATCTATATTAA
TAAAATCGA

QA 1 249 1 249
DS 

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AAAGCAATTAACAACCATAAAGAGATATTTAAATTAGAAAAA**AGAAAGAGATCAGAGA
TGGCAGGAATCATCAACAAGATCGGAGATGCTCTCCATATCGGAGGAGGCCACAAGGAAG
ATGAGCACAAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAAGAAACACGCCGACGAGCACA
AGAGTGGTGAGCGCAAAGAAGGTATCGTTGACAAGATCAAAGACAAGATCCACGGTGGAG
AAGGCCACAGCAGCGGAGACCACAAACACGATGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGACAAGA
AGGAGAAGAAACACCATGACGATGGTCACCACAGCAGCAGCAGTGACAGCGACAGCGATT
AAGAGCAAGGAGGATGTGAGGAGGACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATCATCTC
ACTCCTGACAGAGAGGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCTGTCTTCCTTTGTTATCT
AATTTTCTTTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAAAAAAA
TAAACCTCATGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCC
G

QA 1 584 1 584
DS 

RD RS1A356TR 589 0 0
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AGAGATGGCAGGAATCATCAACAAGATCGGAGATGCTCTCCATATCGGAGGAGGCCACAA
GGAAGATGAGCACAAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAAGAAACACGCCGACGA
GCACAAGAGTGGTGAGCGCAAAGAAGGTATCGTTGACAAGATCAAAGACAAGATCCACGG
TGGAGAAGGCCACAGCAGCGGAGACCACAAACACGATGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGA
CAAGAAGGAGAAGAAACACCATGACGATGGTCACCACAGCAGCAGCAGTGACAGCGACAG
CGATTAAG*GCAAGGAGGATGTGAGGAGGACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATC
ATCTCACTCCTGACAGAGAGGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCTGTCTTCCTTTGT
TATCTAATTTTCTTTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAA
AAAAATAAACCTCATGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCC

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1E619JQ 626 0 0
GGATCAAAGCAATTAACAACCATAAAGAGATATTTAAATTAGAAAAAA*AGAAAGAGATC
AGAGATGGCAGGAATCATCAACAAGA*CGGATATGCTCTCCATATCGGAGGAGTCCACAA
GGAAGATGAGCACAAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAAGAAACACGCCGACGA
GCACAAGAGTGGTGAGCACAAAGAAGGTATCGTTGACAAGATCAAAGACAAGATCCACGG
TGGAGAAGGCCACAGCAGCGGAGACCACAAACACGATGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGA
CAAGAAGGAGAAGAAACACCATGACGATGGTCACCACAGCAGCAGCAGTGACAGCGACAG
CGATTAAG*GCAAGGAGGATGTGAGGAGGACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATC
ATCTCACTCCTGACAGAGAGGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCTGTCTTCCTTTGT
TATCTAATTTTCTTTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAA
AAAAATAAACCTCATGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCCTAATGTAAGAA
GTTTATATTTAACTTCGAAATTTGTT

QA 1 626 1 626
DS 

RD RS1E619TF 626 0 0
GGATCAAAGCAATTAACAACCATAAAGAGATATTTAAATTAGAAAAAA*AGAAAGAGATC
AGAGATGGCAGGAATCATCAACAAGA*CGGATATGCTCTCCATATCGGAGGAGTCCACAA
GGAAGATGAGCACAAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAAGAAACACGCCGACGA
GCACAAGAGTGGTGAGCACAAAGAAGGTATCGTTGACAAGATCAAAGACAAGATCCACGG
TGGAGAAGGCCACAGCAGCGGAGACCACAAACACGATGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGA
CAAGAAGGAGAAGAAACACCATGACGATGGTCACCACAGCAGCAGCAGTGACAGCGACAG
CGATTAAG*GCAAGGAGGATGTGAGGAGGACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATC
ATCTCACTCCTGACAGAGAGGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCTGTCTTCCTTTGT
TATCTAATTTTCTTTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAA
AAAAATAAACCTCATGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCCTAATGTAAGAA
GTTTATATTTAACTTCGAAATTTGTT

QA 1 626 1 626
DS 

RD RS1A356TV 772 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGATCAAAGCA
ATTAACAACCATAAAGAGATATTTAAATTAGAAAAA**AGAAAGAGATCAGAGATGGCAG
GAATCATCAACAAGATCGGAGATGCTCTCCATATCGGAGGAGGCCACAAGGAAGATGAGC
ACAAGAAAGAGGAGCACAAGAAAGAGGAACACAAGAAACACGCCGACGAGCACAAGAGTG
GTGAGCGCAAAGAAGGTATCGTTGACAAGATCAAAGACAAGATCCACGGTGGAGAAGGCC
ACAGCAGCGGAGACCACAAACACGATGGTGAGAAGAAAAAGAAGAAGGACAAGAAGGAGA
AGAAACACCATGACGATGGTCACCACAGCAGCAGCAGTGACAGCGACAGCGATTAAG*GC
AAGGAGGATGTGAGGAGGACTATAAATGCTGCTGTTGTCTGTTCCTATCATCTCACTCCT
GACAGAGAGGGGTGAATGGAAAAAGAAGAGTGCATCTGTCTTCCTTTGTTATCTAATTTT
CTTTTAACTGTCATTTTCACCTCTTATGTTTTATGTTATCTTGTCAGAAAAAAATAAACC
TCATGTATCGTAATCTATATTAATAAAATCGAGTTTCCGAAA**AAAAAAAAAAAAGGCC
GCCTCGGCCCTCGAGAAGCTTTCTAGACCATTCGTTTGGCGCGCGGGCCCAGTAGGTAAG
TGAACATGGTCATAGCTGTTTCCTAGGAGATCCTGGTCATGACTAGTGCTTG

QA 1 772 1 772
DS 



CO CL1Contig35 754 4 5 U
CAAGCACTAGTCATGACCAGGATCTCCTAGGAAACAGCTATGACCATGTTCACTTACCTA
CTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTT
TTTTTTTTTTTTTTCCAAGGAACATTGATTTATTCTTAAGAAATCACAAAGAGAGTGACA
GTAAAACATGAAGGAAACATCGTTTTAGAGGATTACATGCATCACTATTATACATAGACG
ATATAAACAACCCAAGAAAATCATATTTTTGAGGAATATAACGACCAACAGATGATAAGA
GATCACGATTGTACTTTCCGGGCAATAAGCAAATATGAAGATTACATGCTTGGCCTAACG
TTGAGACGGCTTGCAAGCTTCTGTCCCAAAGATCGATCAGCCTGAGACCAGTAAGAGATC
CAGATGCTACGGATCTCATGCGTGAGACGTGGCTCTGACAGAATCTCTACCCATCTCTTA
ACAAACCGGTCTTGCCTGTCTGGTGCCCATGATCTGTATCTATCTCCAGGTTGCTTGAAG
TTGTTCTCCTTCTTGATGATGCACTTTGTTCGGATTCCAGTGTAAGACTTGGTAGGGATA
GGAACTTTCTCAGCACAGCGGACAGGATCAAACTTTGAGGGGTAGTAGTTGATCTCCTCA
TCTCTATGCATGAAGTTCATAAAACCTTCATGGTGATTGTTGTGCCCCGGCCGTAATGGC
CGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A357JQ U 135
AF RS1A357TR U 153
AF RS1A357TF C 1
AF RS1A357TV C 1
BS 1 134 RS1A357TF
BS 135 705 RS1A357JQ
BS 706 737 RS1A357TF
BS 738 738 RS1A357TV
BS 739 754 RS1A357TF

RD RS1A357JQ 571 0 0
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AAACATCGTTTTAGAGGATTACATGCATCACTATTATACATAGACGATATAAACAACCCA
AGAAAATCATATTTTTGAGGAATATAACGACCAACAGATGATAAGAGATCACGATTGTAC
TTTCCGGGCAATAAGCAAATATGAAGATTACATGCTTGGCCTAACGTTGAGACGGCTTGC
AAGCTTCTGTCCCAAAGATCGATCAGCCTGAGACCAGTAAGAGATCCAGATGCTACGGAT
CTCATGCGTGAGACGTGGCTCTGACAGAATCTCTACCCATCTCTTAACAAACCGGTCTTG
CCTGTCTGGTGCCCATGATCTGTATCTATCTCCAGGTTGCTTGAAGTTGTTCTCCTTCTT
GATGATGCACTTTGTTCGGATTCCAGTGTAAGACTTGGTAGGGATAGGAACTTTCTCAGC
ACAGCGGACAGGATCAAACTTTGAGGGGTAGTAGTTGATCTCCTCATCTCTATGCATGAA
GTTCATAAAACCTTCATGGTGATTGTTGTGC

QA 1 571 1 571
DS 

RD RS1A357TR 553 0 0
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TTACATGCATCACTATTATACATAGACGATATAAACAACCCAAGAAAATCATATTTTTGA
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ATATGAAGATTACATGCTTGGCCTAACGTTGAGACGGCTTGCAAGCTTCTGTCCCAAAGA
TCGATCAGCCTGAGACCAGTAAGAGATCCAGATGCTACGGATCTCATGCGTGAGACGTGG
CTCTGACAGAATCTCTACCCATCTCTTAACAAACCGGTCTTGCCTGTCTGGTGCCCATGA
TCTGTATCTATCTCCAGGTTGCTTGAAGTTGTTCTCCTTCTTGATGATGCACTTTGTTCG
GATTCCAGTGTAAGACTTGGTAGGGATAGGAACTTTCTCAGCACAGCGGACAGGATCAAA
CTTTGAGGGGTAGTAGTTGATCTCCTCATCTCTATGCATGAAGTTCATAAAACCTTCATG
GTGATTGTTGTGC

QA 1 553 1 553
DS 

RD RS1A357TF 754 0 0
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CTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTT
TTTTTTTTTTTTTTCCAAGGAACATTGATTTATTCTTAAGAAATCACAAAGAGAGTGACA
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ATATAAACAACCCAAGAAAATCATATTTTTGAGGAATATAACGACCAACAGATGATAAGA
GATCACGATTGTACTTTCCGGGCAATAAGCAAATATGAAGATTACATGCTTGGCCTAACG
TTGAGACGGCTTGCAAGCTTCTGTCCCAAAGATCGATCAGCCTGAGACCAGTAAGAGATC
CAGATGCTACGGATCTCATGCGTGAGACGTGGCTCTGACAGAATCTCTACCCATCTCTTA
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TTGTTCTCCTTCTTGATGATGCACTTTGTTCGGATTCCAGTGTAAGACTTGGTAGGGATA
GGAACTTTCTCAGCACAGCGGACAGGATCAAACTTTGAGGGGTAGTAGTTGATCTCCTCA
TCTCTATGCATGAAGTTCATAAAACCTTCATGGTGATTGTTGTGCCCCGGCCGTAATGGC
CGAATTCCCGGGCATAT*TCCGGTACCGTCGACT

QA 1 754 1 754
DS 

RD RS1A357TV 754 0 0
CAAGCACTAGTCATGACCAGGATCTCCTAGGAAACAGCTATGACCATGTTCACTTACCTA
CTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTT
TTTTTTTTTTTTTTCCAAGGAACATTGATTTATTCTTAAGAAATCACAAAGAGAGTGACA
GTAAAACATGAAGGAAACATCGTTTTAGAGGATTACATGCATCACTATTATACATAGACG
ATATAAACAACCCAAGAAAATCATATTTTTGAGGAATATAACGACCAACAGATGATAAGA
GATCACGATTGTACTTTCCGGGCAATAAGCAAATATGAAGATTACATGCTTGGCCTAACG
TTGAGACGGCTTGCAAGCTTCTGTCCCAAAGATCGATCAGCCTGAGACCAGTAAGAGATC
CAGATGCTACGGATCTCATGCGTGAGACGTGGCTCTGACAGAATCTCTACCCATCTCTTA
ACAAACCGGTCTTGCCTGTCTGGTGCCCATGATCTGTATCTATCTCCAGGTTGCTTGAAG
TTGTTCTCCTTCTTGATGATGCACTTTGTTCGGATTCCAGTGTAAGACTTGGTAGGGATA
GGAACTTTCTCAGCACAGCGGACAGGATCAAACTTTGAGGGGTAGTAGTTGATCTCCTCA
TCTCTATGCATGAAGTTCATAAAACCTTCATGGTGATTGTTGTGCCCCGGCCGTAATGGC
CGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 754 1 754
DS 



CO CL1Contig36 589 4 3 U
CAAGCACTAGTCATGACCAGGATCTCCTAGGAAACAGCTATGACCATGTTCACTTACCTA
CTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTT
TTTTTTTTTTGCTCAAGAAGAGAGACATTGGTTCTAAAGATAGAAGCATTAGAGAGCCAC
TTTTTGAAACTTTCAGACAAATAGTTTTAAACAGTACATACAGGAAGAAGAAGAGTTGAA
ACAAGTCTTAATAGTTACTACTCCTGCCCAAAGCCATCACGGTTGTCTTGTTGCCACCCG
AAACCTTGAGCGTCTCTACCCCGGTTAACCTGTTGAGGCGGTTCCATACCAGGATTCCAC
GAGGACTGAGGATGATAAGATCCTTGGAAACTCAGATTCATCGTTGGCGCAGGCTGCTGC
TGCTGCTGCTGATACCCGAGCGCAGAACCTTGTTCTGTCTTCAGGTCTTGTCATCTCAAA
AGGTGCACCATTGTAGAATTGCTCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCC
GGTACCGTCGACTGATAACTTCGTATAATGTATGCTATACGAAGTTATG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A359JQ U 131
AF RS1A359TR U 131
AF RS1A359TF C 1
AF RS1A359TV C 1
BS 1 130 RS1A359TF
BS 131 504 RS1A359JQ
BS 505 589 RS1A359TF

RD RS1A359JQ 374 0 0
GCTCAAGAAGAGAGACATTGGTTCTAAAGATAGAAGCATTAGAGAGCCACTTTTTGAAAC
TTTCAGACAAATAGTTTTAAACAGTACATACAGGAAGAAGAAGAGTTGAAACAAGTCTTA
ATAGTTACTACTCCTGCCCAAAGCCATCACGGTTGTCTTGTTGCCACCCGAAACCTTGAG
CGTCTCTACCCCGGTTAACCTGTTGAGGCGGTTCCATACCAGGATTCCACGAGGACTGAG
GATGATAAGATCCTTGGAAACTCAGATTCATCGTTGGCGCAGGCTGCTGCTGCTGCTGCT
GATACCCGAGCGCAGAACCTTGTTCTGTCTTCAGGTCTTGTCATCTCAAAAGGTGCACCA
TTGTAGAATTGCTC

QA 1 374 1 374
DS 

RD RS1A359TR 374 0 0
GCTCAAGAAGAGAGACATTGGTTCTAAAGATAGAAGCATTAGAGAGCCACTTTTTGAAAC
TTTCAGACAAATAGTTTTAAACAGTACATACAGGAAGAAGAAGAGTTGAAACAAGTCTTA
ATAGTTACTACTCCTGCCCAAAGCCATCACGGTTGTCTTGTTGCCACCCGAAACCTTGAG
CGTCTCTACCCCGGTTAACCTGTTGAGGCGGTTCCATACCAGGATTCCACGAGGACTGAG
GATGATAAGATCCTTGGAAACTCAGATTCATCGTTGGCGCAGGCTGCTGCTGCTGCTGCT
GATACCCGAGCGCAGAACCTTGTTCTGTCTTCAGGTCTTGTCATCTCAAAAGGTGCACCA
TTGTAGAATTGCTC

QA 1 374 1 374
DS 

RD RS1A359TF 589 0 0
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CTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTT
TTTTTTTTTTGCTCAAGAAGAGAGACATTGGTTCTAAAGATAGAAGCATTAGAGAGCCAC
TTTTTGAAACTTTCAGACAAATAGTTTTAAACAGTACATACAGGAAGAAGAAGAGTTGAA
ACAAGTCTTAATAGTTACTACTCCTGCCCAAAGCCATCACGGTTGTCTTGTTGCCACCCG
AAACCTTGAGCGTCTCTACCCCGGTTAACCTGTTGAGGCGGTTCCATACCAGGATTCCAC
GAGGACTGAGGATGATAAGATCCTTGGAAACTCAGATTCATCGTTGGCGCAGGCTGCTGC
TGCTGCTGCTGATACCCGAGCGCAGAACCTTGTTCTGTCTTCAGGTCTTGTCATCTCAAA
AGGTGCACCATTGTAGAATTGCTCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCC
GGTACCGTCGACTGATAACTTCGTATAATGTATGCTATACGAAGTTATG

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1A359TV 553 0 0
CAAGCACTAGTCATGACCAGGATCTCCTAGGAAACAGCTATGACCATGTTCACTTACCTA
CTGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTT
TTTTTTTTTTGCTCAAGAAGAGAGACATTGGTTCTAAAGATAGAAGCATTAGAGAGCCAC
TTTTTGAAACTTTCAGACAAATAGTTTTAAACAGTACATACAGGAAGAAGAAGAGTTGAA
ACAAGTCTTAATAGTTACTACTCCTGCCCAAAGCCATCACGGTTGTCTTGTTGCCACCCG
AAACCTTGAGCGTCTCTACCCCGGTTAACCTGTTGAGGCGGTTCCATACCAGGATTCCAC
GAGGACTGAGGATGATAAGATCCTTGGAAACTCAGATTCATCGTTGGCGCAGGCTGCTGC
TGCTGCTGCTGATACCCGAGCGCAGAACCTTGTTCTGTCTTCAGGTCTTGTCATCTCAAA
AGGTGCACCATTGTAGAATTGCTCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCC
GGTACCGTCGACT

QA 1 553 1 553
DS 



CO CL1Contig37 766 4 2 U
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TGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTTT
TTTTTTTTTTTTTTTCATCAAGTCTTTTTAGCATCTTTAATACGCGAGAGAAAAAAAATA
GAATAGTCTGTCTTCACAACTCATAAAATAAGACTACTAAAATCCAAATCACAGGAGATG
CACAAAAGCATCTTTGAACATCCAACACTGGCCACATCTCTCATTTGGTTACTGGTAAAA
GTTCTGCCGAGGCATGATGAATAAAGACAAGCTAAAAGACTTCAATATATTCTTATTACA
TTTATGTTTTGCGAGGAGGCGGTGAGCTGCTACTGCTGCTGTTACTGCTGCTTCTTTTTC
CTCTCAGTGGCCTCTTAGGACTGCGGCTCCTTGAAATCTTCCTAGGACTCCTTGAAATCT
TTCTAGGAACTCTTCTGGGACTAGGCGAACTAGAGTAAGAAGATGACCTCCCACGCCTCC
CAGCTGGACCACGTCCCCTGCGGGGTGAGATGGACCTTGAACGAGAGCGAACAGGCCTAC
GAATTGGGGATCGGCTACGTCTGCGGATTGGAGATCTTCTGAGGGGACTGCGTAGCCTCC
TTGGAGGTGACCTTCGCCTTAGAGGAGGAGGAGACCGTCTTCGAACAGGACTGCCACGGA
TTCTTCTAGGGGAGCCCCTTGGAGGAGATCTATTTCGTCTTGGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A366TV C 1
AF RS1A366JQ U 150
AF RS1A366TF C 150
AF RS1A366TR U 150
BS 1 149 RS1A366TV
BS 150 766 RS1A366JQ

RD RS1A366TV 712 0 0
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TGGGCCCGCGCGCCAAACGAATGGTCTAGAAAGCTTCTCGAGGGCCGAGGCGGCCTTTTT
TTTTTTTTTTTTTTTCATCAAGTCTTTTTAGCATCTTTAATACGCGAGAGAAAAAAAATA
GAATAGTCTGTCTTCACAACTCATAAAATAAGACTACTAAAATCCAAATCACAGGAGATG
CACAAAAGCATCTTTGAACATCCAACACTGGCCACATCTCTCATTTGGTTACTGGTAAAA
GTTCTGCCGAGGCATGATGAATAAAGACAAGCTAAAAGACTTCAATATATTCTTATTACA
TTTATGTTTTGCGAGGAGGCGGTGAGCTGCTACTGCTGCTGTTACTGCTGCTTCTTTTTC
CTCTCAGTGGCCTCTTAGGACTGCGGCTCCTTGAAATCTTCCTAGGACTCCTTGAAATCT
TTCTAGGAACTCTTCTGGGACTAGGCGAACTAGAGTAAGAAGATGACCTCCCACGCCTCC
CAGCTGGACCACGTCCCCTGCGGGGTGAGATGGACCTTGAACGAGAGCGAACAGGCCTAC
GAATTGGGGATCGGCTACGTCTGCGGATTGGAGATCTTCTGAGGGGACTGCGTAGCCTCC
TTGGAGGTGACCTTCGCCTTAGAGGAGGAGGAGACCGTCTTCGAACAG
ACTG

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DS 

RD RS1A366JQ 617 0 0
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AAGACTACTAAAATCCAAATCACAGGAGATGCACAAAAGCATCTTTGAACATCCAACACT
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AGCTAAAAGACTTCAATATATTCTTATTACATTTATGTTTTGCGAGGAGGCGGTGAGCTG
CTACTGCTGCTGTTACTGCTGCTTCTTTTTCCTCTCAGTGGCCTCTTAGGACTGCGGCTC
CTTGAAATCTTCCTAGGACTCCTTGAAATCTTTCTAGGAACTCTTCTGGGACTAGGCGAA
CTAGAGTAAGAAGATGACCTCCCACGCCTCCCAGCTGGACCACGTCCCCTGCGGGGTGAG
ATGGACCTTGAACGAGAGCGAACAGGCCTACGAATTGGGGATCGGCTACGTCTGCGGATT
GGAGATCTTCTGAGGGGACTGCGTAGCCTCCTTGGAGGTGACCTTCGCCTTAGAGGAGGA
GGAGACCGTCTTCGAACAGGACTGCCACGGATTCTTCTAGGGGAGCCCCTTGGAGGAGAT
CTATTTCGTCTTGGAGC

QA 1 617 1 617
DS 

RD RS1A366TF 610 0 0
AGCATCTTTAATACGCGAGAGAAAAAAAATAGAATAGTCTGTCTTCACAACTCATAAAAT
AAGACTACTAAAATCCAAATCACAGGAGATGCACAAAAGCATCTTTGAACATCCAACACT
GGCCACATCTCTCATTTGGTTACTGGTAAAAGTTCTGCCGAGGCATGATGAATAAAGACA
AGCTAAAAGACTTCAATATATTCTTATTACATTTATGTTTTGCGAGGAGGCGGTGAGCTG
CTACTGCTGCTGTTACTGCTGCTTCTTTTTCCTCTCAGTGGCCTCTTAGGACTGCGGCTC
CTTGAAATCTTCCTAGGACTCCTTGAAATCTTTCTAGGAACTCTTCTGGGACTAGGCGAA
CTAGAGTAAGAAGATGACCTCCCACGCCTCCCAGCTGGACCACGTCCCCTGCGGGGTGAG
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GGAGATCTTCTGAGGGGACTGCGTAGCCTCCTTGGAGGTGACCTTCGCCTTAGAGGAGGA
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CTATTTCGTC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RS1A366TR 617 0 0
AGCATCTTTAATACGCGAGAGAAAAAAAATAGAATAGTCTGTCTTCACAACTCATAAAAT
AAGACTACTAAAATCCAAATCACAGGAGATGCACAAAAGCATCTTTGAACATCCAACACT
GGCCACATCTCTCATTTGGTTACTGGTAAAAGTTCTGCCGAGGCATGATGAATAAAGACA
AGCTAAAAGACTTCAATATATTCTTATTACATTTATGTTTTGCGAGGAGGCGGTGAGCTG
CTACTGCTGCTGTTACTGCTGCTTCTTTTTCCTCTCAGTGGCCTCTTAGGACTGCGGCTC
CTTGAAATCTTCCTAGGACTCCTTGAAATCTTTCTAGGAACTCTTCTGGGACTAGGCGAA
CTAGAGTAAGAAGATGACCTCCCACGCCTCCCAGCTGGACCACGTCCCCTGCGGGGTGAG
ATGGACCTTGAACGAGAGCGAACAGGCCTACGAATTGGGGATCGGCTACGTCTGCGGATT
GGAGATCTTCTGAGGGGACTGCGTAGCCTCCTTGGAGGTGACCTTCGCCTTAGAGGAGGA
GGAGACCGTCTTCGAACAGGACTGCCACGGATTCTTCTAGGGGAGCCCCTTGGAGGAGAT
CTATTTCGTC
TTGGAGC

QA 1 610 1 610
DS 



CO CL1Contig38 713 4 4 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGACATAATCT
CTAAATAACTTTCATTTGTTTTTGTTTTATATCTTGTCAAAACATAAGAAACGATGCTGG
CTTTGAACAGAAATGTTACGGTTTTAGCTATGATATTGTTCGTTATACTAAGTGTTTCGC
CTTTGAGTGCAGGAAAATCTTATTTCTATAGTCCTGCAGAATGTCTTAAGACAATCCAAA
ATGTGGAGGGATGCACTGATGCCATAACTGCCATACTACGTTGGGATTTTAGCCACCTTA
AGCACAATTGCTGTGACGTTTTGGAAGGTTTAAGCGAAGATTGCTGGCCAATAGTGTTCC
CCGGACAGCCTCTTGTTCACCTGATGATCAAAGGAATATGTTTCTTCCCATAGAAACGAC
TGTTT*CTTCCCATAGAAACGTCTATTTCTTCTATAATTAATCAACTGCTATGATGGTAC
GTATGAGTGAGTAAACCAATAAAAATGCCTTGTAATAGGTTTTATCTTATTATTCTTATT
CTGGATGATATAATATAATGAGAAGCTATCTTATTAATGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGC
CGCCTCGGCCCTCGAGAAGCTTTCTAGACCATTCGTTTGGCGCGCGGGCCCAGTAGGTAA
GTGAACATGGTCATAGCTGTTTCCTAGGAGATCCTGGTCATGACTAGTGCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A380TV U 1
AF RS1A380JQ C 84
AF RS1A380TR C 84
AF RS1A380TF U 29
BS 1 425 RS1A380TV
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BS 427 500 RS1A380TV
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CTAAATAACTTTCATTTGTTTTTGTTTTATATCTTGTCAAAACATAAGAAACGATGCTGG
CTTTGAACAGAAATGTTACGGTTTTAGCTATGATATTGTTCGTTATACTAAGTGTTTCGC
CTTTGAGTGCAGGAAAATCTTATTTCTATAGTCCTGCAGAATGTCTTAAGACAATCCAAA
ATGTGGAGGGATGCACTGATGCCATAACTGCCATACTACGTTGGGATTTTAGCCACCTTA
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CCGGACAGCCTCTTGTTCACCTGATGATCAAAGGAATATGTTTCTTCCCATAGAAACGAC
TGTTTTCTTCCCATAGAAACGTCTATTTCTTCTATAATTAATCAACTGCTATGATGGTAC
GTATGAGTGAGTAAACCAAT

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DS 

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GAAGGTTTAAGCGAAGATTGCTGGCCAATAGTGTTCCCCGGACAGCCTCTTGTTCACCTG
ATGATCAAAGGAATATGTTTCTTCCCATAGAAACGACTGTTT*CTTCCCATAGAAACGTC
TATTTCTTCTATAATTAATCAACTGCTATGATGGTACGTATGAGTGAGTAAACCAATAAA
AATGCCTTGTAATAGGTTTTATCTTATTATTCTTATTCTGGATGATATAATATAATGAGA
AGCTATCTTATTAATG

QA 1 496 1 496
DS 

RD RS1A380TR 496 0 0
GTTTTATATCTTGTCAAAACATAAGAAACGATGCTGGCTTTGAACAGAAATGTTACGGTT
TTAGCTATGATATTGTTCGTTATACTAAGTGTTTCGCCTTTGAGTGCAGGAAAATCTTAT
TTCTATAGTCCTGCAGAATGTCTTAAGACAATCCAAAATGTGGAGGGATGCACTGATGCC
ATAACTGCCATACTACGTTGGGATTTTAGCCACCTTAAGCACAATTGCTGTGACGTTTTG
GAAGGTTTAAGCGAAGATTGCTGGCCAATAGTGTTCCCCGGACAGCCTCTTGTTCACCTG
ATGATCAAAGGAATATGTTTCTTCCCATAGAAACGACTGTTT*CTTCCCATAGAAACGTC
TATTTCTTCTATAATTAATCAACTGCTATGATGGTACGTATGAGTGAGTAAACCAATAAA
AATGCCTTGTAATAGGTTTTATCTTATTATTCTTATTCTGGATGATATAATATAATGAGA
AGCTATCTTATTAATG

QA 1 496 1 496
DS 

RD RS1A380TF 685 0 0
AATTCGGCCATTACGGCCGGGGGACATAATCTCTAAATAACTTTCATTTGTTTTTGTTTT
ATATCTTGTCAAAACATAAGAAACGATGCTGGCTTTGAACAGAAATGTTACGGTTTTAGC
TATGATATTGTTCGTTATACTAAGTGTTTCGCCTTTGAGTGCAGGAAAATCTTATTTCTA
TAGTCCTGCAGAATGTCTTAAGACAATCCAAAATGTGGAGGGATGCACTGATGCCATAAC
TGCCATACTACGTTGGGATTTTAGCCACCTTAAGCACAATTGCTGTGACGTTTTGGAAGG
TTTAAGCGAAGATTGCTGGCCAATAGTGTTCCCCGGACAGCCTCTTGTTCACCTGATGAT
CAAAGGAATATGTTTCTTCCCATAGAAACGACTGTTT*CTTCCCATAGAAACGTCTATTT
CTTCTATAATTAATCAACTGCTATGATGGTACGTATGAGTGAGTAAACCAATAAAAATGC
CTTGTAATAGGTTTTATCTTATTATTCTTATTCTGGATGATATAATATAATGAGAAGCTA
TCTTATTAATGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCGCCTCGGCCCTCGAGAAGCTTTCTAGA
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QA 1 685 1 685
DS 



CO CL1Contig39 701 26 2 U
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TCGACGACACCGATATCAACTGATCTTCTTTAGTTCTCTAAGGTTTCAGATGTCCCCTTG
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TTACTGGATCTATCAACAGGAGTCCAAGCGAGCTCGATATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 40 40 40 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 

AF RS1A393JQ C 86
AF RS1A393TR C 86
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CGACGCCGATTTCTTCAACAAGTTCGACGATGATTTCGACGACACCGATATCAACTGATC
TTCTTTAGTTCTCTAAGGTTTCAGATGTCCCCTTGTTGCGGTTGAGTTTTATGTAATTTT
CTGGAATAATCTATAAAACCCGTTAATTAGGGATTCTGTGTTTGCGAATCGAAGTATGTG
TTCATAAG

QA 1 368 1 368
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TCTAAGGTTTCAGATGTCCCCTTGTTGCGGTTGAGTTTTATGTAATTTTCTGGAATAATC
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AAAAAAAAAAAAAAAAGGCCGCCTCGGCCCTCGAGAAGCTTTCTAGACCATTCGTTTGGC
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GACTAGTGCTTG

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QA 1 226 1 226
DS 



CO CL1Contig40 1135 7 8 U
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AAAGAATCGGCATAACACTCCTAGTCGATTGGAATTGAGAAAATTCTGTCCCTATTGTTA
TAAACATACAATTCATGGGGAAATCAAGAAATAGATAAAATTGAGTCCTTGTATGTCAAA
TTTTATTTCAAGAACAGGAATAATGAGAGTATCTACGTATTATTACATATATATAAATAT
AAACAAATAAAATAATAGAAAGAAATAAAATCCTATATTCTTAATTCTATATAAAAACTC
TATCCTATATAGAAATAGAAATCGTTTTTATTTTGATCCGATCAAAATAGGATTTTAGAG
GTAAGGAATAAAAAATTATGAATAAATCTAAGCGACCTTTTACTAAATCCAAGCGATCTT
TTCGTCGGCGTTTGCCCCCGATCCAATCGGGGGATCGAATTGATTATAGAAACATGAGTT
TAATTAGTCGATTTATTAGTGAACAAGGAAAAATATTATCTAGACGGGTGAATAGAGTAA
CTTTAAAACAACAACGATTAATTACTATTGCTATAAAACAAGCTCGTATTTTATCTTTGT
TACCTTTTCTTAATAATCAGAAACAATTTGAGAGAAGTGAGTCGACCCCTAGAACTACTA
GCCTTAGAACCAGAAAAAAATAGACTTATTCTTCAATTGAATAACTAATCTGAAGGAATT
AAAAAAGAGGTTAATATTTTGTTCGACAAATCCAATCAAGAATCAAAATTTGATTGTTAC
GTCTGTGTCTGTCATAAAAAAAAAAAAAAGAATCGTCGAAAAGAAAAAGAATAAGTCTAT
TTTTAGCGACTATATACCCTCGTTTTGTTTTGACGACTTTTTTTATAATACTAATTTCTA
CTCTACCCTCCCCGAGCTTATTATACTTAAGAACTCTATTTCAAATATTTTAGTGGATTT
CTTCCAATCCCCTCATTTTTTGATCTCATTTGAAATCGTATAAAGACAACTCCTC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B860JQ U 1
AF RS1DV96JQ U 186
AF RS1B860TF C 1
AF RS1DV96TF C 1
AF RS1CY31JQ U 351
AF RS1AA79JQ U 1
AF RS1AA79TF C 469
BS 1 99 RS1AA79JQ
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BS 309 309 RS1B860JQ
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BS 414 414 RS1CY31JQ
BS 415 729 RS1AA79JQ
BS 730 1135 RS1AA79TF

RD RS1B860JQ 309 0 0
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TTTTATTTC

QA 1 309 1 309
DS 

RD RS1DV96JQ 124 0 0
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TTTC

QA 1 124 1 124
DS 

RD RS1B860TF 309 0 0
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CAGTTGTGTTCGAAATGATATTAAGAAAGAATCGGCTGGAATTTCCAGATATATTACTCA
AAAGAATCGGCATAACACTCCTAGTCGATTGGAATTGAGAAAATTCTGTCCCTATTGTTA
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TTTTATTTC

QA 1 309 1 309
DS 

RD RS1DV96TF 309 0 0
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AAAGAATCGGCATAACACTCCTAGTCGATTGGAATTGAGAAAATTCTGTCCCTATTGTTA
TAAACATACAATTCATGGGGAAATCAAGAAATAGATAAAATTGAGTCCTTGTATGTCAAA
TTTTATTTC

QA 1 309 1 309
DS 

RD RS1CY31JQ 211 0 0
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ATAAAAACTCTATCCTATATAGAAATAGAAATCGTTTTTATTTTGATCCGATCAAAATAG
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QA 1 211 1 211
DS 

RD RS1AA79JQ 729 0 0
GGTTCTTGTTCTTTATGGATCCTAAAATGAAAACAGAAGGTTGGGGGTGAATCATAAATC
CAAAGGAGGTTTCATGGCCAAAGGTAAAGATGTTCGAGTGACAATTATTTTGGAATGTAC
CAGTTGTGTTCGAAATGATATTAAGAAAGAATCGGCTGGAATTTCCAGATATATTACTCA
AAAGAATCGGCATAACACTCCTAGTCGATTGGAATTGAGAAAATTCTGTCCCTATTGTTA
TAAACATACAATTCATGGGGAAATCAAGAAATAGATAAAATTGAGTCCTTGTATGTCAAA
TTTTATTTTAAGAACAGGAATAATGAGAGTATCTACGTATTATTACATATATATAAATAT
AAACAAATAAAATAATAGAAAGAAATAAAATCCTATATTCTTAATTCTATATAGAAACTC
TATCCTATATAGAAATAGAAATCGTTTTTATTTTGATCCGATCAAAATAGGATTTTAGAG
GTAAGGAATAAAAAATTATGAATAAATCTAAGCGACCTTTTACTAAATCCAAGCGATCTT
TTCGTCGGCGTTTGCCCCCGATCCAATCGGGGGATCGAATTGATTATAGAAACATGAGTT
TAATTAGTCGATTTATTAGTGAACAAGGAAAAATATTATCTAGACGGGTGAATAGAGTAA
CTTTAAAACAACAACGATTAATTACTATTGCTATAAAACAAGCTCGTATTTTATCTTTGT
TACCTTTTC

QA 1 729 1 729
DS 

RD RS1AA79TF 667 0 0
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CCAAGCGATCTTTTCGTCGGCGTTTGCCCCCGATCCAATCGGGGGATCGAATTGATTATA
GAAACATGAGTTTAATTAGTCGATTTATTAGTGAACAAGGAAAAATATTATCTAGACGGG
TGAATAGAGTAACTTTAAAACAACAACGATTAATTACTATTGCTATAAAACAAGCTCGTA
TTTTATCTTTGTTACCTTTTCTTAATAATCAGAAACAATTTGAGAGAAGTGAGTCGACCC
CTAGAACTACTAGCCTTAGAACCAGAAAAAAATAGACTTATTCTTCAATTGAATAACTAA
TCTGAAGGAATTAAAAAAGAGGTTAATATTTTGTTCGACAAATCCAATCAAGAATCAAAA
TTTGATTGTTACGTCTGTGTCTGTCATAAAAAAAAAAAAAAGAATCGTCGAAAAGAAAAA
GAATAAGTCTATTTTTAGCGACTATATACCCTCGTTTTGTTTTGACGACTTTTTTTATAA
TACTAATTTCTACTCTACCCTCCCCGAGCTTATTATACTTAAGAACTCTATTTCAAATAT
TTTAGTGGATTTCTTCCAATCCCCTCATTTTTTGATCTCATTTGAAATCGTATAAAGACA
ACTCCTC

QA 1 667 1 667
DS 



CO CL1Contig41 824 6 4 U
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AGTGATCCAAGAAGAAGATGGTGATGCAAATAGCGACACCGGCCCCTGCACCGATCACAG
CACCGGAGATAAACATCATCCTCACGCCAGCAAAGACGGAGACTCACAAGAAGAACAGGA
TTCAAGTTTCCAACACGAAGAAGCCACTGTTCTTCTACG*TTAATCTCGCCAAGAGGTAC
ATTCAGCAACACAATGAGGTTGAACTCTCTGCACTCGGAATGGCAATTACGACGGTTGTA
ACAATCTCTGAGATCTTGAAGAACAATGGATTGGCTACAGAGAAGAAAGTGTTGACATCC
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GTGTTGGGAAAATCAGACAAGTTCGACTCTCTGGTGCCACCTGTGACCAATGGCAAGACC
CCTGAAGAAGTAGCTAAAGCAGAGACCGAGGCGGCTGTTGAAGTACAAGAAGCTGCAGCC
ACCCAAGTCTAGGACTGATCCTGCTAACCCACATAACAATGCTCGTTCCATATTTTTTTT
TAAATATGTTTGTTGTTTTTGTTTCAGTTGTGACAATTCGAACATAATACTACTCTAGAT
ATGTAATATAATAAGTAAAATGATGGTTGACAACAAAAAAAAAAAAAAGGCCGCCTCGGC
CCTCGAGAAGCTTTCTAGACCATTCGTTTGGCGCGCGGGCCCAGTAGGTAAGTGAACATG
GTCATAGCTGTTTCCTAGGAGATCCTGGTCATGACTAGTGCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 30 30 10 15 15 30 15 30 30 30 15 15 15 15 30 30 15 15 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BJ81TF U 1
AF RS1EM16JQ C 99
AF RS1EM16TF U 99
AF RS1A192JQ C 232
AF RS1A192TR C 232
AF RS1A192TF U 211
BS 1 428 RS1BJ81TF
BS 429 429 RS1A192TF
BS 430 694 RS1BJ81TF
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RD RS1BJ81TF 706 0 0
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GATATCATTTGT

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RD RS1EM16JQ 614 0 0
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TGAGATTGTGTTGGGGAAATCAGACAAGTTCGACTCTCTGGTGCCACCTGTGACCAATGG
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RD RS1EM16TF 614 0 0
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GACATCCACTGTGGGAATGAAGGATGAGACGAAAGGAAAGATGGTTCAGAAAGCAAAGAT
TGAGATTGTGTTGGGGAAATCAGACAAGTTCGACTCTCTGGTGCCACCTGTGACCAATGG
CAAGACCCCTGAAGAAGTGGCTAAAGCAGAGACCGAGGCGGCTGTTGAAGTACAAGAAGC
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GATATCATTTGTTTTTGG

QA 16 596 16 596
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DS 

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TTGACATCCACTGTGGGAATGAAGGATGAGACGAAAGGAAAGATGGTTCAGAAAGCAAAG
ATTGAGATTGTGTTGGGAAAATCAGACAAGTTCGACTCTCTGGTGCCACCTGTGACCAAT
GGCAAGACCCCTGAAGAAGTAGCTAAAGCAGAGACCGAGGCGGCTGTTGAAGTACAAGAA
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ATTTTTTTTTAAATATGTTTGTTGTTTTTGTTTCAGTTGTGACAATTCGAACATAATACT
ACTCTAGATATGTAATATAATAAGTAAAATGATGGTTGACAAC

QA 1 463 1 463
DS 

RD RS1A192TF 614 0 0
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CTGGTGCCACCTGTGACCAATGGCAAGACCCCTGAAGAAGTAGCTAAAGCAGAGACCGAG
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ACATAACAATGCTCGTTCCATATTTTTTTTTAAATATGTTTGTTGTTTTTGTTTCAGTTG
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ATGACTAGTGCTTG

QA 1 614 1 614
DS 



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ATGAACTCACTTTCTGGTTTAGCTCTACTGAGCCAGCACCAGAGATTGCGTAGCTGCAGG
TGAGAACACTTGAGTTCATGGCTGCCCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1BO36TF C 1
AF RS1BO36JQ U 6
BS 1 5 RS1BO36TF
BS 6 628 RS1BO36JQ

RD RS1BO36TF 628 0 0
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CCAACGCCAAATCTTCAGAGATAAATGGGACTTTCTTTTGCTTGGCGAGATCTTGGCAAC
CAGTGAAATTCTCAGGGAACTTGCAGCTTCCGAATTGGACAGTGAATGTTCTCGCAAAGT
TTGCTCCACTTGCTGCCAATCTCTTCTTATCGTTCAGTTCTTTGTCGGCCTTGCTCTTCT
CGAGGTATTCATCGAAGACGCTAGCATTAGCAGAAGCAGACACAGCAGCAGAGGAGAAGA
GGGTAGCCGCTAAGAACAACATGGCTGATCTTCTTCCATTAGACCCATCAACATCATCAC
CACCAGCTCGTTGAGCTTTGATCACAGGAAACGTCTGTTTCTTCTGACCAAACCCAACTG
ATGAACTCACTTTCTGGTTTAGCTCTACTGAGCCAGCACCAGAGATTGCGTAGCTGCAGG
TGAGAACACTTGAGTTCATGGCTGCC
CC

QA 1 626 1 626
DS 

RD RS1BO36JQ 623 0 0
GGGAGGATAACTTTGATAGATTCAAATGGGACATGAAAATTTTGATGGATAAAGGGAGAT
ACATTGTTGTTGGGGGTGGGTTTATATAAGAATGAATAACAAACAACAAACAGACTTCTT
CACCATTTCCAGAAAACATTGGAACCACACTTGTACTTGTCTTTGCCTTCGCATTCCAAC
GCCAAATCTTCAGAGATAAATGGGACTTTCTTTTGCTTGGCGAGATCTTGGCAACCAGTG
AAATTCTCAGGGAACTTGCAGCTTCCGAATTGGACAGTGAATGTTCTCGCAAAGTTTGCT
CCACTTGCTGCCAATCTCTTCTTATCGTTCAGTTCTTTGTCGGCCTTGCTCTTCTCGAGG
TATTCATCGAAGACGCTAGCATTAGCAGAAGCAGACACAGCAGCAGAGGAGAAGAGGGTA
GCCGCTAAGAACAACATGGCTGATCTTCTTCCATTAGACCCATCAACATCATCACCACCA
GCTCGTTGAGCCTTGATCACAGGAAACGTCTGTTTCTTCTGACCAAACCCAACTGATGAA
CTCACTTTCTGGTTTAGCTCTACTGAGCCAGCACCAGAGATTGCGTAGCTGCAGGTGAGA
ACACTTGAGTTCATGGCTGCCCC

QA 1 623 1 623
DS 



CO CL1Contig43 635 2 2 U
CAAATCATTAAAAAACTAGATAAAGCATAACCAATACGACTTTTTCTTAGTAGATAAAAA
CCAAAAGCGACCAGATCTAGATCCCTAAGCCAAACCCAACACGACACGATTCAAGAGCTA
GTAAACTTAGTAACAGCCTTAGTGCCCTCAGAGACGGCGTGCTTAGCGAGCTCCCCGGGC
AGAACAAGCCTGACAGCGGTCTGGATCTCCCTCGAGGTGATGGTCGGCTTCTTGTTGTAC
CTAGCGAGCTTGGAGGCCTCCTGGGCGAGCTTCTCGAAGATGTCGTTGATGAAGCTGTTC
ATGATCCCCATGGCCTTGCTCGAGATCCCGATGTCCGGGTGGACCTGTTTCAGCACCTTG
AAGATGTAGATCTTGTAAGTCTCGATGCTCTTCTTGTTCCGCTTCTTCTTCTTGTCGATG
GCCCCGGCCTCCTTCGGGAGCTTCTTCCCGGCCTTTGGCTTCTTCTCCGCCGGGGCTTTC
TCGGCGACCTCCTCAGCTGGCTTCTCAGCGGCGGCGGCGGCGGGTTTCTTCTCTGCTGGC
TTCTTTCCTGCCTTTGGTGCCATCTTTGATTCTTGTTTTTGGGAGTGGAGGAGAATTAGG
TTTTTGAGATTTGAGATGAGGAGTTTCTGGGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BU66TF C 1
AF RS1BU66JQ U 374
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BS 374 635 RS1BU66JQ

RD RS1BU66TF 635 0 0
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DS 

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QA 1 262 1 262
DS 



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T


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 

AF RS1BY07JQ C 1
AF RS1BY07TF U 1
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TCAATTGTATTTTAGAAATTTATAAATGTTACATAAAATGAGAATAAACCCATTTAAGAC
T

QA 1 601 1 601
DS 

RD RS1BY07TF 601 0 0
GG
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AATGCTGAAGCACCAAAGCGGAATGCGACAAACATTGTATCTGGTAGCATCTGGGGCCGT
TGAATATTTATGAAGAGAAATTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTCATACTTAATAA
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TACTAAATGTTTTTGAATTTCTTTGAAAATTCAATAAATAGTTATTTTCTGACTTTCTTC
AATTGTATTTTAGAAATTTATAAATGTTACATAAAATGAGAATAAACCCATTTAAGACT

QA 3 601 3 601
DS 



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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1CJ85TF U 1
AF RS1CJ85JQ C 1
AF RS1CT33JQ C 188
AF RS1CT33TF U 1
BS 1 542 RS1CJ85TF
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TT

QA 1 542 1 542
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CATCGTGGATTCAAAGACAACTGTGAGACAAATTGAGGATGCTTTCAAGGAATTCTCATC
GAGAGATGATATTGCTATCATCCTCATCAGCCAATACGTTGCCAATATGATCCGTTTCTT
GGTGGATAGCTACAACAAGCCAGTGCCTGCGATTCTGGAGATCCCTTCCAAGGACCATCC
CTATGATCCTGCTCATGATTCGGTTCTCTCCCGTGTCAAGTACCTCTTTTCTGCTGAATC
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QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1CT33JQ 461 0 0
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AGCTACAACAAGCCAGTGCCTGCGATTCTGGAGATCCCTTCCAAGGACCATCCCTATGAT
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QA 1 461 1 461
DS 

RD RS1CT33TF 648 0 0
GGGAATGCGCTTCTTCTCCATCTTCGTCCGATCTGAGATCACGAATTGATTAAACCCAGT
TTCGATTAATCTATTGTGGGTTCTATTTCTCATGTGTAGTTGAATCAAAATGGCTGGGAG
AGCTTCGATCCCTGCTCGCAACTCTGCCCTCATCGCTATGATCGCCGACGAGGACACCGT
AGTTGGATTCTTGATGGCTGGAGTTGGTAATGTTGACATCAGGAGGAAGACTAACTACCT
CATCGTGGATTCAAAGACAACTGTGAGACAAATTGAGGATGCTTTCAAGGAATTCTCATC
GAGAGATGATATTGCTATCATCCTCATCAGCCAATACGTTGCCAATATGATCCGTTTCTT
GGTGGATAGCTACAACAAGCCAGTGCCTGCGATTCTGGAGATCCCTTCCAAGGACCATCC
CTATGATCCTGCTCATGATTCGGTTCTCTCCCGTGTCAAGTACCTCTTCTCTGCTGAATC
TGTGTCACAGCGTTAAACATATTTACATTCTGCAAGCTTGCTTGAACCTCTATATATCAT
TTGTTTGTTTTTGACATTCTTGTATTTCTCCTTTCAAACTCGAAAACTTTCAATAAATGT
ATAACTCTTGATTTTTATTTGGAGATGATTGTTATATTACTGAGAACC

QA 1 648 1 648
DS 



CO CL1Contig46 560 10 9 U
GAGGTAAAAACCATAAGAAAACAAATATATTATCTAAACAAAATGGAATTTCTCAAATCC
TTTGCAACTATTCTCTTTGTAATGTTTCTGGCAATGAGCGCTCTAGAGACCGGACCTATG
GTTCGTGCTCAACAATGCCTAGACAATCTGAGCAATATGCAAGTGTGTGCGCCGCTGGTT
CTGCCTGGTGCGGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCATCGCTCTCCAAGCAACT
AACAAAGATTGTATATGTAACGCTCTTCGAGCAGCCACCACGTTTACCACTACTTGTAAC
CTCCCCTCTTTAGATTGTGGTATAACCATATAAGTGCTGTGCCTAGTTCCAGCAACGGTC
AGTTCCGAGGATTTGGGGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAGAATAAAATAAAAGCATT
TTAAATAATGAGAAAGTGTTTTCTTTTTTAAACTTGGTCTGTTGTTTGGTTGGGTTTAAT
ACTTATGACACATCTATTAATATCGTTTTCATATTTATTATGGGGAATATTTTTAAATAA
TTGCATCTTTATAGACTTGC


BQ
10 10 30 45 45 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BY87TF U -3
AF RS1GE43TF U 5
AF RS1FM50JQ C 0
AF RS1FM50TF U 0
AF RS1BY87JQ C 71
AF RS1D146JQ C 1
AF RS1CE52JQ C 2
AF RS1CE52TF U 2
AF RS1D146TF U 1
AF RS1BM20TF U 105
BS 1 2 RS1D146JQ
BS 3 3 RS1CE52TF
BS 4 46 RS1BY87TF
BS 47 47 RS1GE43TF
BS 48 198 RS1BY87TF
BS 199 514 RS1GE43TF
BS 515 534 RS1FM50TF
BS 535 549 RS1CE52TF
BS 550 560 RS1BM20TF

RD RS1BY87TF 202 0 0
GGAAAAT
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GCAACTATTCTCTTTGTAATGTTTCTGGCAATGAGCGCTCTAGAGACCGGACCTATGGTT
CGTGCTCAACAATGCCTAGACAATCTGAGCAATATGCAAGTGTGTGCGCCGCTGGTTCTG
CCTGGTGCGGTCAAT

QA 8 202 8 202
DS 

RD RS1GE43TF 510 0 0
G
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AACTATTCTCTTTGTAATGTTTCTGGCAATGAGCGCTCTAGAGACCGGACCTATGGTTCG
TGCTCAACAATGCCTAGACAATCTGAGCAATATGCAAGTGTGTGCGCCGCTGGTTCTGCC
TGGTGCGGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCATCGCTCTCCAAGCAACTAACAA
AGATTGTATATGTAACGCTCTTCGAGCAGCCACCACGTTTACCACTACTTGTAACCTCCC
CTCTTTAGATTGTGGTATAACCATATAAGTGCTGTGCCTAGTTCCAGCAACGGTCAGTTC
CGAGGATTTGGGGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAGAATAAAATAAAAGCATTTTAAA
TAATGAGAAAGTGTTTTCTTTTTTAAACTTGGTCTGTTGTTTGGTTGGGTTTAATACTTA
TGACACATCTATTAATATCGTTTTCATAT

QA 2 510 2 510
DS 

RD RS1FM50JQ 535 0 0
GGAT
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GCAACTATTCTCTTTGTAATGTTTCTGGCAATGAGCGCTCTAGAGACCGGACCTATGGTT
CTTGCTCAACAATGCCTAGACAATCTGAGCAATATGCAAGTGTGTGCGCCGCTGGTTCTG
CCTGGTGCGGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCATCGCTCTCCAAGCAACTAAC
AAAGATTGTATATGTAACGCTCTTCGAGCAGCCACCACGTTTACCACTACTTGTAACCTC
CCCTCTTTAGATTGTGGTATAACCATATAAGTGCTGTGCCTAGTTCCAGCAACGGTCAGT
TCCGAGGATTTGGGGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAGAATAAAATAAAAGCATTTTA
AATAATGAGAAAGTGTTTTCTTTTTTAAACTTGGTCTGTTGTTTGGTTGGGTTTAATACT
TATGACACATCTATTAATATCGTTTTCATATTTATTATGGGGAATATTTTT

QA 5 535 5 535
DS 

RD RS1FM50TF 535 0 0
GGAT
GTAAAAACCATAAGAAAACAAATATATTATCTAAACAAAATGGAATTTCTCAAATCCTTT
GCAACTATTCTCTTTGTAATGTTTCTGGCAATGAGCGCTCTAGAGACCGGACCTATGGTT
CTTGCTCAACAATGCCTAGACAATCTGAGCAATATGCAAGTGTGTGCGCCGCTGGTTCTG
CCTGGTGCGGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCATCGCTCTCCAAGCAACTAAC
AAAGATTGTATATGTAACGCTCTTCGAGCAGCCACCACGTTTACCACTACTTGTAACCTC
CCCTCTTTAGATTGTGGTATAACCATATAAGTGCTGTGCCTAGTTCCAGCAACGGTCAGT
TCCGAGGATTTGGGGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAGAATAAAATAAAAGCATTTTA
AATAATGAGAAAGTGTTTTCTTTTTTAAACTTGGTCTGTTGTTTGGTTGGGTTTAATACT
TATGACACATCTATTAATATCGTTTTCATATTTATTATGGGGAATATTTTT

QA 5 535 5 535
DS 

RD RS1BY87JQ 464 0 0
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AACAATGCCTAGACAATTTGAGCAATATGCAAGTGTGTGCGCCGCTGGTTTTGCCTGGTG
CGGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCATCGCTTTCCAAGCAACTAACAAAGATT
GTATATGTAACGCTTTTCGAGCAGCCACCACGTTTACCACTACTTGTAACCTCCCCTCTT
TAGATTGTGGTATAACCATATAAGTGCTGTGCCTAGTTCCAGCAACGGTCAGTTCCGAGG
ATTTGGGGAGTTTGGTTTGCAAAAGACAATGAGAATAAAATAAAAGCATTTTAAATAATG
AGAAAGTGTTTTTTTTTTTAAACTTGGTCTGTTGTTTGGTTGGGTTTAATACTTATGACA
CATCTATTAATATCGTTTTCATATTTATTATGGGGAATATTTTT

QA 1 464 1 464
DS 

RD RS1D146JQ 554 0 0
GAGGTAAAAACCATAAGAAAACAAATATATTATCTAAACAAAATGGAATTTCTCAAATCC
TTTGCAACTATTCTCTTTGTAATGTTTCTGGCAATGAGCGCTCTAGAGACCGGACCTATG
GTTCGTGCTCAACAATGCCTAGACAATCTGAGCAATATGCAAGTGTGTGCGCCGCTGGTT
CTGCCTGGTGCGGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCATCGCTCTCCAAGCAACT
AACAAAGATTGTATATGTAACGCTCTTCGAGCAGCCACCACGTTTACCACTACTCGTAAC
CTCCCCTCTTTAGATTGTGGTATAACCATATAAGTGCTGTGCCTAGTTCCAGCAACGGTC
AGTTCCGAGGATTTGGGGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAGAATAAAATAAAAGCATT
TTAAATAATGAGAAAGTGTTTTCTTTTTTAAACTTGGTCTGTTGTTTGGTTGGGTTTAAT
ACTTATGACACATCTATTAATATCGTTTTCATATTTATTATGGGGAATATTTTTAAATAA
TTGCATCTT
TATAG

QA 1 549 1 549
DS 

RD RS1CE52JQ 552 0 0
G
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TGCAACTATTCTCTTTGTAATGTTTCTGGCAATGAGCGCTCTAGAGACCGGACCTATGGT
TCGTGCTCAACAATGCCTAGACAATTTGAGCAATATGCAAGTGTGTGCGCCGCTGGTTTT
GCCTGGTGCGGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCATCGCTCTCCAAGCAACTAA
CAAAGATTGTATATGTAACGCTCTTCGGGCAGCCACCACGTTTACCACTACTTGTAACCT
CCCCTCTTTAGATTGTGGTATAACCATATAAGTGCTGTGCCTAGTTCCAGCAACGGTCAG
TTCCGAGGATTTGGGGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAGAATAAAATAAAAGCATTTT
AAATAATGAGAAAGTGTTTTTTTTTTTAAACTTGGTCTGTTGTTTGGTTGGGTTTAATAC
TTATGACACATCTATTAATATCGTTTTCATATTTATTATGGGGAATATTTTTAAATAATT
GCATCTT
ATAG

QA 2 548 2 548
DS 

RD RS1CE52TF 552 0 0
G
GGTAAAAGCCATAAGAAAACAAATATATTATCTAAACAAAGTGGAATTTCTCAAATCCTT
TGCAACTATTCTCTTTGTAATGTTTCTGGCAATGAGCGCTCTAGAGACCGGACCTATGGT
TCGTGCTCAACAATGCCTAGACAATCTGAGCAATATGCAAGTGTGTGCGCCGCTGGTTCT
GCCTGGTGCGGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCATCGCTCTCCAAGCAACTAA
CAAAGATTGTATATGTAACGCTCTTCGGGCAGCCACCACGTTTACCACTACTTGTAACCT
CCCCTCTTTAGATTGTGGTATAACCATATAAGTGCTGTGCCTAGTTCCAGCAACGGTCAG
TTCCGAGGATTTGGGGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAGAATAAAATAAAAGCATTTT
AAATAATGAGAAAGTGTTTTCTTTTTTAAACTTGGTCTGTTGTTTGGTTGGGTTTAATAC
TTATGACACATCTATTAATATCGTTTTCATATTTATTATGGGGAATATTTTTAAATAATT
GCATCTT
ATAG

QA 2 548 2 548
DS 

RD RS1D146TF 554 0 0
GA
GGTAAAAACCATAAGAAAACAAATATATTATCTAAACAAAATGGAATTTCTCAAATCCTT
TGCAACTATTCTCTTTGTAATGTTTCTGGCAATGAGCGCTCTAGAGACCGGACCTATGGT
TCGTGCTCAACAATGCCTAGACAATCTGAGCAATATGCAAGTGTGTGCGCCGCTGGTTCT
GCCTGGTGCGGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCATCGCTCTCCAAGCAACTAA
CAAAGATTGTATATGTAACGCTCTTCGAGCAGCCACCACGTTTACCACTACTCGTAACCT
CCCCTCTTTAGATTGTGGTATAACCATATAAGTGCTGTGCCTAGTTCCAGCAACGGTCAG
TTCCGAGGATTTGGGGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAGAATAAAATAAAAGCATTTT
AAATAATGAGAAAGTGTTTTCTTTTTTAAACTTGGTCTGTTGTTTGGTTGGGTTTAATAC
TTATGACACATCTATTAATATCGTTTTCATATTTATTATGGGGAATATTTTTAAATAATT
GCATCTT
TATAG

QA 3 549 3 549
DS 

RD RS1BM20TF 456 0 0
AGAGACCGGACCTATGGTTCGTGCTCAACAATGCCTAGACAATCTGAGCAATATGCAAGT
GTGTGCGCCGCTGGTTCTGCCTGGTGCGGTCAATCCAGCCCCGAATTCAAATTGCTGCAT
CGCTCTCCAAGCAACTAACAAAGATTGTATATGTAACGCTCTTCGAGCAGCCACCACGTT
TACCACTACTTGTAACCTCCCCTCTTTAGATTGTGGTATAACCATATAAGTGCTGTGCCT
AGTTCCAGCAACGGTCAGTTCCGAGGATTTGGGGAGTTTGGTCTGCAAAAGACAATGAGA
ATAAAATAAAAGCATTTTAAATAATGAGAAAGTGTTTTCTTTTTTAAACTTGGTCTGTTG
TTTGGTTGGGTTTAATACTTATGACACATCTATTAATATCGTTTTCATATTTATTATGGG
GAATATTTTTAAATAATTGCATCTTTATAGACTTGC

QA 1 456 1 456
DS 



CO CL1Contig47 1178 4 5 U
CCATTAAATTACTATCGAAATTTTATTTTCTTCAAAAGTTTGCTTGCTGAGCACTCGTTA
GGACAACAAGGAAGACAACAGAGTTCCAAACGCACAACGATTACGTGTCTCTACTCAAAA
ACAACCCGAAGTTTGTTAAAAGAGAAGCAAAACGATCTGCTTTCACAAGTCACTTGCCTC
TAAAGCCAATTAAAAGACAGCTAAAAGAGCTATATCGTAGTGGCAACAGCTTCAGGTTGA
TGAGGAAGTATCTTATGAGCCGTGGGGACATTGTTCTTGGACTTGTTAGCTACACGGCTC
GCTCTTGGTTCCTTCACCGGTGTCACTTTCTTCCTCGAGGACTCCGGGAGAACTTTCCTC
ACCTCGTTCGCCAGCTCTATAACATAATCCTCCTCATGCCCGATGTCGTGCATTGCCTTC
TCTAGCAGGAAGAGATAATCTCTGTTGTTACCACATGGTCCATTGGCTGTCGCAATTTGT
CTTGCCATGTCTTCTAATGGCGCAGGTCCAAGGTAATACTTGTTGGAGACCTTGTCTGGG
GTAGAAGTGAATACTATCACTCCAGTTACAGATGGCTTCAGGGGATCATCTTCGTTGTAA
AAGTCTACACATGTCTTGAGATCATATTCACACTCTCTACGTTCCAGGTACTCCATAGCC
AGACGTTCTTCTTCGGGCCCTCCACGGACACAGAAAGCAGCACCCCAGCATATGGCTTCT
TCATCTTTCTCGAGTGTGCAAGTTCTTGCAGGGTGTTCTGGTGTACCTCTGTGATCAATG
CAAGCAAGATCAAAGACACGTTTATATCCCTTGATGAAACCCAACACTTTCTCATCGTAA
TGAAATCCTGGGTTCCACACAAGAGAGCCATAACCAAAGACCCACATCACCATCTTCTGC
AGTTAACTGCGTCGGGGACGATCTTGGTGAAGAGGAAAACGCAATTCCACGGGTAGACAA
GATCTCCTCTCGTAAATTAAAACCCGAAATAAAACTGAGAGAAACTGGTGGGAGGAGAGA
TTCCAGAGGATGGTAGAGGGAACGACGTCGTTTAATGTTTATGTTCGAATGGAGCTGGTA
ATGGTGATGAGACCACTTAGCTCCTTTCTTCTCCCTCCTTTCTCTCTGAGTCTCTCTCTC
TCTCTTATTTTTTTTTCTCTCTCTGATTTCGAGTTCAC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CG35JQ U 2
AF RS1D488JQ U 1
AF RS1AH74JQ U 60
AF RS1D488TF C 402
BS 1 227 RS1D488JQ
BS 228 228 RS1CG35JQ
BS 229 705 RS1D488JQ
BS 706 859 RS1AH74JQ
BS 860 1178 RS1D488TF

RD RS1CG35JQ 643 0 0
CG
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CAACAAGGAAGACAACAGAGTTCCAAACGCACAACGATTACGTGTCTCTACTCAAAAACA
ACCCGAAGTTTGTTAAAAGAGAAGCAAAACGATCTGCTTTCACAAGTCACTTGCCTCTAA
AGCCAATTAAAAGACAGCTAAAAGAGCTATATCGTAGTGGCAACAGCTTCAGGTTGATGA
GGAAGTATCTTATGAGCCGTGGGGACATTGTTCTTGGACTTGTTAGCTACACGGCTCGCT
CTTGGTTCCTTCACCGGTGTCACTTTCTTCCTCGAGGACTCCGGGAGAACTTTCCTCACC
TCGTTCGCCAGCTCTATAACATAATCCTCCTCATGCCCGATGTCGTGCATTGCCTTCTCT
AGCAGGAAGAGATAATCTCTGTTGTTACCACATGGTCCATTGGCTGTCGCAATTTGTCTT
GCCATGTCTTCTAATGGCGCAGGTCCAAGGTAATACTTGTTGGAGACCTTGTCTGGAGTA
GAAGTGAATACTATCACTCCAGTTACAGATGGCTTCAGGGGATCATCTTCGTTGTAAAAG
TCTACACATGTCTTGAGATCATATTCACACTCTCTACGTTC

QA 3 643 3 643
DS 

RD RS1D488JQ 705 0 0
CCATTAAATTACTATCGAAATTTTATTTTCTTCAAAAGTTTGCTTGCTGAGCACTCGTTA
GGACAACAAGGAAGACAACAGAGTTCCAAACGCACAACGATTACGTGTCTCTACTCAAAA
ACAACCCGAAGTTTGTTAAAAGAGAAGCAAAACGATCTGCTTTCACAAGTCACTTGCCTC
TAAAGCCAATTAAAAGACAGCTAAAAGAGCTATATCGTAGTGGCAACGGCTTCAGGTTGA
TGAGGAAGTATCTTATGAGCCGTGGGGACATTGTTCTTGGACTTGTTAGCTACACGGCTC
GCTCTTGGTTCCTTCACCGGTGTCACTTTCTTCCTCGAGGACTCCGGGAGAACTTTCCTC
ACCTCGTTCGCCAGCTCTATAACATAATCCTCCTCATGCCCGATGTCGTGCATTGCCTTC
TCTAGCAGGAAGAGATAATCTCTGTTGTTACCACATGGTCCATTGGCTGTCGCAATTTGT
CTTGCCATGTCTTCTAATGGCGCAGGTCCAAGGTAATACTTGTTGGAGACCTTGTCTGGG
GTAGAAGTGAATACTATCACTCCAGTTACAGATGGCTTCAGGGGATCATCTTCGTTGTAA
AAGTCTACACATGTCTTGAGATCATATTCACACTCTCTACGTTCCAGGTACTCCATAGCC
AGACGTTCTTCTTCGGGCCCTCCACGGACACAGAAAGCAGCACCC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RS1AH74JQ 800 0 0
AGGACAACAAGGAAGACAACAGAGTTCCAAACGCACAACGATTACGTGTCTCTACTCAGA
AACAACCCGAAGTTTGTTAAAAGAGAAGCAAAACGATCTGCTTTCACAAGTCACTTGCCT
CTAAAGCCAATTAAAAGACAGCTAAAAGAGCTATATCGTAGTGGCAACAGCTTCAGGTTG
ATGAGGAAGTATCTTATGAGCCGTGGGGACATTGTTCTTGGACTTGTTAGCTACACGGCT
CGCTCTTGGTTCCTTCACCGGTGTCACTTTCTTCCTCGAGGACTCCGGGAGAACTTTCCT
CACCTCGTTCGCCAGCTCTATAACATAATCCTCCTCATGCCCGATGTCGTGCATTGCCTT
CTCTAGCAGGAAGAGATAATCTCTGTTGTTACCACATGGTCCATTGGCTGTCGCAATTTG
TCTTGCCATGTCTTCTAATGGCGCAGGTCCAAGGTAATACTTGTTGGAGACCTTGTCTGG
AGTAGAAGTGAATACTATCACTCCGGTTACAGATGGCTTCAGGGGATCATCTTCGTTGTA
AAAGTCTACACATGTCTTGAGATCATATTCACACTCTCTACGTTCCAGGTACTCCATAGC
CAGACGTTCTTCTTCGGGCCCTCCACGGACACAGAAAGCAGCACCCCAGCATATGGCTTC
TTCATCTTTCTCGAGTGTGCAAGTTCTTGCAGGGTGTTCTGGTGTACCTCTGTGATCAAT
GCAAGCAAGATCAAAGACACGTTTATATCCCTTGATGAAACCCAACACTTTCTCATCGTA
ATGAAATCCTGGGTTCCACA

QA 1 800 1 800
DS 

RD RS1D488TF 777 0 0
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ATTGGCTGTCGCAATTTGTCTTGCCATGTCTTCTAATGGCGCAGGTCCAAGGTAATACTT
GTTGGAGAC*TTGTCTGGGGTAGAAGTGAATACTATCACTCCAGTTACAGATGGCTTCAG
GGGATCATCTTCGTTGTAAAAGTCTACACATGTCTTGAGATCATATTCACACTCTCTACG
TTCCAGGTACTCCATAGCCAGACGTTCTTCTTCGGGCCCTCCACGGACACAGAAAGCAGC
ACCCCAGCATATGGCTTCTTCATCTTTCTCGAGTGTGCAAGTTCTTGCAGGGTGTTCTGG
TGTACCTCTGTGATCAATGCAAGCAAGATCAAAGACACGTTTATATCCCTTGATGAAACC
CAACACTTTCTCATCGTAATGAAATCCTGGGTTCCACACAAGAGAGCCATAACCAAAGAC
CCACATCACCATCTTCTGCAGTTAACTGCGTCGGGGACGATCTTGGTGAAGAGGAAAACG
CAATTCCACGGGTAGACAAGATCTCCTCTCGTAAATTAAAACCCGAAATAAAACTGAGAG
AAACTGGTGGGAGGAGAGATTCCAGAGGATGGTAGAGGGAACGACGTCGTTTAATGTTTA
TGTTCGAATGGAGCTGGTAATGGTGATGAGACCACTTAGCTCCTTTCTTCTCCCTCCTTT
CTCTCTGAGTCTCTCTCTCTCTCTTATTTTTTTTTCTCTCTCTGATTTCGAGTTCAC

QA 1 777 1 777
DS 



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ATTAAACGACGTCGTTCCCTCTACCATCCTCTGGAATCTCTCCTCCCACCAGTTTCTCTC
AGTTTTATTTCGGGTTTTAATTTACGAAAGGAGATCTTGTCTACCCGTGGAATTGCGTTT
TCCTCTTCACCAAGATCGTCCCCAACGGTAACGTCTTGATTTTGATTTATTTGGGTCTCC
TCTCCTCCAGCATTTAAGCAGTTAACTGCAGAAGATGGTGATGTGGGTCTTTGGTTATGG
CTCTCTTGTGTGGAACCCAGGATTTCATTACGATGAGAAAGTGTTGGGTTTCATCAAGGG
ATATAAACGTGTCTTTGATCTTGCTTGCATTGATCACAGAGGTACACCAGAACACCCTGC
AAGAACTTGCACACTCGAGAAAGATGAAGAAGCCATATGCTGGGGTGCTGCTTTCTGTGT
CCGTGGAGGGCCCGAAGAAGAACGTCTGGCTATGGAGTACCTGGAACGTAGAGAGTGTGA
ATATGATCTCAAGACATGTGTAGACTTTTACAACGAAGATGATCCCCTGAAGCCATCTGT
AACTGGAGTGATAGTATTCACTTCTACTCCAGACAAGTCTCCAACAAGTATTACCTTGGA
CCTGCGCCATTAGAAGACATGGCAAGACAAATTGCGACAGCCAATGGACCATGTGGTACA
CAGAGATATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DB82TF U 1
AF RS1CG35TF U 11
BS 1 186 RS1DB82TF
BS 187 187 RS1CG35TF
BS 188 299 RS1DB82TF
BS 300 791 RS1CG35TF

RD RS1DB82TF 299 0 0
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AGGGAGAAAAAAGGAGCTAAGTGGTCTCATCACCATTACCAGCTCCATTCGAACATAAAC
ATTAAACGACGTCGTTCCCTCTACCATCCTCTGGAATCTCTCCTCCCACCAGTTTCTCTC
AGTTTTTTTTCGGGTTTTAATTTACGAAAGGAGATCTTGTCTACCCGTGGAATTGCGTTT
TCCTCTTCACCAAGATCGTCCCCAACGGTAACGTCTTGATTTTGATTTATTTGGGTCTC

QA 1 299 1 299
DS 

RD RS1CG35TF 781 0 0
GGAGAGAGAGA
AAAAAAAATAAGAGAGAGAGAGAGATTCAGAGAGAAAGGAGGGAGAAGAAAGGAGCTAAG
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TACCATCCTCTGGAATCTCTCCTCCCACCAGTTTCTCTCAGTTTTATTTCGGGTTTTAAT
TTACGAGAGGAGATCTTGTCTACCCGTGGAATTGCGTTTTCCTCTTCACCAAGATCGTCC
CCGACGGTAACGTCTTGATTTTGATTTATTTGGGTCTCCTCTCCTCCAGCATTTAAGCAG
TTAACTGCAGAAGATGGTGATGTGGGTCTTTGGTTATGGCTCTCTTGTGTGGAACCCAGG
ATTTCATTACGATGAGAAAGTGTTGGGTTTCATCAAGGGATATAAACGTGTCTTTGATCT
TGCTTGCATTGATCACAGAGGTACACCAGAACACCCTGCAAGAACTTGCACACTCGAGAA
AGATGAAGAAGCCATATGCTGGGGTGCTGCTTTCTGTGTCCGTGGAGGGCCCGAAGAAGA
ACGTCTGGCTATGGAGTACCTGGAACGTAGAGAGTGTGAATATGATCTCAAGACATGTGT
AGACTTTTACAACGAAGATGATCCCCTGAAGCCATCTGTAACTGGAGTGATAGTATTCAC
TTCTACTCCAGACAAGTCTCCAACAAGTATTACCTTGGACCTGCGCCATTAGAAGACATG
GCAAGACAAATTGCGACAGCCAATGGACCATGTGGTACACAGAGATATCT

QA 12 781 12 781
DS 



CO CL1Contig49 1345 3 3 U
AAACTTCAAATTATTATATAAAAAAAATGAATAAAAACATCATTTTGCAACACACATTAA
TGTTTACATGCTTTCAGTTACTTTTACACACTCTGCAAATACAACAATTCAATACGACAT
ACATACAGATATAAAATTTTCGTTTGTATAAGTTCTACAGGGAGTCAGGGAGGACAACCC
CTAAAGAAAAATAGCACACTTATTACGTAAACACTTGTCGAGTGAAGAAGCAAAGAGGAT
CTTGAGAACAACCGCAAAACGGAGGAGAGAGACTTACGAAGTGGAAGAAGTAGGTGCAGT
TGCAGGGTTGAATGCTTTCTGCTCAGCGCAACTGAGCTCCTCGTTTGGACCCGCGTCTTC
TCTTCCAATACCCAAGAGGTCCAGGAAGTACAAGTAGTGCGAGACTATGTTGTTCATTGG
CTCAATGTCGCCTTGACCACACGTGTACTCTCCGTACAGAACGTTCATGGTGGTGCCAAA
AGTCGGGCCACGCTTGGACGGAGTATCGTTCTTGGTTGGTTTCCAGTTACCAACAAAGAT
GTCGTGAGCAGAGGGCTGAACTTTCTTGATCGGCGTCATCCATCTCCAGATAGCAGCTTG
GAAGGCGAGTGTGGCGTTCTGCTCGATGTACTCGGGATGGTTCAAGAGATCGGCTTTTAG
GGCTTCCCCAGCTGCACCGTAGTTGAAGTTCCAGTAAATGGGTAAAGCACCACGTCCGTA
GTACTCAGCTCCAGGGCTGCAAGGGTACTTGTATTTCCAGGTCTCGTCACAGTAAGATTG
CATTGGACTCATCTCCCTGTTGTAGCAAAGACCCCAAGCTAAAGGCCCTCCTGTTGCGAC
TCCATAACCACAGGAGGTTTTGCTGGCGACATGACCGAGAAAGGCAGCCATTTCTTTCTG
TCCCATGAGTTTTCCACCGGTGGTACCAAACCCGAGAGGCTCAAAGAGAGCAGCGGCGGT
GATGAAGGACCGGTAGTCCCAGAAACCAACGGCATGAGCTATGGGAGTGTTTCTTTTGGC
GAAGAGCTGCTCGAACTGGTAAACCTGAAAGTAATCTGATATCGTCTGGTTACAGCAGTA
TTCGGACCACCAGACGCATTCCCATCCTTGCGTGCACACTTTCTTCCCCTTCACTTTCTT
CACTTTGATCGTCTTGTCTTCCCCATTTGCAAACAAAGCCAGGGATGATACAGCCAGCAG
AACAAGGATAAACACTGAAACGCTCCGGATTGTCACCAGCTTATACACGGCTGCAATGCT
GCTCAGCTAGATCCAGAGAGAGATTGAGAAAAACTTTCTTTTTTTTTTGTTTTGCTTCGT
TGCCGAACAATTAAGAGATTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1DZ47JQ U 1
AF RS1E974JQ U 29
AF RS1E974TF C 619
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GTTGAAAC

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CACTCTGCAAATACAACAATTCAATACGACATACATACAGATATAAAATTTTCGTTTGTA
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AAACACTTGTCGAGTGAAGAAGCAAAGAGGATCTTGAGAACAACCGCAAAACGGAGGAGA
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TCTCCGTACAGAACGTTCATGGTGGTGCCAAAAGTCGGGCCACGCTTGGACGGAGTATCG
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TACTCGGGATGGTTCAAGAGATCGGCTTTTAGGGCTTCCCCAGCTGCACCGTAGTTGAAG
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QA 1 711 1 711
DS 

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GTAGTTGAAGTTCCAGTAAATGGGTAAAGCACCACGTCCGTAGTACTCAGCTCCAGGGCT
GCAAGGGTACTTGTATTTCCAGGTCTCGTCACAGTAAGATTGCATTGGACTCATCTCCCT
GTTGTAGCAAAGACCCCAAGCTAAAGGCCCTCCTGTTGCGACTCCATAACCACAGGAGGT
TTTGCTGGCGACATGACCGAGAAAGGCAGCCATTTCTTTCTGTCCCATGAGTTTTCCACC
GGTGGTACCAAACCCGAGAGGCTCAAAGAGAGCAGCGGCGGTGATGAAGGACCGGTAGTC
CCAGAAACCAACGGCATGAGCTATGGGAGTGTTTCTTTTGGCGAAGAGCTGCTCGAACTG
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TTCCCATCCTTGCGTGCACACTTTCTTCCCCTTCACTTTCTTCACTTTGATCGTCTTGTC
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AGAGATTGAGAAAAACTTTCTTTTTTTTTTGTTTTGCTTCGTTGCCGAACAATTAAGAGA
TTCTCCC

QA 1 727 1 727
DS 



CO CL1Contig50 686 3 6 U
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TAGTGAATTTTAATTTGGTTTCTTTC


BQ
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AF RS1F308JQ C 1
AF RS1F308TF U 60
AF RS1EO48TF U 18
BS 1 24 RS1F308JQ
BS 25 59 RS1EO48TF
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BS 682 686 RS1EO48TF

RD RS1F308JQ 681 0 0
GGGTAGTGTTCATTAGATTAGATCATTAGATCAGATCTCTTTGTTTTACATTTCCAATGG
CGTCCTCTTGCTTTGCTCATCTTCCTCTCTCAGGTGGTTCTCAATCTCATTACGTGAATG
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AGAAGAAATCAAACCGGACTCGCAACTTTTCAGTTTGT*CAGAGTATGGGAGAAGGAGAG
GAAGCGGTGGTGGTGGTGATTTCGTAGCTGGTTTTCTTCTTGGAGGTGCTTTGTTTGGCG
CTGCCGCCTACATCTTTGCTCCTCAGATCCGAAGATCGATAATGAGTGAAGAAGATGAGT
ATGGATTCAAGAAGCCAGAGCAACCAAGTTACTA*GATGAAGGTTTGGAGAAAACAAGGG
AGACTTTGAACGAGAAGATCGGACAGCTTAACTCGGCTATTGATAATGTCTCTTCGCGTT
TGAGAGGTCGAGGAAAGAAGAGTTCTCCCTCCCCTGTCGAAACTGATGCAGAAGTTGAAG
CTACTACTTGAAAAAAAGAACACAAAAACACTTGCAAAGTTATTTCCTTCTCTGTTTTTG
TGCTCTTGTCTTATGTAGAAACTCTTGCAAAGTTACGATGTTACTGTCTCTTTTGGTTTT
TAGTGAATTTTAATTTGGTTT

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DS 

RD RS1F308TF 622 0 0
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GCAAATGGACTGTCCACCGCAAAGCTCAATTCGATCTGTAAATCCTCTGCATTGAGTATC
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GGAAGCGGTGGTGGTGGTGATTTCGTAGCTGGTTTTCTTCTTGGAGGTGCTTTGTTTGGC
GCTGCCGCCTACATCTTTGCTCCTCAGATCCGAAGATCGATAATGAGTGAAGAAGATGAG
TATGGATTCAAGAAGCCAGAGCAACCAAGTTACTA*GATGAAGGTTTGGAGAAAACAAGG
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TTGAGAGGTCGAGGAAAGAAGAGTTCTCCCTCCCCTGTCGAAACTGATGCAGAAGTTGAA
GCTACTACTTGAAAAAAAGAACACAAAAACACTTGCAAAGTTATTTCCTTCTCTGTTTTT
GTGCTCTTGTCTTATGTAGAAACTCTTGCAAAGTTACGATGTTACTGTCTCTTTTGGTTT
T*AGTGAATTTTAATTTGGTTT

QA 1 622 1 622
DS 

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GGAGATC
ATTAGATCAGATCTCTTTGTTTTACATTTCCAATGGCGTCCTCTTGCTTTGCTCATCTTC
CTCTCTCAGGTGGTTCTCAATCTCATTACGTGAATGCAAATGGACTGTCCACCGCAAAGC
TCAATTCGATCTGTAAATCCTCTGCATTGAGTATCCAGAAGAAATCAAACCGGACTCGCA
ACTTTTCATTTTGTGCAGAGTATGGGAGAAGGAGAGGAAGCGGTGGTGGTGGTGATTTCG
TAGCTGGTTTTCTTCTTGGAGGTGCTTTGTTTGGCGCTGCCGCCTACATCTTTGCTCCTC
AGATCCGAAGATCGATAATGAGTGAAGAAGATGAGTATGGATTCAAGAAGCCAGAGCAAC
CAAGTTACTACGATGAAGGTTTGGAGAAAACAAGGGAGACTTTGAACGAGAAGATCGGAC
AGCTTAACTCGGCTATTGATAATGTCTCTTCGCGTTTGAGAGGTCGAGGAAAGAAGAGTT
CTCCCTCCCCTGTCGAAACTGATGCAGAAGTTGAAGCTACTACTTGAAAAAAAGAACACA
AAAACACTTGCAAAGTTATTTCCTTCTCTGTTTTTGTGCTCTTGTCTTATGTAGAAACTC
TTGCAAAGTTACGATGTTACTGTCTCTTTTGGTTTTTAGTGAATTTTAATTTGGTTTCTT
TC

QA 8 669 8 669
DS 



CO CL1Contig51 568 7 8 U
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AAGAAGATGAACAACGCTATGAAGATGTAAACAGACTTCATTTTGCTTTGTTTACTGTTT
ATTGTCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FJ83JQ U 1
AF RS1FJ83TF C 1
AF RS1GK85JQ U 1
AF RS1A213JQ U 63
AF RS1A213TR U 96
AF RS1GK85TF C 1
AF RS1A213TF C 63
BS 1 105 RS1FJ83JQ
BS 106 106 RS1GK85JQ
BS 107 272 RS1FJ83JQ
BS 273 273 RS1GK85JQ
BS 274 371 RS1FJ83JQ
BS 372 372 RS1GK85JQ
BS 373 547 RS1FJ83JQ
BS 548 568 RS1A213TF

RD RS1FJ83JQ 547 0 0
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AAGAAGATGAACAACGCTATGAAGATGTAAACAGACTTCATTTTGCTTTGTTTACTGTTT
ATTGTCC

QA 1 547 1 547
DS 

RD RS1FJ83TF 547 0 0
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TTGAGCGGTTGCGTTTAGCGTTTTAAACAGTAATAATAAGCGGTGTATGATTTCTAGCTT
GTAATATATATCTAATCGTCTTTGCAGTAGTCACAGAAACATTTGATAGGTTTGCTTTTG
TGTTTCTTCACGCATTTACCGCCTTTAGCACCTTTGAAACTCCTGCAGTTTTGACGACAC
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AAGAAGATGAACAACGCTATGAAGATGTAAACAGACTTCATTTTGCTTTGTTTACTGTTT
ATTGTCC

QA 1 547 1 547
DS 

RD RS1GK85JQ 548 0 0
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ATTGTCC
C

QA 1 547 1 547
DS 

RD RS1A213JQ 484 0 0
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AATATATATCTAGTCGTCTTTGCAGTAGTCGCAAAAACATTTGATAGGTTTGCTTTTGTG
TTTCTTCACGCATTTACCGCCTTTAGCACCTTTGAAACTCCTGCAGTTTTGACGACACAA
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GAAGATGAACAACGCTATGAAGATGTAAACAGACTTCATTTTGCTTTGTTTACTGTTTAT
TGTC

QA 1 484 1 484
DS 

RD RS1A213TR 451 0 0
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GTTTTTTTT*GTTTGCAATAGTGGATTGAGCGGTTGCGTTTAGCGTTTTAAACAGTAATA
ATAAGCGGTGTATGATTTCTAGCTTGTAATATATATCTAGTCGTCTTTGCAGTAGTCGCA
AAAACATTTGATAGGTTTGCTTTTGTGTTTCTTCACGCATTTACCGCCTTTAGCACCTTT
GAAACTCCTGCAGTTTTGACGACACAACGTGGGGAAAAACTTAGGGTTACAGAACGTGGG
ACCCACGTCTCCCCCGTACTCCTCCAGGCATTTGAACTTCTCGTCGGCTCCTGTCTTCTC
CGGCGACTCACCAAGAACGGCGAGGAAAAAAATGAACAACGCTATGAAAATGTAAACAGA
CTTCATTTTGCTTTGTTTACTGTTTATTGTC

QA 1 451 1 451
DS 

RD RS1GK85TF 548 0 0
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TTGAGCGGTTGCGTTTAGCGTTTTAAACAGTAATAATAAGCGGTGTATGATTTCTAGCTT
GTAATATATATCTAATCGTCTTTGCAGTAGTCGCAGAAACATTTGATAGGTTTGCTTTTG
TGTTTCTTCACGCATTTACCGCCTTTAGCACCTTTGAAACTCCTGCAGTTTTGACGACAC
AACGTGGGGAAGAACTTAGGGTTACAGAACGTGGGACCCACGTCTCCCCCGTACTCCTCC
AGGCATTTGAACTTCTCGTCGGCTCCTGTCTTCTCCGGCGACTCACCAAGAACGGCGAGG
AAGAAGATGAACAACGCTATGAAGATGTAAACAGACTTCATTTTGCTTTGTTTACTGTTT
ATTGTCC
C

QA 1 547 1 547
DS 

RD RS1A213TF 506 0 0
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TTATATCAAAGTATAAAACGCTATAGGGAAAAGGTTTTTTTT*GTTTGCAATAGTGGATT
GAGCGGTTGCGTTTAGCGTTTTAAACAGTAATAATAAGCGGTGTATGATTTCTAGCTTGT
AATATATATCTAGTCGTCTTTGCAGTAGTCGCAGAAACATTTGATAGGTTTGCTTTTGTG
TTTCTTCACGCATTTACCGCCTTTAGCACCTTTGAAACTCCTGCAGTTTTGACGACACAA
CGTGGGGAAGAACTTAGGGTTACAGAACGTGGGACCCACGTCTCCCCCGTACTCCTCCAG
GCATTTGAACTTCTCGTCGGCTCCTGTCTTCTCCGGCGACTCACCAAGAACGGCGAGGAA
GAAGATGAACAACGCTATGAAGATGTAAACAGACTTCATTTTGCTTTGTTTACTGTTTAT
TGTCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTC

QA 1 506 1 506
DS 



CO CL1Contig52 424 2 16 U
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AAGTTGCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGACAGCC
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CCACTACACAATGCCGAAACACCAAAGCGGAATGTGACAAACATTGTATCTATTAGCATC
TGGGGCCGTTGAATATTTATGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTCAT
ACTTCATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATAATTCATAATCCACAGGAGGAGCAGCT
AGTATTATGTACTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGAAAATTCAATAAATAGTTATTTTCTG
ACTG


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 

AF RS1FW49TF U 1
AF RS1E587JQ C -1
BS 1 12 RS1FW49TF
BS 13 13 RS1E587JQ
BS 14 193 RS1FW49TF
BS 194 194 RS1E587JQ
BS 195 198 RS1FW49TF
BS 199 199 RS1E587JQ
BS 200 245 RS1FW49TF
BS 246 246 RS1E587JQ
BS 247 338 RS1FW49TF
BS 339 339 RS1E587JQ
BS 340 355 RS1FW49TF
BS 356 356 RS1E587JQ
BS 357 397 RS1FW49TF
BS 398 398 RS1E587JQ
BS 399 423 RS1FW49TF
BS 424 424 RS1E587JQ

RD RS1FW49TF 424 0 0
GGACAAAAAAAA*CACACTAAACATTTATTTAAAGTGGAGAGTTACAATGTCGGCATCCA
AAGTTGCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGACAGCC
CTCAAAGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGAACCAAAGTTTGGTTGGTGTTGCAGCT
CCACTACACAATGTCGAAGCACCAAAGCGGAATGTGACAAACATTGTATCTATTAGCATC
TGGGGTCGTTGAATATTTATGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTCAT
ACTTCATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATAATTCCTAATCCACAGGAGGAGGAGCT
AGTATTATGTACTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGAAAGTTCAATAAATAGTTATTTTCTG
ACT
A

QA 1 423 1 423
DS 

RD RS1E587JQ 426 0 0
GGCT
ACAAAAAAAAACACACTAAACATTTATTTAATGTGGAGAGTTACAATGTCGGCATCCAAA
GTTGCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAGCCCT
CAAAGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGAACCAAAGTTTGGTTGGTGTTGCAGCTCC
ACTACACAATGCCGAAACACCAAAGCGGAATGTGACAAACATTGTATCTATTAGCATCTG
GGGCCGTTGAATTTTTCTGAAGAGAATTTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTCATAC
TTCATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATAATTCATATTCCACAGGAGGAGCAGCTAG
TATTATGTACTAAATGTTTTGGAATTTCTTTGAAAATTCAATAAATAGTTATTTTCTGAC
TG

QA 5 426 5 426
DS 



CO CL1Contig53 521 4 5 U
AACGCAGAGTGGGTCATTACGGCCGGGGGACGAAAAAAACACACTAAACATTTATTTAAA
GTGGAGAGTTACAATGTCGGCATCCAAAGTTGCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCT
TGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAGCCCTCAAAGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGA
ACCAAAGTTTGGTTGGTGTTGCAGCTCCACTACACAATGCCGAAGCACCAAAGCGGAATG
CGACAAACATTGTATCTGGTAGCATCTGGGGCCGTTGAATATTTATGAAGAGAAATTCCA
TAATTATATGTTCCAAATATTTTCATACTTAATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATA
ATTCCTATTCCACAGGAGGAGCAGCTAGTATTATGTACTAAATGTTTTTGAATTTCTTTG
AAAATTCAATAAATAGTTATTTTCTGACTTTCTTCAATTGTATTTTAGAAATTTATAAAT
GTTACATAAAATGAGAATAAACCCATTTAAGACTAAGAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AV96JQ C 28
AF RS1AV96TF U 28
AF RS1G825JQ C 1
AF RS1EA05TF U 74
BS 1 27 RS1G825JQ
BS 28 326 RS1AV96TF
BS 327 327 RS1EA05TF
BS 328 449 RS1AV96TF
BS 450 521 RS1EA05TF

RD RS1AV96JQ 422 0 0
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GTATTATGTACTAAATGTTTTTGAATTTCTTTGAAAATTCAATAAATAGTTATTTTCTGA
CT

QA 1 422 1 422
DS 

RD RS1AV96TF 422 0 0
GGACGAAAAAAACACACTAAACATTTATTTAAAGTGGAGAGTTACAATGTCGGCATCCAA
AGTTGCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAGCCC
TCAAAGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGAACCAAAGTTTGGTTGGTGTTGCAGCTC
CACTACACAATGCCGAAGCACCAAAGCGGAATGCGACAAACATTGTATCTGGTAGCATCT
GGGGCCGTTGAATATTTATGAAGAGAAATTCCATAATTATATGTTCCAAATATTTTCATG
CTTAATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATAATTCCTATTCCACAGGAGGAGCAGCTA
GTATTATGTACTAAATGTTTTTGAATTTCTTTGAAAATTCAATAAATAGTTATTTTCTGA
CT

QA 1 422 1 422
DS 

RD RS1G825JQ 513 0 0
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GTGGAGAGTTACAATGTCGGCATCCAAAGTTGCTTTATTTTGTATTGTTCTAGTTTGTCT
TGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAGCCCTCAAAGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGA
ACCAAAGTTTGGTTGGTGTTGCAGCTCCACTACACAATGCCGAAGCACCAAAGCGGAATG
CGACAAACATTGTATCTGGTAGCATCTGGGGTCGTTGAATATTTATGAAGAGAAATTCCA
TAATTATATGTTCCAAATATTTTCATACTTAATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATA
ATTCCTATTCCACAGTAGGAGCAGCTAGTATTATGTACTAAATGTTTTTGAATTTCTTTG
AAAATTCAATAAATAGTTATTTTCTGACTTTCTTCAATTGTATTTTAGAAATTTATAAAT
GTTACATAAAATGAGAATAAACCCATTTAAGAC

QA 1 513 1 513
DS 

RD RS1EA05TF 448 0 0
G
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AATGTGCCAGCCCTCAAAGAAAACCTAAGGGAACATGCTCTAAAGAACCAAAGTTTGGTT
GGTGTTGCAGCTCCACTACACAATGCCGAAGCACCAAAGCGGAATGCGACAAACATTGTA
TCTGGTAGCATCTGGGGCCGTTGAATATTTATGAAGAGAAATTCCATAATTATATGTTCC
AAATATTTTCATACTTAATAAATTTAAATTTGAATAATAAATAATAATTCCTATTCCACA
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AGTTATTTTCTGACTTTCTTCAATTGTATTTTAGAAATTTATAAATGTTACATAAAATGA
GAATAAACCCATTTAAGACTAAGAAAA

QA 2 448 2 448
DS 



CO CL1Contig54 648 2 5 U
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CCTAAGTCGAAAATTCAATACTGGAAAAAACTTATACGGAACTTGGTAGCATGACAAAGC
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TCAAACTTCCCTTGATCCTTGCTTCCAGTATTCTGAACGAGCCCTTCACCCACAACGTAT
TGACCAATAATGGGGTGACGCTGCTTTGCGTGATCCACTATGTCAGTCGGCTCTTCCATT
CCCTTGAATAGAAGAAGATCAATCACCTTAGGATCGGTGACGTGAGCGTTTTTACGAATC
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GCCTCCGTGAGGTTAGCTGAGTTCGGCGGAACTCCGATCTTCCTCAACGTGAAAGGTGCT
GCCATCTGATCTACGCTTGCTTTAATCGCTAAAGACAGAGAGAGAGCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GT10JQ U 0
AF RS1GT10TF C 1
BS 1 2 RS1GT10TF
BS 3 81 RS1GT10JQ
BS 82 82 RS1GT10TF
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RD RS1GT10JQ 377 0 0
AAA
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AAACTTCCCTTGATCCTTGCTTCCAGTATTCTGAACGAGCCCTTCACCCACAACGTATTG
ACCAATAATGGGGTGACGCTGCTTTGCGTGATCCACTATGTCAGTCGGCTCTTCCATTCC
CTTGAATA
AAAAAA

QA 4 371 4 371
DS 

RD RS1GT10TF 648 0 0
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CCCTTGAATAGAAGAAGATCAATCACCTTAGGATCGGTGACGTGAGCGTTTTTACGAATC
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TCCATGATGGTGGGGATGGATCTACATGCAGCTCTGAAGTAATCGAAAACACGGCGGCGA
GCCTCCGTGAGGTTAGCTGAGTTCGGCGGAACTCCGATCTTCCTCAACGTGAAAGGTGCT
GCCATCTGATCTACGCTTGCTTTAATCGCTAAAGACAGAGAGAGAGCC

QA 1 648 1 648
DS 



CO CL1Contig55 524 2 1 U
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GTTTTGGATTTTGGAACATGGTTGTTATCACATTGAGGTTCTGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1GZ93JQ C 1
AF RS1GZ93TF U 1
BS 1 524 RS1GZ93TF

RD RS1GZ93JQ 524 0 0
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GGGAAAGGTCATTTGCCTGAGGGCAAGCCGTTTGTGGTGAAGGCGAAGTTGATCTCGAAG
ACTGCTGAGAAGAAGATCGAGGAAGCTGGTGGTGCTGTTGTGCTCACTGCTTAGGTTTAT
CGCGAATTTATCTTTTTATTTTTGCTTTTTGTTTTTGAATTTTTTGCTAAGACTTGTCCT
GTTTTGGATTTTGGAACATGGTTGTTATCACATTGAGGTTCTGG

QA 1 524 1 524
DS 

RD RS1GZ93TF 524 0 0
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AGACTCAGGGAACAGGAAGAAGCGCGGTCACGTCAGCGCCGGACACGGTCGTATCGGGAA
GCACCGCAAGCATCCCGGAGGTCGCGGTAACGCAGGAGGTATGCACCACCACAGGATCCT
CTTCGACAAGTACCATCCCGGTTACTTCGGCAAAGTCGGTATGGGGTACTTCCACAAGCT
CCGCAACAGGATAAGGTGCCGATGATCGATGTGACGCAGCATGGGTTCTTTAAGGTGCTC
GGGAAAGGTCATTTGCCTGAGGGCAAGCCGTTTGTGGTGAAGGCGAAGTTGATCTCGAAG
ACTGCTGAGAAGAAGATCGAGGAAGCTGGTGGTGCTGTTGTGCTCACTGCTTAGGTTTAT
CGCGAATTTATCTTTTTATTTTTGCTTTTTGTTTTTGAATTTTTTGCTAAGACTTGTCCT
GTTTTGGATTTTGGAACATGGTTGTTATCACATTGAGGTTCTGG

QA 1 524 1 524
DS 



AS 3 59

CO CL2Contig1 760 23 12 U
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CCTCTATGCTTTCCTCCGCTGCTGTTGTTACCTCACCCGCTCAAGCCACCATGGTCGCTC
CATTCACCGGCTTGAAGTCATCCGCTGCATTCCCAGTCACCCGCAAAGCAAACAACGACA
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GAAAGAAGAAGTTTGAGACCCTCTCTTACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTA
AGGAAGTCGACTACCTTCTCCGCAACAAGTGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGC
ACGGATTTGTGTACCGTGAGCACGGAAGCACACCCGGATACTATGATGGACGGTACTGGA
CAATGTGGAAACTTCCCTTGTTCGGATGCACTGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCC
AAGAATGCAAAAAAGAGTACCCTAACGCCTTCATCAGGATCATCGGATTTGACAACAACC
GTCAGGTTCAGTGCATCAGTTTCATCGCCTACAAACCACCAAGCTTCACCGATGCTTAAT
TTGCTATGTCATTCACATAATAATAATCCCTGCTCATTTCATTTCCAATTCTGTTTTCGT
TCCCCTTTGGATTTCTGTTTCTCAGACATTCTATATCGGATTGTCAAATGTCTGATTGTG
AACATATAATTTCTATATTGCTTCTTCGTCTTGGTTAAAA


BQ
10 10 10 10 40 25 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 90 90 90 90 90 90 90 0 0 65 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 25 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 97 97 97 97 85 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
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97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 60 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 
97 45 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 85 85 85 80 75 75 40 40 40 35 35 35 35 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AV70TF U 16
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AF RS1H702JQB C 367
AF RS1FV31JQ C 85
AF RS1BV62JQ C 16
AF RS1EQ87TF U 19
AF RS1CX09TF U 5
AF RS1BW87TF U 1
AF RS1H702TF U 5
AF RS1CX09JQ C 7
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AF RS1CW57TF U 5
AF RS1AX50JQ C 5
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AF RS1BG95JQ C 250
AF RS1FV31TF U 5
AF RS1BJ25TF U 20
AF RS1BV62TF U 91
AF RS1BJ25JQ C 35
BS 1 5 RS1B570TF
BS 6 6 RS1CX09TF
BS 7 32 RS1B570TF
BS 33 33 RS1CX09TF
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BS 435 435 RS1E690TF
BS 436 643 RS1B570TF
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CTCCATTCACCGGCTTGAAGTCATCCGCTGCATTCCCAGTCACCCGCAAAGCAAACAACG
ACATTACTTCCATTGCAAGCAACGGAGGAAGAGTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCGCCAA
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GGACAATGTGGAAACTTCCCTTGTTCGGATGCACTGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAG
TCCAAGAATGCA

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CCGCTGCATTCCCAGTCACCCGCAAAGCAAACAACGACATTACTTCCATTGCAAGCAACG
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TACCGTGAGCACGGAAGCACACCCGGATACTATGATGGACGGTACTGGACAATGTGGAAA
CTTCCCTTGTTCGGATTCACTGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAATGCAAA
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TTGCTATGTCATTCACATAATAATAATCCCTGCTCATTTCATT*CCAATTCTGTTTTCGT
TCCCCTTTGGATTTCTGTTTCTCAGACATTCTATATCGGATTGTCAAATGTCTGATTGTG
A*CATATAATTTCTATATTGCTTCTTCGTCT
GGTC

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TGTCATTCACATAATAATAATCCCTGCTCATTTCATTTCCAATTCTGTTTTCGTTCCCCT
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TAATTTCTATATTGCT

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TTT
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GAGTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCGCCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGACCCTTTCTT
ACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCGACTACCTTTTCCGCAACA
AGTGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTGTGTACCGTGAGCACGGAA
GCACACCCGGATACTATGATGGACGGTACTGGACAATGTGGAAACTTCCCTTGTTCGGAT
GCACTGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAATGCAAAAAAGAGTACCCTAACG
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CCTACAAACCACCAAGCTTCACCGATGCTTAATTTGCTATGTCATTCACATAATAATAAT
CCCTGCTCATTTCATTTCCAATTCTGTTTTCGTTCCCCTTTGGATTTCTGTTTTTCAGAC
ATTCTATATCGGATTGTCAAATGTCTGATTGTGAACATATAATTTCTA
C

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GAGGAAGAGTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCGCCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGACCC
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AATAATCCCTGCTCATTTCATTTCCAATTCTGTTTTCGTTCCCCTTTGGATTTCTGTTTC
TCAGACATTCTATATCGGATTGTCAAATGTCTGATTGTGAACATGTAATTTCTATATTGC
TTCTTCGTCT
TG

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CCGCTGCATTCCCAGTCACCCGCAAAGCAAACAACGACATTACTTCCATTGCAAGCAACG
GAGGAAGAGTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCGCCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGACCC
TCTCTTACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCGACTACCTTCTCC
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TCGGATGCACTGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAATGCAAAAAAGAGTACC
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DS 

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TAATTTCTA

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TATAATTTCTATATTGCT

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TAATTTCTATATTGCT

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DS 

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TATAATTTCTATATTGCT

QA 1 738 1 738
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TATAATTTCTATATTG

QA 1 736 1 736
DS 

RD RS1AX50JQ 736 0 0
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GGTTCAGTGCATCAGTTTCATCGCCTACAAACCACCAAGCTTCACCGATGCTTAATTTGC
TATGTCATTCACATAATAATAATCCCTGCTCATTTCATTTCCAATTCTGTTTTCGTTCCC
CTTTGGATTTCTGTTTTTCAGACATTCTATATCGGATTGTCAAATGTCTGATTGTGAACA
TATAATTTCTATATT
A

QA 1 735 1 735
DS 

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GGAAGT
AAGTTAAGAGAAAAGAAG**AAGA*AGAAGAAGAAGAAGAAGTAGTAATGGCTTCCTCTA
TGCTTTCCTCCGCTGCTGTTGTTACCTCACCCGCTCAAGCCACCATGGTCGCTCCATTCA
CCGGCTTGAAGTCATCCGCTGCATTCCCAGTCACCCGCAAAGCAAACAACGACATTACTT
CCATTGCAAGCAACGGAGGAAGAGTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCGCCAATTGGAAAGA
AGAAGTTTGAGACCCTCTCTTACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAG
TCGACTACCTTCTCCGCAACAAGTGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGAT
TTGTGTACCGTGAGCACGGAAGCACACCCGGATACTATGATGGACGGTACTGGACAATGT
GGAAACTTACCTTGTTCGGATGCACTGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAAT
GCAAAAAAGAGTACCCTAACGCCTTCATCAGGATCATCGGATTTGACAACAACCGTCAGG
TTCAGTGCATCAGTTTCATCGCCTACAAACCACCAAGCTTCACCGATGCTTAATTTGCTA
TGTCATTCACATAATAATAATCCCTGCTCATTTCATT*CCAATTCTGTTTTCGTTCCCCT
TTGGATTTCTGTTTCTCAGACATTCTATATCGGATTGTCAAATGTCTGATTGTGAACATA
TAATTTCTATATTGCTTCTTCGT

QA 7 749 7 749
DS 

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AGTCACCCGCAAAGCAAACAACGACATTACTTCCATTGCAAGCAACGGAGGAAGAGTTAG
CTGCATGAAGGTGTGGCCGCCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGACCCTCTCTTACCTTCC
TGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCGACTACCTTCTCCGCAACAAGTGGAT
TCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTGTGTACCGTGAGCACGGAAGCACACC
CGGATACTATGATGGACGGTACTGGACAATGTGGAAACTTACCTTGTTCGGATGCACTGA
CTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAATGCAAAAAAGAGTACCCTAACGCCTTCAT
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ACCACCAAGCTTCACCGATGCTTAATTTGCTATGTCATTCACATAATAATAATCCCTGCT
CATTTCATT*CCAATTCTGTTTTCGTTCCCCTTTGGATTTCTGTTTCTCAGACATTCTAT
ATCGGATTGTCAAATGTCTGATTGTGAACATATAATTTCTATATTGCT

QA 1 648 1 648
DS 

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ACTACCTTCTCCGCAACAAGTGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTG
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AACTTACCTTGTTCGGATGCACTGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAATGCA
AAAAAGAGTACCCTAACGCCTTCATCAGGATCATCGGATTTGACAACAACCGTCAGGTTC
AGTGCATCAGTTTCATCGCCTACAAACCACCAAGCTTCACCGATGCTTAATTTGCTATGT
CATTCACATAATAATAATCCCTGCTCATTTCATT*CCAATTCTGTTTTCGTTCCCCTTTG
GATTTCTGTTTCTCAGACATTCTATATCGGATTGTCAAATGTCTGATTGTGAACATATAA
TTTCTATATTGCT

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DS 

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GG
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TGCTTTCCTCCGCTGCTGTTTTTACCTCACCCGCTCAAGCCACCATGGTCGCTCCATTCA
CCGGCTTGAAGTCATCCGCTGCATTCCCAGTCACCCGCAAAGCAAACAACGACATTACTT
CCATTGCAAGCAACGGAGGAAGAGTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCGCCAATTGGAAAGA
AGAAGTTTGAGACCCTCTCTTACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAG
TCGACTACCTTCTCCGCAACAAGTGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGAT
TTGTGTACCGTGAGCACGGAAGCACACCCGGATACTATGATGGACGGTACTGGACAATGT
GGAAACTTCCCTTGTTCGGATGCACTGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAAT
GCAAAAAAGAGTACCCTAACGCCTTCATCAGGATCATCGGATTTGACAACAACCGTCAGG
TTCAGTGCATCAGTTTCATCGCCTACAAACCACCAAGCTTCACCGATGCTTAATTTGCTA
TGTCATTCACATAATAATAATCCCTGCTCATTTCATTTCCAATTCTGTTTTCGTTCCCCT
TTGGATTTCTGTTTCTCAGACATTCTATATCGGATTGTCAAATGTCTGATTGTGAACATA
TAATTTCTA
C

QA 3 731 3 731
DS 

RD RS1BJ25TF 741 0 0
GG
AAGTTAAGAGAAAAGAAGAAGAAGTAGTAGTAATGGCTTCCTCTATGCTTTCCTCCGCTG
CTGTTGTTACCTCACCTGCTCAAGCCACCATGGTCGCTCCATTCACCGGCTTGAAGTCAT
CCGCTGCATTCCCAGTCACCCGCAAAGCAAACAACGACATTACTTCCATTGCAAGCAACG
GAGGAAGAGTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCGCCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGACCC
TCTCCTACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCGACTACCTTCTCC
GCAACAAGTGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGTACGGATTTGTGTACCGTGAGC
ACGGAAGCACACCCGGATACTATGATGGACGGTACTGGACAATGTGGAAACTTCCCTTGT
TCGGATGCACTGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAATGCAAAAAAGAGTACC
CTAACGCCTTCATCAGGATCATCGGATTTGACAACAACCGTCAGGTTCAGTGCATCAGTT
TCATCGCCTACAAACCACCAAGCTTCACCGATGCTTAATTTGCTATGTCATTTACATAAT
AATAATCCCTGCTCATTTCATTTCCAATTCTGTTTTCGTTCCCCTTTGGATTTCTGTTTC
TCAGACATTCTATATCGGATTGTCAAATGTCTGATTGTGAACATGTAATTTCTATATTGC
TTCTTCGTCTTGGTTAAAA

QA 3 741 3 741
DS 

RD RS1BV62TF 668 0 0
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TCCCAGTCACCCGCAAAGCAAACAACGACATTACTTCCATTGCAAGCAACGGAGGAAGAG
TTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCGCCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGACCCTCTCTTACC
TTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCGACTACCTTCTCCGCAACAAGT
GGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTGTGTACCGTGAGCACGGAAGCA
CACCCGGATACTATGATGGACGGTACTGGACAATGTGGAAACTTCCCTTGTTCGGATGCA
CTGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAATGCAAAAAAGAGTACCCTAACGCCT
TCATCAGGATCATCGGATTTGACAACAACCGTCAGGTTCAGTGCATCAGTTTCATCGCCT
ACAAACCACCAAGCTTCACCGATGCTTAATTTGCTATGTCATTCACATAATAATAATCCC
TGCTCATTTCATTTCCCATTCTGTTTTCGT*CCCCTTTGGATTTCTGTTTCTCAGACATT
CTATATCGGATTGTCAAATGTCTGATTGTGAACATGTAATTTCTATATTGCTTCTTCGTC
T
TGAAAAA

QA 1 661 1 661
DS 

RD RS1BJ25JQ 708 0 0
AGAAGAAGAAGTAGTAGTAATGGCTTCCTCTATGCTTTCCTCCGCTGCTGTTGTTACCTC
ACCTGCTCAAGCCACCATGGTCGCTCCATTCACCGGCTTGAAGTCATCCGCTGCATTCCC
AGTCACCCGCAAAGCAAACAACGACATTACTTCCATTGCAAGCAACGGAGGAAGAGTTAG
CTGCATGAAGGTGTGGCCGCCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGACCCTCTCCTACCTTCC
TGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCGACTACCTTCTCCGCAACAAGTGGAT
TCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGTACGGATTTGTGTACCGTGAGCACGGAAGCACACC
CGGATACTATGATGGACGGTACTGGACAATGTGGAAACTTCCCTTGTTCGGATGCACTGA
CTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAATGCAAAAAAGAGTACCCTAACGCCTTCAT
CAGGATCATCGGATTTGACAACAACCGTCAGGTTCAGTGCATCAGTTTCATCGCCTACAA
ACCACCAAGCTTCACCGATGCTTAATTTGCTATGTCATTTACATAATAATAATCCCTGCT
CATTTCATTTCCAATTCTGTTTTCGTTCCCCTTTGGATTTCTGTTTCTCAGACATTCTAT
ATCGGATTGTCAAATGTCTGATTGTGAACATGTAATTTCTATATTGCT

QA 1 708 1 708
DS 



CO CL2Contig2 780 9 5 U
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TCTCCTCCGCTGCTGTGGTTACCTCCCCGGCTCAAGCCACCATGGTCGCTCCATTCACGG
GCTTGAAGTCTTCCTCTGCATTCCCAGTCACCCGCAAGGCCAGCAATGACATTACTTCCA
TCGCTAGCAACGGAGGAAGAGTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCGCCAATTGGAAAGAAGA
AGTTTGAGACCCTCTCTTACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAAGAAGTCG
ACTACCTTCTCCGAAACAAGTGGATTCCCTGTGTTGAATTTGAGTTGGAGCACGGGTTTG
TGTACCGTGAGCACGGAAGTACACCCGGATACTACGATGGACGTTATTGGACAATGTGGA
AGCTTCCATTGTTCGGATGCACTGACTCTGCTCAAGTATTGAAGGAAGTCCAAGAGTGCA
AAAAGGAGTACCCTAACGCCTTCATCAGAATCATCGGATTTGACAACAACCGTCAAGTCC
AATGCATCAGTTTCATCGCCTACAAGCCACCAAGCTTCACCGATGCTTAATCACGTTACA
AGACATTCATAAATAATATCTACTCATTTCATTTCCATGTGTCTGTTTCTTTTTTTTTCT
TTGGCTTTTTGTTTATGAGACATGTTATATCGGATTGTCAAGTGTCTGATTTATGAACAT
GTAATCTCTATATTTCATTTTCTTTTTGGTTACTTATTGATGACTATTAGGTTATCAATT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RS1BA12TF U 1
AF RS1D988TF U 1
AF RS1CA79TF U 1
AF RS1D988JQ C 1
AF RS1CA79JQ C 20
AF RS1A489JQ C 135
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RD RS1BA12TF 710 0 0
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TTGGCTTTTTGTTTATGAGACATGTTATATCGGATTGTCAAGTGTCTGAT

QA 1 710 1 710
DS 

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AGCTTCCATTGTTCGGATGCACTGACTCTGCTCAAGTATTGAAGGAAGTCCAAGAGTGCA
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AGACATTCATAAATAATATCTACTCATTTCATTTCCATGTGTCTGTTTCTTTTTTTT*CT
TTGGCTTT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1CA79TF 685 0 0
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TCGCTAGCAACGGAGGAAGAGTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCGCCAATTGGAAAGAAGA
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ACTACCTTCTCCGAAACAAGTGGATTCCCTGTGTTGAATTTGAGTTGGAGCACGGGTTTG
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TTGGCTTTTTGTTTATGAGACATGT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RS1D988JQ 741 0 0
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GCTTGAAGTCTTCCTCTGCATTCCCAGTCACCCGCAAGGCCAGCAATGACATTACTTCCA
TCGCTAGCAACGGAGGAAGAGTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCGCCAATTGGAAAGAAGA
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AATGCATCAGTTTCATCGCCTACAAGCCACCAAGCTTCACCGATGCTTAATCACGTTACA
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TTGGCTTTTTGTTTATGAGACATGTTATATCGGATTGTCAAGTGTCTGATTTATGAACAT
GTAATCTCTATATTTCATTTT

QA 1 741 1 741
DS 

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A
AAAGAAGAAGTAGAAGTGGTAGTAATGGCGTCCTCTATGCTCTCCTCCGCTGCTGTGGTT
ACCTCCCCGGCTCAAGCCACCATGGTCGCTCCATTCACGGGCTTGAAGTCTTCCTCTGCA
TTCCCAGTCACCCGCAAGGCCAGCAATGACATTACTTCCATCGCTAGCAACGGAGGAAGA
GTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCGCCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGACCCTCTCTTAC
CTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAAGAAGTCGACTACCTTTTCCGAAACAAG
TGGATTCCCTGTGTTGAATTTGAGTTGGAGCACGGGTTTGTGTACCGTGAGCACGGAAGT
ACACCCGGATACTACGATGGACGTTATTGGACAATGTGGAAGCTTCCATTGTTCGGATGC
ACTGACTCTGCTCAAGTATTGAAGGAAGTCCAAGAGTGCAAAAAGGAGTACCCTAACGCC
TTCATCAGAATCATCGGATTTGACAACAACCGTCAAGTCCAATGCATCAGTTTCATCGCC
TACAAGCCACCAAGCTTCACCGATGCTTAATCACGCTACAAGACATTCATAAATAATATC
TACTCATTTCATTTCCATGTGTCTGTTTCTTTTTTTTTCTTTGGCTTTTTGTTTATGAGA
CATGTTATATCGGATTGTCAAGTGTCTGATTTATGAACATGTAATCTCTATATTTCATTT
TCTTTTTGGTTACTTATTGATGGCTATTAGGTTATC

QA 2 757 2 757
DS 

RD RS1A489JQ 620 0 0
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TCTTACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAAGAAGTCGACTACCTTTTCCGA
AACAAGTGGATTCCCTGTGTTGAATTTGAGTTGGAGCACGGGTTTGTGTACCGTGAGCAC
GGAAGCACACCCGGATATTACGATGGACGTTATTGGACAATGTGGAAGCTTCCATTGTTC
GGATGCACTGACTCTGCTCAAGTATTGAAGGAAGTCCAAGAGTGCAAAAAGGAGTACCCT
AACGCCTTCATCAGAATCATCGGATTCGACAACAACCGTCAAGTCCAATGCATCAGTTTC
ATCGCCTACAAGCCACCAAGCTTCACCGATGCTTAATCACGTTACAAGACATTCATAAAT
AATATCTACTCATTTCATTTCCATGTGTCTGTTTCTTTTTTTTTCTTTGGCTTTTTGTTT
ATGAGACATGTTATATCGGATTGTCAAGTGTCTGATTTATGAACATGTAATCTCTATATT
GCATTTTCTTTTTGGTTAC
C

QA 1 619 1 619
DS 

RD RS1A489TF 675 0 0
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ATTCCCAGTCACCCGCAAGGCCAGCAATGACATTACTTCCATCGCTAGCAACGGAGGAAG
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CCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAAGAAGTCGACTACCTTCTCCGAAACAA
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CACACCCGGATACTACGATGGACGTTATTGGACAATGTGGAAGCTTCCATTGTTCGGATG
CACTGACTCTGCTCAAGTATTGAAGGAAGTCCAAGAGTGCAAAAAGGAGTACCCTAACGC
CTTCATCAGAATCATCGGATTCGACAACAACCGTCAAGTCCAATGCATCAGTTTCATCGC
CTACAAGCCACCAAGCTTCACCGATGCTTAATCACGTTACAAGACATTCATAAATAATAT
CTACTCATTTCATTTCCATGTGTCTGTTTCTTTTTTTTTCTTTGGCTTTTTGTTTATGAG
ACATGTTATATCGGATTGTCAAGTGTCTGATTTATGAACATGTAATCTCTATATTGCATT
TTCTTTTTGGTTAC
C

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1BA12JQ 671 0 0
TGCTGTGGTTACCTCCCCGGCTCAAGCCACCATGGTCGCTCCATTCACGGGCTTGAAGTC
TTCCTCTGCATTCCCAGTCACCCGCAAGGCCAGCAATGACATTACTTCCATCGCTAGCAA
CGGAGGAAGAGTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCGCCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGAC
CCTCTCTTACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAAGAAGTCGACTACCTTCT
CCGAAACAAGTGGATTCCCTGTGTTGAATTTGAGTTGGAGCACGGGTTTGTGTACCGTGA
GCACGGAAGTACACCCGGATACTACGATGGACGTTATTGGACAATGTGGAAGCTTCCATT
GTTCGGATGCACTGACTCTGCTCAAGTATTGAAGGAAGTCCAAGAGTGCAAAAAGGAGTA
CCCTAACGCCTTCATCAGAATCATCGGATTTGACAACAACCGTCAAGTCCAATGCATCAG
TTTCATCGCCTACAAGCCACCAAGCTTCACCGATGCTTAATCACGTTACAAGACATTCAT
AAATAATATCTACTCATTTCATTTCCATGTGTCTGTTTCTTTTTTTTTCTTTGGCTTTTT
GTTTATGAGACATGTTATATCGGATTGTCAAGTGTCTGATTTATGAACATGTAATCTCTA
TATTTCATTTT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1CB45TF 106 0 0
ATGAGACATGTTATATCGGATTGTCAAGTGTCTGATTTATGAACATGTAATCTCTATATT
TCATTTTCTTTTTGGTTACTTATTGATGACTATTAGGTTATCAATT

QA 1 106 1 106
DS 



CO CL2Contig3 735 27 9 U
GGGAAGAGTTAAGAGAACGAAGAAGAAATAGTCATGGCTTACTCTATGCTCTCCTCCGCC
GCTGTTGTTACCTCACCGGCTCAAACCACCATGGTCGCTCCATTCACCGGGTTGAAGTCT
TCCGCTGCATTCCC*AGTCACCCAGAAGGCCAACAACGACATTACTTCCATCGCTAGCAA
CGGAGGAAGAGTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCACCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGAC
CCTTTCTTACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCGACTACCTTCT
CCGCAACAAGTGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTGTGTACCGTGA
GCACGGAAGCACACCCGGATACTACGATGGCCGTTACTGGACAATGTGGAAGCTTCCCTT
GTTCGGATGCACCGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAGTGCAAAAAGGAGTA
CCCCAATGCCTTTATCAGAATCATCGGATTCGACAACAACCGTCAAGTGCAGTGCATCAG
TTTCATCGCCTACAAGCCACCAAGCTTCACTGATGCTTAAGTTGCGTCCATATAATAATA
TCTTCTCATTTCATTTTCAATAAGTCTGTTGCTTTTTTT*CTCTTTGGATTTCTGTTTAT
GAGACTTTATATATCGGATTGTAAAATGTCTGATTTATGAAACATGTAATTTCTATATTG
CTTCTTAAAAAAAAA


BQ
10 60 60 70 70 70 70 70 75 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 95 95 95 95 97 97 10 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 20 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 45 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 50 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 95 10 50 50 35 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AN34JQ C 2
AF RS1G668TF U 0
AF RS1BU39JQ C 26
AF RS1C623JQ C 343
AF RS1GQ57JQ C 295
AF RS1GK08JQ C 206
AF RS1GK08TF U 206
AF RS1G049JQ C 131
AF RS1BU39TF U 9
AF RS1B893TF U 9
AF RS1B893JQ C 2
AF RS1AZ18JQ C 2
AF RS1AZ18TF U 2
AF RS1D876TF U 2
AF RS1D876JQ C 2
AF RS1FB95TF U 0
AF RS1AF84TF U 9
AF RS1FB95JQ C 295
AF RS1G668JQ C 159
AF RS1BZ56TF U 70
AF RS1C623TF U 9
AF RS1EI54TF U 21
AF RS1G049TF U 2
AF RS1GQ57TF U 2
AF RS1B710TF U 2
AF RS1GD41TF U 1
AF RS1GD41JQ C 75
BS 1 178 RS1GD41TF
BS 179 179 RS1BU39TF
BS 180 456 RS1GD41TF
BS 457 457 RS1GK08TF
BS 458 639 RS1GD41TF
BS 640 640 RS1GK08TF
BS 641 672 RS1GD41TF
BS 673 673 RS1GK08TF
BS 674 735 RS1GD41TF

RD RS1AN34JQ 218 0 0
GGAAGAGTTAAGAGAACGAAGAAGAATTAGTCATGGCTTACTCTATGCTCTCCTCCGCCG
CTGTTGTTACCTCACCGGCTCAAACCACCATGGTCGCTCCATTCACCGGCTTGAAGTCTT
CCGCTGCATTCCCCAGTCACCCAGAAGGCCAACAACGACATTACTTCCATCGCTAGCAAC
GGAGGAGGAGTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCACCAA
A

QA 1 217 1 217
DS 

RD RS1G668TF 383 0 0
GGGT
AAGAGTTAAGAGAACGAAGAAGAAATAGTCATGGCTTACTCTATGCTCTCCTCCGCCGCT
GTTGTTACCTCACCGGCTCAAACCACCATGGTCGCTCCATTCACCGGGTTGAAGTCTTCC
GCTGCATTCCC*AGTCACCCAGAAGGCCAACAACGACATTACTTCCATCGCTAGCAACGG
AGGAAGA*TTAGCCGCATGAAGGTGTGGCCACCAATTGGAAAGAAGAA*TTTGAGACCCT
TTCTTACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCGACTACCTTCTCCG
CAACAAGTGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTGTGTACCGTGAGCA
CGGAAGCACACCCGGATAC

QA 5 383 5 383
DS 

RD RS1BU39JQ 525 0 0
AATTAGTCATGGCTTACTCTATGCTCTCCTCCGCCGCTGTTGTTACCTCACCGGCTCAAA
CCACCATGGTCGCTCCATTCACCGGCTTGAAGTCTTCCGCTGCATTCCC*AGTCACCCAG
AAGGCCAACAACGACATTACTTCCATCGCTAGCAACGGAGGAAGAGTTAGCTGCATGAAG
GTGTGGCCACCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGACCCTTTCTTACCTTCCTGACCTTTCC
GATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCGACTACCTTTTCCGCAACAAGTGGATTCCTTGTGTT
GAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTGTGTACCGTGAGCACGGAAGCACACCCGGATACTAC
GATGGCCGTTACTGGACAATGTGGAAGCTTCCCTTGTTCGGATGCACTGACTCTGCTCAA
GTGTTGAAGGAAGTCCAAGAGTGCAAAAAGGAGTACCCCAATGCCTTTATCAGAATCATC
GGATTCGACAACAACCGTCAAGTGCAGTGCATCAGTTTCATCGCC

QA 1 525 1 525
DS 

RD RS1C623JQ 372 0 0
CGGATTTGTGTACCGTGAGCACGGAAGCACACCCGGATACTACGATGGCCGTTACTGGAC
AATGTGGAAGCTTCCCTTGTTCGGATGCACCGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCA
AGAGTGCAAAAAGGAGTACCCCAATGCCTTTATCAGAATCATCGGATTCGACAACAACCG
TCAAGTGCAGTGCATCAGTTTCATCGCCTACAAGCCACCAAGCTTCACTGATGCTTAAGT
TGCGTCCATATAATAATATCTTCTCATTTCATTTTCAATAAGTCTGTTGCTTTTTTT*CT
CTTTGGATTTCTGTTTATGAGACTTTATATATCGGATTGTAAAATGTCTGATTTATGAAA
CATGTAATTTCC

QA 1 372 1 372
DS 

RD RS1GQ57JQ 420 0 0
CCTTCTCCGCAACAAGTGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTGTGTA
CCGTGAGCACGGAAGCACACCCGGATACTACGATGGCCGTTACTGGACAATGTGTAAGCT
TCCCTTGTTCGGATGCACTGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAGTGCAAAAA
GGAGTACCCCAATACCTTTATCAGAATCATCGGATTCGACAACAACCGTCAAGTGCAGTG
CATCAGTTTCATCGCCTACAAGCCACCAAGCTTCACTGATGCTTAAGTCGCGTCCATATA
ATAATATCTTCTCATTTCATTTTCAATAAGTCTGTTGCTTTTTTT*CTCTTTGGATTTCT
GTTTATGAGACTTTATATATCGGATTGTAAAATGTCTGATTTATGAAACATGTAATTTCC

QA 1 420 1 420
DS 

RD RS1GK08JQ 513 0 0
GGAAGAGTTAAGAGAACG
AAGAAGAAGTTTGAGACCCTTTCTTACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAG
GAAGTCGACTACCTTCTCCGCAACAAGTGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCAC
GGATTTGTGTACCGTGAGCACGGAAGCACACCCGGATACTACGATGGCCGTTACTGGACA
ATGTGGAAGCTTCCCTTGTTCGGATGCACCGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAA
GAGTGCAAAAAGGAGTACCCCAATGCCTTTATCAGAATCATCGGATTCGACAACAACCGT
CAAGTGCAGTGCATCAGTTTCATCGCCTACAAGCCACCAAGCTTCACTGACGCTTAAGTT
GCGTCCATATAATAATATCTTCTCATTTCATTTTCAATAAGTCTGTTGCTTTTTTT*CTC
TTTGGATTTCTGTTTATGAGACTTTATATATCGGATTGTAAAATGTCTGATTTATGAAAC
ATGTAATTTCTATA
G

QA 19 512 19 512
DS 

RD RS1GK08TF 513 0 0
GGAAGAGTTAAGAGAACG
AAGAAGAAGTTTGAGACCCTTTCTTACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAG
GAAGTCGACTACCTTCTCCGCAACAAGTGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCAC
GGATTTGTGTACCGTGAGCACGGAAGCACACCCGGATACTACGATGGCCGTTACTGGACA
ATGTGGAAGCTTCCCTTGTTCGGATGCACCGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAA
GAGTGCAAAAAGGAGTACCCCAATGCCTTTATCAGAATCATCGGATTCGACAACAACCGT
CAAGTGCAGTGCATCAGTTTCATCGCCTACAAGCCACCAAGCTTCACTGACGCTTAAGTT
GCGTCCATATAATAATATCTTCTCATTTCATTTTCAATAAGTCTGTTGCTTTTTTT*CTC
TTTGGATTTCTGTTTATGAGACTTTATATATCGGATTGTAAAATGTCTGATTTATGAAAC
ATGTAATTTCTATA
G

QA 19 512 19 512
DS 

RD RS1G049JQ 584 0 0
TTCCCAGTCACCCAGAAGGCCAACAACGACATTACTTCCATCGCTAGCAACGGAGGAAGA
GTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCACCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGACCCTTTCTTAC
CTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCGACTACCTTTTCCGCAACAAG
TGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTGTGTACCGTGAGCACGGAAGC
ACACCCGGATACTACGATGGCCGTTACTGGACAATGTGGAAGCTTCCCTTGTTCGGATGC
ACCGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAGTGCAAAAAGGAGTACCCCAATGCC
TTTATCAGAATCATCGGATTCGACGACAACCGTCAAGTGCAGTGCATCAGTTTCATCGCC
TACAAGCCACCAAGCTTCACTGATGCTTAAGTTGCGTCCATATAATAATATCTTCTCATT
TCATTTTCAATAAGTCTGTTGCTTTTTTT*CTCTTTGGATTTCTGTTTATGAGACTTTAT
ATATCGGATTGTAAAATGTCTGATTTATGAAACATGTAATTTCC

QA 1 584 1 584
DS 

RD RS1BU39TF 708 0 0
GG
AAGAGAACGAAGAAGAATTAGTCATGGCTTACTCTATGCTCTCCTCCGCCGCTGTTGTTA
CCTCACCGGCTCAAACCACCATGGTCGCTCCATTCACCGGCTTGAAGTCTTCCGCTGCAT
TCCC*AGTCACCCAGAAGGCCAACAACGACATTACTTCCATCGCTAGCAACGGAGGAAGA
GTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCACCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGACCCTTTCTTAC
CTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCGACTACCTTCTCCGCAACAAG
TGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTGTGTACCGTGAGCACGGAAGC
ACACCCGGATACTACGATGGCCGTTACTGGACAATGTGGAAGCTTCCCTTGTTCGGATGC
ACTGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAGTGCAAAAAGGAGTACCCCAATGCC
TTTATCAGAATCATCGGATTCGACAACAACCGTCAAGTGCAGTGCATCAGTTTCATCGCC
TACAAGCCACCAAGCTTCACTGATGCTTAAGTCGCGTCCATATAATAATATCTTCTCATT
TCATTTTCAATAAGTCTGTTGCTTTTTT**CTCTTTGGATTTCTGTTTATGAGACTTTAT
ATATCGGATTGTAAA*TGTCTGATTTATGAAACATGTAATTTCTAT

QA 3 708 3 708
DS 

RD RS1B893TF 698 0 0
TTAAGAGAACGAAGAAGAATTAGTCATGGCTTACTCTATGCTCTCCTCCGCCGCTGTTGT
TACCTCACCGGCTCAAACCACCATGGTCGCTCCATTCACCGGCTTGAAGTCTTCCGCTGC
ATTCCC*AGTCACCCAGAAGGCCAACAACGACATTACTTCCATCGCTAGCAACGGAGGAA
GAGTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCACCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGACCCTTTCTT
ACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCGACTACCTTCTCCGCAACA
AGTGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTGTGTACCGTGAGCACGGAA
GCACACCCGGATACTACGATGGCCGTTACTGGACAATGTGGAAGCTTCCCTTGTTCGGAT
GCACTGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAGTGCAAAAAGGAGTACCCCAATG
CCTTTATCAGAATCATCGGATTCGACAACAACCGTCAAGTGCAGTGCATCAGTTTCATCG
CCTACAAGCCACCAAGCTTCACTGATGCTTAAGTCGCGTCCATATAATAATATCTTCTCA
TTTCATTTTCAATAAGTCTGTTGCTTTTTT**CTCTTTGGATTTCTGTTTATGAGACTTT
ATATATCGGATTGTAAAATGTCTGATT*ATGAAACATG

QA 1 698 1 698
DS 

RD RS1B893JQ 715 0 0
GGAAGAGTTAAGAGAACGAAGAAGAATTAGTCATGGCTTACTCTATGCTCTCCTCCGCCG
CTGTTGTTACCTCACCGGCTCAAACCACCATGGTCGCTCCATTCACCGGCTTGAAGTCTT
CCGCTGCATTCCC*AGTCACCCAGAAGGCCAACAACGACATTACTTCCATCGCTAGCAAC
GGAGGAAGAGTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCACCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGACC
CTTTTTTACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCGACTACCTTTTC
CGCAACAAGTGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTGTGTACCGTGAG
CACGGAAGCACACCCGGATACTACGATGGCCGTTACTGGACAATGTGGAAGCTTCCCTTG
TTCGGATGCACTGACTTTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAGTGCAAAAAGGAGTAC
CCCAATGCCTTTATCAGAATCATCGGATTCGACAACAACCGTCAAGTGCAGTGCATCAGT
TTCATCGCCTACAAGCCACCAAGCTTCACTGATGCTTAAGTCGCGTCCATATAATAATAT
CTTCTCATTTCATTTTCAATAAGTTTGTTGCTTTTTTT*CTCTTTGGATTTCTGTTTATG
AGACTTTATATATCGGATTGTAAAATGTTTGATTTATGAAACATGTGATTTCTAT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1AZ18JQ 714 0 0
GGAAGAGTTAAGAGAACGAAGAAGAATTAGTCATGGCTTACTCTATGCTCTCC*CCGCCG
CTGTTGTTACCTCACCGGCTCAAGCCACCATGGTCGCTCCATTCACCGGCTTGAAGTCTT
CCGCTGCATTCCC*AGTCACCCAGAAGGCCAACAACGACATTACTTCCATCGCTAGCAAC
GGAGGAAGAGTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCACCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGACC
CTTTCTTACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAATTCGACTACCTTCTC
CGCAACAAGTGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTGTGTACCGTGAG
CACGGAAGCACACCCGGATACTACGATGGCCGTTACTGGACAATGTGGAAGCTTCCCTTG
TTCGGATGCACTGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAGTGCAAAAAGGAGTAC
CCCAATGCCTTTATCAGAATCATCGGATTCGACAGCAACCGTCAAGTGCAGTGCATCAGT
TTCATCGCCTACAAGCCACCAAGCTTCACTGATGCTTAAGTCGCGTCCATATAATAATAT
CTTCTCATTTCATTTTCAATAAGTCTGTTGCTTTTTTT*CTCTTTGGATTTCTGTTTATG
AGACTTTATATATCGGATTGTAAAATGTTTGATTTATGAAACATGTAATTT
TTG

QA 1 711 1 711
DS 

RD RS1AZ18TF 705 0 0
GGAAGAGTTAAGAGAACGAAGAAGAATTAGTCATGGCTTACTCTATGCTCTCC*CCGCCG
CTGTTGTTACCTCACCGGCTCAAGCCACCATGGTCGCTCCATTCACCGGCTTGAAGTCTT
CCGCTGCATTCCC*AGTCACCCAGAAGGCCAACAACGACATTACTTCCATCGCTAGCAAC
GGAGGAAGAGTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCACCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGACC
CTTTCTTACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAATTCGACTACCTTCTC
CGCAACAAGTGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTGTGTACCGTGAG
CACGGAAGCACACCCGGATACTACGATGGCCGTTACTGGACAATGTGGAAGCTTCCCTTG
TTCGGATGCACTGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAGTGCAAAAAGGAGTAC
CCCAATGCCTTTATCAGAATCATCGGATTCGACAGCAACCGTCAAGTGCAGTGCATCAGT
TTCATCGCCTACAAGCCACCAAGCTTCACTGATGCTTAAGTCGCGTCCATATAATAATAT
CTTCTCATTTCATTTTCAATAAGTCTGTTGCTTTTTT**CTCTTTGGATTTCTGTTTATG
AGACTTTATATATCGGATTGTAAA*TGTCTGATTTATGAAACATG

QA 1 705 1 705
DS 

RD RS1D876TF 717 0 0
GGAAGAGTTAAGAGAACGAAGAAGAAATAGTCATGGCTTACTCTATGCTCTCCTCCGCCG
CTGTTGTTACCTCACCGGCTCAAACCACCATGGTCGCTCCATTCACCGGGTTGAAGTCTT
CCGCTGCATTCCC*AGTCACCCAGAAGGCCAACAACGACATTACTTCCATCGCTAGCAAC
GGAGGAAGAGTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCACCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGACC
CTTTCTTACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCGACTACCTTCTC
CGCAACAAGTGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTGTGTACCGTGAG
CACGGAAGCACACCCGGATACTACGATGGCCGTTACTGTACAATGTGGAAGCTTCCCTTG
TTCGGATGCACCGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAGTGCAAAAAGGAGTAC
CCCAATGCCTTTATCAGAATCATCGGATTCGACAACAACCGTCAAGTGCAGTGCATCAGT
TTCATCGCCTACAAGCCACCAAGCTTCACTGATGCTTAAGTTGCGTCCATATAATAATAT
CTTCTCATTTCATTTTCAATAAGTCTGTTGCTTTTTTT*CTCTTTGGATTTCTGTTTATG
AGACTTTATATATCGGATTGTAAAATGTCTGATTTATGAA*CATGTAATTTCTATA
A

QA 1 716 1 716
DS 

RD RS1D876JQ 715 0 0
GGAAGAGTTAAGAGAACGAAGAAGAAATAGTCATGGCTTACTCTATGCTCTCCTCCGCCG
CTGTTGTTACCTCACCGGCTCAAACCACCATGGTCGCTCCATTCACCGGGTTGAAGTCTT
CCGCTGCATTCCC*AGTCACCCAGAAGGCCAACAACGACATTACTTCCATCGCTAGCAAC
GGAGGAAGAGTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCACCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGACC
CTTTCTTACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCGACTACCTTCTC
CGCAACAAGTGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTGTGTACCGTGAG
CACGGAAGCACACCCGGATACTACGATGGCCGTTACTGTACAATGTGGAAGCTTCCCTTG
TTCGGATGCACCGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAGTGCAAAAAGGAGTAC
CCCAATGCCTTTATCAGAATCATCGGATTCGACAACAACCGTCAAGTGCAGTGCATCAGT
TTCATCGCCTACAAGCCACCAAGCTTCACTGATGCTTAAGTTGCGTCCATATAATAATAT
CTTCTCATTTCATTTTCAATAAGTCTGTTGCTTTTTTT*CTCTTTGGATTTCTGTTTATG
AGACTTTATATATCGGATTGTAAAATGTCTGATTTATGAAACATGTAATTTCTAT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1FB95TF 716 0 0
GGGT
AAGAGTTAAGAGAACGAAGAAGAAATAGTCATGGCTTACTCTATGCTCTCCTCCGCCGCT
GTTGTTACCTCACCGGCTCAAACCACCATGGTCGCTCCATTCACCGGGTTGAAGTCTTCC
GCTGCATTCCC*AGTCACCCAGAAGGCCAACAACGACATTACTTCCATCGCTAGCAACGG
AGGAAGAGTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCACCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGACCCT
TTCTTACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCGACTACCTTCTCCG
CAACAAGTGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTGTGTACCGTGAGCA
CGGAAGCACACCCGGATACTACGATGGCCGTTACTGGACAATGTGGAAGCTTCCCTTGTT
CGGATGCACCGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAGTGCAAAAAGGAGTACCC
CAATGCCTTTATCAGAATCATCGGATTCGACAACAACCGTCAAGTGCAGTGCATCAGTTT
CATCGCCTACAAGCCACCAAGCTTCACTGATGCTTAAGTTGCGTCCATATAATAATATCT
TCTCATTTCATTTTCAATAAGTCTGTTACTTTTTTT*CTCTTTGGATTTCTGTTTATGAG
ACTTTATATATCGGATTGTAAA*TGTCTGATTTATGAAACATGTAATTTCC
A

QA 5 715 5 715
DS 

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GG
AAGAGAACGAAGAAGAAATAGTCATGGCTTACTCTATGCTCTCCTCCGCCGCTGTTGTTA
CCTCACCGGCTCAAACCACCATGGTCGCTCCATTCACCGGGTTGAAGTCTTCCGCTGCAT
TCCC*AGTCACCCAGAAGGCCAACAACGACATTACTTCCATCGCTAGCAACGGAGGAAGA
GTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCACCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGACCCTTTCTTAC
CTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCGACTACCTTCTCCGCAACAAG
TGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTGTGTACCGTGAGCACGGAAGC
ACACCCGGATACTACGATGGCCGTTACTGGACAATGTGGAAGCTTCCCTTGTTCGGATGC
ACCGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAGTGCAAAAAGGAGTACCCCAATGCC
TTTATCAGAATCATCGGATTCGACAACAACCGTCAAGTGCAGTGCATCAGTTTCATCGCC
TACAAGCCACCAAGCTTCACTGATGCTTAAGTTGCGTCCATATAATAATATCTTCTCATT
TCATTTTCAATAAGTCTGTTGCTTTTTTT*CTCTTTGGATTTCTGTTTATGAGACTTTAT
ATATCGGATTGTAAAATGTCTGATTTATGAAACATGTAATTTC

QA 3 705 3 705
DS 

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CCGTGAGCACGGAAGCACACCCGGATACTACGATGGCCGTTACTGGACAATGTGGAAGCT
TCCCTTGTTCGGATGCACCGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAGTGCAAAAA
GGAGTACCCCAATGCCTTTATCAGAATCATCGGATTCGACAACAACCGTCAAGTGCAGTG
CATCAGTTTCATCGCCTACAAGCCACCAAGCTTCATTGATGCTTAAGTTGCGTCCATATA
ATAATATCTTCTCATTTCATTTTCAATAAGTCTGTTACTTTTTTT*CTCTTTGGATTTCT
GTTTATGAGACTTTATATATCGGATTGTAAAA

QA 1 392 1 392
DS 

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TTGGAAAGAAGAAGTTTGAGACCCTTTCTTACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGG
CTAAGGAAGTCGACTACCTTCTCCGCAACAAGTGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGG
AGCACGGATTTGTGTACCGTGAGCACGGAAGCACACCCGGATACTACGATGGCCGTTACT
GGACAATGTGGAAGCTTCCCTTGTTCGGATGCACCGACTCTACTCAAGTGTTGAAGGAAG
TCCAAGAGTGCAAAAAGGAGTACCCCAATGCCTTTATCAGAATCATCGGATTCGACAACA
ACCGTCAAGTGCAGTGCATCAGTTTCATCGCCTACAAGCCACCAAGCTTCACTGATGCTT
AAGTTGCGTCCATATAATAATATCTTCTCATTTCATTTTCAATAAGTCTGTTGCTTTTTT
T*CTCTTTGGATTTCTGTTTATGAGACTTTATATATCGGATTGTAAAATGTCTGATTTAT
GAAACATGTAATTT
TT

QA 1 554 1 554
DS 

RD RS1BZ56TF 643 0 0
ACCTCACCGGCTCAAACCACCATGGTCGCTCCATTCACCGGGTTGAAGTCTTCCGCTGCA
TTCCC*AGTCACCCAGAAGGCCAACAACGACATTACTTCCATCGCTAGCAACGGAGGAAG
AGTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCACCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGACCCTTTCTTA
CCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCGACTACCTTCTCCGCAACAA
GTGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTGTGTACCGTGAGCACGGAAG
CACACCCGGATACTACGATGGCCGTTACTGGACAATGTGGAAGCTTCCCTTGTTCGGATG
CACCGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAGTGCAAAAAGGAGTACCCCAATGC
CTTTATCAGAATCATCGGATTCGACAACAACCGTCAAGTGCAGTGCATCAGTTTCATCGC
CTACAAGCCACCAAGCTTCACTGATGCTTAAGTTGCGTCCATATAATAATATCTTCTCAT
TTCATTTTCAATAAGTCTGTTGCTTTTTTT*CTCTTTGGATTTCTGTTTATGAGACTTTA
TATATCGGATTGTAAAATGTCTGATTTATGAAACATGTAATTT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RS1C623TF 673 0 0
GG
AAGAGAACGAAGAAGAAATAGTCATGGCTTACTCTATGCTCTCCTCCGCCGCTGTTGTTA
CCTCACCGGCTCAAACCACCATGGTCGCTCCATTCACCGGGTTGAAGTCTTCCGCTGCAT
TCCC*AGTCACCCAGAAGGCCAACAACGACATTACTTCCATCGCTAGCAACGGAGGAAGA
GTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCATCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGACCCTTTCTTAC
CTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCGACTACCTTCTCCGCAACAAG
TGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTGTGTACCGTGAGCACGGAAGC
ACACCCGGATACTACGATGGCCGTTACTGGACAATGTGGAAGCTTCCCTTGTTCGGATGC
ACCGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAGTGCAAAAAGGAGTACCCCAATGCC
TTTATCAGAATCATCGGATTCGACAACAACCGTCAAGTGCAGTGCATCAGTTTCATCGCC
TACAAGCCACCAAGCTTCACTGATGCTTAAGTTGCGTCCATATAATAATATCTTCTCATT
TCATTTTCAATAAGTCTGTTGCTTTTTTT*CTCTTTGGATTTCTGTTTATGAGACTTTAT
ATATCGGATTG

QA 3 673 3 673
DS 

RD RS1EI54TF 693 0 0
G
GAAGAAATAGTCATGGCTTACTCTATGCTCTCCTCCGCCGCTGTTGTTACCTCACCGGCT
CAAACCACCATGGTCGCTCCATTCACCGGGTTGAAGTCTTCCGCTGCATTCCC*AGTCAC
CCAGAAGGCCAACAACGACATTACTTCCATCGCTAGCAACGGAGGAAGAGTTAGCTGCAT
GAAGGTGTGGCCACCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGACCCTTTCTTACCTTCCTGACCT
TTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCGACTACCTTCTCCGCAACAAGTGGATTCCTTG
TGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTGTGTACCGTGAGCACGGAAGCACACCCGGATA
CTACGATGGCCGTTACTGGACAATGTGGAAGCTTCCCTTGTTCGGATGCACCGACTCTGC
TCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAGTGCAAAAAGGAGTACCCCAATGCCTTTATCAGAAT
CATCGGATTCGACAACAACCGTCAAGTGCAGTGCATCAGTTTCATCGCCTACAAGCCACC
AAGCTTCACTGATGCTTAAGTTGCGTCCATATAATAATATCTTCTCATTTCATTTTCAAT
AAGTCTGTTGCTTTTTTTTCTCTTTGGATTTCTGTTTATGAGACTTTATATATCGGATTG
TAAAATGTCTGATTTATGAAACATGTAATTTC

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DS 

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CTGTTGTTACCTCACCGGCTCAAACCACCATGGTCGCTCCATTCACCGGGTTGAAGTCTT
CCGCTGCATTCCC*AGTCACCCAGAAGGCCAACAACGACATTACTTCCATCGCTAGCAAC
GGAGGAAGAGTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCACCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGACC
CTTTCTTACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCGACTACCTTCTC
CGCAACAAGTGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTGTGTACCGTGAG
CACGGAAGCACACCCGGATACTACGATGGCCGTTACTGGACAATGTGGAAGCTTCCCTTG
TTCGGATGCACCGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAGTGCAAAAAGGAGTAC
CCCAATGCCTTTATCAGAATCATCGGATTCGACGACAACCGTCAAGTGCAGTGCATCAGT
TTCATCGCCTACAAGCCACCAAGCTTCACTGATGCTTAAGTTGCGTCCATATAATAATAT
CTTCTCATTTCATTTTCAATAAGTCTGTTGCTTTTTTT*CTCTTTGGATTTCTGTTTATG
AGACTTTATATATCGGATTGTAAAATGTCTGATTTATGAAACATGTAATTTCC

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DS 

RD RS1GQ57TF 713 0 0
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CTGTTGTTACCTCACCGGCTCAAACCACCATGGCCGCTCCATTCACCGGCTTGAAGTCTT
CCGCTGCATTCCC*AGTCACCCAGAAGGCCAACAACGACATTACTTCCATCGCTAGCAAC
GGAGGAAGAGTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCACCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGACC
CTTTCTTACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCGACTACCTTCTC
CGCAACAAGTGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTGTGTACCGTGAG
CACGGAAGCACACCCGGATACTACGATGGCCGTTACTGGACAATGTGTAAGCTTCCCTTG
TTCGGATGCACTGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAGTGCAAAAAGGAGTAC
CCCAATACCTTTATCAGAATCATCGGATTCGACAACAACCGTCAAGTGCAGTGCATCAGT
TTCATCGCCTACAAGCCACCAAGCTTCACTGATGCTTAAGTCGCGTCCATATAATAATAT
CTTCTCATTTCATTTTCAATAAGTCTGTTGCTTTTTTT*CTCTTTGGATTTCTGTTTATG
AGACTTTATATATCGGATTGTAAAATGTCTGATTTATGAAACATGTAATTTCC

QA 1 713 1 713
DS 

RD RS1B710TF 712 0 0
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CTGTTGTTACCTCACCGGCTCAAACCACCATGGTCGCTCCATTCACCGGGTTGAAGTCTT
CCGCTGCATTCCC*AGTCACCCAGAAGGCCAACAACGACATTACTTCCATCGCTAGCAAC
GGAGGAAGAGTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCACCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGACC
CTTTCTTACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCGACTACCTTCTC
CGCAACAAGTGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTGTGTACCGTGAG
CACGGAAGCACACCCGGATACTACGATGGCCGTTACTGGACAATGTGGAAGCTTCCCTTG
TTCGGATGCACCGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAAGTCCAAGAGTGCAAAAAGGAGTAC
CCCAATGCCTTTATCAGAATCATCGGATTCGACAACAACCGTCAAGTGCAGTGTATCAGT
TTCATCGCCTACAAGCCACCAAGCTTCACTGATGCTTAAGTTGCGTCCATATAATAATAT
CTTCTCATTTCATTTTCAATAAGTCTGTTGCTTTTTTT*CTCTTTGGATTTCTGTTTATG
AGACTTTATATATCGGATTGTAAAATGTCTGATTTATGAAACATGTAATTTC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RS1GD41TF 735 0 0
GGGAAGAGTTAAGAGAACGAAGAAGAAATAGTCATGGCTTACTCTATGCTCTCCTCCGCC
GCTGTTGTTACCTCACCGGCTCAAACCACCATGGTCGCTCCATTCACCGGGTTGAAGTCT
TCCGCTGCATTCCC*AGTCACCCAGAAGGCCAACAACGACATTACTTCCATCGCTAGCGA
CGGAGGAAGAGTTAGCTGCATGAAGGTGTGGCCACCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGAC
CCTTTCTTACCTTCCTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCGACTACCTTCT
CCGCAACAAGTGGATTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTGTGTACCGTGA
GCACGGAAGCACACCCGGATACTACGATGGCCGTTACTGGACAATGTGGAAGCTTCCCTT
GTTCGGATGCACCGACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAGGTCCAAGAGTGCAAAAAGGAGTA
CCCCAATGCCTTTATCAGAATCATCGGATTCGACAACAACCGTCAAGTGCAGTGCATCAG
TTTCATCGCCTACAAGCCACCAAGCTTCACTGATGCTTAAGTTGCGTCCATATAATAATA
TCTTCTCATTTCATTTTCAATAAGTCTGTTGCTTTTTTTTCTCTTTGGATTTCTGTTTAT
GAGACTTTATAT*TCGGATTGTAAAATGTCTGATTTATGAAACATGTAATTTCTATATTG
CTTCTTAAAAAAAAA

QA 1 735 1 735
DS 

RD RS1GD41JQ 652 0 0
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*AGTCACCCAGAAGGCCAACAACGACATTACTTCCATCGCTAGCGACGGAGGAAGAGTTA
GCTGCATGAAGGTGTGGCCACCAATTGGAAAGAAGAAGTTTGAGACCCTTTCTTACCTTC
CTGACCTTTCCGATGTTGAGTTGGCTAAGGAAGTCGACTACCTTCTCCGCAACAAGTGGA
TTCCTTGTGTTGAATTCGAGTTGGAGCACGGATTTGTGTACCGTGAGCACGGAAGCACAC
CCGGATACTACGATGGCCGTTACTGGACAATGTGGAAGCTTCCCTTGTTCGGATGCACCG
ACTCTGCTCAAGTGTTGAAGGAGGTCCAAGAGTGCAAAAAGGAGTACCCCAATGCCTTTA
TCAGAATCATCGGATTCGACAACAACCGTCAAGTGCAGTGCATCAGTTTCATCGCCTACA
AGCCACCAAGCTTCACTGATGCTTAAGTTGCGTCCATATAATAATATCTTCTCATTTCAT
TTTCAATAAGTCTGTTGCTTTTTTTTCTCTTTGGATTTCTGTTTATGAGACTTTATAT*T
CGGATTGTAAAATGTCTGATTTATGAAACATGTAATTTCTATATTGCTTCTT

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 38

CO CL3Contig1 1299 38 15 U
TGGGATAACCCCCTTTCGAAATCTCAAGAGGTTTCCATCGAATTCGGATTATCCGTATTA
AATGGATCAAACAAACAAATGAAATTGAGAAAGTATGTACATACATTTCATATTCTATAT
TAATTTATATTTACATTTATAAAGAAAAAGAGAGATATGGGTGGATTCCTTTATATTAAG
ATATTTCACTTGTATCTTTATACATTACAATAACCATAATGGCTAGTATGGTAGAAAGAG
ATCTCTTTCTACCATACTAGCGGGCCCCTTAGGATACTACCGAATCTAATGCATTCCTTC
ATTTAAGACGAGAAATTGACATCTTTTTTTTTCATTGATAGTCAAATTGTATTCAAATTA
ATTATTTTGACTAACCGTTTTTACGTAAATTATAAGCAAAAAAGCAGTAGGAACGAGAAT
GAAGAGTGCAGTAGCAATAAATGCAAGAATATTGACTTCCATAATTAAATAGTTTATTAT
TTATTTTTTTTT*CTTTGGAATATCTCGGGATTTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTC
GCTTGTAAACTCACTCAGATGAATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATG
AATAACAATATCGGAGCTATAAAATCGATTCATCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAG
GAAGATCTTTTATCCACACCGAATACATAATGAGATTCCTGATCCAATAAAAAACTATTT
ATTTATGATTCTTTTTCACCGCTTTCTTTTCTACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCA
TCTGATGAAATATCATAAAAAACCTTTTCTACTTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAA
AGAACCTTAAATAAACAATAGAAATCAAATAGAGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGA
AATTTAAAAAATTTTGTAAGGG*TCTATGATCTTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAA
AGACGAGTCCCGATAAAAAAAACTAAAATATTCCAAAAAATTAACTCTTTAAATTTTCTT
ACGAGTTTTTCTTCGACATCAACTCTAATTTTTAAAAAGAGCATATTCATTAGGGAAGAC
TAAATTGATCTTTATTTTTTAAATATCCTCTTTACTTGGTTGGATTCGAACTATTTTAAC
TTCCTTGACTTCATAGAAACAAAAGTATATATAGGTACTCTTGGCCAACGTATTATACGC
TATCCTATTTCATTTTCCTACACGAGTTAATGGGAGATTAATTGACAAAAAGAGGAAACC
CCGTACAGTATCTCGTTCTTGAAGTGGTGAATGCTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 
75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 40 55 85 95 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 70 80 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1H137TF C 1
AF RS1DO75JQ U 498
AF RS1DO75TF C 498
AF RS1CN77JQ U 498
AF RS1CN77TF C 498
AF RS1G825TF C 417
AF RS1CP79JQ U 333
AF RS1CP79TF C 333
AF RS1A462JQ U 333
AF RS1A462TF C 333
AF RS1GI59JQ U 498
AF RS1GI59TF C 498
AF RS1E385JQ U 329
AF RS1BW84JQ U 333
AF RS1FI26JQ U 498
AF RS1FD36JQ U 498
AF RS1BQ23TF U 333
AF RS1BT83JQ U 333
AF RS1B481TF C 496
AF RS1BW84TF C 333
AF RS1BQ23JQ C 382
AF RS1BT83TF C 388
AF RS1B481JQ U 498
AF RS1A607TF C 494
AF RS1A607JQ U 496
AF RS1CW45JQ U 498
AF RS1FI26TF C 498
AF RS1CW45TF C 498
AF RS1E385TF C 421
AF RS1AF60JQ U 498
AF RS1B184TF C 938
AF RS1B184JQ U 498
AF RS1AJ38JQ U 498
AF RS1AJ38TF C 498
AF RS1DT92JQ U 498
AF RS1C394JQ U 498
AF RS1C394TF C 516
AF RS1DT92TF C 505
BS 1 332 RS1H137TF
BS 333 492 RS1E385JQ
BS 493 493 RS1CP79JQ
BS 494 958 RS1E385JQ
BS 959 959 RS1BT83JQ
BS 960 981 RS1E385JQ
BS 982 1094 RS1BT83JQ
BS 1095 1095 RS1A607JQ
BS 1096 1099 RS1B481JQ
BS 1100 1100 RS1A607JQ
BS 1101 1156 RS1B481JQ
BS 1157 1185 RS1A607JQ
BS 1186 1186 RS1CW45JQ
BS 1187 1196 RS1AF60JQ
BS 1197 1299 RS1C394JQ

RD RS1H137TF 638 0 0
TGGGATAACCCCCTTTCGAAATCTCAAGAGGTTTCCATCGAATTCGGATTATCCGTATTA
AATGGATCAAACAAACAAATGAAATTGAGAAAGTATGTACATACATTTCATATTCTATAT
TAATTTATATTTACATTTATAAAGAAAAAGAGAGATATGGGTGGATTCCTTTATATTAAG
ATATTTCACTTGTATCTTTATACATTACAATAACCATAATGGCTAGTATGGTAGAAAGAG
ATCTCTTTCTACCATACTAGCGGGCCCCTTAGGATACTACCGAATCTAATGCATTCCTTC
ATTTAAGACGAGAAATTGACATCTTTTTTTTTCATTGATAGTCAAATTGTATTCAAATTA
ATTATTTTGACTAACCGTTTTTACGTAAATTATAAGCAAAAAAGCAGTAGGAACGAGAAT
GAAGAGTGCAGTAGCAATAAATGCAAGAATATTGACTTCCATAATTAAATAGTTTATTAT
TTATTTTTTTTT*CTTTGGAATATCTCGGGATTTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTC
GCTTGTAAACTCACTCAGATGAATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATG
AATAACAATATCGGAGCTATAAAATCGATTCATCGTCC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1DO75JQ 141 0 0
GGAATATCTCGGGATCTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCG
GATGAATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGC
TATAAAATCGATTCATCGTCC

QA 1 141 1 141
DS 

RD RS1DO75TF 141 0 0
GGAATATCTCGGGATCTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCG
GATGAATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGC
TATAAAATCGATTCATCGTCC

QA 1 141 1 141
DS 

RD RS1CN77JQ 141 0 0
GGAATATCTCGGGATTTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACACA
GATGAATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGC
TATAAAATCGATTCATCGTCC

QA 1 141 1 141
DS 

RD RS1CN77TF 141 0 0
GGAATATCTCGGGATTTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACACA
GATGAATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGC
TATAAAATCGATTCATCGTCC

QA 1 141 1 141
DS 

RD RS1G825TF 222 0 0
CAACGC
AGAGTGCAGTAGCAATAAATGCAAGAATATTGACTTCCATAATTAAATAGTTTATTATTT
ATTTTTTTTT*CTTTGGAATATCTCGGGATTTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGC
TTGTAAACTCACTCAGATGAATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAA
TAACAATATCGGAGCTATAAAATCGATTCATCGTCC

QA 7 222 7 222
DS 

RD RS1CP79JQ 306 0 0
CATTGATAGTCAAATTGTATTCAAATTAATTATTTTGACTAACCGTTTTTACGTAAATTA
TAAGCAAAAAAGCAGTAGGAACGAGAATGAAGAGTGCAGTAGCAATAAATGCAAGAATAT
TGACTTCCATAATTAAATAGTTTATTATTTATTTTTTTTT*CTTTGGAATATCTCGGGAT
TTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCAATCAGATGAATTAGATTTC
GATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGCTATAAAATCGATTCA
TCGTCC

QA 1 306 1 306
DS 

RD RS1CP79TF 306 0 0
CATTGATAGTCAAATTGTATTCAAATTAATTATTTTGACTAACCGTTTTTACGTAAATTA
TAAGCAAAAAAGCAGTAGGAACGAGAATGAAGAGTGCAGTAGCAATAAATGCAAGAATAT
TGACTTCCATAATTAAATAGTTTATTATTTATTTTTTTTT*CTTTGGAATATCTCGGGAT
TTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCAATCAGATGAATTAGATTTC
GATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGCTATAAAATCGATTCA
TCGTCC

QA 1 306 1 306
DS 

RD RS1A462JQ 419 0 0
CATTGATAGTCGAATTGTATTCAAATTAATTATTTTGACTAACCGTTTTTACGTAAATTA
TAAGCAAAAAAGCAGTAGGAACGAGAATGAAGAGTGCAGTAGCAATAAATGCAAGAATAT
TGACTTCCATAATTAAATAGTTTATTATTTATTTTTTTTT**TTTGGAATATCTCGGGAT
TTAATCCCATAGAGATGAAAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCAAATGAATTAAATTTC
GATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGCTATAAAATCGATTCA
TCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCACACCGAATACATAATG
AGATTCCTGATCCAATAAAAAACTATTTATTTATGATTCTTTTTCACCGCTTTCTTTTC

QA 1 419 1 419
DS 

RD RS1A462TF 419 0 0
CATTGATAGTCGAATTGTATTCAAATTAATTATTTTGACTAACCGTTTTTACGTAAATTA
TAAGCAAAAAAGCAGTAGGAACGAGAATGAAGAGTGCAGTAGCAATAAATGCAAGAATAT
TGACTTCCATAATTAAATAGTTTATTATTTATTTTTTTTT**TTTGGAATATCTCGGGAT
TTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCAGATGAATTAGATTTC
GATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGCTATAAAATCGATTCA
TCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCACACCGAATACATAATG
AGATTCCTGATCCAATAAAAAACTATTTATTTATGATTCTTTTTCACCGCTTTCTTTTC

QA 1 419 1 419
DS 

RD RS1GI59JQ 390 0 0
GGAATATCTCGGGATTTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCA
GATGAATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGC
TATAAAATCGATTCATCGTCAAGAATTTAACAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCAC
ACCGAATACATAATGAGATTCCTGATCCAATAAAAAACTATTTATTTATGATTCTTTTTC
ACCGCTTTCTTTTCTACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCATA
AAAAACCTTTTCTACTTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAACA
ATAGAAATCAAATAGAGAAAACAAGTACG
C

QA 1 389 1 389
DS 

RD RS1GI59TF 390 0 0
GGAATATCTCGGGATTTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCA
GATGAATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGC
TATAAAATCGATTCATCGTCAAGAATTTAACAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCAC
ACCGAATACATAATGAGATTCCTGATCCAATAAAAAACTATTTATTTATGATTCTTTTTC
ACCGCTTTCTTTTCTACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCATA
AAAAACCTTTTCTACTTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAACA
ATAGAAATCAAATAGAGAAAACAAGTACG
C

QA 1 389 1 389
DS 

RD RS1E385JQ 653 0 0
TTTT
CATTGATAGTCAAATTGTATTCAAATTAATTATTTTGACTAACCGTTTTTACGTAAATTA
TAAGCAAAAAAGCAGTAGGAACGAGAATGAAGAGTGCAGTAGCAATAAATGCAAGAATAT
TGACTTCCATAATTAAATAGTTTATTATTTATTTTTTTTTTCTTTGGAATATCTCGGGAT
TTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCAGATGAATTAGATTTC
GATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGCTATAAAATCGATTCA
TCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCACACCGAATACATAATG
AGATTCCTGATCCAATAAAAAACTATTTATTTATGATTCTTTTTCACCGCTTTCTTTTCT
ACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCATAAAAAACCTTTTCTAC
TTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAACAATAGAAATCAAATAG
AGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAATTTTGTAAGGG*TCTATGATC
TTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATGAAGACGAGTCCCGATAAAAAAA

QA 5 653 5 653
DS 

RD RS1BW84JQ 668 0 0
CATTGATAGTCAAATTGTATTCAAATTAATTATTTTGACTAACCGTTTTTACGTAAATTA
TAAGCAAAAAAGCAGTAGGAACGAGAATGAAGAGTGCAGTAGCAATAAATGCAAGAATAT
TGACTTCCATAATTAAATAGTTTATTATTTATTTTTTTT**CTTTGGAATATCTCGGGAT
TTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCAGATGAATTAGATTTC
GATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGCTATAAAGTCGATTCA
TCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCACACCGAATACATAATG
AGATTCCTGATCCAATAAAAAACTATTTATTTATGATTCTTTTTCACCGCTTTCTTTTCT
ACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCATAAAAAACCTTTTCTAC
TTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAACAATAGAAATCAAATAG
AGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAATTTTGTAAGGG*TCTATGATC
TTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCGATAAAAAAAACTAAAATATT
CCAAAAAA

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1FI26JQ 466 0 0
GGAATATCTCGGGATTTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCA
GATGAATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGC
TATAAAATCGATTCATCGTCAAAAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCAC
ACCGAATACATAATGAGATTCCTGATCCAATAAAAAACTATTTATTTATGATTCTTTTTC
ACCGCTTTCTTTTCTACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCATA
AAAAACCTTTTCTACTTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAACA
ATAGAAATCAAATAGAGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAATTTTGT
AAGGG*TCTATGATCTTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGA

QA 1 466 1 466
DS 

RD RS1FD36JQ 503 0 0
GGAATATCTCGGGATTTAATCCCATAAAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCA
GATGAATTAGATTTCCATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGC
TATAAAATCGATTCATCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCAC
ACCGAATACATAATGAGATTCCTAATCCAATAAAAAACTATTTATTTATGATTCTTTTTC
ACCGCTTTCTTTTCTACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCATA
AAAAACCTTTTCTACTTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAACA
ATAGAAATCAAATAGAGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAATTTTGT
AAGGG*TCTATGATCTTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCGATAAA
AAAAACTAAAATATTCCAAAAAA

QA 1 503 1 503
DS 

RD RS1BQ23TF 737 0 0
G
ATTGATAGTCAAATTGTATTCAAATTAATTATTTTGACTAACCGTTTTTACGTAAATTAT
AAGCAAAAAAGCAGTAGGAACGAGAATGAAGAGTGCAGTAGCAATAAATGCAAGAATATT
GACTTCCATAATTAAATAGTTTATTATTTATTTTTTTTT*CTTTGGAATATCTCGGGATT
TAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCAGATGAATTAGATTTCG
ATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGCTATAAAATCGATTCAT
CGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCACACCGAATACATAATGA
GATTCCTGATCCAATAAAAAACTATTTATTTATGATTCTTTTTCACCGCTTTCTTTTCTA
CAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCATAAAAAACCTTTTCTACT
TCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAACAATAGAAATCAAATAGA
GAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTTAAAAATTTTGTAAGGG*TCTATGATCT
TTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAATACGAGTCCCGATAAAAAAA*CTAAAATATTC
CAAAAA*TTAACTCTTTAA*TTTTCTTACGAGTTTTTCTTCGACATCA*CTCTAATTTT*
*AAAAGAGCATATTCA

QA 2 737 2 737
DS 

RD RS1BT83JQ 762 0 0
CATTGATAGTCAAATTGTATTCAAATTAATTATTTTGACTAACCGTTTTTACGTAAATTA
TAAGCAAAAAAGCAGTAGGAACGAGAATGAAGAGTGCAGTAGCAATAAATGCAAGAATAT
TGACTTCCATAATTAAATAGTTTATTATTTATTTTTTTTT*CTTTGGAATATCTCGGGAT
TTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCAGATGAATTAGATTTC
GATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGCTATAAAATCGATTCA
TCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCACACCGAATACATAATG
AGATTCCTGATCCAATAAAAAACTATTTATTTATGATTCTTTTTCACCGCTTTCTTTTCT
ACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCATAAAAAACCTTTTCTAC
TTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAACAATAGAAATCAAATAG
AGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAATTTTGTAAGGG*TCTATGATC
TTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCGATAAAAAAAACTAAAATATT
CCAAAAAATTAACTCTTTAAATTTTCTTACGAGTTTTTCTTCGACATCAACTCTAATTTT
TAAAAAGAGCATATTCATTAGGGAAGACTAAATTGATCTTTA

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1B481TF 632 0 0
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CAGATGGATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGA
GCTATAAAATCGATTCATCGTCAAAAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCC
ACACCGAATACATAATGAGATTCCTGATCCAATAAAAAACTATTTATTTATGATTCTTTT
TCACCGCTTTCTTTTCTACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCA
TAAAAAACCTTTTCTACTTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAA
CAATAGAAATCAAATAGAGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAATTTT
GTAAGGG*TCTATGATCTTTTTGTAAAA**ACGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCGATA
AAAAAAACTAAAATATTCCAAAAAATTAACTCTTTAAATTTTCTTACGAGTTTTTCTTCG
ACATCAACTCTAATTTTTAAAAAGAGCATATTCATTAGGGAAGACTAAATTGATCTTTAA
TTTT*AAATATCCTCTTTACTTGGTTGGATTC

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1BW84TF 854 0 0
CATTGATAGTCAAAT*GTATTCAAATTAATTATTT*GACTAACCGTTTTTACGTAAATTA
TAAGCAAAAA*GCAGTAGGAACGAGAATGAAGAGTGCAGTAGCAATAAATGCAAGAATAT
TGACTTCCATAATTAAATAGTTTATTATTTATTTTTTTT**CTTTGGAATATCTCGGGAT
TTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCAGATGAATTAGATTTC
GATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGCTATAAAGTCGATTCA
TCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCACACCGAATACATAATG
AGATTCCTGATCCAATAAAAAACTATTTATTTATGATTCTTTTTCACCGCTTTCTTTTCT
ACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCATAAAAAACCTTTTCTAC
TTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAACAATAGAAATCAAATAG
AGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAATTTTGTAAGGG*TCTATGATC
TTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCGATAAAAAAAACTAAAATATT
CCAAAAAATTAACTCTTTAAATTTTCTTACGAGTTTTTCTTCGACATCAACTCTAATTTT
TAAAAAGAGCATATTCATTAGGGAAGACTAAATTGATCTTTATTTTTTAAATATCCTCTT
TACTTGGTTGGATTCGAACTATTTTAACTTCCTTGACTTCATAGAAACAAAAGTATATAT
AGGTACTCTTGGCC

QA 1 854 1 854
DS 

RD RS1BQ23JQ 775 0 0
TACGTAAATTATAAGCAAAAAAGCAGTAGGAACGAGAATGAAGAGTGCAGTAGCAATAAA
TGCAAGAATATTGACTTCCATAATTAAATAGTTTATTATTTATTTTTTTTT*CTTTGGAA
TATCTCGGGATTTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCAGATG
AATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGCTATA
AAATCGATTCATCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCACACCG
AATACATAATGAGATTCCTGATCCAATAAAAAACTATTTATTTATGATTCTTTTTCACCG
CTTTCTTTTCTACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCATAAAAA
ACCTTTTCTACTTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAACAATAG
AAATCAAATAGAGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTTAAAAATTTTGTAAGG
G*TCTATGATCTTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAATACGAGTCCCGATAAAAAAA
ACTAAAATATTCCAAAAAATTAACTCTTTAAATTTTCTTACGAGTTTTTCTTCGACATCA
ACTCTAATTTTTAAAAAGAGCATATTCATTAGGGAAGACTAAATTGATCTTTATTTTTTA
AATATCCTCTTTACTTGGTTGGATTCGAACTATTTTAACTTCCTTGACTTCATAG

QA 1 775 1 775
DS 

RD RS1BT83TF 799 0 0
TAAATATAAGC
AAAAAGCAGTAGGAACGAGA*TGAAGAGTGCAGTAGCAATAAATGCAAGAATAT*GACTT
CCATAATTAAATAGTTTATTATTTATTTTTTTT**CTTTGGAATATCTCGGGATTTAATC
CCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCAGATGAATTAGATTTCGATGAT
ATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGCTATAAAATCGATTCATCGTCA
AGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCACACCGAATACATAATGAGATTC
CTGATCCAATAAAAAACTATTTATTTATGATTCTTTTTCACCGCTTTCTTTTCTACAACC
TATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCATAAAAAACCTTTTCTACTTCGAT
TGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAACAATAGAAATCAAATAGAGAAAA
CAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAATTTTGTAAGGG*TCTATGATCTTTTTG
TAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCGATAAAAAAAACTAAAATATTCCAAAA
AATTAACTCTTTAAATTTTCTTACGAGTTTTTCTTCGACATCAACTCTAATTTTTAAAAA
GAGCATATTCATTAGGGAAGACTAAATTGATCTTTATTTTTTAAATATCCTCTTTACTTG
GTTGGATTCGAACTATTTTAACTTCCTTGACTTCATAGGAACAAAAGTATATATAGGTAC
TCTTGGCC

QA 12 799 12 799
DS 

RD RS1B481JQ 659 0 0
GGAATATCTCGGGATTTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCA
GATGGATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGC
TATAAAATCGATTCATCGTCAAAAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCAC
ACCGAATACATAATGAGATTCCTGATCCAATAAAAAACTATTTATTTATGATTCTTTTTC
ACCGCTTTCTTTTCTACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCATA
AAAAACCTTTTCTACTTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAACA
ATAGAAATCAAATAGAGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAATTTTGT
AAGGG*TCTATGATCTTTTTGTAAAA**ACGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCGATAAA
AAAAACTAAAATATTCCAAAAAATTAACTCTTTAAATTTTCTTACGAGTTTTTCTTCGAC
ATCAACTCTAATTTTTAAAAAGAGCATATTCATTAGGGAAGACTAAATTGATCTTTAATT
TT*AAATATCCTCTTTACTTGGTTGGATTCGAACTATTTTAACTTCCTTGACTTCATAG

QA 1 659 1 659
DS 

RD RS1A607TF 692 0 0
CTTTGGAATATCTCGGGATTTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCA
CTCAGATGAATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCG
GAGCTATAAAATCGATTCATCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTAT
CCACACCGAATACATAATGAGATTCCTGATCCAATAAAAAACTATTTATTTATGATTCTT
TTTCACCGCTTTCTTTTCTACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATAT
CATAAAAAACCTTTTCTACTTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATA
AACAATAGAAATCAAATAGAGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAATT
TTGTAAGGG*TCTATGATCTTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCGA
TAAAAAAAACTAAAATATTCCAAAAAATTAACTCTTTAAATTTTCTTACGAGTTTTTCTT
CGACATCAACTCTAGTTTTTAAAAGGAGCATATTCATTAGGGAAGACTAAATTGATCTTT
ATTTTTTAAATATCCTCTTTACTTGGTTGGATTCGAACTATTTTAACTTCCTTGACTTCA
TAGAAACAAAAGTATATATAGGTACTCTTGGC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RS1A607JQ 690 0 0
TTGGAATATCTCGGGATTTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTAGTAAACTCACT
CAGATGAATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGA
GCTATAAAATCGATTCATCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCC
ACACCGAATACATAATGAGATTCCTGATCCAATAAAAAACTATTTATTTATGATTCTTTT
TCACCGCTTTCTTTTCTACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCA
TAAAAAACCTTTTCTACTTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAA
CAATAGAAATCAAATAGAGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAATTTT
GTAAGGG*TCTATGATCTTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCGATA
AAAAAAACTAAAATATTCCAAAAAATTAACTCTTTAAATTTTCTTACGAGTTTTTCTTCG
ACATCAACTCTAGTTTTTAAAAGGAGCATATTCATTAGGGAAGACTAAATTGATCTTTAT
TTTTTAAATATCCTCTTTACTTGGTTGGATTCGAACTATTTTAACTTCCTTGACTTCATA
GAAACAAAAGTATATATAGGTACTCTTGGC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1CW45JQ 689 0 0
GGAATATCTCGGGATTTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTCGCTTGTAAACTCACTCA
GATGAATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGC
TATAAAATCGATTCATCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCAC
ACCGAATACATAATGAGATTCCTGATCCAATAAAAAACTATTTATTTATGATTCTTTTTC
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TTTAAATATCCTCTTTACTTGGTTGGATTCGAACTATTTTAACTTCCTTGACTTCATAGA
AACAAAAGTATATATAGGTACTCTTGGCC

QA 1 689 1 689
DS 

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GATGAATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGC
TATAAAATCGATTCATCGTCAAAAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCAC
ACCGAATACATAATGAGATTCCTGATCCAATAAAAAACTATTTATTTATGATTCTTTTTC
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AAAAACCTTTTCTACTTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAACA
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AACAAAAGTATATATAGGTACTCTTGGCC

QA 1 689 1 689
DS 

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GATGAATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGC
TATAAAATCGATTCATCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCAC
ACCGAATACATAATGAGATTCCTGATCCAATAAAAAACTATTTATTTATGATTCTTTTTC
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TTTAAATATCCTCTTTACTTGGTTGGATTCGAACTATTTTAACTTCCTTGACTTCATAGA
AACAAAAGTATATATAGGTACTCTTGGCC

QA 1 689 1 689
DS 

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TTATTTTTTTTT*CTTTGGAATATCTCGGGATTTAATCCCATAGAGATGAGAAATCTTTC
GCTTGTAAACTCACTCAGATGAATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATG
AATAACAATATCGGAGCTATAAAATCGATTCATCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAG
GAAGATCTTTTATCCACACCGAATACATAATGAGATTCCTGATCCAATAAAAAACTATTT
ATTTATGATTCTTTTTCACCGCTTTCTTTTCTACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCA
TCTGATGAAATATCATAAAAAACCTTTTCTACTTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAA
AGAACCTTAAATAAACAATAGAAATCAAATAGAGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGA
AATTTAAAAAATTTTGTAAGGG*TCTATGATCTTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATGA
AGACGAGTCCCGATAAAAAAA*CTAAAATATTCCAAAAAATTAACTCTTTAAATTTTCTT
ACGAGTTTTTCTTCGACATCAACTCTAATTTTTAAAAAGAGCATATTCATTAGGGAAGAC
TAAATTGATCTTTATTTTTTAAATATCCTCTTTACTTGGTTGGATTCGAACTATTTTAAC
TTTCTTGACTTCATAGAAACAAAAGTATATATAGGTACTCTTGGCC

QA 1 766 1 766
DS 

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ACCGAATACATAATGAGATTCCTGATCCAATAAAAAACTATTTATTTATGATTCTTTTTC
ACCGCTTTCTTTTCTACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCATA
AAAAACCTTTTCTACTTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAACA
ATAGAAATCAAATAGAGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAATTTTGT
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AAAAACTAAAATATTCCAAAAAATTAACTCTTTAAATTTTCTTACGAGTTTTTCTTCGAC
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TTTAAATATCCTCTTTACTTGGTTGGATTCGAACTATTTTAACTTCCTTGACTTCATAGA
AACAAAAGTATATATAGGTACTCTTGGCAAACGTATTAT
C

QA 1 699 1 699
DS 

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GGTTGGATTCGAACTATTTTAACTTCCTTGACTTCATAGAAACAAAAGTATATATAGGTA
CTCTTGGCAAACGTATTAT
C

QA 1 259 1 259
DS 

RD RS1B184JQ 659 0 0
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ACCGCTTTCTTTTCTACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCATA
AAAAACCTTTTCTACTTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAACA
ATAGAAATCAAATAGAGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAATTTTGT
AAGGG*TCTATGATCTTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCGATAAA
AAAAACTAAAATATTCCAAAAAATTAACTCTTTAAATTTTCTTACGAGTTTTTCTTCGAC
ATCAACTCTAATTTTT**AAAGAGCATATTCATTAGGGAAGACTAAATTGATCTTTATTT
TTTAAATATCCTCTTTACTTGGTTGGATTCGAACTATTTTAACTTCCTTGACTTCATAG

QA 1 659 1 659
DS 

RD RS1AJ38JQ 689 0 0
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AACGCTTTCTTTTCTACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCATA
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AAGGGGTCTATGATCTTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCGATAAA
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ATCAACTCTAATTTTTAAAAAGAGCATATTCATTAGGGAAGACTAAATTGATCTTTATTT
TTTAAATATCCTCTTTACTTGGTTGGATTCGAACTATTTTAACTTCCTTGACTTCATAGA
AACAAGAGTATATATAGGTACTCTTGGCC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1AJ38TF 689 0 0
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ATCAACTCTAATTTTTAAAAAGAGCATATTCATTAGGGAAGACTAAATTGATCTTTATTT
TTTAAATATCCTCTTTACTTGGTTGGATTCGAACTATTTTAACTTCCTTGACTTCATAGA
AACAAGAGTATATATAGGTACTCTTGGCC

QA 1 689 1 689
DS 

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AAAAACTAAAATATTCCAAAAAATTAACTCTTTAAATTTTCTTACGAGTTTTTCTTCGAC
ATCAACTCTAATTTTTAAAAAGAGCATATTCATTAGGGAAGACTAAATTGATCTTTATTT
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AACAAAAGTATATATAGGTACTCTTGGCAAACGTATTATACGCTATCCTATTTCATTTTC
CTACACGAGTTAATGGGAGATTAATTGA

QA 1 748 1 748
DS 

RD RS1C394JQ 802 0 0
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GATGAATTAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGC
TATAAAATCGATTCATCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCAC
ACCGAATACATAATGAGATTCCTGATCCAATAAAAAACTATTTATTTATGATTCTTTTTC
ACCGCTTTCTTTTCTACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCATA
AAAAACCTTTTCTACTTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAACA
ATAGAAATCAAATAGAGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAATTTTGT
AAGGG*TCTATGATCTTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCGATAAA
AAAAACTAAAATATTCCAAAAAATTAACTCTTTAAATTTTCTTACGAGTTTTTCTTCGAC
ATCAACTCTAATTTTTAAAAAGAGCATATTCATTAGGGAAGACTAAATTGATCTTTATTT
TTTAAATATCCTCTTTACTTGGTTGGATTCGAACTATTTTAACTTCCTTGACTTCATAGA
AACAAAAGTATATATAGGTACTCTTGGCAAACGTATTATACGCTATCCTATTTCATTTTC
CTACACGAGTTAATGGGAGATTAATTGACAAAAAGAGGAAACCCCGTACAGTATCTCGTT
CTTGAAGTGGTGAATGCTCTCC

QA 1 802 1 802
DS 

RD RS1C394TF 784 0 0
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GATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGCTATAAAATCGATTCATCG
TCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCACACCGAATACATAATGAGA
TTCCTGATCCAATAAAAAACTATTTATTTATGATTCTTTTTCACCGCTTTCTTTTCTACA
ACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCATAAAAAACCTTTTCTACTTC
GATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAACAATAGAAATCAAATAGAGA
AAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAATTTTGTAAGGG*TCTATGATCTTT
TTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCGATAAAAAAAACTAAAATATTCCA
AAAAATTAACTCTTTAAATTTTCTTACGAGTTTTTCTTCGACATCAACTCTAATTTTTAA
AAAGAGCATATTCATTAGGGAAGACTAAATTGATCTTTATTTTTTAAATATCCTCTTTAC
TTGGTTGGATTCGAACTATTTTAACTTCCTTGACTTCATAGAAACAAAAGTATATATAGG
TACTCTTGGCAAACGTATTATACGCTATCCTATTTCATTTTCCTACACGAGTTAATGGGA
GATTAATTGACAAAAAGAGGAAACCCCGTACAGTATCTCGTTCTTGAAGTGGTGAATGCT
CTCC

QA 1 784 1 784
DS 

RD RS1DT92TF 795 0 0
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TAGATTTCGATGATATCGAATGAAAGAAATATCATGAATAACAATATCGGAGCTATAAAA
TCGATTCATCGTCAAGAATTTAATAGTATAACATAGGAAGATCTTTTATCCACACCGAAT
ACATAATGAGATTCCTGATCCAATAAAAAACTATTTATTTATGATTCTTTTTCACCGCTT
TCTTTTCTACAACCTATTACTTTCCTTGTACAATCATCTGATGAAATATCATAAAAAACC
TTTTCTACTTCGATTGTTTACAAAAAGAGTTTCTAAAGAACCTTAAATAAACAATAGAAA
TCAAATAGAGAAAACAAGTACGAAATTTCAAATTGAAATTTAAAAAATTTTGTAAGGG*T
CTATGATCTTTTTGTAAAACAAAGGAAATGTGATAAAGACGAGTCCCGATAAAAAAAACT
AAAATATTCCAAAAAATTAACTCTTTAAATTTTCTTACGAGTTTTTCTTCGACATCAACT
CTAATTTTTAAAAAGAGCATATTCATTAGGGAAGACTAAATTGATCTTTATTTTTTAAAT
ATCCTCTTTACTTGGTTGGATTCGAACTATTTTAACTTCCTTGACTTCATAGAAACAAAA
GTATATATAGGTACTCTTGGCAAACGTATTATACGCTATCCTATTTCATTTTCCTACACG
AGTTAATGGGAGATTAATTGACAAAAAGAGGAAACCCCGTACAGTATCTCGTTCTTGAAG
TGGTGAATGCTCTCC

QA 1 795 1 795
DS 



AS 4 33

CO CL4Contig1 699 2 7 U
GTGAAAAACAGGTTCGGTTTCTGATAAGATCATACAAAGATAAGACAAAGGAAGTTTCAC
AAATATACAATCAAACTCTTTCTCTGCTGCCCACTAGCATGATAATAAACCTTTTAACTC
GTTCATTTTCCGGGTACGAAGTTGGTGGCAAAGGCCCATGCGTTGTTGCTAACTGGATCA
GCCAAATGATCGGCAAGATTCTCCAACGGTCCCTTTCCGGTGACGATGGCCTGAACGAAG
AATCCAAACATAGAGAACATAGCCAACCTTCCGTTCTTGATCTCCTTCACCTTCAACTCC
GCGAAAGCCTCTGGGTCAGTAGCAAGACCCAACGGGTCGAAGCTGCCTCCTGGATAAAGC
AAGTCCTCTGCTTCTCCCAATGGTCCCTCTCCGGCGACTCTGTAACCTTCAACAGCTCCC
ATGAGGATCACCTGAGTAGCCCAAATGGCTAAAATGCTCTGTGCATGGACCAAGCTCGGG
TTTCCCAAGTAGTCGAGCCCTCCTTCGCTGAAAATCTGTGAACCAGCCTTGAACCAAACA
GCTTCTCCGAACTTCACTCCGTTCCTAGCCAAAAGCTCAGGGAAAACGCAGCCTAGGGCT
CCAAGCATGGCCCATCTGCAGTGGATAACTTCTAGCTCACGGTTCCTTGCGAAGGTCTCG
GGGGCGCCCCGGAGAATGGACCCAAGTACTTAACCCTGT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 0 0 0 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A748JQ U 1
AF RS1FV87JQ U 1
BS 1 168 RS1A748JQ
BS 169 169 RS1FV87JQ
BS 170 665 RS1A748JQ
BS 666 666 RS1FV87JQ
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BS 669 699 RS1A748JQ

RD RS1A748JQ 699 0 0
GTGAAAAACAGGTTCGGTTTCTGATAAGATCATACAAAGATAAGACAAAGGAAGTTTCAC
AAATATACAATCAAACTCTTTCTCTGCTGCCCACTAGCATGATAATAAACCTTTTAACTC
GTTCATTTTCCGGGTACGAAGTTGGTGGCAAAGGCCCATGCGTTGTTGTTAACTGGATCA
GCCAAATGATCGGCAAGATTCTCCAACGGTCCCTTTCCGGTGACGATGGCCTGAACGAAG
AATCCAAACATAGAGAACATAGCCAACCTTCCGTTCTTGATCTCCTTCACCTTCAACTCC
GCGAAAGCCTCTGGGTCAGTAGCAAGACCCAACGGGTCGAAGCTGCCTCCTGGATAAAGC
AAGTCCTCTGCTTCTCCCAATGGTCCCTCTCCGGCGACTCTGTAACCTTCAACAGCTCCC
ATGAGGATCACCTGAGTAGCCCAAATGGCTAAAATGCTCTGTGCATGGACCAAGCTCGGG
TTTCCCAAGTAGTCGAGCCCTCCTTCGCTGAAAATCTGTGAACCAGCCTTGAACCAAACA
GCTTCTCCGAACTTCACTCCGTTCCTAGCCAAAAGCTCAGGGAAAACGCAGCCTAGGGCT
CCAAGCATGGCCCATCTGCAGTGGATAACTTCTAGCTCACGGTTCCTTGCGAAGGTCTCG
GGGGCTCTCCGGAGAATGGACCCAAGTACTTAACCCTGT

QA 1 699 1 699
DS 

RD RS1FV87JQ 668 0 0
GA
GAAAAACAGGTTCGGTTTCTGATAAGATCATACAAAGATAAGACAAAGGAAGTTTCACAA
ATATACAATCAAACTCTTTCTCTGCTGCCCACTAGCATGATAATAAACCTTTTAACTCGT
TCATTTTCCGGGTACGAAGTTGGTGGCAAAGGCCCATGCGTTGTTGCTAACTGGATCAGC
CAAATGATCGGCAAGATTCTCCAACGGTCCCTTTCCGGTGACGATGGCCTGAACGAAGAA
TCCAAACATAGAGAACATAGCCAACCTTCCGTTCTTGATCTCCTTCACCTTCAACTCCGC
GAAAGCCTCTGGGTCAGTAGCAAGACCCAACGGGTCGAAGCTGCCTCCTGGATAAAGCAA
GTCCTCTGCTTCTCCCAATGGTCCCTCTCCGGCGACTCTGTAACCTTCAACAGCTCCCAT
GAGGATCACCTGAGTAGCCCAAATGGCTAAAATGCTCTGTGCATGGACCAAGCTCGGGTT
TCCCAAGTAGTCGAGCCCTCCTTCGCTGAAGATCTGTGAACCAGCCTTGAACCAAACAGC
TTCTCCGAACTTCACTCCGTTCCTAGCCAAAAGCTCAGGGAAAACGCAGCCTAGGGCTCC
AAGCATGGCCCATCTGCAGTGGATAACTTCTAGCTCACGGTTCCTTGCGAAGGTCTCGGG
GTCGGC

QA 3 668 3 668
DS 



CO CL4Contig2 983 4 4 U
GGCACTCTCACCAGTCACAACAACAAAAAAACACAAAAACTGAAAAAAGAAGAAAAGTTC
TAATGGCTGCTTCAACCATGGCTCTCTCCTCCCCTGCCTTTGCCGGAAAGGCCGTGAAGC
TCTCACCGGGAGCCTCTGAAGTCTTTGGAACCGGCCGTGTCACCATGCGCAAAACCGTCA
AACCTACCGGTCCATCTGGCAGCCCATGGTACGGATCCGACAGGGTTAAGTACTTGGGTC
CATTCTCCGGAGAGCCCCCGAGCTACCTTACCGGAGAGTTCCCTGGTGACTACGGATGGG
ACACCGCCGGTCTATCCGCTGACCCCGAGACCTTCGCCAGGAACCGTGAGCTAGAAGTTA
TCCACTGCAGATGGGCCATGCTTGGAGCCCTAGGCTGCGTTTTCCCTGAGCTATTGGCTA
GGAACGGAGTTAAGTTCGGAGAAGCTGTCTGGTTCAAGGCCGGTTCACAGATCTTCAGCG
AAGGAGGGCTCGACTACTTGGGAAACCCGAGCTTGGTCCATGCACAGAGCATCTTAGCCA
TTTGGGCTACTCAGGTGATCCTCATGGGAGCTGTTGAAGGTTACAGAGTCGCCGGAGAGG
GACCATTGGGAGAAGCAGAGGACTTGCTTTACCCAGGAGGCAGCTTCGACCCGTTGGGTC
TTGCTACTGACCCAGAGGCTTTCGCGGAGTTGAAGGTGAAGGAGATCAAGAACGGGAGGT
TGGCTATGTTCTCTATGTTTGGATTCTTCTTTCAGGCCATCGTCACCGGAAAGGGACCGT
TGGAGAATCTTGCCGACCATTTGGCTGATCCAGTCAACAACAACGCATGGGCCTTTGCCA
CCAACTTCGTCCCCGGAAAGTGAGCGAGTTGAAGGTTATTATCATGCGAGTGACAAGCAG
AGAAAGAGTTTGTTTGTATATTTGTGAAACTTCCTTTGTCTTATCTTTGTATGATTTTAT
CAGAGATCGAACCTGTTTTTCCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 10 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FV87TF U 2
AF RS1C285TF U 3
AF RS1AB30TF U 1
AF RS1AB30JQ C 397
BS 1 39 RS1AB30TF
BS 40 42 RS1FV87TF
BS 43 736 RS1AB30TF
BS 737 983 RS1AB30JQ

RD RS1FV87TF 634 0 0
GG
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TGGCTGCTTCAACCATGGCTCTCTCCTCCCCTGCCTTTGCCGGAAAGGCCGTGAAGCTCT
CACCAGGAGCCTCTGAAGTCTTTGGAACAGGCCGTGTCACCATGCGCAAAACCGTCAAAC
CCACCGGTCCTTCTGGCAGCCCATGGTACGGATCCGACAGGGTTAGGTACTTGGGTCCAT
TCTCCGGAGAGCCCCCAAGCTACCTAACAGGAGAGTTCCCTGGTGACTACGGATGGGACA
CCGCCGGTCTATCTGCCGACCCCGAGACCTTCGCAAGGAACCGTGAGCTAGAAGTTATCC
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ACGGAGTGAAGTTCGGAGAAGCTGTTTGGTTCAAGGCTGGTTCACAGATCTTCAGCGAAG
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CATTGGGAGAAGCAGAGGACTTGCTTTATCCA

QA 3 634 3 634
DS 

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G
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CACCGGGAGCCTCTGAAGTCTTTGGAACCGGCCGTGTCACCATGCGCAAAACCGTCAAAC
CTACCGGTCCATCTGGCAGCCCATGGTACGGATCCGACAGGGTTAAGTACTTGGGTCCAT
TCTCCGGAGAGCCCCCGAGCTACCTTACCGGAGAGTTCCCTGGTGACTACGGATGGGACA
CCGCCGGTCTATCCGCTGACCCCGAGACCTTCGCCAGGAACCGTGAGCTAGAAGTTATCC
ACTGCAGATGGGCCATGCTTGGAGCCCTAGGCTGCGTTTTCCCTGAGCTATTGGCTAGGA
ACGGAGTTAAGTTCGGAGAAGCTGTCTGGTTCAAGGCCGGTTCACAGATCTTCAGCGAAG
GAGGGCTCGACTACTTGGGAAACCCGAGCCTGGTCCATGCACAGAGCATCTTAGCCATTT
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CATTGGGAGAAGCAGAGGACTTGCTT

QA 2 627 2 627
DS 

RD RS1AB30TF 736 0 0
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TAATGGCTGCTTCAACCATGGCTCTCTCCTCCCCTGCCTTTGCCGGAAAGGCCGTGAAGC
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AACCTACCGGTCCATCTGGCAGCCCATGGTACGGATCCGACAGGGTTAAGTACTTGGGTC
CATTCTCCGGAGAGCCCCCGAGCTACCTTACCGGAGAGTTCCCTGGTGACTACGGATGGG
ACACCGCCGGTCTATCCGCTGACCCCGAGACCTTCGCCAGGAACCGTGAGCTAGAAGTTA
TCCACTGCAGATGGGCCATGCTTGGAGCCCTAGGCTGCGTTTTCCCTGAGCTATTGGCTA
GGAACGGAGTTAAGTTCGGAGAAGCTGTCTGGTTCAAGGCCGGTTCACAGATCTTCAGCG
AAGGAGGGCTCGACTACTTGGGAAACCCGAGCTTGGTCCATGCACAGAGCATCTTAGCCA
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GACCATTGGGAGAAGCAGAGGACTTGCTTTACCCAGGAGGCAGCTTCGACCCGTTGGGTC
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TGGCTATGTTCTCTAT

QA 1 736 1 736
DS 

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AGGCCGGTTCACAGATCTTCAGCGAAGGAGGGCTCGACTACTTGGGAAACCCGAGCTTGG
TCCATGCACAGAGCATCTTAGCCATTTGGGCTACTCAGGTGATCCTCATGGGAGCTGTTG
AAGGTTACAGAGTCGCCGGAGAGGGACCATTGGGAGAAGCAGAGGACTTGCTTTACCCAG
GAGGCAGCTTCGACCCGTTGGGTCTTGCTACTGACCCAGAGGCTTTCGCGGAGTTGAAGG
TGAAGGAGATCAAGAACGGGAGGTTGGCTATGTTCTCTATGTTTGGATTCTTCTTTCAGG
CCATCGTCACCGGAAAGGGACCGTTGGAGAATCTTGCCGACCATTTGGCTGATCCAGTCA
ACAACAACGCATGGGCCTTTGCCACCAACTTCGTCCCCGGAAAGTGAGCGAGTTGAAGGT
TATTATCATGCGAGTGACAAGCAGAGAAAGAGTTTGTTTGTATATTTGTGAAACTTCCTT
TGTCTTATCTTTGTATGATTTTATCAGAGATCGAACCTGTTTTTCCC

QA 1 587 1 587
DS 



CO CL4Contig3 717 3 13 U
GGGACTCTCACCGGTCACAAAAGAAAAAAAAAACATAAAACCAAAAAAAGAAGAAGAAAA
*TTTCTAATGGCTGCTTCAACCATGGCTCTCTCCTCCCCTGCCTTAGCCGGAAAGGCCGT
GAAGCTCTCACCGGGAGCCTCCGAAGTCTTTGGAACCGGTCGTGTCACCATGCGTAAAAC
CGTCAAACCCACCGGTCCATCAGGCAGCCCATGGTACGGATCCGACAGGGTTAAGTACTT
GGGTCCATTCTCCGGCGAGCCCCCGAGCTACCTCACTGGTGAGTTCCCTGGAGATTACGG
ATGGGACACCGCTGGTCTCTCAGCCGACCCTGAGACTTTTGCTAGGAACCGTGAGCTAGA
AGTTATCCACTGCAGATGGGCTATGCTTGGAGCCCTAGGCTGTGTTTTCCCTGAGCTCTT
GGCTCGTAATGGTGTGAAGTTCGGAGAAGCGGTTTGGTTCAAGGCCGGTTCACAGATCTT
CAGCGAAGGAGGGCTCGACTACTTGGGCAACCCGAGCTTGGTCCACGCTCAGAGCATCTT
AGCCATTTGGGCCACTCAGGTGATCCTCATGGGAGCTGTTGAAGGTTACAGAGTCGCTGG
AGAAGGACCATTGGGAGAAGCGGAGGATTTGCTTTACCCAGGTGGCAGCTTCGACCCGTT
GGGACTCGCTACCGATCCAGAAGCTTTCGCAGAGTTGAAGTGAAGAGATCAAGAACG


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 5 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B282TF U 1
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AF RS1B684TF U 2
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RD RS1B282TF 556 0 0
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*TTTCTAATGGCTGCTTCAACCATGGCTCTCTCCTCCCCTGCCTTAGCCGGAAAGGCCGT
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GGGTCCATTCTCCGGCGAGCCCCCGAGCTACCTCACTGGTGAGTTCCCTGGAGATTACGG
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AGTTATCCACTGCAGATGGGCTATGCTTGGAGCCCTAGGCTGTGTTTTCCCTGAGCTCTT
GGCTCGTAATGGTGTGAAGTTCGGAGAAGCGGTTTGGTTCAAGGCCGGTTCACAGATCTT
CAGCGAAGGAGGGCTCGACTACTTGGGCAACCCGAGCTTGGTCCACGCTCAGAGCATCTT
AGCCATTTGGGC
CACT

QA 1 552 1 552
DS 

RD RS1AO34TFB 695 0 0
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TTTCTAATGGCTGCTTCAACCATGGCTCTCTCCTCCCCTGCCTTAGCCGGAAAGGCCGTG
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GAAGGACCATTGGGAGAAGCGGAGGATTTGCTTTACCCAGGTGGCAGCTTCGACCCGTTG
GGACTCGCTACCGATCCAGAAGCTTTCGCAGAGTT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1B684TF 716 0 0
GGACTCTCACCGGTCATAAAAGAAAAAAAACATAAAAACAAAAAAAAAGAAGAAGAAAA*
GTTCTAATGGCTGCTTCAACCATGGCTCTCTCCTCTCCTGCCTTAGCCGGAAAGGCCGTG
AAGCTCTCACCGGGAGCCTCGGAAGTCTTTGGAACCGGTCGTGTCACCATGCGTAAAACC
GTCAAACCCACCGGTCCATCAGGCAGCCCATGGTACGGATCCGACAGGGTTAAGTACTTG
GGTCCATTCTCCGGCGAGCCCCCGAGCTACCTCACTGGAGAGTTCCCTGGAGATTACGGA
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GTTATCCACTGCAGATGGGCTATGCTTGGAGCCTTAGGCTGTGTTTTCCCTGAACTCTTG
GCCCGTAACGGAGTGAAGTTCGGAGAAGCGGTTTGGTTCAAGGCCGGTTCACAGATCTTC
AGTGAAGGAGGGCTCGACTACTTGGGCAACCCGAGCTTGGTCCACGCTCAGAGCATCTTA
GCCATTTGGGCTACTCAGGTGATCCTCATGGGAGCTGTTGAAGGTTACAGAGTCGCTGGG
GAAGGACCATTGGGAGAAGCGGAGGATTTGCTTTACCCAGGTGGCAGCTTCGACCCGTTG
GGTCTCGCTACCGATCCAGA*GCTTTCGCAGAGTTGAAGTGAAGAGATCAAGAACG

QA 1 716 1 716
DS 



CO CL4Contig4 995 24 14 U
GGGAAAAAGAGGTTCGATTTCTGATGAATCATACAAAGATACGACAAAGGAAATTGCACA
ATTTTACATAGGAAAGATCACAAACAAACTCTTTCTCTGGCTCTCACTCACATTACAATA
AGATTCAACTCGCTCACTTTCCGGGGACGAAGTTGGTAGCGAAGGCCCATGCGTTGTTGT
TGACTGGGTCAGCCAAATGGTCGGCAAGATTCTCCAACGGTCCCTTTCCGGTGACAATAG
CCTGAACAAAGAATCCAAACATAGAGAACATAGCCAACCTTCCGTTCTTGATCTCCTTCA
CCTTCAACTCGGCGAAAGCCTCTGGGTCCGTAGCGAGGCCCAATGGGTCGAAGCTGCCTC
CTGGGTAAAGCAAGTCCTCTGCCTCTCCCAACGGTCCCTCTCCGGCAACTCTGTAACCCT
CAACAGCTCCCATGAGGATCACCTGAGTAGCCCAAATGGCTAAGATGCTCTGAGCGTGGA
CAAGGCTCGGGTTGCCCAAGTAGTCGAGTCCTCCTTCGCTGAAGATCTGTGAACCGGCCT
TGAACCAAACGGCTTCTCCGAACTTGACTCCGTTACGAGCCAAGAGCTCAGGGAAAACAC
AGCCTAGGGCTCCGAGCATGGCCCATCTGCAGTGGATAACTTCTAGCTCACGGTTCCTGG
CGAAGGTCTCGGGGTCGGCTGATAGACCGGCGGTGTCCCATCCGTAGTCTCCGGGGAACT
CTCCGGTAAGGTAGCTCGGGGGCTCGCCGGAGAATGGACCCAAGTACTTAACCCTGTCGG
ATCCGTACCATGGGGAGCCTGATGGACCGGTGGGTTTGACGGTTTTGCGCATGGTGACAC
GGCCGGTTCCAAAGACTTCGGAGGCTCCTGGTGAGAGCTTCACGGCCTTTCCGGCGAAGG
CAGGGGAGGACAGAGCCATGGTTGAAGCAGCCATTTGAACGTTTCTTCTTTTTTGTTGAT
TTTATGTTTTTTTTTT*GTGACTGGGTGAGAGTCC


BQ
10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 50 65 65 65 65 65 65 
65 50 65 65 65 50 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 65 65 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 
85 45 85 85 85 70 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 70 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 40 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 60 85 85 85 85 
85 40 85 85 85 85 90 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 75 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 65 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 80 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 85 85 85 85 70 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 5 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 

AF RS1F364JQ U 114
AF RS1GR87JQ U 21
AF RS1FF77JQ U 1
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AF RS1CY74JQ U 1
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AF RS1CJ72JQ U 1
AF RS1DQ78JQ U 1
AF RS1CP83JQ U 41
AF RS1FU40JQ U 1
AF RS1A432JQ U 53
AF RS1A432TF C 308
AF RS1BW01TF C 148
AF RS1CY74TF C 710
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AF RS1DQ78TF C 206
AF RS1B735TF C 324
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BS 465 606 RS1BW01JQ
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BS 977 995 RS1BW01TF

RD RS1F364JQ 338 0 0
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CTGCCTCCTGGGTAAAGCAAGTCCTCTGCCTCTCCCAACGGTCCCTCTCCGGCAACTCTG
TAACCCTCAACAGCTCCCATGAGGATCACCTGAGTAGC

QA 1 338 1 338
DS 

RD RS1GR87JQ 462 0 0
A
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AAACAAACTCTTTCTCTGGCTCTCACTCACATTACAATAAGATTCAACTCGCTCACTTTC
CGGGGACGAAGTTGGTAGCGAAGGCCCATGCGTTGTTGTTGACTGGGTCAGCCAAATGGT
CGGCAAGATTCTCCAACGGTCCCTTTCCGGTGACAATAGCCTGAACAAAGAATCCAAACA
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CTGGGTCCGTAGCGAGGCCCAATGGGTCGAAACTGCCTCCTGGGTAAAGCAAGTCCTCTG
CCTCTCCCAACGGTCCCTCTCCGGCAACTCTGTAACCCTCAACAGCTCCCATGAGGATCA
CCTGAGTAGCCCAAATGGCTAAAATGCTCTGAGCGTGGACA

QA 2 462 2 462
DS 

RD RS1FF77JQ 522 0 0
GT
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ACTGGGTCAGCCAAATGGTCGGCAAGATTCTCCAACGGTCCCTTTCCGGTGACAATAGCC
TGAACAAAGAATCCAAACATAGAGAACATAGCCAACCTTCCGTTCTTGATCTCCTTCACC
TTCAACTCGGCGAAAGCCTCTGGGTCCGTAGCGAGGCCCAATGGGTCGAAGCTGCCTACT
GGGTAAAGCAAGTCCTCTGCCTCTCCCAACGGTCCCTCTCCGGCAACTCTGTAACCCTCA
ACAGCTCCCATGAGGATCACCTGAGTAGCCCAAATGGCTAAGATGCTCTGAGCGTGGACA
AGGCTCGGGTTGCCCAAGTAGTCGAGTCCTCCTTCGCTGA

QA 3 522 3 522
DS 

RD RS1B735JQ 531 0 0
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CGGGGACGAAGTTGGTAGCGAAGGCCCATGCGTTGTTGTTGACTGGGTCAGCCAAATGGT
CGGCAAGATTCTCCAACGGTCCCTTTCCGGTGACAATAGCCTGAACAAAGAATCCAAACA
TAGAGAACATAGCCAACCTTCCGTTCTTGATCTCCTTCACCTTCAACTCGGCGAAAGCCT
CTGGGTCCGTAGCGAGGCCCAATGGGTCGAAGCTGCCTCCTGGGTAAAGCAAGTCCTCTG
CCTCTCCCAACGGTCCCTCTCCGGCAACTCTGTAACCCTCAACAGCTCCCATGAGGATCA
CCTGAGTAGCCCAAATGGCTAAAATGCTCTGAGCGTGGACAAGGCTCGGGTTGCCCAAGT
AGTCGAGTCCTCCTTCGCTGAAGATCTGTGAACCGGCCTTGAACCAAACGGCTTCTCCGA
ACTTGACTCCGTTACGAGCCAAGAGCTCAGGGAAAACACAGCCTAGGGCTC

QA 1 531 1 531
DS 

RD RS1BW01JQ 661 0 0
GGGAAAAAGAGGTTCGATTTCTGATGAATCATACAAAGATACGACAAAGGAAATTGCACA
ATTTTACATAGGAAAGATCACAAACAAACTCTTTCTCTGGCTCTCACTCACATTACAATA
AGATTCAACTCGCTCACTTTCCGGGGACGAAGTTGGTAGCGAAGGCCCATGCGTTGTTGT
TGACTGGGTCAGCCAAATGGTCGGCAAGATTCTCCAACGGTCCCTTTCCGGTGACAATAG
CCTGAACAAAGAATCCAAACATAGAGAACATAGCCAACCTTCCGTTCTTGATCTCCTTCA
CCTTCAACTCGGCGAAAGCCTCTGGGTCCGTAGCGAGGCCCAATGGGTCGAAGCTGCCTC
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CAAGGCTCGGGTTGCCCAAGTAGTCGAGTCCTCCTTCGCTGAAGATCTGTGAACCGGCCT
TGAACCAAACGGCTTCTCCGAACTTGACTCCGTTACGAGCCAAGAGCTCAGGGAAAACAC
AGCCTAAGGCTCCGAGCATGGCCCATCTGCAGTGGATAACTTCTAGCTCACGGTTCCTGG
C

QA 1 661 1 661
DS 

RD RS1CY74JQ 661 0 0
GA
GAAAAAGAGGTTCGATTTCTGATGAATCATGCAAAGATACGACAAAGGAAATTGCACAAT
TTTACATAGGAAAAATCACAAACAAACTCTTTCTCTGGCTCTCACTCACATTACAATAAG
ATTCAACTCGCTCACTTTCCGGGGACGAAGTTGGTAGCGAAGGCCCATGCGTTGTTGTTG
ACTGGGTCAGCCAAATGGTCGGCAAGATTCTCCAACGGTCCCTTTCCGGTGACAATAGCC
TGAACAAAGAATCCAAACATAGAGAACATAGCCAACCTTCCGTTCTTGATCTCCTTCACC
TTCAACTCGGCGAAAGCCTCTGGGTCCGTAGCGAGGCCCAATGGGTCGAAGCTGCCTCCT
GGGTAAAGCAAGTCCTCTGCCTCTCCCAACGGTCCCTCTCCGGCAACTCTGTAACCCTCA
ACAGCTCCCATGAGGATCACCTGAGTAGCCCAAATGGCTAAGATGCTCTGAGCGTGGACA
AGGCTCGGGTTGCCCAAGTAGTCGAGTCCTCCTTCGCTGAAGATCTGTGAACCGGCCTTG
AACCAAACGGCTTCTCCGAACTTGACTCCGTTACGAGCCAAGAGCTCAGGGAAAACACAG
CCTAGGGCTCCGAGCATGGCCCATCTGCAGTGGATAACTTCTAGCTCACGGTTCCTGGC

QA 3 661 3 661
DS 

RD RS1FM13JQ 661 0 0
GA
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ATTCAACTCGCTCACTTTCCGGGGACGAAGTTGGTAGCGAAGGCCCATGCGTTGTTGTTG
ACTGGGTCAGCCAAATGGTCGGCAAGATTCTCCAACGGTCCCTTTCCGGTGACAATAGCC
TGAACAAAGAATCCAAACATAGAGAACATAGCCAACCTTCCGTTCTTGATCTCCTTCACC
TTCAACTCGGCGAAAGCCTCTGGGTCCGTAGCGAGGCCCAATGGGTCGAAGCTGCCTCCT
GGGTAAAGCAAGTCCTCTGCCTCTCCCAACGGTCCCTCTCCGGCAACTCTGTAACCCTCA
ACAGCTCCCATGAGGATCACCTGAGTAGCCCAAATGGCTAAGATGCTCTGAGCGTGGACA
AGGCTCGGGTTGCCCAAGTAGTCGAGTCCTCCTTCGCTGAAGATCTGTGAACCGGCCTTG
AACCAAACGGCTTCTCCGAACTTGACTCCGTTACGAGCCAAGAGCTCAGGGAAAACACAG
CCTAGGGCTCCGAGCATGGCCCATCTGCAGTGGATAACTTCTAGCTCACGGTTCCTGGC

QA 3 661 3 661
DS 

RD RS1CJ72JQ 726 0 0
GG
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ATTCAACTCGCTCACTTTCCGGGGACGAAGTTGGTAGCGAAGGCCCATGCGTTGTTGTTG
ACTGGGTCAGCCAAATGGTCGGCAAGATTCTCCAACGGTCCCTTTCCGGTGACAATAGCC
TGAACAAAGAATCCAAACATAGAGAACATAGCCAACCTTCCGTTCTTGATCTCCTTCACC
TTCAACTCGGCGAAAGCCTCTGGGTCCGTAGCGAGGCCCAATGGGTCGAAGCTGCCTCCT
GGGTAAAGCAAGTCCTCTGCCTCTCCCAACGGTCCCTCTCCGGCAACTCTGTAACCCTCA
ACAGCTCCCATGAGGATCACCTGAGTAGCCCAAATGGCTAAAATGCTCTGAGCGTGGACA
AGGCTCGGGTTGCCCAAGTAGTCGAGTCCTCCTTCGCTGAAGATCTGTGAACCGGCCTTG
AACCAAACGGCTTCTCCGAACTTGACTCCGTTACGAGCCAAGAGCTCAGGGAAAACACAG
CCTAGGGCTCCGAGCATGGCCCATCTGCAGTGGATAACTTCTAGCTCACGGTTCCTGGCG
AAGGTCTCGGGGTCGGCTGATAGACCGGCGGTGTCCCATCCGTAGTCTCCGGGGAACTCT
CCGG

QA 3 726 3 726
DS 

RD RS1DQ78JQ 745 0 0
GA
GAAAAAGAGGTTCGATTTCTGATGAATCATACAAAGATACGACAAAGGAAATTGCACAAT
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ATTCAACTCGCTCACTTTCCGGGGACGAAGTTGGTAGCGAAGGCCCATGCGTTGTTGTTG
ACTGGGTCAGCCAAATGGTCGGCAAGATTCTCCAACGGTCCCTTTCCGGTGACAATAGCC
TGAACAAAGAATCCAAACATAGAGAACATAGCCAACCTTCCGTTCTTGATCTCCTTCACC
TTCAACTCGGCGAAAGCCTCTGGGTCCGTAGCGAGGCCCAATGGGTCGAAGCTGCCTCCT
GGGTAAAGCAAGTCCTCTGCCTCTCCCAACGGTCCCTCTCCGGCAACTCTGTAACCCTCA
ACAGCTCCCATGAGGATCACCTGAGTAGCCCAAATGGCTAAGATGCTCTGAGCGCGGACA
AGGCTCGGGTTGCCCAAGTAGTCGAGTCCTCCTTCGCTGAAGATCTGTGAACCGGCCTTG
AACCAAACGGCTTCTCCGAACTTGACTCCGTTACGAGCCAAGAGCTCAGGGAAAACACAG
CCTAGGGCTCCGAGCATGGCCCATCTGCAGTGGATAACTTCTAGCTCACGGTTCCTGGCG
AAGGTCTCGGGGTCGGCTGATAGACCGGCGGTGTCCCATCCGTAGTCTCCGGGGAACTCT
CCGGTAAG*TAGCTCGGGGGCTC

QA 3 745 3 745
DS 

RD RS1CP83JQ 686 0 0
ACGACAAAGGAAATTGCACAATTTTACATAGGAAAGATCACAAACAAACTCTTTCTCTGG
CTCTCACTCACATTACAATAAGATTCAACTCGCTCACTTTCCGGGGACGAAGTTGGTAGC
GAAGGCCCATGCGTTGTTGTTGACTGGGTCAGCCAAATGGTCGGCAAGATTCTCCAACGG
TCCCTTTCCGGTGACAATAGCCTGAACAAAGAATCCAAACATAGAGAACATAGCCAACCT
TACGTTCTTGATCTCCTTCACCTTCAACTCGGCGAAAGCCTCTGGGTCCGTAGCGAGGCC
CAATGGGTCGAAGCTGCCTCCTGGGTAAAGCAAGTCCTCTGCCTCTCCCAACGGTCCCTC
TCCGGCAACTCTGTAACCCTCAACAGCTCCCATGAGGATCACCTGAGTAGCCCAAATGGC
TAAGATGCTCTGAGCGTGGACAAGGCTCGGGTTGCCCAAGTAGTCGAGTCCTCCTTCGCT
GAAGATCTGTGAACCGGCCTTGAACCAAACGGCTTCTCCGAACTTGACTCCGTTACGAGC
CAAGAGCTCAGGGAAAACACAGCCTAGGGCTCCGAGCATGGCCCATCTGCAGTGGATAAC
TTCTAGCTCACGGTTCCTGGCGAAGGTCTCGGGGTCGGCTGATAGACCGGCGGTGTCCCA
TCCGTAGTCTCCGGGGAACTCTCCGG

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1FU40JQ 771 0 0
GG
GAAAAAGAGGTTCGATTTCTGATGAATCATACAAAGATACGACAAAGGAAATTGCACAAT
TTTACATAGGAAAGATCACAAACAAACTCTTTCTCTGGCTCTCACTCACATTACAATAAG
ATTCAACTCGCTCACTTTCCGGGGACGAAGTTGGTAGCGAAGGCCCATGCGTTGTTGTTG
ACTGGGTCAGCCAAATGGTCGGCAAGATTCTCCAACGGTCCCTTTCCGGTGACAATAGCC
TGAACAAAGAATCCAAACATAGAGAACATAGCCAACCTTCCGTTCTTGATCTCCTTCACC
TTCAACTCGGCGAAAGCCTCTGGGTCCGTAGCGAGGCCCAATGGGTCGAAGCTGCCTCCT
GGGTAAAGCAAGTCCTCTGCCTCTCCCAACGGTCCCTCTCCGGCAACTCTGTAACCCTCA
ACAGCTCCCATGAGGATCACCTGAGTAGCCCAAATGGCTAAAATGCTCTGAGCGTGGACA
AGGCTCGGGTTGCCCAAGTAGTCGAGTCCTCCTTCGCTGAAGATCTGTGAACCGGCCTTG
AACCAAACGGCATCTCCGAATTTGACTCCGTTACGAGCCAAGAGCTCAGGGAAAACACAG
CCTAGGGCTCCGAGCATGGCCCATCTGCAGTGGATAACTTCTAGCTCACGGTTCCTGGCG
AAGGTCTCGGGGTCGACTGATAGACCGGCGGTGTCCCATCCGTAGTCTCCGGGGAACTCT
CCGGTAAGGTAGCTCGGGGGCTCGCCGGAGAATGGACCCAAGTACTTAA

QA 3 771 3 771
DS 

RD RS1A432JQ 790 0 0
ATTGCACAATTTTACATAGGAAAGATCACAAACAAACTCTTTCTCTGGCTCTCACTCACA
TCACAATAAGATTCAACTCGCTCACTTTCCGGGGACGAAGTTGGTAGCGAAGGCCCATGC
GTTGTTGTTGACTGGGTCAGCCAAATGGTCGGCAAGATTCTCCAACGGTCCCTTTCCGGT
GACAATAGCCTGAACAAAGAATCCAAACATAGAGAACATAGCCAACCTTCCGTTCTTGAT
CTCCTTCACCTTCAACTCGGCGAAAGCCTCTGGGTCCGTAGCGAGGCCCAATGGGTCGAA
GCTGCCTCCTGGGTAAAGCAAGTCCTCTGCCTCTCCCAACGGTCCCTCTCCGGCAACTCT
GTAACCCTCAACAGCTCCCATGAGGATCACCTGAGTAGCCCAAATGGCTAAGATGCTCTG
AGCGTGGACAAGGCTCGGGTTGCCCAAGTAGTCGAGTCCTCCTTCGCTGAAGATCTGTGA
ACCGGCCTTGAACCAAACGGCTTCTCCGAACTTGACTCCGTTACGAGCCAAGAGCTCAGG
GAAAACACAGCCTAGGGCTCCGAGCATGGCCCATCTGCAGTGGATAACTTCTAGCTCACG
GTTCCTGGCGAAGGTCTCGGGGTCGGCTGATAGACCGGCGGTGTCCCATCCGTAGTCTCC
GGGGAACTCTCCGGTAAGGTAGCTCGGGGGCTCGCCGGAGAATGGACCCAAGTACTTAAC
CCTGTCGGATCCGTACCATGGGGAGCCTGATGGACCGGTGGGTTTGACGGTTTTGCGCAT
GGTGACACGG

QA 1 790 1 790
DS 

RD RS1A432TF 592 0 0
CTCGGCGAAAGCCTCTGGGTCCGTAGCGAGGCCCAATGGGTCGAAGCTGCCTCCTGGGTA
AAGCAAGTCCTCTGCCTCTCCCAACGGTCCCTCTCCGGCAACTCTGTAACCCTCAACAGC
TCCCATGAGGATCACCTGAGTAGCCCAAATGGCTAAGATGCTCTGAGCGTGGACAAGGCT
CGGGTTGCCCAAGTAGTCGAGTCCTCCTTCGCTGAAGATCTGTGAACCGGCCTTGAACCA
AACGGCTTCTCCGAACTTGACTCCGTTACGAGCCAAGAGCTCAGGGAAAACACAGCCTAG
GGCTCCGAGCATGGCCCATCTGCAGTGGATAACTTCTAGCTCACGGTTCCTGGCGAAGGT
CTCGGGGTCGGCTGATAGACCGGCGGTGTCCCATCCGTAGTCTCCGGGGAACTCTCCGGT
AAGGTAGCTCGGGGGCTCGCCGGAGAATGGACCCAAGTACTTAACCCTGTCGGATCCGTA
CCATGGGGAGCCTGATGGACCGGTGGGTTTGACGGTTTTGCGCATGGTGACACGGCCGGT
TCCAAAGACTTCGGAGGCTCCTGGTGAGAGCTTCACGGCCTTTCCGGCGAAG

QA 1 592 1 592
DS 

RD RS1BW01TF 848 0 0
CGAAGTTGGTAGCGAAGGCCCATGCGTTGTTGTTGACTGGGTCAGCCAAATGGTCGGCAA
GATTCTCCAACGGTCCCTTTCCGGTGACAATAGC*TGAACAAAGAATCCAAACATAGAGA
ACATAGCCAACTTTCCGTTCTTGATCTCCTTCACTTTCAACTCGGCGAAAGCCTCTGGGT
CCGTAGCGAGGCCCAATGGGTCGAAGCTGCCTCCTGGGTAAAGCAAGTCCTCTGCCTCTC
CCAACGGTCCCTCTCCGGCAACTCTGTAACCCTCAACAGCTCCCATGAGGATCACCTGAG
TAGCCCAAATGGCTAAGATGCTCTGAGCGTGGACAAGGCTCGGGTTGCCCAAGTAGTCGA
GTCCTCCTTCGCTGAAGATCTGTGAACCGGCCTTGAACCAAACGGCTTCTCCGAACTTGA
CTCCGTTACGAGCCAAGAGCTCAGGGAAAACACAGCCTAGGGCTCCGAGCATGGCCCATC
TGCAGTGGATAACTTCTAGCTCACGGTTCCTGGCGAAGGTCTCGGGGTCGGCTGATAGAC
CGGCGGTGTCCCATCCGTAGTCTCCGGGGAACTCTCCGGTAAGGTAGCTCGGGGGCTCGC
CGGAGAATGGACCCAAGTACTTAACCCTGTCGGATCCGTACCATGGGGAGCCTGATGGAC
CGGTGGGTTTGACGGTTTTGCGCATGGTGACACGGCCGGTTCCAAAGACTTCGGAGGCTC
CTGGTGAGAGCTTCACGGCCTTTCCGGCGAAGGCAGGGGAGGACAGAGCCATGGTTGAAG
CAGCCATTTGAACGTTTCTTCTTTTTTGTTGATTTTATGTTTTTTTTT**GTGACTGGGT
GAGAGTCC

QA 1 848 1 848
DS 

RD RS1CY74TF 286 0 0
TCCGGGGAACTCTCCGGTAAGGTAGCTCGGGGGCTCGCCGGAGAATGGACCCAAGTACTT
AACCCTGTCGGATCCGTACCATGGGGAGCCTGATGGACCGGTGGGTTTGACGGTTTTGCG
CATGGTGACACGGCCGGTTCCAAAGACTTCGGAGGCTCCTGGTGAGAGCTTCACGGCCTT
TCCGGCGGAGGCAGGGGAGGACAGAGCCATGGTTGAAGCAGCCATTTGAACGTTTCTTCT
TTTTTGTTGATTTTATGTTTTTTTT***GTGACTGGGTGAGAGTCC

QA 1 286 1 286
DS 

RD RS1CJ72TF 671 0 0
GGGT
CGTAGCGAGGCCCAATGGGTCGAAGCTGC*TCCTGGGTAAAGCAAGTCCTCTGCCTCTCC
CAACGGTCCCTCTCCGGCAACTCTGTAACCCTCAACAGCTCCCATGAGGATCACCTGAGT
AGCCCAAATGGCTAAGATGCTCTGAGCGTGGACAAGGCTCGGGTTGCCCAAGTAGTCGAG
TCCTCCTTCGCTGAAGATCTGTGAACCGGCCTTGAACCAAACGGCTTCTCCGAACTTGAC
TCCGTTACGAGCCAAGAGCTCAGGGAAAACACAGCCTAGGGCTCCGAGCATGGCCCATCT
GCAGTGGATAACTTCTAGCTCACGGTTCCTGGCGAAGGTCTCGGGGTCGGCTGATAGACC
GGCGGTGTCCCATCCGTAGTCTCCGGGGAACTCTCCGGTAAGGTAGCTCGGGGGCTCGCC
GGAGAATGGACCCAAGTACTTAACCCTGTCGGATCCGTACCATGGGGAGCCTGATGGACC
GGTGGGTTTGACGGTTTTGCGCATGGTGACACGGCCGGTTCCAAAAACTTCGGAGGCTCC
TGGTGAGAGCTTCACGGCCTTTCCGGCGAAGGCAGGGGAGGACAGAGCCATGGTTGAAGC
AGCCATTTGAACGTTTCTTCTTTTTTGTTGATTTTATGTTTTTTTTT**GTGACTGGGTG
AGAGTCC

QA 5 671 5 671
DS 

RD RS1F364TF 664 0 0
AGCGAGGCCCAATGGGTCGAAGCTGC*TCCTGGGTAAAGCAAGTCCTCTGCCTCTCCCAA
CGGTCCCTCTCCGGCAACTCTGTAACCCTCAACAGCTCCCATGAGGATCACCTGAGTAGC
CCAAATGGCTAAGATGCTCTGAGCGTGGACAAGGCTCGGGTTGCCCAAGTAGTCGAGTCC
TCCTTCGCTGAAGATCTGTGAACCGGCCTTGAACCAAACGGCTTCTCCGAACTTGACTCC
GTTACGAGCCAAGAGCTCAGGGAAAACACAGCCTAGGGCTCCGAGCATGGCCCATCTGCA
GTGGATAACTTCTAGCTCACGGTTCCTGGCGAAGGTCTCGGGGTCGGCTGATAGACCGGC
GGTGTCCCATCCGTAGTCTCCGGGGAACTCTCCGGTAAGGTAGCTCGGGGGCTCGCCGGA
GAATGGACCCAAGTACTTAACCCTGTCGGATCCGTACCATGGGAAGCCTGATGGACCGGT
GGGTTTGACGGTTTTGCGCATGGTGACACGGCCGGTTCCAAAGACTTCGGAGGCTCCTGG
TGAGAGCTTCACGGCCTTTCCGGCGAAGGCAGGGGAGGACAGAGCCATGGTTGAAGCAGC
CATTTGAACGTTTCTTCTTTTTTGTTGATTTTATGTTTTTTTTT**GTGACTGGGTGAGA
GTCC

QA 1 664 1 664
DS 

RD RS1CP83TF 677 0 0
CCTCTGGGTCCGTAGCGAGGCCCAATGGGTCGAAGCTGCCTCCTGGGTAAAGCAAGTCCT
CTGCCTCTCCCAACGGTCCCTCTCCGGCAACTCTGTAACCCTCAACAGCTCCCATGAGGA
TCACCTGAGTAGCCCAAATGGCTAAGATGCTCTGAGCGTGGACAAGGCTCGGGTTGCCCA
AGTAGTCGAGTCCTCCTTCGCTGAAGATCTGTGAACCGGCCTTGAACCAAACGGCTTCTC
CGAACTTGACTCCGTTACGAGCCAAGAGCTCAGGGAAAACACAGCCTAGGGCTCCGAGCA
TGGCCCATCTGCAGTGGATAACTTCTAGCTCACGGTTCCTGGCGAAGGTCTCGGGGTCGG
CTGATAGACCGGCGGTGTCCCATCCGTACTCTCCGGGGAACTCTCCGGTAAGGTAGCTCG
GGGGCTCGCCGGAGAATGGACCCAAGTACTTAACCCTGTCGGATCCGTACCATGGGGAGC
CTGATGGACCGGTGGGTTTGACGGTTATGCGCATGGTGACACGGCCGGTTCCAAAGACTT
CGGAGGCTCCTGGTGAGAGCTTCACGGCCTTTCCGGCGAAGGCAGGGGAGGACAGAGCCA
TGGTTGAAGCAGCCATTTGAACGTTTCTTCTTTTTTGTTGATTTTATGTTTTTTTTTT*G
TGACTGGGTGAGAGTCC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RS1FM13TF 689 0 0
ACTCGGCGAAAGCCTCTGGGTCCGTAGCGAGGCCCAATGGGTCGAAGCTGCCTCCTGGGT
AAAGCAAGTCCTCTGCCTCTCCCAACGGTCCCTCTCCGGCAACTCTGTAACCCTCAACAG
CTCCCATGAGGATCACCTGAGTAGCCCAAATGGCTAAGATGCTCTGAGCGTGGACAAGGC
TCGGGTTGCCCAAGTAGTCGAGTCCTCCTTCGCTGAAGATCTGTGAACCGGCCTTGAACC
AAACGGCTTCTCCGAACTTGACTCCGTTACGAGCCAAGAGCTCAGGGAAAACACAGCCTA
GGGCTCCGAGCATGGCCCATCTGCAGTGGATAACTTCTAGCTCACGGTTCCTGGCGAAGG
TCTCGGGGTCGGCTGATAGACCGGCGGTGTCCCATCCGTAGTCTCCGGGGAACTCTCCGG
TAAGGTAGCTCGGGGGCTCGCCGGAGAATGGACCCAAGTACTTAACCCTGTCGGATCCGT
ACCATGGGGAGCCTGATGGACCGGTGGGTTTGACGGTTTTGCGCATGGTGACACGGCCGG
TTCCAAAGACTTCGGAGGCTCCTGGTGAGAGCTTCACGGCCTTTCCGGCGAAGGCAGGGG
AGGA****GCCATGGTTGAAGCAGCCATTTGAACGTTTCTTCTTTTTTGTTGATTTTATG
TTTTTTTTT**GTGACTGGGTGAGAGTCC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1F865TF 807 0 0
GGTCAGCCAAATGTC
GCAAGATTCTCCAACGT**CCTTTCCGGTGACA*TAGC*TGA*CAAAGAATCCAAACATA
GAGAACATAGCCAAC*TTCCGTTCTTGATCTC*TTCAC*TTCAACTCGGCGAAAGCCTCT
GGGTCCGTAGCGAGGCCCAATGGGTCGAAGCTGC*TCCTGGGTAAAGCAAGTCCTCTGCC
TCTCCCAACGGTCCCTCTCCGGCAACTCTGTAACCCTCAACAGCTCCCATGAGGATCACC
TGAGTAGCCCAAATGGCTAAGATGCTCTGAGCGTGGACAAGGCTCGGGTTGCCCAAGTAG
TCGAGTCCTCCTTCGCTGAAGATCTGTGAACCGGCCTTGAACCAAACGGCTTCTCCGAAC
TTGACTCCGTTACGAGCCAAGAGCTCAGGGAAAACACAGCCTAGGGCTCCGAGCATGGCC
CATCTGCAGTGGATAACTTCTAGCTCACGGTTCCTGGCGAAGGTCTCGGGGTCGGCTGAT
AGACCGGCGGTGTCCCATCCGTAGTCTCCGGGGAACTCTCCGGTAAGGTAGCTCGGGGGC
TCGCCGGAGAATGGACCCAAGTACTTAACCCTGTCGGATCCGTACCATGGGGAGCCTGAC
GGACCGGTGGGTTTGACGGTTTTGCGCATGGTGACACGGCCGGTTCCAAAGACTTCGGAG
GCTCCTGGTGAGAGCTTCACGGCCTTTCCGGCGAAGGCAGGGGAGGACAGAGCCATGGTT
GAAGCAGCCATTTGAACGTTTCTTCTTTTTTGTTGATTTTATGTTTTTTTTTT*GTGACT
GGGTGAGAGTCC

QA 16 807 16 807
DS 

RD RS1GR87TF 549 0 0
GTAGCCCAAATGGCTAAGATGCTCTGAGCGTGGACAAGGCTCGGGTTGCCCAAGTAGTCG
AGTCCTCCTTCGCTGAAGATCTGTGAACCGGCCTTGAACCAAACGGCTTCTCCGAACTTG
ACTCCGTTACGAGCCAAGAGCTCAGGGAAAACACAGCCTAGGGCTCCGAGCATGGCCCAT
CTGCAGTGGATAACTTCTAGCTCACGGTTCCTGGCGAAGGTCTCGGGGTCGGCTGATAGA
CCGGCGGTGTCCCATCCGTAGTCTCCGGGGAACTCTCCGGTAAGGTAGATCGGGGGCTCG
CCGGAGAATGGACCCAAGTACTTAACCCTGTCGGATCCGTACCATGGGGAGCCTGATGGA
CCGGTGGGTTTGACGGTTTTGCGCATGGTGACACGGCCGGTTCCAAAGACTTCGGAGGCT
CCTGGTGAGAGCTTCACGGCCTTTCCGGCGAAGGCAGGGGAGGACAGAGCCATGGTTGAA
GCAGCCATTTGAACGTTTCTTCTTTTTTGTTGATTTTATGTTTTTTTTTT*GTGACTGGG
TGAGAGTCC

QA 1 549 1 549
DS 

RD RS1FU40TF 673 0 0
GGGTCCGTAGCGAGGCCCAATGGGTCGAAGCTGC*TCCTGGGTAAAGCAAGTCCTCTGCC
TCTCCCAACGGTCCCTCTCCGGCAACTCTGTAACCCTCAACAGCTCCCATGAGGATCACC
TGAGTAGCCCAAATGGCTAAGATGCTCTGAGCGTGGACAAGGCTCGGGTTGCCCAAGTAG
TCGAGTCCTCCTTCGCTGAAGATCTGTGAACCGGCCTTGAACCAAACGGCATCTCCGAAT
TTGACTCCGTTACGAGCCAAGAGCTCAGGGAAAACACAGCCTAGGGCTCCGAGCATGGCC
CATCTGCAGTGGATAACTTCTAGCTCACGGTTCCTGGCGAAGGTCTCGGGGTCGACTGAT
AGACCGGCGGTGTCCCATCCGTAGTCTCCGGGGAACTCTCCGGTAAGGTAGCTCGGGGGC
TCGCCGGAGAATGGACCCAAGTACTTAACCCTGTCGGATCCGTACCATGGGGAGCCTGAT
GGACCGGTGGGTTTGACGGTTTTGCGCATGGTGACACGGCCGGTTCCAAAGACTTCGGAG
GCTCCTGGTGAGAGCTTCACGGCCTTTCCGGCGAAGGCAGGGGAGGACAGAGCCATGGTT
GAAGCAGCCATTTGAACGTTTCTTCTTTTTTGTTGATTTTATGTTTTTTTTTT*GTGACT
GGGTGAGAGT
GCC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RS1DQ78TF 790 0 0
GCAAGATTCTCCACCGT
CCTTTCCGGTGACAATAGC*TGAACAAAGAATCCAA*CATAGAGAACATAGCCAAC*TTC
CGTTCTTGATCTC*TTCAC*TTCAACTCGGCGAAAGCCTCTGGGTCCGTAGCGAGGCCCA
ATGGGTCGAAGCTGCCTCCTGGGTAAAGCAAGTCCTCTGCCTCTCCCAACGGTCCCTCTC
CGGCAACTCTGTAACCCTCAACAGCTCCCATGAGGATCACCTGAGTAGCCCAAATGGCTA
AGATGCTCTGAGCGCGGACAAGGCTCGGGTTGCCCAAGTAGTCGAGTCCTCCTTCGCTGA
AGATCTGTGAACCGGCCTTGAACCAAACGGCTTCTCCGAACTTGACTCCGTTACGAGCCA
AGAGCTCAGGGAAAACACAGCCTAGGGCTCCGAGCATGGCCCATCTGCAGTGGATAACTT
CTAGCTCACGGTTCCTGGCGAAGGTCTCGGGGTCGGCTGATAGACCGGCGGTGTCCCATC
CGTAGTCTCCGGGGAACTCTCCGGTAAGGTAGCTCGGGGGCTCGCCGGAGAATGGACCCA
AGTACTTAACCCTGTCGGATCCGTACCATGGGGAGCCTGATGGACCGGTGGGTTTGACGG
TTTTGCGCATGGTGACACGGCCGGTTCCAAAGACTTCGGAGGCTCCTGGTGAGAGCTTCA
CGGCCTTTCCGGCGAAGGCAGGGGAGGACAGAGCCATGGTTGAAGCAGCCATTTGAACGT
TTCTTCTTTTTTGTTGATTTTATGTTTTTTTTTTTGTGACTGGGTGAGAGTCC

QA 18 790 18 790
DS 

RD RS1B735TF 672 0 0
GGGTCCGTAGCGAGGCCCAATGGGTCGAAGCTGCCTCCTGGGTAAAGCAAGTCCTCTGCC
TCTCCCAACGGTCCCTCTCCGGCAACTCTGTAACCCTCAACAGCTCCCATGAGGATCACC
TGAGTAGCCCAAATGGCTAAGATGCTCTGAGCGTGGACAAGGCTCGGGTTGCCCAAGTAG
TCGAGTCCTCCTTCGCTGAAGATCTGTGAACCGGCCTTGAACCAAACGGCTTCTCCGAAC
TTGACTCCGTTACGAGCCAAGAGCTCAGGGAAAACACAGCCTAGGGCTCCGAGCATGGCT
CATCTGCAGTGGATAACTTCTAGCTCACGGTTCCTGGCGAAGGTCTCGGGGTCGGCTGAT
AGACCGGCGGTGTCCCATCCGTAGTCTCCGGGGAACTCTCCGGTAAGGTAGCTCGGGGAC
TCGCCGGAGAATGGACCCAAGTACTTAACCCTGTCGGATCCGTACCATGGGGAGCCTGAT
GGACCGGTGGGTTTGACGGTTTTGCGCATGGTGACACGGCCGGTTCCAAAGACTTCGGAG
GCTCCTGGTGAGAGCTTCACGGCCTTTCCGGCGAAGGCAGGGGAGGACAGAGCCATGGTT
GAAGCAGCCATTTGAACGTTTCTTCTTTTTTGTTGATTTTATGTTTTTTTTTTTGTGACT
GGGTGAGAGTCC

QA 1 672 1 672
DS 



AS 3 27

CO CL5Contig1 1029 21 24 U
GGGCAGACCAATCACCACATAAATAAACCCATCAGAAAACGTTTTAACCTAAATCTCTAC
GATCATGCCGGCCAGAAACATTGCCATCGGCGGAGTCCAAGAAGAAGTGACTCACCCCAG
CGCACTTAGGGCGGCCCTCGCTGAGTTTATCTCGACTTTGATCTTTGTCTTCGCCGGCTC
AGGCTCAGGAATTGCTTTCAACAAGCTCACTGACAATGGAGCCACCACTCCTTCAGGCCT
TGTCGCCGCTGCCTTAGCTCATGCTTTCGGTCTCTTCGTCGCTGTTTCTGTCGGTGCCAA
CATCTCCGGTGGACACGTTAACCCTGCCGTTACCTTCGGTGCCTTCCTCGGTGGAAACAT
CACTCTCCTCCGTGGCCTTCTCTATTGGATTGCTCAGCTTCTTGGCTCAGTCGCCGCTTG
CTTCCTCCTTCAATTCGCCACCGGTGGCTTGGCAGTTCCAGCTTTCGGTCTCTCTGCTGG
AGTTGGAACCTTGAACGGTCTCGTCTTCGAGATCGTGATGACCTTCGGGCTCGTCTACAC
CGTCTACGCCACAGCCATCGACCCCAAAAACGGTAGCCTCGGAACAATCGCACCAATCGC
AATAGGTTTCATCGTCGGAGCTAACATCCTCGCGGGTGGAGCTTTCAGCGGAGCCTCCAT
GAACCCAGCCGTCGCTTTTGGACCAGCCGTCGTGAGCTGGTCGTGGAGCAACCACTGGAT
TTACTGGGTTGGTCCTCTTGTTGGTGGTGGTCTCGCTGGAATCATCTACGACTTTGTTTA
CATCATCGAAAACGGTCACGAGCAATTGCCCACCACTGATTACTGAAGACGCTGAAAATT
AAATGTTGTGATATGATTTGTTTTTAATTCTCATCGTAATTGAATTTCTGTGTGACCGTT
GGATCATCTTTTTAGATGAATCCTTGTCCGTTGATTTATGTTGTATTTGGGTTTGTTGTT
GGAGTTGTAATTTTCATTGAAGGCTCTTTTAGATGAATGTGAATTATGCATGCTTCTACG
TTATATTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 60 60 60 60 60 60 40 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 80 95 97 97 97 97 
97 97 97 65 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 85 97 97 97 85 97 97 97 97 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 65 90 90 90 90 75 90 90 90 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 40 85 55 85 85 40 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 60 85 60 60 85 50 85 85 85 85 85 85 90 90 75 65 65 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 50 75 75 75 75 40 75 75 75 60 75 75 75 75 70 70 70 70 55 70 
70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 45 60 60 60 60 60 60 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 40 55 55 55 55 
45 40 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AT19TF U 1
AF RS1EA91TF U 20
AF RS1EU08TF U 20
AF RS1H341TF U 20
AF RS1E504TF U 20
AF RS1CX13TF U 1
AF RS1BP79TF U 20
AF RS1GS92TF U 20
AF RS1AT24TF U 1
AF RS1E504JQ C 225
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BS 1 603 RS1AT19TF
BS 604 683 RS1AT24TF
BS 684 684 RS1E504TF
BS 685 705 RS1AT24TF
BS 706 706 RS1GS92TF
BS 707 710 RS1AT24TF
BS 711 711 RS1GS92TF
BS 712 729 RS1AT24TF
BS 730 730 RS1E504TF
BS 731 731 RS1AT24TF
BS 732 733 RS1E504TF
BS 734 734 RS1AT24TF
BS 735 735 RS1CX13TF
BS 736 743 RS1AT24TF
BS 744 746 RS1E504TF
BS 747 749 RS1AT24TF
BS 750 750 RS1E504TF
BS 751 760 RS1AT24TF
BS 761 761 RS1D437TF
BS 762 778 RS1AT24TF
BS 779 779 RS1D437TF
BS 780 791 RS1AT24TF
BS 792 1022 RS1D437TF
BS 1023 1029 RS1AT19JQ

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CGCACTTAGGGCGGCCCTCGCTGAGTTTATCTCGACTTTGATCTTTGTCTTCGCCGGCTC
AGGCTCAGGAATTGCTTTCAACAAGCTCACTGACAATGGAGCCACCACTCCTTCAGGCCT
TGTCGCCGCTGCCTTAGCTCATGCTTTCGGTCTCTTCGTCGCTGTTTCTGTCGGTGCCAA
CATCTCCGGTGGACACGTTAACCCTGCCGTTACCTTCGGTGCCTTCCTCGGTGGAAACAT
CACTCTCCTCCGTGGCCTTCTCTATTGGATTGCTCAGCTTCTTGGCTCAGTCGCCGCTTG
CTTCCTCCTTCAATTCGCCACCGGTGGCTTGGCAGTTCCAGCTTTCGGTCTCTCTGCTGG
AGTTGGAACCTTGAACGGTCTCGTCTTCGAGATCGTGATGACCTTCGGGCTCGTCTACAC
CGTCTACGCCACAGCCATCGACCCCAAAAACGGTAGCCTCGGAACAATCGCACCAATCGC
AAT

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DS 

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GCTGAGTTTATCTCGACTTTGATCTTTGTCTTCGCCGGCTCAGGCTCAGGAATTGCTTTC
AACAAGCTCACTGACAATGGAGCCACCACTCCTTCAGGCCTTGTCGCCGCTGCCTTAGCT
CATGCTTTCGGTCTCTTCGTCGCTGTTTCTGTCGGTGCCAACATCTCCGGTGGACACGTT
AACCCTGCCGTTACCTTCGGTGCCTTCCTCGGTGGAAACATCACTCTCCTCCGTGGCCTT
CTCTATTGGATTGCTCAGCTTCTTCGCTCAGTCGCCGCTTGCTTCCTCCTTCAATTCGCC
ACCGGTGGCTTGGCAGTTCCAGCTTTCGGTCTCTCTGCTGGAGTTGGAACCTTGAACGGT
CTCGTCTTCGAGATCGTGATGACCTTCGGGCTCGTCTACACCGTCTACGCCACAGCCATC
GACCCCAAAAACGGTAGTCTCGGAACAATCGCACCAATCGCAATATGTTTCATCGTCAGA
GC

QA 1 602 1 602
DS 

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GCTGAGTTTATCTCGACTTTGATCTTTGTCTTCGCCGGCTCAGGCTCAGGAATTGCTTTC
AACAAGCTCACTGACAATGGAGCCACCACTCCTTCAGGCCTTGTCGCCGCTGCCTTAGCT
CATGCTTTCGGTCTCTTCGTCGCTGTTTCTGTCGGTGCCAACATCTCCGGTGGACACGTT
AACCCTGCCGTTACCTTCGGTGCCTTCCTCGGTGGAAACATCACTCTCCTCCGTGGCCTT
CTCTATTGGATTGCTCAGCTTCTTGGCTCAGTCGCCGCTTGCTTCCTCCTTCAATTCGCC
ACCGGTGGCTTGGCAGTTCCAGCTTTCGGTCTCTCTGCTGGAGTTGGAACCTTGAACGGT
CTCGTCTTCGAGATCATGATGACCTTCGGGCTCGTCTACACCGTCTACGCCACAGCCATC
GACCCCAAAAACGGTAGCCTCGGAACAATCGCACCAATCGCAATAGGTTTCATCGTCGGA
GCTAACATCCTC

QA 1 612 1 612
DS 

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GCTGAGTTTATCTCGACTTTGATCTTTGTCTTCGCCGGCTCAGGCTCAGGAATTGCTTTC
AACAAGCTCACTGACAATGGAGCCACCACTCCTTCAGGCCTTGTCGCCGCTGCCTTAGCT
CATGCTTTCGGTCTCTTCGTCGCTGTTTCTGTCGGTGCCAACATCTCCGGTGGACACGTT
AACCCTGCCGTTACCTTCGGTGCCTTCCTCGGTGGAAACATCACTCTCCTCCGTGGCCTT
CTCTATTGGATTGCTCAGCTTCTTGGCTCAGTCGCCGCTTGCTTCCTCCTTCAATTCGCC
ACCGGTGGCTTGGCAGTTCCAGCTTTCGGTCTCTCTGCTGGAGTTGGAACCTTGAACGGT
CTCGTCTTCGAGATCGTGATGACCTTCGGGCTCGTCTACACCGTCTACGCCACAGCCATC
GACCCCAAAAACGGTAGCCTCGGAACAATCGCACCAATCGCAATA*GTTTCATCGTCGGA
GCTAACATCCTCGCGGGTGGAGCTTTCAGCGGAGCCTCCATGAACCCAGCCGTCGCTTTT
GGACCAGC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1E504TF 749 0 0
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ATTGCCATCGGCGGAGTCCAAGAAGAAGTGACTCACCCCAGCGCACTTAGGGCGGCCCTC
GCTGAGTTTATCTCGACTTTGATCTTTGTCTTCGCCGGCTCAGGCTCAGGAATTGCTTTC
AACAAGCTCACTGACAATGGAGCCACCACTCCTTCAGGCCTTGTCGCCGCTGCCTTAGCT
CATGCTTTCGGTCTCTTCGTC**TGTTTCTGTCGGTGCCAACATCTCCGGTGGACACGTT
AACCCTGCCGTTACCTTCGGTGCCTTCCTCGGTGGAAACATCACTCTCCTCCGTGGCCTT
CTCTATTGGATTGCTCAGCTTCTTGGCTCAGTCGCCGCTTGCTTCCTCCTTCAATTCGCC
ACCGGTGGCTTGGCAGTTCCAGCTTTCGGTCTCTCTGCTGGAGTTGGAACCTTGAACGGT
CTCGTCTTCGAGATCGTGATGACCTTCGGGCTCGTCTACACCGTCTACGCCACAGCCATC
GACCCCAAAAACGGTAGCCTCGGAACAATCGCACCAATCGCAATAGGTTTCATCGTCGGA
GCTAACATCCTCGCGGGTGGAGCTTTCAGCGGAGCCTCCATGAACCCAGCCGTCGCTTTT
GGACCAGCCGTCGTGAGCTGGTCGTG*AGCA*CCACTGGATTTACTGGGTTGGTC*TCTT
GTTGGTGGTGGTCTCGCTGGA
TCATCTAC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1CX13TF 746 0 0
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GATCATGCCGGCCAGAAACATTGCCATCGGCGGAGTCCAAGAAGAAGTGACTCACCCCAG
CGCACTTAGGGCGGCCCTCGCTGAGTTTATCTCGACTTTGATCTTTGTCTTCGCCGGCTC
AGGCTCAGGAATTGCTTTCAACAAGCTCACTGACAATGGAGTCACCACTCCTTCAGGCCT
TGTCGCCGCTGCCTTAGCTCATGCTTTCGGTCTCTTCGTCGCTGTTTCTGTCGGTGCCAA
CATCTCCGGTGGACACGTTAACCCTGCCGTTACCTTCGGTGCCTTCCTCGGTGGAAACAT
CACTCTCCTCCGTGGCCTTCTCTATTGGATTGCTCAGCTTCTTGGCTCAGTCGCCGCTTG
CTTCCTCCTTCAATTCGCCACCGGTGGCTTGGCAGTTCCAGCTTTCGGTCTCTCTGCTGG
AGTTGGAACCTTGAACGGTCTCGTCTTCGAGATCGTGATGACCTTCGGGCTCGTCTACAC
CGTCTACGCCACAGCCATCGACCCCAAAAACGGTAGCCTCGGAACAATCGCACCAATCGC
AATAGGTTTCATCGTCGGAGCTAACATCCTCGCGGGTGGAGCTTTCAGCGGAGCCTCCAT
GAACCCAGCCGTCGCTTTTGGACCAGCCGTCGTGAGCTGGTCGTG*AGCA*CCACTGGAT
TTACTGGGTTGGTCCTCTTGTTGGTG

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1BP79TF 756 0 0
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ATTGCCATCGGCGGAGTCCAAGAAGAAGTGACTCACCCCAGCGCACTTAGGGCGGCCCTC
GCTGAGTTTATCTCGACTTTGATCTTTGTCTTCGCCGGCTCAGGCTCAGGAATTGCTTTC
AACAAGCTCACTGACAATGGAGCCACCACTCCTTCAGGCCTTGTCGCCGCTGCCTTAGCT
CATGCTTTCGGTCTCTTCGTCGCTGTTTCTGTCGGTGCCAACATCTCCGGTGGACACGTT
AACCCTGCCGTTACCTTCGGTGCCTTCCTCGGTGGAAACATCACTCTCCTCCGTGGCCTT
CTCTATTGGATTGCTCAGCTTCTTGGCTCAGTCGCCGCTTGCTTCCTCCTTCAATTCGCC
ACCGGTGGCTTGGCAGTTCCAGCTTTCGGTCTCTCTGCTGGAGTTGGAACCTTGAACGGT
CTCGTCTTCGAGATCGTGATGACCTTCGGGCTCGTCTACACCGTCTACGCCACAGCCATC
GACCCCAAAAACGGTAGCCTCGGAACAATCGCACCAATCGCAATAGGTTTCATCGTCGGA
GCTA*CATCCTCGCGGGTGGAGCTTTCAGCGGAGCCTCCATGAACCCAGCCGTCGCTTT*
GGACCAGCCGTCGTGAGCTGGTCGTG*AGCA*CCACTGGATTTACTGGGTGGTCC*TCTT
GTTGG*TGTGGTCTCGCTGGA*TCATCTACGACTT
G

QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1GS92TF 749 0 0
TAAATAAACCCATCAGAAAACGTTTTAACCTAAATCTCTACGATCATGCCGGCCAGAAAC
ATTGCCATCGGCGGAGTCCAAGAAGAAGTGACTCACCCCAGCGCACTTAGGGCGGCCCTC
GCTGAGTTTATCTCGACTTTGATCTTTGTCTTCGCCGGCTCAGGCTCAGGAATTGCTTTC
AACAAGCTCACTGACAATGGAGCCACCACTCCTTCAGGCCTTGTCGCCGCTGCCTTAGCT
CATGCTTTCGGTCTCTTCGTCGCTGTTTCTGTCGGTGCCAACATCTCCGGTGGACACGTT
AACCCTGCCGTTACCTTCGGTGCCTTCCTCGGTGGAAACATCACTCTCCTCCGTGGCCTT
CTCTATTGGATTGCTCAGCTTCTTGGCTCAGTCGCCGCTTGCTTCCTCCTTCAATTCGCC
ACCGGTGGCTTGGCAGTTCCAGCTTTCGGTCTCTCTGCTGGAGTTGGAACCTTGAACGGT
CTCGTCTTCGAGATCGTGATAACCTTCGGGCTCGTCTACACCGTCTACGCCACAGCCATC
GACCCCAAAAACGGTAGCCTCGGAACAATCGCACCAATCGCAATAGGTTTCATCGTCGGA
GCTAACATCCTCGCGGGTGGAGCTTTCAGCGGAGCCTCCATGAACCCAGCCGTCGCTTT*
GGACCAGCCGTCGTGAGCTGGTCGTGGATCAACCACTGGATTTACTGGGTTGGTCCTCTT
GTTGGTGGTGGTCTCGCTGGA
TCATCTAC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1AT24TF 804 0 0
GGGCAGACCAATCACCACATAAATAAACCCATCAGAAAACGTTTTAACCTAAATCTCTAC
GATCATGCCGGCCAGAAACATTGCCATCGGCGGAGTCCAAGAAGAAGTGACTCACCCCAG
CGCACTTAGGGCGGCCCTCGCTGAGTTTATCTCGACTTTGATCTTTGTCTTCGCCGGCTC
AGGCTCAGGAATTGCTTTCAACAAGCTCACTGACAATGGAGCCACCACTCCTTCAGGCCT
TGTCGCCGCTGCCTTAGCTCATGCTTTCGGTCTCTTCGTCGCTGTTTCTGTCGGTGCCAA
CATCTCCGGTGGACACGTTAACCCTGCCGTTACCTTCGGTGCCTTCCTCGGTGGAAACAT
CACTCTCCTCCGTGGCCTTCTCTATTGGATTGCTCAGCTTCTTGGCTCAGTCGCCGCTTG
CTTCCTCCTTCAATTCGCCACCGGTGGCTTGGCAGTTCCAGCTTTCGGTCTCTCTGCTGG
AGTTGGAACCTTGAACGGTCTCGTCTTCGAGATCGTGATGACCTTCGGGCTCGTCTACAC
CGTCTACGCCACAGCCATCGACCCCAAAAACGGTAGCCTCGGAACAATCGCACCAATCGC
AATAGGTTTCATCGTCGGAGCTAACATCCTCGCGGGTGGAGCTTTCAGCGGAGCCTCCAT
GAACCCAGCCGTCGCTTTTGGAC*AGCCGTCGTGAGCTGGTCGTG*AGCA*CCACTGGAT
TTACTGGGTGGTCC*TCTTGTTG**TGTG*TCTCGCTGGA*TCATCTACGACTTTGTT*A
CATCATCGAAA
CGTCACGAGCATT

QA 1 791 1 791
DS 

RD RS1E504JQ 729 0 0
CCACTCTTTCAGGCCTTGTCGCCGCTGCCTTAGCTCATGCTTTCGGTCTCTTCGTC**TG
TTTCTGTCGGTGCCAACATCTCCGGTGGACACGTTAACCCTGCCGTTACCTTCGGTGCCT
TCCTCGGTGGAAACATCACTCTCCTCCGTGGCCTTCTCTATTGGATTGCTCAGCTTCTTG
GCTCAGTCGCCGCTTGCTTCCTCCTTCAATTCGCCACCGGTGGCTTGGCAGTTCCAGCTT
TCGGTCTCTCTGCTGGAGTTGGAACCTTGAACGGTCTCGTCTTCGAGATCGTGATGACCT
TCGGGCTCGTCTACACCGTCTACGCCACAGCCATCGACCCCAAAAACGGTAGCCTCGGAA
CAATCGCACCAATCGCAATAGGTTTCATCGTCGGAGCTAACATCCTCGCGGGTGGAGCTT
TCAGCGGAGCCTCCATGAACCCAGCCGTCGCTTTTGGACCAGCCGTCGTGAGCTGGTCGT
GGAGCAACCACTGGATTTACTGGGTTGGTCCTCTTGTTGGTGGTGGTCTCGCTGGAATCA
TCTACGACTTTGTTTACATCATCGAAAACGGTCACGAGCAATTGCCCACCACTGATTACT
GAAGACGCTGAAAATTAAATGTTGTGATACGATTTGTTTTTAATTCTCATCGTAATTGAA
TTTCTGTGTGACCGTTGGATCATCTTTCTAGATGAATCCTTGTCCGTTGATTTATGTTGT
ATTTGGG
CT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1BR85TF 646 0 0
GCTCATGCTTTCGGTCTCTTCGTCGCTGTTTCTGTCGGTGCCAACATCTCCGGTGGACAC
GTTAACCCTGCCGTTACCTTCGGTGCCTTCCTCGGTGGAAACATCACTCTCCTCCGTGGC
CTTCTCTATTGGATTGCTCAGCTTCTTGGCTCAGTCGCCGCTTGCTTCCTCCTTCAATTC
GCCACCGGTGGCTTGGCAGTTCCAGCTTTCGGTCTCTCTGCTGGAGTTGGAACCTTGAAC
GGTCTCGTCTTCGAGATCGTGATGACCTTCGGGCTCGTCTACACCGTCTACGCCACAGCC
ATCGACCCCAAAAACGGTAGCCTCGGAACAATCGCACCAATCGCAATAGGTTTCATCGTC
GGAGCTAACATCCTCGCGGGTGGAGCTTTCAGCGGAGCCTCCATGAACCCAGCCGTCGCT
TTTGGACCAGCCGTCGTGAGCTGGTCGTGGAGCAACCACTGGATTTACTGGGTTGGTCCT
CTTGTTGGTGGTGGTCTCGCTGGAATCATCTACGACTTTGTTTACATCATCGAAAACGGT
CACGAGCAATTGCCCACCACTGATTACTGAAGACGCTGAAAATTAAATGTTGTGATATGA
TTTGTTTTTAATTCTCATCGTAATTGAATTTCTGTGTGACCGTTG
A

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1EU08JQ 111 0 0
TT
TTTTTAGATGAATCCTTGTCCGTTGATTTATGTTGTATTTGGGTTTGTTGTTGGAGTTGT
AATTTTCATTGAAGGCTTTTTTAGATGAATGTGAATTATGCATGCTT
TT

QA 3 109 3 109
DS 

RD RS1CX13JQ 485 0 0
ACACCGTTTACGCCACAGCCATCGACCCCAAAAACGGTAGCCTCGGAACAATCGCACCAA
TCGCAATAGGTTTCATCGTCGGAGCTAACATCCTCGCGGGTGGAGCTTTCAGCGGAGCCT
CCATGAACCCAGCCGTCGCTTTTGGACCAGCCGTCGTGAGCTGGTCGTGGAGCAACCACT
GGATTTACTGGGTTGGTCCTCTTGTTGGTGGTGGTCTCGCTGGAATCATTTACGACTTTG
TTTACATCATCGAAAACGGTCACGAGCAATTGCCCACCACTGATTACTGAAGACGCTGAA
AATTAAATGTTGTGATATGATTTGTTTTTAATTCTCATCGTAATTGAATTTCTGTGTGAC
CGTTGGATCATCTTTTTAGATGAATCCTTGTCCGTTGATTTATGTTGTATTTGGGTTTGT
TGTTGGAGTTGTAATTTTCATTGAAGGCTCTTTTAGATGAATGTGAATTATGCATGCTTC
TACG
C

QA 1 484 1 484
DS 

RD RS1BR85JQ 686 0 0
CGGTGCCTTCCTCGGTGGAAACATCACTCTCCTCCGTGGCCTTCTCTATTGGATTGCTCA
GCTTCTTGGCTCAGTCGCCGCTTGCTTCCTCCTTCAATTCGCCACCGGTGGCTTGGCAGT
TCCAGCTTTCGGTCTCTCTGCTGGAGTTGGAACCTTGAACGGTCTCGTCTTCGAGATCGT
GATGACCTTCGGGCTCGTCTACACCGTCTACGCCACAGCCATCGACCCCAAAAACGGTAG
CCTCGGAACAATCGCACCAATCGCAATAGGTTTCATCGTCGGAGCTAACATCCTCGCGGG
TGGAGCTTTCAGCGGAGCCTCCATGAACCCAGCCGTCGCTTTTGGACCAGCCGTCGTGAG
CTGGTCGTGGAGCAACCACTGGATTTACTGGGTTGGTCCTCTTGTTGGTGGTGGTCTCGC
TGGAATCATCTACGACTTTGTTTACATCATCGAAAACGGTCACGAGCAATTGCCCACCAC
TGATTACTGAAGACGCTGAAAATTAAATGTTGTGATATGATTTGTTTTTAATTCTCATCG
TAATTGAATTTCTGTGTGACCGTTGAATCATCTTTTTAGATGAATCCTTGTCCGTTGATT
TATGTTGTATTTGGGTTTGTTGTTGGAGTTGTAATTTTCATTGAAGGCTCTTTTAGATGA
ATGTGAATTATGCATGCTTCTACG
CG

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1AT19JQ 784 0 0
GCCGCTG
CTTAGCTCATGCTTTCGGTCTCTTCGTCGCTGTTTCTGTCGGTGCCAACATCTCCGGTGG
ACACGTTAACCCTGCCGTTACCTTCGGTGCCTTCCTCGGTGGAAACATCACTCTCCTCCG
TGGCCTTCTCTATTGGATTGCTCAGCTTCTTGGCTCAGTCGCCGCTTGCTTCCTCCTTCA
ATTCGCCACCGGTGGCTTGGCAGTTCCAGCTTTCGGTCTCTCTGCTGGAGTTGGAACCTT
GAACGGTCTCGTCTTCGAGATCGTGATGACCTTCGGGCTCGTCTACACCGTCTACGCCAC
AGCCATCGACCCCAAAAACGGTAGCCTCGGAACAATCGCACCAATCGCAATAGGTTTCAT
CGTCGGAGCTAACATCCTCGCGGGTGGAGCTTTCAGCGGAGCCTCCATGAACCCAGCCGT
CGCTTTTGGACCAGCCGTCGTGAGCTGGTCGTGGAGCAACCACTGGATTTACTGGGTTGG
TCCTCTTGTTGGTGGTGGTCTCGCTGGAATCATCTACGACTTTGTTTACATCATCGAAAA
CGGTCACGAGCAATTGCCCACCACTGATTACTGAAGACGCTGAAAATTAAATGTTGTGAT
ATGATTTGTTTTTAATTCTCATCGTAATTGAATTTCTGTGTGACCGTTGGATCATCTTTT
TAGATGAATCCTTGTCCGTTGATTTATGTTGTATTTGGGTTTGTTGTTGGAGTTGTAATT
TTCATTGAAGGCTCTTTTAGATGAATGTGAATTATGCATGCTTCTACGTTATATTTC

QA 8 784 8 784
DS 

RD RS1D437TF 282 0 0
G
TGGTGGTGGTCTCGCTGGAATCATCTACTACTTTGTTTACATCATCGAAAACGGTCACGA
GCAATTGCCCACCACTGATTACTGAAGACGCTGAAAATTAAATGTTGTGATATGATTTGT
TTTTAATTCTCATCGTAATTGAATTTCTGTGTGACCGTTGGATCATCTTTTTAGATGAAT
CCTTGTCCGTTGATTTATGTTGTATTTGGGTTTGTTGTTGGAGTTGTAATTTTCATTGAA
GGCTCTTTTAGATGAATGTGAATTATGCATGCTTCTACGTT

QA 2 282 2 282
DS 

RD RS1GS92JQ 477 0 0
ACGCCACAGCCATCGACCCCAAAAACGGTAGCCTCGGAACAATCGCACCAATCGCAATAG
GTTTCATCGTCGGAGCTAACATCCTCGCGGGTGGAGCTTTCAGCGGAGCCTCCATGAACC
CAGCCGTCGCTTTTGGACCAGCCGTCGTGAGCTGGTCGTGGATCAACCACTGGATTTACT
GGGTTGGTCCTCTTGTTGGTGGTGGTCTCGCTGGAATCATCTACGACTTTGTTTACATCA
TCGAAAACGGTCACGAGCAATTGCCCACCACTGATTACTGAAGACGCTGAAAATTAAATG
TTGTGATATGATTTGTTTTTAATTCTCATCGTAATTGAATTTCTGTGTGACCGTTGGATC
ATCTTTTTAGATGAATCCTTGTCCGTTGATTTATGTTGTATTTGGGTTTGTTGTTGGAGT
TGTAATTTGCATTGAAGGCTCTTTTAGATGAATGTGAATTATGTATGCTTCTACGTT

QA 1 477 1 477
DS 

RD RS1H341JQB 517 0 0
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AAAAACGGTAGCCTCGGAACAATCGCACCAATCGCAATAGGTTTCATCGTCGGAGCTAAC
ATCCTCGCGGGTGGAGCTTTCAGCGGAGCCTCCATGAACCCAGCCGTCGCTTTTGGACCA
GCCGTCGTGAGCTGGTCGTGGAGCAACCACTGGATTTACTGGGTTGGTCCTCTTGTTGGT
GGTGGTCTCGCTGGAATCATTTACGACTTTGTTTACACCATCGAAAACGGTCACGAGCAG
TTGCCCACCACTGATTACTGAAGACGCTGAAAATTAAATGTTGTGATATGATTTGTTTTT
AATTCTCATCGTAATTGAATTTCTGTGTGACCGTTGGATCATCTTTTTAGATGAATCCTT
GTCCGTTGATTTATGTTGTATTTGGGTTTGTTGTTGGAGTTGTAATTTTCATTGAAGGCT
CTTTTAGATGAATGTGAATTATGCATGCTTCTACGT
C

QA 1 516 1 516
DS 

RD RS1BP79JQ 517 0 0
TTCGAGATCGTGATGACCTTCGGGCTCGTTTACACCGTTTACGCCACAGCCATCGACCCC
AAAAACGGTAGCCTCGGAACAATCGCACCAATCGCAATAGGTTTCATTGTCGGAGCTAAC
ATCCTCGCGGGTGGAGCTTTCAGCGGAGCCTCCATGAACCCAGCCGTCGCTTTTGGACCA
GCCGTCGTGAGCTGGTCGTGGAGCAACCACTGGATTTACTGGGTTGGTCCTCTTGTTGGT
GGTGGTCTCGCTGGAATCATTTACGACTTTGTTTACATCATCGAAAACGGTCACGAGCAA
TTGCCCACCACTGATTACTGAAGACGCTGAAAATTAAATGTTGTGATATGATTTGTTTTT
AATTCTCATCGTAATTGAATTTCTGTGTGACCGTTGGATCATCTTTTTAGATGAATCCTT
GTCCGTTGATTTATGTTGTATTTGGGTTTGTTGTTGGAGTTGTAATTTTCATTGAAGGCT
CTTTTAGATGAATGTGAATTATGCATGCTTTTACGTT

QA 1 517 1 517
DS 

RD RS1EA91JQ 519 0 0
TCTTCGAGATCGTGATGACCTTCGGGCTCGTCTACACCGTCTACGCCACAGCCATCGACC
CCAAAAACGGTAGTCTCGGAACAATCGCACCAATCGCAATAGGTTTCATCGTCGGAGCTA
ACATCCTCGCGGGTGGAGCTTTCAGCGGAGCCTCCATGAACCCAGCCGTCGCTTTTGGAC
CAGCCGTCGTGAGCTGGTCGTGGAGCAACCACTGGATTTACTGGGTTGGTCCTCTTGTTG
GTGGTGGTCTCGCTGGAATCATCTACGACTTTGTTTACATCATCGAAAACGGTCACGAGC
AATTGCCCACCACTGATTACTGAAGACGCTGAAAATTAAATGTTGTGATATGATTTGTTT
TTAATTCTCATCGTAATTGAATTTCTGTGTGACCGTTGGATCATCTTTTTAGATGAATCC
TTGTCCGTTGATTTATGTTGTATTTGGGTTTGTTGTTGGAGTTGTAATTTTCATTGAAGG
CTCTTTTAGATGAATGTGAATTATGCATGCTTCTACGTT

QA 1 519 1 519
DS 

RD RS1AT24JQ 693 0 0
CGGTGCCTTCCTCGGTGGAAACATCACTCTCCTCCGTGGCCTTCTCTATTGGATTGCTCA
GCTTCTTGGCTCAGTCGCCGCTTGCTTCCTCCTTCAATTCGCCACCGGTGGCTTGGCAGT
TCCAGCTTTCGGTCTCTCTGCTGGAGTTGGAACCTTGAACGGTCTCGTCTTCGAGATCGT
GATGACCTTCGGGCTCGTCTACACCGTCTACGCCACAGCCATCGACCCCAAAAACGGTAG
CCTCGGAACAATCGCACCAATCGCAATAGGTTTCATCGTCGGAGCTAACATCCTCGCGGG
TGGAGCTTTCAGCGGAGCCTCCATGAACCCAGCCGTCGCTTTTGGACCAGCCGTCGTGAG
CTGGTCGTGGAGCAACCACTGGATTTACTGGGTTGGTCCTCTTGTTGGTGGTGGTCTCGC
TGGAATCATCTACGACTTTGTTTACATCATCGAAAACGGTCACGAGCAATTGCCCACCAC
TGATTACTGAAGACGCTGAAAATTAAATGTTGTGATATGATTTGTTTTTAATTCTCATCG
TAATTGAATTTCTGTGTGACCGTTGGATCATCTTTTTAGATGAATCCTTGTCCGTTGATT
TATGTTGTATTTGGGTTTGTTGTTGGAGTTGTAATTTTCATTGAAGGCTCTTTTAGATGA
ATGTGAATTATGCATGCTTCTACGTT
ATATTTC

QA 1 686 1 686
DS 



CO CL5Contig2 857 3 7 U
AGCATGATAATTCACATTCCCTGGTTTTATCATTTATATTAGTACAATAAAATTGCACAA
AAGTCTTCCAGGGAATTTAAAACTCCAACAACAAACCCAAATACACCATGCAATCAACAT
ACAACAATTCATCTAAAAAGATCCAACGACCACATAGAAATCCCATTACGATGCAAAATA
AAAACAAATCAAGTCACATTGAATTTTGGCAGTCTTCAGTAATCAGTGGTTGGCAATTGC
TCGTGACCGTTTTGGTTGATGAAGACAAACTCGTAGATGAGTCCAGCGAGTCCACCACCG
ACAAGAGGGCCGGCCCAGTAGATCCAGTGGTTGGTCCACGTCCAGCTCACGACGGCTGGT
CCAAAAGCGACGGCTGGGTTCATGGAGGCTCCGCTGAAAGCTCCACCGGCGAGGATGTTA
GCTCCAACGATGAAACCTATGGCAATTGGTGCGATTGTTCCGAGACTACCGTTCTTGGGG
TCGACGGCTGTGGCGTAAACGGTGTAGACGAGCCCGAAGGTCATCACGATCTCGAAGACA
AATCCGTTTAAGGATTCAACTCCAGCAGAGAGACCAAAAGCTGGAACTGCCAAGCCACCG
GTGGCGAATTTAAGGAGGAGACAAGCGACGACTGAGCCAAGAAGCTGAGCAATCCAATAG
AGGATACCACGGAGGAGAGTGATGTTCCCACCGACGAAAGCACCGAAGGTAACGGCAGGG
TTAACGTGACCACCAGAGATGTTAGCACCGACGGAAACAGCGACGAAGAGACCGAAAGCA
TGAGCTATGCAGCGGCTACGAGTCCTGAAGAGTGGTCGCTCCATTGTCAGTGAGCTTGTG
AAGCGATACCGGAGCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AZ30JQ U 3
AF RS1CF92JQ U 5
AF RS1BC14JQ U 1
BS 1 266 RS1BC14JQ
BS 267 267 RS1AZ30JQ
BS 268 275 RS1BC14JQ
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RD RS1AZ30JQ 747 0 0
CGTGA
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QA 6 747 6 747
DS 

RD RS1CF92JQ 783 0 0
CGG
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ATCAAGTCACATTGAATTTTGGCAGTCTTCAGTAATCAGTGGTTGGCAATTGCTCGTGAC
CGTTTTGGTTGATGAAGACAAACTCGTAGATGAGTCCAGCGAGTCCACCACCGACAAGAG
GGCCGGCCCAGTAGATCCAGTGGTTGGTCCACGTCCAGCTCACGACGGCTGGTCCAAAAG
CGACGGCTGGGTTCAGGGAGGCTCCGCTGAAAGCTCCACCGGCGAGGATGTTAGCTCCAA
CGATGAAACCTATGGCAATTGGTGCGATTGTTCCGAGACTACCGTTCTTGGGGTCGACGG
CTGTGGCGTAAACGGTGTAGACGAGCCCGAAGGTCATCACGATCTCGAAGACAAATCCGT
TTAAGGATTCAACTCCAGCAGAGAGACCAAAAGCTGGAACTGCCAAGCCACCGGTGGCGA
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QA 4 783 4 783
DS 

RD RS1BC14JQ 857 0 0
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GCTCCAACGATGAAACCTATGGCAATTGGTGCGATTGTTCCGAGACTACCGTTCTTGGGG
TCGACGGCTGTGGCGTAAACGGTGTAGACGAGCCCGAAGGTCATCACGATCTCGAAGACA
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AAGCGATACCGGAGCTG

QA 1 857 1 857
DS 



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CGACCACTCCTTCAGGACTCGTAGCCGCTGCATTAGCTCATGCTTTCGGTCTCTTCGTCG
CTGTTT*CCGTCGGTGCTAACATCTCTGGTGGTCACGTTAACCCTGCCGTTACCTTCGGT
GCTTTCGTCGGTGGGAACATCACTCTCCTCCGTGGTATCCTCTATTGGATTGCTCAGCTT
CTTGGCTCAGTCGTCGCTTGTCTCCTCCTTAAATTCGCCACCGGTGGCTTGGCAGTTCCA
GCTTTTGGTCTCTCTGCTGGAGTTGAATCCTTAAACGGATTTGTCTTCGAGATCGTGATG
ACCTTCGGGCTCGTCTACACCGTTTACGCCACAGCCGTCGACCCCAAGAACGGTAGTCTC
GGAACAATCGCACCAATTGCCATAGGTTTCATCGTTGGAGCTA*CATCCTCGCCGGTGGA
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CGTGGACAACCACTGGATCTACTGGGCGGCCCTCTTGTCGTGGTGGACTCGCTGACTCAT
CTACGAGTCGTCTTCATCACAAACGTCACGAGCATGC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AZ30TF U 2
AF RS1CF92TF U 1
AF RS1BC14TF U 1
BS 1 322 RS1BC14TF
BS 323 323 RS1AZ30TF
BS 324 817 RS1BC14TF

RD RS1AZ30TF 731 0 0
GG
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GGCTCAGTCGTCGCTTGTCTCCTCCTTAAATTCGCCACCGGTGGCTTGGCAGTTCCAGCT
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GGAC
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QA 3 726 3 726
DS 

RD RS1CF92TF 741 0 0
GGA
GACCAATCACTACACAAATAAACCCACAACTCTCCTTATCAAAAACATTGTAACCTCAAA
CCAATTAAATCTCTCCGATCATGCCGATAAGAAACATCGCCATCGGCGGAGTCCAAGAAG
AAGTGACTCATCCCAGCGCACTTAGGGCGGCGCTGGCTGAGTTTATCTCGACTTTGATCT
TTGTCTTCGCCGGCTCAGGCTCCGGTATCGCTTTCAACAAGCTCACTGACAATGGAGCGA
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TTT*CCGTCGGTGCTAACATCTCTGGTGGTCACGTTAACCCTGCCGTTACCTTCGGTGCT
TTCGTCGGTGGGAACATCACTCTCCTCCGTGGTATCCTCTATTGGATTGCTCAGCTTCTT
GGCTCAGTCGTCGCTTGTCTCCTCCTTAAATTCGCCACCGGTGGCTTGGCAGTTCCAGCT
TTTGGTCTCTCTGCTGGAGTTGAATCCTTAAACGGATTTGTCTTCGAGATCGTGATGACC
TTCGGGCTCGTCTACACCGTTTACGCCACAGCCGTCGACCCCAAGAACGGTAGTCTCGGA
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TTCAGCGGAGCCTCCATGAACCCAGCCGTCGCTTTGGACCAGCCGTCGTGAGCTGGACGT
GGACAACCACTGGATCTA

QA 4 741 4 741
DS 

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AAACCAATTAAATCTCTCCGATCATGCCGATAAGAAACATCGCCATCGGCGGAGTCCAAG
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TCTTTGTCTTCGCCGGCTCAGGCTCCGGTATCGCTTTCAACAAGCTCACTGACAATGGAG
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CTGTTT*CCGTCGGTGCTAACACCTCTGGTGGTCACGTTAACCCTGCCGTTACCTTCGGT
GCTTTCGTCGGTGGGAACATCACTCTCCTCCGTGGTATCCTCTATTGGATTGCTCAGCTT
CTTGGCTCAGTCGTCGCTTGTCTCCTCCTTAAATTCGCCACCGGTGGCTTGGCAGTTCCA
GCTTTTGGTCTCTCTGCTGGAGTTGAATCCTTAAACGGATTTGTCTTCGAGATCGTGATG
ACCTTCGGGCTCGTCTACACCGTTTACGCCACAGCCGTCGACCCCAAGAACGGTAGTCTC
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GCTTTCAGCGGAGC*TCCATGAACCCAGCCGTCGCTTTGGAC*AGCCGTCGTGAGCTGGA
CGTGGACAACCACTGGATCTACTGGGCGGCCCTCTTGTCGTGGTGGACTCGCTGACTCAT
CTACGAGTCGTCTTCATCACAAACGTCACGAGCATGC

QA 1 817 1 817
DS 



AS 4 24

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AGAAGAAACAGAATGTTGGCAATATTTCAGAAAGCGTTTGCTCACCCACCGGAGGAGCTC
AACAGCCCGGCGTCTCATTTCTCCGGCAAAACCCCAAAACTTCCCGGAGAAACTCTCTCC
GACTTCCTCTCCCTCCACAAGGACACAGCTTTCTCCATGAACTTTGGAGACTCTGCCGTC
TTAGCTTACTCCCGCCCTAACAATTCTCTTCGCCAGAGGTTGTTCTGTGGGATAGACGGA
GTGTACTGTATGTTTCTTGGGAGGTTAAGCAATCTCTGCACGTTGAACCGACAGTACGGG
CTCACGGGGAAGAACACGAACGAGGCCATGTTTGTGATCGAAGCTTACAGAACACTCCGT
GATCGTGGTCCTTACCCAGCAGATCAAGTCCTCAGAGGTTTAGAAGGAAGCTACGCCTTT
GTCGTCTACGATACTCAAACCTCCTCTGTTTTCTCAGCTCTGAGCTCTGATGGAGGAGAG
AGTCTTTACTGGGGAATCTCCGCTGACGGGTCTGTTGTGATGTCTGATGATGTGAAGATT
ATAAAGCAAGGATGTGCCAAGTCATTTGCTCCTTTCCCTACTGGGTGTATGTTTCACAGT
GAGACGGGGCTTAAGAGCTTTGAGCATCCGAAGAACAAGATGAAGGCGATGCAGAGGATT
GACAGTGAAGGTGTGATATGTGGAGCTAACTTCAAAGTGGATGCTTGTAGTAAGGTCAAT
GCCATTCCTAGGAGAGGAAGTGAAGCTAACTGGGCTCTCGCTAATTCACGTTAATCTCTT
CTTCTTTGTTGATTCAGTTGTTGAGTTGGTTCTTTTGTCTTTGTTGCATTTTACTTTTT*
ACCTACTTCCTCTGTGTAAATAGCATCTTTAGTGTTACATCAATGAAGAAGCAAAAGCAC
TTTATATTGC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 30 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 45 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 45 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 45 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 45 

AF RS1GK43TF U 4
AF RS1AT39TF U 1
AF RS1FR74TF U 1
AF RS1G144TF U 7
AF RS1FR74JQ C 192
AF RS1AT39JQ C 204
AF RS1B155JQ C 570
AF RS1C489JQ C 570
AF RS1B155TF U 570
AF RS1C489TF U 570
AF RS1G144JQ C 282
AF RS1FP06JQ C 241
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BS 59 135 RS1AT39TF
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BS 137 170 RS1AT39TF
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BS 207 207 RS1FR74TF
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BS 766 774 RS1G144TF
BS 775 970 RS1B155TF

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GG
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AAACAGAATGTTGGCAATATTTCAGAAAGCGTTTGCTCACCCACCGGAGGAGCTCAACAG
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CTGTATGTTTCTTGGGAGGTTA

QA 3 324 3 324
DS 

RD RS1AT39TF 712 0 0
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AACAGCCCGGCGTCTAATTTCTCCGGCAAAACCCCAAAACTTCCCGGAGATACTCTCTCC
GACTTCCTTTCCCTCCACAAGGACACCGCTTTCTCCATGAACTTTGGAGACTCTGCCGTC
TTAGCTTACTCCCGCCCTAACAATTCTCTTCGCCAGAGGTTGTTCTGTGGGATAGACGGA
GTCTACTGTATGTTTCTTGGGAGGTTAAGCAATCTCTGCACGTTGAACCGACAGTACGGG
CTCACGGGTAAGAACACGAACGAGGCCATGTTTGTGATCGAAGCTTACAGAACACTCCGT
GATCGTGGTCCTTACCCAGCAGATCAAGTCCTCAGAGGTTTAGAAGGAAGCTACGCCTTT
GTCGTCTACGATACTCAAACCTCCTCTGTTTTCTCAGCTCTGAGCTCTGATGGAGGAGAG
AGTCTTTACTGGGGAATCTCCGCTGACGGGTCTGTTGTGATGTCTGATGATGTGAAGATT
ATAAAGCAAGGATGTGCCAAGTCATTTGCTCCTTTCCCTACTGGGTGTATGTTTCACAGT
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DS 

RD RS1FR74TF 782 0 0
GGATC
ATCATCACAACAACAACAAACCAAACAACAAAAGATTCGAACTTTGATCAAATAAAGAAG
AAACAGAATGTTGGCAATATTTCAGAAAGCGTTTGCTCACCCACCGGAGGAGCTCAACAG
CCCGGCGTCTCATTTCTCCGGCAAAACCCCAAAACTTCCCGGAGAAACTCTCTCCGACTT
CCTCTCCCTCCACAAGGACACAGCTTTCTCCATGAACTTTGGAGACTCTGCCGTCTTAGC
TTACTCCCGCCCTAACAATTCTCTTCGCCAGAGGTTGTTCTGTGGGATAGACGGAGTGTA
CTGTATGTTTCTTGGGAGGTTAAGCAATCTCTGCACGTTGAACCGACAGTACGGGCTCAC
GGGGAAGAACACGAACGAGGCCATGTTTGTGATCGAAGCTTACAGAACACTCCGTGATCG
TGGTCCTTACCCAGCAGATCAAGTCCTCAGAGGTTTAGAAGGAAGCTACGCCTTTGTCGT
CTACGATACTCAAACCTCCTCTGTTTTCTCAGCTCTGAGCTCTGATGGAGGAGAGAGTCT
TTACTGGGGAATCTCCGCTGACGGGTCTGTTGTGATGTCTGATGATGTGAAGATTATAAA
GCAAGGATGTGCCAAGTCATTTGCTCCTTTCCCTACTGGGTGTATGTTTCACAGTGAGAC
GGGGCTTAAGAGCTTTGAGCATCCGAAGAACAAGATGAAG*CGATGCAGAGGAT*GACAG
TGAAG*TGTGATATGTGGAGCTAC**TCAA*GTGGATGCT
GTAGTAAGTCATGCATT

QA 6 765 6 765
DS 

RD RS1G144TF 780 0 0
GG
ATCACAACAACAACAAACCAAACAACAAAAGATTCGAACTTTGATCAAATAAAGAAGAAA
CAGAGTGTTGGCAATATTTCAGAAAGCGTTTGCTCACCCACCGGAGGAGCTCAACAGCCC
GGCGTCTCATTTCTCCGGCAAAACCCCAAAACTTCCCGGAGAAACTCTCTCCGACTTCCT
CTCCCTCCACAAGGACACAGCTTTCTCCATGAACTTTGGAGACTCTGCCGTCTTAGCTTA
CTCCCGCCCTAACAATTCTCTTCGCCAGAGGTTGTTCTGTGGGATAGACGGAGTGTACTG
TATGTTTCTTGGGAGGTTAAGCAATCTCTGCACGTTGAACCGACAGTACGGGCTCACGGG
GAAGAACACGAACGAGGCCATGTTTGTGATCGAAGCTTACAGAACACTCCGTGATCGTGG
TCCTTACCCAGCAGATCAAGTCCTCAGAGGTTT*GAAGGAAGCTACGCCTTTGTCGTCTA
CGATACTCAAACCTCCTCTGTTTTCTCAGCTCTGAGCTCTGATGGAGGAGAGAGTCTTTA
CTGGGGAATCTCCGCTGACGGGTCTGTTGTGATGTCTGATGATGTGAAGATTATAAAGCA
AGGATGTGCCAAGTCATTTGCTCCTTTCCCTACTGGGTGTATGTTTCACAGTGAGACGGG
GCTTAAGAGCTTTGAGCATCCGAAGAACAAGATGACG*CGATGCAGAGGATTGACAGTGA
AG*TGTGATATGTGGAGCTAACTTCAA*GTGGATGCTTGTAGTAAG
TCATGCCATCCT

QA 3 768 3 768
DS 

RD RS1FR74JQ 779 0 0
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CCGCCCTAACAATTCTCTTCGCCAGAGGTTGTTCTGTGGGATAGACGGAGTGTACTGTAT
GTTTCTTGGGAGGTTAAGCAATCTCTGCACGTTGAACCGACAGTACGGGCTCACGGGGAA
GAACACGAACGAGGCCATGTTTGTGATCGAAGCTTACAGAACACTCCGTGATCGTGGTCC
TTACCCAGCAGATCAAGTCCTCAGAGGTTTAGAAGGAAGCTACGCCTTTGTCGTCTACGA
TACTCAAACCTCCTCTGTTTTTTCAGCTTTGAGCTCTGATGGAGGAGAGAGTCTTTACTG
GGGAATCTCCGCTGACGGGTCTGTTGTGATGTCTGATGATGTGAAGATTATAAAGCAAGG
ATGTGCCAAGTCATTTGCTCCTTTCCCTACTGGGTGTATGTTTCACAGTGAGACGGGGCT
TAAGAGCTTTGAGCATCCGAAGAACAAGATGAAGGCGATGCAGAGGATTGACAGTGAAGG
TGTGATATGTGGAGCTAACTTCAAAGTGGATGCTTGTAGTAAGGTCAATGCCATTCCTAG
GAGAGGAAGTGAAGCTAACTGGGCTCTCGCTAATTCACGTTAATCTCTTTTTCTTTGTTG
ATTCAGTTGTTGAGTTGGTTCTTTTGTCTTTGTTGCATTTTATTTTTTTACCTACTTCCT
TTGTGTAAATAGCATCTTTAGTGTTACATCAATGAAGAAGCAAAAGCACTTTATATTG
T

QA 1 778 1 778
DS 

RD RS1AT39JQ 767 0 0
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TTCTCTTCGCCAGAGGTTGTTCTGTGGGATAGACGGAGTCTACTGTATGTTTCTTGGGAG
GTTAAGCAATCTCTGCACGTTGAACCGACAGTACGGGCTCACGGGTAAGAACACGAACGA
GGCCATGTTTGTGATCGAAGCTTACAGAACACTCCGTGATCGTGGTCCTTACCCAGCAGA
TCAAGTCCTCAGAGGTTTAGAAGGAAGCTACGCCTTTGTCGTCTACGATACTCAAACCTC
CTCTGTTTTTTCAGCTCTGAGCTCTGATGGAGGAGAGAGTCTTTACTGGGGAATCTCCGC
TGACGGGTCTGTTGTGATGTCTGATGATGTGAAGATTATAAAGCAAGGATGTGCCAAGTC
ATTTGCTCCTTTCCCTACTGGGTGTATGTTTCACAGTGAGACGGGGCTTAAGAGCTTTGA
GCATCCGAAGAACAAGATGAAGGCGATGCAGAGGATTGACAGTGAAGGTGTGATATGTGG
AGCTAACTTCAAAGTGGATACTTGTAGTAAGGTCAATGCCATTCCTAGGAGAGGAAGTGA
AGCTAACTGGGCTCTCGCTAATTCACGTTAATCTCTTCTTCTTTGTTGATTCAGTTGTTG
AGTTG*TTCTTTTGTCTTTGTTGCATTTTACTTTTT*ACCTACTTCCTCTGTGTAAATAG
CATCTTTAGTGTTACATCAATGAAGAAGCAAAAGCACTTTATATTGC

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DS 

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GAAGAACAAGATGAAGGCGATGCAGAGGATTGACAGTGAAGGTGTGATATGTGGAGCTAA
CTTCAAAGTGGATGCTTGTAGTAAGGTCAATGCCATTCCTAGGAGAGGAAGTGAAGCTAA
CTGGGCTCTCGCTAATTCACGTTAATCTCTTCTTCTTTGTTGATTCAGTTGTTGAGTTGG
TTCTTTTGTCTTTGTTGCATTTTACTTTTT*ACCTACTTCCTCTGTGTAAATAGCATCTT
TAGTGTTACATCAATGAAGAAGCAAAAGCACTTTATATTGC

QA 1 401 1 401
DS 

RD RS1C489JQ 401 0 0
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CTTCAAAGTGGATGCTTGTAGTAAGGTCAATGCCATTCCTAGGAGAGGAAGTGAAGCTAA
CTGGGCTCTCGCTAATTCACGTTAATCTCTTCTTCTTTGTTGATTCAGTTGTTGAGTTGG
TTCTTTTGTCTTTGTTGCATTTTACTTTTT*ACCTACTTCCTCTGTGTAAATAGCATCTT
TAGTGTTACATCAATGAAGAAGCAAAAGCACTTTATATTGC

QA 1 401 1 401
DS 

RD RS1B155TF 401 0 0
GGCTGTTGTGATGTCTGATGATGTGAAGATTATAAAGCAAGGATGTGCCAAGTCATTTGC
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GAAGAACAAGATGAAGGCGATGCAGAGGATTGACAGTGAAGGTGTGATATGTGGAGCTAA
CTTCAAAGTGGATGCTTGTAGTAAGGTCAATGCCATTCCTAGGAGAGGAAGTGAAGCTAA
CTGGGCTCTCGCTAATTCACGTTAATCTCTTCTTCTTTGTTGATTCAGTTGTTGAGTTGG
TTCTTTTGTCTTTGTTGCATTTTACTTTTT*ACCTACTTCCTCTGTGTAAATAGCATCTT
TAGTGTTACATCAATGAAGAAGCAAAAGCACTTTATATTGC

QA 1 401 1 401
DS 

RD RS1C489TF 401 0 0
GGCTGTTGTGATGTCTGATGATGTGAAGATTATAAAGCAAGGATGTGCCAAGTCATTTGC
TCCTTTCCCTACTGGGTGTATGTTTCACAGTGAGGCGGGGCTTAAGAGCTTTGAGCATCC
GAAGAACAAGATGAAGGCGATGCAGAGGATTGACAGTGAAGGTGTGATATGTGGAGCTAA
CTTCAAAGTGGATGCTTGTAGTAAGGTCAATGCCATTCCTAGGAGAGGAAGTGAAGCTAA
CTGGGCTCTCGCTAATTCACGTTAATCTCTTCTTCTTTGTTGATTCAGTTGTTGAGTTGG
TTCTTTTGTCTTTGTTGCATTTTACTTTTT*ACCTACTTCCTCTGTGTAAATAGCATCTT
TAGTGTTACATCAATGAAGAAGCAAAAGCACTTTATATTGC

QA 1 401 1 401
DS 

RD RS1G144JQ 689 0 0
GTTCTGTGGGATAGACGGAGTGTACTGTATGTTTCTTGGGAGGTTAAGCAATCTCTGCAC
GTTGAACCGACAGTACGGGCTCACGGGGAAGAACACGAACGAGGCCATGTTTGTGATCGA
AGCTTACAGAACACTCCGTGATCGTGGTCCTTACCCAGCAGATCAAGTCCTCAGAGGTTT
*GAAGGAAGCTACGCCTTTGTCGTCTACGATACTCAAACCTCCTCTGTTTTTTCAGCTCT
GAGCTCTGATGGAGGAGAGAGTCTTTACTGGGGAATCTCCGCTGACGGGTCTGTTGTGAT
GTCTGATGATGTGAAGATTATAAAGCAAGGATGTGCCAAGTCATTTGCTCCTTTCCCTAC
TGGGTGTATGTTTCACAGTGAGACGGGGCTTAAGAGCTTTGAGCATCCGAAGAACAAGAT
GAAGGCGATGCAGAGGATTGACAGTGAAGGTGTGATATGTGGAGCTAACTTCAAAGTGGA
TGCTTGTAGTAAGGTCAATGCCATTCCTAGGAGAGGAAGTGAAGCTAACTGGGCTCTCGC
TAATTCACGTTAATCTCTTTTTCTTTGTTGATTCAGTTGTTGAGTTGGTTCTTTTGTCTT
TGTTGCATTTTATTTTTTTACCTACTTCCTTTGTGTAAATAGCATCTTTAGTGTTACATC
AATGAAGAAGCAAAAGCACTTTATATTGC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1FP06JQ 730 0 0
TTAGCTTACTCCCGCCCTAACAATTCTCTTCGCCAGAGGTTGTTCTGTGGGATAGACGGA
GTCTACTGTATGTTTCTTGGGAGGTTAAGCAATCTCTGCACGTTGAACCGACAGTACGGG
CTCACGGGGAAGAACACGAACGAGGCCATGTTTGTGATCGAAGCTTACAGAACACTCCGT
GATCGTGGTCCTTACCCAGCAGATCAAGTCCTCAGAGGTTTAGAAGGAAGCTACGCCTTT
GTCGTCTACGATACTCAAACCTCCTCTGTTTTCTCAGCTCTGAGCTCTGATGGAGGAGAG
AGTCTTTACTGGGGAATCTCCGCTGACGGGTCTGTTGTGATGTCTGATGATGTGAAGATT
ATAAAGCAAGGATGTGCCAAGTCATTTGCTCCTTTCCCTACTGGGTGTATGTTTCACAGT
GAGACGGGGCTTAAGAGCTTTGAGCATCCGAAGAACAAGATGAAGGCGATGCAGAGGATT
GACAGTGAAGGTGTGATATGTGGAGCTAACTTCAAAGTGGATGCTTGTAGTAAGGTCAAT
GCCATTCCTAGGGGAGGAAGTGAAGCTAACTGGGCTCTCGCTAATTCACGTTAATCTCTT
CTTCTTTGTTGATTCAGTTGTTGAGTTGGTTCTTTTGTCTTTGTTGCATTTTACTTTTT*
ACCTACTTCCTCTGTGTAAATAGCATCTTTAGTGTTACATCAATGAAGAAGCAAAAGCAC
TTTATATTGC

QA 1 730 1 730
DS 



CO CL6Contig2 950 4 2 U
GGACCTCACCAACAAAACACAATCACAAGAAACAAAAGATTCAAACAGAAACAAAAAAAA
AATGTTGGCAATATTCCAGAAAGCATTCGCTCACCCACCGGAAGAGCTCAATAGTCCGGC
GTCTCATTCCTCCGGCAAATCCCCAAAACTCCCCGGAGAAACCCTCTCCGACTTCCTCTC
CCTCCACGAGGACACCGCTTTCTCCATGACCTTCGGCGACTCCTCCTCCGCCGTCTTAGC
CTACTCCCGCCCCCACGGCAACTCTCTCCGCAAGAGGCTGTTCTGCGGGATAGACGGGAT
CTACTGTACCTTCCTCGGCACACTAACCAACCTCTGCACGCTGAACCGGCAGTACGGACT
CACTGGGAAGAACACGAGCGAGGCGATGTTCGTGATCGAAGCCTACCGAACTCTCCGCGA
CCGTGGTCCTTACCCTGCTGATCAAGTCCTCAGAGGTTTAGAAGGAAGCTTCGCCTTCGT
GGTGTACGATACTCAGAGCTCCTCTGTTTTCTCGGCTCTGAGCTCAGATGGAGGGGAGAG
CCTATACTGGGGGATCTCCGGTGATGGGTCTGTTGTGATGTCTGATGAT*TGAAGATCAT
AAAGCAAGGATGTGCTAAATCGTTTGCTCCTTTCCCTACTGGGTGTATGTTTCACAGTGA
GACAGGGCTTAAGAGCTTTGAATATCCGAGGAACGAGATGAAGGCGATGCCGAGGATTGA
TAGTGAAGGTGTGTTGTGTGGTGCTAATTTCAAAGTGGATGCTTGTTCTAAGGTTAATGG
CATTCCTAGGAGAGGAAGTGAAGCTAACTGGGCTCTTGCTAACTCTCGTTAACTTTCTTC
TTATGATTGTAGCTCTTGAGTTGTTCTGCTCACTTTCTTTTTACCTGCTTTGTTTTATGT
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

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AATGTTGGCAATATTCCAGAAAGCATTCGCTCACCCACCGGAAGAGCTCAATAGTCCGGC
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CCTCCACGAGGACACCGCTTTCTCCATGACCTTCGGCGACTCCTCCTCCGCCGTCTTAGC
CTACTCCCGCCCCCACGGCAACTCTCTCCGCAAGAGGCTGTTCTGCGGGATAGACGGGAT
CTACTGTACCTTCCTCGGCACACTAACCAACCTCTGCACGCTGAACCGGCAGTACGGACT
CACTGGGAAGAACACGAGCGAGGCGATGTTCGTGATCGAAGCCTACCGAACTCTCCGCGA
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GATA

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TCTTGCTAACTCTCGTTAACTTTCTTCTTATGATTGTAGCTCTTGAGTTGTTCTGCTCAC
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AAACTAAATTGCATC
CC

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DS 



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AAATGTTGGCAATATTCCAGAAAGCATTCGCTCACCCACCGGAAGAGCTCAACAGTCCGG
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CCCTCCACGAGGACACCGCTTTCTCCATGACCTTCGGCGACTCCGCCGTCTTAGCCTACT
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 10 10 10 10 

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A**TGTTGGCAATATTCCAGAAAGCATTCGCTCACCCACCGGAAGAGCTCAATAGTCCGG
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GTACCTTCCTAGGCACGTTAACCAACCTCTGCACGTTGAACCGACAGTACGGACTAACGG
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DS 

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GTACCTTCCTAGGCACGTTAACCAACCTCTGCACGTTGAACCGACAGTACGGACTAACGG
GGAAGAACACGAGCGAGGCGATGTTCGTGATCGAAGCGTACCGAACGCTGCGCGACCGTG
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QA 1 656 1 656
DS 

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GGGAAGAACACGAGCGAGGCGATGTTCGTGATCGAAGCGTACCGAACGCTGCGCGACCGT
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QA 1 656 1 656
DS 

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ATGTGAAGATCATAAAGCAAGGATGTGCTAAATCGTTTGCTCCTTTCCCTACTGGGTGTA
TGTTTCACAGTGAGACAGGGCTTAAGAGCTTTGAACATCCGAGGACCGAGATGAAGGCGA
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G
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QA 2 565 2 565
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RD RS1C973TF 565 0 0
G
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AGCTCAGATGGAGGGGAGAGTCTTTACTGGGGGATCTCCGGTGATGGGTCTGTTGTGATG
TCTGATGATGTGAAGATCATAAAGCAAGGATGTGCTAAATCGTTTGCTCCTTTCCCTACT
GGGTGTATGTTTCACAGTGAGACAGGGCTTAAGAGCTTTGAGCATCCGAGGAACGAGATG
AAGGCGATGCCGAGGATTGATAGTGAAGGTGTGTTGTGTGGTGCTAATTTCAAAGTGGAT
GCTTGTTCTAAGGTTAATGGCATTCCTAGGAGAGGAAGTGAAGCTAACTGGGCTCTTGCT
AACTCTCGTTAACTTTCTTCTTATGATTGTAGCTCTTGAGTTGTTCTGCTCCTCTCTTGT
TGCACATTCTTTTTACCTGCTTTGTTTTATGTAATTATTAGACCTTTGATGCCATATCAA
TAAAGAAACTAAATTGCATC
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QA 2 561 2 561
DS 



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GCTTACTCCCGCCCTAACAATTCTCTTCGCCAGAGGTATATATATACTCAAAAAGTATCA
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CGTGGTCCTTACCCAGCAGATCAAGTCCTCAGAGGTTTAGAAGGAAGCTACGCCTTTGTC
GTCTACGATACTCAAACCTCCTCTGTTTTCTCAGCTCTGAGCTCTGATGGAGGAGAGAGT
CTTTACTGGGGAATCTCCGCTGACGGGTCTGTTGTGATGTCTGATGATGTGAAGATTATA
AAGCAAGGATGTGCCAAGTCATTTGCTCCTTTCCCTACTGGTAAGTGCAAAAAGACACAA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GV40TF U 1
AF RS1GV40JQ C 511
BS 1 621 RS1GV40TF
BS 622 622 RS1GV40JQ
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RD RS1GV40TF 799 0 0
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AGCCCGGCGTCTAATTTCTCCGGCAAAACCCCAAAACTTCCCGGAGATACTCTCTCCGAC
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TTTTACATTTTTAAAACAGATTAAAAAGATTATTAAATTTCATTTATGTTTTTAAGGAAT
ACATTTTCCTAACCAAAGTTTTTTAAAATGAATAAACTACTGAAAAGAATAATGTATTTT
GGTATTAATATTAAGTTCAAAATATATATAACTGAAATTATTAATGTAACAATAAAATAG
TAAACGTACACACATTCTTACAACTTGTGTTTCAGGTTGTTCTGTGGGATAGACGGAGTC
TACTGTATGTTTCTTGGGAGGTTAAGCAATCTCTGCACGTTGAACCGACAGTACGGGCTC
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CTTTACTGGGGA
TCTCCGC

QA 1 792 1 792
DS 

RD RS1GV40JQ 787 0 0
TTC
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TGAAGTGTTTGATGTTTGTGTAATTTTTGTTTGCAGGGTGTATGTTTCACAGTGAGACGG
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AAGGTGTGATATGTGGAGCTAACTTCAAAGTGGATGCTTGTAGTAAGGTCAATGCCATTC
CTAGGAGAGGAAGTGAAGCTAACTGGGCTCTCGCTAATTCACGTTAATCTCTTCTTCTTT
GTTGATTCAGTTGTTGAGTTGGTTCTTTTGTCTTTGTTGCATTTTACTTTTTACCTACTT
CCTCTGTGTAAATAGCATCTTTAGTGTTACATCAATGAAGAAGCAAAAGCACTTTATATT
GCAG

QA 4 787 4 787
DS 



AS 4 26

CO CL7Contig1 1251 2 2 U
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TAAAGGGTTATAGTTAACATCGTAATCAAGCATGGTTGATGGCTTCATACGGTTACAGAA
AATACATAAAATCTTTAACCTTGATGTCTTTTTATACAAAATCACCAAATAAATAAACAA
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ATAGCCGCCACTTTGTTCTTCATTTTCTCACCATACTCTGCCTTTTTCTTCTCTAGTTTC
TCTTCAATCTTCCTGAGTTGAGCTTCAGTGGCTGCTTTCTTGCTGTTCTCCCAAGCAAGC
ACATCAGATATCTTCTTTTGTGCCCTGCACATTTTCATCATTAGCTGATGGTTATCCAGC
AAAAGTAGTGTAATCTTTGGGGGTGCCAGAAGATCAAAAATAATTTTAAGAAAGTTTACT
TGTGCTCAGCCTTTGACTTCTCACTCTCTTCCCATGCTTTGATGAATGAAGTTTTTTTCT
CCTTTTCCAAGTCTGCAAGCTTCACATTTGATAAAAACAAACACAACATATTATTGCGTC
AGTCATGTATTTGCCTTCCATGGTACGGTCAGATAATAGTAACGACAATCTATATCAATA
TATATGTTTTTGTTAATATTAAAACTACAAGGCAGTTATTCCATAGGTTAAACCAGAAAA
GGTCGACATAAAGAAAAAAATGTTATATAGCTTACCTCTATCAACCGAGCCAGCTGAACT
TTTCTTTGGTGTGGGCTCCTCAATGGGTTCTGCAAGAAGCTCACTTATTATAAGTCTACC
CACATTATCAGAAAGTAGCAACTTTAAGAAGGAACTAATGCGTTTGGATTTTTTAAATTG
CTAAAGAAAAAGTTGGTGCTTACTTGTTATTTTCCAAGAGTTAGGCATCTTTAAAAGTAA
CTAATCATGTATGAGAAATAAAGAAAGTAAACCACTCTCTTAATTGTTAGCTGTCCACAA
CTAATTTGCATGATTCCATATACTTTTTGATAACAACACCTCACTAGTAGG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BY24TF U 1
AF RS1BY24JQ C 497
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DS 

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CTTCTCACTCTCTTCCCATGCTTTGATGAATGAAGTTTTTTTCTCCTTTTCCAAGTCTGC
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TATTAAAACTACAAGGCAGTTATTCCATAGGTTAAACCAGAAAAGGTCGACATAAAGAAA
AAAATGTTATATAGCTTACCTCTATCAACCGAGCCAGCTGAACTTTTCTTTGGTGTGGGC
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CATATACTTTTTGATAACAACACCTCACTAGTAGG

QA 1 755 1 755
DS 



CO CL7Contig2 829 5 6 U
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AAAATCACCAAATAAATAAACAAGACAGCAAACAAACAAAAACCAACTATAAAAGATAAC
TGAATCACACAAAAAAGGAGAGAGGAAGTATTACAAACAATGACATGAGCAACATATTAA
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TCTTCTCTTCTGCTTGCTTGTGAATAGCCGCCACTTTGTTCTTCATTTTCTCACCATACT
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TCTTGCTGTTCTCCCAAGCAAGCACATCAAATATCTTCTTTTGTGCCTTGTGCTCAGCCT
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BQ
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AF RS1FN47JQ U 1
AF RS1FK27JQ U 1
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AF RS1BM94JQ U 18
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GGTGGC
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CTTCTGCTTGCTTGTGAATAGCCGCCACTTTGTTCTTCATTTTCTCACCATACTCTGCCT
TTTTCTTCTCTAGTTTCTCTTCAATCTTCCTGAGTTGAGCTTCAGTGGCTGCTTTCTTGC
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GTTTTTCAACAACGGTAAGAGCTTTGG

QA 7 633 7 633
DS 

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TGAATCACACAAAAAAGGAGAGAGGAAGTATTACAAACAATGACATGAGCAACATATTAA
ATAAAAAGACTTAAAAACATCCACAGGTTGCCTTGGGAACGACACCAGTGGCTCTATACT
TAGCAGCCATTTCTTCAGCTTTGAGAAGCTCTTCTCCCTTTTTAGCTTCAACCATTGCTC
TCTTCTCTTCTGCTTGCTTGTGAATAGCCGCCACTTTGTTCTTCATTTTCTCACCATACT
CTGCCTTTTTCTTCTCTAGTTTCTCTTCAATCTTCCTGAGTTGAGCTTCAGTGGCTGCTT
TCTTGCTGTTCTCCCAAGCAAGCACATCAAATATCTTCTTTTGTGCCTTGTGCTCAGCCT
TTGACTTCTCACTCTCTTCCCATGCTTTGATGAATGAAGTTTTCTTCTCCTTTTCCAAGT
CTGCAAGTTTCACATCTCTATCAACCGAACCAGCTGAACTTTTCTTTGGTGTGGGCTCCT
CAATGGGTTTTTCAACAACGGTAAGAGCTTTGGACTCGTCGGGAAGTGGAGTATGAAATT
TCTCCTCCGCCACGTCTTTTGAAACTT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1EL83JQ 701 0 0
CATAAAATCTTTAACCTTGATGTCTTTTTATACAAAATCACCAAATAAATAAACAAGACA
GCAAACAAACAAAAACCAACTATAAAAGATAACTGAATCACACAAAAAAGGAGAGAGGAA
GTATTACAAACAATGACATGAGCAACATATTAAATAAAAAGACTTAAAAACATCCACAGG
TTGCCTTGGGAACGACACCAGTGGCTCTATACTTAGCAGCCATTTCTTCAGCTTTGAGAA
GCTCTTCTCCCTTTTTAGCTTCAACCATTGCTCTCTTCTCTTCTGCTTGCTTGTGAATAG
CCGCCACTTTGTTCTTCATTTTCTCACCATACTCTGCCTTTTTCTTCTCTAGTTTCTCTT
CAATCTTCCTGAGTTGAGCTTCAGTGGCTGCTTTCTTGCTGTTCTCCCAAGCAAGCACAT
CAAATATCTTCTTTTGTGCCTTGTGCTCAGCCTTTGACTTCTCACTCTCTTCCCATGCTT
TGATGAATGAAGTTTTCTTCTCCTTTTCCAAGTCTGCAAGCTTCACATCTCTATCAACCG
AACCAGCTGAACTTTTCTTTGGTGTGGGCTCCTCAATGGGTTTTTCAACAACGGTAAGAG
CTTTGGACTCGTCGGGAAGTGGAGTATGAACTTTCTCCTCCGCCACGTCTTTTAAAACTT
CCACCGGAGCAGGAGTAGGTTCCTTCGCCGGAGCTACAACC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RS1BM94JQ 812 0 0
ACAGAAAATACATAAAATCTTTAACCTTGATGTCTTTTTATACAAAATCACCAAATAAAT
AAACAAGACAGCAAACAAACAAAAACCAACTATAAAAGATAACTGAACCACACAAAAAAG
GAGAGAGGAAGTATTACAAACAATGACATGAGCAACATATTAAATAAAAAGACTTAGAAA
CATCCACAGGTTGCCTTGGGAACGGCACCAGTGGCTCTATACTTAGCAGCCATTTCTTCA
GCTTTGAGAAGCTCTTCTCCCTTTTTAGCTTCAACCATTGCTCTCTTCTCTTCTGCTTGC
TTGTGAATAGCCGCCACTTTGTTCTTCATTTTCTCACCATACTCTGCCTTTTTCTTCTCT
AGTTTCTCTTCAATCTTCCTGAGTTGAGCTTCAGTGGCTGCTTTCTTGCTGTTCTCCCAA
GCAAGCACATCAAATATCTTCTTTTGTGCCTTGTGCTCAGCCTTTGACTTCTCACTCTCT
TCCCATGCTTTGATGAATGAAGTTTTCTTCTCCTTTTCCAAGTCTGCAAGTTTCACATCT
CTATCAACCGAACCAGATGAACTTTTCTTTGGTGTGGGCTCCTCAATGGGTTTTTCAACA
ACGGTAAGAGCTTTGGACTCGTCGGGAAGTGGAGTATGAACTTTCTCCTCCGCCACGTCT
TTTGAAACTTCCACCGGAGCAGGAGTAGGTTCCTTCGCCGGAGCTACAACCGCAGGAGAA
TCTACGTCAACTTTGATCGTCTTTTGCTCCTCCGCCATTGCCTCTCAGCCAAAGAA*AAC
AAGAGCTGAAGAAATGGTTTTCTTTTTTTTTT

QA 1 812 1 812
DS 

RD RS1E247JQ 785 0 0
G
TAAAATCTTTAACCTTGATGTCTTTTTATACAAAATCACCAAATAAATAAACAAGACAGC
AAACAAACAAAAACCAACTATAAAAGATAACTGAATCACACAAAAAAGGAGAGAGGAAGT
ATTACAAACAATGACATGAGCAACATATTAAATAAAAAGACTTAGAAACATCCACAGGTT
GCCTTGGGAACGACACCAGTGGCTCTATACTTAGCAGCCATTTCTTCAGCTTTGAGAAGC
TCTTCTCCCTTTTTAGCTTCAACCATTGCTCTCTTCTCTTCTGCTTGCTTGTGAATAGCC
GCCACTTTGTTCTTCATTTTCTCACCATACTCTGCCTTTTTCTTCTCTAGTTTCTCTTCA
ATCTTCCTGAGTTGAGCTTAAGTGGCTGCTTTCTTGCTGTTCTCCCAAGCAAGCACATCA
GATATCTTCTTTTGTGCCTTGTGCTCAGCCTTTGACTTCTCACTCTCTTCCCATGCTTTG
ATGAATGAAGTTTTCTTCTCCTTTTCCAAGTCTGCAAGTTTCACATCTCTATCAACCGAA
CCAGCTGAACTTTTCTTTGGTGTGGGCTCCTCAATGGGTTTTTCAACAACGGTAAGAGCT
TTGGACTCGTCGGGAAGTGGAGTATGAACTTTCTCCTCCGCCACGTCTTTTGAAACTTCC
ACCGGAGCAGGAGTAGGTTCCTTCGCCGGAGCTATAACCGCAGGAGAATCTACGTCAACT
TTGATCGTCTTTTGCTCCTCCGCCATTGCCTCTCAGCCAAAGAAGAACAAGAGCTGAAGA
AATG

QA 2 785 2 785
DS 



CO CL7Contig3 847 7 11 U
AGGAAAGTCTCAGAGATTTTATCCAAAAATAGTTTTGTTTAATTCTCTGGAAGGAAAAAA
ATAAAAAAGAAAACCATTTCTTCAGCTCTTGTTCTTCTTTGGCTGAGAGGCAATGGCGGA
GGAGCAAAAGACGATCAAAGTTGACGTAGATTCTCCTGCGGTTGTAGCTCCGGCGAAGGA
ACCTACTCCTGCTCCGGTGGAAGTTTCAAAAGACGTGGCGGAGGAGAAAGTTCATACTCC
ACTTCCCGACGAGTCCAAAGCTCTTACCGTTGTTGAAAAACCCATTGAGGAGCCCACACC
AAAGAAAAGTTCAGCTGGTTCGGTTGATAGAGATGTGAAACTTGCAGACTTGGAAAAGGA
GAAGAAAACTTCATTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAGGCTGAGCACAA
GGCACAAAAGAAGATATCTGATGTGCTTGCTTGGGAGAACAGCAAGAAAGCAGCCACTGA
AGCTCAACTCAGGAAGATTGAAGAGAAACTAGAGAAGAAAAAGGCAGAGTATGGTGAGAA
AATGAAGAACAAAGTGGCGGCTATTCACAAGCAAGCAGAAGAGAAGAGAGCAATGGTTGA
AGCTAAAAAGGGAGAAGAGCTTCTCAAAGCTGAAGAAATGGCTGCTAAGTATAGAGCCAC
TGGTGTCGTTCCCAAGCAACCTGTGGATGTTTCTAAGTCTTTTATTTAATATGTTGCTCA
TGTCATTGTTTGTA*TACTTCCTCTCTCCTTTTTGTGTGAT*CAGTTATCTTT*ATAGTT
GGTTTTGTTTGTTTGCTGTCTTGTTATTTTTTGGTGATTTGTATAAAAGACATCAAGGTA
AAGATTT


BQ
10 20 20 20 20 20 25 10 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 30 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1H321TF U 1
AF RS1BM94TF U 25
AF RS1AW94TF U 95
AF RS1E247TF U 10
AF RS1EL83TF U 7
AF RS1FN47TF U 1
AF RS1FK27TF U 1
BS 1 229 RS1FK27TF
BS 230 230 RS1H321TF
BS 231 678 RS1FK27TF
BS 679 679 RS1FN47TF
BS 680 708 RS1FK27TF
BS 709 709 RS1FN47TF
BS 710 766 RS1FK27TF
BS 767 767 RS1FN47TF
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BS 790 790 RS1FN47TF
BS 791 847 RS1FK27TF

RD RS1H321TF 609 0 0
G
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TAAAAAAGAAAACCATTTCTTCAGCTCTTGTTCTTCTTTGGCTGAGAGGCAATGGCGGAG
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AAGAAAACTTCATTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAGGCTGAGCACAAG
GCACAAAAGAAGATATCTGATGTGCTTGCTTGGGAGAACAGCAAGAAAGCAGCCACTGAA
GCTCAACTCAGGAAGATTGAAGAGAAACTAGAGAAGAAAAAAGCAGAGTATGGTGAGAAA
ATGAAGAACAAAGTGGCGGCTATTCACAAGGAAGCAGAAGAGAAGAGGGCAATGGTTGAA
GCTAAAAA

QA 2 609 2 609
DS 

RD RS1BM94TF 648 0 0
AAAAATAGTTTTGTTTAATTCTCTGGAAGGAAAAAAATAAAAAAGAAAACCATTTCTTCA
GCTCTTGTTCTTCTTTGGCTGAGAGGCAATGGCGGAGGAGCAAAAGACGATCAAAGTTGA
CGTAGATTCTCCTGCGGTTGTAGCTCCGGCGAAGGAACCTACTCCTGCTCCGGTGGAAGT
TTCAAAAGACGTGGCGGAGGAGAAAGTTCATACTCCACTTCCCGACGAGTCCAAAGCTCT
TACCGTTGTTGAAAAACCCATTGAGGAGCCCACACCAAAGAAAAGTTCATCTGGTTCGGT
TGATAGAGATGTGAAACTTGCAGACTTGGAAAAGGAGAAGAAAACTTCATTCATCAAAGC
ATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAGGCTGAGCACAAGGCACAAAAGAAGATATCTGATGT
GCTTGCTTGGGAGAACAGCAAGAAAGCAGCCACTGAAGCTCAACTCAGGAAGATTGAAGA
GAAACTAGAGAAGAAAAAGGCAGAGTATGGTGAGAAAATGAAGAACAAAGTGGCGGCTAT
TCACAAGCAAGCAGAAGAGAAGAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAAGGGAGAAGAGCTTCT
CAAAGCTGAAGAAATGGCTGCTAAGTATAGAGCCACTGGTGCCGTTCC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1AW94TF 577 0 0
TTCTTTGGCTGAGAGGCAATGGCGGAGGAGCAAAAGACGATCAAAGTTGACGTAGATTCT
CCTGCGGTTGTAGCTCCGGCGAAGGAACCTACTCCCGCTCCGGTGGAAGTTTCAAAAGAC
GTGGCGGAGGAGAAAGTTCATACTCCACTTCCCGACGAGTCCAAAGCTCCTACCGTTGTT
GAAAAACCCATTGAGGAGCCCACACCAAAGAAAAGTTCAGCTGGTTCGGTTGATAGAGAT
GTGAAGCTTGCAGACTTGGAAAAGGAGAAGAAAACTTCATTCATCAAAGCATGGGAAGAG
AGTGAGAAGTCAAAGGCTGAGCACAAGGCACAAAAGAAGATATCTGATGTGCTTGCTTGG
GAGAACAGCAAGAAAGCAGCCACTGAAGCTCAACTCAGGAAGATTGAAGAGAAACTGGAG
AAGAAAAAGGCAGAGTATGGTGAGAAAATGAAGAACAAAGTGGCGGCTATTCACAAGCAA
GCAGAAGAGAAGAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAAGGGAGAAGAGCTTCTCAAAGCTGAA
GAAATGGCTGCTAAGTATAGAGCCACTGGTGTCGTTC

QA 1 577 1 577
DS 

RD RS1E247TF 740 0 0
GG
AGAGATTTTATCCAAAAATAGTTTTGTTTAATTCTCTGGAAGGAAAAAA*TAAAAAAGAA
AACCATTTCTTCAGCTCTTGTTCTTCTTTGGCTGAGAGGCAATGGCGGAGGAGCAAAAGA
CGATCAAAGTTGACGTAGATTCTCCTGCGGTTATAGCTCCGGCGAAGGAACCTACTCCTG
CTCCGGTGGAAGTTTCAAAAGACGTGGCGGAGGAGAAAGTTCATACTCCACTTCCCGACG
AGTCCAAAGCTCTTACCGTTGTTGAAAAACCCATTGAGGAGCCCACACCAAAGAAAAGTT
CAGCTGGTTCGGTTGATAGAGATGTGAAACTTGCAGACTTGGAAAAGGAGAAGAAAACTT
CATTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAGGCTGAGCACAAGGCACAAAAGA
AGATATCTGATGTGCTTGCTTGGGAGAACAGCAAGAAAGCAGCCACTTAAGCTCAACTCA
GGAAGATTGAAGAGAAACTAGAGAAGAAAAAGGCAGAGTATGGTGAGAAAATGAAGAACA
AAGTGGCGGCTATTCACAAGCAAGCAGAAGAGAAGAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAAGG
GAGAAGAGCTTCTCAAAGCTGAAGAAATGGCTGCTAAGTATAGAGCCACTGGTGTCGTTC
CCAAGCAACCTGTGGATGTTTCTAAGTCTTTTATTTAATATGTTGCTCATGTCATTGTTT
GTA*TACTTCCTCTCTCC

QA 3 740 3 740
DS 

RD RS1EL83TF 771 0 0
GGCTCAGAGATTTTATCCAAAAATAGTTTTGTTTAATTCTCTGGAAGGAAAAAAATAAAA
AAGAAAACCATTTCTTCAGCTCTTGTTCTTCTTTGGCTGAGAGGCAATGGCGGAGGAGCA
AAAGACGATCAAAGTTGACGTAGATTCTCCTGCGGTTGTAGCTCCGGCGAAGGAACCTAC
TCCTGCTCCGGTGGAAGTTTTAAAAGACGTGGCGGAGGAGAAAGTTCATACTCCACTTCC
CGACGAGTCCAAAGCTCTTACCGTTGTTGAAAAACCCATTGAGGAGCCCACACCAAAGAA
AAGTTCAGCTGGTTCGGTTGATAGAGATGTGAAGCTTGCAGACTTGGAAAAGGAGAAGAA
AACTTCATTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAGGCTGAGCACAAGGCACA
AAAGAAGATATCTGATGTGCTTGCTTGGGAGAACAGCAAGAAAGCAGCCACTGAAGCTCA
ACTCAGGAAGATTGAAGAGAAACTAGAGAAGAAAAAGGCAGAGTATGGTGAGAAAATGAA
GAACAAAGTGGCGGCTATTCACAAGCAAGCAGAAGAGAAGAGAGCAATGGTTGAAGCTAA
AAAGGGAGAAGAGCTTCTCAAAGCTGAAGAAATGGCTGCTAAGTATAGAGCCACTGGTGT
CGTTCCCAAGCA*CCTGTGGATGTTTCTAAGTCTTTTATTTAATATGTTGCTCATGTCAT
TGTTTGTA*TACTTCCTCTCTCCTTTTTGTGTGATTCAGTTATCTTTTATA

QA 1 771 1 771
DS 

RD RS1FN47TF 801 0 0
A
GGAAAGTCTCAGAGATTTTATCCAAAAATAGTTTTGTTTAATTCTCTGGAAGGAAAAAAA
TAAAAAAGAAAACCATTTCTTCAGCTCTTGTTCTTCTTTGGCTGAGAGGCAATGGCGGAG
GAGCAAAAGACGATCAAAGTTGACGTAGATTCTCCTGCGGTTGTAGCTCCGGCGAAGGAA
CCTACTCCTGCTCCGGTGGAAGTTTCAAAAGACGTGGCGGAGGAGAAATTTCATACTCCA
CTTCCCGACGAGTCCAAAGCTCTTACCGTTGTTGAAAAACCCATTGAGGAGCCCACACCA
AAGAAAAGTTCAGCTGGTTCGGTTGATAGAGATGTGAAACTTGCAGACTTGGAAAAGGAG
AAGAAAACTTCATTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAGGCTGAGCACAAG
GCACAAAAGAAGATATCTGATGTGCTTGCTTGGGAGAACAGCAAGAAAGCAGCCACTGAA
GCTCAACTCAGGAAGATTGAAGAGAAACTAGAGAAGAAAAAGGCAGAGTATGGTGAGAAA
ATGAAGAACAAAGTGGCGGCTATTCACAAGCAAGCAGAAGAGAAGAGAGCAATGGTTGAA
GCTAAAAAGGGAGAAGAGCTTCTCAAAGCTGAAGAAATGGCTGCTAAGTATAGAGCCACT
GGTGTCGTTCCCAAGCAACCTGTGGATGTTTCTAAGTCTTTTATTTAATATGTTGCTCAT
GTCATTGTTTGTAATACTTCCTCTCTCCTTTTTGTGTGAT*CAGTTATCTTT*ATAGTTG
GTTTTGTTTGTTTGCTGTCT

QA 2 801 2 801
DS 

RD RS1FK27TF 847 0 0
AGGAAAGTCTCAGAGATTTTATCCAAAAATAGTTTTGTTTAATTCTCTGGAAGGAAAAAA
ATAAAAAAGAAAACCATTTCTTCAGCTCTTGTTCTTCTTTGGCTGAGAGGCAATGGCGGA
GGAGCAAAAGACGATCAAAGTTGACGTAGATTCTCCTGCGGTTGTAGCTCCGGCGAAGGA
ACCTACTCCTGCTCCGGTGGAAGTTTCAAAAGACGTGGCGGAGGAGAAATTTCATACTCC
ACTTCCCGACGAGTCCAAAGCTCTTACCGTTGTTGAAAAACCCATTGAGGAGCCCACACC
AAAGAAAAGTTCAGCTGGTTCGGTTGATAGAGATGTGAAACTTGCAGACTTGGAAAAGGA
GAAGAAAACTTCATTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAGGCTGAGCACAA
GGCACAAAAGAAGATATCTGATGTGCTTGCTTGGGAGAACAGCAAGAAAGCAGCCACTGA
AGCTCAACTCAGGAAGATTGAAGAGAAACTAGAGAAGAAAAAGGCAGAGTATGGTGAGAA
AATGAAGAACAAAGTGGCGGCTATTCACAAGCAAGCAGAAGAGAAGAGAGCAATGGTTGA
AGCTAAAAAGGGAGAAGAGCTTCTCAAAGCTGAAGAAATGGCTGCTAAGTATAGAGCCAC
TGGTGTCGTTCCCAAGCA*CCTGTGGATGTTTCTAAGTCTTTTATTTA*TATGTTGCTCA
TGTCATTGTTTGTA*TACTTCCTCTCTCCTTTTTGTGTGAT*CAGT*ATCTTT*ATAGTT
GGTTTTGTT*GTTTGCTGTCTTGTTATTTTTTGGTGATTTGTATAAAAGACATCAAGGTA
AAGATTT

QA 1 847 1 847
DS 



CO CL7Contig4 911 12 30 U
GGAAAGGCTCCGAGATTTTATCCAAAAATAGTTTTGTTTAATTCTCTGGAAGGAAAAAAA
AAAAAA**GAAACCATTTGTGTTCCGCTCTTGTTCTTCTTTGGCTGAGAGGCAATGGCGG
AGGAGCAAAAGACGGGTAAAGTTGACGTAGAATCTCCTGCGGTTGTAGCTCCGGCGAAGG
AACCTACTCCTGCTCCGGTGGAAGTTTCAAAAGACGTGGCGGAGGAGAAAGTTCATACTC
CACTTCCCGACGAGTCCAAAGCTCTTACCGTTGTTGAAAAACCCATTGAGGAGCCCACAC
CAAAGAAAAGTTCAGCTGGTTCGGTTGATAGAGATGTGAAACTTGCAGACTTGGAAAAGG
AGAAGAAAACTTCATTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAGGCTGAGCACA
AGGCACAAAAGAAGATATCTGATGTGCTTGCTTGGGAGAACAGCAAGAAAGCAGCCACTG
AAGCTCAACTCAGGAAGATTGAAGAGAAACTAGAGAAGAAAAAAGCAGAGTATGGTGAGA
AGATGAAGAACAAAGTGGCGGCTATTCACAAGGAAGCAGAAGAGAAGAGAGCAATGGTTG
AAGCTAAAAAGGGAGAAGAGCTTCTCAAAGCTGAAGAAATGGCTGCTAAGTATAGAGCCA
CTGGTGTCGTTCCCAAGGCAACCTGTGGATGTTTCTAAGTCTTTTTATTTAATATGTTTC
TCATGTCATTGTTTGTAATACTTCCTCTCTCCTTTTTTT*GTGTGATTCAGTTACCTTTT
ATAGTTGGTTTTTGTTTGTTTGCTGTCTTGTTTATATAATTGGTGATTTTGTATAAAAAG
ACATCAAGGTTAAAGATATTATGTATTTTCTGTAATCGTATGAATCATCAACCATGCTTG
ATTACGATGTC


BQ
15 15 15 15 15 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 20 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 40 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 
70 55 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 
70 55 55 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 30 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 
65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 0 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 20 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 30 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 35 45 60 60 60 60 60 35 60 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 30 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 40 40 40 40 40 40 40 5 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 20 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EK58TF U 6
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*AAACTTCATTCATCAA*GCATGGGAAGAGAGTGAGA
GTCAAAGCTGAGCA

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AAAAAGGGAGAAGAGCTTCTCAAAGCTGAAGAAATGGCTGCTAAGTATAGAGCCACTGGT
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TC

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DS 

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AGGCACAAAAGAAGATATCTGATGTGCTTGCTTGGGAGAACAGCAAGAAAGCAGCCACTG
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CTGGTGTCGTTCCCAAG*CAACCTGTGGATGTTTCTAAGTCTTTTTATTTAATATGTTTC
TCATGTCATTGTTTGTAATACTTC**CTCTC*T

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DS 

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AAAAAAATGAAACCATTTGTGTTCCGCTCTTGTTCTTCTTTGGCTGAGAGGCAATGGCGG
AGGAGCAAAAGACGGGTAAAGTTGACGTAGAATCTCCTGCGGTTGTAGCTCCGGCGAAGG
AACCTACTCCTGCTCCGGTGGAAGTTTCAAAAGACGTGGCGGAGGAGAAAGTTCATACTC
CACTTCCCGACGAGTCCAAAGCTCTTACCGTTGTTGAAAAACCCATTGAGGAGCCCACAC
CAAAGAAAAGTTCAGCTGGTTCGGTTGATAGAGATGTGAAACTTGCAGACTTGGAAAAGG
AGAAGAAAACTTCATTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAGGCTGAGCACA
AGGCACAAAAGAAGATATCTGATGTGCTTGCTTGGGAGAACAGCAAGAAAGCAGCCACTG
AAGCTCAACTCAGGAAGATTGAAGAGAAACTAGAGAAGAAAAAAGCAGAGTATGGTGAGA
AGATGAAGAACAAAGTGGCGGCTATTCACAAGGAAGCAGAAGAGAAGAGAGCAATGGTTG
AAGCTAAAAAGGGAGAAGAGCTTCTCAAAGCTGAAGAAATGGCTGCTAAGTATAGAGCCA
CTGGTGTCGTTCCCAAG*CAACCTGTGGATGTTTCTAAGTCTTTT*ATTTAATATGTTTC
TCATGTCATTGTTTGTAATACTTC*TCTCTC*TTTTTT**GTGTGAT*CAGT*ACCTTTT
ATAGTTGGTTTT*GTT
GTTGCTGTCTT

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DS 

RD RS1F913TF 803 0 0
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G**GAAACCATTTGTGTTCCGCTCTTGTTCTTCTTTGGCTGAGAGGCAATGGCGGAGGAG
CAAAAGACGGGTAAAGTTGACGTAGAATCTCCTGCGGTTGTAGCTCCGGCGAAGGAACCT
ACTCCTGCTCCGGTAGAAGTTTCAAAAGACGTGGCGGAGGAGAAAGTTCATACTCCACTT
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AAAACTTCATTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAGGCTGAGCACAAGGCA
CAAAAGAAGATATCTGATGTGCTTGCTTGGGAGAACAGCAAGAAAGCAGCCACTGAAGCT
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AAGAACAAAGTGGCGGCTATTCACAAGGAAGCAGAAGAGAAGAGAGCAATGGTTGAAGCT
AAAAAGGGAGAAGAGCTTCTCAAAGCTGAAGAAATGGCTGCTAAGTATAGAGCCACTGGT
GTCGTTCCCAAGACAACCTGTGGATGTTTCTAAGTCTTTT*ATTTAATATGTTTCTCATG
TCATTGTTTGTAATACTTCCTCTCTCCTTTTTT**GTGTGATTCAGT*ACCTTTTATAGT
TGGTTTT*GTTTGTTTGCAGTCT

QA 1 803 1 803
DS 

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AGCTGGTTCGGTTGATAGAGATGTGAAACTTGCAGACTTGGAAAAGGAGAAGAAAACTTC
ATTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAGGCTGAGCACAAGGCACAAAAGAA
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AGTGGCGGCTATTCACAAGGAAGCAGAAGAGAAGAGGGCAATGGTTGAAGCTAAAAAGGG
AGAAGAGCTTCTCAAAGCTGAAGAAATGGCTGCTAAGTATAGAGCCACTGGTGTCGTCCC
CAAGGCAACCTGTGGATGTTTCTAAGTCTTTTTATTTAATATGTTTCTCATGTCATTGTT
TGGAATACTTCCTCTCTCCTTTTTTTTGTGTGATTCAGTTATCTTTTATAGTTGGTTTTT
GTTTGTTTGCTGTCTTGTTTATTTATTTGGTGATTTTG
C

QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1AB29TF 828 0 0
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AAAGTTCATACTCCACTTCCCGACGAGTCCAAAGCTCTTACCGTTGTTGAAAAACCCATT
GAGGAGCCCACACCAAAGAAAAGTTCAGCTGGTTCGGTTGATAGAGATGTGAAACTTGCA
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GAGTATGGTGAGAAGATGAAGAACAAAGTGGCGGCTATTCACAAGGAAGCAGAAGAGAAG
AGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAAGGGAGAAGAGCTTCTCAAAGCTGAAGAAATGGCTGCT
AAGTATAGAGCCACTGGTGTCGTTCCCAAGGCAACCTGTGGATGTTTCTAAGTCTTTTTA
TTTAATATGTTTCTCATGTCATTGTTTGTAATACTTCCTCTCTCCTTTTTTT*GTGTGAT
TCAGTTACCTTTTATAGTTGGTTTTTGTTTGTTTGCTGTCTTGTTTATATAATTGGTGAT
TTTGTATAAAA*GACATCAAG*TTAAAGATATTATGTATTTTCTGTA
G

QA 1 827 1 827
DS 

RD RS1AB29JQ 779 0 0
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AGAAAAAAGCAGAGTATGGTGAGAAGATGAAGAACAAAGTGGCGGCTATTCACAAGGAAG
CAGAAGAGAAGAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAAGGGAGAAGAGCTTCTCAAAGCTGAAG
AAATGGCTGCTAAGTATAGAGCCACTGGTGTCGTTCCCAAGGCAACCTGTGGATGTTTTT
AAGTCTTTTTATTTAATATGTTTCTCATGTCATTGTTTGTAATACTTCCTCTCTCCTTTT
TTT*GTGTGATTCAGTTACCTTTTATAGTTGGTTTTTGTTTGTTTGCTGTCTTGTTTATA
TAATTGGTGATTTTGTATAAAAAGACATCAAGGTTAAAGATATTATGTATTTTCTGTA
G

QA 1 778 1 778
DS 

RD RS1E326JQ 654 0 0
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AAACTTGCAGACTTGGAAAAGGAGAAGAAAACTTCATTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGT
GAGAAGTCAAAGGCTGAGCACAAGGCACAAAAGAAGATATTTGATGTGCTTGCTTGGGAG
AACAGCAAGAAAGCAGCCACTGAAGCTCAACTCAGGAAGATTGAAGAGAAACTAGAGAAG
AAAAAAGCAGAGTATGGTGAGAAGACGAAGAACAAAGTGGCGGCTATTCACAAGGAAGCA
GAAGAGAAGAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAAGGGAGAAGAGCTTTTCAAAGCTGAAGAA
ATGGCTGCTAAGTATAGAGCCACTGGTGTCGTTCCCAAGGCAACCTGTGGATGTTTTTAA
GTCTTTTTATTTAATATGTTTCTCATGTCATTGTTTGTAATACTTCCTCTCTCCTTTTTT
T*GTGTGATTCAGTTACCTTTTATAGTTGGTTTTTGTTTGTTTGCTGTCTTGTTTATATA
ATTGGTGATTTTGTATAAAAAGACATCAAGGTTAAAGATATTATGTATTTT
TTG

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1GC62JQ 648 0 0
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ATTCACAAGGAAGCAGAAGAGAAGAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAAGGGAGAAGAGCTT
CTCAAAGCTGAAGAAATGGCTGCTAAGTATAGAGCCACTGGTGTCGTTCCCAAGGCAACC
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CCTCTCTCCTTTTTTT*GTGTGATTCAGTTACCTTTTATAGTTGGTTTTTGTTTGTTTGC
TGTCTTGTTTATATAATTGGTGATTTTGTATAAAAAGACATCAAGGTT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1H016JQB 755 0 0
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AGAACAGCAAGAAAGCAGCCACTGAAGCTCAACTCAGGAAGATTGAAGAGAAACTAGAGA
AGAAAAAAGCAGAGTATGGTGAGAAGATGAAGAACAAAGTGGCGGCTATTCACAAGGAAG
CAGAAGAGAAGAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAAGGGAGAAGAGCTTCTCAAAGCTGAAG
AAATGGCTGCTAAGTATAGAGCCACTGGTGTCGTTCCCAAGGCAACCTGTGGATGTTTTT
AAGTCTTTTTATTTAATATGTTTCTCATGTCATTGTTTGTAATACTTCCTCTCTCCTTTT
TTT*GTGTGATTCAGTTACCTTTTATAGTTGGTTTTTGTTTGTTTGCTGTCTTGTTTATA
TAATTGGTGATTTTGTATAAAAAGACATCAAGGTT

QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1F913JQ 711 0 0
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GCTCTTACCGTTGTTGAAAAACCCATTGAGGAGCC*ACACCAAAGAAAAGTTCAGCTGGT
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AAAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAGGCTGAGCACAAGGCACAAAAGAAGATATCT
GATGTGCTTGCTTGGGAGAACAGCAAGAAAGCAGCCACTGAAGCTCAACTCAGGAAGATT
GAAGAGAAACTAGAGAAGAAAAAAGCAGAGTATGGTGAGAAGATGAAGAACAAAGTGGCG
GCTATTCACAAGGAAGCAGAAGAGAAGAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAAGGGAGAAGAG
CTTCTCAAAGCTGAAGAAATGGCTGCTAAGTATAGAGCCACTGGTGTCGTTCCCAAGACA
ACCTGTGGATGTTTTTAAGTCTTTTTATTTAATATGTTTCTCATGTCATTGTTTGTAATA
CTTCCTCTCTCCTTTTTTT*GTGTGATTCAGTTACCTTTTATAGTTGGTTTTTGTTTGTT
TGCAGTCTTGTTTATATAATTGGTGATTTTTTATAAAA*TACATCAAGGTTAAAGATATT
ATGTATTTTCTGTAATCGTATGAATCATCAACCATGCTTGATTACGATGTC

QA 1 711 1 711
DS 



AS 4 21

CO CL8Contig1 628 2 3 U
GGGAGAGCTCACGAGAGAGACAGATACAGAGAGAGAAAATGGCGTACAGCGCGTGCTTCC
TACATCAGAGCGCACTGGCCTCTGCCGCCACACGATCATCATCTTCCTCCTCATCCCAGC
GTCACGTTTCACTCTCCAAACCCGTCCAGGTAGTGTGCAAAGCCCAACAGGCTCATGAAG
ACGATAACTCCGCCGTCTCTCGCCGTCTCGCTCTCACACTCCTCGTTGGCAAACAAGCTT
ACTTCGGTGAGACTGCCTCTGAGGGAGGCTTTGACAACAATGCAGTGGCAACAGCAAACA
TTCTGGAGACTAATGTTCAGGACGTTGGTGGGAAACCATACTATTACTTGTCCGTGCTGA
CAAGAACGGCCGATGGAGATGAAGGCGGTAAGCATCAGCTTATCACAGCCACTGTGAATG
GAGGCAAGCTGTACATCTGCAAAGCACAAGCTGGAGACAAGAGGTGGTTCAAGGGAGCCA
ACAAATTTGTGGAGAAAGCAGCCACTTCTTTCAGTGTTGCTTGAATGTAAAAGCAACTCA
AACAGAACATAACAATGCTTTGCTTTCTTTCTTCATTTGTCTCTTTGTAAAAAAAGGATA
ATGAAACTAAGCTTTTGAGAAACCTAAC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1A709JQ C 1
AF RS1A709TF U 1
BS 1 5 RS1A709JQ
BS 6 626 RS1A709TF
BS 627 628 RS1A709JQ

RD RS1A709JQ 628 0 0
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TACATCAGAGCGCACTGGCCTCTGCCGCCACACGATCATCATCTTCCTCCTCATCCCAGC
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CAAGAACGGCCGATGGAGATGAAGGCGGTAAGCATCAGCTTATCACAGCCACTGTGAATG
GAGGCAAGCTGTACATCTGCAAAGCACAAGCTGGAGACAAGAGGTGGTTCAAGGGAGCCA
ACAAATTTGTGGAGAAAGCAGCCACTTCTTTCAGTGTTGCTTGAATGTAAAAGCAACTCA
AACAGAACATAACAATGCTTTGCTTTCTTTCTTCATTTGTCTCTTTGTAAAAAAAGGATA
ATGAAACTAAGCTTTTGAGAAACCTAAC

QA 1 628 1 628
DS 

RD RS1A709TF 628 0 0
GGGAG
AGCTCACGAGAGAGACAGATACAGAGAGAGAAAATGGCGTACAGCGCGTGCTTCCTACAT
CAGAGCGCACTGGCCTCTGCCGCCACACGATCATCATCTTCCTCCTCATCCCAGCGTCAC
GTTTCACTCTCCAAACCCGTCCAGGTAGTGTGCAAAGCCCAACAGGCTCATGAAGACGAT
AACTCCGCCGTCTCTCGCCGTCTCGCTCTCACACTCCTCGTTGGCAAACAAGCTTACTTC
GGTGAGACTGCCTCTGAGGGAGGCTTTGACAACAATGCAGTGGCAACAGCAAACATTCTG
GAGACTAATGTTCAGGACGTTGGTGGGAAACCATACTATTACTTGTCCGTGCTGACAAGA
ACGGCCGATGGAGATGAAGGCGGTAAGCATCAGCTTATCACAGCCACTGTGAATGGAGGC
AAGCTGTACATCTGCAAAGCACAAGCTGGAGACAAGAGGTGGTTCAAGGGAGCCAACAAA
TTTGTGGAGAAAGCAGCCACTTCTTTCAGTGTTGCTTGAATGTAAAAGCAACTCAAACAG
AACATAACAATGCTTTGCTTTCTTTCTTCATTTGTCTCTTTGTAAAAAAAGGATAATGAA
ACTAAGCTTTTGAGAAACCTA
AC

QA 6 626 6 626
DS 



CO CL8Contig2 1084 11 20 U
GGACTTTCATCACAACTTAACCAGCCAGCTCACGAGAGAGACAGATACAGAGAGAGAAAA
TGGCGTACAGCGCGTGCTTCCTACATCAGAGCGCACTGGCCTCTGCCGCCACACGATCAT
CATCTTCCTCCTCATCCCAGCGTTACGTTTCACTCTCCAAGCCCGTCCAGGTAGTGTGCA
AAGCCCAACAGGCTCATGAAGACGATAACTCCGCCGTCTCTCGCCGTCTCGCTCTCACAC
TCCTCGTTGGCGCCGCCGCAGTTGGTTCCAAAGTATCTCCCGCCGATGCTGCCTACGGTG
AAGCTGCAAATGTGTTTGGGAAGCCAAAGAAGAACACAGACTTCACGGCATACAGTGGAG
ATGGGTTCCAAGTGCAGGTGCCAGCTAAATGGAACCCAAGCAGAGAGGTAGAGTATCCAG
GACAAGTCCTTAGGTACGAAGACAACTTCGATGCTACTAGCAACCTCAATGTCATGGTCA
CCCCTACCGACAAGAAGTCCATCACTGATTACGGCTCTCCTGAAGAGTTCCTCTCTCAGG
TCAATTACCTCCTTGGCAAACAAGCTTACTTCGGTGAGACTGCCTCTGAGGGAGGCTTTG
ACAACAATGCAGTGGCAACAGCAAACATTCTGGAGACTAATGTTCAGGACGTTGGTGGGA
AACCATACTATTACTTGTCCGTGCTGACAAGAACGGCCGATGGAGATGAAGGCGGTAAGC
ATCAGCTTATCACAGCCACTGTGAATGGAGGCAAGCTGTACATCTGCAAAGCACAAGCTG
GAGACAAGAGGTGGTTCAAGGGAGCCAACAAATTTGTGGAGAAAGCAGCCACTTCTTTCA
GTGTTGCTTGAATGTAAAAGCAACTCAAACAGAACATAACAATGCTTTGCTTTCTTTCTT
CATTTGTCTCTTTGTAAAAAAAGGATAATGAAACTAAGCTTTTGAGAAACCTATCAAGAT
GATGATGCTATATATCTTTGCGGCTTTACTTGTTTACGTGTGGTAAACAGGACTCTAGCT
TTCTATGCTTGATCAAAAATTTGAATATCATATGTATAATCAATTATCAATGAAACAAAA
AAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 40 40 40 45 45 50 35 50 50 50 50 50 50 0 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 50 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 50 50 50 35 50 10 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

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AF RS1AA26TF U 1
AF RS1BN59TF U 45
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AF RS1C105TF U 374
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RD RS1AA14TF 643 0 0
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AAGCTGCAAATGTGTTTGGGAAGCCAAAGAAGAACACAGACTTCACGGCATACAGTGGAG
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GACAAGTCCTTAGGTACGAAGACAACTTCGATGCTACTAGCAACCTCAATGTCATGGTCA
CCCCTACCGACAAGAAGTCCATCACTGATTACGGCTCTCCTGAAGAGTTCCTCTCTCAGG
TCAATTACCTCCTTGGCAAACAAGCTTACTTCGGTGAGACTGCCTCTGAGGGAGGCTTTG
ACAACAATGCAGTGGCAACAGCAAACATTCTGGAGACTAATGT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RS1H207TF 668 0 0
G
AGAGCTCACGAGAGAGACAGATACAGAGAGAGAAAATGGCGTACAGCGCGTGCTTCCTAC
ATCAGAGCGCACTGGCCTCTGCCGCCACACGATCATCATCTTCCTCCTCATCCCAGCGTT
ACGTTTCACTCTCCAAGCCCGTCCAGGTAGTGTGCAAAGCCCAACAGGCTCATGAAGACG
ATAACTCCGCCGTCTCTCGCCGTCTCGCTCTCACACTCCTCGTTGGCGCCGCTGCAGTTG
GTTCCAAAGTATCTCCCGCCGATGCTGCCTACGGTGAAGCTGCAAATGTGTTTGGGAAGC
CAAAGAAGAACACAGACTTCACGGCATACAGTGGAGATGGGTTCCAAGTGCAGGTGCCAG
CTAAATGGAACCCAAGCAGAGAGGTAGAGTATCCAGGACAAGTCCTTAGGTGCGAAGACA
ACTTCGATGCTACTAGCAACCTCAATGTCATGGTCACCCCTACCGACAAGAAGTCCATCA
CTGATTACGGCTCTCCTGAAGAGTTCCTCTCTCAGGTCAATTACCTCCTTGGGAAACAAG
CTTACTTCGGTGAGACTGCCTCTGAGGGAGGCTTTGACAACAATGCAGTGGCAACAGCAA
ACATTCTGGAGACTAATGTTCAGGACGTTGGTGGGAAACCATACTATTACTTGTCCGTGT
TGACAAG

QA 2 668 2 668
DS 

RD RS1ER92TF 663 0 0
GG
ACAGAGAGAGAAAATGGCGTACAGCGCGTGCTTCCTACATCAGAGCGCACTGGCCTCTGC
CGCCACACGATCATCATCTTCCTCCTCATCCCAGCGTTACGTTTCACTCTCCAAGCCCGT
CCAGGTAGTGTGCAAAGCCCAACAGGCTCATGAAGACGATAACTCCGCCGTCTCTCGCCG
TCTCGCTCTCACACTCCTCGTTGGCGCCGCTGCAGTTGGTTCCAAAGTATCTCCCGCCGA
TGCTGCCTACGGTGAAGCTGCAAATGTGTTTGGGAAGCCAAAGAAGAACACAGACTTCAC
GGCATACAGTGGAGATGGGTTCCAAGTGCAGGTGCCAGCTAAATGGAACCCAAGCAGAGA
GGTAGAGTATCCAGGACAAGTCCTTAGGTACGAAGACAACTTCGATGCTACTAGCAACCT
CAATGTCATGGTCACCCCTACCGACAAGAAGTCCATCACTGATTACGGCTCTCCTGAAGA
GTTCCTCTCTCAGGTCAATTACCTCCTTGGGAAACAAGCTTACTTCGGTGAGACTGCCTC
TGAGGGAGGCTTTGACAACAATGCAGTGGCAACAGCAAACATTCTGGAGACTAATGTTCA
GGACGTTGGTGGGAAACCATACTATTACTTGTCCGTGTTGACAAGAACGGCCGATGGAGA
C

QA 3 663 3 663
DS 

RD RS1AA26TF 798 0 0
GGACTTTCATCACAACTTAACCAGCCAGCTCACGAGAGAGACAGATACAGAGAGAGAAAA
TGGCGTACAGCGCGTGCTTCCTACATCAGAGCGCACTGGCCTCTGCCGCCACACGATCAT
CATCTTCCTCCTCATCCCAGCGTTACTTTTCACTCTCCAAACCCGTCCAGGTAGTGTGCA
AAGCCCAACAGGCTCATGAAGACGATAACTCCGCCGTCTCTCGCCGTCTCGCTCTCACAC
TCCTCGTTGGCGCCGCCGCCGTTGGTTCCAAAGTATCTCCCGCCGATGCTGCCTACGGTG
AAGCTGCAAATGTGTTTGGGAAGCCAAAGAAGAACACAGACTTCACGGCATACAGTGGAG
ATGGGTTCCAAGTGCAGGTGCCAGCTAAATGGAACCCAAGCAGAGAGGCAGAGTATCCAG
GACAAGTCCTTAGGTACGAAGACAACTTCGATGCTACTAGCAACCTCAATGTCATGGTCA
CCCCTACCGACAAGAAGTCCATCACTGATTACGGCTCTCCTGAAGAGTTCCTCTCTCAGG
TCAATTACCTCCTTGGCAAACAAGCTTACTTCGGTGAGACTGCCTCTGAGGGAGGCTTTG
ACAACAATGCAGTGGCAACAGCAAACATTCTGGAGACTAATGTTCAGGACGTTGGTGGGA
AACCATACTATTACTTGTCCGTGCTGACAAGAACGGCCGATGGAGATGAAAGCGGTAAGC
ATCAGCTTATCACAGCCACTGTGAATGGAGGCAAGCTGTACATCTGCAAAGCACAAGCTG
GAGACAAGAGGTGGTTCA

QA 1 798 1 798
DS 

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GG
ACAGAGAGAGAAAATGGCGTACAGCGCGTGCTTCCTACATCAGAGCGCACTGGCCTCTGC
CGCCACACGATCATCATCTTCCTCCTCATCCCAGCGTTACGTTTCACTCTCCAAGCCCGT
CCAGGTAGTGTGCAAAGCCCAACAGGCTCATGAAGACGATAACTCCGCCGTCTCTCGCCG
TCTCGCTCTCACACTCCTCGTTGTCGCCGCTGCAGTTGGTTCCAAAGTATCTCCCGCCGA
TGCTGCCTACGGTGAAGCTGCAAATGTGTTTGGGAAGCCAAAGAAGAACACAGACTTCAC
GGCATACAGTGGAGATGGGTTCCAAGTGCAGGTGCCAGCTAAATGGAACCCAAGCAGAGA
GGTAGAGTATCCAGGACAAGTCCTTAGGTACGAAGACAACTTCGATGCTACTAGCAACCT
CAATGTCATGGTCACCCCTACCGACAAGAAGTCCATCACTGATTACGGCTCTCCTGAAGA
GTTCCTCTCTCAGGTCAATTACCTCCTTGGGAAACAAGCTTACTTCGGTGAGACTGCCTC
TGAGGGAGGCTTTGACAACAATGCAGTGGCAACAGCAAACATTCTGGATACTAATGTTCA
GGACGTTGGTGTGAAACCATACTATTACTTGTCCGTGTTGACAAGAACGGCCGATGGAGA
CGAAGGAGGTAAGCATCAGCTGATCACAGCCACCGTGAATGGAGGCAAGCTGTACATCTG
CAAAGCACAAGCTGGAGACAAGAGGTGGTTCAAGGGAGCCAACAAATTTGTCGAGAAAGC
AGCCACTTCTT

QA 3 793 3 793
DS 

RD RS1AA14JQ 709 0 0
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CTGCAAATGTGTTTGGGAAGCCAAAGAAGAACACAGACTTCACGGCATACAGTGGAGATG
GGTTCCAAGTGCAGGTGCCAGCTAAATGGAACCCAAGCAGAGAGGCAGAGTATCCAGGAC
AAGTCCTTAGGTACGAAGACAACTTCGATGCTACTAGCAACCTCAATGTCATGGTCACCC
CTACCGACAAGAAGTCCATCACTGATTACGGCTCTCCTGAAGAGTTCCTCTCTCAGGTCA
ATTACCTCCTTGGCAAACAAGCTTACTTCGGTGAGACTGCCTCTGAGGGAGGCTTTGACA
ACAATGCAGTGGCAACAGCAAACATTCTGGAGACTAATGTTCAGGACGTTGGTGGGAAAC
CATACTATTACTTGTCCGTGCTGACAAGAACGGCCGATGGAGATGAAGGCGGTAAGCATC
AGCTTATCACAGCCACTGTGAATGGAGGCAAGCTGTACATCTGCAAAGCACAAGCTGGAG
ACAAGAGGTGGTTCAAGGGAGCCAACAAATTTGTGGAGAAAGCAGCCACTTCTTTCAGTG
TTGCTTGAATGTAAAAGCAACTCAAACAGAACATAACAATGCTTTGCTTTCTTTCTTCAT
TTGTCTCTTTGTAAAAAAAGGATAATGAAATTAAGCTTTTGAGAAACC
C

QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1H207JQB 321 0 0
GGAGGCTTTGACAACAATGCAGTGGCAACAGCAAACATTCTGGAGATTAATGTTCAGGAC
GTTGGTGGGAAACCATACTATTACTTGTCCGTGTTGACAAGAACGGCCGATGGAGACGAA
GGAGGTAAGCATCAGCTGATCACAGCCACCGTGAATGGAGGCAAGCTGTACATCTGCAAA
GCACAAGCTGGAGACAAGAGGTGGTTCAAGGGAGCCAACAAATTTGTCGAGAAAGCAGCC
ACTTCTTTCAGTGTTGCTTGAATGTAAAAGCAACTCAAACAGAACAGAACAATGCTTTGC
TTTCTTTCTTCATTTGTCTCT

QA 1 321 1 321
DS 

RD RS1AA26JQ 708 0 0
GGCGCCGCCGCCGTTGGTTCCAAAGTATCTCCCGCCGATGCTGCTTACGGTGAAGCTGCA
AATGTGTTTGGGAAGCCAAAGAAGAACACAGACTTCACGGCATACAGTGGAGATGGGTTC
CAAGTGCAGGTGCCAGCTAAATGGAACCCAAGCAGAGAGGCAGAGTATCCAGGACAAGTC
CTTAGGTACGAAGACAACTTCGATGCTACTAGCAACCTCAATGTCATGGTCACCCCTACC
GACAAGAAGTCCATCACTGATTACGGCTCTCCTGAAGAGTTCCTCTCTCAGGTCAATTAC
CTCCTTGGCAAACAAGCTTACTTCGGTGAGACTGCCTCTGAGGGAGGCTTTGACAACAAT
GCAGTGGCAACAGCAAACATTCTGGAGACTAATGTTCAGGACGTTGGTGGGAAACCATAC
TATTACTTGTCCGTGCTGACAAGAACGGCCGATGGAGATGAAGGCGGTAAGCATCAGCTT
ATCACAGCCACTGTGAATGGAGGCAAGCTGTACATCTGCAAAGCACAAGCTGGAGACAAG
AGGTGGTTCAAGGGAGCCAACAAATTTGTGGAGAAAGCAGCCACTTCTTTCAGTGTTGCT
TGAATGTAAAAGCAACTCAAACAGAACATAACAATGCTTTGCTTTCTTTCTTCATTTGTC
TCTTTGTAAAAAAAGGATAATGAAATTAAGCTTTTGAGAAACC
CAAAA

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1A730JQ 728 0 0
TTGGCGCCGCTGCAGTTGGTTCCAAAGTATCTCCCGCCGATGCTGCCTACGGTGAAGCTG
CAAATGTGTTTGGGAAGCCAAAGAAGAACACAGACTTCACGGCATACAGTGGAGATGGGT
TCCAAGTGCAGGTGCCAGCTAAATGGAACCCAAGCAGAGAGGTAGAGTATCCAGGACAAG
TCCTTAGGTACGAAGACAACTTCGATGCTACTAGCAACCTCAATGTCATGGTCACCCCTA
CCGACAAGAAGTCCATCACTGATTACGGCTCTCCTGAAGAGTTCCTCTCTCAGGTCAATT
ACCTCCTTGGGAAACAAGCTTACTTCGGTGAGACTGCCTCTGAGGGAGGCTTTGACAACA
ATGCAGTGGCAACAGCAAACATTCTGGAGACTAATGTTCAGGACGTTGGTGGGAAACCAT
ACTATTACTTGTCCGTGTTGACAAGAACGGCCGATGGAGACGAAGGAGGTAAGCATCAGC
TGATCACAGCCACCGTGAATGGAGGCAAGCTGTACATCTGCAAAGCACAAGCTGGAGACA
AGAGGTGGTTCAAGGGAGCCAACAAATTTGTCGAGAAAGCAGCCACTTCTTTCAGTGTTG
CTTGAATGTAAAAGCAACTCAAACAGAACAGAACAATGCTTTGCTTTCTTTCTTCATTTG
TCTCTTTGTAAAAAAAGGATAATGAAACTAAGCTTTTGAGAGACCTATCAAGATGATGAT
G
GTGCTAC

QA 1 721 1 721
DS 

RD RS1C105JQ 699 0 0
GCAGGTGCCAGCTAAATGGAACCCAAGCAGAGAGGTAGAGTATCCAGGACAAGTCCTTAG
GTACGAAGACAACTTCGATGCTACTAGCAACCTCAATGTCATGGTCACCCCTACCGACAA
GAAGTCCATCACTGATTACGGCTCTCCTGAAGAGTTCCTCTCTCAGGTCAATTACCTCCT
TGGCAAACAAGCTTACTTCGGTGAGACTGCCTCTGAGGGAGGCTTTGACAACAATGCAGT
GGCAACAGCAAACATTCTGGAGACTAATGTTCAGGACGTTGGTGGGAAACCATACTATTA
CTTGTCCGTGCTGACAAGTACGGCCGATGGAGATGAAGGCGGTAAGCATCAGCTTATCAC
AGCCACTGTGAATGGAGGCAAGCTGTACATCTGCAAAGCACAAGCTGGAGACAAGAGGTG
GTTCAAGGGAGCCAACAAATTTGTGGAGAAAGCAGCCACTTCTTTCAGTGTTGCTTGAAT
GTAAAAGCAACTCAAACAGAACATAACAATGCTGTGCTTTCTTTCTTCATTTGTCTCTTT
GTAAAAAAAGGATAATGAAACTAAGCTTTTGAGAAACCTATCAAGATGATGATGCTATAT
ATCTTTGCGGCTTTACTTGTTTACGTGTGGTAAACAGGACTCTAGCTTTCTATGCTTGAT
CAAAAATTTGAATATCATATGTATAATCAATTATCAATG

QA 1 699 1 699
DS 

RD RS1C105TF 711 0 0
GCAGGTGCCAGCTAAATGGAACCCAAGCAGAGAGGTAGAGTATCCAGGACAAGTCCTTAG
GTACGAAGACAACTTCGATGCTACTAGCAACCTCAATGTCATGGTCACCCCTACCGACAA
GAAGTCCATCACTGATTACGGCTCTCCTGAAGAGTTCCTCTCTCAGGTCAATTACCTCCT
TGGCAAACAAGCTTACTTCGGTGAGACTGCCTCTGAGGGAGGCTTTGACAACAATGCAGT
GGCAACAGCAAACATTCTGGAGACTAATGTTCAGGACGTTGGTGGGAAACCATACTATTA
CTTGTCCGTGCTGACAAGTACGGCCGATGGAGATGAAGGCGGTAAGCATCAGCTTATCAC
AGCCACTGTGAATGGAGGCAAGCTGTACATCTGCAAAGCACAAGCTGGAGACAAGAGGTG
GTTCAAGGGAGCCAACAAATTTGTGGAGAAAGCAGCCACTTCTTTCAGTGTTGCTTGAAT
GTAAAAGCAACTCAAACAGAACATAACAATGCTGTGCTTTCTTTCTTCATTTGTCTCTTT
GTAAAAAAAGGATAATGAAACTAAGCTTTTGAGAAACCTATCAAGATGATGATGCTATAT
ATCTTTGCGGCTTTACTTGTTTACGTGTGGTAAACAGGACTCTAGCTTTCTATGCTTGAT
CAAAA*TTTGAATATCATATGTATAATCAATTATCAATGAAACAAAAAAAA

QA 1 711 1 711
DS 



CO CL8Contig3 846 4 12 U
GACTATTAATTAATAATATCATTATTGCAAATGAGTTCTGTTATCACAGGTACACAGGTG
AAGCTTCCTAGGTAGCATCATTATCTATATAGTTCTCAAAAGCTTAGTTTCAAAAGAAAA
ACAGAGGACTCTTCTGTTGCGTTGCTTTTCAATTTAAGCAACACTGAAAGAAGTGGCTGC
TTTCTCAACAAACTT*ATTGGCTCCCTTGAACCACCTCTTGTCTCCAGCTTGCGATTTGC
AGATATATAGCTTCCCTCC*ATTCACAGTGGCTGTGATCAGCTGATGCTTACCACCTTCA
TCTCCATCTGCTGTTCTTGTCAACACTGACAA*GTAATAGTATGGCTTCCCACCAACGTC
CTGAATCTTTGTGTCCAGAA*TGTTTGCTGTCGCCACTGCATTGTTGTCAAAA*CCTCCC
TCAGAGGCAGTCTCACCAAAGTAAGCTTGTTTACCTAGGAGATAGTTGACCTGAGAGAGG
AACTCTTCAGGGGAACCGTAGTCAGTGATGGACTTCTTGTCAGTAGGAGTGACCATGACA
TTGAGATTGCTAGTAGCGTCAAAGTTGTCTTCGTACCTAAGGACTTGTCCTGGATACTCT
ACCTCTCTGCTTGGGTTCCATTTAGCTGGCACCTGCACAATGAATCCATCTCCACTGTAT
GCAGTGAAGTCTGTGTTCTTCTTTGGCTTCCCAAACACATTAGCAGCTTCACCGTAGGCT
GCTTCAGCGGGAGACACTTTGGAACCGAGGGCGGCGGCGCCAACGAGGAGTGTGAGAGCT
AGACGGCGAGAGACAGTGGAGTTATCCTCTTCATGGTGTTGTTGGGCTTTACAGACTATC
TGGAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1BN32JQ U 150
AF RS1AH08TF C 175
AF RS1CC12JQ U 1
AF RS1BN32TF C 220
BS 1 234 RS1CC12JQ
BS 235 235 RS1BN32JQ
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BS 703 713 RS1CC12JQ
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RD RS1BN32JQ 271 0 0
CAATTT
AAGCAACACTGAAAGAAGTGGCTGCTTTCTCAACAAACTT*ATTGGCTCCCTTGAACCAC
CTCTTGTCTCCAGCTTGCGATTTGCAGATATATAGCTTCCCTCC*ATTCACGGTGGCTGT
GATCAGCTGAAGCTTACCACCTTCGTCTCCATCTGCTGTTCTTGTCAACACTGACAA*GT
AATAGTATGGCTTCCCACCAACGTCCTGAATCTTTGTGTCCAGAA*TGTTTGCTGTCCCC
ACTGCATTGTTGTCAAAA*CCTCCC

QA 7 271 7 271
DS 

RD RS1AH08TF 275 0 0
GGCTGCTTTCTCAACAAACTTTATTGGCTCCCTTGAACCACCTCTTGTCTCCAGCTTGCG
CTTTGCAGATATATAGCTTCCCTCCCATTCACAGTGGCTGTGGTCAGCTGATGCTTACCA
CCTTCATCTCCATCTGCTGTTCTTGTCAACACTGACAAAGTAATAGTATGGCTTCCCACC
AACGTCCTGAATGTTTGTGTCCAGAAATGTTTGCTGTCGCCACTGCATTGTTGTCAAAAA
CCTCCCTCAGAGGCAGTCTCA
AACAAAAGTAAGCT

QA 1 261 1 261
DS 

RD RS1CC12JQ 713 0 0
GACTATTAATTAATAATATCATTATTGCAAATGAGTTCTGTTATCACAGGTACACAGGTG
AAGCTTCCTAGGTAGCATCATTATCTATATAGTTCTCAAAAGCTTAGTTTCAAAAGAAAA
ACAGAGGACTCTTCTGTTGCGTTGCTTTTCAATTTAAGCAACACTGAAAGAAGTGGCTGC
TTTCTCAACAAACTT*ATTGGCTCCCTTGAACCACCTCTTGTCTCCAGCTTGCGCTTTGC
AGATATATAGCTTCCCTCC*ATTCACAGTGGCTGTGATCAGCTGATGCTTACCACCTTCA
TCTCCATCTGCTGTTCTTGTCAACACTGACAA*GTAATAGTATGGCTTCCCACCAACGTC
CTGAATGTTTGTGTCCAGAA*TGTTTGCTGTCGCCACTGCATTGTTGTCAAAA*CCTCCC
TCAGAGGCAGTCTCACCAAAGTAAGCTTGTTTACCTAGGAGATAGTTGACCTGAGAGAGG
AACTCTTCAGGGGAACCGTAGTCAGTGATGGACTTCTTGTCAGTAGGAGTGACCATGACA
TTGAGATTGCTAGTGGCGTCAAAGTTGTCTTCGTACCTAAGGACTTGTCCTGGATACTCT
ACCTCTCTGCTTGGGTTCCATTTAGCTGGCACCTGCACAATGAATCCATCTCCACTGTAT
GCCGTGAAGTCTGTGTTCTTCTTTGGCTTCCCAAACACATTTGCAGCTTCACC

QA 1 713 1 713
DS 

RD RS1BN32TF 627 0 0
TGTCTCCAGCTTGCGATTTGCAGATATATAGCTTCCCTCC*ATTCACGGTGGCTGTGATC
AGCTGATGCTTACCACCTTCGTCTCCATCTGCTGTTCTTGTCAACACTGACAA*GTAATA
GTATGGCTTCCCACCAACGTCCTGAATCTTTGTGTCCAGAA*TGTTTGCTGTCGCCACTG
CATTGTTGTCAAAA*CCTCCCTCAGAGGCAGTCTCACCAAAGTAAGCTTGTTTACCTAGG
AGATAGTTGACCTGAGAGAGGAACTCTTCAGGGGAACCGTAGTCAGTGATGGACTTCTTG
TCAGTAGGAGTGACCATGACATTGAGATTGCTGGTAGCGTCAAAGTTGTCTTCGTACCTA
AGGACTTGTCCTGGATACTCTACCTCTCTGCTTGGGTTCCATTTAGCTGGCACCTGCACA
ATGAATCCATCTCCACTGTATGCAGTGAAGTCTGTGTTCTTCTTTGGCTTCCCAAACACA
TTAGCAGCTTCACCGTAGGCTGCTTCAGCGGGAGACACTTTGGAACCGAGGGCGGCGGCG
CCAACGAGGAGTGTGAGAGCTAGACGGCGAGAGACAGTGGAGTTATCCTCTTCATGGTGT
TGTTGGGCTTTACAGACTATCTGGAAG

QA 1 627 1 627
DS 



CO CL8Contig4 940 4 20 U
GGACACACACTTTCATCATATAACTTCAACCAAACACAGATCGCTTAAGAGACAGAGAAG
ATGGCGTACAGCGCGTGTTTCCTACATCAAAGCGCACTAGCCTCCTCCTCCGCCGCGAGA
TCATCACCTTCCTCATCATCTCAGCGCTACGTGTCACTCTCTAAACTAGTGTGTAAAGCA
CAACAGACTCACGAAAACGATACCTCCGCCGTCTCTCGCCGTCTCGCTCTCACACTCCTC
GTCGGCGCCGCTGCGGTTGGTTCGAAAGTGTCTCCAGCCGATGCTGCCTACGGTGAAGCT
GCAAATGTGTTTGGGAAGCCAAAGCAAAACACAGACTTCACGGCGTACAGTGGAGACGGA
TTCCAAGTGCAGGTGCCAGCTAAGTGGAACCCA*GCAGAGAGGTTGAGTATCCAGGACAA
GTCCTTAGGTATGAAGACAACTTTGACGCTACTAGCAACCTCAATGTCATGGTCACTCCT
ACTGATAAGAAGTCCATCACTGATTACGGTTCTCCTGAAGAGTTCCTCTCTCAGGTCAAT
TACCTTCTAGGGAAACAAGCTTACTTCGGTGAGACTGCCTCTGAGGG*AGGGTTTGACAA
CAATGCAGTGGCAACAGCAAACATTCTGGAGACGAATATTCAGGACGTTGGTGGGAAAAC
CATACTATTACTTGTCTGTGTTGACGAGAACAGCCGATGGAGACGAAGGTGGTAAGCATC
AGCTGATCACAGCCACCGTGAATGGAGGCAAGCTTTATATCTGCAAAGCACAAGCTGGAG
ACAAGAGGTGGTTCAAGGGAGCCAATAAATTCGTCGAGAAAGCAGCCACTTCTTTCAGTG
TTGCTTGATTTTAAAAGCTGCACAACTATATGCTCTGCTTGCTTCTTATCTCCATTTGCG
TCTTGTAAAAAAATTGGAAAATGAAAACTTAGCTTTTGGC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EB63TF U 24
AF RS1BH12TF U 3
AF RS1DS26TF U 1
AF RS1BH12JQ C 316
BS 1 180 RS1DS26TF
BS 181 181 RS1EB63TF
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BS 460 485 RS1DS26TF
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RD RS1EB63TF 616 0 0
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TCCTGGAGACGA
TATT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RS1BH12TF 637 0 0
GG
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GCGCCGCTGCGGTTGGTTCGAAAGTGTCTCCAGCCGATGCTGCCTACGGTGAAGCTGCAA
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GCAGTGGCAACAGCAAACATTCTGGAGACGAATAT

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DS 

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ATGGCGTACAGCGCGTGTTTCCTACATCAAAGCGCACTAGCCTCCTCCTCCGCCGCGAGA
TCATCACCTTCCTCATCATCTCAGCGCTACGTGTCACTCTCTAAACTAGTGTGTAAAGCA
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GTCGGCGCCGCTGCGGTTGGTTCGAAAGTGTCTCCAGCCGATGCTGCCTACGGTGAAGCT
GCAAATGTGTTTGGGAAGCCAAAGCAAAACACAGACTTCACGGCGTACAGTGGAGACGGA
TTCCAAGTGCAGGTGCCAGCTAAGTGGAACCCAAGCAGAGAGGTTGAGTATCCAGGACAA
GTCCTTAGATATGAAGACAACTTTGA*GCTACTAGCAATCTCAATGTCATGGTCACTCCT
ACTGACAAGAAGTCCATCACTGATTACGGTTCCCCTGAAGAGTTCCTCTCTCAGGTCAAT
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CATACTATTACTTGTCTGTGTTGACGAGAACAGCCGATGGAGAC

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DS 

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CCAGCTAAGTGGAACCCA*GCAGAGAGGTTGAGTATCCAGGACAAGTCCTTAGGTATGAA
GACAACTTTGACGCTACTAGCAACCTCAATGTCATGGTCACTCCTACTGATAAGAAGTCC
ATCACTGATTACGGTTCTCCTGAAGAGTTCCTCTCTCAGGTCAATTACCTTCTAGGGAAA
CAAGCTTACTTCGGTGAGACTGCCTCTGAGGG*AGGGTTTGACAACAATGCAGTGGCAAC
AGCAAACATTCTGGAGACGAATATTCAGGACGTTGGTGGGAAAACCATACTATTACTTGT
CTGTGTTGACGAGAACAGCCGATGGAGACGAAGGTGGTAAGCATCAGCTGATCACAGCCA
CCGTGAATGGAGGCAAGCTTTATATCTGCAAAGCACAAGCTGGAGACAAGAGGTGGTTCA
AGGGAGCCAATAAATTCGTCGAGAAAGCAGCCACTTCTTTCAGTGTTGCTTGATTTTAAA
AGCTGCACAACTATATGCTCTGCTTGCTTCTTATCTCCATTTGCGTCTTGTAAAAAAATT
GGAAAATGAAAACTTAGCTTTTGGC

QA 1 625 1 625
DS 



AS 3 21

CO CL9Contig1 753 5 4 U
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CTGGTCGGAAGCACTACAAAAAGAGGATAGAGCGAACAAGCAAAATTATAGAGATATGTA
ATAATTCAAGTGCGGTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTGGTCGCTCGCTCTTTTGTCTTAAG
AAGAAGCAGCAGCTACTTTCTCTTCAGCGGCGGCTTCGAAAGTCTCACCAGCTACAAGAT
CCGGGACATCATCATCGTCCTCATCATCCTCTTGAATGGTTGCTGGGACATTACCTCCAC
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GCTAACAACCCATGTGTTTGCACCAACTGCAGCTTGAACCTTAGGGTTGATGAACTGAAT
AACAACATCATCCTTGAAGATGTTAACTTCTTCAATAGCTGGAATAGAGTTAACTCCAAT
TCTCTTGAGAGTGCTTTGGAGCTTCTTGTCATCAGTAGTATTAGTCTTGTGCACAGCCTT
CTTCTTTCTTCTAACAGTACCCTTTCCGCCAGTGCGGACAGTGTTAGCCATCTTCATCAA
CTTCTCACGATTCATCTTGAGATTTGATTATTAGGGTTCTGGTTTCTTCAGAGAGAGTGG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1AF62TF C 327
AF RS1DS29JQ U 22
AF RS1C146TF C 1
AF RS1AF62JQ U 8
AF RS1C146JQ U 8
BS 1 11 RS1C146TF
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RD RS1AF62TF 321 0 0
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GATATCTTCCAAATTTTTTGGTCTGAGGAGAACCGCTAACAACCCATGTGTTTGCACCAA
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TGTCATCAGTAGTATTAGTCTTGTGCACAGCCTTCTTCTTTCTTCTAACAGTACCCTTTC
CGCCAGTGCGGACAGTGTTAG

QA 1 321 1 321
DS 

RD RS1DS29JQ 647 0 0
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AGAGGATAGAGCGAACAAGCAAAATTATAAAGATATGTAATAATTCAAGTGCGGTTTTGT
TGTTGTTGTTGTTGTGGTCTCTCGCTCTTTTGTCTTAAGAAGAAGCAGCAGCTACTTTCT
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CATCATCCTCTTGAACGGTTGCTGGGACATTACCTCCACCAGGAGATTGCTTCTTGAACT
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GGAAGGATATCTTCCAA*TTTTTTGGTCTGAGGAGAACCGCTAACAACCCATGTGTTTGC
ACCAACTGCAGCTTGAACCTTAGGGTTGATGAACTGAATAACAACATCATCCTTGAAGAT
GTTAACTTCTTCAATAGCTGGAATGGAGTTAACTCCAATTCTCTTTAAGGTGCTTTGGAG
CTTCTTGTCATCAGTAGTATTAGTCTTGTGCACAGCCTTCTTCTTTCTTCTAACTGTGCC
CTTTCCGCCAGTGCGGACAGTGTTAGCCATCTTCATCAACTTCTC
CC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1C146TF 753 0 0
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CTGGTCGGAAGCACTACAAAAAGAGGATAGAGCGAACAAGCAAAATTATAGAGATATGTA
ATAATTCAAGTGCGGTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTGGTCGCTCGCTCTTTTGTCTTAAG
AAGAAGCAGCAGCTACTTTCTCTTCAGCGGCGGCTTCGAAAGTCTCACCAGCTACAAGAT
CCGGGACATCATCATCGTCCTCATCATCCTCTTGAATGGTTGCTGGGACATTACCTCCAC
CAGGAGATTGCTTCTTGAACTGCTCTGCTAGCTTCTTCAGGTTCTCCATGTTGTCTGGTC
CGAGATGGCTGAGAA*TCTGAGGAAGGATATCTTCCAA*TTTTTTGGTCTGAGGAGAACC
GCTAACAACCCATGTGTTTGCACCAACTGCAGCTTGAACCTTAGGGTTGATGAACTGAAT
AACAACATCATCCTTGAAGATGTTAACTTCTTCAATAGCTGGAATAGAGTTAACTCCAAT
TCTCTTGAGAGTGCTTTGGAGCTTCTTGTCATCAGTAGTATTAGTCTTGTGCACAGCCTT
CTTCTTTCTTCTAACAGTACCCTTTCCGCCAGTGCGGACAGTGTTAGCCATCTTCATCAA
CTTCTCACGATTCATCTTGAGATTTGATTATTAGGGTTCTGGTTTCTTCAGAGAGAGTGG
TAAGGAGATAACAAGTGACTGACTAGAGACGCC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1AF62JQ 746 0 0
GAAG
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CACTACAAAAAGAGGATAGAGCGAACAAGCAAAATTATAGAGATATGTAATAATTCAAGT
GCGGTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTGGTCGCTCGCTCTTTTGTCTTAAGAAGAAGCAGCA
GCTACTTTCTCTTCAGCGGCGGCTTCGAAAGTCTCACCAGCTACAAGATCCGGGACATCA
TCATCGTCCTCATCATCCTCTTGAATGGTTGCTGGGACATTACCTCCACCAGGAGATTGC
TTCTTGAACTGCTCTGCTAGCTTCTTCAGGTTCTCCATGTTGTCTGGTCCGAGATGGCTG
AAAA*TCTGAGGAAGGATATCTTCCAA*TTTTTTGGTCTGAGGAGAACCGCTAACAACCC
ATGTGTTTGCACCAACTGCAGCTTGAACCTTAGGGTTGATGAACTGAATAACAACATCAT
CCTTGAAGATGTTAACTTCTTCAATAGCTGGAATAGAGTTAACTCCAATTCTCTTGAGAG
TGCTTTGGAGCTTCTTGTCATCAGTAGTATTAGTCTTGTGCACAGCCTTCTTCTTTCTTC
TAACAGTACCCTTTCCGCCAGTGCGGACAGTGTTAGCCATCTTCATCAACTTCTCACGAT
TCATCTTGAGATTTGATTATTAGGGTTCTGGTTTCTTCAGAGAGAGTGGTAAGGAGATAA
CAAGTGACTGACTAGAGACGCC

QA 5 746 5 746
DS 

RD RS1C146JQ 746 0 0
GAAG
CAGATCAACTAGATATAAAACCTTAAATCATTATCTGGGAAACAAGAATCTGGTCGGAAG
CACTACAAAAAGAGGATAGAGCGAACAAGCAAAATTATAGAGATATGTAATAATTCAAGT
GCGGTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTGGTCGCTCGCTCTTTTGTCTTAAGAAGAAGCAGCA
GCTACTTTCTCTTCAGCGGCGGCTTCGAAAGTCTCACCAGCTACAAGATCCGGGACATCA
TCATCGTCCTCATCATCCTCTTGAATGGTTGCTGGGACATTACCTCCACCAGGAGATTGC
TTCTTGAACTGCTCTGCTAGCTTCTTCAGGTTCTCCATGTTGTCTGGTCCGAGATGGCTG
AAAA*TCTGAGGAAGGATATCTTCCAA*TTTTTTGGTCTGAGGAGAACCGCTAACAACCC
ATGTGTTTGCACCAACTGCAGCTTGAACCTTAGGGTTGATGAACTGAATAACAACATCAT
CCTTGAAGATGTTAACTTCTTCAATAGCTGGAATAGAGTTAACTCCAATTCTCTTGAGAG
TGCTTTGGAGCTTCTTGTCATCAGTAGTATTAGTCTTGTGCACAGCCTTCTTCTTTCTTC
TAACAGTACCCTTTCCGCCAGTGCGGACAGTGTTAGCCATCTTCATCAACTTCTCACGAT
TCATCTTGAGATTTGATTATTAGGGTTCTGGTTTCTTCAGAGAGAGTGGTAAGGAGATAA
CAAGTGACTGACTAGAGACGCC

QA 5 746 5 746
DS 



CO CL9Contig2 755 9 6 U
GGGCCCGCGTCTCTCTTCACTTGTTATCTTCTTTCCACTCCTTCGAAGGAAAACAGAAAC
CCTAATCATCAAATCTCAAGATGAATCGTGAGAAGTTGATGAAGATGGCTAACACTGTCC
GC*ACTGGCGGAAAGGGTACAGTTAGAAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGACCAATACA
ACTGATGACAAGAAGCTCCAAAGCACCTTGAAGAGGATTGGAGTTAACTCCATTCCTGGG
ATTGAAGAAGTTAACATCTTCAAGGATGATGTTGTTATTCAGTTCACCAACCCCAAGGTG
CAAGCTGCAGTTGGTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAA*TT
GGAAGATATTCTTCCTCAGATTCTCAGCCATCTCGGACCAGACAACATGGAGAATCTGAA
GAAGCTAGCAGAGCAGTTCAAGAAGCAATCTCCTGGTGGAGGTAATGTCCCCGCAACCAT
TCAAGAGGATGATGAGGACGATGATGACGTCCCGGATCTTGTAGCTGGTGAGACTTTCGA
AGCTGCTGCTGAAGAGAAAGTACCTGCTGCTGCTGCTTCTTCTTAAGACAGAAGAGCGAG
AGACCACAACAGCAACAACCAAAACCGTACTTTAATTATTTCATATCTTTATAATTGCTT
GTTCGCTCTATCCTCTTTTTTGTAGTGTTTCCGACCGGATTCTTGTTTCCCAGATAATGA
TTTAAGGTTTTTATCTATTTGATCTGTTTCTCCAA


BQ
10 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 30 45 45 15 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 
40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 

AF RS1DR48TF U 2
AF RS1F450TF U 1
AF RS1FT23TF U 5
AF RS1DF13TF U 1
AF RS1FT23JQ C 5
AF RS1F450JQ C 1
AF RS1DR48JQ C 74
AF RS1B479TF U 2
AF RS1B479JQ C 87
BS 1 286 RS1DF13TF
BS 287 287 RS1FT23TF
BS 288 357 RS1DF13TF
BS 358 358 RS1FT23TF
BS 359 735 RS1DF13TF
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RD RS1DR48TF 581 0 0
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AAGCTAGCAGAGCAGTTCAAGAAGCAATCTCCTGGTGGAGGTAATTTCCCCGCAACCATT
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GCTGCTGCTGAAGAGAAAGTACCTGCTGCTGCTGCTTCTTC

QA 1 581 1 581
DS 

RD RS1F450TF 611 0 0
G
GGCCCGCGTCTCTCTTCACTTGTTATCTTCTTTCCACTCCTTCGAAGGAAAACAGAAACC
CTAATCATCAAATCTCAAGATGAATCGTGAGAAGTTGATGAAGATGGCTAACACTGTCCG
C*ACTGGCGGAAAGGGTACAGTTAGAAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGACCAATACAA
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AAGCTGCAGTTGGTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAA*TTG
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GACCACA
CAG

QA 2 608 2 608
DS 

RD RS1FT23TF 681 0 0
GG
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TCTATCCTCTTTTTTGTA
T

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DS 

RD RS1DF13TF 744 0 0
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CCTAATCATCAAATCTCAAGATGAATCGTGAGAAGTTGATGAAGATGGCTAACACTGTCC
GC*ACTGGCGGAAAGGGTACAGTTAGAAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGACCAATACA
ACTGATGACAAGAAGCTCCAAAGCACCTTGAAGAGGATTGGAGTTAACTCCATTCCTGGG
ATTGAAGAAGTTAACATCTTCAAGGATGATGTTGTTATTCAGTTCATCAACCCCAAGGTG
CAAGCTGCAGTTGGTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAAATT
GGAAGATATTCTTCCTCAGATTCTCAGCCATCTCGGACCAGACAACATGGAGAATCTGAA
GAAGCTAGCAGAGCAGTTCAAGAAGCAATCTCCTGGTGGAGGTAATGTCCCCGCAACCAT
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GTTCGCTCTATCCTCTTTTTTGTAGTGTTTCCGACCGGATTCTTGTTTCCCAGATAATGA
TTTAAGGTTTTTATCC
AAAAAAAA

QA 1 736 1 736
DS 

RD RS1FT23JQ 733 0 0
GG
GCGTCTCTCTTCACTTGTTATCTTCTTTCCACTCCTTCGAAGGAAAACAGAGACCCTAAT
CATCAAATCTCAAGATGAATCGTGAGAAGTTGATGAAGATGGCTAACACTTTCCGC*ACT
GGCGGAAAGGGTACAGTTAGAAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGACCAATACCACTGAT
GACAAGAAGCTCCAAAGCACCTTGAAGAGGATTGGAGTTAACTCCATTCCTGGGATTGAA
GAAGTTAACATCTTCAAGGATGATGTTGTTATTCAGTTCACCAACCCCAAGGTGCAAGCT
GCAGTTGGTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAA*TTGGAAGA
TATTCTTCCTCAGATTCTCAGCCATCTCGGACCAGACAACATGGAGAATCTGAAGAAGCT
AGCGGAGCAGTTCAAGAAGCAATCTCCTGGTGGAGGTAATGTCCCCGCAACCATTCAAGA
GGATGATGAGGACGATGATGACGTCCCGGATCTTGTAGCTGGTGAGACTTTCGAAGCTGC
TGCTGAAGAGAAAGTACCTGCTGCTGCTGCTTCTTCTTAAGACAGAAGAGCGAGAGACCA
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GTTTTTATC
CG

QA 3 731 3 731
DS 

RD RS1F450JQ 755 0 0
G
GGCCCGCGTCTCTCTTCACTTGTTATCTTCTTTCCACTCCTTCGAAGGAAAACAGAAACC
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C*ACTGGCGGAAAGGGTACAGTTAGAAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGACCAATACAA
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AAGCTGCAGTTGGTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAA*TTG
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AAGCTAGCAGAGCAGTTCAAGAAGCAATCTCCTGGTGGAGGTAATGTCCCCGCAACCATT
CAAGAGGATGATGAGGACGATGATGACGTCCCGGATCTTGTAGCTGGTGAGACTTTCGAA
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GACCACAACAGCAACAACCAAAACCGTACTTTAATTATTTCATATCTTTATAATTGCTTG
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TTAAGGTTTTTATCTATTTGATCTGTTTCT
TCAC

QA 2 751 2 751
DS 

RD RS1DR48JQ 680 0 0
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AGCTCCAAAGCACCTTGAAGAGGATTGGAGTTAACTCCATTCCTGGGATTGAAGAAGTTA
ACATCTTCAAGGATGATGTTGTTATTCAGTTCACCAACCCCAAGGTGCAAGCTGCAGTTG
GTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAA*TTGGAAGATATTCTT
CCTCAGATTTTCAGCCATCTCGGACCAGACAACATGGAGAATCTGAAGAAGCTAGCAGAG
CAGTTCAAGAAGCAATCTCCTGGTGGAGGTAATTTCCCCGCAACCATTCAAGAGGATGAT
GAGGACGATGATGACGTCCCGGATCTTGTAGCTGGTGAGACTTTCGAAGCTGCTGCTGAA
GAGAAAGTACCTGCTGCTGCTGCTTCTTCTTAAGACAGAAGAGCGAGAGACCACAACAGC
AGCAACCAAAACCGTACTTTAATTATTTCATATCTTTATAATTGCTTGTTCGCTCTATCC
TCTTTTTTGTAGTGTTTCCGACCGGATTCTTGTTTCCCAGATAATGATTTAAGGTTTTTA
TCTATTTGATCTGTTTCT
TC

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1B479TF 754 0 0
GGCCCGCGTCTCTCTTCACTTGTTATCTTCTTTCCACTCCTTCGAAGGAATA**GAAACC
CTAATCATCAAATCTCAAGATGAATCGTGAGAAGTTGATGGAGATGGCTAACACTGTCCG
C*ACTGGCGGAAAGGGTACAGTTAGAAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGACCAATACAA
CTGATGACAAGAAGCTCCAAAGCACCTTGAAGAGGATTGGAGTTAACTCCATTCCTGGGA
TTGAAGAAGTTAACATCTTCAAGGATGATGTTGTTATTCAGTTCACCAACCCCAAGGTGC
AAGCTGCAGTTGGTGTAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAA**TTG
GAAGATATTCTTCCTCAGATTCTCAGCCATCTCGGACCAGACAACATGGAGAATCTGAAG
AAGCTAGCAGAGCAGTTCAAGAAGCAATCTCCTGGTGGAGGTAATGTCCCCGCAACCATT
CAAGAGGATGATGAGGACGATGATGACGTCCCGGATCTTGTAGCTGGTGAGACTTTCGAA
GCTGCTGCTGAAGAGAAAGTACCTGCTGCTGCTGCTTCTTCTTAAGACAGAAGAGCGAGA
GACCACAACAGCAACAACCAAAACCGTACTTTAATTATTTCATATCTTTATAATTGCTTG
TTCGCTCTATCCTCTTTTTTGTAGTGTTTCCGACCGGATTCTTGTT*CCCAGATAATGAT
TTAAG*TTTTTATCTATTTGATCTGTTTCTCCAA

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DS 

RD RS1B479JQ 667 0 0
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AAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGACCAATACAACTGATGACAAGAAGCTCCAAAGCAC
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TGATGTTGTTATTCAGTTCACCAACCCCAAGGTGCAAGCTGCAGTTGGTGTAAACACATG
GGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAA**TTGGAAGATATTCTTCCTCAGATTTTCA
GCCATCTCGGACCAGACAACATGGAGAATCTGAAGAAGCTAGCAGAGCAGTTCAAGAAGC
AATCTCCTGGTGGAGGTAATGTCCCCGCAACCATTCAAGAGGATGATGAGGACGATGATG
ACGTCCCGGATCTTGTAGCTGGTGAGACTTTCGAAGCTGCTGCTGAAGAGAAAGTACCTG
CTGCTGCTGCTTCTTCTTAAGACAGAAGAGCGAGAGACCACAACAGCAACAACCAAAACC
GTACTTTAATTATTTCATATCTTTATAATTGCTTGTTCGCTCTATCCTCTTTTTTGTAGT
GTTTCCGACCGGATTCTTGTTTCCCAGATAATGATTTAAGGTTTTTATCTATTTGATCTG
TTTCT
CC

QA 1 665 1 665
DS 



CO CL9Contig3 745 7 7 U
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CAGGAAACCCTAATCATCAAATCTCAAGATGAATCGTGAGAAGTTGATGAAGATGGCTAA
CACTGTCCGCACTGGCGGAAAGGGGACAGTTAGAAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGAC
CAATACTACTGATGACAAGAAGCTTCAAAGCACCTTAAAGAGAATTGGAGTCAACTCCAT
TCCAGCTATTGAAGAAGTTAACATCTTCAAGGATGATGTTGTTATTCAGTTCATCAACCC
TAAAGTGCAAGCTGCAGTTGGTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAA
AAAATTGGAAGATATTCTTCCTCAGATTCTCAGCCATCTCGGACCAGACAACATGGAGAA
TCTGAAGAAGCTAGCAGAGCAGTTCAAGAAGCAATCTCCTGGTGGAGGTAATGTCCCAGC
AACCATTCAAGAGGATGATGAGGACGACGATGATGTCCCGGATCTTGTAGCTGGTGAGAC
TTTCGAAGCCGCCGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCTGCTTCTTCTTAAGACAAAAGAGCGAG
AGACCACAAAAACAGCACTTTGGATTATTACATATCTTTATAATTGCTTGTTCGCTCTAT
CCTCTTTTTGTAGTGTTTCCTACCAGATTCTTGTTTCCCAGATAATGATTTAAAAGTTTT
TATCCAATTGATCTGTTTTCTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 20 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FD38TF U 8
AF RS1CU96TF U 4
AF RS1G307TF U 8
AF RS1EB18TF U 1
AF RS1EB18JQ C 232
AF RS1G307JQ C 102
AF RS1FD38JQ C 38
BS 1 29 RS1EB18TF
BS 30 30 RS1FD38TF
BS 31 670 RS1EB18TF
BS 671 671 RS1G307TF
BS 672 704 RS1EB18TF
BS 705 705 RS1EB18JQ
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GG
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CACTGGCGGAAAGGGGACAGTTAGAAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGACCAATACTAC
TTATGACAAGAAGCTTCAAAGCACCTTAAAGAGAATTGGAGTCAACTCCATTCCAGCTAT
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AGCTGCAGTTGGTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAATTGGA
AGATATTCTTCCTCAGATTCTCAGCCATCTCGGACCAGACAACATGGAGAATCTGAAGAA
GCTAGCAGAGCAGTTCAAGAAGCAATCTCCTGGTGGAGGTAATGTCCCAGCAACCATTCA
AGAGGATGATGAGGACG

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DS 

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GGGCCC
GCGTCCGTCTCTCTTCACTTGTTATCTTCTTCCAACTCCTTCGTAGGGAAACAGGAAACC
CTAATCATCAGATCTCAAGATGAATCGTGAGAAGTTGATGAAGATGGCTAACACTGTCCG
CACTGGCGGAAAGGGGACAGTTAGAAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGACCAATACTAC
TGATGACAAGAAGCTTCAAAGCACCTTAAAGAGAATTGGAGTCAACTCCATTCCAGCTAT
TGAAGAAGTTAACATCTTCAAGGATGATGTTGTTATTCAGTTCATCAACCCTAAAGTGCA
AGCTGCAGTTGGTGCAAACACATGGGTTGTCAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAATTGGA
AGATATTCTTCCTCAGATTCTCAGCCATCACGGACCAGACAACATGGAGAATCTGAAGAA
GCTAGCAGAGCAGTTCAAGAAGCAATCTCCTGGTGGAGGTAATGTCCCAGCAACCATTCA
AGAGGATGATGAGGACGACGATGATGTCCCGGATCTTGTAGCTGGTGAGACTTTCGAAGC
CGCCGC

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DS 

RD RS1G307TF 691 0 0
GGT
CGTCCGTCTCTCTTCACTTGTTATCTTCTTCCAACTCCTTCGTAGGGAAACAGGAAACCC
TAATCATCAAATCTCAAGATGAATCGTGAGAAGTTGATGAAGATGGCTAACACTGTCCGC
ACTGGCGGAAAGGGGACAGTTAGAAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGACCAATACTACT
GATGACAAGAAGCTTCAAAGCACCTTAAAGAGAATTGGAGTCAACTCCATTCCAGCTATT
GAAGAAGTTAACATCTTCAAGGATGATGTTGTTATTCAGTTCATCAACCCTAAAGTGCAA
GCTGCAGTTGGTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAATTGGAA
GATATTCTTCCTCAGATTCTCAGCCATCTCGGACCAGACAACATGGAGAATCTGAAGAAG
CTAGCAGAGCAGTTCAAGAAGCAATCTCCTGGTGGAGGTAATGTCCCAGCAACCATTCAA
GAGGATGATGAGGACGACGATGATGTCCCGGATCTTGTAGCTGGTGAGACTTTCGAAGCC
GCCGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCTGCTTCTTCTTAAGACAAAAGAGCGAGAGACCACAAA
AACAGCACTTTGGATTATTACATATCTTTATAATTGCTTGTTCGCTCTATCCTCTTTTTG
TAGTGTTTCCTACCAGATTCTTGTTTCC

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DS 

RD RS1EB18TF 745 0 0
GGGCCGCCCGCGTCCGTCTCTCTTCACTT*TTATCTTCTTCCAACTCCTTCGTAGGGAAA
CAGGAAACCCTAATCATCAAATCTCAAGATGAATCGTGAGAAGTTGATGAAGATGGCTAA
CACTGTCCGCACTGGCGGAAAGGGGACAGTTAGAAGAAAGAAGAAGGCTGTGCACAAGAC
CAATACTACTGATGACAAGAAGCTTCAAAGCACCTTAAAGAGAATTGGAGTCAACTCCAT
TCCAGCTATTGAAGAAGTTAACATCTTCAAGGATGATGTTGTTATTCAGTTCATCAACCC
TAAAGTGCAAGCTGCAGTTGGTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAA
AAAATTGGAAGATATTCTTCCTCAGATTCTCAGCCATCTCGGACCAGACAACATGGAGAA
TCTGAAGAAGCTAGCAGAGCAGTTCAAGAAGCAATCTCCTGGTGGAGGTAATGTCCCAGC
AACCATTCAAGAGGATGATGAGGACGACGATGATGTCCCGGATCTTGTAGCTGGTGAGAC
TTTCGAAGCCGCCGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCTGCTTCTTCTTAAGACAAAAGAGCGAG
AGACCACAAAAACAGCACTTTGGATTATTACATATCTTTATAATTGCTTGTTCGCTCTAT
CCTCTTTTTGCAGTGTTTCCTACCAGATTCTTGTTTCCCAGATA*TGATTTAAAAGTTTT
TATCCAATTGATCTGTTTTCTTCCC

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DS 

RD RS1EB18JQ 514 0 0
CAACTCCATTCCAGCTATTGAAGAAGTTAACATTTTCAAGGATGATGTTGTTATTCAGTT
CATCAACCCTAAAGTGCAAGCTGCAGTTGGTGCAAACACATGGGTTGTTAGCGGTTCTCC
TCAGACCAAAAAATTGGAAGATATTTTTCCTCAGATTTTCAGCCATTTCGGACCAGACAA
CATGGAGAATCTGAAGAAGCTAGCAGAGCAGTTCAAGAAGCAATCTCCTGGTGGAGGTAA
TGTCCCAGCAACCATTCAAGAGGATGATGAGGACGACGATGATGTCCCGGATCTTGTAGC
TGGTGAGACTTTCGAAGCCGCCGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCTGCTTTTTCTTAAGACAA
AAGAGCGAGAGACCACAAAAACAGCACTTTGGATTATTACATATCTTTATAATTGCTTGT
TCGCTCTATCCTCTTTTTGCAGTGTTTCCTACCAGATTCTTGTTTCCCAGATAATGATTT
AAAAGTTTTTATCCAATTGATCTGTTT
TCTTCCC

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DS 

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AGAAGGCTGTGCACAAGACCAATACTACTGATGACAAGAAGCTTCAAAGCACCTTAAAGA
GAATTGGAGTCAACTCCATTCCAGCTATTGAAGAAGTTAACATCTTCAAGGATGATGTTG
TTATTCAGTTCATCAACCCTAAAGTGCAAGCTGCAGTTGGTGCAAACACATGGGTTGTTA
GCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAATTGGAAGATATTTTTCCTCAGATTTTCAGCCATTTCG
GACCAGACAACATGGAGAATTTGAAGAAGCTAGCAGAGCAGTTCAAGAAGCAATCTCCTG
GTGGAGGTAATGTCCCAGCAACCATTCAAGAGGATGATGAGGACGACGATGATGTCCCGG
ATCTTGTAGCTGGTGAGACTTTCGAAGCCGCCGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCTGCTTTTT
CTTAAGACAAAAGAGCGAGAGACCACAAAAACAGCACTTTGGATTATTACATATCTTTAT
AATTGCTTGTTCGCTCTATCCTCTTTTTGTAGTGTTTCCTACCAGATTCTTGTTTCCCAG
ATAATGATTTAAAAGTTTTTATCCAATTGATCTGTTT
TTT

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DS 

RD RS1FD38JQ 689 0 0
CTTCCAACTCCTTCGTAGGGAAACAGGAAACCCTAATCATCAAATCTCAAGATGAATCGT
GAGAAGTTGATGAAGATGGCTAACACTGTCCGCACTGGCGGAAAGGGGACAGTTAGAAGA
AAGAAGAAGGCTGTGCACAAGACCAATACTACTTATGACAAGAAGCTTCAAAGCACCTTA
AAGAGAATTGGAGTCAACTCCATTCCAGCTATTGAAGAAGTTAACATCTTCAAGGATGAT
GTTGTTATTCAGTTCATCAACCCTAAAGTGCAAGCTGCAGTTGGTGCAAACACATGGGTT
GTTAGCGGTTCTCCTCAGACCAAAAAATTGGAAGATATTCTTCCTCAGATTTTCAGCCAT
CTCGGACCAGACAACATGGAGAATCTGAAGAAGCTAGCAGAGCAGTTCAAGAAGCAATCT
CCTGGTGGAGGTAATGTCCCAGCAACCATTCAAGAGGATGATGAGGACGACGATGATGTC
CCGGATCTTGTAGCTGGTGAGACTTTCGAAGCCGCCGCTGAAGAGAAAGTAGCTGCTGCT
TCTTCTTAAGACAAAAGAGCGAGAGACCACAAAAACAGCACTTTGGATTATTACATATCT
TTATAATTGCTTGTTCGCTCTATCCTCTTTTTGTAGTGTTTCCTACCAGATTCTTGTTTC
CCAGATAATGATTTAAAAGTTTTTATCC
G

QA 1 688 1 688
DS 



AS 2 20

CO CL10Contig1 753 6 2 U
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CGTGACTCGCTCTGAAGACTCAGTTCGACTTGTGAATCAGCGAGAGTATTGTGATCGGAG
GTGGAAAAATGTCGACGGTGGTAGATGGGAGTGTATCGACGCTGAATCCAAACGCGCCGG
TGTTCGATCCGGTGGGATTCCGTGAGGTAGAGGATTTCTCGCCCAAGTGGTGGGAGCTCG
TGACGACATCCAAGTGGTTCCGTGACTTCTGGCTCAGTTCCAACTCGGAGTATGAGTTCT
CAGATATGGAGGACGAGTTCGAGGAGCTAACCATGACCGAGGCTGAGATGGGTGGATCTA
CAGTTACAGGTAACGAGTCAGATGTTGGTAGGTACTTGAAGGTGCTTCTGAGCATGGCGG
AGTCTAGGAAAGGGGAGCTCTACAGATCTAATGTGTCTTATTCTACAAAGTATAACCAGA
AGAAGATGAACCCGAATTTATACTGTCGCCGGAACCATCTCATCTATCAGCCTCGGAGTC
GCACAAAAAAGAAAACAAAAAAACAAAAAAAAAAAAAATCTATCAGCCTCGGTGAAAAAA
GGTTGTAGAAGCGTCTGGAGAAAGAATAAAAGCTCATCTTTATGTTTTCGTGAATGAGAA
ACTTATCTTTGCTTCCTGTTCTGTACTACTTTCTTCCTCTGATTATGTGAATATTCTTCC
GTTATGAGCTTCGTGTTTAACAAAATCTATCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 10 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RS1GH47TF U 25
AF RS1A257TF U 1
AF RS1A257JQ C 23
AF RS1DD49TF U 23
AF RS1A257TR C 121
AF RS1AZ07TF U 20
BS 1 752 RS1A257TF
BS 753 753 RS1A257JQ

RD RS1GH47TF 523 0 0
GGAAAAAGACA
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ACCGAGGCTGAGATGGGTGGATCTACCGTTACAGGTAACGAATCAGACGTTGGTAGGTAC
TTGAAGGTGCTTCTGAGCATGGCGGAGTCTAGGAAAGGGAAGCTCTACAGATCTAATGTG
TCTTTTTCTACAAAGTATAACCAGAAGAAGATGAACCCCAATTTATACTGTCGCCGGAAC
CATCTCATCTATCAGCCTCGGAGTCGCACAAA

QA 12 523 12 523
DS 

RD RS1A257TF 753 0 0
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TGTTCGATCCGGTGGGATTCCGTGAGGTAGAGGATTTCTCGCCCAAGTGGTGGGAGCTCG
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GCACAAAAAAGAAAACAAAAAAACAAAAAAAAAAAAAATCTATCAGCCTCGGTGAAAAAA
GGTTGTAGAAGCGTCTGGAGAAAGAATAAAAGCTCATCTTTATGTTTTCGTGAATGAGAA
ACTTATCTTTGCTTCCTGTTCTGTACTACTTTCTTCCTCTGATTATGTGAATATTCTTCC
GTTATGAGCTTCGTGTTTAACAAAATCTATCG
C

QA 1 752 1 752
DS 

RD RS1A257JQ 731 0 0
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CTGTCGCCGGAACCATCTCATCTATCAGCCTCGGAGTCGCACAAAAAAGAAAACAAAAAA
ACAAAAAAAAAAAAAATCTATCAGCCTCGGTGAAAAAAGGTTGTAGAAGCGTCTGGAGAA
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GTACTACTTTCTTCCTCTGATTATGTGAATATTCTTCCGTTATGAGCTTCGTGTTTAACA
AAATCTATCGC

QA 1 731 1 731
DS 

RD RS1DD49TF 703 0 0
GGATCAAAAGACAAAGAGTTTTCTAGTAACTCGGAAAGCGTGACCCGCTCTGAAGACTCA
GTTCGACTTGCGAATCAGCGAGAGTATTGTGATCGGAGGTGGAAAAATGTCGACGGTGGT
AGATGGGAGTGTATCGACGCTGAATCCAAACGCGCCGGTGTTCGATCCGGTGGGGTTCCG
TGAGGTAGAGGATTTCTCGCCCAAGTGGTGGGAGCTCGTGACGACATCAAAGTGGTTCCG
TGACTTCTGGCTCAGTGCCAACTCGGAGTATGAGTTGTCAGATATGGAGGACGAGTTGGA
GGAGCTAACCATGACCGAGGCTGAGATGGGTGGATCTACCGTTACAGGTAACGAATCAGA
CGTTGGTAGGTACTTGAAGGTGCTTCTGAGCATGGCGGAGTCTAGGAAAGGGAAGCTCTA
CAGATCTAATGTGTCTTTTTCTACAAAGTATAACCAGAAGAAGATGAACCCCAATTTATA
CTGTCGCCGGAACCATCTCATCTATCAGCCTCGGAGTCGCACAAAAAAGAAAACAAAAAA
ACAAAAAAAAAAA***TCTATCAGCCTCGGTGAAAAAAGGTTGTAGAAGCGTCTGGAGAA
AGAATAAAAGCTCATCTTTGTGTTTTCGTGAATGAGAAACTCATCTTTGCTTGTTGCTCT
GTACTACTTTCTTCCTCTGATTATGTGAATATTCTTCCGTTA
C

QA 1 702 1 702
DS 

RD RS1A257TR 632 0 0
GTGGAAAAATGTCGACGGTGGTAGATGGGAGTGTATCGACGCTGAATCCAAACGCGCCGG
TGTTCGATCCGGTGGGATTCCGTGAGGTAGAGGATTTCTCGCCCAAGTGGTGGGAGCTCG
TGACGACATCCAAGTGGTTCCGTGACTTCTGGCTCAGTTCCAACTCGGAGTATGAGTTTT
CAGATATGGAGGACGAGTTCGAGGAGCTAACCATGACCGAGGCTGAGATGGGTGGATCTA
CAGTTACAGGTAACGAGTCAGATGTTGGTAGGTACTTGAAGGTGCTTCTGAGCATGGCGG
AGTCTAGGAAAGGGGAGCTCTACAGATCTAATGTGTCTTATTCTACAAAGTATAACCAGA
AGAAGATGAACCCGAATTTATACTGTCGCCGGAACCATCTCATCTATCAGCCTCGGAGTC
GCCCAAAAAAGAAAACAAAAAAACAAAAAAAAAAAAAATCTATCAGCCTCGGTGAAAAAA
GGTTGTAGAAGCGTCTGGAGAAAGAATAAAAGCTCATCTTTATGTTTTCGTGAATGAGAA
ACTTATCTTTGCTTCCTGTTCTGTACTACTTTCTTCCTCTGATTATGTGAATATTCTTCC
GTTATGAGCTTCGTGTTTAACAAAATCTATCG

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1AZ07TF 717 0 0
GGCTT
ATCAAAAGACAA*GAGTTTTCTAGTAACTCGGAAAGCGTGACTCGCTCTGAAGACTCAGT
TCGACTTGTGAATCAGCGAGAGTATTGTGATCGGAGGTGGAAAAATGTCGACGGTGGTAG
ATGGGAGTGTATCGACGCTGAATCCAAACGCGCCGGTGTTCGATCCGGTGGGATTCCGTG
AGGTAGAGGATTTCTCGCCCAAGTGGTGGGAGCTCGTGACGACATCCAAGTGGTTCCGTG
ACTTCTGGCTCAGTTCCAACTCGGAGTATGAGTTCTCAGATATGGAGGACGAGTTCGAGG
AGCTAACCATGACCGAGGCTGAGATGGGTGGATCTACAGTTACAGGTAACGAGTCAGATG
TTGGTAGGTACTTGAAGGTGCTTCTGAGCATGGCGGAGTCTAGGAAAGGGAAGCTCTACA
GATCTAATGTGTCTTATTCTACAAAGTATAACCAGAAGAAGATGAACCCGAATTTATACT
GTCGCCGGAACCATCTCATCTATCAGCCTCGGAGTCGCACAAAAAAGAAAACAAAAAAAC
AAAAAAAAAAA***TCTATCAGCCTCGGTGAAAAA*GGTTGTAGAAGCGTCTGGAGAAAG
AATAAAAGCTCATCTTTATGTTTTCGTGAATGAGAAACTTATCTTTGCTTCTTGTTCTGT
ACTACTTTCTTCCTCTGATTATGTGA*TATTCTTCCGT*ATGAGCTTCGTGT

QA 6 717 6 717
DS 



CO CL10Contig2 750 14 10 U
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GTGAATCAGCGAGAGTAAAATGTCGACGGTGGTTGATCGTAGTGTTTCGACGCTGAATCC
AAACGCGCCGGTGTTCGATCCGGTGGGATTCCGTGAGGTAGAGGATTTCTCGCCCAAGTG
GTGGGAGCTCGTGACGACATCAAAGTGGTTCCGTGACTTCTGGCTCAGTGCCAACTCGGA
GTATGAGTTCTCAGATATGGAGGACGAGTTCGAGGAGCTAACCATGACCGAGGCTGAGAT
GGGTGGATCTACAGTTACAGGTAACGAGTCAGATGTTGGTAGGTACTTGAAGGTGCTTCT
GAGCATGGCGGAGTCTAGGAAAGGGAAGCTCTACAGATCTAATGTGTCTTATTCTACAAA
GTATAACCAGAAGAAGATGAACCCGAATTTATACTGTCGCCGGAACCATCTCATCTATCA
GCCTCGGAGTCGCACAAAAAA*GAAAACAAAAAAACAAAAAAAAAAA*TCTATCAGCCTC
GGTGAAAAAAGGTTGTAGAAGCGTCTGGAGAAAGAATAAAAGCTCATCTTTGTGTTTTCG
TGAATGAGAAACTCATCTTTGCTTGTTGCTCTGTACTACTTTCTTCCTCTGATTATGTGA
ATATTCTTCCGTTATGATCTTCGTGTTTAACAAAATCTACCGCATATATATTTTGTTATA
TAAGCAATAAACCAAATTCGGAAACTAAAC


BQ
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 
65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 35 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 65 80 80 65 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 15 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 

AF RS1FI84TF U 1
AF RS1FK28JQ C 409
AF RS1FK28TF U 215
AF RS1DA71TF U 1
AF RS1GH47JQ C 119
AF RS1CG58TF U 1
AF RS1CG58JQ C 1
AF RS1GR05TF U 1
AF RS1A439JQ C 1
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AF RS1GR05JQ C 164
AF RS1AS83TF U 1
AF RS1A439TF U 1
BS 1 501 RS1FI84TF
BS 502 674 RS1CG58TF
BS 675 690 RS1GR05TF
BS 691 694 RS1AS83TF
BS 695 695 RS1A439TF
BS 696 716 RS1AS83TF
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BS 718 735 RS1AS83TF
BS 736 745 RS1A439TF
BS 746 750 RS1A439JQ

RD RS1FI84TF 501 0 0
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DS 

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TTTGTGTTTTCGTGAATGAGAAACTCATCTTTGCTTGTTGCTC
G

QA 1 223 1 223
DS 

RD RS1FK28TF 418 0 0
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TCTACAAAGTATAACCAGAAGAAGATGAACCCGAATTTATACTGTCGCCGGAACCATCTC
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G

QA 19 417 19 417
DS 

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QA 1 660 1 660
DS 

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AAGTATAACCAGAAGAAGATGAACCCCAATTTATACTGTCGCCGGAACCATCTCATCTAT
CAGCCTCGGAGTCGCACAAAAAAAGAAAACAAAAAAACAAAAAAAAAA**TCTATCAGCC
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CGTGAATGAGAAACTCATCTTTGCTTGTTGCTCTGTACTACTTTCTTCCTCTGATTATGT
GAATATTCTTCCGTTATGATCTTCGTGTTTAACAAAATCTACCGCATA
G

QA 1 588 1 588
DS 

RD RS1CG58TF 678 0 0
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AAACTCGCCGGTGTTCGATCCGGTGGGATTCCGTGAGGTAGAGGATTTCTCGCCCAAGTG
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GGGTGGATCTACAGTTACAGGTAACGAGTCAGATGTTGGTAGGTACTTGAAGGTGCTTCT
GAGCATGGCGGAGTCTAGGAAAGGGAAGCTCTACAGATCTAATGTGTCTTATTCTACAAA
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GGTGAAAAAAGGTTGTAGAAGCGTCTGGAGAAAGAATAAAAGCTCATCTTTGTGTTTTCG
TGAATGAGAAACTCATCTTTGCTTGTTGCTCTGTACTACTTTCTTCCTCTGATTATGTGA
ATATTCTTCCGTTA
ATAA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1CG58JQ 673 0 0
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GGGTGGATCTACAGTTACAGGTAACGAGTCAGATGTTGGTAGGTACTTGAAGGTGCTTCT
GAGCATGGCGGAGTCTAGGAAAGGGAAGCTCTACAGATCTAATGTGTCTTATTCTACAAA
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GGTGAAAAAAGGTTGTAGAAGCGTCTGGAGAAAGAATAAAAGCTCATCTTTGTGTTTTCG
TGAATGAGAAACTCATCTTTGCTTGTTGCTCTGTACTACTTTCTTCCTCTGATTATGTGA
ATATTCTTCCGTT

QA 1 673 1 673
DS 

RD RS1GR05TF 690 0 0
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AAACGCGCCGGTGTTCGATCCGGTGGGATTCCGTGAGGTAGAGGATTTCTCGCCCAAGTG
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GTATGAGTTCTCAGATATGGAGGACGAGTTCGAGGAGCTAACCATGACCGAGGCTGAGAT
GGGTGGATCTACAGTTACAGGTAACGAGTCAGATGTTGGTAGGTACTTGAAGGTGCTTCT
GAGCATGGCGGAGTCTAGGAAAGGGAAGCTCTACAGATCTAATGTGTCTTATTCTACAAA
GTATAACCAGAAGAAGATGAACCCGAATTTATACTGTCGCCGGAACCATCTCATCTATCA
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GGTGAAAAAAGGTTGTAGAAGCGTCTGGAGAAAGAATAAAAGCTCATCTTTGTGTTTTCG
TGAATGAGGAACTCATCTTTGCTTGTTGCTCTGTACTACTTTCTTCCTCTGATTATGTGA
ATATTCTTCCGTTATGATCTTCGTGTTTAA

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1A439JQ 750 0 0
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AAACGCGCCGGTGTTCGATCCGGTGGGATTCCGTGAGGTAGAGGATTTCTCGCCCAAGTG
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GGGTGGATCTACAGTTACAGGTAACGAGTCAGATGTTGGTAGGTACTTGAAGGTGCTTCT
GAGCATGGCGGAGTCTAGGAAAGGGAAGCTCTACAGATCTAATGTGTCTTATTCTACAAA
GTATAGCCAGAAGAAGATGAACCCGAATTTATACTGTCGCCGGAACCATCTCATCTATCA
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GGTGAAAAAAGGTTGTAGAAGCGTCTGGAGAAAGAATAAAAGCTCATCTTTGTGTTTTCG
TGAATGAGAAACTCATCTTTGCTTGTTGCTCTGTACTACTTTCTTCCTCTGATTATGTGA
ATATTCTTCCGTTATGATCTTCGTGTTTAACAAAATCTACCGCATATATATTTTGTTATA
TAAGCAATAAACCAAATTCGGAAACTAAAC

QA 1 750 1 750
DS 

RD RS1AS83JQ 636 0 0
CGCTGAATCCAAACGCGCCGGTGTTCGATCCGGTGGGATTCCGTGAGGTAGAGGATTTCT
CGCCCAAGTGGTGGGAGCTCGTGACGACATCAAAGTGGTTCCGTGACTTCTGGCTCAGTG
CCAACTCGGAGTATGAGTTTTCAGATATGAAGGACGAGTTCTAGGAGCTAACCATGACCG
AGGCTGAGATGGGTGGATCTACAGTTACAGGTAACGAGTCAGATGTTGGTAGGTACTTGA
AGGTGCTTCTGAGCATGGCGGAGTCTAGGAAAGGGAAGCTCTACAGATCTAATGTGTCTT
ATTCTACAAAGTATAACCAGAAGAAGATGAACCCGAATTTATACTGTCGCCGGAACCATC
TCATCTATCAGCCTCGGAGTCGCACAAAAAA*GAAAACAAAAAAACAAAAAAAAAA**TC
TATCAGCCTCGGTGAAAAAAGGTTGTAGAAGCGTCTGGAGAAAGAATAAAAGCTCATCTT
TGTGTTTTCGTGAATGAGAAACTCATCTTTGCTTGTTGCTCTGTACTACTTTCTTCCTCT
GATTATGTGAATATTCTTCCGTTATGATCTTCGTGTTTAACAAAATCTACCGCATATATA
TTTTGTTATATAAGCAATAAACCAAATTCGGAAAC
C

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1G981JQ 656 0 0
AATCAGCGA
GAGTGTTTCGACGCTGAATCCAAACGCGCCGGTGTTCGATCCGGTGGGATTCCGTGAGGT
AGAGGATTTCTCGCCCAAGTGGTGGGAGCTCGTGACGACATCAAAGTGGTTCCGTGACTT
CTGGCTCAGTGCCAACTCGGAGTATGAGTTTTCAGATATGGAGGACGAGTTCGAGGAGCT
AACCATGACCGAGGCTGAGATGGGTGGATCTACAGTTACAGGTAACGAGTCAGATGTTGG
TAGGTACTTGAAGGTGCTTCTGAGCATGGCGGAGTCTAGGAAAGGGAAGCTCTACAGATC
TAATGTGTCTTATTCTACAAAGTATAACCAGAAGAAGATGAACCCGAATTTATACTGTCG
CCGGAACCATCTCATCTATCAGCCTCGGAGTCGCACAAAAAA*GAAAACAAAAAAACAAA
AAAAAAAA*TCTATCAGCCTCGGTGAAAAAAGGTTGTAGAAGCGTCTGGAGAAAGAATAA
AAGCTCATCTTTGTGTTTTCGTGAATGAGAAACTCATCTTTGCTTGTTGCTCTGTACTAC
TTTCTTCCTCTGATTATGTGAATATTCTTCCGTTATGATCTTCGTGTTTAACAAAATCTA
CCGCATATATATTTTGTTATATAAGCAATAAACCAAATTCGGAAAC
C

QA 10 655 10 655
DS 

RD RS1GR05JQ 583 0 0
GATTTCTCGCCCAAGTGGTGGGAGCTCGTGACGACATCAAAGTGGTTCCGTGACTTCTGG
CTCAGTGCCAACTCGGAGTATGAGTTCTCAGATATGGAGGACGAGTTCGAGGAGCTAACC
ATGACCGAGGCTGAGATGGGTGGATCTACAGTTACAGGTAACGAGTCAGATGTTGGTAGG
TACTTGAAGGTGCTTCTGAGCATGGCGGAGTCTAGGAAAGGGAAGCTCTACAGATCTAAT
GTGTCTTATTCTACAAAGTATAACCAGAAGAAGATGAACCCGAATTTATACTGTCGCCGG
AACCATCTCATCTATCAGCCTCGGAGTCGCACAAAAAA*GAAAACAAAAAAACAAAAAAA
AAAAATCTATCAGCCTCGGTGAAAAAAGGTTGTAGAAGCGTCTGGAGAAAGAATAAAAGC
TCATCTTTGTGTTTTCGTGAATGAGGAACTCATCTTTGCTTGTTGCTCTGTACTACTTTC
TTCCTCTGATTATGTGAATATTCTTCCGTTATGATCTTCGTGTTTAACAAAATCTACCGC
ATATATATTTTGTTATATAAGCAATAAACCAAATTCGGAAAC
C

QA 1 582 1 582
DS 

RD RS1AS83TF 735 0 0
GGATCAAAAGACAGAGTTAACTCGGAAAGCGTGACTCGCTCTGAAGACTCAGTTCGACTT
GTGAATCAGCGAGAGTGAAATGTCGACGGTGGTTGATCGTAGTGTTTCGACGCTGAATCC
AAACGCGCCGGTGTTCGATCCGGTGGGATTCCGTGAGGTAGAGGATTTCTCGCCCAAGTG
GTGGGAGCTCGTGACGACATCAAAGTGGTTCCGTGACTTCTGGCTCAGTGCCAACTCGGA
GTATGAGTTCTCAGATATGAAGGACGAGTTCTAGGAGCTAACCATGACCGAGGCTGAGAT
GGGTGGATCTACAGTTACAGGTAACGAGTCAGATGTTGGTAGGTACTTGAAGGTGCTTCT
GAGCATGGCGGAGTCTAGGAAAGGGAAGCTCTACAGATCTAATGTGTCTTATTCTACAAA
GTATAACCAGAAGAAGATGAACCCGAATTTATACTGTCGCCGGAACCATCTCATCTATCA
GCCTCGGAGTCGCACAAAAAA*GAAAACAAAAAAACAAAAAAAAAA**TCTATCAGCCTC
GGTGAAAAAAGGTTGTAGAAGCGTCTGGAGAAAGAATAAAAGCTCATCTTTGTGTTTTCG
TGAATGAGAAACTCATCTTTGCTTGTTGCTCTGTACTACTTTCTTCCTCTGATTATGTGA
ATATTCTTCCGTTATGATCTTCGTGTTTAACAAA*TCTACCGCATATATATTTTGT*ATA
TAAGCAATAAACCAA

QA 1 735 1 735
DS 

RD RS1A439TF 750 0 0
GGATCAAAAGACAGAGTTAACTCGGAAAGCGTGACTCGCTCTGAAGACTCAGTTCGACTT
GTGAATCAGCGAGAGTAAAATGTCGACGGTGGTTGATCGTAGTGTTTCGACGCTGAATCC
AAACGCGCCGGTGTTCGATCCGGTGGGATTCCGTGAGGTAGAGGATTTCTCGCCCAAGTG
GTGGGAGCTCGTGACGACATCAAAGTGGTTCCGTGACTTCTGGCTCAGTGCCAACTCGGA
GTATGAGTTCTCAGATATGGAGGACGAGTTCGAGGAGCTAACCATGACCGAGGCTGAGAT
GGGTGGATCTACAGTTACAGGTAACGAGTCAGATGTTGGTAGGTACTTGAAGGTGCTTCT
GAGCATGGCGGAGTCTAGGAAAGGGAAGCTCTACAGATCTAATGTGTCTTATTCTACAAA
GTATAGCCAGAAGAAGATGAACCCGAATTTATACTGTCGCCGGAACCATCTCATCTATCA
GCCTCGGAGTCGCACAAAAAA*GAAAACAAAAAAACAAAAAAAAAA**TCTATCAGCCTC
GGTGAAAAAAGGTTGTAGAAGCGTCTGGAGAAAGAATAAAAGCTCATCTTTGTGTTTTCG
TGAATGAGAAACTCATCTTTGCTTGTTGCTCTGTACTACTTTCTTCCTCTGATTATGTGA
ATATTCTTCCGTTATGATCTTCGTGTTTAACAAAATCTACCGCATATATATTTTGTTATA
TAAGCAATAAACCAAATTCGGAAAC
TAAAC

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 23

CO CL11Contig1 2110 23 17 U
AGTTCATCCTATTGGCTCGGCTTTTAGGAAAAAAGTATCTTTCAAATTGGAGATTAAGCT
ATCTATAATAATATGAATACGACCTTTATTCTTCTGTTTGTTTGATCTAAAAACGAATCG
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CAATAAGCATCTTGTATTTCATAAAAATTGGGGGCAATATAATCCTTACGTAAAGGCCAC
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BQ
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C

QA 2 194 2 194
DS 

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G
GTTCATCCTATTGGCTCGGCTTTTAGGAAAAGAGTATCTTTCAAATTGGAGATTAAGCTA
TCTATAATAATATGAATACGACCTTTATTCTTCTGTTTGTTTGATCTAAAAACGAATCGA
ATTAAAAATATTCCGCGAAGGTCCGTAGTTGTAGAAACTAAGACTCATTTTTTATCATTC
AATAAGCATCTTG
C

QA 2 194 2 194
DS 

RD RS1G734JQ 262 0 0
AGTTCATCCTATTGGCTCGGCTTTTAGGAAAAAAGGATCTTTCAAATTGGAGATTAAGCT
ATCTATAATAATATGAATAAGACCTTTATTCTTCTGTTTGTTTGATCTAAAAACGAATCG
AATTAAAAATATTCCGCGAAGGTCCGTAGTTGTAGAAACTAAGACTCATTTTTTATCATT
CAATAAGCATCTTGTATTTCATAAAAATTGGGGGCAATATAATCCTTACGTAAAGGCCAC
CCTATCCAACTTTCGGGCATT
C

QA 1 261 1 261
DS 

RD RS1G734TF 262 0 0
AGTTCATCCTATTGGCTCGGCTTTTAGGAAAAAAGGATCTTTCAAATTGGAGATTAAGCT
ATCTATAATAATATGAATAAGACCTTTATTCTTCTGTTTGTTTGATCTAAAAACGAATCG
AATTAAAAATATTCCGCGAAGGTCCGTAGTTGTAGAAACTAAGACTCATTTTTTATCATT
CAATAAGCATCTTGTATTTCATAAAAATTGGGGGCAATATAATCCTTACGTAAAGGCCAC
CCTATCCAACTTTCGGGCATT
C

QA 1 261 1 261
DS 

RD RS1B592JQ 305 0 0
CCTATTGGCTCGGCTTTTAGGAAAAAAGTATCTTTCAAATTGGAGATTAAGCTATCTATA
ATAATATAAATACGACCTTTATTCTTCTGTTTGTTTGATCTAAAAACGAATCGAATTAAA
AATATTCCGCGAAGGTCCGTAGTTGTAGAAACTAAGACTCATTTTT*ATCATTCAATAAG
CATCTTGTATTTCATAAAAATTGGGGGCAATATAATCCTTACGTAAAGGCCACCCTATCC
AACTTTCGGGCATTAAGATCCGTTTCAGCCGAGGATGGCTATCATAAGTGATTCCTAACA
TATC
C

QA 1 304 1 304
DS 

RD RS1B592TF 305 0 0
CCTATTGGCTCGGCTTTTAGGAAAAAAGTATCTTTCAAATTGGAGATTAAGCTATCTATA
ATAATATAAATACGACCTTTATTCTTCTGTTTGTTTGATCTAAAAACGAATCGAATTAAA
AATATTCCGCGAAGGTCCGTAGTTGTAGAAACTAAGACTCATTTTT*ATCATTCAATAAG
CATCTTGTATTTCATAAAAATTGGGGGCAATATAATCCTTACGTAAAGGCCACCCTATCC
AACTTTCGGGCATTAAGATCCGTTTCAGCCGAGGATGGCTATCATAAGTGATTCCTAACA
TATC
C

QA 1 304 1 304
DS 

RD RS1BN93TF 468 0 0
AGTTCATCCTATTGGCTCGGCTTTTAGGAAAAAAGTATCTTTCAAATTGGAGATTAAGCT
ATCTATAATAATATGAATACGACCTTTATTCTTCTGTTTGTTTGATCTGAAAACGAATCG
AATTAAAAATATTCCGCGAAGGTCCGTAGTTGTAGAAACTAAGACTCATTTTTTATCATT
CAATAAGCATCTTGTATTTCATAAAAATTGGGGGCAATATAATCCTTACGTAAAGGCCAC
CCTATCCAACTTTCGGGCATTAAGATCCGTTTCAGCCGAGGATGGCTATCATAAGTGATT
CCTAACATATCATAAGATTCCCGTTCTTGAAAATCCGTACTTTTCCAAACCCAGAAAACA
GATGGAATTCTGGGATTACTCCTGTGAGTAAATAATT**ATGCAAACTTCTTCCGCCTGA
TTGACACCATATTCTATTCTCGTAAGATGATACACACTGGCTAAGAGG

QA 1 468 1 468
DS 

RD RS1BN93JQ 519 0 0
AGTTCATCCTATTGGCTCGGCTTTTAGGAAAAAAGTATCTTTCAAATTGGAGATTAAGCT
ATCTATAATAATATGAATACGACCTTTATTCTTCTGTTTGTTTGATCTGAAAACGAATCG
AATTAAAAATATTCCGCGAAGGTCCGTAGTTGTAGAAACTAAGACTCATTTTTTATCATT
CAATAAGCATCTTGTATTTCATAAAAATTGGGGGCAATATAATCCTTACGTAAAGGCCAC
CCTATCCAACTTTCGGGCATTAAGATCCGTTTCAGCCGAGGATGGCTATCATAAGTGATT
CCTAACATATCATAAGATTCCCGTTCTTGAAAATCCGTACTTTTCCAAACCCAGAAAACA
GATGGAATTCTGGGATTACTCCTGTGAGTAAATAATT**ATGCAAACTTCTTCCGCCTGA
TTGACACCATATTCTATTCTCGTAAGATGATACACACTGGCTAAGAGGCCACCTGGTGCC
ACATCATAGGCACATTGGGAACGTAAATAATTGTAACC
C

QA 1 518 1 518
DS 

RD RS1H766JQB 626 0 0
AGTTCATCCTATTGGCTCGGCTTTTAGGAAAAAAGGATCTTTCAAATTGGAGATTAAGCT
ATCTATAATAATATGAATAAAACCTTTATTCTTCTGTTTGTTTGATCTAAAAACGAATCG
AATTAAAAATATTCCGCGAAGGTCCGTAGTTGTAGAAACTAAAACTCATTTTTTATCATT
CAATAAGCATCTTGTATTTCATAAAAATTGGGGGCAATATAATCCTTACGTAAAGGCCAC
CCTATCCAACTTTCGGGCATTAAGATCCGTTTCAGCCGAGGATGGCTATCATAAGTTATT
CCTAACATATCATAAGATTCCCGTTCTTGAAAATCCGTACTTTTCCAAACCCAGAAAACA
GATGGAATTCTGGGATTACTCCTGTGAGTAAATACTTTTATGCAAACTTCTTCCGCTTGA
TTGACACCATATTCTATTCTCGTAAGGTGATACACACTGGCTAAAAGGCCACCTGGTGCC
ACATCATAGGCACATTGGGAACGTAAATAATTGTAACCATATACATATAAAATTACAGCA
ATAGAATGCCAATCTTCGGGCTTTATTTGTAAAGTCTCTATTCCTTGGTAATCGAAGCCC
AACGATCTATGAACCTGCCCCCGTTT

QA 1 626 1 626
DS 

RD RS1FH27JQ 690 0 0
AGTTCATCCCATTGGCTCGGCTTTTAGGAAAAAAGTATCTTTCAAATTGGAGATTAAGCT
ATCTATAATAATATGAATACGACCTTTATTCTTCTGTTTGTTTGATCTAAAAACGAATCG
AATTAAAAATATTCCGCGAAGGTCCGTAGTTGTAGAAACTAAGACTCATTTTTTATCATT
CAATAAGCATCTTGTATTTCATAAAAATTGGGGGCAATATAATCCTTACGTAAAGGCCAC
CCTATCCAACTTTCGGGCATTAAGATCCGTTTCAGCCGAGGATGGCTATCATAAGTGATT
CCTAACATATCATAAGATTCCCGTTCTTGAAAATCCGTACTTTTCCAAACCCAGAAAACA
GATGGAATTCTGGGATTACTCCTGTGAGTAAATACTTTTATGCAAACTTCTTCCGCTTGA
TTGACACCATATTCTATTCTCGTAAGATGATACACACTGGCTAAGAGGCCACCTGGTGCC
ACATCATAGGCACATTGGGAACGTAAATAATTGTAACCATATACATATAAAATTACAGCA
ATAGAATGCCAATCTTCGGGCTTTATTTGTAAAGTCTCTATTCCTTGGTAATCGAAGCCC
AACGATCTATGAACCAGCCCCCGTTTGGCTAGCCAAACGGACAAAGTGCCCTGCATCTTT
TTTATTTCCCCCACACCTTTTTTATATAAA

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1GH93JQ 727 0 0
C
GTTCATCCTATTGGCTCGGCTTTTAGGAAAAAAGTATCTTTCAAATTGGAGATTAAGCTA
TCTATAATAATATGAATACGACCTTTATTCTTCTGTTTGTTTGATCTAAAAACGAATCGA
ATTAAAAATATTCCGCGAAGGTCCGTAGTTGTAGAAACTAAGACTCATTTTTTATCATTC
AATAAGCATCTTGTATTTCATAAAAATTGGGGGCAATATAATCCTTACGTAAAGGCCACC
CTATCCAACTTTCGGGCATTAAGATCCGTTTCAGCCGAGGATGGCTATCATAAGTGATTC
CTAACATATCATAAGATTCCCGTTCTT*****TCCGTACTTTTCCAAACCCAGAAAACAG
ATGGAATTCTGGGATTACTCCTGTGAGTAAATACTTTTATGCAAACTTCTTCCGCTTGAT
TGACACCATATTCTATTCTCGTAAGATGATACACACTGGCTAAGAGGCCACCTGGTGCCA
CATCATAGGCACATTGGGAACGTAAATAATTGTAACCATATACATATAAAATTACAGCAA
TAGAATGCCAATCTTCGGGCTTTATTTGTAAAGTCTCCATTCCTTGGTAATCGAAGCCCA
ACGATCTATGAACCGGCCCCCGTTTGGCTAGCCAAACGGACAAAGTGCCCTGCATCTTTT
TTATTTCCCCCACACCTTTTTTATATAAATTTAAGTCTTTCACATTTACCATGAGTTCTA
ATTTAT

QA 2 727 2 727
DS 

RD RS1FX62JQ 734 0 0
AGTTCATCCTATTGGCTCGGCTTTTAGGAAAAAAGTATCTTTCAAATTGGAGATTAAGCT
ATCTATAATAATATGAATACGACCTTTATTCTTCTGTTTGTTTGAT**AAAAACGAATCG
AATTAAAAATATTCCGCGAAGGTCCGTAGTTGTAGAAACTAAGACTCATTTTTTATCATT
CAATAAGCATCTTGTATTTCATAAAAATTGGGGGCAATATAATCCTTACGTAAAGGCCAC
CCTATCCAACTTTCGGGCATTAAGATCCGTTTCAGCCGAGGATGGCTATCATAAGTGATT
CCTAACATATCATAAGATTCCCGTTCTTGAAAATCCGTACTTTTCCAAACCCAGAAAACA
GATGGAATTCTGGGATTACTCCTGTGAGTAAATACTTTTATGCAAACTTCTTCCGCTTGA
TTGACACCATATTCTATTCTCGTAAGATGATACACACTGGCTAAGAGGCCGCCTGGTGCC
ACATCATAGGCACATTGGGAACGTAAATAATTGTAACCATATACATATAAAATTACAGCA
ATAGAATGCCAATCTTCGGGCTTTATTTGTAAAGTCTCTATTCCTTGGTAATCGAAGCCC
AACGATCTATGAACCAGCCCCCGTTTGGCTAGCCAAACGGACAAAGTGCCCTGCATCTTT
TTTATTTCCCCCACACCTTTTTTATATAAATTTAAGTCTTTCACATTTACCATGAGTTCT
AATTTATGAAGATT

QA 1 734 1 734
DS 

RD RS1BP49JQ 805 0 0
AGTTCATCCTATTGGCTCGGCTTTTAGGAAAAAAGTATCTTTCAAATTGGAGATTAAGCT
ATCTATAATAATATGAATACGACCTTTATTCTTCTGTTTGTTTGATCTAAAAACGAATCG
AATTAAAAATATTCCGCGAAGGTCCGTAGTTGTAAAAACTAAAACTCATTTTTTATCATT
CAATAAGCATCTTGTATTTCATAAAAATTGGGGGCAATATAATCCTTACGTAAAGGCCAC
CCTATCCAACTTTCGGGCATTAAGATCCGTTTCAGCCGAGGATGGCTATCATAAGTGATT
CCTAACATATCATAAGATTCCCGTTCTTGAA**TCCGTACTTTTCCAAACCCAGAAAACA
GATGGAATTCTGGGATTACTCCTGTGAGTAAATACTTTTATGCAAACTTCTTCCGCTTGA
TTGACACCATATTCTATTCTCGTAAGATGATACACACTGGCTAAGAGGCCACCTGGTGCC
ACATCATAGGCACATTGGGAACGTAAATAATTGTAACCATATACATATAAAATTACAGCA
ATAGAATGCCAATCTTCGGGCTTTATTTGTAAAGTCTCTATTCCTTGGTAATCGAAGCCC
AACGATCTATGAACCAGCCCCCGTTTGGCTAGCCAAACGGACAAAGTGCCCTGCATCTTT
TTTATTTCCCCCACACCTTTTTTATATAAATTTAAGTCTTTCACATTTACCATGAGTTCT
AATTTATGAAGATTTTTTTCTTATTCTCTCAAATCCTCCCTAATTCACTAATTCGTGG*A
AGATACTGGGCTTTTGTATTTAAAA

QA 1 805 1 805
DS 

RD RS1H766TF 684 0 0
AATTGGGGGCAATATAATCTTTACGTAAAGGCCACCCTATCCAACTTTCGGGCATTAAGA
TCCGTTTCAGCCGAGGATGGCTATCATAAGTTATTCCTAACATATCATAAGATTCCCGTT
CTTGAAAATCCGTACTTTTCCAAACCCAGAAAACAGATGGAATTCTGGGATTACTCCTGT
GAGTAAATACTTTTATGCAAACTTCTTCCGCTTGATTGACACCATATTCTATTCTCGTAA
GGTGATACACACTGGCTAAGAGGCCACCTGGTGCCACATCATAGGCACATTGGGAACGTA
AATAATTGTAACCATATACATATAAAATTACAGCAATAGAATGCCAATCTTCGGGCTTTA
TTTGTAAAGTCTCTATTCCTTGGTAATCGAAGCCCAACGATCTATGAACCTGCCCCCGTT
TGGCTAGCCAAACGGACAAAGTGCCCTGCATCTTTTTTATTTCCCCCACACCTTTTTTAT
ATAAATTTAAGTCTTTCACATTTACCATGAGTTCTAATTTATGAAGATTTTTTTCTTATT
CTCTCAAATCCTCCCTAATTCACTAATTCGTGGGAAGATACTGGGCTTTTGTATTTAAAA
AAATGTTTCAGTAGAGATCTCTGAAGTAGATGATGGTGGATAGAGTAATTCTTGATCATA
ATTTCCAGTCTGCGTACTGC
CCCG

QA 1 680 1 680
DS 

RD RS1BP49TF 632 0 0
ATGCAAACTTCTTCCGCTTGATTGACACCATATTCTATTCTCGTAAGATGATACACACTG
GCTAAGAGGCCACCTGGTGCCACATCATAGGCACATTGGGAACGTAAATAATTGTAACCA
TATACATATAAAATTACAGCAATAGAATGCCAATCTTCGGGCTTTATTTGTAAAGTCTCT
ATTCCTTGGTAATCGAAGCCCAACGATCTATGAACCAGCCCCCGTTTGGCTAGCCAAACG
GACAAAGTGCCCTGCATCTTTTTTATTTCCCCCACACCTTTTTTATATAAATTTAAGTCT
TTCACATTTACCATGAGTTCTAATTTATGAAGATTTTTTTCTTATTCTCTCAAATCCTCC
CTAATTCACTAATTCGTGGGAAGATACTGGGCTTTTGTATTTAAAAAA*TGTTTCAGTAG
AGATCTCTGAAGTAGATGATGGTGGATAGAGTAATTCTTGATCATAATTTCCAGTCTGCG
TACTGCGTACAACAAAAAACTTGTGATTGGTAGTAAAACACCGATTACCCCGTTGAGGTC
TAATTCGATCCTTATAGATTTCTCTAGCTATTTTCTTACGAAGCTTTGTTATAGCGTCTA
TAACAGCCTCTGGTTTAGGTGGACAACCCGGC

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1D646JQ 718 0 0
CTCTCAAATCCTCCCTAATTCACTAATTCGTGGGAAGATACTGGGCTTTTGTATTTAAAA
AA*TGTTTCAGTAGAGATCTCTGAAGTAGATGATGGTGGATAGAGTAATTCTTGATCATA
ATTTCCAGTCTGCGTACTGCGTACAACAAAAAACTTGTGATTGGTAGTAAAACACCGATT
ACCCCGTTGAGGTCTAATTCGATCCTTATAGATTTCTCTAGCTATTTTCTTACGAAGCTT
TGTTATAGCGTCTATAACAGCCTCTGGTTTAGGTGGACAACCCGGCAAATAGACATCTAC
AGGAATTAGCTTATCAACCCCTCGAACAGTACTATAAGAATCGGTACTGAACATCCCCCC
TGTAATTGTACACGCTCCCATAGCAATAACATACTTTGGTTCAGGCATTTGTTCATATAA
TCTCACTAAAGAAGGAGCCATTTTCATTGTTACTGTACCTGCTGTTAAAATAAGGTCCGC
CTGCCTAGGACTTGATCTTGGTACTAGCCCATAACGATCAAAGTCAAATCGGGAGCCTAT
TAATGAGGCAAATTCAATAAAACAACAACTGGCACCATAAAGAAGCGGCCATAGGCTGGA
AAGTCTTGACCAATTTGAAAGATCATTTAACGTAGTTGAAATAACTGAGTTTTTTGTTGT
TCGATCAAGTACGGGAAACTTAATGGAATTCATAATTGTTTCAATGGTTTTTTTTACT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1DN59JQ 773 0 0
CTCTCAAATCCTCCCTAATTCAATAATTCGTGGGAAGATACTGGGCTTTTGTATTTAAAA
AA*TGTTTCAGTAGAGATCTCTGAAGTAGATGATGGTGGATAGAGTAATTCTTGATCATA
ATTTCCAGTCTGCGTACTGCGTACAACAAAAAACTTGTGATTGGTAGTAAAACACCGATT
ACCCCGTTGAGGTCTAATTCGATCCTTATAGATTTCTCTAGCTATTTTCTTACGAAGCTT
TGTTATAGCGTCTATAACAGCCTCTGGTTTAGGTGGACAACCCGGCAAATAGACATCTAC
AGGAATTAGCTTATCAACCCCTCGAACAGTACTATAAGAATCGGTACTGAACATCCCCCC
TGTAATTGTACACGCTCCCATAGCAATAACATACTTTGGTTCAGGCATTTGTTCATATAA
TCTCACTAAAGAAGGAGCCATTTTCATTGTTACTGTACCTGCTGTTAAAATAAGGTCCGC
CTGCCTAGGACTTGATCTTGGTACTAGCCCATAACGATCAAAGTCAAATCGGGAGCCTAT
TAATGAGGCAAATTCAATAAAACAACAACTGGTACCATAAAGAAGCGGCCATAGGCTGGA
AAGTCTTGACCAATTTGAAAGATCATTTAACGTAGTTGAAATAACTGAGTTTTTTGTTGT
TCGATCAAGTACGGGAAACTTAATGGAATTCATAATTGTTTCAATGGTTTTTTTTACTTT
TTTTTTTTTTGTTATTGTACAAGTATTCAGGAAACGAACTAAGACCATTCCA
A

QA 1 772 1 772
DS 

RD RS1GH93TF 754 0 0
TTCACTAA
TCGTGGGAAGATACTGGGCTTT*GTATTTAAAAA**TGTTTCAGTAGAGATCTCTGAAGT
AGATGATGGTGGATAGAGTAATTCTTGATCATAATTTCCAGTATGCGTACTGCGTACAAC
AAAAAACTTGTGATTGGTAGTAAAACACCGATTACCCCGTTGAGGTCTAATTCGATCCTT
ATAGATTTCTCTAGCTATTTTCTTACGAAGCTTTGTTATAGCGTCTATAACAGCCTCTGG
TTTAGGTGGACAACCCGGCAAATAGACATCTACAGGAATTAGCTTATCAACCCCTCGAAC
AGTACTATAAGAATCGGTACTGAACATCCCCCCTGTAATTGTACACGCTCCCATAGCAAT
AACATACTTTGGTTCAGGCATTTGTTCATATAATCTCACTAAAGAAGGAGCCATTTTCAT
TGTTACTGTACCTGCTGTTAAAATAAGGTCCGCCTGCCTAGGACTTGATCTTGGTACTAG
CCCATAACGATCAAAGTCAAATCGGGAGCCTATTAATGAGGCAAATTCAATAAAACAACA
ACTGGTACCATAAAGAAGCGGCCATAGGCTGGAAAGTCTTGACCAATTTGAAAGATCGTT
TAACGTAGTTGAAATAACTGAGTTTTTTGTTGTTCGATCAAGTACGGGAAACTTAATGGA
ATTCATAATTGTTTCAATGGTTTTTTTTACTTTTTTTTTTTT*GTTATTGTACAAGTATT
CAGGAAACGAACTAAGACCATTCCA
C

QA 9 753 9 753
DS 

RD RS1FX62TF 814 0 0
AGGTCTATTCGAT
CTTATAGATTTCTCTAGCTATTTT*TTACGAAGCTTTGTTATAGCGTCTATAACAGCCTC
TGGTT*AGGTGGACAACCCGGCAAATAGACATCTACAGGAATTAGCTTATCAACCCCTCG
AACAGTACTATAAGAATCGGTACTGAACATCCCCCCTGTAATTGTACACGCTCCCATAGC
AATAACATACTTTGGTTCAGGCATTTGTTCATATAATCTCACTAAAGAAGGAGCCATTTT
CATTGTTACTGTACCTGCTGTTAAAATAAGGTCCGCCTGCCTAGGACTTGATCTTGGTAC
TAGCCCATAACGATCAAAGTCAAATCGGGAGCCTATTAATGAGGCAAATTCAATAAAACA
ACAACTGGTACCATAAAGAAGCGGCCATAGGCTGGAAAGTCTTGACCAATTTGAAAGATC
ATTTAACGTAGTTGAAATAACTGAGTTTTTTGTTGTTCGATCAAGTACGGGAAACTTAAT
GGAATTCATAATTGTTTCAATGGTTTTTTTACTTTTTTTTTTTTTTGTTATTGTACAAGT
ATTCAGGAAACGAACTAAGACCATTCCAACGCTCCTTTTCGCCATGCATAAACTAAACCA
AGAATTAGGATAAGCACGAAAATGAAAGCTTCTATAAAAGCGGATACCCCTAGTACATCG
AAACTCATTGCCCACGGATACAGAAAAACGGTTTCAACATCAAAAACAACAAAAACTAGA
GCAAACATATAATAACGGATTCTAAATTGTAACCAAGCATCCCCGATCGGTTCTATACCT
GATTCATAACTAGAAAGTTTC

QA 14 814 14 814
DS 

RD RS1D646TF 762 0 0
TATAGCGTCTATAACAGCCTCTGGTTTAGGTGGACAACCCGGCAAATAGACATCTACAGG
AATTAGCTTATCAACCCCTCGAACAGTACTATAAGAATCGGTACTGAACATCCCCCCTGT
AATTGTACACGCTCCCATAGCAATAACATACTTTGGTTCAGGCATTTGTTCATATAATCT
CACTAAAGAAGGAGCCATTTTCATTGTTACTGTACCTGCTGTTAAAATAAGGTCCGCCTG
CCTAGGACTTGATCTTGGTACTAGCCCATAACGATCAAAGTCAAATCGGGAGCCTATTAA
TGAGGCAAATTCAATAAAACAACAACTGGCACCATAAAGAAGCGGCCATAGGCTGGAAAG
TCTTGACCAATTTGAAAGATCATTTAACGTAGTTGAAATAACTGAGTTTTTTGTTGTTCG
ATCAAGTACGGGAAACTTAATGGAATTCATAATTGTTTCAATGGTTTTTTTTACTTTTTT
TTTTTTTGTTATTGTACAAGTATTCAGGAAACGAACTAAGACCATTCCAACGCTCCTTTT
CGCCATGCATAAACTAAACCAAGAATTAGGATAAGCACGAAAATGAAAGCTTCTATAAAA
GCGGATACCCCTAGTACATCGAAACTCATTGCCCACGGATACAGAAAAACGGTTTCAACA
TCAAAAACAACAAAAACTAGAGCAAACATATAATAACGGATTCTAAATTGTAACCAAGCA
TCCCCGATCGGTTCTATACCTGATTCATAACTAGAAAGTTTC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1E730TF 632 0 0
ATT
GTACAAGTATTCAGGAAACGAACTAAGACCATTCCAACGCTCCTTTTCGCCATGCATAAA
CTAAACCAAGAATTAGGATAAGCACGAAAATGAAAGCTTCTATAAAAGCGGATACCCCTA
GTACATCGAAACTCATTGCCCACGGATACAGAAAAACGGTTTCAACATCAAAAACAACAA
AAACTAGAGCAAACATATAATAACGGATTCTAAATTGTAACCAAGCATCCCCGATCGGTT
CTATACCTGATTCATAACTAGAAAGTTTCTCCGGCCCCTTCGTAATTGGAGATAAAACCC
CGGAAATTAGAAATGCCAAAACAGGAATAGCACTTGATATTATTAAAA*TGCCCAGAAAA
TATCATATTCGTAAAGCAGAAACATAGACGAACTCCTATGAATGTGGAAAAAATACCCGC
TTAGTCACTTCCAATCGGAGTGGATTGGGCAAGGGATATATAACTCTTGCTTCAAAACCA
AAATTAAGGTTAATCGAATTAATCGAATTATTTATTTTTGTTTGGTTGCTGTGGTAGACG
TCCCCTTTTAAGATTTATTGATTGTAATCTTATTTTCAGTACACTTATTACTTAATATTT
CCATGTTTCTATTACTAATAGTTTCTCC
C

QA 4 631 4 631
DS 

RD RS1DN59TF 628 0 0
GTACAAGTATTCAGGAAACGAACTAAGACCATTCCAACGCTCCTTTTCGCCATGCATAAA
CTAAACCAGGAATTAGGATAAGCACGAAAATGAAAGCTTCTATAAAAGCGGATACCCCTA
GTACATCGAAACTCATTGCCCACGGATACAGAAAAACGGTTTCAACATCAAAAACAACAA
AAACTAGAGCAAACATATAATAACGGATTCTAAATTGTAACCAAGCATCCCCGATCGGTT
CTATACCTGATTCATAACTAGAAAGTTTCTCCGGCCCCTTCGTAATTGGAGATAAAACCC
CGGAAATTAGAAATGCCAAAACAGGAATAGCACTTGATATTATTAAAAATGCCCAGAAAA
TATCATATTCGTAAAGCAGAAACATAGACGAACTCCTATGAATGTGGAAAAAATACCCGC
TTAGTCACTTCCAATCGGAGTGGATTGGGCAAGGGATATATAACTCTTGCTTCAAAACCA
AAATTAAGGTTAATCGAATTAATCGAATTATTTATTTTTGTTTGGTTGCTGTGGTAGACG
TCCCCTTTTAAGATTTATTGATTGTAATCTTATTTTCAGTACACTTATTACTTAATATTT
CCATGTTTCTATTACTAATAGTTTCTCC

QA 1 628 1 628
DS 

RD RS1E730JQ 629 0 0
GTACAAGTATTCAGGAAACGAACTAAGACCATTCCAACGCTCCTTTTCGCCATGCATAAA
CTAAACCAAGAATTAGGATAAGCACGAAAATGAAAGCTTCTATAAAAGCGGATACCCCTA
GTACATCGAAACTCATTGCCCACGGATACAGAAAAACGGTTTCAACATCAAAAACAACAA
AAACTAGAGCAAACATATAATAACGGATTCTAAATTGTAACCAAGCATCCCCGATCGGTT
CTATACCTGATTCATAACTAGAAAGTTTCTCCGGCCCCTTCGTAATTGGAGATAAAACCC
CGGAAATTAGAAATGCCAAAACAGGAATAGCACTTGATATTATTAAAA*TGCCCAGAAAA
TATCATATTCGTAAAGCAGAAACATAGACGAACTCCTATGAATGTGGAAAAAATACCCGC
TTAGTCACTTCCAATCGGAGTGGATTGGGCAAGGGATATATAACTCTTGCTTCAAAACCA
AAATTAAGGTTAATCGAATTAATCGAATTATTTATTTTTGTTTGGTTGCTGTGGTAGACG
TCCCCTTTTAAGATTTATTGATTGTAATCTTATTTTCAGTACACTTATTACTTAATATTT
CCATGTTTCTATTACTAATAGTTTCTCCC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 5 15

CO CL12Contig1 905 2 7 U
AGGAACCATATATTCTTACATGTTTACATATATACTTTCACACGCAAACAAATTATAGGA
AACAACGCAAGAAATTAAAGCAGTGCTTTAAGAAAGTTAAAAAAGGGAGATTCATATATT
CTTGATTATACTTGAGCAGAAGGGAAGCTGCGGAATGGATCCCCAAGTGCAGCCACATTT
CCAGGACGTGAGAAAACTACCTGATAGTTTCCAAGGGTAAGAGTCTTGAAACCAGCTACA
CAGTAGTCAAAATAATATTCCCATGTCCTTATGAATTTATCGTCGAATCCAAGATCATTT
ATTTGTTTCTGTCTTTCCAAGAAGGTCTTCCTCCACAATCTCAATGTTTGGTAGTAATGA
ATCCCAATGTTCTCAACGTTTTCAATGCATAGCCTAAAAGAAGATGCCATAGCTGAAGTA
ACTCTGGCTAAAGAAGGAAGGCATCCACCAGGAAATATGTATTCTTTTATGAAATCTGAA
CTTAGTCTGTACTCATCATAACGCTCCTCAGGTATTGATATGAACTGCAATACAAAAACA
CCGTCTTCTGCAAGTGCAGCTTCAAAATGACTAAAAAATGTCTCCATGAATTCATGGCCA
ACAGCTTCTAGCATCTCGCAAGATATAATCCTGTCATATTTGTGAGCATCAGATAGTTGG
CGATAATCGCAGAGCTTGAACTTAATCCGATCCTCAAGTCCAGCTTCTTTCACTTTTTCT
TCTGCATACTTAAGTTGTTCAATAGATAGTGTGATGCCAGTGTATTTGCATCCAGTTCTT
CTCACAACTTCTATGGCCAAAGTTCCCCACCCGCATCCGATTTCTAAAACCTCATGGTCC
TTCTCTATCCTTGCCTTATCAATCAGAGATATATTTTCCTCATTTGTGCATTCTCAGACC
TTCAT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 

AF RS1FP13JQ U 5
AF RS1A737JQ U 1
BS 1 237 RS1A737JQ
BS 238 238 RS1FP13JQ
BS 239 286 RS1A737JQ
BS 287 287 RS1FP13JQ
BS 288 396 RS1A737JQ
BS 397 397 RS1FP13JQ
BS 398 905 RS1A737JQ

RD RS1FP13JQ 829 0 0
ACCATATATTCTTACATGTTTACATATATACTTTCACACGCAAACAAATTATAGGAAACA
ACGCAAGAAATTAAAGCAGTGCTTTAAGAAAGTTAAAAAAGGGAGATTCATATATTCTTG
ATTATACTTGAGCAGAAGGGAAGCTGCGGAATGGATCCCCAAGTGCAGCCACATTTCCAG
GACGTGAGAAAACTACCTGATAGTTTCCAAGGGTAAGAGTCTTGAAACCAGCTACACAGT
AGTCAAAATAATATTCCCATGTCCTTATGAATTTATCGTCGAATCCAAGATCATTTATTT
GTTTCTGTCTTTCCAAGAAGGTCTTCCTCCACAATCTCAATGTTTGGTAGTAATGAATCC
CAATGTTCTCAACGTTTTCAATGCATAGCCTAAAAGAAGATGCCATAGCTGAAGTAACTC
TGGCTAAAGAAGGAAGGCATCCACCAGGAAATATGTATTCTTTTATGAAATCTGAACTTA
GTCTGTACTCATCATAACGCTCCTCAGGTATTGATATGAACTGCAATACAAAAACACCGT
CTTCTGCAAGTGCAGCTTCACAATGACTAAAAAATGTCTCCATGAATTCATGGCCAACAG
CTTCTAGCATCTCGCAAGATATAATCCTGTCATATTTGTGAGCATCAGATAGTTGGCGAT
AATCGCAGAGCTTGAACTTAATCCGATCCTCAAGTCCAGCTTCTTTCACTTTTTCTTCTG
CATACTTAAGTTGTTCAATAGATAGTGTGATGCCAGTGTATTTGCATCCAGTTCTTCTCA
CAACTTCTATGGCCAAAGTTCCCCACCCGCATCCGATTTCTAAA
CCTCA

QA 1 824 1 824
DS 

RD RS1A737JQ 905 0 0
AGGAACCATATATTCTTACATGTTTACATATATACTTTCACACGCAAACAAATTATAGGA
AACAACGCAAGAAATTAAAGCAGTGCTTTAAGAAAGTTAAAAAAGGGAGATTCATATATT
CTTGATTATACTTGAGCAGAAGGGAAGCTGCGGAATGGATCCCCAAGTGCAGCCACATTT
CCAGGACGTGAGAAAACTACCTGATAGTTTCCAAGGGTAAGAGTCTTGAAACCAGCTGCA
CAGTAGTCAAAATAATATTCCCATGTCCTTATGAATTTATCGTCGA*TCCAAGATCATTT
ATTTGTTTCTGTCTTTCCAAGAAGGTCTTCCTCCACAATCTCAATGTTTGGTAGTAATGA
ATCCCAATGTTCTCAACGTTTTCAATGCATAGCCTAGAAGAAGATGCCATAGCTGAAGTA
ACTCTGGCTAAAGAAGGAAGGCATCCACCAGGAAATATGTATTCTTTTATGAAATCTGAA
CTTAGTCTGTACTCATCATAACGCTCCTCAGGTATTGATATGAACTGCAATACAAAAACA
CCGTCTTCTGCAAGTGCAGCTTCAAAATGACTAAAAAATGTCTCCATGAATTCATGGCCA
ACAGCTTCTAGCATCTCGCAAGATATAATCCTGTCATATTTGTGAGCATCAGATAGTTGG
CGATAATCGCAGAGCTTGAACTTAATCCGATCCTCAAGTCCAGCTTCTTTCACTTTTTCT
TCTGCATACTTAAGTTGTTCAATAGATAGTGTGATGCCAGTGTATTTGCATCCAGTTCTT
CTCACAACTTCTATGGCCAAAGTTCCCCACCCGCATCCGATTTCTAAAACCTCATGGTCC
TTCTCTATCCTTGCCTTATCAATCAGAGATATATTTTCCTCATTTGTGCATTCTCAGACC
TTCAT

QA 1 905 1 905
DS 



CO CL12Contig2 824 2 4 U
GCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGTAA
GTATGAACGAATTCAGACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTGTT
TGATGGTAACTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCAACAAACC
CCGACTTCTGGAAGGGATGCATTTATTAGATAAAAGGTCGACGCGGACTCTGCGTTGATA
CCACTGCTTACGGCCGGGGCTGCTAGGAAAAGATATGGTTCCTCCTCTGAGCAACCCGAA
ACATATGGTCCCATCTCTAACCGAGAAAGGGGCTCGGTTATTCGTTACTAGATTCTTGAG
ACATTTCATATCAACCGGTTGCATAATAATACATGAAGAAGGAGGAACAGTTTTCACTTT
CCAAGGAAAAGATTCGAGATGTGACTTGAAATCTATCCTGCAAATTCACAGTCCTCAGTT
TTACTGGAAGGTTATGACACAGGCAGATTTAGGTCTTGCTGATGCTTATATCAATGGAGA
TTTTTCGTTTGCTGATAAGGAAAGAGGACTTTTGGATTTTATCATGATTCTCATTGCTAA
CAAAGAGCTGAACTCAAAAAACTCAAAACTTGCTAAGAAAAGGGGATGGTGGACACCTAT
GTTTCTGACTGCCGGTTTAGCATCTGCAAATAATTTTCTAAAGCATTTCTCTAGGCAGAA
CACACTAACTCAAGCTAGAAGGAACATTTCTCGTCACTATGACCTTAGTAACGAGCTTTT
TGCTTTGTTCTTGGATGATACCACGACTTATTCCTCTGCAGTAT


BQ
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AF RS1BQ66TF U 1
AF RS1A737TF U 16
BS 1 43 RS1BQ66TF
BS 44 44 RS1A737TF
BS 45 219 RS1BQ66TF
BS 220 824 RS1A737TF

RD RS1BQ66TF 219 0 0
GCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTGAGCCATGCATGTGTAA
GTATGAACGAATTCAGACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTGTT
TGATGGTAACTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCAACAAACC
CCGACTTCTGGAAGGGATGCATTTATTAGATAAAAGGTC

QA 1 219 1 219
DS 

RD RS1A737TF 809 0 0
CAGTAGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGTAAGTATGAACGAATTCA
GACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTGTTTGATGGTAACTACTA
CTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCAACAAACCCCGACTTCTGGAAGG
GATGCATTTATTAGATAAAAGGTCGACGCGGACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCC
GGGGCTGCTAGGAAAAGATATGGTTCCTCCTCTGAGCAACCCGAAACATATGGTCCCATC
TCTAACCGAGAAAGGGGCTCGGTTATTCGTTACTAGATTCTTGAGACATTTCATATCAAC
CGGTTGCATAATAATACATGAAGAAGGAGGAACAGTTTTCACTTTCCAAGGAAAAGATTC
GAGATGTGACTTGAAATCTATCCTGCAAATTCACAGTCCTCAGTTTTACTGGAAGGTTAT
GACACAGGCAGATTTAGGTCTTGCTGATGCTTATATCAATGGAGATTTTTCGTTTGCTGA
TAAGGAAAGAGGACTTTTGGATTTTATCATGATTCTCATTGCTAACAAAGAGCTGAACTC
AAAAAACTCAAAACTTGCTAAGAAAAGGGGATGGTGGACACCTATGTTTCTGACTGCCGG
TTTAGCATCTGCAAATAATTTTCTAAAGCATTTCTCTAGGCAGAACACACTAACTCAAGC
TAGAAGGAACATTTCTCGTCACTATGACCTTAGTAACGAGCTTTTTGCTTTGTTCTTGGA
TGATACCACGACTTATTCCTCTGCAGTAT

QA 1 809 1 809
DS 



CO CL12Contig3 1212 6 21 U
GAACTTTTAAAGATTTTGTACATAATTTGCGTTCATATATGCACAAAGAGATAAACACAT
AAATGTAGGTCGGACAAGGGAAATAAAAA*CTAACAAAAACTTCCACATTATCCACAATC
AAGAGTCAATGAATGTGTACACCATGTGCCCTTAACTTAAACTCAGTCTTGGTGGATTTC
ATCAAAAGGGGCAGGAGCAAACCTCACATCTTCAGGCCGTGCAATCACCGCAGGCTCATC
AGCGAAAAGGGCTTTGAGGAAAGATGGAGTCTTCAAGGGTCGCCTATCCGTCATTCGTGG
ATAGACAAATGCCAAAAAGTAATAGGCGTGACCTGCTATCATTCCCAATAAATCCCCCCA
GGGACTTGCACCAACAAGGACAGAGAATCCAAGAAGTACCCATGGTAAATACGCTGCTGT
AAAAGTGAAAAGGCCAAGGAAACTCATGTGGACGTAAGGATTCTGTTTGCTCCATACATA
CACCATCATGAAAGTCAAAGAGTTGCTGAGGAAAATGATCTGGGAGATTGAGACTGACAA
ATAAGGTATGGTTCCGCCAATTAGGACAATGCCGGTAAGAACAGTTGCTCCGAACAAGAG
CATGTAAAGGAAATCAGCAGTCTTCCCCCTGAAGGAGTTTTCTTCAAGGAGTTTGCAGTA
TCTAGCTAGAAAAAACATATGGAACAAGAAGTCCAAATCCATATTGCGGAAATAAAGAAA
ATTGGTGACGAGGCGCCATAACTGGTACTGCTTCACCACAAGGGTCGGATTCAGGTAAAG
ATTATACGGTGATATTATCTCGAGGGAACATCCGACGGTGGTGACAACAGCCGCCGTGAG
ATACGACCTTGTTATAATCGGCATCTGCTTGTACCATTCTTCCACCGCTTGAGCCATAAT
TATTCCACCTAATCGCCCGATTGGATTCAGAATCAGCCCTACAGAAACTTTTTTTAATAT
CGGAAACGAAAGCGATTGAATTTTTTCTCCTTTTTTTTCTTTCCCGCACGTATGGATCGG
TATCAACGCAGAGTCCGCGTCGACCTTTTATCTAATAAATGCATCCCTTCCAGAAGTCGG
GGTTTGTTGCACGTATTAGCTCTAGAATTACTACGGTTATCCGAGTAGTAGTTACCATCA
AACAAACTATAACTGATTTAATGAGCCATTCGCAGTTTCACAGTCTGAATTCGTTCATAC
TTACACATGCAC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 20 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 5 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 5 20 5 20 5 5 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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ATAATCGGCATCTGCTTGTACCATTCTTCCACCGCTTGAACCATAATTATTCCACCTAAT
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TTCTTCCACCGCTTGAGCCATAATTATTCCACCTAATCGCCCGATTGGATTCAGAATCAG
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TTCTTTCCCGCACGTATGGATC
C

QA 1 682 1 682
DS 

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CCGCCGTGAGATACGACCTTGTTATAATCGGCATCTGCTTGTACCATTCTTCCACCGCTT
GAGCCATAATTATTCCACCTAATCGCCCGATTGGATTCAGAATCAGCCCTACAGAAACTT
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GTTACCATCAAACAAACTATAACTGATTTAATGAGCCATTCGCAGTTTCACAGTCTGAAT
TCGTTCATACTTACACATGCAC

QA 1 682 1 682
DS 



CO CL12Contig4 1148 3 4 U
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GTGGTTTTATTTTTTTCCCACAGCCATGGGTATGGAGCTTAGGAGAAAATCGAAAACTTG
TAGATCCGCGATCGTCTTTATCCCCCGACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGG
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TCACGGCGGCTGTTGTCACCACCGTCGGATGTTCCCTCGAGATAATATCACCGTATAATC
TTTACCTGAATCCGACCCTTGTGGTGAAGCAGTACCAGTTATGGCGCCTCGTCACCAATT
TTCTTTATTTCCGCAATATGGATTTGGACTTCTTGTTCCATATGTTTTTTCTAGCTAGAT
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TCTTGTTCGGAGCAACTGTTCTTACCGGCATTGTCCTAATTGGCGGAACCATACCTTATT
TGTCAGTCTCAATCTCCCAGATCATTTTCCTCAGCAACTCTTTGACTTTCATGATGGTGT
ATGTATGGAGCAAACAGAATCCTTACGTCCACATGAGTTTCCTTGGCCTTTTCACTTTTA
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1E533TF U 1
AF RS1ER96TF U 460
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TCACGGCGGCTGTTGTCACCACCGTCGGATGTTCCCTCGAGATAATATCACCGTATAATC
TTTACCTGAATCCGACCCTTGTGGTGAAGCAGTACCAGTTATGGCGCCTCGTCACCAATT
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DS 

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GTGGTTTTATTTTTTTCCCACAGCCATGGGTATGGAGCTTAGGAGAAAATCGAAAACTTG
TAGATCCGCGATCGTCTTTATCCCCCGACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGG
ATCCATACGTGCGGGAAAGAAAAAAAAAAGGAGAAAAAATTCAATCGCTTTCGTTTCCGA
TATTTAAAAAAGTTTCTGTAGGGCTGATTCTGAATCCAATCGGGCGATTAGGTGGAATAA
TTATGGCTCAAGCGGTGGAAGAATGGTACAAGCAGATGCCGATTATAACAAGGTCGTATC
TCACGGCGGCTGTTGTCACCACCGTCGGATGTTCCCTCGAGATAATATCACCGTATAATC
TTTACCTGAATCCGACCCTTGTGGTGAAGCAGTACCAGTTATGGCGCCTCGTCACCAATT
TTCTTTATTTCCGCAATATGGATTTGGACTTCTTGTTCCATATGTTTTTTCTAGCTAGAT
ACTGCAAACTCCTTGAAGAAAACTCCTTCAGGGG*AAGACTGCTGATTTCCTTTACATGC
TCTTGTT

QA 1 607 1 607
DS 

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G
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TATGTTTTTTCTAGCTAGATACTGCAAACTCCTTGAAGAAAACTCCTTCAGGGGGAAGAC
TGCTGATTTCCTTTACATGCTCTTGTTCGGAGCAACTGTTCTTACCGGCATTGTCCTAAT
TGGCGGAACCATACCTTATTTGTCAGTCTCAATCTCCCAGATCATTTTCCTCAGCAACTC
TTTGACTTTCATGATGGTGTATGTATGGAGCAAACAGAATCCTTACGTCCACATGAGTTT
CCTTGGCCTTTTCACTTTTACTGCAGCGTATTTACCATGGGTGAGTTGGACTTTTCTCAT
TTTCTTACGATAGTTTGAATCATATCTTACGCCAGGTTCTGAAAATTGGCAGGTGCTTCT
TGGATTCTCTGTCCTTGTTGGTGCAAGTCCCTGGGGGGATTTACTGGGAATGATAGCAGG
TCACGCCTATTACTTTTTGGCATTTGTCTATCCACGAATGACCGATAGGCGACCCTTGAA
GACTCCATCTTTCCTCAAAGCCCTTTTCGCTGATGAGCCTGTGGTGATTGCACGGCCTGA
AGATGTTAGGTTTGCTCCTGCCCCTTTTGATGAAATCCACCAAGACTGAGCCCTCATCCT
CCACACAGCACAGTTTAAGTTAAGGGCA

QA 2 689 2 689
DS 



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CAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTGGTAACGGGTGACGGAGAATTAGGG
TTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGACTACCACATCCAAGTGGTTATACTGCTTC
TCTTCACAAACACAAAAAAAAACTGTAAATGTATGTTGAAGAATGTAGTTTTTGAGGTAA
AGTAGTTGAACTTGAGATAGTGGAAAAACATGTTTAAATTTTGAAAAAGCATCGATTTCT
GTTAACTATTTTTTTTCTAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1E708TF U 1
AF RS1EE34TF U 48
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TTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGACTACCACATCCAAGTGGTTATACTGCTTC
TCTTCACAAACACAAAAAAAAACTGTAAATGTATGTTGAAGAATGTAGTTTTTGAGGTAA
AGTAGTTGAACTTGAGATAGTGGAAAAACATGTTTAAATTTTGAAAAAGCATCGATTTCT
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QA 1 503 1 503
DS 

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TGATGATTCATGATAACTCGACGGATCGCATGGCCTTTGTGCTGGCGACGCATCATTCAA
ATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTGGTAACGGGTGA
CGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGACTACCACATCCAAGTG
GTTATACTGCTTCTCTTCACAAACACAAAAAAAAACTGTAAATGTATGTTGAAGAATGTA
GTTTTTGAGGTAAAGTAGTTGAACTTGAGATAGTGGAAAAACATGTTTAAATTTTGAAAA
AGCATCGATTTCTGTTAACTATTTTTTTTCTAAAAA

QA 1 456 1 456
DS 



AS 4 20

CO CL13Contig1 705 2 2 U
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CAATAGGTTTATGAAGCTTCTAATAGAAACAACAACTCTCACTCAATTAAGACAGCGGAA
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GTCTGGGTAATTGGATGTAAGACTCTCCAATTCTTCCTTTAAGAGAATGTCTTCGTATGT
GACATTGGCATAAACGAGGTGAACCTTTGTCTTGTCTGTTGGGTTTTCTAGAATTGCTCT
TGCCACTTGGAACATGGGAGTGATGCCTGAACCTCCAGCAAGCATTCCAAATGCCCTAAA
CTGACCTGGCTGATACTTGAACCTACCCTTTGGTCCCTTGACAGCAAGATGGTCTCCAAC
ACGCATCTCCCTGAAATGATGAGACATCCTTCCTTGCGGATACCC


BQ
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AF RS1AE62TF C 1
AF RS1AE62JQ U 2
BS 1 1 RS1AE62TF
BS 2 705 RS1AE62JQ

RD RS1AE62TF 704 0 0
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CAAT*GGTTTATGAAGCTTCTAATAGAAACAACAACTCTCACTCAATTAAGACAGCGGAA
CACTCATTATTGATCAGAGATACGAGTTTTTTTTTTCTCTTTTAAATAGCTCCATTTTGT
GGAGAAGTAATCAAAAGCAGAGTATTTAGATCAGAACTGGAATTGCATCTCTGGAGAGTA
ACCAAGAGCTTCAAGGTTTGCAGCCATGGCCTTGTTCATCGGCGGTGGTCCACATCTCAG
GATCTGAATATCAGATGCTGGTGCAGGGCAGTGGGCCTGAATCATTTCCTTAGATACAAA
TCCAACACCACCATCCCATGTTTCTGGAGGCTGGTTCAGAACATAGTAGATTTTGAACTG
GTCTGGGTAATTGGATGTAAGACTCTCCAATTCTTCCTTTAAGAGAATGTCTTCGTATGT
GACATTGGCATAAACGAGGTGAACCTTTGTCTTGTCTGTTGGGTTTTCTAGAATTGCTCT
TGCCACTTGGAACATGGGAGTGATGCCTGAACCTCCAGCAAGCATTCCAAATGCCCTAAA
CTGACCTGGCTGATACTTGAACCTACCCTTTGGTCCCTTGACAGCAAGATGGTCTCCAAC
ACGCATCTCCCTGAAATGATGAGACATCCTTCCTTG
CGATACCC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RS1AE62JQ 704 0 0
CCAAATCTTTAACCAATAAATCAGAACTCCCAACGAGATAACAAACGGTCAAACAAACAC
AATAGGTTTATGAAGCTTCTAATAGAAACAACAACTCTCACTCAATTAAGACAGCGGAAC
ACTCATTATTGATCAGAGATACGAGTTTTTTTTTTCTCTTTTAAATAGCTCCATTTTGTG
GAGAAGTAATCAAAAGCAGAGTATTTAGATCAGAACTGGAATTGCATCTCTGGAGAGTAA
CCAAGAGCTTCAAGGTTTGCAGCCATGGCCTTGTTCATCGGCGGTGGTCCACATCTCAGG
ATCTGAATATCAGATGCTGGTGCAGGGCAGTGGGCCTGAATCATTTCCTTAGATACAAAT
CCAACACCACCATCCCATGTTTCTGGAGGCTGGTTCAGAACATAGTAGATTTTGAACTGG
TCTGGGTAATTGGATGTAAGACTCTCCAATTCTTCCTTTAAGAGAATGTCTTCGTATGTG
ACATTGGCATAAACGAGGTGAACCTTTGTCTTGTCTGTTGGGTTTTCTAGAATTGCTCTT
GCCACTTGGAACATGGGAGTGATGCCTGAACCTCCAGCAAGCATTCCAAATGCCCTAAAC
TGACCTGGCTGATACTTGAACCTACCCTTTGGTCCCTTGACAGCAAGATGGTCTCCAACA
CGCATCTCCCTGAAATGATGAGACATCCTTCCTTGCGGATACCC

QA 1 704 1 704
DS 



CO CL13Contig2 1031 8 19 U
GGACACCACTCCAAAAAGAACTGATCCTAATTTGATCCTTTTCATTTGCAATGGATACCG
AGTTTCTCCGAACCCTAGATCGCCAGATTCTCTTGGGTGTCTTCGTCGCTTTCGTCGCCG
TCAGTGCCGGTGCTGCTTTTTATCTCTCCTCCTCCAAGAAACGCAGAGGGTGTTTGGATC
CAGAGAATTTCAAAGAGTTCAAGCTTGTTAAGAAGCAGCAACTCAGTCACAATGTCGCCA
AATTCGTTTTTGAACTCCCTTCTTCTACTGCTGCGTTGGGTCTTCCCATTGGACAACACA
TCAGTTGCAGGGGAAAGGATGCTCAAGGAGAGGATGTTATTAAGCCTTACACTCCCACTA
CGTTAGATTCAGATCTTGGACGCTTTGAGCTTGTCATTAAGATGTATCCACAAGGAAGGA
TGTCTCATCATTTCAGGGAGATGCGTGTTGGAGACCATCTTGCTGTAAAAGGACCAAAGG
GAAGGTTCAAGTATCAGCCAGGTCAGTTTAGGGCATTTGGCATGCTTGCTGGAGGTTCAG
GCATCACTCCCATGTTTCAAGTTGCAAGAGCGATTCTTGAAAACCCAACAGACAAGACAA
AGGTGCATCTCATTTATGCCAATGTCACATACGATGACATTCTCTTAAGGGAAGAATTGG
AGAGTCTTACAGCCAATTACCCAGATCAATTCAAAATTTACTATGTTTTGAACCAGCCTC
CGGAGACATGGGATGGTGGTGTTGGATTTGTATCAAAGGAAATGATCCAGGCTCATTGCC
CTGCACCTGCATCCGATATTCAGGTCTTGAGATGTGGACCACCGCCAATGAACAAGGCCA
TGGCTGCAAACCTTGAAGCTCTTGGTTACTCTCCAGAGATGCAATTCCAGTTCTGATTGA
TCCCAAAAAGATGGAACTATTTAGAAAAGAAAAAAAAA*CGTATTTCTTTGATCAAATAA
TTTTTGTTACAATTTCTTTTTTTTTTT*GAATGAATGTTAAATTTTATTCATCAAAAAGC
CTTTTTACATC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 
10 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 5 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RS1EI75TF U 43
AF RS1BO14TF U 1
AF RS1H537TF U 3
AF RS1E611TF U 537
AF RS1BO14JQ C 263
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AF RS1AK24TF U 470
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RD RS1EI75TF 440 0 0
CA
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GTCGCTTTCGTCGCCGTCAGTGCCGGTGCTGCTTTTTATCGCTCCTCCTCCAAGAAACGC
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AGTCACAATGTCGCCAAATTCGTTTTTGAACTCCCTTCTTCTACTGCTGCGCTGGGTCTT
CCCATTGGACAACACATCAGTTGCAGGGGAAAGGATGCTCAAGGAGAGGATGTTATTAAG
CCTTACACTCCCACTACGTTAGATTCAGATCTTGGACGCTTTGAGCTTGTCATTAAGATG
TATCCACAAGGAAGGATGTCTCATCATTTCAGGGAGATGCGTGTTGGAGACCATCTTGCT
GTAAAAGGACCAAAGGGA

QA 3 440 3 440
DS 

RD RS1BO14TF 645 0 0
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AGTTTCTCCGAACCCTAGATCGCCAGATTCTCTTGGGTGTCTTCGTCGCTTTCGTCGCCG
TCAGTGCCGGTGCTGCTTTTTATCTCTCCTCCTCCAAGAAACGCAGAGGGTGTTTGGATC
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AATTCGTTTTTGAACTCCCTTCTTCTACTGCTGCGTTGGGTCTTCCCATTGGACAACACA
TCAGTTGCAGGGGAAAGGATGCTCAAGGAGAGGATGTTATTAAGCCTTACACTCCCACTA
CGTTAGATTCAGATCTTGGACGCTTTGAGCTTGTCATTAAGATGTATCCACAAGGAAGGA
TGTCTCATCATTTCAGGGAGATGCGTGTTGGAGACCATCTTGCTGTAAAAGGACCAAAGG
GAAGGTTCAAGTATCAGCCAGGTCAGTTTAGGGCATTTGGCATGCTTGCTGGAGGTTCAG
ACACCACTCCCATATTTCAAGTTGCAAGAGCGATTCTTGAAAACCCAACAGACAAGACAA
AGGTGCATCTCATTTATGCCAATGTCACATACGATGACATTCTCT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1H537TF 642 0 0
GG
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TCTCCGAACCCTAGATCGCCAGATTCTCTTGGGTGTCTTCGTCGCTTTCGTCGCCGTCAG
TGCCGGTGCTGCTTTTTATCTCTCCTCCTCCAAGAAACGCAGAGGGTGTTTGGATCCAGA
GAATTTCAAAGAGTTCAAGCTTGTTAAGAAGCAGCAACTCAGTCACAATGTCGCCAAATT
CGTTTTTGAACTCCCTTCTTCTACTGCTGCGTTGGGTCTTCCCATTGGACAACACATCAG
TTGCAGGGGAAAGGATGCTCAAGGAGAGGATGTTATTAAGCCTTACACTCCCACTACGTT
AGATTCAGATCTTGGACGCTTTGAGCTTGTCATTAAGATGTATCCACAAGGAAGGATGTC
TCATCATTTCAGGGAGATGCGTGTTGGAGACCATCTTGCTGTAAAAGGACCAAAGGGAAG
GTTCAAGTATCAGCCAGGTCAGTTTAGGGCATTTGGCATGCTTGCTGGAGGTTCAGGCAT
CACTCCCATGTTTCAAGTTGCAAGAGCGATTCTTGAAAACCCAACAGACAAGACAAAGGT
GCATCTCATTTATGCCAATGTCACATACGATGACATTCTC

QA 3 642 3 642
DS 

RD RS1E611TF 482 0 0
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ACAAAGGTGCATCTCATTTATGCCAATGTCACATACGATGACATTCTCTTAAGGGAAGAA
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TGCCCTGCACCTGCATCCGATATTCAGGTCTTGAGATGTGGACCACCGCCAATGAACAAG
GCCATGGCTGCAAACCTTGAAGCTCTTGGTTACTCTCCAGAGATGCAATTCCAGTTCTGA
TTGATCCCAAAAAGATG*AACTATTTAGAAAAGAAAAAAAAA*CGTATTTCTTTGATCAA
ATAATTTTTGTTACAATTTCTTTTTTTTTT**GAATGAATGTTAAATTTTATTCATCAAA
AA

QA 1 482 1 482
DS 

RD RS1BO14JQ 769 0 0
TTCTACTGCTGCGTTGGGTCTTCCCATTGGACAACACATCAGTTGCAGGGGAAAGGATGC
TCAAGGAGAGGATGTTATTAAGCCTTACACTCCCACTACGTTAGATTCAGATCTTGGACG
CTTTGAGCTTGTCATTAAGATGTATCCACAAGGAAGGATGTCTCATCATTTCAGGGAGAT
GCGTGTTGGAGACCATCTTGCTGTAAAAGGACCAAAGGGAAGGTTCAAGTATCAGCCAGG
TCAGTTTAGGGCATTTGGCATGCTTGCTGGAGGTTCAGACACCACTCCCATATTTCAAGT
TGCAAGAGCGATTCTTGAAAACCCAACAGACAAGACAAAGGTGCATCTCATTTATGCCAA
TGTCACATACGATGACATTCTCTTAAGGGAAGAATTGGAGAGTCTTACAGCCAATTACCC
AGATCAATTCAAAATTTACTATGTTTTGAACCAGCCTCCGGAGACATGGGATGGTGGTGT
TGGATTTGTATCAAAGGAAATGATCCAGGCTCATTGCCCTGCACCTGCATCCGATATTCA
GGTCTTGAGATGTGGACCACCGCCAATGAACAAGGCCATGGCTGCAAACCTTGAAGCTCT
TGGTTACTCTCCAGAGATGCAATTCCAGTTCTGATTGATCCCAAAAAGATGGAACTATTT
AGAAAAGAAAAAAAA**CGTATTTCTTTGATCAAATAATTTTTGTTACAATTTCTTTTTT
TTTTTTGAATGAATGTTAAATTTTATTCATCAAAAAGCCTTTTTACATC

QA 1 769 1 769
DS 

RD RS1H537JQB 421 0 0
CATTTATGCCAATGTCACATACGATGACATTATCTTAAGGGAAGAATTGGAGAGTCTTAC
AGCCAATTACCCAGATCAATTCAAAATTTATTATGTTTTGAACCAGCCTCCGGAGACATG
GGATGGTGGTGTTGGATTTGTATCAAAGGAAATGATCCAGGCTCATTGCCCTGCACCTGC
ATCCGATATTCAGGTCTTGAGATGTGGACCACCGCCAATGAACAAGGCCATGGCTGCAAA
CCTTGAAGCTCTTGGTTACTCTCCAGAGATGCAATTCCAGTTTTGATTGATCCCAAAAAG
ATGGAACTATTTAGAAAAGAAAAAAAAA*CGTATTTCTTTGATCAAATAATTTTTGTTAC
AATTTCTTTTTTTTTT**GAATGAATGTTAAATTTTATTCATCAAAAAGCCTTTTTACAT
C

QA 1 420 1 420
DS 

RD RS1AK24JQ 561 0 0
GGGACCAAAGGGAAGGTTCAAGTATCAGCCAGGTCAGTTTAGGGCATTTGGCATGCTTGC
TGGAGGTTCAGGCATCACTCCCATGTTTCAAGTTGCAAGAGCGATTCTTGAAAACCCAAC
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GGAAGAATTGGAGAGTCTTACAGCCAATTACCCAGATCAATTCAAAATTTACTATGTTTT
GAACCAGCCTCCGGAGACATGGGATGGTGGTGCTGGATTTGTATCAAAGGAAATGATCCA
GGCTCATTGCCCTGCACCTGCATCCGATATTCAGGTCTTGAGATGTGGACCACCGCCAAT
GAACAAGGCCATGGCTGCAAACCTTGAAGCTCTTGGTTACTCTCCGGAGATACAATTCCA
GTTCTGATTGATCCCAAAAAGATGGAACTATTTAGAAAAGAAAAAAAAAACGTATTTCTT
TGATCAAATAATTTTTGTTACAATTTCTTTTTTTTTTT*GAATGAATGTTAAATTTTATT
CATCAAAAAGCCTTTTTACAT

QA 1 561 1 561
DS 

RD RS1AK24TF 561 0 0
GGGACCAAAGGGAAGGTTCAAGTATCAGCCAGGTCAGTTTAGGGCATTTGGCATGCTTGC
TGGAGGTTCAGGCATCACTCCCATGTTTCAAGTTGCAAGAGCGATTCTTGAAAACCCAAC
AGACAAGACAAAGGTGCATCTCATTTATGCCAATGTCACATACGATGACATTCTCTTAAG
GGAAGAATTGGAGAGTCTTACAGCCAATTACCCAGATCAATTCAAAATCTACTATGTTTT
GAACCAGCCTCCGGAGACATGGGATGGTGGTGCTGGATTTGTATCAAAGGAAATGATCCA
GGCTCATTGCCCTGCACCTGCATCCGATATTCAGGTCTTGAGATGTGGACCACCGCCAAT
GAACAAGGCCATGGCTGCAAACCTTGAAGCTCTTGGTTACTCTCCGGAGATACAATTCCA
GTTCTGATTGATCCCAAAAAGATGGAACTATTTAGAAAAGAAAAAAAAAACGTATTTCTT
TGATCAAATAATTTTTGTTACAATTTCTTTTTTTTTTT*GAATGAATGTTAAATTTTATT
CATCAAAAAGCCTTTTTACAT

QA 1 561 1 561
DS 



CO CL13Contig3 908 5 6 U
GCGGATGTCAGTATCAAGTCTTTATATGATATCAAACCAAACCGATACATGTAAGACAAT
ATGCCTAACCAAATCGTTAAAAAGCAAACCGGAACTCCCTATGGGATAACACAACAGAAA
TACAAGTCTCACTCAATTAAGACACAAGTCTCAGTGAAATTGTAACAAAAATTATTTGAT
CAAAGAAATAAGTGTTTTTTTTAAATAGTTCCATCTTTTTAGGACCAATTAGAATTGGAA
TTGCATCTCTGGAGAGTAACCAAGAGCTTCAAGGTTTGCAGCCATGGCCTTGTTCATTGG
CGGTGGTCCACATCTCAAGACCTGAATATCGGATGCAGGTGCAGGGCAATGAGCCTGGAT
CATTTCCTTTGATACAAATCCAACACCACCATCCCATGTCTCCGGAGGCTGGTTCAAAAC
ATAGTAAATTTTGAATTGATCTGGGTAATTGGCTGTAAGACTCTCCAATTCTTCCCTTAA
GAGAATGTCTTCGTATGTGACATTGGCATAAATGAAATGCACCTTTGTCTTGTCTGTTGG
GTTTTCAAGAATCGCTCTTGCAACTTGGAACATGGGAGTGATGCCTGAACCTCCAGCAAG
CATTCCAAATGCCCTAAACTGACCTGGCTGATACTTGAACCTCCCCTTTGGTCCTTTTAC
AGCAAGATGGTCTCCAACACGCATCTCCCTGAAATGATGAGACATCCTTCCTTGTGGATA
CATCTTAATGACAAGCTCAAAGCGTCCAAGATCTGAATCTAACGTTGTGGG*AGTGTAAG
GCTTAATAACATCCTCTCCTTGAGCATCCTTTCCCCTGCAACTGATGTGTTGTCCAATGG
GAAGACCCAAGACAGCAGCAGAAAAGGAGTTCAAAAACGAATTTGGCGACATTGTGACTG
AGTTGCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

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TG

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F505TF U 1
AF RS1BI82TF U 74
AF RS1BD70TF U 72
AF RS1AR13TFB U 73
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AATGGATACCGAGTTTCTCCGCACCTTAGATCGCCAGATTCTCTTGGGCGTCTTCGTTGC
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AGGACCAAAGGGGAGGTTCAAGTATCAGCCAGGTCAGTTTAGGGCATTTGGAATGCTTGC
TGG

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GG
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TCTCCGCACCTTAGATCGCCAGATTCTCTTGGGCGTCTTCGTTGCTTTCGTCGCCGTCAG
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CGTTTTTGAACTCCCTTCTTCTGCTGCTGTCTTGGGTCTTCCCATTGGACAACACATCAG
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GTTCAAGTATCAGCCAGGTCAGTTTAGGGCATTTGGAATGCTTGCTGGAGGTTCAGGCAT
CACTCCCATGTTCCAAGTTGCAAGAGCGATTCTTGAAAACCCAACAGACAAGAC

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G
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AGTGCCGGTGCTGCTTTTTATCTCTCCTCCTCCAAGAAACGCAGAGGGTGGTTGGATCCA
GAGAATTTCAAAGAGTTCAAGCTTGTTAAGAAGCAGCAACTCAGTCACAATGTCGCCAAA
TTCGTTTTTGAACTCCCTTCTTCTGCTGCTGTCTTGGGTCTTCCCATTGGACAACACATC
AGTTGCAGGGGAAAGGATGCTCAAGGAGAGGATGTTATTAAGCCTTACACTCCCACAACG
TTAGATTCAGATCTTGGACGCTTTGAGCTTGTCATTAAGATGTATCCACAAGGAAGGATG
TCTCATCATTTCAGGGAGATGCGTGTTGGAGACCATCTTGCTGTAAAAGGACCGAAGGGG
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ACCACTCCCATGTTCCAAGTTGCAAGAGCGATTCTTGAAAACCCAACAGACAAGACAAAG
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GAGACATGGGATGGTGGTGTTGGATTTGTATC

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CATCAGTTGCAGGGGAAAGGATGCTCAAGGAGAGGATGTTATTAAGCCTTACACTCCCAC
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DS 



AS 3 21

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AAAAAAATGGCATCAAATGCAGAGTTGTTGGAGTGGCCAAAGAAGGATAAGCGTCGTTTT
CTCCATGTTGTTTACCGCGTTGGTGATCTTGATCGCACTATCCAGTTTTACACTGAGTGC
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CTTGGTTTTGGTCCTGAGACCTCCAACTTCGTCGTCGAGCTCACATACAATTATGGTGTT
AGCTCCTATGACATTGGGACTGGATTTGGGCATTTCGCCATTTCCACTCAAGATGTTGCC
AAGATGGTTGAGACTGTCCGTGCCAAGGGTGGAAATGTCACCAGAGAGCCTGGTCCTGTC
AAAGGTGGAAACAGTGTCATTGCCTTTGTGAAGGACCCTGATGGTTACACTTTTGAGCTC
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GACCGTGCCATCCAGTTCTATGAGAAGGCCTTAGGGATGAGACTCTTGAGAAGGATCGAG
AGACCTGAATACAAGTACACCATAGGCATGATGGGATATGCTGAGGAACATGAGTCGATA
GTTTTGGAGCTGACCTATAACTACGGTGTGACTGAGTACACAAAGGGCAATGCGTATGCA
CAGATTGCAATAGGCACGGATGATGTGTACAAAAGCGGTGAAGTTGTGAAGATAATGAAC
CAAGAGCTAGGAGGAAAGATCACTAGAGAAGCCGGACCTCTTCCTGGACTCGGCACCAAG
ATTGTCTCGTTCCTCGATCCTGATGGCTGGAAAACAGTTCTGGTAGACAACGAAGATCTT
CTGAAGGAACTGGAATGAGGAGAGAGAGGGATGATGATGGTCAAGAATAGATCACAGCTA
AAAACGTTACCATAATAATAAAATATGTGATCTTTTGAAGTAGAGAAAAGACTTAGTATT
TGATCTAAATAAGATGTTGGTGGTTCAGTACTTCAGTTTGTGTGTCGTGTGCTATGTGCT
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TCTAGTTTTGGTGTTTACCGG


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1EV21TF U 2
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DS 

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CTTGGTTTTGGTCCTGAGACCACCAACTTCGTCGTCGAGCTCACATACAATTATGGTGTT
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GACCGTGCCATCCAGTTCTATG

QA 1 562 1 562
DS 

RD RS1GL33TF 548 0 0
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ACCGTGCC

QA 1 548 1 548
DS 

RD RS1EV21TF 728 0 0
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TCCATGTTGTTTACCGCGTTGGTGATCTTGATCGCACTATCCAGTTTTACACTGAGTGCT
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TTGGTTTTGGTCCTGAGACCTCCAACTTCGTCGTCGAGCTCACATACAATTATGGTGTTA
GCTCCTATGACATTGGGACTGGATTTGGGCATTTCGCCATTTCCACTCAAGATGTTGCCA
AGATGGTTGAGACTGTCCGTGCCAAGGGTGGAAATGTCACCAGAGAGCCTGGTCCTGTCA
AAGGTGGAAACAGTGTCATTGCCTTTGTGAAGGACCCTGATGGTTACACTTTTGAGCTCA
TCCAGAGAGGTCCTACTCCTGAACCACTCTGCCAAGTCATGCTTCGTGTTGGTGATCTTG
ACCGTGCCATCCAGTTCTATGAGAAGGCCTTAGGGATGAGACTCTTGAGAAGGATCGAGA
GACCTGAATACAAGTACACCATAGGCATGATGGGATATGCTGAGGAACATGAGTCGATAG
TTTTGGAGCTGACCTATAACTACGGTGTGACTGAGTACACAAAGGGCAATGCGTATGCAC
AGATTGCA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1AQ21TFB 676 0 0
G
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TCGAGCTCACATACAATTATGGTGTTAGCTCCTATGACATTGGGACTGGATTTGGGCATT
TCGCCATTTCCACTCAAGATGTTGCCAAGATGGTTGAGACTGTCCGTGCCAAGGGTGGAA
ATGTCACCAGAGAGCCTGGTCCTGTCAAAGGTGGAAACAGTGTCATTGCCTTTGTGAAGG
ACCCTGATGGTTACACTTTTGAGCTCATCCAGAGAGGTCCTACTCCTGAACCACTCTGCC
AAGTCATGCTTCGTGTTGGTGATCTTGACCGTGCCATCCAGTTCTATGAGAAGGCCTTAG
GGATGAGACTCTTGAGAAGGATCGAGAGACCTGAATACAAGTACACCATAGGCATGATGG
GATATGCTGAGGAACATGAGTCGATAGTTTTGGAGCTGACCTATAACTACGGTGTGACTG
AGTACACAAAGGGCAATGCGTATGCACAGATTGCAATAGGCACGGATGATGTGTACAAAA
GCGGTGAAGTTGTGAAGATAATGAACCAAGAGCTAGGAGGAAAGATCACTAGAGAAGCCG
GACCTCTTCCTGGACTCGGCACCAAGATTGTCTCGTTCCTCGATCCTGATGGCTGGAAAA
CAGTTCTGGTAGACA

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ATAGATCACAGCTAAAAACGTTACCATAATAATAAAATATGTGATCTTTTGAAGTAGAGA
AAAGACTTAGTATTTGATCTAAATAAGATGTTGTTGGTTCAGTACTTC

QA 1 228 1 228
DS 

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AGAAGGCCTTAGGGATGAGACTCTTGAGAAGGATCGAGAGACCTGAATACAAGTACACCA
TAGGCATGATGGGATATGCTGAGGAACATGAGTCGATAGTTTTGGAGCTGACCTATAACT
ACGGTGTGACTGAGTACACAAAGGGCAATGCGTATGCACAGATTGCAATAGGCACGGATG
ATGTGTACAAAAGCGGTGAAGTTGTGAAGATAATGAACCAAGAGCTAGGAGGAAAGATCA
CTAGAGAAGCCGGACCTCTTCCTGGACTCGGCACCAAGATTGTCTCGTTCCTCGATCCTG
ATGGCTGGAAAACAGTTCTGGTAGACAACGAAGATCTTCTGAAGGAACTGGAATGAGGAG
AGAGAGGGATGATGATGGTCAAGAATAGATCACAGCTAAAAACGTTACCATAATAATAAA
ATATGTGATCTTTTGAAGTAGAGAAAAGACTTAGTATTTGATCTAAATAAGATGTTGTTG
GTTCAGTACTTC

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DS 

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AGGCATGATGGGATATGCTGAGGAACATGAGTCGATAGTTTTGGAGCTGACCTATAATTA
CGGTGTGACTGAGTACACAAAGGGCAATGCGTATGCACAGATTGCAATAGGCACGGATGA
TGTGTACAAAAGCAGTGAAGTTGTGAAGATAATGAACCAAGAGCTAGGAGGAAAGATCAC
TAGAGAAGCCGGACCTCTTCCTGGACTCGGCACCAAGATTGTCTCGTTCCTCGATCCTGA
TGGCTGGAAAACAGTTTTGGTAGACAACGAAGATTTTTTGAAGGAACTGGAATGAGGAGA
GAGAGGGATGATGATGGTCAAGAATAGATCACAGCTAAAAACGTTACCATAATAATAAAA
TATGTGATCTTTTGAAGTAGAGAAAAGACTTAGTATTTGATCTAAATAAGATGTTGGTGG
TTCAGTACTTCAGTTTGTGTGTCGTGTGCTATGTGCTCGTTCCTTTTTAACTTTTGAGCT
AAACTCTGTTATGTTCCTGAATAAAATATA
CCCACCATCC

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DS 

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TGCCAAGGGTGGAAATGTCACCAGAGAGCCTGGTCCTGTCAAAGGTGGAAACAGTGTCAT
TGCCTTTGTGAAGGACCCTGATGGTTACACTTTTGAGCTCATCCAGAGAGGTCCTACTCC
TGAACCACTCTGCCAAGTCATGCTTCGTGTTGGTGATCTTGACCGTGCCATCCAGTTCTA
TGAGAAGGCCTTAGGGATGAGACTCTTGAGAAGGATCGAGAGACCTGAATACAAGTACAC
CATAGGCATGATGGGATATGCTGAGGAACATGAGTCGATAGTTTTGGAGCTGACCTATAA
CTACGGTGTGACTGAGTACACAAAGGGCAATGCGTATGCACAGATTGCAATAGGCACGGA
TGATGTGTACAAAAGCGGTGAAGTTGTGAAGATAATGAACCAAGAGCTAGGAGGAAAGAT
CACTAGAGAAGCCGGACCTCTTCCTGGACTCGGCACCAAGATTGTCTCGTTCCTCGATCC
TGATGGCTGGAAAACAGTTCTGGTAGACAACGAAGATTTTCTGAAGGAACTGGAATGAGG
AGAGAGAGGGATGATGATGGTCAAGAATAGATCACAGCTAAAAACGTTACCATAATAATA
AAATATGTGATCTTTTGAAGTAGAGAAAAGACTTAGTATTTGATCTAAATAAGATGTTGG
TGGTTCAGTACTTCAGTTTGTGTGTCGTGTGCTATGTGCTCGTTCCTTTTTAACTTTTGA
GCTAAACTCTGTTATGTTCCTGAATAAAATATACCCACCATCTAGTTTTGGTGTTTACCG
G

QA 1 841 1 841
DS 



CO CL14Contig2 1154 9 15 U
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GAAAAAATGGCAGAGAAGGCAGAGTTGTTGGAGTGGCCAAAGAAGGATAAGCGTCGTTTT
CTCCATGTTGTCTACCGCGTTGGTGATCTTGATCGCACTATCCAGTTTTACACTGAGTGC
TTTGGGATGAAGGTGTTGAGGAAAAGAGATGTCCCTGAGGAGAAGTACTCTAATGCTTTC
CTTGGTTTTGGTCCTGAAACTTCCAACTTCGTCGTCGAGCTCACATACAATTATGGTGTT
ACCTCGTATGACATTGGGACTGGATTTGGGCATTTCGCCATTTCCACACAAGATGTTGCC
AAGATGGTTGAGACTGTCCGTGCCAAGGGTGGAAATGTCACCAGAGAGCCTGGTCCTGTC
AAAGGTGGAAACAGTGTCATTGCCTTTGTGAAGGACCCTGATGGTTACACTTTTGAGCTC
ATCCAGAGAGGTCCTACTCCTGAACCACTCTGCCAAGTCATGCTTCGTGTTGGTGATCTT
GACCGTGCCATCCAGTTCTATGAGAAGGCCTTAGGGATGAGACTCTTGAGAAGGATTGAG
AGACCTGAATACAAGTACACCATAGGCATGATGGGATATGCTGAGGAACATGAGTCGATA
GTTTTGGAGCTGACCTATAACTACGGTGTGACTGAGTACACAAAGGGCAATGCGTATGCA
CAGATTGCAATAGGCACGGATGATGTGTACAAAAGCGGTGAAGTTGTGAAGATAATGAAC
CAAGAGCTAGGAGGAAAGATCACTAGAGAAGCCGGACCTCTTCCTGGACTCGGCACCAAG
ATTGTCTCGTTCCTCGATCCTGATGGCTGGAAAACAGTTCTGGTAGACAATGAAGATTTT
CTGAAGGAACTGGAATGAGGAGAGAGAGAGAGGGATGATGATGGTCAAGATCACAGCTAA
AACGTAACCATAATAATAAAATATGTGATCTTATCAAAGTAGAGAGAAGACTTAGTATTT
GATCTAAATAAGACGTTGGTGGTTCAGTTTGTGTGTTGTGTTCTATGTGCTCGTTCCTTT
TGTCTTTTGAGCTAAAACTCTGTTACATTCCTGAATAAAATATATACACCACCTGGTTTT
GGTGTTTACCGGTC


BQ
35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1FT48TF U 1
AF RS1FZ23TF U 1
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AF RS1ED85TF U 1
AF RS1H538TF U 2
AF RS1G234TF U 1
AF RS1BH30TF U 1
AF RS1G234JQ C 504
AF RS1H538JQB C 512
BS 1 307 RS1BH30TF
BS 308 308 RS1FT48TF
BS 309 685 RS1BH30TF
BS 686 686 RS1G234JQ
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BS 748 930 RS1G234JQ
BS 931 932 RS1H538JQB
BS 933 980 RS1G234JQ
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BS 1153 1154 RS1H538JQB

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QA 1 547 1 547
DS 

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GAAAAAATGGCAGAGAAGGCAGAGTTGTTGGAGTGGCCAAAGAAGGATAAGCGTCGTTTT
CTCCATGTTGTCTACCGCGTTGGTGATCTTGATCGCACTATCCAGTTTTACACTGAGTGC
TTTGGGATGAAGGTGTTGAGGAAAAGAGATGTCCCTGAGGAGAAGTACTCTAATGCTTTC
CTTGGTTTTGGTCCTGAAACTTCCAACTTCGTCGTCGAGCTCACATACAATTATGGTGTT
ACCTCGTATGACATTGGGACTGGATTTGGGCATTTCGCCATTTCCGCTCAAGATGTTGCC
AAGATGGTTGAGACTGTCCGTGCCAAGGGTGGAAATGTCACCAGAGAGCCTGGTCCTGTC
AAAGGTGGAAACAGTGTCATTGCCTTTGTGAAGGACCCTGATGGTTACACTTTTGAGCTC
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GACCGTGCCATCCAGTTCTATGA

QA 1 563 1 563
DS 

RD RS1GV89TF 563 0 0
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GAAAAAATGGCAGAGAAGGCAGAGTTGTTGGAGTGGCCAAAGAAGGATAAGCGTCGTTTT
CTCCATGTTGTCTACCGCGTTGGTGATCTTGATCGCACTATCCAGTTTTACACTGAGTGC
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GACCGTGCCATCCAGTTCTATGA

QA 1 563 1 563
DS 

RD RS1ED85TF 589 0 0
GGATCCGTGTCCAGCGGTGTCTGTCCTAGGTGTCTGTGTATCTGCTTCATCTTCGATCAG
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CTCCATGTTGTCTACCGCGTTGGTGATCTTGATCGCACTATCCAGTTTTACACTGAGTGC
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ACCTCGTATGACATTGGGACTGGATTTGGGCATTTCGCCATTTCCACTCAAGATGTTGCC
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QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1H538TF 621 0 0
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AAAAAATGGCAGAGGAGGCAGAGTTGTTGGAGTGGCCAAAGAAGGATAAGCGTCGTTTTC
TCCATGTTGTCTACCGCGTTGGTGATCTTGATCGCACTATCCAGTTTTACACTGAGTGCT
TTGGGATGAAGGTGTTGAGGAAAAGAGATGTCCCTGAGGAGAAGTACTCTAATGCTTTCC
TTGGTTTTGGTCCTGAAACTTCCAACTTCGTCGTCGAGCTCACATACAATTATGGTGTTA
CCTCGTATGACATTGGGACTGGATTTGGGCATTTCGCCATTTCCACACAAGATGTTGCCA
AGATGGTTGAGACTGTCCGTGCCAAGGGTGGAAATGTCACCAGAGAGCCTGGTCCTGTCA
AAGGTGGAAACAGTGTCATTGCCTTTGTGAAGGACCCTGATGGTTACACTTTTGAGCTCA
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ACCGTGCCATCCAGTTCTATGAGAAGGCCTTAGGGATGAGACTCTTGAGAAAGATTGAGA
GACCTGAATACAAGTACACCA

QA 1 621 1 621
DS 

RD RS1G234TF 621 0 0
GGATCCGTGTCCAGTGGTGTCTGTCCTAGGTGTCTGTGTATCTGCTTCATCTTCGATCAG
GAAAAAATGGCAGAGAAGGCAGAGTTGTTGGAGTGGCCAAAGAAGGATAAGCGTCGTTTT
CTCCATGTTGTCTACCGCGTTGGTGATCTTGATCGCACTATCCAGTTTTACACTGAGTGC
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CTTGGTTTTGGTCCTGAAACTTCCAACTTCGTCGTCGAGCTCACATACAATTATGGTGTT
ACCTCGTATGACATTGGGACTGGATTTGGGCATTTCGCCATTTCCACACAAGATGTTGCC
AAGATGGTTGAGACTGTCCGTGCCAAGGGTGGAAATGTCACCAGAGAGCCTGGTCCTGTC
AAAGGTGGAAACAGTGTCATTGCCTTTGTGAAGGACCCTGATGGTTACACTTTTGAGCTC
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GACCGTGCCATCCAGTTCTATGAGAAGGCCTTAGGGATGAGACTCTTGAGAAGGATTGAG
AGACCTGAATACAAGTACACC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RS1BH30TF 747 0 0
GGATCCGTGTCCAGTGGTGTCTGTCCTAGGTGTCTGTGTATCTGCTTCATCTTCGATCAG
GAAAAAATGGCAGAGAAGGCAGAGTTGTTGGAGTGGCCAAAGAAGGATAAGCGTCGTTTT
CTCCATGTTGTCTACCGCGTTGGTGATCTTGATCGCACTATCCAGTTTTACACTGAGTGC
TTTGGGATGAAGGTGTTGAGGAAAAGAGATGTCCCTGAGGAGAAGTACTCTAATGCTTTC
CTTGGTTTTGGTCCTGAAACTTCCAACTTCGTCGTCGAGCTCACATACAATTATGGTGTT
ACCTCGTGTGACATTGGGACTGGATTTGGGCATTTCGCCATTTCCACACAAGATGTTGCC
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AAAGGTGGAAACAGTGTCATTGCCTTTGTGAAGGACCCTGATGGTTACACTTTTGAGCTC
ATCCAGAGAGGTCCTACTCCTGAACCACTCTGCCAAGTCATGCTTCGTGTTGGTGATCTT
GACCGTGCCATCCAGTTCTATGAGAAGGCCTTAGGGATGAGACTCTTGAGAAGGATTGAG
AGACCTGAATACAAGTACACCATAGGCATGATGGGATATGCTGAGGAACATGAGTCGATA
GTTTTGGAGCTGACCTATAACTACG*TGTGACTGAGTACACAAAGGGCAATGCGTATGCA
CAGATTGCAATAG*CACGTATGATGTG

QA 1 747 1 747
DS 

RD RS1G234JQ 650 0 0
ACCACTCTGCCAAGTCATGCTTCGTGTTGATGATCTTGACCGTGCCATCCAGTTCTATGA
GAAGGCCTTAGGGATGAGACTCTTGAGAAGGATTGAGAGACCTGAATACAAGTACACCAT
AGGCATGATGGGATATGCTGAGGAACATGAGTCGATAGTTTTGGAGCTGACCTATAACTA
CGGTGTGACTGAGTACACAAAGGGCAATGCGTATGCACAGATTGCAATAGGCACGGATGA
TGTGTACAAAAGCGGTGAAGTTGTGAAGATAATGAACCAAGAGCTAGGAGGAAAGATCAC
TAGAGAAGCCGGACCTCTTCCTGGACTCGGCACCAAGATTGTCTCGTTCCTCGATCCTGA
TGGCTGGAAAACAGTTCTGGTAGACAATGAAGATTTTCTGAAGGAACTGGAATGAGGAGA
GAGAGAG**GGATGATGATGGTCAAGATCACAGCTAAAACGTAACCATAATAATAAA*TA
TGTGATCTTATCAAAGTAGAGAGAAGACTTAGTATTTGATCTAAATAAGACGTTGGTGGT
TCAGTTTGTGTGTTGTGTTCTATGTGCTCGTTCCTTTTGTCTTTTGAGCTAAAACTCTGT
TACATTCCTGAATAAAATATATACACCACCTGGTTTTGGTGTTTACCGG
T

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1H538JQB 643 0 0
GCCAAGTCATGCTTCGTGTTGGTGATCTTGACCGTGCCATCCAGTTCTATGAGAAGGCCT
TAGGGATGAGACTCTTGAGAAGGATTGAGAGACCTGAATACAAGTACACCATAGGCATGA
TGGGATATGCTGAGGAACATGAGTCGATAGTTTTGGAGCTGACCTATAACTACGGTGTGA
CTGAGTACACAAAGGGCAATGCGTATGCACAGATTGCAATAGGCACGGATGATGTGTACA
AAAGCGGTGAAGTTGTGAAGATAATGAACCAAGAGCTAGGAGGAAAGATCACTAGAGAAG
CCGGACCTCTTCCTGGACTCGGCACCAAGATTGTCTCGTTCCTCGATCCTGATGGCTGGA
AAACAGTTCTGGTAGACAATGAAGATTTTCTGAAGGAACTGGAATGAGGAGAGAGAGAGA
GGGATGATGATGGTCAAGATCACAGCTAAAACGTAACCATAATAATAAAATATGTGATCT
TATCAAAGTAGAGAGAAGACTTAGTATTTGATCTAAATAAGACGTTGGTGGTTCAGTTTG
TGTGTTGTGTTCTATGTGCTCGTTCCTTTTGTCTTTTGAGCTAAAACTCTGTTACGTTCC
TGAATAAAATATATACACCACCTGGTTTTGGTGTTTACCGGTC

QA 1 643 1 643
DS 



CO CL14Contig3 805 3 10 U
GTCCGGTAAACACCAAAACCAGGTGGTGTATATATTTTTATTCAGGAACGTAACAGAGTT
TTAGCAGACGCACAAACTGAACAAACATCTTATTTAGTAGATCAAATACTAAGTCTTCTC
TCTACTTTGATAAGATCACATATTTTTATTATTATTTATGGTTACGTTTTAGCTGTGTTC
TTGACCATCAGCATCCCTCTCTCTCTCTCCTCATTCCAGTTCCTTCAGAAAATCTTCATT
GTCTACCAGAACTGTTTTCCAGCCATCAGGATCGAGGAACGAGACAATCTTGGTGCCGAG
TCCAGGAAGAGGTCCGGCTTCTCTAGTGATCTTTCCTCCTAGCTCTTGGTTCATTATCTT
CACAACTTCACCGCTTTTGTACACATCATCCGTGCCTATTGCAATCTGTGCATACGCATT
GCCCTTTGTGTACTCAGTCACGCCGTAGTTATAGGTCAGTTCCAAAACGATCGACTCATG
TTCCTCAGAATATCCCATCATGCCTATGGTGTACTTGTATTCAGGTCTCTCAATCCTTCT
CAAGAGTCTCATCCCTAAGGCCTTCTCATAGAACTGGATGGCACGGTCAAGATCACCAAC
ACGAAGCATGACTTGGCAGAGTGGTTCAGGAGTAGGACCTCTCTGGATGAGCTCAAAAGT
GTAACCATCAGGGTCCTTCACAAAGGCAATGACACTGTTTCCACCTTTGACAGGACCAGG
CTCTCTGGTGACATTTCCACCCTTGGCACGGACAGTCTCAACCATCTTGGCAACATCTTG
AGTGGAAATGGCGAAATGCCCAAAT


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1ED85JQ U 1
AF RS1FZ23JQ U 1
AF RS1FT48JQ U 2
BS 1 123 RS1ED85JQ
BS 124 124 RS1FZ23JQ
BS 125 207 RS1ED85JQ
BS 208 209 RS1FZ23JQ
BS 210 355 RS1ED85JQ
BS 356 356 RS1FZ23JQ
BS 357 649 RS1ED85JQ
BS 650 650 RS1FZ23JQ
BS 651 804 RS1ED85JQ
BS 805 805 RS1FT48JQ

RD RS1ED85JQ 804 0 0
GTCCGGTAAACACCAAAACCAGGTGGTGTATATATTTTTATTCAGGAACGTAACAGAGTT
TTAGCAGACGCACAAACTGAACAAACATCTTATTTAGTAGATCAAATACTAAGTCTTCTC
TCTGCTTTGATAAGATCACATATTTTTATTATTATTTATGGTTACGTTTTAGCTGTGTTC
TTGACCATCAGCATCCCTCTCTCTCTC**CTCATTCCAGTTCCTTCAGAAAATCTTCATT
GTCTACCAGAACTGTTTTCCAGCCATCAGGATCGAGGAACGAGACAATCTTGGTGCCGAG
TCCAGGAAGAGGTCCGGCTTCTCTAGTGATCTTTCCTCCTAGCTCTTGGTTCATTGTCTT
CACAACTTCACCGCTTTTGTACACATCATCCGTGCCTATTGCAATCTGTGCATACGCATT
GCCCTTTGTGTACTCAGTCACGCCGTAGTTATAGGTCAGTTCCAAAACGATCGACTCATG
TTCCTCAGAATATCCCATCATGCCTATGGTGTACTTGTATTCAGGTCTCTCAATCCTTCT
CAAGAGTCTCATCCCTAAGGCCTTCTCATAGAACTGGATGGCACGGTCAAGATCACCAAC
ACGAAGCATGACTTGGCAGAGTGGTTCAGGAGTAGGACCTCTCTGGATG*GCTCAAAAGT
GTAACCATCAGGGTCCTTCACAAAGGCAATGACACTGTTTCCACCTTTGACAGGACCAGG
CTCTCTGGTGACATTTCCACCCTTGGCACGGACAGTCTCAACCATCTTGGCAACATCTTG
AGTGGAAATGGCGAAATGCCCAAA

QA 1 804 1 804
DS 

RD RS1FZ23JQ 785 0 0
AG
CCGGTAAACACCAAAACCAGGTGGTGTATATATTTTTATTCAGGAACGTAACAGAGTTTT
AGCAGACGCACAAACTGAACAAACATCTTATTTAGTAGATCAAATACTAAGTCTTCTCTC
TACTTTGATAAGATCACATATTTTTATTATTATTTATGGTTACGTTTTAGCTGTGTTCTT
GACCATCAGCATCCCTCTCTCTCTCTCCTCATTCCAGTTCCTTCAAAAAATCTTCATTGT
CTACCAAAACTGTTTTCCAGCCATCAGGATCGAGGAACGAGACAATCTTGGTGCCGAGTC
CAGGAAGAGGTCCGGCTTCTCTAGTGATCTTTCCTCCTAGCTCTTGGTTCATTATCTTCA
CAACTTCACCGCTTTTGTACACATCATCCGTGCCTATTGCAATCTGTGCATACGCATCGC
CCTTTGTGTACTCAGTCACGCCGTAGTTATAGGTCAGTTCCAAAACGATCGACTCATGTT
CCTCAAAATATCCCATCATGCCTATGGTGTACTTGTATTCAGGTCTCTCAATCCTTCTCA
AGAGTCTCATCCCTAAGGCCTTCTCATAGAACTGGATGGCACGGTCAAGATCACCAACAC
GAAGCATGACTTGGCAGAGTGGTTCAGGAGTAGGACCTCTCTGGATGAGCTCAAAAGTGT
AACCATCAGGGTCCTTCACAAAGGCAATGACACTGTTTCCACCTTTGACAGGACCAGGCT
CTCTGGTGACATTTCCACCCTTGGCACGGACAGTCTCAACCATCTTGGCAACATCTTGAG
CGG

QA 3 782 3 782
DS 

RD RS1FT48JQ 804 0 0
G
CCGGTAAACACCAAAACCAGGTGGTGTATATATTTTTATTCAGGAACGTAACAGAGTTTT
AGCAGACGCACAAACTGAACAAACATCTTATTTAGTAGATCAAATACTAAGTCTTCTCTC
TACTTTGATAAGATCACATATTTTTATTATTATTTATGGTTACGTTTTAGCTGTGTTCTT
GACCATCAGCATCCCCCTCTCTCTCTCCTCATTCCAGTTCCTTCAGAAAATCTTCATTGT
CTACCAGAACTGTTTTCCAGCCATCAGGATCGAGGAACGAGACAATCTTGGTGTCGAGTC
CAGGAAGAGGTCCGGCTTCTCTAGTGATCTTTCCTCCTAGCTCTTGGTTCATTATCTTCA
CAACTTCACCGCTTTTGTACACATCATCCGTGCCTATTGCAATCTGTGCATACGCATTGC
CCTTTGTGTACTCAGTCACGCCGTAGTTATAGGTCAGTTCCAAAACGATCGACTCATGTT
CCTCAGAATATCCCATCATGCCTATGGTGTACTTGTATTCAGGTCTCTCAATCCTTCTCA
AGAGTCTCATCCCTAAGGCCTTCTCATAGAACTGGATGGCACGGTCAAGATCACCAACAC
GAAGCATGACTTGGCAGAGTGGTTCAGGAGTAGGACCTCTCTGGATGAGCTCAAAAGTGT
AACCATCAGGGTCCTTCACAAAGGCAATGACACTGTTTCCACCTTTGACAGGACCAGGCT
CTCTGGTGACATTTCCACCCTTGGCACGGACAGTCTCAACCATCTTGGCAACATCTTGAG
TGGAAATGGCGAAATGCCCAAAT

QA 2 804 2 804
DS 



AS 2 21

CO CL15Contig1 923 19 17 U
GGACAACCATCGGGTATCAAAGAAGCAGGTTCTCTCCCTCTCTTCTAGCCATTCAAAATA
GTGAGAATGGGGTTGTTGAAAAAA*CACGAGAAACATTCAAAGCCGACGTTTAAGGGTAT
CTTGACGGCCATTTTAGCTACCATAGCCGCAATGTTCCTCTTGTTGCTCGCCGGTTTATC
CCTCGCTGGCACAGCCGTGGCATTTATTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCC
GCTTCTCGTACCAGCCGGTATTACCACTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCGGG
CGGCTCCGGTTTGACGGCCCTCAGCATCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAA
GGAGCTGTCAAAAATTTCGGGTTAAACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGCCGTTGGTC
GCACTGAATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAGTGATGATATGAAAAA*TTGATATA
TAGTTGTTATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCA
AACATAAAAAAA*TCTAGTTAACCCGACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTT
CAAAATAATAATTATTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAGTG
TATGTCGTGGTACACAATAATTATAAATGTATGCGTTTTCGTTATCTACAGCCATACTCT
ACTCTCTAAATATACAAGTGTTGTATATGGTTTAGTCCAAAAGTATTGTATATGATATCT
AATAGTATGTCATTTTGAAAACGAAATAATGTCATTGATTCTTACCTTTAGACCAATATT
TTGAACTTTTAGCGCAAATGTAGTTATCCAACTTTTGGCAACATATCGACTTTAAGAAGG
AAAAAAACGTATCTACTTTATCG


BQ
35 45 55 55 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 30 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 0 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 60 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 0 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 55 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 65 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 5 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 90 97 97 97 97 75 97 
97 97 97 97 90 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 0 97 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 70 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 5 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 85 85 70 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 75 70 70 70 70 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GJ52TF U 1
AF RS1G427TF U 23
AF RS1CA66TF U 2
AF RS1GA61JQ C 1
AF RS1GA61TF U 1
AF RS1EL77TF U -3
AF RS1E941TF U 3
AF RS1E941JQ C 3
AF RS1GR38TF U 25
AF RS1C527TF U 1
AF RS1EL77JQ C 431
AF RS1GJ52JQ C 2
AF RS1EE03TF U 1
AF RS1ER19TF U -2
AF RS1DT20TF U 444
AF RS1G427JQ C 109
AF RS1GR38JQ C 345
AF RS1ER19JQ C 87
AF RS1EE03JQ C 84
BS 1 14 RS1C527TF
BS 15 15 RS1GJ52TF
BS 16 381 RS1C527TF
BS 382 382 RS1GJ52TF
BS 383 455 RS1C527TF
BS 456 456 RS1GJ52TF
BS 457 551 RS1C527TF
BS 552 552 RS1CA66TF
BS 553 613 RS1C527TF
BS 614 614 RS1CA66TF
BS 615 702 RS1C527TF
BS 703 703 RS1EL77TF
BS 704 761 RS1C527TF
BS 762 762 RS1EE03TF
BS 763 800 RS1C527TF
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BS 829 923 RS1EE03JQ

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TCTCGCTGGCACAGCCGTGGCATTTATTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCC
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CGGCTCCGGTTTGACGGCCCTCAGCATCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAA
GGAGCTGTCAAAAATTTCGGGTTAAACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGCCGTTGGCC
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DS 

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GG
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CATCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAAGGAGCTGTCAAAAATTTCGGGTTA
AACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGCCGTTGGTCGCACTGAATAAATGAAAAGAAGGT
GGCATAGACAAATGATGATATGAAAAA*TTGATATATAGTTGTTATTATAATTTCACAAA
TTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCAAACATAAAAAA**TCTAGTTAACC
CGACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTT

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DS 

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CTCGCTGGCACAGCCGTGGCATTTATTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCCG
CTTCTCGTACCAGCGGGTATTACCACTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCGGGC
GGCTCCGGTTTGACGGCCCTCAGCATCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAAG
GAGCTGTCAAAAATTTCGGGTTAAACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGCCGTTGGTCG
CACTGAATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAGTGATGATATGAAAAA*TTG*TATAT
AGTTGTTATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCAA
ACATAAAAAAAATCTAGTTAACCCGACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTTC
AAAATAATAATTATTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGC

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DS 

RD RS1GA61JQ 709 0 0
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GTGAGAATGGGGTTGTTGAAAAAA*CACGAGAAACATTCAAAGCCGACGTTTAAGGGTAT
CTTGACGGCCATTTTAGCTACCATAGCCGCAATGTTCCTCTTGTTGCTCGCCGGTTTATC
TCTCGCTGGCACAGCCGTGGCATTTATTGCCAGTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCC
GCTTCTCGTACCAGCGGGTATTACCACTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCGGG
CGGCTCCGGTTTGACGGCCCTCAGCATCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAA
GGAGCTGTCAAAAATTTCGGGTTAAACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGCCGTTGGTC
GCACTGAATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAGTGATGATATGAAAAA*TTGATATA
TAGTTGTTATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCA
AACATAAAAAAA*TCTAGTTAACCCGACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTT
CAAAATAATAATTATTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAGTG
TATGTCGTGGTACACAATAATTATAAATGTATGCGTTTTCGTTATCTAC

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DS 

RD RS1GA61TF 700 0 0
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GTGAGAATGGGGTTGTTGAAAAAA*CACGAGAAACATTCAAAGCCGACGTTTAAGGGTAT
CTTGACGGCCATTTTAGCTACCATAGCCGCAATGTTCCTCTTGTTGCTCGCCGGTTTATC
TCTCGCTGGCACAGCCGTGGCATTTATTGCCAGTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCC
GCTTCTCGTACCAGCGGGTATTACCACTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCGGG
CGGCTCCGGTTTGACGGCCCTCAGCATCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAA
GGAGCTGTCAAAAATTTCGGGTTAAACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGCCGTTGGTC
GCACTGAATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAGTGATGATATGAAAAA*TTGATATA
TAGTTGTTATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCA
AACATAAAAAAA*TCTAGTTAACCCGACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTT
CAAAATAATAATTATTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAGTG
TATGTCGTGGTACACAATAATTATAAATGTATGCGTTTTC

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DS 

RD RS1EL77TF 722 0 0
GGTCCC
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GCTCCGGTTTGACGGCCCTCAGCATCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAAGG
AGCTGTCAAAAATTTCGGGTTAAACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGCCGTTGGTCGC
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GTTGTTATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCAAA
CATAAAAAAA*TCTAGTTAACCCGACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTTCA
AAATAATAATTATTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAGTGTA
TGCCGTGGTACACAATAATTATAAATGTATGCGTTTTCGTTATCTACAGCCATACT

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DS 

RD RS1E941TF 717 0 0
GG
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ACGGCCATTTTAGCTACCATAGCCGCAATGTTCCTCTTGTTGCTCGCCGGTTTATCTCTC
GCTGGCACAGCCGTGGCATTTATTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCCGCTT
CTCGTACCAGCGGGTATTACCACTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCGGGCGGC
TCCGGTTTGACGGCCCTCAGCATCATCTCGTGGCTCTACAATAAATTAACGGTTAAGGAG
CTGTCAAAAATTTCGGGTTAAACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGCCGTTGGTCGCAC
TGAATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAGTGATGATATGAAAAA*TTGATATATAGT
TGGTATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCAAACA
TAAAAAAA*TCTAGTTAACCCGACTTTTCTTAGTGGTAATTATTACGTGGCATTTTCAAA
ATAATAATTATTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAGTGTATG
TCGTGGTACACAATAATTATAAATGTATGCGTTTTCGTTATCTACAGCCA
AAAAA

QA 3 712 3 712
DS 

RD RS1E941JQ 711 0 0
GG
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GAATGGGGTTGTTGAAAAAA*CACGAGAAACATTCAAAGCCGACGTTTAAGGGTATCTTG
ACGGCCATTTTAGCTACCATAGCCGCAATGTTCCTCTTGTTGCTCGCCGGTTTATCTCTC
GCTGGCACAGCCGTGGCATTTATTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCCGCTT
CTCGTACCAGCGGGTATTACCACTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCGGGCGGC
TCCGGTTTGACGGCCCTCAGCATCATCTCGTGGCTTTACAATAAATTAACGGTTAAGGAG
CTGTCAAAAATTTCGGGTTAAACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGCCGTTGGTCGCAC
TGAATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAGTGATGATATGAAAAA*TTGATATATAGT
TGTTATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCAAACA
TAAAAAAA*TCTAGTTAACCCGACTTTTCTTAGTGGTAATTATTACGTGGCATTTTCAAA
ATAATAATTATTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAGTGTATG
TCGTGGTACACAATAATTATAAATGTATGCGTTTTCGTTATCTACAGCC

QA 3 711 3 711
DS 

RD RS1GR38TF 706 0 0
GG
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TTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCCGCTTCTCGTACCAGCCGGTATTACCA
CTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCGGGCGGCTCCGGTTTGACGGCCCTCAGCA
TCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAAGGAGCTGTCAAAAATTTCGGGCTAAA
CGTTCGTCAGAGGTTCTC*AGGCGGCCGTTGGTCGCACTGAATAAATGAAAAGAAGGTGG
CATAGACAAATGATGATATGAAAAA*TTGATATATAGTTGTTATTATAATTTCACAAATT
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ACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTTCAAAATAATAATTCTTACTTGGGGAT
GGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAGTGTATGTCGTGGTACACAATAATTATAA
ATGTATGCGTTTTCGTTATCTACAGCCATACTCTACTCTCTAA
T

QA 3 705 3 705
DS 

RD RS1C527TF 800 0 0
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GTGAGAATGGGGTTGTTGAAAAAA*CACGAGAAACATTCAAAGCCGACGTTTAAGGGTAT
CTTGACGGCCATTTTAGCTACCATAGCCGCAATGTTCCTCTTGTTGCTCGCCGGTTTATC
CCTCGCTGGCACAGCCGTGGCATTTATTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCC
GCTTCTCGTACCAGCCGGTATTACCACTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCGGG
CGGCTCCGGTTTGACGGCCCTCAGCATCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAA
GGAGCTGTCAAAAATTTCGGGCTAAACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGCCGTTGGTC
GCACTGAATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAATGATGATATGAAAAA*TTGATATA
TAGTTGTTATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCA
AACATAAAAAA**TCTAGTTAACCCGACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTT
CAAAATAATAATTCTTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAGTG
TATGTCGTGGTACACAATAATTATAAATGTATGCGTTTTCGT*ATCTACAGCCATACTCT
ACTCTCTAAATATACAAGTGTTGTATATGGTTTAGTCCAAA*GTATTGTATATGATATCT
AATAGTATGTCATTTTGAAA

QA 1 800 1 800
DS 

RD RS1EL77JQ 367 0 0
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TATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCAAACATAAAAA
AA*TCTAGTTAACCCGACTTTTTTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTTCAAAATAATA
ATTATTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAGTGTATGCCGTGG
TACACAATAATTATAAATGTATGCGTTTTCGTTATCTACAGCCATACTCTACTCTCTAAA
TATACAAGTGTTGTATATGGTTTAGTCCAAAAGTATTGTATATGATATCTAATAGTATGT
CATTTTG

QA 1 367 1 367
DS 

RD RS1GJ52JQ 796 0 0
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CTCGCTGGCACAGCCGTGGCATTTATTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCCG
CTTCTCGTACCAGCGGGTATTACCACTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCGGGC
GGCTCCGGTTTGACGGCCCTCAGCATCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAAG
GAGCTGTCAAAAATTTCGGGTTAAACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGCCGTTGGCCG
CACTGAATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAGTGATGATATGAAAAA*TTGATATAC
AGTTGTTATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCAA
ACATAAAAAAAATCTAGTTAACCCGACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTTC
AAAATAATAATTATTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAGTGT
ATGTCGTGGTACACAATAATTATAAATGTATGCGTTTTCGTTATCTACAGCCATACTCTA
CTCTCTAAATATACAAGTGTTGTATACGGTTTAGTCCAAAAGTATTGTATATGATATCTA
ATAGTATGTCATTTTG

QA 1 796 1 796
DS 

RD RS1EE03TF 798 0 0
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GTGAGAATGGGGTTGTTGAAAAAA*CACGAGAAACATTCAAAGCCGACGTTTAAGGGTAT
CTTGACGGCCATTTTAGCTACCATAGCCGCAATGTTCCTCTTGTTGCTCGCCGGTTTATC
CCTCGCTGGCACAGCCGTGGCATTTATTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCC
GCTTCTCGTACCAGCCGGTATTACCACTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCGGG
CGGCTCCGGTTTGACGGCCCTCAGCATCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAA
GGAGCTGTCAAAAATTTCGGGTTAAACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGCCGTTGGTC
GCACTGAATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAATGATGATATGAAAAA*TTGATATA
TAGTTGTTATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGGACGACCTTTTGTGGTCA
AACATAAAAAA**TCTAGTTAACCCGACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTT
CAAAATAATAATTCTTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAGTG
TATGTCGTGGTACACAATAATTATAAATGTATGCGTTTTCGTTATCTACAGCCATACTCT
ACTCTCTAAATATACAAGTGTTGTATATGGTTTAGTCCAAAAGTAT*GTATATGATATCT
AATAGTATGTCATTT
GAA

QA 1 795 1 795
DS 

RD RS1ER19TF 810 0 0
GGCCC
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GAGAATGGGGTTGTTGAAAAAA*CACGAGAAACATTCAAAGCCGACGTTTAAGGGTATCT
TGACGGCCATTTTAGCTACCATAGCCGCAATGTTCCTCTTGTTGCTCGCCGGTTTATCCC
TCGCTGGCACAGCCGTGGCATTTATTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCCGC
TTCTCGTACCGGCCGGTATTACCACTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCGGGCG
GCTCCGGTTTGACGGCCCTCAGCATCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAAGG
AGCTGTCAAAAATTTCGGGTTAAACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGTCGTTGGTCGC
ACTGAATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAATGATGATATGAAAAA*TTGATATATA
GTTGTTATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCAAA
CATAAAAAA**TCTAGTCAACCCGACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTTCA
AAATAATAATTCTTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAGTGTA
TGTCGTGGTACACAATAATTATAAATGTATGCGTTTTCGTTATCTACAGCCATACTCTAC
TCTCTAA*TATACAAGTGTTGTATATGGTTTAGTCCAAAAGTATTGTATATGATATCTAA
TAGTATGTCATTTTGAAA
CGAAAAA

QA 6 803 6 803
DS 

RD RS1DT20TF 386 0 0
G
GGCATAGACAAGTGATGATATGAAAAA*TTGATATATAGTTGTTATTATAATTTCACAAA
TTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCAAACATAAAAAAA*TCTAGTTAACC
CGACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTTCAAAATAATAATTATTACTTGGGG
ATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAGTGTATGTCGTGGTACACAATAATTAT
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ATATGGTTTAGTCCAAAAGTATTGTATATGATATCTAATAGTATGTCATTTTGAAAACGA
AATAATGTCATTGATTCTTACCTT
T

QA 2 385 2 385
DS 

RD RS1G427JQ 710 0 0
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CGCCGGTTTATCCCTCGCTGGCACAGCCGTGGCATTTATTGCCATT**GCCGCTATTTGT
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CGGCCGTTGGTCGCACTGAATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAATGATGATATGAA
AAA*TTGATATATAGTTGTTATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAACGAC
CTTTTGTGGTCAAACATAAAAAA**TCTAGTTAACCCGACTTTTCTTAGTAGTAATTATT
ACGTGGCATTTTCAAAATAATAATTCTTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGC
ATCTTATTAGTGTATGTCGTGGTACACAATAATTATAAATGTATGCGTTTTCGTTATCTA
CAGCCATACTCTACTCTCTAAATATACAAGTGTTGTATATGGTTTAGTCCAAAAGTATTG
TATATGATATCTAATAGTATGTCATTTTGAAAACGAAATAATGTCATTGA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1GR38JQ 474 0 0
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*AGGCGGCCGTTGGTCGCACTGAATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAATGATGATA
TGAAAAA*TTGATATATAGTTGTTATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAA
CGACCTTTTGTGGTCAAACATAAAAAA**TCTAGTTAACCCGACTTTTCTTAGTAGTAAT
TATTACGTGGCATTTTCAAAATAATAATTCTTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAAA
TAGCATCTTATTAGTGTATGTCGTGGTACACAATAATTATAAATGTATGCGTTTTCGTTA
TCTACAGCCATACTCTACTCTCTAAATATACAAGTGTTGTATATGGTTTAGTCCAAAAGT
ATTGTATATGATATCTAATAGTATGTCATTTTGAAAACGAAATAATGTCATTGA

QA 1 474 1 474
DS 

RD RS1ER19JQ 743 0 0
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CCGCAATGTTCCTCTTGTTGCTCGCCGGTTTATCCCTCGCTGGCACAGCCGTGGCATTTA
TTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCCGCTTCTCGTACCGGCCGGTATTACCA
CTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCGGGCGGCTCCGGTTTGACGGCCCTCAGCA
TCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAAGGAGCTGTCAAAAATTTCGGGTTAAA
CGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGTCGTTGGTCGCACTGAATAAATGAAAAGAAGGTGG
CATAGACAAATGATGATATGAAAAA*TTGATATATAGTTGTTATTATAATTTCACAAATT
AAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTGGTCAAACATAAAAAA**TCTAGTCAACCCG
ACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTTCAAAATAATAATTCTTACTTGGGGAT
GGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAGTGTATGTCGTGGTACACAATAATTATAA
ATGTATGCGTTTTCGTTATCTACAGCCATACTCTACTCTCTAAATATACAAGTGTTGTAT
ATGGTTTAGTCCAAAAGTATTGTATATGATATCTAATAGTATGTCATTTTGAAAACGAAA
TAATGTCATTGATTCTTACCTT
C

QA 1 742 1 742
DS 

RD RS1EE03JQ 840 0 0
A*CACGAGAAACATTCAAAGCCGACGTTTAAGGGTATCTTGACGGCCATTTTAGCTACCA
TAGCCGCAATGTTCCTCTTGTTGCTCGCCGGTTTATCCCTCGCTGGCACAGCCGTGGCAT
TTATTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCCGCTTCTCGTACCAGCCGGTATTA
CCACTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCGGGCGGCTCCGGTTTGACGGCCCTCA
GCATCATCTCGTGGCTCTACAAGAAATTAACGGTTAAGGAGCTGTCAAAAATTTCGGGTT
AAACGTTCGTCAGAGGTTCTCCAGGCGGCCGTTGGTCGCACTGAATAAATGAAAAGAAGG
TGGCATAGACAAATGATGATATGAAAAA*TTGATATATAGTTGTTATTATAATTTCACAA
ATTAAATCTAGTTAACCCGGACGACCTTTTGTGGTCAAACATAAAAAA**TCTAGTTAAC
CCGACTTTTTTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATTTTCAAAATAATAATTCTTACTTGGG
GATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAGTGTATGTCGTGGTACACAATAATTA
TAAATGTATGCGTTTTCGTTATCTACAGCCATACTCTACTCTCTAAATATACAAGTGTTG
TATATGGTTTAGTCCAAAAGTATTGTATATGATATCTAATAGTATGTCATTTTGAAAACG
AAATAATGTCATTGATTCTTACCTTTAGACCAATATTTTGAACTTTTAGCGCAAATGTAG
TTATCCAACTTTTGGCAACATATCGACTTTAAGAAGGAAAAAAACGTATCTACTTTATCG

QA 1 840 1 840
DS 



CO CL15Contig2 739 2 2 U
GGACAACCATCGGGATCAAAGAAGCAGGTTCTCTCCCTCTCTTCTAGCCATTCAAAATAG
TGAGAATGGGGTTGTTGAAAAAACACGAGAAACATTCAAAGCCGACGTTTAAGGGTATCT
TGACGGCCATTTTAGCTACCATAGCCGCAATGTTCCTCTTGTTGCTCGCCGGTTTATCCC
TCGCTGGCACAGCCGTGGCATTTATTGCCATTATGCCGCTATTTGTCGTATTCAGTCCGC
TTCTCGTACCAGCCGGTATTACCACTGGTTTGCTAGCTACGGGATTAGCCGCCTCGGGCG
GCTCCGGTTTGACGGCCCTCAGCATTATCTCGTGGCTCTACAAGTTCTCCAGGCGGCCGT
TGGTCGCACTGAATAAATGAAAAGAAGGTGGCATAGACAAATGATGATATGAAAAATTGA
TATATAGTTGTTATTATAATTTCACAAATTAAATCTAGTTAACCCGAACGACCTTTTGTG
GTCAAACATAAAAAATCTAGTTAACCCGACTTTTCTTAGTAGTAATTATTACGTGGCATT
TTCAAAATAATAATTCTTACTTGGGGATGGAACTAAAGTTTTCAAATAGCATCTTATTAG
TGTATGTCGTGGTACACAATAATTATAAATGTATGCGTTTTCGTTATCTACAGCCATACT
CTACTCTCTAAATATACAAGTGTTGTATATGGTTTAGTCCAAAAGTATTGTATATGATAT
CTAATAGTATGTCATTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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DS 



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BQ
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QA 1 497 1 497
DS 

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DS 

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DS 

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DS 

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C
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DS 



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ACATATTTCTCCTCTCGCCCTTCTTTCTCCACATTTTGCTTCATTCTGCATGGCTTTTAT
TAACCTCTCCCTCACTACTCTTCGATTCCTCCTCACTACTCTTTGATGATTCATCAAACG
CCATCAACGGTTTGATGTCACCGTTCCAAATGCAGTGAGAAGCCAGGAACCCAATGACGG
CTGGGACAATGTATAACAAAGCAGGCTGTGCTGCTTGAAACCAGTTCATGACTACAATAG
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GAGCATCAAAGGATTTGGCAACACTAACCATAACTGGGGTAAAGAAAACCCAGAAAATAT
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TGAACTCTACCTCCAAAGATTTGAAATAAGGAAAACGCCAGACGATAAGATTGTCATTCC
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BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GB51JQ U 1
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AF RS1EQ49TF C 551
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CAAGCCCTAGCAT

QA 1 553 1 553
DS 

RD RS1DZ45JQ 736 0 0
C
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ATCCCCTGAATGCAG

QA 2 736 2 736
DS 

RD RS1EA61JQ 735 0 0
G
GTCAAAGGAAACCTGTTGTTACTTGTATAACTTCTTACATAAGTCTTTGTGAAAAGATGT
TTGAAAATCTAAAAA*GAGCGAAAAAGGTGAAGGGAATGATGATCATTGGAAACAAGAAT
TGTTTTCCTTATCTTTGTTTCCAAACATATAAAATACACACACATTCATGTGTATACATA
TTTCTCCTCTCGCCCTTCTTTCTCCACATTTTGCTTCATTCTGCATGGCTTTTATTAACC
TCTCCCTCACTACTCTTCGATTCCTCCTCACTACTCTTTGATGATTCATCAAACGCCATC
AACGGTTTGATGTCACCGTTCCAAATGCAGTGAGAAGCCAGGAACCCAATGACGGCTGGG
ACAATGTATAACAAAGCAGGCTGTGCTGCTTGAAACCAGTTCATGACTACAATAGTGAGG
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GACACATCGAATCTTAGAGCCAACGCAACAAAAATACCCGGAATGACAATATCACCAAGC
CCTAGCATAGAGTATGGCCTTAGAGCATCCCCCGTAGGGAACAAAAGCTTTATCGGAGCA
TCAAAGGATTTGGCAACACTAACCATAACTGGGGTAAAGAAAACCCAGAAAATATCATAG
AAAAACAGTCCTACCAAAAGGATGGCACCAGTCTTGAATGATCCAAGAGAGAGCATCTCA
ATTCCCTGAAT
ACA

QA 2 732 2 732
DS 

RD RS1EQ49TF 716 0 0
CATAGAGTATGGC*TTAGAGCATCCCC*GTAGGGAACAAAAGCTTTATCGGAGCATCAAA
GGATTTGGCAACACTAACCATAACTGGGGTAAAGAAAACCCAGAAAATATCATAGAAAAA
CAGTCCTACCAAAAGGATGGCACCAGTCTTGAATGATCCAAGAGAGAGCATCTCAATCCC
CTGAATGCAGAAGGAGAGGCCAAGGGTATTGTTAGCCAGCCAATGTTTCTTCCAAGCGTA
CCACGCGCAGAAGAAGGTTCCAGGGATTCCCGCAACAACTTGGGACTTTGTGAACTCTAC
CTCCAAAGATTTGAAATAAGGAAAACGCCAGACGATAAGATTGTCATTCCATGGTTTTGG
CAGAAACCTGCTGATGGCAGGTAACAATGTCGCCGAAAGAGCGACGATGCCAAGAACAAA
GAAGTAAGCAGTGAGCACAGCATTGACCAAGTCCTTAGAGAGAAACTTGAACAACAAGAA
AAGAGAGAGAAGCATAGCACTCCCAACCAATGGGAAACGCATGGCATGCTCTTTCGACAT
CGTCTCCGTTGGAGGAGAATCCTTCACGGAACGAAAGCAACCGACGTAAACTGTAAGACA
TGCCGTAAGAACAACATTCAAGTTCGGGTTCACATTCACAACAAGTGGTGCCACCGTCAA
TCCTGCGAGAGCGAGATTGGCGATTCTCTCACAATTCTTCATGATTGAATCTTT
CC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RS1FA83TF 671 0 0
TATCGGAGCATCAAAGGATTTGGCAACACTAACCATAACTGGGGTAAAGAAAACCCAGAA
AATATCATAGAAAAACAGTCCTACCAAAAGGATGGCACCAGTCTTGAATGATCCAAGAGA
GAGCATCTCAATCCCCTGAATGCAGAAGGAGAGGCCAAGGGTATTGTTAGCCAGCCAATG
TTTCTTCCAAGCGTACCACGCGCAGAAGAAGGTTCCAGGGATTCCCGCAACAACTTGGGA
CTTTGTGAACTCTACCTCCAAAGATTTGAAATAAGGAAAACGCCAGACGATAAGATTGTC
ATTCCATGGTTTTGGCAGAAACCTGCTGATGGCAGGTAACAATGTCGCCGAAAGAGCGAC
GATGCCAAGAACAAAGAAGTAAGCAGTGAGCACAGCATTGACCAAGTCCTTAGAGAGAAA
CTTGAACAACAAGAAAAGAGAGAGAAGCATAGCACTCCCAACCAATGGGAAACGCATGGC
ATGCTCTTTCGACATCGTCTCCGTTGGAGGAGAATCCTTCACGGAACGAAAGCAACCGAC
GTAAACTGTAAGACATGCCGTAAGAACAACATTCAAGTTCGGGTTCACATTCACAACAAG
TGGTGCCACCGTCAATCCTGCGAGAGCGAGATTGGCGATTCTCTCACAATTCTTCATGAT
TGAATCTTT
CC

QA 1 669 1 669
DS 

RD RS1DZ45TF 723 0 0
AAACCCAGAAAATATCATAGAAAAACAGTCCTACCAAAAGGATGGCACCAGTCT*GAATG
ATCCAAGAGAGAGCATCTCAATCCCCTGAATGCAGAAGGAGAGGCCAAGGATATTGTTAG
CCAGCCAATGTTTCTTCCAAGCGTACCACGCGCAGAAGAAGGTTCCAGGGATTCCCGCAA
CAACTTGGGACTTTGTGAACTCTACCTCCAAAGATTTGAAATAAGGAAAACGCCAGACGA
TAAGATTGTCATTCCATGGTTTTGGCAGAAACCTGCTGATGGCAGGTAACAATGTCGCCG
AAAGAGCGACGATGCCAAGAACAAAGAAGTAAGCAGTGAGCACAGCATTGACCAAGTCCT
TAGAGAGAAACTTGAGCAACAAGAAAAGAGAGAGAAGCATAGCACTCCCAACCAATGGGA
AACGCATGGCATGCTCTTTCGACATCGTCTCCGTTGGAGGAGAATCCTTCACGGAACGAA
AGCAACCGACGTAAACTGTAAGACATGCCGTAAGAACAACATTCAAGTTCGGGTTCACAT
TCACAACAAGTGGTGCCACCGTCAATCCTGCGAGAGCGAGATTGGCGATTCTCTCACAAT
TCCTCATGATTGAATCTTTGTGTCTCTGTAAAAAACTGATGAATGTATAGAGAGAGAGCG
ATCCAGTGGGGTCAAGTGATAAAAATTTCCACCAGATCTGTTAAAATACTAATTTATTTC
ACC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 3 18

CO CL17Contig1 813 2 6 U
GATCAAAGGAATCTGCTCTCTCTCAAAAAGTGGCGATAACACAGGTTTAACAACAATGTC
AGGCATTCACGGGGCTCATGATTTATGTCCTTTGGTCAAGAACATTCTTCTCCTGGACTC
TGAAGGGAAGCGTGTGGCTGTCAAGTATTACTCCGATGACTGGCCAACTAATGCTGCCAA
GTTGAGTTTTGAGAAGTACGTTTTCTCCAAGACCTCTAAGACCAATGCTCGCACTGAAGC
TGAGATCACACTCTTGGACAGTAATATTATTGTCTACAAGTTCGCTCAGGACCTTCACTT
CTTTGTTACGGGAGGCGACAATGAAAACGAGCTAGTCTTATCCTCTGTTCTTCAAGGCTT
TTTCGATGCTGTTGCACTTCTTCTAAGGAACAATGTGGAAAAGATGGAGGCCCTTGAGAA
CTTGGACCTCATCTTTCTGTGCCTCGATGAAATGGTCGATCAGGGGGTGGTTCTTGAAAC
AGACCCGAGTGTCATTGCGGGGGAAAGTAGCAATGCAGAGCACAGAAGCTAGTGGTTCAC
TTTTCTGAACAGACACTAACTCAAGCACTGGCAACAGCTCGTGAACATCTCGCTAGAAGT
CTGCTTACATGAGAGTTTCCTCACCTCCATATGAATTTATGCATAATACTGTTGTGGGAT
TTTATCTCAATAACGTGTGAAAAGGCTTTCTAATAATTCATTGCACTTTGCTTACGTCGT
TTCTGCATACTTAATCTGAAGTTTTGGGTATTATATAGCTGTGTGCAATGCTGGAATTGT
TTTTCTGGAGCTATAAAATCTTTTGATTCGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AH79JQ C 1
AF RS1AH79TF U 248
BS 1 247 RS1AH79JQ
BS 248 767 RS1AH79TF
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BS 769 797 RS1AH79TF
BS 798 798 RS1AH79JQ
BS 799 813 RS1AH79TF

RD RS1AH79JQ 813 0 0
GATCAAAGGAATCTGCTCTCTCTCAAAAAGTGGCGATAACACAGGTTTAACAACAATGTC
AGGCATTCACGGGGCTCATGATTTATGTCCTTTGGTCAAGAACATTCTTCTCCTGGACTC
TGAAGGGAAGCGTGTGGCTGTCAAGTATTACTCCGATGACTGGCCAACTAATGCTGCCAA
GTTGAGTTTTGAGAAGTACGTTTTCTCCAAGACCTCTAAGACCAATGCTCGCACTGAAGC
TGAGATCACACTCTTGGACAGTAATATTATTGTCTACAAGTTCGCTCAGGACCTTCACTT
CTTTGTTACGGGAGGCGACAATGAAAACGAGCTAGTCTTATCCTCTGTTCTTCAAGGCTT
TTTCGATGCTGTTGCACTTCTTTTAAGGAACAATGTGGAAAAGATGGAGGCCCTTGAGAA
CTTGGATCTCATCTTTCTGTGCCTCGATGAAATGGTCGATCAGGGGGTGGTTCTTGAAAC
AGACCCGAGTGTCATTGCGGGG*AAAGTAGCAATGCAGAGCACAGAAGCTAGTGGTTCAC
TTT*CTGAACAGACACTAACTCAAGCACTGGCAACAGCTCGTGAACATCTCGCTAGAAGT
CTGCTTACATGAGAGTTTCCTCACCTCCATATGAATTTATGCATAATACTGTTGTGGGAT
TTTATCTCAATAACGTGTGAAA*GGCTTTCTAATAATTCATTGCACTTTGCTTACGTCGT
TTCTGCATACTTAATCTGAAGTTTTGGGTATTATATAGCTGTGTGCAATGCTGGAATTGT
TTTTCTGGAGCTATAAAATCTTTTGATTCGTGG

QA 1 813 1 813
DS 

RD RS1AH79TF 566 0 0
ACACTCTTGGACAGTAATATTATTGTCTACAAGTTCGCTCAGGACCTTCACTTCTTTGTT
ACGGGAGGCGACAATGAAAACGAGCTAGTCTTATCCTCTGTTCTTCAAGGCTTTTTCGAT
GCTGTTGCACTTCTTCTAAGGAACAATGTGGAAAAGATGGAGGCCCTTGAGAACTTGGAC
CTCATCTTTCTGTGCCTCGATGAAATGGTCGATCAGGGGGTGGTTCTTGAAACAGACCCG
AGTGTCATTGCGGGGGAAAGTAGCAATGCAGAGCACAGAAGCTAGTGGTTCACTTTTCTG
AACAGACACTAACTCAAGCACTGGCAACAGCTCGTGAACATCTCGCTAGAAGTCTGCTTA
CATGAGAGTTTCCTCACCTCCATATGAATTTATGCATAATACTGTTGTGGGATTTTATCT
CAATAACGTGTGAAAAGGCTTTCTAATAATTCATTGCACTTTGCTTACGTCGTTTCTGCA
TACTTAATCTGAAGTTTTGGGTATTATATAGCTGTGTGCA*TGCTGGAATTGTTTTTCTG
GAGCTATAAA*TCTTTTGATTCGTGG

QA 1 566 1 566
DS 



CO CL17Contig2 893 14 6 U
AGCTTCTACTCGATTTGACCTTTATTTTAAAGCGTTTGTTGTTTTACAGATTTGTCGTTA
CTAGAAAAGTTCAACAAAAGAGGCATATCAAGAACATATAGAACTCCAGAAAAACAATTC
CAGCATTGCACACAGCTATATAATACCCAAAACTTCAGATTAAGTATGCAGAAACGACGT
AAGCAAAGTGCATGAATTATTAGAAAGCCTTTCACACGTTATGAGATAAATCCCACAACA
ATTATTATGCATAATGCATATGAGGTGAGGAAACTCTCATGTAAGCAGACTTCTAGCGAG
ATGTTCCCGAGCTGTTGCCAGTGCTTGAGTTAGTGTCTGTTCAGAAA*GTGAACCACTAG
CTTCTGTGCTCTGCATTGCTACTTTCCCCGCAATGACACTCGGGTCTGTTTCAAGAACCA
CCCCCTGATCGACCATTTCATCGAGGCACAGAAAGATGAGATCCAAGTTCTCAAGGGCCT
CCATCTTTTCCACATTGTTCCTTAGAAGAAGTGCAACAGCATCGAAAAAGCCTTGAAGAA
CAGAGGATAAGACTAGCTCGTTTTCATTGTCGCCTCCCGTAACAAAGAAGTGAAGGTCCT
GGGCGAACTTATAGACAATAATATTACTGTCCAAGAGTGTGATCTCAGCTTCAGTGCGAG
CATTGGTCTTAGAGGTCTTGGAGAATACGTACTTCTCAAAACTCAACTTGGCAGCATTAG
TTGGCCAGTCATCGGAGTAATACTTGACAGCCACACGCTTCCCTTCAGAGTCCAGGAGAA
GAATGTTCTTGACCAAAGGACATAAATCATGATTCCCGTGAATGCCTGACATTGTTGTTA
AACCTGTGTTATCGCCACTTTTTGAGAGAGAGCAGATTCCTTAGAATGATCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 40 45 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
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80 80 80 80 80 80 20 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
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15 75 75 75 75 75 75 75 75 15 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 15 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
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65 50 65 65 65 65 65 65 60 10 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 0 50 40 40 40 30 30 10 

AF RS1EC63TF C 163
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AF RS1C209JQ U 1
AF RS1DV30JQ U 1
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AF RS1A755TF C 99
AF RS1DV30TF C 118
AF RS1C209TF C 128
AF RS1D713JQ U 100
AF RS1D713TF C 213
BS 1 789 RS1C209JQ
BS 790 870 RS1AC04JQ
BS 871 885 RS1A755JQ
BS 886 886 RS1D713JQ
BS 887 892 RS1A755JQ
BS 893 893 RS1AN50TF

RD RS1EC63TF 204 0 0
AGTATGCAGAAACGACGTAAGCAAAGTGCATGAATTATTAGAAAGC*TTTCACACGTTAT
GAGATAAATCCCACAACAATTATTATGCATAATGCATATGAGGTGAGGAAACTCTCATGT
AAGCAGACTTCTAGCGAGATGTTCCCGAGCTGTTGCCAGTGCTTGAGTTAGTGTCTGTTC
AGAAAAGTGAACCACTAGCTTCTG

QA 1 204 1 204
DS 

RD RS1CX70JQ 623 0 0
GG
ACTCCAGAAAAACAATTCCAGCATTGCACACAGCTATATAATACCCAAAACTTCAGATTA
AGTATGCAGAAACGACGTAAGCAAAGTGCATGAATTATTAGAAAGCCTTTCACACGTTAT
GAGATAAATCCCACAACAATTATTATGCATAATGCATATGAGGTGAGGAAACTCTCATAT
AAGCAGACTTCTAGCGAGATGTTCACGAGCTGTTGCCAGTGCTTGAGTTAGTGTCTGTTC
AGAAA*GTGAACCACTAGCTTCTGTGCTCTGCATTGCTACTTTCCCCGCAATGACACTCG
GGTCTGTTTCAAGAACCACCCCCTGATCGACCATTTCATCGAGGCACAGAAAGATGAAAT
CCAAGTTCTCAAGGGCCTCCATCTTTTCCACATTGTTCCTTAAAAGAAGTGCAACAGCAT
CGAAAAAGCCTTGAAGAACAGAGGATAAGACTAGCTCGTTTTCATTGTCGCCTCCCGTAA
CAAAGAAGTGAAGGTCCTGAGCGAACTTGTAGACAATAATATTGCTGTCCAAGAGTGTGA
TCTCAGCTTCAGTGCGAGCATTGGTCTTAGAGGTCTTGGGGAAAACGTACTTCTCAAAAC
TCAACTTGGCAGCATTAGTTG

QA 3 623 3 623
DS 

RD RS1C209JQ 789 0 0
AGCTTCTACTCGATTTGACCTTTATTTTAAAGCGTTTGTTGTTTTACAGATTTGTCGTTA
CTAGAAAAGTTCAACAAAAGAGGCATATCAAGAACATATAGAACTCCAGAAAAACAATTC
CAGCATTGCACACAGCTATATAATACCCAAAACTTCAGATTAAGTATGCAGAAACGACGT
AAGCAAAGTGCATGAATTATTAGAAAGCCTTTCACACGTTATGAGATAAATCCCACAACA
ATTATTATGCATAATGCATATGAGGTGAGGAAACTCTCATGTAAGCAGACTTCTAGCGAG
ATGTTCCCGAGCTGTTGCCAGTGCTTGAGTTAGTGTCTGTTCAGAAA*GTGAACCACTAG
CTTCTGTGCTCTGCATTGCTACTTTCCCCGCAATGACACTCGGGTCTGTTTCAAGAACCA
CCCCCTGATCGACCATTTCATCGAGGCACAGAAAGATGAGATCCAAGTTCTCAAGGGCCT
CCATCTTTTCCACATTGTTCCTTAGAAGAAGTGCAACAGCATCGAAAAAGCCTTGAAGAA
CAGAGGATAAGACTAGCTCGTTTTCATTGTCGCCTCCCGTAACAAAGAAGTGAAGGTCCT
GGGCGAACTTATAGACAATAATATTACTGTCCAAGAGTGTGATCTCAGCTTCAGTGCGAG
CATTGGTCTTAGAGGTCTTGGAGAATACGTACTTCTCAAAACTCAACTTGGCAGCATTAG
TTGGCCAGTCATCGGAGTAATACTTGACAGCCACACGCTTCCCTTCAGAGTCCAGGAGAA
GAATGTTCT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RS1DV30JQ 781 0 0
AGCTTCTACTCGATTTGACCTTTATTTTAAAGCGTTTGTTGTTTTACAGATTTGTCGTTA
CTAGAAAAGTTCAACAAAAGAGGCATATCAAGAACATATAGAACTCCAGAAAAACAATTC
CAGCATTGCACACAGCTATATAATACCCAAAACTTCAGATTAAGTATGCAGAAACGACGT
AAGCAAAGTGCATGAATTATTAGAAAGCCTTTCACACGTTATGAGATAAATCCCACAACA
ATTATTATGCATAATGCATATGAGGTGAGGAAACTCTCATGTAAGCAGACTTCTAGCGAG
ATGTTCCCGAGCTGTTGCCAGTGCTTGAGTTAGTGTCTGTTCAGAAA*GTGAACCACTAG
CTTCTGTGCTCTGCATTGCTACTTTCCCCGCAATGACACTCGGGTCTGTTTCAAGAACCA
CCCCCTGATCGACCATTTCATCGAGGCACAGAAAGATGAGATCCAAGTTCTCAAGGGCCT
CCATCTTTTCCACATTGTTCCTTAGAAGAAGTGCAACAGCATCGAAAAAGCCTTGAAGAA
CAGAGGATAAGACTAGCTCGTTTTCATTGTCGCCTCCCGTAACAAAGAAGTGAAGGTCCT
GGGCGAACTTATAGACAATAATATTACTGTCCAAGAGTGTGATCTCAGCTTCAGTGCGAG
CATTGGTCTTAGAGGTCTTGGAGAATACGTACTTCTCAAAACTCAACTTGGCAGCATTAG
TTGGCCAGTCATCGGAGTAATACTTGACAGCCACACGCTTCCCTTCAGAGTCCAGGAGAA
G

QA 1 781 1 781
DS 

RD RS1G364JQ 706 0 0
ATCAAGAACATATAGAACTCCAGAAAAACAATTCCAGCATTGCACACAGCTATATAATAC
CCAAAACTTCAGATTAAGTATGCAGAAACGACGTAAGCAAAGTGCATGAATTATTAGAAA
GCCTTTCACACGTTATGAGATAAATCCCACAACAATTATTATGCATAATGCATATGAGGT
GAGGAAACTCTCATGTAAGCAGACTTCTAGCGAGATGTTCCCGAGCTGTTGCCAGTGCTT
GAGTTAGTGTCTGTTCAGAAA*GTGAACCACTAGCTTCTGTGCTCTGCATTGCTACTTTC
CCCGCAATGACACTCGGGTCTGTTTCAAGAACCACCCCCTGATCGACCATTTCATCGAGG
CACAGAAAGATGAGATCCAAGTTCTCAAGGGCCTCCATCTTTTCCACATTGTTCCTTAGA
AGAAGTGCAACAGCATCGAAAAAGCCTTGAAGAACAGAGGATAAGACTAGCTCGTTTTCA
TTGTCGCCTCCCGTAACAAAGAAGTGAAGGTCCTGGGCGAACTTATAGACAATAATATTA
CTGTCCAAGAGTGTGATCTCAGCTTCAGTGCGAGCATTGGTCTTAGAGGTCTTGGAGAAT
ACGTACTTCTCAAAACTCAACTTGGCAGCATTAGTTGGCCAGTCATCGGAGTAATACTTG
ACAGCCACACGCTTCCCTTCAGAGTCCAGGAGAAGAATGTTCTTGA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RS1AC04JQ 828 0 0
TTACAGATTTGTCGTTACTAGAAAAGTTCAACAAAAGAGGCATATCAAGAACATATAGAA
CTCCAGAAAAACAATTCCAGCATTGCACACAGCTATATAATACCCAAAACTTCAGATTAA
GTATGCAGAAACGACGTAAGCAAAGTGCATGAATTATTAGAAGGCCTTTCACACGTTATG
AGATAAATCCCACAACAATTATTATGCATAATGCATATGAGGTGAGGAAACTCTCATGTA
AGCAGACTTCTAGCGAGATGTTCCCGAGCTGTTGCCAGTGCTTGAGTTAGTGTCTGTTCA
GAAA*GTGAACCACTAGCTTCTGTGCTCTGCATTGCTACTTTCCCCGCAATGACACTCGG
GTCTGTTTCAAGAACCACCCCCTGATCGACCATTTCATCGAGGCACAGAAAGATGAGATC
CAAGTTCTCAAGGGCCTCCATCTTTTCCACATTGTTCCTTAGAAGAAGTGCAACAGCATC
GAAAAAGCCTTGAAGAACAGAGGATAAGACTAGCTCGTTTTCATTGTCGCCTCCCGCAAC
AAAGAAGTGAAGGTCCTGGGCGAACTTATAGACAATAATAT*ACTGTCCAAGAGTGTGAT
CTCAGCTTCAGTGCGAGCATTGGTCTTAGAGGTCTTGGAGAATACGTACTTCTCAAAACT
CAACTTGGCAGCATTAGTTGGCCAGTCATCGGAGTAATACTTGACAGCCACACGCTTCCC
TTCAGAGTCCAGGAGAAGAGTGTTCTTGACCAAAGGACATAAATCATGATTCCCGTGAAT
GCCTGACATTGTTGTTAAACCTGTGTTATCGCCACTTTTTGAGAGAG
C

QA 1 827 1 827
DS 

RD RS1AN50TF 847 0 0
CAGATTTGTCGTTACTAGAAAAGTTCAACAAAAGAGGCATATCAAGAACAGATAGAACTC
CAGAAAAACAATTCCAGCATTGCACACAGCTATATAATACCCAAAACTTCAGATTAAGTA
TGCAGAAACGACGTAAGCAAAGTGCATGAATTATTAGAAAGCCTTTCACACGTTATGAGA
TAAATCCCACAACAATTATTATGCATAATGCATATGAGGTGAGGAAGCTCTCATGTAAGC
AGACTTCTAGCGAGATGTTCACGAGCTGTTGCCAGTGCTTGAGTTAGTGTCTGTTCAGAA
A*GTGAACCACTAGCTTCTGTGCTCTGCATTGCTACTTTCCCCGCAATGACACTCGGGTC
TGTTTCAAGAACCACCCCCTGATCGACCATTTCATCGAGGCACAGAAAGATGAGATCCAA
GTTCTCAAGGGCCTCCATCTTTTCCACATTGTTCCTTAGAAGAAGTGCAACAGCATCGAA
AAAGCCTTGAAGAACAGAGGATAAGACTAGCTCGTTTTCATTGTCACCTCCCGTAACAAA
GAAGTGAAGGTCCTGAGCGAACTTGTGGACAATAATATTGCTGTCCAAGAGTGTGATCTC
AGCTTCAGTGCGAGCATTGGTCTTAGAGGTCTTGGAGAAAACGTACTTCTCAAAACTCAA
CTTGGCAGCATTAGTTGGCCAGTCATCGGAGTAATACTTGACAGCCACACGCTTCCCTTC
AGAGTCCAGGAGAAGAATGTTCTTTACCAAAGGACATAAATCATGAGCCCCGTGAATGCC
TGACATTGTTGTTAAACCTGTGTTATCGCCACTTTTTGAGAGAGAGCAGATTCCTTTGAA
TGATCCC

QA 1 847 1 847
DS 

RD RS1CX70TF 749 0 0
ATACCC
AAACTTCAGATTAAGTATGCAGAAACGACGTAAGCAAAGTGCATGAATTATTAGAAAGC*
TTTCACACGTTATGAGATAAATCCCACAACAATTATTATGCATAATGCATATGAGGTGAG
GAAACTCTCATATAAGCAGACTTCTAGCGAGATGTTCACGAGCTGTTGCCAGTGCTTGAG
TTAGTGTCTGTTCAGAAA*GTGAACCACTAGCTTCTGTGCTCTGCATTGCTACTTTCCCC
GCAATGACACTCGGGTCTGTTTCAAGAACCACCCCCTGATCGACCATTTCATCGAGGCAC
AGAAAGATGAGATCCAAGTTCTCAAGGGCCTCCATCTTTTCCACATTGTTCCTTAGAAGA
AGTGCAACAGCATCGAAAAAGCCTTGAAGAACAGAGGATAAGACTAGCTCGTTTTCATTG
TCGCCTCCCGTAACAAAGAAGTGAAGGTCCTGAGCGAACTTGTAGACAATAATATTGCTG
TCCAAGAGTGTGATCTCAGCTTCAGTGCGAGCATTGGTCTTAGAGGTCTTGGGGAAAACG
TACTTCTCAAAACTCAACTTGGCAGCATTAGTTGGCCAGTCATCGGAGTAATACTTGACA
GCCACACGCTTCCCTTCAGAGTCCAGGAGAAGAATGTTCTTTACCAAAGGACATAAATCA
TGAGCCCCGTGAATGCCTGACATTGTTGTTAAACCTGTGTTATCGCCACTTTTTGAGAGA
GAGCAGATTCCTTTGAATGATCC

QA 7 749 7 749
DS 

RD RS1A755JQ 793 0 0
AGAACTCCAGAAAAACAATTCCAGCATTGCACACAGCTATATAATACCCAAAACTTCAGA
TTAAGTATGCAGAAACGACGTAAGCAAAGTGCATGAATTATTAGAAAGCCTTTCACACGT
TATGAGATAAATCCCACAACAATTATTATGCATGATGCATATGAGGTGAGGAAACTCTCA
TGTAAGCAGACTTCTAGCGAGATGTTCCCGAGCTGTTGCCAGTGCTTGAGTTAGTGTCTG
TTCAGAAA*GTGAACCACTAGCTTCTGTGCTCTGCATTGCTACTTTCCCCGCAATGACAC
TCGGGTCTGTTTCAAGAACCACCCCCTGATCGACCATTTCATCGAGGCACAGAAAGATGA
GATCCAAGTTCTCAAGGGCCTCCATCTTTTCCACATTGTTCCTTAAAAGAAGTGCAACAG
CATCGAAAAAGCCTTGAAGAACAGAGGATAAGACTAGCTCGTTTTCATTGTCGCCTCCCG
TAACAAAGAAGTGAAGGTCCTGGGCGAACTTATAGACAATAATATTACTGTCCAAGAGTG
TGATC**AGCTTCAGTGCGAGCATTGGTCTTAGAGGTCTTGGAGAATACGTACTTCTCAA
AACTCAACTTGGCAGCATTAGTTGGCCAGTCATCGGAGTAATACTTGACAGCCACACGCT
TCCCTTCAGAGTCCAGGAGAAGAATGTTCTTGACCAAAGGACATAAATCATGATTCCCGT
GAATGCCTGACATTGTTGTTAAACCTGTGTTATCGCCACTTTTTGAGAGAGAGCAGATTC
CTTAGAGTGATCC

QA 1 793 1 793
DS 

RD RS1A755TF 794 0 0
TAGAACTCCAGAAAAACAATTCCAGCATTGCACACAGCTATATAATACCCAAAACTTCAG
ATTAAGTATGCAGAAACGACGTAAGCAAAGTGCATGAATTATTAGAAAGC*TTTCACACG
TTATGAGATAAATCCCACAACAATTATTATGCATGATGCATATGAGGTGAGGAAACTCTC
ATGTAAGCAGACTTCTAGCGAGATGTTCCCGAGCTGTTGCCAGTGCTTGAGTTAGTGTCT
GTTCAGAAA*GTGAACCACTAGCTTCTGTGCTCTGCATTGCTACTTTCCCCGCAATGACA
CTCGGGTCTGTTTCAAGAACCACCCCCTGATCGACCATTTCATCGAGGCACAGAAAGATG
AGATCCAAGTTCTCAAGGGCCTCCATCTTTTCCACATTGTTCCTTAGAAGAAGTGCAACA
GCATCGAAAAAGCCTTGAAGAACAGAGGATAAGACTAGCTCGTTTTCATTGTCGCCTCCC
GTAACAAAGAAGTGAAGGTCCTGGGCGAACTTATAGACAATAATATTACTGTCCAAGAGT
GTGATC**AGCTTCAGTGCGAGCATTGGTCTTAGAGGTCTTGGAGAATACGTACTTCTCA
AAACTCAACTTGGCAGCATTAGTTGGCCAGTCATCGGAGTAATACTTGACAGCCACACGC
TTCCCTTCAGAGTCCAGGAGAAGAATGTTCTTGACCAAAGGACATAAATCATGATTCCCG
TGAATGCCTGACATTGTTGTTAAACCTGTGTTATCGCCACTTTTTGAGAGAGAGCAGATT
CCTTAGAGTGATCC

QA 1 794 1 794
DS 

RD RS1DV30TF 772 0 0
AATCCAGCA
TGCACACAGCTATATAATACCCAAAACTTCAGATTAAGTATGCAGAAACGACGTAAGCAA
AGTGCATGAAT*ATTAGAAAGC*TTTCACACGTTATGAGATAAATCCCACAACAATTATT
ATGCATAATGCATATGAGGTGAGGAAACTCTCATGTAAGCAGACTTCTAGCGAGATGTTC
CCGAGCTGTTGCCAGTGCTTGAGTTAGTGTCTGTTCAGAAA*GTGAACCACTAGCTTCTG
TGCTCTGCATTGCTACTTTCCCCGCAATGACACTCGGGTCTGTTTCAAGAACCACCCCCT
GATCGACCATTTCATCGAGGCACAGAAAGATGAGATCCAAGTTCTCAAGGGCCTCCATCT
TTTCCACATTGTTCCTTAGAAGAAGTGCAACAGCATCGAAAAAGCCTTGAAGAACAGAGG
ATAAGACTAGCTCGTTTTCATTGTCGCCTCCCGTAACAAAGAAGTGAAGGTCCTGGGCGA
ACTTATAGACAATAATATTACTGTCCAAGAGTGTGATCTCAGCTTCAGTGCGAGCATTGG
TCTTAGAGGTCTTGGAGAATACGTACTTCTCAAAACTCAACTTGGCAGCATTAGTTGGCC
AGTCATCGGAGTAATACTTGACAGCCACACGCTTCCCTTCAGAGTCCAGGAGAAGAATGT
TCTTGACCAAAGGACATAAATCATGATTCCCGTGAATGCCTGACATTGTTGTTAAACCTG
TGTTATCGCCACTTTTTGAGAGAGAGCAGATTCCTTAGAGT
CC

QA 10 770 10 770
DS 

RD RS1C209TF 762 0 0
GCACACAGCTATATAATACCCAAAACTTCAGATTAAGTATGCAGAAACGACGTAAGCAAA
GTGCATGAATTATTAGAAAGC*TTTCACACGTTATGAGATAAATCCCACAACAATTATTA
TGCATAATGCATATGAGGTGAGGAAACTCTCATGTAAGCAGACTTCTAGCGAGATGTTCC
CGAGCTGTTGCCAGTGCTTGAGTTAGTGTCTGTTCAGAAA*GTGAACCACTAGCTTCTGT
GCTCTGCATTGCTACTTTCCCCGCAATGACACTCGGGTCTGTTTCAAGAACCACCCCCTG
ATCGACCATTTCATCGAGGCACAGAAAGATGAGATCCAAGTTCTCAAGGGCCTCCATCTT
TTCCACATTGTTCCTTAGAAGAAGTGCAACAGCATCGAAAAAGCCTTGAAGAACAGAGGA
TAAGACTAGCTCGTTTTCATTGTCGCCTCCCGTAACAAAGAAGTGAAGGTCCTGGGCGAA
CTTATAGACAATAATATTACTGTCCAAGAGTGTGATCTCAGCTTCAGTGCGAGCATTGGT
CTTAGAGGTCTTGGAGAATACGTACTTCTCAAAACTCAACTTGGCAGCATTAGTTGGCCA
GTCATCGGAGTAATACTTGACAGCCACACGCTTCCCTTCAGAGTCCAGGAGAAGAATGTT
CTTGACCAAAGGACATAAATCATGATTCCCGTGAATGCCTGACATTGTTGTTAAACCTGT
GTTATCGCCACTTTTTGAGAGAGAGCAGATTCCTTAGAGT
CC

QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1D713JQ 796 0 0
G
GAACTCCAGAAAAACAATTCCAGCATTGCACACAGCTATATAATACCCAAAACTTCAGAT
TAAGTATGCAGAAACGACGTAAGCAAAGTGCATGAATTATTAGAAAGCCTTTCACACGTT
ATGAGATAAATCCCACAACAATTATTATGCATAATGCATATGAGGTGAGGAAACTCTCAT
GTAAGCAGACTTCTAGCGAGATGTTCACGAGCTGTTGCCAGTGCTTGAGTTAGTGTCTGT
TCAGAAA*GTGAACCACTAGCTTCTGTGCTCTGCATTGCTACTTTCCCCGCAATGACACT
CGGGTCTGTTTCAAGAACCACCCCCTGATCGACCATTTCATCGAGGCACAGAAAGATGAG
ATCCAAGTTCTCAAGGGCCTCCATCTTTTCCACATTGTTCCTTAGAAGAAGTGCAACAGC
ATCGAAAAAGCCTTGAAGAACAGAGGATAAGACTAGCTCGTTTTCATTGTCGCCTCCCGT
AACAAAGAAGTGAAGGTCCTGAGCGAACTTGTAGACAATAATATTGCTGTCCAAGAGTGT
GATCTCAGCTTCAGTGCGAGCATTGGTCTTAGAGGTCTTGGAGAAAACGTACTTCTCAAA
ACTCAACTTGGCAGCATTAGTTGGCCAGTCATCGGAGTAATACTTGACAGCCACACGCTT
CCCTTCAGAGTCCAGGAGAAGAATGTTCTTTACCAAAGGACATAAATCATGAGCCCCGTG
AATGCCTGACATTGTTGTTAAACCTGTGTTATCGCCACTTTTTGAGAGAGAGCAGATTCC
TTTGAATGAT
GGATC

QA 2 791 2 791
DS 

RD RS1D713TF 683 0 0
CACACGTTATGAGATAAATCCCACAACAATTATTATGCATAATGCATATGAGGTGAGGAA
ACTCTCATGTAAGCAGACTTCTAGCGAGATGTTCACGAGCTGTTGCCAGTGCTTGAGTTA
GTGTCTGTTCAGAAA*GTGAACCACTAGCTTCTGTGCTCTGCATTGCTACTTTCCCCGCA
ATGACACTCGGGTCTGTTTCAAGAACCACCCCCTGATCGACCATTTCATCGAGGCACAGA
AAGATGAGATCCAAGTTCTCAAGGGCCTCCATCTTTTCCACATTGTTCCTTAGAAGAAGT
GCAACAGCATCGAAAAAGCCTTGAAGAACAGAGGATAAGACTAGCTCGTTTTCATTGTCG
CCTCCCGTAACAAAGAAGTGAAGGTCCTGAGCGAACTTGTAGACAATAATATTGCTGTCC
AAGAGTGTGATCTCAGCTTCAGTGCGAGCATTGGTCTTAGAGGTCTTGGAGAAAACGTAC
TTCTCAAAACTCAACTTGGCAGCATTAGTTGGCCAGTCATCGGAGTAATACTTGACAGCC
ACACGCTTCCCTTCAGAGTCCAGGAGAAGAATGTTCTTTACCAAAGGACATAAATCATGA
GCCCCGTGAATGCCTGACATTGTTGTTAAACCTGTGTTATCGCCACTTTTTGAGAGAGAG
CAGATTCCTTTGAATGAT
GGATC

QA 1 678 1 678
DS 



CO CL17Contig3 361 2 6 U
GGGTAACAATTCATATCAAATCCATCGAGCTTCGAGACGAATCTGCTGTGGGATCCCAAA
GATCAACTGGAGAGAACTTAACAATGTCAGGCTTTCACGGGACTCATGATTCATGTCCTT
TGGTGAAGAACATTCTTCTTCTGGACTCTGAAGGGAAGCGTGTGGCTGTCAAGTATTACT
CCGATGACTGGCCTACTCATGCTGCCAAGTTGACTTTTGAGAAGTATGTCTTCTCAAAGA
CCTCTAAGACCAATGCTCGCACTGAAGCTGAGATCACATTGTTGGACAGTAATATCATTG
TCTATAAGTTCGCCCAGGACCTTCACTTCTTTGTTACTGGAGGCGAAAATGAAAACGAGC
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1FR11TF U 1
AF RS1CB81TF U 11
BS 1 64 RS1FR11TF
BS 65 65 RS1CB81TF
BS 66 260 RS1FR11TF
BS 261 261 RS1CB81TF
BS 262 278 RS1FR11TF
BS 279 361 RS1CB81TF

RD RS1FR11TF 285 0 0
GGGTAACAATTCATATCAAATCCATCGAGCTTCGAGACGAATCTGCTGTGGGATCCCAAA
GATCGACTGGAGAGAACTTAACAATGTCAGGCTTTCACGGGACTCATGATTCATGTCCTT
TGGTGAAGAACATTCTTCTTCTGGACTCTGAAGGGAAGCGTGTGGCTGTCAAGTATTACT
CCGATGACTGGCCTACTCATGCTGCCAAGTTGACTTTTGAGAAGTATGTCTTCTCAAAGA
CCTCTAAGACCAATGCTCGCTCTGAAGCTGAGATCACA
TTGTTGG

QA 1 278 1 278
DS 

RD RS1CB81TF 351 0 0
GG
ATATCAAATCCATCGAGCTTCGAGACGAATCTGCTGTGGGATCTCAAAGATCAACTGGAG
AGAACTTAACAATGTCAGGCTTTCACGGGACTCATGATTCATGTCCTTTGGTGAAGAACA
TTCTTCTTCTGGACTCTGAAGGGAAGCGTGTGGCTGTCAAGTATTACTCCGATGACTGGC
CTACTCATGCTGCCAAGTTGACTTTTGAGAAGTATGTCTTCTCCAAGACCTCTAAGACCA
ATGCTCGCACTGAAGCTGAGATCACATTGTTGGACAGTAATATCATTGTCTATAAGTTCG
CCCAGGACCTTCACTTCTTTGTTACTGGAGGCGAAAATGAAAACGAGCT

QA 3 351 3 351
DS 



AS 2 19

CO CL18Contig1 1096 7 9 U
GGTAAAAGCCCAAAATTAATTTCATAAAGGCCCAAAATAGTCATACAAAGAAACAGCTGA
ATTCAAAACAAGCAAAGATGATCATGGTTCATATATCACTCATAAGCATTTGAATTGGTT
ATATAAACCAGAAATGGAAAAGGGATAGTAAAGACTCAATAATCAGATTGGAACTCTGAT
CTTATTCATTGGTTAGAATATTATTCGTAAAATGATTTGATCAAGCGACATAGTAGATGG
AGTTAGGGAGCTTGAAGGTTCTCTTGGGAACTGGACAACCTGCGAAGCTGTTCCATTGTG
CACCCATCACTCCCCAAACTCTGTATCCAAGACTTGTAAGCCATGTCCTCACATCTGCTT
TGTATTGGGTCACGCTCTTCTTCTCTTCCTCTTCTCCTCTGAGAAGGAGGTTAGACCAGC
TGTGGTAACCGGCTTCAATAAGGTTCTCGACGGTGGCGGATCTGAGGTACTCCTTGCGAG
AAGAAACCAAAAAGATCTTGAAACCCCTCTCCCGGATCTCATGGAATAGCTTCACCATGT
TTGGAACAGCTGGTGCCTTTCCCCAACTCTGCCATTCCTCGAATTTGGTCGTGTTTAGTT
GCTCACCACCGAAACAGCCGTTGCTCTTGTGGTACGGGATGGTGGAAAGCAGAGTGTCGT
CAATGTCAAAGATCCAAGCATCCATGTCATCACATTTCTTCTTTCCGCAACATGTTTTCC
CGAGGTAGAGGATGGCTTCCTCAACAGCTCTCTCCACGTCATCATCGTACTGAGATGACG
TCATGTACTGTTGGACGAACCACACGCACTCCTGTGGCACCACCGTGAAGTCTCTGATGT
TGTGAAGCTCCACGTTGACTCTCCAGCTCTCGCAGTATCCGTTTAGGTTTGGTCCTTTCA
ATGAGGCGACGCCGTTCTGGTTGGTGGTTGCGGTTGGCTTGAGTCCCTTAAACTGGTTTA
GGATGTTCCAGTCACGAGCTGAGACCATTCCTATGAAGAGGAATGCGAGGGTTAGCGAGA
GCACCAAAGATCTAGCCATGTTGCTGATGATACCAATTGAAGAGGGTTATACTTTTTGGT
GATCTGTTTGTAATCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 40 40 40 40 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

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AF RS1FX15JQ U 65
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AA

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GA
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TATTGGGTCACGCTCTTCTTCTCTTCCTCTTCTCCTCTGAAAAGGAGGTTAGACCAGCTG
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ATATAAACCAGAAATGGAAAAGGGATAGTAAAGACTCAATAATCAGATTGGAACTCTGAT
CTTATTCATTGGTTAGAATATTATTCGTAAAATGATTTGATCAAGCGACATAGTAGATGG
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TGTATTGGGTCACGCTCTTCTTCTCTTCCTCTTCTCCTCTGAGAAGGAGGTTAGACCAGC
TGTGGTAACCGGCTTCAATAAGGTTCTCGACGGTGGCGGATCTGAGGTACTCCTTGCGAG
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AACAGCTGGTGCCTTTCCCCAACTCTGCCATTCCTCGAATTTGGTCGTGTTTAGTTGCTC
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GTA

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C
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AATC

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CC

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CTTTCCGCAACATGTTTTCCCGAGGTAGAGGATGGCTTCCTCAACAGCTCTCTCCACGTC
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GTTTAGGTTTGGTCCTTTCAATGAGGCGACGCCGTTCTGGTTGGTGGTTGCGGTTGGCTT
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GAATGCGAGGGTTAGCGAGAGCACCAAAGATCTAGCCATGTTGCTGATGATACCAATTGA
AGAGGGTTATACTTTTTGGTGATCTGTTTGTAATCC

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DS 



CO CL18Contig2 1136 12 19 U
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GCTAGATCTTTGTTGCTCTCGCTAACCCTCGCGTGCTTCTTCACCGCAATGGTCTCAGCT
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AACGTGGAGCTTCACAACATCAGAGACTTCACGGTGGTGCCACAAGAGTGCGTCTGGTTC
GTCCAAAAGTACATGACGTCATCTCAATACGAGGATGACGTGGAGAGAGCCGTTGATGAA
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TGGATCTTTGACATTGATGACACTCTTCTCTCCACCATTCCTTACCACAAGAGCAACGGA
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GCACCAGCGGTTCCAAGCATGGTGAAGCTGTTCCACGAGATCAGAGAGAGAGGCTTCAAA
ATCTTTTTAGTCTCTTCTCGTAAAGAGTATCTCAGATCCGCCACCGTCGAAAACCTTATT
GAAGTCGGTTACCACGGCTGGTCTAACCTTCTACTCAGGGGAGAAGAGGAAGAGAAGAAG
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TGGGGAGTGATGGGTGCACAATGGAACAGCTTTGCAGGTTGCCCAGTTCCCAAGAGAACC
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CGATCATCTTTGGTTCTGTTGAATTCAGCTGTTTTTCTTTCATTGTATTACAATTTTGGG
CCTTTGTGAAATTGATTATGGGCTCTTTTTAATAAGTAATCTCATCTTTTTATATC


BQ
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40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 30 55 55 55 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 35 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 60 60 60 60 60 60 45 60 45 60 50 50 50 20 50 50 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 20 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1C939TF U 4
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AF RS1AM83TF U 0
AF RS1FS53TF U 3
AF RS1EL81TF U 4
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AF RS1C939JQ C 650
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BS 731 796 RS1CE07TF
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BS 862 909 RS1F958JQ
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GACTGGAACATCCTAAAGCAGCTCAAAGGAGGCAAGCCAACCACAACCACCAGCCAAAAC
GGCCTAGGATCCTTGAAAGTATCAAACCTAAACGGATACTGCGAGAGCTGGAGAGTCAAC
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CAAAAGTACATGACGTCATCTCAATACGAGGATGACGTGGAGAGAGCCGTTGATGAAGCC
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ATCTTTGACATTGATGACACTCTTCTCTCCACCATTCCTTACCACAAGAGCAACGGATGC
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CCAGCGGTTCCAAGCATGGTGAAGCTGTTCCACGAGATCAGAGAGAGAGGCTTCAAAATC
TTTTTAGTCTCTTCTCGTAAAGAGTATCTCAGATCCGCCACCGTCGAAA

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DS 

RD RS1F958TF 703 0 0
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GCTAGATCTTTGTTGCTCTCGCTAACCCTCGCGTGCTTCTTCACCGCAATGGTCTCAGCT
CGTGACTGGAACATCCTAAAGCAGCTCAAAGGAGGCAAGCCAACCACAACCACCAGCCAA
AACGGCCTAGGATCCTTGAAAGTATCAAACCTAAACGGATACTGCGAGAGCTGGAGAGTC
AACGTGGAGCTTCACAACATCAGAGACTTCACGGTGGTGCCACAAGAGTGCGTCTGGTTC
GTCCAAAATTACATGACGTCATCTCAATACTAGGATGACGTGGAGAGAGCCGTTGATGAA
GCCATCCTATACCTCGGAAAAACTTGTTGCGAGAAGAAGAAATGTGATGGCATGGATGCT
TGGATCTTTGACATTGATGACACTCTTCTCTCCACCATTCCTTACCACAAGAGCAACGGA
TGCTTCGGTGGTGAGCAACTAAACACGACCAAGTTCGAGGAATGGCAAAATTTGGGAAAG
GCACCAGCGGTTCCAAGCATGGTGAAGCTGTTCCACGAGATCAGAGAGAGAGGCTTCAAA
ATCTTTTTAGTCTCTTCTCGTAAAGAGTATCTCAGATCCGCCACCGTCGAAAACCTTATT
GAAGTCAGTTACCACGGCTGGTCTAACCTTCTACTCAGGG
AGA

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DS 

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CAAAACAAGTAAATCTTCTTCATCGGTCAACTTGATCAAGTCATCATCGACATGGCTAGA
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AAGTACATGACGTCATCTCAATACGAGGATGACGTGGAGAGAGCCGTTGATGAAGCCGTC
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GGTGGTGAGCAACTAAACACGACCAAGTTCGAGGAATGGCAAAATTTGGGAAAGGCACCA
GCGGTTCCAAGCATGGTGAAGCTGTTCCACGAGATCAGAGAGAGAGGCTTCAAAATCTTT
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GGTTACCACGGCTGGTCT

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DS 

RD RS1AM83TF 695 0 0
GGATC
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GCCTAGGATCCTTGAAAGTATCAAACCTAAACGGATACTGCGAGAGCTGGAGAGTCAACG
TGGAGCTTCACAACATCAGAGACTCCACGGTGGTGCCACAAGAGTGCGTCTGGTTCGTCC
AAAAGTACATGACGTCATCTCAATACGAGGATGACGTGGAGAGAGCCGTTGATGAAGCCA
TCCTATACCTCGGAAAAACTTGTTGCGAGAAGAAGAAATGTGATGGCATGGATGCTTGGA
TCTTTGACATTGATGACACTCTTCTCTCCACCATTCCTTACCACAAGAGCAACGGATGCT
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CAGCGGTTCCAAGCATGGTGAAGCTGTTCCACGAGATCAGAGAGAGAGGCTTCAAAATCT
TTTTAGTCTCTTCTCGTAAAGAGTATCTCAGATCCGCCACCGTCGAAAACCTTATTGAAG
TCGGTTACCACGGCTGGTCTAACCTTCTAC

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DS 

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G
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GTGGAGCTTCACAACATCAGAGACTTCACGGTGGTGCCACAAGAGTGCGTCTGGTTCGTC
CAAAAGTACATGACGTCATCTCAATACGAGGATGACGTGGAGAGAGCCGTTGATGAAGCC
ATCCTATACCTCGGAAAAACTTGTTGCGAGAAGAAGAAATGTGATGGCATGGATGCTTGG
ATCTTTGACATTGATGACACTCTTCTCTCCACCATTCCTTACCACAAGAGCAACGGATGC
TTCGGTGGTGAGCAACTAAACACGACCAAGTTCGAGGAATGGCAAAATTTGGGAAAGGCA
CCAGCGGTTCCAAGCATGGTGAAGCTGTTCCACGAGATCAGAGAGAGAGGCTTCAAAATC
TTTTTAGTCTCTTCTCGTAAAGAGTATCTCAGATCCGCCACCGTCGAAAACCTTATTGAA
GTCGGCTACCACGGCTGGTCTAACCTTCTAC

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DS 

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GGG
CAAAACAAGTAAATCTTCTTCATCGGTCAACTTGATCAAGTCATCATCGACATGGCTAGA
TCTTTGTTGCTCTCGCTAACCCTAGCGTTCTTCTTCACCGCAATGGTCTCAGCTCGTGAC
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AAGTACATGACGTCATCTCAATACGAGGATGACGTGGAGAGAGCCGTTGATGAAGCCGTC
CTATACCTCGGAAAAACTTGTTGCGAGAAGAAGAAATGTGATGGCATGGATGCTTGGATC
TTTGACATTGATGACACTCTTCTCTCCACCATTCCTTACCACAAGAGCAACGGATGCTTC
GGTGGTGAGCAACTAAACACGACCAAGTTCGAGGAATGGCAAAATTTGGGAAAGGCACCA
GCGGTTCCAAGCATGGTGAAGCTGTTCCACGAGATCAGAGAGAGAGGCTTCAAAATCTTT
TTGGTCTCTTCTCGTAAAGAGTATCTCAGATCCGCCACCGTCGAAAACCTTATTGAAGTC
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AGCCAATACAAAGCAGATGTGAGGACATGGCTTACAAGTCT*GGATACAGA

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DS 

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G
GGCCAAAACAAGTAAATCTTCTTCATCGGTCAACTTGATCAAGTCATCATCGACATGGCT
AGATCTTTGTTGCTCTCGCTAACCCTCGCGTGCTTCTTCACCGCAATGGTCTCAGCTCGT
GACTGGAACATCCTAAAGCAGCTCAAAGGAGGCAAGCCAACCACAACCACCAGCCAAAAC
GGCCTAGGATCCTTGAAAGTATCAAACCTAAACGGATACTGCGAGAGCTGGAGAGTCAAC
GTGGAGCTTCACAACATCAGAGACTTCACGGTGGTGCCACAAGAGTGCGTCTGGTTCGTC
CAAAAGTACATGACGTCATCTCAATACGAGGATGACGTGGAGAGAGCCGTTGATGAAGCC
ATCCTATACCTCGGAAAAACTTGTTGCGAGAAGAAGAAATGTGATGGCATGGATGCTTGG
ATCTTTGACATTGATGACACTCTTCTCTCCACCATTCCTTACCACAAGAGCAACGGATGC
TTCGGTGGTGAGCAACTAAACACGACCAAGTTCGAGGAATGGCAAAATTTGGGAAAGGCA
CCAGCGGTTCCAAGCATGGTGAAGCTGTTCCACGAGATCAGAGAGAGAGGCTTCAAAATC
TTTTTAGTCTCTTCTCGTAAAGAGTATCTCAGAACCGCCACCGTCGAAAACCTTATTGAA
GTCGGTTACCACGGCTGGTCTAACCTTCTACTCACGGGAGAAGAGGAAGAGAAGAAGAGC
GTGAGC*AATACAAAGCAGATGTGAGGACATGGCTTACAAGTCTTGGATACAGAGTTTGG
GGAGTGATGGGTG

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DS 

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TTACCACGGCTGGTCTAACCTTCTACTCAGGGGAGAAGAGGAAGAGAAGAAGAGCGTGAG
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GATGGGTGCACAATGGAACAGCTTTGCAGGTTGCCCAGTTCCCAAGAGAACCTTCAAGCT
CCCTAACTC

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DS 

RD RS1F958JQ 759 0 0
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TGACACTCTTCTCTCCACCATTCCTTACCACAAGAGCAACGGATGCTTCGGTGGTGAGCA
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TCGTAAAGAGTATTTCAGATCCGCCACCGTCGAAAACCTTATTGAAGTCAGTTACCACGG
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ATGGGCTCTTTTTAATAAGTAATCTCATCTTTTTATATC

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DS 

RD RS1FS53JQ 505 0 0
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GGTGCACAATGGAACAGCTTTGCAGGTTGCCCAGTTCCCAAGAGAACCTTCAAGCTCCCT
AACTCCATTTACTACATTGCTTGATCAAATCATATTTACTACTCTAACCAAAAAAAAAGA
TCAGAGATTCAATTTGATTCTTGAGTTTGCTTATCATCTCCCTTTTTTTCTTTTTGTCAT
TTTTGGTTTATTTAAAAGTCAAATGATTATGAGTGATATTATGAACCACGATCATCTTTG
GTTTTGTTGAATTCAGCTGTTTTTCTTTCATTGTATTACAATTTTGGGCCTTTGTGAAAT
TGATTATGGGCTCTTTTT
AATAAGT

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DS 

RD RS1CE07JQ 490 0 0
CCGTCGAAAACCTTATTGAAGTCGGTTACCACGGCTGGTCTAACCTTCTACTCAGGGGAG
AAGAGGAAGAGAAGAAGAGCGTGAGCCAATACAAAGCAGATGTGAGGACATGGCTTACAA
GTTTTGGATACAGAGTTTGGGGAGTGATGGGTGCACAATGGAACAGCTTTGCAGGTTGCC
CAGTTCCCAAGAGAACCTTCAAGCTCCCTAACTCCATTTACTACATTGCTTGATCAAATC
ATATTTACTACTCTAACCAAAAAAAAAGATCAGAGATTCAATTTGATTCTTGAGTCTGCT
TATCATCTCCCTTCTTTTCTTTTTGTCATTTTTGGTTTATTTAAAAGTCAAATGATTATG
AGTGATATTATGAACCACGATCATCTTTGGTTCTGTTGAATTCAGCTGTTTTTTTTTCAT
TGTATTACAATTTTGGGCCTTTGTGAAATTGATTATGGGCTCTTTTTAATAAGTAATTTC
ATCTTTTTAT

QA 1 490 1 490
DS 



AS 2 19

CO CL19Contig1 588 13 10 U
GGGCAAGACACAAACAAGATTGACACAACAGAATCTCATTCTTATACCAAATCTCCAACA
CAAAAAAAAA**CATAATGGCATCTTCTATGAAATTTCTCTGCGTTCTTGGCCTTATTCT
CCTTGTTGGAACAGTTGTAGACGGAGCAGGAGAGTGCGGTAGATCTACTCCGGACAATGA
GGCGATGAAGTTGGCCCCATGTGTAGGTGCGGCTCAGGACGCTAACGCCGCCGTGCCGGG
CGGTTGCTGTTCTCAGATTAAAAGATTCTCTCAGAATCCTAAGTGTCTCTGCGCCGTTCT
TCTCTCCGACACGGCTAAAGCCTCAGGAGTGCAGCCGGAGGTTGCCCTCACTATCCCCAA
ACGCTGCAATTTCGCTAACCGCCCCATCGGTTACAAGTGCGGAGCATACACACTTCCATG
AACATGAAGTGTTGAGGATGGAGATTCATGGGCTTTGGAGTTCACTACTACACCCCAAAA
GCCAATCCTCATGTACCTTATATTATATGAATAATGATAATGTTTTATATGTATCAGTGT
GATTGTAATTAATAACTAAATCAATAATATATGAGAAAATTCCACCCG


BQ
15 15 15 15 30 30 10 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 65 50 65 30 65 65 65 65 65 65 65 70 70 45 70 70 55 
70 35 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 

AF RS1AZ70JQ C 3
AF RS1GK72JQ C 6
AF RS1DI79TF U 1
AF RS1GN51TF U 1
AF RS1E736TF U 8
AF RS1AZ70TF U 3
AF RS1B435JQ C 7
AF RS1GK72TF U 6
AF RS1B435TF U 7
AF RS1E736JQ C 297
AF RS1CM26JQ C 7
AF RS1GN51JQ C 164
AF RS1CM26TF U 7
BS 1 6 RS1DI79TF
BS 7 7 RS1GK72TF
BS 8 69 RS1DI79TF
BS 70 70 RS1GN51TF
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BS 279 279 RS1GN51TF
BS 280 376 RS1DI79TF
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BS 378 587 RS1DI79TF
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GG
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ATGAAGTTGGCCCCATGTGTAGGTGCGGCTCAGGACGCTAACGCCGCCGTGCCGGGCGGT
TGCTGTTCTCAGATTAAAAGATTCTCTCAGAATCCTAAGTG

QA 3 283 3 283
DS 

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G
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AAAA**CATAATGGCATCTTCTATGAAATTTCTCTGCGTTCTTGGCCTTATTCTCCTTGT
TGGAACAGTTGTAGACGGAGCAGGAGAGTGCGGTAGATCTACTCCGGACAATGAGGCGAT
GAAGTTGGCCCCATGTGTAGGTGCGGCTCAGGACGCTAACGCCGCCGTGCCGGGCGGTTG
CTGTTCTCAGATTAAAAGATTCTCTCAGAATCCTAAGTGTCTCTGCGCCGTTCTTCTCTC
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AAGTGTTGAGGATGGAGATTCATGGGCTTTGGAGTTCACTACTACACCCCAAAAGCCAAT
CCTCATGTACCTTATATTATATGAATATTGATAATGTTTTATATGTATCA

QA 2 531 2 531
DS 

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CAAAAAAAA***CATAATGGCATCTTCTATGAAATTTCTCTGCGTTCTTGGCCTTATTCT
CCTTGTTGGAACAGTTGTAGACGGAGCAGGAGAGTGCGGTAGATCTACTCCGGACAATGA
GGCGATGAAGTTGGCCCCATGTGTAGGTGCGGCTCAGGACGCTAACGCCGCCGTGCCGGG
CGGTTGCTGTTCTCAGATTAAAAGATTCTCTCAGAATCTTAAGTGTCTCTGCGCCGTTCT
TCTCTCCGACACGGCTAAAGCCTCAGGAGTGCAGCCGGAGGTTGCCCTCACTATCCCCAA
ACGCTGCAATTTCGCTGACCGCCCCATCGGTTACAAGTGCGGAGCATACACACTTCCATG
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GCCAATCCTCATGTACCTTATATTATATGAATAATGATAATGTTTTATATGTATCAGTGT
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DS 

RD RS1GN51TF 587 0 0
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CAAAAAAAAAAACATAATGGCATCTTCTATGAAATTTCTCTACGTTCTTGGCCTTATTCT
CCTTGTTGGAACAGTTGTAGACGGAGCAGGAGAGTGCGGTAGATCTACTCCGGACAATGA
GGCGATGAAGTTGGCCCCATGTGTAGGTGCGGCTCAGGACGCTAACGCCGCCGTGCCGGG
CGGTTGCTGTTCTCAGATTAAAAGATTCTCTCAGAATCCTAAGTGTCTCTGCGCCGTTCT
TCTCTCCGACACGGCTAGAGCCTCAGGAGTGCAGCCGGAGGTTGCCCTCACTATCCCCAA
ACGCTGCAATTTCGCTAACCGCCCCATCGGTTACAAGTGCGGAGCATACACACTTCCATG
AACATGAAGTGTTGAGGATGGAGATTCATGGGCTTTGGAGTTCACTACTACACCCCAAAA
GCCAATCCTCATGTACCTTATATTATATGAATAATGATAATGTTTTATATGTATCAGTGT
GATTGTAATTAATAACTAAATCAATAATATATGAGAAAATTCCACCC

QA 1 587 1 587
DS 

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G
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AAAACATAATGGCATCTTCTATGAAATTTCTCTGCGTTCTTGGCCTTATTCTCCTTGTTG
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AGTTGGCCCCATGTGTAGGTGCGGCTCAGGACGCTAACGCCGCCGTGCCGGGCGGTTGCT
GTTCTCAGATTAAAAGATTCTCTCAGAATCCTAAGTGTCTCTGCGCCGTTCTTCTCTCCG
ACACGGCTAAAGCCTCAGGAGTGCAGCCGGAGGTTGCCCTCACTATCCCCAAACGCTGCA
ATTTCGCTAACCGCCCCATCGGTTACAAGTGCGGAGCATACACACTTCCATGAACATGAA
GTGTTGAGGATGGAGATTCATGGGCTTTGGAGTTCACTACTACACCCCAAAAGCCAATCC
TCATGTACCTTATATTATATGAATAATGATAATGTTTTATATGTATCAGTGTGATTGT

QA 2 539 2 539
DS 

RD RS1AZ70TF 585 0 0
GG
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AAAAAAA*CATAATGGCATCTTCTATGAAATTTCTCTGCGTTCTTGGCCTTATTCTCCTT
GTTGGAACAGTTGTAGACGGAGCAGGAGAGTGCGGTAGATCTACTCCGGACAATGAGGCG
ATGAAGTTGGCCCCATGTGTAGGTGCGGCTCAGGACGCTAACGCCGCCGTGCCGGGCGGT
TGCTGTTCTCAGATTAAAAGATTCTCTCAGAATCCTAAGTGTCTCTGCGCCGTTCTTCTC
TCCGACACGGCTAAAGCCTCAGGAGTGCAGCCGGAGGTTGCCCTCACTATCCCCAAACGC
TGCAATTTCGCTAACCGCCCCATCGGTTACAAGTGCGGAGCATACACATTTCCATGAACA
TGAAGTGTTGAGGATGGAGATTCATGGGCTTTGGAGTTCACTACTACACCCCAAAAGCCA
ATCCTCATGTACCTTATATTATATGAATAATGATAATGTTTTATATGTATCAGTGTGATT
GTAATTAATAACTAAATCAATAATATATGAGAAAATTCCACCC

QA 3 585 3 585
DS 

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GAAGTTGGCCCCATGTGTAGGTGCGGCTCAGGACGCTAACGCCGCCGTGCCGGGCGGTTG
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AAGTGTTGAGGATGGAGATTCATGGGCTTTGGAGTTCACTACTACCCCCCAAAAGCCAAT
CCTCATGTACCTTATATTATATGAATAATGATAATGTTTTATATGTACCAGTGTGATTGT
AATTAATAACTAAATCAATAATA

QA 1 563 1 563
DS 

RD RS1GK72TF 570 0 0
G
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AAAA**CATAATGGCATCTTCTATGAAATTTCTCTGCGTTCTTGGCCTTATTCTCCTTGT
TGGAACAGTTGTAGACGGAGCAGGAGAGTGCGGTAGATCTACTCCGGACAATGAGGCGAT
GAAGTTGGCCCCATGTGTAGGTGCGGCTCAGGACGCTAACGCCGCCGTGCCGGGCGGTTG
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CAATTTCGCTAACCGCCCCATCGGTTACAAGTGCGGAGCATACACACTTCCATGAACATG
AAGTGTTGAGGATGGAGATTCATGGGCTTTGGAGTTCACTACTACACCCCAAAAGCCAAT
CCTCATGTACCTTATATTATATGAATATTGATAATGTTTTATATGTATCAGTGTGATTGT
AATTAATAACTAAATCAATAATATATGAG

QA 2 570 2 570
DS 

RD RS1B435TF 582 0 0
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AAAA**CATAATGGCATCTTCTATGAAATTTCTCTGCGTTCTTGGCCTTATTCTCCTTGT
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AAGTGTTGAGGATGGAGATTCATGGGCTTTGGAGTTCACTACTACACCCCAAAAGCCAAT
CCTCATGTACCTTATATTATATGAATAATGATAATGTTTTATATGTACCAGTGTGATTGT
AATTAATAACTAAATCAATAATATATGAGAAAATTCCACCCG

QA 1 582 1 582
DS 

RD RS1E736JQ 291 0 0
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CATGAACATGAAGTGTTGAGGATGGAGATTCATGGGCTTTGGAGTTCACTACTACACCCC
AAAAGCCAATCCTCATGTACCTTATATTATATGAATAATGATAATGTTTTATATGTATCA
GTGTGATTGTAATTAATAACTAAATCAATAATATATGAGAAAATTCCACCC

QA 1 291 1 291
DS 

RD RS1CM26JQ 582 0 0
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AAAA**CATAATGGCATCTTCTATGAAATTTCTCTGCGTTCTTGGCCTTATTCTCCTTGT
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GAAGTTGGCCCCATGTGTAGGTGCGGCTCAGGACGCTAACGCCGCCGTGCCGGGCGGTTG
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CGACACGGCTAAAGCCTCAGGAGTGCAGCCGGAGGTTGCCCTCACTATCCCCAAACGCTG
CAATTTCGCTAACCGCCCCATCGGTTACAAGTGCGGAGCATACACACTTCCATGAACATG
AAGTGTTGAGGATGGAGATTCATGGGCTTTGGAGTTCACTACTACACCCCAAAAGCCAAT
CCTCATGTACCTTATATTATATGAATAATGATAATGTTTTATATGTACCAGTGTGATTGT
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G

QA 1 581 1 581
DS 

RD RS1GN51JQ 424 0 0
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GCCCTCACTATCCCCAAACGCTGCAATTTCGCTAACCGCCCCATCGGTTACAAGTGCGGA
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TTTATATGTATCAGTGTGATTGTAATTAATAACTAAATCAATAATATATGAGAAAATTCC
ACCC

QA 1 424 1 424
DS 

RD RS1CM26TF 582 0 0
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AAAA**CATAATGGCATCTTCTATGAAATTTCTCTGCGTTCTTGGCCTTATTCTCCTTGT
TGGAACAGTTGTAGACGGAGCAGGAGAGTGCGGTAGATCTACTCCGGACAATGAGGCGAT
GAAGTTGGCCCCATGTGTAGGTGCGGCTCAGGACGCTAACGCCGCCGTGCCGGGCGGTTG
CTGTTCTCAGATTAAAAGATTCTCTCAGAATCCTAAGTGTCTCTGCGCCGTTCTTCTCTC
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AAGTGTTGAGGATGGAGATTCATGGGCTTTGGAGTTCACTACTACACCCCAAAAGCCAAT
CCTCATGTACCTTATATTATATGAATAATGATAATGTTTTATATGTACCAGTGTGATTGT
AATTAATAACTAAATCAATAATATATGAGAAAATTCCACCC
G

QA 1 581 1 581
DS 



CO CL19Contig2 591 6 11 U
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TGTAATTAATAACTATATCAATAATATAAGAAATGATTTCAAAGGACGCTA


BQ
25 30 30 0 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 0 0 0 30 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 15 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RS1DZ12JQ C 1
AF RS1CS72JQ C 1
AF RS1CS72TF U 1
AF RS1DZ12TF U 2
AF RS1A680TF U 63
AF RS1A680JQ C 19
BS 1 20 RS1CS72TF
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RD RS1DZ12JQ 591 0 0
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G

QA 1 590 1 590
DS 

RD RS1CS72JQ 580 0 0
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QA 1 580 1 580
DS 

RD RS1CS72TF 580 0 0
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GGGCGGTTGCTGTTCTCAGATTAAAAGATTCTCTCAGAATCCTAAGTGTCTCTGCGCCGT
TCTTCTCTCCGACACGGCTAAAGCCTCAGGAGTGCAGCCGGAGGTTGCCCTCACTATCCC
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AATCCTCATGTACCGTATATTATATGAATAATGATAATGTTTTATATGTATCAGTGTGGT
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QA 1 580 1 580
DS 

RD RS1DZ12TF 590 0 0
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GTAATTAATAACTATATCAATAATATAAGAAATGATTTCAAAGGACGCT
G

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1A680TF 528 0 0
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TCCTTGTTGGAACAGTTGTAGACGGAGCAGGAGAGTGCGGTAGGTCTACTCCGGACAATG
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GCGGTTGCTGTTCTCAGATTAAAAGATTCTCTCAGAATCCTAAGTGTCTCTGCGCCGTTC
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AACGCTGCAATTTCGCTAACCGCCCCATCGGTTACAAGTGCGGAGCATACACACTTCCAT
GAAGTGTTGAGGATGGAGATTCATGGGCTTTGGAGTTCACTACTACACCCCAAAAGCCAA
TCCTCATGTACCGTATATTATATGAATAATGATAATGTTTTATATGTATCAGTGTGGTTG
TAATTAATAACTATATCAATAATATAAGAAATGATTTCAAAGGACGCT

QA 1 528 1 528
DS 

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QA 16 573 16 573
DS 



AS 1 20

CO CL20Contig1 2424 20 42 U
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BQ
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5 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 

AF RS1C475TF U 1
AF RS1EJ23TF U 1
AF RS1C013TF U 8
AF RS1DT14TF U 4
AF RS1B306TF U 6
AF RS1B306JQ C 61
AF RS1FC38TF U 436
AF RS1CU14TF U 425
AF RS1C475JQ C 567
AF RS1FC38JQ C 509
AF RS1BX30JQ C 504
AF RS1C013JQ C 530
AF RS1DT14JQ C 448
AF RS1FR77TF U 1201
AF RS1B764TF U 1200
AF RS1EA43TF U 1201
AF RS1BY64TF U 1779
AF RS1EA43JQ C 1705
AF RS1B764JQ C 1882
AF RS1FR77JQ C 1709
BS 1 310 RS1C475TF
BS 311 311 RS1C013TF
BS 312 312 RS1EJ23TF
BS 313 335 RS1C475TF
BS 336 336 RS1EJ23TF
BS 337 403 RS1C475TF
BS 404 404 RS1EJ23TF
BS 405 455 RS1C475TF
BS 456 456 RS1EJ23TF
BS 457 476 RS1C475TF
BS 477 477 RS1EJ23TF
BS 478 545 RS1C475TF
BS 546 546 RS1EJ23TF
BS 547 608 RS1C475TF
BS 609 651 RS1EJ23TF
BS 652 693 RS1C013TF
BS 694 694 RS1DT14TF
BS 695 1108 RS1CU14TF
BS 1109 1109 RS1DT14JQ
BS 1110 1116 RS1CU14TF
BS 1117 1117 RS1DT14JQ
BS 1118 1126 RS1CU14TF
BS 1127 1127 RS1DT14JQ
BS 1128 1138 RS1CU14TF
BS 1139 1139 RS1DT14JQ
BS 1140 1153 RS1CU14TF
BS 1154 1154 RS1DT14JQ
BS 1155 1182 RS1CU14TF
BS 1183 1202 RS1DT14JQ
BS 1203 1391 RS1B764TF
BS 1392 1392 RS1EA43TF
BS 1393 1441 RS1B764TF
BS 1442 1442 RS1EA43TF
BS 1443 1472 RS1B764TF
BS 1473 1473 RS1EA43TF
BS 1474 1681 RS1B764TF
BS 1682 1682 RS1EA43TF
BS 1683 1746 RS1B764TF
BS 1747 1747 RS1EA43TF
BS 1748 1915 RS1B764TF
BS 1916 2392 RS1BY64TF
BS 2393 2424 RS1EA43JQ

RD RS1C475TF 608 0 0
GGAACTTTGCTGCCGTGAAAGGCAGCTCCTTTTCTCTATTTATGAAATACAATTTCTATC
TATTTTAACTCTTGAAGACAATCTAAAGCTTTTCCCTTTCTTGTTTCTTCCATTGCAATA
AGGCTTTAACAAGCCATTCTATTTATGTCTTAATAAAGCTCTTTGAGCATTTTCTACAAA
TGTCATCATGGTATCAGAGCTTCAGTCGATTTTCATGGGTTACCCTATCATGTTGTAGCT
TCTGCACACTCTATCTAAACCATCTCAAGTCTCCACCAAATTCTCTCTCTCAAAAAAAA*
GAAAAAAAAAAAGGAGAAAAGGAAAAAAAAAAAAAAGCAAGAGTTCAAGGTCGAAGCTTT
CATCAGATCCGAGCAAATCTAGACATAGACTTCATCTTGGGTCGTAATAAGAAGGCCCAG
CAGTGAGCCCAAGAAAAGAAGACCTATTATGCAAGCCCCGTTTGACGCTCATCTCGCTCA
TGGCCGCGAGTGATATAACTCAGTCACGGTAATGTTTCTACTCTTGTGCCCCGGAGTGCT
GGTCGGTAGATTAAGCTTGCTGGCTGGATGGTTTTAGAGTTGTAGGTTTGGAACGTCAAG
TTAAATGA

QA 1 608 1 608
DS 

RD RS1EJ23TF 651 0 0
GG
AACTTTGCTGCCGTGAAAGGCAGCTCCTTTTCTCTATTTATGAAATACAATTTCTATCTA
TTTTAACTCTTGAAGACAATCTAAAGCTTTTCCCTTTCTTGTTTCTTCCATTGCAATAAG
GCTTTAACAAGCCATTCTATTTATGTCTTAATAAAGCTCTTTGAGCATTTTCTACAAATG
TCATCATGGTATCAGAGCTTCAGTCGATTTTCATGGGTTACCCTATCATGTTGTAGCTTC
TGCACACTCTATCTAAACCATCTCAAGTCTCCACCAAATTCTCTCTCTCAAAAAAAA*GA
AAAAAAAAA*GGAGAAAAGGAAAAAAAAAAAAA*GCAAGAGTTCAAGGTCGAAGCTTTCA
TCAGATCCGAGCAAATCTAGACATAGACTTCATCTTGGGTCATAATAAGAAGGCCCAGCA
GTGAGCCCAAGAAAAGAAGACCTATTATGCAAGTCCCGTTTGACGCTCATCTCGTTCATG
GCCGCGAGTGATATAACTCAGTCACGGTAATGTTTCTACTCTTGTGCCCCGGAGTGCTGG
TCGATAGATTAAGCTTGCTGGCTGGATGGTTTTAGAGTTGTAGGTTTGGAACGTCAAGTT
AAATGATTAGGCTGTGGTTAGTGGTTACGATGGCTTTTTTT*AGATGCA

QA 3 651 3 651
DS 

RD RS1C013TF 686 0 0
TGCTGCCGTGAAAGGCAGCTCCTTTTCTCTATTTATGAAATACAATTTCTATCTATTTTA
ACTCTTGAAGACAATCTAAAGCTTTTCCCTTTCTTGTTTCTTCCATTGCAATAAGGCTTT
AACAAGCCATTCTATTTATGCCTTAATAAAGCTCTTTGAGCATTTTCTACAAATGTCATC
ATGGTATCAGAGCTTCAGTCGATTTTCATGGGTTACCCTATCATGTTGTAGCTTCTGCAC
ACTCTATCTAAACCATCTCAAGTCTCCACCAAATTCTCTCTCTCAAAAAAAA*GAAAAAA
AAA**GGAGAAAAGGAAAAAAAAAAAAA*GCAAGAGTTCAAGGTCGAAGCTTTCATCAGA
TCCGAGCAAATCTAGACATAGACTTCATCTTGGGTCATAATAAGAAGGCCCAGCAGTGAG
CCCAAGAAAAGAAGACCTATTATGCAAGTCCCGTTTGACGCTCATCTCGTTCATGGCCGC
GAGTGATATAACTCAGTCACGGTAATGTTTCTACTCTTGTGCCCCGGAGTGCTGGTCGAT
AGATTAAGCTTGCTGGCTGGATGGTTTTAGAGTTGTAGGTTTGGAACGTCAAGTTAAATG
ATTAGGCTGTGGTTAGTGGTTACGATGGCTTTTTTT*AGATGCAAAGCTCTAGGCACGCA
CATAACGTGCTCATCCAAATGCCGAC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1DT14TF 693 0 0
CGGGG
GCTGCCGTGAAAGGCAGCTCCTTTTCTCTATTTATGAAATACAATTTCTATCTATTTTAA
CTCTTGAAGACAATCTAAAGCTTTTCCCTTTCTTGTTTCTTCCATTGCAATAAGGCTTTA
ACAAGCCATTCTATTTATGTCTTAATAAAGCTCTTTGAGCATTTTCTACAAATGTCATCA
TGGTATCAGAGCTTCAGTCGATTTTCATGGGTTACCCTATCATGTTGTAGCTTCTGCACA
CTCTATCTAAACCATCTCAAGTCTCCACCAAATTCTCTCTCTCAAAAAAAAAGAAAAAAA
AAAAGGAGAAAAGGAAAAAAAAAAAAAAGCAAGAGTTCAAGGTCGAAGCTTTCATCAGAT
CCGAGCAAATCTAGACATAGACTTCATCTTGGGTCATAATAAGAAGGCCCAGCAGTGAGC
CCAAGAATAGAAGACCTATTATGCAAGTCCCGTTTGACGCTCATCTCGTTCATGGCCGCG
AGTGATATAACTCAGTCACGGTAATGTTTCTACTCTTGTGCCCCGGAGTGCTGGTCGATA
GATTAAGCTTGCTGGCTGGATGGTTTTAGAGTTGTAGGTTTGGAACGTCAAGTTA**TGA
TTAGGCTGTGGTTAGTGGTTACGATGGCTTTTTTT*AGATGCAAAGCTCTAGGCACGCAC
ATAACGTGCTCATCCAAATGCCGACA
GA

QA 6 691 6 691
DS 

RD RS1B306TF 691 0 0
GGG
GCTGCCGTGAAAGGCAGCTCCTTTTCTCTATTTATGAAATACAATTTCTATCTATTTTAA
CTCTTGAAGACAATCTAAAGCTTTTCCCTTTCTTGTTTCTTCCATTGCAATAAGGCTTTA
ACAAGCCCTTCTATTTATGTCTTAATAAAGCTCTTTGAGCATTTTCTACAAATGTCATCA
TGGTATCAGAGCTTCAGTCGATTTTCATGGGTTACCCTATCATGTTGTAGCTTCTGCACA
CTCTATCTAAACCATCTCAAGTCTCCACCAAATTCTCTCTCTCAAAAAAA**GAAAAAAA
AA**GGAGAAAAGGAAAAAAAAAAA***GCAAGAGTTCAAGGTCGAAGCTTTCATCAGAT
CCGAGCAAATCTAGACATAGACTTCATCTTGGGTCATAATAAGAAGGCCCAGCAGTGAGC
CCAAGAAAAGAAGACCTATTATTCAAGTCCCGTTTGACGCTCATCTCGTTCATGGCCGCG
AGTGATATAACTCAGTCACGGTAATGTTTCTACTCTTGTGCCCCGGAGTGCTGGTCGATA
GATTAAGCTTGCTGGCTGGATGGTTTTAGAGTTGTAGGTTTGGAACGTCAAGTTAAATGA
TTACGCTGTGGTTAGTGGTTACGATGGCTTTTTT**AGATGCAAAGCTCTAG*CACGCAC
ATAACGTGCTCATCCAAATGCCGACA
GA

QA 4 689 4 689
DS 

RD RS1B306JQ 636 0 0
TATTTTAACTCTTGAAGACAATCTAAAGCTTTTCCCTTTCTTGTTTCTTCCATTGCAATA
AGGCTTTAACAAGCCCTTCTATTTATGTCTTAATAAAGCTCTTTGAGCATTTTCTACAAA
TGTCATCATGGTATCAGAGCTTCAGTCGATTTTCATGGGTTACCCTATCATGTTGTAGCT
TCTGCACACTCTATTTAAACCATCTCAAGTCTCCACCAAATTCTCTCTCTCAAAAAAA**
GAAAAAAAAA**GGAGAAAAGGAAAAAAAAAAA***GCAAGAGTTCAAGGTCGAAGCTTT
CATCAGATCCGAGCAAATCTAGACATAGACTTCATCTTGGGTCATAATAAGAAGGCCCAG
CAGTGAGCCCAAGAAAAGAAGACCTATTATTCAAGTCCCGTTTGACGCTCATCTCGTTCA
TGGCCGCGAGTGATATAACTCAGTCACGGTAATGTTTTTACTCTTGTGCCCCGGAGTGCT
GGTCGATAGATTAAGCTTGCTGGCTGGATGGTTTTAGAGTTGTAGGTTTGGAACGTCAAG
TTAAATGATTAGGCTGTGGTTAGTGGTTACGATGGCTTTTTTT*AGATGCAAAGCTCTAG
GCACGCACATAACGTGCTCATCCAAATGCCGACAAG

QA 1 636 1 636
DS 

RD RS1FC38TF 568 0 0
G
AGAAGACCTATTATGCAAGTCCCGTTTGACGCTCATCTCGTTCATGGCCGCGAGTGATAT
AACTCAGTCACGGTAATGTTTCTACTCTTGTGCCCCGGAGTGCTGGTCGATAGATTAAGC
TTGCTGGCTGGATGGTTTTAGAGTTGTAGGTTTGGAACGTCAAGTTAAATGATTAGGCTG
TGGTTAGAGGTTACGATGGCTTTTTTT*AGATGCAAAGCTCTAGGCACGCACATAACGTG
CTCATCCAAATGCCGACAAGAAAAAGAAAAAAAAAA**CAAGAAGGTTATATGCTGAGTT
TATATGGTTATTGGATGGAAGATAGATAAGTGGAAAGGATCTAAGTTGTTATGGGAAGGT
CCTTTTTTGTTACGAGACAAATTTGTCTGAGTTAAAATGGTTCACAAAAGAACCTAGACT
CTTTGTGAGAAAGAAAAGTCACCTCTGAGTGAGATTGACTAAGCTCTCCAAGTTCAAAAG
AAACCTCTGACTGAAGCCATGCAATACTCTCCAAGTACAGACCAAACCATCTCTTCTACG
TGGTGAATTAAAGATTACTCCTATAGC

QA 2 568 2 568
DS 

RD RS1CU14TF 758 0 0
GAGCCCAAGAAAAGAAGACCTATTATGCAAGTCCTGTTTGACGCTCATCTCGTTCATGGC
CGCGAGTGATATAACTCAGTCACGGTAATGTTTCTACTCTTGTGCCCCGGAGTGCTGGTC
GATAGATTAAGCTTGCTGGCTGGATGGTTTTAGAGTTGTAGGTTTGGAACGTCAAGTTAA
ATGATTAGGCTGTGGTTAGTGGTTACGATGGCTTTTTTT*AGATTCAAAGCTCTAGGCAC
GCACATAACGTGCTCATCCAAATGCCGACAAGAAAAAGAAAAAAAAAA**CAAGAAGCTT
ATATGCTGAGTTTATATGGTTATTGGATGGAAGATAGATAAGTGGAAAGGATCTAAGTTG
TTATGGGAAGGTCCTTTTTTGTTACGAGACAAATTTGTCTGAGTTAAAATGGTTCACAAA
AGAACCTAGACTCTTTGTGAGAAAGAAAAGTCACCTCTGAGTGAGATTGACTAAGCTCTC
CAAGTTCAAAAGAAACCTCTGACTGAAGCCATGCAATACTCTCCAAGTACAGACCAAACC
ATCTCTTCTACGTGGTGAATTAAAGATTACTCCTATAGCTCCATGTGATCATGCTTCCAC
TACCCATTCCACCAAGTCATCTATCAAACTTAGCTTCTCGGTTTTCACCCGACGCAAAGT
TTGCGGGGGAGTAATAGAGCAAAG*CCCAAACGATCAAGTGAGGCCCATCAGCC*ATACT
GTCTAGGGT*CCTATCATGATTGATACTATAAATTTGT

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1C475JQ 694 0 0
GATGGTTTTAGAGTTGTAGGTTTGGAACGTCAAGTTAAATGATTAGGCTGTGGTTAGTGG
TTACGATGGCTTTTTTT*AGATGCAAAGCTCTAGGCACGCACATAACGTGCTCATCCAAA
TGCCGACAAGAAAAAGAAAAAAAAAAAACAAGAAGCTTATATGCTGAGTTTATATGGTTA
TTGGATGGAAGATAGATAAGTGGAAAGGATTTAAGTTGTTATGGGAAGGTCCTTTTTTGT
TACGAGACAAATTTGTTTGAGTTAAAATGGTTCACAAAAGAACCTAGACTCTTTGTGAGA
AAGAAAAGTCGCCTTTGAGTGAGATTGACTAAGCTCTCCAAGTTCAAAAGAAACCTTTGA
CTGAAGCCATGCAATACTCTCCAAGTACAGACCAAACCATTTTTTTTACGTGGTGAATTA
AAGATTACTCCTATAGCTCCATGTGATCATGCTTCCACTACCCATTCCACCAAGTCATCT
ATCAAACTTAGCTTCTCGGTTTTCACCCGACGCAAAGTTTGCGGGGGAGTAATAGAGCAA
AGGCCCAAACAATCAAGTGAAGCCCATCAGCCCATACTGTCTAGGGTTCCTATCATGATT
GATACTATAAATTTGTGTAATGTTGAGATGTGTATTAACTTTGCTGTCGTAAAGACAGCT
TCCTCTTCCTCTTATGAATATCAGTTTAGAATC
G

QA 1 693 1 693
DS 

RD RS1FC38JQ 751 0 0
GTAATGTTTCTACTCTTGTGCCCCGGAGTGCTGGTCGATAGATTAAGCTTGCTGGCTGGA
TGGTTTTAGAGTTGTAGGTTTGGAACGTCAAGTTAAATGATTAGGCTGTGGTTAGAGGTT
ACGATGGCTTTTTTT*AGATGCAAAGCTCTAGGCACGCACATAACGTGCTCATCCAAATG
CCGACAAGAAAAAGAAAAAAAAAA**CAAGAAGGTTATATGCTGAGTTTATATGGTTATT
GGATGGAAGATAGATAAGTGGAAAGGATTTAAGTTGTTATGGGAAGGTCCTTTTTTGTTA
CGAGACAAATTTGTTTGAGTTAAAATGGTTCACAAAAGAACCTAGACTCTTTGTGAGAAA
GAAAAGTCACCTCTGAGTGAGATTGACTAAGCTCTCCAAGTTCAAAAGAAACCTCTGACT
GAAGCCATGCAATACTCTCCAAGTACAGACCAAACCATTTTTTTTACGTGGTGAATTAAA
GATTACTCCTATAGCTCCATGTGATCATGCTTCCACTACCCATTCCACCAAGTCATCTAT
CAAACTTAGCTTTTCGGTTTTCACCCGACGCAAAGTTTGCGGGGGAGTAATAGAGCAAAG
GCCCAAACAATCAAGTGAAGCCCATCAGCCCATACTGTCTAGGGTTCCTATCATGATTGA
TACTATAAATTTGTGTAATGTTGAGATGTGTATTAACTTTGCTGTCGTAAAGACAGCTTC
CTCTTCCTCTTATGAATATCAGTTTAGAATC

QA 1 751 1 751
DS 

RD RS1BX30JQ 756 0 0
TCACGGTAATGTTTCTACTCTTGTGCCCCGGAGTGCTGGTCGATAGATTAAGCTTGCTGT
CTGGATGGTTTTAGAGTTGTAGGTTTGGAACGTCAAGTTAAATGATTAGGCTGTGGTTAG
TGGTTACGATGGCTTTTTTTTAGATGCAAAGCTCTAGGCACGCACATAACGTGCTCATCC
AAATGCCGACAAGAAAAAGAAAAAAAAAA**CAAGAAGCTTATATGCTGAGTTTATATGG
TTATTGGATGGAAGATAGATAAGTGGAAAGGATTTAAGTTGTTATGGGAAGGTCCTTTTT
TGTTACGAGACAAATTTGTCTGAGTTAAAATGGTTCACAAAAGAACCTAGACTCTTTGTG
AGAAAGAAAAGTCACCTCTGAGTGAGATTGACTAAGCTCTCCAAGTTCAAAAGAAACCTC
TGACTGAAGCCATGCAATACTCTCCAAGTACAGACCAAACCATCTCTTCTACGTGGTGAA
CTAAAGATTACTCCTATAGCTCCATGTGATCATGCTTCCACTACCCATTCCACCAAGTCA
TCTATCAAACTTAGCTTCTCGGTTTTCACCCGACGCAAAGTTTGCGGGGGAGTAATAGAG
CAAAGGCCCAAACAATCAAGTGAAGCCCATCAGCCCATACTGTCTAGGGTTCCTATCATG
ATTGATACTATAAATTTGTGTAATGTTGAGATGTGTATTAACTTTGCTGTCGTAAAGACA
GCTTCCTCTTCCTCTTATGAATATCAGTTTAGAA
GC

QA 1 754 1 754
DS 

RD RS1C013JQ 705 0 0
CCCGGAGTGCTGGTCGATAGATTAAGCTTGCTGGCTGGATGGTTTTAGAGTTGTAGGTTT
GGAACGTCAAGTTAAATGATTAGGCTGTGGTTAGTGGTTACGATGGCTTTTTTT*AGATG
CAAAGCTCTAGGCACGCACATAACGTGCTCATCCAAATGCCGACAAGAAAAAGAAAAAAA
AAAA*CAAGAAGCTTATATGCTGAGTTTATATGGTTATTGGATGGAAGATAGATAAGTGG
AAAGGATCTAAGTTGTTATGGGAAGGTCCTTTTTTGTTACGAGACAAATTTGTCTGAGTT
AAAATGGTTCACAAAAGAACCTAGACTCTTTGTGAGAAAGAAAAGTCACCTCTGAGTGAG
ATTGACTAAGCTCTCCAAGTTCAAAAGAAACCTCTGACTGAAGCCATGCAATACTCTCCA
AGTACAGACCAAACCATCTCTTCTACGTGGTGAATTAAAGATTACTCCTATAGCTCCATG
TGATCATGCTTCCACTACCCATTCCACCAAGTCATCTATCAAACTTAGCTTCTCGGTTTT
CACCCGACGCAAAGTTTGCGGGGGAGTAATAGAGCAAAGGCCCAAACAATCAAGTGAAGC
CCATCAGCCCATACTGCCTAGGGTTCCTATCATGATTGATACTATAAATTTGTGTAATGT
TGAGATGTGTATTAACTTTGCTGTCGTAAAGACAGCTTCCTCT
CT

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1DT14JQ 823 0 0
TATGCAAGTCCCGTTTGACGCTCATCTCGTTCATGGCCGCGAGTGATATAACTCAGTCAC
GGTAATGTTTCTACTCTTGTGCCCCGGAGTGCTGGTCGATAGATTAAGCTTGCTGGCTGG
ATGGTTTTAGAGTTGTAGGTTTGGAACGTCAAGTTA**TGATTAGGCTGTGGTTAGTGGT
TACGATGGCTTTTTTT*AGATGCAAAGCTCTAGGCACGCACATAACGTGCTCATCCAAAT
GCCGACAAGAAAAAGAAAAAAAAAA**CAAGAAGGTTATATGCTGAGTTCATATGGTTAT
TGGATGGAAGATAGATAAGTGGAAAGGATCTAAGTTGTTATGGGAAGGTCCTTTTTTGTT
ACGAGACAAATTTGTCTGAGTTAAAATGGTTCACAAAAGAACCTAGACTCTTTGTGAGAA
AGAAAAGTCACCTCTGAGTGAGATTGACTAAGCTCTCCAAGTTCAAAAGAAACCTCTGAC
TGAAGCCATGCAATACTCTCCAAGTACAGACCAAACCATCTCTTCCACGTGGTGAATTAA
AGATTACTCCTATAGCTCCATGTGATCATGCTTCCACTACCCATTCCACCAAGTCATCTA
TCAAACTTAGCTTCTCGGTTTTCACCCGACGCAAAGTTTGCGGGGGAGTAATAGAGCAAA
GGCCCAAACAATCAAGTGAAGCCCATCAGCCCATACTGTCTAGGGTTCCTATCATGATTG
ATACTATAAATTTGTGTAATGTTGAGATGTGTATTAACTTTGCTGTCGTAAAGACAGCTT
CCTCTTCCTCTTATGAATATCAGTTTAGAATCATTTTGATCTT

QA 1 823 1 823
DS 

RD RS1FR77TF 514 0 0
GG
AACTTTGCTGTCGTAAAGACAGCTTCCTCTTCCTCTTATGAATATCAGTTTAGAATCATT
TTGATCTTGAAGGCAATCTAAAGCTTCCTCCTTTTCTTTCTGTTTCTTACATAATAAAGC
TCTTTGAGCTATGTCTTTTATCTCTTTAGTTTATGTTTCAATAAAGCTTCTATAACACAA
ATCTCTCTTATTCACAAATATCATCATGGTATCAGAGCACCAGGGATTAGATCTTGGTGT
CTCTACACTTCTTCTCAACTTCTCACATGTTCCATCAGTCACCCCTTCTCCAAGAGCTGC
TGTTGTCTCGGTCTAGTTCCAAGAGAAACAAGACTCGAGCTTTACCTGTGAAGAGTCTCA
CAAGCTTCTATTTCACAAGGGAGACCGGTTTGTTCGTTGCCTGCAAGTGGGTTCTCTACA
ACTCTTCAGAACGTGGGTTATCTGCAAACTTATCCAGGAAATCATCAAAGTCTTCTACAC
CTTTAAAACATGGTAAAGTGACCTTTTATCAC

QA 3 514 3 514
DS 

RD RS1B764TF 725 0 0
GGG
AACTTTGCTGTCGTAAAGACAGCTTCCTCTTCCTCTTATGAATATCAGTTTAGAATCATT
TTGATCTTGAAGGCAATCTAAAGCTTCCTCCTTTTCTTTCTGTTTCTTACATAATAAAGC
TCTTTGAGCTATGTCTTTTATCTCTTTAGTTTATGTTTCAATAAAGCTTCTATAACACAA
ATCTCTCTTGTTCACAAATATCATCATGGTATCAGAGCACCAGGGATTAGATCTTGGTGC
CTCTACACTTCTTCTCAACTTCTCACATGT*CCATCAGTCACCCCTTCTCCAAGAGCTGC
TGTTGTCTCGGTCTAGTTCCAAGAGAAACAAGACTCGAGCTTTACCTGTGAAGAGTCTCA
CAAGCTTCTATTTCACAAGGGAGACCGGTTTGTTCGTTGCCTGCAAGTGGGTTCTCTACA
ACTCTTCAGAACGTGGGTTATCTGCAAACTTATCCAGGAAATCATCAAAGTCTTCTACAT
CTTTAAAACATGGTAAAGTGACCTTTTATCACAAAAAAAAAAAAAAATGGTTGCTTGTTC
TGGTCGATTCTTCGTGGTGGTTTGCTTGCTGGTTTTAGATATTAGGATTGAATTCATGAA
GCTGTAGAATGCAACTGGAACGTTTTGGGTTTGATAATAATGAGATCAGTGGCAGCAAGT
CTATGTTTTTGATGAGTGCACACAAGATGTTTAGTTAAATGTCCAAGAGAAAA
CAGATGTGA

QA 4 716 4 716
DS 

RD RS1EA43TF 715 0 0
GG
AACTTTGCTGTCGTAAAGACAGCTTCCTCTTCCTCTTATGAATATCAGTTTAGAATCATT
TTGATCTTGAAGGCAATCTAAAGCTTCCTCCTTTTCTTTCTGTTTCTTACATAATAAAGC
TCTTTGAGCTATGTCTTTTATCTCTTTAGTTTATGTTTCAATAAAGCTTCTATAACACAA
ATCTCTCTTATTCACAAATATCATCATGGTATCAGAGCACCAGGGATTAGATCTTGGTGT
CTCTACACTTCTTCTCAACTTCTCACATGTTCCATCAGTCACCCCTTCTCCAAGAGCTGC
TGTTGTCTCGGTCTAGTTCCAAGAGAAACAAGACTCGAGCTTTACCTGTGAAGAGTCTCA
CAAGCTTCTATTTCACAAGGGAGACCGGTTTGTTCGTTGCCTGCAAGTGGGTTCTCTACA
ACTCTTCAGAACGTGGGTTATCTGCAAACTTATCCAGGAAATCATCAAAGTCTTCTACAC
CTTTAAAACATGGTAAAGTGACCTTTTATCACAAAAAAAAAAAAAAATGGTTGCTTGTTC
TGGTTGATTCTTCGTGGTGGTTTGCTTGCTGGTTTTAGATATTAGGATTGAATTCATGAA
GCTGTAGAATGCAACTGGAACGTTTTGGGTTTGATAATAATGAGATCAGTGGCAGCAAGT
CTATGTTTTTGATGAGTGCACACAAGATGTTTAGTTAAATGTCCA
GAGAAAAA

QA 3 707 3 707
DS 

RD RS1BY64TF 614 0 0
G
GATATTAGGATTGAATTCATGAAGCTGTAGAATGCAACTGGAACGTTTTGGGTTTGATAA
TAATGAGATCAGTGGCAGCAAGTCTATGTTTTTGATGAGTGCACACAAGATGTTTAGTTA
AATGTCCAAGAGAAAAACAGATTGTGAAAATGAAGAGTTTCGATGGCATATGGATAGGAA
ATAGAGAGTTGAGGTTTAGACAGTTGTAGAATGGATATTCTCTTTGGTGGTGAGATAGCT
TAGTCTAGTTAGGAGGATATAAAAAAAAA**AATCCCCAACTTGTTGTGAGACAGGTCAA
AAGAACCTAAAGATGTTCTCACATTTATGTCTATTCTCCAAGCTAAATAGGATCATCTAC
CTACCTCCCATGAACCTTCAACTACCTGTGCTCTTTTCAAAACCACCTCTATTTGCATCT
TCAAACTTGGCTCAGCTGCTTGATTCACCACCCGATGCCAAGTTTGCGGGAGGATATTGA
AGCCCACACTGAAGGCCCACTTATGATCCATTAAGAAGTCTCAATAGTTCTATGTATTAG
GGTTTCTAGACTGATATAAATATGTGGTTAGTTGTTCTTTGGTTGTAACTTTGCTGCCGT
GAAAGGCAGCTCC

QA 2 614 2 614
DS 

RD RS1EA43JQ 720 0 0
CCTTTTATCAC
AAAAAAAAAAAAAATGGTTGCTTGTTCTGGTTGATTCTTCGTGGTGGTTTGCTTGCTGGT
TTTAGATATTAGGATTGAATTCATGAAGCTGTAGAATGCAACTGGAACGTTTTGGGTTTG
ATAATAATGAGATCAGTGGCAGCAAGTCTATGTTTTTGATGAGTGCACACAAGATGTTTA
GTTAAATGTCCAAGAGAAAAACAGATTGTGAAAATGAAGAGTTTCGATGGCATATGGATA
GGAAATAGAGAGTTGAGGTTTAGACAGTTGTAGAATGGATATTCTCTTTGGTGGTGAGAT
AGCTTAGTCTAGTTAGGAGGATATAAAAAAAA***AATCCCCAACTTGTTGTGAGACAGG
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CTACCTACCTCCCATGAACCTTCAACTACCTGTGCTCTTTTCAAAACCACCTCTATTTGC
ATCTTCAAACTTGGCTCAGCTGCTTGATTCACCACCCGATGCCAAGTTTGCGGGAGGATA
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TTAGGGTTTCTAGACTGATATAAATATGTGGTTAGTTGTTCTTTGGTTGTAACTTTGCTG
CCGTGAAAGGCAGCTCCTTTTCTCTATTTATGAAATACAATTTCTATCT

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DS 

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ATGGCATATGGATAGGAAATAGAGAGTTGAGGTTTAGACAGTTGTAGAATGGATATTCTC
TTTGGTGGTGAGATAGCTTAGTCTAGTTAGGAGGATATAAAAAAAAAAAAATCCCTAACT
TGTTGTGAGACAGGTCAAAAGAACCTAAAGATGTTCTCACATTTATGTCTATTCTCCAAG
CTAAATAGGATCATCTACCTACCTCCCATGAACCTTCAACTACCTGTGCTCTTTTCAAAA
CCACCTCTATTTGCATCTTCAAACTTGGCTCAGCTGCTTGATTCACCACCCGATGCCAAG
TTTGCGGGAGGATATTGAAGCCGACACTGAAGGCCCACTTATGATCCATTAAGAAGTCTC
AATAGTTCTATGTATTAGGGTTTCTAGACTGATATAAATATGTGGTTAGTTGTTCTTTGG
TTGTAACTTTGCTGCCGTGAAAGGCAGCTCCTTTTCTCTATTTATGAAATACAATTTCTA
TC
C

QA 1 542 1 542
DS 

RD RS1FR77JQ 716 0 0
TATCACA
AAAAAAAAAAAAAATGGTTGCTTGTTCTGGTTGATTCTTCGTGGTGGTTTGCTTGCTGGT
TTTAGATATTAGGATTGAATTCATGAAGCTGTAGAATGCAACTGGAACGTTTTGGGTTTG
ATAATAATGAGATCAGTGGCAGCAAGTCTATGTTTTTGATGAGTGCACACAAGATGTTTA
GTTAAATGTCCAAGAGAAAAACAGATTGTGAAAATGAAGAGTTTCGATGGCATATGGATA
GGAAATAGAGAGTTGAGGTTTAGACAGTTGTAGAATGGATATTCTCTTTGGTGGTGAGAT
AGCTTAGTCTAGTTAGGAGGATATAAAAAAAA***AATCCCCAACTTGTTGTGAGACAGG
TCAAAAGAACCTAAAGATGTTCTCACATTTATGTCTATTCTCCAAGCTAAATAGGATCAT
CTACCTACCTCCCATGAACCTTCAACTACCTGTGCTCTTTTCAAAACCACCTCTATTTGC
ATCTTCAAACTTGGCTCAGCTGCTTGATTCACCACCCGATGCCAAGTTTGCGGGAGGATA
TTGAAGCCCACACTGAAGGCCCACTTATGATCCATTAAAAAGTCTCAATAGTTCTATGTA
TTAGGGTTTCTAGACTGATATAAATATGTGGTTAGTTGTTCTTTGGTTGTAACTTTGCTG
CCGTGAAAGGCAGCTCCTTTTCTCTATTTATGAAATACAATTTCTATCT

QA 8 716 8 716
DS 



AS 3 13

CO CL21Contig1 919 6 29 U
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AAAAAAATATGTTTGGTTAAAACATGGATTGCTCTTTCATTCTTTATTGACTTTTCATGA
AATAAAGAACACCAGAAGAGACAAGTTAAGAAGGAGAGAGAGTAGTAACTAGTGAAACAC
AAGTATTTTTTTTTTAAAAAAAACAGAGAGGTCTGTGAAATTGGTTCAAGAGACACAGCA
CAAGACAGATGCCTCAAAGACAATATGAAAGGCTTCCACGCTCAAAGGAAAGCATCCTTC
TCGAGCAGCGTCACCACCTCGAGCTGGTTGTTCAGCTTTGCCACATCAATGGGTGTCTTC
TCGTCTAGGTTTTGCAGAGTCACAGCAG*ACCATTCTCTAGGAGAAGGGTTACACACTCT
TTCCTCCCGTACCCAGCAGCGTAATGCAGAGGCGTGTTCTTGTTTTTGTCAACAGCGTTA
ACACTTGCTCCAGCATCGATAAGAACTTGAGCACATTTCAACTCGCCGTATCCACAAGCA
AAATGCAATGCTGTCCTTCCCTCAGAATCCTCTTCATCTTTGTTACCACCAGATGCCAAA
GCATTTTTCAAACCCTCAACATCACCAAGACTAGCAGTTTGATGAACAATAGACTCTTCT
TCTTCTTCACCGTCTTCCGCTACCTCGGCAGGTTCAGCTGAAGCAGCCTGGTCTGGCATG
CCAGCAATAGGCATACCCAGTGCTTCACCCAGCTTTTTCAGCACATCTTTATCATCCCAG
TACTTCATCATGGCAGAAGGACCACCAGCATCAATCTCATCAAGTATAGGTTTCAACTCT
GGATCTTCTTTCATCCGCGCCATACGCTCAGTAAAATGCTCTGCTGTTTCAGGTTTGAGA
ATGCCTCCAAAATGGAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1AX68JQ U 85
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RD RS1B617JQ 654 0 0
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QA 1 654 1 654
DS 

RD RS1DB20JQ 826 0 0
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TCGTCTAGGTTTTGCAGAGTCACAGCAGCACCATTCTCTAGGAGAAGGGTTACACACTCT
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QA 1 826 1 826
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QA 1 766 1 766
DS 

RD RS1A180JQ 814 0 0
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GAAGAGACAAGTTAAGAAGGAGAGAGAGTAGTAACTAGTGAAACACAAGTATTTTTTTTT
TAAAAAAAACAGAGAGGTCTGTGAAATTGGTTCAAGAGACACAGCACAAGACAGATGCCT
CAAAGACAATATGAAAGGCTTCCACGCTCAAAGGAAAGCATCCTTCTCGAGCAGCGTCAC
CACCTCGAGCTGGTTGTTCAGCTTTGCCACATCAATGGGTGTCTTCTCGTCTAGGTTTTG
CAGAGTCACAGCAG*ACCATTCTCTAGGAGAAGGGTTACACACTCTTTCCTCCCGTACCC
AGCAGCGTAATGCAGAGGCGTGTTCTTGTTTTTGTCAACAGCGTTAACACTTGCTCCAGC
ATCGATAAGAACTTGAGCACATTTCAACTCGCCGTATCCACAAGCAAAATGCAATGCTGT
CCTTCCCTCAGAATCCTCTTCATCTTTGTTACCACCAGATGCCAAAGCATTTTTCAAACC
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ACCCAGTGCTTCACCCAGCTTTTTCAGCACATCTTTATCATCCCAGTACTTCATCATGGC
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CCGCGCCATACGCTCAGTAAAATGCTCTGCTGTT

QA 1 814 1 814
DS 

RD RS1A180TR 814 0 0
GGTTAAAACATGGATTGCTCTTTCATTCTTTATTGACTTTTCATGAAATAAAGAACACCA
GAAGAGACAAGTTAAGAAGGAGAGAGAGTAGTAACTAGTGAAACACAAGTATTTTTTTTT
TAAAAAAAACAGAGAGGTCTGTGAAATTGGTTCAAGAGACACAGCACAAGACAGATGCCT
CAAAGACAATATGAAAGGCTTCCACGCTCAAAGGAAAGCATCCTTCTCGAGCAGCGTCAC
CACCTCGAGCTGGTTGTTCAGCTTTGCCACATCAATGGGTGTCTTCTCGTCTAGGTTTTG
CAGAGTCACAGCAG*ACCATTCTCTAGGAGAAGGGTTACACACTCTTTCCTCCCGTACCC
AGCAGCGTAATGCAGAGGCGTGTTCTTGTTTTTGTCAACAGCGTTAACACTTGCTCCAGC
ATCGATAAGAACTTGAGCACATTTCAACTCGCCGTATCCACAAGCAAAATGCAATGCTGT
CCTTCCCTCAGAATCCTCTTCATCTTTGTTACCACCAGATGCCAAAGCATTTTTCAAACC
CTCAACATCACCAAGACTAGCAGTTTGATGAACAATAGACTCTTCTTCTTCTTCACCGTC
TTCCGCTACCTCGGCAGGTTCAGCTGAAGCAGCCTGGTCTGGCATGCCAGCAATAGGCAT
ACCCAGTGCTTCACCCAGCTTTTTCAGCACATCTTTATCATCCCAGTACTTCATCATGGC
AGAAGGACCACCAGCATCAATCTCATCAAGTATAGGTTTCAACTCTGGATCTTCTTTCAT
CCGCGCCATACGCTCAGTAAAATGCTCTGCTGTT

QA 1 814 1 814
DS 

RD RS1AX68JQ 835 0 0
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AGAGAGGTCTGTGAAATTGGTTCAAGAGACACAGCACAAGACAGATGCCTCAAAGACAAT
ATGAAAGGCTTCCACGCTCAAAGGAAAGCATCCTTCTCGAGCAGCGTCACCACCTCGAGC
TGGTTGTTCAGCTTTGCCACATCAATGGGTGTCTTCTCGTCTAGGTTTTGCAGAGTCACA
GCAGCACCATTCTCTAGGAGAAGGGTTACACACTCTTTCCTCCCGTACCCAGCAGCGTAA
TGCAGAGGCGTGTTCTTGTTTTTGTCAACAGCGTTAACACTTACTCCAGCATCGATAAGA
ACTTGAGCACATTTCAACCCGCCGTATCCACAAGCAAAATGCAATGCTGTCCTTCCCTCA
GAATCCTCTTCATCTTTGTTACCACCAGATGCCAAAGCATTTTTCAAACCCTCAACATCA
CCAAGACTAGCAGTTTGATGAACAATAGACTCTTCTTCTTCTTCACCGTCTTCCGCTACC
TCGGCAGGTTCAGCTGAAGCAGCCTGGTCTGGCATGCCAGCAATAGGCATACCCATTGCT
TCACCCAGCTTTTTCAGCACATCTTTATCATTCCAGTACTTCATCATGGCAGAAGGACCA
CCAGCATCAATCTCATCAAGTATAGGTTTCAACTCTGGATCTTCTTTCATCCGCGCCATA
CGCTCAGTAAA*TGCTCTGCTGTTTCAGGTTTGAGAATGCCTCCAAAATGGAGAC

QA 1 835 1 835
DS 



CO CL21Contig2 1099 5 8 U
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GAAAGAGGTCATACGAAAAGTCTGTCAACATCTTCGAGATAAAATACAAGACAAATCATT
CAAAGACAATTACGATCTTAGAGCTTCTTTTGACACACACTCAAAGGAAAGCATCTTTTT
CGAGCAGCTACACCACCTCGAGCTGGTTGTTGAGCTTAGCCACATCAATGGGTGTTTTCT
CGTCTAGGTTTTGCAGAGTCACTGCTGCACCATTCTCAAGGAGAAGGCTAACACACTCTT
TCCTCCCATAACCAGCAGCGTAATGCAGAGGTGTGTTCTTGTTTTTGTCAACAGCGTTAA
CACTTGCTCCAGCATCGATAAGAACTTGAGCACATTTCAACTCGCCGTATCCACACGCAA
AATGCAGTGCTGTCCTTCCTTCAGAATCTTCTTCATCTTTGTTACCACCAGATTCCAAAG
CGGTTTTCAAACCCTCAGCATCACCAAGACTGGCCGCTTGATGAACAATAGACTCTTCTT
CTTCTTCTTCAGCCACCTCGGGTTCAGCTGAAGGAGTTTGGTCAGGCAAGCCAGCAACAG
GCATACCCATTGCTTCACCAAGCTTTTTCAGCACATCTTTATCATTCCAGTACTTCATCA
TGACAGAAGGACCACCAGCATCAATCTCATCAAGTATAGGTTTCAACTCCGGATCTTCTT
TCAACCGCGCCATACGCTCAGTAAAGTTCCCAGCTGTTTCAGGGTTCGAGAAAGCATCCA
AAAAGGGAGACATTTGTGGATCCTTGACTAAGGCGTTACCAAGTCGCTCAGCCATGGTCT
GAAACTCGGGGTTATGCATAACCTGTTGCATTGTGCTGACATACTGTTGTGGATCAATGT
TAGGGAAACCTCCTCCTGCTCCTCCCTCAGCTGCGTTTGGGATAGATCTCTGAAGCTGCT
CAGCCAACTGGTTAAAGGCAGGATCTTTAGCAATCTGCTCCGCCAATTCTCTGATGCTTG
GATCGTTGAGGATACTAGCCATGTTTGAGAAATCAAAAGCATCGAAATTCAAGCCAGGAG
GATTAGGTGATGAAGGTGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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CGTCTAGGTTTTGCAAAGTCACTGCTGCACCATTCTCAAGGAAAAGGCTAACACACTCTT
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AATGCAGTGCTGTCCTTCCTTCAAAATCTTCTTCATCTTTGTTACCACCAGATTCCAAAG
CGGTTTTCAAACCCTCAGCATCACCAAGACTGGCCGCTTGATGAACAATAAACTCTTCTT
CTTCTTCTTCAGCCACCTCGGGTTCAGCTGAAGGAGTTTGGTCAGGCAAGCCAGCAACAG
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C

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GC

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DS 



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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EP61TF U 1
AF RS1EP61JQ C 625
BS 1 749 RS1EP61TF
BS 750 750 RS1EP61JQ
BS 751 758 RS1EP61TF
BS 759 759 RS1EP61JQ
BS 760 810 RS1EP61TF
BS 811 1359 RS1EP61JQ

RD RS1EP61TF 810 0 0
GAACGTTGTCTTCTCGGGTAACTCATCATCATATCTCTTTGATTGGGTTTAAGTTTTACT
TTATCTAATGGCTTCCAATCCAGACAAGAATCTGTCTCCTTCAGATGATAAGCCGGAAAC
GACGGAGGAGAACCAGAGTCCTAAACCGGAATCAGAGAAGAAGAGTCCTAAACCGGAACC
AGCAGCCTCTGGGAGTTCACCTTCATCAGCTAACCCTGCTATGAATTTAAATGCTTTTGA
TTTCTCTAATATGGCTGGTATCCTCAACGACCCAAGCATCAGAGAATTGGCTGAGCAGGT
TGCTAAAGATCCTGCCTTTAACAAGTTGGCTGAGCAGCTTCAGGGATCTATTCCAAACGC
AGCTCAAGGTGGAGGAGGTGGATTCCCTAACATTGATCCGGAACAGTATATCAATACAAT
GCAGCAGGTTATGCATAACCCTGAGTTTCAGACTATGGCTGAGCGTCTTGGTCAAGCCTT
AGTGCAGGATCCACAAATGTCTCCTTTCTTGGAGGCCTTCTCAAACCCTGAAACAGCAGA
GCATTTTACTGAGCGTATGGCGCGGATGAAACAAGATCCTGAGTTGAAACCTATACTTGA
TGAGATTGATGCTGGTGGTCCTTCTGCCATGATGAAGTACTGGAATGATAAAGATGTACT
GAAAAAGCTGGGTGAAGCAATGGGTATGCCTATTGCTGGCTTGCCAGACCAGGCTGCTTC
AGCTGAACCTGCCGAGGTAGCAGAAGAAG*CGAAGAAA*GAGTCTATTGTTCATCAAACT
GCCAGTCTTGGTGATGTTGAGGGTTTGAAA

QA 1 810 1 810
DS 

RD RS1EP61JQ 735 0 0
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TATGCCTATTGCTGGCTTGCCAGACCAGGCTGCTTCAGCTGAACCTGCCGAGGTAGCAGA
AGAAGGCGAAGAAAAGAGTCTATTGTTCATCAAACTGCCAGTCTTGGTGATGTTGAGGGT
TTGAAAAATGCTTTGGCATCTGGTGGTAACAAAGATGATGAAGATTCTGAGGGAAGGACA
GCATTGCATTTTGCTTGTGGATACGGCGAGTTGAAATGTGCTCAAGTTCTTATCGATGCT
GGAGCAAGTGTTAACGCTGTTGACAAAAACAAGAACACGCCTCTGCATTACGCTGCTGGT
TACGGGAGGAAAGAGTGTGTAACCCTTCTTCTTGAGAATGGTGCTGCAGTGACTTTACAA
AACCTAGACGAGAAGACACCCATTGATGTGGCGAAGCTGAACAACCAGCTCGGTGTGGTG
AAGCTGCTCGAGAAGGATGCTTTCCTTTGAGCGTGGAAGGCTTTCTTTCATATTTGTCTT
TGAGGGATCTGTCTTGTGTTGCGTCTATTGAACCAATTTCACAGACCTCTCTGTATACTT
CTTTGTTTTTTTTTAAAAAAAAGTTTACTTGTGTTTCACTAGTTACTACTCTCTCTCCTT
CTTAACTCGTCTCTTCTGTTGTTTTTCTTTATTTCATGAAAAGTCAATAAAGAATGAAAG
AGCAATCCATGTTTT

QA 1 735 1 735
DS 



AS 3 20

CO CL22Contig1 754 4 2 U
CATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATCAGTCGACGGTACCGGACATATGCC
CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAGAGGGGAGAATGTTTTCTTTTCTCCTCCCAGT
GTTAGAGGTTATCAAGGTGGTTATGGCTTCCGTTGCCTCCGTAGTCTTTTTAGGCTTCGC
CGGTGTAACACTCGCTTGTTCAGCCGTGGCATTAGCCGTATCCACGCCGCTTTTCATCAT
CTTCAGTCCGATTCTCGTACCCGCCACTATAGCCACGACCCTCCTAGCATCTGGGCTCGG
CTCTAGTGCCACCCTCGGAGCGACGGGCATGGGTCTCCTCATGCGGCTCATTAAGAATCC
TGAAGGAGCTTCCCCGGCAGCTCAGCCATCCTTCTTATCTCTGTTGGAAATGCCAAACTT
TATTAAGAGTAAGATGCAAGAAAGGTTAATTGATATACCAGGAATTGGAAAATCTGAAGG
TAAAAAAGGTAAATCTAAAGGTAAAAAAGGTAAAGGTAAGAAAAAAGGTAAAGGTTCAAA
GGGTAAAGATAAGAAAAAGGGTAAAGGTTCACGTAAGGGTTCATCTGATGATGAAAGTTC
ATAAATGGAAGCTCATATAGGAATTGTGGTAAATGTATGGGTAAAGATAAATTCATATAA
AGATAAACACATTGGTCCATGTATTCCAATATTCAGAATACGTTGTGTATTCATGAATTT
ATGCCAGCTATTATAATAAAAGGCTTTGATTAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 

AF RS1A268TF U 1
AF RS1A268TV U 37
AF RS1A268JQ C 86
AF RS1A268TR C 86
BS 1 751 RS1A268TF
BS 752 754 RS1A268JQ

RD RS1A268TF 751 0 0
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CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAGAGGGGAGAATGTTTTCTTTTCTCCTCCCAGT
GTTAGAGGTTATCAAGGTGGTTATGGCTTCCGTTGCCTCCGTAGTCTTTTTAGGCTTCGC
CGGTGTAACACTCGCTTGTTCAGCCGTGGCATTAGCCGTATCCACGCCGCTTTTCATCAT
CTTCAGTCCGATTCTCGTACCCGCCACTATAGCCACGACCCTCCTAGCATCTGGGCTCGG
CTCTAGTGCCACCCTCGGAGCGACGGGCATGGGTCTCCTCATGCGGCTCATTAAGAATCC
TGAAGGAGCTTCCCCGGCAGCTCAGCCATCCTTCTTATCTCTGTTGGAAATGCCAAACTT
TATTAAGAGTAAGATGCAAGAAAGGTTAATTGATATACCAGGAATTGGAAAATCTGAAGG
TAAAAAAGGTAAATCTAAAGGTAAAAAAGGTAAAGGTAAGAAAAAAGGTAAAGGTTCAAA
GGGTAAAGATAAGAAAAAGGGTAAAGGTTCACGTAAGGGTTCATCTGATGATGAAAGTTC
ATAAATGGAAGCTCATATAGGAATTGTGGTAAATGTATGGGTAAAGATAAATTCATATAA
AGATAAACACATTGGTCCATGTATTCCAATATTCAGAATACGTTGTGTATTCATGAATTT
ATGCCAGCTATTATAATAAAAGGCTTTGATT

QA 1 751 1 751
DS 

RD RS1A268TV 715 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAGAGGGGAG
AATGTTTTCTTTTCTCCTCCCAGTGTTAGAGGTTATCAAGGTGGTTATGGCTTCCGTTGC
CTCCGTAGTCTTTTTAGGCTTCGCCGGTGTAACACTCGCTTGTTCAGCCGTGGCATTAGC
CGTATCCACGCCGCTTTTCATCATCTTCAGTCCGATTCTCGTACCCGCCACTATAGCCAC
GACCCTCCTAGCATCTGGGCTCGGCTCTAGTGCCACCCTCGGAGCGACGGGCATGGGTCT
CCTCATGCGGCTCATTAAGAATCCTGAAGGAGCTTCCCCGGCAGCTCAGCCATCCTTCTT
ATCTCTGTTGGAAATGCCAAACTTTATTAAGAGTAAGATGCAAGAAAGGTTAATTGATAT
ACCAGGAATTGGAAAATCTGAAGGTAAAAAAGGTAAATCTAAAGGTAAAAAAGGTAAAGG
TAAGAAAAAAGGTAAAGGTTCAAAGGGTAAAGATAAGAAAAAGGGTAAAGGTTCACGTAA
GGGTTCATCTGATGATGAAAGTTCATAAATGGAAGCTCATATAGGAATTGTGGTAAATGT
ATGGGTAAAGATAAATTCATATAAAGATAAACACATTGGTCCATGTATTCCAATATTCAG
AATACGTTGTGTATTCATGAATTTATGCCAGCTATTATAATAAAAGGCTTTGATT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1A268JQ 669 0 0
GGAGAGGGGAGAATGTTTTCTTTTCTCCTCCCAGTGTTAGAGGTTATCAAGGTGGTTATG
GCTTCCGTTGCCTCCGTAGTCTTTTTAGGCTTCGCCGGTGTAACACTCGCTTGTTCAGCC
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GGCATGGGTCTCCTCATGCGGCTCATTAAGAATCCTGAAGGAGCTTCCCCGGCAGCTCAG
CCATCCTTCTTATCTCTGTTGGAAATGCCAAACTTTATTAAGAGTAAGATGCAAGAAAGG
TTAATTGATATACCAGGAATTGGAAAATCTGAAGGTAAAAAAGGTAAATCTAAAGGTAAA
AAAGGTAAAGGTAAGAAAAAAGGTAAAGGTTCAAAGGGTAAAGATAAGAAAAAGGGTAAA
GGTTCACGTAAGGGTTCATCTGATGATGAAAGTTCATAAATGGAAGCTCATATAGGAATT
GTGGTAAATGTATGGGTAAAGATAAATTCATATAAAGATAAACACATTGGTCCATGTATT
CCAATATTCAGAATACGTTGTGTATTCATGAATTTATGCCAGCTATTATAATAAAAGGCT
TTGATTAAT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RS1A268TR 669 0 0
GGAGAGGGGAGAATGTTTTCTTTTCTCCTCCCAGTGTTAGAGGTTATCAAGGTGGTTATG
GCTTCCGTTGCCTCCGTAGTCTTTTTAGGCTTCGCCGGTGTAACACTCGCTTGTTCAGCC
GTGGCATTAGCCGTATCCACGCCGCTTTTCATCATCTTCAGTCCGATTCTCGTACCCGCC
ACTATAGCCACGACCCTCCTAGCATCTGGGCTCGGCTCTAGTGCCACCCTCGGAGCGACG
GGCATGGGTCTCCTCATGCGGCTCATTAAGAATCCTGAAGGAGCTTCCCCGGCAGCTCAG
CCATCCTTCTTATCTCTGTTGGAAATGCCAAACTTTATTAAGAGTAAGATGCAAGAAAGG
TTAATTGATATACCAGGAATTGGAAAATCTGAAGGTAAAAAAGGTAAATCTAAAGGTAAA
AAAGGTAAAGGTAAGAAAAAAGGTAAAGGTTCAAAGGGTAAAGATAAGAAAAAGGGTAAA
GGTTCACGTAAGGGTTCATCTGATGATGAAAGTTCATAAATGGAAGCTCATATAGGAATT
GTGGTAAATGTATGGGTAAAGATAAATTCATATAAAGATAAACACATTGGTCCATGTATT
CCAATATTCAGAATACGTTGTGTATTCATGAATTTATGCCAGCTATTATAATAAAAGGCT
TTGATTAAT

QA 1 669 1 669
DS 



CO CL22Contig2 738 14 6 U
CTACCATTATTAATCAAAGCCTTTTATTATAATAGCTGGCATAAATTCATGAATACACAA
CGTATTCTAAATATTGGAATACATGGACCAATGTGTTTATCTTTATATGAATTTATCTTT
ACCC*ATACATTTACCACAATTCCTATATGAGCTTCCATTTATGAACTTTCATCATCAGA
TGAACCCTTACGTGAACCTTTACCCTTTTTCTTATCTTTACCCTTTGAACCTTTACCTTT
TTTCTTACCTTTACCTTTTTTACCTTTAGATTTACCTTTTTTACCTTCAGATTTTCCAAT
TCCTGGTATATCAATTAACCTTTCTTGCATCTTACTCTTAATAAAGTTTGGCATTTCCAA
CAGAGATAAGAAGGATGGCTGAGCTGCCGGGGAAGCTCCTTCAGGATTCTTAATGAGCCG
CATGAGGAGACCCATGCCCGTCGCTCCGAGGGTGGCACTAGCGCCGAGCCCAGATGCTAG
GAGGGTCGTGGCTATAGTGGCGGGTACGAGAATCGGACTGAAGATGATGAAAAGCGGCGT
GGATACGGCTAATGCCACGGCTGAACAAGCGAGTGTTACACCGGCGAAGCCTAAAAAGAC
TACGGAGGCAACGGAAGCCATAACCACCTTGATAACCTCTAACACTGGGAGGAGAAAAGA
AAACATTCTCCCCTCTCTCTGTGACAGATGAGTCTGAGCTGTTTCGTTTTGAATTTCTTG
CTTCATATTTTCTTATCC


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 30 35 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 55 70 70 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 55 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 30 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 30 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 10 40 10 

AF RS1B732JQ U 8
AF RS1BW70TF C 1
AF RS1FC49JQ U 8
AF RS1DC73JQ U 29
AF RS1BW70JQ U 1
AF RS1CK59JQ U 3
AF RS1CK59TF C 16
AF RS1DN38TF C 12
AF RS1B732TF C 22
AF RS1B321JQ U 9
AF RS1AK96JQ U 26
AF RS1AK96TF C 21
AF RS1DC73TF C 26
AF RS1B321TF C 26
BS 1 89 RS1BW70JQ
BS 90 90 RS1B732JQ
BS 91 509 RS1BW70JQ
BS 510 510 RS1FC49JQ
BS 511 737 RS1BW70JQ
BS 738 738 RS1B321JQ

RD RS1B732JQ 497 0 0
GT
TTAATCAAAGCCTTTTATTATAATAGCTGGCATAAATTCATGAATACACAACGTATTCTA
AATATTGGAATACATGGACCAATGTGTTTATCTTTATATGAATTTATCTTTACCC*ATAC
ATTTACCACAATTCCTATATGAGCTTCCATTTATGAACTTTCATCATCAGATGAACCCTT
ACGTGAACCTTTACCCTTTTTCTTATCTTTACCCTTTGAACCTTTACCTTTTTTCTTACC
TTTACCTTTTTTACCTTTAGATTTACCTTTTTTACCTTCAGATTTTCCAATTCCTGGTAT
ATCAATTAACCTTTCTTGCATCTTACTCTTAATAAAGTTTGGCATTTCCAACAGAAATAA
GAAGGATGGCTGAACTGCCGGGGAAGCTCCTTCAGGATTCTTAATGAGCCGCATGAGGAG
ACCCATGCCCGTCGCTACGAGGGTGGCACTAGCGCCGAGCCCAGATGCTAGGAGGGTCGT
GGCTATAGTGGCGGG

QA 3 497 3 497
DS 

RD RS1BW70TF 597 0 0
CTA
CCATTATTAATCAAAGCCTTTTATTATAATAGCTGGCATAAATTCATGAATACACAACGT
ATTCTAAATATTGGAATACATGGACCGATGTGTTTATCTTTATATGAATTTATCTTTACC
CCATACATTTACCACAATTCCTATATGAGCTTCCATTTATGAACTTTCATCATCAGATGA
ACCCTTACGTGAACCTTTACCCTTTTTCTTATCTTTACCCTTTGAACCTTTACCTTTTTT
CTTACCTTTACCTTTTTTACCTTTAGATTTACCTTTTTTACCTTCAGATTTTCCAATTCC
TGGTATATCAATTAACCTTTCTTGCATCTTACTCTTAATAAAGTTTGGCATTTCCAACAG
AGATAAGAAGGATGGCTGAGCTGCCGGGGAAGCTCCTTCAGGATTCTTAATGAGCCGCAT
GAGGAGACCCATGCCCGTCGCTCCGAGGGTGGCACTAGCGCCGAGCCCAGATGCTAGGAG
GGTCGTGGCTATAGTGGCGGGTACGAGAATCGGACTGAAGATGATGAAAAGCGGCGTGGA
TACGGCTAATGCCACGGCTGAACAAGCGAGTGTTACACCGGCGAAGCCTAAAAA

QA 4 597 4 597
DS 

RD RS1FC49JQ 641 0 0
CGC
TAATCAAAGCCTTTTATTATAATAGCTGGCATAAATTCATGAATACACAACGTATTCTAA
ATATTGGAATACATGGACCAATGTGTTTATCTTTATATGAATTTATCTTTACCC*ATACA
TTTACCGCAATTCCTATATGAGCTTCCATTTATGAACTTTCATCATCAGATGAACCCTTA
CGTGAACCTTTACCCTTTTTCTTATCTTTACCCTTTGAACCTTTACCTTTTTTCTTACCT
TTACCTTTTTTACCTTTAGATTTACCTTTTTTACCTTCAGATTTTCCAATTCCGGGTATA
TCAATTAACCTTTCTTGCATCTTACTCTTAATAAAGTTTGGCATTTCCAACAGAGATAAG
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GCTATAGTGGCGGGTACGAGAATCGGACTGAAGATGATGAAAAGCGGCGTGGATACGGCT
AATGCCACGGCTGAACAAGCGAGTGTTACACCGGCGAAGCCTAAAAAGACTACGGAGGCA
ACGGAGGCCATAACCACCTTGATAACCTCTAACACTGG

QA 4 641 4 641
DS 

RD RS1DC73JQ 666 0 0
ATAATAGCTGGCATAAATTCATGAATACACAACGTATTCTAAATATTGGAATACATGGAC
CAATGTGTTTATCTTTATATGAATTTATCTTTACCC*ATACATTTACCACAATTCCTATA
TGAGCTTCCATTTATGAACTTTCATCATCAGATGAACCCTTACGTGAACCTTTACCCTTT
TTCTTATCTTTACCCTTTGAACCTTTACCTTTTTTCTTACCTTTACCTTTTTTACCTTTA
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ATCTTACTCTTAATAAAGTTTGGCATTTCCAACAGAAATAAAAAGGATGGATGAGCTGCC
GGGGAAGCTCCTTCAGGATTCTTAATGAGCCGCATGAGGAGACCGATGCCCGTCGCTCCG
AGGGTGGCACTAGCGCCGAGCCCAGATGCTAGGAGGGTCGTGGCTATAGTGGCGGGTACG
AGAATCGGACTGAAGATGATGAAAAGCGGCGTGGATACGGCTAATGCCACGGCTGAACAA
GCGAGTGTTACACCGGCGAAGCCTAAAAAGACTACGGAGGCAACGGAAGCCATAACCACC
TTGATAACCTCTAACACTGGGAGGAGAAAAGAAAACATTCTCCCCTCTCTCTGTGACAGA
TGAGTC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RS1BW70JQ 738 0 0
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CGTATTCTAAATATTGGAATACATGGACCGATGTGTTTATCTTTATATGAATTTATCTTT
ACCC*ATACATTTACCACAATTCCTATATGAGCTTCCATTTATGAACTTTCATCATCAGA
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TTTCTTACCTTTACCTTTTTTACCTTTAGATTTACCTTTTTTACCTTCAGATTTTCCAAT
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GGATACGGCTAATGCCACGGCTGAACAAGCGAGTGTTACACCGGCGAAGCCTAAAAAGAC
TACGGAGGCAACGGAAGCCATAACCACCTTGATAACCTCTAACACTGGGAGGAGAAAAGA
AAACATTCTCCCCTCTCTCTGTGACAGATGAGTCTGAGCTGTTTCGTTTTGAATTTCTTG
CTTCATATTTTCTTATC
C

QA 1 737 1 737
DS 

RD RS1CK59JQ 734 0 0
G
CCATTATTAATCAAAGCCTTTTATTATAATAGCTGGCATAAATTCATGAATACACAACGT
ATTCTAAATATTGGAATACATGGACCAATGTGTTTATCTTTATATGAATTTATCTTTACC
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CTTACCTTTACCTTTTTTACCTTTAGATTTACCTTTTTTACCTTCAGATTTTCCAATTCC
TGGTATATCAATTAACCTTTCTTGCATCTTACTCTTAATAAAGTTTGGCATTTCCAACAG
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GAGGAGACCCATGCCCGTCGCCCCGAGGGTGGCACTAGCGCCGAGCCCAGATGCTAGGAG
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GGAGGCAACGGAAGCCATAACCACCTTGATAACCTCTAACACTGGGAGGAGAAAAGAAAA
CATTCTCCCCTCTCTCTGTGACAGATGAGTCTGAGCTGTTTCGTTTTGAATTTCTTGCTT
CATATTTTCTTCC

QA 2 734 2 734
DS 

RD RS1CK59TF 721 0 0
TCAAAGCTTTTA
TATAATAGCTGGCATAAATTCATGAATACACAACGTATTCTAAATATTGGAATACATGGA
CCAATGTGTTTATCTTTATATGAATTTATCTTTACCC*ATACATTTACCACAATTCCTAT
ATGAGCTTCCATTTATGAACTTTCATCATCAGATGAACCCTTACGTGAACCTTTACCCTT
TTTCTTATCTTTACCCTTTGAACCTTTACCTTTTTTCTTACCTTTACCTTTTTTACCTTT
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CGGGGAAGCTCCTTCAGGATTCTTAATGAGCCGCATGAGGAGACCCATGCCCGTCGCCCC
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CTTGATAACCTCTAACACTGGGAGGAGAAAAGAAAACATTCTCCCCTCTCTCTGTGACAG
ATGAGTCTGAGCTGTTTCGTTTTGAATTTCTTGCTTCATATTTTCTTCC

QA 13 721 13 721
DS 

RD RS1DN38TF 727 0 0
T
ATCAAAGCCTTTTATTATAATAGCTGGCATAAATTCATGAATACACAACGTATTCTAAAT
ATTGGAATACATGGACCAATGTGTTTATCTTTATATGAATTTATCTTTACCC*ATACATT
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TTCC
CT

QA 2 725 2 725
DS 

RD RS1B732TF 715 0 0
TTTTATTATAATAGCTGGCATAAATTCATGAATACACAACGTATTCTAAATATTGGAATA
CATGGACCAATGTGTTTATCTTTATATGAATTTATCTTTACCC*ATACATTTACCACAAT
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ACCCTTTTTCTTATCTTTACCCTTTGAACCTTTACCTTTTTTCTTACCTTTACCTTTTTT
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TTCTTGCATCTTACTCTTAATAAAGTTTGGCATTTCCAACAGAGATAAGAAGGATGGCTG
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GGGTACGAGAATCGGACTGAAGATGATGAAAAGCGGCGTGGATACGGCTAATGCCACGGC
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AACCACCTTGATAACCTCTAACACTGGGAGGAGAAAAGAAAACATTCTCCCCTCTCTCTG
TGACAGATGAGTCTGAGCTGTTTCGTTTTGAATTTCTTGCTTCATATTTTCTTCC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1B321JQ 730 0 0
ATTAATCAAAGCCTTTTATTATAATAGCTGGCATAAATTCATGAATACACAACGTATTCT
AAATATTGGAATACATGGACCAATGTGTTTATCTTTATATGAATTTATCTTTACCC*ATA
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TCCCCTCTCTCTGTGACAGATGAGTCTGAGCTGTTTCGTTTTGAATTTCTTGCTTCATAT
TTTCTTATCC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RS1AK96JQ 712 0 0
ATTATAATAGCTGGCATAAATTCATGAATACACAACGTATTCTAAATATTGGAATACATG
GACCAATGGGTTTATCTTTATATGAATTTATCTTTACCC*ATACATTTACCACAATTCCT
ATATGAGCTTCCATTTATGAACTTTCATCATCAGATGAACCCTTACGTGAACCTTTACCC
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ACCTTGATAACCTCTAACACTGGGAGGAGAAAAGAAAACATTCTCCCCTCTCTCTGTGAC
AGATGAGTCTGAGCTGTTTCGTTTTGAATTTCTTGCTTCATATTTTCTTATC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RS1AK96TF 717 0 0
TTTA
TATTATAATAGCTGGCATAAATTCATGAATACACAACGTATTCTAAATATTGGAATACAT
GGACCAATGTGTTTATCTTTATATGAATTTATCTTTACCC*ATACATTTACCACAATTCC
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TTGCATCTTACTCTTAATAAAGTTTGGCATTTCCAACAGAGATAAGAAGGATGGATGAGC
TGCCGGGGAAGCTCCTTCAGGATTCTTAATGAGCCGCATGAGGAGACCGATGCCCGTCGC
TCCGAGGGTGGCACTAGCGCCGAGCCCAGATGCTAGGAGGGTCGTGGCTATAGTGGCGGG
TACGAGAATCGGACTGAAGATGATGAAAAGCGGCGTGGATACGGCTAATGCCACGGCTGA
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CAGATGAGTCTGAGCTGTTTCGTTTTGAATTTCTTGCTTCATATTTTCTTATC

QA 5 717 5 717
DS 

RD RS1DC73TF 712 0 0
ATTATAATAGCTGGCATAAATTCATGAATACACAACGTATTCTAAATATTGGAATACATG
GACCAATGTGTTTATCTTTATATGAATTTATCTTTACCC*ATACATTTACCACAATTCCT
ATATGAGCTTCCATTTATGAACTTTCATCATCAGATGAACCCTTACGTGAACCTTTACCC
TTTTTCTTATCTTTACCCTTTGAACCTTTACCTTTTTTCTTACCTTTACCTTTTTTACCT
TTAGATTTACCTTTTTTACCTTCAGATTTTCCAATTCCTGGTATATCAATTAACCTTTCT
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AGATGAGTCTGAGCTGTTTCGTTTTGAATTTCTTGCTTCATATTTTCTTATC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RS1B321TF 713 0 0
ATTATAATAGCTGGCATAAATTCATGAATACACAACGTATTCTAAATATTGGAATACATG
GACCAATGTGTTTATCTTTATATGAATTTATCTTTACCC*ATACATTTACCACAATTCCT
ATATGAGCTTCCATTTATGAACTTTCATCATCAGATGAACCCTTACGTGAACCTTTACCC
TTTTTCTTATCTTTACCCTTTGAACCTTCACCTTTTTTCTTACCTTTACCTTTTTTACCT
TTAGATTTACCTTTTTTACCTTCAGATTTTCCAATTCCTGGTATATCAATTAACCTTTCT
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ACCTTGATAACCTCTAACACTGGGAGGAGAAAAGAAAACATTCTCCCCTCTCTCTGTGAC
AGATGAGTCTGAGCTGTTTCGTTTTGAATTTCTTGCTTCATATTTTCTTATC
C

QA 1 712 1 712
DS 



CO CL22Contig3 659 2 2 U
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AGAGAGGGGAGAATGTTTTCTTTTCTCCTCCCAGTGTTAGAGGTTATCAAGGTGGTTATG
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AAAAAGGTAAAGGTTCAAAGGGTAAAGATAAGAAAAAGGGTAAAGGTTCACGTAAGGGTT
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TAAAGATAAATTCATATAAAGATAAACACATTGGTCCATGTATTCCAATATTTAGAATAC
GTTGTGTATTCATGAATTTATGCCAGCTATTATAATAAAAGGCTTTGATTAATAATGGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EE61JQ C 1
AF RS1EE61TF U 1
BS 1 616 RS1EE61TF
BS 617 659 RS1EE61JQ

RD RS1EE61JQ 659 0 0
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QA 1 659 1 659
DS 

RD RS1EE61TF 616 0 0
GGATAAGAAAATATGAAGCAAGAAATTCAAAACGAAACAGCTCAGACTCATCTGTCACAG
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GCTTCCGTTGCCTCCGTAGTCTTTTTAGGCTTCGCCGGTGTAACACTATAGCCACGACCC
TCCTAGCATCTGGGCTCGGCGCTAGTGCCACCCTCGGAGCGACGGGCATGGGTCTCCTCA
TGCGGCTCATTAAGAATCCTGAAGGAGCTTCCCCGGCAGCTCAGCCATCCTTCTTATCTC
TGTTGGAAATGCCAAACTTTATTAAGAGTAAGATGCAAGAAAGGTTAATTGATATACCAG
GAATTGGAAAATCTGAAGGTAAAAAAGGTAAATCTAAAGGTAAAAAAGGTAAAGGTAAGA
AAAAAGGTAAAGGTTCAAAGGGTAAAGATAAGAAAAAGGGTAAAGGTTCACGTAAGGGTT
CATCTGATGATGAAAGTTCATAAATGGAAGCTCATATAGGAATTGTGGTAAATGTATGGG
TAAAGATAAATTCATATAAAGATAAACACATTGGTCCATGTATTCCAATATTTAGAATAC
GTTGTGTATTCATGAA

QA 1 616 1 616
DS 



AS 2 20

CO CL23Contig1 901 6 5 U
ACACAATTTGAGAATTTTCGAAATCTTCTCCCAGTGATAACCTTTTTAGCTCGTTTTATC
ATCTGCACGCTTGAATAAATGGCTTCCACACTCTCATTCACATCGGCTCTTAGCTCACCT
CTCGCTCTATCTCCTACTTCTTTCTCGTCCAAACCTACTTCGCCTTTCTCTGTCTCGTTT
CCACGGATGGTCCCTGGTAAGATCAGAGCTCAAGACCACAGAGAAGACTCTGTTGATGTT
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GCTATGGACGTTTCTCCTTTCGGATTGTTGGATCCTCTGTCACCGATGAGGACAATGCGT
CAAATGCTCGACACAATGGACAGGATGTTCGATGACGCTGCCATGATCGCCCCAGGAAGA
AGCAGAGGAGGAGGAGGAAGCGGAGCTTCCGAGATCCGTGCGCCTTGGGACATGAAGGAA
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GATTCTTGGTCCGGAAGAAGCTTTAGCTCTTATGGTACGCGACTTCAGCTACCTGATAAC
TGCGAGAAAGACAAGATCAAAGCTGAGCTCAAGAATGGAGTTCTGTTTATCACAATTCCT
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TTCTTCTGTTTTCTTGTTCTTGTGCTGTCTATTGTACATAATAAACATGCGTCTCGCTAT
CTGTGTAATAACAAGGAGAAGAATTGGTGTGCGAAGATAATAGATATGCGTTTCCCAGAC
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 

AF RS1CM66TF U 65
AF RS1BB34TF U 1
AF RS1G689JQ C 531
AF RS1G689TF U 531
AF RS1BB34JQ C 159
AF RS1CM66JQ C 428
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RD RS1CM66TF 152 0 0
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ACTTCTTTCTCGTCCAAACCTACTTCGCCTTTCTCTGTCTCGTTTCCACGGATGGTCCCT
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QA 12 152 12 152
DS 

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ATCTGCACGCTTGAATAAATGGCTTCCACACTCTCATTCACATCGGCTCTTAGCTCACCT
CTCGCTCTATCTCCTACTTCTTTCTCGTCCAAACCTACTTCGCCTTTCTCTGTCTCGTTT
CCACGGATGGTCCCTGGTAAGATCAGAGCTCAAGACCACAGAGAAGACTCTGTTGATGTT
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CAAATGCTCGACACAATGGACAGGATGTTCGATGACGCTGCCATGATCGCCCCAGGAAGA
AGCAGAGGAGGAGGAGGAAGCGGAGCTTCCGAGATCCGTGCGCCTTGGGACATGAAGGAA
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TGCGAGAAAG*CAAGATCAAAGCTGAGCTCAAGAATGGAGTTCTGTTTATCACAATT

QA 1 717 1 717
DS 

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GGACGACAGTGATTCTTGGTCCGGAAGAAGCTTTAGCTCTTATGGTACGCGACTTCAGCT
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QA 1 343 1 343
DS 

RD RS1G689TF 343 0 0
GGACGTCAAGGTCTCTGTCGAAGACAACGTTCTTGTGATCAGAGGAGAACAGAAGAAGGA
GGACGACAGTGATTCTTGGTCCGGAAGAAGCTTTAGCTCTTATGGTACGCGACTTCAGCT
ACCTGATAACTGCGAGAAAGACAAGATCAAAGCTGAGCTCAAGAATGGAGTTCTGTTTAT
CACAATTCCTAAAACCAAAGTCGAACGCAAAGTTGTCGATGTCCAGGTTCAGTGAGAATA
CAGTAACGTTTTCTTCTGTTTTCTTGTTCTTGTGCTGTCTATTGTACATAATAAACATGC
GTCTCGCTATCTGTGTAATAACAAGGAGAAGAATTGGTGTGCG

QA 1 343 1 343
DS 

RD RS1BB34JQ 743 0 0
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GTCACCGATGAGGACAATGCGTCAAATGCTCGACACAATGGACAGGATGTTCGATGACGC
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TGCGCCTTGGGACATGAAGGAAGAAGAGCACGAGATCAAGATGCGTTTCGACATGCCTGG
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TCAGTGAGAATACAGTAACGTTTTCTTCTGTTTTCTTGTTCTTGTGCTGTCTATTGTACA
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AATAGATATGCGTTTCCCAGACT

QA 1 743 1 743
DS 

RD RS1CM66JQ 474 0 0
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TCGAAGACAACGTTTTTGTGATCAGAGGAGAACAGAAGAAGGAGGACGACAGTGATTCTT
GGTCCGGAAGAAGCTTTAGCTTTTATGGTACGCGACTTCAGCTACCTGATAACTGCGAGA
AAGACAAGATCAAAGCTGAGCTCAAGAATGGAGTTTTGTTTATCACAATTCCTAAAACCA
AAGTCGAACGCAAAGTTGTTGATGTCCAGGTTCAGTGAGAATACAGTAACGTTTTTTTCT
GTTTTCTTGTTCTTGTGCTGTCTATTGTACATAATAAACATGCGTCTCGCTATCTGTGTA
ATAACAAGGAGAAGAATTGGTGTGCGAAGATAATAGATATGCGTTTCCCAGACT

QA 1 474 1 474
DS 



CO CL23Contig2 967 14 12 U
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AACGCATATCTATTATCTTCGCACACCAGTTCTTCTCCTTGTTATTACACAGATAGCGAG
ACGCATGTTTATTATGTACAATAGACAGCACCAGAACAAGAAAACAGAAGAAAACGTTAC
TGTATTCTCACTGAATCTGGACATCAACAACTTTGCGTTCGACTTTGGTTTTAGGAATTG
TGATAAACAGAACTCCATTCTTGAGCTCAGCTTTGATCTTGTCTTTCTCGCAGTTATCAG
GTAGCTGAAGTCGCGTACCGTAAGAGCTAAAGCTTCTTCCGGACCAAGAATCACTCTCGT
CTTCCTTCTTCTGTTCTCCTTTGATCACAAGAACGTTGTCTTCGACAGAGACCTTGACGT
CTTCCC*TAGATAAGCCGGGCATGTCAAAACGCATCTTGATCTCGTGCTCTTCCTCTTTC
ATGTCCCAAGGCGCACGGATCTCGGAAACTCCACTTCCTCC*TCCTCCTCTGCTTCTTCC
TGGGACGATCATGGCAGCGTCATCGAACATCCTGTCCATTGTGTCGAGCATTTGACGCAT
TGTCCTCATCGGTGACAGAGGATCCAACAAGCCGAAAGGAGAAACGTCCAGAGCTAAGCG
TTGAGGTCTTTTCTCCACACTAGATCCTTGATTCCCTTTCTGTCCTTGGTGAACAACATC
AACAGAGTCTCCCCTGTCTCTGTGGTCTTGAGCTCTGATCTTACCAGGGACCATCCGTGG
AAACGAGACAGAGAAAGGCGAAGTAGGTTTGGAAGAGCAAGAACTCAGAGATAGAGCGGG
AGGTGAGCGTAGAGCCGAAGCGAATGAGAGTGCTGAAGCCATTTACTCGAGTGTGTAGAC
GATAAAACGAGCTAAAAAGGTTATCACTGGGAGAAGATTTCGAAAAGTCTCAAATTGTGT
TTCTTCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 
50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 40 55 40 40 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 45 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 
65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 45 45 45 45 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 35 35 

AF RS1FP01JQ U 52
AF RS1FP01TF C 52
AF RS1AD91JQ U 281
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AF RS1A471JQ U 688
BS 1 409 RS1FP18JQ
BS 410 410 RS1FP01JQ
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BS 708 791 RS1FP18JQ
BS 792 793 RS1CV75JQ
BS 794 802 RS1DN15JQ
BS 803 945 RS1A471JQ
BS 946 946 RS1A471TF
BS 947 967 RS1A471JQ

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AAACGTTACTGTATTCTCACTGAATCTGGACATCAACAACTTTGCGTTCGACTTTGGTTT
TAGGAATTGTGATAAACAGAACTCCATTCTTGAGCTCAGCTTTGATCTTGTCTTTCTCGC
AGTTATCAGGTAGCTGAAGTCGCGTACCGTAAGAGCTAAAGCTTCTTCCGGACCAAGAAT
CACTCTCGTCTTCCTTCTTCTGTTCTCCTCTGATCACAAGAACGTTGTCTTCGACAGAGA
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TCCTCTTTCATGTCCCAAGGCGCACGGATCTCGGAAACTCCACTTCCTCC*TCCTCCTCT
GCTTCTTCCTGGGACGATCATGGCAGCGTCATCGAACATCCTGTCCATTGTGTCGAG

QA 1 537 1 537
DS 

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GATAGCGAGACGCATGTTTATTATGTACAATAGACAGCACCAGAACAAGAAAACAGAAGA
AAACGTTACTGTATTCTCACTGAATCTGGACATCAACAACTTTGCGTTCGACTTTGGTTT
TAGGAATTGTGATAAACAGAACTCCATTCTTGAGCTCAGCTTTGATCTTGTCTTTCTCGC
AGTTATCAGGTAGCTGAAGTCGCGTACCGTAAGAGCTAAAGCTTCTTCCGGACCAAGAAT
CACTCTCGTCTTCCTTCTTCTGTTCTCCTCTGATCACAAGAACGTTGTCTTCGACAGAGA
CCTTGACGTCTTCCC*TAGATGAGCCGGGCATGTCAAAACGCATCTTGATCTCGTGCTCT
TCCTCTTTCATGTCCCAAGGCGCACGGATCTCGGAAACTCCACTTCCTCC*TCCTCCTCT
GCTTCTTCCTGGGACGATCATGGCAGCGTCATCGAACATCCTGTCCATTGTGTCGAGCAT
TTGACGCATTGTCCTCATCGGTGACAGAGGATCCAACAAGCCGAAAGGAGAAACGTCCAG
AGCTAAGCGTTGAGGTCTT
C

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DS 

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GGACCAAGAATCACTCTCGTCTTCCTTCTTCTGTTCTCCTTTGATCACAAAAACGTTGTC
TTCGACAGAAACCTTGACGTCTTCCC*TAAATAAGCCGGGCATGTCAAAACGCATCTTGA
TCTCGTGCTCTTCCTCTTTCATGTCCCAAGGCGCACGGATCTCGGAAACTCCACTTCCTC
C*TCCTCCTCTGCTTCTTCCTGGGACGATCATGGCAGCGTCATCGAACATCCTGTCCATT
GTGTCGAGCATTTGACGCATTGTCCTCATCGGTGACAGAGGATCCAACGAGCCGAAAGGA
GAAACGTCCAGAGCTAAGCGTTGAGGTCTTTTCTCCACAC

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DS 

RD RS1GM65JQ 762 0 0
AG
CTCTGGCCCAAAAGAACATTGGGCCGAATATCTAAGCTTTCATTAATCTAGTCTGGGAAA
CGCATATCTATTATCTTCGCACACCAGTTCTTCTCCTTGTTATTACACAGATAGCGAGAC
GCATGTTTATTATGTACAATAGACAGCACCAGAACAAGAAAACAGAAGAAAACGTTACTG
TATTCTCACTGAATCTGGACATCAACAACTTTGCGTTCGACTTTGGTTTTAGGAATTGTG
ATAAACAGAACTCCATTCTTGAGCTCAGCTTCGATCTTGTCTTTCTCGCAGTTATCAGGT
AGCTGAAGTCGCGTACCGTAAGAGCTAAAGCTTCTTCCGGACCAAGAATCACTCTCGTCT
TCCTTCTTCTGTTCTCCTTTGATCACAAGAACGTTGTCTTCGACAGAGACCTTGACGTCT
TCCC*TAGATAAGCCGGGCATGTCAAAACGCATCTTGATCACGTGCTCTTCCTCTTTCAT
GTCCCAAGGCGCGCGGATCTCGGAAACTCCACTTCCTCC*TCCTCCTCTGCTTCTTCCTG
GGACGATCATGGCAGCGTCACCGAACATCCTGTCCATTGTGTCGAGCATTTGACGCATTG
TCCTCATCGGTGACAGAGGATCCAACAAGCCGAAAGGAGAAACGTCCAGAGCTAAGCGTT
GAGGTCTTTTCTCCACACTAGATCCTTGATTCCCTTTCTGTCCTTGGTGAACAACATCAA
CAGAGTCTCCCCTGTCTCTGTGGTCTTGAGCTCTGATCTT

QA 3 762 3 762
DS 

RD RS1FP18JQ 791 0 0
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AACGCATATCTATTATCTTCGCACACCAGTTCTTCTCCTTGTTATTACACAGATAGCGAG
ACGCATGTTTATTATGTACAATAGACAGCACCAGAACAAGAAAACAGAAGAAAACGTTAC
TGTATTCTCACTGAATCTGGACATCAACAACTTTGCGTTCGACTTTGGTTTTAGGAATTG
TGATAAACAGAACTCCATTCTTGAGCTCAGCTTTGATCTTGTCTTTCTCGCAGTTATCAG
GTAGCTGAAGTCGCGTACCGTAAGAGCTAAAGCTTCTTCCGGACCAAGAATCACTCTCGT
CTTCCTTCTTCTGTTCTCCTTTGATCACAAGAACGTTGTCTTCGACAGAAACCTTGACGT
CTTCCC*TAGATAAGCCGGGCATGTCAAAACGCATCTTGATCTCGTGCTCTTCCTCTTTC
ATGTCCCAAGGCGCACGGATCTCGGAAACTCCACTTCCTCC*T******CTGCTTCTTCC
TGGGACGATCATGGCAGCGTCATCGAACATCCTGTCCATTGTGTCGAGCATTTGACGCAT
TGTCCTCATCGGTGACAGAGGATCCAACAAGCCGAAAGGAGAAACGTCCAGAGCTAAGCG
TTGAGGTCTTTTCTCCACACTAGATCCTTGATTCCCTTTCTGTCCTCGGTGAACAACATC
AACAGAGTCTCCCCTGTCTCTGTGGTCTTGAGCTCTGATCTTACCAGGGACCATCCGTGG
AAACGAGACAG

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DS 

RD RS1CV75JQ 690 0 0
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ACAGAAGAAAACGTTACTGTATTCTCACTGAATCTGGACATCAACAACTTTGCGTTCGAC
TTTGGTTTTAGGAATTGTGATAAACAGAACTCCATTCTTGAGCTCAGCTTTGATCTTGTC
TTTCTCGCAGTTATCAGGTAGCTGAAGTCGCGTACCGTAAGAGCTAAAGCTTCTTCCGGA
CCAAGAATCACTCTCGTCTTCCTTCTTCTGTTCTCCTTTGATCACAAGAACGTTGTCTTC
GACAGAGACCTTGACGTCTTCCC*TAGATAAGCCGGGCATGTCAAAACGCATCTTGATCT
CGTGCTCTTCCTCTTTCATGTCCCAAGGCGCACGGATCTCGGAAACTCCACTTCCTCC*T
CCTCCTCTGCTTCTTCCTGGGACGATCATGGCAGCGTCATCGAACATCCTGTCCATTGTG
TCGAGCATTTGACGCATTGTCCTCATCGGTGACAGAGGATCCAACAAGCCGAAAGGAGAA
ACGTCCAGAGCTAAGCGTTGAGGTCTTTTCTCCACACTAGATCCTTGATTCCCTTTCTGT
CCTTGGTGAACAACATCAACAGAGTCTCCCCTGTCTCTGTGGTCTTGAGCTCTGATCTTA
CCAGGGACCATCCGTGGAAACGAGACAGAG

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1DN15JQ 696 0 0
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GAAGAAAACGTTACTGTATTCTCACTGAATCTGGACATCAACAACTTTGCGTTCGACTTT
GGTTTTAGGAATTGTGATAAACAGAACTCCATTCTTGAGCTCAGCTTTGATCTTGTCTTT
CTCGCAGTTATCAGGTAGCTGTAGTCGCGTACCGTAAGAGCTAAAGCTTCTTCCGGACCA
AGAATCACTCTCGTCTTCCTTCTTCTGTTCTCCTTTGATCACAAGAACGTTGTCTTCGAC
AGAGACCTTGACGTCTTCCC*TAGATAAGCCGGGCATGTCAAAACGCATCTTGATCTCGT
GCTCTTCCTCTTTCATGTCCCAAGGCGCACGGATCTCGGAAACTCCACTTCCTCC*TCCT
CCTCTGCTTCTTCCTGGGACGATCATGGCAGCGTCATCGAACATCCTGTCCATTGTGTCG
AGCATTTGACGCATTGTCCTCATCGGTGACAGAGGATCCAACAAGCCGAAAGGAGAAACG
TCCAGAGCTAAGCGTTGAGGTCTTTTCTCCACACTAGATCCTTGATTCCCTTTCTGTCCT
TGGTGAACAACATCAACAGAGTCTCCCCTGTCTCTGTGGTCTTGAGCTCTGATCTTACCA
GGGACCATCCGTGGAAACGAGACAGAGAAAGGCGAA

QA 1 696 1 696
DS 

RD RS1GM65TF 689 0 0
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GCAGTTATCAGGTAGCTGAAGTCGCGTAC*GTAAGAGCTAAAGCTTCTTCCGGACCAAGA
ATCACTCTCGTCTTC*TTCTTCTGTTCTCCTTTGATCACAAGAACGTTGTCTTCGACAGA
GACCTTGACGTCTTCCC*TAGATAAGCCGGGCATGTCAAAACGCATCTTGATCACGTGCT
CTTCCTCTTTCATGTCCCAAGGCGCGCGGATCTCGGAAACTCCACTTCCTCC*TCCTCCT
CTGCTTCTTCCTGGGACGATCATGGCAGCGTCACCGAACATCCTGTCCATTGTGTCGAGC
ATTTGACGCATTGTCCTCATCGGTGACAGAGGATCCAACAAGCCGAAAGGAGAAACGTCC
AGAGCTAAGCGTTGAGGTCTTTTCTCCACACTAGATCCTTGATTCCCTTTCTGTCCTTGG
TGAACAACATCAACAGAGTCTCCCCTGTCTCTGTGGTCTTGAGCTCTGATCTTACCAGGG
ACCATCCGTGGAAACGAGACAGAGAAAGGCGAAGTAGGTTTGGAAGAGCAAGAACTCAGA
GATAGAGCGGGAGGTGAGCGTAGAGCCGAAGCGAATGAGAGTGCTGAAGCCATTTACTCG
AGTGTGTAGACGATAAAACGAGCTAAAAA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1A471TF 800 0 0
G
AGAAAACGTTACTGTAT*CTCACTGAATCTGGACATCAACAACTTTGCGT*CGACTTTGG
TTTTAGGAATTGTGATAAACAGAACTCCATTCTTGAGCTCAGCTTTGATCTTGTCTTTCT
CGCAGTTATCAAGTAGCTGAAGTCGCGTACCGTAAGAGCTAAAGCTTCTTCCGGACCAAG
AATCACTCTCGTCTTCCTTCTTCTGTTCTCCTTTGATCACAAGAACGTTGTCTTCGACAG
AGACCTTGACGTCTTCCC*TAGATAAGCCGGGCATGTCAAAACGCATCTTGATCTCGTGC
TCTTCCTCTTTCATGTCCCAAGGCGCACGGATCTCGGAAACTCCACTTCCTCC*TCCTCC
TCTGCTTCTTCCTGGGACGATCATGGCAGCGTCATCGAACATACTGTCCATTGTGTCGAG
CATTTGACGCATTGTCCTCATCGGTGACAGAGGATCCAACAAGCCGAAAGGAGAAACGTC
CAGAGCTAAGCGTTGAGGTCTTTTCTCCACACTAGATCCTTGATTCCCTTTCTGTCCTTG
GTGAACAACATCAACAGAGTCTCCCCTGTCTCTGTGGTCTTGAGCTCTGATCTTACCAGG
GACCATCCGTGGAAACGAGACAGAGAAAGGCGAAGTAGGTTTGGAAGAGCAAGAACTCAG
AGATAGAGCGGGAGGTGAGCGTAGAGCCGAAGCGAATGAGAGTGCTGAAGCCATTTACTC
GAGTGTGTAGACGATAAAACGAGCTAAAAAGGTTATCACTGGGAGAAGATTTCGAAAAGT
CTCAAATTGTGTTTCTTCC

QA 2 800 2 800
DS 

RD RS1DN15TF 625 0 0
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CAGAGACCTTGACGTCTTCCC*TAGATAAGCCGGGCATGTCAAAACGCATCTTGATCTCG
TGCTCTTCCTCTTTCATGTCCCAAGGCGCACGGATCTCGGAAACTCCACTTCCTCC*TCC
TCCTCTGCTTCTTCCTGGGACGATCATGGCAGCGTCATCGAACATCCTGTCCATTGTGTC
GAGCATTTGACGCATTGTCCTCATCGGTGACAGAGGATCCAACAAGCCGAAAGGAGAAAC
GTCCAGAGCTAAGCGTTGAGGTCTTTTCTCCACACTAGATCCTTGATTCCCTTTCTGTCC
TTGGTGAACAACATCAACAGAGTCTCCCCTGTCTCTGTGGTCTTGAGCTCTGATCTTACC
AGGGACCATCCGTGGAAACGAGACAGAGAAAGGCGAAGTAGGTTTGGAAGAGCAAGAACT
CAGAGATAGAGCGGGAGGTGAGCGTAGAGCCGAAGCGAATGAGAGTGCTGAAGCCATTTA
CTCGAGTGTGTAGACGATAAAACGAACTAAAAAGGTTATCGCTGGGAGAAGATTTCGAAA
AGTCTCAAATTGTGTTTCTT
GATCC

QA 1 620 1 620
DS 

RD RS1CV75TF 645 0 0
AGAGCTAAAGCTTCTTCCGGACCAAGAATCACTCTCGTCTTCCTTCTTCTGTTCTCCTTT
GATCACAAGAACGTTGTCTTCGACAGAGACCTTGACGTCTTCCCCTAGATAAGCCGGGCA
TGTCAAAACGCATCTTGATCTCGTGCTCTTCCTCTTTCATGTCCCAAGGCGCACGGATCT
CGGAAACTCCACTTCCTCC*TCCTCCTCTGCTTCTTCCTGGGACGATCATGGCAGCGTCA
TCGAACATCCTGTCCATTGTGTCGAGCATTTGACGCATTGTCCTCATCGGTGACAGAGGA
TCCAACAAGCCGAAAGGAGAAACGTCCAGAGCTAAGCGTTGAGGTCTTTTCTCCACACTA
GATCCTTGATTCCCTTTCTGTCCTTGGTGAACAACATCAACAGAGTCTCCCCTGTCTCTG
TGGTCTTGAGCTCTGATCTTACCAGGGACCATCCGTGGAAACGAGACAGAGAAAGGCGAA
GTAGGTTTGGAAGAGCAAGGACTCAGAGATAGAGCGGGAGGTGAGCGTAGAGCCGAAGCG
AATGAGAGTGCTGAAGCCATTTACTCGAGTGTGTAGACGATAAAACGAGCTAAAAAGGTT
ATCACTGGGAGAAGATTTCGAAAAGTCTCAAATTGTGTTTCTTCC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1FP18TF 797 0 0
AGAAACG
TACTGTAT*CTCACTGA*TCTGGACATCAACAACTTTGCGTTCGACTTGG**TTTAGGAA
TTGTGATAA*CAGAACTCCATTCTTGAGCTCAGCTTTGATCTTGTCTTTCTCGCAGTTAT
CAGGTAGCTGAAGTCGCGTACCGTAAGAGCTAAAGCTTCTTCCGGACCAAGAATCACTCT
CGTCTTCCTTCTTCTGTTCTCCTTTGATCACAAGAACGTTGTCTTCGACAGAGACCTTGA
CGTCTTCCC*TAGATAAGCCGGGCATGTCAAAACGCATCTTGATCTCGTGCTCTTCCTCT
TTCATGTCCCAAGGCGCACGGATCTCGGAAACTCCACTTCCTCC*T******CTGCTTCT
TCCTGGGACGATCATGGCAGCGTCATCGAACATCCTGTCCATTGTGTCGAGCATTTGACG
CATTGTCCTCATCGGTGACAGAGGATCCAACAAGCCGAAAGGAGAAACGTCCAGAGCTAA
GCGTTGAGGTCTTTTCTCCACACTAGATCCTTGATTCCCTTTCTGTCCTCGGTGAACAAC
ATCAACAGAGTCTCCCCTGTCTCTGTGGTCTTGAGCTCTGATCTTACCAGGGACCATCCG
TGGAAACGAGACAGAGAAAGGCGAAGTAGGTTTGGAAGAGCAAGAACTCAGAGATAGAGC
GGGAGGTGAGCGTAGAGCCGAAGCGAATGAGAGTGCTGAAGCCATTTACTCGAGTGTGTA
GACGATAAAACGAGCTAAAAAGGTTATCACTGGGAGAAGATTTCGAAAAGTCTCAAATTG
TGTTTCTTCC

QA 8 797 8 797
DS 

RD RS1AD91TF 774 0 0
AATCTGGACATCAACAACTTTGCGTTCGACTTTGGTTTTAGGAATTGTGATAAACAGAAC
TCCATTCTTGAGCTCAGCTTTGATCTTGTCTTTCTCGCAGTTATCAGGTAGCTGAAGTCG
CGTACCGTAAGAGCTAAAGCTTCTTCCGGACCAAGAATCACTCTCGTCTTCCTTCTTCTG
TTCTCCTTTGATCACAAGAACGTTGTCTTCGACAGAGACCTTGACGTCTTCCC*TAGATA
AGCCGGGCATGTCAAAACGCATCTTGATCTCGTGCTCTTCCTCTTTCATGTCCCAAGGCG
CACGGATCTCGGAAACTCCACTTCCTCCCTCCTCCTCTGCTTCTTCCTGGGACGATCATG
GCAGCGTCATCGAACATCCTGTCCATTGTGTCGAGCATTTGACGCATTGTCCTCATCGGT
GACAGAGGATCCAACGAGCCGAAAGGAGAAACGTCCAGAGCTAAGCGTTGAGGTCTTTTC
TCCACACTAGATCCTTGATTCCCTTTCTGTCCTTGGTGAACAACATCAACAGAGTCTCCC
CTGTCTCTGTGGTCTTGAGCTCTGATCTTACCAGGGACCATCCGTGGAAACGAGACAGAG
AAAGGCGAAGTAGGTTTGGAAGAGCAAGAACTCAGAGATAGAGCGGGAGGTGAGCGTAGA
GCCGAAGCGAATGAGAGTGCTGAAGCCATTTACTCGAGTGTGTAGACGATAAAACGAGCT
AAAAAGGTTATCACTGGGAGAAGATTTCGAAAAGTCTCAAATTGTGTTTCTTCC

QA 1 774 1 774
DS 

RD RS1A471JQ 280 0 0
TTGATTCCCTTTCTGTCCTTGGTGAACAACATCAACAGAGTCTCCCCTGTCTCTGTGGTC
TTGAGCTCTGATCTTACCAGGGACCATCCGTGGAAACGAGACAGAGAAAGGCGAAGTAGG
TTTGGAAGAGCAAGAACTCAGAGATAGAGCGGGAGGTGAGCGTAGAGCCGAAGCGAATGA
GAGTGCTGAAGCCATTTACTCGAGTGTGTAGACGATAAAACGAGCTAAAAAGGTTATCAC
TGGGAGAAGATTTCGAAA*GTCTCAAATTGTGTTTCTTCC

QA 1 280 1 280
DS 



AS 2 16

CO CL24Contig1 834 2 2 U
GTCCTCCAACTCTTCTGTCGTAGAGTTTTCATCATCTTCTGCAAGATCTATTTTATTCTT
TAATTCTTCAATCAAGACGGAAGAGTTTGTGGGATTATTCTTCCTCCAAGAACTGATCTT
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AAAATTTTTCCTTGTTCTCCGGGTGGTAGATTGGATACGTGCTAGGACAGGTCTATGATC
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ATTTGCCACTGCTCTATCCAGTTTGCATTTGACTTTCCCGGTACTTCTTCTTCCCATCAC
GAGAAAGAATTGCCTTTATAAGGGAAGTCTAACATCCCACAATTTTCTGACATGGTACGG
AAAAGGAGGAAAGAACTTTCTAAACGACGTCTTCCTCCCCTCTTTTCATGGTTTCCAGTG
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GTGGTATCAACGCAGAGTTCCTTTACAAACAATTGGAGCTAAAATTGATTATTGTTCCTA
TACAGTTCGAACTATTTATGGGGTTTTAGGAATAAAAATTTGGATATTCGTAGACGAAGA
ATAAAAAAACTTTATTTGTCTTTACATTTTATCCAATGATAAAAAACGAAAACTATGTAG
TATAACACTATAAAGAAATAAAAAAAGAAATAAAAATAAAAACTTGTAGTCTTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AS76TF U 1
AF RS1AS76JQ C 108
BS 1 568 RS1AS76TF
BS 569 834 RS1AS76JQ

RD RS1AS76TF 568 0 0
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AAAATTTTTCCTTGTTCTCCGGGTGGTAGATTGGATACGTGCTAGGACAGGTCTATGATC
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ATTTCATTAAAATCTCCAAGCATAAACC

QA 1 568 1 568
DS 

RD RS1AS76JQ 727 0 0
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GAAAACTATGTAGTATAACACTATAAAGAAATAAAAAAAGAAATAAAAATAAAAACTTGT
AGTCTTC

QA 1 727 1 727
DS 



CO CL24Contig2 1700 14 24 U
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ATGAGAAATTCCATCTCTACTGCAGAACTGGACGTGAGAGTTTCTTCTCATCCAGCTCCT
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ATATGATCAGCCTATCATATCTTGACTAATTTTTTGGATCCAGATAATGCGAAGCAATGA
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AAAGGAGTTTTGATGGAAATGTTTATTCAACCTTATAGGATTGCTTATTTTTTTTCTTAA
ACATAAAAAAGAAGACTACAAGTTTTTATTTTTATTTCTTTTTTTATTTCTTTATAGTGT
TATACTATATAGTTTTCGTTTTTTATCATTGGATAAAATGTAAAGACAAATAAAGTTTTT
TTATTCTTCGTCTACGAATATCCAAATTTTTATTCCTAAAACCCCATAAATAGTTCGAAC
TGTATAGGAACAATAATCAATTTTAGCTTCAATTGTTTGTAAAGGAACTCTGCCTTCTCT
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AACACGATTTTTTAATTGGCCAGCTATAAATTCTGCAAGAATATTAGGATGCCCATACGG
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AACATTCATCTGTAATTCTT


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TTGCTTTTATTACAGTGAC

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G
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TGTTTATACCCCGAGGTCTCAGAATCAAAATCAGAAATCAAAATAGATAATAAAGTTTCT
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GTTTTTATTGGCTCAAGGCTCTTAATTTTTTGTTTTCGGAACAGATTTATCTAATTATTA
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TCAGTTGCTCCAATG
C

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TCATTAATATCCAATTTTTTC*GCTCTTTCTTTCATCCTTCCATTTATCCGCATACTTTT
TGATTACCTTTCATAACTTAATAATCA
C

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TTTTTTC*GCTCTTTCTTTCATCCTTCCATTTATCCGCATACTTTTTGATTACCTTTCAT
AACTTAATAATCA
C

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GA
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CTGTTTATACCCCGAGGTCTCAGAATCAAAATCAGAAATCAGAATAGATAATAAAGTTTC
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TTTTTTTTTTTTTTAGTCAGTTGCTCCAATGATATGATCAGCCTATC

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GA
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CTGTTTATACCCCGAGGTCTCAAAATCAAAATCAGAAATCAAAATAGATAATAAAGTTTC
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TTTTTTTTTTTTTTAGTCAGTTGCTCCAATGATATGATCAGCCTATC

QA 3 589 3 589
DS 

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AATCAGAATAGATAATAAAGTTTCTGGTTTATTCCGCCATCCTGTCCAATGAATTACTAA
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C

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DS 

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TT
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TGTTTATTCAACCTTA

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GT
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DS 

RD RS1FB62TF 587 0 0
GT
GGCAATTTTCTCAGTTTTTATTGGCTCAAGGCTCTTAATTTTTTGTTTTCGGAACAGATT
TATCTAATTATTATGAATGAATCTGTATTGATGCTTTATTACATTGCTTTTCTTACAGTG
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CTTTCTTTATTCTTTGTTTTTTTT**AGTCAGTTGCTCCAATGATATGATCAGCCTATCA
TATCTTGACTAATTTTTTGGATCCAGATAATGCGAAGCAATGAGTTGCTTAGGTTATTTA
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ACAAGTTTTTATTTTTATTTCTTTTTTTATTTCTTTATAGTGTT
C

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DS 

RD RS1GN10JQ 432 0 0
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DS 

RD RS1GN10TF 189 0 0
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TTCTTTATAGTGTTATACTATATAGTTTTCGTTTTTTATCATTGGATAAAATGTAAAGAC
AAATAAAGTTTTTTTATTCTTCGTCTACGAATATCCAAATTTTTATTCCTAAAACCCCAT
AAATAGTTC

QA 1 189 1 189
DS 

RD RS1A530JQ 746 0 0
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CAATGAGTTGCTTAGGTTATTTATTAATGCTGTAGTTATTAGTTGCTCTTATAGGTAAGT
TCTTTTTTTT**ATCGTAATCTAACCCTAAACCAACGAGTCACACACTAAGCATAGCAAT
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TTTTTGAACATTCATCTGTAATTCTT

QA 1 746 1 746
DS 



AS 2 17

CO CL25Contig1 770 6 6 U
GCTCAATTAGATAAAAAAGAAAAACTTAAAATCATTATCTGGGAAAGTAGAATCTGGTCG
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BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G947JQ U 27
AF RS1DG46JQ U 1
AF RS1DG46TF C 1
AF RS1C163JQ U 9
AF RS1G947TF C 433
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C

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DS 

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GAAACACTACAAAAGAAAAGGATGGAGAGAACAAAAATATATAAAGATACGCAGAAATCC
AAGTGCTTTTTTT*CTTGTCTAGGAAGAAGCAGCAGGAGCAGCAGGAGCAGCAGCAGGAG
CAGCAGGAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGGTACTTTCTCTTCAGCAGCAGCAGCTTCGAACG
TCTCACCAGCTACAAGGTCTGGGACATCATCGTCATCCTCCTCTTGGATGGTTGCTGAGG
CATTACCTTCACCAGGAGGTTGCTTCTTCAACTGCTCTGCTAGCTTCCTCAGATTGTCCA
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TCTTCATCAACTTCTCCCTATTCATCTTGAGATTTGATTATTAGCT
C

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DS 

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ATTCTCTTCAAGGTGCTTTGAAGCTTCTTGTCATCAGTTGTATTGGTCTTGTGCACAGCC
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GATGCGGGCGGCCC

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DS 



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BQ
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60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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G

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A
GG

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AAGGTTTTCTT

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DS 

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DS 

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G

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DS 

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AAGTTAACATCTTTAAAGATGATGTTGTTATTCAGTTCACCAATCCTAAGGTTCAAGCTT
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ATTTCTGCGTATCTTTATATATGTTTGTTCTCTCCATCCTTTTCTTTTGTAGTGTTTCCG
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CC

QA 1 542 1 542
DS 



AS 2 16

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TGGAGATCAACTACAGCTTCGACATCCGTAAAGAATGGGCTGCGGTTTGAAACTCGAGAA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 25 40 40 40 15 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

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GG
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CGAGTTGATCTGATCTG*****ATTTTGATTTGATGTCTGGAGCTGTATCTGGTTCCAGG
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CA*GAACTAAGTTTCTTGATGATGATAC**AGTGCTACTTGGAGATCA
CT

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TCCTTTTT*CTCATCGTTGAACATATTATTCTGAATCGTTTTTTTTCC

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DS 

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GG
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CTTGGCCATCTTATCCCCCGGAAGACCTGATATCGTTCTTATGGTTCCGGAGAATGGGAA
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GCGACATTTATGTCCTCTTTGGTCTTGATTTT*TTTTGTCGAGTAAGAAAGACAGTGATT
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QA 3 883 3 883
DS 

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TTGCTCGAGGATCATGTTCTGCAAGAACTAAGTTTCTTGATGATGATAACAAGTGCTACT
TGGAGATCAACTACAGCTTCGACATCCGTAAAGAATGGGCTGCGGTTTGAAACTCGAGAA
CAAAGTCTCCTGAGATGAAGTGTTTGTCAGTAGAAGTTGTGTGTTTGTTATTTCACTCCC
TATCTCCTTTTTTCTCATCGTTGAACATATTATTGTGAATCGTTTTTTTTCCTCTTCCGG
TTATTATCGTAGAACAAGAGCGACATTTATTTCCTCTTTGGTCTTGATTTT*TTTTGTCG
AGTAAGAAAGACAGTGATTGTTCTCAAGTCAATCTTTAGCTTCATAAAATGTGTTTGAT
G

QA 1 779 1 779
DS 

RD RS1GN76JQ 498 0 0
TCTGGTCTTAGGTACACCAATACTGTTTGGAAGACCGGTGTTAAAGTGGACAGAGGAAAG
GAAATGCTTGGAACCTTTAGTCCTCAGTCGGAGCCATACAACCACGTGATGCCTGAAGAG
ACCACTCCTTCTGGCATGTTTGCTCGAGGATCATATTCTGCTAGAACTAAGTTTCTTGAT
GATGATAACAAGTGCTACTTGGAGATCAACTACAGCTTCGACATCCGTAAAGAATGGGCT
GCGGTTTGAAACTCGAGAACAAAGTCTCCTGAGATGAAGTGTTTGTCAGTAGAAGTTATG
TGTTTGTTATTTCACTCCCTATCTCCTTTTT*CTCATCGTTGAACATATTATTTTGAATC
GTTTTTTTTCCTCTTCCGGTTATTATCGTAGAACAAGAGCGACCTTTATTTCCTCTTTGG
TCTTGATTTTCTTTTGTCGAGTAAGAAAGACAGCGATTGTTCTCAAGTCAATTTTTAGCT
TCATAAAATGTGTTTGAT

QA 1 498 1 498
DS 

RD RS1AG03TF 868 0 0
GG
CGACGACGAGGGTGCTGCTGGATCCTTGGGGAGGCAAATGAGCGAAGCCTCTCTTAGCGC
TGCCGAGGAAGAAGAAGACGATGATTCCAAATTACAATTGGGTCCTCAGTACACTATCAA
GGAACATCTCGAGAAGGATAAGGATGATGAGAGTCTGAGGAAGTGGAAAGAACAGCTTCT
CGGAAGTGTTGATGTCACCAACATTGGAGAGACTCTTGACCCTGAAGTGAAGATCATTAG
CTTGGCCATCTTATCCCCCGGAAGACCTGATATCGTTCTTATGGTTCCGGAGAATGGGAA
TCCAAAGGGGATGTGGTTTACTTTGAAAGAAGGGAGCAAGTACAACTTGAAGTTCACGTT
TCATGTTAATAACAACATTGTCTCTGGTCTTAGGTACACCAATACTGTTTGGAAGACCGG
TGTTAAAGTGGACAGAGGAAAGGAAATGCTTGGAACCTTTAGTCCTCAGTCGGAGCCATA
CAACCACGTGATGCCTGAAGAGACCACTCCTTCTGGCATGTTTGCTCGAGGATCATATTC
TGCAAGAACTAAGTTTCTCGATGATGATAACAAGTGCTACTTGGAGATCAACTACAGCTT
CGACATCCGTAAAGAATGGGCTGCGGTTTGAAACTCGAGAACAAAGTCTCCTGAGATGAA
GTGTTTGTCAGTAGAAGTTGTGTGTTTGTTATTTCACTCCCTATCTCCTTTTTTCTCATC
GTTGAACATATTATTGTGAATCGTTTTTTTTCCTCTTCCGGTTATTATCGTAGAACAAGA
GCGACATTTATGTCCTCTTTGGTCTTGATTTT*TTTTGTCGAGTAG**AAGACAGTGATT
GTTCTCAAGTCAATCTTTAGCTTCAT

QA 3 868 3 868
DS 



CO CL26Contig2 1209 8 19 U
GGGACTCTCCACGATCTGTTCACTTTCTCTCTCCTATAACTCGGATCACCACATGACTTC
ACCTCCTCCTCCCTTTCCGTTAACACAGAACCAATCTCCCCAACTCCTCATTGCCTCTTA
TCTCTTCGTTTAGATCCCCCCCAAAAAAGGCAAAGACTTTGATTAATTAATTGATTGATG
TCTTTGGTATCTGGAGCTGTATCGAGTTCCAGAGACATGGGAGGAGACGACGAAAGCACG
TCGAGAACGCGTCATCACAACGATGGCACAGACGACGAGGGTGTTGAATCCTTGGGGAGG
CAGATGAGCGAGTCTTCAATCTGCGCTACAGAGGATGAAGAAGAAGACGACGATTCCAAA
TTGCATTTGGGTCCTCAGTACACTATCAAAGAGCATCTCGAGAAGGATAAAGATGATGAG
AGCTTGAGGAAGTGGAAGGAGCAGCTCCTTGGAAGTGTTGATGCCACCAACATTGGAGAG
ACGCTTGATCCTGAAGTGAAGATCATTAGCCTGGCCATCTTATCCCCTGGAAGACCAGAT
ATTGTACTTATGGTTCCGGAGAATGGGAATCCAAAGGGAATGTGGTTCACTTTGAAAGAA
GGGAGCAAGTACTGTTTGAAATTCACATTTCACGTTAACAACAACATTGTCTCTGGTCTT
AGGTACACCAATACTGTTTGGAAGACCGGTGTTAAAGTGGATAGAACAAAGGAAATGCTT
GGAACCTCCAGTCCTCAGTTGGAGCCATACAACCACGTGATGCCGGAAGAGACCACTCCT
TCTGGCTTGTTCGCTCGAGGATCATATTCTGCTAGAACTAAGTTTCTTGATGATGATAAT
AAGTGCTACTTGGAGATCAACTACAGCTTCGACATCCGTAAAGAATGGCCTGCGGTTTGA
AAACTCGAGAACAAGTTATCATGAGATGATGTGTTGTCAGTAGAAGTTGCGTTCGTTTCA
CTCCTATTGTTTTTTTTTTTTT*GTTATTTCCGATCATCATGGTAGAACAAGAGCGACAT
TTACTTCCTCTTTGATCTTGATTTTTTTGTCCAGTAACTCTCCTTCTGCTTCTTAACATG
TGTTTGATGATATGATTGCGTCATACTCATAATATCCTGAGATGTAAAATGAGTAATTGT
ATCAGTCAAAAGCTGAAGAGATGAAAGTTAAAAAGACAAAATGGATTTGCTTGCAAGAAA
ATGCATACC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 15 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 40 40 15 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1GG34TF U 1
AF RS1GA09TF U 2
AF RS1DR03TF U 175
AF RS1A132TF U 203
AF RS1A132TV U 201
AF RS1A132TR C 399
AF RS1DR03JQ C 656
AF RS1A132JQ C 652
BS 1 425 RS1GG34TF
BS 426 426 RS1DR03TF
BS 427 440 RS1GG34TF
BS 441 441 RS1DR03TF
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BS 464 464 RS1DR03TF
BS 465 482 RS1GG34TF
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BS 904 910 RS1DR03TF
BS 911 982 RS1A132TV
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BS 984 1045 RS1A132TV
BS 1046 1209 RS1A132TR

RD RS1GG34TF 553 0 0
GGGACTCTCCACGATCTGTTCACTTTCTCTCTCCTATAACTCGGATCACCACATGACTTC
ACCTCCTCCTCCCTTTCCGTTAACACAGAACCAATCTCCCCAACTCCTCATTGCCTCTTA
TCTCTTCGTTTAGATCCCCCCCAAAAAAGGCAAAGACTTTGATTAATTAATTGATTGATG
TCTTTGGTATCTGGAGCTGTATCGAGTTCCAGAGACATGGGAGGAGACGACGAAAGCACG
TCGAGAACGCGTCATCACAACGATGGCACAGACGACGAGGGTGTTGAATCCTTGGGGAGG
CAGATGAGCGAGTCTTCAATCTGCGCTACAGAGGATGAAGAAGAAGACGACGATTCCAAA
TTGCATTTGGGTCCTCAGTACACTATCAAAGAGCATCTCGAGAAGGATAAAGATGATGAG
AGCTTAAGGAAGTGGAAGGAACAGCTCCTTGGAAGTGTTGATGTCACCAACATTGGAGAG
ACTCTTGACCCTGAAGTGAAGATCATTAGCCTGGCCATCTTATCCCCTGGAAGACCAGAT
ATTGTACTTATGG

QA 1 553 1 553
DS 

RD RS1GA09TF 573 0 0
GGACTCTCCACGATCTGTTCACTTTCTCTCTCCTATAACTCGGATCACCACATGACTTCA
CCTCCTCCTCCCTTTCCGTTAACACAGAGCCAATCTCCCCAACTCCTCATTGTCTCTTAT
CTCTTCGTTTAGATCCCCCCCAAAAAAGGCAAAGACTTTGATTAATTAATTGATTGATGT
CTTTGGTATCTGGAGCTGTATCGAGTTCCAGAGACATGGGAGGAGACGACGAAAGCACGT
CGAGAACGCGTCATCACAACGATGGCACAGACGACGAGGGTGTTGAATCCTTGGGGAGGC
AGATGAGCGAGTCTTCAATCTGCGCTACAGAGGATGAAGAAGAAGACGACGATTCCAAAT
TGCATTTGGGTCCTCAGTACACTATCAAAGAGCATCTCGAGAAGGATAAAGATGATGAGA
GCTTAAGGAAGTGGAAGGAACAGCTCCTTGGAAGTGTTGATGTCACCAACATTGGAGAGA
CTCTTGACCCTGAAGTGAAGATCATTAGCCTGGCCATCTTATCCCCTGGAAGACCAGATA
TTGTACTTATGGTTCCGGAGAATGGGAATCCAA

QA 1 573 1 573
DS 

RD RS1DR03TF 748 0 0
GG
GATGTCTTTGGTATCTGGAGCTGTATCGAGTTCCAGAGACATGGGAGGAGACGACGAAAG
CACGTCGAGAACGCGTCATCACAACGATGGCACAGACGACGAGGGTGTTGAATCCTTGGG
GAGGCAGATGAGCGAGTCTTCAATCTGCGCTACAGAGGATGAAGAAGAAGACGACGATTC
CAAATTGCATTTGGGTCCTCAGTACACTATCAAAGAGCATCTCGAGAAGGATAAAGATGA
TGAGAGCTTGAGGAAGTGGAAGGAGCAGCTCCTTGGAAGTGTTGATGCCACCAACATTGG
AGAGACGCTTGATCCTGAAGTGAAGATCATTAGCCTGGCCATCTTATCCCCTGGAAGACC
AGATATTGTACTTATGGTTCCGGAGAATGGGAATCCAAAGGGAATGTGGTTCACTTTGAA
AGAAGGGAGCAAGTACTGTTTGAAATTCACATTTCACGTTAACAACAACATTGTCTCTGG
TCTTAGGTACACCAATACTGTTTGGAAGACCGGTGTTAAAGTGGATAGAACAAAGGAAAT
GCTTGGAACCTCCAGTCCTCAGTTGGAGCCATACAACCACGTGATGCCGGAAGAGACCAC
TCCTTCTGGCTTGTTCGCTCGAGGATCATATTCTGCTAGAACTAAGTTTCTTGATGATGA
TAATAAGTGCTACTTGGAGATCAACTACAGCTTCGACATCCGTAAAGAATGGCCTGCGGT
TTGAAA*CTCGAGA
CAGTTATCATGA

QA 3 736 3 736
DS 

RD RS1A132TF 778 0 0
CGAGTTCCAGAGACATGGGAGGAGACGACGAAAGCACGTCGAGAACGCGTCATCACAACG
ATGGCACAGACGACGAGGGTGTTGAATCCTTGGGGAGGCAGATGAGCGAGTCTTCAATCT
GCGCTACAGAGGATGAAGAAGAAGACGACGATTCCAAATTGCATTTGGGTCCTCAGTACA
CTATCAAAGAGCATCTCGAGAAGGATAAAGATGATGAGAGCTTGAGGAAGTGGAAGGAGC
AGCTCCTTGGAAGTGTTGATGCCACCAACATTGGAGAGACGCTTGATCCTGAAGTGAAGA
TCATTAGCCTGGCCATCTTATCCCCTGGAAGACCAGATATTGTACTTATGGTTCCGGAGA
ATGGGAATCCAAAGGGAATGTGGTTCACTTTGAAAGAAGGGAGCAAGTACTGTTTGAAAT
TCACATTTCACGTTAACAACAACATTGTCTCTGGTCTTAGGTACACCAATACTGTTTGGA
AGACCGGTGTTAAAGTGGATAGAACAAAGGAAATGCTTGGAACCTCCAGTCCTCAGTTGG
AGCCATACAACCACGTGATGCCGGAAGAGACCACTCCTTCTGGCTTGTTCGCTCGAGGAT
CATATTCTGCTAGAACTAAGTTTCTTGATGATGATAATAAGTGCTACTTGGAGATCAACT
ACAGCTTCGACATCCGTAAAGAATGGCCTGCGGTTTGAAAACTCGAGAACAAGTTATCAT
GAGATGATGTGTTGTCAGTAGAAGTTGCGTTCGTTTCACTCCTATTGTTTTTTTTTTT

QA 1 778 1 778
DS 

RD RS1A132TV 845 0 0
ATCGAGTTCCAGAGACATGGGAGGAGACGACGAAAGCACGTCGAGAACGCGTCATCACAA
CGATGGCACAGACGACGAGGGTGTTGAATCCTTGGGGAGGCAGATGAGCGAGTCTTCAAT
CTGCGCTACAGAGGATGAAGAAGAAGACGACGATTCCAAATTGCATTTGGGTCCTCAGTA
CACTATCAAAGAGCATCTCGAGAAGGATAAAGATGATGAGAGCTTGAGGAAGTGGAAGGA
GCAGCTCCTTGGAAGTGTTGATGCCACCAACATTGGAGAGACGCTTGATCCTGAAGTGAA
GATCATTAGCCTGGCCATCTTATCCCCTGGAAGACCAGATATTGTACTTATGGTTCCGGA
GAATGGGAATCCAAAGGGAATGTGGTTCACTTTGAAAGAAGGGAGCAAGTACTGTTTGAA
ATTCACATTTCACGTTAACAACAACATTGTCTCTGGTCTTAGGTACACCAATACTGTTTG
GAAGACCGGTGTTAAAGTGGATAGAACAAAGGAAATGCTTGGAACCTCCAGTCCTCAGTT
GGAGCCATACAACCACGTGATGCCGGAAGAGACCACTCCTTCTGGCTTGTTCGCTCGAGG
ATCATATTCTGCTAGAACTAAGTTTCTTGATGATGATAATAAGTGCTACTTGGAGATCAA
CTACAGCTTCGACATCCGTAAAGAATGGCCTGCGGTTTGAAAACTCGAGAACAAGTTATC
ATGAGATGATGTGTTGTCAGTAGAAGTTGCGTTCGTTTCACTCCTATTGTTTTTTTTTTT
TTTGTTATTTCCGATCATCATGGTAGAACAAGAGCGACATTTACTTCCTCTTTGATCTTG
ATTTT

QA 1 845 1 845
DS 

RD RS1A132TR 811 0 0
CGAGAAGGATAAAGATGATGAGAGCTTGAGGAAGTGGAAGGAGCAGCTCCTTGGAAGTGT
TGATGCCACCAACATTGGAGAGACGCTTGATCCTGAAGTGAAGATCATTAGCCTGGCCAT
CTTATCCCCTGGAAGACCAGATATTGTACTTATGGTTCCGGAGAATGGGAATCCAAAGGG
AATGTGGTTCACTTTGAAAGAAGGGAGCAAGTACTGTTTGAAATTCACATTTCACGTTAA
CAACAACATTGTCTCTGGTTTTAGGTACACCAATACTGTTTGGAAGACCGGTGTTAAAGT
GGATAGAACAAAGGAAATGCTTGGAACCTCCAGTCCTCAGTTGGAGCCATACAACCACGT
GATGCCGGAAGAGACCACTCCTTCTGGCTTGTTCGCTCGAGGATCATATTCTGCTAGAAC
TAAGTTTCTTGATGATGATAATAAGTGCTACTTGGAGATCAACTACAGCTTCGACATCCG
TAAAGAATGGCCTGCGGTTTGAAAACTCGAGAACAAGTTATCATGAGATGATGTGTTGTC
AGTAGAAGTTGCGTTCGTTTCACTCCTATTGTTTTTTTTTTTTT*GTTATTTCCGATCAT
CATGGTAGAACAAGAGCGACATTTACTTCCTCTTTGATCTTGATTTTTTTGTCCAGTAAC
TCTCCTTCTGCTTCTTAACATGTGTTTGATGATATGATTGCGTCATACTCATAATATCCT
GAGATGTAAAATGAGTAATTGTATCAGTCAAAAGCTGAAGAGATGAAAGTTAAAAAGACA
AAATGGATTTGCTTGCAAGAAAATGCATACC

QA 1 811 1 811
DS 

RD RS1DR03JQ 554 0 0
GTCTTAGGTACACCAATACTGTTTGGAAGACCGGTGTTAAAGTGGATAGAACAAAGGAAA
TGCTTGGAACCTCCAGTCCTCAGTTGGAGCCATACAACCACGTGATGCCGGAAGAGACCA
CTCCTTCTGGCTTGTTCGCTCGAGGATCATATTCTGCTAGAACTAAGTTTTTTGATGATG
ATAATAAGTGCTACTTGGAGATCAACTACAGCTTCGACATCCGTAAAGAATGGCCTGCGG
TTTGAAAACTCGAGAACAAGTTATCATGAGATGATGTGTTGTCAGTAGAAGTTGCGTTCG
TTTCACTCCTATTGTTTTTTTTTTTTT*GTTATTTCCGATCATCATGGTAGAACAAGAGC
GACATTTACTTCCTCTTTGATCTTGATTTTTTTGTCCAGTAACTCTCCTTCTGCTTCTTA
ACATGTGTTTGATGATATGATTGCGTCATACTCATAATATCCTGAGATGTAAAATGAGTA
ATTGTATCAGTCAAAAGCTGAAGAGATGAAAGTTAAAAAGACAAAATGGATTTGCTTGCA
AGAAAATGCATACC

QA 1 554 1 554
DS 

RD RS1A132JQ 558 0 0
TCTGGTTTTAGGTACACCAATACTGTTTGGAAGACCGGTGTTAAAGTGGATAGAACAAAG
GAAATGCTTGGAACCTCCAGTCCTCAGTTGGAGCCATACAACCACGTGATGCCGGAAGAG
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GATGATAATAAGTGCTACTTGGAGATCAACTACAGCTTCGACATCCGTAAAGAATGGCCT
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AGTAATTGTATCAGTCAAAAGCTGAAGAGATGAAAGTTAAAAAGACAAAATGGATTTGCT
TGCAAGAAAATGCATACC

QA 1 558 1 558
DS 



AS 2 19

CO CL27Contig1 942 4 19 U
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TCTTGATATTTTTGAATCTTGAATTGTATCTTCGTGAAAGGAATGTTGAATTTCAAAAAA
CCACTGACTTATTTGAAACCTTGTTATGGAGTCTAGAAAGTGGCTGTTCCCCGATTAACT
TAATACCTAAGAACTTACTAAAATTTTTAACTTTTTCTCCTATAGGTATACCTATACAAA
AATATGTCGAATCCTTTCAGAAGCACGACCTAAAATAAAAAAAATCTTTAGTATCTAAAC
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TCTTTAATTTCATTTGGGGTAAAACATTCTAAACTTTTTTTAGCAGGGGTGGTATTACAC
AACCCCCCTTTTTTTTTTCACAAATGGTAAGTTCCGGATATCCAATTTTGATATTAGAAG
GATTACCATATATAACACAAAATTTCTCCGCCGATTCTTTTTAGTCGAGCTTCTCGATCT
GTCATTATACCTTGAGAAGTCGAAAGGATTACAATTCCTATTCCGCCTAAAATTCGTGGA
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TGATTGTTTTCGCGATGTTTCCTTACGTTTTCGATAAAACCCTCTCGTAAAAGTATTTTA
ACAATGCTTTCGGTGATGTTAGTCGATCCTATCCGAACTGTC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CP44JQ U 15
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AF RS1C759JQ U 6
AF RS1C759TF C 189
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TC
C*TTGTATTTGTTTATGCCTCGGGTTGGAACAAATTACTATAATTCGTCCCCTCCTACGG
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QA 3 579 3 579
DS 

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AATATGTCGAATCCTTTCAGAAGCATGACCTAAAATAAAAAAAATCTTTAGTATCTAAAC
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TCTTTAATTTCATTTGGGGTAAAACATTCTAAACTTTTTTTAGCAGGGGTGGTATTACAC
AACCCCCCTTTTTTTTTTCACAAATGGTAAGTTCCGGATATCCAATTTTGATATTAGAAG
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ATTCGTT
C

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1C759JQ 772 0 0
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QA 1 772 1 772
DS 

RD RS1C759TF 754 0 0
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TTATTTGAAAC*TTGTTATGGAGTCTAGAAAGTGGCTGTTCCCCGATTAACTTAATACCT
AAGAACTTACTAAAATTTTTAACTTTTTCTCCTATAGGTATACCTATACAAAAATATGTC
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TTCATTTGGGGTAAAACATTCTAAACTTTTTTTAGCAGGGGTGGTATTACACAACCCCCC
TTTTTTTTT*CACAAATGGTAAGTTCCGGATATCCAATTTTGATATTAGAAGGATTACCA
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ACCTTGAGAAGTCGAAAGGATTACAATTCCTATTCCGCCTAAAATTCGTGGAATTCGTTG
AGAGTTAGAATAGATTCGTAGACCCGGTCGGCTTATTCTCTTTAAATTTAAAATAGTTTT
ATAGGATTCTTTCTTATTTCGTCTATGTCTTAGGGTTAAAATCAAAAAATATTGATTGTT
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TTCGGTGATGTTAGTCGATCCTATCCGAACTGTC

QA 1 754 1 754
DS 



CO CL27Contig2 1667 15 21 U
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TATAGATTCTGGGAGGCAATTCTAATTGGTCAATAAAAATATATTGAAATCCTAGTTCTT
TTTTTTTTTTTTCTTAGGTTAACTAATCTATTATGAAAAGGAAAAAGGGGTAAAGTAACT
TGATGTTGATTGTTCTCTAAATAGAACGTTTCTTCTTCTACATGTAGAAAAGGAATAAAT
AAATTAATCAAATTCCGGGAGGCTTCATGAAGTGCTTCTTTAGGAGTTAAACTTCCATTT
GTCCATATTTCTAGAAAAAGAATCTCTTGTTTTTCATTCCCATTCCCATAAGAATGAATA
CTATGATTCGCATTTTGAACAGGCATGAATACAGCATCTATAGGATAACTTCGGTCTTCA
AAGTTATTTGACATTTTTAGACTATATCCGCGATTCCTCTCGATTTTTAATCCAATACAC
AAATTTATTGGTTCCGTTAAGGTAGCTATATGCTGTGTATTATCAACGATTTCCACAGAG
GGCGGTAAAACTATGTCTCGAGCAGTTATATATCCGGGACCTTGGACACAAATAAGCGCG
TTGCGCGTTCCATATAGATTACTTTTTAATACAATCTCGTTCAAATTCATTAAAA*TTTC
ATGTACTGATTCTTGAATACCGACTATGTTAGAATAGTCATGTGGTATGTTCTCAAATTT
TGCACGTGTAATACATGTTCCTTCTATTTCGCCAAGTAAAGCTCTTCGCATCGCAATGCC
TATTGTGTCGGCTTGACCTTTCATAAGTGGAGACAGAATAAAGCGTCCATAATAAAGACG
CTTACTGTCTCTTCTTGATTCAACACACTTCCACTGTAGTGTCCGAGTAGATACTTTGAC
TTTCTCTCGAACCATAGTAATTTTATTTGATCAGATCATTGAATCATTTATTTCTCATGA
AACCCTTTCAGCCTTTATTTAGTTCTATACACGTCGTTTTTTAGGGGGTCTACAACCATT
ATGTGGCATAGGGGTTACATCTCGTACGAAACTTAAAAGTATACCGCTTCTACGAATAGC
TCGTAATGCTGCATCTCTTCCCAGTCCAGGGCCTTTTATCCTTACTTCAGCTCGTTGCAT
ACCTTGATCCACTACCGCTCGAATAGCATTTCCTGCTGCGGTTTGAGCAGCAAAAGGTGT
TCCTCTTCTTGTACCCCTGAATCCACAAGTACCCGCGGAGGACCAAGAAATCACCCGACC
CCGTACATCTGTAACGGTCACAATGGTATTGTTGAAACTTGCTTGAACATGAATAACTCC
CTTTGGTATTCTACGTACATTTTTACGTGAACCACTACGGGTATTTTTACGTGAACCAAT
TCTTAATATAGGTTTTGCCATATTTTTTCATTTCACAAGAAATATATGGATATATCCATT
TCATGTCAAAACGGACCTTTTTTTTTGACTAGCTCCCTGGAAGTGCCTTTTCCTTTAGTA
AGATTATCCTTGTCTTTGTTTATGCCTCGGGTTGGAACAAATTACTATAATTCGTCCCCT
CCTACGGATTAGCCGACACTTTTCACAAATTTTACGAACGGAAGCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 35 65 65 70 70 70 35 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 35 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
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70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
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75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
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CTAGAGCAGTTATATATCCGGGACCTTGGACACAAATAAGCGCGTTGCGCGTTCCATATA
GATTACTTTTTAATACAATCTCGTTCAAATTCATTAAAA*TTTCATGTACTGATTCTTGA
ATACCGACTATGTTAGAATAGTCATGTGGTATGTTCTCAAATTTTGCACGTGTAATACAT
GTTCCTTCTATTTCGCCAAGTAAAGCTCTTCGCATCGCAATGCCTATTGTGTCGGCTTGA
CCTTTCATAAGTGGAGACAGAATAAAGCGTCCATAATAAAGACGCTTACTGTCTCTTCTT
GATTCAACACACTTCCACTGTAGTGTCCGAGTAGATACTTTGACTTTCTCTCGAACCATA
GTAATTTTATTTGATCAGATCATTGAATCATTTATTTCTCTTGAAA

QA 2 827 2 827
DS 

RD RS1A443TF 909 0 0
CA
TTTTAGACTATATCCGCGAT*CCTCTCGATTTT*AATCCAATACACAAATTTATTGGT*C
CGTTAAGGTAGCTATATGCTGTGTATTATCAACGATTTCCACAGAGGGCGGTAAAACTAT
GTCTCGAGCAGTTATATATCCGGGAC*TTGGACACAAATAAGCGCGTTGCGCGTTCCATA
TAGATTACTTTTTAATACAATCTCGTTCAAATTAATTAAAA*TTTCATGTACTGATTCTT
GAATACCGACTATGTTAGAATAGTCATGTGGTATGTTCTCAAATTTTGCACGTGTAATAC
ATGTTCCTTCTATTTCGCCAAGTAAAGCTCTTCGCATCGCAATGCCTATTGTGTCGGCTT
GACCTTTCATAAGTGGAGACAGAATAAAGCGTCCATAATAAAGACGCTTACTGTCTCTTC
TTGATTCAACACACTTCCACTGTAGTGTCCGAGTAGATACTTTGACTTTCTCTCGAACCA
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TTATTTAGTTCTATACACGTCGTTTTTTAGGGGGTCTACAACCATTATGTGGCATAGGGG
TTACATCTCGTACGAAACTTAAAAGTATACCGCTTCTACGAATAGCTCGTAATGCTGCAT
CTCTTCCCAGTCCAGGGCCTTTTATCCTTACTTCAGCTCGTTGCATACCTTGATCCACTA
CCGCTCGAATAGCATTTCCTGCTGCGGTTTGAGCAGCAAAAGGTGTTCCTCTTCTTGTAC
CCCTGAATCCACAAGTACCCGCGGAGGACCAAGAAATCACCCGACCCCGTACATCTGTAA
CGGTCACAATGGTATTGTTGAAACTTGCTTGAACATGAATAACTCCCTTTGGTATTCTAC
GTACAT
C

QA 3 908 3 908
DS 

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TACTGTCTCTTCTTGATTCAACACACTTCCACTGTAGTGTCCGAGTAGATACTTTGACTT
TCTCTCGAACCATAGTAATTTTATTTGATCAGATCATTGAATCATTTATTTCTCATGAAA
CCCTTTCAGCCTTTATTTAGTTCTATACACGTCGTTTTTTAGGGGGTCTACAACCATTAT
GTGGCATAGGGGTTACATCTCGTACGAAACTTAAAAGTATACCGCTTCTACGAATAGCTC
GTAATGCTGCATCTCTTCCCAGTCCAGGGCCTTTTATCCTTACTTCAGCTCGTTGCATAC
CTTGATCCACTACCGCTCGAATAGCATTTCCTGCTGCGGTTTGAGCAGCAAAAGGTGTTC
CTCTTCTTGTACCCCTGAATCCACAAGTACCCGCGGAGGACCAAGAAATCACCCGACCCC
GTACATCTGTAACGGTCACAATGGTATTGTTGAAACTTGCTTGAACATGAATAACTCCCT
TTGGTATTCTACGTACAT
C

QA 1 558 1 558
DS 

RD RS1G471TF 611 0 0
TTTTTTAGGGGGTCTACAACCATTATGTGGCATAGGGGTTACATCTCGTACGAAACTTAA
AAGTATACCGCTTCTACGAATAGCTCGTAATGCTGCATCTCTTCCCAGTCCAAGGCCTTT
TATCCTTACTTCAGCTCGTTGCATACCTTGATCCACTACCGCTCGAATAGCATTTCCTGC
TGCGGTTTGAGCAGCAAAAGGTGTTCCTCTTCTTGTACCCCTGAATCCACAAGTACCCGC
GGAGGACAAAGAAATTACCCGACCCCGTACATCTGTAACGGTCACAATGGTATTGTTGAA
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ACGGGTATTTTTACGTGAACCAATTCTTAATATAGGTTTTGCCATATTTTTTCATTTCAC
AAGAAATATATGGATATATCCATTTCATGTCAAAACGGACCTTTTTTTTTGACTAGCTCC
CTGGAAGTGCCTTTTCCTTTAGTAAGATTATCCTTGTCTTTGTTTATGCCTCGGGTTGGA
ACAAATTACTATAATTCGTCCCCTCCTACGGATTAGCCGACACTTTTCACAAATTTTACG
AACGGAAGCCC

QA 1 611 1 611
DS 



AS 4 16

CO CL28Contig1 1133 8 33 U
GGATTCACAGAGCTTAACAAAAAAACGTCTCATCTAAAATCAAACCCAGAAGAAAATCAA
AAGACGAGTGAAGAAAGATGGGGAACTTGTTGTGCTGTGTACAAGTGGACCAGTCAACGG
TGGCGATAAAAGAAACGTTTGGGAA*GTTCGAAGATGTTCTAGAGCCTGGTTGCCATTTT
CTCCCATGGTGTCTTGGTCAGCAAGTCGCTGGTTACCTCTCTCTCAGGCTTCAGCAGTTG
GATGTTCGTTGCGAGACTAAGACCAAGGACAATGTGTTTGTTAATGTTGTTGCATCGATT
CAGTACCGTGCCTTGGCTAATAATGCCAATGATGCCTTCTACAAGCTTAGTAACACTAGG
AGCCAGATCCAAGCTTACGTCTTTGATGTTATCAGAGCAAGTGTCCCCAAGCTGATTCTG
GATGATGTCTTTGAGCAGAAGAATGAAATTGCCAAAGCTGTTGAAGAGGAGCTCGAGAAG
GCAATGTCTGCTTACGGTTTTGAGATTGTCCAAACTCTCATCGTTGACATCGAGCCTGAC
GAACATGTCAAACGAGCCATGAACGAAATCAACGCTGCTGCGAGGATGAGGTTGGCTGCG
AACGAAAAGGCAGAGGCTGAGAAAATCCTCCAGATCAAGCGAGCTGAAGGTGAAGCCGAG
GCCAAGTACCTATCTGGTCTTGGTATCGCCCGTCAGAGGCAAGCCATTGTCGACGGCCTA
CGCGACAGCGTCCTTGGTTTCTCTGTGAATGTTCCCGGGACAACTGCTAAAGATGTGATG
GACATGGTGCTCGTTACGCAGTACTTTGACACGATGAAGGAGATTGGCGCCAGTTCCAAA
TCCTCTGCTGTCTTCATTCCACACGGACCAGGAGCTGTACGCGATGTGGCTACTCAGATC
AGAGATGGGCTCCTTCAAGGCTCCTTTGCAGACCAGTCTTGAAATATAGATAATGGACTG
ATATCATTATATGTACTCTACTAAGCTTGCTGTGTGTTAAGACTTATGATCTCGTGTTGA
GAAACTCTCATGCTTTAGGTTTCTATATTTTTCGTTATTGTATTCCACGTATTTGGAGTG
TGCAACCAAAAAATCGTAATTAATCAAATAATGTATATGTTGATCATGTTCAA


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 25 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 
50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FJ66TF U 4
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AF RS1CC43TF U 1
AF RS1GN42TF U 3
AF RS1CQ60TF U 1
AF RS1DP13TF U 91
AF RS1DP13JQ C 318
AF RS1AQ45JQ C 236
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RD RS1FJ66TF 652 0 0
GACAGAGCTTAACAA
AAAAAAACGTCTCATCTAAAATCAAACCCAGAAGAAAATCAAAAGACGAGTGAAGAAAGA
TGGGGAACTTGTTGTGCTGTGTACAAGTGGACCAGTCAACGGTGGCGATCAAAGAAACGT
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AATAATGCCAATGATGCCTTCTACAAGCTTAGTAACACTAGGAGCCAGATCCAAGCTTAC
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ATGAACGAAATCAACGCTGCTGCGAGGATGAGGTTGGCTGCGAACAAAAAGGCAGAGGCT
GAGAAAATCCTCCAGATCAAGCGAGCTGAAG
TGAAGC

QA 16 646 16 646
DS 

RD RS1E993TF 619 0 0
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GGCGATAAAAGAAACGTTTGGGAA*GTTCGAAGATGTTCTAGAGCCTGGTTGCCATTTTC
TCCCATGGTGTCTTGGTCAGCAAGTCGCTGGTTACCTCTCTCTCAGGCTTCAGCAGTTGG
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AGTACCGTGCCTTGGCTAATAATGCCAATGATGCCTTCTACAAACTCAGTAACACTAGGA
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AACATGTCAAACGAGCCATGAACGAAATCAACGCTGCTGCAAGGATGAGGTTGGCTGCAA
ACGAAAAGGCAGAG
CTGAG

QA 1 614 1 614
DS 

RD RS1CC43TF 699 0 0
GGATTCACAGAGCTTAACAAAAAAACGTCTCATCTAAAATCAAACCCAGAAGAAA*TCAA
AAGACGAGTGAAGAAAGATGGGGAACTTGTTGTGCTGTGTACAAGTGGACCAGTCAACGG
TGGCGATAAAAGAAACGTTTGGGAA*GTTCGAAGATGTTCTAGAGCCTGGTTGCCATTTT
CTCCCATGGTGTCTTGGTCAGCAAGTCGCTGGTTACCTCTCTCTCAGGCTTCAGCAGTTG
GATGTTCGCTGCGAGACTAAGACCAAGGACAATGTGTTTGTTAATGTTGTTGCATCGATT
CAGTACCGTGCCTTGGCTAATAATGCCAATGATGCCTTCTACAAACTCAGTAACACTAGG
AGCCAGATCCAAGCTTACGTCTTTGATGTTATCAGAGCAAGTGTCCCCAAGCTGATTCTG
GATGATGTCTTTGAGCAGAAGAATGAAATTGCCAAAGCTGTTGAAGAGGAGCTCGAGAAG
GCAATGTCTGCTTACGGTTTTGAGATTGTCCAAACTCTCATCGTTGACATCGAGCCTGAC
GAACATGTCAAACGAGCCATGAACGAAATCAACGCTGCTGCAAGGATGAGGTTGGCTGCA
AACGAAAAGGCAGAGGCTGAGAAAATCCTCCAGATCAAGCGAGCTGAAG*TGAAGCCGAG
*CCAAGTACCTGTCTGGTCTAG*TATCGCCCGC
AGAGCA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RS1GN42TF 678 0 0
GGACAGAGCTTAACAA
AAAAAAACGTCTCATCTAAAATCAAACCCAGAAGAAAATCAAAAGACGAGTGAAGAAAGA
TGGGGAACTTGTTGTGCTGTGTACAAGTGGACCAGTCAACGGTGGCGATCAAAGAAACGT
TTGGGAAAGTTCGAAGATGTTCTAGAGCCTGGTTGCCATTTTCTCCCTTGGTGTCTTGGT
CAGCAAGTTGCTGGTTACCTCTCCCTCAGGCTTCAGCAGTTGGATGTTCGTTGCGAGACT
AAGACCAAGGACAATGTGTTTGTTAATGTTGTTGCATCGATTCAGTACCGTGCCTTGGCT
AATAATGCCAATGATGCCTTCTACAAGCTTAGTAACACTAGGAGCCAGATCCAAGCTTAC
GTCTTTGATGTTATCAGAGCAAGTGTCCCCAAGCTGATTCTGGATGATGTCTT*GAGCAG
AAGAATGAAATTGCCAAAGCTGTTGAAGAGGAGCTCGAGAAGGCAATGTCTGCTTACGGT
TTTGAGATCGTCCAAACTCTCATCGTTGACATCGAGCCTGACGAACATGTCAAACGAGCC
ATGAACGAAATCAACGCTGCTGCGAGGATGAGGTTGGCTGCGAACGAAAAGGCAGAGGCT
GAGAAAATCCTCCAGATCAAGCGAGCTGAAAGTGAAGCCGAG*CCAAGTACCT
CTCCCGTCT

QA 17 669 17 669
DS 

RD RS1CQ60TF 778 0 0
G
GATTCACAGAGCTTAACAAAAAAACGTCTCATCTAAAATCAAACCCAGAAGAAAATCAAA
AGACGAGTGAAGAAAGATGGGGAACTTGTTGTGCTGTGTACAAGTGGACCAGTCAACGGT
GGCGATAAATGAAACGTTTGGGAA*GTTCGAAGATGTTCTAGAGCCTGGTTGCCATTTTC
TCCCATGGTGTCTTGGTCAGCAAGTCGCTGGTTACCTCTCTCTCAGGCTTCAGCAGTTGG
ATGTTCGCTGCGAGACTAAGACCAAGGACAATGTGTTTGTTAATGTTGTTGCATCGATTC
AGTACCGTGCCTTGGCTAATAATGCCAATGATGCCTTCTACAAACTCAGTAACACTAGGA
GCCAGATCCAAGCTTACGTCTTTGATGTTATCAGAGCAAGTGTCCCCAAGCTGATTCTGG
ATGATGTCTTTGAGCAGAAGAATGAAATTGCCAAAGCTGTTGAAGAGGAGCTCGAGAAGG
CAACGTCTGCTTACGGTTTTGAGATTGTCCAAACTCTCATCGTTGACATCGAGCCTGACG
AACATGTCAAACGAGCCATGAACGAAATCAACGCTGCTGCAAGGATGAGGTTGGCTGCAA
ACGAAAAGGCAGAGGCTGAGAAAATCCTCCAGATCAAGCGAGCTGAAGGTGAAGCCGAGG
CCAAGTACCTGTCTGGTCTAGGTATCGCCCGCCAGAGGCAAGCCATTGTCGACGGGCTAC
GCGACAGTGTCCTTGGTTTCTCTGTGAATGTTCCCGGGACAACTGCTAAAGATGTGA

QA 2 778 2 778
DS 

RD RS1DP13TF 789 0 0
GT
TGCTGTGTACAAGTGGACCAATCAACGGTGGCGATCAAAGAAACGTTTGGGAA*GTTCGA
AGATGTTCTAGAGCCTGGTTGCCATTTTCTCCCATGGTGTCTTGGTCAGCAAGTTGCTGG
TTACCTCTCTCTAAGGCTTCAGCAGTTGGATGTTCGTTGCGAGACTAAGACAAAGGACAA
TGT*TTTGTTAACGTTGTTGCATCGATTCAGTACCGTGCCTTGGCTAATAATGCCAATGA
TGCCTTCTACAAGCTTAGTAACACTAGGAGCCAGATCCAAGCTTACGTCTTTGATGTTAT
CAGAGCAAGTGTCCCCAAGCTGATTCTGGATGATGTCTTTGAACAGAAGAATGAAATTGC
CAAAGCTGTTGAAGAGGAGCTCGAGAAGGCAATGTCTGCTTACGGTTTTGAGATTGTCCA
AACTCTCATTGTTGACATCGAGCCTGACGAACATGTCAAAC*AGCCATGAACGAAATCAA
CGCTGCTGCGAGGATGAGGTTGGCTGCGAACGAAAAGGCAGAGGCTGAGAAAATCCTCCA
GATCAAGCGAGCTGAAGGTGAAGCCGAGGCCAAGTACCTATCTGGTCTTGGTATCGCCCG
TCAGAGGCAAGCCATTGTCGACGGCCTACGCGACAGCGTCCTTGGTTTCTCTGTGAATGT
TCCCGGGACAACTGCTAAAGATGTGATGGACATGGTGCTCGTTACGCAGTACTTTGACAC
GATGAAAGAGATTGGCGCCAGTTCCAAATCCTCTGCTGTCTTCATTCCACACGGACCAGG
AGCTGTA

QA 3 789 3 789
DS 

RD RS1DP13JQ 753 0 0
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CGTCTTTGATGTTATCAGAGCAAGTGTCCCCAAGCTGATTCTGGATGATGTCTTTGAACA
GAAGAATGAAATTGCCAAAGCTGTTGAAGAGGAGCTCGAGAAGGCAATGTCTGCTTACGG
TTTTGAGATTGTCCAAACTCTCATTGTTGACATCGAGCCTGACGAACATGTCAAAC*AGC
CATGAACGAAATCAACGCTGCTGCGAGGATGAGGTTGGCTGCGAACGAAAAGGCAGAGGC
TGAGAAAATCCTCCAGATCAAGCGAGCTGAAGGTGAAGCCGAGGCCAAGTACCTATCTGG
TCTTGGTATCGCCCGTCAGAGGCAAGCCATTGTCGACGGCCTACGCGACAGCGTCCTTGG
TTTCTCTGTGAATGTTCCCGGGACAACTGCTAAAGATGTGATGGACATGGTGCTCGTTAC
GCAGTACTTTGACACGATGAAGGAGATTGGCGCCAGTTCCAAATCCTCTGCTGTCTTCAT
TCCACACGGACCAGGAGCTGTACGCGATGTGGCTACTCAGATCAGAGATGGGCTCCTTCA
AGGCTCCTTTGCAGACCAGTCTTGAAATATAGATAATGGACTGATATCATTATATGTTCT
CTACTAAGCTTGCTGTGTGTTAAGACTTATGATCTCGTGTTGAGAAACTCTCATGCTTTA
GGTTTCTATATTTTTCGTTATTGTATTCCACGT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1AQ45JQ 898 0 0
CAG
TGGATGTTCGTTGCGAGACTAGGACAAAGGACAATGTGTT*GTTAACGTTGTTGCATCGA
TTCAGTACCGTGC*TTGGCTAATAATGCCAATGATGCGTTCTACAAGCTTAGTAACACTA
GGAGCCAGATCCAAGCTTACGTCTTTGATGTTATCAGAGCAAGTGTCCCCAAGCTGATTC
TGGATGATGTCTTTGAACAGAAGAATGAAATTGCCAAAGCTGTTGAAGAGGAGCTCGAGA
AGGCAATGTCTGCTTACGGTTTTGAGATTGTCCAAACTCTCATTGTTGACATCGAGCCTG
ACGAACATGTCAAACGAGCCATGAACGAAATCAACGCTGCTGCGAGGATGAGGTTGGCTG
CGAACGAAAAGGCAGAGGCTGAGAAAATCCTCCAGATCAAGCGAGCTGAAGGTGAAGCCG
AGGCCAAGTACCTATCTGGTCTTGGTATCGCCCGTCAGAGGCAAGCCATTGTCGACGGCC
TACGCGACAGCGTCCTTGGTTTCTCTGTGAATGTTCCCGGGACAACTGCTAAAGATGTGA
TGGACATGGTGCTCGTTACGCAGTACTTTGACACGATGAAGGAGATTGGCGCCAGTTCCA
AATCCTCTGCTGTCTTCATTCCACACGGACCAGGAGCTGTACGCGATGTGGCTACTCAGA
TCAGAGATGGGCTCCTTCAAGGCTCCTTTGCAGACCAGTCTTGAAATATAGATAATGGAC
TGATATCATTATATGTACTCTACTAAGCTTGCTGTGTGTTAAGACTTATGATCTCGTGTT
GAGAAACTCTCATGCTTTAGGTTTCTATATTTTTCGTTATTGTATTCCACGTATTTGGAG
TGTGCAACCAAAAAATCGTAATTAATCAAATAATGTATATGTTGATCATGTTCAA

QA 4 898 4 898
DS 



CO CL28Contig2 1134 3 10 U
GGACATGATCAAAATATAGATTATTTGATTAATTACGATTTTTTGGTTGCACACTCCAAA
TACGTGGAAATATAGAAACCTAAAGCATGAGAGTTTCTCAGCACAAGATCATAGGATCTT
AACACACAGCAAGCTTAGTAGAGAACATATAATGATCAGTCCATTATCTATATTTCAGGA
CTGGTCTGCAAAGGAGCCTTGAAGGAGCCCATCTCTGATCTGAGTAGCCACATCGCGTAC
AGCTCCTGGTCCGTGGGGAATGAAGACAGCAGAGGATTTGGAACTGGCACCAATCTCCTT
CATCGTGTCGAAGTACTGCGTAACGAGCACCATGTCCATCACATCTTTAGCAGTTGTCCC
GGGAACATTCACAGAGAAACCAAGGACACTGTCGCGTAGCCCGTCGACAATGGCTTGCCT
CTGGCGGGCGATACCTAGACCAGACAGGTACCTGGCCTCGGCTTCACCTTCAGCTCGCTT
GATCTGGAGGATTTTCTCAGCCTCTGCCTTTTCGTTTGCAGCCAACCTCATCCTTGCAGC
AGCGTTGATTTCGTTCATGGCTCGTTTGACATGTTCGTCAGGCTCGATGTCAACGATGAG
AGTTTGGACAATCTCAAAACCGTAAGCAGACATTGCCTTCTCGAGCTCCTCTTCAACAGC
TTTGGCAATTTCATTCTTCTGCTCAAAGACATCATCCAGAATCAGCTTGGGGACACTTGC
TCTGATAACATCAAAGACGTAAGCTTGGATCTGGCTCCTAGTGTTACTGAGTTTGTAGAA
GGCATCATTGGCATTATTAGCCAAGGCACGGTACTGAATCGATGCAACAACGTTAACAAA
CACATTGTCCTTTGTCCTAGTCTCGCAACGAACATCCAACTGCTGAAGCCTTAGAGAGAG
GTAACCAGCAACTTGCTGACCAAGACACCATGGGAGAAAATGGCAACCAGGCTCTAGAAC
ATCTTCGAACTTCCCAAACGTTTCTTTGATCGCCACCGTTGATTGGTCCACTTGTACACA
GCACAATAAATTCCCCATCTTTCTTCACGGATTCTCGAAAGTTGTCGTCTTTTTGATTTG
CAGATTTGGTGGGTTCGATTTCGATGAAACGTTTTTGTGTAGCTCTGTGAATCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CQ60JQ U 1
AF RS1E993JQ U 1
AF RS1AQ45TFB C 510
BS 1 147 RS1CQ60JQ
BS 148 148 RS1E993JQ
BS 149 150 RS1CQ60JQ
BS 151 151 RS1E993JQ
BS 152 451 RS1CQ60JQ
BS 452 452 RS1E993JQ
BS 453 631 RS1CQ60JQ
BS 632 632 RS1E993JQ
BS 633 775 RS1CQ60JQ
BS 776 1134 RS1AQ45TFB

RD RS1CQ60JQ 775 0 0
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TACGTGGAAATATAGAAACCTAAAGCATGAGAGTTTCTCAGCACAAGATCATAGGATCTT
AACACACAGCAAGCTTAGTAGAGAACA*ATGATGATCAGTCCATTATCTATATTTCAGGA
CTGGTCTGCAAAGGAGCCTTGAAGGAGCCCATCTCTGATCTGAGTAGCCACATCGCGTAC
AGCTCCTGGTCCGTGGGGAATGAAGACAGCAGAGGATTTGGAACTGGCACCAATCTCCTT
CATCGTGTCGAAGTACTGCGTAACGAGCACCATGTCCATCACATCTTTAGCAGTTGTCCC
GGGAACATTCACAGAGAAACCAAGGACACTGTCGCGTAGCCCGTCGACAATGGCTTGCCT
CTGGCGGGCGATACCTAGACCAGACAGGTACTTGGCCTCGGCTTCACCTTCAGCTCGCTT
GATCTGGAGGATTTTCTCAGCCTCTGCCTTTTCGTTTGCAGCCAACCTCATCCTTGCAGC
AGCGTTGATTTCGTTCATGGCTCGTTTGACATGTTCGTCAGGCTCGATGTCAACGATGAG
AGTTTGGACAATCTCAAAACCGTAAGCAGACGTTGCCTTCTCGAGCTCCTCTTCAACAGC
TTTGGCAATTTCATTCTTCTGCTCAAAGACATCATCCAGAATCAGCTTGGGGACACTTGC
TCTGATAACATCAAAGACGTAAGCTTGGATCTGGCTCCTAGTGTTACTGAGTTTG

QA 1 775 1 775
DS 

RD RS1E993JQ 775 0 0
GC
ACATGATCAACATATAGATTATTTGATTAATTACGATTTTTTGGTTGCACACTCCAAATA
CGTGGAAATATAGAAACCTAAAGCATGAGAGTTTCTCAGCACAAGATCATAGGATCTTAA
CACACAGCAAGCTTAGTAGAGAACATATAATGATCAGTCCATTATCTATATTTCAGGACT
GGTCTGCAAAGGAGCCTTGAAGGAGCCCATCTCTGATCTGAGTAGCCACATCGCGTACAG
CTCCTGGTCCGTGGGGAATGAAGACAGCAGAGGATTTGGAACTGGCACCAATCTCCTTCA
TCGTGTCGAAGTACTGCGTAACGAGCACCATGTCCATCACATCTTTAGCAGTTGTCCCGG
GAACATTCACAGAGAAACCAAGGACGCTGTCGCGTAGCCCGTCGACAATGGCTTGCCTCT
GGCGGGCGATACCTAGACCAGACAGGTACCTGGCCTCGGCTTCACCTTCAGCTCGCTTGA
TCTGGAGGATTTTCTCAGCCTCTGCCTTTTCGTTTGCAGCCAACCTCATCCTTGCAGCAG
CGTTGATTTCGTTCATGGCTCGTTTGACATGTTCGTCAGGCTCGATGTCAACGATGAGAG
TTTGGACAATCTCAAAACCGTAAGCAGACATTGCCTTCTCGAGCTCCTCTTCAACAGCTT
TGGCAATTTCATTCTTCTGCTCAAAGACATCATCCAGAATCAGCTTGGGGACACTTGCTC
TGATAACATCAAAGACGTAAGCTTGGATCTGGCTCCTAGTGTTACTGAGTTTG

QA 3 775 3 775
DS 

RD RS1AQ45TFB 625 0 0
TTTCGTTCGCAGCCAAC*TCATCCTCGCAGCAGCGTTGATTTCGTTCATGGCTCGTTTGA
CATGTTCGTCAGGCTCGATGTCAACAATGAGAGTTTGGACAATCTCAAAACCGTAAGCAG
ACATTGCCTTCTCGAGCTCCTCTTCAACAGCTTTGGCAATTTCATTCTTCTGTTCAAAGA
CATCATCCAGAATCAGCTTGGGGACACTTGCTCTGATAACATCAAAGACGTAAGCTTGGA
TCTGGCTCCTAGTGTTACTAAGCTTGTAGAAGGCATCATTGGCATTATTAGCCAAGGCAC
GGTACTGAATCGATGCAACAACGTTAACAAACACATTGTCCTTTGTCCTAGTCTCGCAAC
GAACATCCAACTGCTGAAGCCTTAGAGAGAGGTAACCAGCAACTTGCTGACCAAGACACC
ATGGGAGAAAATGGCAACCAGGCTCTAGAACATCTTCGAACTTCCCAAACGTTTCTTTGA
TCGCCACCGTTGATTGGTCCACTTGTACACAGCACAATAAATTCCCCATCTTTCTTCACG
GATTCTCGAAAGTTGTCGTCTTTTTGATTTGCAGATTTGGTGGGTTCGATTTCGATGAAA
CGTTTTTGTGTAGCTCTGTGAATCC

QA 1 625 1 625
DS 



CO CL28Contig3 843 3 4 U
AGATTATTTGATTAATTACGATTTTTTGGTTGCACACTCCAAATACGTGGAAATATAGAA
ACCTAAAGCATGAGAGTTTCTCAGCACAAGATCATAGGATCTTAACACACAGCAAGCTTA
GTAAAGAACATATAATGATCAGTCCATTATCTATATTTCAGGACTGGTCTGCAAAGGAGC
CTTGAAGGAGCCCATCTCTGATCTGAGTAGCCACATCGCGTACAGCTCCTGGTCCGTGGG
GAATGAAGACAGCAGAGGATTTGGAACTGGCACCAATCTCCTTCATCGTGTCGAAGTACT
GCGTAACGAGCACCATGTCCATCACATCTTTAGCAGTTGTCCCGGGAACATTCACAGAGA
AACCAAGGACGCTGTCGCGTAGCCCGTCGACAATGGCTTGCCTCTGGCGGGCGATACCTA
GACCAGACAGGTACTTGGGGACACTTGCTCTGATAACATCAAAGACGTAAGCTTGGATCT
GGCTCCTAGTGTTACTGAGTTTGTAGAAGGCATCATTGGCATTATTAGCCAAGGCACGGT
ACTGAATCGATGCAACAACATTAACAAACACATTGTCCTTGGTCCTAGTCTCGCAGCGAA
CATCCAACTGCCGAAGCCTGAGAGAGAGGTAACCAGCGACTTGCTGACCAAGACACCATG
GGAGAAAATGGCAACCAGGCTCTAGAACATCTTCGAACTTCCCAAACGTTTCTTTTATCG
CCACCGTTGACTGGTCCACTTGTACACAGCACAACAAGTTCCCCATCTTTCTTCACTCGT
CTTTTGATTTTCTTCTGGGTTTGATCTTAGATGAGACGTTTTTTTGTTAAGCGCTGTGAA
TCC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
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10 10 10 

AF RS1F963JQ U 6
AF RS1DE82JQ U 1
AF RS1DE82TF C 233
BS 1 123 RS1DE82JQ
BS 124 124 RS1F963JQ
BS 125 665 RS1DE82JQ
BS 666 843 RS1DE82TF

RD RS1F963JQ 419 0 0
ATTTGATTAATTACGATTTTTTGGTTGCACACTCCAAATACGTGGAAATATAGAAACCTA
AAGCATGAGAGTTTCTCAGCACAAGATCATAGGATCTTAACACACAGCAAGCTTAGTAAA
GAACATATAATGATCAGTCCATTATCTATATTTCAGGACTGGTCTGCAAAGGAGCCTTGA
AGGAGCCCATCTCTGATCTGAGTAGCCACATCGCGTACAGCTCCTGGTCCGTGGGGAATG
AAGACAGCAAAGGATTTGGAACTGGCACCAATCTCCTTCATCGTGTCGAAGTACTGCGTA
ACGAGCACCATGTCCATCACATCTTTAGCAGTTGTCCCGGGAACATTCACAGAAAAACCA
AGGACGCTGTCGCGTAGCCCGTCGACAATGGCTTGCCTCTGGCGGGCGATACCTA
AACC

QA 1 415 1 415
DS 

RD RS1DE82JQ 665 0 0
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ACCTAAAGCATGAGAGTTTCTCAGCACAAGATCATAGGATCTTAACACACAGCAAGCTTA
GTAGAGAACATATAATGATCAGTCCATTATCTATATTTCAGGACTGGTCTGCAAAGGAGC
CTTGAAGGAGCCCATCTCTGATCTGAGTAGCCACATCGCGTACAGCTCCTGGTCCGTGGG
GAATGAAGACAGCAGAGGATTTGGAACTGGCACCAATCTCCTTCATCGTGTCGAAGTACT
GCGTAACGAGCACCATGTCCATCACATCTTTAGCAGTTGTCCCGGGAACATTCACAGAGA
AACCAAGGACGCTGTCGCGTAGCCCGTCGACAATGGCTTGCCTCTGGCGGGCGATACCTA
GACCAGACAGGTACTTGGGGACACTTGCTCTGATAACATCAAAGACGTAAGCTTGGATCT
GGCTCCTAGTGTTACTGAGTTTGTAGAAGGCATCATTGGCATTATTAGCCAAGGCACGGT
ACTGAATCGATGCAACAACATTAACAAACACATTGTCCTTGGTCCTAGTCTCGCAGCGAA
CATCCAACTGCCGAAGCCTGAGAGAGAGGTAACCAGCGACTTGCTGACCAAGACACCATG
GGAGA

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1DE82TF 611 0 0
TCCGTGGGGAATGAAGACAGCAGAGGATTTGGAACTGGCACCAATCTCCTTCATCGTGTC
GAAGTACTGCGTAACGAGCACCATGTCCATCACATCTTTAGCAGTTGTCCCGGGAACATT
CACAGAGAAACCAAGGACGCTGTCGCGTAGCCCGTCGACAATGGCTTGCCTCTGGCGGGC
GATACCTAGACCAGACAGGTACTTGGGGACACTTGCTCTGATAACATCAAAGACGTAAGC
TTGGATCTGGCTCCTAGTGTTACTGAGTTTGTAGAAGGCATCATTGGCATTATTAGCCAA
GGCACGGTACTGAATCGATGCAACAACATTAACAAACACATTGTCCTTGGTCCTAGTCTC
GCAGCGAACATCCAACTGCCGAAGCCTGAGAGAGAGGTAACCAGCGACTTGCTGACCAAG
ACACCATGGGAGAAAATGGCAACCAGGCTCTAGAACATCTTCGAACTTCCCAAACGTTTC
TTTTATCGCCACCGTTGACTGGTCCACTTGTACACAGCACAACAAGTTCCCCATCTTTCT
TCACTCGTCTTTTGATTTTCTTCTGGGTTTGATCTTAGATGAGACGTTTTTTTGTTAAGC
GCTGTGAATCC

QA 1 611 1 611
DS 



CO CL28Contig4 703 2 3 U
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GAAATATAATAACGAAAAATATAGAAACCTAAAGCATGAGAGTTTCTCAACACAGGATGA
TAGGATCTTAACACACAGCAAAGCTTAGTAGAGAACATATAATGATCAGTCCATTATCTA
TATTTCAGGACTGGTCTGCAAAGGAGCCTTGAAGGAGCCCATCTCTGATCCGAGTAGCCA
CATCGCGAACAGCTCCTGGTCCGTGTGGAATGAAGACAGCAAAGGATTTGGAACTGGCAC
CAATCTCCTTCATCGTGTCAAAGTACTGCGTAACGAGCACCATGTCCATCACATCTTTAG
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TGGCTTGCCTCTGACGGGCGATACCTAGACCGGAGAGGTACTTGGCCTCGGCTTCACCTT
CAGCTCGCTTGATCTGGAGGATTTTCTCAGCCTCTGCCTTTTTGTTCGCAGCCAACCTCA
TCCTCGCAGCAGCGTTGATTTCGTTCATGGCTCGTTTGACATGTTCGTCAGGCTCGATGT
CAACGATGAGAGTTTGGACGATCTCAAAACCGTAAGCAGACATTGCCTTCTCGAGCTCCT
CTTCAACAGCTTTGGCAATTTCATTCTTCTGCTCAAAGACATC


BQ
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AF RS1GN42JQ U 26
AF RS1FJ66JQ U 1
BS 1 230 RS1FJ66JQ
BS 231 231 RS1GN42JQ
BS 232 703 RS1FJ66JQ

RD RS1GN42JQ 368 0 0
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AACCTAAAGCATGAGAGTTTCTCAACACAGGATGATAGGATCTTAACACACAGCAGAGCT
TAGTAGAGAACATATAATGATCAGTCCATTATCTATATTTCAGGACTGGTCTGCAAAGGA
GCCTTGAAGGAGCCCATCTCTGATCCGAGTAGCCACATCGCGAACAGCTCCTGGTCCGTG
TGGAATGAAGACAGCAGAGGATTTGGAACTGGCACCAATCTCCTTCATCGTGTCAAAGTA
CTGCGTAACGAGCACCATGTCCATCACATCTTTAGCAGTAGTCCCGGGAACATTCACAGA
GAAACCAA

QA 1 368 1 368
DS 

RD RS1FJ66JQ 703 0 0
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GAAATATAATAACGAAAAATATAGAAACCTAAAGCATGAGAGTTTCTCAACACAGGATGA
TAGGATCTTAACACACAGCAAAGCTTAGTAGAGAACATATAATGATCAGTCCATTATCTA
TATTTCAGGACTGGTCTGCAAAGGAGCCTTGAAGGAGCCCATCTCTGATCTGAGTAGCCA
CATCGCGAACAGCTCCTGGTCCGTGTGGAATGAAGACAGCAAAGGATTTGGAACTGGCAC
CAATCTCCTTCATCGTGTCAAAGTACTGCGTAACGAGCACCATGTCCATCACATCTTTAG
CAGTAGTCCCGGGAACATTCACAGAGAAACCAAGGACGCTGTCGCGTAGCCCGTCGACAA
TGGCTTGCCTCTGACGGGCGATACCTAGACCGGAGAGGTACTTGGCCTCGGCTTCACCTT
CAGCTCGCTTGATCTGGAGGATTTTCTCAGCCTCTGCCTTTTTGTTCGCAGCCAACCTCA
TCCTCGCAGCAGCGTTGATTTCGTTCATGGCTCGTTTGACATGTTCGTCAGGCTCGATGT
CAACGATGAGAGTTTGGACGATCTCAAAACCGTAAGCAGACATTGCCTTCTCGAGCTCCT
CTTCAACAGCTTTGGCAATTTCATTCTTCTGCTCAAAGACATC

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 18

CO CL29Contig1 910 18 19 U
GGACTCTTCTGCATAATCTCCAACTTCAAAAACCAACCTTCTTTCTTGCTACTTGCTAAC
AATTATATCTTTCAGTGAAGATGATAAAGTCTGTTACTCTTCGACCGTTTCCTCTCCCTA
TAGAGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAAACGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTGGTCA
GGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTCGACC
GTGTTCTTCAAGATCCCCCATTAATAGAAAAAA*CCGAGACCGAACTCTCAGATTACTGT
TGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGCTTACTTTGAACTCAAGGAC
CTTGAGAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAGCAGGCGGTGTG
AAATCGCTAATCGGGTGTTTACATGGAATTTCTTCGATGGAGAAGGAAAGCAAAACCAAG
AATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGAATCAGATACAGATGCGACGAAACTTCACGTTCATGTT
CCTGATGGTTTACCAAAATCTCAACAAGAATTGGAAGAAGAAGAGAAATCAAGAATGCCA
GATTCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCATCCCTGCTTGGTTCTCTCAC
CCTCCGGACCACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACACAGTTTTACTTCTATGTACAT
ATAATTATTGTAATATATCTGTTTTTGTAATATATCTTCATAATGCCTATAAAATATAGT
TGTCAATGTGTGATGATCTTGAATGGTTCGATGATAAAGTTGTTTCCAAGCCGTGTGCTT
ATTTTAGTACCTGGTTTTGGTTACAAAGATATTTCTATTCTTGATAATGTTCTGTCTCCG
AATGTTAAGC


BQ
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90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 85 85 85 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 50 50 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 35 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RS1G640TF U 11
AF RS1DJ73TF U 94
AF RS1E654TF U 1
AF RS1GS29TF U 1
AF RS1DI74TF U 94
AF RS1BB65TF U 1
AF RS1DI35TF U 1
AF RS1BR51TF U 1
AF RS1GD49TF U 1
AF RS1CS08JQ C 54
AF RS1CP57TF U 2
AF RS1CS08TF U 54
AF RS1BR51JQ C 42
AF RS1EF21JQ C 46
AF RS1E654JQ C 64
AF RS1BB65JQ C 190
AF RS1GS29JQ C 125
AF RS1GD49JQ C 272
BS 1 162 RS1BB65TF
BS 163 165 RS1BR51TF
BS 166 249 RS1BB65TF
BS 250 250 RS1BR51TF
BS 251 329 RS1BB65TF
BS 330 330 RS1BR51TF
BS 331 527 RS1BB65TF
BS 528 528 RS1BR51TF
BS 529 634 RS1BB65TF
BS 635 635 RS1BR51TF
BS 636 661 RS1BB65TF
BS 662 745 RS1BR51TF
BS 746 746 RS1CP57TF
BS 747 749 RS1BR51TF
BS 750 750 RS1CP57TF
BS 751 762 RS1BR51TF
BS 763 773 RS1GD49TF
BS 774 829 RS1CP57TF
BS 830 910 RS1GS29JQ

RD RS1G640TF 352 0 0
GG
ATAATCTCCAACTTCAAAAACCAACCTTCTTTCTTGCTACTTGCTAACAATTATATCTTT
CAGTGAAGATGATAAAGTCTGTTACTCTTCGACCGTTTCCTCTCCCTATAGAGTTTCACG
GCAAGCCTAAGTTCGTCCAAACGTCGAAGTCTCGTTTCCCGGTGGTCAGGTGTTCAAGCA
CGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTCGACCGTGTTCTTCAAG
ATCCCCCATTAATAGAAAAAA*CCGAGACCGAACTCTCAGATTACTGTTG*AAACTCGAA
GGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAG*TTACTTTGAACTCAAGGACCT

QA 3 352 3 352
DS 

RD RS1DJ73TF 389 0 0
GG
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TCGAAGTCTTGTTTCCCGGTGGTCAGGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAG
CTCTTCAACCGCGGACAGTTCGACCGTGTTCTTCAAGATCCCCCATTAATAGAAAAAA*C
CGAGACCGAACTCTCAGATTACTGTTGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTG
GAGAGCTTACTTTGAACTCAAGGACCTTGAGAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAA
TCTAATCTTGCAAGCAGGCGGTGTGAAATCGCTAATCGGGTGTTTACATGGAATTTCTTC
GATGGAGAAGGAAAGCAAAACCAA
AAA

QA 3 386 3 386
DS 

RD RS1E654TF 560 0 0
GGACTCTTCTGCATAATCTCCAACTTCAAAAACCAACCTTCTTTCTTGCTACTTGCTAAC
AATTATATCTTTCAGTGAAGATGATAAAGTCTGTTACTCTTCGACCGTTTCCTCTCCCTA
TAGAGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAAACGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTGGTCA
GGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTCGACC
GTGTTCTTCAAGATCCCCCATTAATAGAAAAAA*CCGAGACCGAACTCTCAGATTACTGT
TGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGCTTACTTTGAACTCAAGGAC
CTTGAGAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAGCAGGCGGTGTG
AAATCGCTAATCGGGTGTTTACATGGAATTTCTTCGATGGAGAAGGAAAGCAAAACCAAG
AATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGAATCAGATACAGATGCGACGAAACTTCACGTTCATGTT
CCTGATGGTTTACCAAAATC

QA 1 560 1 560
DS 

RD RS1GS29TF 560 0 0
GGACTCTTCTGCATAATCTCCAACTTCAAAAACCAACCTTCTTTCTTGCTACTTGCTAAC
AATTATATCTTTCAGTGAAGATGATAAAGTCTGTTACTCTTCGACCGTTTCCTCTCCCTA
TAGAGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAAACGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTGGTCA
GGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTCGACC
GTGTTCTTCAAGATCCCCCTTTAATAGAAAAAA*CCGAGACCGAACTCTCAGATTACTGT
TGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGCTTACTTTGAACTCAAGGAC
CTTGAGAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAGCAGGCGGTGTG
AAACCGCTAATCGGGTGTTTACATGGAATTTCTTCGATGGAGAAGGAAAGCAAAACCAAG
AATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGAATCAGATACAGATGCGACGAAACTTCACGTTCATGTT
CCTGATGGTTTACCAAAATC

QA 1 560 1 560
DS 

RD RS1DI74TF 464 0 0
GG
ACTCTTCGACCGTTTCCTCTCCCTATAGAGCTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAAACG
TCGAAGTCTTGTTTCCCGGTGGTCAGGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAG
CTCTTCAGCCGCGGACAGTTCGACCGTGTTCTTCAAGATCCCCCATTAATAGAAAAAA*C
CGAGACCGAACTCTCAGATTACTGTTGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTG
GAGAGCTTACTTTGAACTCAAGGACCTTGAGAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAA
TCTAATCTTGCAAGCAGGCGGTGTGAAATCGCTAATCGGGTGTTTACATGGAATTTCTTC
GATGGAGAAGGAAAGCAAAACCAAGAATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGAATCAGATACAGA
TGCGACGAAACTTCACGTTCATGTTCCTGATGGTTTACCAAA

QA 3 464 3 464
DS 

RD RS1BB65TF 680 0 0
GGACTCTTCTGCATAATCTCCAACTTCAAAAACCAACCTTCTTTCTTGCTACTTGCTAAC
AATTATATCTTTCAGTGAAGATGATAAAGTCTGTTACTCTTCGACCGTTTCCTCTCCCTA
TAGAGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAAACGTCGAAGT***GTTTCCCGGTGGTCA
GGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTCGACC
GTGTTCTTCGAGATCCCCCATTAATAGAAAAAA*CCGAGACCGAACTCTCAGATTACTGT
TGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGTTGCTGGAGAGCTTACTTTGAACTCAAGGAC
CTTGAGAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAGCAGGCGGTGTG
AAATCGCTAATCGGGTGTTTACATGGAATTTCTTCGATGGAGAAGGAAAGCAAAACCAAG
AATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGAATCAGATACAGATGCGACGAAACTCCACGTTCATGTT
CCTGATGGTTTACCAAAATCTCAACAAGAATTGGAAGAAGAAGAGAAATCAAGAATGCCA
GATTCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAG*AACCATCCCTGCTTGGTTCTCTCAC
C
TCCTGACACGAACAGACTG

QA 1 661 1 661
DS 

RD RS1DI35TF 705 0 0
GGACTCTTCTGCATAATCTCCAACTTCAGAAACCAACCTTCTTTCTTGTTACTTGCTAAC
AATTATATCTTTCAGTGAAGATGATAAAGTCTGTTACTCTTCGACCGTT*CCTCTCCCTA
TAGAGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAAACGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTGGTCA
GGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTCGACC
GTGTTCTTCAAGATCCCCCATTAATAGAAAAAA*CCGAGACCGAACTCTCAGATTACTGT
TGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGCTTACTTTGAACTCAAGGAC
CTTGAGAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGATAATCTAATCTTGCAAGCAGGCGGTGTG
AAATCGCTAATCGGGTGTTTACATGGAATTTCTTCGATGGAGAAGGAAAGCAAAACCAAG
AATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGAATCTGATACAGATGCGACGAAACTTCACGTTCATGTT
CCTGATGGTTTACCAAAATCTCAACAAGAATTGGAAGAAGAAGAGAAATCAAGAATGCCA
GATTCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCATCCCTGCTTGGTTCTCTCAC
CCTCCGGACCACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACACAGTTT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RS1BR51TF 767 0 0
GGACTCTTCTGCATAATCTCCAACTTCAAAAACCAACCTTCTTTCTTGCTACTTGCTAAC
AATTATATCTTTCAGTGAAGATGATAAAGTCTGTTACTCTTCGACCGTTTCCTCTCCCTA
TAGAGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAAACGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTGGTCA
GGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTCGACC
GTGTTCTTCAAGATCCCCCATTAATAGAAAAAA*CCGAGACCGAACTCTCAGATTACTGT
TGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGCTTACTTTGAACTCAAGGAC
CTTGAGAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAGCAGGCGG*GTG
AAATCGCTAATCGGGTGTTTACATGGAATTTCTTCGATGGAGAAGGAAAGCAAAACCAAG
AATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGAATCAGATACAGATGCGACGAAACTTCACGTTCATGTT
CCTGATGGTTTACCAAAATCTCAACAAGAATTGGAAGAGGAAGAGAAATCAAGAATGCCA
GATTCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCATCCCTGCTTGGTTCTCTCAC
CCTCCGGACCACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACACAGTTTTACTTCTATGTACAT
ATAATTATTGTAATATATCTGTTTT*GTA*TATATCTTCATA
TGCTA

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1GD49TF 773 0 0
GGACTCTTCTGCATAATCTCCAACTTCAAAAACCAACCTTCTTTCTTGCTACTTGCTAAC
AATTATATCTTTCAGTGAAGATGATAAAGTCTGTTACTCTTCGACCGTTTCCTCTCCCTA
TAGAGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAAACGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTGGTCA
GGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTCGACC
GTGTTCTTCAAGATCCCCCTTTAATAGAAAAAA*CCGAGACCGAACTCTCAGATTACTGT
TGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGCTTACTTTGAACTCAAGGAC
CTTGAGAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAGCAGGCGGTGTG
AAACCGCTAATCGGGTGTTTACATGGAATTTCTTCGATGGAGAAGGAAAGCAAAACCAAG
AATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGAATCAGATACAGATGCGACGAAACTTCACGTTCATGTT
CCTGATGGTTTACCAAAATCTCAACAAGAATTGGAAGAAGAAGAGAAATCAAGAATGCCA
GATTCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCATCCCTGCTTGGTTCTCTCAC
CCTCCGGACCACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACACAGTTTTACTTCTATGTACAT
ATAATA**TGTAATATATCTGTTTT*GTA*TATATCTTCATAATGCCTATAAA

QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1CS08JQ 712 0 0
G
GCTAACAATTATATCTTTCAGTGAAGATGATAAAGTCTGTTACTCTTCGACCGTTTCCTC
TCCCTATAGAGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAAACGTCGAAGTCTTGTTTCCCGG
TGGTCAGGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGT
TCGACCGTGTTCTTCAAGATCCCCCATTAATAGAAAAAAACCGAGACCGAACTCTCAGAT
TACTGTTGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGCTTACTTTGAACTC
AAGGACCTTGAGAAAGAGAAGCCTAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAGCAGGC
GGTGTGAAATCGCTAATCGGGTGTTTACATGGAATTTCTTCGATGGAGAAGGAAAGCAAA
ACCAAGAATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGAATCAGATACAGATGCGACGAAACTTCACGTT
CATGTTCCTGATGGTTTACCAAAATCTCAACAAGAATTGGAAGAAGAAGAGAAATCAAGA
ATGCCAGATTCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCATCCCTGCTTGGTTC
TCTCACCCTCCGGACCACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACACAGTTTTACTTCTAT
GTACATATAATTATTGTAATATATCTGTTTTTGTAATATATCTTCATAATG

QA 2 712 2 712
DS 

RD RS1CP57TF 834 0 0
GACTCTTCTGCATAATCTCCAACTTCAAAAACCAACCTTCTTTCTTGCTACTTTCTAACA
ATTATATCTTTCAGTGA*GATGATAAAGTCTGTT*CTCTTCGACCGTTTCCTCTCCCTAT
AGAGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAAACGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTGGTCAG
GTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTCGACCG
TGTTCTTCAAGATCCCCCATTAATAGAAAAAA*CCGAGACCGAACTCCCAGATTACTGTT
GTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGCTTACTTTGAACTCAAGGACC
TTGAGAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAGCGGGCGGTGTGA
AATCGCTAATCGGGTGTTTACATGGAATTTCTTCGATGGAGAAGGAAAGCAAAACCAAGA
ATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGAATCAGATACAGATGCGACGAAACTTCACGTTCATGTTC
CTGATGGTTTACCAAAATCTCAACAAGAATTGGAAGAAGAAGAGAAATCAAGAATGCCAG
ATTCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCATCCCTGCTTGGTTCTCTCACC
CTCCGGACCACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACACAGTTTTACTTCTATGTACATA
TAATTATTGTAATATATCTGTTTTTGTAATATATCTTCATAATGCCTATAAAATATAGTT
GTCAATGTGTGATGATCTTGAATGGTTCGATGATAAAGTTGTTTCCAA
AAAAAA

QA 1 828 1 828
DS 

RD RS1CS08TF 735 0 0
G
GCTAACAATTATATCTTTCAGTGAAGATGATAAAGTCTGTTACTCTTCGACCGTTTCCTC
TCCCTATAGAGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAAACGTCGAAGTCTTGTTTCCCGG
TGGTCAGGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGT
TCGACCGTGTTCTTCAAGATCCCCCATTAATAGAAAAAAACCGAGACCGAACTCTCAGAT
TACTGTTGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGCTTACTTTGAACTC
AAGGACCTTGAGAAAGAGAAGCCTAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAGCAGGC
GGTGTGAAATCGCTAATCGGGTGTTTACATGGAATTTCTTCGATGGAGAAGGAAAGCAAA
ACCAAGAATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGAATCAGATACAGATGCGACGAAACTTCACGTT
CATGTTCCTGATGGTTTACCAAAATCTCAACAAGAATTGGAAGAAGAAGAGAAATCAAGA
ATGCCAGATTCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCATCCCTGCTTGGTTC
TCTCACCCTCCGGACCACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACACAGTTTTACTTCTAT
GTACATATAATTATTGTAATATATCTGTTTTTGTAATATATCTTCATAATGCCTATAAA*
TATAGTTGTCAA
AA

QA 2 733 2 733
DS 

RD RS1BR51JQ 743 0 0
TTTCTTGCTACTTGCTAACAATTATATCTTTCAGTGAAGATGATAAAGTCTGTTACTCTT
CGACCGTTTCCTCTCCCTATAGAGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAAACGTCGAAG
TCTTGTTTCCCGGTGGTCAGGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTC
AGCCGCGGACAGTTCGACCGTGTTCTTCAAGATCCCCCATTAATAGAAAAAA*CCGAGAC
CGAACTCTCAGATTACTGTTGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGC
TTACTTTGAACTCAAGGACCTTGAGAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAAT
CTTGCAAGCAGGCGG*GTGAAATCGCTAATCGGGTGTTTACATGGAATTTCTTCGATGGA
GAAGGAAAGCAAAACCAAGAATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGAATCAGATACAGATGCGAC
GAAACTTCACGTTCATGTTCCTGATGGTTTACCAAAATCTCAACAAGAATTGGAAGAGGA
AGAGAAATCAAGAATGCCAGATTCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCAT
CCCTGCTTGGTTCTCTCACCCTCCGGACCACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACACA
GTTTTACTTCTATGTACATATAATTATTGTAATATATCTGTTTTTGTAATATATCTTCAT
AATGCCTATAAAATATAGTTGTC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RS1EF21JQ 739 0 0
TTGCTACTTGCTAACAATTATATCTTTCAGTGAAGATGATAAAGTCTGTTACTCTTCGAC
CGTTTCCTCTCCCTATAGAGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAAACGTCGAAGTCTT
GTTTCCCGGTGGTCAGGTGTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCC
GCGGACAGTTCGACCGTGTTCTTCAAGATCCCCCATTAATAGAAAAAA*CCGAGACCGAA
CTCTCAGATTACTGTTGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGCTTAC
TTTGAACTCAAGGACCTTGAGAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTG
CAAGCAGGCGGTGTGAAATCGCTAATCGGGTGTTTACATGGAATTTCTTCGATGGAGAAG
GAAAGCAAAACCAAGAATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGAATCAGATACAGATGCGACGAAA
CTTCACGTTCATGTTCCTGATGGTTTACCAAAATCTCAACAAGAATTGGAAGAAGAAGAG
AAATCAAGAATGCCAGATTCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCATCCCT
GCTTGGTTCTCTCACCCTCCGGACCACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACACAGTTT
TACTTCTATGTACATATAATTATTGTAATATATCTGTTTTTGTAATATATCTTCATAATG
CCTATAAAATATAGTTGTC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1E654JQ 725 0 0
TATATCTTTCAGTGAAGATGATAAAGTCTGTTACTCTTCGACCGTTTCCTCTCCCTATAG
AGTTTCACGGCAAGCCTAAGTTCGTCCAAACGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTGGTCAGGT
GTTCAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTCGACCGTG
TTCTTCAAGATCCCCCATTAATAGAAAAAA*CCGAGACCGAACTCTCAGATTACTGTTGT
AAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGCTTACTTTGAACTCAAGGACCTT
GAGAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAGCAGGCGGTGTGAAA
TCGCTAATCGGGTGTTTACATGGAATTTTTTCGATGGAGAAGGAAAGCAAAACCAAGAAT
GGTTTAGAGGTTAGAGAGGAATCAGATACAGATGCGACGAAACTTCACGTTCATGTTCCT
GATGGTTTACCAAAATCTCAACAAGAATTGGAAGAAGAAGAGAAATCAAGAATGCCAGAT
TCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCATCCCTGCTTGGTTCTCTCACCCT
CCGGACCACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACACAGTTTTACTTCTATGTACATATA
ATTATTGTAATATATCTGTTTTTGTAATATATCTTCATAATGCCTATAAAATATAGTTGT
CAA
GG

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1BB65JQ 696 0 0
GCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTCGACCGTGTTCTTC
GAGATCCCCCATTAATAGAAAAAA*CCGAGACCGAACTCTCAGATTACTGTTGTAAACTC
GAAGGTGATGACTCTTACAGTTGCTGGAGAGCTTACTTTGAACTCAAGGACCTTGAGAAA
GAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAGCAGGCGGTGTGAAATCGCTA
ATCGGGTGTTTACATGGAATTTCTTCGATGGAGAAGGAAAGCAAAACCAAGAATGGTTTA
GAGGTTAGAGAGGAATCAGATACAGATGCGACGAAACTCCACGTTCATGTTCCTGATGGT
TTACCAAAATCTCAACAAGAATTGGAAGAAGAAGAGAAATCAAGAATGCCAGATTCTGCT
TTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCATCCCTGCTTGGTTCTCTCACCCTCCTGAC
CACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACACAGTTTTACTTCTATGTACATATAATTATT
GTAATATATCTGTTTTTGTAATATATCTTCATAATGCCTATAAAATATAGTTGTCAATGT
GTGATGATCTTGAATGGTTCGATGATAAAGTTGTTTCCAAGCCGTGTGCTTATTTTAGTA
CCTGGTTTTGGTTACAAAGATATTTCTATTCTTGAT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RS1GS29JQ 786 0 0
AG
TTCACGGCAAGCCTAAGT*CGTCCAAACGTCGAAGTCTTGTTTCCCGGTGGTCAGGTGTT
CAAGCACGAGAGACGTTCCTAAGCTTGAGCTCTTCAGCCGCGGACAGTTCGACCGTGTTC
TTCAAGATCCCCCTTTAATAGAAAAAA*CCGAGACCGAACTCTCAGATTACTGTTGTAAA
CTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCTGCTGGAGAGCTTACTTTGAACTCAAGGACCTTGAG
AAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTGAGAATCTAATCTTGCAAGCAGGCGGTGTGAAACCG
CTAATCGGGTGTTTACATGGAATTTCTTCGATGGAGAAGGAAAGCAAAACCAAGAATGGT
TTAGAGGTTAGAGAGGAATCAGATACAGATGCGACGAAACTTCACGTTCATGTTCCTGAT
GGTTTACCAAAATCTCAACAAGAATTGGAAGAAGAAGAGAAATCAAGAATGCCAGATTCT
GCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCAAAGGAACCATCCCTGCTTGGTTCTCTCACCCTCCG
GACCACGAAACAGACTGAAGAATCCATCTCACACAGTTTTACTTCTATGTACATATAATT
ATTGTAATATATCTGTTTTTGTAATATATCTTCATAATGCCTATAAAATATAGTTGTCAA
TGTGTGATGATCTTGAATGGTTCGATGATAAATTTGTTTCCAAGCCGTGTGCTTATTTTA
GTACCTGGTTTTGGTTACAAAGATATTTCTATTCTTGATAATGTTCTGTCTCCGAATGTT
AAGC

QA 3 786 3 786
DS 

RD RS1GD49JQ 635 0 0
AAACCGAGACCGAACTCTCAGATTACTGTTGTAAACTCGAAGGTGATGACTCTTACAGCT
GCTGGAGAGCTTACTTTGAACTCAAGGACCTTGAGAAAGAGAAGCCAAAGGTGGAAGTTG
AGAATCTAATCTTGCAAGCAGGCGGTGTGAAACCGCTAATCGGGTGTTTACATGGAATTT
CTTCGATGGAGAAGGAAAGCAAAACCAAGAATGGTTTAGAGGTTAGAGAGGAATCAGATA
CAGATGCGACGAAACTTCACGTTCATGTTCCTGATGGTTTACCAAAATCTCAACAAGAAT
TGGAAGAAGAAGAGAAATCAAGAATGCCAGATTCTGCTTTCACAAGATTGCTTAGAGCCA
AAGGAACCATCCCTGCTTGGTTCTCTCACCCTCCGGACCACGAAACAGACTGAAGAATCC
ATCTCACACAGTTTTACTTCTATGTACATATAATTATTGTAATATATCTGTTTTTGTAAT
ATATCTTCATAATGCCTATAAAATATAGTTGTCAATGTGTGATGATCTTGAATGGTTCGA
TGATAAATTTGTTTCCAAGCCGTGTGCTTATTTTAGTACCTGGTTTTGGTTACAAAGATA
TTTCTATTCTTGATAATGTTCTGTCTCCGAATGTT

QA 1 635 1 635
DS 



AS 4 12

CO CL30Contig1 1030 4 5 U
GGCAGAACAGACTAGTTTTCTTATAAGAATAATAATACTCAAACAGTTGCTACACTCTCT
TAACTTCTTGGAATCCCTTCTGGCAAATCTAAAGAGAGAGTTTTTGTATGCTTTGAAATT
AAAAGGTTAAAAGAAACAAGAAAAAAAGGTTGATTAATATATC*GATTAAGACATAAGAA
CCAGAGTCTCTGGGGAGATATGGAGATGATGATGATGATCACTGTCTTCCTTTCTTTGCA
CAGCAAGGTGGGCATTTATACTGCTTGATGCTCTCTGCTTTGGCGGGAGTGATCTTCACG
CATTTCCCGTGGTACCAACGTTCACAAACATCATAGCAAATCCAGAACTCATCTTGTGTA
TAGTTGCCTCCACAGATACCACAGAGAGTGTCTCCATGCTCGTCTTCTTCTTCATCCTCA
TCCTCGTAGCTCTCTTCCATCAGTCTTGGTGTCGGACTCTTTGTCTGCCCTTCTATTGAT
CTCTTAGTACCGTTTCTAGATTTGCTTCCGGAATCCGAGCTTGGCTTGTTGTCTTTGATT
GGTTTCCTACCAGTCACTACATCAAAGAGAGTTGGGAGATCGTTGATCAGACTGAATAGC
CGCTTCCTCTCGTTGCGGTTAAGTCGAGCACCAAAGTAGAAAGAGACAGAGAGCAACCAA
CAGTCACTATGGACAGCAACAAGCGAGAGCCAATCTTTCCTCTGCATACCATCTCTAGCG
AAATTGATACCAAGAGCAGGCTCAGGAAGCTCAGGAGGAACTTCCTCCGCTGGTAGATTC
ACTTCCCATGACTCATTCGGGTGTCCATACAAACACAAATTCTCCTTCTCCGGATCGCAT
TGAGAGTAGAAATCATCAACATCTTTAGTAAGAGCACGGAGAAGAGCGGAGCGACGAGCG
GTGTAATCCTTGAAGATCTCTTCGACGGTGCGAGGGTTAGAGGAAACGGCGGCCATAGAT
TTTTACAGAGTATGTATGTGTATGTACGGTTTGTATAAGGGTGTAGATCAGTAGCTAGTG
GAGAAAGATC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BJ37JQ U 4
AF RS1A241JQ U 1
AF RS1A241TR U 1
AF RS1A241TF C 195
BS 1 385 RS1A241JQ
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BS 751 753 RS1A241TR
BS 754 1030 RS1A241TF

RD RS1BJ37JQ 632 0 0
AA
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TCTTGGAATCCCTTCTGGCAA*TCTAAAGAGAGAGTTTTTGCATGCTTTGAAATTAAAAG
GTTAAAAAAAACAAGAAAAA**GGTTGATTAATATATCCGATTAAGACATAAAAACCAGA
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AGGTGGGCATTTATACTGCTTGATGCTCTCTGCTTTGGCGGGAGTGATCTTCACGCATTT
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CCTCTCGTTGCGGTTAAGGCGAGCACCAAA

QA 3 632 3 632
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CGCTTCCTCTCGTTGCGGTTAAGTCGAGCACCAAAGTAGAAAGAGACAGAGAGCAACCAA
CAGTCACTATGGACAGCAACAAGCGAGAGCCAATCTTTCCTCTGCATACCATCTCTAGCG
AAATTGATACCAAGAGCAGGCTCAGGAAGC

QA 1 750 1 750
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GGCAG
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TCTTGGAATCCCTTCTGGCAAATCTAAAGAGAGAGTTTTTGTATGCTTTGAAATTAAAAG
GTTAAAAGAAACAAGAAAAAAAGGTTGATTAATATATC*GATTAAGACATAAGAACCAGA
GTCTCTGGGGAGATATGGAGATGATGATGATGATCACTGTCTTCCTTTCTTTGCACAGCA
AGGTGGGCATTTATACTGCTTGATGCTCTCTGCTTTGGCGGGAGTGATCTTCACGCATTT
CCCGTGGTACCAACGTTCACAAACATCATAGCAAATCCAGAACTCATCTTGTGTATAGTT
GCCTCCACAGATACCACAGAGAGTGTCTCCATGCTCGTCTTCTTCTTCATCCTCATCCTC
GTAGCTCTCTTCCATCAGTCTTGGTGTCGGACTCTTTGTCTGCCCTTCTATTGATCTCTT
AGTACCGTTTCTAGATTTGCTTCCGGAATCCGAGCTTGGCTTGTTGTCTTTGATTGGTTT
CCTACCAGTCACTACATCAAAGAGAGTTGGGAGATCGTTGATCAGACTGAATAGCCGCTT
CCTCTCGTTGCGGTTAAGTCGAGCACCAAAGTAGAAAGAGACAGAGAGCAACCAACAGTC
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QA 6 753 6 753
DS 

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GAGATATGGAGATGATGATGATGATCACTGTCTTCCTTTCTTTGCACAGCAAGGTGGGCA
TTTATACTGCTTGATGCTCTCTGCTTTGGCGGGAGTGATCTTCACGCATTTCCCGTGGTA
CCAACGTTCACAAACATCATAGCAAATCCAGAACTCATCTTGTGTATAGTTGCCTCCACA
GATACCACAGAGAGTGTCTCCATGCTCGTCTTCTTCTTCATCCTCATCCTCGTAGCTCTC
TTCCATCAGTCTTGGTGTCGGACTCTTTGTCTGCCCTTCTATTGATCTCTTAGTACCGTT
TCTAGATTTGCTTCCGGAATCCGAGCTTGGCTTGTTGTCTTTGATTGGTTTCCTACCAGT
CACTACATCAAAGAGAGTTGGGAGATCGTTGATCAGACTGAATAGCCGCTTCCTCTCGTT
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AGCAGGCTCAGGAAGCTCAGGAGGAACTTCCTCCGCTGGTAGATTCACTTCCCATGACTC
ATTCGGGTGTCCATACAAACACAAATTCTCCTTCTCCGGATCGCATTGAGAGTAGAAATC
ATCAACATCTTTAGTAAGAGCACGGAGAAGAGCGGAGCGACGAGCGGTGTAATCCTTGAA
GATCTCTTCGACGGTGCGAGGGTTAGAGGAAACGGCGGCCATAGATTTTTACAGAGTATG
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QA 1 836 1 836
DS 



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AGTTTCGGTGTTGTGCTCTTTGGCTGCCCTTCTATTGATCTCTTAGTGCCGTTTCTGGAT
TTACTTCCGGAATCCGAGCTTGGCTTGTTGTCTTTGATGGGTTTCCTAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AG58JQ U 1
AF RS1CC95JQ U 1
BS 1 165 RS1AG58JQ
BS 166 166 RS1CC95JQ
BS 167 169 RS1AG58JQ
BS 170 173 RS1CC95JQ
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BS 209 211 RS1AG58JQ
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BS 213 398 RS1AG58JQ
BS 399 399 RS1CC95JQ
BS 400 406 RS1AG58JQ
BS 407 589 RS1CC95JQ

RD RS1AG58JQ 406 0 0
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CTCTTAACTTCTTGAAACCCCTTTCTGGATCTCTAAAAAGAAAGAGAGAGTTCTGTATGC
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GGTTGACTAATAATATATCATTAAAACGTGAGAACCAAAGTCTGGGGGAGGGGTTTTCAT
CATCACTGTCTTCCTTTCTTTGCACAGCAAGGGGGGCATTTATACTGCTTGATGCTCTCT
GCTTTGGTGGGAGTGATCTTCACGCATTTTCCGTGGTACCAACGCTCACAAACATCGCAG
CAAATCCAAAACTCATCTTGGGTGTAGTTGCCTCCACAGATTCCAC

QA 1 406 1 406
DS 

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CTCTTAACTTCTTGAAACCCCTTTCTGGATCTCTAAAAAGAAAGAGAGAGTTCTGTATGC
TTTAAAATTAAAAGGTTAAAGAAACAACAACAAACAAAAAAAAAAAAAAGAGGAAAAAAA
GGTTGACTAATAATATATCATTAAAACATGAAAACCAAAGTCTGTGGGAGGTGTTTTCAT
CATCACTGTCTTCCTTTCTTTGCACAGCAAGGGGGGCATTTATACTGCTTGATGCTCTCT
GCTTTGGTGGGAGTGATCTTCACGCATTTTCCGTGGTACCAACGCTCACAAACATCGCAG
CAAATCCAAAACTCATCTTGGGTGTAGTTGCCTCCACAAATTCCACAAAAAGTGTCTCCA
TGCTCGTCTTCTTCTTCTTATTCTTCATCTTCAACTTCATCCTCGTAGCTCCCTTCCATC
AGTTTCGGTGTTGTGCTCTTTGGCTGCCCTTCTATTGATCTCTTAGTGCCGTTTCTGGAT
TTACTTCCGGAATCCGAGCTTGGCTTGTTGTCTTTGATGGGTTTCCTAC

QA 1 589 1 589
DS 



CO CL30Contig3 1266 3 15 U
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AGAAAGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCCAAACTCTCTCTTTTCTCTCTCCGT
GTCCGAACGCATCAGAAACAATTGATGTCGACCTCGATCTTCCTCCACTAGCAACTGATC
TAATACCGTTTTTTGCACATTTAATAAAAAAAGAACAAAAAAATCGAGTTTCTCTCTCTC
TCTGTACAGAGAGCTATGGCGGCCGTTTCCTCAAACCCTCGCACCGTAGAAGAGATCTTC
AAGGATTACACCTCTCGCCGCTCCGCTCTTCTTCGTGCTCTTACTAAAGATGTTGATGAT
TTCTACTCTCAATGCGATCCGGAAAAGGAGAATCTTTGTTTGTACGGACACCCGAACGAG
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GGTATCAATTTCGCTAGAGACGGTATGCAGAGGAAAGACTGGCTCTCGCTCGTTGCTGTT
CATAGTGATTGTTGGTTGCTCTCTGTTTCTTTCTACTTTGGTGCTCGCCTTAATCGCAAC
GACAGGAAGCGGTTATTCAGTCTGATCAACGATCTCCCAACTCTATTCGATGTAGTGACT
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GGCACTAAGAGATCAATAGAAGGGCAGCCAAAGAGCACAACACCGAAACTGATGGAAGGG
AGCTACGAGGATGAAGATGAAGATGAAAAAGAAGAAGAAGAAGACGAGCATGGAGACACT
CTCTGTGGAATCTGTGGAGGCAACTACACACAAGATGAGTTCTGGATTTGCTGCGATGTT
TGCGAGCGTTGGTACCACGGAAAATGCGTGAAGATCACTCCCACCAAAGCAGAGAGCATC
AAGCAGTATAAATGCCCGCCTTGCTGTGCAAAGAAAGGAAGACAGTGATGATGAAAACAC
CTCCCACAGACTCTGGTTCTCACGTCTTAATGATATATTATTAGTCAACCTTTTTCTTCT
CTTTTTTTTTTGTTTGTTGTTGTTTCTTTAACCTTTTAATTTTAAAGCATACAGAACTCT
CTCTCTCTTTTTAGAGATCCAGAAAGGGGTTTCAAGAAGTTAAGAGAGAGAGAGTAGCAA
CTGTTTGAGTATTATTATTCTTATAAAAAAACTGAGGTGTTCCATCAAATGTGTCATGTG
ATTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 

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DS 

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TGCGCTCGGTATCAATTTCGCTAGAGACGGTATGCAGAGGAAAGACTGGCTCTCGCTCGT
TGCTGTTCATAGTGATTGTTGGTTGCTCTCTGTTTCTTTCTACTTTGGTGCTCGCCTTAA
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AGACACTCTCTGTGGAATCTGTGGAGGCAACTACACACAAGATGAGTTTTGGATTTGCTG
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AAAACACCTCCCACAGACTCTGGTTCTCACGTCT*AATGATATAT*ATTAGTCAACCT

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DS 

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AGCTA
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CTCTCGTTGCTGTTCATAGTGATTGTTGGTTGCTCTCTGTTTCTTTCTACTTTGGTGCTC
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TCGATGTAGTGACTGGTAGGAAACCCATTAAAGACAACAAGCCAAGCTCGGATTCCGGAA
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AGAGAGAGTAGCAACTGTTTGAGTATTATTATTCTTATAAAAAAACTGAGGTGTTCCATC
AAATGTGTCATGTGATTTGC

QA 6 805 6 805
DS 



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ACACTCAACTTCTTGAATTCCTTTTACGGAGATCCAAAGAGAGAGAGAGTTTTGTATGCT
TTAAAATTAAAACGGTTAAAAAACAAAAGATAGAAGGAAGGTTGATTAATATATCGTTTA
AGACATGATAACCAGAGTCTCTGGGAGATGATGATGATCAATCACTGTCTTCCTTTCTTT
GCACAGCAAGGTGGGCATTTATACTGCTTGATGCTGTCTGCTTTGGCGGGAGTGATCTTC
ACGCATTTGCCATGGTACCAACGTTCACAGACATCACAGCCGATCCAGAACTCATCTTGT
GTGTAATTGCCTCCGCAGCTTCCACAGAGAGTGTCTCCATGCTCGTCTTCTTCTTCTTCA
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TCTATTGATCTATTAGTGCCACCGTTTCTGGATTTGCTTCCGGAATCTGAGCTTGGCTTG
TTGTCTTTGATTGGTTTCCTACCAGTCACGACATCAAACAGAGTTGGGTGATCGTTGATC
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GAGAGCAACCAACAGTCACTATGAACAGCAACAAGAGAGAGCCAATCTTTCCTCTGCATA
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GCCGGTAGATTCACTTCCCACGACTCATTCGGATGTCCATACAAACACAAATTCTCCTTC
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GCGCGGCGAGAGGTGTAATCTTTGAAGATCTCTTCGACGGTGCGAGGGTTTGAGGAGACG
GCGGCCATAATAGCTGTACAGAGAGATGCGTGAGACCGTTTGATGTGTAGATCAGTTGCT
AGTGGAGAAAGATCGAGGTTTGTATCGATGGTTTTTGAGACAGGATGCGTTCGGACTTGC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H020JQB U 1
AF RS1H008JQB U 1
AF RS1AD89TF C 242
BS 1 569 RS1H008JQB
BS 570 570 RS1AD89TF
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QA 1 325 1 325
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ACACTCAACTTCTTGAATTCCTTTTACGGAGATCCAAAGAGAGAGAGAGTTTTGTATGCT
TTAAAATTAAAACGGTTAAAAAACAAAAGATAGAAGGAAGGTTGATTAATATATCGTTTA
AGACATGATAACCAGAGTCTCTGGGAGATGATGATGATCAATCACTGTCTTCCTTTCTTT
GCACAGCAAGGTGGGCATTTATACTGCTTGATGCTGTCTGCTTTGGCGGGAGTGATCTTC
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DS 

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TGTCTTTGATTGGTTTCCTACCAGTCACGACATCGAACAGAGTTGGGTGATCGTTGATCA
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CCGGTAGATTCACTTCCCACGACTCATTCGGATGTCCATACAAACACAAATTCTCCTTCT
CCGGATCGCATTGAGAGTAGAAATCATCAACATCTTTGGTGAGAGCACGGAGAAGAGCGG
CGCGGCGAGAGGTGTAATCTTTGAAGATCTCTTCGACGGTGCGAGGGTTTGAGGAGACGG
CGGCCATAATAGCTGTACAGAGAGATGCGTGAGACCGTTTGATGTGTAGATCAGTTGCTA
GTGGAGAAAGATCGAGGTTTGTATCGATGGTTTTTGAGACAGGATGCGTTCGGACTTGC

QA 1 839 1 839
DS 



AS 3 15

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AAGTATCTGTATGTCGTTTTCTCAGGAGTGTCATATTTATTTGTAAACTGGTGGTAGCAT
CATCACAGGCAAGCAGGTTTCTTTCGGGGGAAAGTCTTCAAAGGTTGGTGAAGTCAACAG
GCTCACGGAGGAGCCTCTCCATCTGCTGTGCCCTTGTCCTGATAGACATGTCCAACACCT
TTTGTTGAAACTCTACTATTAGCCCTCCGTAGATACTCGGATCAATCTTTTGTTCCACAG
TTACTTTCTTCCCTTCTCCAATTATCTCCTGGAGCGTCTCCTTCAGCTCCTTCTCCTCAG
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TCAACTGCATGAATTTTTTCACAATCACGTCCAAATTCTTCAGCTTCCCATTCTCAGCTA
ACAGAGA*********GAGGAAGTTCTTGGTGGGTTCTGCGAACTTGGCTTTATCACAAA
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AAAAAATAGGGCTCGTCTTCATAGCCTCGACGAGCTCAGAGAGGTCAGACTCGATCT*CT
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CAACTAAAGCAACAGGCACCTTAACATTGGCGGTCTTCTGAGCGCAAGCTGTTGCGTAGT
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CAGATAATCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CS83JQ U 1
AF RS1FE47JQ U 1
AF RS1AQ22JQ U 57
AF RS1FE47TF C 234
AF RS1AQ22TFB C 282
BS 1 294 RS1CS83JQ
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AAAAGCTTACTTCGAAGCAAAACAACAATTGTAAAATGTGAAAAGTTCAAAAAAGGACAC
AAGTATCTGTATGTCGTTTTCTCAGGAGTGTCATATTTATTTGTAAACTGGTGGTAGCAT
CATCACAGGCAAGCAGGTTTCTTTCGGGGGAAAGTCTTCAAAGGTTGGTGAAGTCAACAG
GCTCACGGAGGAGCCTCTCCATCTGCTGTGCCCTTGTCCTGATAGACATGTCCAACACCT
TTTGTTGAAACTCTACTATTAGCCCTCCGTAAATACTCGGATCAATCTTTTGTTCCACAG
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TCAACTGCATGAATTTTTTCACAATCACGTCCAAATTCTTCAGCTTCCCATTCTCAGCTA
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CGAC

QA 1 547 1 547
DS 

RD RS1AQ22JQ 814 0 0
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ACCTTTTGTTGAAACTCTACTATTAGCCCTCCGTAAATACTCGGATCAATCTTTTGTTCC
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GCTAACAGAGA*********GAGGAAGTTCTTGGTGGGTTCTGCGAACTTGGCTTTATCA
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TGCGAAAAAATAGGGCTCGTCTTCATAGCCTCGACGAGCTCAGAGAGGTCAGACTCGATC
T*CTCCAAGGAGTTCATTTTCACAGCTGCAATGTACAGCCACGAAGCGAAGTTTCCAGAT
TCACCAACTAAAGCAACAGGCACCTTAACATTGGCGGTCTTCTGAGCGCAAGCTGTTGCG
TAGTCTCTCAACGCGGGGATGAGCGGCGCTCC
AC

QA 1 812 1 812
DS 

RD RS1FE47TF 682 0 0
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AACAC*TTTTGTTGAAACTCTACTATTAGCCCTCCGTAGATACTCGGATCAATCTTTTGT
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TCCACAGCAGGTGGAAGCGGCATGACAGTGGTAACCAAAACCTTGACATCTCCTCTATGT
GCAGTCGTCAACTGCATGAATTTTTTCACAATCACGTCCAAATTCTTCAGCTTCCCATTC
TCAGCTAACGGAGACGACATACAGAGGAAGTTCTTGGTGGGTTCTGCGAACTTGGCTTTA
TCACAAACATCCACGATAGCAGCGAGTCTCGTCTCTCTAGGAACAGAGGGATCTTTAGTG
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ATCTTCTCCAAGGAGTTCATTTTCACAGCTGCAATGTACAGCCACGAAGCGAAGTTTCCA
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GCGTAGTCTCTCAACGCGGGGATGAGCGGCGCTCCGCGGAGGTGAGATCTAGCAGGTGAG
ACGGAGGTGGTCTTGAAGAAGG

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1AQ22TFB 689 0 0
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TCAATCTTTTGTTCCACAGTTACTTTCTTCCCTTCTCCAATTATCTCCTGGAGCGTCTCC
TTCAGCTCCTTCTCCTCAGCAGGTGGAAGCGGCATGACAGTGGTAACCAAAACCTTGACA
TCTCCTCTATGTGCAGTCGTCAACTGCATGAATTTTTTCACAATCACGTCCAAATTCTTC
AGCTTCCCATTCTCAGCTAACAGAGA*********GAGGAAGTTCTTGGTGGGTTCTGCG
AACTTGGCTTTATCACAAACATCCACGATAGCAGCGAGTCTCGTCTCTCTAGGAACAGAG
GGATCTTTAGTGAACTGCGAAAAAATAGGGCTCGTCTTCATAGCCTCGACGAGCTCAGAG
AGGTCAGACTCGATCT*CTCCAAGGAGTTCATTTTCACAGCTGCAATGTACAGCCACGAA
GCGAAGTTTCCAGATTCACCAACTAAAGCAACAGGCACCTTAACATTGGCGGTCTTCTGA
GCGCAAGCTGTTGCGTAGTCTCTCAACGCGGGGATGAGCGGCGCTCCACGGAGGTGAGAT
CTAGCAGGTGAGACGGAGGTGGTCTTGAAGAAGGAGATCCCGGATCTGATACGACCAGCC
AACGCCATTTTTGTTGTTGCAGATAATCC

QA 1 689 1 689
DS 



CO CL31Contig2 910 6 5 U
GGAATCAGATTATCTGCAACGAAACAAAATGGCATTGGCTGGTCGTATCAGATCCGGGAT
CTCCTTCTTCAGGACCATCTCCGTCTCAGATGCTAGATCTTCGCTTATCCCTTCGCTGAG
AGATTATGCAACAGCTTCTGCTCAGAAAACCGGCAACGTTAAGGTGCCTGTGGCTTTGGT
TGGTGAATCTGGCAACTTTGCATCGTGGCTGTACATTGCAGCTGTGAAAATGAACTCCTT
GGAAAAGATTGAGTCCGATCTTTCTGAGCTGGTTGAGGCTATGAAGACAAGCCCTACTTT
TTCACAGTTTACTAAGGATCCCTCTGTTCCTAGAGAGACGAGACTCGCTGCTATTGTCGA
TGTTTGTGACAAAGCAAAGTTTGCTGAACCCACCAAGAACTTCCTCTCTTTGTTAGCTGA
GAATGGGAAGCTGAAGAACTTAGACGTGATTGTGAAAAAAATTCATGCAGCTGACGACGA
CACATAGGGGAGACGTCAAGGTTTTGGTTACCACAGTCATGCCGCTACCACCTGCTGAGG
AGAAAGAGCTTAAGGAGACGCTTCAGGAGATAATTGGAGAAGGGAAGAAAGTTACTGTGG
AACAAAAGATTGATCCGAGTATATATGGAGGGCTAATAGTAGAGTTTCAACAAAAGGTGT
TGGACATGTCTATCAGGACAAGGGCACAGCAGATGGAGAGGCTCCTCCGTGAACCTGTTG
ACTTCACCAACCTCTGATAATTTCCCCTTAAGAAACATGCTTTCTGATTTGCTGCTACAG
AATCAGTTGACAAATAAATATGACCCTCCTCCTGGGAAACAATTTAATACAAGACACTTT
TTGGAAAAAAATTGTCATTGCATTTTACAATTGTTGTTTGCTTCAAAATAAGCTTTTGGA
GATATCAAAC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 

AF RS1DQ90TF U 1
AF RS1FA03TF U 1
AF RS1DQ90JQ C 243
AF RS1DC04JQ C 267
AF RS1CJ10JQ C 675
AF RS1CJ10TF U 675
BS 1 562 RS1DQ90TF
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BS 673 675 RS1DQ90JQ
BS 676 906 RS1CJ10TF
BS 907 910 RS1CJ10JQ

RD RS1DQ90TF 562 0 0
GGAATCAGATTATCTGCAACGAAACAAAATGGCATTGGCTGGTCGTATCAGATCCGGGAT
CTCCTTCTTCAGGACCATCTCCGTCTCAGATGCTAGATCTTCGCTTATCCCTTCGCTGAG
AGATTATGCAACAGCTTCTGCTCAGAAAACCGGCAACGTTAAGGTGCCTGTGGCTTTGGT
TGGTGAATCTGGCAACTTTGCATCGTGGCTGTACATTGCAGCTGTGAAAATGAACTCCTT
GGAAAAGATTGAGTCCGATCTTTCTGAGCTGGTTGAGGCTATGAAGACAAGCCCTACTTT
TTCACAGTTTACTAAGGATCCCTCTGTTCCTAGAGAGACGAGACTCGCTGCTATTGTCGA
TGTTTGTGACAAAGCAAAGTTTGCTGAACCCACCAAGAACTTCCTCTCTTTGTTAGCTGA
GAATGGGAAGCTGAAGAACTTAGACGTGATTGTGAAAAAAATTCATGCAGCTGACGACGA
CACATAGGGGAGACGTCAAGGTTTTGGTTACCACAGTCATGCCGCTACCACCTGCTGAGG
AGAAAGAGCTTAAGGAGACGCT

QA 1 562 1 562
DS 

RD RS1FA03TF 672 0 0
GG
AATCAGATTATCTGCAACGAAACAAAATGGCATTGGCTGGTCGTATCAGATCCGGGATCT
CCTTCTTCAGGACCATCTCCGTCTCATATGCTAGATCTTCGCTTATCCCTTCGCTGAGAG
ATTATGCAACAGCTTCTGCTCAGAAAACCGGCAACGTTAAGGTGCCTGTGGCTTTGGTTG
GTGAATCTGGCAACTTTGCATCGTGGCTGTACATTGCAGCTGTGAAAATGAACTCCTTGG
AAAAGATTGAGTCCGATCTTTCTGAGCTGGTTGAGGCTATGAAGACAAGCCCTACTTTTT
CACAGTTTACTAAGGATCCCTCTGTTCCTAGAGAGACGAGACTCGCTGCTATTGTCGATG
TTTGTGACAAAGCAAAGTTTGCTGAACCCACCAAGAACTTCCTCTCTTTGTTAGCTGAGA
ATGGGAAGCTGAAGAACTTAGACGTGATTGTGAAAAAAATTCATGCAGCTGACGACGGCA
CATAGGGGAGACGTCAGGGTTTTGGTTACCACAGTCATGCCGCTACCACCTGCTGAGGAG
AAAGGGCTTAAGTAGACGCTTCAGGAGATAATTGGAGAAGGGAAGAAAGTTACTGTGGAA
CAAAAGATTGATCCGAGTATATATGGAGGGCTAATAGTAGAGTTTCAACAAAAGGTGTTG
GACATGTCTA

QA 3 672 3 672
DS 

RD RS1DQ90JQ 668 0 0
AAAAGATTGAGTCCGATCTTTCTGAGCTGGTTGAGGCTATGAAGACAAGCCCTACTTTTT
CACAGTTTACTAAGGATCCCTCTGTTCCTAGAGAGACGAGACTCGCTGCTATTGTCGATG
TTTGTGACAAAGCAAAGTTTGCTGAACCCACCAAGAACTTCCTCTCTTTGTTAGCTGAGA
ATGGGAAGCTGAAGAACTTAGACGTGATTGTGAAAAAAATTCATGCAGCTGACGACGACA
CATAGGGGAGACGTCAAGGTTTTGGTTACCACAGTCATGCCGCTACCACCTGCTGAGGAG
AAAGAGCTTAAGGAGACGCTTCAGGAGATAATTGGAGAAGGGAAGAAAGTTACTGTGGAA
CAAAAGATTGATCCGAGTATATATGGAGGGCTAATAGTAGAGTTTCAACAAAAGGTGTTG
GACATGTCTATCAGGACAAGGGCACAGCAGATGGAGAGGCTCCTCCGTGAACCTGTTGAC
TTCACCAACCTCTGATAATTTCCCCTTAAGAAACATGCTTTCTGATTTGCTGCTACAGAA
TCAGTTGACAAATAAATATGACCCTCCTCCTGGGAAACAATTTAATACAAGACACTTTTT
GGAAAAAAATTGTCATTGCATTTTACAATTGTTGTTTGCTTCAAAATAAGCTTTTGGAGA
TATC
AAAC

QA 1 664 1 664
DS 

RD RS1DC04JQ 640 0 0
AGCTGGTTGAGGCTATGAAGACAAGCCCTACTTTTTCACAGTTTACTAAGGATCCCTCTG
TTCCTAGAGAGACGAGACTCGCTGCTATTGTCGATGTTTGTGACAAAGCAAAGTTTGCTG
AACCCACCAAGAACTTCCTCTCTTTGTTAGCTGAGAATGGGAAGCTGAAGAACTTAGACG
TGATTGTGAAAAAA*TTCATGCAGCTGACGACGGCACATAGGGGAGACGTCAAGGTTTTG
GTTACCACAGTCATGCCGCTACCACCTGCTGAGGAGAAAGAGCTTAAGGAGACGCTTCAG
GAGATAATTGGAGAAGGGAAGGAAGTTACTGTGGAACAAAAGATTGATCCGAGTATATAT
GGAGGGCTAATAGTAGAGTTTCAACAAAAGGTGTTGGACATGTCTATCAGGACAAGGGCA
CAGCAGATGGAGTGGCTCCTCCGTGAACCTGTTGACTTCACCAACCTCTGATAATTTCCC
CTTAAGAAACATGCTTTCTGATTTGCTGCTACAGAATCAGTTGACAAATAAATATGACCC
TCCTCCTGGGAAACAATTTAATACAAGACACTTTTTGGAAAAAAATTGTCATTGCATTTT
ACAATTGTTGTTTGCTTCGAAATAAGCTTTTGGAGATATC

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1CJ10JQ 236 0 0
G
GGACAAGGGCACAGCAGATGGAGAGGCTCCTCCGTGAACCTGTTGACTTCACCAACCTCT
GATAATTTCCCCTTAAGAAACATGCTTTTTGATTTGCTGCTACAGAATCAGTTGACAAAT
AAATATGACCCTCCTCCTGGGAAACAATTTAATACAAGACACTTTTTGGAAAAAAATTGT
CATTGCATTTTACAATTGTTGTTTGCTTCAAAATAAGCTTTTGGAGATATCAAAC

QA 2 236 2 236
DS 

RD RS1CJ10TF 236 0 0
G
GGACAAGGGCACAGCAGATGGAGAGGCTCCTCCGTGAACCTGTTGACTTCACCAACCTCT
GATAATTTCCCCTTAAGAAACATGCTTTCTGATTTGCTGCTACAGAATCAGTTGACAAAT
AAATATGACCCTCCTCCTGGGAAACAATTTAATACAAGACACTTTTTGGAAAAAAATTGT
CATTGCATTTTACAATTGTTGTTTGCTTCAAAATAAGCTTTTGGAGATATC
AAAC

QA 2 232 2 232
DS 



CO CL31Contig3 949 4 5 U
GGAGATTATCTGCAACAACAAAAATGGCGTTGGCTGGTCGTATCAGATCCGGGATCTCCT
TCTTCAAAACCACCTCCGTCTCATCTGCTAGATCTCACCTCCGTGGAGCGCCGCTTATCC
CCGCGTTGAGAGATTACGCAACAGCTTCGACTCAGAAGACCGCCAATGTTAAGGTGCCTG
TGGCTTTAGTTGGTGAATCTGGCAACTTCGCCTCGTGGCTATACATAGCAGCAGTGAAAA
TGAACTCCTTGGAGAAGATCGAGTCTGATCTCTCCGAGCTCGTCGAGGCTATGAAGACGA
CCCCTATTTTTTCGCAGTTCACTAAAGATCCCTCTGTTCCTAGAGAGACGAGGCTCGCTG
CTATCGTGGATGTTTGTGATAAAGCCAAGTTCGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTCTCTT
TGTTAGCTGAGAATGGGAAGCTGAAGAATTTGGATGTGATTGTGAAAAAATTCATGCAGT
TGACAACAGCGCATAGAGGAGATGTCAAGGTTTTGGTTACCACTGTCATGCCGCTTCCAC
CTGCTGAGGAGAAGGAGTTGAAGGAGACACTCCAGGAGATAATCGGAGAAGGGAAGAAAG
TAACTGTGGAACAAAAGATTGATCCGAGTATCTACGGAGGGCTAATAGTAGAGTTTCAAC
AAAAGGTATTGGACATGTCTATTAGGACAAGGGCACAGCAGATGGAGAGGCTCCTCCGTG
AGCCTGTTGACTTCACCAACCTCTGAAGACTTCCCCCTAAAGAAACGTGCTTGTGATGAT
TCTACCACCAGTTGACAAATAAAATATGACACTGTCCTGAGAAACAACATATAAACACTT
GTGTCGGTTTTTTCGAATTTTGTCATTTCATTTTACAATTCTTGTTTTTTGCTTCGAAAT
AAGCTTTTGAAGACATCAAGTTTCAATGATATTTGGGTTTACGTTTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RS1GV25TF U 1
AF RS1BT70JQ C 245
AF RS1BT70TF U 245
AF RS1GV25JQ C 307
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BS 302 559 RS1GV25TF
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TGAACTCCTTGGAGAAGATCGAGTCTGATCTCTCCGAGCTCGTCGAGGCTATGAAGACGA
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CTGCTGAGGAGAAGGAGTT

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DS 

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G
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DS 

RD RS1BT70TF 703 0 0
G
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ATTTTTTCGCAGTTCACTAAAGATCCCTCTGTTCCTAGAGAGACGAGGCTCGCTGCTATC
GTGGATGTTTGTGATAAAGCCAAGTTCGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTCTCTTTGTTA
TCTGAGAATGGGAAGCTGAAGAATTTGGATGTGATTGTGAAAAAATTCATGCAGTTGACA
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GAGGAGAAGGAGTTGAAGGAGACACTCCAGGAGATAATCGGAGAAGGGAAGAAAGTAACT
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GGTTTTTTCGAATTTTGTCATTTCATTTTACAATTCTTGTTTTTTGCTTCGAAATAAGCT
TTTGAAGACATCAAGTTTCAATGATATTTGGGTTTACGTTTG

QA 2 703 2 703
DS 

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GTTTTTTCGAATTTTGTCATTTCATTTTACAATTCTTGTTTTTTGCTTCGAAATAAGCTT
TTGAAGACATCAAGTTTCAATGATATTTGGGTTTACGTTTGAG

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 18

CO CL32Contig1 672 18 9 U
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TCAACGGCCATGGCAGCTATAATAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATTATGA
ACAAAACAAT*GGATGATTCTGATATTAATCTCCTGATCTTATACTTTATACATGTAATC
ATATAGTTCTTGGCAAATAAAGTGTGAAAATTCCCACATTTATATATTCCTCAATCTCCT
AGAACGCAGCATCAAAAAGATTCTGGTATCAGTCTCACATTACAAGAATATGTTCAAAGA
TTCATGACGTTT


BQ
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 50 80 55 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 30 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 25 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 25 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 25 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 40 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 40 90 90 90 90 45 90 90 
90 90 90 90 65 90 90 90 90 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 70 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 40 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 70 95 95 95 95 65 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 70 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 60 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 30 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 75 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 
97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 97 80 95 95 95 95 95 90 90 90 90 90 90 90 90 70 70 70 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RS1AS69JQ C 1
AF RS1B151JQ C 1
AF RS1B151TF U 1
AF RS1AS69TF U 1
AF RS1D714JQ C 1
AF RS1CQ74TF U 52
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AF RS1GE09TF U 1
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AF RS1F207JQ C 13
AF RS1G755JQ C 174
AF RS1AR46TFB U 431
BS 1 297 RS1B151TF
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QA 1 577 1 577
DS 

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TCAACGGCCATGGCAGCTATAATAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATTATGA
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ATATAGTTCTTGGCAAATAAAGT

QA 1 563 1 563
DS 

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QA 1 577 1 577
DS 

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TCAACGGCCATGGCAGCTATAATAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATTATGA
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ATATAGTTCTTGGCAAATAAAGTGTGAAA

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TCAACGGCCATGGCAGCTATAATAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATTATGA
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ATATAGTTCTTGGCAAATAAAGTGTGAAAATTCCCACATTTATA
C

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DS 

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TATCACGAGGGAGAAGCTATATCATGTTCGCAGGTAAACATGTTCTTAGCACCATGTTTG
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GTTGATCTGGGTGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAG
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GCATTATGAACAAAACAAT*GGATGATTCTGATATTAATCTCCTGATCTTATACTTTATA
CATGTAATCATATAGTTCTTGGCAAATAAAGTGTGAAAATTCCCACATT

QA 1 529 1 529
DS 

RD RS1GL64TF 577 0 0
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ATCCCTGGAATCAACGATGACAATTCCAAACAACTACCTTCTAAATGTAATGTTGATCTG
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TCAACGGCCATGGCAGCTATAATAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATTATGA
ACAAAACAAT*GGATGATTCTGATATTAATCTCCTGATCTTATACTTTATACATGTAATC
ATATAGTTCTTGGCAAATAAAGTGTGAAAATTCCCAC

QA 1 577 1 577
DS 

RD RS1D714TF 585 0 0
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TCAACGGCCATGGCAGCTATAATAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATTATGA
ACAAAACAAT*GGATGATTCTGATATTAATCTCCTGATCTTATACTTTATACATGTAATC
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C

QA 1 584 1 584
DS 

RD RS1BU25JQ 568 0 0
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GATGATTCTGATATTAATCTCCTGATCTTATACTTTATACATGTAATCATATAGTTCTTG
GCAAATAAAGTGTGAAAATTCCCACATT

QA 1 568 1 568
DS 

RD RS1GE09JQ 492 0 0
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AACAACTACCTTTTAAATGTAATGTTGATTTGGGTGTCCCTTTTTTTAAGAGCGTGGACT
GTAACAGCATAAACTGAAAAGAGGACTATGTATCAACGGCCATGGCAGCTATAATAATAA
GTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATTATGAACAAATCAATTGGATGATTTTGATATTA
ATTTCCTGATTTTATACTTTATACATGTAATCATATAGTTCTTGGCAAATAAAGTGTGAA
AATTCCCACATT

QA 1 492 1 492
DS 

RD RS1BU25TF 568 0 0
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ATGTTAATGTTTGTCGTCATACTTTTAACGGTGATTGCGTATCATGAGGGAGAAGCTATA
TCATGTTCGCAGGTAAACATGTTCTTAGCACCATGTTTGTCTTATCTAAGATCTGGAGGA
AACCCCTCTCAACAGTGTTGTGGCGGGCTTAGCAGTCTAAAAGCCGCTGCGCCTGGGAAG
GCAGATAGGCAAACAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTGTCTAACACAATCCCTGGAATC
AACGATGACAATTCCAAACAACTACCTTCTAAATGTAATGTTGATCTGGGTGTCCCTTTC
TCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAGGACTATGTATCAACGGCCATG
GCAGCTATAATAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATTATGAACAAATCAATTG
GATGATTCTGATATTAATCTCCTGATCTTATACTTTATACATGTAATCATATAGTTCTTG
GCAAATAAAGTGTGAAAATTCCCACATT

QA 1 568 1 568
DS 

RD RS1GE09TF 580 0 0
CATCAAAACAATATTATCAAACACAAAGTTTTGAAGTAAGAGATTAGGAACATTACTTCT
AAAACAAGGAACATGTTAATGTTTGTCGTCATACTTTTAACGGTGATTGCGTATCATGAG
GGAGAAGCTATATCATGTTCGCAGGTAAACATGTTCTTAGCACCATGTTTGTCTTATCTA
AGATCTGGAGGAAACCCCTCTCAACAGTGTTGTGGCGGGCTTAGCAGTCTAAAAGCCGCT
GCGCCTGGGAAGGCAGATAGGCAAACAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTGTCTAACACA
ATCCCTGTAATCAACGATGACAATTCCAAACAACTACCTTCTAAATGTAATGTTGATCTG
GGTGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAGGACTATGTA
TCAACGGCCATGGCAGCTATAATAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATTATGA
ACAAATCAATTGGATGATTCTGATATTAATCTCCTGATCTTATACTTTATACATGTAATC
ATATAGTTCTTGGCAAATAAAGTGTGAAAATTCCCACATT

QA 1 580 1 580
DS 

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GGAAACCCCTCTCAACAGTGTTGTGGCGGGCTTAGCAGTTTAAAAGCCGCTGCGCCTGGG
AAGGCAGATAGGCAAACAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTGTCTAACACAATCCCTGGA
ATCAACGATGACAATTCCAAACAACTACCTTCTAAATGTAATGTTGATCTGGGTGTCCCT
TTCTTTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAGGACTATGTATCAACGGCC
ATGGCAGCTATAATAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATTATGAACAAAACAA
T*GGATGATTCTGATATTAATCTCCTGATCTTATACTTTATACATGTAATCATATAGTTC
TTGGCAAATAAAGTGTGAAAATTCCCAC

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DS 

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ATTATCAAACACAAAGTTTTGAAGTAAGAGATGAGGAACATTACTTCTAAAACAAGCAAC
ATGTTAATGTTTGTCGCCATACTTTTAGCGGTGATTGCGTATCACGAGGGAGAAGCTATA
TCATGTTCGCAGGTAAACATGTTCTTAGCACCATGTTTGTCTTATCTAAGATCTGGAGGA
AACCCCTCTCAACAGTGTTGTGGCGGGCTTAGCAGTCTAAAAGCCGCTGCGCCTGGGAAG
GCAGATAGGCAAACAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTGTCTAACACAATCCCTGGAATC
AACGATGACAATTCCAAACAACTACCTTCTAAATGTAATGTTGATCTGGGTGTCCCTTTC
TCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAGGACTATGTATCAACGGCCATG
GCAGCTATAATAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATTATGAACAAAACAAT*G
GATGATTCTGATATTAATCTCCTGATCTTATACTTTATACATGTAATCATATAGTTCTTG
GCAAATAAAGTGTGAAAATTCCCACATTTATATATTCCTCAATCTCCTAGAACGCAG
CTTCAAAAA

QA 1 597 1 597
DS 

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AAAACAAGGAACATGTTAATGTTTGTCGTCATACTTTTAACGGTGATTGCGTATCATGAG
GGAGAAGCTATATCATGTTCGCAGGTAAACATGTTCTTAGCACCATGTTTGTCTTATCTA
AGATCTGGAGGAAACCCCTCTCAACAGTGTTGTGGCGGGCTTAGCAGTCTAAAAGCCGCT
GCGCCTGGGAAGGCAGATAGGCAAACAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTGTCTAACACA
ATCCCTGGAATCAACGATGACAATTCCAAACAACTACCTTCTAAATGTAATGTTGATCTG
GGTGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAGGACTATGTA
TCAACGGCCATGGCAGCTATAATAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATTATGA
ACAAATCAATTGGATGATTCTGATATTAATCTCCTGATCTTATACTTTATACATGTAATC
ATATAGTTCTTGGCAAATAAAGTGTGAAAATTCCCACATTTATATATTCCTCAATCTCCT
AGAACGCAGTATCAAAAAGATTCTGGTATCAGTCTCACATTACAAGAATATGTTCAAAGA
TTCATGACGTT

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DS 

RD RS1F207JQ 651 0 0
ATTATCAAACACAAAGTTTTGAAGTAAGAGATGAGGAACATTACTTCTAAAACAAGCAAC
ATGTTAATGTTTGTCGCCATACTTTTAGCGGTGATTGCGTATCACGAGGGAGAAGCTATA
TCATGTTCGCAGGTAAACATGTTTTTAGCACCATGTTTGTTTTATTTAAGATCTGGAGGA
AACCCCTCTCAACAGTGTTGTGGCGGGCTTAGCAGTTTAAAAGCCGCTGCGCCTGGGAAG
GCAGATAGGCAAACAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTGTCTAACACAATCCCTGGAATC
AACGATGACAATTCCAAACAACTACCTTCTAAATGTAATGTTGATCTGGGTGTCCCTTTC
TCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAGGACTATGTATCAACGGCCATG
GCAGCTATAATAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATTATGAACAAAACAAT*G
GATGATTCTGATATTAATCTCCTGATCTTATACTTTATACATGTAATCATATAGTTCTTG
GCAAATAAAGTGTGAAAATTCCCACATTTATATATTCCTCAATCTCCTAGAACGCAGCTT
CAAAAAGATTCTGGTATCAGTCTCACATTACAAGAATATGTTCAAAGATTC

QA 1 651 1 651
DS 

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TTATCTAAGATCTGGAGGAAACCCCTCTCAACAGTGTTGTGGCGGGCTTAGCAGTCTAAA
AGCCGCTGCGCCTGGGAAGGCAGATAGGCAAACAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTGTC
TAACACAATCCCTGGAATCAACGATGACAATTCCAAACAACTACCTTCTAAATGTAATGT
TGATCTGGGTGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAGGA
CTATGTATCAACGGCCATGGCAGCTATAATAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGC
ATTATGAACAAATCAATTGGATGATTCTGATATTAATCTCCTGATCTTATACTTTATACA
TGTAATCATATAGTTCTTGGCAAATAAAGTGTGAAAATTCCCACATTTATATATTCCTCA
ATCTCCTAGAACGCAGTATCAAAAAGATTCTGGTATCAGTCTCACATTACAAGAATATGT
TCAAAGATTCATGACGTT
T

QA 1 498 1 498
DS 

RD RS1AR46TFB 242 0 0
G
GGCAGCTATAATAATAAGTGGATGTCCTTAAAGAGCAAACGCATTATGAACAAAACAAT*
GGATGATTCTGATATTAATCTCCTGATCTTATACTTTATACATGTAATCATATAGTTCTT
GGCAAATAAAGTATGAAAATTCCCACATTTATATATTCCTCAATCTCCTAGAACGCAGCT
TCAAAAAGATTCTGGTATCAGTCTCACATTACAAGAATATGTTCAAAGATTCATGACGTT
T

QA 2 242 2 242
DS 



AS 2 17

CO CL33Contig1 1205 15 21 U
CAATTTACATGAAGTTTAAGTTTTAATTTAGCTGAACGTCAAGTCGTTCACATTTTAATG
CAGTTCTAGCGTCTTTCATGGAAACACAATACAAACACACACCCAACGTGAATTCGAAAA
CACTTACACTGATGCAAAAACATGAAGTGAATTAAGGGAACAATGCAGAATATAATGAAC
ACTAAAAAGAATAGGCATATGCTATTTATCACACAAAATTTGTTCACACAAGGCCATCAT
ATAATAGCTCTTAGGAGCTACTCATTGATCCTCACTTCGACGCTTTTTACTCCCTTCCGA
CTTCTTATTATACAGCAATCGGTGTATCCTTGGAAGCTATGTTGGAGACGGCTAGATTGA
ACTTCTCTTTGGTTTTCGAGCCAGCAAGCTGACCTGCTCTCGCAACTTTGCTGAAAGCGC
CACTAAACCAAGCAGCTCCAGCAGTCACATACCTGCTTGATTTGACAGCTGAACCAGTGT
CGTTTAACTTCTTCTCAGCTGCAAATATAGCGGCCATGGTTTTATCGGAAACCTGAAGCC
TCTGGTCAACGGATTTTACTTTCTCGTTAACCACAGAGATACCCACGTTGAACTTCTCGC
TAAGCCTGACTCTCTTGTCAAAAGAAGAAACTCTGGCGGAAGCATTGGCTCTTATCTGGT
GCAACTCATCAAAAGCCTTGGCTTTGTTCACAGCATCTTGTCCAAGAGCAGAGCCTTTGG
CCAAAACAGTAGCCATCACATCTTGCGCTTTGCTAACGTACGCTCTACCACCATTGCCAT
CATTGTTCTGGCGTGTTGGTGTTGCTGGCATCGCGTTCTCTACCACTTGCTGCATGATCT
CACGCCTAGGAACATAGTTGTCAGCTGGAGTTATAGTAACGATCTTGTCTACAATTGTGG
CACCCGATAATAAGAGAGCGATTTCAAGGGCTTTAGGTTCAGTAAAGGTAACAAAAGCGA
CTCTTGATTGCTCGGAAGCATCTTTAAGGATGTGGATGTGGTCTATGTCGCCGGAGAAGG
AGAAAAACTCGTGAATCTCTCTCTCCGTTGCCAGATCTGATACATTCTCCACTTTAACAC
TTCTCGTCTGGTGCTGCATTGTCGGCGGCGGAAGGAAGGAAGGAAG****TCTGAGAGGG
GGAGAGAATATTAATTTGCGGAAGAGAGAAGTAAAAGATTTGAACAGCCCACTCACCCAA
CTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 35 35 35 35 35 35 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 40 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 65 65 65 50 50 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
45 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 35 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 70 70 70 70 
70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 55 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 50 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 50 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 
60 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 45 45 60 60 45 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1G855JQ U 9
AF RS1G765JQ U 9
AF RS1BV52JQ U 166
AF RS1C875JQ U 131
AF RS1E592JQ U 1
AF RS1DJ86JQ U 57
AF RS1G656JQ U 7
AF RS1B546JQ U 49
AF RS1CU78JQ U 50
AF RS1G656TF C 162
AF RS1DS92TF C 328
AF RS1E592TF C 407
AF RS1CU78TF C 435
AF RS1BV52TF C 537
AF RS1C875TF C 545
BS 1 233 RS1E592JQ
BS 234 234 RS1G656JQ
BS 235 259 RS1E592JQ
BS 260 260 RS1G656JQ
BS 261 776 RS1E592JQ
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BS 847 874 RS1B546JQ
BS 875 896 RS1CU78JQ
BS 897 959 RS1G656TF
BS 960 962 RS1DS92TF
BS 963 1039 RS1E592TF
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BS 1041 1093 RS1E592TF
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BS 1101 1101 RS1CU78TF
BS 1102 1142 RS1E592TF
BS 1143 1149 RS1BV52TF
BS 1150 1205 RS1C875TF

RD RS1G855JQ 343 0 0
G
TGAAGTTTAAGTTTTAATTTAGCTGAACGTCAAGTCGTTCACATTTTAATGCAGTTCTAG
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TGATGCAAAAACATGAAGTGAATTAAGGGAACAATGCAGAATATAATGAACACTAAAAAG
AATAGGCATATGCTATTTATCACACAAAATTTGTTCACACAAGGCCATCATATAATAGCT
CTTAGGAGCTACTCATTGATCCTCACTTCGACGCTTTTTACTCCCTTCCGACTTCTTATT
ATACAGCAATCGGTGTATCCTTGGAAGCTATGTTGGAGACGG

QA 2 343 2 343
DS 

RD RS1G765JQ 465 0 0
G
TGAAGTTTAAGTTTTAATTTAGCTGAACGTCAAGTCGTTCACATTTTAATGCAGTTCTAG
CGTCTTTCATGGAAACACAATACAAACACACACCCAACGTGAATTCGAAAACACTTACAC
TGATGCAAAAACATGAAGTGAATTAAGGGAACAATGCAGAATATAATGAACACTAAAAAG
AATAGGCATATGCTATTTATCACACAAAATTTGTTCACACAAGGCCATCATATAATAGCT
CTTAGGAGCTACTCATTGATCCTCACTTCGACGCTTTTTACTCCCTTCCGACTTCTTATT
ATACAGCAATCGGTGTATCCTTGGAAGCTATGTTGGAAACGGCTAGATTGAACTTCTCTT
TGGTTTTCGAGCCAGCAAGCTGACCTGCTCTCGCAACTTTGCTGAAAGCGCCACTAAACC
AAGCAGCTCCAGCAGTCACATACCTGCTTGATTTGACAGCTGAA

QA 2 465 2 465
DS 

RD RS1BV52JQ 394 0 0
CAGAATATAATGAACACTAAAAAGAATAGGCATATGCTATTTATCACACAAAATTTGTTC
ACACAAGGGCATCATATAATAGCTCTTAGGAGCTACTCATTGATCCTCACTTCGACGCTT
TTTACTCCCTTCCGACTTCTTATTATACAGCAATCGGTGTATCCTTGGAAGCTATGTTGG
AGACGGCTAGATTGAACTTCTCTTTGGTTTTCGAGCCAGCAAGCTGACCTGCTCTCGCAA
CTTTGCTGAAAGCGCCACTAAACCAAGCAGCTCCAGCAGTCACATACCTGCTTGATTTGA
CAGCTGAACCAGTGTCGTTTAACTTCTTCTCAGCTGCAAATATAGCGGCCATGGTTTTAT
CGGAAACCTGAAGCCTCTGGTCAACGGATTTTAC

QA 1 394 1 394
DS 

RD RS1C875JQ 582 0 0
TT
TGCAAAAACATGAAGTGAATTAAGGGAACAATGCAGAATATAATGAACACTAAAAAGAAT
AGGCATATGCTATTTATCACACAAAATTTGTTCACACAAGGCCATCATATAATAGCTCTT
AGGAGCTACTCATTGATCCTCACTTCGACGCTTTTTACTCCCTTCCGACTTCTTATTATA
CAGCAATCGGTGTATCCTTGGAAGCTATGTTGGAGACGGCTAGATTGAACTTCTCTTTGG
TTTTCGAGCCAGCAAGCTGACCTGCTCTCGCAACTTTGCTGAAAGCGCCACTAAACCAAG
CAGCTCCAGCAGTCACATACCTGCTTGATTTGACAGCTGAACCAGTGTCGTTTAACTTCT
TCTCAGCTGCAAATATAGCGGCCATGGTTTTATCGGAAACCTGAAGCCTCTGGTCAACGG
ATTTTACTTTCTCGTTAACCACAGAGATACCCACGTTGAACTTCTCGCTAAGCCTGACTC
TCTTGTCAAAAGAAAAAACTCTGGCGGAAGCATTGGCTCTTATCTGGGGCAACTCATCAA
AAGCCTTGGCTTTGTTCACAGCATCTTGTCCAAGAGCAGA

QA 3 582 3 582
DS 

RD RS1E592JQ 776 0 0
CAATTTACATGAAGTTTAAGTTTTAATTTAGCTGAACGTCAAGTCGTTCACATTTTAATG
CAGTTCTAGCGTCTTTCATGGAAACACAATACAAACACACACCCAACGTGAATTCGAAAA
CACTTACACTGATGCAAAAACATGAAGTGAATTAAGGGAACAATGCAGAATATAATGAAC
ACTAAAAAGAATAGGCATATGCTATTTATCACACAAAATTTGTTCACACAAGGGCATCAT
ATAATAGCTCTTAGGAGCTGCTCATTGATCCTCACTTCGACGCTTTTTACTCCCTTCCGA
CTTCTTATTATACAGCAATCGGTGTATCCTTGGAAGCTATGTTGGAGACGGCTAGATTGA
ACTTCTCTTTGGTTTTCGAGCCAGCAAGCTGACCTGCTCTCGCAACTTTGCTGAAAGCGC
CACTAAACCAAGCAGCTCCAGCAGTCACATACCTGCTTGATTTGACAGCTGAACCAGTGT
CGTTTAACTTCTTCTCAGCTGCAAATATAGCGGCCATGGTTTTATCGGAAACCTGAAGCC
TCTGGTCAACGGATTTTACTTTCTCGTTAACCACAGAGATACCCACGTTGAACTTCTCGC
TAAGCCTGACTCTCTTGTCAAAAGAAGAAACTCTGGCGGAAGCATTGGCTCTTATCTGGT
GCAACTCATCAAAAGCCTTGGCTTTGTTCACAGCATCTTGTCCAAGAGCAGAGCCTTTGG
CCAAAACAGTAGCCATCACATCTTGCGCTTTGCTAACGTACGCTCTACCACCATTG

QA 1 776 1 776
DS 

RD RS1DJ86JQ 765 0 0
AATGCAGTTCTAGCGTCTTTCATGGAAACACAATACAAACACATACCCAACGTGAATTCG
AAAACACTTACACTGATGCAAAAACATGAAGTGAATTAAGGGAACAATGCAAAATATAAT
GAACACTAAAAAGAATAGGCATATGCTATTTATCACACAAAATTTGTTCACACAAGGCCA
TCATATAATAGCTCTTAGGAGCTACTCATTGATCCTCACTTCGACGCTTTTTACTCCCTT
CCGACTTCTTATTATACAGCAATCGGTGTATCCTTGGAAGCTATGTTGGAGACGGCTAGA
TTGAACTCCTCTTTGGTTTTCGAGCCAGCAAGCTGACCTGCTCTCGCAACTTTGCTGAAA
GCGGCACTAAACCAAGCAGCTCCAGCAGTCACATACCTGCTTGATTTGACAGCTGAACCA
GTGTCGTTTAACTTCTTCTCAGCTGCAAATATAGCGGCCATGGTTTTATCGGAAACCTGA
AGCCTCTGGTCAACGGATTTTACTTTCTCGTTAACCACAGAGATACCCACGTTGAACTTC
TCGCTAAGCCTGACTCTCTTGTCAAAAGAAGAAACTCTGGCGGAAGCATTGGCTCTTATC
TGGTGCAACTCATCAAAAGCCTTGGCTTTGTTCACAGCATCTTGTCCAAGAGCAGAGCCT
TTGGCCAAAACAGTAGCCATCACATCTTGCGCTTTGCTAACGTACGCTCTACCACCATTG
CCATCATTGTTCTGGCGTGTTGGTGTTGCTGGCATAGCGTTCTCT

QA 1 765 1 765
DS 

RD RS1G656JQ 843 0 0
GCA
TGAAGTTTAAGTTTTAATTTAGCTGAACGTCAAGTCGTTCACATTTTAATGCAGTTCTAG
CGTCTTTCATGGAAACACAATACAAACACACACCCAACGTGAATTCGAAAACACTTACAC
TGATGCAAAAACATGAAGTGAATTAAGGGAACAATGCAGAATATAATGAACACTAAAAAG
AATAGGCATATGCTATTTATCACACAAAATTTGTTCACACAAGGCCATCATATAATAGCT
CTTAGGAGCTACTCATTGATCCTCACTTCGACGCTTTTTACTCCCTTCCGACTTCTTATT
ATACAGCAATCGGTGTATCCTTGGAAGCTATGTTGGAGACGGCTAGATTGAACTTCTCTT
TGGTTTTCGAGCCAGCAAGCTGACCTGCTCTCGCAACTTTGCTGAAAGCGCCACTAAACC
AAGCAGCTCCAGCAGTCACATACCTGCTTGATTTGACAGCTGAACCAGTGTCGTTTAACT
TCTTCTCAGCTGCAAATATAGCGGCCATGGTTTTATCGGAAACCTGAAGCCTCTGGTCAA
CGGATTTTACTTTCTCGTTAACCACAGAGATACCCACGTTGAACTTCTCGCTAAGCCTGA
CTCTCTTGTCAAAAGAAGAAACTCTGGCGGAAGCATTGGCTCTTATCCGGTGCAACTCAT
CAAAAGCCTTGGCTTTGTTCACAGCATCTTGTCCAAGAGCAGAGCCTTTGGCCAAAACAG
TAGCCATCACATCTTGCGCTTTGCTAACGTACGCTCCACCACCATTGCCATCATTGTTCT
GGCGTGTTGGTGTTGCTGGCATCGCGTTCTCTACCACTTGCTGCATGATCTCAC
CCTAGG

QA 4 837 4 837
DS 

RD RS1B546JQ 826 0 0
CACATTTTAAGGCAGTTCTAGCGTCTTTCATGGAAACACAATACAAACACACACCCAACG
TGAATTCGAAAACACTTACACTGATGCAAAAACATGAAGTGAATTAAGGGAACAATGCAA
AATATAATGAACACTAAAAAGAATAGGAATATGCTATTTATCACACAAAATTTGTTCACA
CAAGGCCATCATATAATAGCTCTTAGGAGCTACTCATTGATCCTCACTTCAACGCTTTTT
ACTCCCTTCCGACTTCTTATTATACAGCAATCGGTGTATCCTTGGAAGCTATATTGGGGA
CGGCTAGATTGAACTTCTCTTTGGTTTTCGAGCCAGCAAGCTGACCTGCTCTCGCAACTT
TGCTGAAAGCGCCACTAAACCAAGCAGCTCCAGCAGTCACGTACCTGCTTGATTTGACAG
CTGAACCAGTGTCGTTTAACTTCTTCTCAGCAGCAAATATAGCCGCCATGGTTTTATCGG
AAACCTGAAGCCTCTGGTCAACGGATTTTACTTTCTCGTTAACCACAGAGATACCCACGT
TGAACTTCTCACTAAGCCTGACTCTCTTGTCAAAAGAAGAAACTCTGGCGGAAGCATTGG
CTCTTATCTGGTGCAACTCATCAAAAGCCTTGGCTTTGTTGACAGCATCTTGTCCAAGAG
CAGAGCCTTTAGCCAAAACAGTAGCCATCACATCTTGGGCTTTGCTAACATACGTTCTAC
CACCATTGCCATCCGTGTTCTGGCGTGTGGGTGTTGGGGGTATCGCGTTCTCTACCACTT
GCTGCATGATCTCACGC*TAGGAACATAGTTGTCAGCTGGAGTTAT

QA 1 826 1 826
DS 

RD RS1CU78JQ 847 0 0
G
CATTTTAATGCAGTTCTAGCGTCTTTCATGGAAACACAATACAAACACACACCCAACGTG
AATTCGAAAACACTTACACTGATGCAAAAACATGAAGTGAATTAAGGGAACAATGCAGAA
TATAATGAACACTAAAAAGAATAGGCATATGCTATTTATCACACAAAATTTGTTCACACA
AGGCCATCATATAATAGCTCTTAGGAGCTACTCATTGATCCTCACTTCGACGCTTTTTAC
TCCCTTCCGACTTCTTATTATACAGCAATCGGTGTATCCTTGGAAGCTATGTTGGAGACG
GCTAGATTGAACTTCTCTTTGGTTTTCGAGCCAGCAAGCTGACCTGCTCTCGCAACTTTG
CTGAAAGCGCCACTAAACCAAGCAGCTCCAGCAGTCACATACCTGCTTGATTTGACAGCT
GAACCAGTGTCGTTTAACTTCTTCTCAGCTGCAAATATAGCGGCCATGGTTTTATCGGAA
ACCTGAAGCCTCTGGTCAACGGATTTTACTTTCTCGTTAACCACAGAGATACCCACGTTG
AACTTCTCGCTAAGCCTGACTCTCTTGTCAAAAGAAGAAACTCTGGCGGAAGCATTGGCT
CTTATCTGGTGCAACTCATCAAAAGCCTTGGCTTTGTTCACAGCATCTTGTCCAAGAGCA
GAGCCTTTGGCCAAAACAGTAGCCATCACATCTTGCGCTTTGCTAACGTACGCTCTACCA
CCATTGCCATCATTGTTCTGGCGTGTTGGTGTTGCTGGCATCGCGTTCTCTACCACTTGC
TGCATGATCTCACGCCTAGGAACATAGTTGTCAGCTGGAGTTATAGTAACGATCTTGTCT
ACAATT

QA 2 847 2 847
DS 

RD RS1G656TF 799 0 0
AATGCAGAATATAATGAACACTAAAA*GAATAGGCATATGCTATTTATCACACAAAATTT
GTTCACACAAGGCCATCATATAATAGCTCTTAGGAGCTACTCATTGATCCTCACTTCGAC
GCTTTTTACTCCCTTCCGACTTCTTATTATACAGCAATCGGTGTATCCTTGGAAGCTATG
TTGGAGACGGCTAGATTGAACTTCTCTTTGGTTTTCGAGCCAGCAAGCTGACCTGCTCTC
GCAACTTTGCTGAAAGCGCCACTAAACCAAGCAGCTCCAGCAGTCACATACCTGCTTGAT
TTGACAGCTGAACCAGTGTCGTTTAACTTCTTCTCAGCTGCAAATATAGCGGCCATGGTT
TTATCGGAAACCTGAAGCCTCTGGTCAACGGATTTTACTTTCTCGTTAACCACAGAGATA
CCCACGTTGAACTTCTCGCTAAGCCTGACTCTCTTGTCAAAAGAAGAAACTCTGGCGGAA
GCATTGGCTCTTATCCGGTGCAACTCATCAAAAGCCTTGGCTTTGTTCACAGCATCTTGT
CCAAGAGCAGAGCCTTTGGCCAAAACAGTAGCCATCACATCTTGCGCTTTGCTAACGTAC
GCTCCACCACCATTGCCATCATTGTTCTGGCGTGTTGGTGTTGCTGGCATCGCGTTCTCT
ACCACTTGCTGCATGATCTCACGCCTAGGAACATAGTTGTCAGCTGGAGTTATAGTAACG
ATCTTGTCTACAATTGTGGCACCCGATAATAAGAGAGCGATTTCAAGGGCTTTAGGTTCA
GTAAAGGTAACAAAAGCG
C

QA 1 798 1 798
DS 

RD RS1DS92TF 635 0 0
TATCCTGGAGCTATG
TGGAGACGGCTAGATTGA*CTTCTCTTTGGTTT*CGAGCCAGCAAGCTGAC*TGCTCTCG
CAACTTTGCTGAAAGCGCCACTAAACCAAGCAGCTCCAGCAGTCACATAC*TGCTTGATT
TGACAGCTGAACCAGTGTCGTTTA*CTTCTTCTCAGCTGCAAATATAGCGGCCATGGTTT
TATCGGAAACCTGAAGCCTCTGGTCAACGGATTTTACTTTCTCGTTAACCACAGAGATAC
CCACGTTGAACTTCTCGCTAAGCCTGACTCTCTTGTCAAAAGAAGAAACTCTGGCGGAAG
CATTGGCTCTTATCTGGTGCAACTCATCAAAAGCCTTGGCTTTGTTCACAGCATCTTGTC
CAAGAGCAGAGCCTTTGGCCAAAACAGTAGCCATCACATCTTGCGCTTTGCTAACGTACG
CTCTACCACCATTGCCATCATTGTTCTGGCGTGTTGGTGTTGCTGGCATCGCGTTCTCTA
CCACTTGCTGCATGATCTCACGCCTAGGAACATAGTTGTCAGCTGGAGTTATAGTAACGA
TCTTGTCTACAATTGTGGCACCCGATAATAAGAGAGCGATTTCAAGGGCTTTAGGTTCAG
TAAAGGTAACAAAAGCGACT

QA 16 635 16 635
DS 

RD RS1E592TF 738 0 0
TTTGCTGAAAGCGCCACTAAACCAAGCAGCTCCAGCAGTCACATAC*TGCTTGATTTGAC
AGCTGAACCAGTGTCGTTTA*CTTCTTCTCAGCTGCAAATATAGCGGCCATGGTTTTATC
GGAAACGTGAAGCCTCTGGTCAACGGATTTTACTTTCTCGTTAACCACAGAGATACCCAC
GTTGAACTTCTCGCTAAGCCTGACTCTCTTGTCAAAAGAAGAAACTCTGGCGGAAGCATT
GGCTCTTATCTGGTGCAACTCATCAAAAGCCTTGGCTTTGTTCACAGCATCTTGTCCAAG
AGCAGAGCCTTTGGCCAAAACAGTAGCCATCACATCTTGCGCTTTGCTAACGTACGCTCT
ACCACCATTGCCATCATTGTTCTGGCGTGTTGGTGTTGCTGGCATCGCGTTCTCTACCAC
TTGCTGCATGATCTCACGCCTGGGAACATAGTTGTCAGCTGGAGTTATAGTAACGATCTT
GTCTACAATTGTGGCACCCGATAATAAGAGAGCGATTTCAAGGGCTTTAGGTTCAGTAAA
GGTAACAAAAGCGACTCTTGATTGCTCGGAAGCATCTTTAAGGATGTGGATGTGGTCTAT
GTCGCCGGAGAAGGAGAAAAACTCGTGAATCTCCCTCTCCGTTGCCAGATCTGATACATT
CTCCACTTTAACACTTCTCGTCTGGTGTTGCATTATCGGCGGCGGAAGGAAGGAAGGAAG
****TCTGAGAGGGGG
CC

QA 1 736 1 736
DS 

RD RS1CU78TF 710 0 0
GCTCCAGCAGTCACATAC*TGCTTGATTTGACAGCTGAACCAGTGTCGTTTAACTTCTTC
TCAGCTGCAAATATAGCGGCCATGGTTTTATCGGAAACCTGAAGCCTCTGGTCAACGGAT
TTTACTTTCTCGTTAACCACAGAGATACCCACGTTGAACTTCTCGCTAAGCCTGACTCTC
TTGTCAAAAGAAGAAACTCTGGCGGAAGCATTGGCTCTTATCTGGTGCAACTCATCAAAA
GCCTTGGCTTTGTTCACAGCATCTTGTCCAAGAGCAGAGCCTTTGGCCAAAACAGTAGCC
ATCACATCTTGCGCTTTGCTAACGTACGCTCTACCACCATTGCCATCATTGTTCTGGCGT
GTTGGTGTTGCTGGCATCGCGTTCTCTACCACTTGCTGCATGATCTCACGCCTAGGAACA
TAGTTGTCAGCTGGAGTTATAGTAACGATCTTGTCTACAATTGTGGCACCCGATAATAAG
AGAGCGATTTCAAGGGCTTTAGGTTCAGTAAAGGTAACAAAAGCGACTCTTGATTGCTCG
GAAGCATCTTTAAGGATGTGGATGTGGTCTATGTCGCCGGAGAAGGAGAAAAACTCGTGA
ATCTCTCTCTCCGTTGCCAGATCTGATACATTCTCCACTTTAACACTTCTCGTCTGGTGC
TGCATTGTCGGCGGCGGAAGGAAGGAAGGAAG****TCTGAGAGGGGG
CC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1BV52TF 618 0 0
AGCCTCTGGTCAACGGATTTTACTTTCTCGTTAACCACAGAGATACCCACGTTGAACTTC
TCGCTAAGCCTGACTCTCTTGTCAAAAGAAGAAACTCTGGCGGAAGCATTGGCTCTTATC
TGGTGCAACTCATCAAAAGCCTTGGCTTTGTTCACAGCATCTTGTCCAAGAGCAGAGCCT
TTGGCCAAAACAGTAGCCATCACATCTTGCGCTTTGCTAACGTACGCTCTACCACCATTG
CCATCATTGTTCTGGCGTGTTGGTGTTGCTGGCATCGCGTTCTCTACCACTTGCTGCATG
ATCTCACGCCTAGGAACATAGTTGTCAGCTGGAGTTATAGTAACGATCTTGTCTACAATT
GTGGCACCCGATAATAAGAGAGCGATTTCAAGGGCTTTAGGTTCAGTAAAGGTAACAAAA
GCGACTCTTGATTGCTCGGAAGCATCTTTAAGGATGTGGATGTGGTCTATGTCGCCGGAG
AAGGAGAAAAACTCGTGAATCTCTCTCTCCGTTGCCAGATCTGATACATTCTCCACTTTA
ACACTTCTCGTCTGGTGCTGCATTGTCGGCGGCGGAAGGAAGGAAGGAAG****TCTGAG
AGGGGGAGAGAAT
ATTCC

QA 1 613 1 613
DS 

RD RS1C875TF 661 0 0
GTCAACGGATTTTACTTTCTCGTTAACCACAGAGATACCCACGTTGAACTTCTCGCTAAG
CCTGACTCTCTTGTCAAAAGAAGAAACTCTGGCGGAAGCATTGGCTCTTATCTGGTGCAA
CTCATCAAAAGCCTTGGCTTTGTTCACAGCATCTTGTCCAAGAGCAGAGCCTTTGGCCAA
AACAGTAGCCATCACATCTTGCGCTTTGCTAACGTACGCTCTACCACCATTGCCATCATT
GTTCTGGCGTGTTGGTGTTGCTGGCATCGCGTTCTCTACCACTTGCTGCATGATCTCACG
CCTAGGAACATAGTTGTCAGCTGGAGTTATAGTAACGATCTTGTCTACAATTGTGGCACC
CGATAATAAGAGAGCGATTTCAAGGGCTTTAGGTTCAGTAAAGGTAACAAACGCGACTCT
TGATTGCTCGGAAGCATCTTTAAGGATGTGGATGTGGTCTATGTCGCCGGAGAAGGAGAA
AAACTCGTGGATCTCTCTCTCCGCTGCCAGATCTGACACATTCTCCACTTTAACACTTCT
CGTCTGGTGCTGCATTGTCGGCGGCGGAAGGAAGGAAGGAAGGGAGTCTGAGAGGGGGAG
AGAATATTAATTTGCGGAAGAGAGAAGTAAAAGATTTGAACAGCCCACTCACCCAACTGC
C

QA 1 661 1 661
DS 



CO CL33Contig2 595 2 2 U
GGATTCTCTCCCCCTCTCAGACTTCCTTCCTTCCTTCCGCCGCCGACAATGCAGCACCAG
ACGAGAAGTGTTAAAGTGGAGAATGTATCAGATCTGGCAACGGAGAGAGAGATTCACGAG
TTTTTCTCCATCTCCGGCGACATAGACCACATCCACATCCTTAATGTGATTTTTGAGTGC
AGAGATGCTTCCGAGCAATCAAGAGTCGCTTTTGTTACCTTTACTGAACCTAAAGCCCTT
GAAATCGCTCTCTTATTATCGGGTGCCACAATTGTAGACAAGATCGTTACTATAACTCCA
GCTGACAACTATGTTCCTAGGCGTGAGATCATGCAGCAAGTGGTAGAGAACGCGATGCCA
GCAACACCAACACGCCAGAACAATGATGGCAATGGTGGTAGAGCGTACGTTAGCAAAGCG
CAAGATGTGATGGCTACTGTTTTGGCCAAAGGCTCTGCTCTTGGACAAGATGCTGTGAAC
AAAGCCAAGGCTTTTGATGAGTTGCACCAGATAAGAGCCAATGCTTCCGCCAGAGTTTCT
TCTTTTGACAAGAGAGTCAGGCTTAGCGAGAAGTTCAACGTGGGTATCTCTGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G765TF U 1
AF RS1G855TF U 1
BS 1 542 RS1G765TF
BS 543 595 RS1G855TF

RD RS1G765TF 542 0 0
GGATTCTCTCCCCCTCTCAGACTTCCTTCCTTCCTTCCGCCGCCGACAATGCAGCACCAG
ACGAGAAGTGTTAAAGTGGAGAATGTATCAGATCTGGCAACGGAGAGAGAGATTCACGAG
TTTTTCTCCATCTCCGGCGACATAGACCACATCCACATCCTTAATGTGATTTTTGAGTGC
AGAGATGCTTCCGAGCAATCAAGAGTCGCTTTTGTTACCTTTACTGAACCTAAAGCCCTT
GAAATCGCTCTCTTATTATCGGGTGCCACAATTGTAGACAAGATCGTTACTATAACTCCA
GCTGACAACTATGTTCCTAGGCGTGAGATCATGCAGCAAGTGGTAGAGAACGCGATGCCA
GCAACACCAACACGCCAGAACAATGATGGCAATGGTGGTAGAGCGTACGTTAGCAAAGCG
CAAGATGTGATGGCTACTGTTTTGGCCAAAGGCTCTGCTCTTGGACAAGATGCTGTGAAC
AAAGCCAAGGCTTTTGATGAGTTGCACCAGATAAGAGCCAATGCTTCCGCCAGAGTTTCT
TC

QA 1 542 1 542
DS 

RD RS1G855TF 595 0 0
GGATTCTCT
CCCCCTCTCAGACTTCCTTCCTTCCTTCCGCCGCCGACAATGCAGCACCAGACGAGAAGT
GTTAAAGTGGAGAATGTATCAGATCTGGCAACGGAGAGAGAGATTCACGAGTTTTTCTCC
ATCTCCGGCGACATAGACCACATCCACATCCTTAATGTGATTTTTGAGTGCAGAGATGCT
TCCGAGCAATCAAGAGTCGCTTTTGTTACCTTTACTGAACCTAAAGCCCTTGAAATCGCT
CTCTTATTATCGGGTGCCACAATTGTAGACAAGATCGTTACTATAACTCCAGCTGACAAC
TATGTTCCTAGGCGTGAGATCATGCAGCAAGTGGTAGAGAACGCGATGCCAGCAACACCA
ACACGCCAGAACAATGATGGCAATGGTGGTAGAGCGTACGTTAGCAAAGCGCAAGATGTG
ATGGCTACTGTTTTGGCCAAAGGCTCTGCTCTTGGACAAGATGCTGTGAACAAAGCCAAG
GCTTTTGATGAGTTGCACCAGATAAGAGCCAATGCTTCCGCCAGAGTTTCTTCTTTTGAC
AAGAGAGTCAGGCTTAGCGAGAAGTTCAACGTGGGTATCTCTGTGG

QA 10 595 10 595
DS 



AS 1 14

CO CL34Contig1 1604 14 23 U
GGTTATATCATAAGCTTTGGATTAAAAAATGAGGCCTGTCCATCAACATCTAGTAAAGGC
CTGTAAAGGCTTCTCTAGCTTACAGGTCGGTAACGTACAAGCACTCGTACACACATATTT
ATTTTGTTTCCTTACTTTCTCTAGAGGATAAGGCGTAATAAAAAA*CGGAACATAAACTA
TAGATAGCGGCTGGCTGCTACTGCAGCGAATGATAGAGCTGCTGATGCAGCAGTAACTAC
TCCAGCTGTCATGGCACTTACACGCAGGAGTCTCCAAGAGATCAGTTTGCAGTACTCGTC
AGCTTCTTTGTAAAGAGAACAATTGGCTCCTCCTTCAGCGATGGCTCTTTTGTTCTGACG
CCTGAAGCTCTCTATAGTTTGTTTGACAATGTCAGTGAGAGTCTCACTTGGTGATGTTGA
TAGCCTGAAGAAATGACCGTTCCATTCGTCTACAAGCTTCTTAAGAAGAGAAACACTGAC
TTCTGGATTATCCATATAAAGTTTGTCCCAAAGGTCAAAGCAGTCTATGTTTTCGGTCAG
AGTTCTGATAGCGATTGATGTAGCTTCCTTGGTTAATAAGACATGATTCCCTTTATCTCC
AGCTAAGGTCAAGGCAAACGAGAATAATTTTTTCATGGCAAATCTTCCTCCTCCTGCCCT
CTCTGGTGAAAGAGCCACTTCCTTCAACAAGGGATAAATTGCCTCAAACCTCTTTGTAGT
CTCAACTCTTGCGGATGGAGCAGGGAATGTGAGGCGCAGCAAGATCTCAAGTGAAGGAAG
TGGAACCAGACGCTGTCCTTCCATAACACCACCTCCTTTTACGAGTATAGTGAGAGCCTC
CGGACGAGACAAAATGAACTCAGCTAATTGAAGGACGAGATCCAAAGACTGAGGGCAGCA
CTTGTCATTACTGACTAGCGGTAGCAAGTTACACATCCATGAATACAAGCCAGTAGATAA
ATCACCTACGGAGGCCTGAGCCATCATCCAAACAATAAGGGGAAGCTTGTCGGGTCCTTG
ATACGTGTCTTTATCCCTCAGTGAAGGCAAAACCGCAACCAAAGAATCAGGTCTACAGCG
CAATACCATAGCCAATACAACAAAATGTCCCGCCTGAGATCTGGGGCGATAAGATGCTGG
AACATTGTCACCACCTTCAGCCAAATTGTCCAGAATACGATCACACAACCAAGATACAAT
ATCCGAGAGATATTCAATTTGACGTTGTTGGATCCAATCGACTGAAAATTTGTAGAGAGG
CGTAGGAATTTGAGATAACGGAATATCGATGAGAGTGGACAAAGGAGCGTCCTTGAACAT
CTTCACCCATGGGAACGCTACTCCTGAGAATGCCTCTTCAAAGTAATCGGTATACCTCGA
CAACAGCTCATCATCCCCACACAAACACTCTCTCATTGCTTTGACGAGGTGATCAATAAG
ATGAGGAGGATCGATCTTTGCCGCTGCTTCGGTCAGAGACACTATCTGCTTATCATATTC
CTCCCCCTTCGCCCCCGCCGCACCCTCGCGATGATCCATTAGGTTTTCTACCGTCCCTCG
CTTCTCAGATTCCTCCGCCTTCAGATTCTTATCCTTCTTCGCCC


BQ
10 10 10 10 10 25 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 30 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 20 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 20 5 5 5 5 20 5 20 20 5 20 5 5 
5 20 20 5 5 5 20 20 20 5 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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G
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AAAAA*CGGAACATAAACTATAAATAGCGGCTGGCTGCTACTGCAGCGAATGATAGAGCT
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AAAA

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DS 

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GG
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TCATGGCAAATCTTCCTCCTCCTGCCCTCTCTGGTGAAAGAGCCACTTCCTTCAACAAGG
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DS 

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A
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AAGGCTTCTCTAGCTTACAGGTCGGTAACGTACAAGCACTCGTACACACATATTTATTTT
GTTTCCTTACTTTCTCTAGAGGATAAGGCGTAATAAAAAA*CGGAACATAAACTATAGAT
AGCGGCTGGCTGCTACTGCAGCGAATGATAGAGCTGCTGATGCAGAAGTAACTACTCCAG
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CTTTGTAAAGAGAACAATTGGCTCCTCCTTCAGCGATGGCTCTTTTGTTCTGACGCCTGA
*GCTCTCTATAGTTTGTTTAACAATGTCAGTGAGAGTCTCACTTGGTGATGTTGATAGCC
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CTA
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CCAGACGCTGTCCTTC

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RD RS1A043TR 799 0 0
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GAAGAAATGACCGTTCCATTCGTCTACAAGCTTCTTAAGAAGAGAAACACTGACTTCTGG
ATTATCCATATAAAGTTTGTCCCAAAGGTCAAAGCAGTCTATGTTTTCGGTCAGAGTTCT
GATAGCGATTGATGTAGCTTCCTTGGTTAATAAGACATGATTCCCTTTATCTCCAGCTAA
GGTCAAGGCAAACGAGAATAATTTTTTCATGGCAAATCTTCCTCCTCCTGCCCTCTCTGG
TGAAAGAGCCACTTCCTTCAACAAGGGATAAATTGCCTCAAACCTCTTTGTAGTCTCAAC
TCTTGCGGATGGAGCAGGGAATGTGAGGCGCAGCAAGATCTCAAGTGAAGGAAGTGGAAC
CAGACGCTGTCCTTC
CATA

QA 1 795 1 795
DS 

RD RS1DQ32TF 607 0 0
GGTTAATAAGACATGATTCCCTTTATCTCCAGCTAAGGTCAAGGCAAACGAGAATAATTT
TTTCATGGCAAATCTTCCTCCTCCTGCCCTCTCTGGTGAAAGAGCCACTTCCTTCAACAA
GGGATAAATTGCCTCAAACCTCTTTGTAGTCTCAACTCTTGCGGATGGAGCAGGGAATGT
GAGGCGCAGCAAGATCTCAAGTGAAGGAAGTGGAACCAGACGCTGTCCTTCCATAACACC
ACCTCCTTTTACGAGTATAGTGAGAGCCTCCGGACGAGACAAAATGAACTCAGCTAATTG
AAGGACGAGATCCAAAGACTGAGGGCAGCACTTGTCATTACTGACTAGCGGTAGCAAGTT
ACACATCCATGAATACAAGCCAGTAGATAAATCACCTACGGAGGCCTGAGCCATCATCCA
AACAATAAGGGGAAGCTTGTCGGGTCCTTGATACGTGTCTTTATCCCTCAGTGAAGGCAA
AACCGCAACCAAAGAATCAGGTCTACAGCGCAATACCATAGCCAATACAACAAAATGTCC
CGCCTGAGATCTGGGGCGATAAGATGCTGGAACATTGTCACCACCTTCAGCCAAATTGTC
CAGAAT
C

QA 1 606 1 606
DS 

RD RS1BV02TF 668 0 0
TACGAGTATAGTGAGAGC*TCCGGACGAGACAAAATGAACTCAGCTAATTGAAGGACGAG
ATCCAAAGACTGAGGGCAGCACTTGTCATTACTGACTAGCGGTAGCAAGTTACACATCCA
TGAATACAAGCCAGTAGATAAATCACCTACGGAGGCCTGAGCCATCATCCAAACAATAAG
GGGAAGCTTGTCGGGTCCTTGATACGTGTCTTTATCCCTCAGTGAAGGCAAAACCGCAAC
CAAAGAATCAGGTCTACAGCGCAATACCATAGCCAATACAACAAAATGTCCCGCCTGAGA
TCTGGGGCGATAAGATGCTGGAACATTGTCACCACCTTCAGCCAAATTGTCCAGAATACG
ATCACACAACCAAGATACAATATCCGAGAGATATTCAATTTGACGTTGTTGGATCCAATC
GACTGAAAATTTGTAGAGAGGCGTAGGAATTTGAGATAACGGAATATCGATGAGAGTGGA
CAAAGGAGCGTCCTTGAACATCTTCACCCATGGGAACGCTACTCCTGAGAATGCCTCTTC
AAAGTAATCGGTATACCTCGACAACAGCTCATCATCCCCACACAAACACTCTCTCATTGC
TTTGACGAGGTGATCAATAAGATGAGGAGGATCGATCTTTGCCGCTGCTTCGGTCAGAGA
CACTATC
C

QA 1 667 1 667
DS 

RD RS1A043TF 694 0 0
T
TACGAGTATAGTGAGAGCCTCCGGACGAGACAAAATGAACTCAGCTAATTGAAGGACGAG
ATCCAAAGACTGAGGGCAGCACTTGTCATTACTGACTAGCGGTAGCAAGTTACACATCCA
TGAATACAAGCCAGTAGATAAATCACCTACGGAGGCCTGAGCCATCATCCAAACAATAAG
GGGAAGCTTGTCGGGTCCTTGATACGTGTCTTTATCCCTCAGTGAAGGCAAAACCGCAAC
CAAAGAATCAGGTCTACAGCGCAATACCATAGCCAATACAACAAAATGTCCCGCCTGAGA
TCTGGGGCGATAAGATGCTGGAACATTGTCACCACCTTCAGCCAAATTGTCCAGAATACG
ATCACACAACCAAGATACAATATCCGAGAGATATTCAATTTGACGTTGTTGGATCCAATC
GACTGAAAATTTGTAGAGAGGCGTAGGAATTTGAGATAACGGAATATCGATGAGAGTGGA
CAAAGGAGCGTCCTTGAACATCTTCACCCATGGGAACGCTACTCCTGAGAATGCCTCTTC
AAAGTAATCGGTATACCTCGACAACAGCTCATCATCCCCACACAAACACTCTCTCATTGC
TTTGACGAGGTGATCAATAAGATGAGGAGGATCGATCTTTGCCGCTGCTTCGGTCAGAGA
CACTATCCCCCGGCCGTAATGG*CCGAATTCCC

QA 2 694 2 694
DS 

RD RS1EQ55TF 635 0 0
GGAGGCGTGAGCCATCATCCAAACAATAAGGGGAAGCTGGTCGGGTCCTTGATACGTGTC
TTTATCCCTCAGTGAAGGCAAAACCGCAACCAAAGAATCAGGTCTACAGCGCAATACCAT
AGCCAATACAACAAAATGTCCCGCCTGAGATCTGGGGCGATAAGATGCTGGAACATTGTC
ACCACCTTCAGCCAAATTGTCCAGAATACGATCACACAACCAAGATACAATATCCGAGAG
ATATTCAATTTGACGTTGTTGGATCCAATCGACTGAAAATTTGTAGAGAGGCGTAGGAAT
TTGAGATAACGGAATATCGATGAGAGTGGACAAAGGAGCGTCCTTGAACATCTTCACCCA
TGGGAACGCTACTCCTGAGAATGCCTCTTCAAAGTAATCGGTATACCTCGACAACAGCTC
ATCATCCCCACACAAACACTCTCTCATTGCTTTGACGAGGTGATCAATAAGATGAGGAGG
ATCGATCTTTGCCGCTGCTTCGGTCAGAGACACTATCTGCTTATCATATTCCTCCCCCTT
CGCCCCCGCCGCACCCTCGCGATGATCCATTAGGTTTTCTACCGTCCCTCGCTTCTCAGA
TTCCTCCGCCTTCAGATTCTTATCCTTCTTCGCCC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1GB56TF 511 0 0
AATACCATAGCCAATACAACAAAATGTCCCGCCTGAGATCTGGGGCGATAAGATGCTGGA
ACATTGTCACCACCTTCAGCCAAATTGTCCAGAATACGATCACACAACCAAGATACAATA
TCCGAGAGATATTCAATTTGACGTTGTTGGATCCAATCGACTGAAAATTTGTAGAGAGGC
GTAGGAATTTGAGATAACGGAATATCGATGAGAGTGGACAAAGGAGCGTCCTTGAACATC
TTCACCCATGGGAACGCTACTCCTGAGAATGCCTCTTCAAAGTAATCGGTATACCTCGAC
AACAGCTCATCATCCCCACACAAACACTCTCTCATCGCTTTGACGAGGTGATCAATAAGA
TGAGGAGGATCGATCTTTGCCGCTGCTTCGGTCAGAGACACTATCTGCTTATCATATTCC
TCCCCCTTCGCCCCCGCCGCACCCTCGCGATGATCCATTAGGTTTTCTACCGTCCCTCGC
TTCTCAGATTCCTCCGCCTTCAGATTCTT
CC

QA 1 509 1 509
DS 



AS 2 17

CO CL35Contig1 879 9 2 U
CGAACATTGATTAACATTGTAATGCAACCAAACAACAATGCACCATTTAGTCAGAAAAGC
CTAAGCACCGATTATTATGTTTCACAACTTAATAAAGATCATTTCCAAGCTTCCAAATAA
ATAAAGAGTTTATGAGTTTTACAACTTTCTCGATCCTTATTGCATTCACATTATTTCTTC
TTGTGATCCAAGTTTGCTCTTCTTTAGTGTTTTGGGTGAAAAACTTGAACTCTTTTCCCT
GCCAATCTTCTTTTATTTTCTTGGTCTCAAAAAA*GCTCACTTGATCTTTTTCATTCTTT
CACGCTGTTATCAACTCTTAACACCACCATCTCACTAGACCGTCATGAACAACCAGAAGG
ATGAAATCACGACCGCAAACGCCAAGTCAAGCTGAGAAGAATTGATAACCGAAGCTGAAC
TTGTTGAGTTGGCTTTGCTAGAAGACGCCGTAGGAGCAGTATCAGCAGCCTTAGCAGCAG
CAGGAGCATGAGCCTTAGCCTTAGCAGAGGATGATGGTGGGGATGGTGGCTCGTCATACT
CATAATCATCATCGTTAGGAGCTTGTGCAGGAAGTGGCGAAGATGATGTATAAATAAAAT
CAGAATTATTAGGATCCATTATAGGTATAGAAGTGCTAATATGAAGCACCGAGATGTTAA
ACGGCTCCGACGCAACCGACTCTAAAAGCTGAGCGTCAAGGAGAGAACCATAAACCGCAG
ATCCAAACATGACGTCGCCGTTATTGTTAACGGTTACGTTTATGAACCCTTGTTTGCCTT
TGGCTTGACCGCTTGATTGGAAGAGAGTGGTGAGTAACGCTGTTTTCTTGCTCAGCTCTT
GAGTTTCTTGATGTCGTAGTAGTCTAGGACGACGTGGAG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EO85JQ U 93
AF RS1FG14JQ U 49
AF RS1GI35JQ U 47
AF RS1DF93JQ U 49
AF RS1EU83JQ U 1
AF RS1DK94JQ U 1
AF RS1C755JQ U 49
AF RS1E950JQ U 52
AF RS1EB40JQ U 49
BS 1 721 RS1DK94JQ
BS 722 879 RS1EB40JQ

RD RS1EO85JQ 435 0 0
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ATCCTTATTGCATTCACATTATTTCTTCTTGTGATCCAAGTTTGCTCTTCTTTAGTGTTT
TGGGTGAAAAACTTGAACTCTTTTCCCTGCCAATCTTCTTTTATTTTCTTGGTCTCAAAA
AAAGCTCACTTGATCTTTTTCATTCTTTCACGCTGTTATCAACTCTTAACACCACCATCT
CACTAGACCGTCATGAACAACCAGAAGGATGAAATCACGACCGCAAACGCCAAGTCAAGC
TGAGAAGAATTAATAACCGAAGCTGAACTTGTTGAGTTGTCTTTGCTAGAAGACGCCGTA
GGAGCAGTATCAGCAGCCTTAGCAGCAGCAGGAGCATGAGCCTTAGCCTTAGCAGAGGAT
GATGGTGGGGATGGT

QA 1 435 1 435
DS 

RD RS1FG14JQ 562 0 0
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GCTTCCAAATAAATAAAGAGTTTATGAGTTTTACAACTTTCTCGATCCTTATTGCATTCA
CATTATTTCTTCTTGTGATCCAAGTTTGCTCTTCTTTAGTGTTTTGGGTGAAAAACTTGA
ACTCTTTTCCCTGCCAATCTTCTTTTATTTTCTTGGTCTCAAAAAA*GCTCACTTGATCT
TTTTCATTCTTTCACGCTGTTATCAACTCTTAACACCACCATCTCACTAGACCGTCATGA
ACAACCAGAAGGATGAAATCACGACCGCAAACGCCAAGTCAAGCTGAGAAGAATTGATAA
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CCTTAGCAGCAGCAGGAGCATGAGCCTTAGCCTTAGCAGAGGATGATGGTGGGGATGGTG
GCTCGTCATACTCATAATCATCATCGTTAGGAGCTTGTGCAAGAAGTGGCGAAGATGATG
TATAAATAAAATCAGAATTATT

QA 1 562 1 562
DS 

RD RS1GI35JQ 638 0 0
CT
AGTCAGAAAAGCCTAAGCACCGATTATTATGTTTCACAACTTAATAAAGATCATTTCCAA
GCTTCCAAATAAATAAAGAGTTTATGAGTTTTACAACTTTCTCGATCCTTATTGCATTCA
CATTATTTCTTCTTGTGATCCAAGTTTGCTCTTCTTTAGTGTTTTGGGTGAAAAACTTGA
ACTCTTTTCCCTGCCAATCTTCTTTTATTTTCTTGGTCTCAAAAAA*GCTCACTTGATCT
TTTTCATTCTTTCACGCTGTTATCAACTCTTAACACCACCATCTCACTAGACCGTCATGA
ACAACCAGAAGGATGAAATCACGACCGCAAACGCCAAGTCAAGCTGAGAAGAATTAATAA
CCGAAGCTGAACTTGTTGAGTTGTCTTTGCTAGAAGACGCCGTAGGAGCAGTATCAGCAG
CCTTAGCAGCAGCAGGAGCATGAGCCTTAGCCTTAGCAGAGGATGATGGTGGGGATGGTG
GCTCGTCATACTCATAATCATCATCGTTAGGAGCTTGTGCAGGAAGTGGTGAAGATGAAG
TATAAATAAAATCAGA*TTATTAGGATCCATTATAGGTATAGAAGTGCTAATATGAAGCA
CCGAGATGTTAAACGGCTCTGACGCAACCGAGTCTA

QA 3 638 3 638
DS 

RD RS1DF93JQ 662 0 0
G
GTCAGAAAAGCCTAAGCACCGATTATTATGTTTCACAACTTAATAAAGATCATTTCCAAG
CTTCCAAATAAATAAAGAGTTTATGAGTTTTACAACTTTCTCGATCCTTATTGCATTCAC
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CTCTTTTCCCTGCCAATCTTCTTTTATTTTCTTGGTCTCAAAAAA*GCTCACTTGATCTT
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CAACCAGAAGGATGAAATCACGACCGCAAACGCCAAGTCAAGCTGAGAAGAATTAATAAC
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CTTAGCAGCAGCAGGAGCATGAGCCTTAGCCTTAGCAGAGGATGATGGTGGGGATGGTGG
CTCGTCATACTCATAATCATCATCGTTAGGAGCTTGTGCAGGAAGTGGTGAAGATGAAGT
ATAAATAAAATCAGAATTATTAGGATCCATTATAGGTATAGAAGTGCTAATATGAAGCAC
CGAGATGTTAAACGGCTCTGACGCAACCGAGTCTAGAAGCTGAGCGTCGAGGAGAGAACC
A

QA 2 662 2 662
DS 

RD RS1EU83JQ 667 0 0
A
GAACATTGATTAACATTGTAATGCAACCAAACAACAATGCACCATTTAGTCAGAAAAGCC
TAAGCACCGATTATTATGTTTCACAACTTAATAAAGATCATTTCCAAGCTTCCAAATAAA
TAAAGAGTTTATGTGTTTTACAACTTTCTCGATCCTTATTGCATTCACATTATTTCTTCT
TGTGATCCAAGTTTGCTCTTCTTTAGTGTTTTGGGTGAAAAACTTGAACTCTTTTCCCTG
CCAATCTTCTTTTATTTTCTTGGTCTCAAAAAA*GCTCACTTGATCTTTTTCATTCTTTC
ACGCTGTTATCAACTCTTAACACCACCATCTCACTAAACCGTCATGAACAACCAGAAGGA
TGAAATCACGACCGCAAACGCCAAGTCAAGCTGAAAAGAATTGATAACCGAAGCTGAACT
TGTTGAGTTGGCTTTGCTAGAAAACGCCGTAGGAGCAGTATCAGCAGCCTTAGCAGCAGC
AGGAGCATGAGCCTTAGCCTTAGCAAAGGATGATGGTGGGGATGGTGGCTCGTCATACTC
ATAATCATCATCGTTAGGAGCTTGTGCAGGAAGTGGCGAAGATGATGTATAAATAAAATC
AGAATTATTAGGATCCATTATAGGTATAGAAGTGCTAATATGAAGCACCGAGATGTTAAA
CGGCTC

QA 2 667 2 667
DS 

RD RS1DK94JQ 721 0 0
CGAACATTGATTAACATTGTAATGCAACCAAACAACAATGCACCATTTAGTCAGAAAAGC
CTAAGCACCGATTATTATGTTTCACAACTTAATAAAGATCATTTCCAAGCTTCCAAATAA
ATAAAGAGTTTATGAGTTTTACAACTTTCTCGATCCTTATTGCATTCACATTATTTCTTC
TTGTGATCCAAGTTTGCTCTTCTTTAGTGTTTTGGGTGAAAAACTTGAACTCTTTTCCCT
GCCAATCTTCTTTTATTTTCTTGGTCTCAAAAAA*GCTCACTTGATCTTTTTCATTCTTT
CACGCTGTTATCAACTCTTAACACCACCATCTCACTAGACCGTCATGAACAACCAGAAGG
ATGAAATCACGACCGCAAACGCCAAGTCAAGCTGAGAAGAATTGATAACCGAAGCTGAAC
TTGTTGAGTTGGCTTTGCTAGAAGACGCCGTAGGAGCAGTATCAGCAGCCTTAGCAGCAG
CAGGAGCATGAGCCTTAGCCTTAGCAGAGGATGATGGTGGGGATGGTGGCTCGTCATACT
CATAATCATCATCGTTAGGAGCTTGTGCAGGAAGTGGCGAAGATGATGTATAAATAAAAT
CAGAATTATTAGGATCCATTATAGGTATAGAAGTGCTAATATGAAGCACCGAGATGTTAA
ACGGCTCCGACGCAACCGACTCTAAAAGCTGAGCGTCAAGGAGAGAACCATAAACCGCAG
A

QA 1 721 1 721
DS 

RD RS1C755JQ 725 0 0
G
GTCAGAAAAGCCTAAGCACCGATTATTATGTTTCACAACTTAATAAAGATCATTTCCAAG
CTTCCAAATAAATAAAGAGTTTATGAGTTTTACAACTTTCTCGATCCTTATTGCATTCAC
ATTATTTCTTCTTGTGATCCAAGTTTGCTCTTCTTTAGCGTTTTGGGTGAAAAACTTGAA
CTCTTTTCCCTGCCAATCTTCTTTTATTTTCTTGGTCTCAAAAAA*GCTCACTTGATCTT
TTTCATTCTTTCACGCTGTTATCAACTCTTAACACCACCATCTCACTAGACCGTCATGAA
CAACCAGAAGGATGAAATCACGACCGCAAACGCCAAGTCAAGCTGAGAAGAATTGATAAC
CGAAGCTGAACTTGTTGAGTTGGCTTTGCTAGAAGACGCCGTAGGAGCAGTATCAGCAGC
CTTAGCAGCAGCAGGAGCATGAGCCTTAGCCTTAGCAGAGGATGATGGTGGGGATGGTGG
CTCGTCATACTCATAATCATCATCGTTAGGAGCTTGTGCAGGAAGTGGCGAAGATGATGT
ATAAATAAAATCAGAATTATTAGGATCCATTATAGGTATAGAAGTGCTAATATGAAGCAC
CGAGATGTTAAACGGCTCCGACGCAACCGACTCTAAAAGCTGAGCGTCAAGGAGAGAACC
ATAAACCGCAGATCCAAACATGACGTCGCCGTTATTGTTAACGGTTACGTTTATGAACCC
TTGT

QA 2 725 2 725
DS 

RD RS1E950JQ 776 0 0
CAGAAAAGCCTAAGCACCGATTATTATGTTTCACAACTTAATAAAGATCATTTCCAAGCT
TCCAAATAAATAAAGAGTTTATGAGTTTTACAACTTTCTCGATCCTTATTGCATTCACAT
TATTTCTTCTTGTGATCCAAGTTTGCTCTTCTTTAGTGCTTTGGGTGAAAAACTTGAACT
CTTTTCCCTGCCAATCTTCTTTTATTTTCTTGGTCTCAAAAAA*GCTCACTTGATCTTTT
TCATTCTTTCACGCTGTTATCAACTCTTAACACCACCATCTCACTAGACCGTCATGAACA
ACCAGAAGGATGAAATCACGACCGCAAACGCCAAGTCAAGCTGAGAAGAATTGATAACCG
AAGCTGAACTTGTTGAGTTGGCTTTGCTAGAAGACGCCGTAGGAGCAGTATCAGCAGCCT
TAGCAGCAGCAGGAGCATGAGCCTTAGCCTTAGCAAAGGATGATGGTGGGGATGGTGGCT
CGTCATACTCATAATCATCATCGTTAGGAGCTTGTGCAGGAAGTGGCGAAGATGATGTAT
AAATAAAATCAGAATTATTAGGATCCATTATAGGTATAGAAGTGCTAATATGAAGCACCG
AGATGTTAAACGGCTCCGACGCAACCGACTCTAAAAGCTGAGCGTCAAGGAGAGAACCAT
AAACCGTAGATCCAAACATGACGTCGCCGTTATTGTTAACGGTTACGTTTATGAACCCTT
GTTTGCCTTTGGCTTGACCGCTTGATTGGAAGAGAGTGGTGAGTAACGCTGTTTTC

QA 1 776 1 776
DS 

RD RS1EB40JQ 831 0 0
AGTCAGAAAAGCCTAAGCACCGATTATTATGTTTCACAACTTAATAAAGATCATTTCCAA
GCTTCCAAATAAATAAAGAGTTTATGAGTTTTACAACTTTCTCGATCCTTATTGCATTCA
CATTATTTCTTCTTGTGATCCAAGTTTGCTCTTCTTTAGTGTTTTGGGTGAAAAACTTGA
ACTCATTTCCCTGCCAATCTTCTTTTATTTTCTTGGTCTCAAAAAA*GCTCACTTGATCT
TTTTCATTCTTTCACGCTGTTATCAACTCTTAACACCACCATCTCACTAGACCGTCATGA
ACAACCAGAAGGATGAAATCACGACCGCAAACGCCAAGTCAAGCTAAGAAGAATTGATAA
CCGAAGCTGAACTTGTTGAGTTGGCTTTGCTAGAAGACGCCGTAGGAGCAGTATCAGCAG
CCTTAGCAGCAGCAGGAGCATGAGCCTTAGCCTTAGCAGAGGATGATGGTGGGGATGGTG
GCTCGTCATACTCATAATCATCATCGTTAGGAGCTTGTGCAGGAAGTGGCGAAGATGATG
TATAAATAAAATCAGAATTATTAGGATCCATTATAGGTATAGAAGTGCTAATATGAAGCA
CCGAGATGTTAAACGGCTCCGACGCAACCGACTCTAAAAGATGAGCGTCAAGGAGAGAAC
CATAAACCGCAGATCCAAACATGACGTCGCCGTTATTGTTAACGGTTACGTTTATGAACC
CTTGTTTGCCTTTGGCTTGACCGCTTGATTGGAAGAGAGTGGTGAGTAACGCTGTTTTCT
TGCTCAGCTCTTGAGTTTCTTGATGTCGTAGTAGTCTAGGACGACGTGGAG

QA 1 831 1 831
DS 



CO CL35Contig2 759 8 11 U
GGAACCTCATCTATCTCT*ATCAATCAACACAATGTCTTCTTCTTCTTATTCTTCACTTA
CACTCTTCTTCT***TACTCGCTTCTGCCTTCATCTACACTCCATCAAACTCATTCAACA
TCACAACCATCTTAAGCCAAAACAAAAACTTCTCCGATTTCAACAAAATGCTCTCCCAGA
CCCAACTCGCTTCCACCATCAACTCCCGCCAAACCATAACCGTCCTCGCCCTCTCCAACG
ACGCAATGTCCTTCTTCTCCAGCCAATCGATCGAAGAAAACAAGAGAGCCTTCAGCCTCC
ACGTCGTCCTAGACTACTACGACATCAAGAAACTCAAGAGCCTGAGCAAGAAAACAGCGT
TACTCACCACTCTCTTCCAATCAAGCGGTCAAGCCAAAGGCAAACAAGGGTTCATAAACG
TAACCGTTAACAATAACGGCGACGTCATGTTTGGATCTGCGGTTTATGGTTCTCTCCTTG
ACGCTCAGCTTTTAGAGTCGGTTGCGTCGGAGCCGTTTAACATCTCGGTGCTTCATATTA
GCACTTCTATACCTATAATGGATCCTAATAATTCTGATTTTATTTATACATCATCTTCGC
CACTTCCTGCACAAGCTCCTAACGATGATGATTATGAGTATGACGAGCCACCATCCCCAC
CATCATCCTCTGCTAAGGCTAAGGCTCATGCTCCTGCTGCTGCTAAGCTGCTGATACTGC
TCCTACAGCGTCTTCTAGCAAGCCAACTCACAAGTTCAG


BQ
30 30 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 5 5 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 25 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
10 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 25 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 15 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 10 25 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DF93TF U -1
AF RS1GI35TF U 1
AF RS1EU83TF U 1
AF RS1DK94TF U 1
AF RS1EO85TF U 1
AF RS1FG14TF U 1
AF RS1EB40TF U 112
AF RS1E950TF U -4
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BS 138 309 RS1DK94TF
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BS 311 359 RS1DK94TF
BS 360 360 RS1EO85TF
BS 361 677 RS1DK94TF
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BS 684 684 RS1EB40TF
BS 685 759 RS1E950TF

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GGGC
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GTCGTCCTAGACTACTA

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DS 

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CACTCTTCTTCTTTTTATTCGCCTCTGCCTTCCTCTACACTCCATCAAACTCATTCAACA
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GCACTTCTATACCTATAATGGATCCTAATAAT*CTGATTTTATTTATACTTCATCT

QA 1 596 1 596
DS 

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CACTCTTCTTCT***TACTCGCTTCTGCCTTCATCTACACTCCATCAAACTCATTCAACA
TCACAACCATCTTAAGCCAAAACAAAAACTTCTCCGATTTCAACAAAATGCTCTCCCAGA
CCCAACTCGCTTCCACCATCAACTCCCGCCAAACCATAACCGTCCTCGCCCTCTCCAACG
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DS 

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CACTCTTCTTCT***TACTCGCTTCTGCCTTCATCTACACTCCATCAAACTCATTCAACA
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CATCATCCTCTGCTAAG
C

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DS 

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CACTCTTCTTCTTTTTATTCGCCTCTGCCTTCCTCTACACTCCATCAAACTCATTCAACA
TCACAACCATCTTAAGCCAAAACAAAAACTTCTCCGATTTCAACAAAATGCTCTCCCAGA
CCCAGCTCGCTTCCACCATCAACTCCCGTCAAACCATAACCGTCCTCGCCCTCTCCAACG
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TAACCGTTAACAATAACGGCGACGTCATGTTTGGATCTGCGGTTTATGGTTCTCTCCTCG
ACGCTCAGCTTCTAGACTCGGTTGCGTCAGAGCCGTTTAACATCTCGGTGCTTCATATTA
GCACTTCTATACCTATAATGGATCCTAATAATTCTGATTTTATTTATACTTCATCTTCAC
CACTTCCTGCACAAGCTCCTAACGATGATGATTATGAGTATGACGAGCCACCATCCCCAC
CATCATCCTCTG

QA 1 672 1 672
DS 

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CACTCTTCTTCT***TACTCGCTTCTGCCTTCATCTACACTCCATCAAACTCATTCAACA
TCACAACCATCTTAAGCCAAAACAAAAACTTCTCCGATTTCAACAAAATGCTCTCCCAGA
CCCAACTCGCTTCCACCATCAACTCCCGCCAAACCATAACCGTCCTCGCCCTCTCCAACG
ACGCAATGTCCTTCTTCTCCAGCCAATCGATCGAAGAAAACAAGAGAGCCTTCAGCCTCC
ACGTCGTCCTAGACTACTACGACATCAAGAAACTCAAGAGCCTGAGCAAGAAAACAGCGT
TACTCACCACTCTCTTCCAATCAAGCGGTCAAGCCAAAGGCAAACAAGGGTTCATAAACG
TAACCGTTAACAATAACGGCGACGTCATGTTTGGATCTGCGGTTTATGGTTCTCTCCTTG
ACGCTCAGCTTTTAGAGTCGGTTGCGTCGGAGCCGTTTAACATCTCGGTGCTTCATATTA
GCACTTCTATACCTATAATGGATCCTAATAATTCTGATTTTATTTATACATCATCTTCGC
CACTTCTTGCACAAGCTCCTAACGATGATGATTATGAGTATGACGAGCCACCATCCCCAC
CATCATCCTCTGCTAAG
CTAA

QA 1 677 1 677
DS 

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TCTCCCAGACCCAACTCGCTTCCACCATCAACTCCCGCCAAACCATAACCGTCCTCGCCC
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TCAGCCTCCACGTCGTCCTAGACTACTACGACATCAAGAAACTCAAGAGCCTGAGCAAGA
AAACAGCGTTACTCACCACTCTCTTCCAATCAAGCGGTCAAGCCAAAGGCAAACAAGGGT
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CTCTCCTTGACGCTCATCTTTTAGAGTCGGTTGCGTCGGAGCCGTTTAACATCTCGGTGC
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CATCTTCGCCACTTCCTGCACAAGCTCCTAACGATGATGATTATGAGTATGACGAGCCAC
CATCCCCACCATCATCCTCTGCTAAGGCTAAGGCTCATGCTCCTGCTGCTG

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DS 

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GGAAAGC
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CTCTTCTTCT***TACTCGCTTCTGCCTTCATCTACACTCCATCAAACTCATTCAACATC
ACAACCATCTTAAGCCAAAACAAAAACTTCTCCGATTTCAACAAAATGCTCTCCCAGACC
CAACTCGCTTCCACCATCAACTCCCGCCAAACCATAACCGTCCTCGCCCTCTCCAACGAC
GCAATGTCCTTCTTCTCCAGCCAATCGATCGAAGAAAACAAGAGAGCCTTCAGCCTCCAC
GTCGTCCTAGACTACTACGACATCAAGAAACTCAAGAGCCTGAGCAAGAAAACAGCGTTA
CTCACCACTCTCTTCCAATCAAGCGGTCAAGCCAAAGGCAAACAAGGGTTCATAAACGTA
ACCGTTAACAATAACGGCGACGTCATGTTTGGATCTACGGTTTATGGTTCTCTCCTTGAC
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CTTCCTGCACAAGCTCCTAACGATGATGATTATGAGTATGACGAGCCACCATCCCCACCA
TCATCCTCTGCTAGG*CTAAG*CTCATGCTCCTGCTGCTGCTAAGCTGCTGATACTGCTC
CTACAGCGTCTTCTAGCAAGCCAACTCACAAGTTCAG

QA 8 764 8 764
DS 



AS 3 17

CO CL36Contig1 804 4 2 U
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TTGTTACCACTGCCTTTCTTTCCAGAGACGCGCATCCACAAGCCCTAAGCAAATCGTCTC
CTCTCTCATACACCGGTGAACATGTCGAGGAGAAAGACCAGAGAGCCCAAGGAGGAAACC
GTCACTCTCGGACCAGCTGTTCGTGACGGAGAGCAAGTCTTCGGTGTTGTTCACATCTTT
GCTTCTTTCAACGACACTTTCATTCATGTGACTGATCTGTCCGGAAGAGAAACTCTCGTC
CGTATCACCGGTGGGATGAAGGTTAAGGCTGATCGTGATGAGTCTTCTCCTTATGCTGCT
ATGCTTGCAGCTCAAGATGTTGCTCAAAGATGCAAGGAGCTTGGCATCACAGCCATGCAC
GTGAAGCTCCGTGCCACTGGAGGAAACAAAACCAAGACTCCAGGCCCTGGTGCTCAGTCT
GCTCTCAGAGCCCTTGCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATTGAGGATGTGACTCCA
ATTCCCACCGACAGTACACGTAGAAAGGGTGGACGCAGAGGAAGAAGACTTTGATTTCCC
ACCAATGAGATTCATCATCGTTCAGTTGTGCCCTTGACTCTTGTGCGGGCACACACTTCG
AAGTTGGTTTTTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCAGTTTATCATTCAAGTTGCTTC
GTAAAAACACTATAAGCTGTCTTTCTTCGACTTTGTAAACTTTTGCATTTTGGAGTTTTG
GGAATGAGAAAAAGTGTTAGTGAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1A358TF U 1
AF RS1A358TV U 1
AF RS1A358JQ C 65
AF RS1A358TR C 65
BS 1 788 RS1A358TF
BS 789 804 RS1A358TV

RD RS1A358TF 788 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGTCTCTTTC
TTGTTACCACTGCCTTTCTTTCCAGAGACGCGCATCCACAAGCCCTAAGCAAATCGTCTC
CTCTCTCATACACCGGTGAACATGTCGAGGAGAAAGACCAGAGAGCCCAAGGAGGAAACC
GTCACTCTCGGACCAGCTGTTCGTGACGGAGAGCAAGTCTTCGGTGTTGTTCACATCTTT
GCTTCTTTCAACGACACTTTCATTCATGTGACTGATCTGTCCGGAAGAGAAACTCTCGTC
CGTATCACCGGTGGGATGAAGGTTAAGGCTGATCGTGATGAGTCTTCTCCTTATGCTGCT
ATGCTTGCAGCTCAAGATGTTGCTCAAAGATGCAAGGAGCTTGGCATCACAGCCATGCAC
GTGAAGCTCCGTGCCACTGGAGGAAACAAAACCAAGACTCCAGGCCCTGGTGCTCAGTCT
GCTCTCAGAGCCCTTGCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATTGAGGATGTGACTCCA
ATTCCCACCGACAGTACACGTAGAAAGGGTGGACGCAGAGGAAGAAGACTTTGATTTCCC
ACCAATGAGATTCATCATCGTTCAGTTGTGCCCTTGACTCTTGTGCGGGCACACACTTCG
AAGTTGGTTTTTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCAGTTTATCATTCAAGTTGCTTC
GTAAAAACACTATAAGCTGTCTTTCTTCGACTTTGTAAACTTTTGCATTTTGGAGTTTTG
GGAATGAG

QA 1 788 1 788
DS 

RD RS1A358TV 804 0 0
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TTGTTACCACTGCCTTTCTTTCCAGAGACGCGCATCCACAAGCCCTAAGCAAATCGTCTC
CTCTCTCATACACCGGTGAACATGTCGAGGAGAAAGACCAGAGAGCCCAAGGAGGAAACC
GTCACTCTCGGACCAGCTGTTCGTGACGGAGAGCAAGTCTTCGGTGTTGTTCACATCTTT
GCTTCTTTCAACGACACTTTCATTCATGTGACTGATCTGTCCGGAAGAGAAACTCTCGTC
CGTATCACCGGTGGGATGAAGGTTAAGGCTGATCGTGATGAGTCTTCTCCTTATGCTGCT
ATGCTTGCAGCTCAAGATGTTGCTCAAAGATGCAAGGAGCTTGGCATCACAGCCATGCAC
GTGAAGCTCCGTGCCACTGGAGGAAACAAAACCAAGACTCCAGGCCCTGGTGCTCAGTCT
GCTCTCAGAGCCCTTGCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATTGAGGATGTGACTCCA
ATTCCCACCGACAGTACACGTAGAAAGGGTGGACGCAGAGGAAGAAGACTTTGATTTCCC
ACCAATGAGATTCATCATCGTTCAGTTGTGCCCTTGACTCTTGTGCGGGCACACACTTCG
AAGTTGGTTTTTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCAGTTTATCATTCAAGTTGCTTC
GTAAAAACACTATAAGCTGTCTTTCTTCGACTTTGTAAACTTTTGCATTTTGGAGTTTTG
GGAATGAGAAAAAGTGTTAGTGAC

QA 1 804 1 804
DS 

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CTCATACACCGGTGAACATGTCGAGGAGAAAGACCAGAGAGCCCAAGGAGGAAACCGTCA
CTCTCGGACCAGCTGTTCGTGACGGAGAGCAAGTCTTCGGTGTTGTTCACATCTTTGCTT
CTTTCAACGACACTTTCATTCATGTGACTGATCTGTCCGGAAGAGAAACTCTCGTCCGTA
TCACCGGTGGGATGAAGGTTAAGGCTGATCGTGATGAGTCTTCTCCTTATGCTGCTATGC
TTGCAGCTCAAGATGTTGCTCAAAGATGCAAGGAGCTTGGCATCACAGCCATGCACGTGA
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TCAGAGCCCTTGCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATTGAGGATGTGACTCCAATTC
CCACCGACAGTACACGTAGAAAGGGTGGACGCAGAGGAAGAAGACTTTGATTTCCCACCA
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TGGTTTTTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCAGTTTATCATTCAAGTTGCTTCGTAA
AAACACTATAAGCTGTCTTTCTTCGACTTTGTAAACTTTTGCATTTTGGAGTTTTGGGAA
TGAGAAAAAGTGTTAGTGAC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RS1A358TR 740 0 0
TACCACTGCCTTTCTTTCCAGAGACGCGCATCCACAAGCCCTAAGCAAATCGTCTCCTCT
CTCATACACCGGTGAACATGTCGAGGAGAAAGACCAGAGAGCCCAAGGAGGAAACCGTCA
CTCTCGGACCAGCTGTTCGTGACGGAGAGCAAGTCTTCGGTGTTGTTCACATCTTTGCTT
CTTTCAACGACACTTTCATTCATGTGACTGATCTGTCCGGAAGAGAAACTCTCGTCCGTA
TCACCGGTGGGATGAAGGTTAAGGCTGATCGTGATGAGTCTTCTCCTTATGCTGCTATGC
TTGCAGCTCAAGATGTTGCTCAAAGATGCAAGGAGCTTGGCATCACAGCCATGCACGTGA
AGCTCCGTGCCACTGGAGGAAACAAAACCAAGACTCCAGGCCCTGGTGCTCAGTCTGCTC
TCAGAGCCCTTGCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATTGAGGATGTGACTCCAATTC
CCACCGACAGTACACGTAGAAAGGGTGGACGCAGAGGAAGAAGACTTTGATTTCCCACCA
ATGAGATTCATCATCGTTCAGTTGTGCCCTTGACTCTTGTGCGGGCACACACTTCGAAGT
TGGTTTTTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCAGTTTATCATTCAAGTTGCTTCGTAA
AAACACTATAAGCTGTCTTTCTTCGACTTTGTAAACTTTTGCATTTTGGAGTTTTGGGAA
TGAGAAAAAGTGTTAGTGAC

QA 1 740 1 740
DS 



CO CL36Contig2 825 5 14 U
GGACTGCCACAGCTCCCACCCAGAGAAAGAGCAGCATCCCAAAATCCCAAAACCCCCTAG
CATTTCGTCTCTCTTCATCCATCGTCCAACATCATGTCGAGGAGAAAGACCAGAGAGCCC
AAGGAGGAAACCGTCACTCTCGGACCCGCCGTTCGTGACGGAGAGCAAGTTTTCGGTGTT
GTTCACATCTTTGCATCTTTCAATGACACTTTCATTCGTGTGACTGATCTTTCTGGAAGA
GAAACTCTCGTTCGTATCACAGGTGGGATGAAGGTCAAGGCTGACCGTGACGAATCCTCT
CCTTATGCTGCTATGCTTGCTGCTCAAGATGTCGCTCAAAGATGCAAGGAGCTCGGCATC
ACAGCCATGCACGTGAAGCTCCGTGCCACTGGAGGAAACAAGACCAAGACTCCAGGTCCT
GGTGCTCAGTCTGCTCTTAGAGCCCTTGCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATAGAG
GATGTGACTCCGATTCCCACCGACAGTACACGTAGAAAGGGTGGACGTAGAGGAAGAAGA
CTTTGATTTCCCCATGAGAGCCTACTCGTCATTGTTCAGTTGTTGTCCCTTTTGACTCTG
GTTGTTTATTGGGTACACACTTGG*AATTCAGTTCTGTCTCGTTACAATTTATCTTTTCA
TGTTACTTCGGAAACATTATAAGCTGTGTCTTTCTTCAATGTTGCATTTGGAGTTTTGAG
AATGAGAAGAGTAACAGTGACTATATCACGTTGTGTTTTGCTTTTCTCTCCTCACTTTAT
CTACTTCAACCTAACTCAAGTTCCTATGCTTTTATATATAGTTAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F665JQ C 135
AF RS1F665TF U 1
AF RS1DL69TF U 1
AF RS1AB42TF U 1
AF RS1DL69JQ C 240
BS 1 114 RS1AB42TF
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BS 788 825 RS1DL69JQ

RD RS1F665JQ 586 0 0
CACTCTCGGACCCGCCGTTCGTGACGGAGAGCAAGTTTTCGGTGTTGTTCACATCTTTGC
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C

QA 1 585 1 585
DS 

RD RS1F665TF 717 0 0
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CCTTATGCTGCTATGCTTGCTGCTCAAGATGTCTCTCAAAGATGCAAGGAGCTCGGCATC
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TGTGCATTTGGAGTTTGAC

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DS 

RD RS1DL69TF 741 0 0
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CATTTCGTCTCTCTTCATCCATCGTCCAACATCATGTCGAGGAGAAAGACCAGAGAGCCC
AAGGAGGAAACCGTCACTCTCGGACCCGCCGTTCGTGACGGAGAGCAAGTTTTCGGTGTT
GTTCACATCTTTGCATCTTTCAATGACACTTTCATTCATGTGACTGATCTTTCTGGAAGA
GAAACTCTCGTTCGTATCACAGGTGGGATGAAGGTCAAGGCTGACCGTGACGAATCCTCT
CCTTATGCTGCTATGCTTGCTTCTCAAGATGTCGCTCAAAGATGCAAGGAGCTCGGCATC
ACAGCCATGCACGTGAAGCTCCGTGCCACTGGAGGAAACAAGACCAAGACTCCAGGTCCT
GGTGCTCAGTCTGCTCTTAGAGCCCTTGCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATAGAG
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CTTTGATTTCCCCATGAGAGCCTACTCGTCATTGTTCAGTTGTTGTCCCTTTTGACTCTG
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AATGAGA
GAGTACAGTGACTA

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1AB42TF 787 0 0
GGACTGCCACAGCTCCCACCCAGAGAAAGAGCAGCATCCCAAAATCCCAAAACCCCCTAG
CATTTCGTCTCTCTTCATCCATCGTCCAACATCATGTCGAGGAGAAAGACCAGATAGCCC
AAGGAGGAAACCGTCACTCTCGGACCCGCCGTTCGTGACGGAGAGCAAGTTTTCGGTGTT
GTTCACATCTTTGCATCTTTCAATGACACTTTCATTCATGTGACTGATCTTTCTGGAAGA
GAAACTCTCGTTCGTATCACAGGTGGGATGAAGGTCAAGGCTGACCGTGACGAATCCTCT
CCTTATGCTGCTATGCTTGCTGCTCAAGATGTCGCTCAAAGATGCAAGGAGCTCGGCATC
ACAGCCATGCACGTGAAGCTCCGTGCCACTGGAGGAAACAAGACCAAGACTCCAGGTCCT
GGTGCTCAGTCTGCTCTTAGAGCCCTTGCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATAGAG
GATGTGACTCCGAATCCCACCGACAGTACACGTAGAAAGGGTGGACGTAGAGGAAGAAGA
CTTTGATTTCCCCATGAGAGCCTACTCGTCATTGTTCAGTTGTTGTCCCTTTCGACTCTG
GTTGTTTATTGGGTACACACTTGGGAATTCAGTTCTGTCTCGTTACAATTTATCTTTTCA
TGTTACTTCGGAAACATTATAAGCTGTGTCTTTCTTCAATGTTGCATTTGGAGTTTTGAG
AATGAGAAGAGTAACAGTGACTATATCACGTTGTGTTTTGCTTTTCTCTTCTCACTTTAT
CTACTTC

QA 1 787 1 787
DS 

RD RS1DL69JQ 586 0 0
AGAAACTCTCGTTCGTATCACAGGTGGGATGAAGGTCAAGGCTGACCGTGACGAATCCTC
TCCTTATGCTGCTATGCTTGCTTCTCAAGATGTCGCTCAAAGATGCAAGGAGCTCGGCAT
CACAGCCATGCACGTGAAGCTCCGTGCCACTGGAGGAAACAAGACCAAGACTCCAGGTCC
TGGTGCTCAGTCTGCTCTTAGAGCCCTTGCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATAGA
GGATGTGACTCCGATTCCCACCGACAGTACACGTAGAAAGGGTGGACGTAGAGGAAGAAG
ACTTTGATTTCCCCATGAGAGCCTACTCGTCATTGTTCAGTTGTTGTCCCTTTTGACTCT
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ATGTTACTTCGGAAACATTATAAGCTGTGTCTTTCTTCAATGTTGCATTTGGAGTTTTGA
GAATGAGAAGAGTAACAGTGACTATATCACGTTGTGTTTTGCTTTTCTCTCCTCACTTTA
TCTACTTCAACCTAACTCAAGTTCCTATGCTTTTATATATAGTTAT

QA 1 586 1 586
DS 



CO CL36Contig3 783 8 7 U
GGTCACTGCCACAGTTCAGAGAAGAGCAGCATCCAAAACCCCTTAGCATTTCGTCTCTCG
TCATCCATTGATAGACATCATGTCGAGGAGAAAGACCAGAGAGCCCAAGGAAGAAACAGT
CACTCTTGGACCCGCTGTTCGCGACGGGGAGCAAGTTTTCGGTGTTGTTCACATCTTTGC
ATCTTTCAATGACACTTTCATCCATGTGACTGATCTTTCTGGAAGAGAAACTCTCGTTCG
TATCACAGGTGGGATGAAGGTCAAGGCTGACCGTGATGAGTCATCTCCTTATGCTGCTAT
GCTTGCTGCTCAAGATGTTGCTCAGAGATGCAAGGAGCTCGGCATCACAGCCATGCACGT
GAAGCTCCGTGCCACTGGAGGAAACAAAACCAAGACTCCAGGTCCTGGTGCCCAGTCTGC
TCTCAGAGCCCTTGCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATAGAGGATGTGACTCCGAT
TCCCACCGACAGTACACGTAGAAAGGGTGGACGTAGAGGAAGAAGACTTTGATTTCCCCA
TGAGAGCCTACTCGTCATTGTTCAGTTGTTGTGCCCTTTGACTCTGGTTGTTTATTGGGT
AACACACTTGGAATTTAGTTCTTTCTCGTTACAATTCATCTTTTCATGTTGCTTCGGAAA
CATTATAAGTGGTGTCTTTCTTCAATGTTGTAACTTTTGCATTTGG*AGTTTTGAGAATC
AGAAGAGGAACAGTGACTATATGTTTTACCTTTTCTCTTCCCTCACTTTATCCACTTCAA
CCT


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 10 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1DF95JQ C 366
AF RS1CU10TF U 3
AF RS1DF95TF U 1
AF RS1CM72TF U 3
AF RS1FX36TF U 3
AF RS1AD82TF U 2
AF RS1AD82JQ C 483
AF RS1CU10JQ C 682
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BS 497 675 RS1DF95TF
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BS 707 707 RS1FX36TF
BS 708 760 RS1AD82TF
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GAGCCCTTGCTGGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATAGAGGATGTGACTCCGATTCCCA
CCGACAGTACGCGTAGAAAGGGTGG

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DS 

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GG
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TTCAATGACACTTTCATCCATGTGACTGATCTTTCTGGAAGAGAAACTCTCGTTCGTATC
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GCTGCTCAAGATGTTGCTCAGAGATGCAAGGAGCTCGGCATCACAGCCATGCACGTGAAG
CTCCGTGCCACTGGAGGAAACAAAACCAAGACTCCAGGTCCTGGTGCCCAGTCTGCTCTC
AGAGCCCTTGCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATAGAGGATGTGACTCCGATTCCC
ACCGACAGTACACGTAGAAAGGGTGGACGTAGAGGAAGAAGACTTTGATTTCCCCATGAG
AGCCTACTCGTCATTGTTCAGTTGTTGTGCCCTTTGACTCTGGTTGTTTATTGGGTAACA
CACTTGGAATTTAGTTCTTTCTCGTTACAATTCATC

QA 3 638 3 638
DS 

RD RS1DF95TF 675 0 0
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CACTCTTGGACCCGCTGTTCGCGACGGGGAGCAAGTTTTCGGTGTTGTTCACATCTTTGC
ATCTTTCAATGACACTTTCATCCATGTGACTGATCTTTCTGGAAGAGAAACTCTCGTTCG
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GCTTGCTGCTCAAGATGTTGCTCAGAGATGCAAGGAGCTCGGCATCACAGCCATGCACGT
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TCCCACCGACAGTACGCGTAGAAAGGGTGGACGTAGAGGAAGAAGACTTTGATTTCCCCA
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CATTATAAGTGGTGT

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DS 

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GC
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CTTGGACCCGCTGTTCGCGACGGGGAGCAAGTTTTCGGTGTTGTTCACATCTTTGCATCT
TTCAATGACACTTTCATCCATGTGACTGATCTTTCTGGAAGAGAAACTCTCGTTCGTATC
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GCTGCTCAAGATGTTGCTCAGAGATGCAAGGAGCTCGGCATCACAGCCATGCACGTGAAG
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AGAGCCCTTGCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATAGAGGATGTGACTCCGATTCCC
ACCGACAGTACACGTAGAAAGGGTGGACGTAGAGGAAGAATACTTTGATTTCCCCATGAG
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CACTTGGAATTTAGTTCTTTCTCGTTACAATTCATCTTTTCATGTTGCTTCGGAAACATT
ATAAGTGGTGTCTTTCTTCAATGTTGTAACTTTTGCATTT

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DS 

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GG
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CCATTGATAGACATCATGTCGAGGAGAAAGACCAGAGAGCCCAAGGAAGAAACAGTCACT
CTTGGACCCGCTGTTCGCGACGGGGAGCAAGTTTTCGGTGTTGTTCACATCTTTGCATCT
TTCAATGACACTTTCATCCATGTGACTGATCTTTCTGGAAGAGAAACTCTCGTTCGTATC
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GCTGCTCAAGATGTTGCTCAGAGATGCAAGGAGCTCGGCATCACAGCCATGCACGTGAAG
CTCCGTGCCACTGGAGGAAACAAAACCAAGACTCCAGGTCCTGGTGCCCAGTCTGCTCTC
AGAGCCCTTGCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATAGAGGATGTGACTCCGATTCCC
ACCGACAGTACACGTAGAAAGGGTGGACGTAGAGGAAGAAGACTTTGATTTCCCCATGAG
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CACTTGGAATTTAGTTCTTTCTCGTTACAATTCATCTTTTCATGTTGCTTCGGAAACATT
ATAAGTGGTGTCTTTCTTCAATGTTGTAACTTTTGCATTTGG*AGTTTTGAGA

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DS 

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GGG
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CCATTGATAGACATCATGTCGAGGAGAAAGACCAGAGAGCCCAAGGAAGAAACAGTCACT
CTTGGACCCGCTGTTCGCGACGGGGAGCAAGTTTTCGGTGTTGTTCACATCTTTGCATCT
TTCAATGACACTTTCATCCATGTGACTGATCTTTCTGGAAGAGAAACTCTCGTTCGTATC
ACAGGTGGGATGAAGGTCAAGGCTGACCGTGATGAGTCATCTCCTTATGCTGCTATGCTT
GCTGCTCAAGATGTTGCTCAGAGATGCAAGGAGCTCGGCATCACAGCCATGCACGTGAAG
CTCCGTGCCACTGGAGGAAACAAAACCAAGACTCCAGGTCCTGGTGCCCAGTCTGCTCTC
AGAGCCCTTGCTCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGTATAGAGGATGTGACTCCGATTCCC
ACCGACAGTACACGTAGAAAGGGTGGACGTAGAGGAAGAAGACTTTGATTTCCCCATGAG
AGCCTACTCGTCATTGTTCAGTTGTTGTGCCCTTTGACTCTGGTTGTTTATTGGGTAACA
CACTTGGAATTTAGTTCTTTCTCGTTACAATTCATCTTTTCATGTTGCTTCGGAAACATT
ATAAGTGGTGTCTTTCTTCAATGTTGTAACTTTTGCATTTGGGAGTTTTGAGAATCAGAA
GAGGAACAGTGACTATATGTTTTACCTTTTCTCTTC

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DS 

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AGAGCCTACTCGTCATTGTTCAGTTGTTGTGCCCTTTGACTCTGGTTGTTTATTGGGTAA
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TTATAAGTGGTGTCTTTTTTCAATGTTGTAACTTTTGCATTTGG*AGTTTTGAGAATCAG
AAGAGGAACAGTGACTATATGTTTTACCTTTTCTCTTC
CCCC

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DS 

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TGTTTTACCTTTTCTCTTCCCTCACTTTATCCACTTCAACCT

QA 1 102 1 102
DS 



AS 3 16

CO CL37Contig1 1022 11 20 U
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AACACACACAAAAAATGGCTCAAACCATGCTGCTTACTTCCGGCATCTCTGCTAACCATT
TCTTGAGGAACAAGAACCCTCTGGCTCAGCCCAAAGTTCACCATCTCTTCCTCTCCGGAA
ACTCACCGGTTACTCTACCATCTCGAAGACCATCGCTGGCTCCTCTCGCTATCTTCAAAC
CCAAAACCAAAGCTGCTCCCAAAAAGGTTGAGAAAGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGTA
TCTTCGGAACGTCTGGTGGGATAGGATTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTG
TTGCTATGATCGGTTTCGCCGCATCGTTGCTAGGTGAGGCGTTGACTGGGAAAGGGATAT
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TCTTCATATTGTTCACTCTGTTGGGTGCCATTGGAGCTCTTGGAGACAGAGGAAAATTCG
TCGACGATCCTCCCACCGGACTCGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAGGGCGTTCGCT
CTGCCCTCGGTCTCAAAGAACAAGGTCCATTGTTTGGGTTCACGAAGGCGAACGAGTTGT
TCGTAGGAAGGTTGGCACAGTTGGGAATAGCATTTTCACTGATTGGGGAGATTATTACCG
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CACTCGTCCTCTTGAACGTTGCTTTCTTCTTCTTTGCTGCCATTAATCCTGGTAATGGAA
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AGTTTGGGAGACCATTATCATGTTGAGACAAAAGGAAATGGACAATTCAAACTATTGTAA
TACTTAAATCCTTTTGTTTTAACTTGCTTTTTTCTGATTATATCCCTAGTTCCTTTACAC
CT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 
60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 20 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 0 0 0 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 

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RD RS1DY24TF 372 0 0
GGACAAC
ACTTGACTGATCTTTTCTCTCATCCTCAGACGCAACAAGCAGCTTGTTGCAACACACACA
AAAAATGGCTCAAACCATGCTGCTTACTTCCGGCATCTCTTCTAACCATTTCTTGAGGAA
CAAGAACCCTCTGGCTCAGCCCAAAGTTCACCATCTCTTCCTCTCCGGAAACTCACCGGT
TACTCTACCATCTCGAAGACCATCGCTGGCTCCTCTCGCTATCTTCAAACCCAAAACCAA
AGCTGCTCCCAAAAAGGTTGAGAAAGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGTATCTTCGGAAC
GTCTGGTGGGATAGGATTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTGTTGCTATGAT
CGGTT

QA 8 372 8 372
DS 

RD RS1AN95TF 643 0 0
GGACCACAACACTTGACTGATCTTTTCTCTCATCCTCAGACGCAACAAGCAGCTTGTTGC
AACACACACAAAAAATGGCTCAAACCATGCTGCTTACTTCCGGCATCTCTGCTAACCATT
TCTTGAGGAACAAGAACCCTCTGGCTCAGCCCAAAGTTCACCATCTCTTCCTCTCCGGAA
ACTCACCGGTTACTCTACCATCTCGAAGACCATC**TGGCTCCTCTCGCTATCTTCAAAC
CCAAAACCAAAGCTGCTCCCAAAAAGGTTGAGAAAGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGTA
TCTTCGGAACGTCTGGTGGGATAGGATTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTG
TTGCTATGATCGGTTTCGCCGCATCGTTGCTAGGTGAGGCGTTGACTGGGAAAGGGATAT
TAGCACAGCTGAACTTGGAGACAGGAATACCGATTTACGAAGCAGAGCCATTGCTTCTCT
TCTTCATATTGTTCACTCTGTTGGGTGCCATTGGAGCTCTTGGAGACAGAGGAAAATTCG
TCGACGATCCTCCCACCGGACTCGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAGGGCGTTCGCT
CTGCCCTCGGTCTCAAAGAACAAGGTCCATTGTTTGGGTTCAC

QA 1 643 1 643
DS 

RD RS1CY69TF 614 0 0
GGAAC
ACTTGACTGATCTTTTCTCTCATCCTCAGACGCAACAAGCAGCTTGTTGCAACACACACA
AAAAATGGCTCAAACCATGCTGCTTACTTCCGGCATCTCTGCTAACCATTTCTTGAGGAA
CAAGAACCCTCTGGCTCAGCCCAAAGTTCACCATCTCTTCCTCTCCGGAAACTCACCGGT
TACTCTACCATCTCGAAGACCATCGCTGGCTCCTCTCGCTATCTTCAAACCCAAAACCAA
AGCTGCTCC*AAAAAGGTTGAGAAAGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGTATCTTCGGAAC
GTCTGGTGGGATAGGATTCACTAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTGTTGCTATGAT
CGGTTTCGCCGCATCGTTGCTAGGTGAGGCGTTGACTGGGAAAGGGATATTAGCACAGCT
GAACTTGGAGACAGGAATACCGATTTACGAAGCAGAGCCATTGCTTCTCTTCTTCATATT
GTTCACTCTGTTGGGTGCCATTGGAGCTCTTGGAGACAGAGGAAAATTCGTCGACGATCC
TCCCACCGGACTTGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAGGGCGTTCGCTCTGCCCTCGG
TCTCAAAGA

QA 6 614 6 614
DS 

RD RS1DX81TF 611 0 0
G
ACTTGACTGATCTTTTCTCTCATCCTCAGACGCAACAAGCAGCTTGTTGCAACACACACA
AAAAATGGCTCAAACCATGCTGCTTACTTCCGGCATCTCTGCTAACCATTTCTTGAGGAA
CAAGAACCCTCTGGCTCAGCCCAAAGTTCACCATCTCTTCCTCTCCGGAAACTCACCGGT
TACTCTACCATCTCGAAGACCATCGCTGGCTCCTCTCGCTATCTTCAAACCCAAAACCAA
AGCTGCTCCCAAAAAGGTTGAGAAAGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGTATCTTCGGAAC
GTCTGGTGGGATAGGATTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTGTTGCTATGAT
CGGTTTCGCCGCATCGTTGCTAGGTGAGGCGTTGACTGGGAAAGGGATATTAGCACAGCT
GAACTTGGAGACAGGAATACCGATTTACGAAGCAGAGCCATTGCTTCCCTTCTTCATATT
GTTCACTCTGTTGGGTGCCATTGGAGCTCTTGGAGACAGAGGAAAATTCGTCGACGATCC
TCCCACCGGACTCGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAGGGCGTTCGCCCTGCCCTCGG
TCTCAAAGAA

QA 2 611 2 611
DS 

RD RS1EH52TF 797 0 0
GG
ATCCTCAGACGCAACAAGCAGCTTGTTGCAACACACACAAAAAATGGCTCAAACCATGCT
GCTTACTTCCGGCATCTCTGCTAACCATTTCTTGAGGAACAAGAACCCTCTGGCTCAGCC
CAAAGTTCACCATCTCTTCCTCTCCGGAAACTCACCGGTTACTCTACCATCTCGAAGACC
ATCGCTGGCTCC*CTCGCTATCTTCAAACCCAAAACCAAAGCTGCTCCCAAAAAGGTTGA
GAAAGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGTATCTTCGGAACGTCTGGTGGGATAGGATTCAC
GAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTGTTGCTATGATCGGTTTCGCCGCATCGTTGCT
AGGTGAGGCGTTGACTGGGAAAGGGATATTAGCACAGCTGAACTTGGAGACAGGAATACC
GATTTACGAAGCAGAGCCATTGCTTCTCTTCTTCATATTGTTCACTCTGTTGGGTGCCAT
TGGAGCTCTTTGAGACAGAGGAAAATTCGTCGACGATCCTCCCACCGGACTCGAGAAAGC
CGTCATTCCTCCCGGCAAGGGCGTTCGCTCTGCCCCCGGTCTCAAAGAACAAGGTCCATT
GTTTGGGTTCACGAAGGCGAACGAGTTGTTCGTAGGAAAGTTGGCACAGTTGGGAATAGC
ATTTTCACTGATTGGGGAGAT*ATTACCGGGAAAGGAGCATTGGCTCAACTCAACATTGA
GACTGGTAT*CCAATTCAAGATATCGAACCACTCGTCCTCTTGA*CGTTGCTTTCTTCTT
CTT
GCTGCATTATCC

QA 3 785 3 785
DS 

RD RS1B801JQ 415 0 0
CTTGGAGACAGGAATACCGATTTACGAAGCAGAGCCATTGCTTCTCTTCTTCATATTGTT
CACTCTGTTGGGTGCCATTGGAACTCTTGGAGACAGAGGAAAATTCGTCGACGATCCTCC
CACCGGACTCGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAGGGCGTTCGCTCTGCCCTCGGTCT
CAAAGAACAAGGTCCATTGTTTGGGTTCACGAAGGCGAACGAGTTGTTCGTAGGAAGGTT
GGCACAGTTGGGAATAGCATTTTCACTGATTGGGGAGATTATTACCGGGAAAGGAGCATT
GGCTCAACTCAACATTGAGACTGGTATTCCAATTCAAGATATCGAACCACTCGTCCTCTT
GAACGTTGCTTTCTTCTTCTTTGCTGCCATTAATCCTGGTAATGGAAAGTTCATT

QA 1 415 1 415
DS 

RD RS1CY69JQ 805 0 0
ACTCTACCATCTCGAAGACCATCGCTGGCTCCTCTCGCTATCTTCAAACCCAAAACCAAA
GCTGCTCC*AAAAAGGTTGAGAAAGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGTATCTTCGGAACG
TCTGGTGGGATAGGATTCACTAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTGTTGCTATGATC
GGTTTCGCCGCATCGTTGCTAGGTGAGGCGTTGACTGGGAAAGGGATATTAGCACAGCTG
AACTTGGAGACAGGAATACCGATTTACGAAGCAGAGCCATTGCTTCTCTTCTTCATATTG
TTCACTCTGTTGGGTGCCATTGGAGCTCTTGGAGACAGAGGAAAATTCGTCGACGATCCT
CCCACCGGACTTGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAGGGCGTTCGCTCTGCCCTCGGT
CTCAAAGAACAAGGTCCATTGTTTGGGTTCACGAAGGCGAACGAGTTGTTCGTAGGAAGG
TTGGCACAGTTGGGAATAGCATTTTCACTGATTGGGGAGATTATTACCGGGAAAGGAGCA
TTGGCTCAACTCAGCATTGAGACTGGTATTCCAATTCAAGATATCGAACCACTCGTCCTC
TTGAACGTTGCTTTCTTCTTCTTTGCTGCCATTAATCCTGGTAATGGAAAGTTCATTACT
GATGATGGTGAAGAAAGCTAGACTCTTTATGTACTTTCGAGTTA***GTAGTTTGGGAGA
CCATTATCATGTTGAGACAAAAGGAAATGGACAATTTAAACTATTGTAATACTTAAATCC
TTTTGTTTTAACTTGCTTTTTTC
CG

QA 1 803 1 803
DS 

RD RS1FN31JQ 474 0 0
TCCTCCCACCGGACTCGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAAGGCGTTCGCTCTGCCCT
CGGTCTCAAAGAACAAGGTCCATTGTTTGGGTTCACGAAGGCGAACGAGTTGTTCGTAGG
AAGGTTGGCACAGTTGGGAATAGCATTTTCACTCATCGGGGAGATTATTACCGGGAAAGG
AGCATTGGCTCAACTCAACATTGAGACTGGTATTCCAATTCAAGATATCGAACCACTCGT
CCTCTTGAACGTTGCTTTTTTTTTCTTTGCTGCCATTAATCCTGGTAATGGAAAGTTCAT
TACTGATGATGGTGAAGAAAGCTAAACTCTTTATGTACTTTCGAGTTATTAGTAGTTTGG
GAGATCATTATCATGTTGAGACAAA*GGAAATGGACAATTCAAACTATTGTAATACTTAA
ATCCTTTTGTTTTAACTTGCTTTTTTCTGATTATATCCCTAGTTCCTTTAC
CCC

QA 1 471 1 471
DS 

RD RS1EH52JQ 506 0 0
CTCTGTTGGGTGCCATTGGAGCTCTTTGAGACAGAGGAAAATTCGTCGACGATCCTCCCC
CCGGACTCGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAGGGCGTTCGCTCTGCCCCCGGTCTCA
AAGAACAAGGTCCATTGTTTGGGTTCACGAAGGCGAACGAGTTGTTCGTAGGAAGGTTGG
CACAGTTGGGAATAGCATTTTCACTGATTGGGGAGATTATTACCGGGAAAGGAGCATTGG
CTCAACTCAACATTGAGACTGGTATTCCAATTCAAGATATCGAACCACTCGTCCTCTTGA
ACGTTGCTTTTTTTTTCTTTGCTGCCATTAATCCTGGTAATGGAAAGTTCATTACTGATG
ATGGTGAAGAAAGCTAAACTCTTTATGTACTTTCGAGTTA***GTAGTTTGGGAGACCAT
TATCATGTTGAGACAAAAGGAAATGGACAATTTAAACTATTGTAATACTTAAATCCTTTT
GTTTTAACTTGCTTTTTTCTGAT
TAC

QA 1 503 1 503
DS 

RD RS1DW46TF 677 0 0
G
AGGATTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTGTTGCTATGATCGGTTTCGCTGC
ATCGTTGCTAGGTGAGGCGCTGACTGGGAAAGGGATATTAGCACAGCTGAACTTGGAGAC
AGGAATACCGATTTACGAAACAGAGCCATTGCTTCTCTTCTTCATATTGTTT**TCTGTT
GGGTGCCATTGGAGCTCTTGGAGACAGAGAAAAATTCGTCGACGATCCTCCCACCGGACT
CGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAAGGCGTTCGCTCTGCCCTCGGTCTCAAAGATCA
AGGTCCATTGTTTGGGTTCACGAAGGCGAACGAGTTGTTCGTAGGAAGGTTGGCACAGTT
GGGAATAGCATTTTCACTCATCGGGGAGATTATTACCGGGAAAGGAGCATTGGCTCAACT
CAACATTGAGACCGGTATTCCAATTCAAGATATCGAACCACTCGTCCTCTTGAACGTTGC
TTTCTTCTTCTTTGCTGCCATTAATCCTGGTAATGGAAAGTTCATTACTGATGATGGTGA
AGAAAGCTAAACTCTTTATGTACTTTCGAGCTATTAGTAGTTTGGGAGATCATTATCATG
TTGAGACAAA*GGAAATGGACAATTCAAACTATTGTAATACTTAAATCCTTTTGTTTTAA
CTTGCTTTTTTCTGAT

QA 2 677 2 677
DS 

RD RS1AN95JQ 716 0 0
GAACGTCTGGTGGGATAGGATTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTGTTGCTA
TGATCGGTTTCGCCGCATCGTTGCTAGGTGAGGCGTTGACTGGGAAAGGGATATTAGCAC
AGCTGAACTTGGAGACAGGAATACCGATTTACGAAGCAGAGCCATTGCTTCTCTTCTTCA
TATTGTTCACTCTGTTGGGTGCCATTGGAGCTCTTGGAGACAGAGGAAAATTCGTCGACG
ATCCTCCCACCGGACTCGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAGGGCGTTCGCTCTGCCC
TCGGTCTCAAAGAACAAGGTCCATTGTTTGGGTTCACGAAGGCGAACGAGTTGTTCGTAG
GAAGGTTGGCACAGTTGGGAATAGCATTTTCACTGATTGGGGAGATTATTACCGGGAAAG
GAGCATTGGCTCAACTCAACATTGAGACTGGTATTCCAATTCAAGATATCGAACCACTCG
TCCTCTTGAACGTTGCTTTCTTCTTCTTTGCTGCCATTAATCCTGGTAATGGAAAGTTCA
TTACTGATGATGGTGAAGAAAGCTAAACTCTTTATGTACTTTCGAGTTA***GTAGTTTG
GGAGACCATTATCATGTTGAGACAAAAGGAAATGGACAATTTAAACTATTGTAATACTTA
AATCCTTTTGTTTTAACTTGCTTTTTTCTGATTATATCCCTAGTTCCTTTACACCT

QA 1 716 1 716
DS 



CO CL37Contig2 978 3 6 U
AATCTGAAAACTCAAGTTAAAACAAGAGGATTTAAGAATTACAACAGTTTAAGCTGCCCA
TTTCATTTTGTCTCAACATGAAGAGGGCTCACAAACTACAAATTTTAAGTACATAAATAG
TTTAGCTTTCTTCACCATCATCAGTAATGAACTTTCCATTACCAGGATTAATGGCTGCAA
AGAAGAAGAAAGCAACGTTTAAAAGGACGAGGGGTTCGATATCTTGAATTGGAATACCAG
TCTCAATGTTGAGTTGAGCCAATGCTCCTTTCCCGGTTATAATCTCTCCTATCAATGAAA
ATGCTATTCCCAACTGTGCCAATCTTCCTACGAACAACTCGTTTGCCTTCGTGAACCCAA
ACAACGGACCTTGTTCTTTAAGACCGAGGGCAGATCGGACGCCTTTGCCGGGAGGAATGA
CGGCTTTCTCAAGTCCGGTGGGAGGATCGTCGACGAATTTTCCTCTGTCCCCAAGAGCTC
CGATAGCACCCAACAGAGTGAACAATATGAAGAAGAGAAGCAATGGCTCTGCTTCGTAAA
TCGGTATCCCCGTCTCCAGATTCAACTGTGCTAATATACCTTTCCCTGTCAACGCCTCAC
CCAGCAACGATGCAGCAAAACCGATCATAGCAACACGACCCACAAAGAGCTCGTTCTGCT
TCGTGAAACCTATCCCACCAGATGCTCCGAAGATACCGTCTTCAACCTTTGGCTTCACCT
TCTCAACCTTTTTGGGAGCAGCTTTGGTTTTGGGTTTGAAGATGGCGAGAGGAACTAATG
ATGGTCTTCGAGATGGTAGAATAACATGAGAGTTTCCCGAGAGGAAGAGATGGTGAACTT
TGGGCTGAGCGAGAGGGTTCATGTTTCTTAAAAATTGGTTTGCAGAGACGCCTGAGGTAA
GCAGCATGGTTTGAGCCATTTTGTATTTTGTGTGGTGTGCTGCTTGCAGCGTCTGAAGAT
GAAAGAAAGGATCAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GP81JQ U 27
AF RS1E481JQ U 1
AF RS1E481TF C 375
BS 1 202 RS1E481JQ
BS 203 203 RS1GP81JQ
BS 204 216 RS1E481JQ
BS 217 217 RS1GP81JQ
BS 218 498 RS1E481JQ
BS 499 978 RS1E481TF

RD RS1GP81JQ 194 0 0
AGGATTTAAGAATTACAACAGTTTAAGCTGCCCATTTCATTTTGTCTCAACATGAAGAGG
GCTCACAAACTACAAATTTTAAGTACATAAATAGTTTAGCTTTCTTCACCATCATCAGTA
ATGAACTTTCCATTATCAGGATTAATGGCTGCAAAGAAGAAGAAGGCAACGTTTAAAAGG
ACGAGGGGTTCGAT

QA 1 194 1 194
DS 

RD RS1E481JQ 498 0 0
AATCTGAAAACTCAAGTTAAAACAAGAGGATTTAAGAATTACAACAGTTTAAGCTGCCCA
TTTCATTTTGTCTCAACATGAAGAGGGCTCACAAACTACAAATTTTAAGTACATAAATAG
TTTAGCTTTCTTCACCATCATCAGTAATGAACTTTCCATTACCAGGATTAATGGCTGCAA
AGAAGAAGAAAGCAACGTTTAAGAGGACGAGGGGTTTGATATCTTGAATTGGAATACCAG
TCTCAATGTTGAGTTGAGCCAATGCTCCTTTCCCGGTTATAATCTCTCCTATCAATGAAA
ATGCTATTCCCAACTGTGCCAATCTTCCTACGAACAACTCGTTTGCCTTCGTGAACCCAA
ACAACGGACCTTGTTCTTTAAGACCGAGGGCAGATCGGACGCCTTTGCCGGGAGGAATGA
CGGCTTTCTCAAGTCCGGTGGGAGGATCGTCGACGAATTTTCCTCTGTCCCCAAGAGCTC
CGATAGCACCCAACAGAG

QA 1 498 1 498
DS 

RD RS1E481TF 604 0 0
TCTTTAAGACCGAGGGCAGATCGGACGCCTTTGCCGGGAGGAATGACGGCTTTCTCAAGT
CCGGTGGGAGGATCGTCGACGAATTTTCCTCTGTCCCCAAGAGCTCCGATAGCACCCAAC
AGAGTGAACAATATGAAGAAGAGAAGCAATGGCTCTGCTTCGTAAATCGGTATCCCCGTC
TCCAGATTCAACTGTGCTAATATACCTTTCCCTGTCAACGCCTCACCCAGCAACGATGCA
GCAAAACCGATCATAGCAACACGACCCACAAAGAGCTCGTTCTGCTTCGTGAAACCTATC
CCACCAGATGCTCCGAAGATACCGTCTTCAACCTTTGGCTTCACCTTCTCAACCTTTTTG
GGAGCAGCTTTGGTTTTGGGTTTGAAGATGGCGAGAGGAACTAATGATGGTCTTCGAGAT
GGTAGAATAACATGAGAGTTTCCCGAGAGGAAGAGATGGTGAACTTTGGGCTGAGCGAGA
GGGTTCATGTTTCTTAAAAATTGGTTTGCAGAGACGCCTGAGGTAAGCAGCATGGTTTGA
GCCATTTTGTATTTTGTGTGGTGTGCTGCTTGCAGCGTCTGAAGATGAAAGAAAGGATCA
GTCC

QA 1 604 1 604
DS 



CO CL37Contig3 684 2 2 U
GGACTGATCCTTTCTTTCATCTTCAGACGCTGCAAGCAGCACACCACACAAAATACAAAA
TGGCTCAAACCATGCTGCTTACTTCAGGCGTCTCTGCAAACACTTTTTTAAGGAACAAGA
ACCCTCTCGCTCAGCCCAAAGTTCACCATCTCCTCCTCTCGGGAAACTCTCATGTTATTC
TACCATCTCGAAGACCATCATTAGTTCCTCTCGCCATCTTCAAACCCAAAACCAAAGCTG
CTCCCAAAAAGGTTGAGAAGGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGTATTTTCGGAACATCTG
GTGGGATAGGTTTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTGTTGCTATGATCGGTT
TCGCTGCATCGTTGCTGGGTGAGGCGTTGACAGGGAAAGGTATATTAGCACAGTTGAATC
CGGAGACAGGGATACCGATTTACGAAGCAGAGCCATTGCTTCTCTTCTTCATATTGTTCA
CTCTGTTGGGTGCTATCGGAGCTCTTGGGGACAGAGGAAAATTCGTCGACGATCCTCCCA
CCGGACTTGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAAGGCGTCCGATCTGCCCTCGGTCTTA
AAGAACAAGTCCATTGTTTGGGTTCACGAAAGCAAACGAGTTGTTCGTAGAAGATTGGCA
CAGTTGGGAATAGCATTTTCATTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FE83TF U 1
AF RS1GP81TF U 1
BS 1 627 RS1FE83TF
BS 628 684 RS1GP81TF

RD RS1FE83TF 627 0 0
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CGGAGACAGGGATACCGATTTACGAAGCAGAGCCATTGCTTCTCTTCTTCATATTGTTCA
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CCGGACTTGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAAGGCGTCCGATCTGCCCTCGGTCTTA
AAGAACAAGTCCATTGTTTGGGTTCAC

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DS 

RD RS1GP81TF 684 0 0
GGACTGATCCTTTCTTTCATCTTCAGACGCTGCAAGCAGCACACCACACAAAATACAAAA
TGGCTCAAACCATGCTGCTTACTTCAGGCGTCTCTGCAAACACTTTTTTAAGGAACAAGA
ACCCTCTCGCTCAGCCCAAAGTTCACCATCTCCTCCTCTCGGGAAACTCTCATGTTATTC
TACCATCTCGAAGACCATCATTAGTTCCTCTCGCCATCTTCAAACCCAAAACCAAAGCTG
CTCCCAAAAAGGTTGAGAAGGTGAAGCCAAAGGTTGAAGACGGTATTTTCGGAACATCTG
GTGGGATAGGTTTCACGAAGCAGAACGAGCTCTTTGTGGGTCGTGTTGCTATGATCGGTT
TCGCTGCATCGTTGCTGGGTGAGGCGTTGACAGGGAAAGGTATATTAGCACAGTTGAATC
CGGAGACAGGGATACCGATTTACGAAGCAGAGCCATTGCTTCTCTTCTTCATATTGTTCA
CTCTGTTGGGTGCTATCGGAGCTCTTGGGGACAGAGGAAAATTCGTCGACGATCCTCCCA
CCGGACTTGAGAAAGCCGTCATTCCTCCCGGCAAAGGCGTCCGATCTGCCCTCGGTCTTA
AAGAACAAGTCCATTGTTTGGGTTCACGAAAGCAAACGAGTTGTTCGTAGAAGATTGGCA
CAGTTGGGAATAGCATTTTCATTG

QA 1 684 1 684
DS 



AS 2 17

CO CL38Contig1 1010 9 13 U
CACACTGAAATTTCCATTAACTTGAAGAAAATACAGGGGTGGAATGCATTTTTGAAATAC
AGAAAGCCAGCAGGAACATAGAGTCCTCTGGAGTCAAAAGCCAACAGAACTACTAGAGAT
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GGACACACCTTGACGAGCCACGAGAAACCACAGAGAATCAAACCCAGGAGGAAGAAGAGA
AACCATTAACTTACAAACCTCCATGAACAAGTGTTGAAGGACCGAAGCCCCAAATCCTTG
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ATAAGCACATTCTCCAGAACACGAAGAGACCACCACATAAGCAAACAACACAAACCAGCA
GGAAAGGGAGACCGAGCTGTTAAGAGAGGAGCAAACCAGAACCGCCATGACCCACAAGAA
CCAGCACCAGCAGCCTCTAATCCCACGAACTCGAACCTGCAAATCTAGAACTATATTCCA
AACGCCAACCTTTCATCCAAGAGAACCTGGAGGCCAGGACATAGATCTGAGGAGGCGCCG
ACTGACCGCTCGTCGCTCAACAACGAAACAACCAGCATCGAGACCTCCTCTTGGCTCAGA
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CTCCGACGCAGACGAAAGGCGTCCGACACCGGAGAGCGACGGGTCTGGACCAAGATTAAG
CTAGGCGGCGCTTTGAGTTGGGAGAGAAATTAGGGCCGCCTGTCAATCCC


BQ
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 25 50 25 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RS1GI44JQ U 1
AF RS1FC20JQ U 1
AF RS1GT27JQ U 1
AF RS1F724JQ U 2
AF RS1CP80JQ U 1
AF RS1CP80TF C 204
AF RS1GI44TF C 516
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BS 1 104 RS1CP80JQ
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BS 969 1009 RS1CP80TF
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DS 

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QA 1 576 1 576
DS 

RD RS1GT27JQ 723 0 0
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CTTTGAAGCCAAACATAAGCTATGAACACAACTGGATAAAAGTATGGACTGATAGGAATC
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GGACACACCTTGACGAGCCACGAGAAACCACAGAGAATCAAACCCAGGAGGAAGAAAAAA
AACCATTAACTTACAAACCTCCATGAACAAGTGTTGAAGGACCGAAGCCCCAAATCCTTG
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ACT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1F724JQ 777 0 0
G
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GAATCAAATAAAATGAGAGCTTAGGAAAGCAGAATCATCGAGAAGAGGAGGACAGGATAA
GCGCACACCAATAGACAAACTTATTAAAGGGGAGACTCTGGAACTCTTATACTGCTCCGG
ACACACCTTGACGAGCCACGAGAAACCACAGAGAATCAAACCCAGGAGGAGGAAGAGAAA
CCATTAACTTACAAACCTCCATGAACAAGTGTTGAAGGACCGAAGCCCCAAATCCTTGAG
ACACTAGCCGGGAAATCCACGAACCGAGACGGACAACAGCCGTCGCAAATGACCAAGGAT
AAGCACATTCTCCAGAACACGAAGAGACCACCACATAAGCAAACAACACAAACCAGCAGG
AAAGGGAGACCGAGCTGTTAAGAGAGGAGCAAACCAGAACCGCCATGACCCACAAGAACC
AGCACCAGCAGCCTCTAATCCCACGAACTCGAACCTGCAAATCTAGAACTATATTCCAAA
CGCCAACCTTTCATCCAAGAGAACCTGGAGGCCAGGACATAGATCTGAGGAGGCGCCGAC
TGACCGCTCGTCGCTCAACAACGAAACAACCAGCATCGAGACCTCCTCTTGGCTCA

QA 2 777 2 777
DS 

RD RS1CP80JQ 812 0 0
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CTTTGAAGCCAAACATAAGCTATGAACACAACTGGATAAAAGTATGGACTGATAGGAATC
TAGAATCAAATAAAATGAGAGCTTAAGAAAGCAGAATCATCGAGAAGAGGAGGACAGGAT
AAGCGCACACCAATAGACAAACTTATTAAAGGGGAGACTCTGGAACTCTTATACTGCTCC
GGACACACCTTGACGAGCCACGAGAAACCACAGAGAATCAAACCCAGGAGGAAGAAGAGA
AACCATTAACTTACAAACCTCCATGAACAAGTGTTGAAGGACCGAAGCCCCAAATCCTTG
AGACACTAGCCGGAAAATCCACGAACCGAGACGGACAACAGCCGTCGCAAATGACCAAGG
ATAAGCACATTCTCCAGAACACGAAGAGACCACCACATAAGCAAACAACACAAACCAGCA
GGAAAGGGAGACCGAGCTGTTAAGAGAGGAGCAAACCAGAACCGCCATGACCCACAAGAA
CCAGCACCAGCAGCCTCTAATCCCACGAACTCGAACCTGCAAATCTAGAACTATATTCCA
AACGCCAACCTTTCATCCAAGAGAACCTGGAGGCCAGGACATAGATCTGAGGAGGCGCCG
ACTGACCGCTCGTCGCTCAACAACGAAACAACAAGCATCGAGACCTCCTCTTGGCTCAGA
CGAGCAA*AATCTGAAAGACAGAGCATCGCCA

QA 1 812 1 812
DS 

RD RS1CP80TF 806 0 0
TAAGAAAGCAGAATCATCGAGAAGAGGAGGACAGGATAAGCGCACACCAATAGACAAACT
TATTAAAGGGGAGACTCTGGAACTCTTATACTGCTCCGGACACACCTTGACGAGCCACGA
GAAACCACAGAGAATCAAACCCAGGAGGAAGAAGAGAAACCATTAACTTACAAACCTCCA
TGAACAAGTGTTGAAGGACCGAAGCCCCAAATCCTTGAGACACTAGCCGGAAAATCCACG
AACCGAGACGGACAACAGCCGTCGCAAATGACCAAGGATAAGCACATTCTCCAGAACACG
AAGAGACCACCACATAAGCAAACAACACAAACCAGCAGGAAAGGGAGACCGAGCTGTTAA
GAGAGGAGCAAACCAGAACCGCCATGACCCACAAGAACCAGCACCAGCAGCCTCTAATCC
CACGAACTCGAACCTGCAAATCTAGAACTATATTCCAAACGCCAACCTTTCATCCAAGAG
AACCTGGAGGCCAGGACATAGATCTGAGGAGGCGCCGACTGACCGCTCGTCGCTCAACAA
CGAAACAACAAGCATCGAGACCTCCTCTTGGCTCAGACGAGCAAGAATCTGAAAGACAGA
GCATCGCCATAAAAACCGATCTATAAACAAACCTCCAGATCCGACAAAATCAGTTCCTAT
ATAATCTAAACGACTGAAACAAAGACAAGAGGAGCCCCTCCGATGCAGACGAAAGGCGTC
CGACACCGGAGAGCGACGGGTCTGGACCAAGATTAAGCTAGGCGACGCTTTGAGTTGGGA
GAGAAATTAGGGCCGCCTGTCAATCC

QA 1 806 1 806
DS 

RD RS1GI44TF 494 0 0
CATAAGCAAACAACACAAACCAGCAGGAAAGGGAGACCGAGCTGTTAAGAGAGGAGCAAA
CCAGAACCGCCATGACCCACAAGAACCAGCACCAGCAGCCTCTAATCCCACGAACTCGAA
CCTGCAAATCTAGAACTATATTCCAAACGCCAACCTTTCATCCAAGAGAACCTGGAGGCC
AGGACATAGATCTGAGGAGGCGCCGACTGACCGCTCGTCGCTCAACAACGAAACAACCAG
CATCGAGACCTCCTCTTGGCTCAGACGAGCAAGAATCTGAAAGACAGAGCATCGCCATAA
AAACCGATCTATAAACAAACCTCCAGATCCGACAAAATCAGTTCCTATATAATCTAAACG
ACTGAAACAAAGACAAGAGGAGCCCCTCCGACGCAGACGAAAGGCGTCCGACACCGGAGA
GCGACGGGTCTGGACCAAGATTAAGCTAGGCGGCGCTTTGAGTTGGGAGAGAAATTAGGG
CCGCCTGTCAATCC

QA 1 494 1 494
DS 

RD RS1GT27TF 705 0 0
CACA
CTTGACGAGCCACGAGAAACCACAGAGAATCAAACCCAGGAGGAAGAAGAGAAACCATTA
ACTTACAAACCTCCATGAACAAGTGTTGAAGGACCGAAGCCCCAAATCCTTGAGACACTA
GCCGGAAAATCCACGAACCGAGACGGACAACAGCCGTCGCAAATGACCAAGGATAAGCAC
ATTCTCCAGAACACGAAGAGACCACCACATAAGCAAACAACACAAACCAGCAGGAAAGGG
AGACCGAGCTGTTAAGAGAGGAGCAAACCAGAACCGCCATGACCCACAAGAACCAGCACC
AGCAGCCTCTAATCCCACGAACTCGAACCTGCAAATCTAGAACTATATTCCAAACGCCAA
CCTTTCATCCAAGAGAACCTGGAGGCCAGGACATAGATCTGAGGAGGCGCCGACTGACCG
CTCGTCGCTCAACAACGAAACAACCAGCATCGAGACCTCCTCTTGGCTCAGACGAGCAAG
AATCTGAAAGACAGAGCATCGCCATAAAAACCGATCTATAAACAAACCTCCAGATCCGAC
AAAATCAGTTCCTATATAATCTAAACGACTGAAACAAAGACAAGAGGAGCCCCTCCGACG
CAGACGAAAGGCGTCCGACACCGGAGAGCGACGGGTCTGGACCAAGATTAAGCTAGGCGG
CGCTTTGAGTTGGGAGAGAAATTAGGGCCGCCTGTCAATCC

QA 5 705 5 705
DS 

RD RS1F724TF 697 0 0
CGAGCCACGAGAAACCACAGAGAATCAAACCCAGGAGGAGGAAGAGAAACCATTAACTTA
CAAACCTCCATGAACAAGTGTTGAAGGACCGAAGCCCCAAATCCTTGAGACACTAGCCGG
GAAATCCACGAACCGAGACGGACAACAGCCGTCGCAAATGACCAAGGATAAGCACATTCT
CCAGAACACGAAGAGACCACCACATAAGCAAACAACACAAACCAGCAGGAAAGGGAGACC
GAGCTGTTAAGAGAGGAGCAAACCAGAACCGCCATGACCCACAAGAACCAGCACCAGCAG
CCTCTAATCCCACGAACTCGAACCTGCAAATCTAGAACTATATTCCAAACGCCAACCTTT
CATCCAAGAGAACCTGGAGGCCAGGACATAGATCTGAGGAGGCGCCGACTGACCGCTCGT
CGCTCAACAACGAAACAACCAGCATCGAGACCTCCTCTTGGCTCAGACGAGCAAGAATCT
GAAAGACAGAGCATCGCCATAAAAACCGATCTATAAACAAACCTCCAGATCCGACAAAAT
CAGTTCCTATATAATCTAAGCGACTGAAACAAAGACAAGAGGAGCCCCTCCAATGCAGAC
GAAAGGCGTCCGACACCGGAGAGCGACGGGTCTGGACCAAGATTAAGCTAGGCGGCGCTT
TGAGTTGGGAGAGAAATTAGGGCCGCCTGTCAATCCC

QA 1 697 1 697
DS 



CO CL38Contig2 1025 8 16 U
CACTGAAATTTCCATTAACTTGAAGAAAATACAGGGGTGAAATGCATTTTTGAAATACAG
AAAGCCAGCAGGAACATAAGAGTCTTCTGGAGCCAAAAGCCAACAGAACTACAAGAGATC
TTTGGAGCCAAACATAAGAAATGAACACAATTGGATAAAAATATGGACTGATAGGAATCT
AGAAGCAAATAAAATAAGAGCTTAAGTAAGCAGAAACAACGAGGAGAGGAGGACAGGATA
AGCGCACACCAATAGACAAACTTATTAAAGGGGGAGACTCTGGAACTCTTATACTGCTCC
GGACACACATTGACGAGCCACGAGAAACCACAGAGAATCAAACCCAGGAGGAAGAAGACT
AACCATTAACTTACAAACCTCCATGAACAGGTGCAGAAGGACCGAAACCCCAAATCCTTG
AGACACTAGCCGGAAAATCCACGAACCGAGACGGACAACAGCCGTCGCAAATGACCAAGG
ATAAGCACATCCTCCAGAACACGAAGAGACCACCACATAAGCAAACAACACAAA*CCCGC
AGGAAAGGGAGACCGAGCTGTTAAGAGAGGACCAAACCAGAACCGACAGGACCCACAAGA
ACCAGCACCAGCAGCCTCTACAACCACGAACTCGAACCTGCAAATCTAGAACTAGATTCC
AAACGCCAACCTTTCATCCAAGAGAACCTGGAGGCAAAGACATAGATCTGAGGAGGCGCC
GACCGACCGCTCGTCGCTCAACAGCGAAACAACCAGCATCGAGACCTCCTCTTGGCTCAG
GCGAGCAAGAATCTGTAAGACAGAGCATCGCCATAAAAACCGATCTATAAACAAACCTCC
AGATCCGACAAAATCAGTTC**ATATAATCTAAACGACTGAAACAAAGACAAGAGGAGCC
CCTCCGATGCTGACGAAAGGCGTCCGACACCGGAGAGCGACGGATCTGGACCAAGATGAA
GCTAGGCGGCGCTTTGAGTTGGGAGAGAAATTAGGGCTCTCGGGGTTTCATTAATTTACA
ATTCC


BQ
20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 15 
35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 

AF RS1BN52JQ U 2
AF RS1G824JQ U 1
AF RS1GP53JQ U 1
AF RS1FS29JQ U 1
AF RS1G824TF C 434
AF RS1FS29TF C 303
AF RS1GP53TF C 295
AF RS1DJ14TF C 444
BS 1 68 RS1FS29JQ
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BS 70 528 RS1FS29JQ
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RD RS1BN52JQ 589 0 0
C
CTGAAATTCCCATTAACTTGAAAAAAATACAGGGGTGAAATGCATTTTTGAAATACAGAA
AGCCAGCAGGAACATAAAAGTCTTCTGGAGCCAAAAGCCAACAGAACTACAAGAGACCTT
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CGCACACCAATAGACAAACTTATTAAAGGGGGAGACTCTGGAACTCTTATACTGCTCCGG
ACACACATTGACGAGCCACGAGAAACCACAGAGAATCAAACCCAGGAGGAAGAAGACTAA
CCATTAACTTACAAACCTCCATGAACAGGTGCAAAAGGACCGAAACCCCAAATCCTTGAA
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AAGCACATCCTCCAAAACACGAAGAGACCACCACATAAGCAAACAACACAAA*CCCGCAG
GAAAGGGAGACTGAGCTGTTAAGAGAGGACCAAACCAGAACCGACAGG

QA 2 589 2 589
DS 

RD RS1G824JQ 651 0 0
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GGACACACATTGACGAGCCACGAGAAACCACAGAGAATCAAGCCCAGGAGGAAGAAGACT
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AGACACTAGCCGGAAAATCCACGAACCGAGACGGACAACAGCCGTCGCAAATGACCAAGG
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QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1GP53JQ 639 0 0
CACTGAAATTTCCATTAACTTGAAGAAAATACAGGGGTGAAATGCATTTTTGAAATACAG
AAAGCCAGCAGGAACATAAGAGTCTTCTGGAGCCAAAAGCCAACAGAACTACAAGAGATC
TTTGGAGCCAAACATAAGAAATGAACACAATTGGATAAAAATATGGACTGATAGGA*TCT
AGAAGCAAATAAAATAAGAGCTTAAGTAAGCAGAAACAACGAGGAGAGGAGGACAGGATA
AGCGCACACCAATAGACAAACTTATTAAAGGGGGAGACTCTGGAACTCTTATACTGCTCC
GGACACACATTGACGAGCCACGAGAAACCACAGAGAATCAAACCCAGGAGGAAGAAGACT
AACCATTAACTTACAAACCTCCATGAACAGGTGCAGAAGGACCGAAACCCCAAATCCTTG
AGACACTAGCCGGAAAATCCACGAACCGAGACGGACAACAGCCGTC**AAATGACCAAGG
ATAAGCACATCCTCCAGAACACGAAGAGACCACCACATAAGCAAACAACACAAA*CCCGC
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ACCAGCACCAGCAGCCTCTACAACCACGAACTCGAACCT

QA 1 639 1 639
DS 

RD RS1FS29JQ 819 0 0
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AAAGCCAGTAGGAACATAAGAGTCTTCTGGAGCCAAAAGCCAACAGAACTACAAGAGATC
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AGAAGCAAATAAAATAAGAGCTTAAGTAAGCAGAAACAACGAGGAGAGGAGGACAGGATA
AGCGCACACCAATAGACAAACTTATTAAAGGGGGAGACTCTGGAACTCTTATACTGCTCC
GGACACACATTGACGAGCCACGAGAAACCACAGAGAATCAAACCCAGGAGGAAGAAGACT
AACCATTAACTTACAAACCTCCATGAACAGGTGCAGAAGGACCGAAACCCCAAATCCTTG
AGACACTAGCCGGAAAATCCACGAACCGAGACGGACAACAGCCGTCGCAAATGACCAAGG
ATAAGCACATCCTCCAGAACACGAAGAGACCACCACATAAGCAAACAAAAAAAAACCCGC
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AAACGCCAACCTTTCATCCAAGAGAACCTGGAGGCAAAGACATAGATCTGAGGAGGCGCC
GACCGACCGCTCGTCGCTCAACAGCGAAACAACCAGCATCGAGACCTCCTCTTGGCTCAG
*CGAGCAA*AATCTGTAAGACAGAGCATCGCCATAAAAA

QA 1 819 1 819
DS 

RD RS1G824TF 570 0 0
AAAATCCACGAACCGAGACGGACAACAGCCGTCGCAAATGACCAAGGATAAGCACATCCT
CCAGAACACGAAGAGACCACCACATAAGCAAACAACACAAA*CCCGCATGAAAGGGAGAC
CGAGCTGTTAAGAGAGGACCAAACCAGAACCGACAGGACCCACAAGAACCAGCACCAGCA
GCCTCTACAACCACGAACTCGAACCTGCAAATCTAGAACTAGATTCCAAACGCCAACCTT
TCATCCAAGAGAACCTGGAGGCAAAGACATAGATCTGAGGAGGCGCCGACCGACCGCTCG
TCGCTCAACAGCGAAACAACCAGCATCGAGACCTCCTCTTGGCTCAGGCGAGCAAGAATC
TGTAAGACAGAGCATCGCCATAAAAACCGATCTATAAACAAACCTCCAGATCCGACAAAA
TCAGTTC**ATATAATCTAAACGACTGAAACAAAGACAAGAGGAGCCCCTCCGATGCTGA
CGAAAGGCGTCCGACACCGGAGAGCGACGGATTTGGACCAAGATGAAGCTAGGCGGCGCT
TTGAGTTGGGAGAGAAATTAGGGCTCTC
CC

QA 1 568 1 568
DS 

RD RS1FS29TF 712 0 0
GACACACA
TGACGAGCCACGAGAAACCACAGAGAATCAAACCCAGGAGGAAGAAGACTAACCATTAAC
TTACAAACCTCCATGAACAGGTGCAGAAGGACCGAAACCCCAAATCCTTGAGACACTAGC
CGGAAAATCCACGAACCGAGACGGACAACAGCCGTCGCAAATGACCAAGGATAAGCACAT
CCTCCAGAACACGAAGAGACCACCACATAAGCAAACAAAAAAAAACCCGCAGGAAAGGGA
GACCGAGCTGTTAAGAGAGGACCAAACCAGAACCGACAGGACCCACAAGAACCAGCACCA
GCAGCCTCTACAACCACGAACTCGAACCTGCAAAGCTAGAACTAGATTCCAAACGCCAAC
CTTTCATCCAAGAGAACCTGGAGGCAAAGACATAGATCTGAGGAGGCGCCGACCGACCGC
TCGTCGCTCAACAGCGAAACAACCAGCATCGAGACCTCCTCTTGGCTCAGGCGAGCAAGA
ATCTGTAAGACAGAGCATCGCCATAAAAACCGATCTATAAACAAACCTCCAGATCCGACA
AAATCAGTTCCTATATAATCTAAACGACTGAGACAAAGACAAGAGGAGCCCCTCCGATGC
TGACGAAAGGCGTCCGACACCGGAGAGCGACGGATCTGGACCAAGATGAAGCTAGGCGGC
GCTTTGAGTTGGGAGAGAAATTAGGGC
TCTCGGGGTTTCATTCC

QA 9 695 9 695
DS 

RD RS1GP53TF 731 0 0
CTGCT
CGGACACACAT*GACGAGCCACGAGAAACCACAGAGAATCAAACCCAGGAGGAAGAAGAC
TAACCATTAACTTACAA*CCTCCATGAACAGGTGCAGAAGGACCGAAACCCCAAATCCTT
GAGACACTAGCCGGAAAATCCACGAACCGAGACGGACAACAGCCGTC**AAATGACCAAG
GATAAGCACATCCTCCAGAACACGAAGAGACCACCACATAAGCAAACAACACAAA*CCCG
CAGGAAAGGGAGACCGAGCTGTTAAGAGAGGACCAAACCAGAACCGACAGGACCCACAAG
AACCAGCACCAGCAGCCTCTACAACCACGAACTCGAACCTGCAAATCTAGAACTAGATTC
CAAACGCCAACCTTTCATCCAAGAGAACCTGGAGGCAAAGACATAGATCTGAGGAGGCGC
CGACCGACCGCTCGTCGCTCAACAGCGAAACAACCAGCATCGAGACCTCCTCTTGGCTCA
GGCGAGCAAGAATCTGTAAGACAGAGCATCGCCATAAAAACCGATCTATAAACAAACCTC
CAGATCCGACAAAATCAGTTC**ATATAATCTAAACGACTGAAACAAAGACAAGAGGAGC
CCCTCCGATGCTGACGAAAGGCGTCCGACACCGGAGAGCGACGGATCTGGACCAAGATGA
AGCTAGGCGGCGCTTTGAGTTGGGAGAGAAATTAGGGCTCTCGGGGTTTCATTAATTTAC
AATTCC

QA 6 731 6 731
DS 

RD RS1DJ14TF 582 0 0
AACCGAGACGGACAACAGC*GTCGCAAATGACCAAGGATAAGCACATCCTCCAGAACACG
AAGAGACCACCACATAAGCAAACAACACAAA*CCCGCAGGAAAGGGAGACCGAGCTGTTA
AGAGAGGACCAAACCAGAACCGACAGGACCCACAAGAACCAGCACCAGCAGCCTCTACAA
CCACGAACTCGAACCTGCAAATCTAGAACTAGATTCCAAACGCCAACCTTTCATCCAAGA
GAACCTGGAGGCAAAGACATAGATCTGAGGAGGCGCCGACCGACCGCTCGTCGCTCAACA
GCGAAA**ACCAGCATCGAGACCTCCTCTCGGCTCAGGCGAGCAAGAATCTGTAAGACAG
AGCATCGCCATAAAAACCGATCTATAAACAAACCTCCAGATCCGACAAAATCAGTTC**A
TATAATCTAAACGACTGAAACAAAGACAAGAGGAGCCCCTCCGATGCTGACGAAAGGCGT
CCGACACCGGAGAGCGACGGATCTGGACCAAGATGAAGCTAGGCGGCGCTTTGAGTTGGG
AGAGAAATTAGGGCTCTCGGGGTTTCATTAATTTACAATTCC

QA 1 582 1 582
DS 



AS 1 18

CO CL39Contig1 760 18 8 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGACTTTAGAT
ATCATCGAGAAAGAGAAAGAAAGATAGAGAGATAAATGGTGAAGGCACGTACCGTGGG*T
GTGGGAATGGACTATTCTCCGACGAGCAAATCGGCTCTTCGGTGGACTGCGGGGAATCTC
CTTGACGATGGAGACACCATCATCTTGATTCATGTTCAACCCCAAAACGCTGAGCACACC
CGCAAAATCCTCTTTGAGGAAACCGGTTCACCGTTGATTCCTCTGGAGGAATTTAGAGAG
GTTAATTTCTCTAAACAGTATGGACTTGCTTATGATCCGGAGGTTCTTGATGTTCTTGAT
ACTCTCTCTAGGGCAAAGAAGGTGAAGGTGGTGGCAAAAGTGTATTGGGGAGATCCAAGA
GAGAAACTTTGCGATGCCGTCGAAAATCTAAAACTCGATTCCATTGTTCTTGGCAGTCGA
GGCTTGGGTCCTCTCAAAAGGATGTTGCTGGGTAGTGTGAGCAACCATGTGGTGACAAAT
GCAACATGTCCAGTCACGGTTGTTAAAGCCAATTAAAGTCTATTGTTCTTTAAAATTTGG
AAACAGCGTGTGGAATGTGTGCACTGGTTTCGACTTGTATGTTGTATCCATACATTAGTC
TTTCAATAAACTAAAGCTAAATGAAATCTGTAGTTATCAATTGTCACTTTTGTTTTATAA
AAAACATGAAAAACAGCACATAATAAATTTTTGATTAGCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 65 65 75 75 75 75 75 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 70 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 60 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 70 90 90 90 90 90 90 90 90 95 95 80 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 97 97 97 97 97 65 97 97 97 97 97 97 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 95 95 80 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 65 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 
95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 95 70 95 95 95 95 95 95 95 95 95 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 60 90 20 90 90 90 60 60 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 70 65 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1GR51TF U 50
AF RS1G489TF U 49
AF RS1H685TF U 50
AF RS1A389TF U 1
AF RS1DJ77JQ C 49
AF RS1DJ77TF U 49
AF RS1FB43JQ C 50
AF RS1FB43TF U 50
AF RS1CL30TF U 50
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AF RS1GZ34TF U 50
AF RS1A389TV U 1
AF RS1F709JQ C 55
AF RS1F709TF U 55
AF RS1BW37TF U 49
AF RS1G851JQ C 158
AF RS1A389TR C 166
AF RS1A389JQ C 443
BS 1 119 RS1A389TF
BS 120 120 RS1GR51TF
BS 121 606 RS1A389TF
BS 607 607 RS1FB43TF
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RD RS1GR51TF 405 0 0
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TACCGTGGG*TGTGGGAATGGACTATTCTCCGACTAGCAAATCGGCTCTTCGGTGGACTG
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AATTTAGAGAGGTTAATTTCTCTAAACAGTATGGACTTGTTTATGATCCGGAGGTTCTTG
ATGTTCTTGATACTCTCTCTAGGGCAAAGAAGGTGAAGGTGGTGGCAAAAGTGTATTGGG
GAGATCCAAGAGAGAAACTTTGCGATGCCGTCGAAAATCTAAAAC

QA 1 405 1 405
DS 

RD RS1G489TF 541 0 0
GGC
ACTTTAGATATCATCGAGAAAGAGAAAGAAAGATAGAGAGATAAATGGTGAAGGCACGTA
CCGTGGG*TGTGGGAATGGACTATTCTCCGACGAGCAAATCGGCTCTTCGGTGGACTGCG
GGGAATCTCCTTGACGATGGAGACACCATCATCTTGATTCATGTTCAACCCCAAAACGCT
GAGCACACCCGCAAAATCCTCTTTGAGGAAACCGGTTCACCGTTGATTCCTCTGGAGGAA
TTTAGAGAGGTTAATTTCTCTAAACAGTATGGACTTGCTTATGATCCGGAGGTTCTTGAT
GTTCTTGATACTCTCTCTAGGGCAAAGAAGGTGAAGGTGGTGGCAAAAGTGTATTGGGGA
GATCCAAGAGAGAAACTTTGCGATGCCGTCGAAAATCTAAAACTCGATTCCATTGTTCTT
GGCAGTCGAGGCTTGGGTCCTCTCAAAAGGATGTTGCTGGGTAGTGTGAGCAACCATGTG
GTGACAAATGCAACATGTCCAGTCACGGTTGTTAAAGCCAATTAAAGTCTATTGTTCT

QA 4 541 4 541
DS 

RD RS1H685TF 595 0 0
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TACCGTGGGGTGTGGGAATGGACTATTCTCCGACGAGCAAATCGGCTCTTCGGTGGACGG
CGGAGAATCTCCTTGACGATGGAGACACCATCATCTTGATTCATGTTCAACCCCAAAACG
CTGAGCACACCCGCAAAATCCTCTTTGAGGAAACCGGTTCACCGTTGATTCCTCTGGAGG
AATTTAGAGAGGTTAATTTCTCTAAACAGTATGGACTTGCTTATGATCCGGAGGTTCTTG
ATGTTCTTGATACTCTCTCTAGGGCAAAGAAGGTGAAGGTGGTGGCAAAAGTGTATTGGG
GAGATCCAAGAGAGAAACTTTGCGATGCCGTCGAAAATCTAAAACTCGATTCCATTATTC
TTGGCAGTCGAGGCTTGGGTCCTCTCAAAAGGATGTTGCTGGGTAGTGTGAGCAACCATG
TGGTGACAAATGCAACATGTCCAGTCACGGTTGTTAAAGCCAATTAAAGTCTATTGTTCT
TTAAAATTTGGAAACAGCGTGTGGAATGTGTGCACTGGTTTCGACTTGTATGTTG

QA 1 595 1 595
DS 

RD RS1A389TF 718 0 0
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ATCATCGAGAAAGAGAAAGAAAGATAGAGAGATAAATGGTGAAGGCACGTACCGTGGG*C
GTGGGAATGGACTATTCTCCGACGAGCAAATCGGCTCTTCGGTGGACTGCGGGGAATCTC
CTTGACGATGGAGACACCATCATCTTGATTCATGTTCAACCCCAAAACGCTGAGCACACC
CGCAAAATCCTCTTTGAGGAAACCGGTTCACCGTTGATTCCTCTGGAGGAATTTAGAGAG
GTTAATTTCTCTAAACAGTATGGACTTGCTTATGATCCGGAGGTTCTTGATGTTCTTGAT
ACTCTCTCTAGGGCAAAGAAGGTGAAGGTGGTGGCAAAAGTGTATTGGGGAGATCCAAGA
GAGAAACTTTGCGATGCCGTCGAAAATCTAAAACTCGATTCCATTGTTCTTGGCAGTCGA
GGCTTGGGTCCTCTCAAAAGGATGTTGCTGGGTAGTGTGAGCAACCATGTGGTGACAAAT
GCAACATGTCCAGTCACGGTTGTTAAAGCCAATTAAAGTCTATTGTTCTTTAAAATTTGG
AAACAGTGTGTGGAATGTGTGCACTGGTTTCGACTTGTATGTTGTATCCATACATTAGTC
TTTCAATAAACTAAAGCTAAATGAAATCTGTAGTTATCAATTGTCACTTTTGTTTTAT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1DJ77JQ 635 0 0
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GTACCGTGGG*TGTGGGAATGGACTATTCTCCGACGAGCAAATCGGCTCTTCGGTGGACT
GCGGGGAATCTCCTTGACGATGGAGACACCATCATCTTGATTCATGTTCAACCCCAAAAC
GCTGAGCACACCCGCAAAATCCTCTTTGAGGAAACCGGTTCACCGTTGATTCCTCTGGAG
GAATTTAGAGAGGTTAATTTCTCTAAACAGTATGGACTTGCTTATGATCCGGAGGTTCTT
GATGTTCTTGATACTCTCTCTAGGGCAAAGAAGGTGAAG*TGGTGGCAAAAGTGTATTGG
GGAGATCCAAGAGAGAAACTTTGCGATGCCGTCGAAAATCTAAAACTCGATTCCATTGTT
CTTGGCAGTCGAGGCTTGGGTCCTCTCAAAAGGATGCTGCTAGGTAGTGTGAGCAACCAT
GTGGTGACAAATGCAACATGTCCAGTCACGGTTGTTAAAGCCAATTAAAGTCTATTGTTC
TTTAAAATTTGGAAACCGTGTG**GAATGTGTACACTGGTTTCGACTTGTATGTTGTATC
CATACATTAGTCTTTCAATAAACTAAAGCTAAATG

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1DJ77TF 635 0 0
GGGACTTTAGATATCATCGAGAAAGAGAAAGAAAGATAGAGAGATAAATGGTGAAGGCAC
GTACCGTGGG*TGTGGGAATGGACTATTCTCCGACGAGCAAATCGGCTCTTCGGTGGACT
GCGGGGAATCTCCTTGACGATGGAGACACCATCATCTTGATTCATGTTCAACCCCAAAAC
GCTGAGCACACCCGCAAAATCCTCTTTGAGGAAACCGGTTCACCGTTGATTCCTCTGGAG
GAATTTAGAGAGGTTAATTTCTCTAAACAGTATGGACTTGCTTATGATCCGGAGGTTCTT
GATGTTCTTGATACTCTCTCTAGGGCAAAGAAGGTGAAG*TGGTGGCAAAAGTGTATTGG
GGAGATCCAAGAGAGAAACTTTGCGATGCCGTCGAAAATCTAAAACTCGATTCCATTGTT
CTTGGCAGTCGAGGCTTGGGTCCTCTCAAAAGGATGCTGCTAGGTAGTGTGAGCAACCAT
GTGGTGACAAATGCAACATGTCCAGTCACGGTTGTTAAAGCCAATTAAAGTCTATTGTTC
TTTAAAATTTGGAAACCGTGTG**GAATGTGTACACTGGTTTCGACTTGTATGTTGTATC
CATACATTAGTCTTTCAATAAACTAAAGCTAAATG

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1FB43JQ 634 0 0
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TACCGTGGG*TGTGGGAATGGACTATTCTCCGACGAGCAAATCGGCTCTTCGGTGGACTG
CGGGGAATCTCCTTGACGATGGAGACACCATCATCTTGATTCATGTTCAACCCCAAAACG
CTGAGCACACCCGCAAAATCCTCTTTGAGGAAACCGGTTCACCGTTGATTCCTCTGGAGG
AATTTAGAGAGGTTAATTTCTCTAAACAGTATGGACTTGCTTATGATCCGGAGGTTCTTG
ATGTTCTTGATACTCTCTCTAGGGCAAAGAAGGTGAAGGTGGTGGCAAAAGTGTATTGGG
GAGATCCAATAGAGAAACTTTGCGATGCCGTCGAAAATCTAAAACTCGATTCCATTGTTC
TTGGCAGTCGAGGCTTGGGTCCTCTCAAAAGGATGTTGCTGGGTAGTGTGAGCAACCATG
TGGTGACAAATGCAACATGTCCAGTCACGGTTGTTAAAGCCAATTAAAGTCTATTGTTCT
TTAAAATTTGGAAACAGCGTGTGGAATGTGTGCACTGGTTTCGACTTGTATGTTGTATCC
ATACATTAGTCTTTCAATAAACTAAAGCTAAA
CG

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1FB43TF 617 0 0
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TACCGTGGG*TGTGGGAATGGACTATTCTCCGACGAGCAAATCGGCTCTTCGGTGGACTG
CGGGGAATCTCCTTGACGATGGAGACACCATCATCTTGATTCATGTTCAACCCCAAAACG
CTGAGCACACCCGCAAAATCCTCTTTGAGGAAACCGGTTCACCGTTGATTCCTCTGGAGG
AATTTAGAGAGGTTAATTTCTCTAAACAGTATGGACTTGCTTATGATCCGGAGGTTCTTG
ATGTTCTTGATACTCTCTCTAGGGCAAAGAAGGTGAAGGTGGTGGCAAAAGTGTATTGGG
GAGATCCAATAGAGAAACTTTGCGATGCCGTCGAAAATCTAAAACTCGATTCCATTGTTC
TTGGCAGTCGAGGCTTGGGTCCTCTCAAAAGGATGTTGCTGGGTAGTGTGAGCAACCATG
TGGTGACAAATGCAACATGTCCAGTCACGGTTGTTAAAGCCAATTAAAGTCTATTGTTCT
TTAAAATTTGGAAACAGCGTGTGGAATGTGTGCACTGGTTTCGACTTGTATGTTGTATCC
ATACATTAGTCTTTCAA

QA 1 617 1 617
DS 

RD RS1CL30TF 633 0 0
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TACCGTGGG*TGTGGGAATGGACTATTCTCCGACGAGCAGATCGGCTCTTCGGTGGACTG
CGGGGAATCTCCTTGACGATGGAGACACCATCATCTTGATTCATGTTCAACCCCAAAACG
CTGAGCACACCCGCAAAATCCTCTTTGAGGAAACCGGTTCACCGTTGATTCCTCTGGAGG
AATTTAGAGAGGTTAATTTCTCTAAACAGTATGGACTTGCTTATGATCCGGAGGTTCTTG
ATGTTCTTGATACTCTCTCTAGGGCAAAGAAGGTGAAGGTGGTGGCAAAAGTGTATTGGG
GAGATCCAAGAGAGAAACTTTGCGATGCCGTCGAAAATCTAAAACTCGATTCCATTGTTC
TTGGCGGTCGAGGCTTGGGTCCTCTCAAAAGGATGTTGCTGGGTAGTGTGAGCAACCATG
TGGTGACAAATGCAACATGTCCAGTCACGGTTGTTAAAGCCAATTAAAGTCTATTGTTCT
TTAAAATTTGGAAACAGCGTGTGGAATGTGTGCACTGGTTTCGACTTGTATGTTGTATCC
ATACATTAGTCTTTCAATAAACTAAAGCTAAAT

QA 1 633 1 633
DS 

RD RS1G851TF 630 0 0
GGACTTTAGATATCATCGAGAAAGAGAAAGAAAGATAGAGAGATAAATGGTGAAGGCACG
TACCGTGGG*TGTGGGAATGGACTATTCTCCGACGAGCAAATCGGCTCTTCGGTGGACTG
CGGGGAATCTCCTTGACGATGGAGACACCATCATCTTGATTCATGTTCAACCCCAAAACG
CTGAGCACACCCGCAAAATCCTCTTTGAGGAAACCGGTTCACCGTTGATTCCTCTGGAGG
AATTTAGAGAGGTTAATTTCTCTAAACAGTATGGACTTGCTTATGATCCGGAGGTTCTTG
ATGCTCTTGATACTCTCTCTAGGGCAAAGAAGGTGAAGGTGGTGGCAAAAGTGTATTGGG
GAGATCCAAGAGAGAAACTTTGCGATGCCGTCGAAAATCTAAAACTCGATTCCATTGTTC
TTGGCAGTCGAGGCTTGGGTCCTCTCAAAAGGATGTTGCTGGGTAGTGTGAGCAACCATG
TGGTGACAAATGCAACATGTCCAGTCACGGTTGTTAAAGCCAATTAAAGTCTATTGTTCT
TTAAAATTTGGAAACAGCGTGTGGAATGTGTGCACTGGTTTCGACTTGTATGTTGTATCC
ATACATTAGTCTTTCAATAAACTAAAGCTA

QA 1 630 1 630
DS 

RD RS1GZ34TF 646 0 0
GGACTTTAGATATCATCGAGAAAGAGAAAGAAAGATAGAGAGATAAATGGTGAAGGCACG
TACCGTGGG*TGTGGGAATGGACTATTCTCCGACGAGCAAATCGGCTCTTCGGTGGACTG
CGGGGAATCTCCTTGACGATGGAGACACCATCATCTTGATTCATGTTCAACCCCAAAACG
CTGAGCACACCCGCAAAATCCTCTTTGAGGAAACCGGTTCACCGTTGATTCCTCTGGAGG
AATTTAGAGAGGTTAATTTCTCTAAACAGTATGGACTTGCTTATGATCCGGAGGTTCTTG
ATGTTCTTGATACTCTCTCTAGGGCAAAGAAGGTGAAGGTGGTGGCAAAAGTGTATTGGG
GAGATCCAAGAGAGAAACTTTGCGATGCCGTCGAAAATCTAAAACTCGATTCCATTGTTC
TTGGCAGTCGAGGCTTGGGTCCTCTCAAAAGGATGTTGCTGGGTAGTGTGAGCAACCATG
TGGTGACAAATGCAACATGTCCAGTCACGGTTGTTAAAGCCAATTAAAGTCTATTGTTCT
TTAAAATTTGGAAACAGCGTGTGGAATGTGTGCACTGGTTTCGACTTGTATGTTGTATCC
ATACATTAGTCTTTCAATAAACTAAAGCTAAATGAAATCTGCAGTT

QA 1 646 1 646
DS 

RD RS1A389TV 718 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGACTTTAGAT
ATCATCGAGAAAGAGAAAGAAAGATAGAGAGATAAATGGTGAAGGCACGTACCGTGGG*C
GTGGGAATGGACTATTCTCCGACGAGCAAATCGGCTCTTCGGTGGACTGCGGGGAATCTC
CTTGACGATGGAGACACCATCATCTTGATTCATGTTCAACCCCAAAACGCTGAGCACACC
CGCAAAATCCTCTTTGAGGAAACCGGTTCACCGTTGATTCCTCTGGAGGAATTTAGAGAG
GTTAATTTCTCTAAACAGTATGGACTTGCTTATGATCCGGAGGTTCTTGATGTTCTTGAT
ACTCTCTCTAGGGCAAAGAAGGTGAAGGTGGTGGCAAAAGTGTATTGGGGAGATCCAAGA
GAGAAACTTTGCGATGCCGTCGAAAATCTAAAACTCGATTCCATTGTTCTTGGCAGTCGA
GGCTTGGGTCCTCTCAAAAGGATGTTGCTGGGTAGTGTGAGCAACCATGTGGTGACAAAT
GCAACATGTCCAGTCACGGTTGTTAAAGCCAATTAAAGTCTATTGTTCTTTAAAATTTGG
AAACAGTGTGTGGAATGTGTGCACTGGTTTCGACTTGTATGTTGTATCCATACATTAGTC
TTTCAATAAACTAAAGCTAAATGAAATCTGTAGTTATCAATTGTCACTTTTGTTTTAT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1F709JQ 644 0 0
GG
AGATATCATCGAGAAAGAGAAAGAAAGATAGAGAGATAAATGGTGAAGGCACGTACCGTG
GG*TGTGGGAATGGACTATTTTCCGACGAGCAAATCGGCTTTTCGGTGGACTGCGGGGAA
TCTCCTTGACGATGGAGACACCATCATCTTGATTCATGTTCAACCCCAAAACGCTGAGCA
CACCCGCAAAATCCTCTTTGAGGAAACCGGTTCACCGTTGATTCCTCTGGAGGAATTTAG
AGAGGTTAATTTCTCTAAACAGTATGGACTTGCTTATGATCCGGAGGTTCTTGATGTTCT
TGATACTCTCTCTAGGGCAAAGAAGGTGAAGGTGGTGGCAAAAGTGTATTGGGGAGATCC
AAGAGAGAAACTTTGCGATGCCGTCGAAAATTTAAAACTCGATTCCATTGTTCTTGGCAG
TCGAGGCTTGGGTCCTCTCAAAAGGATGTTGCTGGGTAGTGAGAGCAACCATGTGGTGAC
AAATGCAACATGTCCAGTCACGGTTGTTAAAGCCAATTAAAGTCTATTGTTCTTTAAAAT
TTGGAAACAGCGTGTGGAATGTGTGCACTGGTTTCGACTTGTATGTTGTATCCATACATT
AGTCTTTCAATAAACTAAAGCTAAATGAAATCTGTAGTTATC

QA 3 644 3 644
DS 

RD RS1F709TF 644 0 0
GG
AGATATCATCGAGAAAGAGAAAGAAAGATAGAGAGATAAATGGTGAAGGCACGTACCGTG
GG*TGTGGGAATGGACTATTCTCCGACGAGCAAATCGGCTCTTCGGTGGACTGCGGGGAA
TCTCCTTGACGATGGAGACACCATCATCTTGATTCATGTTCAACCCCAAAACGCTGAGCA
CACCCGCAAAATCCTCTTTGAGGAAACCGGTTCACCGTTGATTCCTCTGGAGGAATTTAG
AGAGGTTAATTTCTCTAAACAGTATGGACTTGCTTATGATCCGGAGGTTCTTGATGTTCT
TGATACTCTCTCTAGGGCAAAGAAGGTGAAGGTGGTGGCAAAAGTGTATTGGGGAGATCC
AAGAGAGAAACTTTGCGATGCCGTCGAAAATCTAAAACTCGATTCCATTGTTCTTGGCAG
TCGAGGCTTGGGTCCTCTCAAAAGGATGTTGCTGGGTAGTGAGAGCAACCATGTGGTGAC
AAATGCAACATGTCCAGTCACGGTTGTTAAAGCCAATTAAAGTCTATTGTTCTTTAAAAT
TTGGAAACAGCGTGTGGAATGTGTGCACTGGTTTCGACTTGTATGTTGTATCCATACATT
AGTCTTTCAATAAACTAAAGCTAAATGAAATCTGTAGTTATC

QA 3 644 3 644
DS 

RD RS1BW37TF 685 0 0
GGC
ACTTTAGATATCATCGAGAAAGAGAAAGAAAGATAGAGAGATAAATGGTGAAGGCACGTA
CCGTGGG*TGTGGGAATGGACTATTCTCCGACGAGCAAATCGGCTCTTCGGTGGACTGCG
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GAGCACACCCGCAAAATCCTCTTTGAGGAAACCGGTTCACCGTTGATTCCTCTGGAGGAA
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GGCAGTCGAGGCTTGGGTCCTCTCAAAAGGATGTTGCTGGGTAGTGTGAGCAACCATGTG
GTGACAAATGCAACATGTCCAGTCACGGTTGTTAAAGCCAATTAAAGTCTATTGTTCTTT
AAAATTTGGAAACAGCGTGTGGAATGTGTGCACTGGTTTCGACTTGTATGTTGTATCCAT
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GTTTTATAAAAAACATGAAAAA

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AAGTGTATTGGGGAGATCCAAGAGAGAAACTTTGCGATGCCGTCGAAAATCTAAAACTCG
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TGAGCAACCATGTGGTGACAAATGCAACATGTCCAGTCACGGTTGTTAAAGCCAATTAAA
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TATGTTGTATCCATACATTAGTCTTTCAATAAACTAAAGCTAAATGAAATCTGTAGTTAT
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GC
G

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DS 

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TGGGGAGATCCAAGAGAGAAACTTTGCGATGCCGTCGAAAATTTAAAACTCGATTCCATT
GTTCTTGGCAGTCGAGGCTTGGGTCCTCTCAAAAGGATGTTGCTGGGTAGTGTGAGCAAC
CATGTGGTGACAAATGCAACATGTCCAGTCACGGTTGTTAAAGCCAATTAAAGTTTATTG
TTCTTTAAAATTTGGAAACAGTGTGTGGAATGTGTGCACTGGTTTCGACTTGTATGTTGT
ATCCATACATTAGTCTTTCAATAAACTAAAGCTAAATGAAATCTGTAGTTATCAATTGTC
ACTTTTGTTTTATAAAAAACATGAAAAACAGCACATAATAAATTTTTGATTAGC
C

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DS 

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AAAATTTAAAACTCGATTCCATTGTTCTTGGCAGTCGAGGCTTGGGTCCTCTCAAAAGGA
TGTTGCTGGGTAGTGTGAGCAACCATGTGGTGACAAATGCAACATGTCCAGTCACGGTTG
TTAAAGCCAATTAAAGTTTATTGTTCTTTAAAATTTGGAAACAGTGTGTGGAATGTGTGC
ACTGGTTTCGACTTGTATGTTGTATCCATACATTAGTCTTTCAATAAACTAAAGCTAAAT
GAAATCTGTAGTTATCAATTGTCACTTTTGTTTTATAAAAAACATGAAAAACAGCACATA
ATAAATTTTTGATTAGCC

QA 1 318 1 318
DS 



AS 3 13

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ATCGATCGTTAACGGCGAACAAACTTAAAGATGAATGACTTAGATGTGTCGAAGCAGATC
CAGCAGATGGTGAGATTCATTCGCCAAGAGGCCGAGGAGAAGGCAAACGAGATCTCCGTC
TCCGCTGAAGAAGAATTCAACATCGAGAAACTGCAGCTAGTTGAGGCGGAAAAGAAGAAG
ATCAGGCAAGACTATGAGAAGAAGGAGAAGCAAGCTGATGTACGCAAGAAGATTGATTAC
TCGATGCAGCTGAATGCGTCAAGGATCAAAGTTCTTCAAGCTCAGGATGATATTGTCAAT
GCCATGAAAGACCAAGCTGCTAAAGATCTTCTCAACGTCAGTGGCGATGAGGATGCCTAC
AAACAGCTTCTCAAGGATCTAATTGTTCAGTGTTTGCTTCGGTTGAAAGAGCCTTCTGTG
TTGTTGCGTTGTCGTGAAGAGGACTTGGGTTTAGTTGAATCTATTCTTGAGGATGCAAAG
GAGGAGTATGCTGGCAAAGCAAATGTTCATGCTCCAGAGGTTGCCGTGGACACAACCATA
TTCCTTCCCCCTCCTCCTACTTCCAGTGATTCTCATGGTCTTCACTGCTCTGGAGGTGTT
GTGCTAGCTTCTCGTGATGGGAAAATCGTGTGCGAGAACACCCTCGATGCTCGTCTTGAT
GTGGCATTCCGTATGAAACTCCCAGTGATCCGTAGGTCATTGTTTGGCCAAGTTGCTGCC
TAATGAATGAAAGAGATGTGATTCATACTGGTTTGTGTGTTTGTTTGTTACCCTTTTGGG
AAAGATTTATCTTTGTTGTGATTCTTTGTTTCTGCAGAATTTTACTTTGAAGTCCAAAAG
AACCCATCGAACTCGTCGTTTACTCGTGTATTTTTTTTCCTCCTTCCTGAATGTTAT


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C850TF U 1
AF RS1AC51TF U 2
AF RS1EF46JQ C 201
AF RS1C850JQ C 489
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RD RS1C850TF 723 0 0
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GTG

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1AC51TF 880 0 0
GG
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GAGTATGCTGGCAAAGCAAATGTTCATGCTCCAGAGGTTGCCGTGGACACAACCATATTC
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CTAGCTTCTCGTGATGGGAAAATCGTGTGCGAGAACACCCTCGATGCTCGTCTTGATGTG
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TGAATGAA*GAGATGTGATTCATACTGGTTTGTGTGTTTGTTTGTTACCCTTTTGGGAA*
GATTTATCTTTGT*GTGATTCTTTGTTTCTGCAGAATT

QA 3 880 3 880
DS 

RD RS1EF46JQ 694 0 0
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AAGGATCAAAGTTCTTCAAGCTCAGGATGATATTGTCAATGCCATGAAAGACCAAGCAGC
TAAAGATCTTCTCAACGTCAGTGCCGATGAGGATGCCTACAAACAGCTTCTTAAGGATCT
CATTGTTCAGTGTTTGCTTCGGTTGAAAGAGCCTTCTGTGTTGTTGCGTTGTCGTGAAGA
GGACTTGGGTTTAGTTGAATCTATTCTTGAGGATGCAAAGGAGGAGTATGCTGGCAAAGC
AAATGTTCATGCTCCAGAGGTTGCCGTAGACACAACCATATTCCTTCCCCCTCCTCCTAC
TTCCAGTGATTCTCATGGTCTTCACTGCTCTGGAGGTGTTGTGCTAGCTTCTCGTGATGG
GAAAATCGTGTGCGAGAACACCCTCGATGCTCGTCTTGATGTGGCATTCCGTGTGAAACT
CCCAGTGATCCGTAGGTCATTGTTTGGCCAAGTTTCTGCCTAATGAATGAAAGAGATGTG
ATTCATACTGGTTTGTGTGTTTGTTTGTTACCCTTTTGGGAAAGATTTATCTTTGTTGTG
ATTCTTTGTTTCTGCAGAATTTTACTTTGAAGTC

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DS 

RD RS1C850JQ 469 0 0
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TGCTGGCAAAGCAAATGTTCATGCTCCAGAGGTTGCCGTGGACACAACCATATTCCTTCC
CCCTCCTCCTACTTCCAGTGATTCTCATGGTCTTCACTGCTCTGGAGGTGTTGTGCTAGC
TTCTCGTGATGGGAAAATCGTGTGCGAGAACACCCTCGATGCTCGTCTTGATGTGGCATT
CCGTATGAAACTCCCAGTGATCCGTAGGTCATTGTTTGGCCAAGTTGCTGCCTAATGAAT
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ATCTTTGTTGTGATTCTTTGTTTTTGCAGAATTTTACTTTGAAGTCCAAAAGAACCCATC
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QA 1 469 1 469
DS 



CO CL40Contig2 522 2 4 U
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GGCATGAAGAAAAAATACAAATGCATAAACAAAAAGTTCGATGGGTTTTATGGCATGAAA
AAAAACATAAAAAAATCACAACAAATAAAAATCTTTCCCAAATGGGTAAAAAACCAAACA
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CAACGACCTGCGGATCACTGGAAGTTTCATACGGAATGCCACATCAAGACGTGCATCGAG
TGTGTTCTCCCACACAATTTTCCCATCCCGAAAAGCCAACACAACACCTCCAGAGCAGTG
GAAACCATGAAAATCACTAAAAGTAGGAGGAGGGGGAAGGAAAATGGTTGTGTCCACGGC
AACCTCTGGAGCATGAACATTTGCTTTACCAGCATACTCCTCCTTAGCGTCATCAAAAAT
AAATTCAACTAAACCCAAATCCTCTTCGCGGCAACCCAACAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DC74JQ U 1
AF RS1BY82JQ U 312
BS 1 321 RS1DC74JQ
BS 322 322 RS1BY82JQ
BS 323 450 RS1DC74JQ
BS 451 522 RS1BY82JQ

RD RS1DC74JQ 450 0 0
AACCAAAAAAACAAAGTCTTTCCCCCCTTTATTTATTTCTATAGCCAATGATAACACTCG
GGCATGAAGAAAAAATACAAATGCATAAACAAAAAGTTCGATGGGTTTTATGGCATGAAA
AAAAACATAAAAAAATCACAACAAATAAAAATCTTTCCCAAATGGGTAAAAAACCAAACA
CAAACCGGTCTGAATCACTTCTCTGTCTCTTTCCATTCATTAGGCAGCAACTTGGCCGAA
CAACGACCTGCGGATCACTGGAAGTTTCATACGGAATGCCACATCAAGACGTGCATCGAG
TGTGTTCTCCCACACAATTTTTCCATCCCGAAAAGCCAACACAACACCTCCAGAGCAGTG
GAAACCATGAAAATCACTAAAAGTAGGAGGAGGGGGAAGGAAAATGGTTGTGTCCACGGC
AACCTCTGGAGCATGAACATTTGCTTTACC

QA 1 450 1 450
DS 

RD RS1BY82JQ 211 0 0
ACACGATTTTCCCATCCCGAAAAGCCAACACAACACCTCCAGAGCAGTGGAAACCATGAA
AATCACTAAAAGTAGGAGGAGGGGGAAGGAAAATGGTTGTGTCCCCGGCAACCTCTGGAG
CATGAACATTTGCTTTACCAGCATACTCCTCCTTAGCGTCATCAAAAATAAATTCAACTA
AACCCAAATCCTCTTCGCGGCAACCCAACAA

QA 1 211 1 211
DS 



CO CL40Contig3 1064 7 12 U
GGACGTAGCGAGAACCCGATCTACGTCGTCTCCCTCTCTCTCCAATCTCCCTCTGCGCCA
CAGATTTCTCGAAATCTCTCCAAACCTCCGATCGTCAACGATCTCCGGCAAAGATGAACG
ACGCCGATGTGTCGATTCAGATCCAGCAGATGGTGAGATTCATCCGCCAAGAGGCGGAGG
AGAAGGCAAACGAGATCTCCGTCTCCGCTGAAGAAGAATTCAACATCGAGAAGCTGCAGT
TAGTTGAGGCGGAGAAGAAGAAGATCAGGCAAGACTATGAGAAGAAGGAGAAGCAAGCCG
ATGTTCGCAAGAAGATTGATTACTCGATGCAGCTAAATGCGTCAAGGATCAAAGTTCTTC
AGGCGCAGGATGATATTGTGAATGCTATGAAAGATCAAGCAGCAAAGGATCTTCTCAACG
TCAGTGGCGATGAGGATGCCTACAAACAGCTTCTTAAGGATCTCATTGTCCAGTGTTTGC
TAAGGTTGAAAGAGCCTTCTGTGTTGTTGCGTTGCCGCGAAGAGGATTTGGGTTTAGTTG
AATCTATTCTTGATGACGCAAAGGAGGAGTATGCTGGTAAAGCAAATGTTCATGCTCCAG
AGGTTGCCGTGGACACAACCATCTTCCTTCCCCCTCCTCCTACTTCTAGTGATTCTCATG
GTCTCCACTGCTCTGGAGGTGTTGTGTTGGCTTCTCGGGATGGAAAAATCGTGTGCGAGA
ACACACTCGATGCACGTCTTGATGTGGCATTCCGTATGAAACTTCCAGTGATCCGCAGGT
CGTTGTTCGGCCAAGTTGCTGCCTAATGAATGGAAAGAGACAGAGAAGTGATTCAGACCG
GTTTGTGTTTGGTTTTTTACCCATCTGGGAAAGATTTCTATTTGTTGTGATTCTTTTATG
TTCTCTTTCATGCCATAAAACCCATCGAACTCTTTGTTTATGCATCTGTATTTTTTCCTC
ATGCCCGAGTGTTATCATTGGCTATAGAAATAAATAAAGAGACGAAAGACTTTGTTTTTT
TGGTTCTGATGATGACCCATGATGCTATATGTGGATTTTAGGCG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 
30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DB53TF U 3
AF RS1DC74TF U 25
AF RS1FI22TF U 1
AF RS1FG84JQ C 325
AF RS1AC07TF U 859
AF RS1DB53JQ C 645
AF RS1FI22JQ C 273
BS 1 104 RS1FI22TF
BS 105 105 RS1DB53TF
BS 106 720 RS1FI22TF
BS 721 721 RS1FI22JQ
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BS 859 1019 RS1AC07TF
BS 1020 1064 RS1FI22JQ

RD RS1DB53TF 557 0 0
GG
GTAGCGAGAACCCGATCTACGTCGTCTCCCTCTCTCTCCAATCTCCCTCTGCGCCACAGA
TTTCTCGAAATCTCTCCAAACCTCCGATCGTCAACGATCTCCGGCAAAGATGAACGATGC
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GGCAAACGAGATCTCCGTCTCCGCTGAAGAAGAATTCAACTTCGAGAAGCTGCAGTTAGT
CGAGGCGGAGAAGAAGAAGATCAGGCAAGACTATGAGAAGAAGGAGAAGCAAGCCGATGT
TCGCAAGAAGAATGATTACTCGATGCAGCTAAATGCATCAAGGATCAAAGTTCTTCAGGC
GCAGGATGATATTGTCAATGCTATGAAAGACCAAGCAGCAAAGGATCTTCTCAACGTCAG
TGGCGATGAGGATGCCTACAAACAGCTTCTTAAGGATCTCATTGTCCAGTGTTTGCTAAG
GTTAAAAGAGCCTTCTGTCTTGTTGCGTTGCCGCGAAGAGGATTTGGGTTTAGTTGAATC
TATTCTTGATGACGC

QA 3 557 3 557
DS 

RD RS1DC74TF 650 0 0
GGACGTCGTCC
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AGATTCATCCGCCAAGAGGCGGAGGAGAAGGCAAACGAGATCTCCGTCTCCGCTGAAGAA
GAATTCAACATCGAGAAGCTGCAGTTAGTTGAGGCGGAGAAGAAGAAGATCAGGCAAGAC
TACGAGAAGAAGGAGAAGCAAGCCGATGTTCGCAAGA***TTGATTACTCGATGCAGCTA
AATGCGTCAAGGATCAAAGTTCTTCAGGCGCAGGATGATATTGTGAATGCTATGTAAGAT
CAAGCAGCAAAGGATCTTCTCAACGTCAGCGGCGATGAGGATGCCTACAAACAGCTTCTT
AAGGATCTCATTGTCCAGTGTTTGCTAAGGTTGAAAGAGCCTTCTGTGTTGTTGCGTTGC
CGCGAAGAGGATTTGGGTTTAGTTGAATCTATTCTTGATGACGCAAAGGAGGAGTATGCT
GGTAAAGCAAATGTTCATGCTCCAGAGGTTGCCGTGGACACAACCATCTTCCTTCCCCCT
CCTCCTACTTCTAGTGATTCTCATGGTCTCCACTGCTCT

QA 12 650 12 650
DS 

RD RS1FI22TF 810 0 0
GGACGTAGCGAGAACCCGATCTACGTCGTCTCCCTCTCTCTCCAATCTCCCTCTGCGCCA
CAGATTTCTCGAAATCTCTCCAAACCTCCGATCGTCAACGATCTGCGGCAAAGATGAACG
ACGCCGATGTGTCGATTCAGATCCAGCAGATGGTGAGATTCATCCGCCAAGAGGCGGAGG
AGAAGGCAAACGAGATCTCCGTCTCCGCTGAAGAAGAATTCAACATCGAGAAGCTGCAGT
TAGTTGAGGCGGAGAAGAAGAAGATCAGGCAAGACTATGAGAAGAAGGAGAAGCAAGCCG
ATGTTCGCAAGAAGATTGATTACTCGATGCAGCTAAATGCGTCAAGGATCAAAGTTCTTC
AGGCGCAGGATGATATTGTGAATGCTATGAAAGATCAAGCAGCAAAGGATCTTCTCAACG
TCAGTGGCGATGAGGATGCCTACAAACAGCTTCTTAAGGATCTCATTGTCCAGTGTTTGC
TAAGGTTGAAAGAGCCTTCTGTGTTGTTGCGTTGCCGCGAAGAGGATTTGGGTTTAGTTG
AATCTATTCTTGATGACGCAAAGGAGGAGTATGCTGGTAAAGCAAATGTTCATGCTCCAG
AGGTTGCCGTGGACACAACCATCTTCCTTCCCCCTCCTCCTACTTCTAGTGATTCTCATG
GTCTCCACTGCTCTGGAGGTGTTGTGTTGGCTTCTCGGGATGGAAAAATCGTGTGCGAGA
*CACACTCGATGCACGTCTTGATGTGGCATTCCGTATGAAACTTCCAGTGATCCGCAG*T
CGT*GTTCGGCCAAGTTGCTGCCTAATGAA

QA 1 810 1 810
DS 

RD RS1FG84JQ 700 0 0
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CTATGAAAGATCAAGCAGCAAAGGATCTTCTCAACGTCAGTGGCGATGAGGATGCCTACA
AACAGCTTCTTAAGGATCTCATTGTCCAGTGTTTGCTAAGGTTGAAAGAGCCTTCTGTGT
TGTTGCGTTGCCGCGAAGAGGATTTGGGTTTAGTTGAATCTATTCTTGATGACGCAAAGG
AGGAGTATGCTGGTAAAGCAAATGTTCATGCTCCAGAGGTTGCCGTGGACACAACCATCT
TCCTTCCCCCTCCTCCTACTTCTAGTGATTCTCATGGTCTCCACTGCTCTGGAGGTGTTG
TGTTGGCTTCTCGGGATGGAAAAATCGTGTGCGAGAACACACTCGATGCACGTCTTGATG
TGGCATTCCGTATGAAACTTCCAGTGATCCGCAGGTCGTTGTTCGGCCAAGTTGCTGCCT
AATGAATGGAAAGAGACAGAGAAGTGATTCAGACCGGTTTGTGTTTGGTTTTTTACCCAT
CTGGGAAAGATTTCTATTTGTTGTGATTCTTTTATGTTCTCTTTCATGCCATAAAACCCA
TCGAACTCTTTGTTTATGCATCTGTATTTTTTCCTCATGCCCGAGTGTTATCATTGGCTA
TAGAAATAAATAAAGAGACGAAAGACTTTGTTTTT
TTGGC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1AC07TF 161 0 0
ACCCATCTGGGAAAGATTTCTATTTGTTGTGATTCTTTTATGTTCTCTTTCATGCCATAA
AACCCATCGAACTCTTTGTTTATGCATCTGTATTTTTTCCTCATGCCCGAGTGTTATCAT
TGGCTATAGAAATAAATAAAGAGACGAAAGACTTTGTTTTT

QA 1 161 1 161
DS 

RD RS1DB53JQ 373 0 0
TCTAGTGATTCTCATGGTCTCCACTGCTCTGGAGGTGTTGTGTTGGCTTCTCGGGATGGG
AAAATCGTGTGCGAGAACACACTCGATGCACGTCTTGATGTGGCATTCCGTATGAAACTT
CCAGTGATCCGCAGGTCGTTGTTCGGCCAAGTTGCTGCCTAATGAATGAAAAGAGACAGA
GAAGTGATTCAGACCGGTTTGTGTTTGGTTTTTTACCCATCTGGGAAAGATTTCTATTTG
TTGTGATTCTTTTATGTTCTCTTTCATGCCATAAAACCCATCGAACTCTTTGTTTATGCA
TCTGTATTTTTTCCTCATGCCCGAGTGTTATCATTGGCTATAGAAATAAATAAAGAAACG
AAAGACTTTGT
CT

QA 1 371 1 371
DS 

RD RS1FI22JQ 792 0 0
GACTATGAGAAGAAGGAGAAGCAAGCCGATGTTCGCAAGAAGATTGATTACTCGATGCAG
CTAAATGCGTCAAGGATCAAAGTTCTTCAGGCGCAGGATGATATTGTGAATGCTATGAAA
GATCAAGCAGCAAAGGATCTTCTCAACGTCAGTGGCGATGAGGATGCCTACAAACAGCTT
CTTAAGGATCTCATTGTCCAGTGTTTGCTAAGGTTGAAAGAGCCTTCTGTGTTGTTGCGT
TGCCGCGAAGAGGATTTGGGTTTAGTTGAATCTATTCTTGATGACGCAAAGGAGGAGTAT
GCTGGTAAAGCAAATGTTCATGCTCCAGAGGTTGCCGTGGACACAACCATCTTCCTTCCC
CCTCCTCCTACTTCTAGTGATTCTCATGGTCTCCACTGCTCTGGAGGTGTTGTGTTGGCT
TCTCGGGATGGAAAAATCGTGTGCGAGAACACACTCGATGCACGTCTTGATGTGGCATTC
CGTATGAAACTTCCAGTGATCCGCAGGTCGTTGTTCGGCCAAGTTGCTGCCTAATGAATG
GAAAGAGACAGAGAAGTGATTCAGACCGGTTTGTGTTTGGTTTTTTACCCATCTGGGAAA
GATTTCTATTTGTTGTGATTCTTTTATGTTCTCTTTCATGCCATAAAACCCATCGAACTC
TTTGTTTATGCATCTGTATTTTTTCCTCATGCCCGAGTGTTATCATTGGCTATAGAAATA
AATGAAGAGACGAAAGACTTTGTTTTTTTGGTTCTGATGATGACCCATGATGCTATATGT
GGATTTTAGGCG

QA 1 792 1 792
DS 



AS 3 14

CO CL41Contig1 977 5 8 U
GGGGCTTCTCTTCTTCTTAACATCATCTCCACATCCTCTGCGATTCCGAAAACATGGCTC
TACCAAACCAGCAAACCGTCGATTACCCTAGCTTCAAGCTCGTCATTGTTGGTGACGGAG
GCACAGGGAAAACCACTTTTGTCAAGAGACATCTTACTGGGGAGTTTGAGAAGAAGTACG
AACCTACCATTGGTGTTGAGGTTCATCCTTTGGATTTCCTCACAAACTGTGGCAAGATCC
GTTTCTATTGCTGGGATACTGCTGGTCAAGAGAAGTTCGGTGGCCTTAGGGATGGTTACT
ACATCCATGGTCAATGTGCAGTAATTATGTTTGACGTCACCGCGCGGCTCACATACAAGA
ACGTTCCGACATGGCACCGTGATCTATGCAGGGTGTGTGAGAACATCCCTATTGTTCTCT
GCGGGAACAAAGTCGACGTGAAGAACAGGCAAGTCAAGGCCAAGCAGGTGACGTTCCACA
GGAAGAAGAATCTGCAGTACTACGAGATATCTGCCAAGAGTAACTACAACTTCGAGAAGC
CCTTCTTGTACCTAGCTAGGAAACTTGCTGGCGATCCTAACCTTCACTTTGTCGAGTCAC
CAGCTCTTGCTCCCCCTGAGGTTCACATCGACGTTGCCGAGCAGCAGAAGAACGAGGCTG
ATCTCATTGCCGCCGCAGCTCAGCCTCTCCCCGATGATGATGATGACGCTTTTGAGTAAA
CAAAAGATGTTCCAAGATGTGTCCTGCCGTGGTTTTGCTGATTCGCTTCTTTGTTTTGGT
TTTTATTCTATGTTGCGTTGATGTTACATATGGAATGAATCGAGTGTTTTAGAACTAATA
TTGGGGAATATTGAGATTGTTCCGTTTTGGAATAGAGCGAGTTGTTTTTGAACCAAAATA
GATTATGCAATCAAGGATCTTATTTGGGGGAAGACTCTTAACTTGAATCTTTTGAGGTCT
AGTTTGTTTCTATGTCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AC96TF U 1
AF RS1GP74TF U 2
AF RS1D648TF U 23
AF RS1D648JQ C 209
AF RS1D091JQ C 179
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BS 117 117 RS1GP74TF
BS 118 147 RS1AC96TF
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BS 220 576 RS1GP74TF
BS 577 592 RS1D648TF
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TACCAAACCAGCAAACCGTCGATTACCCTAGCTTCAAGCTCGTCATTGTTGGTGACAGAG
GCACAGGGAAAACCACTTTTGTCAAGA

QA 1 147 1 147
DS 

RD RS1GP74TF 575 0 0
G
GGCTTCTCTTCTTCTTAACATCATCTCCACATCCTCTGCGATTCCGAAAACATGGCTCTA
CCAAACCAGCAAACCGTCGATTACCCTAGCTTCAAGCTCGTCATTGTTGGTGACGGAGGC
ACAGGGAAAACCACTTTTGTCAAGAGACATCTTACTGGGGAGTTTGAGAAGAAGTACGAA
CCTACCATTGGTGTTGAGGTTCATCCTTTGGATTTCTTCACAAACTGTGGCAAGATCCGT
TTCTATTGCTGGGATACTGCTGGTCAAGAGAAGTTCGGTGGCCTTAGGGATGGTTACTAC
ATCCATGGTCAATGTGCAGTAATTATGTTTGACGTCACCGCGCGGCTCACATACAAGAAC
GTTCCGACATGGCACCGTGATCTATGCAGGGTGTGTGAGAACATCCCTATTGTTCTCTGC
GGGAACAAAGTCGACGTGAAGAACAGGCAAGTCAAGGCCAAGCAGGTGACGTTCCACAGG
AAGAAGAATCTGCAGTACTACGAGATATCTGCCAAGAGTAACTACAACTTCGAGAAGCCC
TTCTTGTACCTAGCTAGGAAACTTGCTGGCGATC

QA 2 575 2 575
DS 

RD RS1D648TF 570 0 0
GG
ATCTCCACATCCTCTGCGATTCCGAAAACATGGCTCTACCAAACCAGCAAACCATCGATT
ACCCTAGCTTCAAGCTCGTCATTGTTGGTGACGGAGGCACAGGGAAAACCACTTTTGTCA
AGAGACATCTTACTGGGGAGTTTGAGAAGAAGTACGAACCTACCATTGGTGTTGAGGTTC
*TCCTTTGGATTTCCTCACAAACTGTGGCAAGATCCGTTTCTATTGCTGGGATACTGCTG
GTCAAGAGAAGTTCGGTGGCCTTAGGGATGGTTACTACATCCATGGTCAATGTGCAGTAA
TTATGTTTGACGTCACCGCGCGGCTCACATACAAGAACGTTCCGACATGGCACCGTGATC
TATGCAGGGTGTGTGAGAACATCCCTATTGTTCTCTGCGGGAACAAAGTCGACGTGAAGA
ACAGGCAAGTCAAGGCCAAGCAGGTGACGTTCCACAGGAAGAAGAATCTGCAGTACTACG
AGATATCTGCCAAGAGTAACTACAACTTCGAGAAGCCCTTCTTGTACCTAGCTAGGAAAC
TTGCTGGCGATCCTAACCTTCACTTTGT

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DS 

RD RS1D648JQ 656 0 0
TTTGGATTTCCTCACAAACTGTGGCAAGATCCGTTTCTATTGCTGGGATACTGCTGGTCA
AGAGAAGTTCGGTGGCCTTAGGGATGGTTACTACATCCATGGTCAATGTGCAGTAATTAT
GTTTGACGTCACCGCGCGGCTCACATACAAGAACGTTCCGACATGGCACCGTGATCTATG
CAGGGTGTGTGAGAACATCCCTATTGTTCTCTGCGGGAACAAAGTCGACGTGAAGAACAG
GCAAGTCAAGGCCAAGCAGGTGACGTTCCACAGGAAGAAGAATCTGCAGTACTACGAGAT
ATCTGCCAAGAGTAACTACAACTTCGAGAAGCCCTTCTTGTACCTAGCTAGGAAACTTGC
TGGCGATCCTAACCTTCACTTTGTCGAGTCACCAGCTCTTGCTCCCCCTGAGGTTCACAT
CGACGTTGCCGAGCAGCAGAAGAACGAGGCTGATCTCATTGCCGCCGCAGCTCAGCCTCT
CCCCGATGATGATGATGACGCTTTTGAGTAAACAAAAGATGTTCCAAGATGTGTCCTGCC
GTGGTTTTGCTGATTCGCTTCTTTGTTTTGGTTTTTATTCTATGTTGCGTTGATGTTACA
TATGGAATGAATCGAGTGTTTTAGAACTAATATTGGGGAATATTGAGATTGTTCCG

QA 1 656 1 656
DS 

RD RS1D091JQ 799 0 0
CGAACCTACCATTGGTGT*GAGGTTCATCCTTTGGATTTCTTCACAAACTGTGGCAAGAT
CCGTTTCTATTGCTGGGATACTGCTGGTCAAGAGAAGTTCGGTGGCCTTAGGGATGGTTA
CTACATCCATGGTCAATGTGCAGTAATTATGTTTGACGTC*****GCGGCTCACATACAA
GAACGTTCCGACATGGCACCGTGATCTATGCAGGGTGTGTGAGAACATCCCTATTGTTCT
CTGCGGGAACAAAGTCGACGTGAAGAACAGGCAAGTCAAGGCCAAGCAGGTGACGTTCCA
CAGGAAGAAGAATCTGCAGTACTACGAGATATCTGCCCAGAGTAACTACAACTTCGAGAA
GCCCTTCTTGTACCTAGCTAGGAAACTTGCTGGCGATCCTAACCTTCACTTTGTCGAGTC
ACCAGCTCTTGCTCCCCCTGAGGTTCACATCGACGTTGCCGAGCAGCAGAAGAACGAGGC
TGATCTCATTGCCGCCGCAGCTCAGCCTCTCCCCGATGATGATGATGACGCTTTTGAGTA
AACAAAAGATGTTCCAAGATGTGTCCTGCCGTGGTTTTGCTGATTCGCTTCTTTGTTTTG
GTTTTTATTCTATGTTGCGTTGATGTTACATATGGAATGAATCGAGTGTTTTAGAACTAA
TATTGGGGAATATTGAGATTGTTCCGTTTTGGAATAGAGCGAGTTGTTTTTGAACCAAAA
TAGATTATGCAATCAAGGATCTTATTTGGGGGAAGACTCTTAACTTGAATCTTTTGAGGT
CTAGTTTGTTTCTATGTCC

QA 1 799 1 799
DS 



CO CL41Contig2 879 7 10 U
GGATAAACATCATCATCATCAATCTCCACGCACACACAAATACATCGCCCAATTCTCTCG
ATCCCGACAACATGGCTCTACCTAACCAGCAAACCGTCGATTACCCTAGCTTCAAGCTCG
TTATCGTTGGTGACGGAGGCACAGGAAAAACAACTTTTGTCAAGAGACATCTTACCGGAG
AGTTTGAGAAGAAGTATGAACCTACAATTGGTGTGGAGGTTCACCCTCTAGATTTCTTCA
CAAACTGCGGCAAGATCCGTTTCTACTGCTGGGATACCGCCGGTCAAGAGAAGTTCGGTG
GCCTTAGAGATGGTTACTACATCCACGGTCAATGCGCGGTGATCATGTTCGACGTGACGG
CGCGTCTAACGTACAAGAACGTCCCCACGTGGCACCGAGACCTCTGCCGTGTGTGCGAGA
ACATCCCCATCGTTTTGTGCGGGAACAAGGTGGACGTGAAGAACAGGCAGGTGAAGGCGA
AGCAGGTGACGTTTCACAGGAAGAAGAATCTTCAGTACTACGAGATATCCGCCAAGAGCA
ACTACAACTTCGAGAAGCCCTTCTTGTACTTAGCTAGGAAGCTCGCCGGAGACCAGAACC
TTCACTTTGTCGAGTCCCCGGCTCTCGCTCCCCCCGAGGTTCACATCGACTTTGCTGAGC
AGCAGAAGAACGAGGCTGATCTCATCGCCGCCGCGGCTCAGCCTCTTCCTGATGATGATG
ATGACGCTTTTGAGTAAAAAAGAAGCTGCTTCCACTATGTCTGAGAAGCTGTTTGCTTTT
GTGTCTGATTCTCTCTCTTTTGTTTTTTTGGTTTCTTCTCTGTGTTGCATTGATGTTAAC
ATATAAAATGAGAACTAAATTGGGATTATTTCGTTTGGG


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1GW78TF U 1
AF RS1AY05TF U 2
AF RS1CW08TF U 10
AF RS1C096TF U 1
AF RS1C096JQ C 102
AF RS1AY05JQ C 358
AF RS1GW78JQ C 208
BS 1 55 RS1C096TF
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BS 530 741 RS1C096TF
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RD RS1GW78TF 635 0 0
G
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TCCCGACAACATGGCTCTACCTAACCAGCAAACCGTCGATTACCCTAGCTTCAAGCTCGT
TATCGTTGGTGACGGAGGCACAGGAAAAACAACTTTTGTCAAGAGACATCTTACCGGAGA
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CATCCCCATCGTTTTGTGCGGGAACAAGGTGGACGTAAAGAACAGGCAGGTGAAGGCGAA
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CTACAACTTCGAGAAGCCCTTCTTATACTTAGCTAGGAAGCTCTCCGGAGACCAGAACCT
TCACTTTGTCGAGTCCCCGGCTCTCGCTCCCCCC

QA 2 635 2 635
DS 

RD RS1AY05TF 707 0 0
GATAAACATCATCATCATCAATTTCCACGCACACACAAATACATCGCCCAATTCTCTCGA
TCCCGACAACATGGCTCTACCTAACCAGCAAACCGTCGATTACCCTAGCTTCAAGCTCGT
TATCGTTGGTGACGGAGGCACAGGAAAAACAACTTTTGTCAAGAGACATCTTACCGGAGA
GTTTGAGAAGAAGTATGAACCTACAATTGGTGTGGAGGTTCACCCTCTAGATTTCTTCAC
AAACTGCGGCAAGATCCGTTCCTACTGCTGGGATACCGCCGGTCAAGAGAAGTTCGGTGG
CCTTAGAGATGGTTACTACATCCACGGTCAATGCGCGGTGATCATGTTCGACGTGACGGC
GCGTCTAACGTACAAGAACGTCCCCACGTGGCACCGAGACCTCTGCCGTGTGTGCGAGAA
CATCCCCATCGTTTTGTGCGGGAACAAGGTGGACGTGAAGAACAGGCAGGTGAAGGCGAA
GCAGGTGACGTTTCACAGGAAGAAGAATCTTCAGTACTACGAGATATCCGCCAAGAGCAA
CTACAACTTCGAGAAGCCCTTCTTGTACTTAGCTAGGAAGCTCGCCGGAGACCAGAACCT
TCACTTTGTCGAGTCCCCGGCTCTCGCTCCCCCCGAGGTTCACATCGACTTTGCTGAGCA
GCAGAAGAACGAG*CTGATCTCATCGCCGCCGCGGCTCAGC
TCTTCC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RS1CW08TF 655 0 0
GGATAAACATCCATC
TCCACGCATACACAAATACTTCGCCCGATTCTCTCGATCCCGACAACATGGCTCTACCTA
ACCAGCAAACCGTAGATTACCCTAGCTTCAAGCTCGTTATCGTCGGTGACGGAGGCACAG
GAAAAACAACTTTTGTCAAGAGACATCTTACCGGAGAGTTTGAAAAGAAGTATGAACCTA
CAATCGGTGTGGAGGTTCACCCTCTAGATTTCTTCACAAACTGTGGCAAGATCCGTTTCT
ACTGCTGGGATACCGCCGGTCAAGAGAAGTTCGGTGGCCTTAGAGATGGTTACTACATCC
ACGGTCAATGCGTGGTAATCATGTTCGACGTGACGGCGCGTCTCACGTACAAGAACGTCC
CCACGTGGCACCGCGACCTCTGCCGCGTGTGCGAGAACATCCCCATCGTTCTGTGCGGGA
ACAAGGTGGACGTGAAGAACAGGCAGGTGAAGGCCAAGCAGGTGACGTTCCACAGGAAGA
AGAATCTCCAGTACTACGAGATATCCGCCAAGAGCAACTACAACTTCGAGAAGCCCTTCT
TGTACTTAGCTAGGAAGCTCGCAGGGGACCAGAACCTTCACTTTGTCGAGTCCCCCGCTC
TCGCTCCCCCTGAGGTTCACATTGACTTTGCTGAGCAGCA

QA 16 655 16 655
DS 

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ATCCCGACAACATGGCTCTACCTAACCAGCAAACCGCCGATTACCCTAGCTTCAAGCTCG
TTATCGTTGGTGACGGAGGCACAGGAAAAACAACTTTTGTCAAGAGACATCTTACCGGAG
AGTTTGAGAAGAAGTATGAACCTACAATTGGTGTGGAGGTTCACCCTCTAGATTTCTTCA
CAAACTGCGGCAAGATCCGTTTCTACTGCTGGGATACCGCCGGTCAAGAGAAGTTCGGTG
GCCTTAGAGATGGTTACTACATCCACGGTCAATGTGCGGTGATCATGTTCGACGTGACGG
CGCGTCTAACGTACAAGAACGTCCCCACGTGGCACCGAGACCTCTGCCGTGTGTGCGAGA
ACATCCCCATCGTTTTGTGCGGGAACAAGGTGGACGTGAAGAACAGGCAGGTGAAGGCGA
AGCAGGTGACGTTTCACAGGAAGAAGAATCTTCAGTACTACGAGATATTCGCCAAGAGCA
ACTACAACTTCGAGAAGCCCTTCTTGTACTTAGCTAGGAAGCTCGCCGGAGACCAGAACC
TTCACTTTGTCGAGTCCCCGGCTCTCGCTCCCCCCGAGGTTCACATCGACTTTGCTGAGC
AGCAGAAGAACGAGGCTGATCTCATCGCCGCCGCGGCTCAGCCTCTTCCTGATGATGATG
ATGACGCTTTTGAGTAAAAAA

QA 1 741 1 741
DS 

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AAGAGACATCTTACCGGAGAGTTTGAGAAGAAGTATGAACCTACAATTGGTGTGGAGGTT
CACCCTCTAGATTTCTTCACAAACTGCGGCAAGATCCGTTTCTACTGCTGGGATACCGCC
GGTCAAGAGAAGTTCGGTGGCCTTAGAGATGGTTACTACATCCACGGTCAATGTGCGGTG
ATCATGTTCGACGTGACGGCGCGTCTAACGTACAAGAACGTCCCCACGTGGCACCGAGAC
CTTTGCCGTGTGTGCGAGAACATCCCCATCGTTTTGTGCGGGAACAAGGTGGACGTGAAG
AACAGGCAGGTGAAGGCGAAGCAGGTGACGTTTCACAGGAAGAAGAATCTTCAGTACTAC
GAGATATTCGCCAAGAGCAACTACAACTTCGAGAAGCCCTTCTTGTACTTAGCTAGGAAG
CTCGCCGGAGACCAGAACCTTCACTTTGTCGAGTCCCCGGCTCTCGCTCCCCCCGAGGTT
CACATCGACTTTGCTGAGCAGCAGAAGAACGAGGCTGATCTCATCGCCGCCGCGGCTCAG
CCTCTTCCTGATGATGATGATGACGCTTTTGAGTAAAAAAGAAGCTGCTTCCACTATGTC
TGAGAAGCTGTTTGCTTTTGTGTCTGATTCTCTCTCTTTTGTTTTTTTGGTTTCTTCTCT
GTGTTGCATTGATGTTAACATATAAAATGAGAACTAAATTGGGATTATTTCGTTTGGG

QA 1 778 1 778
DS 

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CGGCGCGTCTAACGTACAAGAACGTCCCCACGTGGCACCGAGACCTTTGCCGTGTGTGCG
AGAACATCCCCATCGTTTTGTGCGGGAACAAGGTGGACGTGAAGAACAGGCAGGTGAAGG
GGAAGCAGGTGACGTTTCACAGGAAGAAGAATTTTCAGTACTACGAGATATCCGCCAAGA
GCAACTACAACTTCGAGAAGCCCTTTTTGTACTTAGCTAGGAAGCTCGCCGGAGACCAGA
ACCTTCACTTTGTCGAGTCCCCGGCTCTCGCTCCCCCCGAGGTTCACATCGACTTTGCTG
AGCAGCAGAAGAACGAGGCTGATTTCATCGCCGCCGCGGCTCAGCCTTTTCCTGATGATG
ATGATGACGCCTTTGAGTAAAAAAGAAGCTGCTTCCACTATGTTTGAGAAGCTGTTTGCT
TTTGTGTTTGATTCTCTCTCTTTTGTTTTTTTGGTTTTTTCTCTGTGTTGCATTGATGTT
AACATATAAAATGAGAACTAAATTGGGATT

QA 1 510 1 510
DS 

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TTGGTGTGGAGGTTCACCCTCTAGATTTCTTCACAAACTGCGGCAAGATCCGTTTCTACT
GCTGGGATACCGCCGGTCAAGAGAAGTTCGGTGGCCTTAGAGATGGTTACTACATCCACG
GTCAATGCGCGGTGATCATGTTCGACGTGACGGCGCGTCTAACGTACAAGAACGTCCCCA
CGTGGCACCGAGACCTCTGCCGTGTGTGCGAGAACATCCCCATCGTTTTGTGCGGGAACA
AGGTGGACGTAAAGAACAGGCAGGTGAAGGCGAAGCAGGTGACGTTTCACAGGAAGAAGA
ATCTTCAGTACTACGAGATATCCGCCAAGAGCAACTACAACTTCGAGAAGCCCTTCTTAT
ACTTAGCTAGGAAGCTCTCCGGAGACCAGAACCTTCACTTTGTCGAGTCCCCGGCTCTCG
CTCCCCCCGAGGTTCACATCGACTTTGCTGAGCAGCAGAAGAACGAGGCTGATCTCATCG
CCGCCGCGGCTCAGCCTCTTCCTGATGATGATGATGACGCTTTTGAGTAAAAAAGAAGCT
GCTTCCACTATGTCTGAGAAGCTGTTTGCTTTTGTGTCTGATTCTCTCTCTTTTGTTTTT
TTGGTTTCTTCTCTGTGTTGCATTGATGTTAACATATAAAATGAGAACTAAATTGGGATT
ATTTCGTTTGGG

QA 1 672 1 672
DS 



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GCAACTACAACTTCGAGAAGCCCTTCTTGTACTTAGCTAGGAAGCTCGCAGGGGACCAGA
ACCTTCACTTTGTCGAGTCCCCCGCTCTCGCTCCCCCTGAGGTTCACATTGACTTTGCTG
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ATGATGACGCTTTCGAGTAAAAAAGGAAGCTTCCACTGTGGGGAGAGCTGTTTGCTTTTG
TCTGATTCTCTTTTGGTTTTGGTTTCTTTCTCTGTGTTGTTGCATTGATGTTAACATTAT
AAAATGATTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1F545JQ C 1
AF RS1F545TF U 1
BS 1 370 RS1F545TF

RD RS1F545JQ 370 0 0
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TCTGATTCTCTTTTGGTTTTGGTTTCTTTCTCTGTGTTGTTGCATTGATGTTAACATTAT
AAAATGATTC

QA 1 370 1 370
DS 

RD RS1F545TF 370 0 0
CCAAGCAGGTGACGTTCCACAGGAAGAAGAATCTCCAGTACTACGAGATATCCGCCAAGA
GCAACTACAACTTCGAGAAGCCCTTCTTGTACTTAGCTAGGAAGCTCGCAGGGGACCAGA
ACCTTCACTTTGTCGAGTCCCCCGCTCTCGCTCCCCCTGAGGTTCACATTGACTTTGCTG
AGCAGCAGAAGAACGAGGCTGATCTCATCGCCGCCGCGGCTCAGCCTCTTCCCGATGATG
ATGATGACGCTTTCGAGTAAAAAAGGAAGCTTCCACTGTGGGGAGAGCTGTTTGCTTTTG
TCTGATTCTCTTTTGGTTTTGGTTTCTTTCTCTGTGTTGTTGCATTGATGTTAACATTAT
AAAATGATTC

QA 1 370 1 370
DS 



AS 1 16

CO CL42Contig1 1075 16 14 U
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AAAACTTAGAAAGTGTGTGGGAGTGCGATGTTCAATGTGTTTCTCACACCCACTTTATGC
TTTATTACTTACAAACGAAGAAGAACCCAATAAAATATAGTTGGAAGAAAAGAGAGAGAA
AGAGAGGATCTCAGAGTAGAAGAAGAAGAAGATGGAGATGGATAAGAGAAAGATGGTGAT
GTGTGGTGTGCTATCACTTCTGGGTTTATTATCTGCTGTTACTGCCTTCGCTGCTGAAGC
TACCCGAATCAAGAAATCTCAGATCAAGATTACCACATCGGACTCAGTCACACAATGCTC
TTACAAGAGAAGTCCAGCTTACAATCTCGGTTTCGCTTCAGCCATTTTTCTCATGATGGC
TCAGATCATCGCCAGCGTCGGTAGCGGTTGTTTCTGCTGTAGAAAAGGTCCTTCTCCGAC
CAGATCCAAGTGGATTCTCGCCTTAGTCTCCTTCATTGTCTCATGGTTCACTTTTGTGCT
AGCTTTTCTCGTGCTGCTCACTGCAGCTTCGCTCAACGATGAACACATCCAGGAGACGGA
GACGAAGACTGCCGACAGCTACTTCTGCTACATTGTGAAACCAGGCGTTTT*CTTCATCG
GTTCCATCCTCTCGCTTTTCACTGTAGCCCTTGGGATTGTCTACTATCTGTGTTTGAATT
CGGTTAAGCAAAACGTTGCTGCTGCAACAACCACGCCGGTTAACCAAGGAATAGCAATGG
GACAGCCTCAGATTCCAGTGAGAGTTGAAGATCCCGTCTTTGTTCACGAAGACACTTACA
TGAGAAGACAGTTCACTTAAAAAAAAAAAAA******TACAGAACAAGGCTTGCTTGTGG
ATCACGCTAGTTATATGGGAGGATATTTTAGGTTTTAAAAAGGGCTTGGTGCTTGTTTTG
ATTTTTTATTTTATTTTATCTTTTGTGATTCTCGTGTGAAAGCAAAAACTATGAGAGACT
TGGTAGTAGTTGGATTAATGAATGATGAATGATTACTGTTGTTGGAATGTTATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 0 80 80 80 80 50 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 20 65 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 35 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RS1DX23TF U 1
AF RS1CN23TF U 257
AF RS1FK39TF U 75
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AAAACTTAGAAAGTGTGTGGGAGTGCGATGTTCAATGTGTTTCTCACACCCACTTTATGC
TTTATTACTTACAAACGAAGAAGAACCCAATAAAATATAGTTGGAAGAAAAGAGAGAGAA
AGAGAGGATCTCAGAGTAGAAGAAGAAGAAGATGGAGATGGATAAGAGAAAGATGGTGAT
GTGTGGTGTG

QA 1 250 1 250
DS 

RD RS1CN23TF 209 0 0
CTTCTGGGTTTATTATCTGCTGTTACTGCCTTCGCTGCTGAATCTACCCGAATCAAGAAA
TCTCAGATCAAGATTACCACATCGGACTCAGTCACACAATGCTCTTACAAGAGAAGTCCA
GCTTACAATCTCGGTTTCGCTTCAGCCATTTTTCTCATGATGGCTCAGATCATCGCCAGC
GTCGGTAGCGGTTGTTTCTGCTGTAGAAA

QA 1 209 1 209
DS 

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GGGT
GGGAGTGCGATGTTCAATGTGTTTCTCACACCCACTTTATGCTTCATTACTTACAAACGA
AGAAGAACCCAATAAAATATAGTTGGAAGAAAAGAGAGAGAAAGAGAGGATCTCAGAGTA
GAAGAAGAAGAAGATGGAGATGGATAAGAGAAAGATGGTGATGTGTGGTGTGCTATCACT
TCTGGGTTTATTATCTGCTGTTACTGCCTTCGCTGCTGAAGCTACCCGAATCAAGAAATC
TCAGATCAAGATTACCACATCGGACTCAGTCACACAATGCTCTTACAAGAGAAGTCCAGC
TTACAATCTCGGTTTCGCTTCAGCCATTTTTCTCATGATGGCTCAGATCATCGCCAGCGT
CGGTAGCGGTTGTTTCTGCTGTAGAAAAGGTCCTTCTCCGACCAGATCCAAGTGGATTCT
CGCCTTAGTCTCCTTCATTGTCTCATGGTTCACTTTTGTGCTAGCTTTTCTCGTGCTGCT
CACTGCAGCTTCGCTCAACGATGAACACATCCAGGAGACGGAGACGAAGACTGCCGACAG
CTACTTCTGCTACATTGTGAAACCAGGCGTTTTTCCTCATCGGTTCCATCCTCTCGCTTT
TCACTGTAGCCCTTGGGATTGTCTACTATCTGTGTTTGAATTCG*TTAAGCAAAACGTTG
CTGCTGCAACAACCACGCCGGTTAAC

QA 5 690 5 690
DS 

RD RS1FQ14TF 607 0 0
GG
AAAATATAGTTGGAAGAA**GAGAGAGAAAGAGAGGATCTCAGAGTAGAAGAAGAAGAAG
ATGGAGATGGATAAGAGAAAGATGGTGATGTGTGGTGTGCTATCACTTCTGGGTTTATTA
TCTGCTGTTACTGCCTTCGCTGCTGAAGCTACCCGAATCAAGAAATCTCAGATCAAGATT
ACCACATCGGACTCAGTCACACAATGCTCTTACAAGAGAAGTCCAGCTTACAATCTCGGT
TTCGCTTCAGCCATTTTTCTCATGATGGCTCAGATCATCGCCAGCGTCGGTAGCGGTTGT
TTCTGCTGTAGAAAAGGTCCTCCTCCGACCAGATCCAAGTGGATTCTCGCCTTAGTCTCC
TTCATTGTCTCATGGTTCACTTTTGTGCTAGCTTTTCTCGTGCTGCTCACTGCAGCTTCG
CTCAACGATGAACACATCCAGGAGACGGAGACGAAGACTGCCGACAGCTACTTCTGCTGC
GTTGTGAAACCAGGCGTTTT*CTTCATCGGTTCCATCCTCTCGCTTTTCACTGTAGCCCT
TGGGATTGTCTACTATCTGTGTTTGAATTCGGTTAAGCAAAACGTTGCTGCTGCAACAAC
CACGC

QA 3 607 3 607
DS 

RD RS1DI55TF 671 0 0
GGGGTGT
GGGAGTGCGATGTTCAATGTGTTTCTCACACCCACTTTATGCTTTATTACTTACAAACGA
AGAAGAACCCAATAAAATATAGTTGGAAGAAAAGAGAGAGAAAGAGAGGATCTCAGAGTA
GAAGAAGAAGAAGATGGAGATGGATAAGAGAAAGATGGTGATGTGTGGTGTGCTATCACT
TCTGGGTTTATTATCTGCTGTTACTGCCTTCGCTGCTGAAGCTACCCGAATCAAGAAATC
TCAGATCAAGATTACCACATCGGACTCAGTCACACAATGCTCTTACAAGAGAAGTCCAGC
TTACAATCTCGGTTTCGCTTCAGCCATTTTTCTCATGATGGCTCAGATCATCGCCAGCGT
CGGTAGCGGTTGTTTCTGCTGTAGAAAAGGTCCTTCTCCGACCAGATCCAAGTGGATTCT
CGCCTTAGTCTCCTTCATTGTCTCATGGTTCACTTTTGTGCTAGCTTTTCTCGTGCTGCT
CACTGCAGCTTCGCTCAACGATGAACACATCCAGGAGACGGAGACGAAGACTGCCGACAG
CTACTTCTGCTACATTGTGAAACCAGGCGTTTT*CTTCATCGGTTCCATCCTCTCGCTTT
TCACTGTAGCCCTTGGGATTGTCTACTATCTGTGTTTGAATTCGGTTAAGCAAAACGTTG
CTGC

QA 8 671 8 671
DS 

RD RS1A210TV 794 0 0
CCATTACGGCCGGG
GGGAGTGCGATGTTCAATGTGTTTCTCACACCCACTTTATGCTTTATTACTTACAAACGA
AGAAGAACCCAATAAAATATAGTTGGAAGAAAAGAGAGAGAAAGAGAGGATCTCAGAGTA
GAAGAAGAAGAAGATGGAGATGGATAAGAGAAAGATGGTGATGTGTGGTGTGCTATCACT
TCTGGGTTTATTATCTGCTGTTACTGCCTTCGCTGCTGAAGCTACCCGAATCAAGAAATC
TCAGATCAAGATTACCACATCGGACTCAGTCACACAATGCTCTTACAAGAGAAGTCCAGC
TTACAATCTCGGTTTCGCTTCAGCCATTTTTCTCATGATGGCTCAGATCATCGCCAGCGT
CGGTAGCGGTTGTTTCTGCTGTAGAAAAGGTCCTTCTCCGACCAGATCCAAGTGGATTCT
CGCCTTAGTCTCCTTCATTGTCTCATGGTTCACTTTTGTGCTAGCTTTTCTCGTGCTGCT
CACTGCAGCTTCGCTCAACGATGAACACATCCAGGAGACGGAGACGAAGACTGCCGACAG
CTACTTCTGCTACATTGTGAAACCAGGCGTTTT*CTTCATCGGTTCCATCCTCTCGCTTT
TCACTGTAGCCCTTGGGATTGTCTACTATCTGTGTTTGAATTCGGTTAAGCAAAACGTTG
CTGCTGCAACAACCACGTCGGTTAACCAAGGAATAGCAATGGGACAGCCTCAGATTCCAG
TGAGAGTTGAAGATCCCGTCTTTGTTCACGAAGACACTTACATGAGAAGACAGTTCACTT

QA 15 794 15 794
DS 

RD RS1FQ14JQ 709 0 0
GG
AAAATATAGTTGGAAGAA**GAGAGAGAAAGAGAGGATCTCAGAGTAGAAGAAGAAGAAG
ATGGAGATGGATAAGAGAAAGATGGTGATGTGTGGTGTGCTATCACTTCTGGGTTTATTA
TCTGCTGTTACTGCCTTCGCTGCTGAAGCTACCCGAATCAAGAAATCTCAGATCAAGATT
ACCACATCGGACTCAGTCACACAATGCTCTTACAAGAGAAGTCCAGCTTACAATTTCGGT
TTCGCTTCAGCCATTTTTCTCATGATGGCTCAGATCATCGCCAGCGTCGGTAGCGGTTGT
TTTTGCTGTAGAAAAGGTCCTCCTCCGACCAGATCCAAGTGGATTCTCGCCTTAGTCTCC
TTCATTGTCTCATGGTTCACTTTTGTGCTAGCTTTTCTCGTGCTGCTCACTGCAGCTTCG
CTCAACGATGAACACATCCAGGAGACGGAGACGAAGACTGCCGACAGCTACTTTTGCTGC
GTTGTGAAACCAGGCGTTTTT*TTCATCGGTTCCATCCTCTCGCTTTTCACTGTAGCCCT
TGGGATTGTCTACTATCTGTGTTTGAATTCGGTTAAGCAAAACGTTGCTGCTGCAACAAC
CACGCCGGTTAACCAAGGAATAGCAATGGGACAGCCTCAGATTCCATTGAGAGTTGAAGA
TCCCGTCTTTGTTCACGAAGACACTTACATGAGAAGACAGTTCACTT

QA 3 709 3 709
DS 

RD RS1FO23TF 758 0 0
GG
ACACCCACTTTATGCTTTATTACTTACAAACGAAGAAGAACCCAATAAAATATAGTTGGA
AGAAAAGAGAGAGAAAGAGAGGATCTCAGAGTAGAAGAAGAAGAAGATGGAGATGGATAA
GAGAAAGATGGTGATGTGTGGTGTGCTATCACTTCTGGGTTTATTATCTGCTGTTACTGC
CTTCGCTGCTGAAGCTACCCGAATCAAGAAATCTCAGATCAAGATTACCACATCGGACTC
AGTCACACAATGCTCTTACAAGAGAAGTCCAGCTTACAATCTCGGTTTCGCTTCAGCCAT
TTTTCTCATGATGGCTCAGATCATCGCCAGCGTCGGTAGCGGTTGTTTCTGCTGTAGAAA
AGGTCCTTCTCCGACCAGATCCAAGTGGATTCTCGCCTTAGTCTCCTTCATTGTCTCATG
GTTCACTTTTGTGCTAGCTTTTCTCGTGCTGCTCACTGCAGCTTCGCACAACGATGAACA
CATCCAGGAGACGGAGACGAAGACTGCCGACAGCTACTTCTGCTACATTGTGAAACCAGG
CGTTTT*CTTCATCGGTTCCATCCTCTCGCTTTTCACTGTAGCCCTTGGGATTGTCTACT
ATCTGTGTTTGAATTCGGTTAAGCAAAACGTTGCTGCTGCAACAACCACGCCGGTTAACC
AAGGAATAGCAATGGGACAGCCTCAGATTCCAGTGAGAGTTGAAGATCCCGTCTTTGTTC
ACGAAGACACTTACATGAGAAGACAGTTCACTTAAA

QA 3 758 3 758
DS 

RD RS1CP60TF 736 0 0
G
AGAGTAGAAGAAGAAGAAGATGGAGATGGATAAGAGAAAGATGGTGATGTGTGGTGTGCT
ATCACTTCTGGGTTTATTATCTGCTGTTACTGCCTTCGCTGCTGAAGCTACCCGAATCAA
GAAATCTCAGATCAAGATTACCACATCGGACTCAGTCACACAATGCTCTTACAAGAGAAG
TCCAGCTTACAATCTCGGTTTCGCTTCAGCCATTTTTCTCATGATGGCTCAGATCATCGC
CAGCGTCGGTAGCGGTTGTTTCTGCTGTAGAAAAGGTCCTTCTCCGACCAGATCCAAGTG
GATTCTCGCCTTAGTCTCCTTCATTGTCTCATGGTTCACTTTTGTGCTAGCTTTTCTCGT
GCTGCTCACTGCAGCTTCGCTCAACGATGAACACATCCAGGAGACGGAGACGAAGACTGC
CGACAGCTACTTCTGCTACATTGTGAAACCAGGCGTTTT*CTTCATCGGTTCCATCCTCT
CGCTTTTCACTGTAGCCCTTGGGATTGTCTACTATCTGTGTTTGAATTCGGTTAAGCAAA
ACGTTGCTGCTGCAACAACCACGCCGGTTAACCAAGGAATAGCAATGGGACAGCCTCAGA
TTCCAGTGAGAGTTGAAGATCCCGTCTTTGTTCACGAAGACACTTACATGAGAAGACAGT
TCACTTAAAAAAAAAAAAA******TACAGAACAAGGCTTGCTTGTGGATCACGCTAGTT
ATATGGGAGGATATT

QA 2 736 2 736
DS 

RD RS1GI79TF 524 0 0
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AAGGTCCTTCTCCGACCAGATCCAAGTGGATTCTCGCCTTAGTCTCCTTCATTGTCTCAT
GGTTCACTTTTGTGCTAGCTTTTCTCGTGCTGCTCACTGCAGCTTCGCTCAACGATGAAC
ACATCCAGGAGACGGAGACGAAGACTGCCGACAGCTACTTCTGCTACATTGTGAAACCAG
GCGTTTT*CTTCATCGGTTCCATCCTCTCGCTTTTCACTGTAGCCCTTGGGATTGTCTAC
TATCTGTGTTTGAATTCGGTTAAGCAAAACGTTGCTGCTGCAACAACCACGCCGGTTAAC
CAAGGAATAGCAATGGGACAGCCTCAGATTCCAGTGAGAGTTGAAGATCCCGTCTTTGTT
CACGAAGACACTTACATGAGAAGACAGTTCACTTAAAAAAAAAAAAA*****ATACAGAA
CAAGGCTTGCTTGTGGATCACGCTAGTTATATGGGAGGATATTT

QA 1 524 1 524
DS 

RD RS1A210TR 866 0 0
GTAGAAGAAGAAGAAGATGGAGATGGATAAGAGAAAGATGGTGATGTGTGGTGTGCTATC
ACTTCTGGGTTTATTATCTGCTGTTACTGCCTTCGCTGCTGAAGCTACCCGAATCAAGAA
ATCTCAGATCAAGATTACCACATCGGACTCAGTCACACAATGCTCTTACAAGAGAAGTCC
AGCTTACAATCTCGGTTTCGCTTCAGCCATTTTTCTCATGATGGCTCAGATCATCGCCAG
CGTCGGTAGCGGTTGTTTTTGCTGTAGAAAAGGTCCTTCTCCGACCAGATCCAAGTGGAT
TCTCGCCTTAGTCTCCTTCATTGTCTCATGGTTCACTTTTGTGCTAGCTTTTCTCGTGCT
GCTCACTGCAGCTTCGCTCAACGATGAACACATCCAGGAGACGGAGACGAAGACTGCCGA
CAGCTACTTTTGCTACATTGTGAAACCAGGCGTTTT*TTTCATCGGTTCCATCCTCTCGC
TTTTCACTGTAGCCCTTGGGATTGTTTACTATCTGTGTTTGAATTCGGTTAAGCAAAACG
TTGCTGCTGCAACAACCACGTCGGTTAACCAAGGAATAGCAATGGGACAGCCTCAGATTC
CAGTGAGAGTTGAAGATCCCGTCTTTGTTCACGAAGACACTTACATGAGAAGACAGTTCA
CTTAAAAAAAAAAAAA******TACAGAACAAGGCTTGCTTGTGGATCACGCTAGTTATA
TGGGAGGATATTTTAGGTTTTAAAA*GGGCTTGGTGCATGTTTTGATTTTTTATTTTATT
TTATCTTTTGTGATTCTCGTGTGAAAGCAAAAACTATGAGAGACTTGGTAGTAGTTGGAT
TAATGAATGATGAATGATTACTGTTG

QA 1 866 1 866
DS 

RD RS1CP60JQ 807 0 0
TCACTTCTGGGTTTATTATCTGCTGTTACTGCCTTCGCTGCTGAAGCTACCCGAATCAAG
AAATCTCAGATCAAGATTACCACATCGGACTCAGTCACACAATGCTCTTACAAGAGAAGT
CCAGCTTACAATCTCGGTTTCGCTTCAGCCATTTTTCTCATGATGGCTCAGATCATCGCC
AGCGTCGGTAGCGGTTGTTTCTGCTGTAGAAAAGGTCCTTCTCCGACCAGATCCAAGTGG
ATTCTCGCCTTAGTCTCCTTCATTGTCTCATGGTTCACTTTTGTGCTAGCTTTTCTCGTG
CTGCTCACTGCAGCTTCGCTCAACGATGAACACATCCAGGAGACGGAGACGAAGACTGCC
GACAGCTACTTTTGCTACATTGTGAAACCAGGCGTTTT*TTTCATCGGTTCCATCCTCTC
GCTTTTCACTGTAGCCCTTGGGATTGTCTACTATCTGTGTTTGAATTCGGTTAAGCAAAA
CGTTGCTGCTGCAACAACCACGCCGGTTAACCAAGGAATAGCAATGGGACAGCCTCAGAT
TCCAGTGAGAGTTGAAGATCCCGTCTTTGTTCACGAAGACACTTACATGAGAAGACAGTT
CACTTAAAAAAAAAAAAA******TACAGAACAAGGCTTGCTTGTGGATCACGCTAGTTA
TATGGGAGGATATTTTAGGTTTTAAAAAGGGCTTGGTGCTTGTTTTGATTTTTTATTTTA
TTTTATCTTTTGTGATTCTCGTGTGAAAGCAGAAACTATGAGAGACTTGGTAGTAGTTGG
ATTAATGAATGATGAATGATTACTGTT

QA 1 807 1 807
DS 

RD RS1A210JQ 761 0 0
TACCCGAATCAAGAAATCTCAGATCAAGATTACCACATCGGACTCAGTCACACAATGCTC
TTACAAGAGAAGTCCAGCTTACAATCTCGGTTTCGCTTCAGCCATTTTTCTCATGATGGC
TCAGATCATCGCCAGCGTCGGTAGCGGTTGTTTCTGCTGTAGAAAAGGTCCTTCTCCGAC
CAGATCCAAGTGGATTCTCGCCTTAGTCTCCTTCATTGTCTCATGGTTCACTTTTGTGCT
AGCTTTTCTCGTGCTGCTCACTGCAGCTTCGCTCAACGATGAACACATCCAGGAGACGGA
GACGAAGACTGCCGACAGCTACTTTTGCTACATTGTGAAACCAGGCGTTTT*TTTCATCG
GTTCCATCCTCTCGCTTTTCACTGTAGCCCTTGGGATTGTCTACTATCTGTGTTTGAATT
CGGTTAAGCAAAACGTTGCTGCTGCAACAACCACGTCGGTTAACCAAGGAATAGCAATGG
GACAGCCTCAGATTCCAGTGAGAGTTGAAGATCCCGTCTTTGTTCACGAAGACACTTACA
TGAGAAGACAGTTCACTTAAAAAAAAAAAAA******TACAGAACAAGGCTTGCTTGTGG
ATCACGCTAGTTATATGGGAGGATATTTTAGGTTTTAAAA*GGGCTTGGTGCATGTTTTG
ATTTTTTATTTTATTTTATCTTTTGTGATTCTCGTGTGAAAGCAAAAACTATGAGAGACT
TGGTAGTAGTTGGATTAATGAATGATGAATGATTACTGTTG

QA 1 761 1 761
DS 

RD RS1DI55JQ 753 0 0
TCAGATCAAGATTACCACATCGGACTCAGTCACACAATGCTCTTACAAGAGAAGTCCAGC
TTACAATCTCGGTTTCGCTTCAGCCATTTTTCTCATGATGGCTCAGATCATCGCCAGCGT
CGGTAGCGGTTGTTTCTGCTGTAGAAAAGGTCCTTCTCCGACCAGATCCAAGTGGATTCT
CGCCTTAGTCTCCTTCATTGTCTCATGGTTCACTTTTGTGCTAGCTTTTCTCGTGCTGCT
CACTGCAGCTTCGCTCAACGATGAACACATCCAGGAGACGGAGACGAAGACTGCCGACAG
CTACTTTTGCTACATTGTGAAACCAGGCGTTTT*CTTCATCGGTTCCATCCTCTCGCTTT
TCACTGTAGCCCTTGGGATTGTCTACTATCTGTGTTTGAATTCGGTTAAGCAAAACGTTG
CTGCTGCAACAACCACGCCGGTTAACCAAGGAATAGCAATGGGACAGCCTCAGATTCCAG
TGAGAGTTGAAGATCCCGTCTTTGTTCACGAAGACACTTACATGAGAAGACAGTTCACTT
AAAAAAAAAAAA*******TACAGAACAAGGCTTGCTTGTGGATCACGCTAGTTATATGG
GAGGATATTTTAGGTTTTAAAAAGGGCTTGGTGCTTGTTTTGATTTTTTATTTTATTTTA
TCTTTTGTGATTCTCGTGTGAAAGCAAAAACTATGAGAGACTTGGTAGTAGTTGGATTAA
TGAATGATGAATGATTACTGTTGTTGGAATGTT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1GI79JQ 656 0 0
TTTTTCTCATGATGGCTCAGATCATCGCCAGCGTCGGTAGCGGTTGTTTCTGCTGTAGAA
AAGGTCCTTCTCCGACCAGATCCAAGTGGATTCTCGCCTTAGTCTCCTTCATTGTCTCAT
GGTTCACTTTTGTGCTAGCTTTTCTCGTGCTGCTCACTGCAGCTTCGCTCAACGATGAAC
ACATCCAGGAGACGGAGACGAAGACTGCCGACAGCTACTTTTGCTACATTGTGAAACCAG
GCGTTTT*CTTCATCGGTTCCATCCTCTCGCTTTTCACTGTAGCCCTTGGGATTGTCTAC
TATCTGTGTTTGAATTCGGTTAAGCAAAACGTTGCTGCTGCAACAACCACGCCGGTTAAC
CAAGGAATAGCAATGGGACAGCCTCAGATTCCAGTGAGAGTTGAAGATCCCGTCTTTGTT
CACGAAGACACTTACATGAGAAGACAGTTCACTTAAAAAAAAAAAAA*****ATACAGAA
CAAGGCTTGCTTGTGGATCACGCTAGTTATATGGGAGGATATTTTAGGTTTTAAAAAGGG
CTTGGTGCTTGTTTTGATTTTTTATTTTATTTTATCTTTTGTGATTCTCGTGTGAAAGCA
AAAACTATGAGAGACTTGGTAGTAGTTGGATTAATGAATGATGAATGATTACTGT
C

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1FO23JQ 619 0 0
CTGTAGAAAAGGTCCTTCTCCGACCAGATCCAAGTGGATTCTCGCCTTAGTCTCCTTCAT
TGTCTCATGGTTCACTTTTGTGCTAGCTTTTCTCGTGCTGCTCACTGCAGCTTCGCACAA
CGATGAACACATCCAGGAGACGGAGACGAAGACTGCCGACAGCTACTTTTGCTACATTGT
GAAACCAGGCGTTTT*TTTCATCGGTTCCATCCTCTCGCTTTTCACTGTAGCCCTTGGGA
TTGTTTACTATCTGTGTTTGAATTCGGTTAAGCAAAACGTTGCTGCTGCAACAACCACGC
CGGTTAACCAAGGAATAGCAATGGGACAGCCTCAGATTCCAGTGAGAGTTGAAGATCCCG
TCTTTGTTCACGAAGACACTTACATGAGAAGACAGTTCACTTAAAAAAAAAAAAAAAAAA
ATACAGAACAAGGCTTGCTTGTGGATCACGCTAGTTATATGGGAGGATATTTTAGGTTTT
AAAAAGGGCTTGGTGCTTGTTTTGATTTTTTATCTTATTTTATCTTTTGTGATTCTCGTG
TGAAAGCAAAAACTATGAGAGACTTGGTAGTAGTTGGATTAATGAATGATGAATGATTAC
TGTTGTTGGAATGTTATAG

QA 1 619 1 619
DS 



AS 2 16

CO CL43Contig1 1017 13 25 U
GGAAAGTGGGGGAGGTGAAGGACGTGAATAATAGTGGTGGTGGTGAGAAGTTTCTGGAAA
TAAAATAACAATGCGAACCATTCTCCAAGGAAGTCTCCTTCCTCCTCCTCCTATAAAACT
CAGCCACTCGTCCCTTCTCCTCTCCGGATCCCATTCTCATTCCAACTTGAAATTCACAAC
CAAATCTTCTCCTTCTCCTCCGACAATCACCATGGCCAGCATCAAAGTCCACGGAGTCCC
CATGTCCACCGCCACCATGCGGGTTCTCGCTGCTCTTTACGAGAAGGACCTCGACTTCGA
GCTGATCCCCGTCGACATGAGAGCCGGTGCTCACAAGCAGGAGCCTTTCGTTTCCCTCAA
CCCCTTCGGTCAAATCCCTGCTCTCCAAGACGGTGACTTAACTCTATTTGAGTCACGAGC
AATCACAGAGTACATAGCGGATGAATACAGTGAGAAAGGTGAGAAGCTTATGTGCCCAGG
GTGCAACAAAGTCAAGGCAATCACCAAGGTCTGGCTTAATGTTGAAGGTCAACAGTTTGA
CCCTATCGCCTCCAAGATCGCCTTCGAGCGTATCTTCAAAGGCATGTTTGGCATGACCAC
CGATCCAGCCGCTGTCCAGGAGCTCGAAGGCAAGCTCGTCAGGGTCTTGGATATCTACGA
GGCAAGGCTCTCCAAATCTGAGTTCCTCGCTTGTGATTGCTTCACTTTGGCTGATCTCCA
CCACCTCCCTGTCATCCACTACTTGATGGGTACTGACTCCAAGGAACTCTTTGAGTCTCG
CCCTAAGGTTGCCGAGTGGGTCAAGAAGATCACTGCCAGGCCTGCTTGGGCTAAGGTCGT
TGACCTCCAGAAGCAGTGATGAACGAGGCTTTTGTTTCATTT***AAATAAAATGATTGT
ACCTCTGTGTGTTTTGTGCTAGTATTGTAATCTTCTTTTCACTTTCTTACCCTTTCTCCT
CTGTTTGTGTGTTTGTTGGGTCGTCGTTTATGTGCAATAAAACAACATTCTGATTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 50 50 50 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 35 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 40 40 70 70 70 
10 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 35 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 35 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 35 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 35 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 10 70 70 70 70 70 20 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 50 40 65 65 65 65 60 
60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 20 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 5 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 30 20 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 25 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1EB53TF U 146
AF RS1BP08TF U 1
AF RS1GK58TF U 23
AF RS1FC28TF U 146
AF RS1EL46TF U 249
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AF RS1F009TF U 198
AF RS1F232TF U 201
AF RS1CB21TF U 145
AF RS1CB21JQ C 190
AF RS1FC28JQ C 255
AF RS1GK58JQ C 202
AF RS1EB53JQ C 314
BS 1 106 RS1BP08TF
BS 107 107 RS1GK58TF
BS 108 139 RS1BP08TF
BS 140 140 RS1GK58TF
BS 141 145 RS1BP08TF
BS 146 147 RS1CB21TF
BS 148 514 RS1BP08TF
BS 515 515 RS1CB21TF
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BS 625 625 RS1CB21TF
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BS 660 765 RS1CB21TF
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BS 906 955 RS1CB21JQ
BS 956 956 RS1GK58JQ
BS 957 1015 RS1CB21JQ
BS 1016 1017 RS1GK58JQ

RD RS1EB53TF 221 0 0
GGATCCCATTCTCATTCCAACTTGAAATTCACAACCAAATCTTCTCCTTCTCCTCCGACA
ATCACCATGGCCAGCATCAAAGTCCACGGAGTCCCCATGTCCACCGCCACCATGCGGGTT
CTCGCTGCTCTTTACGAGAAGGACCTCGACTTCGAGCTGATCCCCGTCGACATGAGAGCC
GGTGCTCACAAGCAGGAGCCTTTCGTT*CCCTCAACCCCTT

QA 1 221 1 221
DS 

RD RS1BP08TF 639 0 0
GGAAAGTGGGGGAGGTGAAGGACGTGAATAATAGTGGTGGTGGTGAGAAGTTTCTGGAAA
TAAAATAACAATGCGAACCATTCTCCAAGGAAGTCTCCTTCCTCCTTCTCCTATAAAACT
CAGCCACTCGTCCCTTCTCTTCTCCCCATCCCATTCTCATTCCAACTTGAAATTCACAAC
CAAATCTTCTCCTTCTCCTCCGACAATCACCATGGCCAGCATCAAAGTCCACGGAGTCCC
CATGTCCACCGCCACCATGCGGGTTCTCGCTGCTCTTTACGAGAAGGACCTCGACTTCGA
GCTGATCCCCGTCGACATGAGAGCCGGTGCTCACAAGCAGGAGCCTTTCGTTTCCCTCAA
CCCCTTCGGTCAAATCCCTGCTCTCCAAGACGGTGACTTAACTCTATTTGAGTCACGAGC
AATCACAGAGTACATAGCGGATGAATACAGTGAGAAAGGTGAGAAGCTTATGTGCCCAGG
GTGCAACAAAGTCAAGGCAATCACCAAGGTCTGGATTAATGTTGAAGGTCAACAGTTTGA
CCCTATCGCCTCCAAGATCGCCTTCGAGCGTATCTTCAAAGGCATGTTTGGCATGACCAC
CGATCCAGCCGCTGTCCAGGAGCTAGAAGGCAAGCTCGT

QA 1 639 1 639
DS 

RD RS1GK58TF 637 0 0
G
GTGAATAATAGTGGTGGTGGTGAGAAGTTTCTGGAAATAAAATAACAATGCGAACCATTC
TCCAAGGAAGTCTCCTTCCTCCTCCTCCTATAAAACTCAGCCACTCGTCCCTTCTCCTCT
CCCCATCCCATTCTCATTCCAACTTGAAATTCACAACCAAATCTTCTCCTTCTCCTCCGA
CAATCACCATGGCCAGCATCAAAGTCCACGGAGTCCCCATGTCCACCGCCACCATGCGGG
TTCTCGCTGCTCTTTACGAGAAGGACCTCGACTTCGAGCTGATCCCCGTCGACATGAGAG
CCGGTGCTCACAAGCAGGAGCCTTTCGTTTCCCTCAACCCCTTCGGTCAAATCCCTGCTC
TCCAAGACGGTGACTTAACTCTATTTGAGTCACGAGCAATCACAGAGTACATAGCGGATG
AATACAGTGAGAAAGGTGAGAAGCTTATGTGCCCAGGGTGCAACAAAGTCAAGGCAATCA
CCAAGGTCTGGATTAATGTTGAAGGTCAACAGTTTGACCCTATCGCCTCCAAGATCGCCT
TCGAGCGTATCTTCAAAGGCATGTTTGGCATGACCACCGATCCAGCCGCTGTCCAGGAGC
TAGAACGCAAGCTCGTCAGGGTCTTGGATATCTACG

QA 2 637 2 637
DS 

RD RS1FC28TF 589 0 0
GGATCCCATTCTCATCCCAACTTAAAATTCACATCCAAATCTTCTCCTTCTCCTCCGACA
ATCACCATGGCCAGCATCAAAGTCCACGGAGTCCCCATGTCCACCGCCACCATGCGGGTT
CTCGCTGCTCTTTACGAGAAGGACCTCGACTTCGAGCTGATCCCCGTCGACATGAGAGCC
GGTGCTCACAAGCAGGAGCCTTTCGTTTCCCTCAACCCCTTCGGTCAAATCCCTGCTCTC
CAAGACGGTGACTTAACTCTATTTGAGTCACGAGCCATCACAGAGTACATAGCGGATGAA
TACAGTGAGAAAGGTGAGAAGCTTATGTGCCCAGGGTGCAACAAAGTCAAGGCAATCACC
AAGGTCTGGCTTAATGTTGAAGGTCAACAGTTTGACCCTATCGCCTCCAAGATCGCCTTC
GAGCGTATCTTCAAAGGCATGTTTGGCATGACCACCGATCCAGCCGCTGTCCAAGAGCTC
GAAGGCAAGCTCGTCAGGGTCTTGGATATCTACGAGGCAAGGCTCTCCAAATCTGAGTTC
CTCGCTTGTGATTGCTTCACTTTGGCTGATCTCCACCACCTCCCTGTCA

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1EL46TF 583 0 0
G
CGCCACCATGCGGGTTCTCGCTGCTCTTTACGAGAAGGACCTCGACTTCGAGCTGATCCC
CGTCGACATGAGAGCCGGTGCTCACAAGCAGGAGCCTTTCGTTTCCCTCAACCCCTTCGG
TCAAATCCCTGCTCTCCAAGACGGTGACTTAACTCTATTTGAGTCACGAGCCATCACAGA
GTACATAGCGGATGAATACAGTGAGAAAGGTGAGAAGCTTATGTGCCCAGGGTGCAACAA
AGTCAAGGCAATCACCAAGGTCTGGCTTAATGTTGAAGGTCAACAGTTTGACCCTATCGC
CTCCAAGATCGCCTTCGAGCGTATCTTCAAAGGCATGTTTGGCATGACCACCGATCCAGC
CGCTGTCCAAGAGCTCGAAGGCAAGCTCGTCAGGGTCTTGGATATCTACGAGGCAAGGCT
CTCCAAATCTGAGTTCCTCGCTTGTGATTGCTTCACTTTGGCTGATCTCCACCACCTCCC
TGTCATCCACTACTTGATGGGTACTGACTCCAAGGACCTCTTTGAGTCTCGCCCTAAG*T
TGCCGAGTGGGTCAAGAAGATCACTGCCAGGCCTGCTTGGGC

QA 2 583 2 583
DS 

RD RS1B276TF 638 0 0
GGATCCCATTCTCATTCCAACTTGAAATTCACAACCAAATCTTCTCCTTCTCCTCCGACA
ATCACCATGGCCAGCATCAAAGTCCACGGAGTCCCCATGTCCACTGCCACCATGCGGGTT
CTCGCTGCTCTTTACGAGAAGGACCTCGACTTCGAGTTGATCCCCGTCGACATGAGAGCC
GGTGCTCACAAGCAGGAGCCTTTCGTTTCCCTCAACCCCTTCGGTCAAATCCCTGCTCTC
CAAGACGGTGACTTAACTCTATTTGAGTCACGAGCAATCACAGAGTACATAGCGGATGAA
TACAGTGAGAAAGGTGAGAAGCTTATGTGCCCAGGGTGCAAAAAAGTCAAGGCAATCACC
AAGGTCTGGCTTAACGTTGAAGGTCAACAGTTCGACCCTATCGCCTCCAAGATCGCCTTC
GAACGTATCTTCAAAGGCATGTTTGGCATGACCACCGATCCAGCCGCTGTCCAGGAGCTC
GAAGGCAAGCTCGTCAGGGTCTTGGATATCTACGAGGCAATGCTCTCCAAATCTGAGTTC
CTCGCTTGTGATTGCTTCACATTGGCTGATCTCCACCACCTCCCTGTCATCCACTACTTG
ATGGGTACTGACTCCAAGACACTCTTTGAGTCTCGCCC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1F009TF 689 0 0
CTCCGACAATCACCATGGCCAGCATCAAAGTCCACGGAGTCCCCATGTCCACTGCCACCA
TGCGGGTTCTCACTGCTCTTTACGAGAAGGACCTCGACTTCGAGTTGATCCCCGTCGACA
TGAGAGCCGGTGCTCACAAGCAGGAGCCTTTCGTTTCCCTCAACCCCTTCGGTCAAATCC
CTGCTCTCCAAGACGGTGACTTAACTCTATCTGAGTCACGAGCAATCACAGAGTACATAG
CGGATGAATACAGTGAGAAAGGTGAGAAGCTTATGTGCCCAGGGTGCAAAAAAGTCAAGG
CAATCACCAAGGTCTGGCTTAACGTTGAAGGTCAACAGTTCGACCCTATCGCCTCCAAGA
TCGCCTTCGAACGTATCTTCAAAGGCATGTTTGGCATGACCACCGATCCAGCCGCTGTCC
AGGAGCTCGAAGGCAAGCTCGTCAGGGTCTTGGATATCTACGAGGCAAGGCTCTCCAAAT
CTGAGTTCCTCGCTTGTGATTGCTTCACATTGGCTGATCTCCACCACCTCCCTGTCATCC
ACTACTTGATGGGTACTGACTCCAAGACACTCTTTGAGTCTCGCCCTAAG*TTGCCGAGT
GGGTCAAGAAGATCACTGCCAGGCCTGCTTGGGCTAAG*TCGTTGACCTTCAGAAACAGC
AATGAACGAG*CTTTTGTTTCATTT***C

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1F232TF 647 0 0
CGACAATCACCATGGCCAGCATCAAAGTCCACGGAGTCCCCATGTCCACTGCCACCATGC
GGGTTCTCGCTGCTCTTTACGAGAAGGACCTCGACTTCGAGTTGATCCCCGTCGACATGA
GAGCCG*TGCTCACAAGCAGGAGCCTTTCGTTTCCCTCAACCCCTTCGGTCAAATCCCTG
CTCTCCAAGACGGTGACTTAACTCTATTTGAGTCACGAGCAATCACAGAGTACATAGTGG
ATGAATACAGTGAGAAAGGTGAGAAGCTTATGTGCCCAGGGTGCAAAAAAGTCAAGGCAA
TCACCAAGGTCTGGCTTAACGTTGAAGGTCAACAGTTCGACCCTATCGCCTCCAAGATCG
CCTTCGAACGTATCTTCAAAGGCATGTTTGGCATGACCACCGATCCAGCCGCTGTCCAGG
AGCTCGAAGGCAAGCTCGTCAGGGTCTTGGATATCTACGAGGCAAGGCTCTCCAAATCTG
AGTTCCTCGCTTGTGATTGCTTCACATTGGCTGATCTCCACCACCTCCCTGTCATCCACT
ACTTGATGGGTACTGACTCCAAGACACTCTTTGAGTCTCGCCCTAAG*TTGCCGAGTGGG
TCAAGAAGATCACTGCCAGGCCTGCTTGGGCTAAG*TCGTTGACCTT

QA 1 647 1 647
DS 

RD RS1CB21TF 761 0 0
G
GGATCCCATTCTCATCCCAACTTAAAATTCACATCCAAATCTTCTCCTTCTCCTCCGACA
ATCACCATGGCCAGCATCAAAGTCCACGGAGTCCCCATGTCCACCGCCACCATGCGGGTT
CTCGCTGCTCTTTACGAGAAGGACCTCGACTTCGAGCTGATCCCCGTCGACATGAGAGCC
GGTGCTCACAAGCAGGAGCCTTTCGTTTCCCTCAACCCCTTCGGTCAAATCCCTGCTCTC
CAAGACGGTGACTTAACTCTATTTGAGTCAT*AGCCATCACAGAGTACATAGCGGATGAA
TACAGTGAGAAAGGTGAGAAGCTTATGTGCCCAGGGTGCAACAAAGTCAAGGCAATCACC
AAGGTCTGGCTTAATGTTGAAGGTCAACAGTTTGACCCTATCGCCTCCAAGATCGCCTTC
GAGCGTATCTTCAAAGGCATGTTTGGCATGACCACCGATCCAGCCGCTGTCCAAGAGCTC
GAAGGCAAGCTCGTCAGGGTCTTGGATATCTACGAGGCAAGGCTCTCCAAATCTGAGTTC
CTCGCTTGTGATTGCTTCACTTTGGCTGATCTCCACCACCTCCCTGTCATCCACTACTTG
ATGGGTACTGACTCCAAGGACCTCTTTGAGTCTCGCCCTAAG*TTGCCGAGTGGGTCAAG
AAGATCACTGCCAGGCCTGCTTGGGCTAAG*TCGTTGACCTCCAGAAGCAGTGATGAACG
AGGCTTTTGTTTCATTT***AAATAAA*TGATTGTACCTC

QA 2 761 2 761
DS 

RD RS1CB21JQ 826 0 0
TCTCTTCT
CTCCGACAATCACCATGGCCAGCATCAAAGTCCACGGAGTCCCCATGTCCACCGCCACCA
TGCGGGTTCTCGCTGCTCTTTACGAGAAGGACCTCGACTTCGAGCTGATCCCCGTCGACA
TGAGAGCCGGTGCTCACAAGCAGGAGCCTTTCGTTTCCCTCAACCCCTTCGGTCAAATCC
CTGCTCTCCAAGACGGTGACTTAACTCTATTTGAGTCAT*AGCCATCACAGAGTACATAG
CGGATGAATACAGTGAGAAAGGTGAGAAGCTTATGTGCCCAGGGTGCAACAAAGTCAAGG
CAATCACCAAGGTCTGGCTTAATGTTGAAGGTCAACAGTTTGACCCTATCGCCTCCAAGA
TCGCCTTCGAGCGTATCTTCAAAGGCATGTTTGGCATGACCACCGATCCAGCCGCTGTCC
AAGAGCTCGAAGGCAAGCTCGTCAGGGTCTTGGATATCTACGAGGCAAGGCTCTCCAAAT
CTGAGTTCCTCGCTTGTGATTGCTTCACTTTGGCTGATCTCCACCACCTCCCTGTCATCC
ACTACTTGATGGGTACTGACTCCAAGGACCTCTTTGAGTCTCGCCCTAAGGTTGCCGAGT
GGGTCAAGAAGATCACTGCCAGGCCTGCTTGGGCTAAGGTCGTTGACCTCCAGAAGCAGT
GATGAACGAGGCTTTTGTTTCATTT***AAATAAAATGATTGTACCTCTGTGTGTTTTGT
GCTAGTATTGTAATCTTCTTTTCACTTTCTTACCCTTT*TCCTCTGTTTGTGTGTTTGTT
GGGTCGTCGTTTATGTGCAATAAAACAACATTCTGATT

QA 9 826 9 826
DS 

RD RS1FC28JQ 758 0 0
CCATGCGGGTTCTCGCTGCTCTTTACGAGAAGGACCTCGACTTCGAGCTGATCCCCGTCG
ACATGAGAGCCGGTGCTCACAAGCAGGAGCCTTTCGTTTCCCTCAACCCCTTCGGTCAAA
TCCCTGCTCTCCAAGACGGTGACTTAACTCTATTTGAGTCACGAGCCATCACAGAGTACA
TAGCGGATGAATACAGTGAGAAAGGTGAGAAGCTTATGTGCCCAGGGTGCAACAAAGTCA
AGGCAATCACCAAGGTCTGGCTTAATGTTGAAGGTCAACAGTTTGACCCTATCGCCTCCA
AGATCGCCTTCGAGCGTATTTTCAAAGGCATGTTTGGCATGACCACCGATCCAGCCGCTG
TCCAAGAGCTCGAAGGCAAGCTCGTCAGGGTCTTGGATATTTACGAGGCAAGGCTCTCCA
AATTTGAGTTCCTCGCTTGTGATTGCTTCACTTTGGCTGATCTCCACCACCTCCCTGTCA
TCCACTACTTGATGGGTACTGACTCCAAGGACCTCTTTGAGTCTCGCCCTAAGGTTGCCG
AGTGGGTCAGGAAGATCACTGCCAGGCCTGCTTGGGCTAAGGTCGTTGACCTCCAGAAGC
AGTGATGAACGAGGCTTTTGTTTCATTT***AAATAAAATGATTGTACCTCTGTGTGTTT
TGTGCTAGTATTGTAATCTTCTTTTCACTTTCTTACCCTTT*TCCTCTGTTTGTGTGTTT
GTTGGGTCGTCGTTTATGTGCAATAAAACAACATT
TTG

QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1GK58JQ 816 0 0
GACAATCACCATGGCCAGCATCAAAGTCCACGGAGTCCCCATGTCCACCGCCACCATGCG
GGTTCTCGCTGCTCTTTACGAGAAGGACCTCGACTTCGAGCTGATCCCCGTCGACATGAG
AGCCGGTGCTCACAAGCAGGAGCCTTTCGTTTCCCTCAACCCCTTCGGTCAAATCCCTGC
TCTCCAAGACGGTGACTTAACTCTATTTGAGTCACGAGCAATCACAGAGTACATAGCGGA
TGAATACAGTGAGAAAGGTGAGAAGCTTATGTGCCCAGGGTGCAACAAAGTCAAGGCAAT
CACCAAGGTCTGGATTAATGTTGAAGGTCAACAGTTTGACCCTATCGCCTCCAAGATCGC
CTTCGAGCGTATCTTCAAAGGCATGTTTGGCATGACCACCGATCCAGCCGCTGTCCAGGA
GCTAGAAGGCAAGCTCGTCAGGGTCTTGGATATCTACGAGGCAAGGCTCTCCAAATCTGA
GTTCCTCGCC*GTGATTGCTTCACTTTGGCTGATCTCCACCACCTCCCTGTCATCCACTA
CTTGATGGGTACCGACTCCAAGGAACTCTTTGAGTCTCGCCCTAAGGTTGCCGAGTGGGT
CAAGAAGATCACTGCCAGGCCTGCTTGGGCTAAGGTCTTTGACCTCCAGAAGCAGTGATG
AACGAGGCTTTTGTTTAATTTCTCAAATAAAATGATTGTACCTCTGTGTGTTTTGTGTTA
GTATTGTAATCTTCTTTTCAGTTTCTTACCTTTTCTCCTCTGTTTGTGTGTTTGTTGGGT
CGTCGTTTATGTGCAATAAAACAACATTCTGATTGT

QA 1 816 1 816
DS 

RD RS1EB53JQ 702 0 0
GACATGAGAGCCGGTGCTCACAAGCAGGAGCCTTTCGTTTCCCTCAACCCCTTCGGTCAA
ATCCCTGCTCTCCAAGACGGTGACTTAACTCTATTTGAGTCACGAGCAATCACAGAGTAC
ATAGCGGATGAATACAGTGAGAAAGGTGAGAAGCTTATGTGCCCAGGGTGCAACAAAGTC
AAGGCAATCACCAGGGTCTGGATTAATGTTGAAGGTCAACAGTTTGACCCTATCGCCTCC
AAGATCGCCTTCGAGCGTATCTTCAAAGGCATGTTTGGCATGACCACCGATCCAGCCGCT
GTCCAGGAGCTAGAAGGCAAGCTCGTCAGGGTCTTGGAT**TTACGAGGCAAGGCTCTCC
AAATCTGAGTTCCTCGCTTGTGATTGCTTCACTTTGGCTGATCTCCACCACCTCCCTGTC
ATCCACTACTTGATGGGTACCGACTCCAAGGAACTCTTTGAGTCTCGCCCTAAGGTTGCC
GAGTGGGTCAAGAAGATCACTGCCAGGCCTGCTTGGGCTAAGGTCGTTGACCCCCAGAAG
CAGTGATGAACGAGGCTTTTGTTTAATTTCTCAAATAAAATGATTGTACCTCTGTGTGTT
TTGTGTTAGTATTGTAATCTTCTTTTCAGTTTCTTACCTTTTCTCCTCTGTTTGTGTGTT
TGTTGGGTCGTCGTTTATGTGCAATAAAACAACATTCTGATT

QA 1 702 1 702
DS 



CO CL43Contig2 749 3 4 U
GGGTATAATCAGAATGTTGTTTTATTGCACATAAACGACGACCCAACAAACACAGAAACA
GAGAGGAAAAGGGTAAGAAAGTGAAAAGAAGATTACAATACTAACACAAAACACAGAGAG
GTACAATCATTTTATTTGAGAAATGAAACAAAAGCCTCGTTCATTACTGTTTCTGAAGGT
CAACGACCTTAGCCCAAGCAGGCCTGGCAGTGATCTTCTTGACCCACTCGGCAACCTTAG
GGCGAGACTCAAAGAGTGTCTTGGAGTCAGTACCCATCAAGTAGTGGATGACAGGGAGGT
GGTGGAGATCAGCCAATGTGAAGCAATCACAAGCGAGGAACTCAGATTTGGAGAGCCTTG
CCTCGTAGATATCCAAGACCCTGACGAGCTTGCCTTCGAGCTCCTGGACAGCGGCTGGAT
CGGTGGTCATGCCAAACATGCCTTTGAAGATACGTTCGAAGGCGATCTTGGAGGCGATAG
GGTCGAACTGTTGACCTTCAACGTTAAGCCAGACCTTGGTGATTGCCTTGACTTTTTTGC
ACCCTGGGCACATAAGCTTCTCACCTTTCTCACTGTATTCATCCACTATGTACTCTGTGA
TTGCTCGTGACTCAAATAGAGTTAAGTCACCGTCTTGGAGAGCAGGGATTTGACCGAAGG
GGTTGAGGGAAACGAAAGGCTCCTGCTTGTGAGCACCGGCTCTCATGTCGACGGGGATCA
ACTCGAAGTCGAGGTCCTTCTCGTAAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E901TF C 9
AF RS1F232JQ U 1
AF RS1B276JQ U 7
BS 1 367 RS1F232JQ
BS 368 368 RS1B276JQ
BS 369 624 RS1F232JQ
BS 625 749 RS1B276JQ

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AAGGGTAAGAAAGTGAAAAGAAGATTACAATACTAACACAAAACACAGAGAGGTACAATC
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TTAGCCCAAGCAGGCCTGGCAGTGATCTTCTTGACCCACTCGGCAACCTTAGGGCGAGAC
TCAAAGAGTGTCTTGGAGTCAGTACCCATCAAGTAGTGGATGACAGGGAGGTGGTGGAGA
TCAGCCAATGTGAAGCAATCACAAGCGAGGAACTCAGATTTGGAGAGCCTTGCCTCGTAG
ATATCCAAGACCCTGACGAGCTTGCCTTCGAGCTCCTGGACAGCGGCTGGATCGGTGGTC
ATGCCAAACATGCCTTTGAAGATACGTTCGAAGGCGATCTTGGAGGCGATAGGGTCGAAC
TGTTGACCTTCAACGTTAAGCCAGACCTTGGTGATTGCC

QA 1 519 1 519
DS 

RD RS1F232JQ 624 0 0
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GAGAGGAAAAGGGTAAGAAAGTGAAAAGAAGATTACAATACTAACACAAAACACAGAGAG
GTACAATCATTTTATTTGAGAAATGAAACAAAAGCCTCGTTCATTACTGTTTCTGAAGGT
CAACGACCTTAGCCCAAGCAGGCCTGGCAGTGATCTTCTTGACCCACTCGGCAACCTTAG
GGCGAGACTCAAAGAGTGTCTTGGAGTCAGTACCCATCAAGTAGTGGATGACAGGGAGGT
GGTGGAGATCAGCCAATGTGAAGCAATCACAAGCGAGGAACTCAGATTTGGAGAGCCTTG
CCTCGTAAATATCCAAGACCCTGACGAGCTTGCCTTCGAGCTCCTGGACAGCGGCTGGAT
CGGTGGTCATGCCAAACATGCCTTTGAAGATACGTTCGAAGGCGATCTTGGAGGCGATAG
GGTCGAACTGTTGACCTTCAACGTTAAGCCAGACCTTGGTGATTGCCTTGACTTTTTTGC
ACCCTGGGCACATAAGCTTCTCACCTTTCTCACTGTATTCATCCACTATGTACTCTGTGA
TTGCTCGTGACTCAAATAGAGTTA

QA 1 624 1 624
DS 

RD RS1B276JQ 743 0 0
AATCAGAATGTTGTTTTATTGCACATAAACGACGACCCAACAAACACAGAAACAGAGAGG
AAAAGGGTAAGAAAGTGAAAAGAAGATTACAATACTAACACAAAACACAGAGAGGTACAA
TCATTTTATTTGAGAAATGAAACAAAAGCCTCGTTCATTACTGTTTCTGAAGGTCAACGA
CCTTAGCCCAAGCAGGCCTGGCAGTGATCTTCTTGACCCACTCGGCAACCTTAGGGCGAG
ACTCAAAGAGTGTCTTGGAGTCAGTACCCATCAAGTAGTGGATGACAGGGAGGTGGTGGA
GATCAGCCAATGTGAAGCAATCACAAGCGAGGAACTCAGATTTGGAGAGCATTGCCTCGT
AGATATCCAAGACCCTGACGAGCTTGCCTTCGAGCTCCTGGACAGCGGCTGGATCGGTGG
TCATGCCAAACATGCCTTTGAAGATACGTTCGAAGGCGATCTTGGAGGCGATAGGGTCGA
ACTGTTGACCTTCAACGTTAAGCCAGACCTTGGTGATTGCCTTGACTTTTTTGCACCCTG
GGCACATAAGCTTCTCACCTTTCTCACTGTATTCATCCGCTATGTACTCTGTGATTGCTC
GTGACTCAAATAGAGTTAAGTCACCGTCTTGGAGAGCAGGGATTTGACCGAAGGGGTTGA
GGGAAACGAAAGGCTCCTGCTTGTGAGCACCGGCTCTCATGTCGACGGGGATCAACTCGA
AGTCGAGGTCCTTCTCGTAAAGA

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 17

CO CL44Contig1 902 17 7 U
GGTATCTTTTGCTTCGGGTGGTGCTGGCTACCTTCCTCAAACATCTGAATCATGGAAAGT
ATTAACAATGTTGGACCAGTTGAGATATTTCCAAGACTACAAGAAAAGAATGAAGAAGCT
AGTAGGAAAAAAGAAGACTAAACATATAGTGAGCAAAGGAGCAGCCATTGTGGTCGCAGG
AAGCAATGATCTAGTTTATACATATTTTGGAAGTCGTGCTCAACGTCTCAGAAATGACGT
CGACTCTTTTACCACCATGATGGCTGATTCTGCTGCCAGTTTCGTTTTGCAACTGTATGG
ATTTGGAACAAGACGTATAGGAGTGGTCGGAACACCACCACTTGGATGTACACCTTCACA
GAGAGTTAAAAGGAAAAAAAAA*TGTAATGAAGATCTAAATTATGCTGCTCAGCTTTTCA
ATGCTAAGCTCTCAATTAGTTTGGGTCAACTGTCCAGAACCCTACCAAATTCTACAATTG
TTTACGGAGACATCTACTCTATCTTCAGTAAGATGCTAGAAAGCCCTGAAGACTATGGGT
TTGAGGAGATAAAGAAACCGTGTTGCAAAACAGGATTGCTGAAAGGAGGTGTATTCTGCA
AAAAGAGGACATCAAAAATATGTCCCAATACATCTTCTTATCTGTTTTGGGACGGTATCC
ATCCCAGTCAGAGAGCTTATGAAATATCAAACAGAAAACTTGTAAAGAAATACCTCCATT
TTATCTGATTAATAAGTATCTTTATTAGTATATTATTGGTAATCTTTTTATCTTACGAAA
AGGAAA*CTTTTGCAATATTAATAATGTAGGCATGATCAATTTCTTCCACAAATAATGTA
AACAAGATCTGAGATAGTCATGTAAACTTTTGGTTTTTGTAAACAAATTCCTCAACGATC
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 60 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 50 55 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 40 85 85 85 85 85 85 85 85 60 85 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 35 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 45 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 75 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 40 55 55 55 30 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 10 10 10 10 10 

AF RS1CF82TF U 187
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BS 1 717 RS1G020TF
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G
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TTTACCACCATGATGGCTGATTCTGCTGCCAGTTTCGTTTTGCAACTGTATGGATTTGGA
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GCTCTCAATTAGTTTGGGTCAACTGTCCAGAACCCTACCAAATTCTACAATTGTTTACGG
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GATAAAGAAACCGTGTTGCAAA
CAGATTGCTGA

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DS 

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ATTAACAATGTTGGACCAGTTGAGATATTTCCAAGACTACAAGAAAAGAATGAAGAAGCT
AGTAGGAAAAAAGAAGACTAAACATATAGTGAGCAAAGGAGCAGCCATTGTGGTCGCAGG
AAGCAATGATCTAGTTTATACATATTTTGGAAGTCGTGCTCAACGTCTCAGAAATGACGT
CGACTCTTTTACCACCATGATGGCTGATTCTGCTGCCAGTTTCGTTTTGCAACTGTATGG
ATTTGGAACAAGACGTATAGGAGTGGTCGGAACACCACCACTTGGATGTACACCTTCACA
GAGAGTTAAAAGGAAAAAAAAA*TGTAATGAAGATCTAAATTATGCTGCTCAGCTTTTCA
ATGCTAAGCTCTCAATTAGTTTGGGTCAACTGTCCAGAACCCTACCAAATTCTACAATTG
TTTACGGAGACATCTACTCTATCTTCAGTAAGATGCTAGAAAGCCCTGAAGACTATGGGT
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AAAAGAGGACATCAAAAATATGTCCCAATACATCTTCTTATCTGTTTTGGGACGGTATCC
ATCCCAGTCAGAGAGCTTATGAAATATCAAACAGAAAACTTGTAAAGAAATACCTCC

QA 1 717 1 717
DS 

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G
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CTGATTCTGCTGCCAGTTTCGTTTTGCAACTGTATGGATTTGGAACAAGACGTATAGGAG
TGGTCGGAACACCACCACTTGGATGTACACCTTCACAGAGAGTTAAAAGGAAAAAAAAA*
TGTAATGAAGATCTAAATTATGCTTCTCAGCTTTTCAATGCTAAGCTCTCAATTAGTTTG
GGTCAACTGTCCAGAACCCTACCAAATTCTACAATTGTTTACGGAGACATCTACTCTATC
TTCAGTAAGATGCTAGAAAGCCCTGAAGACTATGGGTTTGAGGAGATAAAGAAACCGTGT
TGCAAAACAGGATTGCTGAAAGGAGGTGTATTCTGCAAAAAGAGGACATCAAAAATATGT
CCCAATACATCTTCTTATCTGTTTTGGGACGGTATCCATCCCAGTCAGAGAGCTTATGAA
ATATCAAACAGAAAACTTGTAAAGAAATACCTCCATTTTATCTGATTAATAAGTATCTTT
ATTAGTAT

QA 2 549 2 549
DS 

RD RS1A921JQ 631 0 0
G
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AGCAATGATCCAGTTTATACATATTTTGGAAGTCGTGCTCAACGTTTCAGAAATGACGTC
GACTCTTTTACCACCATGATGGCTGATTCTGCTGCCAGTTTCGTTTTGCAACTGTATGGA
TTTGGAACAAGACGTATAGGAGTGGTCGGAACACCACCACTTGGATGTACACCTTCACAG
AGAGTTAAAAGGAAAAAAAAA*TGTAATGAAGATCTAAATTATGCTGCTCAGCTTTTCAA
TGCTAAGCTCTCAATTAGTTTGGGTCAACTGTCCAGAACCCTACCAAATTCTACAATTGT
TTACGGAGACATCTACTCTATCTTCAGTAAGATGCTAGAAAGCCCTGAAGACTATGGGTT
TGAGGAGATAAAGAAACCGTGTTGCAAAACAGGATTGCTGAAAGGAGGTGTATTCTGCAA
AAAGAGGACATCAAAAATATGTCCCAATACATCTTCTTATCTGTTTTGGGACGGTATCCA
TCCCAGTCAGAGAGCTTATGAAATATCAAACAGAAAACTTGTAAAGAAATACCTCCATTT
TATCTGATTAATAAGTATCTTTATTAGTA
C

QA 2 630 2 630
DS 

RD RS1A921TF 631 0 0
G
GTAGGAAAAAAGAAGACTAAACATATAGTGAGCAAAGGAGCAGCCATTGTGGTCGCAGGA
AGCAATGATCCAGTTTATACATATTTTGGAAGTCGTGCTCAACGTCTCAGAAATGACGTC
GACTCTTTTACCACCATGATGGCTGATTCTGCTGCCAGTTTCGTTTTGCAACTGTATGGA
TTTGGAACAAGACGTATAGGAGTGGTCGGAACACCACCACTTGGATGTACACCTTCACAG
AGAGTTAAAAGGAAAAAAAAA*TGTAATGAAGATCTAAATTATGCTGCTCAGCTTTTCAA
TGCTAAGCTCTCAATTAGTTTGGGTCAACTGTCCAGAACCCTACCAAATTCTACAATTGT
TTACGGAGACATCTACTCTATCTTCAGTAAGATGCTAGAAAGCCCTGAAGACTATGGGTT
TGAGGAGATAAAGAAACCGTGTTGCAAAACAGGATTGCTGAAAGGAGGTGTATTCTGCAA
AAAGAGGACATCAAAAATATGTCCCAATACATCTTCTTATCTGTTTTGGGACGGTATCCA
TCCCAGTCAGAGAGCTTATGAAATATCAAACAGAAAACTTGTAAAGAAATACCTCCATTT
TATCTGATTAATAAGTATCTTTATTAGTA
C

QA 2 630 2 630
DS 

RD RS1D331TF 701 0 0
G
GAATGAAGAAGCTAGTAGGAAAAAAGAAGACTAAACATATAGTGAGCAAAGGAGCAGCCA
TTGTGGTCGCAGGAAGCAATGATCTAGTTTATACATATTTTGGAAGTCGTGCTCAACGTC
TCAGAAATGACGTCGACTCTTTTACCACCATGATGGCTGATTCTGCTGCCAGTTTCGTTT
TGCAACTGTATGGATTTGGAACAAGACGTATAGGAGTGGTCGGAACACCACCACTTGGAT
GTACACCTTCACAGAGAGTTAAAAGGAAAAAAAAA*TGTAATGAAGATCTAAATTATGCT
GCTCAGCTTTTCAATGCTAAGCTCTCAATTAGTTTGGGTCAACTGTCCAGAACCCTACCA
AATTCTACAATTGTTTACGTAGACATCTACTCTATCTTCAGTAAGATGCTAGAAAGCCCT
GAAGACTATGGGTTTGAGGAGATAAAGAAACCGTGTTGCAAAACAGGATTGCTGAAAGGA
GGTGTATTTTGCAAAAAGAGGACATCAAAAATATGTCCCAATACATCTTCTTATCTGTTT
TGGGACGGTATCCATCCCAGTCAGAGAGCTTATGAAATATCAAACAGAAAACTTGTAAAG
AAATACCTCCATTTTATCTGATTAATAAGTATCTTTATTAGTATATTATTGGTAATCTTT
TTATCTTACGAAAAGGAAA*CTTTTGCAATATTAATAATG

QA 2 701 2 701
DS 

RD RS1BU94TF 531 0 0
TGGATTTGGAACAAGACGTATAGGAGTGGTCGGAACACCACCACTTGGATGTACACCTTC
ACAGAGAGTTAAAAGGAAAAAAAAA*TGTAATGAAGATCTAAATTATGCTGCTCAGCTTT
TCAATG*TAAGCTCTCAATTAGTTTGGGTCAACTGTCCAGAACCCTACCAAATTCTACAA
TTGTTTACGGAGACATCTACTCTATCTTCAGTAAGATGCTAGAAAGCCCTGAAGACTATG
GGTTTGAGGAGATAAAGAAACCGTGTTGCAAAACAGGATTGCTGAAAGGAGGTGTATTCT
GCAAAAAGAGGACATCAAAAATATGTCCCAATACATCTTCTTATCTGTTTTGGGACGGTA
TCCATCCCAGTCAGAGAGCTTATGAAATATCAAACAGAAAACTTGTAAAGAAATACCTCC
ATTTTATCTGATTAATAAGTATCTTTATTAGTATATTATTGGTAATCTTTTTATCTTACG
AAAAGGAAAACTTTTGCAATATTAATAATGTAGGCATGATCAATTTCTTCC

QA 1 531 1 531
DS 

RD RS1BU94JQ 324 0 0
TCAGTAAGATGCTAGAAAGCCCTGAAGACTATGGGTTTGAGGAGATAAAGAAACCGTGTT
GCAAAACAGGATTGCTGAAAGGAGGTGTATTTTGCAAAAAGAGGACATCAAAAATATGTC
CCAATACATCTTCTTATCTGTTTTGGGACGGTATCCATCCCAGTCAGAGAGCTTATGAAA
TATCAAACAGAAAACTTGTAAAGAAATACCTCCATTTTATCTGATTAATAAGTATCTTTA
TTAGTATATTATTGGTAATCTTTTTATCTTACGAAAAGGAAAACTTTTGCAATATTAATA
ATGTAGGCATGATCAATTTTTTCC

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DS 

RD RS1CY45JQ 733 0 0
G
AGGAAAAAAGAAGACTAAACATATAGTGAGCAAAGGAGCAGCCATTGTGGTCGCAGGAAG
CAATGATCTAGTTTATACATATTTTGGAAGTCGTGCTCAACGTCTCAGAAATGACGTCGA
CTCTTTTACCACCATGATGGCTGATTCTGCTGCCAGTTTCGTTTTGCAACTGTATGGATT
TGGAACAAGACGTATAGGAGTGGTCGGAACACCACCACTTGGATGTACACCTTCACAGAG
AGTTAAAAGGAAAAAAAA**TGTAATGAAGATCTAAATTATGCTGCTCAGCTTTTCAATG
CTAAGCTCTCAATTATTTTGGGTCAACTGTCCAGAACCCTACCAAATTCTACAATTGTTT
ACGGAGACATTTACTCTATCTTCAGTAAGATGCTAGAAAGCCCTGAAGACTATGGGTTTG
AGGAGATAAAGAAACCGTGTTGCAAAACAGGATTGCTGAAAGGAGGTGTATTCTGCAAAA
AGAGGACATCAAAAATATGTCCCAATACATCTTTTTATCTGTTTTGGGACGGTATCCATC
CCAGTCAGAGAGCTTATGAAATATCAAACAGAAAACTTGTAAAGAAATACCTCCATTTTA
TCTGATTAATAAGTATCTTTATTAGTATATTATTGGTAATCTTTTTATCTTACGAAAAGG
AAA*CTTTTGCAATATTAATAATGTAGGCATGATCAATTTCTTCCACAAATAATGTAAAC
AAGATTTGAGA
C

QA 2 732 2 732
DS 

RD RS1CY45TF 735 0 0
G
AGGAAAAAAGAAGACTAAACATATAGTGAGCAAAGGAGCAGCCATTGTGGTCGCAGGAAG
CAATGATCTAGTTTATACATATTTTGGAAGTCGTGCTCAACGTCTCAGAAATGACGTCGA
CTCTTTTACCACCATGATGGCTGATTCTGCTGCCAGTTTCGTTTTGCAACTGTATGGATT
TGGAACAAGACGTATAGGAGTGGTCGGAACACCACCACTTGGATGTACACCTTCACAGAG
AGTTAAAAGGAAAAAAAA**TGTAATGAAGATCTAAATTATGCTGCTCAGCTTTTCAATG
CTAAGCTCTCAATTATTTTGGGTCAACTGTCCAGAACCCTACCAAATTCTACAATTGTTT
ACGGAGACATCTACTCTATCTTCAGTAAGATGCTAGAAAGCCCTGAAGACTATGGGTTTG
AGGAGATAAAGAAACCGTGTTGCAAAACAGGATTGCTGAAAGGAGGTGTATTCTGCAAAA
AGAGGACATCAAAAATATGTCCCAATACATCTTCTTATCTGTTTTGGGACGGTATCCATC
CCAGTCAGAGAGCTTATGAAATATCAAACAGAAAACTTGTAAAGAAATACCTCCATTTTA
TCTGATTAATAAGTATCTTTATTAGTATATTATTGGTAATCTTTTTATCTTACGAAAAGG
AAA*CTTTTGCAATATTAATAATGTAGGCATGATCAATTTCTTCCACAAATAATGTAAAC
A*GATCTGAGA
CAA

QA 2 732 2 732
DS 

RD RS1G020JQ 650 0 0
TTTACCACCATGATGGCTGATTCTGCTGCCAGTTTCGTTTTGCAACTGTATGGATTTGGA
ACAAGACGTATAGGAGTGGTCGGAACACCACCACTTGGATGTACACCTTCACAGAGAGTT
AAAAGGAAAAAAAAA*TGTAATGAAGATCTAAATTATGCTGCTCAGCTTTTCAATGCTAA
GCTCTCAATTAGTTTGGGTCAACTGTCCAGAACCCTACCAAATTCTACAATTGTTTACGG
AGACATTTACTCTATTTTCAGTAAGATGCTAGAAAGCCCTGAAGACTATGGGTTTGAGGA
GATAAAGAAACCGTGTTGCAAAACAGGATTGCTGAAAGGAGGTGTATTTTGCAAAAAGAG
GACATCAAAAATATGTCCCAATACATCTTTTTATCTGTTTTGGGACGGTATCCATCCCAG
TCAGAGAGCTTATGAAATATCAAACAGAAAACTTGTAAAGAAATACCTCCATTTTATCTG
ATTAATAAGTATCTTTATTAGTATATTATTGGTAATCTTTTTATCTTACGAAAAGGAAA*
CTTTTGCAATATTAATAATGTAGGCATGATCAATTTCTTCCACAAATAATGTAAACAAGA
TCTGAGATAGTCATGTAAACTTTTGGTTTTTGTAAACAAATTCCTCAACG

QA 1 650 1 650
DS 

RD RS1DM11JQ 606 0 0
GCCAGTTTCGTTTTGCAACTGTATGGATTTGGAACAAGACGTATAGGAGTGGTCGGAACA
CCACCACTTGGATGTACACCTTCACAGAGAGTTAAAAGGAAAAAAAAA*TGTAATGAAGA
TTTAAATTATGCTTTTCAGCTTTTCAATGCTAAGCTCTCAATTAGTTTGGGTCAACTGTC
CAGAACCCTACCAAATTTTACAATTGTTTACGGAGACATTTACTCTATTTTCAGTAAGAT
GCTAGAAAGCCCTGAAGACTATGGGTTTGAGGAGATAAAGAAACCGTGTTGCAAAACAGG
ATTGCTGAAAGGAGGTGTATTTTGCAAAAAGAGGACATCAAAAATATGTCCCAATACATC
TTTTTATCTGTTTTGGGACGGTATCCATCCCAGTCAGAGAGCTTATGAAATATCAAACAG
AAAACTTGTAAAGAAATACCTCCATTTTATCTGATTAATAAGTATCTTTATTAGTATATT
ATTGGTAATCTTTTTATCTTACGAAAAGGAAAACTTTTGCAATATTAATAATGTAGGCAT
GATCAATTTTTTCCACAAATAATGTAAACAAGATTTGAGATAGTCATGTAAACTTTTGGT
TTTTGT

QA 1 606 1 606
DS 

RD RS1CF82JQ 626 0 0
CCAGTTTCGTTTTGCAACTGTATGGATTTGGAACAAGACGTATAGGAGTGGTCGGAACAC
CACCACTTGGATGTACACCTTCACAGAGAGTTAAAAGGAAAAAAAAAATGTAATGAAGAT
CTAAATTATGCTGTTCAGCTTTTCAATGCTAAGCTCTCAATTAGTTTGGGTCAACTGTCC
AGAACCCTACCAAATTCTACAATTGTTTACGGAGACATTTACTCTATCTTCAGTAAGATG
CTAGAAAGCCCTGAAGACTATGGGTTTGAGGAGATAAAGAAACCGTGTTGCAAAACAGGA
TTGCTGAAAGGAGGTGTATTCTGCAAAAAGAGGACATCAAAAATATGTCCCAATACATCT
TTTTATCTGTTTTGGGACGGTATCCATCCCAGTCAGAGAGCTTATGAAATATCAAACAGA
AAACTTGTAAAGAAATACCTCCATTTTATCTGATTAATAAGTATCTTTATTAGTATATTA
TTGGTAATCTTTTTATCTTACGAAAAGGAAA*CTTTTGCAATATTAATAATGTAGGCATG
ATCAATTTCTTCCACAAATAATGTAAACAAGATCTGAGATAGTCATGTAAACTTTTGGTT
TTTGTAAACAAATTCCTCAACG
ATCC

QA 1 622 1 622
DS 

RD RS1DZ22TF 290 0 0
G
CAAAAATATGTCCCAATACATCCTCTTATCTGTTTTGGGACGGTATCCATCCCAGTCAGA
GAGCTTATGAAATATCAAACA*AAAACTTGTAAAGAAATACCTCCATTTTATCTGATTAA
TAAGTATCTTTATTAGTATATTATTGGTAATCTTTTTATCTTACGAAAAGGAAA*CTTTT
GCAATATTAATAATGTAGGCATGATCAATTTCTTCCACAAATAATGTAAACAAGATCTGA
GATAGTCATGTAAACTTTTGGTTTTTGTAAACAAATTCCTCAACG
ATCC

QA 2 286 2 286
DS 

RD RS1BP16TF 444 0 0
GG
GTTTGGGTCAACTGTCCAGAACCCTACCAAATTCTACAATTGTTTACGGAGACATCTACT
CTATCTTCAGTAAGATGCTAGAAAGCCCTGAAGACTATGGGTTTGAGGAGATAAAGAAAC
CGTTTTGCAAAACAGGATTGCTGAAAGGAGGTGTATTCTGCAAAAAGAGGACATCAAAAA
TATGTCCCAATACATCTTCTTATCTGTTTTGGGACGGTATCCACCCCAGTCAGAGAGCTT
ATGAAATATCAAACAGAAAACTTGTAAAGAAATACCTCCATTTTATCTGATTAATAAGTA
TCTTTATTAGTATATTATTGGTAATCTTTTTATCTTACGAAAAGGAAA*CTTTTGCAATA
TTAATAATGTAGGCATGATCAATTTCTTCCACAAATAATGTAAACAAGATCTGAGATAGT
CATGTAAACTTTTGGTTTTTGT

QA 3 444 3 444
DS 

RD RS1AM59TF 498 0 0
ATTATGCTGCTCAGCTTTTCAATGCTAAGCTCTCAATTAGTTTGGGTCAACTGTCCAGAA
CCCTACCAAATTCTACAATTGTTTACGGAGACATCTACTCTATCTTCAGTAAGATGCTAG
AAAGCCCTGAAGACTATGGGTTTGAGGAGATAAAGAAACCGTGTTGCAAAACAGGATTGC
TGAAAGGAGGTGTATTCTGCAAAAAGAGGACATCAAAAATATGTCCCAATACATCTTCTT
ATCTGTTTTGGGACGGTATCCATCCCAGTCAGAGAGCTTATGAAATATCAAACAGAAAAC
TTGTAAAGAAATACCTCCATTTTATCTGATTAATAAGTATCTTTATTAGTATATTATTGG
TAATCTTTTTATCTTACGAAAAGGAAAACTTTTGCAATATTAATAATGTAGGCATGATCA
ATTTCTTCCACAAATAATGTAAACAAGATCTGAGATAGTCATGTAAACTTTTGGTTTTTG
TAAACAAATTCCTCAACG

QA 1 498 1 498
DS 

RD RS1DL21TF 512 0 0
G
AGATCTAAATTATGCTGCTCAGCTTTTCAATGCTAAGCTCTCAATTAGTTTGGGTCAACT
GTCCAGAACCCTACCAAATTCTACAATTGTTTACGGAGACATCTACTCTATCTTCAGTAA
GATGCTAGAAAGCCCTGAAGACTATGGGTTTGAGGAGATAAAGAAACCGTGTTGCAAAAC
AGGATTGCTGAAAGGAGGTGTATTCTGCAAAAAGAGGACATCAAAAATATGTCCCAATAC
ATCTTCTTATCTGTTTTGGGACGGTATCCATCCCAGTCAGAGAGCTTATGAAATATCAAA
CAGAAAACTTGTAAAGAAATACCTCCATTTTATCTGATTAATAAGTATCTTTATTAGTAT
ATTATTGGTAATCTTTTTATCTTACGAAAAGGAAA*CTTTTGCAATATTAATAATGTAGG
CATGATCAATTTCTTCCACAAATAATGTAAACAAGATCTGAGATAGTCATGTAAACTTTT
GGTTTTTGTAAACAAATTCCTTAACGATCCC

QA 2 512 2 512
DS 



AS 1 16

CO CL45Contig1 981 16 17 U
GGAGTACAAAAGAAAAAGAAAGGATAGGAAAGTACTATATTTATATGTCCATAAGTATTG
CAAAGCTTTTTTGAAGTTGAAGGCATCACAAGATGGAACCAGATATGGAGAATTTGATTC
CGTCCAAAGGAATTCTCAAGAACGAGGAACTCAAAAAGTACATCCTTGAAACAATGGCAT
ATCCAAGAGAGCATGAAGAGCTCAAGAAACTACGAGAAGCTACGGTCCAAAAGTATGGCA
ATTTAAGCGAGATGGAGGTACCGGTTGATGAGGGACACTTTCTATCGATGCTTTTAAAAA
TGATGAACGCCAAGAACACGCTAGAACTCGGTGTTTTCACGGGCTACTCGTTGCTCGCGA
CGGCCCTTGCATTGCCTGAAGATGGCCGTATTACTGCAATAGATATTGATAAAGAAGCTT
ACGAGATGGGTTTAGAGTTCATCAAGAATGCTGGTGTTGATCATAAAATCAACTTCATCC
AATCCGATGGTCTTCAGGCCTTAGACAAGTTGCTGACCGAGAATCCAAAACCGGAGTTTG
ATTTCGCATTTGTGGACGCTGATAAACCAAACTACGCTAACGCCCTCGAGAGACTAATGA
AGCTGGTGAAGGTAGGGGG*AATAATAGCTTTTGATAACACATTGTGGTTTGGGTTTGTG
GCCGAGGAAGAGGAGACTGTGCCAGTGCACATGAGGGTCAACAGAAAAGCCCTCATGGAG
TTGAACAAGCAGCTCGCTTCTGATCCTCGCATCGAGGTCTCTCAAGTCTCCATTGG*TGA
TGGTGTCACTCTCTGCAGACGCCTTGTGTGATTGAAAGAGACTCATCCAATGTTCTTGGT
TTTTTT*ACTTAAAATCAACTTTTTAAGAATATTTTTAATTCTCTCTTGTCTCTTTAATC
AAGTTCTTGTTCATTCCGTGTTGCGTTTGTGTGTGTGTG**TTGGATTATGCTAAAGAAT
AAAGATTTGTTCCTTTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 50 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 30 90 90 90 90 90 90 30 90 90 90 
90 90 90 90 75 90 60 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 60 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 50 45 35 35 

AF RS1C888TF U 83
AF RS1BO59TF U 20
AF RS1E848TF U 1
AF RS1A940TF U 24
AF RS1B187TF U 136
AF RS1EG22TF U 83
AF RS1C888JQ C 144
AF RS1A262TR C 145
AF RS1AO29JQ C 488
AF RS1AO29TFB U 488
AF RS1A262TV U 271
AF RS1EG22JQ C 229
AF RS1E848JQ C 222
AF RS1BO59JQ C 179
AF RS1B187JQ C 170
AF RS1A262JQ C 289
BS 1 71 RS1E848TF
BS 72 72 RS1BO59TF
BS 73 201 RS1E848TF
BS 202 202 RS1BO59TF
BS 203 261 RS1E848TF
BS 262 262 RS1BO59TF
BS 263 672 RS1E848TF
BS 673 673 RS1A940TF
BS 674 747 RS1E848TF
BS 748 776 RS1A940TF
BS 777 777 RS1B187TF
BS 778 807 RS1A940TF
BS 808 808 RS1B187TF
BS 809 846 RS1A940TF
BS 847 847 RS1EG22TF
BS 848 869 RS1A940TF
BS 870 981 RS1AO29TFB

RD RS1C888TF 526 0 0
GG
ATCACAAGATGGAACCAGATATGGAGAATTTGATTCCGTCCAAAGGAATTCTCAAGAACG
AGGAACTCAAAAAGTACATCCTTGAAACAATGGCATATCCAAGAGAGCATGAAGAGCTCA
AGAAACTACGAGAAGCTACGGTCCAAAAGTATGGCAATTTAAGCGAGATGGAGGTACCGG
TTGATGAGGGACACTTTCTATCGATGCTTTTAAAAATGATGAACGCCAAGAACACGCTAG
AACTCGGTGTTTTCACGGGCTACTCGTTGCTCGCGACGGCCCTTGCATTGCCTGAAGATG
GCCGTATTACTGCAATAGATATTGATAAAGAAGCTTACGAGATGGGTTTAGAGTTCATCA
AGAATGCTGGTGTTGATCATAAAATCAACTTCATCCAATCCGATGGTCTTCAGGCCTTAG
ACAAGTTGTTGACCGAGAATCCAAAACCGGAGTTTGATTTCGCATTTGTGGACGCTGATA
AACCAAACTACGCTAACGCCCTCGAGAGACTAATGAAGCTGGTG

QA 3 526 3 526
DS 

RD RS1BO59TF 643 0 0
GGGGAT
AGGAAAGTACTATATTTATATGTCCATAAGTATTGCAAAGCTTTTTTGAAGTTGAAGGCA
TCACAAGATGGAACCAGATATGGAGAATTTGATTCCGTCCAAAGGAATTCTCAAGAACGA
GGAACTCAAAAAGTACATCCTTGAAACAATGGCATATCCAAGAGAGCATGAAGAGCTCAA
GAAACTACGAGAAGCTACGGTCCAAAAGTATGGCAATTTAAGCGAGATGGAGGTACCGGT
TGATGAGGGACACTTTCTATCGATGCTTTTAAAAATGATGAACGCCAAGAACACGCTAGA
ACTCGGTGTTTTCACGGGCTACTCGTTGCTCGCGACGGCCCTTGCATTGCCTGAAGATGG
CCGTATTACTGCAATAGATATTGATAAAGAAGCTTACGAGATGGGTTTAGAGTTCATCAA
GAATGCTGGTGTTGATCATAAAATCAACTTCATCCAATCCGATGGTCTTCAGGCCTTAGA
CAAGTTGCTGACCGAGAATCCAAAACCGGAGTTTGATTTCGCATTTGTGGACGCTGATAA
ACCAAACTACGCTAACGCCCTCGAGAGACTAATGAAGCTGGTGAAGGTAGGGGG*AATAA
TAGCTTTTGATAACACATTGTGGTTTGGGTTTGTGGC

QA 7 643 7 643
DS 

RD RS1E848TF 747 0 0
GGAGTACAAAAGAAAAAGAAAGGATAGGAAAGTACTATATTTATATGTCCATAAGTATTG
CAAAGCTTTTTCGAAGTTGAAGGCATCACAAGATGGAACCAGATATGGAGAATTTGATTC
CGTCCAAAGGAATTCTCAAGAACGAGGAACTCAAAAAGTACATCCTTGAAACAATGGCAT
ATCCAAGAGAGCATGAAGAGCCCAAGAAACTACGAGAAGCTACGGTCCAAAAGTATGGCA
ATTTAAGCGAGATGGAGGTACTGGTTGATGAGGGACACTTTCTATCGATGCTTTTAAAAA
TGATGAACGCCAAGAACACGCTAGAACTCGGTGTTTTCACGGGCTACTCGTTGCTCGCGA
CGGCCCTTGCATTGCCTGAAGATGGCCGTATTACTGCAATAGATATTGATAAAGAAGCTT
ACGAGATGGGTTTAGAGTTCATCAAGAATGCTGGTGTTGATCATAAAATCAACTTCATCC
AATCCGATGGTCTTCAGGCCTTAGACAAGTTGCTGACCGAGAATCCAAAACCGGAGTTTG
ATTTCGCATTTGTGGACGCTGATAAACCAAACTACGCTAACGCCCTCGAGAGACTAATGA
AGCTGGTGAAGGTAGGGGG*AATAATAGCTTTTGATAACACATTGTGGTTTGGGTTTGTG
GCCGAGGAAGAG*AGACTGTGCCAGTGCACATGAGGGTCAACAGAAAAGCCCTCATGGAG
TTGAACAAGCAGCTCGCTTCTGATCCT

QA 1 747 1 747
DS 

RD RS1A940TF 863 0 0
GG
AGGAAAGTACTATATTTATATGTCCATAAGTATTGCAAAGCTTTTTTGAAGTTGAAGGCA
TCACAAGATGGAACCAGATATGGAGAATTTGATTCCGTCCAAAGGAATTCTCAAGAACGA
GGAACTCAAAAAGTACATCCTTGAAACAATGGCATATCCAAGAGAGCATGAAGAGCTCAA
GAAACTACGAGAAGCTACGGTCCAAAAGTATGGCAATTTAAGCGAGATGGAGGTACCGGT
TGATGAGGGACACTTTCTATCGATGCTTTTAAAAATGATGAACGCCAAGAACACGCTAGA
ACTCGGTGTTTTCACGGGCTACTCGTTGCTCGCGACGGCCCTTGCATTGCCTGAAGATGG
CCGTATTACTGCAATAGATATTGATAAAGAAGCTTACGAGATGGGTTTAGAGTTCATCAA
GAATGCTGGTGTTGATCATAAAATCAACTTCATCCAATCCGATGGTCTTCAGGCCTTAGA
CAAGTTGCTGACCGAGAATCCAAAACCGGAGTTTGATTTCGCATTTGTGGACGCTGATAA
ACCAAACTACGCTAACGCCCTCGAGAGACTAATGAAGCTGGTGAAGGTAGGGGGGAATAA
TAGCTTTTGATAACACATTGTGGTTTGGGTTTGTGGCCGAGGAAGAGGAGACTGTGCCAG
TGCACATGAGGGTCAACAGAAAAGCCCTCATGGAGTTGAACAAGCAGCTCGCTTCTGATC
CTCGCATCGAGGTCTCTCAAGTCTCCATTGGGTGATGGTGTCACTCTCTGCAGACGCCTT
GTTTGATTGAAAGAGACTCATCCAATGTTCTTGGTTTTTTTTACTTAAAATCAACTTTTT
AAGA
TATTTTAATCTCTCTGT

QA 3 846 3 846
DS 

RD RS1B187TF 715 0 0
G
CAAGAACGAGGAACTCAAAAAGTACATCCTTGAAACAATGGCATATCCAAGAGAGCATGA
AGAGCTCAAGAAACTACGAGAAGCTACGGTCCAAAAGTATGGCAATTTAAGCGAGATGGA
GGTACCGGTTGATGAGGGACACTTTCTATCGATGCTTTTAAAAATGATGAACGCCAAGAA
CACGCTAGAACTCGGTGTTTTCACGGGCTACTCGTTGCTCGCGACGGCCCTTGCATTGCC
TGAAGATGGCCGTATTACTGCAATAGATATTGATAAAGAAGCTTACGAGATGGGTTTAGA
GTTCATCAAGAATGCTGGTGTTGATCATAAAATCAACTTCATCCAATCCGATGGTCTTCA
GGCCTTAGACAAGTTGCTGACCGAGAATCCAAATCCGGAGCTTGATTTCGCATTTGTGGA
CGCTGATAAACCAAACTACGCTAACGCCCTCGAGAGACTAATGAAGCTGGTGAAGGTAGG
GGG*AATAATAGCTTTTGATAACACATTGTGGTTTGGGTTTGTGGCCGAGGAAGAGGAGA
CTGTGCCAGTGCACATGAGGGTCAACAGAAAAGCCCTCATGGAGTTGAACAAGCAGCTCG
CTTCTGATCCTCGCATCGAGGTCTCTCAAGTCTCCATTGG*TGATGGTGTCACTCTCTGC
AGACGCCTTGTGTGATTGAAAGAGACTCATCCAATGTTCTTGGTTTTTT
ACTTA

QA 2 710 2 710
DS 

RD RS1EG22TF 783 0 0
GG
ATCACAAGATGGAACCAGATATGGAGAATTTGATTCCGTCCAAAGGAATTCTCAAGAACG
AGGAACTCAAAAAGTACATCCTTGAAACAATGGCATATCCAAGAGAGCATGAAGAGCTCA
AGAAACTACGAGAAGCTACGGTCCAAAAGTATGGCAATTTAAGCGAGATGGAGGTACCGG
TTGATGAGGGACACTTTCTATCGATGCTTTTAAAAATGATGAACGCCAAGAACACGCTAG
AACTCGGTGTTTTCACGGGCTACTCGTTGCTCGCGACGGCCCTTGCATTGCCTGAAGATG
GCCGTATTACTTCAATAGATATTGATAAAGAAGCTTACGAGATGGGTTTAGAGTTCATCA
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ATAGCTTTTGATAACACATTGTGGTTTGGGTTTGTGGCCGAGGAAGAGGAGACTGTGCCA
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CCTCGCATCGAGGTCTCTCAAGTCTCCATTGG*TGATGGTGTCACTCTCTGCAGACGCCT
TGTGTGATTGAAAGAGACTCATCCAATGTTCTTGGTTTTTT**ACTTAAAATCAACTTTT
T

QA 3 783 3 783
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AAGAAACTACGAGAAGCTACG*TCCAAAAGTATGGCAATTTAAGCGAGATGGAGGTACCG
GTTGATGAGGGACACTTTCTATCGATGCTTTTAAAAATGATGAACGCCAAGAACACGCTA
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TTAAGAATATTTTTAATTCTCTCTTGTCTCTTTAATCAAGTTCTTGTTCATTCCGTGTTG
CGTTTGTGTGTGTGTG**TTGGATTATGCTAAAGAATAAAGATTTGTTCCTTTT

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DS 

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AGAAACTACGAGAAGCTACGGTCCAAAAGTATGGCAATTTAAGCGAGATGGAGGTACCGG
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GCCGTATTACTGCAATAGATATTGATAAAGAAGCTTACGAGATGGGTTTAGAGTTCATCA
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ACAAGTTGCTGACCGAGAATCCAAATCCGGAGCTTGATTTCGCATTTGTGGACGCTGATA
AACCAAACTACGCTAACGCCCTCGAGAGACTAATGAAGCTGGTGAAGGTAGGGGG*AATA
ATAGCTTTTGATAACACATTGTGGTTTGGGTTTGTGGCCGAGGAAGAGGAGACTGTGCCA
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CCTCGCATCGAGGTCTCTCAAGTCTCCATTGG*TGATGGTGTCACTCTCTGCAGACGCCT
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TAAGAATATTTTTAATTCTCTCTTGTCTCTTTAATCAAGTTCTTGTTCATTCCGTGTTGC
GTTTGTGTGTGTGTGTGTTGGATTATGCTAAAGAATAAAGATTTGTTCCTTTTTTCC

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G
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TTTGTGGACGCTGATAAACCAAACTACGCTAACGCCCTCGAGAGACTAATGAAGCTGGTG
AAGGTAGGGGG*AATAATAGCTTTTGATAACACATTGTGGTTTGGGTTTGTGGCCGAGGA
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GTTCATTCCGTGTTGCGTTTGTGTGTGTGTG**TTGGATTATGCTAAAGAATAAAGATTT
GTTCCTTTTTTCC

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DS 

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G
GGTCTTCAGGCCTTAGACAAGTTGCTGACCGAGAATCCAAAACCGGAGTTTGATTTCGCA
TTTGTGGACGCTGATAAACCAAACTACGCTAACGCCCTCGAGAGACTAATGAAGCTGGTG
AAGGTAGGGGG*AATAATAGCTTTTGATAACACATTGTGGTTTGGGTTTGTGGCCGAGGA
AGAGGAGACTGTGCCAGTGCACATGAGGGTCAACAGAAAAGCCCTCATGGAGTTGAACAA
GCAGCTCGCTTCTGATCCTCGCATCGAGGTCTCTCAAGTCTCCATTGG*TGATGGTGTCA
CTCTCTGCAGACGCCTTGTGTGATTGAAAGAGACTCATCCAATGTTCTTGGTTTTTTT*A
CTTAAAATCAACTTTTTAAGAATATTTTTAATTCTCTCTTGTCTCTTTAATCAAGTTCTT
GTTCATTCCGTGTTGCGTTTGTGTGTGTGTG**TTGGATTATGCTAAAGAATAAAGATTT
GTTCCTTTTTTCC

QA 2 494 2 494
DS 

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GTGTTTTCACGGGCTACTCGTTGCTCGCGACGGCCCTTGCATTGCCTGAAGATGGCCGTA
TTACTGCAATAGATATTGATAAAGAAGCTTACGAGATGGGTTTAGAGTTCATCAAGAATG
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TTTGATAACACATTGTGGTTTGGGTTTGTGGCCGAGGAAGAGGAGACTGTGCCAGTGCAC
ATGAGGGTCAACAGAAAAGCCCTCATGGAGTTGAACAAGCAGCTCGCTTCTGATCCTCGC
ATCGAGGTCTCTCAAGTCTCCATTGG*TGATGGTGTCACTCTCTGCAGACGCCTTGTGTG
ATTGAAAGAGACTCATCCAATGTTCTTGGTTTTTTT*ACTTAAAATCAACTTTTTAAGAA
TATTTTTAATTCTCTCTTGTCTCTTTAATCAAGTTCTTGTTCATTCCGTGTTGCGTTTGT
GTGTGTGTGTGTTGGATTATGCTAAAGAATAAAGATTTGTTCCTTTTT

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DS 

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CGTTGCTCGCGACGGCCCTTGCATTGCCTGAAGATGGCCGTATTACTTCAATAGATATTG
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AACCGGAGTTTGATTTTGTATTTGTGGACGCTGATAAACCAAACTACGCTAACGCCCTCG
AGAGACTAATGAAGCTGGTAAAGGTAGGGGG*AATAATAGCTTTTGATAACACATTGTGG
TTTGGGTTTGTGGCCGAGGAAGAGGAGACTGTGCCAGTGCACATGAGGGTCAACAGAAAA
GCCCTCATGGAGTTGAACAAGCAGCTCGCTTTTGATCCTCGCATCGAGGTCTCTCAAGTC
TCCATTGG*TGATGGTGTCACTCTCTGCAGACGCCTTGTGTGATTGAAAGAGACTCATCC
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GTCTCTTTAATCAAGTTTTTGTTCATTCCGTGTTGCGTTTGTGTGTGTGT****TGGATT
ATGCTAAAGAATAAAGATTTGTTCCTTTTTT
G

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DS 

RD RS1E848JQ 761 0 0
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CTATCGATGCTTTTAAAAATGATGAACGCCAAGAACACGCTAGAACTCGGTGTTTTCACG
GGCTACTCGTTGCTCGCGACGGCCCTTGCATTGCCTGAAGATGGCCGTATTACTGCAATA
GATATTGATAAAGAAGCTTACGAGATGGGTTTAGAGTTCATCAAGAATGCTGGTGTTGAT
CATAAAATCAACTTCATCCAATCCGATGGTCTTCAGGCCTTAGACAAGTTGCTGACCGAG
AATCCAAAACCGGAGTTTGATTTCGCATTTGTGGACGCTGATAAACCAAACTACGCTAAC
GCCCTCGAGAGACTAATGAAGCTGGTGAAGGTAGGGGG*AATAATAGCTTTTGATAACAC
ATTGTGGTTTGGGTTTGTGGCCGAGGAAGAGGAGACTGTGCCAGTGCACATGAGGGTCAA
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TCAAGTCTCCATTGG*TGATGGTGTCACTCTCTGCAGACGCCTTGTGTGATTGAAAGAGA
CTCATCCAATGTTCTTGGTTTTTTT*ACTTAAAATCAACTTTTTAAGAATATTTTTAATT
CTCTCTTGTCTCTTTAATCAAGTTCTTGTTCATTCCGTGTTGCGTTTGTGTGTGTGTG**
TTGGATTATGCTAAAGAATAAAGATTTGTTCCTTTTTT
TCG

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1BO59JQ 795 0 0
ATATCCAAGAGAGCATGAAGAGCTCAAGAAACTACGAGAAGCTACGGTCCAAAAGTATGG
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AATGATGAACGCCAAGAACACGCTAGAACTCGGTGTTTTCACGGGCTACTCGTTGCTCGC
GACGGCCCTTGCATTGCCTGAAGATGGCCGTATTACTGCAATAGATATTGATAAAGAAGC
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TGATTTCGCATTTGTGGACGCTGATAAACCAAACTACGCTAACGCCCTCGAGAGACTAAT
GAAGCTGGTGAAGGTAGGGGG*AATAATAGCTTTTGATAACACATTGTGGTTTGGGTTTG
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AGTTGAACAAGCAGCTCGCTTCTGATCCTCGCATCGAGGTCTCTCAAGTCTCCATTGG*T
GATGGTGTCACTCTCTGCAGACGCCTTGTGTGATTGAAAGAGACTCATCCAATGTTCTTG
GTTTTTTT*ACTTAAAATCAACTTTTTAAGAATATTTTTAATTCTCTCTTGTCTCTTTAA
TCAAGTTCTTGTTCATTCCGTGTTGCGTTTGTGTGTGTGT****TGGATTATGCTAAAGA
ATAAAGATTTGTTCC

QA 1 795 1 795
DS 

RD RS1B187JQ 812 0 0
AAACAAT
GCATATCCAAGAGAGCATGAAGAGCTCAAGAAACTACGAGAAGCTACGGTCCAAAAGTAT
GGCAATTTAAGCGAGATGGAGGTACCGGTTGATGAGGGACACTTTCTATCGATGCTTTTA
AAAATGATGAACGCCAAGAACACGCTAGAACTCGGTGTTTTCACGGGCTACTCGTTGCTC
GCGACGGCCCTTGCATTGCCTGAAGATGGCCGTATTACTGCAATAGATATTGATAAAGAA
GCTTACGAGATGGGTTTAGAGTTCATCAAGAATGCTGGTGTTGATCATAAAATCAACTTC
ATCCAATCCGATGGTCTTCAGGCCTTAGACAAGTTGCTGACCGAGAATCCAAATCCGGAG
CTTGATTTCGCATTTGTGGACGCTGATAAACCAAACTACGCTAACGCCCTCGAGAGACTA
ATGAAGCTGGTGAAGGTAGGGGG*AATAATAGCTTTTGATAACACATTGTGGTTTGGGTT
TGTGGCCGAGGAAGAGGAGACTGTGCCAGTGCACATGAGGGTCAACAGAAAAGCCCTCAT
GGAGTTGAACAAGCAGCTCGCTTCTGATCCTCGCATCGAGGTCTCTCAAGTCTCCATTGG
*TGATGGTGTCACTCTCTGCAGACGCCTTGTGTGATTGAAAGAGACTCATCCAATGTTCT
TGGTTTTTTT*ACTTAAAATCAACTTTTTAAGAATATTTTTAATTCTCTCTTGTCTCTTT
AATCAAGTTCTTGTTCATTCCGTGTTGCGTTTGTGTGTGTGTGTGTTGGATTATGCTAAA
GAATAAAGATTTGTTCCTTTTTTCC

QA 8 812 8 812
DS 

RD RS1A262JQ 693 0 0
TGCTTTTAAAAATGATGAACGCCAAGAACACGCTAGAACTCGGTGTTTTCACGGGCTACT
CGTTGCTCGCGACGGCCCTTGCATTGCCTGAAGATGGCCGTATTACTGCAATAGATATTG
ATAAAGAAGCTTACGAGATGGGTTTAGAGTTCATCAAGAATGCTGGTGTTGATCATAAAA
TCAACTTCATCCAATCCGATGGTCTTCAGGCCTTAGACAAGTTGCTGACCGAGAATCCAA
ATCCGGAGCTTGATTTCGCATTTGTGGACGCTGATAAACCAAACTACGCTAACGCCCTCG
AGAGACTAATGAAGCTGGTGAAGGTAGGGGG*AATAATAGCTTTTGATAACACATTGTGG
TTTGGGTTTGTGGCCGAGGAAGAGGAGACTGTGCCAGTGCACATGAGGGTCAACAGAAAA
GCCCTCATGGAGTTGAACAAGCAGCTCGCTTCTGATCCTCGCATCGAGGTCTCTCAAGTC
TCCATTGG*TGATGGTGTCACTCTCTGCAGACGCCTTGTGTGATTGAAAGAGACTCATCC
AATGTTCTTGGTTTTTTT*ACTTAAAATCAACTTTTTAAGAATATTTTTAATTCTCTCTT
GTCTCTTTAATCAAGTTCTTGTTCATTCCGTGTTGCGTTTGTGTGTGTGTGTGTTGGATT
ATGCTAAAGAATAAAGATTTGTTCCTTTTTTCC

QA 1 693 1 693
DS 



AS 3 17

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AGAAAATGGCGTTGATCGTAGAGAAGACGTCGAGTGGGCGCGAGTACAAGGTCAAGGACA
TGTCTCAGGCGGACTTCGGTCGTCTGGAGCTCGAACTCGCGGAGGTGGAGATGCCCGGAC
TCATGGCCTGCCGTACGGAGTTCGGCCCATCTCAGCCCTTCAAAGGCGCGAGAATCACCG
GATCTCTCCACATGACGATCCAAACCGCCGTGCTCATCGAAACCCTAACGGCCCTGGGTG
CGGAAGTGAGATGGTGCTCGTGCAACATCTTCTCGACCCAAGACCACGCCGCGGCCGCGA
TCGCTCGCGACTCCGCCGCCGTGTTCGCGTAGAAAGGAGAGACGCTTCAGGAGTACTGGT
GGTGCACGGAGCGTGCTCTGGACTGGGGTCCAGGCGGTGGTCCGGATCTGATCGTGGACG
ACGGTGGTGACGCGACGCTTTTGATCCACGAGGGAGTCAAGGCAGAGGAGATCTTTGAGA
AGACGGGTCAGGTTCCGGATCCGAGTTCCACTGATAACCCTGAGTTCCAGATCGTGCTTT
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TCGTTGGTGTCTCTGAGGAGACCACCACTGGTGTCAAGAGGCTTTACCAGATGCAGGAGA
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ACAACTTGTACGGATGCCGTCACTCCCTACCAGATGGTCTCATGAGGGCCACCGATGTCA
TGATCGCCGGAAAGGTTGTCGTTGTTTGCGGATATGGTGATGTCGGAAAGGGTTGTGCCG
CTGCCATGAAGACCGCTGGGGCCAGAGTCATTGTCACCGAGATCGATCCCATCTGTGCTT
TACAAGCTATGATGGAAGGACTTCAAGTTCTCACCCTTGAGGATGTCGTCTCCGAAGCCG
ACATCTTTGTCACCACCACCGGTAACAAAGACATCATCATGGTTGACCACATGAGGAAGA
TGAAGAACAACGCCATCGTCTGCAACATTGGTCACTTTGACAACGAGATTGACATGCTTG
GTCTCGAGACCTTCCCTGGTGTCAAGCGTATCACCATCAAGCCCCAGACCGACAGGTGGG
TCTTCCCTGACACCAAGTCCGGAATCATTGTTCTCGCTGAGGGTCGTCTCATGAACTTGG
GTTGTGCCACTGGTCACCCGAGTTTCGTCATGTCTTGCTCTTTCACCAACCAGGTGATCG
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AAGGTTGTTGCTTGTTGTTCTTCTTTCTCTTGAAACTTAATTTAGCTTTTGGTTGTCAGT
TCCTTCCCGATTTGTTTTTGTGTTTTGATCACCGTTGTACTCTTTAAACGAAAAATGGTA
AAAGAGGAAACTATTTTCCTCACCAATTTTAGAGCTTTCTTTATCTTTTCACCTTTATTA
TGTTCTTTGTTTCATTGAATGTGATGTGAAGCTCTCATTTCAAATGTGGGCATTGCTATT
TACGGTAGTTATGTTTTAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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TCATGGCCTGCCGTACGGAGTTCGGCCCATCTCAGCCCTTCAAAGGCGCGAGAATCACCG
GATCTCTCCACATGACGATCCAAACCGCCGTGCTCATCGAAACCCTAACGGCCCTGGGTG
CGGAAGTGAGATGGTGCTCGTGCAACATCTTCTCGACCCAAGACCACGCCGCGGCCGCGA
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GGTGCACGGAGCGTGCTCTGGACTGGGGTCCAGGCGGTGGTCCGGATCTGATCGTGGACG
ACGGTGGTGACGCGACGCTTTTGATCCACGAGGGAGTCAAGGCAGAGGAGATCTTTGAGA
AGACGGGTCAGGTTCCGGATCCGAGTTCCACTGATAACCCTGAGTTCCAGATCGTGCTTT
CGATCATCAAGGAAGGTCTTCAGGTTGACCCTAAGAAGTACCACAAGATGAAAGAGAGAC
TCGTTGGTGTCTCCGAGGAGACCACCACTGGTGTCAAGAGGCTTTACCAGATGCAGGAGA
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AAGTTCGACAACTTGTACGGATGCCGTCACTCCCTACCTGATGGTCTCATGAGGGCCACC
GATGTCATGATCGCCGGAAAGGTTGTCGTTGTTTGCGGATATGGTGATGTCGGAAAGGGT
TGTGCCGCTGCCATGAAGACCGCTGGTGCCAGAGTCATTGTCACCGAGATCGATCCCATC
TGTGCTTTACAAGCTATGATGGAAGGACTTCAAGTTCTGACCCTTGAGGATGTCGTCTCC
GAAGCTGACATCTTTGTCACCACCACCGGTAACAAAGACATCATCATGGTTGACCACATG
AGGAAGATGAAGAACAACGCCATCGTCTGCAACATTGGTCACTTCGACAACGAGATTGAC
ATGCTTGGTCTCGAGACCTTCCCTGGTGTCAAGCGTATCACCATCA*GCCCCAGACCG

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GAGAGACTCGTTGGTGTCTCTGAGGAGACCACCACTGGTGTCAAGAGGCTTTACCAGATG
CAGGAGACTGGCGCTCTTTTGTTCCCTGCCATTAACGTCAACGACTCCGTCACCAAGAGC
AAGTTCGACAACTTGTACGGATGCCGTCACTCCCTACCTGATGGTCTCATGAGGGCCACC
GATGTCATGATCGCCGGAAAGGTTGTCGTTGTTTGCGGATATGGTGATGTCGGAAGGGGT
TGTGCCGCTGCCATGAAGACCGCTGGTGCCAGAGTCATTGTCACCGAGATCGATCCCATC
TGTGCTTTACAAGCTATGATGGAAGGACTTCAAGTTCTGACCCTTGAGGATGTCGTCTCC
GAAGCTGACATCTTTGTCACCACCACCGGTAACAAAGACATCATCATGGTTGACCACATG
AGGAAGATGAAGAACAACGCCATCGTCTGCAACATTGGTCACTTCGACAACGAGATTGAC
ATGCTTGGTCTCGAGACCTTCCCTGGCGTCAAGCGTATCACCATCAAGCCCCAGACCGAC
AGGTGGGTCTTCCCTGACAC
AA

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AGATGGTCTCATGAGGGCCACCGATGTCATGATCGCCGGAAAGGTTGTCGTTGTTTGCGG
ATATGGTGATGTCGGAAAGGGTTGTGCCGCTGCCATGAAGACCGCTGGGGCCAGAGTCAT
TGTCACCGAGATCGATCCCATCTGTGCTTTACAAGCTATGATGGAAGGACTTCAAGTTCT
CACCCTTGAGGATGTCGTCTCCGAAGCCGACATCTTTGTCACCACCACCGGTAACAAAGA
CATCATCATGGTTGACCACATGAGGAAGATGAAGAACAACGCCATCGTCTGCAACATTGG
TCACTTTGACAACGAGATTGACATGCTTGGTCTCGAGACCTTCCCTGGTGTCAAGCGTAT
CACCATCAAGCCCCAGACCGACAGGTGGGTCTTCCCTGACACCAAGTCCGGAATCATTGT
TCTCGCTGAGGGTCGTCTCATGAACTTGGGTTGTGCCACTGGTCACCCGAGTTTCGTCAT
GTCTTGCTCTTTCACCAACCAGGTGATCGCCCAGCTTGAGCTTTGGAATGAGAAGTCGAG
CGGTAAGTACGAGAA

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DS 

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G
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AGATGGTCTCATGAGGGCCACCGATGTCATGATCGCCGGAAAGGTTGTCGTTGTTTGCGG
ATATGGTGATGTCGGAAAGGGTTGTGCCGCTGCCATGAAGACCGCTGGGGCCAGAGTCAT
TGTCACCGAGATCGATCCCATCTGTGCTTTACAAGCTATGATGGAAGGACTTCAAGTTCT
CACCCTTGAGGATGTCGTCTCCGAAGCCGACATCTTTGTCACCACCACCGGTAACAAAGA
CATCATCATGGTTGACCACATGAGGAAGATGAAGAACAGCGCCATCGTCTGCAACATTGG
TCACTTTGACAACGAGATTGACATGCTTGGTCTCGAGACCTTCCCTGGTGTCAAGCGTAT
CACCATCAAGCCCCAGACCGACAGGTGGGTCTTCCCTGACACCAAGTCCGGAATCATTGT
TCTCGCTGAGGGTCGTCTCATGAACTTGGGTTGTGCCACTGGTCACCCGGTTTTCGTCAT
GTCTTGCTCTTTCACCAACCAGGTGATCGCCCAGCTTGAGCTTTGGAATGAGAAGTCGAG
CGGTAAGTACGGGAAGAAGGTGTACGTTCTACCCAAGCATTTGGATGAGAAGGTTGCGG

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ACAACGAGATTGACATGCTTGGTCTCGAGACCTTCCCTGGTGTCAAGCGTATCACCATCA
AGCCCCAGACCGACAGGTGGGTCTTCCCTGACACCAAGTCCGGAATCATTGTTCTCGCTG
AGGGTCGTCTCATGAACTTGGGTTGTGCCACTGGTCACCCGGTTTTCGTCATGTCTTGCT
CTTTCACCAACCAGGTGATCGCCCAGCTTGAGCTTTGGAATGAGAAGTCGAGCGGTAAGT
ACGGGAAGAAGGTGTACGTTCTACCCAAGCATTTGGATGAGAAGGTTGCGGCCCTTCACT
TGGGCAAGCTTGGAGCTAAGCTCACTAAGTTGACAAAGGACCAATCTGACTACGTCAGCA
TTCCCATTGAAGGACCATACAAGCCTGCTCACTACAGGTACTGAGAGCTCTTTGGTTCGT
GTCGTTTATGGTGGGAAGAGTGGAAGATATTGGCCCGCTGATGAAGTTGACCAAATATCA
TTCTGAATAAATTGGCTTTTGAAGGTTGTTGCTTGTTGTTCTTCTTTCTCTTGAAACTTA
ATTTAGCTTTTGGTTGTCAGTTCCTTCTCGATTTGTTTTTGTGTTTTGATCACCGTTGTA
CTCTTTAAACGAAAAATGGTAAAAGAGGAAACTATTTTCCTCACC
C

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DS 

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TCAAGCGTATCACCATCAAGCCCCAGACCGACAGGTGGGTCTTCCCTGACACCAAGTCCG
GAATCATTGTTCTCGCTGAGGGTCGTCTCATGAACTTGGGTTGTGCCACTGGTCACCCGA
GTTTCGTCATGTCTTGCTCTTTCACCAACCAGGTGATCGCCCAGCTTGAGCTTTGGAATG
AGAAGTCGAGCGGTAAGTACGAGAAGAAGGTGTACGTTCTACCCAAGCATTTGGATGAGA
AGGTTGCGGCCCTTCACTTGGGCAAGCTTGGAGCTAAGCTCACTAAGTTGACAAAGGACC
AATCTGACTACGTCAGCATTCCCATTGAAGGACCATACAAGCCTGCTCACTACAGGTACT
GAGAGCTCTTTGGTTCGTGTCGTTTATGGTGGGAAGAGTGGAAGATATTGGCCCGCTGAT
GAAGTTGACCAAATATCATTCTGAATAAATTGGCTTTTGAAGGTTGTTGCTTGTTGTTCT
TCTTTCTCTTGAAACTTAATTTAGCTTTTGGTTGTCAGTTCCTTCTCGATTTGTTTTTGT
GTTTTGATCACCGTTGTACTCTTTAAACGAAAAATGGTAAAAGAGGAAACTATTTTCCTC
ACC

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DS 

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G
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AAGGTGTACGTTCTACCCAAGCATTTGGATGAGAAGGTTGCGGCCCTTCACTTGGGCAAG
CTTGGAGCTAAGCTCACTAAGTTGACAAAGGACCAATCCGACTACGTCAGCATTCCCATT
GAAGGACCATACAAGCCTGCTCACTACAGGTACTGAGAGCTCTTTGGTTCGTGTCGTTTA
TGGTGGGAAGAGTGGAAGATATTGGCCCGCTGATGAAGTTGACCAAATATCATTCTGAAT
AAATTGGCTTTTGAAGGTTGTTGCTTGTTGTTCTTCTTTCTCTTGAAACTTAATTTAGCT
TTTGGTTGTCAGTTCCTTCCCGATTTGTTTTTGTGTTTTGATCACCGTTGTACTCTTTAA
ACGAAAAATGGTAAAAGAGGAAACTATTTTCCTCACCAATTTTAGAGCTTTCTTTATCTT
TTCACCTTTATTATGTTCTTTGTTTCATTGAATGTGATGTGAAGCTCTCATTTCAAATGT
GGGCATTGCTATTTACGGTAGTTATGTTTTAAGCC

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DS 

RD RS1D773TF 636 0 0
G
CTCATGAACTTGGGTTGTGCCACTGGTCACCCGAGTTTCGTCATGTCTTGCTCTTTCACC
AACCAGGTGATCGCCCAGCTTGAGCTTTGGAATGAGAAGTCGAGCGGTAAGTACGAGAAG
AAGGTGTACGTTCTACCCAAGCATTTGGATGAGAAGGTTGCGGCCCTTCACTTGGGCAAG
CTTGGAGCTAAGCTCACTAAGTTGACAAAGGACCAATCCGACTACGTCAGCATTCCCATT
GAAGGACCATACAAGCCTGCTCACTACAGGTACTGAGAGCTCTTTGGTTCGTGTCGTTTA
TGGTGGGAAGAGTGGAAGATATTGGCCCGCTGATGAAGTTGACCAAATATCATTCTGAAT
AAATTGGCTTTTGAAGGTTGTTGCTTGTTGTTCTTCTTTCTCTTGAAACTTAATTTAGCT
TTTGGTTGTCAGTTCCTTCCCGATTTGTTTTTGTGTTTTGATCACCGTTGTACTCTTTAA
ACGAAAAATGGTAAAAGAGGAAACTATTTTCCTCACCAATTTTAGAGCTTTCTTTATCTT
TTCACCTTTATTATGTTCTTTGTTTCATTGAATGTGATGTGAAGCTCTCATTTCAAATGT
GGGCATTGCTATTTACGGTAGTTATGTTTTAAGCC

QA 2 636 2 636
DS 



CO CL46Contig2 785 3 22 U
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GAAAGAAATGGCGTTGATCGTAGAGAAGACGTCGAGTGGGCGCGAGTACAAAGTCAAGGA
CATGTCTCAGGCGGACTTCGGTCGTCTGGAGCTCGAACTCGCGGAGGTGGAGATGCCCGG
ACTGATGGCCTGCCGTACGGAGTTCGGCCCATCTCAGCCCTTCAAAGGCGCGAGAATCAC
CGGATCTCTCCACATGACGATCCAAACCGCCGTGCTCATCGAGACCCTAACCGCCCTGGG
CGCGGAAGTGAGATGGTGCTCGTGCAACATCTTCTCGACCCAAGACCACGCCGCGGCCGC
GATCGCTCGCGACTCCGCCGCCGTGTTCGCGTGGAAAGGAGAGACGCTTCAGGAGTACTG
GTGGTGCACGGAGCGTGCTCTGGACTGGGGTCCAGGCGGTGGTCCGGATCTGATCGTGGA
CGACGGTGGTGACGCGACGCTTTTGATCCACGAGGGAGTCAAGGCAGAGGAGATCTTTGA
GAAGACGGGTCAGGTTCCGGATCCGAGTTCCACTGATAACCCTGAGTTCCAGATCGTGCT
TTCGATCATCAAGGAAGGTCTTCAGGTTGATCCTAAGAAGTACCACAAGATGAAAGAGAG
ACTCGTTGGTGTCTCTGAGAGACCACCACTGGTGTCAAGAGCTTTACCAGATGCAGAGAC
TGGCGCTCTTTGTCCCTGCCATTAACGTTAACGACTCCGTCACCAAGAGCAAGTTCGACA
CTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

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TTCGGTCGTCTGGAGCTCGAACTCGCGGAGGTGGAGATGCCCGGACTCATGGCCTGCCGT
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ACCATCCAAACCGCCGTGCTCATCGAGACCCTAACCGCCCTGGGCGCGGAAGTGAGATGG
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GCCGCCGTGTTCGCGTGGAAAGGAGAGACGCTTCAGGAGTACTGGTGGTGCACGGAGCGT
GCTCTGGACTGGGGTCCAGGCGGTGGTCCGGATCTGATCGTGGACGATGGAGGTGACGCG
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GAGAGAC*ACCACTGGTGTCAAGAGCTTTACCAGATGCAGAGACTGGCGCTCTTT
GT

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GGAC
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TGGCGTTGATCGTAGAGAAGACGTCGAGTGGGCGCGAGTACAAGGTCAAGGACATGTCTC
AGGCGGACTTCGGTCGTCTGGAGCTCGAACTCGCGGAGGTGGAGATGCCCGGACTGATGG
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TCCACATGACGATCCAAACCGCCGTGCTCATCGAAACCCTAACGGCCCTGGGCGCGGAAG
TGAGATGGTGCTCGTGCAACATCTTCTCGACCCAAGACCACGCCGCGGCCGCGATCGCTC
GCGACTCCGCCGCCGTGTTCGCGTGGAAAGGAGAGACGCTTCAGGAGTACTGGTGGTGCA
CGGAGCGTGCTCTGGACTGGGGTCCAGGCGGTGGTCCGGATCTGATCGTGGACGACGGTG
GTGACGCGACGCTTTTGATCCACGAGGGAGTCAAGGCAGAGGAGATCTTTGAGAAGACGG
GTCAGGTTCCGGATCCGAGTTCCACTGATAACCCTGAGTTCCAGATCGTGCTTTCGATCA
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QA 5 781 5 781
DS 



CO CL46Contig3 916 5 9 U
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GCTTCACATCACATTCAACGAAACAAAGAACATAGTAAAAGGTGAAAAGATAAAGAAAGC
TCTAAAATTGGTGAGGAAAATAGTTTCCTCTTTTACCATTTTTCGTTTAAAGAGTACAAC
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ACAAACCACAAACAGAACCAAACAGCTCTCCTCTCAGTACCTGTAGTGAGCAGGCTTGTA
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AGCTCCAAGCTTGCCCAAGTGAAGAGCCGCAACCTTCTCATCCAAATGCTTGGGTAGAAC
GTACACCTTCTTCTCGTACTTACCGCTCGACTTCTCATTCCAAAGCTCAAGCTGGGCAAT
GACCTGGTTGGTGAAAGAGCAAGACATGACGAAACTCGGGTGACCAGTGGCACAACCCAA
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CCTCATGTGGTCAACCATGATGATGTCTTTGTTACCGGTGGTGGTGACAAAGATGTCGCT
TCAGAGACGACATCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FI28TF C 117
AF RS1GY34JQ U 1
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CGACACAAACC

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CTGGGGCTTGATGGT

QA 1 615 1 615
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GG
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AAACGACACAAACCACAAACAGAACCAAACAGCTCTCCTCTCAGTACCCGTAGTGAGCAG
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GACCAAGCATGTCAATCTCGTTGT

QA 3 746 3 746
DS 

RD RS1F345JQ 799 0 0
AGCTCTAAAACTGGTGAGGAAAATAGTTTCCTCTTTTACCATTTTTCGTTTAAAGAGTAC
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GTTTCAAGAGAAAGAAAAACAACAAGCAACAACCTTCAAAAGCCAATAACCCTTTATTCA
AAATGATATTTGGTCAACTTCATCAGCGGACCAATATCTTCCACTCTTCCCACCATAAAC
GACACAAACCACAAGCAGAACCAAAGAGCTCTCCTCTCAGTACCTGTAGTGAGCAGGCTT
GTATGGTCCTTCAATGGGAATGCTGACGTAGTCAGATTGGTCCTTTGTCAACTTAGTGAG
CTTAGCTCCAAGCTTGCCCAAGTGAAAAGCCGCAACCTTCTCATCCAAATGCTTGGGTAG
AACGTACACCTTCTTCTCGTACTTACCGCTCGACTTCTCATTCCAAAGCTCAAGCTGGGC
GATCACCTGGTTGGTGAAAGAGCAAGACATGACGAAACTCGGGTGACCAGTGGCACAACC
CAAGTTCATGAAACGACCCTCAGCCAGGACAATGATTCCGGACTTGGTGTCTGGGAAGAC
CCACCTGTCGGTCTGGGGCTTGATGGTGATACGCTTGACACCAGGGAAGGTCTCGAGACC
AAGCATGTCAATCTCGTTGTCAAAGTGACCAATGTTGCAGACGATGGCGTTGTTCTTCAT
CTTCCTCATGTGGTCAACCATGATGATGTCTTTGTTACCGGTGGTGGTGACAAAGATGTC
GCTTCAGAGACGACATCCT

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 16

CO CL47Contig1 907 16 16 U
GGAAACTTGGATATTGTTTTAATGTATAGTTTTTTGTCTGAAGGTTTTAATGTATAGTTA
TGTCTTATAGTTAAAATGTTGGCAAACATAACTTAATATATTTATGGAAATTCAGGTACA
GGCATGAGGGTATCATCTCAACCCATTATTTTAGGCCATGGACGAGTCACAGGCTTTACA
TTACATGATTTTGGCTTGTTGACTAGTAGAATGGGAACATCCTTAGACCTAACTTCTACA
GACTTGAAGTAGAAGTAGTATCATCATGAACCCTATGAAATTTCACGAGGAAGGTCTTCG
CGGTATCATTGGTGATAACTAGTTGTGGTGCATTTTCCCAAGGCCCTGGGACGGTTCCAA
TGGTTCCGGTTAAGGTGCTCAACTTGTAAGCAACTCCTCCAACAAATTTTTCTTTTCTCT
CAATTTTAAACCAGCTGTTTTGTTCCTGCTTCTTACCACCGACGAGAATCGCAGGCTCCT
CGGAAGCCGATGAGGATTCATCTACTTCCCAGTACTTGGAAAACTCCTCGCAGCCCGGCC
ATGCGTGTGACTTAAACTCGATATTTACAGCTTGCCCTTCGTTAACATAGGTGTCCATGA
GCGCGTATGGATATGAGAAGCTAACTGGTAGGCCTGGTAAGGCGGTAACAGAGGATTGGC
TGATGCCAAGTGGACAAAGGGGAAGTAGTTTAACGGGGACTGGGAGAAGACCACCTCCGT
TACTACTGTGGGAGTACGGTTGGATCAGGTATTGTGCAGTCCTTAGAACTGGATTTCCGG
CCGTGTCCAGCACAGGTTCTTGTCCTCCGTGGGTGCATACAGCTGCAGCCAACATGAGAA
TGATGAGAAAGGAGACCAATGGGAATGATGACATCATTGTTATTTGTTTTCTTTTGAGTT
GAGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 35 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 35 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 25 70 70 70 55 70 70 70 55 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 30 
85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 30 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 50 80 80 80 80 80 
80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
40 40 40 40 25 20 20 

AF RS1GE29JQ U 69
AF RS1CN89JQ U 1
AF RS1AT41JQ U 78
AF RS1D605JQ U 81
AF RS1FG02JQ U 81
AF RS1FG02TF C 72
AF RS1A735JQ U 81
AF RS1FC60TF C 140
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AF RS1CS22JQ U 81
AF RS1A735TF C 81
AF RS1D605TF C 450
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AF RS1CN89TF C 185
AF RS1H124JQB U 81
BS 1 260 RS1CN89JQ
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BS 262 272 RS1CN89JQ
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BS 274 555 RS1CN89JQ
BS 556 556 RS1AT41JQ
BS 557 652 RS1CN89JQ
BS 653 734 RS1AT41JQ
BS 735 799 RS1A735JQ
BS 800 850 RS1CS22JQ
BS 851 851 RS1H124JQB
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BS 905 907 RS1A735TF

RD RS1GE29JQ 305 0 0
GGTTAAAATG
TTGGCAAACATAACTTAATATATTTATGGAAATTCAGGTACAGGCATGAGGGTATCATCT
CAACCCATTATTTTAGGCCATGGACGAATCACAGGCTTTACATTACATGACTTTGGCTTG
TTGACTAGTAAAATGGGAACATCCTTAGACCTAACTTCTACAGACTTGAAGTAGAAGTAG
TATCATCATGAACCCTATGAAATTTCACGAGGAAGGTCTTCCCGGTATCATTGGTGATAA
CTAGTTGTGGTGCATTTTCCCAAGGCCCTGGGACGGTTCCAATGGTTCCGGTTAA

QA 11 305 11 305
DS 

RD RS1CN89JQ 652 0 0
GGAAACTTGGATATTGTTTTAATGTATAGTTTTTTGTCTGAAGGTTTTAATGTATAGTTA
TGTCTTATAGTTAAAATGTTGGCAAACATAACTTAATATATTTATGGAAATTCAGGTACA
GGCATGAGGGTATCATCTCAACCCATTATTTTAGGCCATGGACGAGTCACAGGCTTTACA
TTACATGATTTTGGCTTGTTGACTAGTAGAATGGGAACATCCTTAGACCTAACTTCTACA
GACTTGAAGTAGAAGTAGTACCATCATGAACCATATGAAATTTCACGAGGAAGGTCTTCG
CGGTATCATTGGTGATAACTAGTTGTGGTGCATTTTCCCAAGGCCCTGGGACGGTTCCAA
TGGTTCCGGTTAAGGTGCTCAACTTGTAAGCAACTCCTCCAACAAATTTTTCTTTTCTCT
CAATTTTAAACCAGCTGTTTTGTTCCTGCTTCTTACCACCGACGAGAATCGCAGGCTCCT
CGGAAGCCGATGAGGATTCATCTACTTCCCAGTACTTGGAAAACTCCTCGCAGCCCGGCC
ATGCGTGTGACTTAAGCTCGATATTTACAGCTTGCCCTTCGTTAACATAGGTGTCCATGA
GCGCGTATGGATATGAGAAGCTAACTGGTAGGCCTGGTAAGGCGGTAACAGA

QA 1 652 1 652
DS 

RD RS1AT41JQ 657 0 0
G
TTGGCAAACATAACTTAATATATTTATGGAAATTCAGGTACAGGCATGAGGGTATCATCT
CAACCCATTATTTTAGGCCATGGACGAGTCACAGGCTTTACATTACATGATTTTGGCTTG
TTGACTAGTAAAATGGGAACATCCTTAAACCCAACTTCTACAGACTTGAAGTAAAAGTAG
TATCATCATGAACCCTATGAAATTTCACGAGGAAGGTCTTCCCGGTATCATTGGTGATAA
CTAGTTGTGGTGCATTTTCCCAAGGCCCTGGGACGGTTCCAATGGTTCCGGTTAAGGTGC
TCAACTTGTAAGCAACTCCTCCAACAAATTTTTCTTTTCTCTCAATTTTAAACCAGCTGT
TTTGTTCCTACTTCTTACCACCGACAAAAATCGCAGGCTCCTCGGAAGCCGATGAGGATC
CATCTACTTCCCAGTACTTGGAAAACTCCTCGCGGCCCGGCCATGCGTGTGACTTAAACT
CGATATTTAAAGCTTGCCCTTCGTTAACATAGGTGTCCATGAGCGCGTATGGATATGAGA
AGCTAACTGGTAGGCCTGGTAAGGCGGTAACAGAGGATTGGCTGATGCCAAGTGGACAAA
GGGGAAGTAGTTTAACGGGGACTGGGAGAAGACCACCTCCGTTACTACTGTGGGAG

QA 2 657 2 657
DS 

RD RS1D605JQ 653 0 0
GGCAAACATAACTTAATATATTTATGGAAATTCAGGTACAGGCATGAGGGTACCATCTCA
ACCCATTATTTTAGGCCATGGACGAGTCACAGGCTTTACATTACATGATTTTGGCTTGTT
GACTAGTAGAATGGGAACATCCTTAGACCTAACTTCTACAGACTTGAAGTAGAAGTAGTA
TCATCATGAACCCTATGAAATTTCACGAGGAAGGTCTTCGCGGTATCATTGGTGATAACT
AGTTGTGGTGCATTTTCCCAAGGCCCTGGGACGGTTCCAATGGTTCCGGTTAAGGTGCTC
AACTTGTAAGCAACTCCTCCAACAAATTTTTCTTTTCTCTCAATTTTAAACCAGCTGTTT
TGTTCCTGCTTCTTACCACCGACGAGAATCGCAGGCTCCTCGGAAGCCGATGAGGATTCA
TCTACTTCCCAGTACTTGGAAAACTCCTCGCAGCCCGGCCATGCGTGTGACTTAAACTCG
ATATTTACAGCTTGCCCTTCGTTAACATAGGTGTCCATGAGCGCGTATGGATATGAGGAG
CTAACTGGTAGGCCTGGTAAGGCGGTAACAGAGGATTGGCTGATGCCAAGTGGACAAAGG
GGAAGTAGTTTAACGGGGATTGGGAGAAGACCACCTCCGTTACTACTGTGGGA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RS1FG02JQ 653 0 0
GGCAAACATAACTTAATATATTTATGGAAATTCAGGTACAGGCATGAGGGTATCATCTCA
ACCCATTATTTTAGGCCATGGACGAGTCACAGGCTTTACATTACATGATTTTGGCTTGTT
GACTAGTAAAATGGGAACATCCTTAGACCTAACTTCTACAGACTTGAAGTAGAAGTAGTA
TCATCATGAACCCTATGAAATTTCACGAGGAAGGTCTTCGCGGCATCATTGGTGATAACT
AGTTGTGGTGCATTTTCCCAAGGCCCTGGGACGGTTCCAATGGTTCCGGTTAAGGTGCTC
AACTTGTAAGCAACTCCTCCAACAAATTTTTCTTTTCTCTCAATTTTAAACCAGCTGTTT
TGTTCCTGCTTCTTACCACCGACGAAAATCGCAGGCTCCTCGGAAGCCGATGAGGATTCA
TCTACTTCCCAGTACTTGGAAAACTCCTCGCAGCCCGGCCATGCGTGTGACTTAAACTCG
ATATTTACAGCTTGCCCTTCGTTAACATAGGTGTCCATGAGCGCGTATGGATATGAGAAG
CTAACTGGTAGGCCTGGTAAGGCGGTAACAGAGGATTGGCTGATGCCAAGTGGACAAAGG
GGAAGTAGTTTAACGGGGACTGGGAGAAGACCACCTCCGTTACTACTGTGGGA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RS1FG02TF 751 0 0
TTTTTTT
TTGGCAAACATAACTTAATATATTTATGGAAATTCAGGTACAGGCATGAGGGTATCATCT
CAACCCATTATTTTAGGCCATGGACGAGTCACAGGCTTTACATTACATGATTTTGGCTTG
TTGACTAGTAGAATGGGAACATCCTTAGACCTAACTTCTACAGACTTGAAGTAGAAGTAG
TATCATCATGAACCCTATGAAATTTCACGAGGAAGGTCTTCGCGGCATCATTGGTGATAA
CTAGTTGTGGTGCATTTTCCCAAGGCCCTGGGACGGTTCCAATGGTTCCGGTTAAGGTGC
TCAACTTGTAAGCAACTCCTCCAACAAATTTTTCTTTTCTCTCAATTTTAAACCAGCTGT
TTTGTTCCTGCTTCTTACCACCGACGAGAATCGCAGGCTCCTCGGAAGCCGATGAGGATT
CATCTACTTCCCAGTACTTGGAAAACTCCTCGCAGCCCGGCCATGCGTGTGACTTAAACT
CGATATTTACAGCTTGCCCTTCGTTAACATAGGTGTCCATGAGCGCGTATGGATATGAGA
AGCTAACTGGTAGGCCTGGTAAGGCGGTAACAGAGGATTGGCTGATGCCAAGTGGACAAA
GGGGAAGTAGTTTAACGGGGACTGGGAGAAGACCACCTCCGTTACTACTGTGGGAGTACG
GTTGGATCAGGTATTGTGCAGTCCTTAGAACTGGATTTCCGGCCGTGTCCAGCACAGGTT
CTTGTCCTCCGTGGGTGCATAC
CC

QA 8 749 8 749
DS 

RD RS1A735JQ 719 0 0
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ACCCATTATTTTAGGCCATGGACGAGTCACAGGCTTTACATTACATGATTTTGGCTTGTT
GACTAGTAGAATGGGAACATCCTTAGACCTAACTTCTACAGACTTGAAGTAGAAGTAGTA
TCATCATGAACCCTATGAAATTTCACGAGGAAGGTCTTCGCGGTATCATTGGTGATAACT
AGTTGTGGTGCATTTTCCCAAGGCCCTGGGACGGTTCCAATGGTTCCGGTTAAGGTGCTC
AACTTGTAAGCAACTCCTCCAACAAATTTTTCTTTTCTCTCAATTTTAAACCAGCTGTTT
TGTTCCTGCTTCTTACCACCGACGAAAATCGCAGGCTCCTCGGAAGCCGATGAGGATTCA
TCTACTTCCCAGTACTTGGAAAACTCCTCGCAGCCCGGCCATGCGTGTGACTTAAACTCG
ATATTTACAGCTTGCCCTTCGTTAACATAGGTGTCCATGAGCGCGTATGGATATGAGAAG
CTAACTGGTAGGCCTGGTAAGGCGGTAACAGAGGATTGGCTGATGCCAAGTGGACAAAGG
GGAAGTAGTTTAACGGGGACTGGGAGAAGACCACCTCCGTTACTACTGTGGGAGTACGGT
TGGATCAGGTATTGTGCAGTCCTTAGAACTGGATTTCCGGCCGTGTCCAGCACAGGTTC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RS1FC60TF 650 0 0
AACCCATTATTTTAGGCCATGGACGAGTCACAGGCTTTACATTACATGA*TTTGGCTTGT
TGACTAGTAGAATGGGAACATCGTTAGACCTAACTTCTACAGACTTGAAGTAGAAGTAGT
ATCATCATGAACCCTATGAAATTTCACGAGGAAGGTCTTCGCGGTATCATTGGTGATAAC
TAGTTGTGGTGCATTTTCCCAAGGCCCTGGGACGGTTCCAATGGTTCCGGTTAAGGTGCT
CAACTTGTAAGCAACTCCTCCAACAAATTTTTCTTTTCTCTCAATTTTAAACCAGCTGTT
TTGTTCCTGCTTCTTACCACCGACGAGAATCGCAGGCTCCTCGGAAGCCGATGAGGATTC
ATCTACTTCCCAGTACTTGGAAAACTCCTCGCAGCCCGGCCATGCGTGTGACTTAAACTC
GATATTTACAGCTTGCCCTTCGTTAACATAGGTGTCCATGAGCGCGTATGGATATGAGAA
GCTAACTGGTAGGCCTGGTAAGGCGGTAACAGAGGATTGGCTGACGCCAAGTGGACAAAG
GGGAAGTAGTTTAACGGGGACTGGGAGAAGACCACCTCCGTTACTACTGTGGGAGTACGG
TTGGATCAGGTATTGTGCAGTCCTTAGAACTGGATTTCCGGCCGTGTCCA

QA 1 650 1 650
DS 

RD RS1AT41TF 626 0 0
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CCCAAGGCCCTGGGACGGTTCCAATGGTTCCGGTTAAGGTGCTCAACTTGTAAGCAACTC
CTCCAACAAATTTTTCTTTTCTCTCAATTTTAAACCAGCTGTTTTGTTCCTACTTCTTAC
CACCGACGAGAATCGCAGGCTCCTCGGAAGCCGATGAGGATCCATCTACTTCCCAGTACT
TGGAGAACTCCTCGCGGCCCGGCCATGCGTGTGACTTAAACTCGATATTTAAAGCTTGCC
CTTCGTTAACATAGGTGTCCATGAGCGCGTATGGATATGAGAAGCTAACTGGTAGGCCTG
GTAAGGCGGTAACAGAGGATTGGCTGATGCCAAGTGGACAAAGGGGAAGTAGTTTAACGG
GGACTGGGAGAAGACCACCTCCGTTACTACTGTGGGAGTACGGTTGGATCAGGTATTGTG
CGGTCCTTAGAACTGGATTTCCGGCCGTGTCCAGCACAGGTTCTTGTCCTCCGTGGGTGC
ATACAGCTGCAGCCAACATGAGAATGATGAGAAAGGAGACCAATGGGAATGATGACATCA
TTGTTATTTGTTTTCTTTTGAGTT
CC

QA 1 624 1 624
DS 

RD RS1CS22JQ 820 0 0
GGCAAACATAACTTAATATATTTATGGAAATTCAGGTACAGGCATGAGGGTATCATCTCA
ACCCATTATTTTAGGCCATGGACGAGTCACAGGCTTTACATTACATGATTTTGGCTTGTT
GACTAGTAGAATGGGAACATCCTTAGACCTAACTTCTACAGACTTGAAGTAGAAGTAGTA
TCATCATGAACCCTATGAAATTTCACGAGGAAGGTCTTCGCGGTATCATTGGTGATAACT
AGTTGTGGTGCATTTTCCCAAGGCCCTGGGACGGTTCCAATGGTTCCGGTTAAGGTGCTC
AACTTGTAAGCAACTCCTCCAACAAATTTTTCTTTTCTCTCAATTTTAAACCAGCTGTTT
TGTTCCTGCTTCTTACCACCGACGAAAATCGCAGGCTCCTCGGAAGCCGATGAGGATTCA
TCTACTTCCCAGTACTTGGAAAACTCCTCGCAGCCCGGCCATGCGTGTGACTTAAACTCG
ATATTTACAGCTTGCCCTTCGTTAACATAGGTGTCCATGAGCGCGTATGGATATGAGAAG
CTAACTGGTAGGCCTGGTAAGGCGGTAACAGAGGGTTGGCTGATGCCAAGTGGACAAAGG
GGAAGTAGTTTAACGGGGACTGGGAGAAGACCACCTCCGTTACTACTGTGGGAGTACGGT
TGGATCAGGTATTGTGCAGTCCTTAGAACTGGATTTCCGGCCGTGTCCAGCACAGGTTCT
TGTCCTCCGTGGGTGCATACAGCTGCAGCCAACATGAGAATGATGAGAAA*GAGAC*AAT
GGGAATGATGACATCATTGTTATTTGTTTTCTTTTGAGTT

QA 1 820 1 820
DS 

RD RS1A735TF 827 0 0
GGCAAACATAACTTTATATATTTATGGAAATTCAGGTACAGGCATGAGGGTATCATCTCA
ACCCATTATTTTAGGCCATGGACGAGTCACAGGCTTTACATTACATGATTTTGGCTTGTT
GACTAGTAGAATGGGAACATCTTTAGACCTAACTTCTACAGACTTGAAGTAGAAGTAGTA
TCATCATGAACCCTATGAAATTTCACGAGGAAGGTCTTCGCGGTATCATTGGTGATAACT
AGTTGTGGTGCATTTTCCCAAGGCCCTGGGACGGTTCCAATGGTTCCGGTTAAGGTGCTC
AACTTGTAAGCAACTCCTCCAACAAATTTTTCTTTTCTCTCAATTTTAAACCAGCTGTTT
TGTTCCTGCTTCTTACCACCGACGAGAATCGCAGGCTCCTCGGAAGCCGATGAGGATTCA
TCTACTTCCCAGTACTTGGAAAACTCCTCGCAGCCCGGCCATGCGTGTGACTTAAACTCG
ATATTTACAGCTTGCCCTTCGTTAACATAGGTGTCCATGAGCGCGTATGGATATGAGAAG
CTAACTGGTAGGCCTGGTAAGGCGGTAACAGAGGATTGGCTGATGCCAAGTGGACAAAGG
GGAAGTAGTTTAACGGGGACTGGGAGAAGACCACCTCCGTTACTACTGTGGGAGTACGGT
TGGATCAGGTATTGTGCAGTCCTTAGAACTGGATTTCCGGCCGTGTCCAGCACAGGTTCT
TGTCCTCCGTGGGTGCATACAGCTGCAGCCAACATGAGAATGATGAGAAAGGAGACCAAT
GGGAATGATGACATCATTGTTATTTGTTTTCTTTTGAGTTGAGTTCC

QA 1 827 1 827
DS 

RD RS1D605TF 458 0 0
TTCTTACCACCGACGAGAATCGCAGGCTCCTCGGAAGCCGATGAGGATTCATCTACTTCC
CAGTACTTGGAAAACTCCTCGCAGCCCGGCCATGCGTGTGACTTAAACTCGATATTTACA
GCTTGCCCTTCGTTAACATAGGTGTCCATGAGCGCGTATGGATATGAGGAGCTAACTGGT
AGGCCTGGTAAGGCGGTAACAGAGGATTGGCTGATGCCAAGTGGACAAAGGGGAAGTAGT
TTAACGGGGATTGGGAGAAGACCACCTCCGTTACTACTGTGGGAGTACGGTTGGATCAGG
TATTGTGCAGTCCTTAGAACTGGATTTCCGGCCGTGTCCAGCACAGGTTCTTGTCCTCCG
TGGGTGCATACAGCTGCAGCCAACATGAGAATGATGAGAAAGGAGACCAATGGGAATGAT
GACATCATTGTTATTTGTTTTCTTTTGAGTTGAGTTCC

QA 1 458 1 458
DS 

RD RS1H124TF 631 0 0
TGAAATTTCACGAGGAAGGTCTTCACGGTATCATTGGTGATAACTAGTTGTGGTGCATTT
TCCCAAGGCCCTGGGACGGTTCCAATGGTTCCGGTTAAGGTGCTCAACTTGTAAGCAACT
CCTCCAACAAATTTTTCTTTTCTCTCAATTTTAAACCAGCTGTTTTGTTCCTGCTTCTTA
CCACCGACGAGAATCGCAGGCTCCTCGGAAGCCGATGAGGATTCATCTACTTCCCAGTAC
TTGGAAAACTCCTCGCAGCCCGGCCATGCGTGTGACTTAAACTCGATATTTACAGCTTGC
CCTTCGTTAACATAGGTGTCCATGAGCGCGTATGGATATGAGAAGCTAACTGGTAGGCCT
GGTAAGGCGGTAACAGAGGATTGGCTGATGCCAAGTGGACAAAGGGGAAGTAGTTTAACG
GGGACTGGGAGAAGACCACCTCCGTTACTACTGTGGGAGTACGGTTGGATCAGGTATTGT
GCAGTCCTTAGAACTGGATTTCCGGCCGTGTCCAGCACAGGTTCTTGTCCTCCGTGGGTG
CATACAGCTGCAGCCAACATGAGAATGATGAGAAAGGAGACCAATGGGAATGATGACATC
ATTGTTATTTGTTTTCTTTTGAGTTGAGT
CC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RS1CS22TF 675 0 0
CTTCTACAGACTTGAAGTAGAAGTAGTATCATCATGAACCCTATGAAATTTCACGAGGAA
GGTCTTCGCGGTATCATTGGTGATAACTAGTTGTGGTGCATTTTCCCAAGGCCCTGGGAC
GGTTCCAATGGTTCCGGTTAAGGTGCTCAACTTGTAAGCAACTCCTCCAACAAATTTTTC
TTTTCTCTCAATTTTAAACCAGCTGTTTTGTTCCTGCTTCTTACCACCGACGAGAATCGC
AGGCTCCTCGGAAGCCGATGAGGATTCATCTACTTCCCAGTACTTGGAAAACTCCTCGCA
GCCCGGCCATGCGTGTGACTTAAACTCGATATTTACAGCTTGCCCTTCGTTAACATAGGT
GTCCATGAGCGCGTATGGATATGAGAAGCTAACTGGTAGGCCTGGTAAGGCGGTAACAGA
GGGTTGGCTGATGCCAAGTGGACAAAGGGGAAGTAGTTTAACGGGGACTGGGAGAAGACC
ACCTCCGTTACTACTGTGGGAGTACGGTTGGATCAGGTATTGTGCAGTCCTTAGAACTGG
ATTTCCGGCCGTGTCCAGCACAGGTTCTTGTCCTCCGTGGGTGCATACAGCTGCAGCCAA
CATGAGAATGATGAGAAAGGAGACCAATGGGAATGATGACATCATTGTTATTTGTTTTCT
TTTGAGTTGAGTTCC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1CN89TF 725 0 0
CATGA
TTTGGCTTGTTGACTAGTAGAATGGGAACATC*TTAGACCTAACTTCTACAGACTTGAAG
TAGAAGTAGTACCATCATGAACCATATGAAATTTCACGAGGAAGGTCTTCGCGGTATCAT
TGGTGATAACTAGTTGTGGTGCATTTTCCCAAGGCCCTGGGACGGTTCCAATGGTTCCGG
TTAAGGTGCTCAACTTGTAAGCAACTCCTCCAACAAATTTTTCTTTTCTCTCAATTTTAA
ACCAGCTGTTTTGTTCCTGCTTCTTACCACCGACGAGAATCGCAGGCTCCTCGGAAGCCG
ATGAGGATTCATCTACTTCCCAGTACTTGGAAAACTCCTCGCAGCCCGGCCATGCGTGTG
ACTTAAGCTCGATATTTACAGCTTGCCCTTCGTTAACATAGGTGTCCATGAGCGCGTATG
GATATGAGAAGCTAACTGGTAGGCCTGGTAAGGCGGTAACAGAGGATTGGCTGATGCCAA
GTGGACAAAGGGGAAGTAGTTTAACGGGGACTGGGAGAAGACCACCTCCGTTACTACTGT
GGGAGTACGGTTGGATCAGGTATTGTGCAGTCCTTAGAACTGGATTTCCGGCCGTGTCCA
GCACAGGTTCTTGTCCTCCGTGGGTGCATACAGCTGCAGCCAACATGAGAATGATGAGAA
AAGAGACCAATGGGAATGATGACATCATTGTTATTTGTTTTCTTTTGAGTTGAGTT
GTCC

QA 6 721 6 721
DS 

RD RS1H124JQB 826 0 0
GT
CAAACATAACTTAATATATTTATGGAAATTCAGGTACAGGCATGAGGGTATCATCTCAAC
CCATTATTTTAGGCCATGGACGAGTCACAGGCTTTACATTACATGATTTTGGCTTGTTGA
CTAGTAGAATGGGAACATCCTTAGACCTAACTTCTACAGACTTGAAGTAGAAGTAGTATC
ATCATGAACCCTATGAAATTTCACGAGGAAGGTCTTCACGGTATCATTGGTGATAACTAG
TTGTGGTGCATTTTCCCAAGGCCCTGGGACGGTTCCAATGGTTCCGGTTAAGGTGCTCAA
CTTGTAAGCAACTCCTCCAACAAATTTTTCTTTTCTCTCAATTTTAAACCAGCTGTTTTG
TTCCTGCTTCTTACCACCGACGAAAATCGCAGGCTCCTCGGAAGCCGATGAGGATTCATC
TACTTCCCAGTACTTGGAAAACTCCTCGCAGCCCGGCCATGCGTGTGACTTAAACTCGAT
ATTTACAGCTTGCCCTTCGTTAACATAGGTGTCCATGAGCGCGTATGGATATGAAAAGCT
AACTGGTAGGCCTGGTAAGGCGGTAACAGAGGATTGGCTGATGCCAAGTGGACAAAGGGG
AAGTAGTTTAACGGGGACTGGGAGAAGACCACCTCCGTTACTACTGTGGGAGTACGGTTG
GATCAGGTATTGTGCAGTCCTTAGAACTGGATTTCCGGCCGTGTCCAGCACAGGTTCTTG
TCCTCCGTGGGTGCATACAGCTGCAGCCAACATGAGAATGATGAGAAAGGAGACCAATGG
GAATGATGACATCATTGTTATTTGTTTTCTTTTGAGTTGAGT
CC

QA 3 824 3 824
DS 



AS 2 17

CO CL48Contig1 909 8 22 U
GGGTCACACATAACCAAAACCACCAGATATTATTATAACTCAAAACAAATCTCTTCTAAC
AATTATTTTCAAAGCAGCAACAGAAAAAAATGGCTCAAGCAGTGACTTCGATGGCTGGTT
TACGTGGTGCATCTCAGGCTGTTCTTGAAGGAAGTTTCCAGAACAATGGCTCAAACCGTT
TGAACATCTCCAGAGCCACGGTCCGGTCTCAGAGAACCGGGCTTGTGATCAGGGCTCAGC
AGAACGAGTCAGTACCAGAAAGCAGTCGCCGGTCTGTGATTGGGCTCGTTGCGGCTGGTT
TAGTCGGTGGTTCGTTCGTTAAGTCTGCCTTCGCCACCGAAGCTCTTGCTATCAAAGTTG
GTCCTCCTCCACCTCCTTCCGGTGGTCTACCTGGAACCGATAACTCAGACCAAGCAAGAG
ACTTTTCACTGAAACTGAAAGACAGGTTTTACTTACAGCCATTGTCACCAACAGAAGCTG
CAGCTAGGGCCAAAGAGTCTGCTAAAGAGATCATTAACGTTAAGTCTTTGATCGACAAAA
AAGCGTGGCCCTACGTTCAGAATGATCTCCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGATC
TTAACACCGTTATCTCCGCTAAGCCTAAGGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCG
GCAAACTCTTCCAAACCATCGACAACCTGGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGG
ATGCTGAGAAGTATTACTCAGAGACTGTCTCGAGTTTGAACAATGTTCTTGCCAAGATCG
GTTAAGGAAGAAAGATCTGCTCTGTAATGTATTGTTGTTGTTATTACTATCCAAGTACTA
TTGTCTTTCTCCTCCTCTTTCTTTCTGATCAAATCGGTTATATTTAATTTCAGTTTCAAG
TTTTAGCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 
30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 20 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 25 50 50 50 50 35 50 50 50 50 35 0 50 35 50 50 50 0 50 
50 50 30 30 45 10 45 45 40 40 40 40 25 40 40 40 0 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1CL55TF U 1
AF RS1BL92JQ C 206
AF RS1AY46TF U 69
AF RS1BL92TF U 57
AF RS1H734TF U 430
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AF RS1AY46JQ C 88
AF RS1CL55JQ C 156
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BS 909 909 RS1CL55JQ

RD RS1CL55TF 791 0 0
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AATTATTTTCAAAGCAGCAACAGAAAAAAATGGCTCAAGCAGTGACTTCGATGGCTGGTT
TACGTGGTGCATCTCAGGCTGTTCTTGAAGGAAGTTTCCAGAACAATGGCTCAAACCGTT
TGAACATCTCCAGAGCCACGGTCCGGTCTCAGAGAACCGGGCTTGTGATCAGGGCTCAGC
AGAACGAGTCAGTACCAGAAAGCAGTCGCCGGTCTGTGATTGGGCTCGTTGCGGCTGGTT
TAGTCGGTGGTTCGTTCGTTAAGTCTGCCTTCGCCACCGAAGCTCTTGCTATCAAAGTTG
GTCCTCCTCCACCTCCTTCCGGTGGTCTACCTGGAACCGATAACTCAGACCAAGCAAGAG
ACTTTTCACTGAAACTGAAAGACAGGTTTTACTTACAGCCATTGTCACCAACAGAAGCTG
CAGCTAGGGCCAAAGAGTCTGCTAAAGAGATCATTAACGTTAAGTCTTTGATCGACAAAA
AAGCGTGGCCCTACGTTCAGAATGATCTCCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGATC
TTAACACCGTTATCTCCGCTAAGCCTAAGGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCG
GCAAGCTCTTCCAAACCATCGACAACCTGGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGG
ATTCTGAGA*GTAT*ACTCAGA*ACTGTCTCGAGTTTGAC**ATGTTCTTGCCA*GATCG
GT
AAGGAAAAA

QA 1 782 1 782
DS 

RD RS1BL92JQ 583 0 0
GTCTCAGAGAACCGGGCTTGTGATCAGGGCTCAGCAGAACGAGTCATTACCGGAAAGCAG
TCGCCGGTCTGTGATTGGGCTCGTTGCGGCTGGTTTAGTCGGTGGTTCGTTTGTTAAGTC
TGCCTTCGCCACCGAAGCTCTTGCTATCAAAGTTGGTCCTCCTCCACCTCCTTCCGGTGG
TCTACCTGGAACCGATAACTCAGACCAAGCAAGAGACTTTTCACTGAAACTTAAAGACAG
GTTTTACTTACAGCCATTGTCACCAACAGAAGCTGCAGCTAGGGCCAAAGAGTCTGCTAA
AGAGATCATTAACGTTAAGTCCTTGATCGACAAAAAAGCGTGGCCTTACGTTCAGAATGA
TCTCCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGATCTTAACACCGTTATTTCCGCTAAGCC
TAAGGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAACTCTTCCAAACCATCGACAA
CCTGGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGAAGTATTACTCAGAGAC
TGTCTCGAGTTTGAACAATGTTCTTGCTAAGATTGGTTAAGGA

QA 1 583 1 583
DS 

RD RS1AY46TF 749 0 0
GG
AAAGCAGCAACAGAAAAAAATGGCTCAAGCAGTGACTTCGATGGCTGGTTTACGTGGTGC
ATCTCAGGCTGTTCTTGAAGGAAGTTTCCAGAACAATGGCTCAAACCGTT*GAACATCTC
CAGAGCCACGGTCCGGTCTCAGAGAACCGGGCTTGTGACCAGGGCTCAGCAGAACGAGTC
AGTACCAGAAAGCAGTCGCCGGTCTGTGATTGGGCTCGTTGCGGCTGGTTTAGTCGGTGG
TTCGTTCGTTAAGTCTGCCTTCGCCACCGAAGCTCTTGCTATCAAAGTTGGTCCTCCTCC
ACCTCCTTCCGGTGGTCTACCTGGAACCGATAACTCAGACCAAGCAAGAGACTTTTCACT
GAAACTGAAAGACAGGTTTTACTTACAGCCATTGTCACCAACAGAAGCTGCAGCTAGGGC
CAAAGAGTCTGCTAAAGAGATCATTAACGTTAAGTCTTTGATCGACAAAAAAGCGTGGCC
CTACGTTCAGAATGATCTCCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGATCTTAACACCGT
TATCTCCGCTAAGCCTAAGGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGCTCTT
CCAAACCATCGACAACCTGGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGAA
GTAT*ACTCAGAAACTGTCTCGAGTTTGAAC*ATGT*CTTGCCAAGATCGGT**AAGAAG
AA*GAT*TGCTCTGTAATGTATTGTTG

QA 3 749 3 749
DS 

RD RS1BL92TF 839 0 0
GAG
CAATTATTTTCAAAGCAGCAACAGAAAAAAATGGCTCAAGCAGTGACTTCGATGGCTGGT
TTACGTGGTGCATCTCAGGCTGTTCTTGAAGGAAGTTTCCAGAACAATGGCTCAAACCGT
TTGAACATCTCCAGAGCCACGGTCCGGTCTCAGAGAACCGGGCTTGTGATCAGGGCTCAG
CAGAACGAGTCATTACCGGAAAGCAGTCGCCGGTCTGTGATTGGGCTCGTTGCGGCTGGT
TTAGTCGGTGGTTCGTTTGTTAAGTCTGCCTTCGCCACCGAAGCTCTTGCTATCAAAGTT
GGTCCTCCTCCACCTCCTTCCGGTGGTCTACCTGGAACCGATAACTCAGACCAAGCAAGA
GACTTTTCACTGAAACTTAAAGACAGGTTTTACTTACAGCCATTGTCACCAACAGAAGCT
GCAGCTAGGGCCAAAGAGTCTGCTAAAGAGATCATTAACGTTAAGTCCTTGATCGACAAA
AAAGCGTGGCCTTACGTTCAGAATGATCTCCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGAT
CTTAACACCGTTATCTCCGCTAAGCCTAAGGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACC
GGCAAACTCTTCCAAACCATCGACAACCTGGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCG
GATGCTGAGAAGTATTACTCAGAGACTGTCTCGAGTTTGAACAATGTTCTTGCTAAGATT
GGTTAAAGAAGAAAGATCTGCTCTGTAATGTATTGTTGTTGTTATTACTATCCAAGTACT
ATTGTCTTTCTCCTCCTCTTTCTTTCTGATCAAATCGGTTATATTTAACTTCAGTT

QA 4 839 4 839
DS 

RD RS1H734TF 456 0 0
G
GAAACTGAAAGACAGGTTTTACTTACAGCCATTGTCACCAACAGAAGCTGCAGCTAGGGC
CAAAGAGTCTGCTAAAGAGATCATTAACGTTAAGTCTTTGATCGACAAAAAAGCGTGGCC
TTACGTTCAGAATGATCTCCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGATCTTAACACCGT
TATCTCCGCTAAGCCTAAGGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAACTCTT
CCAAACCATCGACAACCTGGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGAA
GTATTACTCAGAGACTGTCTCGAGTTTGAACAATGTTCTTGTTAAGATTGGTTAAGGAAG
AAAGATCTGCTCTGTAATGTATTGTTGTTGTTATTACTATCCAAGTACTATTGTCTTTCT
CCTCCTCTTTCTTTCTGATCAAATCGGTTATATTT

QA 2 456 2 456
DS 

RD RS1FQ82TF 773 0 0
G
GTGGTGCATCTCAGGCTGTTCTTGAAGGAAGTTTCCAGAACAATGGCTCAAACCGTTTGA
ACATCTCCAGAGCCACGGTCCGGTCTCAGAGAACCGGGCTTGTGATCAGGGCTCAGCAGA
ACGAGTCATTACCGGAAAGCAGTCGCCGGTCTGTGATTGGGCTCGTTGCGGCTGGTTTAG
TCGGTGGTTCGTTTGTTAAGTCTGCCTTCGCCACCGAAGCTCTTGCTATCAAAGTTGGTC
CTCCTCCACCTCCTTCCGGTGGTCTACCTGGAACCGATAACTCAGACCAAGCAAGAGACT
TTTCACTGAAACTGAAAGACAGGTTTTACTTACAGCCATTGTCACCAACAGAAGCTGCAG
CTAGGGCCAAAGAGTCTGCTAAAGGGATCATTAACGTTAAGTCTTTGATCGACAAAAAAG
CGTGGCCTTACGTTCAGAATGATCTCCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGATCTTA
ACACCGTTATCTCCGCTAAGCCTAAGGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCA
AACTCTTCCAAACCATCGACAACCTGGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATG
CTGAGAAGTATTACTCAGAGACTGTCTCGAGTTTGAACAATGTTCTTGCTAAGATTGGTT
AAAGAAGAAAGATCTTCTCTGTAATGTATTGTTGTTGTTATTACTATCCAAGTACTATTG
TCTTTCTCCTCCTCTTTCTTTCTGATCAAATCGGTTATATTTAATTTCAGTT

QA 2 773 2 773
DS 

RD RS1AY46JQ 821 0 0
AAAAT
GCTCAAGCAGTGACTTCGATGGCTG*TTTACGTGGTGCATCTCAGGCTGT*CTTGAAGGA
AGTTTCCAGAACAATGGCTCAAACCGTT*GAACATCTCCAGAGCCACGGTCCGGTCTCAG
AGAACCGGGCTTGTGACCAGGGCTCAGCAGAACGAGTCAGTACCAGAAAGCAGTCGCCGG
TCTGTGATTGGGCTCGTTGCGGCTGGTTTAGTCGGTGGTTCGTTCGTTAAGTCTGCCTTC
GCCACCGAAGCTCTTGCTATCAAAGTTGGTCCTCCTCCACCTCCTTCCGGTGGTCTACCT
GGAACCGATAACTCAGACCAAGCAAGAGACTTTTCACTGAAACTGAAAGACAGGTTTTAC
TTACAGCCATTGTCACCAACAGAAGCTGCAGCTAGGGCCAAAGAGTCTGCTAAAGAGATC
ATTAACGTTAAGTCTTTGATCGACAAAAAAGCGTGGCCCTACGTTCAGAATGATCTCCGT
TTAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGATCTTAACACCGTTATTTCCGCTAAGCCTAAGGAA
GAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGCTCTTCCAAACCATCGACAACCTGGAC
TATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGAAGTATTACTCAGAAACTGTCTCG
AGTTTGAACAATGTTCTTGCCAAGATCGGTTAAGGAAGAAAGATTTGCTCTGTAATGTAT
TGTTGTTGCTATTACTATCCAAGTACTATTGTCTTTCTCCTCCTCTTCCTTTCTGATCAA
ATCGGTTATATTTAATTTCAGTTTCAAGTTTTAGCC

QA 6 821 6 821
DS 

RD RS1CL55JQ 754 0 0
TTCCAGAACAATGGCTCAAACCGTTTGAACATCTCCAGAGCCACGGTCCGGTCTCAGAGA
ACCGGGCTTGTGATCAGGGCTCAGCAGAACGAGTCAGTACCAGAAAGCAGTCGCCGGTCT
GTGATTGGGCTCGTTGCGGCTGGTTTAGTCGGTGGTTCGTTCGTTAAGTCTGCCTTCGCC
ACCGAAGCTCTTGCTATCAAAGTTGGTCCTCCTCCACCTCCTTCCGGTGGTCTACCTGGA
ACCGATAACTCAGACCAAGCAAGAGACTTTTCACTGAAACTGAAAGACAGGTTTTACTTA
CAGCCATTGTCACCAACAGAAGCTGCAGCTAGGGCCAAAGAGTCTGCTAAAGAGATCATT
AACGTTAAGTCTTTGATCGACAAAAAAGCGTGGCCCTACGTTCAGAATGATCTCCGTTTA
AGAGCATCGTACCTCCGTTACGATCTTAACACCGTTATCTCCGCTAAGCCTAAGGAAGAG
AAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGCTCTTCCAAACCATCGACAACCTGGACTAT
GCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATTCTGAGAAGTATTACTCAGAAACTGTCTCGAGT
TTGAACAATGTTCTTGCCAAGATCGGTTAAGGAAGAAAGATTTGCTCTGTAATGTATTGT
TGTTGCTATTACTATCCAAGTACTATTGTCTTTCTCCTCCTCTTCCTTTCTGATCAAATC
GGTTATATTTAATTTCAGTTTCAAGTTTTAGCCT

QA 1 754 1 754
DS 



CO CL48Contig2 879 9 21 U
GGAAAACAAATCTCTTCTAACAATTATTTTCAAAGCAGCAACAGAAAAAAATGGCTCAAG
CAATGACTTCGATGGCTGGTCTACGTGGTGCATCTCAGGCTCTCCAGACCAATGACTCAA
ACCGTCTGAACATCTCTAGAGTCACCGTTGGGTCTAAGAGAACCGGGCTTGTGATCAGGG
CTCAGCAGAACGAGTCAGTGCCGGAAAGTAGTCGCCGGTCTGTGATTGGACTCGTGGCGG
CTGGTTTAGTCGGTGGTTCGTTCGTTAAGTCTGCCTTCGCCACCGAAGCTCTTGCGATTA
AAGTTGGTCCTCCTCCACCTCCTTCCGGTGGTCTACCTGGAACAGATAACTCAGACCAAG
CAAGAGACTTTTCACTGAAACTGAAAGACAGGTTTTACTTACAGCCATTGTCACCAACAG
AAGCTGCAGCTAGGGCCAAAGAATCTGCTAAAGAGATCATTAACGTTAAGTCTTTGATCG
ACAAAAAAGCGTGGCCTTACGTCCAGAACGATCTCCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTT
ACGATCTTAACACCGTTATCTCCGCCAAGCCTAAGGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAAC
TCACCGGCAAGCTCTTCCAAACCATCGACAACCTGGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCA
GCCCGGATGCTGAGAAGTATTACTCAGAAACTGTCTCGAGTTTGAACAATGTACTTGCCA
AGATCGGTTAAGGAAGAAAGATTTGCTCTGTAATGTATTGTTGTTGCTATTACTATCCAA
GTACTATTGTCTTTCTCCTCCTCTTCCTTTCTGATCAAATCGGTTATATTTAATTTCAGT
TTCAAGTTTTAGCCAAGAACATAGTCATATAATCACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 45 30 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 35 35 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B053TF U 24
AF RS1GS39TF U 1
AF RS1FA39JQ C 24
AF RS1B053JQ C 127
AF RS1BC16TF U 28
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AF RS1GS39JQ C 38
AF RS1BC16JQ C 133
AF RS1G377TF U 209
BS 1 246 RS1GS39TF
BS 247 247 RS1B053TF
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BS 425 588 RS1GS39TF
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BS 744 744 RS1FA39TF
BS 745 793 RS1BC16TF
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BS 844 854 RS1GS39JQ
BS 855 879 RS1BC16JQ

RD RS1B053TF 608 0 0
GGA
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GGTGCATCTCAGGCTCTCCAGACCAATGACTCAAACCGTCTGAACATCTCTAGAGTCACC
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AGTAGTCGCCGGTCTGTGATTGGACTCGTGGCGGCTGGTTTAGTCGGTGGTTCGTTCGTT
AAGTCTGCCTTCGCCACCGAAGCTCTTGCGATTAAAGTTGGTCCTCCTCCACCTCCTTCC
GGTGGTCTACCTGGAACAGATAACTCAGAC*AAGCAAGAGACTTTTCACTGAAACTGAAA
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GCTAAAGAGATCATTAACGTTAAGTCTTTGATCGACAAAAAAGCGTGGCCCTACGTCCAG
AACGATCTCCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGATCTTAACACCGTTATCTCCGCC
AAGCCTAAAGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGCTCTTCCAAACCATC
GACA
C

QA 4 607 4 607
DS 

RD RS1GS39TF 723 0 0
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ACCGTCTGAACATCTCTAGAGTCACCGTTGGGTCTAAGAGAACCGGGCTTGTGATCAGGG
CTCAGCAGAACGAGTCAGTGCCGGAAAGTAGTCGCCGGTCTGTGATTGGACTCGTGGCGG
CTGGTT*AGTCGGTGGTTCGTTCGTTAAGTCTGCCTTCGCCACCGAAGCTCTTGCGATTA
AAGTTGGTCCTCCTCCACCTCCTTCCGGTGGTCTACCTGGAACAGATAACTCAGACCAAG
CAAGAGACTTTTCACTGAAACTGAAAGACAGGTTTTACTTACAGCCATTGTCACCAACAG
AAGTTGCAGCTAGGGCCAAAGAATCTGCTAAAGAGATCATTAACGTTAAGTCTTTGATCG
ACAAAAAAGCGTGGCCTTACGTCCAGAACGATCTCCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTT
ACGATCTTAACACCGTTATCTCCGCCAAGCCTAAGGAAGAGAAACAGATCCTCAAAGAAC
TCACCGGCAAGCTCTTCCAAACCATCGACAACCTGGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCA
GCCCGGATGCTGAGAAGTATTACTCAGAAACTGTCTCGAGTTTGA
CATGTACTTGCCAGATCG

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DS 

RD RS1FA39JQ 772 0 0
GGA
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GTTGGGTCTAAGAGAACCGGGCTTGTGATCAGGGCTCAGCAGAACGAGTCAGTGCCGGAA
AGTAGTCGCCGGTCTGTGATTGGACTCGTGGCGGCTGGTTTAGTCGGTGGTTCGTTCGTT
AAGTCTGCCTTCGCCACCGAAGCTCTTGCGATTAAAGTTGGTCCTCCTCCACCTCCTTCC
GGTGGTCTACCTGGAACAGATAACTCAGACCAAGCAAGAGACTTTTCACTGAAACTGAAA
GACAGGTTTTACTTACAGCCATTGTCACCAACAGAAGCTGCAGCTAGGGCCAAAGAATCT
GCTAAAGAGATCATTAACGTTAAGTCTTTGATCGACAAAAAAGCGTGGCCTTACGTCCAG
AACGATCTCCGTTTAAGAGCATCATACCTCCGTTACGATCTTAACACCGTTATCTCCGCC
AAGCCTAAGGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGCTCTTCCAAACCATC
GACAACCTGGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGAAGTATTACTCA
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TCTGTAATGTATTGTTGTTGCTATTACTATCCAAGTACTATTGTCTTTC

QA 4 772 4 772
DS 

RD RS1B053JQ 666 0 0
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AGAACGAGTCAGTGCCGGAAAGTAGTCGCCGGTCTGTGATTGGACTCGTGGCGGCTGGTT
TAGTCGGTGGTTCGTTCGTTAAGTCTGCCTTCGCCACCGAAGCTCTTGCGATTAAAGTTG
GTCCTCCTCCACCTCCTTCCGGTGGTCTACCTGGAACAGATAACTCAGAC*AAGCAAGAG
ACTTTTCACTGAAACTGAAAGACAGGTTTTACTTACAGCCATTGTCACCAACAGAAGCTG
CAGCTAGGGCCAAAGAATCTGCTAAAGAGATCATTAACGTTAAGTCTTTGATCGACAAAA
AAGCGTGGCCCTACGTCCAGAACGATCTCCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGATC
TTAACACCGTTATCTCCGCCAAGCCTAAGGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCG
GCAAGCTCTTCCAAACCATCGACAACCTGGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGG
ATGCTGAGAAGTATTACTCAGAAACTGTCTCGAGTTTGAACAATGTACTTGCCAAGATCG
GTTAAGGAAGAAAGATTTGCTCTGTAATGTATTGTTGTTGCTATTACTATCCAAGTACTA
TTGTC
C

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DS 

RD RS1BC16TF 774 0 0
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GTGCATCTCAGGCTCTCCAGACCAATGACTCAAACCGTCTTAACATCTCTAGAGTCACCG
TTGGGTCTAAGAGAACCGGGCTTGTGATCAGGGCTCAGCAGAACGAGTCAGTGCCGGAAA
GTAGTCGCCGGTCTGTGATTGGACTCGTGGCGGCTGGTTTAGTCGGTGGTTCGTTCGTTA
AGTCTGCCTTCGCCACCGAAGCTCTTGCGATTAAAGTTGGTCCTCCTCCACCTCCTTCCG
GTGGTCTACCTGGAACAGATAACTCAGACCAAGCAAGAGACTTTTCACTGAAACTGAAAG
ACAGGTTTTACTTACAGCCATTGTCACCAACAGAAGCTGCAGCTAGGGCCAAAGAATCTG
CTAAAGAGATCATTAACGTTAAGTCTTTGATCGACAAAAAAGCGTGGCCTTACGTCCAGA
ACGATCTCCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGATCTTAACACCGTTATCTCCGCCA
AGCCTAAGGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGCTCTTCCAAACCATCG
ACAACCTGGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGAAGTAT*ACTCAG
AAACTGTCTCGAGTTTGA*CAATGTACTTGCCA*GATCGGTTAAG*AAGAA*GATT*GCT
CTGTAATGTATTGTTGTTGCTATTACTATCCAAGTACTATTGTCTT
CTCCCCTC

QA 1 766 1 766
DS 

RD RS1FA39TF 777 0 0
T
TTTTCAAAGCAGCAACAGAAAAAAATGGCTCAAGCAATGACTTCGATGGCTGGTCTACGT
GGTGCATCTCAGGCTCTCCAGACCAATGACTCAAACCGTCTGAACATCTCTAGAGTCACC
GTTGGGTCTAAGAGAACCGGGCTTGTGATCAGGGCTCAGCAGAACGAGTCAGTGCCGGAA
AGTAGTCGCCGGTCTGTGATTGGACTCGTGGCGGCTGGTTTAGTCGGTGGTTCGTTCGTT
AAGTCTGCCTTCGCCACCGAAGCTCTTGCGATTAAAGTTGGTCCTCCTCCACCTCCTTCC
GGTGGTCTACCTGGAACAGATAACTCAGACCAAGCAAGAGACTTTTCACTGAAACTGAAA
GACAGGTTTTACTTACAGCCATTGTCACCAACAGAAGCTGCAGCTAGGGCCAAAGAATCT
GCTAAAGAGATCATTAACGTTAAGTCTTTGATCGACAAAAAAGCGTGGCCTTACGTCCAG
AACGATCTCCGTTTAAGAGCATCATACCTCCGTTACGATCTTAACACCGTTATCTCCGCC
AAGCCTAAGGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGCTCTTCCAAACCATC
GACAACCTGGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGAAGTATTACTCA
GAAACTGTCTCGAGTTTGAACAATGTACTTGCCAAGATCGGTTAAG*AAGAAAGATTTGC
TCTGTAATGTATTGTTGTTGCTAT*ACTATCCAAGTACTATTGTCTTTC
AAAAAAA

QA 2 770 2 770
DS 

RD RS1GS39JQ 818 0 0
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GGCTCTCCAGACCAATGACTCAAACCGTCTGAACATCTCTAGAGTCACCGTTGGGTCTAA
GAGAACCGGGCTTGTGATCAGGGCTCAGCAGAACGAGTCAGTGCCGGAAAGTAGTCGCCG
GTCTGTGATTGGACTCGTGGCGGCTGGTT*AGTCGGTGGTTCGTTCGTTAAGTCTGCCTT
CGCCACCGAAGCTCTTGCGATTAAAGTTGGTCCTCCTCCACCTCCTTCCGGTGGTCTACC
TGGAACAGATAACTCAGACCAAGCAAGAGACTTTTCACTGAAACTGAAAGACAGGTTTTA
CTTACAGCCATTGTCACCAACAGAAGTTGCAGCTAGGGCCAAAGAATTTGCTAAAGAGAT
CATTAACGTTAAGTCTTTGATCGACAAAAAAGCGTGGCCTTACGTCCAGAACGATCTCCG
TTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGATCTTAACACCGTTATTTCCGCCAAGCCTAAGGA
AGAGAAACAGATCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGCTCTTCCAAACCATCGACAACCTGGA
CTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGAAGTATTACTCAGAAACTGTCTC
GAGTTTGAACAATGTACTTGCCAAGATCGGTTAAGGAAGAAAGATTTGCTCTGTAATGTA
TTGTTGTTGCTATTACTATCCAAGTACTATTGTCTTTCTCCTCCTCTTCCTTTCTGATCA
AATCGGTTATATTTAATTTCAGTTTCAAGTTTTAGCC
G

QA 1 817 1 817
DS 

RD RS1BC16JQ 747 0 0
TCTCTAGAGTCACCGTTGGGTCTAAGAGAACCGGGCTTGTGATCAGGGCTCAGCAGAACG
AGTCAGTGCCGGAAAGTAGTCGCCGGTCTGTGATTGGACTCGTGGCGGCTGGTTTAGTCG
GTGGTTCGTTCGTTAAGTCTGCCTTCGCCACCGAAGCTCTTGCGATTAAAGTTGGTCCTC
CTCCACCTCCTTCCGGTGGTCTACCTGGAACAGATAACTCAGACCAAGCAAGAGACTTTT
CACTGAAACTGAAAGACAGGTTTTACTTACAGCCATTGTCACCAACAGAAGCTGCAGCTA
GGGCCAAAGAATCTGCTAAAGAGATCATTAACGTTAAGTCTTTGATCGACAAAAAAGCGT
GGCCTTACGTCCAGAACGATCTCCGTTTAAGAGCATCGTACCTCCGTTACGATCTTAACA
CCGTTATTTCCGCCAAGCCTAAGGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGC
TCTTCCAAACCATCGACAACCTGGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTG
AGAAGTATTACTCAGAAACTGTCTCGAGTTTGAACAATGTACTTGCCAAGATCGGTTAAG
GAAGAAAGATTTGCTCTGTAATGTATTGTTGTTGCTATTACTATCCAAGTACTATTGTCT
TTCTCCCCCTCTTCCTTTCTGATCAAATCGGTTGTATTTAATTTCAGTTTCAAGTTTTAG
CCAAGAACATAGTCATATAATCACTCC

QA 1 747 1 747
DS 

RD RS1G377TF 639 0 0
G
AGTCGCCGGTCTGTGATTGGACTCGTGGCGGCTGGTTTAGTCGGTGGTTCGTTCGTTAAG
TCTGCCTCCGCCACCGAAGCTCTTGCGATTAAAGTTGGTCCTCCTCCACCTCCTTCCGGT
GGTCTACCTGGAACAGATAACTCAGACCAAGCAAGAGACTTTTCACTGAAACTGAAAGAC
AGGTTTTACTTACAGCCATTGTCACCAACAGAAGCTGCAGCTAGGGCCAAAGAATCTGCT
AAAGAGATCATTAACGTTAAGTCTTTGATCGACAAAAAAGCGTGGCCTTACGTCCAGAAC
GATCCCCGTTTAAGAGCATCGCACCTCCGTTACGATCTTAACACCGTTATCTCCGCCAAG
CCTAAGGAAGAGAAACAGAGCCTCAAAGAACTCACCGGCAAGCTCTTCCAAACCATCGAC
AACCTGGACTATGCGGCGAGGTCAAAGAGCAGCCCGGATGCTGAGAAGTATTACTCAGAA
ACTGTCTCGAGTTTGAACAATGTACTTGCCAAGATCGGTTAAGGAAGAAAGATTTGCTCT
GTAATGTATTGTTGTTGCTATTACTATCCAAGTACTATTGTCTTTCTCCTCCTCTTCCTT
TCTGATCAAATCGGTTATATTTAATTTCAGTTTC
CAAA

QA 2 635 2 635
DS 



AS 1 15

CO CL49Contig1 1079 15 44 U
GCTTAAAAATAGAGGAACATATAAATTTCATTATTTTTATTCAACTTTTGAGGAGAATCA
CACAGAAGAAACATAAGTAATGAAGTCAAAGCAAAGTTTTCAAGCAAATGTTATCTTGGC
AAAAATAAAAACTGAGCTCTCCAACACAGGAAAAAGATAAACATGTCCTCTGCTTTTTCA
CCGAACATATGTTTTATATGAAA*GACTCTTAAATAGCTGAAAAATACTCTTTGCTGAGC
TTGGGGTCAGGTTTCATCGATTTCTCCCCAGGCTTCCATCCCGCGGGGCAGACCTCATCA
GGGTTTTCTTGAACATACTGTAATGCCTGGAGGGTTCTCATTGTCTCATCAACGCTTCGG
CCAATACCGAGGTTGTTGATGGTGGAATGCTGGATGACTCCTTCCTTGTCGATGATGAAA
AGCCCTCTCAATGCAATGCCCTGATCAGGGATGAGCACTCCAAACGATTTAGAAATGGAT
TTGGTGATATCCGAGACGAGTGGGTAGTTCAGATCACCGAGCCCTCCTGACTTTCTGTCT
GTTTGGACCCACGCAAGATGCGAGAACACACTGTCGACTGAGACACCTAACACTTCGGTG
TTTAGCTTCTCAAACTCTTCATAACGGTCACTGAAGGCAGTAATCTCTGTAGGGCAGACA
AAAGTGAAGTCCAATGGGTAGAAAAATAGAATCACATATTTTTTACCAATGTACTCTGAG
AGCTTCACCTTGATGAACTCTTGATCAAAAACAGCCTCTGCCTCAAAATCAGGCGCCCTA
TTACCAACTAGTGGCAAATCATCGGCCTGGGCCTTGACGGCGAAGCTACGGCGAGTGGAA
GAGCTGCTGTTGGAGG***TGAGGGGACCGATGCGGGAGAAACCGGAGCAGAGAGAAGAC
GGTGATGATGCAGATGAAGAGGGAAGAGTTCGGAGGAAAGAGGCGGCGGGAGAAAAGAGA
GAAGGCTTGGAGGGGAGAACTCTAGCGGAAGAGATAAGGGTGGTGGATGAAGCTAAGGAC
GCCATGGACTGAAAGTACTCTGCTCTCTCTCTCCGTGTGACACAGTGCTCTACAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 45 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 60 60 60 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 30 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 50 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 25 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 
50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 20 20 20 20 40 40 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1GV91JQ U 1
AF RS1EV85TF C 23
AF RS1DX86JQ U 14
AF RS1FX84JQ U 21
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AF RS1EH79TF C 279
AF RS1GL07JQ U 21
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AF RS1AE25JQ U 21
AF RS1BN10TF C 311
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AF RS1GV91TF C 531
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BS 391 451 RS1GV91JQ
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BS 456 471 RS1GV91JQ
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BS 851 856 RS1AE25JQ
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BS 882 885 RS1BN10TF
BS 886 887 RS1AE25JQ
BS 888 989 RS1BN10TF
BS 990 990 RS1F148TF
BS 991 1022 RS1BN10TF
BS 1023 1079 RS1F148TF

RD RS1GV91JQ 475 0 0
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CCGAACATATGTTTTATATGAAA*GACTCTTAAATAGCTGAAAAATACTCTTTGCTGAGC
TTGGGGTCAGGTTTCATCGATTTCTCCCCAGGCTTCCATCCCGCGGGGCAGACCTCATCA
GGGTTTTCTTGAACATACTGTAATGCCTGGAGGGTTCTCATTGTCTCATCAACGCTTCGG
CCAATACCGAGGTTGTTGATGGTGGAATGTTGGATGACTCCTTCCTTGTCGATGATGAAA
AGCCCTCTCAATGCAATGCCCTGATCAGGGACGAACACTCCAAACGATTTA
AAAA

QA 1 471 1 471
DS 

RD RS1EV85TF 419 0 0
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AAGTCAAAGCAAAGTTTTCAAGCAAATGTTATCTTGGCAAAAATAAAAACTGAGCTCTCC
AACACAGGAAAAAGATAAACATGTCCTCTGCTTTTTCACCGAACATATGTTTTATATGAA
A*GACTCTTAAATAGCTGAAAAATACTCTTTGCTGAGCTTGGGGTCAGGTTTCATCGATT
TCTCCCCAGGCTTCCATCCCGCGGGGCAGACCTCATCAGGGTTTTCTTGAACATACTGTA
ATGCCTGGAGGGTTCTCATTGTCTCATCAACGCTTCGGCCAATACCGAGGTTGTCGATGG
TGGAATGCTGGATGACTCCTTCCTTGTCGATGATGAAAAGCCCTCTCAATGCAATGCCC

QA 1 419 1 419
DS 

RD RS1DX86JQ 624 0 0
GGAA
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TCTCCAACACAGGAAAAAGATAAACATGTCCTCTGTTTTTTCACCGAACATATGTTTTAT
ATGAAAAGCCTCTTAAATAGCTGAAAAATACTCTTTGCTGAGCTTGGGGTCAGGTTTCAT
CGATTTCTCCCCAGGCTTCCATCCCGCGGGGCAGACCTCATCAGGGTTTTCTTGAACATA
CTGTAATGCCTGGAGGGTTCTCATTGTCTCATCAACACTTCGGCCAATACCGAGGTTGTT
GATGGTGGAATGCTGGATAACTCCTTCCTTGTCGATGATGAAAAGCCCTCTCAATGCAAT
GCCTTGATCAGGGATGAGCACTCCAAACGATTTTGAAATGGATTTGGTGATATCCGAGAC
GAGTGGGTAGTTCAGATCACCGAGCCCTCCTGACTTTCTGTCTGTTTGGACCCACGCAAG
ATGCGAGAACACACTATCGACTGAGACACCTAACACTTCGGTGTTTAGCTTCTCAAACTC
TTCATAACGGTCACTGAAGG

QA 5 624 5 624
DS 

RD RS1FX84JQ 617 0 0
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TGAAGTCAAAGCAAAGTTTTCAAGCAAATGTTATCTTGGCAAAAATAAAAACTGAGCTCT
CCAACACAGGAAAAAGATAAACATGTCCTCTGCTTTTTCACCGAACATATGTTTTATATG
AAA*GACTCTTAAATAGCTGAAAAATACTCTTTGCTGAGCTTGGGGTCAGGTTTCACCGA
TTTCTCCCCAGGCTTCCATCCCGCGGGGCAGACCTCATCAGGGTTTTCTTGAACATACTG
TAATGCCTGGAGGGTTCTCATTGTCTCATCAACGCTTCGGCCAATACCGAGGTTGTTGAT
GGTGGAATGCTGGATGACTCCTTCCTTGTCGATGATGAAAAGCCCTCTCAATGCAATGCC
CTGATCAGGGATGAGCACTCCAAACGATTTAGAAATGGATTTGGTGATATCCGAGACGAG
TGGGTAGTTCAGATCACCGAGCCCTCCTGACTTTCTGTCTGTTTGGACCCACGCAAGATG
CGAGAACACACTGTCGACTGAGACACCTAGCACTTCGGTGTTTAGCTTCTCAAACTCTTC
ATAACGGTCACTGAAGG

QA 1 617 1 617
DS 

RD RS1GG91JQ 737 0 0
AGA
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TAATAAAGTCAAAGCAAAGTTTTCAAGCAAATGTTATCTTGGCAAAAATAAAAACTGAGC
TCTCCAACACAGGAAAAAGATAAACATGTCCTCTGTTTTTTCACCGAACATATGTTTTAC
ATGAAAAGCCTCTTAAATAGCTGAAAAATACTCTTTGCTGAGCTTGGGGTCAGGTTTCAT
CGATTTCTCCCCAGGCTTCCATCCCGCGGGGCAGACCTCATCAGGGTTTTCTTGAACATA
CTGTAATGCCTGGAGGGTTCTCATTGTCTCATCAACACTTCGGCCAATACCGAGGTTGTT
GATGGTGGAATGCTGGATGACTCCTTCCTTGTCGATGATGAAAAGCCCTCTCAATGCAAT
GCCTTGATCAGGGATGAGCACTCCAAACGATTTTGAAATGGATTTGGTGATATCCGAGAC
GAGTGGGTAGTTCAGATCACCGAGCCCTCCTGACTTTCTGTCTGTTTGGACCCACGCAAG
ATGCGAGAACACACTGTCGACTGAGACACCTAACACTTCGGTGTTTAGCTTCTCAAACTC
TTCATAACGGTCACTGAAGGCAGTAATCTCTGTGGGGCAGACAAAAGTGAAGTCCAATGG
ATAGAAAAACAGAATCACATACTTTTTACCAATGTACTCTGAGAGTTTCACCTTGATGAA
CTCTTGATCAAAAA

QA 4 737 4 737
DS 

RD RS1BN10JQ 730 0 0
AG
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TAATGAAGTCAAAGCAAAGTTTTCAAGCAAATGTTATCTTGGCAAAAATAAAAACTGAGC
TCTCCAACACAGGAAAAAGATAAACATGTCCTCTGCTTTTTCACCGAACATATGTTTTAT
ATGAAA*GACTCTTAAATAGCTGAAAAATACTCTTTGCTGAGCTTGGGGTCAGGTTTCAT
CGATTTCTCCCCAGGCTTCCATCCCGCGGGGCAGACCTCATCAGGGTTTTCTTGAACATA
CTGTAATGCCGGGAGGGTTCTCATTGTCTCATCAACGCTTCGGCCAATACCGAGGTTGTT
GATGGTGGAATGCTGGATGACTCCTTCCTTGTCGATGATGAAAAGCCCTCTCAATGCAAT
GCCCTGATCAGGGATGAGCACTCCAAACGATTTAAAAATGGATTTGGTGATATCCGAGAC
GAGTGGGTAGTTCAAATCACCGAGCCCTCCTGACTTTCTGTCTGTTTGGACCCACGCAAG
ATGCGAGAACACACTGTCGACTGAGACACCTAACACTTCGGTGTTTAGCTTCTCAAACTC
CTCATAACGGTCACTGAAGGCAGTAATCTCTGTAGGGCAGACAAAAGTGAAGTCCAATGG
GTAGAAAAATAGAATCACATATTTTTTACCAATGTACTCTGAGAGCTTCACCTTGATGAA
CTCTTGAT

QA 3 730 3 730
DS 

RD RS1EH79TF 473 0 0
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CTCATCAGGGTTTTCT*GAACATACTGTAATGCCTGGAGGGTTCTCATTGTCTCATCAAC
ACTTCGGCCAATACCGAGGTTGTTGATGGTGGAATGCTGGATGACTCTTTCCTTGTCGAT
GATGAAAAGCCCTCTCAATGCAATGCCTTGATCAGGGATGAGCACTCCAAACGATTTTGA
AATGGATTTGGTGATATCCGAGACGAGTGGGTAGTTCAGATCACCGAGCCCTCCTGACTT
TCTGTCTGTTTGGACCCACGCAAGATGCGAGAACACACTGTCGACTGAGACACCTAACAC
TTCGGTGTTTAGCTTCTCAAACTCTTCATAACGGTCACTGAAGGCAGTAATCTCTGTGGG
GCAGACAAAAGTGAAGTCCAATGGATAGAACAACAGAATCACATACTTTTTACCAATGTA
CTCTGAGAGTTTCACCTTGATGAACTCTTGATCAAAAA

QA 16 473 16 473
DS 

RD RS1GL07JQ 815 0 0
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TGAAGTCAAAGCAAAGTTTTCAAGCAAATGTTGTCTTGGCAAAAATAAAAACTGAGCTCT
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AAA*GACTCTTAAATAGCTGAAAAATACTCTTTGCTGAGCTTGGGGTCAGGTTTCATCGA
TTTCTCCCCAGGCTTCCATCCCGCGGGGCAGACCTCATCAGGGTTTTCTTGAACATACTG
TAATGCCTGGAGGGTTCTCATTGTCTCATCAACGCTTCGGCCAATACCGAGGTTGTTGAT
GGTGGAATGCTGGATGACTCCTTCCTTGTCGATGATGAAAAGCCCTCTCAATGCAATGCC
CTGATCAGGGATGAGCACTCCAAACGATTTAGAAATGGATTTGGTGATATCCGAGACGAG
TGGGTAGTTCAGATCACCGAGCCCTCCAGACTTTCTGTCTGTTTGGACCCACGCAAGATG
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ATAACGGTCACTGAAGGCAGTAATCTCTGTAGGGCAGACAAAAGTGAAGTCCAATGGGTA
GAAAAATAGAATCACATATTTTTTACCAATGTACTCTGAGAGCTTCACCTTGATGAACTC
TTGATCAAAAACAGCCTCTGCCTCAAAATCAGGCGCCCTATTACCAACTAGTGGCAAATC
ATCGGCCTGGGCCTTGACGGCGAAGCTACGGCGAG

QA 1 815 1 815
DS 

RD RS1F148JQ 795 0 0
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TGAAGTCAAAGCAAAGTTTTCAAGCAAATGTTGTCTTGGCAAAAATAAAAACTGAGCTCT
CCAACACAGGAAAAAGATAAACATGTCCTCTGCTTTTTCACCGAACATATGTTTTATATG
AAA*GACTCTTAAATAGCTGAAAAATACTCTTTGCTGAGCTTGGGGTCAGGTTTCATCGA
TTTCTCCCCAGGCTTCCATCCCGCGGGGCAGACCTCATCAGGGTTTTCTTGAACATACTG
TAATGCCTGGAGGGTTCTCATTGTCTCATCAACGCTTCGGCCAATACCGAGGTTGTTGAT
GGTGGAATGCTGGATGACTCCTTCCTTGTCGATGATGAAAAGCCCTCTCAATGCAATGCC
CTGATCAGGGATGAGCACTCCAAACGATTTAGAAATGGATTTGGTGATATCCGAGACGAG
TGGGTAGTTCAGATCACCGAGCCCTCCAGACTTTCTGTCTGTTTGGACCCACGCAAGATG
CGAGAACACAC*GTCGACTGAGACACCTAACACTTCGGTGTTTAGCTTCTCAAACTCTTC
ATAACGGTCACTGAAGGCAGTAATCTCTGTAGGGCAGACAAAAGTGAAGTCCAATGGGTA
GAAAAATAGAATCACATATTTTTTACCAATGTACTCTGAGAGCTTCACCTTGATGAACTC
TTGATCAAAAACAGCCTCTGCCTCAAAATCAGGCGCCCTATTACCAACTAGTGGCAAATC
ATCGGCCTGGGCCTT

QA 1 795 1 795
DS 

RD RS1AE25JQ 868 0 0
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TAAAGTCAAAGCAAAGTTTTCAAGCAAATGTTATCTTGGCAAAAATAAAAACTGAGCTCT
CCAACACAGGAAAAAGATAAACATGTCCTCTGTTTTTTCACCGAACATATGTTTTATATG
AAAAGCCTCTTAAATAGCTGAAAAATACTCTTTGCTGAGCTTGGGGTCAGGTTTCATCGA
TTTCTCCCCAGGCTTCCATCCCGCGGGGCAGACCTCATCAGGGTTTTCTTGAACATACTG
TAATGCCTGGAGGGTTCTCATTGTCTCATCAACACTTCGGCCAATACCGAGGTTGTTGAT
GGTGGAATGCTGGATGACTCCTTCCTTGTCGATGATGAAAAGCCCTCTCAATGCAATGCC
TTGATCAGGGATGAGCACTCCAAACGATTTTGAAATGGATTTGGTGATATCCGAGACGAG
TGGGTAGT*CAGATCACCGAGCCCTCCTGACTTTCTGTCTGTTTGGACCCACGCAAGATG
CGAGAACACACTGTCGACTGAGACACCTAACACTTCGGTGTTTAGCTTCTCAAACTCTTC
ATAACGGTCACTGAAGGCAGTAATCTCTGTGGGGCAGACAAAAGTGAAGTCCAATGGATA
GAAAAACAGAATCACATACTTTTTACCAATGTACTCTGAGAGTTTCACCTTGATGAACTC
TTGATCAAAAACAGCCTCTGCCTCAAAATCAGGCGCCTTATTACCGACCAGTGGCAAATC
ATCGGCCTGGGCCTTGACGGCGAAGTTACGGCGAGTGGAAGAGCTGCTGCTGGAGGAGGT
GAGGGGAACGATGCGGGAGCAGAGAGAA

QA 1 868 1 868
DS 

RD RS1BN10TF 712 0 0
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GGTTGTTGATGGTGGAATGCTGGATGACTCCTTCCTTGTCGATGATGAAAAGCCCTCTCA
ATGCAATGCCCTGATCAGGGATGAGCACTCCAAACGATTTAGAAATGGATTTGGTGATAT
CCGAGACGAGTGGGTAGTTCAGATCACCGAGCCCTCCTGACTTTCTGTCTGTTTGGACCC
ACGCAAGATGCGAGAACACACTGTCGACTGAGACACCTAACACTTCGGTGTTTAGCTTCT
CAAACTCCTCATAACGGTCACTGAAGGCAGTAATCTCTGTAGGGCAGACAAAAGTGAAGT
CCAATGGGTAGAAAAATAGAATCACATATTTTTTACCAATGTACTCTGAGAGCTTCACCT
TGATGAACTCTTGATCAAAAACAGCCTCTGCCTCAAAATCAGGCGCCTTATTACCAACTA
GTGGCAAATCATCGGCCTGGGCCTTGACGGCGAAGCTACGGCGAGTGGAAGAGCTGCTGT
TGGAGG***TGAGGGGACCGATGCGGGAGAAACCGGAGCAGAGAGAAGACGGTGATGATG
CAGATGAAGAGGGAAGAGTTCGGAGGAAAGAGGCGGCGGGAGAAAAGAGAGAAGGCTTGG
AGGGGAGAACTCTAGCGGAGGAGATAAGGGTGGTGGATGAAGCTAAGGACGC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RS1F148TF 635 0 0
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AATAGAATCACATATTTTTTACCAATGTACTCTGAGAGCTTCACCTTGATGAACTCTTGA
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GGACCGATGCGGGAGAAACCGGAGCAGAGAGAAGACGGTGATGATGCAGATGAAGAGGGA
AGAGTTCGGAGGAAAGAGGCGGCGGGAGAAAAGAGAGAAGGCTTGGAGGGGAGAACTCTA
GCGGAAGAGATAAGGGTGGTGGATGAAGCTAAGGACGCCATGGACTGAAAGTACTCTGCT
CTCTCTCTCCGTGTGACACAGTGCTCTACAAAAAA

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1GL07TF 431 0 0
GTAGGGCAGACAAAAGTGAAGTCCAATGGGTAGAAAAATAGAATCACATATTTTTTACCA
ATGTACTCTGAGAGCTTCACCTTGATGAACTCTTGATCAAAAACAGCCTCTGCCTCAAAA
TCAGGCGCCCTATTACCAACTAGTGGCAAATCATCGGCCTGGGCCTTGACGGCGAAGCTA
CGGCGAGTGGAAGAGCTGCTGTTGGAGG***TGAGGGGACCGATGCGGGAGAAACCGGAG
CAGAGAGAAGACGGTGATGATGCAGATGAAGAGGGAAGAGTTCGGAGGAAAGAGGCGGCG
GGAGAAAAGAGAGAAGGCTTGGAGGGGAGAACTCTAGCGGAAGAGATAAGGGTGGTGGAT
GAAGCTAAGGACGCCATGGACTGAAAGTACTCTGCTCTCTCTCTCCGTGTGACACAGTGC
TCTACAAAAAA

QA 1 431 1 431
DS 

RD RS1FX84TF 635 0 0
TCAGGGATGAGCACTCCAAACGATTTAGAAATGGATTTGGTGATATCCGAGACGAGTGGG
TAGTTCAGATCACCGAGCCCTCCTGACTTTCTGTCTGTTTGGACCCACGCAAGATGCGAG
AACACACTGTCGACTGAGACACCTAGCACTTCGGTGTTTAGCTTCTCAAACTCTTCATAA
CGGTCACTGAAGGCAGTAATCTCTGTAGGGCAGACAAAAGTGAAGTCCAATGGGTAGAAA
AATAGAATCACATATTTTTTACCAATGTACTCTGAGAGCTTCACCTTGATGAACTCTTGA
TCAAAAACAGCCTCTGCCTCAAAATCAGGCGCCTTATTACCAACTAGTGGCAAATCATCG
GCCTGGGCCTTGACGGCGAAGCTACGGCGAGTGGAAGAGCTGCTGTTGGAGG***TGAGG
GGACCGATGCGGGAGAAACCGGAGCAGAGAGAAGACGGTGATGATGCAGATGAAGAGGGA
AGAGTTCGGAGGAAAGAGGCGGCGGGAGAAAAGAGAGAAGGCTTGGAGGGGAGAACTCTA
GCGGAAGAGATAAGGGTGGTGGATGAAGCTAAGGACGCCATGGACTGAAAGTACTCTGCT
CTCTCTCTCCGTGTGACACAGTGCTCTACAAAAAA

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1GV91TF 549 0 0
CTTTCTGTCTGTTTGGACCCACGCAAGATGCGAGAACACACTGTCGACTGAGACACCTAA
CACTTCGGTGTTTAGCTTCTCAAACTCTTCATAACGGTCACTGAAGGCAGTAATCTCTGT
AGGGCAGACAAAAGTGAAGTCCAATGGGTAGAAAAATAGAATCACATATTTTTTACCAAT
GTACTCTGAGAGCTTTACCTTGATGAACTCTTGATCAAAAACAGCCTCTGCCTCAAAATC
AGGCGCCTTATTACCAACTAGTGGCAAATCATCGGCCTGGGCCTTGACGGCGAAGCTACG
GCGAGTGGAAGAGCTGCTGTTGGAGG***TGAGGGGACCGATGCGGGAGAAACCGGAGCA
GAGAGAAGACGGTGATGATGCAGATGAAGAGGGAAGAGTTCGGAGGAAAGAGGCGGCGGG
AGAAAAGAGAGAAGGCTTGGAGGGGAGAACTCTAGCGGAAGAGATAAGGGTGGTGGATGA
AGCTAAGGACGCCATGGACTGAAAGTACTCTGCTCTCTCTCTCCGTGTGACACAGTGCTC
TACAAAAAA

QA 1 549 1 549
DS 



AS 5 14

CO CL50Contig1 543 2 6 U
CTGAATTTAAAATGGTCTTTTTAACTAAAGAGCACAAATAAAAAAAAACAAGTCCAAAGT
AGAATTTAAAATAGGTCTTTTTAACTAAAGAGCACAAATAAAGAAAAACACAAGTCCAAA
GTAGTGGTGTTTACACCCATGTAATGGATGTAGTAACAAACTGAAACAAGAAACTCGAAG
TAACTCTTTTTTTTTTTGAATGCCGGAAAAGCAAAACAAAACTAGAACGGTGATTCTCAA
GCAGTAGCGGAAGGCTTGGCAGCAGCAAAAGAAAGTCTAGACCTCTTCTTTGCCAAACTC
TCACTCCTCTTGTCACGCTGTTCCTTCAACCTTGAGGTAAGAAGCTTCTGGTACTCAGCA
GCATCAGAGTTAGCCTTAGCAATCCTCTTCTCGGCGATTCTAGCTCTCTTCCTCTGAAGT
GTCAAAGGAGTCACAAGTCTCTGGATCTTGGGAGCTTTGCTCACTTCCTTACCTTTCTTG
TTTGTGAACTTGCGGCGGTAAGTGTTGACGTACTTCCTAACATCATCATCCTTGGTGAGG
TTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1A521TF C 1
AF RS1A521JQ U 16
BS 1 15 RS1A521TF
BS 16 159 RS1A521JQ
BS 160 160 RS1A521TF
BS 161 172 RS1A521JQ
BS 173 173 RS1A521TF
BS 174 543 RS1A521JQ

RD RS1A521TF 378 0 0
CTGAATTTAAAATGGTCTTTTTAACTAAAGAGCACAAATAAAAAAAAACAAGTCCAAAGT
AGAATTTAAAAT*GGTCTTTTTAACTAAAGAGCACAAATAAAGAAAAACACAAGTCCAAA
GTAGTGGTGTTTACACCCATGTAATGGATGTAGTAACAAACTGAAACAAGAAACTCGAAG
TAACTCTTTTTTTTTTTGAATGCCGGAGAAGCAAAACAAAACTAGAACGGTGATTCTCAA
GCAGTAGCGGAAGGCTTGGCAGCAGCAGAAGAAAGTCTAGACCTCTTCTTTGCCAAACTC
TCACTCCTCTTGTCACGCTGTTCCTTCAACCTTGAGGTAAGAAGCTTCTGGTACTCAGCA
GCATCAGAGTTAGCCTTA

QA 1 378 1 378
DS 

RD RS1A521JQ 528 0 0
TCTTTTTAACTAAAGAGCACAAATAAAAAAAAACAAGTCCAAAGTAGAATTTAAAATAGG
TCTTTTTAACTAAAGAGCACAAATAAAGAAAAACACAAGTCCAAAGTAGTGGTGTTTACA
CCCATGTAATGGATGTAGTAACAA*CTGAAACAAGAA*CTCGAAGTAACTCTTTTTTTTT
TTGAATGCCGGAAAAGCAAAACAAAACTAGAACGGTGATTCTCAAGCAGTAGCGGAAGGC
TTGGCAGCAGCAAAAGAAAGTCTAGACCTCTTCTTTGCCAAACTCTCACTCCTCTTGTCA
CGCTGTTCCTTCAACCTTGAGGTAAGAAGCTTCTGGTACTCAGCAGCATCAGAGTTAGCC
TTAGCAATCCTCTTCTCGGCGATTCTAGCTCTCTTCCTCTGAAGTGTCAAAGGAGTCACA
AGTCTCTGGATCTTGGGAGCTTTGCTCACTTCCTTACCTTTCTTGTTTGTGAACTTGCGG
CGGTAAGTGTTGACGTACTTCCTAACATCATCATCCTTGGTGAGGTTC

QA 1 528 1 528
DS 



CO CL50Contig2 965 3 12 U
CGAATTTAAAATGGTCTTTTAACTAAAGAGCACAAATCAAAAAACACAAGTCCAAAGTAG
TGGTGTTTACACCCATGTAATGGATGTAGTAACAACTGAAACAAGAACTCGAAGTAACTC
TTTTTTTTTTGGAATGCCGGAAAAGCAAAACAAAACTAGGAATGGTGATTCTCAAGCAGT
AACGGAAGGCTTGGCAGCAGCAAAAAAAAGTCTAAATCTCTTCTTTGCCAAACTCTCACT
CCTCTTGTCACGCTGTTCCTTCAACCTTGAGGCAAGAAGCTTCTGGTACTCAGCAGCATC
AGAGTTAGCCTTAGCGATCCTCTTCTTCTTGTCGGCGATTCTAGCTCTCTTCCTCTGAAG
TGTCAAAGGAGTCACAAGCCTCTGGATCTTGGGAGCTTTGCTCACTTCCTTACCTTTCTT
GTTTGTGAACTTGCGACGGTAAGTATTGACATACTTACTCACATCATCATCCTTAGTGAG
GTTGAACAGTTTACGGATCTTAAAAGCTCTCTTAGGTCCCCTCATTCTTGGCTTCTCGGT
ATCGGTAAGCCCGGGAAGATCCTTCTCACCCTTCTCGACAATGACAAGGTTGAGAACAGA
GAGATCTTGGCTGACAATGCAACCACGAACAGACTTTCATCTCCTCTCTCCAGTCCTCCT
TCCGTGTCCTCTGAAGCAAGGAGTTCCTCGGTGAAGCAAAAGGCGGACACGGCCAGGAGT
TAGAACTCCCTGCTTCATTGGGAAACCTTGCTTGTCACACCCACCCATGATCTTGAAAAC
GTATCCTTTGAACTCCTCGCCCAAAGCATCTCCACTGACTTCTTGGGAGAGTCTCTTATC
ATAAAAAGCACGGAGTTTCTGGTCATCGTCGATCTCGAGCTTCTTCTGGCAACCAGTGAT
TGGATTCGCGACGTTGAACTTCATCTTCTCAGGTCGACTACAGCCACGAGAGAAAGACGG
CTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1B201JQ U 1
AF RS1AN90JQ U 205
AF RS1AN90TF C 263
BS 1 301 RS1B201JQ
BS 302 302 RS1AN90JQ
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BS 560 560 RS1AN90JQ
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BS 576 576 RS1AN90JQ
BS 577 598 RS1B201JQ
BS 599 965 RS1AN90TF

RD RS1B201JQ 598 0 0
CGAATTTAAAATGGTCTTTTAACTAAAGAGCACAAATCAAAAAACACAAGTCCAAAGTAG
TGGTGTTTACACCCATGTAATGGATGTAGTAACAACTGAAACAAGAACTCGAAGTAACTC
TTTTTTTTTTGGAATGCCGGAAAAGCAAAACAAAACTAGGAATGGTGATTCTCAAGCAGT
AACGGAAGGCTTGGCAGCAGCAAAAAAAAGTCTAAATCTCTTCTTTGCCAAACTCTCACT
CCTCTTGTCACGCTGTTCCTTCAACCTTGAGGCAAGAAGCTTCTGGTACTCAGCAGCATC
AAAGTTAGCCTTAGCGATCCTCTTCTTCTTGTCGGCGATTCTAGCTCTCTTCCTCTGAAG
TGTCAAAGGAGTCACAAGCCTCTGGATCTTGGGAGCTTTGCTCACTTCCTTACCTTTCTT
GTTTGTGAGCTTGCGACGGTAAGTATTGACATACTTCCTCACATCATCATCCTTAGTGAG
GTTGAACAGTTTACGGATCTTAAAAGCTCTCTTAGGTCCCCTCATTCTTGGCTTCTCGGT
ATCGGTAAGCCCGGGAAGACCCTTCTCACCCTTCTTGACAATGACAAGGTTGAGAACA

QA 1 598 1 598
DS 

RD RS1AN90JQ 383 0 0
AAAAAGTCTAGATCTCTTCTTTGCCAAACTCTCACTCCTCTTGTCACGCTGTTCCTTCAA
CCTTGAGGCAAGAAGCTTCTGGTACTCAGCAGCATCAGAATTAGCCTTAACGATCCTCTT
CTTCTTGTCGGCGATTCTAGCTCTCTTCCTCTGAAGTGTCAAAGGAGTCACAAGCCTCTG
GATCTTGGGAGCTTTGCTCACTTCCTTACCTTTCTTGTTTGTGAACTTGCGACGGTAAGT
ATTGACATACTTACTCACATCATCATCCTTAGTGAGGTTGAACAGTTTACGGATCTTAAA
AGCTCTCTTAAGTCCCCTCATTCTTGGCTTCTCGGTATCGGTAAGCCCGGGAAGATCCTT
CTCACCCTTCTCGACAATGACAA

QA 1 383 1 383
DS 

RD RS1AN90TF 703 0 0
CAA
CTTGAGGCAAGAAGCTTCTGGTACTCAGCAGCATCAGAGTTAGCCTTAGCGATCCTCTTC
TTCTTGTCGGCGATTCTAGCTCTCTTCCTCTGAAGTGTCAAAGGAGTCACAAGCCTCTGG
ATCTTGGGAGCTTTGCTCACTTCCTTACCTTTCTTGTTTGTGAACTTGCGACGGTAAGTA
TTGACATACTTACTCACATCATCATCCTTAGTGAGGTTGAACAGTTTACGGATCTTAGAA
GCTCTCTTAGGTCCCCTCATTCTTGGCTTCTCGGTATCGGTAAGCCCGGGAAGATCCTTC
TCACCCTTCTCGACAATGACAAGGTTGAGAACAGAGAGATCTTGGCTGACAATGCAACCA
CGAACAGACTTTCATCTCCTCTCTCCAGTCCTCCTTCCGTGTCCTCTGAAGCAAGGAGTT
CCTCGGTGAAGCAAAAGGCGGACACGGCCAGGAGTTAGAACTCCCTGCTTCATTGGGAAA
CCTTGCTTGTCACACCCACCCATGATCTTGAAAACGTATCCTTTGAACTCCTCGCCCAAA
GCATCTCCACTGACTTCTTGGGAGAGTCTCTTATCATAAAAAGCACGGAGTTTCTGGTCA
TCGTCGATCTCGAGCTTCTTCTGGCAACCAGTGATTGGATTCGCGACGTTGAACTTCATC
TTCTCAGGTCGACTACAGCCACGAGAGAAAGACGGCTTTC

QA 4 703 4 703
DS 



CO CL50Contig3 800 2 12 U
TTCAGCAGCCAGCTTAATCTAGACTATCATAAGATATTTTCAACCAAATATGACAAAATC
TTCTATAATTGTAACATGGTTCATGAAAGAATATGTGATGTAAAATTAACCAACGAGCAG
AAATATACTTGAACAAAAACTTATCATATCTCTAGACCATATTCCTCGACCACCTATGGA
TGTACTACAATTGTTAAGCATATGGGTATATAACTAATTTTGGCTTCTCATGGGTATACT
TTGATATAATTAAGCTAAAGAATACTTATCAACGATTTGCAAAATATACTTATACCTTTT
CATTTGTTTAAAATATGTGAAAAAAAATGTGGAAATTATAAATTTAAAAATTAATAAAAT
ATGATAATTCCAACATAATTAACTTATAAAGCTTCAAGTTTTTTAATCAAGATGGAATAT
AGCATAATATTGAAACAATGAAAGTGTACCATAAAGACCGTCAAAATGGCGTTTACATGC
CAAAAGGGAACCTAAATACGAACAGAAACAAACTTGACAAAGAAATCCTCAAAATCTTAA
AAAGGGGTTTAAGCAGCGACGGGCTTAGCGGCAGCAGAGGAGAGTCTAGACCTCTTCTTG
GCTAAACTCTCACTACGGCGATCACGCTGCTCCTTGAGTCTCGAGGCAAGAAGCTTCTGG
TACTCGGCAGCATCAGAGTTGGCCTTGGCGATCCTCTTCTTCTTGTCGCCAATTCTAGCT
CTCTTCCTCTGAAGTGTCAAAGGAGTCACAAGCCTCTGGATCTTGGGGGCTTTGCTCACT
TCCTTACCTGTTACGACCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BA64TF U 1
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QA 1 780 1 780
DS 



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BQ
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AF RS1C274JQ U 1
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AF RS1C274TF C 1
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AAAAAA

QA 1 576 1 576
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GAGATCTTGGCTC

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DS 



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BQ
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AF RS1GW28TF U 1
AF RS1EO15TF U 8
AF RS1EO15JQ C 290
AF RS1GW28JQ C 406
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GG
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AGGATGAAGTTTAACGTCGCGAATCCAACCACTGGTTGCCAGAAGAAGCTCGAGATCGAC
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GGTTTCCCCATGAAGCAGGGAGTTCTAACTCCTGGCCGTGTTCGCCTTTTACTTCACAGA
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AACACTTACCGCCGCAAGTTCACTAACAAGAAAGGTAAGGAAGTGAGCAAAGCCCCTAAG
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TT
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CAGAAGCTTCTTGCCTCGAGGTTGAAGGAACAACGTGACAAGAGGAGTGAGAGTTTGGCA
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CGTTAGTTCGAGTTTATATTTCTGTTGTTCCATCCGTTACATCGACTTTGTACTCGTGTT
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AAGAGGGCTAGAATCGCTGACAAGAAGAAGAGGATTGCTAAGGCTAACTCTGATGCTGCT
GAGTACCAGAAGCTTCTTGCCTCGAGGTTGAAGGAACAACGTGACAAGAGGAGTGAGAGT
TTGGCAAAGAAGAGGTCTAGACTTTTTTTTGCTGCCGCCAAGCCTTCCGCTACTGCTTAA
AAATCCTGAGAATCTCATTTCTAGTTTTGTTTTTCCTTTTTTTTTTGCTTCATCCGCATT
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CGTGTTGCTTGTTTTATTCTCTTTTAGTTGAAAGACCACCTTAATACT

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DS 



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CTCTTCCCTTTTATCTTGTTTTATTTCCTTTGGATATGTCATCATGTAAAGTTTTCTCCT
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TAAATATGAACGTTGACTATTTCTAAACATCATTGGTCATTGATCTTTTGACTATTCCAA
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AGTATTTTCGGCCTACATTACATATCCACACAAAGGATATGACACAAGTGTTTTCAAATC
TTTCTTTATAAAACACATGCATATGCACACTAGCCAATGACCAAAGTATAACATCTCTCT
TTATTACAAAGACACCTCAATACTCCTCACAATCGCCAGACTGAGAGATGGCGGATGAAC
TACCTCCCAAAGGGATCCTCAAGAGCGAAGCTCTGAGACAGTATATCTTGGAAACGTCAG
CGTATCCAAGAGAACATGAGCTGCTCAAGGAGCTTCGGAAAGTCACAGAAGAGAAATTTG
GCAACTTAATCGAAATGGTTATTCCAGTTGATGAGGGCATTTTTCTATCGATGCTTTTAA
AGATCATAAACGCTAAGAACACTCTTGAGCTTGGTGTTTTCACTGGTTACTCTCTTCTCA
CCACGGCTCTTGCTTTGCCTGAAGATGGTCGCATTACTGCAATAGACATTGACAAGGAAG
CCTATGAAGTGGGATTAGAGTTTATGAAGAAAGCAGGTGTTGATCACAAGATCAATTTTA
TCTATTGCGATGGTCTGGAGGTCTTAGACAAATTGGTTAACGACAA***TCAGGAGTTTG
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AATTGGTGAAGGTTGGAGGAATCATTGCATTCGACAACACCTTGTGGTTTAGTTTTGTGG
TCGAGGAAGAAGAGAACGTTCCTGAGTTTATGAGGGAATCAAGAGCGGCTGTTATAGAAT
TTAATAAGAAATTGGCTTTGGATCCTCGAGTAGAAATCTCTCAGATCTCCGTTGGAGATG
GTCTCACTCTATGCAGACGCCTTGTGTGAGCAAAAGACTACTTAAGATTTAAGACCGAAC
TTTGGAATAAAACTGTTATGCTTCAATAAATACTTGTGTGTTTGATTGATGATCACTCAA
CATCTTCTTCACATAACCAGTTTTTTTTTTAAATTAAGAAATAATATAGTTAAACAGTTT
AGAATGAGCCAAAAATATTTACCTTATATGTATATGTATATACAGAAATATGGTGTGTAT
TTTATAATTTTTAGTTCTTCTACTTTTTGTTTTTATTAATTTTAAATAAAAATGCAAAAA
GGGAGAAGATATTCTCGTGGATG


BQ
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75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 55 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 50 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 15 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 40 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 
70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 25 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 30 65 50 65 40 65 65 65 65 65 65 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
5 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
10 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 10 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AL69TF C 1
AF RS1DI28TF U 577
AF RS1DX55TF U 578
AF RS1GG63TF U 581
AF RS1AY33TF U 586
AF RS1EX32TF U 581
AF RS1D229TF U 580
AF RS1DL76TF U 579
AF RS1FJ41TF U 578
AF RS1D229JQ C 629
AF RS1DL76JQ C 630
AF RS1GG63JQ C 1026
AF RS1DI28JQ C 794
AF RS1GT29JQ C 1045
AF RS1GT29TF U 942
AF RS1AY33JQ C 882
BS 1 578 RS1AL69TF
BS 579 623 RS1DI28TF
BS 624 624 RS1DX55TF
BS 625 681 RS1DI28TF
BS 682 682 RS1DX55TF
BS 683 1149 RS1DI28TF
BS 1150 1162 RS1FJ41TF
BS 1163 1163 RS1D229TF
BS 1164 1237 RS1FJ41TF
BS 1238 1238 RS1EX32TF
BS 1239 1295 RS1FJ41TF
BS 1296 1296 RS1EX32TF
BS 1297 1340 RS1FJ41TF
BS 1341 1341 RS1D229TF
BS 1342 1354 RS1FJ41TF
BS 1355 1355 RS1GT29TF
BS 1356 1364 RS1FJ41TF
BS 1365 1365 RS1GT29TF
BS 1366 1371 RS1FJ41TF
BS 1372 1372 RS1GT29TF
BS 1373 1386 RS1FJ41TF
BS 1387 1581 RS1GT29TF
BS 1582 1643 RS1AY33JQ

RD RS1AL69TF 671 0 0
TGTCTATGCATCCATTTTAGAATTGAGCGTAAATTCTTTTTATATAATAAACTGAGAGAA
CATACTAGAAGTGTTTCTATGGAGTTAATTCCCCCCTCCCAGGGCCTCCAGTGATGACCT
CTCTTCCCTTTTATCTTGTTTTATTTCCTTTGGATATGTCATCATGTAAAGTTTTCTCCT
CCCTTAATTCCTCATCATAGTTATTAATTGGTGAAGTAAGTAGTAACCATCTATAAATAG
TAAATATGAACGTTGACTATTTCTAAACATCATTGGTCATTGATCTTTTGACTATTCCAA
GCTAAATAAATATTCTTAGGTTTGTGGAGATAATGGGCTTCCGAGAAATTTCTCACTAGG
AACCATTATGGAAGATAATGTACCAAAGATTTTATTTTCTTCAGCTTTTCGAGGTCATAT
GTAATTTGTGAGTTTCATGTCGTATTTACAGAATATATGCATTTTAGCGTGTTTCAGCTC
AGTATTTTCGGCCTACATTACATATCCACACAAAGGATATGACACAAGTGTTTTCAAATC
TTTCTTTATAAAACACATGCATATGCACACTAGCCAATGACCAAAGTATAACATCTCTCT
TTATTACAAAGACACCTCAATACTCCTCACAATCGCCAGACTGAGAGATGGCGGATGAAC
TACCTCCCAAA

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DS 

RD RS1DI28TF 573 0 0
GG
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GACTGAGAGATGGCGGATGAACTACCTCCCAAAGGGATCCTCA*GAGCGAAGCTCTGAGA
CAGTATATCTTGGAAACGTCAGCGTATCCAAGAGAACATGAGCTGCTCAAGGAGCTTCGG
AAAGTCACAGAAGAGAAATTTGGCAACTTAATCGAAATGGTTATTCCAGTTGATGAGGGC
ATTTTTCTATCGATGCTTTTAAAGATCATAAACGCTAAGAACACTCTTGAGCTTGGTGTT
TTCACTGGTTACTCTCTTCTCACCACGGCTCTTGCTTTGCCTGAAGATGGTCGCATTACT
GCAATAGACATTGACAAGGAAGCCTATGAAGTGGGATTAGAGTTTATGAAGAAAGCAGGT
GTTGATCACAAGATCAATTTTATCTATTGCGATGGTCTGGAGGTCTTAGACAAATTGGTT
AACGACAA***TCAGGAGTTTGATTTCATATTTGCTGACGCTGACAAGCCAAACTACGTG
AACTTCCTTGAGAGATTTCTGAAATTGGTGA

QA 3 573 3 573
DS 

RD RS1DX55TF 570 0 0
G
GACCAAAGTATAACATCTCTCTATATTACAAAGACACCTCAACACTCCTCACAATCGCCA
GACTGAGAGATGGCGGATGAACTACCTCCCAAAGGGATCCTCAAGAGCGAAGCTCTGAGA
CAGTATATCTTGGAAACGTCGGCGTATCCAAGAGAACATGAGCTGCTCAAGGAGCTTCGG
AAAGTCACAGAAGAGAAATTTGGCAACTTAATCGAAATGGTTATTCCAGTTGATGAGGGC
ATTTTTCTATCGATGCTTTTAAAGATCATAAACGCTAAGAACACTCTTGAGCTTGGTGTT
CTCACTGGTTACTCTCTTCTCACCACGGCTCTTGCTTTGCCTGAAGATGGTCGCATTACT
GCAATAGACATTGACAAGGAAGCCTATGAAGTGGGATTAGAGTTTATGAAGAAAGCAGGT
GTTGATCACAAGATCAATTTTATCTATTGCGATGGTCTGGAGGTCTTAGACAAATTGGTT
AACGACAA***TCAGGAGTTTGATTTCATATTTGCTGACGCTGACAAGCCAAACTACGTG
AACTTCCTTGAGAGATTTCTGAAATTGGT

QA 2 570 2 570
DS 

RD RS1GG63TF 604 0 0
GG
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ATATCTTGGAAACGTCAGCGTATCCAAGAGAACATGAGCTGCTCAAGGAGCTTCGGAAAG
TCACAGAAGAGAAATTTGGCAACTTAATCGAAATGGTTATTCCAGTTGATGAGGGCATTT
TTCTATCGATGCTTTTAAAGATCATAAACGCTAAGAACACTCTTGAGCTTGGTGTTTTCA
CTGGTTACTCTCTTCTCACCACGGCTCTTGCTTTGCCTGAAGATGGTCGCATTACTGCAA
TAGACATTGACAAGGAAGCCTATGAAGTGGGATTAGAGTTTGTGAAGAAAGCAGGTGTTG
ATCACAAGATCAATTTTATCTATTGCGATGGTCTGGAGGTCTTAGACAAATTGGTTAACG
ACAA***TCAGGAGTTTGATTTCATATTTGCTGACGCTGACAAGCCAAACTACGTGAACT
TCCTTGAGAGATTTCTGAAATTGGTGAAGGTTGGAGGAATCATTGCATTCGACAACACCT
TG

QA 3 604 3 604
DS 

RD RS1AY33TF 691 0 0
GG
ATAACATCTCTCTTTATTACAAAGACACCTCAATACTCCTCACAATCGCCAGACTGAGAG
ATGGCGGATGAACTACCTCCCAAAGGGATCCTCAAGAGCGAAGCTCTGAGACAGTATATC
TTGGAAACGTCAGCGTATCCAAGAGAACATGAGCTACTCAAGGAGCTTCGGAAATTCACA
GAAGAGAAATTTGGCAACTTAATCGAAATGGTTATTCCAGTTGATGAGGGCATTTTTCTA
TCGATGCTTTTAAAGATCATAAACGCTAAGAACACTCTTGAGCTTGGTGTTTTCACTGGT
TACTCTCTTCTCACCACGGCTCTTGCTTTGCCTGAAGATGGTCGCATTACTGCAATAGAC
ATTGACAAGGAAGCCTATGAAGTGGGATTAGAGTTTATGAAGAAAGCAGGTGTTGATCAC
AAGATCAATTTTATCTATTGCGATGGTCTGGAGGTCTTAGACAAATTGGTTAACGACAA*
**TCAGGAGTTTGATTTCATATTTGCTGACGCTGACA*GCCAAACTACGTGAACTTCCTT
GAGAGATTTCTGAAATTGGTGAAGGTTGGAGGAATCATTGCATTCGACAACACCTTGTGG
TTTAGTTTTGTGGTCGAGGAAGAAGAGAACGTTCCTGAGTTTACGAGGGA*TCAAGAGCG
GCTGTTATAGA*TTTAATAAGAAAT
GGGC

QA 3 687 3 687
DS 

RD RS1EX32TF 726 0 0
GG
AAAGTATAACATCTCTCTTTATTACAAAGACACCTCAATACTCCTCACAATCGCCAGACT
GAGAGATGGCGGATGAACTACCTCCCAAAGGGATCCTCAAGAGCGAAGCTCTGAGACAGT
ATATCTTGGAAACGTCAGCGTATCCAAGAGAACATGAGCTGCTCAAGGAGCTTCGGAAAG
TCACAGAAGAGAAATTTGGCAACTTAATCGAAATGGTTATTCCAGTTGATGAGGGCATTT
TTCTATCGATGCTTTTAAAGATCATAAACGCTAAGAACACTCTTGAGCTTGGTGTTTTCA
CTGGTTACTCTCTTCTCACCACGGCTCTTGCTTTGCCTGAAGATGGTCGCATTACTGCAA
TAGACATTGACAAGGAAGCCTATGAAGTGGGATTAGAGTTTATGAAGAAAGCAGGTGTTG
ATCACAAGATCAATTTTATCTATTGCGATGGTCTGGAGGTCTTAGACAAATTGGTTAACG
ACAA***TCAGGAGTTTGATTTCATATTTGCTGACGCTGACAAGCCAAACTACGTGAACT
TCCTTGAGAGATTTCTGAAATTGGTGAAGGTTGGAGGAATCATTGCATTCGACAACACCT
TGTGGTTTAGTTTTGTGGTCGAG*AAGAAGAGAACGTTCCTGAGTTTATGAGGGAATCAA
GAGCGGCTGTTATAGAATTTAATAAGAAAT*GGCTTTGGATCCTCGAGTAGAAATCTCTC
AGAT

QA 3 726 3 726
DS 

RD RS1D229TF 781 0 0
GGA
AAAGTATAACATCTCTCTTTATTACAAAGACACCTCAATACTCCTCACAATCGCCAGACT
GAGAGATGGCGGATGAACTACCTCCCAAAGGGATCCTCAAGAGCGAAGCTCTGAGACAGT
ATATCTTGGAAACGTCAGCGTATCCAAGAGAACATGAGCTGCTCAAGGAGCTTCGGAAAG
TCACAGAAGAGAAATTTGGCAACTTAATCGAAATGGTTATTCCAGTTGATGAGGGCATTT
TTCTATCGATGCTTTTAAAGATCATAAACGCTAAGAACACTCTTGAGCTTGGTGTTTTCA
CTGGTTACTCTCTTCTCACCACGGCTCTTGCTTTGCCTGAAGATGGTCGCATTACTGCAA
TAGACATTGACAAGGAAGCCTATGAAGTGGGATTAGAGTTTATGAAGAAAGCAGGTGTTG
ATCACAAGATCAATTTTATCTATTGCGATGGTCTGGAGGTCTTAGACAAATTGGTTAACG
ACAAGAATCAGGAGTTTGATTTCATATTTGCTGACGCTGACAAGCCAAACTACGTGAACT
TCCTTGAGAGATTTCTGAAATTGGTGAAGGTTGGAGGAATCATTGCATTCGACAACACCT
TGTGGTTTAGTTTTGTGGTCGAGGAAGAAGAGAACGTTCCTGAGTTTATGAGGGA*TCAA
GAGCGGCTGTTATAGAATTTAATAAGAAATTGGCTTTGGATCCTCGAGTAGAA*TCTCTC
AGATCTCCGTTGGAGATGGTCTCACTCTATGCAGACGCCTTGTGTGAGCAAA
GACTAC

QA 4 775 4 775
DS 

RD RS1DL76TF 757 0 0
GACCAAAGTATAACATCTCTCTTTATTACAAAGACACCTCAATACTCCTCACAATCGCCA
GACTGAGAGATGGCGGATGAACTACCTCCCAAAGGGATCCTCAAGAGCGAAGCTCTGAGA
CAGTATATCTTGGAAACGTCAGCGTATCCAAGAGAACATGAGCTGCTCAAGGAGCTTCGG
AAAGTCACAGAAGAGAAATTTGGCAACTTAATCGAAATGGTTATTCCAGTTGATGAGGGC
ATTTTTCTATCGATGCTTTTAAAGATCATAAACGCTAAGAACACTCTTGAGCTTGGTGTT
TTCACTGGTTACTCTCTTCTCACCACGGCCCTTGCTTTGCCTGAAGATGGTCGCATTACT
GCAATAGATATTGACAAGGAAGCCTATGAAGTGGGATTAGAGTTTATGAAGAAAGCAGGT
GTCGATCACAAGATCAATTTCATCTATTGCGATGGTCTGGAGGTCTTAGACAAATTGGTT
AACGACAA***TCAGGAGTTTGATTTCATATTTGCTGACGCTGACAAGCCAAACTACGTG
AACTTCCTTGAGAGATTTCTGAAATTGGTGAAGGTTGGAGGAATTATTGCATTCGACAAC
ACCTTGTGGTTTAGTTTTGTGGTCGAGGAAGAAGAGAACGTTCCTGAGTTTATGAGGGA*
TCAAGAGCGGCTGTTATAGAATTTAATAAGAAATTGGCTTTGGATCCTCGAGTAGAA*TC
TCTCAGATCTCCGTTGGAGATGGTCTCACTCTATGCA

QA 1 757 1 757
DS 

RD RS1FJ41TF 809 0 0
G
GACCAAAGTATAACATCTCTCTTTATTACAAAGACACCTCAATACTCCTCACAATCGCCA
GACTGAGAGATGGCGGATGAACTACCTCCCAAAGGGATCCTCAAGAGCGAAGCTCTGAGA
CAGTATATCTTGGAAACGTCAGCGTATCCAAGAGAACATGAGCTGCTCAAGGAGCTTCGG
AAAGTCACAGAAGAGAAATTTGGCAACTTAATCGAAATGGTTATTCCAGTTGATGAGGGC
ATTTTTCTATCGATGCTTTTAAAGATCATAAACGCTAAGAACACTCTTAAGCTTGGTGTT
TTCACTGGTTACTCTCTTCTCACCACGGCCCTTGCTTTGCCTGAAGATGGTCGCATTACT
GCAATAGATATTGACAAGGAAGCCTATGAAGTGGGATTAGAGTTTATGAAGAAAGCAGGT
GTCGATCACAAGATCAATTTCATCTATTGCGATGGTCTGGAGGTCTTAGACAAATTGGTT
AACGACAA***TCAGGAGTTTGATTTCATATTTGCTGACGCTGACAAGCCAAACTACGTG
AACTTCCTTGAGAGATTTCTGAAATTGGTGAAGGTTGGAGGAATTATTGCATTCGACAAC
ACCTTGTGGTTTAGTTTTGTGGTCGAGGAAGAAGAGAACGTTCCTGAGTTTATGAGGGA*
TCAAGAGCGGCTGTTATAGAATTTAATAAGAAATTGGCTTTGGATCCTCGAGTAGAA*TC
TCTCAGATCTCCGTTGGAGATGGTCTCACTCTATGCAGACGC*TTGTGTGAGCAAA*GAC
TACTTA*GATTTA*GACCGAACTTTGGA

QA 2 809 2 809
DS 

RD RS1D229JQ 776 0 0
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AGCTCTGAGACAGTATATCTTGGAAACGTCAGCGTATCCAAGAGAACATGAGCTGCTCAA
GGAGCTTCGGAAAGTCACAGAAGAGAAATTTGGCAACTTAATCGAAATGGTTATTCCAGT
TGATGAGGGCATTTTTCTATCGATGCTTTTAAAGATCATAAACGCTAAGAACACTCTTGA
GCTTGGTGTTTTCACTGGTTACTCTCTTCTCACCACGGCTCTTGCTTTGCCTGAAGATGG
TCGCATTACTGCAATAGACATTGACAAGGAAGCCTATGAAGTGGGATTAGAGTTTATGAA
GAAAGCAGGTGTTGATCACAAGATCAATTTTATCTATTGCGATGGTCTGGAGGTCTTAGA
CAAATTGGTTAACGACAAGAATCAGGAGTTTGATTTCATATTTGCTGACGCTGACAAGCC
AAACTACGTGAACTTCCTTGAGAGATTTCTGAAATTGGTGAAGGTTGGAGGAATCATTGC
ATTCGACAACACCTTGTGGTTTAGTTTTGTGGTCGAGGAAGAAGAGAACGTTCCTGAGTT
TATGAGGGAATCAAGAGCGGCTGTTATAGAATTTAATAAGAAATTGGCTTTGGATCCTCG
AGTAGAAATCTCTCAGATCTCCGTTGGAGATGGTCTCACTCTATGCAGACGCCTTGTGTG
AGCAAAAGACTACTTAAGATTTAAGACCGAACTTTCGAATAAAACTGTTATGCT
CC

QA 1 774 1 774
DS 

RD RS1DL76JQ 802 0 0
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GCTCTGAGACAGTATATCTTGGAAACGTCAGCGTATCCAAGAGAACATGAGCTGCTCAAG
GAGCTTCGGAAAGTCACAGAAGAGAAATTTGGCAACTTAATCGAAATGGTTATTCCAGTT
GATGAGGGCATTTTTCTATCGATGCTTTTAAAGATCATAAACGCTAAGAACACTCTTGAG
CTTGGTGTTTTCACTGGTTACTCTCTTCTCACCACGGCCCTTGCTTTGCCTGAAGATGGT
CGCATTACTGCAATAGATATTGACAAGGAAGCCTATGAAGTGGGATTAGAGTTTATGAAG
AAAGCAGGTGTCGATCACAAGATCAATTTCATCTATTGCGATGGTCTGGAGGTTTTAGAC
AAATTGGTTAACGACAA***TCAGGAGTTTGATTTCATATTTGCTGACGCTGACAAGCCA
AACTACGTGAACTTCCTTGAGAGATTTCTGAAATTGGTGAAGGTTGGAGGAATTATTGCA
TTCGACAACACCTTGTGGTTTAGTTTTGTGGTCGAGGAAGAAGAGAACGTTCCTGAGTTT
ATGAGGGAATCAAGAGCGGCTGTTATAGAATTTAATAAGAAATTGGCTTTGGATCCTCGA
GTAGAAATCTCTCAGATCTCCGTTGGAGATGGTCTCACTCTATGCAGACGCCTTGTGTGA
GCAAAAGACTACTTAAGATTTAAGACCGAACTTTGGAATAAAACTGTTATGCTTCAATAA
ATACTTGTGTGTTTGATTGATG

QA 1 802 1 802
DS 

RD RS1GG63JQ 474 0 0
TGCGATGGTTTGGAGGTTTTAGACAAATTGGTTAACGACAA***TCAGGAGTTTGATTTC
ATATTTGCTGACGCTGACAAGCCAAACTACGTGAACTTCCTTGAGAGATTTTTGAAATTG
GTGAAGGTTGGAGGAATCATTGCATTCGACAACCCCTTGTGGTTTAGTTTTGTGGTCGAG
GAAGAAGAGAACGTTCCTGAGTTTATGAGGGAATCAAGAGCGGCTGTTATAGAATTTAAT
AAGAAATTGGCTTTGGATCCTCGAGTAGAAATTTTTCAGATTTCCGTTGGAGATGGTCTC
ACTCTATGCAGACGCCTTGTGTGAGCAAAAGACTACTTAAGATTTAAGACCGAACTTTCG
AATAAAACTGTTATGCTTCAATAAATACTTGTGTGTTTGATTGATGATCACTCAACATTT
TTTTCACATAACCAGTTTTTTTTTTAAATTAAGAAATAATATAGTTAAACAGTT

QA 1 474 1 474
DS 

RD RS1DI28JQ 790 0 0
GAAATGGTATCCCAG
TGATGAGGGCATTTT*CTATCGATGCTTTTAAAGATCATAAACGCTAAGAACACTCTTGA
GCTTGGTGTTTTCACTGGTTACTCTCTTCTCACCACGGCTCTTGCTTTGCCTGAAGATGG
TCGCATTACTGCAATAGACATTGACAAGGAAGCCTATGAAGTGGGATTAGAGTTTATGAA
GAAAGCAGGTGTTGATCACAAGATCAATTTTATCTATTGCGATGGTCTGGAGGTCTTAGA
CAAATTGGTTAACGACAA***TCAGGAGTTTGATTTCATATTTGCTGACGCTGACAAGCC
AAACTACGTGAACTCCCTTGAGAGATTTCTGAAATTGGTGAAGGTTGGAGGAATCATTGC
ATTCGACAACACCTTGTGGTTTAGTTTTGTGGTCGAGGAAGAAGAGAACGTTCCTGAGTT
TATGAGGGAATCAAGAGCGGCTGTTATAGAATTTAATAAGAAATTGGCTTTGGATCCTCG
AGTAGAAATCTCTCAGATCTCCGTTGGAGATGGTCTCACTCTATGCAGACGCCTTGTGTG
AGCAAAAGACTACTTAAGATTTAAGACCGAACTTTCGAATAAAACTGTTATGCTTCAATA
AATACTTGTGTGTTTGATTGATGATCACTCAACATCTTCTTCACATAACCAGTTTTTTTT
TTAAATTAAGAAATAATATAGTTAAACAGTTTAGAATGAGCAAAAAATATTTACCTTATA
TGTATATGTATATACAGAAATATGGTGTGTATTTTATAATTTTTAG
CTCTTCTAC

QA 16 781 16 781
DS 

RD RS1GT29JQ 559 0 0
TAGACAAATTGGTTAACGACAA***TCAGGAGTTTGATTTCATATTTGCTGACGCTGACA
AGCCAAACTACGTGAACTTCCTTGAGAGATTTTTGAAATTGGTGAAGGTTGGAGGAATTA
TTGCATTCGACAACCCCTTGTGGTTTAGTTTTGTGATCGAGGAAGAAGAGAACGTTCCTG
AGTTTATGAGGGAATCAAGAGCGGCTGTTATAGAATTTAATAAGAAATTGGCTTTGGATC
CTCGAGTAGAAATCTTTCAGATTTCCGTTGGAGATGGTCTCACTTTATGCAGACGCCTTG
TGTGAGCAAAAGACTACTTAAGATTTAAGACCGAACTTTGGAATAAAACTGTTATGCTTC
AATAAATACTTGTGTGTTTGATTGATGATCACTCAACATTTTTTTCACATAACCAGTTTT
TTTTTTAAATTAAGAAATAATATAGTTAAACAGTTTAGAATGAGCCAAAAATATTTACCT
TATATGTATATGTATATACAGAAATATGGTGTGTATTTTATAATTTTTAGTTTTTCTTCT
TTTTGTTTTTATTAATTTT

QA 1 559 1 559
DS 

RD RS1GT29TF 647 0 0
GG
AGATATTGACAAGGAAGCCTATGAAGTGGGATTAGAGTTTATGAAGAAAGCAGGTGTCGA
TCACAAGATTAATTTCATCTATTGCGATGGTCTGGAGGTCTTAGACAAATTGGTTAACGA
CAA***TCAGGAGTTTGATTTCATATTTGCTGACGCTGACAAGCCAAACTACGTGAACTT
CCTTGAGAGATTTCTGAAATTGGTGAAGGTTGGAGGAATTATTGCATTCGACAACACCTT
GTGGTTTAGTTTTGTGATCGAGGAAGAAGAGAACGTTCCTGAGTTTATGAGGGAATCAAG
AGCGGCTGTTATAGAATTTAATAAGAAATTGGCTTTGGATCCTCGAGTAGAAATCTCTCA
GATCTCCGTTGGAGATGGTCTCACTCTATGCAGACGCCTTGTGTGAGCAAAAGACTACTT
AAGATTTAAGACCGAACTTTGGAATAAAACTGTTATGCTTCAATAAATACTTGTGTGTTT
GATTGATGATCACTCAACATCTTCTTCACATAACCAGTTTTTTTTTTAAATTAAGAAATA
ATATAGTTAAACAGTTTAGAATGAGCCAAAAATATTTACCTTATATGTATATGTATATAC
AGAAATATGGTGTGTATTTTATAATTTTTAGTTCTTCT
TCTTTTG

QA 3 640 3 640
DS 

RD RS1AY33JQ 762 0 0
ACTGGTTACTCTCTTCTCACCACGGCTCTTGCTTTGCCTGAAGATGGTCGCATTACTGCA
ATAGACATTGACAAGGAAGCCTATGAAGTGGGATTAGAGTTTATGAAGAAAGCAGGTGTT
GATCACAAGATCAATTTTATCTATTGCGATGGTCTGGAGGTCTTAGACAAATTGGTTAAC
GACAA***TCAGGAGTTTGATTTCATATTTGCTGACGCTGACA*GCCAAACTACGTGAAC
TTCCTTGAGAGATTTTTGAAATTGGTGAAGGTTGGAGGAATCATTGCATTCGACAACCCC
TTGTGGTTTAGTTTTGTGGTCGAGGAAGAAGAGAACGTTCCTGAGTTTACGAGGGAATCA
AGAGCGGCTGTTATAGAATTTAATAAGAAATTGGCTTTGGATCCTCGAGTAGAAATCTCT
CAGATCTCCGTTGGAGATGGTCTCACTCTATGCAGACGCCTTGTGTGAGCAAAAGACTAC
TTAAGATTTAAGACCGAACTTTCGAATAAAACTGTTATGCTTCAATAAATACTTGTGTGT
TTGATTGATGATCACTCAACATCTTCTTCACATAACCAGTTTTTTTTTTAAATTAAGAAA
TAATATAGTTAAACAGTTTAGAATGAGCAAAAAATATTTACCTTATATGTATATGTATAT
ACAGAAATATGGTGTGTATTTTATAATTTTTAGCTCTTCTACTTTTTGTTTTTATTAATT
TTAAATAAAAATGCAAAAAGGGAGAAGATATTCTCGTGGATG

QA 1 762 1 762
DS 



AS 3 16

CO CL52Contig1 1175 6 32 U
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AGAAGAAATCTAAGAGAAGAACTTGTAGGTGCTTGCGTTGATAATGATGGTTCTGAGGCC
ACCAATGGGTGCTAGGATCGTCAATATAACTCCTACTATAATGCAGAACCAGTTAATCGT
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CGGCATTGCAAAGATCTGATAACTTCCAATGACATGGACGACGACAAACAAGTTAGCTAT
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AAAGATCCAATAGCCTAGGAACGCTACAGGGAAGTAGCAAATGGCGACTACGATGTAGGC
TACAACGACTCCTCTCATCATTGGAACCTTTGATGGCACCTCCACAATCAGCTGTTGAGG
CACAACAATCCAAAGGCCAAGCTTTTCGCCAAAAGCTTCTTGGCCAAGCTCGTGATATCT
GTCGAGCCTCTTCCCTGGTACAATCTCGTGCATCTCCACCATTTGCCACAGTGTGTAGAA
AGTTATCAACCATGACAGTATCATCATCGTCACGCCAGGTCCCCATCCGAGATTTGACAT
AGCATAGGGCAAGCTTAGAACACCAGCACCAACCATGGCAGTAACATTATGGAAAGCAGA
GTACCACCACTTGGCCTTTCTGGAGGATGTGATCGGTAACCACTCGTCGATTTTCTTTTG
CTTCGCCGCAACAATCTCGCTCGCTGACATTTCGCTCTTACTCATATTCTTCTTTTGAGA
GATACTGTTTGAGAAATAAGAAGATTTTAGGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 0 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 0 0 20 0 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CB38JQ U 218
AF RS1CB38TF C 38
AF RS1AM94JQ U 38
AF RS1AF53JQ U 1
AF RS1E720JQ U 38
AF RS1DF40TF C 501
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A

QA 1 361 1 361
DS 

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QA 1 616 1 616
DS 

RD RS1AM94JQ 683 0 0
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TGC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RS1AF53JQ 771 0 0
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AGAAAAAATCTAAAAAAAAAACTTGTAGGTGCTTGCGTTGATAATGATGGTTCTGAGGCC
ACCAATGGGTGCTAGGATCGTCAATATAACTCCTACTATAATGCAAAACCAGTTAATCGT
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GTAAGTTGTTGGCGCGAAAGCAAATCCCCCAAAGAAACCGAGTAGTCCACCAAAGAATGG
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TGCGAAAGAAGGATCGAAATTCATCTTCTTGACCAAAACAGTTTCCATCATGTCAAACAC
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TGCGACAAGCCAGACTGGCTTCTCCAAAGTCATGAGAATGTTGTCGTCAACACTGTTTCC
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TACAACGACTCCTCTCATCATTGGAACCTTTGATGGCACCTCCGGAGTC
GA

QA 1 769 1 769
DS 

RD RS1E720JQ 732 0 0
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TATGGACAGTCGTAGAAAACCTAGACAGGCCGTGATTATTTTCTTAAAGCAGCTAACTTC
ATTTATGCTGGTGTTGCACAAGAAGAAGAAATCTAAGAGAAGGACTTGTAGGTGCTTGCG
TTGATAATGATGGTTCTGAGGCCACCAATGGGTGCTAAGATCGTCAATATAACTCCTACT
ATAATGCAGAACCAGTTAATCGTCCAAGATAAACCAAACTTCTTTGGTTTCTTGAGAACG
AGCCACATAATGCATGGAAGGTAGTAAGTTGTTGGCGCGAAAGCAAATCCCCCAAAGAAA
CCGAGTAGTCCACCAAAGAATGGGATACATACCGCAACGAACATAGTAAAAGCAACATAA
AGACTGCGAGTGATGAAGCGGAGTGTGAAAGAAGGATCGAAATTCATCTTCTTGACCAAA
ACAGTTTCCATCATGTCAAACACCGGCATTGCAAAGATCTGATAACCTCCAATGACATGG
ACGACGACAAACAAGTTAGCTATTGCGACAAGCCAGACTGGCTTCTCCAAAGTCATGAGA
ATGTTGTCGTCAACACTGTTTCCAAAGATCCAATAGCCTAGGAACGCTACAGGGAAGTAG
CAAATGGCGACTACGATGTAG*CTACAACGACTCCTCTCATCATTGGAACCTTTGATGGC
ACCTCC
GGAGTC

QA 1 726 1 726
DS 

RD RS1DF40TF 675 0 0
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AACTTCCAATGACATGGACGACGACAAACAAGTTAGCTATTGCGACAAGCCAGACTGGCT
TCTCCAAAGTCATGAGAATGTTGTCGTCAACACTGTTTCCAAAGATCCAATAGCCTAGGA
ACGCTACAGGGAAGTAGCAAATGGCGACTACGATGTAGGCTACAACGACTCCTCTCATCA
TTGGAACCTTTGATGGCACCTCCACGATGAGCTGTTGAGGCACAACAATCCAAAGGCCAA
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TCATCATCGTCACGCCAGGTCCCCATCCGAGATTTGACATAGCATAGGGCAAGCTTAGAA
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TGGAGGATGTGATCGGTAACCACTCGTCGATTTTCTTTTGCTTCGCCGCAACAATCTCGC
TCGCTGACATTTCGCTCTTACTCATATTCTTCTTTTGAGAGATACTGTTTGAGAAATAAG
AAGATTTTAGGATCC

QA 1 675 1 675
DS 



CO CL52Contig2 1582 7 21 U
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TGGTTACCGATCACATCCTCCAGAAAGGCCAAGTGGTGGTACTCTGCTTTCCATAATGTT
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GGACCTGGCGTGACGATGATGATACTGTCATGGTTGATAACTTTCTACACACTGTGGCAA
ATGGTGGAGATGCACGAGATTGTACCAGGGAAGAGGCTCGACAGATATCACGAGCTTGGC
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GAGGTCGGTGTCGATATCGTTTACATGGTCACCGGAGGTAAATCCCTCAAGAAAGTCCAT
GGACTCCTCTGCTCCGATTGCAAAGACATCAGAACCACATACTGGATCATGATCTTTGCT
TCTGTCCATTTCGTTATCTCTCACCTACCCAACTTCAACTCCATCGCGGTCATTTCACTC
GCCGCTGCCGTTATGTCCTTAAGTTACTCAACTATTGCTTGGACTGCATCAGTGCACAAA
GGGGTTAAACCAGATGTAGACTACTCGTATAGAGCCTCGACAACACCTGGAAAAGTATTC
AACTTCTTGAACGCGATGGGAGATGTGGCTTTTGCCTACGCAG*TCACAACGTTGTGTTG
GAGATTCAAGCCACGATCCCTTCGACTCCGGAG*TGCCATCAAAG*TTCCAATGATGAGA
GGAGTCGTTGTAGCCTACATCGTAGTCGCCATTTGCTACTTCCCTGTAGCGTTCCTAGGC
TATTGGATCTTTGGAAACAGTGTTGACGACAACATTCTCATGACTTTGGAGAAGCCAGTC
TGGCTTGTCGCAATAGCTAACTTGTTTGTCGTCGTCCATGTCATTGGAAGTTATCAGATC
TTTGCAATGCCGGTGTTTGACATGATGGAAACTGTTTTGGTCAAGAAGACGAATTTCGAT
CCTTCTTTCACACTCCGCTTCATCACTCGCAGTCTTTATGTTGCTTTTACTATGTTCGTT
GCGATATGTATCCCATTCTTTGGTGGACTACTCGGTTTCTTTGGGGGATTTGCTTTCGCG
CCAACAACTTACTACCTTCCATGCATTATGTGGCTCGTTCTCAAGAAACCAAAGAAGTTT
GGTTTATCTTGGACGATTAACTGGTTCTGCATTATAGTAGGAGTTATATTGACGATCCTA
GCACCCATTGGTGGCCTCAGAACCATCATTATCAACGCAAGCACCTACAAGTTCTTCTCT
TAGATTTCTTCTCCTTGTGCAACACCAGCATAAATGAAGTTAGCTGCTTTAAGAAAATAA
TCACGGCCTGTCTAGGTTCTCTACGACTGTCCATATTGTTACTTCTAAAGCTTTTAGTAT
TAGTTAAAGACTCGTAATAATTTTTGTGAATTTTCAGCATTTATAATTTTTTTAACTCAG
CTTTTATAATTTAAAACTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 0 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1AM94TF U 8
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GG
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TTTGGCGAAAAGCTTGGCCTTTGGATTGTTGTGCCTCAACAGCTCATCGTGGAGGTCGGT
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G
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TTTG

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TCATCACTCGCAGTCTTTATGTTGCTTTTACTATGTTCGTTGCGATATGTATCCCATTCT
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CATGCATTATGTGGCTCGTTCTCAAGAAACCAAAGAAGTTTGGTTTATCTTGGACGATTA
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TCC

QA 1 723 1 723
DS 

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GGATTACTCGGTTTCTTTGGGGGATTTGCTTTCGCGCCAACAACTTACTACCTTCCATGC
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TTCTGCATTATAGTAGGAGTTATATTGACGATCCTAGCACCCATTGGTGGCCTCAGAACC
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TGTGAATTTTCAGCATTTATAATTTTTTTAACTCAGCTTTTA
CAAAAAAAA

QA 1 702 1 702
DS 



CO CL52Contig3 1230 3 6 U
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GAGTATCGCTTATAGAACGATATGCGGAGTAACGAAACCTCAGCGAGTGAGATTGCTGCT
GCGAAGCAGAAGAAAGTCGACGATTGGTTACCGATCACATCCTCAAGAAACGCCAAGTGG
TGGTACTCTGCGTTTCACAATGTCACTGCCATGGTTGGTGCTGGTGTACTCAGCTTGCCC
TACGCCATGTCCAATCTCGGATGGGGACCTGGCGTGACGTTGATGATAATGTCATGGCTC
ATAACTTTGTACACACTGTGGCAAATGGTGGAGATGCACGAGATGGTACCTGGGAAGAGG
TTTGATAGATATCACGAGCTAGGCCAAGAAGCTTTTGGCGAAAAGCTTGGCCTTTGGATC
ATTGTGCCGTTATGTCCCTATCTTACTCAACTATTGCATGGACTGCATCAGTGCACAAAG
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ACTTCTTGAACGCGTTGGGAGATGTGGCTTTTGCATACGCAGGTCACAACGTTGTGCTGG
AGATTCAAGCCACGATTCCTTCGACACCGGAGATACCATCCAAGGCTCCAATGTGGAGAG
GAGTCCTTGTAGCCTACATCATAGTCGCCATTTGCTACTTCCCTGTAGCGTTCCTCGGCT
ATTGGATCTTTGGAAACAGCGCTGACGACAACGTTCTAATGACTTTGGAGAAGCCTGTAT
GGCTTATTGCAATAGCTAACTCGTTTGTGGTGGTCCATGTCATTGGAAGCTATCAGATCT
TTGCAATGCCAGTGTTTGACATGCTTGAAACCGTTTTGGTCAAGAAGATGAATTTTAATC
CTTCCTTCAAACTTCGCTTCATCACTCGTAGTCTTTATGTTGCTTTCACTATGTTCATCG
CGATATGTATCCCGTTCTTTGGTGGACTACTCGGCTTCTTTGGAGGATTTGCATTCGCCC
CAACAACTTACTACCTTCCATGCATTATTTGGCTCATTCTCAAGAAACCTAAGAAGTTCA
GTCTATCCTGGATAAGTAACTGGTTCTGCATTATAGTAGGAGTTATTTTGACGGTCATAG
CACCCATTGGTGGCCTCAGAACCATCATTGTCAACGCAAGCACCTACAAGTTCTTCTCTT
AGTTTTTTTCTTCTTGTACCACAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1G858TF U 575
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ATTGGATCTTTGGAAACAGC

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DS 

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G
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TATGTTGCTTTCACTATGTTCATCGCGATATGTATCCCGTTCTTTGGTGGACTACTCGGC
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ATTCTCAAGAAACCTAAGAAGTTCAGTCTATCCTGGATAAGTAACTGGTTCTGCATTATA
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GCAAGCACCTACAAGTTCTTCTCTTAGTTTTTTTCTTCTTGTACCACAAAAAAAA

QA 2 656 2 656
DS 

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CCGGAGATA
CCATCCAAGGCTCCAATGTGGAGAGGAGTCCTTGTAGCCTACATCATAGTCACCATTTGC
TACTTCCCTGTAGCGTTCCTCGGCTATTGGATCTTTGGAAACAGCGTTGACGACAACGTT
TTAATGACTTTGGAGAAGCCTGTATGGCTTATTGCAATAGCTAACTCGTTTGTGGTGGTC
CATGTCATTGGAAGCTATCAGATCTTTGCAATGCCAGTGTTTGACATGCTTGAAACCGTT
TTGGTCAAGAAGATGAATTTTAATCCTTCCTTCAAACTTCGCTTCATCACTCGTAGTCTT
TATGTTGCTTTCACTATGTTCATCGCGATATGTATCCCGTTCTTTGGTGGACTACTCGGC
TTCTTTGGAGGATTTGCATTCGCCCCAACAACTTACTACCTTCCATGCATTATTTGGCTC
ATTCTCAAGAAACCTAAGAAGTTCAGTCTATCCTGGATAAGTAACTGGTTCTGCATTATA
GTAGGAGTTATTTTGACGGTCATAGCACCCATTGGTGGCCTCAGAACCATCATTGTCAAC
GCTAGCACCTACAAGTTCTTTTCTTAGTTTTTTTCTTCTTGT
ACCCC

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DS 



AS 1 13

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GAAAAAAAAGAATTCAAGTTACAAAGCATTAATACATCAAGATATTTTTTTCAATACAAG
AAGTAATAAAGCTTTCACATGTCTTGAAGCAAAGTGACGGACATGATCTCTATAGGTGCT
TTTGGTTGATGATGTTCATCTGTCTCAACCTCCTCGATCTCCTGAACCACATCTTGTCCC
TTTGCAACACGACCAAAAACTGTCAATTTCTCGTTCAGATCTGTGATCTGAGAAGATACA
ATGAAAAACTGAAACCCTCCTTCCTGGTTTTTAGCTTTAGGAGTTCCCACCATGAATTCT
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GACTCAGCAGAGTGACCAGCTTGAATGACGGAATGCTTTACAACTCTGCTGAATAAGAAA
CCTTTGAAATACCCATCTTGACATAAGTTGATGAACTCGTCAACAACGTTCGGAGCAGCA
TCTTTGAACAGTTCAATAGTCACTGAACCTTTGCCCGTATCTAAGGTAGCAAACCATGGG
ACATTACTAGTCTTGGCTGAATCCTGAAGAAGTGATCTACCATTGTGGGTTGGGATCTCA
GATCTGAGGGTCCAACGTTTGTACGCGGAGAAGAGGACGAAGACGACCAAAAGCAGGGCC
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TGCTGCAATAGAGCTTGCGGCTTGATCTTCGCCATTAGATCCCACAAAACCTTCTGCTTC
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GTGGTTTCTTCTTTCC


BQ
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 35 10 35 35 10 10 10 10 10 10 35 0 20 20 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 

AF RS1EJ64JQ U 19
AF RS1AQ75JQ U 1
AF RS1AZ16JQ U 20
AF RS1FK19JQ U 74
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AF RS1CL14TF C 629
BS 1 262 RS1AQ75JQ
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BS 284 284 RS1AZ16JQ
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BS 650 702 RS1GB49JQ
BS 703 735 RS1F895JQ
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BS 831 831 RS1AZ16TF
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TTACAAAGCATTAATACATCAAGATATTTTTTTCAATACAAGAAGTAATAAAGCTTTCAC
ATGTCTTGAAGCAAAGTGACGGACATGATCTCTATAGGTGCTTTTGGTTGATGATGTTCA
TCTGTCTCAACCTCCTCGATCTCCTGAACCACATCTTGTCCCTTTGCAACACGACCAAAA
ACTGTCAATTTCTCGTTCAAATCTGTGATCTGAGAAAAAACAATGAAAAACTGAAACCCT
CCTTCCTGGTTTTTAGCTTTAGGAGTTCCCACCATGAATTCTTCTTGTTTAAAACTGGTA
TG

QA 1 362 1 362
DS 

RD RS1AQ75JQ 654 0 0
GGCGATGCAGGAGATAGAAAATTAAAAGTTGTGTTACCACAAAGTTGCAAATGAGGTGAT
GAAAAAAAAGAATTCAAGTTACAAAGCATTAATACATCAAGATATTTTTTTCAATACAAG
AAGTAATAAAGCTTTCACATGTCTTGAAGCAAAGTGACGGACATGATCTCTATAGGTGCT
TTTGGTTGATGATGTTCATCTGTCTCAACCTCCTCGATCTCCTGAACCACATCTTGTCCC
TTTGCAACACGACCAAAAACTGCCAATTTCTCGTTCAGATCTGCGATCTGAGAAGATACA
ATGAAAAACTGAAACCCTCCTTCCTGGTTTTTAGCTTTAGGAGTTCCCACCATGAATTCT
TCTTGTTTAAAACTGGTATGAAGGTTATTCTTTTGGAGAGCCCAATCAGTGACAGCATCG
GACTCAGCAGAGTGACCAGCTTGAATGACGGAATGCTTTACAACTCTGCTGAATAAGAAA
CCTTTGAAATACCCATCTTGACATAAGTTGATGAACTCGTCAACAACGTTCGGAGCAGCA
TCTTTGAACAGTTCAATAGTCACTGAACCTTTGCCCGTATCTAAGGTAGCAAACCATGGG
ACATTACTAGTCTTGGCTGAATCCTGAAGAAGTGATCTACCATTGTGGG
GTTGG

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DS 

RD RS1AZ16JQ 607 0 0
AATTAAAAGTTGTGTTACCACAAAGTTGCAAATGAGGTGATGAAAAAAAAGAATTCAAGT
TACAAAGCATTAATACATCAAGATATTTTTTTCAATACAAGAAGTAATAAAGCTTTCACA
TGTCTTGAAGCAAAGTGACGGACATGATCTCTATAGGTGCTTTTGGTTGATGATGTTCAT
CTGTCTCAACCTCCTCGATCTCCTGAACCACATCTTGTCCCTTTGCAACACGACCAAAAA
CTGTCAATTCCTCGTTCAGATCTGTGATCTGAGAAGATACAATGAAAAACTGAAACCCTC
CTTCCTGGTTTTTAGCTTTAGGAGTTCCCACCATGAATTCTTCTTGTTTAAAACTGGTAT
GAAGGTTATTCTTTTGGAGAGCCCAATCAGTGACAGCATCGGACTCAGCAGAGTGACCAG
CTTGAATGACGGAATGCTTTACAACTCTGCTGAATAAGAAACCTTTGAAATACCCATCTT
GACATAAGTTGATGAACTCGTCAACAACGTTCGGAGCAGCATCTTTGGACAGTTCAATAG
TCACTGAACCTTTGCCCGTATCTAAGGTAGCAAACCATGGGACATTACTAGTCTTGGCTG
AATCCTG

QA 1 607 1 607
DS 

RD RS1FK19JQ 585 0 0
C
CAAGTTACAAAGCATTAATACATCAAGAGATTTTTTTCAATACAAGAAGTAATAAAGGTT
TCACATGTCTTGAAGCAAAGTGACGGACATGATCTCTATAGGTGCTTTTGGTTGATGATG
TTCATCTGTCTCAACCTCCTCGATCTCCTGAACCACATCTTGTCCCTTTGCAACACGACC
AAAAACTGTCAATTTCTCGTTCAAATCTGTGATCTGAGAAGATACAATGAAAAACTGAAA
CCCTCCTTCCTGGTTTTTAGCTTTAGGAGTTCCCACCATGAATTCTTCTTGTTTAAAACT
GGTATGAAGGTTATTCTTTTGGAGAGCCCAATCTGTGACAGCATCAGACTCAGCAGAGTG
ACCAGCTTGAATGACGGAATGCTTTACAACTCTGCTGAATAAGAAACCTTTGAAATACCC
ATCTTGACATAAGTTGATGAATTCGTCAACAACGTTGGGAGCAGCATCTTTGAACAGTTC
AATAGTCACTGAACCTTTGCCCGTATCTAAGGTAGCAAACCATGGGACATTACTAGTCTT
GGCTGAATCCTGAAGAAGTGATCTACCATTGTGGGTTGGGATCT

QA 2 585 2 585
DS 

RD RS1GB49JQ 686 0 0
GA
AAATTAAAAGTTGTGTTACCACAAAGTTGCAAATGAGGTGATGAAAAAAAAGAATTCAAG
TTACAAAGCATTAATACATCAAGATATTTTTTTCAATACAAGAAGTAATAAAGCTTTCAC
ATGTCTTGAAGCAAAGTGACGGACATGATCTCTATAGGTGCTTTTGGTTGATGATGTTCA
TCTGTCTCAACCTCCTCGATCTCCTGAACCACATCTTGTCCCTTTGCAACACGACCAAAA
ACTGTCAATTTCTCGTTCAGATCTGTGATCTGAGAAGATACAATGAAAAACTGAAACCCT
CCTTCCTGGTTTTTAGCTTTAGGAGTTCCCACCATGAATTCTTCTTGTTTAAAACTGGTA
TGAAGGTTATTCTTTTGGAGAGCCCAATCAGTGACAGCATCGGACTCAGCAGAA**ACCA
GCTTGAATGACGGAATGCTTTACAACTCTGCTGAATAAGAAACCTTTGAAATACCCATCT
TGACATAAGTTGATGAACTCGTCAACAACGTTCGGAGCAGCATCTTTGAACAGTTCAATA
GTCACTGAACCTTTGCCCGTATCTAAGGTAGCAAACCATGGGACATTACTAGTCTTGGCT
GAATCCTGAAGAAGTGATCTACCATTGTGGGTTGGGATCTCAGATCTGAGGGTCCAACGT
TTGTACGCGGAGAAGAGGACGAAG

QA 3 686 3 686
DS 

RD RS1CL14JQ 656 0 0
GCAAATGAGGTGATGAAAAAAAAGAATTCAAGTTACAAAGCATTAATACATCAAGATATT
TTTTTCAATACAAGAAGTAATAAAGCTTTCACATGTCTTGAAGCAAAGTGACGGACATGA
TCTCTATAAGTGCTTTTGGTTGATGATGTTCATCTGTCTCAACCTCCTCGATCTCCTGAA
CCACATCTTGTCCCTTTGCAACACGACCAAAAACTGTCAATTTCTCGTTCAGATCTGTGA
TCTGAGAAGATACAATGAAAAACTGAAACCCTCCTTCCTGGTTTTTAGCTTTAGGAGTTC
CCACCATGAATTCTTCTTGTTTAAAACTGGTATGAAGGTTATTCTTTTGGAGAGCCCAAT
CAGTGACAGCATCGGACTCAGCAGAATGACCAGCTTGAATGACGGAATGCTTTACAACTC
TGCTGAATAAGAAACCTTTGAAATACCCATCTTGACATAAGTTGATGAACTCGTCAACAA
CGTTCGGAGCAGCATCTTTGAACAGTTCAATAGTCACTGAACCCTTGCCCGTATCTAAGG
TAGCAAACCATGGGACATTACTAGTCTTGGCTGAATCCTGAAGAAGTGACCTACCATTGT
GGGTTGGGATCTCAGATCTGAGGGTCCAACGTTTGTACGCGGAGAAGAGGACGAAG

QA 1 656 1 656
DS 

RD RS1F895JQ 700 0 0
ACCACAAAGTTGCAAATGAGGGGATGGAAAAAA*GAATTCAAGTTACAAAGCATTAATAC
ATCAAGAGATTTTTTTCAATACAAGAAGTAATAAAGGTTTCACATGTCTTGAAGCAAAGT
GACGGACATGATCTCTATAGGTGCTTTTGGTTGATGATGTTCATCTGTCTCAACCTCCTC
GATCTCCTGAACCACATCTTGTCCCTTTGCAACACGACCAAAAACTGTCAATTTCTCGTT
CAGATCTGTGATCTGAGAAGATACAATGAAAAACTGAAACCCTCCTTCCTGGTTTTTAGC
TTTAGGAGTTCCCACCATGAATTCTTCTTGTTTAAAACTGGTATGAAGGTTATTATTTTG
GAGAGCCCAATCTGTGACAGCATCAGACTCAGCAAAGTGACCAGCTTGAATGACGGAATG
CTTTACAACTCTGCTGAATAAGAAACCTTTGAAATACCCATCTTGACATAAGTTGATGAA
TTCGTCAACAACGTTGGGAGCAGCATCTTTGAACAGTTCAATAGTCACTGAACCTTTGCC
CGTATCTAAGGTAGCAAACCATGGGACATTACTAGTCTTGGCTGAATCCTGAAGAAGTGA
TCTACCATTGTGGGTTGGGATCTCAGATCTGAGGGTCCAACGTTTGTAGGCGGAGAAGAG
GACGAAGACGACCAAAAGCAGGGCCAAGGTGTAAATCACG

QA 1 700 1 700
DS 

RD RS1AQ75TFB 850 0 0
AAAAGAATTCAAGTTACAAAGCATTAATACATCAAGATATTTTTT*CAATACAAGAAGTA
ATAAAGCTTTCACATGTCTTGAAGCAAAGTGACGGACATGATCTCTATAGGTGCTTTTGG
TTGATGATGTTCATCTGTCTCAACCTCCTCGATCTCGTGAACCACATCTTGTCCCTTTGC
AACACGACCAAAAACTGCCAATTTCTCGTTCAGATCTGCGATCTGAGAAGATACAATGAA
AAACTGAAACCCTCCTTCCTGGTTTTTAGCTTTAGGAGTTCCCACCATGAATTCTTCTTG
TTTAAAACTGGTATGAAGGTTATTCTTTTGGAGAGCCCAATCAGTGACAGCATCGGACTC
AGCAGAGTGACCAGCTTGAATGACGGAATGCTTTACAACTCTGCTGAATAAGAAACCTTT
GAAATACCCATCTTGACATAAGTTGATGAACTCGTCAACAACGTTCGGAGCAGCATCTTT
GAACAGTTCAATAGTCACTGAACCTTTGCCCGTATCTAAGGTAGCAAACCATGGGACATT
ACTAGTCTTGGCTGAATCCTGAAGAAGTGATCTACCATTGTGGGTTGGGATCTCAGATCT
GAGGGTCCAACGTTTGTACGCGGAGAAGAGGACGAAGACGACCAAAAGCAGGGCCAAGGT
GTAAATCACGATGCTGGTTATGCTAATAGGAGAAGGTCCTTTTTTCTTCTTGCTTTGCTG
CAATAGAGCTTGCGGCTTGATCTTCGCCATTAGATCCCACAAAAC*CTTTGCTTCTTGTT
AGTTAGCTGATGGTGGAGAATTCAAGAGTAAGTTGGTCTTGTTTCTGCAAAGAGAGTGGT
TTCTTC
TTTC

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DS 

RD RS1F895TF 688 0 0
ACCACATCTTGTCCCTTTGCAACACGACCAAAAACTGTCAATTTCTCGTTCAGATCTGTG
ATCTGAGAAGATACAATGAAAAACTGAAACCCTCCTTCCTGGTTTTTAGCTTTAGGAGTT
CCCACCATGAATTCTTCTTGTTTAAAACTGGTATGAAGGTTATTATTTTGGAGAGCCCAA
TCTGTGACAGCATCAGACTCAGCAGAGTGACCAGCTTGAATGACGGAATGCTTTACAACT
CTGCTGAATAAGAAACCTTTGAAATACCCATCTTGACATAAGTTGATGAATTCGTCAACA
ACGTTGGGAGCAGCATCTTTGAACAGTTCAATAGTCACTGAACCTTTGCCCGTATCTAAG
GTAGCAAACCATGGGACATTACTAGTCTTGGCTGAATCCTGAAGAAGTGATCTACCATTG
TGGGTTGGGATCTCAGATCTGAGGGTCCAACGTTTGTAGGCGGAGAAGAGGACGAAGACG
ACCAAAAGCAGGGCCAAGGTGTAAATCACGATGCTGGTTATGCTAATAGGAGAAGGTCCT
TTCTTCTTCTTGCTTTACTGCAATAGAGCTTGCGGCTTGATCTTCGCCATT***TACC**
****C*TTCTGCTTCTTGTTAGTTAGCTGATGGTGGAGAATTCAAGAGTAAGTTGGTCTT
GTTTCTGCAAAGAGAGTGGTTTCTTC
CC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1FK19TF 575 0 0
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AGCCCAATCTGTGACAGCATCAGACTCAGCAGAGTGACCAGCTTGAATGACGGAATGCTT
TACAACTCTGCTGAATAAGAAACCTTTGAAATACCCATCTTGACATAAGTTGATGAATTC
GTCAACAACGTTGGGAGCAGCATCTTTGAACAGTTCAATAGTCACTGAACCTTTGCCCGT
ATCTAAGGTAGCAAACCATGGGACATTACTAGTCTTGGCTGAATCCTGAAGAAGTGATCT
ACCATTGTGGGTTGGGATCTCAGATCTGAGGGTCCAACGTTTGTAGGCGGAGAAGAGGAC
GAAGACGACCAAAAGCAGGGCCAAGGTGTAAATCACGATGCTGGTTATGCTAATAGGAGA
AGGTCCTTTCTTCTTCTTGCTTTGCTGCAATAGAGCTTGCGGCTTGATCTTCGCCATT**
*TACC******C*TCCTGCTTCTTGTTAGTTAGCTGATGGTGGAGAATTCAAGAGTAAGT
TGGTCTTGTTTCTGCAAAGAGAGTGGTTTCTTC
CC

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DS 

RD RS1AZ16TF 625 0 0
CTGAGAAGATACAATGAAAAACTGAAACCCTC*TTCCTGGTTTTTAGCTTTAGGAGTTCC
CACCATGAATTCTTCTTGTTTAAAACTGGTATGAAGGTTATTCTTTTGGAGAGCCCAATC
AGTGACAGCATCGGACTCAGCAGAGTGACCAGCTTGAATGACGGAATGCTTTACAACTCT
GCTGAATAAGAAACCTTTGAAATACCCATCTTGACATAAGTTGATGAACTCGTCAACAAC
GTTCGGAGCAGCATCTTTGGACAGTTCAATAGTCACTGAACCTTTGCCCGTATCTAAGGT
AGCAAACCATGGGACATTACTAGTCTTGGCTGAATCCTGAAGAAGTGATCTACCATTGTG
GGTTGGGATCTCAGATCTGAGGGTCCAACGTTTGTACGCGGAGAAGAGGACGAAGACGAC
CAAAAGCAGGGCCAAGGTGTAAATCACGATGCTGGTTATGCTAATAGGAGAAGGTCCTTT
TTTCTTCTTGCTGTGCTGCAATAGAGCTTGCGGCTTGATCTTCGCCATTAGATCCCACAA
AACCTTCTGCTTCTTGTTAGTTAGCTGATGGTGGAGAATTCAAGAGTAAGTTGGTCTTGT
TTCTGCAAAGAGAGTGGTTTCTTC
C

QA 1 624 1 624
DS 

RD RS1EJ64TF 779 0 0
ATAAAGCTTTCACATGTCT*GAAGCAAAGTGACGGACATGATCTCTATAGGTGCTTTTGG
TTGATGATGTTCATCTGTCTCA*CCTCCTCGATCTC*TGAACCACATCTTGTCCCTTTGC
AACACGACCAAAAACTGTCAATTTCTCGTTCAGATCTGTGATCTGAGAAGATACAATGAA
AAACTGAAACCCTCCTTCCTGGTTTTTAGCTTTAGGAGTTCCCACCATGAATTCTTCTTG
TTTAAAACTGGTATGAAGGTTATTCTTTTGGAGAGCCCAATCAGTGACAGCATCGGACTC
AGCAGAGTGACCAGCTTGAATGACGGAATGCTTTACAACTCTGCTGAATAAGAAACCTTT
GAAATACCCATCTTGACATAAGTTGATGAACTCGTCAACAACGTTCGGAGCAGCATCTTT
GAACAGTTCAATAGTCACTGAACCTTTGCCCGTATCTAAGGTAGCAAACCATGGGACATT
ACTAGTCTTGGCTGAATCCTGAAGAAGTGATCTACCATTGTGGGTTGGGATCTCAGATCT
GAGGGTCCAACGTTTGTACGCGGAGAAGAGGACGAAGACGACCAAAAGCAGGGCCAAGGT
GTAAATCACGATGCTGGTTATGCTAATAGGAGAAGGTCCTTTTTTCTTCTTGCTTTGCTG
CAATAGAGCTTGCGGCTTGATCTTCGCCATTAGATCCCACAAAACCTTCTGCTTCTTGTT
AGTTAGCTGATGGTGGAGAATTCAAGAGTAAGTTGGTCTTGTTTCTGCAAAGAGAGT
CC

QA 1 777 1 777
DS 

RD RS1CL14TF 288 0 0
GAAGTGACCTACCATTGTGGGTTGGGATCTCAGATCTGAGGGTCCAACGTTTGTACGCGG
AGAAGAGGACGAAGACGACCAAAAGG*GGGCCAAGGTGTAAATCACGATGCTGGTTATGC
TAATAGGAGAAGGTCCTTT*TTCTTCTTGCTTTGCTGCAATAGAGCTTGCGGCTTGATCT
TCGCCATTAGATCCCACAAAACCTTCTGCTTCTTGTTAGTTAGCTGATGGTGGAGAATTC
AAGAGTAAGTTGGTCTTGTTTCTGCAAAGAGAGTGGTTTCTTCTTTCC

QA 1 288 1 288
DS 



AS 1 16

CO CL54Contig1 814 16 20 U
GGATCCACAAGAATATCTCAAAGCTTTCGATTTGATCAAATACATCAATCAACAATGGCG
TTCCCTAAGGTTTTCTTCGACATAACCATCGGCGGGCAACCAGCGGGAAGGATCGTGATG
GAGTTGTATACCGATAAGACTCCGAAGACGGCTGAGAACTTCAGAGCTCTGTGCACTGGA
GAGAGGGGAGTGGGGCGTAAGGGAAAAGCCCTTCACTTCAAGGGATCTGGCTTCCACAGA
GTGATCCCTAGTTTCATGTGCCAGGGAGGCGATTTCACCGCCGGAAACGGGACAGGAGGT
GAGTCCATCTACGGGGATAAGTTCGAGGACGAGAGCTTTGAGAGGAAGCACACCGGTCCT
GGTAACCTTTCCATGGCCAACGCCGGCGCCAACACCAACGGATCTCAGTTCTTCATCTGC
ACCGTGAAAACCGATTGGCTGGACGGTAAGCACGTGGTGTTCGGTCAGGTGGTGGAAGGG
TTAGACGTGGTGAAGGCGATCGAGAAGGTGGGATCGTCGTCTGGAAAGCCGTCGAAGCAG
GTGGTTATCGCCGATTGTGGACAGCTCTCTTAGATGATCTCAGCTCTCTCTCCCTCTATC
CTCATTTTAATTATGGCGTCTCCCCCCCTATGTTATGTTTGGTGTCTCGTTTGTATAAGT
AGTCAAAAACTTGGTCTCTGTGTTCTCATGGCAGTCTTTTGGATTGACAGAGAGAAACTC
GTCAGTCACCCTTATTACCTTACTACCATAAATAATGAGAGCTTTAACAATAATGAAATT
AGTAATATCTCTTGCAATTAATCTGTGATTTTAC


BQ
35 45 50 50 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 15 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 80 80 80 80 10 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 10 80 80 80 80 80 65 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 15 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 40 85 85 85 85 85 85 40 85 85 85 85 85 30 85 85 85 
70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 15 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 15 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 
85 85 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 5 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 35 70 10 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 5 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 35 65 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 40 40 10 35 35 35 35 30 30 30 30 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E218TF U 7
AF RS1B149TF U -3
AF RS1FB90TF U 2
AF RS1EA04JQ C 338
AF RS1EA04TF U 1
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AF RS1C417TF U 1
AF RS1AM96TF U 1
AF RS1B149JQ C 69
AF RS1E977TF U 1
AF RS1FB90JQ C 2
AF RS1E218JQ C 171
AF RS1BC41JQ C 157
AF RS1C417JQ C 1
AF RS1E977JQ C 69
AF RS1AM96JQ C 73
BS 1 194 RS1AM96TF
BS 195 195 RS1E977TF
BS 196 210 RS1AM96TF
BS 211 211 RS1B149TF
BS 212 314 RS1AM96TF
BS 315 315 RS1E977TF
BS 316 334 RS1AM96TF
BS 335 335 RS1E977TF
BS 336 362 RS1AM96TF
BS 363 363 RS1E977TF
BS 364 452 RS1AM96TF
BS 453 453 RS1E977TF
BS 454 464 RS1AM96TF
BS 465 465 RS1E977TF
BS 466 500 RS1AM96TF
BS 501 501 RS1E977TF
BS 502 580 RS1AM96TF
BS 581 581 RS1E977TF
BS 582 779 RS1AM96TF
BS 780 814 RS1AM96JQ

RD RS1E218TF 252 0 0
GG
AAGAATATCTCAAAGCTTTCGATTTGATCAAATACATCAATCAACAATGGCGTTCCCTAA
GGTTTTCTTCGACATAACCATCGGCGGGCAACCAGCGGGAAGGATCGTGATGGAGTTGTA
TACCGATAAGACTCCGAAGACGGCTGAGAACTTCAGAGCTCTGTGCACTGGAGAGAGGGG
AGTGGGGCGTAAGGGAAA*GCCCTTCACTTCAAGGGATCTGGCTTCCACAGAGTGATCCC
TA
TTTCATGT

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DS 

RD RS1B149TF 540 0 0
GAATTC
ATCCACAAGAATATCTCAAAGCTTTCGATTTGATCAAATACATCAATCAACAATGGCGTT
CCCTAAGGTTTTCTTCGACATAACCATCGGCGGGCAACCAGCGGGAAGGATCGTGATGGA
GTTGTATACCGATAAGACTCCGAAGACGGCTGAGAACTTCAGAGCTCTGTGCACTGGAGA
GAGGGGAGTGGGACGTAAGGGAAAAGCCCTTCACTTCAAGGGATCTGGCTTCCACAGAGT
GATCCCTAGTTTCATGTGCCAGGGAGGCGATTTCACCGCCGGAAACGGGACAGGAGGTGA
GTCCATCTACGGTGATAAGTTCGAGGACGAGAACTTTGAGAGGAAGCACACCGGTCCTGG
GAACCTTTCCATGGCCAACGCCGGCGCCAACACCAACGGATCTCAGTTCTTCATCTGCAC
CGTGAAAACCGATTGGCTGGACGGTAAGCATGTGGTGTTCGGGCAGGTGGTGGAAGGGTT
AGACGTGGTGAAGGCGATGGAGAAGGTGGGATCGTCGTCTGGAAAGCCGTCGAA

QA 7 540 7 540
DS 

RD RS1FB90TF 499 0 0
GATCCACAAGAATATCTCAAAGCTTTCGATTTGATCAAATACATCAATCAACAATGGCGT
TCCCTAAGGTTTTCTTCGACATAACCATCGGCGGGCAACCAGCGGGAAGGATCGTGATGG
AGTTGTATACCGATAAGACTCCGAAGACGGCTGAGAACTTCAGAGCTCTGTGCACTGGAG
AGAGGGGAGTGGGGCGTAAGGGAAAAGCCCTTCACTTCAAGGGATCTGGCTTCCACAGAG
TGATCCCTAGTTTCATGTGCCAGGGAGGCGATTTCACCGCCGGAAGCGGGACAGGAGGTG
AGTCCATCTACGGGGATAAGTTCGAGGACGAGAGCTTTGAGAGGAAGCACACCGGTCCTG
GTAACCTTTCCATGGCCAACGCCGGCGCCAACACCAACGGATCTCAGTTCTTCATCTGCA
CCGTGAAAACCGATTGGCTGGACGGTAAGCACGTGGTGTTCGGTCAGGTGGTGGAAGGGT
TAGACGTGGTGAAGGCGAT

QA 1 499 1 499
DS 

RD RS1EA04JQ 145 0 0
TTGG
GAGGAAGCACACCGGTCCTGGTAACCTTTCCATGGCCAACGCCGGGGCCAACACCAACGG
ATTTCAGTTTTTCATTTGCCCCGTGAAAACCGATTGGCTGGACGGTAAGCACGTGGTGTT
TGGTCAGGTGGTGGAAGGGTT

QA 5 145 5 145
DS 

RD RS1EA04TF 666 0 0
GGATCCACAAGAATATCTCAAAGCTTTCGATTTGATCAAATACATCAATCAACAATGGCG
TTCCCTAAGGTTTTCTTCGACATAACCATCGGCGGGCAACCAGCGGGAAGGATCGTGATG
GAGTTGTATACCGATAAGACTCCGAAGACGGCTGAGAACTTCAGAGCTCTGTGCACTGGA
GAGAGGGGAGTGGGGCGTAAGGGAAAAGCCCTTCACTTCAAGGGATCTGGCTTCCACAGA
GTGATCCCTAGTTTCATGTGCCAGGGAGGCGATTTCACCGCCGGAAACGGGACAGGAGGT
GAGTCCATCTACGGGGATAAGTTCGAGGACGAGAGCTTTGGGAGGAAGCACACCGGTCCT
GGTAACCTTTCCATGGCCAACGCCGGCGCCAACACCAACGGATCTCAGTTCTTCATCTGC
ACCGTGAAAACCGATTGGCTGGACGGTAAGCACGTGGTGTTCGGTCAGGTGGTGGAAGGG
TTAGACGTGGTGAAGGCGATCGAGAAGGTGGGATCGTCGTCTGGAAAGCCGTCGAAGCAG
GTGGTTATCGCCGATTGTGGACGGCTCTCTTAGATGATCTCAGCTCTCTCTCCCTCTATC
CTCATTTTAATTATGGCGTCTCCCCCC*TATGTTATGTTTGGTGTCTCGTTTGTATAAGT
AGTCAA

QA 1 666 1 666
DS 

RD RS1BC41TF 710 0 0
GG
CCACAAGAATATCTCAAAGCTTTCGATTTGATCAAATACATCAATCAACAATGGCGTTCC
CTAAGGTTTTCTTCGACATAACCATCGGCGGGCAACCAGCGGGAAGGATCGTGATGGAGT
TGTATACCGATAAGACTCCGAAGACGGCTGAGAACTTCAGAGCTCTGTGCACTAGAGAGA
GGGGAGTGGGGCGTAAGGGAAAAGCCCTTCACTTCAAGGGATCTGGCTTCCACAGAGTGA
TCCCTAGTTTCATGTGCCAGGGAGGCGATTTCACCGCCGGAAACGGGACAGGAGGTGAGT
CCATCTACGGGGATAAGTTCGAGGACGAGAGCTTTGAGAGGAAGCACACCGGTCCTGGTA
ACCTTTCCATGGCCAACGCCGGCGCCAACACCAACGGATCTCAGTTCTTCATCTGCACCG
TGAAAACCGATTGGCTGGACGGTAAGCACGTGGTGTTCGGTCAGGTGGTGTAAGGGTTAG
ACGTGGTGAAGGCGATCGAGAAGGTGGGATCGTTGTCTGGAAAGCCGTCGAAGCAGGTGG
TTATCGCCGATTGTGGACAGCTCTCTTAGATGATCTCAGCTCTCTCTCCCTCTATCCTCA
TTTTAATTATGGCGTCTCCCCCC*TATGTTATGTTTGGTGTCTCGTTTGTATAAGTAGTC
AAAA*CTTGGTCTCTGTGTTCTCATGGCAGTCTTTTGGATTGACAGAG

QA 3 710 3 710
DS 

RD RS1C417TF 708 0 0
GGATCCACAAGAATATCTCAAAGCTTTCGATTTGATCAAATACACCAATCAACAATGGCG
TTCCCTAAGGTTTTCTTCGACATAACCATCGGCGGGCAACCAGCGGGAAGGATCGTGATG
GAGTTGTATACCGATAAGACTCCGAAGACGGCTGAGAACTTCAGAGCTCTGTGCACTGGA
GAGAGGGGAGTGGGACGTAAGGGAAAAGCCCTTCACTTCAAGGGATCTGGCTTCCACAGA
GTGATCCCTAGTTTCATGTGCCAGGGAGGCGATTTCACCGCCGGAAACGGGACAGGAGGT
GAGTCCATCTACGGTGATAAGTTCGAGGACGAGAACTTTGAGAGGAAGCACACCGGTCCT
GGGAACCTTTCCATGGCCAACGCCGGCGCCAACACCAACGGATCTCAGTTCTTCATCTGC
ACCGTGAAAACCGATTGGCTGGACGGTAAGCATGTGGTGTTCGGGCAGGTGGTGGAAGGG
TTAGACGTGGTGAAGGCGATGGAGAAGGTGGGATCGTCGTCTGGAAAGCCGTCGAAGCAG
GTGGTTATCGCCGATTGTGGACAGCTCTCTTAGATGATCTGAGCTCTCTCTCCCTCTATC
CTCATTTTAATTATGGCGTCTCCCCCC*TATGTTATGTTTGGTGTCTCGTTTGTATAAGT
AGTCAAAAACTTGGTCTCTGTGTTCTCATGGCAGTCTTTTGGATTGAC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1AM96TF 782 0 0
GGATCCACAAGAATATCTCAAAGCTTTCGATTTGATCAAATACATCAATCAACAATGGCG
TTCCCTAAGGTTTTCTTCGACATAACCATCGGCGGGCAACCAGCGGGAAGGATCGTGATG
GAGTTGTATACCGATAAGACTCCGAAGACGGCTGAGAACTTCAGAGCTCTGTGCACTGGA
GAGAGGGGAGTGGGACGTAAGGGAAAAGCCTTTCACTTCAAGGGATCTGGCTTCCACAGA
GTGATCCCTAGTTTCATGTGCCAGGGAGGCGATTTCACCGCCGGAAACGGGACAGGAGGT
GAGTCCATCTACGGTGATAAGTTCGAGGACGAGAACTTTGAGAGGAAGCACACCGGTCCT
GGGAACCTTTCCATGGCCAACGCCGGCGCCAACACCAACGGATCTCAGTTCTTCATCTGC
ACCGTGAAAACCGATTGGCTGGACGGTAAGCATGTGGTGTTCGGGCAGGTGGTGGAAGGG
TTAGACGTGGTGAAGGCGATGGAGAAGGTGGGATCGTCGTCTGGAAAGCCGTCGAAGCAG
GTGGTTATCGCCGATTGTGGACAGCTCTCTTAGATGATCTGAGCTCTCTCTCCCTCTATC
CTCATTTTAATTATGGCGTCTCCCCCCCTATGTTATGTTTGGTGTCTCGTTTGTATAAGT
AGTCAAAAACTTGGTCTCTGTGTTCTCATGGCAGTCTTTTGGATTGACAGAGAGAAACTC
GTCAGTCACCCTTATTACCTTACTACCATAAATAATGAGAGCTTTAACAATAATGAAAT
TAG

QA 1 779 1 779
DS 

RD RS1B149JQ 703 0 0
GGTTTTCTTCGACATAACCATCGGCGGGCAACCAGCGGGAAGGATCGTGATGGAGTTGTA
TACCGATAAGACTCCGAAGACGGCTGAGAACTTCAGAGCTCTGTGCACTGGAGAGAGGGG
AGTGGGACGTAAGGGAAAAGCCCTTCACTTCAAGGGATCTGGCTTCCACAGAGTGATCCC
TAGTTTCATGTGCCAGGGAGGCGATTTCACCGCCGGAAACGGGACAGGAGGTGAGTCCAT
CTACGGTGATAAGTTCGAGGACGAGAACTTTGAGAGGAAGCACACCGGTCCTGGGAACCT
TTCCATGGCCAACGCCGGCGCCAACACCAACGGATCTCAGTTCTTCATCTGCACCGTGAA
AACCGATTGGCTGGACGGTAAGCATGTGGTGTTCGGGCAGGTGGTGGAAGGGTTAGACGT
GGTGAAGGCGATGGAGAAGGTGGGATCGTCGTCTGGAAAGCCGTCGAAGCAGGTGGTTAT
CGCCGATTGTGGACAGCTCTCTTAGATGATCTGAGCTCTCTCTCCCTCTATCCTCATTTT
AATTATGGCGTCTCCCCCCCTATGTTATGTTTGGTGTCTCGTTTGTATAAGTAGTCAAAA
ACTTGGTCTCTGTGTTCTCATGGCAGTCTTTTGGATTGACAGAGAGAAACTCGTCAGTCA
CCCTTATTACCTTACTACCATAAATAATGAGAGCTTTAACAAT

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1E977TF 782 0 0
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TTCCCTAAGGTTTTCTTCGACATAACCATCGGCGGGCAACCAGCGGGAAGGATCGTGATG
GAGTTGTATACCGATAAGACTCCGAAGACGGCTGAGAGCTTCAGAGCTCTGTGCACTGGA
GAGAGGGGAGTGGGGCGTAAGGGAAAAGCCCTTCACTTCAAGGGATCTGGCTTCCACAGA
GTGATCCCTAGTTTCATGTGCCAGGGAGGCGATTTCACCGCCGGAAACGGGACAGGAGGT
GAGTCCATCTACGGGGATAAGTTCGAGGACGAGAGCTTTGAGAGGAAGCACACCGGTCCT
GGTAACCTTTCCATGGCCAACGCCGGCGCCAACACCAACGGATCTCAGTTCTTCATCTGC
ACCGTGAAAACCGATTGGCTGGACGGTAAGCACGTGGTGTTCGGTCAGGTGGTGGAAGGG
TTAGACGTGGTGAAGGCGATCGAGAAGGTGGGATCGTCGTCTGGAAAGCCGTCGAAGCAG
GTGGTTATCGCCGATTGTGGACAGCTCTCTTAGATGATCTCAGCTCTCTCTCCCTCTATC
CTCATTTTAATTATGGCGTCTCCCCCCTTATGTTATGTTTGGTGTCTCGTTTGTATAAGT
AGTCAAAAACTTGGTCTCTGTGTTCTCATGGCAGTCTTTTGGATGG*CAGAGAGAAACTC
GTCAGTCACCCTTATTACCTTACTAC*ATAAATAATGAGAGCTTTAACAAAAATGAAAT
AGT

QA 1 779 1 779
DS 

RD RS1FB90JQ 768 0 0
GATCCACAAGAATATCTCAAAGCTTTCGATTTGATCAAATACATCAATCAACAATGGCGT
TCCCTAAGGTTTTCTTCGACATAACCATCGGCGGGCAACCAGCGGGAAGGATCGTGATGG
AGTTGTATACCGATAAGACTCCGAAGACGGCTGAGAACTTCAGAGCTCTGTGCACTGGAG
AGAGGGGAGTGGGGCGTAAGGGAAAAGCCCTTCACTTCAAGGGATCTGGCTTCCACAGAG
TGATCCCTAGTTTCATGTGCCAGGGAGGCGATTTCACCGCCGGAAGCGGGACAGGAGGTG
AGTCCATTTACGGGGATAAGTTCGAGGACGAGAGCTTTGAGAGGAAGCACACCGGTCCTG
GTAACCTTTCCATGGCCAACGCCGGCGCCAACACCAACGGATTTCAGTTTTTCATTTGCA
CCGTGAAAACCGATTGGCTGGACGGTAAGCACGTGGTGTTCGGTCAGGTGGTGGAAGGGT
TAGACGTGGTGAAGGCGATCGAGAAGGTGGGATCGTCGTCTGGAAAGCCGTCGAAGCAGG
TGGTTATCGCCGATTGTGGACAGCTCTTTTAGATGATTTCAGCTCTCTCTCCCTCTATCC
TCATTTTAATTATGGCGTCTCCCCCCCTATGTTATGTTTGGTGTCTCGTTTGTATAAGTA
GTCAAAAACTTGGTCTCTGTGTTCTCATGGCAGTCTTTTGGATTGACAGAGAGAAACTCG
TCAGTCACCCTTATTACCTTACTACCATAAATAATGAGAGCTTTAAC
G

QA 1 767 1 767
DS 

RD RS1E218JQ 595 0 0
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CTTCCACAGAGTGATCCCTAGTTTCATGTGCCAGGGAGGCGATTTCACCGCCGGAAACGG
GACAGGAGGTGAGTCCATCTACGGGGATAAGTTCGAGGACGAGAGCTTTGAGAGGAAGCA
CACCGGTCCTGGTAACCTTTCCATGGCCAACGCCGGCGCCAACACCAACGGATTTCAGTT
TTTCATTTGCACCGTGAAAACCGATTGGCTGGACGGTAAGCACGTGGTGTTCGGTCAGGT
GGTGGAAGGGTTAGACGTGGTGAAGGCGATCGAGAAGGTGGGATCGTCGTCTGGAAAGCC
GTCGAAGCAGGTGGTTATCGCCGATTGTGGACAGCTCTCTTAGATGATTTCAGCTCTCTC
TCCCTCTATCCTCATTTTAATTATGGCGTCTCCCCCCCCATGTTATGTTTGGTGTCTCGT
TTGTATAAGTAGTCAAAAACTTGGTCTCTGTGTTCTCATGGCAGTCTTTTGGATTGACAG
AGAGAAACTCGTCAGTCACCCTTATTACCTTACTACCATAAATAATGAGAGCTTT

QA 1 595 1 595
DS 

RD RS1BC41JQ 612 0 0
AACTTCAGAGCTCTGTGCACTAGAGAGAGGGGAGTGGGGCGTAAGGGAAAAGCCCTTCAC
TTCAAGGGATCTGGCTTCCACAGAGTGATCCCTAGTTTCATGTGCCAGGGAGGCGATTTC
ACCGCCGGAAACGGGACAGGAGGTGAGTCCATTTACGGGGATAAGTTCGAGGACGAGAGC
TTTGAGAGGAAGCACACCGGTCCTGGTAACCTTTCCATGGCCAACGCCGGCGCCAACACC
AACGGATTTCAGTTTTTCATTTGCACCGTGAAAACCGATTGGCTGGACGGTAAGCACGTG
GTGTTCGGTCAGGTGGTGTAAGGGTTAGACGTGGTGAAGGCGATCGAGAAGGTGGGATCG
TTGTCTGGAAAGCCGTCGAAGCAGGTGGTTATCGCCGATTGTGGACAGCTCTCTTAGATG
ATTTCAGCTCTCTCTCCCTCTATCCTCATTTTAATTATGGCGTCTCCCCCCCTATGTTAT
GTTTGGTGTCTCGTTTGTATAAGTAGTCAAAAACTTGGTCTCTGTGTTCTCATGGCAGTC
TTTTGGATTGACAGAGAGAAACTCGTCAGTCACCCTTATTACCTTACTACCATAAATAAT
GAGAGCTTTAAC

QA 1 612 1 612
DS 

RD RS1C417JQ 775 0 0
GGATCCACAAGAATATCTCAAAGCTTTCGATTTGATCAAATACACCAATCAACAATGGCG
TTCCCTAAGGTTTTCTTCGACATAACCATCGGCGGGCAACCAGCGGGAAGGATCGTGATG
GAGTTGTATACCGATAAGACTCCGAAGACGGCTGAGAACTTCAGAGCTCTGTGCACTGGA
GAGAGGGGAGTGGGACGTAAGGGAAAAGCCCTTCACTTCAAGGGATCTGGCTTCCACAGA
GTGATCCCTAGTTTCATGTGCCAGGGAGGCGATTTCACCGCCGGAAACGGGACAGGAGGT
GAGTCCATCTACGGTGATAAGTTCGAGGACGAGAACTTTGAGAGGAAGCACACCGGTCCT
GGGAACCTTTCCATGGCCAACGCCGGCGCCAACACCAACGGATCTCAGTTCTTCATTTGC
ACCGTGAAAACCGATTGGCTGGACGGTAAGCATGTGGTGTTCGGGCAGGTGGTGGAAGGG
TTAGACGTGGTGAAGGCGATGGAGAAGGTGGGATCGTCGTCTGGAAAGCCGTCGAAGCAG
GTGGTTATCGCCGATTGTGGACAGCTCTCTTAGATGATCTGAGCTCTCTCTCCCTCTATC
CTCATTTTAATTATGGCGTCTCCCCCCCTATGTTATGTTTGGTGTCTCGTTTGTATAAGT
AGTCAAAAACTTGGTCTCTGTGTTCTCATGGCAGTCTTTTGGATTGACAGAGAGAAACTC
GTCAGTCACCCTTATTACCTTACTACCATAAATAATGAGAGCTTTAACAATAATG

QA 1 775 1 775
DS 

RD RS1E977JQ 715 0 0
GGTTTTCTTCGACATAACCATCGGCGGGCAACCAGCGGGAAGGATCGTGATGGAGTTGTA
TACCGATAAGACTCCGAAGACGGCTGAGAGCTTCAGAGCTCTGTGCACTGGAGAGAGGGG
AGTGGGGCGTAAGGGAAAAGCCCTTCACTTCAAGGGATCTGGCTTCCACAGAGTGATCCC
TAGTTTCATGTGCCAGGGAGGCGATTTCACCGCCGGAAACGGGACAGGAGGTGAGTCCAT
CTACGGGGATAAGTTCGAGGACGAGAGCTTTGAGAGGAAGCACACCGGTCCTGGTAACCT
TTCCATGGCCAACGCCGGCGCCAACACCAACGGATCTCAGTTCTTCATCTGCACCGTGAA
AACCGATTGGCTGGACGGTAAGCACGTGGTGTTCGGTCAGGTGGTGGAAGGGTTAGACGT
GGTGAAGGCGATCGAGAAGGTGGGATCGTCGTCTGGAAAGCCGTCGAAGCAGGTGGTTAT
CGCCGATTGTGGACAGCTCTCTTAGATGATCTCAGCTCTCTCTCCCTCTATCCTCATTTT
AATTATGGCGTCTCCCCCCTTATGTTATGTTTGGTGTCTCGTTTGTATAAGTAGTCAAAA
ACTTGGTCTCTGTGTTCTCATGGCAGTCTTTTGGATTGGCAGAGAGAAACTCGTCAGTCA
CCCTTATTACCTTACTAC*ATAAATAATGAGAGCTTTAACAAAAATGAAAT
TAGT

QA 1 711 1 711
DS 

RD RS1AM96JQ 742 0 0
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GATAAGACTCCGAAGACGGCTGAGAACTTCAGAGCTCTGTGCACTGGAGAGAGGGGAGTG
GGACGTAAGGGAAAAGCCTTTCACTTCAAGGGATCTGGCTTCCACAGAGTGATCCCTAGT
TTCATGTGCCAGGGAGGCGATTTCACCGCCGGAAACGGGACAGGAGGTGAGTCCATCTAC
GGTGATAAGTTCGAGGACGAGAACTTTGAGAGGAAGCACACCGGTCCTGGGAACCTTTCC
ATGGCCAACGCCGGCGCCAACACCAACGGATCTCAGTTCTTCATCTGCACCGTGAAAACC
GATTGGCTGGACGGTAAGCATGTGGTGTTCGGGCAGGTGGTGGAAGGGTTAGACGTGGTG
AAGGCGATGGAGAAGGTGGGATCGTCGTCTGGAAAGCCGTCGAAGCAGGTGGTTATCGCC
GATTGTGGACAGCTCTCTTAGATGATCTGAGCTCTCTCTCCCTCTATCCTCATTTTAATT
ATGGCGTCTCCCCCCCTATGTTATGTTTGGTGTCTCGTTTGTATAAGTAGTCAAAAACTT
GGTCTCTGTGTTCTCATGGCAGTCTTTTGGATTGACAGAGAGAAACTCGTCAGTCACCCT
TATTACCTTACTACCATAAATAATGAGAGCTTTAACAATAATGAAATTAGTAATATCTCT
TGCAATTAATCTGTGATTTTAC

QA 1 742 1 742
DS 



AS 2 16

CO CL55Contig1 472 2 2 U
GGATCGGAGAATGGATCAAACCTACCTCTAATCCAGAGGAGGAGATTTTGAAACCAGCTA
TAGAGGGCACACTGAATGTACTGAGATCATGCGGGAAGAACCCACATTCTTGTTTTCGAA
CACGAAGCAGCTCATGGAAGATACATTTGCAGCTCTAAAGTTGTCTCTCTAGAGGAACTG
GTTTCCTTCTTATCCACACGTTACCCATCACTCCCTATCCCCAAGAGGTTTGAGGAACTA
TATAGGCTGCATTACAACTTGGACACTTCGAAGATAAAGAGTCTTGGGCTCGAGTTCAAG
TCCCTTGAAGAGATGTTTGATGACTGCATTGCCTCACTTGTGGAGCAAGGCTATTTATCT
CATGTAGTTTCTTAACTCTTTAGACTCGTGAACAAGATATGTTGCTTAACAATAAACCAG
TATAAGTGGAAAACGTGTAGACAAAGGTAAAGAATGAATGATCTTATATATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DV08JQ C 1
AF RS1DV08TF U 1
BS 1 15 RS1DV08JQ
BS 16 472 RS1DV08TF

RD RS1DV08JQ 472 0 0
GGATCGGAGAATGGATCAAACCTACCTCTAATCCAGAGGAGGAGATTTTGAAACCAGCTA
TAGAGGGCACACTGAATGTACTGAGATCATGCGGGAAGAACCCACATTCTTGTTTTCGAA
CACGAAGCAGCTCATGGAAGATACATTTGCAGCTCTAAAGTTGTCTCTCTAGAGGAACTG
GTTTCCTTTTTATCCACACGTTACCCATCACTCCCTATCCCCAAGAGGTTTGAGGAACTA
TATAGGCTGCATTACAACTTGGACACTTCGAAGATAAAGAGTCTTGGGCTCGAGTTCAAG
TCCCTTGAAGAGATGTTTGATGACTGCATTGCCTCACTTGTGGAGCAAGGCTATTTATCT
CATGTAGTTTCTTAACTCTTTAGACTCGTGAACAAGATATGTTGCTTAACAATAAACCAG
TATAAGTGGAAAACGTGTAGACAAAGGTAAAGAATGAATGATCTTATATATA

QA 1 472 1 472
DS 

RD RS1DV08TF 472 0 0
GGATCGGAGAATGGA
TCAAACCTACCTCTAATCCAGAGGAGGAGATTTTGAAACCAGCTATAGAGGGCACACTGA
ATGTACTGAGATCATGCGGGAAGAACCCACATTCTTGTTTTCGAACACGAAGCAGCTCAT
GGAAGATACATTTGCAGCTCTAAAGTTGTCTCTCTAGAGGAACTGGTTTCCTTCTTATCC
ACACGTTACCCATCACTCCCTATCCCCAAGAGGTTTGAGGAACTATATAGGCTGCATTAC
AACTTGGACACTTCGAAGATAAAGAGTCTTGGGCTCGAGTTCAAGTCCCTTGAAGAGATG
TTTGATGACTGCATTGCCTCACTTGTGGAGCAAGGCTATTTATCTCATGTAGTTTCTTAA
CTCTTTAGACTCGTGAACAAGATATGTTGCTTAACAATAAACCAGTATAAGTGGAAAACG
TGTAGACAAAGGTAAAGAATGAATGATCTTATATATA

QA 16 472 16 472
DS 



CO CL55Contig2 1220 14 9 U
GGACAATTGCGATTTTGTATTTCGTGTATATTTGATATACATTACTGTCTGAAAGTGAAA
CTATATTGTTGAAACATTGCATTTTATATATAAGATCATTCATTCTTTACCTTTGTCTAC
ACGTTTTCCACTTATACTGGTTTATTGTTAAGCAACATATCTTGTTCACGAGTCTAAAGA
GTTAAGAAACTACATGAGATAAATAGCCTTGCTCCACAAGTGAGGCAATGCAGTCATCAA
ACATCTCTTCAAGGGACTTGAACTCGAGCCCAAGACTCTTTATCTTCGAAGTGTCCAAGT
TGTAATGCAGCCTATATAGTTCCTCAAACCTCTTGGGGATAGGGAGTGATGGGTAACGTG
TGGATAAGAAGGAAACCAGTTCCTCTAGAGAGACAACTTTAGAGCTGCAAATGTATCTTC
CATGAGCTGCTTCGTGTTCGAAAACAAGAATGTGGGTTCTTGCCACATCATCGATATGAA
CATACCCCATCTGTCCATGCCACTGGAACTTCTCTGTTTCTCCTTTCAACAACCCGAGGA
CATCGGATGCTGTAGAGCACAGATCAGGAGGCAGGCTTGGTCCGATGAGGAAAGATGGTA
GAACAGTTACAAGGTCAAGGCCATTCTCTTCACAGTATTTCCATGCAGCTTGTTCGGCTA
ATGTCTTTGATAAAGCATACCACACCTGGAAACGCTTGCAAAGTTCAACAGAGGTCCAAA
CTGATTCATCAAGAGGGATGTTAGGATCAAAATCATCTCTGATCCTGACTGTTGAAGAGG
ATGAGGTGAGAACTACACGCTTCAAAGACTGATTCTTCCCGCATGATCTCAGTACATTCA
GTGTGCCCTCTATAGCTGGTTTCAAAATCTCCTCCTCTGGATTAGAGGTAGGTTTGAGAA
CAGGAGAAGCAGTATGGAAAACTCCTTGGCATCCCATTATAGCGTTATCAAAACTTCCTT
CTTCCATTAAATCAGCCTTAACCAACCTTAGTCTCTCCTTTGCCCCTTCCAGTTTCCAAA
GGTGTGCAAGCTTCTTCTCATTCCCTGGATCTCTGACTGTTCCTGTAACTTCATACCCCT
CAAGGAGAAGCCTCTTCACAAGCCAAGAAGCTAAGAATCCTGAAGCTCCAGTAACACAAA
CTTTTCCTTTAGTTTGATCCATTCTCCGATCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCA
TATGTCCGGTACCGTCGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 30 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 30 65 65 65 65 65 50 65 65 65 50 65 65 65 65 65 25 65 50 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 50 75 75 75 75 75 75 55 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 
50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1EE70JQ U 1
AF RS1BJ18JQ U 85
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AF RS1A322TR U 46
AF RS1GE06TF C 345
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BS 1 185 RS1EE70JQ
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GTTAAAAAACTACATGAGATAAATAGCCTTGCTCCACAAGTGAGGCAATGCAGTCATCAA
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CATCGGATGCTGTAGAGCACA

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DS 

RD RS1BJ18JQ 479 0 0
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CGAGCCCAAGACTCTTTATCTTCGAAGTGTCCAAGTTGTAATGCAGCCTATATAGTTCCT
CAAACCTCTTGGGGATAGGGAGTGATGGGTAACGTGTGGATAAAAAGGAAACCAGTTCCT
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CGAAGTGTCCAAGTTGTAATGCAGCCTATATAGTTCCTCAAACCTCTTGGGGATAGGGAG
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GCAAATGTATCTTCCATGAGCTGCTTCGTGTTCGAAAACAAGAATGTAGGTTCTTGCCAC
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GAGGAAAGATGGTAGAACAGTTACAAGGTCAAGGCCATTCTCTTCACAGTATTTCCATGC
AGCTTGTTCGGCTAATGTCTTTGATAAAGCATACCACACCTGGAAACGCTTGCAAAGTTC
AACAGAGGTCCAAACTGATTCATCAAGAGGGATGTTAGGATCAAAATCATCTCTGATCCT
GACTGTTGAAG

QA 1 731 1 731
DS 

RD RS1E113JQ 663 0 0
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ATCTTGTTCACGAGTCTAAAGAGTTAAAAAACTACATGAAATAAATAGCCTTGCTCCACA
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TTAAAGCTGCAAATGTATCTTCCATGAGCTGCTTCGTGTTCGAAAACAAAAATGTGGATT
CTTGCCACATCATCGATATGAACATACCCCATCTGTCCATGCCACTGGAACTTCTCTGTT
TCTCCTTTCAACAACCCGAGGACATCGGATGCTGTAAAGCACAAATCAGGAGGCAGGCTT
GGTCCGATGAGGAAAGATGGTAAAACAGTTACAAGGTCAAGGCCATTCTCTTCACAGTAT
TTCCATGCAGCTTGTTCGGCTAATGTCTTTGATAAAGCATACCACACCTGGAAACGCTTG
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CTG

QA 1 663 1 663
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AC
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TTAAGCAACATATCTTGTTCACGAGTCTAAAGAGTTAAGAAACTACATGAGATAAATAGC
CTTGCTCCACAAGTGAGGCAATGCAGTCATCAAACATCTCTTCAAGGGACTTGAACTCGA
GCCCAAGACTCTTTATCTTCGAAGTGTCCAAGTTGTAATGCAGCCTATATAGTTCCTCAA
ACCTCTTGGGGATAGGGAGTGATGGGTAACGTGTGGATAAAAAGGAAACCAGTTCCTCTA
GAGAGACAACTTTAGAGCTGCAAATGTATCTTCCATGAGCTGCTTCGTGTTCGAAAACAA
GAATGTGGGTTCTTGCCACATCATCGATATGAACATACCCCATCTGTCCATGCCACTGGA
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GGAAACGCTTGCAAAGTTCAACAGAGGTCCAAACTGATTCATCAAGAGGGATGTTA

QA 3 658 3 658
DS 

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TTGTTAAGCAACATATCTTGTTCACGAGCCTAAAGAGTTAAGAAACTACATGAGATAAAT
AGCCTTGCTCCACAAGTGAGGCAATGCAGTCATCAAACATCTCTTCAAGGGAATTGAACT
CGAGCCCAAGACTCTTTATCTTCGAAGTGTCCAAGTTGTAATGCAGCCTATATAGTTCCT
CAAACCTCTTGGGGATAGGGAGTGATGGGTAACGTGTGGATAAGAAGGAAACCAGTTCCT
CTAGAGAGACAACTTTAGAGCTGCAAATGTATCTTCCATGAGCTGCTTCGTGTTCGAAAA
CAAGAATGTGGGTTCTTGCCACATCATCGATATGAACATACCCCATCTGTCCATGCCACT
GGAACTTCTCTGTTTCTCCTTTCAACAACCCGAGGACATCGGATGCTGTAGAGCACAGAT
CAGGAGGCAGGCTTGGTCCGATGAGGAAAGATGGTAGAACAGTTACAAGGTCAAGGCCAT
TCTCTTCACAGTATTTCCATGCAGCTTGTTCGGCTAATGTCTTTGATAAAGCATACCACA
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QA 1 700 1 700
DS 

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T
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TTACCTTTGTCTACACGTTTTCCACTTATACTGGTTTATTGTTAAGCAACATATCTTGTT
CACGAGTCTAAAGAGTTAAGAAACTACATGAGATAAATAGCCTTGCTCCACAAGTGAGGC
AATGCAGTCATCAAACATCTCTTCAAGGGACTTGAACTCGAGCCCAAGACTCTTTATCTT
CGAAGTGTCCAAGTTGTAATGCAGCCTATATAGTTCCTCAAACCTCTTGGGGATAGGGAG
TGATGGGTAACGTGTGGATAAGAAGGAAACCAGTTCCTCTAGAGAGACAACTTTAGAGCT
GCAAATGTATCTTCCATGAGCTGCTTCGTGTTCGAAAACAAGAATGTAGGTTCTTGCCAC
ATCATCGATATGAACATACCCCATCTGTCCATGCCACTGGAACTTCTCTGTTTCTCCTTT
CAACAACCCGAGGACATCGGATGCTGTAGAGCACAGATCAGGAGGCAGGCTTGGTCCGAT
GAGGAAAGATGGTAGAACAGTTACAAGGTCAAGGCCATTCTCTTCACAGTATTTCCATGC
AGCTTGTTCGGCTAATGTCTTTGATAAAGCATACCACACCTGGAAACGCTTGCAAAGTTC
AACAGAGGTCCAAACTGATTCATCAAGAGGGATGTTAGGATCAAAATCATCTCTGATCCT
GACTGTTGAAGAGGATGAGGTGAGAACTACACGCTTCAAAGACTGATTCTTCCCGCATGA
TCTCAGTACATTCAGTGTGCCCTCTATAGCTGGTTTCAAAATCTCCTCCTCTGGA

QA 2 836 2 836
DS 

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CTGCAAATGTATCTTCCATGAGCTGCTTCGTGT*CGAAAACAAGAATGTGGGTTCTTGCC
ACATCATCGATATGAACATACCCCATCTGTCCATGCCACTGGAACTTCTCTGTTTCTCCT
TTCAACAACCCGAGGACATCGGATGCTGTAGAGCACAGATCAGGAGGCAGGCTTGGTCCG
ATGAGGAAAGATGGTAGAACAGTTACAAGGTCAAGGCCATTCTCTTCACAGTATTTCCAT
GCAGCTTGTTCGGCTAATGTCTTTGATAAAGCATACCACACCTGGAAACGCTTGCAAAGT
TCAACAGAGGTCCAAACTGATTCATCAAGAGGGATGTTAGGATCAAAATCATCTCTGATC
CTGACTGTTGAAGAGGATGAGGTGAGAACTACACGCTTCAAAGACTGATTCTTCCCGCAT
GATCTCAGTACATTCAGTGTGCCCTCTATAGCTGGTTTCAAAATCTCCTCCTCTGGATTA
GAGGTAGGTTTGAGAACAGGAGAAGCAGTATGGAAAACTCCTTGGCATCCCATTATAGCG
TTATCAAAACTTCCTTCTTCCATTAAATCAGCCTTAACCAACCTTAGTCTCTCCTTTGCC
CCTTCCAGTTTCCAAAGGTGTGCAAGCTTCTTCTCATTCCCTGGATCTCTGACTGTTCCT
GTAACTTCATACCCCTCAAGGAGAAGCCTCTTCACAAGCCAAGAAGCTAAGAATCCTGAA
GCTCCAGTAACACAAACTTTTCCTTTA

QA 1 807 1 807
DS 

RD RS1B828TF 784 0 0
GAGAGAC
ACTTTAGAGCTGCAAATGTATCTTCCATGAGCTGCTTCGTGT*CGAAA*CAAGAATGTGG
GTTCTTGCCACATCATCGATATGAACATACCCCATCTGTCCATGCCACTGGAACTTCTCT
GTTTCTCCTTTCAACAACCCGAGGACATCGGATGCTGTAGAGCACAGATCAGGAGGCAGG
CTTGGTCCGATGAGGAAAGATGGTAGAACAGTTACAAGGTCAAGGCCATTCTCTTCACAG
TATTTCCATGCAGCTTGTTCGGCTAATGTCTTTGATAAAGCATACCACACCTGGAAACGC
TTGCAAAGTTCAACAGAGGTCCAAACTGATTCATCAAGAGGGATGTTAGGATCAAAATCA
TCTCTGATCCTGACTGTTGAAGAGGATGAGGTGAGAACTACACGCTTCAAAGACTGATTC
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TCTGGATTAGAGGTAGGTTTGAGAACAGGAGAAGCAGTATGGAAAACTCCTTGGCATCCC
ATTATAGCGTTATCAAAACTTCCTTCTTCCATTAAATCAGCCTTAACCAACCTTAGTCTC
TCCTTTGCCCCTTCCAGTTTCCAAAGGTGTGCAAGCTTCTTCTCATTCCCTGGATCTCTG
ACTGTTCCTGTAACTTCATACCCCTCAAGGAGAAGCCTCTTCACAAGCCAAGAAGCTAAG
AATCCTGAAGCTCCAGTAACACAAACTTTTCCTTTAGTTTGATCCATTCTCCGATCC

QA 8 784 8 784
DS 

RD RS1BJ18TF 784 0 0
GAGACAAC
TTAGAGCTGCAAATGTATCTTCCATGAGCTGCTTCGTGT*CGAAAACAAGAATGTGGGTT
CTTGCCACATCATCGATATGAACATACCCCATCTGTCCATGCCACTGGAACTTCTCTGTT
TCTCCTTTCAACAACCCGAGGACATCGGATGCTGTAGAGCACAGATCAGGAGGCAGGCTT
GGCCCGATGAGGAAAGATGGTAGAACAGTTACAAGGTCAAGGCCATTCTCTTCACAGTAT
TTCCATGCAGCTTGTTCGGCTAATGTCTTTGATAAAGCATACCACACCTGGAAACGCTTG
CAAAGTTCAACAGAGGTCCAAACTGATTCATCAAGAGGGATGTTAGGATCAAAATCATCT
CTGATCCTGACTGTTGAAGAGGATGAGGTGAGAACTACACGCTTCAAAGACTGATTCTTC
CCGCATGATCTCAGTACATTCAGTGTGCCCTCTATAGCTGGTTTCAAAATCTCCTCCTCT
GGATTAGAGGTAGGTTTGAGAACAGGAGAAGCAGTATGGAAAACTCCTTGGCATCCCATT
ATAGCGTTATCAAAACTTCCTTCTTCCATTAAATCAGCCTTAACCAACCTTAGTCTCTCC
TTTGCCCCTTCCAGTTTCCAAAGGTGTGCAAGCTTCTTCTCATTCCCTGGATCTCTGACT
GTTCCTGTAACTTCATACCCCTCAAGGAGAAGCCTCTTCACAAGCCAAGAAGCTAAGAAT
CCTGAAGCTCCAGTAACACAAACTTTTCCTTTAGTTTGATCCATTCTCCGATC
ACC

QA 9 781 9 781
DS 

RD RS1EE70TF 357 0 0
TTCCCGCATGATCTCAGTACATTCAGTGTGCCCTCTATAGCTGGTTTCAAAATCTCCTCC
TCTGGATTAGAGGTAGGTTTGAGAACAGGAGAAGCAGTATGGAAAACTCCTTGGCATCCC
ATTATAGCGTTATCAAAACTTCCTTCCTCCATTAAATCAGCCTTAACCAACCTTAGTCTC
TCCTTTGCCCCTTCCAGTTTCCAAAGGTGTGCAAGCTTCTTCTCATTCCCTGGATCTCTG
ACTGTTCCTGTAACTTCATACCCCTCAAGGAGAAGCCTCTTCACAAGCCAAGAAGCTAAG
AATCTTGAAGCTCCAGTAACACAAACTTTTCCTTTAGTTTGATCCATTCTCCGATCC

QA 1 357 1 357
DS 

RD RS1E113TF 634 0 0
GACATCGGATGCTGTAGAGCACAGATCAGGAGGCAGGCTTGGTCCGATGAGGAAAGATGG
TAGAACAGTTACAAGGTCAAGGCCATTCTCTTCACAGTATTTCCATGCAGCTTGTTCGGC
TAATGTCTTTGATAAAGCATACCACACCTGGAAACGCTTGCAAAGTTCAACAGAGGTCCA
AACTGATTCATCAAGAGGGATGTTAGGATCAAAATCATCTCTGATCCTGACTGTTGAAGA
GGATGAGGTGAGAACTACACGCTTCAAAGACTGATTCTTCCCGCATGATCTCAGTACATT
CAGTGTGCCCTCTATAGCTGGTTTCAAAATCTCCTCCTCTGGATTAGAGGTAGGTTTGAG
AACAGGAGAAGCAGTTTGGAAAACTCCTTGGCATCCCATTATAGCGTTATCAAAACTTCC
TTCTTCCATTAAATCAGCCTTAACCAACCTTAGTCTCTCCTTTGCCCCTTCCAGTTTCCA
AAGGTGTGCAAGCTTCTTCTCATTCCCTGGATCTCTGACTGTTCCTGTAACTTCATACCC
CTCAAGGAGAAGCCTCTTCACAAGCCAAGAAGCTAAGAATCCTGAAGCTCCAGTAACACA
AACTTTTCCTTTAGTTTGATCCATTCTCCGATCC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1A322TF 789 0 0
TCGTGTTCGAAAACAAGAATGTAGGTTCTTGCCACATCATCGATATGAACATACCCCATC
TGTCCATGCCACTGGAACTTCTCTGTTTCTCCTTTCAACAACCCGAGGACATCGGATGCT
GTAGAGCACAGATCAGGAGGCAGGCTTGGTCCGATGAGGAAAGATGGTAGAACAGTTACA
AGGTCAAGGCCATTCTCTTCACAGTATTTCCATGCAGCTTGTTCGGCTAATGTCTTTGAT
AAAGCATACCACACCTGGAAACGCTTGCAAAGTTCAACAGAGGTCCAAACTGATTCATCA
AGAGGGATGTTAGGATCAAAATCATCTCTGATCCTGACTGTTGAAGAGGATGAGGTGAGA
ACTACACGCTTCAAAGACTGATTCTTCCCGCATGATCTCAGTACATTCAGTGTGCCCTCT
ATAGCTGGTTTCAAAATCTCCTCCTCTGGATTAGAGGTAGGTTTGAGAACAGGAGAAGCA
GTATGGAAAACTCCTTGGCATCCCATTATAGCGTTATCAAAACTTCCTTCTTCCATTAAA
TCAGCCTTAACCAACCTTAGTCTCTCCTTTGCCCCTTCCAGTTTCCAAAGGTGTGCAAGC
TTCTTCTCATTCCCTGGATCTCTGACTGTTCCTGTAACTTCATACCCCTCAAGGAGAAGC
CTCTTCACAAGCCAAGAAGCTAAGAATCCTGAAGCTCCAGTAACACAAACTTTTCCTTTA
GTTTGATCCATTCTCCGATCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTA
CCGTCGACT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RS1A322TV 757 0 0
CACATCATCGATATGAACATACCCCATCTGTCCATGCCACTGGAACTTCTCTGTTTCTCC
TTTCAACAACCCGAGGACATCGGATGCTGTAGAGCACAGATCAGGAGGCAGGCTTGGTCC
GATGAGGAAAGATGGTAGAACAGTTACAAGGTCAAGGCCATTCTCTTCACAGTATTTCCA
TGCAGCTTGTTCGGCTAATGTCTTTGATAAAGCATACCACACCTGGAAACGCTTGCAAAG
TTCAACAGAGGTCCAAACTGATTCATCAAGAGGGATGTTAGGATCAAAATCATCTCTGAT
CCTGACTGTTGAAGAGGATGAGGTGAGAACTACACGCTTCAAAGACTGATTCTTCCCGCA
TGATCTCAGTACATTCAGTGTGCCCTCTATAGCTGGTTTCAAAATCTCCTCCTCTGGATT
AGAGGTAGGTTTGAGAACAGGAGAAGCAGTATGGAAAACTCCTTGGCATCCCATTATAGC
GTTATCAAAACTTCCTTCTTCCATTAAATCAGCCTTAACCAACCTTAGTCTCTCCTTTGC
CCCTTCCAGTTTCCAAAGGTGTGCAAGCTTCTTCTCATTCCCTGGATCTCTGACTGTTCC
TGTAACTTCATACCCCTCAAGGAGAAGCCTCTTCACAAGCCAAGAAGCTAAGAATCCTGA
AGCTCCAGTAACACAAACTTTTCCTTTAGTTTGATCCATTCTCCGATCCCCGGCCGTAAT
GGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 757 1 757
DS 



AS 4 15

CO CL56Contig1 799 2 3 U
GGAGAAATTCATTCAATTCGCGTGGTTTTGACGAGACGAGGAAGGGAACAAACGCATAAC
GAAGACAGACGATGGGTGAAGCCGTGAAGGATGGAAGAGAAGACGTGATTCAAGCATGGT
ACATGGATGATAGCCAAGAGGATCAGCGACTTCCTCACCACAAGGATCCTAAAGACTTCA
TCTCCCTCGACAAACTTGCAGAGCTTGGAGTCCTTAGCTGGAGACTTGATGCTGATCACT
ACGAAACTGATGAGGAGTTGAAAAAGATCCGCGACTCTCGTGGTTACTCCTACATGGACT
TCTGTGAGGTATGCCCTGAGAAGCTTCCAAATTATGAAGAGAAAGTTAAGAGCTTTTTCG
AGGAACATCTTCACACTGATGAAGAGATCCGTTACTGCGTTGCAGGAAGTGGCTACTTTG
ATGTGAGGGACCGCAACGAAGCTTGGATCAGAGTTTGGGTGAAGAAGGGAGGAATGATAG
TCTTGCCTGCTGGAATTTATCATCGCTTCACCGTGGATTCTGACAACTATATCAAGGCAA
TGCGTCTTTTCGTGGGTGAACCGGTGTGGACGCCGTACAATCGTCCACACGACCATCTTC
CTGCAAGGAAGGAATATGTTGATAACTTCGTGAAGAAAGCCATTAACGCATCTGTTTAGA
GAGCTCTCTCTCTATCTCTCTCTCTGTCCCCTGCTTCTAAAAGCGGGATCTATATTATAA
TAACTTGGCCTACATAAAGATCGATCTTGATCTATAGTATGCATGTGGAGATGATGCTTT
GGTGTGCATGTGTTGTAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AZ80TF U 9
AF RS1AV08TF U 1
BS 1 69 RS1AV08TF
BS 70 70 RS1AZ80TF
BS 71 799 RS1AV08TF

RD RS1AZ80TF 541 0 0
GGATTCA
ATTCGCGTGGTTTTGACGAGACGAGGAAGGGAACAAACGCATAACGAAGACAGACGATGG
GTGAAGCCGTGAAGGATGGAAGAGAAGACGTGATTCAAGCATGGTACATGGATGATAGCC
AAGAGGATCAGCGACTTCCTCACCATAAGGATCCTAAAGACTTCATCTCCCTCGACAAAC
TTGCAGAGCTTGGAGTCCTTAGCTGGAGACTTGATGCTGATCACTACGAAACTGATGAGG
AGTTGAAAAAGATCCGCGACTCTCGTGGTTACTCCTACATGGACTTCTGTGAGGTATGCC
CTGAGAAGCTTCCAAATTATGAAGAGAAAGTTAAGAGCTTTTTCGAGGAACATCTTCACA
CTGATGAAGAGATCCGTTACTGCGTTGCAGGAAGTGGCTACTTTGATGTGAGGGACCGCA
ACGAAGCTTGGATCAGAGTTTGGGTGAAGAAGGGAGGAATGATAGTCTTGCCTGCTGGAA
TTTATCATCGCTTCACCGTGGATTCTGACAACTATATCAAGGCAATGCGTCTTT

QA 8 541 8 541
DS 

RD RS1AV08TF 799 0 0
GGAGAAATTCATTCAATTCGCGTGGTTTTGACGAGACGAGGAAGGGAACAAACGCATAAC
GAAGACAGAGGATGGGTGAAGCCGTGAAGGATGGAAGAGAAGACGTGATTCAAGCATGGT
ACATGGATGATAGCCAAGAGGATCAGCGACTTCCTCACCACAAGGATCCTAAAGACTTCA
TCTCCCTCGACAAACTTGCAGAGCTTGGAGTCCTTAGCTGGAGACTTGATGCTGATCACT
ACGAAACTGATGAGGAGTTGAAAAAGATCCGCGACTCTCGTGGTTACTCCTACATGGACT
TCTGTGAGGTATGCCCTGAGAAGCTTCCAAATTATGAAGAGAAAGTTAAGAGCTTTTTCG
AGGAACATCTTCACACTGATGAAGAGATCCGTTACTGCGTTGCAGGAAGTGGCTACTTTG
ATGTGAGGGACCGCAACGAAGCTTGGATCAGAGTTTGGGTGAAGAAGGGAGGAATGATAG
TCTTGCCTGCTGGAATTTATCATCGCTTCACCGTGGATTCTGACAACTATATCAAGGCAA
TGCGTCTTTTCGTGGGTGAACCGGTGTGGACGCCGTACAATCGTCCACACGACCATCTTC
CTGCAAGGAAGGAATATGTTGATAACTTCGTGAAGAAAGCCATTAACGCATCTGTTTAGA
GAGCTCTCTCTCTATCTCTCTCTCTGTCCCCTGCTTCTAAAAGCGGGATCTATATTATAA
TAACTTGGCCTACATAAAGATCGATCTTGATCTATAGTATGCATGTGGAGATGATGCTTT
GGTGTGCATGTGTTGTAAC

QA 1 799 1 799
DS 



CO CL56Contig2 922 5 12 U
CGACATATATAATAAGGCTCATTAAATTATCCACGCAGCAATAAACAACTCTTATTATGT
TTCCTTAGTTGCTCACAAAGAAACGTACGCATGAAAATATATGATCGAACTGACTCGATA
CAATTTTTCGTAAAACGGATACGGCAAAGATGGTCAATAAAGACGAGCAGAGTGTGATTA
AGTTTACAAGACATGCATACCAAAGCAATCATTCTCCACATGCATACTCTCTTCATTGCA
GGCCAAGTTTATTATAGATCATGTTTCTTTAGAAGGGAGAGAGAGAGAGCTCTCTAAGCA
GAGGCGTTAACGGCTTTGTTCACGAAATTATCAACATATTCTTTCCTTGCAGGAAGATGG
TCGTGTGGACGATTGTATGGTGTCCACACCGGTTCACCCACGAAAAGACGCATTGCCTTG
ATATAGTTGTCAGAATCCACGGTGAAGCGATGATAAATTCCAGCAGGCAAGACTATCATT
CCTCCCTTCTTCACCCAAACTCTGATCCAAGCTTCGTTGCGGTCCCTCACATCAAAGTAG
CCACTTCCTGCAACGCAGTAACGGATCTCTTCATCAGTGTGAAGATGTTCCTCGAAAAAA
CTCTTTACTTTCTCTTCATAATTTTGAAGCTTCTCAGGGCATACCTCACAGAAGTCCATG
TAGGAGTAGCCACGAGACTCGCGGATCTTTTTCAACTCCTCATCGGTTTCGTAGTGATCA
GCATCAAGTCTCCAGCTAAGGACTCCAAGCTCTGCAAGTTTGTCGAGAGAGATGAACTCT
TTAGGATCCTTGTGGTGAGGAAGTCGCTGATCCTCTTGGCTATCATCCATGTACCAAGCC
TGTATCACTTCTTCTCTTCCATCCTTCACGGCTTCACCCATCGTCGTCTTCGTTATGCGT
TTGTTCCCTTCCTCGTCTCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G761JQ U 31
AF RS1BH48JQ U 1
AF RS1B718JQ U 29
AF RS1B718TF C 87
AF RS1BH48TF C 350
BS 1 232 RS1BH48JQ
BS 233 233 RS1B718JQ
BS 234 314 RS1BH48JQ
BS 315 315 RS1B718JQ
BS 316 366 RS1BH48JQ
BS 367 367 RS1B718JQ
BS 368 582 RS1BH48JQ
BS 583 736 RS1B718JQ
BS 737 767 RS1B718TF
BS 768 768 RS1BH48TF
BS 769 883 RS1B718TF
BS 884 922 RS1BH48TF

RD RS1G761JQ 498 0 0
CCACGCAGCAATAAACAACTCTTATTATGTTTCCTTAGTTGCTCACAAAGAAACGTACGC
ATGAAAATATATGATCGAACTGACTCGATACAATTTTTCGTAAAACGGATACGGCAAAGA
TGGTCAATAAAGACAAGCAGAGTGTGATTAAGTTTACAAGACATGCATACCAAAGCAATC
ATTCTCCACATGCATACTCTCTTCATTGCAGGCCAAGTTTATTATAGATCATGTTTCTTT
AGAAGGGAGAGAGAGAGAGCTCTCTAAGCAGAGGCGTTAACGGCTTTGTTCACGAAATTA
TCAACATATTCTTTCCTTGCAGGAAGATGGTCGTGTGGACGATTGTATGGTGTCCACACC
GGTCCACCCACGAAAAGACGCATTGCCTTGATATATTTGTCAGAATCCACGGTGAAGCGA
TGATAAATTCCAGCAGGCAAGACTATCATTCCTCCCTTCTTCACCCAAACTCTGATCCAA
GCTTCGTTGCGGTCCCTC

QA 1 498 1 498
DS 

RD RS1BH48JQ 582 0 0
CGACATATATAATAAGGCTCATTAAATTATCCACGCAGCAATAAACAACTCTTATTATGT
TTCCTTAGTTGCTCACAAAGAAACGTACGCATGAAAATATATGATCGAACTGACTCGATA
CAATTTTTCGTAAAACGGATACGGCAAAGATGGTCAATAAAGACGAGCAGAGTGTGATTA
AGTTTACAAGACATGCATACCAAAGCAATCATTCTCCACATGCATACTCTCTCCATTGCA
GGCCAAGTTTATTATAGATCATGTTTCTTTAGAAGGGAGAGAGAGAGAGCTCTCTAAGCA
GAGGCGTTAACGGCATTGTTCACGAAATTATCAACATATTCTTTCCTTGCAGGAAGATGG
TCGTGTAGACGATTGTATGGTGTCCACACCGGTTCACCCACGAAAAGACGCATTGCCTTG
ATATAGTTGTCAGAATCCACGGTGAAGCGATGATAAATTCCAGCAGGCAAGACTATCATT
CCTCCCTTCTTCACCCAAACTCTGATCCAAGCTTCGTTGCGGTCCCTCACATCAAAGTAG
CCACTTCCTGCAACGCAGTAACGGATCTCTTCATCAGTGTGA

QA 1 582 1 582
DS 

RD RS1B718JQ 708 0 0
ATCCACGCAGCAATAAACAACTCTTATTATGTTTCCTTAGTTGCTCACAAAGAAACGTAC
GCATGAAAATATATGATCGAACTGACTCGATACAATTTTTCGTAAAACGGATACGGCAAA
GATGGTCAATAAAGACGAGCAGAGGGTGATTAAGTTTACAAGACATGCATACCAAAGCAA
TCATTCTCCACATGCATACTCTCTTCATTGCAGGCCAAGTTTATTATAGATCATGTTTCT
TTAGAAGGGAGAGAGAGAGAGCTCTCTAAGCAGAGGCGTTAACGGCTTTGTTCACGAAAT
TATCAACATATTCTTTCCTTGCAGGAAGATGGTCGTGTGGACGATTGTATGGTGTCCACA
CCGGTTCACCCACGAAAAGACGCATTGCCTTGATATAGTTGTCAGAATCCACGGTGAAGC
GATGATAAATTCCAGCAGGCAAGACTATCATTCCTCCCTTCTTCACCCAAACTCTGATCC
AAGCTTCGTTGCGGTCCCTCACATCAAAGTAGCCACTTCCTGCAACGCAGTAACGGATCT
CTTCATCAGTGTGAAGATGTTCCTCGAAAAAACTCTTTACTTTCTCTTCATAATTTTGAA
GCTTCTCAGGGCATACCTCACAGAAGTCCATGTAGGAGTAGCCACGAGACTCGCGGATCT
TTTTCAACTCCTCATCGGTTTCGTAGTGATCAGCATCAAGTCTCCAGC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1B718TF 798 0 0
TACGCATG
AAATAAATGATCGA*CTGACTCGATACA**TTTTCGTAAA*CGGATACGGCAAAGATG*T
CAATAAAGACGAGCAGAGTGTGATTAAGTT*ACAAGACATGCATACCAAAGCAATCATTC
TCCACATGCATACTCTCTTCATTGCAGGCCAAGTTTATTATAGATCATGTTTCTTTAGAA
GGGAGAGAGAGAGAGCTCTCTAAGCAGAGGCGTTAACGGCTTTGTTCACGAAATTATCAA
CATATTCTTTCCTTGCAGGAAGATGGTCGTGTGGACGATTGTATGGTGTCCACACCGGTT
CACCCACGAAAAGACGCATTGCCTTGATATAGTTGTCAGAATCCACGGTGAAGCGATGAT
AAATTCCAGCAGGCAAGACTATCATTCCTCCCTTCTTCACCCAAACTCTGATCCAAGCTT
CGTTGCGGTCCCTCACATCAAAGTAGCCACTTCCTGCAACGCAGTAACGGATCTCTTCAT
CAGTGTGAAGATGTTCCTCGAAAAAACTCTTTACTTTCTCTTCATAATTTTGAAGCTTCT
CAGGGCATACCTCACAGAAGTCCATGTAGGAGTAGCCACGAGACTCGCGGATCTTTTTCA
ACTCCTCATCGGTTTCGTAGTGATCAGCATCAAGTCTCCAGCTAAGGACTCCAAGCTCTG
CAAGTTTGTCGAGGGAGATGAACTCTTTAGGATCCTTGTGGTGAGGAAGTCGCTGATCCT
CTTGGCTATCATCCATGTACCAAGCCTGTATCACTTCTTCTCTTCCATCCTTCACGGCTT
CACCCATCG
C

QA 9 797 9 797
DS 

RD RS1BH48TF 573 0 0
CAGGAAGATGGTCGTGTAGACGATTGTATGGTGTCCACACCGGTTCACCCACGAAAAGAC
GCATTGCCTTGATATAGTTGTCAGAATCCACGGTGAAGCGATGATAAATTCCAGCAGGCA
AGACTATCATTCCTCCCTTCTTCACCCAAACTCTGATCCAAGCTTCGTTGCGGTCCCTCA
CATCAAAGTAGCCACTTCCTGCAACGCAGTAACGGATCTCTTCATCAGTGTGAAGATGTT
CCTCGAAAAAACTCTTTACTTTCTCTTCATAATTTTGAAGCTTCTCAGGGCATACCTCAC
AGAAGTCCATGTAGGAGTAGCCACGAGACTCGCGGATCTTTTTCAACTCCTCATCGGTTT
CGTAGTGATCAGCATCAAGTCTCCAGCTAAGGACTCCAAGCTCTGCAAGTTTGTCGAGAG
AGATGAACTCTTTAGGATCCTTGTGGTGAGGAAGTCGCTGATCCTCTTGGCTATCATCCA
TGTACCAAGCCTGTATCACTTCTTCTCTTCCATCCTTCACGGCTTCACCCATCGTCGTCT
TCGTTATGCGTTTGTTCCCTTCCTCGTCTCCTC

QA 1 573 1 573
DS 



CO CL56Contig3 318 2 3 U
GGAACTATATCAAGGCAATGCGTCTTTTCGTGGGTGAACCGGTGTGGACGCCTTACAATC
GTCCACACGACCATCTTCCTGCAAGGAAGGAATATGTTGATAACTTCGTGAAGAAAGCCA
TTAACGCATCTGTTTAGAGAGCTCTCTCTCTATCTCTCTCTCTGTCCCCTGCTTCTAAAA
AGCGGGATCTATATTATAATAAACTTGGCCTACAATAAAGATCGATCTTGAATCTATAGT
ATGCATGTGGAGAATGATTGCTTTGGTGTGCATGTGTTGTAAACTTAATCACACTCTGTT
AAGTCTTTATTTACCATC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1FL89JQ C 1
AF RS1FL89TF U 1
BS 1 2 RS1FL89JQ
BS 3 317 RS1FL89TF
BS 318 318 RS1FL89JQ

RD RS1FL89JQ 318 0 0
GGAACTATATCAAGGCAATGCGTCTTTTCGTGGGTGAACCGGTGTGGACGCCTTACAATC
GTCCACACGACCATCTTCCTGCAAGGAAGGAATATGTTGATAACTTCGTGAAGAAAGCCA
TTAACGCATCTGTTTAGAGAGCTCTCTCTCTATCTCTCTCTCTGTCCCCTGCTTCTAAAA
AGCGGGATCTATATTATAATAAACTTGGCCTACAATAAAGATCGATCTTGAATCTATAGT
ATGCATGTGGAGAATGATTGCTTTGGTGTGCATGTGTTGTAAACTTAATCACACTCTGTT
AAGTCTTTATTTACCATC

QA 1 318 1 318
DS 

RD RS1FL89TF 318 0 0
GG
AACTATATCAAGGCAATGCGTCTTTTCGTGGGTGAACCGGTGTGGACGCCTTACAATCGT
CCACACGACCATCTTCCTGCAAGGAAGGAATATGTTGATAACTTCGTGAAGAAAGCCATT
AACGCATCTGTTTAGAGAGCTCTCTCTCTATCTCTCTCTCTGTCCCCTGCTTCTAAAAAG
CGGGATCTATATTATAATAAACTTGGCCTACAATAAAGATCGATCTTGAATCTATAGTAT
GCATGTGGAGAATGATTGCTTTGGTGTGCATGTGTTGTAAACTTAATCACACTCTGTTAA
GTCTTTATTTACCAT
C

QA 3 317 3 317
DS 



CO CL56Contig4 917 6 10 U
GGATTCGCGTGGTTTTGACGAGACGAAGAAGGGAACAAACGCATAACGAAGACGACGATG
GGTGAAGCCGTGAAGGATGGAAGAGAAGAAGTGATACAGGCATGGTACATGGATGATAGC
CAAGAGGATCAGCGACTTCCTCACC*ACAAGGATCCTAGAGAGTTTATCTCTCTCGACAA
ACTTGCAGAGCTTGGAGTCCTTAGCTGGAGACTTGATGCTGATCACTACGAAACCGACGA
GGAGTTGAAAAAGATCCGCGACTCTCGTGGTTACTCCTACATGGACTTCTGTGAGGTATG
CCCTGAGAAGCTTCAAAATTATGAAGAGAAAGTTAAGAGCTTTTTCGAGGAACATCTTCA
CACTGATGAAGAGATCCGTTACTGCGTTGCAGGAAGTGGCTACTTTGATGTGAGGGACCG
CAACGAAGCTTGGATCAGAGTTTGGGTGAAGAAGGGAGGAATGATAGTCTTACCTGCTGG
AATTTATCATCGTTTCACCGTGGATTCTGACAACTATATCAAGGCAATGCGTCTTTTCGT
GGGTGAACCGGTGTGGACACCATACAATCGTCCACACGACCATCTTCCTGCAAGGAAAGA
ATATGTTGATAACTTCGTGAACAAAGCCGTTAACGCCTCTGCTTAGAGAGCTCTCTCTCT
CCCTCTTGGTTCTAAAGAAACATGATCTATAATAAACTTGGCCTGCAATAAAGAGAGTAT
GCATGTGGAGAATGATTGCTTTGGTATGCATGTCTTGTAAACTTAATCACACTCTGTTAA
GTCTTTATTTACCATCTTTGCCGTATCCGTTTTTACGGAAATTTGTATCGACTCAGTTTG
ATCATATATTTTCCTGCGTACGTTTCTTTGTGAGCAACTAAGGAAAAATAATAAGAGTTG
TTTATTGCTGTGTGGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 

AF RS1FW45TF U 1
AF RS1AO67TFB U 23
AF RS1AO67JQ C 44
AF RS1B655TF U 346
AF RS1BK82JQ C 391
AF RS1BK82TF U 466
BS 1 58 RS1FW45TF
BS 59 59 RS1AO67TFB
BS 60 368 RS1FW45TF
BS 369 369 RS1AO67TFB
BS 370 590 RS1FW45TF
BS 591 878 RS1AO67TFB
BS 879 887 RS1B655TF
BS 888 888 RS1BK82TF
BS 889 916 RS1B655TF
BS 917 917 RS1BK82TF

RD RS1FW45TF 590 0 0
GGATTCGCGTGGTTTTGACGAGACGAAGAAGGGAACAAACGCATAACGAAGACGACGACG
GGTGAAGCCGTGAAGGATGGAAGAGAAGAAGTGATACAGGCATGGTACATGGATGATAGC
CAAGAGGATCAGCGACTTCCTCACC*ACAAGGATCCTAGAGAGTTTATCTCTCTCGACAA
ACTTGCAGAGCTTGGAGTCCTTAGCTGGAGACTTGATGCTGATCACTACGAAACCGACGA
GGAGTTGAAAAAGATCCGCGACTCTCGTGGTTACTCCTACATGGACTTCTGTGAGGTATG
CCCTGAGAAGCTTCAAAATTATGAAGAGAAAGTTAAGAGCTTTTTCGAGGAACATCTTCA
CACTGATGGAGAGATCCGTTACTGCGTTGCAGGAAGTGGCTACTTTGATGTGAGGGACCG
CAACGAAGCTTGGATCAGAGTTTGGGTGAAGAAGGGAGGAATGATAGTCTTACCTGCTGG
AATTTATCATCGTTTCACCGTGGATTCTGACAACTATATCAAGGCAATGCGTCTTTTCGT
GGGTGAACCGGTGTGGACACCATACAATCGTCCACACGACCATCTTCCTG

QA 1 590 1 590
DS 

RD RS1AO67TFB 856 0 0
GGGAA
GAAGGGAACAAACGCATAACGAAGACGACGATGGGTGAAGCCGTGAAGGATGGAAGAGAA
GAAGTGATACAGGCATGGTACATGGATGATAGCCAAGAGGATCAGCGACTTCCTCACC*A
CAAGGATCCTAGAGAGTTTATCTCTCTCGACAAACTTGCAGAGCTTGGAGTCCTTAGCTG
GAGACTTGATGCTGATCACTACGAAACCGACGAGGAGTTGAAAAAGATCCGCGACTCTCG
TGGTTACTCCTACATGGACTTCTGTGAGGTATGCCCTGAGAAGCTTCAAAATTATGAAGA
GAAAGTTAAGAGCTTTTTCGAGGAACATCTTCACACTGATGAAGAGATCCGTTACTGCGT
TGCAGGAAGTGGCTACTTTGATGTGAGGGACCGCAACGAAGCTTGGATCAGAGTTTGGGT
GAAGAAGGGAGGAATGATAGTCTTACCTGCTGGAATTTATCATCGTTTCACCGTGGATTC
TGACAACTATATCAAGGCAATGCGTCTTTTCGTGGGTGAACCGGTGTGGACACCATACAA
TCGTCCACACGACCATCTTCCTGCAAGGAAAGAATATGTTGATAACTTCGTGAACAAAGC
CGTTAACGCCTCTGCTTAGAGAGCTCTCTCTCTCCCTCTTGGTTCTAAAGAAACATGATC
TATAATAAACTTGGCCTGCAATAAAGAGAGTATGCATGTGGAGAATGATTGCTTTGGTAT
GCATGTCTTGTAAACTTAATCACACTCTGTTAAGTCTTTATTTACCATCTTTGCCGTATC
CGTTTTTACGGAAATTTGTATCGACTCAGTTTGATCATATATTTTCCTGCGTACGTTTCT
TTGTGAGCAAC

QA 6 856 6 856
DS 

RD RS1AO67JQ 813 0 0
TAACGAAGACGACGATGGGTGAAGCCGTGAAGGATGGAAGAGAAGAAGTGATACAGGCAT
GGTACATGGATGATAGCCAAGAGGATCAGCGACTTCCTCACCCACAAGGATCCTAGAGAG
TTTATCTCTCTCGACAAACTTGCAGAGCTTGGAGTCCTTAGCTGGAGACTTGATGCTGAT
CACTACGAAACCGACGAGGAGTTGAAAAAGATCCGCGACTCTCGTGGTTACTCCTACATG
GACTTCTGTGAGGTATGCCCTGAGAAGCTTCAAAATTATGAAGAGAAAGTTAAGAGCTTT
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A

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DS 

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QA 1 527 1 527
DS 

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QA 1 452 1 452
DS 



AS 2 15

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BQ
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15 15 15 15 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B182TF U 1
AF RS1ER93TF U 1
AF RS1GL72TF U 64
AF RS1GL72JQ C 156
AF RS1ER93JQ C 69
AF RS1FX06TF U 515
AF RS1G495JQ C 479
AF RS1F242JQ C 941
AF RS1F242TF U 941
AF RS1FC09TF U 1179
AF RS1FC09JQ C 1430
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BS 79 79 RS1ER93TF
BS 80 96 RS1B182TF
BS 97 97 RS1ER93TF
BS 98 325 RS1B182TF
BS 326 326 RS1ER93TF
BS 327 339 RS1B182TF
BS 340 341 RS1ER93TF
BS 342 375 RS1B182TF
BS 376 376 RS1ER93TF
BS 377 483 RS1B182TF
BS 484 484 RS1ER93TF
BS 485 540 RS1B182TF
BS 541 541 RS1ER93TF
BS 542 624 RS1B182TF
BS 625 698 RS1ER93TF
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BS 1896 1935 RS1FC09TF
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BS 1966 1986 RS1FC09TF
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RD RS1B182TF 624 0 0
GATTGTATCATTAACTATTTCTTTATTTTGGTGTGAGGAACTTATCATGAATCCACTGGT
TTCTGCTGCTTCGGTTATTGCTGCTGGGTTGGCTGTAGGGCTTGCTTCTATTGGACCTGG
GGTTGGTCAAGGTACAGCTGCGGGTCAAGCTGTCGAAGGTATCGCGAGACAACCCGAGGC
AGAAGGAAAAATACGAGGTACTTTATTGCTTAGTTTGGCTTTTATGGAAGCTTTAACAAT
TTATGGCCTGGTTGTAGCATTAGCGCTTTTATTTGCGAATCCTTTTGTTTAATCCTAGAA
ATAAGAAAATTATGAATTTTTTTTTTCGTAGTTTTTTTT***ATTCTATCAAGATTTAAC
TCCTACAATTATTCACTGAGACAACAACCCTTGGGAAGGACTAATTTGAGGATGGGGAAT
TAACACATCGATTCGCTTTCTTCCTTCCCCTTATTCTTTTTAGTTTAATGGAAACTTTTT
TTT*AAGGAGTGTTGCGCAAAAAGGAGGTTTAAGTTTTTTAAAATTTATATAAAACTTGG
CCTCAAATTCTAGCTTAATTCTAATTAAGTCTCATTATTATTATTGAAAATTCAAAATTT
TTGGAAAATAAATTTGTAAATAGA

QA 1 624 1 624
DS 

RD RS1ER93TF 698 0 0
G
ATTGTATCATTAACTATTTCTTTATTTTGGTGTGAGGAACTTATCATGAATCCACTGGTT
TCTGCTGCTTCGGTTATCGCTGCTGGGTTGGCTGTTGGGCTTGCTTCTATTGGACCTGGG
GTTGGTCAAGGTACAGCTGCGGGTCAAGCTGTCGAAGGTATCGCGAGACAACCCGAGGCA
GAAGGAAAAATACGAGGTACTTTATTGCTTAGTTTGGCTTTTATGGAAGCTTTAACAATT
TATGGCCTGGTTGTAGCATTAGCGCTTTTATTTGCGAATCCTTTTGTTTAATCCTAGAAA
TAAGAAAATTATGAATTTTTTTTT*CGTAGTTTTTTTTTT*ATTCTATCAAGATTTAACT
CCTACAATTATTCATTGAGACAACAACCCTTGGGAAGGACTAATTTGAGGATGGGGAATT
AACACATCGATTCGCTTTCTTCCTTCCCCTTATTCTTTTTAGTTTAATGGAAACTTTTTT
TTTAAGGAGTGTTGCGCAAAAAGGAGGTTTAAGTTTTTTAAAATTTATATAAAACTTGGT
CTCAAATTCTAGCTTAATTCTAATTAAGTCTCATTATTATT***GAAAATTCAAAATTTT
TGGAAAATAAATTTGTAAATAGAATAGGTTTTTGATTCTGTTTATAAATATCCAAATAGG
TAAATTAAATTATAAATTATTAAACGAAATTTTCTTT

QA 2 698 2 698
DS 

RD RS1GL72TF 644 0 0
G
GCTGCTTCGGTTATTGCTGCTGGGTTGGCTGTTGGGCTTGCTTCTATTGGACCTGGGGTT
GGTCAAGGTACAGCTGCGGGTCAAGCTGTCGAAGGTATCGCGAGACAACCCGAGGCAGAA
GGAAAAATACGAGGTACTTTATTGCTTAGTTTGGCTTTTATGGAAGCTTTAACAATTTAT
GGCCTGGTTGTAGCATTAGCGCTTTTATTTGCGAATCCTTTTGTTTAGTCCTAGAAATAA
GAAAATTATGAATTTTTTTTT*CGTAGTTTTTTTTTTTATTCTATCAAGATTTAACTCCT
ACAATTATTCATTGAGACAACAGCCCTTGGGAAGGACTAATTTGAGGATGGGGAATTAAC
ACATCGATTCGCTTTCTTCCCTCCCCTTATTCTTTTTAGTTTAATGGAAACTTTTTTTT*
AAGGAGTGTTGCGCAAAAAGGAGGTTTAAGTTTTTTAAAATTTATATAAAACTTGGTCTC
AAATTCTAGCTTAATTCTAATTAAGTCTCATTATTATTATTGAAAATTCAAAATTTTTGG
AAAATAAATTTGTAAATAGAATAGGTTTTTGATTCTGTTTATAAATATCCAAATAGGTAA
ATTAAATTATAAATTATTAAACGAAATTTTCTTTTTATTG
AAA

QA 2 641 2 641
DS 

RD RS1GL72JQ 549 0 0
AAGGTATCGCGAGACAACCCGAGGCAGAAGGAAAAATACGAGGTACTTTATTGCTTAGTT
TGGCTTTTATGGAAGCTTTAACAATTTATGGCCTGGTTGTAGCATTAGCGCTTTTATTTG
GGAATCCTTTTGTTTAGTCCTAGAAATAAGAAAATTATGAATTTTTTTTT*CGTAGTTTT
TTTTTTTATTCTATCAAGATTTAACTCCTACAATTATTCATTGAGACAACAGCCCTTGGG
AAGGACTAATTTGAGGATGGGGAATTAACACATCGATTCGCTTTCTTCCCTCCCCTTATT
CTTTTTAGTTTAATGGAAACTTTTTTTT*AAGGAGTGTTGCGCAAAAAGGAGGTTTAAGT
TTTTTAAAATTTATATAAAACTTGGTCTCAAATTCTAGCTTAATTCTAATTAAGTCTCAT
TATTATTATTGAAAATTCAAAATTTTTGGAAAATAAATTTGTAAATAGAATAGGTTTTTG
ATTCTGTTTATAAATATCCAAATAGGTAAATTAAATTATAAATTATTAAACGAAATTTTC
TTTTTATTG

QA 1 549 1 549
DS 

RD RS1ER93JQ 636 0 0
CTTCGGTTATCGCTGCTGGGTTGGCTGTTGGGCTTGCTTCTATTGGACCTGGGGTTGGTC
AAGGTACAGCTGCGGGTCAAGCTGTCGAAGGTATCGCGAGACAACCCGAGGCAGAAGGAA
AAATACGAGGTACTTTATTGCTTAGTTTGGCTTTTATGGAAGCTTTAACAATTTATGGCC
TGGTTGTAGCATTAGCGCTTTTATTTGCGAATCCTTTTGTTTAATCCTAGAAATAAGAAA
ATTATGAATTTTTTTTT*CGTAGTTTTTTTTTT*ATTCTATCAAGATTTAACTCCTACAA
TTATTCATTGAGACAACAACCCTTGGGAAGGACTAATTTGAGGATGGGGAATTAACACAT
CGATTCGCTTTCTTCCTTCCCCTTATTCTTTTTAGTTTAATGGAAACTTTTTTTTTAAGG
AGTGTTGGGCAAAAAGGAGGTTTAAGTTTTTTAAAATTTATATAAAACTTGGTCTCAAAT
TCTAGCTTAATTCTAATTAAGTCTCATTATTATT***GAAAATTCAAAATTTTTGGAAAA
TAAATTTGTAAATAGAATAGGTTTTTGATTCTGTTTATAAATATCCAAATAGGTAAATTA
AATTATAAATTATTAAACGAAATTTTCTTTTTATTG

QA 1 636 1 636
DS 

RD RS1FX06TF 190 0 0
TTTTTTAAAATTTATATAAAACTTGGTCTCAAATTCTAGCTTAATTCTAATTAAGTCTCA
TTATTATTATTGAAAATTCAAAATTTTTGGAAAATAAATTTGTAAATAGAATAGGTTTTT
GATTCTGTTTATAAATATCCAAATAGGTAAATTAAATTATAAATTATTAAACGAAATTTT
CTTTTTATTG

QA 1 190 1 190
DS 

RD RS1G495JQ 539 0 0
TTTTTTAAGGAGTGTTGCGCAAAAAGGAGGTTTAAGTTTTTTAAAATTTATATAAAACTT
GGTCTCAAATTCTAGCTTAATTCTAATTAAGTCTCATTATTATTATTGAAAATTCAAAAT
TTTTGGAAAATAAATTTGTAAATAGAATAGGTTTTTGATTCTGTTTATAAATATCCAAAT
AGGTAAATTAAATTATAAATTATTAAACGAAATTTTCTTTTTATTGAAAAAAATAAAGAA
TAAAAAAAAAAAAAAAGGACAGAGTTCTTTTTTTTATAGTTTAGCTAGAAGAGGAGATTC
TATGAAAAATTTAACCGATTCTTTCGTTTACTTGGGTCACTGGCCATCCGCCGGGAGTTT
CGGGTTTAATACCGATATTTTAGCAACAAATCTAATAAATCTAAGTGTAGTCTTCGGTGT
ATTGATCTTTTTTGGAAAGGGAGTGTGTGTGAGTTGTTCATTTCAAGAATAGGCTGGATT
CGCCCAGTGGCACTATAACTAGCAAAGAGTGCCTAATCCCGCGAATTACTTCTGAATAC

QA 1 539 1 539
DS 

RD RS1F242JQ 327 0 0
G
CAAGAATAGGCTGGATTCGCCCAGTGGCACTATAACTAGCAAAGAGTGCCTAATCCCGCG
AATTACTTCTGAATACAAAATTCAATAAAAAATCATATTTTAGAACCATAGCATTTCGTT
ATTCTTTGGTAAGTCTACTTGACTTTGATTCTCTATCAACCAAAAATTTGGGACCATTAA
TTAACATGGTTAAAACTAAACCGTTTGAAGTTCAGATGCAACATGGTACTCTTTCTACCA
TATGTAGTCTAATTAAAAAATGAATAAGATTTTCAAAAAGAATAGTTCGGCTTTTTTCGA
TATAAAACACTCATGTCGATAAAAAA

QA 2 327 2 327
DS 

RD RS1F242TF 396 0 0
G
CAAGAATAGGCTGGATTCGCCCAGTGGCACTATAACTAGCAAAGAGTGCCTAATCCCGCG
AATTACTTCTGAATACAAAATTCAATAAAAAATCATATTTTAGAACCATAGCATTTCGTT
ATTCTTTGGTAAGTCTACTTGACTTTGATTCTCTATCAACCAAAAATTTGGGACCATTAA
TTAACATGGTTAAAACTAAACCGTTTGAAGTTCAGATGCAACATGGTACTCTTTCTACCA
TATGTAGTCTAATTAAAAAATGAATAAGATTTTCAAAAAGAATAGTTCGGCTTTTTTCGA
TATAAAACACTCATGTCGATAAAAAATTTTGAGTCTTTTTGTATAATGCAGAATTGATAA
CCTACGTATAAAGTAATAAAAATTCTTTGGATTTC

QA 2 396 2 396
DS 

RD RS1FC09TF 813 0 0
G
CATATGTAGTCTAATTAAAAAGTGAATAAGATTTTCAAAAAGAATAGTTCGGCTTTTTTC
GATATAAAACACTCATGTCGATAAAAAATTTTGAGTCTTTTTGTATAATGCAGAATTGAT
AACCTACGTATAAAGTAATAAAAATTCTTTGGATTTCAAGAAAAAAAGAAACAACTTTGC
TGACAATTATCAATTTTTTATTGGTCAGAAGAATCCTCCAAATAGTTTTGTCTTGGATTG
GTGATCTTTTTCAATAGAAATATATATTGAATATGAATTGAATACAACAAAATTGGGAGA
GGATAGGCTCATTACATGAAAAATATGGGAATGAAAGTCTCATAAATAATTGATAAATGA
TTGGAATACGTTAGCATGAGAGCCAAATGAATCGAAAGATTCATGTTTGGTTCGGGAAGG
GATCATAGAACTTTTTTTTTACGGAATGGAAAGATAATCTACTTTCATTAAATGATTTAT
TAGATAACCGAAAGCAGAGGATATTAAATACTATTCGAAATTCAGAAGAACTACGTGAAG
GAGCTATTCAACAATTAGAAAACGCCCGAGCTCGCCTGCGTAAAGTAGAAACGGAGGCGG
ATCAGTTTCGCGTAAATGGATACTCTGAAATCGAACGAGAAAAAGTAAATTTGATTAATT
CAACTTCTAGGACTTTGAAACAATTAGAAAATTACAAAA*CGAAACCATTCTTTT*GAGC
AACAAAGAACAATTAATCAAGTCCGTGAACGGGTTT*CCAACAAGCTTTACAGG*AGCTA
CAGGA*CCTTAAATAGTTGTTTGAGTA
CGAGT

QA 2 808 2 808
DS 

RD RS1FC09JQ 671 0 0
TCAATAGAAATATATATTGAATATGAATTGAATACAACAAAATTGGGAGAGGATAGGCTC
ATTACATGAAAAATATGGGAATGAAAGTCTCATAAATAATTGATAAATGATTGGAATACG
TTAGCATGAGAGCCAAATGAATCGAAAGATTCATGTTTGGTTCGGGAAGGGATCATAGAA
CTTTTTTTTTACGGAATGGAAAGATAATCTACTTTCATTAAATGATTTATTAGATAACCG
AAAGCAGAGGATATTAAATACTATTCGAAATTCAGAAGAACTACGTGAAGGAGCTATTCA
ACAATTAGAAAACGCCCGAGCTCGCCTGCGTAAAGTAGAAACGGAGGCGGATCAGTTTCG
CGTAAATGGATACTCTGAAATCGAACGAGAAAAAGTAAATTTGATTAATTCAACTTCTAG
GACTTTGAAACAATTAGAAAATTACAAAAACGAAACCATTCTTTTTGAGCAACAAAGAAC
AATTAATCAAGTCCGTGAACGGGTTTTCCAACAAGCTTTACAGGGAGCTACAGGAACCTT
AAATAGTTGTTTGAGTAACGAGTTACATTTACGTACTATTAATGCAAATATTGGTGTGTT
TGGTACGATGAAAGAAATTACTGATTAGCCCTTTCCTTACGATTATGATAGGCATTATTT
TTTTTTCTTCC

QA 1 671 1 671
DS 



CO CL57Contig2 625 4 5 U
GATAGTTTAGCTAGAAGAGGAGATTCTATGAAAAATTTAACCGATTCTTTCGTTTACTTG
GGTCACTGGCCATCCGCCGGGAGTTTCGGGTTTAATACCGATATTTTAGCAACAAATCTA
ATAAATCTAAGTGTAGTCTTCGGTGTATTGATCTTTTTTGGAAAGGGAGTGTTAAATGAT
TTATTAGATAACCGAAAGCAGAGGATATTAAATACTATTCGAAATTCAGAAGAACTACGT
GAAGGAGCTATTCAACAATTAGAAAACGCCCGAGCTCGCCTGCGTAAAGTAGAAACGGAG
GCGGATCAGTTTCGCGTAAATGGATACTCTGAAATCGAACAAGAAAAAGTAAATTTGATT
AATTCAACTTCTAGGACTTTGAAACAATTAGAAAATTACAAAAACGAAACCATTCTTTTT
GAGCAACAAAGAACAATTAATCAAGTCCGTGAACGGGTTTTCCAACAAGCTTTACAGGGA
GCTATAGGAACCTTAAATAGTTGTTTGAGTAACGAGTTACATTTACGTACTATTAATGCA
AATATTGGTATGTTTGGTACGATGAAAGAAATTACTGATTAGCCCTTTCCTTACGATTAT
GATAGGCATTATTTTTTTTTCTTCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CS48TF U 1
AF RS1CS48JQ C 1
AF RS1BJ07JQ C 350
AF RS1BJ07TF U 350
BS 1 1 RS1CS48JQ
BS 2 172 RS1CS48TF
BS 173 350 RS1CS48JQ
BS 351 619 RS1BJ07TF
BS 620 625 RS1CS48JQ

RD RS1CS48TF 179 0 0
G
ATAGTTTAGCTAGAAGAGGAGATTCTATGAAAAATTTAACCGATTCTTTCGTTTACTTGG
GTCACTGGCCATCCGCCGGGAGTTTCGGGTTTAATACCGATATTTTAGCAACAAATCTAA
TAAATCTAAGTGTAGTCTTCGGTGTATTGATCTTTTTTGGAAAGGGAGTGT
TAAATGA

QA 2 172 2 172
DS 

RD RS1CS48JQ 625 0 0
GATAGTTTAGCTAGAAGAGGAGATTCTATGAAAAATTTAACCGATTCTTTCGTTTACTTG
GGTCACTGGCCATCCGCCGGGAGTTTCGGGTTTAATACCGATATTTTAGCAACAAATCTA
ATAAATCTAAGTGTAGTCTTCGGTGTATTGATCTTTTTTGGAAAGGGAGTGTTAAATGAT
TTATTAGATAACCGAAAGCAGAGGATATTAAATACTATTCGAAATTCAGAAGAACTACGT
GAAGGAGCTATTCAACAATTAGAAAACGCCCGAGCTCGCCTGCGTAAAGTAGAAACGGAG
GCGGATCAGTTTCGCGTAAATGGATACTCTGAAATCGAACAAGAAAAAGTAAATTTGATT
AATTCAACTTCTAGGACTTTGAAACAATTAGAAAATTACAAAAACGAAACCATTCTTTTT
GAGCAACAAAGAACAATTAATCAAGTCCGTGAACGGGTTTTCCAACAAGCTTTACAGGGA
GCTATAGGAACCTTAAATAGTTGTTTGAGTAACGAGTTACATTTACGTACTATTAATGCA
AATATTGGTATGTTTGGTACGATGAAAGAAATTACTGATTAGCCCTTTCCTTACGATTAT
GATAGGCATTATTTTTTTTTCTTCC

QA 1 625 1 625
DS 

RD RS1BJ07JQ 275 0 0
G
AAATTTGATTAATTCAACTTCTAGGACTTTGAAACAATTAGAAAATTACAAAAACGAAAC
CATTCTTTTTGAGCAACAAAGAACAATTAATCAAGTCCGTGAACGGGTTTTCCAACAAGC
TTTACAGGGAGCTATAGGAACCTTAAATAGTTGTTTGAGTAACGAGTTACATTTACGTAC
TATTAATGCAAATATTGGTATGTTTGGTACGATGAAAGAAATTACTGATTAGCCCTTTCC
TTACGATTATGATAGGCATTATTTTTTTT
CTTCC

QA 2 270 2 270
DS 

RD RS1BJ07TF 275 0 0
G
AAATTTGATTAATTCAACTTCTAGGACTTTGAAACAATTAGAAAATTACAAAAACGAAAC
CATTCTTTTTGAGCAACAAAGAACAATTAATCAAGTCCGTGAACGGGTTTTCCAACAAGC
TTTACAGGGAGCTATAGGAACCTTAAATAGTTGTTTGAGTAACGAGTTACATTTACGTAC
TATTAATGCAAATATTGGTATGTTTGGTACGATGAAAGAAATTACTGATTAGCCCTTTCC
TTACGATTATGATAGGCATTATTTTTTTT
CTTCC

QA 2 270 2 270
DS 



AS 2 15

CO CL58Contig1 1315 13 10 U
GGAAAACAAAACAAAAAAAAATGCTGAATGTACTTAGAAAATCTAACCTGACCCTTATCA
TTTTGATCTGCTCTGTCCTGATAGCCTCAAGGCTATGCTCTGTGGACTCCTCTGTGTACG
ACCCAATCACAACCCTGAGAGAGCGGTTCAATAAGTGGCTTCAAACGCATAGCATATTAT
ATGGAGGAAAGGAGGAGTGGATGCTACGGTTTGGGATATACCAGTCTAATCTCCAGCTGA
TAGACTACATCAACTCCCTCCACTTACCCTTTAAGTTAACAGACAACAGATTTGCGGACA
TGACCAATGCTGAGTTTAAGGCTCATTTTCTCGGTTTGAACACGTCTTCCCTGAAGTTAA
ACAGGGACCAAAGGCCGGTCTGTGACGCGGTAGGTAACGTGCCTGACGCTGTGGACTGGA
GGAAAGAAGGTGCAGTGACTCCTGTTAGAAACCAAGGAAAATGCGGAGGTTGCTGGGCGT
TCACTGCAGTGGCAGCTATTGAAGGCATCAACAAGATAAAGACAGGGAACTTAGTATCTC
TCTCAGAACAACAGCTCATAGACTGTGACGTCGGCTCTTTCAACAAAGGCTGCAGCGGTG
GATTAATGACAACAGCATATGAATACCTCATAGCCAATGGTGGACTAGTCACCGAGGCTG
ACTATCCATACACAGCCACACAGGGTGCATGCGACCAAGAGAAGTCCAAAAATAAGGTGG
TTACAATACAAGGATACACAAAGGTAGCACAGAACGAGGCGAGTTTACAAGCCGCTACCG
CTCAACAACCTGTATCAGTTGGAATAGACGCTGCTGGTTTCATCTTTCAGCTTTACTCTT
CTGGTGTGTTCACAGGCTACTGTGGAAATCATCTCAACCATGGAGTGACTGTTGTTGGAT
ATGGAGAAGAAGATGGGCAAAAGTACTGGATTGTGAAGAATTCGTGGGGAACTGCTTGGG
GTGAACAGGGGTATGTAAGGATGGAACGTGGTTATAGTGAAGAGACGGGTAAGTGTGGTA
TTGCTATGCTTGCAAGCTATCCTACGAAGTGAGTCCAAGATTTTCTAGAAACTTTAAAGA
GCCTTTTATCTCTGTATGAAAATCTGCAATAGCGCAGATAAAATAATTATGATGTGTGAA
AATAAAGTAGTACTAGAGATACTTGAGAACCAAGTTATAATGCTAACATGATTCCAAAGA
TAAGATGCGATTATAATAGAATCATGTGAGATTCACTTGAACAGTGCATTGATACTTTCT
CCTAGAAGCATATTGTTTGAGAAGCTGATTCTTATATATAACATTAGGTTTGGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 40 55 40 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 35 50 
50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
30 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 35 50 50 50 50 35 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 15 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 
55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RS1AV79TF U 6
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AF RS1A916TF U 6
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AF RS1C753TF U 731
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GA
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AAAGGAGGAGTGGATGCTACGGTTTGGGATATACCAGTCTAATCTCCAGCTGATAGACTA
CATCAACTCCCTCCACTTACCCTTTAAGTTAACAGACAACAGATTTGCGGACATGACCAA
TGCTGAGTTTAAGGCTCATTTTCTCGGTTTGAACACGTCTTCCCTGAAGTTAAACAGGGA
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AGTGGCAGCTATTGAAGGCATCAACAAGATAAAGACAGGGAACTTAGTATCTCTCTCAGA
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DS 

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GGTGCAGTGACTCCTGTTAGAAACCAAGGAAAATGCGGAGGTTGCTGGGCGTTCACTGCA
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TACACAGCCACACAGGGTGCATGCGACCAAGAGAAGTCCAAAAATAAGGTGGTTACAATA
CAAGGATACACAAAGGTAG

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DS 

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TTTTGATCTGCTCTGTCCTGATAGCCTCAAGGCTATGCTCTGTGGACTCCTCTGTGTACG
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ATGGAGGAAAGGAGGAGTGGATGCTACGGTTTGGGATATACCAGTCTAATCTCCAGCTGA
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ACAGGGACCAAAGGCCGGTCTGTGACGCGGTAGGTAACGTGCCTGACGCTGTGGACTGGA
GGAAAGAAGGTGCAGTGACTCCTGTTAGAAACCAAGGAAAATGCGGAGGTTGCTGGGCGT
TCACTGCAGTGGCAGCTATTGAAGGCATCAACAAGATAAAGACAGGGAACTTAGTATCTC
TCTCAGAACAACAGCTCATAGACTGTGACGTCGGCTCTTTCAACAAAGGCTGCAGCGGTG
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ACTATCCATACACAGCCACACAGGGTGCATGCGACCAAGAGAAGTCCAAAAATAAGGTGG
TTACAATACAAAGATACACAAAGGTAGCACAGAACGAGGCGAGTTTACAAGCCGCTACCG
CTCAACAACCTGTATCAGTTGGAATAGACGCTGCTGGTTTCATCTTTCAGCTTTACTCTT
CTGGTGTGTTC

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DS 

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GG
AAAACAAAAAAAAATG*TGAATGTACTTAGAAAATCTAACCCGACCCTTATCATTTTGAT
CTGCTCTGTCCTGATAGCCTCAAGGCTATGCTCTGTGGACTCCTCTGTGTACGACCCAAT
CACAACCCTGAGAGAGCGGTTCAATAAGTGGCTTCAAACGCATAGCATATTATATGGAGG
AAAGGAGGAGTGGATGCTACGGTTTGGGATATACCAGTCTAATCTCCAGCTGATAGACTA
CATCAACTCCCTCCACTTACCCTTTAAGTTAACAGACAACAGATTTGCGGACATGACCAA
TGCTGAGTTTAAGGCTCATTTTCTCGGTTTGAACACGTCTTCCCTGAAGTTAAACAGGGA
CCAAAGGCCGGTCTGTGACGCGGTAGGTAACGTGCCTGACGCTGTGGACTGGAGGAAAGA
AGGTGCAGTGACTCCTGTTAGAAACCAAGGAAAATGCGGAGGTTGCTGGGCGTTCACTGC
AGTGGCAGCTATTGAAGGCATCAACAAGATAAAGACAGGGAACTTAGTATCTCTCTCAGA
ACAACAGCTCATAGACTGTGACGTCGGCTCTTTCAACAAAGGCTGCAGCGGTGGATTAAT
GACAACAGCATATGAATACCTCATAGCCAATGGTGGACTAGTCACCGAGGCTGACTATCC
ATACACAGCCACACAGGGTGCATGCGACCAAGAGAAGTCCAAAAATAAAGTGGTTACAAT
ACAAAGATACACAAAGGTAGCACAGAACGAGGCGAGTTTACAAGCCGCTACCGCTCAACA
*CCTGTATCAGTTGGAATAGACGCTGCTGGTTTCATCTTTCAGCTTTACTCTTCTGGTGT
GTCA*CAGGCTACTGTGGAAATCATCTCAACCATGGAGTGACTG

QA 3 886 3 886
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G
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CTACGAAGTGAGTCCAAGATTTTTTAGAAACTTTAAAGAGCCTTT

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DS 

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GGAGGAAAGAAGGTGCAGTGACTCCTGTTAGAAACCAAGGAAAATGCGGAGGTTGCTGGG
CGTTCACTGCAGTGGCAGCTATTGAAGGCTTCAACAAGATAAAGACAGGGAACTTAGTAT
CTCTCTCAGAACAACAGCTCATAGACTGTGACGTCGGCTCTTTCAACAAAGGCTGCAGCG
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CTGACTATCCATACACAGCCACACAGGGTGCATGCGACCAAGAGAAGTCCAAAAATAAGG
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CCGCTCAACAACCTGTATCAGTTGGAATAGACGCTGCTGGTTTCATCTTTCAGCTTTACT
CTTCTGGTGTGTTCACAGGCTACTGTGGAAATCATTTCAACCATGGAGTGACTGTTGTTG
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GGGGTGAACAGGGGTATGTAAGGATGGAACGTGGTTATAGTGAAGAGACGGGTAAGTGTG
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AGAGCCTTTTATCTCTGTATGAAAATCTGCAATAGCGCAGATAAAATAATTATGATGTGT
GAAAATAAAGTAGTACTAGAGATACTTGAGAACCAAGTTATAATGCTAACATGATTCC

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G
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CAACAGCTCATAGACTGTGACGTCGGCTCTTTCAACAAAGGCTGCAGCGGTGGATTAATG
ACAACAGCATATGAATGCCTCATAGCCAATGGTGGACCAGTCACCGAGGCTGACTATCCA
TACACAGCCACACAGGGTGCATGCGACCAAGAGAAGTCCAAAAATAAGGTGGTTACAATA
CAAGGATACACAAAGGTAGCACAGAACGAGGCGAGTTTACAAGCCGCTACCGCTCAACAA
CCTGTATCAGTTGGAATAGACGCTGCTGGTTTCATCTTTCAGCTTTACTCTTCTGGTGTG
TTCACAGGCTACTGTGGAAATCATCTCAACCATGGAGTGACTGTTGTTGGATATGGAGAA
GAAGATGGGCAAAAGTACTGGATTGTGAAGAATTCGTGGGGAACTGCTTGGGGTGAACAG
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CTTGCAAGCTATCCTACGAAGTGAGTCCAAGATTCTCTAGAAACTTTAAAGAGCCTTTTA
TCTCTGTATGAAAATCTGCAATAGCGCAGATAAAATAATTATGATGTGTGAAAATAAAGT
AGTACTAGAGATACTTGAGAACCAAGTTATAATGCTAACATGATTCC

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DS 

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AAGGCCGGTCTGTGACGCGGTAGGTAACGTGC*TGACGCTGTGGACTGGAGGAAAGAAGG
TGCAGTGACTCCTGTTAGAAACCAAGGAAAATGCGGAGGTTGCTGGGCGTTCACTGCAGT
GGCAGCTATTGAAGGCATCAACAAGATAAAGACAGGGAACTTAGTATCTCTCTCAGAACA
ACAGCTCATAGACTGTGACGTCGGCTCTTTCAACAAAGGCTGCAGCGGTGGATTAATGAC
AACAGCATATGAATACCTCATAGCCAATGGTGGACTAGTCACCGAGGCTGACTATCCATA
CACAGCCACACAGGGTGCATGCGACCAAGAGAAGTCCAAAAATAAGGTGGTTACAATACA
AGGATACACAAAGGTAGCACAGAACGAGGCGAGTTTACAAGCCGCTACCGCTCAACAACC
TGTATCAGTTGGAATAGACGCTGCTGGTTTCATCTTTCAGCTTTACTCTTTTGGTGTGTT
CACAGGCTACTGTGGAAATCATCTCAACCATGGAGTGACTGTTGTTGGATATGGAGAAGA
AGATGGGCAAAAGTACTGGATTGTGAAGAATTCGTGGGGAACTGCTTGGGGTGAACAGGG
GTATGTAAGGATGGAACGTGGTTATAGTGAAGAGACGGGTAAGTGTGGTATTGCTATGCT
TGCAAGCTATCCTACGAAGTGAGTCCAAGATTTTCTAGAAACTTTAAAGAGCCTTTTATC
TCTGTATGAAAATCTGCAATAGCGCAGATAAAATAATTATGATGTGTGAAAATAAAGTAG
TACTAGAGATACTTGAGAACCAAGTTATAATGCTAACATGATTCCAAAGATAAGATGCGA
TTATAATAGAATCATGTGAGATTCACTTGAACAGTG

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DS 

RD RS1BB19TF 379 0 0
G
GTGGAAATCATCTCAACCATGGAGTGACTGTTGTTGGATATGGAGAAGAAGATGGGCAAA
AGTACTGGATTGTGAAGAATTCGTGGGGAACTGCTTGGGGTGAACAGGGGTATGTAAGGA
TGGAACGTGGTTATAGTGAAGAGACGGGTAAGTGTGGTATTGCTATGCTTGCAAGCTATC
CTACGAAGTGAGTCCAAGATTTTCTAGAAACTTTAAAGAGCCTTTTATCTCTGTATGAAA
ATCTGCAATAGCGCAGATAAAATAATTATGATGTGTGAAAATAAAGTAGTACTAGAGATA
CTTGAGAACCAAGTTATAATGCTAACATGATTCCAAAGATAAGATGCGATTATAATAGAA
TCATGTGAGATTCGCTTG

QA 2 379 2 379
DS 

RD RS1EI58JQ 669 0 0
ACGTCGGCTCTTTCAACAAAGGCTGCAGCGGTGGATTAATGACAACAGCATATGAATACC
TCATAGCCAATGGTGGACTAGTCACCGAGGCTGACTATCCCTACACAGCCATACAGGGTA
CGTGCGACCAAGAGAAGTCCAAAAACAAGGTAGTTACGATACAAGGATACACAAAGGTAG
CACAGAACGAGGGGAGTTTACAAGCCGCTACCGCTCAACAACCGGTATCAGTTGGAATAG
ACGCTGCTGGTTTCATCCTTCAGCTTTACTCTTCTGGTGTGTTCACAGGATACTGTGGAA
ATCATTTCAACCATGGAGTGACTGTTGTTGGATATGGAGAAGAAGATGGGCAAAAGTACT
GGATTGTGAAGAATTCGTGGGGAACTGCTTGGGGTGAACAGGGGTATGTAAGGATGGAAC
GTGGTTATAGTGAAGAGACGGGTAAGTGTGGTATTGCTATGCTTGCAAGCTATCCTACGA
AGTGAGTCCAAGATTTTCTAGAAACTTTAAAGAGCCTTTTATCTCTGTATGAAAATCTGC
AATAGCGCAGATAAAATAATTATGATGTGTGAAAATAAAGTAGTACTAGAGATACTTGAG
AACCAAGTTATAATGCTAACATGATTCCAAAGATAAGATGCGATTATAATAGAATCATGT
GAGATTC
GC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RS1BZ75JQ 684 0 0
TAGCCAATGGTGGACTAGTCACCGAGGCTGACTATCCATACACAGCCACACAGGGTGCAT
GCGACCAAGAGAAGTCCAAAAATAAGGTGGTTACAATACAAGGATACACAAAGGTAGCAC
AGAACGAGGCGAGTTTACAAGCCGCTACCGCTCAACAACCTGTATCAGTTGGAATAGACG
CTGCTGGTTTCATCTTTCAGCTTTACTCTTTTGGTGTGTTCACAGGCTACTGTGGAAATC
ATTTCAACCATGGAGTGACTGTTGTTGGATATGGAGAAGAAGATGGGCAAAAGTACTGGA
TTGTGAAGAATTCGTGGGGAACTGCTTGGGGTGAACAGGGGTATGTAAGGATGGAACGTG
GTTATAGTGAAGAGACGGGTAAGTGTGGTATTGCTATGCTTGCAAGCTATCCTACGAAGT
GAGTCCAAGATTTTCTAGAAACTTTAAAGAGCCTTTTATCTCTGTATGAAAATCTGCAAT
AGCGCAGATAAAATAATTATGATGTGTGAAAATAAAGTAGTACTAGAGATACTTGAGAAC
CAAGTTATAATGCTAACATGATTCCAAAGATAAGATGCGATTATAATAGAATCATGTGAG
ATTCACTTGAACAGTGCATTGATACTTTCTCCTAGAAGCATATTGTTTGAGAAGCTGATT
CTTATATATAACATTAGGTTTGGC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1C753JQ 585 0 0
G
GGATACACAAAGGTAGCACAGAACGAGGCGAGTTTACAAGCCGCTACCGCTCAACAACCT
GTATCAGTTGGAATAGACGCTGCTGGTTTCATCTTTCAGCTTTACTCTTCTGGTGTGTTC
ACAGGCTACTGTGGAAATCATCTCAACCATGGAGTGACTGTTGTTGGATATGGAGAAGAA
GATGGGCAAAAGTACTGGATTGTGAAGAATTCGTGGGGAACTGCTTGGGGTGAACAGGGG
TATGTAAGGATGGAACGTGGTTATAGTGAAGAGACGGGTAAGTGTGGTATCGCTATGCTT
GCAAGCTATCCTACGAAGTGAGTCCAAGATTTTCTAGAAACTTTAAGGAGCCTTTTATCT
CTGTATGAAAATCTGCAATAGCGCAGATAAAATAATTATGATGTGTGAAAATAAAGTAGT
ACTAGAGATACTTGAGAACCAAGTTATAATGCTAACATGATTCCAAAGATAAGATGCGAT
TATAATAGAATCATGTGAGATTCACTTGAACAGTGCATTGATACTTTCTCCTAGAAGCAT
ATTGTTTGAGAAGCTGATTCTTATATATAACATTAGGTTTGGCG

QA 2 585 2 585
DS 

RD RS1C753TF 585 0 0
G
GGATACACAAAGGTAGCACAGAACGAGGCGAGTTTACAAGCCGCTACCGCTCAACAACCT
GTATCAGTTGGAATAGACGCTGCTGGTTTCATCTTTCAGCTTTACTCTTCTGGTGTGTTC
ACAGGCTACTGTGGAAATCATCTCAACCATGGAGTGACTGTTGTTGGATATGGAGAAGAA
GATGGGCAAAAGTACTGGATTGTGAAGAATTCGTGGGGAACTGCTTGGGGTGAACAGGGG
TATGTAAGGATGGAACGTGGTTATAGTGAAGAGACGGGTAAGTGTGGTATCGCTATGCTT
GCAAGCTATCCTACGAAGTGAGTCCAAGATTTTCTAGAAACTTTAAGGAGCCTTTTATCT
CTGTATGAAAATCTGCAATAGCGCAGATAAAATAATTATGATGTGTGAAAATAAAGTAGT
ACTAGAGATACTTGAGAACCAAGTTATAATGCTAACATGATTCCAAAGATAAGATGCGAT
TATAATAGAATCATGTGAGATTCACTTGAACAGTGCATTGATACTTTCTCCTAGAAGCAT
ATTGTTTGAGAAGCTGATTCTTATATATAACATTAGGTTTGGC
G

QA 2 584 2 584
DS 



CO CL58Contig2 813 2 8 U
GGAACAAAAACAAAAACAAAAAAAATGCTGAATGCACTTAGAAACTCTAACCTGACCCTT
GTCGTTTTGATCTGCTCTGTCCTGGTAGCTTCGAGGCTATGCTCTGTGGACTCCTCTGTG
TACGACCCAATCACAACCCTGAGAGAGCGGTTCAATAAGTGGCTTCAAACGCATAGCATA
TTATATGGAGGAAAGGAGGAGTGGATGCTACGGTTTGGGATATACCAGTCTAATCTCCAG
CTGATTGACTACATCAACTCCCTCCACTTGCCCTTTAAGTTAACAGACAACAGATTTGCG
GACATGACCAATGCTGAGTTTAAGGCTCATTTTCTCGGTTTGAACACAGAACGAGGCGAG
TTTACAAGCCGCTACCGCTCAACAACCGGTATCAGTTGGAATAGACGCTGCTGGTTTCAT
CTTTCAGCTTTACTCTTCTGGTGTGTTCACAGGATACTGTGGAAATCATCTCAACCATGG
AGTGACTGTTGTTGGATATGGAGAAGAAGATGGGCAAAAGTACTGGATTGTGAAGAATTC
GTGGGGAACTGCTTGGGGTGAACAGGGGTATGTAAGGATGGAACGTGGTTATAGTGAGAC
GGGTAAGTGTGGTATTGCTATGCTTGCAAGCTATCCTACGAAGTGAGTCCAAGATTTTCT
AGAAACTTTAAAGAGCCTTTTATCTCTGTATGAAAATCTGCAATAGCGCAGATAAAATAA
TTATGATGTGTGAAAATAAAGTAGTACTAGAGATACTTGAGAACCAAGTTATAATGCTAA
CATGATTCCAAAGATAAGATGCGATTATAATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DO33TF U 1
AF RS1DO33JQ C 62
BS 1 716 RS1DO33TF
BS 717 717 RS1DO33JQ
BS 718 735 RS1DO33TF
BS 736 736 RS1DO33JQ
BS 737 762 RS1DO33TF
BS 763 763 RS1DO33JQ
BS 764 786 RS1DO33TF
BS 787 813 RS1DO33JQ

RD RS1DO33TF 786 0 0
GGAACAAAAACAAAAACAAAAAAAATGCTGAATGCACTTAGAAACTCTAACCTGACCCTT
GTCGTTTTGATCTGCTCTGTCCTGGTAGCTTCGAGGCTATGCTCTGTGGACTCCTCTGTG
TACGACCCAATCACAACCCTGAGAGAGCGGTTCAATAAGTGGCTTCAAACGCATAGCATA
TTATATGGAGGAAAGGAGGAGTGGATGCTACGGTTTGGGATATACCAGTCTAATCTCCAG
CTGATTGACTACATCAACTCCCTCCACTTGCCCTTTAAGTTAACAGACAACAGATTTGCG
GACATGACCAATGCTGAGTTTAAGGCTCATTTTCTCGGTTTGAACACAGAACGAGGCGAG
TTTACAAGCCGCTACCGCTCAACAACCGGTATCAGTTGGAATAGACGCTGCTGGTTTCAT
CTTTCAGCTTTACTCTTCTGGTGTGTTCACAGGATACTGTGGAAATCATCTCAACCATGG
AGTGACTGTTGTTGGATATGGAGAAGAAGATGGGCAAAAGTACTGGATTGTGAAGAATTC
GTGGGGAACTGCTTGGGGTGAACAGGGGTATGTAAGGATGGAACGTGGTTATAGTGAGAC
GGGTAAGTGTGGTATTGCTATGCTTGCAAGCTATCCTACGAAGTGAGTCCAAGATTTTCT
AGAAACTTTAAAGAGCCTTTTATCTCTGTATGAAAATCTGCAATAGCGCAGATAAA*TAA
TTATGATGTGTGAAA*TAAAGTAGTACTAGAGATACTTGAGA*CCAAGTTATAATGCTAA
CATGAT

QA 1 786 1 786
DS 

RD RS1DO33JQ 752 0 0
TCG
TTTTGATCTGCTCTGTCCTGGTAGCTTCGAGGCTATGCTCTGTGGACTCCTCTGTGTACG
ACCCAATCACAACCCTGAGAGAGCGGTTCAATAAGTGGCTTCAAACGCATAGCATATTAT
ATGGAGGAAAGGAGGAGTGGATGCTACGGTTTGGGATATACCAGTCTAATCTCCAGCTGA
TTGACTACATCAACTCCCTCCACTTGCCCTTTAAGTTAACAGACAACAGATTTGCGGACA
TGACCAATGCTGAGTTTAAGGCTCATTTTCTCGGTTTGAACACAGAACGAGGCGAGTTTA
CAAGCCGCTACCGCTCAACAACCGGTATCAGTTGGAATAGACGCTGCTGGTTTCATCTTT
CAGCTTTACTCTTCTGGTGTGTTCACAGGATACTGTGGAAATCATCTCAACCATGGAGTG
ACTGTTGTTGGATATGGAGAAGAAGATGGGCAAAAGTACTGGATTGTGAAGAATTCGTGG
GGAACTGCTTGGGGTGAACAGGGGTATGTAAGGATGGAACGTGGTTATAGTGAGACGGGT
AAGTGTGGTATTGCTATGCTTGCAAGCTATCCTACGAAGTGAGTCCAAGATTTTCTAGAA
ACTTTAAAGAGCCTTTTATCTCTGTATGAAAATCTGCAATAGCGCAGATAAAATAATTAT
GATGTGTGAAAATAAAGTAGTACTAGAGATACTTGAGAACCAAGTTATAATGCTAACATG
ATTCCAAAGATAAGATGCGATTATAATAG

QA 4 752 4 752
DS 



AS 2 16

CO CL59Contig1 650 11 6 U
GGGGGGGCCGTCTCCTCAGCTAAAAGACGCCGCTCGTTTATTCAGACAGTCTCACCTTCT
AGGATTTGTTCAAGAGAGAA*GGGGGTTTGAAAGATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTCGC
CAAGGGAAAGAAGAAGGGAGTCTCCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAA
GATCATGGAGATTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAA
AGCCGGTGCTCTCGGTGACTCTGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCAC
TTCTGATGGTCAGTTCTCCAAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAA
GCACAACGTGAGGGATTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGA
GTTGAGGTACTTCAACATCGCTGAGAACGAGGGTGAGGAAGAAGACTAGAAGAGTTATTA
CTTCTGTTTCGTGTTTCTGTTGTTTTGGTTTCTGCTCGTTGCTGCTCAGTACAATTTATC
TTGGTACTTCTATTGTTTTTTT*GACAGATCTTGTTTAGTTTGGTTGAACTTAAACTTGT
TTCAGACACTTGTTTGAGAAAAATTTAAAGATCTTTATGATCCAATCCCT


BQ
10 30 30 30 30 0 0 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 
65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A915JQ C 8
AF RS1BE75JQ C 6
AF RS1BE75TF U 6
AF RS1BZ90JQ C 1
AF RS1DK76JQ C 57
AF RS1D647TF U 6
AF RS1D708TF U 2
AF RS1D708JQ C 2
AF RS1A915TF U 8
AF RS1DK76TF U 6
AF RS1BZ90TF U 1
BS 1 1 RS1BZ90JQ
BS 2 5 RS1D708TF
BS 6 589 RS1BE75TF
BS 590 623 RS1D647TF
BS 624 639 RS1DK76TF
BS 640 650 RS1BZ90JQ

RD RS1A915JQ 124 0 0
GG
GTCTCCTCAGCTAAAAGACGCCGCTCGTTTATTCAGACAGTCTCACCTTCTAGGATTTGT
TCAAGAGAGAAAGGGGGTTTGAAAGATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTCGCCAA
AGGGAAAA

QA 3 116 3 116
DS 

RD RS1BE75JQ 586 0 0
GGCCGTCTCCTCAGCTAAAAGACGCCGCTCGTTTATTCAGACAGTCTCACCTTCTAGGAT
TTGTTCAAGAGAGAA*GGGGGTTTGAAAGATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTCGCCAAGG
GAAAGAAGAAGGGAGTCTCCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAGATCA
TGGAGATTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCCG
GTGCTCTCGGTGACTCTGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACTTCTG
ATGGTCAGTTCTCCAAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACA
ACGTGAGGGATTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGA
GGTACTTCAACATCGCTGAGAACGAGGGTGAGGAAGAAGACTAGAAGAGTTATTACTTCT
GTTTCGTGTTTCTGTTGTTTTGGTTTCTGCTCGTTGCTGCTCAGTACAATTTATCTTGGT
ACTTCTATTGTTTTTTT*GACAGATCTTGTTTAGTTTGGTTGAA
AG

QA 1 584 1 584
DS 

RD RS1BE75TF 586 0 0
GGCCGTCTCCTCAGCTAAAAGACGCCGCTCGTTTATTCAGACAGTCTCACCTTCTAGGAT
TTGTTCAAGAGAGAA*GGGGGTTTGAAAGATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTCGCCAAGG
GAAAGAAGAAGGGAGTCTCCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAGATCA
TGGAGATTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCCG
GTGCTCTCGGTGACTCTGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACTTCTG
ATGGTCAGTTCTCCAAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACA
ACGTGAGGGATTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGA
GGTACTTCAACATCGCTGAGAACGAGGGTGAGGAAGAAGACTAGAAGAGTTATTACTTCT
GTTTCGTGTTTCTGTTGTTTTGGTTTCTGCTCGTTGCTGCTCAGTACAATTTATCTTGGT
ACTTCTATTGTTTTTTT*GACAGATCTTGTTTAGTTTGGTTGAA
AG

QA 1 584 1 584
DS 

RD RS1BZ90JQ 650 0 0
GGGGGTTCCGTCTCCTCAGCTAAAAGACGCCGCTCGTTTATTCAGACAGTCTCACCTTCT
AGGATTTGTTCAAGAGAGAA*GGGGGTTTGAAAGATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTCGC
CAAGGGAAAGAAGAAGGGAGTCTCCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAA
GATCGTGGAGATTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAA
AGCCGGTGCTCTCGGTGACTCTGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCAC
TTCTGATGGTCAGTTCTCCAAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAA
GCACAACGTGAGGGATTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGA
GTTGAGGTACTTCAACATCGCTGAGAACGAGGGTGAGGAAGAAGACTAGAAGAGTTATTA
CTTCTGTTTCGTGTTTCTGTTGTTTTGGTTTCTGCTCGTTGCTGCTCAGTACAATTTATC
TTGGTACTTCTATTGTTTTTTT*GACAGATCTTGTTTAGTTTGGTTGAACTTAAACTTGT
TTCAGACACTTGTTTGAGAAAAATTTAAAGATCTTTATGATCCAATCCCT

QA 1 650 1 650
DS 

RD RS1DK76JQ 586 0 0
TTT
TAGGATTTGTTCAAGAGAGAA*GGGGGTTTGAAAAATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTCG
CCAAGGGAAAGAAGAAGGGAGTCTCCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACA
AGATCATGGAGATTGCTTCCCTCGAGAAGTCCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCA
AAGCCGGTGCTCTCGGTGACTCTGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCA
CTTCTGATGGTCAGTTCTCCAAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGA
AGCACAACGTGAGGGATTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACG
AGTTGAGGTACTTCAACATCGCTGAGAACGAGGGTGAGGAAGAAGACTAGAAGAGTTATT
ACTTCTGTTTCGTGTTTCTGTTGTTTTGGTTTCTGCTCGTTGCTGCTCAGTACAATTTAT
CTTGGTACTTCTATTGTTTTTCT*GACAGATCTTGTTTAGTTTGGTTGAACTTAAACTTG
TTTCAGACACTTGTTTGAGAAAAATTTAAAAATCTTTATG
CCC

QA 4 583 4 583
DS 

RD RS1D647TF 618 0 0
GGCCGTCTCCTCAGCTAAAAGACGCCGCTCGTTTATTCAGACAGTCTCACCTTCTAGGAT
TTGTTCAAGAGAGAA*GGGGGTTTGAAAGATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGCCGCCAAGG
GAAAGAAGAAGGGAGTCTCCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAGATCA
TGGAGATTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAACCG
GTGCTCTCGGTGACTCTGCCACAATCACCCGTGAGGAGAACAAGATCACTGTCACTTCTG
ATGGTCAGTTCTCCAAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACA
ACGTGAGGGATTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGA
GGTACTTCAACATCGCTGAGAACGAGGGTGAGGAAGAAGACTAGAAGAGTTATTACTTCT
GTTTCGTGTTTCTGTTGTTTTGGTTTCTGCTCGTTGCTGCTCAGTACAATTTATCTTGGT
ACTTCTATTGTTTTTTTTGACAGATCTTGTTTAGTTTGGTTGAACTTAAACTTGTTTCAG
ACACTTGTTTGAGAAAAA

QA 1 618 1 618
DS 

RD RS1D708TF 614 0 0
GGGGTTCCGTCTCCTCAGCTAAAAGACGCCGCTCGTTTATTCAGATAGTCTCACCTTCTA
GGATTTGTTCAAGAGAGAA*GGGGGTTTGAAAGATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTCGCC
AAGGGAAAGAAGAAGGGAGTCTCCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAG
ATCATGGAGATTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAA
GCCGGTGCTCTCGGTGACTCTGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACT
TCTGATGGTCAGTTCTCCAAGAGGTACCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAG
CACAACGTGAGGGATTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAG
TTGAGGTACTTCAACATCGCTGAGAACGAGGGTGAGGAAGAAGACTAGAATAGTTATTAC
TTCTGTTTCGTGTTTCTGTTGTTTTGGTTTCTGCTCGTTGCTGCTCAGTACAATTTATCT
TGGTACTTCTATTGTTTTTTT*GACAGATCTTGTTTAGTTTGGTTGAACTTAAACTTGTT
TCAGACA
AAAAAAA

QA 1 607 1 607
DS 

RD RS1D708JQ 606 0 0
GGGGTTCCGTCTCCTCAGCTAAAAGACGCCGCTCGTTTATTCAGATAGTCTCACCTTCTA
GGATTTGTTCAAGAGAGAA*GGGGGTTTGAAAGATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTCGCC
AAGGGAAAGAAGAAGGGAGTCTCCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAG
ATCATGGAGATTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAA
GCCGGTGCTCTCGGTGACTCTGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACT
TCTGATGGTCAGTTCTCCAAGAGGTACCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAG
CACAACGTGAGGGATTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAG
TTGAGGTACTTCAACATCGCTGAGAACGAGGGTGAGGAAGAAGACTAGAATAGTTATTAC
TTCTGTTTCGTGTTTCTGTTGTTTTGGTTTCTGCTCGTTGCTGCTCAGTACAATTTATCT
TGGTACTTCTATTGTTTTTTT*GACAGATCTTGTTTAGTTTGGTTGAACTTAAACTTGTT
TCAGAC

QA 1 606 1 606
DS 

RD RS1A915TF 623 0 0
GG
GTCTCCTCAGCTAAAAGACGCCGCTCGTTTATTCAGACAGTCTCACCTTCTAGGATTTGT
TCAAGAGAGAA*GGGGGTTTGAAAGATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTCGCCAAGGGAAA
GAAGAAGGGAGTCTCCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAGATCATGGA
GATTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCCGGTGC
TCTCGGTGACTCTGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACTTCTGATGG
TCAGTTCTCCAAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAACGT
GAGGGATTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGAGGTA
CTTCAACATCGCTGAGAACGAGGGTGAGGAAGAAGACTAGAAGAGTTATTACTTCTGTTT
CGTATTTCTGTTGTTTTGGTTTCTGCTCGTTGCTGCTCAGTACAATTTATCTTGGTACTT
CTATTGTTTTTTT*GACAGATCTTGTTTAGTTTGGTTGAACTTAAACTTGTTTCAGACAC
TTGTTTGAGAAAAA
TTTAAAG

QA 3 616 3 616
DS 

RD RS1DK76TF 637 0 0
GGCCGTCTCCTCAGCTAAAAGACGCCGCTCGTTTATTCAGACAGTCTCACCTTCTAGGAT
TTGTTCAAGAGAGAA*GGGGGTTTGAAAAATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTCGCCAAGG
GAAAGAAGAAGGGAGTCTCCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAGATCA
TGGAGATTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCCG
GTGCTCTCGGTGACTCTGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACTTCTG
ATGGTCAGTTCTCCAAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACA
ACGTGAGGGATTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGA
GGTACTTCAACATCGCTGAGAACGAGGGTGAGGAAGAAGACTAGAAGAGTTATTACTTCT
GTTTCGTGTTTCTGTTGTTTTGGTTTCTGCTCGTTGCTGCTCAGTACAATTTATCTTGGT
ACTTCTATTGTTTTTCT*GACAGATCTTGTTTAGTTTGGTTGAACTTAAACTTGTTTCAG
ACACTTGTTTGAGAAAA*TTTAAAGATCTTTATG
ACC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1BZ90TF 623 0 0
G
GGGGTTCCGTCTCCTCAGCTAAAAGACGCCGCTCGTTTATTCAGACAGTCTCACCTTCTA
GGATTTGTTCAAGAGAGAA*GGGGGTTTGAAAGATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTCGCC
AAGGGAAAGAAGAAGGGAGTCTCCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAG
ATCGTGGAGATTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAA
GCCGGTGCTCTCGGTGACTCTGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACT
TCTGATGGTCAGTTCTCCAAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAG
CACAACGTGAGGGATTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAG
TTGAGGTACTTCAACATCGCTGAGAACGAGGGTGAGGAAGAAGACTAGAAGAGTTATTAC
TTCTGTTTCGTGTTTCTGTTGTTTTGGTTTCTGCTCGTTGCTGCTCAGTACAATTTATCT
TGGTACTTCTATTGTTTTTTT*GACAGATCTTGTTTAGTTTGGTTGAACTTAAACTTGTT
TCAGACACTTGTTTGAGAAAAA

QA 2 623 2 623
DS 



CO CL59Contig2 615 5 4 U
GCCGGGGGCCGTCTCCTCAGCTAAAAGACGCCGCTCGTCTATTCAGACAGTCTCACCTTC
TAGGATTTGTTCAAGAGAGAAGGGGGTTGAAAGATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTCGCC
AAGGGAAAGAAGAAGGGAGTCTCCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAG
ATCATGGAGATTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAA
GCCGGTGCCCTCGGTGACTCTGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACT
TCTGATGGCCAGTTCTCCAAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAG
CACAATGTGAGGGATTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAG
TTGAGGTACTTCAACATCGCTGAGAACGAGGGTGAGGAAGAAGACTAGAAGAACTACACT
ACTGTTTCTGTTGTTTTGGTTTCTGCTCGTTGCTGCTCAGTACAATTTATCTTGGTCCTC
CTATTGTTTTTTGTCAGATCTTGTTTAGTTTGGTTGAACTTAAACTCTTGTTTCAGACAC
TTTTGTTTGAGAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 

AF RS1G633TF U 17
AF RS1CO96TF U 1
AF RS1DV33TF U 7
AF RS1G247JQ C 17
AF RS1G247TF U 17
BS 1 486 RS1CO96TF
BS 487 487 RS1DV33TF
BS 488 611 RS1CO96TF
BS 612 615 RS1G247JQ

RD RS1G633TF 563 0 0
GG
AGCTAAAAGACGCCGCTCGTCTATTCAGACAGTCTCACCTTCTAGGATTTGTTCAAGAGA
GAAGGGGGTTGAAAGATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTCGCCAAGGGAAAGAAGAAGGGA
GTCTCCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAGATCATGGAGATTGCTTCC
CTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCCGGTGCCCTCGGTGAC
TCTGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACTTCTGATGGCCAGTTCTCC
AAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAATGTGAGGGATTGG
CCCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGAGGTACTTCAACATC
GCTGAGAACGAGGGTGAGGAAGAAGACTAGAAGAACTACACTACTGTTTCTGTTGTTTTG
GTTTCTGCTCGTTGCTGCTCAGTACAATTTATCTTGGTCCTCCTATTGTTTTTTGTCAGA
TCTTGTTTAGTTTGGTTGAAC

QA 3 563 3 563
DS 

RD RS1CO96TF 611 0 0
GCCGGGGGCCGTCTCCTCAGCTAAAAGACGCCGCTCGTCTATTCAGACAGTCTCACCTTC
TAGGATTTGTTCAAGAGAGAAGGGGGTTGAAAGATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTCGCC
AAGGGAAAGAAGAAGGGAGTCTCCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAG
ATCATGGAGATTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAA
GCCGGTGCCCTCGGTGACTCTGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACT
TCTGATGGCCAGTTCTCCAAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAG
CACAATGTGAGGGATTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAG
TTGAGGTACTTCAACATCGCTGAGAACGAGGGTGAGGAAGAAGACTAGAAGAACTACACT
ACTGTTCCTGTTGTTTTGGTTTCTGCTCGTTGCTGCTCAGTACAATTTATCTTGGTCCTC
CTATTGTTTTTTGTCAGATCTTGTTTAGTTTGGTTGAACTTAAACTCTTGTTTCAGACAC
TTTTGTTTGAG

QA 1 611 1 611
DS 

RD RS1DV33TF 607 0 0
GGCCGTCTCCTCAGCTAAAAGACGCCGCTCGTCTATTCAGACAGTCTCACCTTCTAGGAT
TTGTTCAAGGGAGAAGGGGGTTGAAAGATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTCGCCAAGGGA
AAGAAGAAGGGAGTCTCCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAGATCATG
GAGATTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCCGGT
GCCCTCGGTGACTCTGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACTTCTGAT
GGCCAGTTCTCCAAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAAT
GTGAGGGATTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGAGG
TACTTCAACATCGCTGAGAACGAGGGTGAGGAAGAAGACTAGAAGAACTACACTACTGTT
TCTGTTGTTTTGGTTTCTGCTCGTTGCTGCTCAGTACAATTTATCTTGGTCCCCCTATTG
TTTTTTGTCAGATCTTGTTTAGTTTGGTTGAACTTAAACTCTTGTTTCAGACACTTTTGT
TTGAG
AA

QA 1 605 1 605
DS 

RD RS1G247JQ 599 0 0
GG
AGCTAAAAGACGCCGCTCGTCTATTCAGACAGTCTCACCTTCTAGGATTTGTTCAAGAGA
GAAGGGGGTTGAAAGATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTCGCCAAGGGAAAGAAGAAGGGA
GTCTCCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAGATCATGGAGATTGCTTCC
CTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCCGGTGCCCTCGGTGAC
TCTGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACTTCTGATGGCCAGTTCTCC
AAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAATGTGAGGGATTGG
CTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGAGGTACTTCAACATC
GCTGAGAACGAGGGTGAGGAAGAAGACTAGAAGAACTACACTACTGTTTCTGTTGTTTTG
GTTTCTGCTCGTTGCTGCTCAGTACAATTTATCTTGGTCCTCCTATTGTTTTTTGTCAGA
TCTTGTTTAGTTTGGTTGAACTTAAACTCTTGTTTCAGACACTTTTGTTTGAGAAAA

QA 3 599 3 599
DS 

RD RS1G247TF 599 0 0
GG
AGCTAAAAGACGCCGCTCGTCTATTCAGACAGTCTCACCTTCTAGGATTTGTTCAAGAGA
GAAGGGGGTTGAAAGATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTCGCCAAGGGAAAGAAGAAGGGA
GTCTCCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAGATCATGGAGATTGCTTCC
CTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCCGGTGCCCTCGGTGAC
TCTGTCACAATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACTTCTGATGGCCAGTTCTCC
AAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAATGTGAGGGATTGG
CTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGAGGTACTTCAACATC
GCTGAGAACGAGGGTGAGGAAGAAGACTAGAAGAACTACACTACTGTTTCTGTTGTTTTG
GTTTCTGCTCGTTGCTGCTCAGTACAATTTATCTTGGTCCTCCTATTGTTTTTTGTCAGA
TCTTGTTTAGTTTGGTTGAACTTAAACTCTTGTTTCAGACACTTTTGTTTGAG
AAAA

QA 3 595 3 595
DS 



AS 2 16

CO CL60Contig1 660 13 2 U
GGAATACAAGTTTGTAATCTCTAAATACATTTTGTGACCATACAAGTAATCAGTGTTAAG
ATGGAAGGCAAAACTGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGATTTTTGTCATGGCCCATAAT
CAAGTCGAAGCGAAGGTTTGTTGCCCGAGCAAGGAAGCCAGATTAGCATTTTATGTATGT
AATCGTACTAAAGCGACGGCGACTTGTGCACAACTTAATGGATGCATAATCGTTCCTGAG
ACGATATGTCCTTCAGGATATCCATATGGCCATTTCGGAAACTCTGGTAATACTGTCAAT
GGATACTGCAAGCTGGGTTGTGCATCCTCTGTGTGCAGTGACTTAGCCACTCTCCAGGAC
TTGGCTGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCAACGCATGTTCTGAT
TTCTGCACCAAGGGCTCAGCTAATGCAGTTGACACTGCCTAAGAAGCATATCCACAATCT
ATGTATTGTATGTGTTGTTGTTCTCCTTGTTTTCAATAATTGTCGTGTATGTGACAAAAT
GCTAGACTCTTGTTCTATTTCCTGGTTTTCTATGTGACGTAGAAGGTCATCGATCCCTAG
ATTGTTAATCCCTTCTACTTGTTATATATCTAAATAAAGAATAATGTTTCCTTCTAAAAA


BQ
10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 35 70 70 70 70 
70 70 35 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 55 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 40 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 50 45 35 15 10 10 10 10 10 

AF RS1DK66JQ C 346
AF RS1CE81TF U 1
AF RS1H781JQB C 129
AF RS1F995JQ C 156
AF RS1DK66TF U 162
AF RS1F995TF U 156
AF RS1FC07JQ C 128
AF RS1FM57TF U 1
AF RS1FM57JQ C 1
AF RS1DM02TF U 1
AF RS1CW67JQ C 15
AF RS1CW67TF U 15
AF RS1H781TF U 483
BS 1 654 RS1CE81TF
BS 655 660 RS1CW67TF

RD RS1DK66JQ 175 0 0
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AACGCATGTTTTGATTTTTGCACCAAGGGCTCAGCTAATGCAGTTGACACTGCCTAAAAA
GCATATCCACAATCTATGTATTGTATGGGTTGTTGTTCTCCTTGTTTTCAATAAT

QA 1 175 1 175
DS 

RD RS1CE81TF 654 0 0
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ATGGAAGGCAAAACTGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGATTTTTGTCATGGCCCATAAT
CAAGTCGAAGCGAAGGTTTGTTGCCCGAGCAAGGAAGCCAGATTAGCATTTTATGTATGT
AATCGTACTAAAGCGACGGCGACTTGTGCACAACTTAATGGATGCATAATCGTTCCTGAG
ACGATATGTCCTTCAGGATATCCATATGGCCATTTCGGAAACTCTGGTAATACTGTCAAT
GGATACTGCAAGCTGGGTTGTGCATCCTCTGTGTGCAGTGACTTAGCCACTCTCCAGGAC
TTGGCTGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCAACGCATGTTCTGAT
TTCTGCACCAAGGGCTCAGCTAATGCAGTTGACACTGCCTAAGAAGCATATCCACAATCT
ATGTATTGTATGTGTTGTTGTTCTCCTTGTTTTCAATAATTGTCGTGTATGTGACAAAAT
GCTAGACTCTTGTTCTATTTCCTGGTTTTCTATGTGACGTAGAAGGTCATCGATCCCTAG
ATTGTTAATCCCTTCTACTTGTTATATATCTAAATAAAGAATAATGTTTCCTTC

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DS 

RD RS1H781JQB 485 0 0
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TAAAGCGACGGTGACTTGTGCACAACTTAATGGATGCATAATCATTCCTGAGACGATATG
TCCTTCAGGATATCCATATGGCCATTTCGGAAACTCTGGTAATACTGTCAATGGATACTG
CAAGCTGGGTTGTGCATCCTCTGTGTGCAGTGATTTAGCCACTCTCCAGGACTTGGCTGC
AAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCAACGCATGTTCTGATTTCTGCAC
CAAGGGCTCAGCTAATGCAGTTGACACTGCCTAAGAAGCATATCCACAATCTATGTATTG
TATGTGTTGTTGTTCTCCTTGTTTTCAATAATTGTCGTGTATGTGACAAAATGCTAGACT
CTTGTTCTATTTCCTGGTTTTCTATGTGAAGTAGAAGGTCATCGATCCCTAGATTGTTAA
TCCCT

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DS 

RD RS1F995JQ 482 0 0
G
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AATGGATGCATAATCGTTCCTGAGACGATATGTCCTTCAGGATATCCATATGGCCATTTC
GGAAACTCTGGTAATACTGTCAATGGATACTGCAAGCTGGGTTGTGCATCCTCTGTGTGC
AGTGACTTAGCCACTCTCCAGGACTTGGCTGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCA
CAATGCACCAACGCATGTTCTGATTTCTGCACCAAGGGCTCAGCTAATGCAGTTGACACT
GCCTAAGAAGCATATCCACAATCTATGTATTGTATGTGTTGTTGTTCTCCTTGTTTTCAA
TAATTGTCGTGTATGTGACAAAATGCTAGACTCTTGCTCTATTTCCTGGTTTTCTATGTG
ACGTAGAAGGTCATCGTTCCCTAGATTGTTAATCCCTTCTACTTGTTATATATCTAAATA
A

QA 2 482 2 482
DS 

RD RS1DK66TF 491 0 0
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ATGCATAATCGTTCCTGAGACGATATGTCCTTCAGGATATCCATATGGCCATTTCGGAAA
CTCTGGTAATACTGTCAATGGATACTGCAAGCTGGGTTGTGCATCCTCTGTGTGCAGTGA
CTTAGCCACTCTCCAGGACTTGGCTGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATG
CACCAACGCATGTTCTGATTTCTGCACCAAGGGCTCAGCTAATGCAGTTGACACTGCCTA
AGAAGCATATCCACAATCTATGTATTGTATGTGTTGTTGTTCTCCTTGTTTTCAATAATT
GTCGTGTATGTGACAAAATGCTAGACTCTTGTTCTATTTCCTGGTTTTCTATGTGACGTA
TAAGGTCATCGATCCCTAGATTGTTAATCCCTTCTACTTGTTATATATCTAAATAAAGAG
TAATGTTTCCT

QA 1 491 1 491
DS 

RD RS1F995TF 499 0 0
G
GCCAGATTAGCATTTTATGTATGTAATCGTACTAAAGCGACGGCGACTTGTGCACAACTT
AATGGATGCATAATCGTTCCTGAGACGATATGTCCTTCAGGATATCCATATGGCCATTTC
GGAAACTCTGGTAATACTGTCAATGGATACTGCAAGCTGGGTTGTGCATCCTCTGTGTGC
AGTGACTTAGCCACTCTCCAGGACTTGGCTGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCA
CAATGCACCAACGCATGTTCTGATTTCTGCACCAAGGGCTCAGCTAATGCAGTTGACACT
GCCTAAGAAGCATATCCACAATCTATGTATTGTATGTGTTGTTGTTCTCCTTGTTTTCAA
TAATTGTCGTGTATGTGACAAAATGCTAGACTCTTGCTCTATTTCCTGGTTTTCTATGTG
ACGTAGAAGGTCATCGATCCCTAGATTGTTAATCCCTTCTACTTGTTATATATCTAAATA
AAGAATAATGTTTCCTTC

QA 2 499 2 499
DS 

RD RS1FC07JQ 524 0 0
AAGCGAAGGTTTGTTGCCCGAGCAAGGAAGCCAGATTAGCATTTTATGTATGTAATCGTA
CTAAAGCGACGGCGACTTGTGCACAACTTAATGGATGCATAATCGTTCCTGAGACGATAT
GTCCTTCAGGATATCCATATGGCCATTTCGGAAACTCTGGTAATACTGTCAATGGATACT
GCAAGCTGGGTTGTGCATCCTCTGTGTGCAGTGACTTAGCCACTCTCCAGGACTTGGCTG
CAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCAACGCATGTTTTGATTTTTGCA
CCAAGGGCTCAGCTAATGCAGTTGACACTGCCTAAGAAGCATATCCACAATCTATGTATT
GTATGTGTTGTTGTTCTCCTTGTTTTCAATAATTGTCGTGTATGTGACAAAATGCTAGAC
TCTTGTTTTATTTCCTGGTTTTCTATGTGACGTAGAAGGTCATCGATCCCTAGATTGTTA
ATCCCTTCTACTTGTTATATATCTAAATAAAGAATAATGTTTCC

QA 1 524 1 524
DS 

RD RS1FM57TF 606 0 0
GGA
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GTCGAAGCGAAGGTTTGTTGCCCGAGCAAGGAAGCCAGATTAGCATTTTATGTATGTAAT
CGTACTAAAGCGACGGCGACTTGTGCACAACTTAATGGATGCATAATCGTTCCTGAGACG
ATATGTCCTTCAGGATATCCATATGGCCATTTCGGAAACTCTGGTAATACTGTCAATGGA
TACTGCAAGCTGGGTTGTGCATCCTCTGTGTGCAGTGACTTAGCCACTCTCCAGGACTTG
GCTGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCAACGCATGTTCTGATTTC
TGCACCAAGGGCTCAGCTAATGCAGTTGACACTGCCTAAGAAGCATATCCACAATCTATG
TATTGTATGTGTTGTTGTTCTCCTTGTTTTCAATAATTGTCGTGTATGTGACAAAATGCT
AGACTCTTGTTCTATTTCCTTGTTTTCTATGTGACGTAGAAGGTCATCGATCCCTAGATT
GTT

QA 4 606 4 606
DS 

RD RS1FM57JQ 656 0 0
GGA
ATACAAGTTTGTAATCTCTAAATACATTTTGTGACCATACAAGTATTCAGTGTTAAGATG
GAAGGCAAAACTGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGATTTTTGTCATGGCCCATAATCAA
GTCGAAGCGAAGGTTTGTTGCCCGAGCAAGGAAGCCAGATTAGCATTTTATGTATGTAAT
CGTACTAAAGCGACGGCGACTTGTGCACAACTTAATGGATGCATAATCGTTCCTGAGACG
ATATGTCCTTCAGGATATCCATATGGCCATTTCGGAAACTCTGGTAATACTGTCAATGGA
TACTGCAAGCTGGGTTGTGCATCCTCTGTGTGCAGTGACTTAGCCACTCTCCAGGACTTG
GCTGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCAACGCATGTTTTGATTTT
TGCACCAAGGGCTCAGCTAATGCAGTTGACACTGCCTAAGAAGCATATCCACAATCTATG
TATTGTATGTGTTGTTGTTCTCCTTGTTTTCAATAATTGTCGTGTATGTGACAAAATGCT
AGACTCTTGTTCTATTTCCTTGTTTTCTATGTGACGTAGAAGGTCATCGATCCCTAGATT
GTTAATCCCTTTTACTTGTTATATATCTAAATAAAGAATAATGTTTCCTT
TTG

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DS 

RD RS1DM02TF 653 0 0
GGG
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GAAGGCAAAACTGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGATTTTTGTCATGGCCCATAATCAA
GTCGAAGCGAAGGTTTGTTGCCCGAGCAAGGAAGCCAGATTAGCATTTTATGTATGTAAT
CGTACTAAAGCGACGGCGACTTGTGCACAACTTAATGGATGCATAATCGTTCCTGAGACG
ATATGTCCTTCAGGATATCCATATGGCCATTTCGGAAACTCTGGTAATACTGTCAATGGA
TACTGCAAGCTGGGTTGTGCATCCTCTGTGTGCAGTGACTTAGCCACTCTCCAGGACTTG
GCTGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCAACGCATGTTCTGATTTC
TGCACCAAGGGCTCAGCTAATGCAGTTGACACTGCCTAAGAAGCATATCCACAATCTATG
TATTGTATGTGTTGTTGTTCTCCTTGTTTTCAATAATTGTCGTGTATGTGACAAAATGCT
AGACTCTTGTTCTATTTCCTGGTTTTCTATGTGACGTAGAAGGTCATCTATCCCTAGATT
GTTAATCCCTTCTACTTGTTATATATCTAAATAAAGAATGATGTTTCCTT

QA 4 653 4 653
DS 

RD RS1CW67JQ 641 0 0
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TGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGATTTTTGTCATGGCCCATAATCAAGTCGAAGCGAA
GGTTTGTTGCCCGAGCAAGGAAGCCAGATTAGCATTTTATGTATGTAATCGTACTAAAGC
GACGGCGACTTGTGCACAACTTAATGGATGCATAATCGTTCCTGAGACGATATGTCCTTC
AGGATATCCATATGGCCATTTCGGAAACTCTGGTAATACTGTCAATGGATACTGCAAGCT
GGGTTGTGCATCCTCTGTGTGCAGTGACTTAGCCACTCTCCAGGACTTGGCTGCAAGTGA
AATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCAACGCATGTTCTGATTTCTGCACCAAGGG
CTCAGCTAATGCAGTTGACACTGCCTAAGAAGCATATCCACAATCTATGTATTGTATGTG
TTGTTGTTCTCCTTGTTTTCAATAATTGTCGTGTATGTGACAAAATGCTAGACTCTTGTT
CTATTTCCTGGTTTTCTATGTGACGTAGAAGGTCATCGATCCCTAGATTGTTAATCCCTT
CTACTTGTTATATATCTAAATAAAGAATAATGTTTCCTTC
T

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1CW67TF 646 0 0
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TGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGATTTTTGTCATGGCCCATAATCAAGTCGAAGCGAA
GGTTTGTTGCCCGAGCAAGGAAGCCAGATTAGCATTTTATGTATGTAATCGTACTAAAGC
GACGGCGACTTGTGCACAACTTAATGGATGCATAATCGTTCCTGAGACGATATGTCCTTC
AGGATATCCATATGGCCATTTCGGAAACTCTGGTAATACTGTCAATGGATACTGCAAGCT
GGGTTGTGCATCCTCTGTGTGCAGTGACTTAGCCACTCTCCAGGACTTGGCTGCAAGTGA
AATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCAACGCATGTTCTGATTTCTGCACCAAGGG
CTCAGCTAATGCAGTTGACACTGCCTAAGAAGCATATCCACAATCTATGTATTGTATGTG
TTGTTGTTCTCCTTGTTTTCAATAATTGTCGTGTATGTGACAAAATGCTAGACTCTTGTT
CTATTTCCTGGTTTTCTATGTGACGTAGAAGGTCATCGATCCCTAGATTGTTAATCCCTT
CTACTTGTTATATATCTAAATAAAGAATAATGTTTCCTTCTAAAAA

QA 1 646 1 646
DS 

RD RS1H781TF 175 0 0
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TAGACTCTTGTTCTATTTCCTGGTTTTCTATGTGACGTAGAAGGTCATCGATCCCTAGAT
TGTTAATCCCTTCTACTTGTTATATATCTAAATAAAGAATAATGTTTCCTTCT
AA

QA 1 173 1 173
DS 



CO CL60Contig2 710 3 3 U
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GAAGGCAAAAATGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTCTTGTCATGGCGCAGAATCAA
GTCGAAGGAAAGAGTTGTTGCCCGGGCACCACTGCCAGAAACGCATATAATATATGCCGT
CTTACTGGATCCTCTAGGAAAACTTGTGCAAAAATCAGTGGATGCAAAATCGTTTCTGGG
ACAACATGTCCCCAGGGATATCTACATGAAATTATCGAAAACTCTGGTGATGCTGTCAAT
GAATACTGCAAGTTGGGGTGTGCATCCTCTGTGTGTGGTGGCTTAACCACTCTCCAGGAC
TCCGATGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCGACACATGTGCTTAT
TTCTGCACCAAGGGCTCAGCTAAAGCAGTTGAAACGGCCTAACAAGCATATCGTGAAAGT
AGTTGAAACGGCCTAACAAGCATATCCACGATCTATGTGTTGTTGTTCTCCATGTTTTTA
ATAATTGTCGTGTATGTGATAAAATGCTAGACTCTTATACAATTTCCTGGTAGTCTATCT
GACGTAGAAGGTCTTCATCGATCCCTAGATTGTCTATCCCTTCTACTTGCTATATCTAAA
TAAAGAATAATGTTTCCTTCTCGAATATTATCAAAACAATCTCTTGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GI67TF U 1
AF RS1G116TF U 4
AF RS1GI67JQ C 115
BS 1 576 RS1GI67TF
BS 577 677 RS1G116TF
BS 678 710 RS1GI67JQ

RD RS1GI67TF 577 0 0
GGACCATTACAAGTTTAAGTGCTCTCTCTACGTACCAAATAAGTAATCAGTCTAAAGATG
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TCCGATGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCGACACATGTGCTTAT
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AGTTGAAACGGCCTAACAAGCATATCCACGATCTATGTGTTGTTGTTCTCCATGTTTTTA
ATAATTGTCGTGTATGTGATAAAATGCTAGACTCTT
A

QA 1 576 1 576
DS 

RD RS1G116TF 682 0 0
GG
ATTACAAGTTTAAGTGCTCTCTCTACGTACCAAATAAGTAATCAGTCTAAAGATGGAAGG
CAAAAATGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTCTTGTCATGGCGCAGAATCAAGTCGA
AGGAAAGAGTTGTTGCCCGGGCACCACTGCCAGAAACGCATATAATATATGCCGTCTTAC
TGGATCCTCTAGGAAAACTTGTGCAAAAATCAGTGGATGCAAAATCGTTTCTGGGACAAC
ATGTCCCCAGGGATATCTACATGAAATTATCGAAAACTCTGGTGATGCTGTCAATGAATA
CTGCAAGTTGGGGTGTGCATCCTCTGTGTGTGGTGGCTTAACCACTCTCCAGGACTCCGA
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AAACGGCCTAACAAGCATATCCACGATCTATGTGTTGTTGTTC**CATGTTTTTAATAAT
TGTCGTGTATGTGATAAAATGCTAGACTCTTATACAATTTCCTGGTAGTCTATCTGACGT
AGAAGGTCTTCATCGATCCCTAGATTGTCTATCCCTTCTACTTGCTATATCTAAATAAAG
AATAATGTTTCC
CTAAAAAA

QA 3 674 3 674
DS 

RD RS1GI67JQ 596 0 0
AATCAAGTCGAAGGAAAGAGTTGTTGCCCGGGCACCACTGCCAGAAACGCATATAATATA
TGCCGTCTTACTGGATCCTCTAGGAAAACTTGTGCAAAAATCAGTGGATGCAAAATCGTT
TCTGGGACAACATGTCCCCAGGGATATCTACATGAAATTATCGAAAACTCTGGTGATGCT
GTCAATGAATACTGCAAGTTGGGGTGTGCATCCTCTGTGTGTGGTGGCTTAACCACTCTC
CAGGACTCCGATGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCGACACATGT
GCTTATTTCTGCACCAAGGGCTCAGCTAAAGCAGTTGAAACGGCCTAACAAGCATATCGT
GAAAGTAGTTGAAACGGCCTAACAAGCATATCCACGATCTATGTGTTGTTGTTCTCCATG
TTTTTAATAATTGTCGTGTATGTGATAAAATGCTAGACTCTTATACAATTTCCTGGTAGT
CTATCTGACGTAGAAGGTCTTCATCGATCCCTAGATTGTCTATCCCTTCTACTTGCTATA
TCTAAATAAAGAATAATGTTTCCTTCTCGAATATTATCAAAACAATCTCTTGTTTT

QA 1 596 1 596
DS 



AS 3 14

CO CL61Contig1 657 4 5 U
GGATGCTTGATCGTACTCCTGAAAATCATCTCTGTAACACTCCCTGGCTTTAAGAGGTTT
AGGCTTAAAGGACGTCAGTATCCATGTGTTATACCGTCTGAAGATGGAGAAGTTCATGGA
AAGTTACTAATGGGATTAACAGATGAAGAACTTGAGAATTTAGATACTGTTGAGGGTAAT
GAATATGAGAGAGTGACAGTTGGTGTCGTACGAGAGGACAATTCTGAGAAGATGACTGTG
AAAACATATATATGGATCAATAAAGATGATCCTGATATCGGAGGAGAATGGGATTTTGAG
GAATGGAAACGCCTACACATGAAGGAATTCATAAAGACGTTCAAAGAAATCATGGAATGG
AAGAGGAATCCTCAAGGAAAGGGAAGGGACGAGTTCAACAATGCCCTACGCGATGCTCCT
TCGGTTTGAATGAATCTGTGCTAAGAGTATGTTCTGTGTATCATTTTTCTCCAGATTGCG
AGTATAATAAAACCTAGAGACTGATAGTACTGTGGAGATCAGTGAAAAGGATATAGTGCC
ATATGTTGTCTTGTGGATTGTATTATTGTTCTTATATGGGATTTTGGTATCTATATTTT*
GTATGGTTTGCTTGATGCTAAGACCATCCACAATGGTGGATTGCTCTTGGAATCCTT


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1DA18TF U 1
AF RS1BF08JQ C 1
AF RS1DA18JQ C 492
AF RS1BF08TF U 1
BS 1 2 RS1BF08JQ
BS 3 389 RS1DA18TF
BS 390 599 RS1BF08TF
BS 600 600 RS1BF08JQ
BS 601 657 RS1BF08TF

RD RS1DA18TF 389 0 0
GG
ATGCTTGATCGTACTCCTGAAAATCATCTCTGTAACACTCCCTGGCTTTAAGAGGTTTAG
GCTTAAAGGACGTCAGTATCCATGTGTTATACCGTCTGAAGATGGAGAAGTTCATGGAAA
GTTACTAATGGGATTAACAGATGAAGAACTTGAGAATTTAGATACTGTTGAGGGTAATGA
ATATGAGAGAGTGACAGTTGGTGTCGTACGAGAGGACAATTCTGAGAAGATGACTGTGAA
AACATATATATGGATCAATAAAGATGATCCTGATATCGGAGGAGAATGGGATTTTGAGGA
ATGGAAACGCCTACACATGAAGGAATTCATAAAGACGTTCAAAGAAATCATGGAATGGAA
GAGGAATCCTCAAGGAAAGGGAAGGGA

QA 3 389 3 389
DS 

RD RS1BF08JQ 657 0 0
GGATGCTTGATCGTACTCCTGAAAATCATCTCTGTAACACTCCCTGGCTTTAAGAGGTTT
AGGCTTAAAGGACGTCAGTATCCATGTGTTATACCGTCTGAAGATGGAGAAGTTCATGGA
AAGTTACTAATGGGATTAACAGATGAAGAACTTGAGAATTTAGATACTGTTGAGGGTAAT
GAATATGAGAGAGTGACAGTTGGTGTCGTACGAGAGGACAATTCTGAGAAGATGACTGTG
AAAACATATATATGGATCAATAAAGATGATCCTGATATCGGAGGAGAATGGGATTTTGAG
GAATGGAAACGCCTACACATGAAGGAATTCATAAAGACGTTCAAAGAAATCATGGAATGG
AAGAGGAATCCTCAAGGAAAGGGAAGGGACGAGTTCAACAATGCCCTACGCGATGCTCCT
TCGGTTTGAATGAATCTGTGCTAAGAGTATGTTCTGTGTATCATTTTTTTCCAGATTGCG
AGTATAATAAAACCTAGAGACTGATAGTACTGTGGAGATCAGTGAAAAGGATATAGTGCC
ATATGTTGTCTTGTGGATTGTATTATTGTTCTTATATGGGATTTTGGTATCTATATTTT*
GTATGGTTTGCTTGATGCTAAGACCATCCACAATGGTGGATTGCTCTTGGAATCCTT

QA 1 657 1 657
DS 

RD RS1DA18JQ 166 0 0
ACCTAGAGACTGATAGTACTGTGGAGATCAGTGAAAAGGATATAGTGCCATATGTTGTCT
TGTGGATTGTATTATTGTTCTTATATGGGATTTTGGTATCTATATTTT*GTATGGTTTGC
TTGATGCTAAGACCATCCACAATGGTGGATTGCTCTTGGAATCCTT

QA 1 166 1 166
DS 

RD RS1BF08TF 657 0 0
GG
ATGCTTGATCGTACTCCTGAAAATCATCTCTGTAACACTCCCTGGCTTTAAGAGGTTTAG
GCTTAAAGGACGTCAGTATCCATGTGTTATACCGTCTGAAGATGGAGAAGTTCATGGAAA
GTTACTAATGGGATTAACAGATGAAGAACTTGAGAATTTAGATACTGTTGAGGGTAATGA
ATATGAGAGAGTGACAGTTGGTGTCGTACGAGAGGACAATTCTGAGAAGATGACTGTGAA
AACATATATATGGATCAATAAAGATGATCCTGATATCGGAGGAGAATGGGATTTTGAGGA
ATGGAAACGCCTACACATGAAGGAATTCATAAAGACGTTCAAAGAAATCATGGAATGGAA
GAGGAATCCTCAAGGAAAGGGAAGGGACGAGTTCAACAATGCCCTACGCGATGCTCCTTC
GGTTTGAATGAATCTGTGCTAAGAGTATGTTCTGTGTATCATTTTTCTCCAGATTGCGAG
TATAATAAAACCTAGAGACTGATAGTACTGTGGAGATCAGTGAAAAGGATATAGTGCCAT
ATGTTGTCTTGTGGATTGTATTATTGTTCTTATATGGGATTTTGGTATCTATATTTTTGT
ATGGTTTGCTTGATGCTAAGACCATCCACAATGGTGGATTGCTCTTGGAATCCTT

QA 3 657 3 657
DS 



CO CL61Contig2 787 4 10 U
ACAAACTTAAACAAAGGCATAAGCATTAGCATCAAGCAAACCATACAAAATATAGATACC
AAAATCCCATATAAGCACAAAATAATACAATCTACAAGATAACAAATGGCACTATATCCT
TTTCACTGATCTCCACAATACTATCAGTCTCTAGGTTTTATTATACTCGGAATCTGGAGA
AAAATGATACATAGAAGTAGAACATACTCCTAACACAGATTTCATTCAAAACGAAGGAGC
ATCGCGTAGGGCATTGTTGAAGACGTCCCTTCCCTTTCCTTGAGGATTCCTCTTCCATCC
CATGATTTTTTTGAACGTCTCTATGAATTCCTTCATGTGTAGTCGTTTCCATTCCTCAAA
ATCCCATTCTCCTCCGATATCAGGATCATCTTTATTGATCCATATATATGTTTCCACAGT
CATCTTCTCAAAATTGTCCTCTCGTACAACACCAACTGTCACCCTCTCATATTCATTACC
CTCGACAGCATCTAAATTCTCAAGTTCTTCATCCGTTAATCCCATTAATAACTTTCCATG
AACTTCTCCATCTTCAGACGGTATAACACATGGATACAAACGTCCATTAAGCCTAAACCT
CTTAAAGCCAGGGAGTGTTGCAAAGATGGTTTCAGGAGTACGATCAAGCATGACCTTGAC
GACCTCAGGCTCCTGAAAGCTACCATAGACGAAAACATTGTGAAGCTGCGCACCGGAGCC
ACTCATTTTTCTTCTCTCTTCAGTCTTTTTTTTTTTTGCTTTATTTGCTTCTGCTGTTTC
TTTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1B678JQ U 2
AF RS1EQ76JQ U 1
AF RS1EQ76TF C 1
AF RS1B678TF C 122
BS 1 196 RS1EQ76JQ
BS 197 202 RS1B678JQ
BS 203 298 RS1EQ76JQ
BS 299 299 RS1B678JQ
BS 300 311 RS1EQ76JQ
BS 312 312 RS1B678JQ
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BS 587 686 RS1EQ76JQ
BS 687 787 RS1EQ76TF

RD RS1B678JQ 625 0 0
GAAACTTAA
ACAAAGGGATAAGCATTAGCATCAAGCAAACCATACAAACTATAGATACCAAAATCCCAT
ATAAGCACAAAATAATACAATCTACAAGATAACAAATGGCACTATATCCTTTTCACTGAT
CTCCACAATACTATCAGTCTCTAGGTTTTATTATACTCGGAATCTGGAGAAAAATGATAC
ATAGAAGTAGAACATACTCCTAACACAGATTTCATTCAAACCGAAGGAGCATCGCGTAGG
GCATTGTTGAAGACGTCCCTTCCCTTTCCTTGAGGATTCCTCTTCCATCCCATGATTTTT
TTGAACGTCTCTATGAATTCCTTCATGTGTAGTCGTTTCCATTCCTCAAAATCCCATTCT
CCTCCGATATCAGGATCATCTTTATTGATCCATATATATGTTTCCACAGTCATCTTCTCA
AAATTGTCCTCTGGTACAACACCAACTGTCACCCTCTCATATTCATTACCCTCGACAGCA
TCTAAATTCTCAAGTTCTTCATCCGTTAATCCCATTGATAACTTTCCATGAACTTCTCCA
TCTTCAGACGGTATAACACATGGATACAAACGTCCATTAAGCCTAAACCTCTTAAAGCCA
GGGAGTGTTGCAAAGA

QA 10 625 10 625
DS 

RD RS1EQ76JQ 686 0 0
ACAAACTTAAACAAAGGCATAAGCATTAGCATCAAGCAAACCATACAAAATATAGATACC
AAAATCCCATATAAGCACAAAATAATACAATCTACAAGATAACAAATGGCACTATATCCT
TTTCACTGATCTCCACAATACTATCAGTCTCTAGGTTTTATTATACTCGGAATCTGGAGA
AAAATGATACATAGAA******CATACTCCTAACACAGATTTCATTCAAAACGAAGGAGC
ATCGCGTAGGGCATTGTTGAAGACGTCCCTTCCCTTTCCTTGAGGATTCCTCTTCCATTC
CATGATTTTTT*GAACGTCTCTATGAATTCCTTCATGTGTAGTCGTTTCCATTCCTCAAA
ATCCCATTCTCCTCCGATATCAGGATCATCTTTATTGATCCATATATATGTTTCCACAGT
CATCTTCTCAAAATTGTCCTCTCGTACAACACCAACTGTCACCCTCTCATATTCATTACC
CTCGACAGCATCTAAATTCTCAAGTTCTTCATCCGTTAATCCCATTAATAACTTTCCATG
AACTTCTCCATCTTCAGACGGTATAACACATGGATACAAACGTCCTTTAAGCCTAAACCT
CTTAAAGCCAGGGAGTGTTGCAAAGATGGTTTCAGGAGTACGATCAAGCATGACCTTGAC
GACCTCAGGCTCCTGAAAGCTACCAT

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1EQ76TF 787 0 0
ACAAACTTAA
ACAAAGGCATAAGCATTAGCATCAAGCAAACCATACAAAATATAGATACCAAAATCCCAT
ATAAGCACAAAATAATACAATCTACAAGATAACAAATGGCACTATATCCTTTTCACTGAT
CTCCACAATACTATCAGTCTCTAGGTTTTATTATACTCGGAATCTGGAGAAAAATGATAC
ATAGAA******CATACTCCTAACACAGATTTCATTCAAAACGAAGGAGCATCGCGTAGG
GCATTGTTGAAGACGTCCCTTCCCTTTCCTTGAGGATTCCTCTTCCATTCCATGATTTTT
T*GAACGTCTCTATGAATTCCTTCATGTGTAGTCGTTTCCATTCCTCAAAATCCCATTCT
CCTCCGATATCAGGATCATCTTTATTGATCCATATATATGTTTCCACAGTCATCTTCTCA
AAATTGTCCTCTCGTACAACACCAACTGTCACCCTCTCATATTCATTACCCTCGACAGCA
TCTAAATTCTCAAGTTCTTCATCCGTTAATCCCATTAATAACTTTCCATGAACTTCTCCA
TCTTCAGACGGTATAACACATGGATACAAACGTCCTTTAAGCCTAAACCTCTTAAAGCCA
GGGAGTGTTGCAAAGATGGTTTCAGGAGTACGATCAAGCATGACCTTGACGACCTCAGGC
TCCTGAAAGCTACCATAGACGAAAACATTGTGAAGCTGCGCACCGGAGCCACTCATTTTT
CTTCTCTCTTCAGTCTTTTTTTTTTTTGCTTTATTTGCTTCTGCTGTTTCTTTATCC

QA 11 787 11 787
DS 

RD RS1B678TF 666 0 0
TTCACTGATCTCCACAATACTATCAGTCTCTAGGTTTTATTATACTCGGAATCTGGAGAA
AAATGATACATAGAAGTAGAACATACTCCTAACACAGATTTCATTCAAACCGAAGGAGCA
TCGCGTAGGGCATTGTTGAAGACGTCCCTTCCCTTTCCTTGAGGATTCCTCTTCCATCCC
ATGATTTTTTTGAACGTCTCTATGAATTCCTTCATGTGTAGTCGTTTCCATTCCTCAAAA
TCCCATTCTCCTCCGATATCAGGATCATCTTTATTGATCCATATATATGTTTCCACAGTC
ATCTTCTCAAAATTGTCCTCTGGTACAACACCAACTGTCACCCTCTCATATTCATTACCC
TCGACAGCATCTAAATTCTCAAGTTCTTCATCCGTTAATCCCATTGATAACTTTCCATGA
ACTTCTCCATCTTCAGACGGTATAACACATGGATACAAACGTCCATTAAGCCTAAACCTC
TTAAAGCCAGGGAGTGTTGCAAAGATGGTTTCAGGAGTACGATCAAGCATGACCTTGACG
ACCTCAGGCTCCTGAAAGCTACCATAGACGAAAACATTGTGAAGCTGCGCACCGGAGCCA
CTCATTTTTCTTCTCTCTTCAGTCTTTTTTTTTTT*GCTTTATTTGCTTCTGCTGTTTCT
TTATCC

QA 1 666 1 666
DS 



CO CL61Contig3 800 6 11 U
GGAACACAAGCAAATAAAGCAAAAACAAATCTGAAGAGAAAATAAAAATGAGTGGCTCGG
GTGCGCAGCTTCACAATGTTTTCGTCTATGGTAGCTTTCAGGAGCCTGAGGTGGCCAAGG
TCATGCTTGATCGTACTCCTGAAATCATCTCTGTAACACTCCCTGGCTTTAAGAGGTTTA
GGCTTAAAGGACGTTTGTATCCATGTGTTATACCGTCTGAAGATGGAGAAGTTCATGGAA
AGTTACTAATGGGATTAACGGATGAAGAACTTGGGCATTTAGATACTGTTGAGGGTAATG
AATATGAGAGAGTGACAGTTGGTGTCGTACGAGAGGACAACTCTGAGAAGATGACTGTCA
AAACATATATATGGATCAATAAAGATGATCCTGATATTGGGGGAGAATGGGATTTTGAGG
AATGGAAACGACTACACATGAAGGAATTCATAGAGACATTTAAAGAAATCATGGAATGGA
AGAGGAATCCTCAAGGAAAGGGAAGGGACGAGTTCAGCAAGGCCCTACGCGATGCTCCTT
CGGTTTGAATGAAATCTGTGTTAAGAGTATGTTCTATGTATCATTTTTCTCCAGTTTCCG
AGTATAATAAAACCTAGAGACTGATAGTATTGTGGAGATCAGTGAAAAGGATATAGTGCC
ATATGTTATCTTGTGGATTTTGTATTATTGTGCTTATATGGGATTTTGGTATCTATATTT
TGTATGGTTTGCTTGATGCTAATGCTTATGCCTTTGTGACATTTGAGAAGTCATGTGAAT
TTGATAAGTCATGTGAAGTC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DL28TF U 2
AF RS1EW56JQ C 506
AF RS1GD93TF U 1
AF RS1GD93JQ C 90
AF RS1EW56TF U 73
AF RS1DL28JQ C 46
BS 1 182 RS1GD93TF
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GGT
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GCAGCTTCACAATGTTTTCGTCTATGGTAGCTTTCAGGAGCCTGAGGTGGCCAAGGTCAT
GCTTGATCGTACTCCTGAAATCATCTCTGTAACACTCCCTGGCTTTAAGAGGTTTAGGCT
TAAAGGACGTTTGTATCCATGTGTTATACCGTCTGAAGATGGAGAAGT*CATGGAAAGT*
ACTAATGGGATTAACGGATGAAGAACTTG

QA 4 272 4 272
DS 

RD RS1EW56JQ 130 0 0
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AGTATTGTGG

QA 1 130 1 130
DS 

RD RS1GD93TF 713 0 0
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GTGCGCAGCTTCACAATGTTTTCGTCTATGGTAGCTTTCAGGAGCCTGAGGTGGCCAAGG
TCATGCTTGATCGTACTCCTGAAATCATCTCTGTAACACTCCCTGGCTTTAAGAGGTTTA
GGTTTAAAGGACGTTTGTATCCATGTGTTATACCGTCTGAAGATGGAGAAGTTCATGGAA
AGTTACTAATGGGATTAACGGATGAAGAACTTGGGCATTTAGATACTGTTGAGGGTAATG
AATATGAGAGAGTGACAGTTGGTGTCGTACGAGAGGACAACTCTGAGAAGATGACTGTCA
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AATGGAAACGACTACACATGAAGGAATTCATAGAGACATTTAAAGAAATCATGGAATGGA
AGAGGGATCCTCAAGGAAAGGGAAGGGACGAGTTCAGCAAGGCCCTACGCGATGCTCCTT
CGGTTTGAATGAAATCTGTGTTAAGAGTATGTTCTATGTATCATTTTTCTCCAGTTTCCG
AGTATAATAAAACCTAGAGACTGATAGTATTGTGGAGATCAGTGAAAAGGATATAGTGCC
ATATGTTATCTTGTGGATTTTGTATTATTGTGCTTATATGGGATTTTGGTATC

QA 1 713 1 713
DS 

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TCTGTAACACTCCCTGGCTTTAAGAGGTTTAGGTTTAAAGGACGTTTGTATCCATGTGTT
ATACCGTCTGAAGATGGAGAAGTTCATGGAAAGTTACTAATGGGATTAACGGATGAAGAA
CTTGGGCATTTAGATACTGTTGAGGGTAATGAATATGAGAGAGTGACAGTTGGTGTCGTA
CGAGAGGACAACTCTGAGAAGATGACTGTCAAAACATATATATGGATCAATAAAGATGAT
CCTGATATTGGGGGAGAATGGGATTTTGAGGAATGGAAACGACTACACATGAAGGAATTC
ATAGAGACATTTAAAGAAATCATGGAATGGAAGAGGGATCCTCAAGGAAAGGGAAGGGAC
GAGTTCAGCAAGGCCCTACGCGATGCTCCTTCGGTTTGAATGAAATCTGTGTTAAGAGTA
TGTTCTATGTATCATTTTTCTCCAGTTTCCGAGTATAATAAAACCTAGAGACTGATAGTA
TTGTGGAGATCAGTGAAAAGGATATAGTGCCATATGTTATCTTGTGGATTTTGTATTATT
GTGCTTATATGGGATTTTGGTATC

QA 1 624 1 624
DS 

RD RS1EW56TF 710 0 0
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GTACTCCTGAAATCATCTCTGTAACACTCCCTGGCTTTAAGAGGTTTAGGCTTAAAGGAC
GTTTGTATCCATGTGTTATACCGTCTGAAGATGGAGAAGTTCATGGAAAGTTACTAATGG
GATTAACGGATGAAGAACTTGGGCATTTAGATACTGTTGAGGGTAATGAATATGAGAGAG
TGACAGTTGGTGTCGTACGAGAGGACAACTCTGAGAAGATGACTGTCAAAACATATATAT
GGATCAATAAAGATGATCCTGATATTGGGGGAGAATGGGATTT*GAGGAATGGAAACGAC
TACACATGAAGGAATTCATAGAGACATTTAAAGAAATCATGGAATGGAAGAGGAATCCTC
GAGGAAAGGGAAGGGACGAGTTCAGCAAGGCCCTACGCGATGCTCCTTCGGTTTGAATGA
AATCTGTGTTAAGAGTATGTTCTATGTATCATTTTTCTCCAGTTTCCGAGTATAATAAAA
CCTAGAGACTGATAGTATTGTGGAGATCAGTGAAAAG*ATATAGTGCCATATGTTACCTT
GTGGATTTTGTATTATTGTGCTTATATGGGATTT*GGTATCTATATTTTGTATGGTTTGC
TTGATGCTA*TGCTTATGCCTTTGTGACATTTGAGA*GTCATGTGA
TTTG

QA 1 706 1 706
DS 

RD RS1DL28JQ 755 0 0
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CTGAGGTGGCCAAGGTCATGCTTGATCGTACTCCTGAAATCATCTCTGTAACACTCCCTG
GCTTTAAGAGGTTTAGGCTTAAAGGACGTTTGTATCCATGTGTTATACCGTCTGAAGATG
GAGAAGTTCATGGAAAGTTACTAATGGGATTAACGGATGAAGAACTTGGGCATTTAGATA
CTGTTGAGGGTAATGAATATGAGAGAGTGACAGTTGGTGTCGTACGAGAGGACAACTCTG
AGAAGATGACTGTCAAAACATATATATGGATCAATAAAGATGATCCTGATATTGGGGGAG
AATGGGATTTTGAGGAATGGAAACGACTACACATGAAGGAATTCATAGAGACATTTAAAG
AAATCATGGAATGGAAGAGGAATCCTCAAGGAAAGGGAAGGGACGAGTTCAGCAAGGCCC
TACGCGATGCTCCTTCGGTTTGAATGAAATCTGTGTTAAGAGTATGTTCTATGTATCATT
TTTCTCCAGTTTCCGAGTATAATAAAACCTAGAGACTGATAGTATTGTGGAGATCAGTGA
AAAGGATATAGTGCCATATGTTATCTTGTGGATTTTGTATTATTGTGCTTATATGGGATT
TTGGTATCTATATTTTGTATGGTTTGCTTGATGCTAATGCTTATGCCTTTGTGACATTTG
AGAAGTCATGTGAATTTGATAAGTCATGTGAAGTC

QA 1 755 1 755
DS 



AS 2 16

CO CL62Contig1 823 6 15 U
TTTTTTCTTCCAATCTCCGATTTCGCAGGAAGCTTTCTTCTACTCTTTAAAAAATGGCGG
GATACGATTGTGTGCCGATGAGGATGAAGAGGAAGGAGATTGACCGAGTGAACGACGACT
T*CTCCGATTTCTCCCTCTCTTCTCCCGCCACTAAGATTCGCCGTCTCGATTTGGATTTA
CCTCCGATTATGGAGGAAGAGGTGGTTATGGAGGATGATATCCAGTCTCCTCCTCCTGAA
AACGAACAGAGAGCGATTGTGCTTTTCAAGCCTCCTCCTCCTCCTCTACTTCACCAGCCT
AACCTTTTCGTTGATCGAAGCTTGATCTCAGGGTTGAGGAATAGATTTCTTCACGATGTA
GCAGTAGCTGATGAAGATTACAAAACTAACAAGCAACAAGCTGTTGTTCCCTGGAACCCA
TCTCAGTTCCAGTTTTTGGAATCCGCTGGAACCTTCCAGGAACCATCTAAGCCAGAGATC
GTTGAGCTAGATGGTGATGATACGATGATGGAAGAAGCAGACATGGATGTCGAAGATAAA
GGAAGAATCAGCATCACTAGCAGTAGTGTTTCTCTGCAACAGCCGCAGCAGCTTCATCAC
TGTATGATGCCTCAGCAGCTTCCCCAAACAAACTCTACTCCCATCTCTTGGTTCCGATGA
ACTTGTATGTTTGGGTTACATAGAAGCAGTGTTTGTCATCAGTAGTTTTCTAGCTGTATA
TTTGGACTCTTTCGCTACGTGTTTAAATGTGAATCTTCGCGGATTTAATGCAAGTTGATG
AGTTTTTGGTAAGAGTAATGAATATGAAAGAGTAAGTTAGCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 0 0 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 10 25 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H624TF U 1
AF RS1B478TF U 7
AF RS1DZ50TF U 1
AF RS1AR29JQ C 7
AF RS1AR29TFB U 7
AF RS1B478JQ C 290
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RD RS1H624TF 690 0 0
TTTTTT
CTTCCAATCTCCGATTTCGCAGGAAGCTTTCTTCTACTCTTTAAAAAATGGCGGGATACG
ATTGTGTGCCGATGAGGATGAAGAGGAAGGAGATTGACCGAGTGAACGACGACTT*CTCC
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ATTATGGAGGAAGAGGTGGTTATGGAGGATGATATCCAGTCTCCTCCTCCTGAAAACGAA
CAGAGAGCGGTTGTGCTTTTCAAGCCTCCTCCTCCTCCTCTACTTCACCAGCCTAACCTT
TTCGTTGATCGAAGCTTGATCTCAGGGTTGAGGAATAGATTTCTTCACGATGTAGCAGTA
GCTGATGAAGATTACAAAACTAACAAGCAACAAGCTGTTGTTCCCTGGAACCCATCTCAG
TTCCAGTTTTTGGAATCCGCTGGAACCTTCCAGGAACCATCTAAGCCAGAGATCGTTGAG
CTAGATGGTGATGATACGATGATGGAGGAAGCAGACATGGATGTCGAAGATAAAGGAAGA
ATCGGCATCACTAGCAGTAGTGTTTCT**GCAACAGCCGCAGCAGCTTCATCACTGTATG
ATGCCTCAGCAGCTTCCCCAAACAAACTCTACTCCCATCTCTTGGTTCCGATGAACTTGT
ATGTTTGGGTTACATAGAAGCAGT

QA 7 690 7 690
DS 

RD RS1B478TF 751 0 0
CTTCCAATCTCCGATTTCGCAGGAAGCTTTCTTCTACTCTTTAAAAAATGGCGGGATACG
ATTGTGTGCCGATGAGGATGAAGAGGAAGGAGATTGACCGAGTGAACGACGACTT*CTCC
GATTTCTCCCTCTCTTCTCCCGCCACTAAGATTCGCCGTCTCGATTTGGATTTACCTCCG
ATTATGGAGGAAGAGGTGGTTATGGAGGATGATATCCAGTCTCCTCCTCCTGAAAACGAA
CAGAGAGCGATTGTGCTTTTCAAGCCTCCTCCTCCTCCTCTACTTCACCAGCCTAACCTT
TTCGTTGATCGAAGCTTGATCTCAGGGTTGAGGAATAGATTTCTTCACGATGTAGCAGTA
GCTGATGAAGATTACAAAACTAACAAGCAACAAGCTGTTGTTCCCTGGAACCCATCTCAG
TTCCAGTTTTTGGAATCCGCTGGAACCTTCCAGGAACCATCTAAGCCAGAGATCGTTGAG
CTAGATGGTGATGATACGATGATGGAAGAAGCAGACATGGATGTCGAAGATAAAGGAAGA
ATCAGCATCACTAGCAGTAGTGTTTCTCTGCAACAGTCGCAGCAGCTTCATCACTGTATG
ATGCCTCAGCAGCTTCCCCAAACAAACTCTACTCCCATCTCTTGGT*CCGATGAACTTGT
ATGTTTGGGT*ACATAGAAGCAGTGTTTGTCATCAGTAGTTTTCTAGCTGTAT*TTTGGA
CTCTTTCGCTACGTGTTTAA*TGTGA*TCTT

QA 1 751 1 751
DS 

RD RS1DZ50TF 784 0 0
TTTTTTCTTCCAATCTCCGATTTCGCAGGAAGCTTTCTTCTACTCTTTAAAAAATGGCGG
GATACGATTGTGTGCCGATGAGGATGAAGAGGAAGGAGATTGACCGAGTGAACGACGACT
T*CTCCGATTTCTCCCTCTCTTCTCCCGCCACTAAGATTCGCTGTCTCGATTTGGATTTA
CCTCCGATTATGGAGGAAGAGGTGGTTATGGAGGATGATATCCAGTCTCCTCCTCCTGAA
AACGAACAGAGAGCGATTGTGCTTTTCAAGCCTCCTCCTCCTCCTCTACTTCACCAGCCT
AACCTTTTCGTTGATCGAAGCTTGATCTCAGGGTTGAGGAATAGATTTCTTCACGATGTA
GCAGTAGCTGATGAAGATTACAAAACTAACAAGCAACAAGCTGTTGTTCCCTGGAACCCA
TCTCAGTTCCAGTTTTTGGAATCCGCTGGAACCTTCCAGGAACCATCTAAGCCAGAGATC
GTTGAGCCAGATGGTGATGATACGATGATGGAAGAAGCAGACATGGATGTCGAAGATAAA
GGAAGAATCAGCATCACTAGCAGTAGTGTTTCTCTGCAACAGCCGCAGCAGCTTCATCAC
TGTATGATGCCTCAGCAGCTTCTCCAAACAAACTCTACTCCCATCTCTTGGTTCCGATGA
ACTTGTATGTTTGGGTTACATAGAAGCAGTGTTTGTCATCAGTAGTTTTCTAGCTGTATA
TTTGGACTCTTTCGCTACGTGTTTAA*TGTGA*TCTTCGCGGATTTA*TGCAAGTTGATG
AGTT

QA 1 784 1 784
DS 

RD RS1AR29JQ 787 0 0
CTTCCAATCTCCGATTTCGCAGGAAGCTTTCTTCTACTCTTTAAAAAATGGCGGGATACG
ATTGTGTGCCGATGAGGATGAAGAGGAAGGAGATTGACCGAGTGAACGACGACTTTCTCC
GATTTCTCCCTCTCTTCTCCCGCCACTAAGATTCGCCGTCTCGATTTGGATTTACCTCCG
ATTATGGAGGAAGAGGTGGTTATGGAGGATGATATCCAGTCTCCTCCTCCTGAAAACGAA
CGGAGAGCGATTGTGCTTTTCAAGCCTCCTCCTCCTC***TACTTCACCAGCCTAACCTT
TTCGTTGATCGAAGCTTGATCTCAGGGTTGAGGAATAGATTTCTTCACGATGTAGCAGTA
GCTGATGAAGATTACAAAACTAACAAGCAACAAGCTGTTGTTCCCTGGAACCCATCTCAG
TTCCAGTTTTTGGAATCCGCTGGAACCTTCCAGGAACCATCTAAGCCAGAGATCGTTGAG
CTAGATGGTGATGATACGATGATGGAAGAAGCAGACATGGATGTCGAAGATAAAGGAAGA
ATCAGCATCACTAGCAGTAGTGTTTCTCTGCAACAGCCGCAGCAGCTTCATCACTGTATG
ATGCCTCAGCAGCTTCCCCAAACAAACTCTACTCCCATCTCTTGGTTCCGATGAACTTGT
ATGTTTGGGTTACATAGAAGCAGTGTTTGTCATCAGTAGTTTTCTAGCTGTATATTTGGA
CTCTTTCGCTACGTGTTTAAATGTGAATCTTCGCGGATTTAATGCAAGTTGATGAGTTTT
TGGTAAG

QA 1 787 1 787
DS 

RD RS1AR29TFB 790 0 0
CTTCCAATCTCCGATTTCGCAGGAAGCTTTCTTCTACTCTTTAAAAAATGGCGGGATACG
ATTGTGTGCCGATGAGGATGAAGAGGAAGGAGATTGACCGAGTGAACGACGACTT*CTCC
GATTTCTCCCTCTCTTCTCCCGCCACTAAGATTCGCCGTCTCGATTTGGATTTACCTCCG
ATTATGGAGGAAGAGGTGGTTATGGAGGATGATATCCAGTCTCCTCCTCCTGAAAACGAA
CGGAGAGCGATTGTGCTTTTCAAGCCTCCTCCTCCTC***TACTTCACCAGCCTAACCTT
TTCGTTGATCGAAGCTTGATCTCAGGGTTGAGGAATAGATTTCTTCACGATGTAGCAGTA
GCTGATGAAGATTACAAAACTAACAAGCAACAAGCTGTTGTTCCCTGGAACCCATCTCAG
TTCCAGTTTTTGGAATCCGCTGGAACCTTCCAGGAACCATCTAAGCCAGAGATCGTTGAG
CTAGATGGTGATGATACGATGATGGAAGAAGCAGACATGGATGTCGAAGATAAAGGAAGA
ATCAGCATCACTAGCAGTAGTGTTTCTCTGCAACAGCCGCAGCAGCTTCATCACTGTATG
ATGCCTCAGCAGCTTCCCCAAACAAACTCTACTCCCATCTCTTGGTTCCGATGAACTTGT
ATGTTTGGGTTACATAGAAGCAGTGTTTGTCATCAGTAGTTTTCTAGCTGTATATTTGGA
CTCTTTCGCTACGTGTTTAAATGTGAATCTTCGCGGATTTAATGCAAGTTGATGAGTTTT
TGGTAAG
AGT

QA 1 787 1 787
DS 

RD RS1B478JQ 534 0 0
TTCACCAGCCTAACCTTTTCGTTGATCGAAGCTTGATCTCAGGGTTGAGGAATAGATTTT
TTCACGATGTAGCAGTAGCTGATGAAGATTACAAAACTAACAAGCAACAAGCTGTTGTTC
CCTGGAACCCATCTCAGTTCCAGTTTTTGGAATCCGCTGGAACCTTCCAGGAACCATTTA
AGCCAGAGATCGTTGAGCTAGATGGTGATGATACGATGATGGAAGAAGCAGACATGGATG
TCGAAGATAAAGGAAGAATCAGCATCACTAGCAGTAGTGTTTTTTTGCAACAGTCGCAGC
AGCTTCATCACTGTATGATGCCTCAGCAGCTTCCCCAAACAAACTCTACTCCCATCTCTT
GGTTCCGATGAACTTGTATGTTTGGGTTACATAGAAGCAGTGTTTGTCATCAGTAGTTTT
CTAGCTGTATATTTGGACTCTTTCGCTACGTGTTTAAATGTGAATCTTCGCGGATTTAAT
GCAAGTTGATGAGTTTTTGGTAAGAGTAATGAATATGAAAGAGTAAGTTAGCCT

QA 1 534 1 534
DS 



CO CL62Contig2 899 10 17 U
GGTCTTAGAAACTCAACTACTTGCTCTCTGCTTAAAAAAAAAA*TTTAATAAGCTTCGCG
AGCCACATCTTCCCACACTCTTCTTCATTCTTCTGATTTCGCTGGAAAGCTTTGTTCGAC
TCTTGTCAAACATGGCGGGATACGATTGTGTGCCGATGAGGATGAAGAGGAAGGAGATTG
ACCGAGTGAACGACGACTTCTCCGATTTCTCCCTCTCTTCTCCCGCCACTAAGATTCGCC
GTCTCGATTTGGATTTACCTCCGATTATGGAGGAAGAGGTGGTTATGGAGGATGATATCC
AGTCTCCTCCTCAAAACGAAGAGAGAGCGATTGTGCTTTTCAAGCCTCCTCCTCCTCCTC
CTCTACTTCACCAGCCTAACCTTTTCGTTGATCGAAGCTTGATCTCAGGGTTGAGGAATA
GGTTTCTTCATGATGTAGCAGTAGCTGATGAAGATTACAAAGCTAACAAGCAACAAGCTG
TTGTTCCCTGGAACCCATCCCAGTTTCAGTTTTTGGAATCCGCTGGAACCTTCCAGGAAC
CGTCTAAGCCAGAGATTGTTGAGCTAGATGGTGATGATACGATGATGGAAGAAGCAGACA
TGGATGTCGAAGATAAAGGAAGAAGCAGCATCACTAATGGTAGTGTTTCTCTGCAACAGC
CGCAGCAGCTTCTTCACTGTATGATGCCTCAGCAGCTTCCCCAAACAAACTCTACTCCCA
TCTCTTGGTTCCGATGAACTTGTATGTTTGGGTTACATAGAAGCAGTGTTTGTCATCAGT
AGTTTTCTAGCTGTATATTTGGACTCTTTCGCTACGTGTTTAAATGTGATCTTCGCGGAT
TTAATGCAAGTTGATGAGTTTTTGGTAAGAGTAATGAATATGAAAGAGTAAGTTAGCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 15 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 
50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 30 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 
20 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GW29TF U 65
AF RS1E015TF U 1
AF RS1E786TF U 17
AF RS1FR33TF U 17
AF RS1DS25TF U 17
AF RS1DS25JQ C 55
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AF RS1GW29JQ C 434
AF RS1E786JQ C 269
AF RS1FR33JQ C 103
BS 1 620 RS1E015TF
BS 621 621 RS1DS25TF
BS 622 708 RS1E015TF
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BS 801 823 RS1DS25TF
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BS 843 854 RS1DS25TF
BS 855 899 RS1DS25JQ

RD RS1GW29TF 573 0 0
GG
ATCTTCCCACACTCTTCTTCATTCTTCTGATTTCGCTGGAAAGCTTTGTTCGACTCTTGT
CAAACATGGCGGGATACGATTGTGTGCCGATGAGGATGAAGAGGAAGGAGATTTACCGAG
TGAACGACGACTTCTCCGATTTCTCCCTCTCTTCTCCCGCCACTAAGATTCGCCGTCTCG
ATTTGGATTTACCTCCGATTATGGAGGAAGAGGTGGTTATGGAGGATGATATCCAGTCTC
CTCCTCAAAACGAAGAGAGAGCGATTGTGCTTTTCAAGCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTAC
TTCACCAGCCTAACCTTTTCGTTGATCGAAGCTTGATCTCAGGGTTGAGGAATAGGTTTC
TTCATGATGTAGCAGTAGCTGATGAAGATTACAAAGCTAACAAGCAACAAGCTGTTGTTC
CCTGGAACCCATCCCAGTTTCAGTTTTTGGAATCCGCTGGAACCTTCCAGGAACCGTCTA
AGCCAGAGATTGTTGAGCTAGATGGTGATGATACGATGATGGAAGAAGCAGACATGGATG
TCGAAGATAAAGGAAGAAGCAGCATCACTAA

QA 3 573 3 573
DS 

RD RS1E015TF 720 0 0
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AGCCACATCTTCCCACACTCTTCTTCATTCTTCTGATTTCGCTGGAAAGCTTTGTTCGAC
TCTTGTCAAACATGGCGGGATACGATTGTGTGCCGATGAGGATGAAGAGGAAGGAGATTG
ACCGAGTGAACGACGACTTCTCCGATTTCTCCCTCTCTTCTCCCGCCACTAAGATTCGCC
GTCTCGATTTGGATTTACCTCCGATTATGGAGGAAGAGGTGGTTATGGAGGATGATATCC
AGTCTCCTCCTCAAAACGAAGAGAGAGCGATTGTGCTTTTCAAGCCTCCTCCTCCTCCTC
CTCTACTTCACCAGCCTAACCTTTTCGTTGATCGAAGCTTGATCTCAGGGTTGAGGAATA
GGTTTCTTCATGATGTAGCAGTAGCTGATGAAGATTACAAAGCTAACAAGCAACAAGCTG
TTGTTCCCTGGAACCCATCCCAGTTTCAGTTTTTGGAATCCGCTGGAACCTTCCAGGAAC
CGTCTAAGCCAGAGATTGTTGAGCTAGATGGTGATGATACGATGATGGAAGAAGCAGACA
TGGATGTCGAAGATAAAGGA*GAAGCAGCATCACTAATGGTAGTGTTTCTCTGCAACAGC
CGCAGCAGCTTCTTCACTGTATGATGCCTCAGCAGCTTCCCCAAACAA*CTCTACTCC
AT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1E786TF 776 0 0
GG
ACTTGCTCTCTGCTTAAAAAAAAA**TTTAATAAGCTTCGCGAGCCACATCTTCCCACAC
TCTTCTTCATTCTTCTGATTTCGCTGGAAAGCTTTGTTCGACTCTTGTCAAACATGGCGG
GATACGATTGTGTGC*GATGAGGATGAAGAGGAAGGAGATTGACCGAGTGAACGACGACT
TCTCCGATTTCTCCCTCTCTTCTCCCGCCACTAAGATTCGCCGTCTCGATTTGGATTTAC
CTCCGATTATGGAGGAAGAGGTGGTTATGGAGGATGATATCCAGTCTCCTCCTCAAAACG
AAGAGAGAGCGATTGTGCTTTTCAAGCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTACTTCACCAGCCTA
ACCTTTTCGTTGATCGAAGCTTGATCTCAGGGTTGAGGAATAGGTTTCTTCATGATGTAG
CAGTAGCTGATGAAGATTACAAAGCTAACAAGCAACAAGCTGTTGTTCCCTGGAACCCAT
CCCAGTTTCAGTTTTTGGAATCCGCTGGAACCTTCCAGGAACCGTCTAAGCCAGAGATTG
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GAAGAAGCAGCATCACTAATGGTAGTGTTTCTCTGCAACAGCCGCAGCAGCTTCTTCACT
GTATGATGCCTCAGCAGCTTCCCCAAACAAACTCTACTCCCATCTCTTGGTTCCGATGAA
CTTGTATGTTTGGGTTACATAGAAGCAGTGTTTGTCATCAGTAGTTTTCTAGCT

QA 3 776 3 776
DS 

RD RS1FR33TF 822 0 0
GG
ACTTGCTCTCTGCTTAAAAAAAAA**TTTAATAAGCTTCGCGAGCCACATCTTCCCACAC
TCTTCTTCATTCTTCTGATTTCGCTGGAAAGCTTTGTTCGACTCTTGTCAAACATGGCGG
GATACGATTGTGTGC*GATGAGGATGAAGAGGAAGGAGATTGACCGAGTGAACGACGACT
TCTCCGATTTCTCCCTCTCTTCTCCCGCCACTAAGATTCGCCGTCTCGATTTGGATTTAC
CTCCGATTATGGAGGAAGAGGTGGTTATGGAGGATGATATCCAGTCTCCTCCTCAAAACG
AAGAGAGAGCGATTGTGCTTTTCAAGCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTACTTCACCAGCCTA
ACCTTTTCGTTGATCGAAGCTTGATCTCAGGGTTGAGGAATAGGTTTCTTCATGATGTAG
CAGTAGCTGATGAAGATTACAAAGCTAACAAGCAACAAGCTGTTGTTCCCTGGAACCCAT
CCCAGTTTCAGTTTTTGGAATCCGCTGGAACCTTCCAGGAACCGTCTAAGCCAGAGATTG
TTGAGCTAGATGGTGATGATACGATGATGGAAGAAGCAGACATGGATGTCGAAGATAAAG
GAAGAAGCAGCATCACTAATGGTAGTGTTTCTCTGCAACAGCCGCAGCAGCTTCTTCACT
GTATGATGCCTCAGCAGCTTCCCCAAACAAACTCTACTCCCATCTCTTGGTTCCGATGAA
CTTGTATGTTTGGGTTACATAGAAGCAGTGTTTGTCATCAGTAGTTTTCTAGCTGTATAT
T*GGACTCTTTCGCTACGTGTTTAA*TGTGATCTTCGCGG

QA 3 822 3 822
DS 

RD RS1DS25TF 838 0 0
GG
ACTTGCTCTCTGCTTAAAAAAAAAAATTTAATAAGCTTCGCGAGCCACATCTTCCCACAC
TCTTCTTCATTCTTCTGATTTCGCTGGAAAGCTTTGTTCGACTCTTGTCAAACATGGCGG
GATACGATTGTGTGCCGATGAGGATGAAGAGGAAGGAGATTGACCGAGTGAACGACGACT
TCTCCGATTTCTCCCTCTCTTCTCCCGCCACTAAGATTCGCCGTCTCGATTTGGATTTAC
CTCCGATTATGGAGGAAGAGGTGGTTATGGAGGATGATATCCAGTCTCCTCCTCAAAACG
AAGAGAGAGCGATTGTGCTTTTCAAGCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTACTTCACCAGCCTA
ACCTTTTCGTTGATCGAAGCTTGATCTCAGGGTTGAGGAATAGGTTTCTTCATGATGTAG
CAGTAGCTGATGAAGATTACAAAGCTAACAAGCAACAAGCTGTTGTTCCCTGGAACCCAT
CCCAGTTTCAGTTTTTGGAATCCGCTGGAACCTTCCAGGAACCGTCTAAGCCAGAGATTG
TTGAGCTAGATGGTGATGATACGATGATGGAAGAAGCAGACATGGATGTCGAAGATAAAG
GAAGAAGCAGCATCACTAATGGTAGTGTTTCTCTGCAACAGCCGCAGCAGCTTCTTCACT
GTATGATGCCTCAGCAGCTTCCCCAAACAAACTCTACTCCCATCTCTTGGTTCCGATGAA
CTTGTATGTTTGGGT*ACATAGAAGCAGTGTTTGTCATCAGTAGTTTTCTAGCTGTATTT
T*GGACTCTTTCGCTACGTGTTTAA*TGTGATCTTCGCGGATT*AATGCAAGTTGA

QA 3 838 3 838
DS 

RD RS1DS25JQ 845 0 0
TTCGCGAGCCACATCTTCC*ACACTCTTCTTCATT*TTCTGATTTCGCTGGAAAGCTTTG
TTCGACTCTTGTCAAACATGGCGGGATACGATTGTGTGCCGATGAGGATGAAGAGGAAGG
AGATTGACCGAGTGAACGACGACTTCTCCGATTTCTCCCTCTCTTCTCCCGCCACTAAGA
TTCGCCGTCTCGATTTGGATTTACCTCCGATTATGGAGGAAGAGGTGGTTATGGAGGATG
ATATCCAGTCTCCTCCTCAAAACGAAGAGAGAGCGATTGTGCTTTTCAAGCCTCCTCCTC
CTCCTCCTCTACTTCACCAGCCTAACCTTTTCGTTGATCGAAGCTTGATCTCAGGGTTGA
GGAATAGGTTTCTTCATGATGTAGCAGTAGCTGATGAAGATTACAAAGCTAACAAGCAAC
AAGCTGTTGTTCCCTGGAACCCATCCCAGTTTCAGTTTTTGGAATCCGCTGGAACCTTCC
AGGAACCGTCTAAGCCAGAGATTGTTGAGCTAGATGGTGATGATACGATGATGGAAGAAG
CAGACATGGATGTCGAAGATAAAGGAAGAAGCAGCATCACTAATGGTAGTGTTTCTCTGC
AACAGCCGCAGCAGCTTCTTCACTGTATGATGCCTCAGCAGCTTCCCCAAACAAACTCTA
CTCCCATCTCTTGGTTCCGATGAACTTGTATGTTTGGGTTACATAGAAGCAGTGTTTGTC
ATCAGTAGTTTTCTAGCTGTATATTTGGACTCTTTCGCTACGTGTTTAAATGTGATCTTC
GCGGATTTAATGCAAGTTGATGAGTTTTTGGTAAGAGTAATGAATATGAAAGAGTAAGTT
AGCCT

QA 1 845 1 845
DS 

RD RS1E015JQ 812 0 0
C
TCGCGAGCCACATCTTCCCACACTCTTCTTCAT*CTTCTGATTTCGCTGGAAAGCTTTGT
TCGACTCTTGTCAAACATGGCGGGATACGATTGTGTGCCGATGAGGATGAAGAGGAAGGA
GATTGACCGAGTGAACGACGACTTCTCCGATTTCTCCCTCTCTTCTCCCGCCACTAAGAT
TCGCCGTCTCGATTTGGATTTACCTCCGATTATGGAGGAAGAGGTGGTTATGGAGGATGA
TATCCAGTCTCCTCCTCAAAACGAAGAGAGAGCGATTGTGCTTTTCAAGCCTCCTCCTCC
TCCTCCTCTACTTCACCAGCCTAACCTTTTCGTTGATCGAAGCTTGATCTCAGGGTTGAG
GAATAGGTTTCTTCATGATGTAGCAGTAGCTGATGAAGATTACAAAGCTAACAAGCAACA
AGCTGTTGTTCCCTGGAACCCATCCCAGTTTCAGTTTTTGGAATCCGCTGGAACCTTCCA
GGAACCGTTTAAGCCAGAGATTGTTGAGCTAGATGGTGATGATACGATGATGGAAGAAGC
AGACATGGATGTCGAAGATAAAGGAAGAAGCAGCATCACTAATGGTAGTGTTTCTCTGCA
ACAGCCGCAGCAGCTTCTTCACTGTATGATGCCTCAGCAGCTTCCCCAAACAAACTCTAC
TCCCATCTCTTGGTTCCGATGAACTTGTATGTTTGGGTTACATAGAAGCAGTGTTTGTCA
TCAGTAGTTTTCTAGCTGTATATTTGGACTCTTTCGCTACGTGTTTAAATGTGATCTTCG
CGGATTTAATGCAAGTTGATGAGTTTTTGGT

QA 2 812 2 812
DS 

RD RS1GW29JQ 414 0 0
TGTAGCAGTAGCTGATGAAGATTACAAAGCTAACAAGCAACAAGCTGTTGTTCCCTGGAA
CCCATCCCAGTTTCAGTTTTTGGAATCCGCTGGAACCTTCCAGGAACCGTTTAAGCCAGA
GATTGTTGAGCTAGATGGTGATGATACGATGATGGAAGAAGCAGACATGGATGTCGAAGA
TAAAGGAAGAAGCAGCATCACTAATGGTAGTGTTTCTCTGCAACAGCCGCAGCAGCTTTT
TCACTGTATGATGCCTCAGCAGCTTCCCCAAACAAACTCTACTCCCATCTTTTGGTTCCG
ATGAACTTGTATGTTTGGGTTACATAGAAGCAGTGTTTGTCATCAGTAGTTTTCTAGCTG
TATATTTGGACTCTTTCGCTACGTGTTTAAATGTGATCTTCGCGGATTTAATGC

QA 1 414 1 414
DS 

RD RS1E786JQ 598 0 0
GGAGGAAGAGGTGGTTATGGAGGATGATATCCAGTCTCCTCCTCAAAACGAAGAGAGAGC
GATTGTGCTTTTCAAGCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTACTTCACCAGCCTAACCTTTTCGT
TGATCGAAGCTTGATCTCAGGGTTGAGGAATAGGTTTCTTCATGATGTAGCAGTAGCTGA
TGAAGATTACAAAGCTAACAAGCAACAAGCTGTTGTTCCCTGGAACCCATCCCAGTTTCA
GTTTTTGGAATCCGCTGGAACCTTCCAGGAACCGTTTAAGCCAGAGATTGTTGAGCTAGA
TGGTGATGATACGATGATGGAAGAAGCAGACATGGATGTCGAAGATAAAGGAAGAAGCAG
CATCACTAATGGTAGTGTTTTTCTGCAACAGCCGCAGCAGCTTCTTCACTGTATGATGCC
TCAGCAGCTTCCCCAAACAAACTCTACTCCCATCTCTTGGTTCCGATGAACTTGTATGTT
TGGGTTACATAGAAGCAGTGTTTGTCATCAGTAGTTTTCTAGCTGTATATTTGGACTCTT
TCGCTACGTGTTTAAATGTGATCTTCGCGGATTTAATGCAAGTTGATGAGTTTT
CGGC

QA 1 594 1 594
DS 

RD RS1FR33JQ 764 0 0
TGGAAAGCTTTGTTCGACTCTTGTCAAACATGGCGGGATACGATTGTGTGC*GATGAGGA
TGAAGAGGAAGGAGATTGACCGAGTGAACGACGACTTCTCCGATTTCTCCCTCTCTTCTC
CCGCCACTAAGATTCGCCGTCTCGATTTGGATTTACCTCCGATTATGGAGGAAGAGGTGG
TTATGGAGGATGATATCCAGTCTCCTCCTCAAAACGAAGAGAGAGCGATTGTGCTTTTCA
AGCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTACTTCACCAGCCTAACCTTTTCGTTGATCGAAGCTTGA
TCTCAGGGTTGAGGAATAGGTTTCTTCATGATGTAGCAGTAGCTGATGAAGATTACAAAG
CTAACAAGCAACAAGCTGTTGTTCCCTGGAACCCATCCCAGTTTCAGTTTTTGGAATCCG
CTGGAACCTTCCAGGAACCGTTTAAGCCAGAGATTGTTGAGCTAGATGGTGATGATACGA
TGATGGAAGAAGCAGACATGGATGTCGAAGATAAAGGAAGAAGCAGCATCACTAATGGTA
GTGTTTTTTTGCAACAGCCGCAGCAGCTTTTTCACTGTATGATGCCTCAGCAGCTTCCCC
AAACAAACTCTACTCCCATCTCTTGGTTCCGATGAACTTGTATGTTTGGGTTACATAGAA
GCAGTGTTTGTCATCAGTAGTTTTCTAGCTGTATATTTGGACTCTTTCGCTACGTGTTTA
AATGTGATCTTCGCGGATTTAATGCAAGTTGATGAGTTTT
CGGC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 2 9

CO CL63Contig1 833 3 13 U
GGATTGCATCTGGAACAAGCGAGAAGCTCTCTAACAAATGATCAGGTTACACAGCCAAGG
AAAGAATTGAGGTTTGAGAAGCACAACAGAACAAGAGGGATCAAATTGAAACTTGCAGCC
ATGGCGCTTAACCCTCAGTTGATGCCCAATGGGATGCCTGTTCCCTTTGTTAATGAAATG
TTTGTTCTTGCCCGAGATGGGGTTGAGTTTGAAGTCGACAAGATTCCTGGAGGACATGGA
GGTCATGTTAAGGCCAAGGGAGTGATATACTTGTCTAACATTCGGATGGTCTTTGTTGCA
AGCAAGCCTGTTGAGAACTTCGTTGCTTTTGACATGCCTATGCTTTACATCCACGCGGAG
AAATTCAACCAGCCAATATTCCACTGCAACAATATATCTGGACAAGTCGAGCCTGTGGTA
CCTGAGAACGAGCACAGAGCACTGTATTCAACACACAGTTTCAAGATCCTATTTAAGGAA
GGTGGTTGCGGGACGTTTGTTCCTCTTTTCTTGAATCTCATATCATCAGTAAGGCAGTAC
AACAGACAAATGCAACAAGCGGCGGCAGCACCACGTGTTGATCCTCTTCAAGCTGCACAG
ACCCCT*GTTGATGAAATGATGAGACATGCGTACGTGGACCCTAACGATCCAACGAAGAT
ATACCTGCAGCAGCCATCTGGGGAGTCTCAGTTGAGGCGTCGAGCTTACCATTCGAGTGC
GGCGGAGCACTGATGACATAAACACCGAAGATACAAGAGGGTGATGGGGATATGCATGCT
GCAACAGATGTGTGTTGCAAATAAGTAAAAGCGTCGTTGGTTTGTTGGATATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A948TF U 1
AF RS1AH01TF U 45
AF RS1DT10JQ C 435
BS 1 190 RS1A948TF
BS 191 191 RS1AH01TF
BS 192 196 RS1A948TF
BS 197 197 RS1AH01TF
BS 198 264 RS1A948TF
BS 265 265 RS1AH01TF
BS 266 589 RS1A948TF
BS 590 590 RS1AH01TF
BS 591 692 RS1A948TF
BS 693 696 RS1AH01TF
BS 697 697 RS1DT10JQ
BS 698 818 RS1AH01TF
BS 819 833 RS1DT10JQ

RD RS1A948TF 692 0 0
GGATTGCATCTGGAACAAGCGAGAAGCTCTCTAACAAATGATCAGGTTACACAGCCAAGG
AAAGAATTGAGGTTTGAGAAGCACAACAGAACAAGAGGGATCAAATTGAAACTTGCAGCC
ATGGCGCTTAACCCTCAGTTGATGCCCAATGGGATGCCTGTTCCCTTTGTTAATGAAATG
TTTGTTCTTGTCCGAGGTGGGGTTGAGTTTGAAGTCGACAAGATTCCTGGAGGACATGGA
GGTCATGTTAAGGCCAAGGGAGTGGTATACTTGTCTAACATTCGGATGGTCTTTGTTGCA
AGCAAGCCTGTTGAGAACTTCGTTGCTTTTGACATGCCTATGCTTTACATCCACGCGGAG
AAATTCAACCAGCCAATATTCCACTGCAACAATATATCTGGACAAGTCGAGCCTGTGGTA
CCTGAGAACGAGCACAGAGCACTGTATTCAACACACAGTTTCAAGATCCTATTTAAGGAA
GGTGGTTGCGGGACGTTTGTTCCTCTTTTCTTGAATCTCATATCATCAGTAAGGCAGTAC
AACAGACAAATGCAACAAGCGGCGGCAGCACCACGTGTTGATCCTCTTCGAGCTGCACAG
ACCCCT*GTTGATGAAATGATGAGACATGCGTACGTGGACCCTAACGATCCAACGAAGAT
ATACCTGCAGCAGCCATCTGGGGAGTCTCAGT

QA 1 692 1 692
DS 

RD RS1AH01TF 781 0 0
GGTTACACAGCCAAGGAAAGAATTGAGGTTTGAGAAGCACAACAGAACAAGAGGGATCAA
ATTGAAACTTGCAGCCATGGCGCTTAACCCTCAGTTGATGCCCAATGGGATGCCTGTTCC
CTTTGTTAATGAAATGTTTGTTCTTGCCCGAGATGGGGTTGATTTTGAAGTCGACAAGAT
TCCTGGAGGACATGGAGGTCATGTTAAGGCCAAGGGAGTGATATACTTGTCTAACATTCG
GATGGTCTTTGTTGCAAGCAAGCCTGTTGAGAACTTTGTTGCTTTTGACATGCCTATGCT
TTACATCCACGCGGAGAAATTCAACCAGCCAATATTCCACTGCAACAATATATCTGGACA
AGTCGAGCCTGTGGTACCTGAGAACGAGCACAGAGCACTGTATTCAACACACAGTTTCAA
GATCCTATTTAAGGAAGGTGGTTGCGGGACGTTTGTTCCTCTTTTCTTGAATCTCATATC
ATCAGTAAGGCAGTACAACAGACAAATGCAACAAGCGGCGGCAGCACCACGTGTTGATCC
TCTTCAAGCTGCACAGACCCCCCGTTGATGAAATGATGAGACATGCGTACGTGGACCCTA
ACGATCCAACGAAGATATACCTGCAGCAGCCATCTGGGGAGTCTCAGTTGAG*CGTCGAG
CTTACCATTCGAGTGCGGCGGAGCACTGATGACATAAACACCGAAGATACAAGAGGGTGA
TGGGGATATGCATGCTGCAACAGATGTGTGTTGCAAATAAGTAAAAGCGTCGTT
TGGTTTG

QA 1 774 1 774
DS 

RD RS1DT10JQ 399 0 0
CAGAGCACTGTATTCAACACACAGTTTCAAGATCCTATTTAAGGAAGTTGGTTGCGGGAC
GTTTGTTCCTCTTTTCTTGAATCTCATATCATCAGTAAGGCAGTACAACAGACAAATGCA
ACAAGCGGCGGCAGCACCACGTGTTGATCCTCTTCAAGCTGCACAGACCCCT*GTTGATG
AAATGATGAGACATGCGT****GGACCCTAACGATCCAACGAAGATATACCTGCAGCAGC
CATCTGGGGAGTTTCAGTTGAGGCGTCGAGCTTACCATTGGAGTGCGGCGGAGCACTGAT
GACATAAACACCGAAGATACAAGAGGGTGATGGGTATATGCATGCTGCAACAGATGTGTG
TTGCAAATAAGTAAAAGCGTCGTTGGTTTGTTGGATATG

QA 1 399 1 399
DS 



CO CL63Contig2 980 6 7 U
CTGAGCCTTGAACACACTTTTTTACTTTTTAATTATAGAGAAATCCAAATTTTCACATAT
ACATAACCAACAAGTGTTTTTTTTTTCTTTTTCCTGTCAAGGACAGAAAGTGGTTTTAGT
TTTACTTATGTTTGACCAAACCAACAACGCTTTTACTTATTTGCAACAACACACATCTGT
TGCTCTGCTTATCTGTCTGCATACCCACCACCCCCTTGTATCTTCGGTGTTTATGTATCA
TCAATGATCCGCTGCACTCGAATGGTAAGCTCGACGCCTCAACTGAGATTCCCCAGATGG
CTGCTGCAGATATATCTTCGTTGGATCATTAGGGTCCACGTATGCATGTCTCATCATTTC
ATCAACAGGGGTCTGTGCAGCTTGAAGAGGATCAACACGTGGTGCTGCCGCTGCTTGTTG
CATTTGTCTATTGTACTGCCTCACTGACGATATGAGATTCAAGAAGAGAGGAACAAACGT
CCCGCAACCACCTTCCTTGAATAAGATCTTGAAACTGTGTGTTGAATACAGTGCTCTATG
CTCGTTCTCTGGTACCACAGGCTCGACTTGTCCAGATATATTGTTGCAGTGGAATATTGG
CTGGTTGAATTTCTCCGCGTGGATGTAAAGCATAGGCATGTCAAAAGCAACAAAGTTCTC
AACAGGCTTGCTTGCAACAAAGACCATCCGAATGTTAGACAAGTATATCACTCCCTTGGC
CTTAACATGACCTCCATGTCCTCCAGGAATCTTGTCGACTTCAAACTCAACGCCATCCCT
GACGAGAACAAACATTTCATTAACAAAGGGAACAGGCATCCCATTGGGCATCAACTGAGG
GTTAAGCGCCATGGCTGCGGTTTCAATTTGATCAAGCCGAGTACTTGGGTCCCTTCTTGC
TCTGTTGTTGTGCTTCCCAAACCTCAATTCTTCCCTTGCTGTGTAACCTCTAGCGACTTT
TTGATCGGGGAGAAGACGAG


BQ
10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 25 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F063JQ U 3
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TACTTATGTTTGACCAAACCAACAACGCTTTTACTTATTTGCAACAACACACATCTGTTG
CTCTGCTTATCTGTCTGCATACCCACCACCCCCTTGTATCTTCGGTGTTTATGTATCATC
AATGATCCGATGCACTCGAATGGTAAGCTCGACGCCTCAACTGAAATTCCCCAAATGGCT
GCTGCAAATATATCTTCGTTGGATCATTAGGGTCCACGTATGCATGTCTCATCATTTCAT
CAACAGGGGTCTGTGCAGCTTGAAAAGGATCAACACGTGGTGCTGCC
C

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ATAACCAACAAGTGTTTTTTTTTTCTTTTTCCTGTCAAGGACAGAAAGTGGTTTTAGTTT
TACTTATGTTTGACCAAACCAACAACGCTTTTACTTATTTGCAACAACACACATCTGTTG
CTCTGCTTATCTGTCTGCATACCCACCACCCCCTTGTATCTTCGGTGTTTATGTATCATC
AATGATCCGATGCACTCGAATGGTAAGCTCGACGCCTCAACTGAGATTCCCCAGATGGCT
GCTGCAGATATATCTTCGTTGGATCATTAGGGTCCACGTATGCATGTCTCATCATTTCAT
CAACAGGGGTCTGTGCAGCTTGAAGAGGATCAACACGTGGTGCTGCC
C

QA 1 407 1 407
DS 

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TCAAGGACAGAAAGTGGTTTTAGTTTTACTTATGTTTGACCAAACCAACAACGCTTTTAC
TTATTTGCAACAACACACATCTGTTGCTCTGCTTATCTGTCTGCATACCCACCACCCTCT
TGTATCTTCGGTGTTTATGTATCATCAATGATCCGCTGCACTCGAATGGTAAGCTCGACG
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CACGTATGCATGTCTCATCATTTCATCAACAGGGGTCTGTGCAGCTTGAAAAGGATCAAC
ACGTGGTGCTGCCGCTGCTTGTTGCATTTGTCTATTGTACTGCCTCACTGACGATATGAG
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CATGTCAAAAGCAACAAAGTTCTCAACAGGCTTGCTTG

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ACATAACCAACAAGTGTTTTTTTTT*CTTTTTCCTGTCAAGGACAGAAAGTGGTTTTAGT
TTTACTTATGTTTGACCAAACCAACAACGCTTTTACTTATTTGCAACAACACACATCTGT
TGCTCTGCTTATCTGTCTGCATACCCACCACCCTCTTGTATCTTCGGTGTTTATGTATCA
TCAATGATCCGCTGCACTCGAATGGTAAGCTCGACGCCTCAACTGAGATTCCCCAGATGG
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ATCAACAGGGGTCTGTGCAGCTTGAAGAGGATCAACACGTGGTGCTGCCGCTGCTTGTTG
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CCCGCAACCACCTTCCTTGAATAAGATCTTGAAACTGTGTGTTGAATACAGTGCTCTATG
CTCGTTCTCTGGTACCACAGGCTCGACTTGTCCAGATATATTGTTGCAGTGGAATATTGG
CTGGTTGAATTTCTCCGCGTGGATGTAAAGCATAGGCATGTCAAAAGCAACAAAGTTCTC
AACAGGCTTGCTTGCAACAAAGACCATCCGAATGTTAGACAAGTATATCACTCCCTTGGC
CTTAACATGACCTCCATGTCCTCCAGGAATCTTGTCGACTTCAAACTCAACGCCATCCCT
GACGAGA
C

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DS 

RD RS1DP01JQ 798 0 0
GAGCCTTGAACACACTTTTTTACTTTTTAATTATAGAGAAATCCAAATTTTCACATATAC
ATAACCAACAAGTGTTTTTTTT**CTTTTTCCTGTCAAGGACAGAAAGTGGTTTTAGTTT
TACTTATGTTTGACCAAACCAACAACGCTTTTACTTATTTGCAACAACACACATCTGTTG
CTCTGCTTATCTGTCTGCATACCCACCACCCTCTTGTATCTTCGGTGTTTATGTATCATC
AATGATCCGCTGCACTCGAATGGTAAGCTCGACGCCTCAACTGAGATTCCCCAGATGGCT
GCTGCAGATATATCTTCGTTGGATCATTAGGGTCCACGTATGCATGTCTCATCATTTCAT
CAACAGGGGTCTGTGCAGCTTGAAGAGGATCAACACGTGGTGCTGCCGCTGCTTGTTGCA
TTTGTCTATTGTACTGCCTCACTGACGATATGAGATTCAAGAAGAGAGGAACAAACGTCC
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CGTTCTCTGGTACCACAGGCTCGACTTGTCCAGATATATTGTTGCAGTGGAATATTGGCT
GGTTGAATTTCTCCGCGTGGATGTAAAGCATAGGCATGTCAAAAGCAACAAAGTTCTCAA
CAGGCTTGCTTGCAACAAAGACCATCCGAATGTTAGACAAGTATATCACTCCCTTGGCCT
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CGAGAACAAACATTTCAT

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DS 

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CTCTGTATCTCGGTGTTAT
TATCATCAATGATCCGCTGCACTCGAATG*TAAGCTCGACGC*TCAACTGAGAT*CCCCA
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TGTTGCATTTGTCTATTGTACTGCCTCACTGACGATATGAGATTCAAGAAGAGAGGAACA
AACGTCCCGCAACCACCTTCCTTGAATAAGATCTTGAAACTGTGTGTTGAATACAGTGCT
CTATGCTCGTTCTCTGGTACCACAGGCTCGACTTGTCCAGATATATTGTTGCAGTGGAAT
ATTGGCTGGTTGAATTTCTCCGCGTGGATGTAAAGCATAGGCATGTCAAAAGCAACAAAA
TTCTCAACAGGCTTGCTTGCAACAAAGACCATCCGAATGTTAGACAAGTATATCACTCCC
TTGGCCTTAACATGACCTCCATGTCCTCCAGGAATCTTGTCGACTTCAAACTCAACGCCA
TCCCTGACGAGAACAAACATTTCATTAACAAAGGGAACAGGCATCCCATTGGGCATCAAC
TGAGGGTTAAGCGCCATGGCTGCGGTTTCAATTTGATCAAGCCGAGTACTTGGGTCCCTT
CTTGCTCTGTTGTTGTGCTTCCCAAACCTCAATTCTTCCCTTGCTGTGTAACCTCTAGCG
ACTTTTTGATCGGGGAGAAGACGAG

QA 20 764 20 764
DS 



AS 2 12

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AAACACACACACCTCATCACCACCGACCCGATCCGATCTCATCACACTCACACACCATGG
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TCGACATCGTGATCCCAACCATCCGAAACCTCGATTTCCTCGAGATGTGGAGGCCCTTTC
TCCAGCCGTACCATCTCATCATCGTCCAGGACGGAGATCCCACGAAGAAGATCCACGTCC
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AAGCTTCTTGCATCTCCTTCAAGGACTCTGCTTGCCGTTGCTTTGGCTACATGGTCTCTA
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AAGCAGTGAACGCTCTTGAGCAACACATCAAGAATCTTCTCTGTCCATCGACTCCATTGT
TCTTCAACACCTTGTATGATCCTTACCGTGAAGGTGCTGACTTCGTTCGTGGATACCCTT
TCAGTCTTCGTGAAGGTGTTACCACTGCTGTTTCCCATGGTCTCTGGCTCAACATCCCTG
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CTGTGATGACCATCCCAAAGGGAACACTTTTCCCAATGTGTGGTATGAACTTGGCTTTCG
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TGGGAGTGAAGACCGGTCTGCCATACATATACCACAGCAAAGCGAGCAACCCGTTTGTGA
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GGATTTTATGAAGTTCGCTTTTGTTTAGTTGTTACTTATCACCACTTTCTCATCATCCAC
CTGTTTATTTATAAACAGTGGTGGATTTGTAGTGCTATTTATGCTTCTTTTTTTTT*GCT
ATTCCTCCCAACTTTTTTTTCTTCCTTGTTTCATTAATAAAAGCACTTCGCATGATT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 

AF RS1A233TF U 17
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AF RS1AU31TF U 50
AF RS1ES76TF U 545
AF RS1A233TR C 601
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AF RS1A233JQ C 662
AF RS1ES76JQ C 852
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AF RS1CG34TF U 797
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TCACCACCGACCCGATCCGATCTCATCACACTCACACACCATGGTTGACCCGGCGAACAC
CGTTGGAATTCCGGTGAATCCGACGCCGCTGCTGAAAGACGAGCTCGACATCGTGATCCC
AACCATCCGAAACCTCGATTTCCTCGAGATGTGGAGGCCCTTTCTCCAGCCGTACCATCT
CATCATCGTCCAGGACGGAGATCCCACGAAGAAGATCCACGTCCCCGAGGGTTACGACTA
CGAGCTCTACAACAGGAACGACATTAACCGTATCCTCGGCCCCAAAGCTTCTTGCATCTC
CTTCAAGGACTCTGCTTGCCGTTGCTTTGGCTACATGGTCTCTAAGAAGAAGTACATCTT
CACCATTGATGACGATTGCTTCGTTGCTAAGGATCCATCTGGGAAAGCAGTGAACGCTCT
TGAGCAACACATCAAGAATCTTCTCTGTCCATCGACTCCATTGTTCTTCAACACCTTGTA
TGATCCTTACCGTGAAGGTGCTGACTTCGTTCGTGGATACCCTTTCAGTCTTCGTGAAGG
TGTTACCACTGCTGTTTCCCATGGTCTCTGGCTCAACATCCCTGACTACGACGCCCCTAC
CCAACTCGTCAAGCCTA

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DS 

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AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGACTTAAAAA
AAACACACACACCTCATCACCACCGACCCGATCCGATCTCATCACACTCACACACCATGG
TTGACCCGGCGAACACCGTTGGAATTCCGGTGAATCCGACGCCGCTGCTGAAAGACGAGC
TCGACATCGTGATCCCAACCATCCGAAACCTCGATTTCCTCGAGATGTGGAGGCCCTTTC
TCCAGCCGTACCATCTCATCATCGTCCAGGACGGAGATCCCACGAAGAAGATCCACGTCC
CCGAGGGTTACGACTACGAGCTCTACAACAGGAACGACATTAACCGTATCCTCGGCCCCA
AAGCTTCTTGCATCTCCTTCAAGGACTCTGCTTGCCGTTGCTTTGGCTACATGGTCTCTA
AGAAGAAGTACATCTTCACCATTGATGACGATTGCTTCGTTGCTAAGGATCCATCTGGGA
AAGCAGTGAACGCTCTTGAGCAACACATCAAGAATCTTCTCTGTCCATCGACTCCATTGT
TCTTCAACACCTTGTATGATCCTTACCGTGAAGGTGCTGACTTCGTTCGTGGATACCCTT
TCAGTCTTCGTGAAGGTGTTACCACTGCTGTTTCCCATGGTCTCTGGCTCAACATCCCTG
ACTACGACGCCCCTACCCAACTCGTCAAGCCTAAGGAGAGGAACACTAGGTATGTGGATG
CTGTGATGACCATCCCAAAGGGAACACTTTTCCCAATGTGTGGTATGAACTTGGCTTTCG
ACCGTGATTTGATTGGACCAGCTATGTACTTTGGTCTCATGGGTGATGGTCAGCCTATTG
GTCGCTACGACGATATGTGGGCTGGTTGGTGCAT

QA 1 874 1 874
DS 

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GGACTTAAAAAAAACACACACACCTCATCACCACCGACCCGATCCGATCTCATCACACTC
ACACACCATGGTTGACTCGGCGAACACCGTTGGAATTCCGGTGAATCCGACGCCGCTGCT
GAAAGACGAGCTCGACATCGTGATCCCAACCATCCGAAACCTCGATTTTCTCGAGATGTG
GAGGCCCTTTCTCCAGCCGTACCATCTCATCATCGTCCAGGACGGAGATCCCACGAAGAA
GATCCACGTCCCCGAGGGTTACGACTACGAGCTCTACAACAGGAACGACATTAACCGTAT
CCTCGGCCCCAAAGCTTCTTGCATCTCCTTCAAGTACTCTGCTTGCCGTTGCTTTGGCTA
CATGGTCTCTAAGAAGAAGTACATCTTCACCATTGATGACGATTGCTTCGTTGCTAAGGA
TCCATCTGGGAAAGCAGTGAACGCTCTTGAGCAACACATCAAGAATCTTCTCTGTCCATC
GACTCCATTGTTCCTCAACACCTTGTATGATCCTTACCGTGAAGGTGCTGACTTCGTTCG
TGGATACCCTTTCAGTCTTCGTGGAGGTGTTACCACTGCTGTTTCCCATGGTCTCTGGCT
CAACATCCCTGACTACGACGCCCCTACCCAACTCGTCAAGCCTAAG*AGAGGAACACTAG
*TATGTGGATGCTGTGATGACCATCCCAAAGG*AACACTTTTCCCAATGTGTGGTATGAA
CTTGGCTTTCGAC*GTGATT*GAT*GGAC*AGCTATGTACTTTGGTCTCATGGGTGATGG
TCAGCCTAT**GTCGCTACGACGA

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DS 

RD RS1ES76TF 652 0 0
G
AACACCTTGTATGATCCTTACCGTGAAGGCGCTGACTTCGTTCGTGGATACCCTTTCAGT
CTTCGTGAAGGTGTTACCACTGCTGTTTCCCATGGTCTCTGGCTCAACATCCCTGACTAC
GACGCCCCTACCCAACTCGTCAAGCCTAAGGAGAGGAACACTAGGTATGTGGATGCTGTG
ATGACCATCCCAAAGGGAACACTTTTCCCAATGTGTGGTATGAACTTGGCTTTCGACCGT
GATTTTATTGGACCAGCTATGTACTTTGGTCTCATGGGTGATGGTCAGCCTATTGGTCGC
TACGACGATATGTGGGCTGGTTGGTGCATCAAGGTGATATGTGACCACTTGGGGTTGGGA
GTGAAGACCGGTCTGCCATACATATACCACAGCAAAGCGAGCAACCCGTTTGTGAACCTG
AAGAAGGAATACAAGGGAATCTTCTGGCGGGAGGATATCATTCCTTTCTTCCAGAACGTG
AAGCTATCTAAGGAAGCAACCACTGTTCAGCAATGCTACATTGAGCTCTCAAAGATGGTC
AAAGAGAAGCTGAGCTCCCTAGACCCCTACTTTGACAAGCTTGCAGACGCCATGGTCACA
TGGATTGAAGCTTGGGATGAGCTTAACCCACCAGCTACTGCTTGAGCAAAC

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DS 

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TCAGTCTTCGTGAAGGTGTTACCACTGCTGTTTCCCATGGTCTCTGGCTCAACATCCCTG
ACTACGACGCCCCTACCCAACTCGTCAAGCCTAAGGAGAGGAACACTAGGTATGTGGATG
CTGTGATGACCATCCCAAAGGGAACACTTTTCCCAATGTGTGGTATGAACTTGGCTTTCG
ACCGTGATTTGATTGGACCAGCTATGTACTTTGGTCTCATGGGTGATGGTCAGCCTATTG
GTCGCTACGACGATATGTGGGCTGGTTGGTGCATCAAGGTGATATGTGACCACTTGGGGT
TGGGAGTGAAGACCGGTCTGCCATACATATACCACAGCAAAGCGAGCAACCCGTTTGTGA
ACCTGAAGAAGGAATACAAGGGAATCTTCTGGCAGGAGGATATCATTCCTTTCTTCCAGA
ACGTGAAGCTATCTAAGGAAGCAACCACTGTTCAGCAATGCTACATTGAGCTCTCAAAGA
TGGTCAAAGAGAAGCTGAGCTCCCTAGACCCCTACTTTGACAAGCTTGCAGACGCCATGG
TCACATGGATTGAAGCTTGGGATG
TTCTTAA

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DS 

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TGGAGGTG
TACCACTGCTGTTTCCCATGGTCTCTGGCTCAACATCC*TGACTACGACGCCCCTACCCA
ACTCGTCAAGC*TAAGGAGAGGAACACTAGGTATGTGGATGCTGTGATGACCATCCCAAA
GGGAACACTTTTCCCAATGTGTGGTATGAACTTGGCTTTCGACCGTGATTTGATTGGACC
AGCTATGTACTTTGGTCTCATGGGTGATGGTCAGCCTATTGGTCGCTACGACGATATGTG
GGCTGGTTGGTGCATCAAGGTGATATGTGGCCACTTGGGGTTGGGAGTGAAGACCGGTCT
GCCATACATATACCACAGCAAAGCGAGCAACCCGTTTGTGAACCTGAAGAAGGAATACAA
GGGAATCTTCTGGCAGGAGGATATCATTCCTTTCTTCCAGAACGTGAAGCTATCTAAGGA
AGCAACCACTGTTCAGCAATGCTACATTGAGCTCTCAAAGATGGTCAAAGAGAAGCTGAG
CTCCCTATACCCCTACTTTGACAAGCTTGCAGACGCCATGGTCACATGGATTGAAGCTTG
GGATGAGCTTAACCCACCAGCTACTGCTTGAGCAAACCAAAAAAAGACCACCGCAGTTTT
GGTTATTTTTTT**AGCTCAAATTATCTTTTCTATATTTTTGGATTTTATGAAGTTCGCT
TTTGTTTAGTTGTTACTTATCACCACTTTCTCATCATCCACCTGTTTATTTATAAACAGT
GGTGGATTTGTAGTGC
C

QA 9 744 9 744
DS 

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CTACGACGCCCCTACCCAACTCGTCAAGCCTAAGGAGAGGAACACTAGGTATGTGGATGC
TGTGATGACCATCCCAAAGGGAACACTTTTCCCAATGTGTGGTATGAACTTGGCTTTCGA
CCGTGATTTGATTGGACCAGCTATGTACTTTGGTCTCATGGGTGATGGTCAGCCTATTGG
TCGCTACGACGATATGTGGGCTGGTTGGTGCATCAAGGTGATATGTGACCACTTGGGGTT
GGGAGTGAAGACCGGTCTGCCATACATATACCACAGCAAAGCGAGCAACCCGTTTGTGAA
CCTGAAGAAGGAATACAAGGGAATCTTCTGGCAGGAGGATATCATTCCTTTCTTCCAGAA
CGTGAAGCTATCTAAGGAAGCAACCACTGTTCAGCAATGCTACATTGAGCTCTCAAAGAT
GGTCAAAGAGAAGCTGAGCTCCCTAGACCCCTACTTTGACAAGCTTGCAGACGCCATGGT
CACATGGATTGAAGCTTGGGATGATCTTAACCCACCAGCTACTGCTTGAGCAAACCAAAA
AAAGACCACCGCAGTTTTGGTTATTTTTTTT*AGCTCAAATTATCTTTTCTATATTTTTG
GATTTTATGAAGTTCGCTTTTGTTTAGTTGTTACTTATCACCACTTTCTCATCATCCACC
TGTTTATTTATAAACAGTGGTGGATTTGTAGTGCTATTTATGCTTCTTTTTTTTT*GCTA
TTCCTCCCAACTTTTTTTTCTTCCTTGTTTCATTAATAAAAGCACTTCGCATGATT

QA 1 776 1 776
DS 

RD RS1ES76JQ 586 0 0
GATATGTGGGCTGGTTGGTGCATCAAGGTGATATGTGACCACTTGGGGTTGGGAGTGAAG
ACCGGTCTGCCATACATATACCACAGCAAAGCGAGCAACCCGTTTGTGAACCTGAAGAAG
GAATACAAGGGAATTTTCTGGCGGGAGGATATCATTCCTTTTTTCCAGAACGTGAAGCTA
TTTAAGGAAGCAACCACTGTTCAGCAATGCTACATTGAGCTTTCAAAGATGGTCAAAGAG
AAGCTGAGCTCCCTAGACCCCTACTTTGACAAGCTTGCAGACGCCATGGTCACATGGATT
GAAGCTTGGGATGAGCTTAACCCCCCAGCTACTGCTTGAGCAAACCAAAAAAAGACCACC
GCAGTTTTGGTTATTTTTTTTTAGCTCAAATTATTTTTTTTATATTTTTGGATTTTATGA
AGTTCGCTTTTGTTTAGTTGTTACTTATCACCACTTTCTCATCATCCACCTGTTTATTTA
TAAACAGTGGTGGATTTGTAGTGCTATTTATGCTTTTTTTTTTTTCGCTATTCCTCCCAA
CTTTTTTTTTTTCCTTGTTTCATTAATAAAAGCACTTCGCATG
ATT

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DS 

RD RS1CG34JQ 638 0 0
G
CCAGCTATGTACTTTGGTCTCATGGGTGATGGTCAGCCTATTGGTCGCTACGACGATATG
TGGGCTGGTTGGTGCATCAAGGTGATATGTGACCACTTGGGGTTGGGAGTGAAGACCGGT
TTGCCATACATATACCACAGCAAAGCGAGCAACCCGTTTGTGAACCTGAAGAAGGAATAC
AAGGGAATTTTTTGGCAGGAGGATATCATTCCTTTCTTCCAGAACGTGAAGCTATCTAAG
GAAGCAACCACTGTTCAGCAATGCTACATTGAGCTCTCAAAGATGGTCAAAGAGAAGCTG
AGCTCCCTAGACCCCTACTTTGACAAGCTTGCAGACGCCATGGTCACATGGATTGAAGCT
TGGGATGAGCTTAACCCACCAGCTACTGCTTGAGCAAACCAAAAAAAGACCACCGCAGTT
TTGGTTATTTTTTTT*AGCTCAAATTATCTTTTCTATATTTTTGGATTTTATGAAGTTCG
CTTTTGTTTAGTTGTTACTTATCACCACTTTCTCATCATCCACCTGTTTATTTATAAACA
GTGGTGGATTTGTAGTGCTATTTATGCTTCTTTTTTTTT*GCTATTCCTCCCAACTTTTT
TTTCTTCCTTGTTTCATTAATAAAAGCACTTCGCATG

QA 2 638 2 638
DS 

RD RS1CG34TF 638 0 0
G
CCAGCTATGTACTTTGGTCTCATGGGTGATGGTCAGCCTATTGGTCGCTACGACGATATG
TGGGCTGGTTGGTGCATCAAGGTGATATGTGACCACTTGGGGTTGGGAGTGAAGACCGGT
CTGCCATACATATACCACAGCAAAGCGAGCAACCCGTTTGTGAACCTGAAGAAGGAATAC
AAGGGAATCTTCTGGCAGGAGGATATCATTCCTTTCTTCCAGAACGTGAAGCTATCTAAG
GAAGCAACCACTGTTCAGCAATGCTACATTGAGCTCTCAAAGATGGTCAAAGAGAAGCTG
AGCTCCCTAGACCCCTACTTTGACAAGCTTGCAGACGCCATGGTCACATGGATTGAAGCT
TGGGATGAGCTTAACCCACCAGCTACTGCTTGAGCAAACCAAAAAAAGACCACCGCAGTT
TTGGTTATTTTTTTT*AGCTCAAATTATCTTTTCTATATTTTTGGATTTTATGAAGTTCG
CTTTTGTTTAGTTGTTACTTATCACCACTTTCTCATCATCCACCTGTTTATTTATAAACA
GTGGTGGATTTGTAGTGCTATTTATGCTTCTTTTTTTTT*GCTATTCCTCCCAACTTTTT
TTTCTTCCTTGTTTCATTAATAAAAGCACTTCGCATG

QA 2 638 2 638
DS 



CO CL64Contig2 1340 2 2 U
AACAAAGCATCTCTCTCTCTCTCTTCTCCAATTCTCAATCAATCAATCAATAATGGTTGA
ACCGGCGAATACCGTTGGAATCCCGCTGAACCACACCGCGTTGTTGAAGGATGAGCTCGA
CATCGTGATCCCGACGATCCGTAACCTCGATTTCCTCGAGATGTGGAGGCCTTTCCTCCA
GCCTTACCATCTCATCATCGTCCAGGACGGAGATCCTTCCAAGACCATTGCTGTCCCCGA
AGGGTTCGATTACGAGCTCTACAACAGGAACGACATCAACCGTATCCTCGGTCCCAAAGC
TTCCTGCATTTCCTTCAAGGACTCTGCTTGTCGCTGCTTCGGCTACATGGTGTCCAAGAA
GAAGTACATCTTCACTATTGACGACGATTGCTTCGTTGCCAAGGATCCATCTGGAAAAGC
AGTGAACGCACTTGAGCAACACATCAAGAACCTTCTCTGTCCATCGTCTCCGTTTTTCTT
CAACACCTTGTACGACCCATACCGTGAAGGTGCTGATTTCGTCCGTGGATACCCTTTCAG
TCTCCGTGAAGGTGTTTCCACTGCTGTTTCTCACGGTCTCTGGCTCAACATCCCTGATTA
CGATGCCCCAACCCAACTCGTCAAGCCTAAGGAAAGGAACACGAGGTATGTGGATGCTGT
CATGACCATCCCAAAGGGAACACTTTTCCCAATGTGTGGCATGAACTTGGCTTTTGATCG
TGATCTCATTGGCCCGGCTATGTACTTTGGTCTCATGGGTGATGGTCAGCCTATTGGTCG
TTACGACGATATGTGGGCTGGATGGTGTGTCAAGGTAATCTGTGACCATTTAGGATTGGG
AGTGAAGACAGGTCTTCCCTACATTTACCACAGCAAGGCAAGCAACCCATTTGTGAACCT
GAAGAAAGAGTACAAAGGGATTTTCTGGCAGGAGGACATCATCCCTTTCTTCCAGAGCGC
AAAGCTCTCAAAAGAAGCTGTGACGGTTCAACAATGCTACTTGGAGCTGTCCAAGTTGGT
GAAGGAGAAGCTTAGCCCCATTGATCCTTACTTTGACAAGCTCGCTGATGCTATGGTCAC
TTGGATTGAAGCTTGGGATGAGCTTAACCCGGCCACTAAAGCTTGAGCAGCAAAGAAAAA
AAAACTACCACCTCAGTTTTGGTTATTAGCTCAACCTATATCATCTATCCTCCTTACCTT
CCCCGTCTTGTTTTATCTCATTTTCCGGCGAATTCTTCAGTAAGTCGCCGGAGTTTATTT
AAGTAGTGATGGTGTAGTTCTATTTTAAGATCCGAGACAATCTATCCTCTGAGCCTTTTG
TCTTTGTTTCAATAATAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BU48TF U 1
AF RS1AL38JQ C 536
BS 1 609 RS1BU48TF
BS 610 1340 RS1AL38JQ

RD RS1BU48TF 614 0 0
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ACCGGCGAATACCGTTGGAATCCCGCTGAACCACACCGCGTTGTTGAAGGATGAGCTCGA
CATCGTGATCCCGACGATCCGTAACCTCGATTTCCTCGAGATGTGGAGGCCTTTCCTCCA
GCCTTACCATCTCATCATCGTCCAGGACGGAGATCCTTCCAAGACCATTGCTGTCCCCGA
AGGGTTCGATTACGAGCTCTACAACAGGAACGACATCAACCGTATCCTCGGTCCCAAAGC
TTCCTGCATTTCCTTCAAGGACTCTGCTTGTCGCTGCTTCGGCTACATGGTGTCCAAGAA
GAAGTACATCTTCACTATTGACGACGATTGCTTCGTTGCCAAGGATCCATCTGGAAAAGC
AGTGAACGCACTTGAGCAACACATCAAGAACCTTCTCTGTCCATCGTCTCCGTTTTTCTT
CAACACCTTGTACGACCCATACCGTGAAGGTGCTGATTTCGTCCGTGGATACCCTTTCAG
TCTCCGTGAAGGTGTTTCCACTGCTGTTTCTCACGGTCTCTGGCTCAACATCCCTGATTA
CGATGCCCC
GACTC

QA 1 609 1 609
DS 

RD RS1AL38JQ 805 0 0
TTCAGTCTCCGTGAAGGTGTTTCCACTGCTGTTTCTCACGGTCTCTGGCTCAACATCCCT
GATTACGATGCTCCAACCCAACTCGTCAAGCCTAAGGAAAGGAACACGAGGTATGTGGAT
GCTGTCATGACCATCCCAAAGGGAACACTTTTCCCAATGTGTGGCATGAACTTGGCTTTT
GATCGTGATCTCATTGGCCCGGCTATGTACTTTGGTCTCATGGGTGATGGTCAGCCTATT
GGTCGTTACGACGATATGTGGGCTGGATGGTGTGTCAAGGTAATCTGTGACCATTTAGGA
TTGGGAGTGAAGACAGGTCTTCCCTACATTTACCACAGCAAGGCAAGCAACCCATTTGTG
AACCTGAAGAAAGAGTACAAAGGGATTTTCTGGCAGGAGGACATCATCCCTTTCTTCCAG
AGCGCAAAGCTCTCAAAAGAAGCTGTGACGGTTCAACAATGCTACTTGGAGCTGTCCAAG
TTGGTGAAGGAGAAGCTTAGCCCCATTGATCCTTACTTTGACAAGCTCGCTGATGCTATG
GTCACTTGGATTGAAGCTTGGGATGAGCTTAACCCGGCCACTAAAGCTTGAGCAGCAAAG
AAAAAAAAACTACCACCTCAGTTTTGGTTATTAGCTCAACCTATATCATCTATCCTCCTT
ACCTTCCCCGTCTTGTTTTATCTCATTTTCCGGCGAATTCTTCAGTAAGTCGCCGGAGTT
TATTTAAGTAGTGATGGTGTAGTTCTATTTTAAGATCCGAGACAATCTATCCTCTGAGCC
TTTTGTCTTTGTTTCAATAATAAAA

QA 1 805 1 805
DS 



AS 4 14

CO CL65Contig1 420 2 1 U
GGGACGCTGTCTTCTCCAAACTAGAAGCGACAATGCCTAAGCAAATCCACGAGATCAAGG
ACTTCCTTCTGACGGCGAGGAGGAAGGATGCTAGGTCTGTAAAGATCAAGAGAAGCAAGG
ACATCGTCAAGTTCAAGGTCAGGTGCTCTAAATACCTCTACACACTCTGCGTCTTTGACC
AAGAGAAGGCTGATAAGCTCAAGCAGTCACTTCCTCCAGGTTTGAGTGTTCAAGACCTTT
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GTTACTGTTATTGAGACTCTTTCTCTTTGTTTTCAAGATTTGGTTTTGTATTTTGCTGTA
TGCTATCCATGTGGTTAGTAACATGTTTTATTTAGAACAAAGCATTCACATGAATTTTAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AZ64JQ C 1
AF RS1AZ64TF U 1
BS 1 420 RS1AZ64TF

RD RS1AZ64JQ 420 0 0
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ACATCGTCAAGTTCAAGGTCAGGTGCTCTAAATACCTCTACACACTCTGCGTCTTTGACC
AAGAGAAGGCTGATAAGCTCAAGCAGTCACTTCCTCCAGGTTTGAGTGTTCAAGACCTTT
GAACATCTCTTCGAGTCTGAGATATCCGACCTGCGTTGAACCGGAGATAGTAGTTTTTGA
GTTACTGTTATTGAGACTCTTTCTCTTTGTTTTCAAGATTTGGTTTTGTATTTTGCTGTA
TGCTATCCATGTGGTTAGTAACATGTTTTATTTAGAACAAAGCATTCACATGAATTTTAC

QA 1 420 1 420
DS 

RD RS1AZ64TF 420 0 0
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ACTTCCTTCTGACGGCGAGGAGGAAGGATGCTAGGTCTGTAAAGATCAAGAGAAGCAAGG
ACATCGTCAAGTTCAAGGTCAGGTGCTCTAAATACCTCTACACACTCTGCGTCTTTGACC
AAGAGAAGGCTGATAAGCTCAAGCAGTCACTTCCTCCAGGTTTGAGTGTTCAAGACCTTT
GAACATCTCTTCGAGTCTGAGATATCCGACCTGCGTTGAACCGGAGATAGTAGTTTTTGA
GTTACTGTTATTGAGACTCTTTCTCTTTGTTTTCAAGATTTGGTTTTGTATTTTGCTGTA
TGCTATCCATGTGGTTAGTAACATGTTTTATTTAGAACAAAGCATTCACATGAATTTTAC

QA 1 420 1 420
DS 



CO CL65Contig2 475 3 9 U
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CAAGGACTTCCTTCTGACGGCGAGGAGGAAGGATGCTAGGTCTGTGAAGATCAAGAGAAG
CAAGGACATTGTCAAGTTCAAGGTCAGGTGCTCCAGGTACCTCTACACGTTATGCGTCTT
CGACCAAGAGAAGGCTGATAAGCTTAAGCAGTCACTTCCTCCAGGTTTGAGTGTTCAAGA
CCTTTGAAGATCTTCTTGAAGTCTAGGGATTATGTCAATGCGACCTCCTGCTTTGAATAC
CTTTCGCTTGGATAATTTTGATTTTTGTTGCCTTTTGAATTACTATTATTGTTCAGACTC
TTTCCCTTTTCTATTCCAAGACTTTGAGTTTTTATTTTGTTATTTGCTATCAACGTGGTT
AGTGTATGGCTCAAAAGAATTTGGCAAGAGTTTTAAGAGAAGATTTTGAGTAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CZ44TF U 2
AF RS1B841JQ C 1
AF RS1B841TF U 1
BS 1 9 RS1B841JQ
BS 10 121 RS1CZ44TF
BS 122 122 RS1B841TF
BS 123 169 RS1CZ44TF
BS 170 170 RS1B841TF
BS 171 375 RS1CZ44TF
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BS 377 388 RS1CZ44TF
BS 389 475 RS1B841TF

RD RS1CZ44TF 387 0 0
GGACGGTT
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GGATAATTTTGATTTTTGTTGCCTTTTGAATTACTATTATTGTTCAGACTCTTTCCCTTT
TCTATTTCAAGACTTTGAG

QA 9 387 9 387
DS 

RD RS1B841JQ 475 0 0
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CAAGGACATTGTCAAGTTCAAGGTCAGGTGCTCCAGGTACCTCTACACGTTATGCGTCTT
CGACCAAGAGAAGGCTGATAAGCTTAAGCAGTCACTTCCTCCAGGTTTGAGTGTTCAAGA
CCTTTGAAGATCTTCTTGAAGTCTAGGGATTATGTCAATGCGACCTCCTGCTTTGAATAC
CTTTCGCTTGGATAATTTTGATTTTTGTTGCCTTTTGAATTACTATTATTGTTCAGACTC
TTTCCCTTTTCTATTCCAAGACTTTGAGTTTTTATTTTGTTATTTGCTATCAACGTGGTT
AGTGTATGGCTCAAAAGAATTTGGCAAGAGTTTTAAGAGAAGATTTTGAGTAGCT

QA 1 475 1 475
DS 

RD RS1B841TF 475 0 0
GGGACGGTT
GTTACGGCGTGCAAAATCAGAACCGAAAATGCCTAAGCAAATCCACGAGATCAAGGACTT
CCTTCTGACGGCGAGGAGGAAGGATGCTAGGTCTGTGAAGATCAAGAGAAGCAAGGACAT
TGTCAAGTTCAAGGTCAGGTGCTCCAGGTACCTCTACACGTTATGCGTCTTCGACCAAGA
GAAGGCTGATAAGCTTAAGCAGTCACTTCCTCCAGGTTTGAGTGTTCAAGACCTTTGAAG
ATCTTCTTGAAGTCTAGGGATTATGTCAATGCGACCTCCTGCTTTGAATACCTTTCGCTT
GGATAATTTTGATTTTTGTTGCCTTTTGAATTACTATTATTGTTCAGACTCTTTCCCTTT
TCTATTCCAAGACTTTGAGTTTTTATTTTGTTATTTGCTATCAACGTGGTTAGTGTATGG
CTCAAAAGAATTTGGCAAGAGTTTTAAGAGAAGATTTTGAGTAGCT

QA 10 475 10 475
DS 



CO CL65Contig3 399 2 1 U
GGGACGCTGTCTTCTCCAAACTCGAAGCGACAATGCCTAAGCAAATCCATGAGATCAAGG
ACTTCCTTCTGACGGCGAGGAGGAAGGATGCTAGGTCTGTAAAGATCAAGAGAAGCAAGG
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AAGAGAAGGCTGATAAGCTCAAGCAGTCACTTCCTCCAGGTTTGAGTGTTCAAGACCTTT
GAACACCTCTTCGAGTCTGGGATATCCGACCTGCGTTGAACCGGAGATGGTAGTTTTTGA
GTTACTGTTATTCAGACTCTTTTCTCTTTGTTTTCAAGACTTGGATTTGTGTTTTGTCTG
TATGCTATTGCCATGTGGTTAGTAACATGTTTTATTTAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1DH51TF U 1
AF RS1GD54TF U 1
BS 1 399 RS1DH51TF

RD RS1DH51TF 399 0 0
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AAGAGAAGGCTGATAAGCTCAAGCAGTCACTTCCTCCAGGTTTGAGTGTTCAAGACCTTT
GAACACCTCTTCGAGTCTGGGATATCCGACCTGCGTTGAACCGGAGATGGTAGTTTTTGA
GTTACTGTTATTCAGACTCTTTTCTCTTTGTTTTCAAGACTTGGATTTGTGTTTTGTCTG
TATGCTATTGCCATGTGGTTAGTAACATGTTTTATTTAG

QA 1 399 1 399
DS 

RD RS1GD54TF 399 0 0
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ACTTCCTTCTGACGGCGAGGAGGAAGGATGCTAGGTCTGTAAAGATCAAGAGAAGCAAGG
ACATTGTTAAGTTCAAGGTCAGGTGCTCCAAGTACCTCTACACACTTTGCGTTTTCGACC
AAGAGAAGGCTGATAAGCTCAAGCAGTCACTTCCTCCAGGTTTGAGTGTTCAAGACCTTT
GAACATCTCTTCGAGTCTGGGATATCCGACCTGCGTTGAACCGGAGATGGTAGTTTTTGA
GTTACTGTTATTCAGACTCTTTTCTCTTTGTTTTCAAGACTTGGATTTGTGTTTTGTCTG
TATGCTATTGCCATGTGGTTAGTAACATGTTTTATTTAG

QA 1 399 1 399
DS 



CO CL65Contig4 1092 7 9 U
GGGGACGCTGTCTTCTCCAAACTCGAAGCGACAATGCCTAAGCAAATCCACGAGATCAAG
GACTTCCTTCTGACGGCGAGGAGGAAGGATGCTAGGTCTGTAAAGATCAAGAGAAGCAAG
GACATTGTCAAGTTCAAGGTCAGGTGCTCTAAATACCTCTACACACTCTGCGTTGATACC
ACTGCTTACGGCCGGGGTGGTGTAATCCCTTCACCGTTCGAGTATGCAGATGTTGTAACC
ACCACAACTCACAAGTCACTTCGTGGACCTCGTGGAGCCATGATTTTCTACAGAAAGGGT
GTTAAGGAAATTAACAAACAAGGGAAAGAGGTTTTGTATGATTATGAAGACAAGATCAAT
CAAGCTGTCTTCCCTGGTCTTCAAGGTGGTCCACACAACCACACTATTACAGGACTAGCT
GTTGCTTTAAAACAGGCAACTACTTCAGAGTACAAAGCATACCAAGAACAAGTCCTGAGT
AACTCTGCAAAGTTTGCTCAGACTCTGATGGAGAGAGGTTATGAACTTGTTTCTGGTGGA
ACTGACAACCATCTGGTTCTAGTGAACCTGAAGCCCAA*GGGAATTGATGGATCTAGAGT
TGAGAAAGTGTTGGAAGCTGTCCACATTGCATCCAACAAAAACACTGTTCCTGGAGATGT
TTCTGCTATGGTTCCCGGTGGAATCAGAATGGGTACACCTGCTCTCACTTCCAGAGGTTT
TGTTGAGGAAGACTTTGCCAAAGTAGCCGAGTACTTTGACAAAGCTGTGAAGTTGGCACT
CAAAGTCAAATCTGAAGCTCAAGGAACGAAGCTGAAAGATTTTGTGTCAGCAATGGAATC
GTCTTCAGGCATCCAATCAGAGATTGCGAAGCTGCGCCACGACGTGGAGGAGTTCGCTAA
GCAGTTCCCAACTATTGGGTTTGAGAAAGAAACCATGAAGTACAAGAACTGAATATGTCT
TTATTATCCTACAAACAAGTCTTCTCTTTATTATTATCATCACATGCTTTGAACTTCCAT
GTAATGTATAGATAATGCTACATGTACTCCATCTTATGATATATGCGAAACATACTCACT
TTTTAATGCAAA


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1BD40TF U -2
AF RS1B514TF U 9
AF RS1H292TF U 1
AF RS1CY94JQ C 544
AF RS1CY94TF U 544
AF RS1H292JQB C 267
AF RS1ES40JQ C 327
BS 1 23 RS1H292TF
BS 24 24 RS1BD40TF
BS 25 125 RS1H292TF
BS 126 126 RS1BD40TF
BS 127 578 RS1H292TF
BS 579 579 RS1CY94TF
BS 580 682 RS1H292TF
BS 683 1076 RS1CY94TF
BS 1077 1092 RS1H292JQB

RD RS1BD40TF 161 0 0
GGCTCC
GACGCTGTCTTCTCCAAACTCGAAGCGACAATGCCTAAGCAAATCCACGAGATCAAGGAC
TTCCTTCTGACGGCGAGGAGGAAGGATGCTAGGTCTGTAAAGATCAAGAGAAGCAAGGAC
ATTGTCAAGTTCAAGGTCAGGTGCTCTAAATACCT

QA 7 161 7 161
DS 

RD RS1B514TF 167 0 0
TGTCTTCTCCAAACTCGAAGCGACAATGCCTAAGCAAATCCACGAGATCAAGGACTTCCT
TCTGACGGCGAGGAGGAAGGATGCTAGGTCTGTAAAGATCAAGAGAAGCAAGGACATTGT
CAAGTTCAAGGTCAGGTGCTCTAAATACCTCTACACACTCTGCGTT
G

QA 1 166 1 166
DS 

RD RS1H292TF 682 0 0
GGGGACGCTGTCTTCTCCAAACTAGAAGCGACAATGCCTAAGCAAATCCACGAGATCAAG
GACTTCCTTCTGACGGCGAGGAGGAAGGATGCTAGGTCTGTAAAGATCAAGAGAAGCAAG
GACATCGTCAAGTTCAAGGTCAGGTGCTCTAAATACCTCTACACACTCTGCGTTGATACC
ACTGCTTACGGCCGGGGTGGTGTAATCCCTTCACCGTTCGAGTATGCAGATGTTGTAACC
ACCACAACTCACAAGTCACTTCGTGGACCTCGTGGAGCCATGATTTTCTACAGAAAGGGT
GTTAAGGAAATTAACAAACAAGGGAAAGAGGTTTTGTATGATTATGAAGACAAGATCAAT
CAAGCTGTCTTCCCTGGTCTTCAAGGTGGTCCACACAACCACACTATTACAGGACTAGCT
GTTGCTTTAAAACAGGCAACTACTTCAGAGTACAAAGCATACCAAGAACAAGTCCTGAGT
AACTCTGCAAAGTTTGCTCAGACTCTGATGGAGAGAGGTTATGAACTTGTTTCTGGTGGA
ACTGACAACCATCTGGTTCTAGTGAACCTGAAGCCCAAAGGGAATTGATGGATCTAGAGT
TGAGAAAGTGTTGGAAGCTGTCCACATTGCATCCAACAAAAACACTGTTCCTGGAGATGT
TTCTGCTATGGTTCCCGGTGGA

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1CY94JQ 533 0 0
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GAAAGTGTTGGAAGCTGTCCACATTGCATCCAACAAAAACACTGTTCCTGGAGATGTTTC
TGCTATGGTTCCCGGTGGAATCAGAATGGGTACACCTGCTCTCACTTCCAGAGGTTTTGT
TGAGGAAGACTTTGCCAAAGTAGCCGAGTACTTTGACAAAGCTGTGAAGTTGGCACTCAA
AGTCAAATCTGAAGCTCAAGGAACGAAGCTGAAAGATTTTGTGTCAGCAATGGAATCGTC
TTCAGGCATCCAATCAGAGATTGCGAAGCTGCGCCACGACGTGGAGGAGTTCGCTAAGCA
GTTCCCAACTATTGGGTTTGAGAAAGAAACCATGAAGTACAAGAACTGAATATGTCTTTA
TTATCCTACAAACAAGTCTTCTCTTTATTATTATCATCACATGCTTTGAACTTCCATGTA
ATGTATAGATAATGCTACATGTACTCCATCTTATGATATATGCGAAACATACT

QA 1 533 1 533
DS 

RD RS1CY94TF 533 0 0
GACAACCATCTGGTTCTAGTGAACCTGAAGCCCAA*GGGAATTGATGGATCTAGAGTTGA
GAAAGTGTTGGAAGCTGTCCACATTGCATCCAACAAAAACACTGTTCCTGGAGATGTTTC
TGCTATGGTTCCCGGTGGAATCAGAATGGGTACACCTGCTCTCACTTCCAGAGGTTTTGT
TGAGGAAGACTTTGCCAAAGTAGCCGAGTACTTTGACAAAGCTGTGAAGTTGGCACTCAA
AGTCAAATCTGAAGCTCAAGGAACGAAGCTGAAAGATTTTGTGTCAGCAATGGAATCGTC
TTCAGGCATCCAATCAGAGATTGCGAAGCTGCGCCACGACGTGGAGGAGTTCGCTAAGCA
GTTCCCAACTATTGGGTTTGAGAAAGAAACCATGAAGTACAAGAACTGAATATGTCTTTA
TTATCCTACAAACAAGTCTTCTCTTTATTATTATCATCACATGCTTTGAACTTCCATGTA
ATGTATAGATAATGCTACATGTACTCCATCTTATGATATATGCGAAACATACT

QA 1 533 1 533
DS 

RD RS1H292JQB 826 0 0
ACCTCGTGGAGCCATGATTT*CTACAGAAAGGGTGTTAAGGAAAT*AACAAACAAGGGAA
AGAGGTTTTGTATGATTATGAAGACAAGATCAATCAAGCTGTCTTCCCTGGTCTTCAAGG
TGGTCCACACAACCACACTATTACAGGACTAGCTGTTGCTTTAAAACAGGCAACTACTTC
AGAGTACAAAGCATACCAAGAACAAGTCCTGAGTAACTCTGCAAAGTTTGCTCAGACTCT
GATGGAGAGAGGTTATGAACTTGTTTCTGGTGGAACTGACAACCATCTGGTTCTAGTGAA
CCTGAAGCCCAA*GGGAATTGATGGATCTAGAGTTGAGAAAGTGTTGGAAGCTGTCCACA
TTGCATCCAACAAAAACACTGTTCCTGGAGATGTTTTTGCTATGGTTCCCGGTGGAATCA
GAATGGGTACACCTGCTCTCACTTCCAGAGGTTTTGTTGAGGAAGACTTTGCCAAAGTAG
CCGAGTACTTTGACAAAGCTGTGAAGTTGGCACTCAAAGTCAAATTTGAAGCTCAAGGAA
CGAAGCTGAAAGATTTTGTGTCAGCAATGGAATCGTCTTCAGGCATCCAATCAGAGATTG
CGAAGCTGCGCCACGACGTGGAGGAGTTCGCTAAGCAGTTCCCAACTATTGGGTTTGAGA
AAGAAACCATGAAGTACAAGAACTGAATATGTCTTTATTATCCTACAAACAAGTTTTCTC
TTTATTATTATCATCACATGCTTTGAACTTCCATGTAATGTATAGATAATGCTACATGTA
CTCCATCTTATGATATATGCGAAACATACTCACTTTTTAATGCAAA

QA 1 826 1 826
DS 

RD RS1ES40JQ 766 0 0
AAGAGG
TTTGTATGATTATGAAGACAAGATCAATCAAGCTGTCTTCCCTGGTCTTCAAGGTGGTCC
ACACAACCACACTATTACAGGACTAGCTGTTGCTTTAAAACAGGCAACTACTTCAGAGTA
CAAAGCATACCAAGAACAAGTCCTGAGTAACTCTGCAAAGTTTGCTCAGACTCTGATGGA
GAGAGGTTATGAACTTGTTTCTGGTGGAACTGACAACCATCTGGTTCTAGTGAACCTGAA
GCCCAA*GGGAATTGATGGATCTAGAGTTGAGAAAGTGTTGGAAGCTGTCCACATTGCAT
CCAACAAAAACACTGTTCCTGGAGATGTTTCTGCTATGGTTCCCGGTGGAATCAGAATGG
GTACACCTGCTCTCACTTCCAGAGGTTTTGTTGAGGAAGACTTTGCCAAAGTAGCCGAGT
ACTTTGACAAAGCTGTGAAGTTGGCACTCAAAGTCAAATTTGAAGCTCAAGGAACGAAGC
TGAAAGATTTTGTGTCAGCAATGGAATCGTCTTCAGGCATCCAATCAGAGATTGCGAAGC
TGCGCCACGACGTGGAGGAGTTCGCTAAGCAGTTCCCAACTATTGGGTTTGAGAAAGAAA
CCATGAAGTACAAGAACTGAATATGTCTTTATTATCCTACAAACAAGTCTTCTCTTTATT
ATTATCATCACATGCTTTGAACTTCCATGTAATGTATAGATAATGCTACATGTACTCCAT
CTTATGATATATGCAAAACATACTCACTTTTTAATGCAAA

QA 7 766 7 766
DS 



AS 1 14

CO CL66Contig1 907 14 19 U
GGACAAGAAAAACACCACAGAGAAAATCAACGCTCAAAATCTCAGAGAGAGCAATGGCAT
CAACATTCACAAGCTCAAGCAGTATTCTGAGCCCAACACCATTTCTTGGCCAGACCAAAG
GCTCCACGTTCAACCCTCTTCGTGATGTTGTCTCTCTCGGAACTCCCAAATACACTATGG
GCAATGATCTTTGGTACGGACCAGACAGAGTGAAGTACTTGGGACCATTTTCCGTCCAAA
CCCCGTCTTACCTCACCGGAGAGTTTCCCGGTGACTATGGTTGGGACACCGCCGGTTTAT
CCGCAGACCCTGAAGCCTTTGCCAAGAACAGAGCTCTTGAGGTGATCCATGGGAGATGGG
CAATGTTGGGAGCACTAGGTTGCATAACACCTGAAGTTCTTCAGAAATGGGTCCGTGTGG
ACTTCAAAGAGCCGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAATCTTCTCAGAAGGAGGTTTGG
ACTACTTAGGCAACCCAAACCTAGTCCATGCCCAAAGCATTTTAGCCGTTCTTGGCTTCC
AAGTTATCCTCATGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCAACGGTCTAGATGGTGTTGGTG
AAGGCAATGACTTGTACCCGGGTGGGCAATACTTTGACCCGCTGGGTCTCGCAGATGATC
CAGTTACCTTCGCTGAGCTCAAGGTGAAGGAGATCAAGAATGGAAGGTTGGCTATGTTCT
CAATGTTTGGCTTCTTTGTTCAAGCCATTGTTACTGGAAAGGGTCCCTTGGAGAATCTCC
TTGACCATCTTGATAACCCTGTTGCTAACAATGCTTGGGCTTTCGCAACAAAGTTTGTAC
CTGGAGCTTGATTTGATGTAATCCTTTGAAATGATATGAACATAAACCTTCTCTTGTTCC
TCTGCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 65 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 65 55 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 60 75 75 75 75 75 75 75 70 70 55 70 70 
70 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CY60TF U 13
AF RS1FH95JQ C 469
AF RS1FV11TF U 1
AF RS1BC58TF U 13
AF RS1CO43TF U 13
AF RS1DF20TF U 13
AF RS1DI65TF U 13
AF RS1EF55TF U 13
AF RS1DE34TF U 13
AF RS1CO43JQ C 99
AF RS1CY60JQ C 465
AF RS1DI65JQ C 100
AF RS1FV11JQ C 201
AF RS1DE34JQ C 123
BS 1 189 RS1FV11TF
BS 190 190 RS1BC58TF
BS 191 253 RS1FV11TF
BS 254 254 RS1BC58TF
BS 255 679 RS1FV11TF
BS 680 683 RS1BC58TF
BS 684 684 RS1CO43JQ
BS 685 689 RS1BC58TF
BS 690 690 RS1CO43JQ
BS 691 704 RS1BC58TF
BS 705 706 RS1DE34TF
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BS 708 766 RS1DE34TF
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BS 770 785 RS1DE34TF
BS 786 893 RS1CO43JQ
BS 894 907 RS1DE34JQ

RD RS1CY60TF 614 0 0
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TCACCGGAGAGTTTCCCGGTGACTATGGTTGGGACACCGCCGGTTTATCCGCAGACCCTG
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CACTAGGTTACATAACACCTGAAGTTCTTCAGAAATGGGTCCGTGTGGACTTCAAAGAGC
CGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAATCTTCTCAGAAGGAGGTTTGGACTACTTAGGCA
ACCCAAACCTAGTCCATGCCCAAAGCATTTTAGCCGTTCTTGGCTTCCAAGTTATCCTCA
TGGGATTAGTTGAAAGTTTCCGCATCAACGGTCTAGATGGTGTTGGTGAAG*CAATGACT
TGTACCCGGGTGGG

QA 1 614 1 614
DS 

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TTTTTGGCTTCCAAGTTATCCTCATGAGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCAACGGTTTAG
ATGGTGTTGGTGAAGGCAATGACTTGTACCCGGGTGGGCAATACTTTGACCCGCTGGGTT
TCGCAGA

QA 1 187 1 187
DS 

RD RS1FV11TF 679 0 0
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CAACATTCACAAGCTCAAGCAGTATTCTGAGCCCAACACCATTTCTTGGCCAGACCAAAG
GCTCCACGTTCAACCCTCTTCGTGATGTTGTCTCTCTCGGAACTCCCAAATACACTATGG
GCAATGATCCTTGGTACGGACCAGACAGAGTGAAGTACTTGGGACCATTTTCCGTCCAAA
CCCCGTCTTACCTTACCGGAGAGTTTCCCGGTGACTATGGTTGGGACACCGCCGGTTTAT
CCGCAGACCCTGAAGCCTTTGCCAAGAACAGAGCTCTTGAGGTGATCCATGGGAGATGGG
CAATGTTGGGAGCACTAGGTTGCATAACACCTGAAGTTCTTCAGAAATGGGTCCGTGTGG
ACTTCAAAGAGCCGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAATCTTCTCAGAAGGAGGTTTGG
ACTACTTAGGCAACCCAAACCTAGTCCATGCCCAAAGCATTTTAGCCGTTCTTGGCTTCC
AAGTTATCCTCATGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCAACGGTCTAGATGGTGTTGGTG
AAGGCAATGACTTGTACCCGGGTGGGCAATACTTTGACCCGCTGGGTCTCGCAGATGATC
CAGTTACCTTCGCTGAGCT

QA 1 679 1 679
DS 

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ACCCTCTTCGTGATGTTGTCTCTCTCGGAACTCCCAAATACACTATGGGCAATGATCTTT
GGTACGGACCAGACAGAGTGAAGTACTTGGGACCATTTTCCGTCCAAACCCTGTCTTACC
TCACCGGAGAGTTTCCCGGTGACTATGGTTGGGACACCGCCGGTTTATCCGCAGACCCTG
AAGCCTTTGCCAAGAACAGAGCTCTTGAGGTGATCCATGGGAGATGGGCAATGTTGGGAG
CACTAGGTTGCATAACACCTGAAGTTCTTCAGAAATGGGTCCGTGTGGACTTCAAAGAGC
CGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAATCTTCTCAGAAGGAGGTTTGGACTACTTAGGCA
ACCCAAACCTAGTCCATGCCCAAAGCATTTTAGCCGTTCTTGGCTTCCAAGTTATCCTCA
TGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCAACGGTCTAGATGGTGTTGGTGAAGGCAATGACT
TGTACCCGGGTGGGCAATACTTTGACCCGCTGGGTCTCGCAGATGATCCAGTTACCTTCG
CTGAGCTCAAG*TGAAG*AGATCAAGAATGGA
GG

QA 1 692 1 692
DS 

RD RS1CO43TF 665 0 0
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ACCCTCTTCGTGATGTTGTCTCTCTCGGAACTCCCAAATACACTATGGGCAATGATCTTT
GGTACGGACCAGACAGAGTGAAGTACTTGGGACCATTTTCCGTCCAAACCCCGTCTTACC
TCACCGGAGAGTTTCCCGGTGACTATGGTTGGGACACCGCCGGTTTATCCGCAGACCCTG
AAGCCTTTGCCAAGAACAGAGCTCTTGAGGTGATCCATGGGAGATGGGCAATGTTGGGAG
CACTAGGTTGCATAACACCTGAAGTTCTTCAGAAATGGGTCCGTGTGGACTTCAAAGAGC
CGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAATCTTCTCAGAAGGAGGTTTGGACTACTTAGGCA
ACCCAAACCTAGTCCATGCCCAAAGCATTTTAGCCGTTCTTGGCTTCCAAGTTATCCTCA
TGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCAACGGTCTAGATGGTGTTGGTGAAGGCAATGACT
TGTACCCGGGTGGGCAATACTTTGACCCGCTGGGTCTCGCAGATGATCCAGTTACCTTCG
CTGAG

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1DF20TF 649 0 0
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ACCCTCTTCGTGATGTTGTCTCTCTCGGAACTCCCAAATACACTATGGGCAATGATCTTT
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TCACCGGAGAGTTTCCCGGTGACTATGGTTGGGACACCGCCGGTTTATCCGCAGACCCTG
AAGCCTTTGCCAAGAACAGAGCTCTTGAGGTGATCCATGGGAGATGGGCAATGTTGGGAG
CACTAGGTTGCATAACACCTGAAGTTCTTCAGAAATGGGTCCGTGTGGACTTCAAAGAGC
CGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAATCTTCTCAGAAGGAGGTTTGGACTACTTAGGCA
ACCCAAACCTAGTCCATGCCCAAAGCATTTTAGCCGTTCTTGGCTTCCAAGTTATCCTCA
TGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCAACGGTCTAGATGGTGTTGGTGAAAGCAATGACT
TGTACCCGGGTGGGCAATACTTTGACCCGCTGGGTCTCGCAGATGATCC

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1DI65TF 686 0 0
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ACCCTCTTCGTGATGTTGTCTCTCTCGGAACTCCCAAATACACTATGGGCAATGATCTTT
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TCACCGGAGAGTTTCCCGGTGACTATGGTTGGGACACCACCGGTTTATCCGCAGACCCTG
AAGCCTTTGCCAAGAACAGAGCTCTTGAGGTGATCCATGGGAGATGGGCAATGTTGGGAG
CACTAGGTTGCATAACACCTGAAGTTCTTCAGAAATGGGTCCGTGTGGACTTCAAAGAGC
CGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAATCTTCTCAGAAGGAGGTTTGGACTACTTAGGCA
ACCCAAACCTAGTCCATGCCCAAAGCATTTTAGCCGTTCTTGGCTTCCAAGTTATCCTCA
TGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCAACGGTCTAGATGGTGTTGGTGAAG*CAATGACT
TGTACCCGGGTGGGCAATACTTTGACCCGCTGGGTCTCGCAGATGATCCAGTTACTTTCG
CTGAGCTCAAG*TGAAG*AGATCAAG

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DS 

RD RS1EF55TF 746 0 0
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ACCCTCTTCGTGATGTTGTCTCTCTCGGAACTCCCAAATACACTATGGGCAATGATCTTT
GGTACGGACCAGACAGAGTGAAGTACTTGGGACCATTTTCCGTCCAAACCCCGTCTTACC
TCACCGGAGAGTTTCCCGGTGACTATGGTTGGGACACCGCCGGTTTATCCGCAGACCCTG
AAGCCTTTGCCAAGAACAGAGCTCTTGAGGTGATCCATGGGAGATGGGCAATGTTGGGAG
CACTAGGTTGCATAACACCTGAAGTTCTTCAGAAATGGGTCCGTGTGGACTTCAAAGAGC
CGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAATCTTCTCAGAAGGAGGTTTGGACTACTTAGGCA
ACCCAAACCTAGTCCATGCCCAAAGCATTTTAGCCGTTCTTGGCTTCCAAGTTATCCTCA
TGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCAACGGTCTAGATGGTGTTGGTGAAGGCAATGACT
TGTACCCGGGTGGGCAATACTTTGACCCGCTGGATCTCGCAGATGGTCCAGTTACCTTCG
CTGAGCTCAAG*TGAAG*AGATCAAGAATGGAAG*TTGGCTATGTTCTCA*TGTTTGGCT
TCTTTGT
CAGCCATGTACTGGAAAGG

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DS 

RD RS1DE34TF 774 0 0
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ACCCTCTTCGTGATGTTGTCTCTCTCGGAACTCCCAAATACACTATGGGCAATGATCTTT
GGTACGGACCTGACAGAGTGAAGTACTTGGGACCATTTTCCGTCCAAACCCCGTCTTACC
TCACCGGAGAGTTTCCCGGTGACTATGGTTGGGACACCGCCGGTTTATCCGCAGACCCTG
AAGCCTTTGCCAAGAACAGAGCTCTTGAGGTGATCCATGGGAGATGGGCAATGTTGGGAG
CACTAGGTTGCATAACACCTGAAGTTCTTCAGAAATGGGTCCGTGTGGACTTCAAAGAGC
CGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAATCTTCTCAGAAGGAGGTTTGGACTACTTAGGCA
ACCCAAACCTAGTCCATGCCCAAAGCATTTTAGCCGTTCTTGGCTTCCAAGTTATCCTCA
TGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCAACGGTCTAGATGGTGTTGGTGAAGGCAATGACT
TGTACCCGGGTGGGCAATACTTTGACCCGCTGGGTCTCGCAGATGATCCAGTTACCTTCG
CTGAGCTCAAG*TGAAG*AGATCAAGAATGGAAG*TTGGCTATGTTCTCAATGTTTGGCT
TCTTTGTTCAAGCCATTGTTACTGGAAAGGGTCCTTGGGAGAATCTCCTTGAC
A

QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1CO43JQ 797 0 0
CCATTTCTTGGCCAGACCAAAGGCTCCACGTTCAACCCTCTTCGTGATGTTGTCTCTCTC
GGAACTCCCAAATACACTATGGGCAATGATCTTTGGTACGGACCAGACAGAGTGAAGTAC
TTGGGACCATTTTCCGTCCAAACCCCGTCTTACCTCACCGGAGAGTTTCCCGGTGACTAT
GGTTGGGACACCGCCGGTTTATCCGCAGACCCTGAAGCCTTTGCCAAGAACAGAGCTCTT
GAGGTGATCCATGGGAGATGGGCAATGTTGGGAGCACTAGGTTGCATAACACCTGAAGTT
CTTCAGAAATGGGTCCGTGTGGACTTCAAAGAGCCGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAA
ATCTTCTCAGAAGGAGGTTTGGACTACTTAGGCAACCCAAACCTAGTCCATGCCCAAAGC
ATTTTAGCCGTTCTTGGCTTCCAAGTTATCCTCATGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATC
AACGGTCTAGATGGTGTTGGTGAAGGCAATGACTTGTACCCGGGTGGGCAATACTTTGAC
CCGCTGGGTCTCGCAGATGATCCAGTTACCTTCGCTGAGCTCAAGGTGAAGGAGATCAAG
AATGGAAGGTTGGCTATGTTCTCAATGTTTGGCTTCTTTGTTCAAGCCATTGTTACTGGA
AAGGGTCCCTTGGAGAATCTCCTTGACCATCTTGATAACCCTGTTGCTAACAATGCTTGG
GCTTTCGCAACAAAGTTTGTACCTGGAGCTTGATTTGATGTAATCCTTTGAAATGATATG
AACATAAACCTTCTC
GC

QA 1 795 1 795
DS 

RD RS1CY60JQ 399 0 0
TCAGAAGGAGGTTTGGACTACTTAGGCAACCCAAACCTAGTCCATGCCCAAAGCATTTTA
GCCGTTTTTGGCTTCCAAGTTATCCTCATGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCAACGGT
CTAGATGGTGTTGGTGAAGGCAATGACTTGTACCCGGGTGGGCAATACTTTGACCCGCTG
GGTCTCGCAGATGATCCAGTTACCTTCGCTGAGCTCAAGGTGAAGGAGATCAAGAATGGA
AGGTTGGCTATGTTCTCAATGTTTGGCTTCTTTGTTCAAGCCATTGTTACTGGAAAGGGT
CCCTTGGAGAATCTCCTTGACCATCTTGATAACCCTGTTGCTAACAATGCTTGGGCTTTC
GCAACAAAGTTTGTACCTGGAGCTTGATTTGATGTAATC

QA 1 399 1 399
DS 

RD RS1DI65JQ 801 0 0
CATTTCTTGGCCAGACCAAAGGCTCCACGTTCAACCCTCTTCGTGATGTTGTCTCTCTCG
GAACTCCCAAATACACTATGGGCAATGATCTTTGGTACGGACCAGACAGAGTGAAGTACT
TGGGACCATTTTCCGTCCAAACCCCGTCTTACCTCACCGGAGAGTTTCCCGGTGACTATG
GTTGGGACACCACCGGTTTATCCGCAGACCCTGAAGCCTTTGCCAAGAACAGAGCTCTTG
AGGTGATCCATGGGAGATGGGCAATGTTGGGAGCACTAGGTTGCATAACCCCTGAAGTTC
TTCAGAAATGGGTCCGTGTGGACTTCAAAGAGCCGGTTTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAA
TCTTCTCAGAAGGAGGTTTGGACTACTTAGGCAACCCAAACCTAGTCCATGCCCAAAGCA
TTTTAGCCGTTCTTGGCTTCCAAGTTATCCTCATGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCA
ACGGTCTAGATGGTGTTGGTGAAGGCAATGACTTGTACCCGGGTGGGCAATACTTTGACC
CGCTGGGTCTCGCAGATGATCCAGTTACTTTCGCTGAGCTCAAGGTGAAGGAGATCAAGA
ATGGAAGGTTGGCTATGTTCTCAATGTTTGGCTTCTTTGTTCAAGCCATTGTTACTGGAA
AGGGTCCCTTGGAGAATCTCCTTGACCATCTTGATAACCCTGTTGCTAACAATGCTTGGG
CTTTCGCAACAAAGTTTGTACCTGGAGCTTGATTTGATGTAATCCTTTGAAATGATATGA
ACATAAACCTTCTC
TTGTTAG

QA 1 794 1 794
DS 

RD RS1FV11JQ 705 0 0
CCAGACAGAGTGAAGTACTTGGGACCATTTTCCGTCCAAACCCCGTCTTACCTTACCGGA
GAGTTTCCCGGTGACTATGGTTGGGACACCGCCGGTTTATCCGCAGACCCTGAAGCCTTT
GCCAAGAACAGAGCTCTTGAGGTGATCCATGGGAGATGGGCAATGTTGGGAGCACTAGGT
TGCATAACACCTGAAGTTCTTCAGAAATGGGTCCGTGTGGACTTCAAAGAGCCGGTCTGG
TTCAAAGCCGGTTCACAAATCTTCTCAGAAGGAGGTTTGGACTACTTAGGCAACCCAAAC
CTAGTCCATGCCCAAAGCATTTTAGCCGTTCTTGGCTTCCAAGTTATCCTCATGGGATTA
GTTGAAGGTTTCCGCATCAACGGTCTAGATGGTGTTGGTGAAGGCAATGACTTGTACCCG
GGTGGGCAATACTTTGACCCGCTGGGTCTCGCAGATGATCCAGTTACCTTCGCTGAGCTC
AAGGTGAAGGAGATCAAGAATGGAAGGTTGGCTATGTTCTCAATGTTTGGCTTCTTTGTT
CAAGCCATTGTTACTGGAAAGGGTCCCTTGGAGAATCTCCTTGACCATCTTGATAACCCT
GTTGCTAACAATGCTTGGGCTTTCGCAACAAAGTTTGTACCTGGAGCTTGATTTGATGTA
ATCCTTTGAAATGATATGAACATAAACCTTCTCTTGTT
CCTCTAC

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DS 

RD RS1DE34JQ 785 0 0
TCCACGTTCAACCCTCTTCGTGATGTTGTCTCTCTCGGAACTCCCAAATACACTATGGGC
AATGATCTTTGGTACGGACCTGACAGAGTGAAGTACTTGGGACCATTTTCCGTCCAAACC
CCGTCTTACCTCACCGGAGAGTTTCCCGGTGACTATGGTTGGGACACCGCCGGTTTATCC
GCAGACCCTGAAGCCTTTGCCAAGAACAGAGCTCTTGAGGTGATCCATGGGAGATGGGCA
ATGTTGGGAGCACTAGGTTGCATAACACCTGAAGTTCTTCAGAAATGGGTCCGTGTGGAC
TTCAAAGAGCCGGTCTGGTTCAAAGCCGGTTCACAAATCTTCTCAGAAGGAGGTTTGGAC
TACTTAGGCAACCCAAACCTAGTCCATGCCCAAAGCATTTTAGCCGTTCTTGGCTTCCAA
GTTATCCTCATGGGATTAGTTGAAGGTTTCCGCATCAACGGTCTAGATGGTGTTGGTGAA
GGCAATGACTTGTACCCGGGTGGGCAATACTTTGACCCGCTGGGTCTCGCAGATGATCCA
GTTACCTTCGCTGAGCTCAAGGTGAAGGAGATCAAGAATGGAAGGTTGGCTATGTTCTCA
ATGTTTGGCTTCTTTGTTCAAGCCATTGTTACTGGAAAGGGTCCCTTGGAGAATCTCCTT
GACCATCTTGATAACCCTGTTGCTAACAATGTTTGGGCTTTCGCAACAAAGTTTGTACCT
GGAGCTTGATTTGATGTAATCCTTTGAAATGATATGAACATAAACCTTCTCTTGTTCCTC
TGCGG

QA 1 785 1 785
DS 



AS 3 15

CO CL67Contig1 884 8 18 U
GGGAAGCTCTCTCTCTCTTTCCTTCTCTTTCAAATTCCGTTCGTCTTCGTCGTCGTCTCT
CTATCAGATATCCGCCGAAGAGTGAAGAAGCAAGGATGGGGTTGTCGTTCGCGAAGCTGT
TTAGCAGGCTTTTTGCCAAGAAGGAGATGAGGATTCTCATGGTTGGTCTTGATGCTGCTG
GTAAGACCACCATTTTGTACAAGCTCAAGCTCGGTGAGATTGTCACCACCATTCCCACTA
TTGGTTTCAATGTGGAAACTGTGGAGTACAAGAACATTAGTTTCACTGTGTGGGATGTCG
GGGGTCAAGACAAGATCCGTCCCTTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACCCAAGGTCTCA
TCTTTGTGGTCGACAGCAATGACAGAGACCGTGTTGTTGAGGCCAGAGATGAACTGCACA
GAATGCTTAATGAGGATGAGCTGCGTGATGCTGTTCTGCTCGTGTTTGCTAACAAACAGG
ATCTTCCAAATGCCATGAACGCTGCTGAAATCACTGATAAGCTTGGTCTCCACTCTCTCC
GCCAGCGTCACTGGTACATCCAGAGCACATGTGCCACTTCAGGCGAGGGGCTTTACGAAG
GTCTTGACTGGCTGTCCAACAACATTGCCGGCAAGGCATAGAGGGAAGATGCGTGGTTGA
GTTGATTTTGCTGGGAAAATCTGGATGCAGTAGCAAACATTATGTGATATTTTTTTCTAT
GGTGTTCTTATTGTTCTGTGTTTTTTTCTATGGGGATATGTGGATTTGATTTTGTGGTCG
TTGTTCTGATTTGTGTAAAGAGGGTTTCTCTTGTACGTAGAACATAGAAACTACCTTTTA
CTATAGCTTGTAATATCGAATTATCTACTGCTTTCGTGGTCAAA


BQ
10 15 15 15 15 15 20 20 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
10 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B776TF U 1
AF RS1C950TF U -4
AF RS1ER31TF U 4
AF RS1D908TF U 2
AF RS1FR05TF U 4
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GTAAGACCACCATTTTGTACA*GCTCAAGCTCGGTGAGATTGTCACCACCATTCCCACTA
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GAATGCTTAATGAGGATGAGCTGCGTGATGCTGTTCTGCTCGTGTTTGCTAACAAACAGG
ATCTTCCAAATGCCATGAACGCTGCTGAAATCACTGATAAGCTTGGTCTCCACTCTCTCC
GCCAGCGTCACTGGTACATCCAGAGCACATGTGCCACTTCAGGCGAGGGGCTTTACGAAG
T*CTTGACTGGCTGTCCAACAACATTGCCGGCA
GGCAT

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DS 

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TCAATGTGGAAACTGTGGAGTACAAGAACATTAGTTTCACTGTGTGGGATGTCGGGGGTC
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TGGTCGACAGCAATGACAGAGACCGTGTTGTTGAGGCCAGAGATGAACTGCACAGAATGC
TTAATGAGGATGAGCTGCGTGATGCTGTTCTTCTCGTGTTTGCTAACAAACAGGATCTTC
CAAATGCCATGAACGCTGCTGAAATCACTGATAAGCTTGGTCTCCACTCTCTCCGCCAGC
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DS 

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AATGTGGAAACTGTGGAGTACAAGAACATTAGTTTCACTGTGTGGGATGTCGGGGGTCAA
GACAAGATCCGTCCCTTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACCCAAGGTCTCATCTTTGTG
GTCGACAGCAATGACAGGGACCGTGTTGTTGAGGCCAGAGATGAACTGCACAGAATGCTT
AATGAGGATGAGCTGCGTGATGCTGTTCTGCTCGTGTTTGCTAACAAACAGGATCTTCCA
AATGCCATGAACGCTGCTGAAATCACTGATAAGCTTGGTCTCCACTCTCTCCGCCAGCGT
CACTGGTACATCCAGAGCACATGTGCCACTTCAGGCGAGGGGCTTTACGAAGGTCTTGAC
TGGCTGTCCAACAACATTGCCGGCAAGGCATAGAGGGAAGATGCGTGGTTGAGTTGATTT
TGCTGGGAAAATCTGGATGCAGTAGCAAACATTATGTGATATTTTTTTCTATGGTGTTCT
TATTGTTCTGTGTTTTTT*TC

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DS 

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TATCAGATATCCGCCGAAGAGTGAAGAAGCAAGGATGGGGTTGTCGTTCGCGAAGCTGTT
TAGCAGGCTTTTTGCCAAGAAGGAGATGAGGATTCTCATGGTTGGTCTTGATGCTGCTGG
TAAGACCACCATTTTGTACAAGCTCAAGTTCGGTGAGATTGTCACCACCATTCCCACTAT
TGGTTTCAATGTGGAAACTGTGGAGTACAAGAACATTAGTTTCACTGTGTGGGATGTCGG
GGGTCAAGACAAGATCCGTCCCTTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACCCAAGGTCTCAT
CTTTGTGGTCGACAGCAATGACAGAGACCGTGTTGTTGAGGCCAGAGATGAACTGCACAG
AATGCTTAATGAGGATGAGCTGCGTGATGCTGTTCTGCTCGTGTTTGCTAACAAACAGGA
TCTTCCAAATGCCATGAACGCTGCTGAAATCACTGATAAGCTTGGTCTCCACTCTCTCCG
CCAGCGTCACTGGTACATCCAGAGCACATGTGCCACTTCAGGCGAGGGGCTTTACGAAGT
TCTTGACTGGCTGTCCAACAACATTGCCGGCAAGGCATAGAGGGAAGATGCGTGGTTGAG
TCGATTTTGCTGGGAAAATCTGGATGCAGTAGCAAACATTATGTGATATTTTTTTCTATG
GTGTTCTTATTGTTCTGTGTTTTTT*CTATGGGGATATGTGGATTTGATTTCGTGGTCGT
TGTTCTGATTTGTGTAAAGAG

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DS 

RD RS1FR05TF 814 0 0
GGAAG
CTCTCTCTCTTTCCTTCTCTTTCAAATTCCGTTCGTCTTCGTCGTCGTCTCTCTATCAGA
TATCCGCCGAAGAGTGAAGAAGCAAGGATGGGGTTGTCGTTCGCGAAGCTGTTTAGCAGG
CTTTTTGCCAAGAAGGAGATGAGGATTCTCATGGTTGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACC
ACCATTTTGTACAAGCTCAAGCTCGGTGAGATTGTCACCACCATTCCCACTATTGGTTTC
AATGTGGAAACTGTGGAGTACAAGAACATTAGTTTCACTGTGTGGGATGTCGGGGGTCAA
GACAAGATCCGTCCCTTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACCCAAGGTCTCATCTTTGTG
GTCGACAGCAATGACAGGGACCGTGTTGTTGAGGCCAGAGATGAACTGCACAGAATGCTT
AATGAGGATGAGCTGCGTGATGCTGTTCTGCTCGTGTTTGCTAACAAACAGGATCTTCCA
AATGCCATGAACGCTGCTGAAATCACTGATAAGCTTGGTCTCCACTCTCTCCGCCAGCGT
CACTGGTACATCCAGAGCACATGTGCCACTTCAGGCGAGGGGCTTTACGAAGGTCTTGAC
TGGCTGTCCAACAACATTGCCGGCAAGGCATAGAGGGAAGATGCGTGGTTGAGTTGATTT
TGCTGGGAAAATCTGGATGCAGTAGCAAACATTATGTGATATTTTTT*CTATGGTGTTCT
TATTGTTCTGTGTTTTTT*CTATGGGGATATGTGGATTTGATTTTGTGGTCGTTGTTCTG
ATTTGTGTAA*GAGGGTTTCTCTTGTACG

QA 6 814 6 814
DS 

RD RS1D908JQ 849 0 0
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ATCCGCCGAAGAGTGAAGAAGCAAGGATGGGGTTGTCGTTCGCGAAGCTGTTTAGCAGGC
TTTTTGCCAAGAAGGAGATGAGGATTCTCATGGTTGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACCA
CCATTTTGTACAAGCTCAAGTTCGGTGAGATTGTCACCACCATTCCCACTATTGGTTTCA
ATGTGGAAACTGTGGAGTACAAGAACATTAGTTTCACTGTGTGGGATGTCGGGGGTCAAG
ACAAGATCCGTCCCTTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACCCAAGGTCTCATCTTTGTGG
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ATGAGGATGAGCTGCGTGATGCTGTTCTGCTCGTGTTTGCTAACAAACAGGATCTTCCAA
ATGCCATGAACGCTGCTGAAATCACTGATAAGCTTGGTCTCCACTCTCTCCGCCAGCGTC
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GGCTGTCCAACAACATTGCCGGCAAGGCATAGAGGGAAGATGCGTGGTTGAGTCGATTTT
GCTGGGAAAATCTGGATGCAGTAGCAAACATTATGTGATATTTTTTTCTATGGTGTTCTT
ATTGTTCTGTGTTTTTTTCTATGGGGATATGTGGATTTGATTTCGTGGTCGTTGTTCTGA
TTTGTGTAAAGAGGGTTTCTCTTGTACGTAGAACATAGAAACTACCTTTTACTATAGCTT
GTAATAT
TG

QA 1 847 1 847
DS 

RD RS1C950JQ 853 0 0
TCAAATCCG
TCGTCTTCGTCGTCGTCTCTCTATCAGATACCCGCGGAAGAGTGAAGAAGCAAGGATGGG
GTTGTCGT*CGCGAAGCTGTT*AGCAGGCTTTT*GCCAAGAAGGAGATGAGGATTCTCAT
GGTTGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACCACCATTTTGTACAAGCTCAAGCTCGGTGAGAT
TGTCACCACCATTCCCACTATTGGTTTCAATGTGGAAACTGTGGAGTACAAGAACATTAG
TTTCACTGTGTGGGATGTCGGGGGTCAAGACAAGATCCGTCCCTTGTGGAGGCACTACTT
CCAGAACACCCAAGGTCTCATCTTTGTGGTCGACAGCAATGACAGAGACCGTGTTGTTGA
GGCCAGAGATGAACTGCACAGAATGCTTAATGAGGATGAGCTGCGTGATGCTGTTCTTCT
CGTGTTTGCTAACAAACAGGATCTTCCAAATGCCATGAACGCTGCTGAAATCACTGATAA
GCTTGGTCTCCACTCTCTCCGCCAGCGTCACTGGTACATCCAGAGCACATGTGCCACTTC
AGGCGAGGGGCTTTACGAAGGTCTTGACTGGCTGTCCAACAACATTGCCGGCAAGGCATA
GAGGGAAGATGCGTGGTTGAGTTGATTTTGCTGGGAAAATCTGGATGCAGTGGCAAACAT
TATGTGATATTTTTTTCTATGGTGTTCTTATTGTTCTGTGTTTTTTTCTATGGGGATATG
TGGATTTGATTTTGTGGTCGTTGTTCTGATTTGTGTAAAGAGGGTTTCTCTTGTACGTAG
AACATAGAAACTACCTTTTACTATAGCTTGTAATATCGAATTCTCTACTGCTTTCGTGGT
CAAA

QA 10 853 10 853
DS 

RD RS1B776JQ 747 0 0
GCCAAGAAGGAGATGAGGATTCTCATGGTTGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACCACCATT
TTGTACA*GCTCAAGCTCGGTGAGATTGTCACCACCATTCCCACTATTGGTTTCAATGTG
GAAACTGTGGAGTACAAGAACATTAGTTTCACTGTGTGGGATGTCGGGGGTCAAGACAAG
ATCCGTCCCTTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACCCAAGGTCTCATCTTTGTGGTCGAC
AGCAATGACAGAGACCGTGTTGTTGAGGCCAGAGATGAACTGCACAGAATGCTTAATGAG
GATGAGCTGCGTGATGCTGTTCTGCTCGTGTTTGCTAACAAACAGGATCTTCCAAATGCC
ATGAACGCTGCTGAAATCACTGATAAGCTTGGTCTCCACTCTCTCCGCCAGCGTCACTGG
TACATCCAGAGCACATGTGCCACTTCAGGCGAGGGGCTTTACGAAGGTCTTGACTGGCTG
TCCAACAACATTGCCGGCAAGGCATAGAGGGAAGATGCGTGGTTGAGTTGATTTTGCTGG
GAAAATCTGGATGCAGTAGCAAACATTATGTGATATTTTTTTCTATGGTGTTCTTATTGT
TCTGTGTTTTTTTCTATGGGGATATGTGGATTTGATTTTGTGGTCGTTGTTCTGATTTGT
GTAAAGAGGGTTTCTCTTGTACGTAGAACATAGAAACTACCTTTTACTATAGCTTGTAAT
ATCGAATTATCTACTGCTTTCGT
GGCC

QA 1 743 1 743
DS 



CO CL67Contig2 768 3 14 U
GGGGCGTCGCGCATCTCTCTCTCTTTCGATCGATCAGAGTGAAGCAAGGATGGGTTTGTC
TTTCGGGAAGCTGTTTAGCAAGCTATTTGCCAAGAAGGAGATGAGGATTCTGATGGTTGG
TCTTGATGCGGCTGGTAAGACCACCATTTTGTACAAGCTCAAGCTCGGAGAGATTGTCAC
CACCATTCCCACTATTGGGTTCAATGTTGAAACTGTGGAGTACAAGAACATCAGTTTCAC
AGTGTGGGATGTCGGGGGTCAAGACAAGATTCGTCCCTTGTGGAGGCATTACTTCCAGAA
CACTCAAGGACTCATCTTTGTGGTGGACAGCAATGACAGAGACCGTGTTGTTGAGGCTAG
AGATGAATTGCACAGAATGCTCAATGAGGATGAGCTACGTGATGCTGTTCTGCTCGTGTT
TGCTAACAAACAGGATCTTCCAAATGCCATGAACGCAGCTGAGATCACTGATAAGCTTGG
TCTCCACTCTCTCCGTCAGCGTCACTGGTACATCCAGAGCACCTGTGCCACTTCAGGCGA
GGGGCTTTACGAAGGTCTTGACTGGTTGTCCAACAACATCGCCGGCAAGGCGTAGAGGAG
AAGTTTGTGGTTGAGTTGATTTTGCTGGGCAAATCTGGATGCAGGGGCAAACATTATCTG
ATTTTTTCTTCTTTATTGTTCTCTTCTTTTTCTTTTTGTTTGTTTCGAGTATGTGGATTT
GATTTTGTGATCGTTGTTCTGATCTGTGCAAGGAGGAGTCTCTTGCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C428JQ C 438
AF RS1DI08TF U 1
AF RS1C428TF U 2
BS 1 327 RS1DI08TF
BS 328 328 RS1C428TF
BS 329 360 RS1DI08TF
BS 361 361 RS1C428TF
BS 362 468 RS1DI08TF
BS 469 469 RS1C428TF
BS 470 471 RS1DI08TF
BS 472 472 RS1C428TF
BS 473 522 RS1DI08TF
BS 523 523 RS1C428TF
BS 524 652 RS1DI08TF
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BS 654 662 RS1DI08TF
BS 663 768 RS1C428TF

RD RS1C428JQ 187 0 0
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AGCGTCACTGGTACATCCAGAGCACCTGTGCCACTTCAGGCGAGGGGCTTTACGAAGGTC
TTGACTGGTTGTCCAACAACATCGCCGGCAAGGCGTAGAGGAGAAGTTTGTGGTTGAGTT
GATTTTG

QA 1 187 1 187
DS 

RD RS1DI08TF 662 0 0
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TTTCGGGAAGCTGTTTAGCAAGCTATTTGCCAAGAAGGAGATGAGGATTCTGATGGTTGG
TCTTGATGCGGCTGGTAAGACCACCATTTTGTACAAGCTCAAGCTCGGAGAGATTGTCAC
CACCATTCCCACTATTGGGTTCAATGTTGAAACTGTGGAGTACAAGAACATCAGTTTCAC
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CACTCAAGGACTCATCTTTGTGGTGGATAGCAATGACAGAGACCGTGTTGTTGAGGCTAG
GGATGAATTGCACAGAATGCTCAATGAGGATGAGCTACGTGATGCTGTTCTGCTCGTGTT
TGCTAACAAACAGGATCTTCCAAATGCCATGAACGCAGCTGAGATCACCGACAAGCTTGG
TCTCCACTCTCTCCGTCAGCGTCACTGGTACATCCAGAGCACATGTGCCACTTCAGGCGA
GGGGCTTTACGAAGGTCTTGACTGGTTGTCCAACAACATCGCCGGCAAGGCGTAGAGGAG
AAGTTTGTGGTTGAGTTGATTTTGCTGGGCAAATCTGGATGCAGGGGCAAACGTTATCTG
AT

QA 1 662 1 662
DS 

RD RS1C428TF 767 0 0
GGGTCGCGCATC
TCTCTCTCTCTTTCGATCGATCAGAGTGAAGCAAGGATGGGTTTGTCTTTCGGGAAGCTG
TTTAGCAAGCTATTTGCCAAGAAGGAGATGAGGATTCTGATGGTTGGTCTTGATGCGGCT
GGTAAGACCACCATTTTGTACAAGCTCAAGCTCGGAGAGATTGTCACCACCATTCCCACT
ATTGGGTTCAATGTTGAAACTGTGGAGTACAAGAACATCAGTTTCACAGTGTGGGATGTC
GGGGGTCAAGACAAGATTCGTCCCTTGTGGAGGCATTACTTCCAGAACACTCAAGGTCTC
ATCTTTGTGGTGGACAGCAATGACAGAGACCGTGTTGTTGAGGCTAGAGATGAATTGCAC
AGAATGCTCAATGAGGATGAGCTGCGTGATGCTGTTCTGCTCGTGTTTGCTAACAAACAG
GATCTTCCAAATGCCATGAACGCAGCTGAGATCACTGATAAGCTTGGTCTCCACTCTCTC
CGTCAGCGTCACTGGTACATCCAGAGCACCTGTGCCACTTCAGGCGAGGGGCTTTACGAA
GGTCTTGACTGGTTGTCCAACAACATCGCCGGCAAGGCGTAGAGGAGAAGTTTGTGGTTG
AGTTGATTTTGCTGGGCAGATCTGGATGCAGGGGCAAACATTATCTGATTTTTTCTTCTT
TATTGTTCTCTTCTTTTTCTTTTTGTTTGTTTCGAGTATGTGGATTTGATTTTGTGATCG
TTGTTCTGATCTGTGCAAGGAGGAGTCTCTTGCAC

QA 13 767 13 767
DS 



CO CL67Contig3 677 4 11 U
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GGTAGTTTCTATGTTCTACGTACAAAAAAAACCCTCTTTACACAAATCAAAACAACGACC
ACAAAATCAAATCCACATATCCCCATAGAAAAAAAAACACAGAACAATAAGAACACCATA
GAAAAAAATATCACATAATGTTTGCTACTGCATCCAGATTTTCCCAGCAAAATCAACTCA
ACCACGCATCTTCCCTCTATGCCTTGCCGGCAATGTTGTTGGACAGCCAGTCAAGACCTT
CGTAAAGCCCCTCGCCTGAAGTGGCACATGTGCTCTGGAAGTAGTGCCTCCACAAGGGAC
GGATCTTGTCTTGACCCCCGACATCCCACACAGTGAAACTAATGTTCTTGTACTCCACAG
TTTCCACATTGAAACCAATAGTGGGAATGGTGGTGACAATCTCACCGAGCTTGAGCTTGT
ACAAAATGGTGGTCTTACCAGCAGCATCAAGACCAACCATGAGAATCCTCATCTCCTTCT
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TCGGCGGATATCTGATAGAGAGACGACGACGAAGACGAACGGAATTTGAAAGAGAAGGAA
AGAGAGAGAGAGCTTCC


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1GP15JQ U 1
AF RS1GO10JQ U 35
AF RS1GO10TF C 2
AF RS1GP15TF C 4
BS 1 62 RS1GP15JQ
BS 63 63 RS1GO10JQ
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BS 272 339 RS1GO10JQ
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RD RS1GP15JQ 157 0 0
GACAACAGAACAAAGACAACGAAAGAAGTAGATAATTCGATATTACAAGCTATAGTAAAA
GGGAGTTTCTATGTTCTACGTACAAAAAAAACCCTCTTTACACAAATCAAAACAACGACC
ACAAAATCAAATCCCCATATCCCCATAGAAAAAAAAA

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DS 

RD RS1GO10JQ 312 0 0
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TCTTTACACAAATCAAAACAACGACCACAAAATCAAATCCACATATCCCCATAAAAAAAA
AAACACAGAACAATAAGAACACCATAAAAAAAAATATCACATAATGTTTGCTACTGCATC
CAGATTTTCCCAGCAAAATCAACTCAACCACGCATCTTCCCTCTATGCCTTGCCGGGAAT
GTTGTTGGACAGCCAGTCAAGACCTTCGTAAAGCCCCTCGCCTGAAGTGGCACATGTGCT
CTGGA
AGTAGTG

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DS 

RD RS1GO10TF 676 0 0
AC
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AGTTTCTATGTTCTACGTACAAGAGAAACCCTCTTTACACAAATCAAAACAACGACCACA
AAATCAAATCCACATATCCCCATAGAAAAAAAAACACAGAACAATAAGAACACCATAGAA
AAAAATATCACATAATGTTTGCTACTGCATCCAGATTTTCCCAGCAAAATCAACTCAACC
ACGCATCTTCCCTCTATGCCTTGCCGGCAATGTTGTTGGACAGCCAGTCAAGACCTTCGT
AAAGCCCCTCGCCTGAAGTGGCACATGTGCTCTGGAAGTAGTGCCTCCACAAGGGACGGA
TCTTGTCTTGACCCCCGACATCCCACACAGTGAAACTAATGTTCTTGTACTCCACAGTTT
CCACATTGAAACCAATAGTGGGAATGGTGGTGACAATCTCACCGAGCTTGAGCTTGTACA
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CAAAAAGCCTGCTAAACAGCTTCGCGAACGACAACCCCATCCTTGCTTCTTCACTCTTCG
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GAGAGAGAGCTTCC

QA 3 676 3 676
DS 

RD RS1GP15TF 674 0 0
AACAGAACAAAGACAACGAAAGAAGTAGATAATTCGATATTACAAGCTATAGTAAAAGGT
AGTTTCTATGTTCTACGTACAAGAGAAACCCTCTTTACACAAATCAAAACAACGACCACA
AAATCAAATCCACATATCCCCATAGAAAAAAAAACACAGAACAATAAGAACACCATAGAA
AAAAATATCACATAATGTTTGCTACTGCATCCAGATTTTCCCAGCAAAATCAACTCAACC
ACGCATCTTCCCTCTATGCCTTGCCGGCAATGTTGTTGGACAGCCAGTCAAGACCTTCGT
AAAGCCCCTCGCCTGAAGTGGCACATGTGCTCTGGAAGTAGTGCCTCCACAAGGGACGGA
TCTTGTCTTGACCCCCGACATCCCACACAGTGAAACTAATGTTCTTGTACTCCACAGTTT
CCACATTGAAACCAATAGTGGGAATGGTGGTGACAATCTCACCGAGCTTGAGCTTGTACA
AAATGGTGGTCTTACCAGCAGCATCAAGACCAACCATGAGAATCCTCATCTCCTTCTTGG
CAAAAAGCCTGCTAAACAGCTTCGCGAACGACAACCCCATCCTTGCTTCTTCACTCTTCG
GCGGATATCTGATAGAGAGACGACGACGAAGACGAACGGAATTTGAAAGAGAAGGAAAGA
GAGAGAGAGCTTCC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 2 14

CO CL68Contig1 955 9 11 U
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GAAATACAAGAAATGGCCACATCAGCAATCCAACACTCCTCTTTTGCCGGCCAAACGGCC
CTGAAGTCCTCCAACGATCTCCTCCGCAAAGTCGGAGCTGCTTCCAACGGTGGTGGTCGC
GTCGTCATGCGCCGTACCGTCAAGTCTACTCCTCAGAGCATCTGGTACGGACCAGACCGT
CCCAAGTACTTAGGACCATTCTCAGAGAACACACCATCGTACCTAACCGGAGAGTACCCC
GGAGACTACGGCTGGGACACCGCCGGTCTCTCGGCCGACCCAGAAACATTTGCAAAGAAC
CGTGAGCTTGAAGTAATCCACAGCAGATGGGCAATGCTCGGCGCTTTAGGTTGCACATTC
CCAGAGATCCTCTCCAAAAACGGTGTTAAATTCGGTGAAGCCGTGTGGTTCAAGGCAGGG
TCTCAGATCTTCTCAGAAGGAGGGCTTGACTACCTCGGAAACCCTAACTTGATCCACGCG
CAAAGCATATTAGCTATCTGGGCTTCTCAAGTTGTGCTGATGGGGTTAATCGAAGGGTAC
AGAATCGGTGGTGGACCTCTTGGTGAAGGACTTGACCCGCTTTACCCGGGTGGGGCGTTT
GACCCGTTGAACTTAGCTGAGGATCCTGAGGCGTTTTCCGAATTGAAAGTGAAGGAGCTT
AAGAACGGTCGGCTTGCCATGTTCTCCATGTTTGGTTTCTTTGTCCAAGCCATTGTTACT
GGTAAAGGACCAATTGAGAATCTTTTCGACCATGTTGCGGACCCTGTGGCTAACAATGCC
TGGGCTTACGCCACCAACTTCGTCCCCGGAAAATAGAATATTATCAGCTGATGTATGCTT
TCAAAACAATTAATGTATGGGAAATATGTGTCTGTTGATTTGAACGTTCCGTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 50 50 50 50 35 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1AL68JQ C 367
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AF RS1EE17TF U 1
AF RS1C172TF U 1
AF RS1CS63JQ C 493
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AF RS1C172JQ C 330
AF RS1EE17JQ C 331
AF RS1AJ42TF U 470
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ACCCTCTCCAAAAACGGTGTTAAATTCGGTGAAGCCGTGTGGTTCAAGGCAGGG

QA 1 114 1 114
DS 

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GGG
ATCTCTTCTTTGCTTTATTTAGCTCTTCATTTGTGTGTTTGCTTGGGAGTTAGAGAAATA
CAAGAAATGGCCACATCAGCAATCCAACACTCCTCTTTTGCCGGCCAAACGGCCCTGAAG
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ATGCGCCGTACCGTCAAGTCTACTCCTCAGAGCATCTGGTACGGACCAGACCGTCCCAAG
TACTTAGGACCATTCTCAGAGAACACACCATCGTACCTAACCGGAGAGTACCCCGGAGAC
TACGGCTGGGACACCGCCGGTCTCTCGGTCGACCCAGAAACATTTGCAAAGAACCGTGAG
CTTGAAGTAATCCACAGCAGATGGGCAATGCTCGGCGCTTTAGGTTGCGCATTCCCAGAG
ATCCTCTCCAAAAACGGTGTTAAATTCGGTGAAGCCGTGTGGTTCAAGGCAGGGTCTCAG
ATCTTCTCAGAAGGAGGGCTTGACTACCTCGGAAACCCTAACTTGATCCACGCGCAAAGC
ATATTAGCTATCTGGGCTTCTCAAGTTGTGCTGATGGGGTTAATCGAAGGGTACAGAATC
GGTGGTGGACCTCTTGGTGAAGGACTTGACCCGCTTTACCCGGGTGGGGCGTTTGACCCG
TTGAACTTAGCTGAG*ATCC

QA 4 683 4 683
DS 

RD RS1EE17TF 686 0 0
GGAGCC
ATCTCTTCTTTGCTTTATTTAGCTCTTCATTTGTGTGTTTGCTTGGGAGTTAGAGAAATA
CAAGAAATGGCCACATCAGCAATCCAACACTCCTCTTTTGCCGGCCAAACGGCCCTGAAG
TCCTCCAACGATCTCCTCCGCAAAGTCGGAGCTGCTTCCAACGGTGGTGGTCGCGTCGTC
ATGCGCCGTACCGTCAAGTCTACTCCTCAGAGCATCTGGTACGGACCAGACCGTCCCAAG
TACTTAGGACCATTCTCAGAGAACACACCATCGTACCTAACCGGAGAGTACCCCGGAGAC
TACGGCTGGGACACCGCCGGTCTCTCGGCCGACCCAGAAACATTTGCAAAGAACCGTGAG
CTTGAAGTAATCCACAGCAGATGGGCAATGCTCGGCGCTTTAGGTTGCACATTCCCAGAG
ATCCTCTCCAAAAACGGTGTTAAATTCGGTGAAGCCGTGTGGTTCAAGGCAGGGTCTCAG
ATCTTCTCAGAAGGAGGGCTTGACTACCTCGGAAACCCTAACTTGATCCACGCGCAAAGC
ATATTAGCTATCTGGGCTTCTCAAGTTGTGCTGATGGGGTTAATCGAAGGGTACAGAATC
GGTGGTGGACCTCTTGGTGAAGGACTTGACCCGCTTTACCCGGGTGGGGCGTTTGACCCG
TTGAACTTAGCTGAG*ATCC

QA 7 686 7 686
DS 

RD RS1C172TF 723 0 0
GGAGCCATCTCTTCTTTGCTTTATTTAGCTCTTCATTTGTGTGTTTGCTTGGGAGTTAGA
GAAATACAAGAAATGGCCACATCAGCAATCCAACACTCCTCTTTTGCCGGCCAAACGGCC
CTGAAGTCCTCCAACGATCTCCTCCGCAAAGTCGGAGCTGCTTCCAACGGTGGTGGTCGC
GTCGTCATGCGCCGTACCGTCAAGTCTACTCCTCAGAGCATCTGGTACGGACCAGACCGT
CCCAAGTACTTAGGACCATTCTCAGAGAACACACCATCGTACCTAACCGGAGAGTACCCC
GGAGACTACGGCTGGGACACCGCCGGTCTCTCGGCCGACCCAGAAACATTTGCAAAGAAC
CGTGAGCTTGAAGTAATCCACAGCAGATGGGCAATGCTCGGCGCTTTAGGTTGCACATTC
CCAGAGATCCTCTCCAAAAACGGTGTTAAATTCGGTGAAGCCGTGTGGTTCAAGGCAGGG
TCTCAGATCTTCTCAGAAGGAGGGCTTGACTACCTCGGAAACCCTAACTTGATCCACGCG
CAAAGCATATTAGCTATCTGGGCTTCTCAAGTTGTGCTGATGGGGTTAATCGAAGGGTAC
AGAATCGGTGGTGGACCTCTTGGTGAAGGACTTGACCCGCTTTACC*GGGTGGGGCGTTT
GACCCGTTGAACTTAGCTGAG*ATCCTGAGGCGTTT*CCGAATTGAAAGTGAAGGAGCTT
AAG

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1CS63JQ 245 0 0
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GCTATTTGGGCTTCTCAAGTTGTGCTGATGGGGTTAATCGAAGGGTACAGAATCGGTGGT
GGACCTCTTGGTGAAGGACTTGACCCGCTTTACCCGGGTGGGGCGTTTGACCCGTTGAAC
TTAGCTGAGGATCCTGAGGCGTTTTCCGAATTGAAAGTGAAGGAGCTTAAGAACGGTCGG
CTTGC

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DS 

RD RS1AL68TF 730 0 0
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AACGGCCCTGAAGTCCTCCAACGATCTCCTCCGCAAAGTCGGAGCTGCTTCCAACGGTGG
TGGTCGCGTCGTCATGCGCCGTACCGTCAAGTCTACCCCTCAGAGCATCTGGTACGGACC
AGACCGTCCCAAGTACTTAGGACCATTCTCAGAGAACACACCATCGTACCTAACCGGAGA
GTACCCCGGAGACTACGGCTGGGACACCGCCGGTCTCTCGGCCGACCCAGAAACATTTGC
AAAGAACCGTGAGCTTGAAGTAATCCACAGCAGATGGGCAATGCTCGGCGCTTTAGGTTG
CACATTCCCAGAGACCCTCTCCAAAAACGGTGTTAAATTCGGTGAAGCCGTGTGGTTCAA
GGCAGGGTCTCAGATCTTCTCAGAAGGAGGGCTTGACTACCTCGGAAACCCTAACTTGAT
CCACGCGCAAAGCATATTAGCTATCTGGGCTTCTCAAGTTGTGCTGATGGGGTTAATCGA
AGGGTACAGAATCGGTGGTGGACCTCTTGGTGAAGGACTTGACCCGCTTTACCCGGGTGG
GGCGTTCGACCCGTTGAACTTAGCTGAGGATCCTGAGGCGTTTTCCGAATTGAAAGTGAA
GGAGCTTAAGAACGGTCGGCTTGCCATGTTCTCCATGTTTGGTTTCTTTGTCCAAGCCAT
TGTTACTGGT

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DS 

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GGCAATGCTCGGCGCTTTAGGTTGCACATTCCCAGAGATCCTCTCCAAAAACGGTGTTAA
ATTCGGTGAAGCCGTGTGGTTCAAGGCAGGGTCTCAGATCTTCTCAGAAGGAGGGCTTGA
CTACCTCGGAAACCCTAACTTGATCCACGCGCAAAGCATATTAGCTATCTGGGCTTCTCA
AGTTGTGCTGATGGGGTTAATCGAAGGGTACAGAATCGGTGGTGGACCTCTTGGTGAAGG
ACTTGACCCGCTTTACCCGGGTGGGGCGTTTGACCCGTTGAACTTAGCTGAGGATCCTGA
GGCGTTTTCCGAATTGAAAGTGAAGGAGCTTAAGAACGGTCGGCTTGCCATGTTCTCCAT
GTTTGGTTTCTTTGTCCAAGCCATTGTTACTGGTAAAGGACCAATTGAGAATCTTTTCGA
CCATGTTGCGGACCCTGTGGCTAACAATGCCTGGGCTTACGCCACCAACTTCGTCCCCGA
AAAATAGAATATTATCAGCTGATGTATGCTTTCAAAACAATTAATGTATGGGAAATATGT
GTCTGTTGATTTGAACGTTCCGTCTT

QA 1 626 1 626
DS 

RD RS1EE17JQ 625 0 0
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GCAATGCTCGGCGCTTTAGGTTGCACATTCCCAGAGATCCTCTCCAAAAACGGTGTTAAA
TTCGGTGAAGCCGTGTGGTTCAAGGCAGGGTTTCAGATCTTTTCAGAAGGAGGGCTTGAC
TACCTTGGAAACCCTAACTTGATCCACGCGCAAAGCATATTAGCTATTTGGGCTTCTCAA
GTTGTGCTGATGGGGTTAATCGAAGGGTACAGAATCGGTGGTGGACCTCTTGGTGAAGGA
CTTGACCCGCTTTACCCGGGTGGGGCGTTTGACCCGTTGAACTTAGCTGAGGATCCTGAG
GCGTTTTCCGAATTGAAAGTGAAGGAGCTTAAGAACGGTCGGCTTGCCATGTTCTCCATG
TTTGGTTTCTTTGTCCAAGCCATTGTTACTGGTAAAGGACCAATTGAGAATCTTTTCGAC
CATGTTGCGGACCCTGTGGCTAACAATGCCTGGGCTTACGCCACCAACTTCGTCCCCGGA
AAATAGAATATTATCAGCTGATGTATGCTTTCAAAACAATTAATGTATGGGAAATATGTG
TCTGTTGATTTGAACGTTCCGTCTT

QA 1 625 1 625
DS 

RD RS1AJ42TF 486 0 0
G
CAAGGCAGGGTCTCAGATCTTCTCAG***GAGGGCTTGACTACCTCGGAAACCCTAACTT
GATCCACGCGCAAAGCATATTAGCTATCTGGGCTTCTCAAGTTGTGCTGATGGGGTTAAT
CGAAGGGTACAGAATCGGTGGTGGACCTCTTGGTGAAGGACTTGACCCGCTTTACCCGGG
TGGGGCGTTTGACCCGTTGAACTTAGCTGAGGATCCTGAGGCGTTTTCCGAATTGAAAGT
GAAGGAGCTTAAGAACGGTCGGCTTGCCATGTTCTCCATGTTTGGTTTCTTTGTCTAAGC
CATTGTTACTGGTAAAGGACCAATTGATAATCTTTTCGACCATGTTGCGGACCCTGTGGC
TAACAATGCCTGGGCTTACGCCACCAACTTCGTCCCCGGAAAATAGAATATTATCAGCTG
ATGTATGCTTTCAAAACAATTAATGTATGGGAAATATGTGTCTGTTGATTTGAACGTTCC
GTCTT

QA 2 486 2 486
DS 



CO CL68Contig2 947 5 21 U
GGAAAACCATCTCATCTCATCCTTGCTTGTTTCTCTTTATTTGTGTTCTTGTTTGGAGCT
AAAGATAAAAAAGAATGGCTACTTCAGCTATCCAACACTCCTCTTTTGCTGGCCAAACGG
CACTTAAGCCCTCCAACGATCTCCTCCGCAAAGTCGGAGCTTCCAACGGTGGTGGTCGTG
TCGTCATGCGTCGTACCGTCAAGTCTACTCCTCAGAGCATCTGGTATGGACCAGACCGTC
CCAAGTACTTAGGACCATTCTCAGAGAACACACCATCATACCTAACCGGAGAATACCCAG
GAGACTACGGCTGGGACACCGCCGGTCTCTCCGCCGACCCAGAAACCTTCGCAAAGAACC
GTGAGCTCGAAGTAATCCACAGCAGATGGGCAATGCTAGGAGCTTTAGGCTGCACCTTCC
CAGAGATTCTCTCCAAAAACGGAGTCAAATTTGGTGAAGCCGTATGGTTCAAGGCAGGTT
CCCAGATCTTCTCAGAAGGAGGACTTGACTACCTCGGAAACCCTAACTTGATCCACGCGC
AAAGCATATTAGCTATATGGGCTTCTCAAGTTGTGCTAATGGGCTTAATCGAAGGGTACA
GAATCGGAGGTGGGCCTCTTGGTGAAGGTCTTGACCCGCTTTACCCGGGTGGGGCATTTG
ACCCGTTAAACTTAGCTGAGGATCCTGAGGCGTTCTCAGAACTGAAAGTGAAGGAGCTCA
AGAACGGTCGGCTTGCGATGTTCTCCATGTTTGGATTCTTTGTCCAAGCAATTGTTACTG
GTAAAGGTCCGATCGAGAACCTGTTTGATCATGTTGCGGACCCTGTGGCTAACAATGCAT
GGGCTTACGCCACCAACTTTGTTCCCGGAAAATAGAGTTTGATCGGATTAATTCATGTAA
CTTCTTTTTATCTGTCAACATTTAATGCATGGAAAATATTTAAGTCG


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 
0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 5 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

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AF RS1GP63TF U 2
AF RS1FK42JQ C 130
AF RS1EN74JQ C 330
AF RS1GS43TF U 575
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GGAAAACCATCTCATCTCATCCTTGCTTGTTTCTCTTTATTTGTGTTCTTGTTT******
**AGATAAAAA*GAATGGCTACTTCAGCTATCCAACACTCCTCTTTTGCTGGCCAAACGG
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CCCAGATCTTCTCAGAAGGAGGACTTGACTACCTCGGAAACCCTAACTTGATCCACGCGC
AAAGCATATTAGCTATATGGGCTTCTCAAGTTGTGCTAATGGGCTTAATCGAAGGGTACA
GAATCGGGGGTGGGCCTCTTGGTGAAGGTCTTGACCCGCTTTACCCGGGTGGGGCATTTG
ACCCGTTAAACTTAGCTGAG*ATCCTGAGGCGTTCTCAGAACTGAAAGTGAAG*AGCTCA
AGAACGGTCGGCTTGCGATGTTCTCCATGTTTGGATTCTTTGTC*AAGCAATTGTT

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GG
AAACCATCTCATCTCATCTTTGCTTGTTTCTCTTTATTTGTGTTCTTGTTTGGAGCTAAA
GATAAAAAAGAATGGCTACTTCAGTTATCCAACACTCCTCTTTTGCTGGCCAAACGGCAC
TTAAGCCCTCCAACGATCTCCTCCGCAAAGTCGGAGCTTCCAACGGTGGTGCCCGTGTTG
TCATGCGTCGTACCGTCAAATCTACTCCTCAGAGCATCTGGTATGGACCAGACCGCCCCA
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AGCTCGAAGTAATCCACAGTAGATGGGCAATGCTAGGAGCTCTAGGCTGCACCTTCCCAG
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AGATCCTCTCAGAAGGAGGACTTGACTACCTCGGAAACCCTAACTTGATCCACGCGCAAA
GCATATTAGCTATATGGGCTTCTCAAGTTGTGCTAATGGGCTTAATCGAAGGGTACAGAA
TCGGAGGTGGACCTCTTGGGGAAGGTCTTGACCCGCTTTACCCGGGTGGGGCATTTGACC
CGTTGAACTTAGCTGAG*ATCCTGAG*CGTTCTCAGAACTGAAAGTGAAG*AGCTCAAGA

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GTCGTACCGTCAAGTCTACTCCTCAGAGCATCTGGTATGGACCAGACCGTCCCAAGTACT
TAGGACCATTCTCAGAGAACACACCATCATACCTAACCGGAGAATACCCAGGAGACTACG
GCTGGGACACCGCCGGTCTCTCCGCCGACCCAGAAACCTTCGCAAAGAACCGTGAGCTCG
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TCTCCAAAAACGGAGTCAAATTTGGTGAAGCCGTATGGTTCAAGGCAGGTTCCCAGATCT
TCTCAGAAGGAGGACTTGACTACCTCGGAAACCCTAACTTGATCCACGCGCAAAGCATAT
TAGCTATATGGGCTTCTCAAGTTGTGCTAATGGGCTTAATCGGAGGGTACAGAATCG*AG
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GGCTTGCGATGTTCTCCATGTTTGGATTCTTTGTCCAAGCAATTGTTACTGGTAAAGGTC
CGATCTAGAACCTGTTTGATCATGTTGCGGACCCTGTGGCTAACAATGCATGGGCTTACG
CCACCAACTTTGTTCCCGGAAAATAGAGTTTGATCGGATTAATTCATGTAACTTCTTTTT
ATCTGTCAACATTTAATGCATGGAAAATATTTAAGTC

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DS 

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GCAATGCTAGGAGCTTTAGGCTGCACCTTCCCAGAGATTCTCTCCAAAAACGGAGTCAAA
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TACCTCGGAAACCCTAACTTGATCCACGCGCAAAGCATATTAGCTATATGGGCTTCTCAA
GTTGTGCTAATGGGCTTAATCGAAGGGTACAGAATCGGGGGTGGGCCTCTTGGTGAAGGT
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GCGTTTTCAGAACTGAAAGTGAAGGAGCTCAAGAACGGTCGGCTTGCGATGTTCTCCATG
TTTGGATTCTTTGTCCAAGCAATTGTTACTGGTAAAGGTCCGATCGAGAACCTGTTTGAT
CATGTTGCGGACCCTGTGGCTAACAATGCATGGGCTTACGCCACCAACTTTGTTCCCGGA
AAATAGAGTTTGATCGGATTAATTCATGTAACTTCTTTTTATCTGTCAACATTTAATGCA
TGGAAAATATTTAAGTCG

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DS 

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CCCGCTTTACCCGGGTGGGGCATTTGACCCGTTGAACTTAGCTGAGGATCCTGAGGCGTT
CTCAGAACTGAAAGTGAAGGAGCTCAAGAACGGTCGGCTTGCGATGTTCTCCATGTTTGG
ATTCTTTGTCCAAGCAATTGTTACTGGTAAAGGTCCGATTGAGAACCTGTTTGATCATGT
TGCGGACCCTGTAGCTAACAATGCATGGGCTTACGCCACCAACTTTGTTCCCGGAAAATA
GAGTTCGATCGGATTAATTCATGTAACTTCTTTTTATCTGTCAACATTTAATGCATGGAA
AATATTTAAGTC
T

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DS 



AS 3 15

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GGATACCAAAAAACAAACGTAACAATTGGAGAAAATAAAACAATTTTCATCTTCCTCTCC
ATCTCTCTATCTCTCTTCTTCCTTAAAGCAATGGATCGACAAGATTCCGATGACATCATG
AAGTTTCTCGACGGCATGGCTAGCTCCGACGATGTTTTATTTGGTTTTCTCGACGGAGGA
AACCATTCACCGGAGATTTACCATGACTCCGGTAATTTCACCGCCGGTGAAGAATCCGAT
GCTGACAACGATGCAGCAGGTAGCAATTCCGAAGAGAACAAAACCTTTTGGCTTGAACAA
GAACAACTTCTCCAGGCGACACTGTATAGGACAAGTTCAATTGAGACAAAGATTCGACAA
GCAACGAAACAAGCCTTGAAAGAAGTGAGATCAAACGGTACGAAATGTGTCTGCCGAAAA
CCCGTGTCCGGCGGTTGCCGTAGCTGTCTACGCGGCGAAGTGTCTCGCCTTCTCCGAGAG
GCCGGATACGATTGCGTCAGCTGTAAATCCAAGTGGAGAAGTAATCATGAGATCCTTGCA
GGTGAGCATGAATATTTGGAAATCGTGGACCAATCGGGATCGAAGAAAGTCGAGATGCGT
GTGGTGATCGAGCTATCTTTCAGGGCTGAGTTCGAGATGGCGAGAGGTAGTGATGAGTAC
AAGCGACTCGTTGGAATATTACCGGAAGTGTACGTCGGGAAAACAGAGAGGCTAAGAACA
CTGATAAAAATATTGTGCACGGCGGCGAAAAAGTGCATGAAAGACAAGAAAATGCACATG
GGACCTTGGAGAAAACACAAGTACATGCAAGCCAAATGGCTCGGCACCTGCGAGAGAAAA
TCAATGAAGCTGGTTGCTGAGACTGAGACTGAGACTGGGGAGAGTGATATGATTGCCAAA
GCTAAACAGAGAGTTTCTATGTTGAATTATGGTATTTTTGAAAATGTATCCGCCGGAATG
GGCCGTCCGGCCGCCGTAGCTGTCGTATGATTATAGATAAAGACGTACGAAATGATAAAT
ACGTTAGGGTGTGATTAAGTGAAGTGAGTTTTGCATTGAGAGTTTGCGTGGAATCGTCTC
ACCGATGTGCTGTGTGCTCAAATAGGGCTACTTCTTGAACCCATTGTATTATACGCAGTG
TTATTTTAATTAAATAAAATTATATTCCACTGTTTACAT


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RS1A896TF U 1
AF RS1H121TF U 94
AF RS1EQ46TF U 5
AF RS1AA64TF U 1
AF RS1GG96TF U 274
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ATCTCTCTATCTCTCTTCTTCCTTAAAGCAATGGATCGACAAGATTCCGATGACATCATG
AAGTTTCTCGACGGCATGGCTAGCTCCGACGATGTTTTATTTGGTTTTCTCGACGGAGGA
AACCATTCACCGGAGATTTACCATGACTCCGGTAATTTCACCGCCGGTGAAGAATCCGAT
GCTGACAACGATGCAGCAGGTAGCAATTCCGAAGAGAACAAAACCTTTTGGCTTGAACAA
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CCCGTGTCCGGCGGTTGCCGTAGCTGTCTACGCGG

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DS 

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GTTTTATTTGGTTTTCTCGACGGAGGAAACCATTCACCGGAGATTTACCATGACTCCGGT
AATTTCACCGCCGGTGAAGAATCCGATGCTGACAACGATGCAGCAGGTAGCAATTCCGAA
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AGTTCAATTGAGACAAAGATTCGACAAGCAACGAAACAAGCCTTGAAAGAAGTGAGATCA
AACGGTACGAAATGTGTCTGCCGAAAACCCGTGTCCGGCGGTTGCCGTAGCTGTCTACGC
GGCGAAGTGTCTCGCCTTCTCCGAGAGGCCGGATACGATTGCGTCAGCTGTAAATCCAAG
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GAGATGGCGAGAGGTAGTGATGAGTACAAGCGACTCGTTGGAATATTACCGGAAGTGTAC
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TGCATGAAA

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DS 

RD RS1EQ46TF 772 0 0
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CTCTATCTCTCTTCTTCCTTAAAGCAATGGATCGACAAGATTCCGATGACATCATGAAGT
TTCTCGACGGCATGGCTAGCTCCGACGATGTTTTATTTGGTTTTCTCGACGGAGGAAACC
ATTCACCGGAGATTTACCATGACTCCGGTAATTTCACCGCCGGTGAAGAATCCGATGCTG
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AACTTCTCCAGGCAACACTGTATAGGACAAGTTCAATTGAGACAAAGATTCGACAAGCAA
CGAAACAAGCCTTGAAAGAAGTGAGATCAAACGGTACGAAATGTGTCTGCCGAAAACCCG
TGTCCGGCGGTTGCCGTAGCTGTCTACGCGGCGAAGTGTCTCGCCTTCTCCGAGAGGCCG
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AGCATGAATATTTGGAAATCGTGGACCAATCGGGATCGAAGAAAGTCGAGATGCGTGTGG
TGATCGAGCTATCTTTCAGGGCTGAGTTCGAGATGGCGAGAGGTAGTGATGAGTACAAGC
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TAAAAATATTGTGCACG*CGGCGAA*AAGTGCATGAAAGACA
GAAATGCACA

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1AA64TF 848 0 0
GGAT
ACCAAAAAACAAACGTAACAATTGGAGAAAATAAAACAATTTTCATCTTCCTCTCCATCT
CTCTATCTCTCTTCTTCCTTAAAGCAATGGATCGACAAGATTCCGATGACATCATGAAGT
TTCTCGACGGCATGGCTAGCTCCGACGATGTTTTATTTGGTTTTCTCGACGGAGGAAACC
ATTCACCGGAGATTTACCATGACTCCGGTAATTTCACCGCCGGTGAAGAATCCGATGCTG
ACAACGATGCAGCAGGTAGCAATTCCGAAGAGAACAAAACCTTTTGGCTTGAACAAGAAC
AACTTCTCCAGGCGACACTGTATAGGACAAGTTCAATTGAGACAAAGATTCGACAAGCAA
CGAAACAAGCCTTGAAAGAAGTGAGATCAAACGGTACGAAATGTGTCTGCCGAAAACCCG
TGTCCGGCGGTTGCCGTAGCTGTCTACGCGGCGAAGTGTCTCGCCTTCTCCGAGAGGCCG
GATACGATTGCGTCAGCTGTAAATCCAAGTGGAGAAGTAATCATGAGATCCTTGCAGGTG
AGCATGAATATTTGGAAATCGTGGACCAATCGGGATCGAAGAAAGTCGAGATGCGTGTGG
TGATCGAGCTATCTTTCAGGGCTGAGTTCGAGATGGCGAGAGGTAGTGATGAGTACAAGC
GACTCGTTGGAATATTACCGGAAGTGTACGTCGGGAAAACAGAGAGGCTAAGAACACTGA
TAAAAATATTGTGCACGGCGGCGAAAAAGTGCATGAAAGACAAGAAAATGCACATGGGAC
CTTGGAGAAAACACAAGTACATGCAAGCCAAATGGCTCGGCACCTGCGAGAGAAAATCAA
TGAA

QA 5 848 5 848
DS 

RD RS1GG96TF 632 0 0
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AGTTCAATTGAGACAAAGATTCGACAAGCAACGAAACAAGCCTTGAAAGAAGTGAGATCA
AACGGTACGAAATGTGTCTGCCGAAAACCCGTGTCCGGCGGTTGCCGTAGCTGTCTACGC
GGTGAAGTGTCTCGCCTTCTCCGAGAGGCCGGATACGATTGCGTCAGCTGTAAATCCAAG
TGGAGAAGTAATCATGAGATCCTTGCAGGTGAGCATGAATATTTGGAAATCGTGGACCAA
TCGGGATCGAAGAAAGTCGAGATGCGTGTGGTGATCGAGCTATCTTTCAGGGCTGAGTTC
GAGATGGCGAGAGGTAGTGATGAGTACAAGCGACTCGTTGGAATATTACCGGAAGTGTAC
GTCGGGAAAACAGAGAGGCTAATAACACTGATAAAAATATTGTGCACGGCGGCGAAAAAG
TGCATGAAAGACAAGAAAATGCACATGGGACCTTGGAGAAAACACAAGTACATGCAAGCC
AAATGGCTCGGCACCTGCGAGAGAAAATCAATGAAGCTGGTTGCTGAGACTGAGACTGAG
ACTGGGGAGAGTGATATGATTGCCAAAGCTAA

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1EQ46JQ 754 0 0
TTTGGCTTGAACAAGAACAACTTCTCCAGGCAACACTGTATAGGACAAGTTCAATTGAGA
CAAAGATTCGACAAGCAACGAAACAAGCCTTGAAAGAAGTGAGATCAAACGGTACGAAAT
GTGTCTGCCGAAAACCCGTGTCCGGCGGTTGCCGTAGCTGTCTACGCGGCGAAGTGTCTC
GCCTTCTCCGAGAGGCCGGATACGATTGCGTCAGCTGTAAATCCAAGTGGAGAAGTAATC
ATGAGATCCTTGCAGGTGAGCATGAATATTTGGAAATCGTGGACCAATCGGGATCGAAGA
AAGTCGAGATGCGTGTGGTGATCGAGCTATCTTTCAGGGCTGAGTTCGAGATGGCGAGAG
GTAGTGATGAGTACAAGCGACTCGTTGGAATATTACCGGAAGTGTACGTCGGGAAAACAG
AGAGGCTAAGAACACTGATAAAAATATTGTGCACGGCGGCGAAAAAGTGCATGAAAGACA
AGAAAATGCACATGGGACCTTGGAGAAAACACAAGTACAT**AAGCCAAATGGCTCGGCA
CCTGCGAGAGAAAATCCATGAAGCTGGTTGCTGAGACTGAGACTGAGACTGGGGAGAGTG
ATGTGATTGCCAAAGCTAAACAGAGAGTTTCTATGTTGAATTATGGTATTTTTGAAAATG
TATCCGCCGGAATGGGCCGTCCGGCCGCCGTAGCTGTCGTATGATTATAGATAAAGACGT
ACGAAATGATAAATACGTTAGGGTGTGATTAAGT

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TGGAAATCGTGGACCAATCGGGATCGAAGAAAGTCGAGATGCGTGTGGTGATCGAGCTAT
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TATTACCGGAAGTGTACGTCGGGAAAACAGAGAGGCTAAGAACACTGATAAAAATATTGT
GCACGGCGGCGAAAAAGTGCATGAAAGACAAGAAAATGCACATGGGACCTTGGAGAAAAC
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CTGAGACTGAGACTGAGACTGGGGAGAGTGATATGATTGCCAAAGCTAAACAGAGAGTTT
CTATGTTGAATTATGGTATTTTTGAAAATGTATCCGCCGGAATGGGCCGTCCGGCCGCCG
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AAGTGAAGTGAGTTTTGCATTGAGAGTTTGCGTGGAATCGTCTCACCGATGTGCTGTGTG
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AAATTATATTCCACTGTT

QA 1 858 1 858
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ATGAATATTTGGAAATCGTGGACCAATCGGGATCGAAGAAAGTCGAGATGCGTGTGGTGA
TCGAGCTATCTTTCAGGGCTGAGTTCGAGATGGCGAGAGGTAGTGATGAGTACAAGCGAC
TCGTTGGAATATTACCGGAAGTGTACGTCGGGAAAACAGAGAGGCTAATAACACTGATAA
AAATATTGTGCACGGCGGCGAAAAAGTGCATGAAAGACAAGAAAATGCACATGGGACCTT
GGAGAAAACACAAGTACATGCAAGCCAAATGGCTCGGCACCTGCGAGAGAAAATCAATGA
AGCTGGTTGCTGAGACTGAGACTGAGACTGGGGAGAGTGATATGATTGCCAAAGCTAAAC
AGAGAGTTTCTATGTTGAATTATGGTATTTTTGAAAATGTATCCGCCGGAATGGGCCGTC
CGGCCGCCGTAGCTGTCGTATGATTATAGATAAAGACGTACGAAATGATAAATACGTTAG
GGTGTGATTAAGTGAAGTGAGTTTTGCATTGAGAGTTTGCGTGGAATCGTCTCACCGATG
TGTTGTGTGCTCAAATAGGGCTACTTCTTGAACCCATTGTATTATACGCAGTGTTATTTT
AATTAAATAAAATTATATTCCACTGTTTACAT

QA 1 692 1 692
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ACGGCGGCTAAAAAGTGTATGAAAGACAAGAAAATGCACATGGGTCCTTGGAGAAAACAC
AAGTACATGCAAGCCAAATGGCACGGCACTTCCGAAAGAAATCCGTGAACCTGACTCCAG
AGACTGAGAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AB18TF U 1
AF RS1D495TF U 1
AF RS1AL51TF U 1
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QA 1 734 1 734
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AAAGAAGTGAGATCAAAGGGTTTGCAATGTGTTTGCCGGAGACCGATGATCGGCGGTTGC
CGTAGCTGTTTGCGCGGTGAAGTAGCTAGCCGTCTCCGAGATGCCGGCTATGATTGCGTC
ATTTGCAAATCCAAGTGGAGAAGCAATCACGAGATTCCTGCAGGTGAGCATGAATATTTG
GAAATCGTGGACAAATCTGGATCAAAGAAAAGCGAGATCCGTGTGGTGATTGAGCTATCT
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QA 1 850 1 850
DS 



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TCTGAAGTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GF58TF U 1
AF RS1GF58JQ C 208
AF RS1A896JQ C 370
AF RS1BM74TF U 566
BS 1 653 RS1GF58TF
BS 654 909 RS1BM74TF

RD RS1GF58TF 653 0 0
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GGAATATTACCGGAAGTGTACGTCGGGAAAACAGAGAGGCTAAGAACACTGATAAAAATA
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GTTGCTGAGACTGAGACTGAGACTGGGGAGAGTGATATGATTGCCAAAGCTAAACAGAGA
GTTTCTATGTTGAATTATGGTATTTTTGAAAATGTATCCGCCGGAATGGGCCG

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DS 

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TCCGAAGAGAACAAAACCTTTTGGCTTGAACAAGAACAACTTCTCCAGGCGACACTGTAT
AGGACAAGTTCAATTGAGTACAAGCGACTCGTTGGAATATTACCGGAAGTGTACGTCGGG
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AAAGACAAGAAAATGCACATGGGACCTTGGAGAAAACGCAAGTACATGCAAGCCAAATGG
CTCGGCACCTGCGAGAGAAAATCAATGAAGCTGGTTGCTGAGACTGAGACTGAGACTGGG
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GAAAATGTATCCGCCGGAATGGGCCGTCCGGCCGCCGTAGCTGTCGTATGATTATAGATA
AAGACGTACGAAATGATAAATACGTTAGGGTGTGATTAAGTGAAGTGAGTTTTGCATTGA
GAGTTTGCGTGGAATCGTCTCACCGATGTGTTGTGTGCTCAAATAGGGCTACTTCTTGAA
CCCATTGTATTATACGCAGTGTTATTTTAATTAAATAAAATTATATTCCACTGTTTACA
C

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DS 

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TACATGCAAGCCAAATGGCTCGGCACCTGCGAGAGAAAATCAATGAAGCTGGTTGCTGAG
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AAGTGAGTTTTGCATTGAGAGTTTGCGTGGAATCGTCTCACCGATGTGTTGTGTGCTCAA
ATAGGGCTACTTCTTGAACCCATTGTATTATACGCAGTGTTATTTTAATTAAATAAAATT
ATATTCCACTGTTTACA
T

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DS 

RD RS1BM74TF 344 0 0
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TTGAAAATGTATCCGCCGGAATGGGCCGTCCGGCCGCCGTAGCTGTCGTATGATTATAGA
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AACCCATTGTATTATACGCAGTGTTATTTTAATTAAATAAAATTATATTCCACTGTTTAC
ATAAAAATAGATGATAATGATCATTTGATATTTTGTCTGAAGTC

QA 1 344 1 344
DS 



AS 1 16

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GGTCTTGTTTATGTTCACAAACCATCTCTCTCCCATATTTATCTTCCTCGTTTGAATTAC
AGTTCAATGTCTGTATTTGTTTTTTT*AATGTATTTT*CCTAAATAAAACTGAAAAGGTT
TAGTCCATTCTAAAATTACTA


BQ
40 40 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 30 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 65 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 60 90 
90 90 90 90 90 90 90 90 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 65 80 80 30 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 55 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 35 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 45 60 60 60 60 60 60 60 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1GC45TF U 1
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AAAAAA*TAACCACCACAAAGCCAGATGTTGTGAACAACATACAGGAATACAAAGACCTC
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DS 

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AAAA*TAACCACCACAAAGCCAGATGTTGTGAACAACATACAGGAATACAAAGACCTCCA
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TT
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CGTCAGTTATTTCCTAATTTTGTTTTAATCAAGTTATTGTTTAATAGGAGAGATTATTGG
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TTTAGTCC

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AAAAAA*TAACCACCACAAAGCCAGATGTTGTGAACAACATACAGGAATACAAAGACCTC
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AACTTTTCAATTTATGTGGAAAAGCTGTTTTGAATGATCCTAACCCGTGTTAATGATGCG
AGCATAAGATAGCCAACCAACCAAACCCCAAGAATCTTCAAACCAAATTGGAGATATTTT
ATCGTCAGTTATTTCCTAATTTTGTTCTAATCAAGTTATTGTTTAATAGGAGAGATTATT
GGTCTTGTTTATGTTCACAAACCATCTCTCTCCCATATTTATCTTCCTCGTTTGAATTAC
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TAGTCTATTCTAAAATTACTA

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DS 

RD RS1GA47JQ 435 0 0
T
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AGATTATTGGTCTTGTTTATGTTCACAAACCATCTCTCTCCCATATTTATCTTCCTCGTT
TGAATTACAGTTCAATGTCTGTATTTGTTTTTTT*AATGTATTTT*CCTAAATAAAACTG
AAAAGGTTTAGTC
G

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DS 

RD RS1AL29JQ 472 0 0
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TCACAAACCATCTCTCTCCCATATTTATCTTCCTCGTTTGAATTACAGTTCAATGTCTGT
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DS 

RD RS1E226JQ 517 0 0
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ATCAAGTTATTGTTTAATAGGAGAGATTATTGGTCTTGTTTATGTTCACAAACCATCTCT
CTCCCATTTTTATCTTCCTCGTTTGAATTACAGTTCAATGTCTGTATTTGTTTTTTTTAA
TGTATTTT*CCTAAATAAAACTGAAAAGGTTTAGTCC

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DS 

RD RS1ET15TF 659 0 0
TT
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AA*GAGTAATTATTAATACCTACTAATCAATCAAAAAA*TGAAGACCATTCCGTTAATGT
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CAGATGTTTGCAAAACAAGTCTTGATTTCTGCATGCGCGAAATTCCAAAAAA*TAACCAC
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TACTGTATATTATCAAAAGATACAGCTAATTTTTTTCGTCTTGCCAAACTTTTCAATTTA
TGTGGAAAAGCTGTTTTGAATGATCCTAACCCGTGTTAATGATGCGAGCGTAAGATAGCC
AACCAACCAAACCCCAAGAATCTTCAAACCAAATTGGAGATATTTTATCGTCAGTTATTT
CCTAATTTTGTTTTAATCAAGTTATTGTTTAATAGGAGAGATTATTGGTCTTGTTTATGT
TTACAAACCATCTCTCTCCCATATTTATCTTCCTCGTTTGAATTACAGTTCAATGTCTGT
ATTTGTTTTTTT*AATGTATTTT*CCTAAATAAAACTGAAAAGGTTTAGTCT
AAAAA

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DS 

RD RS1AL29TF 666 0 0
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ATATTGTTACAAAAAA*GAGTAATTATTAATACCTACTAATCAATCAAAAAA*TGAAGAC
CATTCCGTTAATGTGCATCGCCTTCGTCATACTCTTGACATCGTTCCCGGCTACGATCAA
GAGTAGCAAGCTCGCAGATGTTTGCAAAACAAGTCTTGATTTCTGCATGCGCGAAATTCC
AAAAAA*TAACCACCACAAAGCCAGATGTTGTGAACAACATACAGGAATACAAAGACCTC
CATCAAGATCATGTTACTGTATATTATCAAAAGATACAGCTAATTTTTTTCGTCTTGCCA
AACTTTTCAATTTATGTGGAAAAGCTGTTTTGAATGATCCTAACCCGTGTTAATGATGCG
AGCGTAAGATAGCCAACCAACCAAACCCCAAGAATCTTCAAACCAAATTGGAGATATTTT
ATCGTCAGTTATTTCCTAATTTTGTTTTAATCAAGTTATTGTTTAATAGGAGAGATTATT
GGTCTTGTTTATGTTCACAAACCATCTCTCTCCCATATTTATCTTCCTCGTTTGAATTAC
AGTTCAATGTCTGTATTTGTTTTTTT*AATGTATTTTTCCTAAATAAAACTGAAAAGGTT
TAGTCC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RS1CH77JQ 677 0 0
GTGCGGCCGGGGG
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ATTGTTACAAAAAA*GAGTAATTATTAATATCTACTAATCAATCAAAAAAATGAAGACCA
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RD RS1GC45TF 666 0 0
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T

QA 1 665 1 665
DS 



AS 2 12

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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

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GG
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GACTGGGC

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GGCGAGAGGATTGAAGAAGCATCTGAAGAGGCTCAATGCTCCCAAGCATTGGATGCTTGA
CAAACTTGGTGGCGCCTTCGCCCCCAAGCCGTCTTCTGGACCACACAAGTCGAGGGAGTG
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CATCTCCATCCTCATGCAAAGGCATATCCAAGTTGATGGAAAAGTCAGGACTGACAAGAC
TTACCCTGCTGGTTTCATGGATGTTGTCTCTATCCCCAAGACGAATGAGAACTTCCGTCT
TCTGTATGACACCAAGGGACGTTTCCGTCTCCACTCCATCAGGGACGAGGAAGCTAAGTT
CAAGCTTTGCAAGGTTAGGACTATCAGTTTGGGGCAGAAGGGGATCCCTTACCTCAACAC
TTACGATGGCCGCACCATCCGTTACCCCGACCCGCTCATCAAGCCGAACGACACCATCAA
GCTAGACCTCGAGGAGAACAAGGTTGTGGAGTTCATCAAGTTCGACGTTGGCAACGTTGT
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CAAGGGAAGCTTTGAGACGATCCATATTCAAGACTCGACTGGGCATGAGTTTGCAACGAG
GTTGGGGAATGTGTTTACTCTCGGGAAAGGG

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ACAAGTCGAGGGAGTGCCTTCCTCTTGTCCTGATCATCAGGAACAGGTTGAAGTACGCTT
TGACATACCGTGAAGTCATCTCCATCCTCATGCAAAGGCATATCCAAGTTGATGGAAAAG
TCAGGACTGACAGGACATACCCTGCTGGCTTCATGGATGTTGTATCCATCCCCAAGACGA
ATGAGAACTTCTGTCTTCTGTATGACACCAAGGGACGTTTCCGTCTCCACTCCATCAGGG
ACGAGGAAGCTAAGTTCAAGCTTTGCAAGGTTAGGACTATCAGTTTGGGGAAGAAGGGAA
TCCCTTACCTCAACACTTACGATGGCCGCACCATCCGTTACCCCGACCCGCTCATCAAGC
CAAACGACACCATCAAGCTAGACCTCGAGGAGAACAAGGTTGTGGAGTTCATCAAGTTCG
ACGTTGGCAACGTTGTGATGGTGACTGGGGGTAGAAACAGAGGGCGTGTGGGTGTGATCA
AGAACCGTGAGAAGCACAAGGGAAGCTTTGAGACGATTCACATTCAAGACTCGAC*GGGC
ATGAGTATGCAACGAGGTTGGGGAATGTGTTTACTCTCGGGAAAGGAC**AAGCCGTGGG
TGTCTCT

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DS 

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ACTTCCGTCTTCTGTATGACACCAAGGGACGTTTCCGTCTCCACTCCATCAGGGACGAGG
AAGCTAAGTTCAAGCTTTGCAAGGTTAGGGCTATCAGTTTGGGGCAGAAGGGGATCCCTT
ACCTCAACACTTACGATGGCCGCACCATCCGTTACCCCGACCCGCTCATCAAGCCGAACG
ACACCATCAAGCTAGACCTCGAGGAGAACAAGGTTGTGGAGTTCATCAAGTTCGACGTTG
GCAACGTTGTGATGGTGACTGGGGGTAGAAACAGAGGGCGTGTGGGTGTGATCAAGAACC
GTGAGAAACACAAGGGAAGCTTTGAGACGATCCACATTCAAGACTCGACTGGGCATGAGT
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TTCCCAAGGGTAAAGGTATCAAGCTTACCATCATTGAGGAAGCTAGAAAGAGGCTTTCTG
GTCAACAAGCTGCTTAAAAA

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DS 

RD RS1A211TR 801 0 0
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ATATCCAAGTTGATGGAAAAGTCAGGACTGACAAGACTTACCCTGCTGGTTTCATGGATG
TTGTCTCTATCCCCAAGACGAATGAGAACTTCCGTCTTCTGTATGACACCAAGGGACGTT
TCCGTCTCCACTCCATCAGGGACGAGGAAGCTAAGTTCAAGCTTTGCAAGGTTAGGACTA
TCAGTTTGGGGCAGAAGGGGATCCCTTACCTCAACACTTACGATGGCCGCACCATCCGTT
ACCCCGACCCGCTCATCAAGCCGAACGACACCATCAAGCTAGACCTCGAGGAGAACAAGG
TTGTGGAGTTCATCAAGTTCGACGTTGGCAACGTTGTGATGGTGACTGGGGGTAGAAACA
GAGGGCGTGTGGGTGTGATCAAGAACCGTGAGAAGCACAAGGGAAGCTTTGAGACGATCC
ATATTCAAGACTCGACTGGGCATGAGTTTGCAACGAGGTTGGGGAATGTGTTTACTCTCG
GGAAAGGGACGAAGCCGTGGGTGTCTCTTCCCAAGGGTAAAGGTATCAAGCTTACCATCA
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GAAGGATATGTTTCGTTTTACTCTTGTGTTGTAGACTCGCTACTTGTCTCGGTTTGTAGG
TTTTTTCCTCTTTTTATGTTGCTTGTTTGCAAAACCTATTACAAGACAGTTTTAAGACTC
CAGTAGAGCGTTTT
TGTATGC

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DS 

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GGACGAGGAAGCTAAGTTCAAGCTTTGCAAGGTTAGGACTATCAGTTTGGGGCAGAAGGG
GATCCCTTACCTCAACACTTACGATGGCCGCACCATCCGTTACCCCGACCCGCTCATCAA
GCCGAACGACACCATCAAGCTAGACCTCGAGGAGAACAAGGTTGTGGAGTTCATCAAGTT
CGACGTTGGCAACGTTGTGATGGTGACTGGGGGTAGAAACAGAGGGCGTGTGGGTGTGAT
CAAGAACCGTGAGAAGCACAAGGGAAGCTTTGAGACGATCCATATTCAAGACTCGACTGG
GCATGAGTTTGCAACGAGGTTGGGGAATGTGTTTACTCTCGGGAAAGGGACGAAGCCGTG
GGTGTCTCTTCCCAAGGGTAAAGGTATCAAGCTTACCATCATTGAGGAAGCTAGAAAGAG
GCTTTCTGGTCAACAAGCTGCTTAAAAATATAATTATCGTTGAAGGATATGTTTCGTTTT
ACTCTTGTGTTGTAGACTCGCTACTTGTCTCGGTTTGTAGGTTTTTTCCTCTTTTTATGT
TGCTTGTTTGCAAAACCTATTACAAGACAGTTTTAAGACTCCAGTAGAGCGTTTT
TGTATGC

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DS 

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AACAGAGGGCGTGTGGGTGTGATCAAGAACCGTGAGAAGCATAAGGGAAGCTTTGAGACG
ATCCACATTCAAGACTCGACGGGGCATGAGTTTGCAACGAGGTTGGGTAATGTGTTTACT
CTCGGGAAAGGGACGAAGCCGTGGGTGTCTCTTCCCAAGGGTAAAGGTATCAAGCTTACC
ATCATTGAGGAAGCTAGAAAGAGGCTTTCTGCTCAACAAGCTGCTTAAAAAATTAATTAT
CGTTGAAGGATATGTTTCGTTTTACTCTTGTGTTGTAGACTCGCTACTTGTCTCGGTTTG
GAGGTTTTTTCCTCTTTTTATGTTGCTTGTTTGCAGAACCTATTACAAGACAGTTTTAAG
ACTCCAGTAGAGTGTTTTGTATGGAAATTTTTAGTAATTTTACT

QA 1 464 1 464
DS 



CO CL71Contig2 1009 3 2 U
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CTTGTAATAGGTTTTGCAAACAAGCAAAATAAAAAGAGGAAAAAACCTCCAAACCGGGAC
AAAGTAGCGAGTCTACAACACAAAAGTAAAACGAAACATATCCTTCAACGATAATTAATT
TTTTAAGCAGCTTGTTGACCAGAAAGCCTCTTTCTAGCTTCTTCAATGATGGTAAGCTTG
ATACCTTTACCCTTGGGAAGAGACACCCACGGCTTGGTCCCTTTCCCGAGAGTAAACACA
TTCCCCAACCTCGTTGCAAACTCATGCCCCGTCGAGTCTTGAATGTGAATCGTCTCAAAG
CTTCCCTTGTGCTTCTCACGGTTCTTGATCACACCCACACGCCCTCTGTTTCTACCCCCA
GTCACCATCACAACGTTGCCAACGTCGAACTTGATGAACTCCACAACCTTGTTCTCCTCG
AGGTCTAGCTTGACGGTGTCGCTTGGCTTGATGAGCGGGTCGGGGTAACGGATGGTGCGG
CCATCGTAAGTGTTGAGGTAAGGGATTCCCTTCTTCCCCAAACTGATAGTCCTAACCTTG
CAAAGCTTGAACTTAGCTTCCTCGTCCCTGATGGAGTGGAGACGGAAACGTCCCTTGGTG
TCATACAGAAGACGGAAGTTCTCATTCGTCTTGGGGATGGATACAACATCCATGAAGCCA
GCAGGGTATGTCTTGTCAGTCCTGACTTTACCATCGACTTGGATATGCCTTTGCATGAGG
ATGGAGATGACTTCACGGTATGTCAAAGCGTACTTCAACCTGTTCCTGATGATCAGGACA
AGGGGAAGACACTCCCTCGACTTGTGAGGTCCAGAAGACGGCTTGGGGGCGAAGGCGCCA
CCAAGTTTGTCAAGCATCCAATGCTTGGGTGCATTGAGCCTCTTCAGATGCTTCTTCAAT
CCTCTCGCCATGTTTGCAGGTGTTGCGAGCTGGAGGACTTGTGATTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CG05JQ U 56
AF RS1FE81JQ U 1
AF RS1DB55TF C 652
BS 1 749 RS1FE81JQ
BS 750 1009 RS1DB55TF

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TGGTGTCATACAGAAGACAGAAGTTCTCATTCGTCTTGGGGATGGATACAACATCCATGA
AGCCA

QA 1 665 1 665
DS 

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CTTCCCTTGTGCTTCTCACGGTTCTTGATCACACCCACACGCCCTCTGTTTCTACCCCCA
GTCACCATCACAACGTTGCCAACGTCGAACTTGATGAACTCCACAACCTTGTTCTCCTCG
AGGTCTAGCTTGACGGTGTCGCTTGGCTTGATGAGCGGGTCGGGGTAACGGATGGTGCGG
CCATCGTAAGTGTTGAGGTAAGGGATTCCCTTCTTCCCCAAACTGATAGTCCTAACCTTG
CAAAGCTTGAACTTAGCTTCCTCGTCCCTGATGGAGTGGAGACGGAAACGTCCCTTGGTG
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GCAGGGTATGTCTTGTCAGTCCTGACTTT

QA 1 749 1 749
DS 

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ATGAAGCCAGCAGGGTATGTCTTGTCAGTCCTGACTTTACCATCGACTTGGATATGCCTT
TGCATGAGGATGGAGATGACTTCACGGTATGTCAAAGCGTACTTCAACCTGTTCCTGATG
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AAGGCGCCACCAAGTTTGTCAAGCATCCAATGCTTGGGTGCATTGAGCCTCTTCAGATGC
TTCTTCAATCCTCTCGCCATGTTTGCAGGTGTTGCGAGCTGGAGGACTTGTGATTCCC

QA 1 358 1 358
DS 



AS 1 15

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CTCC***CTCTCTCTGCGTCCTCTGCTTTCGCTTTCGGCTCCTGCAAAGAAGGCTGGTAC
TTCCGCTGCATCGGCCTCGACCCGTGAAACCCTAATCTCGATTTCCATCTACAATTTTTT
TTTTT*GTTTTCTTTTTTAAAATCTCTC**TCTATCAAAGATGTTGCTCTACAACAAGCA
GAAGAAGAACGCTAAGGGAAACCGGATCCTCATCAGCGTAACCGTTCTCGGCAGCGCCGG
TCCGATCCGGTTCGTTGCTTACGAGGAAGATCTCGTCGCTTCTGTTATCGACACTGCTCT
CAAGTGCTACGCTCGCGAAGGTCGCCTCCCTCTCCTCGGATCCGATTTCAATGACTTTCT
TCTCTACTGTCCCATGGTCGGACCTGAAGCTTTAAGCGCGTGGAATGCGATTGGATCGCT
TGGTGCGAGGAACTTTACTCTGTGTAAGAAACCAGAGGAGAAGAAGGTTGTGGCCAGGGA
AGGAGCAAGGAAAGGAGGGAGCTTTAAAGCTTGGATCAACAAGTCCTTCAGCCTCAAAGT
CTCCACCCATTAAAAACGCTTTTTTGTTTATTTTTTTT**CAGACAAGACAAGATCGGTT
TTTATGTTTTCTGTGCATTTATGATTTGATTCCAATTTGTCAAAAAAG*CTTCCATTGGC
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TTTCTCG


BQ
10 10 10 10 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 25 25 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 0 0 0 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 25 25 
15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
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85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 15 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 10 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 5 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CW09TF U 1
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AF RS1A040JQ C 23
BS 1 184 RS1CW09TF
BS 185 187 RS1AT71TF
BS 188 191 RS1CW09TF
BS 192 192 RS1AT71TF
BS 193 305 RS1CW09TF
BS 306 306 RS1AT71TF
BS 307 633 RS1CW09TF
BS 634 645 RS1AT71TF
BS 646 646 RS1A040TV
BS 647 662 RS1AT71TF
BS 663 744 RS1A040TF
BS 745 745 RS1A040TV
BS 746 766 RS1A040TF
BS 767 767 RS1A040TV
BS 768 810 RS1A040TF
BS 811 893 RS1A040TR
BS 894 907 RS1A040JQ

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CTCCTCCCTCTTTCTGCGTCCTCTGCTTTCGCTTTCGGCTCCTGCAAAGAAGGCTGGTAC
TTCCGCTGCATCGGCCTCGACCCGTGAAACCCTAATCTCGATTTCCATCTACAATTTTTT
TTTTTTGTTTTCTTTTTTAAAATCTCTC**TCTATCAAAGATGTTGCTCTACAACAAGCA
GAAGAAGAACGCTAAGGGAAACCGGATCCTCATCAGCGTAACCGTTCTCGGCAGCGCCGG
TCCGATCCGGTTCGTTGCTTACGAGGAAGATCTCGTCGCTTCTGTTATCGACACTGCTCT
CAAGTGCTACGCTCGCGAAGGTCGCCTCCCTCTCCTCGGATCCGATTTCAATGACTTTCT
TCTCTACTGTCCCATGGTCGGACCTGAAGCTTTAAGCGCGTGGAATGCGATTGGATCGCT
TGGTGCGAGGAACTTTACTCTGTGTAAGAAACC

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DS 

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GGAATT
ACATTCCTTCTTCTTCTTCACAACTCTCTCTCTCTCGAAAAAAAA**GTCCCTCTTCCTA
GCTCGATTTCGATCTCAACTTTTCGTGTGGAAACGTTTGTGAATGGTGGAAACGAATCCG
ATCAGTGGTGAGTTTACGCTTTCCCTTCAAATCCAAAGGGCGAGCTTCCTCCTCCTCC**
*CTCTCTCTGCGTCCTCTGCTTTCGCTTTCGGCTCCTGCAAAGAAGGCTGGTACTTCCGC
TGCATCGGCCTCGACCCGTGAAACCCTAATCTCGATTTCCATCTACAATTTTTTTTTT**
GTTTTCTTTTTTAAAATCTCTC**TCTATCAAAGATGTTGCTCTACAACAAGCAGAAGAA
GAACGCTAAGGGAAACCGGATCCTCATCAGCGTAACCGTTCTCGGCAGCGCCGGTCCGAT
CCGGTTCGTTGCTTACGAGGAAGATCTCGTCGCTTCTGTTATCGACACTGCTCTCAAGTG
CTACGCTCGCGAAGGTCGCCTCCCTCTCCTCGGATCCGATTTCAATGACTTTCTTCTCTA
CTGTCCCATGGTCGGACCTGAAGCTTTAAGCGCGTGGAATGCGATTGGATCGCTTGGTGC
GAGGAACTTTACTCTGTGTAAGAA

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DS 

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GGAGTC
ACATTCCTTCTTCTTCTTCACAACTCTCTCTCTCCCGAAAAAAAAAAGCCCCTCTTCCTA
GCTCGATTTCGATCTCAACTTTTCGTGTGGAAACGTTTGTGAATGGTGGAAACGAATCCG
ATCAGTGGTGAGTTTACGCTTTCCCTTCAAATCCAAAGGGCGAGCTTCCTCCTCCTCC**
*CTCTCTCTGCGTCCTCTGCTTTCGCTTTCGGCTCCTGCAAAGAAGGCTGGTACTTCCGC
TGCATCGGCCTCGACTCGTGAAACCCTAATCTCGATTTCCATCTACAATTTTTTTTTTTT
GTTTTCTTTTTTAAAATCTCTC**TCTATCAAAGATGTTGCTCTACAACAAGCAGAAGAA
GAACGCTAAGGGAAACCGGATCCTCATCAGCGTAACCGTTCTCGGCAGCGCCGGTCCGAT
CCGGTTCGTTGCTTACGAGGAAGATCTCGTCGCTTCTGTTATCGACACTGCTCTCAAGTG
CTACGCTCGCGAAGGTCGCCTCCCTCTCCTCGGATCCGATTTCAATGACTTTCTTCTCTA
CTGTCCCATGGTCGGACCTGAAGCTTTAAGCGCGTGGAATGCGATTGGATCGCTTGGTGC
GAGGAACTTTACTCTGTGTAAGAAACCAGAGGAGAAGAAAGTTGTGGC

QA 7 654 7 654
DS 

RD RS1EQ32TF 630 0 0
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TTCCCTTCAAATCCAAAGGGCGAGCTTCCTCCTCCTCC***CTCTCTCTGCTTCCTCTGC
TTTCGCTTTCGGCTCCTGCAAAGAAGGCTGGTACTTCCGCTGCACCGGCCTCGACCCGTG
AAACCCTAATCTCGATTTCCATCTACAGTTTTTTTT****GTTTTCTTTTTTAAAATCTC
TCTTTCTATCAAAGATGTTGCTCTACAACAAGCAGAAGAAGAACGCTAAGGGAAACCGGA
TCCTAATCAGCGTAACCGTTCTCGGCAGCGCCGGTCCGATCCGGTTCGTTGCTTACGAGG
AAGATCTCGTCGCTTCTGTTATCGACACTGCTCTCACGTGCTACGCTCGCGAAGGTCGCC
TCCCTCTCCTCGGATCCGATTTCAACGACTTTCTTCTCTACTGTCCCATGGTCGGACCTG
AAGCTTTAAGCGCGTGGAATGCGATTGGATCGCTTGGTGCGAGGAACTTTACTCTGTGTA
AGAAACCAGAGGAGAAGAAAGTTGTGGCCA

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DS 

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TTTCGTGTGGAAACGTTTGTGAATGGTGGAAACGAATCCGATCAGTGGTGAGTTTACGCT
TTCCCTTCAAATCCAAAGGGCGAGCTTCCTCCTCCTCC***CTCTCTCTGCTTCCTCTGC
TTTCGCTTTCGGCTCCTGCAAAGAAGGCTGGTACTTCCGCTGCACCGGCCTCGACCCGTG
AAACCCTAATCTCGATTTCCATCTACAGTTTTTTTT****GTTTTCTTTTTTAAAATCTC
TCTTTCTATCAAAGATGTTGCTCTACAACAAGCAGAAGAAGAACGCTAAGGGAAACCGGA
TCCTAATCAGCGTAACCGTTCTCGGCAGCGCCGGTCCGATCCGGTTCGTTGCTTACGAGG
AAGATCTCGTCGCTTCTGTTATCGACACTGCTCTCACGTGCTACGCTCGCGAAGGTCGCC
TCCCTCTCCTCGGATCCGATTTCAACGACTTTCTTCTCTACTGTCCCATGGTCGGACCTG
AAGCTTTAAGCGCGTGGAATGCGATTGGATCGCTTGGTGCGAGGAACTTTACTCTGTGTA
AGAAACC

QA 1 607 1 607
DS 

RD RS1AT71TF 664 0 0
GAA
TCACATTCCTTCTTCTTCTTCACAACTCTCTCTCTCTCGAAAAAAAAA*GTCCCTCTTCC
TAGCTCGATTTCGATCTCAACTTTTCG***GGAAACGTTTGTGAATGGTGGAAACGAATC
CGATCAGTGGTGAGTTTACGCTTTCCCTTCAAATCCAAAGGGCGAGCTTCCTCCTCCTCC
***CTCTCTCTGCGTCCTCTGCTTTCGCTTTCGGCTCCTGCAAAGAAGGCTGGTACTTCC
GCTGCATCGGCCTCGACCCGTGAAACCCTAATCTCGATTTCCATCTACAATTTTTTTTTT
T*GTTTTCTTTTTTAAAATCTCTC**TCTATCAAAGATGTTGCTCTACAACAAGCAGAAG
AAGAACGCTAAGGGAAACCGGATCCTCATCAGCGTAACCGTTCTCGGCAGCGCCGGTCCG
ATCCGGTTCGTTGCTTACGAGGAAGATCTCGTCGCTTCTGTTATCGACACTGCTCTCAAG
TGCTACGCTCGCGAAGGTCGCCTCCCTCTCCTCGGATCCGATTTCAATGACTTTCTTCTC
TACTGTCCCATGGTCGGACCTGAAGCTTTAAGCGCGTGGAATGCGATTGGATCGCTTGGT
GCGAGGAACTTTACTCTGTGTAAGAAACCAGAGGAGAAGAA*GTTGTGGCCAGGGAAG
AGC

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DS 

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TTACGAGGAAGATCTCGTCGCTTCTGTTATCGACACTGCTCTCAAGTGCTACGCTCGCGA
AGGTCGCCTCCCTCTCCTCGGATCCGATTTCAATGACTTTCTTCTCTACTGTCCCATGGT
CGGACCTGAAGCTTTAAGCGCGTGGAATGCGATTGGATCGCTTGGTGCGAGGAACTTTAC
TCTGTGTAAGAAACCAGAGGAGAAGAAAGTTGTGGCCAGGGAAGGAGCAAGGAAAGGAGG
GAGCTTTAAAGCTTGGATCAACAAGTCCTTCAGCCTCAAAGTCTCCACCCATTAAAAACG
CTTTTT*GTTTATTTTTTTT**CAGACA*GACAAGATCGGTTTTTATGTTTTCTGTGCAT
TTATGATTTGAT

QA 1 492 1 492
DS 

RD RS1G384JQ 500 0 0
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AGGTCGCCTCCCTCTCCTCGGATCCGATTTCAATGACTTTCTTCTCTACTGTCCCATGGT
CGGACCTGAAGCTTTAAGCGCGTGGAATGCGATTGGATCGCTTGGTGCGAGGAACTTTAC
TCTGTGTAAGAAACCAGAGGAGAAGAAGGTTGTGGCCAAGGAAGGAGCAAGGAAAGGAGG
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CTTTTTTGTTTATTTTTTTTT*CAGACAAGACAAGATCAGTTTTTATGTTTTCTGTGCAT
TTATGATTTGATTCCAATT
C

QA 1 499 1 499
DS 

RD RS1A040TV 629 0 0
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TTTTTTTT*GTTTTCTTTTTTAAAATCTCTC**TCTATCAAAGATGTTGCTCTACAACAA
GCAGAAGAAGAACGCTAAGGGAAACCGGATCCTCATCAGCGTAACCGTTCTCGGCAGCGC
CGGTCCGATCCGGTTCGTTGCTTACGAGGAAGATCTCGTCGCTTCTGTTATCGACACTGC
TCTCAAGTGCTACGCTCGCGAAGGTCGCCTCCCTCTCCTCGGATCCGATTTCAATGACTT
TCTTCTCTACTGTCCCATGGTCGGACCTGAAGCTTTAAGCGCGTGGAATGCGATTGGATC
GCTTGGTGCGAGGAACTTTACTCTGTGTAAGAAACCAGAGGAGAAGAAGGTTGTGGCCAG
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AGTCTCCACCCATTAAAAACGCTTTTTTGTTTATTTTTTTT**CAGACAAGACAAGATCG
GTTTTTATGTTTTCTGTGCATTTATGATT

QA 1 629 1 629
DS 

RD RS1AT71JQ 751 0 0
TCCCTC
TCCTAGCTCGATT*CGATCTCAACTTTTCG***GGAAACGTTTGTGAATG*TGGAAACGA
ATCCGATCAGTGGTGAGTTTACGCTTTCCCTTCAAATCCAAAGGGCGAGCTTCCTCCTCC
TCC***CTCTCTCTGCGTCCTCTGCTTTCGCTTTCGGCTCCTGCAAAGAAGGCTGGTACT
TCCGCTGCATCGGCCTCGACCCGTGAAACCCTAATCTCGATTTCCATCTACAATTTTTTT
TTTT*GTTTTCTTTTTTAAAATCTCTC**TCTATCAAAGATGTTGCTCTACAACAAGCAG
AAGAAGAACGCTAAGGGAAACCGGATCCTCATCAGCGTAACCGTTCTCGGCAGCGCCGGT
CCGATCCGGTTCGTTGCTTACGAGGAAGATCTCGTCGCTTCTGTTATCGACACTGCTCTC
AAGTGCTACGCTCGCGAAGGTCGCCTCCCTCTCCTCGGATCCGATTTCAATGACTTTCTT
CTCTACTGTCCCATGGTCGGACCTGAAGCTTTAAGCGCGTGGAATGCGATTGGATCGCTT
GGTGCGAGGAACTTTACTCTGTGTAAGAAACCAGAGGAGAAGAAGGTTGTGGCCAGGGAA
GGAGCAAGGAAAGGAGGGAGCTTTAAAGCTTGGATCAACAAGTCCTTCAGCCTCAAAGTC
TCCACCCATTAAAAACGCTTTTTTGTTTATTTTTTTT**CAGACAAGACAAGATCGGTTT
TTATGTTTTCTGTGCATTTATGATT

QA 7 751 7 751
DS 

RD RS1A040TR 876 0 0
TCTTCTTCACAACTCTCTCTCTCTCGAAAAAAAAA*GTCCCTCTTCCTAGCTCGATTTCG
ATCTCAACTTTTCG***GGAAACGTTTGTGAATGGTGGAAACGAATCCGATCAGTGGTGA
GTTTACGCTTTCCCTTCAAATCCAAAGGGCGAGCTTCCTCCTCCTCC***CTCTCTCTGC
GTCCTCTGCTTTCGCTTTCGGCTCCTGCAAAGAAGGCTGGTACTTCCGCTGCATCGGCCT
CGACCCGTGAAACCCTAATCTCGATTTCCATCTACAATTTTTTTTTTT*GTTTTCTTTTT
TAAAATCTCTC**TCTATCAAAGATGTTGCTCTACAACAAGCAGAAGAAGAACGCTAAGG
GAAACCGGATCCTCATCAGCGTAACCGTTCTCGGCAGCGCCGGTCCGATCCGGTTCGTTG
CTTACGAGGAAGATCTCGTCGCTTCTGTTATCGACACTGCTCTCAAGTGCTACGCTCGCG
AAGGTCGCCTCCCTCTCCTCGGATCCGATTTCAATGACTTTCTTCTCTACTGTCCCATGG
TCGGACCTGAAGCTTTAAGCGCGTGGAATGCGATTGGATCGCTTGGTGCGAGGAACTTTA
CTCTGTGTAAGAAACCAGAGGAGAAGAAGGTTGTGGCCAGGGAAGGAGCAAGGAAAGGAG
GGAGCTTTAAAGCTTGGATCAACAAGTCCTTCAGCCTCAAAGTCTCCACCCATTAAAAAC
GCTTTTTTGTTTATTTTTTTT**CAGACAAGACAAGATCGGTTTTTATGTTTTCTGTGCA
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TCTTTTGTATCTATCATTCAACGGAAATAAAAGTTT

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DS 

RD RS1CW09JQ 549 0 0
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CGGACCTGAAGCTTTAAGCGCGTGGAATGCGATTGGATCGCTTGGTGCGAGGAACTTTAC
TCTGTGTAAGAAACCAGAGGAGAAGAAGGTTGTGGCCAAGGAAGGAGCAAGGAAAGGAGG
GAGCTTTAAAGCTTGGATCAACAAGTCCTTCAGCCTCAAAGTCTCCACCCATTAAAAACG
CTTTTTTGTTTATTTTTTTTTTCAGACAAGACAAGATCAGTTTTTATGTTTTCTGTGCAT
TTATGATTTGATTCCAATTTGTCAAAAAAG*CTTCCATTGGCATTGATGAAGCCTTGTTT
CTTTTGTAT

QA 1 549 1 549
DS 

RD RS1FD60JQ 588 0 0
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AAACCGGATCCTCATCAGCGTAACCGTTCTCGGCAGCGCCGGTCCGATCCGGTTCGTTGC
TTACGAGGAAGATCTCGTCGCTTCTGTTATCGACACTGCTCTCAAGTGCTACGCTCGCGA
AGGTCGCCTCCCTCTCCTCGGATCCGATTTCAATGACTTTCTTCTCTACTGTCCCATGGT
CGGACCTGAAGCTTTAAGCGCGTGGAATGCGATTGGATCGCTTGGTGCGAGGAACTTTAC
TCTGTGTAAGAAACCAGAGGAGAAGAAGGTTGTGGCCAAGGAAGGAGCAAGGAAAGGAGG
GAGCTTTAAAGCTTGGATCAACAAGTCCTTCAGCCTCAAAGTCTCCACCCATTAAAAACG
CTTTTTTGTTTATTTTTTTT**CAGACAAGACAAGATCAGTTTTTATGTTTTCTGTGCAT
TTATGATTTGATTCCAATTTGTCAAAAAAG*CTTCCATTGGCATTGATGAAGCCTTGTTT
CTTTTGTATCTATCATTCAACGGAAATAAAAGTTTCGAATTT
TTTCTC

QA 1 582 1 582
DS 

RD RS1GI26JQ 681 0 0
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GCTCTACAACAAGCAGAAGAAGAACGCTAAGGGAAACCGGATCCTAATCAGCGTAACCGT
TCTCGGCAGCGCCGGTCCGATCCGGTTCGTTGCTTACGAGGAAGATCTCGTCGCTTCTGT
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TTTCAACGACTTTCTTCTCTACTGTCCCATGGTCGGACCTGAAGCTTTAAGCGCGTGGAA
TGCGATTGGATCGCTTGGTGCGAGGAACTTTACTCTGTGTAAGAAACCAGAGGAGAAGAA
GGTTGTGGCCAAGGAAGGAGCAAGGAAAGGAGGGAGCTTTAAAGCTTGGATCAACAAGTC
CTTCAGCCTCAAAGTCTCCACCCATTAAAAATGCTTTTT*GTTTATATTTTTTT*CAGAC
AAGACAAGATCAGTTTTTATGTTTTCTGTGCATTTATGATTTGATTCCAATTTGTCAAAA
AAAACTTCCATTGGCATTGATGAAGCCTTGTTTCTTTTATATCTATCATTCAACGGAAAT
AAAAGTTTCAAATTT
CTTTCC

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DS 

RD RS1A040JQ 885 0 0
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AACTTTTCG***GGAAACGTTTGTGAATGGTGGAAACGAATCCGATCAGTGGTGAGTTTA
CGCTTTCCCTTCAAATCCAAAGGGCGAGCTTCCTCCTCCTCC***CTCTCTCTGCGTCCT
CTGCTTTCGCTTTCGGCTCCTGCAAAGAAGGCTGGTACTTCCGCTGCATCGGCCTCGACC
CGTGAAACCCTAATCTCGATTTCCATCTACAATTTTTTTTTTT*GTTTTCTTTTTTAAAA
TCTCTC**TCTATCAAAGATGTTGCTCTACAACAAGCAGAAGAAGAACGCTAAGGGAAAC
CGGATCCTCATCAGCGTAACCGTTCTCGGCAGCGCCGGTCCGATCCGGTTCGTTGCTTAC
GAGGAAGATCTCGTCGCTTCTGTTATCGACACTGCTCTCAAGTGCTACGCTCGCGAAGGT
CGCCTCCCTCTCCTCGGATCCGATTTCAATGACTTTCTTCTCTACTGTCCCATGGTCGGA
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GATTTGATTCCAATTTGTCAAAAAAG*CTTCCATTGGCATTGATGAAGCCTTGTTTCTTT
TGTATCTATCATTCAACGGAAATAAAAGTTTCGAATTTTTTCTCG

QA 1 885 1 885
DS 



AS 2 13

CO CL73Contig1 994 6 14 U
AAAGATGATTTTTAAATTTATATTAAACATATGAAGATAGATACTTGAAAAGAGAGGCTG
ATGTAAAAAGGGACAATAGTGACAGACTCAGAACAACAAAGCAAAGACGCAACGTACTTT
TTAAAAAAAAA**GTAGCAAATAGTGTATTCTTCTTATTCTTTCAAATTTACTCATCAGC
CTTCTCCACGGCAACTTCTGCTGGAGCTACGGCGGCGGCTTCCACGGCTGCTACTTCAGT
GGTTTTCTCCTCCTCTGCTTCTGTCTTCTTCTCTTCCTCCACAACAGCTGGAGTTTCCTC
TGTCTTCACTTCTTCCTCTGCTTTGGTCTCTTCTTCCACAACCACCGGAGCTTCTTCCTC
TTTCTTGGGCTCTACGACTTCTTTGCTCTCTTCCTCGACAACCGCCGGAGTTTCTTCCTC
TTTCTTGGGCTCTACAACTTCCTCTGTTTTGCTTTCTTCCTCAACAACGGCTGGAGTTTC
CTCTGTCTTTGTTTCTTCTACTTCTTCCTCTTTCTTAGGCTCTACGACTTCCTCTGCTTT
GCTCTCTTCCTCCACAACGGCTGCAGTTTCCTCTGTCTTTGTTTCTTCTACTTCTTCCTC
TTTCTTGGGCTCTACGACTTCCTCTGTCTTGCTCTCTTCCTCCACAGCGGCCGGAGTTTC
CACTGGAGCTTCTTCCACAGGGACGTCTTTAGTGGTTACTTGGACGTGAGCTTCTTCCTC
TTTCTTGATCTCCTCCGTCTCTGTCTTGGTTTCCACTGTCTCTTCCACCGGAGCTTCAGG
TTCTGTCACCGTAGCTGGAGTAGAGTCAGCCACAACGGCAGCTACGGTTTCCTCAGGCTC
CACTGTCTTTGGTGGTGTCACCTCGACGTGCTCAGCTGCGGCTGGAGTCACTTGTTCAAC
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TGTGTGTTTGTGTGTGTGATGCTTTGATGTGTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

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TTTCTTGGGCTCTACAACTTCCTCTGTTTTGCTTTCTTCCTCAACAACGGCTGGAGTTTC
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TTTCTTGGGCTCTACGACTTCCTCTG

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ATGTAAAAAGGGACAATAGTGACAGACTCAGAGCAACAAAGCAAAGACGCAACGTACTTT
TTAAAAAAAAA**GTAGCAAATAGTGTATTCTTCTTATTCTTTCAAATTTACTCATCAGC
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GGTTTTCTCCTCCTCTGCTTCTGTCTTCTTCTCTTCCTCCACAACAGCTGGAGTTTCCTC
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TTTCTTGGGCTCTACGACTTCTTTGCTCTCTTCCTCGACAACCGCCGGAGTTTCTTCCTC
TTTCTTGGGCTCTACAACTTCCTCTGTTTTGCTTTCTTCCTCAACAACGGCTGGAGTTTC
CTCTGTCTTTGTTTCTTCTACTTCTTCCTCTTTCTTAGGCTCTACGACTTCCTCTGCTTT
GCTCTCTTCCTCCACAACGGCTGCAGTTTCCTCTGTCTTTGTTTCTTCTACTTCTTCCTC
TTTCTTGGGCTCTACGACTTCCTCTGTCTTGCTCTCTTCCTCCACAGCGGCCGGAGTTT

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GAACAACAAAGCAAAGACGCAACGTACTTTTTAAAAAAAAAAAGTAGCAAATAGTGTATT
CTTCTTCTTCTTTCAAATTTACTCATCAGCCTTCTCCACGGCAACTTCTGCTGGAGCTGC
GGCGGCGGCTTCCACGGCTGCTACTTCAGTGGTTTTCTCCTCCTCTGCTTCTGTCTTCTT
CTCTTCCTCCACAACAGCTGGAGTTTCCTCTGTCTTCACTTCTTCCTCTGCTTTGGTCTC
TTCTTCCACAACCACCGGAGCTTCTTCCTCTTTCTTGGGCTCTACGACTTCTTTGCTCTC
TTCCTCGACAACCGCCGGAGTTTCTTCCTCTTTCTTGGGCTCTACAACTTCCTCTGTTTT
GCTTTCTTCCTCAACAACGGCTGGAGTTTCCTCTGTCTTTGTTTCTTCTACTTCTTCCTC
TTTCTTAGGCTCTACGACTTCCTCTGCTTTGCTCTCTTCCTCCACAACGGCTGCAGTTTC
CTCTGTCTTTGTTTCTTCTACTTCTTCCTCTTTCTTGGGCTCTACGACTTCCTCTGTCTT
GCTCTATTCCTCCACAGCGGCCGGAGTTTCCACTGG

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TA
AATTTATATTAAACATATGAAGATAGATACTTGAAAAGAGAGGCTGAAGTAAAAAGGGAC
AATAGTGACAGACTCAGAACAACAAAGCAAAGACGCAACGTACTTTTTAAAAAAAA***G
TAGCAAATAGTGTATTCTTCTTCTTCTTTCAAATTTACTCATCAGCCTTCTCCACGGCAA
CTTCTGCTGGAGCTGCGGCGGCGGCTTCCACGGCTGCTACTTCAGTGGTTTTCTCCTCCT
CTGCTTCTGTCTTCTTCTCTTCCTCCACAACAGCTGGGGTTTCCTCTGTCTTCACTTCTT
CCTCTGCTTTGGTCTCTTCTTCCACAACCACCGGAGCTTCTTCCTCTTTCTTGGGCTCTA
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CAACTTCCTCTGTTTTGCTTTCTTCCTCAACAACGGCTGGAGTTTCCTCTGTCTTTGTTT
CTTCTACTTCTTCCTCTTTCTTAGGCTCTACGACTTCCTCTGCTTTGCTCTCTTCCTCCA
CAACGGCTGCAGTTTCCTCTGTCTTTGTTTCTTCAACTTCTTCCTCTTTCTTGGGCTCTA
CGACTTCCTCTGTCTTGCTCTCTTCCTCCACAGCGGCCGGAGTTTCCACTGGAGCTTCTT
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CCGTCTCTGTCTT

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TCTTGGGCTCTACAACTTCCTCTGTTTTGCTT*CTTCCTCAACAACGGCTGGAGTT*CCT
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TCTTGGGCTCTACGACTTCCTCTGTCTTGCTCTCTTCCTCCACAGCGGCCGGAGTTTCCA
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TCTTGATCTCCTCCGTCTCTGTCTTGGTTTCCACTGTTTCTTCCACTGGAGCTTCAGGTT
CTGTCACCGTAGCTGGAGTAGAGTCAGCCACAACGGCAGCTACGGTTTCCTCAGGCTCCA
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TGTGTTTGTGTGTGTGATGCTTTGATGTGTCC

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CTTCTACTTCTTCCTCTTTCTTGGGCTCTACGACTTCCTCTGTCTTGCTCTATTCCTCCA
CAGCGGCCGGAGTTTCCACTGGAGCTTCTTCCACAGGGACGTCTTTAGTGGTTACTTGGA
CGTGAGCTTCTTCCTCTTTCTTGATCTCCTCCGTCTCTGTCTTGGTTTCCACTGTCTCTT
CCACCGGAGCTTCAGGTTCTGTCACCGTAGCTGGAGTAGAGTCAGCCACAACGGCAGCTA
CGGTTTCCTCAGGCTCCACTGTCTTTGGTGGTGTCACCTCGACGTGCTCAGCTGCGGCTG
GAGTCACTTGTTCAACATCAGCAGTGGCCATTTGAATGCGTAGAAAAGAGGAAAGATCAA
AGAAGAGAAGAGAAAGTGTGTGTTTGTGTGTGTGATGCTTTGATGT
CC

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DS 



CO CL73Contig2 982 7 10 U
GGCTCACACATCAAAGCATCACACACACAAACACACACTTTCTCTTCTCATTCTTTGATC
TTTCCTCTTTTCTACGCATTCAAATGGCCACTGCTGATGTTGAACAAGTGACTCCAGCCG
CAGCTGAGCACGTCGAGGTGGCACCACCAAAGACAGTGGAGCCTGAGGAAACCGTCGCTG
CTGCCGTTGTGGCTGACTCTGCTCCAGCTCCGGTAACAGAGGAAACCAAGACAGAGACGG
AGGAGATCAAGAAAGAGGAAGAAGCTCCCGTCGAAGTAACCACTAAAGACGTCCCTGTGG
AAGAAGCTCCAGTGGAAACACCGGCCGCTGTGGAGGAAGAGAGCAAGACAGAGGAAGTCG
TAGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAGTAGAAGAAACAAAGACAGAGGAAACTCCAGCGGTTG
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GCCAGAAGCAGAGGAGGAGGAGAAAACCACTGAAGTAGCCGCCGTCCAAGCCGCCGCAGC
TCCAGCAGAAGTTGCCGTGGAGAAGGCTGATGAGTAAATCTGAAAGAAGAAGAAGAAGTA
CACTATTTGCTACTTTTTTTAAAAGTACGTTGCGTCTTTGCTTTGTTGTTCTGAGTCTGT
CACTCTTGTCCCTTTTTGCATCACCCTCTCTTTTTAAGTTTCTATCTTCCATATGTTTAA
TATAAATTAAAAATCATCTTTG


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GV83TF U 1
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AF RS1BR87TF U 4
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AF RS1BR87JQ C 181
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BS 950 982 RS1GV83JQ

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GCA
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ATAAGCTCCCGTCGAAGTAACCACTAAAGACGTCCCTGTGGAAGAAGCTCCAGTGGAAAC
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AGAAGTAGAAGAAACAAAGACAGAGGAAACTCCAGCGGTTGTTGAGGAAGAGAGCAAAAC
AGAGGGAGTTTGTAGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAGTGGAAGAAACAAAGACAGAGGAAA
CTCCAGCGGTTTGTTGAGGAAGAGAGCAAAGC

QA 4 455 4 455
DS 

RD RS1BR87TF 618 0 0
GG
ACACATCAAAGCATCACACACACAAACACACACTTTCTCTTCTCATTCTTTGATCTTTCC
TCTTTTCTACGCTTTCAAATGGCCACTGCTGATGTTGAACAAGTGACTCCAGCCGCAGCT
GAGCACGTCGAGGTGGCACCACCAAAGACAGTGGAGCCTGAGGAAACCGTCGCTGCTGCC
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CCCAAGAAAGAGGAAGAAGTAGAAGAAACAAAGACAGAGGAAACTCCAGCGGTTGTTGAG
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AAAGACAGAGGAAACTCCAGCGGTT*GTTGAGGAAGAGAGCAAAGCAGAGGACGTTGTAG
AGCCCAAGAAAGAGGAAGAAACTCCAGCGGTTGTCGAGGAAGAGAGCAAAACAGAGGAAG
TCGTAGAGCCCAAGAA

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DS 

RD RS1F685TF 662 0 0
AGGG
ACACATCAAAGCATCACACACACAAACACACACTTTCTCTTCTCATTCTTTGATCTTTCC
TCTTTTCTACGCGTTCAAATGGCCACTGCTGATGTTGAACAAGTGACTCCAGCCGCAGCT
GAGCACGTCGAGGTGGCACCACTAAAGACAGTGGAGCCTGAGGAAACCGTCGCTGCTGCC
GTTGTGGCTGACTCTGCTCCAGCTCCGGTAACAGAGGAAACCAAGACAGAGACGGAGGAG
ATCAAGA****GGAAGAAGCTCCCGTCGAAGTAACCACTAAAGACGTCCCTGTGGAAGAA
GCTCCAGTGGAAACACCGGCCGCTGTGGAGGAAGAGAGCAAGACAGAGGAAGTCGTAGAG
CCCAAGAAAGAGGAAGAAGTAGAAGAAACAAAGACAGAGGAAACTCCAGCGGTTGTTGAG
GAAGAGAGCAAAACAGAGGAAGTT*GTAGAGCCCAAGAAATAGGAAGAAGTGGAAGAAAC
AAAGACAGAGGAAACTCCAGCGGTT*GTTGAGGAAGAGAGCAAAGCAGAGGACGTTGTAG
AGCCCAAGAAAGAGGAAGAAACTCCAGCGGTTGTCGAGGAAGAGAGCAAAACAGAGGAAG
TCGTAGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAGCACCGGTGGTTGTGGAAGAAGAGACCAAAGC

QA 5 662 5 662
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GGAAGTCGTAGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAGCACCGGTGGTTGTGGAAGAAGAGACCAA
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TCCAGCAGAAGTTGCCGTGGAGAAGGCTGATGAGTAAATTTGAAAGGAGAAGAAGAAGTA
CACTATTTGCTACTTTTTTTAAAAGTACGTTGCGTCTTTGCTTTGTTGTTTTGAGTCTGT
CACTCTTGTCCCTTTTTGCATCACCCTCTCTTTTTAAGTTTCTATCTTC
CATATG

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TGGAAACACCGGCCGCTGTGGAGGAAGAGAGCAAGACAGAGGAAGTCGTAGAGCCCAAGA
AAGAGGAAGAAGTAGAAGAAACAAAGACAGAGGAAACTCCAGCGGTTGTTGAGGAAGAGA
GCAAAACAGAGGAAGTT*GTAGAGCCCAAGAAATAGGAAGAAGTGGAAGAAACAAAGACA
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GAAAGAGGAAGAAACTCCAGCGGTTGTCGAGGAAGAGAGCAAAACAGAGGAAGTCGTAGA
GCCCAAGAAAGAGGAAGAAGCACCGGTGGTTGTGGAAGAAGAGACCAAAGCAGAGGAAGA
AGTGAAGAAGACAGAGGAAACTCCAGCTGTTTTGGAGGAAGAGAAGAAGCCAGACGCAGA
GGAGGAGGAGAAAACCACTGAAGTAGCCGCCGTCCAAGCCGCCGCAGCTCCAGCAGAAGT
TGCCGTGGAGAAGGCTGATGAGTAAATCTGAAAGAAGAAGAAGAAGTACACTATTTGCTA
CTTTTTTTAAAAGTACGTTGCGTCTTTGCTTTGTTGTTCTGAGTCTGTCACTCTTGTCCC
TTTTTGCATCACCCTCTCTTTTTAAGTTTCTATCTTC
CATATG

QA 19 715 19 715
DS 

RD RS1GV83JQ 770 0 0
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GAGGAAGAGAGCAAGACAGAGGAAGTCGTAGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAGTAGAAGAA
ACAAAGACAGAGGAAACTCCAGCGGTTGTTGAGGAAGAGAGCAAAACAGAGGAAGTT*GT
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TTGAGGAAGAGAGCAAAGCAGAGGACGTTGTAGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAACTCCAG
CGGTTGTCGAGGAAGAGAGCAAAACAGAGGAAGTCGTAGAGCCCAAGAAAGAGGAAGAAG
CACCGGTGGTTGTGGAAGAAGAGACCAAAGCAGAGGAAGAAGTGAAGAAGACAGAGGAAA
CTCCAGCTGTTGTGGAGGAAGAGAAGAAGCCAGAAGCAGAGGAGGAGGAGAAAACCACTG
AAGTAGCCGCCGTCCAAGCCGCCGCAGCTCCAGCAGAAGTTGCCGTGGAGAAGGCTGATG
AGTAAATCTGAAAGAAGAAGAAGAAGTACACTATTTGCTACTTTTTTTAAAAGTACGTTG
CGTCCTTGCTTTGTTGTTCTGAGTCTGTCACTCTTGTCCCTTTTTGCATCACCCTCTCTT
TTTAAGTTTCTATCTTCCATATGTTTAATATAAATTAAAAATCATCTTTG

QA 1 770 1 770
DS 



AS 2 12

CO CL74Contig1 864 7 19 U
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ATCATCACTGATCAAAAGGACGATATGAAACTTGTGAAACAATTCAAGATTCGAAAAGTT
TTATAGCAAAGTTCTTAAACAAAGAGAAGGAGAAGTCACTGAAAGCTCAAACAATGGATG
GATATAATAAAAGCAACCGTGATGGTTTTATTGGTATGGCATGTAACGCATTGGCCTTCT
GAACCTAGGAACTTTCCCATATCCATATGGAGAATACATATACGGAGACATGAAAGGTCT
GCGGAAGCCCATGTACGGGTTGAATCTTCTACCACGGAACTGTTTCAATCCAGGAACGTT
TGTTCTCTTAGGCATCACCTTTATCTGACGACCATGTAACTCTGATTCGTTCAGTTGTAG
CGCCTCTTGTATAGCTTCAGCTTCCACAAACTCGACATAAGCGAACCCCTTTGGCTGCCC
GAACTTGTCTGTCAGAATTGTCACTCGGTGGACTGTGCCGCATGATTGGAAATGTTGCTG
CACTTCTTCAGGTGTACAAGCGTAATCAACATTGCCAACAAAAACAGATCGAGCATCCAC
CTCCTCTTTGCCTGCTTGATCTGCTGCTACAGTACCAGCATCTTGAGGTCCCATATCCTT
CTCAACCTTGGCCTGCATCTCACGAAGAGCAGCAGCTTCGTCCTCAATCTCTTTCAATCG
CTTCTTCATCTCATCCAACTCCTTAGCGGCATCATCATCAGCGGCAGTCATGTCCATGTC
TCCATCCATCTCTCCGACGTCCGGAATCTCTCCACCGTATACCTCGTGCTCCTCTTCCTC
CATAGCCTCTCTCTCTCTCTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 10 

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TTGTTCTCTTAGGCATCACCTTTTTCTG

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TCCAT

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ATATGAAACTTGTGAAACAATTCAAGATTCGAAAAGTTTTATAGCAAAGTTCTTAAACAA
AGAGAAGGAGAAGTCACTGAAAGCTCAAACAATGGATGGATATAATAA**GCAACCGTGA
TGGTTTTATTGGTATGGCATGTAACGCAT*GGCCTTCTGAACCTAGGAACTTTCCCATAT
CCATATGGAGAATACATATACGGAGACATGAAAGGTCTGCGGAAGCCCATGTACGGGTTG
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ATCTGACGACCATGTAACTCTGATTCGTTCAGTTGTAGCGCCTCTTGTATAGCTTCAGTT
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GCTGCTACAGTACCAGCATCTTGAGGTCCCATATCCTTCTCAACCTTGGCCTGCATCTCA
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TTAGCGGCATCATCATCAGCGGCAGTCATGTCCATGTCTC*ATCCATCTCTCCGACGTCC
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DS 

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AACCGTGATGGTTTTATTGGTATGGCATGTAACGCATTGGCCTTCTGAACCTAGGAACTT
TCCCATATCCATATGGAGAATACATATACGGAGACATGAAAGGTCTGCGGAAGCCCATGT
ACGGGTTGAATCTTCTACCACGGAACTGTTTCAATCCAGGAACGTTTGTTCTCTTAGGCA
TCACCTTTATCTGACGACCATGTAACTCTGATTCGTTCAGTTGTAGCGCCTCTTGTATAG
CTTCAGCTTCCACAAACTCGACATAAGCGAACCCCTTTGGCTGCCCGAACTTGTCTGTCA
GAATCGTCACTCGGTGGACTGTGCCGCGTGATTGGAAATGTTGCTGCACTTCTTCAGGTG
TACAAGCGTAATCAACATTGCCAACAAAAACAGACCGAGCATCCACCTCCTCTTTGCCTG
CTTGATCTGCTGCTACAGTACCAGCATCTTGAGGTCCCATATCCTTCTCAACCTTGGCCT
GCATCTCACGAAGAGCAGCAGCTTCGTCCTCAATCTCTTTCAATCGCTTCTTCATCTCAT
CCAACTCCTTAGCGGCATCATCATCAGCGGCAGTCATGTCCATGTCTCCATCCATCTCTC
CGACGTCCGGAATCTCTCCACCGTATACCTCGTGCTCCTCTTCCTCCATAGCCTCTCTCT
CTCTCTC
CC

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DS 

RD RS1FX69TF 614 0 0
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GGCATCACCTTTATCTGACGACCATGTAACTCTGATTCGTTCAGTTGTAGCGCCTCTTGT
ATAGCTTCAGTTTCCACAAACTCGACATAAGCGAACCCCTTTGGCTGCCCGAACCTGTCT
GTCAGAATTGTCACTCGGTGGACTGTGCCGCATGATTGGAAATGTTGCTGCACTTCTTCA
GGTGTACAAGCGTAATCAACATTGCCAACAAAAACAGATCGAGCATCCACCTCCTCTTTG
CCTGCTTGATCTGCTGCTACAGTACCAGCATCTTGAGGTCCCATATCCTTCTCAACCTTG
GCCTGCATCTCACGAAGAGCAGCAGCTTCGTCCTCAATCTCTTTCAATCGCTTCTTCATC
TCATCCAACTCCTTAGCGGCATCATCATCAGCGGCAGTCATGTCCATGTCTCCATCCATC
TCTCCGACGTCCGGAATCTCTCCACCGTATACCTCGTGCTCCTCTTCCTCCATAGCCTCT
CTCTCTCTCTCTC
C

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DS 

RD RS1C248TF 599 0 0
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CTTCTACCACGGAACTGTTTCAATC*AGGAACGTTTGTTCTCTTAGGCATCACCTTTATC
TGACGACCATGTAACTCTGATTCGTTCAGTTGTAGCGCCTCTTGTATAGCTTCAGCTTCC
ACAAACTCGACATAAGCGAACCCCTTTGGCTGCCCGAACTTGTCTGTCAGAATTGTCACT
CGGTGGACTGTGCCGCATGATTGGAAATGTTGCTGCACTTCTTCAGGTGTACAAGCGTAA
TCAACATTGCCAACAAAAACAGATCGAGCATCCACCTCCTCTTTGCCTGCTTGATCTGCT
GCTACAGTACCAGCATCTTGAGGTCCCATATCCTTCTCAGCCTTGGCCTGCATCTCACGA
AGAGCAGCAGCTTCGTCCTCAATCTCTTTCAATCGCTTCTTCATCTCATCCAACTCCTTA
GCGGCATCATCATCAGCGGCAGTCATGTCCATGTCTCCATCCATCTCTCCGACGTCCGGA
ATCTCTCCACCGTATACCTCGTGCTCCTCTTCCTCCATAGCCTCTCTCTCTCTCTCTCC

QA 1 599 1 599
DS 



CO CL74Contig2 864 5 19 U
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GAGATTCCGGACGTCGGAGAGATGGATGGAGACATGGACATGACTGCCGCTGATGATGAT
GCCGCTAAGGAGTTGGATGAGATGAAGAAGCGATTGAAGGAGATTGAGGACGAAGCTGCT
GCTCTTCGTGAGATGCAAGCCAAGGTTGAGAAGGATATGGGACCTCAAGATGCTGGTACT
GTAGCAGCAGATCAAGCAGGCAAAGAGGAGGTGGATGCTCGATCTGTTTTTGTTGGCAAT
GTTGATTACGCTTGTACACCTGAAGAAGTGCAGAAACACTTCCAATCATGCGGCACAGTC
CACCGGGTGACAATTCTGACAGACAAGTTTGGGCAGCCAAAGGGGTTCGCTTATGTCGAG
TTTGTGGAAGCTGAAGCTATACAAGAGGCGCTACAACTGAACGAATCAGAGTTACATGGT
CGTCTGATAAAGGTGATGCCTAAGAGAACAAACGTTCCTGGATTGAAACAGTTCCGCGGT
AGAAGATTCAACCCGTACATGGGCTTCCGCAGACCTTTCATGTCTCCCTATATGTATTCT
CCATATGGATATGGGAAAGTTCCAAGGTTCAGAAGGCCAATGCGTTACATGCCATACCAA
TAAAACCATCATGGCTGCTTTATATCCATCCATTGTTTGAGCTTTCAGTGACTTCTCTTT
GTTTAAGAACTCTGCGATAAAAGTTTTCGAATCTTGAATTGTTTTACAAGTTTCATATCG
TCCCTTTTGATCAGTGATGATATACTTTTTTGTTATGTGTTTACATTATGCGGATGGGTT
TTAATATCAGTTGAAATTATGTTG


BQ
10 10 10 10 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 20 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1FO37TF U 2
AF RS1EA88JQ C 5
AF RS1FO37JQ C 48
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GTAGCAGCAGATCAAGCAGGCAAAGAGGAGGTGGATGCTCGATCTGTTTTTGTTGGCAAT
GTTGATTACGCTTGTACACCTGAAGAAGTGCAGCAACACTTCCAATCATGCGGCACAGTC
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TTTGTGGAAGCTGAAGCTATACAAGAGGCGCTACAACTGAACGAATCAGAGTTACATGGT
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DS 

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AGCAGATCAAGCAGGCAAAGAGGAGGTGGATGCTCGATCTGTTTTTGTTGGCAATGTTGA
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TGGATATGGGAAAGTTCCAAGGTTCAGAAGGCCAATGCGTTACATGCCATA

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TGGAAGCTGAAGCTATACAAGAGGCGCTACAACTGAACGAATCAGAGTTACATGGTCGTC
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CAGCAGATCAAGCAGGCAAAGAGGAGGTGGATGCTCGATCTGTTTTTGTTGGCAATGTTG
ATTACGCTTGTACACCTGAAGAAGTGCAGCAACACTTCCAATCATGCGGCACAGTCCACC
GGGTGACAATTCTGACAGACAAGTTTGGGCAGCCAAAGGGGTTCGCTTATGTCGAGTTTG
TGGAAGCTGAAGCTATACAAGAGGCGCTACAACTGAACGAATCAGAGTTACATGGTCGTC
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GATTCAACCCGTACATGGGATTCCGCAGACCTTTCATGTCTCCCTATATGTATTCTCCAT
ATGGATATGGGAAAGTTCCAAGGTTCAGAAGGCCAATGCGTTACATGCCATACCAATAAA
ACCATCATAGCTGCTTTATATCCATCCATTGTTTGAGCTTTCAGTGACTTCTCTTTGTTT
AAGAACTCTGCGATAAAAGTTTTCGAATCTTGAATTGTTTTACAAGTTTCATATCGTCCC
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TATCAGTTGAAATTATGTTG

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DS 

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AGATGCT**TACTGTAGCAGCAGATCAAGCAGGCAAAGAGGAGGTGGATGCTCGATCTGT
TTTTGTTGGCAATGTTGATTACGCTTGTACACCTGAAGAAGTGCAGAAACACTTCCAATC
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CGCTTATGTCGAGTTTGTGGAAGCTGAAGCTATACAAGAGGCGCTACAACTGAACGAATC
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CTATATGTATTCTCCATATGGATATGGGAAAGTTCCAAGGTTCAGAAGGCCAATGCGTTA
CATGCCATACCAATAAAACCATCATGGCTGCTTTATATCCATCCATTGTTTGAGCTTTCA
GTGACTTCTCTTTGTTTAAGAACTCTGCGATAAAAGTTTTCGAATCTTGAATTGTTTTAC
AAGTTTCATATCGTCCCTTTTGATCAGTGATGATATACTTTTTTGTTATGTGTTTACATT
ATGCGGATGGGTTT
TAATATC

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DS 



AS 2 11

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AAAATGGTGAAGATCGCAGTTGGAAGTTTGGGTGACTCATTCAGTGTTGCATCTCTGAAG
GCTTACTTGTCTGAGTTCATCGCAACTCTTATCTTTGTATTCGCTGGTGTTGGCTCTGCT
ATTGCTTTTGGCAAGATAACCTCTGATGCAGCCTTGGACCCAGCTGGTCTTGTGGCTATT
GCGGTGGCTCACGCCTTCGCTTTGTTCGTCGGAGTTTCGGTTGCAGCTAACATCTCTGGT
GGCCACTTAAACCCAGCCGTGACTCTCGGTCTTGCTGTTGGAGGAAACATCACACTGATC
ACAGGTTTCTTGTACTGGGTTGCTCAGTGTCTTGGCTCCATCGTTGCATGCCTTCTCCTT
GTCTTCGTTACCAACGGCGAGAGCGTACCAACCCACGGAGTTGGAGCCGGTTTAGGAGCG
GTCGAAGCTATCGTGATGGAGATCATTGTGACCTTTGCTTTGGTCTACACCGTTTACGCC
ACAGCTGCTGATCCAAAGAAAGGTTCGCTCAGAACCATCGCACCAATCGCTATTGGTTTC
ATCGTTGGTGCCAACATCCTCGCTGCTGGTCCATTTAGCGGTGGCTCCATGAACCCAGCA
AGGTCGTTCGGACCAGCTATTGTAAGTGGAGACTTGTCACAAATCTGGATCTACTGGGTG
GGTCCACTCGTTGGTGGTGCACTTGCTGGACTTATCTACAGAGACGTGTTCATCGGTTCT
CCTTACGAAGCGGTTGAAACCCGCGAGATCCGAGTTAAAATTAACCGGGTTTTGTGATTG
ATGTTTGCTTGTTGGTTGGTTTGATGGTTGTGTGTTTGCTTGCGCAATGTTTGATGTCCC
TTTTCTTTTAAATTCGTCTGTAGAGAAAAGAGCCATCTCTTGCTAATAATAAGAAAATGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DN48TF U 1
AF RS1GM01TF U 1
AF RS1FC45TF U 1
AF RS1GM01JQ C 259
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GGTCCACTC

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TAT

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GCT
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GCTGCTGGTCCATTTAGCGGTGGCTCCATGAACCCAGCAAGGTCGTTCGGACCAGCTATT
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DS 



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TGTCTGAGTTTATCGCAACTTTTATCTTTGTATTCGCTGGCGTTGGCTCAGCTATCGCTT
TTGGCAAGCTAACATCCGATGCCGCCTTGGACCCAGCTGGTCTTGTGGCTGTTGCGGTGG
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TTAACCCTGCCGTGACTCTCGGTCTTGCCGTTGGAGGAAACATAACACTGATCACAGGTT
TCTTATACTGGATCGCTCAGTGTCTTGGATCCATCGTTGCTTGCCTTCTCCTTGTCTTTG
TTACCAATGGAGAGAGCGTACCGACCCATGGAGTCGGAGCCGGTTTAGGAGCACTGGAAG
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CTGATCCAAAGAAGGGATCGCTAGGAACCATTGCTCCAATCGCTATCGGTTTCATCGTTG
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ATGTAAAT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 20 
20 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 10 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 

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TCGGAGCCGGTTTAGGAGCACTGGACGGTATCGTGATGGAGATCGTTGTGACATTTGCTT
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DS 

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TCTGAGTTTATCGCAACTTTTATCTTTGTATTCGCTGGCGTTGGCTCAGCTATCGCTTTT
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AACCCTGCCGTGACTCTCGGTCTTGCCGTTGGAGGAAACATAACACTGATCACAGGTTTC
TTATACTGGATCGCTCAGTGTCTTGGATCCATCGTTGCTTGCCTTCTCCTTGTCTTTGTT
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GATCCAAAGAAGGGATCGCTAGGAACCATTGCTCCAATCGCTATCGGTTTCATCGTTGGT
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GTGATTCTGA

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DS 

RD RS1BZ48TF 613 0 0
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CCTTGTCTTTGTTACCAATGGAGAGAGCGTACCGACCCATGGAGTCGGAGCCGGTTTAGG
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AGCGAGGTCGTTCGGACCAGCTGTTGTCAGTGGAGACTTGTCACAAATCTGGATCTACTG
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TTCTTACC*AAGA

QA 1 613 1 613
DS 

RD RS1FB80JQ 835 0 0
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TTTGCCTTGTTTGTTGGGGTTTCGGTTGCTGCTAACATCTCTGGTGGGCACCTTAACCCT
GCCGTGACTCTCGGTCTTGTCGTTGGAGGAAACATAACACTGATCACAGGTTTCTTATAC
TGGATCGCTCAGTGTCTTGGATCCATCGTTGCTTGCCTTCTCCTTGTCTTTGTTACCAAT
GGAGAGAGCGTACCGACCCATGGAGTCGGAGCCGGTTTAGGAGCACTGGAAGGTATCGTG
ATGGAGATCGTTGTGACATTTGCTTTGGTCTACACCGTTTACGCCACAGCTGCTGATCCA
AAGAAGGGATCGCTAGGAACCATTGCTCCAATCGCTATCGGTTTCATCGTTGGTGCCAAC
ATCCTCGCTGCTGGTCCTTTCAGCGGTGGCTCCATGAACCCAGCGAGGTCGTTCGGACCA
GCTGTTGTCAGTGGAGACTTGTCACAAATCTGGATCTACTGGGTGGGTCCACTCGTTGGT
GGTGCACTTGCTGGACTCATTTACGGCGATGTGTTCATTGGTTCTTACCGAGAAGTTTAA
ACCCGCGAGGTCCGAGTTTGATTAAACGGATTTGTGATTTCTTGATGTTTTGCTTTGATT
TTGTGTTTGATTGTGTATGTTTGATGTCTATGCCTGCGTCTCTACAAGATTGCATGTAGA
GAAAAAGTTGTCTTAAAAAAAGAAGAAGTTATATCTTGTTAATAATAAAAAGATG

QA 1 835 1 835
DS 

RD RS1BB48JQ 663 0 0
CCTGCCGTGACTCTCGGTCTTGCCGTTGGAGGAAACATAACACTGATCACAGGTTTCTTA
TACTGGATCGCTCAGTGTCTTGGATCCATCGTTGCTTGCCTTCTCCTTGTCTTTGTTACC
AATGGAGAGAGCGTACCGACCCATGGAGTCGGAGCCGGTTTAGGAGCACTGGACGGTATC
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CCAAAGAAGGGATCGCTAGGAACCATTGCTCCAATCGCTATCGGTTTCATCGTTGGTGCC
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CCAGCTGTTGTCAGTGGAGACTTGTCACAAATCTGGATCTACTGGGTGGGTCCACTCGTT
GGTGGTGCACTTGCTGGACTCATTTACGGCGATGTGTTCATTGGTTCTTACCAAGAAGTT
TAAACCCGCGAGGTCCGAGTTTGATTAAACGGATTTGTGATTTCTTGATGTTTTGCTTTG
ATTTTGTGTTTGATTGTGTATGTTTGATGTCTATGCCTGCGTCTCTACAAGATTGCATGT
AGAGAAAAAGTTGTCTTAAAAAAAGAAG***TTATATCTTGTTAATAATAAAAAGATGTA
AAT

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DS 

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ACTGGGTGGGTCCACTCGTTGGTGGTGCACTTGCTGGACTCATCTACGGCGATGTGTTCA
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TTTCTTGATGTTTTGCTTTGATTTTGTGTTTGATTGTGTATGTTTGATGTCTATGCCTGC
GTCTCTACAAGATTGCATGTAGAGAAAAAGTTGTCTTAAAAAAAGAAG***TTATATCTT
GTTAATAATAAAAAGATG

QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 15

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GCCTTCAGCTTTTCTCAAGTTCGCTTCTGCTATTTCAAGAGTTTGCTGAGCTTCTTGTGG
ATCAATGTCACTATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAGTAATTTCATTATTGCCTAT
TCTAGCAAAACCGCCCATCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAA
AATACCTATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCC
ACTATTAGTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGT
CAGTACACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCC
TTCGCAGTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCA
AATTCTCCGGAAAGGATCAATTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATATTTT
CCCGGAGAACCTGTAAATACTTCTGCTACGAAAAAAGGTTGTGATAAGAAACGCTCAATC
TTTCGTGCTCTTGCGACGGTTAAGCGATCCTCTTCGGATAATTCGTCCAACCCCAGGATA
GCTATAATGTCCTGAAGCTCCTTGTAACGTTGTAAAGTTTGCTTAACTTGTTGCGCAGTT
TCATAATGTTCCTCGCCAACGATTCGAGGTTGTAGCATAGTTGACGTTGAATCTAAAGGA
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AAATGTGCAAATGTGGTGGCAGGAGCAGGGTCAGTCAAATCGTCTGCAGGTACATAC


BQ
40 45 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 5 60 60 60 60 60 60 60 15 60 60 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 50 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H193JQB U 1
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TCTCTGCATCATTTACTAAAATAGTAATTTCATTATTGCCTATTCTAGCAAAACCGCCCA
TCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAAAATACCTATATCAACAG
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TGATTTCT
C

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DS 

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C

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C

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DS 

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AATACCTATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCC
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C

QA 1 421 1 421
DS 

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DS 

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GCTATAATGTCCTGAAGCTCCTTGTA
CGTTGTA

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DS 

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GCCTTCAGCTTTTCTCAAGTTCGCTTCTGCTATTTCAAGAGTTTGCTGAGCTTCTTGTGG
ATCAATGTCACTATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAGTAATTTCATTATTGCCTAT
TCTAGCAAAACCGCCCATCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAA
AATACCTATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCC
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CAGTACACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCC
TTCGCAGTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCA
AATTCTCCGGAAAGGATCAATTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATATTTT
CCCGGAGAACCTGTAAATACTTCTGCTACGAAAAAAGGTTGTGATAAGAAACGCTCAATC
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GCTATAATGTCCTGAAGCT

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DS 

RD RS1GS49JQ 780 0 0
G
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CCTTCAGCTTTTCTCAAGTTCGCTTCTGCTATTTCAAGAGTTTGCTGAGCTTCTTGTGGA
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CTAGCAAAACCGCCCATCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAAA
ATACCTATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCCA
CTATTAGTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGTC
AGTACACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCCT
TCGCAGTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCAA
ATTCTCCGGAAAGGATCAATTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATATTTTC
CCGGAGAACCTGTAAATACTTCTGCTACGAAAAAAGGTTGTGATAAGAAACGCTCAATCT
TTCGTGCTCTTGCGACGGTTAAGCGATCCTCTTCGGATAATTCGTCCAACCCCAGGATAG
CTATAATGTCCTGAAGCTCCTTGTAACGTTGTAAAGTTTGCTTAACTTGTTGCGCAGTT

QA 2 780 2 780
DS 

RD RS1D442JQ 727 0 0
GGATCCTATTTTTTTATACGTCAGCTAGTTACAAAATCAAATCATATTGAGAGCCTCGAC
GCGTGTCCGAGCTCGTCTGAGAGTTAGATTTGCCTCAATTGTTTGTCTCTTGCCTTCAGC
TTTTCTCAAGTTCGCTTCTGCTATTTCAAGAGTTTGCTGAGCTTCTTGTGGATCAATGTC
ACTATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAGTAATTTCATTATTGCCTATTCTAGCAAA
ACCGCCCATCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAAAATACCTAT
ATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCCACTATTAGT
AGACAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGTCAGTACACA
AAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCCTTCGCAGTA
GCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCAAATTCTCCG
GAAAGGATCAATTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATATTTTCCCGGAGAA
CCTGTAAATACTTCTGCTACGAAAAAAGGTTGTGATAAGAAACGCTCAATCTTTCGTGCT
CTTGCGACGGTTAAGCGATCCTCTTCGGATAATTCGTCCAACCCCAGGATAGCTATAATG
TCCTGAA

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1BX18TF 126 0 0
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TGCGCAGTTTCATAATGTTCCTCGCCAACGATTCGAGGTTGTAGCATAGTTGACGTTGAA
TCTAAA

QA 1 126 1 126
DS 

RD RS1H193TF 749 0 0
AGCTTTTCTCAAGTTCGCTTCTGCTATTTCAAGAGTTTGCTGAGCTTCTTGTGGATCAAT
GTCACTATTCTTCTCTGCATCATTTACTAAAATAGTAATTTCATTATTGCCTATTCTAGC
AAAACCGCCCATCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAAAATACC
TATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCCACTATT
AGTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGTCAGTAC
ACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCCTTCGCA
GTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCAAATTCT
CCGGAAAGGATCAATTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATATTTTCCCGGA
GAACCTGTAAATACTTCTGCTACGAAAAAAGGTTGTGATAAGAAACGCTCAATCTTTCGT
GCTCTTGCGACGGTTAAGCGATCCTCTTCGGATAATTCGTCCAACCCCAGGATAGCTATA
ATGTCCTGAAGCTCCTTGTAACGTTGTAAAGTTTGCTTAACTTGTTGCGCAGTTTCATAA
TGTTCCTCGCCAACGATTCGAGGTTGTAGCATAGTTGACGTTGAATCTAAAGGATCTACC
GCTGGATAGATACCTTTAGCAGCTAATCC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RS1D442TF 635 0 0
TCTAGCAAAACCGCCCATCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAA
AATACCTATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCC
ACTATTAGTAGACAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGT
CAGTACACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCC
TTCGCAGTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCA
AATTCTCCGGAAAGGATCAATTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATATTTT
CCCGGAGAACCTGTAAATACTTCTGCTACGAAAAAAGGTTGTGATAAGAAACGCTCAATC
TTTCGTGCTCTTGCGACGGTTAAGCGATCCTCTTCGGATAATTCGTCCAACCCCAGGATA
GCTATAATGTCCTGAAGCTCCTTGTAACGTTGTAAAGTTTGCTTAACTTGTTGCGCAGTT
TCATAATGTTCCTCGCCAACGATTCGAGGTTGTAGCATAGTTGACGTTGAATCTAAAGGA
TCTACCGCTGGATAGATACCTTTAGCAGCTAATCC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1GE59TF 715 0 0
TAGCAAAACCGCCCATCAGAGCCATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAAAA
TAC*TATATCAACAGCTGTGGCAATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCCAC
TATTAGTAGATAAAATGATTTCTTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGTCA
GTACACAAAGATTTAAGGTCATTTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGCAGCCTT
CGCAGTAGCTTCATCGATGTTACCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCAAA
TTCTCCGGAAAGGATCAATTTAAACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATATTTTCC
CGGAGAACCTGTAAATACTTCTGCTACGAAAAAAGGTTGTGATAAGAAACGCTCAATCTT
TCGTGCTCTTGCGACGGTTAAGCGATCCTCTTCGGATAATTCGTCCAACCCCAGGATAGC
TATAGTGTCCTGAAGCTCCTTGTAACGTTGTAAAGTTTGCTTAACTTGTTGCGCAGTTTC
ATAATGTTCCTCGCCAACGATTCGAGGTTGTAGCATAGTTGACGTTGAATCTAAAGGATC
TACCGCTGGATAGATACCTTTAGCAGCTAATCCTCTTGATAGTACGGCAGTCGCATCTAA
ATGTGCAAATGTGGTGGCAGGAGCAGGGTCAGTCAAATCGTCTGCAGGTACATAC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1GS49TF 650 0 0
CATTGTTAACCATTGGTTATTAAGGCGTATTTTCAAAATACCTATATCAACAGCTGTGGC
AATCGGCGCGTGATTTGGTAATACGCCAATTTGTCCACTATTAGTAGATAAAATGATTTC
TTTTACTTCTGAATCCCAAACAATTCGATTCGGAGTCAGTACACAAAGATTTAAGGTCAT
TTCTTCAATTTACTCTCCATTTCTAAGTTCGTAGCCTTCGCAGTAGCTTCATCGATGTTA
CCCACTAAGTAAAAGGCCTGTTCAGGAAGAGAATCAAATTCTCCGGAAAGGATCAATTTA
AACCCTCTAATTGTTTCCGCTAGACCAACATATTTTCCCGGAGAACCTGTAAATACTTCT
GCTACGAAAAAAGGTTGTGATAAGAAACGCTCAATCTTTCGTGCTCTTGCGACGGTTAAG
CGATCCTCTTCGGATAATTCGTCCAACCCCAGGATAGCTATAATGTCCTGAAGCTCCTTG
TAACGTTGTAAAGTTTGCTTAACTTGTTGCGCAGTTTCATAATGTTCCTCGCCAACGATT
CGAGGTTGTAGCATAGTTGACGTTGAATCTAAAGGATCTACCGCTGGATAGATACCTTTA
GCAGCTAATCCTCTTGATAGTACGGTAGTCGCATCTAAATGTGCAAAT
CC

QA 1 648 1 648
DS 



AS 3 15

CO CL77Contig1 827 8 12 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGCAACTCAAA
CCACGATTCCAATTATTGAACTCTCTCTAATTTACTTTAATCACCAAAAAAAA*GTCTTT
CTAGAAGTCATTTTTACTTTCTACCACCACCTTTTGTGTCTTGAAAACATGACTATTGCT
TTAACTATCGGAGGAAACGGGTTCTCGGGTTTATCCGGATCTTCCTTTTCATCATCTTCT
TCATCGTTTCGACTGAAGAACAGCAGAAGAAAAGACACGAAGATGCTTAACAGAACACGA
GTCGTCTGTTCTTCATCTTCAGTAATGGATCCTTATAAAACACTACAGATCCGACCCGAT
TCATCAGAATACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCCTGAT
GTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGAGTACAGTTTCAGACAATCAACGAAGCTTACGATATT
GTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAATTTGAGCCATTCGATGTG
TACGAAGAGGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGAAGAATGGATG
GGGTGGG*AAGGTGCAGGAACCAGAGACTACTCCTCTCACGTCAATCCTTACGCTTGATG
AAGAAGTAATGATTCAAATGCACATAAATAACAACATAGAGACTGAACGATGTAAATACA
TGAAACTGTCTCGTGAATGGTACTTAAAATGTAAATAAAAGTCATTTCTCTCCTTCATTG
TAAATCTCAACGTTAAAGCTTAAATGAAAATCATCTCAATATACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 10 35 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A570TF U 51
AF RS1A292TF U 1
AF RS1GH28TF U 49
AF RS1GH28JQ C 51
AF RS1A292TV U 159
AF RS1CI66TF U 50
AF RS1EC93TF U 51
AF RS1CI66JQ C 155
BS 1 592 RS1A292TF
BS 593 593 RS1A570TF
BS 594 603 RS1A292TF
BS 604 604 RS1A570TF
BS 605 607 RS1A292TF
BS 608 608 RS1GH28TF
BS 609 748 RS1A292TF
BS 749 759 RS1GH28TF
BS 760 760 RS1EC93TF
BS 761 789 RS1CI66TF
BS 790 817 RS1EC93TF
BS 818 827 RS1CI66JQ

RD RS1A570TF 563 0 0
GG
AACTCAAACCACGATTCCAATTATTGAACTCTCTCTAATTTACTTTAATCACCAAAAAAA
**GTCTTTCTAGAAGTCATTTTTACTTTCTACCACCACCTTTTGTGTCTTGAAAACATGA
CTATTGCTTTAACTATCGGAGGAAACGGGTTCTCGGGTTTATCCGGATCTTCCTTTTCAT
CATCTTCTTCATCGTTTCGACTGAAGAACAGCAGAAGAAAAGACACGAAGATGCTTAACA
GAACACGAGTCGTCTGTTCTTCATCTTCAGTAATGGATCCTTATAAAACACTACAGATCC
GACCCGATTCATCAGAATACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATC
ATCCTGATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGAGTACAGTTTCAGACAATCAACGAAGCTT
ACGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAATTTGAGCCAT
TCGATGTGTACGAAGAGGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGAAG
AATGGATGGGGTGGGGAAGGT

QA 3 563 3 563
DS 

RD RS1A292TF 750 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGCAACTCAAA
CCACGATTCCAATTATTGAACTCTCTCTAATTTACTTTAATCACCAAAAAAAA*GTCTTT
CTAGAAGTCATTTTTACTTTCTACCACCACCTTTTGTGTCTTGAAAACATGACTATTGCT
TTAACTATCGGAGGAAACGGGTTCTCGGGTTTATCCGGATCTTCCTTTTCATCATCTTCT
TCATCGTTTCGACTGAAGAACAGCAGAAGAAAAGACACGAAGATGCTTAACAGAACACGA
GTCGTCTGTTCTTCATCTTCAGTAATGGATCCTTATAAAACACTACAGATCCGACCCGAT
TCATCAGAATACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCCTGAT
GTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGAGTACAGTTTCAGACAATCAACGAAGCTTACGATATT
GTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAATTTGAGCCATTCGATGTG
TACGAAGAGGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGAAGGATGGATG
GGGCGGGGAAGGTGCAGGAACCAGAGACTACTCCTCTCACGTCAATCCTTACGCTTGATG
AAGAAGTAATGATTCAAATGCACATAAATAACAACATAGAGACTGAACGATGTAAATACA
TGAAACTGTCTCGTGAATGGTACTTAAA
TG

QA 1 748 1 748
DS 

RD RS1GH28TF 715 0 0
GGC
CAACTCAAACCACGATTCCAATTATTGAACTCTCTCTAATTTACTTTAATCACCAAAAAA
AAAGTCTTTCTAGAAGTCATTTTTACTTTCTACCACCACCTTTTGTGTCTTGAAAACATG
ACTATTGCTTTAACTATCGGAGGAAACGGGTTCTCGGGTTTATCCGGATCTTCCTTTTCA
TCATCTTCTTCATCGTTTCGACTGAAGAACAGCAGAAGAAAAGACACGAAGATGCTTAAC
AGAACACGAGTCGTCTGTTCTTCATCTTCGGTAATGGATCCTTATAAAACACTACAGATC
CGACCTGATTCATCAGAATACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTAT
CATCCTGATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGAGTACAGTTTCAGACAATCAACGAAGCT
TACGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAATTTGAGCCA
TTCGATGTGTACGAAGAGGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGAA
GAATGGATGGGGTGGG*AAGGTGCAGGAACCAGAGACTACTCCTCTCACGTCAATCCTTA
CGCTTGATGAAGAAGTAATGATTCAAATGCACATAAATAACAACATAGAGACTGAACGAT
GTAA*TACATGAAACTGTCTCGTGAATGGTACTTAAAATGTAAATAAA
GTCA

QA 4 711 4 711
DS 

RD RS1GH28JQ 726 0 0
C
CAACTCAAACCACGATTCCAATTATTGAACTCTCTCTAATTTACTTTAATCACCAAAAAA
AAAGTCTTTCTAGAAGTCATTTTTACTTTCTACCACCACCTTTTGTGTCTTGAAAACATG
ACTATTGCTTTAACTATCGGAGGAAACGGGTTCTCGGGTTTATCCGGATCTTCCTTTTCA
TCATCTTCTTCATCGTTTCGACTGAAGAACAGCAGAAGAAAAGACACGAAGATGCTTAAC
AGAACACGAGTCGTCTGTTCTTCATCTTCGGTAATGGATCCTTATAAAACACTACAGATC
CGACCTGATTCATCAGAATACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTAT
CATCCTGATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGAGTACAGTTTCAGACAATCAACGAAGCT
TACGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAATTTGAGCCA
TTCGATGTGTACGAAGAGGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGAA
GAATGGATGGGGTGGG*AAGGTGCAGGAACCAGAGACTACTCCTCTCACGTCAATCCTTA
CGCTTGATGAAGAAGTAATGATTCAAATGCACATAAATAACAACATAGAGACTGAACGAT
GTAAATACATGAAACTGTCTCGTGAATGGTACTTAAAATGTAAATAAAAGTCATTTCTCT
CCTTC

QA 2 726 2 726
DS 

RD RS1A292TV 615 0 0
TCTTGAAAACATGACTATTGCTTTAACTATCGGAGGAAACGGGTTCTCGGGTTTATCCGG
ATCTTCCTTTTCATCATCTTCTTCATCGTTTCGACTGAAGAACAGCAGAAGAAAAGACAC
GAAGATGCTTAACAGAACACGAGTCGTCTGTTCTTCATCTTCAGTAATGGATCCTTATAA
AACACTACAGATCCGACCCGATTCATCAGAATACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACT
CGCCAAAAAGTATCATCCTGATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGAGTACAGTTTCAGAC
AATCAACGAAGCTTACGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGA
GGAATTTGAGCCATTCGATGTGTACGAAGAGGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTG
TGACACGTGGGAAGGATGGATGGGGCGGG*AAGGTGCAGGAACCAGAGACTACTCCTCTC
ACGTCAATCCTTACGCTTGATGAAGAAGTAATGATTCAAATGCACATAAATAACAACATA
GAGACTGAACGATGTAAATACATGAAACTGTCTCGTGAATGGTACTTAAAATGTAAATAA
AAGTCATTTCTCTCC

QA 1 615 1 615
DS 

RD RS1CI66TF 749 0 0
GG
CAACTCAAACCACGATTCCAATTATTGAACTCTCTCTAATTTACTTTAATCACCAAAAAA
AA*GTCTTTCTAGAAGTCATTTTTACTTTCTACCACCACCTTTTGTGTCTTGAAAACATG
ACTATTGCTTTAACTATCGGAGGAAACGGGTTCTCGGGTTTATCCGGATCTTCCTTTTCA
TCATCTTCTTCATCGTTTCGACTGAAGAACAGCAGAAGAAAAGACACGAAGATGCTTAAC
AGAACACGAGTCGTCTGTTCTTCATCTTCAGTAATGGATCCTTATAAAACACTACAGATC
CGACCCGATTCATCAGAATACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTAT
CATCCTGATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGAGTACAGTTTCAGACAATCAACGAAGCT
TACGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAATTTGAGCCA
TTCGATGTGTACGAAGAGGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGAA
GAATGGATGGGGTGGG*AAGGTGCAGGAACCAGAGACTACTCCTCTCACGTCAATCCTTA
CGCTTGATGAAGAAGTAATGATTCAAATGCACATAAATAACAACATAGAGACTGAACGAT
GTAAATACATGAAACTGTCTCGTGAATGGTACTTAAAATGTAATAAAA*GTCATTTCTCT
CCTTCATTGTAAATCTCA
CGTTAAAGC

QA 3 740 3 740
DS 

RD RS1EC93TF 767 0 0
G
CAACTCAAACCACGATTCCAATTATTGAACTCTCTCTAATTTACTTTAATCACCAAAAAA
AA*GTCTTTCTAGAAGTCATTTTTACTTTCTACCACCACCTTTTGTGTCTTGAAAACATG
ACTATTGCTTTAACTATCGGAGGAAACGGGTTCTCGGGTTTATCCGGATCTTCCTTTTCA
TCATCTTCTTCATCGTTTCGACTGAAGAACAGCAGAAGAAAAGACACGAAGATGCTTAAC
AGAACACGAGTCGTCTGTTCTTCATCTTCAGTAATGGATCCTTATAAAACACTACAGATC
CGACCCGATTCATCAGAATACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTAT
CATCCTGATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGAGTACAGTTTCAGACAATCAACGAAGCT
TACGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAATTTGAGCCA
TTCGATGTGTACGAAGAGGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGAA
GAATGGATGGGGGTGGGAAGGTGCAGGAACCAGAGACTACTCCTCTCACGTCAATCCTTA
CGCTTGATGAAGAAGTAATGATTCAAATGCACATAAATAACAACATAGAGACTGAACGAT
GTAAATACATGAAACTGTCTCGTGAATGGTACTTAAAATGTAAATAAAAGTCATTTCTCT
CCTTCATTGTAAATCTCAACGTTAAAGCTTAAATGAAAATCATCTC

QA 2 767 2 767
DS 

RD RS1CI66JQ 673 0 0
TGTGTCTTGAAAACATGACTATTGCTTTAACTATCGGAGGAAACGGGTTCTCGGGTTTAT
CCGGATCTTCCTTTTCATCATCTTCTTCATCGTTTCGACTGAAGAACAGCAGAAGAAAAG
ACACGAAGATGCTTAACAGAACACGAGTCGTCTGTTCTTCATCTTCAGTAATGGATCCTT
ATAAAACACTACAGATCCGACCCGATTCATCAGAATACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGAC
AACTCGCCAAAAAGTATCATCCTGATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGAGTACAGTTTC
AGACAATCAACGAAGCTTACGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAA
CAGAGGAATTTGAGCCATTCGATGTGTACGAAGAGGGATTCAACGGAATGAATGATCCAG
ATTGTGACACGTGGGAAGAATGGATGGGGTGGG*AAGGTGCAGGAACCAGAGACTACTCC
TCTCACGTCAATCCTTACGCTTGATGAAGAAGTAATGATTCAAATGCACATAAATAACAA
CATAGAGACTGAACGATGTAAATACATGAAACTGTCTCGTGAATGGTACTTAAAATGTAA
ATAAAAGTCATTTCTCTCCTTCATTGTAAATCTCAACGTTAAAGCTTAAATGAAAATCAT
CTCAATATACTCC

QA 1 673 1 673
DS 



CO CL77Contig2 758 5 18 U
GGGACGATTCCAATTATTGAACTCTCTCTAATTTACTTGAATCACCAAAAAAAAAAAAAA
GTCTTTCTAGAAGTCATTTTTACTTTCTACCACCACCACCTTTTTGTGTCTTCAAAACAT
GACTATTGCTTTAACGATCGGAGGAAACGGGTTCTCGGGTTTATCCGGATCTTCCTTTTC
ATCATCTTCTTCATCGTTTCGACTGAAGAACAGCAGAAGAAAAGACACGAAGATGCTTAA
CAGAACACGAGTCGTCTGTTCTTCGTCTTCAGTAATGGATCCTTATAAAACACTTCAGAT
CCGACCCGATTCATCGGAATACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTA
TCATCCTGATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGAGTACAGTTTCAGACAATCAACGAAGC
TTACGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAATTTGAGCC
ATTTGATGTGTATGACGAGGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGA
AGAATGGATGGGATGGG*AAGGTGCAGGAACCAGAGACTACTCCTCTCACGTCAATCCTT
ACGCTTGAAGAAGATGATTCGAAGGCATATAAATAACCAACATAGAGACTGATGTAAATA
CATGAAACTGTCTCGTGAATAAAAATGTAAATAAAAAGTCATTTCTCTCTGTCATTGTAA
ATCTCAACCTTAAGCTTAAATGAAAATCATCTCAAAAA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BM79JQ C 90
AF RS1BU05TF U 1
AF RS1BM79TF U 2
AF RS1EP40TF U 271
AF RS1BU05JQ C 90
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BS 58 59 RS1BM79TF
BS 60 455 RS1BU05TF
BS 456 456 RS1BM79TF
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BS 484 557 RS1BU05TF
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BS 746 758 RS1BM79TF

RD RS1BM79JQ 608 0 0
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AATAAAAA

QA 1 608 1 608
DS 

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GACTATTGCTTTAACGATCGGAGGAAACGGGTTCTCGGGTTTATCCGGATCTTCCTTTTC
ATCATCTTCTTCATCGTTTCGACTGAAGAACAGCAGAAGAAAAGACACGAAGATGCTTAA
CAGAACACGAGTCGTCTGTTCTTCGTCTTCAGTAATGGATCCTTATAAAACACTTCAGAT
CCGACCCGATTCATCGGAATACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTA
TCATCCTGATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGAGTACAGTTTCAGACAATCAACGAAGC
TTACGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGACGGAGGGAACAGAGGAATTTGAGCC
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ACGCTTGAAGAAGATGATTCGAAGGCATATAAATAACCAACATAGAGACTGATGTAAATA
CATGAAACTGTC*CGTGAATAAAA*TGTAAATAAAA*GTCATTTCTCTCTGTCATTGTAA
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TCATCTCATATACTCC

QA 1 745 1 745
DS 

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ACTATTGCTTTAACGATCGGAGGAAACGGGTTCTCGGGTTTATCCGGATCTTCCTTTTCA
TCATCTTCTTCATCGTTTCGACTGAAGAACAGCAGAAGAAAAGACACGAAGATGCTTAAC
AGAACACGAGTCGTCTGTTCTTCGTCTTCAGTAATGGATCCTTATAAAACACTTCAGATC
CGACCCGATTCATCGGAATACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTAT
CATCCTGATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGAGTACAGTTTCAGACAATCAACGAAGCT
TACGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAAT*AGATGGAGGGAACAGAGGAATTTGAGCCA
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CGCTTGAAGAAGATGATTCGAAGGCATATAAATAACCAACATAGAGACTGATGTAAATAC
ATGAAACTGTCTCGTGAATAAAAATGTAAATAAAAAGTCATTTCTCTCTGTCATTGTAAA
TCTCAACCTTAAGCTTAAATGAAAATCATCTCAAAAA

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DS 

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G
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CAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCCTGATGTTTGTAGAGGAAGCCACTGT
GGAGTACAGTTTCAGACAATCAACGAAGCTTACGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAAT
CAGATGGAGGGAACAGAGGAATTTGAGCCATTTGATGTGTATGACGAGGGATTCAACGGA
ATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGAAGAATGGATGGGATGGG*AAGGTGCAGGAAC
CAGAGACTACTCCTCTCACGTCAATCCTTACGCTTGAAGAAGATGATTCGAAGGCATATA
AATAACCAACATAGAGACTGATGTAAATACATGAAACTGTCTCGTGAATAAAAATGTAAA
TAAAAAGTCATTTCTCTCTGTCATTGTAAATCTCAACCTTAAGCTTAAATGAAAATCAT

QA 2 480 2 480
DS 

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CAGTAATGGATCCTTATAAAACACTTCAGATCCGACCCGATTCATCGGAATACGAGGTCA
AGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCCTGATGTTTGTAGAGGAAGCAACT
GTGGAGTACAGTTTCAGACAATCAACGAAGCTTACGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGA
ATCAGACGGAGGGAACAGAGGAATTTGAGCCATCTGATGTGTATGACGAGGGATTCAACG
GAATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGAAGAATGGATGGGATGGG*AAGGTGCAGGA
ACCAGAGACTACTCCTCTCACGTCAATCCTTACGCTTGAAGAAGATGATTCGAAGGCATA
TAAATAACCAACATAGAGACTGATGTAAATACATGAAACTGTC*CGTGAATAAAAATGTA
AATAAAAAGTCATTTCTTTCTGTCATTGTAAATCTCAACCTTAAGCTTAAATGAAA
ATCAT

QA 1 656 1 656
DS 



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GGCGAGTTGTCTGAAAGCTTGCTTGACCACGTATTCTGATGAATCGGGTCGGATCTGAAG
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GGTGATTCAAGTAAATTAGAGAGGTTCAATAATTGGAATCGTCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DP07TF C 1
AF RS1DP07JQ U 5
BS 1 4 RS1DP07TF
BS 5 764 RS1DP07JQ

RD RS1DP07TF 764 0 0
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GACGTGAGAGGAGTAGTCTCTGGTTCCTGCACCTTCCCAGCCCATCCATTCTTCCCACGT
GTCACAATCTGGATCATTCATTCCGTTGAATCCCTCGTCATACACATCAAATGGCTCAAA
TTCCTCTGTTCCCTCCATCTGATTCTTTATTTGCTTCAACACAATATCGTAAGCTTCGTT
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GGCGAGTTGTCTGAAAGCTTGCTTGACCACGTATTCTGATGAATCGGGTCGGATCTGAAG
TGTTTTATAAGGATCCATTACTGAAGATGAAGAACAGACGACTCGTGTTCTGTTAAGCAT
CTTCGTGTCTTTTCTTCTGCTGTTCTTCAGTCGAAACGATGAAGAAGATGATGAAAAGGA
GGATCCGGATAAACCCGAGAACCCGTTTCCTCCGATCGTTAAAGCAATAGTCATCTTTTC
AAGACACAAAAAGGTGGTGGTGGTAGAAAGTAAAAATGACTTCTAGAAAGACTTTTTTTT
GGTGATTCAAGTAAATTAGAGAGGTTCAATAATTGGAATCGTCC

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1DP07JQ 760 0 0
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TTTACATTTTAAGTAACCATTCACGAGACAGTTTATCATGTATTTACATCGTTCAGTCTC
TATGTTGGTTATTTATGTGCATTCGAATCGTTACTTCATCTTCAAGCGTAAGGATTGACG
TGAGAGGAGTAGTCTCTGGTTCCTGCACCTTCCCAGCCCATCCATTCTTCCCACGTGTCA
CAATCTGGATCATTCATTCCGTTGAATCCCTCGTCATACACATCAAATGGCTCAAATTCC
TCTGTTCCCTCCATCTGATTCTTTATTTGCTTCAACACAATATCGTAAGCTTCGTTGATT
GTCAGAAACTGTACTCCACAGTTGCTTCCTCTACAAACATCAGGATGATACTTTTTGGCG
AGTTGTCTGAAAGCTTGCTTGACCACGTATTCTGATGAATCGGGTCGGATCTGAAGTGTT
TTATAAGGATCCATTACTGAAGATGAAGAACAGACGACTCGTGTTCTGTTAAGCATCTTC
GTGTCTTTTCTTCTGCTGTTCTTCAGTCGAAACGATGAAGAAGATGATGAAAAGGAGGAT
CCGGATAAACCCGAGAACCCGTTTCCTCCGATCGTTAAAGCAATAGTCATCTTTTCAAGA
CACAAAAAGGTGGTGGTGGTAGAAAGTAAAAATGACTTCTAGAAAGACTTTTTTTTGGTG
ATTCAAGTAAATTAGAGAGGTTCAATAATTGGAATCGTCC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 3

CO CL78Contig1 1204 3 11 U
GGACTCACCATCGTCACTGTTTAATCTCTCTTCTAATCTCGCCTTCAATCTCTCTCTCAC
ACTCACCATGGCTGGCGGTAAGATCAAGATCGGAATCAACGGATTCGGAAGAATCGGTCG
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GAAACACCATGAGCTTAAGGTTAAGGATGAGAAGACTCTTCTCTTCGGTGAGAAGCCTGT
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TGTCAACGAGCACGAGTAATCAACGACAGGTTCGGAATTGTTGAGGGTCTCATGACCACC
GTCCACTCCATCACCGCTACTCAGAAGACCGTTGATGGACCATCGATGAAGGAGGGGTGG
AAGAGCCGCTTCATTCAACATCATTCCCAGCAGCACCGGAGCTGCCAAGGCTGTCGGAAA
GGTGCTTCCACGGCTCAACGGAAAGCTGACCGGAATGTCCTTCCGTGTTCCCACCGTTGA
TGTCTCAGTTGTTGACCTCACTGTTAGACTCGAGAAAGCTGCAACCTACGACGATATCAA
GAAGGCTATCAAGGAGGAATCTGAAGGCAAGCTTAAGGGAATCCTCGGATACACTGAGGA
TGATGTCGTCTCAACTGACTTCATTGGTGACAGCAGGTCAAGCATCTTCGACGCAAAGGC
TGGAATCGCTTTGAGTGACAACTTCGTGAAGCTGGTGTCGTGGTATGACAACGAATGGGG
TTACAGCACCCGTGTGGTCGACTTGATCGTCCACATGTCCAAGTGCTAAATCTGAGAAGG
TCTGGAATGGTGTTTGGAGGAAGAAGTCCTGTGTTTCGTTTCTGCTAATGGTTTAAATAT
GTCGTTTTTGAATAAAATTTCTTGGGATTTCAATCTCCTTTCAGTTTAAGCGAATCTCCC
TCAGAGTTTGTGAAGAGGTTCTTTTATGTTTGGCTTTTGATATATTGAGCTGTGTTTTCT
CAGG


BQ
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AF RS1CJ89TF U 1
AF RS1GY56TF U 691
AF RS1CJ89JQ C 425
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GATGCTATCAAGAGGATC

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G
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CACATGTCCAAGTGCTAAATCTGAGAAGGTCTGGAATGGTGTTTGGAGGAAGAAGTCCTG
TGTTTCGTTTCTGCTAATGGTTTAAATATGTCGTTTTTGAATAAAATTTCTTGGGATTTC
AATCTCCTTTCAGTTTAAGCGAATCTCCCTCAGAGTTTGTGAAGAGGTTCTTTTATGTTT
GGCTTTTGATA
TATTGAGCTGTGTTTTCCC

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ACTCCATCACCGCTACTCAGAAGACCGTTGATGGACCATCGATGAAGGAGGGGTGGAAGA
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AGCACCCGTGTGGTCGACTTGATCGTCCACATGTCCAAGTGCTAAATCTGAGAAGGTCTG
GAATGGTGTTTGGAGGAAGAAGTCCTGTGTTTCGTTTCTGCTAATGGTTTAAATTTGTCG
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AGTTTGTGAAGAGGTTCTTTTATGTTTGGCTTTTGATATATTGAGCTGTGTTTTCTCAGG

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 8

CO CL79Contig1 1259 8 7 U
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TGTTCAGATTACAGAGACATTGGATCTGAAAAAATTACACTAATACTTTTGCCATATAGA
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ATCAAACCAGTCAATACCGTCATTAGCAGCTAAGGAGACCATGATGTCGTCAATTCCTTT
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AGGCATAAGCATTTCTTTCCCTACAGGACCAGTGAGCTTGACATCACTTCCTGGTTTCAA
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BK65TF C 26
AF RS1A319TR U 17
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AF RS1CX31JQ U 4
AF RS1A319JQ U 1
AF RS1A319TF C 1
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AF RS1EQ89TF C 602
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BS 831 831 RS1EQ89TF
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CTGAAAAAATTACACTAATACTTTTGCCATATGGAATGTTCAAATCAGTAAACTTCAACG
TTCCATTGCTCTGCCTTCTTCAACTGCTTCTTATAATCAAACCAGTCAATACCGTCATTA
GCAGCTAAGGAAACCATGATGTCGTCAATTCCTTTCTCCATCCCCTTAAGCCCACACATG
TAGACAAACGTGTTGTCTTTCTTCAGCAACTCCCATAGCTCAGGTGCGTATTGTGCCATT
CTTGTCTGGATATACATTTTCTCTCCTTTATCATTTGCTTGTTCTCTGCTTATCGCGTAA
TCAACCCTGAAGTTCTCTGGTGCCTTTGCTTTCATCTTATCAAACTCCTCTGTGTATAGC
AATGAACTAGTGGTTGGTACACCCAAGAACAACCAAGCTAAGCCATTAAACTTGTAGTCA
C

QA 1 480 1 480
DS 

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ACATTGGATCTGAAAAAATTACACTAATACTTTTGCCATATAGAATGTTCAGATCAGTAA
ACTTCAACGTTCCATTGCTCTGCCTTCTTCAACTGCTTCTTATAATCAAACCAGTCAATA
CCGTCATTAGCAGCTAAGGAGACCATGATGTCGTCAATTCCTTTCTCCATCCCCTTAAGC
CCACACATGTAGACAAACGTGTTGTCTTTCTTCAGCAACTCCCATAGCTCAGGTGCGTAT
TGTGCCATTCTTGTCTGGATATACATTTTCTCTCCTTTATCATTTGCTTGTTCTCTGCTT
ATCGCGTAATCAACCCTGAAGTTCTCTGGTGCCTTTGCTTTCATCTTATCAAACTCCACA
GTGTAGAGCAGTGAACTAGTGGTTGGTACACCCAAGAACAACCAAGCTAAGCCATTAAAC
TTGTAATCATCATGTTTCTCGAAGAACATC

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DS 

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GACAAACGTGTCGTCTTTCTTCAGCAACTCCCATAGCTCAGGTGCGTATTGTGCCATTCT
TGTCTGGATATACATTTTCTCTCCTTTATCATTTGCTTGTTCTCTGCTTATCGCGTAATC
AACCCTGAAGTTCTCTGGTGCCTTTGCTTTCATCTTATCAAACTCCTCAGTGTAAAGCAG
TGAACTAGTGGTTGGTACACCCAAGAACAACCAAGCTAAGCCATTAAACTTGTAATCATC
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GGCAAGCATAATAACAGTGGCGTTTG

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AG
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AGATTACAGAGACATTGGATCTGAAAAAATTACACTAATACTTTTGCCATATAGAATGTT
CAGATCAGTAAACTTCAACGTTCCATTGCTCTGCCTTCTTCAAATGCTTCTTATAATCAA
ACCAGTCAATACCGTCATTAGCAGCTAAGGAGACCATGATGTCGTCAATTCCTTTCTCCA
TCCCCTTAAGCCCACACATGTAGACAAACGTGTTGTCTTTCTTCAGCAACTCCCATAGCT
CAGGTGCGTATTGTGCCATTCTTGTCTGGATATACATTTTCTCTCCTTTATCATTTGCTT
GTTCTCTGCTTATCGCGTAATCAACCCTGAAGTTCTCTGGTGCCTTTGCTTTCATCTTAT
CAAACTCCTCAGTGTAGAGCAGTGAACTAGTGGTTGGTACACCCAAGAACAACCAAGCTA
AGCCATTAAACTTGTAATCATCATGTTTCTCGAAGAACATCTTCCACAAGAAAGACCTAA
AAGGAGCTATTCCTGTCCCTGTGGCAAGCATAATAACAGTGGCGTTTGGATCCTTAGGCA
TAAGCATTTCTTTCCCTACAGGACCAGTGAGCTTGACATCACTTCCTGGTTTCAAGTCAC
ACAAGAAGTTTGAGCAAACTCCTTTAACAACCTCTC

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DS 

RD RS1A319JQ 784 0 0
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TGTTCAGATTACAGAGACATTGGATCTGAAAAAATTACACTAATACTTTTGCCATATAGA
ATGTTCAGATCAGTAAACTTCAACGTTCCATTGCTCTGCCTTCTTCAACTGCTTCTTATA
ATCAAACCAGTCAATACCGTCATTAGCAGCTAAGGAGACCATGATGTCGTCAATTCCTTT
CTCCATCCCCTTAAGCCCACACATGTAGACAAACGTGTTGTCTTTCTTCAGCAACTCCCA
TAGCTCAGGTGCGTATTGTGCCATTCTTGTCTGGATATACATTTTCTCTCCTTTATCATT
TGCTTGTTCTCTGCTTATCGCGTAATCAACCCTGAAGTTCTCTGGTGCCTTTGCTTTCAT
CTTATCAAACTCCACAGTGTAGAGCAGTGAACTAGTGGTTGGTACACCCAAGAACAACCA
AGCTAAGCCATTAAACTTGTAATCATCATGTTTCTCGAAGAACATCTTCCACAAGAAAGA
CCTAAAAGGAGCTATTCCTGTCCCTGTGGCAAGCATAATAACAGTGGCGTTTGGATCCTT
AGGCATAAGCATTTCTTTCCCTACAGGACCAGTGAGCTTGACATCACTTCCTGGTTTCAA
GTCACACAAGAAGTTTGAGCAAACTCCTTTAACAACCTCTCCTGCGTCATTAGTATAAAC
AAGCCTTTTCACACACAGAGAAACAGTTTCAGAGTTGCCAAGATCTCCAAGAGCGCTGCT
TGC
C

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DS 

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GATAA
AGATAAAAGAACCCCCTTTTCAGTATAATGTATATATATCTAAAACATAAACTTATGTTC
AGATTACAGAGACATTGGATCTGAAAAAATTACACTAATACTTTTGCCATATAGAATGTT
CAGATCAGTAAACTTCAACGTTCCATTGCTCTGCCTTCTTCAACTGCTTCTTATAATCAA
ACCAGTCAATACCGTCATTAGCAGCTAAGGAGACCATGATGTCGTCAATTCCTTTCTCCA
TCCCCTTAAGCCCACACATGTAGACAAACGTGTTGTCTTTCTTCAGCAACTCCCATAGCT
CAGGTGCGTATTGTGCCATTCTTGTCTGGATATACATTTTCTCTCCTTTATCATTTGCTT
GTTCTCTGCTTATCGCGTAATCAACCCTGAAGTTCTCTGGTGCCTTTGCTTTCATCTTAT
CAAACTCCACAGTGTAGAGCAGTGAACTAGTGGTTGGTACACCCAAGAACAACCAAGCTA
AGCCATTAAACTTGTAATCATCATGTTTCTCGAAGAACATCTTCCACAAGAAAGACCTAA
AAGGAGCTATTCCTGTCCCTGTGGCAAGCATAATAACAGTGGCGTTTGGATCCTTAGGCA
TAAGCATTTCTTTCCCTACAGGACCAGTGAGCTTGACATCACTTCCTGGTTTCAAGTCAC
ACAAGAAGTTTGAGCAAACTCCTTTAACAACCTCTCCTGCGTCATTAGTATAAACAAGCC
TTTTCACACACAGAGAAACAGTTTCAGAGTTGCCAAGATCTCCAAGAGCGCTGCTTGCCC
CCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTA

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DS 

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ACTTTTGCCATATAGAATGTTCAGATCAGTAAACTTCAACGTTCCATTGCTCTGCCTTCT
TCAACTGCTTCTTATAATCAAACCAGTCAATACCGTCATTAGCAGCTAAGGAGACCATGA
TGTCGTCAATTCCTTTCTCCATCCCCTTAAGCCCACACATGTAGACAAACGTGTTGTCTT
TCTTCAGCAACTCCCATAGCTCAGGTGCGTATTGTGCCATTCTTGTCTGGATATACATTT
TCTCTCCTTTATCATTTGCTTGTTCTCTGCTTATCGCGTAATCAACCCTGAAGTTCTCTG
GTGCCTTTGCTTTCATCTTATCAAACTCCTCAGTGTAAAGCAGTGAACTAGTGGTTGGTA
CACCCAAGAACAACCAAGCTAAGCCATTAAACTTGTAATCACCATGTTTCTCGAAAAACA
TCTTCCACAAGAAGGACCTAAAAGGAGCTATTCCTGTCCCTGTGGCAAGCATAATAACAG
TGGCGTTTGGATCCTTAGGCATAAGCATTTCTTTCCCTACAGGACCAGTGAGCTTGACAT
CACTTCCTGGTTTCAAGTCACACAAGAAGTTTGAGCAAACTCCTTTAACAACCTCTCCTG
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CTCCAAGAGCGCTGCTTGCAATGGA**GTAAAGCCTGACTTTGTTAGGCTTT**CCGTTC
TTGTCA*CTCCATCAGCAATCACACCAACAGATTGT

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DS 

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TCACACAAGAAGTTTGAGCAAACTCCTTTAACAACCTCTCCTGCGTCATTAGTATAAACA
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GCAATGGA**GTAAAGCCTGACTTTGTTAGGCTTT**CCGTTCTTGTCAACTCCATCAGC
AATCACACCAACAGATTGTCCCTCTCTGTACGGTATTTCTCCTGCATGGCTGAAAACCAT
GTGCCAGGTCTCTCCAGGAGCATCATCTGCTGTGATTTTGGTGTTGAGGAGGACTTTTCC
GGTGTAAGGCTCTTTTGGTCTGTACTTGTTAGTAATCACACCTTCCTCGTTCTTCTTAGA
CTCTTTCTCTACTTTCTTCACTGGAGGAGCATCTGTTGTGACTTCAGCTCTTACTGAAAC
CACTCTTCTGCTTGTCACCACACTGTTGCTTTTGTAGTTAAAAGCACCCTTACCAAACCT
GATCCTTTCAGGAGCAATGGCACAGCTTGTAGCTGGAAATGAAGAAGACTTGGAAGATGT
GAGAGACACAGCAGCATTCAAAGTAGACGCCATTGGAGAGGTAATGAAATGAAACTCC

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DS 



AS 1 12

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TGGGTGGTGATGATTTTGACAAGAGGGTTGTTGATTGGCTTGCTTCAAACTTCAAGAAAG
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AAAAAGCTAAAATCGAGCTTTCATCTCTGACTCAAACGAATATGAGCTTGCCATTTATCA
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AATTGTGCTCAGATTTACTGGACAGGTGTAAGACTCCCGTTGAGAATTCTCTGAGAGATG
CAAAGCTCAGCTTTAAGGATATTGATGAGGTGATCCTTGTTGGTGGATCCACACGTATTC
CTGCTGTTCAGGAAGTCGTCAGGAAGCTGACTGGGAAAGAACCCAATGTCACAGTAAACC
CTGATGAGGTTGTAGCTTTAGGTGCTGCGGTTCAGGCTGGTGTTCTAGCTGGAGATGTGA
GCGACATTGTCCTTCTTGACGTGACACCCCTATCCATTGGTTTAGAAACACTTGGCGGTG
TTATGACCAAGATTATTCCAAGGAACTCAACTCTGCCTACTTCCAAGTCGGAAGTCTTCT
CCACTGCTGCTGATGGACAGACAAGTGTTGAGATTAATGTGTTGCAGGGTGAGAGGGAGT
TTGTCCGGGATAACAAGTCTCTTGGCAGCTTCCGGCTAGATGGCATCCCACCAGCACCAC
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GTGCTAGTGACAAAGGCACCGGAAAGAAACAAGACATCACCATTACTGGTGCCAGTACAT
TGCCCAAGGACGAGGTAGAGCAAATGGTCCAAGAAGCAGAAAGGTTTGCAAAGGACGACA
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CCAAGCTACAAGAGCTGAAAGACAAGATTGCAAGTGGAACTACTCAAGAGATCAAGGACA
CGATGGCTGCTCTTAACCAAGAAGTGATGCAGATTGGTCAGTCGATGTACAACCAGCCTG
GAGCAGGAGCAGCAGGTGCAGGTCCTTCCCCTGGAGGCGAAGATGCTTCATCAGCTGATT
CAACCGGGAAAGATGGCGATGATGTGATTGACGCTGACTTCACAGACAGCAGCAAATGAT
GAAAGAAATACGGTTTTGAATTCATATATCCGATGAAACACATGATTTTGTAGGCTTGAT
TGGGTTGAGAAACAACGCATGTGAACACGAAATGTTTTTACAGAATGTGTTGTTACGTTA
TTCCTGCATGTTATTGCCTTCTTTTGGAACTATAAATAAGGATATTTTTCAATTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 20 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 30 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 45 10 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 10 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DP51TF U 1
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AF RS1FS54TF U 747
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AF RS1EM35JQ C 1236
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TGGGTGGTGATGATTTTGACAAGAGGGTTGTTGATTGGCTTGCTTCAAACTTCAAGAAAG
ATGAGGGTATTGATCTTCTGAAAGACAAACAAGCACTTCAAAGGTTGACAGAGGCAGCAG
AAAAAGCTAAAATCGAGCTTTCATCTCTGACTCAAACGAATATGAGCTTGCCATTTATCA
CGGCCACAGCTGATGGACCTAAACACATAGAAACCACCCTCACACGTGCCAAGTTCGAGG
AATTGTGCTCAGATTTACTGGACAGGTGTAAGACTCCCGTTGAGAATTCTCTGAGAGATG
CAAAGCTCAGCTTTAAGGATATTGATGAGGTGATCCTTGTTGGTGGATCCACACGTATTC
CTGCTGTTCAGGAAGTCGTCAGGAAGCTGACTGGGAAAGAACCCAATGTCACAGTAAACC
CTGATGAGGTTGTAGCTTTAGGTGCTGCGGTTCAGTCTGGTGTTCTAGCTGGAGATGTGA
GCGACATTGTCCTTCTTGACGTGACACCCCTATCCATTGGTTTAGAAACACTTGGCGGTG
TTATGACCAAGATTATTCCAAGGAACTCAACTCTGCCTACTTCCAAGTCGGAAGTCTTCT
CCACTGCTGCTGATGGACAGACAAGTGTTGAGAT*AATGTGTTGCAGG
TG

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DS 

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G
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TGGTTTAGAAACACTTGGCGGTGTTATGGCCAAGATTATTCCAAGGAACTCAACTCTGCC
TACTTCCAAGTCGGAAGTCTTCTCCACTGCTGCTGATGGACAGACAGGTGTTGAGATTAA
TGTGTTGCAGGGTGAGAGGGAGTTTGTCCGGGATAACAAGTCTCTTGGCAGCTTCCGGCT
AGATGGCATCCCACCAGCACCACGTGGAGTTCCACAGATCGAAGTCAAATTTGACATCGA
CGCCAATGGAATTCTATCCGTCAGTGCTAGTGACAAAGGCACCGGAAAGAAACAAGACAT
CACCATTACTGGTGCCAGTACATTGCCCAAGGACGAGGTAGAGCAAATGGTCCAAGAAGC
AGAAAGGTTTGCAAAGGACGACAAGGAGAAGAGAGACGCAATTGACACGAAGAACCAGGC
GGATTCAGTGGTGTACCAGACAGAGAAGCAACTCAAAGAACTCGGTGAGAAGATTCCAGG
TGAAGTGAAAGAGAAGGTGGAGGCCAAGC

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DS 

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G
GCTTCCGGCTAGATGGCATCCCACCAGCACCACGTGGAGTTCCACAGATCGAAGTCAAAT
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AACAAGACATCACCATTACTGGTGCCAGTACATTGCCCAAGGACGAGGTAGAGCAAATGG
TCCAAGAAGCAGAAAGGTTTGCAAAGGACGACAAGGAGAAGAGAGACGCAATTGACACGA
AGAACCAGGCGGATTCAGTGGTGTACCAGACAGAGAAGCAACTCAAAGAACTCGGTGAGA
AGATTCCAGGTGAAGTGAAAGAGAAGGTGGAGGCCAAGCTACAAGAGCTGAAAGACAAGA
TTGCAAGTGGAACTACTCAAGAGATCAAGGACACGATGGCTGCCCTTAACCAAGAAGTGA
TGCAGATTGGTCAGTCGAGGTACAACCAGCCTGGAGCAGGAGCAGCAGGTGCAGGTCCTT
CCCCTGGAGGCGAAGATGCTTCATCAGCAGATTCAACCGGGAAAGATGGTGATGATGTGA
TTGACGCTGACTTCACAGATAGCAGCAAATGATGAATGGAATACGGTTTTGAATTCATAT
ATCCGATGAAACACATGATTTTGTAGGCTTGATTGGGTTGAGAAACAACGCATGTGAACA
CGAAATGTTTTTAC

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DS 

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ATTGCCCAAGGACGAGGTAGAGCAAATGGTCCAAGAAGCAGAAAGGTTTGCAAAGGACGA
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AGAGAAGCAACTCAAAGAACTCGGTGAGAAGATTCCAGGTGAAGTGAAAGAGAAGGTGGA
GGCCAAGCTACAAG*GCTGAAAGACAAGATTGCAAGTGGAACTACTCAAGAGATCAAGGA
CACGATGGCTGCTTTTAACCAAGAAGTGATGCAGATTGGTCAGTCGATGTACAACCAGCC
TGGAGCAGGAGCAGCAGGTGCAGGTCCTTCCCCTGGAGGGGAAGGTGCTTCATCAGCAGA
TTCAACCGGGAAAGATGGTGATGATGTGATTGACGCTGACTTCACAGATAGCAGCAAATG
ATGAATGAAATACGGTTTTGAATTCATATATCCGATGAAACACATGATTTTGTAGGCTTG
ATTGGGTTGAGAAACAACGCATGTGAACACGAAATGTTTTTACAGAATGTGTTGTTACG
GC

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DS 

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CATTGCCCAAGGACGAGGTAGAGCAAATGGTCCAAGAAGCAGAAAGGTTTGCAAAGGACG
ACAAGGAGAAGAGAGACGCAATTGACACGAAGAACCAGGCGGATTCAGTGGTGTACCAGA
CAGAGAAGCAACTCAAAGAACTCGGTGAGAAGATTCCAGGTGAAGTGAAAGAGAAGGTGG
AGGCCAAGCTACAAGAGCTGAAAGACAAGATTGCAAGTGGAACTACTCAAGAGATCAAGG
ACACGATGGCTGCCCTTAACCAAGAAGTGATGCAGATTGGTCAGTCGAGGTACAACCAGC
CTGGAGCAGGAGCAGCAGGTGCAGGTCCTTCCCCTGGAGGGGAAGATGCTTCATCAGCAG
ATTCAACCGGGAAAGATGGTGATGATGTGATTGACGCTGACTTCACAGATAGCAGCAAAT
GATGAATGGAATACGGTTTTGAATTCATATATCCGATGAAACACATGATTTTGTAGGCTT
GATTGGGTTGAGAAACAACGCATGTGAACACGAAATGTTTTTAC

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DS 

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CAAGGACACGATGGCTGCTCTTAACCAAGAAGTGATGCAGATTGGTCAGTCGATGTACAA
CCAGCCTGGAGCAGGAGCAGCAGGTGCAGGTCCTTCCCCTGGAGGCGAAGATGCTTCATC
AGCTGATTCAACCGGGAAAGATGGCGATGATGTGATTGACGCTGACTTCACAGACAGCAG
CAAATGATGAAAGGAATACGGTTTTAAATTCATATATCCGATGAAACACATGATTTTGTA
GGCTTGATTGG*TTGAGAATCAACGCATGTGAACACGAAATGTTTTTACAGAATGTGTTG
TTAC

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DS 

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G
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GAAACAAGACATCACCATTACTGGTGCCAGTACATTGCCCAAGGACGAGGTAGAGCAAAT
GGTCCAAGAAGCAGAAAGGTTTGCAAAGGACGACAAGGAGAAGAGAGACGCAATTGACAC
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GAAGATTCCAGGTGAAGTGAAAGAGAAGGTGGAGGCCAAGCTACAAGAGCTGAAAGACAA
GATTGCAAGTGGAACTACTCAAGAGATCAAGGACACGATGGCTGCTCTTAACCAAGAAGT
GATGCAGATTGGTCAGTCGATGTACAACCAGCCTGGAGCAGGAGCAGCAGGTGCAGGTCC
TTCCCCTGGAGTCGAAGATGCTTCATCGGCTGATTCAACCGGGAAAGATGGCGATGATGT
GATTGACGCTGACTTCACAGACAGCAGCAAATGATGAAAGAAATACGGTTTTGAATTCAT
ATATCCGATGAAACACATGATTTTGTAGGCTTGATTGGGTTGAGAAACAACGCATGTGAA
CACGAAATGTTTTTACAGAATGTGTTGTTACGTTATTCCTGCATGTTATTGCCTTCTTTT
GGAACTATAAATAA
CGA

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DS 

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G
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GACGCAATTGACACAAAGAACCAGGCGGATTCAGTGGTGTATCAAACAGAGAAGCAACTC
AAAGAACTCGGAGAGAAGATTCCAGGTGAAGTGAAAGAGAAGGTGGAGGCCAAGCTACAA
GAGCTGAAAGACAAGATTGCAAGTGGAACTACTCAAGAGATCAAGGACACGATGGCTGCT
CTTAACCAAGAAGTGATGCAGATTGGTCAGTCGATGTACAACCAGCCTGGAGCAGGAGCA
GCAGGTGCAGGTCCTTCCCCTGGAGGCGAAGATGCTTCATCAGCTGATTCAACCGGGAAA
GATGGCGATGATGTGATTGACGCTGACTTCACAGACAGCAGCAAATGATGAAAGAAATAC
GGTTTTGAATTCATATATCCGATGAAACACATGATTTTGTAGGCTTGATTGGGTTGAGAA
ACAACGCATGTGAACACGAAATGTTTTTACAGAATGTGTTGTTACGTTATTCCTGCATGT
TATTGCCTTCTTTTGGAACTATAAATAAGGATATTTT
AC

QA 2 578 2 578
DS 

RD RS1GR62JQ 560 0 0
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ATTCAGTGGTGTACCAGACAGAGAAGCAACTCAAAGAACTCGGTGAGAAGATTCCAGGTG
AAGTGAAAGAGAAGGTGGAGGCCAAGCTACAAGAGCTGAAAGACAAGATTGCAAGTGGAA
CTACTCAAGAGATCAAGGACACGATGGCTGCTCTTAACCAAGAAGTGATGCAGATTGGTC
AGTCGATGTACAACCAGCCTGGAGCAGGAGCAGCAGGTGCAGGTCCTTCCCCTGGAGGCG
AAGATGCTTCATCAGCAGATTCAACCGGGAAAGATGGTGATGATGTGATTGACGCTGACT
TCACAGATAGCAGCAAATGATGAATGAAATACGGTTTTGAATTCATATATCCGATGAAAC
ACATGATTTTGTAGGCTTGATTGGGTTGAGAAACAACGCATGTGAACACGAAATGTTTTT
ACAGAATGTGTTGTTACGTTATTCCTGCATGTTATTGCCTTCTTTTTGAACTATAAATAA
GGATATTTTTCAATTGATCC

QA 1 560 1 560
DS 

RD RS1FZ74JQ 321 0 0
CAGATTGGTCAGTCGATGTACAACCAGCCTGGAGCAGGAGCAGCAGGTGCAGGTCCTTCC
CCTGGAGGCGAAGATGCTTCATCAGCTGATTCAACCGGGAAAGATGGCGATGATGTGATT
GACGCTGACTTCACAGACAGCAGCAAATGATGAAAGAAATACGGTTTTGAATTCATATAT
CCGATGAAACACATGATTTTGTAGGCTTGATTGGGTTGAGAAACAACGCATGTGAACACG
AAATGTTTTTACAGAATGTGTTGTTACGTTATTCCTGCATGTTATTGCCTTCTTTTGGAA
CTATAAATAAGGATATTTT
AC

QA 1 319 1 319
DS 

RD RS1E160TF 401 0 0
G
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TCTTAACCAAGAAGTGATGCAGATTGGTCAGTCGATGTACAACCAGCCTGGAGCAGGATC
AGCAGGTGCAGGTCCTTCCCCTGGAGGCGAAGATGCTTCATCAGCTGATTCAACCGGGAA
AGATGGCGATGATGTGATTGACGCTGACTTCACAGACAGCAGCAAATGATGAAAGAAATA
CGGTTTTGAATTCATATATCCGATGAAACACATGATTTTGTAGGCTTGATTGGGTTGAGA
AACAACGCATGTGAACACGAAATGTTTTTACAGAATGTGTTGTTACGTTATTCCTGCATG
TTATTGCCTTCTTTTGGAACTATAAATAAGGATATTTT
TC

QA 2 399 2 399
DS 

RD RS1EM35JQ 255 0 0
GTG
GAAGATGCTTCATCGGGTGATTCAACCGGGAAAGATGGGGATGATGTGATTGACGCTGAC
TTCACAGACAGCAGCAAATGATGAAAGAAATACGGTTTTGAATTCATATATCCGATGAAA
CACATGATTTTGTAGGCTTGATTGGGTTGAGAAACAACGCATGTGAACACGAAATGTTTT
TACAGAATGTGTTGTTACGTTATTCCTGCATGTTATTGCCTTTTTTTGGAACTATAAATA
AGGATATTTT
TC

QA 4 253 4 253
DS 



AS 1 15

CO CL81Contig1 775 15 11 U
ATTAGCTGTTCTACTCTGTCTTACCTTTACCTACAAGCTTTCTTGGTCAGTGTTATGTTT
TTCATATTCAACATCTTTCTTGTACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGAATC
CTAGGGTCATCAATAAAAATCTTGTGTAATTTTTTCAATCTCCACAGCCTTAACCCAACC
AAAACAAAACAAAACTAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAAACCCAAGGAATCAGACATG
AACAACGAAGAAGGCTCTGTTCCTAACAAGCCTGTGTCTGAAACCATAGTACAGGAGAAC
AACACGGAAGAAAGCGGTGAGAAACAGAACCAGACAGAGACTGAAACAACTTCTGTCGAA
CCTAAGGAAGCATCTGAGGTCGAGCCGACCAAGGAAGCATCTCCTGCTGTTGAGCCAGAG
GTTGCAGCAGCTGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGGTGAGGCTGCAGCACCTGAGAAGGTG
GAGAACGCAGCGGCTGCAACAGAAAATGCTGAAGCAGCTGTGGAAGCGGTCGTCGCTGCT
GAACCAGTAAAGGATGAGGTTAAAAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCGCTATTTGATTG
ATTAAATCTTGTGAAAATGTTTTGAATGTTGTTGTTTACCACCTGGATTTGATTTGCTAC
TAACTGGTTTTATCGAGCTGTTTCTTTGTATTTCACAATGGTTATTCTTTGATTCAATTA
AATAAAAATCAGTTTTGCTTAATGGAAATTTAGAATGAGCATTCATTAGCCGAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 75 75 75 75 75 75 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 55 55 85 55 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
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85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 
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85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 
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GT

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QA 1 614 1 614
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A

QA 1 661 1 661
DS 



AS 2 12

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A413TF U 1
AF RS1AG85TF U 35
BS 1 668 RS1A413TF
BS 669 835 RS1AG85TF

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ACTCACTCCATGGCCACCCGTCTTCAGTTTGAGAACAACTGTGAAGTTGGTGTCTTTTCA
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TGTCGACGAGAT

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AATCAAACAATCTTTT


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 5 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 55 55 55 35 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 5 5 5 5 5 5 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1GU57TF U 1
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RD RS1GR56TF 655 0 0
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AA

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TGCTTTCTGCGGGTCAGACACAACCGCAACAGAGCTCTCTGTTATTGACAGCATCTTCAA
GCTAAAGGAAGCCCAGCCCAGCTCCATTGTCGAC

QA 1 754 1 754
DS 

RD RS1CK05TF 810 0 0
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GTAGCTTTCTCTTCCTCAATGGCCACTCGTCTTCAGTTTGAGAACAACTGCGAAGTTGGT
GTCTTTTCAAAACTCACCAACGCCTATTGCTTAGTCGCTATTGGAGGCTCTGAGAACTTC
TACAGTGCTTTTGAGTCGGAGTTAGCTGATGTTATCCCTATCGTTAAAACCTCTATTGGT
GGAACACGAATCATTGGTCGTCTTTGTGCTGGAAACAAGAATGGCCTTCTTGTGCCCCAT
ACAACTACTGACCAAGAGCTTCAGCACTTGAGGAACAGTCTACCTGATTCAGTTGTTGTC
CAGAGAATCGAGGAACGTCTGTCTGCTCTTGGTAATTGCATTGCCTGCAATGACCATGTT
GCTCTTGCTCACACCGATCTTGACAAGGAAACTGAGGAGATAATAGCAGATGTTCTCGGT
GTTGAAGTTTTCCGTCAGACAATTGCAGGCAACATTCTTGTGGGCAGTTACTGTGCCTTG
TCCAACAGAGGTGGAATTGTCCATCCTCACACCTCAGTGGAAGACTTGGACGAACTATCA
ACACTTCTTCAAGTCCCTCTAGTTGCAG*AACCGTGAACCGTGGTAGTGAATTCATAGGC
GCTGGTATGACGGTTAATGACTGGACTGCTTTCTGCGGGTCAGACACAACCGCA*CAGAG
CTCTCTGTTATTGACAGCATCTTCAAGCTAAGG**AGCCCAGCCCAGCTC*ATTGTCGAC
GAGATGAGGAAGTCTCTGATCGATAC
TACG

QA 1 806 1 806
DS 

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TCCCTATCGTTAAAACCTCTATTGGTGGAACACGAATCATTGGTCGTCTCTGTGCTGGAA
ACAAGAATGGCCTTCTTGTGCCTCATACAACTACTGACCAAGAGCTTCAGCACTTGAGGA
ACAGTCTACCTGATTCAGTTGTTGTCCAGAGAATCGAGGAACGTCTGTCTGCTCTTGGAA
ACTGCATTGCCTGCAATGACCATGTTGCTCTTGCTCACACCGACCTTGACAAGGAAACTG
AGGAGGTAATAGCAGATGTTCTCGGTGTTGAAGTTTTCCGTCAGACAATTGCAGGCAACA
TTCTTGTGGGCAGTTACTGTGCCTTGTCCAACAGAGGTGGAATTGTCCATCCTCACACCT
CAGTGGAAGACTTGGACGAACTATCAACACTTCTTCAAGTCCCTCTAGTTGCAGGAACCG
TGAACCGTGGTAGTGAAGTCATAGGCGCTGGTATGACGGTTAATGACTGGACTGCTTTTT
GCGGGTCAGACACAACCGCAACAGAGCTCTCTGTTATTGACAGCATCTTCAAGCTAAGGG
AAGCCCAGCCCAGCTCCATTGTCGACGAGATGAGGAAGTCTCTGATCGATACCTACGTTT
AAATTTTGCTTTGTTTGGATTACATTACACAAGAACATCATCCAACGAATGTCGCAATGC
CATAAAATTTTCATCTTTTTGTGGTCT********CCTGAATGAAACATCTCTTTATGTT
TTGTTGAATCTTATCCA
TG

QA 1 797 1 797
DS 

RD RS1CA70JQ 691 0 0
TCTCTGTGCTGGAAACAAGAATGGCCTTCTTGTGCCTCATACAACTACTGACCAAGAGCT
TCAGCACTTGAGGAACAGTCTACCTGATTCAGTTGTTGTCCAGAGAATCGAGGAACGTCT
GTCTGCTCTTGGAAACTGCATTGCCTGCAATGACCATGTTGCTCTTGCTCACACCGATCT
TGACAAGGAAACTGAGGAGATAATAGCAGATGTTCTCGGTGTTGAAGTTTTCCGTCAGAC
AATTGCAGACAACATTCTTGTGGGCAGTTACTGTGCCTTGTCCAACAGAGGTGGAATTGT
CCATCCTCACACCTCAGTGGAAGACTTGGACGAACTATCAACACTTCTTCAAGTCCCTCT
AGTTGCAGGAACCGTGAACCGTGGTAGTGAAGTCATAGGCGCTGGTATGACGGTTAATGA
CTGGACTGCTTTCTGCGGGTCAGACACAACCGCAACAGAGCTCTCTGTTATTGACAGCAT
CTTCAAGCTAAGGGAAGCCCAGCCCAGCTCCATTGTCGACGAGATGAGGAAGTCTCTGAT
CGATACCTACGTTTAAATTTTGCTTTGTTTGGATGACATTACACAAGAACATCATCCAAC
GAATGTCGCAATGCCATAAAATTTTCATCTTTTTGTGGTCT********CCTGAATGAAA
CATCTCTTTATGTTTTGTTGAATCTTATCCA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1CK05JQ 640 0 0
TGCCCCATACAACTACTGACCAAGAGCTTCAGCACTTGAGGAACAGTCTACCTGATTCAG
TTGTTGTCCAGAGAATCGAGGAACGTCTGTCTGCTCTTGGTAATTGCATTGCCTGCAATG
ACCATGTTGCTCTTGCTCACACCGATCTTGACAAGGAAACTGAGGAGATAATAGCAGATG
TTCTCGGTGTTGAAGTTTTCCGTCAGACAATTGCAGGCAACATTCTTGTGGGCAGTTACT
GTGCCTTGTCCAACAGAGGTGGAATTGTCCATCCTCACACCTCAGTGGAAGACTTGGACG
AACTATCAACACTTCTTCAAGTCCCTCTAGTTGCAGGAACCGTGAACCGTGGTAGTGAAT
TCATAGGCGCTGGTATGACGGTTAATGACTGGACTGCTTTTTGCGGGTCAGACACAACCG
CAACAGAGCTCTCTGTTATTGACAGCATCTTCAAGCTAAGGGAAGCCCAGCCCAGCTCCA
TTGTCGACGAGATGAGGAAGTCTCTGATCGATACCTACGTTTAAATTTTGCTTTGTTTGG
ATGACATTACACAAGAACATCATCCAACGAATGTCGCAATGCCATAAAACTTTCATCTTT
TTGTGGTCTTTTAAGCTCCTGAATGAAACATCTCTTTATG

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1AI42JQ 787 0 0
TTTGAGTCGGAGTTAGCTGATGTTATCCCTATCGTTAAAACCTCTATTGGTGGAACACGA
ATCATTGGTCGTCTTTGTGCTGGAAACAAGAATGGCCTTCTTGTGCCCCATACAACTACT
GACCAAGAGCTTCAGCACTTGAGGAACAGTCTACCTGATTCAGTTGTTGTCCAGAGAATC
GAGGAACGTCTGTCTGCTCTTGGTAATTGCATTGCCTGCAATGACCATGTTGCTCTTGCT
CACACCGATCTTGACAAGGAAACTGAGGAGATAATAGCAGATGTTCTCGGTGTTGAAGTT
TTCCGTCAGACAATTGCAGGCAACATTCTTGTGGGCAGTTACTGTGCCTTGTCCAACAGA
GGTGGAATTGTCCATCCTCACACCTCAGTGGAAGACTTGGACGAACTATCAACACTTCTT
CAAGTCCCTCTAGTTGCAGGAACCGTGAACCGTGGTAGTGAAGTCATAGGCGCTGGTATG
ACGGTTAATGACTGGACTGCTTTTTGCGGGTCAGACACAACCGCAACAGAGCTCTCTGTT
ATTGACAGCATCTTCAAGCTAAGGGAAGCCCAGCCCAGCTCCATTGTCGACGAGATGAGG
AAGTCTCTGGTCGATACCTACGTTTAAATTTTGCTTTGTTTGGATGACATTACACAAGAA
CATCATCCAACGAATGTCGCAATGCCATAAAACTTTCATCTTTTTGTGGTCTTTTAAGCT
CCTGAATGAAACATCTCTTTATGTTTTGTTGAATCTTATCCATGAAAAAAAAATCAAACA
ATCTTTT

QA 1 787 1 787
DS 

RD RS1GR56JQ 629 0 0
TTCAGTTGTTGTCCAGAGAATCGAGGAACGTCTGTCTGCTCTTGGTAATTGCATTGCCTG
CAATGACCATGTTGCTCTTGCTCACACCGATCTTGACAAGGAAACTGAGGAGATAATAGC
AGATGTTCTCGGTGTTGAAGTTTTCCGTCAGACAATTGCAGGCAACATTCTTGTGGGCAG
TTACTGTGCCTTGTCCAACAGAGGTGGAATTGTCCATCCTCACACCTCAGTGGAAGATTT
GGACGAACTATCAACACTTCTTCAAGTCCCTCTAGTTGCAGGAACCGTGAACCGTGGTAG
TGAAGTCATAGGCGCTGGTATGACGGTTAATGACTGGACTGCTTTCTGCGGGTCAGACAC
AACCGCAACAGAGCTCTCTGTTATTGACAGCATCTTCAAGCTAAGGGAAGCCCAGCCCAG
CTCCATTGTCGACGAGATGAGGAAGTCTCTGATCGATACCTACGTTTAAATTTTGCTTTG
TTTGGATGACATTACACAAGAACATCATCCAACGAATGTCGCAATGCCATAAAACTTTCA
TCTTTTTGTGGTCTTTTAAGCTCCTGAATGAAACATCTCTTTATGTTTTGTTGAATCTTA
TCCATGAAAAAAAAATCAAACAATCTTTT

QA 1 629 1 629
DS 



AS 3 12

CO CL83Contig1 956 4 18 U
GGGAGAACTCCCCCGAGACAACAAGACACGACTGAGATAGTGCAGAAATGGAGGTGAGTA
TGTCTCTCAACGCGTTGTCTCGGCTTCCACTGAAGAAGAATACAGGAAGACTGGAAGAGG
TCGGTTTAGCGAGACACTCTCTGGTGAAAACACCGAAACAACGACGGCGGATGGTGTTCG
TGGTGGAGGCGAAAGGGAAGAAAGGAATGGCGGCTCGACAGTATCAACGGACGCCTCCTC
CTATGCCTAAGATTGAAGACGACGGAAACCCTAGATTCGTTATCTTCATCCGTATGGCCA
ATGTGTATCTTTGGTATCCGCTTAGTATAATAGCCGGTGGTACAACGGCTAAGATCATGG
TTGCCGCTAAAGATAACCTCTTGGGGAAGTATATTTACAAAGACACCATTGCTAGAAACA
TTGCTGCTGTTATTTACAGAGATGAGAAGGAGATACAAAAGACTGCTATAAAACAGCATC
GGGTCTTGCGGACTGCCACTGAGTTTCGTTATGGCTACAAACTTGTTGAAAACGGGAACA
TGAGAGCTGCACTTAGTACCTCAGATGTCATCGAGCTCCCAACTCAGGACCAGCTAAAAA
CAGTGTTGGACGAAGTGAAAGACTTTTTCGGGGATGCAAAAGAGTCGTTCGGTAAGATAT
CATCGTTGAATCCTGGGGCAGATGAAGAAATCCCTGATGAGAAAGCCAAGCAAGTTTAGA
CAGACAGGATCCATCCAAGGCTGGAGAATTGACACTTGATGGCCTAATTCCAATCTCAAC
CGTCTTGATATGGGATCCAGAAGGTCCACTGGATAATACTATGACGAGATTCCCGCTATT
TTGTCCACATTTTTTCTTTCTTTTATACACCTCTCAGAGAGAAACAGTTTTTCTTAAATC
TTCTTGTAAACTTATTGTGTCTGTAGATTTGTTGAAAGAAAGAGCTGTTTGGTGGC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CD95TF U 2
AF RS1EO82TF U 2
AF RS1CY13TF U 1
AF RS1CD95JQ C 245
BS 1 298 RS1CY13TF
BS 299 299 RS1CD95TF
BS 300 364 RS1CY13TF
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RD RS1CD95TF 779 0 0
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TGCTGCTGTTATTTACAGAGATGAGAAGGAGATACAAAAGACTGCTATAAAACAGCATCG
GGTCTTGCGGACTGCCACTGAGTTTCGTTATGGCTACAAACTTGTTGAAAACGGGAACAT
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ATCGTTGAATCCTGGGGCAGATGAAGAAATCCCTGATGAGAAAGCCAAGCAAGTTTAGAC
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CC

QA 1 777 1 777
DS 

RD RS1EO82TF 729 0 0
GGAGAACTCCCCCGAGACAACAAGACACGACTGAGATAGTGCAGAAATGGAGGTGAGTAT
GTCTCTCAACGCGTTGTCTCGGCTTCCACTGAAGAAGAATACAGGAAGACTGGAAGAGGT
CGGTTTAGCGAGACACTCTCTGGTGAAAACACCGAAACAACGACGGCGGATGGTGTTCGT
GGTGGAGGCGAAAGGGAAGAAAGGAATGGCGGCTCGACAGTATCAACGGACGCCTCCTCT
TATGCCTAAGATTGAAGACGACGGAAACCCTAGATTCGTTATCTTCATCCGTATGGCCAA
TGTGTATCTTTGGTATCCGCTTAGTATAATAGCCGGTGGTACAACGGCTAAGATCATGGT
TGCTGCTAAAGATAACCTCTTGGGGAAGTATATTTACAAAGACACCATTGCTAGAAACAT
TGCTGCTGTTATTTACAGTGATGAGAAGGAGATACAAAAGACTGCTATAAAACAGCATCG
GGTCTTGCGGACTGCCACTGAGTTTCGTTATGGCTACAAACTTGTTGAAAACGGGAACAT
GAGAGCTGCACTTAGTACCTCAGATGTCATCGAGCTCCCAACTCAGGACCAGCTAAAAAC
AGTGTTGGACAAAGTGAAAGACTTTTTCGGGGATGCAAAAGAGTCGTTCGGTAAGATATC
ATCGTTGAATCCTGGGGCAGATGAAGAAATCTCTGATGAGAAAGCCAAGCAAGTTTAGAC
AGACAGGAT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RS1CY13TF 796 0 0
GGGAGAACTCCCCCGAGACAACAAGACACGACTGAGATAGTGCAGAAATGGAGGTGAGTA
TGTCTCTCAACGCGTTGTCTCGGCTTCCACTGAAGAAGAATACAGGAAGACTGGAAGAGG
TCGGTTTAGCGAGACACTCTCTGGTGAAAACACCGAAACAACGACGGCGGATGGTGTTCG
TGGTGGAGGCGAAAGGGAAGAAAGGAATGGCGGCTCGACAGTATCAACGGACGCCTCCTC
CTATGCCTAAGATTGAAGACGACGGAAACCCTAGATTCGTTATCTTCATCCGTATGGCTA
ATGTGTATCTTTGGTATCCGCTTAGTATAATAGCCGGTGGTACAACGGCTAAGATCATGG
TTGCTGCTAAAGATAACCTCTTGGGGAAGTATATTTACAAAGACACCATTGCTAGAAACA
TTGCTGCTGTTATTTACAGATATGAGAAGGAGATACAAAAGACTGCTATAAAACAGCATC
GGGTCTTGCGGACTGCCACTGAGTTTCGTTATGGCTACAAACTTGTTGAAAACGGGAACA
TGAGAGCTGCACTTAGTACCTCAGATGTTATCGAGCTCCCAACTCAGGACCAGCTAAAAA
CAGTGTTGGACAAAGTGAAAGACTTTTTCGGGGATGCAAAAGAGTCGTTCGGTAAGATAT
CATCGTTGAATCCTGGGGCAGATGAAGAAATCCCTGATGAGAAAGCCAAGCAAGTTTAGA
CAGACAGGATCCATCCAAG*CTGGAGA*TTGACACTTGATGGCCTAATTCCAATCTCA*C
CGTCTTGATATGGGAT

QA 1 796 1 796
DS 

RD RS1CD95JQ 712 0 0
GCCTAAGATTGAAGACGACGGAAACCCTAGATTCGTTATCTTCATCCGTATGGCCAATGT
GTATCTTTGGTATCCGCTTAGTATAATAGCCGGTGGTACAACGGCTAAGATCATGGTTGC
CGCTAAAGATAACCTCTTGGGGAAGTATATTTACAAAGACACCATTGCTAGAAACATTGC
TGCTGTTATTTACAGAGATGAGAAGGAGATACAAAAGACTGCTATAAAACAGCATCGGGT
CTTGCGGACTGCCACTGAGTTTCGTTATGGCTACAAACTTGTTGAAAACGGGAACATGAG
AGCTGCACTTAGTACCTCAGATGTCATCGAGCTCCCAACTCAGGACCAGCTAAAAACAGT
GTTGGACGAAGTGAAAGACTTTTTCGGGGATGCAAAAGAGTCGTTCGGTAAGATATCATC
GTTGAATCCTGGGGCAGATGAAGAAATCCCTGATGAGAAAGCCAAGCAAGTTTAGACAGA
CAGGATCCATCCAAGGCTGGAGAATTGACACTTGATGGCCTAATTCCAATCTCAACCGTC
TTGATATGGGATCCAGAAGGTCCACTGGATAATACTATGACGAGATTCCCGCTATTTTGT
CCACATTTTTTCTTTCTTTTATACACCTCTCAGAGAGAAACAGTTTTTCTTAAATCTTCT
TGTAAACTTATTGTGTCTGTAGATTTGTTGAAAGAAAGAGCTGTTTGGTGGC

QA 1 712 1 712
DS 



CO CL83Contig2 941 3 14 U
GTAACCAAACAGCTCTTTCTTTCAACAAATCTACACACACATAAGTTATATGTTACAAGA
GATTTTGGAGAAACTGTTTCTCTCAGAGGTGTATAAAGAAAAATGTGCACAAAGTAGTGG
ACAATCTCGTCCTATCCAGTGAACTTCTGCATTCCATATCAAGTCGGTTGAGACATTAGG
AATCAGCCCATCATGTGTCAATCGTTCAGCCTTGGGCCTTGGCTTTCTCATCAGTGCTTC
CTTCGGTTTCTTCATCTGTCCCAGGATTCAGTGATGATATCTTTCCGAAGGACTCTTTTG
CATCCCCAAAAAAGTCTTTCACTTTGTCCAATACTGTTTTAAGCTGGTCCTGGGTTGGGA
GCTCGATGACATCTGAAGTACTCAGTGCAGCTCTCATATTTCCATTTTCAACAAGTTTGT
AGCCATATCGAAACTCAGTGGCAGTCCGCAAGACACGATGCTGCTTAATTGCTGTCTTTT
GTATCTCCTTCTCATCTCTGTAAATAACAGCAGCAATATTTCTAGCAATGGTGTCTTTGT
ATATATACTTCCCCAAGAGGTTGTCTTTAGCAGCAACCATGATCTTAGCAGTTGTACCAC
CAGCTATTATACTGAGAGGATACCAAAGATACACATTGGCCATACGAATGAAGATAACGA
ATCTAGGGTTTCCGTCGTCTTCAATCTTAGGCATAGGGGGAGGAGTACGTTGATACTGAC
GCGCCGCCATACCTTTCTTCCCCTTCGCCTCCACCACTAAAACCTTCCCCCGCTGCGCCG
TCTCTAGGCATGGTGTTCTCGAGGTGAACAGAGAGTGTCTCGCTAAACCGAACTCTTCGA
GTCTTCCCGTGTTCTTCAGTGGAAGCCGAGTTAACGCGTTGAGGAACATACTTGCCTCCA
TTTTGAGCACTTCGATTCACCAACTGGAGTTTTTTTGGGCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GR45JQ U 1
AF RS1E513JQ U 1
AF RS1B273TF C 270
BS 1 38 RS1E513JQ
BS 39 39 RS1GR45JQ
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BS 599 599 RS1B273TF
BS 600 601 RS1E513JQ
BS 602 602 RS1B273TF
BS 603 619 RS1E513JQ
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BS 635 635 RS1B273TF
BS 636 695 RS1E513JQ
BS 696 941 RS1B273TF

RD RS1GR45JQ 568 0 0
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CTTCGGTTTCTTCATCTGTCCCAGGATTCAGTGATGATATCTTTCCGAAGGACTCTTTTG
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GTATCTCCTTCTCATCTCTGTAAATAACAGCAGCAATATTTCTAGCAATGGTGTCTTTGT
ATATATACTTCCCCAAGAGGTTGTCTTT

QA 1 568 1 568
DS 

RD RS1E513JQ 695 0 0
GTAACCAAACAGCTCTTTCTTTCAACAAATCTACACACGCATAAGTTATATGTTACAAGA
GATTTTGGAGAAACTGTTTCTCTCAGAGGTGTATAAAGAAAAATGTGCACAAAGTAGTGG
ACAATCTCGTCCTATCCAGTGAACTTCTGCATTCCATATCAAGTCGGTTGAGACATTAGG
AATCAGCCCATCATGTGTCAATCGTTCAGCCTTGGGCCTTGGCTTTCTCATCAGTGCTTC
CTTCGGTTTCTTCATCTGTCCCAGGATTCAGTGATGATATCTTTCCGAAGGACTCTTTTG
CATCCCCAAAAAAGTCTTTCACTTTGTCCAATACTGTTTTAAGCTGGTCCTGGGTTGGGA
GCTCGATGACATCTCAAGTACTCAGTGCAGCTCTCATATTTCCATTTTCAACAAGTTTGT
AGCCATATCGAAACTCAGTGGCAGTCCGCAAGACACGATGCTGCTTAATTGCTGTCTTTT
GTATCTCCTTCTCATCTCTGTAAATAACAGCAGCAATATTTCTAGCAATGGTGTCTTTGT
ATATATACTTCCCCAAGAGGTTGTCTTTAGCAGCAACCATGATCTTAGCAGTTGTACCTC
CGGCTATTATACTGAGAGGGTACCAAAGATACACGTTGGCCATACGAATGAAGATAACGA
ATCTAGGGTTTCCGTCGTCTTCAATCTTAGGCATA

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1B273TF 672 0 0
AGTGATGATATCTTTCCGAAGGACTCTTTTGCATCCCCAAAAAAGTCTTTCACTTTGTCG
AATACTGTTTTAAGCTGGTCCTGGGTTGGGAGCTCGATGACATCTGAGGTACTAAGTGCA
GCTCTCATACTTCCATTTTCAACAAGTTTGTAGCCATAACGAAACTCAGTGGCAGTCCGC
AAGACACGATGCTGCTTTATTGCTGTCTTTTGTATCTCCTTCTCATCTCTATAAATAACA
GCAGCAATATTTCTTGCAATGGTGTCTTTGTAAATATACTTCCCCAAGAGGTTGTCTTTA
GCAGCAACCATGATCTTGGCAGTTGTACCACCAGCTATTATACTGAGAGGATACCAAAGA
TACACATTGGCCATACGAATGAAGATAACGAATCTAGGGTTTCCGTCGTCTTCAATCTTA
GGCATAGGGGGAGGAGTACGTTGATACTGACGCGCCGCCATACCTTTCTTCCCCTTCGCC
TCCACCACTAAAACCTTCCCCCGCTGCGCCGTCTCTAGGCATGGTGTTCTCGAGGTGAAC
AGAGAGTGTCTCGCTAAACCGAACTCTTCGAGTCTTCCCGTGTTCTTCAGTGGAAGCCGA
GTTAACGCGTTGAGGAACATACTTGCCTCCATTTTGAGCACTTCGATTCACCAACTGGAG
TTTTTTTGGGCC

QA 1 672 1 672
DS 



CO CL83Contig3 879 5 8 U
GGACGATCCACGACATCGTCATCATCATCCCCAAAAAAAACTCCAGTTGGTGAATCTACG
TGCTCAAATGGAGGCAAGTATGTCCCTCAACGCGTTAACTCGGCTTCCACTGAAGAACAC
GGGAAGACTAGAAGAGTTCGGTTTAGCGAGACACTCTCTGTTCACCTCCTCGAGAACGCC
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AGGTATGGCGGCGCGTCAGTATCAACGTACGCCTCCCCCTATGCCTAAGATTGAAGACGA
CGGAAACCCTAGATTCGTTATCTTCATTCGTATGGCCAACGTGTATCTTTGGTACCCTCT
CAGTATAATAGCCGGAGGTACAACTGCTAAGATCATGGTTGCTGCTAAAGACAACCTCTT
GGGGAAGTATATATACAAAGACACCATTGCTAGAAATATTGCTGCTGTTATTTACAGAGA
TGAGAAGGAGATACAAAAGACAGCAATTAAGCAGCATCGTGTCTTGCGGACTGCCACTGA
GTTTCGATATGGCTACAAACTTGTTGAAAATGGAAATATGAGAGCTGCACTGAGTACTTC
AGATGTCATCGAGCTCCCAACCCAGGACCAGCTTAAAACAGTATTGGACAAAGTGAAAGA
CTTTTTTGGGGATGCAAAAGAGTCCTTCGGAAAGATATCATCACTGAATCCTGGGACAGA
TGAAGAAACCGAAAGAAGCACTGATGAGAAAGCCAAGCCCAAGCTGACGATTGACACATG
ATGGGCTGATCCAATGTCTCACCGACTTGATATGGAATGCAGAGTCACTGGATAGACGAG
ATGTCCACTACTTTGTGCACATTTTCTTTTACACCTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AL85TF U 25
AF RS1AL85JQ C 375
AF RS1E513TF U 1
AF RS1CD76TF U 64
AF RS1GR45TF U 51
BS 1 599 RS1E513TF
BS 600 600 RS1GR45TF
BS 601 678 RS1E513TF
BS 679 679 RS1GR45TF
BS 680 720 RS1E513TF
BS 721 733 RS1GR45TF
BS 734 734 RS1CD76TF
BS 735 879 RS1GR45TF

RD RS1AL85TF 336 0 0
GGATCCCCA
AAAAAAACTCCAGTTGGTGAATCTACGTGCTCAAATGGAGGCAAGTATGTCCCTCAACGC
GTTAACTCGGCTTCCACTGAAGAACACGGGAAGACTAGAAGAGTTCGGTTTAGCGAGACA
CTCTCTGTTCACCTCCTCGAGAACGCCATGCCAAGAGAAGGCGCAGCAGCGGAGGAGGGT
TTTAGTGGTGGAGGCGAAGGGGAAGAAAGGTATGGCGGCGCGTCAGTATCAACGTACGCC
TCCCCCTATGCCTAAGATTGAAGACGACGGAAACCCTAGATTCGTTATCTTCATTCGTAT
GGCCAACGTGTATCTTTGGTACCCTCT

QA 10 336 10 336
DS 

RD RS1AL85JQ 150 0 0
GAGGTACAACTGCTAAGATCATGGTTGATGCTAAAGACAACCTCTTGGGGAAGTATATAT
ACAAAGACACCATTGCTAGAAATATTGGTGCTGTTATTTACAGAGATGAGAAGGAGATAC
AAAAGACAGCAATTAAGCAGCATCGTGTCT

QA 1 150 1 150
DS 

RD RS1E513TF 720 0 0
GGACGATCCACGACATCGTCATCATCATCCCCAAAAAAAACTCCAGTTGGTGAATCTACG
TGCTCAAATGGAGGCAAGTATGTCCCTCAACGCGTTAACTCGGCTTCCACTGAAGAACAC
GGGAAGACTAGAAGAGTTCGGTTTAGCGAGACACTCTCTGTTCACCTCCTCGAGAACGCC
ATGCCAAGAGAAGGCGCAGCAGCGGAGGAGGGTTTTAGTGGTGGAGGCGAAGGGGAAGAA
AGGTATGGCGGCGCGTCAGTATCAACGTACGCCTCCCCCTATGCCTAAGATTGAAGACGA
CGGAAACCCTAGATTCGTTATCTTCATTCGTATGGCCAACGTGTATCTTTGGTACCCTCT
CAGTATAATAGCCGGAGGTACAACTGCTAAGATCATGGTTGCTGCTAAAGACAACCTCTT
GGGGAAGTATATATACAAAGACACCATTGCTAGAAATATTGCTGCTGTTATTTACAGAGA
TGAGAAGGAGATACAAAAGACAGCAATTAAGCAGCATCGTGTCTTGCGGACTGCCACTGA
GTTTCGATATGGCTACAAACTTGTTGAAAATGGAAATATGAGAGCTGCACTGAGTACTTG
AGATGTCATCGAGCTCCCAACCCAGGACCAGCTTAAAACAGTATTGGACAAAGTGAAAGA
CTTTTTTGGGGATGCAAA*GAGTCCTTCGGAAAGATATCATCACTGAATCCTGGGACAGA

QA 1 720 1 720
DS 

RD RS1CD76TF 704 0 0
GG
AAATGGAGGCAAGTATGTCCCTCAACGCGTTAACTCGGCTTCCACTGAAGAACACGGGAA
GACTAGAAGAGTTCGGTTTAGCGAGACACTCTCTGTTCACCTCCTCGAGAACGCCATGCC
AAGAGAAGGCGCAGCAGCGGAGGAGGGTTTTAGTGGTGGAGGCGAAGGGGAAGAAAGGTA
TGGCGGCGCGTCAGTATCAACGTACGCCTCCCCCTATGCCTAAGATTGAAGACGACGGAA
ACCCTAGATTCGTTATCTTCATTCGTACGGCCAACGTGTATCTTTGGTACCCTCTCAGTA
TAATAGCCGGAGGTACAACTGCTAAGATCATGGTTGCTGCTAAAGACAACCTCTTGGGGA
AGTATATATACAAAGACACCATTGCTAGAAATATTGCTGCTGTTATTTACAGAGATGAGA
AGGAGATACAAAAGACAGCAATTAAGCAGCATCGTGTCTTGCGGACTGCCACTGAGTTTC
GATATGGCTACAAACTTGTTGAAAATGGAAATATGAGAGCTGCACTGAGTACTTCAGATG
TCATCGAGCTCCCAACCCAGGACCAGCTTAAAACAGTATTGGACAAAGTGAAAGACTTTT
TTGGGGATGCAAAAGAGTCCTTCGGAAAGATATCATCACTGAATCCTGGGACAGATGAAG
AAACCGAAAGAAGCACTGATGAGAAAGCCAAG
CCCAAGCTGA

QA 3 694 3 694
DS 

RD RS1GR45TF 829 0 0
GGAATCTACGTGCTC
AAATGGAGGCAAGTATGTCCCTCAACGCGTTAACTCGGCTTCCACTGAAGAACACGGGAA
GACTAGAAGAGTTCGGTTTAGCGAGACACTCTCTGTTCACCTCCTCGAGAACGCCATGCC
AAGAGAAGGCGCAGCAGCGGAGGAGGGTTTTAGTGGTGGAGGCGAAGGGGAAGAAAGGTA
TGGCGGCGCGTCAGTATCAACGTACGCCTCCCCCTATGCCTAAGATTGAAGACGACGGAA
ACCCTAGATTCGTTATCTTCATTCGTATGGCCAACGTGTATCTTTGGTACCCTCTCAGTA
TAATAGCCGGAGGTACAACTGCTAAGATCATGGTTGCTGCTAAAGACAACCTCTTGGGGA
AGTATATATACAAAGACACCATTGCTAGAAATATTGCTGCTGTTATTTACAGAGATGAGA
AGGAGATACAAAAGACAGCAATTAAGCAGCATCGTGTCTTGCGGACTGCCACTGAGTTTC
GATATGGCTACAAACTTGTTGAAAATGGAAATATGAGAGCTGCACTGAGTACTTCAGATG
TCATCGAGCTCCCAACCCAGGACCAGCTTAAAACAGTATTGGACAAAGTGAAAGACTTTT
TTGGGGATGCAAAAGAGTCCTTCGGAAAGATATCATCACTGAATCCTGGGACAGATGAAG
AAACCGAA*GAAGCACTGATGAGAAAGCCAAGCCCAAGCTGACGATTGACACATGATGGG
CTGATCCAATGTCTCACCGACTTGATATGGAATGCAGAGTCACTGGATAGACGAGATGTC
CACTACTTTGTGCACATTTTCTTTTACACCTCTG

QA 16 829 16 829
DS 



AS 2 14

CO CL84Contig1 1010 7 5 U
TTTTTGCGCTAAGAAGATGGCATCTTTGGGTGTGTCGGAAATGCTTGGTACGCCCCTTAA
CTTCAGGGCAGTGTCGAGATCGTCTGCTCCATTGGCATCGAACCCCTCCACGTTCAAGAC
AGTTGCTCTGTTCTCCAAGAAGAAGCCAGCTCCTCCTCCCAAGGCCAAGACCGTCTCTGC
TGCCAACGACGAGCTCGCCAAGTGGTATGGTCCTGACAGGAGAATCTTCTTGCCTGATGG
TCTTTTGGACAGATCAGAGATCCCAGAGTACTTAAACGGTGAAGTTGCTGGAGATTATGG
TTATGACCCTTTTGGACTTGGAAAGAAGCCTGAGAACTTTGCTAAATACCAAGCCTTTGA
ACTGATCCACGCCAGATGGGCTATGTTGGGAGCAGCTGGTTGCATCATCCCTGAAGCCTT
AAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCCGTCTGGTTTAAGACTGGTGCTTTGCT
TCTTGATGGAAACACATTGAGTTACTTTGGCAAGAACATCCCAATCAACCTTGTTCTCGC
TGTAGTTGCTGAGGTTGTTCTCCTTGGTGGAGCTGAGTACTACCGAATCACCAATGGATT
GGACTTCGAGGACAAGCTTCACCCAGGAGGTCCATTTGATCCTTTGGGACTTGCTAAAGA
CCCTGAACAAGGAGCTCTTCTCAAGGTTAAGGAGATCAAGAACGGGAGACTAGCCATGTT
TTCCATGTTCGCTTTCTTCATCCAAGCTTATGTTACCGGAGAAGGTCCTGTTGAGAACCT
TTCAAAGCATCTAAGTGATCCTTTTGGCAACAATTTGCTTACCGTCATCGCTGGAACTGC
TGAGAGAGCTCCCACTCTTTAAGTGGTTTCTAGTATTAATGATCTTTCAAACTGCTTTGT
ACACTTGGTTTGATGAGAGTTTCTATTGACATTGTGATAAAACAATTATCTTCTTATTCA
TTCCAACAGTGGATATATATTTGGGCTTAATGAAGGAATTTGCTTCCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 25 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 25 40 15 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RS1EW54TF U -3
AF RS1DN22TF U 1
AF RS1BY61TF U 1
AF RS1DN22JQ C 284
AF RS1EE26JQ C 248
AF RS1FG46TF U 621
AF RS1EW54JQ C 369
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RD RS1EW54TF 626 0 0
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GTTGTTCTCCTTGGTGGAGCTGAGTACTACCGAATCACCAATGGATTGGACTTCGAGGAC
AAGCTTCAC

QA 18 626 18 626
DS 

RD RS1DN22TF 728 0 0
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CA**GAGCTCTTCTCAGG*TTAAG*AGATCA*GAACGGGAGACTAGC
ATGTTTCATGTCGC

QA 8 714 8 714
DS 

RD RS1BY61TF 753 0 0
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TTATGACCCTTTTGGACTTGGAAAGAAGCCTGAGAACTTTGCTAAATACCAAGCCTTTGA
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AAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCCGTCTGGTTTAAGACTGGTGCTTTGCT
TCTTGATGGAAACACATTGAGTTACTTTGGCAAGAACATCCCAATCAACCTTGTTCTCGC
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QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1DN22JQ 676 0 0
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TTGGGACTTGCTAAAGACCCTGAACAAGGAGCTCTTCTCAAGGTTAAGGAGATCAAGAAC
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GTCATCGCTGGAACTGCTGAGAGAGCTCCCACTCTTTAAGTGGTTTCTAGTATTAATGAT
CTTTCAAACTGCTTTGTACACTTGGTTTGATGAGAGTTTCTATTGACATTGTGATAAAAC
AATTATCTTCTTATTC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1EE26JQ 763 0 0
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TATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCCGTCTGGTTTAAGACTGGTGCTTTGCTTCTTGAT
GGAAACACATTGAGTTACTTTGGCAAGAACATCCCAATCAACCTTGTTCTCGCTGTAGTT
GCTGAGGTTGTTCTCCTTGGTGGAGCTGAGTACTACCGAATCACCAATGGATTGGACTTC
GAGGACAAGCTTCACCCAGGAGGTCCATTTGATCCTTTGGGACTTGCTAAAGACCCTGAA
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TTCGCTTTCTTCATCCAAGCTTATGTTACCGGAGAAGGTCCTGTTGAGAACCTTTCAAAG
CATCTAAGTGATCCTTTTGGCAACAATTTGCTTACCGTCATCGCTGGAACTGCTGAGAGA
GCTCCCACTCTTTAAGTGGTTTCTAGTATTAATGATCTTTCAAACTGCTTTGTACACTTG
GTTTGATGAGAGTTTCTATTGACATTGTGATAAAACAATTATCTTCTTATTCATTCCAAC
AGTGGATATATATTTGGGCTTAATGAAGGAATTTGCTTCCACC

QA 1 763 1 763
DS 

RD RS1FG46TF 387 0 0
G
CCCAGGAGGTCCATTTGCTCCTTTGGGACTTGCTAAAGACCCTGAACAAGGAGCTCTTCT
CAAGGTTAAGGAGATCAAGAACGGGAGACTAGCCATGTTTTCCATGTTCGCTTTCTTCAT
CCAAGCTTATGTTACCGGAGAAGGTCCTGTTGAGAACCTTTCAAAGCATCTAAGTGATCC
TTTTGGCAACAATTTGCTTACCGTCATCGCTGGAACTGCTGAGAGAGCTCCCACTCTTTA
AGTGGTTTCTAGTATTAATGATCTTTCAAACTGCTTTGTACACTTGGTTTGATGAGAGTT
TCTATTGACATTGTGATAAAACAATTATCTTCTTATTCATTCCAACAGTGGATATATATT
TGGGCTTAATGAAGGAATTTGCTTCC

QA 2 387 2 387
DS 

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ATGGAGCTGACTGTGGCCCTGAAGCCGTTTGGTTTAAGACTGGTGCTTTGCTTCTTGATG
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GTGAGGTTGTTTTCCTTGGTGGAGGTGAGTACTACCGAATCACCAATGGATTGGACTTCG
AGGACAAGCTTCACCCAGGAGGTCCATTTGATCCTTTGGGACTTGCTAAAGACCCTGAAC
AAGGAGCTTTTTTCAAGGTTAAGGAGATCAAGAACGGGAGACTAGCCATGTTTTCCATGT
TCGCTTTTTTCATCCAAGCTTATGTTACCGGAGAAGGTCCTGTTGAGAACCTTTCAAAGC
ATTTAAGTGATCCTTTTGGCAACAATTTGCTTACCGTCATCGCTGGAACTGCTGAGAGAG
CTCCCACTCTTTAAGTGGTTTTTAGTATTAATGATCTTTCAAACTGCTTTGTACACTTGG
TTTGATGAGGGTTTTTATTGACATTGTGATAAAACAATTATTTTTTTATTCATTCCAACA
GTGGATATATATTTGGGCTTAA

QA 1 622 1 622
DS 



CO CL84Contig2 1147 7 6 U
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GAAATCTGTATATGACAAAACGCGAATGCACCATCAGATGGTTATCCATTAAAAGCAATA
ATTAAGTACCATTGGAATATATCAAGAAGATGCAGATGGAAGTTTTTTTTCACAATGTCA
ACAGAGACTCTCATCAAACAAAGTGTACAAAGCATCTTCGAAGCTGCTTGAAATGAGAAA
TGTCTTAAAGAGTGGGAGCTCTCTCAGCAGTTCCAGCGATGACGGTAAGCAAATTGTTTC
CGAAAGGATCACTTAAATGCTTTGAAAGGTTCTCAACAGGACCTTCTCCGGTAACATAAG
CTTGGATGAAGAAAGCGAACATGGAAAACATGGCTAATCTCCCGTTCTTGATCTCCTTAA
CCTTGAGAAGTGCTGCTTGTTCAGGGTCTTTAGCAAGTCCCAAAGGATCAAATGGACCGC
CTGGGTGAAGCTTGTCTTCGAAGTCCAATCCATTGATGATTCGGTAGTACTCAGCTCCAC
CAAGGAGAACAACCTCAGCAACTACAGCGAGAACAAGGTTGATTGGGATGTTCTTGCCAA
AGTAGCTCAATGTGTTTCCATCAAGAAGCAGAGCACCAGTCTTAAACCAGACGGCTTCAG
GGACACAGTTAGCGCCATATTTGTTTAAGGCTTCAGGGATGATGCAACCAGCTGCTCCCA
ACATAGCCCATCTCGCGTGGATCAGTTCAAAGGCTTGGTATTTAGCAAAGTTCTCAGGTT
TCTTGCCAAGTCCAAATGGGTCATAGCCATAGTCTCCAGCAACTTCACCGTTCAAGTACT
CTGGAACTTCTGATCTGTCCAAAAGACCATCCGGCAAGAAAATTCTCCTGTCAGGACCAT
ACCACTTGGCGAGCTCGTCGTTGGCAGCAGAGACGGTCTTGGCCTTTGGAGGAGGAGCTG
GCTTCTTCTTGGAGAACAGAGCAACTGTCTTGAACGTGGCGGGACTTGACGCCAATGGAG
CAGACGGTCTTGACACTGCCCTGAAGTTAAGGGGCGTACCAAGCATTTCCGACACACCCA
AAGACGCCATCTTTTTAGCCCAAGCTTTTTTTTTACTCTGCTTCAAGACCAAGAAATGTT
AAGTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GL11JQ U 120
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AF RS1GL11TF C 170
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AAGCTGCTTGAAATGAAAAATGTCTTAAAGAGTGGGAGCTCTCTCAGCAGTTCCAGCGAT
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ACCTTCTCCGGTAACATAAGCTTGGATGAAGAAAGCGAACATGGAAAACATGGCTAATCT
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ACAGAGACTCTCATCAAACAAAGTGTACAAAGCATCTTCGAAGCTGCTTGAAATGAGAAA
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AGTAGCTCAATGTGTTTCCATCAAGAAGCAGAGCACCAGTCTTAAACCAGACGGCTTCAG
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GACGGCTTCAGGGCCACAGTTAGCGCCATATTTGTTTAAGGCTTCAGGGATGATGCAACC
AGCTGCTCCCAACATAGCCCATCTCGCGTG
C

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AAG
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ATGGCTAATCTCCCGTTCTTGATCTCCTTAACCTTGAGAAGTGCTGCTTGTTCAGGGTCT
TTAGCAAGTCCCAAAGGATCAAATGGACCGCCTGGGTGAAGCTTGTCTTCGAAGTCCAAT
CCATTGATGATTCGGTAGTACTCAGCTCCACCAAGGAGAACAACCTCAGCAACTACAGCG
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AAAGCACCAGTCTTAAACCAGACGGCTTCAGGGCCACAGTTAGCGCCATATTTGTTTAAG
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TCCGGCAAGAAAATTCTCCTGTCAGGACCATACCACTTGGCGAGCTCGTCGTTGGCAGCA
GA

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TT
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T
AAGTCC

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CCATCTTTTTAGCCCAAGCTTTTTTTTTACTCTGCTTCAAGACCAAGAAATGTTAAGTGC
C

QA 1 301 1 301
DS 



AS 2 10

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CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAAGAAACCTTAAGCTTAATAAGAGTCTTCACTT
CCCTTCATCATCTCTCTCCCTTCGTCGTTGTTCGATCCGTACATCAAAAGGTTTTTGAGG
TTAGCTTTAAGGTGCAATGGGAGATAGTCAGTACTCGTTTTCTCTCACTACGTTCAGCCC
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TCTTGTTGATGAAGCTTCTGTTCAAAAGATTCAGCATTTGACTCCCAACATTGGAGTTGT
TTACAGTGGTATGGGTCCTGATTTCCGAGTTCTTGTACGTAAGAGTAGGAAGCAGGCGGA
GCAATACAACCGATTGTACAAAGAGCCTATTCCCGTTACGCAACTTGTAAGGGAAACAGC
TACGGTGATGCAAGAGTTCACTCAATCAGGTGGTGTGAGGCCGTTTGGAGTTTCTCTACT
AGTGGCTGGGTATGATGACAAGGGTCCACAGTTGTATCAGGTGGATCCGTCTGGCTCTTA
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GAAGAGGTACACTGAAGACATGGAACTTGATGATGCCATTCACACTGCCATATTGACATT
GAAGGAAGGTTTCGAGGGAGAAATCTCAAGCAAAAACATTGAGATTGGCAAAATTGGTGC
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BQ
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5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1BL10JQ C 342
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AF RS1A382TF U 1
AF RS1FN76TF U 86
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AF RS1E448JQ C 356
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AAGATTCAGCATTTGACTCCCAACATTGGAGTTGTTTACAGTGGTATGGGTCCTGATTTC
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CCACAGTTGTA

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TTC
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TCAGTACTCGTTTTCTCTCACTACGTTCAGCCCATCAGGGAAGCTGGTTCAGATAGAACA
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TGTCATTGCAACAGAAAAGAAGCTTCCCTCTATTCTTGTTGATGAAGCTTCTGTTCAAAA
GATTCAGCATTTGACTCCCAACATTGGAGTTGTTTACAGTGGTATGGGTCCTGATTTCCG
AGTTCTGGTACGTAAGAGTAGGAAGCAGGCTGAGCAATACAACCGATTGTACAAAGAACC
TATCCCTGTTACGCAACTTGTTAGGGAAACAGCTACGGTGATGCAAGAGTTCACTCAATC
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ACAGTTGTAT

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CCCTTCATCATCTCTCTCCCTTCGTCGTTGTTCGATCCGTACATCAAAAGGTTTTTGAGG
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TCTTGTTGATGAAGCTTCTGTTCAAAAGATTCAGCATTTGACTCCCAACATTGGAGTTGT
TTACAGTGGTATGGGTCCTGATTTCCGAGTTCTTGTACGTAAGAGTAGGAAGCAGGCGGA
GCAATACAACCGATTGTACAAAGAGCCTATTCCCGTTACGCAACTTGTAAGGGAAACAGC
TACGGTGATGCAAGAGTTCACTCAATCAGGTGGTGTGAGGCCGTTTGGAGTTTCTCTACT
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TTTCTCATGGAAAGCTTCAGCAATGGGAAAGAATGTTTCGAATGCCAAGACATTCCTTGA
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G

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CGTTGTTCGATCCGTACACCAAAAGGTTTTTGAGTTTAGCTTTAAGGTGAAATGGGAGAT
AGTCAGTACTCGTTTTCTCTCACTACGTTCAGCCCATCAGGGAAGCTGGTTCAGATAGAA
CATGCTCTAACAGCTGTTGGATCAGGCCAAACATCCCTGGGAATCAAAGCTTCAAACGGA
GTTGTCATTGCAACAGAAAAGAAGCTTCCCTCTATTCTTGTTGATGAAGCTTCTGTTCAA
AAGATTCAGCATTTGACTCCCAACATTGGAGTTGTTTACAGTGGTATGGGTCCTGATTTC
CGAGTTCTGGTACGTAAGAGTAGGAAGCAGGCTGAGCAATACAACCGATTGTACAAATAA
CCTATCCCCGTTACGCAACTTGTTAGGGAAACAGCTACGGTGATGCAAGAGTTCACTCAA
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CCACAGTTGTATCAGGTGGATCCGTCTGGCTCTTATTTCTCATGGAAAGCTTCAGCAATG
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CTTGATGATGCCATTCACACTGCCATATTGACATTGA

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AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAAGAAACCT
TAAGCTTAATAAGAGTCTTCACTTCCCTTCATCATCTCTCTCCCTTCGTCGTTGTTCGAT
CCGTACATCAAAAGGTTTTTGAGGTTAGCTTTAAGGTGCAATGGGAGATAGTCAGTACTC
GTTTTCTCTCACTACGTTCAGCCCATCAGGGAAGCTGGTTCAGATAGAACATGCTCTAAC
TGCTGTTGGATCAGGCCAAACATCCCTGGGAATCAAAGCTTCAAACGGAGTTGTCATTGC
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TTTGACTCCCAACATTGGAGTTGTTTACAGTGGTATGGGTCCTGATTTCCGAGTTCTTGT
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TACGCAACTTGTAAGGGAAACAGCTACGGTGATGCAAGAGTTCACTCAATCAGGTGGTGT
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TCAGGTGGATCCGTCTGGCTCTTATTTCTCATGGAAAGCTTCAGCAATGGGAAAGAATGT
TTCGAATGCCAAGACATTCCTTGAGAAGAGGTACACTGAAGACATGGAACTTGATGATGC
CATTCACACTGCCATATTGACATTGAAGGAAGGTTTCGAGGGAGAAATCTCAAGCAAAAA
CATTGAGATTGGCAAAATTGGTGCTGACAAAGTGTTTAGGGTGCTAACTCCAGCAGAAAT
CGATGATTACTTGGCTGAAGTCGAG

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DS 

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AAGCTTCTGTTCAAAAGATTCAGCATTTGACTCCCAACATTGGAGTTGTTTACAGTGGTA
TGGGTCCTGATTTCCGAGTTCTTGTACGTAAGAGTAGGAAGCAGGCGGAGCAATACAACC
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AAGAGTTCACTCAATCAGGTGGTGTGAGGCCGTTTGGAGTTTCTCTACTAGTGGCTGGGT
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TCGAGGGAGAAATCTCAAGCAAAAACATTGAGATTGGCAAAATTGGTGCTGACAAAGTGT
TTAGGGTGCTAACTCCAGCAGAAATCGATGATTACTTGGCTGAAGTCGAGTAAACTTTCA
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TCTTGCTGGGTTGCACAAACTTGTTGGCTATTACTTCTGTAACTCCTTTGGAACTTGTCA
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GTTGTTTACAGTGGTATGGGTCCTGATTTCCGAGTTCTTGTACGTAAGAGTAGGAAGCAG
GCGGAGCAATACAACCGATTGTACAAAGAGCCTATTCCCGTTACGCAACTTGTAAGGGAA
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CTACTAGTGGCTGGGTATGATGACAAGGGTCCACAGTTGTATCAGGTGGATCCGTCTGGC
TCTTATTTCTCATGGAAAGCTTCAGCAATGGGAAAGAATGTTTCGAATGCCAAGACATTC
CTTGAGAAGAGGTACACTGAAGACATGGAACTTGATGATGCCATTCACACTGCCATATTG
ACATTGAAGGAAGGTTTCGAGGGAGAAATCTCAAGCAAAAACATTGAGATTGGCAAAATT
GGTGCTGACAAAGTGTTTAGGGTGCTAACTCCAGCAGAAATCGATGATTACTTGGCTGAA
GTCGAGTAAACTTTCAGTTGGCCGTTTAACAAACCAGAAACCAGGATTCGAATCCCAAAT
ACTATATTTTGTTTCTTCTTGCTGGGTTGCACAAACTTGTTGGCTATTACTTCTGTAACT
CCTTTGGAACTTGTCAAGTCTCAAAACTCAATTTAGAATCTGGCTTCATTTGTTTCGATA
TGTTC

QA 1 725 1 725
DS 



CO CL85Contig2 845 2 8 U
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TCACATGAAGAGATTTTGAACATATCGAAACAAATGAAAACAGATTCTAAATTGAGTTTT
GAGACATGACCAGTTCCAAAGGAGTTACAGAAGTAAAAGCCAACAAGTTTGTGCAACCCA
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CAACTGAAAGTTTACTCGACTTCAGCCAAGTAATCATCGATTTCTGCTGGAGTTAGCACC
CTAAACACTTTGTCAGCACCAATTTTGCCAATCTCAATGTTTTTGCTTGAGATTTCTCCC
TCGAAACCTTCCTTCAATGTCAATATGGCAGTGTGAATGGCATCATCAAGTTCCATGTCT
TCAGTGTACCTCTTCTCAAGGAATGTCTTCGAATTCGAAACATTCTTTCCCATTGCTGAA
GCTTTCCATGAGAAATAAGAGCCAGACGGATCCACCTGATACAACTGTGGACCCTTGTCA
TCATACCCAGCCACTAGTAGTGAAACTCCAAACGGTCTCACACCACCTGATTGAGTGAAC
TCTTGCATCACCGTAGCTGTTTCCCTAACAAGTTGCGTAACAGGGATAGGTTATTTGTAC
AATCGGTTGTATTGCTCAGCCTGCTTCCTACTCTTACGTACCAGAACTCGGAAATCAGGA
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GCTTCATCAACAAGAATAGAGGGAAGCTTCTTTTCTGTTGCAATGACAACTCCGTTTGAA
GCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1EU28JQ U 1
AF RS1FN76JQ U 105
BS 1 329 RS1EU28JQ
BS 330 330 RS1FN76JQ
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RD RS1EU28JQ 714 0 0
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TCTTGCATCACCGTAGCTGTTTCCCTAACAAGTTGCGTAACAGGGATAGGTTCTTTGTAC
AATCGGTTGTATTGCTCAGCCTGCTTCCTACTCTTACGTACCAGAACTCGGAAA

QA 1 714 1 714
DS 

RD RS1FN76JQ 741 0 0
TTCTAAATTGAGTTTTGAGACATGACCAGTTCCAAAGGAGTTACAGAAGTAAAAGCCAAC
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TGGTTTGTTGCACGGCCAACTGAAAGTTTACTCGACTTCAGCCAAGTAATCATCGATTTC
TGCTGGAGTTAGCACCCTAAACACTTTGTCAGCACCAATTTTGCCAATCTCAATGTTTTT
GCTTGAGATTTCTCCCTCGAAACCTTCCTTCAATGTCAATATGGCAGTGTGAATGGCATC
ATCAAGTTCCATGTCTTCAGTGTACCTCTTCTCAAGGAATGTCTTCGCATTCGAAACATT
CTTTCCCATTGCTGAAGCTTTCCATGAGAAATAAGAGCCAGACGGATCCACCTGATACAA
CTGTGGACCCTTGTCATCATACCCAGCCACTAGTAGTGAAACTCCAAACGGTCTCACACC
ACCTGATTGAGTGAACTCTTGCATCACCGTAGCTGTTTCCCTAACAAGTTGCGTAACGGG
GATAGGTTATTTGTACAATCGGTTGTATTGCTCAGCCTGCTTCCTACTCTTACGTACCAG
AACTCGGAAATCAGGACCCATACCACTGTAAACAACTCCAATGTTGGGAGTCAAATGCTG
AATCTTTTGAACAGAAGCTTCATCAACAAGAATAGAGGGAAGCTTCTTTTCTGTTGCAAT
GACAACTCCGTTTGAAGCTTT

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 15

CO CL86Contig1 823 15 14 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGATTCTACAA
ACAAACATCTTCTCATTTCTCATTTTATCTAATTCGTATCACCGATCTCAAAGCTTTTCG
GCTCGTTTTATCTAA*GTTGTAGCCATGTCTCAGACCGTTGTCCTCAAAGTTGGTATGTC
ATGCCAAGGTTGCGTTGGTGCCGTCAATAGAGTCCTAGGCAAAATGGAAGGCGTTGAGTC
ATTTGACATTGATATCAAGGAACAAAAGGTGACAGTGAAAGGAAAAGTTGAGCCTGAGGC
AGTTTTTCAAACAGTTTCTAAGACTGGAAAGAAGACTTCTTACTGGCCCGTGGAGGCTGA
GGTTGAGCCTAAGGACGAGACAGAGACAAAACCTGAAGGTGAGACTAAGACTGAGGGTAA
GGTTGATGCTGAGGTACCGGAGGTTAAGGTTGATGCTAAGGTCGAGCCTAAGGCTGATGT
TGAACCGAAACTCGCAGAAACGGAGACTAAGACCGAGGGTAAGGTTGATGATGAGATACT
TGATGCCAAGGTTGATCCTAAGGTCGATGCTAAGGCTGATGTTGAACCGAAACTCGTTGA
AGCCAAGACTAAGCCACCACAAGTTTAAGTACTAAAGAAATATTGTAATGATGATTCTAA
TCCATATTTGCAATGCTTCTTATTATCCTATGTTTATCTGTTGTTGTAAGAACTAAGAAA
TGTATCCGATTTACTAAAAAATGTTTTCTCTAAACAGAATGCTGGACCCATGTAGTACCG
ACTTTCTATAAGCTTCAATTTAACTATAGACATCGGAAATCTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 55 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 80 
80 55 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 30 80 30 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 30 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 60 85 35 85 85 85 85 85 60 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 70 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 60 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 60 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 35 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 60 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 60 85 85 85 70 85 85 85 85 35 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 70 85 60 85 70 85 85 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 45 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 50 60 60 60 60 60 45 60 60 60 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E279TF U 76
AF RS1AA24TF U 81
AF RS1A325TF U 1
AF RS1F774TF U 55
AF RS1A325TR C 66
AF RS1A325TV U 1
AF RS1A325JQ C 66
AF RS1DB50TF U 66
AF RS1A563JQ C 66
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AF RS1A563TF U 66
AF RS1CS91JQ C 66
AF RS1DM90JQ C 66
AF RS1DM90TF U 66
AF RS1DB50JQ C 339
BS 1 186 RS1A325TF
BS 187 187 RS1F774TF
BS 188 188 RS1A325TF
BS 189 189 RS1F774TF
BS 190 284 RS1A325TF
BS 285 285 RS1F774TF
BS 286 383 RS1A325TF
BS 384 384 RS1F774TF
BS 385 613 RS1A325TF
BS 614 614 RS1F774TF
BS 615 750 RS1A325TF
BS 751 751 RS1A563TF
BS 752 816 RS1DM90TF
BS 817 823 RS1DB50JQ

RD RS1E279TF 642 0 0
TTTT
TCATTTTATCTAATTCGGATCACCGATCTCAAAGCTTT*CGGTTCGTTTTATCTAAAGTT
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GAACAAAAGGTGACAGTGAAAGGAAAAGTTGAGCCTGAGGGAGTTTTTCAAACAGTTTCT
AAGACTGGAAAGAAGACTTCTTACTGGCCCGTGGAGGCTGAGGTTGAGCCTAAGGACGAG
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AAGGTCGATGCTAAGGCTGATGTTGAACCGAAACTCGTTGAAGCCGAGACTAAGCCACCA
CAAGTTTAAGTGCCAAAGAAATATTGTAATGATGATTTTAATCCATATTTGCAATGCTTC
TTATTATCCTATGTTTATCTGTTGTTGTAAGAACTAA
A

QA 5 641 5 641
DS 

RD RS1AA24TF 634 0 0
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CGGAGACTAAGACCAAGGGTAAGGTTGATGATGAGATACTTGATGCCAAGGTTGATACTA
AGGTCGATGCTAAGGCTGATGTTGAACCGAAACTCGTTGAAGCCGAGACTAAGCCACCAC
AAGTTTAAGTACCAAAGAAATACTGTAATGATGATTTTAATCCATATTTGCAATGCTTCT
TATTATCCTATGTTTATCTGTTGTTGTAAGAACT

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1A325TF 751 0 0
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GCTCGTTTTATCTAA*GTTGTAGCCATGTCTCAGACCGTTGTCCTCAAAGTTGGTATGTC
ATGCCATGTTTGCGTTGGTGCCGTCAATAGAGTCCTAGGCAAAATGGAAGGCGTTGAGTC
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GGTTGAGCCTAAGGACGAGACAGGGACAAAACCTGAAGGTGAGACTAAGACTGAGGGTAA
GGTTGATGCTGAGGTACCGGAGGTTAAGGTTGATGCTAAGGTCGAGCCTAAGGCTGATGT
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TCCATATTTGCAATGCTTCTTATTATCCTATGTTTATCTGTTGTTGTAAGAACTAAGAAA
TGTATCCGATTTACTAAAAAATGTTTTCTCC

QA 1 751 1 751
DS 

RD RS1F774TF 687 0 0
GG
ACAAACAAACATCTTCTCGTTTCTCATTTTATCTAATTTGTATCACCGATCTCAAAGCTT
TTCGGCTCGTTTTATCTAA*GTTGTAGCCATGTCTCAGACCGTTGTCCTCAAAGTTGGTA
TGTCATGCCAAGGTTGCGTTGGTGCCGTCAATAGAGTCCTAAGCAAAATGGAAGGCGTTG
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ATGTTGAACCGAAACTCGCAGAAACGGAGACTAAGACCGAGGGTAAGGTTGATGATGAGA
TACTTGATGCCAAGGTTGATCCTAAGGTCGATGCTAAGGCTGATGTTGAACCGAAACTCG
TTGAAGCCAAGACTAAGCCACCACAAGTTTAAGTACTAAAGAAATATTGTAATGATGATT
CTAATCCATATTTGCAATGCTTCTTATTATCCTATGTTTATCTGTTGTTGTAAGAACTAA
GAAATGTATCCGATTTACTAAAAAA

QA 3 687 3 687
DS 

RD RS1A325TR 686 0 0
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ATGTTTGCGTTGGTGCCGTCAATAGAGTCCTAGGCAAAATGGAAGGCGTTGAGTCATTTG
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ATGCTGAGGTACCGGAGGTTAAGGTTGATGCTAAGGTCGAGCCTAAGGCTGATGTTGAAC
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CCAAGGTTGATCCTAAGGTCGATGCTAAGGCTGATGTTGAACCGAAACTCGTTGAAGCCA
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ATTTGCAATGCTTCTTATTATCCTATGTTTATCTGTTGTTGTAAGAACTAAGAAATGTAT
CCGATTTACTAAAAAATGTTTTCTCC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1A325TV 751 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGATTCTACAA
ACAAACATCTTCTCATTTCTCATTTTATCTAATTCGTATCACCGATCTCAAAGCTTTTCG
GCTCGTTTTATCTAA*GTTGTAGCCATGTCTCAGACCGTTGTCCTCAAAGTTGGTATGTC
ATGCCATGTTTGCGTTGGTGCCGTCAATAGAGTCCTAGGCAAAATGGAAGGCGTTGAGTC
ATTTGACATTGATATCAAGGAACAAAAGGTGACAGTGAAAGGAAGAGTTGAGCCTGAGGC
AGTTTTTCAAACAGTTTCTAAGACTGGAAAGAAGACTTCTTACTGGCCCGTGGAGGCTGA
GGTTGAGCCTAAGGACGAGACAGGGACAAAACCTGAAGGTGAGACTAAGACTGAGGGTAA
GGTTGATGCTGAGGTACCGGAGGTTAAGGTTGATGCTAAGGTCGAGCCTAAGGCTGATGT
TGAACCGAAACTCGCAGAAACGGAGACTAAGACCGAGGGTAAGGTTGATGATGAGATACT
TGATGCCAAGGTTGATCCTAAGGTCGATGCTAAGGCTGATGTTGAACCGAAACTCGTTGA
AGCCAAGACTAAGTCACCACAAGTTTAAGTACTAAAGAAATATTGTAATGATGATTCTAA
TCCATATTTGCAATGCTTCTTATTATCCTATGTTTATCTGTTGTTGTAAGAACTAAGAAA
TGTATCCGATTTACTAAAAAATGTTTTCTCC

QA 1 751 1 751
DS 

RD RS1A325JQ 686 0 0
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ATGCTGAGGTACCGGAGGTTAAGGTTGATGCTAAGGTCGAGCCTAAGGCTGATGTTGAAC
CGAAACTCGCAGAAACGGAGACTAAGACCGAGGGTAAGGTTGATGATGAGATACTTGATG
CCAAGGTTGATCCTAAGGTCGATGCTAAGGCTGATGTTGAACCGAAACTCGTTGAAGCCA
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ATTTGCAATGCTTCTTATTATCCTATGTTTATCTGTTGTTGTAAGAACTAAGAAATGTAT
CCGATTTACTAAAAAATGTTTTCTCC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1DB50TF 675 0 0
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TTCAAACAGCTTCTAAGACTGGAAAGAAGACTTCTTACTGGTCCGTGGAGGCTGAGGTTG
AGCCTAAGGACGAGACAGAGACAAAACCTGAAGGTGAGACTAAGACTGAGGGTAAGGTTG
ATGCTGAGGTACCGGAGGTTAAGGTTGATGCTAAGGTCGAGCCTAAGGCTGATGTTGAAC
CGAAACTCGCAGAAACGGAGACTAAGACCGAGGGTAAGGTTGATGATGAGATACTTGATG
CCAAGGTTGATCCTAAGGTCGATGCTAAGGCTGATGTTGAACCGAAACTCGTTGAAGCCA
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ATTTGCAATGCTTCTTATTATCCTATGTTTATCTGTTGTTGTAAGAACTAAGAAATGTAT
CCGATTTACTAAAAA

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1A563JQ 686 0 0
CATCTTCTCATTTCTCATTTTATCTAATTCGTATCACCGATCTCAAAGCTTTTCGGCTCG
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AAGGTTGCGTTGGTGCCGTCAATAGAGTCCTAGGCAAAATGGAAGGCGTTGAGTCATTTG
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TTCAAACAGTTTCTAAGACTGGAAAGAAGACTTCTTACTGGCCCGTGGAGGCTGAGGTTG
AGCCTAAGGACGAGACAGAGACAAAACCTGAAGGTGAGACTAAGACTGAGGGTAAGGTTG
ATGCTGAGGTACCGGAGGTTAAGGTTGATGCTAAGGTCGAGCCTAAGGCTGATGTTGAAC
CGAAACTCGCAGAAACGGAGACTAAGACCGAGGGTAAGGTTGACGATGAGATACTTGATG
CCAAGGTTGATCCTAAGGTCGATGCTAAGGCTGATGTTGAACCGAAACTCGTTGAAGCCA
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ATTTGCAATGCTTCTTATTATCCTATGTTTATCTGTTGTTGTAAGAACTAAGAAATGTAT
CCGATTTACTAAAAAATGTTTTCTCT

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1CS91TF 673 0 0
CATCTTCTCATTTCTCATTTTATCTAATTCGTATCACCGATCTCAAAGCTTTTCGGCTCG
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AAGGTTGCGTTGGTGCCGTCAATAGAGTCCTAGGCAAAATGGAAGGCGTTGAGTCATTTG
ACATTGATATCAAGGAACAAAAGGTGACAGTGAAAGGAAAAGTTGAGCCTGAGGCAGTTT
TTCAAACAGTTTCTAAGACTGGAAAGAAGACTTCTTACTGGCCCGTGGAGGCTGAGGTTG
AGCCTAAGGACGAGACAGAGACAAAACCTGAAGGTGAGACTAAGACTGAGGGTAAGGTTG
ATGCTGAGGTACCGGAGGTTAAGGTTGATGCTAAGGTCGAGCCTAAGGCTGATGTTGAAC
CGAAACTCGCAGAAACGGAGACTAAGACCGAGGGTAAGGTTGACGATGAGATACTTGATG
CCAAGGTTGATCCTAAGGTCGATGCTAAGGCTGATGTTGAACCGAAACTCGTTGAAGCCA
AGACTAAGCCACCACAAGTTTAAGTACTAAAGAAATATTGTAATGATGATTCTAATCCAT
ATTTGCAATGCTTCTTATTATCCTATGTTTATCTGTTGTTGTAAGAACTAAGAAATGTAT
CCGATTTACTAAA

QA 1 673 1 673
DS 

RD RS1A563TF 686 0 0
CATCTTCTCATTTCTCATTTTATCTAATTCGTATCACCGATCTCAAAGCTTTTCGGCTCG
TTTTATCTAA*GTTGTAGCCATGTCTCAGACCGTTGTCCTCAAAGTTGGTATGTCATGCC
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ACATTGATATCAAGGAACAAAAGGTGACAGTGAAAGGAAAAGTTGAGCCTGAGGCAGTTT
TTCAAACAGTTTCTAAGACTGGAAAGAAGACTTCTTACTGGCCCGTGGAGGCTGAGGTTG
AGCCTAAGGACGAGACAGAGACAAAACCTGAAGGTGAGACTAAGACTGAGGGTAAGGTTG
ATGCTGAGGTACCGGAGGTTAAGGTTGATGCTAAGGTCGAGCCTAAGGCTGATGTTGAAC
CGAAACTCGCAGAAACGGAGACTAAGACCGAGGGTAAGGTTGACGATGAGATACTTGATG
CCAAGGTTGATCCTAAGGTCGATGCTAAGGCTGATGTTGAACCGAAACTCGTTGAAGCCA
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ATTTGCAATGCTTCTTATTATCCTATGTTTATCTGTTGTTGTAAGAACTAAGAAATGTAT
CCGATTTACTAAAAAATGTTTTCTCT

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1CS91JQ 686 0 0
CATCTTCTCATTTCTCATTTTATCTAATTCGTATCACCGATCTCAAAGCTTTTCGGCTCG
TTTTATCTAA*GTTGTAGCCATGTCTCAGACCGTTGTCCTCAAAGTTGGTATGTCATGCC
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ACATTGATATCAAGGAACAAAAGGTGACAGTGAAAGGAAAAGTTGAGCCTGAGGCAGTTT
TTCAAACAGTTTCTAAGACTGGAAAGAAGACTTCTTACTGGCCCGTGGAGGCTGAGGTTG
AGCCTAAGGACGAGACAGAGACAAAACCTGAAGGTGAGACTAAGACTGAGGGTAAGGTTG
ATGCTGAGGTACCGGAGGTTAAGGTTGATGCTAAGGTCGAGCCTAAGGCTGATGTTGAAC
CGAAACTCGCAGAAACGGAGACTAAGACCGAGGGTAAGGTTGACGATGAGATACTTGATG
CCAAGGTTGATCCTAAGGTCGATGCTAAGGCTGATGTTGAACCGAAACTCGTTGAAGCCA
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ATTTGCAATGCTTCTTATTATCCTATGTTTATCTGTTGTTGTAAGAACTAAGAAATGTAT
CCGATTTACTAAAAAATGTTTTCTCT

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1DM90JQ 751 0 0
CATCTTCTCATTTCTCATTTTATCTAATTCGTATCACCGATCTCAAAGCTTTTCGGCTCG
TTTTATCTAA*GTTGTAGCCATGTCTCAGACCGTTGCCCTCAAAGTTGGTATGTCATGCC
AAGGTTGCGTTGGTGCCGTCAATAGAGTCCTAGGCAAAATGGAAGGCGTTGAGTCATTTG
ACATTGATATCAAGGAACAAAAGGTGACAGTGAAAGGAAAAGTTGAGCCTGAGGCAGTTT
TTCAAACAGTTTCTAAGACTGGAAAGAAGACTTCTTACTGGCCCGTGGAGGCTGAGGTTG
AGCCTAAGGACGAGACAGAGACAAAACCTGAAGGTGAGACTAAGACTGAGGGTAAGGTTG
ATGCTGAGGTACCGGAGGTTAAGGTTGATGCTAAGGTCGAGCCTAAGGCTGATGTTGAAC
CGAAACTCGCAGAAACGGAGACTAAGACCGAGGGTAAGGTTGATGATGAGATACTTGATG
CCAAGGTTGATCCTAAGGTCGATGCTAAGGCTGATGTTGAACCGAAACTCGTTGAAGCCA
AGACTAAGCCACCACAAGTTTAAGTACTAAAGAAATATTGTAATGATGATTCTAATCCAT
ATTTGCAATGCTTCTTATTATCCTATGTTTATCTGTTGTTGTAAGAACTAAGAAATGTAT
CCGATTTACTAAAAAATGTTTTCTCTAAACAGAATGCTGGACCCATGTAGTACCGACTTT
CTATAAGCTTCAATTTAACTATAGACATCGG

QA 1 751 1 751
DS 

RD RS1DM90TF 751 0 0
CATCTTCTCATTTCTCATTTTATCTAATTCGTATCACCGATCTCAAAGCTTTTCGGCTCG
TTTTATCTAA*GTTGTAGCCATGTCTCAGACCGTTGCCCTCAAAGTTGGTATGTCATGCC
AAGGTTGCGTTGGTGCCGTCAATAGAGTCCTAGGCAAAATGGAAGGCGTTGAGTCATTTG
ACATTGATATCAAGGAACAAAAGGTGACAGTGAAAGGAAAAGTTGAGCCTGAGGCAGTTT
TTCAAACAGTTTCTAAGACTGGAAAGAAGACTTCTTACTGGCCCGTGGAGGCTGAGGTTG
AGCCTAAGGACGAGACAGAGACAAAACCTGAAGGTGAGACTAAGACTGAGGGTAAGGTTG
ATGCTGAGGTACCGGAGGTTAAGGTTGATGCTAAGGTCGAGCCTAAGGCTGATGTTGAAC
CGAAACTCGCAGAAACGGAGACTAAGACCGAGGGTAAGGTTGATGATGAGATACTTGATG
CCAAGGTTGATCCTAAGGTCGATGCTAAGGCTGATGTTGAACCGAAACTCGTTGAAGCCA
AGACTAAGCCACCACAAGTTTAAGTACTAAAGAAATATTGTAATGATGATTCTAATCCAT
ATTTGCAATGCTTCTTATTATCCTATGTTTATCTGTTGTTGTAAGAACTAAGAAATGTAT
CCGATTTACTAAAAA*TGTTT*CTCTAAACAGAATGCTGGACCCATGTAGTACCGACTTT
CTATAAGCTTCAATTTAACTATAGACATCGG

QA 1 751 1 751
DS 

RD RS1DB50JQ 485 0 0
CTTACTGGTCCGTGGAGGCTGAGGTTGAGCCTAAGGACGAGACAGAGACAAAACCTGAAG
GTGAGACTAAGACTGAGGGTAAGGTTGATGCTGAGGTACCGGAGGTTAAGGTTGATGCTA
AGGTCGAGCCTAAGGCTGATGTTGAACCGAAACTCGCAGAAACGGAGACTAAGACCGAGG
GTAAGGTTGATGATGAGATACTTGATGCCAAGGTTGATCCTAAGGTCGATGCTAAGGCTG
ATGTTGAACCGAAACTCGTTGAAGCCAAGATTAAGCCACCACAAGTTTAAGTACTAAAGA
AATATTGTAATGATGATTTTAATCCATATTTGCAATGCTTCTTATTATCCTATGTTTATC
TGTTGTTGTAAGAACTAAGAAATGTATCCGATTTACTAAAAAATGTTTTCTCTAAACAGA
ATGCTGGACCCATGTAGTACCGACTTTCTATAAGCTTCAATTTAACTATAGACATCGGAA
ATCTC

QA 1 485 1 485
DS 



AS 3 12

CO CL87Contig1 910 3 5 U
CTTAACAGAAACAGCATAATAATATCCTGAAGTGGGCAACATCGATAATAATAGCAAAAA
GTTTCGAAACATTCCATGAAACAGCTAAACAAAACAATCATAATCACCATGAGATGCTCT
GCTTAGTTCAACCTCTGGGCAGCCTCCTTGGCAAGAACCCTCTCCTTAGCTTTGGTCTTG
GCTTGAGACTTGGATCCCATTATACCTCCTCCCCACTTCTTCCTGTACTCCTCGTACTTG
TCGTTGAAGTTTGCCTTGATGGCTTCAAGGATTTTGCTGAACTCGAGCTTGTCCTCGTTC
TTGACAGTGGTCAAACACAAGCAAGCAGCAGTCTTCTGGTGAACTACCGTTCCGAGACGA
GATTTGCCTTTGACAATGCAGTAAGGCACTTCCATCTTTCTGCAAAGAGCAGGCAACCAG
ACGACGAGCTCGATGGGGTCAACATCGTGAGC*AATGACAACAAGCTGGGC*CTTGTTCT
GCTCGATGAGGTAAGTCACGTGGTTGAGACCATACTTGACGACAAT**GGGCTTCTTGGA
CTCAGGAGGCTTGCCCTCAGCCTCGGCTTGGGCCTTTTTCAAAAGACGATCCTTCTTAGC
GGCCTTGTCCTCTGGCCTGTACTTCATAAGAACCTTGAATAGCTGGGTTGCGAGGTTCTT
GTCGAGAGTCTTGGTGAACTGGTTCAGAGCCGGTGGGACCTTGAGCCTCTGCTTGAGGAT
ACGCTTCTGCCTTTGGAGACGGATGGACTTGGGCCATTTGATGTAACGAGTCAAGTCCTT
TCTTTGGAGGCAAAGCACCTCCGATACCGAACTGCTTTGGCCTCCTCCCAAATAGAGGGT
TCGTAACCTTCTCCGTCTTCTTCTTCGTGACTGCTTTCACTCCCCTTTTGGGTGCCATTG
CTGTCGATTA


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1A230TF C 210
AF RS1A230TR U 1
AF RS1A230JQ U 1
BS 1 34 RS1A230JQ
BS 35 35 RS1A230TR
BS 36 780 RS1A230JQ
BS 781 781 RS1A230TR
BS 782 910 RS1A230JQ

RD RS1A230TF 344 0 0
TCCCCCAC
TCTTCCTGTACTCCTCGTACTTGTCGTTGAAGTTTGCCTTGATGGCTTCAAGGATTTTGC
TGAACTCGAGCTTGTCCTCGTTCTTGACAGTGGTCAAACACAAGCAAGCAGCAGTCTTCT
GGTGAACTACCGTTCCGAGACGAGATTTGCCTTTGACAATGCAGTAAGGCACTTCCATCT
TTCTGCAAAGAGCAGGCAACCAGACGACGAGCTCGATGGGGTCAACATCGTGAGCGAATG
ACAACAAGCTGGGCTCTTGTTCTGCTCGATGAGGTAAGTCACGTGGTTGAGACCATACTT
GACGACAAATGGGGCTTCTTGGACTCAGGAGG
GCTT

QA 9 340 9 340
DS 

RD RS1A230TR 799 0 0
CTTAA
CAGAAACAGCATAATAATATCCTGAAGTGGGCAACATCGATAATAATAGCAAAAAGTTTC
GAAACATTCCATGAAACAGCTAAACAAAACAATCATAATCACCATGAGATGCTCTGCTTA
GTTCAACCTCTGGGCAGCCTCCTTGGCAAGAACCCTCTCCTTAGCTTTGGTCTTGGCTTG
AGACTTGGATCCCATTATACCTCCTCCCCACTTCTTCCTGTACTCCTCGTACTTGTCGTT
GAAGTTTGCCTTGATGGCTTCAAGGATTTTGCTGAACTCGAGCTTGTCCTCGTTCTTGAC
AGTGGTCAAACACAAGCAAGCAGCAGTCTTCTGGTGAACTACCGTTCCGAGACGAGATTT
GCCTTTGACAATGCAGTAAGGCACTTCCATCTTTCTGCAAAGAGCAGGCAACCAGACGAC
GAGCTCGATGGGGTCAACATCGTGAGC*AATGACAACAAGCTGGGC*CTTGTTCTGCTCG
ATGAGGTAAGTCACGTGGTTGAAACCATACTTGACGACAAT**GGGCTTCTTGGACTCAG
GAGGCTTGCCCTCAGCCTCGGCTTGGGCCTTTTTCAAAAGACGATCCTTCTTAGCGGCCT
TGTCCTCTGGCCTGTACTTCATAAGAACCTTGAATAGCTGGGTTGCGAGGTTCTTGTCGA
GAGTCTTGGTGAACTGGTTCAGAGCCGGTGGGACCTTGAGCCTCTGCTTGAGGATACGCT
TCTGCCTTTGGAGACGGATGGACTTGGGCCATTTGATGTAACGAGTCAAGTCCTTTCTTT
GGAGGCAAAGCACC

QA 6 799 6 799
DS 

RD RS1A230JQ 910 0 0
CTTAACAGAAACAGCATAATAATATCCTGAAGTGTGCAACATCGATAATAATAGCAAAAA
GTTTCGAAACATTCCATGAAACAGCTAAACAAAACAATCATAATCACCATGAGATGCTCT
GCTTAGTTCAACCTCTGGGCAGCCTCCTTGGCAAGAACCCTCTCCTTAGCTTTGGTCTTG
GCTTGAGACTTGGATCCCATTATACCTCCTCCCCACTTCTTCCTGTACTCCTCGTACTTG
TCGTTGAAGTTTGCCTTGATGGCTTCAAGGATTTTGCTGAACTCGAGCTTGTCCTCGTTC
TTGACAGTGGTCAAACACAAGCAAGCAGCAGTCTTCTGGTGAACTACCGTTCCGAGACGA
GATTTGCCTTTGACAATGCAGTAAGGCACTTCCATCTTTCTGCAAAGAGCAGGCAACCAG
ACGACGAGCTCGATGGGGTCAACATCGTGAGC*AATGACAACAAGCTGGGC*CTTGTTCT
GCTCGATGAGGTAAGTCACGTGGTTGAGACCATACTTGACGACAAT**GGGCTTCTTGGA
CTCAGGAGGCTTGCCCTCAGCCTCGGCTTGGGCCTTTTTCAAAAGACGATCCTTCTTAGC
GGCCTTGTCCTCTGGCCTGTACTTCATAAGAACCTTGAATAGCTGGGTTGCGAGGTTCTT
GTCGAGAGTCTTGGTGAACTGGTTCAGAGCCGGTGGGACCTTGAGCCTCTGCTTGAGGAT
ACGCTTCTGCCTTTGGAGACGGATGGACTTGGGCCATTTGATGTAACGAGTCAAGTCCTT
*CTTTGGAGGCAAAGCACCTCCGATACCGAACTGCTTTGGCCTCCTCCCAAATAGAGGGT
TCGTAACCTTCTCCGTCTTCTTCTTCGTGACTGCTTTCACTCCCCTTTTGGGTGCCATTG
CTGTCGATTA

QA 1 910 1 910
DS 



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TTGCCGCCCCGCGTCTAACTCCAGAAATTGAACAACCATGGCACCCAAAAGGGGAGTGAA
AGCAGTCACGAAGAAGAAGACGGAGAAGGTTACGAACCCTCTATTTGAGAGGAGGCCAAA
GCAGTTCGGTATCGGAGGTGCTTTGCCTCCAAAGAAGGACTTGACTCGTTACATCAAATG
GCCCAAGTCAATCCGTCTCCAAAGGCAGAAGCGTATCCTCAAGCAGAGGCTCAAGGTGCC
ACCGGCTCTGAACCAGTTCACCAAGACTCTCGACAAGAACCTCGCAACCCAGCTTTTCAA
GGTTCTTATGAAGTACAGGCCAGAGGACAAGGCCGCTAAGAAGGATCGTCTTTTGAAAAA
GGCCCAAGCCGAGACTGAGGGAAAGCCTTCTGAGTCCAAGAAGCCCATTGTCGTCAAGTA
TGGTCTCAACCACGTGACTTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCCCAGCTTGTTGTCATTGC
TCACGATGTTGACCCCATCGAGCTCGTCGTCTGGTTGCCTGCTCTTTGCAGAAAGATGG*
AAGTGCCTTACTGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGTCTCGGAACGGTGGTTCACCAGAAGA
CTGCTGCTTGCTTGTGCTTGACCACTGTGAAGAACGAGGACAAGCTCGAGTTCAGCAAGA
TCCTCGAGGCCATCAA*GGCAAACTTCAACGACAAGTACGAGGAGTACAGGAGGAAGTGG
GGAGGAGGTATCATGGGATCAAAGTCTCAAGCCAAGACCAAAGCTAA*GGAGAGGGTTCT
TGCCAAGGAGGCTGCCCAGAGGATGAACTAAGCAGAGCGTCTTCACAATGATGATGATTA
TGGTTTTGTTTAGCTTTTTCATGGAATGTTTCGAAATGTTTTGCTATTATTATCCCTGTT
GCTCACTTCAGGATATTATTATGCAGTTTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A376TF U 509
AF RS1A376TV U 12
AF RS1A376JQ C 1
AF RS1A376TR C 40
BS 1 11 RS1A376JQ
BS 12 524 RS1A376TV
BS 525 539 RS1A376TF
BS 540 540 RS1A376TV
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BS 677 677 RS1A376TV
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BS 699 767 RS1A376TV
BS 768 768 RS1A376JQ
BS 769 784 RS1A376TV
BS 785 932 RS1A376JQ

RD RS1A376TF 190 0 0
TGGGTTGCCCTGCTCT
TTTGCAGAAAGATGGGAAGTGCCTTACTGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGTCTCGGAACG
GTGGTTCACCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGCTTGACCACTGTGAAGAACGAGGACAAG
CTCGAGTTCAGCAAGATCCTCGAGGCCATCAAAGGCAAACTTCAACGACAAGTA

QA 17 190 17 190
DS 

RD RS1A376TV 773 0 0
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TCCGTCTCCAAAGGCAGAAGCGTATCCTCAAGCAGAGGCTCAAGGTGCCACCGGCTCTGA
ACCAGTTCACCAAGACTCTCGACAAGAACCTCGCAACCCAGCTTTTCAAGGTTCTTATGA
AGTACAGGCCAGAGGACAAGGCCGCTAAGAAGGATCGTCTTTTGAAAAAGGCCCAAGCCG
AGACTGAGGGAAAGCCTTCTGAGTCCAAGAAGCCCATTGTCGTCAAGTATGGTCTCAACC
ACGTGACTTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCCCAGCTTGTTGTCATTGCTCACGATGTTG
ACCCCATCGAGCTCGTCGTCTGGTTGCCTGCTCTTTGCAGAAAGATGG*AAGTGCCTTAC
TGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGTCTCGGAACGGTGGTTCACCAGAAGACTGCTGCTTGC
TTGTGCTTGACCACTGTGAAGAACGAGGACAAGCTCGAGTTCAGCAAGATCCTCGAGGCC
ATCAA*GGCAAACTTCAACGACAAGTACGAGGAGTACAGGAGGAAGTGGGGAGGAGGTAT
CATGGGATCAAAGTCTCAAGCCAAGACCAAAGCTAAAGGAGAGGGTTCTTGCC

QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1A376JQ 932 0 0
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AGCAGTCACGAAGAAGAAGACGGAGAAGGTTACGAACCCTCTATTTGAGAGGAGGCCAAA
GCAGTTCGGTATCGGAGGTGCTTTGCCTCCAAAGAAGGACTTGACTCGTTACATCAAATG
GCCCAAGTCAATCCGTCTCCAAAGGCAGAAGCGTATCCTCAAGCAGAGGCTCAAGGTGCC
ACCGGCTCTGAACCAGTTCACCAAGACTCTCGACAAGAACCTCGCAACCCAGCTTTTCAA
GGTTCTTATGAAGTACAGGCCAGAGGACAAGGCCGCTAAGAAGGATCGTCTTTTGAAAAA
GGCCCAAGCCGAGACTGAGGGAAAGCCTTCTGAGTCCAAGAAGCCCATTGTCGTCAAGTA
TGGTCTCAACCACGTGACTTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCCCAGCTTGTTGTCATTGC
TCACGATGTTGACCCCATCGAGCTCGTCGTCTGGTTGCCTGCTCTTTGCAGAAAGATGG*
AAGTGCCTTACTGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGTCTCGGAACGGTGGTTCACCAGAAGA
CTGCTGCTTGCTTGTGCTTGACCACTGTGAAGAACGAGGACAAGCTCGAGTTCAGCAAGA
TCCTCGAGGCCATCAA*GGCAAACTTCAACGACAAGTACGAGGAGTACAGGAGGAAGTGG
GGAGGAGGTATCATGGGATCAAAGTCTCAAGCCAAGACCAAAGCTAA*GGAGAGGGTTCT
TGCCAAGGAGGCTGCCCAGAGGATGAACTAAGCAGAGCGTCTTCACAATGATGATGATTA
TGGTTTTGTTTAGCTTTTTCATGGAATGTTTCGAAATGTTTTGCTATTATTATCCCTGTT
GCTCACTTCAGGATATTATTATGCAGTTTCTG

QA 1 932 1 932
DS 

RD RS1A376TR 889 0 0
GGCACCCAAAAGGGGAGTGAAAGCAGTCACGAAGAAGAAGACGGAGAAGGTTACGAACCC
TCTATTTGAGAGGAGGCCAAAGCAGTTCGGTATCGGAGGTGCTTTGCCTCCAAAGAAGGA
CTTGACTCGTTACATCAAATGGCCCAAGTCAATCCGTCTCCAAAGGCAGAAGCGTATCCT
CAAGCAGAGGCTCAAGGTGCCACCGGCTCTGAACCAGTTCACCAAGACTCTCGACAAGAA
CCTCGCAACCCAGCTTTTCAAGGTTCTTATGAAGTACAGGCCAGAGGACAAGGCCGCTAA
GAAGGATCGTCTTTTGAAAAAGGCCCAAGCCGAGACTGAGGGAAAGCCTTCTGAGTCCAA
GAAGCCCATTGTCGTCAAGTATGGTCTCAACCACGTGACTTACCTCATCGAGCAGAACAA
GGCCCAGCTTGTTGTCATTGCTCACGATGTTGACCCCATCGAGCTCGTCGTCTGGTTGCC
TGCTCTTTGCAGAAAGATGG*AAGTGCCTTACTGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGTCTCG
GAACGGTGGTTCACCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGCTTGACCACTGTGAAGAACGAGG
ACAAGCTCGAGTTCAGCAAGATCCTCGAGGCCATCAA*GGCAAACTTCAACGACAAGTAC
GAGGAGTACAGGAGGAAGTGGGGAGGAGGTATCATGGGATCAAAGTCTCAAGCCAAGACC
AAAGCTAA*GGAGAGGGTTCTTGCCAAGGAGGCTGCCCAGAGGATGAACTAAGCAGAGCG
TCTTCACAATGATGATGATTATGGTTTTGTTTAGCTTTTTCATGGAATGTTTCGAAATGT
TTTGCTATTATTATCCCTGTTGCTCACTTCAGGATATTATTATGC
AGTT

QA 1 885 1 885
DS 



CO CL87Contig3 980 5 13 U
GGAAATAGAGTCGTCTTTCTTTGCCAGCTCCCCGCCGTCCCTCTGTAGCAAAATGGCACC
CAAAAAGGGAGTGAAAGCTGTTGCCAAGAAGAAAACGGAGAAGGTGACGAATCCGTTGTT
TGAGAGAAGGCCAAAGCAATTCGGTATCGGAGGTGCTTTGCCTCCTAAGAAGGACTTGAC
CCGTTACATCAAATGGCCCAAGTCCATCCGTCTCCAGAGGCAGAAGCGTATCCTTAAGCA
GAGGCTCAAGGTCCCTCCTGCTTTGAACCAGTTCACCAAGACTCTTGACAAGAACCTTGC
AACCCAGCTTTTCAAGGTTCTTATGAAGTACAGGCCAGAGGACAAGGCCGCAAAGAAGGA
TCGTCTTTTGAAAAAGGCTCAAGCCGAGGCTGAGGGAAAGCCTTCTGAATCCAAGAAGCC
CATTGTCGTCAAGTATGGTCTCAACCACGTGACTTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCACA
GCTTGTTGTCATTGCTCATGATGTTGACCCCATCGAGCTCGTCGTCTGGTTACCTGCTCT
TTGCAGAAAGATGGAAGTGCCTTACTGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGCCTTGGAACGGT
TGTTCATCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGCTTGACCACTGTCAAGAATGAGGACAAGCT
CGAGTTCAGCAAAATCCTTGAAGCCATCAAAGCAAACTTCAACGACAAGTACGAGGAGTA
CAGGAAGAAGTGGGGAGGAGGGATTATGGGATCCAAGTCTCAAGCCAAGACCAAAGCTAA
GGAGAGGGTTCTTGCCAAGGAGGCTGCCCAGAGAATGAACTAAGCAGAAACTTTATTATG
ATTGTGGTTTTGTTTAGCGGTTTCATGAAATACTCTGAAACTTTATGCTCTTGCTATCAA
TGTTGCACACTAGAGGATATTATGCAGTTTTGCTATACATTGTGCTTTCTACTTATTTAT
CTAATTCTCTCTTTTTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AP79TFB U 1
AF RS1BN25TF U 5
AF RS1EW03TF U 32
AF RS1BN25JQ C 174
AF RS1AP79JQ C 263
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RD RS1AP79TFB 640 0 0
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CAAAAAGGGAGTGAAAGCTGTTGCCAAGAAGAAAACGGAGAAGGTGACGAATCCGTTGTT
TGAGAGAAGGCCAAAGCAATTCGGTATCGGAGGTGCTTTGCCTCCTAAGAAGGACTTGAC
CCGTTACATCAAATGGCCCAAGTCCATCCGTCCCCAGAGGCAGAAGCGTATCCTTAAGCA
GAGGCTCAAGGTCCCTCCTGCTTTGAACCAGTTCACCAAGACTCTTGACAAGAACCTTGC
AACCCGGCTTTTCAAGGTTCTTATGAAGTACAGGCCAGAGGACAAGGCCGCAAAGAAGGA
TCGTCTTTTGAAAAAGGCTCAAGCCGAGGCTGAGGGAAAGCCTTCTGAATCCAAGAAGCC
CATTGTCGTCAAGTATGGTCTCAACCACGTGACTTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCACA
GCTTGTTGTCATTGCTCATGATGTTGACCCCATCGAGCTCGTCGTCTGGTTACCTGCTCT
TTGCAGAAAGATGGAAGTGCCTTACTGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGCCTTGGATCGGT
TGTTCATCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGCTTGACCACT

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1BN25TF 707 0 0
GG
AGAGTCGTCTTTCTTTGCCAGCTCCCCGCCGTCCCTCTGTAGCAAAATGGCACCCAAAAA
GGGAGTGAAAGCTGTTGCCAAGAAGAAAACGGAGAAGGTGACGAATCCGTTGTTTGAGAG
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CATCAAATGGCCCAAGTCCATCCGTCTCCAGAGGCAGAAGCGTATCCTTAAGCAGAGGCT
CAAGGTCCCTCCTGCTTTGAACCAGTTCACCAAGACTCTTGACAAGAACCTTGCAACCCA
GCTTTTCAAGGTTCTTATGAAGTACAGGCCAGAGGACAAGGCCGCAAAGAAGGATCGTCT
TTTGAAAAAGGCTCAAGCCGAGGCTGAGGGAAAGCCTTCTGAATCCAAGAAGCCCATTGT
CGTCAAGTATGGTCTCAACCACGTGACTTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCACAGCTTGT
TGTCATTGCTCATGATGTTGACCCCATCGAGCTCGTCGTCTGGTTACCTGCTCTTTGCAG
AAAGATGGAAGTGCCTTACTGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGCCTTGGAACGGTTGTTCA
TCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGCTTGACCACTGTCAAGAATGAGGACAAGCTCGAGTT
CAGCAAAATCCTTGAAGCCATCAAAGCAAACTTCAACGACAAGTA

QA 3 707 3 707
DS 

RD RS1EW03TF 688 0 0
GG
GCCGTCCCTCTGTAGCAAAATGGCACCCAAAAAGGGAGTGAAAGCTGTTGCCAAGAAGAA
AACGGAGAAGGTGACGAATCCGTTGTTTGAGAGAAGGCCAAAGCAATTCGGTATCGGAGG
TGCTTTGCCTCCTAAGAAGGACTTGACCCGTTACATCAAATGGCCCAAGTCCATCCTTCT
CCAGAGGCAGAAGCGTATCCTTAAGCAGAGGCTCAAGGTCCCTCCTGCTTTGAACCAGTT
CACCAAGACTCTTGACAAGAACCTTGCAACCCAGCTTTTCAAGGTTCTTATGAAGTACAG
GCCAGAGGACAAGGCCGCAAAGAAGGATCGTCTTTTGAAAAAGGCTCGAGCCGAGGCTGA
GGGAAAGCCTTCTGAATCCAAGAAGCCCATTGTCGTCAAGTATGGTCTCAACCACGTGAC
TTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCACAGCTTGTTGTCATTGCTCATGATGTTGACCCCAT
CGAGCTCGTCGTCTGGTTACCTGCTCTTTGCAGAAAGATGGAAGTGCCTTACTGCATTGT
CAAAGGCAAATCTCGCCTTGGAACGGTTGTTCATCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGCTT
GACCACTGTCAAGAATGAGGACAAGCTCGAGTTCAGCAAAATCCTTGAAGCCATCAAAGC
AAACTTCAACGACA*GTACGAGGAGT

QA 3 688 3 688
DS 

RD RS1BN25JQ 784 0 0
ACTTGACCCGTTACATCAAATGGCCCAAGTCCATCCGTCTCCAGAGGCAGAAGCGTATCC
TTAAGCAGAGGCTCAAGGTCCCTCCTGCTTTGAACCAGTTCACCAAGACTCTTGACAAGA
ACCTTGCAACCCAGCTTTTCAAGGTTCTTATGAAGTACAGGCCAGAGGACAAGGCCGCAA
AGAAGGATCGTCTTTTGAAAAAGGCTCAAGCCGAGGCTGAGGGAAAGCCTTCTGAATCCA
AGAAGCCCATTGTCGTCAAGTATGGTCTCAACCACGTGACTTACCTCATCGAGCAGAACA
AGGCACAGCTTGTTGTCATTGCTCATGATGTTGACCCCATCGAGCTCGTCGTCTGGTTAC
CTGCTCTTTGCAGAAAGATGGAAGTGCCTTACTGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGCCTTG
GAACGGTTGTTCATCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGCTTGACCACTGTCAAGAATGAGG
ACAAGCTCGAGTTCAGCAAAATCCTTGAAGCCATCAAGGCAAACTTCAACGACAAGTACG
AGGAGTACAGGAAGAAGTGGGGAGG**GGATTATGGGATCCAAGTCTCAAGCCAAGACCA
AAGCTAAGGAGAGGGTTCTTGCCAAGGAGGCTGCCCAGAGAATGAACTAAGCAGAAACTT
TATTATGATTGTGGTTTTGTTTAGCGGTTTCATGAAATACTCTGAAACTTTATGCTCTTG
CTATCAATGTTGCACACTAGAGGATATTATGCAGTTTTGCTATACATTGTGCTTTCTACT
TATT

QA 1 784 1 784
DS 

RD RS1AP79JQ 718 0 0
TTGAACCAGTTCACCAAGACTCTTGACAAGAACCTTGCAACCCGGCTTTTCAAGGTTCTT
ATGAAGTACAGGCCAGAGGACAAGGCCGCAAAGAAGGATCGTCTTTTGAAAAAGGCTCAA
GCCGAGGCTGAGGGAAAGCCTTCTGAATCCAAGAAGCCCATTGTCGTCAAGTATGGTCTC
AACCACGTGACTTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCACAGCTTGTTGTCATTGCTCATGAT
GTTGACCCCATCGAGCTCGTCGTCTGGTTACCTGCTCTTTGCAGAAAGATGGAAGTGCCT
TACTGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGCCTTGGATCGGTTGTTCATCAGAAGACTGCTGCT
TGCTTGTGCTTGACCACTGTCAAGAATGAGGACAAGCTCGAGTTCAGCAAAATCCTTGAA
GCCATCAAGGCAAACTTCAACGACAAGTACGAGGAGTACAGGAAGAAGTGGGGAGGAGGG
ATTATGGGATCCAAGTCTCAAGCCAAGACCAAAGCTAAGGAGAGGGTTCTTGCCAAGGAG
GCTGCCCAGAGAATGAACTAAGCAGAAACTTTATTATGATTGTGGTTTTGTTTAGCGGTT
TCATGAAATACTCTGAAACTTTATGCTCTTGCTATCAATGTTGCACACTAGAGGATATTA
TGCAGTTTTGCTATACATTGTGCTTTCTACTTATTTATCTAATTCTCTCTTTTTTTGC

QA 1 718 1 718
DS 



AS 3 15

CO CL88Contig1 871 3 4 U
GCCTTCAATAACACAAAGATTCTATTAATATCATAAAAGTTTTGAGAGAGTGGCTGCAAC
AATGGCAGCCTTCGTTGCCTTCATCAAAACACATTACAGCATATATATAAAAATCTAAAA
CCCTAGTTACATGGGCTACAAAAGCTTCAAATGGATAATAAACTTGGGCTTTACTTTGGG
CTTCAATACTCCTCCGCAAACTTAGCGTCGGGTGCAACAGAGAGGCTGAGTTTGAATGCA
AATGGAGATGGCTTGGAATGAGCATAAGTAGACGAAGTAGGATGCTGTTGATGTATGCAA
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TTGTCTGAAGCTTAAAGACAAAGTCTTGTTGACTCGGTGTTGAAAAGGCCGGATGATGTT
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AGCTCTGATACCATGATAACAATCTCAAACAAAAGAGATTGGATGCTCAAAGAGCTTATT
AAGAAAGATAGAAATAGCTTATAAAAAAGCTTTATTATACAAGAAAGTAAAGAGGAAGGA
AAGCTTTAGACTTGTCTTCAATAACACAAAGATTCTATTAATATCATAAAAGTTTTGAGA
GAGTGGCTGCAACAATGGCAGCCTTCGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G170JQ U 44
AF RS1AZ60JQ U 1
AF RS1AZ60TF C 127
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DS 

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DS 

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CTGCAACAATGGCAGCCTTCGTTCC

QA 1 745 1 745
DS 



CO CL88Contig2 1364 10 24 U
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AAAAAAAA*TGGTTGTGTTGGATTGATTTGCTCGTTGGCTTAGATTCTTGGGTTAAGATA
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TCTCTCAAAACTTTTATGATATTAATAGGATCTTTGTGTTATTC


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 10 

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AAAAAAA**TGGTTGTGTTGGATTGATTTGCTCGTTGGCTTAGATTCTTGGGTTAAGATA
G*TTTGGAACAGAAGCTATA
TGAATA

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DS 

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AGCTTTTTTATAAGCTATTTCTATCTTTCTTAATAAGCTCTTTGAGCATCCAATCTCTTT
TGTTTGAGATTGTTATCATGGTATCAGAGCTCCAGGGAGTAAGTCCTTGGCTCTATGGGT
TTTATTAAACTCGTTTCTACAACCGGTTCATGGGTTTTTACTTATTCTGTTCGGCTCAGC
ATCTTTGAAGATCCACGCTTCTGACAAACCCTCACTCACGCAGCTCTCCCTCACTCAAGC
TAAAACACGTTACTACATGGCACAAGAGGATAACATCATCCGGCCTTTTCAACACCGAGT
CAACAAGACTTTGTCTTTAAGCTTCAGACAAACGAATTCAGTTAGATGAAGCTGTGTGTG
TTCTGGTTAAGGATGGAGCTGAAGCTGTGAAGAAGCTTTGGTGAAGAAAAAGCGAGACTT
CCTCTTCACTTAATAGATGGTATTGTCTGTTCTCCCTCTCTAGACAGAACAAAGGATTAA
AAAAAAAA*TGGTTGTGTTGGATTGATTTGCTCGTTGGCTTAGATTCTTGGGTTAAGATA
GGTTTGGAACAGAAGCTATAATGAAATAGGCTGGTTTTTGGTTTGTTGCGTGTGGAGTTC
TCTGGCTTTAATGATAATGCACACAAG*TGCTCGCTGGA
TGCTG

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DS 

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CTTTGTGTTATTGAAGACAAGTCTAAAGCTTTCCTTCCTCTTTACTTTCTTGTATAATAA
AGCTTTTTTATAAGCTATTTCTATCTTTCTTAATAAGCTCTTTGAGCATCCAATCTCTTT
TGTTTGAGATTGTTATCATGGTATCAGAGCTCCAGGGAGTAAGTCCTTGGCTCTATGGGT
TTTATTAAACTCGTTTCTACAACCGGTTCATGGGTTTTTACTTATTCTGTTCGGCTCAGC
ATCTTTGAAGATCCACGCTTCTGACAAACCCTCACTCACGCAGCTCTCCCTCGCTCAAGC
TAAAACACGTTACTACATGGCACAAGAGGATAACATCATCCGGCCTTTTCAACACCGAGT
CAACAAGACTTTGTCTTTAAGCTTCAGACAAACGAATTCAGTTAGATGAAGCTGTGTGTG
TTCTGGTTAAGGATGAAGCTGAAGCTGTGAAGAAGCTTTGGTGAA**AAAAGCGAGACTT
CCTCTTCACTTAATAGATGGTATTGTCTGTTCTTCCTCTCTAGACAGAACAAAGGATTAA
AAAAAAA**TGGTTGTGTTGGATTGATTTGCTCGTTGGCTTAGATTCTTGGGTTAAGATA
G*TTTGGAACAGAAGCTATAGTGAAATAG*CTGGTTTT*GGTTTGTTGCGTGTGGAGTTC
TCTGGCTTTAATGATAATGCACACAAG*TGCTCGCTGGA*TGCTGACGAGAAAGTCAAGT
TGT

QA 1 783 1 783
DS 

RD RS1CV48TF 692 0 0
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CTCACGCAGCTCTCCCTCACTCAAGCTAAAACACGTTACTACATGGCACAAGAGGATAAC
ATCATCCGGCCTTTTCAACACCGAGTCAACAAGACTTTGTCTTTAAGCTTCAGACAAACG
AATTCAGTTAGATGAAGCTGTGTGTGTTCTGGTTAAGGATGAAGCTGAAGCTGTGAAGAA
GCTTTGGTGAAGAAAAAGCGAGACTTCCTCTTCGCTTAATAGATGGTATTGTCTGTTCTT
CCTCTCTAGACAGAACAAAGGATTAAAAAAAAA**TGGTTGT**TGGATTGATTTGCTCG
TTGGCTTAGATTCTTGGGTTAAGATAGGTTTGGAACAGAAGCTATAATGAAATAGGCTGG
TTTTTGGTTTGTTGCGTGTGGAGTTCTCTGGCTTTAATGATAATGCACACAAGGTGCTCG
CTGGAATGCTGACGAGAAAGTCAAGTTGTTTAGAGAAGAGTTTTGGTGGTATGTTGATAG
GCATCAGAGAGTTAATAGGATGGTTTAGTAAGTGTGGAAAGAGAGTTTTGCTTCTTCATG
AGACAGAATAAGAAATAGGTAAAGTAAGCCTAGATTCATAGTGAGACAAAGAGACCACAA
TTATACCTCTGAGTGAGATCAACTAAGCTCTC

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DS 

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G
GATCCACGCTTCTGACAAACCCTCACTCACGCAGCTCTCCCTCACTCAAGCTAAAACACG
TTACTACATGGCACAAGAGGATAACATCATCCGGCCTTTTCAACACCGAGTCAACAAGAC
TTTGTCTTTAAGCTTCAGACAAACGAATTCAGTTAGATGAAGCTGTGTGTGTTCTGGTTA
AGGATGAAGCTGAAGCTGTGAAGAAGCTTTGGTGAAGAAAAAGCGAGACTTCCTCTTCAC
TTAATAGATGGTATTGTCTGTTCTTCCTCTCTAGACAGAACAAAGGATTAAAAAAAAAA*
TGGTTGTGTTGGATTGATTTGCTCGTTGGCTTAGATTCTTGGGTTAAGATAGGTTTGGAA
CAGAAGCTATAATGAAATAGGCTGGTTTTTGGTTTGTTGCGTGTGGAGTTCTCTGGCTTT
AATGATAATGCACACAAGGTGCTCGCTGGAATGCTGACGAGAAAGTCAAGTTGTTTAGAG
AAGAGTTTTGGTGGTATATTGATAGGCATCAGAGAGTTAATAGGATGGTTTAGTAAGTGT
GGATAGAGAGTTTTGCTTCTTCATGAGACAGAATAAGAAATAGGTAAAGTAAGCCTAGAT
TCATAGTGAGACAAAGAGACCACAATTATACCTCTGAGTGAGATCAACTAAGCTCTCCAA
GT

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DS 

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G
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AAAAAAAAAATGGTTGTGTTGGATTGATTTGCTCGTTGGCTTAGATTCTTGGGTTAAGAT
AGGTTTGGAACAGAAGCTATAATGAAATAGGCTGGTTTTTGGTTTGTTGCGTGTGGAGTT
CTCTGGCTTTAATGATAATGCACACAAGGTGCTCGCTGGAATGCTGACGAGAAAGTCAAG
TTGTTTAGAGAAGAGTTTTGGTGGTATATTGATAGGCATCAGAGAGTTAATAGGATGGTT
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AAGCCTAGATTCATAGTGAGACAAAGAGACCACAATTATACCTCTGAGTGAGATCAACTA
AGCTCTCCAAGTTCAAAAGAAACCTCTGAGTGAAGCCATGTGATACTCTCCAAGTATAGG
CCTGAATAGATCTCACACTTAGTTTGTTTTCCATGAAGAAGAAGAGCCATTTGCATACAT
CAACAGCATCCTACTTCATCTACTTATGTTCATTCCAAGCCATCTCCATTTGCATTCAAA
CTCAGCCTCTCTGTTGCACCCGACGCTAAGTTTGCGGAGGAGTATTGAAGCCCAAAGTAA
AGCCCAAGTT*ATTATCCATTTGAAGCTTTTGTAGCCCATGTAACTAGGGTTTTAGATTC
TTATATATATGCTGTA
TGTGTTTGAT

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DS 

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AAAAATGGTTGTGTTGGATTGATTTGCTCGTTGGCTTAGATTCTTGGGTTAAGATAGGTT
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GCTTTAATGATAATGCACACAAGGTGCTCGCTGGAATGCTGACGAGAAAGTCAAGTTGTT
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AGTGTGGAAAGAGAGTTTTGCTTCTTCATGAGACAGAATAAGAAATAGGTAAAGTACGCC
TAGATTCATAGTGAGACAAAGAGACCACAATTATACCTCTGAGTGAGATCAACTAAGCTC
TCCAAGTTCAAAAGAAACCTCTGAGTGAAGCCATGTGATACTCTCCAAGTATAGGCCTGA
ATAGATCTCACACTTAGTTTGTTTTCCATGAAGAAGAAGAGCCATTTGCATACATCAACA
GCATCCTACTTCATCTACTTATGCTCATTCCAAGCCATCTCCATTTGCATTCAAACTCAG
CCTCTCTGTTGCACCCGACGCTAAGTTTGCGGAGGAGTATTGAAGCCCAAAGTAAAGCCC
AAGTTTATTATCCATTTGAAGCTTTTGTAGCCCATGTAACTAGGGTTTTAGATTCTTATA
TATATGCTGTAATGTGTTTTGATGAAGGCAACGAAGGCTGCCATTGTTGCAGCCACTCTC
TCAAAACTTTTATGATATTAATAGAATCTTTGTGTTAT
CG

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1D814JQ 695 0 0
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TGGTTTT*GGTTTGTTGCGTGTGGAGTTCTCTGGCTTTAATGATAATGCACACAAGGTGC
TCGCTGGAATGCTGACGAGAAAGTCAAGTTGTTTAGAGAAGAGTTTTGGTGGTATATTGA
TAGGCATCAGAGAGTTAATAGGATGGTTTAGTAAGTGTGGAAAGAGAGTTTTGCTTCTTC
ATGAGACAGAATAAGAAATAGGTAAAGTAAGCCTAGATTCATAGTGAGACAAAGAGACCA
CAATTATACCTCTGAGTGAGATCAACTAAGCTCTCCAAGTTCAAAAGAAACCTCTGAGTG
AAGCCATGTGATACTCTCCAAGTATAGGCCTGAATAGATCTCACACTTAGTTTGTTTTCC
ATGAAGAAGAAGAGCCATTTGCATACATCAACAGCATCCTACTTCATCTACTTATGCTCA
TTCCAAGCCATTTCCATTTGCATTCAAACTCAGCCTTTCTGTTGCACCCGACACTAAGTT
TGCGGAGGAGTATTGAAGCCCAAAGTAAAGCCCAAGTTTATTATCCATTTGAAGCTTTTG
TAGCCCATGTAACTAGGGTTTTAGATTCTTATATATATGCTGTAATGTGTTTTGATGAAG
GCAACGAAGGCTGCCATTGTTGCAGCCACTCTC
CC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RS1BA85JQ 707 0 0
G
TAGGTTTGGAACAGAAGCTATAATGAAATAGGCTGGTTTTTGGTTTGTTGCGTGTGGAGT
TCTCTGGCTTTAATGATAATGCACACAAGGTGCTCGCTGGAATGCTGACGAGAAAGTCAA
GTTGTTTAGAGAAGAGTTTTGGTGGTATATTGATAGGCACCAGAGAGTTAATAAGATGGT
TTAGTAAGTGTGGAAAGAGAGTTTTGCTTCTTCATGAGACAGAATAAGAAATAGGTAAAG
TAAGCCTAGATTCATAGTGAGACAAAGAGACCACAATTATACCTCTGAGTGAGATCAACT
AAGCTCTCCAAGCTCAAAAGAAACCTCTGAGTGAAGCCATGTGATACTCTCCAAGTATAG
GCCTGAATAGATCTCACACTTAGTTTGTTTTCCATGAAGAAGAAGAGCCATTTGCATACA
TCAACAGCATCCTACTTCATCTACTTATGCTCATTCCAAGCCATCTCCATTTGCATTCAA
ACTCAGCCTCTCTGTTGCACCCGACGCTAAGTTTGCGGAGGAGTATTGAAGCCCAAAGTA
AAGCCCAAGTTTATTATCCATTTGAAGCTTTTGTAGCCCATGTAACTAGGGTTTTAGATT
CTTATATATATGCTGTAATGTGTTTTGATGAAGGCAACGAAGGCTGCCATTGTTGCAGCC
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QA 2 707 2 707
DS 

RD RS1BA85TF 665 0 0
GGTTTGTTGCGTGTGGAGTTCTCTGGCTTTAATGATAATGCACACAAGGTGCTCGCTGGA
ATGCTGACGAGAAAGTCAAGTTGTTTAGAGAAGAGTTTTGGTGGTATATTGATAGGCACC
AGAGAGTTAATAAGATGGTTTAGTAAGTGTGGAAAGAGAGTTTTGCTTCTTCATGAGACA
GAATAAGAAATAGGTAAAGTAAGCCTAGATTCATAGTGAGACAAAGAGACCACAATTATA
CCTCTGAGTGAGATCAACTAAGCTCTCCAAGCTCAAAAGAAACCTCTGAGTGAAGCCATG
TGATACTCTCCAAGTATAGGCCTGAATAGATCTCACACTTAGTTTGTTTTCCATGAAGAA
GAAGAGCCATTTGCATACATCAACAGCATCCTACTTCATCTACTTATGCTCATTCCAAGC
CATCTCCATTTGCATTCAAACTCAGCCTCTCTGTTGCACCCGACGCTAAGTTTGCGGAGG
AGTATTGAAGCCCAAAGTAAAGCCCAAGTTTATTATCCATTTGAAGCTTTTGTAGCCCAT
GTAACTAGGGTTTTAGATTCTTATATATATGCTGTAATGTGTTTTGATGAGGGCAACGAA
AGCTGCCATTGTTGCAGCCACTCTCTCAAAACTTTTATGATATTAATAGGATCTTTGTGT
TATT
C

QA 1 664 1 664
DS 



CO CL88Contig3 658 2 2 U
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TTCCTATCTTTAGCCAGAAAAAAAAACATAGCTCCATCTGACTGTCTTCATTTGTCTGAA
GCTTGAAGACAACGACTTGAATGCGACTTTGAACATGCTGGATGATTTTGTGCTATTGTT
CTCACTTCACCACCGGTCTGCTCTCCTCCAGTTTCTCTTTCTATAAGATCAATACTTCAA
GCAAATCTGGACCGGAAAACAAGCAGATGGAAGAAAGGCACAACTTCGACGTTGAACTCT
TGTGATGGTTTGGTGGAGACTTGAGATGGTTTAAATAGAGTGTGCGGAAGCTACAAGATG
ATAGGATAACCCATGAAAATCGACTCAAGCTCTGATACCATGAGAACATTTATGAAACTA
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TGAGTGCAAGAAAATAAGGAGAAATGAAAGCTTTAGGCTTGTCTTCAAGAACACAAAGAT
TATATTAATATCATAAAAGTTTTGAGAGAATGGCTGCAACAATGGCAGCCTGGGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D080TF C 1
AF RS1D080JQ U 6
BS 1 5 RS1D080TF
BS 6 658 RS1D080JQ

RD RS1D080TF 658 0 0
TTTTTCCAACACACGACATTTTATTTTCATCCTTTGTTCTCTCTAAAGAGAAAGAAACAG
ACAATACCGTGGACTGAGTTATGAAGAAATCTTATTTCTTTGACTGATCTTCCAACAAAG
TTCCTATCTTTAGCCAGAAAAAAAAACATAGCTCCATCTGACTGTCTTCATTTGTCTGAA
GCTTGAAGACAACGACTTGAATGCGACTTTGAACATGCTGGATGATTTTGTGCTATTGTT
CTCACTTCACCACCGGTCTGCTCTCCTCCAGTTTCTCTTTCTATAAGATCAATACTTCAA
GCAAATCTGGACCGGAAAACAAGCAGATGGAAGAAAGGCACAACTTCGACGTTGAACTCT
TGTGATGGTTTGGTGGAGACTTGAGATGGTTTAGATAGAGTGTGCGGAAGCTACAAGATG
ATAGGATAACCCATGAAAATCGACTCAAGCTCTGATACCATGAGAACATTTATGAAACTA
GATAGATTTGTCTTGAAGATATTATTAAACTTGAAATGAAATAGCTTGTTAAAGCTTTAT
TGAGTGCAAGAAAATAAGGAGAAATGAAAGCTTTAGGCTTGTCTTCAAGAACACAAAGAT
TATATTAATATCATAAAAGTTTTGAGAGAATGGCTGCAACAATGGCAGCCT
GGGTTCC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1D080JQ 653 0 0
CCAACACACGACATTTTATTTTCATCCTTTGTTCTCTCTAAAGAGAAAGAAACAGACAAT
ACCGTGGACTGAGTTATGAAGAAATCTTATTTCTTTGACTGATCTTCCAACAAAGTTCCT
ATCTTTAGCCAGAAAAAAAAACATAGCTCCATCTGACTGTCTTCATTTGTCTGAAGCTTG
AAGACAACGACTTGAATGCGACTTTGAACATGCTGGATGATTTTGTGCTATTGTTCTCAC
TTCACCACCGGTCTGCTCTCCTCCAGTTTCTCTTTCTATAAGATCAATACTTCAAGCAAA
TCTGGACCGGAAAACAAGCAGATGGAAGAAAGGCACAACTTCGACGTTGAACTCTTGTGA
TGGTTTGGTGGAGACTTGAGATGGTTTAAATAGAGTGTGCGGAAGCTACAAGATGATAGG
ATAACCCATGAAAATCGACTCAAGCTCTGATACCATGAGAACATTTATGAAACTAGATAG
ATTTGTCTTGAAGATATTATTAAACTTGAAATGAAATAGCTTGTTAAAGCTTTATTGAGT
GCAAGAAAATAAGGAGAAATGAAAGCTTTAGGCTTGTCTTCAAGAACACAAAGATTATAT
TAATATCATAAAAGTTTTGAGAGAATGGCTGCAACAATGGCAGCCTGGGTTCC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 14

CO CL89Contig1 845 14 11 U
GGGAAACAAGAAGCACATAATATCTGCCGCAGTTAGTTCCCCCATGGCTTCTCTTGAGCT
CTGGAAGAAAATCGTTGCTCCGCTGTCTTCGAACGGTCGTATGTGGAAGATGGCTTGTAC
AACGGTGGCTGCGCCGTTTTCATCTGGCGTCGAGAGCTCAGCACCGGTCAAGGTTGAGAA
GGAGAGCTCTGGTCCGATAAAGCCAGAGAAACAGAAAGTGGAGAAGAGGAAGGTATTTCA
GAAGCTGAAGTCTCTTACGGTTGAGACAATAGATCTCATCATAAGGGAAGAAGGAAAGAA
GGGCGTTTTTGTAGATCAGGAGGATCTTGTCAGGTGGGCCAGACTTCTTAAGAACCGCAA
ACCTGAAAACGCCCTTGAGATCTTTAGGTGGATGGATAAAAAGAAGATGGTGTTTTCTCC
CTCTCAACTTGAGCTTTATGTGGATCTTCTTGGCAAGGTTAAAGGACATGCAGCAGCTTC
AGCGTACTTCAACAAAGTAGAGCCTAATTTCGATGAGATGGACGTTGATGCCAAAAACCG
CCCTGCCTACTTGAAGGTCTTGCATCGGTTCCACGTTGCAGGCCAGAGTCGGACTAAAGG
GCTAATACCATATGTTCTCAAGTACCCTAAATGTGATGATAATTGGAATCTTCTCGAGTG
AATTTGTTGTTTCAAGCTGTTTGG*TGTGTGTTTTAATGCCTTCTTGTAGTCACTCATCT
ATGTAATAATCTTTTGCTCTGTAAAACGAATCCTAAGTTAAATTGCATCTCTTCTGTTTA
TAGTCCTTATAAGTATTAAATTTTCATGGTAAAATCTCACTATCACAACAAATTTGTATC
CTTTT


BQ
10 35 45 45 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 65 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 50 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1GJ87TF U 33
AF RS1CV15TF U 1
AF RS1C659TF U 1
AF RS1A502TF U 2
AF RS1H617TF U -6
AF RS1C659JQ C 5
AF RS1G018TF U 1
AF RS1AM52TF U 213
AF RS1H617JQB C 266
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AF RS1DV69JQ C -5
AF RS1B501JQ C 5
AF RS1GJ87JQ C 256
AF RS1AO28TFB U 7
BS 1 151 RS1C659TF
BS 152 152 RS1CV15TF
BS 153 443 RS1C659TF
BS 444 444 RS1CV15TF
BS 445 647 RS1C659TF
BS 648 648 RS1A502TF
BS 649 681 RS1C659TF
BS 682 682 RS1A502TF
BS 683 767 RS1C659TF
BS 768 773 RS1G018TF
BS 774 845 RS1AO28TFB

RD RS1GJ87TF 545 0 0
GG
AGTTCCCCCATGGCTTCTCTTGAGCTCTGGAAGAAAATCGTTGCTCCGCTGTCTTCGAAC
GGTCGTATGTGGAAGATGGCTTGTACAACGGTGGCTGCGCCGTTTTCATCTGGCGTCGAG
AGCTCAGCACCGGTCAAGGTTGAGAAGGAGAGCTCTGGTCCGATAAAGCCAGAGAAACAG
AAAGTGGAGAAGAGGAGGGTATTTCAGAAGCTGAAGTCTCTTACGGTTGAGACAATAGAT
CTCATCATAAGGGAAGAAGGAAAGAAGGGCGTTTTTGTAGATCAAGAGGATCTTGTCAGG
TGGGCCAGACTTCTTAAGAACCGCAAACCTGAAAACGCCCTTGAGATCTTTAGGTGGATG
GATAAAAAGAAGATGGTGTTTTCTCCCTCTCAACTTGAGCTTTATGTGGATCTTCTTGGC
AAGGTTAAAGGACATGCAGCAGCTTCAGCGTACTTCAACAAAGTAGAGCCTAATTTCGAT
GAGATGGACGTTGATGCCAAAAACCGCCCTGCCTACTTGAAGGTCTTGCATCGGTTCCAC
GTT

QA 3 545 3 545
DS 

RD RS1CV15TF 676 0 0
G
GGAAACAAGAAGCACATAATATCTGCCGCAGTTAGTTCCCCCATGGCTTCTCTTGAGCTC
TGGAAGAAAATCGTTGCTCCGCTGTCTTCGAACGGTCGTATGTGGAAGATGGCTTGTACA
ACGGTGGCTGCGCCGTTTTCATCTGGCGTCGAGAGCTCAGCACCGGTCAAGGTTGAGAAG
GAGAGCTCTGGTCCGATAAAGCCAGAGAAACAGAAAGTGGAGAAGAGGAAGGTATTTCAG
AAGCTGAAGTCTCTTACGGTTGAGACAATAGATCTCATCATAAGGGAAGAAGGAAAGAAG
GGCGTTTTTGTAGATCAGGAGGATCTTGTCAGGTGGGCCAGACTTCTTAAGAACCGCAAA
CCTGAAAACGCCCTTGAGATCTTTAGGTGGATGGATAAAAAGAAGATGGTGTTTTCTCCC
TCTCAACTTGAGCTTTATGTGGATCTTCTTGGCAAGGTTAAAGGACATGCAGCAGCTTCA
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CCTGCCTACTTGAAGGTCTTGCATCGGTTCCACGTTGCAGGCCAGAGTCGGACTAAAGGG
CTAATACCATATGTTCTCAAGTACCCTAAATGTGATGATAATTGGA*TCTTCTCGAGTGA
ATTTGTTGTTTCA
GC

QA 2 674 2 674
DS 

RD RS1C659TF 770 0 0
GGGAAACAAGAAGCACATAATATCTGCCGCAGTTAGTTCCCCCATGGCTTCTCTTGAGCT
CTGGAAGAAAATCGTTGCTCCGCTGTCTTCGAACGGTCGTATGTGGAAGATGGCTTGTAC
AACGGTGGCTGCGCCGTTTTCATCTGGCGTCAAGAGCTCAGCACCGGTCAAGGTTGAGAA
GGAGAGCTCTGGTCCGATAAAGCCAGAGAAACAGAAAGTGGAGAAGAGGAAGGTATTTCA
GAAGCTGAAGTCTCTTACGGTTGAGACAATAGATCTCATCATAAGGGAAGAAGGAAAGAA
GGGCGTTTTTGTAGATCAGGAGGATCTTGTCAGGTGGGCCAGACTTCTTAAGAACCGCAA
ACCTGAAAACGCCCTTGAGATCTTTAGGTGGATGGATAAAAAGAAGATGGTGTTTTCTCC
CTCTCAACTTGAGCTTTATGTGGGTCTTCTTGGCAAGGTTAAAGGACATGCAGCAGCTTC
AGCGTACTTCAACAAAGTAGAGCCTAATTTCGATGAGATGGACGTTGATGCCAAAAACCG
CCCTGCCTACTTGAAGGTCTTGCATCGGTTCCACGTTGCAGGCCAGAGTCGGACTAAAGG
GCTAATACCATATGTTCTCAAGTACCCTAAATGTGATGATAATTGGA*TCTTCTCGAGTG
AATTTGTTGTTTCAAGCTGTTCGG*TGTGTGTTTTAATGCCTTCTTGTAGTCACTCATCT
ATGTAATAATCTTTTGCTCTGTAAAACGAATCCTAAGTTAAATTGCA
AAA

QA 1 767 1 767
DS 

RD RS1A502TF 754 0 0
GGAAACAAGAAGCACATAATATCTGCCGCAGTTAGTTCCCCCATGGCTTCTCTTGAGCTC
TGGAAGAAAATCGTTGCTCCGCTGTCTTCGAACGGTCGTATGTGGAAGATGGCTTGTACA
ACGGTGGCTGCGCCGTTTTCATCTGGCGTCGAGAGCTCAGCACCGGTCAAGGTTGAGAAG
GAGAGCTCTGGTCCGATAAAGCCAGAGAAACAGAAAGTGGAGAAGAGGAAGGTATTTCAG
AAGCTGAAGTCTCTTACGGTTGAGACAATAGATCTCATCATAAGGGAAGAAGGAAAGAAG
GGCGTTTTTGTAGATCAGGAGGATCTTGTCAGGTGGGCCAGACTTCTTAAGAACCGCAAA
CCTGAAAACGCCCTTGAGATCTTTAGGTGGATGGATAAAAAGAAGATGGTGTTTTCTCCC
TCTCAACTTGAGCTTTATGTGGATCTTCTTGGCAAGGTTAAAGGACATGCAGCAGCTTCA
GCGTACTTCAACAAAGTAGAGCCTAATTTCGATGAGATGGACGTTGATGCCAAAAACCGC
CCTGCCTACTTGAAGGTCTTGCATCGGTTCCACGTTGCAGGCCAGAGTCGGACTAAAGGG
CTAATACCATATGTTCTCAAGTACCCTAAATGTGATGATAATTGGAATCTTCTCGAGTGA
ATTTGTTGTTTCAAGCTGTTTGG*TGTGTGTTTTAATGCCTTCTTGTAGTCACTCATCTA
TGTAATAATCTTTTGCTCTGTAAAACGAATCCTA

QA 1 754 1 754
DS 

RD RS1H617TF 751 0 0
GGAGGGTTT
GAAACAAGAAGCACATAATATCTGCCGCAGTTAGTTCCCCCATGGCTTCTCTCGAGCTCT
GGAAGAAAATCGTTGCTCCGCTGTCTTCGAACGGTCGTATGTGGAAGATGGCTTGTACAA
CGGTGGCTGCGCCGTTTTCATCTGGTGTCGAGAGCTCAGCACCGGTCAAGGTTGAGAAGG
ATAGCTCTGGTCCGATAAAGCCAGAGAAACAGAAAGTGGAGAAGAGGAAGGTATTTCAGA
AGCTGAAGTCTCTTACGGTTGAGACAATAGATCTCATCATAAGGGAAGAAGGAAAGAAGG
GCGTTTTTGTAGATCAGGAGGATCTTGTCAGGTGGGCCAGACTTCTTAAGAACCGCAAAC
CTGAAAACGCCCTTGAGATCTTTAGGTGGATGGATAAAAAGAAGATGGTGTTTTCTCCCT
CTCAACTTGAGTTTTATGTGGATCTTCTTGGCAAGGTTAAAGGACATGCAGCAGCTTCAG
CGTACTTCAACAAAGTAGAGCCTAATTTCGATGAGATGGACGTTGATGCCAAAAACCGCC
CTGCCTACTTGAAGGTCTTGCATCGGTTCCACGTTGCAGGCCAGAGTCGGACTAAAGGGC
TAATACCATATGTTCTCAAGTACCCTAAATGTGATGATAATTGGAATCTTCTCGAGTGAA
TTTGTTGTTTCAAGCTGTTTGGGTGTGTGTTTTAATCCCTTCTTGTAGTCACTCATCTAT
GTAATAATCTTTTGCTCTGTAA

QA 10 751 10 751
DS 

RD RS1C659JQ 762 0 0
AACAAGAAGCACATAATATCTGCCGCAGTTAGTTCCCCCATGGCTTCTCTTGAGCTCTGG
AAGAAAATCGTTGCTCCGCTGTCTTCGAACGGTCGTATGTGGAAGATGGCTTGTACAACG
GTGGCTGCGCCGTTTTCATCTGGCGTCAAGAGCTCAGCACCGGTCAAGGTTGAGAAGGAG
AGCTCTGGTCCGATAAAGCCAGAGAAACAGAAAGTGGAGAAGAGGAAGGTATTTCAGAAG
CTGAAGTCTCTTACGGTTGAGACAATAGATCTCATCATAAGGGAAGAAGGAAAGAAGGGC
GTTTTTGTAGATCAGGAGGATCTTGTCAGGTGGGCCAGACTTCTTAAGAACCGCAAACCT
GAAAACGCCCTTGAGATCTTTAGGTGGATGGATAAAAAGAAGATGGTGTTTTCTCCCTCT
CAACTTGAGCTTTATGTGGGTCTTCTTGGCAAGGTTAAAGGACATGCAGCAGCTTCAGCG
TACTTCAACAAAGTAGAGCCTAATTTCGATGAGATGGACGTTGATGCCAAAAACCGCCCT
GCCTACTTGAAGGTCTTGCATCGGTTCCACGTTGCAGGCCAGAGTCGGACTAAAGGGCTA
ATACCATATGTTCTCAAGTACCCTAAATGTGATGATAATTGGAATCTTCTCGAGTGAATT
TGTTGTTTCAAGCTGTTCGG*TGTGTGTTTTAATGCCTTCTTGTAGTCACTCATCTATGT
AATAATCTTTTGCTCTGTAAAACGAATCCTAAGTTAAATTGC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1G018TF 773 0 0
G
GGAAACAAGAAGCACATAATATCTGCCGCAGTTAGTTCCCCCATGGCTTCTCTTGAGCTC
TGGAAGAAAATCGTTGCTCCGCTGTCTTCGAACGGTCGTATGTGGAAGATGGCTTGTACA
ACGGTGGCCGCGCCGTTTTCATCTGGCGTCGAGAGCTCAGCACCGGTCAAGGTTGAGAAG
GAGAGCTCTGGTCCGATAAAGCCAGAGAAACAGAAAGTGGAGAAGAGGAAGGTATTTCAG
AAGCTGAAGTCTCTTACGGTTGAGACAATAGATCTCATCATAAGGGAAGAAGGAAAGAAG
GGCGTTTTTGTAGATCAGGAGGATCTTGTCAGGTGGGCCAGACTTCTTAAGAACCGCAAA
CCTGAAAACGCCCTTGAGATCTTTAGGTGGATGGATAAAAAGAAGATGGTGTTTTCTCCC
ACTCAACTTGAGCTTGATGTGGATCTTCTTGGCGAGGTTAAAGGACATGCAGCAGCTTCA
GCGTACTTCAACAAAGTAGAGCCTAATTTCGATGAGATGGACGTTGATGCCAAAAACCGC
CCTGCCTACTTGAAGGTCTTGCATCGGTTCCACGTTGCAGGCCAGAGTCGGACTAAAGGG
CTAATACCATATGTTCTCAAGCACCCTAAATGTGATGATAATTGGAATCTTCTCGAGTGA
ATTTGTTGTTTCAAGCTGTTTGG*TGTGTGTTTTAATGCCTTCTTGTAGTCACTCATCTA
TGTAATAATCTTTTGCTCTGTAAA*CGAATCCTAAGTTAAATTGCATCTCTT

QA 2 773 2 773
DS 

RD RS1AM52TF 552 0 0
G
GAAAGTGGAGAAGAGGAAGGTATTTCAGAAGCTGAAGTCTCTTACGGTTGAGACAATAGA
TCTCATCATAAGGGAAGAAGGAAAGAAGGGCGTTTTTGTAGATCAGGAGGATCTTGTCAG
GTGGGCCAGACTTCTTAAGAACCGCAAACCTGAAAACGCCCTTGAGATCTTTAGGTGGAT
GGATAAAAAGAAGATGGTGTTTTCTCCCTCTCAACTTGAGCTTTATGTGGATCTTCTTGG
CAAGGTTAAAGGACATGCAGCAGCTTCAGCGTACTTCAACAAAGTTGAGCCTAATTTCGA
TGAGATGGACGTTGATGCCAAAAACCGCCCTGCCTACTTGAAGGTCTTGCATCGGTTCCA
CGTTGCAGGCCAGAGTCGGACTAAAGGGCTAATACCATATGTTCTCGAGTACCCTAAATG
TGATGATAATTGGAATCTTCTCGAGTGAATTTGTTGTTTCAAGCTGTTTGG*TGTGTGTT
TTAATGCCTTCTTGTAGTCACTCATCTATGTAATAATCTTTTGCTCTGTAAAACGAATCC
TAAGTTAAATT

QA 2 552 2 552
DS 

RD RS1H617JQB 514 0 0
ACAATAGATCTCATCATAAGGGAAGAAGGAAAGAAGGGCGTTTTTGTAGATCAGGAGGAT
CTTGTCAGGTGGGCCAGACTTCTTAAGAACCGCAAACCTGAAAACGCCCTTGAGATCTTT
AGGTGGATGGATAAAAAGAAGATGGTGTTTTCTCCCTCTCAACTTGAGTTTTATGTGGAT
CTTCTTGGCAAGGTTAAAGGACATGCAGCAGCTTCAGCGTACTTCAACAAAGTAGAGCCT
AATTTCGATGAGATGGACGTTGATGCCAAAAACCGCCCTGCCTACTTGAAGGTCTTGCAT
CGGTTCCACGTTGCAGGCCAGAGTCGGACTAAAGGGCTAATACCATATGTTCTCAAGTAC
CCTAAATGTGATGATAATTGGAATCTTCTCGAGTGAATTTGTTGTTTCAAGCTGTTTGG*
TGTGTGTTTTAATCCCTTCTTGTAGTCACTCATCTATGTAATAATCTTTTGCTCTGTAAA
ACGAATCCTAAGTTAAATTGCATCTCTTCTGT
CT

QA 1 512 1 512
DS 

RD RS1CV15JQ 784 0 0
GGAAACAAGAAGCACATAATATCTGCCGCAGTTAGTTCCCCCATGGCTTCTCTTGAGCTC
TGGAAGAAAATCGTTGCTCCGCTGTCTTCGAACGGTCGTATGTGGAAGATGGCTTGTACA
ACGGTGGCTGCGCCGTTTTCATCTGGCGTCGAGAGCTCAGCACCGGTCAAGGTTGAGAAG
GAGAGCTCTGGTCCGATAAAGCCAGAGAAACAGAAAGTGGAGAAGAGGAAGGTATTTCAG
AAGCTGAAGTCTCTTACGGTTGAGACAATAGATCTCATCATAAGGGAAGAAGGAAAGAAG
GGCGTTTTTGTAGATCAGGAGGATCTTGTCAGGTGGGCCAGACTTCTTAAGAACCGCAAA
CCTGAAAACGCCCTTGAGATCTTTAGGTGGATGGATAAAAAGAAGATGGTGTTTTCTCCC
TCTCAACTTGAGCTTTATGTGGATCTTCTTGGCAAGGTTAAAGGACATGCAGCAGCTTCA
GCGTACTTCAACAAAGTAGAGCCTAATTTCGATGAGATGGACGTTGATGCCAAAAACCGC
CCTGCCTACTTGAAGGTCTTGCATCGGTTCCACGTTGCAGGCCAGAGTCGGACTAAAGGG
CTAATACCATATGTTCTCAAGTACCCTAAATGTGATGATAATTGGAATCTTCTCGAGTGA
ATTTGTTGTTTCAAGCTGTTTGG*TGTGTGTTTTAATGCCTTCTTGTAGTCACTCATCTA
TGTAATAATCTTTTGCTCTGTAAAACGAATCCTAAGTTAAATTGCATCTCTTCTGTTTAT
AGTC

QA 1 784 1 784
DS 

RD RS1DV69JQ 793 0 0
GAGGGTTT
GAAACAAGAAGCACATAATATCTGCCGCAGTTAGTTCCCCCATGGCTTCTCTTGAGCTCT
GGAAGAAAATCGTTGCTCCGCTGTCTTCGAACGGTCGTATGTGGAAGATGGCTTGTACAA
CGGTGGCTGCGCCGTTTTCATCTGGCGTCGAGAGCTCAGCACCGGTCAAGGTTGAGAAGG
AGAGCTCTGGTCCTATAAAGCCAGAGAAACAGAAAGTGGAGAAGGGGAAGGTATTTCAGA
AGCTGAAGTCTCTTACGGTTGAGACAATAGATCTCATCATAAGGGAAGAAGGAAAGAAGG
GCGTTTTTGTAGATCAGGAGGATCTTGTCAGGTGGGCCAGACTTCTTAAGAACCGCAAAC
CTGAAAACGCCCTTGAGATCTTTAGGTGGATGGATAAAAAGAAGATGGTGTTTTCTCCCT
CTCAACTTGAGCTTTATGTGGATCTTCTTGGCAGGGTTAAAGGACATGCAGCAGCTTCAG
CGTACTTCAACAAAGTATAGCCTAATTTCGATGAGATGGACGTTGATGGCAAAAACCGCC
CTGCCTACTTGAAGGTCTTGCATCGGTTCCACGTTGCAGGCCAGAGTCGGACTAAAGGGC
TAATACCATATGTTCTCAAGTACCCTAAATGTGATGATAATTGGAATCTTCTCGAGTGAA
TTTGTTGTTTCAAGCTGTTTGG*TGTGTGTTTTAATGCCTTCTTGTAGTCACTCATCTAT
GTAATAATCTTTTGCTCTGTAAAACGAATCCTAAGTTAAATTGCATCTCTTCTGTTTATA
GTC
CC

QA 9 791 9 791
DS 

RD RS1B501JQ 781 0 0
AACAAGAAGCACATAATATCTGCCGCAGTTAGTTCCCCCATGGCTTCTCTTGAGCTCTGG
AAGAAAATCGTTGCTCCGCTGTCTTCGAACGGTCGTATGTGGAAGATGGCTTGTACAACG
GTGGCTGCGCCGTTTTCATCTGGCGTCGAGAGCTCAGCACCGGTCAAGGTTGAGAAGGAG
AGCTCTGGTCCGATAAAGCCAGAGAAACAGAAAGTGGAGAAGAGGAAGGTATTTCAGAAG
CTGAAGTCTCTTACGGTTGAGACAATAGATCTCATCATAAGGGAAGAAGGAAAGAAGGGC
GTTTTTGTAGATCAGGAGGATCTTGTCAGGTGGGCCAGACTTCTTAAGAACCGCAAACCT
GAAAACGCCCTTGAGATCTTTAGGTGGATGGATAAAAAGAAGATGGTGTTTTCTCCCTCT
CAACTTGAGCTTTATGTGGATCTTCTTGGCAAGGTTAAAGGACATGCAGCAGCTTCAGCG
TACTTCAACAAAGTAGAGCCTAATTTCGATGAGATGGACGTTGATGCCAAAAACCGCCCT
GCCTACTTGAAGGTCTTGCATCGGTTCCACGTTGCAGGCCAGAGTCGGACTAAAGGGCTA
ATACCATATGTTCTCAAGTACCCTAAATGTGATGATAATTGGAATCTTCTCGAGTGAATT
TGTTGTTTCAAGCTGTTTGG*TGTGTGTTTTAATGCCTTCTTGTAGTCACTCATCTATGT
AATAATCTTTTGCTCTGTAAAACGAATCCTAAGTTAAATTGCATCTCTTCTGTTTATAGT
C

QA 1 781 1 781
DS 

RD RS1GJ87JQ 556 0 0
TACGGTTGAGACAATAGATCTCATCATAAGGGAAGAAGGAAAGAAGGGCGTTTTTGTAGA
TCAAGAGGATCTTGTCAGGTGGGCCAGACTTCTTAAGAACCGCAAACCTGAAAACGCCCT
TGAGATCTTTAGGTGGATGGATAAAAAGAAGATGGTGTTTTCTCCCTCTCAACTTGAGCT
TTATGTGGATCTTCTTGGCAAGGTTAAAGGACATGCAGCAGCTTCAGCGTACTTCAACAA
AGTAGAGCCTAATTTCGATGAGATGGACGTTGATGCCAAAAACCGCCCTGCCTACTTGAA
GGTCTTGCATCGGTTCCACGTTGCAGGCCAGAGTCGGACTAAAGGGCTAATACCATATGT
TCTCAAGTACCCTAAATGTGATGATAATTGGAATCTTCTCGAGTGAATTTGTTGTTTCAA
GCTGTTTGG*TGTGTGTTTTAATGCCTTCTTGTAGTCACTCATCTATGTAATAATCTTTT
GCTCTGTAAAACGAATCCTAAGTTAAATTGCATCTCTTCTGTTTATAGTCCTTATAAGTA
TTAAATTTTCATGGT
T

QA 1 555 1 555
DS 

RD RS1AO28TFB 839 0 0
G
AAGAAGCACATAATATCTGCCGCAGTTAGTTCCCCCATGGCTTCTCTTGAGCTCTGGAAG
AAAATCGTTGCTCCGCTGTCTTCGAACGGTCGTATGTGGAAGATGGCTTGTACAACGGTG
GCTGCGCCGTTTTCATCTGGCGTCGAGAGCTCAGCACCGGTCAAGGTTGAGAAGGAGAGC
TCTGGTCCGATAAAGCCAGAGAAACAGAAAGTGGAGAAGAGGAAGGTATTTCAGAAGCTG
AAGTCTCTTACGGTTGAGACAATAGATCTCATCATAAGGGAAGAAGGAAAGAAGGGCGTT
TTTGTAGATCAGGAGGATCTTGTCAGGTGGGCCAGACTTCTTAAGAACCGCAAACCTGAA
AACGCCCTTGAGATCTTTAGGTGGATGGATAAAAAGAAGATGGTGTTTTCTCCCTCTCAA
CTTGAGCTTTATGTGGATCTTCTTGGCAAGGTTAAAGGACATGCAGCAGCTTCAGCGTAC
TTCAACAAAGTAGAGCCTAATTTCGATGAGATGGACGTTGATGCCAAAAACCGCCCTGCC
TACTTGAAGGTCTTGCATCGGTTCCACGTTGCAGGCCAGAGTCGGACTAAAGGGCTAATA
CCATATGTTCTCAAGTACCCTAAATGTGATGATAATTGGAATCTTCTCGAGTGAATTTGT
TGTTTCAAGCTGTTTGG*TGTGTGTTTTAATGCCTTCTTGTAGTCACTCATCTATGTAAT
AATCTTTTGCTCTGTAAAACGAATCCTAAGTTAAATTGCATCTCTTCTGTTTATAGTCCT
TATAAGTATTAAATTTTCATGGTAAAATCTCACTATCACAACAAATTTGTATCCTTTT

QA 2 839 2 839
DS 



AS 2 15

CO CL90Contig1 886 4 4 U
GGACCACACACTACCTCTATTGTTCACTTTGAACATAAATCAAGAACATATCATTTCTTT
GTGAGCTTTAGTGATCTAAACCAATGGCGAACTCGACGATTCTTCTTGATTACTGGCCAA
GCATGTTCTGTATGAGGGCTAGAGTCGCGTTGAGGGAGAAAGGTGTTGTGTTCGAGGCCA
GAGAAGAGGATCTCACGAACAAGAGCCCTTTGCTCCTCCAAAGTAATCCGATTCACAAGA
AGGTCCCGGTTCTGATCCACAACGGTAAACCAGTATGCGAGTCCCTCAATGTTGTCCAGT
ACGTGGACGAGGCTTGGTCTGACAAGAACCCATTCTTCCCTTCTGATCCTTACGGGAAAG
CTCAGGCTAGGTTTTGGGCTGATTTCGTGGACAAGAAGTTTAGTGATGCCCAATTCAAGA
TATGGGGAAAGAAAGGTGAGGAACAAGCAGCAGGGGTGAAGCTGAGCTTGGAGACAAATC
TTACTTTGGTGGAGATACCTTTGGCTATGTTGACATTGCACTGATTACATTCTACAGTTG
GTTCGGAGCATATGAGAAGTTTGGTAACTTCAGCATCGAGGCAGAGAGTCCAAAACTGAT
TGCTTGGGCTAAGAGGTGTATGCAGAAAGAGAGCGTGTCTAAGTCTCTCCCTGACCAAGA
GAAAATTGTTGCGTACGCCGCTGAGTTTAGGAAGAATAATCTCTGATACTGAATAAAACC
TTGTGTTGTGTCTTCTGTTTCTGATGATGCTGTGCTCTGCTTTCGTTCTCTTTTAGCTTT
GGTTTTCGTGTGTTTCCTAATAATACGTGAGGGCAAGCGTCAGTGTTTGTGTGGTGGTTT
GTATTGGATCCTAAGTAGTGCATTTTAAAATAAAGTTTGTTTCCGC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1BQ18TF U 1
AF RS1AF50TF U 1
AF RS1AF50JQ C 250
AF RS1BQ18JQ C 341
BS 1 690 RS1AF50TF
BS 691 691 RS1AF50JQ
BS 692 773 RS1AF50TF
BS 774 886 RS1AF50JQ

RD RS1BQ18TF 693 0 0
GG
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GAAGAGGATCTCACGAACAAGAGCCCTTTGCTCCTCCAAAGTAATCCGATTCACAAGAAG
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GTGGACGAGGCTTGGTCTGACAAGAACCCATTCTTCCCTTCTGATCCTTACGGGAAAGCT
CAGGCTAGGTTTTGGGCTGATTTCGTGGACAAGAAGTTTAGTGATGCCCAATTCAAGATA
TGGGGAAAGAAAGGTGAGGAACAAGCAGCAGGGGTGAAGCTGAGCTTGGAGACAAATCTT
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CTTGGGCTAAGAGGTGTATGCAGAAAGAGAGCGTGTCTAAGTCTCTCCCTGAC*AAGAGA
AA*TTGTTGCGTACGCCGCTGAGTTTAG*A
A

QA 3 692 3 692
DS 

RD RS1AF50TF 776 0 0
GGACCACACACTACCTCTATTGTTCACTTTGAACATAAATCAAGAACATATCATTTCTTT
GTGAGCTTTAGTGATCTAAACCAATGGCGAACTCGACGATTCTTCTTGATTACTGGCCAA
GCATGTTCTGTATGAGGGCTAGAGTCGCGTTGAGGGAGAAAGGTGTTGTGTTCGAGGCCA
GAGAAGAGGATCTCACGAACAAGAGCCCTTTGCTCCTCCAAAGTAATCCGATTCACAAGA
AGGTCCCGGTTCTGATCCACAACGGTAAACCAGTATGCGAGTCCCTCAATGTTGTCCAGT
ACGTGGACGAGGCTTGGTCTGACAAGAACCCATTCTTCCCTTCTGATCCTTACGGGAAAG
CTCAGGCTAGGTTTTGGGCTGATTTCGTGGACAAGAAGTTTAGTGATGCCCAATTCAAGA
TATGGGGAAAGAAAGGTGAGGAACAAGCAGCAGGGGTGAAGCTGAGCTTGGAGACAAATC
TTACTTTGGTGGAGATACCTTTGGCTATGTTGACATTGCACTGATTACATTCTACAGTTG
GTTCGGAGCATATGAGAAGTTTGGTAACTTCAGCATCGAGGCAGAGAGTCCAAAACTGAT
TGCTTGGGCTAAGAGGTGTATGCAGAAAGAGAGCGTGTCTAAGTCTCTCCCTGACCAAGA
GAAAATTGTTGCGTACGCCGCTGAGTTTAG*AAGAATAATCTCTGATACTGAATAAAACC
TTGTGTTGTGTCTTCTGTTTCTGATGATGCTGTGCTCTGCTTTCGTTCTCTTT
AGC

QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1AF50JQ 637 0 0
TTCTGATCCACAACGGTAAACCAGTATGCGAGTCCCTCAATGTTGTCCAGTACGTGGACG
AGGCTTGGTCTGACAAGAACCCATTCTTCCCTTCTGATCCTTACGGGAAAGCTCAGGCTA
GGTTTTGGGCTGATTTCGTGGACAAGAAGTTTAGTGATGCCCAATTCAAGATATGGGGAA
AGAAAGGTGAGGAACAAGCAGCAGGGGTGAAGCTGAGCTTGGAGACAAATCTTACTTTGG
TGGAGATACCTTTGGCTATGTTGACATTGCACTGATTACATTCTACAGTTGGTTCGGAGC
ATATGAGAAGTTTGGTAACTTCAGCATCGAGGCAGAGAGTCCAAAACTGATTGCTTGGGC
TAAGAGGTGTATGCAGAAAGAGAGCGTGTTTAAGTCTCTCCCTGACCAAGAGAAAATTGT
TGCGTACGCCGCTGAGTTTAGGAAGAATAATCTCTGATACTGAATAAAACCTTGTGTTGT
GTCTTCTGTTTCTGATGATGCTGTGCTCTGCTTTCGTTCTCTTTTAGCTTTGGTTTTCGT
GTGTTTCCTAATAATACGTGAGGGCAAGCGTCAGTGTTTGTGTGGTGGTTTGTATTGGAT
CCTAAGTAGTGCATTTTAAAATAAAGTTTGTTTCCGC

QA 1 637 1 637
DS 

RD RS1BQ18JQ 546 0 0
TTT
TGATCCTTACGGGAAAGCTCAGGCTAGGTTTTGGGCTGATTTCGTGGACAAGAAGTTTAG
TGATGCCCAATTCAAGATATGGGGAAAGAAAGGTGAGGAACAAGCAGCAGGGGTGAAGCT
GAGCTTGGAGACAAATCTTACTTTGGTGGAGATACCTTTGGCTATGTTGACATTGCACTG
ATTACATTCTACAGTTGGTTCGGAGCATATGAGAAGTTTGGTAACTTCAGCATCGAGGCA
GAGAGTCCAAAACTGATTGCTTGGGCTAAGAGGTGTATGCAGAAAGAGAGCGTGTTTAAG
TCTCTCCCTGACCAAGAGAAAATTGTTGCGTACGCCGCTGAGTTTAGGAAGAATAATCTC
TGATACTGAATAAAACCTTGTGTTGTGTCTTCTGTTTCTGATGATGCTGTGCTCTGCTTT
CGTTCTCTTTTAGCTTTGGTTTTCGTGTGTTTCCTAATAATACGTGAGGGCAAGCGTCAG
TGTTTGTGTGGTGGTTTGTATTGGATCCTAAGTAGTGCATTTTAAAATAAAGTTTGTTTC
C
GC

QA 4 544 4 544
DS 



CO CL90Contig2 919 11 18 U
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TGTGAGCTTTAGTGATCTAAACCAATGGCGAACTCGACGATTCTTCTTGATTACTGGCCA
AGCATGTTCTGTATGAGGGCTAGAGTCGCGTTGAGGGAGAAAGGTGTTGTGTTCGAGGCC
AGAGAAGAGGATCTCACGAACAAGAGCCCTTTGCTCCTCCAAAGTAATCCGATTCATAAG
AAGGTCCCGGTTCTGATCCACAACGGTAAACCGGTATGCGAGTCCCTCAATGTTGTCCAG
TACGTGGACGAGGCTTGGTCTGACAAGAACCCATTCTTCCCTTCTGATCCATACGGGAAA
GCTCAGGCTAGGTTTTGGGCTGATTTCGTGGACAAGAAGTTTAGTGATGCCCAATTCAAG
ATATGGGGAAAGAAAGGTGAGGAACAAGCAGCAGGGGTGAAGGAGTTTATTGAGGCAGTG
AAGATTCTTGAAGCTGAGCTTGGAGACAAACCTTACTTTGGTGGAGATACCTTTGGCTAT
GTAGACATTTCACTGATTACATTCTACAGTTGGTTCGGAGCATATGAGAAGTTTGGTAAC
TTCAGCATCGAGGCAGAGAGTCCAAAACTGATTGCTTGGGCTAAGAGGTGTATGCAGAAA
GAGAGCGTGTCTAAGTCTCTCCCTGACCAAGAGAAAATTGTTGCGTACGCCGCTGAGTTT
AGGAAGAATAATCTCTGATACTGAATAAAACCTTGTGTTGTGTCTTCTGTTTCTGATGAT
GCTGTGCTCTGCTTTCGTTCTCTTTTAGCTCTGGTTTTTGTGTGTTTCCTAATAATACGT
GAGGGCAAGCGTCAGTGTTTGTG*TGGTGGTTTGTATTGGATCCTAAGTAGTGCATTTTA
AAATAAAGTTTGTTTCCAC


BQ
10 10 10 15 15 15 30 30 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 20 20 25 25 25 25 25 25 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 45 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 
45 45 25 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RS1CN54TF U 5
AF RS1FB09TF U 5
AF RS1H688TF U 1
AF RS1FP28TF U 1
AF RS1E076TF U 1
AF RS1FP83TF U 7
AF RS1AH50JQ C 33
AF RS1CN54JQ C 324
AF RS1E076JQ C 94
AF RS1FP83JQ C 104
AF RS1AH50TF U 30
BS 1 647 RS1E076TF
BS 648 648 RS1FB09TF
BS 649 687 RS1E076TF
BS 688 688 RS1FB09TF
BS 689 722 RS1E076TF
BS 723 724 RS1FP83TF
BS 725 725 RS1AH50TF
BS 726 758 RS1FP83TF
BS 759 759 RS1AH50TF
BS 760 766 RS1FP83TF
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BS 768 795 RS1FP83TF
BS 796 841 RS1AH50TF
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RD RS1CN54TF 454 0 0
GG
ACACACTGCCTCTATTGTTCACT************CAAGAACATATCATTTCTTTGTGAG
CTTTAGTGATCTAAACCAATGGCGAACTCGACGATTCTTCTTGATTACTGGCCAAGCATG
TTCTGTATGAGGGCTAGAGTCGCGTTGAGGGAGAAAGGTGTGGAGTTCGAGGCTAGAGAA
GAGGATCTCACGAACAAGAGCCCTTTGCTCCTCCAAAGTAATCCGATTCACAAGAAGGTC
CCGGTTCTGATCCACAACGGTAAACCGGTATGCGAGTCCCTCAATGTTGTCCAGTACGTG
GACGAGGCTTGGTCTGACAAGAACCCATTCTTCCCTTCTGATCCTTACGGGAAAGCTCAG
GCTAGGTTTTGGGCTGATTTCGTGGACAAGAAGTTTAGTGATGCCCAATTCAAGATATGG
GGAAAGAAAGGTGAGGAACAAGCAGCAGGGGT

QA 3 454 3 454
DS 

RD RS1FB09TF 714 0 0
GG
ACACACTACCTCTATTGTTCACTTTGAACATAAATCAAGAACATATCATTTCTTTGTGAG
CTTTAGTGATCTAAACCAATGGCGAACTCGACGATTCTTCTTGATTACTGGCCAAGCATG
TTCTGTATGAGGGCTAGAGTCGCGTTGAGGGAGAAAGGTGTTGTGTTCGAGGCCAGAGAA
GAGGATCTCACGAACAAGAGCCCTTTGCTCCTCCAAAGTAATCCGATTCATAAGAAGGTC
CCGGTTCTGATCCACAA*GGTAAACCGGTATGCGAGTCCCTCAATGTTGTCCAGTACGTG
GACGAGGCTTGGTCTGACAAGAACCCATTCTTCCCTTCTGATCCATACGGGAAAGCTCAG
GCTAGGTTTTGGGCTGATTTCGTGGACAAGAAGTTTAGTGATGCCCAATTCAAGATATGG
GGAAAGAAAGGTGAGGAACAAGCAGCAGGGGTGAAGGAGTTTATTGAGGCAGTGAAGATT
CTTGAAGCTGAGCTTGGAGACAAACCTTACTTTGGTGGAGATACCTTTGGCTATGTAGAC
ATTTCACTGATTACATTCTACAGTTGGTTCGGAGCATATGAGAAGTTTGGTAACTTCAGC
ATCGAGGCAGAGAGTCCAAAACTGATTGCTTGGGCTAAGAGGTGTGTGCAGAAAGAGAGC
GTGTCTAAGTCTCTCCCTGACCAAGAGAAA*TTGTTGCGTACGCCGCTGAGT

QA 3 714 3 714
DS 

RD RS1H688TF 718 0 0
GGA
ACCACACACTACCTCTATTGTTCACTTTGAACATAAATCAAGAACATATCATTTCTTTGT
GAGCTTTAGTGATCTAAACCAATGGCGAACTCGACGATTCTTCTTGATTACTGGCCAAGC
ATGTTCTGTATGAGGGCTAGAGTCGCGTTGAGGGAGAAAGGTGTTGTGTTCGAGGCCAGA
GAAGAGGATCTCACGAACAAGAGCCCTTTGCTCCTCCAAAGTAATCCGATTCATAAGAAG
GTCCCGGTTCTGATCCACAACGGTAAACCGGTATGCGAGTCCCTCAATGTTGTCCAGTAC
GTGGACGAGGCTTGGTCTGACAAGAACCCATTCTTCCCTTCTGATCCATACGGGAAAGCT
CAGGCTAGGTTTTGGGCTGATTTCGTGGACAAGAAGTTTAGTGATGCCCAATTCAAGATA
TGGGGAAAGAAAGGTGAGGAACAAGCAGCAGGG*TGAAGGAGTTTATTGAGGCAGTGAAG
ATTCTTGAAGCTGAGCTTGGAGACAAACCTTACTTTGGTGGAGATACCTTTGGCTATGTA
GACATTTCACTGATTACATTCTACAGTTGGTTCGGAGCATATGAGAAGTTTGGTAACTTC
AGCATCGAGGCAGAGAGTCCAAAACTGATTGCTTGGGCTAAGAGGTGTATGCAGAAAGAG
AGCGTGTCTAAGTCTCTCCCTGAC*AAGAGAAAATTGTTGCGTACGCCGCTGAGT

QA 4 718 4 718
DS 

RD RS1FP28TF 718 0 0
GGAACC
ACACACTGCCTCTATTGTTCACT************CAAGAACATATCATTTCTTTGTGAG
CTTTAGTGATCTAAACCAATGGCGAACTCGACGATTCTTCTTGATTACTGGCCAAGCATG
TTCTGTATGAGGGCTAGAGTCGCGTTGAGGGAGAAAGGTGTGGAGTTCGAGGCCAGAGAA
GAGGATCTCACGAACAAGAGCCCTTTGCTCCTCCAAAGTAATCCGATTCACAAGAAGGTC
CCGGTTCTGATCCACAACGGTAAACCGGTATGCGAGTCCCTCAATGTTGTCCAGTACGTG
GACGAGACTTGGTCTGACAAGAACCCATTCTTCCCTTCTGATCCTTACGGGAAAGCTCAG
GCTAGGTTTTGGGCTGATTTCGTGGACAAGAAGTTTAGTGATGCCCAATTCAAGATATGG
GGAAAGAAAGGTGAGGAACAAGCAGCAGGGGTGAAGGAGTTTATTGAGGCAGTGAAGATT
CTTGAAGCTGAGCTTGGAGACAAACCTTACTTTGGTGGAGATACCTTTGGCTATGTAGAC
ATTTCACTGATTACATTCTACAGTTGGTTCGGAGCATATGAGAAGTTTGGTAACTTCAGC
ATCG**GCAGAGAGTCCAAAACTGATTGCTTGGGCTAAGAGGTGTATGCAGAAAGAGAAC
GTGTCTAAGTCTCTCCCTGAC*AAGAGAAAATTGTTGCGTACGCCGCTGAGT

QA 7 718 7 718
DS 

RD RS1E076TF 741 0 0
GGAACCACACACTACCTCTATTGTTCACTTTGAACATAAATCAAGAACATATCATTTCTT
TGTGAGCTTTAGTGATCTAAACCAATGGCGAACTCGACGATTCTTCTTGATTACTGGCCA
AGCATGTTCTGTATGAGGGCTAGAGTCGCGTTGAGGGAGAAAGGTGTTGTGTTCGAGGCC
AGAGAAGAGGATCTCACGAACAAGAGCCCTTTGCTCCTCCAAAGTAATCCGATTCATAAG
AAGGTCCCGGTTCTGATCCACAACGGTAAACCGGTATGCGAGTCCCTCAATGTTGTCCAG
TACGTGGACGAGGCTTGGTCTGACAAGAACCCATTCTTCCCTTCTGATCCATACGGGAAA
GCTCAGGCTAGGTTTTGGGCTGATTTCGTGGACAAGAAGTTTAGTGATGCCCAATTCAAG
ATATGGGGAAAGAAAGGTGAGGAACAAGCAGCAGGGGTGAAGGAGTTTATTGAGGCAGTG
AAGATTCTTGAAGCTGAGCTTGGAGACAAACCTTACTTTGGTGGAGATACCTTTGGCTAT
GTAGACATTTCACTGATTACATTCTACAGTTGGTTCGGAGCATATGAGAAGTTTGGTAAC
TTCAGCATCGAGGCAGAGAGTCCAAAACTGATTGCTTGGGCTAAGAG*TGTATGCAGAAA
GAGAGCGTGTCTAAGTCTCTCCCTGAC*AAGAGAAAATTGTTGCGTACGCCGCTGAGTTT
AG
AGATATCTCTGATACTGAT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RS1FP83TF 789 0 0
GG
ACACTACCTCTATTGTTCACTTTGAACATAAATCAAGAACATATCATTTCTTTGTGAGCT
TTAGTGATCTAAACCAATGGCGAACTCGACGATTCTTCTTGATTACTGGCCAAGCATGTT
CTGTATGAGGGCTAGAGTCGCGTTGAGGGAGAAAGGTGTTGTGTTCGAGGCCAGAGAAGA
GGATCTCACGAACAAGAGCCCTTTGCTCCTCCAAAGTAATCCGATTCATAAGAAGGTCCC
GGTTCTGATCCACAACGGTAAACCGGTATGCGAGTCCCTCAATGTTGTCCAGTACGTGGA
CGAGGCTTGGTCTGACAAGAACCCATTCTTCCCTTCTGATCCATACGGGAAAGCTCAGGC
TAGGTTTTGGGCTGATTTCGTGGACAAGAAGTTTAGTGATGCCCAATTCAAGATATGGGG
AAAGAAAGGTGAGGAACAAGCAGCAGGGGTGAAGGAGTTTATTGAGGCAGTGAAGATTCT
TGAAGCTGAGCTTGGAGACAAACCTTACTTTGGTGGAGATACCTTTGGCTATGTAGACAT
TTCACTGATTACATTCTACAGTTGGTTCGGAGCATATGAGAAGTTTGGTAACTTCAGCAT
CGAGGCAGAGAGTCCAAAACTGATTGCTTGGGCTAAGAGGTGTATGCAGAAAGAGAGCGT
GTCTAAGTCTCTCCCTGACCAAGAGAAAATTGTTGCGTACGCCGCTGAGTTTAGGA*GAA
TAATCTCTGATACTGAATAAAACCTTGTGT*GTGTCTT*TGTTTCTGATGATGCTGTGCT
CTGCTTT

QA 3 789 3 789
DS 

RD RS1AH50JQ 887 0 0
AACATAAATCAAGAACATATCATTTCTTTGTGAGCTTTAGTGATCTAAACCAATGGCGAA
CTCGACGATTCTTCTTGATTACTGGCCAAGCATGTTCTGTATGAGGGCTAGAGTCGCGTT
GAGGGAGAAAGGTGTTGTGTTCGAGGCCAGAGAAGAGGATCTCACGAACAAGAGCCCTTT
GCTCCTCCAAAGTAATCCGATTCACAAGAAGGTCCCGGTTCTGATCCACAACGGTAAACC
AGTATGCGAGTCCCTCAATGTTGTCCAGTACGTGGACGAGGCTTGGCCTGACAAGAACCC
ATTCTTCCCTTCTGATCCTTACGGGAAAGCTCAGGCTAGGTTTTGGGCTGATTTCGTGGA
CAAGAAGTTTAGTGATGCCCAATTCAAGATATGGGGAAAGAAAGGCGAGGAACAAGCAGC
AGGGGTGAAGGAGTTTATTGAGGCAGTGAAGATTCTTGAAGCTGAGCTTGGAGACAAATC
TTACTTTGGTGGAGATACCTTTGGCTATGTAGACATTGCACTGATTACATTCTACAGTTG
GTTCGGAGCATATGAGAAGTTTGGTAACTTCAGCATCGAGGCAGAGAGTCCAAACCTGAT
TGCTTGGGCTA*GAGGTGTATGCAGAAAGAGAGCGTGTCTAAGTCTCTCCCTGACCAAGA
GAAAATTGTTGCGTACGCCGCTGAGTTTAGGAAGAATAATCTCTGATACTGAATAAAACC
TTGTGTTGTGTCTTCTGTTTCTGATGATGCTGTGCTCTGCTTTCGTTCTCTTTTAGCTCT
GGTTTTTGTGTGTTTCCTAATAATACGTGGGGGCAAGCGTCAGTGTTTGTG*TGGTGGTT
TGTATTGGATCCTAAGTAGTGCATTTTAAAATAAAGTTTGTTTCCAC

QA 1 887 1 887
DS 

RD RS1CN54JQ 594 0 0
CAAGAACCCATTCTTCCCTTCTGATCCTTACGGGAAAGCTCAGGCTAGGTTTTGGGCTGA
TTTCGTGGACAAGAAGTTTAGTGATGCCCAATTCAAGATATGGGGAAAGAAAGGTGAGGA
ACAAGCAGCAGGGGTGAAGGAGTTTATTGAGGCAGTGAAGATTCTTGAAGCTGAGCTTGG
AGACAAACCTTACTTTGGTGGAGATACCTTTGGCTATGTAGACATTTCACTGATTACATT
CTACAGTTGGTTCGGAGCATATGAGAAGTTTGGTAACTTCAGCATCGAGGCAGAGAGTCC
AAAACTGATTGCTTGGGCTAAGAGGTGTATGCAGAAAGAGAGCGTGTTTAAGTCTCTCCC
TGACCAAGAGAAAATTGTTGCGTACGCCGCTGAGTTTAGGAAGAATAACCTCTGATACTG
AATAAAACCTTGTGTTGTGTCTTCTGTTTCTGATGATGCTGTGCTCTGCTTTCGTTCTCT
TTTAGCTTTGGTTTTTGTGTGTTTCCTAATAATACGTGAGGGCAAGCGTCAGTGTTTGTG
*TGGTGGTTTGTATTGGATCCTAAGTAGTGCATTTTAAAATAAAGTTTGTTTCC

QA 1 594 1 594
DS 

RD RS1E076JQ 824 0 0
TCGACGATTCTTCTTGATTACTGGCCAAGCATGTTCTGTATGAGGGCTAGAGTCGCGTTG
AGGGAGAAAGGTGTTGTGTTCGAGGCCAGAGAAGAGGATCTCACGAACAAGAGCCCTTTG
CTCCTCCAAAGTAATCCGATTCATAAGAAGGTCCCGGTTCTGATCCACAACGGTAAACCG
GTATGCGAGTCCCTCAATGTTGTCCAGTACGTGGACGAGGCTTGGTCTGACAAGAACCCA
TTCTTCCCTTCTGATCCATACGGGAAAGCTCAGGCTAGGTTTTGGGCTGATTTCGTGGAC
AAGAAGTTTAGTGATGCCCAATTCAAGATATGGGGAAAGAAAGGTGAGGAACAAGCAGCA
GGGGTGAAGGAGTTTATTGAGGCAGTGAAGATTCTTGAAGCTGAGCTTGGAGACAAACCT
TACTTTGGTGGAGATACCTTTGGCTATGTAGACATTTCACTGATTACATTCTACAGTTGG
TTCGGAGCATATGAGAAGTTTGGTAACTTCAGCATCGAGGCAGAGAGTCCAAAACTGATT
GCTTGGGCTAAGAGGTGTATGCAGAAAGAGAGCGTGTCTAAGTCTCTCCCTGACCAAGAG
AAAATTGTTGCGTACGCCGCTGAGTTTAGGAAGAATAATCTCTGATACTGAATAAAACCT
TGTGTTGTGTCTTTTGTTTCTGATGATGCTGTGCTCTGCTTTCGTTCTCTTTTAGCTTTG
GTTTTTGTGTGTTTCCTAATAATACGTGAGGGCAAGCGTCAGTGTTTGTG*TGGTGGTTT
GTATTGGATCCTAAGTAGTGCATTTTAAAATAAAGTTTGTTTCC

QA 1 824 1 824
DS 

RD RS1FP83JQ 814 0 0
TTCTTGATTACTGGCCAAGCATGTTCTGTATGAGGGCTAGAGTCGCGTTGAGGGAGAAAG
GTGTTGTGTTCGAGGCCAGAGAAGAGGATCTCACGAACAAGAGCCCTTTGCTCCTCCAAA
GTAATCCGATTCATAAGAAGGTCCCGGTTCTGATCCACAACGGTAAACCGGTATGCGAGT
CCCTCAATGTTGTCCAGTACGTGGACGAGGCTTGGTCTGACAAGAACCCATTCTTCCCTT
CTGATCCATACGGGAAAGCTCAGGCTAGGTTTTGGGCTGATTTCGTGGACAAGAAGTTTA
GTGATGCCCAATTCAAGATATGGGGAAAGAAAGGTGAGGAACAAGCAGCAGGGGTGAAGG
AGTTTATTGAGGCAGTGAAGATTCTTGAAGCTGAGCTTGGAGACAAACCTTACTTTGGTG
GAGATACCTTTGGCTATGTAGACATTTCACTGATTACATTCTACAGTTGGTTCGGAGCAT
ATGAGAAGTTTGGTAACTTCAGCATCGAGGCAGAGAGTCCAAAACTGATTGCTTGGGCTA
AGAGGTGTATGCAGAAAGAGAGCGTGTTTAAGTCTCTCCCTGACCAAGAGAAAATTGTTG
CGTACGCCGCTGAGTTTAGGAAGAATAATCTCTGATACTGAATAAAACCTTGTGTTGTGT
CTTTTGTTTCTGATGATGCTGTGCTCTGCTTTCGTTCTCTTTTAGCTTTGGTTTTTGTGT
GTTTCCTAATAATACGTGAGGGCAAGCGTCAGTGTTTGTG*TGGTGGTTTGTATTGGATC
CTAAGTAGTGCATTTTAAAATAAAGTTTGTTTCC

QA 1 814 1 814
DS 

RD RS1AH50TF 873 0 0
GGGAG
CATAAATCAAGAACATATCATTTCTTTGTGAGCTTTAGTGATCTAAACCAATGGCGAACT
CGACGATTCTTCTTGATTACTGGCCAAGCATGTTCTGTATGAGGGCTAGAGTCGCGTTGA
GGGAGAAAGGTGTTGTGTTCGAGGCCAGAGAAGAGGATCTCACGAACAAGAGCCCTTTGC
TCCTCCAAAGTAATCCGATTCACAAGAAGGTCCCGGTTCTGATCCACAACGGTAAACCAG
TATGCGAGTCCCTCAATGTTGTCCAGTACGTGGACGAGGCTTGGCCTGACAAGAACCCAT
TCTTCCCTTCTGATCCTTACGGGAAAGCTCAGGCTAGGTTTTGGGCTGATTTCGTGGACA
AGAAGTTTAGTGATGCCCAATTCAAGATATGGGGAAAGAAAGGCGAGGAACAAGCAGCAG
GGGTGAAGGAGTTTATTGAGGCAGTGAAGATTCTTGAAGCTGAGCTTGGAGACAAATCTT
ACTTTGGTGGAGATACCTTTGGCTATGTAGACATTGCACTGATTACATTCTACAGTTGGT
TCGGAGCATATGAGAAGTTTGGTAACTTCAGCATCGAGGCAGAGAGTCCAAACCTGATTG
CTTGGGCTA*GAGGTGTATGCAGAAAGAGAGCGTGTCTAAGTCTCTCCCTGACCAAGAGA
AAATTGTTGCGTACGCCGCTGAGTTTAG*AAGAATAATCTCTGATACTGAATAAAACCTT
GTGTTGTGTCTTCTGTTTCTGATGATGCTGTGCTCTGCTTTCGTTCTCTTTTAGCTCTGG
TTTTTGTGTGTTTCCTAATAATACGTG*GGGCAAGCGTCAGTGTTTGTGGTGGTGGTTTG
TATTGGATCCTAAGTAGTGCATTTTAAA

QA 6 873 6 873
DS 



AS 2 8

CO CL91Contig1 1013 6 8 U
TTTTTAAAAGCTCCCCTATCTCCTCTCTCTCATCTGCGAGAAAGAGTCATCAAATCCAAA
TCGCCGCCATGTTCAGACAAGCTTCCCGCCTCCTCTCCCGATCTGTCTCCGCCGCCGCAC
CCTCTAGATCAACGACTAATCGTGCCTTTTCAACGGAAGTTCCGTCGACTATCGATTCAA
CATTCGTGGAGTCATGGAAGAAAGTCGCACCGAACATGGACCCGCCGCAGACTCCTTCCT
CCTTCATGAAGGCTCGTCCATCGACTGCTTCCTCGATTCCGACGAAGCTCACCGTCAATT
TCGTCCTCCCTTACGCATCTGAACTTTCCGGGAAAGAGGTCGACATGGTCATCATTCCCG
CAACAACAGGACAAATGGGTGTTTT*GCCTGGACACGTTCCAACAATCGCTGAGCTGAAA
CCCGGTATCATGTCCGTTCACGAAGGCACTGACATAAAGAAGTACTTTGTTAGCAGTGGA
TTCGCATTTCTACACGCAAATTCCGTCGCTGACATTATCGCTGTTGAGGCCGTGCCGCTT
GAGAACATCGACGCTAGCCAAGTCCAAAAGGGTTTAGCTGAGTTCACGCAGAAACTTGCT
TCTGCAACAACAGATCTTGAGAAGGCAGAAGCACAGATTGGTGTCGAAGTTCACAGTGCT
*TGAACGCAGCTCTCTCGGGCTAAAAGAAGATGATCCCTTATTTACCCTACTACAAAGGA
TGGAATAATTTAGAAAAATGATTTTTGCTTTGCTTAATTTTGTTGGACTTTGTTTTGAAT
AAATGATTTTGTTGAAGGCACAAACCAACAGAGTTTCTTGTGTTCATATTCTTCTCTACT
TAGTTTGGGTTGAGAAACTAAGTTGTTTTTGTAATTTCTTTTCAGAAAAGAAATAAAATT
TCATATGCCACGTCCTCTGTAAGGAAGGTTGGAATATTTTTTTATGTAATTACTAACAAA
AGTTATGTAATTCCAAACAGTAGAGGATAATTAATAAATATCTTTTACTATCT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DZ29TF U 1
AF RS1G595TF U 36
AF RS1CQ85TF U 1
AF RS1DZ29JQ C 92
AF RS1B725JQ C 167
AF RS1CQ85JQ C 297
BS 1 119 RS1CQ85TF
BS 120 120 RS1DZ29TF
BS 121 728 RS1CQ85TF
BS 729 859 RS1DZ29JQ
BS 860 860 RS1B725JQ
BS 861 903 RS1DZ29JQ
BS 904 920 RS1B725JQ
BS 921 1013 RS1CQ85JQ

RD RS1DZ29TF 565 0 0
TTTTT
AAAAGCTCCCCTATCTCCTCTCTCTCATCTGCGAGAAAGAGTCATCAAATCCAAATCGCC
GCCATGTTCAGACAAGCTTCCCGCCTCCTCTCCCGATCTGTCTCCGCCGCCGCACCCTCT
AGATCAACGACTAATCGTGCCTTTTCAACGGAAGTTCCGTCGACTATCGATTCAACATTC
GTGGAGTCATGGAAGAAAGTCGCACCGAACATGGACCCGCCGCAGACTCCTTCCTCCTTC
ATGAAGGCTCGTCCATCGACTGCTTCCTCGATTCCGACGAAGCTCACCGTCAATTTCGTC
CTCCCTTACGCATCTGAACTTTCCGGGAAAGAGGTTGACATGGTCATCATTCCCGCAACA
ACAGGACAAATGGGTGTTTTTGCCTGGACACGTTCCAACAATCGCTGAGCTGAAACCCGG
TATCATGTCCGTTCACGAAGGCACTGACATAAAGAAGTACTTTGTTAGCAGTGGATTCGC
ATTTCTACACGCAAATTCCGTCGCTGACATTATCGCTGTTGAGGCCGTGCCGCTTGAGAA
CATCGACGCTAGCCAAGTCC

QA 6 565 6 565
DS 

RD RS1G595TF 612 0 0
GGGC
GAAAGTGTCATCAAAACCAAATCGCCGCCATGTTCAGACAAGCTTCCCGCCTCCTCTCCC
GATCTGTCTCCTTCGCCGCATCCTCTAGATCAACGACTAATCGTGCCTTTTCAACGGAAG
TTCCGTTGACGATCGATTCAGCATTCGTGGAGTCATGGAAGAAAGTCGCACCGAACATGG
ACCCGCCGCAGACTCCTTCATCCTTCATGAAGCCTCGTCCATCGACTGCTTCCTCGATTC
CGACGAAGCTCACCGTCAACTTCGTCCTCCCTTACGCATCTGAGCTTTCCGAGAAAGAGG
TCGACATGGTCATCATTCCAGCGACAACAGGACAAATGGGTGTTTT*GCCTGGACACGTT
CCAACGATCGCCGAGCTGAAACCCGGTATCATGTCCGTTCACGAAGGCACTGACACAAAG
AAATACTTTGTGAGCAGTG*ATTCGCATTTCTCCACGCCAATTCCGTCGCTGACATTATC
GCTGTTGAGGCCGTGCCGCTTGAGAACATCGACGCTAGCCAAGTCCAAAAGGGTTTAGCT
GAGTTCACGCAGAAACTTGCTTCTGCAACAACAGATCTTGAGAAAGCAGAAGCACAGATT
GGTGTCGA

QA 5 612 5 612
DS 

RD RS1CQ85TF 728 0 0
TTTTTAAAAGCTCCCCTATCTCCTCTCTCTCATCTGCGAGAAAGAGTCATCAAATCCAAA
TCGCCGCCATGTTCAGACAAGCTTCCCGCCTCCTCTCCCGATCTGTCTCCGCCGCCGCAT
CCTCTAGATCAACGACTAATCGTGCCTTTTCAACGGAAGTTCCGTCGACTATCGATTCAA
CATTCGTGGAGTCATGGAAGAAAGTCGCACCGAACATGGACCCGCCGCAGACTCCTTCCT
CCTTCATGAAGGCTCGTCCATCGACTGCTTCCTCGATTCCGACGAAGCTCACCGTCAATT
TCGTCCTCCCTTACGCATCTGAACTTTCCGGGAAAGAGGTCGACATGGTCATCATTCCCG
CAACAACAGGACAAATGGGTGTTTT*GCCTGGACACGTTCCAACAATCGCTGAGCTGAAA
CCCGGTATCATGTCCGTTCACGAAGGCACTGACATAAAGAAGTACTTTGTTAGCAGTGGA
TTCGCATTTCTACACGCAAATTCCGTCGCTGACATTATCGCTGTTGAGGCCGTGCCGCTT
GAGAACATCGACGCTAGCCAAGTCCAAAAGGGTTTAGCTGAGTTCACGCAGAAACTTGCT
TCTGCAACAACAGATCTTGAGAAGGCAGAAGCACAGATTGGTGTCGAAGTTCACAGTGCT
*TGAACGCAGCTCTCTCGGGCTAAAAGAAGATGATCCCTTATTTACCCTACTACAAAGGA
TGGAATAA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1DZ29JQ 813 0 0
CCTCTCCCGATCTGTCTCCGCCGCCGCACCATCTAGATCAACGACTAATCGTGC*TTTTC
AACGGAAGTTCCGTCGACTATCGATTCAACATTCGTGGAGTCATGGAAGAAAGTCGCACC
GAACATGGACCCGCCGCAGACTCCTTCCTCCTTCATGAAGGCTCGTCCATCGACTGCTTC
CTCGATTCCGACGAAGCTCACCGTCAATTTCGTCCTCCCTTACGCATCTGAACTTTCCGG
GAAAGAGGTTGACATGGTCATCATTCCCGCAACAACAGGACAAATGGGTGTTTTTGCCTG
GACACGTTCCAACAATCGCTGAGCTGAAACCCGGTATCATGTCCGTTCACGAAGGCACTG
ACATAAAGAAGTACTTTGTTAGCAGTGGATTCGCATTTCTACACGCAAATTCCGTCGCTG
ACATTATCGCTGTTGAGGCCGTGCCGCTTGAGAACATCGACGCTAGCCAAGTCCAAAAGG
GTTTAGCTGAGTTCACGCAGAAACTTGCTTCTGCAACAACAGATCTTGAGAAGGCAGAAG
CACAGATTGGTGTCGAAGTTCACAGTGCTATGAACGCAGCTCTCTCGGGCTAAAAGAAGA
TGATCCCTTATTTACCCTACTACAAAGGATGGAATAATTTAGAAAAATGATTTTTGCTTT
GCTTAATTTTGTTGGACTTTGTTTTGAATAAATGATTTTGTTGAAGGCACAAACCAACAG
AGTTTCTTGTGTTCATATTCTTCTCTACTTAGTTTGGGTTGAGAAACTGAGTTGTTTTTG
TAATTTCTTTTCAGAAAAGAAATAAAATTTCA
G

QA 1 812 1 812
DS 

RD RS1B725JQ 754 0 0
GACTATCGATTCAACATTCGTGGAGTCATGGAAGAAAGTCGCACCGAACATGGACCCGCC
GCAGACTCCTTCCTCCTTCATGAAGGCTCGTCCATCGACTGCTTCCTCGATTCCGACGAA
GCTCACCGTCAATTTCGTCCTCCCTTACGCATCTGAACTTTCCGGGAAAGAGGTCGACAT
GGTCATCATTCCCGCAACAACAGGACAAATGGGTGTTTT*GCCTGGACACGTTCCAACAA
TCGCTGAGCTGAAACCCGGTATCATGTCCGTTCACGAAGGCACTGACATAAAGAAGTACT
TTGTTAGCAGTGGATTCGCATTTCTACACGCAAATTCCGTCGCTGACATTATCGCTGTTG
AGGCCGTGCCGCTTGAGAACATCGACGCTAGCCAAGTCCAAAAGGGTTTAGCTGAGTTCA
CGCAGAAACTTGCTTCTGCAACAACAGATCTTGAGAAGGCAGAAGCACAGATTGGTGTCG
AAGTTCACAGTGCTATGAACGCAGCTCTCTCGGGCTAAAAGAAGATGATCCCTTATTTAC
CCTACTACAAAGGATGGAATAATTTAGAAAAATGATTTTTGCTTTGCTTAATTTTGTTGG
ACTTTGTTTTGAATAAATGATTTTGTTGAAGGCACAAACCAACAGAGTTTCTTGTGTTCA
TATTCTTCTCTACTTAGTTTGGGTTGAGAAACTAAGTTGTTTTTGTAATTTCTTTTCAGA
AAAGAAATAAAATTTCATATGCCACGTCCTCTGT

QA 1 754 1 754
DS 

RD RS1CQ85JQ 717 0 0
AATTTCGTCCTCCCTTACGCATCTGAACTTTCCGGGAAAGAGGTCGACATGGTCATCATT
CCCGCAACAACAGGACAAATGGGTGTTTT*GCCTGGACACGTTCCAACAATCGCTGAGCT
GAAACCCGGTATCATGTCCGTTCACGAAGGCACTGACATAAAGAAGTACTTTGTTAGCAG
TGGATTCGCATTTCTACACGCAAATTCCGTCGCTGACATTATCGCTGTTGAGGCCGTGCC
GCTTGAGAACATCGACGCTAGCCAAGTCCAAAAGGGTTTAGCTGAGTTCACGCAGAAACT
TGCTTCTGCAACAACAGATCTTGAGAAGGCAGAAGCACAGATTGGTGTCGAAGTTCACAG
TGCT*TGAACGCAGCTCTCTCGGGCTAAAAGAAGATGATCCCTTATTTACCCTACTACAA
AGGATGGAATAATTTAGAAAAATGATTTTTGCTTTGCTTAATTTTGTTGGACTTTGTTTT
GAATAAATGATTTTGTTGAAGGCACAAACCAACAGAGTTTCTTGTGTTCATATTCTTCTC
TACTTAGTTTGGGTTGAGAAACTAAGTTGTTTTTGTAATTTCTTTTCAGAAAAGAAATAA
AATTTCATATGCCACGTCCTCTGTAAGGAAGGTTGGAATATTTTTTTATGTAATTACTAA
CAAAAGTTATGTAATTCCAAACAGTAGAGGATAATTAATAAATATCTTTTACTATCT

QA 1 717 1 717
DS 



CO CL91Contig2 810 2 2 U
GACAAGCTTCTCGCCTCCTCTCCCGATCCATCACCGCCGGATCCTCCAAATCGGCGACGG
CTCGTGCCTTTTCAACGGAAGTTCCGTCGACGATCGATTCGACGTTCGTGGAGTCATGGA
AGAAGGTCGCACCGAACATGGACCCGCCGCAGACTCCTTCCTCATTCATGAAGCCTCGTC
GGACGACTGCGTCTTCGATTCCGACGAAGCTCACCGTCAATTTCGTCCTCCCTTACGCAT
CTGAGCTTTCCGGGAAAGAGGTCGACATGGTCATCATTCCAGCGACAACAGGACAAATGG
GTGTTTTGCCTGGACACGTTCCAACCATCGCTGAGCTGAAACCCGGTATCATGTCCGTTC
ACGAAGGCACTGACGTGAAGAAATACTTCGTGAGCAGTGGTTTCGCGTTTCTCCACGCTA
ATTCCGTGGCTGACATTATCGCGGTTGAGGCCGTGCCGCTGGAGAACATTGACGCTAGCC
AAGTCCAAAAGGGTTTAGCTGAGTTCACACAGAAACTTGCTTCTGCATCAACGGATCTTG
AGAAAGCAGAAGCACAGATTGGTGTTGAAGTTCACAGTGCTATGAACGCAGCTCTCTCAG
GCTAAGAGCAGGTTTATTTCTTCCAAGTAAAAGAAAAAGGAAAATCATTTTGCTTTTCAA
ATGATTAGTGAAAGTCCCTTGACTGCAAAGGATGGAATAAATAAGAAACTTACTTTTCCT
CTTTGTTTTATTTGGGTTGGACTTTGTTTGAATAAATGATTTTGTTGAGTACACAAACCA
ACATAAAGTTTATTATACTCATATTTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EX72TF U 1
AF RS1AU04JQ C 162
BS 1 276 RS1EX72TF
BS 277 810 RS1AU04JQ

RD RS1EX72TF 276 0 0
GACAAGCTTCTCGCCTCCTCTCCCGATCCATCACCGCCGGATCCTCCAAATCGGCGACGG
CTCGTGCCTTTTCAACGGAAGTTCCGTCGACGATCGATTCGACGTTCGTGGAGTCATGGA
AGAAGGTCGCACCGAACATGGACCCGCCGCAGACTCCTTCCTCATTCATGAAGCCTCGTC
GGACGACTGCGTCTTCGATTCCGACGAAGCTCACCGTCAATTTCGTCCTCCCTTACGCAT
CTGAGCTTTCCGGGAAAGAGGTCGACATGGTCATCA

QA 1 276 1 276
DS 

RD RS1AU04JQ 649 0 0
TCA
TTCATGAAGCCTCGTCTGACGACTGCGTCTTCGATTCCGACGAAGCTCACCGTCAATTTC
GTCCTCCCTTACGCATCTGAGCTTTCCGGGAAAGAGGTCGACATGGTCATCATTCCAGCG
ACAACAGGACAAATGGGTGTTTTGCCTGGACACGTTCCAACCATCGCTGAGCTGAAACCC
GGTATCATGTCCGTTCACGAAGGCACTGACGTGAAGAAATACTTCGTGAGCAGTGGTTTC
GCGTTTCTCCACGCTAATTCCGTGGCTGACATTATCGCGGTTGAGGCCGTGCCGCTGGAG
AACATTGACGCTAGCCAAGTCCAAAAGGGTTTAGCTGAGTTCACACAGAAACTTGCTTCT
GCATCAACGGATCTTGAGAAAGCAGAAGCACAGATTGGTGTTGAAGTTCACAGTGCTATG
AACGCAGCTCTCTCAGGCTAAGAGCAGGTTTATTTCTTCCAAGTAAAAGAAAAAGGAAAA
TCATTTTGCTTTTCAAATGATTAGTGAAAGTCCCTTGACTGCAAAGGATGGAATAAATAA
GAAACTTACTTTTCCTCTTTGTTTTATTTGGGTTGGACTTTGTTTGAATAAATGATTTTG
TTGAGTACACAAACCAACATAAAGTTTATTATACTCATATTTTCCC

QA 4 649 4 649
DS 



AS 2 14

CO CL92Contig1 768 3 2 U
GGGAACAACCCTAAGTCATTTGGTTCCGTCTCCTCAGCTAAAAGACGCCGCTCGTCTATT
CAAGAGAGAAGGGGGTTGAAAGATGAGTCGTGGAAGTGCAGCAGTCGCCAAGGGAAAGAA
GAAGGGAGTCTCCTTCTCCATCGACTGCTCCAAGCCTGTCGATGACAAGATCATGGAGAT
TGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTA
ATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCT
TGGGATGGGTCGCCCGGTCCGCCTTCGGCGAGCACCGGTCGGCTTGTCTCTTCTGTTGGC
GATACGCTCCTGGTCTTAACTGGCCGGGTCGTGCCTCCTTCGCTGTTACTTTGAAGAAAT
TAGAGTGCTCAAAGCAAGCCTACGCTCTGTATACATTAGCATGGGATAACATCATAGGAT
TTCGATCCTATTGTGTTGGCCTTCGGGATCGGAGTAATGATTAACAGGGACAGTCGGGGG
CATTCGTATTTCATAGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACAACTGCGA
AAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGAT
CAGATACCGTCCTAGTCTCAACCATAAACGAAGCTATACATGCTGCAGTTACCCGCGTTG
CCTAAACTATAGCCAGACGATATATTTCTTGTTTTGTCTAATAAAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1B096TF U 1
AF RS1AP71JQ C 436
AF RS1AP71TFB U 436
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QA 3 333 3 333
DS 



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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
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45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 50 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 55 55 55 25 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 50 50 50 
50 50 35 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 25 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 
45 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 25 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

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GG
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CCTCTTCTCCCACCCTCGGTCTCGCCGATACGTTCACCCAGCTCAAAAAACAGGGCAAAG
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CTTTAGCCGATGGACCTGTTATTCAGGCTGCGGCGACAAGGTCTTTGGAGAAAGGAACCA
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CCTCTTCTCCCACCCTCGGTCTCGCCGATACGTTCACCCAGCTCAAAAAACAGGGCAAAG
TAGCATTCATACCGTACATCACAGCTGGTGACCCAGATCTCTCTACTACTGCTGAAGCAT
TGAAAGTCCTTGACGCTTGCGGTTCCGACATTATCGAACTGGGTGTTCCTTACTCTGACC
CTTTAGCTGATGGACCTGTTATTCAGGCTGCGGCGACAAGGTCTTTGGAGAAAGGAACCA
ACCTTGATAACATACTTGACATGTTGGATAGGGTTCTTCCAGAGTTATCGTGTCCTGTTT
CGCTGTTTACTTATTACAACCCGATTCTCAAACGTGGGTTGGGGAAGTTCATGTCCAGTA
TAAGAGATGTTGGTGTACAGGGGCTTGTGGTTCCTGATGTTCCGCTTGAGGAAACTGAGT
TGCTGAGAGAAAGAGCACTTAGCAACGGCATCGAACTGGTCCTACTCACTACACCAACCA
CACCAACAGAGAGGATGAAGCGAATTGTTGAAGCATCAGAACGGTTTATTTACCTTGTGA
GCTCAATAGGAGTGACCGGTGCACGTTCATCTGTC

QA 5 759 5 759
DS 

RD RS1AV16TF 759 0 0
AGTCGTATCATCCATTATCTTTTCTAAAAAACAAAATGGCGATTGCTTTCAAATCCGGCG
TCTGCTTCCTCAACTCCCCAAAACCCCAAATCGGAATCCGCCACTCTTCTCCCGACTCCT
CCCTCTCTTTCAAGAGATTAACTCCCACCGCCGCCCTCTCCACCTCTTCTCCCACCCTCG
GTCTCGCCGATACGTTCACCCAGCTCAAAAAACAGGGCAAAGTAGCATTCATACCGTACA
TCACAGCTGGTGACCCAGATCTCTCTACTACTGCTGAAGCATTGAAAGTCCTTGACGCTT
GCGGTTCCGACATTATCGAACTGGGTGTTCCTTACTCTGACCCTTTAGCTGATGGACCTG
TTATTCAGGCTGCGGCGACAAGGTCTTTGGAGAAAGGAACCAACCTTGATAACATACTTG
ACATGTTGGATAAGGTTCTTCCAGAGTTATCGTGTCCTGTTTCGCTGTTTACTTATTACA
ACCCGATTCTCAAACGTGGGTTGGGGAAGTTCATGTCCAGTATAAGAGATGTTGGTGTAC
AGGGGCTTGTGGTTCCTGATGTTCCGCTTGAGGAAACTGAGTTGCTGAGAGAA*GAGCAC
TTAGCAACGGCATTGAACTGGTCCTACTCACTACACCAACCACACCAACAGAGAGGATGA
AGCGA*TTGTTGA*GCATCAGAA*GGTTCATTTACCTTGTGAGCTCA*TAG*AGTGACCG
*TGCACGT*CATCTGTCAGCGGAAAG*TTGAGTCGCTCT

QA 1 759 1 759
DS 

RD RS1E096TF 667 0 0
GGTC
CACCCAGCTCAAAAAACAGGGCAAAGTAGCATTCATACCGTACATCACAGCTGGTGACCC
AGATCTCTCTACTACTGCTGAAGCATTGAAAGTCCTTGACGCTTGCGGTTCCGACATTAT
CGAACTGGGTGTTCCTTACTCTGACCCTTTAGCTGATGGACCTGTTATTCAGGCTGCGGC
GACAAGGTCTTTGGAGAAAGGAACCAACCTTGATAACATACTTGACATGTTGGATAAGGT
TCTTCCAGAGTTATCGTGTCCTGTTTCGCTGTTTACTTATTACAACCCGATTCTCAAACG
TGGGTTGGGGAAGTTCATGTCCAGTATAAGAGATGTTGGTGTACAGGGGCTTGTGGTTCC
TGATGTTCCGCTTGAGGAAACTGAGTTGCTGAGAGAAGGAGCACTTAGCAACGGCATTGA
ACTGGTCCTACTCACTACACCAACCACACCAACAGAGAGGATGAAGCGAATTGTTGAAGC
ATCAGAAGGGTTTATTTACCTTGTAAGCTCAATAGGAGTGACCGGTGCACGTTCATCTGT
CAGCGGAAAGGTTGAGTCGCTCTCGAAGGATATCAAGGAGGCAACAGACAAGCCAGTGGC
GGTTGGTTTTGGAATATCAAAGCCTGAGCATGTGAAACAGATAGCTGGATGGGGAGCTGA
TGG

QA 5 667 5 667
DS 

RD RS1EI47JQ 442 0 0
AAACGTGGGTTGGGGAAGTTCATGTCCAGTATAAGAGATGTTGGTGTACAGGGGCTTGTG
GTTCCTGATGTTCCGCTTGAGGAAACTGAGTTGCTGAGAGAAGGAGCACTTAGCAACGGC
ATCGAACTGGTCCTACTCACTACCCCAACCACACCAACAGAGAGGATGAAGCGAATTGTT
GAAGCATCAGAAGGGTTTATTTACCTTGTGAGCTCAATAGGAGTGACCGGTGCACGTTCA
TTTGTCAGCGGAAAGGTTGAGTCGCTTTTGAAGGATATCAGGGAGGCAACTGACAAGCCA
GTGGCGGTTGGTTTTGGAATATCAAAGCCTGAGCATGTGAAACAGATAGCTGGATGGGGA
GGTGATGGAGTGATTGTAGGAAGTGCAATGGTGAGGCTTTTAGGGGATGCCAAGTCACCA
ACTGAAGGGCTCAAGGAGCTTG

QA 1 442 1 442
DS 

RD RS1EU84JQ 341 0 0
AAGGAGCACTTAGCAACGGCATCGAACTGGTCCTACTCACTACACCAACCACACCAACAG
AGAGGATGAAGCGAATTGTTGAAGCATCAGAAGGGTTTATTTACCTTGTGAGCTCAATAG
GAGTGACCGGTGCACGTTCATTTGTCAGCGGAAAGGTTGAGTCGCTTTTGAAGGATATCA
GGGAGGCAACTGACAAGCCAGTGGCGGTTGGTTTTGGAATATCAAAGCCTGAGCATGTGA
AACAGATAGCTGGATGGGGAGCTGATGGAGTGATTGTAGGAAGTGCAATGGTGAGGCTTT
TAGGAGATGCCAAGTCACCAACTGAAGGGCTCAAGGAGCTT

QA 1 341 1 341
DS 

RD RS1BC87JQ 749 0 0
CAGGCTGCGGCGACAAGGTCTTTGGAGAAAGGAACCAACCTTGATAACATACTTGACATG
TTGGATAAGGTTCTTCCAGAGTTATCGTGTCCTGTTTCGCTGTTTACTTATTACAACCCG
ATTCTCAAACGTGGGTTGGGGAAGTTCATGTCCAGTATAAGAGATGTTGGTGTACAGGGG
CTTGTGGTTCCTGATGTTCCGCTTGAGGAAACTGAGTTGCTGAGAGAAGGAGCACTTAGC
AACGGCATTGAACTGGTC*TACTCACTACACCAACCACACCAACAGAGAGGATGAAGCGA
ATTGTTGAAGCATCAGAAGGGTTTATTTACCTTGTGAGCTCAATAGGAGTGACCGGTGCA
CGTTCATCTGTCAGCGGAAAGGTTGAGTCGCTCTTGAAGGATATCAAGGAGGCAACAGAC
AAGCCAGTGGCGGTTGGTTTTGGAATATCAAAGCCTGAGCATGTGAAACAGATAGCTGGA
TAGGGAGCTGATGGAGTGATTGTAGGAAGTGCAATGGTGAGGCTTTTGGGAGATGCCAAG
TCCCCAACTGAAGGGCTCAAGGAGCTTGAGCGTCTCACAAAGTCTCTCAAATCTGCTCTT
CTTTGAAAACACAAAGAAAAAAATAACATTTGCAGACCGCTTCATTGATTGTGTTTTATT
TTACTTCAGTAATGTATGAAAATGATGTTCCAAACTGTTGAGACATTTCAAGTATAATGA
TAATTAAAAACTTTCGGTTTGATTTCAAG

QA 1 749 1 749
DS 

RD RS1AV16JQ 708 0 0
ACCTTGATAACATACTTGACATGTTGGATAAGGTTCTTCCAGAGTTATCGTGTCCTGTTT
CGCTGTTTACTTATTACAACCCGATTCTCAAACGTGGGTTGGGGAAGTTCATGTCCAGTA
TAAGAGATGTTGGTGTACAGGGGCTTGTGGTTCCTGATGTTCCGCTTGAGGAAACTGAGT
TGCTGAGAGAAGGAGCACTTAGCAACGGCATTGAACTGGTCCTACTCACTACACCAACCA
CACCAACAGAGAGGATGAAGCGAATTGTTGAAGCATCAGAAGGGTTCATTTACCTTGTGA
GCTCAATAGGAGTGACCGGTGCACGTTCATCTGTCAGCGGAAAGGTTGAGTCGCTCTTGA
AGGATATCAAGGAGGCAACAGACAAGCCAGTGGCGGTTGGTTTTGGAATATCAAAGCCTG
AGCATGTGAAACAGATAGCTGGATGGGGAGCTGATGGAGTGATTGTAGGAAGTGCAATGG
TGAGGCTTTTGGGAGATGCCAAGTCACCAACTGAAGGGCTCAAGGAGCTTGAGCGTCTCA
CAAAGTCTCTCAAATCTGCTCTTCTTTGAAAACACAAAGAAAAAAACAACATTTGCAGAC
CGCTTCATTGATTGTGTTTTATTTTACTTCAGTAATGTATGAAAATGATGTTCCAAACTG
TTGAGACATTTCAAGTATAATGATAATTAAAAACTTTCGGTTTGATTT

QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1FH09JQ 682 0 0
ATAACATACTTGACATGTTGGATAAGGTTCTTCCAGAGTTATCGTGTCCAGTTTCGCTGT
TTACTTATTACAACCCGATTCTCAAACGTGGGTTGGGGAAGTTCATGTCCAGTATAAGAG
ATGTTGGTGTACAGGGGCTTGTGGTTCCTGATGTTCCTCTTGAGGAAACTGAGTTGCTGA
GAGAAGGAGCACTTAGCAACGGCATTGAACTGGTCCTACTCACGACACCAACCACACCAA
CAGAGAGGATGAAGCGAATTGTTGAAGCATCAGAAGGGTTTATTTACCTTGTGAGCTCAA
TAGGAGTGACCGGTGCACTTTCATCTGTCAGCGGAAAGGTTGAGTCGCTCTTGAAGGATA
TCAAAGAGGCAACAGACAAGCCAGTGGCGGTTGGTTTTGGAATATCAAAGCCTGAGCATG
TGAAACAGATAGCTGGTTGGGGAGCTGATGGAGTGATCGTAGGAAGTGCAATGGTGAGGC
TTTTGGGAGATGCCAAGTCACCAACTGAAGGGCTCAAGGAGCTTGAGCGTCTCACAAAGT
CTCTCAAATTTGCTTTTCTTTGAAAACACAAAGAAAAAAATAACATTTGCAGACCGCTTC
ATTGATTGTGTTTTATTTTACTTCAGTAATGTATGAAAATGATGTTCCAAACTGTTGAGA
CATTTCAAGTATAATGATAATT

QA 1 682 1 682
DS 



AS 2 15

CO CL93Contig1 626 5 8 U
CTTTGTATTATATTTTATGTCAAATATGCTTGTAAATTGTAAAAACGTTATTGATTGGCT
TGACATATTGTGTTTTGATTTTTATGTTGAAAAGTGAGAGGCAACAAAGCAAAAAAAGCT
CAAAATCTTTAACAGATTATTTAAATACCAA*TCAAACGGCTAACTCAACTAATTATTAA
TCATCTTGAAATAGTAGTGTAGCCACTTAATTTTATGAGATCTTGACTTATTTTAGTTTG
ACGATCCGTTGATAACAGCAAGCTTCAACGGTGCTTGCTCCTCGTTTCGCTGCTGTACAT
CCAGTCATAAACCGTGGGAAAATTAGGATGAGAAGGTTTATCAAAGACATTAGCACCAAT
CTCCCTTGTGGTCACATTACTTGCTGGATGAAATACACTTCTCCACACATCCACTTTCCG
ACCAGATCCTGGTGTGGCCGGGGTAGTCGGACTCGCTGGTAGAGACGCTGATCCGCCCAC
CATTGTTACTTCTTTGGTATTGTTCAGGCTAGTCAAACCGGTAGAGATTCGCCTGAGATG
CCCACGGCCACGGGCTTCAGGTTGAGGACCAGCCACAACGTCGTCCCAAAAATTTTCAAG
TACACCCATTCTTTATTTTGCTTCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 25 25 5 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DE52JQ U 34
AF RS1D689JQ U 1
AF RS1CO18TF C 114
AF RS1D689TF C 1
AF RS1CO18JQ U 114
BS 1 241 RS1D689JQ
BS 242 242 RS1CO18JQ
BS 243 319 RS1D689JQ
BS 320 320 RS1CO18JQ
BS 321 534 RS1D689JQ
BS 535 536 RS1CO18JQ
BS 537 537 RS1D689TF
BS 538 626 RS1CO18JQ

RD RS1DE52JQ 158 0 0
AAATTGTA
AAAACGTTATTGATTGGCTTGACATATTGTGTTTTGATTTTTATGTTGAAAAGTGAAAGG
CAACAAAACAAAAAAAGCTCAAAATCTTTAACAAATTATTTAAATACCAA*TCAAACGGC
TAACTCAACTAATTATTAATCATCTTGAAA

QA 9 158 9 158
DS 

RD RS1D689JQ 534 0 0
CTTTGTATTATATTTTATGTCAAATATGCTTGTAAATTGTAAAAACGTTATTGATTGGCT
TGACATATTGTGTTTTGATTTTTATGTTGAAAAGTGAGAGGCAACAAAGCAAAAAAAGCT
CAAAATCTTTAACAGATTATTTAAATACCAA*TCAAACGGCTAACTCAACTAATTATTAA
TCATCTTGAAATAGTAGTGTAGCCACTTAATTTTATGAGATCTTGACTTATTTTAGTTTG
ATGATCCGTTGATAACAGCAAGCTTCAACGGTGCTTGCTCCTCGTTTCGCTGCTGTACAT
CCAGTCATAAACCGTGGGAGAATTAGGATGAGAAGGTTTATCAAAGACATTAGCACCAAT
CTCCCTTGTGGTCACATTACTTGCTGGATGAAATACACTTCTCCACACATCCACTTTCCG
ACCAGATCCTGGTGTGGCCGGGGTAGTCGGACTCGCTGGTAGAGACGCTGATCCGCCCAC
CATTGTTACTTCTTTGGTATTGTTCAGGCTAGTCAAACCGGTAGAGATTCGCCT

QA 1 534 1 534
DS 

RD RS1CO18TF 429 0 0
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TTATTAATCATCTTGAAATAGTAGTGTAGCCACTTAATTTTATGAGTTCTTGACTTATTT
TAGTTTGACGATCCGTTGATAACAGCAAGCTTCAACGGTGCTTGCTCCTCGTTTCGCTGC
TGTACATCCAGTCATAAACCGTGGGAAAATTAGGATGAGAAGGTTTATCAAAGACATTAG
CACCAATCTCCCTTGTGGTCACATTACTTGCTGGATGAAATACACTTCTCCACACATCCA
CTTTCCGACCAGATCCTGGTGTGGCCGGGGTAGTCGGACTCGCTGGTAGAGACGCTGATC
CGCCCACCATTGTTGCTTCTTTGGTATTGTTCAGGCTAGTCAAACCGGTAGAGATTCGCC
TGAGATG
CC

QA 1 427 1 427
DS 

RD RS1D689TF 621 0 0
CTTTGTATTATATTTTATGTCAAATATGCTTGTAAATTGTAAAAACGTTATTGATTGGCT
TGACATATTGTGTTTTGATTTTTATGTTGAAAAGTGAGAGGCAACAAAGCAAAAAAAGCT
CAAAATCTTTAACAGATTATTTAAATACCAA*TCAAACGGCTAACTCAACTAATTATTAA
TCATCTTGAAATAGTAGTGTAGCCACTTAATTTTATGAGATCTTGACTTATTTTAGTTTG
ATGATCCGTTGATAACAGCAAGCTTCAACGGTGCTTGCTCCTCGTTTCGCTGCTGTACAT
CCAGTCATAAACCGTGGGAGAATTAGGATGAGAAGGTTTATCAAAGACATTAGCACCAAT
CTCCCTTGTGGTCACATTACTTGCTGGATGAAATACACTTCTCCACACATCCACTTTCCG
ACCAGATCCTGGTGTGGCCGGGGTAGTCGGACTCGCTGGTAGAGACGCTGATCCGCCCAC
CATTGTTACTTCTTTGGTATTGTTCAGGCTAGTCAAACCGGTAGAGATTCGCCTGAGATG
CCCACGGCCACGGGCTTCAGGTTGAGGACCAGCCACAACGTCGTCCCAGAGGTTTTCAAG
TACACCCATTCTTTATTTT
CC

QA 1 619 1 619
DS 

RD RS1CO18JQ 513 0 0
AAAAGCTCAAAATCTTTAACAGATTATTTAAATACCAA*TCAAACGGCTAACTCAACTAA
TTATTAATCATCTTGAAATAGTAGTGTAGCCACTTAATTTTATGAGATCTTGACTTATTT
TAGTTTGACGATCCGTTGATAACAGCAAGCTTCAACGGTGCTTGCTCCTCGTTTCGCTGC
TGTACATCCAGTCATAAACCGTGGGAAAATTAGGATGAGAAGGTTTATCAAAGACATTAG
CACCAATCTCCCTTGTGGTCACATTACTTGCTGGATGAAATACACTTCTCCACACATCCA
CTTTCCGACCAGATCCTGGTGTGGCCGGGGTAGTCGGACTCGCTGGTAGAGACGCTGATC
CGCCCACCATTGTTGCTTCTTTGGTATTGTTCAGGCTAGTCAAACCGGTAGAGATTCCCC
TGAAATGCCCACGGCCACGGGCTTCAGGTTGAGGACCAGCCACAACGTCGTCCCAAAAAT
TTTCAAGTACACCCATTCTTTATTTTGCTTCCC

QA 1 513 1 513
DS 



CO CL93Contig2 646 10 7 U
AAACACGATAAAAAAGATGCTTTGTATTATATTTCATGTCAAATATGCTTGTAAATTATT
AAAACGTTATTGATTGGCTTGACATATTGTGTTCTGTTTTTTATGTTAAAAAGTGAGAGC
CAACAAAGGCAAAAAAAGCTCAAAATCTTTTAACAAATTATTTAAATACCAATCAAACGG
CCAACTCAACTGATTATTAATCATCTTGAAATAGTAGTGTAGCCACTTAATTTTATGAGA
TCTTGACTTATTTTAATTTGACGATCCGTTGATAACAGCAAGCTTCAACGGTGCTTGCTC
CTCGTTTCGCTGCTATACATCCAGTCATAAACCGTGGGAGAATTAGGATGAGAAGGTTTA
TCAAAGACATTAGCACCAATCTCCCTTGTGGTCACATTACTTGCTGGATGAAATACACTT
CTCCACACATCCACTTTCCGGCCAGATCCTGGTGTGGCCGGGGTAGTCGGACTCACTGGT
AGAGAGGCTGATCCGCCCACCATTGTTCCTTCTTTGGTATTGTTCAGGCTAGTCAAACCG
GTAGAGATTCGCCTGAGATGTCCACGGCCACGGGCTTCAGGTTGAGGACCAGCCACGACG
TCGTCCCAGAGGTTTTCAAGTACACCCATTCTTTATTTTGCTTCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 35 5 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 

AF RS1CG01JQ U 61
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AF RS1DQ62JQ U 1
AF RS1DQ62TF C 1
AF RS1AL12TF C 35
AF RS1DR23TF C 35
AF RS1BX79JQ U 38
AF RS1BX79TF C 339
AF RS1CG01TF C 61
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CCAACTCAACTGATTATTAATCATCTTGAAATAGTAGTGTAGCC

QA 1 164 1 164
DS 

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AATCAAACGGCCAACTCAACTGATTATTAATCATCTTGAAATAGTAGTGTAGCCACTTAA
TTTTATGAGATCTTGACTTATTTTAATTTGACGATCCGTTGATAACAGCAAGCTTCAACG
GTGCTTGCTCCTCGTTTCGCTGCTATACATCCAGTCATAAACCGTGGGAATATTAGGATG
AGAAGGTTTATCAAAAACATTAGCACCAATCTCCCTTGTGGTCACATTACTTGCTGGATG
AAATACACTTCTCCACACATCCACTTTCCGGCCAGATCCTGGTGTGGCCGGGGTAGTC

QA 1 358 1 358
DS 

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TGTTTTTTATGTTAAAAAGTGAGAGCCAACAAAGGCAAAAAAAGCTCAAAATCTTTTAAC
AAATTATTTAAATACCAATCAAACGGCCAACTCAACTGATTATTAATCATCTTGAAATAG
TAGTGTAGCCACTTAATTTTATGAAATCTTGACTTATTTTAATTTGACGATCCGTTGATA
ACAGCAAGCTTCAACGGTGCTTGCTCCTCGTTTCGCTGCTATACATCCAGTCATAAACCG
TGGGAGAATTAGGATGAAAAGGTTTATCAAAGACATTAGCACCAATCTCCCTTGTGGTCA
CATTACTTGCTGGATGAAATACACTTCTCCACACATCCACTTTCCGGCCAGATCCTGGTG
TGGCCGGGGTAGTCGGACTCACTGGTAGAGAGGCTGATCCGCCCACCATTGTT*CATCTT
TGGTATTGTTCAGGCTAGTCAAACCGGTAGAGATTCGCCTGAAATGTCCACGGCCACGGG
CTTCAGGTTGAGGACCAGCCA

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DS 

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AAAACGTTATTGATTGGCTTGACATATTGTGTTCTGTTTTTTATGTTAAAAAGTGAGAGC
CAACAAAGGCAAAAAAAGCTCAAAATCTTTTAACAAATTATTTAAATACCAATCAAACGA
CCAACTCAACTGATTATTAATCATCTTGAAATAGTAGTGTAGCCACTTAATTTTATGAGA
TCTTGACTTATTTTAATTTGACGATCCGTTGATAACAGCAAGCTTCAACGGTGCTTGCTC
CTCGTTTCGCTGCTATACATCCAGTCATAAACCGTGGGAGAATTAGGATGAAAAGGTTTA
TCAAAGACATTAGCACCAATCTCCCTTGTGGTCACATTACTTGCTGGATGAAATACACTT
CTCCACACATCCACTTTCCGGCCAGATCCTGGTGTGGCCGGGGTAGTCGGACTCACTGGT
AGAGAGGCTGATCCGCCCACCATTGTTACTTCTTTGGTATTGTTCAGGCTAGTCAAACCG
GTAGAGATTCGCCTGAGATGTCCACGGCCACGGGCTTCAGGTTGAGGACCAGCCACGACG
TCGTCCCAGAGGTTTTCAAGTACACCCATTCTTTATTTTGCTTCCC

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DS 

RD RS1DQ62TF 646 0 0
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AAAACGTTATTGATTGGCTTGACATATTGTGTTCTGTTTTTTATGTTAAAAAGTGAGAGC
CAACAAAGGCAAAAAAAGCTCAAAATCTTTTAACAAATTATTTAAATACCAATCAAACGA
CCAACTCAACTGATTATTAATCATCTTGAAATAGTAGTGTAGCCACTTAATTTTATGAGA
TCTTGACTTATTTTAATTTGACGATCCGTTGATAACAGCAAGCTTCAACGGTGCTTGCTC
CTCGTTTCGCTGCTATACATCCAGTCATAAACCGTGGGAGAATTAGGATGAGAAGGTTTA
TCAAAGACATTAGCACCAATCTCCCTTGTGGTCACATTACTTGCTGGATGAAATACACTT
CTCCACACATCCACTTTCCGGCCAGATCCTGGTGTGGCCGGGGTAGTCGGACTCACTGGT
AGAGAGGCTGATCCGCCCACCATTGTTACTTCTTTGGTATTGTTCAGGCTAGTCAAACCG
GTAGAGATTCGCCTGAGATGTCCACGGCCACGGGCTTCAGGTTGAGGACCAGCCACGACG
TCGTCCCAGAGGTTTTCAAGTACACCCATTCTTTATTTTGCTTCCC

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DS 

RD RS1AL12TF 612 0 0
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TGTTTTTTATGTTAAAAAGTGAGAGCCAACAAAGGCAAAAAAAGCTCAAAATCTTTTAAC
AAATTATTTAAATACCAATCAAACGGCCAACTCAACTGATTATTAATCATCTTGAAATAG
TAGTGTAGCCACTTAATTTTATGAGATCTTGACTTATTTTAATTTGACGATCCGTTGATA
ACAGCAAGCTTCAACGGTGCTTGCTCCTCGTTTCGCTGCTATACATCCAGTCATAAACCG
TGGGAGAATTAGGATGAGAAGGTTTATCAAAGACATTAGCACCAATCTCCCTTGTGGTCA
CATTACTTGCTGGATGAAATACACTTCTCCACACATCCACTTTCCGGCCAGATCCTGGTG
TGGCCGGGGTAGTCGGACTCACTGGTAGAGAGGCTGATCCGCCCACCATTGTT*CATCTT
TGGTATTGTTCAGGCTAGTCAAACCGGTAGAGATTCGCCTGAGATGTCCACGGCCACGGG
CTTCAGGTTGAGGACCAGCCACGACGTCGTCCCAGAGGTTTTCAAGTACACCCATTCTTT
ATTTTGCTTCCC

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DS 

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CG
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ATTATTTAAATACCAATCAAACGGCCAACTCAACTGATTATTAATCATCTTGAAATAGTA
GTGTAGCCACTTAATTTTATGAGATCTTGACTTATTTTAATTTGACGATCCGTTGATAAC
AGCAAGCTTCAACGGTGCTTGCTCCTCGTTTCGCTGCTATACATCCAGTCATAAACCGTG
GGAATATTAGGATGAGAAGGTTTATCAAAGACATTAGCACCAATCTCCCTTGTGGTCACA
TTACTTGCTGGATGAAATACACTTCTCCACACATCCACTTTCCGGCCAGATCCTGGTGTG
GCCGGGGTAGTCGGACTCACTGGTAGAGAGGCTGATCCGCCCACCATTGTT***CCTTTG
GTATTGTTCAGGCTAGTCAAACCGGTAGAGATTCGCCTGAGATGTCCACGGCCACGGGCT
TCAGGTTGAGGACCAGCCACGACGTCGTCCCAGAGGTTTTCAAGTACACCCATTCTTTAT
TTT
CCCT

QA 3 605 3 605
DS 

RD RS1BX79JQ 609 0 0
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TTTTTATGTTAAAAAGTGAGAGCCAACAAAGGCAAAAAAAGCTCAAAATCTTTTAACAAA
TTATTTAAATACCAATCAAACGGCCAACTCAACTGATTATTAATCATCTTGAAATAGTAG
TGTAGCCACTTAATTTTATGAGATCTTGACTTATTTTAATTTGACGATCCGTTGATAACA
GCAAGCTTCAACGGTGCTTGCTCCTCGTTTCGCTGCTATACATCCAGTCATAAACCGTGG
GAGAATTAGGATGAGAAGGTTTATCAAAGACATTAGCACCAATCTCCCTTGTGGTCACAT
TACTTGCTGGATGAAATACACTTCTCCACACATCCACTTTCCGGCCAGATCCTGGTGTGG
CCGGGGTAGTCGGACTCACTGGTAGAGAGGCTGATCCGCCCACCATTGTTCCTTCTTTGG
TATTGTTCAGGCTAGTCAAACCGGTAGAGATTCGCCTGAGATGTCCACGGCCACGGGCTT
CAGGTTGAGGACCAGCCACGACGTCGTCCCAGAGGTTTTCAAGTACACCCATTCTTTATT
TTGCTTCCC

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DS 

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CGGGGTAGTCGGACTCACTGGTAGAGAGGCTGATCCGCCCACCATTGTTCCTTCTTTGGT
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AGGTTGAGGACCAGCCACGACGTCGTCCCAGAGGTTTTCAAGTACACCCATTCTTTATTT
TGCTTCCC

QA 1 308 1 308
DS 

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CCAACTCAACTGATTATTAATCATCTTGAAATAGTAGTGTAGCCACTTAATTTTATGAGA
TCTTGACTTATTTTAATTTGACGATCCGTTGATAACAGCAAGCTTCAACGGTGCTTGCTC
CTCGTTTCGCTGCTATACATCCAGTCATAAACCGTGGGAGAATTAGGATGAGAAGGTTTA
TCAAAGACATTAGCACCAATCTCCCTTGTGGTCACATTACTTGCTGGATGAAATACACTT
CTCCACACATCCACTTTCCGGCCAGATCCTGGTGTGGCCGGGGTAGTCGGACTCACTGGT
AGAGAGGCTGATCCGCCCACCATTGTTCCTTCTTTGGTATTGTTCAGGCTAGTCAAACCG
GTAGAGATTCGCCTGAGATGTCCACGGCCACGGGCTTCAGGTTGAGGACCAGCCACGACG
TCGTCCCAGAGGTTTTCAAGTACACCCATTCTTTATTTTGCTTCCC

QA 1 586 1 586
DS 



AS 3 10

CO CL94Contig1 1028 6 29 U
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ACAAAACTAAATGCATAAAAATACCCTCACCCAAAAGTGATTAAGCAACACCAGTTTCTA
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AAATAGCTTAAGCAGCAGCAGTTTATTAGAGAAGCTTCTGATCGAAATGCCATGTCCCAT
GTCCTTTGCCGAGTCTTCTGAGTTGAGAGACGTATTCCGAGATTTTCTTAATTGCTTCAA
CCTGTTCGTTCAAAAACACGCTCTCAATGAAATCAGCCAACTGGACATCATCGTTCTTGG
AAGCCACACTGTGCAGGTTTAGGAGTTTTTCATTGACCAGTTTCTCCAATGATAGAGCCA
ACTCCATGGCATAGAGAGCATCTCCTTTCTCAGCGTGGTCAAACTCAGACTGAGGCATCA
CCATAGGCTGTAGCTTAACCCTCCCACCACGTTTGTTCTGATACTCCATCAACATCTCAG
CGTGGTCTCGTTCTTCCACACTCGAGTCCTTGAAAAACTTGGCAAGACCTTTGAGAGCAA
CGTTGTCACGGTCAAAGTAAGCGTACAAAGCGTGATACACATAAGACACGTTGTACTCAA
CATTGATCTGCTCGTTCACGGCGGCTTCGCACTCAGGGGAGTACATATGTCGAGCAAGAG
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AAGCAGCTTTGAGAAGCATTTTTGAATCTCTCTCTCTCTCTGTCTGCAGCGAAAAAATGG
GAAGAAGGGTTTGTGTCCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTAC
CGTCGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 20 5 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 20 20 20 20 5 5 20 5 20 20 
20 20 20 20 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 

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AF RS1BA78JQ U 1
AF RS1A133JQ U 120
AF RS1CX96TF C 329
AF RS1A133TV C 141
AF RS1A133TF C 188
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RD RS1CX96JQ 548 0 0
ATGAACTTATTAGTCAAAGGTTTGTGAGCAAACAAAACTAAATGCATAAAAATACCCTCA
CCCAAAAGTGATTAAGCAACACCAGTTTCTAAAGAGAGTACAACAACCATAGATTAAGCA
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AAAAGCTTCTGATCGAAATGCCATGTCCCATGTCCTTTGCCGAGTCTTCTGAGTTGAGAG
ACGTATTCCGAGATTTTCTTAATTGCTTCAACCTGTTCGTTCAAAAACTCGCTCTCAATG
AAATCGGCCAACTGGACATCATCGTTCTTGGAAGCCACACTGTGCAGGTTTAGGAGTTTT
TCATTGACCAGTTTCTCCAATGATAGAGCCAACTCCATGGCATAAAAAGCATCTCCTTTC
TCAGCGTGGTCAAACTCAGACTGAGGCATCACCATAGGCTGTAGCTTAACCCTCCCACCA
CGTTTGTTCTGATACTCCATCAACATCTCAGCGTGGTCTCGTTCTTCCACACTCGAGTCC
TTGAAAAA

QA 1 548 1 548
DS 

RD RS1BA78JQ 692 0 0
GGTTAACATTAACTTTCACCTCAAGTAAAATGAACTTATTAGTCAAAGGTTTGTGAGCAA
ACAAAACTAAATGCATAAAAATACCCTCAGCCAAAAGTGATTAAGCAACACCAGTTTCTA
AAGAGAGTACAACAACCATAGATTAAGCAGCAGCAGCAGTTTATTAGAGAT*ACAACCAA
AAATAGCTTAAGCAGCAGCAGTTTATTAGAGAAGCTTCTGATCGAAATGCCATGTCCCAT
GTCCTTTGACGAGTCTTCTGAGTTGAGAGACGTATTCCGAGATTTTCTTAATTGCTTCAA
CCTGTTCGTTCAAAAACTCGCTCTCAATGAAATCGGCCAACTGGACATCATCGTTCTCGG
AAGCCACACTGTGCAGGTTTAGGAGTTTTTCATTGACCAGTTTCTCCAATGATAGAGCCA
ATTCCATGGCATAGAGAGCATCTCCTTTCTCAGTGTGGTCAAACTCAGACTGAGGCATCA
CCATAGGCTGTAGCTTAACCCTCCCACCACGTTTGTTCTGATACTCCATCAACATCTCAG
CGTGGTCTCGTTCTTCCACACTCGAGTCCTTGAAAAACTTGGCAAGACCTTTGAGAGCAA
CGTTGTCACGATCGAAGTAAGCGTACAAAGCGTGATACACATAAGACACGTTGTATTCCA
CATTGATCTGCTCATTCACGGCGGCTTCGCAC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RS1A133JQ 772 0 0
AAAGAGAGTACAACAACCATAGATTAAGCAGCAGCAG***TTTATTAGAGATTACAACCA
AAAATAGCTTAAGCAGCAGCAGTTTATTAGAGAAGCTTCTGATCGAAATGCCATGTCCCA
TGTCCTTTGCCGAGTCTTCTGAGTTGAGAGACGTATTCCGAGATTTTCTTAATTGCTTCA
ACCTGTTCGTTCAAAAACACGCTCTCAATGAAATCAGCCAACTGGACATCATCGTTCTTG
GAAGCCACACTGTGCAGGTTTAGGAGTTTTTCATTGACCAGTTTCTCCAATGATAGAGCC
AACTCCATGGCATAGAGAGCATCTCCTTTCTCAGCGTGGTCAAACTCAGACTGAGGCATC
ACCATAGGCTGTAGCTTAACCCTCCCACCACGTTTGTTCTGATACTCCATCAACATCTCA
GCGTGGTCTCGTTCTTCCACACTCGAGTCCTTGAAAAACTTGGCAAGACCTTTGAGAGCA
ACGTTGTCACGGTCAAAGTAAGCGTACAAAGCGTGATACACATAAGACACGTTGTACTCA
ACATTGATCTGCTCGTTCACGGCGGCTTCGCACTCAGGGGAGTACATATGTCGAGCAAGA
GAGAGCTGCGGACTCGAAGGGACGAGATCGAGTTCCTTCTTCACCTCCACGAACGGCTCG
AAAACGACGCCGCTTAGTGGCTGCGTGGAGGCGCGAACAGAGAAGGAGAGGTTTTTCCCG
GAGGAGAAGAGAGGAGAGATGTCCTTCTTCGCTCCGTGAACGTTCATGAG
GG

QA 1 770 1 770
DS 

RD RS1CX96TF 655 0 0
GAAATCGGCCAACTGGACATCATCGTTCTTGGAAGCCACACTGTGCAGGTTTAGGAGTTT
TTCATTGACCAGTTTCTCCAATGATAGAGCCAACTCCATGGCATAGAGAGCATCTCCTTT
CTCAGCGTGGTCAAACTCAGACTGAGGCATCACCATAGGCTGTAGCTTAACCCTCCCACC
ACGTTTGTTCTGATACTCCATCAACATCTCAGCGTGGTCTCGTTCTTCCACACTCGAGTC
CTTGAAAAACTTGGCAAGACCTTTGAGAGCAACGTTGTCACGATCGAAGTAAGCGTACAA
AGCGTGATACACATAAGACACGTTGTATTTCACATTGATCTGCTCATTCACGGCGGCTTC
GCACTCAGGGGAGTACATATGTCGAGCAAGAGAGATCTGCGGACTCGAAGGGACGAGATC
GAGTTCCTTCTTCACTTCCACAAACGGCTCGAAAACGACGCCGCTTAGTGGCTGCGTGGA
GGCGCGAACAGAGAAGGAGAGGTTTTTCCCGGAGGAGAAGAGAGGAGAGATGTCCTTCTT
CACTCCGTGAACGTTCATGAGCGAGAGCGAAGAAGCGTACTTGAGAAGCATTTTTGAATC
TCTCTCTCTCTCTCTCTGAAGCGAAGAAATGGGAAGA
GAGAAGAAGGGTTTGTCC

QA 1 637 1 637
DS 

RD RS1A133TV 888 0 0
ATAGATTA
AGCAGCAGCAGTTTATTAGAGATTACAACCAAAAATAGCTTAAGCAGCAGCAGTTTATTA
GAGAAGCTTCTGATCGAAATGCCATGTCCCATGTCCTTTGCCGAGTCTTCTGAGTTGAGA
GACGTATTCCGAGATTTTCTTAATTGCTTCAACCTGTTCGTTCAAAAACACGCTCTCAAT
GAAATCAGCCAACTGGACATCATCGTTCTTGGAAGCCACACTGTGCAGGTTTAGGAGTTT
TTCATTGACCAGTTTCTCCAATGATAGAGCCAACTCCATGGCATAGAGAGCATCTCCTTT
CTCAGCGTGGTCAAACTCAGACTGAGGCATCACCATAGGCTGTAGCTTAACCCTCCCACC
ACGTTTGTTCTGATACTCCATCAACATCTCAGCGTGGTCTCGTTCTTCCACACTCGAGTC
CTTGAAAAACTTGGCAAGACCTTTGAGAGCAACGTTGTCACGGTCAAAGTAAGCGTACAA
AGCGTGATACACATAAGACACGTTGTACTCAACATTGATCTGCTCGTTCACGGCGGCTTC
GCACTCAGGGGAGTACATATGTCGAGCAAGAGAGAGCTGCGGACTCGAAGGGACGAGATC
GAGTTCCTTCTTCACCTCCACGAACGGCTCGAAAACGACGCCGCTTAGTGGCTGCGTGGA
GGCGCGAACAGAGAAGGAGAGGTTTTTCCCGGAGGAGAAGAGAGGAGAGATGTCCTTCTT
CGCTCCGTGAACGTTCATGAGGGAGAAAGTAGAAGCAGCTTTGAGAAGCATTTTTGAATC
TCTCTCTCTCTCTGTCTGCAGCGAAAAAATGGGAAGAAGGGTTTGTGTCCCCCCGGCCGT
AATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 9 888 9 888
DS 

RD RS1A133TF 841 0 0
TTAAGCAGCAGCAGTTTATTAGAGAAGCTTCTGATCGAAATGCCATGTCCCATGTCCTTT
GCCGAGTCTTCTGAGTTGAGAGACGTATTCCGAGATTTTCTTAATTGCTTCAACCTGTTC
GTTCAAAAACACGCTCTCAATGAAATCAGCCAACTGGACATCATCGTTCTTGGAAGCCAC
ACTGTGCAGGTTTAGGAGTTTTTCATTGACCAGTTTCTCCAATGATAGAGCCAACTCCAT
GGCATAGAGAGCATCTCCTTTCTCAGCGTGGTCAAACTCAGACTGAGGCATCACCATAGG
CTGTAGCTTAACCCTCCCACCACGTTTGTTCTGATACTCCATCAACATCTCAGCGTGGTC
TCGTTCTTCCACACTCGAGTCCTTGAAAAACTTGGCAAGACCTTTGAGAGCAACGTTGTC
ACGGTCAAAGTAAGCGTACAAAGCGTGATACACATAAGACACGTTGTACTCAACATTGAT
CTGCTCGTTCACGGCGGCTTCGCACTCAGGGGAGTACATATGTCGAGCAAGAGAGAGCTG
CGGACTCGAAGGGACGAGATCGAGTTCCTTCTTCACCTCCACGAACGGCTCGAAAACGAC
GCCGCTTAGTGGCTGCGTGGAGGCGCGAACAGAGAAGGAGAGGTTTTTCCCGGAGGAGAA
GAGAGGAGAGATGTCCTTCTTCGCTCCGTGAACGTTCATGAGGGAGAAAGTAGAAGCAGC
TTTGAGAAGCATTTTTGAATCTCTCTCTCTCTCTGTCTGCAGCGAAAAAATGGGAAGAAG
GGTTTGTGTCCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGAC
T

QA 1 841 1 841
DS 



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AAACTAACTGCTTAATAGTCAAGAACCAAAACAGATCAAGGAACAAGAGTTTATAAGAGA
GATTACAACCAAAACAGATTAAGCAACATTAGTTTTATAAGAAGAGATTAAGCAGCAGCA
GCTTCCAGAAGCTCTTGATCGAAGTGCCATGTTCCATGCCCTTTGCCGAGTCTTCTGAGC
TGAGCCACATATTCAGAGATTTTCTTAATCGCTTCAACCTGTTCGTTCAAAAACTCGCTC
TCAATGAAATCTGCCAACTGGACATCATCGTTCTTCGAAGCCACACTGTACACGTTGAGG
AGCTTTTCATTGACCAGCTTCTCCAACGATAGAGCCAGCTCCATGGCATAGAGAGCATCT
CCCTTCTCAGCGTGATCAAACTCAGACTGAGGCATCACCATAGGCTGTAACTTAACTCTC
CCACCACGTTTGTTCTGATACTCCATCAACATCTCAGCGTGGTCTCGTTCTTCCACACTC
GACTCCTTGAAAAACTTGGCAAGACCTTTGAGAGCAACGTTATCACGATCAAAGTAAGCG
TACAAGGCGTGATACACGTAAGACACGTTGTACTCCACATTGATCTGCTCATTCACGGCG
GCTTCGCACTCGGGAGAGTACAGATGGCGAGCAAGAGAGAGCTGAAGGCTCGAAGGGACG
AGATCGAGCTCCCTCTTCACCTCCTCAAACGGCTCGAAAACGACGCCGCTTAGGGTCTGC
GTCGTGGTGGTGGTAGCCTTTGAGGCAGACACAGAGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G806JQ U 17
AF RS1EO75JQ U 1
BS 1 406 RS1EO75JQ
BS 407 408 RS1G806JQ
BS 409 644 RS1EO75JQ
BS 645 646 RS1G806JQ
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BS 673 673 RS1G806JQ
BS 674 758 RS1EO75JQ

RD RS1G806JQ 693 0 0
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ATTAGTTTTATAAGAAGAGATTAAGCAGCAGCAGCTTCCAGAAGCTCTTGATCGAAGTGC
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TCGTTCTTCGAAGCCGCACTGTGCACGTTGAGGAGCTTTTCATTGACCAGCTTCTCCAAC
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CGAGCAAGAGAGATC*GAAGGCTCGAAGGGACGAGATCGAGCTCCCTCTTCACCTCCTCA
AACGGCTCGAAAACGACGCCGC

QA 12 693 12 693
DS 

RD RS1EO75JQ 758 0 0
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GATTACAACCAAAACAGATTAAGCAACATTAGTTTTATAAGAAGAGATTAAGCAGCAGCA
GCTTCCAGAAGCTCTTGATCGAAGTGCCATGTTCCATGCCCTTTGCCGAGTCTTCTGAGC
TGAGCCACATATTCAGAGATTTTCTTAATCGCTTCAACCTGTTCGTTCAAAAACTCGCTC
TCAATGAAATCTGCCAACTGGACATCATCGTTCTTCGAAGCCACACTGTACACGTTGAGG
AGCTTTTCATTGACCAGCTTCTCCAACGATAGAGCCAGCTCCATGGCATAGAGAGCATCT
CCCTTCTCAGCGTGATCAAACTCAGACTGAGGCATCACCATAGGCT**AACTTAACTCTC
CCACCACGTTTGTTCTGATACTCCATCAACATCTCAGCGTGGTCTCGTTCTTCCACACTC
GACTCCTTGAAAAACTTGGCAAGACCTTTGAGAGCAACGTTATCACGATCAAAGTAAGCG
TACAAGGCGTGATACACGTAAGACACGTTGTACTCCACATTGATCTGCTCATTCACGGCG
GCTTCGCACTCGGGAGAGTACAGATGGCGAGCAAGAGAGAGCTGTGGGCTCGAAGGGACG
AGATCGAGCTCCTTCTTCACCTCCTCAAACGGCTCGAAAACGACGCCGCTTAGGGTCTGC
GTCGTGGTGGTGGTAGCCTTTGAGGCAGACACAGAGAA

QA 1 758 1 758
DS 



CO CL94Contig3 844 2 9 U
GGACAGACAAACCCTTTCCTCCTCCCATTTCATTGCAGAGACAGAGAGAGAGAGATTCAG
ACACAAAAAATGCTTCTCAAATCAGCTTCTGCTTTCTCCCTCGTGAACATCCATGGAGTC
GAGAAGGACATCTCTCCTCTCTCCTCCTCCTCGTCCTCGAGTCTTCCCGTTTCTTCGGGA
AAACCACGAAACCTCTCCTTCTCTGTGTCTGCCTCAAAGGCTACCACCACCACGACGCAG
ACCCTAAGCGGCGTCGTTTTCGAGCCGTTTGAGGAGGTGAAGAAGGAGCTCGATCTCGTC
CCTTCGAGCCCACAGATCTCTCTTGCTCGCCATCTGTACTCTCCCGAGTGCGAAGCCGCC
GTGAATGAGCAGATCAATGTGGAGTACAACGTGTCTTACGTGTATCACGCCTTGTACGCT
TACTTTGATCGTGATAACGTTGCTCTCAAAGGTCTTGCCAAGTTTTTCAAGGAGTCGAGT
GTGGAAGAACGAGACCACGCTGAGATGTTGATGGAGTATCAGAACAAACGTGGTGGGAGA
GTTAAGTTACAGCCTATGGTGATGCCTCAGTCTGAGTTTGATCACGCTGAGAAGGGAGAT
GCTCTCTATGCCATGGAGCTGGCTCTATCGTTGGAGAAGCTGGTCAATGAAAAGCTCCTC
AACGTGTACAGTGTGGCTTCGAAGAACGATGATGTCCAGTTGGCAGATTTCATTGAGAGC
GAGTTTTGAACGAACAGGTGAAGCGATAAGAAATCTCTGATATGTGGCTCAGCTCAGAGA
CTCGGCAAAGGCATGGAACATGGCACTTCGATCAGAGCTTCTGGAGCTGCTGCTGCTTAT
CTCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1G806TF U 1
AF RS1EO75TF U 1
BS 1 162 RS1EO75TF
BS 163 163 RS1G806TF
BS 164 186 RS1EO75TF
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BS 317 549 RS1EO75TF
BS 550 551 RS1G806TF
BS 552 844 RS1EO75TF

RD RS1G806TF 589 0 0
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AAACCACGAAACCTCTCCTTCTCTGTGTCTGCCTCAAAGGCTACCACCACCACGACGCAG
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QA 1 589 1 589
DS 

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GGACAGACAAACCCTTTCCTCCTCCCATTTCATTGCAGAGACAGAGAGAGAGAGATTCAG
ACACAAAAAATGCTTCTCAAATCAGCTTCTGCTTTCTCCCTCGTGAACATCCATGGAGTC
GAGAAGGACATCTCTCCTCTCTCCTCCTCCTCGTCCTCGAGTTTTCCCGTTTCTTCGGGA
AAACCA**AAACCTCTCCTTCTCTGTGTCTGCCTCAAAGGCTACCACCACCACGACGCAG
ACCCTAAGCGGCGTCGTTTTCGAGCCGTTTGAGGAGGTGAAGAAGGAGCTCGATCTCGTC
CCTTCGAGCCCACAGCTCTCTCTTGCTCGCCATCTGTACTCTCCCGAGTGCGAAGCCGCC
GTGAATGAGCAGATCAATGTGGAGTACAACGTGTCTTACGTGTATCACGCCTTGTACGCT
TACTTTGATCGTGATAACGTTGCTCTCAAAGGTCTTGCCAAGTTTTTCAAGGAGTCGAGT
GTGGAAGAACGAGACCACGCTGAGATGTTGATGGAGTATCAGAACAAACGTGGTGGGAGA
GTTAAGTTA**GCCTATGGTGATGCCTCAGTCTGAGTTTGATCACGCTGAGAAGGGAGAT
GCTCTCTATGCCATGGAGCTGGCTCTATCGTTGGAGAAGCTGGTCAATGAAAAGCTCCTC
AACGTGTACAGTGTGGCTTCGAAGAACGATGATGTCCAGTTGGCAGATTTCATTGAGAGC
GAGTTTTGAACGAACAGGTGAAGCGATAAGAAATCTCTGATATGTGGCTCAGCTCAGAGA
CTCGGCAAAGGCATGGAACATGGCACTTCGATCAGAGCTTCTGGAGCTGCTGCTGCTTAT
CTCT

QA 1 844 1 844
DS 



AS 4 15

CO CL95Contig1 775 3 17 U
ATCCATACAATCTTGCACTTCTCGACAAATCTAATATCTTTCGTTATTCTAAGTGGTTAT
TCCTTTTGGGGTAAGGAAAAGCTTTTTATTCTCAATTCTTGGGTTCAAGAATTCCTATAT
AATTTAAGTGATACAATTAAAGCTTTTTCGATTCTTTTATTAACTGATTTATGTATCGGA
TTCCATTCGCCTCACGGTTGGGAACTAATGATTGGTTATATTTACAAAGATTTTGGGTTT
GCTCATTATGAACAAATTTTATCTGGTCTAGTTTCTACCTTTCCAGTCATTCTTGATACA
ATTTTTAAATATTGGATCTTTCGTTATTTAAATCGTGTATCTCCGTCACTTGTAGTGATT
TATCATGCAATAAATGACTAAAAAACGATTCACTGATCCAATTCTACT*********TTT
ATACATCATAACCAAATCAAAGTCGTATTTACTTTACTCTTTTTTACCCACGAGGGATTC
CTTGTATATTTCAATAAAAAAAAAATTTTTTTTTCAGTAAATGTAAATAGCAGAATTGTG
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ATCTGTCTCACTCATGATATATATAATAACTTGGGCATCCATTTCAAGTGCATATCCAAT
TTTTGCCCAGCAGAATTATGAAAATCCACGAGAGGCAACTGGGCGTATTGTATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 0 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C381TF U 1
AF RS1E520TF U 8
AF RS1D965TF U 195
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RD RS1C381TF 717 0 0
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T*CCATTCGCCTCACGGTTGGGAACTAATGATTGGTTATATTTACAAAGATTTTGGGTTT
GCTCATTATGAACAAATTTTATCTGGTCTAGTTTCTACCTTTCCAGTCATTCTTGATACA
ATTTTTAAATATTGGATCTTTCGTTATTTAAATCGTGTATCTCCGTCACTTGTAGTGATT
TATCATGCAATAAATGACTAAAAAACGATTCACTGATCCAATTCTACTCTTTCTTACTTT
ATACATCATAACCAAATCAAAGTCGTATTTACTTTACTCTTTTTTACCCACGAGGGATTC
CTTGTATATTTCAATAAAAAAAA***TTTTTTTTCAGTAAATGTAAATAGCAGAATTGTG
GCTAGGGAAGTATATTATCGACCTACCTAACTTTATTGTGGAAATTTTCGGGATAAATGA
TTGGACCAGGCAAACTAGAAATACCTTTTCTTGGATAAGGGAAGAGATTACTCGCTCCAT
ATCTGTCTCACTCATGATATATATAATAACTTGGGCATCCATTTCAAGTGCATATCC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1E520TF 751 0 0
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GGGGTAAGGAAAAGCTTTTTATTCTCAATTCTTGGGTTCAAGAATTCCTATATAATTTAA
GTGATACAATTAAAGCTTTTTCGATTCTTTTATTAACTGATTTATGTATCGGATTCCATT
CGCCTCACGGTTGGGAACTAATGATTGGTTATATTTACAAAGATTTTGGGTTTGCTCATT
ATGAACAAATTTTATCTGGTCTAGTTTCTACCTTTCCAGTCATTCTTGATACAATTTTTA
AATATTGGATCTTTCGTTATTTAAATCGTGTATCTCCGTCACTTGTAGTGATTTATCATG
CAATAAATGACTAAAAAACGATTCACTGATCCAATTCTACT*********TTTATACATC
ATAACCAAATCAAAGTCGTATTTACTTTACTCTTTTTTACCCACGAGGGATTCCTTGTAT
ATTTCAATAAAAAAAAATTTTTTTTTTCAGTAAATGTAAATAGCAGAATTGTGGCTAGGG
AAGTATATTATCGACCTACCTAACTTTATTGTAGAAATTTTCGGGATAAATGATTGGACC
ATGCAAACTAGAAATACCTTTTCTTGGATAAGGGAAGAGATTACTCGCTCCATATCTGTC
TCACTCATGATATATATAATAACTTGGGCATCCATTTCAAGTGCATATCCAATTTT*GCC
CAGCAGAATTATGAAAATCCACGAGAGGCAA

QA 1 751 1 751
DS 

RD RS1D965TF 581 0 0
G
GGTTGGGAACTAATGATTGGTTATATTTACAAAGATTTTGGGTTTGCTCATTATGAACAA
ATTTTATCTGGTCTAGTTTCTACCTTTCCAGTCATTCTTGATACAATTTTTAAATATTGG
ATCTTTCGTTATTTAAATCGTGTATCTCCGTCACTTGTAGTGATTTATCATGCAATAAAT
GACTAAAAAACGATTCACTGATCCAATTCTACT*********TTTATACATCATAACCAA
ATCAAAGTCGTATTTACTTTACTCTTTTTTACCCACGAGGGATTCCTTGTATATTTCAAT
AAAAAAAAAATTTTTTTTTCAGTAAATGTAAATAGCAGAATTGTGGCTAGGGAAGTATAT
TATCGACCTACCTAACTTTATTGTAGAAATTTTCGGGATAAATGATTGGACCATGCAAAC
TAGAAATACCTTTTCTTGGATAAGGGAAGAGATTACTCGCTCCATATCTGTCTCACTCAT
GATATATATAATAACTTGGGCATCCATTTCAAGTGCATATCCCATTTTTGCCCAGCAGAA
TTATGAAAATCCACGAGAGGCAACTGGGCGTATTGTATGT

QA 2 581 2 581
DS 



CO CL95Contig2 1206 5 22 U
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AGGTTCATTGGGATTCTTATTGATTGGAACTTCCAGTTATCTTGGTAGAAATTTTATATC
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GATCGCGGGTCTCTTTATTAGTTGCTATTTGTGGTGCACTATTTTGTGGAATGTGGGTAG
TGGTTATGATCTTTTCGACCGAAAAGAAGGGATAGTACGTATTTTTCGTTGGGGATTTCC
TGGAAAAAGCCGTCGCATCTTTTTACGATTCCTTATGAAAGATATTCAGTCGATCAGAAT
CGAAGTTAAAGAGGGTGTTTCTGCCCGGCGTGTCCTTTATATGGAAATTCGAGGTCAAGG
GGCTATTCCTTTAATTCGTACTGATGAGAATTTTACTACACGAGAAATTGAGCAAAAAGC
TGCTGAATTGGCTTACTTCTTGCGTGTACCAATTGAAGTATTTTGAAATGAATTCTTTAA
AGTTTAAAGACTAAATCCTTTGGTAGTAGGAAGAAAAAACGAAAGAATTGCTTTCTTTTT
TTTTT*CAATTGAACATTCATCTATTCTTTTATGCTCGTTTTTTTTT*ATATATTTGATA
GAAAAGAAAGGGAGTTTATTCGTCTCGAAAATAGAATCATATTTTTTATTTTAAAAATTA
AAAAAAGTTCTTTTAGTAGTGATCGAAAAAAGGGGGAATAACATCCTGGAAATACAATTT
TTTCTTGATTCAAATTGGAAGTGTATTCTGAGTCTATTTCTGTATTCTTTCTAGATTCAA
AGCAAAGACTAAGTATTGAATCAAAAGAAAAAGATAAAAGGGATTATAGGCTCAATACAT
TCTATTTGAATTAGAATAGAAACTCATGCTCGATAGAAATAGTAGATCTAATAGAATCAA
CAAATGCGGTAGGTTCATTAACAATTCACAGATTCAAAATGGCAAAAAAGAAAGCATTCA
TTCCTTTTTTTTATTTTACATCTATAGTCTTTTTGCCCTGGCTGATCTCTCTCTGCTGTA
ATAAAAATTTGAAAACTTGGATTACTAATTGGTGGAATACTAGACAATGCGAAACTTTCT
TGAATGATATTCAAGAAAAAGTGTCTAGAAAATTCATACATTAGAGGACTATTCAGCTGG
ATGAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1CJ26TF U 1
AF RS1DH79TF U 10
AF RS1CJ26JQ C 320
AF RS1G870TF U 607
AF RS1ET94TF U 409
BS 1 701 RS1CJ26TF
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BS 781 953 RS1ET94TF
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BS 1063 1086 RS1ET94TF
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BS 1088 1094 RS1ET94TF
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BS 1128 1133 RS1ET94TF
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BS 1145 1206 RS1ET94TF

RD RS1CJ26TF 701 0 0
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TGGAAAAAGCCGTCGCATCTTTTTACGATTCCTTATGAAAGATATTCAGTCGATCAGAAT
CGAAGTTAAAGAGGGTGTTTCTGCCCGGCGTGTCCTTTATATGGAAATTCGAGGTCAAGG
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TGCTGAATTGGCTTACTTCTTGCGTGTACCAATTGAAGTATTTTGAAATGAATTCTTTAA
AGTTTAAAGACTAAATCCTTTGGTAGTAGGAAGAAAAAACGAAAGAATTGCTTTCTTTTT
TTTTT*CAATTGAACATTCATCTATTCTTTTATGCTCGTTTTTTTTT*ATATATTTGATA
GAAAAGAAAGGGAGTTTATTCGTCTCGAAAATAGAATCATA

QA 1 701 1 701
DS 

RD RS1DH79TF 657 0 0
G
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CTTTTCGACCGAAAAGAAGGGATAGTACGTATTTTTCGTTGGGGATTTCCTGGAAAAAGC
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TGAACGTTCATCTATTCTTTTATGCTCGTTTTTTT***ATATATTTGATAGAAAAG

QA 2 657 2 657
DS 

RD RS1CJ26JQ 684 0 0
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TTGGTAGTAGGAAGAAAAAACGAAAGAATTGCTTTCTTTTTTTTTT*CAATTGAACATTC
ATCTATTCTTTTATGCTCGTTTTTTTTTTATATATTTGATAGAAAAGAAAGGGAGTTTAT
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AAACTCATGCTCGATAGAAATAGTAGATCTAATAGAATCAACAAATGCGGTAGGTTCATT
AACAATTCACAGATTCAAAATGGC

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DS 

RD RS1G870TF 569 0 0
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AAAGGGAGTTTATTCGTCTCGAAAATAGAATCATATTTTTTATTTTAAAAATTAAAAAAA
GTTCTTTTAGTAGTGATCGAAAAAAGGGGGAATAACATCCTGGAAATACAATTTTTTCTT
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GACTAAGTATTGAATCAAAAGAAAAAGATAAAAGGGATTATAGGCTCAATACATTCTATT
TGAATTAGAATAGAAACTCATGCTCGATAGAAATAGTAGATCTAATAGAATCAACAAATG
CGGTAGGTTCATTAACAATTCACAGATTCAAAATGGCAAAAAAGAAAGCATTCATTCCTT
TTTTTTATTTTACATCTATAGTCTTTTTGCCCTGGCTGATCTCTCTCTGCTGTAATAAAA
ATTTGAAAACTTGGATTACTAATTGGTGGAATACTAGACAATGCGAAACTTTCTTGAATG
ATATTCAAGAAAAA
AGTGTTCTAGAAAAA

QA 1 554 1 554
DS 

RD RS1ET94TF 798 0 0
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TGAGCAAAAAGCTGCTGAATTGGCTTACTTCTTGCGTGTACCAATTGAAGTATTTTGAAA
TGAATTCTTTAAAGTTTAAAGACTAAATCCTTTGGCAGTAGGAAGAAAAAACGAAAGAAT
TGCTTTCTTTTTTTTT**CAATTGAACATTCATCTATTCTTTTATGCTCGTTTTTTTT**
ATATATTTGATAGAAAAGAAAGGGAGTTTATTCGTCTCGAAAATAGAATCATATTTTTTA
TTTTAAAAATTAAAAAAAGTTCTTTTAGTAGTGATCGAAAAAAGGGGGAATAACATCCTG
GAAATACAATTCTTTCTTGATTCAAATTGGAAGTGTATTCTGAGTCTATTTCTGTATTCT
TTCTAGATTCAAAGCAAAGACTAAGTATTGAATCAAAAGAAAAAGATAAAAGGGATTATA
GGCTCAATACATTCTATTTGAATTAGAATAGAAACTCATGCTCGATAGAAATAGTAGATC
TAATAAAATCAACAAATGCGGTAGGTTCATTAACAATTCACAGATTCAAAATGGCAAAAA
AGAAAGCATTCATTCCTTTTTTT*ATTTTACATCTATAGTCTTTTTGCCCTGGTTGATCT
CTCTCTGCTGTAATAAAA*TTTGAAA*CTTGGATTACTAATTGGTGGA*TACTAGACA*T
GCGAA*CTTTCTTGA*TGATATTCAAGAAAAAGTGTCTAGAAAATTCATACATTAGAGGA
CTATTCAGCTGGATGAAT

QA 1 798 1 798
DS 



CO CL95Contig3 756 3 3 U
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CGAAAGATCCAATATTTAAAAATTGTATCAAGAATGACTGGAAAGGTAGAAACTAGACCA
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TCCCAACCGTGAGGCGAATGGAATCCGATACATAAATCAGTTAATAAAAGAATCGAAAAA
GCTTTAATTGTATCACTTAAATTATATAGGAATTCTTGAACCCAAGAATTGAGAATAAAA
AGCTTTTCCTTACCCCAAAAGGAATAACCACTTAGAATAACGAAAGATATTAGATTTGTC
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ATATCATTCAAGAAAGTTTCGCATTGTCTAGTATTCCACCAATTAGTAATCCAAGTTTTC
AAATTTTTATTACAGCAGAGAGAGATCAACCAGGGC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G870JQ U 12
AF RS1DK21TF C 1
AF RS1ET94JQ U 12
BS 1 11 RS1DK21TF
BS 12 630 RS1G870JQ
BS 631 756 RS1ET94JQ

RD RS1G870JQ 623 0 0
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GTGA

QA 1 619 1 619
DS 

RD RS1DK21TF 664 0 0
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TCCCAACCGTGAGGCGAATGGAATCCGATACATAAATCAGTTAATAAAAGAATCGAAAAA
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GAGAAGTGCAAGATTGTATGGATACGATACTCGTTGTGTATCTTGATGAATTGGATCGTT
TCTTTGTGGATTCCTAGACGAAATTGTTGTAAATCGGTTTCTGGGTATTCCTTTATCATT
TCATCCAGCTGGAATAGTTCCTCTAATTGTATGAATTTTTCTAGAACACTTTTTTCTTGA
ATA
C

QA 1 663 1 663
DS 

RD RS1ET94JQ 745 0 0
GAAATATACAAGGAATCCCTCGTGGGTAAAAAAGAGTAAAGTAAATACGACTTTGATTTG
GTTATGATGTATAAAGTAAGAAAGAGTAGAATTGGATCAGTGAATCGTTTTTTAGTCATT
TATTGCATGATAAATCACTACAAGTGACGGAGATACACGATTTAAATAACGAAAGATCCA
ATATTTAAAAATTGTATCAAGAATGACTGGAAAGGTAGAAACTAGACCAGATAAAATTTG
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AGGCGAATGGAATCCGATACATAAATCAGTTAATAAAAGAATCGAAAAAGCTTTAATTGT
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ACCCCAAAAGGAATAACCACTTAGAATAACGAAAGATATTAGATTTGTCGAGAAGTGCAA
GATTGTATGGATACGATACTCGTTGTGTATCTTGATGAATTGGATCGTTTCTTTGTGGAT
TCCTAGACGAAATTGTTGTAAATCGGTTTCTGGGTATTCCTTTATCATTTCATCCAGCTG
GAATAGTTCCTCTAATTGTATGAATTTTTCTAGAACACTTTTTTCTTGAATATCATTCAA
GAAAGTTTCGCATTGTCTAGTATTCCACCAATTAGTAATCCAAGTTTTCAAATTTTTATT
ACAGCAGAGAGAGATCAACCAGGGC

QA 1 745 1 745
DS 



CO CL95Contig4 956 4 6 U
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CTACCATCAGGATAAATCTGACCCCTTCCCCTACTTCCACCTACGTATATAGGATATTTT
AAGAAGTGAACATCTTTATTAGTAGCAGGGTCTGGGGCAAGAATAGGAAAGGTTATTTCA
CTATATTTTTGACCAGGAACAGGACCTATCACAAGAATATTTTTTTTATTGGGGCGATAA
TTCTGAAAAGACAGATTTCCTATCTTTTCTTTGATCTCGGGTGAAATACGATCGGGGGGG
GCTAATTCAAACCCCTCAGGTAAAATAAGAACAGCTCCCACATTCAAAGCTCCTTTTTTA
CCATTAGCTAGAACTTGTTTTAGCTGCATATCATAAGGAATTTTAACAACTGCTTCAAAT
ACAGTATCAGGAAGTACCGCTTGTGGAACCTCAATATCCACGGGCTTACTAGCTAAATGG
CAATTGGCACATACAATACGCCCAGTTGCCTCTCGTGGATTTTCATAATTCTGCTGGGCA
AAAATTGGATATGCACTTGAAATGGATGCCCAAGTTATTATATATATCATGAGTGAGACA
GATATGGAGCGAGTAATCTCTTCCCTTATCCAAGAAAAGGTATTTCTAGTTTGCATGGTC
CAATCATTTATCCCGAAAATTTCTACAATAAAGTTAGGTAGGTCGATAATATACTTCCCT
AGCCACAATTCTGCTATTTACATTTACTGAAAAAAAAATTTTTTT*TTATTGAAATATAC
AAGGAATCCCTCGTGGGTAAAAAAGAGTAAAGTAAATACGACTTTGATTTGGTTATGATG
TATAAAGTAAGAAAGAGTAGAATTGGATCAGTGAATCGTTTTTTAGTCATTTATTGCATG
ATAAATCACTACAAGTGACGGAGATACACGATTTAAATAACGAAAGATCCAATATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1E520JQ U 1
AF RS1DK21JQ U 231
AF RS1C381JQ U 231
AF RS1D965JQ U 231
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RD RS1E520JQ 758 0 0
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QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1DK21JQ 574 0 0
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QA 1 574 1 574
DS 

RD RS1C381JQ 726 0 0
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ATCGGGGGGGGCTAATTCAAACCCCTCAGGTAAAATAAGAACAGCTCCCACACTCAAAGC
TCCTTTTTTACCATTAGCTAGAACTTGTTTTAGCTGCATATCATGAGGAATTTTAACAAC
TGCTTCAAATACAGTATCAGGAAGTACCGCTTGTGGAACCTCAATATCCACGGGCTTACT
AGCTAAATGGCAATTGGCACATACAATACGCCCAGTTGCCTCTCGTGGATTTTCATAATT
CTGCTGGGCAAAAATTGGATATGCACTTGAAATGGATGCCCAAGTTATTATATATATCAT
GAGTGAGACAGATATGGAGCGAGTAATCTCTTCCCTTATCCAAGAAAAGGTATTTCTAGT
TTGCCTGGTCCAATCATTTATCCCGAAAATTTCCACAATAAAGTTAGGTAGGTCGATAAT
ATACTTCCCTAGCCACAATTCTGCTATTTACATTTACTGAAAAAAAATTTTTT***TTAT
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AATATT

QA 1 726 1 726
DS 

RD RS1D965JQ 724 0 0
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ATCGGGGGGGGCTAATTCAAACCCCTCAGGTAAAATAAGAACAGCTCCCACATTCAAAGC
TCCTTTTTTACCATTAGCTAGAACTTGTTTTAGCTGCATATCATAAGGAATTTTAACAAC
TACTTCAAATACAGTATCAGGAAGTACCGCTTGTGGAACCTCAATATCCACGGGCTTACT
AGCTAAATGGCAATTGGCACATACAATACGCCCAGTTGCCTCTCGTGGATTTTCATAATT
CTGCTGGGCAAAAATTGGATATGCACTTGAAATGGATGCCCAAGTTATTATATATATCAT
GAGTGAGACAGATATGGAGCGAGTAATCTCTTCCCTTATCCAAGAAAAGGTATTTCTAGT
TTGCATGGTCCAATCATTTATCCCGAAAATTTCTACAATAAAGTTAGGTAGGTCGATAAT
ATACTTCCCTAGCCACAATTCTGCTATTTACATTTACTGAAAAAAAAATTTTTTTTTTAT
TGAAATATACAAGGAATCCCTCGTGGGTAAAAAAGAGTAAAGTAAATACGACTTTGATTT
GGTTATGATGTATAAA*********AGTAGAATTGGATCAGTGAATCGTTTTTTAGTCAT
TTATTGCATGATAAATCACTACAAGTGACGGAGATACACGATTTAAATAACGAAAGATCC
AATA

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 12

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CTCTCTCTCTCTAGGCTCTCTCAGAAAACATTAGAAAGGTCGTGAGAATGGCGGCGACAG
CAGCTTCAAGCTTGCAATTTGCTACAATAAGGCCAAGCATCTCTAGCAAAGTTTTTAAAG
CAGGGACCTGCATTGTCGGTGCCAATCCCAGGAACGCATCATGGGACAAACTCGCTTGCA
CTCGCCCTCTATCGAACCTCGGATGTTTGAGAAACAACAGTTCTCTTCCAACTTCTAAAA
AGAGTTTTTCCTTTTCAACAAAGGCAATGTCTGAATCCAGCCAGAACAACGCTTCTTCTG
GACTTCCTATTGATTTGAGAGGGAAAAGGGCTTTCATTGCTGGTATT*GCTGATGATAAT
GGATATGGTT*GGGCCATAGCCAAATCTCTTGCTGCTGCTGGTGCTGAAATATTGGTT*G
GGACATGGGTTCCTGCACTTAACATTTTTGAGACGAGCCTGAGACGTGGAAAATTTGACC
AGTCACGCGTGCTGCCTGACGGGTCATTGATGGAGATTAAAAAGGTCTATCCTTTGGATG
CTGTGTTTGACAATCC*TGAAGATGTGCCTGAGGATGTGAAAGCGAATAAGCGATATGCT
GGATCATCAAACTGGACAGTACAGGAAGCTGCTGAATGTGTGAGAAAAGATTTCGGAACC
ATTGACATTCTTGTCCACTCACTT*GCAAATGGACCAGAGGTTAGCAAACCTCTTCTAGA
GACATCAAGAAAGGGCTACCTCGCTGCTATCTCTGCTTCGAGTTACTCTTTTGTTTCCCT
CCTCAGGCATTTCCTGCCAATTATGAACCCAGGAGGTGCTTCTATATCTCTTACTTACAT
TGCTTCTGAAAGGATCATTCCTGGGTATGG*TGGAGG*TATGAGTTCCGCGAAAGCCGCA
CTAGAGAGTGATACACGGGTGCTTGCATTTGAAGCTGGAAGGAAACAAAACATTAGGGTC
AACACCATCTCTGCAGGTCCTTTGGGAAGCCGAGCAGCAAAAGCAATTGGGTTCATAGAC
ACCATGATTGAGTATTCATACAATAATGCGCCTGTTCAGAAAACATTGACCGCAGATGAA
GTTGGGAATGCAGCAGCCTTCTTGGTATCTCCATTGGCCTCTGCCATAACTGGTGCAACC
ATCTATGTTGACAATGGCTTGAATTCAATGGGTGTTGCCATCGACAGTCCAGTTTTCAAA
GACCTCAAATAGAGACTTAAGTAACTGCGGAAACTCTTTTTCTTGTGTTGCATTTGTTTT
TTTGTTTCTATTGAGAATGTTTTTTTTTTTCGAACAAACTTGTTTCTAGAACAAAATATA
ATATTTAAAACAATCAGAATAAATTCCAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 25 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 20 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F201TF U 1
AF RS1GB74TF U 49
AF RS1CO30TF U 396
AF RS1C604TF U 49
AF RS1AC54TF U 31
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AF RS1A349TV U 270
AF RS1AC54JQ C 560
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AF RS1C604JQ C 633
AF RS1DW39TF U 994
AF RS1CO30JQ C 712
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BS 233 233 RS1C604TF
BS 234 322 RS1F201TF
BS 323 323 RS1C604TF
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BS 762 831 RS1AC54TF
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CAGCTTCAAGCTTGCAATTTGCTACAATAAGGCCAAGCATCTCTAGCAAAGTTTTTAAAG
CAGGGACCTGCATTGTCGGTGCCAATCCCAGGAACGCATCATGGGACAAACTTGCTTGCA
CTCGCCCTCTATCGAACCTCGGATGTTTGAGAAACAACAGTTCTCTTCCAACTTCTAAAA
AGAGTTTTTCCTTTTCAACAAAAGCAATGTCTGAATCCAGCCAGAACAACGCTTCTTCTG
GACTTCCTATTGATTTGAGAGGGAAAAGGGCTTTCATTGCTGGTATT*GCTGATGATAAT
GTATATGGCT*GGGCCATAGCCAAATCTCTTGCTGCTGCTGGTGCTGAAATATTGGTT*G
GGACATGGGTTCCTGCACTTAACATTTTTGAGACGAGCCTGAGACGTGGAAAATTTGACC
AGTCACGCGTGCTGCCTGACGGGTCATTGATGGAGATTAAAAAGGTCTATCCTTTGGATG
CTGTGTTTGACAATCC*TGAAGATGTGCC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RS1GB74TF 655 0 0
GGACTCCCCTCTT
TCTCTCTCTCTAGGCTCTCTCAGAAAACATTAGAAAGGTCGTGAGAATGACGGCGACGGC
AGCTTCAAGCTTGCAATTTGCTACAATAAGGCCAAGCATCTCTAGCAAAGTTTTTAAAGC
AGGGACCTGCATTGTCGGTGCCAATCCCAGGAACGCATCATGGGACAAACTCGCTTGCAC
TCGCCCTCTATCGAACCTCGGATGTTTGAGAAACAACAGTTCTCTTCCAACTTCTAAAAA
GAGTTTTTCCTTTTCAACAAAGGCAATGTCTGAATCCAGCGAGAACAACGCTTCTTCTGG
ACTTCCTATTGATTTGAGAGGGAAAAGAGCTTTCATTGCTGGTATT*GCTGATGATAATG
GATATGGTT*GGGCCATAGCCAAATCTCTTGCTGCTGCTGGTGCTGAAATATTGGTT*GG
GACATGGGTTCCTGCACTTAACATTTTTGAGACGAGCCTGAGACGTGGAAAATTTGACCA
GTCACGCGTGCTGCCTGACGGTTCATTGATGGAGATTAAAAAGGTCTATCCTTTGGATGC
TGTGTTTGACAATCC*TGAAGATGTGCCTGAGGATGTGAAAGCGAATAAGCGATATGCTG
GATCATCAAACTGGACAGTACAGGAAGCTGCTGAATGTGTGA

QA 14 655 14 655
DS 

RD RS1CO30TF 267 0 0
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CTGCTGGTGCTGAAATATTGGTTTGGGACATGGGTTCCTGCACTTAACATTTTTGAGACG
AGCCTGAGACGTGGAAAATTTGACCAGTCACGCGTGCTGCCTGACGGTTCATTGATGGAG
ATTAAAAAGGTCTATCCTTTGGATGCTGTGTTTGACAATCCCTGAAGATGTGCCTGAGGA
TGTGAAAGCGAATAAGCGATATGCTGG

QA 1 267 1 267
DS 

RD RS1C604TF 758 0 0
GGACTCCCCTCTT
TCTCTCTCTCTAGGCTCTCTCAGAAAACATTAGAAAGGTCGTGAGAATGGCGGCGACGGC
AGCTTCAAGCTTGCAATTTGCTACAATAAGGCCAAGCATCTCTAGCAAAGTTTTTAAAGC
AGGGACCTGCATTGTCGGTGCCAATCCCAGGAACGCATCATGGGACAAACTCGCTTGCAC
TCGCCCTCTATCGAACCTCGGATGTTTGAGAAACAACAGTTCTCTTCCAACTTCTAAAAA
GAGTTTTTCCTTTTCAACAAAGGCAATGTCTGAATCCAGCGAGAACAACGCTTCTTCTGG
ACTTCCTATTGATTTGAGAGGGAAAAGAGCTTTCATTGCTGGTATT*GCCGATGATAATG
GATATGGTT*GGGCCATAGCCAAATCTCTTGCTGCTGCTGGTGCTGAAATATTGGTT*GG
GACATGGGTTCCTGCACTTAACATTTTTGAGACGAGCCTGAGACGTGGAAAATTTGACCA
GTCACGCGTGCTGCCTGACGGTTCATTGATGGAGATTAAAAAGGTCTATCCTTTGGACGC
TGTGTTTGACAATCC*TGAAGATGTGCCTGAGGATGTGAAAGCGAATAAGCGATATGCTG
GATCATCAAACTGGACAGTACAGGAAGCTGCTGAATGTGTGAGAAAAGATTTCGGAACCA
TTGACATTCTTGTCCACTCACTT*GCAAATGGACCAGAG*TTAGCAAACCTCTTCTAGAG
ACATCAAGAAAGGGCTACCTCGCTG

QA 14 758 14 758
DS 

RD RS1AC54TF 840 0 0
GGG
ACACCAAACAAACCTACTCCCCTCTTTCTCTCTCTCTCTAGGCTCTCTCAGAAAACATTA
GAAAGGTCGTGAGAATGGCGGCGACAGCAGCTTCAAGCTTGCAATTTGCTACAATAAGGC
CAAGCATCTCTAGCAAAGTTTTTAAAGCAGGGACCTGCATTGTCGGTGCCAATCCCAGGA
ACGCATCATGGGACAAACTTGCTTGCACTCGCCCTCTATCGAACCTCGGATGTTTGA*AA
ACAACAGTTCTCTTCCAACTTCTAAAAAGAGTTTTTCCTTTTCAACAAAAGCAATGTCTG
AATCCAGCCAGAACAACGCTTCTTCTGGACTTCCTATTGATTTGAGAGGGAAAAGGGCTT
TCATTGCTGGTATT*GCTGATGATAATGGATATGGCT*GGGCCATAGCCAAATCTCTTGC
TGCTGCTGGTGCTGAAATATTGGTT*GGGACATGGGTTCCTGCACTTAACATTTTTGAGA
CGAGCCTGAGACGTGGAAAATTTGACCAGTCACGCGTGCTGCCTGACGGGTCATTGATGG
AGATTAAAAAGGTCTATCCTTTGGATGCTGTGTTTGACAATCC*TGAAGATGTGCCTGAG
GATGTGAAAGCGAATAAGCGATATGCTGGATCATCAAACTGGACAGTACAGGAAGCTGCT
GAATGTGTGAGAAAAGATTTCGGAACCATTGACATTCTTGTCCACTCACTT*GCAAATGG
ACCAGAG*TTAGCAAACCTCTTCTAGAGACATCAAGAAAGGGCTACCTCGCTGCTATCTC
TGCTTCGAGTTACTCTTT*GTTTCCCTCCTCAG*CATTTCCTGCCAATTATGAACCC

QA 4 840 4 840
DS 

RD RS1A349TF 308 0 0
TCCACTCACTTTGCAAATGGACCAGAGGTTAGCAAACCTCTTCTGGAGACATCAAGAAAA
GGCTACCTCGCTGCTATCTCTGCTTCGAGTTACTCTTTTGTTTCCCTCCTCAGGCATTTC
CTGCCAATTATGAACCCAGGAGGTGCTTCTATATCTCTTACTTACATTGCTTCTGAAAGG
ATCATTCCTGGGTATGGGTGGAGGGTATGAGTTCCGCGAAAGCCGCACTAGAGAGTGATA
CACGGGTGCTTGCATTTGAAGCTGGAAAGAAACAAAACATTAGGGTCAACACCATCTCTG
CACGTCCT

QA 1 308 1 308
DS 

RD RS1A349TV 859 0 0
CCATTACGGCCGGGG
CTTCCAACTTCTAAAAAGAGTTTTTCCTTTTCAACAAAGGCAATGTCTGAATCCAGCCAG
AACAACGCTTCTTCTGGACTTCCTATTGATTTGAGAGGGAAAAGGGCTTTCATTGCTGGT
ATT*GCTGATGATAATGGATATGGTT*GGGCCATAGCCAAATCTCTTGCTGCTGCTGGTA
CTGAAATATTGGTT*GGGACATGGGTTCCTGCACTTAACATTTTTGAGACGAGCCTGAGA
CGTGGAAAATTTGACCAGTCACGCGTGCTGCCTGACGGGTCATTGATGGAGATTAAAAAG
GTCTATCCTTTGGATGCTGTGTTTGACAATCC*TGAAGATGTGCCCGAGGATGTGAAAGC
GAATAAACGATATGCTGGATCATCAAACTGGACAGTACAGGAAGCTGCTGAATGTGTGAG
AAAAGATTTCGGAACCATTGACATTCTTGTCCACTCACTT*GCAAATGGACCAGAGGTTA
GCAAACCTCTTCTGGAGACATCAAGAAAAGGCTACCTCGCTGCTATCTCTGCTTCGAGTT
ACTCTTTTGTTTCCCTCCTCAGGCATTTCCTGCCAATTATGAACCCAGGAGGTGCTTCTA
TATCTCTTACTTACATTGCTTCTGAAAGGATCATTCCTGGGTATGG*TGGAGG*TATGAG
TTCCGCGAAAGCCGCACTAGAGAGTGATACACGGGTGCTTGCATTTGAAGCTGGAAAGAA
ACAAAACATTAGGGTCAACACCATCTCTGCA*GTCCTTTGGGAAGCCGAGCAGCAAAAGC
AATTGGGTCCATAGACACCATGATTGAGTATTCATACAATAATGCGCCTGTTCAGAAAAC
ATTG

QA 16 859 16 859
DS 

RD RS1AC54JQ 685 0 0
CGGGTCATTGATGGAGATTAAAAAGGTCTATCCTTTGGATGCTGTGTTTGACAATCC*TG
AAGATGTGCCTGAGGATGTGAAAGCGAATAAGCGATATGCTGGATCATCAAACTGGACAG
TACAGGAAGCTGCTGAATGTGTGAGAAAAGATTTCGGAACCATTGACATTCTTGTCCACT
CACTT*GCAAATGGACCAGAGGTTAGCAAACCTCTTCTAGAGACATCAAGAAAGGGCTAC
CTCGCTGCTATTTCTGCTTCGAGTTACTCTTTTGTTTCCCTCCTCAGGCATTTCCTGCCA
ATTATGAACCCAGGAGGTGCTTCTATATTTCTTACTTACATTGCTTCTGAAAGGATCATT
CCTGGGTATGG*TGGAGG*TATGAGTTCGGCGAAAGCCGCACTAGAGAGTGATACACGGG
TGCTTGCATTTGAAGCTGGAAGGAAACAAAACATTAGGGTCAACACCATCTCTGCAGGTC
CTTTGGGAAGCCGAGCAGCAAAAGCAATTGGGTTCATAGACACCATGATTGAGTATTCAT
ACAATAATGCGCCTGTTCAGAAAACATTGACCGCAGATGAAGTTGGGAATGCAGCAGCCT
TCTTGGTATCTCCATTGGCCTCTGCCATAACTGGTGCAACCATCTATGTTGACAATGGCT
TGAATTCAATGGGTGTTGCCATCGA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RS1F201JQ 582 0 0
ACATCAAGAAAGGGCTACCTCGCTGCTATCTCTGCTTCGAGTTACTCTTTTGTTTCCCTC
CTCAGGCATTTCCTGCCAATTATGAACCCAGGGGGTGCTTCTATATCTCTTACTTACATT
GCTTCTGAAAGGATCATTCCTGGGTATGG*TGGAGG*TATGAGTTCGGCGAAAGCCGCAC
TAGAGAGTGATACACGGGTGCTTGCATTTGAAGCTGGAAGGAAACAAAACATTAGGGTCA
ACACCATCTCTGCAGGTCCTTTGGGAAGCCGAGCAGCAAAAGCAATTGGGTTCATAGACA
CCATGATTGAGTATTCATACAATAATGCGCCTGTTCAGAAAACATTGACCGCAGATGAAG
TTGGGAATGCAGCAGCCTTCTTGGTATCTCCACTGGCCTCTGCCATAACTGGTGCAACCA
TCTATGTTGACAATGGCTTGAATTCAATGGGTGTTGCCATCGACAGTCCAGTTTTCAAAG
ACCTCAAATAGAGACTTAAGTAACTGCGGAAACTCTTTTTCTTGTGTTGCATTTGTTTTT
TTGTTTCTATTGAGAATGTTTTTTTTT**CGAACAAACTTGT

QA 1 582 1 582
DS 

RD RS1C604JQ 779 0 0
GGATGTGAAAGCGAATAAGCGATATGCTGGATCATCAAACTGGACAGTACAGGAAGCTGC
TGAATGTGTGAGAAAAGATTTCGGAACCATTGACATTCTTGTCCACTCACTT*GCAAATG
GACCAGAGGTTAGCAAACCTCTTCTAGAGACATCAAGAAAGGGCTACCTCGCTGCTATTT
CTGCTTCGAGTTACTCGTTTGTTTCCCTCCTCAGGCATTTCCTGCCAATTATGAACCCAG
GAGGCGCTTCTATATTTCTTACTTACATTGCTTCTGAAAGGATCATTCCTGGGTATGG*T
GGAGG*TATGAGTTCTGCGAAAGCCGCACTAGAGAGTGATACACGGGTGCTTGCATTTGA
AGCTGGAAGGAACCAAAACATTAGGGTCAACACCATCTCTGCAGGTCCTTTGGGAAGCCG
AGCGGCAAAAGCAATTGGGTTCATAGACACCATGATTGAGTATTCATACAATAATGCGCC
TGTTCAGAAAACATTGACCGCAGATGAAGTTGGGAATGCAGCAGCCTTCTTGGTATCTCC
ATTGGCCTCTGCCATAACTGGTGCAACCATCTATGTTGACAATGGCTTGAATTCAATGGG
TGTTGCCATCGACAGTCCAGTTTTCAAAGACCTCAAATAGAGACTTAAGTAACTGCGGAA
ACTCTTTTTCTTGTGTTGCATTTGTTTTTTTGTTTCTATTGAGAATGTTTTTTTTTTTCG
AACAAACTTGTTTCTAGAACAAAATATAATATTTAAAACAATCAGAATAAATTCCAGTC

QA 1 779 1 779
DS 

RD RS1DW39TF 415 0 0
GG
TGGAAGGAAACAAAACATTAGGGTCAACACCATCTCTGCAGGTCCTTTGGGAAGCCGAGC
AGCAAAAGCAATTGGGTTCATAGACACCATGATTGAGTATTCATACAATAATGCGCCTGT
TCAGAAAACATTGACCGCAGATGAAGTTGGGAATGCAGCAGCCTTCTTGGTATCTCCATT
GGCCTCTGCCATAACTGGTGCAACCATCTATGTTGACAATGGCTTGAATTCAATGGGTGT
TGCCATCGACAGTCCAGTTTTCAAAGACCTCAAATAGAGACTTAAGTAACTGCGGAAACT
CTTTTTCTTGTGTTGCATTTGTTTTTTTGTTTCTATTGAGAATGTTTTTTTTTTTCGAAC
AAACTTGTTTCTAGAACAAAATATAATATTTAAAACAATCAGAATAAATT
TCA

QA 3 412 3 412
DS 

RD RS1CO30JQ 700 0 0
TTCGGAACCATTGACATTCTTGTCCACTCACTT*GCAAATGGACCAGAGGTTAGCAAACC
TCTTCTAGAGACATCAAGAAAGGGCTACCTCGCTGCTATCTCTGCTTCGAGTTACTCGTT
TGTTTCCCTCCTCAGGCATTTCCTGCCAATTATGAACCCAGGAGGCGCTTCTATATCTCT
TACTTACATTGCTTCTGAAAGGATCATTCCTGGGTATGG*TGGAGG*TATGAGTTCTGCG
AAAGCCGCACTAGAGAGTGGTACACGGGTGCTTGCATTTGAAGCTGGAAGGAAACAAAAC
ATTAGGGTCAACACCATCTCTGCAGGTCCTTTGGGAAGCCGAGCAGCAAAAGCAATTGGG
TTCATAGACACCATGATTGAGTATTCATACAATAATGCGCCTGTTCAGAAAACATTGACC
GCAGATGAAGTTGGGAATGCAGCAGCCTTCTTGGTATCTCCATTGGCCTCTGCCATAACT
GGTGCAACCATCTATGTTGACAATGGCTTGAATTCAATGGGTGTTGCCATCGACAGTCCA
GTTTTCAAAGACCTCAAATAGAGACTTAAGTAACTGCGGAAACTCTTTTTCTTGTGTTGC
ATTTGTTTTTTTGTTTCTATTGAGGATGTTTTTTTTT**CGAACAAACTTGTTTCTAGAA
CAAAATATAATATTTAAAACAATCAGAATAAATT
CCAGCC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 2 15

CO CL97Contig1 871 12 17 U
TTCGGCCATTACGGCCGGGGGGACACATTTGCGTTTCGCAACCGCAAGAACCAAACTGAT
AAAATAACAAAACCTGTGGGCAGAATCTCTTT*TTTTTGGTAAAGTTTTACATAATGGGA
ATGGTATTTGGTAAAATCTCGGTGGAGACACCCAAATACACCGTGGTTAAATCCGGCGAC
GGTTACGAGATCCGTGAGTATCCACCGACCGTTGCGGCCGAGATCACTTACGATCCTTCC
GAGTTCAAAGACAACAAAGACGGCGGTTTCACGGTCTTGGCCAAGTACATAGGCGTGTTC
GGCAAGCCTGAGAACCAGAAGCCTGAGAAGATCGCCATGACTGCTCCTGTGATCACCAAA
GAAGGAGAGAAGATCGCCATGACTGCTCCGGTCGTGACCAAGGAAGGAGGAGGAG**GGA
GGAGGA*GGAGA*GGAGAAGAAGACGGTGACGATGCAGTTTCTGTTGCCGGAGATGTACA
AGAAGGCTGAGGATGCGCCGCGTCCGACTGATGAGAGGGTGGTGATTAAGGAGGAAGGAG
GGAGGAAGTACGGCGTGGTTACGTTCAGTGGTAACGCGGCGGAGAGTGTGGTGAGCGAGA
AGGTGAAGAAGCTGAGGAGTGACCTCGAGAGAGATGGGTTTAAGAGCACCGGAGATTACA
TCCTTGCTAGGTACAATCCTCCATGGACAATACCTCCGTTCAAGACCAACGAAGTCATGA
TTCCTGTTGAATGATGAAAACTATATCCAAAGTTTATAGCTTTTGGTCTCAAAAAAACAC
TCGTCTTTTCAGAACAATAATGTAATACAATGTCAGGTTTTGAATTTTAATGAATCAACG
ACAAAAGAAGACAAGTGTGTGTTAAGGTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 60 60 45 10 60 60 60 60 
60 60 60 45 60 60 65 50 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 
70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 50 65 50 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 50 50 50 50 50 0 30 30 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CY37TF U 21
AF RS1A291TV U 414
AF RS1BW17TF U 21
AF RS1GO75TF U 22
AF RS1A291TR C 20
AF RS1A291TF U 1
AF RS1C328TF U 122
AF RS1A291JQ C 20
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AF RS1GO75JQ C 466
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BS 409 418 RS1A291TF
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BS 434 544 RS1A291TF
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CAGAATCTCTTTCTTTTTGGTAAAGTTTTACATAATGGGAATGGTATTTGGTAAAATCTC
GGTGGAGACACCCAAATACACCGTGGTTAAATCCGGCGACGGTTACGAGATCCGTGAGTA
TCCACCGACCGTTGCGGCCGAGATCACTTACGATCCTTCCGAGTTCAAAGACAACAAAGA
CGGCGGTTTCACGGTCTTGGCCAAGTACATAGGCGTGTTCGGCAAGCCTGAGAACCAGAA
GCCTGAGAAGATCGCCATGACTGCTCCTGTGATCACCAAAGAAGGAGAGAAGATCGCCAT
GACTGCTCCGGTCGTGACCAAGGAAGGAGGAGGAG**GGAGGAGGA*GGAGA*GGAGAAG
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ACGTTCAGTGGTAACGCGGCGGAGAGTGTGGTGAGCGAGAAGGTGAAG

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DS 

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GAAGGAGGGAGTAAGTACGGCGTGGTTACGTTCAGTGGTAACGCGGCGGAGAGTGTGGTG
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GTCATGATTCCTGTTGAATGATGAAAACTATATCCAAAGTTTATAGCTTTTGGTCTC

QA 1 357 1 357
DS 

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CAGAATCTCTTTCTTTTTGGTAAAGTTTTACATAATGGGAATGGTATTTGGTAAAATCTC
GGTGGAGACACTCAAATACACCGTGGTTAAATCCGGCGACGGTTACGAGATCCGTGAGTA
TCCACCGACCGTTGTGGCCGAGATCACTTACGATCCTTCCGAGTTCAAAGACAACAAAGA
CGGCGGTTTCACGGTCTTGGCCAAGTACATAGGCGTGTTCGGCAAGCCTGAGAACCAGAA
GCCTGAGAAGATCGCCATGACTGCTCCTGTGATCACCAAAGAAGGAGAGAAGATCGCCAT
GACTGCTCCGGTCGTGACCAAGGAAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGA*GGAGA*GGAGAAG
AAGACGGTGACGATGCAGTTTCTGTTGCCGGAGATGTACAAGAAGGCTGAGGATGCGCCG
CGTCCGACTGATGAGAGGGTGGTGATTAAGGAGGAAGGAGGGAGGAAGTACGGCGTGGTT
ACGTTCAGTGGTAACGCGGCGGAGAGTGTGGTGAGCGAGAAGGTGAAGAAGCTGAGGAGT
GACCTCGAGAGAGATGGGTTTAAGAGCACCGGAGATTACATCCTTGCTAGGTACAATCCT
CCATGGACAATACCTCCGTTCAAGACCAACGAAGTCATGATTCCTGTTGA

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DS 

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GTGGAGACACCCAAATACACCGTGGTTAAATCCGGCGACGGTTACGAGATCCGTGAGTAT
CCACCGACCGTTGCGGCCGAGATCACTTACGATCCTTCCGAGTTCAAAGACAACAAAGAC
GGCGGTTTCACGGTCTTGGCCAAGTACATAGGCGTGTTCGGCAAGCCTGAGAACCAGAAG
CCTGAGTAGATCGCCATGACTGCTCCTGTGATCACCAAAGAAGGAGAGAAGATCGCCATG
ACTGCTCCGGTCGTGACCAAGGAAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGA*GGAGA*GGAGAAGA
AGACGGTGACGATGCAGTTTCTGTTGCCGGAGATGTACAAGAAGGCTGAGGATGCGCCGC
GTCCGACTGATGAGAGGGTGGTGATTAAGGAGGAAGGAGGGAGGAAGTACGGCGTGGTTA
CGTTCAGTGGTAACGCGGCGGAGAGTGTGGTGAGCGAGAAGGTGAAGAAGCTGAGGAGTG
ACCTCGAGAGAGATGGGTTTAAGAGCACCGGAGATTACATCCTTGCTAGGTACAATCCTC
CATGGACAATACCTCCGTTCAAGACCAACGAAGTCATGATTCCTGTTGAATGATGAAA*C
TATATCCAA*GTTTATAGCTTTTGGTCTCAAAAAA

QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1A291TR 751 0 0
G
GGACACATTTGCGTTTCGCAACCGCAAGAACCAAACTGATAAAATAACAAAACCTGTGGG
CAGAATCTCTTT*TTTTTGGTAAAGTTTTACATAATGGGAATGGTATTTGGTAAAATCTC
GGTGGAGACACCCAAATACACCGTGGTTAAATCCGGCGACGGTTACGAGATCCGTGAGTA
TCCACCGACCGTTGCGGCCGAGATCACTTACGATCCTTCCGAGTTCAAAGACAACAAAGA
CGGCGGTTTCACGGTCTTGGCCAAGTACATAGGCGTGTTCGGCAAGCCTGAGAACCAGAA
GCCTGAGAAGATCGCCATGACTGCTCCTGTGATCACCAAAGAAGGAGAGAAGATCGCCAT
GACTGCTCCGGTCGTGACCAAGGAAGGTGGAGGAG***GAGGAGGA*GGAGA*GGAGAAG
AAGACGGTGACGATGCAGTTTCTGTTGCCGGAGATGTACAAGAAGGCTGAGGATGCGCCG
CGTCCGACTGATGAGAGGGTGGTGATTAAGGAGGAAGGAGGGAGTAAGTACGGCGTGGTT
ACGTTCAGTGGTAACGCGGCGGAGAGTGTGGTGAGCGAGAAGGTGAAGAAGCTGAGGAGT
GACCTCGAGAGAGATGGGTTTAAGAGCACCGGAGATTACATCCTTGCTAGGTACAATCCT
CCATGGACAATACCTCCGTTCAAGACCAACGAAGTCATGATTCCTGTTGAATGATGAAAA
CTATATCCAAAGTTTATAGCTTTTGGTCTC

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DS 

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AAAATAACAAAACCTGTGGGCAGAATCTCTTT*TTTTTGGTAAAGTTTTACATAATGGGA
ATGGTATTTGGTAAAATCTCGGTGGAGACACCCAAATACACCGTGGTTAAATCCGGCGAC
GGTTACGAGATCCGTGAGTATCCACCGACCGTTGCGGCCGAGATCACTTACGATCCTTCC
GAGTTCAAAGACAACAAAGACGGCGGTTTCACGGTCTTGGCCAAGTACATAGGCGTGTTC
GGCAAGCCTGAGAACCAGAAGCCTGAGAAGATCGCCATGACTGCTCCTGTGATCACCAAA
GAAGGAGAGAAGATCGCCATGACTGCTCCGGTCGTGACCAAGGAAGGTGGAGGAG**G*A
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AGAAGGCTGAGGATGCGCCGCGTCCGACTGATGAGAGGGTGGTGATTAAGGAGGAAGGAG
GGAGTAAGTACGGCGTGGTTACGTTCAGTGGTAACGCGGCGGAGAGTGTGGTGAGCGAGA
AGGTGAAGAAGCTGAGGAGTGACCTCGAGAGAGATGGGTTTAAGAGCACCGGAGATTACA
TCCTTGCTAGGTACAATCCTCCATGGACAATACCTCCGTTCAAGACCAACGAAGTCATGA
TTCCTGTTGAATGATGAAAACTATATCCAAAGTTTATAGCTTTTGGTCTCAAAAAA*CAC
TCGTCTTTTCAGAACAATAATGTAATACAATG

QA 1 812 1 812
DS 

RD RS1C328TF 692 0 0
G
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TTACGTGATCCGTGAGTATCCACCGACCGTTGCGGCCGAGATCACTTACGATCCTTCCGA
GTTCAAAGACAACAAAGACGGCGGTTTCACGGTCTTGGCCAAGTACATAGGCGTGTTCGG
CAAGCCTGAGAACCAGAAGCCTGAGAAGATCGCCATGACTGCTCCTGTGATCACCAAAGA
AGGAGAGAAGATCGCCATGACTGCTCCGGTCGTGACCAAGGAAGGAGGAGGAGGAGGAGG
AGGA*GGAGA*GGAGAAGAAGACGGTGACGATGCAGTTTCTGTTGCCGGAGATGTACAAG
AAGGCTGAGGATGCGCCGCGTCCGACTGATGAGAGGGTGGTGATTAAGGAGGAAGGAGGG
AGGAAGTACGGCGTGGTTACGTTCAGTGGTAACGCGGCGGAGAGTGTGGTGAGCGAGAAG
GTGAAGAAGCTGAGGAGTGACCTCGAGAGAGATGGGTTTAAGAGCACCGGAGATTACATC
CTTGCTAGGTACAATCCTCCATGGACAATACCTCCGTTCAAGACCAACGAAGTCATGATT
CCTGTTGAATGATGAAAACTATATCCAAAGTTTATAGCTTTTGGTCTCAAAAAA*CACTC
GTCTTTTCAGAACAATAATGTAATACAATGT

QA 2 692 2 692
DS 

RD RS1A291JQ 852 0 0
G
GGACACATTTGCGTTTCGCAACCGCAAGAACCAAACTGATAAAATAACAAAACCTGTGGG
CAGAATCTCTTT*TTTTTGGTAAAGTTTTACATAATGGGAATGGTATTTGGTAAAATCTC
GGTGGAGACACCCAAATACACCGTGGTTAAATCCGGCGACGGTTACGAGATCCGTGAGTA
TCCACCGACCGTTGCGGCCGAGATCACTTACGATCCTTCCGAGTTCAAAGACAACAAAGA
CGGCGGTTTCACGGTCTTGGCCAAGTACATAGGCGTGTTCGGCAAGCCTGAGAACCAGAA
GCCTGAGAAGATCGCCATGACTGCTCCTGTGATCACCAAAGAAGGAGAGAAGATCGCCAT
GACTGCTCCGGTCGTGACCAAGGAAGGTGGAGGAG**G*AGGAGGA*GGAGA*GGAGAAG
AAGACGGTGACGATGCAGTTTCTGTTGCCGGAGATGTACAAGAAGGCTGAGGATGCGCCG
CGTCCGACTGATGAGAGGGTGGTGATTAAGGAGGAAGGAGGGAGTAAGTACGGCGTGGTT
ACGTTCAGTGGTAACGCGGCGGAGAGTGTGGTGAGCGAGAAGGTGAAGAAGCTGAGGAGT
GACCTCGAGAGAGATGGGTTTAAGAGCACCGGAGATTACATCCTTGCTAGGTACAATCCT
CCATGGACAATACCTCCGTTCAAGACCAACGAAGTCATGATTCCTGTTGAATGATGAAAA
CTATATCCAAAGTTTATAGCTTTTGGTCTCAAAAAAACACTCGTCTTTTCAGAACAATAA
TGTAATACAATGTCAGGTTTTGAATTTTAATGAATCGACGACAAAAGAAGACAAGTGTGT
GTTAAGGTTGT

QA 2 852 2 852
DS 

RD RS1GU24JQ 671 0 0
GTGAGTATCCACCGACCGTTGCGGCCGAGATCACTTACGATCCTTCCGAGTTCAAAGACA
ACAGAGACGGCGGCTTCACGGTCTTGGCCAAGTACATAGGCGTGTTCGGCAAGCCTGAGA
ACCAGAAGCCGGAGAAGATCGCCATGACTGCTCCTGTGATCACCAAGGAAGGAGAGAAGA
TCGCCATGACTGCTCCGGTCGTGACCAAGGAAGGAGGAGGAG**G*AGGAGGA**GAG**
*GAGAAGAAGACGGTGACGATGCAGTTTCTGTTGCCGGAGATGTACAAGAAGGCTGAGGA
TGCGCCTCGTCCGACTGATGAGAGGGTGGTGATTAAGGAGGAAGGAGGGAGGAAGTATGG
CGTGGTCACGTTCAGTGGTAACGCGGCGGAGAGTGTGGTGAGCGAGAAGGTGAAGAAGCT
GACGAGTGACCTCGAGAGAGATGGGTTTAAGATCACCGGAGAGTTCGTCCTTGCTAGGTA
CAATCCTCCATGGACAATACCTCCGTTCAAGACCAACGAAGTCATGATTCCTGTTGAATG
ATGAAAACTATATCCAAAGTTTATAGCTTTTGGTCTCAAAAAA***CTTGTCTTTTCAGA
ACAATAATGTAATACAATGCCGGGTTTTGAATTTTAATAAATCAACGACAAA*GAAGAGA
AGTGTGT
TTAC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RS1CY37JQ 658 0 0
CGACCGTTGCGGCCGAGATCACTTACGATCCTTCCGAGTTCAAAGACAACAAAGACGGCG
GTTTCACGGTCTTGGCCAAGTACATAGGCGTGTTCGGCAAGCCTGAGAACCAGAAGCCTG
AGAAGATCGCCATGACTGCTCCTGTGATCACCAAAGAAGGAGAGAAGATCGCCATGACTG
CTCCGGTCGTGACCAAGGAAGGAGGAGGAG**GGAGGAGGA*GGAGA*GGAGAAGAAGAC
GGTGACGATGCAGTTTCTGTTGCCGGAGATGTACAAGAAGGCTGAGGATGCGCCGCGTCC
GACTGATGAGAGGGTGGTGATTAAGGAGGAAGGAGGGAGGAAGTACGGCGTGGTTACGTT
CAGTGGTAACGCGGCGGAGAGTGTGGTGAGCGAGAAGGTGAAGAAGCTGAGGAGTGACCT
CGAGAGAGATGGGTTTAAGAGCACCGGAGATTACATCCTTGCTAGGTACAATCCTCCATG
GACAATACCTCCGTTCAAGACCAACGAAGTCATGATTCCTGTTGAATGATGAAAACTATA
TCCAAAGTTTATAGCTTTTGGTCTCAAAAAAACACTCGTCTTTTCAGAACAATAATGTAA
TACAATGTCAGGTTTTGAATTTTAATGAATCAACGACAAAAGAAGACAAGTGTGT
GTT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1BW17JQ 412 0 0
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GGATGCGCCGCGTCCGACTGATGAGAGGGTGGTGATTAAGGAGGAAGGAGGGAGGAAGTA
CGGCGTGGTTACGTTCAGTGGTAACGCGGCGGAGAGTGTGGTGAGCGAGAAGGTGAAGAA
GCTGAGGAGTGACCTCGAGAGAGATGGGTTTAAGAGCACCGGAGATTACATCCTTGCTAG
GTACAATCCTCCATGGACAATACCTCCGTTCAAGACCAACGAAGTCATGATTCCTGTTGA
ATGATGAAAACTATATCCAAAGTTTATAGCTTTTGGTCTCAAAAAAACACTCGTCTTTTC
AGAACAATAATGTAATACAATGTCAGGTTTTGAATTTTAATGAATCAACGAC

QA 1 412 1 412
DS 

RD RS1GO75JQ 377 0 0
TGCCGGAGATGTACAAGAAGGCTGAGGATGCGCCGCGTCCGACTGATGAGAGGGTGGTGA
TTAAGGAGGAAGGAGGGAGGAAGTACGGCGTGGTTACGTTCAGTGGTAACGCGGCGGAGA
GTGTGGTGAGCGAGAAGGTGAAGAAGCTGAGGAGTGACCTCGAGAGAGATGGGTTTAAGA
GCACCGGAGATTACATCCTTGCTAGGTACAATCCTCCATGGACAATACCTCCGTTCAAGA
CCAACGAAGTCATGATTCCTGTTGAATGATGAAAACTATATCCAAAGTTTATAGCTTTTG
GTCTCAAAAAAACACTCGTCTTTTCAGAACAATAATGTAATACAATGTCAGGTTTTGAAT
TTTAATGAATCAACGAC

QA 1 377 1 377
DS 



CO CL97Contig2 1029 3 3 U
GGACACATTTGCGTTTCGCAACCGCAAGAACCAAACTGATAAAATAACAAAACCTGTGGG
AAGAATCTCTTTTTTTTTTTTGGTAAAGCTTTTGCATAATGGGAATGGTATTTGGTAAAA
TCTCCGTGGAGACTCCCAAGTACACCGTGGTTAAATCCGGCGACGGTTACGAGATCCGTG
AGTATCCACCGACCGTTGCGGCCGAGATCACTTACGATCCTTCCGAGTTCAAAGACAACA
GAGACGGCGGCTTCACGGTCTTGGCCAAGTACATAGGCGTGTTCGGCAAGCCTGAGAACC
AGAAGCCGGAGAAGATCGCCATGACTGCTCCTGTGATCACCAAGGAAGGAGAGAAGATCG
CCATGACTGCTCCGGTCGTGACCAAGGAAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGAGGAGAAGAAGA
CGGTGACGATGCAGTTTCTGTTGCCGGAGATGTACAAGAAGGCTGAGGATGCGCCTCGTC
CGACTGATGAGAGGGTGGTGATTAAGGAGGAAGGAGGGAGGAAGTATGGCGTGGTCACGT
TCAGTGGTAACGCGGCGGAGAGTGTGGTGAGCGAGAAGGTGAAGAAGCTGACGAGTGACC
TCGAGAGAGATGGGTTTAAGATCACCGGAGAGTTCGTCCTTGCTAGGTACAATCCTCCAT
GGACAATACCTCCGTTCAAGACCAACGAAGTCATGATTCCTGTTGAATGATGAAAACTAT
ATCCAAAGTTTATAGCTTTTGGTCTCAAAAAACTTGTCTTTTCAGAACAATAATGTAATA
CAATGCCGGGTTTTGAATTTTAATAAATCAACGACAAAGAAGAGAAGTGTGTTTACTGTT
TAGGTTGTGAATTATTAGAATTTACTATAGTTTGGCTTGTTTTAACCGGAGAAGAGCTTA
AAAACGATGACAATCAAGTTAAAGAGCATGAGAGGGAGCCTCATGTAGTGGCAGGCGTGG
ATGAGACCAACGATCTGGCCTTTGAGGGAGTTTCTTTTGCCGGTTTGGTGAAGCTCGGTG
AGTGTCCAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GU24TF U 1
AF RS1H050TF U 1
AF RS1H050JQB C 481
BS 1 519 RS1GU24TF
BS 520 574 RS1H050TF
BS 575 1029 RS1H050JQB

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AGTATCCACCGACCGTTGCGGCCGAGATCACTTACGATCCTTCCGAGTTCAAAGACAACA
GAGACGGCGGCTTCACGGTCTTGGCCAAGTACATAGGCGTGTTCGGCAAGCCTGAGAACC
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CCATGACTGCTCCGGTCGTGACCAAGGAAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGAGGAGAAGAAGA
CGGTGACGATGCAGTTTCTGTTGCCGGAGATGTACAAGAAGGCTGAGGATGCGCCTCGTC
CGACTGATGAGAGGGTGGTGATTAAGGAGGAAGGAGGGA

QA 1 519 1 519
DS 

RD RS1H050TF 574 0 0
GGACACATTTGCGTTTCGCAACCGCAAGAACCAAACTGATAAAATAACAAAACCTGTGGG
AAGAATCTCTTTTTTTTTTT*GGTAAAGCTTTTGCATAATGGGAATGGTATTTGGTAAAA
TCTCCGTGGAGACTCCCAAGTACACCGTGGTTAAATCCGGCGACGGTTACGAGATCCGTG
AGTATCCACCGACCGTTGCGGCCGAGATCACTTACGATCCTTCCGAGTTCAAAGACAACA
GAGACGGCGGCTTCACGGTCTTGGCCAAGTACATAGGCGTGTTTGGCAAGCCTGAGAACC
AGAAGCCGGAGAAGATCGCCATGACTGCTCCTGTGATCACCAAGGAAGGAGAGAAGATCG
CCATGACTGCTCCGGTCGTGACCAAGGAAGGAGGAGGAGGAGGAG***AGGAGAAGAAGA
CGGTGACGATGCAGTTTCTGTTGCCGGAGATGTACAAGAAGGCTGAGGATGCGCCTCGTC
CGACTGATGAGAGGGTGGTGATTAAGGAGGAAGGAGGGAGGAAGTATGGCGTGGTCACGT
TCAGTGGTAACGCGGCGGAGAGTGTGGTGAGCGA

QA 1 574 1 574
DS 

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TCAGTGGTAACGCGGCGGAGAGTGTGGTGAGCGAGAAGGTGAAGAAGCTGACGAGTGACC
TCGAGAGAGATGGGTTTAAGATCACCGGAGAGTTCGTCCTTGCTAGGTACAATCCTCCAT
GGACAATACCTCCGTTCAAGACCAACGAAGTCATGATTCCTGTTGAATGATGAAAACTAT
ATCCAAAGTTTATAGCTTTTGGTCTCAAAAAACTTGTCTTTTCAGAACAATAATGTAATA
CAATGCCGGGTTTTGAATTTTAATAAATCAACGACAAAGAAGAGAAGTGTGTTTACTGTT
TAGGTTGTGAATTATTAGAATTTACTATAGTTTGGCTTGTTTTAACCGGAGAAGAGCTTA
AAAACGATGACAATCAAGTTAAAGAGCATGAGAGGGAGCCTCATGTAGTGGCAGGCGTGG
ATGAGACCAACGATCTGGCCTTTGAGGGAGTTTCTTTTGCCGGTTTGGTGAAGCTCGGTG
AGTGTCCAT

QA 1 549 1 549
DS 



AS 1 15

CO CL98Contig1 1569 15 24 U
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AAACCCTAACTTCATCTCTCTGATCCTTATCGGCCTCGTCGCGATCGCATCTGCTAGCGT
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GAAAGATGACAACACTGCTGGAGAATGGAGCCACACAGCTGGCAACTGGTCTGGTGACGC
TAACGACAAAGGTATCCAGACTAGCGAGGACTACAGATTCTACGCCATTTCAGCTGAGTT
CCCTGAGTTCACCAACAAGGACAAGACCCTTGTGTTCCAGTTCTCTGTCAAGCACGAGCA
GAAGCTTGACTGTGGTGGTGGATACATGAAGCTTCTCAGTGGTGATGTTGACCAGAAGAA
ATTCGGTGGAGACACTCCTTACAGCATCATGTTCGGTCCTGATAT*CTGTGGCTACGACA
CTAAGAAAGTGCATGCTATCCTTACCTACAATGGAAAAAACCATCTGATCAAGAAGGAGG
TTCCATGTGAGACTGATCAGCTCACGCATGTCTACACGTTTATCCTCCGCCCAGATGCTA
CTTACAGCATTCTTATCGATAACGTTGAGAAGCAAACTGGTAGCCTCTACTCCGACTGGG
ATCTACTCCCAGCCAAGAAGATTAAGGATCCAAGCGCCAAGAAGCCTGAGGACTGGGATG
ACAAAGAGTACATTCCTGATCCTGAAGACACAAAGCCAGCTGGATACGATGACATCCCAA
AGGAGATCCCAGACGCTGATGCAAAGAAGCCCGAGGACTGGGATGATGAAGAAGATGGTG
AGTGGACTGCCCCTACCACTCCCAACCCCGAGTACAACGGTGAATGGAAGCCCAAGAAAA
TCAAGAACCCTAACTACAAGGGAAAATGGAAGGCTCCAATGATTGACAACCCTGACTTCA
AGGATGACCCAGAACTCTATGTCTTCAAATTTAAGTATGTTGGAGTAGAGTTGTGGCAGG
TGAAATCTGGATCATTGTTCGACAATGTCTTAGTCTGCGATGACCCTGACTACGCTAAGA
AGTTGGCTGAGGAAACCTGGGGAAAGCTCAAGGATGCTGAGAAAGCAGCATTCGACGAAG
CTGAGAAGAAGAGAGAGGAAGAGGAATCAAAGGATGCTCCCGCTGCTGATTCTGATGCTG
AGGATGAACAAGATGACGATGACCATGAAGGAGATGAATCCGACACTGAATCAAAAACTG
AGGAAACCAAGGAAGAAGCCTCCTCGGACAAGGATGATGCCGCCCATGACGAGCTCTAAG
CCGAAGAAGGTGGAGATTATGAAGGATTCAACAAGTTTTCAGAGTCGTATTTGTTTTTCT
TTCTTTTAAAGAATTATTTCAGCGCTAGTTTGTTGGGGATGTTAGAACTTTTTTAGCTAC
CAAAAAAAAAGAATATGGTGAAATGATGGGCGTGGCAGCTTCTTTTAGACTTTGATAAAT
TCCTGACTTTCTGATACTCTCTCATCTGTACGTTCTTTCTATGGACCAACAATAGATCCA
CTCTTGAGC


BQ
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 40 0 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 
55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 35 20 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D992TF U 3
AF RS1DL94TF U 3
AF RS1DJ61TF U 1
AF RS1EH10TF U 5
AF RS1CC91TF U 145
AF RS1FC23TF U 253
AF RS1CC91JQ C 739
AF RS1GF10TF U 877
AF RS1FC23JQ C 1056
AF RS1EH10JQ C 821
AF RS1EF78TF U 917
AF RS1D992JQ C 1251
AF RS1DL94JQ C 1064
AF RS1FQ65JQ C 1014
AF RS1FQ65TF U 1041
BS 1 291 RS1DJ61TF
BS 292 292 RS1D992TF
BS 293 729 RS1DJ61TF
BS 730 730 RS1EH10TF
BS 731 771 RS1DJ61TF
BS 772 894 RS1CC91TF
BS 895 896 RS1FC23TF
BS 897 897 RS1GF10TF
BS 898 921 RS1CC91TF
BS 922 922 RS1FC23TF
BS 923 924 RS1CC91TF
BS 925 926 RS1FC23TF
BS 927 931 RS1CC91TF
BS 932 932 RS1GF10TF
BS 933 948 RS1CC91TF
BS 949 949 RS1FC23TF
BS 950 958 RS1CC91TF
BS 959 1019 RS1FC23TF
BS 1020 1314 RS1GF10TF
BS 1315 1315 RS1EF78TF
BS 1316 1449 RS1GF10TF
BS 1450 1558 RS1EF78TF
BS 1559 1561 RS1FQ65TF
BS 1562 1569 RS1FQ65JQ

RD RS1D992TF 679 0 0
GGAGCATC
TTACTGTTTTCGAGGAAGGTGCGATCTGAGTTTCTAGCGATGGCGAAACTAAACCCTAAC
TTCATCTCTCTGATCCTTATCGGCCTCGTCGCGATCGCATCTGCTAGCGTTATCTTCGAG
GAGAAATTCGACGATGGATGGGAGAACAGATGGGTGAAATCTGACTGGAAGAAAGATGAC
AACACTGCTGGAGAATGGAGCCACACAGCTGGCAACTGGTCTGGTGACGCTAACGACAAA
GGTATCCAGACTAGCGAGGACTACAGATTCTACGCCATTTCAGCTGAGTTCCCTGAGTTC
ACCAACAAGGACAAGACCCTTGTGTTCCAGTTCTCTGTCAAGCACGAGCAGAAGCTTGAC
TGTGGTGGTGGATACATGAAGCTTCTCAGTGGTGATGTTGACCAGAAGAAATTCGGTGGA
GACACTCCTTACAGCATCATGTTCGGTCCTGATAT*CTGTGGCTACGACACTAAGAAAGT
GCATGCTATCCTTACCTACAATGGAAAAAACCATCTGATCAAGAAGGAGGTTCCATGTGA
GACTGATCAGCTCACGCATGTCTACACGTTTATCCTCCGCCCAGATGCTACTTACAGCAT
TCTTATCGATAACGTTGAGAAGCAAACTGGTAGCCTCTACTCCGACTGGGATCTACTCCC
AGCCAAGAAGA

QA 9 679 9 679
DS 

RD RS1DL94TF 680 0 0
GGAGCATC
TTACTGTTTTCGAGGAAGGTGCGATCTGAGTTTCTAGCGATGGCGAAACTAAACCCTAAC
TTCATCTCTCTGATCCTTATCGGCCTCGTCGCGATCGCATCTGCTAGCGTTATCTTCGAG
GAGAAATTCGACGATGGATGGGAGAACAGATGGGTGAAATCTGACTGGAAGAAAGATGAC
AACACTGCTGGAGAATGGAGCCACACAGCTGGCAACTGGTCTGGTGACGCTAACGACAAA
GGTATCCAGACTAGCGAGGACTACAGATTCTACGCCATTTCAGCTGAGTTCCCTGAGTTC
ACCAACAAGGACAAGACCCTTGTGTTCCAGTTCTCTGTCAAGCACGAGCAGAAGCTTGAC
TGTGGTGGTGGATACATGAAGCTTCTCAGTGGTGATGTTGACCAGAAGAAATTCGGTGGA
GACACTCCTTACAGCATCATGTTCGGTCCTGATAT*CTGTGGCTACGACACTAAGAAAGT
GCATGCTATCCTTACCTACAATGGAAAAAACCATCTGATCAAGAAGGAGGTTCCATGTGA
GACTGATCAGCTCACGCATGTCTACACGTTTATCCTCCGCCCAGATGCTACTTACAGCAT
TCTTATCGATAACGTTGAGAAGCAAACTGGTAGCCTCTACTCCGACTGGGATCTACTCCC
AGCCAAGA
GATT

QA 9 676 9 676
DS 

RD RS1DJ61TF 772 0 0
GGGTAGCATCTTACTGTTTTCGAGGAAGGTGCGATCTGAGTTTCTAGCGATGGCGAAACT
AAACCCTAACTTCATCTCTCTGATCCTTATCGGCCTCGTCGCGATCGCATCTGCTAGCGT
TATCTTCGAGGAGAAATTCGACGATGGATGGGAGAACAGATGGGTGAAATCTGACTGGAA
GAAAGATGACAACACTGCTGGAGAATGGAGCCACACAGCTGGCAACTGGTCTGGTGACGC
TAACGACAAAGGTATCCAGACTAGCGAGGACTACAGATTCTACGCCATTTCGGCTGAGTT
CCCTGAGTTCACCAACAAGGACAAGACCCTTGTGTTCCAGTTCTCTGTCAAGCACGAGCA
GAAGCTTGACTGTGGTGGTGGATACATGAAGCTTCTCAGTGGTGATGTTGACCAGAAGAA
ATTCGGTGGAGACACTCCTTACAGCATCATGTTCGGTCCTGATAT*CTGTGGCTACGACA
CTAAGAAAGTGCATGCTATCCTTACCTACAATGGAAAAAACCATCTGATCAAGAAGGAGG
TTCCATGTGAGACTGATCAGCTCACGCATGTCTACACGTTTATCCTCCGCCCAGATGCTA
CTTACAGCATTCTTATCGATAACGTTGAGAAGCAAACTGGTAGCCTCTACTCCGACTGGG
ATCTACTCCCAGCCAAGAAGATTAAGGATCCAAGCGCCAAGAAGCCTGAGGACTGGGATG
ACAAAGAGTGCATTCCTGATCCTGAAGACACAAAGCCAGCTGGATACGATG
A

QA 1 771 1 771
DS 

RD RS1EH10TF 767 0 0
GGATCT
TTACTGTTTTCGAGGAAGGTGCGATCTGAGTTTCTAGC*ATGGTGAAACTAAACCCTAAC
TTCATCTCTCTGATTCTTATCGGCCTCCTCGCGATCGCTTCTGCTAGCGTTATCTTCGAG
GAGAAATTCGACGATGGATGGGAGAACAGATGGGTGAAATCTGACTGGAAGAAAGATGAC
AACACTGCTGGGGAATGGAGCCACACAGCTGGCAACTGGTCTGGTGACGCTAACGACAAA
GGTATCCAGACTAGCGAGGACTACAGATTCTACGCCATATCAGCTGAGTTCCCTGAGTTC
AGCAACAAGGACAAGACCCTTGTGTTCCAGTTCTCTGTCAAGCACGAGCAGAAGCTTGAC
TGTGGTGGTG*ATACATGAAGCTTCTCAGTGGTGATGTTGACCAGAAGAAATTCGGTGGA
GACACTCCTTACAGCATCATGTTTGGTCCTGATAT*CTGTGGCTACGACACCAAGAAAGT
GCATGCTATCCTTACATACAATGGAAAAAACCATCTGATCAAGAAGGAGGTTCCATGTGA
GACTGATCAGCTCACACATGTCTACACGTTTATCCTCCGCCCAGATGCTACTTACAGTAT
TCTTATCGATAACGTTGAGAAGCAAACTGGCAGCCTCTACTCTGACTGGGATCTCCTCCC
AGCCAAGAAGATTAAGGATCCAAGCGCCAAGAAGCCTGAGGACTGGGATGACAAAGAGTA
CATTCCTGATCCTGAAGACACAAAGCCAGCTGGATACGATG

QA 7 767 7 767
DS 

RD RS1CC91TF 814 0 0
G
GGATGGGAGAACAGATGGGTGAAATCTGACTGGAAGAAAGATGACAACACTGCTGGAGAA
TGGAGCCACACAGCTGGCAACTGGTCTGGTGACGCTAACGACAAAGGTATCCAGACTAGC
GAGGACTACAGATTCTACGCCATTTCAGCTGAGTTCCCTGAGTTCACCAACAAGGACAAG
ACCCTTGTGTTCCTGTTCTCTGTCAAGCACGAGCAGAAGCTTGACTGTGGTGGTGGATAC
ATGAAGCTTCTCAGTGGTGATGTTGACCAGAAGAAATTCGGTGGAGACACTCCTTACAGC
ATCATGTTCGGTCCTGATAT*CTGTGGCTACGACACTAAGAAAGTGCATGCTATCCTTAC
CTACAATGGAAAAAACCATCTGATCAAGAAGGAGGTTCCATGTGAGACTGATCAGCTCAC
GCATGTCTACACGTTTATCTTCCGCCCAGATGCTACTTACAGCATTCTTATCGATAACGT
TGAGAAGCAAACTGGTAGCCTCTACTCCGACTGGGATCTACTCCCAGCCCA**AGATTAA
GGATCCAAGCGCCAAGAAGCCTGAGGACTGGGATGACAAAGAGTACATTCCTGATCCTGA
AGACACAAAGCCAGCTGGATACGATGACATCCCAAAGGAGATCCCAGACGCTGATGCAAA
GAAGCCCGAGGACTGGGATGATGAAGAAGATGGTGAGTGGACTGCCCCTACCACTCCCAA
CCCCGAGTACAACGGTGAATGGAAGCCCA**GAAATCAAGAACCCTAACTACAAGGCAA*
*TGGAA*GCTCCAATGATTGACA*CCCTGACTT

QA 2 814 2 814
DS 

RD RS1FC23TF 769 0 0
G
ATCCAGACTAGCGAGGACTACAGATTCTACGCCATATCAGCTGAGTTCCCTGAGTTCAGC
AACAAGGACAAGACCCTTGTGTTCCAGTTCTCTGTCAAGCACGAGCAGAAGCTTGACTGT
GGTGGTGGATACATGAAGCTTCTCAGTGGTGATGTTGACCAGAAGAAATTCGGTGGAGAC
ACTCCTTACAGCATCATGTTCGGTCCTGATATTCGGTGGCTACGACACCAAGAAAGTGCA
TGCTATCCTTACATACAGTGGAAAAAACCATCTGATCAAGAAGGAGGTTCCATGTGAGAC
TGATCAGCTCACACATGTCTACACGTTTATCCTCCGCCCAGATGCTACTTACAGTATTCT
TATCGATAACGTTGAGAAGCAAACTGGCAGCCTCTACTCTGACTGGGATCTCCTCCCAGC
CAAGAAGATTAAGGATCCAAGCGCCAAGAAGCCTGAGGACTGGGATGACAAAGAGTACAT
TCCTGATCCTGAAGACACAAAGCCAGCCGGATACGATGACATCCCAAAGGAGATCCCAGA
CGCTGATGCAAAGAAGCCTGAGGACTGGGATGATGAAGAAGATGGTGGGTGGACTGCCCC
TACCATTCCCAACCCCGAGTACAACGGTGAATGGAAGCCCAAGGAAATCAAGAACCCTAA
CTACAAGGGAAAATGGAAAGCTCCAATGATTGACAACCCTGACTTCAAGGATGACCCAGA
ACTCTATGTCTTCAAATTTAAGTATGTTGGAGTAGAGTTGTGGCAG
TG

QA 2 767 2 767
DS 

RD RS1CC91JQ 756 0 0
GAT
CTGAAGACACAAAGCCAGCTGGATACGATGACATCCCAAAGGAGATCCCAGACGCTGATG
CAAAGAAGCCCGAGGACTGGGATGATGAAGAAGATGGTGAGTGGACTGCCCCTACCACTC
CCAACCCCGAGTACAACGGTGAATGGAAGCCCAAGAAAATCAAGAACCCTAACTACAAGG
GCAAATGGAAGGCTCCAATGATTGACAACCCTGACTTCAAGGATGACCCAGAACTCTATG
TCTTCAAATTTAAGTATGTTGGAGTAGAGTTGTGGCAGGTGAAATTTGGATCATTGTTCG
ACAATGTCTTAGTTTGCGATGACCCTGACTACGCTAAGAAGTTGGCTGAGGAAACCTGGG
GAAAGCTCAAGGATGCTGAGAAAGCAGCATTCGACGAAGCTGAGAAGAAGAGAGAGGAAG
AGGAATCAAAGGATGCTCCCGCTGCTGATTCTGATGCTGAGGATGAACAAGATGACGATG
ACCATGAAGGAGATGAATCCGACACTGTATCAAAAACTGAGGAAACCAAGGAAGAAGCCT
CCTCGGACAAGGATGATGCCGCCCATGACGAGCTTTAAGCCGAAGAAGGTGGAGATTATG
AAGGATTCAACAAGTTTTCAGAGTCGTATTTGTTTTTCTTTCTTTTAAAGAATTATTTCA
GCGCTAGTTTGTTGGGGATGTTAGAACTTTTTTAGCTACCAAAAAAAAAGAATATGGTGA
AATGGTGGGCGTGGCAGCTTCTTTTAGACTTTG

QA 4 756 4 756
DS 

RD RS1GF10TF 573 0 0
G
CGGTGAATGGAAGCCCAAGAAAATCAAGAACCCTAACTACAAGGGAAAATGGAAGGCTCC
AATGATTGACAACCCTGACTTCAAGGATGACCCAGAACTCTATGTCTTCAAATTTAAGTA
TGTTGGAGTAGAGTTGTGGCAGGTGAAATCTGGATCATTGTTCGACAATGTCTTAGTCTG
CGATGACCCTGACTACGCTAAGAAGTTGGCTGAGGAAACCTGGGGAAAGCTCAAGGATGC
TGAGAAAGCAGCATTCGACGAAGCTGAGAAGAAGAGAGAGGAAGAGGAATCAAAGGATGC
TCCCGCTGCTGATTCTGATGCTGAGGATGAACAAGATGACGATGACCATGAAGGAGATGA
ATCCGACACTGAATCAAAAACTGAGGAAACCAAGGAAGAAGCCTCCTCGGACAAGGATGA
TGCCGCCCATGACGAGCCCTAAGCCGAAGAAGGTGGAGATTATGAAGGATTCAACAAGTT
TTCAGAGTCGTATTTGTTTTTCTTTCTTTTAAAGAATTATTTCAGCGCTAGTTTGTTGGG
GATGTTAGAACTTTTTTAGCTACCAAAAAAAA

QA 2 573 2 573
DS 

RD RS1FC23JQ 445 0 0
TGCGATGACCCTGACTACGCTAAGAAGTTGGCTGAGGAAACCTGGGGAAAGCTCAAGGAT
GCTGAGAAAGCAGCATTCGACGAAGCTGAGAAGAAGAGAGAGGAAGAGGAATCAAAGGAT
GCTCCCGCTGCTGATTCTGATGCTGAGGATGAACAAGATGACGATGACCATGAAGGAGAT
GAATCCGACACTGAATCAAAAACTGAGGAAACCAAGGAAGAAGCCTCCTCGGACAAGGAT
GATGCCGCCCATGACGAGCTCTAAGCCGAAGAAGGTGGAGATTATGAAGGATTCAACAAG
TTTTCAGAGTCGTATTTGTTTTTCTTTTTTTTAAAGAATTATTTCAGCGCTAGTTTGTTG
GGGATGTTAGAACTTTTTTAGCTACCAAAAAAAA*GAATATGGTGAAATGATGGGCGTGG
CAGCTTCTTTTAGACTTTGATAAAT

QA 1 445 1 445
DS 

RD RS1EH10JQ 742 0 0
GGATGATGAAGAAGATGGTGAGTGGACTGCCCCTACCATTCCCAACCCCGAGTACAACGG
TGAATGGAAGCCCAAGAAAATCAAGAACCCTAACTACAAGGGAAAATGGAAGGCTCCAAT
GATTGACAACCCTGACTTCAAGGATGACCCAGAACTCTATGTCTTCAAATTTAAGTATGT
TGGAGTAGAGTTGTGGCAGGTGAAATCTGGATCATTGTTCGACAATGTCTTAGTCTGCGA
TGACCCTGACTACGCTAAGAAGTTGGCTGAGGGAACCTGGGGAAAGCTCAAGGATGCTGA
GAAAGCAGCATTCGACGAAGCTGAGAAGAAGAGAGAGGAAGAGGAATCAAAGGATGCTCC
GGCTGCTGATTCTGATGCTGAGGATGAACAAGATGACGATGACCATGAAGGAGATGAATC
CGACACTGAATCAAAAACTGAGGAAACCAAGGAAGAAGCCTCCTCGGACAAGGATGATGC
CGCCCATGACGAGCTTTAAGCCGAAGAAGGTGGAGATTATGAAGGATTCAACAAGTTTTC
AGAGTCGTATTTGTTTTTCTTTCTTTTAAAGAATTATTTCAGCGCTAGTTTGTTGGGGAT
GTTAGAACTTTTTTAGCTACCAAAAAAAA*GAATATGGTGAAATGATGGGCGTGGCAGCT
TCTTTTAGACTTTGATAAATTCGTGACTTTCTGATACTCTCTCATCTGTACGTTCTTTCT
ATGGACCAACAATAGATC
CACC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1EF78TF 651 0 0
G
AAGGGCAAATGGAAGGCTCCAATGATTGACAACCCTGACTTCAAGGATGACCCAGAACTC
TATGTCTTCAAATTTAAGTATGTTGGAGTAGAGTTGTGGCAGGTGAAATCTGGATCATTG
TTCGACAATGTCTTAGTCTGCGATGACCCTGACTACGCTAAGAAGTTGGCTGAGGAAACC
TGGGGAAAGCTCAAGGATGCTGAGAAAGCAGCATTCGACGAAGCTGAGAAGAAGAGAGAG
GAAGAGGAATCAAAGGATGCTCCCGCTGCTGATTCTGATGCTGAGGATGAACAAGATGAC
GATGACCATGAAGGAGATGAATCCGACACTGAATCAAAAACTGAGGAAACCAAGGAAGAA
GCCTCCTCGGACAAGGATGATGCCGCCCATGACGAGCTCTAAGCCGAAGAAGGTGGAGAT
TATGAAGGATTCAACAAGTTTTCAGAGTCGTATTTGTTTTTCTTTCTTTTAAAGAATTAT
TTCAGCGCTAGTTTGTTGGGGATGTTAGAACTTTTTTAGCTACCAAAAAAAAAGAATATG
GTGAAATGATGGGCGTGGCAGCTTCTTTTAGACTTTGATAAATTCCTGACTTTCTGATAC
TCTCTCATCTGTACGTTCTTTCTATGGACCAACAATAGATC
AACTCTTGA

QA 2 642 2 642
DS 

RD RS1D992JQ 265 0 0
TCAAAAACTGAGGAAACCAAGGAAGAAGCCTCCTCGGACAAGGATGATGCCGCCCATGCC
GAGCTTTAAGCCGAAGAAGGTGGAGATTATGAAGGATTCAACAAGTTTTCAGAGTCGTAT
TTGTTTTTTTTTTTTTTAAAGAATTATTTCAGCGCTAGTTTGTTGGGGATGTTAGAACTT
TTTTAGCTACCAAAAAAAAAGAATATGGTGAAATGATGGGCGTGGCAGCTTTTTTTAGAC
TTTGATAAATTCCTGACTTTTTGAT

QA 1 265 1 265
DS 

RD RS1DL94JQ 452 0 0
CCCTGACTACGCTAAGAAGTTGGCTGAGGAAACCTGGGGAAAGCTCAAGGATGCTGAGAA
AGCAGCATTCGACGAAGCTGAGAAGAAGAGAGAGGAAGAGGAATCAAAGGATGCTCCCGC
TGCTGATTTTGATGCTGAGGATGAACAAGATGACGATGACCATGAAGGAGATGAATCCGA
CACTGAATCAAAAACTGAGGAAACCAAGGAAGAAGCCTCCTCGGACAAGGATGATGCCGC
CCATGCCGAGCTTTAAGCCGAAGAAGGTGGAGATTATGAAGGATTCAACAAGTTTTCAGA
GTCGTATTTGTTTTTTTTTTTTTTAAAGAATTATTTCAGCGCTAGTTTGTTGGGGATGTT
AGAACTTTTTTAGCTACCAAAAAAAAAGAATATGGTGAAATGATGGGCGGGGCAGCTTTT
TTTAGACTTTGATAAATTCCTGACTTTTTGAT

QA 1 452 1 452
DS 

RD RS1FQ65JQ 556 0 0
G
GGCAGGTGAAATCTGGATCATTGTTCGACAATGTCTTAGTCTGCGATGACCCTGACTACG
CTAAGAAGTTGGCTGAGGAAACCTGGGGAAAGCTCAAGGATGCTGAGAAAGCAGCATTCG
ACGAAGCTGAGAAGAAGAGAGAGGAAGAGGAATCAAAGGATGCTCCCGCTGCTGATTCTG
ATGCTGAGGATGAACAAGATGACGATGACCATGAAGGAGATGAATCCGACACTGAATCAA
AAACTGAGGAAACCAAGGAAGAAGCCTCCTCGGACAAGGATGATGCCGCCCATGACGAGC
TTTAAGCCGAAGAAGGTGGAGATTATGAAGGATTCAACAAGTTTTCAGAGTCGTATTTGT
TTTTCTTTCTTTTAAAGAATTATTTCAGCGCTAGTTTGTTGGGGATTTTAGAACTTTTTT
AGCTACCAAAAAAAA*GAATATGGTGTAATGATGGGCGTTGCAGCTTCTTTTAGACTTTG
ATAAATTCCTGACTTTCTGATACTCTCTCATCTGTACGTTCTTTCTATGGACCGACAATA
GATCCACTCTTGAGC

QA 2 556 2 556
DS 

RD RS1FQ65TF 529 0 0
GACAATGTCTTAGTCTGCGATGACCCTGACTACGCTAAGAAGTTGGCTGAGGAAACCTGG
GGAAAGCTCAAGGATGCTGAGAAAGCAGCATTCGACGAAGCTGAGAAGAAGAGAGAGGAA
GAGGAATCAAAGGATGCTCCCGCTGCTGATTCTGATGCTGAGGATGAACAAGATGACGAT
GACCATGAAGGAGATGAATCCGACACTGAATCAAAAACTGAGGAAACCAAGGAAGAAGCC
TCCTCGGACAAGGATGATGCCGCCCATGACGAGCTCTAAGCCGAAGAAGGTGGAGATTAT
GAAGGATTCAACAAGTTTTCAGAGTCGTATTTGTTTTTCTTTCTTTTAAAGAATTATTTC
AGCGCTAGTTTGTTGGGGATTTTAGAACTTTTTTAGCTACCAAAAAAAA*GAATATGGTG
TAATGATGGGCGTTGCAGCTTCTTTTAGACTTTGATAAATTCCTGACTTTCTGATACTCT
CTCATCTGTACGTTCTTTCTATGGACCGACAATAGATCCAC
TCTTGAGC

QA 1 521 1 521
DS 



AS 1 15

CO CL99Contig1 670 15 12 U
TTTTTTTTTGCAATTAAATAAATAAAACTTGTAAGTAAAATTTGTTATTCTACTAGTTTA
TTATTTCTCTGTTTACACGAGTGAAATATTCCACTAATGTTCTTTTGATAACAACATCTC
GGTCTGATGAGACTTATTGAGATTAATTATGTTAATTATTACAAATTCAAACGACAAAAG
ACCAAAAACTTCATTAGCTAGTTAGATTGTGGTGTCATTGCAGCCTCTTGCACTTCATAA
TTATCGTTGACATTATTGTGTTTGAACGTCTCGGGGATCTTGTAATCAACAGTTGATGGT
TGTTTTGCTGCTACGAGAGATTTGTACAGCCCTTTGTCTAAATGCAAATGGAGTGCATCA
CATGAGCCAGACCAGCAAGTCAGCGGTTTGCAGTACATGGTCTCTCTGATACCAGTCCTG
TCCCTGCCACCATTGTATCGCATTCTTCCGCGACCACCACGGCCAAAATTGACTCTGCTA
CCACCGGCTCCTCTAATGCAGAGTCCGGGAAGACAAAAGCCTCCATCGTAAACAAAGTGG
TTTCCAACAGACCATTTCTGAGAGACTGTGTTATGGGATCCAACTGCTAAGCTGAGCAAC
AGTGTTAGTGAGAAGCAAAGGCATATCCATTTGAGTTCTGTCATTTTGGCTTTCTATGTT
GATACTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 35 45 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 70 70 70 70 70 70 70 75 80 80 80 80 80 80 55 85 85 85 
85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 15 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 85 55 55 85 85 85 85 85 70 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 
85 85 15 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 55 85 85 85 55 85 85 85 85 85 
85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 85 80 80 80 80 65 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 55 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 65 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 5 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 60 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 
60 60 60 0 0 35 35 35 35 35 

AF RS1CP17TF C 49
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AF RS1ET51TF C 35
AF RS1DA29TF C 19
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AF RS1FT83TF C 33
AF RS1EZ23TF C 30
AF RS1CP17JQ U 50
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ATAATTATCGTTGACATTATTGTGTTTGAACGTCTCGG

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DS 

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ACGACAAAAGACCAAAAACTTCATTAGCTAGTTAGATTGTGGTGTCATTGCAGCCTCTTG
CACTTCATAATTATCGTTGACATTATTGTGTTTGAACGTCTCGGGGATTTTGTAATCAAC
ATTTGATGGTTGTTTTGCTGCTACGAAAAATTTGTACAGCCCTTTGTCTAAATGCAAATG
GAGTGCATCACATGAGCCA
AAC

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DS 

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GAACGTCTCGGGGATCTTGTAATCAACAGTTGATGGTTGTTTTGCTGCTACGAGAGATTT
GTACAGCCCTTTGTCTAAATGCAAATGGAGTGCATCACATGAGCCAGACCAGCAAGTCAG
CGGTTTGCAGTACATGGTCTCTCTGATACCAGTCCTGTCCCTGCCACCATTGTATCGCAT
TCTTCCGCGACCACCACGGCCAAAATTGACTCTGCTACCACCGGCTCCTCTAATGCAGAG
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GACTGTGTTATGGGATCCAACTGCTAAGCTGAGCAACAGTGTTAGTGAGAAGCAAAGGCA
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CC

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DS 

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TCATTGCAGCCTCTTGCACTTCATAATTATCGTTGACATTATTGTGTTTGAACGTCTCGG
GGATCTTGTAATCAACAGTTGATGGTTGTTTTGCTGCTACGAGAGATTTGTACAGCCCTT
TGTCTAAATGCAAATGGAGTGCATCACATGAGCCAGACCAGCAAGTCAGCGGTTTGCAGT
ACATGGTCTCTCTGATACCAGTCCTGTCCCTGCCACCATTGTATCGCATTCTTCCGCGAC
CACCACGGCCAAAATTGACTCTGCTACCACCGGCTCCTCTAATGCAGAGTCCGGGAAGAC
AAAAGCCTCCATCGTAAACAAAGTGGTTTCCAACAGACCATTTCTGAGAGACTGTGTTAT
GGGATCCAACTGCTAAGCTGAGCAACAGTGTTAGTGAGAAGCAAAGGCATATCCATTTGA
GTTCTGTCATTTTGGCTTTCTAT
CC

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DS 

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TAATTATGTTAATTATTACAAATTCAAACGACAAAAGACCAAAAACTTCATTAGCTAGTT
AGATTGTGGTGTCATTGCAGCCTCTTGCACTTCATAATTATCGTTGACATTATTGTGTTT
GAACGTCTCGGGGATCTTGTAATCAACAGTTGATGGTTGTTTTGCTGCTACGAGAGATTT
GTACAGCCCTTTGTCTAAATGCAAATGGAGTGCATCACATGAGCCAGACCAGCAAGTCAG
CGGTTTGCAGTACATGGTCTCTCTGATACCAGTCCTGTCCCTGCCACCATTGTATCGCAT
TCTTCCGCGACCACCACGGCCAAAATTGACTCTGCTACCACCGGCTCCTCTAATGCAGAG
TCCGGGAAGACAAAAGCCTCCATCGTAAACAAAGTGGTTTCCAACAGACCATTTCTGAGA
GACTGTGTTATGGGATCCAACTGCTAAGCTGAGCAACAGTGTTAGTGAGAAGCAAAGGCA
TATCCATTTGAGTTCTGTCATTTTGGCTTTCTATGTT
CC

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DS 

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CATGAGCCAGACCAGCAAGTCAGCGGTTTGCAGTACATGGTCTCTCTGATACCAGTCCTG
TCCCTGCCACCATTGTATCGCATTATTCCGCGACCACCACGGCCAAAATTGACCCTGCTA
CCACCGGCTCCTCTAATGCAGAGTCCGGGAAGACAAAAGCCTCCATCGTAAACAAAGTGG
TTTCCAACAGACCATTTCTGAGAGACTGTGTTATGGGATCCAACTGCTAAGCTGAGCAAC
AGTGTTAGTGAGAAGCAAAGGCATATCCATTTGAGTTCTGTCATTTTGGCTTTCTATGTT
GATAGTTTCC

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AGACTTATTGAGATTAATTGTGTTAATTATTACAAATTCAAACGACAAAAGACCAAAAAC
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GACCAGCAAGTCAGCGGTTTGCAGTACATGGTCTCTCTGATACCAGTCCTGTCCCTGCCA
CCATTGTATCGCATTATTCCGCGACCACCACGGCCAAAATTGACCCTGCTACCACCGGCT
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GACCATTTCTGAGAGACTGTGTTATGGGATCCAACTGCTAAGCTGAGCAACAGTGTTAGT
GAGAAGCAAAGGCATATCCATTTGAGTTCTGTCATTTTGGCTTTCTATGTTGATAGTTTC
C

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DS 

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GTTAATTATTACAAATTCAAACGACAAAAGACCAAAAACTTCATTAGCTAGTTAGATTGT
GGTGTCATTGCAGCCTCTTGCACTTCATAATTATCGTTGACATTATTGTGTTTGAACGTC
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CCTTTGTCTAAATGCAAATGGAGTGCATCACATGAGCCAGACCAGCAAGTCAGCGGTTTG
CAGTACATGGTCTCTCTGATACCAGTCCTGTCCCTGCCACCATTGTATCGCATTCTTCCG
CGACCACCACGGCCAAAATTGACTCTGCTACCACCGGCTCCTCTAATGCAGAGTCCGGGA
AGACAAAAGCCTCCATCGTAAACAAAGTGGTTTCCAACAGACCATTTCTGAGAGACTGTG
TTATGGGATCCAACTGCTAAGCTGAGCGACAGTGTTAGTGAGAAGCAAAGGCATATCCAT
TTGAGTTCTGTCATTTTGGCTTTCTATGTTGATCC

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DS 

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GA
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TTAATTATTACAAATTCAAACGACAAAAGACTAAAAACTTCATTAGCTAGTTAGATTGTG
GTGTCATTGCAGCCTCTTGCACTTCATAATTATCGTTGACATTATTGTGTTTGAACGTCT
CGGGGATCTTGAAATCAACAGTTGATGGTTGTTTTGCTGCTACGAAAGATTTGTACAGCC
CTTTGTCTAAATGCAAATGGAGTGCATCACATGAGCCAGACCAGCAAGTCAGCGGTTTGC
AGTACATGGTCTCTCTGATACCAGTCCTGTCCCTGCCACCATTGTATCGCATTCTTCCGC
GACCACCACGGCCAAAATTGACTCTGCTACCACCGGCTCCTCTAATGCAAAGTCCGGGAA
GACAAAAGCCTCCATCGTAACCAAAGTGGTTTCCAACAGACCATTTCTGAAAGACTGTGT
TATGGGATCCAACTGCTAAGCTGAGCAACAGTGTTAGTGAGAAGCAAAGGCATATCCATT
TGAGTTCTGTCATTTTGGCTTTCTATGTTGATAGTTTCC

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DS 

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A
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AAATTCAAACGACAAAAGACTAAAAACTTCATTAGCTAGTTAGATTGTGGTGTCATTGCA
GCCTCTTGCACTTCATAATTATCGTTGACATTATTGTGTTTGAACGTCTCGGGGATCTTG
TAATCAACAGTTGATGGTTGTTTTGCTGCTACGAGAGATTTGTACAGCCCTTTGTCTAAA
TGCAAATGGAGTGCATCACATGAGCCAGACCAGCAAGTCAGCGGTTTGCAGTACATGGTC
TCTCTGATACCAGTCCTGTCCCTGCCACCATTGTATCGCATTCTTCCGCGACCACCACGG
CCAAAATTGACTCTGCTACCACCGGCTCCTCTAATGCAGAGTCCGGGAAGACAAAAGCCT
CCATCGTAACCAAAGTGGTTTCCAACAGACCATTTCTGAGAGACTGTGTTATGGGATCCA
ACTGATAAGCTGAGCAACAGTGTTAGTGAGAAGCAAAGGCATATCCATTTGAGTTCTGTC
ATTTTGGCTTTCTATGTTGATCC

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DS 

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TTA
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AAATTCAAACGACAAAAGACTAAAAACTTCATTAGCTAGTTAGATTGTGGTGTCATTGCA
GCCTCTTGCACTTCATAATTATCGTTGACATTATTGTGTTTGAACGTCTCGGGGATCTTG
TAATCAACAGTTGATGGTTGTTTTGCTGCTACGAGAGATTTGTACAGCCCTTTGTCTAAA
TGCAAATGGAGTGCATCACATGAGCCAGACCAGCAAGTCAGCGGTTTGCAGTACATGGTC
TCTCTGATACCAGTCCTGTCCCTGCCACCATTGTATCGCATTCTTCCGCGACCACCACGG
CCAAAATTGACTCTGCTACCACCGGCTCCTCTAATGCAGAGTCCGGGAAGACAAAAGCCT
CCATCGTAACCAAAGTGGTTTCCAACAGACCATTTCTGAGAGACTGTGTTATGGGATCCA
ACTGATAAGCTGAGCAACAGTGTTAGTGAGAAGCAAAGGCATATCCATTTGAGTTCTGTC
ATTTTGGCTTTCTATGTTGATCC

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DS 

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AG
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TGTCTAAATGCAAATGGAGTGCATCACATGAGCCAGACCAGCAAGTCAGCGGTTTGCAGT
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GGGATCCAACTGCTAAGCTGAGCAACAGTGTTAGTGAGAAGCAAAGGCATATCCATTTGA
GTTCTGTCATTTTGGCTTTCTATGTTGATCC

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DS 

RD RS1FT83TF 633 0 0
AG
GTAAAATTTGTTATTCTACTAGTTTATTATTTCTCTGTTTACACGAGTGAAATATTCCAC
TAATGTTCTTGTGATAACAACATCTCGGTCTGATGAGACTTATTGAGATTAATTATGTTA
ATTATTACAAATTCAAACGACAAAAGACTAAAAACTTCATTAGCTAGTTAGATTGTGGTG
TCATTGCAGCCTCTTGTACTTCATAATTATCGTTGACATTATTGTGTTTGAACGTCTCGG
GGATCTTGTAATCAACAGTTGATGGTTGTTTTGCTGCTACGAGAGATTTGTACAGCCCTT
TGTCTAAATGCAAATGGAGTGCATCACATGAGCCAGACCAGCAAGTCAGCGGTTTGCAGT
ACACGGTCTCTCTGATACCAGTCCTGTCCCTGCCACCATTGTATCGCATTCTTCCGCGAC
CACCACGGCCAAAATTGACTCTGCTACCACCGGCTCCTCTAATGCAGAGTCCGGGAAGAC
AAAAGCCTCCATCGTAACCAAAGTGGTTTCCAACAGACCATTTCTGAGAGACTGTGTTAT
GGGATCCAACTGCTAAGCTGAGCAACAGTGTTAGTGAGAAGCAAAGGCATATCCATTTGA
GTTCTGTCATTTTGGCTTTCTATGTTGATCC

QA 3 633 3 633
DS 

RD RS1EZ23TF 641 0 0
GA
TAAGTAAAATTTGTTATTCTACTAGTTTATTATTTCTCTGTTTACACGAGTGAAATATTC
CACTAATGTTCTTGTGATAACAACATCTCGGTCTGATGAGACTTATTGAGATTAATTATG
TTAATTATTACAAATTCAAACGACAAAAGACTAAAAACTTCATTAGCTAGTTAGATTGTG
GTGTCATTGCAGCCTCTTGCACTTCATAATTATCGTTGACATTATTGTGTTTGAACGTCT
CGGGGATCTTGAAATCAACAGTTGATGGTTGTTTTGCTGCTACGAGAGATTTGTACAGCC
CTTTGTCTAAATGCAAATGGAGTGCATCACATGAGCCAGACCAGCAAGTCAGCGGTTTGC
AGTACATGGTCTCTCTGATACCAGTCCTGTCCCTGCCACCATTGTATCGCATTCTTCCGC
GACCACCACGGCCAAAATTGACTCTGCTACCACCGGCTCCTCTAATGCAGAGTCCGGGAA
GACAAAAGCCTCCATCGTAACCAAAGTGGTTTCCAACAGACCATTTCTGAGAGACTGTGT
TATGGGATCCAACTGCTAAGCTGAGCAACAGTGTTAGTGAGAAGCAAAGGCATATCCATT
TGAGTTCTGTCATTTTGGCTTTCTATGTTGATAGTTTCC

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DS 

RD RS1CP17JQ 621 0 0
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AACAACATCTCGGT**GATGAGACTTATTGAGATTAATTATGTTAATTATTACAAATTCA
AACGACAAAAGACCAAAAACTTCATTAGCTAGTTAGATTGTGGTGTCATTGCAGCCTCTT
GCACTTCATAATTATCGTTGACATTATTGTGTTTGAACGTCTCGGGGATCTTGTAATCAA
CAGTTGATGGTTGTTTTGCTGCTACGAGAGATTTGTACAGCCCTTTGTCTAAATGCAAAT
GGAGTGCATCACACGAGCCAGACCAGCAAGTCAGCGGTTTGCAGTACATGGCCTCTCTGA
TACCAGTCCTGTCCCTGCCACCATTGTATCGCATTCTTCCGCGACCACCACGGCCAAAAT
TGACTCTGCTACCACCGGCTCCTCTAATGCAGAGTCCGGGAAGACAAAAGCCTCCATCGT
AAACAAAGTGGTTTCCAACAGACCATTTCTGAAAGACTGTGTTATGGGATCCAACTGCTA
AGCTGAACAACAGTGTTAGTGAGAAGCAAAGGCATATCCATTTGAGTTCTGTCATTTTGG
CTTTCTATGTTGATAGTTTCC

QA 1 621 1 621
DS 



AS 2 14

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GGATCTCACACTAAAACATATATCTCTCATCATCTTCTCAACTTACTTTCAAATCTTACT
AAATCTCATTTCTATCATCTAAACCCAAATGGGACGAAGCTGGAGCCTCACCATCGTGGC
AGCTGTTCTGCTGGTAATGATGTTCGGTTCAGCCTACTCAGGCAACTTCTTCGACGAGTT
CGACCTCACGTGGGGTGACCACAGGGGTAAAATCTTCAACGGAGGAAACATGTTGTCCCT
GTCTCTGGACAGGGTTTCCGGATCGGGGTTCAAATCCAAGAAAGAGTATCTATTCGGACG
GATCGATATGCAGCTCAAACTCGTCGCCGGAAACTCAGCCGGCACCGTCACTGCTTACTA
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AGGTAAACCTTATGTTCTTCACACCAACGTCTTTGCTCAAGGGAAAGGCAACAGAGAACA
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ACCTCAACACATCATATTCTTGGTGGACAATTTGCCTATAAGAGTGTTCAACAATGCAGA
GAGGCTTGGTGTTCCGTTCCCAAAGAACCAACCAATGAGGATCTACTCGAGCCTGTGGAA
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TCTCAAAAGGTTCCCTCGAGGATTCCCTCCTGAGTGCAGGAGGTCAAGAGTCTAAGGGAA
ACCATCCAATATGATTGTGTGTATGCTTAATGTTGTAATTCCTTTCTTTGAGTTATAAGA
TTTGTTTTGTTCTCTGTTGTTATTCTTCCGTTGTACATTCTCAAGGTCAATAAGTCTCCT
AC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1EX49TF U 1
AF RS1BQ25TF U 1
AF RS1FJ07TF U 1
AF RS1BQ25JQ C 243
AF RS1AB78TF U 433
AF RS1FJ07JQ C 373
AF RS1EX49JQ C 350
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BS 641 695 RS1BQ25TF
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BS 697 712 RS1BQ25TF
BS 713 713 RS1AB78TF
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BS 744 770 RS1BQ25TF
BS 771 771 RS1AB78TF
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BS 787 1036 RS1AB78TF
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RD RS1EX49TF 472 0 0
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AGCTGTTCTGCTGGTAATGATGTTCGGTTCAGCCTACTCAGGCAACTTCTTCGACGAGTT
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GTCTCTGGACAGGGTTTCCGGATCGGGGTTCAAATCCAAGAAAGAGTATCTATTCGGACG
GATCGATATGCAGCTCAAACTCGTCGCCGGAAACTCAGCCGGCACCGTCACTGCTTACTA
CTTGTCGTCGCAAGGAGCAACACATGATGAGATAGATTTCGAGTTTCTTGGAAACGAGAC
AGGTAAACCTTATGTTCTTCACACCAACGTCTTTGCTCAAGGGAAAGGCAAC

QA 1 472 1 472
DS 

RD RS1BQ25TF 790 0 0
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AAATCTCATTTCTATCATCTAAACCCAAATGGGACGAAGCTGGAGCCTCACCATCGTGGC
AGCCGTTCTGCTGGTAATGATGTTCGGTTCAGCCTACTCAGGCAACTTCTTCGACGAGTT
CGACCTCACGTGGGGTGACCACAGGGGTAAAATCTTCAACGGAGGAAACATGTTGTCCCT
GTCTCTGGACAGGGTTTCCGGATCGGGGTTCAAATCCAAGAAAGAGTATCTATTCGGACG
GATCGATATGCAGCTCAAACTCGTCGCCGGAAACTCAGCCGGCACCGTCACTGCTTACTA
CTTGTCGTCGCAAGGAGCAACACATGATGAGATAGATTTCGAGTTTCTTGGAAACGAGAC
AGGTAAACCTTATGTTCTTCACACCAACGTCTTTGCTCAAGGGAAAGGCAACAGAGAACA
ACAGTTTTATCTTTGGTTCGATCCAACCAAGAACTTCCACACTTACTCTATTGTCTGGAG
ACCTCAACACATCATATTCTTGGTGGACAATTTGCCTATAAGAGTGTTCAACAATGCAGA
GAGGCTTGGTGTTCCGTTCCCAAAGAACCAACCAATGAG*ATCTACTCGAGCCTGTGGAA
TGCAGATGACTGGGCCACGAGAGGTGGTCTTGTAA*GACTGACTGGTCCAAG*CTCCTTT
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CAAAT
CAGAC

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DS 

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AAATCTCATTTCTATCATCTAAACCCAAATGGGACGAAGTTGGAGCCTCACCATCGTGGC
AGCTGTTCTGCTGGTAATGATGTTCGGTTCAGCCTACTCAGGCAACTTCTTCGACGAGTT
CGACCTCACGTGGGGTGACCACAGGGGTAAAATCTTCAACGGAGGAAACATGTTGTCCCT
GTCTCTGGACAGGGTTTCCGGATCGGGGTTCAAATCCAAGAAAGAGTATCTATTCGGACG
GATCGATATGCAGCTCAAACTCGTCGCCGGAAACTCAGCCGGCACCGTCACTGCTTACTA
CTTGTCGTCGCAAGGAGCAACACATGATGAGATAGATTTCGAGTTTCTTGGAAACGAGAC
AGGTAAACCTTATGTTCTTCACACCAACGTCTTTGCTCAAGGGAAAGGCAACAGAGAACA
ACAGTTTTATCTTTGGTTCGATCCAACCAAGAACTTCCACACTTACTCTATTGTCTGGAG
ACCTCAACACATCATATTCTTGGTGGACAATTTGCCTATAAGAGTGTTCAACAATGCAGA
GAGGCTTGGTGTTCCGTTCCCAAAGGACCAACCAATGAGGATCTACTCGAGCCTGTGGAA
TGCAGATGACTGGGCCACGAGAGGTGGTCTTGTAAAGACTGACTGGTCCAAG*CTCCTTT
CACAGCTTACTACAGAGGATC**ACGCTGCGGCTTGCACCGTCTCTTCAG*CTGTGATCC
CAAATT

QA 1 786 1 786
DS 

RD RS1BQ25JQ 793 0 0
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TCGATATGCAGCTCAAACTCGTCGCCGGAAACTCAGCCGGCACCGTCACTGCTTACTACT
TGTCGTCGCAAGGAGCAACACATGATGAGATAGATTTCGAGTTTCTTGGAAACGAGACAG
GTAAACCTTATGTTCTTCACACCAACGTCTTTGCTCAAGGGAAAGGCAACAGAGAACAAC
AGTTTTATCTTTGGTTCGATCCAACCAAGAACTTCCACACTTACTCTATTGTCTGGAGAC
CTCAACACATCATATTCTTGGTGGACAATTTGCCTATAAGAGTGTTCAACAATGCAGAGA
GGCTTGGTGTTCCGTTCCCAAAGAACCAACCAATGAGGATCTACTCGAGCCTGTGGAATG
CAGATGACTGGGCCACGAGAGGTGGTCTTGTAAAGACTGACTGGTCCAAGGCTCCTTTCA
CAGCTTACTACAGAGGATTCAACGCTGCGGCTTGCACCGTCTCTTCAGGCTGTGATCCCA
AATTCAAGACTTCTTTAAGTGATAGTGAGCTGCAAACGGCAAATGAGCTCAATGCATATG
GCAGGAGGAGGCTGAGATGGGTGCAGAAGTACTTTATGATCTATAATTATTGCTCTGATC
TCAAAAGGTTCCCTCGAGGATTCCC*CCTGAGTGCAGGAGGTCAAGAGTCTAAGGGAAAC
CATCCAATATGATTGTGTGTATGCTTAATGTTGTAATTCCTTTCTTTGAGTTATAAGATT
TGTTTTGTTCTCT

QA 1 793 1 793
DS 

RD RS1AB78TF 604 0 0
G
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TGGTTCGATCCAACCAAGAACTTCCACACTTACTCTATTGTCTGGAGACCTCAACACATC
ATATTCTTGGTGGACAATTTGCCTATAAGAGTGTTCAACAATGCAGAGAGGCTTGGTGTT
CCGTTCCCAAAGAACCAACCAATGAGGATCTACTCGAGCCTGTGGAATGCAGATGACTGG
GCCACGAGAGGTGGTCTTGTAAAGACTGACTGGTCCAAGGCTCCTTTCACAGCTTACTAC
AGAGGATTCAACGCTGCGGCTTGCACCGTCTCTTCAGGCTGTGATCCCAAATTCAAGACT
TCTTTAAGTGATAGTGAGCTGCAAACGGCAAATGAGCTCAATGCATATGGCAGGAGGAGG
CTGAGATGGGTGCAGAAGTACTTTATGATCTATAATTATTGCTCTGATCTCAAAAGGTTC
CCTCGAGGATTCCCTCCTGAGTGCAGGAGGTCAAGAGTCTAAGGGAAACCATCCAATATG
ATTGTGTGTATGCTTAATGTTGTAATTCCTTTCTTTGAGTTATAAGATTTGTTTTGTTCT
CTG

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DS 

RD RS1FJ07JQ 662 0 0
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TGTTCTTCACACCAACGTCTTTGCTCAAGGGAAAGGCAACAGAGAACAACAGTTTTATCT
TTGGTTCGATCCAACCAAGAACTTCCACACTTACTCTATTGTCTGGAGACCTCAACACAT
CATATTCTTGGTGGACAATTTGCCTATAAGAGTGTTCAACAATGCAGAGAGGCTTGGTGT
TCCGTTCCCAAAGGACCAACCAATGAGGATTTACTCGAGCCTGTGGAATGCAGATGACTG
GGCCACGAGAGGTGGTCTTGTAAAGACTGACTGGTCCAAGGCTCCTTTCACAGCTTACTA
CAGAGGATTCAACGCTGCGGCTTGCACCGTCTTTTCAGGCTGTGATCCCAAATTCAAGAC
TTCTTTAAGTGATAGTGAGCTGCAAACGGCAAATGAGCTCAATGCATATGGCAGGAGGAG
GCTGAGATGGGTGCAGAAGTACTTTATGATCTATAATTATTGCTCTGATCTCAAAAGGTT
CCCTCGAGGATTCCCTCCTGAGTGCAGGAGGTCAAGAGTTTAAGGGAAACCATCCAATAT
GATTGTGTGTATGCTTAATGTTGTAATTCCTTTCTTTGAGTTATAAGATTTGTTTTGTT
TTG

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DS 

RD RS1EX49JQ 733 0 0
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ATTGTCTGGAGACCTCAACACATCATATTCTTGGTGGACAATTTGCCTATAAGAGTGTTC
AACAATGCAGAGAGGCTTGGTGTTCCGTTCCCAAAGAACCAACCAATGAGGATCTACTCG
AGCCTGTGGAATGCAGATGACTGGGCCACGAGAGGTGGTCTTGTAAAGACTGACTGGTCC
AAGGCTCCTTTCACAGCTTACTACAGAGGATTCAACGCTGCGGCTTGCACCGTCTCTTCA
GGCTGTGATCCCAAATTCAAGACTTCTTTAAGTGATAGTGAGCTGCAAACGGCAAATGAG
CTCAATGCATATGGCAGGAGGAGGCTGAGATGGGTGCAGAAGTACTTTATGATCTATAAT
TATTGCTCTGATCTCAAAAGGTTCCCTCGAGGATTCCCTCCTGAGTGCAGGAGGTCAAGA
GTCTAAGGGAAACCATCCAATATGATTGTGTGTATGCTTAATGTTGTAATTCCTTTCTTT
GAGTTATAAGATTTGTTTTGTTCTCTGTTGTTATTCTTCCGTTGTACATTCTCAAGGTCA
ATAAGTCTCCTAC

QA 1 733 1 733
DS 



CO CL100Contig2 1108 7 18 U
GGATCTCACACCAAAACATAAATATCTCATCATCTTCTCAACTTACTTTCAAATCTTACT
AAACACACACCCCTCAGCTCCACCATCTAAACCCAAATGGGACGAAGCTCGAGCCTCACC
ATCACCATCGTGGCAGCTGTTCTGCTGGTAATGATGTTCGGTTCAGCCTACTCAGGCAAC
TTCTTCGACGAGTTCGACCTCACGTGGGGTGACCACAGGGGTAAAATCTTCAACGGAGGA
AACATGCTGTCCCTGTCTCTAGACCGGGTTTCCGGGTCGGGGTTCAAATCCAAGAAAGAG
TATCTATTCGGACGGATCGATATGCAGCTTAAACTCGTAGCCGGTAACTCAGCCGGCACC
*GTCACTGCTTACTACTTGTCGTCACAAGGAGCAACACATGATGAGATAGATTTCGAGTT
TCTAGGGAACGAGACAGGTAAGCCTTATGTTCTCCACACCAACGTCTTTGCTCAAGGGAA
AGGCAACAGAGAACAACAGTTTTATCTCTGGTTCGATCCAACCAAGAACTTCCACACTTA
CTCTATTGTCTGGAGACCTCAACACATCATATTCTTGGTGGACAATTTGCCTATAAGAGT
GTTCAACAATGCAGAGAAGCTTGGTGTTCCTTTCCCAAAGAACCAACCAATGAGGATCTA
CTCGAGCCTGTGGAATGCAGATGACTGGGCCACGAGAGGTGGCCTTGTAAAGACTGACTG
GTCCAAGGCTCCTTTCACAGCTTACTACAGAGGATTCAATGCTGCGGCTTGCACTGTCTC
TTCAGGCTGTGACCCCAAATTCAAGACTTCTTTAAGTGATAGTGAGCTGCAAACGGCAAA
CGAGCTCAATGCATATGGTAGGAGGAGGCTGAGATGGGTGCAGAAGTACTTTATGATCTA
TAATTATTGCTCTGATCTCAAAAGGTTCCCTAGAGGATTCCCTCCTGAGTGCAGGAGGTC
AAGAGTCTAAGGGAAACCATCCAATATGATTGTGTGTGTGCTTGTTGCAATTCCTCTCTT
TTGAGTTATAAGATTTGCTTTGTTCTCTGTTATTCTTCCGTTGTACATTCTCAAGGTCAA
TAAAAGCTCCTTCCTGTGTTTAAAGTAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BB72TF U 8
AF RS1AG69TF U 524
AF RS1D625TF U 1
AF RS1FT61TF U 1
AF RS1AG69JQ C 291
AF RS1FT61JQ C 365
AF RS1D625JQ C 510
BS 1 290 RS1D625TF
BS 291 291 RS1FT61TF
BS 292 427 RS1D625TF
BS 428 429 RS1FT61TF
BS 430 533 RS1D625TF
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BS 535 699 RS1D625TF
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RD RS1BB72TF 562 0 0
G
CACCAAAACATAAATATCACATCATCTTCTCAACTTACTTTCAAATCTTACTAAACACAC
ACCCCTCAGCTCCACCATCTAAACCCAAATGGGACGAAGCTGGAGCCTCACCATCACCAT
CATGGCAGCTGTTCTGCTGGTAATGATGTTCGGTTCAGCCTACTCAGGCAACTTCTTCGA
CGAGTTCGACCTCACGTGGGGTGACCGCAGGGGTAAAATCTTCAACGGAGGAAACATGCT
GTCCCTGTCTCTAGACCGGGTTTCCGGGTCGGGGTTCAAATCCAAGAAAGAGTATCTATT
CGGACGGATCGATATGCAGCTTAAACTCGTAGCCGGAAACTCAGCCGGCACC*GTCACTG
CTTACTACTTGTCGTCGCAAGGAGCAACACATGATGAGATAGATTTCGAGTTTCTTGGAA
ACGAGACAGGTAAGCCTTATGTTCTTCACACCAACGTCTTTGCTCAAGGGAAAGGCAACA
GAGAACAACAGTTTTATCTCTGGTTCGACCCAACCAAGAACTTCCACACTTACTCTATTG
TCTGGAGACCTCAACACATCA

QA 2 562 2 562
DS 

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AAGAACTTCCACACTTACTCTATTGTCTGGAGACCTCAACACATCATATTCTTGGTGGAC
AATTTGCCTATAAGAGTGTTCAACAATGCAGAGAAGCTTGGTGTTCCTTTCCCAAAGAAC
CAACCAATGATGATCTACTCTAGCCTGTGGAATGC

QA 1 155 1 155
DS 

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AAACACACACCCCTCAGCTCCACCATCTAAACCCAAATGGGACGAAGCTCGAGCCTCACC
ATCACCATCGTGGCAGCTGTTCTGCTGGTAATGATGTTCGGTTCAGCCTACTCAGGCAAC
TTCTTCGACGAGTTCGACCTCACGTGGGGTGACCACAGGGGTAAAATCTTCAACGGAGGA
AACATGCTGTCCCTGTCTCTAGACCGGGTTTCCGGGTCGGGGTTCAAATCAAAGAAAGAG
TATCTATTCGGACGGATCGATATGCAGCTTAAACTCGTAGCCGGTAACTCAGCCGGCACC
*GTCACTGCTTACTACTTGTCGTCACAAGGAGCAACACATGATGAGATAGATTTCGAGTT
TCTAGGG**CGAGACAGGTAAGCCTTATGTTCTCCACACCAACGTCTTTGCTCAAGGGAA
AGGCAACAGAGAACAACAGTTTTATCTCTGGTTCGATCCAACCAAGAACTTCCTCACTTA
CTCTATTGTCTGGAGACCTCAACACATCATATTCTTGGTGGACAATTTGCCTATAAGAGT
GTTCAACAATGCAGAGAAGCTTGGTGTTCCTTTCCCAAAGAACCAACCAATGAGGATCTA
CTCGAGCCTGTGGAATGCAGATGACTGGGCCACGAGAGG*GGCCTTGTAAAGACTGACTG
GTCCAAG*CTCCTTTCACAGCTTACTACA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RS1FT61TF 722 0 0
GGATCTCACACCAAAACATAAATATCTCATCATCTTCTCAACTTACTTTCAAATCTTACT
AAACACACACCCCTCAGCTCCACCATCTAAACCCAAATGGGACGAAGCTCGAGCCTCACC
ATCACCATCGTGGCAGCTGTTCTGCTGGTAATGATGTTCGGTTCAGCCTACTCAGGCAAC
TTCTTCGACGAGTTCGACCTCACGTGGGGTGACCACAGGGGTAAAATCTTCAACGGAGGA
AACATGCTGTCCCTGTCTCTAGACCGGGTTTCCGGGTCGGGGTTCAAATCCAAGAAAGAG
TATCTATTCGGACGGATCGATATGCAGCTTAAACTCGTAGCCGGTAACTCAGCCGGCACC
*GTCATTGCTTACTACTTGTCGTCACAAGGAGCAACACATGATGAGATAGATTTCGAGTT
TCTAGGGAACGAGACAGGTAAGCCTTATGTTCTCCACACCAACGTCTTTGCTCAAGGGAA
AGGCAACAGAGAACAACAGTTTTATCTCTGGTTCGATCCAACCAAGAACTTCCACACTTA
CTCTATTGTCTGGAGACCTCAACACATCATATTCTTGGTGGACAATTTGCCTATAAGAGT
GTTCAACAATGCAGAGAAGCTTGGTGTTCCTTTCCCAAAGAACCAACCAATGAGGATCTA
CTCGAGCCTGTGGAATGCAGATGACTGGGCCACGAGAGGTGGCCTTGTAAAGACTGACTG
GT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RS1AG69JQ 751 0 0
CAC
GAAAGAGTATCTATTCGGACGGATCGATATGCAGCTTAAACTCGTAGCCGGTAACTCAGC
CGGCACCCGTCACTGCTTACTACTTGTCTTCACAAGGAGCAACACATGATGAGATAGATT
TCGAGTTTCTAGGGAACGAGACAGGTAAGCCTTGTGTTCTCCACACCAACGTCTTTGCTC
AAGGGAAAGGCAACAGAGAACAACAGTTTTATCTCTGGTTCGATCCAACCAAGAACTTCC
ACACTTACTCTATTGTCTGGAGACCTCAACACATCATATTCTTGGTGGACAATTTGCCTA
TAAGAGTGTTCAACAATGCAGAGAAGCTTGGTGTTCCTTTCCCAAAGAACCAACCAATGA
GGATCTACTCGAGCCTGTGGAATGCAGATGACTGGGCCACGAGAGGTGGCCTTGTAAAGA
CTGACTGGTCCAAGGCTCCTTTCACAGCTTACTACAGAGTATTCAATGCTGCGGCTTGCA
CTGTCTCTTCAGGCTGTGACCCCAAATTCAAGACTTCTTTAAGTGATAGTGAGCTGCAAA
CGGCAAACGAGCTCAATGCATATGGTAGGAGGAGGCTGAGATGGGTGCAGAAGTACTTTA
TGATCTATAATTATTGCTCTGATCTCAAAAGGTTCCCTAGAGGATTCCCTCCTGAGTGCA
GGAGGTCAAGAGTTTAAGGGAAACCATCCAATATGATTGTGTGTGTGCTTGTTGCAATTC
CTCTCTTTTGAGTTATAAGATTTG
CTTT

QA 4 747 4 747
DS 

RD RS1FT61JQ 683 0 0
AT
TGCTTACTACTTGTCGTCACAAGGAGCAACACATGATGAGATAGATTTCGAGTTTCTAGG
GAACGAGACAGGTAAGCCTTATGTTCTCCACACCAACGTCTTTGCTCAAGGGAAAGGCAA
CAGAGAACAACAGTTTTATCTCTGGTTCGATCCAACCAAGAACTTCCACACTTACTCTAT
TGTCTGGAGACCTCAACACATCATATTCTTGGTGGACAATTTGCCTATAAGAGTGTTCAA
CAATGCAGAGAAGCTTGGTGTTCCTTTCCCAAAGAACCAACCAATGAGGATCTACTCGAG
CCTGTGGAATGCAGATGACTGGGCCACGAGAGGTGGCCTTGTAAAGACTGACTGGTCCAA
GGCTCCTTTCACAGCTTACTACAGAGGATTCAATGCTGCGGCTTGCACTGTCTCTTCAGG
CTGTGACCCCAAATTCAAGACTTCTTTAAGTGATAGTGAGCTGCAAACGGCAAACGAGCT
CAATGCATATGGTAGGAGGAGGCTGAGATGGGTGCAGAAGTACTTTATGATCTATAATTA
TTGCTCCGATCTCAAAAGGTTCCCTAGAGGATTCCCTCCTGAGTGCAGGAGGTCAAGAGT
CTAAGGGAAACCATCCAATATGATTGTGTGTGTGCTTGTTGCAATTCCTCTCTTTTGAGT
TATAAGATTTGCTTTGTTCTC

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DS 

RD RS1D625JQ 599 0 0
GGTTCGATCCAACCAAGAACTTCCTCACTTACTCTATTGTCTGGAGACCTCAACACATCA
TATTCTTGGTGGACAATTTGCCTATAAGAGTGTTCAACAATGCAGAGAAGCTTGGTGTTC
CTTTCCCAAAGAACCAACCAATGAGGATCTACTCGAGCCTGTGGAATGCAGATGACTGGG
CCACGAGAGGTGGCCTTGTAAAGACTGACTGGTCCAAGGCTCCTTTCACAGCTTACTACA
GAGGATTCAATGCTGCGGCTTGCACTGTCTCTTCAGGCTGTGACCCCAAATTCAAGACTT
CTTTAAGTGATAGTGAGCTGCAAACGGCAAACGAGCTCAATGCATATGGTAGGAGGAGGC
TGAGATGGGTGCAGAAGTACTTTATGATCTATAATTATTGCTCTGATCTCAAAAGGTTCC
CTAGAGGATTCCCTCCTGAGTGCAGGAGGTCAAGAGTCTAAGGGAAACCATCCAATATGA
TTGTGTGTGTGCCTGTTGCAATTCCTCTCTTTTGAGTTATAAGATTTGCTTTGTTCTCTG
TTATTCTTCCGTTGTACATTCTCAAGGTCAATAAAAGCTCCTTCCTGTGTTTAAAGTAC

QA 1 599 1 599
DS 



AS 2 14

CO CL101Contig1 871 8 15 U
GGTCCTTCTCTACGATCAGCGCCAAGAGGAATAAGCAACGATGCCGGCAAAACAGAGGAC
GCCGAAGGTCAGCCGAAACCCTGATCTCATCAGGGGAGTTGGCAAATACTCGAGGTCTCA
GATGTACCACAAGAGAGGTCTTTGGGCTATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCTCG
CCACGATGCTAAACCCAAGGTTGATGCTGTAGCTGAGAAGCCACCAAAGTTCTATCCAGC
TGAAGATGTTAAGAAACCTCTCGCCAACAGGCGCAAGGCAAAGCCGACCAAGCTCAGATC
CAGCATCACCCCAGGAACTGTTCTGATCATCCTTGCTGGGAGGTTCAAGGGCAAGAGAGT
TGTCTTCTTGAAGCAGCTTCCCTCTGGTTTGCTTCTTGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAA
TGGTGTGCCTTTGAGACGTGTTAACCAGTCCTACGTGATTGGAACATCTACAAAGGTTGA
CATCTCTGGTGTTAGCCTTGATAAATTCGATGATAAGTATTTTGGAAAGGTGGCTGAGAA
GAAGAACAAGAAGGGAGAAGGGGAGTTCTTCGAAGCAGAGAAAGAGGAGAAGAAGGTGTT
CCCACAAGGGAAGAAAGATGACCAGAAAGCTGTGGACGGAGCATTGATCAAAGCCATTGA
GTCTGTTCCAGAGTTGAAGACTTACCTTGGCGCAAGGTTTTCACTGAAACAAGGAATGAA
GCCACATGAGCTTGTCTTCTAGATTTTCAATAAACTTTTATTTGTGTGTTACTCCCAACG
TTTGTTTTTGTTCTTGTCCACTTACTAGAATTTTGGTTTATACATTCTATATTTTATGTT
TTCGCATTTGGTATCTGAATGTGAACTCTGT


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 20 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B296TF U 2
AF RS1DD39TF U 10
AF RS1AS70TF U 1
AF RS1AW43TF U 12
AF RS1DD39JQ C 121
AF RS1A473JQ C 136
AF RS1A473TF U 136
AF RS1AW43JQ C 327
BS 1 609 RS1AS70TF
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BS 611 687 RS1AS70TF
BS 688 694 RS1AW43TF
BS 695 695 RS1A473TF
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BS 747 749 RS1A473TF
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BS 846 851 RS1DD39JQ
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RD RS1B296TF 277 0 0
GG
CCTTCTCTACGATCAGCGCCAAGAGGAATAAGCAACGATGCCGGCAAAACAGAGGACGCC
GAAGGTCAGCCGAAACCCTGATCTCATCAGGGGAGTTGGCAAATACTCGAGGTCTCAGAT
GTACCACAAGAGAGGTCTTTGGGCTATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCTCGCCA
CGATGTTAAACCCAAGGTTGATGCTGTAGCTGAGAAGCCACCAAAGTTCTATCCAGCTGA
AGATGTTAAGAAACCTCTCGCCAACAGGCGCAAGG

QA 3 277 3 277
DS 

RD RS1DD39TF 576 0 0
GGAC
GATCAGCGCCAAGAGGAATAAGCAACGATGCCGGCAAAACAGAGGACGCCGAAGGTCAGC
CGAAACCCTGATCTCATCAGGGGAGTTGGCAAATACTCGAGGTCTCAGATGTACCACAAG
AGAGGTCTTTGGGCTATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCTCGCCACGATGCTAAA
CCCAAGGTTGATGCTGTAGCTGAGAAGCCACCAAAGTTCTATCCAGCTGAAGATGTTAAG
AAACCTCTCGCCAACAGGCGCAAGGCAAAGCCGACCAAGCTCAGATCCAGCATCACCCCA
GGAACTGTTCTGATCATCCTTGCTGGGAGGTTCAAGGGCAAGAGAGTTGTCTTCTTGAAG
CAGCTTCCCTCTGGTTTGCTTCTTGTGTCCGGACCTTTCAAGATCAATGGTGTGCCTTTG
AGACGTGTTAACCAGTCCTACGTGATTGGAACATCTACAAAGGTTGACATCTCTGGTGTT
AGCCTTGATAAATTCGATGATAAGTATTTTGGAAAGGTGGCTGAGAAGAAGAACAAGAAG
GGAGAAGGGGAGTTCTTCGAAGCAGAGAAAGA

QA 5 576 5 576
DS 

RD RS1AS70TF 687 0 0
GGTCCTTCTCTACGATCAGCGCCAAGAGGAATAAGCAACGATGCCGGCAAAACAGAGGAC
GCCGAAGGTCAGCCGAAACCCTGATCTCATCAGGGGAGTTGGCAAATACTCGAGGTCTCA
GATGTACCACAAGAGAGGTCTTTGGGCTATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCTCG
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TGAAGATGTTAAGAAACCTCTCGCCAACAGGCGCAAGGCAAAGCCGACCAAGCTCAGATC
CAGCATCACCCCAGGAACTGTTCTGATCATCCTTGCTGGGAGGTTCAAGGGCAAGAGAGT
TGTCTTCTTGAAGCAGCTTCCCTCTGGTTTGCTTCTTGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAA
TGGTGTGCCTTTGAGACGTGTTAACCAGTCCTACGTGATTGGAACATCTACAAAGGTTGA
CATCTCTGGTGTTAGCCTTGATAAATTCGATGATAAGTATTTTGGAAAGGTGGCTGAGAA
GAAGAACAAGAAGGGAGAAGGGGAGTTCTTCGAAGCAGAGAAAGAGGAGAAGAAGGTGTT
CCCACAAGG*AAGAAAGATGACCAGAAAGCTGTGGACGGAGCATTGATCAAAGCCATTGA
GTCTGTTCCAGAGTTGAAGACTTACCT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1AW43TF 763 0 0
GG
GATCAGCGCCAAGAGGAATAAGCAACGATGCCGGCAAAACAGAGGACGCCGAAGGTCAGC
CGAAACCCTGATCTCATCAGGGGAGTTGGCAAATACTCGAGGTCTCAGATGTACCACAAG
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TTGAAGACTTACCTTGGCGCAGG**TTTCACTGAAACAA*GAATGAAGCCACATGAGCTT
GTCTTCTAGATTTC**ATAAACTTTTATTTGTGTGT
ACTCC

QA 3 758 3 758
DS 

RD RS1DD39JQ 732 0 0
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CCACGATGCTAAACCCAAGGTTGATGCTGTAGCTGAGAAGCCACCAAAGTTCTATCCAGC
TGAAGATGTTAAGAAACCTCTCGCCAACAGGCGCAAGGCAAAGCCGACCAAGCTCAGATC
CAGCATCACCCCAGGAACTGTTCTGATCATCCTTGCTGGGAGGTTCAAGGGCAAGAGAGT
TGTCTTCTTGAAGCAGCTTCCCTTTGGTTTGCTTCTTGTGTCCGGACCTTTCAAGATCAA
TGGTGTGCCTTTGAGACGTGTTAACCAGTCCTACGTGATTGGAACATCTACAAAGGTTGA
CATCTCTGGTGTTAGCCTTGATAAATTCGATGATAAGTATTTTGGAAAGGTGGCTGAGAA
GAAGAACAAGAAGGGAGAAGGGGAGTTTTTCGAAGCAGAGAAAGAGGAGAAGAAGGTGTT
CCCACAAGGGAAGAAAGATGACCAGAAAGCTGTGGACGGAGCATTGATCAAAGCCATTGA
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TTTGTTTTTGTTCTTGTCCACTTACTAGAATTTTGGTTTATACATTCTATATTTTATGTT
TTCGCATTTGG
G

QA 1 731 1 731
DS 

RD RS1A473JQ 710 0 0
G
GGTCTTTGGGCTATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCTCGCCACGATGCTAAACCC
AAGGTTGATGCTGTAGCTGAGAAGCCACCAAAGTTCTATCCAGCTGAAGATGTTAAGAAA
CCTCTCGCCAACAGGCGCAAGGCAAAGCCGACCAAGCTCAGATCCAGCATCACCCCAGGA
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CTTGATAAATTCGATGATAAGTATTTTGGAAAGGTGGCTGAGAAGAAGAACAAGAAGGGA
GAAGGGGAGTTTTTCGAAGCAGAGAAAGAGGAGAAGAAGGTGTTCCCACAAGGGAAGAAA
GATGACCAGAAAGCTGTGGACGGAGCATTGATCAAAGCCATTGAGTCTGTTCCAGAGTTG
AAGACTTACCTTGGCGCAAGGTTTTCACTGAAACAAGGAATGAAGCCACATGAGCTTGTC
TTCTAGATTTTCAATAAACTT**ATTTGTGTGTTACTCCCAACGTTTGTTTTTGTTCTTG
TCCACTTACTAGAATTTTGGTTTATACATTCTATATTTTATGTTTTCGC

QA 2 710 2 710
DS 

RD RS1A473TF 710 0 0
G
GGTCTTTGGGCTATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCTCGCCACGATGCTAAACCC
AAGGTTGATGCTGTAGCTGAGAAGCCACCAAAGTTCTATCCAGCTGAAGATGTTAAGAAA
CCTCTCGCCAACAGGCGCAAGGCAAAGCCGACCAAGCTCAGATCCAGCATCACCCCAGGA
ACTGTTCTGATCATCCTTGCTGGGAGGTTCAAGGGCAAGAGAGTTGTCTTCTTGAAGCAG
CTTCCCTCTGGTTTGCTTCTTGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTGCCTTTGAGA
CGTGTTAACCAGTCCTACGTGATTGGAACATCTACAAAGGTTGACATCTCTGGTGTTAGC
CTTGATAAATTCGATGATAAGTATTTTGGAAAGGTGGCTGAGAAGAAGAACAAGAAGGGA
GAAGGGGAGTTCTTCGAAGCAGAGAAAGAGGAGAAGAAGGTGTTCCCACAAGGGAAGAAA
GATGACCAGAAAGCTGTGGACGGAGCATTGATCAAAGCCATTGAGTCTGTTCCAGAGTTG
AAGACTTACCTTGGCGCAAGGTTTTCACTGAAACAAGGAATGAAGCCACATGAGCTTGTC
TTCTAGATTTTCAATAAACTT**ATTTGTGTGTTACTCCCAACGTTTGTTTTTGTTCTTG
TCCACTTACTAGAATTTTGGTTTATACATTCTATATTTTATGTTTTCGC

QA 2 710 2 710
DS 

RD RS1AW43JQ 545 0 0
TCATCCTTGCTGGGAGGTTCAAGGGCAAGAGAGTTGTTTTCTTGAAGCAGCTTCCCTTTG
GTTTGCTTCTTGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTGCCTTTGAGACGTGTTAACC
AGTCCTACGTGATTGGAACATTTACAAAGGTTGACATTTTTGGTGTTAGCCTTGATAAAT
TCGATGATAAGTATTTTGGAAAGGTGGCTGAGAAGAAGAACAAGAAGGGAGAAGGGGAGT
TTTTCGAAGCAGAGAAAGAGGAGAAGAAGGTGTTCCCACAAGGGAAGAAAGATGACCAGA
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AGAATTTTGGTTTATACATTCTATATTTTATGTTTTCGCATTTGGTATCTGAATGTGAAC
TCTGT

QA 1 545 1 545
DS 



CO CL101Contig2 930 6 19 U
GGATATTTCCGCAGCCGGAAAACTTATCATCTCCTTCTACGATCAGCGCCAAGAGACAGC
AAAGATGCCGGCAAAACAGAGGACGCCGAAGGTCAGCCGAAACCCCGATCTCATCAGGGG
AGTTGGCAAATACTCAAGGTCTCAGATGTACCACAAGAGAGGTCTTTGGGCTATCAAGGC
CAAAAACGGCGGCGTTTTCCCACGCCACGACGCTAAGTCCAAGGTTGATGCCGTAGCTGA
GAAGCCACCAAAGTTCTATCCAGCTGAAGATGTTAAGAAACCTCTCGCCAACAGGCGCAA
GGCAAATCCGACCAAGCTCAGATCCAGCATCACCCCTGGAACTGTTCTGATCATCCTTGC
TGGTAGGTTCAAGGGCAAGAGAGTTGTCTTTTTGAAGCAGCTTCCCTCTGGTTTGCTTCT
TGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTTCCTTTGAGACGTGTTAACCAGTCCTACGT
GATTGGAACATCCACAAAGGTTGACATCTCTGGTATTAGCCTTGATAAATTCGATGATAA
GTATTTTGGAAAGGTGGCCGAGAAGAAGAACAAGAAGGGAGAAGGAGAGTTCTTCGAGGC
AGAGAAAGAGGAGAAGAAGGTGTTCCCACAAGGGAAGAAAGATGACCAGAAAGCTGTGGA
CGGAGCATTGATCAAAGCCATTGAGTCGTTTCCAGAGTTGAAGACTTACCTTGGCGCAAG
GTTTTCACTGAAGCAAGGAATGAAGCCACATGAGCTTGTTTTTTAGATTTTCAGTAAACT
TTTATTTGTGTGTTACTCCCAACGTTTGTTTTTGTCCTTGTCCACTTGCTAGAATTTTGG
TTTATACATTCTATATTTTAAATTTTCGCATTTGGTATCTGAATGTGAACTTTGAAGCAA
TATATTTCAATAGATAGTAGTGCTCTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 10 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GP23TF U 1
AF RS1BP84TF U 32
AF RS1E694TF U 32
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AF RS1BP84JQ C 123
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RD RS1GP23TF 591 0 0
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GGTAAATCCGACCAAGCTCAGATCCAGCATCACCCCTGGAACTGTTCTGATCATCCTTGC
TGGTAGGTTCAAGGGCAAGAGAGTTGTCTTTTTGAAGCAGCTTCCCTCTGGTTTGCTTCT
TGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTTCCTTTGAGACGTGTTAACCAGTCCTACGT
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GTATTTTGGAAAGGTGGCCGAGAAGAAGAACAAGAAGGGAGAAAGAGAGTT

QA 1 591 1 591
DS 

RD RS1BP84TF 593 0 0
GG
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CCCTGGAACTGTTCTGATCATCCTTGCTGGTAGGTTCAAGGGCAAGAGAGTTGTCTTTTT
GAAGCAGCTTCCCTCTGGTTTGCTTCTTGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTTCC
TTTGGGACGTGTTAACCAGTCCTACGTGATTGGAACATCCACAAAGGTTGACATCTCTGG
TATTAGCCTTGATAAATTCGATGATAAGTATTTTGGAAAGGTGGCCGAGAAGAAGAACAA
GAAGGGAGAAGGAGAGTTCTTCGAGGCAGAGAAAGAGGAGAAGAAGGTGTT

QA 3 593 3 593
DS 

RD RS1E694TF 685 0 0
GG
CTTCTACGATCAGCGCCAAGAGACAGCAAAGATGCCGGCAAAACAGAGGACGCCGAAGGT
CAGCCGAAACCCCGATCTCATCAGGGGAGTTGGCAAATACTCAAGGTCTCAGATGTACCA
CAAGAGAGGTCTTTGGGCTATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCACGCCACGACGC
TAAGTCCAAGGTTGATGCCGTAGCTGAGAAGCCACCAAAGTTCTATCCAGCTGAAGATGT
TAAGAAACCTCTCGCCAACAGGCGCAAGGCAAATCCGACCAAGCTCAGATCCAGCATCAC
CCCTGGAACTGTTCTGATCATCCTTGCTGGTAGGTTCAAGGGCAAGAGAGTTGTCTTTTT
GAAGCAGCTTTCCTCTGGTTTGCTTCTTGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTTCC
TTTGAGACGTGTTAACCAGTCCTACGTGATTGGAACATCCACAAAGGTTGACGTCTCTGG
TATTAGCCTTGATAAATTCGATGACAAGTATTTTGGAAAGGTGGCCGAGAAGAAGAACAA
GAAGGGAGAAGGAGAGTTCTTCGAGGCAGAGAAAGAGGAGAAGAAGGTGTTCCCACAAGG
*AAGAAAGATGACCAGAAAGCTGTGGACGGAGCATTGATCAAAGCCATTGAGTCGTTTCC
AGAGTTGAAGACTTACCTTGGCG

QA 3 685 3 685
DS 

RD RS1E694JQ 787 0 0
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TATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCACGCCACGACGCTAAGTCCAAGGTTGATGC
CGTAGCTGAGAAGCCACCAAAGTTCTATCCAGCTGAAGATGTTAAGAAACCTCTCGCCAA
CAGGCGCAAGGCAATTCCGACCAAGCTCAGATCCAGCATCACCCCTGGAACTGTTCTGAT
CATCCTTGCTGGTAGGTTCAAGGGCAAGAGAGTTGTCTTTTTGAAGCAGCTTTCCTCTGG
TTTGCTTCTTGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTTCCTTTGAGACGTGTTAACCA
GTCCTACGTGATTGGAACATCCACAAAGGTTGACGTCTCTGGTATTAGCCTTGATAAATT
CGATGACAAGTATTTTGGAAAGGTGGCCGAGAAGAAGAACAAGAAGGGAGAAGGAGAGTT
CTTCGAGGCAGAGAAAGAGGAGAAGAAGGTGTTCCCACAAGGGAAGAAAGATGACCAGAA
AGCTGTGGACGGAGCATTGATCAAAGCCATTGAGTCGTTTCCAGAGTTGAAGACTTACCT
TGGCGCAAGGTTTTCACTGAAGCAAGGAATGAAGCCACATGAGCTTGTTTTTTAGATTTT
CAGTAAACTTTTATTTGTGTGTTACTCCCAACGTTTTTTTTTGTCCTTGTCCACTTGCTA
GAATTTTGGTTTATACATTCTATATTTTAAATTTTCGCATTTGGTATCTGAATGTGAA
CTTTGAAGC

QA 1 778 1 778
DS 

RD RS1GP23JQ 627 0 0
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AGCTCAGATCCAGCATCACCCCTGGAACTGTTCTGATCATCCTTGCTGGTAGGTTCAAGG
GCAAGAGAGTTGTCTTTTTGAAGCAGCTTCCCTCTGGTTTGCTTCTTGTGTCCGGACCGT
TCAAGATCAATGGTGTTCCTTTGAGACGTGTTAACCAGTCCTACGTGATTGGAACATCCA
CAAAGGTTGACATCTCTGGTATTAGCCTTGATAAATTCGATTATAAGTATTTTGGAAAGG
TGGCCGAGAAGAAGAACAAGAAGGGAGAAAGAGAGTTCTTCGAGGCAGAGAAAGAGGAGA
AGAAGGTGTTCCCACAAGGGAAGAAAGATGACCAGAAAGCTGTGGACGGAGCATTGATCA
AAGCCATTGAGTCGGTTCCAGAGTTGAAGACTTACCTTGGCGCAAGGTTTTCACTGAAGC
AAGGAATGAAGCCACATGAGCTTGTTTTCTAGATTTTCAGTAAACTTTTATTTGTGTGTT
ACTCCCAACGTTTGTTTTTGTCCTTGTCCACTTGCTAGAATTTTGGTTTATACATTCTAT
ATTTTAAATTTTCGCATTTGGTATCTG

QA 1 627 1 627
DS 

RD RS1BP84JQ 808 0 0
G
TGGCAAATACTCAAGGTCTCAGATGTACCACAAGAGAGGTCTTTGGGCTATCAAGGCCAA
AAACGGCGGCGTTTTCCCACGCCACGACGCTAAGTCCAAGGTTGATGCCGTAGCTGAGAA
GCCACCAAAGTTCTATCCAGCTGAAGATGTTAAGAAACCTCTCGCCAACAGGCGCAAGGC
AAATCCGACCAAGCTCAGATCCAGCATCACCCCTGGAACTGTTCTGATCATCCTTGCTGG
TAGGTTCAAGGGCAAGAGAGTTGTCTTTTTGAAGCAGCTTCCCTCTGGTTTGCTTCTTGT
GTCCGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTTCCTTTGGGACGTGTTAACCAGTCCTACGTGAT
TGGAACATCCACAAAGGTTGACATTTTTGGTATTAGCCTTGATAAATTCGATGATAAGTA
TTTTGGAAAGGTGGCCGAGAAGAAGAACAAGAAGGGAGAAGGAGAGTTTTTCGAGGCAGA
GAAAGAGGAGAAGAAGGTGTTCCCACAAGGGAAGAAAGATGACCAGAAAGCTGTGGACGG
AGCATTGATCAAAGCCATTGAGTCGGTTCCAGAGTTGAAGACTTACCTTGGCGCAAGGTT
TTCACTGAAGCAAGGAATGAAGCCACATGAGCTTGTTTTTTAGATTTTCAGTAAACTTTT
ATTTGTGTGTTACTCCCAACGTTTGTTTTTGTCCTTGTCCATTTGCTAGAATTTTGGTTT
ATACATTTTATATTTTAAATTTTCGCATTTGGTATCTGAATGTGAACTTTGAAGCAATAT
ATTTCAATAGATAGTAGTGCTCTTGTT

QA 2 808 2 808
DS 



AS 3 10

CO CL102Contig1 1522 6 12 U
AAGTCAAAGTGCCTGTGTGTGTAATTGAGAACTTGTAATGTGTCTATGGGAGTAATATTC
TCTAAAAACAAAATACTATTTGCTCAAACCAGTTCAAGGGAGAACACATTGCAAATGAAA
AATCAGAAAAACCAAAACAAATAACCAATTTTTGTTTTTAGCAAACCACCACCCAAAACT
TGATTTATAATCATACAAACCACAGCAAATTAAGAAACACAGAGACCTCTTTCTTCTTCT
TCTTCATCAATAAGCCAAATCTTCTTCACCTGAGATGAGGTTTGTTTACTCACTGCTGCT
TGCATTCCGGTGGCCTCTCACCTTGTTGACCTTCTGCCAGTTGACTTCTTCCAAACTTCT
TGTGCCCAGCTGATGACTTCTTTCCGCTCTTCTTTCCTTGCTCTTCCTCTTCGTCCTCAT
CATCCTCGTCCTCTGCCTCTTCATCATCTTCCTCGTCCTCCTCATCATCATCTTCATCAA
TCTCATCATCATCATCCTCCATCTCAAGGTCATCTTCGTCTACAGCTTCACCAGTGAACC
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CCATTTGACCTTGGAGTTCTTCAGCCAATTCATCATCAAGATCATCTTCGTCCTCAGGAA
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BQ
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C

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DV66TF U 1
AF RS1BD85TF U 174
BS 1 450 RS1DV66TF
BS 451 451 RS1BD85TF
BS 452 472 RS1DV66TF
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BS 524 524 RS1BD85TF
BS 525 592 RS1DV66TF
BS 593 593 RS1BD85TF
BS 594 598 RS1DV66TF
BS 599 599 RS1BD85TF
BS 600 634 RS1DV66TF
BS 635 718 RS1BD85TF

RD RS1DV66TF 634 0 0
GGGACTCTTATTCTCTTTTACTTGCGAAGATGAGCAGCGACAAGGTCAACAACTTGAACA
TGTCCGATCTCACAGCCGCTCTTAACGAGGAGGATAGAGCTGGGCTTGTCAATGCTCTTA
AGAACAAGTTGCAGAATTTGGCTGGACAACACTCTGATGTCCTTGAGAACTTGAGTCCTG
CCGTCAGGAAGCGTGTCGAGGTTCTTAGAGAGATTCAGAACCAACATGATGAAATCGAAG
CCAAGTTTTTCGAGGAGAGGGCAGCTCTAGAAGCTAAATATCAGAAATTGTATCAGCCTT
TCTATACCAAGCGATATGAGATTGTCACCAGTGTGGTTGAAGTTGAAGGTGAACCAGAAG
AAGTGAAAACTGAACAAGGAGAAGATAAAGCCCCTGAAGAGAAAGGAGTACCTGATTTCT
GGCTTATTGCACTGAAGAACAATGAAATCATCGCTGAGGAGATAACTGAGCGGGATGAAG
GAGCTCTCAAGTATCTCAAAGACATCAAGTGGAACAAGGTTGAGGAACCAAAAGGGTTCA
AGCTCGAGTTTTTCTTTGATGAGAACCCTTACTTCAAGAACACTGTCTTGTCCAAGACGT
ATCACATGATTGATGAAGATGAGCCTATCCTCGA

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1BD85TF 545 0 0
GGTCCTGCC
GTCAGGAAGCGTGTCGAGGTTCTTAGAGAGATTCAGAACCAACATGATGAAATCGAAGCC
AAGTTTTTCGAGGAGAGGGCAGCTCTAGAAGCTAAATATCAGAAATTGTATCAGCCTTTC
TATACCAAGCGATATGAGATTGTCACTGGTGTGGTTGAAGTTGAAGGTGGACCAGAAGAA
GTGAAAACTGAACAAGGAGAAGATAAAGCCGCTGAAGAGAAAGGAGTACCTGATTTCTGG
CTTATTGCACTGAAGAACAATGAAATTACCGCTGAGGAGATAACTGAGCGAGACGAAGGA
GCTCTCAAGTATCTCAAAGACATCAAGTGGAACAAGGTTGAAGAACCAAAAGGGTTCAAG
CTCGATTTTTTCTTTGATGAGAACCCTTACTTTAAGAACACTGTCTTGTCAAAGACATAT
CACATGATTGATGAAGATGAGCCTATCCTCGAAAAGGCCATTGGGACGGAGATCGAGTGG
TATCCTGGAAAATGTTTGACTCAGAAGATCCTTAGAAAGAAGCCGAAGAAGGGATC

QA 10 545 10 545
DS 



CO CL102Contig3 909 2 14 U
GGAATTAACTAATTTATTTACATTTAATTTTAATTGGTCTCTCTCTGGGCTGTCATCCCA
AAAAAAAAAACTAGGGTTTTAAAGGGGTCTTCCCTTCTTCTTCTTATCCTCCGTTTCCTC
CGCCAGATTTTCTTCTCTTACTTGCGAAGATGAGCAACGACAAAGACAACTTGAACATGT
CTGGTCTCACCGCCGCTCTTAACGAGGAGGATCGCGCAGGCCTTGTTAATGCTCTCAAGG
ATAAGTTGCAGAATTTGGCAGGACAACACTCGGATGTCCTAGAGAACTTGAGTCCGGCAG
TCAGGAAGCGTGTCGAGGTTCTAAGAGAGATTCAAAACCAACATGATGAAATTGAAGCAA
AGTTCTTCGAAGAGAGGGCAGCTCTTGAAGCTAAGTATCAAAAGTTGTATCAGCCTTTCT
ACACCAAGCGATATGAGATTGTGACCGGTGCGGTTGAAGTTGAAGGTGCACCTGAAGAAG
TAAAAACAGAACAAGGAGAAGACAAAGCTGCTGAAGAGAAAGGAGTACCGGACTTTTGGC
TTACTGCATTGAAGAACAATGAAATTACAGCTGAGGAGATAACTGAGAGAGATGAAGGGG
CTCTCAAGTATCTTAAGGATATCAAGTGGAACAGGGTCGAAGAACCAAAAGGGTCCAAGC
TCGAGTTTTTCTTTGATGAGAACCCTTACTTCAATACACTGTCTTGACCAAGACATATCA
CATGATTGATGAGGATGAGCCTATCCTCGAGAAGGCCATTGGGACGGAGATTGAGTGGTA
CCCTGGAAAATGTTTGACTCAGAAGATCCTAAAAAAGAAGCCAAAGAAAGGGATCCAAAA
ACACAAAGCCGATCACCAAGACTGAGACTGTGAGAGTTTCTTCAACTTTTTCAGTCCACC
TCAAGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EK36TF U 1
AF RS1B510TF U 244
BS 1 413 RS1EK36TF
BS 414 414 RS1B510TF
BS 415 469 RS1EK36TF
BS 470 470 RS1B510TF
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BS 482 482 RS1B510TF
BS 483 502 RS1EK36TF
BS 503 503 RS1B510TF
BS 504 532 RS1EK36TF
BS 533 533 RS1B510TF
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BS 544 544 RS1B510TF
BS 545 595 RS1EK36TF
BS 596 909 RS1B510TF

RD RS1EK36TF 602 0 0
GGAATTAACTAATTTATTTACATTTAATTTTAATTGGTCTCTCTCTGGGCTGTCATCCCA
AAAAAAAAAACTAGGGTTTTAAAGGGGTCTTCCCTTCTTCTTCTTATCCTCCGTTTCCTC
CGCCAGATTTTCTTCTCTTACTTGCGAAGATGAGCAACGACAAAGACAACTTGAACATGT
CTGGTCTCACCGCCGCTCTTAACGAGGAGGATCGCGCAGGCCTTGTTAATGCTCTCAAGG
ATAAGTTGCAGAATTTGGCAGGACAACACTCGGATGTCCTAGAGAACTTGAGTCCGGCAG
TCAGGAAGCGTGTCGAGGTTCTAAGAGAGATTCAAAACCAACATGATGAAATTGAAGCAA
AGTTCTTCGAAGAGAGGGCAGCTCTTGAAGCTAAGTATCAAAAGTTGTATCAGTCTTTCT
ACACCAAGCGATATGAGATTGTGACCGGTGCGGTTGAAGTTGAAGGTGCGCCTGAAGAAG
TGAAAACAGAACAAGGAGAAGATAAAGCTGCTGAAGAGAAAGGAGTACCGGATTTTTGGC
TTATTGCATTGAAGAACAATGAAATTACAGCTGAGGAGATAACTGAGAGAGATGA
GGGGGCT

QA 1 595 1 595
DS 

RD RS1B510TF 666 0 0
G
GTTGCAGAATTTGGCAGGACAACACTCGGATGTCCTAGAGAACTTGAGTCCGGCAGTCAG
GAAGCGTGTCGAGGTTCTAAGAGAGATTCAAAACCAACATGATGAAATTGAAGCAAAGTT
CTTCGAAGAGAGGGCAGCTCTTGAAGCTAAGTATCAAAAGTTGTATCAGCCTTTCTACAC
CAAGCGATATGAGATTGTGACCGGTGTGGTTGAAGTTGAAGGTGCACCTGAAGTAGTAAA
AACAGAACAAGGAGAAGACAAAGCTGCTGAAGAGAAAGGAGTACCGGACTTTTGGCTTAC
TGCATTGAAGAACAATGAAATTACAGCTGAGGAGATAACTGAGAGAGATGAAGGGGCTCT
CAAGTATCTTAAGGATATCAAGTGGAACAGGGTCGAAGAACCAAAAGGGTCCAAGCTCGA
GTTTTTCTTTGATGAGAACCCTTACTTCAATACACTGTCTTGACCAAGACATATCACATG
ATTGATGAGGATGAGCCTATCCTCGAGAAGGCCATTGGGACGGAGATTGAGTGGTACCCT
GGAAAATGTTTGACTCAGAAGATCCTAAAAAAGAAGCCAAAGAAAGGGATCCAAAAACAC
AAAGCCGATCACCAAGACTGAGACTGTGAGAGTTTCTTCAACTTTTTCAGTCCACCTCAA
GTTCC

QA 2 666 2 666
DS 



AS 3 12

CO CL103Contig1 1194 5 5 U
GATTGTAAATTTCAACATTAAGACTTTCTTTCACCATATAACAACAATGAATTGTGCTCT
TGATGTATAGTTAAGATCCAAGATCTAAATTGAAAACAACAAGTTGAGATAATTATGTAA
ATTCGAAGACCAAAGATTTGAAACAAAACCTTGAGTTCAATGTTTTGAAGTTATAAGGCA
TTGTTACAAGGCTACTAGTAAATTATAATAACTAACCATAGATTCTAAGCAAAAACACAA
TGATACTAACCAATAATCATATCTACAAATCAAGAAGAACCCTGACGGAAAAGACCCATC
TCTTTATACCACCATCTTCTGACGCTGTTGCTCTGTTTCATAACAGAAGCTGCCAGCTGA
TGATGACGACAACAACACATCTTGATGCACTGTTAAGGCGTCCAGATTCATTTTAAGTTC
CCCTACAGACGCTAAAGCCATGAGTTCCTTACTGTCTAAACCTTTCGCTGGCCCGAGGCT
GCACCTCTCGCTACCGTGCTTGTCCAAAGCTTTCTTGAACTTATTAATGGTGGCGATGGT
GCAGCTGAAACTACACAGTTTACCCTCTGCTCCTCTATAGAACTTGAAGAAAGGAAGCAC
ATGGACGTTAAGGCCATGACACATTGTTCTAAGCTCTTCTTGATTCACTTTGAGAAACAT
CACGTTTGGGTTTGTTTCAGCCAATTGACAGATCTTTGGGTGGAGAGATTTGCAGCCACC
ACAACCAGGAGAGTAGAAATCAAGAACAACTAATCTATCACCAGCGTTAAGCAAAGAGTC
AACGAGATGATTAGCAGAGTGAATCTCTAACATGTTGACTTTCGTTGACTTCTCCCACCA
CCTCATCCCTCTACTCATACCAATTGATGATGTCTTTGTAGGAACAACATAGGAAGAAGA
AGACAAGGCGGTGAGTGTTTGGTTTGAAGCCACGGGATGTTCCTTCAAATCTAGGCTCAT
AACTGGCGAAAGTTTCAATTTTGATTTGTTCTCCTGAGAAAGTGAACAAAACCCAGAAAG
CCCGTGATCGATTCTAGTCCCGGAGTATTGAGCACCGGTTCCACACAGAGCCCTGAGAGG
TGAAACAGCATCCATGTCTGTCTACAGGAGGAAGACTCAGAGATTCTTGAGATGAAGAAG
AAGAAGAAGGAGAGAGAAAAGTGCAGAGGGGTTTTGATTGAATGAGATTAAAAA


BQ
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DS 



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BQ
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ATCTCTCCACCCAAAGATCTGTCAATTGGCTGAATCAAACCCAAACGTGATGTTTCTCAA
AGTGAATCAAGAAGAGCTTAGAACAATGTGTCATGGCCTTAACGTCCATGTGCTTCCTTT
CTTTAAGTTCTATAGAGGAGCAGAGGGTAAACTGTGTAGTTTCAGCTGCACCATCGCCAC
CATTAATAAGTTCAAGAAAGCTTTGGA

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DS 

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TGAGTCTTCCTCTTGTAGACAGACATGGATGCTGTTTCACCTCTCAGAGCTGTGTGTGGA
AGCGTTGCTCAATACTCCGGGACTAGAATCGATCACGGGCTTTTTGGGTTTTGTTCATTT
TCTCAGGAAAACAAATCAAAATCCAAACTTTCACCTGTTATGAGCCTAGATTTGAAGGAA
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ACAAAGACATCATCAATTGGTATGAGTAGAGGGATGAGATGGTGGGAGAAGTCAACGAAA
GTCAATATGTTAGAGATTCACTCTGCTAATCATCTCGTTGACTCTTTGCTTAACGCTGGT
GATAGATTAGTTGTTCTTGATTTCTACTCTCCTGGTTGTGGTGGCTGCAAATCTCTCCAC
CCAAAGATCTGTCAATTGGCTGAATCAAACCCAAACGTGATGTTTCTCAAAGTGAATCAA
GAAGAGCTTAGAACAATGTGTCATGGCCTTAACGTCCATGTGCTTCCTTTCTTTAAGTTC
TATAGAGGAGCAGAGGGTAAACTGTGTAGTTTCAGCTGCACCATCGCCACCATTAATAAG
TTCAAGAAAGCTTTGGACAAGTACG*TAGCGAGAGGTGCAGCCTTGGACCAGCGAAAGGT
TTAGACAGTAAGGAGCTCATGGCTTTAGCATCTGTAGGG*AATTGAAAA
AAA

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DS 

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G
AAATCAAAATCCAAACTTTCACCTGTTATGAGCCTAGATTTGAAGGAACATCCCATGTCT
TCAAACCAAACACTCACCGCCTTGTCTTCTTCTTCCTATGTTGTTCCTACAAAGACATCA
TCAATTGGTATGAGTAGAGGGATGAGATGGTGGGAGAAGTCAACGAAAGTCAATATGTTA
GAGATTCACTCTGCTAATCATCTCGTTGACTCTTTGCTTAACACTGGTGATAGATTAGTT
GTTCTTGATTTCTACTCTCCTGGTTGTGGTGGCTGCAAATCTCTCCACCCAAAGATCTGT
CAATTGGCTGAATCAAACCCAAACGTGATGTTTCTCAAAGTGAATCAAGAAGAGCTTAGA
ACAATGTGTCATGGCCTTAACGTCCATGTGCTTCCTTTCTTTAAGTTCTATAGAGGAGCA
GAGGGTAAACTGTGTAGTTTCAGCTGCACCATCGCCACCATTAATAAGTTCAAGAAAGCT
TTGGACAAGCACGGTAGCGAGAGGTGCAGCCTTGGACCAGCGAAAGGTTTAGACAGTAAG
GAGCTCATGGCTTTAGCATCTGTAGGGGAATTGAAAATGAATCTGGATTCCTTAACAGTT
CATCAAGATGTGTTGTTGTCCTCATCATCAGCTAGCAGCTTCTGTTATGAGACAGAGCAA
CAGCATCAGAAGATGGTGGTATAAAGAGATGGGTCTTTTCCATCAGG*CTCTTATTGGTT
TGTAGATATGATTATTGGTTAGTATCATTGTGTTTT*GCTTAGAGTCTATGGT*AGTTAT
TATAGTTTACTAGTA

QA 2 796 2 796
DS 

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GTAAACTGTGTAGTTTCAGCTGCACCATCGCCACCATTAATAAGTTCAAGAAAGCTTTGG
ACAAGCACGGTAGCGAGAGGTGCAGCCTTGGACCAGCGAAAGGTTTAGACAGTAAGGAGC
TCATGGCTTTAGCATCTGTAGGGGAATTGAAAATGAATCTGGATTCCTTAACAGTTCATC
AAGATGTGTTGTTGTCCTCATCATCAGCTAGCAGCTTCTGTTATGAGACAGAGCAACAGC
ATCAGAAGATGGTGGTATAAAGAGATGGGTCTTTTCCATCAGGGCTCTTATTGGTTTGTA
GATATGATTATTGGTTAGTATCATTGTGTTTTTGCTTAGAGTCTATGGTTAGTTATTATA
GTTTACTAGTAGCCTAGTAACAATGCCTTATAACTTCAAAACATTGAATTCCAGGTTTTG
TTTCA
C

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DS 

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TGTAGTTTCAGCTGCACCATCGCCACCATTAATAAGTTCAAGAAAGCTTTGGACAAGCAC
GGTAGCGAGAGGTGCAGCCTTGGACCAGCGAAAGGTTTAGACAGTAAGGAGCTCATGGCT
TTAGCATCTGTAGGGGAATTGAAAATGAATCCGGATTCCTTAACAGTTCATCAAGATGTG
TTGTTGTCCTCATCATCAGCTAGCAGCTTCTGTTATGAGACAGAGCAACAGCATCAGAAG
ATGGTGGTATAAAGAGATGGGTCTTTTCCATCAGGGCTCTTATTGGTTTGTAGATATGAT
TATTGGTTAGTATCATTGTGTTTTTGCTTAGAGTCTATGGTTAGTTATTATAGTTTACTA
GTAGCCTAGTAACAATGCCTTATAACTTCAAAACATTGAATTCCAGGTTTTGTTTCAAAT
ATTTTGTCTTCAAATTTACATAGTTATCTCAACTTGTTGTTTTCAATCTAGATCTTGGAT
CTTAACTATACATCAAGAGCACAATTCATTGTTGTT

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 11

CO CL104Contig1 1077 11 45 U
GGATATTCCCTGGTAATAGATCGTCATTGACTCTTGCTCTCATCAGGTAATAGAAAATGG
GTATATTCCCTGGATTTGGTAGCTGGATCAGTAAGAACACTCAACAGCTTCTCAAGGCCG
AGTCCAAGGGATCTGAAAATGTCGAATCTAAGTCGGTGTCAGAGAAAGACACTAATTATA
ATGCTCCTGCTAACAAGAAGAAGAAAGAATATGTTTATGATGAAAAACAGGAGATGATAG
AACATATACTTTGGTATGACGAAGAGAAGAAGCATCCCTGGCATAGTCCCCCTCCCAAGG
TCAAGGTGACAACAAAGAAGGGTGTTTACCATATGAACTTAGAAGTGACCATAGGAGCCG
CGCCTCAACAAACCTTCTTATGGTTGACTGATGCATGGGGCAGTTCGTTTTTTGATGAGA
AGAAGTGGCGCGACCTTATGAAAAACGTAGAACGAAAGGTTTTGACGGAGGATGGTCCGA
GGCGGGTCATCAAGGTGAAGAAAGTTGTGGTTCATGACTTCTTATCGCTGACGTCTATAC
CTATCCCGTTACATCTAATTGTGGAAGAAAACGAAAAAGATCTTACGGGAAAATATAAGA
AAGAGAAAGTAATGTTCATGAAAGTGTTCCAAGGCAACTTTAAAGTGGAGCCTATATATA
TAGATCAAGAACGATTGTGCAAAAAGAGGTTACCAAAAAGTCTAGAAGAATACAAAAAAT
GTAGTGGTGACCAAGGAAAGATTGCGTCAAAATTGACAGTAAACCAATACTTTGGGCTAT
ATCCTCCATTTAATCTACCGCCGCTTTCTTGGTACATCCGTGGGAACACCATCAAAACCT
CCAAAAATCTGCTCAAAGCACTTCAGAACACGGCTAAGAGTATACGAACGGTTGAGCTGC
CCGAAGACTTTAAAGAATTTAGAGAAAAGATGCACTCCAGAAATAAGGCTAATTCAATAT
TTTAAAAGCTTTTAAAAAAATTACTACGAATCTGTTTAACCAGAATAACTTGACTTTACA
GCTTGTGAATCAACATTGACCACTTTCTAATCTAATCAACACAACTCTCTTTGCACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 50 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 
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65 65 65 65 65 65 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 0 25 25 25 25 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1DY09TF U 1
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RD RS1DY09TF 666 0 0
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GTATATTCCCTGGATTTGGTAGCT**ATCAGTAAGAACACTCAACAGCTTCTCAAGGCCG
AGTCCAAGGGATCTGAAAATGTCGAATCTAAGTCGGTGTCAGAGAAAGGCACTAATTATA
ATGCTCCTGCTAACAAGAAGAAGAAAGAATATGTTTATGATGAAAGACAGGAGATGATAG
AACATATACTTTGGTATGACGAAGAGAAGAAGCATCCTTGGCATAGTCCCCCTCCCAATG
TCAAGGTGACAACAAAGAAGGGTGTTTACCATATGAACTTAGAAGTGACCATAGGAGCGG
CGCCTGAAAAAACCTTCTTATGGTTGACTGATCCATGGGGCAATTCGTTTTTGGATGAGA
AGAAGTGGCGCGACCTTATGAAAAACGTAAAACGAAAGGTTTTGACGGAGGATGGTCCGA
GGCGGGTCATCAAGGTGAAGAAAATTGTGGTTCATGACTTCTTATCGCTGACGTCTATAC
CTATCCCGTTACATCTAATTGTGGAAGAAAACGAAAAAGATCTTACGGGAAAGTATAAGA
AAGAGAAAGTAATGTTGATGAAAGTGTTCCAAGGCAACTTTAAAGTGGAGCCTATATATA
TAGATC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RS1EX75TF 659 0 0
CGCAAGTTT
TAGATCGTCATTGACTCTTGCTCTCATCAGGTAATAGAAAATGGGCATATTCCCTGGATT
TGGTAGCTGGATCAGTAAGAACACTCAACAGCTTCTCAAGGCCGAGTCCAAGGGATCTGA
AAATGTCGAATCTAAGTCGGTGTCAGAGAAAGACACTAATTATAATGCTCCTGCTAACAA
GAAGAAGAAAGAATATGTTTATGATGAAAAACAGGAGATGATAGAACATATACTTTGGTA
TGACGAAGAGAAGAAGCATCCCTGGCATAGTCCCCCTCCCAAGGTCAAGGTGACAACAAA
GAAGGGTGTTTACCATATGAACTTAGAAGTGACCATAGGAGCCGCGCCTCAACAAACCTT
CTTATGGTTGACTGATGCATGGGGCAGTTCGTTTTTTGATGAGAAGAAGTGGCGCGACCT
TATGAAAAACGTAGAACGAAAGGTTTTGACGGAGGATGGTCCGAGGCGGGTCATCAAGGT
GAAGAAAGTTGTGGTTCATGACTTCTTATCGCTGACGTCTATACCTATCCCGTTACATCT
AATTGTGGAAGAAAACGAAAAAGATCTTACGGGAAAATATAAGAAAGAGAAAGTAATGTT
CATGAAAGTGTTCCAAGGCAACTTTAAAGTGGAGCCTAT*TATATAGATC

QA 10 659 10 659
DS 

RD RS1C742TF 633 0 0
GG
GCTCTCATCAGGTAATAGAAAATGGGTATATTCCCTGGATTCGGTAGCTGGATCAGTAAG
AACACTCAACAGCTTCTCAAGGCCGAGTCCAAGGGATCTGAAAATGTCGAATCTAAGTCG
GTGTCAGAGAAAGACACTAATTATAATGCTCCTGCTAACAAGAAGAAGAAAGAATATGTT
TATGATGAAAAACAGGAGATGATAGAACATATACTTTGGTATGACGAAGAGAAGAAGCAT
CCCTGGCATAGTCCCCCTCC*AAGGTCAAGGTGACAACAAAGAAGGGTGTTTACCATATG
AACTTAGAAGTGACCATAGGAGCCGCGCCTCAACAAACCTTCTTATGGTTGACTGATGCA
TGGGGCAGTTCGTTTTTTGATGAGAAGAAGTGGCGCGACCTTATGAAAAACGTAGAACGA
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GACTTCTTATCGCTGACGTCTATACCTATCCCGTTACATCTAATTGTGGAAGAAAACGAA
AAAGATCTTGCGGGAAAATATAAGAAAGAGAAAGTAATGTTCATGAAAGTGTTCCAAGGC
AACTTTAAAGTGGAGCCTATATATATAGATC

QA 3 633 3 633
DS 

RD RS1DC31TF 685 0 0
GG
GCTCTCATCAGGTAATAGAAAATGGGTATATTCCCTGGATTTGGTAGCTGGATCAGTAAG
AACACTCAACAGCTTCTCAAGGCCGAGTCCAAGGGATCTGAAAATGTCGAATCTAAGTCG
GTGTCAGAGAAAGACACTAATTATAATGCTCCTGCTAACAAGAAGAAGAAAGAATATGTT
TATGATGAAAAACAGGAGATGATAGAACATATACTTTGGTATGACGA*GAGAAGAAGCAT
CCCTGGCATAGTCCCCCTCCCAAGGTCAAGGTGACAACAAAGAAGGGTGTTTACCATATG
AACTTAGAAGTGACCATAGGAGCCGCGCCTCAACAAACCTTCTTATGGTTGACTGATGCA
TGGGGCAGTTCGTTTTTTGATGAGAAGAAGTGGCGCGACCTTATGAAAAACGTAGAACGA
AAGGTTTTGACGGAGGATGGTCCGAGGCGGGTCATCAAGGTGAAGAAAGTTGTGGTTCAT
GACTTCTTATCGCTGACGTCTATACCTATCCCGTTACATCTAATTGTGGAAGAAAACGAA
AAAGATCTTACGGGAAAATATAAGAAAGAGAAAGTAATGTTCATGAAAGTGTTCCAAGGC
AACTTTAAAGTGGAGCCTATATATATAGATCAAGAACGATTGTGCAAAAAGAG*TTACCA
AAAAGTCTAGAAGAATACAAAAA

QA 3 685 3 685
DS 

RD RS1A740TF 831 0 0
GG
GCTCTCATCAGGTAATAGAAAATGGGTATATTCCCTGGATTTGGTAGCTGGATCAGTAAG
AACACTCAACAGCTTCTCAAGGCCGAGTCCAAGGGATCTGAAAATGTCGAATCTAAGTCG
GTGTCAGAGAAAGACACTAATTATAATGCTCCTGCCAACAAGAAGAAGAAAGAATATGTT
TATGATGAAAAACAGGAGATGATAGAACATATACTTTGGTATGACGAAGAGAAGAAGCAT
CCCTGGCATAGTCCCCCTCCCAAGGTCAAGGTGACAACAAAGAAGGGTGTTTACCATATG
AACTTAGAAGTGACCATAGGAGCCGCGCCTCAACAAACCTTCTTATGGTTGACTGATGCA
TGGGGCAGTTCGTTTTTTGATGAGAAGAAGTGGCGCGACCTTATGAAAAACGTAGAACGA
AAGGTTTTGACGGAGGATGGTCCGAGGCGGGTCATCAAGGTGAAGAAAGTTGTGGTTCAT
GACTTCTTATCGCTGACGTCTATACCTATCCCGTTACATCTAATTGTGGAAGAAAACGAA
AAAGATCTTACGGGAAAATATAAGAAAGAGAAAGTAATGTTCATGAAAGTGTTCCAAGGC
AACTTTAAAGTGGAGCCTATATATATAGATCAAGAACGATTGTGCAAAAAGAGGTTACCA
AAAAGTCTAGAAGA*TACAAAAAATGTAGTGGTGACCAAAGAAAGATTGCGTCAAAATTG
ACAGTAAACCAATACTTTGGGCTATATCCTCCATTTAATCTACCGCCGCTTTCTTGGTAC
ATCCGTGGGA*CACCATCAAA*CCTCCAAAA*TCTGCTCAAAGCACTTC

QA 3 831 3 831
DS 

RD RS1C742JQ 550 0 0
CGACCTTATGAAAAACGTAGAACGAAAGGTTTTGACGGAGGATGGTCCGAGGCGGGTCAT
CAAGGTGAAGAAAGTTGCGGTTCATGACTTCTTATCGCTGACGTCTATACCTATCCCGTT
ACATCTAATTGTGGAAGAAAACGAAAAAGTTCTTGCGGGAAAATATAAGAAAGAGAAAGT
AATGTTCATGAAAGTGTTCCAAGGCAACTTTAAAGTGGAGCCTATATATATAGATCAAGA
ACGATTGTGCAAAAAGAGGTTACCAAAAAGTCTAGAAGAATACAAAAAATGTAGTGGTGA
CCAAGGAAAGATTGCGTCAAAATTGACAGTAAACCAATACTTTGGGCTATATCCTCCATT
TAATCTACCGCCGCTTTCTTGGTACATCCGTGGGAACACCATCAAAACCTCCAAAAATCT
GCTCAAAGCACTTCAGAACACGGTTAAGAGTATACGAACGGTTGAGCTGCCCGAAGACTT
TGAAGAATTTAGAGAAAAGATGCACTCCAGAAATAAGGCTAATTCAATATTTTAAAAGTT
TTTAAAAAAA

QA 1 550 1 550
DS 

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TCTTATGGTTGACTGATGCATGGGGCAGTTCGTTTTTTGATGAGAAGAAGTGGCGCGACC
TTATGAAAAACGTAGAACGAAAGGTTTTGACGAAGGATGGTCCGAGGCGGGTCATCAAGG
TGAAGAAAGTTGTGGTTCATGACTTCTTATCGCTGACGTCTATACCTATCCCGTTACATC
TAATTGTGGAAGAAAACGAAAAAGATCTTACGGGAAAATATAAGAAAGAGAAAGTAATGT
TCATGAAAGTGTTCCAAGGCAACTTTAAAGTGGAGCCTAT**ATATAGATCAAGAACGAT
TGTGCAAAAAGAGGTTACCAAAAAGTCTAGAAGAATACAAAAAATGTAGTGGTGACCAAG
GAAAGATTGCGTCAAAATTGACAGTAAACCAATACTTTGGGCTATATCCTCCATTTAATC
TACCGCCGCTTTCTTGGTACATCCGTGGGAACACCATCAAAACCTCCAAAAATCTGCTCA
AAGCACTTCAGAACACGGCTAAGAGTATACGAACGGTTGAGCTGCCCGAAGACTTTAAAG
AATTTAGAGAAAAGATGCACTCCAGAAATAAGGCTAATTCAATATTTTAAAAGCTTTTAA
AAAAATTACTACGAATCTGTTTAACCAGAATAACTTGACTTTACAGCTTGTGAATCAACA
TTGACCACTTTCTAATC
T

QA 1 797 1 797
DS 

RD RS1EX75JQ 797 0 0
GCATAGTCCCCCTCCCAAGGTCAAGGTGACAACAAAGAAGGGTGTTTACCATATGAACTT
AGAAGTGACCATAGGAGCCGCGCCTCAACAAACCTTCTTATGGTTGACTGATGCATGGGG
CAGTTCGTTTTTTGATGAGAAGAAGTGGCGCGACCTTATGAAAAACGTAGAACGAAAGGT
TTTGACGGAGGATGGTCCGAGGCGGGTCATCAAGGTGAAGAAAGTTGTGGTTCATGACTT
CTTATCGCTGACGTCTATACCTATCCCGTTACATCTAATTGTGGAAGAAAACGAAAAAGA
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TAAAGTGGAGCCTAT*TATATAGATCAAGAACGATTGTGCAAAAAGAGGTTACCAAAAAG
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AAACCAATACTTTGGGCTACATCCTCCATTTAATCTACCGCCGCTTTCTTGGTACATCCG
TGGGAACACCATCAAAACCTCCAAAAATTTGCTCAAAGCACTTCAGAACACGGCTAAGAG
TATACGAACGGTTGAGCTGCCCGAAGACTTTAAAGAATTTAGAGAAAAGATGCACTCCAG
AAATAAGGCTAATTCAATATTTTAAAAGCTTTTAAAAAAATTACTACGAATCTGTTTAAC
CAGAATAACTTGACTTTACAGCTTGTGAATCAACATTGACCACTTTTTAATTTAATCAAC
ACAACTCTCTTTGCACG

QA 1 797 1 797
DS 

RD RS1DC31JQ 643 0 0
CCTTATGAAAAACGTAGAACGAAAGGTTTTGACGGAGGATGGTCCGAGGCGGGTCATCAA
GGTGAAGAAAGTTGTGGTTCATGACTTCTTATCGCTGACGTCTATACCTATCCCGTTACA
TCTAATTGTGGAAGAAAACGAAAAAGATCTTACGGGAAAATATAAGAAAGAGAAAGTAAT
GTTCATGAAAGTGTTCCAAGGCAACTTTAAAGTGGAGCCTATATATATAGATCAAGAACG
ATTGTGCAAAAAGAGGTTACCAAAAAGTCTAGAAGAATACAAAAAATGTAGTGGTGACCA
AGGAAAGATTGCGTCAAAATTGACAGTAAACCAATACTTTGGGCTATATCCTCCATTTAA
TCTACCACCGCTTTCTTGGTACATCCGTGGGAACACCATCAAAACCTCCAAAAATCTGCT
CAAAGCACTTCAGAACACGGCTAAGAGTATACGAACGGTTGAGCTGCCCGAAGACTTTAA
AGAATTTAGAGAAAAGATGCACTCCAGAAATAAGGCTAATTCAATATTTTAAAAGCTTTT
AAAAAAATTACTACGAATCTGTTTAACCAGAATAACTTGACTTTACAGCTTGTGCATCAA
CATTGACCACTTTCTAATCTAATCAACACAACTCTCTTTGC
GC

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1D943TF 565 0 0
GGCGGGTCATCAAGGTGAAGAAAGTTGTGGTTCATGACTTCTTATCGCTGACGTCTATAC
CTATCCCGTTACATCTAATTGTGGAAGAAAACGAAAAAGATCTTACGGGAAAATATAAGA
AAGAGAAAGTAATGTTCATGAAAGTGTTCCAAGGCAACTTTAAAGTGGAGCCTATATATA
TAGATCAAGAACGATTGTGCAAAAAGAGGTTACCAAAAAGTCTAGAAGAATACAAAAAAT
GTAGTGGTGACCAAGGAAAGATTGCGTCAAAATTGACAGTAAACCAATACTTTGGGCTAT
ATCCTCCATTTAATCTACCGCCGCTTTCTTGGTACATCCGTGGGAACACCATCAAAACCT
CCAAAAATCTGCTCAAAGCACTTCAGAACACGGCTAAGAGTATACGAACGGTTGAGCTGC
CCGAAGACTTTAAAGAATTTAGAGAAAAGATGCACTCCAGAAATAAGGCTAATTCAATAT
TTTAAAAGCTTTTAAAAAAATTACTACGAATCTGTTTAACCAGAATAACTTGACTTTACA
GCTTGTGAATCAACATTGACCACTT

QA 1 565 1 565
DS 

RD RS1A740JQ 679 0 0
TTCTTATGGTTGACTGATGCATGGGGCAGTTCGTTTTTTGATGAGAAGAAGTGGCGCGAC
CTTATGAAAAACGTAGAACGAAAGGTTTTGACGGAGGATGGTCCGAGGCGGGTCATCAAG
GTGAAGAAAGTTGTGGTTCATGACTTCTTATCGCTGACGTCTATACCTATCCCGTTACAT
TTAATTGTGGAAGAAAACGAAAAAGATCTTACGGGAAAATATAAGAAAGAGAAAGTAATG
TTCATGAAAGTGTTCCAAGGCAACTTTAAAGTGGAGCCTATATATATAGATCAAGAACGA
TTGTGCAAAAAGAGGTTACCAAAAAGTTTAGAAGAATACAAAAAATGTAGTGGTGACCAA
GGAAGGATTGCGTCAAAATTGACAGTAAACCAATACTTTGGGCTATATCCTCCATTTAAT
CTACCGCCGCTTTCTTGGTACATCCGTGGGAACACCATCAAAACCTCCAAAAATCTGCTC
AAAGCACTTCAGAACACGGCTAAGAGTATACGAACGGTTGAGCTGCCCGAAGACTTTAAA
GAATTTAGAGAAAAGATGCACTCCAGAAATAAGGCTAATTCAATATTTTAAAAGCTTTTA
AAAAAATTATTACGAATCTGTTTAACCAGAATAACTTGACTTTACAGCTTGTGAATCAGC
ATTGACCACTTTTTAATC
C

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 14

CO CL105Contig1 637 14 10 U
GGGAATCAAAACTGATAGAACTTACTCTCTAATATATTTTGTATCCTTTTCTCTTCTTTG
AATCATCAATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCCATGCTCAAG
AGAAGGCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCCAAGCAGACCGCACAATCAGCATGTGACAAGA
CTGCAGATGCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATA
GCAAGTCTGCAGATGCATCTCATTCCACCCACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAA
CCACTGGTTTTCTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCG
ATGGTGTTAAAAACAGCCTTGGCATGAACGAGAAGAAATGAGGAGATGAGTATTCGTACT
TCTCAAATAACTATTTATATATTCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGCAATTTTTTATTTCT
CTAAATTATGTTTGTAATAAATATATTTTTGAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGAT
CTATATATAATAATTTGGGG*TGGTATTACACCCCAGTTTCTATTTTAAAGAAATGTGAC
AAATTAATGTTCCAGTGGTTTATCGTTATATAACAAT


BQ
10 45 50 50 50 50 50 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 35 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 35 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 55 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 65 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 
60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 35 35 35 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FG81JQ C 163
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AF RS1AL26JQ C 2
AF RS1AL26TF U 2
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AF RS1FG81TF U 2
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AF RS1G092JQ C 31
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AF RS1GN27TF U 2
AF RS1CE57TF U 2
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DS 

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CCACTGGTTTTCTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCG
ATGGTGTTAAAAACAGCCTTGGCATGAACGAGAAGAAATGAGGAGATGAGTATTCGTACT
TCTCAAATAACTATTTATATATTCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGCAATTTTTTATTTCT
CTAAATTATGTTTGTAATAAATATATTTTTGAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGAT
CTATATATAATAATTTGGGG*TGGTATTACAC

QA 1 572 1 572
DS 

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TATATATAATAATTTGGGG*TGGTATTA

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DS 

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CAAGTCTGCAGATGCATCTCATTCCACCCACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAAC
CACTGGTTTTCTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGA
TGGTGTTAAAAACAGCCTTGGCATGAACGAGAAGAAATGAGGAGATGAGTATTCGTACTT
CTCAAATAACTATTTATATATTCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGCAATTTTTTATTTCTC
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TATATATAATAATTTGGGG*TGGTATTACACCCCAGTTTCTATTTTAAAG
G

QA 1 590 1 590
DS 

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TAAAAACAGCCTTGCCATGAACGAGAAGAAATGAGGAGATGAGTATTCGTACTTCTCAAA
TAACTATTTATATATTCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGCAATTTTTTATTTCTCTAAATT
ATGTTTGTAATAAATATATTTTTGAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGATCTATATA
TAATAATTTGGGG*TGGTATTACAC

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DS 

RD RS1GC16TF 284 0 0
GT
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GGTGCTTTCGATGGTGTTAAAAACAGCCTTGCCATGAACGAGAAGAAATGAGGAGATGAG
TATTCGTACTTCTCAAATAACTATTTATATATTCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGCAATT
TTTTATTTCTCTAAATTATGTTTGTAATAAATATATTTTTGAAAGGTTTCATGATCATAA
GATATGAGATCTATATATAATAATTTGGGG*TGGTATTACAC

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DS 

RD RS1AP53JQ 569 0 0
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AACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCCATGCTCAAGAGAAGGCTGAGCAGTGGA
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CAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAGCAAGTTTGCAGATGCAT
TTCATTCCACCCACGCATTTGCTCAACATGGCCAGGAACAAACCACTGGTTTTTTCGGTC
AGACCGGTGAATTTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGATGGTGTTAAAAACAGCC
TTGGCATGAACGAGAAGAAATGAGGAGATGAGTATTCGTACTTTTCAAATAACTATTTAT
ATATTCATGGCTATTTTTGGTTTTTAGCAATTTTTTATTTTTTTAAATTATGTTTGTAAT
AAATATATTTTTGAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGATCTATATATAATAATTTGG
GG*TGGTATTACACCCCAGTTTTTATTTT

QA 1 569 1 569
DS 

RD RS1AP53TFB 573 0 0
GGC
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TCATCAATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCCATGCTCAAGAG
AAGGCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCCAAGCAGACCGCACAATCAGCATGTGACAAGACT
GCAGATGCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAGC
AAGTCTGCAGATGCATCTCATTCCACCCACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAACC
ACTGGTTTTCTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGAT
GGTGTTAAAAACAGCCTTGGCATGAACGAGAAGAAATGAGGAGATGAGTATTCGTACTTC
TCAAATAACTATTTATATATTCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGCAATTTTTTATTTCTCT
AAATTATGTTTGTAATAAATATATTTTTGAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGATCT
ATATATAATAATTTGGGG*TGGTATTACAC

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DS 

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ATCATCAATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCCATGCTCAAGA
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TGCAGATGCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAG
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CACTGGTTTTCTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGA
TGGTGTTAAAAACAGCCTTGGCATGAACGAGAAGAAATGAGGAGATGAGTATTCGTACTT
CTCAAATAACTATTTATATATTCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGCAATTTTTTATTTCTC
TAAATTATGTTTGTAATAAATATATTTTTGAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGATC
TATATATAATAATTTGGGG*TGGTATTACAC

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DS 

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GG
AAAACTGATAGAACTTACTCTCTAATATATTTTGTATCCTTTTCTCTTCTTTGAATCATC
AATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCCATGCTCAAGAGAAGGC
CGAGCAGTGGACTGAGTCTGCCAAGCAGACCGCACAATCAGCATGTGACAAGACTGCAGA
TGCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAGCAAGTC
TGCAGATGCATCTCATTCCACCCACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAACCACTGG
TTTTCTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGATGGTGT
TAAAAACAGCCTTGGCATGAATGAGAAGAAATGAGGAGATGAGTATTCGTACTTCTCAAA
TAACTATTTATATATTCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGCAATTTTTTATTTCTCTAAATT
ATGTTTGTAATAAATATATTTTTGAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGATCTATATA
TAATAATTTGGGG*TGGTATTACACCCCAGTTTCTATTTTAAA
AAAAA

QA 3 585 3 585
DS 

RD RS1G092JQ 542 0 0
AATATATTTTGTATCCTTTTCTCTTCTTTGAATCATCAATTATGTCTCAACAATCATTCA
ATGCTGGACAAACCAGAGGCCATGCTCAAGAGAAGGCCGAGCAGTGGACTGAGTCTGCCA
AGCAGACCGCACAATCAGCATGTGACAAGACTGCAGATGCAGCACTATCAGCACGTGACA
AGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAGCAAGTCTGCAGATGCATCTCATTCCACCC
ACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAACCACTGGTTTTTTCGGTCAGACCGGTGAAT
CTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGATGGTGTTAAAAACAGCCTTGGCATGAATG
AGAAGAAATGAGGAGATGAGTATTCGTACTTCTCAAATAACTATTTATATATTCATGGCT
ATTTCTGGTTTCTAGCAATTTTTTATTTCTCTAAATTATGTTTGTAATAAATATATTTTT
GAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGATCTATATATAATAATTTGGGG*TGGTATTAC
AC

QA 1 542 1 542
DS 

RD RS1CE57JQ 636 0 0
GGAATCGAAACTGATAGAACTTACTCTCTAATATATTTTGTACCCTTTTCTCTTCTTTGA
ATCATCAATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCCATGCTCAAGA
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TGCAGATGCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAG
CAAGTCTGCAGATGCATCTCATTCCACCCACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAAC
CACTGGTTTTCTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGA
TGGTGTTAAAAACAGCCTTGGCATGAACGAGAAGAAATGAGGAGATGAGTATTCGTACTT
CTCAAATAACTATTTATATATTCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGCAATTTTTTATTTCTC
TAAATTATGTTTGTAATAAATATATTTTTGAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGATC
TATATATAATAATTTGGGG*TGGTATTACACCCCAGTTTCTATTTTAAAGAAATGTGACA
AATTAATGTTCCAGTGGTTTATCGTTATATAACAAT

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DS 

RD RS1GN27TF 616 0 0
GGAATCAAAACTGATAGAACTTACTCTCTAATATATTTTGTATCCTTTTCTCTTCTTTGA
ATCATCAATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCCATGCTCAAGA
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TGCAGATGCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAG
CAAGTCTGCAGATGCATCTCATTCCACCCACGCATCTGCTCAACATGGCCAGGAACAAAC
CACTGGTTTTCTCGGTCAGACCGGTGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAGGGTGCTTTCGA
TGGTGTTAAAAACAGCCTTGGCATGAACGAGAAGAAATGAGGAGATGAGTATTCGTACTT
CTCAAATAACTATTTATATATTCATGGCTATTTCTGGTTTCTAGCAATTTTTTATTTCTC
TAAATTATGTTTGTAATAAATATATTTTTGAAAGGTTTCATGATCATAAGATATGAGATC
TATATATAATAATTTGGGG*TGGTATTACACCCCAGTTTCTATTTTAAAGAAATGTGACA
AATTAATGTTCCAGTG

QA 1 616 1 616
DS 

RD RS1CE57TF 636 0 0
GGAATCGAAACTGATAGAACTTACTCTCTAATATATTTTGTACCCTTTTCTCTTCTTTGA
ATCATCAATTATGTCTCAACAATCATTCAATGCTGGACAAACCAGAGGCCATGCTCAAGA
GAAGGCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCCAAGCAGACCGCACAATCAGCATGTGACAAGAC
TGCAGATGCAGCACTATCAGCACGTGACAAGACTGCCAATTTGACACAATCAACACATAG
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TATATATAATAATTTGGGGGTGGTATTACACCCCAGTTTCTATTTTAAAGAAATGTGACA
AATTAATGTTCCAGTGGTTTATCGTTATATAACAAT

QA 1 636 1 636
DS 



AS 2 11

CO CL106Contig1 1377 9 40 U
GGACTTCTCGTTGCAGTGAGCTACAGCCGCAGGACTCATCGCAGCTTCAGGAGGAG***G
AAGAGAATGTCTCACAGGAAGTTTGAGCACCCAAGGCACGGTTCTCTTGGTTTCCTTCCC
AGGAAGAGAGCTAACCGTCACAGAGGAAAAGTGAAGGCCTTCCCCAAGGATGACCAAACC
AAGCCTTGCAAGTTCACAGCCTTCATGGGATACAAGGCTGGCATGACCCACATTGTTAGA
GATGTCGAGAAGCCCGGATCCAAGCTTCACAAGAAGGAGACCTGTGAGGCTGTTACCATC
ATCGAGACACCTGCTATGGTTGTCGTTGGTGTTGTCGCCTACGTCAAGACTCCCCGTGGT
CTGAGGTCTTTGAACACCGTCTGGGCACAGCACTTGAGTGAGGAGGTCAGGAGAAGGTTC
TACAAGAACTGGGCCAAGTCCAAGAAGAAGGCCTTCACCGGATACGCCAAGCAGTACGAG
AGCGAGGAAGGCAAGAAGAGCATCCAGTCCCAGCTCGAGAAGATGAAGAAGTACGGAACC
GTCATCCGTGTCTTGGCCCACACTCAGATCAGGAAGATGAAGGGATTGAAGCAGAAGAAA
GCTCACATGATGGAGGTCCAGATCAACGGTGGTACCATTGCTCAGAAGGTCGACTTTGCC
TACAGCTTCTTCGAGAAACAGATCCCCATCGATGCTGTTTTCCAGAAGGATGAGATGATT
GATGTGATTGGTGTGACAAAGGGTAAAGGTTACGAAGGTGTTGTTACCCGTTGGGGTGTG
ACGAGGCTTCCACGTAAGACCCACAGGGGTCTGCGTAAGGTTGCTTGTATCGGTGCTTGG
CATCCAGCTAGAGTCTCCTACACTGTTGCCAGAGCTGGTCAGAACGGTTACCATCACCGT
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ATGACTGAATACGACAGGACCGAGAAGGATGTGACTCCAATGGGTGGATTCGCACACTAT
GGTGTGGTGAAGGATGACTACTTGATGATCAAGGGATGCTGCATGGGTCCAAAGAAGAGG
GTTGTGACTCTTAGACAGTCGTTGCTCACTCAGACTTCCCGTCTTGCCATGGAGCAGATC
AACCTCAAGTTTATCGACACTTCCTCAAAGATGGGACATGGCAAATTCCAGACTACCCAG
GAGAAGAACAAGTTTTACGGTCGTGCCCCTGCCAAGGCTTAAAACAGTTTGTTCCTTTTT
CAGTTTGTATTCGCTCTTTCTTCA***AAGTCTT*GATAATACTCTTTTGAACTATTCGC
TGCAATTTTGTGTTTTAGTTATTTGGAGAGTTTTATACATCATATGCTTCTTCCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 25 25 25 25 10 

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AF RS1DI41TF U 12
AF RS1DL01TF U 69
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AF RS1DI41JQ C 669
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AF RS1GP12TF U 1130
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BS 1211 1376 RS1GP12TF
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RD RS1B494TF 682 0 0
GGACTTCTCGTTGCAGTGAGCTTCAGCCGCAGGACTCATCGCAGCTTCAGGAGGAG***G
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AGGAAGAGAGCTAACCGTCACAGAGGAAAAGTGAAGGCCTTCCCCAAGGATGACCAAACC
AAGCCTTGCAAGTTCACAGCCTTCATGGGATACAAGGCTGGTATGACCCACATTGTTAGA
GACGTCGAGAAGCCCGGATCCAAGCTTCACAAGAAGGAGACCTGTGAGGCTGTTACCATC
ATCGAGACACCTGCTATGGTTGTCGTTGGGGTTGTTGCCTACGTCAAGACTCCCCGTGGT
CTGAGGTCTTTGAACACCGTCTGGGCACAGCACTTGAGTGAGGAGGTGAGGAGAAGGTTC
TACAAGAACTGGGCCAAGTCCAAGAAGAAGGCCTTCACCGGATACGCCAAGCAGTACGAG
AGCGAGGAAGGCAAGAAGAGCATCCAGTCCCAGCTCGAGAAGATGAAGAAGTACGGAACT
GTCATCCGTGTCTTGGCCCACACTCAGATCAGGAAGATGAAGGGATTGAAGCAGAAGAAA
GCTCACATGATGGAGGTCCAGATCAACGGTGGTACCATTGCTCAGAA*GTCGACTTTGCC
TACAGCTTCTTCGAGAAACAGA

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1B733TF 677 0 0
GGG
GCAGTGAGCTACAGCCACAGGACTCATTGCAGCTTCAGGAGGAGGAGGAAGAGAATGTCT
CACAGGAAGTTTGAACACCCAAGGCACGGTTCCCTTGGTTTCCTTCCCAGGAAGAGAGCT
AACCGTCACAGAGGAAAAGTGAAGGCCTTCCCTAAGGATGACCAAACCAAGCCTTGCAAG
TTCACAGCCTTCATGGGATACAAGGCTGGCATGACCCACATTGTTAGAGATGTCGAGAAG
CCCGGATCCAAGCTTCACAAGAAGGAGACCTGTGAGGCTGTTACCATCATCGAGACACCT
GCTATGGTTGTCGTTGGTGTTGTTGCCTACGTCAAGACTCCCCGTGGCCTGAGGTCTTTG
AACACCGTCTGGGCACAGCACTTGAGCGAGGAGGTCAGGAGAAGGTTCTACAAGAACTGG
GCCAAGTCCAAGAAGAAGGCCTTCACCGGATACGCCAAGCAGTACGAGAGCGAGGAAGGC
AAGAAGAGCATCCAGTCCCAACTCGAGAAGATGAAGAAGTACGGAACCGTCATCCGTGTT
TTGGCCCACACTCAGATCAGGAAGATGAAGGGATTGAAGCAGAAGAAAGCTCACATGATG
GAAGTCCAGATCAACGGTGGTACCATTGCCCAGAA*GTCGACTTTGCCTACAGCTTCTTT
GAGAAACAGATCCC

QA 4 677 4 677
DS 

RD RS1DI41TF 733 0 0
GGCAGTTAGCTAT
AGCCGCAGGACTCATCGCAGCTTCAGGAGGAG***GAAGAGAATGTCTCACAGGAAGTTT
GAGCACCCAAGGCACGGTTCTCTTGGTTTCCTTCCCAGGAAGAGAGCTAACCGTCACAGA
GGAAAAGTGAAGGCCTTCCCCAAGGATGACCAAACCAAGCCTTGCAAGTTCACAGCCTTC
ATGGGATACAAGGCTGGCATGACCCACATTGTTAGAGATGTCGAGAAGCCCGGATCCAAG
CTTCACAAGAAGGAGACCTGTGAGGCTGTTACCATCATCGAGACACCTGCTATGGTTGTC
GTTGGTGTTGTCGCCTACGTCAAGACTCCCCGTGGTCTGAGGTCTTTGAACACCGTCTGG
GCACAGCACTTGAGTGAGGAGGTCAGGAGAAGGTTCTACAAGAACTGGGCCAAGTCCAAG
AAGAAGGCCTTCACTGGATACGCCAAGCAGTACGAGAGCGAGGAAGGCAAGAAGAGCATC
CAGTCCCAGCTCGAGAAGATGAAGAAGTACGGAACCGTCATCCGTGTCTTGGCCCACACT
CAGATCAGGAAGATGAAGGGATTGAAGCAGAAGAAAGCTCACATGATGGAGGTCCAGATC
AACGGTGGTACCATTGCTCAGAAAGTCGACTTTGCCTACAGCTTCTTCGAGAAACAGATC
CCCATCGATTCTGTTTTCCAGAA*GATGAGATGATTGATGTGATTGGTGTGACAAAGG
TA

QA 14 731 14 731
DS 

RD RS1DL01TF 676 0 0
GTCTCACAGGAAGTTTGAGCACCCAAGGCACGGTTCTCTTGGTTTCCTTCCCAGGAAGAG
AGCTAACCGTCACAGAGGAAAAGTGAAGGCCTTCCCCAAGGATGACCAAACCAAGCCTTG
CAAGTTCACAGCCTTCATGGGATACAAGGCTGGCATGACCCACATTGTTAGAGATGTCGA
GAAGCCCGGATCCAAGCTTCACAAGAAGGAGACCTGTGAGGCTGTTACCATCATCGAGAC
ACCTGCTATGGTTGTCGTTGGTGTTGTCGCCTACGTCAAGACTCCCCGTGGTCTGAGGTC
TTTGAACACCGTCTGGGCACAGCACTTGAGTGAGGAGGTCAGGAGAAGGTTCTACAAGAA
CTGGGCCAAGTCCAAGAAGAAGGCCTTCACCGGATACGCCAAGCAGTGCGAGAGCGAGGA
AGGCAAGAAGAGCATCCAGTCCCAGCTCGAGAAGATGAAGAAGTACGGAACCGTCATCCG
TGTCTTGGCCCACACTCAGATCAGGAAGATGAAGGGATTGAAGCAGAAGAAAGCTCACAT
GATGGAGGTCCAGATCAACGGTGGTACCATTGCTCAGAAGGTCGACTTTGCCTACAGCTT
CTTCGAGAAACAGATCCCCATCGATGCTGTTTTCCAGAAAGATGAGATGATTGATGTGAT
TGGTGTGACAAAGGGT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1B494JQ 825 0 0
TCTT
GCCCACACTCAGATCAGGAAGATGAAGGGAT*GAAGCAGAAGAAAGCTCACATGATGGAG
GTCCAGATCAACGGTGGTACCAT*GCTCAGAAGGTCGACTTTGCCTACAGCTTCTTCGAG
AAACAGATCCCCATCGATGCTGTTTTCCAGAAGGATGAGATGATTGATGTGATTGGTGTG
ACCAAGGGTAAAGGTTACGAAGGTGTTGTTACCCGTTGGGGTGTGACCAGGCTTCCACGT
AAGACCCACAGGGGTCTGCGTAAGGTTGCTTGTATCGGTGCCTGGCATCCTGCTAGAGTC
TCCTACACTGTTGCCAGAGCTGGTCAGAACGGTTACCATCACCGTACTGAATTGAACAAG
AAGATTTACAGGTTGGGCAAGGTTGGTCAGGAGACTCACACTGCCATGACTGAATACGAC
AGGACCGAGAAGGATGTGACTCCAATGGGTGGATTCGCACACTATGGTGTGGTGAAGGAT
GACTACTTGATGATCAAGGGATGCTGCATGGGTCCAAAGAAGAGGGTTGTGACTCTTAGA
CAGTCGTTGCTCACTCAGACATCCCGTCTTGCCACGGAGCAGATCAACCTCAAGTTTATC
GACACTTCCTCAAAGATGGGACATGGCAAATTCCAGACTACCCAGGAGAAGAACAAGTTT
TACGGCCATGCCCCTGCCAAGGCTTAAAACAGTTTGTTCTTTTTTCAGTTTGTATTTGCT
CTTTCTTCAGAAAAGTCTTTGATAATACTCTTTTGAACTATTCGCTGCAATTTTGTGTTT
TAGTTATTTGGAGAGTTTTAAACATCATATGCTTC
CTCCTC

QA 5 819 5 819
DS 

RD RS1B733JQ 779 0 0
AAGCTCACATGATGGAAGTCCAGATCAACGGTGGTACCAT*GCCCAGAAGGTCGACTTTG
C*TACAGCTTCTTTGAGAAACAGATCCCCATCGATGCTGTTTTCCAGAAGGATGAGATGA
TTGATGTGATTGGTGTGACCAAGGGTAAAGGTTACGAAGGTGTTGTTACCCGTTGGGGTG
TGACGAGGCTGCCACGTAAGACCCACAGGGGTCTGCGTAAGGTTGCTTGTACCGGTGCTT
GGCATCCAGCTAGAGTCTCCTACACTGTTGCCAGAGCTGGTCAGAACGGTTACCATCACC
GTACTGAATTGAACAAGAAGATTTACAGGTTGGGCAAGGTTGGTCAGGAGACCCACACTG
CCATGACTGAATACGACAGGACCGAGAAGGATGTGACTCCAATGGGCGGATTCGCACACT
ATGGTGTGGTGAAGGATGACTACTTGATGATTAAGGGATGCTGCATGGGTCCAAAGAAGA
GGGTTGTGACTCTTAGACAGTCGTTGCTCACTCAGACTTCCCGTCTTGCCATGGAGCAGA
TCAACCTCAAGTTTATCGACACTTCCTCAAAGATGGGACATGGCAAATTCCAGACTACCC
AGGAGAAGAACAAGTTTTACGGCCGTGCCCCTGCCAAGGCTTAAAACAGTTTGTTCTTTT
TTCAGTTTGTATTCGCTCTTTCTTCAGAAAAGTCTTTGATAATACTCTTTTGAACTATTC
GCTGCAATTTTGTGTTTTAGTTGTTTGGAGAGTTTTAAACATCATATGCTTCTT
TCCCT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RS1DI41JQ 709 0 0
CTTCGAGAAACAGATCCCCATCGATTCTGTTTTCCAGAAGGATGAGATGATTGATGTGAT
TGGTGTGACAAAGGGTAAAGGTTACGAAGGTGTTGTTACCCGTTGGGGTGTGACGAGGCT
TCCACGTAAGACCCACAGGGGTCTGCGTAAGGTTGCTTGTATCGGTGCTTGGCATCCAGC
TAGAGTCTCCTACACTGTTGCCAGAGCTGGTCAGAACGGTTACCACCACCGTACTGAATT
GAACAAGAAGATTTACAGGTTGGGCAAGGTTGGTCAGGAGACTCACACTGCCATGACTGA
ATACGGCAGGACCGAGAAGGATGTGACTCCAATGGGTGGATTCGCACACTATGGTGTGGT
GAAGGATGACTACTTGATGATCAAGGGATGCTGCATGGGTCCAAAGAAGAGGGTTGTGAC
TCTTAGACAGTCGTTGCTCACTCAGACTTCCCGTCTTGCCATGGAGCAGATCAACCTCAA
GTTTATCGACACTTCCTCAAAGATGGGACATGGCAAATTCCAGACTACCCAGGAGAAGAA
CAAGTTTTACGGTCGTGCCCCTGCCAAGGCTTAAAACAGTTTGTTCCTTTTTCAGTTTGT
ATTCGCTCTTTCTTCA***AAGTCTT*GATAATACTCTTTTGAGCTATTCGCTGCAATTT
TGTGTTTTAGTTATTTGGAGAGTTTTATACATCATATGCTTCTTCCCCC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1GP12JQ 247 0 0
G
GGAGCAGATCAACCTCAAGTTTATCGACACTTCCTCAAAGATGGGACATGGCAAATTCCA
GACTACCCAGGAGAAGAACGAGTTTTACGGTCGTGCCCCTGCCAAGGCTTAAAACAGTTT
GTTCCTTTTTCAGTTTGTATTCGCTCTTTCTTCA***AAGTCTT*GATAATACTCTTTTG
AACTATTCGCTGCAATTTTGTGTTTTAGTTATTTGGAGAGTTTTATACATCATATGCTTC
TTCCCC

QA 2 247 2 247
DS 

RD RS1GP12TF 247 0 0
G
GGAGCAGATCAACCTCAAGTTTATCGACACTTCCTCAAAGATGGGACATGGCAAATTCCA
GACTACCCAGGAGAAGAACGAGTTTTACGGTCGTGCCCCTGCCAAGGCTTAAAACAGTTT
GTTCCTTTTTCAGTTTGTATTCGCTCTTTCTTCA***AAGTCTT*GATAATACTCTTTTG
AACTATTCGCTGCAATTTTGTGTTTTAGTTATTTGGAGAGTTTTATACATCATATGCTTC
TTCCCC

QA 2 247 2 247
DS 



CO CL106Contig2 759 2 2 U
GCATGATGGAGATCCAGATCAACGGTGGTACCATTGCTCAGAAGGTCGACTTTGCCTACA
GCTTCTTTGAGAAGCAGATTCCCATCGATGCTGTTTTTCAGAAGGATGAGATGATTGATG
TCATCGGTGTGACCAAGGGTAAAGGTTACGAAGGTGTTGTCACTCGTTGGGGTGTGACTA
GGCTTCCACGTAAGACTCACAGGGGTCTACGTAAGGTTGCTTGTATCGGTGCCTGGCATC
CTGCTAGAGTCTCCTACACTGTTGCCAGAGCTGGTCAGAACGGTTACCATCACCGTACCG
AACTTAACAAGAAGATTTATAGGTTGGGCAAGGTTGGTCAGGAGACACACACAGCCATGA
CTGAATACGACAGGACCGAGAAGGATGTGACTCCAATGGGTGGATTTGCACACTATGGTG
TGGTGAAGGATGACTACTTGATGATTAAGGGATGCTGCATGGGTCCAAAGAAGAGGGTTG
TGACTCTTAGACAGTCACTGCTCACTCAGACTTCCCGTCTTGCCATGGAGCAGATCAACC
TCAAGTTTATCGACACTTCCTCAAAGATGGGACATGGCAAATTCCAGACCACCCAGGAAA
AGAACAAATTCTACGGCCGTGCCTCTGCCAAAACTTAAGCTATTTGTTTCTTTTTTTCAA
TTTTCATGACCTCTTTCCTCAAAAAAGTCTTGAAAATACTTTTTAGAACTATTCGCTGCA
CTTTGTGTTTTATTTGTTTGGAGAATTTGAACTCATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CW22TF U 1
AF RS1CW22JQ C 100
BS 1 672 RS1CW22TF
BS 673 759 RS1CW22JQ

RD RS1CW22TF 672 0 0
GCATGATGGAGATCCAGATCAACGGTGGTACCATTGCTCAGAAGGTCGACTTTGCCTACA
GCTTCTTTGAGAAGCAGATTCCCATCGATGCTGTTTTTCAGAAGGATGAGATGATTGATG
TCATCGGTGTGACCAAGGGTAAAGGTTACGAAGGTGTTGTCACTCGTTGGGGTGTGACTA
GGCTTCCACGTAAGACTCACAGGGGTCTACGTAAGGTTGCTTGTATCGGTGCCTGGCATC
CTGCTAGAGTCTCCTACACTGTTGCCAGAGCTGGTCAGAACGGTTACCATCACCGTACCG
AACTTAACAAGAAGATTTATAGGTTGGGCAAGGTTGGTCAGGAGACACACACAGCCATGA
CTGAATACGACAGGACCGAGAAGGATGTGACTCCAATGGGTGGATTTGCACACTATGGTG
TGGTGAAGGATGACTACTTGATGATTAAGGGATGCTGCATGGGTCCAAAGAAGAGGGTTG
TGACTCTTAGACAGTCACTGCTCACTCAGACTTCCCGTCTTGCCATGGAGCAGATCAACC
TCAAGTTTATCGACACTTCCTCAAAGATGGGACATGGCAAATTCCAGACCACCCAGGAAA
AGAACAAATTCTACGGCCGTGCCTCTGCCAAAACTTAAGCTATTTGTTTCTTTTTTTCAA
TTTTCATGACCT

QA 1 672 1 672
DS 

RD RS1CW22JQ 660 0 0
AGAAGGATGAGATGATTGATGTCATCGGTGTGACCAAGGGTAAAGGTTACGAAGGTGTTG
TCACTCGTTGGGGTGTGACTAGGCTTCCACGTAAGACTCACAGGGGTCTACGTAAGGTTG
CTTGTATCGGTGCCTGGCATCCTGCTAGAGTCTCCTACACTGTTGCCAGAGCTGGTCAGA
ACGGTTACCATCACCGTACCGAACTTAACAAGAAGATTTATAGGTTGGGCAAGGTTGGTC
AGGAGACACACACAGCCATGACTGAATACGACAGGACCGAGAAGGATGTGACTCCAATGG
GTGGATTTGCACACTATGGTGTGGTGAAGGATGACTACTTGATGATTAAGGGATGCTGCA
TGGGTCCAAAGAAGAGGGTTGTGACTCTTAGACAGTCACTGCTCACTCAGACTTCCCGTC
TTGCCATGGAGCAGATCAACCTCAAGTTTATCGACACTTCCTCAAAGATGGGACATGGCA
AATTCCAGACCACCCAGGAAAAGAACAAATTTTACGGCCGTGCCTCTGCCAAAACTTAAG
CTATTTGTTTCTTTTTTTCAATTTTCATGACCTCTTTCCTCAAAAAAGTCTTGAAAATAC
TTTTTAGAACTATTCGCTGCACTTTGTGTTTTATTTGTTTGGAGAATTTGAACTCATACC

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 14

CO CL107Contig1 1028 14 28 U
CCGACAATGGAAACAGAAGCTTTTTAGTGGTGTTCAAGCTAGACAAATAAAAAAGATATT
TGATATCTGCATTTTTCGTCTCAAATTAAAAACTTTTATAGTTTTCATAACTAGAATTAA
AAGGTGGGACTTAAACGGGAAAATACTAGTGACATCGATAAAAGCAAACCTCGATTTTTA
AAATTCATATTTTGAACACACAAATAAAAGTAGCACCATCAAAAAAAAAA*GAAATGATA
ATACTTTGTGACGGAATCACATAGTGCGGAACTCTCTCTCTCTCTCCCTACTCGAAGGTG
TCATCATCGTCATCTGGGAGTGGCTGACTTGCTGCCGCTGCAAGCTCCGCCTCATGCTGT
TGCTGAGCAGCCATGTCAATCTGGACTTCTGGAGGAGCAAGGGCAGGTGATTCCACAAAG
TGAAGGTTAGGGTCACCGGCAAGTTTTCTAGCAAGGTACAAGAATGGCTTCTCGAAATTG
TAGTTGCTCTTGGCAGAGATCTCGTAGTACTGGAGATTCTTCTTCCTGTGGAATGTCACC
TGCTTCGCCTTCACTTGCCTGTTCTTCACATCAACTTTGTTCCCACAAAGAACAATCGGG
ATGTTTTCACAGACCCTGCAAAGATCACGGTGCCATGTTGGGACGTTCTTGTACGTCAGA
CGTGCTGTGACATCAAACATGATGACGGCACACTGCCCATGGATGTAGTAACCATCCCTT
AGACCACCAAACTTCTCTTGTCCAGCAGTATCCCAGCAGTAAAACCGGATCTTGCCACAG
TTAGTGAAGAAGTCTAAAGGGTGAACCTCAACACCAATGGTGGGTTCATATTTCTTCTCA
AACTCTCCAGTGAGATGTCTCTTCACAAACGTGGTTTTCCCTGTGCCTCCATCGCCAACG
ATGACGAGCTTGAAGCTAGGGTAATCGACCGTTTGCTGGTTAGGTAAAGCCATGGATGAT
GAAACTGAAGTAGCGGAGATCGAGAAGAGAAGCGAGTCGAGGAGTATATATGAGAACAAG
ACGGCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 35 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 45 60 60 60 60 60 60 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 35 5 5 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 70 70 70 55 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 50 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 50 75 10 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 60 75 45 75 75 60 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1GB37JQ U 1
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TGATATCTGCATTTTTCGTCTCAAATTAAAAACTTTTATAGTTTTCATAACTAGAATTAA
AAGGTGGGACTTAAACGGGAAAATACTAGTGACATCGATAAAAGCAAACCTCGATTTTTA
AAATTCATATTTTGAACACACAAATAAAAGTAGCACCATCAAAAAAAAAAAAAAATGATA
ATACTTTGTGACGGAATCACATAGTGCGGAACTCTCTCTCTCTCTCCCTACTCGAAGGTG
TCATCATCGTCATCTGGGAGTGGCTGACTTGCTGCCGCTGCAAGCTCCGCCTCATGCTGT
TGCTGAACAGCCATGTCAATCTGGACTTCTGGAGGAGCAAGGGCAGGTGATTCCACAAAG
TGAAGGTTAGGGTCACCGGCAAGTTTTCTAGCAAGGTACAAAAATGGCTTCTCGAAATTG
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TGCTTCGCCTTCACTTGCCTGTTCTTCACATCAACTTTGTTCCCACAAA

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DS 

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GCAAGCTCCGCCTCATGCTGTTGCTGAGCAGCCATGTCAATCTGGACTTCTGGAGGAGCA
AGGGCAGGTGATTCCACAAAGTGAAGGTTAGGGTCACCGGCAAGTTTTCTAGCAAGGTAC
AAAAATGGCTTCTCGAAATTGTAGTTGCTCTTGGCAAAAATCTCGTAGTACTGGAAATTC
TTCTTCCTGTGGAATGTCACCTGCTTCCCCTTCACTTGCCTGTTCTTCACATCAACTTTG
TTCCCACAAAAAACAATCGGGATGTTTTCACAAACCCTGCAAA
AA

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DS 

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CAAAAAAAAAA*GAAATGATAATACTTTGTGACGGAATCACATAGTGCGGAACTCTCTCT
CTCTCTCCCTACTCGAAGGTGTCATCATCGTCATCTGGGAGTGGCTGACTTGCTGCCGCT
GCAAGCTCCGCCTCATGCTGTTGCTGAGCAGCCATGTCAATCTGGACTTCTGGAGGAGCA
AGGGCAGGTGATTCCACAAAGTGAAGGTTAGGGTCACCGGCAAGTTTTCTAGCAAGGTAC
AAGAATGGCTTCTCGAAATTGTAGTTGCTCTTGGCAGAGATCTCGTAGTACTGGAGATTC
TTCTTCCTGTGGAATGTCACCTGCTTCGCCTTCACTTGCCTGTTCTTCACATCAACTTTG
TTCCCACAAAGAACAATCGGGATGTTTTCACAGACCCTGCAAAGATCACGGTGCC
C

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DS 

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ACACAAATAAAAGTAGCACCATCAAAAAAAAA**GAAATGATAATACTTTGTGACGGAAT
CACATAGTGCGGAACTCTCTCTCTCTCTCCCTACTCGAAGGTGTCATCATCGTCATCTGG
GAGTGGCTGACTTGCTGCCGCTGCAAGCTCCGCCTCATGCTGTTGCTGAACAGCCATGTC
AATCTGGACTTCTGGAGGAGCAAGGGCAGGTGATTCCACAAAGTGAAGGTTAGGGTCACC
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AATCTCGTAGTACTGGAGATTCTTCTTCCTGTGGAATGTCACCTGCTTCGCCTTCACTTG
CCTGTTCTTCACATCAACTTTGTTCCCACAAAGAACAATCGGGATGTTTTCACAGACCCT
GCAAAGATCACGGTGCCATGTTGGGACGTTCTTGTACGTCAGACGTGCTGTGACATCAAA
CATGATGACGGCACACTGCCCATGGATGTAGTAACCATCCCTT

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DS 

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CAAAAAAAAAA*GAAATGATAATACTTTGTGACGGAATCACATAGTGCGGAACTCTCTCT
CTCTC**CCTACTCGAAGGTGTCATCATCGTCATCTGGGAGTGGCTGACTTGCTGCCGCT
GCAAGCTCCGCCTCATGCTGTTGCTGAGCAGCCATGTCAATCTGGACTTCTGGAAGAGCA
AGGGCAGGTGATTCCACAAAGTGAAGGTTAGGGTCACCGGCAAGTTTTCTAGCAAGGTAC
AAGAATGGCTTCTCGAAATTGTAGTTGCTCTTGGCAGAAATCTCGTAGTACTGGAGATTC
TTCTTCCTGTGGAATGTCACCTGCTTCGCCTTCACTTGCCTGTTCTTCACATCAACTTTA
TTCCCACAAAGAACAATCGGGATGTTTTCACAGACCCTGCAAAGATCACGGTGCCATGTT
GGGACGTTCTTGTACGTCAGACGTGCTGTGACATCAAACATGATGACGGCACACTGCCCA
TGGATGTAGTAACCATCCCTTAGACCACCAAACTTCTCT
C

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DS 

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TTTTTT
TAAAAGCAAACCTCGATTTTTAAAATTCATATTTTGAACACACAAATAAAAGTAGCACCA
TCAAAAAAAAAA*GAAATGATAATACTTTGTGACGGAATCACATAGTGCGGAACTCTCTC
TCTCTC**CCTACTCGAAGGTGTCATCATCGTCATCTGGGAGTGGCTGACTTGCTGCCGC
TGCAAGCTCCGCCTCATGCTGTTGCTGAGCAGCCATGTCAATCTGGACTTCTGGAAGAGC
AAGGGCAGGTGATTCCACAAAGTGAAGGTTAGGGTCACCGGCAAGTTTTCTAGCAAGGTA
CAAGAATGGCTTCTCGAAATTGTAGTTGCTCTTGGCAGAGATCTCGTAGTACTGGAGATT
CTTCTTCCTGTGGAATGTCACCTGCTTCGCCTTCACTTGCCTGTTCTTCACATCAACTTT
ATTCCCACAAAGAACAATCGGGATGTTTTCACAGACCCTGCAAAGATCACGGTGCCATGT
TGGGACGTTCTTGTACGTCAGACGTGCTGTGACATCAAACATGATGACGGCACACTGCCC
ATGGATGTAGTAACCATCCCTTAGACCACCAAACTTCTCT
C

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DS 

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AAAAAAAAAAAGAAATGATAATACTTTGTGACGGAATCACATAGTGCGGAACTCTCTCTC
TCTC**CCTACTCGAAGGTGTCATCATCGTCATCTGGGAGTGGCTGACTTGCTGCCGCTG
CAAGCTCCGCCTCACGCTGTTGCTGAGCAGCCATGTCAATCTGGACTTCTGGAGGAGTAA
GGGCAGGTGATTCCACAAAGTGAAGGTTAGGGTCACCGGCAAGTTTTCTAGCAAGGTACA
AGAATGGCTTCTCGAAATTGTAGTTGCTCTTGGCAGAAATCTCGTAGTACTGGAGATTCT
TCTTCCTGTGGAATGTCACCTGCTTCGCCTTCACTTGCCTGTTCTTCACATCAACTTTGT
TCCCACAAAGAACAATCGGGATGTTTTCACAGACCCTGCAAAGATCACGGTGCCATGTTG
GGACGTTCTTGTACGTCAGACGTGCTGTGACATCAAACATGATGACGGCACACTGCCCAT
GGATGTAGTAACCATCCCTTAGACCACCAAACTTCTCTTGTCCAGCAGTATCCCAGCAGT
AAAACCGGATCTTGC

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DS 

RD RS1DY19JQ 787 0 0
G
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GGAAAATACTAGTGACATCGATAAAAGCAAACCTCGATTTTTAAAATTCATATTTTGAAC
ACACAAATAAAAGTAGCACCATCAAAAAAAAAAAGAAATGATAATACTTTGTGACGGAAT
CACATAGTGCGGAACTCTCTCTCTCTCTCCCTACTCGAAGGTGTCATCATCGTCATCTGG
GAGTGGCTGACTTGCTGCCGCTGCAAGCTCCGCCTCATGCTGTTGCTGAGCAGCCATGTC
AATCTGGACTTCTGGAGGAGCAAGGGCAGGTGATTCCACAAAGTGAAGGTTAGGGTCACC
GGCAAGTTTTCTAGCAAGGTACAAGAATGGTTTCTCGAAATTGTAGTTGCTCTTGGCAGA
AATCTCGTAGTACTGGAGATTCTTCTTCCTGTGGAATGTCACCTGCTTCGCCTTCACTTG
CCTGTTCTTCACATCAACTTTGTTCCCACAAAGAACAATCGGGATGTTTTCACAGACCCT
GCAAAGATAACGGTGCCATGTTGGGACGTTCTTGTACGTCAGACGTGCTGTGACATCAAA
CATGATGACGGCACACTGCCCATGGATGTAGTAACCATCCCTTAGACCACCAAACTTCTC
TTGTCCAGCAGTATCCCAGCAGTAAAACCGGATCTTGCCACAGTTAGTGAAGAAGTCTAA
AGGGTGAACCTCAACACCAATGGTGGGTTCATATTTCTTCTCAA*CTCTCCAGTGAGATG
TCTCTT

QA 2 787 2 787
DS 

RD RS1FV35TF 670 0 0
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CTTTGTGACGGAATCACATAGTGCGGAACTCTCTCTCTCTCTCCCTACTCGAAGGTGTCA
TCATCGTCATCTGGGAGTGGCTGACTTGCTGCCGCTGCAAGCTCCGCCTCATGCTGTTGC
TGAGCAGCCATGTCAATCTGGACTTCTGGAGGAGCAAGGGCAGGTGATTCCACAAAGTGA
AGGTTAGGGTCACCGGCAAGTTTTCTAGCAAGGTACAAGAATGGCTTCTCGAAATTGTAG
TTGCTCTTGGCAGAGATCTCGTAGTACTGGAGATTCTTCTTCCTGTGGAATGTCACCTGC
TTCGCCTTCACTTGCCTGTTCTTCACATCAACTTTGTTCCCACAAAGAACAATCGGGATG
TTTTCACAGACCCTGCAAAGATCACGGTGCCATGTTGGGACGTTCTTGTACGTCAGACGT
GCTGTGACATCAAACATGATGACGGCACACTGCCCATGGATGTAGTAACCATCCCTTAGA
CCACCAAACTTCTCTTGTCCAGCAGTATCCCAGCAGTAAAACCGGATCTTGCCACAGTTA
GTGAAGAAGTCTAAAGGGTGAACCTCAACACCAATGGTGGGTTCATATTTCTTCTCAAAC
TCTCCAGTG
C

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DS 

RD RS1FI16JQ 761 0 0
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TAGCACCATCAAAAAAAAAAAGAAATGATAATACTTTGTGACGGAATCACATAGTGCGGA
ACTCTCTCTCTC****CCTACTCGAAGGTGCCATCATCGTCATCTGGGAGTGGCTGACTT
GCTGCCGCTGCAAGCTCCGCCTCATGCTGTTGCTGAGCAGCCATGTCAATCTGGACTTCT
GGAGGAGCAAGGGCAGGTGATTCCACAAAGTGAAGGTTAGGGTCACCGGCAAGTTTTCTA
GCAAGGTACAAGAATGGCTTCTCGAAATTGTAGTTGCTCTTGGCAGAGATCTCGTAGTAC
TGGAGATTCTTCTTCCTGTGGAATGTCACCTGCTTCGCCTTCACTTGCCTGTTCTTCACA
TCAACTTTGTTCCCACAAAGAACAATCGGGATGTTTTCACAGACCCTGAAAAGATCACGG
TGCCATGTTGGGACGTTCTTGTACGTCAGACGTGCTGTGACATCAAACATGATGACGGCA
CACTGCCCATGGATGTAGTAACCATCCCTTAGACCACCAAACTTCTCTTGTCCAGCAGTA
TCCCAGCAGTAAAACCGGATCTTGCCACAGTTAGTGAAGAAGTCTAAAGGGTGAACCTCA
ACACCAATGGTGGGTTCATATTTCTTCTCAAACTCTCCAGTGAGATGTCTCTTCACAAAC
GTGGTTTTCCCTGTGCCTCCATCGCCA*CGATGACGAGCTT

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DS 

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CTGGAGATTCTTCTTCCTGTGGAATGTCACCTGCTTCGCCTTCACTTGCCTGTTCTTCAC
ATCAACTTTGTTCCCACAAAGAACAATCGGGATGTTTTCACAGACCCTGCAAGGATCACG
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ATCCCAGCAGTAAAACCGGATCTTGCCACAGTTAGTGAAGAAGTCTAAAGGGTGAACCTC
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CGTGGTTTTCCCTGTGCCTCCATCGCCAACGATGACGAGCTTGAAGCTAGGGTAATCGAC
CGTTTGCTGGTTAGGTAAAGCCATGGATGATGAAACTGAAGTAGCGG
CC

QA 1 527 1 527
DS 

RD RS1FI16TF 789 0 0
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GTTGCTGAGCAGCCATGTCAATCTGGACTTCTGGAGGAGCAAGGGCAGGTGATTCCACAA
AGTGAAGGTTAGGGTCACCGGCAAGTTTTCTAGCAAGGTACAAGAATGGCTTCTCGAAAT
TGTAGTTGCTCTTGGCAGAGATCTCGTAGTACTGGAGATTCTTCTTCCTGTGGAATGTCA
CCTGCTTCGCCTTCACTTGCCTGTTCTTCACATCAACTTTGTTCCCACAAAGAACAATCG
GGATGTTTTCACAGACCCTGAAAAGATCACGGTGCCATGTTGGGACGTTCTTGTACGTCA
GACGTGCTGTGACATCAAACATGATGACGGCACACTGCCCATGGATGTAGTAACCATCCC
TTAGACCACCAAACTTCTCTTGTCCAGCAGTATCCCAGCAGTAAAACCGGATCTTGCCAC
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CAAACTCTCCAGTGAGATGTCTCTTCACAAACGTGGTTTTCCCTGTGCCTCCATCGCCAA
CGATGACGAGCTTGAAGCTAGGGTAATCGACCGTTTGCTGGTTAGGTAAAGCCATGGATG
ATGAAACTGAAGTAGCGGAGGTCGAGAAGAGAAGCGAGTCGAGGAGTATATATGAGAACA
AGACGGCCC

QA 1 789 1 789
DS 

RD RS1G457TF 634 0 0
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GGTACAAGAATGGCTTCTCGAAATTGTAGTTGCTCTTGGCAGAGATCTCGTAGTACTGGA
GATTCTTCTTCCTGTGGAATGTCACCTGCTTCGCCTTCACTTGCCTGTTCTTCACATCAA
CTTTGTTCCCACAAAGAACAATCGGGATGTTTTCACAGACCCCGCAAAGATCACGGTGCC
ATGTTGGGACGTTCTTGTACGTCAGACGTGCTGTGACATCAAACATGATGACGGCACACT
GCCCATGGATGTAGTAACCATCCCTTAGACCACCAAACTTCTCTTGTCCAGCAGTATCCC
AGCAGTAAAACCGGATCTTGCCACAGTTAGTGAAGAAGTCTAAAGGGTGAACCTCAACAC
CAATGGTGGGTTCATATTTCTTCTCAAACTCTCCAGTGAGATGTCTCTTCACAAACGTGG
TTTTCCCTGTGCCTCCATCGCCAACGATGACGAGCTTGAAGCTAGGGTAATCGACCGTTT
GCTGGTTAGGTAAAGCCATGGATGATGAAACTGAAGTAGCGGAGATCGAGAAGAGAAGCG
AGTCGAGGAGTATATATGAGAACAAGACGGCCCT

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DS 

RD RS1DY19TF 484 0 0
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TTTTCACAGACCCTGCAAAGATAACGGTGCCATGTTGGGACGTTCTTGTACGTCAGACGT
GCTGTGACATCAAACATGATGACGGCACACTGCCCATGGATGTAGTAACCATCCCTTAGA
CCACCAAACTTCTCTTGTCCAGCAGTATCCCAGCAGTAAAACCGGATCTTGCCACAGTTA
GTGAAGAAGTCTAAAGGGTGAACCTCAACACCAATGGTGGGTTCATATTTCTTCTCAAAC
TCTCCAGTGAGATGTCTCTTCACAAACGTGGTTTTCCCTGTGCCTCCATCGCCAACGATG
ACGAGCTTGAAGCTAGGGTAATCGACCGTTTGCTGGTTAGGTAAAGCCATGGATGATGAA
ACTGAAGTAGCGGAGATCGAGAAGAGAAGCGAGTCGAGGAGTATATATGAGAACAAGACG
GCCC

QA 1 484 1 484
DS 



AS 2 13

CO CL108Contig1 715 3 3 U
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GGTTATTGCTTAATTTATTATAAGTTTTGATGGAACCAACAAAAACATACTAATAAAAAC
ACCACCAAAGTACGATGTTTGTATCCGGTTGGTTCAAATGCATTCTCAGACGTTAATGAA
ACCTTTCTCCTTCAAGGACTCAACTGTCTCCTTGATGCTAACTTCCAAGGGTATGTAGTC
AATGCCAAGGCTCTTTATTTTCTCCTTGGACACTTGATAAGTCGGAACATACGGATTCTC
ATCCGCACACATTTCAGGGAGTTGGAGATTTGGGTAAAGCTGACGCAAAATGTTCACAAT
CTCAGAGTGGTGAAGAACTCTCTCCACCATACAGTAACGTCCGTTAGCTGAAGGGATCTC
ATATGCTTGGATGTGTGCATTGGCTACGTCCTTTACGTTAACCCATCCAAAGGTTGCGTT
GGAAAATGTCTTTGCACCATTTATAAAGTTTAGTATAGCAGCAGCACTCGTGTTCAGAGT
TGGCTGCAAGAGAGGACCGATCACCATTGCCGGGTTGATCATTACAACGTCCAAGCCTTT
CTCTTTAGCGAATTTCCAAGCAGCATCTTCGGCCAAAGTCTTGGAGAGAACATACCACAT
CTTTGAAGTCTTGCAAATCTCGGGATCAGAAAACCAAGTTTCATCGACGGTCACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F352JQ U 1
AF RS1G411JQ U 16
AF RS1ES50JQ U 13
BS 1 585 RS1F352JQ
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RD RS1F352JQ 715 0 0
GAAAACCATGATGATGAAATCAATTGTAATAAACTGAAAGAAATGTCGCGACATTACAAA
GGTTATTGCTTAATTTATTATAAGTTTTGATGGAACCAACAAAAACATACTAATAAAAAC
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ACCTTTCTCCTTCAAGGACTCAACTGTCTCCTTGATGCTAACTTCCAAGGGTATGTAGTC
AATGCCAAGGCTCTTTATTTTCTCCTTGGACACTTGATAAGTCGGAACATACGGATTCTC
ATCCGCACACATTTCAGGGAGTTGGAGATTTGGGTAAAGCTGACGCAAAATGTTCACAAT
CTCAGAGTGGTGAAGAACTCTCTCCACCATACAGTAACGTCCGTTAGCTGAAGGGATCTC
ATATGCTTGGATGTGTGCATTGGCTACGTCCTTTACGTTAACCCATCCAAAGGTTGCGTT
GGAAAATGTCTTTGCACCATTTATAAAGTTTAGTATAGCAGCAGCACTCGTGTTCAGAGT
TGGCTGCAAGAGAGGACCGATCACCATTGCCGGGTTGATCATTACGACGTCCAAGCCTTT
CTCTTTAGCGAATTTCCAAGCAGCATCTTCGGCCAAAGTCTTGGAGAGAACATACCACAT
CTTTGAAGTCTTGCAAATCTCGGGATCAGAAAACCAAGTTTCATCGACGGTCACA

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1G411JQ 661 0 0
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TATTATAAGTTTTGATGGAACCAACAAAAACATACTAATAAAAACACCACCAAAGTACGA
TGTTTGTATCCGGTTGGTTCAAATGCATTCTCAGACGTTAATGAAACCTTTCTCCTTCAA
GGACTCAACTGTCTCCTTGATGCTAACTTCCAAGGGTATGTAGTCAATGCCAAGGCTCTT
TATTTTCTCCTTGGACACTTGATAAGTCGGAACATACGGATTCTCATCCGCACACATTTC
AGGGAGTTGGAGATTTGGGTAAAGCTGACGCAGAATGTTCACAATCTCAGAGTGGTGAAG
AACTCTCTCCACCATACAGTAACGTCCGTTAGCTGAAGGGATCTCATATGCTTGGATGTG
TGCATTGGCTACGTCCTTTACGTTAACCCATCCAAAGGTTGCGTTGGAAAATGTCTTTGC
ACCATTTATAAAGTTTAGTATAGCAGCAGCACTCGTGTTCAGAGTTGGCTGCAAGAGAGG
ACCGATCACCATTGCCGGGTTGATCATTACAACGTCCAAGCCTTTCTCTTTAGCGAATAT
CCAAGCAGCATCTTCGGCCAAAGTCTTGGAGAGAACATACCACATCTTTGAAGTCTCGCA
A

QA 1 661 1 661
DS 

RD RS1ES50JQ 678 0 0
GGT
GAAATCAATTGTAATAAACTGAAAGAAATGTCGCGACATTACAAAGGTTATTGCTTAATT
TATTATAAGTTTTGATGGAACCAACAAAAACATACTAATAAAAACACCACCAAAGTACGA
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TGCATTGGCTACGTCCTTTACGTTAACCCATCCAAAGGTTGCGTTGGAAAATGTCTTTGC
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CCAAGCAGCATCTTCGGCCAAAGTCTTGGAGAGAACATACCACATCTTTGAAGTCTTGCA
AATCTCGGGATCAGA

QA 4 678 4 678
DS 



CO CL108Contig2 1191 10 54 U
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CGAATCTAAATCTAAAGAGAAAAAATGGCAAAGAGTGGTGAAGGTAAAGTGGTGTGTGTA
ACAGGAGCATCAGGTTACATCGCTTCTTGGCTTGTCAAGTTCCTCCTTAGCCGTGGCTAC
ACCGTCAAGGCATCCGTCCGTGACCCCAGTGATCCGAAAAAGACACAACACTTGGTTTCG
TTGGAAGGTGCGAAGGAGAGACTTCACTTGTTCAAAGCAGATCTTTTGGAACAAGGATCG
TTCGACTCTGCTGTTGATGGATGCGAAGGTGTTTTCCACACTGCCTCCCCGTTTTATCAT
GATGTCAAAGACCCGCAGGCTGAACTTATTGAACCTGCTGTCAAGGGAACACTTAACGTT
TTGAACTCGTGCACCAAAGCATCTTCTGTCAAAAGGGTTGTTGTTACCTCCTCCATGGCA
GCCGTTGCTTACAATGGTAAACCACGCACACCTGATGTGACCGTCGATGAAACTTGGTTT
TCTGATCCCGAGATTTGCAAGACTTCAAAGATGTGGTATGTTCTCTCCAAGACCTTGGCT
GAAGATGCTGCTTGGAAGTTCGCTAAAGAGAAAGGCTTGGACGTTGTAATGATCAACCCG
GCAATGGTGATCGGTCCTCTCTTGCAACCAACTCTGAACACGAGTGCTGCTGCTATACTA
AACTTTATAAATGGTGCAAAGACATTTTCCAACGCAACCTTTGGATGGGTTAACGTAAAG
GACGTAGCCAATGCACACATCCAAGCATATGAGATCCCTTCAGCTAACGGACGTTACTGT
ATGGTGGAGAGAGTTCTTCACCACTCTGAGATTGTGAACATTCTGCGTCAGCTTTACCCA
AATCTCCAACTCCCTGAAAGTTGTGCGGATGACAATCCGTATGTTCCGACTTATCAAGTT
TCGAAGGAGAAAATAAAGAGCCTTGGCATTGACTACATACTCTTGGAAGTTAGCATCAAG
GAGACCGTTGAATCCTTGAAGGAGAAAGGTTTCATAAACGTCTGAGAAAGCATTTGAGCC
AAACTGGATTCAAAACATCTTACTCTGTTGTTGGAATGGTTCCATCAAAACTTTTAATAA
ATTAAGCATTTGTTTCAGTTTATGACATGAGCTTTCACCATCATGTTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 35 10 35 20 20 35 10 40 5 5 
40 5 0 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 
45 45 45 45 45 20 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 35 55 55 55 55 35 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 35 55 
55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 
40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 40 55 55 20 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 20 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 15 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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A

QA 1 434 1 434
DS 

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CTTGGCTGAAGATGCTGCTTGGAAGTTCGC

QA 9 578 9 578
DS 

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TCTCTC
AAAATATATTAATAAGATACAGAAGTAGGTA***AGACACACACACACACGCACACGCAA
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TGCACAAAAGCATCTTCTGTCAAACGGGTTGTTGTTACCTCCTCCATGGCAGCCGTTGCT
TACAATGGTAAACCACGCACACCTGATGTGACCGTCGATGAAACTTGGTTTTCTCATCCC
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GCTTGGATATTCGCTAAAGAGAAAGGCTTGGACGTTGTAATGATCAACCCGGCAATGGTG
ATCGGTCCTCTCTTGCAGCCAACTCTGAACACGAGTGCTGCTGCTATA

QA 7 714 7 714
DS 

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GG
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ATCTAAAGAGAAAAAATGGCAAAGAGTGGTGAAGGTAAAGTGGTGTGTGTAACAGGAGCA
TCAGGTTACATCGCTTCTTGGCTTGTCAAGTTCCTCCTTAGCCGTGGCTACACCGTCAAG
GCATCCGTCCGTGACCCCAGTGATCCGAAAAAGACACAACACTTGGTTTCGTTGGAAGGT
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GCTGTTGATGGATGCGAAGGTGTTTTCCACACTGCCTCCCCGTTTTATCATGATGTCAAA
GACCCGCAGGCTGAACTTATTGAACCTGCTGTCAAGGGAACACTTAACGTTTTGAACTCG
TGCACCAAAGCATCTTCTGTCAAAAGGGTTGTTGTTACCTCCTCCATGGCAGCCGTTGCT
TACAATGGTAAACCACGCACACCTGATGTGACCGTCGATGAAACTTGGTTCTCTGATCCC
GAGATTTGCAAGACTTCAAAGATGTGGTATGTTCTCTCCAAGACTTTGGCCGAAGATGCT
GCTTGGAAATTCGCTAAAGAGAAAGGCTTGGACGTTGTAATGATCAACCCGGCAATGGTG
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GG
AGACACACGAATCTAAATCTAAAGAGAAAAAATGGCAAAGAGTGGTGAAGGTAAAGTGGT
GTGTG***CAGGAGCATCAGGTTACATCGCTTCTTGGCTTGTCAAGTTCCTCCTTAGCCG
TGGCTACACCGTCAAGGCATCCGTCCGTGACCCCAGTGATCCGAAAAAGACACAACACTT
GGTTTCGTTGGAAGGTGCGAAGGAGAGACTTCACTTGTTCAAAGCAGATCTTTTGGAACA
AGGATCGTTCGACTCTGCTGTTGATGGATGCGAAGGTGTTTTCCACACTGCCTCCCCGTT
TTATCATGATGTCAAAGACCCGCAGGCTGAACTTATTGAACCTGCTGTCAAGGGAACACT
TAACGTTTTGAACTCGTGCACCAAAGCATCTTCTGTCAAAAGGGTTGTTGTTACCTCCTC
CATGGCAGCCGTTGCTTACAATGGTAAACCACGCACACCTGATGTGACCGTCGATGAAAC
TTGGTTTTCTGATCCCGAGATTTGCAAGACTTCAAAGATGTGGTATGTTCTCTCCAAGAC
CTTTGCTGAAGATGCTGCTTGGAAGTTCGCTAAAGAGAAAGGCTTGGACGTTGTAATGAT
CAACCCGGCAATGGTGATCGGTCCTCTCTTGCAACCAACTCTGAACACGAGTGCTGCTGC
TATACTAAACTTTATAAATGGTGCAAAGACATTTTCCAACGCAACCTTTGGATGGGTTAA

QA 3 722 3 722
DS 

RD RS1DI93TF 761 0 0
GGAGAC
ACACACAGACACACGAATCTAAATCTAAAGAGAAAAAATGGCAAAGAGTGGTGAAGGTAA
AGTGGTGTGTGTAACAGGAGCATCAGGTTACATCGCTTCTTGGCTTGTCAAGTTCCTCCT
TAGCCGTGGCTACACCGTCAAGGCATCCGTCCGTGACCCCAGTGATCCGAAAAAGACACA
ACACTTGGTTTCGTTGGAAGGTGCGAAGGAGAGACTTCACTTGTTCAAAGCAGATCTTTT
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CCCGTTTTATCATGATGTCAAAGACCCGCAGGCTGAACTTATTGAACCTGCTGTCAAGGG
AACACTTAACGTTTTGAACTCGTGCACCAAAGCATCTTCTGTCAAAAGGGTTGTTGTTAC
CTCCTCCATGGCAGCCGTTGCTTACAATGGTAAACCACGCACACCTGATGTGACCGTCGA
TGAAACTTGGTTTTCTGATCCCGAGATTTGCAAGGCTTCAAAGATGTGGTATGTTCTCTC
CAAGACCTTGGCTGAAGATGCTGCTTGGAAGTTCGCTAAAGAGAAAGTCTTGGACGTTGT
AATGATCAACCCGGCAATGGTGATCGGTCCTCTCTTGCAACCAACTCTAAACACGAGTGC
TGCTGCTATACTAAACTTTATAAATGGTGCAAAGACATTTTCCAACGCAACCTTTGGATG
GGTTAACGTAAAGGACGTAGCCAATGCACACATCC

QA 7 761 7 761
DS 

RD RS1GP65TF 826 0 0
GGGACAGACAGACA
CACACACAAATCTAAAGAGAAAAAATGGCAAACAGTGGTGAAGGTAAAGTGGTGTGTGTA
ACAGGAGCATCCGGTTACATCGCTTCTTGACTTGTCAAGTTCCTCCTTAGCCGTGGCTAC
ACCGTCAAGGCATCCGTCCGCGACCCCAGTGATCCGAAAAAGACACAACACTTGGTTTCG
TTGGAAGGTGTAAAGGAGAGACTTCACTTGTTCAAAGCAGATCTTTTGGAACAAGGATCG
TTCGACTCTGCTGTTGATGGATGCGAAGGTGTTTTCCACACTGCCTCCCCGTTTTATCAT
GATGTCAAAGACCCGCAGGCTGAACTTATTGAACCTGCTGTCAAGGGAACACTTAACGTT
TTGAACTCGTGCACCAAAGCATCTTCTGTCAAAAGGGTTGTTGTTACCTCCTCCATGGCA
GCCGTTGCTTACAATGGTAAACCACGCACACCTGATGTGACCGTCGATGAAACTTGGTTT
TCTGATCCCGAGATTTGCAAGACTTCAAAGATGTGGTATGTTCTCTCCAAGACTTTGGCC
GAAGATGCTGCTTGGAAATTCGCTAAAGAGAAAGGCTTGGACGTTGTAATGATCAACCCG
GCAATGGTGATCGGTCCTCTCTTGCAGCCAACTCTGAACACGAGTGCTGCTGCTATACTA
AACTTTATAAATGGTGCAAAGACATTTTCCAACGCAACCTTTGGATGGGTTAACGTAAAG
GT*GTAGCCA*TGCACACATCCA*GCATATGAGATCCCTTCAGCTA*CGGACGT*ACTGT
ATGGTGGAGAGAGT
CTCACACTCTGAGATTGT

QA 15 808 15 808
DS 

RD RS1DN45TF 770 0 0
GGAGCATCAGGTTACATCGCTTCTTGGCTTGTCAAGTTCCTCCTTAGCCGTGGCTACACC
GTCAAGGCATCCGTCCGTGACCCCAGTGATCCGAAAAAGACACGACACTTGGTTTCGTTG
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GACTCTGCTGTTGATGGATGCGAAGGTGTTTTCCACACTGCCTCCCCGTTTTATCATGAT
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GTTGCTTACAATGGTAAACCACGCACACCTGATGTGACCGTCGATGAAACTTGGTTTTCT
GATCCCGAGATTTGCAAGACTTCAAAGATGTGGTATGTTCTCTCCAAGACCTTGGCTGAA
GATGCTGCTTGGAAGTTCGCTAAAGAGAAAGGCTTGGACGTTGTAATGATCAACCCGGCA
ATGGTGATCGGTCCTCTCTTGCAACCAACTCTGAACACGAGTGCTGCTGCTATACTAAAC
TTTATAAATGGTGCAAAGACATTTTCCAACGCAACCTTTGGATGGGTTAACGTAAAGGAC
GTAGCCAATGCACACATCCA*GCATATGAGATCCCTTCAGCTAACGGACGTTACTGTATG
GTGGAGAGAGTTCTTCACCACTCTGAGATTGTGAACATTCTGCGTCAGCT

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DS 

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ACGTTT*GAACTCGTGCACCAAAGCATCTTCTGTCAAAAGGGTTGTTGTTACCTCCTCCA
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GGTTTTCTGATCCCGAGATTTGCAAGGCTTCAAAGATGTGGTATGTTCTCTCCAAGACCT
TGGCTGAAGATGCTGCTTGGAAGTTCGCTAAAGAGAAAGTCTTGGACGTTGTAATGATCA
ACCCGGCAATGGTGATCGGTCCTCTCTTGCAACCAACTCTAAACACGAGTGCTGCTGCTA
TACTAAACTTTATAAATGGTGCAAAGACATTTTCCAACGCAACCTTTGGATGGGTTAACG
TAAAGGACGTAGCCAATGCACACATCCAAGCATATGAGATCCCTTCAGCTAACGGACGTT
ACTGTATGGTGGAGAGAGTTCTTCACCACTCTGAGATTGTGAACATTCTGCGTCGGCTTT
ACCCAAATCTCCAACTCCCTGAAAGTTGTGCGGATGACAATCCGTATGTTCCGACTTATC
AAGTTTCGAAGGGGAAAATAAAGAGCCTTGGCATTGACTACATACTCTTGGAAGTTAGCA
TCAAGGAGACCGTTGAATCCTTGAAGGAGAAAGGTTTCATAAACGTCTGAGAAAGCATTT
GAGCCAAACTGGATTCAAAACATCTTACTCTGTTGTTGGAATGGTTCCATCAAAACTTTT
AATAAATTAAGCATTTGTTTCAGTTTATGACATGAGCTTTCACC

QA 1 824 1 824
DS 

RD RS1DZ61JQ 765 0 0
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GCTTACAATGGTAAACCACGCACACCTGATGTGACCGTCGATGAAACTTGGTTTTCTGAT
CCCGAGATTTGCAAGACTTCAAAGATGTGGTATGTTCTCTCCAAGACCTTGGCTGAAGAT
GCTGCTTGGAAGTTCGCTAAAGAGAAAGGCTTGGACGTTGTAATGAGCAACCCGGCAATG
GTGATCGGTCCTCTCTTGCGACCAACTCTGAACACGAGTGCTGCTGCTATACTAAACTTT
ATAAATGGTGCAAAGACATTTTCCAACGCAACCTTTGGATGGGTTAACGTAAAGGACGTA
GCCAATGCACACATCCAAGCATATGAGATCCCTTCAGTTAACGGACGTCACTGTATGGTG
GAGAGAGTTCTTCACCACTCTGAGATTGTGAACATTCTGCGCCAGCTTTACCCAAATCTC
CAACTCCCTGAAAGTTGTGCGGATGACAATCCGTATGTTCCGACTTATCAAGTTTCGAAG
GAGAAAATAAAGAGCCTTGGCATTGACTACATACTCTTGGAAGTTAGCATCAAGGAGACC
GTTGAATCCTTGAAGGAGAAAGGTTTCATAAACGTCTGAGAAAGCATTTGAGCCAAACTG
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CATTTGTTTCAGTTTATGACATGAGCTTTCACCATCATGTTTTAT

QA 1 765 1 765
DS 



AS 2 13

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GAGAAATGAAATGAAGAAGAAGAAAAAACGTACAAAATTATTACAGCAACCATTTCAACT
TAATACATTTTAAATGAAAGATCAAAATTTGAGCTTTTAAGCCCAAGGGCTAATGGAACA
CTCCCAAGGCATTTTAGGGAATCTCTCACGGTCCTGACAATAATCGTATACGACAAGGTT
ACGTTGCACCCACGCATAGTCCATCTTCTGTGTCTTTGACAAGTGCCATGCGTCGTACTG
GTCCCACCAGTTCTCCGTTGTGGTGGAAACGCAAGCAGGGAACGGATCCTTCCAGCGGCA
GCCTTCGACGGCGAAGTCCTTGTAGGAAGAGACGAATGGAGCTTTCTTCCAGTCTGTCTT
CTCGAGACCACCACGTGTTGCCCAGTCGTCAGCGTTCCAGATGCTGGAGAACAAGTACAT
CGGCTTCTGGTTCGGGAAGAAATCGTTGTTCGGTACCTTATCGCTGTTCTTGTACACTCG
AATCGGTACTCTATCCACGAAGAACACGAGCTGGTGGTTATTCCAGAGAATGGAGTAGGT
GTGGTAGTCCTTGGTCGGGTCGAACCAGAGAGTATGTCGCATCTCCCGATTCCCGGTTCC
GTTTTTAAACACATTGGTCTGAATGATGTACGGCTCTCCGGTTCGGTTCCCAAGAAATTC
AAAATCTATCTCGTCTCTCTCCAGTCCGGCTCCATTCTCCGAACACATGTAGTAAGCGGT
AACGACGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D455JQ U 12
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AF RS1D121JQ U 49
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G
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DS 

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TGCGTCGTACTGGTCCCACCAGTTCTCCGTTGTGGTGGAAACGCAAGCAGGGAACGGATC
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CCAGTCTGTCTTCTCGAGACCACCACGTGTTGCCCAGTCGTCAGCGTTCCAGATGCTGGA
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AATGGAGTAGGTGTGGTAGTCCTTGGTCGGGTCGAACCAGAGAGTATGTCGCATCTCCCG
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GTAGTAAGCGGTA

QA 1 733 1 733
DS 



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TTTTGAATTCCTAGGGAACCGAACCGGAGAGCCGTACATCATTCAGACCAATGTGTTTAA
GAACGGAACCGGGAATCGGGAGATGCGACATACTCTCTGGTTCGACCCGACCAAGGACTA
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CATTGATTGTATCATCTGTTATTTGATTGATTATTTAGTCGGCTATGTCCCC


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 15 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 5 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 
35 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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G
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TTCGAAGAAAATTTCAATATAATGTGGTCTGAAAATCACTTCACGACTTCCGACGATGGA
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TTTGAATTCCTAGGGAACCGAACCGGAGAGCCGTACATCATTCAGACCAATGTGTTTAAG
AACAGAACCGGGAATCGGGAGATGCGACATACTCTCTGGTTCGACCCGAC

QA 2 531 2 531
DS 

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GTTCTTTTTCGTGGCGGCTCTAATGGCGTCTTCCTCAATCACAGCAACACCGACACCGTC
GTTCGAAGAAAATTTCAATATAATGTGGTCTGAAAATCACTTCACGACTTCCGACGATGG
ACAGATCTGGAATCTGGCCTTAGACAACGATACCGGATGTGGATTTCAGACAAAGCATAT
GTACAGATTTGGATGGTTCAGTATGAAGCTAAAGCTTGTCGGCGGCGACTCAGCCGGCGT
CGTTACCGCTTACTACATGTGTTCGGAGAATGGAGCCGGACCGGAGAGAGACGAGATAGA
TTTTGAATTTCTTGGGAACCGAACCGGAGAGCCGTACATCATTCAGACCAATGTGTTTAA
AAACGGAACCGGGAATCGGGAGATGCGACATACTCTCTGGTTCGACCCGACCAAGGACTA
CCACACCTACTCCATTCTCTG

QA 1 561 1 561
DS 

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GG
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CTGAGACGACACAATGGAGACGAGATGTTCTTCCATGGCGGCTGTGTTCTTTTTCGTGGC
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GGCCTTAGACAACGACACCGGATGTGGATTTCAGACAAAGCACATGTACAGATTTGGATG
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CCTGTGTTCGGAGAATGGAGCCGGACCGGAGAGAGACGAGATAGATTTTGAATTCCTAGG
GAACCGAACCGGAGAACCGTACATCATCCAGACCAATGTGTTTAAGAACGGAACCGGGAA
TCGGGAGATGCGACATACTCTCTGGTTCGACCCGACCAAGGACTACCACACTTACTCCAT
TCTCTGGAATAACCACCAGCTCGTGTTCTTCGTAGATAGAGTACCGATTCGAGTGTACAA
GAACAGCGATAAAGTACCGAACAACGACTTCT

QA 3 634 3 634
DS 

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G
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TTCTTTTTCGTGGCGGCTCTAATGGCGTCTTCCTCAATCACATCAACACCGACACCGTCG
TTCGAAGAAAATTTCAATATAATGTGGTCTGAAAATCACTTCACGACTTCCGACGATGGA
CAGATCTGGAATCTGGCCTTAGACAACGATACCGGATGTGGATTTCAGACAAAGCACATG
TACAGATTTGGATGGTTCAGTATGAAGCTAAAGCTTGTCGGCGGCGACTCAGCCGGCGTC
GTTACCGCTTACTACATGTGTTCGGAGAATGGAGCCGGACCGGAGATAGACGAGATAGAT
TTTGAATTCCTAGGGAACCGAACCGGAGAGCCGTACATCATTCAGACCAATGTGTTTAAG
AACGGAACCGGGAATCGGGAGATGCGACATACTCTCTGGTTCGACCCGACCAAGGACTAC
CACACCTACTCCATTCTCTGGAATAACCACCAGCTCGTGTTCTTCGTGGATAGAGTACCG
ATTCGAGTGTACAAGAACAGCGATAAG*TACCGAACAACGATTTCTTCCCGAACCAGAAG
CCGATGTACTTGTTCTC*AGCATCTGGAACGCTGACGACTGGGCAACACGTGGTGGTCTC

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TTCTTTTTCGTGGCGGCTCTAATGGCGTCTTCCTCAATCACAGCAACACCGACACCGTCG
TTCGAAGAAAATTTCAATATAATGTGGTCTGAAAATCACTTCACGACTTCCGACGATGGA
CAGATCTGGAATCTGGCCTTAGACAACGATACCGGATGTGGATTTCAGACAAAGCATATG
TACAGATTTGGATGGTTCAGTATGAAGCTAAAGCTTGTCGGCGGCGACTCAGCCGGCGTC
GTTACCGCTTACTACATGTGTTCGGAGAATGGAGCCGGACTGGAGAGAGACGAGATAGAT
TTTGAATTTCTTGGGAACCGAACCGGAGAGCCGTACATCATTCAGACCAATGTGTTTAAA
AACGGAACCGGGAATCGGGAGATGCGACATACTCTCTGGTTCGACCCGACCAAGGACTAC
CACACCTACTCCATTCTCTGGAATAACCACCAGCTCGTGTTCTTCGTGGATAGAGTACCG
ATTCGAGTGTACAAGAACAGCGATAAGGTACCGAACAACGATTTCTTCCCGAACCAGAAG
CCGATGTACTTGTTCTCCAGCATCTGGAACGCTGACGACTGGGCAACACGTGGTGGTCTC
GAGA*GACAGACTGGAAGAA*GCTCCATTCGTCTCTTCCTACA
GGACTT

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DS 

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TTCTTTTTCGTGGCGGCTCTAATGGCGTCTTCCTCAATCACAGCAACACCGACACCGTCG
TTCGAAGAAAATTTCAATATAATGTGGTCTGAAAATCACTTCACGACTTCCGACGATGGA
CAGATCTGGAATCTGGCCTTAGACAACGATACCGGATGTGGATTTCAGACAAAGCATATG
TACAGATTTGGATGGTTCAGTATGAAGCTAAAGCTTGTCGGCGGCGACTCAGCCGGCGTC
GTTACCGCTTACTACATGTGTTCGGAGAATGGAGCCGGACTGGAGAGAGACGAGATAGAT
TTTGAATTTCTTGGGAACCGAACCGGAGAGCCGTACATCATTCAGACCAATGTGTTTAAA
AACGGAACCGGGAATCGGGAGATGCGACATACTCTCTGGTTCGACCCGACCAAGGACTAC
CACACCTACTCCATTCTCTGGAATAACCACCAGCTCGTGTTCTTCGTGGATAGAGTACCG
ATTCGAGTGTACAAGAACAGCGATAAG*TACCGAACAACGATTTCTTCCCGAACCAGAAG
CCGATGTACTTGTTCTCCAGCATCTGGAACGCTGACGACTGGGCAACACGTGGTGGTCTC
GAGA
GACAGAC

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DS 

RD RS1CG85TF 749 0 0
GG
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GAGACGACACAATGGAGACGAGATGTTCTTCCATGGCGGCTGTGTTCTTTTTCGTGGCGG
CTCTAATGGCGTCTTCCTCAATCACAGCAACACCGACACCGTCGTTCGAAGAAAATTTCA
ATATAATGTGGTCTGAAAATCACTTCACGACTTCCGACGATGGACAGATCTGGAATCTGG
CCTTAGACAACGATACCGGATGTGGATTTCAGACAAAGCATATGTACAGATTTGGATGGT
TCAGTATGAAGCTAAAGCTTGTCGGCGGCGACTCAGCCGGCGTCGTTACCGCTTACTACA
TGTGTTCGGAGAATGGAGCCGGACCGGAGAGAGACGAGATAGATTTTGAATTTCTTGGGA
ACCGAACCGGAGAGCCGTACATCATTCAGACCAATGTGTTTAAAAACGGAACCGGGAATC
GGGAGATGCGACATACTCTCTGGTTCGACCCGACCAAGGACTACCACACCTACTCCATTC
TCTGGAATAACCACCAGCTCGTGTTCTTCGTGGATAGAGTACCGATTCGAGTGTACAAGA
ACAGCGATAAGGTACCGAACAACGATTTCTTCCCGAACCAGAAGCCGATGTACTTGTTCT
CCAGCATCTGGAACGCTGACGACTGGGCAACACGTGGTGGTCTCGAGAAGACAGACTGGA
AGAAAGCTCCATTCGTCTCTTCCTACA

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DS 

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A
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GCGACTCAGCCGGCGTCGTTACCGCTTACTACATGTGTTCGGAGAATGGAGCCGGACCGG
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AGACCAATGTGTTTAAGAACGGAACCGGGAATCGGGAGATGCGACATACTCTCTGGTTCG
ACCCGACCAAGGACTACCACACCTACTCCATTCTCTGGAATAACCACCAGCTCGTGTTCT
TCGTGGATAGAGTACCGATTCGAGTGTACAAGAACAGCGATAAGGTACCGAACAACGATT
TCTTCCCGAACCAGAAGCCGATGTACTTGTTCTCCAGCATCTGGAACGCTGACGACTGGG
CAACACGTGGTGGTCTCGAGAAGACAGACTGGAAGAAAACTCCATTCGTCTCTTCCTACA
AGGACTTCGCCGTCGAAGGCTGTCGTTGGAAGGATCCGTTCCCTGCTTGCGTTTCTACCA
CAACGGAGAACTGGTGGGACCAGTACGACGCATGGCACTTGTCAAAGACACAGAAGATGG
ACTATGCGTGGGTGCAACGTAACCTCGTCGTATACGATTATTGTCAGGACCGTGAGAGAT
TCCCTAAAATGCCTTGGGAGTGTTCCATTAGCCCTTGGGCTTAAGCTCAAATTTTGGTCT
TTCATTCAAATGTATTAAGTTGGAATGGTTGCTGTAATAATTTTGTACGTTTTTTCTTCT
TCTTCATTTCATTTCTCATTGATTGTATCATCTGTTATTTGATTGATTATTTAGTCGGC
C

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DS 

RD RS1EN06JQ 612 0 0
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TTCTTCGTGGATAGAGTACCGATTCGAGTGTACAAGAGCAGCGATAAGGTACCGAACAAC
GATTTCTTCCCGAACCAGAAGCCGATGTACTTGTTCTCCAGCATCTGGAACGCTGACGAC
TGGGCAACACGTGGTGGTCTCGAGAAGACAGACTGGAAGAAAGCTCCATTCGTCTCTTCC
TACAAGGACTTCGCCGTCGAAGGCTGTCGTTGGAAGGATCCGTTCCCTGCTTGCGTTTCT
ACCACAACGGAGAACTGGTGGGACCAGTACGACGCATGGCACTTGTTAAAGACACAGAAG
ATGGACTATGCGTGGGTGCAACGTAACCTCGTCGTATACGATTATTGTCAGGACCGTGAG
AGATTCCCTAAAATGCCTTGGGAGTGTTCCATTAGCCCTTGGGCTTAAGCTCAAATTTTG
GTCTTTCATTCAAATGTATTAAGTTGGAATGGTTGCTGTAATAATTTTGTACGTTTTTTC
TTCTTCTTCATTTCATTTCTCATTGATTGTATCATCTGTTATTTGATTGATTATTTGGTC
GGCTATGTCCCC

QA 1 612 1 612
DS 



AS 2 14

CO CL110Contig1 760 12 7 U
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GTGTTCTTCATGTGGAGGTTGAGGTGAAGTCTCCAGCAGAAAAGTTCTGGGTAGCACTCG
GTGACGGTATCAATCTCTTTCCCAAAGAGTTCCCTAAGGACTACAAAACAATGCAAGTTC
TTGCCGGAGATGGCAACTCTCCTGGTTCCATTCGCCTCATTATTTATGGAGAAGGATCCA
CGCTGGTGAAGGTCTCGGCGGAAAGAATCGAAGCAGTGGATCTGGAAAACAAAAGCATGA
CGTACAGCATCATCGGCGGTGAAATGTTGGAATACTATAAGACGTTCAAAGGAACCATCA
CCGTTACTCCCAAGGGCGGTGGCAGCATTTTGAAATGGTCTGCTGAGTTTGAGAAGACCG
GCCATGAGATTGAAGATCCACACGTCATCAAGGACTTTGCTGTCAAGAACTTCAAAGAGA
TCGATGAGTATCTCCTTAAGCAATCCAGCGTCTAAA*CTCTAGAAGCTTCTATTATATAT
TTATATATAAGGGGCTTCAATCATCTCTATCAGTTTATTGTTGTCTAATTAAGAAGTTAA
ATAAAGTGGAACCTCCTTATGAATAATTATGTTT******CCGAAGTCTGAGTATTGGAG
ATACACTACGTGTCTTTGAATATATGTATATGCATGATATCTAGGTAGTACATTTTATTA
ACACACGATTTAAACAATTCAAAAACGTTTTTTGTTGACG


BQ
50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 45 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 55 70 70 55 55 55 55 55 55 55 55 55 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 55 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 45 45 45 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FU30TF U 1
AF RS1B470JQ C 1
AF RS1CR93TF U 1
AF RS1CR93JQ C 1
AF RS1G884TF U 1
AF RS1B470TF U 1
AF RS1DM07TF U 2
AF RS1DM07JQ C 2
AF RS1G884JQ C 139
AF RS1EC16TF U 398
AF RS1D883JQ C 1
AF RS1D883TF U 1
BS 1 561 RS1CR93TF
BS 562 562 RS1FU30TF
BS 563 620 RS1CR93TF
BS 621 624 RS1B470TF
BS 625 626 RS1DM07TF
BS 627 724 RS1D883TF
BS 725 760 RS1D883JQ

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GTGACGGTATCAATCTCTTTCCCAAAGAGTTCCCTAAGGACTACAAAACAATGCAAGTTC
TTGCCGGAGATGGCAACTCTCCTGGTTCCATTCGCCTCATTATTTATGGAGAAGGATCCA
CGCTGGTGAAGGTCTCGGCGGAAAGAATCGAAGCAGTGGATCTGGAAAACAAAAGCATGA
CGTACAGCATCATCGGCGGTGAAATGTTGGAATACTATAAGACGTTCAAAGGAACCATCA
CCGTTACTCCCAAGGGCGGTGTCAGCATTTTGAAATGGTCTGCTGAGTTTGAGAAGACCG
GCCATGAGATTGAAGATCCACACGTCATCAAGGACTTTGCTGTCAAGAACTTCAAAGAGA
TCGATGAGTATCTCCTTAAGCAATCCAGCGTCTAAAACTCTAGAAGCTCCT*********
TTATATATAAGGGGGTTCGATCATCTCTATCA
TTTATT

QA 1 572 1 572
DS 

RD RS1B470JQ 624 0 0
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GTGTTCTTCATGTGGAGGTTGAGGTGAAGTCTCCAGCAGAAAAGTTCTGGGTAGCACTCG
GTGACGGTATCAATCTCTTTCCCAAAGAGTTCCCTAAGGACTACAAAACAATGCAAGTTC
TTGCCGGAGATGGCAACTCTCCTGGTTCCATTCGCCTCATTATTTATGGAGAAGGATCCA
CGCTGGTGAAGGTCTCGGCGGAAAGAATCGAAGCAGTGGATCTGGAAAACAAAAGCATGA
CGTACAGCTTCATCGGCGGTGAAATGTTGGAATACTATAAGACGTTCAAAGGAACCATCA
CCGTTACTCCCAAGGGCGGTGGCAGCATTTTGAAATGGTCTGCTGAGTTTGAGAAGACCG
GCCATGGGATTGAAGATCCACACGTCATCAAGGACTTTGCTGTCAAGAACTTCAAAGAGA
TCGATGAGTATCTCCTTAAGCAATCCAGCGTCTAAA*CTCTAGAAGCTTCTATTATATAT
TTATATATAAGGGGCTTCAATCATCTCTATCAGTTTATTGTTGTCTAATTAAGAAGTTAA
ATAAAGTGGAACCTCCTTATGAAT

QA 1 624 1 624
DS 

RD RS1CR93TF 628 0 0
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GTGTTCTTCATGTGGAGGTTGAGGTGAAGTCTCCAGCAGAAAAGTTCTGGGTAGCACTCG
GTGACGGTATCAATCTCTTTCCCAAAGAGTTCCCTAAGGACTACAAAACAATGCAAGTTC
TTGCCGGAGATGGCAACTCTCCTGGTTCCATTCGCCTCATTATTTATGGAGAAGGATCCA
CGCTGGTGAAGGTCTCGGCGGAAAGAATCGAAGCAGTGGATCTGGAAAACAAAAGCATGA
CGTACAGCATCATCGGCGGTGAAATGTTGGAATACTATAAGACGTTCAAAGGAACCATCA
CCGTTACTCCCAAGGGCGGTGGCAGCATTTTGAAATGGTCTGCTGAGTTTGAGAAGACCG
GCCATGAGATTGAAGATCCACACGTCATCAAGGACTTTGCTGTCAAGAACTTCAAAGAGA
TCGATGAGTATCTCCTTAAGCAATCCAGCGTCTAAA*CTCTAGAAGCTTCTATTATATAT
TTATATATAAGGGGCTTCAATTATCTCTATCAGTTTATTGTTGTCTAATTAAGAAGTTAA
ATAAAGTGGAACCTCCTTAT
AAAAAAAA

QA 1 620 1 620
DS 

RD RS1CR93JQ 620 0 0
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GTGTTCTTCATGTGGAGGTTGAGGTGAAGTCTCCAGCAGAAAAGTTCTGGGTAGCACTCG
GTGACGGTATCAATCTCTTTCCCAAAGAGTTCCCTAAGGACTACAAAACAATGCAAGTTC
TTGCCGGAGATGGCAACTCTCCTGGTTCCATTCGCCTCATTATTTATGGAGAAGGATCCA
CGCTGGTGAAGGTCTCGGCGGAAAGAATCGAAGCAGTGGATCTGGAAAACAAAAGCATGA
CGTACAGCATCATCGGCGGTGAAATGTTGGAATACTATAAGACGTTCAAAGGAACCATCA
CCGTTACTCCCAAGGGCGGTGGCAGCATTTTGAAATGGTCTGCTGAGTTTGAGAAGACCG
GCCATGAGATTGAAGATCCACACGTCATCAAGGACTTTGCTGTCAAGAACTTCAAAGAGA
TCGATGAGTATCTCCTTAAGCAATCCAGCGTCTAAA*CTCTAGAAGCTTCTATTATATAT
TTATATATAAGGGGCTTCAATTATCTCTATCAGTTTATTGTTGTCTAATTAAGAAGTTAA
ATAAAGTGGAACCTCCTTAT

QA 1 620 1 620
DS 

RD RS1G884TF 608 0 0
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GTGTTCTTCATGTGGAGGTTGAGGTGAAGTCTCCAGCAGAAAAGTTCTGGGTAGCACTCG
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TTGCCGGAGATGGCAACTCTCCTGGTTCCATTCGCCTCATTATTTATGGAGAAGGATCCA
CGCTGGTGAAGGTCTCGGCGGAAAGAATCGAAGCAGTGGATCTGGAAAACAAAAGCATGA
CGTACAGCATCATCGGCGGTGAAATGTTGGAATACTATAAGACGTTCAAAGGAACCATCA
CCGTTACTCCCAAGGGCGGTGGCAGCATTTTGAAATGGTCTGCTGAGTTTGAGAAGACCG
GCCATGAGATTGAAGATCCACACGTCATCAAGGACTTTGCTGTCAAGAACTTCAAAGAGA
TCGATGAGTATCTCCTTAAGCAATCCAGCGTCTAAA*CTCTAGAAGCTTCTATTATATAT
TTATATATAAGGGGCTTCAATCATCTCTATCAGTTTATTGTTGTCTAATTAAGAAGTTAA
ATAAAGTG

QA 1 608 1 608
DS 

RD RS1B470TF 624 0 0
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GTGTTCTTCATGTGGAGGTTGAGGTGAAGTCTCCAGCAGAAAAGTTCTGGGTAGCACTCG
GTGACGGTATCAATCTCTTTCCCAAAGAGTTCCCTAAGGACTACAAAACAATGCAAGTTC
TTGCCGGAGATGGCAACTCTCCTGGTTCCATTCGCCTCATTATTTATGGAGAAGGATCCA
CGCTGGTGAAGGTCTCGGCGGAAAGAATCGAAGCAGTGGATCTGGAAAACAAAAGCATGA
CGTACAGCTTCATCGGCGGTGAAATGTTGGAATACTATAAGACGTTCAAAGGAACCATCA
CCGTTACTCCCAAGGGCGGTGGCAGCATTTTGAAATGGTCTGCTGAGTTTGAGAAGACCG
GCCATGGGATTGAAGATCCACACGTCATCAAGGACTTTGCTGTCAAGAACTTCAAAGAGA
TCGATGAGTATCTCCTTAAGCAATCCAGCGTCTAAA*CTCTAGAAGCTTCTATTATATAT
TTATATATAAGGGGCTTCAATCATCTCTATCAGTTTATTGTTGTCTAATTAAGAAGTTAA
ATAAAGTGGAACCTCCTTATGAAT

QA 1 624 1 624
DS 

RD RS1DM07TF 627 0 0
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TGTTCTTCATGTGGAGGTTGAGGTGAAGTCTCCAGCAGAAAAGTTCTGGGTAGCACTCGG
TGACGGTATCAATCTCTTTCCCAAAGAGTTCCCTAAGGACTACAAAACAATGCAAGTTCT
TGCCGGAGATGGCAACTCTCCTGGTTCCATTCGCCTCATTATTTATGGAGAAGGATCCAC
GCTGGCGAAGGTCTCGGCGGAAAGAATCGAAGCAGTGGATCTGGAAAACAAAAGCATGAC
GTACAGCATCATCGGCGGTGAAATGTTGGAATACTATAAGACGTTCAAAGGAACCATCAC
CGTTACTCCCAAGGGCGGTGGCAGCATTTTGAAATGGTCTGCTGAGTTTGAGAAGACCGG
CCATGAGATTGAAGATCCACACGTCATCAAGGACTTTGCTGTCAAGAACTTCAAAGAGAT
CGATGAGTATCTCCTTAAGCAATCCAGCGTCTAAA*CTCTAGAAGCTTCTATTATATATT
TATATATAAGGGGCTTCAATCATCTCTATCAGTTTATTGTTGTCTAATTAAGAAGTTAAA
TAAAGTGGAACCTCCTTATGAATAA
AA

QA 1 625 1 625
DS 

RD RS1DM07JQ 620 0 0
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TGTTCTTCATGTGGAGGTTGAGGTGAAGTCTCCAGCAGAAAAGTTCTGGGTAGCACTCGG
TGACGGTATCAATCTCTTTCCCAAAGAGTTCCCTAAGGACTACAAAACAATGCAAGTTCT
TGCCGGAGATGGCAACTCTCCTGGTTCCATTCGCCTCATTATTTATGGAGAAGGATCCAC
GCTGGCGAAGGTCTCGGCGGAAAGAATCGAAGCAGTGGATCTGGAAAACAAAAGCATGAC
GTACAGCATCATCGGCGGTGAAATGTTGGAATACTATAAGACGTTCAAAGGAACCATCAC
CGTTACTCCCAAGGGCGGTGGCAGCATTTTGAAATGGTCTGCTGAGTTTGAGAAGACCGG
CCATGAGATTGAAGATCCACACGTCATCAAGGACTTTGCTGTCAAGAACTTCAAAGAGAT
CGATGAGTATCTCCTTAAGCAATCCAGCGTCTAAA*CTCTAGAAGCTTCTATTATATATT
TATATATAAGGGGCTTCAATCATCTCTATCAGTTTATTGTTGTCTAATTAAGAAGTTAAA
TAAAGTGGAACCTCCTTATG

QA 1 620 1 620
DS 

RD RS1G884JQ 501 0 0
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CTCCTGGTTCCATTCGCCTCATTATTTATGGAGAAGGATCCACGCTGGTGAAGGTCTCGG
CGGAAAGAATCGAAGCAGTGGATCTGGAAAACAAAAGCATGACGTACAGCATCATCGGCG
GTGAAATGTTGGAATACTATAAGACGTTCAAAGGAACCATCACCGTTACTCCCAAGGGCG
GTGGCAGCATTTTGAAATGGTCTGCTGAGTTTGAGAAGACCGGCCATGAGATTGAAGATC
CACACGTCATCAAGGACTTTGCTGTCAAGAACTTCAAAGAGATCGATGAGTATCTCCTTA
AGCAATCCAGCGTCTAAA*CTCTAGAAGCTTCTATTATATATTTATATATAAGGGGCTTC
AATCATCTCTATCAGTTTATTGTTGTCTAATTAAGAAGTTAAATAAAGTGGAACCTCCTT
ATGAATAATTATGTTT
ATGAG

QA 1 496 1 496
DS 

RD RS1EC16TF 281 0 0
GTCTGCTGAGTTTGAGAAGACCGGCCATGAGATTGAAGATCCACACGTCATCAAGGACTT
TGCTGTCAAGAACTTCAAAGAGATCGATGAGTATCTCCTTAAGCAATCCAGCGTCTAAA*
CTCTAGAGGCTTCTATTATATATTTATATATAAGGGGCTTCAATCATCTCTATCAGTTTA
TTGTTGTCTAATTAAGAAGTTAAATAAAGTGGAACCTCCTTATGAATAATTATGTTTATG
ATTCCGAAGTCTGAGTATTGGGGATACACTACGTGTCTTT
G

QA 1 280 1 280
DS 

RD RS1D883JQ 760 0 0
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GTGACGGTATCAATCTCTTTCCCAAAGAGTTCCCTAAGGACTACAAAACAATGCAAGTTC
TTGCCGGAGATGGCAACTCTCCTGGTTCCATTCGCCTCATTATTTATGGAGAAGGATCCA
CGCTGGTGAAGGTCTCGGCGGAAAGAATCGAAGCAGTGGATCTGGAAAACAAAAGCATGA
CGTACAGCATCATCGGCGGTGAAATGTTGGAATACTATAAGACGTTCAAAGGAACCATCA
CCGTTACTCCCAAGGGCGGTGGCAGCATTTTGAAATGGTTTGCTGAGTTTGAGAAGACCG
GCCATGAGATTGAAGATCCACACGTCATCAAGGACTTTGCTGTCAAGAACTTCAAAGAGA
TCGATGAGTATCTCCTTAAGCAATCCAGCGTCTAAA*CTCTAGAAGCTTCTATTATATAT
TTATATATAAGGGGCTTCAATCATCTCTATCAGTTTATTGTTGTCTAATTAAGAAGTTAA
ATAAAGTGGAACCTCCTTATGAATAATTATGTTT******CCGAAGTCTGAGTATTGGAG
ATACACTACGTGTCTTTGAATATATGTATATGCATGATATCTAGGTAGTACATTTTATTA
ACACACGATTTAAACAATTCAAAAACGTTTTTTGTTGACG

QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1D883TF 724 0 0
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GTGTTCTTCATGTGGAGGTTGAGGTGAAGTCTCCAGCAGAAAAGTTCTGGGTAGCACTCG
GTGACGGTATCAATCTCTTTCCCAAAGAGTTCCCTAAGGACTACAAAACAATGCAAGTTC
TTGCCGGAGATGGCAACTCTCCTGGTTCCATTCGCCTCATTATTTATGGAGAAGGATCCA
CGCTGGTGAAGGTCTCGGCGGAAAGAATCGAAGCAGTGGATCTGGAAAACAAAAGCATGA
CGTACAGCATCATCGGCGGTGAAATGTTGGAATACTATAAGACGTTCAAAGGAACCATCA
CCGTTACTCCCAAGGGCGGTGGCAGCATTTTGAAATGGTCTGCTGAGTTTGAGAAGACCG
GCCATGAGATTGAAGATCCACACGTCATCAAGGACTTTGCTGTCAAGAACTTCAAAGAGA
TCGATGAGTATCTCCTTAAGCAATCCAGCGTCTAAA*CTCTAGAAGCTTCTATTATATAT
TTATATATAAGGGGCTTCAATCATCTCTATCAGTTTATTGTTGTCTAATTAAGAAGTTAA
ATAAAGTGGAACCTCCTTATGAATAATTATGTTT******CCGAAGTCTGAGTATTGGAG
ATACACTACGTGTCTTTGAATATATGTATATGCATGATATCTAGGTAGTACATTTTATTA
ACAC

QA 1 724 1 724
DS 



CO CL110Contig2 379 2 2 U
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ATCATAAACATGATTATTCATAAGGAGGTTCCACTTTATTTAACTTCTTAATTAGACAAC
AATAAACTGATAGAGATGATCGAACCCCCTTATATATAATAGGAGCTTCTAGAGTTTTAG
ACGCCGGATTGCTTAAGGAGATACTCATCGATCTCTTTGAAGTTCTTGACAGCAAAGTCC
TTGATGACGTGTGGATCTTCAATCTCATGGCCGGTCTTCTCAAACTCAGCAGACCATTTC
AAAATGCTGCCACCGCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FU30JQ U 1
AF RS1AQ46TFB C 139
BS 1 317 RS1FU30JQ
BS 318 379 RS1AQ46TFB

RD RS1FU30JQ 317 0 0
GTCAACAGAAAACGTTGTTGAATTGTTTAAATCGTGTGTTAATAAAATGTACTACCTAGA
TATCATGCATATACGTATATTGAAAGACACGTAGCGTATCTCCAATACTCAGATTTCGGA
ATCATAAACATGATTATTCATAAGGAGGTTCCACTTTATTTAACTTCTTAATTAGACAAC
AATAAACTGATAGAGATGATCGAACCCCCTTATATATAATAGGAGCTTCTAGAGTTTTAG
ACGCCGGATTGCTTAAGGAGATACTCATCGATCTCTTTGAAGTTCTTGACAGCAAAGTCC
TTGATGACGTGTGGATC

QA 1 317 1 317
DS 

RD RS1AQ46TFB 241 0 0
CATAAGGAGGTTCCACTTTATTTAACTTCTTAATTAGACAACAATAAACTGATAGAGATG
ATCGAACCCCCTTATATATAATAGGAGCTTCTAGAGTTTTAGACGCTGGATTGCTTAAGG
AGATACTCATCGATCTCTTTGAAGTTCTTGACAGCAAAGTCCTTGATGACGTGTGGATCT
TCAATCTCATGGCCGGTCTTCTCAAACTCAGCAGACCATTTCAAAATGCTGCCACCGCCC
C

QA 1 241 1 241
DS 



AS 3 14

CO CL111Contig1 457 4 8 U
GTTTTACTTGGTGAAAATCACTTTCGCACCAAAATTTCAGTATGATCTTTTTCGTACTTA
ACAAGAGAAATGATTTTATCCAGCCAAGGACTGACCATGCTTGACTCTATAGTCCACGAA
AACTCGAACCATCTGCACTGTTAGTACATGGACAATCCTTGGAAATACTGGAAGGATTCA
AAGACTGTCCAGACTTGAAGATATCTAGTCCACGAGTCATCAGTACTACTAACAGTACTT
CATCCGGGAAGGATTTAATCCAGCAAAAAGACTGGTTTATCGATCCAACAGACGGACAGT
CTATGAAAACTCTAGCAAACAGATAGTCCGAATCAACCGGGAAGAATAACAAATTTCATG
GACCAGACTGACATACTGATGCCCACGACTGGGTGTACTGATGGGACCATCAGGTTGTGA
AAATACCCCGTAGACTGTCGTGCACGTCCGTGAAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RS1BS37JQ C 1
AF RS1CC04JQ C 237
AF RS1CC04TF U 237
AF RS1BS37TF U 48
BS 1 49 RS1BS37JQ
BS 50 237 RS1BS37TF
BS 238 263 RS1CC04TF
BS 264 264 RS1BS37TF
BS 265 270 RS1CC04TF
BS 271 271 RS1BS37TF
BS 272 455 RS1CC04TF
BS 456 457 RS1BS37JQ

RD RS1BS37JQ 457 0 0
GTTTTACTTGGTGAAAATCACTTTCGCACCAAAATTTCAGTATGATCTTTTTCGTACTTA
ACAAGAGAAATGATTTTATCCAGCCAAGGACTGACCATGCTTGACTCTATAGTCCACGAA
AACTCGAACCATCTGCACTGTTAGTACATGGACAATCCTTGGAAATACTGGAAGGATTCA
AAGACTGTCCAGACTTGAAGATATTTAGTCCACGAGTCATCAGTACTACTAACAGTACTT
CATCCGGGAAGGATTTAATCCAGCAAAAAGACTGGTTTATCGATCCAACAGACGGACAGT
CTATGAAAACTCTAGCAAACAGATAGTCCGAATCAACCGGGAAGAATAACAAATTTCATG
GACCAGACTGACATACTGATGCCCACGACTGGGTGTACTGATGGGACCATCAGGTTGTGA
AAATACCCCGTAGACTGTCGTGCACGTCCGTGAAGGC

QA 1 457 1 457
DS 

RD RS1CC04JQ 221 0 0
G
CTTCATCCGGGAAGGATTTAATCCAGTAAAAAGGCTGGTTTATCGATCCAACAGACGGAC
AGTCTATGAAAACTCTAGCAAACAGATAGTCCGAATCAACCGGGAAGAATAACAAATTTC
ATGGACCAGACTGACATACTGATGCCCACGACTGGGTGTACTGATGGGACCATCAGGTTG
TGAAAATACCCCGTAGACTGTCGTGCACGTCCGTGAAG
AC

QA 2 219 2 219
DS 

RD RS1CC04TF 221 0 0
G
CTTCATCCGGGAAGGATTTAATCCAGTAAAAAGGCTGGTTTATCGATCCAACAGACGGAC
AGTCTATGAAAACTCTAGCAAACAGATAGTCCGAATCAACCGGGAAGAATAACAAATTTC
ATGGACCAGACTGACATACTGATGCCCACGACTGGGTGTACTGATGGGACCATCAGGTTG
TGAAAATACCCCGTAGACTGTCGTGCACGTCCGTGAAG
AC

QA 2 219 2 219
DS 

RD RS1BS37TF 410 0 0
TT
TTTCGTACTTAACAAGAGAAATGATTTTATCCAGCCAAGGACTGACCATGCTTGACTCTA
TAGTCCACGAAAACTCGAACCATCTGCACTGTTAGTACATGGACAATCCTTGGAAATACT
GGAAGGATTCAAAGACTGTCCAGACTTGAAGATATCTAGTCCACGAGTCATCAGTACTAC
TAACAGTACTTCATCCGGGAAGGATTTAATCCAGCAAAAAGACTGGTTTATCGATCCAAC
AGACGGACAGTCTATGAAAACTCTAGCAAACAGATAGTCCGAATCAACCGGGAAGAATAA
CAAATTTCATGGACCAGACTGACATACTGATGCCCACGACTGGGTGTACTGATGGGACCA
TCAGGTTGTGAAAATACCCCGTAGACTGTCGTGCACGTCCGTGAAG
GC

QA 3 408 3 408
DS 



CO CL111Contig2 707 2 4 U
GGCCGTTCGGACCGCCTTGAATTATAATTACCACCGAGCGGCGGGTAGAATCCTTTGCAG
ACGACTTAAATACGCGACGGGGTATTGTAAGTGGCAGAGTGGCCTTGCTGCTACGATCCA
CTGAGATTCAGCCCTTTGTCGCTAAGATTCGACCCTCCCCCCTTTCCATTCATATGTTCC
TCCCCAAAACGTCAAAAACAAAGAACCCAAAAAAAATTCTAAGTTTATAAGAAAACGTTG
TGCGAGGTTCCAGTTTTTTACTTGGTGAAAATCACTCTCGCACCAAAATTTCAGTATGAT
CTTTCGTACTTAACAAGAGAAATGATTTTATCCAGCCAAGGACTGACCATGCTTGACTCT
ATAGTCCACGAAAACTCGAACCATCTGCACTAATAGTACATGGACAATCCTTGGAAATAC
CGGAAGGATTCAAAGACTGTCCAGACTTGAAGATATCTAGTCCACGAGTCATCAGTACTA
CTAACAGTACTTCATCCGGGAAGGATTTAATCCAGCAAAAAGACTGGTTTATCGATCCAA
CAGACGGACAGTCTATGAAAACTCTAGCAAACAGATAGTCCGAATCAACCAGGAAGAATA
AAAAATTATGGACCAGACTGACATACTGATGCCCACGGCTGGGTGTACTGATGGGACATT
CAGGGTGTGAAAATACCCCGCAGACTGTCGTGAACATCCGTGAAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
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20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1F363TF U 1
AF RS1F363JQ C 146
BS 1 664 RS1F363TF
BS 665 665 RS1F363JQ
BS 666 705 RS1F363TF
BS 706 707 RS1F363JQ

RD RS1F363TF 706 0 0
GGCCGTTCGGACCGCCTTGAATTATAATTACCACCGAGCGGCGGGTAGAATCCTTTGCAG
ACGACTTAAATACGCGACGGGGTATTGTAAGTGGCAGAGTGGCCTTGCTGCTACGATCCA
CTGAGATTCAGCCCTTTGTCGCTAAGATTCGACCCTCCCCCCTTTCCATTCATATGTTCC
TCCCCAAAACGTCAAAAACAAAGAACCCAAAAAAAATTCTAAGTTTATAAGAAAACGTTG
TGCGAGGTTCCAGTTTTTTACTTGGTGAAAATCACTCTCGCACCAAAATTTCAGTATGAT
CTTTCGTACTTAACAAGAGAAATGATTTTATCCAGCCAAGGACTGACCATGCTTGACTCT
ATAGTCCACGAAAACTCGAACCATCTGCACTAATAGTACATGGACAATCCTTGGAAATAC
CGGAAGGATTCAAAGACTGTCCAGACTTGAAGATATCTAGTCCACGAGTCATCAGTACTA
CTAACAGTACTTCATCCGGGAAGGATTTAATCCAGCAAAAAGACTGGTTTATCGATCCAA
CAGACGGACAGTCTATGAAAACTCTAGCAAACAGATAGTCCGAATCAACCAGGAAGAATA
AAAAATTATGGACCAGACTGACATACTGATGCCCACGGCTGGGTGTACTGATGGGACATT
CAGG*TGTGAAAATACCCCGCAGACTGTCGTGAACATCCGTGAAG
C

QA 1 705 1 705
DS 

RD RS1F363JQ 562 0 0
GATTCGACCCTCCCCCCTTTCCATTCATATGTTCCTCCCCAAAACGTCAAAAACAAAGAA
CCCAAAAAAAATTCTAAGTTTATAAGAAAACGTTGTGCGAGGTTCCAGTTTTTTACTTGG
TGAAAATCACTCTCGCACCAAAATTTCAGTATGATCTTTCGTACTTAACAAGAGAAATGA
TTTTATCCAGCCAAGGACTGACCATGCTTGACTTTATAGTCCACGAAAACTCGAACCATT
TGCACTAATAGTACATGGACAATCCTTGGAAATACCGGAAGGATTCAAAGACTGTCCAGA
CTTGAAGATATTTAGTCCACGAGTCATCAGTACTACTAACAGTACTTCATCCGGGAAGGA
TTTAATCCAGCAAAAAGACTGGTTTATCGATCCAACAGACGGACAGTTTATGAAAACTTT
AGCAAACAGATAGTCCGAATCAACCAGGAAGAATAAAAAATTATGGACCAGACTGACATA
CTGATGCCCACGGCTGGGTGTACTGATGGGACATTCAGGGTGTGAAAATACCCCGCAGAC
TGTCGTGAACATCCGTGAAGGC

QA 1 562 1 562
DS 



CO CL111Contig3 1412 8 12 U
GAACAACCCCTTCTTTTAGATCCAAGGCTTGCTTCGGCAGGTCGATCCGGGCGGAGGACA
TTGTCAGGTGGGGAGTTTGGCTGGGGCGGCACATCTGTTAAAAGATAACGCAGGTGTCCT
AAGATGAGCTCAACGAGAACAGAAATCTCGTGTGGAACAAAAGGGTAAAAGCTCGTTTGA
TTCTGATTTTCAGTACGAATACGAACCGTGAAAGCGTGGCCTATCGATCCTTTAGACCTT
CGGAATTTGAAGCTAGAGGTGTCAGAAAAGTTACCACAGGGATAACTGGCTTGTGGCAGC
CAAGCGTTCATAGCGACGTTGCTTTTTGATCCTTCGATGTCGGCTCTTCCTATCATTGTG
AAGCAGAATTCACCAAGTGTTGGATTGTTCACCCACCAATAGGGAACGTGAGCTGGGGTT
AGACCGTCGTGAGACAGGTTAGTTTTACCCTACTGATGCCCGCGTCGCGATAGTAATTCA
ACCTAGTACGAGAGGAACCGTTGATTCGCACAATTGGTCATCGCGCTTGGTTGAAAAGCC
AGTGGCGCGAAGCTACCGTGCGCTGGATTATGACTGAACGCCTCTAAGTCAGAATCCGGG
CTAGAAGCGACGCATGCGCCCGCCGCCCGATTGCCGACCCTCAGTAGGAGCTTCGGCTCC
CAAAGGCACGTGTCGTTGGCTAAGTCCGTTCGGTGGAAGCGCCGTTCGGACCGCCTTGAA
TTATAATTACCACCGAGCGGCGGGTAGAATCCTTTGCAGACGACTTAAATACGCGACGGG
GTATTGTAAGTGGCAGAGTGGCCTTGCTGCCACGATCCACTGAGATTCAGCCCTTTGTCG
CTAAGATTCGACCCTCCCCCCTTTCCATTCATTGTTCCTCCCCAAAACGTCAAAAACAAA
AAACCCAAAAAAAAATTCTAAGTTTATAAGAAAATGTTGTGCGAGGTTCCAGTTTTTTAC
TTGGTGAAAATCACTCTCGCACCAAAATTTCAGTATGATCTTTCGTACTTAACGAGAAAA
ATGATTTTATCCAGCCAAGGGACTGTCCATGCTTGACTCTAGTCCACGAAAACTCGAACC
ATCAGCACTGTCAGTACATGGACAATCCTTGGAAATACCAGAAGGATTCAATCCATCCAA
AGACTATCCAGACTTGAAGATATCTAGTCCACGAGCCATCAGTACTACTAACAGTACTTC
ATCCGGG*AAGAATTCAATCCAGCAAAAAGACTGGTTTATCGATCCAACAGACGGACAGT
CTATGAAAACTCTAGCAAACAGATAGTCTAAATCAACCGGGAAGAAAAACAATTTCATGG
AGCAGACTCACATACTGATGCCCACGGATGTGTGTACTGACAGGAGGGTGTGAAAATACC
CCGTAGACTGTGTCCTGAACGTTCGTGAAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1H262TF U 1
AF RS1GF57JQ C 338
AF RS1H262JQB C 470
AF RS1GF57TF U 338
AF RS1AN70TF U 568
AF RS1AN70JQ C 873
AF RS1EB46TF U 821
AF RS1EB46JQ C 845
BS 1 417 RS1H262TF
BS 418 418 RS1GF57TF
BS 419 583 RS1H262TF
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BS 843 893 RS1AN70TF
BS 894 894 RS1EB46TF
BS 895 1207 RS1AN70TF
BS 1208 1208 RS1EB46TF
BS 1209 1212 RS1AN70TF
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BS 1214 1359 RS1AN70TF
BS 1360 1412 RS1EB46TF

RD RS1H262TF 587 0 0
GAACAACCCCTTCTTTTAGATCCAAGGCTTGCTTCGGCAGGTCGATCCGGGCGGAGGACA
TTGTCAGGTGGGGAGTTTGGCTGGGGCGGCACATCTGTTAAAAGATAACGCAGGTGTCCT
AAGATGAGCTCAACGAGAACAGAAATCTCGTGTGGAACAAAAGGGTAAAAGCTCGTTTGA
TTCTGATTTTCAGTACGAATACGAACCGTGAAAGCGTGGCCTATCGATCCTTTAGACCTT
CGGAATTTGAAGCTAGAGGTGTCAGAAAAGTTACCACAGGGATAACTGGCTTGTGGCAGC
CAAGCGTTCATAGCGACGTTGCTTTTTGATCCTTCGATGTCGGCTCTTCCTATCATTGTG
AAGCAGAATTCACCAAGTGTTGGATTGTTCACCCACCAATAGGGAACGTGAGCTGGGTTT
AGACCGTCGTGAGACAGGTTAGTTTTACCCTACTGATGCCCGCGTCGCGATAGTAATTCA
ACCTAGTACGAGAGGAACCGTTGATTCGCACAATTGGTCATCGCGCTTGGTTGAAAAGCC
AGTGGCGCGAAGCTACCGTGCGCTGGATTATGACTGAACGCCT
CTAA

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DS 

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G
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CCCGCGTCGCGATAGTAATTCAACCTAGTACGAGAGGAACCGTTGATTCGCACAATTGGT
CATCGCTCTTGGTTGAAAAGCCAGTGGCGCGAAGCTACCGTGCGCTGGATTATGACTGAA
CGCCTCTAAGTCAGAATCCGGGCTAGAAGCGACGCATGCGCCCGCCGCCCGATTGCCGAC
CCTCAGTAGGAGCTTCGGCTCCCAAAGGCACGTGTCGTTGGCTAAGTCCGTTCGGTGGAA
GCGCCGTTCGGACCGCCTTGAATTATAATTACCACCGAGCGGCGGGTAGAATCCTTTGCA
GACGACTTAAATACGCGACGGGGTATTGTAAGTGGCAGAGTGGCCTTGCTGCCACGATCC
ACTGAGATTCAGCCCTTTGTCGCTAAGATTCG

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DS 

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GTTGAAAAGCCAGTGGCGCGAAGCTACCGTGCGCTGGATTATGACTGAACGCCTTTAAGT
CAGAATCCGGGCTAGAAGGGACGCATGCGCCCGCCGCCCGATTGCCGACCCTCAGTAGGA
GCTTCGGCTCCCAAAGGCACGTTTCGTTGGCTAAGTCCGTTCGGTGGAAGCGCCGTTCGG
ACCGCCTTGAATTATAATTACCACCGAGCGGCGGGTAGAATCCTTTGCAGACGACTTAAA
TACGCGACGGGGTATTGTAAGTGGCAGAGTGGCCTTGCTGCCACGATCCACTGAGATTCA
GCCCTTTGTCGCTAAGATTCG

QA 1 381 1 381
DS 

RD RS1GF57TF 505 0 0
G
GTCGGCTCTTCCTATCATTGTGAAGCAGAATTCACCAAGTGTTGGATTGTTCACCCACCA
ATAGGGAACGTGAGCTGGGGTTAGACCGTCGTGAGACAGGTTAGTTTTACCCTACTGATG
CCCGCGTCGCGATAGTAATTCAACCTAGTACGAGAGGAACCGTTGATTCGCACAATTGGT
CATCGCTCTTGGTTGAAAAGCCAGTGGCGCGAAGCTACCGTGCGCTGGATTATGACTGAA
CGCCTCTAAGTCAGAATCCGGGCTAGAAGCGACGCATGCGCCCGCCGCCCGATTGCCGAC
CCTCAGTAGGAGCTTCGGCTCCCAAAGGCACGTGTCGTTGGCTAAGTCCGTTCGGTGGAA
GCGCCGTTCGGACCGCCTTGAATTATAATTACCACCGAGCGGCGGGTAGAATCCTTTGCA
GACGACTTAAATACGCGACGGGGTATTGTAAGTGGCAGAGTGGCCTTGCTGCCACGATCC
ACTGAGATTCAGCCCTTTGTCGCT

QA 2 505 2 505
DS 

RD RS1AN70TF 792 0 0
G
TATGACTGAACGCCTCTAAGTCAGAATCCGGGCTAGAAGCGACGCATGCGCCCGCCGCCC
GATAGCCGACCCTCAGTAGGAGCTTCGGCTCCCAAAGGCACGTGTCGTTGGCTAAGTCCG
TTCGGTGGAAGCGCCGTTCGGACCGCCTTGAATTATAATTACCACCGAGCGGCGGGTAGA
ATCCTTTGCAGACGACTTAAATACGCGACGGGGTATTGTAAGTGGCAGAGTGGCCTTGCT
GCCACGATCCACTGAGATTCAGCCCTTTGTCGCTAAGATTCGACCCTCCCCCCTTTCCAT
TCATTGTTCCTCCCCAAAACGTCAAGAACAAAAAACCCAAAAAAAAATTCTAAGTTTATA
AGAAAATGTTGTGCGAGGTTCCAGTTTTTTACTTGGTGAAAATCACTCTCGCACCAAAAT
TTCAGTATGATCTTTCGTACTTAACGAGAAAAATGATTTTATCCAGCCAAGGGACTGTCC
ATGCTTGACTCTAGTCCACGAAAACTCGAACCATCAGCACTGTCAGTACATGGACAATCC
TTGGAAATACCAGAAGGATTCAATCCATCCAAAGACTATCCAGACTTGAAGATATCTAGT
CCACGAGCCATCAGTACTACTAACAGTACTTCATCCGGGGAAGAGTTCAATCCAGCAAAA
AGACTGGTTTATCGATCCAACAGACGGACAGTCTATGAAAACTCTAGCAAACAGATAGTC
TAAATCAACCGGGAAGAAAAACAATTTCATGGAGCAGACTCACATACTGATGCCCACGGA
TGTGTGTACTG

QA 2 792 2 792
DS 

RD RS1AN70JQ 486 0 0
TGTTCCTCCCCAAAACGTCAAGAACAAAAAACCCAAAAAAAAATTCTAAGTTTATAAGAA
AATGTTGTGCGAGGTTCCAGTTTTTTACTTGGTGAAAATCACTCTCGCACCAAAATTTCA
GTATGATCTTTCGTACTTAACGAGAAAAATGATTTTATCCAGCCAAGGGACTGTCCATGC
TTGACTTTAGTCCACGAAAACTCGAACCATCAGCACTGTCAGTACATGGACAATCCTTGG
AAATACCAGAAGGATTCAATCCATCCAAAGACTATCCAGACTTGAAGATATCTAGTCCAC
GAGCCATCAGTACTACTAACAGTACTTCATCCGGG*AAGAGTTCAATCCAGCAAAAAGAC
TGGTTTATCGATCCAACAGACGGACAGTCTATGAAAACTCTAGCAAACAGATAGTCTAAA
TCAACCGGGAAGAAAAACAATTTCATGGAGCAGACTCACATACTGATGCCCACGGATGTG
TGTACT

QA 1 486 1 486
DS 

RD RS1EB46TF 592 0 0
G
GAGATTCAGCCCTTTGTCGCTAAGATTCGACCCTCCCCCCTTTCCATTCATTGTTCCTCC
CCAAAACGTCAAAAACAAAAAACCCAAGAAAAA*TTCTAAGTTTATAAGAAAATGTTGTG
CGAGGTTCCAGTTTTTTACTTGGTGAAAATCACTCTCGCACCAAAATTTCAGTATGATCT
TTCGTACTTAACGAGAAAAATGATTTTATCCAGCCAAGGGACTGTCCATGCTTGACTCTA
GTCCACGAAAACTCGAACCATCAGCACTGTCAGTACATGGACAATCCTTGGAAATACCAG
AAGGATTCAATCCATCCAAAGACTATCCAGACTTGAAGATATCTAGTCCACGAGCCATCA
GTACTACTAACAGTACTTCATCCGGG*AAGAATTCAATCCAGCAAAAAGACTGGTTTATC
GATCCAACAGACGGACAGTCTATGAAAACTCTAGCAAACAGATAGTCTAAATCAACCGGG
AAGAAAAACAATTTCATGGAGCAGACTCACATACTGATGCCCACGGATGTGTGTACTGAC
AGGAGGGTGTGAAAATACCCCGTAGACTGTGTCCTGAACGTTCGTGAAGGC

QA 2 592 2 592
DS 

RD RS1EB46JQ 568 0 0
GATTCGACCCTCCCCCCTTTCCATTCATTGTTCCTCCCCAAAACGTCAAAAACAAAAAAC
CCAAGAAAAA*TTCTAAGTTTATAAGAAAATGTTGTGCGAGGTTCCAGTTTTTTACTTGG
TGAAAATCACTCTCGCACCAAAATTTCAGTATGATCTTTCGTACTTAACGAGAAAAATGA
TTTTATCCAGCCAAGGGACTGTCCATGCTTGACTTTAGTCCACGAAAACTCGAACCATCA
GCACTGTCAGTACATGGACAATCCTTGGAAATACCAGAAGGATTCAATCCATCCAAAGAC
TATCCAGACTTGAAGATATTTAGTCCACGAGCCATCAGTACTACTAACAGTACTTCATCC
GGG*AAGAATTCAATCCAGCAAAAAGACTGGTTTATCGATCCAACAGACGGACAGTCTAT
GAAAACTCTAGCAAACAGATAGTTTAAATCAACCGGGAAGAAAAACAATTTCATGGAGCA
GACTCACATACTGATGCCCACGGATGTGTGTACTGACAGGAGGGTGTGAAAATACCCCGT
AGACTGTGTCCTGAACGTTCGTGAAGGC

QA 1 568 1 568
DS 



AS 1 13

CO CL112Contig1 828 13 18 U
GGGGACAACCATCCGATCTGAGAATATGAGCGAAGAACTCGTTCAACACGAATCTCATTC
TCAGCAATCGATATTTAGCCGTTTCTTCAAAATGTTCTCTTTTATTTTCCCATTGCTGAA
CGTTATAAAGATTATTATAGCTTCCGTGACCTCCTTAGTCTTCTTAGCCCTTTCTTGCGT
AACACTCGGTGGTTCAGCCGTGGCATTAATCGTATCCGCACCACTTTTCATCATATTTAG
TCCAATTCTCGTACCCGCCACTATTACCACTACCCTCCTAGCCAGTGGGCTCATGGCCGG
TACCACCCTCGGACTGACCGGCATAGGTCTCATCACGGGGCTCTTTAGGACTGCAGGAGA
AGTCACATTGGCCTCAAACCCGTTACGAAGAATTATAATAAATAGAATTAAAGCAAGACT
TGGGGGTGGCGGTGGCGGCGGTTCACGTTTGGCAATTCTCAAAAAAATTCTGGGACTCGT
TAATAAATATCGTAGCATGGCTTCAGGTGGAGCTGCAGCAGCACCAGCAGCTGCACCTGC
AGCTGAAGCAGCACCAGCAGCAGATCCAGCAGCGGCACCAGCGGCTGCACCTGCACCCAC
CTGATAAAAAA*CGTTGGTTTATACTGTTTCAATATGTAACATATATAAATCATGTAATA
ATTAACTTAAGAATTTATGATACGGAAACTAAAAATAAAATAGCCTTTTTACTAAGCTTT
ATACATTATATTTTTCTATGTAACAATGTTTAATTTGCTTATAATTATAAAAGACGGATA
CATAGTTGACTAGAAAATAATGTTAACTATCTATTGTCCATGCGCTTC


BQ
10 10 35 20 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 
60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 40 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 50 65 65 65 60 60 60 40 40 40 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 40 25 55 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DZ49TF U 2
AF RS1BF86JQ C 3
AF RS1BF86TF U 3
AF RS1DM58TF U 3
AF RS1DO78TF U 1
AF RS1BY05TF U 1
AF RS1DO78JQ C 3
AF RS1DM58JQ C 24
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BS 1 3 RS1DO78TF
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BS 601 687 RS1DO78TF
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BS 710 710 RS1BY05TF
BS 711 730 RS1DO78TF
BS 731 772 RS1BY05TF
BS 773 812 RS1AP47TFB
BS 813 828 RS1AZ21TF

RD RS1DZ49TF 359 0 0
GGA
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CAATCGATATTTAGCCGTTTCTTCAAAATGTTCTCTTTTATTTTCCCATTGCTGAACGTT
ATAAAGATTATTATAGCTTCCGTGACCTCCTTAGTCTTCTTAGCCCTTTCTTGCGTAACA
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ATTCTCGTACCCGCCACTATTACCACTACCCTCCTAGCCAGTGGGCTCATGGCCGGTACC
ACCCTCGGACTGACCGGCATAGGTCTCATCACGGGGCTCTTTAGGACTGCAGGAGA

QA 4 359 4 359
DS 

RD RS1BF86JQ 689 0 0
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AGCAATCGATATTTAGCCGTTTCTTCAAAATGTTCTCTTTTATTTTCCCATTGCTGAACG
TTATAAAGATTATTATAGCTTCCGTGACCTCCTTAGTCTTCTTAGCCCTTTCTTGCGTAA
CACTCGGTGGTTCAGCCGTGGCATTAATCGTATCCGCACCACTTTTCATCATATTTAGTC
CAATTCTCGTACCCGCCACTATTACCACTACCCTCCTAGCCATTGGGCTCATGGCCGGTA
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TCACATTGGCCTCAAACCCGTTACGAAGAATTATAATAAATAGAATTAAAGCAAGACTTG
GGGGTGGCGGTGGCGGCGGTTCACGTTTGGCAATTCTCAAAAAAATTCTGGGACTCGTTA
ATAAATATCGTAGCATGGCTTCAGGTGGAGCTGCAGCAGCACCAGCAGCTGCACCCGCAG
CTGAAGCAGCACCAGCAGCAGATCCAGCAGCGGCACCATCGGCTGCACCTGCACCCCCCT
GATAAAAAA*CGTTGGTTTATACTGTTTCAATATGTAACATATATAAATCAT*TAATAAT
TAACTTAAGAATTTATGATACGGAAACTA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1BF86TF 700 0 0
GGACAACCATCCGATCTGAGAATATGAGCGAAGAACTCGTTCAACACGAATCTCATTCTC
AGCAATCGATATTTAGCCGTTTCTTCAAAATGTTCTCTTTTATTTTCCCATTGCTGAACG
TTATAAAGATTATTATAGCTTCCGTGACCTCCTTAGTCTTCTTAGCCCTTTCTTGCGTAA
CACTCGGTGGTTCAGCCGTGGCATTAATCGTATCCGCACCACTTTTCATCATATTTAGTC
CAATTCTCGTACCCGCCACTATTACCACTACCCTCCTAGCCATTGGGCTCATGGCCGGTA
CCACCCTCGGACTGACCGGCATAGGTCTCATCACGGGGCTCTTTAGGACTGCAGGAGAAG
TCACATTGGCCTCAAACCCGTTACGAAGAATTATAATAAATAGAATTAAAGCAAGACTTG
GGGGTGGCGGTGGCGGCGGTTCACGTTTGGCAATTCTCAAAAAAATTCTGGGACTCGTTA
ATAAATATCGTAGCATGGCTTCAGGTGGAGCTGCAGCAGCACCAGCAGCTGCACCCGCAG
CTGAAGCAGCACCAGCAGCAGATCCAGCAGCGGCACCATCGGCTGCACCTGCACCCACCT
GATAAAAAA*CGTTGGTTTATACTGTTTCAATATGTAACATATATAAATCATGTAATAAT
TAACTTAAGA*TTTATGATACGGAAACTAAAA
TAAATAGC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RS1DM58TF 689 0 0
GGACAACCATCCGATCTGAGAATATGAGCGAAGAACTCGTTCAACACGAATCTCATTCTC
AGCAATCGATATTTAGCCGTTTCTTCAAAATGTTCTCTTTTATTTTCCCATTGCTGAACG
TTATAAAGATTATTATAGCTTCCGTGACCTCCTTAGTCTTCTTAGCCCTTTCTTGCGTAA
CACTCGGTGGTTCAGCCGTGGCATTAATCGTATCCGCACCACTTTTCATCATATTTAGTC
CAATTCTCGTACCCGCCACTATTACCACTACCCTCCTAGCCAGTGGGCTCATGGCCGGTA
CCACCCTCGGACTGACCGGCATAGGTCTCATCACGGGGCTCTTTAGGACTGCAGGAGAAG
TCACATTGGCCTCAAACCCGTTACGAAGAATTATAATAAATAGAATTAAAGCAAGACTTG
GGGGTGGCGGTGGCGGCGGTTCACGTTTGGCAATTCTCAAAAAAATTCTGGGACTCGTTA
ATAAATATCGTAGCATGGCTTCAGGTGGAGCTGCAGCAGCACCAGCAGCTGCACCTGCAG
CTGAAGCAGCACCAGTAGCAGATCCAGCAGCGGCACCAGCGGCTGCACCTGCACCCACCT
GATAAAAAAACGTTGGTTTATACTGTTTCAATATGTAACATATATAAATCATGTAATAAT
TAACTTAAGAATTTATGATACGGAA
CTAA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RS1DO78TF 730 0 0
GGGAACAACCATCCGATCTGAGAATATGAGCGAAGAACTCGTTCAACACGAATCTCATTC
TCAGCAATCGATATTTAGCCGTTTCTTCAAAATGTTCTCTTTTATTTTCCCATTGCTGAA
TGTTATAAAGATTATTATAGCTTCCGTGACCTCCTTAGTCTTCTTAGCCCTTTCTTGCGT
AACACTCGGTGGTTCAGCCGTGGCATTAATCGTATCCGCACCACTTTTCATCATATTTAG
TCCAATTCTCGTACCCGCCACTATTACCACTACCCTCCTAGCCAGTGGGCTCATGGCCGG
TACCACCCTCGGACTGACCGGCATAGGTCTCATCACGGGGCTCTTTAGGACTGCAGGAGA
AGTCACATTGGCCTCAAACCCGTTACGAAGAATTATAATAAATAGAATTAAAGCAAGACT
TGGGGGTGGCGGTGGCGGCGGTTCACGTTTGGCAATTCTCAAAAAAATTCTGGGACTCGT
TAATAAATATCGTAGCATGGCTTCAGGTGGAGCTGCGGCAGCACCAGCAGCTGCACCTGC
AGCTGAAGCAGCACCAGCAGCAGATCCAGCAGCGGCACCAGCGGCTGCACCTGCACCCAT
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ATTAACTTAAGAATTTATGATACGGAA*CTAAAAT**AAATAGCCTTTT*ACTAAGCTTT
ATACATTATA

QA 1 730 1 730
DS 

RD RS1BY05TF 772 0 0
GGGAG
CAACCATCCGATCTGAGAATATGAGCGAAGAACTCGTTCAACACGAATCTCATTCTCAGC
AATCGATATTTAGCCGTTTCTTCAAAATGTTCTCTTTTATCTTCCCATTGCTGAACGTTA
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TTCTCGTACCCGCCACTATTACCACTACCCTCCTAGCCAGTGGGCTCATGGCCGGTACCA
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CATTGGCCTCAAACCCGTTACGAAGAATTATAATAAATAGAATTAAAGCAAGACTTGGGG
GTGGCGGTGGCGGCGGTTCACGTTTGGCAATTCTCAAAAAAATTCTGGGACTCGTTAATA
AATATCGTAGCATGGCTTCAGGTGGAGCTGCAGCAGCACCAGCAGCTGCACCTGCAGCTG
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AAAAAA*CGTTGGTTTATACTGTTTCAATATGTAGCATATATAAATCATGTAATAATTAA
CTTAAGAATTTATGATACGGAAACTAAAAATAAAATAGCCTTTTTACTAAGCTTTATACA
TTATATTTTTCTATGTAACAATGTTTAATTTGCTTATAATTATAAAA

QA 6 772 6 772
DS 

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GGACAACCATCCGATCTGAGAATATGAGCGAAGAACTCGTTCAACACGAATCTCATTCTC
AGCAATCGATATTTAGCCGTTTCTTCAAAATGTTCTCTTTTATTTTCCCATTGCTGAATG
TTATAAAGATTATTATAGCTTCCGTGACCTCCTTAGTCTTCTTAGCCCTTTCTTGCGTAA
CACTCGGTGGTTCAGCCGTGGCATTAATCGTATCCGCACCACTTTTCATCATATTTAGTC
CAATTCTCGTACCCGCCACTATTACCACTACCCTCCTAGCCAGTGGGCTCATGGCCGGTA
CCACCCTCGGACTGACCGGCATAGGTCTCATCACGGGGCTCTTTAGGACTGCAGGAGAAG
TCACATTGGCCTCAAACCCGTTACGAAGAATTATAATAAATAGAATTAAAGCAAGACTTG
GGGGTGGCGGTGGCGGCGGTTCACGTTTGGCAATTCTCAAAAAAATTCTGGGACTCGTTA
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ACATTATATTTTTCTATGTAACAATGTTTAATTTGCTTATAATTATAAAAGACGGATACA
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QA 1 788 1 788
DS 

RD RS1DM58JQ 770 0 0
ATATGAGCGAAGAACTCGTTCAACACGAATCTCATTCTCAGCAATCGATATTTAGCCGTT
TCTTCAAAATGTTCTCTTTTATTTTCCCATTGCTGAACGTTATAAAGATTATTATAGCTT
CCGTGACCTCCTTAGTCTTCTTAGCCCTTTCTTGCGTAACACTCGGTGGTTCAGCCGTGG
CATTAATCGTATCCGCACCACTTTTCATCATATTTAGTCCAATTCTCGTACCCGCCACTA
TTACCACTACCCTCCTAGCCAGTGGGCTCATGGCCGGTACCACCCTCGGACTGACCGGCA
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TACGAAGAATTATAATAAATAGAATTAAAGCAAGACTTGGGGGTGGCGGTGGCGGCGGTT
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ATCCAGCAGCGGCACCAGCGGCTGCACCTGCACCCACCTGATAAAAAAACGTTGGTTTAT
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GGAAACTAAAAATAAAATAGCCTTTTTACCAAGCTTTATACATTATATTTTTCTATGTAA
CAATGTTTAATTTGCTTATAATTATAAAAGACGGATACATAGTTGACT
AG

QA 1 768 1 768
DS 

RD RS1AT03JQ 586 0 0
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ACCACTACCCTCCTAGCCAGTGGGCTCATGGCCGGTACCACCCTCGGACCGACCGGCATA
GGTCTCATCACGGGGCTCTTTAGGACTGCAGGAGAAGTCACATTGGCCTCAAACCCGTTA
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GGTGGAGCTGCAGCAGCACCAGCAGCTGCACCTGCAGCTGAAGCAGCACCAGCAGCAGAT
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TGTTTCAATATGTAGCATATATAAATCATGTAATAATTAACTTAAGAATTTATGATACGG
AAACTAAAAATAAAATAGCCTTTTTATTAAGCTTTATACATTATATTTTTCTATGTAACA
ATGTTTAATTTGCTTATAATTATAAAAGACGGATACATAGTTGAC
C

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DS 

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TCTTCTTAGCCCTTTCTTGCGTAACACTCGGTGGTTCAGCCGTGGCATTAATCGTATCCG
CACCACTTTTCATCATATTTAGTCCAATTCTCGTACCCGCCACTATTACCACTACCCTCC
TAGCCAGTGGGCTCATGGCCGGTACCACCCTCGGACTGACCGGCATAGGTCTCATCACGG
GGCTCTTTAGGACTGCAGGAGAAGTCACATTGGCCTCAAACCCGTTACGAAGAATTATAA
TAAATAGAATTAAAGCAAGACTTGGGGGTGGCGGTGGCGGCGGTTCACGTTTGGCAATTC
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CAGCACCAGCAGCTGCACCTGCAGCTGAAGCAGCACCAGCAGCAGATCCAGCAGCGGCAC
CAGCGGCTGCACCTGCACCCACCTGATAAAAAA*CGTTGGTTTATACTGTTTCAATATGT
AACATATATAAATCATGTAATAATTAACTTAAGAATTTATGATACGGAAACTAAAAATAA
AATAGCCTTT**ACTAAGCTTTATACATTATATTTTTCTATGTAACAATGTTTAATTTGC
TTATAATTATAAAAGACGGATACATAGTTGACT

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DS 

RD RS1BY05JQ 728 0 0
GCAATCGATATTTAGCCGTTTCTTCAAAATGTTCTCTTTTATCTTCCCATTGCTGAACGT
TATAAAGATTATTATAGCTTCCGTGACCTCCTTAGTCTTCTTAGCCCTTTCTTGTGTAAC
ATTCGGTGGTTCAGCCGTGGCATTAATCGTATCCGCACCACTTTTCATCATATTTAGTCC
AATTCTCGTACCCGCCACTATTACCACTACCCTCCTAGCCAGTGGGCTCATGGCCGGTAC
CACCCTCGGACCGACCGGCATAGGTCTCATCACGGGGCTCTTTAGGACTGCAGGAGAAGT
CACATTGGCCTCAAACCCGTTACGAAGAATTATAATAAATAGAATTAAAGCAAGACTTGG
GGGTGGCGGTGGCGGCGGTTCACGTTTGGCAATTCTCAAAAAAATTCTGGGACTCGTTAA
TAAATATCGTAGCATGGCTTCAGGTGGAGCTGCAGCAGCACCAGCAGCTGCACCTGCAGC
TGAAGCAGCACCAGCAGCAGATCCTGCAGCGGCACCAGCGGCTGCACCTGCACCCACCTG
ATAAAAAA*CGTTGGTTTATACTGTTTCAATATGTAGCATATATAAATCATGTAATAATT
AACTTAAGAATTTATGATACGGAAACTAAAAATAAAATAGCCTTTTTACTAAGCTTTATA
CATTATATTTTTCTATGTAACAATGTTTAATTTGCTTATAATTATAAAAGACGGATACAT
AGTTGAC
C

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1AP47TFB 241 0 0
GG
GGCACCAGCGGCTGCACCTGCACCCACCTGATAAAAAA*CGTTGGTTTATACTGTTTCAA
TATGTAACATATATAAATCATGTAATAATTAACTTAAGAATTTATGATACGGAAACTAAA
AATAAAATAGTCTTTTTACTAAGCTTTATACATTATATTTTTCTATGTAACAATGTTTAA
TTTGCTTATAATTATAAAAGACGGATACATAGTTGACTAGAAAATAATGTTAACTATCT

QA 3 241 3 241
DS 

RD RS1AZ21TF 250 0 0
G
AGCGGCTGCACCTGCACCCACCTGATAAAAAA*CGTTGGTTTATACTGTTTCAATATGTA
GCATATATAAATCATGTAATAATTAACTTAAGAATTTATGATACGGAAACTAAAAATAAA
ATAGCCTTTTTACTAAGCTTTATACATTATATTTTTCTATGTAACAATGTTTAATTTGCT
TATAATTATAAAAGACGGATACATAGTTGACTAGAAAATAATGTTAACTATCTATTGTCC
ATGCGCTTC

QA 2 250 2 250
DS 



AS 1 14

CO CL113Contig1 817 14 27 U
GGGAGCAGAAAAAAAGTGTGAAAGACTAAAAATGAAGGGTTTCTACTTTCACCTCTTCCT
AGTAACCATGACGGTCGTTGCCTCCATCTCCGCTGCTACACCGGCGGCTCCGGCGGGAGG
AGGATCTTTGTTAGACGAATGTAGCAAAGATATTCAAACGGTGACTTTGTGTTTGGATTT
CGCGACAGGGAAGGCACCAAATCCATCTAAGAAGTGTTGTGACGCTATCGAAGGAATAAA
AGAGAAAGATCCAAAGTGTTTGTGTTTCTTGATTCAACAAGCCAAGTCAGGAGGACAAGC
TTTTAAGGATCTTGGTATTCAAGAAGCCAAACTCATTCAACTTCCAACTTCTTGTCAGCT
CCACAACGCTAGCATCTCCAACTGTCCAAAACTCCTCGGGATTTTGCCAAGCTCACCAGA
GGCAGCCGTATTCACAACAAGCAATGCCACCTCAACAACACCTTCTGCACCGGGAGGAAC
GTCTCCAGCAACTCCAGCGATGTCTAGCGAGAAAGCAGGATCAGCTTCCATAAAAGATGG
CCACGCCGTAATGGCTCTAGCCGTCGCTTCGATGACCGTCTCCTTCCTCTCGACCTTGCC
TTGGATGGGTTTGGCCTAGACGGTAGGCACGTGATATTAGGGGATGTAATCTTTCTTTCT
TTATTGTGTGG*AGCTTTTGTCTCAAAATTTTAAGACTTATCTTGTCGAGTGTGTTTCTT
GCTTCGGACCATTTGTTGTAATGAATGAACTTTCCCGCTTAATCTTTATCTCTTTCCACA
CATAACTAAAGTTTTATATTACAACCTAAGCTCAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 30 30 35 35 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 50 50 50 50 50 50 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 30 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 35 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 40 70 70 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 50 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 10 50 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 30 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 30 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 30 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 
30 80 80 80 80 80 80 30 80 30 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 20 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 50 45 30 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1GS23TF U 3
AF RS1FY22TF U 5
AF RS1BG82TF U 1
AF RS1DY68TF U 4
AF RS1BE03TF U 3
AF RS1DY68JQ C 107
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AF RS1E442TF U 5
AF RS1FY22JQ C 141
AF RS1BE03JQ C 11
AF RS1GS23JQ C 64
AF RS1BG82JQ C 70
AF RS1AX79JQ C 220
AF RS1AX79TF U 220
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RD RS1GS23TF 597 0 0
GGGC
AGAAAAAAAGTGTGAAAGACTAAAAATGAAGGGTTTCTACTTTCACCTCTTCCTAGTAAC
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QA 5 597 5 597
DS 

RD RS1FY22TF 593 0 0
GG
AGAAAAAAATTGTGAAAGACTAAAAATGAAGGGTTTCTACTTTCACCTCTTCCTAGTAAC
CATGACGGTCGTTGCCTCCATCTCCGCTGCTACACCGGCGGCTCCGGCGGGAGGAGGATC
TTTGTTAGACGAATGTAGCAAAGATATTCAAACGGTGACTTTGTGTTTGGATTTCGCGAC
AGGGAAGGCACCAAATCCATCTAAGAAGTGTTTTGACGCTATCGAAGGAATAAAAGAGAA
AGATCCAAAGTGTTTGTGTTTCTTGATTCAACAAGCCAAGTCAGGAGGACAAGCTTTTAA
GGATCTTGGTATTCAAGAAGCCAAACTCATTCAACTTCCAACTTCTTGTCAGCTCCACAA
CGCTAGCATCTCCAACTGTCCAAAACTCCTCGGGATTTTGCCAAGCTCACCAGAGGCAGC
CGTATTCACAACAAGCAATGCCACCTCAACAACACCTTCTGCACCGGGAGGAACGTCTCC
AGCAACTCCAGCGATGTCTAGCGAGAAAGCAGGATCAGCTTCCATAAAAGATGGCCACGC
CGTAATGGCTCTAGCCGTCGCTTCGATGACCGTCTCCTTCCTCTC
TCAACT

QA 3 587 3 587
DS 

RD RS1BG82TF 686 0 0
GGGAGCAGAAAAAAAGTGTGAAAGACTAAAAATGAAGGGTTTCTACTTTCACCTCTTCCT
AGTAACCATGACGGTCGTTGCCTCCATCTCCGCTGCTACAC*GGCGGCTCCGGCGGGAGG
AGGATCTTTGTTAGACGAATGTAGCAAAGATATTCAAACGGTGACTTTGTGTTTGGATTT
CGCGACAGGGAAGGCACCAAATCCATCTAAGAAGTGTTGTGACGCTATCGAA**AATAAA
AGAGAAAGATCCAAAGTGTTTGTGTTTCTTGATTCAACAAGCCAAGTCAGGAGGACAAGC
TTTTAAGGATCTTGGTATTCAAGAAGCCAAACTCATTCAACTTCCAACTTCTTGTCAGCT
CCACAACGCTAGCATCTCCAACTGTCCAAAACTCCTCGGGATTTTGCCAAGCTCACCAGA
GGCAGCCGTATTCACAACAAGCAATGCCACCTCAACAACACCTACTGCACCGGGAGGAAC
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CCACGCCGTAATGGCTCTAGCCGTCGCTTCGATGACCGTCTCCTTCCTCTCGACCTTGCC
TTGGATGGGTTTGGCCTAGACGGTAGGCACGCGATATTAGGGGATGTAATCTTTCTTTCT
TTATTGTGGGGGAGCTTTTGTCTCAA

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1DY68TF 671 0 0
GGAGA
AAAAAAAGTGTGAAAGACTAAAAATGAAGGGTTTCTACTTTCACCTCTTCCTAGTAACCA
TGACGGTCGTTGCCTCCATCTCCGCTGCTACACCGGCGGCTCCGGCGTGAGGAGGATCTT
TGTTAGACGAATGTAGCAAAGATATTCAAACGGTGACTTTGTGTTTGGATTTCGCGACAG
GGAAGGCACCAAATCCATCTAAGAAGTGTTGTGACGCTATCGAAGGAATAAAAGAGAAAG
ATCCAAAGTGTTTGTGTTTCTTGATTCAACAAGCCAAGTCAGGAGGACAAGCTTTTAAGG
ATCTTGGTATTCAAGAAGCCAAACTCATTCAACTTCCAACTTCTTGTCAGCTCCACAACG
CTAGCATCTCCAACTGTCCAAAACTCCTCGGGATTTTGCCAAGCTCACCAGAGGCAGCCG
TATTCACAACAAGCAATGCCACCTCAACAACACCTTCTGCACCGGGAGGAACGTCTCCGG
CAACTCCAGCGACGTCTAGCGAGAATGCAGGATCAGGTTCCATACAAGATGGTCACGCCT
TCATGGCTCTAGCCGTCGCTTCGATGACCGTCTCCTTCCTCTCGACCTTGCCTTGGATGG
GTTTGGCCTAGACG*TAGGCACGTGATATTAGGGGATGTAATCTTTCTTTCTTTATTGTG
TGA*AG

QA 6 671 6 671
DS 

RD RS1BE03TF 778 0 0
GGGC
AGAAAAAAAGTGTGAAAGACTAAAAATGAAGGGTTTCTACTTTCACCTCTTCCTAGTAAC
CATGACGGTCGTTGCCTCCATCTCCGCTGCTACACCGGCGGCTCCGGCGGG*GGAGGATC
TTTGTTAGACGAATGTAGCAAAGATATTCAAACGGTGACTTTGTGTTTGGATTTCGCGAC
AGGGAAGGCACCAAATCCATCTAAGAAGTGTTGTGACGCTATCGAAGGAATAAAAGAGAA
AGATCCAAAGTGTTTGTGTTTCTTGATTCAACAAGCCAAGTCAGGAGGACAAGCTTTTAA
GGATCTTGGTATTCAAGAAGCCAAACTCATTCAACTTCCAACTTCTTGTCAGCTCCACAA
CGCTAGCATCTCCAACTTTCCAAAACTCCTCGGGATTTTGCCAAGCTCACCAGAGGCAGC
CGTATTCACAACAAGCAATGCCACCTCAACAACACCGTCTGCACCGGGAGGAACGTCTCC
AGCAACTCCAGCGATGTCTAGCGAGAAAGCAGGATCAGCTTCCATAAAAGATGGCCACGC
CGTAATGGCTCTAGCCGTCGCTTCGATGACCGTCTCCTTCCTCTCGACCTTGCCTTGGAT
GGGTTTGGCCTAGACGGTAGGCACGTGATATTAGGGGATGTAATCTTTCTTTCTTTATTG
TGTGG*AGCTTTTGTCTCAAA*TTTTAAGACT*ATCTTGTCGAGTGTGTTTCTTGCTTCG
GAC*ATTTGTTGTA*TGA*TGAACTTTCCCGCTTA*TCTTTATCTCTTTC
ACAC

QA 5 774 5 774
DS 

RD RS1DY68JQ 654 0 0
GCTCCGGCGTGAGGAGGATCTTTGTTAGACGAATGTAGCAAAGATATTCAAACGGTGACT
TTGTGTTTGGATTTCGCGACAGGGAAGGCACCAAATCCATCTAAGAAGTGTTGTGACGCT
ATCGAAGGAATAAAAGAGAAAGATCCAAAGTGTTTGTGTTTCTTGATTCAACAAGCCAAG
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TAATCTTTCTTTCTTTATTGTGTGA*AGCTTTTGTCTCAAAATTTTAAGACTTATCTTGT
CGAGTGTGTTTCTTGCTTCGGACCATTTGTTGTAATGAATGAACTTTCCCGCTT

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DS 

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CGGTGACTTTGTGTTTGGATTTCGCGACAGGGAAGGCACCAAATCCATCTAAGAAGTGTT
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GGATTTTGCCAAGCTCACCAGAGGCAGCCGTATTCACAACAAGCAATGCCACCTCAACAA
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TATCTTGTCGAGTGTGTTTCTTGCTTCGGACCATTTGTTGTAATGAATGAACTTTCCCGC

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DS 

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GG
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TCTCAAAATTTTAAGACTTATCTTGTCGAGTGTGTTTCTTGCTTCGGACCATTTGTTGTA
ATGAATGAACTTTCCCGCTTAATC
CG

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ACGGTCGTTGCCTCCATCTCCGCTGCTACACCGGCGGCTCCGGCGGG*GGAGGATCTTTG
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G*AGCTTTTGTCTCAAAATTTTAAGACTTATCTTGTCGAGTGTGTTTCTTGCTTCGGACC
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DS 

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GTTAGACGAATGTAGCAAAGATATTCAAACGGTGACTTTGTGTTTGGATTTCGCGACAGG
GAAGGCACCAAATCCATCTAAGAAGTGTTGTGACGCTATCGAA**AATAAAAGAGAAAGA
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TAGCATCTCCAACTGTCCAAAACTCCTCGGGATTTTGCCAAGCTCACCAGAGGCAGCCGT
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GG*AGCTTTTGTCTCAAAATTTTAAGACTTATCTTGTCGAGTGTGTTTCTTGCTTCGGAC
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AT

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GGC
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DS 

RD RS1AX79TF 598 0 0
GGC
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AGCTTCCATAAAAGATGGCCACGCCGTAATGGCTCTAGCCGTCGCTTCGATGACCGTCTC
CTTCCTCTCGACCTTGCCTTGGATGGGTTTGGCCTAGACGGTAGGCACGTGATATTAGGG
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TCTTTATCTCTTTCCACACATAACTAAAGTTTTATATTACAACCTAAGCTCAAAG

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DS 



AS 1 12

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TCTCAGCATCGCTTGTCATCTCAGAATGAGTCTCTCTGGTGCTGCTGCAGTTGGTTCAAG
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GATGTTGGAGACGCTTCCCCTTCCAAATATCAAATGGATATGCCCGACTGCTCCTTCTCA
GCCAATAAGTTTGTTTGGTGGTTTCCCTTCCACAGCTTGGTTTGATGTTGTGGACCTGAC
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AACTGGTAAACTAGAAGAGGAGCAGATCAAGAACCGAGCTGCATCGTTACCCATCTTAGT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 
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35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
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TGAAGATGGACCTGACGAT

QA 1 439 1 439
DS 

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GG
ATACGGATTGCTGCCGCTGGAGCTCTTCTAATCTTTTGGTGGCTTCCGTAGACTTCTCCG
TCGCTACACCTTTGCCGAGAGC*AGTTTCTTCTCAGCATCGCTTGTCATCTCAGAATGAG
TCTCTCTGGTGCTGCTGCAGTTGGTTCAAGCAGAAATTTGAGGAGAGCGGTGGAGTTTGG
TAAAACTCATGTTGTTAGGCCCAAAGGGAAGCATCAAGCTACTATTGTCTGGCTACATGG
CCTTGGCGACAATGGCTCCAGCTGGTCCCAGATGTTGGAGACGCTTCCCCTTCCAAATAT
CAAATGGATATGCCCGACTGCTCCTTCTCAGCCAATAAGTTTGTTTGGTGGTTTCCCTTC
CACAGCTTGGTTTGATGTTGTGGACCTGACTGAAGATGGACCTGACGATGTAGAAGGACT
GGATGTGACTGCCGAACATGTTGCAAAACTCTTGTCAAATGAGCCTGCTGACATTAAGTT
AGGTGTTGGAGGGTTCAGCATGGGTGCCGGGACGTCTCTATATTCTGCGACCTGTTTTGC
ACTCGGTAAATATGGAAATGGCAATCCTTACCCTATCAATTTAAGCGCAGTCATTGGCTT
AAGCGGGTGGCTTCCTTGTGCCAAGACACTAACTGGTAAACTAGAAGAGGAGCAGATCAA
GAACCGAGCTGCATCGTT

QA 3 680 3 680
DS 

RD RS1A461TF 684 0 0
GG
GGAGCTCTTCTAATCTTTTGGTGGCTTCCGTAGACTTCTCCGTCGCTACACCTTTGCCGA
GAGCCAGTTTCCTCTCAGCATTACTTGTCATCTCAGAATGAGTCTCTCTGGCGCTGCTGC
AGTTGGTTCAAGCAGAAATTTGAGAAGAGCGGTGGAGTTTGGGAAAACTCATGTGGTTAG
GCCCAAAGGGAAGCATCAAGCTACTATTGTCTGGCTACATGGCCTTGGCGACAATGGCTC
CAGCTGGTCTCAGATGTTGGAGACGCTTCCCCTTCCAAATATCAAATGGATATGCCCGAC
TGCTCCTTCTCAGCCAATAAGTTTGTCTGGTGGTTTCCCTTCCACAGCTTGGTTTGATGT
TGTGGACCTGACTGAAGATGGACCTGATGATGTAGAAGGACTGGATGTGACTGCCGAACA
TGTTGCAAAACTCTTGTCAAACGAGCCTGCTGACATTAAGTTAGGTGTTGGAGGGTTCAG
CATGGGTGCGGGGACTTCTCTATATTCTGCGACCTGCTTTGCGCTCGGTAAATATGGAAA
TGGCAATCCTTACCCTATCAATTTAAGCGCGGTCATTGGCTTGAGCGGGTGGCTTCCTTG
TGCCAAGACACTAACTGGTAAACTAGAAGAGGAGCAGATCAAGAACCGAGCTGCATCGTT
ACCCATCTTAGTTTGTCATGGA

QA 3 684 3 684
DS 

RD RS1H651TF 666 0 0
GG
GGTGGCTTCCGTAGACTTCTCCGTCGCTACACCTTTGCCGAG******TTTCTTCTCAGC
ATCGCTTGTCATCTCAGAATGAGTCTCTCTGGTGCTGCTGCAGTTGGTTCAAGCAGAAAT
TTGAGAAGAGCGGTGGAGTTTGGTAAAACTCATGTTGTTAGGCCCAAAGGGAAGCATCAA
GCTACTATTGTCTGGCTACATGGCCTTGGCGACAATGGCTCCAGCTGGTCCCAGATGTTG
GAGACGCTTCCCCTTCCAAATATCAAATGGATATGCCCGACTGCTCCTTCTCAGCCAATA
AGTTTGTTTGGTGGTTTCCCTTCCACAGCTTGGTTTGATGTTGTGGACCTGACTGAAGAT
GGACCTGACGATGTAGAAGGACTGGATGTGACTGCCGAACATGTTGCAAAACTCTTGTCA
AATGAGCCTGCTGACATTAAGTTAGGTGTTGGAGGGTTCAGCATGGGTGCCGGGACGTCT
CTATATTCTGCAACCTGTTTTGCACTCGGTAAATATGGAAATGGCAATCCTTACCCTATC
AATTTAAGCGCAGTCATTGGCTTAAGCGGGTGGCTTCCTTGTGCCAAGACACTAACTGGT
AAACTAGAAGAGGAGCAGATCAAGAACCGAGCTGCATCGTTACCCATCTTAGTTTGTCAT
GGAA

QA 3 666 3 666
DS 

RD RS1C133TF 788 0 0
GG
AATCTTTTGGTGGCTTCCGTAGACTTCTCCGTCGCTACACCTTTGCCGAGAGC*AGTTTC
TTCTCAGCATCGCTTGTCATCTCAGAATGAGTCTCTCTGGTGCTGCTGCAGTTGGTTCAA
GCAGAAATTTGAGAAGAGCGGTGGAGTTTGGTAAAACTCATGTTGTTAGGCCCAAAGGGA
AGCATCAAGCTACTATTGTCTGGCTACATGGCCTTGGCGACAATGGCTCCAGCTGGTCCC
AGATGTTGGAGACGCTTCCCCTTCCAAATATCAAATGGATATGCCCGACTGCTCCTTCTC
AGCCAATAAGTTTGTTTGGTGGTTTCCCTTCCACAGCTTGGTTTGATGTTGTGGACCTGA
CTGAAGATGGACCTGACGATGTAGAAGGACTGGATGTGACTGCCGAACATGTTGCAAAAC
TCTTGTCAAATGAGCCTGCTGACATTAAGTTAGGTGTTGGAGGGTTCAGCATGGGTGCCG
GGACGTCTCTATATTCTGCGACCTGTTTTGCACTCGGTAAATATGGAAATGGCAATCCTT
ACCCTATCAATTTAAGCGCAGTCATTGGCTTAAGCGGGTGGCTTCCTTGTGCCAAGACAC
TAACTGGTAAACTAGAAGAGGAGCAGATCAAGAACCGAGCTGCATCGTTACCCATCTTAG
TTTGTCATGGAAA*GGTGATGATGTTGTACCGTTCAAGTTTGGGGAGAAATCATCACAG*
CCTTGATAGCACATGGGTTTAAGA*GACGACCTTCAAAGCTTACAGTGGGCTTGGTCAT
ACACATC

QA 3 781 3 781
DS 

RD RS1C788TF 718 0 0
GTCG
GAATGAGTCTCTCTGGTGCTGCTGCAGTTGGTTCAAGCAGAAATTTGAGAAGAGCGGTGG
AGTTTGGTAAAACTCATGTTGTTAGGCCCAAAGGGAAGCATCAAGCTACTATTGTCTGGC
TACATGGCCTTGGCGACAATGGCTCCAGCTGGTCCCAGATGTTGGAGACGCTTCCCCTTC
CAAATATCAAATGGATATGCCCGACTGCTCCTTCTCAGCCAATAAGTTTGTTTGGTGGTT
TCCCTTCCACAGCTTGGTTTGATGTTGTGGACCTGACTGAAGATGGACCTGACGATGTAG
AAGGACTGGATGTGACTGCCGAACATGTTGCAAAACTCTTGTCAAATGAGCCTGCTGACA
TTAAGTTAGGTGTTGGAGGGTTCAGCATGGGTGCCGGGACGTCTCTATATTCTGCGACCT
GTTTTGCACTCGGTAAATATGGAAATGGCAATCCTTACCCTATCAATTTAAGCGCAGTCA
TTGGCTTAAGCGGGTGGCTTCCTTGTGCCAAGACACTAACTGGTAAACTAGAAGAGGAGC
AGATCAAGAACCGAGCTGCATCGTTACCCATCTTAGTTTGTCATGGAAAAGGTGATGATG
TTGTACCGTTCAAGTTTGGGGAGAAATCATCACAGGCCTTGATAGCACATGGGTTTAAGA
AGACGACCTTCAAAGCTTACAGTGGGCTTGGTCATTACACAATCCCACAG
AGAC

QA 5 714 5 714
DS 

RD RS1C788JQ 761 0 0
ACTATTGTCTGGCTACATGGCCTTGGCGACAATGGCTCCAGCTGGTCCCAGATGTTGGAG
ACGCTTCCCCTTCCAAATATCAAATGGATATGCCCGACTGCTCCTTCTCAGCCAATAAGT
TTGTTTGGTGGTTTCCCTTCCACAGCTTGGTTTGATGTTGTGGACCTGACTGAAGATGGA
CCTGACGATGTAGAAGGACTGGATGTGACTGCCGAACATGTTGCAAAACTCTTGTCAAAT
GAGCCTGCTGACATTAAGTTAGGTGTTGGAGGGTTCAGCATGGGTGCCGGGACGTCTCTA
TATTTTGCGACCTGTTTTGCACTCGGTAAATATGGAAATGGCAATCCTTACCCTATCAAT
TTAAGCGCAGTCATTGGCTTAAGCGGGTGGCTTCCTTGTGCCAAGACACTAACTGGTAAA
CTAGAAGAGGAGCAGATCAAGAACCGAGCTGCATCGTTACCCATCTTAGTTTGTCATGGA
AAAGGTGATGATGTTGTACCGTTCAAGTTTGGGGAGAAATCATCACAGGCCTTGATAGCA
CATGGGTTTAAGAAGACGACCTTCAAAGCTTACAGTGGGCTTGGTCATTACACAATCCCA
CAGGAGACGGAGGATTTGTGCACGTGGTTGACATCCACCCTCGGCCTCGAAGGTTGAAAA
GGCTTTTCAATCTGATGGAAAAAAAAAACTCGTGAGATTTTTCTTTGAATTGGATTTGG*
ATCTTTCGGATTTTTT*ACTTTGGGATTTGGATCTTGTTAC

QA 1 761 1 761
DS 

RD RS1H651JQB 492 0 0
GCA
ACCTGTTTTGCACTCGGTAAATATGGAAATGGCAATCCTTACCCTATCAATTTAAGCGCA
GTCATTGGCTTAAGCGGGTGGCTTCCTTGTGCCAAGACACTAACTGGTAAACTAGAAGAG
GAGCAGATCAAGAACCGAGCTGCATCGTTACCCATTTTAGTTTGTCATGGAAAAGGTGAT
GATGTTGTACCGTTCAAGTTTGGGGAGAAATCATCACAGGCCTTGATAGCACATGGGTTT
AAGAAGACGACCTTCAAAGCTTACAGTGGGCTTGGTCATTACACAATCCCACAGGAGACG
GAGGATTTGTGCACGTGGTTGACATCCACCCTCGGCCTCGAAGGTTGAAAAGGCTTTTCA
ATTTGATGGAAAAAAAAAACTCGTGAGATTTTTCTTTGAATTGGATTTGG*ATCTTTCGG
ATTTTTT*ACTTTGGGATTTGGATCTTGTTACATTTGGGATATTAGTGTAAGACTATGCC
CTCTCTAGT

QA 4 492 4 492
DS 

RD RS1C133JQ 738 0 0
CTGAAGATGGACCTGACGATGTAGAAGGACTGGATGTGACTGCCGAACATGTTGCAAAAC
TCTTGTCAAATGAGCCTGCTGACATTAAGTTAGGTGTTGGAGGGTTCAGCATGGGTGCCG
GGACGTCTCTATATTCTGCGACCTGTTTTGCACTCGGTAAATATGGAAATGGCAATCCTT
ACCCTATCAATTTAAGCGCAGTCATTGGCTTAAGCGGGTGGCTTCCTTGTGCCAAGACAC
TAACTGGTAAACTAGAAGAGGAGCAGATCAAGAACCGAGCTGCATCGTTACCCATCTTAG
TTTGTCATGGAAAAGGTGATGATGTTGTACCGTTCAAGTTTGGGGAGAAATCATCACAGG
CCTTGATAGCACATGGGTTTAAGAAGACGACCTTCAAAGCTTACAGTGGGCTTGGTCATT
ACACAATCCCACAGGAGACGGAGGATTTGTGCACGTGGTTGACATCCACCCTCGGCCTCG
AAGGTTGAAAAGGCTTTTCAATCTGATGGAAAAAAAAAACTCGTGAGATTTTTCTTTGAA
TTGGATTTGG*ATCTTTCGGATTTTTT*ACTTTGGGATTTGGATCTTGTTACATTTGGGA
TATTAGTGTAAGACAATGCCCTCTCTAGTATTAAAGCTTCTTGTCGTTTGGCACGTCTGA
ACCCGGACCATCGGTAGACGCAGTTGTGTTTGTTTTCTTGTGGTCGAACGGATATTAAAC
AAAGATTTTCACTGCTAT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1FM87JQ 598 0 0
CGACCTGTTTTGCACTCGGTAAATATGGAAATGGCAATCCTTACCCTATCAATTTAAGCG
CAGTCATTGGCTTAAGCGGGTGGCTTCCTTGTGCCAAGACACTAACTGGTAAACTAGAAG
AGGAGCAGATCAAGAACCGAGCTGCATCGTTACCCATTTTAGTTTGTCATGGAAAAGGTG
ATGATGTTGTACCGTTCAAGTTTGGGGAGAAATCATCACAGGCCTTGATAGCACATGGGT
TTAAGAAGACGACCTTCAAAGCTTACAGTGGGCTTGGTCATTACACAATCCCACAGGAGA
CGGAGGATTTGTGCACGTGGTTGACATCCACCCTCGGCCTCGAAGGTTGAAAAGGCTTTT
CGATTTGATGGAAAAAAAAA*CTCGTGAGATTTTTCTTTGAATTGGATTTGG*ATCTTTC
GGATTTTTT*ACTTTGGGATTTGGATCTTGTTACATTTGGGATATTAGTGTAAGACTATG
CCCTCTCTAGTATTAAAGCTTCTTGTCGTTTGGCACGTCTGAACCCGGACCATCGGTAGA
CGCAGTTGTGTTTGTTTTCTTGTGGTCGAACGGATATTAAACAAAGATTTTCA
CTGGG

QA 1 593 1 593
DS 

RD RS1F139TF 696 0 0
G
CGAACATGTTGCAAAACTCTTGTCAAACGAGCCTGCTGACATTAAGTTAGGTGTTGGAGG
GTTCAGCATGGGTGCGGGGACTTCTCTATATTCTGCGACCTGCTTTGCGCTCGGTAAATA
TGGAAATGGCAATCCTTACCCTATCAATTTAAGCGCGGTCATTGGCTTGAGCGGGTGGCT
TCCTTGTGCCAAGACACTAACTGGTAAACTAGAAGAGGAGCAGATCAAGAACCGAGCTGC
ATCGTTACCCATCTTAGTTTGTCATGGAAAAGGTGATGATGTTGCACCGTTCAAGTTTGG
GGAGAAATCATCACAGGCCTTGATAGCACATGGGTTTAAGAAGACGACCTTCAAAGCTTA
CAGTGGACTTGGTCACTACACAATCCCACAGGAGACGGAGGATCTGTGCTCGTGGTTGAC
ATCCACCCTCGGCCTCGAAGGCTGAAAAGGCTTTTCAATCTGATG*AAAAAAAAAACTCG
TGAGATTTTTCTTTGAATTGGATTTGGGATCTTTCAGATTTTTTCACTTTCGGATTTGGA
TCTTGTTACATTTGGGATATTAATGTAAGACTATGCCCTCTCTAGTATTAAAGCTTCTTG
TCGTTTGGCACGTCTGAACC*GGACCATCGGTAGACGCAGTTGTGTTTGTTTTCTTGTGG
TCGAACGGATATTAAACAAAGATTTTCA
GTGCTGA

QA 2 689 2 689
DS 

RD RS1F139JQ 601 0 0
TGCGACCTGCTTTGCGCTCGGTAAATATGGAAATGGCAATCCTTACCCTATCAATTTAAG
CGCGGTCATTGGCTTGAGCGGGTGGCTTCCTTGTGCCAAGACACTAACTGGTAAACTAGA
AGAGGAGCAGATCAAGAACCGAGCTGCATCGTTACCCATTTTAGTTTGTCATGGAAAAGG
TGATGATGTTGCACCGTTCAAGTTTGGGGAGAAATCATCACAGGCCTTGATAGCACATGG
GTTTAAGAAGACGACCTTCAAAGCTTACAGTGGACTTGGTCACTACACAATCCCACAGGA
GACGGAGGATCTGTGCTCGTGGTTGACATCCACCCTCGGCCTCGAAGGCTGAAAAGGCTT
TTCAATTTGATG*AAAAAAAAAACTCGTGAGATTTTTCTTTGAATTGGATTTGGGATCTT
TCAGATTTTTTCACTTTCGGATTTGGATCTTGTTACATTTGGGATATTAATGTAAGACTA
TGCCCTCTCTAGTATTAAAGCTTCTTGTCGTTTGGCACGTTTGAACC*GGACCATCGGTA
GACGCAGTTGTGTTTGTTTTCTTGTGGTCGAACGGATATTAAACAAAGATTTTCA
GTGCTG

QA 1 595 1 595
DS 



AS 2 13

CO CL115Contig1 717 5 11 U
GACTTCCCAACAAGTTATGACATTCATAATGAACCTAGAGAAGAAGAGTCCGCAGAAGGA
GGAATACAAGCAGTTTTTCGAGAAACTAAAGAGTACCATGACAGGAAAGGTTTCTTCTCC
AAAGAAAAAAGGAGGCTTGTTCGCTATGATCAAAGGTGCTGTTGGAAAAATAGGTGATGC
CATGCAATTTATTCGTTCAAGACTTGCAAACAAATCAGCAGAAGTAAAGAAGTCAATGGA
AACTTACCAAGCAGAAGTGATAAAGAATATGGAAGAGCTAGATGCAATCTACGCTAAAAT
TGTAGCCGAAAATCAAAACAAGAAAGGAGGAGCAATGACATGCACACCAGAACAACAAGC
ACAGATTAAGACGACAATCACCAAGTGGGAACAAGTCACAACCCAATTCGTTGAGGTTGC
TGTTAAGAGTGAAACTTCAACATCTACTTCTACATCATCCTCCACAGGAACAGCCCAGGC
AAATTGAAGTGAAGCTAAGATGTAACTTCACCAAGATGGCAAAACTAGTAACCAATAGCT
AATAATTTAGAGATTTTTATTTTTGATTGAAAATAAAACAAACATCGGTGTAGGCTAGCA
ATATATCTATTGACCGACCTATACAAAAGAATAACTATGCATAAGTACATATAGACTGTA
AGCATTCTATATGCTAACATCCAAAAGTGATGATTAGTGAAAGAAAAATTTTGTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 

AF RS1F811JQ C 1
AF RS1DQ91JQ C 34
AF RS1D193TF U 582
AF RS1DQ91TF U 34
AF RS1BJ82TF U 470
BS 1 34 RS1F811JQ
BS 35 501 RS1DQ91TF
BS 502 502 RS1BJ82TF
BS 503 533 RS1DQ91TF
BS 534 534 RS1BJ82TF
BS 535 537 RS1DQ91TF
BS 538 538 RS1BJ82TF
BS 539 582 RS1DQ91TF
BS 583 715 RS1D193TF
BS 716 716 RS1DQ91TF
BS 717 717 RS1BJ82TF

RD RS1F811JQ 699 0 0
GACTTCCCAACAAGTTATGACATTCATAATGAACCTAGAGAAGAAGAGTCCGCAGAAGGA
GGAATACAAGCAGTTTTTCGAGAAACTAAGGAGTACCATGACAGGAAAGGTTTCTTCTCC
AAAGAAAAAAGGAGGCTTGTTCGCTATGATCAAAGGTGCTGTTGGAAAAATAGGTGATGC
CATGCAATTTATTCGTTCAAGACTTGCAAACAAATCAGCAGAAGTAAAGAAGTCAATGGA
AACTTACCAAGCAGAAGTGATAAAGAATATGGAAGAGCTAGATGCAATTTACGCTAAAAT
TGTAGCCGAAAATCAAAACAAGAAAGTAGGAGCAATGACATGCACACCAGAACAACAAGC
ACAGATTAAGACGACAATCACCAAGTGGGAACAAGTCACAACCCAATTCGTTGAGGTTGC
TGTTAAGAGTGAAACTTCAACGTTTACTTTTACATCATCCTCCACAGGAACAGCCCAGGC
AAATTGAAGTGAAGCTAAGATGTAACTTCACCAAGATGGCAAAACTAGTAACCAATAGCT
AATAATTTAGAGATTTTTATTTTTGATTGAAAATAAAACAAACATCGGTGTAGGCTAGCA
ATATATTTATTGACCGACCTATACAAAAGAATAACTATGCATAAGTACATATAGACTGTA
AGCATTCTATATGCTAACATCCAAAAGTGATGATTAGTG

QA 1 699 1 699
DS 

RD RS1DQ91JQ 684 0 0
G
CTAGAGAAGAAGAGTCCGCAGAAGGAGGAATACAAGCAGTTTTTCGAGAAACTAAAGAGT
ACCATGACAGGAAAGGTTTCTTCTCCAAAGAAAAAAGGAGGCTTGTTCGCTATGATCAAA
GGTGCTGTTGGAAAAATAGGTGATGCCATGCAATTTATTCGTTCAAGACTTGCAAACAAA
TCAGCAGAAGTAAAGAAGTCAATGGAAACTTACCAAGCAGAAGTGATAAAGAATATGGAA
GAGCTAGATGCAATCTACGCTAAAATTGTAGCCGAAAATCAAAACAAGAAAGGAGGAGCA
ATGACATGCACACCAGAACAACAAGCACAGATTAAGACGACAATCACCAAGTGGGAACAA
GTCACAACCCAATTCGTTGAGGTTGCTGTTAAGAGTGAAACTTCAACATCTACTTCTACA
TCATCCTCCACAGGAACAGCCCAGGCAAATTGAAGTGAAGCTAAGATTTAACTTCACCAA
GATGGCAAAACTAGTAACCCATATCTAATAATTTAGAGATTTTTATTTTTGATTGAAAAT
AAAACAAACATCGGTGTAGGCTAGCAATATATCTATTGACCGACCTATACAAAAGAATAA
CTATGCATAAGTACATATAGACTGTAAGCATTCTATATGCTAACATCCAAAAGTGATGAT
TAGTGAAAGAAAAATTTTGTGG
T

QA 2 683 2 683
DS 

RD RS1D193TF 136 0 0
G
CATCGGTGTAGGCTAGCAATATATCTATTGACCGACCTATACAAAAGAATAACTATGCAT
AAGTACATATAGACTGTAAGCATTCTATATGCTAACATCCAAAAGTGATGATTAGTGAAA
GAAAAATTTTGTG
AT

QA 2 134 2 134
DS 

RD RS1DQ91TF 684 0 0
G
CTAGAGAAGAAGAGTCCGCAGAAGGAGGAATACAAGCAGTTTTTCGAGAAACTAAAGAGT
ACCATGACAGGAAAGGTTTCTTCTCCAAAGAAAAAAGGAGGCTTGTTCGCTATGATCAAA
GGTGCTGTTGGAAAAATAGGTGATGCCATGCAATTTATTCGTTCAAGACTTGCAAACAAA
TCAGCAGAAGTAAAGAAGTCAATGGAAACTTACCAAGCAGAAGTGATAAAGAATATGGAA
GAGCTAGATGCAATCTACGCTAAAATTGTAGCCGAAAATCAAAACAAGAAAGGAGGAGCA
ATGACATGCACACCAGAACAACAAGCACAGATTAAGACGACAATCACCAAGTGGGAACAA
GTCACAACCCAATTCGTTGAGGTTGCTGTTAAGAGTGAAACTTCAACATCTACTTCTACA
TCATCCTCCACAGGAACAGCCCAGGCAAATTGAAGTGAAGCTAAGATTTAACTTCACCAA
GATGGCAAAACTAGTAACCCATATCTAATAATTTAGAGATTTTTATTTTTGATTGAAAAT
AAAACAAACATCGGTGTAGGCTAGCAATATATCTATTGACCGACCTATACAAAAGAATAA
CTATGCATAAGTACATATAGACTGTAAGCATTCTATATGCTAACATCCAAAAGTGATGAT
TAGTGAAAGAAAAATTTTGTGG
T

QA 2 683 2 683
DS 

RD RS1BJ82TF 248 0 0
G
CAGCCCAGGCAAATTGAAGTGAAGCTAAGATGTAACTTCACCAAGATGGCAAAACTAGTA
ACCAATAGCTAATAATTTAGAGATTTTTATTTTTGATTGAAAATAAAACAAACATCGGTG
TAGGCTAGCAATATATCTATTGACCGACCTATACAAAAGAATAACTATGCATAAGTACAT
ATAGACTGTAAGCATTCTATATGCTAACATCCAAAATTGATGATTAGTGAAAGAAAAATT
TTGTGGT

QA 2 248 2 248
DS 



CO CL115Contig2 1803 8 18 U
GGAAAATCATCCAATTCGTTCCTCACAAAAAAAAATATAATTTTCTTATAAAAAAATCAA
AAAGAAAATAATAATGGCAAAAGTTCATCTACTATTATGCTTCGCCCTTCTATTTGCATC
TGTAACTCTTTTTGACGTGGCTTCAGCTTTTCTGAAACTAAAACCAGCTTTGCCTCAGAT
TGAAGATCCGAAGACGGTAGGTGATGTGGAAGAATACACTGTTAAGGTAGTGATGGTATT
TGTGGGAGACCTCGAGAAAGAATGTCCTAAAACAAGCAAATTCAAAGCGTTCTTCGACAA
ACTCAGAGGATTTGCCAGGTATGTTTGCCCACTGAAAATATTTGGCAAAAAAGATGATGC
CGACATGAAGGCCAAAGAAGCAGGCATCCTCAAAACCATCGCCTCTTTTGCTATTGGAAA
GATAAAGAGGGAAATTCAAGAGGAGAAACAGGAAGCTATCGAAACCTTTAAGTTTATGAA
ATCCTTGGCTGGTAGAATTTTGGGTGGCCGCAAGAAAGAAGAGAAAGCAACCACGGCACT
AACAGCTGGACAGCTGAAAGAAATCAAAGATGGGATCTTGAAGTGGCAGACTACGATTGT
TAAGATCACAAACACTATGGTAGTTAGCACCTCAACCAGCGAAAGCTCTGAAACTACTAC
CACTGGAGGCTCTGAATCTACCACTGGAGGCTCTTCGGGTCCTAATGCCGGAAGCTCTAC
TGGAAGTCCATCAAACAAACCAGAAGCTGGTTCAAACCCTGGAGCTGGAACTCCCTCAAA
CAAACCAGAAGCTGGTTCAAACCCTGGAGCTGGAACTCCCTCTGAGGATAAAGACAATGA
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TAACTCCGGAAGCTCTACTGGAAGTCCATCAAACAAGCCAGCAGCTGGTTCAAACCCTGG
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TACTTCAACTGCAACTCAAAGTACTAGCCAGACCAAGGAGGTGACAGTGACAGAAGTCGA
GACTCAGACTTCCCAACAAGTTATGACATTCATAATGAACCTAGAGAAGAAGAGTCCGCA
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TGATGCCATGCAATTTATTCGTTCAAGACTTGCAAACAAATCAGCAGAAGTAAAGAAGTC
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TAAAATTGTAGCCGAAAATCAAAACAAGAAAGGAGGAGCAATGACATGCACACCAGAACA
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GGC


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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 
15 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 15 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 10 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 30 30 30 15 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1F811TF U 1
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AAAGAAAATAATAATGGCAAAAGTTCATCTACTATTATGCTTCGCCCTTCTATTTGCATC
TGTAACTCTTTTTGACGTGGCTTCAGCTTTTCTGAAACTAAAACCAGCTTTGCCTCAGAT
TGAAGATCCGAAGACGGTAGGTGATGTGGAAGAATACACTGTTAAGGTAGTGATGGTATT
TGTGGGAGACCTCGAGAAAGAATGTCCTAAAACAAGCAAATTCAAAGCGTTCTTCGACAA
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CGACATGAAGGCCAAAGAAGCAGGCATCCTCAAAACCATCGCCTCTTTTGCTATTGGAAA
GATAAAGAGGGAAATTCAAGAGGAGAAACAGGAAGCTATCGAAACCTTTAAGTTTATGAA
ATCCTTGGCTGGTAGAATTTTGGGTGGCCGCAAGAAAGAAGAGAAAGCAACCACGGCACT
AACAGCTGGACAGCTGAAAGAAATCAAAGATGGGATCTTGAAGTGGCAGACTACGATTGT
TAAGATCACAAACACTATGGTAGTTAGCACCTCAACCAGCGAAAGCTCTGAAACTACTAC
CACTGGAGGCTCTGAATCTACCACT

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DS 

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G
GAAATCAAAGATGGGATCTTGAAGTGGCAGACTACGATTGTTAAGATCACAAACACTATG
GTAGTTAGCACCTCAACCAGCGAAAGCTCTGAAACTACTACCACTGGAGGCTCTGAATCT
ACCACTGGAGGCTCTTCGGGTCCTAATGCCGGAAGCTCTACTGGAAGTCCATCAAACAAA
CCAGAAGCTGGTTCAAACCCTGGAGCTGGAACTCCCTCAAACAAACCAGAAGCTGGTTCA
AACCCTGGAGCTGGAACTCCCTCTGAGGATAAAGACAATGAATCCGAAGATACCACGAAC
ACTGCTTCTACTGGAACTGAAACTGGAGGCTCTACGGGTCCTAACTCCGGAAGCTCTACT
GGAAGTCCATCAAACAAGCCAGCAGCTGGTTCAAACCCTGGAGCTGGAACTCCCTCTCAG
GATACAAACAATGAATCCAAAGATACCACGAACGCTGCTTCTACTTCAACTGCAACTCAA
AGTACTAGCCAGACCAAGGAGGTGACAGTGACAGAAGTCGAGACTCAGACTTCCCAACAA
GTTATGACATTCATAATGAACCTAGAGAAGAAGAGTCCGCAGAAGGAGGAATACAAGCAG
TTTTTCGAGAAACTAAAGAGTACCATGACAGGAAAGGTTTCTTCTCCAAAGAAAAAAGGA
GGCTTGTTCGCTATGATCAAAGGTGCTGTTGGAAAAATATGTGATGCCATGCAATTTATT
CGTTCAAGACTTGCAAACAAATCAGCAGAAGTAAAGAAGTCAATGGAAACTTACCAAGC

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AAACCAGAAGCTGGTTCAAACCCTGGAGCTGGAACTCCCTTTGAGGATAAAGACAATGAA
TCCGAAGATACCACGAACACTGCTTCTACTGGAACTGAAACTGGAGGCTTTACGGGTCCT
AACTCCGGAAGCTTTACTGGAAGTCCATCAAACAAGCCAGCAGCTGGTTCAAACCCTGGA
GCTGGAACTCCCTCTCAGGATACAAACAATGAATCCAAAGATACCACGAACGCTGCTTTT
ACTTCAACTGCAACTCAAAGTACTAGCCAGACCAAGGAGGTGACAGTGACAGAAGTCGAG
ACTCAGACTTCCCAACAAGTTATGACATTCATAATGAACCTAGAGAAGAAGAGTCCGCAG
AAGGAGGAATACAAGCAGTTTTTCGAGAAACTAAAGAGTACCATGACAGGAAAGGTTTCT
TCTCCAAAGAAAAAAGGAGGCTTGTTCGCTATGATCAAAGGTGCTGTTGGAAAAATAGGT
GATGCCATGCAATTTATTCGTTCAAGACTTGCAAACAAATCAGCAGAAGTAAAGAAGTCA
ATGGAAACTTACCAAGCAGAAGTGATAAAGAATATGGAAGAGCTAGATGCAATTTACGCT
AAAATTGTAGCCG

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DS 

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GTT
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CCCAACAAGTTATGACATTCATAATGAACCTAGAGAAGAAGAGTCCGCAGAAGGAGGAAT
ACAAGCAGTTTTTCGAGAAACTAAAGAGTACCATGGCAGGAAAGGTTTCTTCTCCAAAGA
AAAAAGGAGGCTTGCTCGCTATGATCAAAGGTGCTGTTGGAAAAATAGGTGATGCCATGC
AATTTATTCGTTCAAGACTTGCAAACAAATCAGCAGAAGTAAAGAAGTCAATGGAAACTT
ACCAAGCAGAAGTGATAAAGAATATGGAAGAGCTAGATGCAATCTACGCTAAAATTGTAG
CCGAAAATCAAAACAAGAAAGGAGGAGCAATGACATGCACACCAGAACAACAAGCACAGA
TTAAGACGACAATCACCAAGTGGGAACAAGTCACAACCCAATTCGTTGAGGTTGCTGTTA
AGAGTGAATCTTCAACATCTACTTCTACATCATCCTCCACAGGAACAGCCCA

QA 4 535 4 535
DS 

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G
GGAGGCTCTACGGGTCCTAACTCCGGAAGCTCTACTGGAAGTCCATCAAAGAAACCAGCA
GCTGGTTCAAACCCTGGAGCTGGAACTCCCTCTCAGGATACAAACAATGAATCCGAAGAT
ACCACGAACGCTGCTTCTACTTCAACTGCAACTCAAAGTACTAGCCAGACCAAGGAGGTG
ACAGTGACAGAAGTCGAGACTCAGACTTCCCAACAAGTTATGACATTCATAATGAACCTA
GAGAAGAAGAGTCCGCAGAAGGAGGAATACAAGCAATTTTTCGAGAAACTAAAGAGTACC
ATGACAGGAAAAGTTTCTTCTCCAAAGAAAAAAGGAGGCTTGTTCGCTATGATCAAAGGT
GCTGTTGGAAAAATAGGCGATGCCATGCAATTTATTCGTCCAAGACTTGCAAACAAATCA
GCAGAAGTAAAGAAGTCAATGGAAACTTACCAAGCAGAAGTGATAAAGAATATGGAAGAG
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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T

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C

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TA
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TTTTTTGATTGTTCTTCTTCGTTTTTATAAATAATAATTTTTTTTTTCCACATGAAATTT
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GCCTTTGGGAACGCATGGATCCTTTAATTATGTCTCGACGAAAATCAGATTGTTCTGAAT
AACGAATCAAAGTCATTTCATCTGGTTGATCAGAATTTTGATTATC

QA 3 768 3 768
DS 

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AAACGGAAATATGATTTTTATCTGAATACCATCCGTTAACCAGTTTCGTGGAAATTCTGT
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TCTTATTATTTGAGCAAATAGGAAGCTATCCCAAGTTTCCGCAATTTCTAGGCGTCTTTG
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TCTATTCTATCAAAAAAAAGGGGCGAATGTGCTTTTGCTTGCAAAAATTCCCAAATAACA
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TCTGAATAACGAATCAAAGTCATTTCATCTGGTTGATCAGAATTTTGATTATCTTTGAGA
TTAGTATAAATCTCGTT
C

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DS 

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ATCAAAGTCATTTCATCTGGTTGATCAGAATTTTGATTATCTTTGAGATTAGTATAAATC
TCGTTATGCGGTTCTTTTAAATCAGTAAAAACCACTACAAGTTTTGCTTTTCTTGAACGA
ATTCCAGGCTCGGTTGGTATATTTTCTTCAGTTTCGCCTTCCACCGCTTCCAATTCACTT
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TTAATCTTCAGAAGTATACCATGAATTTTGTTTATCCAAGATCCTCTTATATTCTTTTTT
TTATAGGTTTTGGTTATGATTTGGAACGGAGATAATTTTTTGATTCTTCCGCGCGAGATC
CCA

QA 1 603 1 603
DS 

RD RS1CV71TF 503 0 0
TTTTTCTCTATTGATAAAGATTTTCTTTTAAATTTTTCTATTGTTTGTTCAAATTTTTGA
GAATTAATCTTCAGAAGTATACCATGAATTTTGTTTATCCAAGATCCTCTTATATTCTTT
TTTTTATAGGTTTTGGTTATGATTTGGAACGGAGATAATTTTTTGATTCTTCCGCGCGAG
ATCCCATGTAAAAATGGGTCATAAATTTTAGGTAAATATTCTTTTTGAGTTTCGTTATGA
CAAAATCGAGTCGTTTTTTCCAGTATATTTTCAACAGACCATTTCTTATCTAAAGCTTCA
ATCCTATTTAAAAATTCGTTTTTTAAATTTTCCTTTTTTTCTTCATTGACCAAACTCCAA
CAAGTATAAACTTGATCCGAGGGTGTTTTTTCTGTTGTAAATGAAGGGATCTTTTTTTGT
ATCATTTCAAAAAACGTTGAAAGGTTGGGGGGATATGTAAAAGATATTCGTTCTTTTCCA
TCACTTTGGCATGTATAAAAAAA

QA 1 503 1 503
DS 

RD RS1EH14JQ 778 0 0
CATTGACCAAACTCCAACAAGTATAAACTTGATCCGAGGGTGTTTTTTCTGTTGTAAATG
AAGGGATCTTTTTTTGTATCATTTCAAAAAAAGTTGAAAGGTTGGGGGGATATGTAAAAG
ATATTCGTTCTTTTCCATCACTTTGGCATGTATAAAAAAAATATTGTGACATTTCATTTC
TTACAGTATTTTCAATTTTATCATTTTTTATATATCGATTTGGTCTATTCCATCTTTTAT
AATCGAAAACTAGAGTTACAAAAGGTTTTTCAAACCATAAAAAATGATCCTCTTTTTTTT
TATTTTGAAAAATTCTAAATTCGAATTTTCTTTGTTTCCATCTCGATTTTCAAAAACTGT
TTTATAGTTATAGTATGTTCGAACGTGGAATTCATCATCCTTATTAATTTTGTCTTTTCC
ATTCACTCCGATTTCTTCCATTTCATCGATTTTGTCCAGATCCTCCCTTTCTTCCGAAAA
AAGAAAAGGAAAAGGAGCTTCTTCGGTGGATACCTCTTGGTCCTGTTTAGTCCCACCCGT
TTCTGAGGTTCCTTTTAGTTTCTTAGTAAAAATGGGTGATGGTATTCTGCCTAAATAGTA
GACACAGGTAATAAATAAGATAATACTAAAGATTCGAGTCATAGAATTTCTCAATTCTGA
CACAAGGAACTTATACTTATTAGATCTAATAAGTACATTAGACCTAATAGAATTATTTTG
CTGTATCCAGACTAATACCAATCCAACCCATTTCATGAATAAAATGTGACCAATTAAC

QA 1 778 1 778
DS 

RD RS1CB71JQ 735 0 0
A
TTTCCATCTCGATTTTCAGAAACTGTTTTATAGTTATAGTATGTTCGAACGTGGAATTCA
TCATCCTTATTAATTTTGTCTTTTCCATTCACTCCGATTTCTTCCATTTCATCGATTTTG
TCCAGGTCCTCCCTTTCTTCCGAAAAAAGAAAAGGAAAAGGAGCTTCTTCGGTGGATACC
TCTTGGTCCTGTTTAGTCCCACCCGTTTCTGAGGTTCCTTTTAGTTTCTTAGTAAAAATG
GGTGATGGTATTCTGCCTAAATAGTAGACACAGGTAATAAATAAGATAATACTAAAGATT
CGAGTCATAAAATTTCTCAATTCTGACACAAGGAACTTATACTTATTAGATCTAATAAGT
ACATTAGACCTAATAGAATTATTTTGCTGTATCCAGACTAATACCAATCCAACCCATTTC
ATGAATAAAATGTGACCAATTAACCAACCAACAAAACTACTTGTTACAAATAACATCTTG
TTGTTGCATCGAAACATATAAATGTTGACTAATCTGGCTAACATTGAACTTGGTAAAATG
AAATGGTTGAATAATTGAAAAATGAAATTATTCAGGAATACACATTGAATGCGAAGATTA
CGCATTTCATTTCTGGTAGTAGATCCATAATCAAAAAAGTGTTTGTGATTGTTCCAGAAG
AAATGAAACAAAAGATACGGTAGAGCTAGGACAGTTATTGTATGAGGTCTACCCAATGCT
AAATGCAGAGGCGC

QA 2 735 2 735
DS 

RD RS1EH14TF 610 0 0
TTAGTCCCACCCGTTTCTGAGGTTCCTTTTAGTTTCTTAGTAAAAATGGGTGATGGTATT
CTGCCTAAATAGTAGACACAGGTAATAAATAAGATAATACTAAAGATTCGAGTCATAGAA
TTTCTCAATTCTGACACAAGGAACTTATACTTATTAGATCTAATAAGTACATTAGACCTA
ATAGAATTATTTTGCTGTATCCAGACTAATACCAATCCAACCCATTTCATGAATAAAATG
TGACCAATTAACCAACCAACAAAACTACTTGTTACAAATAACATCTTGTTGTTGCATCGA
AACATATAAATGTTGACTAATCTGGCTAACATTGAACTTGGTAAAATGAAATGGTTGAAT
AATTGAAAAATGAAATTATTCAGGAATACACATTGAATGCGAAGATTACGCATTTCATTT
CTGGTAGTAGATCCATAATCAAAAAAGTGTTTGTGATTGTTCCAGAAGAAATGAAACAAA
AGATACGGTAGAGCTAGGACAGTTATTGTATGAGGTCTACCCAATGCTAAATGCAGAGGC
GCATAATAGATCGATATGAACATCATGAGCTGTCCCGCAATAAAACCAGTTGTTGCTGAT
ACTTTCTTC
C

QA 1 609 1 609
DS 

RD RS1CB71TF 627 0 0
ATCCAGACTA*TACCAATCCAACCCATTTCATGAATAAAATGTGACCAATTAACCAACCA
ACAAAACTACTTGTTACAAATAACATCTTGTTGTTGCATCGAAACATATAAATGTTGACT
AATCTGGCTAACATTGAACTTGGTAAAATGAAATGGTTGAATAATTGAAAAATGAAATTA
TTCAGGAATACACATTGAATGCGAAGATTACGCATTTCATTTCTGGTAGTAGATCCATAA
TCAAAAAAGTGTTTGTGATTGTTCCAGAAGAAATGAAACAAAAGATACGGTAGAGCTAGG
ACAGTTATTGTATGAGGTCTACCCAATGCTAAATGCAGAGGCGCATAATAGATCGATATG
AACATCATGAGCTGTCCCGCAATAAAACCAGTTGTTGCTGATACTTTCTTCTCGGTTCCT
TCTTCTCCTTCGTCCATAACCCGAGCTCGGAGAAGGAAGAGATAAGAGGGCCCTATGGAG
AATGTGGTCAGAAATCCATAATAGAGTCCGACCACAGCGACCGAATTGATTATCTTCATG
CATAAGGATACTAGATTACCTAGTATAAAAGATTGAAAAACCATCACAAACCTCCCTTTT
TTCTTTTCTATTTCAATTTCTGGATTC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 2 14

CO CL117Contig1 800 12 10 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGACTCCAAGCA
AAGAAAAAATACAAGACCAACAGTCTTAGGAAAACTAAGACATATATGGCTATGGAGTTA
GAGCTTGATGATGATGTCTTCTTTGCAGACATAAGCAAACAGATCTCTCTTCTCATTATG
GATGAAGATGAACAGTTAAACCATGTCTCTCTCTCTACCTCCTCTCTTGCGTTCCAGGGT
ATGTTCAGAGGAAGCTACCAAACGGATCCATATATGTTACATAAAGAACCAAGCAAAGGA
ACTGGTGTGTTCATCCCTAAATCTTCTCAGTCCAGAAGAAGACCTCATCATCCGAAGCAA
GGTAGGGTTAATTCCTTCAACACCAAGCAACACAACCCTCTTCATCAAAACAGACAACAG
TATCAAGACAACTCAAGGTGTACTCTCACAACTCACAACAACAACAAGAGCAGCATGAAC
ACTAATAATGTTCATGCTTCTATCCCAAAAAGAACCTACAGAGATGCAACATCTATCTAC
ACTTGATTAATTTTTAACAAATATTCTGCTTTATTCATGGTTTTTGTGTGATTGATTCAT
ATAATTATATATAGATGCATAAGCTTTATTTATTTGTAGATCAGCAAATAATAAGGATTC
TTCCATAAGGAAGGTCTTGGAGATTTGTTCCAAGTTTGTTCTTGTTTTAATGTAATTCTT
TCATGTCATTCTAGAGATATTCACTGACTTATCTCCATTTGTAAAATATTTTTAAGGATT
AAATCAAAAATCAACTTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 55 55 55 55 55 55 55 5 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 0 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 
65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 35 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 35 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RS1AR44JQ C 47
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AF RS1CL21JQ C 245
AF RS1CL21TF U 245
AF RS1F470TF U 49
AF RS1BL44TF U 54
AF RS1A335TV U 1
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AF RS1AR44TFB U 47
AF RS1BL44JQ C 55
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AF RS1F470JQ C 70
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BS 787 798 RS1AR44TFB
BS 799 800 RS1BL44JQ

RD RS1AR44JQ 344 0 0
GGCC
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TATGGAGTTAGAGCTTGATGATGATGTCTTCTTTGCAGACATAAGCAAACAGATCTCTCT
TCTCATTATGGATGAAGATGAACAGTTAAACCATGTCTCTCTCTCTACCTCCTCTCTTGC
GTTCCAGGGTATGTTCAGAGGAAGCTACCAAACGGATCCATATATGTCTCATAAAGAACC
AAGCAAAGGAACTGGTGTGTTCATCCCTAAATCTTCTCAGTCCAGAAGAAGACCTCATCA
TCCGAAGCAAGGTAGGGTTAATTCCTTCAACACCAAGCAA

QA 5 344 5 344
DS 

RD RS1D548TF 571 0 0
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CTTCTCATTATGGATGAAGATGAACAGTTAAACCATGTCTCTCTCTCTACCTCCTCTCTT
GCGTTCCAGGGTATGTTCAGAGGAAGCTACCAAACGGATCCATATATGTTACATAAAGAA
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CATCCGAAGCAAGGTAGGGTTAATTCCTTCAACACCAAGCAACACAACCCTCTTCATCAA
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AGCAGCATGAACACTAATAATGTTCATGCTTCTATCCCAAAAAGAACCTACAGAGATGCA
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TGATTGATTCATATAATTATATATAGATGCA

QA 1 571 1 571
DS 

RD RS1CL21JQ 461 0 0
G
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TGTGTTCATCCCTAAATCTTCTCAGTCCAGAAGAAGACCTCATCATCCGAAGCAAGGTAG
GGTTAATTCCTTCAACACCAAGCAACACAACCCTCTTCATCAAAACAGACAACAGTATCA
AGACAACTCAAGGTGTACTCTCACAACTCACAACAACAACAAGAGCAGCATCAACACTGA
TAATGTTCATGCTTCTATCCCAAAAAGAACCTACAGAGATGCAACATCTATCTACACTTG
ATTAATGTTTAACAAATATTCCGCATTATTCATGGTTTTTGTGTGATTGATTCATATAAT
TATATATAGATGCATAAGCTTTATTTATTTGTAGATCAGCAAATAATAAGGATTCTTCCA
TAAGGAAGGTCTTGGAGATTTGTTCCAAGTTTGTTCTTGT

QA 2 461 2 461
DS 

RD RS1CL21TF 461 0 0
G
CAGAGGAAGCTACCAAACGGATCCATATATGTTTCATAAAGAACCAAGCAAAGGAACTGG
TGTGTTCATCCCTAAATCTTCTCAGTCCAGAAGAAGACCTCATCATCCGAAGCAAGGTAG
GGTTAATTCCTTCAACACCAAGCAACACAACCCTCTTCATCAAAACAGACAACAGTATCA
AGACAACTCAAGGTGTACTCTCACAACTCACAACAACAACAAGAGCAGCATCAACACTGA
TAATGTTCATGCTTCTATCCCAAAAAGAACCTACAGAGATGCAACATCTATCTACACTTG
ATTAATGTTTAACAAATATTCCGCATTATTCATGGTTTTTGTGTGATTGATTCATATAAT
TATATATAGATGCATAAGCTTTATTTATTTGTAGATCAGCAAATAATAAGGATTCTTCCA
TAAGGAAGGTCTTGGAGATTTGTTCCAAGTTTGTTCTTGT

QA 2 461 2 461
DS 

RD RS1F470TF 709 0 0
GGACTCCAAGCAAAGAAAAAACACAAGACTGACAGTCTTAGGAAAACTAAGACATATATG
GCTATGGAGTTAGAGCTTGATGATGATGTCTTCTTTGCAGACATAAGCAAACAGATCTCT
CTTCTCATTATGGATGAAGATGAACAGTTAAACCATGTCTCTCTCTCTACCTCCTCTCTT
GCGTTCCAGGGTATGTTCAGAGGAAGCTACCAAACGGATCCATATATGTTTCATAAAGAA
CCAAGCAAAGGAACTGGTGTGTTCATCCCTAAATCTTCTCAGTCCAGAAGAAGACCTCAT
CATCCGAAGCAAGGTAGGGTTAATTCCTTCAACACCAAGCAACACAACCCTCTTCATCAA
AACAGACAACAGTATCGAGACAACTCAAGGTGTACTCTCACAACTCACAACAACAACAAG
AGCAGCATCAACACTGATAATGCTCATGCTTCTATCCCAAAAAGAACCTACAGAGATGCA
ACATCTATCTACACTTGATTAATGTTTAACAAATATTCTGCATTATTCATGGTTTTTGTG
TGATTGATTCATATAATTATATATAGATGCATAAGCTTTATTTATTTGTAGATCAGCAAA
TAATAAGGATTCTTCCATAAGGAAGGTCTTGGAGATTTGTTCCAAGTTTGTTCTTGTTTT
AATGTAATT*TTTCATGTCATTCTAGAGATATTCACTGACTTATCTCCA

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1BL44TF 717 0 0
GG
AAGCAAAGAAAAAATACAAGACCAACAGTCTTAGGAAAACTAAGACATATATGGCTATGG
AGTTAGAGCTTGATGATGATGTCTTCTTTGCAGACATAAGCAAACAGATCTCTCTTCTCA
TTATGGATGAAGATGAACAGTTAAACCATGTCTCTCTCTCTACCTCCTCTCTTGCGTTCC
AGGGTATGTTCAGAGGAAGCTACCAAACGGATCCATATATGTTACATAAAGAACCAAGCA
AAGGAACTGGTGTGTTCATCCCTAAATCTTCTCAGTCCAGAAGAAGACCTCATCATCCGA
AGCAAGGTAGGGTTAATTCCTTCAACACCAAGCAACACAACCCTCTTCATCAAAACAGAC
AACAGTATCAAGACAACTCAAGGTGTACTCTCACAACTCACAACAACAACAAGAGCAGCA
TGAACACTAATAATGTCCATGCTTCTATCCCAAAAAGAACCTACAGAGATGCAACATCTA
TCTACACTTGATTAATTTTTAACAAATATTCTGCTTTATTCATGGTTTTTGTGTGATTGA
TTCATATAATTATATATAGATGCATAAGCTTTATTTATTTGTAGATCAGCAAATAATAAG
GATTCTTCCATAAGGAAGGTCTTGGAGATTTGTTCCAAGTTTGTTCTTGTTTTAATGTAA
TTCTTTCATGTCATTCTAGAGATATTCACTGACTTATCTCCATTTGTAAAATATT

QA 3 717 3 717
DS 

RD RS1A335TV 785 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGACTCCAAGCA
AAGAAAAAATACAAGACCAACAGTCTTAGGAAAACTAAGACATATATGGCTATGGAGTTA
GAGCTTGATGATGATGTCTTCTTTGCAGACATAAGCAAACAGATCTCTCTTCTCATTATG
GATGAAGATGAACAGTTAAACCATGTCTCTCTCTCTACCTCCTCTCTTGCGTTCCAGGGT
ATGTTCAGAGGAAGCTACCAAACGGATCCATATATGTTACATAAAGAACCAAGCAAAGGA
ACTGGTGTGTTCATCCCTAAATCTTCTCAGTCCAGAAGAAGACCTCATCATCCGAAGCAA
GGTAGGGTTAATTCCCTCAACACCAAGCAACACAACCCTCTTCATCAAAACAGACAACAG
TATCAAGACAACTCAAGGTGTACTCTCACAACTCACAACAACAACAAGAGCAGCATGAAC
ACTAATAATGTTCATGCTTCTATCCCAAAAAGAACCTACAGAGATGCAACATCTATCTGC
ACTTGATTAATTTTTAACAAATATTCTGCTTTATTCATGGTTTTTGTGTGATTGATTCAT
ATAATTATATATAGATGCATAAGCTTTATTTATTTGTAGATCAGCAAATAATAAGGATTC
TTCCATAAGGAAGGTCTTGGAGATTTGTTCCAAGTTTGTTCTTGTTTTAATGTAATTCTT
TCATGTCATTCTAGAGATATTCACTGACTTATCTCCATTTGTAAAATATTTTTAAAGATT
AAATC

QA 1 785 1 785
DS 

RD RS1A335TF 780 0 0
CGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGACTCCAAGCAAAGAAA
AAATACAAGACCAACAGTCTTAGGAAAACTAAGACATATATGGCTATGGAGTTAGAGCTT
GATGATGATGTCTTCTTTGCAGACATAAGCAAACAGATCTCTCTTCTCATTATGGATGAA
GATGAACAGTTAAACCATGTCTCTCTCTCTACCTCCTCTCTTGCGTTCCAGGGTATGTTC
AGAGGAAGCTACCAAACGGATCCATATATGTTACATAAAGAACCAAGCAAAGGAACTGGT
GTGTTCATCCCTAAATCTTCTCAGTCCAGAAGAAGACCTCATCATCCGAAGCAAGGTAGG
GTTAATTCCCTCAACACCAAGCAACACAACCCTCTTCATCAAAACAGACAACAGTATCAA
GACAACTCAAGGTGTACTCTCACAACTCACAACAACAACAAGAGCAGCATGAACACTAAT
AATGTTCATGCTTCTATCCCAAAAAGAACCTACAGAGATGCAACATCTATCTGCACTTGA
TTAATTTTTAACAAATATTCTGCTTTATTCATGGTTTTTGTGTGATTGATTCATATAATT
ATATATAGATGCATAAGCTTTATTTATTTGTAGATCAGCAAATAATAAGGATTCTTCCAT
AAGGAAGGTCTTGGAGATTTGTTCCAAGTTTGTTCTTGTTTTAATGTAATTCTTTCATGT
CATTCTAGAGATATTCACTGACTTATCTCCATTTGTAAAATATTTTTAAGGATTAAATCA

QA 1 780 1 780
DS 

RD RS1AR44TFB 753 0 0
GGCC
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TATGGAGTTAGAGCTTGATGATGATGTCTTCTTTGCAGACATAAGCAAACAGATCTCTCT
TCTCATTATGGATGAAGATGAACAGTTAAACCATGTCTCTCTCTCTACCTCCTCTCTTGC
GTTCCAGGGTATGTTCAGAGGAAGCTACCAAACGGATCCATATATGTCTCATAAAGAACC
AAGCAAAGGAACTGGTGTGTTCATCCCTAAATCTTCTCAGTCCAGAAGAAGACCTCATCA
TCCGAAGCAAGGTAGGGTTAATTCCTTCAACACCAAGCAACACAACCCTCTTCATCAAAA
CAGACAACAGTATCAAGACAACTCAAGGTGTACTCTCACAACTCACAACAACAACAAGAG
CAGCATCAACACTGATAATGTTCATGCTTCTATCCCAAAAAGAACCTACAGAGATGCAAC
ATCTATCTACACTTGATTAATGTTTAACAAATATTCTGCATTATTCATGGTTTTTGTGTG
ATTGATTCATATAATTATATATAGATGCATAAGCTTTATTTATTTGTAGATCAGCAAATA
ATAAGGATTCTTCCATAAGGAAGGTCTTGGAGATTTGTTCCAAGTTTGTTCTTGTTTTAA
TGTAATTTTTTCATGTCATTCTAGAGATATTCACTGACCTATCTCCATTTGTAAAATATT
TTTAAGGATTAAATCAAAAATCAACTTG
T

QA 5 752 5 752
DS 

RD RS1BL44JQ 746 0 0
G
AAGCAAAGAAAAAATACAAGACCAACAGTCTTAGGAAAACTAAGACATATATGGCTATGG
AGTTAGAGCTTGATGATGATGTCTTCTTTGCAGACATAAGCAAACAGATCTCTCTTCTCA
TTATGGATGAAGATGAACAGTTAAACCATGTCTCTCTCTCTACCTCCTCTCTTGCGTTCC
AGGGTATGTTCAGAGGAAGCTACCAAACGGATCCATATATGTTACATAAAGAACCAAGCA
AAGGAACTGGTGTGTTCATCCCTAAATCTTCTCAGTCCAGAAGAAGACCTCATCATCCGA
AGCAAGGTAGGGTTAATTCCTTCAACACCAAGCAACACAACCCTCTTCATCAAAACAGAC
AACAGTATCAAGACAACTCAAGGTGTACTCTCACAACTCACAACAACAACAAGAGCAGCA
TGAACACTAATAATGTCCATGCTTCTATCCCAAAAAGAACCTACAGAGATGCAACATCTA
TCTACACTTGATTAATTTTTAACAAATATTCTGCTTTATTCATGGTTTTTGTGTGATTGA
TTCATATAATTATATATAGATGCATAAGCTTTATTTATTTGTAGATCAGCAAATAATAAG
GATTCTTCCATAAGGAAGGTCTTGGAGATTTGTTCCAAGTTTGTTCTTGTTTTAATGTAA
TTCTTTCATGTCATTCTAGAGATATTCACTGACTTATCTCCATTTGTAAAATATTTTTAA
GGATTAAATCAAAAATCAACTTGTG

QA 2 746 2 746
DS 

RD RS1D548JQ 700 0 0
CATATATGGCTATGGAGTTAGAGCTTGATGATGATGTCTTCTTTGCAGACATAAGCAAAC
AGATCTCTCTTCTCATTATGGATGAAGATGAACAGTTAAACCATGTCTCTCTCTCTACCT
CCTCTCTTGCGTTCCAGGGTATGTTCAGAGGAAGCTACCAAACGGATCCATATATGTTAC
ATAAAGAACCAAGCAAAGGAACTGGTGTGTTCATCCCTAAATTTTCTCAGTCCAGAAGAA
GACCTCATCATCCGAAGCAAGGTAGGGTTAATTCCTTCAACACCAAGCAACACAACCCTC
TTCATCAAAACAGACAACAGTATCAAGACAACTCAAGGTGTACTCTCACAACTCACAACA
ACAACAATAGCAGCATGAACACTAATAATGTTCATGCTTCTATCCCAAAAAGAACCTACA
GAGATGCAACATCTATCTACACTTGATTAATTTTTAACAAATATTCTGCTTTATTCATGG
TTTTTGTGTGATTGATTCATATAATTATATATAGATGCATAAGCTTTATTTATTTGTAGA
TCAGCAAATAATAAGGATTCTTCCATAAGGAAGGTCTTGGAGATTTGTTCCAAGTTTGTT
CTTGTTTTAATGTAATTCTTTCATGTCATTCTAGAGATATTCACTGACTTATCTCCATTT
GTAAAATATTTTTAAGGATTAAATCAAAAATCAACTTG
CG

QA 1 698 1 698
DS 

RD RS1F470JQ 731 0 0
CACAAGACTGACAGTCTTAGGAAAACTAAGACATATATGGCTATGGAGTTAGAGCTTGAT
GATGATGTCTTCTTTGCAGACATAAGCAAACAGATCTCTCTTCTCATTATGGATGAAGAT
GAACAGTTAAACCATGTCTCTCTCTCTACCTCCTCTCTTGCGTTCCAGGGTATGTTCAGA
GGAAGCTACCAAACGGATCCATATATGTTTCATAAAGAACCAAGCAAAGGAACTGGTGTG
TTCATCCCTAAATCTTCTCAGTCCAGAAGAAGACCTCATCATCCGAAGCAAGGTAGGGTT
AATTCCTTCAACACCAAGCAACACAACCCTTTTCATCAAAACAGACAACAGTATCGAGAC
AACTCAAGGTGTACTCTCACAACTCACAACAACAACAAGAGCAGCATCAACACTGATAAT
GCTCATGCTTCTATCCCAAAAAGAACCTACAGAGATGCAACATCTATCTACACTTGATTA
ATGTTTAACAAATATTTTGCATTATTCATGGTTTTTGTGTGATTGATTCATATAATTATA
TATAGATGCATAAGCTTTATTTATTTGTAGATCAGCAAATAATAAGGATTCTTCCATAAG
GAAGGTCTTGGAGATTTGTTCCAAGTTTGTTCTTGTTTTAATGTAATT*TTTCATGTCAT
TCTAGAGATATTCACTGACTTATCTCCATTTGTAAAATATTTTTAAGGATTAAATCAAAA
ATCAACTTG
TG

QA 1 729 1 729
DS 



CO CL117Contig2 842 2 2 U
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TGGCTATGGAGTTAGAGCTTGATGATGATGTCTTCTTTGCAGACATAAGCAAACAGATCT
CTCTTCTCATTATGGATGAAGATGAACAGTTAAACCATGTCTCTCTCTCTACCTCCTCTC
TTGCGTTCCAGGTTTTTTCATCTGTCCACACATATAATCTCTCTCTCTCAAAACATACCT
CTATCTAACTGTTTGTTTCTTGAATCTTTGTGGAAACAGGGTATGTTCAGAGGAAGCTAC
CAAACAGCTCCATATATGTATCATAAGGAACCAAGCAAAGGAACTGGTGTGTTCATCCCT
AAATCTTCTCAGTCCAGAAGAAGACCTCATCATCCGAAGCAAGGTAGGTTTAGTTCCTTC
AACGCCAAGCAACATAACCCTCTTCATCAAAACAGACAACAGTATCAAGACAACTCAAGG
TGTACCCTCACAACTCACAGCAACAACAAGAGCAGCATGATCACTAATAATGTTCATGCT
TCTATCCCAAAAAGAACCTACAGAGATGCAGCATCTATCTACACTTGATTAATTTTTAAC
AAATATTCTGTATTATTCATGTTTTTTGTGTGATTGATTCATATAATTATATATAGATGC
ATAAGATTTATTTATTTGTAGATCAGCAAATAATAAGTATTCTTTCATAAGGAAGGTCTT
GGAGATTTGTTCCAAGTTTGTTCTTGTTTTAATGTAATTCTTTCATGTCATTTTAGAGAT
ATTCACTGACTTATCTCGTTTTGTAAAATATGTTTAAGGATTAAATCAAAAATCAACTTG
CG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1GZ66TF U 1
AF RS1GZ66JQ C 52
BS 1 697 RS1GZ66TF
BS 698 842 RS1GZ66JQ

RD RS1GZ66TF 705 0 0
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TGGCTATGGAGTTAGAGCTTGATGATGATGTCTTCTTTGCAGACATAAGCAAACAGATCT
CTCTTCTCATTATGGATGAAGATGAACAGTTAAACCATGTCTCTCTCTCTACCTCCTCTC
TTGCGTTCCAGGTTTTTTCATCTGTCCACACATATAATCTCTCTCTCTCAAAACATACCT
CTATCTAACTGTTTGTTTCTTGAATCTTTGTGGAAACAGGGTATGTTCAGAGGAAGCTAC
CAAACAGCTCCATATATGTATCATAAGGAACCAAGCAAAGGAACTGGTGTGTTCATCCCT
AAATCTTCTCAGTCCAGAAGAAGACCTCATCATCCGAAGCAAGGTAGGTTTAGTTCCTTC
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TGTACCCTCACAACTCACAGCAACAACAAGAGCAGCATGATCACTAATAATGTTCATGCT
TCTATCCCAAAAAGAACCTACAGAGATGCAGCATCTATCTACACTTGATTAATTTTTAAC
AAATATTCTGTATTATTCATGTTTTTTGTGTGATTGATTCATATAATTATATATAGATGC
ATAAGATTTATTTATTTGTAGATCAGCAAATAATAAG
TATCTTTC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RS1GZ66JQ 791 0 0
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AACAGATCTCTCTTCTCATTATGGATGAAGATGAACAGTTAAACCATGTCTCTCTCTCTA
CCTCCTCTCTTGCGTTCCAGGTTTTTTCATCTGTCCACACATATAATCTCTCTCTCTCAA
AACATACCTCTATCTAACTGTTTGTTTCTTGAATCTTTGTGGAAACAGGGTATGTTCAGA
GGAAGCTACCAAACAGCTCCATATATGTATCATAAGGAACCAAGCAAAGGAACTGGTGTG
TTCATCCCTAAATCTTCTCAGTCCAGAAGAAGACCTCATCATCCGAAGCAAGGTAGGTTT
AGTTCCTTCAACGCCAAGCAACATAACCCTCTTCATCAAAACAGACAACAGTATCAAGAC
AACTCAAGGTGTACCCTCACAACTCACAGCAACAACAAGAGCAGCATGATCACTAATAAT
GTTCATGCTTCTATCCCAAAAAGAACCTACAGAGATGCAGCATCTATCTACACTTGATTA
ATTTTTAACAAATATTCTGTATTATTCATGTTTTTTGTGTGATTGATTCATATAATTATA
TATAGATGCATAAGATTTATTTATTTGTAGATCAGCAAATAATAAGTATTCTTTCATAAG
GAAGGTCTTGGAGATTTGTTCCAAGTTTGTTCTTGTTTTAATGTAATTCTTTCATGTCAT
TTTAGAGATATTCACTGACTTATCTCGTTTTGTAAAATATGTTTAAGGATTAAATCAAAA
ATCAACTTGCG

QA 1 791 1 791
DS 



AS 3 14

CO CL118Contig1 789 6 34 U
GGATCAACTTCAGTAGTCTTCTTCTTCATTGCTATTGCTATCTCTCACTCTCTGTTTTGT
CCAAAAATGGCCCTTCAAGCCGCTTCTTTGGTCTCCTCTGCTTTCTCTGTCCGAAAAGAT
GTAAAACTGAATGCTTCTTCATCATCATCCTTCAAGGACTCGAGTCTCTTTGGTGCCTCC
TTTGCCGATCAGATCAAATCCGAACATGGCTCTTCCTCGCTAAGATTCAAGAGGAATGTA
GCGATTAGAGCTCAAACCGCCGCAACTTCAAGCCCCTCCATCACAAAATCTCCAGTAGAC
GGCAAGAAGACCTTGAGGAAAGGCAACGTGGTGGTCACGGGAGCTTCGTCAGGGTTAGGT
CTAGCCACGGCCAAAGCCCTCGCCGAGACGGGGAAATGGCACGTGATAATGGCGTGCAGG
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ACATTTTCTTCTCTCGAGGTTGTTGCTTGATGACTTGAACAAGTCTGATTACCCTTCAAA
GCGTCTCATCATTGTCGGATCCATTACAGGAACACGATACATTGGCTGGTACGTACCACC
GAAAGCTAC


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 20 
35 10 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 10 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FS10TF U 1
AF RS1AI51TF U 1
AF RS1E105TF U 4
AF RS1F557TF U 13
AF RS1EQ83TF U 4
AF RS1GI22TF U 1
BS 1 87 RS1AI51TF
BS 88 88 RS1FS10TF
BS 89 113 RS1AI51TF
BS 114 114 RS1FS10TF
BS 115 119 RS1AI51TF
BS 120 120 RS1FS10TF
BS 121 121 RS1AI51TF
BS 122 122 RS1FS10TF
BS 123 208 RS1AI51TF
BS 209 209 RS1FS10TF
BS 210 240 RS1AI51TF
BS 241 241 RS1FS10TF
BS 242 244 RS1AI51TF
BS 245 245 RS1FS10TF
BS 246 291 RS1AI51TF
BS 292 292 RS1FS10TF
BS 293 296 RS1AI51TF
BS 297 297 RS1FS10TF
BS 298 323 RS1AI51TF
BS 324 324 RS1FS10TF
BS 325 434 RS1AI51TF
BS 435 435 RS1FS10TF
BS 436 527 RS1AI51TF
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BS 529 624 RS1AI51TF
BS 625 625 RS1E105TF
BS 626 645 RS1AI51TF
BS 646 646 RS1GI22TF
BS 647 699 RS1AI51TF
BS 700 700 RS1F557TF
BS 701 711 RS1AI51TF
BS 712 712 RS1GI22TF
BS 713 745 RS1AI51TF
BS 746 789 RS1GI22TF

RD RS1FS10TF 536 0 0
GGATC
AACTTCAGTAGTCTTCTTCTTCATTGCTATTGCTATCTCTCACTCTCTGTTTTGTCCAAA
AATGGCCCTTCAAGCCGCTTCTTTGGTCTCCTCTGCTTTCTCTGTCCGAAAAGATGTAAA
ACTGAATGCTTCTTCATCATCATCCTTCAAGGACTCGAGTCTCTTTGGTGCCTCCTTTGC
CGATCAGATCAAATCCGAACATGGCTCTTCCTCGCTAAGATTCAAGAGGAATGTAGCGAT
TAGAGCTCAAACCGCCGCAACTTCAAGCCCCTCCATCACAAAATCTCCAGTAGACGGCAA
GAAGACCTTGAGGAAAGGCAACGTGGTGGTCACGGGAGCTTCGTCAGGGTTAGGTCTAGC
CACGGCCAAAGCCCTCGCCGAG*CGGGGAAATGGCACGTGATAATGGCGTGCAGGGACTT
CCTCAAAGCGGAGAGAGCGGCCAAATCCGCAGGGATGCCTAAAGACAGCTACACGGTGAT
GCATCTAGACTTGGCTTCGTTAGACAGCGTGAGACAGTTCGTCGATAGCTT

QA 6 536 6 536
DS 

RD RS1AI51TF 745 0 0
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CCAAAAATGGCCCTTCAAGCCGCTTCTCTGGTCTCCTCTGCTTTCTCTGTCCGCAAAGAC
GGAAAACTGAATGCTTCTTCATCATCATCCTTCAAGGACTCGAGTCTCTTTGGTGCCTCC
TTTGCCGATCAGATCAAATCCGAACATGTCTCTTCCTCGCTAAGATTCAAGAGGAATGTA
ACGACTAGAGCTCAAACCGCCGCAACTTCAAGCCCCTCCATCACAAAATCTTCAGTTGAC
GGCAAGAAGACCTTGAGGAAAGGTAACGTGGTGGTCACGGGAGCTTCGTCAGGGTTAGGT
CTAGCCACGGCCAAAGCCCTCGCCGAGACGGGGAAATGGCACGTGATAATGGCGTGCAGG
GACTTCCTCAAAGCCGAGAGAGCGGCCAAATCCGCAGGGATGCCTAAAGACAGCTACACG
GTGATGCATCTAGACTTGGCTTCGTTAGACAGCGTGAGACAGTTCGTTGATAGCTTCAGG
AGATCGGAGATGCCTCTCGATGTTTTGGTCTGCAACGCTGCTGTCTATTTCCCGACAGCT
AAAGAGCCTACTTACAGCGCAGAA*GGGTTTGAGCTTAGCGTTGCAACCAATCATTTGGG
ACATTTTCTTCTCTCGAGGTTGTTGCTTGATGACTTGAAGAAGTCTGATTATCCTTCAAA
GCGTCTCATCATTGTCGGATCCATT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1E105TF 731 0 0
GG
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AATGGCCCTTCAAGCCGCTTCTCTGGTCTCCTCTGCTTTCTCTGTCCGCAAAGATGGAAA
ACTGAATGCTTCTTCATCATCATCCTTCAAGGACTCGAGTCTCTTTGGTGCCTCCTTTGC
CGATCAGATCAAATCCGAACATGTCTCTTCCTCGCTAAGATTCAAGAGGAATGTAGCGAT
TAGAGCTCAAACCGCCGCAACTTCAAGCCCCTCCATCACAAAATCTTCAGTTGACGGCAA
GAAGACCTTGAGGAAAGGTAACGTGGTGGTCACGGGAGCTTCGTCAGGGTTAGGTCTAGC
CACGGCCAAAGCCCTCGCCGAGACGGGGAAATGGCACGTGATAATGGCGTGCAGGGACTT
CCTCAAAGCCGAGAGAGCGGCCAAATCCGCAGGGATGCCTAAAGACAGCTACACGGTGAT
GCATCTAGACTTGGCTTCGTTAGACAGCGTGAGACAGTTCGTTGATAGCTTCAGGAGATC
GGAGATGCCTCTCGATGTTTTGGTCTGCAACGCTGCTGTCTATTTCCCGACAGCTAAAGA
GCCTACTTACAGCGCAGAAAGGGTTTGAGCTTAGCGTTGCAACCAATCATTTGGGACATT
TTCTTCTCTCGAGGTTGTTGCTTGATGACTTGAAGAAGTCTGATTATCCTTCAAAGCGTC
TCATCATTG

QA 3 731 3 731
DS 

RD RS1F557TF 734 0 0
GG
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TCAAGCCGCTTCTTTGGCCTCCTCTGCTTTCTCTGTCCGAAAAGATGTAAAACTGGATGC
TTCTTCATCATCATCCTTCAAGGACTCGAGTCTCTTTGGTGCCTCCTTTGCCGATCAGAT
CAAATCCGAACATGGCTCTTCCTCGCTAAGATTCAAGAGGAATGTAGCGATTAGAGCTCA
AACCGCCGCAACTTCAAGCCCCTCCATCACAAAATCTCCAGTAGACGGCAAGAAGACCTT
GAGGAAAGGCAACGTGGTGGTCACGGGAGCTTCGTCAGGGTTAGGTCTAGCCACGGCCAA
AGCCCTCGCCGAGACGGGGAAATGGCACGTGATAATGGCGTGCAGGGACTTCCTCAAAGC
GGAGAGAGCGGCCAAATCCGCAGGGATGCCTAAAGACAGCTACACGGTGATGCATCTAGA
CTTGGCTTCGTTAGACAGCGTGAGACAGTTCGTCGATAGCTTCGGGAGATCGGAGATGCC
TCTCGATGTTTTGGTCTGCAACGCTGCTGTCTATTTCCCGACAGCTAAAGAGCCTACTTA
CAGCGCAGAAAGGGTTTGAGCTTGGCGTTGCGACCAATCATTTGGGACATTTTCTTCTCT
CGAGGTTGTTGCTTGATGACTTGAACAAGTCTGATTACCCTTCAAAGCGTCTCATCATTG
TCGGATCCATT
A

QA 3 733 3 733
DS 

RD RS1EQ83TF 742 0 0
GG
AACTTCAGTAGTCTTCTTCTTCATTGCTATTGCTATCTCTCACTCTCTGTTTTGTCCAAA
AATGGCCCTTCAAGCCGCTTCTTTGGTCTCCTCTGCTTTCTCTGTCCGAAAAGATGTAAA
ACTGAATGCTTCTTCATCATCATCCTTCAAGGACTCGAGTCTCTTTGGTGCCTCCTTTGC
CGATCAGATCAAATCCGAACATGGCTCTTCCTCGCTAAGATTCAAGAGGAATGTAGCGAT
TAGAGCTCAAACCGCCGCAACTTCAAGCCCCTC*ATCACAAAATCTCCAGTAGACGGCAA
GAAGACCTTGAGGAAAGGCAACGTGGTGGTCACGGGAGCTTCGTCAGGGTTAGGTCTAGC
CACGGCCAAAGCCCTCGCCGAGACGGGGAAATGGCACGTGATAATGGCGTGCAGGGACTT
CCTCAAAGCGGAGAGAGCGGCCAAATCCGCAGGGATGCCTAAAGACAGCTACACGGTGAT
GCATCTAGACTTGGCTTCGTTAGACAGCGTGAGACAGTTCGTCGATAGCTTCAGGAGATC
GGAGATGCCTCTCGATGTTTTGGTCTGCAACGCTGCTGTCTATTTCCCGACAGCTAAAGA
GCCTACTTACAGCGCAGAAAGGGTTTGAGCTTAGCGTTGCGACCAATCATTTGGGACATT
TTCTTCTCTCGAGGTTGTTGCTTGATGACTTGAACAAGTCTGATTACCCTTCAAAGCGTC
TCATCATTGTCGGATCCATT

QA 3 742 3 742
DS 

RD RS1GI22TF 789 0 0
GGATC
AACTTCAGTAGTCTTCTTCTTCATTGCTATTGCTATCTCTCACTCTCTGTTTTGTCCAAA
AATGGCCCTTCAAGCCGCTTCTTTGGTCTCCTCTGCTTTCTCTGTCCGAAAAGATGTAAA
ACTGAATGCTTCTTCATCATCATCCTTCAAGGACTCGAGTCTCTTTGGTGCCTCCTTTGC
CGATCAGATCAAATCCGAACATGGCTCTTCCTCGCTAAGATTCAAGAGGAATGTAGCGAT
TAGAGCTCAAACCGCCGCAACTTCAAGCCCCTCCATCACAAAATCTCCAGTAGACGGCAA
GAAGACCTTGAGGAAAGGCAACGTGGTGGTCACGGGAGCTTCGTCAGGGTTAGGTCTAGC
CACGGCCAAAGCCCTCGCCGAG*CGGGGAAATGGCACGTGATAATGGCGTGCAGGGACTT
CCTCAAAGCGGAGAGAGCGGCCAAATCCGCAGGGATGCCTAAAGACAGCTACACGGTGAT
GCATCTAGACTTGGCTTCGTTAGACAGCGTGAGACAGTTCGTCGATAGCTTCAGGAGATC
GGAGATGCCTCTCGATGTTTTGGTCTGCAACGCTGCTGTCTATTTCCCGACAGCTAAAGA
GCCTACTTACAGCGCAGAA*GGGTTTGAGCTTAGCGTTGCGACCAATCATTTGGGACATT
TTCTTCTCTCGAGGTTGTTGCTTGATGACTTGAC*AAGTCTGATTACCCTTCAAAGCGTC
TCATCATTGTCGGATCCATTACAGGAACACGATACATTGGCTGGTACGTACCACCGAAAG
CTAC

QA 6 789 6 789
DS 



CO CL118Contig2 744 6 6 U
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TCTAGGACTCATCAGTTGGTAGGTGGTAATAGAGAGGTCTCATCAAGGGAAAGAGACTTT
GAAGTCCGTCTTAGGCCAAGCCAACGAGCTTCTCACTGATCTCCCACACTTTACGAGCCT
TCTCAACATCACTCGCTTCTTCCGATAACTGGTTCTCAAAAGAAGCCGAAGCCTTGTTCC
AGCTCCAGTACACTCCTGATTTCGTCAAACTCGGATCACTCACCACCTGAGCAAGTCTTT
TGCCAGACTCTGTCTCGGAGACGTATCCTTTGGTGATGTACTTCTGAAACGGAGGGAAGA
GGGTACGGAAAAGCGGGATGTGCTCTCTGAATAAACCTGTGGAGGCGATGCAACCAGGGT
ACAGCGAGGCGAACGTGATTCCTGTTTCTTCATGGTAACGCCTGTGAAACTCTTGCATGG
TCAACATGTTGCACACTTTGCTGTCTTTGTATGCCTTTGCACCGTCGAATTCTCCTCCAT
CGATCATCGCCGAGCTGTTCAAACCGTTCAAGCCACCAGCTAAACCTCTCAAGTCGCCTA
GGTTAGCTTTCGGTGGTACGTTACCAGCCAATGTATTCGTGTTCCCTGTAATGGATCCGA
CAATGATGAGACGCTTTGAAGGTA


BQ
10 25 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GI22JQ U 1
AF RS1CP87JQ U 1
AF RS1CP87TF C 1
AF RS1F557JQ U 2
AF RS1FS10JQ U 1
AF RS1EQ83JQ U 7
BS 1 50 RS1CP87JQ
BS 51 51 RS1F557JQ
BS 52 685 RS1CP87JQ
BS 686 692 RS1F557JQ
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BS 716 744 RS1EQ83JQ

RD RS1GI22JQ 423 0 0
GT
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CCAGACTCTGTCTCGGAGACGTATCCTTTGGTGATGTACTTCTGAAACGGAGGGAAGAGG
G

QA 3 423 3 423
DS 

RD RS1CP87JQ 686 0 0
GGGGATAAACCAACTTTATTTCATTATTGTGGGCTATTCGCCAAACAGAGATACACTCAA
CATGCACTAATGAAAAATTCGCAGTTACAATATCAGACAATCTAAAAAACCCGAACACCC
TCTAGGACTCATCAGTTGGTAGGTGGTAATAGAGAGGTCTCATCAAGGGAAAGAGACTTT
GAAGTCCGTCTTAGGCCAAGCCAACGAGCTTCTCACTGATCTCCCACACTTTACGAGCCT
TCTCAACATCACTCGCTTCTTCCGATAACTGGTTCTCAAAAGAAGCCGAAGCCTTGTTCC
AGCTCCAGTACACTCCTGATTTCGTCAAACTCGGATCACTCACCACCTGAGCAAGTCTTT
TGCCAGACTCTGTCTCGGAGACGTATCCTTTGGTGATGTACTTCTGAAACGGAGGGAAGA
GGGTACGGAAAAGCGGGATGTGCTCTCTGAATAAACCTGTGGAGGCGATGCAACCAGGGT
ACAGCGAGGCGAACGTGATTCCTGTTTCTTCATGGTAACGCCTGTGAAACTCTTGCATGG
TCAACATGTTGCACACTTTGCTGTCTTTGTATGCCTTTGCACCGTCGAATTCTCCTCCAT
CGATCATCGCCGAGCTGTTCAAACCGTTCAAGCCACCAGCTAAACCTCTCAAGTCGCCTA
GGTTAGCTTTCGGTGGTACGTTACC
C

QA 1 685 1 685
DS 

RD RS1CP87TF 686 0 0
G
GGGATAAACCAACTTTATTTCATTATTGTGGGCTATTCGCCAAACAGAGATACACTCAAC
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CTAGGACTCATCAGTTGGTAGGTGGTAATAGAGAGGTCTCATCAAGGGAAAGAGACTTTG
AAGTCCGTCTTAGGCCAAGCCAACGAGCTTCTCACTGATCTCCCACACTTTACGAGCCTT
CTCAACATCACTCGCTTCTTCCGATAACTGGTTCTCAAAAGAAGCCGAAGCCTTGTTCCA
GCTCCAGTACACTCCTGATTTCGTCAAACTCGGATCACTCACCACCTGAGCAAGTCTTTT
GCCAGACTCTGTCTCGGAGACGTATCCTTTGGTGATGTACTTCTGAAACGGAGGGAAGAG
GGTACGGAAAAGCGGGATGTGCTCTCTGAATAAACCTGTGGAGGCGATGCAACCAGGGTA
CAGCGAGGCGAACGTGATTCCTGTTTCTTCATGGTAACGCCTGTGAAACTCTTGCATGGT
CAACATGTTGCACACTTTGCTGTCTTTGTATGCCTTTGCACCGTCGAATTCTCCTCCATC
GATCATCGCCGAGCTGTTCAAACCGTTCAAGCCACCAGCTAAACCTCTCAAGTCGCCTAG
GTTAGCTTTCGGTGGTACGTTACC
C

QA 2 685 2 685
DS 

RD RS1F557JQ 691 0 0
GGGATAAACCAACTTTATTTCATTATTGTGGGCTATTCGCCAAACAGAGCTACACTCAAC
ATGCACTAATGAAAAATTCGCAGTTACAATATCAGACAATCTAAAAAACCCGAACACCCT
CTAGGACTCATCAGTTGGTAGGTGGTAATAGAGAGGTCTCATCAAGGGAAAGAGACTTTG
AAGTCCGTCTTAGGCCAAGCCAACGAGCTTCTCACTGATCTCCCACACTTTACGAGCCTT
CTCAACATCACTCGCTTCTTCCGATAACTGGTTCTCAAAAGAAGCCGAAGCCTTGTTCCA
GCTCCAGTACACTCCTGATTTCGTCAAACTCGGATCACTCACCACCTGAGCAAGTCTTTT
GCCAGACTCTGTCTCGGAAACGTATCCTTTGGTGATGTACTTCTGAAACGGAGGGAAGAG
GGTACGGAAAAGCGGGATGTGCTCTCTGAATAAACCTGTGGAGGCGATGCAACCAGGGTA
CAGCGAGGCGAACGTGATTCCTGTTTCTTCATGGTAACGCCTGTGAAACTCTTGCATGGT
CAACATGTTGCACACTTTGCTGTCTTTGTATGCCTTTGCACCGTCGAATTCTCCTCCATC
GATCATCGCCGAGCTGTTCAAACCGTTCAAGCCACCAGCTAAACCTCTCAAGTCGCCTAG
GTTAGCTTTCGGTGGTACGTTACCAGCCAAT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1FS10JQ 715 0 0
GT
GGATAAACCAACTTTATTTCATTATTGTGGGCTATTCGCCAAACAGAGCTACACTCAACA
TGCACTAATGAAAAATTCGCAGTTACAATATCAGACAATCTAAAAAACCCGAACACCCTC
TAGGACTCATCAGTTGGTAGGTGGTAATAGAGAGGTCTCATCAAGGGAAAGAGACTTTGA
AGTCCGTCTTAGGCCAAGCCAACGAGCTTCTCACTGATCTCCCACACTTTACGAGCCTTC
TCAACATCACTCGCTTCTTCCGATAACTGGTTCTCAAAAGAAGCCGAAGCCTTGTTCCAG
CTCCAGTACACTCCTGATTTCGTCAAACTCGGATCACTCACCACCTGAGCAAGTCTTTTG
CCAGACTCTGTCTCGGAGACGTATCCTTTGGTGATGTACTTCTGAAACGGAGGGAAGAGG
GTACGGAAAAGCGGGATGTGCTCTCTGAATAAACCTGTGGAGGCGATGCAACCAGGGTAC
AGCGAGGCGAACGTGATTCCTGTTTCTTCATGGTAACGCCTGTGAAACTCTTGCATGGTC
AACATGTTGCACACTTTGCTGTCTTTGTATGCCTTTGTACCGTCGAATTCTCCTCCATCG
ATCATCGCCGAGCTGTTCAAACCGTTCAAGCCACCAGCTAAACCTCTCAAGTCGCCTAGG
TTAGCTTTCGGTGGTACGTTACCAGCCAATGTATTCGTGTTCCCTGTAATGGA

QA 3 715 3 715
DS 

RD RS1EQ83JQ 738 0 0
AAACCAACTTTATTTCATTATTGTGGGCTATTCGCCAAACAGAGCTACACTCAACATGCA
CTAATGAAAAATTCGCAGTTACAATATCAGACAATCTAAAAAACCCGAACACCCTCTAGG
ACTCATCAGTTGGTAGGTGGTAATAGAGAGGTCTCATCAAGGGAAAGAGACTTTGAAGTC
CGTCTTAGGCCAAGCCAACGAGCTTCTCACTGATCTCCCACACTTTACGAGCCTTCTCAA
CATCACTCGCTTCTTCCGATAACTGGTTCTCAAAAGAAGCCGAAGCCTTGTTCCAGCTCC
AGTACACTCCTGATTTCGTCAAACTCGGATCACTCACCACCTGAGCAAGTCTTTTGCCAG
ACTCTGTCTCGGAGACGTATCCTTTGGTGATGTACTTCTGAAACGGAGGGAAGAGGGTAC
GGAAAAGCGGGATGTGCTCTCTGAATAAACCTGTGGAGGCGATGCAACCAGGGTACAGCG
AGGCGAACGAGATTCCTGTTTCTTCATGGTAACGCCTGTGAAACTCTTGCATGGTCAACA
TGTTGCACACTTTGCTGTCTTTGTATGCCTTTGCACCGTCGAATTCTCCTCCATCGATCA
TCGCCGAGCTGTTCAAACCGTTCAAGCCACCAGCTAAACCTCTCAAGTCGCCTAGGTTAG
CTTTCGGTGGTACGTTACCAGCCAATGTATTCGTGTTCCCTGTAATGGATCCGACAATGA
TGAGACGCTTTGAAGGTA

QA 1 738 1 738
DS 



CO CL118Contig3 951 2 4 U
GGGATAAACCAACTTTTACTTCATTATTGTGGGCTATTCGCCAAACAGAGCTACACTTAA
ACATGCACTAGTGAAAAATTCGCAGTTACAATATCAGACAATCTAAAAATCCCGAACACC
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TGAAGTCCGTCTTAGGCCAAGCCAACGAGCTTCTCACTGATCTCCCAAACTTTACGAGCC
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CAGCTCCAGTACACTCCTGATTTCGTCAAACTCGGATCACTCACCACCTGAGCAAGTCTT
TTGCCAGACTCTGTCTCGGAGACGTATCCTTTGGTGATGTACTTCTGAAACGGAGGGAAG
AGCGTTCGGAAAAGCGGAATGTGCTCTCTGAACAAACCTGTGGAGGCGATGCAACCAGGG
TAAAGCGAGGCGAATGTGATTCCTGTTTCTTCATGGTAACGCCTGTGAAACTCTTGCATC
GTCAACATGTTGCACACTTTGCTGTCTTTGTAAGCCTTTGCACCGTCGAAATCTCCTCCA
TCGATCATCGCCGAGCTGTTCAAACCGTTCAAGCCTCCCGCTAAACCTCTCAAATCGCCT
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BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1E105JQ U 1
AF RS1AI51JQ U 1
BS 1 18 RS1E105JQ
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BS 20 739 RS1E105JQ
BS 740 951 RS1AI51JQ

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ACAATGATGAGACGCTTTG

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DS 

RD RS1AI51JQ 951 0 0
C
GGATAAACCAACTTTTACTTCATTATTGTGGGCTATTCGCCAAACAGAGCTACACTTAAA
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TCTCAACATCACTCGCTTCTTCTGACAACTGGTTCTCAAAAGAAGCCGAAGCCTTGTTCC
AGCTCCAGTACACTCCTGATTTCGTCAAACTCGGATCACTCACCACCTGAGCAAGTCTTT
TGCCAGACTCTGTCTCGGAGACGTATCCTTTGGTGATGTACTTCTGAAACGGAGGGAAGA
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QA 2 951 2 951
DS 



AS 1 10

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TGCATGCGTGTGAATTAATAAAGAAGACTCTCTTCAATACTGTGTTGTATACAATTTCTC
TTTTATAAAACTAAAAGTGTTAC


BQ
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 10 10 

AF RS1GN19TF U 1
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AF RS1ES27TF U 1
AF RS1AC72TF U 0
AF RS1GR44TF U 1
AF RS1DV57JQ C 659
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AF RS1DS76JQ C 563
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BS 372 372 RS1ES27TF
BS 373 592 RS1DV57TF
BS 593 593 RS1ES27TF
BS 594 683 RS1DV57TF
BS 684 732 RS1GR44TF
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BS 1279 1281 RS1ES27JQ
BS 1282 1283 RS1DS76JQ

RD RS1GN19TF 570 0 0
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TACCAGTCATCGACATGTCGAACCCCGACGAGCACAAAGTAGCTGAAGCTATCTGTGACG
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ACACAGAGGAGAACTCTCTTTCGACCAATGTTAGGTTTGGTACTAGTTTCAGTCCTCGGG
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CTGAACAGTTTTGGCCTGATGTTTGCAAGA

QA 1 570 1 570
DS 

RD RS1DV57TF 683 0 0
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CTCCAACACTCTCCATGGCACAGTTCGCAGACCCAGCTGAAGTAACCGAGTTCGTGGTCA
ACAAAGGCAATGGCGTAAAGGGTTTATCAGAGACAGGAATCAAAGCTCTTCCAGACCAAT
ACATTCAACCATTCGAAGAGCGTCTCATCAACAAGTTCGTCAACGAGACAGACGAGGCTA
TACCAGTCATCGACATGTCGAACCCCGACGAGCACAAAGTAGCTGAAGCTATCTGTGACG
CTGCTGAGAAATGGGGTTTCTTTCAAGTGATCAACCATGGAGTTCCTTTGGATGTTCTTG
AAAACGTGAAGACCGCCACTCACAGGTTCTTTAATCTTCCTGTTGAGGAGAAGAGCAAGT
ACACAAAGGAGAACTCTCTTTCGACCAATGTTAGGTTTGGTACTAGTTTCAGTCCTCGGG
CTGAGAAAGCTCTCGAGTGGAAAGATTACCTCAGTCTCTTCTTTGTGTCCGAAGCTGAAG
CTGAACAGTTTTGGCCTGATGTTTGCAAGAATGAAGCTCTAGAGTACATGAATAAGTCAA
AGACAATGGTGAGGAAGCTTCTAGAGTATTTAGGAAAGAATCTCAACGTGAAAGAGCTAG
ACGAGACCAAAGAGTCACTCTTC

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DS 

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CTCCAACACTCTCCATGGCACAGTTCGCAGACCCAGCTGAAGTAACCGAGTTCGTGGTCA
ACAAAGGCAATGGCGTAAAGGGTTTATCAGAGACAGGAATCAAAGCTCTTCCAGACCAAT
ACATTCAACCATTCGAAGAGCGTCTCATCAACAAGTTCGTCAACGAGACAGACGAGGCTA
TACCAGTCATCGACATGTCGAACCCCGACGAGCACAAAGTAGCTGAAGCTATCTGTGACG
CTGCTGAGAAATGGGGTTTCTTTCAAGTGATCAACCATGGAGTTCCTTTGGATGTTCTTG
AAAACGTGAAGGCCGCCACTCACAGGTTCTTTAATCTTCCTGTTGAGGAGAAGAGCAAGT
ACACAAAGGAGAACTCTCTTTCGACCAATGTTAGGTTTGGTACTAGTTTCAGTCCTCGGG
CTGAGAAAGCTCTCGAGTGGAAAGATTACCTCAGTCTCTTCTTTGTGTCCGAAGCTGAAG
CTGAACAGTTTTGGCCTGATGTTTGCAAGAATGAAGCTCTAGAGTACATGAACAAGTCAA
AGACAATGGTGAGGAAGCTTCTAGAGTATTTAGGAAAGAATCTCAACGTGAAAGAGCTAG
ACGAGA

QA 1 666 1 666
DS 

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GGC
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CCAACACTCTCCATGGCACAGTTCGCAGACCCAGCTGAAGTAACCGAGTTCGTGGTCAAC
AAAGGCAATGGCGTAAAGGGTTTATCAGAGACAGGAATCAAAGCTCTTCCAGACCAATAC
ATTCAACCATTCGAAGAGCGTCTCATCAACAAGTTCGTCAACGAGGCAGACGAGGCTATA
CCAGTCATCGACATGTCGAACCCCGACGAGCACAAAGTAGCTGAAGCTATCTGTGACGCT
GCTGAGAAATGGGGTTTCTTTCAAGTGATCAACCATGGAGTTCCTTTGGATGTTCTTGAA
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ACAAAGGAGAACTCTCTTTCGACCAATGTTAGGTTTGGTACTAGTTTCAGTCCTCGGGCT
GAGAAAGCTCTCGAGTGGAAAGATTACCTCAGTCTCTTCTTTGTGTCCGAAGCTGAAGCT
GAACAGTTTTGGCCTGATGTTTGCAAGAATGAAGCTCTAGAGTACATGAACAAGTCAAAG
ACAATGGTGAGGAAGCTTCTAGAGTATTTAGGAAAGAATCTCAACGTGAAAGAGCTAGAC
GAGACCAAAGAGTCACTCTTCATGGGCTCAATCCGAGTCAACCTCAACTACTATCCCATC
TGTCCTAACCCTGACTTAACCGTTGGCGTTGGTCGCCACTCAGACGTCTCTTCC

QA 4 777 4 777
DS 

RD RS1GR44TF 781 0 0
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CTCCAACACTCTCCATGGCACAGTTCGCAGACCCAGCTGAAGTAACCGAGTTCGTGGTCA
ACAAAGGCAATGGCGTAAAGGGTTTATCAGAGACAGGAATCAAAGCTCTTCCAGACCAAT
ACATTCAACCATTCGAAGAGCGTCTCATCAACAAGTTCGTCAACGAGACAGACGAGGCTA
TACCAGTCATCGACATGTCGAACCCCGACGAGCACAAAGTAGCTGAAGCTATCTGTGACG
CTGCTGAGAAATGGGGTTTCTTTCAAGTGATCAACCATGGAGTTCCTTTGGATGTTCTTG
AAAACGTGAAGGCCGCCACTCACAGGTTCTTTAATCTTCCTGTTGAGGAGAAGAGCAAGT
ACACAAAGGAGAACTCTCTTTCGACCAATGTTAGGTTTGGTACTAGTTTCAGTCCTCGGG
CTGAGAAAGCTCTCGAGTGGAAAGATTACCTCAGTCTCTTCTTTGTGTCCGAAGCTGAAG
CTGAACAGTTTTGGCCTGATGTTTGCAAGAATGAAGCTCTAGAGTACATGAACAAGTCAA
AGACAATGGTGAGGAAGCTTCTAGAGTATTTAGGAAAGAATCTCAACGTGAAAGAGCTAG
ACGAGACCAAAGAGTCACTCTTCATGGGCTCAATCCGAGTCAACCTCAACTACTATCCCA
TCTGTCCTAACC*TGACT*AACCGTTGGCGTTGGTCGCCACTCAGACGTCTCTTCCCTCA
C

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DS 

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CATCTGTCCTAACCCTGACTTAACCGTTGGCGTTGGTCGCCACTCAGACGTCTCTTCCCT
CACCATTCTCTTACAAGACCAAATCGGTGGCCTCCACGTTCGTTCCCTATCCTCAGGGAA
CTGGGTCCACGTGCCACCGGTTCCCGGATCCTTTGTGATCAACATAGGAGACGCTATGCA
GATCTTGAGCAACGGTCGTTACAAGAGCGTGGAGCATCGTGTCTTAGCTAACGGTAGCAA
CAACAGAATCTCGGTTCCTATCTTTGTGAATCCAAAACCAGAGTCCGTGATTGGTCCTCT
CCCTGAGGTGGTCGCAAAGGGTGAGGAACCGATTTATAAAGACGTTGTGTACTCTGATTA
CGTCAGGTACTTCTTCAAGAAAGCACATGATGGAAAGAAGACCGTTGACTTCGCCAAGAT
ATGATCCAAAACCAGACCTCAAACGAGTTTGGTTTCTTTTGTTTTGTTTCATGTTTGTGT
GTTGCATGCGTGTGAATTAATAAAGAAGACTCTCTTCAATACTGTG

QA 1 586 1 586
DS 

RD RS1AC72JQ 754 0 0
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AACGTGAAAGAGCTAGACGAGACCAAAGAGTCACTCTTCATGGGCTCAATCCGAGTCAAC
CTCAACTACTATCCCATCTGTCCTAACCCTGACTTAACCGTTGGCGTTGGTCGCCACTCA
GACGTCTCTTCCCTCACCATTTTCTTACAAGACCAAATCGGTGGCCTCCACGTTCGTTCC
CTATCCTCAGGGAACTGGGTCCACGTGCCACCGGTTCCCGGATCCTTTGTGATCAACATA
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GCTAACGGTAGCAACAACAGAATCTCGGTTCCTATCTTTGTGAATCCAAAACCAGAGTCC
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GTGTACTCTGATTACGTCAGGTACTTCTTCAAGAAAGCACATGATGGAAAGAAGACCGTT
GACTTCGCCAAGATATGATCCAAAACCAGACCTCAAACGAGTTTGGTTTCTTTTGTTTTG
TTTCATGTTTGTGTGTTGCATGCGTGTGAATTAATATAGAAGACTCTCTTCAATACTGTG
TTGTATACAATTTCTCTTTTATAAAACTAAAAGT

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DS 

RD RS1ES27JQ 728 0 0
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CACTCTTCATGGGCTCAATCCGAGTCAACCTCAACTACTATCCCATCTGTCCTAACCCTG
ACTTAACCGTTGGCGTTGGTCGCCACTCAGACGTCTCTTCCCTCACCATTCTCTTACAAG
ACCAAATCGGTGGCCTCCACGTTCGTTCCCTATCCTCAGGGAACTGGGTCCACGTGCCAC
CGGTTCCCGGATCCTTTGTGATCAACATAGGAGACGCTATGCAGATCTTGAGCAACGGTC
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CTATCTTTGTGAATCCAAAACCAGAGTCCGTGATTGGTCCTCTCCCTGAGGTGGTCGCAA
AGGGTGAGGAACCGATTTATAAAGACGTTGTGTACTCTGATTACGTCAGGTACTTCTTCA
AGAAAGCACATGATGGAAAGAAGACCGTTGACTTCGCCAAGATATGATCCAAAACCAGAC
CTCAAACGAGTTTGGTTTCTTTTGTTTTGTTTCATGTTTGTGTGTTGCATGCGTGTGAAT
TAATAAAGAAGACTCTCTTCAATACTGTGTTGTATACAATTTCTCTTTTATAAAACTAAA
AGTGTT
GC

QA 1 726 1 726
DS 

RD RS1GR44JQ 650 0 0
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TCCGAGTCAACCTCAACTACTATCCCATCTGTCCTAACCCTGACTTAACCGTTGGCGTTG
GTCGCCACTCAGACGTCTCTTCCCTCACCATTCTCTTACAAGACCAAATCGGTGGCCTCC
ACGTTCGTTCCCTATCCTCAGGGAACTGGGTCCACGTGCCACCGGTTCCCGGATCCTTTG
TGATCAACATAGGAGACGCTATGCAGATCTTGAGCAACGGTCGTTACAAGAGCGTGGAGC
ATCGTGTCTTAGCTAACGGTAGCAACAACAGAATCCCGGTTCCTATCTTTGTGAATCCAA
AACCAGAGTCCGTGATTGGTCCTCTCCCTGAGGTGGTCGCAAAGGGTGAGGAACCGATTT
ATAAAGACGTTGTGTACTCTGATTACGTCAGGTACTTCTTCAAGAAAGCACATGATGGAA
AGAAGACCGTTGACTTCGCCAAGATATGATCCAAAACCAGACCTCAAACGAGTTTGGTTT
CTTTTGTTTTGTTTCATTTTTGTGTGTTGCATGCGTGTGAATTAATAAAGAAGACTCTCT
TCAATACTGTGTTGTATACAATTTCTCTTTTATAAAACTAAAAGTGTT
AC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1DS76JQ 721 0 0
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AGAGTATTTAGGAAAGAATCTCAACGTGAAAGAGCTAGACGAGACCAAAGAGTCACTCTT
CGTGGGCTCAATCCGAGTCAACCTCAACTACTATCCCATCTGTCCTAACCCTGACTTAAC
CGTTGGCGTTGGTCGCCACTCAGACGTCTCTTCCCTCACCATTCTCTTACAAGACCAAAT
CGGTGGCCTCCACGTTCGTTCCCTATCCTCAGGGAACTGGGTCCACGTGCCACCGGTTCC
CGGATCCTTTGTGATCAACATAGGAGACGCTATGCAGATCTTGAGCAACGGTCGTTACAA
GAGCGTGGAGCATCGTGTCTTAGCTAACGGTAGCAACAACAGAATCTCGGTTCCTATCTT
TGTGAATCCAAAACCAGAGTCCGTGATTGGTCCTCTCCCTGAGGTGGTCGCAAAGGGTGA
GGAACCGATTTATAAAGACGTTGTGTACTCTGATTACGTCAGGTACTTCTTCAAGAAAGC
ACATGATGGAAAGAAGACCGTTGACTTCGCCAAGATATGATCCAAAACCAGACCTCAAAC
GAGTTTGGTTTCTTTTGTTTTGTTTCATGTTTGTGTGTTGCATGCGTGTGAATTAATAAA
GAAGACTCT*TTCAATACTGTGTTGTATACAATTTCTCTTTTATAAAACTAAAAGTGTTA
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 2 13

CO CL120Contig1 1287 11 32 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGTGCCATAA
GCTTTTAATTAAAGAGAAACACTTACAAAGCTTATATCTCTCTTACCTCGAAGAGTTCAT
CTTCTCCCTCCTATACAAATAAAAACCTAAATTATTCTTCCTACCTAAAAATACTCTAAA
ACCATGGCTATCTTCAACACTCAAAACACATGGGCCTTCGCCTTCGGCTTGCTCGGAAAC
ATCATTTCCTTTGCTGTTTTCCTCTCCCCCGTGCCAACGTTCTATAGGATTTGGAAGAAA
AAAACCACAGAAGATTTTCAATCTCTTCCCTATGTGGTGGCGCTCTTCAGCGCGATGCTT
TGGCTCTACTACGCTACTCAGAAGAAAGATGTCTTCCTTCTCGTCACAATCAACTCCTTT
GGTTGCTTCATAGAAACCATATACATCGCCATATTCGTTGCCTTCGCCACCAAGAAAGCA
CGAATGTTAACGGTGAAGCTCTTGTTGCTAATGAACTTTGGAGGATTCTGTCTGATTCTC
CTCCTCTGCCAATTCTTAGCAAAAGGTTCCACACGTGCGAAGATTATCGGAGGAATCTGT
GTCGGATTCTCTGTCTGCGTTTTCGCTGCGCCGCTTAGCATTATCAGAACGGTGATAAAG
ACAAAAAGTGTGGAGTACATGCCGTTTAGCTTATCCTTGACACTTACAATCAGTGCGGTC
GTATGGCTTCTTTATGGTCTTGCTCTTAGGGATATCTACGTTGCTTTCCCGAACGTGATT
GGGTTTGTTCTCGGTGCACTTCAAATGATACTTTACGTGGTTTTCAAATACTGCAAAACG
CCGTCGGATTTGGTGGAGAAAGAACTCGAAGCCGCTAAGTTGCCGGAGGTGAGTATTGAT
ATGCTGAAGCTAGGGACATTGGCATCTCCTGAAGCAGCAGAGATCACAGTCGTACCAACT
GCGAACAAGTGTATATGTAATGATCGGAAGACTGAAACTGAAAATGGACAGCGAGTTAAA
AACGGCAAACACTCCACTGCAGCTTGTTAAAAAACAATAAACCGTTTGCCTATCTTTTGC
ATTGTTGAATTTGTACTCTATCTTAATATCATCGTCTACGTGTGCCAAGTCGAGGATTAA
TTATCTCGGGATTTACATTATCCTGAGTTGATTTTTCCCTTCCCCTAGACTATATTTGAG
AAGTGATTTTGCCACGTGTCCTCTCTATAATCAATTTCACAAAATAAATATGACATGGCT
AATGAAATTGATGACATGTCTTTCGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 40 40 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 35 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 35 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 40 40 40 40 40 40 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 5 5 5 5 5 5 20 20 5 20 5 20 5 20 
5 20 5 5 5 20 5 5 20 20 5 5 20 5 5 5 20 20 5 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1GG93TF U 50
AF RS1CX49TF U 50
AF RS1A084TF U 1
AF RS1H354TF U 52
AF RS1GL46TF U 50
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AF RS1AH38TF U 50
AF RS1A084TV U 56
AF RS1AH38JQ C 399
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AF RS1GL46JQ C 510
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BS 212 466 RS1A084TF
BS 467 467 RS1AH38TF
BS 468 788 RS1A084TF
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BS 829 863 RS1AH38TF
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BS 1064 1182 RS1AH38JQ
BS 1183 1184 RS1GL68JQ
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RD RS1GG93TF 678 0 0
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TCAACTCCTTTGGTTGCTTCATAGAAACCATATACATCGCCATATTCGTTGCCTTCGCCA
CCAAGAAAGCACGAATGTTAACGGTGAAGCTCTTGTTGCTAATGAACTTTGGAGGATTCT
GTCTGATTCTCCTCCTCTGCCAATTCTTAGCAAAAGGTTCCACACGTGCGAAGATTATCG
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CGGTGATAAAGACAAAAAGTGTGGAGTACATGCCGTTTAGCTTATCCTTGACACTTACAA
TCAGTGCGGTCGTATGGC

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DS 

RD RS1CX49TF 696 0 0
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AATACTCTAAAACCATGGCTATCTTCAACACTCAAAACACATGGGCCTTCGCCTTCGGCT
TGCTCGGAAACATCATTTCCTTTGCTGTTTTCCTCTCCCCCGTGCCAACGTTCTATAGGA
TTTGGAAGAAAAAAACCACAGAAGATTTTCAATCTCTTCCCTATGTGGTGGCGCTCCTCA
GCGCGATGCTTTGGCTCTACTACGCTACTCAGAAGAAAGATGTCTTCCTTCTCGTCACAA
TCAACTCCTTTGGTTGCTTCATAGAAACCATATACATCGCCATATTCGTTGCCTTCGCCA
CCAAGAAAGCACGAATGTTAACGGTGAAGCTCTTGTTGCTAATGAACTTTGGAGGATTCT
GTCTGATTCTCCTCCTCTGCCAATTCTTAGCAAAAGGTTCCACACGTGCGAAGATTATCG
GAGGAATCTGTGTCGGATTCTCTGTCTGCGTTTTCGCTGCGCCGCTTAGCATTATCAGAA
CGGTGATAAAGACAAAAAGTGTGGAGTACATGCCGTTTAGCTTATCCTTGACACTTACAA
TCAGTGCGGTCGTATGGCTTCTTTATGGTCTTGCTC

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DS 

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CTTCTCCCTCCTATACAAATAAAAACCTAAATTATTCTTCCTACCTAAAAATACTCTAAA
ACCATGGCTATCTTCAACACTCAAAACACACGGGCCTTCGCCTTCGGCTTGCTCGGAAAC
ATCATTTCCTTTGCTGTTTTCCTCTCCCCCGTGCCAACGTTCTATAGGATTTGGAAGAAA
AAAACCACAGAAGATTTTCAATCTCTTCCCTATGTGGTGGCGCTCTTCAGCGCGATGCTT
TGGCTCTACTACGCTACTCAGAAGAAAGATGTCTTCCTTCTCGTCACAATCAACTCCTTT
GGTTGCTTCATAGAAACCATATACATCGCCATATTCGTTGCCTTCGTCACCAAGAAAGCA
CGAATGTTAACGGTGAAGCTCTTGTTGCTAATGAACTTTGGAGGATTCTGTCTGATTCTC
CTCCTCTGCCAATTCTTAGCAAAAGGTTCCACACGTGCGAAGATTATCGGAGGAATCTGT
GTCGGATTCTCTGTCTGCGTTTTCGCTGCGCCGCTTAGCATTATCAGAACGGTGATAAAG
ACAAAAAGTGTGGAGTACATGCCGTTTAGCTTATCCTTGACACTTACAATCAGTGCGGTC
GTATGGCTTCTTTATGGTCTTGCTCTTAGGGATATCTACGTTGCTTTCCCGAACGTGATT
GGGTTTGT

QA 1 788 1 788
DS 

RD RS1H354TF 758 0 0
GG
GCCATAAGCTTTTAATTAAAGAGAAACACTTACAAAGCTTATATCTCTCTTACCTCGAAG
AGTTCATCTTCTCCCTCCTATACAAATAAAAACCTAAATTATTCTTCCTACCTAAAAATA
CTCTAAAACCATGGCTATCTTCAACACTCAAAACACATGGGCCTTCGCCTTCGGCTTGCT
CGGAAACATCATTTCCTTTGCTGTTTTCCTCTCCCCCGTGCCAACGTTCTATAGGATTTG
GAAGAAAAAAACCACAGAAGATTTTCAATCTCTTCCCTATGTGGTGGCGCTCTTCAACGC
GATGCTTTGGCTCTACTACGCTACTCAGAAGAAAGATGTCTTCCTTCTCGTCACAATCAA
CTCCTTTGGTTGCTTCATAGAAACCATATACATCGCCATATTCGTTGCCTTCGCCACCAA
GAAAGCACGAATGTTAACGGTGAAGCTCTTGTTGCTAATGAACTTTGGAGGATTCTGTCT
GATTCTCCTCCTCTGCCAATTCTTAGCAAAAGGTTCCACACGTGCGAAGATTATCGGAGG
AATCTGTGTCGGATTCTCTGTCTGCGTTTTCGCTGCGCCGCTTAGCATTATCAGAACGGT
GATAAAGACAAAAAGTGTGGAGTACATGCCGTTTAGCTTATCCTTGACACTTACAATCAG
TGCGGTCGTATGGCTTCTTTATGGTCTTGCTCTTAGGGATATCTACGTTGCTTTCCCGAA
CGTGATTGGGTTTGTTCTCG*TGCACTTCAA
TGATA

QA 3 753 3 753
DS 

RD RS1GL46TF 793 0 0
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GAAGAGTTCATCTTCTCCCTCCTATACAAATAAAAACCTAAATTATTCTTCCTACCTAAA
AATACTCTAAAACCATTGCTATCTTCAACACTCAAAACACATGGGCCTTCGCCTTCGGCT
TGCTCGGAAACATCATTTCCTTTGCTGTTTTCCTCTCCCCCGTGCCAACGTTCTATAGGA
TTTGGAAGAAAAAAACCACAGAAGATTTTCAATCTCTTCCCTATGTGGTGGCGCTCTTCA
GCGCGATGCTTTGGCTCTACTACGCTACTCAGAAGAAAGATGTCTTCCTTCTCGTCACAA
TCAACTCCTTTGGTTGCTTCATAGAAACCATATACATCGCCATATTCGTTGCCTTCGCCA
CCAAGAAAGCACGAATGTTAACGGTGAAGCTCTTGTTGCTAATGAACTTTGGAGGATTCT
GTCTGATTCTCCTCCTCTGCCAATTCTTAGCAAAAGGTTCCACACGTGCGAAGATTATCG
GAGGAATCTGTGTCGGATTCTCTGTCTGCGTTTTCGCTGCGCCGCTTAGCATTATCAGAA
CGGTGATAAAGACAAAAAGTGTGGAGTACATGCCGTTTAGCTTATCCTTGACACTTACAA
TCAGTGCGGTCGTATGGCTTCTTTATGGTCTTGCTCTTAGGGATATCTACGTTGCTTTCC
CGA*CGTGATTGGGTTTGTTCTCG*TGCACTTCAAATGATACTTTACGTGGTTTTCAA*T
ACTGCAAA
CGCGT

QA 1 788 1 788
DS 

RD RS1GL68TF 782 0 0
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GAAGAGTTCATCTTCTCCCTCCTATACAAATAAAAACCTAAATTATTCTTCCTACCTAAA
AATACTCTAAAACCATTGCTATCTTCAACACTCAAAACACATGGGCCTTCGCCTTCGGCT
TGCTCGGAAACATCATTTCCTTTGCTGTTTTCCTCTCCCCCGTGCCAACGTTCTATAGGA
TTTGGAAGAAAAAAACCACAGAAGATTTTCAATCTCTTCCCTATGTGGTGGCGCTCTTCA
GCGCGATGCTTTGGCTCTACTACGCTACTCAGAAGAAAGATGTCTTCCTTCTCGTCACAA
TCAACTCCTTTGGTTGCTTCATAGAAACCATATACATCGCCATATTCGTTGCCTTCGCCA
CCAAGAAAGCACGAATGTTAACGGTGAAGCTCTTGTTGCTAATGAACTTTGGAGGATTCT
GTCTGATTCTCCTCCTCTGCCAATTCTTAGCAAAAGGTTCCACACGTGCGAAGATTATCG
GAGGAATCTGTGTCGGATTCTCTGTCTGCGTTTTCGCTGCGCCGCTTAGCATTATCAGAA
CGGTGATAAAGACAAAAAGTGTGGAGTACATGCCGTTTAGCTTATCCTTGACACTTACAA
TCAGTGCGGTCGTATGGCTTCTTTATGGTCTTGCTCTTAGGGATATCTACGTTGCTTTCC
CGA*CGTGATTGGGTTTGTTCTCG*TGCACTTCAAATGATACTTTACGTGGTTTTCAAAT
AC

QA 1 782 1 782
DS 

RD RS1AH38TF 826 0 0
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TAAGAGTTCATCTTCTCCCTCCTATACAAATAAAAACCTAAATTATTCTTCCTACCTAAA
AATACTCTAAAACCATGGCTATCTTCAACACTCAAAACACATGGGCCTTCGCCTTCGGCT
TGCTCGGAAACATCATTTCCTTTGCTGTTTTCCTCTCCCCCGTGCCAACGTTCTATAGGA
TTTGGAAGAAAAAAACCACAGAAGATTTTCAATCTCTTCCCTATGTGGTGGCGCTCTTCA
GCGCGATGCTTTGGCTCTACTACGCTACTCAGAAGAAAGATGTCTTCCTTCTCGTCACAA
TCAACTCCTTTGGTTGCTTCATAGAAACCATATACATCGCCATATTCGTTGCCTTCGCCA
CCAAGAAAGCACGAATGTTAACGGTGAAGCTCTTGTTGCTAATGAACTTTGGAGGATTCT
GTCTGATTCTCCTCCTCTGCCAATTCTTAGCAAAAGGTTCCACACGTGCGAAGATTATCG
GAGGAATCTGTGTCGGATTCTCTGTCTGCGTTTTCGCTGCGCCGCTTAGCATTATCAGAA
CGGTGATAAAGACAAAAAGTGTGGAGTACATGCCGTTTAGCTTATCCTTGACACTTACAA
TCAGTGCGGTCGTATGGCTTCTTTATGGTCTTGCTCTTAGGGATATCTACGTTGCTTTCC
CGAACGTGATTGGGTTTGTTCTCGGTGCACTTCAAATGATACTTTACGTGGTTTTCAA*T
ACTGCAAAACGCCGTCGGATTTGGTGGAGAAAGA
CTCGAGCGCTAG

QA 1 814 1 814
DS 

RD RS1A084TV 794 0 0
CATAAGCTTTTAATTAAAGAGAAACACTTACAAAGCTTATATCTCTCTTACCTCGAAGAG
TTCATCTTCTCCCTCCTATACAAATAAAAACCTAAATTATTCTTCCTACCTAAAAATACT
CTAAAACCATGGCTATCTTCAACACTCAAAACACACGGGCCTTCGCCTTCGGCTTGCTCG
GAAACATCATTTCCTTTGCTGTTTTCCTCTCCCCCGTGCCAACGTTCTATAGGATTTGGA
AGAAAAAAACCACAGAAGATTTTCAATCTCTTCCCTATGTGGTGGCGCTCTTCAGCGCGA
TGCTTTGGCTCTACTACGCTACTCAGAAGAAAGATGTCTTCCTTCTCGTCACAATCAACT
CCTTTGGTTGCTTCATAGAAACCATATACATCGCCATATTCGTTGCCTTCGTCACCAAGA
AAGCACGAATGTTAACGGTGAAGCTCTTGTTGCTAATGAACTTTGGAGGATTCTGTCTGA
TTCTCCTCCTCTGCCAATTCTTAGCAAAAGGTTCCACACGTGCGAAGATTATCGGAGGAA
TCTGTGTCGGATTCTCTGTCTGCGTTTTCGCTGCGCCGCTTAGCATTATCAGAACGGTGA
TAAAGACAAAAAGTGTGGAGTACATGCCGTTTAGCTTATCCTTGACACTTACAATCAGTG
CGGTCGTATGGCTTCTTTATGGTCTTGCTCTTAGGGATATCTACGTTGCTTTCCCGAACG
TGATTGGGTTTGTTCTCGGTGCACTTCAAATGATACTTTACGTGGTTTTCAAATACTGCA
AAACGCCGTCGGAT

QA 1 794 1 794
DS 

RD RS1AH38JQ 821 0 0
TCTCGTCACAATCAACTCCTTTGGT*GCTTCATAGAAACCATATACATCGCCATATTCGT
TGC*TTCGCCACCAAGAAAGCACGAATGTTAACGGTGAAGCTCTTGTTGCTAATGAACTT
TGGAGGATTCTGTCTGATTCTCCTCCTCTGCCAATTCTTAGCAAAAGGTTCCACACGTGC
GAAGATTATCGGAGGAATCTGTGTCGGATTCTCTGTCTGCGTTTTCGCTGCGCCGCTTAG
CATTATCAGAACGGTGATAAAGACAAAAAGTGTGGAGTACATGCCGTTTAGCTTATCCTT
GACACTTACAATCAGTGCGGTCGTATGGCTTCTTTATGGTCTTGCTCTTAGGGATATTTA
CGTTGCTTTCCCGAACGTGATTGGGTTTGTTCTCGGTGCACTTCAAATGATACTTTACGT
GGTTTTCAAATACTGCAAAACGCCGTCGGATTTGGTGGAGAAAGAACTCGAAGCCGCTAA
GTTGCCGGAGGTGAGTATTGATATGCTGAAGCTAGGGACATTGGCATCTCCTGAAGCAGC
AGAGATCACAGTCGTACCAACTGCGAACAAGTGTATATGTAATGATCGGAAGACTGAAAC
TGAAAATGGACAGCGAGTTAAAAACGGCAAACACTCCACTGCAGCTTGTTAAAAAACAAT
AAACTGTTTGCCTATCTTTTGCATTGTTGAATTTGTACTCTATCTTAATATCATCGTCTA
CGTGTGCCAAGTCGAGGATTAATTATCTCGGGATTTACATTATCCTGAGTTGATTTTTCC
CTTCTTCTTTTAATTACTAGTGTAACTAAATTATCTGTTGG

QA 1 821 1 821
DS 

RD RS1GL68JQ 811 0 0
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TCTCCTCCTCTGCCAATTCTTAGCAAAAGGTTCCACACGTGCGAAGATTATCGGAGGAAT
CTGTGTCGGATTCTCTGTCTGCGTTTTCGCTGCGCCGCTTAGCATTATCAGAACGGTGAT
AAAGACAAAAAGTGTGGAGTACATGCCGTTTAGCTTATCCTTGACACTTACAATCAGTGC
GGTCGTATGGCTTCTTTATGGTCTTGCTCTTAGGGATATCTACGTTGCTTTCCCGAACGT
GATTGGGTTTGTTCTCGGTGCACTTCAAATGATACTTTACGTGGTTTTCAAATACTGCAA
AACGCCGTCGGATTTGGTGGAGAAAGAACTCGAAGCCGCTAAGTTGCCGGAGGTGAGTAT
TGATATGCTGAAGCTAGGGACATTGGCATCTCCTGAAGCAGCAGAGATCACAGTCGTACC
AACTGCGAACAAGTGTATATGTAATGATCGGAAGACTGAAACTGAAAATGGACAGCGAGT
TAAAAACGGCAAACACTCCACTGCAGCTTGTTAAAAAACAATAAACCGTTTGCCTATCTT
TTGCATTGTTGAATTTGTACTCTATCTTAATATCATCGTCTACGTGTGCCAAGTCGAGGA
TTAATTATCTCGGGATTTACATTATCCTGAGTTGATTTTTCCCTTCCCCTAGACTATATT
TGAGAAGTGATTTTGCCACGTGTCCTCTCTATAATCAATTTCACAAAATAAATATGACAT
GGCTAATGAAATTGATGACATGTCTTTCGGG

QA 1 811 1 811
DS 

RD RS1GL46JQ 778 0 0
AATGAACTTTGGAGGATTCTGTCTGATTCTCCTCCTCTGCCAATTCTTAGCAAAAGGTTC
CACACGTGCGAAGATTATCGGAGGAATCTGTGTCGGATTCTCTGTCTGCGTTTTCGCTGC
GCCGCTTAGCATTATCAGAACGGTGATAAAGACAAAAAGTGTGGAGTACATGCCGTTTAG
CTTATCCTTGACACTTACAATCAGTGCGGTCGTATGGCTTCTTTATGGTCTTGCTCTTAG
GGATATCTACGTTGCTTTCCCGAACGTGATTGGGTTTGTTCTCGGTGCACTTCAAATGAT
ACTTTACGTGGTTTTCAAATACTGCAAAACGCCGTCGGATTTGGTGGAGAAAGAACTCGA
AGCCGCTAAGTTGCCGGAGGTGAGTATTGATATGCTGAAGCTAGGGACATTGGCATCTCC
TGAAGCAGCAGAGATCACAGTCGTACCAACTGCGAACAAGTGTATATGTAATGATCGGAA
GACTGAAACTGAAAATGGACAGCGAGTTAAAAACGGCAAACACTCCACTGCAGCTTGTTA
AAAAACAATAAACCGTTTGCCTATCTTTTGCATTGTTGAATTTGTACTCTATCTTAATAT
CATCGTCTACGTGTGCCAAGTCGAGGATTAATTATCTCGGGATTTACATTATCCTGAGTT
GATTTTTCCCTTCCCCTAGACTATATTTGAGAAGTGATTTTGCCACGTGTCCTCTCTATA
ATCAATTTCACAAAATAAATATGACATGGCTAATGAAATTGATGACATGTCTTTCGGG

QA 1 778 1 778
DS 



CO CL120Contig2 699 2 10 U
GGGAAAATAAGGGGATATTCATATCCAACAGATAATTTAGTTACACTAGTAATTAAAAGA
AGAAGGGAAAAATCAACTCAGGATAATGTAAATCCCGAGATAATTAATCCTCGACTTGGC
ACACGTAGACGATGATATTAAGATAGAGTACAAAGTCAACAATGCAAAAGATAGGCAAAC
AGTTTATCTGTTTTTTAACAAGCTGCAGTGGAGTGTGTGCCGTTTTTAACTCGCTGTCCA
TTTTCAGTTTCAGTCTTCCGATCATTACATATACACTTGTTCGCAGTTGGTACGACTGTG
ATCTCTGCTGCTTCAGGAGATGCCAATGTACCTAGCTTCAGCATATCAACACTCACCTCC
AGCAACTTAGCGGCTTCGAGTTCTTTCTCCACCAAATCCGACGGCGTTTTGCAGTATTTG
AAAACCACGTAAAGTATCATTTGAAGTGCACCGAGAACAAACCCAATCACGTTCGGGAAA
GCAACGTAAATATCCCTAAGAGCAAGACCATAAAGAAGCCATACGACCGCACTGATTGTA
AGTGTCAAGGATAAGCTAAACGGCATGTACTCCACACTTTTTGTCTTTATCACCGTTCTG
ATAATGCTAAGCGGCGCAGCGAAAACGCAGACAGAGAATCCGACACAGATTCCTCCGATA
ATCTTCGCACGTGTGGAACCTTTTGCTAAGAATTGGCAG


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H354JQB U 1
AF RS1GG93JQ U 2
BS 1 12 RS1H354JQB
BS 13 13 RS1GG93JQ
BS 14 154 RS1H354JQB
BS 155 155 RS1GG93JQ
BS 156 187 RS1H354JQB
BS 188 188 RS1GG93JQ
BS 189 216 RS1H354JQB
BS 217 217 RS1GG93JQ
BS 218 634 RS1H354JQB
BS 635 699 RS1GG93JQ

RD RS1H354JQB 634 0 0
GGGAAAATAAGGTGATATTCATATCCAACAGATAATTTAGTTACACTAGTAATTAAAAGA
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AGTTTAT*TGTTTTTTAACAAGCTGCAGTGGAGTGTTTGCCGTTTTTAACTCGCTGTCCA
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ATCTCTGCTGCTTCAGGAGATGCCAATGTACCTAGCTTCAGCATATCAACACTCACCTCC
AGCAACTTAGCGGCTTCGAGTTCTTTCTCCACCAAATCCGACGGCGTTTTGCAGTATTTG
AAAACCACGTAAAGTATCATTTGAAGTGCACCGAGAACAAACCCAATCACGTTCGGGAAA
GCAACGTAAATATCCCTAAGAGCAAGACCATAAAGAAGCCATACGACCGCACTGATTGTA
AGTGTCAAGGATAAGCTAAACGGCATGTACTCCACACTTTTTGTCTTTATCACCGTTCTG
ATAATGCTAAGCGGCGCAGCGAAAACGCAGACAG

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1GG93JQ 698 0 0
C
GAAAATAAGGGGATATTCATATCCAACAGATAATTTAGTTACACTAGTAATTAAAAGAAG
AAGGGAAAAATCAACTCAGGATAATGTAATTCCCGAGATAATTAATCCTCGACTTGGCAC
ACGTAGATGATGATATTAAGATAGAGTACAAAGTCAACAATGCAAAAGATAGGCAAACAG
TTTTTCTGTTTTTTAACAAGCTGCAGTGGAGTGTGTGCCGTTTTTAACTCGCTGTCCATT
TTCAGTTTCAGTCTTCTGATCATTACATATACACTTGTTCGCAGTTGGTACGACTGTGAT
CTCTGCTGCTTCAGGAGATGCCAATGTCCCTAGCTTCAGCATATCAATACTCACCTCCGG
CAACTTAGCGGCTTCGAGTTCTTTCTCCACCAAATCCGACGGCGTTTTGCAGTATTTGAA
AACCACGTAAAGTATCATTTGAAGTGCACCGAGAACAAACCCAATCACGTTCGGGAAAGC
AACGTAGATATCCCTAAGAGCAAGACCATAAAGAAGCCATACGACCGCACTGATTGTAAG
TGTCAAGGATAAGCTAAACGGCATGTACTCCACACTTTTTGTCTTTATCACCGTTCTGAT
AATGTTAAGCGGCGCAGCGAAAACGCAGACAGAGAATCCGACACAGATTCCTCCGATAAT
CTTCGCACGTGTGGAACCTTTTGCTAAGAATTGGCAG

QA 2 698 2 698
DS 



AS 1 13

CO CL121Contig1 899 13 27 U
TTTTTGTAGTAGATCAATAATCTCACATTTCATTTCATGGAATTTAATGAACAAATTTCA
TAACCCAAACCGGATAGAATCATCAGAAACAAATACAATGCAACGATCACAATTATATTC
AGAAGATAAACTTCAAACACAAGATAACAAGTCCAAAACCAAACCCTAGTCCAACTCTCC
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TAGCTTCACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACACCGTTGTCACGGCCGGAAGCTTGAGTCC
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TGAATGTCCACTTGGCTACCGATTTGAGTGATTTTCAAAAGATGCATGAAAGTAGTGAAT
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GCTAGAGTTAGACGGGTGATAGCCATTGCTAGGTTGTTTACTTAATCTCTGAAGAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 20 25 25 25 25 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 50 50 55 40 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 
70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 15 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 35 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 15 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 15 75 60 75 75 45 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 15 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 15 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 
70 70 10 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 10 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1DY58JQ U 11
AF RS1G693JQ U 1
AF RS1GS90JQ U 5
AF RS1AK36JQ U 6
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AF RS1CS28JQ U 241
AF RS1AL10TF C 121
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BS 888 899 RS1AL10TF

RD RS1DY58JQ 648 0 0
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CGGATAGAATCATCAGAAACAAATACAATGCAACGATCACAATTATATTCAGAAGATAAA
CTTCAAACACAAGACAACAAGTCCAAAACCAAACCCTAGTCCAACTCTCCTCTCACCAGA
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CGCATTGCTGACACGTGTCTCCACGTAACCGGTTGAGACATTGACTTGGTTAGCTTCACC
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CATTGTCCGTTGGAGCGAACACGGTCATGCCTTCGGATGAACTGTTGA

QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1G693JQ 691 0 0
TTTTTGTAGTAGATCAATAATCTCACATTTCATTTCATGGAATTTAATGAACAAATTTCA
TAACCCAAACCGGATAGAATCGTCAGAAACAAATACAATGCAACGATCACAATTATATTC
AGAAGATAAACTTCAAACACAAGATAACAAGTCCAAAACCAAACCCTAGTCCAACTCTCC
TCTCACCAGATGCTGACTTATCTGCCGACGCAGGAGCCTTTTTAGTGGAGTTGGTGTTGT
CATCGGAAACCCCAGTGGTCGGAGATTTAGGGGCAGGAGCGATCGGGGAAAGCTTGTGCT
CTCCGAACATCTCACCAGGCAACAAAACCATGTCGACAACATACACCGCGAGAGGACGTT
GTGATCTCAACGCATTGCTGACACGTGTCTCCACGTAACCGGTTGAGACATTGACTTGGT
TAGCTTCACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACACCGTTGTCACGGCCGGAAGCTTGAGTCC
TAACCGGGTTACTCACGGAGAGGAGATCGTCCAAAGTGTAGAATTT*GGGGCTGACGTGG
TAGAGAATGAGTTTGACTTGTTCGTCTGCGCTCAACTTGTTTAGAGTTCCGGCTTTGAGG
TTTTGGAAAGCATTGTCCGTTGGAGCGAACACGGTCATGCCTTCGGATGAACTGTTGACT
TGAGTGTCCACTTGGCTACCGATTTGAGTGA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1GS90JQ 666 0 0
C
GTAGTAGATCAATAATCTCACATTTCATTTCATGGAATTTAATGAACAAATTTCATAACC
CAAACCGGATAGAATCATCAGAAACAAATACAATGCAACGATCACAATTATATTCAGAAG
ATAAACTTCAAACACAAGATAACAAGTCCAAAACCAAACCCTAGTCCAACTCTCCTCTCA
CCAGATGCTGACTTATCTGCCGACGCAGGAGCCTTTTTAGTGGAGTTGGTGTTGTCATCG
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CTCAACGCATTGCTGACACATGTCTCCACGTAACCGGTTGAGACATTGACTTGGTTAGCT
TCACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACACCGTTGTCACGGCCGGAAGCTTGAGTCCTAACC
GGGTTACTCACGGAGAGGAGATCGTCCAAAGTGTAGAATTTTGGGGCAGACGTGGTAGAG
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GAAAGCATTGTCCGTTGGAGCGAACACGGTCATGCCTTCGGATGAACTGTTGACTTGAGT
GTCC
C

QA 2 665 2 665
DS 

RD RS1AK36JQ 703 0 0
GTAGTAGATCAATAATCTCACATTTCATTTCATGGAATTTAATGAACAAATTTCATAACC
CAAACCGGATAGAATCATCAGAAACAAATACAATGCAACGATCTCAATTATATTCAGAAG
ATAAACTTCAAACACAAGACAACAAGTCCAAAACCAAACCCTAGTCCAACTCTCCTCTCA
CCAGATGCTGACTTATCTGCCGACGCAGGAGCGTTTT*AGTGGAGTTGGTGTTGTCATCG
GAAACCCCAGTGGTCGGAGATTTAGGGGCAGGAGCGATCGGGGAAAGCTTGTGCTCTCCG
AACATCTCACCAGGCAACAAAACCATGTCGACAACATACACCGCGAGAGGACGCTGTGAT
CTCAACGCATTGCTGACACGTGTCTCCACGTAACCGGTTGAGACATTGACTTGGTTAGCT
TCACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACACTGTTGTCACGGCCGGAAGCTTGAGTCCTAACC
GGGTTACTTACGGAGAGGAGATCGTCCAAAGTGTAGAATTT*GGGACTGACGTGGTAGAG
AATGAGTTTGACTTGTTCGTCTGCGCTCAACTTGTTAAGAGTTCCGGCTTTGAGGTTTTG
AAAAGCATTGTCCGTTGGAGCGAACACGGTCATGCCTTCGGATGAACTGTTGACTTGAAT
GTCCACTTGGCTACCGATTTGAGTGATTTTCAAAAGATGCATG

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1AL10JQ 739 0 0
A
TAGTAGATCAATAATCTCACATTTCATTCCATGGAATTTAATGAACAAATTTCATAACCC
AAACCGGATAGAATCATCAGAAACAAATACAATGCAACGATCACAATTATATTCAGAAGA
TAAACTTCAAACACAAGATAACAAGTCCAAAACCAAACCCTAGTCCAACTCTCCTCTCAC
CAGATGCTGACTTATCTGCCGACGCAGGAGCCTTTTTAGTGGAGTTGGTGTTGTCATCGG
AAACCCCAGTGGCCGGAGATTTAGGGGCAGGAGCGATCGGGGAAAGCTTGTGCTCTCCGA
ACATCTCACCAGGCAACAAAACCATGTCGACAACATACACCGCGAGAGGACGTTGTGATC
TCAACGCATTGCTGACACGTGTCTCCACGTAACCGGTTGAGACATTGACTTGGTTAGCTT
CACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACACCGTTGTCACGGCCGCTAGCTTGAGTCCTAACCG
GGTTACTCACGGAGAGGAGATCGTCCAAAGTGTAGAATTT*GGGGCTGACGTGGTAGAGA
ATGAGTTTGACTTGTTCGTCTGCGCTCAACTTGTTTAGAGTTCCGGCTTTGAGGTTTTGG
AAAGCATTGTCCGTTGGAGCGAACACGGTCATGCCTTCGGATGAACTGTTGACTTGAGTG
TCCACTTGGCTACCGATTTGAGTGATTTTCAAGAGATGCATGAAAGTAGTGAATTGACCG
CCTTTTTCGAGGATTGCC

QA 2 739 2 739
DS 

RD RS1FS56JQ 723 0 0
G
GATCAATAATCTCACATTTCATTTCATGGAATTTAATGAACAAATTTTATAACCCAAACC
GGATAGAATCATCAGAAACAAATACAATGCAACGATCACAATTATATTCAGAAGATAAAC
TTCAAACACAAGACAACAAGTCCAAA*CCAAACCCTAGTCCAACTCTCCTCTCACCAGAT
GCTGACTTATCTGCCGACGCAGGAGCCTTTTTAGTGGAGTTGGTGTTGTCATCGGAAACC
CCAGTGGTCGGAAATTTAGGGGCAGGAGCGATCGGGGAAAGCTTGTGCTCTCCGAACATC
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GCATTGCTGACACGTGTCTCCACGTAACCGGTTGAGACATTGACTTGGTTAGCTTCACCG
GTGAAGTTAAGTCCGTAAACACCGTTGTCACGGCCGGAAGCTTGAGTCCTAACCGGGTTA
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ATTGTCCGTTGGAGCGAACACGGTCATGCCTTCGGATGAACTGTTGACTTGAATGTCCAC
TTGGCTACCGATTTGAGTGATTTTCAAAAGATGCATGAAAGTAGTGAATTGACCGCCTTT
TT

QA 2 723 2 723
DS 

RD RS1CS28JQ 507 0 0
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CTCCGAACATCTCACCAGGCAACAAAACCATGTCGACAACATACACCGCGAGAGGACGCT
GTGATCTCAACGCATTGCTGACACGTGTCTCCACGTAACCGGTTGAGACATTGACTTGGT
TAGCTTCACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACACTGTTGTCACGGCCGGAAGCTTGAGTTC
TAACCGGGTTACTTACGGAGAGGAGATCGTCCAAAGTGTAGAATTT*GGGACTGACGTGG
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TTTTGAAAAGCATTGTCCGTTGGAGCGAACACGGTCATGCCTTCGGATGAACTGTTGACT
TGAATGTCCACTTGGCTACCGATTTGAGTGATTTTCAAAAGATGCATGAAAGTAGTGAAT
TGACCGCCTTTTTCGAGGATTGCCGTG

QA 1 507 1 507
DS 

RD RS1AL10TF 779 0 0
AGAAGATAAACTTCAAACACAAGATAACAAGTCCAAAACCAAACCCTAGTCCAACTCTCC
TCTCACCAGATGCTGACTTATCTGCCGACGCAGGAGCCTTTTTAGTGGAGTTGGTGTTGT
CATCGGAAACCCCAGTGGCCGGAGATTTAGGGGCAGGAGCGATCGGGGAAAGCTTGTGCT
CTCCGAACATCTCACCAGGCAACAAAACCATGTCGACAACATACACCGCGAGAGGACGTT
GTGATCTCAACGCATTGCTGACACGTGTCTCCACGTAACCGGTTGAGACATTGACTTGGT
TAGCTTCACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACACCGTTGTCACGGCCGCTAGCTTGAGTCC
TAACCGGGTTACTCACGGAGAGGAGATCGTCCAAAGTGTAGAATTT*GGGGCTGACGTGG
TAGAGAATGAGTTTGACTTGTTCGTCTGCGCTCAACTTGTTTAGAGTTCCGGCTTTGAGG
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TGAGTGTCCACTTGGCTACCGATTTGAGTGATTTTCAAGAGATGCATGAAAGTAGTGAAT
TGACCGCCTTTTTCGAGGATTGCCGTGAGGTTGATAGGACCAGCAGGGCCTGGAGCTGGT
GCTGCCGGCTGAGCTGATGTCTCCGTTGAGAGAAGCACCGCGGCGATGAGGAGGAGAGGA
GCTAGAGTTAGACGGGTGATAGCCATTGCTAGTTTGTTTACTTGATGTCTGAAGAGTCC

QA 1 779 1 779
DS 

RD RS1G693TF 636 0 0
GATTTAGGGGCAGGAGCGATCGGGGAAAGCTTGTGCTCTCCGAACATCTCACCAGGCAAC
AAAACCATGTCGACAACATACACCGCGAGAGGACGTTGTGATCTCAACGCATTGCTGACA
CGTGTCTCCACGTAACCGGTTGAGACATTGACTTGGTTAGCTTCACCGGTGAAGTTAAGT
CCGTAAACACCGTTGTCACGGCCGGAAGCTTGAGTCCTAACCGGGTTACTCACGGAGAGG
AGATCGTCCAAAGTGTAGAATTT*GGGGCTGACGTGGTAGAGAATGAGTTTGACTTGTTC
GTCTGCGCTCAACTTGTTTAGAGTTCCGGCTTTGAGGTTTTGGAAAGCATTGTCCGTTGG
AGCGAACACGGTCATGCCTTCGGATGAACTGTTGACTTGAGTGTCCACTTGGCTACCGAT
TTGAGTGATTTTCAAAAGATGCATGAAAGTAGTGAATTGACCGCCTTTTTCGAGGATTGC
CGTGAGGTTGATAGGACCAGCAGGGCCTGGAGCTGGTGGT**CGGCTGAGCTGATGTCTC
C*TTGAGAGAAGCACCGCGGCGATGAGGAGGAGAGGAGCTAGAGTTAGACGGGTGATAGC
CATTGCTAGTTTGTTTACTTGATGTCTGAAGAGTCC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RS1AK36TF 682 0 0
GCAGGAGCG
TTTTAGTGGAGTTGGTGTTGTCATCGGAAACCCCAGTGGTCGGAGATTTAGGGGCAGGAG
CGATCGGGGAAAGCTTGTGCTCTCCGAACATCTCACCAGGCAACAAAACCATGTCGACAA
CATACACCGCGAGAGGACGCTGTGATCTCAACGCATTGCTGACACGTGTCTCCACGTAAC
CGGTTGAGACATTGACTTGGTTAGCTTCACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACACTGTTGT
CACGGCCGGAAGCTTGAGTCCTAACCGGGTTACTTACGGAGAGGAGATCGTCCAAAGTGT
AGAATTT*GGGACTGACGTGGTAGAGAATGAGTTTGACTTGTTCGTCTGCGCTCAACTTG
TTAAGAGTTCCGGCTTTGAGGTTTTGAAAAGCATTGTCCGTTGGAGCGAACACGGTCATG
CCTTCGGATGAACTGTTGACTTGAATGTCCACTTGGCTACCGATTTGAGTGATTTTCAAA
AGATGCATGAAAGTAGTGAATTGACCGCCTTTTTCGAGGATTGCCGTGAGGTTGATAGGA
CCAGCAGGGCCTGGAGCTGGTGCTGCCGGCTGAGCAGATGTCTCCGTTGAGAGAAGCACC
GCGGCGATGAGGAGGAGAGGAGCTAGAGTTAGACGGGTGATAGCCATTGCTAGGTTGTTT
ACTTAATCTCT
CC

QA 10 680 10 680
DS 

RD RS1FS56TF 671 0 0
TTAGTGGAGTTGGTGTTGTCATCGGAAACCCCAGTGGTCGGAGATTTAGGGGCAGGAGCG
ATCGGGGAAAGCTTGTGCTCTCCGAACATCTCACCAGGCAACAAAACCATGTCGACAACA
TACACCGCGAGAGGACGCTGTGATCTCAACGCATTGCTGACACGTGTCTCCACGTAACCG
GTTGAGACATTGACTTGGTTAGCTTCACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACACCGTTGTCA
CGGCCGGAAGCTTGAGTCCTAACCGGGTTACTTACGGAGAGGAGATCGTCCAAAGTGTAG
AATTT*GGGACTGACGTGGTAGAGAATGAGTTTGACTTGTTCGTCTGCGCTCAACTTGTT
AAGAGTTCCGGCTTTGAGGTTTTGAAAAGCATTGTCCGTTGGAGCGAACACGGTCATGCC
TTCGGATGAACTGTTGACTTGAATGTCCACTTGGCTACCGATTTGAGTGATTTTCAAAAG
ATGCATGAAAGTAGTGAATTGACCGCCTTTTTCGAGGATTGCCGTGAGGTTGATAGGACC
AGCAGGGCCTGGAGCTGGTGCTGCCGGCTGAGCAGATGTCTCCGTTGGGAGAAGCACCGC
GGCGATGAGGAGGAGAGGAGCTAGAGTTAGACGGGTGATAGCCATTGCTAGGTTGTTTAC
TTAATCTCT
CC

QA 1 669 1 669
DS 

RD RS1DY58TF 670 0 0
GTTGGTGTTGTCATCGGAA*CCCCAGTGGTCGGAGATTTAGGGGCAGGAGCGATCGGGGA
AAGCTTGTGCTCTCCGAACATCTCACCAGGCAACAAAACCATGTCGACAACATACACCGC
GAGAGGACGCTGTGATCTCAACGCATTGCTGACACGTGTCTCCACGTAACCGGTTGAGAC
ATTGACTTGGTTAGCTTCACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACACCGTTGTCACGGCCGGA
AGCTTGAGTCCTAACCGGGTTACTTACGGAGAGGAGATCGTCCAAAGTGTAGAATTT*GG
GACTGA*GTGGTAGAGAATGAGTTTGACTTGTTCGTCTGCGCTCAACTTGTTAAGAGTTC
CGGCTTTGAGGTTTTGAAAAGCATTGTCCGTTGGAGCGAACACGGTCATGCCTTCGGATG
AACTGTTGACTTGAATGTCCACTTGGCTACCGATTTGAGTGATTTTCAAAAGATGCATGA
AAGTAGTGAATTGACCGCCTTTTTCGAGGATTGCCGTGAGGTTGATAGGACCAGCAGGGC
CTGGAGCTGGTGCTGCCGGCTGAGCAGATGTCTCCGTTGAGAGAAGCACCGCGGCGATGA
GGAGGAGAGGAGCTAGAGTTAGACGGGTGATAGCCATTGCTAGGTTGTTTACTTAATCTC
TGAAGAGTCC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RS1D727TF 665 0 0
GTG
TGTCATCGGAAACCCCAGTGGTCGGAGATTTAGGGGCAGGAGCGATCGGGGAAAGCTTGT
GCTCTCCGAACATCTCACCAGGCAACAAAACCATGTCGACAACATACACCGCGAGAGGAC
GCTGTGATCTCAACGCATTGCTGACACGTGTCTCCACGTAACCGGTTGAGACATTGACTT
GGTTAGCTTCACCGGTGAAGTTAAGTCCGTAAACACCGTTGTCACGGCCGGAAGCTTGAG
TCCTAACCGGGTTACTTACGGAGAGGAGATCGTCCAAAGTGTAGAATTT*GGGACTGACG
TGGTAGAGAATGAGTTTGACTTGTTCGTCTGCGCTCAACTTGTTAAGAGTTCCGGCTTTG
AGGTTTTGAAAAGCATTGTCCGTTGGAGCGAACACGGTCATGCCTTCGGATGAACTGTTG
ACTTGAATGTCCACTTGGCTACCGATTTGAGTGATTTTCAAAAGATGCATGAAAGTAGTG
AATTGACCGCCTTTTTCGAGGATTGCCGTGAGGTTGATAGGACCAGCAGGGCCTGGAGCT
GGTGCTGCCGGCTGAGCAGATGTCTCCGTTGAGAGAAGCACCGCGGCGATGAGGAGGAGA
GGAGCTAGAGTTAGACGGGTGATAGCCATTGCTAGGTTGTTTACTTAATCTCTGAAGAGT
CC

QA 4 665 4 665
DS 



AS 1 14

CO CL122Contig1 752 14 8 U
GGAACCAAACAAAAAAAAGAGAGCCAAAGCTTTAAAACAAGAAAGAAATGGCAACGTCGG
GAACATACGTGACGGAGGTTCCTTTAAAAGGGACGGCGGAGAAACACTACAAGCGGTGGA
AGAGTGAGAACCATCTCTTCCCTGATACCATCGGCCACCACATTCAGAATGTCACCGTTC
ACGAAGGCGAATGGGACTCTCACGGGGGTATCAAGATTTGGAACTACACATTGGATGGAA
AGCAGGAGGTATACAAGGAGAAAAGAGAGATAGACGATGAGAATAAAACAATGACGGCTA
GAGGAATTGAAGGTCACGTGATGGAGCATTTCAAGGTTTGTGACATCGTCGTCCAATTT*
ATTCCCAGGACTGAAGACAGTTGCGTCGGCAAAATCACTATGATCTGGGAGAAGCGCAAC
GATGAAGTCCCCGAACCAAGCAGCTACATGAAACTCGTCAAGAGCATGGTT*GCTGACAT
GGAGGAGCACGTCCACAAAGCTTAATCACCATCA******CAATCACCATCACAATCCCC
ATCACCATCAAGTCATCACTTTCTCAATTTACTTATTAAGGTGTTTTCAATATAATTATT
AATGAATAAGTGTGATCTTGTACGTGGAGTTCCATTTCTATGAAATCGTTTGGTTCTTGT
AAGATGGTCTAAGTATCGAATTCTGTAATGATCCTTCAGTTAATTTTAAATTTCCCATAT
AGTATGCACATATCTAATGATGTGTTCCAAAA


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 55 70 70 70 70 
70 70 70 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 10 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 45 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 10 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 5 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 55 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 50 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 55 50 50 50 50 50 30 30 30 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RS1AC39TF U 83
AF RS1DX79TF U 1
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AF RS1EM83JQ C 184
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AF RS1FT03TF U 1
AF RS1DR63JQ C 19
AF RS1EX17JQ C 53
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RD RS1AC39TF 486 0 0
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TGATACCATCGGCCACCACATTCAGAATGTCACCGTTCACGAAGGCGAATGGGACTCTCA
CGGGGGTATCAAGATTTGGAACTACACATTGGATGGAAAGCAGGAGGTATACAAGGAGAA
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GGAGCATTTCAAGGTTTGTGACATCGTCGTCCAATTTTATTCCCAGGACTGAAGACAGTT
GCGTCGGCAAAATCACTATGATCTGGGAGAAGCGCAACGATGAAGTCCCCGAACCAAGCA
GCTACATGAAACTCGTCAAGAGCATGGTTTGCTGACATGGAGGAGCACGTCCACAAAGCT
TAATCACCATCA******CAATCACCATCACAATCCCCATCACCATCAAGTCATCACTTT
CTCAAT

QA 1 486 1 486
DS 

RD RS1DX79TF 659 0 0
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AGAGTGAGAACCATCTCTTCCCTGATACCATCGGCCACCACATTCAGAATGTCACCGTTC
ACGAAGGCGAATGGGACTCTCACGGGGTTATCAAGATTTGGAACTACACATTGGATGGAA
AGCAGGAGGTATACAAGGAGAAAAGAGAGATAGACGATGAGAATAAAACAATGACGGCTA
GAGGAATTGAAGGTCACGTGATGGAGCATTTCAAGGTTTGCGACATCGTCGTCCAATTT*
ATTCCCAGGACTGAAGACAGTTGCGTCGGCAAAATCACTATGATCTGGGAGAAGCGCAAC
GATGAAGTCCCCGAACCAAGCAGCTACATGAAACTCGTCAAGAGCATGGTT*GCTGACAT
GGAGGAGCACGTCCACAAAGCTTAATCACCATCA******CAATCACCATCACAATCCCC
ATCACCATCAAGTCATCACTTTCTCAATTTACTTATTAAGGTGTTTTCAATATAATTATT
AATGAATAAGTGTGATCTTGTACGTGGAGTTCCATTTCTATGAAATCGTTTGGTTCTTG

QA 1 659 1 659
DS 

RD RS1EM83TF 709 0 0
AAGAGAGCCAAAGCTTTAAAACAAGAAAGAAATGGCAACGTCGGGAACATACGTGACGGA
GGTTCCTTTAAAAGGGACGGCGGAGAAACACTACAAGCGGTGGAAGAGTGAGAACCATCT
CTTCCCTGATACCATCGGCCACCACATTCAGAATGTCACCGTTCACGAAGGCGAATGGGA
CTCTCACGGGGGTATCAAGATTTGGAACTACACATTGGATGGAAAGCAGGAGGTATACAA
GGAGAAGAGAGAGATAGACGATGAGAATAGAACAATGACGGCTAGAGGAATTGAAGGTCA
CGTGATGGAGCATTTCAAGGTTTGTGACATCGTCGTCCAATTT*ATTCCCAGGACTGAAG
ACAGTTGCGTCGGCAAAATCACTATGATCTGGGAGAAGCGCAACGATGAAGTCCCCGAAC
CAAGCAGCTACATGAAACTCGTCAAGAGCATGGTT*GCTGACATGGAGGAGCACGTCCAT
AAAGCTTAATCACCATCACCATCACAATCACCATCACAATCCCCATCACCATCAAGTCAT
CACTTTCTCAATTTACTTATTAAGGTGTTTTCAATATAATTATTAATGAATAAGTGTGGT
CTTGTACGTGGAGTTCCATTTCTATGAAATCGTTTGGTTCTTGTAAGATGGTCTAAGTAT
CGAATTCTGTAATGATCCTTCAGTTAATTTTAAATTTCCCA
AAAAAAAA

QA 1 701 1 701
DS 

RD RS1EM83JQ 533 0 0
AAGGCGAATGGGACTCTCACGGGGGTATCAAGATTTGGAACTACACATTGGATGGAAAGC
AGGAGGTATACAAGGAGAAGAGAGAGATAGACGATGAGAATAGAACAATGACGGCTAGAG
GAATTGAAGGTCACGTGATGGAGCATTTCAAGGTTTGTGACATCGTCGTCCAATTT*ATT
CCCAGGACTGAAGACAGTTGCGTCGGCAAAATCACTATGATTTGGGAGAAGCGCAACGAT
GAAGTCCCCGAACCAAGCAGCTACATGAAACTCGTCAAGAGCATGGTT*GCTGACATGGA
GGAGCACGTCCATAAAGCTTAATCACCATCACCATCACAATCACCATCACAATCCCCATC
ACCATCAAGTCATCACTTTCTCAATTTACTTATTAAGGTGTTTTCAATATAATTATTAAT
GAATAAGTGTGGTCTTGTACGTGGAGTTCCATTTCTATGAAATCGTTTGGTTCTTGTAAG
ATGGTCTAAGTATCGAATTCTGTAATGATCCTTCAGTTAATTTTAAATTTCCC

QA 1 533 1 533
DS 

RD RS1DR63TF 669 0 0
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GTTCCTTTAAAAGGTACGGCGGAGAAACACTACAAGCGGTGGAAGAGTGAGAACCATCTC
TTCCCTGATACCATCGGCCACCACATTCAGAATGTCACCGTTCACGAAGGCGAATGGGAC
TCTCACGGGGGTATCAAGATTTGGAACTACACATTGGATGGAAAGCAGGAGGTATACAAG
GAGAAAAGAGAGATAGACGATGAGAATAAAACAATGACGGCTAGAGGAATTGAAGGTCAC
GTGATGGAGCATTTCAAGGTTTGTGACATCGTCGTCCAATTT*ATTCCCAGGACTGAAGA
CGGTTGCGTCGGCAAAATCACTATGATCTGGGAGAAGCGCAACGATGAAGTCCCCGAACC
AAGCAGCTACATGAAACTCGTCAAGAGCATGGTT*GCTGACATGGAGGAGCACGTCCACA
AAGCTTAATCACCATCA******CAATCACCATCACAATCCCCATCACCATCAAGTCATC
ACTTTCTCAATTTACTTATTAAGGTGTTTTCAATATAATTATTAATGAATAAGTGTGATC
TTGTACGTGGAGTTCCATTTCTATGAAATCGTTTGGTTCTTGTAAGATGGTCTAAGTATC
GAATTCTGT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RS1DX79JQ 664 0 0
ACAAGAAAGAAATGGCAACGTCGGGAACATACGTGACGGAGGTTCCTTTAAAAGGGACGG
CGGAGAAACACTACAAGCGGTGGAAGAGTGAGAACCATCTCTTCCCTGATACCATCGGCC
ACCACATTCAGAATGTCACCGTTCACGAAGGCGAATGGGACTCTCACGGGGTTATCAAGA
TTTGGAACTACACATTGGATGGAAAGCAGGAGGTATACAAGGAGAAAAGAGAGATAGACG
ATGAGAATAAAACAATGACGGCTAGAGGAATTGAAGGTCACGTGATGGAGCATTTCAAGG
TTTGCGACATCGTCGTCCAATTT*ATTCCCAGGACTGAAGACAGTTGCGTCGGCAAAATC
ACTATGATCTGGGAGAAGCGCAACGATGAAGTCCCCGAACCAAGCAGCTACATGAAACTC
GTCAAGAGCATGGTT*GCTGACATGGAGGAGCACGTCCACAAAGCTTAATCACCATCA**
****CAATCACCATCACAATCCCCATCACCATCAAGTCATCACTTTCTCAATTTACTTAT
TAAGGTGTTTTCAATATAATTATTAATGAATAAGTGTGATCTTGTACGTGGAGTTCCATT
TCTATGAAATCGTTTGGTTCTTGTAAGGTGGTCTAAGTATCGAATTCTGTAATGATCCTT
CAGT

QA 1 664 1 664
DS 

RD RS1EX17TF 752 0 0
G
GAACCAAACAAAAAAAAGAGAGCCAAAGCTTTAAAACAAGAAAGAGATGGCAACGTCGGG
AACATACGTGACGGAGGTTCCTTTAAAAGGGACGGCGGAGAAACACTACAAGCGGTGGAA
GAGTGAGAACCATCTCTTCCCTGATACCATCGGCCACCACATTCAGAATGTCACCGTTCA
CGAAGGCGAATGGGACTCTCACGGGGGTATCAAGATTTGGAACTACACATTGGATGGAAA
GCAGGAGGTATATAAGGAGAAAAGAGAGATAGACGATGAGAATAAAACAATGACGGCTAG
AGGAATTGAAGGTCACGTGATGGAGCATTTCAAGGTTTGTGACATCGTCGTCCAATTT*A
TTCCCAGGACTGAAGACAGTTGCGTCGGCAAAATCACTATGATCTGGGAGAAGCGCAACG
ATGAAGTCCCCGAACCAAGCAGCTACATGAAACTCGTCAAGAGCATGGTT*GCTGACATG
GAGGAGCACGTCCACAAAGCTTAATCACCATCA******CAATCACCATCACAATCCCCA
TCACCATCAAGTCATCACTTTCTCAATTTACTTATTAAGGTGTTTTCAATATAATTATTA
ATGAATAAGTGTGATCTTGTACGTGGAGTTCCATTTCTATGAAATCGTTTGGTTCTTGTA
AGATGGTCTAAGTATCGAATTCTGTAATGATCCTTCAGTTAATTTTAA*TTTCCCATATA
GTATGCACATATCTAATGATGTGTTCCAAAA

QA 2 752 2 752
DS 

RD RS1EY02JQ 540 0 0
AAGGCGAATGGGACTCTCACGGGGGTATCAAGATTTGGAACTACACATTGGATGGAAAGC
AGGAGGTATACAAGGAGAAGAGAGAGATAGACGATGAGAATAAAACAATGACGGCTAGAG
GAATTGAAGGTCACGTGATGGAGCATTTCAAGGTTTGTGACATCGTCGTCCAATTT*ATT
CCCAGGACTGAAGACAGTTGCGTCGGCAAAATCACTATGATTTGGGAGAAGCGCAACGAT
GAAGTCCCCGAACCAAGCAGCTACATGAAACTCGTCAAGAGCATGGTT*GCTGACATGGA
GGAGCACGTCCATAAAGCTTAATCACCATCACCATCACAATCACCATCACAATCCCCATC
ACCATCAAGTCATCACTTTCTCAATTTACTTATTAAGGTGTTTTCAATATAATTATTAAT
GAATAAGTGTGGTCTTGTACGTGGAGTTCCATTTCTATGAAATCGTTTGGTTCTTGTAAG
ATGGTCTAAGTATCGAATTCTGTAATGATCCT*CAGTTAATTTTAAATTTCCCATATAG
C

QA 1 539 1 539
DS 

RD RS1H426JQB 585 0 0
TCCCTGATACCATCGGCCACCACATTCAGAATGTCACCGTTCACGAAGGCGAATGGGACT
CTCACGGGGGTATCAAGATTTGGAACTACACATTGGATGGAAAGCAGGAGGTATACAAGG
AGAAGAGAGAGATAGACGATGAGAATAAAACAATGACGGCTAGAGGAATTGAAGGTCACG
TGATGGAGCATTTCAAGGTTTGTGACATCGTCGTCCAATTT*ATTCCCAGGACTGAAGAC
AGTTGCGTCGGCAAAATCACTATGATTTGGGAGAAGCGCAACGATGAAGTCCCCGAACCA
AGCAGCTACATGAAACTCGTCAAGAGCATGGTT*GCTGACATGGAGGAGCACGTCCATAA
AGCTTAATCACCATCACCATCACAATCACCATCACAATCCCCATCACCATCAAGTCATCA
CTTTCTCAATTTACTTATTAAGGTGTTTTCAATATAATTATTAATGAATAAGTGTGGTCT
TGTACGTGGAGTTCCATTTCTATGAAATCGTTTGGTTCTTGTAAGATGGTCTAAGTATCG
AATTCTGTAATGATCCTTCAGTTAATTTTAAATTTCCCATATAG
G

QA 1 584 1 584
DS 

RD RS1EY02TF 707 0 0
AAGAGAGCCAAAGCTTTAAAACAAGAAAGAAATGGCAACGTCGGGAACATACGTGACGGA
GGTTCCTTTAAAAGGGACGGCGGAGAAACACTACAAGCGGTGGAAGAGTGAGAACCATCT
CTTCCCTGATACCATCGGCCACCACATTCAGAATGTCACCGTTCACGAAGGCGAATGGGA
CTCTCACGGGGGTATCAAGATTTGGAACTACACATTGGATGGAAAGCAGGAGGTATACAA
GGAGAAGAGAGAGATAGACGATGAGAATAAAACAATGACGGCTAGAGGAATTGAAGGTCA
CGTGATGGAGCATTTCAAGGTTTGTGACATCGTCGTCCAATTT*ATTCCCAGGACTGAAG
ACAGTTGCGTCGGCAAAATCACTATGATCTGGGAGAAGCGCAACGATGAAGTCCCCGAAC
CAAGCAGCTACATGAAACTCGTCAAGAGCATGGTT*GCTGACATGGAGGAGCACGTCCAT
AAAGCTTAATCACCATCACCATCACAATCACCATCACAATCCCCATCACCATCAAGTCAT
CACTTTCTCAATTTACTTATTAAGGTGTTTTCAATATAATTATTAATGAATAAGTGTGGT
CTTGTACGTGGAGTTCCATTTCTATGAAATCGTTTGGTTCTTGTAAGATGGTCTAAGTAT
CGAATTCTGTAATGATCCT*CAGTTAATTTTAAATTTCCCATATAG
C

QA 1 706 1 706
DS 

RD RS1H426TF 721 0 0
GAACCAAACAAAAAAAAGAGAGCCAAAGCTTTAAAACAAGAAAGAAATGGCAACGTCGGG
AACATACGTGACGGAGGTTCCTTTAAAAGGGACGGCGGAGAAACACTACAAGCGGTGGAA
GAGTGAGAACCATCTCTTCCCTGATACCATCGGCCACCACATTCAGAATGTCACCGTTCA
CGAAGGCGAATGGGACTCTCACGGGGGTATCAAGATTTGGAACTACACATTGGATGGAAA
GCAGGAGGTATACAAGGAGAAGAGAGAGATAGACGATGAGAATAAAACAATGACGGCTAG
AGGAATTGAAGGTCACGTGATGGAGCATTTCAAGGTTTGTGACATCGTCGTCCAATTT*A
TTCCCAGGACTGAAGACAGTTGCGTCGGCAAAATCACTATGATCTGGGAGAAGCGCAACG
ATGAAGTCCCCGAACCAAGCAGCTACATGAAACTCGTCAAGAGCATGGTT*GCTGACATG
GAGGAGCACGTCCATAAAGCTTAATCACCATCACCATCACAATCACCATCACAATCCCCA
TCACCATCAAGTCATCACTTTCTCAATTTACTTATTAAGGTGTTTTCAATATAATTATTA
ATGAATAAGTGTGGTCTTGTACGTGGAGTTCCATTTCTATGAAATCGTTTGGTTCTTGTA
AGATGGTCTAAGTATCGAATTCTGTA*TGATCCTTCAGTTAATTTTAAATTTCCCATATA
G

QA 1 721 1 721
DS 

RD RS1FT03TF 728 0 0
G
GAACCAAACAAAAAAAAGAGAGCCAAAGCTTTAAAACAAGAAAGAAATGGCAACGTCGGG
AACATACGTGACGGAGGTTCCTTTAAAAGGGACGGCGGAGAAACACTACAAGCGGTGGAA
GAGTGAGAACCATCTCTTCCCTGATACCATCGGCCACCACATTCAGAATGTCGC*GTTCA
CGAAGGCGAATGGGACTCTCACGGGGGTATCAAGATTTGGAACTACACATTGGATGGAAA
GCAGGAGGTATACAAGGAGAAAAGAGAGATAGACGATGAGAATAAAACAATGACGGCTAG
AGGAATTGAAGGTCACGTGATGGAGCATTTCAAGGTTTGTGACATCGTCGTCCAATTT*A
TTCCCAGGACTGAAGACAGTTGCGTCGGCAAAATCACTATGATCTGGGAGAAGCGCAACG
ATGATGTCCCCGAACCAAGCAGCTACATGAAACTCGTCAAGAGCATGGTT*GCTGACATG
GAGGAGCACGTCCACAAAGCTTAATCACCATCA******CAATCACCATCACAATCCCCA
TCACCATCAAGTCATCACTTTCTCAATTTACTTATTAAGGT**TTTCAATATAATTATTA
ATGAATAAGTGTGATCTTGTACGTGGAGTTCCATTTCTATGAAATCGTTTGGTTCTTGTA
AGATGGTCTAAGTATCGAATTCTGTAATGATCCTTCAGTTAATTTTAAATTTCCCATATA
GTAT
ACA

QA 2 725 2 725
DS 

RD RS1DR63JQ 711 0 0
GAGAGCCAAAGCTTTAAAACAAGAAAGAAATGGCAACGTCGGGAACATACGTGACGGAGG
TTCCTTTAAAAGGTACGGCGGAGAAACACTACAAGCGGTGGAAGAGTGAGAACCATCTCT
TCCCTGATACCATCGGCCACCACATTCAGAATGTCACCGTTCACGAAGGCGAATGGGACT
CTCACGGGGGTATCAAGATTTGGAACTACACATTGGATGGAAAGCAGGAGGTATACAAGG
AGAAAAGAGAGATAGACGATGAGAATAAAACAATGACGGCTAGAGGAATTGAAGGTCACG
TGATGGAGCATTTCAAGGTTTGTGACATCGTCGTCCAATTT*ATTCCCAGGACTGAAGAC
GGTTGCGTCGGCAAAATCACTATGATCTGGGAGAAGCGCAACGATGAAGTCCCCGAACCA
AGCAGCTACATGAAACTCGTCAAGAGCATGGTT*GCTGACATGGAGGAGCACGTCCACAA
AGCTTAATCACCATCA******CAATCACCATCACAATCCCCATCACCATCAAGTCATCA
CTTTCTCAATTTACTTATTAAGGTGTTTTCAATATAATTATTAATGAATAAGTGTGATCT
TGTACGTGGAGTTCCATTTCTATGAAATCGTTTGGTTCTTGTAAGATGGTCTAAGTATCG
AATTCTGTAATGATCCTTCAGTTAATTTTAAATTTCCCATATAGTAT
ACAC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1EX17JQ 696 0 0
AACGTCGGGAACATACGTGACGGAGGTTCCTTTAAAAGGGACGGCGGAGAAACACTACAA
GCGGTGGAAGAGTGAGAACCATCTCTTCCCTGATACCATCGGCCACCACATTCAGAATGT
CACCGTTCACGAAGGCGAATGGGACTCTCACGGGGGTATCAAGATTTGGAACTACACATT
GGATGGAAAGCAGGAGGTATATAAGGAGAAAAGAGAGATAGACGATGAGAATAAAACAAT
GACGGCTAGAGGAATTGAAGGTCACGTGATGGAGCATTTCAAGGTTTGTGACATCGTCGT
CCAATTT*ATTCCCAGGACTGAAGACAGTTGCGTCGGCAAAATCACTATGATCTGGGAGA
AGCGCAACGATGAAGTCCCCGAACCAAGCAGCTACATGAAACTCGTCAAGAGCATGGTT*
GCTGACATGGAGGAGCACGTCCACAAAGCTTAATCACCATCA******CAATCACCATCA
CAATCCCCATCACCATCAAGTCATCACTTTCTCAATTTACTTATTAAGGTGTTTTCAATA
TAATTATTAATGAATAAGTGTGATCTTGTACGTGGAGTTCCATTTCTATGAAATCGTTTG
GTTCTTGTAAGATGGTCTAAGTATCGAATTCTGTAATGATCCTTCAGTTAATTTTAAATT
TCCCATATAGTATGCACATATCTAATGATGTGTTCC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 9

CO CL123Contig1 1241 9 19 U
GGAACATCGTCACTAGCTTTCTCACTCTTCTTATTTAAGCCACCTCGCATCGCTTACGTG
GGGATTACCTTCCTTCCTTTCCCTCTTCTCTACCCAACTGCCATCAAACGAACTTAAACC
GGCCAGTCGCACCACAAGATTCATTCTCGTCTAAATTTCATCAAACCAGCCCAAGTCGTT
GATCCAATATTGTCGTCTGTTTTGTTCTTTTCTTTTAACTATCAATTGGGCTTTCCAGAA
CTCGATGAATCCGTTTCAGCTCCAAGAAGGTGATCCACCACCGAAACCAGTCGAAGGATT
ACACGAGATTGGACCGCCACCGTTTCTAATCAAGACATTCGAGATAGTGGAGGATCCAAG
CACAGACCACATCGTATCTTGGAACAGAGGAGGTACTAGTTTTGTCGTTTGGGATTTGCA
TTCCTTCTCAACGTTTCTTCTCCCTCGACACTTCAAACACAGCAATTTCTCAAGTTTCAT
CAGACAGCTTAACACTTATGGTTTCAGAAAGATAGAAGCAGATAGGTGGGAATTTGCAAA
CGATGGGTTCTTGTTAGGACAGAGACAGTTACTGAAGTTCATCAAGAGACGAGCTTCCTT
TGGTTCATCGTCTCCATCGATCAATGATCCTTGTACCGAGCTTCGTAGGGAGAAGCAGTT
GTTAATGATGGAGCTGGTGTGTCTGAGACAACAGCAACAAACCACGAGGAGATACATCAA
AGCTATGGAACAGAGGATTGAAAGAGCAGAGAGGAAACAGAGACAGATGATGTCTTTCTT
GGCTAGAGCGATGCAGAGCCC*TTCGTTTCTGCATCAGCTGCTGAAGCAGAGAGATATGA
GACTCAAGGAGATTGAGGATGAGGCGGCAGAGAGAGAAAGATGTTCTTCGATGTCGGAAC
TTGAAACTCTTGCTTTGGAAATGCAAGGCTATGGGAAACAGAAGAATGTGAAGGAAGAAG
AGGATATGGTGGTCGAGAGAGAACTGGATGATGGTTTCTGGGAAGAGTTGCTTAGTAATG
AGAGTTTGGCTTCGACTTCTAGCTATTAGATGGATATCCTTTGG**TTTTTGGTTGTGCT
CATAAGCTTTTTTATTTTATTTTTTATCAAGTACTCTGAAGCTTTTATTATCTTCCAAAT
ATTTCTTGCCAGTTTTCAATTAGTAATAGTGTATAATTACAGAACGTTATAATTCTTTCA
TGTATGCCAATAGCTATATGTGAAATATACTTTTCCTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 20 40 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RS1FD43TF U 1
AF RS1CF95TF U 65
AF RS1BV30TF U 623
AF RS1AH64TF U 537
AF RS1AH64JQ C 685
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AF RS1GQ19TF U 551
AF RS1CF95JQ C 676
AF RS1FD43JQ C 891
BS 1 133 RS1FD43TF
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RD RS1FD43TF 829 0 0
GGAACATCGTCACTAGCTTTCTCACTCTTCTTATTTAAGCCACCTCGCATCGCTTACGTG
GGGATTACCTTCCTTCCTTTCCCTCTTCTCTACCCAACTGCCATCAAACGAACTTAAACC
GGCCAGTCGCACCGCAAGATTCATTCTCGTCTAAATTTCATCAAACCAGCCCAAGTCGTT
GATCCAATATTGTCGTCTGTTTTGTTCTTTTCTTTTAACTATCAATTGGGCTTTCCAGAA
CTCGATGAATCCGTTTCAGCTCCAAGAAGGTGATCCACCACCGAAACCAGTCGAAGGATT
ACACGAGATTGGACCGCCACCGTTTCTAATCAAGACATTCGAGATAGTGGAGGATCCAAG
CACA**CCACATCGTATCTTGGAACAGAGGAGGTACTAGTTTTGTCGTTTGGGATTTGCA
TTCCTTCTCAACGTTTCTTCTCCCTCGACACTTCAAACACAGCAATTTCTCAAGTTTCAT
CAGACAGCTTAACACTTATGGTTTCAGAAAGATAGAAGCAGATAGGTGGGAATTTGCAAA
CGATGGGTTCTTGTTAGGACAGAGACAGTTACTGAAGTTCATCAAGAGACGAGCTTCCTT
CGGTTCGTCGTCTCCATCAATCAATGATCCTTGTACCGAGCTTCGTAGGGAGAAGCAGTT
GTTAATGATGGAGCTGGTGTGTCTGAGACAACAGCAACAAACCACGAGGAGATACATCAA
AGCTATGGAACAGAGGATTGAAGCAGCAGAGAGGAAACAGAGACAGATGATGTCTTTCTT
GGCTAGAGCGATGCAGAGCCC*TTCGTTTCTGCATCAGCTGCTGAAGCA

QA 1 829 1 829
DS 

RD RS1CF95TF 780 0 0
GG
ACCTTCCTTCCTTTCCCTCTTCTCTACCCAACTGCCATCAA*CGAACTTAAACCGGCCAG
TCGCACCACAAGATTCATTCTCGTCTAAATTTCATCAAACCAGCCCAAGTCGTTGATCCA
ATATTGTCGTCTGTTTTTTTCTTTTCTTTTAACTATCAATTGGGCTTTCCAGAACTCGAT
GAATCCGTTTCAGCTCCAAGAAGGTGATCCACCACCGAAACCAGTCGAAGGATTACACGA
GATTGGACCGCCACCGTTTCTAATCAAGACATTCGAGATAGTGGAGGATCCAAGCACAGA
CCACATCGTATCTTGGAACAGAGGAGGTACTAGTTTTGTCGTTTGGGATTTGCATTCTTT
CTCAACGTTTCTTCTCCCTCGACACTTCAAACACAGCAATTTCTCAAGTTTCATCAGACA
GCTTAACACTTAT********AAAGATAGAAGCAGATAGGTGGGAATTTGCAAACGATGG
GTTCTTGTTAGGACAGAGACAGTTACTGAAGTTCATCAAGAGACGAGCTTCCTTTGGTTC
ATCGTCTCCATCGATCAATGATCCTTGTACCGAGCTTCGTAGGGAGAAGCAGTTGTTAAT
GATGGAGCTGGTGTGTCTGAGACAACAGCAACGAACCACGATGAGATACATCAAAGCTAT
GGAACAGAGGATTGAAAGAGCAGAGAGGAAACAGAGACAGATGATGTCTTTCTTGGCTAG
AGCGATGCAGAGCTC*TTCGTTTCTGCATCAGCTGCTGAAGCAGAGAGATATGAGACT

QA 3 780 3 780
DS 

RD RS1BV30TF 336 0 0
AATGATCCTTGTACCGAGCTTCGTAGGGAGAAGCAGTTGTTAATGATGGAGCTGGTGTGT
CTGAGACAACAGCAACAAACCACGAGGAGATACATCAAAGCTATGGAACAGAGGATTGAA
AGAGCAGAGAGGAAACAGAGACAGATGATGTCTTTCTTGGCTAGAGCGATGCAGAGCCC*
TTCGTTTCTGCATCAGCTGCTGAAGCAGAGAGATATGAGACTCAAGGAGATTGAGGATGA
GGCGGCAGAGAGAGAAAGATGTTCTTCGATGTCGGAACTTGAAACTCTTGCTTTGGAAAT
GCAAGGCTATGGGAATCAGAAGAATGTGAAGGAAGA

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DS 

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CCTTTGGTTCATCGTCTCCATCGATCAATGACCCTTGTACCGAGCTTCGTAGGGAGAAGC
AGTTGTTAATGATGGAGCTGGTGTGTCTGAGACAACAGCAACAAACCACGAGGAGATACA
TCAAAGCTATGGAACAGAGGATTGAAAGAGCAGAGAGGAAACAGAGACAGATGATGTCTT
TCTTGGCTAGAGCGATGCAGAGCCCCTTCGTTTCTGCATCAGCTGCTGAAGCAGAGAGAT
ATGAGACTCAAGGAGATTGAGGATGAGGCGGCAGAGAGAGAAAGATGTTCTTCGATGTCG
GAACTTGAAACTCTTGCTTTGGAAATGCAAGGCTATGGGAAACAGAAGAATGTGAAGGAA
GAAGAGGATATGGTGGTCGAGAGAGAACTGGATGATGGTTTCTGGGAAGAGTTGCTTAGT
AATGAGAGTTTGGCTTCGACTTCTAGCTATTAGATGGATATCCTTTGG**TTTTTGGTTG
TGCTCATAAGCTTTTTTATTTTATTTTTTATCAAGTACTCTGAAGCTTTTATTATCTTC

QA 1 599 1 599
DS 

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GAGACAACAGCAACAAACCACGAGGAGATACATCAAAGCTATGGAACAGAGGATTGAAAG
AGCAGAGAGGAAACAGAGACAGATGATGTCTTTCTTGGCTAGAGCGATGCAGAGCCC*TT
CGTTTTTGCATCAGCTGCTGAAGCAGAGAGATATGAGACTCAAGGAGATTGAGGATGAGG
CGGCAGAGAGAGAAAGATGTTTTTCGATGTCGGAACTTGAAACTCTTGCTTTGGAAATGC
AAGGCTATGGGAAACAGAAGAATGTGAAGGAAGAAGAGGATATGGTGGTCGAGAGAGAAC
TGGATGATGGTTTCTGGGAAGAGTTGCTTAGTAATGAGAGTTTGGCTTCGACTTCTAGCT
ATTAGATGGATATCCTTTGG**TTTTTGGTTGTGCTCATAAGCTTTTTTATTTTATTTTT
TATCAAGTACTCTGAAGCTTTTATTATCTTCC

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DS 

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GACAACAGCAACAAACCACGAGGAGATACATCAAAGCTATGGAACAGAGGATTGAAAGAG
CAGAGAGGAAACAGAGACAGATGATGTCTTTTTTGGCTAGAGGGATGCAGAGCCC*TTCG
TTTTTGCATCAGCTGCTGAAGCAGAGAGATATGAGACTCAAGGAGATTGAGGATGAGGCG
GCAGAGAGAGAAAGATGTTTTTCGATGTCGGAACTTGAAACTCTTGCTTTGGAAATGCAA
GGCTATGGGAATCAGAAGAATGTGAAGGAAGAAGAGGATATGGTGGTCGAGAGAGAACTG
GATGATGGTTTCTGGGAAGAGTTGCTTAGTAATGAGAGTTTGGCTTCGACTTCTAGCTAT
TAGATGGATATCCTTTGG**TTTTTGGTTGTGCTCATAAGCTTTTTTATTTTATTTTTTA
TCAAGTACTTTGAAGCTTTTAT

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DS 

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GG
GTTAGGACAGAGACAGTTACTGAAGTTCATCAAGAGACGAGCTTCCTTTGGTTCATCGTC
TCCATCGATCAATGATCCTTGTACCGAGCTTCGTAGGGAGAAGCAGTTGTTAATGATGGA
GCTGGTGTGTCTGAGACAACAGCAACAAACCACGAGGAGATACATCAAAGCTATGGAACA
GAGGATTGAAAGAGCAGAGAGGAAACAGAGACAGATGATGTCTTTCTTGGCTAGAGCGAT
GCAGAGCCC*TTCGTTTCTGCATCAGCTGCTGAAGCAGAGAGATATGAGACTCAAGGAGA
TTGAGGATGAGGCGGCAGAGAGAGAAAGATGTTCTTCGATGTCGGAACTTGAAACTCTTG
CTTTGGAAATGCAAGGCTATGGGAAACAGAAGAATGTGAAGGAAGAAGAGGATATGGTGG
TCGAGAGAGAACTGGATGATGGTTTCTGGGAAGAGTTGCTTAGTAATGAGAGTTTGGCTT
CGACTTCTAGCTATTAGATGGATATCCTTTGG**TTTTTGGTTGTGCTCATAAGCTTTTT
TATTTTATTTTTTATCAAGTACTCTGAAGCTTTTATTATCTTCCAAATATTTCTTGCCAG
TTTTCAATTAGTAATAGTGTATAATTACAGAACGTTATAATTCTTTCATGTATGCCAATA
GCTATATGTGAA*TATACTTTTCCT

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DS 

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GGTGTGTTTGAGACAACAGCAACGAACCACGATGAGATACATCAAAGCTATGGAACAGAG
GATTGAAAGAGCAGAGAGGAAACAGAGACAGATGATGTCTTTTTTGGCTAGAGCGATGCA
GAGCCC*TTCGTTTTTGCATCAGCTGCTGAAGCAGAGAGATATGAGACTCAAGGAGATTG
AGGATGAGGCGGCAGAGAGAGAAAGATGTTTTTCGATGTCGGAACTTGAAACTCTTGCTT
TGGAAATGCAAGGCTATGGGAAACAGAAGAATGTGAAGGAAGAAGAGGATATGGTGGTCG
AGAGA*AACTGGATGATGGTTTTTGGGAAGAGTTGCTTAGTAATGAGAGTTTGGCTTCGA
CTTCTAGCTATTAGATGGATATCCTTTGG**TTTTTGGTTGTGCTCATAAGCTTTTTTAT
TTTATTTTTTATCAAGTACTTTGAAGCTTTTATTATCTTCCAAATATTTCTTGCCAGTTT
TCAATTAGTAATAGTGTATAATTACAGAACGTTATAATTCTTTCATGTATGCCAATAGCT
ATATGTGAAATATACTTTTCCT
TT

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DS 

RD RS1FD43JQ 351 0 0
ATGTCGGAACTTGAAACTCTTGCTTTGGAGATGCAAGGCTATGGTAAACAGAAGAATGTG
AAGGAAGAAGAGGATATGGTGGTCGAGAGAGAACTGGATGATGGTTTCTGGGAAGAGTTG
CTTAGTAATGAGAGTTTGGCTTCGACTTCTCGCTATTAGATGGATATCCTTTGGGTTTTT
TAGTTGTGCTCAGAAGCTTTTTTATTTTATTTTTTATCAAGTAGTCTGAAGCTTTTATTA
TCTTCCAAATATTTCTTGCCAGTTTTCAATTAGTAATAGTGTATAATTACAGAACGTTAT
AATTCTTTCATGTATGCCAATAGCTATATGTGAAATATACTTTTCCTTTAC

QA 1 351 1 351
DS 



AS 1 14

CO CL124Contig1 1340 14 14 U
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TCCCAATGGGAAGTACAGAGTCGTCAGCACGAAACCTATGCCTGGTACTCGCTGGATCAA
CCTCTTGATCGACCAAGGTTGTCGCCTCGAGATATGCCATTTGAAGAAGACAATCTTGTC
TGTGGAAGACATCATTGATCTGATTGGAAACAGGTGTGATGGAGTCATCGGTCAGTTGAC
GGAAGATTGGGGAGAGACACTGTTTTCAGCTCTGAGCAAAGCTGGAGGAAAAGCTTTCAG
CAACATGGCCGTAGGTTACAACAACGTCGATGTTGAAGCCGCCAATAAGTATGGTATCGC
CGTTGGTAACACTCCTGGAGTGTTGACCGAGACAACCGCTGAACTAGCTGCTTCTCTTTC
CCTTGCTGCTGCAAGAAGGATCGTTGAAGCTGATGGTTTCATGAGAGGTGGCTTGTACGA
GGGTTGGCTTCCTCATCTGTTTGTGGGGAACTTACTTAAAGGACAGACCGTGGGAGTTAT
TGGAGCTGGACGTATTGGGTCTGCTTATGCTAGAATGATGGTTGAAGGGTTCAAGATGAA
TTTGATCTACTTTGATCTTTACCAATCCACTCGTCTTGAGAAATTCGTGACAGCTTATGG
ACAATTCTTGAAAGCAAATGGGGAACAACCTGTGACATGGAAACGAGCTTCTTCCATGGA
GGAGGTTCTGCGTGAGGCTGATCTGATAAGTCTTCACCCTGTATTGGACAAAACCACTTA
CCATCTTGTCAATAAGGAGAGGCTTGCCATGATGAAAAAGGAAGCAATTCTTGTGAACTG
TAGTAGAGGTCCAGTGATCGATGAGGTAGCACTTGTCGATCATCTAAGAGAGAACCCAAT
GTTCCGAGTTGGCCTGGATGTGTTTGAGGAAGAGCCATTCATGAAGCCAGGCCTTGCTGA
TATGAAGAATGCTATTGTTGTTCCTCACATTGCTTCTGCTTCCAAGTGGACTCGTGAAGG
AATGGCTACGCTTGCAGCTCTCAACGTCGTCGGAAGGATCAAAGGATATCCTATTTGGAG
TGACCCGAACCGGGTCGACCCGTTCTTGAACGAAAATGCTTCACCGCCTAATGCCAGCCC
AAGCATTGTCAACTCAAAAGCCTTGGGATTGCCTGTGTCGAAGCTGTGAGTTAAAGAGTA
TTATGAAGAAGAGGAGATATGGAAGAATCATTTTAGTAAAAATATCTGATGGTCTCAAGT
TGTAATGTATTGCAAAACAACCATGTTGGATCATAAATAACTCTTTTTAAGTGTTATTGA
GTAATTTTACTCTTCCTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 
55 55 55 55 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 40 55 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 40 40 40 40 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CA42TF U 1
AF RS1E907TF U 5
AF RS1DG82TF U 5
AF RS1H627TF U 3
AF RS1BK62TF U 5
AF RS1DA51TF U 281
AF RS1AL42JQ C 682
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AF RS1AL42TF U 682
AF RS1E907JQ C 933
AF RS1EC87TF U 760
BS 1 592 RS1CA42TF
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BS 594 603 RS1CA42TF
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BS 605 665 RS1CA42TF
BS 666 724 RS1H627TF
BS 725 725 RS1DA51TF
BS 726 736 RS1H627TF
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BS 738 767 RS1H627TF
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BS 1061 1061 RS1EC87TF
BS 1062 1340 RS1AL42TF

RD RS1CA42TF 672 0 0
GGCTCCACAGAAACACTTGTTCTCTGCCATGGCCAAACCGGTGTCTATTGAAGTGTATAA
TCCCAATGGGAAGTACAGAGTCGTCAGCACGAAACCTATGCCTGGTACTCGCTGGATCAA
CCTCTTGATCGACCAAGGTTGTCGCCTCGAGATATGCCATTTGAAGAAGACAATCTTGTC
TGTGGAAGACATCATTGATCTGATTGGAAACAGGTGTGATGGAGTCATCGGTCAGTTGAC
GGAAGATTGGGGAGAGACACTGTTTTCAGCTCTGAGCAAAGCTGGAGGAAAAGCTTTCAG
CAACATGGCCGTAGGTTACAACAACGTCGATGTTGAAGCCGCCAATAAGTATGGTATCGC
CGTTGGTAACACTCCTGGAGTGTTGACCGAGACAACCGCTGAACTAGCTGCTTCTCTTTC
CCTTGCTGCTGCAAGAAGGATCGTTGAAGCTGATGGTTTCATGAGAGGTGGCTTGTACGA
GGGTTGGCTTCCTCATCTGTTTGTGGGGAACTTACTTAAAGGACAGACCGTGGGAGTTAT
TGGAGCTGGACGTATTGGGTCTGCTTATGCTAGAATGATGGTTGAAGGGTTCGAGATGAA
TTTTATCTACTTTGATCTTTACCAATCCACTCGTCTTGAGAAATTCGTGACAGCTTATGG
ACAAT
CTTGAAA

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1E907TF 716 0 0
GG
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TGGGAAGTACAGAGTCGTCAGCACGAAACCTATGCCTGGTACTCGCTGGATCAACTTCTT
GATCGACCAAGGTTGTCGCCTCGAGATATGCCATTTGAAGAAGACAATCTTGTCTGTGGA
AGACATCATTGATCTGATTGGAAACAGGTGTGATGGAGTCATCGGTCAGTTGACGGAAGA
TTGGGGAGAGACACTGTTTTCAGCTCTGAGCAAAGCTGGAGGAAAAGCTTTCAGCAACAT
GGCCGTAGGTTACAACAACGTCGATGTTGAAGCCGCCAATAAGTATGGTATCGCCGTTGG
TAACACTCCTGGAGTGTTGACCGAGACAACCGCTGAACTAGCTGCTTCTCTTTCCCTTGC
TGCTGCAAGAAGGATCGTTGAAGCTGATGGTTTCATGAGAGGTGGCTTGTACGAGGGTTG
GCTTCCTCATCTGTTTGTGGGGAACTTACTTAAAGGACAGACCGTGGGAGTTATTGGAGC
TGGACGTATTGGGTCTGCTTATGCTAGAATGATGGTTGAAGGGTTCAAGATGAATTTGAT
CTACTTTGATCTTTACCAATCCACTCGTCTTGAGAAATTCGTGACAGCTTATGGACAATT
CTTGAAAGCAAATGGGGAACAACCTGTGACATGGAA*CGAGCTTCTTCCATGGA

QA 3 716 3 716
DS 

RD RS1DG82TF 715 0 0
GG
ACAGAAACACTTGTTCTCTGCCATGGCCAAACCGGTGTCTATTGAAGTGTATAATCCCAA
TGGGAAGTACAGAGTCGTCAGCACGAAACCTATGCCTGGTACTCGCTGGATCAACCTCTT
GATCGACCAAGGTTGTCGCCTCGAGATATGCCATTTGAAGAAGACAATCTTGTCTGTGGA
AGACATCATTGATCTGATTGGAAACAGGTGTGATGGAGTCATCGGTCAGTTGACGAAAGA
TTGGGGAGAGACACTGTTTTCAGCTCTGAGCAAAGCTGGAGGAAAAGCTTTCAGCAACAT
GGCCGTAGGTTACAACAACGTCGATGTTGAAGCCGCCAATAAGTATGGTATCGCCGTTGG
TAACACTCCTGGAGTGTTGACCGAGACAACCGCTGAACTAGCTGCTTCTCTTTCCCTTGC
TGCTGCAAGAAGGATCGTTGAAGCTGATGGTTTCATGAGAGGTGGCTTGTACGAGGGTTG
GCTTCCTCATCTGTTTGTGGGGAACTTACTTAAAGGACAGACCGTGGGAGTTATTGGAGC
TGGACGTATTGGGTCTGCTTATGCTAGAATGATGGTTGAAGGGTTCAAGATGAATTTGAT
CTACTTTGATCTTTACCAATCCACTCGTCTTGAGAAATTCGTGACAGCTTATGGACAATT
CTTGAAAGCAAATGGGGAACAACCTGTGACATGGAAACGAGCTTCTTCCATGG

QA 3 715 3 715
DS 

RD RS1H627TF 765 0 0
GGCC
ACAGAAACACTTGTTCTCTGCCATGGCCAAACCGGTGTCTATTGAAGTGTATAATCCCAA
TGGGAAGTACAGAGTCGTCAGCACGAAACCTATGCCTGGTACTCGCTGGATCAACCTCTT
GATCGACCAAGGTTGTCGCCTCGAGATATGCCATTTGAAGAAGACAATCTTGTCTGTGGA
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TTGGGGAGAGACACTGTTTTCAGCTCTGAGCAAAGCTGGAGGAAAAGCTTTCAGCAACAT
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TAACACTCCTGGAGTGTTGACCGAGACAACCGCTGAACTAGCTGCTTCTCTTTCCCTTGC
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TGGACGTATTGGGTCTGCTTATGCTAGAATGATGGTTGAAGGGTTCAAGATGAATTTGAT
CTACTTTGATCTTTACCAATCCACTCGTCTTGAGAAATTCGTGACAGCTTATGGACAATT
CTTGAAAGCAAATGGGGAACAACCTGTGACATGGAAACGAGCTTCTTCCATGGAGGAG*T
TCTGCGTGAG*CTGATCTGATAAGTCTTCACCCTGTATTGG

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DS 

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GG
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TGGGAAGTACAGAGTCGTCAGCACGAAACCTATGCCTGGTACTCGCTGGATCAACCTCTT
GATCGACCAAGGTTGTCGCCTCGAGATATGCCATTTGAAGAAGACAATCTTGTCTGTGGA
AGACATCATTGATCTGATTGGAAACAGGTGTGATGGAGTCATCGGTCAGTTGACGGAAGA
TTGGGGAGAGACACTGTTTTCAGCTCTGAGCAAAGCTGGAGGAAAAGCTTTCAGCAACAT
GGCCGTAGGTTACAACAACGTCGATGTTGAAGCCGCCAATGAGTATGGTATCGCCGTTGG
TAACACTCCTGGAGTGTTGACCGAGACAACCGCTGAACTAGCTGCTTCTCTTTCCCTTGC
TGCTGCAAGAAGGATCGTTGAAGCTGATGGTTTCATGAGAGGTGGCTTGTACGAGGGTTG
GCTTCCTCATCTGTTTGTGGGGAACTTACTTAAAGGACAGACCGTGGGAGTTATTGGAGC
TGGACGTATTGGGTCTGCTTATGCTAGAATGATGGTTGAAGGGTTCAAGATGAATTTGAT
CTACTTTGATCTTTACCAATCCACTCGTCTTGAGAAATTCGTGACAGCTTATGGACAATT
CTTGAAAGCAAATGGGGAACAACCTGTGACATGGAAACGAGCTTCTTCCATGGAGGAG
TTCTGCG

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DS 

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GCCAATAAGTGTGGTATCGCCGTTGGTAACACTCCTGGAGTGTTGACCGAGACAACCGCT
GAACTAGCTGCTTCTCTTTCCCTTGCTGCTGCAAGAAGGATCGTTGAAGCTGATGGTTTC
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GGACAGACCGTGGGAGTTATTGGAGCTGGACGTATTGGGTCTGCTTATGCTAGAATGATG
GTTGAAGGGTTCAAGATGAATTTGATCTACTTTGATCTTTACCAATCCACTCGTCTTGAG
AAATTTGTGACAGCTTATGGACAATTCTTGAAAGCAAATGGGGAACAACCTGTGCCATGG
AAACGAGCTTCTTCCATGGAGGAGGTTCTGCGTGAGGCTGATCTGATAAGTCTTCACCCT
GTATTGGAC

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DS 

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TCTGATAAGTCTTCACCCTGTATTGGACAAAACCACTTACCATCTTGTCAATAAGGAGAG
GCTTGCCATGATGAAAAAGGAAGCAATTCTTGTGAACTGTAGTAGAGGTCCAGTGATCGA
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GTTTGAGGAAGAGCCATTCATGAAGCCAGGCCTTGCTGATATGAAGAATGCTATTGTTGT
TCCTCACATTGCTTCTGCTTCCAAGTGGACTCGTGAAGGAATGGCTACGCTTGCAGCTCT
CAACGTCGTCGGAAGGATCGAAGGATATCCTATTTGGAGTGACCCGAACCGGGTCGACCC
GTTCTTGAACGAAAATGCTTCACCGCCTAATGCCAGCCCAAGCATTGTCAACTCAAAAGC
CTTGGGATTGCCTGTGTCGAAGCTGTGAGTTAAAGAGTATTATGAAGAAGAGGAGATATG
GAAGAATCATTTTAGT

QA 1 556 1 556
DS 

RD RS1BK62JQ 685 0 0
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ACATGGAAACGAGCTTCTTCCATGGAGGAGGTTCTGCGTGAGGCTGATCTGATAAGTCTT
CACCCTGTATTGGACAAAACCACTTACCATCTTGTCAATAAGGAGAGGCTTGCCATGATG
AAAAAGGAAGCAATTCTTGTGAACTGTAGTAGAGGTCCAGTGATCGATGAGGTAGCACTT
GTCGATCATCTAAGAGAGAACCCAATGTTCCGAGTTGGCCTGGATGTGTTTGAGGAAGAG
CCATTCATGAAGCCAGGCCTTGCTGATATGAAGAATGCTATTGTTGTTCCTCACATTGCT
TCTGCTTCCAAGTGGACTCGTGAAGGAATGGCTACGCTTGCAGCTCTCAACATCGTCGGA
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GTGTCGAAGCTGTGAGTTAAAGAGTATTATGAAGAAGAGGAGATATGGAAGAATCATTT*
AGTAAAAATATCTGATGGTCTCAAGTTGTAATGTATTGCAAAACAACCATGTTGGATCAT
AAATAACTCTTTTTAAGTGTTATTG

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DS 

RD RS1DA51JQ 723 0 0
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GCTTATGGACAATTCTTGAAAGCAAATGGGGAACAACCTGTGCCATGGAAACGAGCTTCT
TCCATGGAGGAGGTTCTGCGTGAGGCTGATCTGATAAGTCTTCACCCTGTATTGGACAAA
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GTGAACTGTAGTAGAGGTCCAGTGATCGATGAGGTAGCACTTGTCGATCATCTAAGAGAG
AACCCAATGTTCCGAGTTGGCCTGGATGTGTTTGAGGAAGAGCCATTCATGAAGCCAGGC
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ATTTGGAGTGACCCGAACCGGGTCGACCCGTTCTTGAACGAAAATGCTTCACCGCCTAAT
GCCAGCCCAAGCATTGTCAACTCAAAAGCCTTGGGATTGCCTGTGTCGAAGCTGTGAGTT
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GTT

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DS 

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CTACTTTGATCTTTACCAATCCACTCGTCTTGAGAAATTCGTGACAGCTTATGGACAATT
CTTGAAAGCAAATGGGGAACAACCTGTGACATGGAAACGAGCTTCTTCCATGGAGGAGGT
TCTGCGTGAGGCTGATCTGATAAGTCTTCACCCTGTATTGGACAAAACCACTTACCATCT
TGTCAATAAGGAGAGGCTTGCCATGATGAAAAAGGAAGCAATTCTTGTGAACTGTAGTAG
AGGTCCAGTGATCGATGAGGTAGCACTTGTCGATCATCTAAGAGAGAACCCAATGTTCCG
AGTTGGCCTGGATGTGTTTGAGGAAGAGCCATTCATGAAGCCAGGCCTTGCTGATATGAA
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GAACCGGGTCGACCCGTTCTTGAACGAAAGTGCTTCACCGCCTAATGCCAGCCCAAGCAT
TGTCAACTCAAAAGCCTTGGGATTGCCTGTGTCGAAGCTGTGAGTTAAAGAGTATTATGA
AGAAGAGGAGATATGGAGGAATCATTTTAGTAAAAATATCTGATGGTCTCAAGTTGTAAT
GTATTGCAAAACAACCATGTTGGATCATAAATAACTCTTTTTAAGTGTTATTGAGTAATT
TTACTC
TTCCTGCT

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DS 

RD RS1DG82JQ 683 0 0
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GCTTCTTCCATGGAGGAGGTTCTGCGTGAGGCTGATCTGATAAGTCTTCACCCTGTATTG
GACAAAACCACTTACCATCTTGTCAATAAGGAGAGGCTTGCCATGATGAAAAAGGAAGCA
ATTCTTGTGAACTGTAGTAGAGGTCCAGTGATCGATGAGGTAGCACTTGTCGATCATCTA
AGAGAGAACCCAATGTTCCGAGTTGGCCTGGATGTGTTTGAGGAAGAGCCATTCATGAAG
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CCTAATGCCAGCCCAAGCATTGTCAACTCAAAAGCCTTGGGATTGCCTGTGTCGAAGCTG
TGAGTTAAAGAGTATTATGAAGAAGAGGAGATATGGAAGAATCATTTTAGTAAAAATATC
TGATGGTCTCAAGTTGTAATGTATTGCAAAACAACCATGTTGGATCATAAATAACTCTTT
TTAAGTGTTATTGAGTAATTTTA

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DS 

RD RS1AL42TF 659 0 0
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TCTGATAAGTCTTCACCCTGTATTGGACAAAACCACTTACCATCTTGTCAATAAGGAGAG
GCTTGCCATGATGAAAAAGGAAGCAATTCTTGTGAACTGTAGTAGAGGTCCAGTGATCGA
TGAGGTAGCACTTGTCGATCATCTAAGAGAGAACCCAATGTTCCGAGTTGGCCTGGATGT
GTTTGAGGAAGAGCCATTCATGAAGCCAGGCCTTGCTGATATGAAGAATGCTATTGTTGT
TCCTCACATTGCTTCTGCTTCCAAGTGGACTCGTGAAGGAATGGCTACGCTTGCAGCTCT
CAACGTCGTCGGAAGGATCGAAGGATATCCTATTTGGAGTGACCCGAACCGGGTCGACCC
GTTCTTGAACGAAAATGCTTCACCGCCTAATGCCAGCCCAAGCATTGTCAACTCAAAAGC
CTTGGGATTGCCTGTGTCGAAGCTGTGAGTTAAAGAGTATTATGAAGAAGAGGAGATATG
GAAGAATCATTTTAGTAAAAATATCTGATGGTCTCAAGTTGTAATGTATTGCAAAACAAC
CATGTTGGATCATAAATAACTCTTTTTAAGTGTTATTGAGTAATTTTACTCTTCCTGCC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RS1E907JQ 401 0 0
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AAAATGCTTCACCGCCTAATGCCAGCCCAAGCATTGTCAACTCAAAAGCCTTGGGATTGC
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ATAAATAACTCTTTTTAAGTGTTATTGAGTAATTTTACTC
G

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DS 

RD RS1EC87TF 573 0 0
G
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GAAGCAATTCTTGTGAACTGCAGTAGAGGTCCAGTGATCGATGAGGTAGCACTTGTCGAT
CATCTAAGAGAGAACCCAATGTTCCGAGTTGGCCTGGATGTGTTTGAGGAAGAGCCATTC
ATGAAACCAGGCCTTGCTGATATGAAGAATGCTATTGTTGTTCCTCACATTGCTTCTGCT
TCCAAGTGGACTCGTGAAGGAATGGCTACGCTTGCAGCTCTCAACGTCGTCGGAAGGATC
AAAGGATATCCTATTTGGAGTGACCCGAACCGGGTCGACCCGTTCTTGAACGAAAATGCT
TCACCGCCTAATGCCAGCCCAAGCATTGTCAACTCAAAAGCCTTGGGATTGCCTGTGTCG
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AATATCTGATGGTCTCAAGTTGTAATGTATTGCAAAACAACCATGTTGGATCATAAATAA
CTCTTTTTAAGT*TTATTGAGTAATTTTACTC

QA 2 573 2 573
DS 



AS 2 12

CO CL125Contig1 1039 7 10 U
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TGTCAAACAGGCTAATAATCCAACACAACATGAACTAAACGCAGTCCAGAGTTTTGTCTA
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TGCCGTAAGAAATGGCTCATGTTTCCCTAGAAGGGCCTTTCTTGGCTGCTTCTGCAGCCG
CCTTCTCAGCTTCAATCTCAGCCACAATCGCATCGATTTCAGCTTCTTCTAGCTGCTTCA
GAGTACCTTCCTCCCTTGTCATTAAAGCAACCTCAATGTTCTTTCCACCACTCTCAACTA
CCTCAAGCAGAGCACGTATTGCAAGTTTAACAGTCTCTTGCCCCGAGGTTTCTTTATAAT
TCTTCTCCAGAAACTCCCTGATTGAGTTAGAGTTTCTCCCGGTCGCATTAGCCTTCCAAG
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GTTGAAGTCCTGCTATGTAGCGAGTGATGTACTCAACAGTCACTGGATCCTCCAAAGTAA
GCCTGTGGCTTTGACACTCGATCCTCGCCTTGTTTATCAGGACACGAGCATCTGCCTTCA
GCCCAGCACAGGCCAATGCGACGTGGTTATCAAGGCTAACAATCTTTCTGGCCGATCTCG
TATCCTGGAGCTTAGGGGTGGATTTCTTCTCGACGGCGAGGACGACAGTATCGGTGCCTC
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GGTGGCCGTCTGGTGAGAAAACAGTGATTGCTCTATCGTATCTCGCCATCTCTCAACTCC
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CCTTTTAGTTCAATATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 
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45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1EY86JQ U 33
AF RS1EY86TF C 349
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RD RS1DD09JQ 672 0 0
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TGATGTACTCAACAGTCACTGGATCCTCCAAAGTAAGCCTGTGGCTTTGACACTCGATCC
TCGCCTTGTTTA

QA 1 672 1 672
DS 

RD RS1BK76JQ 727 0 0
AAGACAACACGTGAAGTATTCATTCATAAAATAGCCAAATATATGATTTAAAATGAAGAA
TGTCAAACAGGCTAATAATCCAACACAACATGAACTAAACGCAGTCCAGAGTTTTGTCTA
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TGCCGTAAGAAATGGCTCATGTTTCCCTAGAAGGGCCTTTCTTGGCTGCTTCTGCAGCCG
CCTTCTCAGCTTCAATCTCAGCCACAATCGCATCGATTTCAGCTTCTTCTAGCTGCTTCA
GAGTACCTTCCTCCCTTGTCATTAAAGCAACCTCAATGTTCTTTCCACCACTCTCAACTA
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TCTTCTCCAGAAACTCCCTGATTGAGTTAGAGTTTCTCCCGGTCGCATTAGCCTTCCAAG
CAGAGAAGGTACCAGACGGATCGGTCTGATAAAGCGAAGGTATACGAGTGTAGGGGTCAA
AACCAACAATAAGAGTGGAAAGACCAAAAGGTCTCACACCACCACTTTGAGTATACTTCT
GTTGAAGTCATGCTATGTAGCGAGTGATGTACTCAACAGTCACTGGATCCTCCAAAGTAA
GCCCGTGGCTTTGACACTCGATCCTCGCCTTGTTTATCAGGACACGAGCATCTGCCTTCA
GCCCAGC

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1CL54JQ 791 0 0
CATT
CATAAAATAGCCAAATATATGATTTAAAATGAAGAATGTCAAACAGGCTAATAATCCAAC
ACAACATGAACTAAACGCAGTCCAGAGTTTTGTCTATTCAACCCTCAAATATCTTTTCTT
CGAACCAACATCACACAATTCAGAAACCAAGACCAATGCCGTAAGAAATGGCTCATGTTT
CCCTAGAAGGGCCTTTCTTGGCTGCTTCTGCAGCCGCCTTCTCAGCTTCAATCTCAGCCA
CAATCGCATCGATTTCAGCTTCTTCTAGCTGCTTCAGAGTACCTTCCTCCCTTGTCATTA
AAGCAACCTCAATGTTCTTTCCACCACTCTCAACTACCTCAAACAGAGCACGTATTGCAA
GTTTAACAGTCTCTTGCCCCGAGGTTTCTTTATAATTCTTCTCCAGAAACTCCCTGATTG
AGTTAGAGTTTCTCCCGGCCGCATTAGCCTTCCAAGCAGAAAAGGTACCAGACGGATCGG
TCTGATAAAGCGAAGGTATACGAGTGTAGGGGTCAAAACCAACAATAAGAGTGGAAAGAC
CAAAAGGTCTCACACCACCACTTTGAGTATACTTCTGTTGAAGTCCTGCTATGTAGCGAG
TGATGTACTCAACAGTCACTGGATCCTCCAAAGTAAGCCTGTGGCTTTGACACTCGATCC
TCGACTTGTTTATCAGGACACGAGCATCTGCCTTCAGCCCAACACAGGCCAATGCGACGT
GGTTATCAAGGCTAACAATCTTTCTGGCCGATCTCGTATCCTGGAGCTTAGGG*TGGATT
TCTTCTC

QA 5 791 5 791
DS 

RD RS1EY86JQ 750 0 0
C
GCCAAATATATGATTTAAAATGAAGAATGTCAAACAGGCTAATAATCCAACACAACATGA
ACTAAACGCAGTCCAGAGTTTTGTCTATTCAACCCTCAAATATCTTTTCTTCGAACCAAC
ATCACACAATTCAAAAACCAAGACCAATGCCGTAAGAAATGGCTCATGTTTCCCTAGAAG
GGCCTTTCCTGGCTGCTTCTGCAGCCGCCTTCTCAGCTTCAATCTCAGCCACAATCGCAT
CGATTTCAGCTTCTTCTAGCTGCTTCAGAGTACCTTCCTCCCTTGTCATTAAAGCAACCT
CAATGTTCTTTCCACCACTCTCAACTACCTCAAGCAGAGCACGTATTGCAAGTTTAACAG
TCTCTTGCCCCGAGGTTTCTTTATAATTCTTCTCCAGAAACTCCCTGATTGAGTTAGAGT
TTCTCCCGGTCGCATTAGCCTTCCAAGCAGAGAAGGTACCAGACGGATCGGTCTGATAAA
GCGAAGGTATACGAGTGTAGGGGTCAAAACCAACAATAAGAGTGGAAAGACCAAAAGGTC
TCACACCACCACTTTGAGTATACTTCTGTTGAAGTCCTGCTATGTAGCGAGTGATGTACT
CAACAGTCACTGGATCCTCCAAAGTAAGCCTGTGGCTTTGACACTCGATCCTCGCCTTGT
TTATCAGGACACGAGCATCTGCCTTCAGCCCAGCACAGGCCAATGCGACGTGGTTATCAA
GGCTAACAATCTTTCTGGCCGATCTCGTA

QA 2 750 2 750
DS 

RD RS1EY86TF 651 0 0
CACTCTCAACTACCTCAAGCAGAGCACGTATTGCAAGTTTAACAGTCTCTTGCCCCGAGG
TTTCTTTATAATTCTTCTCCAGAAACTCCCTGATTGAGTTAGAGTTTCTCCCGGTCGCAT
TAGCCTTCCAAGCAGAGAAGGTACCAGACGGATCGGTCTGATAAAGCGAAGGTATACGAG
TGTAGGGGTCAAAACCAACAATAAGAGTGGAAAGACCAAAAGGTCTCACACCACCACTTT
GAGTATACTTCTGTTGAAGTCCTGCTATGTAGCGAGTGATGTACTCAACAGTCACTGGAT
CCTCCAAAGTAAGCCTGTGGCTTTGACACTCGATCCTCGCCTTGTTTATCAGGACACGAG
CATCTGCCTTCAGCCCAGCACAGGCCAATGCGACGTGGTTATCAAGGCTAACAATCTTTC
TGGCCGATCTCGTATCCTGGAGCTTAGGGGTGGATTTCTTCTCGACGGCGAGGACGACAG
TATCGGTGCCTCGGACGCCGACGGCGGCGTTACCTTTGCGGACAGCTTCTAGGGCGTACT
CTACCTGGAAAAGGTGGCCGTCTGGTGAGAAAACAGTGATTGCTCTATCGTATCTCGCCA
TCTCTCAACTCCCAACTCTCTCCCTTGTGAGTGTTATTTCTGATTCAAT
CC

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1DD09TF 579 0 0
GGTTTCTTTATAATTCTTCTCCAGAAACTCCCTGATTGGGTTAGAGTTTCTCCCGGTCGC
ATTAGCCTTCCAAGCAGAGAAGGTACCAGACGGATCGGTCTGATAAAGCGAAGGTATACG
AGTGTAGGGGTCAAAACCAACAATAAGAGTGGAAAGACCAAAAGGTCTCACACCACCACT
TTGAGTATACTTCTGTTGAAGTCCTGCTATGTAGCGAGTGATGTACTCAACAGTCACTGG
ATCCTCCAAAGTAAGCCTGTGGCTTTGACACTCGATCCTCGCCTTGTTTATCAGGACACG
AGCATCTGCCTTCAGCCCAGCACAGGCCAATGCGACGTGGTTATCAAGGCTAACAATCTT
TCTGGCCGATCTCGTATCCTGGAGCTTAGGGGTGGATTTCTTCTCGACGGCGAGGACGAC
AGTATCGGTGCCTTGGACGCCGACGGCGGCGTTACCTTTGCGGACAGCTTCTAGGGCGTA
CTCTACCTGGAAAAGGTGGCCGTCTGGTGAGAAAACAGTGATTGCTCTATCGTATCTCGC
CATCTCTCAACTCCCAACTCTCTCCCTTGTGAGTGTT
CC

QA 1 577 1 577
DS 

RD RS1BK76TF 622 0 0
AATTGTTCTCCAGAAACTCCCTGATTGAGTTAGAGTTTCTCCCGGTCGCATTAGCCTTCC
AAGCAGAGAAGGTACCAGACGGATCGGTCTGATAAAGCGAAGGTATACGAGTGTAGGGGT
CAAAACCAACAATAAGAGTGGAAAGACCAAAAGGTCTCACACCACCACTTTGAGTATACT
TCTGTTGAAGTCATGCTATGTAGCGAGTGATGTACTCAACAGTCACTGGATCCTCCAAAG
TAAGCCCGTGGCTTTGACACTCGATCCTCGCCTTGTTTATCAGGACACGAGCATCTGCCT
TCAGCCCAGCACAAGCCAATGCGACGTGGTTATCAAGGCTAACAATCTTTCTGGCCGATC
TCGTATCCTGGAGCTTAGGGGTGGATTTCTTCTCGACGGCGAGGACGACAGTATCGGTGC
CTCGGACGCCGACGGCGGCGTTACCTTTGCGGACAGCTTCTAGGGCGTACTCTACCTGGA
AAAGGTGGCCGTCTGGTGAGAAAACAGTGATTGCTCTATCGTATCTCGCCATCTCTCAAC
TCCCAACTCTCTCCCTTGTGAGTGTTATTTCTGATTCAATAAGACCTCTCTTCTCTTCTC
TTCCCTTTTAGTTCAATATCCC

QA 1 622 1 622
DS 



CO CL125Contig2 1008 5 44 U
CATAAAATAGCCAAATATATGATTTAAAATGAAGAATGTCAAACAGGCTAATAATCCAAC
AAAGCATGAACTAAACGCAGCCCAGATTTTTGTCTATTCAAACCACAAATATCTTTTCTT
CGAACCAACATCACAATTCAAAAACCAAGACCAATGCCGTAAGAAATGGCTCATGTTTCC
CTAGAAGGGCCTTTCTTGGCTGCTTCTGCAGCCGCCTTCTCAGCTTCAATCTCAGCCACA
ATCGCATCGATTTCAGCTTCTTCTAGCTGCTTCAGAGTACCTT*CCTCCCTTGTCATTAA
AGCAACCTCAATGTTCTTTCCACCACTCTCAACTACCTCAAGCAGAGCACGTATTGCAAG
TTTAACAGTCTCTTGCCCCGAGGTTTCTTTATAATTCTTCTCCAGAAACTCCCTGATCGA
GTTTGAGTTTCTCCCGGTCGCATTAGCCTTCCAAGCAGAGAAGGTACCAGATGGATCAGT
CTGATAAAGCGAAGGTATACGAGTGTAGGGGTCAAAACCAACAATGAGAGTGGAAAGACC
AAAAGGTCTCACACCACCACTTTGAGTATACTTCTGCTGAAGCCCTGCTATGTAGCGAGT
GATGTACTCAACAGTGACCGGATCCTCCAAAGTAAGCCTGTGGCTTTGACACTCGATCCT
CGCTTTGTTTATCAGGACACGAGCATCTGCCTTCAGCCCAGCACAGGCCAATGCGACGTG
GTTATCAAGGCTAACAATCTTTCTCGCCGATCTTGTATCCTGGAGCTTAGGGG*TGGATT
TCTTCTCGACAGCGAGGACGACAGTATCGGTGCCTCGGACGCCGACGGCGGCGTTACCTT
TACGGACAGCTTCTAGGGCGTACTCTACCTGGAAAAGGTGGCCGTCTGGTGAAAACACTG
TGATTGCTCTATCGTATCTCGCCATCTCTCAACTCTCTATCTCTCTCTTGTGATGAGTGT
TCTTTCTGATTCAATAAGACCTCTCTTCTCTTCTCTTCCCTTTTAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BK31JQ U 177
AF RS1CJ93JQ U 9
AF RS1BQ10JQ U 1
AF RS1CJ93TF C 218
AF RS1BK31TF C 210
BS 1 10 RS1BQ10JQ
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BS 33 33 RS1CJ93JQ
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BS 827 1008 RS1BK31TF

RD RS1BK31JQ 529 0 0
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TTAAAGCAACCTCAATGTTCTTTCCACCACTCTCAACTACCTCAAGCAGAGCACGTATTG
CAAGTTTAACAGTCTCTTGCCCCGAGGTTTCTTTATAATTCTTCTCCAGAAACTCCCTGA
TCGAGTTTGAGTTTCTCCCGGTCGCATTAGCCTTCCAAGCAGAAAAGGTACCAGATGGAT
CAGTCTGATAAAGCGAAGGTATACGAGTGTAGGGGTCAAAACCAACAATGAGAGTGGAAA
GACCAAAAGGTCTCACACCACCACTTTGAGTATACTTCTGCTGAAGCCCTGCTATGTAGC
GAGTGATGTACTCAACAGTGACCGGATCCTCCAAAGTAAGCCTGTGGCTTTGACACTCGA
TCCTCGCTTTGTTTATCAGGACACGAGCATCTGCCTTCAGCCCAGCACA

QA 1 529 1 529
DS 

RD RS1CJ93JQ 663 0 0
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AACTAAACGCAGTCCAGATTTTTGTCTATTCAACCCACAAATATCTTTTCTTCGAACCAA
CATCACAATTCAAAAACCAAGACCAATGCCGTAAGAAATGGCTCATGTTTCCCTAGAAGG
GCCTTTCTTGGCTGCTTCTGCAGCCGCCTTCTCAGCTTCAATCTCAGCCACAATCGCATC
GATTTCAGCTTCTTCTAGCTGCTTCAGAGTACCTT*CCTCCCTTGTCATTAAAGCAACCT
CAATGTTCTTTCCACCACTCTCAACTACCTCAAGCAGAGCACGTATTGCAAGTTTAACAG
TCTCTTGCCCCGAGGTTTCTTTATAATTCTTCTCCAGAAACTCCCTGATCGAGTTTGAGT
TTCTCCCGGTCGCATTAGCCTTCCAAGCAGAGAAGGTACCAGATGGATCAGTCTGATAAA
GCGAAGGTACACGAGTGTAGGGGTCAAAACCAACAATGAGAGTGGAAAGACCAAAAGGTC
TCACACCACCACTTTGAGTATACTTCTGCTGAAGCCCTGCTATGTAGCGAGTGATGTACT
CAACAGTGACCGGATCCTCCAAAGTAAGCCTGTGGCTTTGACACTCGATCCTCGCTTTGT
TTA

QA 1 663 1 663
DS 

RD RS1BQ10JQ 821 0 0
CATAAAATAGTCAAATATATGATTTAAAATGACGAATGTCAAACAGGCTAATAATCCAAC
ACAGCATGAACTAAACGCAGCCCAGATTTTTGTCTATTCAAACCTCAAATATCTTTTCTT
CGAACCAACATCACAATTCAAAAACCAAGACCAATGCCGTAAGAAATGGCTCATGTTTCC
CTAGAAGGGCCTTTCTTGGCTGCTTCTGCAGCCGCCTTCTCAGCTTCAATCTCAGCCACA
ATCGCATCGATTTCAGCTTCTTCTAGCTGCTTCAGAGTACCTT*CCTCCCTTGTCATTAA
AGCAACCTCAATGTTCTTTCCACCACTCTCAACTACCCCAAGCAGAGCACGGATTGCAAG
TTTAACAGTCTCTTGCCCCGAGGTTTCTTTATAATTCTTCTCCAGAAACTCCCTGATCGG
GTTAGAGTTCCTCCCGGTCGCATTAGCCTTCCAAGCAGAGAAGGTACCAGATGGATCAGT
CTGATAAAGCGAAGGTATACGAGTGTAGGGGTCAAAACCAACAATAAGAGTGGAAAGACC
AAAAGGTCTCACACCACCACTTTGAGTATACTTCTGTTGAAGCCCTGCTATGTAGCGGGC
GATGTACTCAACAGTCACCGGATCCTCCAAAGTAAGCCTGTGGCTTTGACACTCGATCCT
CGCTTTGTTTATCAGGACACGAGCATCAGCCTTCAGCCCAGCACAGGCCAGTGCGACGTG
GTTATCAAGGCTAACAATCTTTCTGGCCGATCTCGTATCCTGGAGCTTAGGGGGTGGATT
TCTTCTCGACGGCGAGGACGACAGTATCGGTGCCTCGGACG

QA 1 821 1 821
DS 

RD RS1CJ93TF 655 0 0
TCTCAGCTTCAATCTCAGCCACAATCGCATCGATTTCAGCTTCTTCTAGCTGCTTCAGAG
TACCTT*CCTCCCTTGTCATTAAAGCAACCTCAATGTTCTTTCCACCACTCTCAACTACC
TCAAGCAGAGCACGTATTGCAAGTTTAACAGTCTCTTGCCCCGAGGTTTCTTTATAATTC
TTCTCCAGAAACTCCCTGATCGAGTTTGAGTTTCTCCCGGTCGCATTAGCCTTCCAAGCA
GAGAAGGTACCAGATGGATCAGTCTGATAAAGCGAAGGTACACGAGTGTAGGGGTCAAAA
CCAACAATGAGAGTGGAAAGACCAAAAGGTCTCACACCACCACTTTGAGTATACTTCTGC
TGAAGCCCTGCTATGTAGCGAGTGATGTACTCAACAGTGACCGGATCCTCCAAAGTAAGC
CTGTGGCTTTGACACTCGATCCTCGCTTTGTTTATCAGGACACGAGCATCTGCCTTCAGC
CCGGCACAGGCCAATGCGACGTGGTTATCAAGGCTAACAATCTTTCTCGCCGATCTTGTA
TCCTGGAGCTTAGGGG*TGGATTTCTTCTCGACAGCGAGGACGACAGTATCGGTGCCTCG
GACGCCGACGGCGGCGTTACCTTTACGGACAGCTTCTAGGGCGTACTCTACCTG
C

QA 1 654 1 654
DS 

RD RS1BK31TF 799 0 0
GCAGCG
CTTCTCAGCTTCAATCTCAGCCACAATCGCATCGATTTCAGCTTCTTCTAGCTGCTTCAG
AGTACCTTTCCTCCCTTGTCATTAAAGCAAC*TCAATGTTCTTTCCACCACTCTCAACTA
C*TCAAGCAGAGCACGTATTGCAAGTTTAACAGTCTCTTGCCCCGAGGTTTCTTTATAAT
TCTTCTCCAGAAACTCCCTGATCGAGTTTGAGTTTCTCCCGGTCGCATTAGCCTTCCAAG
CAGAGAAGGTACCAGATGGATCAGTCTGATAAAGCGAAGGTATACGAGTGTAGGGGTCAA
AACCAACAATGAGAGTGGAAAGACCAAAAGGTCTCACACCACCACTTTGAGTATACTTCT
GCTGAAGCCCTGCTATGTAGCGAGTGATGTACTCAACAGTGACCGGATCCTCCAAAGTAA
GCCTGTGGCTTTGACACTCGATCCTCGCTTTGTTTATCAGGACACGAGCATCTGCCTTCA
GCCCAGCACAGGCCAATGCGACGTGGTTATCAAGGCTAACAATCTTTCTCGCCGATCTTG
TATCCTGGAGCTTAGGGG*TGGATTTCTTCTCGACAGCGAGGACGACAGTATCGGTGCCT
CGGACGCCGATGGCGGCGTTACCTTTACGGACAGCTTCTAGGGCGTACTCTACCTGGAAA
AGGTGGCCGTCTGGTGAAAACACTGTGATTGCTCTATCGTATCTCGCCATCTCTCAACTC
TCTATCTCTCTCTTGTGATGAGTGTTCTTTCTGATTCAATAAGACCTCTCTTCTCTTCTC
TTCCCTTTTAGTT

QA 7 799 7 799
DS 



AS 2 10

CO CL126Contig1 958 6 13 U
CGTGGTGACTCAGTGGTGCTCATGGGGAAGAACACCATGATGAAGCGTTCGGTTAAGATT
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GTTGGTTTGATCTTCACCAAGGGTGACCTCAAGGAAGTGAGCGAGGAAGTTGCCAAGTAC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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TAG

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GG
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AAGGTCGGTTCTTCTGAGGCCGCCCTTCTAGCCAAACTTGGAATCAGGCCGTTTTCATAC
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AAGGAGTACTTGAAGGATCCTAGCAAGTTTGCTGTTGCTGTAGCGGCGGTGTCTGCAGAT
GCAGGTGGTGGTGCTTCAGGTGGAGCTGCCAAGGTTGAGGAGAAGAAGGAAGTTGTTGAG
GAATCAGATGAAGAAGACTACGGTGGTTTCGATATGTTCGGTGATGAATAGATTAAAAAT
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GTTTTCAATGTTCGTGATTTTGACAAATTCAGATTTATGTTATTGTCTTTT
AG

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DS 



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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F339JQ U 51
AF RS1GT41JQ U 1
AF RS1GT41TF C 446
AF RS1F339TF C 701
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A*GGTGGAACTCGGGAGAGATATAACAAACGGATCTACTCATCACCGAACATATCGAAAC
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CTCCAGCCGAAGCCCCACCACCTGCATCGGCAGATACAGCCGCTGCAGCAACAGCAAACT
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CAACTGAAATAGCCAATGCGTTCTTGTAGGCATTGATGAACATATGCGGAGCAGCAGCAA
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DS 

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GACT
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AGAACCTCTGGGCTGAAGACAGAGCCATTGTCGTAAACAGACTGGACAACAAGACCGTAA
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GGGATGTTCAAAACCTGGAAGAAAGATGTCTGAGATGGATCGAGACCAGTGTTACCAGGT
TGGACAACCACATCAATTGGCGCAACCAAACCCACACGAGCAGGAGCACCAACCTTGTAC
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TTAACGGAACGCTTCATCATAGTGTTCTTGCCCATGAGGACAACTGAGTCACCACGAAGA
CCTTTCCTGATGTTCTG
C

QA 5 681 5 681
DS 

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GAGCTCAACAGGGGTGATGATTTCGACTGTTCCCTTGTTAATCTTAGTTGGGATGTTCAA
AACCTGGAAGAAAGATGTCTGAGATGGATCGAGACCAGTGTTACCAGGTTGGACAACCAC
ATCAATTGGCGCAACCAAACCCACACGAGCAGGAGCACCAACCTTGTACTCGGCAACTTC
CTCACTCACTTCCTTGAGGTCACCCTTGGTGAATATCAAACCAACATTTCCCTGAAGGAG
GGGCATGAGATTGAGGATTCCAGTGTTTCCAGTGTTCTCGGCGTGAATCTTAACGGAACG
CTTCATCATAGTGTTCTTACCCATGAGAACCACCGAGTCACCACGAAGACCTTTCCTGAT
GTTCTGGAGCTGGGTCGACCCGACGTTGTCGGCTGCAACGACCAAGATCTGGGTGAACTC
GTCGATGAGCTGACATAGCTTCGCGTCGTAAGCGATCTTCTTCTCGGCCTTTGTTGCCTT
CACCATTGTTGTTGCTCACGGGATGAGACTCGTTTTTTGCTCTTTGTCTGCAGAAAGAGT
GACGGAGATTCC

QA 1 612 1 612
DS 



AS 2 12

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GGCCAGAAAGTTCTTCGTCGGAGGCAACTGGAAATGCAACGGAACTGGTGAGGAGGTGAA
GAAGATTGTCAATACTCTTAACGAAGCTCAAGTTCCTTCCCAGGATCTCGTTGAGGTTGT
CGTTAGCCCTCCATATGTGTTCCTTCCTCTGGTTAAGAGCATATTGAGGCCTGACTTCCA
TGTTGCGGCACAAAACTGCTGGGTCAAGAAAGGAGGTGCCTTCACTGGTGAAGTTAGTGC
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TTTGAAAGTGATTGCTTGTGTTGGCGAGACTCTTGAGCAGCGGGAGGCTGGGTCGACCAT
GGATGTTGTGGCTGCCCAGACTAAAGCTATTGCTGACCGGGTGTCGAACTGGTCAAATGT
TGTCGTAGCCTATGAACCAGTGTGGGCCATTGGAACCGGAAAGGTCGCTAGCCCAGCCCA
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CGCTGCTGCAACCCGCATCATTTATGGAGGATCCGTCAATGGTGGTAACTGCAAGGAGCT
AGGTGGTCAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGCCCGAGTT
TATCGACATCATCAAGGCTGCTGAGGTGAAGAAAAGCGCTTAGTGGCTTCACGAAACAAT
CTCAAATCCTTTTGCTTCTTCAGTCTCAACTCTGATCGAAAAAAA*TGAATAAGTTGATA
CAGTGTTATTGTGATACTCTTTTGCTTCAGTTGTATGTTGTCTTGAGGAGGCAACACACT
TTTTCTTGGCCGTTTTGTTTAGCTCTGAAATCACAAAATCTCACCCTTTTCC


BQ
10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CK62TF U 1
AF RS1C266TF U 2
AF RS1CG82TF U 2
AF RS1GQ01TF U 5
AF RS1GO28TF U 2
AF RS1CK62JQ C 264
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GGATGTTGTGGCTGCCCAGACTAAAGCTATTGCTGACCGGGTGTCGAACTGGTCAAATGT
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CGCTGCTGCA*CCCGCATCATTTATGGAGGATCCGTCAATGGTGGTA*CTGCAAGGAGCT

QA 1 720 1 720
DS 

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GTTAGCCCTCCATATGTGTTCCTTCCTCTGGTTAAGAGCATATTGAGGCCTGACTTCCAT
GTTGCAGCACAAAACTGCTGGGTCAAGAAAGGAGGTGCCTT***TGGTGAAGTTAGTGCT
GAGATGCTTGTGAACTTGGACATCCCATGGGTTATCCTTGGTCACTCTGAAAGGAGAGCA
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GATGTTGTGGCTGCCCAGACTAAAGCTATTGCTGACCGGGTGTCGAACTGGTCAAATGTT
GTCGTAGCCTATGAACCAGTGTGGGCCATTGGAACCGGAAAGGTCGCTAGCCCAGCCCAA
GCTCAAGAAGTACATGATGAGCTGAGGAAATGGCTTGCAAAGAACGTGAGCGCTGATGTC
GCTGCTGCA*CCCGCATCATTTATG

QA 1 685 1 685
DS 

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AAGATTGTCAACACTCTTAACGAAGCTCAAGTTCCTTCCCAGGATGTCGTTGAGGTTGTC
GTTAGCCCTCCATATGTGTTCCTTCCTCTGGTTAAGAGCATATTGAGACCTGACTTCCAT
GTTGCAGCACAAAACTGCTGGGTCAAGAAAGGAGGTGCCTTCACTGGTGAAGTTAGTGCT
GAGATGCTTGTGAACTTGGACATCCCATGGGTTATCCTTGATCACTCTGAAAGGAGAGCA
CTCCTCAATGAAACAAACGAGTTTGTTGGAGACAAGGTTGCCTATGCTCTTGCTCAAGGT
TTGAAAGTGATTGCTTGTGTTGGCGAGACTCTTGAGCAGCGGGAGGCTGGGTCGACCATG
GATGTTGTGGCTGCCCAGACTAAAGCTATTGCTGACCGGGTGTCGAACTGGTCAAATGTT
GTCGTAGCCTATGAACCAGTGTGGGCCATTGGAACCGGAAAGGTCGCTAGCCCAGCCCAA
GCTCAAGAAGTACATGATGAGCTGAGGAAATGGCTTGCAAAGAACGTGAGCGCTGATGTC
GCTGCTGCA*CCCGCATCATTTATGGAGGATCCGTCAATGGTGGTA
CT

QA 1 706 1 706
DS 

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GG
ACACTCGATCGATCTATCTAATCTTCATCCTCGTGATCATCGCTGAGAAAAGATGGCCAG
AAAGTTCTTCGTCGGAGGCAACTGGAAATGCAACGGAACTGGTGAGGAGGTGAAGAAGAT
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GGCACAAAACTGCTGGGTCAAGAAAGGAGGTGCCTTCACTGGTGAAGTTAGTGCTGAGAC
GCTTGTGAACTTGGACATCCCATGGGTTATCCTTGGTCACTCTGAAAGGAGAGCACTCCT
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TGTGGCTGCCCAGACTAAAGCTATTGCTGACCGGGTGTCGAACTGGTCAAATGTTGTCGT
AGCCTATGAACCAGTGTGGGCCATTGGAACCGGAAAGGTCGCTAGCCCAGCCCAAGCTCA
AGAAGTACATGATGAGCTGAGGAAATGGCTTGCAAAGAACGTGAGCGCTGATGTCGCTGC
TGCAACCCGCATCATTTATGGAGGATCCGTCA*TGGTGGTAACTGCAAG
A

QA 3 711 3 711
DS 

RD RS1GO28TF 708 0 0
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GCCAGAAAGTTCTTCGTCGGAGGCAACTGGAAATGCAACGGAACTGGTGAGGAGGTGAAG
AAGATTGTCAATACTCTTAACGAAGCTCAAGTTCCTTCCCAGGATCTCGTTGAGGTTGTC
GTTAGCCCTCCATATGTGTTCCTTCCTCTGGTTAAGAGCATATTGAGGCCTGACTTCCAT
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GAGATGCTTGTGAACTTGGACATCCCATGGGTTATCCTTGGTCACTCTGAAAGGAGAGCA
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TTGAAAGTGATTGCTTGTGTTGGCGAGACTCTTGAGCAGCGGGAGGCTGGGTCGACCATG
GATGTTGTGGCTGCCCAGACTAAAGCTATTGCTGACCGGGTGTCGAACTGGTCAAATGTT
GTCGTAGCCTATGAACCAGTGTGGGCCATTGGAACCGGAAAGGTCGCTAGCCCAACCCAA
GCTCAAGAAGTACATGATGAGCTGAGGAAATGGCTTGCAAAGAACGTGAGCGCTGATGTC
GCTGCTGCA*CCCGCATCATTTATGGAG*ATCCGTCA*TGGTGGTA
CT

QA 1 706 1 706
DS 

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TCCCATGGGTTATCCTTGGTCACTCTGAAAGGAGAGCACTCCTCAATGAAACAAACGAGT
TTGTTGGAGACAAGGTTGCCTATGCTCTTGCTCAAGGTTTGAAAGTGATTGCTTGTGTTG
GCGAGACTCTTGAGCAGCGGGAGGCTGGGTCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACTA
AAGCTATTGCTGACCGGGTGTCGAACTGGTCAAATGTTGTCGTAGCCTATGAACCAGTGT
GGGCCATTGGAACCGGAAAGGTCGCTAGCCCAGCCCAAGCTCAAGAAGTACATGATGAGC
TGAGGAAATGGCTTGCAAAGAACGTGAGCGCTGATGTCGCTGCTGCAACCCGCATCATTT
ATGGAGGATCCGTCAATGGTGGTAACTGCAAGGAGCTAGGTGGTCAGGCCGATGTTGATG
GTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGCCCGAGTTTATCGACATCATCAAGGCTGCTG
AGGTGAAGAAAAGCGCTTAGTGGCTTCACGAAACAATCTCAAATCCTTTTGCTTCTTCAG
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GCTTCAGTTGTATGTTGTCTTGAGGAGGCAACACACTTTTTCTTGGCCGTTTTGTTTAGC
TCTGAAATCACAAAATCTCACCCTTTTCC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RS1GQ01JQ 597 0 0
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TCTTGAGCAGCGGGAGGCTGGGTCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACTAAAGCTAT
TGCTGACCGGGTGTCGAACTGGTCAAATGTTGTCGTAGCCTATGAACCAGTGTGGGCCAT
TGGAACCGGAAAGGTCGCTAGCCCAGCCCAAGCTCAAGAAGTACATGATGAGCTGAGGAA
ATGGCTTGCAAAGAACGTGAGCGCTGATGTCGCTGCTGCAACCCGCATCATTTATGGAGG
ATCCGTCAATGGTGGTAACTGCAAGGAGCTAGGTGGTCAGGCCGATGTTGATGGTTTCTT
GGTCGGTGGTGCTTCTCTAAAGCCCGAGTTTATCGACATCATCAAGGCTGCTGAGGTGAA
GAAAAGCGCTTAGTGGCTTCACGAAACAATCTCAAATCCTTTTGCTTCTTCAGTCTCAAC
TCTGATCGAAAAAA**TGAATAAGTTGATACAGTGTTATTGTGATACTCTTTTGCTTCAG
TTGTATGTTGTCTTGAGGAGGCAACACACTTTTTCTTGGCCGTTTTGTTT
AGCTCTG

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DS 

RD RS1CG82JQ 622 0 0
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CTTGCTCAAGGTTTGAAAGTGATTGCTTGTGTTGGCGAGACTCTTGAGCAGCGGGAGGCT
GGGTCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACTAAAGCTATTGCTGACCGGGTGTCGAAC
TGGTCAAATGTTGTCGTAGCCTATGAACCAGTGTGGGCCATTGGAACCGGAAAGGTCGCT
AGCCCAGCCCAAGCTCAAGAAGTACATGATGAGCTGAGGAAATGGCTTGCAAAGAACGTG
AGCGCTGATGTCGCTGCTGCAACCCGCATCATTTATGGAGGATCCGTCAATGGTGGTAAC
TGCAAGGAGCTAGGTGGTCAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTA
AAGCCCGAGTTTATCGACATCATCAAGGCTGCTGAGGTGAAGAAAAGCGCTTAGTGGCTT
CACGAAACAATCTCAAATCCTTTTGCTTCTTCAGTCTCAACTCTGACCGAAAAAAAATGA
ATAAGTTGATACAGTGTTATTGTGATACTCTTTTGCTTCAGTTGTATGTTGTCTTGAGGA
GGCAACACACTTTTTCTTGG
GC

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DS 

RD RS1GO28JQ 639 0 0
GTCACTCTGAAAGGAGAGCACTCCTCAATGAAACAAACGAGTTTGTTGGAGACAAGGTTG
CCTATGCTCTTGCTCAAGGTTTGAAAGTGATTGCTTGTGTTGGCGAGACTCTTGAGCAGC
GGGAGGCTGGGTCGACCATGGATGTTGTGGCTGCCCAGACTAAAGCTATTGCTGACCGGG
TGTCGAACTGGTCAAATGTTGTCGTAGCCTATGAACCAGTGTGGGCCATTGGAACCGGAA
AGGTCGCTAGCCCAACCCAAGCTCAAGAAGTACATGATGAGCTGAGGAAATGGCTTGCAA
AGAACGTGAGCGCTGATGTCGCTGCTGCAACCCGCATCATTTATGGAGGATCCGTCAATG
GTGGTAACTGCAAGGAGCTAGGTGGTCAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGCCGGTGGTG
CTTCTCTAAAGCCCGAGTTTATCGACATCATCAAGGCTGCTGAGGTGAAGAAAAGCGCTT
AGTGGCTTCACGAAACAATCTCAAATCCTTTTGCTTCTTCAGTCTCAACTCTGATCGAAA
AAA**TGAATAAGTTGATACAGTGTTATTGTGATACTCTTTTGCTTCAGTTGTATGTTGT
CTTGAGGAGGCAACACACTTTTTCTTGGCCGTTTTGTTT

QA 1 639 1 639
DS 



CO CL127Contig2 988 3 11 U
GGGCACTGAACACTCTCTCTCGATCTATCTTCCTAAAGCTCTCTCTCTCTCGTGATCATC
GTTGACAAAAAGATGGCCAGAAAGTTCTTCGTCGGAGGCAACTGGAAATGCAACGGAACT
GTTGAGGAGGTGAAGAAGATTGTGAACACTCTTAACGAAGCTCAAGTACCTTCCCAGGAT
GTCGTTGAGGTTGTGCTTAGCCCTCCATATGTGTTTCTTCCTCTTGTTAAGAGCATTTTG
AGGCCTGACTTCCATGTTGCTGCCCAAAACTGCTGGGTTAAGAAAGGAGGTGCCTTCACT
GGTGAAGTGAGTGCTGAGATGCTTGTGAACTTGGACATCCCATGGGTTATCCTTGGTCAC
TCTGAAAGGAGGGCACTCCTCAATGAATCAAACGAGTTTGTCGGAGACAAGGTTGCCTAT
GCACTTGCTCAAGGTTTGAAAGTGATCGCTTGTGTTGGTGAGACTCTTGAGCAGCGAGAG
GCTGGGTCGACCATGGATGTTGTGGCCGCTCAGACTAAAGCTATTGCTGATCGTGTGCCG
AACTGGTCAAATGTGGTTATAGCCTATGAACCAGTGTGGGCCATTGGAACCGGAAAGGTC
GCTAGCCCAGCTCAAGCTCAGGAAGTACACGATGAGCTTGGGAAATGGCTTGCAAAGAAC
GTGAGTGATGATGTTGCCGCTACAACCCGCATCATATACGAAGGATCCGTCAATGGTGGT
AACTGCAAGGAGCTAGGTGGTCAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCT
CTAAAGCCCGAGTTTATCGACACCATCAAGGCTGCCGAGGTGAAGAAAAGTGCTTAATGA
GTTTCACTAAGCAATATAGCTTCCTTTTGCTTTTTTTCCGGTCTCAGCTCTGAATTTTAA
AAATGAATAAGTTGATACAGTATTATTGTGATACTCTTTGGTTCATGTGTATGTTTTCTT
GAGAAGGCAAACAATCATTTTCTTCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F478TF U 1
AF RS1E235TF U 3
AF RS1E235JQ C 306
BS 1 339 RS1F478TF
BS 340 340 RS1E235TF
BS 341 469 RS1F478TF
BS 470 470 RS1E235TF
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BS 696 701 RS1E235TF
BS 702 703 RS1E235JQ
BS 704 721 RS1E235TF
BS 722 988 RS1E235JQ

RD RS1F478TF 698 0 0
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GTTGACAAAAAGATGGCCAGAAAGTTCTTCGTCGGAGGCAACTGGAAATGCAACGGAACT
GTTGAGGAGGTGAAGAAGATTGTGAACACTCTTAACGAAGCTCAAGTACCTTCCCAGGAT
GTCGTTGAGGTTGTGCTTAGCCCTCCATATGTGTTTCTTCCTCTTGTTAAGAGCATTTTG
AGGCCTGACTTCCATGTTGCTGCCCAAAACTGCTGGGTTAAGAAAGGAGGTGCCTTCACT
GGTGAAGTGAGTGCTGAGATGCTTGTGAACTTGGACATCTCATGGGTTATCCTTGGTCAC
TCTGAAAGGAGGGCACTCCTCAATGAATCAAACGAGTTTGTCGGAGACAAGGTTGCCTAT
GCACTTGCTCAAGGTTTGAAAGTGATCGCTTGTGTTGGTGAGACTCTTG*GCAGCGAGAG
GCTGGGTCGACCATGGATGTTGTGGCCGCTCAGACTAAAGCTATTGCTGATCGTGTGCCG
AACTGGTCAAATGTGGTTATAGCCTATGAACCAGTGTGGGCCATTGGAACCGGAAAGGTC
GCTAGCCCAGCTCAAGCTCAGGAAGTACACGATGAGCTTAGGAAATGGCTTGCAAAGAAC
GTGAGTGATGATGTTGCCGCTACAACCCGCATCAT
ATA

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1E235TF 723 0 0
GGACTA
AACACTCTCTCTCGATCTATCTTCCTAAAGCTCTCTCTCTCTCGTGATCATCGTTGACAA
AAAGATGGCCAGAAAGTTCTTCGTCGGAGGCAACTGGAAATGCAACGGAACTGTTGAGGA
GGTGAAGAAGATTGTGAACACTCTTAACGAAGCTCAAGTACCTTCCCAGGATGTCGTTGA
GGTTGTGCTTAGCCCTCCATATGTGTTTCTTCCTCTTGTTAAGGGCATTTTGAGGCCTGA
CTTCCATGTTGCTGCCCAAAACTGCTGGGTTAAGAAAGGAGGTGCCTTCACTGGTGAAGT
GAGTGCTGAGATGCTTGTGAACTTGGACATCCCATGGGTTATCCTTGGTCACTCTGAAAG
GAGGGCACTCCTCAATGAATCAAACGAGTTTGTCGGAGACAAGGTTGCCTATGCACTTGC
TCAAGGTTTGAAAGTGATCGCTTGTGTTGGTGAGACTCTTGAGCAGCGAGAGGCTGGGTC
GACCATGGATGTTGTGGCCGCTCAGACTAAAGCTATTGCTGATCGTGTGCCGAACTGGTC
AAATGTGGTTATAGCCTATGAACCAGTGTGGGCCATTGGAACCGGAAAGGTCGCTAGCCC
AGCTCAAGCTCAG*AAGTACACGATGAGCTTGGGAAATGGCTTGCAA*GAACGTGAGTGA
TGATGTTGCCGCTACAACCCGCATCATATACGA**GATCCGTCAATGGTGGTA
CTGC

QA 7 719 7 719
DS 

RD RS1E235JQ 683 0 0
AGTGAGTGCTGAGATGCTTGTGAACTTGGACATCCCATGGGTTATCCTTGGTCACTCTGA
AAGGAGGGCACTCCTCAATGAATCAAACGAGTTTGTCGGAGACAAGGTTGCCTATGCACT
TGCTCAAGGTTTGAAAGTGATCGCTTGTGTTGGTGAGACTCTTGAGCAGCGAGAGGCTGG
GTCGACCATGGATGTTGTGGCCGCTCAGACTAAAGCTATTGCTGATCGTGTGCCGAACTG
GTCAAATGTGGTTATAGCCTATGAACCAGTGTGGGCCATTGGAACCGGAAAGGTCGCTAG
CCCAGCTCAAGCTCAGGAAGTACACGATGAGCTTGGGAAATGGCTTGCAAAGAACGTGAG
TGATGATGTTGCCGCTACAACCCGCATCATATACGGAGGATCCGTCAATGGTGGTAACTG
CAAGGAGCTAGGTGGTCAGGCCGATGTTGATGGTTTCTTGGTCGGTGGTGCTTCTCTAAA
GCCCGAGTTTATCGACACCATCAAGGCTGCCGAGGTGAAGAAAAGTGCTTAATGAGTTTC
ACTAAGCAATATAGCTTCCTTTTGCTTTTTTTCCGGTCTCAGCTCTGAATTTTAAAAATG
AATAAGTTGATACAGTATTATTGTGATACTCTTTGGTTCATGTGTATGTTTTCTTGAGAA
GGCAAACAATCATTTTCTTCACC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 2 14

CO CL128Contig1 832 4 10 U
GGGAGAGTATTATCGTGAACAAAGGGATGGGGCGTGTGGATTATCTGGCGATGAAGACAG
ACGTGGATACGGCTGCTTTAGTCAATTCCGACGTGGAGGAGCTCAAGATCGCTGCCAAGA
AACTCCTCACCGATGTTTCGAACCTCGGTGGTTTAGCCTTTGGCGTCTCTTTCGTCAAAT
GGATCGCTTCTTTCTCCGCCATTTACTTGTTGATATTGGATCGTACCAATTGGAGAACCA
AGATGCTTACTTCACTCTTGATTCCATACATCTTCCTCACCCTTCCTGGTGTGATCTTTA
ACTTCCTCAGTGGAGACGTTGGGAAATGGATAGCTTTCGTTGCAGTTGTACTCAGACTTT
TCTTCCCTAAGCATTTCCCAGACTGGCTTGAGATGCCTGGTTCTCTGATCCTTCTGCTGG
TAGTTTCTCCAAACTTCCTTGTTCACCATATACGCGGAGGCTGGATCGGCTCTGTCATCA
GCCTTTTCATTGGTTGTTACCTTCTTCAAGAACATATCCGAGTGTCTGGTGGGTTCAGGA
ACTCGTTCACGCAGCCCCGTGGAGTTTCAAACACTTTGGGGATCATCCTTCTTCTTGTCT
ACCCTGTTTGGGCTCTAATCATCCGTGTCTCATAATAATTATACCATTCGTCTTCCTGTC
TCCAAAGTTGTGTTAATTACTCGGCATGTCAAATAAGCGTTAGCAAGAAACCTCGGAGAT
CTTTGGTGTTCCTTTGTTCTTGCTTCTGTTACAATACATACCCAAATATTCGTGCGTGAA
GCTCAATCAATGTTATATTGTTTTACATAAATAAAAGAATCTCATTTTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1E658TF U 1
AF RS1FT16TF U 1
AF RS1FT16JQ C 187
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ACTTCACTCTTGATTCCATACATCTTCCTCACCCTTCCTGGTGTGATCTTTAACTTCCTC
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AAGCATTTCCCAGACTGGCTTGAGATGCCTGGTTCTCTGATCCTTCTGCTGGTAGTTTCT
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ATTGGTTGTTACCTTCTTCAAGAACATATCCGAGTGTCTGGTGGGTTCAGGAACTCGTTC
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CTCCAAACTTCCTTGTTCACCATATACGCGGAGGCTGGATCGGCTCTGTCATCAGCCTTT
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TCACGCAGCCCCGTGGAGTTTCAAACACTTTGGGGATCATCCTTCTTCTTGTCTACCCTG
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CTC

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DS 

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TTCTTCTTGTCTACCCTGTTTGGGCTCTAATCATCCGTGTCTCATAATAATTATACCATT
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TTCGTGCGTGAAGCTCAATCAATGTTATATTGTTTTACATAAATAAAAGAATCTCATTTT
TCCC

QA 1 424 1 424
DS 



CO CL128Contig2 974 10 32 U
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GCTTTAGTCAATTCCGACGTGGAGGAGCTCAAGATCGCTGCCAAGAAACTCCTCAACGAC
GTTTCGAACCTCGGTGGTTTAGCCTTTGGCGTCTCTTTCGTCAAATGGATCGCTTCTTTC
TCCGCCATTTACTTGTTGATATTGGATCGTACCAACTGGAGAACCAAGATGCTTACTTCA
CTCTTGATTCCATACATCTTCCTCACCCTTCCTGGTGTGATCTTTAACTTCCTCAGTGGA
GACGTTGGGAAATGGATAGCGTTCGTTGCTGTTGTGCTCAGACTTTTCTTCCCTAAGCAT
TTCCCAGATTGGCTTGAGATGCCTGGTTCTCTGATCCTTCTGCTGGTAGTCTCTCCAAAC
TTCCTTGTTCACCATATACGCGGAGGCTGGATCGGCTCTGTCATCAGCCTTTTCATTGGT
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CTAATCATCCGTGTCTCGTAATAATTACACCGTTCCTCTTCCTGTCTCCAAAGTTATGTG
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ATATTGTTTTACATAAATAAAAGAATCTCATTTTTTTCAACTATTTGTTTGTCTCTGTTG
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CTTTTGGGTATAGC


BQ
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55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 35 35 35 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 25 
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BS 824 941 RS1E505JQ
BS 942 974 RS1DQ09JQ

RD RS1E505TF 590 0 0
GGGAG
TATCGTCAACAAAGGAATGGGGCGTGTGGATTATCTGGCGATGAAGACAGACGTGGATAC
GGCTGCTTTAGTCAATTCCGACGTGGAGGAGCTCAAGATCGCTGCCAAGAAACTCCTCAA
CGATGTTTCGAACCTCGGTGGTTTAGCCTTTGGCGTCTCTTTCGTCAAATGGATCGCTTC
TTTCTCCGCCATTTACTTGTTGATATTGGATCGTACCAACTGGAGAACCAAGATGCTTAC
TTCACTCTTGATTCCATACATCTTCCTCACCCTTCCTGGTGTGATCTTTAACTTCCTCAG
TGGAGACGTTGGGAAATGGATAGCGTTCGTTGCTGTTGTGCTCAGACTTTTCTTCCCTAA
GCATTTCCCAGATTGGCTTGAGATGCCTGGTTCTCTGATCCTTCTGCTGGTAGTCTCTCC
AAACTTCCTTGTTCACCATATACGCGGAGGCTGGATCGGCTCTGTCATCAGCCTTTTCAT
TGGTTGTTACCTTCTTCAAGAACATATCCGAGTGTCTGGTGGGTTCAGGAACTCGTTCAC
GCAGCCCCGTGGAGTTTCAAACACTTTGGGGATCATCCTTCTTCT

QA 6 590 6 590
DS 

RD RS1FO24TF 671 0 0
GGGGAGAG
TATCGTCAACAAAGGAATGGGGCGTGTGGATTATCTGGCGATGAAGACAGACGTGGATAC
AGCTGCTTTAGTCAATTCCGACGTGGAGGAGCTCAAGATCGCTGCCAAGAAACTCCTCAA
CGACGTTTCGAACCTCGGTGGTTTAGCCTTTGGCGTCTCTTTCGTCAAATGGATCGCTTC
TTTCTCCGCCATTTACTTGTTGATATTGGATCGTACCAACTGGAGAACCAAGATGCTTAC
TTCACTCTTGATTCCATACATCTTCCTCACCCTTCCTGGTGTGATCTTTAACTTCCTCAG
TGGAGACGTTGGGAAATGGATAGCGTTCGTTGCTGTTGTGCTCAGACTTTTCTTCCCTAA
GCATTTCCCAGATTGGCTTGAGATGCCTGGTTCTCTGATCCTTCTGCTGGTAGTCTCTCC
AAACTTCCTTGTTCACCATATACGCGGAGGCTGGATCGGCTCTGTCATCAGCCTTTTCAT
TGGTTGTTACCTTCTTCAAGAACATATCCGAGTGTCTGGTGGGTTCAGGAACTCGTTCAC
GCAGCCCCGTGGAGTTTCAAACACTTTGGGGATCATCCTTCTTCTTGTCTACCCTGTTTG
GGCTCTAATCATCCGTGTCTCGTAATAATTACACCGTTCCTCTTCCTGTCTCCAAAGTTA
TGT

QA 9 671 9 671
DS 

RD RS1CT62TF 724 0 0
GG
ATTATCGTGAACAAAGGGATGGGGCGTGTGGATTATCTGGCGATGAAGACAGACGTGGAT
ACGGCTGCTTTAGTCAATTCCGACGTGGAGGAGCTCAAGATCGCTGCCAAGAAACTCCTC
ACCGACGTTTCGAACCTCGGTGGTTTAGCCTTTGGCGTCTCTTTCGTCAAATGGATCGCT
TCTTTCTCCGCCATTTACTTGTTGATATTGGATCGTACCAATTGGAGAACCAAGATGCTT
ACTTCACTCTTGATTCCATACATCTTCCTCACCCTTCCTGGTGTCATCTTTAACTTCCTC
AGTGGGGACGTTGGGAAATGGATAGCTTTCGTTGCTGTTGTACTCAGACTTTTCTTCCCT
AAGCATTTCCCAGATTGGCTTGAGATGCCTGGTTCTCTGATCCTTCTGCTGGTAGTTTCT
CCAAACTTCCTTGTTCACCATATACGCGGAGGATGGATCGGCTCTGTCATCAGCCTTTTC
ATTGGTTGTTACCTTCTTCAAGAACATATCCGAGTGTCAGGTGGGTTCAGGAACTCGTTC
ACGCAGCCCCGTGGAGTTTCAAACACTTTGGGGATCATCCTTCTTCTTGTCTACCCTGTT
TGGGCTCTAATCATCCGTGTCTCGTAATAATTACACCGTTCCTCTTCCTGTCTCCAAAGT
TATGTGTTACTTACTCTCGGCATGTCAAATAAGCGTTAGCAAGAACCTCGGAGATCTTTG
GT

QA 3 724 3 724
DS 

RD RS1CT62JQ 709 0 0
A
TATCGTGAACAAAGGGATGGGGCGTGTGGAT*ATCTGGCGATGAAGACAGACGTGGATAC
GGCTGCTTTAGTCAATTCCGACGTGGAGGAGCTCAAGATCGCTGCCAAGAAACTCCTCAC
CGACGTTTCGAACCTCGGTGGTTTAGCCTTTGGCGTCTCTTTCGTCAAATGGATCGCTTC
TTTCTCCGCCATTTACTTGTTGATATTGGATCGTACCAATTGGAGAACCAAGATGCTTAC
TTCACTCTTGATTCCATACATCTTCCTCACCCTTCCTGGTGTCATCTTTAACTTCCTCAG
TGGGGACGTTGGGAAATGGATAGCTTTCGTTGCTGTTGTACTCAGACTTTTCTTCCCTAA
GCATTTCCCAGATTGGCTTGAGATGCCTGGTTCTCTGATCCTTCTGCTGGTAGTTTCTCC
AAACTTCCTTGTTCACCATATACGCGGAGGATGGATCGGCTCTGTCATCAGCCTTTTCAT
TGGTTGTTACCTTCTTCAAGAACATATCCGAGTGTCAGGTGGGTTCAGGAACTCGTTCAC
GCAGCCCCGTGGAGTTTCAAACACTTTGGGGATCATCCTTCTTCTTGTCTACCCTGTTTG
GGCTCTAATCATCCGTGTCTCGTAATAATTACACCGTTCCTCTTCCTGTCTCCAAAGTTA
TGTGTTACTTACTCTCGGCATGTCAAATAAGCGTTAGCAAGAACCTCG

QA 2 709 2 709
DS 

RD RS1FR28TF 784 0 0
AGAAAATCAAAATTCATATAATACCTTGAAATTATCATTACGAAGATCGAGAGTATTATC
GTGAACAAAGGGATGGGGCGTGTGGATTATCTGGCGATGAAGACAGACGTGGATACGGCT
GCTTTAGTCAATTCCGACGTGGAGGAGCTCAAGATCGCTGCCAAGAAACTCCTCACCGAC
GTTTCGAACCTCGGTGGTTTAGCCTTTGGCGTCTCTTTCGTCAAATGGATCGCTTCTTTC
TCCGCCATTTACTTGTTGATATTGGATCGTACCAATTGGAGAACCAAGATGCTTACTTCA
CTCTTGATTCCATACATCTTCCTCACCCTTCCTGGTGTCATCTTTAACTTCCTCAGTGGG
GACGTTGGGAAATGGATAGCTTTCGTTGCTGTTGTACTCAGACTTTTCTTCCCTAAGCAT
TTCCCAGATTGGCTTGAGATGCCTGGTTCTCTGATCCTTCTGCTGGTAGTTTCTCCAAAC
TTCCTTGTTCACCATATACGCGGAGGGTGGATCGGCTCTGTCATCAGCCTTTTCATTGGT
TGTTACCTTCTTCAAGAACATATCCGAGTGTCAGGTGGGTTCAGGAACTCGTTCACGCAG
CCCCGTGGAGTTTCAAACACTTTGGGGATCATCCTTCTTCTTGTCTACCCTGTTTGGGCT
CTAATCATCCGTGTCTCGTA*TAATTACACCGTTCCTCTTC*TGTCTCCAAAGTTATGTG
TTACTTACTCTCGGCATGTCAAA*AAGCGT*AGCAG**ACCTCGGAGATCTTTGGTGTT*
*T
CC

QA 1 782 1 782
DS 

RD RS1DQ09TF 774 0 0
GGGGGAG
TATCGTCAACAAAGGAATGGGGCGTGTGGATTATCTGGCGATGAAGACAGACGTGGATAC
GGCTGCTTTAGTCAATTCCGACGTGGAGGAGCTCAAGATCGCTGCCAAGAAACTCCTCAA
CGATGTTTCGAACCTCGGTGGTTTAGCCTTTGGCGTCTCTTTCGTCAAATGGATCGCTTC
TTTCTCCGCCATTTACTTGCTGATATTGGATCGTACCAACTGGAGAACCAAGATGCTTAC
TTCACTCTTGATTCCATACATCTTCCTCACCCTTCCTGGTGTGATCTTTAACTTCCTCAG
TGGAGACGTTGGGAAATGGATAGCGTTCGTTGCTGTTGTGCTCAGACTTTTCTTCCCTAA
GCATTTCCCAGATTGGCTTGAGATGCCTGGTTCTCTAATCCTTCTGCTGGTAGTCTCTCC
AAACTTCCTTGTTCACCATATACGCGGAGGCTGGATCGGCTCTGTCATCAGCCTTTTCAT
TGATTGTTACCTTCTTCAAGAACATATCCGAGTGTCTGGTGGGTTCAGGAACTCGTTCAC
GCAGCCCCGTGGAGTTTCAAACACTTTGGGGATCATCCTTCTTCTTGTCTACCCTGTTTG
GGCTCTAATCATCCGTGTCTCGTAATAATTACACCGTTCCTCTTCCTGTCTCCAAAGTTA
TGTGTTACTTACTC**GGCATGTCAAATAAGCGTTAGCAAGAACCTCGGAGATCTTTGGT
GTT**CCTTTGTTCTTGCTTCTGTTACATACCCAAATATTCGTGCGT

QA 8 774 8 774
DS 

RD RS1E505JQ 792 0 0
AGATCGCTGCCAAGAAACTCCTCAACGATGTTTCGAAC*TCGGTGGTTTAGC*TTTGGCG
TCTCTTTCGTCAAATGGATCGCTTCTTTCTCCGCCATTTACTTGTTGATATTGGATCGTA
CCAACTGGAGAACCAAGATGCTTACTTCACTCTTGATTCCATACATCTTCCTCACCCTTC
CTGGTGTGATCTTTAACTTCCTCAGTGGAGACGTTGGGAAATGGATAGCGTTCGTTGCTG
TTGTGCTCAGACTTTTCTTCCCTAAGCATTTCCCAGATTGGCTTGAGATGCCTGGTTCTC
TGATCCTTCTGCTGGTAGTCTCTCCAAACTTCCTTGTTCACCATATACGCGGAGGCTGGA
TCGGCTCTGTCATCAGCCTTTTCATTGGTTGTTACCTTCTTCAAGAACATATCCGAGTGT
CTGGTGGGTTCAGGAACTCGTTCACGCAGCCCCGTGGAGTTTCAAACACTTTGGGGATCA
TCCTTCTTCTTGTCTACCCTGTTTGGGCTCTAATCATCCGTGTCTCGTAATAATTACACC
GTTCCTCTTCCTGTCTCCAAAGTTATGTGTTACTTACTC**GGCATGTCAAATAAGCGTT
AGCAAGAACCTCGGAGATCTTTGGTGTT**CCTTTGTTCTTGCTTCTGTTACATACCCAA
ATATTCGTGCGTGAAGCTCAATCAATATTATATTGTTTTACATAAATAAAAGAATCTCAT
TTTTTTCAACTATTTGTTTGTCTCTGTTGTAATAAGACGGAATTTTTATGTGTAAAAATT
GCTTGTAAGG
AC

QA 1 790 1 790
DS 

RD RS1FR28JQ 734 0 0
GGCGTCTCTTTCGTCAAATGGATCGCTTCTTTCTCCGCCATTTACTTGTTGATATTGGAT
CGTACCAATTGGAGAACCAAGATGCTTACTTCACTCTTGATTCCATACATCTTCCTCACC
CTTCCTGGTGTCATCTTTAACTTCCTCAGTGGGGACGTTGGGAAATGGATAGCTTTCGTT
GCTGTTGTACTCAGACTTTTCTTCCCTAAGCATTTCCCAGATTGGCTTGAGATGCCTGGT
TCTCTGATCCTTCTGCTGGTAGTTTCTCCAAACTTCCTTGTTCACCATATACGCGGAGGG
TGGATCGGCTCTGTCATCAGCCTTTTCATTGGTTGTTACCTTCTTCAAGAACATATCCGA
GTGTCAGGTGGGTTCAGGAACTCGTTCACGCAGCCCCGTGGAGTTTCAAACACTTTGGGG
ATCATCCTTCTTCTTGTCTACCCTGTTTGGGCTCTAATCATCCGTGTCTCGTA*TAATTA
CACCGTTCCTCTTCCTGTCTCCAAAGTTATGTGTTACTTACTCTCGGCATGTCAAATAAG
CGTTAGCAAGAACCTCGGAGATCTTTGGTGTTTTCCTTTGTTCTTGCTTCTGTTACATAC
CAAAATATTCGTGCGTGAAGCTCAATCAATGTTATATTGTTTTACATAAATAAAAGAATC
TCATTTTTTTCAACTATTTGTTTGTCGC*GTTGTAATAAGACGGAATTCTTATGTGTAAA
ATTTGCTTGTAAGG

QA 1 734 1 734
DS 

RD RS1FO24JQ 779 0 0
GAAACTCCTCAACGACGTTTCGAACCTCGGTGGTTTAGCCTTTGGCGTCTCTTTCGTCAA
ATGGATCGCTTCTTTCTCCGCCATTTACTTGTTGATATTGGATCGTACCAACTGGAGAAC
CAAGATGCTTACTTCACTCTTGATTCCATACATCTTCCTCACCCTTCCTGGTGTGATCTT
TAACTTCCTCAGTGGAGACGTTGGGAAATGGATAGCGTTCGTTGCTGTTGTGCTCAGACT
TTTCTTCCCTAAGCATTTCCCAGATTGGCTTGAGATGCCTGGTTCTCTGATCCTTCTGCT
GGTAGTCTCTCCAAACTTCCTTGTTCACCATATACGCGGAGGCTGGATCGGCTCTGTCAT
CAGCCTTTTCATTGGTTGTTACCTTCTTCAAGAACATATCCGAGTGTCTGGTGGGTTCAG
GAACTCGTTCACGCAGCCCCGTGGAGTTTCAAACACTTTGGGGATCATCCTTCTTCTTGT
CTACCCTGTTTGGGCTCTAATCATCCGTGTCTCGTAATAATTACACCGTTCCTCTTCCTG
TCTCCAAAGTTATGTGTTACTTACTC**GGCATGTCAAATAAGCGTTAGCAAGAACCTCG
GAGATCTTTGGTGTT**CCTTTGTTCTTGCTTCTGTTACATACCCAAATATTCGTGCGTG
AAGCTCAATCAATATTATATTGTTTTACATAAATAAAAGAATCTCATTTTTTTCAACTAT
TTGTTTGTCTCTGTTGTAATAAGACGGAATTTTTATGTGTAAAAATTGCTTGTAAGG
AT

QA 1 777 1 777
DS 

RD RS1DQ09JQ 734 0 0
TCCGCCATTTACTTGCTGATATTGGATCGTACCAACTGGAGAACCAAGATGCTTACTTCA
CTCTTGATTCCATACATCTTCCTCACCCTTCCTGGTGTGATCTTTAACTTCCTCAGTGGA
GACGTTGGGAAATGGATAGCGTTCGTTGCTGTTGTGCTCAGACTTTTCTTCCCTAAGCAT
TTCCCAGATTGGCTTGAGATGCCTGGTTCTCTAATCCTTCTGCTGGTAGTCTCTCCAAAC
TTCCTTGTTCACCATATACGCGGAGGCTGGATCGGCTCTGTCATCAGCCTTTTCATTGAT
TGTTACCTTCTTCAAGAACATATCCGAGTGTCTGGTGGGTTCAGGAACTCGTTCACGCAG
CCCCGTGGAGTTTCAAACACTTTGGGGATCATCCTTCTTCTTGTCTACCCTGTTTGGGCT
CTAATCATCCGTGTCTCGTAATAATTACACCGTTCCTCTTCCTGTCTCCAAAGTTATGTG
TTACTTACTC**GGCATGTCAAATAAGCGTTAGCAAGAACCTCGGAGATCTTTGGTGTT*
*CCTTTGTTCTTGCTTCTGTTACATACCCAAATATTCGTGCGTGAAGCTCAATCAATATT
ATATT**TTTACATAAATAAAAGAATCTCATTTTTTTCAACTATTTGTTTGTCTCTGTTG
TAATAAGACGGAATTTTTATGTGTAAAAATTGCTTGTAAGGATTATGTTTCGTGTATGCA
CTTTTGGGTATAGC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 14

CO CL129Contig1 752 14 31 U
GGATTCACTTCCCCTATAAATACACATAAACACTCTTCACCTTCTGGACCACTTCTCAAC
TTGAAAGT****TTTAGGGCTTTTTTCC*ATTCCCTCAGTAACCAATGGCTCTTAAAGAC
TCTCTTGCTCTCTTCCTTCTCTTCAACATCCTTTTCTTCACCCTCACTACAGCCACCCGA
AGTACCAATTGTCCTCCTCCACCACGCAAACACAACAAACACAAACCTAGCCCACCATCT
ACACCAACCACCACGGGAGCTTGCCCTAAAGACGCCTTAAAGCTTGGTGTTTGTGTTGAC
GCCCTAAACTTGTTGAACGATGTGACTCTCGGAACTCCTCCTGTGACTCCATGTTGTAAC
CTCATCAGGGGTTTGGTCGATCTTGAAGCTGCGGTTTGTCTTTGCACTGCCCTCAAGGCT
AGCGTTCTTGGCATCAAACTTAACCTTCCCATCAACCTAAGTTTGCTTCTCAATGTGTGC
AAAAGAAAGTCCCCAGCTGGCTTCCAATGCCCTTAAACTCAAAGCGACGTCAATCAGATA
AATTAAAGCTTGAATATTTTATTGTAATGTTTTCTTTTGTACTCGTTTATTTGAAGTGGT
GAAGTTCAAGATGAACATCAGAACATCAATGAGTTTGTGTTGTTTACTTTT*GTTGTATG
GCGAGAGCGCCTTGCTTGAGTGTTACTCCCTTTATTGTAATTTGTTCATTTGTCGTATTG
AATAAAATATCAATGATTTGACCTTTTAGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 5 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 50 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 5 75 5 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 5 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 5 75 75 75 75 75 75 
75 75 5 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 35 75 5 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 
80 80 80 80 80 80 80 80 80 10 80 80 80 65 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 50 80 80 80 80 80 80 80 80 80 80 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 5 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 5 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 5 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 10 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 50 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 
65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 45 45 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 
30 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C213JQ C 177
AF RS1ER07TF U 1
AF RS1CH48TF U 152
AF RS1E402TF U 45
AF RS1C213TF U 46
AF RS1B746JQ C 105
AF RS1B746TF U 105
AF RS1G082TF U 46
AF RS1CZ92JQ C 46
AF RS1CZ92TF U 46
AF RS1CH48JQ C 141
AF RS1ER07JQ C 142
AF RS1E402JQ C 209
AF RS1G082JQ C 399
BS 1 45 RS1ER07TF
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BS 744 752 RS1E402JQ

RD RS1C213JQ 289 0 0
CCGAAGTACCAATTGTCCTCCTCCACCAGGCAAACACAACAAACACAAACCTAGCCCACC
ATTTACACCAACCACCACGGGAGCTTGCCCTAAAGACGCCTTAAAGCTTGGTGTTTGTGT
TGACGCCCTAAACTTGTTGAACGATGTGACTCTCGGAACTCCTCCTGTGACTCCATGTTG
TAACCTCATCAGGGGTTTGGTCGATCTTGAAGCTGCGGTTTGTCTTTGCACTGCCCTCAA
GGCTAGCGTTCTTGGCATCAAAATTAACCTTCCCATCAGCCTAAGTTTG

QA 1 289 1 289
DS 

RD RS1ER07TF 562 0 0
GGATTCACTTCCCCTATAAATACACATAAACACTCTTCACCTTCTCCACCACTTCTCAAC
TTGAAAGT****TTTAGGGCTTTTTTCC*ATTCCCTCAGTAACCAATGGCTCTTAAAGTC
TCTCTTGCTCTCTTCCTTCTCTTCAACATCCTTTTCTTCACCCTCACTACAGCCACCCGA
AGTACCAATTGTCCTCCTCCACCACGCAAACACAACAAACACAAACCTAGCCCACCATCT
ACACCAACCACCACGGCAACTTGCCCTAAAGACACCTTAAAGCTTGGTGTTTGTGTTGAC
GCCCTAAACTTGTTGAACGATGTGACTCTCGGAACTCCTCCTGTGACTCCATGTTGTAGC
CTCATCAAGGGTTTGGTCGATCTCGAAGCTGCGGTTTGTCTTTGCACTGCCCTCAAGGCT
AGCGTTCTTGGCATTAAACTTAACCTTCCCATCAACCTAAGTTTGCTTCTCAATGTGTGC
AAAAGAAAGTCACCAGCTGGCTTCCAATGCCCTTAAACTCAAAGCGACGTCAATCGGATA
AATTAAAGCTTGAATCTTTTAT

QA 1 562 1 562
DS 

RD RS1CH48TF 477 0 0
TTTTCTTCACCCTCACTACAGCCACCCGAAGTACCAATTGTCCTCCTCCACCACGCAAAC
ACAACAAACACAAACCTAGCCCACCATCTACACCAACCACCACGGCAACTTGCCCTAAAG
ACACCTTAAAGCTTGGTGTTTGTGTTGACGCCCTAAACTTGTTGAACGATGTGACTCTCG
GAACTCCTCCTGTGACTCCATGTTGTAGCCTCATCAAGGGTTTGGTCGATCTCGAAGCTG
CGGTTTGTCTTTGCACTGCCCTCAAGGCTAGCGTTCTTGGCATTAAACTTAACCTTCCCA
TCAACCTAAGTTTGCTTCTCAATGTGTGCAAAAGAAAGTCACCAGCTGGCTTCCAATGCC
CTTAAACTCAAAGCGACGTCAATCGGATAAATTAAAGCTTGAATCTTTTATTGTAATGTT
TTCTTTTGTACTCATTTATTTGAAGTGGTGAAGTTCAAGATGAACATCAGAACATCA

QA 1 477 1 477
DS 

RD RS1E402TF 625 0 0
G
GGACCACTTCTCAACTTGAAATTAATTTATAGGGCTTTTTTCCCATTCCCTCAGTAACCA
ATGGCTCTTAAAGACTCTCTTGCTCTCTTCCTTCTCTTCAACATCCTTTTCTTCACCCTC
ACTACAGCCACCCGAAGTACCAATTGTCCTCCTCCACCACGCAAACACAACAAACACAAA
CCTAGCCCACCATCTACACCAACCACCACGGGAGCTTGCCCTAAAGACGCCTTAAAGCTT
GGTGTTTGTGTTGACGCCCTAAACTTGTTGAACGATGTGACTCTCGGAACTCCTCCTGTG
ACTCCATGTTGTAACCTCATCAGGGGTTTGGTCGATCTTGAAGCTGCGGTTTGTCTTTGC
ACTGCCCTCAAGGCTAGCGTTCTTGGCATCAAACTTAACCTTCCCATCAACCTAAGTTTG
CTTCTCAATGTGTGCAAAAGAAAGTCCCCAGCTGGCTTCCAATGCCCTTAAACTCAAAGC
GACGTCAATCAGATAAATTAAAGCTTGAATATTTTATTGTAATGTTTTCTTTTGTACTCG
TTTATTTGAAGTGGTGAAGTTCAAGATGAACATCAGAACATCAATGAGTTTGTGTTGTTT
ACTTTT*GTTGTATGGCGAGAGCG

QA 2 625 2 625
DS 

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ATGGCTCTTAAAGACTCTCTTGCTCTCTTCCTTCTCTTCAACATCCTTTTCTTCACCCTC
ACTACAGCCACCCGAAGTACCAATTGTCCTCCTCCACCACGCAAACACAACAAACACAAA
CCTAGCCCACCATCTACACCAACCACCACGGGAGCTTGCCCTAAAGACGCCTTAAAGCTT
GGTGTTTGTGTTGACGCCCTAAACTTGTTGAACGATGTGACTCTCGGAACTCCTCCTGTG
ACTCCATGTTGTAACCTCATCAGGGGTTTGGTCGATCTTGAAGCTGCGGTTTGTCTTTGC
ACTGCCCTCAAGGCTAGCGTTCTTGGCATCAAACTTAACCTTCCCATCAGCCTAAGTTTG
CTTCTCAATGTGTGCAAAAGAAAGTCCCCAGCTGGCTTCCAATGCCCTTAAACTCAAAGC
GACGTCAATCAGATAAATTAAAGCTTGAATATTTTATTGTAATGTTTTCTTTTGTACTCG
TTTATTTGAAGTGGTGAAGTTCAAGATGAACATCAGAACATCAATGAGTTTGTGTTGTTT
ACTTTT*GTTGTATGGCGAGAGCGCCTTGCTTGAGTGTTACTCCCTTTATTGTAATTTGT
TCATTTGTCGTATTGAATAAA*TATCAATGATT
GTTTT

QA 1 693 1 693
DS 

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G
ATGGCTCTTAAAGACTCTCTTGCTCTCTTCCTTCTCTTCAACATCCTTTTCTTCACCCTC
ACTACAGCCACCCGAAGTACCAATTGTCCTCCTCCACCACGCAAACACAACAAACACAAA
CCTAGCCCACCATCTACACCAACCACCACGGGAGCTTGCCCTAAAGACGCCTTAAAGCTT
GGTGTTTGTGTTGACGCCCTAAACTTGTTGAACGATGTGACTCTCGGAACTCCTCCTGTG
ACTCCATGTTGTAACCTCATCAGGGGTTTGGCCGATCTTGAAGCTGCGGTTTGTCTTTGC
ACTGCCCTCAAGGCTAGCGTTCTTGGCATCAAACTTAACCTTCCCATCAACCTAAGTTTG
CTTCTCAATGTGTGCAAAAGAAAGTCCCCAGCTGGCTTCCAATGCCCTTAAACTCAAAGC
GACGTCAATCAGATAAATTAAAGCTTGAATATTTTATTGTAATGTTTTCTTTTGTACTCG
TTTATTTGAAGTGGTGAAGTTCAAGATGAACATCAGAACATCAATGAGTTTGTGTTGTTT
ACTTTT*GTTGTATGGCGAGAGCGCCTTGCTTGAGTGTTACTCCCTTTATTGTAATTTGT
TCATTTGTCGTATTGAATAAAATATCAATG

QA 2 631 2 631
DS 

RD RS1B746TF 631 0 0
G
ATGGCTCTTAAAGACTCTCTTGCTCTCTTCCTTCTCTTCAACATCCTTTTCTTCACCCTC
ACTACAGCCACCCGAAGTACCAATTGTCCTCCTCCACCACGCAAACACAACAAACACAAA
CCTAGCCCACCATCTACACCAACCACCACGGGAGCTTGCCCTAAAGACGCCTTAAAGCTT
GGTGTTTGTGTTGACGCCCTAAACTTGTTGAACGATGTGACTCTCGGAACTCCTCCTGTG
ACTCCATGTTGTAACCTCATCAGGGGTTTGGCCGATCTTGAAGCTGCGGTTTGTCTTTGC
ACTGCCCTCAAGGCTAGCGTTCTTGGCATCAAACTTAACCTTCCCATCAACCTAAGTTTG
CTTCTCAATGTGTGCAAAAGAAAGTCCCCAGCTGGCTTCCAATGCCCTTAAACTCAAAGC
GACGTCAATCAGATAAATTAAAGCTTGAATATTTTATTGTAATGTTTTCTTTTGTACTCG
TTTATTTGAAGTGGTGAAGTTCAAGATGAACATCAGAACATCAATGAGTTTGTGTTGTTT
ACTTTT*GTTGTATGGCGAGAGCGCCTTGCTTGAGTGTTACTCCCTTTATTGTAATTTGT
TCATTTGTCGTATTGAATAAAATATCAATG

QA 2 631 2 631
DS 

RD RS1G082TF 678 0 0
GGACCACTTCTCAACTTGAAATTAATTTATAGGGCTTTTTTCCCATTCCCTCAGTAACCA
ATGGCTCTTAAAGACTCTCTTGCTCTCTTCCTTCTCTTCAACATCCTTTTCTTCACCCTC
ACTACAGCCACCCGAAGTACCAATTGTCCTCCTCCACCACGCAAACACAACAAATACAAA
CCTAGCCCACCATCTACACCAACCACCACGGGAGCTTGTCCTAAAGACGCCTTAAAGCTT
GGTGTTTGTGTTGACGCCCTAAACTTGTTGAACGATGTGACTCTCGGAACTCCTCCTGTG
ACTCCATGTTGTAACCTCATCAGGGGTTTGGTCGATCTTGAAGCTGCGGTTTGTCTTTGC
ACTGCCCTCAAGGCTAGCGTTCTTGGCATCAAACTTAACCTTCCCATCAACCTAAGTTTG
CTTCTCAATGTGTGCAAAAGAAAGTCCCCAGCTGGCTTCCAATGCCCTTAAACTCAAAGC
GACGTCAATCAGATAAATTAAAGCTTGAATATTTTATTGTAATGTTTTCTTTTGTACTCG
TTTATTTGAAGTGGTGAAGTTCAAGATGAACATTAGAACATCAATGAGTTTGTGTTGTTT
ACTTTT*GTTGTATGGCGAGAGCGCCTTGCTTGAGTGTTACTCCCTTTATTGTAATTTGT
TCATTTGTCGTATTGAAT

QA 1 678 1 678
DS 

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GG
ACCACTTCTCAACTTGAAAGT****TTTAGGGCTTTTTTCC*ATTCCCTCAGTAACCAAT
GGCTCTTAAAGTCTCTCTTGCTCTCTTCCTTCTCTTCAACATCCTTTTCTTCACCCTCAC
TACAGCCACCCGAAGTACCAATTGTCCTCCTCCACCACGCAAACACAACAAACACAAACC
TAGCCCACCATCTACACCAACCACCACGGCAACTTGCCCTAAAGACACCTTAAAGCTTGG
TGTTTGTGTTGACGCCCTAAACTTGTTGAACGATGTGACTCTCGGAACTCCTCCTGTGAC
TCCATTTTGTAGCCTCATCAAGGGTTTGGTCGATTTCGAAGCTGCGGTTTGTCTTTGCAC
TGCCCTCAAGGCTAGCGCTCTTGGCATTAAACTTAACCTTCCCATCAACCTAAGTTTGCT
TCTCAATGTGTGCAAAAGAAAGTCACCAGCTGGCTTCCAATGCCCTTAAACTCAAAGCGA
CGTCAATCGGATAAATTAAAGCTTGAATCTTTTATTGTAATGTTTTCTTTTGTACTCATT
TATTTGAAGTGGTGAAGTTCAAGATGAACATCAGAACATCAATGAGTTGGTGTTGTTTAC
TTTTTGTTGTATGGCGAGAGCGCCTTGCTTGAGTGTTATTCCCTTTATTGTAATTTGTTC
ATTTGTCGTATTGAATAAAATATCAATGATTTGACC
C

QA 3 698 3 698
DS 

RD RS1CZ92TF 699 0 0
GG
ACCACTTCTCAACTTGAAAGT****TTTAGGGCTTTTTTCC*ATTCCCTCAGTAACCAAT
GGCTCTTAAAGTCTCTCTTGCTCTCTTCCTTCTCTTCAACATCCTTTTCTTCACCCTCAC
TACAGCCACCCGAAGTACCAATTGTCCTCCTCCACCACGCAAACACAACAAACACAAACC
TAGCCCACCATCTACACCAACCACCACGGCAACTTGCCCTAAAGACACCTTAAAGCTTGG
TGTTTGTGTTGACGCCCTAAACTTGTTGAACGATGTGACTCTCGGAACTCCTCCTGTGAC
TCCATTTTGTAGCCTCATCAAGGGTTTGGTCGATTTCGAAGCTGCGGTTTGTCTTTGCAC
TGCCCTCAAGGCTAGCGCTCTTGGCATTAAACTTAACCTTCCCATCAACCTAAGTTTGCT
TCTCAATGTGTGCAAAAGAAAGTCACCAGCTGGCTTCCAATGCCCTTAAACTCAAAGCGA
CGTCAATCGGATAAATTAAAGCTTGAATCTTTTATTGTAATGTTTTCTTTTGTACTCATT
TATTTGAAGTGGTGAAGTTCAAGATGAACATCAGAACATCAATGAGTTGGTGTTGTTTAC
TTTTTGTTGTATGGCGAGAGCGCCTTGCTTGAGTGTTATTCCCTTTATTGTAATTTGTTC
ATTTGTCGTATTGAATAAA*TATCAATGATTTGACC
C

QA 3 698 3 698
DS 

RD RS1CH48JQ 604 0 0
CTTCAACATCCTTTTCTTCACCCTCACTACAGCCACCCGAAGTACCAATTGTCCTCCTCC
ACCACGCAAACACAACAAACACAAACCTAGCCCACCATTTACACCAACCACCACGGCAAC
TTGCCCTAAAGACACCTTAAAGCTTGGTGTTTGTGTTGACGCCCTAAACTTGTTGAACGA
TGTGACTCTCGGAACTCCTCCTGTGACTCCATGTTGTAGCCTCATCAAGGGTTTGGTCGA
TTTCGAAGCTGCGGTTTGTCTTTGCACTGCCCTCAAGGCTAGCGTTCTTGGCATTAAACT
TAACCTTCCCATCAACCTAAGTTTGCTTCTCAATGTGTGCAAAAGAAAGTCACCAGCTGG
CTTCCAATGCCCTTAAACTCAAAGCGACGTCAATCGGATAAATTAAAGCTTGAATCTTTT
ATTGTAATGTTTTTTTTTGTACTCATTTATTTGAAGTGGTGAAGTTCAAGATGAACATCA
GAACATCAATGAGTTTGTGTTGTTTACTTTTTGTTGTATGGCGAGAGCGCCTTGCTAGAG
TGTTACTCCCTTTATTGTAATTTGTTCATTTGTCGTATTGAATAAAATATCAATGATTTG
ACC
G

QA 1 603 1 603
DS 

RD RS1ER07JQ 602 0 0
TTCAACATCCTTTTCTTCACCCTCACTACAGCCACCCGAAGTACCAATTGTCCTCCTCCA
CCACGCAAACACAACAAACACAAACCTAGCCCACCATCTACACCAACCACCACGGCAACT
TGCCCTAAAGACACCTTAAAGCTTGGTGTTTGTGTTGACGCCCTAAACTTGTTGAACGAT
GTGACTCTCGGAACTCCTCCTGTGACTCCATGTTGTAGCCTCATCAAGGGTTTGGTCGAT
CTCGAAGCTGCGGTTTGTCTTTGCACTGCCCTCAAGGCTAGCGTTCTTGGCATTAAACTT
AACCTTCCCATCAACCTAAGTTTGCTTCTCAATGTGTGCAAAAGAAAGTCACCAGCTGGC
TTCCAATGCCCTTAAACTCAAAGCGACGTCAATCGGATAAATTAAAGCTTGAATCTTTTA
TTGTAATGTTTTCTTTTGTACTCATTTATTTGAAGTGGTGAAGTTCAAGATGAACATCAG
AACATCAATTAGTTTGTGTTGTTTACTTTTTGTTGTATGGTGAGAGCGCCTTGCTTAAGT
GTTACTCCCTTTATTGTAATTTGTTCATTTGTCGTATTGAATAAAATATCAATGATTTGA
CC

QA 1 602 1 602
DS 

RD RS1E402JQ 544 0 0
AACACAACAAACACAAACCTAGCCCACCATCTACACCAACCACCACGGGAGCTTGCCCTA
AAGACGCCTTAAAGCTTGGTGTTTGTGTTGACGCCCTAAACTTGTTGAACGATGTGACTC
TCGGAACTCCTCCTGTGACTCCATGTTGTAACCTCATCAGGGGTTTGGTCGATCTTGAAG
CTGCGGTTTGTCTTTGCACTGCCCTCAAGGCTAGCGTTCTTGGCATCAAACTTAACCTTC
CCATCAACCTAAGTTTGCTTCTCAATGTGTGCAAAAGAAAGTCCCCAGCTGGCTTCCAAT
GCCCTTAAACTCAAAGCGACGTCAATCAGATAAATTAAAGCTTGAATATTTTATTGTAAT
GTTTTCTTTTGTACTCGTTTATTTGAAGTGGTGAAGTTCAAGATGAACATCAGAACATCA
ATGAGTTTGTGTTGTTTACTTTT*GTTGTATGGCGAGAGCGCCTTGCTTGAGTGTTACTC
CCTTTATTGTAATTTGTTCATTTGTCGTATTGAATAAAATATCAATGATTGTTTTTTTTA
GTCT

QA 1 544 1 544
DS 

RD RS1G082JQ 349 0 0
TT
TTTGCACTGCCCTCAAGGCTAGCGTTCTTGGCATCAAACTTAACCTTCCCATCAACCTAA
GTTTGCTTCTCAATGTGTGCAAAAGAAAGTCCCCAGCTGGCTTCCAATGCCCTTAAACTC
AAAGGGACGTCAATCAGATAAATTAAAGCTTGAATATTTTATTGTAATGTTTTCTTTTGT
ACTCGTTTATTTGAAGTGGTGAAGTTCAAGATGAACATTAGAACATCAATGAGTTTGTGT
TGTTTACTTTT*GTTGTATGGCGAGAGCGCCTTGCTTGAGTGTTACTCCCTTTATTGTAA
TTTGTTCATTTGTCGTATTGAATAAAATATCAATGATT
GGTTTTTTC

QA 3 340 3 340
DS 



AS 1 13

CO CL130Contig1 644 13 3 U
GGCCAACAATTAAAAAAACACAACTCAAAAGACTTCGATCGTCTTCAAGAGAGAATCGAA
CCAAGTTTACATGGTTGAGCTAGACATCCAAGTTCCATCAGCATTCGACCCGTTCGCAGA
AGCTCAAGAATCAGATGCACCAGGGACAAAAGAGTACATCCACGTCCGGATCCAGCAGAG
GAATGGGAAAAAGAGCTTGACGACTGTTCAGGGTCTGAAGAAAGCGTACAGCTACGAGAA
GATTCTCAAGGATCTTAAGAAGGACTTCTGCTGCAACGGGAACGTGGTGCAGGACAAGGA
GCTAGGAAAGATCATTCAGCTTCAGGGTGATCAGAGGAAGAAGGTGTCTCACTTCTTGGT
TCAGACTGGGATTGCTAAGAAGGAGCAGATCAAGATCCACGGGTTCTAAAGACCCGCGAT
TCGAATTGGATCGTGTGATATCTTTCTGTCTATTTATATATATATGCGAATAATTGGACG
TGGTGTTTGTGATCACTAGGAAGGTTTTTTTTT*CTCGTTTTGATTGTTGTTTGTTGGTG
TGGGACATTTGAGTTGTGGAATGATGATAAACCACCTTTCGATTATTGTATTTTACATAT
CTTCGTTTAAGTTATTTGCTCAAGAAAGAATTGTTTACGGAAAA


BQ
10 10 10 40 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 60 60 60 65 35 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 30 70 70 70 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 30 75 75 75 75 75 75 75 75 75 65 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 10 10 10 10 

AF RS1H581JQB C 39
AF RS1EJ74JQ C 2
AF RS1EJ74TF U 2
AF RS1DZ76TF U 3
AF RS1H581TF U 3
AF RS1EM65TF U 1
AF RS1EM65JQ C 357
AF RS1GP40JQ C 42
AF RS1EL68JQ C 36
AF RS1EL68TF U 2
AF RS1GP40TF U 10
AF RS1F581JQ C 1
AF RS1F581TF U 1
BS 1 352 RS1EM65TF
BS 353 353 RS1EJ74TF
BS 354 644 RS1EM65TF

RD RS1H581JQB 546 0 0
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CAGCATTCGACCCGTTCGCAGAAGCTCAAGAATCAGATGCACCAGGGACAAAAGAGTACA
CCCACGTCCGGATCCAGCAGAGGAATGGGAAAAATAGCTTGACGACTGTTCAGGGTCTGA
AGAAAGCGTACAGCTACGAGAAGATTCTCAAGGATCTTAAGAAGGACTTCTGCTGCAACG
GGAACGTGGTGCAGGACAAGGAGCTAGGAAAGATCATTCAGCTTCAGGGTGATCAGAGGA
AGAAGGTGTCTCACTTCTTGGTTCAGACTGGGATTGCTAAGAAGGAGCAGATCAAGATCC
ACGGGTTCTAAAGACCCGCGATTCGAATTGGATCGTGTGATATCTTTCTGTCTATTTATA
TATATATGCGAATAATTGGACGTGGTGTTTGTGATCACTAGGAAGGTTTTTTTTTTCTCG
TTTTGATTGTTGTTTGTTGGTGTGGGACATTTGAGTTGTGGAATGATGATAAACCCCCTT
TCGAT
C

QA 1 545 1 545
DS 

RD RS1EJ74JQ 583 0 0
GG
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TCAAGAATCAGATGCACCAGGGACAAAAGAGTACATCCACGTCCGGATCCAGCAGAGGAA
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TCTCAAGGATCTTAAGAAGGACTTTTGCTGCAACGGGAACGTGGTGCAGGACAAGGAGCT
AGGAAAGATCATTCAGCTTCAGGGTGATCAGAGGAAGAAGGTGTCTCACTTCTTGGTTCA
GACTGGGATTGCTAAGAAGGAGCAGATCAAGATCCACGGGTTCTAAAGACCCGCGATTCG
AATTGGATCTTGTGATATCTTTCTGTCTATTTATATATATATGCGAATAATTGGACGTGG
TGTTTGTGATCACTAGGAAGGTTTTTTTTT*CTCGTTTTGATTGTTGTTTGTTGGTGTGG
GACATTTGAGTTGTGGAATGATGATAAACCCCCTTTCGATT

QA 3 583 3 583
DS 

RD RS1EJ74TF 583 0 0
GG
CAACAATTAAAAAAACACAACTCAAAAGACTTCGATTGTCTTCAAGAGAGAATCGAACCA
AGTTTACATGGTTGAGCTAGACATCCAAGTTCCATCAGCATTCGACCCGTTCGCAGAAGC
TCAAGAATCAGATGCACCAGGGACAAAAGAGTACATCCACGTCCGGATCCAGCAGAGGAA
TGGGAAAAAGAGCTTGACGACTGTTCAGGGTCTGAAGAAAGCGTACAGCTACGAGAAGAT
TCTCAAGGATCTTAAGAAGGACTTCTGCTGCAACGGGAACGTGGTGCAGGACAAGGAGCT
AGGAAAGATCATTCAGCTTCAGGGTGATCAGAGGAAGAAGGTGTCTCACTTCTTGGTTCA
GACTGGGATTGCTAAGAAGGAGCAGATCAAGATCCACGGGTTCTAAAGACCCGCGATTCG
AATTGGATCTTGTGATATCTTTCTGTCTATTTATATATATATGCGAATAATTGGACGTGG
TGTTTGTGATCACTAGGAAGGTTTTTTTTT*CTCGTTTTGATTGTTGTTTGTTGGTGTGG
GACATTTGAGTTGTGGAATGATGATAAACCACCTTTCGATT

QA 3 583 3 583
DS 

RD RS1DZ76TF 597 0 0
GGG
ACAATTAAAAAAACACAACTCAAAAGACTTCGATCGTCTTCAAGAGAGAATCGAACCAAG
TTTACATGGTTGAGCTAGACATCCAAGTTCCATCAGCATTCGACCCGTTCGCAGAAGCTC
AAGAATCAGATGCACCAGGGACAAAAGAGTACATCCACGTCCGGATCCAGCAGAGGAATG
GGAAAAAGAGCTTGACGACTGTTCAGGGTCTGAAGAAAGCGTACAGCTACGAGAAGATTC
TCAAGGATCTTAAGAAGGACTTCTGCTGCAACGGGAACGTGGTGCAGGACAAGGAGCTAG
GAAAGATCATTCAGCTTCAGGGTGATCAGAGGAAGAAGGTGTCTCACTTCTTGGTTCAGA
CTGGGATTGCTAAGAAGGAGCAGATCAAGATCCACGGGTTCTAAAGACCCGCGATTCGAA
TTGGATCGTGTGATATCTTTCTGTCTATTTATATATATATGCGAATAATTGGACGTGGTG
TTTGTGATCACTAGGAAGGTTTTTTTTT*CTCGTTTTGATTGTTGTTTGTCGGTGTGGGA
CATTTGAGTTGTGGAATGATGATAAACCACCTTTCGATTATTGTATTTTACATA

QA 4 597 4 597
DS 

RD RS1H581TF 582 0 0
GG
AACAATTAAAAAAACACAACTCAAAAGACTTCGATCGTCTTCAAGAGAGAATCGAACCAA
GTTTACATGGTTGAGCTAGACATCCAAGTTCCATCAGCATTCGACCCGTTCGCAGAAGCT
CAAGAATCAGATGCACCAGGGACAAAAGAGTACACCCACGTCCGGATCCAGCAGAGGAAT
GGGAAAAATAGCTTGACGACTGTTCAGGGTCTGAAGAAAGCGTACAGCTACGAGAAGATT
CTCAAGGATCTTAAGAAGGACTTCTGCTGCAACGGGAACGTGGTGCAGGACAAGGAGCTA
GGAAAGATCATTCAGCTTCAGGGTGATCAGAGGAAGAAGGTGTCTCACTTCTTGGTTCAG
ACTGGGATTGCTAAGAAGGAGCAGATCAAGATCCACGGGTTCTAAAGACCCGCGATTCGA
ATTGGATCGTGTGATATCTTTCTGTCTATTTATATATATATGCGAATAATTGGACGTGGT
GTTTGTGATCACTAGGAAGGTTTTTTTTTTCTCGTTTTGATTGTTGTTTGTTGGTGTGGG
ACATTTGAGTTGTGGAATGATGATAAACCACCTTTCGAT
C

QA 3 581 3 581
DS 

RD RS1EM65TF 644 0 0
GGCCAACAATTAAAAAAACACAACTCAAAAGACTTCGATCGTCTTCAAGAGAGAATCGAA
CCAAGTTTACATGGTTGAGCTAGACATCCAAGTTCCATCAGCATTCGACCCGTTCGCAGA
AGCTCAAGAATCAGATGCACCAGGGACAAAAGAGTACATCCACGTCCGGATCCAGCAGAG
GAATGGGAAAAAGAGCTTGACGACTGTTCAGGGTCTGAAGAAAGCGTACAGCTACGAGAA
GATTCTCAAGGATCTTAAGAAGGACTTCTGCTGCAACGGGAACGTGGTGCAGGACAAGGA
GCTAGGAAAGATCATTCAGCTTCAGGGTGATCAGAGGAAGAAGGTGTCTCACCTCTTGGT
TCAGACTGGGATTGCTAAGAAGGAGCAGATCAAGATCCACGGGTTCTAAAGACCCGCGAT
TCGAATTGGATCGTGTGATATCTTTCTGTCTATTTATATATATATGCGAATAATTGGACG
TGGTGTTTGTGATCACTAGGAAGGTTTTTTTTT*CTCGTTTTGATTGTTGTTTGTTGGTG
TGGGACATTTGAGTTGTGGAATGATGATAAACCACCTTTCGATTATTGTATTTTACATAT
CTTCGTTTAAGTTATTTGCTCAAGAAAGAATTGTTTACGGAAAA

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1EM65JQ 284 0 0
TGGTTCAGACTGGGATTGCTAAGAAGGAGCAGATCAAGATCCACGGGTTTTAAAGACCCG
CGATTCGAATTGGATCGTGTGATATCTTTCTGTCTATTTATATATATATGCGAATAATTG
GACGTGGTGTTTGTGATCACTAGGAAGGTTTTTTTTT*CTCGTTTTGATTGTTGTTTGTT
GGTGTGGGACATTTGAGTTGTGGAATGATGATAAACCCCCTTTCGATTATTGTATTTTAC
ATATCTTCGTTTAAGTTATTTGCTCAAGAAAGAATTGTTTACGG

QA 1 284 1 284
DS 

RD RS1GP40JQ 580 0 0
TCTTCAAGAGAGAATCGAACCAAGTTTACATGGTTGAGCTAGACATCCAAGTTCCATCAG
CATTCGACCCGTTCGCAGAAGCTCAAGAATCAGATGCACCAGGGACAAAAGAGTACATCC
ACGTCCGGATCCAGCAGAGGAATGGGAAAAAGAGCTTGACGACTGTTCAGGGTCTGAAGA
AAGCGTACAGCTACGAGAAGATTCTCAAGGATCTTAAGAAGGACTTCTGCTGCAACGGGA
ACGTGGTGCAGGACAAGGAGCTAGGAAAGATCATTCAGCTTCAGGGTGATCAGAGGAAGA
AGGTGTCTCACTTCTTGGTTCAGACTGGGATTGCTAAGAAGGAGCAGATCAAGATCCACG
GGTTCTAAAGACCCGCGATTCGAATTGGATCGTGTGATATCTTTCTGTCTATTTATATAT
ATATGCGAATAATTGGACGTGGTGTTTGTGATCACTAGGAAGGTTTTTTTTTTCTCGTTT
TGATTGTTGTTTGTTGGTGTGGGACATTTGAGTTGTGGAATGATGATAAACCACCTTTCG
ATTATTGTATTTTACATATCTTCGTTTAAGTTATTTGC
CC

QA 1 578 1 578
DS 

RD RS1EL68JQ 603 0 0
CGATCGTCTTCAAGAGAGAATCGAACCAAGTTTACATGGTTGAGCTAGACATCCAAGTTC
CATCAGCATTCGACCCGTTCGCAGAAGCTCAAGAATCAGATGCACCAGGGACAAAAGAGT
ACATCCACGTCCGGGTCCAGCAGAGGAATGG*AAAAAGAGCTTGACGACTGTTCAGGGTC
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TCGTTTTGATTGTTGTTTGTTGGTGTGGGACATTTGAGTTGTGGAATGATGATAAACCCC
CTTTCGATTATTGTATTTTACATATCTTCGTTTAAGTTATTTGCTCAAGAAAGAATTGTT
TAC

QA 1 603 1 603
DS 

RD RS1EL68TF 637 0 0
GG
CAACAATTAAAAAAACACAACTCAAAAGACTTCGATCGTCTTCAAGAGAGAATCGAACCA
AGTTTACATGGTTGAGCTAGACATCCAAGTTCCATCAGCATTCGACCCGTTCGCAGAAGC
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GACATTTGAGTTGTGGAATGATGATAAACCACCTTTCGATTATTGTATTTTACATATCTT
CGTTTAAGTTATTTGCTCAAGAAAGAATTGTTTAC

QA 3 637 3 637
DS 

RD RS1GP40TF 612 0 0
GGAAAG
AAACACAACTCAAAAGACCTCGATCGTCTTCAAGAGAGAATCGAACCAAGTTTACATGGT
TGAGCTAGACATCCAAGTTCCATCAGCATTCGACCCGTTCGCAGAAGCTCAAGAATCAGA
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CTTGACGACTGTTCAGGGTCTGAAGAAAGCGTACAGCTACGAGAAGATTCTCAAGGATCT
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GTGGAATGATGATAAACCACCTTTCGATTATTGTATTTTACATATCTTCGTTTAAGTTAT
TTGC
CC

QA 7 610 7 610
DS 

RD RS1F581JQ 640 0 0
GGC
CAACAATTAAAAAAACACAACTCAAAAGACTTCGATCGTCTTCAAGAGAGAATCGAACCA
AGTTTACATGGTTGAGCTAGACATCCAAGTTCCATCAGCATTCGACCCGTTCGCAGAAGC
TCAAGAATCAGATGCACCAGGGACAAAAGAGTACATCCACGTCCGGATCCAGCAGAGGAA
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TCTCAAGGATCTTAAGAAGGACTTTTGCTGCAACGGGAACGTGGTGCAGGACAAGGAGCT
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GACATTTGAGTTGTGGAATGATGATAAACCACCTTTCGATTATTGTATTTTACATATCTT
CGTTTAAGTTATTTGCTCAAGAAAGAATTGTTTACGG

QA 4 640 4 640
DS 

RD RS1F581TF 640 0 0
GGC
CAACAATTAAAAAAACACAACTCAAAAGACTTCGATCGTCTTCAAGAGAGAATCGAACCA
AGTTTACATGGTTGAGCTAGACATCCAAGTTCCATCAGCATTCGACCCGTTCGCAGAAGC
TCAAGAATCAGATGCACCAGGGACAAAAGAGTACATCCACGTCCGGATCCAGCAGAGGAA
TGGGAAAAAGAGCTTGACGACTGTTCAGGGTCTGAAGAAAGCGTACAGCTACGAGAAGAT
TCTCAAGGATCTTAAGAAGGACTTCTGCTGCAACGGGAACGTGGTGCAGGACAAGGAGCT
AGGAAAGATCATTCAGCTTCAGGGTGATCAGAGGAAGAAGGTGTCTCACCTCTTGGTTCA
GACTGGGATTGCTAAGAAGGAGCAGATCAAGATCCACGGGTTCTAAAGACCCGCGATTCG
AATTGGATCGTGTGATATCTTTCTGTCTATTTATATATATATGCGAATAATTGGACGTGG
TGTTTGTGATCACTAGGAAGGTTTTTTTTT*CTCGTTTTGATTGTTGTTTGTTGGTGTGG
GACATTTGAGTTGTGGAATGATGATAAACCACCTTTCGATTATTGTATTTTACATATCTT
CGTTTAAGTTATTTGCTCAAGAAAGAATTGTTTACGG

QA 4 640 4 640
DS 



AS 1 9

CO CL131Contig1 1141 9 20 U
CGGAGAGAAGAGAGAGAGGAGATACTATATATAAGAACAGTAGAAGACAATAAAAAACAT
TTTAAGCAGGACTCTGCAACAAAAGACTGAAAATGGTACTCCTAGAAACAAAAGATTATA
ATAGCTAAAAATGTATTTTTCTCGAAGCATATGAAAAAGCTAAGTCTTGTATGTTATTGT
CATGAGCCATTTTAATTAAAATTAAAACCCTTTCAACACACTCTGTTATAGAAGAAAGAC
ATGTAAGCAAATGTGGTTTCCGGGGAAAGCCTCTCCCATCATTCCTCACCATCTTCGCCT
TCTCTTTCATCGTCTTCATCAGAATCACCTTCCCCCTCATCATCTTCATCATCAAAATCC
TCTTCATCAGCCTCATTGTTGAAGTAGGTGAGAGGGTTGGCCCATAAATCTTCCTTGATG
ATATCCGCAACCTCGTCGTGAATCTCAACTTCAACGTCTTCTTCCTTGTGTTGACCATCG
CTAAACCAGGTAAAGAAACTCTCTTCAGGCAATGCACGTTTGTTTCCATTCTTCTCGTGG
TCCACACCATTTGGCAAGCCCTT*GCCCTCTTTCCACTTGATAGGTGTGGCTGAGATTTT
GGTT*GTCCCTTCGTCGAGGAAGGTAAAGGTCTTGGTTAGTTTCCCATCCTCAAAATAAG
GG*TTGGCATTGAAGTTAAAAGTGATAGAGTATCCAGACTTCACATCTTTGGCATCCTCA
ACATCCAGAGAGCTTAGATATTTGAATATCTTCTGGTCTTCTTCAGTCAAGAGATCACCA
AGAGCAGGGTGGCTCAAGAAAGCAGTGAGCCAGAAATCAGGGATGGCTTTGATGATATCG
GCACGCTTGTCATAGACAGGCTTTCTTATACCGTTGTACTTCTGCTCCACTTCCAACACT
TCATCGCTAGCCTTCTCGTTTATCTTCTCGAGGTCGTCTTGAATGGACTGAAGCTTTTCG
ATAGAAAGGAGAAGCTCTCCGTCGATTTGCTCGGCGTTCTCCTCATCGGTCTTCGCCTTC
TTGCTCTTGTTGTCCGCCACCATTCTCACTTTTTTTACCCTAATTTGCAAATCTCTCAGA
GAGTTTCGACTCCTCCTTTGCTCTCTCTCTTGCTTTTTAGTTCCGTCACACGAGCAACTC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 25 40 40 40 40 10 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D975JQ U 46
AF RS1DF52JQ U 1
AF RS1GB89JQ U 46
AF RS1DB26JQ U 98
AF RS1AB56JQ U 175
AF RS1D975TF C 615
AF RS1DF52TF C 492
AF RS1AB56TF C 436
AF RS1CY25TF C 417
BS 1 74 RS1DF52JQ
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RD RS1D975JQ 305 0 0
GG
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ACAAAAGATTATAATAGCTAAAAATGTATTTTTCTCGAAGCATATGAAAAAGCTAAGTCT
TGTATGTTATTGTCATGAGCCATTTTAATTAAAATTAAAACCCTTTCAACACACTCTGTT
ATAGAAGAAAGACATGTAAGCAAATGTGGTTTCCGGGGAAAGCCTCTCCCATCATTCCTC
ACCATCTTCGCCTTCTCTTTCATCGTCTTCATCAGAATCACCTTCCCCCTCATCATCTTC
ATC

QA 3 305 3 305
DS 

RD RS1DF52JQ 782 0 0
CGGAGAGAAGAGAGAGAGGAGATACTATATATAAGAACAGTAGAAGACAATAAAAAACAT
TTTAAGCAGGACTC*GCAACAAAAGACTGAAAATGGTACTCCTAGAAACAAAAGATTATA
ATAGCTAAAAATGTATTTTTCTCGAAGCATATGAAAAAGCGAAGTCATGTATGTTATTGT
CATGAGCCATTTTAATTAAAATTAAAACCCTTTCAACACACTCTGTTATAGAAGAAAGAC
ATGTAAGCAAATGTGGTTTCCGGGGAAAGCCTCTCCCATCATTCCTCACCATCTTCGCCT
TCTCTTTCATCGTCTTCATCAGAATCATCTTCCCCCTCATCATCTTCATCATCAAAATCC
TCTTCATCAGCCTCATTGTTGAAGTAGGTGAGAGGGTTGGCCCATAAATCTTCCTTGATG
ATATCCGCAACCTCGTCGTGAATCTCAACTTCAACGTCTTCTTCCTTGCGTTGACCATCG
CTAAACCAGGTAAAGAAACTCTCTTCAGGCAATGCACGTTTGTTTCCATTCTTCTCGTGG
TCCACACCATTTGGCAAGCCCTT*GCCCTCTTTCCACTTGATAGGTGTGGCTGAGATTTT
GGTT*GTCCCTTCGTCGAGGAAGGTAAAGGTCTTGGTTAGTTTCCCATCCTCAAAATAAG
GG*TTGGCATTGAAGTTAAAAGTGATAGAGTATCCAGACTTCACATCTTTGGCATCCTCA
ACATCCAGAGAGCTTAGATATTTGAATATCTTCTGGTCTTCTTCAGTCAAAAGATCAC
AAGA

QA 1 778 1 778
DS 

RD RS1GB89JQ 710 0 0
GG
CAATAAAAAACATTTTAAGCGGGACTCTGCAACAAAAGACTGAAAATGGTACTCCTAGAA
ACAAAAGATTATAATAGCTAAAAATGTATTTTTCTCGAAGCATATGAAAAAGCTAAGTCT
TGTATGTTATTGTCATGAGCCATTTTAATTAAAATTAAAACCCTTTCAACACACTCTGTT
ATAGAAGAAAGACATGTAAGCAAATGTGGTTTCCGGGGAAAGCCTCTCCCATCATTCCTC
ACCATCTTCGCCTTCTCTTTCATCGTCTTCATCAGAATCACCTTCCCCCTCATCATCTTC
ATCATCAAAATCCTCTTCATCAGCCTCATTGTTGAAGTAGGTGAGAGGGTTGGCCCATAA
ATCTTCCTTGATGATATCCGCAACCTCGTCGTGAATCTCAACTTCAACGTCTTCTTCCTT
GTGTTGACCATCGCTAAACCAGGTAAAGAAACTCTCTTCAGGCAATGCACGTTTGTTTCC
ATTCTTCTCGTGGTCCACACCATTTGGCAAGCCCTT*GCCCTCTTTCCACTTGATAGGTG
TGGCTGAGATTTTGGTT*GTCTCTTCGTCGAGGAAGGTAAAGGTCTTGGTTAGTTTCCCA
TCCTCAAAATAAGGGGTTGGCATTGAAGTTAAAAGTGATAGAGTATCCAGACTTCACATC
TTAGGCATCCTCAACATCCAGAGAGCTTAGATATTTGAATATCTTCTG

QA 3 710 3 710
DS 

RD RS1DB26JQ 686 0 0
ACTCCTAGAAACAAAAGATTATAATAGCTAAAAATGTATTTTTCTCGAAGCATATGAAAA
AGCTAAGTCTTGTATGTTATTGTCATGAGCCATTTTAATTAAAATTAAAACCCTTTCAAC
ACACTCTGTTATAGAAGAAAGACATGTAAGCAAATGTGGTTTCCGGGGAAAGCCTCTCCC
ATCATTCCTCACCATCTTCGCCTTCTCCTTCATCGTCTTCATCAGAATCACCTTCCCCCT
CATCATCTTCATCATCAAAATCCTCTTCATCAGCCTCATTGTTGAAGTAGGTGAGAGGGT
TGGCCCATAAATCTTCCTTGATGATATCCGCAACCTCGTCGTGAATCTCAACTTCAACGT
CTTCTTCCTTGTGTTGACCATCGCTAAACCAGGTAAAGAAACTCTCTTCAGGCAATGCAC
GTTTGTTTCCATCCTTATCGTGGTCCACACCATTTGGCAAGCCCTT*GCCCTCTTTCCAC
TTGATAGGTGTGGCTGAGATTTTGGTT*GTCCCTTCGTCGAGGAAGGTAAAGGTCTTGGT
TAGTTTCCCATCCTCAAAATAAGGG*TTGGCATTGAAGTTAAAAGTGATAGAGTATCCAG
ACTTCACATCTTTGGCATCCTCAACATCCAGAGAGCTTAGATATTTGAATATCTTCTGGT
CTTCTTCAGTCAAGAGATCACCAAGA

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1AB56JQ 755 0 0
TATTGTCATGAGCCATTTTAATTAAAATTAAAACCCTTTCAACACACTCTGTTATAGAAG
AAAGACATGTAAGCAAATGTGGTTTCCGGGGAAAGCCTCTCCCATCATTCCTCACCATCT
TCGCCTTCTCCTTCATCGTCTTCATCAGAATCACCTTCCCCCTCATCATCTTCATCATCA
AAATCCTCTTCATCAGCCTCATTGTTGAAGTAGGTGAGAGGGTTGGCCCATAAATCTTCC
TTGATGATATCCGCAACCTCGTCGTGAATCTCAACTTCAACATCTTCTTCCTTGTGTTGA
CCATCGCTAAACCAGGTAAAGAAACTCTCTTCAGGCAATGCACGTTTGTTTCCATTCTTC
TCGTGGTCCACACCATTTGGCAAGCCCTTTGCCCTCTTTCCACTTGATAGGTGTGGCTGA
AATTTTGGTTTGTCCCTTCGTCGAGGAAGGTAAAGGTCTTGGTTAGTTTCCCATCCTCAA
AATAAGGG*TTGGCATTGAAGTTAAAAGTGATAGAGTATCCAGACTTCACATCTTTGGCA
TCCTCAACATCCAGAGAGCTTAGATATTTGAATATCTTCTGGTCTTCTTCAGTCAAGAGA
TCACCAAGAGCAGGGTGGCTCAGGAAAGCAGTGAGCCAGAAATCAGGGATGGCTTTGATG
ATATCGGCACGCTTGTCATAGACAGGCTTTCTTATACCGTTGTACTTCTGCTCCACTTCC
AACACTTCATCGCTAGCCTTCTCGTTTATCTTCTC

QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1D975TF 527 0 0
TCGAGGAAGGTAAAGGTCTTGGTTAGTTTCCCATCCTCAAAATAAGGG*TTGGCATTGAA
GTTAAAAGTGATAGAGTATCCAGACTTCACATCTTTGGCATCCTCAACATCCAGAGAGCT
TAGATATTTGAATATCTTCTGGTTTTCTTCAGTCAAAAGATCACCAAGAGCAGGGTGGCT
CAAGAAAGCAGTGAGCCAGAAATCAGGGATGGCTTTGATGATATCGGCACGCTTGTCATA
GACAGGCTTTCTTATACCGTTGTACTTCTGCTCCACTTCCAACACTTCATCGCTAGCCTT
CTCGTTTATCTTCTCGAGGTCGTCTTGAATGGACTGAAGCTTTTCGATAGAAAGGAGAAG
CTCTCCGTCGATTTGCTCGGCGTTCTCCTCATCGGTCTTCGCCTTCTTGCTCTTGTTGTC
CGCCACCATTCTCACTT*****ACCCTAATTTGCAAATCTCTCAGAGAGTTTCGACTCCT
CCTTTGCTCTCTCTCTTGCTTTTTAGTTCCGTCACACGAGC
AACTCC

QA 1 521 1 521
DS 

RD RS1DF52TF 646 0 0
AAAGAAACTCTCTTCAGGCAATGCACGTTTGTTTCCATTCTTCTCGTGGTCCACACCATT
TGGCAAGCCCTT*GCCCTCTTTCCACTTGATAGGTGTGGCTGAGATTTTGGTT*GTCCCT
TCGTCGAGGAAGGTAAAGGTCTTGGTTAGTTTCCCATCCTCAAAATAAGGG*TTGGCATT
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GCTTAGATATTTGAATATCTTCTGGTCTTCTTCAGTCAAAAGATCACCAAGAGCAGGGTG
GCTCAAGAAAGCAGTGAGCCAGAAATCAGGGATGGCTTTGATGATATCGGCACGCTTGTC
ATAGACAGGCTTTCTTATACCGTTGTACTTCTGCTCCACTTCCAACACTTCATCGCTAGC
CTTCTCGTTTATCTTCTCGAGGTCGTCTTGAATGGACTGAAGCTTTTCGATAGAAAGGAG
AAGCTCTCCGTCGATTTGCTCGGCGTTCTCCTCATCGGTCTTCGCCTTCTTGCTCTTGTT
GTCCGCCACCATTCTCACTTTTTTTACCCTAATTTGCAAATCTCTCAGAGAGTTTCGACT
CCTCCTTTGCTCTCTCTCTTGCTTTT*AGTTCCGTCACACGAGC
CC

QA 1 644 1 644
DS 

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AAACTCTCTTCAGGCAATGCACGTTTGTTTCCATTCTTCTCGTGGTCCACACCATTTGGC
AAGCCCTT*GCCCTCTTTCCACTTGATAGGTGTGGCTGAGATTTTGGTT*GTCCCTTCGT
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AGATATTTGAATATCTTCTGGTCTTCTTCAGTCAAGAGATCACCAAGAGCAGGGTGGCTC
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ACAGGCTTTCTTATACCGTTGTACTTCTGCTCCACTTCCAACACTTCATCGCTAGCCTTC
TCGTTTATCTTCTCGAGGTCGTCTTGAATGGACTGAAGCTTTTCGATAGAAAGGAGAAGC
TCTCCGTCGATTTGCTCGGCGTTCTCCTCATCGGTCTTCGCCTTCTTGCTCTTGTTGTCC
GCCACCATTCTCACTTTTTTTACCCTAATTTGCAAATCTCTCAGAGAGTTTCGACTCCTC
CTTTGCTCTCTCTCTCGCTTTTTAGTTCCGTCACACGAGC
CCC

QA 1 700 1 700
DS 

RD RS1CY25TF 725 0 0
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ATCGCTAAACCAGGTAAAGAAACTCTCTTCAGGCAATGCACGTTTGTTTCCATTCTTCTC
GTGGTCCACACCATTTGGCAAGCCCTT*GCCCTCTTTCCACTTGATAGGTGTGGCTGAGA
TTTTGGTT*GTCCCTTCGTCGAGGAAGGTAAAGGTCTTGGTTAGTTTCCCATCCTCAAAA
TAAGGG*TTGGCATTGAAGTTAAAAGTGATAGAGTATCCAGACTTCACATCTTTGGCATC
CTCAACATCCAGAGAGCTTAGATATTTGAATATCTTCTGGTCTTCTTCAGTCAAGAGATC
ACCAAGAGCAGGGTGGCTCAAGAAAGCAGTGAGCCAGAAATCAGGGATGGCTTTGATGAT
ATCGGCACGCTTGTCATAGACAGGCTTTCTTATACCGTTGTACTTCTGCTCCACTTCCAA
CACTTCATCGCTAGCCTTCTCGTTTATCTTCTCGAGGTCGTCTTGAATGGACTGAAGTTT
TTCGATAGAAAGGAGAAGCTCTCCGTCGATTTGCTCGGCGTTCTCCTCATCGGTCTTCGC
CTTCTTGCTCTTGTTGTCCGCCACCATTCTCACTTTTTTTACCCTAATTTGCAAATCTCT
CAGAGAGTTTCGACTCCTCCTTTGCTCTCTCTCTTGCTTTTTAGTTCCGTCACACGAGCA
ACTCC

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 13

CO CL132Contig1 802 13 9 U
GGACATCCAAATCCAATAGCAACAAAAAA*GGGTCTGCTCCTTAGTTTCATATACAATCT
TTAGCAATCTTAACAACATGTCAATGTTCATCAAGAACAAGAACATGGCCTTCTCACTGA
TCTTGATGTGTTTCATTGTGGTGTCTCCAATGGCCAATGCTCAATTTGGTGGGCTTCCTG
GGACTAATATCGTCAATATACAAGGGCTTGTCACGTGCTCTATCAATGGCAGCGTCTCTA
CTAATGGGACTGTCATTCCTCCTTTCGCCGGTGTACCCGTTGTGCTTCAGTGTGCTGGGC
AAAATGTTTCAACTACGACTACGGGAGCTAATGGAGTATTCTCGTTTCCTTCCACTACAG
TATTTCCGATCTCGCTGCTTTCCACACTCCTTGCCTCCGGTTGTAGGGTCATTGTCACGG
CCCCTCTCTCCAGATGCAACGCCAGCCTCCCTACCAACGGACTCCTCACGGCACCGGTAA
ATCTCGTAGGAAGCACCGTAACCGGCGGCATCAGCATCTTGCAATTCGTCAATGGCCTCT
TTAGGCTCCTCTAACTGATTTAAAACCAAGTCTCCCTTCTTGGTTTGGTTACGGTGTTTT
TCCTTTCTGTTGTTTTATGTTTTGTGTCATGGCCATTAACATGTATGCTTACGTATGCAT
GCATGAAATAAGGTCTATTATGCGTATGTCTCTACTTTCAAAGTATTGTGGTTGTAACTT
CTTGTCCAGGTCTTCATTTGCATGCATAGTGCTGCAATGAAATGTAACGAATGAAAATAA
AATAGTTTCCCTTTTAAAAAAA


BQ
30 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 35 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 70 70 70 70 70 
70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 
35 65 65 65 65 65 60 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A840JQ C 372
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ATCT

QA 1 484 1 484
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GCATGAA

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TATGAAA

QA 1 667 1 667
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GCATGAAA

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1AV94TF 687 0 0
GG
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TCTCCCCAGATGCAACGCCAGCCTCCCTACCAACGGACTCCTCACGGCACCGGTAAATCT
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GAAATAAG*TCTATTATGCGTATGT

QA 3 687 3 687
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DS 

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TAGCAATCTTAACAACATGTCAATGTTCATCAAGAACAAGAACATGGCCTTCTCACTGAT
CTTGATGTGTTTCATTGTGGTGTCTCCAATGGCCAATGCTCAATTTGGTGGGCTTCCTGG
GACTAATATCGTCAATATACAAGGGCTTGTCACGTGCTCTATCAATGGCAGCGTCTCTAC
TAATGGGACTGTCATTCCTCCTTTCGCCGGTGTACCCGTTGTGCTTCAGTGTGCTGGGCA
AAATGTTTCAACTACGACTACGGGAGCTAATGGAGTATTCTCGTTTCCTTCCACTACAGT
ATTTCCGATCTCGCTGCTTTCCACACTCCTTGCCTCCGGTTGTAGGGTCATTGTCACGGC
CCCTCTCTCCAGATGCAACGCCAGCCTCCCTACCAACGGACTCCTCACGGCACCGGTAAA
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CCTTTCTGTTGTTTTATGTTTTGTGTCATGGCCATTAACATGTATGCTTACGTATGCATG
CATGAAATAAGGTCTATTATGCGTATGTCTCTACTTTCAAAGTATTGTGGTTGTAACTTC
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TGAAAA

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DS 

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TTAGCAATCTTAACAACATGTCAATGTTCATCAAGAACAAGAACATGGCCTTCTCACTGA
TCTTGATGTGTTTCATTGTGGTGTCTCCAATGGCCAATGCTCAATTTGGTGGGCTTCCTG
GGACTAATATCGTCAATATACAAGGGCTTGTCACGTGCTCTATCAATGGCAGCGTCTCTA
CTAATGGGACTGTCATTCCTCCTTTCGCCGGTGTACCCGTTGTGCTTCAGTGTGCTGGGC
AAAATGTTTCAACTACGACTACGGGAGCTAATGGAGTATTCTCGTTTCCTTCCACTACAG
TATTTCCGATCTCGCTGCTTTCCACACTCCTTGCCTCCGGTTGTAGGGTCATTGTCACGG
CCCCTCTCTCCAGATGCAACGCCAGCCTCCCTACCGACGGACTCCTCACGGCACCGGTAA
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TCCTTTCTGTTGTTTTATGTTTTGTGTCATGGCCATTAACATGTATGCTTACGTATGCAA
GCATGAAATAAGGTCTATTATGCGTATGTCTCTACTTTCAA*GTATTGTGGTTGTAACTT
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AATAGTTTCCC

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DS 

RD RS1AV94JQ 749 0 0
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TGGTGGGCTTCCTGGGACTAATATCGTCAATATACAAGGGCTTGTCACGTGCTCTATCAA
TGGCAGCGTCTCTACTAATGGGACTGTCATTCCTCCTTTCGCCGGTGTACCCGTTGTGCT
TCAGTGTGCTGGGCAAAATGTTTCAACTACGACTACGGGAGCTAATGGAGTATTCTCGTT
TCCTTCCACTACAGTATTTCCGATCTCGCTGCTTTCCACACTCCTTGCCTCCGGTTGTAG
GGTCATTGTCACGGCCCCTCTCCCCAGATGCAACGCCAGCCTCCCTACCAACGGACTCCT
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GGTTACGGTGTTTTTCCTTTCTGTTGTTTTATGTTTTGTGTCATGGCCATTAACATGTAT
GCTTACGTATGCATGCATGAAATAAGGTCTATTATGCGTATGTCTCTACTTTCAAAGTAT
TGTGGTTGTAACTTCTTGTCCAGGTCTTCATTTACATGCATAGTGCTGCAATGAAATGTA
ACGAATGAAAATAAAATAGTTTCCCTTT
T

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DS 

RD RS1CU15JQ 756 0 0
TTCATATACAATCTTTAGCAATCTTAACAACATGTCAATGTTCATCAAGAACAAGAACAT
GGCCTTCTCACTGATCTTGATGTGTTTCATTGTGGTGTCTCCAATGGCCAATGCTCAATT
TGGTGGGCTTCCTGGGACTAATATCGTCAATATACAAGGGCTTGTCACGTGCTCTATCAA
TGGCAGCGTCTCTACTAATGGGACTGTCATTCCTCCTTTCGCCGGTGTACCCGTTGTGCT
TCAGTGTGCTGGGCAAAATGTTTCAACTACGACTACGGGAGCTAATGGAGTATTCTCGTT
TCCTTCCACTACAGTATTTCCGATCTCGCTGCTTTCCACACTCCTTGCCTCCGGTTGTAG
GGTCATTGTCACGGCCCCTCTCTCCAGATGCAACGCCAGCCTCCCTACCAACGGACTCCT
CACGGCACCGGTAAATCTCGTAGGAAGCACCGTAACCGGCGGCATCAGCATCTTGCAATT
CGTCAATGGTCTCTTTAGGCTCCTCTAACTGATTTAAAACCAAGTCTCCCTTCTTGGTTT
GGTTACGGTGTTTTTCCTTTCTGTTGTTTTATGTTTTGTGTCATGGCCATTAACATGTAT
GCTTACGTATGCATGTATGAAATAAGGTCTATTATGCGTATGTCTCTACTTTCAAAGTAT
TGTGGTTGTAACTTCTTGTCCAGGTCTTCATTTGCATGCATAGTGCTGCAATGAAATGTA
ACGAATGAAAATAAAATAGTTTCCCTTTTAAAAAAA

QA 1 756 1 756
DS 

RD RS1C851TF 519 0 0
G
CCGTTGTGCTTCAGTGTGCTGGGCAAAATGTTTCAACTACGATTACGGGAGCTAATGGAG
TATTCTCGTTTCCTTCCACTACAGTATTTCCGATCTCGCTGCTTTCCACACTCCTTGCCT
CCGGTTGTAGGGTCATTGTCACGGCCCCTCTCTCCAGATGCAACGCCAGCCTCCCTACCA
ACGGACTCCTCACGGCACCGGTAAATCTCGTAGGAAGCACCGTAACCGGCGGCATCAGCA
TCTTGCAATTCGTCAATGGCCTCTTTAGGCTCCTCTAACTGATTTAAAACCAAGTCTCCC
TTCTTGGTTTGGTTACGGTGTTTTTCCTTTCTGTTGTTTTATGTTTTGTGTCATGGCCAT
TAACATGTATGCTTACGTATGCATGCATGAAATAAGGTCTATTATGCGTATGTCTCTACT
TTCAAAGTATTGTGGTTGTAACTTCTTGTCCAGGTCTTCATTTGCATGCATAGTGCTGCA
ATGAAATGTAACGAATGAAAATAAAATAGTTTCCCTTT

QA 2 519 2 519
DS 

RD RS1G738JQ 565 0 0
TCTCTACTAATGGGACTGTCATTCCTCCTTTCGCCGGTGTACCCGTTGTGCTTCAGTGTG
CTGGGCAAAATGTTTCAACTACGACTACGGGAGCTAATGGAGAATTCTCGTTTCCTTCCA
CTACAGTATTTCCGATCTCGCTGCTTTCCACACTCCTTGCCTCCGGTTGTAGGGTCATTG
TCACGGCCCCTCTCTCCAGATGCAACGCCAGCCTCCCTACCAACGGACTCCTCACGGCAC
CGGTAAATCTCGTAGGAAGCACCGTAACCGGCGGCATCAGCATCTTGCAATTCGTCAATG
GCCTCTTTAGGCTCCTCTAACTGATTTAAAACCAAGTCTCCCTTCTTGGTTTGGTTACGG
TGTTTTTCCTTTCTGTTGTTTTATGTTTTGTGTCATGGCCATTAACATGTATGCTTACGT
ATGCATGCATGAAATAAGGTCTATTATGCGTATGTCTCTACTTTCAAAGTATTGTGGTTG
TAACTTCTTGTCCAGGTCTTCATTTGCATGCATAGTGCTGCAATGAAATGTAACGAATGA
AAGTAAAATAGTTTCCCTTT
TATGT

QA 1 560 1 560
DS 



AS 1 13

CO CL133Contig1 933 13 17 U
GGAAAGTGTTCTTAAAATTTTTGAAAGGTATAAGAGCAACAGAACAAATCATATAACTAT
AGAAGGTGACACTATTGCAACGAACAATATTACTGCTAAGCTAAAA*CAAATTTTAATTC
CATCTTTCGTTTGTTTTTTCCTCTAAATCCTTCCCTTGTAGCTGCATAACTTTTGTCAAA
TGTAAAAATAGTCCAAAATGATTTTCTAAAAAAAAAAAAA*CAAATGTTTTGTTGTTTTG
CAATGGCCAACATTCATCATAAAAGTTGGTCAGTTCAGTCCGCATTACGTGGGCCGCTGG
CGCTTCGTCCACCATATTTCTGTTTGCCGAAGCTGAAAGGGATGTACTTGTACTTGATCA
TGTGGGAGATCTGGCGTCTCATGGTGAGAACAAAGAGAACGATCCAATAGCAAAGCAGGA
TAGGCCAGAACACAGGCACGTCAAACACCGAGAAGAACGTCATCACAAACGCAATGCAGA
ACGCCTTTGTCATCGAATACCAGAACTTGAACTCAGGGAGACGGCGGATGAAAGGCTTGA
ACTCATCAGAGCCTCTAGTAGGAAGCGAAGGTCCATCAGATCCCCCACCAGCAGCCTCGG
GATCAACGAGAGGGGACAAGAACCCGATGAGGAGATTCAAGAGGTAGATCCCGAGACCGT
AAGCGATGATGTAGAATCCCTGGATGTAGTAAACCCTCAGACAGTAGGCGAGGGCCACGA
CGAGAGTCCCGATCCACCTGTAAGTAGCGTGAGGCGTGGTCTTGTCGAGGTAATGCTGGT
AGATTCTCCACGCCTCGTGTGCTTTCTGTTGAACCGGGGTCGCCACTGAACCACTATCAC
CTCCTCCGCCGCCGTCCATGGGAAGAAGATGAGAGATGCTTATCCAGAAATGGAGCAGAT
CTGACGAAAGACGCAACAAAACGCGAAAATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 5 50 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 15 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 55 55 55 60 60 60 60 60 60 45 20 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 35 60 60 60 
60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 50 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 
65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 40 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 30 70 70 25 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 35 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 30 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

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TGTAAAAATAATCCAAAATGATTTTCT

QA 1 207 1 207
DS 

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AGTAGGAAGCGAAGGTCCATCAGATCCCCCACC

QA 1 513 1 513
DS 

RD RS1H765JQB 467 0 0
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TTTCCTCTAAATCCTTCCCTTGTAGCTGCATAATTTTCGTCAAATGTAAAAACAGTCCAA
AATGATTTTCTAAAAAAAAAA****CAAATGTTTTGTTCTTTTGCAATGGCCAACATTCA
TCATAAAAATTGGTCAGATCAGTCCGCATTACGTGGGCCGCTGCCGCTTCGTCCACCATA
TTTCTGTTTGCCGAAGCTGAAAGGGATGTACTTGTACTTGATCATGTGGGAGATCTGGCG
TCTCATGGTGAGAACAAAGAGAACGATCCAATAGCAAAGCAGGATAGGCCAGAACACAGG
CACGTCAAACACCGAGAAGAACGTCATCACAAACGCAATACAGAACGCCTTTGTCATCGA
ATACCAGAACTTGAACTCAGGGAGACGGCGGATGAAAGGCTTGAACT

QA 1 467 1 467
DS 

RD RS1CQ16TF 621 0 0
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**CAAATGTTTTGTTCTTTTGCAATGGCCAACATTCATCATAAAAGTTGGTCAGATCAGT
CCGCATTACGTGGGCCGCTGCCGCTTCGTCCACCATATTTCTGTTTGCCGAAGCTGAAAG
GGATGTACTTGTACTTGATCATGTGGGAGATCTGGCGTCTCATGGTGAGAACAAAGAGAA
CGATCCAATAGCAAAGCAGGATAGGCCAGAACACAGGCACGTCAAACACCGAGAAGAACG
TCATCACAAACGCAATACAGAACGCCTTTGTCATCGAATACCAGAACTTGAACTCAGGGA
GACGGCGGATGAAAGGCTTGAACTCATCAGAGCCTCTAGTAGGAAGCGAAGGTCCATCAG
ATCCCCCACCAGCAGCCTCTGGATCAACGAGAGGGGACAAGAACCCGATGAGGAGATTCA
GCAGGTAGATCCCGAGACCGTAAGCGATGATGTAGAATCCCTGGATGTAGTAAACCCTCA
AACAGTAGGCGAGGGCCACGACGAGAGTCCCGTTCCACCTGTAAGTAGCGTGAGGCGTAG
TCTTGTCGAGGTAATGCTGGT

QA 1 621 1 621
DS 

RD RS1CX92JQ 744 0 0
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TTTCCTCTAAATCCTTCCCTTGTAGCTGCATAACTTTTGTCAAATGTAAAAATAGTCCAA
AATGATTTTCTAAAAAAAAAAAAAACAAATGTTTTGTTGTTTTGCAATGGCCAACATTCA
TCATAAAAGTTGGTCAGTTCAGTCCGCATTACGTGGGCCGCTGGCGCTTCGTCCACCATA
TTTCTGTTTGCCGAAGCTGAAAGGGATGTACTTGTACTTGATCATGTGGGAGATCTGGCG
TCTCATGGTGGGAACAAAGAGAACGATCCAATAGCAAAGCAGGATAGGCCAGAACACAGG
CACGTCAAACACCGAGAAAAACGTCATCACAAACGCAATGCAAAACGCCTTTGTCATCGA
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AGTAGGAAGCGAAGGTCCATCAAATCCCCCACCAGCAGCCTCGGGATCAACGAGAGGGGA
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GTGTGCTTTCTGTTGAACCGGGGT

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DS 

RD RS1B087JQ 772 0 0
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TTTCCTCTAAATCCTTCCCTTGTAGCTGCATAACTTTTGTCAAATGTAAAAATAGTCCAA
AATGATTTTCTAAAAAAAAAAAAAACAAATGTTTTGTTGTTTTGCAATGGCCAACATTCA
TCATAAAAGTTGGTCAGTTCAGTCCGCATTACGTGGGCCGCTGGCGCTTCGTCCACCATA
TTTCTGTTTGCCGAAGCTGAAAGGGATGTACTTGTACTTGATCATGTGGGAGATCTGGCG
TCTCATGGTGGGAACAAAGAGAACGATCCAATAGCAAAGCAGGATAGGCCAGAACACAGG
CACGTCAAACACCGAGAAGAACGTCATCACAAACGCAATGCAAAACGCCTTTGTCATCGA
ATACCAAAACTTGAACTCAGGGAGACGGCGGATGAAAGGCTTGAACTCATCAGAGCCTCT
AGTAGGAAGCGAAGGTCCATCAGATCCCCCACCAGCAGCCTCGGGATCAACGAGAGGGGA
CAAGAACCCGATGAGGAGATTCAAGAGGTAGATCCCGAGACCGTAAGCGATGATGTAGAA
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GTGTGCTTTCTGTTGAACCGGGGTCGCCACTGAACCACTATCACCTCCTCCG

QA 1 772 1 772
DS 

RD RS1DN81JQ 779 0 0
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TTTCCTCTAAATCCTTCCCTTGTAGCTGCATAACTTTTGTCAAATGTAAAAATAGTCCAA
AATGATTTTCTAAAAAAAAAAAAA*CAAATGTTTTGTTGTTTTGCAATGGCCAACATTCA
TCATAAAAGTTGGTCAGTTCAGTCCGCATTACGTGGGCCGCTGGCGCTTCGTCCACCATA
TTTCTGTTTGCCGAAGCTGAAAGGGATGTACTTGTACTTGATCATGTGGGAGATCTGGCG
TCTCATGGTGAGAACAAAGAGAACGATCCAATAGCAAAGCAGGATAGGCCAGAACACAGG
CACGTCAAACACCGAGAAGAACGTCATCACAAACGCAATGCAAAACGCCTTTGTCATCGA
ATACCAGAACTTGAACTCAGGGAGACGGCGGATGAAAGGCTTGAACTCATCAGAGCCTCT
AGTAGGAAGCGAAGGTCCATCAAATCCCCCACCAGCAGCCTCGGGATCAACGAGAGGGGA
CAAGAACCCGATGAGGAGATTCAAGAGGTAGATCCCGAGACCGTAAGCGATGATGTAGAA
TCCCTGGATGTAGTAAACCCTCAGACAGTAGGCGGGGGCCACGACGAGAGTCCCGATCCA
CCTGTAAGTAGCGTGAGGCGTGGTCTTGTCGAGGTAATGCTGGTAGATTCTCCACGCCTC
GTGTGCTTTCTGTTGAACCGGGGTCGCCACTGAACCACTATCACCTCCTCCGCCGCCGT

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DS 

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AAGCTAAAA*CAAATTTTAATTCCATCTTTCGTTTGTTTTTTCCTCTAAATCCTTCCCTT
GTAGCCGCATAACTTTTGTCAAATGTAAAAATAGTCCAAAATGATTTTCTAAAAAAAAAA
A***CAAATGTTTTGTTGTTTTGCAATGGCCAACATTCATCATAAAAGTTGGTCAGTTCA
GTCCGCATTACGTGGGCCGCTGGCGCTTCGTCCACCATATTTCTGTTTGCCGAAGCTGAA
AGGGATGTACTTGTACTTGATCATGTGGGAGATCTGGCGTCTCATGGTGAGAACAAAGAG
AACGATCCAATAGCAAAGCAGGATAGGCCAGAACACAGGCACGTCAAACACCGAGAAGAA
CGTCATCACAAACGCAATGCAGAACGCCTTTGTCATCGAATACCAGAACTTGAACTCAGG
GAGACGGCGGATGAAAGGCTTGAACTCATCAGAGCCTCTAGTAGGAAGCGAAGGTCCATC
AGATCCCCCACCAGCAGCCTCGGGATCAACGAGAGGGGACAAGAACCCGATGAGGAGATT
CAAGAGGTAGATCCCGAGACCGTAAGCGATGATGTAGAATCCCTGGATGTAGTAAACCCT
CAGACAGTAGGCGAGGGCCACGACGAGCGTCCCGATCCACCTGTAAGTAGCGTGAGGCGT
GGTCTTGTCGAGGTAATGCTGGTAGATTCTCCACGCCTCGTGTGCTTTCTGTTGAACCGG
GGTCGCCACTGAACCACTATCACCTCCTCCGCCGCCGTCCA

QA 1 761 1 761
DS 

RD RS1B087TF 680 0 0
T
AAAAAAAAAAAAACAAATGTTTTGTTGTTT*GCAATGGCCAACATTCATCATAAAAGTTG
GTCAGTTCAGTCCGCATTACGTGGGCCGCTGGCGCTTCGTCCACCATATTTCTGTTTGCC
GAAGCTGAAAGGGATGTACTTGTACTTGATCATGTGGGAGATCTGGCGTCTCATGGTGGG
AACAAAGAGAACGATCCAATAGCAAAGCAGGATAGGCCAGAACACAGGCACGTCAAACAC
CGAGAAGAACGTCATCACAAACGCAATGCAGAACGCCTTTGTCATCGAATACCAGAACTT
GAACTCAGGGAGACGGCGGATGAAAGGCTTGAACTCATCAGAGCCTCTAGTAGGAAGCGA
AGGTCCATCAGATCCCCCACCAGCAGCCTCGGGATCAACGAGAGGGGACAAGAACCCGAT
GAGGAGATTCAAGAGGTAGATCCCGAGACCGTAAGCGATGATGTAGAATCCCTGGATGTA
GTAAACCCTCAGACAGTAGGCGAGGGCCACGACGAGAGTCCCGATCCACCTGTAAGTAGC
GTGAGGCGTGGTCTTGTCGAGGTAATGCTGGTAGATTCTCCACGCCTCGTGTGCTTTCTG
TTGAACCGGGGTCGCCACTGAACCACTATCACCTCCTCCGCCGCCGTCCATGGGAAGAAG
ATGAGAGATGCTTATCC
CC

QA 2 678 2 678
DS 

RD RS1CX92TF 676 0 0
AAAAAAAAAACAAATGTTTTGTTGTTT*GCAATGGCCAACATTCATCATAAAAGTTGGTC
AGTTCAGTCCGCATTACGTGGGCCGCTGGCGCTTCGTCCACCATATTTCTGTTTGCCGAA
GCTGAAAGGGATGTACTTGTACTTGATCATGTGGGAGATCTGGCGTCTCATGGTGGGAAC
AAAGAGAACGATCCAATAGCAAAGCAGGATAGGCCAGAACACAGGCACGTCAAACACCGA
GAAGAACGTCATCACAAACGCAATGCAGAACGCCTTTGTCATCGAATACCAGAACTTGAA
CTCAGGGAGACGGCGGATGAAAGGCTTGAACTCATCAGAGCCTCTAGTAGGAAGCGAAGG
TCCATCAGATCCCCCACCAGCAGCCTCGGGATCAACGAGAGGGGACAAGAACCCGATGAG
GAGATTCAAGAGGTAGATCCCGAGACCGTAAGCGATGATGTAGAATCCCTGGATGTAGTA
AACCCTCAGACAGTAGGCGAGGGCCACGACGAGAGTCCCGATCCACCTGTAAGTAGCGTG
AGGCGTGGTCTTGTCGAGGTAATGCTGGTAGATTCTCCACGCCTCGTGTGCTTTCTGTTG
AACCGGGGTCGCCACTGAACCACTATCACCTCCTCCGCCGCCGTCCATGGGAAGAAGATG
AGAGATGCTTATCC
CC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1BW92TF 729 0 0
TCAAATGTAAAAATAGTCCAAAATGATTTTCTAAAAAAAAAAA***CAAATGTTTTGTTG
TTTTGCAATGGCCAACATTCATCATAAAAGTTGGTCAGTTCAGTCCGCATTACGTGGGCC
GCTGGCGCTTCGTCCACCATATTTCTGTTTGCCGAAGCTGAAAGGGATGTACTTGTACTT
GATCATGTGGGAGATCTGGCGTCTCATGGTGAGAACAAAGAGAACGATCCAATAGCAAAG
CAGGATAGGCCAGAACACAGGCACGTCAAACACCGAGAAGAACGTCATCACAAACGCAAT
GCAGAACGCCTTTGTCATCGAATACCAGAACTTGAACTCAGGGAGACGGCGGATGAAAGG
CTTGAACTCATCAGAGCCTCTAGTAGGAAGCGAAGGTCCATCAGATCCCCCACCAGCAGC
CTCGGGATCAACGAGAGGGGACAAGAACCCGATGAGGAGATTCAAGAGGTAGATCCCGAG
ACCGTAAGCGATGATGTAGAATCCCTGGATGTAGTAAACCCTCAGACAGTAGGCGAGGGC
CACGACGAGCGTCCCGATCCACCTGTAAGTAGCGTGAGGCGTGGTCTTGTCGAGGTAATG
CTGGTAGATTCTCCACGCCTCGTGTGCTTTCTGTTGAACCGGGGTCGCCACTGAACCACT
ATCACCTCCTCCGCCGCCGTCCATGGGAAGAAGATGAGAGATGCTTATCCAGAAATGGAG
CAGATCT
CC

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1DN81TF 685 0 0
CCAACATTCATCATAAAAGTTGGTCAGTTCAGTCCGCATTACGTGGGCCGCTGGCGCTTC
GTCCACCATATTTCTGTTTGC*GAAGCTGAAAGGGATGTACTTGTACTTGATCATGTGGG
AGATCTGGCGTCTCATGGTGAGAACAAAGAGAACGATCCAATAGCAAAGCAGGATAGGCC
AGAACACAGGCACGTCAAACACCGAGAAGAACGTCATCACAAACGCAATGCAGAACGCCT
TTGTCATCGAATACCAGAACTTGAACTCAGGGAGACGGCGGATGAAAGGCTTGAACTCAT
CAGAGCCTCTAGTAGGAAGCGAAGGTCCATCAGATCCCCCACCAGCAGCCTCGGGATCAA
CGAGAGGGGACAAGAACCCGATGAGGAGATTCAAGAGGTAGATCCCGAGACCGTAAGCGA
TGATGTAGAATCCCTGGATGTAGTAAACCCTCAGACAGTAGGCGGGGGCCACGACGAGAG
TCCCGATCCACCTGTAAGTAGCGTGAGGCGTGGTCTTGTCGAGGTAATGCTGGTAGATTC
TCCACGCCTCGTGTGCTTTCTGTTGAACCGGGGTCGCCACTGAACCACTATCACCTCCTC
CGCCGCCGTCCATGGGAAGAAGATGAGAGATGCTTATCCAGAAATGGAGCAGATCTGACG
AAAGACGCAACAAAACGCGAAA
TCC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1G145TF 474 0 0
TCATCACAAACGCAATGCAGAACGCCTTTGTCATCGAATACCAGAACTTGAACTCAGGGA
GACGGCGGATGAAAGGCTTGAACTCATCAGAGCCTCTAGTAGGAAGCGAAGGTCCATCAG
ATCCCCCACCAGCAGCCTCGGGATCAACGAGAGGGGACAAGAACCCGATGAGGAGATTCA
AGAGGTAGATCCCGAGACCGTAAGCGATGATGTAGAATCCCTGGATGTAGTAAACCCTCA
GACAGTAGGCGAGGGCCACGACGAGAGTCCCGATCCACCTGTAAGTAGCGTGAGGCGTGG
TCTTGTCGAGGTAATGCTGGTAGATTCTCCACGCCTCGTGTGCCTTCTGTTGAACCGGGG
TCGCCACTGAACCACTATCACCTCCTCCGCCGCCGTCCATGGGAAGAAGATGAGAGATGC
TTATCCAGAAATGGAGCAGATCTGACGAAAGACGCAACAAAACGCGAAAATCCC

QA 1 474 1 474
DS 



AS 3 9

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ATCCGAAAAGCTTCTTCACTCCTGTCTTCTGCTCTAAGGTTAATCTCGTGGGGAACTTGA
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CCTTTGGAATCACTTCCTCGTACTCGGGGTGGATCACACTGGTGACTGGAATTGTTAGTC
TCCGGCCATCAAGTGTTATCAGGTTCACAGTGCAGCCTGTCAAGGCCTCAACAAGCGAGA
CCTTCTGTGTGACTACGAAATCATTGCCCTCCCGAGTGAAGACCGGGTGAGGCTTCTCGT
CGGTGATGAAGACTAAATCAGCTGGAGTGACACCGGGTTGCTCGTTTCCTTTCTCAGGGA
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TACCTTTGTAGAGATCTTCAAGGCTACAAGGCAGCTTGTTTTCGATA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GG33JQ U 1
AF RS1AU16JQ U 1
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BS 133 133 RS1GG33JQ
BS 134 349 RS1AU16JQ
BS 350 350 RS1GG33JQ
BS 351 707 RS1AU16JQ

RD RS1GG33JQ 433 0 0
G
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CTTTGGAATCACTTCCTCGTACTCGGGGTGGATCACACTGGTGACTGGAATTGTTAGTCT
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CTTCTGTGT
GAC

QA 2 430 2 430
DS 

RD RS1AU16JQ 707 0 0
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CTCTGTTGTTGACTTGTTGTACATTGCTTTGACTGGTACGTAGTGATTATAGTTCAATTT
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TGTTGAACTTGATCCTCAAGTTTCCTCTCTTTGTCTGATCTTTCTGCAAGGGCATTCCTT
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CCTTCTGTGTGACTACGAAATCATTGCCCTCCCGAGTGAAGACCGGGTGAGGCTTCTCGT
CGGTGATGAAGACTAAATCAGCTGGAGTGACACCGGGTTGCTCGTTTCCTTTCTCAGGGA
ATGTGATTCTTGTGCCTTTCTTCCACCCTGGCTTCACATCAATCGTTAAAATCTCTTCCA
CAGGCATCGTCTTCCCGCTGACATCAGCGATCTCTCTAGAGATCTTCATCTTATTGGTGG
TACCTTTGTAGAGATCTTCAAGGCTACAAGGCAGCTTGTTTTCGATA

QA 1 707 1 707
DS 



CO CL134Contig2 1307 5 7 U
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ATTTTATTACAGATCGACCAAAAAGGATACAACAGTAATAATCACAATCTCTCTGATCGA
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AAGGTTAATCTCGTTGGGAACTTGATGTTGAACTTGATCCTCAAGTTTCCTCTCTTTGTC
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CCTCCTTCACCGAAAGAGGCAAAGATGTTATCTCCAAACATGCTGCTAGAGAATCTTGTA
CCACCACCACCACCAAACGGCCCGGAGAACCCAAAGAACTCGGCAAATACATCGTCTGCG
CTTCTCGGGTTGAACCGGAAGGAAGTTGGACCGTCTCCGGTAGAGAAGTAAGTGGCTCCA
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GCCTTCTTCTGGGGATCACTAAGAACCTCGTAGGCTTCGGAGATCTGCTTGAACTTGGCT
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TAAGCTTTCTTAAGATCATCGTCTGAGGCGTTGCGATCGACTTGAAGGACGTTGTAGTAA
TCCACTCCCATCCGACTTTCTTCTTCTTCTCTCTTTCGCTTCTCCACTTTTCCTGATTCT
AAGAAGTATGGTGAGTCAATAAGGGGGCTTTGTTCTTGTTTTTATCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DG60JQ U 1
AF RS1GI46JQ U 36
AF RS1BC17JQ U 31
AF RS1GI46TF C 155
AF RS1DG60TF C 698
BS 1 323 RS1DG60JQ
BS 324 324 RS1GI46JQ
BS 325 682 RS1DG60JQ
BS 683 817 RS1BC17JQ
BS 818 818 RS1DG60TF
BS 819 839 RS1BC17JQ
BS 840 1307 RS1DG60TF

RD RS1DG60JQ 682 0 0
GTACTCTTGCATCTATAGGAATGGTGATTTAGATTACAACAAACAAATTTTATTACGAGT
ATTTTATTACAGATCGACCAAAAAGGATACAACAGTAATAATCACAATCTCTCTGATCGA
CACATGACAGAAGCTTAAATCTTTCTCTTCCTCTGTTCTACATTGCTTTTGACTGGTATG
TTACTCACTGATAACAGCTCAATTTATCCAAGAAGCTTCTTTACTCCTGTCTTCTGCTCT
AAGGTTAATCTCGTTGGGAACTTGATGTTGAACTTGATCCTCAAGTTTCCTCTCTTTGTC
TGATCTTTCTGCAACGGCATTCCTTCCTTTGGAACCACTTCCTCGTACTCTGGGTGTATC
ACACTGGTGACTGGGATTGTCAGTCTTCGACCATCGAGTGTTGTCAGGTTCACAGTGCAG
CCGGTCAAGGCCTCAACAAGCGAGATCTTCTGTGTAACTACGAGGTCATTGCCCTCCCGA
GTGAAAACCGGGTGAGGCTTCTCGTCGATGATGAAGACTAAATCAGCTGGAGTGACACCG
GGTTGCTCGTTTCCTTTCTCAGGGAATGTGATTCTTGTGCCTTTCTTCCACCCTGGCTTC
ACATCAATCGTTAATATCTCTTCCACCGGCATCGTCTTCCCGCTGACATCAGCAATCTCC
CTCGAGATCTTCATCTTCTTGG

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1GI46JQ 674 0 0
ACAACAAACAAATTTTATTACGAGTATTTTATTACAGATCGACCAAAAAGGATACAACAG
TAATAATCACAACCTCTCTGATCGACATATGACAGAAGCTTAAATCTTTCTCTTCCTCTG
TTCTACATTGCTTTTGACTGGTATGTTACTCACTGATAACAGCTCAATTTATCCAAGAAG
CTTCTTTACTCCTGTCTTCTGCTCTAAGGTTAATCTCGTTGGGAACTTGATGTTGAACTT
GATCCTCAAGTTTCCTCTCTTTGTCTGATCTTTCTGCAACGGCATTCCCTCCTTTGGAAC
CACTTCCTCGTACTCTGGGTGTATCACACTGGTGACTGGGATTGTCAGTCTTCGACCATC
GAGTGTTGTCAGGTTCACAGTGCAGCCGGTCAAGGCCTCAACAAGCGAGATCTTCTGTGT
AACTACGAGGTCATTGCCCTCCCGAGTGAAAACCGGGTGAGGCTTCTCGTCGATGATGAA
GACTAAATCAGCTGGAGTGACACCGGGTTGCTCGTTTCCTTTCTCAGGGAATGTGATTCT
TGTGCCTTTCTTCCACCCTGGCTTCACATCAATCGTTAATATCTCTTCCACCGGCATCGT
CTTCCCGCTGACATCAGCAATCTCCCTCGAGATCTTCATCTTCTTGGTGGTTCCTTTGTA
GAGATCTTCAAGGC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1BC17JQ 809 0 0
C
GATTACAACAAACAAATTTTATTACGAGTATTTTATTACAGATCGACCAAAAAGGATACA
ACAGTAATAATCACAATCTCTCTGATCGACACATGACAGAAGCTTAAATCTTTCTCTTCC
TCTGTTCTACATTGCTTTTGACTGGTATGTTACTCACTGATAACAGCTCAATTTATCCAA
GAAGCTTCTTTACTCCTGTCTTCTGCTCTAAGGTTAATCTCGTTGGGAACTTGATGTTGA
ACTTGATCCTCAAGTTTCCTCTCTTTGTCTGATCTTTCTGCAACGGCATTCCTTCCTTTG
GAACCACTTCCTCGTACTCTGGGTGTATCACACTGGTGACTGGGATTGTCAGTCTTCGAC
CATCGAGTGTTGTCAGGTTCACAGTGCAGCCGGTCAAGGCCTCAACAAGCGAGATCTTCT
GTGTAACTACGAGGTCATTGCCCTCCCGAGTGAAAACCGGGTGAGGCTTCTCGTCGATGA
TGAAGACTAAATCAGCTGGAGTGACACCGGGTTGCTAGTTTCCTTTCTCAGGGAATGTGA
TTCTTGTGCCTTTCTTCCACCCTGGCTTCACATCAATCGTTAATATCTCTTCCACCGGCA
TCGTCTTCCCGCTGACATCAGCAATCTCCCTCGAGATCTTCATCTTCTTGGTGGTTCCTT
TGTAGAGATCTTCAAGGCTACAAGGCAGCTTGTTTTCGATAGGAGCCGCCTTCCTGGGTA
CACTATGATGCATAGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTTCACCGAAAGAGGCAAAGATGTTAT
CTCCAA*CATGCTGCTAGAGAATCTTGT

QA 2 809 2 809
DS 

RD RS1GI46TF 637 0 0
GTTCTACATTGCTTT*GACTGGTATGTTACTCACTGATAACAGCTCAATTTATCCAAGAA
GCTTCTTTACTC*TGTCTTCTGCTCTAAGGTTAATCTCGTTGGGAACTTGATGTTGAACT
TGATCCTCAAGTTTCCTCTCTTTGTCTGATCTTTCTGCAACGGCATTCCCTCCTTTGGAA
CCACTTCCTCGTACTCTGGGTGTATCACACTGGTGACTGGGATTGTCAGTCTTCGACCAT
CGAGTGTTGTCAGGTTCACAGTGCAGCCGGTCAAGGCCTCAACAAGCGAGATCTTCTGTG
TAACTACGAGGTCATTGCCCTCCCGAGTGAAAACCGGGTGAGGCTTCTCGTCGATGATGA
AGACTAAATCAGCTGGAGTGACACCGGGTTGCTCGTTTCCTTTCTCAGGGAATGTGATTC
TTGTGCCTTTCTTCCACCCTGGCTTCACATCAATCGTTAATATCTCTTCCACCGGCATCG
TCTTCCCGCTGACATCAGCAATCTCCCTCGAGATCTTCATCTTCTTGGTGGTTCCTTTGT
AGAGATCTTCAAGGCTACAAGGCAGCTTGTTTTCGATAGGAGCCGCCTTCCTGGGTACAC
TATGATGCATAGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTTCACC

QA 1 637 1 637
DS 

RD RS1DG60TF 610 0 0
GATCTTCAAGGCTACAAGGCAGCTTGTTTTCGATAGGAGCCGCCTTCCTGGGTACACTAT
GATGCATAGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTTCACCGAAAGAGGCAAAGATGTTATCTCCAA
ACATGCTGCTAGAGAATCTTGTACCACCACCACCACCAAACGGCCCGGAGAACCCAAAGA
ACTCGGCAAATACATCGTCTGCGCTTCTCGGGTTGAACCGGAAGGAAGTTGGACCGTCTC
CGGTAGAGAAGTAAGTGGCTCCACCAGCATCTGGAGGAGGGACGTTCCCTTTCAAGCCTT
CCTCGCCATACTGATCGTACACAGCCTTCTTCTGGGGATCACTAAGAACCTCGTAGGCTT
CGGAGATCTGCTTGAACTTGGCTTCCGCGTCCTTTTTGTTGTTGGGGTTCTTGTCGGGAT
GCCATTTCATGGCGAGTTTTCTGTAAGCTTTCTTAAGATCATCGTCTGAGGCGTTGCGAT
CGACTTGAAGGACGTTGTAGTAATCCACTCCCATCCGACTTTCTTCTTCTTCTCTCTTTC
GCTTCTCCACTTTTCCTGATTCTAAGAAGTATGGTGAGTCAATAAGGGGGCTTTGTTCTT
GTTTTTATCC

QA 1 610 1 610
DS 



CO CL134Contig3 756 2 2 U
GGACAAGACATAAGAACAAGAACAAAGCCCCCTTATTGACTCACCATACTTCTTAGAATC
AGGAAAAGTGAAGAAGCGAAAGAGAGAAGAAGAAGAAAGTCGGATGGGAGTGGATTACTA
CAACGTCCTCCAAGTCGATCGCAACGCCTCAGACGATGATCTTAAGAAAGCTTACAGAAA
ACTCGCCATGAAATGGCATCCCGACAAGAACCCCAACAACAAAAAGGACGCGGAAGCCAA
GTTCAAGCAGATCTCCGAAGCTTACGAGGTTCTTAGTGATCCCCAGAAGAAAGCTGTGTA
CGATCAGTATGGCGAGGAAGGCTTGAAAGGGAACGTCCCTCCTCCAGATGCTGGTGGAGC
CACTTACTTCTCTACCGGAGACGGTCCAACTTCCTTCCGGTTCAACCCGAGAAGCGCAGA
CGATGTATTTGCCGAGTTCTTTGGGTTCTCCGGGCCGCTTGGTGGTGGTGGCGGTGGTGG
TACAAGATTCTCTAGAAGCATGTTTGGAGATAACATCTTTGCCTCTTTCGGTGAAGGAGG
AGGATGAGGAGGAGCTATGCATCATAGTGTACCCAAGAAGGCGCCTCCTATCGAAAACAA
GCTGCCTTGTAGCCTTGAAGATCTCTACAAAGGTACCACCAATAAGATGAAGATCTCTAG
AGAGATCGCTGATGTCAGCGGGAAGACGATGCCTGTGGAGAGATTTTAACGATTGATGTG
AAGCAGGGTGGAAGAAGCACAAGAATCACATTCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GG33TF U 1
AF RS1AU16TF U 8
BS 1 528 RS1GG33TF
BS 529 756 RS1AU16TF

RD RS1GG33TF 528 0 0
GGACAAGACATAAGAACAAGAACAAAGCCCCCTTATTGACTCACCATACTTCTTAGAATC
AGGAAAAGTGAAGAAGCGAAAGAGAGAAGAAGAAGAAAGTCGGATGGGAGTGGATTACTA
CAACGTCCTCCAAGTCGATCGCAACGCCTCAGACGATGATCTTAAGAAAGCTTACAGAAA
ACTCGCCATGAAATGGCATCCCGACAAGAACCCCAACAACAAAAAGGACGCGGAAGCCAA
GTTCAAGCAGATCTCCGAAGCTTACGAGGTTCTTAGTGATCCCCAGAAGAAAGCTGTGTA
CGATCAGTATGGCGAGGAAGGCTTGAAAGGGAACGTCCCTCCTCCAGATGCTGGTGGAGC
CACTTACTTCTCTACCGGAGACGGTCCAACTTCCTTCCGGTTCAACCCGAGAAGCGCAGA
CGATGTATTTGCCGAGTTCTTTGGGTTCTCCGGGCCGCTTGGTGGTGGTGGCGGTGGTGG
TACAAGATTCTCTAGAAGCATGTTTGGAGATAACATCTTTGCCTCTTT

QA 1 528 1 528
DS 

RD RS1AU16TF 749 0 0
GG
ATAAGAACAAGAACAAAGCCCCCTTATTGACTCACTATACTTCTTAGAATCAGGAAAAGT
GAAGAAGCGAAAGAGAGAAGAAGAAGAAAGTCGGATGGGAGTGGATTACTACAACGTCCT
CCAAGTCGATCGCAACGCCTCAGACGATGATCTTAAGAAAGCTTACAGAAAACTCGCCAT
GAAGTGGCATCCCGACAAGAACCCCAACAACAAAAAGGACGCGGAAGCCAAGTTCAAGCG
GATCTCCGAAGCTTACGAGGTTCTTAGTGATCCCCAGAAGAAAGCTGTGTACGATCAGTA
TGGCGAGGAAGGCTTGAAAGGGAACGTCCCTCCTCCAGATTCTGGTGGAGCCACTTACTT
CTCTACCGGAGACGGTCCAACTTCCTTCCGGTTCAACCCGAGAAGCGCAGACGATGTATT
TGCCGAGTTCTTTGGGTTCTCCGGGCCGTTTGGTGGTGGTGGCGGTGGTGGTACAAGATT
CTCTAGAAGCATGTTTGGAGATAACATCTTTGCCTCTTTCGGTGAAGGAGGAGGATGAGG
AGGAGCTATGCATCATAGTGTACCCAAGAAGGCGCCTCCTATCGAAAACAAGCTGCCTTG
TAGCCTTGAAGATCTCTACAAAGGTACCACCAATAAGATGAAGATCTCTAGAGAGATCGC
TGATGTCAGCGGGAAGACGATGCCTGTGGAGAGATTTTAACGATTGATGTGAAGCAGGGT
GGAAGAAGCACAAGAATCACATTCCCT

QA 3 749 3 749
DS 



AS 3 11

CO CL135Contig1 863 3 5 U
AAATTAAAAAAGGGCTTTGCAAATCCGATGTCTGGTTTTAAGAGTTAAAGGCCCATATTG
TACAACAACAACGACAACACAAAGAGTTTATAACATCAAACAAATTCTCTCCTCTCTTCT
CGAATAGTAAATCTAAGCGGTGGTTCGCCACTCAAGCTCAATTTGGATCTTTCCGTTCTT
GGAATCGATAAGGTGAAACTTTTGGTTCATCCTTTTGTTGTTCACCACGTCCACCACCGG
AATGTCCACGTACCCCAGTGTTTCCTTGGGATGCAAGAGACCTATCCTTGAAGAGGTGCT
GAGTACTTCCACGTGCAGCTTCTCGCGCACTGGAGGCTCCTCGAGCACGAAGGTGAACTC
CTCCTCCCACCTGGGGTCTCTGTTCTTCTTCACGTGCTTGGTTTTCCTCTCCTCTCCTTT
GAAGTAAATGCGGACGTAAGGGTTGGTATGGTGCTTCCCTTCAACGTCTTCAGCTGAATG
CACTATCACCGCGAGTACTCCTCCACCAACAGGTGTGCCTTCTGGAGCCTTCTGCACTGA
TTGCGATTCTTCGAAGCCCTTTGGCATTTCTTCTTCTGTGAACGGCTTATACAGGAGCTC
AACCTCCAGCCTACCTCTATCCTTGTCAGGCTGCGCTCCTTCTTCAGCACCCTCCAGAGT
CTTCCGCAGTTCCAAAGTGAAGCTTTTGTGTTCGTTAGGCACCATTTCTTTCAGCGGTAA
TACATTCATACCCATCTTGTCGTGCTTGCCAACCTGTTCCCAGTCATAGACACTGAACTC
TAGGACCTGAGTCTGGGGATCTCTGACAGAGAATTTATGTTCCTCATTCCATTCAGGGTT
CAGATTCTTGTGTTTAACAGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FM49JQ U 1
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AF RS1FM49TF C 223
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CTTCCGCAGTTCCAAAGTGAAGCTTTTGTGT

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CTGGGGTCTCTGTTCTTCTTCACGTGCTTGGTTTTCCTCTCCTCTCCTTTGAAGTAAATG
CGGACGTAAGGGTTGGTATGGTGCTTCCCTTCAACGTCTTCAGCTGAATGCACTATCACC
GCGAGCACTCCTCCACCAGCCGGTGTGCCTTCTGGAGCCTTCTGCACTGATTGCGATTCT
TCGAAGCCCTTTGGCATTTCTTCTTCTGTGAACGGCTTATACAGGAGCTCAACCTCCAGC
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GTCTGGGGATCTCTGACA

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DS 

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TTTCCTCTCCTCTCCTTTGAAGTAGATGCGGACGTAAGGGTTGGTATGGTGCTTCCCTTC
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TGGAGCCTTCTGCACTGATTGCGATTCTTCGAAGCCCTTTGGCATTTCTTCTTCTGTGAA
CGGCTTATACAGGAGCTCAACCTCCAGCCTACCTCTATCCTTGTCAGGCTGCGCTCCTTC
TTCAGCACCCTCCAGAGTCTTCCGCAGTTCCAAAGTGAAGCTTTTGTGTTCGTTAGGCAC
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CTCATTCCATTCAGGGTTCAGATTCTTGTGTTTAACAGTGC

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DS 



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CTCTCCTCTCTTCTCGAATATCAATCTAAGAGGTGGTTCGCCACTCAAGCTCGATTTGGA
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CGAAGGTGAACTCCTCCTCCCACCTGGGGTCTCTGTTCTTCTTCACGTGCTTGGTTTTCC
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CTTCAGCTGAATGCACTATCACCGCGAGCACTCCTCCACCAGCCGGTGTGCCTTCAGGAG
CCTTCTGCACTGATTGCGATTCTTCGAAGCCCTTTGGCATTTCTTCTTCTGTGAACGGCT
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BQ
10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 15 30 15 15 0 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AG50JQ U 2
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AF RS1FG27JQ U 2
AF RS1F592JQ U 15
AF RS1F592TF C 15
AF RS1G220JQ U 1
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GG
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C

QA 3 651 3 651
DS 

RD RS1AG50TF 652 0 0
GG
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TTCCGTTCTTGGAATCGATAAGGTGAAACTTTTGGTTCATCCTCTTGTTGTTCACCACGT
CCACCACCGGAATGTCCACGTACCCCAGTGTTTCCTTGGGATGCAAGAGACCTATCCTTG
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TCTGCACTGATTGCGATTCTTCGAAGCCCTTTGGCATTTCTTCTTCTGTGAACGGCTTAT
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C

QA 3 651 3 651
DS 

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GA
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TCTGCACTGATTGCGATTCTTCGAAGCCCTTTGGCATTTCTTCTTCTGTGAACGGCTTAT
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TCAGCGGTAACACATTCATACCCATCT
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QA 3 749 3 749
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AGTC

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DS 

RD RS1F592TF 759 0 0
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CGAATATCAATCTAAGAGGTGGTTCGCCACTCAAGCTCGATTTGGATCTTTCCGTTCTTG
GAATCGATAAGGTGAAACTTTTGGTTCATCCTTTTGTTGTTCACCACGTCCACCACCGGA
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ACTATCACCGCGAGCACTCCTCCACCAGCCGGTGTGCCTTCAGGAGCCTTCTGCACTGAT
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ACCTCCAGCCTCCCTCTATCCTTGTCAGGCTGCGCTCCTTCTTCAGCACCCTCCAGAGTC
TTACGCAATTCCAAAGTGAAGCTTTTGTGTTCGTTGGGCACCATTTCTTTCAGCGGTAAC
ACATTCATACCCATCTTGTCGTGCTTCCCAACCTGTTCC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RS1G220JQ 837 0 0
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AAAGGTCCATATTGTACAACAACAACGACAACACAAAGAGTTTATAACACCAAACAAATT
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TCTTTCCGTTCTTGGAATCGATAAGGTGAAACTTTTGGTTCATCCTTTTGTTGTTCACCA
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CGAAGGTGAACTCCTCCTCCCACCTGGGGTCTCTGTTCTTCTTCACGTGCTTGGTTTTCC
TCTCCTCTCCTTTGAAGTAGATGCGGACGTAAGGGTTGGTATGGTGCTTACCTTCAACGT
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CCTTCCGCACTGATTGCGATTCTTCGAAGCCCTTTGGCATTTCTTCTTCTGTGAACGGCT
TATACAGGAGCTCAACCTCCAGCCTCCCTCTATCCTTGTCAGGCTGCGCTCCTTCTTCAG
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CACACTGAACTCTAGACTGAGTCTGGGGATCCCTGACAGAGAATTTATGTCCTCGTT

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DS 



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AGAAGCTCCAGAAGCACACCGGCTGGTGGAGGAGTGCTCGCGGTGATAGTGCATTCAGCT
GAGACGTTGAAGGGAGCACCATACCAACCCTTACGTCCGC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GG03TF U 1
AF RS1CZ29TF U 192
BS 1 229 RS1GG03TF
BS 230 230 RS1CZ29TF
BS 231 256 RS1GG03TF
BS 257 257 RS1CZ29TF
BS 258 386 RS1GG03TF
BS 387 387 RS1CZ29TF
BS 388 544 RS1GG03TF
BS 545 545 RS1CZ29TF
BS 546 565 RS1GG03TF
BS 566 566 RS1CZ29TF
BS 567 592 RS1GG03TF
BS 593 593 RS1CZ29TF
BS 594 644 RS1GG03TF
BS 645 645 RS1CZ29TF
BS 646 649 RS1GG03TF
BS 650 650 RS1CZ29TF
BS 651 663 RS1GG03TF
BS 664 665 RS1CZ29TF
BS 666 675 RS1GG03TF
BS 676 676 RS1CZ29TF
BS 677 697 RS1GG03TF
BS 698 880 RS1CZ29TF

RD RS1GG03TF 697 0 0
GCAGCTAATCCTAATGTCCTTGTCGCTATCAAGGCTTTCGGACTCAAGGTTACTGTTCAG
GTCGTTGATTTCAGGTTTTTGCGCAGCCTCGTATCACTCTCAAACCCTTGGTCCCGAGCT
TCCCTTGTTTCGCCAGTATTTATGTCTCTCTTATGGACAAGCCACACGTTGATTTTGGGC
TCAAGCTTGGTGGAGCTGATCTTATGCCTATCCCTGGCCTCTACAGATTTGTCCAGGAGC
AAATCAAGGATCAAGTTGCAAACATGTATCTCTGGCCTAAGACCCTTGTGGTTCCAATCC
TTGACCCTGCCAAAGCGTTTAGAAGGCCGGTTGGAATCGTCCATGTGAAGGTCGTGAGGG
CTGTTGGGCTCAGGAAGAAAGATATGTTGGGTGGGGCTGACCCCTACGTCAAGATCAAGC
TCTCTGAAGACAAGATTCCCTCTAAGAAGACCACTGTCAAACACAAGAATCTGAACCCTG
AATGGAACGAGGAACATAAATTCTCTGTCAGAGATCCCCAGACTCAGGTCCTAGAGTTCA
GTGTGTATGACTGGGAACAGGTTGGGAAGCACGACAAGATGGGTATGAATGTGTTACCGC
TGAAAGAAATGGTGCCTAACGAACACAAAAGCTTCACTTTGGAATTGCGTAAGACTCTGG
AGGT*GCTGAAGAAG*AGCGCAGCCTGACAAGGATAG

QA 1 697 1 697
DS 

RD RS1CZ29TF 689 0 0
GGT
GCTGATCTTATGTCTATCCCTGGCCTCTACAGATTCGTCCAGGAGCAAATCAAGGATCAA
GTGGCAAACATGTATCTCTGGCCTAAGACCCTTGTGGTTCCAATCCTTGACCCTGCCAAA
GCGTTTAGAAGGCCGGTTGGAATCGTCCATGTGAAGGTCGTGAGGGCTGTTGGGCTGAGG
AAGAAAGATATGCTGGGTGGGGCTGACCCCTACGTCAAGATCAAGCTCTCTGAAGACAAG
ATTCCCTCTAAGAAGACCACTGTTAAACACAAGAATCTGAACCCTGAATGGAATGAGGAA
CATAAATTCTCTGTCAGAGATCCCCAGACTCAGGTCCTAGAGTTCAGTGTCTATGACTGG
GAACAGGTTGGCAAGCACGACAAGATGGGTATGAATGTATTACCGCTGAAAGAAATGGTG
CCTAACGAACACAAAAGCTTCACTTTGGAACTGCGGAAGACTCTGGAGGGCGCTGAAGAA
GGAGCGCAGCCTGACAAGGATAGAGGGAGGCTGGAGGTTGAGCTCCTGTATAAGCCGTTC
ACAGAAGAAGAAATGCCAAAGGGCTTCGAAGAATCGCAATCAGTGCAGAAGCTCCAGAAG
CACACCGGCTGGTGGAGGAGTGCTCGCGGTGATAGTGCATTCAGCTGAGACGTTGAAGGG
AGCACCATACCAACCCTTACGTCCGC

QA 4 689 4 689
DS 



AS 3 9

CO CL136Contig1 788 2 5 U
GGAGACCGATCTCATCCAAAGAACACGCTCCTCCATCTTCCTCGGCTGTATCTCTTCTTG
TCTCGGTTTTACAGTTGGGATTCACATATCAGCCTTGTATTTTTTTTACTCGATAACTAC
TAGCAATTATGGATGATTGGGAGGATGAGCAGCTTGCACCACTTCCAGCTAAAGTTGAGC
TCAAAAGCAATTGGGATGACGAGGATGTAGATGAGAATGACATTAAGGACTCTTGGGAGG
ATGATGATGATGACGACGAACCTGCTCCGGTAAAGCCTGCTACGGACAAGGCTCCTCCTA
AGAAAGCAGCAGCCAAAGCTGTCGAAAAGAAGGGTAAAGCAGCCGATGTTCCCAAAGAAG
CACCAAAGGAAGAAGAACCTTTGGATCCTATCTCTGAGAAACTTCGCATGCAGAGGCTTG
TTGAAGAAGCTGACTACAAGGCAACCGCTGAACTCTTTGGAACCAAGGGTGAAGAGACAA
AACTTGATGTGTTCATCCCCAAGTCTGAAAGCGATTTTTTGGAATATGCTGAAATGATTT
CTCATAGGCTTAAACCATATGAGAAAAGTTATCATTATATTGCGCTACTCAAAGCAGTCA
TGAGACTTTCCGTGACCAACATGAAGGCAGCAGATGTTAAAGATGTTGCTTCCTCCATTA
CAGCAATAGCAAATGAAAACTTAAGCGGAGAAAGAAGCTGCTGCTGGTAGAAAGAAGACT
GGTGGGAAAAGAACAGCTGATTGTAGATAGCCATGACGATCTAGTGGCTGGTCCTATGAT
GCCATGGA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AW66TF U 2
AF RS1C352TF U 1
BS 1 151 RS1C352TF
BS 152 152 RS1AW66TF
BS 153 297 RS1C352TF
BS 298 298 RS1AW66TF
BS 299 788 RS1C352TF

RD RS1AW66TF 390 0 0
GGGACC
GATCTCATCCAAAGAACACGCTCCTCCATCTTCCTCGGCTGTATCTCTTCTTGTCTCGGT
TTTACAGTTGGGATTCACATATCAGCCTTGTATTTTTTTTACTCGATAACTACTAGCAAT
TATGGATGATTGGGAGGATGAGCAGCTTGCACCACTTCCAGCTAAAGTTGAGCTCAAAAG
CAATTGGGATGACGAGGATGTAGATGAGAATGACATTAAGGACTCTTGGGAGGATGATGA
TGATGACGACGAACCTGCTCCGGTAAAGCCTGCTACGGACAAGGCTCCTCCTAAGAAAGC
AGCAGCCAAAGCTGTCGAAAAGAAGGGTAAAGCAGCCGATGTTCCCAAAGAAGCACCAAA
GGAAGAAGAACCTTTGGATCCTAT

QA 7 390 7 390
DS 

RD RS1C352TF 788 0 0
GGAGACCGATCTCATCCAAAGAACACGCTCCTCCATCTTCCTCGGCTGTATCTCTTCTTG
TCTCGGTTTTACAGTTGGGATTCACATATCAGCCTTGTATTTTTTTTACTCGATAACTAC
TAGCAATTATGGATGATTGGGAGGATGAGCATCTTGCACCACTTCCAGCTAAAGTTGAGC
TCAAAAGCAATTGGGATGACGAGGATGTAGATGAGAATGACATTAAGGACTCTTGGGAGG
ATGATGATGATGACGACGAACCTGCTCCGGTAAAGCCTGCTACGGACAAGGCTCCTCTTA
AGAAAGCAGCAGCCAAAGCTGTCGAAAAGAAGGGTAAAGCAGCCGATGTTCCCAAAGAAG
CACCAAAGGAAGAAGAACCTTTGGATCCTATCTCTGAGAAACTTCGCATGCAGAGGCTTG
TTGAAGAAGCTGACTACAAGGCAACCGCTGAACTCTTTGGAACCAAGGGTGAAGAGACAA
AACTTGATGTGTTCATCCCCAAGTCTGAAAGCGATTTTTTGGAATATGCTGAAATGATTT
CTCATAGGCTTAAACCATATGAGAAAAGTTATCATTATATTGCGCTACTCAAAGCAGTCA
TGAGACTTTCCGTGACCAACATGAAGGCAGCAGATGTTAAAGATGTTGCTTCCTCCATTA
CAGCAATAGCAAATGAAAACTTAAGCGGAGAAAGAAGCTGCTGCTGGTAGAAAGAAGACT
GGTGGGAAAAGAACAGCTGATTGTAGATAGCCATGACGATCTAGTGGCTGGTCCTATGAT
GCCATGGA

QA 1 788 1 788
DS 



CO CL136Contig2 869 2 12 U
GGGATCTCATTCAAAGAACACGCTCCTTCATCTTCCTCGGCTGATCTCTTCTTGTCTCGG
TTTTACAGTTGGATTCACATATCCGCCTTGTATTTTTTTACTCGATAACTACTAGCAATT
ATGGATGATTGGGAGGATGAGCAGCTTGCACCACTTCCAGCTAAAGTTGAGCTTAAAAGC
AACTGGGATGACGAGGATGTAGATGACAATGTAGATGAGAATGATGACGAACCTGCTCCG
GTAAAGCCTGCTACTGAGAAGGCTAAAGCAGCAGCCAAAGCTGTTGAAAAGAAGGGTAAA
GCAGCCGATGTTCCCAAAGAAGCACCAAAGGAAGAAGAACCTTTGGATCCTATCTCTGAG
AAACTTCTCATGCAGAGGCTTGTTGAAGAAGCTGACTACAAGGCAACTGCTGAACTCTTT
GGAACGAAGGGTGAAGAGACAAAACTTGATGTGTTCATCCCCAAGTCTGAAAGCGATTTT
TTGGAATATGCTGAAATGATTTCTCATAGGCTTAAACCATATGAGAAAAGTTATCATTAT
ATTGCGCTACTCAAAGCAGTCATGAGACTTTCCGTGACCAACATGAAGGCAGCAGATGTT
AAAGATGTTGCTTCCTCCATTACAGCAATAGCAAATGAAAAACTTAAGGCGGAGAAAGAA
GCTGCTGCTGGTAGAAAGAAGACTGGTGGGAAAAAGAAACAGCTGATTGTAGATAAGCCC
AATGACGATCTAGTGGCTGGTCCTTATGATGCCATGGACGGTTTCGACTTCATGTAGATT
ATAAGAGCTTTTTTGAGAGCATGTAATTTGGATTTGTCTATTTCATCATTTATCACTCAG
AAGAAAGAACAAAAGTTTATTATTTTTGG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F065TF U 1
AF RS1F065JQ C 93
BS 1 648 RS1F065TF
BS 649 649 RS1F065JQ
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RD RS1F065TF 769 0 0
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AAAGATGTTGCTTCCTCCATTACAGCAATAGCAAATGAAAAACTTAAG*CGGAGAAAGAA
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*ATGACGATCTAGTGGCTGGTC*TTATGATGCCATGGACG
TTTCGACTT

QA 1 760 1 760
DS 

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GTTCATCCCCAAGTTTGAAAGCGATTTTTTGGAATATGCTGAAATGATTTTTCATAGGCT
TAAACCATATGAGAAAAGTTATCATTATATTGCGCTACTCAAAGCAGTCATGAGACTTTC
CGTGACCAACATGAAGGCAGCAGATGTTAAAGATGTTGCTTCCTCCATTACAGCAATAGC
AAATGAAAAACTTAAGGCGGAGAAAGAAGCTGCTGCTGGTAGAAAGAAGACTGGTGGGAA
AAAGAAACAGCTGATTGTAGATAAGGCCAATGACGATCTAGTGGCTGGTCCTTATGATGC
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TTTGTCTATTTCATCATTTATCACTCAGAAGAAAGAACAAAAGTTTATTATTTTTGG

QA 1 777 1 777
DS 



CO CL136Contig3 839 5 29 U
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CATAAAGCAAGCTTTCTTTGTTCCAACTATATATCCCAGTAATTAAGAAACTTTTGCTCT
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ATCTGCTGCCTTCATGTTGGTCACCGAAAGTCTCATGACTGCTTTGAGCAATGCGATATA
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AGCTTTTGCTGCTTTCTTCGGAGGAGCAGGCTTTACCGGAGCAGTTGGTCGTCGTCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1BY67TF C 35
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AF RS1BY67JQ U 35
AF RS1CB08JQ U 41
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QA 7 278 7 278
DS 

RD RS1H295JQB 536 0 0
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TCTTCC*ACATAAATGCCAAAAAA*TAAAAGCTGCATTCCCTCACAAA*GCTCTTATAAT
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ATCTGCTGCCTTCATGTTGGTCACCGAAAGTCTCATGACTGCTTTGAGCAATGCGA

QA 1 536 1 536
DS 

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CCACAT
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GCTTTGAGCAATGCGATATAGTGATAACATTTCTCATAAGGTCTAAGCCTATGAGAAATC
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TCTTCACCCTTGGTTCCAAAGAGTTCAGCAGTTGCCCTGTAGTCCGCTTCTTCAACAAGC
CTCTGCATGCGGAGTTTCTCAGAGAGAGGATCTAAAGGTTCT
C

QA 7 708 7 708
DS 

RD RS1CB08JQ 799 0 0
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AATTAAGAAACTTTTGCTCTTCTTCC*ACATAGATGCCAGAAAA*TAGAAGCTGCATTCC
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GCTACTAGATCGTCATCGGACTTATCTACAATAAGTTGTTTCTTCTTGCCGCCTGTCTTC
TTTCTACCAGCAGCAGCTTCTTTCTCAGCCTTAAGCTTTTCATTTGCTACTGCTGTAACG
GAGGAAGCAACATCTTTAACATCTGCTGCCTTCATGTTGGTCACCGAAAGTCTCATGACT
GCTTTGAGCAATGCGATATAGTGATAACATTTCTCATAAGGTCTAAGCCTATGAGAAATC
ATTTCAGCATACTCCAGAAAATCACTTTCAGACTTGGGGATGAAGGCGTCAAGTTTTTTC
TCTTCACCCTTGGTTCCAAAGAGTTCAGCAGTTGCCCTGTAGTCCGCTTCTTCAACAAGC
CTCTGCATGCGGAGTTTCTCAGAGAGAGGATCTAAAGGTTCTTCTTTTGCAACTTCAGCT
GCTTTGCCCTTTTTCTCAACAGCTTTTGCTGCTTTCTTCGGAGGAGCAG*CTTTACCGGA
GCAGTTGGTCGTCGTCATC

QA 1 799 1 799
DS 

RD RS1CB08TF 755 0 0
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AAAAAAA**CAAAACAAAA*CATGACTAATGCCACAAGACCAAAACCCATAAAGCAAGCT
TTCTTTGTTCCAACTATATATCCCAGTAATTAAGAAACTTTTGCTCTTCTTCC*ACATAG
ATGCCAGAAAA*TAGAAGCTGCATTCCCTCACAAA*GCTCTTATAATCTACATGAAGTCA
AAATCGTCCATGGCATCATAAGGACCAGCTACTAGATCGTCATCGGACTTATCTACAATA
AGTTGTTTCTTCTTGCCGCCTGTCTTCTTTCTACCAGCAGCAGCTTCTTTCTCAGCCTTA
AGCTTTTCATTTGCTACTGCTGTAACGGAGGAAGCAACATCTTTAACATCTGCTGCCTTC
ATGTTGGTCACCGAAAGTCTCATGACTGCTTTGAGCAATGCGATATAGTGATAACATTTC
TCATAAGGTCTAAGCCTATGAGAAATCATTTCAGCATACTCCAGAAAATCACTTTCAGAC
TTGGGGATGAAGGCGTCAAGTTTTTTCTCTTCACCCTTGGTTCCAAAGAGTTCAGCAGTT
GCCCTGTAGTCCGCTTCTTCAACAAGCCTCTGCATGCGGAGTTTCTCAGAGAGAGGATCT
AAAGGTTCTTCTTTTGCAACTTCAGCTGCTTTGCCCTTTTTCTCAACAGCTTTTGCTGCT
TTCTTCGGAGGAGCAGGCTTTACCGGAGCAG
GTTG

QA 1 751 1 751
DS 



AS 2 13

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AGGGGTACCCTGAGATCACAAAGGATTCACATACTATGGGCAAGGGAGTTGCAGTGTTGA
ACAGCAGCGAGGGTGTCAAGGGGACCATCTTCTTCACCCAGGAAGGAAATGGTGCCACCA
CTGTGACTGGAACTGTTTCTGGCCTTAAACCTGGTCTCCATGGTTTCCATGTCCATGCCC
TTGGTGACACCACTAATGGTTGCATGTCCACCGGTCCGCATTTCAACCCTGATGGTAAAA
CCCACGGTGCACCAGAGGATGCTAATCGTCATGCTGGAGATCTAGGAAACATAACTGTTG
GGGATGATGGAACTGCCACCTTCACAATCACTGACAGCCAGATACCTCTTGATGGACCTA
ACTCTATTGTTGGAAGGGCTGTTGTTGTCCACGCAGACCCTGATGACCTCGGAAAGGGAG
GCCATGAACTCAGCTTGGCTACTGGAAACGCAGGAGGCCGTGTTGCTTGTGGTATTATTG
GTCTTCAGGGCTAAGCTGTTGCTATTCAAGGAAGGGAGTGATTTAATAAGAGGAGGTTCT
TACCTCTAGACCTGGCTAGTTTGTGTATCGTTTGTGTGTGGCTGTAATCATTGAGTTAGT
GGCTCAATACATTTGATTTAAGACAAAAAAAAACAGAGCAAACTTTT*CTATTTCA*TGA
ATAACAGAGTTGGTTGAAAA


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BR50TF U 1
AF RS1EV38TF U -3
AF RS1AP73TFB U 65
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BS 77 77 RS1EV38TF
BS 78 316 RS1BR50TF
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BS 726 726 RS1EV38TF
BS 727 732 RS1BR50TF
BS 733 740 RS1AP73TFB

RD RS1BR50TF 737 0 0
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ATAACGGAGTTG
GTTGA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1EV38TF 732 0 0
GGAACC
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GTGACTGGAACTGTTTCTGGCCTTAAACCTGGTCTCCATGGTTTCCATGTCCATGCCCTT
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AACAGA

QA 7 732 7 732
DS 

RD RS1AP73TFB 676 0 0
GG
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GCGAGGGTGTCAAGGGGACCATCTTCTTCACCCAGGAAGGAAATGGTGCCACCACTGTGA
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ACACCACTAATGGTTGCATGTCCACCGGTCCGCATTTCAACCCTGATGGTAAAACCCACG
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ATGGAACTGCCACCTTCACAATCACTGACAGCCAGATACCTCTTGATGGACCTAACTCTA
TTGTTGGAAGGGCTGTTGTTGTCCACGCAGACCCTGATGACCTCGGAAAGGGAGGCCATG
AACTCAGCTTGGCTACTGGAAACGCAGGAGGCCGTGTTGCTTGTGGTATTATTGGTCTTC
AGGGCTAAGCTGTTGCTATTCAAGGAAGGGAGTGATTTAATAAGAGGAGGTTCTTACCTC
TAGACCTGGCTAGTTTGTGTATCGTTTGTGTGTGGCTGTAATCATTGAGTTAGTGGCTCA
ATACATTTGATTTAAGACAAAAAAAAACAGAGCAAACTTTTTCTATTTCAATGAATAACA
GAGTTGGTTGAAAA

QA 3 676 3 676
DS 



CO CL137Contig2 738 10 11 U
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TTAAAATCAAATGTATTGAGCCACTAACTCAATGATTACAGCCACACACAAACGATACAC
AAACTAGCCAGGTCTAGAGGTAAGAACCTCCTTATTACATCACTCTCTTCCTCGAATAGC
AACAGCTTAGCCCTGAAGACCAATAATACCACAAGCAACACGGCCTCCTGCGTTTCCAGT
AGCCAAGCTGAGTTCATGGCCTCCCTTTCCGAGGTCATCAGGGTCTGCGTGGACAACAAC
AGCCCTTCCAACAATAGAGTTAGGTCCATCAAGAGGTATCTGGCTGTCAGTGATTGTGAA
GGTGGCAGTTCCATCATCCCCAACAGTTATGTTTCCTAGATCTCCAGCATGACGATTAGC
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GCGTAGCTTCGTGGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 25 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 20 20 20 20 

AF RS1GP72JQ U 5
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AF RS1FP67JQ U 4
AF RS1BJ96JQ U 31
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AF RS1GP72TF C 1
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AF RS1E873TF C 52
BS 1 6 RS1GP72TF
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RD RS1GP72JQ 531 0 0
CA
AGCAACTCTGTTATTCATTGAAATAAAAAAGTTTTCTCTGTTTTTCTTTTTGTCTTAAAA
TCAAATGTATTGAGCCACTAACTCAATGATTACAGCCACACACAAACGATACACAAACTA
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AGTTCCATCATCCCCAACAGTTATGTTTCCTAAATCTCCAGCATGACGATTAGCATCCTC
TGGTGCACCGTGGGTTTTACCATCAGGGTTGAAATGCGGACCGGTGGACATGCAACCATT
AGTGGTGTCACCAAGGGCATGGACATGGAAACCATGGAGACCAGGCTTA

QA 3 531 3 531
DS 

RD RS1DJ34JQ 480 0 0
CTTAGCCCTGAAGACCAATAATACCACAAGCAACACGGCCTCCTGCGTTTCCAGTAGCCA
AGCTGAGTTCATGGCCTCCCTTTCCGAGGTCATCAGGGTCTGCGTGGACAACAACAGCCC
TTCCAACAATAGAGTTAGGTCCATCAAGAGGTATCTGGCTGTCAGTGATTGTGAAGGTGG
CAGTTCCATCATCCCCAACAGTTATGTTTCCTAGATCTCCAGCATGACAATTAGCATCCT
CTGGTGCACCGTGGGTTTTACCATCAGGGTTGAAATGCGGACCGGTGGACATGCAACCAT
TAGTGGTGTCACCAAGGGCATGGACATGGAAACCATGGAGACCAGGCTTAAGACCAGAAA
CAGTTCCAGTCACAGTGGTAGAACCATTTCCTTCCTGGGTGAAGAAGATGGTCCCCTTGA
CACCCTCGCTGCTGTTCAACACTGCAACTCCCTTGCCCATAGTATGTATCCTTTGTGATC

QA 1 480 1 480
DS 

RD RS1FP67JQ 662 0 0
CCG
AGCAACTCTGTTATTCATTGAAATAGAAAAGTTTTCTCTGTTTTTCTTTTTGTCTTAAAA
TCAAATGTATTGAGCCACTAACCCAATGATTACAGCCACACACAAACGATACACAAACTA
GCCAGGTCTAGAGGTAAGAACCTCCTTATTACATCACTCTCTTCCTCGAATAGCAACAGC
TTAGCCCTGAAGACCAATAATACCACAAGCAACACGGCCTCCTGCGTTTCCAGTAGCCAA
GCTGAGTTCATGGCCTCCCTTTCCGAGGTCATCAGGGTCTGCGTGGACAACAACAGCCCT
TCCAACAATAGAGTTAGGTCCATCAAGAGGTATCTGGCTGTCAGTGATTGTGAAGGTGGC
AGTTCCATCATCCCCAACAGTTATGTTTCCTAGATCTCCAGCATGACGATTAGCATCCTC
TGGTGCACCGTGGGTTTTACCATCAGGGTTGAAATGCGGACCGGTGGACATGCAACCATT
AGTGGTGTCACCAAGGGCATGGACATGGAAACCATGGAGACCAGGCTTAAGACCAGAAAC
AGTTCCAGTCACAGTGGTAGAACCATTTCCTTCCTGGGTGGAGAAGATGGTCCCCTTGAC
ACCCTCGCTGCTGTTCAACACTGCAACTCCCTTGCCCATAGTATGTATCCTTTGTGATC

QA 4 662 4 662
DS 

RD RS1BJ96JQ 663 0 0
AGAAAAGTTTTCTCTGTTTTTCTTTTTGTCTTAAAATCAAATGTATTGAGCCACTAACTC
AATGATTACAGCCACACACAAACGATACACAAACTAGCCAGGTCTAGAGGTAAGAACCTC
CTTATTACATCACTCTCTTCCTCGAATAGCAACAGCTTAGCCCTGAAGACCAATAATACC
ACAAGCAACACGGCCTCCTGCGTTTCCAGTAGCCAAGCTGAGTTCATGGCCTCCCTTTCC
GAGGTCATCAGGGTCTGCGTGGACAACAACAGCCCTTCCAACAATAGAGTTAGGTCCATC
AAGAGGTATCTGGCTGTCAGTGATTGTGAAGGTGGCAGTTCCATCATCCCCAACAGTTAT
GTTTCCTAGATCTCCAGCATGACGATTAGCATCCTCTGGTGCACCGTGGGTTTTACCATC
AGGGTTGAAATGCGGACCAGTGGACATGCAACCATTAGTGGTGTCACCAAGGGCATGGAC
ATGGAAACCATGGAGACCAGGCTTAAGACCAGAAACAGTTCCAGTCACAGCGGTAGAACC
ATTTCCTTCCTGGGTGAAGAAGATGGTCCCCTTGACACCCTCGCTGCTGTTCAACACTGC
AACTCCCTTGCCCATAGTATGTATCCTTTGTGATCTCAGGGTACCCCTTTTGGAAATGAA
TGA

QA 1 663 1 663
DS 

RD RS1E873JQ 682 0 0
CA
AGCAACTCTGTTATTCATTGAAATAGAAAAGTTTTCTCTGTTTTTCTTTTTGTCTTAAAA
TCAAATGTATTGAGCCACTAACTCAATGATTACAGCCACACACAAACGATACACAAACTA
GCCAGGTCTAGAGGTAAGAACCTCCTTATTACATCACTCTCTTCCTCGAATAGCAACAGC
TTAGCCCTGAAGACCAATAATACCACAAGCAACACGGCCTCCTGCGTTTCCAGTAGCCAA
GCTGAGTTCATGGCCTCCCTTTCCGAGGTCATCAGGGTCTGCGTGGACAACAACAGCCCT
TCCAACAATAGAGTTAGGTCCATCAAGAGGTATCTGGCTGTCAGTGATTGTGAAGGTGGC
AGTTCCATCATCCCCAACAGTTATGTTTCCTAGATCTCCAGCATGACGATTAGCATCCTC
TGGTGCACCGTGGGTTTTACCATCAGGGTTGAAATGCGGACCGGTGGACATGCAACCATT
AGTGGTGTCACCAAGGGCATGGACATGGAAACCATGGAGACCAGGCTTAA*ACCAGAAAC
AGTTCCAGTCACAGTGGTAGAACCATTTCCTTCCTGGGTGAAGAAGATGGTCCCCTTGAC
ACCCTCGCTGCTGTTCAACACTGCAACTCCCTCGCCCATAGTATGTATCCTTTGTGATCT
CAGGGTACCCCTTTTGGAAA

QA 3 682 3 682
DS 

RD RS1GP72TF 738 0 0
TTTTCAAGCAACTCTGTTATTCATTGAAATAGAAAAGTTTTCTCTGTTTTTCTTTTTGTC
TTAAAATCAAATGTATTGAGCCACTAACTCAATGATTACAGCCACACACAAACGATACAC
AAACTAGCCAGGTCTAGAGGTAAGAACCTCCTTATTACATCACTCTCTTCCTCGAATAGC
AACAGCTTAGCCCTGAAGACCAATAATACCACAAGCAACACGGCCTCCTGCGTTTCCAGT
AGCCAAGCTGAGTTCATGGCCTCCCTTTCCGAGGTCATCAGGGTCTGCGTGGACAACAAC
AGCCCTACCAACAATAGAGTTAGGTCCATCAAGAGGTATCTGGCTGTCAGTGATTGTGAA
GGTGGCAGTTCCATCATCCCCAACAGTTATGTTTCCTAGATCTCCAGCATGACGATTAGC
ATCCTCTGGTGCACCGTGGGTTTTACCATCAGGGTTGAAATGCGGACCGGTGGACATGCA
ACCATTAGTGGTGTCACCAAGGGCATGGACATGGAAACCATGGAGACCAGGCTTAAGACC
AGAAACAGTTCCAGTCACAGTGGTAGAACCATTTCCTTCCTGGGTGAAGAAGATGGTCCC
CTTGACACCCTCGCTGCTGTTCAACACTGCAACTCCCTTGCCCATAGTATGTATCCTTTG
TGATCTCAGGGTACCCCTTTTGGAAATGAATGAAGATGAAATGCCTGGAACTGAATTAAT
GCGTAGCTTCGTGGTTCC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1DJ34TF 307 0 0
GGTGCACCGTGGGTTTTACCATCAGGGTTGAAATGCGGACCGGTGGACATGCAACCATTA
GTGGTGTCACCAAGGGCATGGACATGGAAACCATGGAGACCAGGCTTAAGACCAGAAACA
GTTCCAGTCACAGTGGTAGAACCATTTCCTTCCTGGGTGAAGAAGATGGTCCCCTTGACA
CCCTCGCTGCTGTTCAACACTGCAACTCCCTTGCCCATAGTATGTATCCTTTGTGATCTC
AGGGTACCCCTTTTGGAAATGAATGAAGATGAAATGCCTGGAACTGAATTAATGCGTAGC
TTCGT
CC

QA 1 305 1 305
DS 

RD RS1FP67TF 735 0 0
CCG
AGCAACTCTGTTATTCAT*GAAATAGAAAAGTTTTCTCTGTTTTC**TTTTGTCTTAAAA
TCAAATGTATTGAGCCACTAACCCAATGATTACAGCCACACACAAACGATACACAAACTA
GCCAGGTCTAGAGGTAAGAACCTCCTTATTACATCACTCTCTTCCTCGAATAGCAACAGC
TTAGCCCTGAAGACCAATAATACCACAAGCAACACGGCCTCCTGCGTTTCCAGTAGCCAA
GCTGAGTTCATGGCCTCCCTTTCCGAGGTCATCAGGGTCTGCGTGGACAACAACAGCCCT
TCCAACAATAGAGTTAGGTCCATCAAGAGGTATCTGGCTGTCAGTGATTGTGAAGGTGGC
AGTTCCATCATCCCCAACAGTTATGTTTCCTAGATCTCCAGCATGACGATTAGCATCCTC
TGGTGCACCGTGGGTTTTACCATCAGGGTTGAAATGCGGACCGGTGGACATGCAACCATT
AGTGGTGTCACCAAGGGCATGGACATGGAAACCATGGAGACCAGGCTTAAGACCAGAAAC
AGTTCCAGTCACAGTGGTAGAACCATTTCCTTCCTGGGTGGAGAAGATGGTCCCCTTGAC
ACCCTCGCTGCTGTTCAACACTGCAACTCCCTTGCCCATAGTATGTATCCTTTGTGATCT
CAGGGTACCCCTTTTGGAAATGAATGAAGATGAAATGCCTGGAACTGAATTAATGCGTAG
CTTCGTGG
CTCC

QA 4 731 4 731
DS 

RD RS1BJ96TF 687 0 0
TC
TTTTGTCTTAAAATCAAATGTATTGAGCCACTAACTCAATGATTACAGCCACACACAAAC
GATACACAAACTAGCCAGGTCTAGAGGTAAGAACCTCCTTATTACATCACTCTCTTCCTC
GAATAGCAACAGCTTAGCCCTGAAGACCAATAATACCACAAGCAACACGGCCTCCTGCGT
TTCCAGTAGCCAAGCTGAGTTCATGGCCTCCCTTTCCGAGGTCATCAGGGTCTGCGTGGA
CAACAACAGCCCTTCCAACAATAGAGTTAGGTCCATCAAGAGGTATCTGGCTGTCAGTGA
TTGTGAAGGTGGCAGTTCCATCATCCCCAACAGTTATGTTTCCTAGATCTCCAGCATGAC
GATTAGCATCCTCTGGTGCACCGTGGGTTTTACCATCAGGGTTGAAATGCGGACCAGTGG
ACATGCAACCATTAGTGGTGTCACCAAGGGCATGGACATGGAAACCATGGAGACCAGGCT
TAAGACCAGAAACAGTTCCAGTCACAGCGGTAGAACCATTTCCTTCCTGGGTGAAGAAGA
TGGTCCCCTTGACACCCTCGCTGCTGTTCAACACTGCAACTCCCTTGCCCATAGTATGTA
TCCTTTGTGATCTCAGGGTACCCCTTTTGGAAATGAATGAAGATGAAATGCCTGGAACTG
AATTAATGCGTAGCTTCGTGGTTCC

QA 3 687 3 687
DS 

RD RS1E873TF 687 0 0
TC
TTTTGTCTTAAAATCAAATGTATTGAGCCACTAACTCAATGATTACAGCCACACACAAAC
GATACACAAACTAGCCAGGTCTAGAGGTAAGAACCTCCTTATTACATCACTCTCTTCCTC
GAATAGCAACAGCTTAGCCCTGAAGACCAATAATACCACAAGCAACACGGCCTCCTGCGT
TTCCAGTAGCCAAGCTGAGTTCATGGCCTCCCTTTCCGAGGTCATCAGGGTCTGCGTGGA
CAACAACAGCCCTTCCAACAATAGAGTTAGGTCCATCAAGAGGTATCTGGCTGTCAGTGA
TTGTGAAGGTGGCAGTTCCATCATCCCCAACAGTTATGTTTCCTAGATCTCCAGCATGAC
GATTAGCATCCTCTGGTGCACCGTGGGTTTTACCATCAGGGTTGAAATGCGGACCGGTGG
ACATGCAACCATTAGTGGTGTCACCAAGGGCATGGACATGGAAACCATGGAGACCAGGCT
TAA*ACCAGAAACAGTTCCAGTCACAGTGGTAGAACCATTTCCTTCCTGGGTGAAGAAGA
TGGTCCCCTTGACACCCTCGCTGCTGTTCAACACTGCAACTCCCTCGCCCATAGTATGTA
TCCTTTGTGATCTCAGGGTACCCCTTTTGGAAATGAATGAAGATGAAATGCCTGGAACTG
AATTAATGCGTAGCTTCGTGGTTCC

QA 3 687 3 687
DS 



AS 3 11

CO CL138Contig1 731 4 17 U
GGGGACAAAAAGTGAGAGGACCATGTATTAAGCGACACTCTTCCGTTAGAGATTTAGATC
GGTCCAAAATTGACATTCACATCATCTTCTTGCTCTCCATTATCATATCCCATTGTGAAA
TCTCTTCATCAACATTCAATGGCGGCCAAGAAGGCAGGAGTGATCGCTTTGTTCGACGTG
GACGGGACTCTCACAGCTCCAAGGAAGGAAGCTACTCCAGAACTTCTCGATTTCATCCGA
GAATTGCGCAAGGTCGTCACTGTTGGAGTCGTTGGTGGATCTGATCTAACCAAGATATCT
GAGCAGCTTGGCAAAACAGTCACTACCGACTATGATTATTGTTTCTCTGAGAATGGTCTT
GTTGCTCATAAAGATGGAAAACCCATTGGGATCCAGAGCCTGAAGCTGCACCTAGGAGAA
GATAAACTCAAGGAGTTGATAAAATTCACGCTGCACTACATTGCAGACTTGGATATTCCA
ATCAAAAGGGGAACATTCATAGAGTTCCGAAATGGCATGCTCAATGTATCACCTATTGGT
CGCAACTGCAGCCAAGAAGAAAGAGACGAATTCGAGAGATATGATAAGGTTCAAAACATA
AGACCAAAGATGGTGGCTGAACTTCGTGAGCGGTTTGCGCATCTGAACCTTACTTTCTCC
ATTGGAGGACAGATTAGCTTCGATGTCTTTCCTAAAGTTGGGATAGACTTACTGCTTGCA
TACCTTGAAGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DB11TF U 54
AF RS1FZ07TF U 1
AF RS1GR07TF U 59
AF RS1CG52TF U 1
BS 1 133 RS1CG52TF
BS 134 134 RS1DB11TF
BS 135 341 RS1CG52TF
BS 342 342 RS1DB11TF
BS 343 369 RS1CG52TF
BS 370 370 RS1DB11TF
BS 371 374 RS1CG52TF
BS 375 375 RS1DB11TF
BS 376 509 RS1CG52TF
BS 510 510 RS1DB11TF
BS 511 527 RS1CG52TF
BS 528 528 RS1DB11TF
BS 529 565 RS1CG52TF
BS 566 566 RS1DB11TF
BS 567 599 RS1CG52TF
BS 600 600 RS1DB11TF
BS 601 731 RS1CG52TF

RD RS1DB11TF 577 0 0
GGAGATC
GGTCCAAGATTGACATTCACATCATCTTCTTGCTCTCCATTATCATAACCCATTGTGAAA
TCTCTTCATCAACATTCAATGGCGGCCAAGAAGGCAGGAGTGATCGCTTTGTTCGACGTG
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GTTGCTCATAAAGATGGAAAACCCATTGGGATCCAGAGCCTGAAGCTGCACCTGGGAGAA
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AGACCAAAGATGGTGGCTGAACTTCGTGAG

QA 8 577 8 577
DS 

RD RS1FZ07TF 693 0 0
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GGTCCAAAATTGACATTCACATCATCTTCTTGCTCTCCATTATCATATCCCATTGTGAAC
TCTCTTCATCAACATTCAATGGCGGCCAAGAAGGCAGGAGTGATCGCTTTGTTCGACGTG
GACGGGACTCTCACAGCTCCAAGGAAGGAAGCTACTCCAGAACTTCTCGATTTCATCCGA
GAATTGCGCAAGGTCGTCACTGTTGGAGTCGTTGGTGGATCTGATCTAACCAAGATATCT
GAGCAGCTTGGCAAAACAGTCACTACCGACTATGATTATTGTTTCTCTGAGAATGGTCTT
GTTGCTCATCAAGATGGAAAACCCATTGGGATCCAGAGCCTGAAGCTACACCTAGGAGAA
GATAAACTCAAGGAGTTGATAAAATTCACGCTGCACTACATTGCAGACTTGGATATTCCA
ATCAAAAGGGGAACATTCATAGAGTTCCGTAATGGCATGCTCAATGTCTCACCTATTGGT
CGCAACTGCAGCCAAGAAGAAAGAGACGAATTCGAGAGATATGATAAGGTTCAAAACATT
AGACCAAAGATGGTGGCTGAACTTCGTGAGCGGTTTGCGCATCTGAACCTTACTTTCTCC
ATTGGAGGACAGATTAGCTTCGATGTCTTTCCT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RS1GR07TF 622 0 0
GG
GGTCCAAAATTGACATTCACATCATCTTCTTGCTCTCCATTATCATATCCCATTGTGAAA
TCTCTTCATCAACATTCAATGGCGGCCAAGAAGGCAGGAGTGATCGCTTTGTTCGACGTG
GACGGGACTCTCACAGCTCCAAGGAAGGAAGCTACTCCAGAACTTCTCGATTTCATCCGA
GAATTGCGCAAGGTCGTCACTGCTGGAGTCGTTGGTGGATCTGATCTAACCAAGATATCT
GAGCAGCTTGGCAAAACAGTCACTACCGACTATGATTATTGTTTCTCTGAGAATGGTCTT
GTTGCTCATAAAGATGGAAAACCCATTGGGATCCAGAGCCTGAAGCTGCACCTGGGAGAA
GATAAACTCAAGGAGTTGATAAAATTCACGCTGCATTACATTGCAGACTTGGATATTCCA
ATCAAAAGGGGAACATTCATAGAGTTCCGAAATGGCATGCTCAATGTATCACCTATTGGT
CGCAACTGCAGCCAAGAAGAAAGAGACGAATTCGAGAGATATGATAAGGTTCAAAACATA
AGACCAAAGATGGTGGCTGAACTTCGTGAGCGGTTTGCGCACCTGAACCTTACTTTCTCC
ATTGGAGGACAGATTAGCTT

QA 3 622 3 622
DS 

RD RS1CG52TF 731 0 0
GGGGACAAAAAGTGAGAGGACCATGTATTAAGCGACACTCTTCCGTTAGAGATTTAGATC
GGTCCAAAATTGACATTCACATCATCTTCTTGCTCTCCATTATCATATCCCATTGTGAAA
TCTCTTCATCAACGTTCAATGGCGGCCAAGAAGGCAGGAGTGATCGCTTTGTTCGACGTG
GACGGGACTCTCACAGCTCCAAGGAAGGAAGCTACTCCAGAACTTCTCGATTTCATCCGA
GAATTGCGCAAGGTCGTCACTGTTGGAGTCGTTGGTGGATCTGATCTAACCAAGATATCT
GAGCAGCTTGGCAAAACAGTCACTACCGACTATGATTATTGCTTCTCTGAGAATGGTCTT
GTTGCTCATCAAGACGGAAAACCCATTGGGATCCAGAGCCTGAAGCTGCACCTAGGAGAA
GATAAACTCAAGGAGTTGATAAAATTCACGCTGCACTACATTGCAGACTTGGATATTCCA
ATCAAAAGGGGAACATTCATAGAGTTCCGTAATGGCATGCTCAATGTCTCACCTATTGGT
CGCAACTGCAGCCAAGAAGAAAGAGTCGAATTCGAGAGATATGATAAGGTTCAAAACATT
AGACCAAAGATGGTGGCTGAACTTCGTGAGCGGTTTGCGCATCTGAACCTTACTTTCTCC
ATTGGAGGACAGATTAGCTTCGATGTCTTTCCTAAAGTTGGGATAGACTTACTGCTTGCA
TACCTTGAAGA

QA 1 731 1 731
DS 



CO CL138Contig2 1010 5 12 U
AATCTGTTGTAAAAACAAACCCTTAACATCCATTTTCTAAACATTTTATTCTTATAAATC
AAAATTCAAACATATTGGAATCACATGTAAACACATACTTCTCTCCATTTCTGATATGTA
AATAATCAAAAGTTGTGAAAATTTGCCAAGAATAGTCAAACTCTGGCAGTGTTCTTGAGA
TGGATACTGTTTCAAGACATGAACAGAGCCTTGCATTTTGCCATTGTATCATCCGGACTA
GTAACTGAATGGCCAATTGTTTTTGGTGATTCATAGATTTCATAATCGTTTCCACCCTCA
TAGGTTTTGTCACCGAAGAAATGGATTTCACTGAAATCCTCAAGGTATTGCAAACAATAA
GTCTTATCCCAACCTTTAGGGAAGACATCGAAGCTAATCTGTCCTCCAATAGAGAAAGTA
AGGTTAAGATGCGCAAACCGCTCACGAAGTTCAGCCACCATCTTTGGTCGGATGTTTTGA
ACCTTATCATATTTCTCGAACTCGTCTCTTTCTTCTTGGCTGCAGTTGCGACCAATCGGT
GACACATTGAGCATTCCATTTCGGAATTCTATAAATGTTCCCCTTTTGATTGGAATATCC
AAGTCTGCAATGTAGTGCAGCACGAAATTTATCAGCTCCTTGAGCTTATCTTCTCCAAGG
TGGAGCTTCAGGCTCTGGATTCCAATGGGCTTCCCATCTTTATGGGCAACAAGACCATTC
TCAGAGAAGCAATAATCATAGTCGGTAGTGACTGTTTTGCCAAGCTGCTCAGAAATCTTG
CTTAAATCAGATCCACCAACGACTCCAACAGTAACCACCTTGCGCAATTGTCTGATAAAA
TGGAGCAGTTCAGGAGTAGCTTCCTTCCTTGGAGCAGTGAGAGTACCGTCGACATCGAAC
AAAGCGATCACTCCTGGCTTTCTGGCCGCCATTGAATGATGAAGAGATTTCAAAGTGGAA
GATGATGATAATGGCGGAATAATATTAAACGAGTGTGGAGGACCGATCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FJ69JQ U 1
AF RS1E713JQ U 26
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AATAATCAAAAGTTGTGAAAATTTGCCAAGAATAGTCAAACTCTGGCAGTGTTCTTGAAA
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GAA

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GAGCCTTGCATTTTGCCATTGTATCATCCGGACTAGTAACTGAATGGCCAATTGTTTTTG
GTGATTCATAGATTTCATAATCGTTTCCACCCTCATAGGTTTTGTCACCGAAGAAATGGA
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CATAGTCGGTAGTGACTGTTTTGCCAAGCTGCTCAGAAATCTTGCTTAAATCAGATCCAC
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GAATAATATTAAACGAGTGTGGAGGACCGATCTC

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DS 

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ATCTTCTCCAAGGTGGAGCTTCAGGCTCTGGATTCCAATGGGCTTCCCATCTTTATGGGC
AACAAGACCATTCTCAGAGAAGCAATAATCATAGTCGGTAGTGACTGTTTTGCCAAGCTG
CTCAGAAATCTTGCTTAAATCAGATCCACCAACGACTCCAACAGTAACCACCTTGCGCAA
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GTCGACATCGAACAAAGCGATCACTCCTGGCTTTCTGGCCGCCATTGAATGATGAAGAGA
TTTCAAAGTGGAAGATGATGATAATGGCGGAATAATATTAAACGAGTGTGGAGGACC
CC

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DS 



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BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GB67JQ C 1
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CATTAGACCAAAGATGGTGGCTGAACTTCGTGAGCGGTTTGCGCATCTGAACCTTACTTT
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CTTGCAATACCTTGAAGACTTCACTGAAATCCATTTCTTCGGTGACAAGACCTACGAGGG
AGGAAACGACTATGAAATCTATGAATCACCAAAAACAATAGGCCATTCAGTTACGAGTCC
AGATGACACAATGGCAAAATGCAAGGCTCTCTTCATGTCTTGAAACACTATCCATCTCAA
GAACACAGTGTCAGAGTTTGATTATTCTTGGTGAATTTCTTACAGCTTATGATTATTTAC
ATCACAAAGAAACAAAGATAAGTATGTTTGGGATACTGTTTGAATT

QA 1 466 1 466
DS 

RD RS1GB67TF 466 0 0
G
GGTCGCAACTGCAGCCAAGAAGAAAGAGACGAATTCGAGAGATATGATAAGGTTCAAAAC
ATTAGACCAAAGATGGTGGCTGAACTTCGTGAGCGGTTTGCGCATCTGAACCTTACTTTC
TCCATTGGAGGACAGATTAGCTTCGATGTCTTTCCTAAAGGTTGGGATAAGACTTACTGC
TTGCAATACCTTGAAGACTTCACTGAAATCCATTTCTTCGGTGACAAGACCTACGAGGGA
GGAAACGACTATGAAATCTATGAATCACCAAAAACAATAGGCCATTCAGTTACGAGTCCA
GATGACACAATGGCAAAATGCAAGGCTCTCTTCATGTCTTGAAACACTATCCATCTCAAG
AACACAGTGTCAGAGTTTGATTATTCTTGGTGAATTTCTTACAGCTTATGATTATTTACA
TCACAAAGAAACAAAGATAAGTATGTTTGGGATACTGTTTGA
ATT

QA 2 463 2 463
DS 



AS 2 10

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GGTGGCAGGACATTAAGAACCCAGGGAGTGTGAACCAAGACCCTATCTTCAAGCAATACA
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GCATCTTAGAGTTCTTGGTTTGTGAGCATGAGACAATATGGTATTGTTGTAGCACATTTA
AAAATCTTCAGTGTACAAAGGAACCAAGTTCATCAAG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1A494JQ C 1
AF RS1A494TF U 1
BS 1 755 RS1A494TF
BS 756 757 RS1A494JQ

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TTGACCCATTGGGACTGGCAGAGGATCCAGAGAACTTGAAGTGGTTCATCCAGGCAGAGC
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CCAAGATCGGAATCATCAACGTTCCTGAGTGGTACGATGCCGGGAAAGAGCAGTATTTTG
CATCATCATCGACATTGTTCGTGATCGAGTTCATATTGTTTCATTACGTTGAGATCAGAC
GGTGGCAGGACATTAAGAACCCAGGGAGTGTGAACCAAGACCCTATCTTCAAGCAATACA
GCTTGCCTCCAAATGAAGTTGGTTACCCCGGAGGAATCTTTAACCCTCTTAACTTCGCTC
CTACGCTCGAGGCTAAGGAGAAAGAGCTTGCAAATGGGAGGTTGGCGATGTTGGCATTCT
TAGGGTTCGTGATTCAACACAATGTGACTGGAAAGGGACCATTTGAGAACCTGTTGCAGC
ACTTGTCTGACCCATGGCACAACACTATTGTCCAAACCTTCAGCGGATGATTTAAGACGG
ACCTATGAATTTAATACATCTCTATCTTATGCTACCTTAATATATCTGTGTGTGTGAGTT
GCATCTTAGAGTTCTTGGTTTGTGAGCATGAGACAATATGGTATTGTTGTAGCACATTTA
AAAATCTTCAGTGTACAAAGGAACCAAGTTCATCA
AG

QA 1 755 1 755
DS 



CO CL139Contig2 1011 8 17 U
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AAATGGCCACTGTCACTACTCAAGCCTCGGCCTCGATCTTCAGACCATGCACTTCAAAGC
CAAGATTCCTCACCGGTTCTTCCGGTAGGTTGAACCGAGACTTGTCGTTTAAGTCAATCG
GCTCAAAGACGTCCTCGTTCAAGGTTGAAGCTAAGAAAGGAGAATGGTTGCCCGGTTTGG
CATCTCCTGGTTATCTCAACGGCAGTCTTGCCGGTGATAATGGGTTTGACCCATTGGGAC
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GGGCCATGCTCGGCGTCGCAGGGATGCTTTTGCCTGAAGTTTTCACCAAGATCGGAATCA
TCAATGTTCCTGAGTGGTATGATGCCGGGAAAGAGCAGTACTTTGCATCATCATCAACAT
TGTTCGTGATCGAATTCATATTGTTCCATTACGTTGAGATCAGACGGTGGCAGGACATTA
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AAGTTGGTTACCCTGGAGGAATCTTTAACCCTCTTAACTTCGCTCCTACGCTCGAGGCTA
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CAACACAATGTGACTGGAAAGGGACCATTTGAGAACCTGTTGCAGCACTTGTCTGACCCA
TGGCACAACACTATTGTCCAAA*CCTTCAGCGGATGATTTAAGACGGACCTATGAATTTA
ATACATCTCTATCTTATGCTACCTTAATATATCTTGTGTGTGTTGCATCTTAGAGTTCTT
GGTTTGTGAGCATGAAACAATATGGTATTTGCTGTAGCTCCATGAACTAATTTAAAAATC
TTCAGTGTACAAAGGAACCAAGTTCATCAAGATTAATATCTCTCTCTTTTC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 35 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E170TF U 1
AF RS1DD95TF U 64
AF RS1FQ54TF U 166
AF RS1AK03TF U 2
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AGAACCCAGGAAGTGTGAACCAAGACCCTATCTTCAAGCAATACAGCTTGCCTCCAAATG
AAGTTGGTTACCCTGGAGGAATCTTTAACCCTCTTAACTTCGCTCCTACGCTC

QA 1 653 1 653
DS 

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G
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AAAGACGTCCTCGTTCAAGGTTGAAGCTAATAAAGTAGAATGGTTGCCCGGTTTGGCATC
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CATGCTCGGCGTCGCAGGGATGCTTTTGCCTGAAGTTTTCACCAAGATCGGAATCATCAA
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ACAACACTATTGT

QA 2 734 2 734
DS 

RD RS1FQ54TF 640 0 0
G
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GTTGCCCGGTTTGGCATCTCCTGGTTATCTCAACGGCAGTCTTGCCGGTGATAATGGGTT
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TGTCAACGGACGGTGGGCCATGCTCGGCGTCGCAGGGATGCTTTTGCCTGAAGTTTTCAC
CAAGATCGGAATCATCAATGTTCCTGAGTGGTATGATGCCGGGAAAGAGCAGTACTTTGC
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GTGGCAGGACATTAAGAACCCAGGAAGTGTGAACCAAGACCCTATCTTCAAGCAATACAG
CTTGCCTCCAAATGAAGTTGGTTACCCTGGAGTAATCTTTAACCCTCTTAACTTCGCTCC
TACGCTCGAGGCTAAGGAGAAAGAGCTTGCAAATGGG*AGGTTGGCGATGTTGGCATTCT
TAGGGTTCGTGATTCAACACAATGTGACTGGAAAGGGACCATTTGAGAACCTGTTGCAGC
ACTTGTCTGACCCATGGCACAACACTATTGTCCAAA*CC

QA 2 640 2 640
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GAATCTCTTCTTGATTCCAATCCATTCTCTACCTTCCTGTAATCCAAGCTCTGCAGGGGA
AATGGCCACTGTCACTACTCAAGCCTCGGCCTCGATCTTCAGACCATGCACTTCAAAGCC
AAGATTCCTCACCGGTTCTTCCGGTAGGTTGAACCGAGACTTGTCGTTTAAGTCAATCGG
CTCAAAGACGTCCTCGTTCAAGGTTGAAGCTAAGAAAGGAGAATGGTTGCCCGGTTTGGC
ATCTCCTGGTTATCTCAACGGCAGTCTTGCCGGTGATAATGGGTTTGACCCATTGGGACT
AGCAGAGGATCCCGAGAACTTGAAGTGGTTCATCCAGGCAGAGCTTGTCAACGGACGGTG
GGCCATGCTCGGCGTCGCAGGGATGCTTTTGCCTGAAGTTTTCACCAAGATCGGAATAAT
CAATGTTCCTGAGTGGTATGATGCCGGGAAAGAGCAGTACTTTGCATCATCATCAACATT
GTTCGTGATCGAATTCATATTGTTCCATTACGTTGAGATCAGACGGTGGCAGGACATTAA
GAACCCAGGAAGTGTGAACCAAGACCCTATCTTCAAGCAATACAGCTTGCCTCCAAATGA
AGTTGGTTACCCTGGAGGAATCTTTAACCCTCTTAACTTCGCTCCTACGCTCGAGGCTAA
GGAGAAAGAGCTTGCAAATGGGGAGGTTGGCGATGTTGGCATTCTTAGGGTTCGTGATTC
AACACAATGTGACTGGAAAGGGACCATTTGAGAACCTGTTGCAGCACTTGTCTGACCCAT
GGCACAACACTATTGTCCAAA*CCTTCAGCGGATGATTTAAGACG*ACCTATGAATTTAA
TACATCTCTATCTTATGCTA

QA 1 860 1 860
DS 

RD RS1AK03JQ 797 0 0
ATCTTCAGACCATGCACTTCAAAGCCAAGATTCCTCACCGGTTCTTCCGGTAGGTTGAAC
CGAGACTTGTCGTTTAAGTCAATCGGCTCAAAGACGTCCTCGTTCAAGGTTGAAGCTAAG
AAAGGAGAATGGTTGCCCGGTTTGGCATCTCCTGGTTATCTCAACGGCAGTCTTGCCGGT
GATAATGGGTTTGACCCATTGGGACTAGCAGAGGATCCCGAGAACTTGAAGTGGTTCATC
CAGGCAGAGCTTGTCAACGGACGGTGGGCCATGCTCGGCGTCGCAGGGATGCTTTTGCCT
GAAGTTTTCACCAAGATCGGAATAATCAATGTTCCTGAGTGGTATGATGCCGGGAAAGAG
CAGTACTTTGCATCATCATCAACATTGTTCGTGATCGAATTCATATTGTTCCATTACGTT
GAGATCAGACGGTGGCAGGACATTAAGAACCCAGGAAGTGTGAACCAAGACCCTATCTTC
AAGCAATACAGCTTGCCTCCAAATGAAGTTGGTTACCCTGGAGGAATCTTTAACCCTCTT
AACTTCGCTCCTACGCTCGAGGCTAAGGAGAAAGAGCTTGCAAATGGG*AGGTTGGCGAT
GTTGGCATTCTTAGGGTTCGTGATTCAACACAATGTGACTGGAAAGGGACCATTTGAGAA
CCTGTTGCAGCACTTGTCTGACCCATGGCACAACACTATTGTCCAAA*CCTTCAGCGGAT
GATTTAAGACGGACCTATGAATTTAATACATCTCTATCTTATGCTACCTTAATATATCTT
GTGTGTGTTGCATC
CAG

QA 1 794 1 794
DS 

RD RS1BD13JQ 755 0 0
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GGTGATAATGGGTTTGACCCATTGGGACTAGCAGAGGATCCCGAGAACTTGAAGTGGTTC
ATCCAGGCAGAGCTTGTCAACGGACGGTGGGCCATGCTCGGCGTCGCAGGGATGCTTTTG
CCTGAAGTTTTCACCAAGATCGGAATCATCAATGTTCCTGAGTGGTATGATGCCGGGAAA
GAGCAGTACTTTGCATCATCATCAACATTGTTCGTGATCGAATTCATATTGTTCCATTAC
GTTGAGATCAGACGGTGGCAGGACATTAAGAACCCAGGAAGTGTGAACCAAGACCCTATC
TTCAAGCAATACAGCTTGCCTCCAAATGAAGTTGGTTACCCTGGAGGAATCTTTAACCCT
CTTAACTTCGCTCCTACGCTCGAGGCTAAGGAGAAAGAGCTTGCAAATGGG*AGGTTGGC
GATGTTGGCATTCTTAGGGTTCGTGATTCAACACAATGTGACTGGAAAGGGACCATTTGA
GAACCTGTTGCAGCACTTGTTTGACCCATGGCACAACACTATTGTCCAAA*CCTTCAGCG
GATGATTTAAGACGGACCTATGAATTTAATACATCTCTATCTTATGCTACCTTAATATAT
CTTGTGTGTGTTGCATCTTAGAGTTCTTGGTTTGTGAGCATGAAACAATATGGTATTTGC
TGTAGCTCCATGAACTAATTTAAAAATCTTCAGTG

QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1E170JQ 438 0 0
TCAAGCAATACAGCTTGCCTCCAAATGAAGTTGGTTACCCTGGAGGAATCTTTAACCCTT
TTAACTTCGCTCCTACGCTCGAGGCTAAGGAGAAAGAGCTTGCAAATGGG*AGGTTGGCG
ATGTTGGCATTCTTAGGGTTCGTGATTCAACACAATGTGACTGGAAAGGGACCATTTGAG
AACCTGTTGCAGCACTTGTTTGACCCATGGCACAACACTATTGTCCAAAACCTTCAGCGG
ATGATTTAAGACGGACCTATGAATTTAATACATCTCTATCTTATGCTACCTTAATATATC
TTGTGTGTGTTGCATCTTAGAGTTCTTGGTTTGTGAGCATGAAACAATATGGTATTTGCT
GTAGCTCCATGAACTAATTTAAAAATCTTCAGTGTACAAAGGAACCAAGTTCATCAAGAT
TAATATCTCTCTCTTTTC

QA 1 438 1 438
DS 

RD RS1DD95JQ 359 0 0
ACGCTGGAGGCTAAGGAGAAAGAGCTTGCAAATGGG*AGGTTGGCGATGTTGGCATTCTT
AGGGTTCGTGATTCAACACAATGTGACTGGAAAGGGACCATTTGAGAACCTGTTGCAGCA
CTTGTTTGACCCATGGCACAACACTATTGTCCAAA*CCTTCAGCGGATGATTTAAGACGG
ACCTATGAATTTAATACATCTCTATCTTATGCTACCTTAATATATCTTGTGTGTGTTGCA
TCTTAGAGTTCTTGGTTTGTGAGCATGAAACAATATGGTATTTGCTGTAGCTCCATGAAC
TAATTTAAAAATCTTCAGTGTACAAAGGAACCAAGTTCATCAAGATTAATATCTCTC
AC

QA 1 357 1 357
DS 



AS 3 13

CO CL140Contig1 788 8 18 U
GGCTCTCAAATCTCTGGAGTTTCAAGCTCGATCTTCTCTATCATCATCGTCCATGGCCTC
GAATTCGCAAGCTATCCTTCTCCTTCAGAAACAACTGAAAGATCTGTGTAAGCATCCTGT
TGATGGATTCTCCGCTGGGCTCGTCGACGAGAAGAATATATTCGAGTGGAACGTTACCAT
CATCGGACCTCCAGATACTCTCTATGAAGGAGGATTCTTTAACGCTATAATGAGCTTCCC
TCAGAATTATCCGAATAGTCCACCAACCGTTAGGTTTACTTCAGATATGTGGCATCCTAA
TGTTTATTCTGATGGTCGTGTTTGCATTTCGATTCTGCACCCTCCTGGTGATGATCCAAG
TGGTTATGAGCTTGCTAGCGAGCGCTGGACCCCTGTTCATACTGTTGAGAGTATTATGTT
GAGTATTATATCTATGCTTTCTGGTCCAAACGATGAGTCTCCTGCAAACGTTGAAGCTGC
TAAAGAATGGCGTGAGAAGAGAGACGAGTTCAAGAAGAAAGTTAGCCGGTGTGTGAGAAA
GTCTCAAGAAATGTTATGAACAAACTACGAACTTTTCCACAATTATGATATCTCTCTGGA
GTTTCATCAAAGTTCTTCATGTTCCCCTTATCTGAAACCCTTCAAAAAAACTGCCCAAAC
ACAACCTGGTTTTACATTTTTATTTTTCTTGCGCAGAGCTTTCTGAAATGTGTTGTTGAA
TTCTCGAGTAACTGGTTATCATAATGATAAAAACTTGTATTCGTTAAGAATAATGCTTCT
TTGCTCTT


BQ
10 10 10 10 10 30 30 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EN53TF U 294
AF RS1ER61TF U 1
AF RS1C288TF U 3
AF RS1CC77TF U 6
AF RS1C288JQ C 6
AF RS1CC77JQ C 7
AF RS1B964TF U 1
AF RS1B964JQ C 64
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RD RS1EN53TF 170 0 0
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ATCCAAGTGGTTATGAGCTTGCTAGCGAGCGCTGGACCCCTGTTCATACTGTTGAGAGTA
TTATGTTGAGTATTATATCTATGCTTTCTGGTCCAAACGATGAGTCTCCT

QA 1 170 1 170
DS 

RD RS1ER61TF 623 0 0
GGCTC
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CGCAAGCTATCCTTCTCCTTCAGAAACAACTGAAAGATCTGTGTAAGCATCCTGTTGATG
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GACCTCCAGATACTCTCTATGAAGGAGGATTCTTTAACGCTATAATGAGCTTCCCTCAGA
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ATTCTGATGGTCGTGTTTGCATTTCGATTCTGCACCCTCCTGGTGATGATCCAAGTGGTT
ATGAGCTTGCTAGCGAGCGCTGGACCCCTGTTCATACTGTTGAGAGTATTATGTTGAGTA
TTATATCTATGCTTTCTGGTCCAAACGATGAGTCTCCTGCAAACGTTGAAGCTGCTAAAG
AATGGCGTGAGAAGAGAGACGAGTTCAAGAAGAAAGTTAGCCGGTGTGTGAGAAAGTCTC
AAGAAATGTTATGAACAAACTACGAACTTTTCCACAATTATGATATCTCTCTGGAGTTTC
ATCAAAGTTCTTCATGTT

QA 6 623 6 623
DS 

RD RS1C288TF 751 0 0
GGC
TCAAATCTCTGGAGTTTCAAGCTCGATCTTCTCTATCATCATCGTCCATGGCCTCGAATT
CGCAAGCTATCCTTCTCCTTCAGAAACAACTGAAAGATCTGTGTAAGCATCCTGTTGATG
GATTCTCCGCTGGGCTCGTCGACGAGAAGAATATATTCGAGTGGAACGTTACCATCATCG
GACCTCCAGATACTCTCTATGAAGGAGGATTCTTTAACGCTATAATGAGCTTCCCTCAGA
ATTATCCGAATAGTCCACCAACCGTTAGGTTTACTTCAGATATGTGGCATCCTAATGTTT
ATTCTGATGGTCGTGTTTGCATTTCGATTCTGCACCCTCCTGGTGATGATCCAAGTGGTT
ATGAGCTTGCTAGCGAGCGCTGGACCCCTGTTCATACTGTTGAGAGTATTATGTTGAGTA
TTATATCTATGCTTTCTGGTCCAAACGATGAGTCTCCTGCAAACGTTGAAGCTGCTAAAG
AATGGCGTGAGAAGAGAGACGAGTTCAAGAAGAAAGTTAGCCGGTGTGTGAGAAAGTCTC
AAGAAATGTTATGAACAAACTACGAACTTTTCCACAATTATGATATCTCTCTGGAGTTTC
ATCAAAGTTCTTCATGTTCCCCTTATCTGAAGCCCTTCAAAAAA*CTGCCCAAACACAAC
CTGGTTTTACATTTTTATTTT*CTTGCGCAGAGCTTTCTGAAATGTGTTGTTGAATTCTC
GAGTAACTGGTTATCATAATGATAAAAA

QA 4 751 4 751
DS 

RD RS1CC77TF 750 0 0
GG
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TTCTCCGCTGGGCTCGTCGACGAGAAGAATATATTCGAGTGGAACGTTACCATCATCGGA
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TCTGATGGTCGTGTTTGCATTTCGATTCTGCACCCTCCTGGTGATGATCCAAGTGGTTAT
GAGCTTGCTAGTGAGCGCTGGACCCCTGTTCATACTGTTGAGAGTATTATGTTGAGTATT
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TGGCGTGAGAAGAGAGGCGAGTTCAAGAAGAAAGTTAGCCGGTGTGTGAGAAAGTCTCAA
GAAATGTTATGAACAAACTACGAACTTTTCCACAATTATGATATCTCTCTGGAGTTTCAT
CAAAGTTCTTCATGTTCCCCTTATCTGAAACCCTTCAAAAAA*CTGCCCAAACACAACCT
GGTTTTACATTTTTATTTT*CTTGCGCAGAGCTTTCTGAAATGTGTTGTTGAATTCTCGA
GTAACTGGTTATCATA
TGATAAAACTTG

QA 3 738 3 738
DS 

RD RS1C288JQ 766 0 0
TCAAATCTCTGGAGTTTCAAGCTCGATCTTCTCTATCATCATCGTCCATGGCCTCGAATT
CGCAAGCTATCCTTCTCCTTCAGAAACAACTGAAAGATCTGTGTAAGCATCCTGTTGATG
GATTCTCCGCTGGGCTCGTCGACGAGAAGAATATATTCGAGTGGAACGTTACCATCATCG
GACCTCCAGATACTCTCTATGAAGGAGGATTCTTTAACGCTATAATGAGCTTCCCTCAGA
ATTATCCGAATAGTCCACCAACCGTTAGGTTTACTTCAGATATGTGGCATCCTAATGTTT
ATTCTGATGGTCGTGTTTGCATTTCGATTCTGCACCCTCCTGGTGATGATCCAAGTGGTT
ATGAGCTTGCTAGCGAGCGCTGGACCCCTGTTCATACTGTTGAGAGTATTATGTTGAGTA
TTATATCTATGCTTTCTGGTCCAAACGATGAGTCTCCTGCAAACGTTGAAGCTGCTAAAG
AATGGCGTGAGAAGAGAGACGAGTTCAAGAAGAAAGTTAGCCGGTGTGTGAGAAAGTCTC
AAGAAATGTTATGAACAAACTACGAACTTTTCCACAATTATGATATCTCTCTGGAGTTTC
ATCAAAGTTCTTCATGTTCCCCTTATCTGAAGCCCTTCAAAAAAACTGCCCAAACACAAC
CTGGTTTTACATTTTTATTTTTCTTGCGCAGAGCTTTCTGAAATGTGTTGTTGAATTCTC
GAGTAACTGGTTATCATAATGATAAAAACTTGTATTCGTT
AAGAGT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1CC77JQ 759 0 0
GG
AATCTCTGGAGTTTCAAGCTCGATCTTCTCTATCATCATCGTCCATGGCCTCGAATTCGC
AAGCTATCCTTCTCCTTCAGAAACAACTGAAAGATCTGTGTAAGCATCCTGTTGATGGAT
TCTCCGCTGGGCTCGTCGACGAGAAGAATATATTCGAGTGGAACGTTACCATCATCGGAC
CTCCAGATACTCTCTATGAAGGAGGATTCTTTAACGCTATAATGAGCTTCCCTCAGAATT
ATCCGAATAGTCCACCAACCGTTAGGTTTACTTCAGATATGTGGCATCCTAATGTTTATT
CTGATGGTCGTGTTTGCATTTCGATTCTGCACCCTCCTGGTGATGATCCAAGTGGTTATG
AGCTTGCTAGTGAGCGCTGGACCCCTGTTCATACTGTTGAGAGTATTATGTTGAGTATTA
TATCTATGCTTTCTGGTCCAAACGATGAGTCTCCTGCAAACGTTGAAGCTGCTAAAGAAT
GGCGTGAGAAGAGAGGCGAGTTCAAGAAGAAAGTTAGCCGGTGTGTGAGAAAGTCTCAAG
AAATGTTATGAACAAACTACGAACTTTTCCACAATTATGATATCTCTCTGGAGTTTCATC
AAAGTTCTTCATGTTCCCCTTATCTGAAACCCTTCAAAAAAACTGCCCAAACACAACCTG
GTTTTACATTTTTATTTTTCTTGCGCAGAGCTTTCTGAAATGTGTTGTTGAATTCTCGAG
TAACTGGTTATCATAATGATAAAAACTTGTATTCGTT

QA 3 759 3 759
DS 

RD RS1B964TF 788 0 0
GGCTCTCAAATCTCTGGAGTTTCAAGCTCGATCTTCTCTATCATCATCGTCCATGGCCTC
GAATTCGCAAGCTATCCTTCTCCTTCAGAAACAACTGAAAGATCTGTGTAAGCATCCTGT
TGATGGATTCTCCGCTGGGCTCGTCGACGAGAAGAATATATTCGAGTGGAACGTTACCAT
CATCGGACCTCCAGATACTCTCTGTGAAGGAGGATTCTTTAACGCTATAATGAGCTTCCC
TCAGAATTATCCGAATAGTCCACCAACCGTTAGGTTTACTTCAGATATGTGGCATCCTAA
TGTTTATTCTGATGGTCGTGTTTGCATTTCGATTCTGCACCCTCCTGGTGATGATCCAAG
TGGTTATGAGCTTGCTAGCGAGCGCTGGACCCCTGTTCATACTGTTGAGAGTATTATGTT
GAGTATTATATCTATGCTTTCTGGTCCAAACGATGAGTCTCCTGCAAACGTTGAAGCTGC
TAAAGAATGGCGTGAGAAGAGAGACGAGTTCAATAAGAAAGTTAGCCGGTGTGTGAGAAA
GTCTCAAGAAATGTTATGAAGAAACTACGAACTTTTCCACAATTATGATATCTCTCTGGA
GTTTCATCAAAGTTCTTCATGTTCCCCTTATCTGAAACCCTTCAAAAAA*CTGCCCAAAC
ACAACCTGGTTTTACATTTTTATTTTTCTTGCGCAGAGCTTTCTGAAATGTGTTGTTGAA
TTCTCGAGTAACTGGTTATCATAATGATAAAAC*TTGTATTCGTAA*GAA*AATGCTTCT
TTGCTCTT

QA 1 788 1 788
DS 

RD RS1B964JQ 725 0 0
TTCGCAAGCTATCCTTCTCCTTCAGAAACAACTGAAAGATCTGTGTAAGCATCCTGTTGA
TGGATTCTCCGCTGGGCTCGTCGACGAGAAGAATATATTCGAGTGGAACGTTACCATCAT
CGGACCTCCAGATACTCTCTGTGAAGGAGGATTCTTTAACGCTATAATGAGCTTCCCTCA
GAATTATCCGAATAGTCCACCAACCGTTAGGTTTACTTCAGATATGTGGCATCCTAATGT
TTATTCTGATGGTCGTGTTTGCATTTCGATTCTGCCCCCTCCTGGTGATGATCCAAGTGG
TTATGAGCTTGCTAGCGAGCGCTGGACCCCTGTTCATACTGTTGAGAGTATTATGTTGAG
TATTATATCTATGCTTTCTGGTCCAAACGATGAGTCTCCTGCAAACGTTGAAGCTGCTAA
AGAATGGCGTGAGAAGAGAGACGAGTTCAATAAGAAAGTTAGCCGGTGTGTGAGAAAGTC
TCAAGAAATGTTATGAAGAAACTACGAACTTTTCCACAATTATGATATCTCTCTGGAGTT
TCATCAAAGTTCTTCATGTTCCCCTTATCTGAAACCCTTCAAAAAAACTGCCCAAACACA
ACCTGGTTTTACATTTTTATTTTTCTTGCGCAGAGCTTTCTGAAATGTGTTGTTGAATTC
TCGAGTAACTGGTTATCATAATGATAAAAACTTGTATTCGTTAAGAATAATGCTTCTTTG
CTCTT

QA 1 725 1 725
DS 



CO CL140Contig2 861 3 2 U
AACGAATACAAGTTTTTATCATTATGATAACCAGTTACTCGAGAATTCAACAACACATTT
CAGAAAGCTCTGCGCAAGAAAAATAAAAATGTAAAACCAGGTTGTGTTTGGGCAGTTTTT
TTGAAGGGTTTCAGATAAGGGGAACATGAAGAACTTTGATGAAACTCCAGAGAGATATCA
TAATTGTGGAAAAGTTCGTAGTTTGTTCATAACATTTCTTGAGACTTTCTCACACACCGG
CTAACTTTCTTCTTGAACTCGTCTCTCTTCTCACGCCATTCTTTAGCAGCTTCAACGTTT
GCAGGAGACTCATCGTTTGGACCAGAAAGCATAGATATAATACTCAACATAATACTCTCA
ACAGTATGAAAAGGGGTCCAGCGCTCGCTAGCAAGCTCATAACCACTTGGATCATCACCA
GGAGGGTGCAGAATCGAAATGCAAACACGACCATCAGAATAAACATTAGGATGCCACATA
TCTGAAGTAAACCTAACGGTTGGTGGACTATTCGGATAATTCTGAGGGAAGCTCATTATA
GCGTTAAAGAATCCTCCTTCACTGCACCAATAAACACACACCAAATAATAATGATTCCAT
TCTCTTAAAATCTCTATTCAAAAATCAATTCGATTACTGTTTCTCAATCTGATCTAACAA
ATGTTTTCAAATCTCAAAAGCGTACTAGAGAGTATCTGGAGGTCCGATGATGGTAACGTT
CCACTCGAATATATTCTTCTCGTCGACGAGCCCAGCGGAGAATCCATCAACAGATGCTTA
CACAGATCTGAATCAAAGAGAAATCAAATTAAGAAACTAAGCATCAGAGAGAGACCATGG
ATCGTGCGTGCGTGCGTGCAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EP76TF C 13
AF RS1BP71JQ U 1
AF RS1DO93JQ U 1
BS 1 769 RS1BP71JQ
BS 770 861 RS1DO93JQ

RD RS1EP76TF 561 0 0
TTTTTATCATTATGATAACCAGTTACTCGAGAATTCAACAACACATTTCAGAAAGCTCTG
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AGATAAGGGGAACATGAAGAACTTTGATGAAACTCCAGAGAGATATCATAATTGTGGAAA
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TTGAACTCGTATCTCTTCTCACGCCATTCTTTAGCAGCTTCAACGTTTGCAGGAGACTCA
TCGTTTGGACCAGAAAGCATAGATATAATACTCAACATAATACTCTCAACAGTGTGAACA
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ATCGAAATGCAAACACGACCATCAGAATAAACATTAGGATGCCACATATCTGAAGTAAAC
CTAACGGTTGGTGGACTATTCGGATAATTCTGAGGGAAGCTCATTATAGCGTTAAAGAAT
CCTCCTTCACTGCACCAATA
C

QA 1 560 1 560
DS 

RD RS1BP71JQ 769 0 0
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TTGAAGGGTTTCAGATAAGGGGAACATGAAGAACTTTGATGAAACTCCAGAGAGATATCA
TAATTGTGGAAAAGTTCGTAGTTTGTTCATAACATTTCTTGAGACTTTCTCACACACCGG
CTAACTTTCTTCTTGAACTCGTCTCTCTTCTCACGCCATTCTTTAGCAGCTTCAACGTTT
GCAGGAGACTCATCGTTTGGACCAGAAAGCATAGATATAATACTCAACATAATACTCTCA
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GCGTTAAAGAATCCTCCTTCACTGCACCAATAAACACACACCAAATAATAATGATTCCAT
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CCACTCGAATATATTCTTCTCGTCGACGAGCCCAGCGGAGAATCCATCA

QA 1 769 1 769
DS 

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AACGAATACAAGTTTTTATCATTATGATAACCAGTTACTCGAGAATTCAACAACACATTT
CAGAAAGCTCTGCGCAAGAAAAATAAAAATGTAAAACCAGGTTGTGTTTGGGCAGTTTTT
TTGAAGGGTTTCAGATAAGGGGAACATGAAGAACTTTGATGAAACTCCAGAGAGATATCA
TAATTGTGGAAAAGTTCGTAGTTTGTTCATAACATTTCTTGAGACTTTCTCACACACCGG
CTAACTTTCTTCTTGAACTCGTCTCTCTTCTCACGCCATTCTTTAGCAGCTTCAACGTTT
GCAGGAGACTCATCGTTTGGACCAGAAAGCATAGATATAATACTCAACATAATACTCTCA
ACAGTATGAAAAGGGGTCCAGCGCTCGCTAGCAAGCTCATAACCACTTGGATCATCACCA
GGAGGGTGCAGAATCGAAATGCAAACACGACCATCAGAATAAACATTAGGATGCCACATA
TCTGAAGTAAACCTAACGGTTGGTGGACTATTCGGATAATTCTGAGGGAAGCTCATTATA
GCGTTAAAGAATCCTCCTTCACTGCACCAATAAACACACACCAAATAATAATGATTCCAT
TCTCTTAAAATCTCTATTCAAAAATCAATTCGATTACTGTTTCTCAATCTGATCTAACAA
ATGTTTTCAAATCTCAAAAGCGTACTAGAGAGTATCTGGAGGTCCGATGATGGTAACGTT
CCACTCGAATATATTCTTCTCGTCGACGAGCCCAGCGGAGAATCCATCAACAGATGCTTA
CACAGATCTGAATCAAAGAGAAATCAAATTAAGAAACTAAGCATCAGAGAGAGACCATGG
ATCGTGCGTGCGTGCGTGCAT

QA 1 861 1 861
DS 



CO CL140Contig3 767 2 2 U
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CCTCGAATTCGCAAGCTATCCTTCTCCTTCAGAAACAACTGAAAGGCATGCACGCACGCA
CGCACGAATCCATGGTTCTCTCTTCTGATTGCTTAGTTTCTTAATTTTGATTTCTCTTTT
GATTTCAGATCTGTGTAAGCATCCTGTTGATGGATTCTCCGCTGGGCTCGTCGACGAGAA
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GAGGATTCTTTAACGCTATAATGAGCTTCCCTCAGAATTATCCGAATAGTCCACCAACCG
TTAGGTTTACTTCAGATATGTGGCATCCTAATGTTTATTCTGATGGTCGTGTTTGCATTT
CGATTCTGCACCCTCCTGGTGATGATCCAAGTGGTTATGAGCTTGCTAGCGAGCGCTGGA
CCCCTTTTCATACTGTTGAGAGTATTATGTTGAGTATTATATCTATGCTTTCTGGTCCAA
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TCAAGAGAAAGTTAGCCCGTGTGTGAGAAGTCTCAAGAAATGTTATG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1BP71TF U 1
AF RS1DO93TF U 1
BS 1 723 RS1BP71TF
BS 724 767 RS1DO93TF

RD RS1BP71TF 723 0 0
GGCTCTCTCTCAAATCTCTGGAGTTTCAAGCTCGATCTTCTCTATCATCATCGTCCATGG
CCTCGAATTCGCAAGCTATCCTTCTCCTTCAGAAACAACTGAAAGGCATGCACGCACGCA
CGCACGAATCCATGGTTCTCTCTTCTGATTGCTTAGTTTCTTAATTTTGATTTCTCTTTT
GATTTCAGATCTGTGTAAGCATCCTGTTGATGGATTCTCCGCTGGGCTCGTCGACGAGAA
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TGAGATTTGAAAACATTTGTTAGATCAGATTGAGAAACAGTAATCGAATTGATTTTTGAA
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CGATTCTGCACCCTCCTGGTGATGATCCAAGTGGTTATGAGCTTGCTAGCGAGCGCTGGA
CCCCTTTTCATACTGTTGAGAGTATTATGTTGAGTATTATATCTATGCTTTCTGGTCCAA
ACGATGAGTCTCCTGCAAACGTTGAAGCTGCTAAAGAATGGCGTGAGAAGAGAGACGAGT
TCA

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1DO93TF 767 0 0
GGCTCTCTCTCAAATCTCTGGAGTTTCAAGCTCGATCTTCTCTATCATCATCGTCCATGG
CCTCGAATTCGCAAGCTATCCTTCTCCTTCAGAAACAACTGAAAGGCATGCACGCACGCA
CGCACGAATCCATGGTTCTCTCTTCTGATTGCTTAGTTTCTTAATTTTGATTTCTCTTTT
GATTTCAGATCTGTGTAAGCATCCTGTTGATGGATTCTCCGCTGGGCTCGTCGACGAGAA
GAATATATTCGAGTGGAACGTTACCATCATCGGACCTCCAGATACTCTCTAGTACGCTTT
TGAGATTTGAAAACATTTGTTAGATCAGATTGAGAAACAGTAATCGAATTGATTTTTGAA
TAGAGATTTTAAGAGAATGGAATCATTATTATTTGGTGTGTGTTTATTGGTGCAGTGAAG
GAGGATTCTTTAACGCTATAATGAGCTTCCCTCAGAATTATCCGAATAGTCCACCAACCG
TTAGGTTTACTTCAGATATGTGGCATCCTAATGTTTATTCTGATGGTCGTGTTTGCATTT
CGATTCTGCACCCTCCTGGTGATGATCCAAGTGGTTATGAGCTTGCTAGCGAGCGCTGGA
CCCCTTTTCATACTGTTGAGAGTATTATGTTGAGTATTATATCTATGCTTTCTGGTCCAA
ACGATGAGTCTCCTGCAAACGTTGAAGCTGCTAAAGAATGGCGTGAGAAGAGAGACGAGT
TCAAGAGAAAGTTAGCCCGTGTGTGAGAAGTCTCAAGAAATGTTATG

QA 1 767 1 767
DS 



AS 3 12

CO CL141Contig1 332 2 11 U
CAAAAACAAAAAAAGTGATTTATTTTGATGAATACAAACAAAAATATCCAAAAAAAAAAA
AAAAAAAACCAAAAACAGCAAATAAAAAAATCATAATGATACTACCTCTGAAAAGTCAAA
CAAAAACCTATTACATGAAAAGGTTGGGTTTGGATGCCTTGTAAGGGGTCTTCACCTTCC
TGCTTGGGGGTCCCCCCTTACGGAACACCAAGGGGAACTTAATCTTACTGTTGTGAAACT
GCTTGGTGCTCTCTCTCTTGCAAAATTTGGCGGGAACAGTTGCCGTCTTAATGATCTGGA
TGCAAGGGAACCTGACACGGGGTCGGGATGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EC52JQ U 1
AF RS1E579JQ U 1
BS 1 49 RS1E579JQ
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BS 166 166 RS1EC52JQ
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BS 265 265 RS1EC52JQ
BS 266 332 RS1E579JQ

RD RS1EC52JQ 275 0 0
CAAAAACAAA
AAAAGTGATTTATTTTGATGAATACAAACAAAAATATCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAACC
AAAAACCGCAAATAAAAAAATCATAATGATACTACCTCTGAAAAGTCAAACAAAAACCTA
TTACATGAAAAGGTTGGGTTTGGATGCCTTGTAAGGGGTCTTCACCTTCCTGCTTGGGGG
TCCCCCCTTACGGAACCCCAAGGGGAACTTAATCTTACTGTTGTGAAACTGCTTGGTGCT
CTCTCTCTTGCAAAATTTGGCGGGA

QA 11 275 11 275
DS 

RD RS1E579JQ 332 0 0
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AAAAAAAGCCAAAAACAGCAAATAAAAAAATCATAATGATACTAGCTCTGAAAAGTCAAA
CAAAAACCTATTACATGAAAAGGTTGGGTTTGGATGCCTTGTAAGTGGTCTTCACCTTCC
TGCTTGGGGGTCCCCCCTTACGGAACACCAAGGGGAACTTAATCTTACTGTTGTGAAACT
GCTTGGTGCTCTCTCTCTTGCAAAGTTTGGCGGGAACAGTTGCCGTCTTAATGATCTGGA
TGCAAGGGAACCTGACACGGGGTCGGGATGCC

QA 1 332 1 332
DS 



CO CL141Contig2 711 2 2 U
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AGAACTGGGTACCACAACATGTACAAAGAGTACCGTGACACTACCTTGAACGGAGCCGTC
GAGCAGATGTACACTGAGATGGCATCCCGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATCCAGATC
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AACAGTAAGATTAAGTTCCCCTTGGTGTTCCGTAAGGTGAGACCACCAAGCAGGAAGCTG
AAGACCACTTACAAGGCATCCAAACCCAACCTTTTCATGTAATAGGTCTCTGTTTGACTT
CTCAGAGCTAGTATCATTATGATTTTCTTATCTGCTGTTTTTGGCTCTTCTTTTTTTTTC
TCGGATATTTTTGTTTGTATTCATCAAACTAAATCACTTTTCTTGCTCTTG


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E579TF U 1
AF RS1EC52TF U 1
BS 1 644 RS1E579TF
BS 645 711 RS1EC52TF

RD RS1E579TF 653 0 0
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TTTTTGAGGAAGCTGAAGAAGGTCAAGAAGAGTAATGGACAGATGCTCGCCATTAACGAG
ATCTTTGAGAAGAACCCAACGACCATCAAGAACTTCGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAGC
AGAACTGGGTACCACAACATGTACAAAGAGTACCGTGACACTACCTTGAACGGAGCCGTC
GAGCAGATGTACACTGAGATGGCATCCCGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATCCAGATC
ATTAAGACGGCAACTGTTCCCGCCAAACTCTGCAAGAGAGAGAGCACCAAGCAGTTTCAC
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CTCAGAGCTAGTATCATTATGATTTTCTTATCTGCTGTTTTTGG
CTCTTCTTT

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1EC52TF 711 0 0
GGG
CTTGAGGTTTCTTCCGCACTGCCAACCCCTGTCGAGACGAAAATGGTTGCTTTCAGGTTT
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TACAGGATGAAGCTCTGGGCCACCAACGAGGTTCGTGCCAAGTCCAAGTTCTGGTATTTT
TTGAGGAAGCTGAAGAAGGTCAAGAAGAGTAATGGACAGATGCTCGCCATTAACGAGATC
TTTGAGAAGAACCCAACGACCATCAAGAACTTCGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAGCAGA
ACTGGGTACCACAACATGTACAAAGAGTACCGTGACACTACCTTGAACGGAGCCGTCGAG
CAGATGTACACTGAGATGGCATCCCGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATCCAGATCATT
AAGACGGCAACTGTTCCCGCCAAACTCTGCAAGAGAGAGAGCACCAAGCAGTTTCACAAC
AGTAAGATTAAGTTCCCCTTGGTGTTCCGTAAGGTGAGACCACCAAGCAGGAAGCTGAAG
ACCACTTACAAGGCATCCAAACCCAACCTTTTCATGTAATAGGTCTCTGTTTGACTTCTC
AGAGCTAGTATCATTATGATTTTCTTATCTGCTGTTTTTGGCTCTTCTTTTTTTTTCTCG
GATATTTTTGTTTGTATTCATCAAACTAAATCACTTTTCTTGCTCTTG

QA 4 711 4 711
DS 



CO CL141Contig3 765 8 6 U
GGGCTTGAGGTTTCTTCCGCACTGCCAACCCCTCTCGAGACGAAAATGGTTGCTTTCAGG
TTTCACCAGTACCAGGTTGTCGGAAGAGCTCTCCCGACAGAGAAGGATGTGCAGCCCAAG
ATTTACAGGATGAAGCTTTGGGCCACGAACGAGGTTCGTGCCAAGTCCAAGTTCTGGTAT
TTTTT*GAGGAAGCTGAAGAAGGTCAAGAAGAGTAATGGACAGATGCTCGCCATTAACGA
GATCTTTGAGAAGAACCCGACGACCATCAAGAACTTCGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAG
CAGAACTGGGTACCACAACATGTACAAGGAGTACCGTGACACTACCTTGAACGGAGCCGT
CGAGCAGATGTACACTGAGATGGCATCCCGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATCCAGAT
CATTAAGACAGCAACTGTTCCCGCCAAACTCTGCAAGAGGGAGAGCACCAAACAGTTTCA
CAACAGTAAGATTAAGTTCCCCTTGGTATTCCGCAAGGTGAGACCACCAAGCAGGAAGCT
CAAGACCACTTACAAGGCATCCAAACCCAACCTTTTCATGTAATAAGTCTCTTATTGACT
TTCACATCTTTTTTGGTTGGGGGCTAGTATCGTTATGATGTCTATGTTATCTGCTCTTTT
GGCTTTTGTTTCTTCTTGGATATTTTTGCTTATCAATATTTTAGATGTTGTGTCCATCAA
ACTAAAGTACTCTCTCTTTCTTATGAAAAAACTTTTACCTTGTTT


BQ
10 10 10 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RS1E714TF U 364
AF RS1E714JQ C 419
AF RS1EM14TF U 1
AF RS1F168TF U 56
AF RS1DO69TF U 25
AF RS1H453TF U 5
AF RS1EM14JQ C 4
AF RS1DO69JQ C 76
BS 1 270 RS1EM14TF
BS 271 271 RS1F168TF
BS 272 750 RS1EM14TF
BS 751 751 RS1EM14JQ
BS 752 764 RS1EM14TF
BS 765 765 RS1DO69JQ

RD RS1E714TF 167 0 0
GCAGATGTACACTGAGATGGCATCCCGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATCCAGATCAT
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CAGTAAGATTAAGTTCCCCTTGGTATTCCGCAAGGTGAGACCACCAA

QA 1 167 1 167
DS 

RD RS1E714JQ 238 0 0
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CACAACAGTAAGATTAAGTTCCCCTTGGTATTCCGCAAGGTGAGACCACCAAGCAGGAAG
CTCAAGACCACTTACAAGGCATCCAAACCCAACCTCTTCATGTAATAAGTCTCTTATTGA
CTTTCACATCTTTTTTGGTTGGGGGGTAGTATCGTTATGATGTCTATGTTATCTGCTC

QA 1 238 1 238
DS 

RD RS1EM14TF 764 0 0
GGGCTTGAGGTTTCTTCCGCACTGCCAACCCCTCTCGAGACGAAAATGGTTGCTTTCAGG
TTTCACCAGTACCAGGTTGTCGGAAGAGCTCTCCCGACAGAGAAGGATGTGCAGCCCAAG
ATTTACAGGATGAAGCTTTGGGCCACGAACGAGGTTCGTGCCAAGTCCAAGTTCTGGTAT
TTTTT*GAGGAAGCTGAAGAAGGTCAAGAAGAGTAATGGACAGATGCTCGCCATTAACGA
GATCTTTGAGAAGAACCCGACGACCATCAATAACTTCGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAG
CAGAACTGGGTACCACAACATGTACAAGGAGTACCGTGACACTACCTTGAACGGAGCCGT
CGAGCAGATGTACACTGAGATGGCATCCCGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATCCAGAT
CATTAAGACAGCAACTGTTCCCGCCAAACTCTGCAAGAGGGAGAGCACCAAACAGTTTCA
CAACAGTAAGATTAAGTTCCCCTTGGTATTCCGCAAGGTGAGACCACCAAGCAGGAAGCT
CAAGACCACTTACAAGGCATCCAAACCCAACCTTTTCATGTAATAAGTCTCTTATTGACT
TTCACATCTTTTTTGGTTGGGGGCTAGTATCGTTATGATGTCTATGTTATCTGCTCTTTT
GGCTTTTGTTTCTTCTTGGATATTTTTGCTTATCAATATTTTAGATGTTGTGTCCATCAA
ACTAAAGTACTCTCTCTTTCTTATGAAAAA*CTTTTACCTTGTT

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1F168TF 681 0 0
TCAGGTTTCACCAGTACCAGGTTGTCGGAAGAGCTCTCCCGACAGAGAAGGATGTGCAGC
CCAAGATTTACAGGATGAAGCTTTGGGCCACGAACGAGGTTCGTGCCAAGTCCAAGTTCT
GGTATTTTTT*GAGGAAGCTGAAGAAGGTCAAGAAGAGTAATGGACAGATGCTCGCCATT
AACGAGATCTTTGAGAAGAACCCGACGACCATCAAGAACTTCGGAATCTGGTTGAGGTAC
CAGAGCAGAACTGGGTACCACAACATGTACAAGGAGTACCGTGACACTACCTTGAACGGA
GCCGTCGAGCAGATGTACACTGAGATGGCATCCCGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATC
CAGGTCATTAAGACATCAACTGTTCCCGCCAAACTCTGCAAGAGGGAGAGCACCAAACAG
TTTCACAACAGTAAGATTAAGTTCCCCTTGGTATTCCGCAAGGTGAGACCACCAAGCAGG
AAGCTCAAGACCACTTACAAGGCATCCAAACCCAACCTTTTCATGTAATAAGTCTCTTAT
TGACTTTCACATCTTTTTTGGTTGGGGGCTATTATCGTTATGATGTCTATGTTATCTGCT
CTTTTGGCTTTTGTTTCTTCTTGGATATTTTTGCTTATCAATATTTTAGATGTTGTGTCC
ATCAAACTAAAGTACTCTCTC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RS1DO69TF 711 0 0
GG
AACCCCTCTCGAGACGAAAATGGTTGCTTTCAGGTTTCACCAGTACCAGGTTGTCGGAAG
AGCTCTCCCGACAGAGAAGGATGTGCAGCCCAAGATTTACAGGATGAAGCTTTGGGCCAC
GAACGAGGTTCGTGCCAAGTCCAAGTTCTGGTATTTTTT*GAGGAAGCTGAAGAAGGTCA
AGAAGAGTAATGGACAGATGCTCGCCATTAACGAGATCTTTGAGAAGAACCCGACGACCA
TCAAGAACTTCGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAGCAGAACTGGGTACCACAACATGTACA
AGGAGTACCGTGACACTACCTTGAACGGAGCCGTCGAGCAGATGTACACTGAGATGGCAT
CCCGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATCCAGATCATTAAGACAGCAACTGTTCCCGCCA
AACTCTGCAAGAGGGAGAGCACCAAACAGTTTCACAACAGTAAGATTAAGTTCCCCTTGG
TATTCCGCAAGGTGAGACCACCAAGCAGGAAGCTCAAGACCACTTACAAGGCATCCAAAC
CCAACCTTTTCATGTAATAAGTCTCTTATTGACTTTCACATCTTTTTTGGTTGGGGGCTA
GTATCGTTATGATGTCTATGTTATCTGCTCTTTTGGCTTTTGTTTCTTCTTGGATATTTT
TGCTTATCAATATTTTAGATGTTGTGTCCATCAAACTAAAGTACTCTCT

QA 3 711 3 711
DS 

RD RS1H453TF 731 0 0
GG
GAGGTTTCTTCCGCACTGCCAACCCCTCTCGAGACGAAAATGGTTGCTTTCAGGTTTCAC
CAGTACCAGGTTGTCGGAAGAGCTCTCCCGACAGAGAAGGATGTGCAGCCCAAGATTTAC
AGGATGAAGCTTTGGGCCACGAACGAGGTTCGTGCCAAGTCCAAGTTCTGGTATTTTTTT
GAGGAAGCTGAAGAAGGTCAAGAAGAGTAATGGACAGATGCTCGCCATTAACGAGATCTT
TGAGAAGAACCCGACGACCATCAAGAACTTCGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAGCAGAAC
TGGGTACCACAACATGTACAAGGAGTACCGTGACACTACCTTGAACGGAGCCGTCGAGCA
GATGTACACTGAGATGGCATCCCGACACCGAGTCAGGTTCCCTTGCATCCAGATCATTAA
GACAGCAACTGTTCCCGCCAAACTCTGCAAGAGGGAGAGCACCAAACAGTTTCACAACAG
TAAGATTAAGTTCCCCTTGGTATTCCGCAAGGTGAGACCACCAAGCAGGAAGCTCAAGAC
CACTTACAAGGCATCCAAACCCAACCTTTTCATGTAATAAGTCTCTTATTGACTTTCACA
TCTTTTTTGGTTGGGGGCTAGTATCGTTATGATGTCTATGTTATCTGCTCTTTTGGCTTT
TGTTTCTTCTTGGATATTTTTGCTTATCAATATTTTAGATGTTGTGTCCATCAA*CTAAA
GTACTCTCT

QA 3 731 3 731
DS 

RD RS1EM14JQ 761 0 0
CTTGAGGTTTCTTCCGCACTGCCAACCCCTCTCGAGACGAAAATGGTTGCTTTCAGGTTT
CACCAGTACCAGGTTGTCGGAAGAGCTCTCCCGACAGAGAAGGATGTGCAGCCCAAGATT
TACAGGATGAAGCTTTGGGCCACGAACGAGGTTCGTGCCAAGTCCAAGTTCTGGTATTTT
TT*GAGGAAGCTGAAGAAGGTCAAGAAGAGTAATGGACAGATGCTCGCCATTAACGAGAT
CTTTGAGAAGAACCCGACGACCATCAATAACTTCGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAGCAG
AACTGGGTACCACAACATGTACAAGGAGTACCGTGACACTACCTTGAACGGAGCCGTCGA
GCAGATGTACACTGAGATGGCATCCCGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATCCAGATCAT
TAAGACAGCAACTGTTCCCGCCAAACTTTGCAAGAGGGAGAGCACCAAACAGTTTCACAA
CAGTAAGATTAAGTTCCCCTTGGTATTCCGCAAGGTGAGACCACCAAGCAGGAAGCTCAA
GACCACTTACAAGGCATCCAAACCCAACCTTTTCATGTAATAAGTCTCTTATTGACTTTC
ACATCTTTTTTGGTTGGGGGCTAGTATCGTTATGATGTCTATGTTATCTGCTCTTTTGGC
TTTTGTTTCTTCTTGGATATTTTTGCTTATCAATATTTTAGATGTTGTGTCCATCAAACT
AAAGTACTCTCTCTTTCTTATGAAAAAACTTTTACCTTGTT

QA 1 761 1 761
DS 

RD RS1DO69JQ 690 0 0
GTTGTCGGAAGAGCTCTCCCGACAGAGAAGGATGTGCAGCCCAAGATTTACAGGATGAAG
CTTTGGGCCACGAACGAGGTTCGTGCCAAGTCCAAGTTCTGGTATTTTTT*GAGGAAGCT
GAAGAAGGTCAAGAAGAGTAATGGACAGATGCTCGCCATTAACGAGATCTTTGAGAAGAA
CCCGACGACCATCAAGAACTTCGGAATCTGGTTGAGGTACCAGAGCAGAACTGGGTACCA
CAACATGTACAAGGAGTACCGTGACACTACCTTGAACGGAGCCGTCGAGCAGATGTACAC
TGAGATGGCATCCCGACACCGTGTCAGGTTCCCTTGCATCCAGATCATTAAGACAGCAAC
TGTTCCCGCCAAACTCTGCAAGAGGGAGAGCACCAAACAGTTTCACAACAGTAAGATTAA
GTTCCCCTTGGTATTCCGCAAGGTGAGACCACCAAGCAGGAAGCTCAAGACCACTTACAA
GGCATCCAAACCCAACCTTTTCATGTAATAAGTCTCTTATTGACTTTCACATCTTTTTTG
GTTGGGGGCTAGTATCGTTATGATGTCTATGTTATCTGCTCTTTTGGCTTTTGTTTCTTC
TTGGATATTTTTGCTTATCAATATTTTAGATGTTGTGTCCATCAAACTAAAGTACTCTCT
CTTTCTTATGAAAAAACTTTTACCTTGTTT

QA 1 690 1 690
DS 



AS 2 12

CO CL142Contig1 796 8 23 U
GGACTTTTCTCTCCCACTCTTTTACAACTCACATTGCATATCCTTTCTCTATATATTACT
TCACCTAAACCACTATTCACAACACAAACACACACATAACCATGGCCTCTTCAGGAGCCT
TCCTTTTGCTCACATTGTCTATGGTTTTAGTTCATTTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATGA
TGGCTCCTTCTGGCTCCATGTCCATGCCGCCAATGCCTAGCGGCGGCTCTCCAATGCCAA
TGATGACTCCACCACCTATGCCAATGATGACTCCCCCACCTATGCCTATGGCTCCACCGC
CTATGCCTATTGCTCCTCCACCTATGGCTATGGCACCACCACCTATGTCCATGGCAACAC
CACCTATGTCCATGACTCCATCTTCAAGCCCAATGAGCCCACCAACTCCTATGGCCCCAA
GTCCAGAAACAATCCCTGATATGGCTTCACCACCTATGATGCCAGGAATGGATTCTTCTC
CTTCTCCGGGACCTATGCCACCCGCAACGTCCTCGCCAGATTCCGGAGCATTCAATGTAA
GAAACGACGTCGTAGCACTTTCGTTCCTTATTGCAGCTCATTTGCTTCTCGTTTGAGATT
ATTATCAAACTGGTCAACATCGTGTTCGTGTAATTTACTTTCATTATTTTTCGAGCCATT
AGTTTTCGTCGGTTTATCATATTTGAGTTTGTGTTTGATATGTACGGTTCAGACATTTGT
TT**TTAATAAGTTTTATCATTGACTCTAGTTGATGTATGTGATGTAAATTCATTTTTAT
CCAATTTTTCACAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 5 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 10 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 40 40 40 40 40 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E749TF U 1
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AF RS1EH20TF U 79
AF RS1EA62TF U 73
AF RS1E749JQ C 67
AF RS1BK01JQ C 79
AF RS1BK01TF U 79
AF RS1EA62JQ C 73
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RD RS1E749TF 448 0 0
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TCACCTAAACCACTATTCACAACACAAACACACACATAACCATGGCCTCTTCAGGAGCCT
TCCTTTTGCTCACATTGTCTATGGTTTTAGTTCATTTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATGA
TGGCTCCTTCTGGCTCCATGTCCATGCCGCCAATGCCTAGCGGCGGCTCTCCAATGCCAA
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CTATGCCTATTGCTCCTCCACCTATGGCTATGGCACCACCACCTATGTCCATGGCAACAC
CACCTATGTCCATGACTCCATCTTCAAGCCCAATGAGCCCACCAACTCCTATGGCCCCAA
GTCCAGAAACAATCCCTGATATGGCTTC

QA 1 448 1 448
DS 

RD RS1G501TF 607 0 0
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CCCACCTATGCCTATGGCTCCACCGCCTATGCCTATGGCTCCTCCACCTATGGCTATGGC
ACCACCACCTATGTCCATGGCAACACCACCTACGTCCATGACTCCATCTTCAAGCCCAAT
GAGCCCACCAACTCCTATGGCCCCAAGCCCAGAAACAATCCCTGATATGGCTTCACCACC
TATGATGCCAGGAATGGATTCTTCTCCTTCTCCTGGACCTATGCCACCGGCAACGTCCTC
GCCAGATTCCGGAGCATTCAATGTAAGAAACGACGTTGTAGCACTTTCGTTACTTATTGC
AGCTCATTTGCTTCTCGTTTGAGATTATTATCAAACTGG*CAGCATCGTGTTCGTGTAAT
TTACTTTCATTATTTTTCGAGCCATTAGTTTTCATCGGTTTATCATATTTGAGTTTGTGT
TTGATAT

QA 1 607 1 607
DS 

RD RS1EH20TF 624 0 0
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TGCCAATGATGACTCCCCCACCTATGCCTATGGCTCCACCGCCTATGCCTATTGCTCCTC
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TTTCGTTCCTTATTGCAGCTCATTTGCTTCTCGTTTGAGATTATTATCAAACTGGTCAAC
ATCGTGTTCGTGTAATTTACTTTCATTATTTTTCGAGCCATTAGTTTTCGTCGGTTTATC
ATATTTGAGTTTGCGTTTGATATG

QA 1 624 1 624
DS 

RD RS1EA62TF 624 0 0
GG
ATTCACAACACAAACACACACATAACCATGGCCTCTTCAGGAGCCTTCCTTTTGCTCACA
TTGTCTATGGTTTTAGTTCATTTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATGATGGCTCCTTCTGGC
TCCATGTCCATGCCGCCAATGCCTAGCGGCGGCTCTCCAATGCCAATGATGACTCCACCA
CCTATGCCAATGATGACTCCCCCACCTATGCCTATGGCTCCACCGCCTATGCCTATTGCT
CCCCCACCTATGGCTATGGCACCACCACCTATGTCCATGGCAACACCACCTATGTCCATG
ACTCCATCTTCAAGCCCAATGAGCCCACCAACTCCTATGGCCCCAAGTCCAGAAACAATC
CCTGATATGGCTTCACCACCTATGATGCCAGGAATGGATTCTTCTCCTTCTCCGGGACCT
ATGCCACCCGCAACGTCCTCGCCAGATTCCGGAGCATTCAATGTAAGAAACGACGTCGTA
GCACTTTCGTTCCTTATTGCAGCTCATTTGCTTCTCGTTTGAGATTATTATCAAACTGGT
CAACATCGTGTTCGTGTAATTTACTTTCATTATTTTTCGAGCCATTAGTTTTCGTCGGTT
TATCATATTTGAGTTTGTGTTT

QA 3 624 3 624
DS 

RD RS1E749JQ 691 0 0
AAACCACT
ATTCACAACACAAACACACACATAACCATGGCCTCTTCAGGAGCCTTCCTTTTGCTCACA
TTGTCTATGGTTTTAGTTCATTTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATGATGGCTCCTTCTGGC
TCCATGTCCATGCCGCCAATGCCTAGCGGCGGCTCTCCAATGCCAATGATGACTCCACCA
CCTATGCCAATGATGACTCCCCCACCTATGCCTATGGCTCCACCGCCTATGCCTATTGCT
CCTCCACCTATGGCTATGGCACCACCACCTATGTCCATGGCAACACCACCTATGTCCATG
ACTCCATCTTCAAGCCCAATGAGCCCACCAACTCCTATGGCCCCAAGTCCAGAAACAATC
CCTGATATGGCTTCACCACCTATGATGCCAGGAATGGATTCTTCTCCTTCTCCGGGACCT
ATGCCACCCGCAACGTCCTCGCCAGATTCCGGAGCATTCAATGTAAGAAACGACGTCGTA
GCACTTTCGTTCCTTATTGCAGCTCATTTGCTTCTCGTTTGAGATTATTATCAAACTGGT
CAACATCGTGTTCGTGTAATTTACTTTCATTATTTTTCGAGCCATTAGTTTTCGTCGGTT
TATCATATTTGAGTTTGTGTTTGATATGTACGGTTCAGACATTTGTTT**TTAATAAGTT
TTATCATTGACTCTAGTTGATG
C

QA 9 690 9 690
DS 

RD RS1BK01JQ 644 0 0
GGAACACAAACACACACATAACCATGGCCTCTTCACAAGCCTTCCTTTTGCTCACATTGT
CTATGGTTTTCGTTCATTTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATGATGGCTCCTTCTGGCTCCA
TGTCCATGCCGCCAATGCCTAGCGGCGGCTCTCCAAGGCCAATGATGACTCCACCACCTA
TGCCAATGATGACTCCCCCACCTATGCCTATGGCTCCACCGCCTATGCCTATGGCTCCTC
CACCTATGGCTATGGCACCACCACCTATGTCCATGGCAACACCACCTATGTCCATGACTC
CATCTTCAAGCCCAATGAGCCCACCAACTCCTATGGCCCCAAGCCCAGAAACAATCCCTG
ATATGGCTTCACCACCTATGATGCCAGGAATGGATTCTTCTCCTTCTCCTGGACCTATGC
CACCGGCAACGTCCTCGCCAGATTCCGGAGCATTCAATGTAAGAAACGACGTTGTAGCAC
TTTCGTTACTTATTGCAGCTCATTTGCTTCTCGTTTGAGATTATTATCAAACTGG*CAGC
ATCGTGTTCGTGTAATTTACTTTCATTATTTTTCGAGCCATTAGTTTTCATCGGTTTATC
ATATTTGAGTTTGTGTTTGATATGTACGGTTCAGACATTTGTTT

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1BK01TF 679 0 0
GGAACACAAACACACACATAACCATGGCCTCTTCACAAGCCTTCCTTTTGCTCACATTGT
CTATGGTTTTCGTTCATTTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATGATGGCTCCTTCTGGCTCCA
TGTCCATGCCGCCAATGCCTAGCGGCGGCTCTCCAAGGCCAATGATGACTCCACCACCTA
TGCCAATGATGACTCCCCCACCTATGCCTATGGCTCCACCGCCTATGCCTATGGCTCCTC
CACCTATGGCTATGGCACCACCACCTATGTCCATGGCAACACCACCTATGTCCATGACTC
CATCTTCAAGCCCAATGAGCCCACCAACTCCTATGGCCCCAAGCCCAGAAACAATCCCTG
ATATGGCTTCACCACCTATGATGCCAGGAATGGATTCTTCTCCTTCTCCTGGACCTATGC
CACCGGCAACGTCCTCGCCAGATTCCGGAGCATTCAATGTAAGAAACGACGTTGTAGCAC
TTTCGTTACTTATTGCAGCTCATTTGCTTCTCGTTTGAGATTATTATCAAACTGG*CAGC
ATCGTGTTCGTGTAATTTACTTTCATTATTTTTCGAGCCATTAGTTTTCATCGGTTTATC
ATATTTGAGTTTGTGTTTGATATGTACGGTTCAGACATTTGTTTACTTAATAAGTTTTAT
CATTGACTCTATTTGATGT

QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1EA62JQ 724 0 0
GG
ATTCACAACACAAACACACACATAACCATGGCCTCTTCAGGAGCCTTCCTTTTGCTCACA
TTGTCTATGGTTTTAGTTCATTTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATGATGGCTCCTTCTGGC
TCCATGTCCATGCCGCCAATGCCTAGCGGCGGCTCTCCAATGCCAATGATGACTCCACCA
CCTATGCCAATGATGACTCCCCCACCTATGCCTATGGCTCCACCGCCTATGCCTATTGCT
CCCCCACCTATGGCTATGGCACCACCACCTATGTCCATGGCAACACCACCTATGTCCATG
ACTCCATCTTCAAGCCCAATGAGCCCACCAACTCCTATGGCCCCAAGTCCAGAAACAATC
CCTGATATGGCTTCACCACCTATGATGCCAGGAATGGATTCTTCTCCTTCTCCGGGACCT
ATGCCACCCGCAACGTCCTCGCCAGATTCCGGAGCATTCAATGTAAGAAACGACGTCGTA
GCACTTTCGTTCCTTATTGCAGCTCATTTGCTTCTCGTTTGAGATTATTATCAAACTGGT
CAACATCGTGTTCGTGTAATTTACTTTCATTATTTTTCGAGCCATTAGTTTTCGTCGGTT
TATCATATTTGAGTTTGTGTTTGATATGTACGGTTCAGACATTTGTTT**TTAATAAGTT
TTATCATTGACTCTAGTTGATGTATGTGATGTAAATTCATTTTTATCCAATTTTTCACAG
AC

QA 3 724 3 724
DS 



CO CL142Contig2 742 4 13 U
CGTATTGCGTTACTGATAATTTGTCTGTGAAAATTTGGATAAAAATGAATTTACATCACA
TACATCAACCTAGAGTCAATGATAAGAACTTATTAAGTAAACAAATGTCTGAACCGTACA
TATCAAAGACAAACTCAAATATGATAAACCGTCGAAAACTAATGGCTCGAGAAATAATGA
AAGTAAATTACACGAACACGATGCTGTCCAGTTTGATAATAATCTCAAACGAGAAGCAAA
TGAGCTGCAATAAGTAACGAAAGTGCTACGACGTCGTTTCTTACATTGAATGCTCCGGAG
TCTGGCGAGGCCGTTGCTGGCGGCATAGGTCCCGGAGAAGGAGAAGAATCCATTCCCGGC
ATCATCGGTGGTGATGCCATATCAGGGACTGTTTCTGGGCTTGGGGCCATAGGAGTTGGT
GGGCTCATTGGGCTTGAAGATGGAGTCATGGACATAGGTGGTGTTGCCATGGACATAGGT
GGTGGTGCCATAGCCATAGGTGGAGGAGCCATAGGCATAGGCGGTGGAGCCATAGGCATA
GGTGGGGGAGTCATCATTGGCATAGGTGGTGGAGTCATCATTGGCATTGGAGAGCCGCCG
CTAGGCATTGGCGGCATGGACATGGAGCCAGA*GGAGCCATCATGGGAGATTGAGCTAAA
GAGAAATGAACTAAAACCATAGACAATGTGAGCAAAAGGAAGGCTCCTGAAGAGGCCATG
GTTATGTGTGTCTTTGTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GTCCAGTTTGATAATAATCTCAAACGAGAAGCAAATGAGCTGCAATAAGTAACGAAAGTG
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CTTTCC

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TAAAAACATAGACAATGTGAGCAAAAGGAAGGCTCCTGAAGAGGCCATGGTTATGTGTGT
CTTTGTGTTCC

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 12

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TACCGGCGGCTCTGATTCTACTCATAGTGGTGGCTCCAGGACTAATCGCCGGCACATTCA
GAGACAACTGGGTTGGTTTAGTCACATGCTTGTTGATCGGATGTTACTTGCTCCAAGAAC
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CTCTGTTTTATTTCCCATTTGTTTTTATTTATGTAATAGTGTGATGATTTGTATGATTCT
GTGTCTTTCATAACTTGTCAACCAGTGTGGTTTCAGTTTCTACGCTTTTGGCCTATTCAA
TAAGAATGGCCATGAGGTGTTTGTTAGTGTGGATGGATTAAACTGAGATTTGTCATTTGC
GATCTCTTGCCAAGTACATCGAAAACTC


BQ
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55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
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CTCTGTTT*ATTTCCCATTTGTTT
ATTATGT

QA 1 684 1 684
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CTCTGTTT*ATTTCCCATT
C

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TCAACGAGCTAGCTACCGCTGCTAAGAATCTCGTTAATCACACCTTCATGCTCACTGGTT
TAGGCTTTGGGACTTCTATCCTCGAATGGATTGCTTCAATAGCCGCCATATACTTGTTGG
TCTTGGATCGAACTAATTGGAAGACGAATATGCTCACATCACTTTTGATTCCTTACATCT
TCTTCAGTCTTCCTTCCGTGATCTTTGGCCTTTTCAGAGGAGATGTTGGTACATGGATCG
CGTTTGTAGCTGTTGTTGTACAACTCTTCTTCCCTAAACACTTCCGAGAATGGTTTGAAT
TACCGGCGGCTCTGATTCTACTCATAGTGGTGGCTCCAGGACTAATCGCCGGCACATTCA
GAGACAACTGGGTTGGTTTAGTCACATGCTTGTTGATCGGATGTTACTTGCTCCAAGAAC
ATATTAGAGCTTCAGGTGGATTTAGAAACGCATTCACAAAAGCTCATGGCATCTCCAACA
CACTTGGGATCATTGCTCTTGTCGTCTTTCCCGTTTGGGCTCTTGCCTTTTAAGACAACT
CTCTGTTTTATTTCCCATTTGTTTTTATTTATGTAATAGTGTGATGATTTGTATGATTCT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RS1BI33TF 752 0 0
TTTTTCAAATCTCTAACCAGTTCTCTTTCTTGTTCCTCTGTAATCTCTCGGGCAAAGAGA
TGACTTTCACAGCGATGAGGAGAGACCATGGAACCCTTCAAGCTATGGTCGGATCCGATC
TCAACGAGCTAGCTACCGCTGCTAAGAATCTCGTTAATCACACCTTCATGCTCACTGGTT
TAGGCTTTGGGACTTCTATCCTCGAATGGATTGCTTCAATAGCCGCCATATACTTGTTGG
TCTTGGATCGAACTAATTGGAAGACGAATATGCTCACATCACTTTTGATTCCTTACATCT
TCTTCAGTCTTCCTTCCGTGATCTTTGGCCTTTTCAGAGGAGATGTTGGTAAATGGATCG
CGTTTGTAGCTGTTGTTGTACAACTCTTCTTCCCTAAACACTTCCGAGAATGGTTTGAAT
TACCGGCGGCTCTGATTCTACTCATAGTGGTGGCTCCAGGACTAATCGCCGGCACATTCA
GAGACAACTGGGTTGGTTTAGTCACATGCTTGTTGATCGGATGTTACTTGCTCCAAGAAC
ATATTAGAGCTTCAGGTGGATTTAGAAACGCATTCACAAAAGCTCATGGCATCTCCAACA
CACTTGGGATCATTGCTCTTGTCGTCTTTCCCGTTTGGGCTCTTGCCTTTTAAGACAACT
CTCTGTTTTATTTCCCATTTGTTTT*ATTTATGTAATAGTGTGATGATTTGTATGATTCT
GTGTCTTTCATAACTTGTCA*CCAGTGTGGTT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RS1EQ72TF 738 0 0
TTTTTCAAATCTCTAACCAGTTCTCTTTCTTGTTCCTCTGTAATCTCTCGGGCAAAGAGA
TGACTTTCACAGCGATGAGGAGAGACCATGGAACCCTTCAAGCTATGGTCGGATCCGATC
TCAACGAGCTAGCTACCGCTGCTAAGAATCTCGTTAATCACACCTTCATGCTCACTGGTT
TAGGCTTTGGGACTTCTATCCTCGAATGGATTGCTTCAATAGCCGCCATATACTTGTTGG
TCTTGGATCGAACTAATTGGAAGACGAATATGCTCACATCACTTTTGATTCCTTACATCT
TCTTCAGTCTTCCTTCCGTGATCTTTGGCCTTTTCAGAGGAGATGTTGGTAAATGGATCG
CGTTTGTAGCTGTTGTTGTACAACTCTTCTTCCCTAAACACTTCCGAGAATGGTTTGAAT
TACCGGCGGCTCTGATTCTACTCATAGTGGTGGCTCCAGGACTAATCGCCGGCACATTCA
GAGACAACGGGGTGGGTTTAGTCACATGCTTGTCGATCGGATGTTACTTGCTCCAAGAAC
ATATTAGAGCTTCAGGTGGATTTAGAAACGCATTCACAAAAGCTCATGGCATCTCCAACA
CACTTGGGATCATTGCTCTTGTCGTCTTTCCCGTTTGGGCTCTTGCCTTTTAAGACAACT
CTCTGTTTTATTTCCCATTTGTTTTTATTTATGTAATAGTGTGATGATTTGTATGATTCT
GTGTCTTTCATAACTTGT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1F837TF 736 0 0
TTTTTCAAATCTCTAACCAGTTCTCTTTCTTGTTCCTCTGTAATCTCTCGGGCAAAGAGA
TGACTTTCACAGCGATGAGGAGAGACCATGGAACCCTTCAAGCTATGGTCGGATCCGATC
TCAACGAGCTAGCTACCGCTGCTAAGAATCTCGTTAATCACACCTTCATGCTCACTGGTT
TAGGCTTTGGGACTTCTATCCTCGAATGGATTGCTTCAATAGCCGCCATATACTTGTTGG
TCTTGGATCGAACTAATTGGAAGACGAATATGCTCACATCACTTTTGATTCCTTACATCT
TCTTCAGTCTTCCTTCCGTGATCTTTGGCCTTTTCAGAGGAGATGTTGGTAAATGGATCG
CGTTTGTAGCTGTTGTTGTACAACTCTTCTTCCCTAAACACTTCCGAGAATGGTTTGAAT
TACCGGCGGCTCTGATTCTACTCATAGTGGTGGCTCCAGGACTAATCGCCGGCACATTCA
GAGACAACTGGGTTGGTTTAGTCACATGCTTGTTGATCGGATGTTACTTGCTCCAAGAAC
ATATTAGAGCTTCAGGTGGATTTAGAAACGCATTCACAAAAGCTCATGGCATCTCCAACA
CACTTGGGATCATTGCTCTTGTCGTCTTTCCCGTTTGGGCTCTTGCCTTTTAAGACAACT
CTCTGTTTTATTTCCCATTTGTTTT*ATTTATGTAATAGTGTGATGATT*GTATGATTCT
GTGTCTTTCATA
CTTG

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1E746TF 752 0 0
TTTTTCAAATCTCTAACCAGTTCTCTTTCTTGTTCCTCTGTAATCTCTCGGTCAAAGAGA
TGACTTTCACAGCGATGAGGAGAGACCATGGAACCCTTCAAGCTATGGTCGGATCCGATC
TCAACGAGCTAGCTACCGCTGCTAAGAATCTCGTTAATCACACCTTCATGCTCACTGGTT
TAGGCTTTGGGACTTCTATCCTCGAATGGATTGCTTCAATAGCCGCCATATACTTGTTGG
TCTTGGATCGAACTAATTGGAAGACGAATATGCTCACATCACTTTTGATTCCTTACATCT
TCTTCAGTCTTCCTTCCGTGATCTTTGGCCTTTTCAGAGGAGATGTTGGTAAATGGATCG
CGTTTGTAGCTGTTGTTGTACAACTCTTCT*CCCTAAACACTTCCGAGAATGGTTTGAAT
TACCGGCGGCTCTGATTCTACTCATAGTGGTGGCTCCAGGACTAATCGCCGGCACATTCA
GAGACAACTGGGTTGGTTTAGTCACATGCTTGTTGATCGGATGTTACTTGCTCCAAGAAC
ATATTAGAGCTTCAGGTGGATTTAGAAACGCATTCACAAAAGCTCATGGCATCTCCAACA
CACTTGGGATCATTGCTCTTGTCGTCTTTCCCGTTTGGGCTCTTGCCTTTTAAGACAACT
CTCTGTTTTATTTCCCATTTGTTTTTATTTATGTAATAGTGTGATGATTTGTATGATTCT
GTGTCTTTCATAACTTGTCAACCAGTGTGGTT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RS1CE89TF 728 0 0
G
GTAATCTCTCGGGCAAAGAGATGACTTTCACAGCGATGAGGAGAGACCATGGAACCCTTC
AAGCTATGGTCGGATCCGATCTCAACGAGCTAGCTACCGCTGCTAAGAATCTCGTTAATC
ACACCTTCATGCTCACTGGTTTAGGCTTTGGGACTTCTATCCTCGAATGGATTGCTTCAA
TAGCCGCCATATACTTGTTGGTCTTGGATCGAACTAATTGGAAGACGAATATGCTCACAT
CACTTTTGATTCCTTACATCTTCTCCAGTCTTCCTTCCGTGATCTTTGGCCTTTTCAGAG
GAGATGTTGGTAAATGGATCGCGTTTGTAGCTGTTGTTGTACAACTCTTCTTCCCTAAAC
ACTTCCGAGAATGGTTTGAATTACCGGCGGCTCTGATTCTACTCATAGTGGTGGCTCCAG
GACTAATCGCCGGCACATTCAGAGACAACTGGGTTGGTTTAGTCACATGCTTGTTGATCG
GATGTTACTTGCTCCAAGAACATATTAGAGCTTCAGGTGGATTTAGAAACGCATTCACAA
AAGCTCCTGGCATCTCCAACACACTTGGGATCATTGCTCTTGTCGTCTTTCCCGTTTGGG
CTCTTGCCTTTTAAGACAACTCTCTGTTTTATTTCCCATTTGTTTTTATTTATGTAATAG
TGTGATGATTTGTATGATTCTGTGTCTTTCATAACTTGTCA*CCAGTGTGGTTTCAGTTT
CTACGCT

QA 2 728 2 728
DS 

RD RS1F837JQ 630 0 0
AATGGATTGCTTCAATAGCCGCCATATACTTGTTGGTCTTGGATCGAACTAATTGGAAGA
CGAATATGCTCACATCACTTTTGATTCCTTACATCTTCTTCAGTCTTCCTTCCGTGATCT
TTGGCCTTTTCAGAGGAGATGTTGGTAAATGGATCGCGTTTGTAGCTGTTGTTGTACAAC
TCTTCTTCCCTAAACACTTCCGAGAATGGTTTGAATTACCGGCGGCTCTGATTCTACTCA
TAGTGGTGGCTCCAGGACTAATCGCCGGCACATTCAGAGACAACTGGGTTGGTTTAGTCA
CATGCTTGTTGATCGGATGTTACTTGCTCCAAGAACATATTAGAGCTTCAGGTGGATTTA
GAAACGCATTCACAAAAGCTCATGGCATCTCCAACACACTTGGGATCATTGCTCTTGTCG
TCTTTCCCGTTTGGGCTCTTGCCTTTTAAGACAACTCTCTGTTTTATTTCCCATTTGTTT
TTATTTATGTAATAGTGTGATGATTTGTATGATTCTGTGTCTTTCATAACTTGTCAACCA
GTGTGGTTTCAGTTTTTACGCTTTTGGCCTATTCAATAAGAATGGCCATGAGGTGTTTGT
TAGTGTGGATGGATTAAACTGAG
ATTTGCC

QA 1 623 1 623
DS 

RD RS1BI33JQ 715 0 0
ATCCGATCTCAACGAGCTAGCTACCGCTGCTAAGAATCTCGTTAATCACACCTTCATGCT
CACTGGTTTAGGCTTTGGGACTTCTATCCTCGAATGGATTGCTTCAATAGCCGCCATATA
CTTGTTGGTCTTGGATCGAACTAATTGGAAGACGAATATGCTCACATCACTTTTGATTCC
TTACATCTTCTTCAGTCTTCCTTCCGTGATCTTTGGCCTTTTCAGAGGAGATGTTGGTAA
ATGGATCGCGTTTGTAGCTGTTGTTGTACAACTCTTCTTCCCTAAACACTTCCGAGAATG
GTTTGAATTACCGGCGGCTCTGATTCTACTCATAGTGGTGGCTCCAGGACTAATCGCCGG
CACATTCAGAGACAACTGGGTTGGTTTAGTCACATGCTTGTTGATCGGATGTTACTTGCT
CCAAGAACATATTAGAGCTTCAGGTGGATTTAGAAACGCATTCACAAAAGCTCATGGCAT
CTCCAACACACTTGGGATCATTGCTCTTGTCGTCTTTCCCGTTTGGGCTCTTGCCTTTTA
AGACAACTCTCTGTTTTATTTCCCATTTGTTTTTATTTATGTAATAGTGTGATGATTTGT
ATGATTCTGTGTCTTTCATAACTTGTCAACCAGTGTGGTTTCAGTTTCTACGCTTTTGGC
CTATTCAATAAGAATGGCCATGAGGTGTTTGTTAGTGTGGATGGATTAAACTGAG

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1ED21JQ 824 0 0
TTCTCTTTCTTGTTCCTCTGTA*TCTCTCGGGCAAAGAGATGACTTTCACAGCGATGAGG
AGAGACCATGGAACCCTTCAAGCTATGGTCGGATCCGATCTCAACGAGCTAGCTACCGCT
GCTAAGAATCTCGTTAATCACACCTTCATGCTCACTGGTTTAGGCTTTGGGACTTCTATC
CTCGAATGGATTGCTTCAATAGCCGCCATATACTTGTTGGTCTTGGATCGAACTAATTGG
AAGACGAATATGCTCACATCACTTTTGATTCCTTACATCTTCTTCAGTCTTCCTTCCGTG
ATCTTTGGCCTTTTCAGAGGAGATGTTGGTAAATGGATCGCGTTTGTAGCTGTTGTTGTA
CAACTCTTCTTCCCTAAACACTTCCGAGAATGGTTTGAATTACCGGCGGCTTTGATTTTA
CTCATAGTGGTGGCTCCAGGACTAATCGCCGGCACATTCAGAGACAACTGGGTTGGTTTA
GTCACATGCTTGTTGATCGGATGTTACTTGCTCCAAGAACATATTAGAGCTTCAGGTGGA
TTTAGAAACGCATTCACAAAAGCTCATGGCATCTCCAACACACTTGGGATCATTGCTCTT
GTCGTCTTTCCCGTTTGGGCTCTTGCCTTTTAAGACAACTCTCTGTTTTATTTCCCATTT
GTTTT*ATTTATGTAATAGTGTGATGATTTGTATGATTCTGTGTCTTTCATAACTTGTCA
ACCAGTGTGGTTTCAGTTTTTACGCTTTTGGCCTATTCAATAAGAATGGCCATGAGGTGT
TTGTTAGTGTGGATGGATTAAACTGAGATTTGTCATTTGCGATC

QA 1 824 1 824
DS 

RD RS1E746JQ 728 0 0
GCTAAGAATCTCGTTAATCACACCTTCATGCTCACTGGTTTAGGCTTTGGGACTTCTATC
CTCGAATGGATTGCTTCAATAGCCGCCATATACTTGTTGGTCTTGGATCGAACTAATTGG
AAGACGAATATGCTCACATCACTTTTGATTCCTTACATCTTCTTCAGTCTTCCTTCCGTG
ATCTTTGGCCTTTTCAGAGGAGATGTTGGTAAATGGATCGCGTTTGTAGCTGTTGTTGTA
CAACTCTTCT*CCCTAAACACTTCCGAGAATGGTTTGAATTACCGGCGGCTCTGATTCTA
CTCATAGTGGTGGCTCCAGGACTAATCGCCGGCACATTCAGAGACAACTGGGTTGGTTTA
GTCACATGCTTGTTGATCGGATGTTACTTGCTCCAAGAACATATTAGAGCTTCAGGTGGA
TTTAGAAACGCATTCACAAAAGCTCATGGCATCTCCAACACACTTGGGATCATTGCTCTT
GTCGTCTTTCCCGTTTGGGCTCTTGCCTTTTAAGACAACTCTCTGTTTTATTTCCCATTT
GTTTTTATTTATGTAATAGTGTGATGATTTGTATGATTCTGTGTCTTTCATAACTTGTCA
ACCAGTGTGGTTTCAGTTTCTACGCTTTTGGCCTATTCAATAAGAATGGCCATGAGGTGT
TTGTTAGTGTGGATGGATTAAACTGAGATTTGTCATTTGCGATCTCTTGCCAAGTACATC
GAAAACTC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 13

CO CL144Contig1 485 13 6 U
AGGGGAACCATCAAACCAACAAGCTTAAATTCAAAAAA*AGTTAATAATAAACGTGTGTA
TTGTAAGAATATCACAAAGAACAAAATGTCGTCATCACAGTTCGCTATCTTTTGCATCAT
CTTGATTGCTTTATTTCCTCTTCACGAATTTGTCGATGGTCAAGGAACTTGCAAACAAAC
CCCATGCCCCAACGCCAAAGATAAAAATAAGACTTGCTTTTGTTGTCCCTCCAATAACAG
GTGTTACGCGACCAAAGATACATGTGCAGGTTGGTGTGGCAAACAATAAGTTATCTTGAG
AACCTACATCAAGGATTTAAGAAAATCTGAATAACCATTTTATTTAATTCTTCCTAATAT
CTACTTTTGTTTTATATGAATAAAACATGCTCATCTGGAGCCCAACAAATACAATGTATG
TCTACTGTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTCTATCATATGTAATGCGAATAAATTAA
ACTTA


BQ
10 10 10 40 55 55 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 
70 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 45 75 75 75 45 60 75 75 75 75 75 75 75 45 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 

AF RS1A477JQ C 4
AF RS1A477TF U 59
AF RS1EZ52JQ C 5
AF RS1EZ52TF U 5
AF RS1BA30JQ C 5
AF RS1BA30TF U 5
AF RS1C226TF U 4
AF RS1GH17TF U 4
AF RS1E393TF U 5
AF RS1CL92TF U 4
AF RS1EZ59TF U 4
AF RS1FF35TF U 1
AF RS1AY29TF U 59
BS 1 37 RS1FF35TF
BS 38 38 RS1EZ52TF
BS 39 87 RS1FF35TF
BS 88 88 RS1A477TF
BS 89 484 RS1FF35TF
BS 485 485 RS1AY29TF

RD RS1A477JQ 472 0 0
GGAACCATCAAACCAACAAGCTTAAATTCAAAAAAAAGTTAATAATAAACGTGTGTATTG
TAAGAATATCACAAAGAACAAAATGTCGTCATCACAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCTT
GATTGCTTTATTTCCTCTTCACGAATTTGTCGATGGTCAAGGAACTTGCAAACAAACCCC
ATGCCCCAACGCCAAAGATAAAAATAAGACTTGCTTTTGTTGTCCCTCCAATAACAGGTG
TTATGCGACCAAAGATACATGTGCAGGTTGGTGTGGCAAACAATAAGTTATCTTGAGAAC
CTACATCAAGGATTTAAGAAAATCTGAATAACCATTTTATTTAATTCTTCCTAATATCTA
CTTTTGTTTTATATGAATAAAACATGCTCATCTGGAGCCCAACAAATACAATGTATGTCT
ACTGTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTCTATCATATGTAATGCGAATAA

QA 1 472 1 472
DS 

RD RS1A477TF 417 0 0
TATTGTAAGAATATCACAAAGAACAAAATGTCGTCATCACAGTTCGCTATCTTTTGCATC
ATCTTGATTGCTTTATTTCCTCTTCACGAATTTGTCGATGGTCAAGGAACTTGCAAACAA
ACCCCATGCCCCAACGCCAAAGATAAAAATAAGACTTGCTTTTGTTGTCCCTCCAATAAC
AGGTGTTATGCGACCAAAGATACATGTGCAGGTTGGTGTGGCAAACAATAAGTTATCTTG
AGAACCTACATCAAGGATTTAAGAAAATCTGAATAACCATTTTATTTAATTCTTCCTAAT
ATCTACTTTTGTTTTATATGAATAAAACATGCTCATCTGGAGCCCAACAAATACAATGTA
TGTCTACTGTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTCTATCATATGTAATGCGAATAA

QA 1 417 1 417
DS 

RD RS1EZ52JQ 471 0 0
GAACCATCAAACCAACAAGCTTAAATTCAAAAAA*AGTTAATAATAAACGTGTGTATTGT
AAGAATATCACAAAGAACAAAATGTCGTCATCACAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCTTG
ATTGCTTTATTTCCTCTTCACGAATTTGTCGATGGTCAAGGAACTTGCAAACAAACCCCA
TGCCCCAACGCCAAAGATAAAAATAAGACTTGCTTTTGTTGTCCCTCCAATAACAGGT*T
TACGCGACCAAGGATACATGTGCAGGTTGGTGTGGCAAACAATAAGTTATCTTGAGAACC
TACATCAAGGATTTAAGAAAATCTGAATAACCATTTTATTTAATTCTTCCTAATATCTAC
TTTTGTTTTATATGAATAAAACATGCTCATCTGGAGCCCAACAAATACAATGTATGTCTA
CTGTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTCTATCATATGTAATGCGAATAA

QA 1 471 1 471
DS 

RD RS1EZ52TF 471 0 0
GAACCATCAAACCAACAAGCTTAAATTCAAAAAA*AGTTAATAATAAACGTGTGTATTGT
AAGAATATCACAAAGAACAAAATGTCGTCATCACAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCTTG
ATTGCTTTATTTCCTCTTCACGAATTTGTCGATGGTCAAGGAACTTGCAAACAAACCCCA
TGCCCCAACGCCAAAGATAAAAATAAGACTTGCTTTTGTTGTCCCTCCAATAACAGGT*T
TACGCGACCAAGGATACATGTGCAGGTTGGTGTGGCAAACAATAAGTTATCTTGAGAACC
TACATCAAGGATTTAAGAAAATCTGAATAACCATTTTATTTAATTCTTCCTAATATCTAC
TTTTGTTTTATATGAATAAAACATGCTCATCTGGAGCCCAACAAATACAATGTATGTCTA
CTGTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTCTATCATATGTAATGCGAATAA

QA 1 471 1 471
DS 

RD RS1BA30JQ 471 0 0
GG
ACCATCAAACCAACAAGCTTAAATTCAAAAAA*AGTTAATAATAAACGTGTGTATTGTAA
GAATATCACAAAGAACAAAATGTCGTCATCACAGTTCGCTATCTTTTGCACCATCTTGAT
TGCTTTATTTCCTCTTCACGAATTTGTCGATGGTCAAGGAACTTGCAAACAAACCCCATG
CCCCAACGCCAAAGATAAAAATAAGACTTGCTTTTGTTGTCCCTCCAATAACAGGTGTTA
CGCGACCAAAGATACATGTGCAGGTTGGTGTGGCAAACAATAAGTTATCTTGAGAACCTA
CATCAAGGATTTAAGAAAATCTGAATAACCATTTTATTTAATTCTTCCTAATATCTACTT
TTGTTTTATATGAATAAAACATACTCATCTGGAGCCCAACAAATACAATGTATGTCTACT
GTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTCTATCATATGTAATGCGAATAA

QA 3 471 3 471
DS 

RD RS1BA30TF 471 0 0
GG
ACCATCAAACCAACAAGCTTAAATTCAAAAAA*AGTTAATAATAAACGTGTGTATTGTAA
GAATATCACAAAGAACAAAATGTCGTCATCACAGTTCGCTATCTTTTGCACCATCTTGAT
TGCTTTATTTCCTCTTCACGAATTTGTCGATGGTCAAGGAACTTGCAAACAAACCCCATG
CCCCAACGCCAAAGATAAAAATAAGACTTGCTTTTGTTGTCCCTCCAATAACAGGTGTTA
CGCGACCAAAGATACATGTGCAGGTTGGTGTGGCAAACAATAAGTTATCTTGAGAACCTA
CATCAAGGATTTAAGAAAATCTGAATAACCATTTTATTTAATTCTTCCTAATATCTACTT
TTGTTTTATATGAATAAAACATACTCATCTGGAGCCCAACAAATACAATGTATGTCTACT
GTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTCTATCATATGTAATGCGAATAA

QA 3 471 3 471
DS 

RD RS1C226TF 472 0 0
GGAACCATCAAACCAACAAGCTTAAATTCAAAAAA*AGTTAATAATAAACGTGTGTATTG
TAAGAATATCACAAAGAACAAAATGTCGTCATCACAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCTT
GATTGCTTTATTTCCTCTTCACGAATTTGTCGATGGTCAAGGAACTTGCAAACAAACCCC
ATGCCCCAACGCCAAAGATAAAAATAAGACTTGCTTTTGTTGTCCCTCCAATAACAGGTG
TTACGCGACCAAAGATACATGTGCAGGTTGGTGTGGCAAACAATAAGTTATCTTGAGAAC
CTACATCAAGGATTTAAGAAAATCTGAATAACCATTTTATTTAATTCTTCCTAATATCTA
CTTTTGTTTTATATGAATAAAACATGCTCATCTGGAGCCCAACAAATACAATGTATGTCT
ACTGTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTCTATCATATGTAATGCGAATAA

QA 1 472 1 472
DS 

RD RS1GH17TF 472 0 0
GGAACCATCAAACCAACAAGCTTAAATTCAAAAAA*AGTTAATAATAAACGTGTGTATTG
TAAGAATATCACAAAGAACAAAATGTCGTCATCACAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCTT
GATTGCTTTATTTCCTCTTCACGAATTTGTCGATGGTCAAGGAACTTGCAAACAAACCCC
ATGCCCCAACGCCAAAGATAAAAATAAGACTTGCTTTTGTTGTCCCTCCAATAACAGGTG
TTACGCGACCAAAGATACATGTGCAGGTTGGTGTGGCAAACAATAAGTTATCTTGAGAAC
CTACATCAAGGATTTAAGAAAATCTGAATAACCATTTTATTTAATTCATCCTAATATCTA
CTTTTGTTTTATATGAATAAAACATGCTCATCTGGAGCCCAACAAATACAATGTATGTCT
ACTGTATTTGTGTTTAGAAGCTTTCATATTCTATCATATGTAATGCGAATAA

QA 1 472 1 472
DS 

RD RS1E393TF 471 0 0
GAACCATCAAACCAACAAGCTTAAATTCAAAAAA*AGTTAATAATAAACGTGTGTATTGT
AAGAATATCACAAAGAACAAAATGTCGTCATCACAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCTTG
ATTGCTTTATTTCCTCTTCACGAATTTGTCGATGGTCAAGGAACTTGCAAACAAACCCCA
TGCCCCAACGCCAAAGATAAAAATAAGACTTGCTTTTGTTGTCCCTCCAATAACAGGTGT
TACGCGACCAAAGATACATGTGCAGGTTGGTGTGGCAAACAATAAGTTATCTTGAGAACC
TACATCATGGATTTAAGAAAATCTGAATAACCATTTTATTTAATTCTTCCTAATATCTAC
TTTTGTTTTATATGAATAAAACATGCTCATCTGGAGCCCAACAAATACAATGTATGTCTA
CTGTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTCTATCATATGTAATGCGAATAA

QA 1 471 1 471
DS 

RD RS1CL92TF 472 0 0
GGAACCATCAAACCAACAAGCTTAAATTCAAAAAA*AGTTAATAATAAACGTGTGTATTG
TAAGAATATCACAAAGAACAAAATGTCGTCATCACAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCTT
GATTGCTTTATTTCCTCTTCACGAATTTGTCGATGGTCAAGGAACTTGCAAACAAACCCC
ATGCCCCAACGCCAAAGATAAAAATAAGACTTGCTTTTGTTGTCCCTCCAATAACAGGTG
TTACGCGACCAAAGATACATGTGCAGGTTGGTGTGGCAAACAATAAGTTATCTTGAGAAC
CTACATCAAGGATTTAAGAAAATCTGAATAACCATTTTATTTAATTCTTCCTAATATCTA
CTTTTGTTTTATATGAATAAAACATGCTCATCTGGAGCCCAACAAATACAATGTATGTCT
ACTGTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTCTATCATATGTAATGCGAATAA

QA 1 472 1 472
DS 

RD RS1EZ59TF 472 0 0
GGAACCATCAAACCAACAAGCTTAAATTCAAAAAA*AGTTAATAATAAACGTGTGTATTG
TAAGAATATCACAAAGAACAAAATGTCGTCATCACAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCTT
GATTGCTTTATTTCCTCTTCACGAATTTGTCGATGGTCAAGGAACTTGCAAACAAACCCC
ATGCCCCAACGCCAAAGATAAAAATAAGACTTGCTTTTGTTGTCCCTCCAATAACAGGTG
TTACGCGACCAAAGATACATGTGCAGGTTGGTGTGGCAAACAATAAGTTATCTTGAGAAC
CTACATCAAGGATTTAAGAAAATCTGAATAACCATTTTATTTAATTCTTCCTAATATCTA
CTTTTGTTTTATATGAATAAAACATGCTCATCTGGAGCCCAACAAATACAATGTATGTCT
ACTGTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTCTATCATATGTAATGCGAATAA

QA 1 472 1 472
DS 

RD RS1FF35TF 484 0 0
AGGGGAACCATCAAACCAACAAGCTTAAATTCAAAAA**AGTTAATAATAAACGTGTGTA
TTGTAAGAATATCACAAAGAACAAAAT*TCGTCATCACAGTTCGCTATCTTTTGCATCAT
CTTGATTGCTTTATTTCCTCTTCACGAATTTGTCGATGGTCAAGGAACTTGCAAACAAAC
CCCATGCCCCAACGCCAAAGATAAAAATAAGACTTGCTTTTGTTGTCCCTCCAATAACAG
GTGTTACGCGACCAAAGATACATGTGCAGGTTGGTGTGGCAAACAATAAGTTATCTTGAG
AACCTACATCAAGGATTTAAGAAAATCTGAATAACCATTTTATTTAATTCTTCCTAATAT
CTACTTTTGTTTTATATGAATAAAACATGCTCATCTGGAGCCCAACAAATACAATGTATG
TCTACTGTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTCTATCATATGTAATGCGAATAAATTAA
ACTT

QA 1 484 1 484
DS 

RD RS1AY29TF 427 0 0
TATG
GTAAAAATATCACAAAAAACAAAATGTCGTCATCACAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCT
TGATTGCTTTATTTCCTCTTCACAAATTTGTCAATGGTCAAGGAACTTGCAAACAAACCC
CATGCCCCAACGCCAAAAATAAAAATAAAACTTGCTTTTGTTGTCCCTCCAATAACAGGT
GTTACCCGACCAAAAATACATGTGCAGGTTGGTGGGGCAAACAATAAGTTATCTTGAAAA
CCTACATCAAGGATTTAAAAAAATCTGAATAACCATTTTATTTAATTCTTCCTAATATCT
ACTTTTGTTTTATATGAATAAAACATGCTCATCTGGAGCCCAACAAATACAATGTATGTC
TACTGTATTTGTGTTTAAAAACTTTCATATTCTATCATATGTAATGCGAATAAATTAAAC
TTA

QA 5 427 5 427
DS 



AS 4 11

CO CL145Contig1 937 3 17 U
GAACATGCAAACCATATATAATTATATTCGAAAGATGATATGAATAGGAAGTAAAAAAAA
AAGAGTATTTTGGTGGTAATGATGCTCTCTTTAGATTGTTGATAGAAAATCATCACATGC
AGAAAAAAGATGAAGAATTGACAATGGCATCAGCTCCTTTATCTACATAATAATATT*AA
TAAACCCTCTCACAATCTTGCTTAGTAGACTTCCACATTCCACTGCTCACTCTTCTTCAA
TTGCTTCTTGTACTCCAACCAATCGATCCCATCTTTAGCAGCAAGTGAGACCATGATCTC
ATCGATACCCTTCTCCATACCCTTGAGACCACACATGTAAACAAAGGTGTTGTCTTTCTT
CAGCAACTCCCACAGCTCTTCTGCATACTCTGCCATTCTTGTCTGTATGTACATTTTCTC
TCCCTTCTCGTTTGTCTGCTCTCTGCTCACCGCAAAGTCCAACCTGAAATTTTCCGGGTT
CTTCTCCTTCATCTTCTCAAACTCCTCCTTGTAGAGCAATGAGCTGCTTGTGGGTACACC
CAAGAAGAGCCATGCCAAACCGTTGAACTTGTAGTCCTCATGCTCCTCAAAGAACATTTT
CCACAAAAATGATCTGAATGGTGCTATTCCAGTTCCTGTTCCAAGCATGATGATGGTGGC
ATTAGGATCTTTAGGCATAAGCATTTCCTTTCCAACTGGTCCAGTGATCTTTGCCTCATC
ACCAGGCTTCAAGTCACACAAGAAGTTGGAGCAGACTCCCTTAACAAGCTCTCCGCTTTC
GTTAGTGTAAACTAATCTCTTGACACAGAGAGAAACGGTTTTGGAATCACCAAAGTCACC
AATGGCACTGCTGGCGATAGAGTATAACCTCAGCTTGTGGGGCTTCCCGTTCTTGTCAAT
TCCTTCTGGAATCACTCCTATCGACTGCCCTTCTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D518JQ U 1
AF RS1BA90JQ U 72
AF RS1EV61TF C 159
BS 1 177 RS1D518JQ
BS 178 178 RS1BA90JQ
BS 179 318 RS1D518JQ
BS 319 319 RS1BA90JQ
BS 320 432 RS1D518JQ
BS 433 433 RS1BA90JQ
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BS 544 544 RS1BA90JQ
BS 545 574 RS1D518JQ
BS 575 575 RS1BA90JQ
BS 576 776 RS1D518JQ
BS 777 817 RS1BA90JQ
BS 818 937 RS1EV61TF

RD RS1D518JQ 776 0 0
GAACATGCAAACCATATATAATTATATTCGAAAGATGATATGAATAGGAAGTAAAAAAAA
AAGAGTATTTTGGTGGTAATGATGCTCTCTTTAGATTGTTGATAGAAAATCATCACATGC
AGAAAAAAGATGAAGAATTGACAATGGCATCAGCTCCTTTATCTACATAATAATATTTAA
TAAACCCTCTCACAATCTTGCTTAGTAGACTTCCACATTCCACTGCTCACTCTTCTTCAA
TTGCTTCTTGTACTCCAACCAATCGATCCCATCTTTAGCAGCAAGTGAGACCATGATCTC
ATCGATACCCTTCTCCATGCCCTTGAGACCACACATGTAAACAAAGGTGTTGTCTTTCTT
CAGCAACTCCCACAGCTCTTCTGCATACTCTGCCATTCTTGTCTGTATGTACATTTTCTC
TCCCTTCTCGTTCGTCTGCTCTCTGCTCACCGCAAAGTCCAACCTGAAATTTTCCGGGTT
CTTCTCCTTCATCTTCTCAAACTCCTCCTTGTAAAGCAGTGAGCTGCTTGTGGGTACACC
CAAAAAGAGCCATGCCAAACCGTTGAACTTGTAGCCCTCATGCTCCTCAAAGAACATTTT
CCACAAAAATGATCTGAATGGTGCTATTCCAGTTCCTGTTCCAAGCATGATGATGGTGGC
ATTAGGATCTTTAGGCATAAGCATTTCCTTTCCAACTGGTCCAGTGATCTTTGCCTCATC
ACCAGGCTTCAAGTCACACAAGAAGTTGGAGCAGACTCCCTTAACAAGCTCTCCGC

QA 1 776 1 776
DS 

RD RS1BA90JQ 746 0 0
GGG
GGTAATGATTGTCTCTTTAGATTGTTGATGGAAAATCATCACATGCAGAAAAAAGATGAA
GAATTGACAATGGCATCAGCTCCTTTATCTACATAATAATATT*AATAAACCCTCTCACA
ATCTTGCTTAATAGACTTCCACATTCCACTGCTCACTCTTCTTCAATTGCTTCTTGTACT
CCAACCAATCGATCCCATCTTTAGCAGCAAGTGAGACCATGATCTCATCGATACCCTTCT
CCATACCCTTGAGACCACACATGTAAACAAAGGTGTTGTCTTTCTTCAGCAACTCCCACA
GCTCTTCTGCATACTCTGCCATTCTTGTCTGCATGTACATTTTCTCTCCCTTCTCGTTTG
TCTGCTCTCTGCTCAA*GCAAAGTCCAACCTGAAATTTTCCGGGTTCTTCTCCTTCATCT
TCTCAAACTCCTCCTTGTAGAGCAATGAGCTGCTTGTGGGTACACCCAAGAAGAGCCATG
CCAAACCGTTGAACTTGTAGTCCTCATGCTCCTCAAAGAACATTTTCCACAAAAATGATC
TGAATGGTGCTATTCCAGTTCCTGTTCCAAGCATGATGATGGTGGCATTAGGATCTTTAG
GCATAAGCATTTCCTTTCCAACTGGTCCAGTGATCTTTGCCTCATCACCAGGCTTCAAGT
CACACAAGAAGTTGGAGCAGACTCCCTTAACAAGCTCTCCGCTTTCGTTAGTGTAAACTA
ATCTCTTGACACAGAGAGAAACG

QA 4 746 4 746
DS 

RD RS1EV61TF 779 0 0
TTATCTACATAATAATAT**AATAAACCCTCTCACAATCTTGCTTAGTAGACTTCCACAT
TCCACTGCTCACTCTTCTTCAATTGCTTCTTGTACTCCAACCAATCGATCCCATCTTTAG
CAGCAAGTGAGACCATGATCTAATCGATACCCTTCTCCATACCCTTGAAACCACACATGT
AAACAAAGGTGTTGTCTTTCTTCAGCAACTCCCACAACTCTTCTGCATACTCTGCCATTC
CTGTCTGTATGTACATTTTCTCTCCCTTCTCGTTTGTCTGCTCTCTGCTCACCGCAAAGT
C*AACCTGAAATTTTCCGGGTTCTTCTCCTTCATCTTCTCAAACTCCTCCTTGTAGAGCA
ATGAGCTGCTTGTGGGTACACCCAAGAAGAGCCATGCCAAACCGTTGAACTTGTAGTCCT
CATGCTCCTCAAAGAACATTTTCCACAAAAATGATCTGAATGGTGCTATTCCAGTTCCTG
TTCCAAGCATGATGATGGTGGCATTAGGATCTTTAGGCATAAGCATTTCCTTTCCAACTG
GTCCAGTGATCTTTGCCTCATCACCAGGCTTCAAGTCACACAAGAAGTTGGAGCAGACTC
CCTTAACAAGCTCTCCGCTTTCGTTAGTGTAAACTAATCTCTTGACACAGAGAGAAACGG
TTTTGGAATCACCAAAGTCACCAATGGCACTGCTGGCGATAGAGTATAACCTCAGCTTGT
GGGGCTTCCCGTTCTTGTCAATTCCTTCTGGAATCACTCCTATCGACTGCCCTTCTCTC

QA 1 779 1 779
DS 



CO CL145Contig2 796 3 24 U
GTGGTTGCATAGTTGATAAAACATGGCTGCTGCAATAGGTGCTGCAGTCTCTTATCCTTC
ATCCAAGTCCTCTTCTCTTCCCTC***CAAAACTTCCTTCGTCTCCCCTCAAAGGATTTT
CCTCAACAACAAGAGCAGAGTGTGCTACAGAGAGGCGTGTATTTATAGGGGAAGAGTGAA
GGCTCAGGTGTCAACAGAGACGCCAGTGAAAGTAGTCAAGGAGTCAAAGAAACAGGAAGA
AGGGATTGTTGTCAACAAATTCAAACCAAAGGAGCCTTACACTGGTAGATGCCTCTTGAA
CACCAGGATCACTGGCGATGACGCTCCCGGTGAAACCTGGCACATCGTCTTCAGCACCGA
AGGGGAGGTTCCATACAGAGAAGGGCAGTCGATAGGAGTGATTCCAGAAGGAATTGACAA
GAACGGGAAGCCCCACAAGCTGAGGTTATACTCTATCGCCAGCAGTGCCATTGGTGACTT
TGGTGATTCCAAAACCGTTTCTCTCTGTGTCAAGAGATTAGTTTACACTAACGAAAGCGG
AGAGCTTGTTAAGGGAGTCTGCTCCAACTTCTTGTGTGACTTGAAGCCTGGTGATGAGGC
AAAGATCACTGGACCAGTTGGAAAGGAAATGCTTATGCCTAAAGATCCTAATGCCACCAT
CATCATGCTTGGAACAGAACTGGAATAGCACCATTCAGATCATTTTTGTGGAAA*TGTTC
TTTGAGAGCATGAGACTACAAGTTCACGGTTTGGCATGGCTCTTCTTGGGTGTACCCACA
AGCAGCTCATTGCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D518TF U 1
AF RS1FU53TF U 30
AF RS1BA90TF U 6
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ATCCAAGTCCTCTTCTCATCCCTCTTCCAATAATTCCTTCGTCTCCCCCCAAAGGATTTT
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GGCTCAGGTGTCAACAGAGACGCCAGTGAAAGTAGTCAAGGAGTCAAAGAAACAGGAAGA
AGGGATTGTTGTGAACAAATTCAAACCAAAGGAGCCTTACACTGGTCGATGCCTCTTGAA
CACCAGGATCACTGGCGATGACGCTCCCGGTGAAACCTGGCACATCGTCTTCAGCACCGA
AGGGGAGGTTCCATACAGAGAAGGGCAGTCGATAGGAGTGATTCCAGAAGGAATTGACAA
GAACGGGAAGCCCCACAAGCTGAGGTTATACTCTATCGCCAGTAGTGCCATTGGTGACTT
TGGTGATTCCAAAACCGTTTCTCTCTGTGTCAAGAGATTAGTTTACACTAACGAAAGCGG
AGAGCTTGTTAAGGGAGTCTGCTCCAACTTCTTGTGTGACTTGAAGCCTGGTGATGAGGC
AAAGATCACTGGACCAGTTGGAAAGGAAATGCTTATGCCTAAAGATCCTAATGCCACCAT
CATCATGCTTGGAACAGGACTGGAATAGCACCATTCAGATCATTTTTGTGGAAA*TGTTC
TTTGAG
AGCA

QA 1 726 1 726
DS 

RD RS1FU53TF 702 0 0
G
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AACTTCCTTCGTCTCCCCTCAAAGGATTTTCCTCAACAACAAGAGCAGAGTGTGCTACAG
AGAGGCGTGTATTTATAGGGGAAGAGTGAAGGCTCAGGTGTCAACAGAGACGCCAGTGAA
AGTAGTCAAGGAGTCAAAGAAACAGGAAGAAGGGATTGTTGTCAACAAATTCAAACCAAA
GGAGCCTTACACTGGTAGATGCCTCTTGAACACCAGGATCACTGGCGATGACGCTCCCGG
TGAAACCTGGCACATCGTCTTCAGCACCGAAGGGGAGGTTCCATACAGAGAAGGGCAGTC
GATAGGAGTGATTCCAGAAGGAATTGACAAGAACGGGAAGCCCCACAAGCTGAGGTTATA
CTCTATCGCCAGCAGTGCCATTGGTGACTTTGGTGATTCCAAAACCGTTTCTCTCTGTGT
CAAGAGATTAGTTTACACTAACGAAAGCGGAGAGCTTGTTAAGGGAGTCTGCTCCAACTT
CTTGTGTGACTTGAAGCCTGGTGATGAGGCAAAGATCACTGGACCAGTTGGAAAGGAAAT
GCTTATGCCTAAAGATCCTAATGCCACCATCATCATGCTTGGAACAGAACTGGAATAGCA
CCATTCAGATCATTTTTGTGGAAAATGTTCTTTGAG
AGCAT

QA 2 697 2 697
DS 

RD RS1BA90TF 791 0 0
GGG
ATAGTTGATAAAACATGGCTGCTGCAATAGGTGCTGCAGTCTCTTATCCTTCATCCAAGT
CCTCTTCTCTTCCCTC***CAAAACTTCCTTCGTCTCCCCTCAAAGGATTTTCCTCAACA
ACAAGAGCAGAGTGTGCTACAGAGAGGCGTGTATTTATAGGGGAAGAGTGAAGGCTCATG
TGTCAACAGAGACGCCAGTGAAAGTAGTCAAGGAGTCAAAGAAACAGGAAGAAGGGATTG
TTGTCAACAAATTCAAACCAAAGGAGCCTTACACTGGTAGATGCCTCTTGAACACCAGGA
TCACTGGCGATGACGCTCCCGGTGAAACCTGGCACATCGTCTTCAGCACCGAAGGGGAGG
TTCCATACAGAGAAGGGCAGTCGATAGGAGTGATTCCATAAGGAATTGACAAGAACGGGA
AGCCCCACAAGCTGAGGTTATACTCTATCGCCAGCAGTGCCATTGGTGACTTTGGTGATT
CCAAAACCGTTTCTCTCTGTGTCAAGAGATTAGTTTACACTAACGAAAGCGGAGAGCTTG
TTAAGGGAGTCTGCTCCAACTTCTTGTGTGACTTGAAGCCTGGTGATGAGGCAAAGATCA
CTGGACCAGTTGGAAAGGAAATGCTTATGCCTAAAGATCCTAATGCCACCATCATCATGC
TTGGAACAGAACTGGAATAGCACCATTCAGATCATTTT*GTGGAAA*TGTTCTTTGAGAG
CATGAGACTACAAGTTCACGGTTTGGCATGGCTCTTCTTGGGTGTACCCACAAGCAGCTC
ATTGCTCT

QA 4 791 4 791
DS 



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CTTCCACATTCCACTGCTCACTCTTCTTCAATTGCTTCTTGTACTCCAACCAATCGATCC
CATCTTTAGCAGCAAGTGAGACCATGATCTCATCGATACCCTTCTCCATACCCTTGAAAC
CACACATGTAAACAAAAGTGTTGTCTTTCTTCAGCAACTCCCACAGCTCTTCTGCATACT
CTGCGTTGATACCACTGCGCTCGATTGTTGATTTGGCTGTTGCTGTGGAAAAAAATGAGC
TCGAAGCTATGATTAAAAGGAAGGAAAAAAAAATGGGGTTTCTCATAATTTCTTTTCTAG
GGTTTTAAACTCTCTCTCTCTCTCTTACAGGAAGCTGCTCACCGTACAATGGAAAAGGTT
CGGACAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FU53JQ U 1
AF RS1DU35JQ U 162
BS 1 297 RS1FU53JQ
BS 298 298 RS1DU35JQ
BS 299 316 RS1FU53JQ
BS 317 317 RS1DU35JQ
BS 318 342 RS1FU53JQ
BS 343 550 RS1DU35JQ

RD RS1FU53JQ 342 0 0
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CTTTAAATTGTTGATGGAAAATCATCACATGCAAAAAAAAGATGAAAAATTGACAATGGC
ATCAGCTCCTTTATCTACATAATAATATTAATAAACCCTCTCACAATCTTGCTTAGTAAA
CTTCCACATTCCACTGCTCACTCTTCTTCAATTGCTTCTTGTACTCCAACCAATCGATCC
CATCTTTAGCAGCAAGTGAGACCATGATCTCATCGATACCCTTCTCCATACCCTTGAGAC
CACACATGTAAACAAAGGTGTTGTCTTTCTTCAGCAACTCCC

QA 1 342 1 342
DS 

RD RS1DU35JQ 389 0 0
AAATAACAA
GCTTAGTAAACTTCCACGTTCCACTGCTCACTCTTCTTCAATTGCTTCTTGTACTCCAAC
CAATCGATCCCATCTTTAGCAGCAAGTGAGACCATGATCTCATCGATACCCTTCTCCATA
CCCTTGAAACCACACATGTAAACAAAAGTGTTGTCTTTCTTCAGCAACTCCCACAGCTCT
TCTGCATACTCTGCGTTGATACCACTGCGCTCGATTGTTGATTTGGCTGTTGCTGTGGAA
AAAAATGAGCTCGAAGCTATGATTAAAAGGAAGGAAAAAAAAATGGGGTTTCTCATAATT
TCTTTTCTAGGGTTTTAAACTCTCTCTCTCTCTCTTACAGGAAGCTGCTCACCGTACAAT
GGAAAAGGTTCGGACAAACC

QA 10 389 10 389
DS 



CO CL145Contig4 1150 3 21 U
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TTGACATTTGAAAAGTAGCAAGTTCTAGTGGACACAAATCAGCTCCAGCTCACGAATTGG
GATTTGGCAACTTGATTGTTCTAAGCAAACTACTTTCTATTCTTCACAGTTAAAAACTTA
AAATAGAGTCATCATTCATCACAGCACATCCTTCTCTGCTTCTTCGGGTGCCATTTTCTT
GATTCTCGCAACAAAAAAACCGCTGGTTGCTGAGGTAAAAGGGTCGAAACGCACTGTTTT
TGGAGTGCGTCCGCTTCTACACGGCCATTCCCTGGCCATTTCAATCTCCTGCAGCTCTGC
GGAGGAGCTTTCAGCAAGGAACTGATCCACCACATCTTCGTTTTGGGCATGCGTCAAACT
GCAGGTACTGTATACAAAAATGCCACCTTGTTTCAACAATCTGAATCCATTTCTCAGTAG
ATTTAACTGAAGAGCAGTCAAGTTTGTATCGGTTCTCTCAGCATCCAGTACACGGCGTTC
CAACGTTGTCCAGCCCCATTGCTCAAACTTCTGGATATGCTTGATTGAACCATCATGTGT
GCACTCTGCGTCTACAAGAACCTTGTCATATCCACAATTTGCATAATCATTTTGGTCAAG
GGATCTAAAAAGCTCCTTCTTTTGTAGCCCTATTACTCCAGAATTCTGTCCGTAGAAATA
ATTTCGGGATGCGGCAAAACAAAGTTGTTCCTGGTCTTGGCTAATTGTTTCCTTTCCTTG
TAAGGTCTACGAGAAGTCCACTGCTTGAACGTCTCTTCATCACATGAACCACGAGGTAGG
TTTGGGGTAGGTGGAAGTGAGAAAGTAGTTCCATCAGCAAGGAAGAGTCGACTCCTATCA
CCGAGACCATATTTTTGAAGCATGGTTCTGCTGGCAGAGAGGCGATGCCTTGCAACATCG
ACACCGGTTGCAGTACCCTTGTCACCAAGTAGGTCTAGAATCATACACAGTTTAGCACCA
AGAGCTGAAACAGCAGCACCTGAAGCTGCGTCGATTCCGTACATCTTGCCTTGCTGATAC
GCCTTGGATCTCGCTATATGAACATGTGAAGGAATTGAGTAAAATCCGGGTAACCAATCC
AGCTGCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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CAAGAACCTTGTCATATCCACAATTTGCATAATCATTTTGGTCAAGGGATCTAAAAAGCT
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DS 

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GGATATGCTTGATTGAACCATCATGTGTGCACTCTGCGTCTACAAGAACCTTGTCATATC
CACAATTTGCATAATCATTTTGGTCAAGGGATCTAAAAAGCTCCTTCTTTTGTAGCCCTA
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AATTGAGTAAAATCCGGGTAACCAATCCAGCTGCTCCC

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DS 



AS 1 8

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GATATATAAATCTCGAAGCATTGTTTTTTCTTACTTGTAATGGAAGCTGTGTTGGTTAAT
AAACCCTTTTAGTCTCTCAAATATCTGCTTTGTGGGTTTTATTCGGGGGTTTAACCAAAT
TTTATACAACCATATTAAATTTGAGCTTATATCTTCGCGTCCTCTGTTATGGTAATAGAT
CTTTGAATTTGAGT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 10 40 40 25 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AAACAAGAAGGTATCAGGAGGA

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TTTTTGCGGAGGTTTCAAGGAAGTAAAGTAACGATGGCGGAAGAGCACAAACACGAGGAA
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TCAGATGACGAGAAGAAAGAATCCTCTATCAAGACGAAGATCTACCGCCTCTTCGGAAGA
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GTTGTTGCTGGCTTGTGGGTTTTGTCCAAAGTTGGTAGCTCATGCAACTTCTTGACCTTG
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G
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AGTTCCTTATGGTTGTTGCTGGTTTGTGGGTTTTGTCCAAAGTTGGTAGTTCATGCAACT
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G

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G
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TAAATCTCGAAGCATTGTTTTTTCTTACTTGTAATGGAAGCTGTGTTGGTT

QA 2 472 2 472
DS 

RD RS1C884JQ 681 0 0
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GTTCACATCCCCGAGGAAGTCGTTCTCCAGCTTGCTTCTGGACTAAGGATTGAAATCAAT
CGTGGTTTTACTCTTCTTAGGAACATTGCATTAGGGAGAGATCTCAAGAAGTTCCTCATG
GTTGTTGCTGGCTTGTGGGTTTTGTCCAAAGTTGGTAGCTCATGCAACTTCTTGACCTTG
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AAAGTAGATGACTTTGCTGAAAAGGCAATGAAGGAGATCAAGAAGCAGTACGCTGTGCTT
GATGAGAAGGTTTTGAGTAAGGTCATGAGCAAAATCCCCAAAGGAGCCTTCAAGAAGAAG
GATTAGAGAGTGTCTACGTTTCTCTCATCACCATCATCATCATCTGAGTCTTCCAGGTTG
ATATATAAATCTCGAAGCATTGTTTTTTCTTACTTGTAATGGAAGCTGTGTTGGTTAATA
AACCCTTTTAGTCTC
GC

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DS 

RD RS1ES31JQ 750 0 0
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CTAGTGCTACTACCTTCATTCACAAGACACCTCCTCATATCCCTGAAGTTCACATCCCCG
AGGAAGTCGTTCTCCAGCTTGCTTCTGGACTAAGGATTGAAATCAATCGTGGTTTTTCTC
TTCTTAGGAACATCGCATTAGGGAGAGATCTCAAGAAGTTCCTTATGGTTGTTGCTGGTT
TGTGGGTTTTGTCCAAAGTTGGTAGCTCATGCAACTTCTTGACCTTGATCTATATCGCAA
CTGTTCTTCTCTTCACCGTTCCCGTGCTTTACGAAAAGTATGATGATAAAGTAGATGACT
TTGCTGAAAAGGCGATGAAGGAGATCAAGAAGCAATACGCTGTGCTTGATGAGAAGGTGT
TGAGTAAGGTCATGAGCAAAATCCCCAAAGGAGCCTTCAAGAAGAAGGATTAGAGAGTGT
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GAAGCATTGTTTTTTCTTACTTGTAATGGAAGCTGTGTTGGTTAATAAACCCTTTTAGTC
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TTAAATTTGAGCTTATATCTTTGCGTCCTC

QA 1 750 1 750
DS 

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TGGGTTTTATTCGGGGGTTTAACCAAATTTTATACAACCATATTAAATTTGAGCTTATAT
CTTCGCGTCCTCTGTTATGGTAATAGATCTTTGAATTTGAGT

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 12

CO CL147Contig1 1070 12 30 U
AAGATAAAATCTTTAAAAAAATCTTAAATCTCACTAATAAGTGAAGAATAGAAAATAAAT
TTTAAAGACTATATCCCAAGTCTTCAAATCTAAAACAAATGATGAAAAAAAATCTTATTT
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TAAACATTTCCGGTTTAGATATGACCGGCCCAGTTTTGGGAGCTCTCGACTCTAGGCATG
CCGGTGGTACCCTCTCTCTTAGCCTCGGCATCAACCTGAAAGGTGGCACCACACACCTCT
CCTGAGCTATCCACCCTCGGCACTGGCTTAAGCTGGTTCTTCGGGTGCTCGTAGCTCCTC
AATCCTCCCGACGATGTAAAGAAGCAACCTTTAGGGAAAGGACTGTAAGATTTGGAGCAA
CCTTTCTTCACAATGGCAGTGTCATCAGAGAGAACAAGGTGACCTTCAGCATCAGTACCC
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GGGCCACGGTCACGTAGAGTCCTGTAAGCCTCGATCACCATGATGGCCTCGTTTGTGACT
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CAGAAGATGTCATCCACAACCGCAAACAATCTGTGAACAAGAGGATCGGTGTTATCAAGG
GAGTAAGCGAGCACTCCCGACGATCCGAGGCTAAGCGTGACGGAGTTGGAGTTTTTGGAG
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GGACTCTGCAGTGCTTCGGGGCTATTCGCTACCGTCTTCTCGAACACAGCCAACATTTTC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 
40 40 40 40 5 20 20 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
10 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 45 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 35 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

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RD RS1E053JQ 506 0 0
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TAAACATTTCCGGTTTAAATATGACCGGCCCAGTTTTGGGAGCTCTCGACTCTAGGCATG
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QA 1 506 1 506
DS 

RD RS1D084JQ 738 0 0
GAG
AAAATCTTAAATCTCACTAATAAGTGAAGAATAGAAGATAAATTTTAAAGACTATATCCC
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AGAAACGCAAACGGAAACAGAGAAACAACACTGGTAAAGTAAAGTCTCAGAGATATATTA
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GATATGACCGGCCCAGTTTTGGGAGCTCTCGACTCTAGGCATGCCGGTGGTACCCTCTCT
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AGTGTCATCAGAGAGAACAAGGTGACCTTTAGCATCAGTACCCCAGAAGAAAGGCACAGT
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AGAGTTTCCATGGAAATCTCTGACAACTTTGTCGACGGGGTAAGGGCCACGGTCACGTAG
AGTCCTGTAAGCCTCGATCACCATGATGGCCTCGTTTGTGACTTTGCTCAGCCCGTACTG
CTGCCCCAGAAACGG

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DS 

RD RS1DF74JQ 661 0 0
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GGTAAACATTTCCGGTTTAGATATGACCGGCCCAGTTTTGGGAGCTCTCGACTCTAGGTA
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TCAATCCTCCCGACGATGTAAAGAAGCAACCTTTAGGGAAAGGACTGTAAGATTTGGAGC
AACCTTTCTTCACAATGGCAGTGTCATCAGAGAGAACAAGGTGACCTTCAGCATCAGTAC
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AAGGGCCACGGTCACGTAGAGTCCTGTAAGCCTCGATCACCATGATGGCCTCGTTTGTGA
CTTTGCTCAGCCCATACTGCTGCCTCAGAAACGGAAGGTTCTCAATGTGTCCTCTGAAGA
C

QA 1 661 1 661
DS 

RD RS1AX69JQ 699 0 0
CGAT
GAAAAAAAATCTTATTTTTTTTTATTTGAATCCGAGAAACGCAAACGGAAACAGAGAAAC
AACACTGGTAAAGTAAAGACTCAGAGATATATTAAACGAAACAAAGTCTCGTCTCTGCTT
GAGCTTTGAAATTTAGGTAAACATTTCCGGTTTAGATATGACCGGCCCAGTTTTGGGAGC
TCTCGACTCTAGGCATGCCGGTGGTACCCTCTCTCCTAGCCTCGGCATCAACCTGAAAGG
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TGTGGCCTCGGAAGACGCAGAAGATGTCATCCAC
C

QA 5 698 5 698
DS 

RD RS1AX69TF 698 0 0
CGATG
AAAAAAATCTTATTTTTTTA***TTGAATCCGAGAAACGCAAACGGAAACAGAGAAACAA
CACTGGTAAAGTAAAGACTCAGAGATATATTAAACGAAACAAAGTCTCGTCTCTGCTTGA
GCTTTGAAATTTAGGTAAACATTTCCGGTTTAGATATGACCGGCCCAGTTTTGGGAGCTC
TCGACTCTAGGCATGCCGGTGGTACCCTCTCTCCTAGCCTCGGCATCAACCTGAAAGGTG
GCACCACACACCTCTCCTGAGCTATCCACCCTCGGCACTGGCTTAAGCTGGTTCTTCGGG
TGCTCGTAGCTCCTCAATCCTCCCGACGATGTAAAGAAGCAACCTTTAGGGAACGGACTG
TAAGATTTGGAGCAACCTTTCTTCACAATGGCAGTGTCATCAGAGAGAACAAGGTGGCCT
TCAGCATCAGTACCCCAGAAGAAAGGCACAGTCCCATCAGCATCAGCAGCAGTGAAGACG
GTTTTGTTGGTGCCATCGAAGAGGATGAAGGCGAAGTTTCCATGGAAGTCTCTGACGACT
TTGTCGACGGGGTAAGGGCCACGGTCACGTAGAGTCCTGTAAGCCTCGATCACCATGATG
GCCTCGTTTGTGACTTTGCTCAGCCCATACTGCTGTCTCAGAAACGGGAGGTTCTCAATG
TGGCCTCGGAAGACGCAGAAGATGTCATCCAC
C

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DS 

RD RS1DO80JQ 689 0 0
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CGGTTTAGATATGACCGGCCCAGTTTTGGGAGCTCTCGACTCTAGGCATGCCGGTGGTAC
CCTCTCTCTTAGCCTCGGCATCAACCTGAAAGGTGGCACCACACACCTCTCCTGAGCTAT
CCACCCTCGGCACTGGCTTAAGCTGATTCTTCGGGTGCTCGTAGCTCCTCAATCCTCCCG
ACGATGTAAAGAAGCAACCTTTAGGGAAAGGACTGTAAGATTTGGAGCAACCTTTCTTCA
CAATGGCAGTGTCATCAGAGAGAACAAGGTGACCTTCAGCATCAGTACCCCAGAAGAAAG
GCACAGTACCATCAGCATCAGCAGCAGTGAAGACGGTTTTGTTGGTGCCATCGAAGAGGA
TGAAGGCAAAGTTTCCATGGAAATCTCTGACAACTTTGTCGACGGGGTAAGGGCCACGGT
CACGTAGAGTCCTGTAAGCCTCGATCACCATGATGGCCTCGTTTGTGACTTTGCTCAGCC
CATACTGCTGCCTCAGAAACGGAAGGTTCTCAATGTGTCCTCTGAAGACGCAGAAGATGT
CATCCACAACCGCAAACAATCTGTGAACA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1E406JQ 788 0 0
G
GAAAAAAAATCTTATTTTTTT**ATTTGAATCCGAGAAACGCAAACGGAAACAGAGAAAC
AACACTGGTAAAGTAAAGTCTCAGAGATATATTAAACGAAACAAAGTCTCGTCTCTGCTT
GAGCTTTGAAATTTAGGTAAACATTTCCGGTTTAGATATGACCGGCCCAGTTTTGGGAGC
TCTCGACTCTAGGCATGCCGGTGGTACCCTCTCTCTTAGCCTCGGCATCAACCTGAAAGG
TGGCACCACACACCTCTCCTGAGCTATCCACCCTCGGCACTGGCTTAAGCTGGTTCTTCG
GGTGCTCGTAGCTCCTCAATCCTCCCGACGATGTAAAGAAGCAACCTTTAGGGAAAGGAC
TGTAAGATTTGGAGCAACCTTTCTTCACAATGGCAGTGTCATCAGAGAGAACAAGGTGAC
CTTCAGCATCAGTACCCCAGAAGAAAGGCACAGTACCATCAGCATCAGCAGCAGTGAAGA
CGGTTTTGTTGGTGCCATCGAAGAGGATGAAGGCAAAGTTTCCATGGAAATCTCTGACAA
CTTTGTCGACGGGGTAAGGGCCACGGTCACGTAGAGTCCTGTAAGCCTCGATCACCATGA
TGGCCTCGTTTGTGACTTTGCTCAGCCCATACTGCTGCCTCAGAAACGGAAGGTTCTCAA
TGTGTCCTCTGAAGACGCAGAAGATGCCATCCACAACCGCAAACAATCTGTGAACAAGAG
GATCGGTGTTATCAAGGGAGTAAGCGAGCACTCCCGACGATCCGAGGCTAAGCGTGACGG
AGTTGGA

QA 2 788 2 788
DS 

RD RS1E053TF 742 0 0
GCATCAA
CTGAAAGGTGGCACCACACAC*TCTC*TGAGCTATCCACC*TCGGCACTG*CTTAAGCTG
GT*CTTCGGGTGCTCGTAGCTCCTCAATCCTCCCGACGATGTAAAGAAGCAAC*TTTAGG
GAAAGGACTGTAAGATTTGGAGCAACCTTTCTTCACAATGGCAGTGTCATCAGAGAGAAC
AAGGTGACCTTCAGCATCAGTACCCCAGAAGAAAGGCACAGTACCATCAGCATCAGCAGC
AGTGAAGACGGTTTTGTTGGTGCCATCGAAGAGGATGAAGGCAAAGTTTCCATGGAAATC
TCTGACAACTTTGTCGACGGGGTAAGGGCCACGGTCACGTAGAGTCCTGTAAGCCTCGAT
CACCATGATGGCCTCGTTTGTGACTTTGCTCAGCCCATACTGCTGCCTCAGAAACGGAAG
GTTCTCAATGTGTCCTCTGAAGACGCAGAAGATGTCATCCACAACCGCAAACAATCTGTG
AACAAGAGGATCGGTGTTATCAAGGGAGTAAGCGAGCACTCCCGACGATCCGAGGCTAAG
CGTGACGGAGTTGGAGTTTTTGGAGACGAATTGACTCGCTAGATATCCTTCTTTCAACGC
GTACGAAGGCGATGATCCGGAGTGTGGACTCTGCAGTGCTTCGGGGCTATTCGCTACCGT
CTTCTCGAACACAGCCAACATTTTCTTTGATTCTGATTTGAATTTGGAGAAAAAATCTCA
ATGGAGAGAAAAAAA

QA 8 742 8 742
DS 

RD RS1D084TF 604 0 0
AAGATTTGGAGCAACCTTTCTTCACAATGGCAGTGTCATCAGAGAGAACAAGGTGACCTT
TAGCATCAGTACCCCAGAAGAAAGGCACAGTACCATCAGCATCAGCAGCAGTGAAGACGG
TTTTGTTGGTGCCATCGAAGAGGATGAAGGCAGAGTTTCCATGGAAATCTCTGACAACTT
TGTCGACGGGGTAAGGGCCACGGTCACGTAGAGTCCTGTAAGCCTCGATCACCATGATGG
CCTCGTTTGTGACTTTGCTCAGCCCGTACTGCTGCCCCAGAAACGGAAGGTTCTCAATGT
GTCCTCTGAAGACGCAGAAGATGTCATTCACAACCGCAAACAATCTGTGAACAAGAGGAT
CGGTGTTATCAAGGGAGTAAGCGAGCACTCCCGACGATCCGAGGCTAAGCGTGACGGAGT
TGGAGTTTTTGGAGACGAATTGACTCGCTAGATATCCTTCTTTCAACGCGTACGAAGGCG
ATGATCCGGAGTGTGGACTATGCAGTGCTTCGGGGCTATTCGCTACCGTCTTCTCGAACA
CAGCCAACATTTTCTTTGATTCTGATTTGAATTTGGAGAAAAAATCTCAATGGAGAGAAA
AAAA

QA 1 604 1 604
DS 

RD RS1DF74TF 581 0 0
ACAATGGCAGTGTCATCAGAGAGAACAAGGTGACTTTCAGCATCAGTACCCCAGAAGAAA
GGCACAGTACCATCAGCATCAGCAGCAGTGAAGACGGTTTTGTTGGTGCCATCGAAGAGG
ATGAAGGCAAAGTTTCCATGGAAATCTCTGACAACTTTGTCGACGGGGTAAGGGCCACGG
TCACGTAGAGTCCTGTAAGCCTCGATCACCATGATGGCCTCGTTTGTGACTTTGCTCAGC
CCATACTGCTGCCTCAGAAACGGAAGGTTCTCAATGTGTCCTCTGAAGACGCAGAAGATG
TCATCCACAACCGCAA*CAATCTGTGAACAAGAGGATCGGTGTTATCAAGGGAGTAAGCG
AGCACTCCCGACGATCCGAGGCTAAGCGTGACGGAGTTGGAGTTTTTGGAGACGAATTGA
CTCGCTAGATATCCTTCTTTCAACGCGTACGAAGGCGATGATCCGGAGTGTGGACTCTGC
AGTGCTTCGGGGCTATTCGCTACCGTCTTCTCGAACACAGCCAACATTTTCTTTGATTCT
GATTTGAATTTGGAGAAAAAATCTCAATGGAGAGAAAAAAA

QA 1 581 1 581
DS 

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CCCG
CGATCCGAGGCTAAGCGTGACGGAGTTGGAGTTTTTGGAGACGAATTGACTCGCTAGATA
TCCTTCTTTCAACGCGTACGAAGGCGATGATCCGGAGTGTGGACTCTGCAGTGCTTCGGG
GCTATTCGCTACCGTCTTCTCGAACACAGCCAACATTTTCTTTGATTCTGATTTGAATTT
GGAGAAAAAACCTCAATGGAGAGAAAAAAA

QA 5 214 5 214
DS 

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AAGATTTGGAGCAACCTTTCTTCACAATGGCAGTGTCATCAGAGAGAACAAGGTGACCTT
CAGCATCAGTACCCCAGAAGAAAGGCACAGTACCATCAGCATCAGCAGCAGTGAAGACGG
TTTTGTTGGTGCCATCGAAGAGGATGAAGGCAAAGTTTCCATGGAAATCTCTGACAACTT
TGTCGACGGGGTAAGGGCCACGGTCACGTAGAGTCCTGTAAGCCTCGATCACCATGATGG
CCTCGTTTGTGACTTTGCTCAGCCCATACTGCTGCCTCAGAAACGGAAGGTTCTCAATGT
GTCCTCTGAAGACGCAGAAGATGTCATCCACAACCGCAAACAATCTGTGAACAAGAGGAT
CGGTGTTATCAAGGGAGTAAGCGAGCACTCCCGACGATCCGAGGCTAAGCGTGACGGAGT
TGGAGTTTTTGGAGACGAATTGACTCGCTAGATATCCTTCTTTCAACGCGTACGAAGGCG
ATGATCCGGAGTGTGGACTCTGTAGTGCTTCGGGGCTATTCGCTACCGTCTTCTCGAACA
CAGCCAACATTTTCTTTGATTCTGATTTGAATTTGGAGAAAAAATCTCAATGGAGAGAAA
AAAA

QA 1 604 1 604
DS 



AS 2 12

CO CL148Contig1 1303 10 28 U
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GCTTCACGTATCCAGGAATCGACGGCCATCCACCACCGGGATCAAAACCGCTTATCGAGG
ATTTCTCTCTGAAGCTCAATTCGAGCGAACGGTGTCTCCTCGTCGGATCCAATGGCGCCG
GGAAAACGACGATACTGAAGATATTGGGAGGGAAACACATGGTGGAGCCGCACATGGTTA
GGGTTCTTGGTCGATCTGCGTTTCACGACACCGGTTTGACCTCTTCTGGTGATCTCTGCT
ATCTCGGCGGCGAGTGGAGGCGTGATGTGGCATTTGCAGGATTTGAAGTTCCGATTCAAA
TGGACATTTCTGCTGAGAAGATGATATTCGGAGTGGCTGGTATTGATCCTCAGAGAAGAG
CTGAACTTATCAAGGTGTTGGATATTGATATCTCATGGAGATTGCACAAGGTCTCTGATG
GCCAGAGAAGACGCGTCCAGATTTGTATGGGACTCCTCAAGCCTTTCAAGGTTCTCCTTT
TGGATGAAATCACTGTTGATCTTGACGTTCTCGCCAGAGCCGATCTTTTGACATTTCTGA
GAAAGGAATGCCAAGAACGAGGAGCTACCATTTTCTACGCCACTCATATTTTCGATGGTC
TTGAGGATTGGCCTACTCACATTGTGTATGTAGCAAACGGGAAGTTGCAATTAGCTATGC
CAATGGAGAAAGTGAAGGAAACAAGCAAGAAGTCATTGATGAGAACAGTTGAGAGTTGGT
TGAGGAAAGAAAGAGACGAGGAGAGGAAGACTAGGAGAGAAAGGAAAGCCAATGGCCTTC
CTGAGTTCGAAACACGTGCTGAAGAAAGCCGTGTCACCGGTGATCCTGCTCGGATGCTCA
ACAATGGATGGGCTGCCGGCAGACTTCACTCTACCATTGCAGGAGGTGAAGAACATTTCG
TCCATAGCTCAAACAGAGTTTTCAGATAAGCATTCATTCGAGCGACTCCAATGGAGCAAA
AGGTCATAATAATAATATGTTCTTCTTCTTTTTTCTTTCTTTTACCACGAATAATACTTC
TTTTTCCTGTAACCGTTTGAGTGTTTGTTATTCTGAGATATGAATTTTATATTATTTTCT
AGCTATATCTTAGTTTGGTAATGAGAAGGATCAAAGATTGAAGAAGTCAGAGAGAGTAAA
AATTCCTCTGTATTATTGTGTGTAGTTAGTTGAGCTTTGTTAGTAAAGTAAAATTTTTAT
TGTAATATCTCCATACCATTGAACTTTTCATTATATATATTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 45 45 45 45 20 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 50 50 50 50 50 35 
50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 20 50 50 15 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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DS 

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GGGAAGT
AGAAATGGAAGAGGAGAAGCGACATTCAACGGTGGAGATCTCTGGATTACGCTTCACGTA
TCCAGGAATCGACGGCCATCCACCACCGGGATCAAAACCGCTTATCGAGGATTTCTCTCT
GAAGCTCAATTCGAGCGAACGGTGTCTCCTCGTCGGATCCAATGGCGCCGGGAAAACGAC
GATACTGAAGATATTGGGAGGGAAACACATGGTGGAGCCGCACATGGTTAGGGTTCTTGG
TCGATCTGCGTTTCACGACACCGGTTTGACCTCTTCTGGTGATCTCTGCTATCTCGGCGG
CGAGTGGAGGCGTGATGTGGCATTTGCAGGATTTGAAGTTCCGATTCAAATGGACATTTC
TGCTGAGAAGATGATATTCGGAGTGGCTGGTATTGATCCTCAGAGAAGAGCTGAACTTAT
CAAGGTGTTGGATATTGATATCTCATGGAGATTACACAAGGTCTCTGATGGCCAGAGAAG
ACGCGTCCAGATTTGTATGGGACTCCTCAAGCCTTTCAAGGTTCTCCTTTTGGATGAAAT
CACTGTTGATCTTGACGTTCTCGCCAGAGCCGATCTTTTGACATTTCTGAGAAAGGAATG
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GCCTACTCACATTGTGTATGTAGCAAACGGGAAGTTGCAATTAGCTATGCCAATGGAGAA
AGT

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DS 

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GGTGTCTCCTCGTCGGATCCAATGGCGCCGGGAAAACGACGATACTGAAGATATTGGGAG
GGAAACACATGGTGGAGCCGCACATGGTTAGGGTTCTTGGTCGATCTGCGTTTCACGACA
CCGGTTTGACATCTTCTGGTGATCTCTGCTATCTCGGCGGCGAGTGGAGGCGTGATGTGG
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GAGTGGCTGGTATTGATCCTCAGAGAAGAGCTGAACTTATCAAGGTGTTGGATATTGATA
TCTCATGGAGATTGCACAAGGTCTCTGATGGCCAAAGAAGACGCGTCCAGATTTGTATGG
TACTCCTCAAGCCTTTCAAGGTTCTCCTTTTGGATGAAATCACTGTTGATCTTGACGTTC
TCGCCAGAGCCGACCTTTTGACATTTCTGAGAAAGGAATGCCAAGAACGAGGAGCTACCA
TTATCTACGCCACTCATATATTCGATGGTCTTGAGGATTGGCCTACTCACATTGTGTATG
TAGCAAACGGGAAGTTGCAATTAGCTATGCCAATGGAGAAAGTGAAG*AA*CAAGCAAGA
*GTCATTGATGAGA*CAGTTGAGAGTTGGT

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DS 

RD RS1FT51TF 787 0 0
GG
AGAAATGGAAGAGGAGAAGCGACATTCAACGGTGGAGATCTCTGGATTACGCTTCACGTA
TCCAGGAATCGACGGCCATCCACCACCGGGATCAAAACCGCTTATCGAGGATTTCTCTCT
GAAGCTCAATTCGAGCGAACGGTGTCTCCTCGTCGGATCCAATGGCGCCGGGAAAACGAC
GATACTGAAGATATTGGGAGGGAAACACATGGTGGAGCCGCACATGGTTAGGGTTCTTGG
TCGATCTGCGTTTCACGACACCGGTTTGACCTCTTCTGGTGATCTCTGCTATCTCGGCGG
CGAGTGGAGGCGTGATGTGGCATTTGCAGGATTTGAAGTTCCGATTCAAATGGACATTTC
TGCTGAGAAGATGATATTCGGAGTGGCTGGTATTGATCCTCAGAGAAGAGCTGAACTTAT
CAAGGTGTTGGATATTGATATCTCATGGAGATTGCACAAGGTCTCTGATGGCCAGAGAAG
ACGCGTCCAGATTTGTATGGGACTCCTCAAGCCTTTCAAGGTTCTCCTTTTGGATGAAAT
CACTGTTGATCTTGACGTTCTCGCCAGAGCCGATCTTTTGACATTTCTGAGAAAGGAATG
CCAAGAACGAGGAGCTACCATTTTCTACGCCACTCATATTTTCGATGGTCTTGAGGATTG
GCCTACTCACATTGTGTATGTAGCAAACGGGAAGTTGCAATTAGCTATGCCAATGGAGAA
AGTGAAGAAA*CAAGCA*GAAGTCATTGATGAGA*CAGTTGAGAGTTGGTTGAG
AAGAAGAGACG

QA 3 776 3 776
DS 

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ATTGGCCTACTCACATTGTGTATGTAGCAAACGGGAAGTTGCAATTAGCTATGCCAATGG
AGAAAGTGAAGGAAACAAGCAAGAAGTCATTGATGAGAACAGTTGAGAGTTGGTTGAGGA
AAGAAAGAGACGAGGAGAGGAAGACTAGGAGAGAAAGGAAAGCCAATGGCCTTCCTGAGT
TCGAAACACGTGCTGAAGAAAGCCGTGTCACCGGTGATCCTGCTCGGATGCTCAACAATG
GATGGGCTGCCGGCAGACTTCACTCTACCATTGTAGGAGGTGAAGAACATTTCGTCCTTA
GCTCAAACAGAGTTTTCAGATAAGCATTCATTCGAGCGACTCCAATGGAGCAAAAGGTCA
TAATAATAATATGTTCTTCTTCTTTTTTCTTTCTTTTACCACGAATAATACTTCTTTTTC
CTGTAACCGTTTGAGTGTTTGTTATTC
CG

QA 1 447 1 447
DS 

RD RS1C191TF 757 0 0
G
CGGAGTGGCTGGTATTGATCCTCAGAGAAGAGCTGAACTTATCAAGGTGTTGGATATTGA
TATCTCATGGAGATTGCACAAGGTCTCTGATGGCCAGAGAAGACGCGTCCAGATTTGTAT
GGGACTCCTCAAGCCTTTCAAGGTTCTCCTTTTGGATGAAATCACTGTTGATCTTGGCGT
TCTCGCCAGAGCCGATCTTTTGACATTTCTGAGAAAGGAATGCCAAGAACGAGGAGCTAC
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AGCATTCATTCGAGCGACTCCAATGGAGCAAAAGGTCATAATAATAATATGTTCTTCTTC
TTTTTTCTTTCTTTTACCACGAATAATACTTCTTTTTCCTGTAACCGTTTGAGTGTTTGT
TATTCTGAGATATGAATTTTATATTATTTTCTAGC
C

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TGGCCAGAGAAGACGCGTCCAGATTTGTATGGGACTCCTCAAGCCTTTCAAGGTTCTCCT
TTTGGATGAAATCACTGTTGATCTTGACGTTCTCGCCAGAGCCGATCTTTTGACATTTCT
GAGAAAGGAATGCCAAGAACGAGGAGCTATCATTTTTTACGCCACTCATATTTTCGATGG
TCTTGAGGATTGGCCTACTCACATTGTGTATGTAGCAAACGGGAAGTTGCAATTAGCTAT
GCCAATGGAGAAAGTGAAGGAAACAAGCAAGAAGTCATTGATGAGAACAGTTGAGAGTTG
GTTGAGGAAAGAAAGAGACGAGGAGAGGAAGACTAGGAGAGAAAGGAAAGCCAATGGCCT
TCCTGAGTTCGAAACACGTGCTGAAGAAAGCCGTGTCACCGGTGATCCTGCTCGGATGCT
CAACAATGGATGGGCTGCCGGCAGACTTCACTCTACCATTGCAGGAGGTGAAGAACATTT
CGTCCTTAGCTCAAACAGAGTTTTCAGATAAGCATTCATTCGAGCGACTCCAATGGAGCA
AAAGGTCATAATAATAATATGTTCTTCTTCTTTTTTCTTTCTTTTACCACGAATAATACT
TCTTTTTCCTGTAACCGTTTGAGTGTTTGTTATTCTGAGATATGAATTTTATATTATTTT
CTAGC
C

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1C191JQ 490 0 0
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CTATGCCAATGGAGAAAGTGAAGGAAACAAGCAAGAAGTCATTGATGAGAACAGTTGAGA
GTTGGTTGAGGAAAGAAAGAGACGAGGAGAGGAAGACTAGGAGAGAAAGGAAAGCCAATG
GCCTTCCTGAGTTCGAAACACGTGCTGAAGAAAGCCGTGTCACCGGTGATCCTGCTCGGA
TGCTCAACAATGGATGGGCTGCCGGCAGACTTCACTCTACCATTGCAGGAGGTGAAGAAC
ATTTCGTCCATAGCTCAAACAGAGTTTTCAGATAAGCATTCATTCGAGGGACTCCAATGG
AGCAAAAGGTCATAATAATAATATGTTCTTTTTCTTTTTTCTTTCTTTTACCACGAATAA
TACTTTTTTTTCCTGTAACCGTTTGAGTGTTTGTTATTTTGAGATATGAATTTTATATTA
TTTTCTAGC
C

QA 1 489 1 489
DS 

RD RS1FT51JQ 676 0 0
CCATTTTCTACGCCACTCATATTTTCGATGGTCTTGAGGATTGGCCTACTCACATTGTGT
ATGTAGCAAACGGGAAGTTGCAATTAGCTATGCCAATGGAGAAAGTGAAGGAAACAAGCA
AGAAGTCATTGATGAGAACAGTTGAGAGTTGGTTGAGGAAAGAAAGAGACGAGGAGAGGA
AGACTAGGAGAGAAAGGAAAGCCAATGGCCTTCCTGAGTTCGAAACACGTGCTGAAGAAA
GCCGTGTCACCGGTGATCCTGCTCGGATGCTCAACAATGGATGGGCTGCCGGCAGACTTC
ACTCTACCATTGCAGGAGGTGAAGAACATTTCGTCCTTAGCTCAAACAGAGTTTTCAGAT
AAGCATTCATTCGAGCGACTCCAATGGAGCAAAAGGTCATAATAATAATATGTTCTTCTT
CTTTTTTCTTTCTTTTACCACGAATAATACTTCTTTTTCCTGTAACCGTTTGAGTGTTTG
TTATTCTGAGATATGAATTTTATATTATTTTCTAGCTATATCTTAGTTTGGTAATGAGAA
GGATCAAAGATTGAAGAAGTCAGAGAGAGTAAAAATTCCTCTGTATTATTGTGTGTAGTT
AGTTGAGCTTTGTTAGTAAAGTAAAATTTTTATTGTAATATCTCCATACCATTGAACTTT
TCATTATATATATTAC

QA 1 676 1 676
DS 



CO CL148Contig2 893 2 8 U
GATATAAAATTTGTAATATATGTAATGAAAAGTTCAATGGTATGGAGATATTACAATATA
AATTTTACTTAACTAACAAAGCTCAACTAACTACACACAATAATACAGAGGATTTTTTAC
TCTCTCTGACTTCTTCAATCTTTGATCCTTCTCATTACCAAACTAAAATATAGCTAGAAA
ATAAATAAAATTCATATCTCAAAAAAACAAGCACTCAAACGGTTACAGGAAAAAGAAGTA
TTATTCGCGGTAAGTAAAAGAAAAAAAGAAGAACATATTACTATGACCTTTTGCTCCATT
GGAGTCCCTCGAATGCTTATCTGAAAACTCTGTTTGAGCTAAGGACGAAATGTTCTTCAC
CTCCTGCAATGGTAGAGTGAAGTCTGCCGGCAGCCCATCCATTGTTGAGCATCCGAGCAG
GATCACCGGTGACACGGCTTTCTTCAGCACGTGTTTCGAACTCAGGAAGGCCATTGGCTT
TCCTTTCTCTCCTTGTCTTCCTCTCCTCGTCTCTTTCTTTCCTCAACCAACTCTCAACTG
TTCTCATCAATGACTTCTTGCTTGTTTCCTTCACTTTCTCCATTGGCATAACTAATTGCA
ACTTCCCGTTTGCTACATACACAATGTGAGTAGGCCAATCCTCAAGACCATCGAATATAT
GAGTGGCGTAAATAATGGTAGCTCCTCGTTCTTGGCATTCCTTTCTCAGAAATGTCAAAA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F059JQ U 1
AF RS1BY29JQ U 157
BS 1 175 RS1F059JQ
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AATTTTACTTAACTAACAAAGCTCAACTAACTACACACAATAATACAGAGGATTTTTTAC
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QA 1 761 1 761
DS 

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CTTTCCTCAACCAACTCTCAACTGTTCTCATCAATGACTTCTTGCTTGTTTCCTTCACTT
TCTCCATTGGCATAGCTAATTGCAACTTCCCGTTTGCTACATACACAATGTGAGTAGGCC
AATCCTCAAGACCATCGAATATATGAGTGGCGTAAATAATGGTAGCTCCTCGTTCTTGGC
ATTCCTTTCTCAGAAATGTCAAAAGGTCGGCTCTGGCGAGAACGTCAAGATCAACAGTGA
TTTCATCCAAAAGGAGAACCTTGAAAGGCTTGAGGAGTACCATACAAATCTGGACGCGTC
TTCTTTGGCCATCAGAGACCTTGTGCAATCTCCATGAGATATCAATATCCAACACCTTGA
TAAGTTCAGCTCTTCTC

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 13

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TCTTCGTGTCCGAGCTTCATCATCATCATCATCGCTCTCTCTGTTCTCATCTAAGTCCTC
CAATTCTGCGAAACCACTTTTCACTTCTCATCGTCAGATTCCATTATCAACAACGGGAGC
TAAACTCTCTAAGTCGGAACATTCCATGGCCACTTCCTCCGAGCCCAAGTCCATCTATGA
TTTCACCGTCAAGGATGCGAAGGGAAAGGATGTTGATCTAAGCACCTACAAGGGGAAGGT
TCTCTTGATTGTCAACGTTGCTTCTCAGTGTGGTTTGACCAATTCGAACTATACCGAGCT
TGCACAGCTGTACCAGAAGTACAAAGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCGTTCCCCTGTAA
CCAGTTTGGGAATCAAGAACCTGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCCTGTACCCG
TTTCAAGGCTGAGTACCCTATCTTTGATAAGGTTGATGTGAATGGTGACACGGCTGCTCC
AATCTATAAGTTCCTGAAATCAAGCAAAGGTGGGCTCTTTGGAGACGGAATCAAGTGGAA
CTTCGCCAAGTTCTTGGTTGACAAAGATGGGAATGTTGTGGACCGTTACGCCCCAACTAC
TTCCCCTCTCAGCATTGAGAAGGACCTGAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTTAAGCAAC
GAAGAGGCGCTAGTACTCAAATAAAAGCTCCTACAGTATTGTAATAAGCTGTCTATGTTC
TTGAGCGTCTTTGGGATGAGTTGTTTCCTGCTACTTAATTCTTCGTTTAGCTACTTATGT
GTGTAATATCGTCGACCTAAATATCATAATTGCTGTTCCTACTGTATTTTGCCTGTTTCC
ATGAACCGTGGGGAGGAGAAATCTAGGGACGGCGTAATATGGTATTTTTAAAATTCAGAC
TTGAAAGTCAAATAATTTTAATTAGATTTTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 25 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 25 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 0 60 60 60 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 70 70 20 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
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75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 50 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 60 75 75 75 
75 75 75 75 75 60 45 50 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 60 30 75 75 75 75 45 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 
25 75 75 75 75 75 60 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 75 50 75 75 75 75 40 75 75 75 75 75 75 75 75 75 0 75 75 75 75 75 70 70 35 35 35 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 35 50 45 45 30 0 45 45 45 45 30 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GG
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CATGGCCACTTCCTCCGAGCCCAAATCCATCTATGATTTCACCGTCAAGGATGCGAAGGG
AAAGGATGTTGATCTAAGCACCTACAAGGGGAAGGTTCTCTTGATTGTCAACGTTGCTTC
TCAGTGTGGTTTGACCAATTCGAACTATACCGAGCTTGCACAGCTGTACCAGAAGTACAA
AGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCGTTCCCCTGTAACCAGTTTGGGAATCAAGAACCTGG
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TGATAAGGTTGATGTGAATGGTGACACGGCTGCTCCAATCTATAAGTTCCTGAAACCAAG
CAAAGGTGGTCTCTTTGGAGACGGAATCAAGTGGAACTTCGCCAAGTTCTTGGTTGACAA
AGATGGGAATGTTGTGGACCGTTACGCCCCAACTACTTCCCCTCTCAGCATTGAGAAGGA
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AAGCTCCTACAGTATTG

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DS 

RD RS1GN66TF 802 0 0
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CAATTCTGCGAAACCACTTTTCACTTCTCATCGTCAGGTTCCATTATCAACAACGGGAGC
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TGCACAGCTGTACCAGAAGTACAAAGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCGTTCCCCTGTAA
CCAGTTTGGGAATCAAGAACCTGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCCTGTACCCG
TTTCAAGGCTGAGTACCCGATCTTTGATAAGGTTGATGTGAATGGTGACACGGCTGCTCC
AATCTATAAGTTCCTGAAATCAAGCAAAGGTGGGCTCTTTGGAGACGGAATCAAGTGGAA
CTTCGCCAAGTTCTTGGTTGACAAAGATGGGAATGTTGTGGACCGTTACGCCCCAACTAC
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TTGAGCGTCTTTGGGATGAGTT

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DS 

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GGGG
GAAAATGTTGAGATCCTCCTTTCGGCTTCTCTATATAACAAGAAGTACTAATCTTCGTGT
CCGAGCTTCATCATCATCATCATCGCTCTCTCTGTTCTCATCTAAGTCCTCCAATTCTGC
GAAACCACTTTTCACTTCTCATCGTCAGATTCCATTATCAACAACGGGAGCTAAACTCTC
TAAGTCGGAACATTCCATGGCCACTTCCTCCGAGCCCAAGTCCATCTATGATTTCACCGT
CAAGGATGCTAAGGGAAATGATGTTGATCTAAGCACTTACAAGGGGAAGGTTCTCTTGAT
TGTCAACGTTGCTTCTCAGTGTGGTTTGACCAATTCGAACTATACCGAGCTTGCACAGCT
GTACCAGAAGTACAAAGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCGTTCCCCTGTAACCAGTTTGG
GAATCAAGAACCTGGTTCTAATGAAGAGATTGTTTAGTTTGCCTGTACCCGTTTCAAGGC
TGAGTACCCTATCTTTGATAAGGTTGATGTGAATGGTGACACGGCTGCTCCAATCTATAA
GTTCCTGAAATCAAGCAAAGGTGGGCTCTTTGGAGACGGAATCAAGTGGAACTTCGCCAA
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CAGCATTGAGAAG*ACCTGAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTTAAGCAACGAAGAGGCG
CTAGTACTCAA*TAAA*GCTCCTACA*TATTGTA**TAGCTGTCTATGTTCTTGAGCGTC
TTTGGGATGAGTTGTTTCCTGCTACT

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DS 

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GG
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GGGAAATGATGTTGATCTAAGCACTTACAAGGGGAAGGTTCTCTTGATTGTCAACGTTGC
TTCTCAGTGTGGTTTGACCAATTCGAACTATACCGAGCTTGCACAGCTGTACCAGAAGTA
CAAAGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCGTTCCCCTGTAACCAGTTTGGGAATCAAGAACC
TGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCCTGTACCCGTTTCAAGGCTGAGTACCCTAC
CTTTGATAAGGTTGATGTGAATGGTGACACGGCTGCTCCAATCTATAAGTTCCTGAAATC
AAGCAAAGGTGGGCTCTTTGGAGACGGAATCAAGTGGAACTTCGCCAAGTTCTTGGTTGA
CAAAGATGGGAATGTTGTGGACCGTTACGCCCCAACTACTTCCCCTCTCAGCATTGAGAA
G*ACCTGAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTTAAGCAACGAAGAGGCGCTAGTACTCAA*
TAAA*GCTCCTACA*TATTGTA**TAGCTGTCTATGTTCTTGAGCGTCTT*GGGATGAGT
GTTTCTGCTACTTAT

QA 3 722 3 722
DS 

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G
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TTCTCATCGTCTGATTCCGTTATCAACAACGGGAGCTAAACTCTCTAAGTCGGAACGTTC
CATGGCCACTTCCTCCGAGCCCAAATCCATCTATGATTTCACCGTCAAGGATGCGAAGGG
AAAGGATGTTGATCTAAGCACCTACAAGTGGAAGGTTCTCTTGATTGTCAACGTTGCTTC
TCAGTGTGGTTTGACCAATTCGAACTATACCGAGCTTGCACAGCTGTACCAGAAGTACAA
AGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCGTTCCCCTGTAACCAGTTTGGGAATCAAGAACCTGG
TTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCCTGTACCCGTTTCAAGGCTGAGTACCCGATCTT
TGATAAGGTTGATGTGAATGGTGACACGGCTGCTCCAATCTATAAGTTCCTGAAATCAAG
CAAAGGTGGTCTCTTTGGAGACGGAATCAAGTGGAACTTCGCCAAGTTCTTGGTTGACAA
AGATGGGAATGTTGTGGACCGTTACGCCCCAACTACTTCCC*TCTCAGCATTGAGAAAGA
CCTGAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTTAAGCAACGAAGAGGCGCTAGTACTCAAATAA
AAGCTCCTACAGTATTGTAATAAGCTGTCTATGTTCTTGAGCG

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DS 

RD RS1C449TF 724 0 0
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TCAGATTCCATTATCAACAACGGGAACTAAACTCTCTAAGTCGGAACATTCCATGGCCAC
TTCCTCCGAGCCCAAGTCCATCTATGGTTTCACCGTCAAGGATGCGAAGGGAAATGATGT
TGATCTAAGCACTTACAAGGGGAAGGTTCTCTTGATTGTCAACGTTGCTTCTCAGTGTGG
TTTGACCAATTCGAACTATACCGAGCTTGCACAGCTGTACCAGAAGTACAAAGATCATGG
GTTTGAGATCCTTGCGTTCCCCTGTAACCAGTTTGGGAATCAAGAACCTGGTTCTAATCA
AGAGATTGTTCAGTTTGCCTGTACCCGTTTCAAGGCTGAGTACCCTATCTTTGATAAGGT
TGATGTGAATGGTGACACGGCTGCTCCAATCTATAAGTTCCTGAAATCAAGCAAAGGTGG
GCTCTTTGGAGACGGAATCAAGTGGAACTTCGCCAAGTTCTTGGTTGACAAAGATGGGAA
TGTTGTGGACCGTTACGCCCCAACTACTTCCCCTCTCAGCATTGAGAAGGACCTTAAGAA
ACTGTTGGGAGTTACTGCTTAAGCAACGAAGAGGCGCTAGTACTCAAATAAAAGCTCCTA
CAATATTGTAATAAGCTGTCTATGTTCTTGAGCGTCTTTGGGATGAGTTGCTTCCTGCTA
CTTA

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DS 

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GG
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CACTTCTCATCGTCAGGTTCCATTATCAACAACGGGAGCTAAACTCTCTAAGTCGGAACA
TTCCATGGCCACTTCCTCCGAGCCCAAGTCCATCTATGATTTCACCGTCAAGGATGCGAA
GGGAAAGGATGTTGATCTAAGCACCTACAAGGGGAAGGTTCTCTTGATTGTCAACGTTGC
TTCTCAGTGTGGTTTGACCAATTCGAACTACACTGAGCTTGCACAGCTGTACCAGAAGTA
CAAAGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCGTTCCCCTGTAACCAGTTTGGGAATCAAGAACC
TGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCCTGTACCCGTTTCAAGGCTGAGTACCCGAT
CTTTGATAAGGTTGATGTGAATGGTGACACGGCTGCTCCAATCTATAAGTTCCTGAAATC
AAGCAAAGGTGGGCTCTTTGGAGACGGAATCAAGTGGAACTTCGCCAAGTTCTTGGTTGA
CAAAGATGGGAATGTTGTGGACCGTTACGCCCCAACTACTTCCCCTCTCAGCATTGAGAA
G*ACCTGAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTTAAGCAACAAAGAGGCGCTAGTACTCAAA
TAAAAGCTCCTACAGTATTGTAATAAGCTGTCTATGTTCTTGAGCGTCTTTGGGATGAGT
TGTTTCCTGCTACTTAATT*TTCGTT*AGCTACTTATGTGTGTA*TATCGTCTAC*TAAA
TATCATAATTGCTGTTC
G

QA 3 799 3 799
DS 

RD RS1C449JQ 753 0 0
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TCTAAGTCGGAACATTCCATGGCCACTTCCTCCGAGCCCAAGTCCATCTATGGTTTCACC
GTCAAGGATGCGAAGGGAAATGATGTTGATCTAAGCACTTACAAGGGGAAGGTTCTCTTG
ATTGTCAACGTTGCTTCTCAGTGTGGTTTGACCAATTCGAACTATACCGAGCTTGCACAG
CTGTACCAGAAGTACAAAGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCGTTCCCCTGTAACCAGTTT
GGGAATCAAGAACCTGGTTCTAATCAAGAGATTGTTCAGTTTGCCTGTACCCGTTTCAAG
GCTGAGTACCCTATCTTTGATAAGGTTGATGTGAATGGTGACACGGCTGCTCCAATCTAT
AAGTTCCTGAAATCAAGCAAAGGTGGGCTCTTTGGAGACGGAATCAAGTGGAACTTCGCC
AAGTTCTTGGTTGACAAAGATGGGAATGTTGTGGACCGTTACGCCCCAACTACTTCCCCT
CTCAGCATTGAGAAGGACCTTAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTTAAGCAACGAAGAGG
CGCTAGTACTCAAATAAAAGCTCCTACAATATTGTAATAAGCTGTCTATGTTCTTGAGCG
TCTTTGGGATGAGTTGCTTCCTGCTACTTAATTCTTCGTTTAGCTACTTATGTGTGTAAT
ATCGTCGACCTAAATATCATAATTGCTGTTCC
G

QA 1 752 1 752
DS 

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TGTCAACGTTGCTTCTCAGTGTGGTTTGACCAATTCGAACTACACTGAGCTTGCACAGCT
GTACCAGAAGTACAAAGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCGTTCCCCTGTAACCAGTTTGG
GAATCAAGAACCTGGTTTTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCCTGTACCCGTTTCAAGGC
TGAGTACCCGATCTTTGATAAGGTTGATGTGAATGGTGACACGGCTGCTCCAATCTATAA
GTTCCTGAAATCAAGCAAAGGTGGGCTCTTTGGAGACGGAATCAAGTGGAACTTCGCCAA
GTTCTTGGTTGACAAAGATGGGAATGTTGTGGACCGTTACGCCCCAACTACTTCCCCTCT
CAGCATTGAGAAGGACCTGAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTTAAGCAACAAAGAGGCG
CTAGTACTCAAATAAAAGCTCCTACAGTATTGTAATAAGCTGTCTATGTTCTTGAGCGTC
TTTGGGATGAGTTGTTTCCTGCTACTTAATTTTTCGTTTAGCTACTTATGTGTGTAATAT
CGTCTACCTAAATATCATAATTGCTGTTCGTACTG

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DS 

RD RS1DK33JQ 590 0 0
AAGGGGAAGGTTCTCTTGATTGTCAACGTTGCTTCTCAGTGTGGTTTGACCAATTCGAAC
TACACTGAGCTTGCACAGCTGTACCAGAAGTACAAAGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCG
TTCCCCTGTAACCAGTTTGGGAATCAAGAACCTGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTT
GCCTGTACCCGTTTCAAGGCTGAGTACCCGATCTTTGATAAGGTTGATGTGAATGGTGAC
ACGGCTGCTCCAATCTATAAGTTCCTGAAATCAAGCAAAGGTGGGCTCTTTGGAGACGGA
ATCAAGTGGAACTTCGCCAAGTTCTTGGTTGACAAAGATGGGAATGTTGTGGACCGTTAC
GCCCCAACTACTTCCCCTTTCAGCATTGAGAAGGACCTGAAGAAACTGTTGGGAGTTACT
GCTTAAGCAACAAAGAGGCGCTAGTACTCAAATAAAAGCTCCTACAGTATTGTAATAAGC
TGTCTATGTTCTTGAGCGTCTTTGGGATGAGTTGTTTCCTGCTACTTAATTTTTCGTTTA
GCTACTTATGTGTGTAATATCGTCTACCTAAATATCATAATTGCTGTTC
G

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1E077JQ 672 0 0
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ACCAATTCGAACTATACCGAGCTTGCACAGCTGTACCAGAAGTACAAAGATCATGGGTTT
GAGATCCTTGCGTTCCCCTGTAACCAGTTTGGGAATCAAGAACCTGGTTCTAATGAAGAG
ATTGTTCAGTTTGCCTGTACCCGTTTCAAGGCTGAGTACCCTACCTTTGATAAGGTTGAT
GTGAATGGTGACACGGCTGCTCCAATCTATAAGTTCCTGAAATCAAGCAAAGGTGGGCTC
TTTGGAGACGGAATCAAGTGGAACTTCGCCAAGTTCTTGGTTGACAAAGATGGGAATGTT
GTGGACCGTTACGCCCCAACTACTTCCCCTCTCAGCATTGAGAAGGACCTGAAGAAACTG
TTGGGAGTTACTGCTTAAGCAACGAAGAGGCGCTAGTACTCAAATAAAAGCTCCTACAAT
ATTGTAATAAGCTGTCTATGTTCTTGAGCGTCTTTGGGATGAGTTGTTTCCTGCTACTTA
ATTCTTCGTTTAGCTACTTATGTGTGTAATATCGTCGACCTAAATATCATAATTGCTGTT
CCTACTGTATTTTGCCTGTTTCCATGAACCGTGGGGAGGAGAAATCTAGGGACGGCGTAA
TATGGTATTTTT

QA 1 672 1 672
DS 

RD RS1EC69JQ 615 0 0
ACCGAGCTTGCACAGCTGTACCAGAAGTACAAAGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCGTTC
CCCTGTAACCAGTTTGGGAATCAAGAACCTGGTTTTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCC
TGTACCCGTTTCAAGGCTGAGTACCCTATCTTTGATAAGGTTGATGTGAATGGTGACACG
GGTGGTCCAATATATAAGTTCCTGAAATCAAGCAAAGGTGGGCTTTTTGGAGACGGAATC
AAGTGGAACTTGGCCAAGTTTTTGGTTGACAAAGATGGGAATGTTGTGGACCGTTACGCC
CCAAATACTTCCCCTTTCAGCATTGAGAAGGACCTGAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCT
TAAGCAACGAAGAGGCGCTAGTACTCAAATAAAAGCTCCTACAATATTGTAATAAGCTGT
CTATGTTCTTGAGCGTCTTTGGGATGAGTTGTTTCCTGCTACTTAATCCTTCGCTTAGCT
ACTTATGTGTGTAATATCGTCGACCTAAATATCATAATTGCTGTTCCTACTGTATTTTGC
CTGTTTCCATGAACCGTGGGGAGGAGAAATCTAGGGACGGCGTAATATGGTATTTTTAAA
ATTCAGACTTGAAAG

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DS 

RD RS1GK73JQ 574 0 0
CCAGTTTGGGAATCAAGAACCTGGTTCTAATGAAGAGATTGTTTAGTTTGCCTGTACCCG
TTTCAAGGCTGAGTACCCTATCTTTGATAAGGTTGATGTGAATGGTGACACGGCTGCTCC
AATCTATAAGTTCCTGAAATCAAGCAAAGGTGGGCTCTTTGGAGACGGAATCAAGTGGAA
CTTCGCCAAGTTCTTGGTTGACAAAGATGGGAATGTTGTGGACCGTTACGTCCCAACTAC
TTCCCCCCTCAGCATTGAGAAGGACCTGAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTTAAGCAAC
GAAGAGGCGCTAGTACTCAAATAAAAGCTCCTACAATATTGTAATAAGCTGTCTATGTTC
TTGAGCGTCTTTGGGATGAGTTGTTTCCTGCTACTCAATTCTTCGTTTAGCTACTTATGT
GTGTAATATCGTCGACCTAAATATCATAATTGCTGTTCCTACTGTATTTTGCCTGTTTCC
ATGGACCGTGGGGAGGAGAAATCTAGGGACGGCGTAATATGGTATTTTTAAAATTCAGAC
TTGAAAGTCAAATAATTTTAATTAGATTTTGACC

QA 1 574 1 574
DS 



AS 2 9

CO CL150Contig1 829 2 4 U
GGTTTCAATGGATAACAAATCCAGTCCATCTAATATTTCTTATGATATTTTAAAAACACA
AATTCTTTTTAGTAGTTTCACTTCAAAAAAACAAAACAATTTTCAGCTGCGGTAGTCGAT
ACCAAAATAATCATACGCGATAAACAGTTTTTTTTGTATGTTTACGTACAATCTTCTAAA
TTTCTAAAAACTATGTATTCAACAACATAGTTTTCTCTAACTTTGATGGCTTATTCTGAG
GGAGGCCCTGCCTGCCGTAAAGAAAAAGCCATGTCCTGAAGCAAGTTGAGCATTTTTTTG
GAGGTTTTAATGGTGAACCCACGGATGAACCAAGAAAGCGGAGGTAGATTAAATGGAGGA
TATGGCTGGAAGTATTGGTTTATTATAAGTTTTGACCCAATCCTTCCTTGGCCACCGCTA
CATTTTTTGTATTCTTCTGGACTCTTTGGTAACCTCTTTTTGAACAACCGTTCTTGATCT
ACATATATAGGCTCCACTTTAAAGTTGCCGTGGAACTCTTTCATCAATATTACTTTCTCT
TTCTTATATTTTGTCGTAAGATCTTTTCTGTTTTCTTCCATAGTTAGATGTATCGGGATA
GATATAGTCGTCAGCGAAAGGAAGTTATAAGCCATAGCTTTCTCTACCATGACGACCCGC
TTCGGACCATTCTCCTTCAGAACCTTTCTTGATGTGTTTTTCATTAGGAAACGCCACTTC
TCCCTATCGAAAAACGGATCGCCTTCAGTCATCACGTAGTAGACAATATTAGGAGTCGTT
CCCACGGTCAACTCTATGTTCATATGGTAAAGACCCTTCTTATTTGTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EC11JQ U 1
AF RS1DD03JQ U 133
BS 1 462 RS1EC11JQ
BS 463 463 RS1DD03JQ
BS 464 597 RS1EC11JQ
BS 598 829 RS1DD03JQ

RD RS1EC11JQ 597 0 0
GGTTTCAATGGATAACAAATCCAGTCCATCTAATATTTCTTATGATATTTTAAAAACACA
AATTCTTTTTAGTAGTTTCACTTCAAAAAAACAAAACAATTTTCAGCTGCGGTAGTCGAT
ACCAAAATAATCATACGCGATAAACAGTTTTTTTTGTATGTTTACGTACAATCTTCTAAA
TTTCTAAAAACTATGTATTCAACAACATAGTTTTCTCTAACTTTGATGGCTTATTCTGAG
GGAGGCCCTGCCTGCCGTAAAGAAAAAGCCATGTCCTGAAGCAAGTTGAGCATTTTTTTG
GAGGTTTTAATGGTGAACCCACGGATGAACCAAGAAAGCGGAGGTAGATTAAATGGAGGA
TATGGCTGGAAGTATTGGTTTATTATAAGTTTTGACCCAATCCTTCCTTGGCCACCGCTA
CATTTTTTGTATTCTTCTGGACTCTTTGGTAACCTCTTTTTGCACAACCGTTCTTGATCT
ACATATATAGGCTCCACTTTAAAGTTGCCGTGGAACTCTTTCATCAATATTACTTTCTCT
TTCTTATATTTTGTCGTAAGATCTTTTCTGTTTTCTTCCATAGTTAGATGTATCGGG

QA 1 597 1 597
DS 

RD RS1DD03JQ 697 0 0
G
TACGCGATAAACAGTTTTTTTTGTATGTTTACGTACAATCTTCTAAATTTCTAAAAACTA
TGTATTCAACAACATAGTTTTCTCTAACTTTGATGGCTTATTCTGAGGGAGGCCCTGCCT
GTCGTAAAGAAAAAGCCATGTCCTGAAGCAAGTTGAGCATTTTTTTGGAGGTTTTAATGG
TGAACCCACGGATGAACCAAGAAAGCGGAGGTAGATTAAATGGAGGATATGGCTGGAAGT
ATTGGTTTATTATAAGTTTTGACCCAATCCTTCCTTGGCCACCGCTACATTTTTTGTATT
CTTCTGGACTCTTTGGTAACCTCTTTTTGAACAACCGTTCTTGATCTACATATATAGGCT
CCACTTTAAAGTTGCCGTGGAACTCTTTCATCAATATTACTTTCTCTTTCTTATATTTTG
TCGTAAGATCTTTTCTGTTTTCTTCCATAGTTAGATGTATCGGGATAGATATAGTCGTCA
GCGAAAGGAAGTTATAAGCCATAGCTTTCTCTACCATGACGACCCGCTTCGGACCATTCT
CCTTCAGAACCTTTCTTGATGTGTTTTTCATTAGGAAACGCCACTTCTCCCTATCGAAAA
ACGGATCGCCTTCAGTCATCACGTAGTAGACAATATTAGGAGTCGTTCCCACGGTCAACT
CTATGTTCATATGGTAAAGACCCTTCTTATTTGTCA

QA 2 697 2 697
DS 



CO CL150Contig2 1093 7 13 U
GGGCTCTCATCAGTTTTGGTATGCTAAACTTTCCAATAGAAATGGGTGTATTCCCTGGAT
TTGGTGCCTGGGTCAATCAGAACAATCAAGAGTCTCCTAATGCCGAGTCCAAGAGATCTG
AAAATGTCGAATCCAAGTCCGCGTCAGAGAAAGACACTAATAATGCTCATTTTAAGAAGA
AGAAGAAGGATGTGATATATTATGATTATAGAGATTCGATCAGACAACAAGGGCTTTGGT
ATGAAGCAGAGAAGAAGCATCCGTGGCATAATCCCCGTCCCAAGATCAAGGTGACAAATA
AAAAGGGTCTTTACCATATGAACATAGAATTGACCGTGGGAACAGCTCCTGATACACTCT
ACGGATTGATGATTGAACCAAAAGGCGGTCCGTTTTTCGATTATGATAAGTGGCGCGACC
TAATGAGAAACACATCAAGAAAGGTTTTGAAGGAGAATGGTCCGAGGCGGGACATCATGG
TGGAGAAAGCTGTAGCTTATAAATTCCTTTCGCTGACGACTATATCCATCCCGATACATC
TAACTATGGTAGAAAACAGAAAAGATCTTACGACAAAATATAAGAAAGGGAAAGTAATGT
TGATGAAAGAGTTCCACGGCAACTATAAAGTGGAGCCTATATATGTAGATCAAGAACGGC
TGTGCAAAAAGAAGTCACCAAAGAGTCCAGAAGAATATAAAAAA*TGTAGTGGTGGCCGA
GGAAGGGTTGCGTCAAAGCTTACAATAAACCACTACTTCGAGCCATATCCTCCATTTAAT
ATACCGCCGCTTTCTTGGTTCATCCGTGGGATCACCATCGAAACCTCCAAAAAGCTGCTC
AGCGCGCTTCAGGAGATGGCTTCGATTGTACGAAATGCAAAGCCACCCTCAGAAGAAATC
ATCAAAGCGAGTGAGAAAGAGATTATTCAATTACATGATTTTTGAAAAATATAGAACTAT
AGAAGATTGTCGTCAAACATACAAAAGCCGTTTACCGCGTATTAGCGATTATCTTGGTAT
CGACTACGTACCGCAGCTAATATTGTTTTCTGAAGTTGAAACTACTAAAAAATTATTTGT
GATTTAACATATC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1FO45TF U 1
AF RS1AI30TF U 6
AF RS1E292TF U 109
AF RS1EE19JQ C 654
AF RS1B777JQ C 566
AF RS1E292JQ C 566
AF RS1EE19TF U 654
BS 1 245 RS1FO45TF
BS 246 246 RS1AI30TF
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BS 834 1085 RS1EE19TF
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RD RS1FO45TF 583 0 0
GGGCTCTCATCAGTTTTGGTATGCTAAACTTTCCAATAGAAATGGGTGTATTCCCTGGAT
TTGGTGCCTGGGTCAATCAGAACAATCAAGAGTCTCCTAATGCCGAGTCCAAGAGATCTG
AAAATGTCGAATCCAAGTCCGCGTCAGAGAAAGACACTAATAATGCTCATTTTAAGAAGA
AGAAGAAGGATGTGATATATTATGATTATAGAGATTCGATCAGACAACAAGGGCTTTGGT
ATGAATCAGAGAAGAAGCATCCGTGGCATAATCCCCGTCCCAAGATCAAGGTGACAAATA
AAAAGGGTCTTTACCATATGAACATAGAATTGACCGTGGGAACAGCTCCTGATACACTCT
ACGGATTGATGATTGAACCAAAAGGCGGTCCGTTTTTAGATTATGATAAGTGGCGCGACC
TAATGAGAAACACATCAAGAAAGGTTTTGAAGGAGAATGGTCCGAGGCGGGACATCATGG
TGGAGAAAGCTGTAGCTTATAAATTCCTTTCGCTGACGACTATATCCATCCCGATACATC
TAACTATGGTAGAAAACAGAAAAGATCTTACGACAAA
TATAAG

QA 1 577 1 577
DS 

RD RS1AI30TF 680 0 0
CTCATCAGTTTTGGTATGCTAAACTTTCCAATAGAAATGGGTGTATTCCCTGGATTTGGT
GCCTGGGTCAATCAGAACAATCAAGAGTCTCCTAATGCCGAGTCCAAGAGATCTGAAAAT
GTCGAATCCAAGTCCGCGTCAGGGAAAGACACTAATAATGCTCATTTTAAGAAGAAGAAG
AAGGATGTGATATATTATGATTATAGAGATTCGATCAGACAACAAGGGCTTTGGTATGAA
GCAGAGAAGAAGCATCCGTGGCATAATCCCCGTCCCAAGATCAAGGTGACAAATAAAAAG
GGTCTTTACCATATGAACATAGAATTGACCGTGGGAACAGCTCCTGATACACTCTACGGA
TTGATGATTGAACCAAAAGGCGGTCCGTTTTTCGATTATGATAAGTGGCGCGACCTAATG
AGAAACACATCAAGAAAGGTTTTGAAGGAGAATGGTCCGAGGCGGGACATCATGGTGGAG
AAAGCTGTAGCTTATAAATTCCTTTCGCTGACGACTATATCCATCCCGATACATCTAACT
ATGGTAGAAAACAGAAAAGATCTTACGACAAAATATAAGAAAGGGAAAGTAATGTTGATG
AAAGAGTTCCACGGCAACTATAAAGTGGAGCCTATATATGTAGATCAAGAACGGCTGTGC
AAAAAGAAGTCACCAAAGAG

QA 1 680 1 680
DS 

RD RS1E292TF 725 0 0
G
CAAGAGATCTGAAAATGTCGAATCCAAGTCCGCGTCAGAGAAAGACACTAATAATGCTCA
TTTTAAGAAGAAGAAGAAGGATGTGATATATTATGATTATAGAGATTCGATCAGACAACA
AGGGCTTTGGTATGAAGCAGAGAAGAAGCATCCGTGGCATAATCCCCGTCCCAAGATCAA
GGTGACAAATAAAAAGGGTCTTTACCATATGAACATAGAATTGACCGTGGGGACAGCTCC
TGATACACTCTACGGATTGATGATTGAACCAAAAGGCGGTCCGTTTTTCGATTATGATAA
GTGGCGCGACCTAATGAGAAACACATCAAGAAAGGTTTTGAAGGAGAATGGTCCGAGGCG
GGACATCATGGTGGAGAAAGCTGTAGCTTATAAATTCCTTTCGCTGACGACTATACCCAT
CCCGATACATCTAACTATGGTAGAAAACAGAAAAGATCTTACGACAAAATATAAGAAAGG
GAAAGTAATGTTGATGAAAGAGTTCCACGGCAACTATAAAGTGGAGCCTATATATGTAGA
TCAAGAACGGCTGTGCAAAAAGAAGTCACCAAAGAGTCCAGAAGAATATAAAAAAATGTA
GTGGTGGCCGAGGAAAGGTTGCGTCAAAGCTTACAATAAACCACTACTTCGAGCCATATC
CTCCATTTAATATACCGCCGCTTTCTTGGTTCATCCGTGGGATCACCATCGAAACCTCCA
AAAA

QA 2 725 2 725
DS 

RD RS1EE19JQ 415 0 0
GAACGGCTGTGCAAAAAGAAGTCACCAAAGAGTCCAGAAGAATATAAAAAA*TGTAGTGG
TGGCCGAGGAAGGGTTGCGTCAAAGCTTACAATAAACCACTACTTCGAGCCATATCCTCC
ATTTAATATACCGCCGCTTTCTTGGTTCATCCGTGGGATCACCATCGAAACCTCCAAAAA
GCTGCTCAGCGCGCTTCAGGAGATGGCTTCGATTGTACGAAATGCAAAGCCACCCTCAGA
AGAAATCATCAAAGCGAGTGAGAAAGAGATTATTCAATTACATGATTTTTGAAAAATATA
GAACTATAGAAGATTGTCGTCAAACATACAAAAGCCGTTTACCGCGTATTAGCGATTATC
TTGGTATCGACTACGTACCGCAGCTAATATTGTTTTCTGAAGTTGAAACTACTAA

QA 1 415 1 415
DS 

RD RS1B777JQ 528 0 0
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TAAAGTGGAGCCTATATATGTAGATCAAGAACAGCTGTGCAAAAAGAAGTCACCAAAGAG
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GTGGGATCACCATCGAAACCTCCAAAAAGCTGCTCAGCGCGCCTCAGGAGATGGCTTCGA
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TTCAATTACATGACTTTTGAAAAATATAGAACTATAGAAGATTGTCGTCAAACATACAAA
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QA 1 528 1 528
DS 

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TAAAGTGGAGCCTATATATGTAGATCAAGAACGGCTGTGCAAAAAGAAGTCACCAAAGAG
TCCAGAAGAATATAAAAAAATGTAGTGGTGGCCGAGGAAGGGTTGCGTCAAAGCTTACAA
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GTGGGATCACCATCGAAACCTCCAAAAAGCTGCTCAGCGCGCTTCAGGAGATGGCTTCGA
TTGTACGAAATGCAAAGCCACCCTCAGAAGAAATCATCAAAGCGAGTGAGAAAGAGATTA
TTCAATTACATGATTTTTGAAAAATATAGAACTATAGAAGATTGTCGTCAAACATACAAA
AGCCGTTTACCGCGTATTAGCGATTATCTTGGTATCGACTACGTACCGCAGCTAATATTG
TTTTCTGAAGTTGAAACTACTAAAAAATTATTTGTGATTTAACATA
CC

QA 1 526 1 526
DS 

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TGGCCGAGGAAGGGTTGCGTCAAAGCTTACAATAAACCACTACTTCGAGCCATATCCTCC
ATTTAATATACCGCCGCTTTCTTGGTTCATCCGTGGGATCACCATCGAAACCTCCAAAAA
GCTGCTCAGCGCGCTTCAGGAGATGGCTTCGATTGTACGAAATGCAAAGCCACCCTCAGA
AGAAATCATCAAAGCGAGTGAGAAAGAGATTATTCAATTACATGATTTTTGAAAAATATA
GAACTATAGAAGATTGTCGTCAAACATACAAAAGCCGTTTACCGCGTATTAGCGATTATC
TTGGTATCGACTACGTACCGCAGCTAATATTGTTTTCTGAAGTTGAAACTACTAAAAAAT
TATTTGTGATTT

QA 1 432 1 432
DS 



AS 2 12

CO CL151Contig1 986 2 12 U
AAATAATAATAAAAAAACAAGAATTAGAAGTTTGCTACAGAAAGAGCAGAAGAAGAAAGA
AGAGAAGGATACTCAAATCCAAAAAACACTTATTATTGGCTTTTTCCTTTTTTCATAGGA
AAGCTTACCTAAGACCTTATATCTAAAACATAATTCCTGACCTTAAATTATTAAATAAGG
CCAAGTTTGATAGTAGTGTAACCCATCCAATTTACTCTTTTCCATCAGCAGCACGGAGCG
ATCCTAGCTGAACCGGTGCTTGAGTCCCAACCACCTTTGATGAACCGTAAAGCGTCACAT
CACTGCCTTTAGCCTTCTCTTTCTCAATCTGTTCCTTTATCCAGAAGTAAGTTATTCTAA
GCCCCTCAATCAATCTCATTGTTGGAGCCCAACCAAGCTTCTCTTTGATCAGATTGTTGT
CAGAGTTACGGCCACGAACACCTTCAGGGCCTGGAATGTGATGAATTGGAAGCTTCTTTT
CCTCAAAGCTGAGAACCATCTCAGCCATCTCATTCATGCTCACCATCTCATCGCTTCCAA
TGTTCACCGGCTCACGGAAATCTGACTTTGTCAACCTGAGTACACCTTCAACACACTCAT
CAATGAAGGTAAATGAACGGGTCTGAAGCCCGTCTCCCCACATCTCAAACCTATCTGTGG
AGGTCAGAGCCTTCCTGCAGAAAGCAGCTGGAGCCTTCTCTCTTCCACCTTTCCATGTTC
CAAAGGGACCGTAAATGTTGTGGAACCTTCCAATGCGGCACTCAACCAAAATCTTTGTTC
CCCGGCCGTAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTCCAAACTACCACTCTTTATTTTCTTCGA
CACTGACACCATTTCGTTTAAGTAACACACAAAGAAACAACTTCTTGTTTATTCATGAAC
TAACTATTTACAAAATACCTGAAAATCGCCACGTAATTCTTGTTTCAAGAAACAACTTCT
TCAATGACACCGTTTCATCTTATAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E124JQ U 1
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RD RS1E124JQ 612 0 0
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CACTGCCTTTAGCCTTCTCTTTCTCAATCTGTTCCTTTATCCAGAAGTAGGTTATTCTAA
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CAATGAAGGTAA

QA 1 612 1 612
DS 

RD RS1BR93TF 649 0 0
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CTTCTCTTTGATCAGATTGTTGTCAGAGTTACGGCCACGAACACCTTCAGGGCCTGGAAT
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GCTCACCATCTCATCGCTTCCAATGTTCACCGGCTCACGGAAATCTGATTTTGTCAACCT
GAGTACACCTTCAACACACTCATCAATGAAGGTAAATGAACGGGTCTGAAGCCCGTCTCC
CCACATCTCAAACCTATCTGTGGAGGTCAGAGCCTTCCTGCAGAAAGCAGCTGGAGCCTT
CTCTCTTCCACCTTTCCATGTTCCAAAGGGACCGTAAATGTTGTGGAACCTTCCAATGCG
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CTACCACTCTTTATTTTCTTCGACACTGACACCATTTCGTTTAAGTAACACACAAAGAAA
CAACTTCTTGTTTATTCATGAACTAACTATTTACAAAATACCTGAAAATCGCCACGTAAT
TCTTGTTTCAAGAAACAACTTCTTCAATGACACCGTTTCATCTTATAGC

QA 1 649 1 649
DS 



CO CL151Contig2 1444 10 42 U
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TGGCTGCAACCACCAATGGAAGTAGTGACTATGGTGCATACACATACAAGGAGCTTGAAA
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TCGCTTCCCACATTGCCCGCCGTTTGAAGCACGAGGGGCATTACGTCATTGCTTCTGACT
GGAAGAAGAATGAGCACATGACCGAGGACATGTTCTGCGACGAGTTCCACCTTGTTGACC
TCAGGGTCATGGAGAATTGCCTCAAGGTCACTGATGGCGTTGATCACGTCTTCAACTTGG
CTGCTGATATGGGTGG*TATGGGTTTCATCCAGTCCAACCACTCGGTGATTATGTATAAC
AACACCATGATTAGCTTCAACATGATTGAGGCTGCTAGGATCAATGGGATCAAGAGGTTC
TTCTATGCTTCAAGTGCATGTATCTACCCGGAGTTCAAGCAGCTGGAAACTACCAATGTG
AGCCTCAAGGAATCAGATGCTTGGCCTGCTGAGCCTCAAGATGCTTATGGTTTGGAGAAA
CTTGCAACGG*AGGAGCTGTGCAAGCATTACAACAAAGATTTTGGCATTGAGTGCCGCAT
TGGAAGGTTCCACAACATTTACGGTCCCTTTGGAACATGGAAAGGTGGAAGAGAGAAGGC
TCCAGCTGCTTTCCGCAGGAAGGCTCTGACCTCCACAGATAGGTTTGAGATGTGGGGAGA
CGGGCTTCAAACCCGTTCATTTACCTTCATTGATGAGTGTGTTGAAGGTGTACTCAGGTT
GACAAAATCAGATTTCCGTGAGCCGGTGAACATTGGAAGCGATGAGATGGTGAGCATGAA
TGAGATGGCTGAGATGGTTCTCAGCTTTGAGGAAAAGAAGCTTCCAATTCACCACATTCC
AGGCCCTGAAGGTGTTCGTGGCCGTAACTCTGACAACAATCTGATCAAAGAGAAGCTTGG
TTGGGCTCCAACAATGAGATTGAAGGAGGGGCTTAGAATAACCTACTTCTGGATAAAGGA
ACAGATTGAGAAAGAGAAGGCTAAAGGCAGTGATGTGACGCTTTACGGTTCATCAAAGGT
GGTTGGGACTCAAGCACCGGTTCAGCTAGGCTCACTCCGTGCTGCTGATGGAAAAGAGTA
AATTGTGGATGGGTTTCACTACTATCAAAGCTTGGCCTTATTTAATAATTTAAGGTCAGG
AATTATGTTTTAGATATATAAGGTCTTAGGTAAGCTTTCCTATGAAAAA***AAAGGAAA
AAGCCAATAATAAGTGTTTTTTGGATTTGAGTCTCCTTTCTCTTCTTTCTTCTTCTGCTC
TTTCTGTAGCAAACTTCTAATTCTTGTTTTTATTATTTTTTAGTTGAAGAAGTCGATTAT
ACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 0 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 15 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 0 0 25 25 25 25 0 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C173TF U 5
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AF RS1GM36TF U 3
AF RS1CA80TF U 5
AF RS1E124TF U 588
AF RS1B060TF U 750
AF RS1CA80JQ C 597
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AF RS1BR93JQ C 774
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BS 1323 1341 RS1CA80JQ
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GGAC
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ACCACCAATGGAAGTAGTGACTATGGTGCATACACATACAAGGAGCTTGAAAGAGAGCTC
TACTGGCCTTCAGAGAAGCTGAGGATCTCCATCACCGGCGCTGGTGGGTTCATCGCTTCC
CACATTGCCCGCCGTTTGAAGCACGAGGGGCATTACGTCATTGCTTCTGACTGGAAGAAG
AATGAGCACATGACCGAGGACATGTTCTGCGACGAGTTC

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DS 

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TGGCTGCAACCACCAATGGAAGTAGTGACTATGGTGCATACACATACAAGGAGCTTGAAA
GAGAGCTCTACTGGCCTTCAGAGAAGCTGAGGATCTCCATCACCGGCGCTGGTGGGTTCA
TCGCTTCCCACATTGCCCGCCGTTTGAAGCACGAGGGGCATTACGTCATTGCTTCTGACT
GGAAGAAGAATGAGCACATGACCGAGGACATGTTCTGCGACGAGTTCCACCTTGTTGACC
TCAGGGTCATGGAGAATTGCCTCAAGGTCACTGATGGCGTTGATCACGTCTTCAACTTGG
CTGCTGATATGGGTGG*TATGGGTTTCATCCAGTCCAACCACTCGGTGATTATGTATAAC
AACACCATGATTAGCTTCAACATGATCGAGGCTGCTAGGATCAATGGGATCAAGAGGTTC
TTCTATGCTTCAAGTGCATGTATCTACCCGGAGTTCAAGCAGCTGGAAACTACCAATGTG
AGCCTCAAGGAATCAGATGCTTGGCCTGCTGAGCCTCAAGATGCTTATGGTTTGGAGAAA
CTTGCAACGG
AGAGCTGT

QA 1 610 1 610
DS 

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GGACCT
CTCTCTCTCTCTCTGCATTATCTCTTCAGATTCTCCAGC*TCTCTCTCAGAATGGCTGCA
GCCACCAATGGAAGTAGTGATTATGGTGCATACACATACAAGGAGCTTGAAAGAGAGCTC
TACTGGCCTTCAGAGAAGCTGAGGATCTCCATCACTGGCGCTGGTGGGTTCATCGCTTCC
CACATTGCTCGCCGTTTGAAGCACGAGGGGCACTACGTCATTGCTTCTGACTGGAAGAAG
AATGAGCACATGACTGAGGACATGTTCTGTGACGAGTTCCACCTCGTTGACCTCAGGGTC
ATGGAGAATTGCCTCAAGGTCACTGATGGCGTTGATCACGTCTTTAACTTGGCTGCTGAT
ATGGGTGG*TATGGGTTTCATCCAGTCCAACCACTCGGTGATTATGTATAACAACACCAT
GATTAGCTTCAACATGATTGAGGCTGCTAGGATCAATGGAATCAAGAGGTTCTTCTATGC
TTCAAGTGCATGTATCTACCCGGAGTTCAAGCAGCTGGAAACTACCAATGTGAGCCTCAA
GGAGTCAGATGCTTGGCCTGCTGAGCCTCAAGATGCTTATGGTTTGGAGAAACTTGCAAC
GG*AGGAGCTGTGCAAGCATTACAACAAAGATTTTGGCATTGAGTGCCGCAT

QA 7 658 7 658
DS 

RD RS1CA80TF 655 0 0
GGAC
CTCTCTCTCTCTCTGCATTATCTCTTCACATTCTCCAAGCTCTCTCTCAGAATGGCTGCA
ACCACCAATGGAAGTAGTGACTATGGTGAATACACATACAAGGAGCTTGAAAGAGAGCTC
TACTGGCCTTCAGAGAAGCTGAGGATCTCCATCACCGGCGCTGGTGGGTTCATCGCTTCC
CACATTGCCCGCCGTTTGAAGCACGAGGGGCATTACGTCATTGCTTCTGACTGGAAGAAG
AATGAGCACATGACCGAGGACATGTTCTGCGACGAGTTCCACCTTGTTGACCTCAGGGTC
ATGGAGAATTGCCTCAAGGTCACTGATGGCGTTGATCACGTCTTCAACTTGGCTGCTGAT
GTGGGTGGGTATGGGTTTCATCCAGTCCAACCACTCGGTGATTATGTATAACAACACCAT
GATTAGCTTCAACATGATTGAGGCTGCTAGGATCAATGGGATCAAGAGGTTCTTCTATGC
TTCAAGTGCATGTATCTATCCGGAGTTCAAGCAGCTGGAAACTACCAATGTGAGCCTCAA
GGAATCAGATGCTTGGCCTGCTGAGCCTCAAGATGCTTATGGTTTGGAGAAACTTGCAAC
GGGAGGAGCTGTGCAAGCATTACAACAAAGATTTTGGCATTGAGTGCCGCA

QA 5 655 5 655
DS 

RD RS1E124TF 690 0 0
GGGTT
TGGAGAAACTTGCAACGG*AGGAGCTGTGCAAGCATTACAACAAAGATTTTGGCATTGAG
TGCCGCATTGGAAGGTTCCACAACATTTACGGTCCCTTTGGAACATGGAAAGGTGGAAGA
GAGAAGGCTCCAGCTGCTTTCCGCAGGAAGGCTCTGACCTCCACAGATAGGTTTGAGATG
TGGGGAGATGGGCTTCAAACCCGTTCATTTACCTTCATTGATGAGTGTGTTGAAGGTGTA
CTCAGGTTGACAAAGTCAGACTTCCGTGAGCCGGTGAACATTGGAAGCGATGAGATGGTG
AGCATGAATGAGATGGCTGAGATGGTTCTCAGCTTTGAGGAAAAGAAGCTTCCAATTCAC
CACATTCCAGGACCTGAAGGTGTTCGTGGCCGTAACTCGGACAACAATCTGATCAAAGAG
AAGCTTGGTTGGGCTCCAACAATGAGATTGATTGAGGGGCTTAGAATAACCTACTTCTGG
ATAAAGGAACAGATTGAGAAAGAGAAGGCTAAAGGCAGTGATGTGACGCTTTACGGTTCA
TCAAAGGTGGTTGGGACTCAAGCACCGGTTCAGCTAGGATCGCTCCGTGCTGCTGATGGA
AAAGAGTAAATTG**GATGGGTTACACTACTATCAAA*CTTGGCCTTATTTAATAATTTA
AGGTCAG*AATTATGTTTTAGATAT

QA 6 690 6 690
DS 

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G
CTCCACAGATAGGTTTGAGATGTGGGGAGACGGGCTTCAAACCCGTTCTTTTACCTTCAT
TGATGAGT*TGTTGAAGGTGTACTCAGGTTGACAAAATCAGATTTCCGTGAGCCGGTGAA
CATTGGAAGCGATGAGATGGTGAGCATGAATGAGATGGCTGAGATGGTTCTCAGCTTTGA
GGAAAAGAAGCTTCCAATTCACCACATTCCAGGCCCTGAAGGTGTTCGTGGCCGTAACTC
TGACAACAATCTGATCAAAGAGAAGCTTGGTTGGGCTCCAACAATGAGATTGGAGGAGGG
GCTTAGAATTACCTACTTCTGGATAAAGGAACAGATTGAGAAAGAGAAGGCTAAAGGCAG
TGATGTGACGCTTTACGGTTCATCAAAGGTGGTTGGGACTCAAGCACCGGTTCAGCTAGG
CTCACTCCGTGCTGCTGATGGAAAAGAGTAAATTGTGGATGGGTTTCACTACTATCAAAG
CTTGGCCTTATTTAATAATTTAAGGTCAGGAATTATGTTTTAGATATA
T

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DS 

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GCATTGGAAGGTTCCACAACATTTACGGTCCCTTTGGAACATGGAAAGGTGGAAGAGAGA
AGGCTCCAGCTGCTTTCTGCAGGAAGGCTCTGACCTCCACAGATAGGTTTGAGATGTGGG
GAGACGGGCTTCAAACCCGTTCTTTTACCTTCATTGATGAGTGTGTTGAAGGTGTACTCA
GGTTGACAAAATCAGATTTCCGTGAGCCGGTGAACATTGGAAGCGATGAGATGGTGAGCA
TGAATGAGATGGCTGAGATGGTTTTCAGCTTTGAGGAAAAGAAGCTTCCAATTCACCACA
TTCCAGGCCCTGAAGGTGTTCGTGGCCGTAACTCTGACAACAATCTGATCAAAGAGAAGC
TTGGTTGGGCTCCAACAATGAGATTGAAGGAGGGGCTTAGAATTACCTACTTCTGGATAA
AGGAACAGATTGAGAAAGAGAAGGCTAAAGGCAGTGATGTGACGCTTTACGGTTCATCAA
AGGTGGTTGGGACTCAAGCACCGGTTCAGCTAGGCTCACTCCGTGCTGCTGATGGAAAAG
AGTAAATTGTGGATGGGTTTCACTACTATCAAAGCTTGGCCTTATTTAATAATTTAAGGT
CAGGAATTATGTTTTAGATATATAAGGTCTTAGGTAAGCTTTCCTATGAAA*****AAAG
GAAAAGGCCAATAATAAGTGTTTTT
GT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1B060JQ 558 0 0
ATTGATGAGT*TGTTGAAGGTGTACTCAGGTTGACAAAATCAGATTTCCGTGAGCCGGTG
AACATTGGAAGCGATGAGATGGTGAGCATGAATGAGATGGCTGAGATGGTTCTCAGCTTT
GAGGAAAAGAAGCTTCCAATTCACCACATTCCAGGCCCTGAAGGTGTTCGTGGCCGTAAC
TCTGACAACAATCTGATCAAAGAGAAGCTTGGTTGGGCTCCAACAATGAGATTGGAGGAG
GGGCTTAGAATTACCTACTTCTGGATAAAGGAACAGATTGAGAAAGAGAAGGCTAAAGGC
AGTGATGTGACGCTTTACGGTTCATCAAAGGTGGTTGGGACTCAAGCACCGGTTCAGCTA
GGCTCACTCCGTGCTGCTGATGGAAAAGAGTAAATTGTGGATGGGTTTCACTACTATCAA
AGCTTGGCCTTATTTAATAATTTAAGGTCAGGAATTATGTTTTAGATATATAAGGTTTTA
GGTAAGCTTTCCTATGAAA*****AAAGGAAAAGGCCAATAATAAGTGTTTTT*GGATTT
GAGTCTCCTTT
TCTTCTT

QA 1 551 1 551
DS 

RD RS1BR93JQ 571 0 0
GGGGAGACGGGCTTCAGACCCGTTCATTTACCTTCATTGATGAGTGTGTTGAAGGTGTAC
TCAGGTTGACAAAATCAGATTTCCGTGAGCCGGTGAACATTGGAAGCGATGAGATGGTGA
GCATGAATGAGATGGCTGAGATGGTTTTCAGCTTTG*GGAAAAGAAGCTTCCAATTCATC
ACATTCCAGGCCCTGAAGGTGTTTGTGGCCGTAACTTTGACAACAATTTGATCAAAGAGA
AGCTTGGTTGGGCTCCAACAATGAGATTGAAGGAGGGGCTTAGAATAACTTACTTTTGGA
TAAAGGAACAGATTGAGAAAGAGAAGGCTAAAGGCAGTGATGTGACGCTTTACGGTTCAT
CAAAGGTGGTTGGGACTCAAGCCCCGGTTCAGCTGGGCTCACTCCGTGCTGGTGATGGAA
AAGAGTAAATTGTGGATGGGTTTCACTACTATCAAAGCTTGGCCTTATTTAATAATTTAA
GGTCAGGAATTATGTTTTAGATATA**AGGTTTTAGTTAAGCTTTCCTATGAAAAA***A
AAGGAAAAAGCCAATAATAAGTGTTTTT
TGG

QA 1 568 1 568
DS 

RD RS1C173JQ 704 0 0
AGGCTCTGACCTCCACAGATAGGTTTGAGATGTGGGGAGACGGGCTTCAGACCCGTTCAT
TTACCTTCATTGATGAGTGTGTTGAAGGTGTACTCAGGTTGACAAAATCAGATTTCCGTG
AGCCGGTGAACATTGGAAGCGATGAGATGGTGAGCATGAATGAGATGGCTGAGATGGTTC
TCAGCTTTGAGGAAAAGAAGCTTCCAATTCATCACATTCCAGGCCCTGAAGGTGTTCGTG
GCCGTAACTCTGACAACAATCTGATCAAAGAGAAGCTTGGTTGGGCTCCAACAATGAGAT
TGAAGGAGGGGCTTAGAATAACTTACTTCTGGATAAAGGAACAGATTGAGAAAGAGAAGG
CTAAAGGCAGTGATGTGACGCTTTACGGTTCATCAAAGGTGGTTGGGACTCAAGCACCGG
TTCAGCTGGGCTCACTCCGTGCTGCTGATGGAAAAGAGTAAATTGTGGATGGGTTTCACT
ACTATCAAAGCTTGGCCTTATTTAATAATTTAAGGTCAGGAATTATGTTTTAGATATA**
AGGTCTTAGTTAAGCTTTCCTATGAAAAAAAAAAAGGAAAAAGCCAATAATAAGTGTTTT
TTGGATTTGAGTCTTCTTTCTCTTCTTTCTTCTTCTGCTCTTTCTGTAGCAAACTTCTAA
TTCTTGTTTTTATTATTTTTTAGTTGAAGAAGTCGATTATACTT

QA 1 704 1 704
DS 



AS 3 13

CO CL152Contig1 689 4 7 U
GGCTGAAAAAAGGAACATTTTATATTGGCAGAAACATTAGTATCAATAACAAAA*CTCAT
GCTGTTTAAAAATCATT*AGTACTTAAGGTCGCTACAAAACATATGGAAGGAAAGCTCAA
AAACATAAGGGGAAGAAAGTAGAACTAATAGCCTCCCTTGAGATCGTTGACGACATCATA
GGGGATAGGAGTGACAGTCTCCAAGGTCATACCCTCAACCATGAACCCTGGTTTGGGGCC
TTTAGGTTGTCTCTTGGTGCTTATTGTCTCGCCTCTGGCTTTGGCTGCGGCCTTGAGCTC
ATCGTTCTTCTTGATTCTAAGTTTGAACTCCTCTGCACACCTTGACTGCTGCACGTGCTC
CACACGCACATGAAGCCTCTTCCTGATGATTCTGTTACCAATCTGTTTGTTGACTTCGAC
ACCGACGGCGCGCTTGGTGACGTTCCAGACACGACCGGTACGACCATGGTAGAACTTGTG
AGGCATACCCTTGTGGATCGCACCGTTAACCTTAACATCGACGTAATCGCCGACCTTGAA
GGTCCTGAGGTAGGTCGAGAGTGGAATTGTACCCTTCTTCCTGAACCCCCTCGCGAACAG
ATCCCTCGTCATCGCACGAACTCCATGTCCTGCCGGCATTGTTCCTCTTCGGTGGATGCG
GCTAGTGAAAACCTAAACAATAGCAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AN18JQ U 2
AF RS1AN18TF C 1
AF RS1A758TF C 48
AF RS1A758JQ U 241
BS 1 8 RS1AN18TF
BS 9 310 RS1AN18JQ
BS 311 312 RS1A758JQ
BS 313 373 RS1AN18JQ
BS 374 374 RS1A758JQ
BS 375 585 RS1AN18JQ
BS 586 689 RS1A758JQ

RD RS1AN18JQ 584 0 0
GGCTGAA
AAAGGAACATTTTATATTGGCAGAAACATTAGTATCAATAACAAAA*CTCATGCTGTTTA
AAAATCATT*AGTACTTAAGGTCGCTACAAAACATATGGAAGGAAAGCTCAAAAACATAA
GGGGAAGAAAGTAGAACTAATAGCCTCCCTTGAGATCGTTGACGACATCATAGGGGATAG
GAGTGACAGTCTCCAAGGTCATACCCTCAACCATGAACCCTGGTTTGGGGCCTTTAGGTT
GTCTCTTGGTGCTTATTGTCTCGCCTCTGGCTTTGGCTGCGGCCTTGAGCTCATCGTTCT
TC**GATTCTAAGTTTGAACTCCTCTGCACACCTTGACTGCTGCACGTGCTCCACACGCA
CATGAGGCCTCTTCCTGATGATTCTGTTACCAATCTGTTTGTTGACTTCGACACCGACGG
CGCGCTTGGTGACGTTCCAGACACGACCGGTACGACCATGGTAGAACTTGTGAGGCATAC
CCTTGTGGATCGCACCGTTAACCTTAACATCGACGTAATCGCCGACCTTGAAGGTCCTGA
GGTAGGTCGAGAGTGGAATTGTACCCTTCTTCCTGAA

QA 8 584 8 584
DS 

RD RS1AN18TF 677 0 0
GGCTGAAAAAAGGAACATTTTATATTGGCAGAAACATTAGTATCAATAACAAAAACTCAT
GCTGTTTAAAAATCATT*AGTACTTAAGGTCGCTACAAAACATATGGAAGGAAAGCTCAA
AAACATAAGGGGAAGAAAGTAGAACTAATAGCCTCCCTTGAGATCGTTGACGACATCATA
GGGGATAGGAGTGACAGTCTCCAAGGTCATACCCTCAACCATGAACCCTGGTTTGGGGCC
TTTAGGTTGTCTCTTGGTGCTTATTGTCTCGCCTCTGGCTTTGGCTGCGGCCTTGAGCTC
ATCGTTCTTC**GATTCTAAGTTTGAACTCCTCTGCACACCTTGACTGCTGCACGTGCTC
CACACGCACATGAGGCCTCTTCCTGATGATTCTGTTACCAATCTGTTTGTTGACTTCGAC
ACCGACGGCGCGCTTGGTGACGTTCCAGACACGACCGGTACGACCATGGTAGAACTTGTG
AGGCATACCCTTGTGGATCGCACCGTTAACCTTAACATCGACGTAATCGCCGACCTTGAA
GGTCCTGAGGTAGGTCGAGAGTGGAATTGTACCCTTCTTCCTGAACCCCCTCGCGAACAG
ATCCCTCGTCCTCGCACGAACTCCATGTCCTGCCGGCATTGTTCCTCTTCGGTGGATGCG
GCTAGTGAAA
ACCTAAA

QA 1 670 1 670
DS 

RD RS1A758TF 635 0 0
G
ACAAAA*CTCATGCTGTTTAAAAATCATTCAGTACTTAAGGTCGCTACAAAACATATGGA
AGGAAAGCTCAAAAACATAAGGGGAAGAAAGTAGAACTAATAGCCTCCCTTGAGATCGTT
GACGACATCGTAGGGGATAGGAGTGACAGTCTCCAAGGTCATACCCTCAACCATGAACCC
TGGTTTGGGGCCTTTAGGTTGTCTCTTGGTGCTTATTGTCTCGCCTCTGGCTTTGGCTGC
GGCCTTGAGCTCATCGTTCTTCTTGATTCTAAGTTTGAACTCCTCTGCACACCTTGACTG
CTGCACGTGCTCCACACGCACATGAAGCCTCTTCCTGATGATTCTGTTACCAATCTGTTT
GTTGACTTCGACACCGACGGCGCGCTTGGTGACGTTCCAGACACGACCGGTACGACCATG
GTAGAACTTGTGAGGCATACCCTTGTGGATCGCACCGTTAACCTTAACATCGACGTAATC
GCCGACCTTGAAGGTCCTGAGGTAGGTCGAGAGTGGAATTGTACCCTTCTTCCTGAACCC
CCTCGCGAACAGATCCCTCGTCATCGCACGAACTCCATGTCCTGCCGGCATTGTTCCTCT
TCGGTGGATGCGGCTAGTGAAA
ACCTAAACAATA

QA 2 623 2 623
DS 

RD RS1A758JQ 449 0 0
TTTAGGTTGTCTCTTGGTGCTTATTGTCTCGCCTCTGGCTTTGGCTGCGGCCTTGAGCTC
ATCGTTCTTCTTGATTCTAAGTTTGAACTCCTCTGCACACCTTGACTGCTGCACGTGCTC
CACACGCACATGAAGCCTCTTCCTGATGATTCTGTTACCAATCTGTTTGTTGACTTCGAC
ACCGACGGCGCGCTTGGTGACGTTCCAGACACGACCGGTACGACCATGGTAGAACTTGTG
AGGCATACCCTTGTGGATCGCACCGTTAACCTTAACATCGACGTAATCGCCGACCTTGAA
GGTCCTGAGGTAGGTCGAGAGTGGAATTGTACCCTTCTTCCTGAACCCCCTCGCGAACAG
ATCCCTCGTCATCGCACGAACTCCATGTCCTGCCGGCATTGTTCCTCTTCGGTGGATGCG
GCTAGTGAAAACCTAAACAATAGCAGACC

QA 1 449 1 449
DS 



CO CL152Contig2 683 5 17 U
GGCTTGCGATTTTAGGTTTCACTTGACGCATCCAACCAAGACGAAGAAAAATGCCGGCAG
GACATGGAGTTCGTGCGAGGACAAGGGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTA
CAATCCCACTCTCGACCTACCTCAGGACCTTCAAGGTCGGCGATTACGTCGATGTTAAGG
TGAACGGTGCGATCCACAAGGGTATGCCTCACAAGTTCTACCACGGTCGTACCGGTCGTG
TCTGGAACGTCACCAAGCGTGCCGTCGGTGTCGAAGTGAACAAGCAGATTGGTAACAGAA
TCATCAGGAAGAGGCTTCATGTGCGTGTGGAGCACGTGCAGCAGTCAAGGTGTGCAGAGG
AGTTCAAACTTAGAATCAAGAAGAACGATGAGCTCAAGGCCGCAGCCAAAGCCAGAGGCG
AGACAATAAGCACCAAGAGACAACCTAAAGGCCCCAAGCCAGGATTCATGGTTGAGGGTA
TGACCTTGGAGACTGTCACTCCTATCCCCTACGACGTCGTCAACGATCTCAAGGGAGGCT
ATTAGTTCTACTTTCTTCCCCTTATGTTTTTGAGCTTTCCTTCCATATGTTTTGTAGCGA
CCTTAAGTACTGAAAGATGATTTTAAACAGCATGAGTTTTGTTATTGATACTTTTGTTTC
TGCCAATATTAAATGTTCCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 0 0 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1GN21TF U 2
AF RS1FZ19TF U 1
AF RS1DD24TF U 1
AF RS1GN21JQ C 48
AF RS1DO55TF U 1
BS 1 33 RS1DD24TF
BS 34 34 RS1FZ19TF
BS 35 82 RS1DD24TF
BS 83 83 RS1FZ19TF
BS 84 136 RS1DD24TF
BS 137 137 RS1FZ19TF
BS 138 160 RS1DD24TF
BS 161 161 RS1FZ19TF
BS 162 187 RS1DD24TF
BS 188 188 RS1FZ19TF
BS 189 356 RS1DD24TF
BS 357 357 RS1FZ19TF
BS 358 496 RS1DD24TF
BS 497 497 RS1FZ19TF
BS 498 514 RS1DD24TF
BS 515 515 RS1FZ19TF
BS 516 683 RS1DD24TF

RD RS1GN21TF 170 0 0
AGGG
GCGATTTTAGGTTTCACTTGACGCATCCACCCAAGAGGAA***AAATGCCGGCAGGACAT
GGAGTTCGTGCGAGGACAAGGGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAATC
CCACTCTCGACCTACCTCAGGACCTTCAAGGTCGGCGATTACGTCG

QA 5 170 5 170
DS 

RD RS1FZ19TF 580 0 0
GGCTT
GCGATTTTAGGTTTCACTTGACGCATCCACCCAAGAGGAA***AAATGCCGGCAGGACAT
GGAGTTCGTGCGAGGACAAGGGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAATC
CCACTCTCGACCTACCTCAGGACCTTCAAGGTCGGCGATTACGTCGATGTTAAGGTGAAC
GGTGCGATCCACAAGGGTATGCCTCACAAGTTCTACCACGGTTGTACCGGTCGTGTCTGG
AACGTCACCAAGCGTGCCGTCGGTGTCGAAGTGAACAAGCAGATTGGTAACAGAATCATC
AGGAAGAGGCTTCATGTGCGTGTGGAGCACGTGCAGCAGTCAAGGTGTGCAGAGGAGTTC
AAACTTAGAATCAAGAAGAACGATGAGCTCAAGGCCGCAGCCAAAGCCAGAGGCGAGACA
ATAAGCACCAAGAGACAACCTAAAGGCCCCAAGCCAGGATTCATGGTTGAGGGTATGACC
TTGGAGACTGTCACTCGTATCCCCTACGACGTCGTCAACGATCTCAAGGGAGGCTATTAG
TTCTACTTTCTTCCCCTTATGTTTTTGAGCTTTCC

QA 6 580 6 580
DS 

RD RS1DD24TF 683 0 0
GGCTTGCGATTTTAGGTTTCACTTGACGCATCCCACCAAGACGAAGAAAAATGCCGGCAG
GACATGGAGTTCGTGCGAGGACGAGGGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTA
CAATCCCACTCTCGACATACCTCAGGACCTTCAAGGTCGGGGATTACGTCGATGTTAAGG
TGAACGGCGCGATCCACAAGGGTATGCCTCACAAGTTCTACCACGGTCGTACCGGTCGTG
TCTGGAACGTCACCAAGCGTGCCGTCGGTGTCGAAGTGAACAAGCAGATTGGTAACAGAA
TCATCAGGAAGAGGCTTCATGTGCGTGTGGAGCACGTGCAGCAGTCAAGGTGTGCATAGG
AGTTCAAACTTAGAATCAAGAAGAACGATGAGCTCAAGGCCGCAGCCAAAGCCAGAGGCG
AGACAATAAGCACCAAGAGACAACCTAAAGGCCCCAAGCCAGGATTCATGGTTGAGGGTA
TGACCTTGGAGACTGTTACTCCTATCCCCTACGATGTCGTCAACGATCTCAAGGGAGGCT
ATTAGTTCTACTTTCTTCCCCTTATGTTTTTGAGCTTTCCTTCCATATGTTTTGTAGCGA
CCTTAAGTACTGAAAGATGATTTTAAACAGCATGAGTTTTGTTATTGATACTTTTGTTTC
TGCCAATATTAAATGTTCCTTTT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RS1GN21JQ 621 0 0
AAAATGCCGGCAGGACATGGAGTTCGTGCGAGGACAAGGGATCTGTTCGCGAGGGGGTTC
AGGAAGAAGGGTACAATCCCACTCTCGACCTACCTCAGGACCTTCAAGGTCGGCGATTAC
GTCGATGTTAAGGTGAACGGTGCGATCCACAAGGGTATGCCTCACAAGTTCTACCACGGT
CGTACCGGTCGTGTCTGGAACGTCACCAAGCGTGCCGTCGGTGTCGAAGTGAACAAGCAG
ATTGGTAACAGAATCATCAGGAAGAGGCTTCATGTGCGTGTGGAGCACGTGCAGCAGTCA
AGGTGTGCAGAGGAGTTCAAACTTAGAATCAAGAAGAACGATGAGCTCAAGGCCGCAGCC
AAAGCCAGAGGCGAGACAATAAGCACCAAGAGACAACCTAAAGGCCCCAAGCCAGGATTC
ATGGTTGAGGGTATGACCTTGGAGACTGTCACTCCTATCCCCTACGACGTCGTCAACGAT
CTCAAGGGAGGCTATTAGTTCTACTTTCTTCCCCTTATGTTTTTGAGCTTTCCTTCCATA
TGTTTTGTAGCGACCTTAAGTACTGAAAGATGATTTTAAACAGCATGAGTTTTGTTATTG
ATACTTTTGTTTCTGCCAATA

QA 1 621 1 621
DS 

RD RS1DO55TF 682 0 0
GGCTT
GCGATTTTAGGTTTCACTTGACGCATCCCACCAAGACGAAGAAAAATGCCGGCAGGACAT
GGAGTTCGTGCGAGGACGAGGGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAATC
CCACTCTCGACATACCTCAGGACCTTCAAGGTCGGGGATTACGTCGATGTTAAGGTGAAC
GGCGCGATCCACAAGGGTATGCCTCACAAGTTCTACCACGGTCGTACCGGTCGTGTCTGG
AACGTCACCAAGCGTGCCGTCGGTGTCGAAGTGAACAAGCAGATTGGTAACAGAATCATC
AGGAAGAGGCTTCATGTGCGTGTGGAGCACGTGCAGCAGTCAAGGTGTGCATAGGAGTTC
AAACTTAGAATCAAGAAGAACGATGAGCTCAAGGCCGCAGCCAAAGCCAGAGGCGAGACA
ATAAGCACCAAGAGACAACCTAAAGGCCCCAAGCCAGGATTCATGGTTGAGGGTATGACC
TTGGAGACTGTTACTCCTATCCCCTACGATGTCGTCAACGATCTCAAGGGAGGCTATTAG
TTCTACTTTCTTCCCCTTATGTTTTTGAGCTTTCCTTCCATATGTTTTGTAGCGACCTTA
AGTACTGAAAGATGATTTTAAACAGCATGAGTTTTGTTATTGATACTTTTGTTTCTGCCA
ATATTAAATGTTCCTTT

QA 6 682 6 682
DS 



CO CL152Contig3 633 4 6 U
TCAATAACAAAAGATCTTTCATTCAAAATCAGAATTTGGTCTGAAGACAAAGGTTTCAAG
TTGCTACAAAACATATGAAAGAAAGCTCCAAAAACACTGGGGGGAACAAAGTAGAACTAA
TAGCCTCCCTTGAGATCGTTGACGACATCGTAGGGGATAGGAGTGACAGTCTCCAAGGTC
ATACCCTCAACCATGAATCCTGGTTTGGGGCCTTTAGGCTGCCTCTTGGTGCTTATTGTC
TCGCCTCTGGCTTTGGCTACGACCTTGAGTTCATCGTTCTTCTTCTTCCTCAGTTTGAAC
TCCTCCGCACACCTAGACTGCTGCACATGCTACACACGCACATGAAGCCTCTTCCTAATG
ATCCTGTTTCCAATCTGCTTGTTAACTTCGACACCGACGGCGCGCTTGGTGACGTTCCAG
ACACGACCGGTACGACCGTGGTAGAACTTGTGAGACATACCCTTGTGGATCGCACCGTTC
ACCTTAACATCGACGTAATCCCCGACCTTGAAGGTCCTGAGGTAGGTCGAGAGTGGGATT
GTACCCTTCTTCCTGAACCCCCTCGCGAACAGATCCCTCGTCCTCGCACGAACTCCATGT
CCTGCCGGCATTTTCTCCTACGACAAGTAAAAA


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1GC64TF C 1
AF RS1DP23JQ U 2
AF RS1GC64JQ U 2
AF RS1DP23TF C 2
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TAGCCTCCCTTGAGATCGTTGACGACATCGTAGGGGATAGGAGTGACAGTCTCCAAGGTC
ATACCCTCAACCATGAATCCTGGTTTGGGGCCTTTAGGCTGCCTCTTGGTGCTTATTGTC
TCGCCTCTGGCTTTGGCTACGACCTTGAGTTCATCGTTCTTCTTCTTCCTCAGTTTGAAC
TCCTCCGCACACCTAGACTGCTGCACATGCTACACACGCACATGAAGCCTCTTCCTAATG
ATCCTGTTTCCAATCTGCTTGTTAACTTCGACACCGACGGCGCGCTTGGTGACGTTCCAG
ACACGACCGGTACGACCGTGGTAGAACTTGTGAGACATACCCTTGTGGATCGCACCGTTC
ACCTTAACATCGACGTAATCCCCGACCTTGAAGGTCCTGAGGTAGGTCGAGAGTGGGATT
GTACCCTTCTTCCTGAACCCCCTCGCGAACAGATCCCTCGTCCTCGCACGAACTCCATGT
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DS 

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TCCTGTTTCCAATCTGCTTGTTAACTTCGACACCGACGGCGCGCTTGGTGACGTTCCAGA
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CTGCCGGCATTTTCTCCTACGACAAGTAAAAA

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1GC64JQ 632 0 0
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TACCCTCAACCATGAATCCTGGTTTGGGGCCTTTAGGCTGCCTCTTGGTGCTTATTGTCT
CGCCTCTGGCTTTGGCTACGACCTTGAGTTCATCGTTCTTCTTCTTCCTCAGTTTGAACT
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CTGCCGGCATTTTCTCCTACGACAAGTAAAAA

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1DP23TF 632 0 0
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TGCTACAAAACATATGAAAGAAAGCTCCAAAAACACTGGGGGGAACAAAGTAGAACTAAT
AGCCTCCCTTGAGATCGTTGACGACATCGTAGGGGATAGGAGTGACAGTCTCCAAGGTCA
TACCCTCAACCATGAATCCTGGTTTGGGGCCTTTAGGCTGCCTCTTGGTGCTTATTGTCT
CGCCTCTGGCTTTGGCTACGACCTTGAGTTCATCGTTCTTCTTCTTCCTCAGTTTGAACT
CCTCCGCACACCTAGACTGCTGCACATGCTCCACACGCACATGAAGCCTCTTCCTAATGA
TCCTGTTTCCAATCTGCTTGTTAACTTCGACACCGACGGCGCGCTTGGTGACGTTCCAGA
CACGACCGGTACGACCGTGGTAGAACTTGTGAGGCATACCCTTGTGGATCGCACCGTTCA
CCTTAACATCGACGTAATCCCCGACCTTGAAGGTCCTGAGGTAGGTCGAGAGTGGGATTG
TACCCTTCTTCCTGAACCCCCTCGCGAACAGATCCCTCGTCCTCGCACGAACTCCATGTC
CTGCCGGCATTTTCTCCTACGACAAGTAAAAA

QA 1 632 1 632
DS 



AS 3 13

CO CL153Contig1 851 7 7 U
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AACAAGAATATCACTCCATTGTCATTGACAAAACACTTGGGTTTAACATAAGTGCGATAT
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TAATCTCAGGAGCTCTGTTTCGACCTCTTCATAAGCTCTATGAACTCTCTAAACGCGTTG
TCAGAGTCGTGAGGTCCAGGGGAGGCTTCAGGGTGGTACTGTAGAGACATGACATTCATA
GCCGGGAAAGACAGACCCGCACAGCTTCCATCATTGAGATTGACATGTGTCACTTCTACC
CCTCCTGGAAGTGAAGCCGGGTCAACCGCATAGTTGTGGTTCTGAGCACTGATCTCCACC
TGGCCAGTTCTGTTATTACGAACTGGGTGGTTCCCTCCATGATGACCAAACTTCATCTTA
TAGGTTTTACCACCCAAAGCTTGTCCGAGCAACTGATGGCCCATACAGATCCCGTAAACA
GGAGCTTTACCAAGAAGCTCCTTGACCGTCTCAACAGCATACGGAACAGCAGAAGGGTCT
CCAGGACCGTTGCTGAACAAGATCCCGTCTGGATTCATTTTAAGAGCCTCGGAAGCTGGA
AATGAAGACGGGACAACGGTGATTTGGCATCCGTAAGAGGACAGGCGTCTTAGGATGTTA
TGCTTGATGCCAAAATCGTATGCTATAACTCTGTAGGACTTCCCATCGCGTGTGTTAGTA
TTAAAATCCCATTCAGAGTCTGTTTTGTCGACCCACTCGTAGGGAGATTTGCAGGAGACA
TCACTTATTAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 
15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 20 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FT50JQ U 60
AF RS1FD74JQ U 251
AF RS1DM26JQ U 1
AF RS1DQ73JQ U 60
AF RS1AP90JQ U 1
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AF RS1AP90TFB C 129
BS 1 43 RS1AP90JQ
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GG
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AATCTCAGGAGCTCTGTT*CGACCTCTTCATAAGCTCTATGAACTCTCTAAACGCGTTGT
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CCGG*AAAGACAGACCCGCACAGCTTCCATCATTGAGATTGACATGTGTCACTTCTACCC
CTCCTGGAAGTGAAGCCGGGTCAACCGCATAGTTGTGGTTCTGAACACTGATCTCCACCT
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AGGTTTTACCACCCAAAGCTTGTCCGAACAACTGATGGCCCATACAGATCCCGTAAACAG
GAGCTTTACCAAGAAGCTCCTTGACCGTCTCCACAGCATACGGAAC

QA 3 528 3 528
DS 

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TGTTATTACGAACTGGGTGGTTGCCTCCATGATGACCAAACTTCATCTTATAGGTCTTAC
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QA 1 357 1 357
DS 

RD RS1DM26JQ 674 0 0
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TAATCTCAGGAGCTCTGTTTCGACCTCTTCATAAGCTCTATGAACTCTCTAAACGCGTTG
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CCTCCTGGAAGTGAAGCCGGGTCAACCGCATAGTTGTGGTTCTGAGCACTGATCTCCACC
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GGAGCTTTACCAAGAAGCTCTTTGACCGTCTCAACAGCATACGGAACAGCAGAAGGGTCT
CCAGGACCGTTGCTGAACAAGATCCCGTCTGGATTCATTTTAAGAGCCTCGGAAGCTGGA
AATGAAGATGGGA
C

QA 1 673 1 673
DS 

RD RS1DQ73JQ 650 0 0
GA
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AATCTCAGGAGCTCTGTTTCGACCTCTTCATAAGCTCTATGAACTCTCTAAACGCGTTGT
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CCGGGAAAGACAGACCCGCACAGCTTCCATCATTGAGATTGACATGTGTCACTTCTACCC
CTCCTGGAAGTGAAGCCGGGTCAACCGCATAGTTGTGGTTCTGAGCACTGATCTCCACCT
GGCCAGTTCTGTTATTACGAACTGGGTGGTTCCCTCCATGATGACCAAACTTCATCTTAT
AGGTTTTACCACCCAAAGCTTGTCCGAGCAACTGATGGCCCATACAGATCCCGTAAACAG
GAGCTTTACCAAGAAGCTCCTTGACCGTCTCAACAGCATACGGAACAGCAGAAGGGTCTC
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ATGAAGACGGGAAAACGGTGATTTGGCATCCGTAAGAGGACAGGCGTC

QA 3 650 3 650
DS 

RD RS1AP90JQ 730 0 0
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GGTTGAAACATTAAATAGTACTACAAAACAAAGAAACAGTTCTTGTTTGCTGCTTCCCAT
TAATCTCAGGAGCTCTGTTTCGACCTCTTCATAAGCTCTATGAACTCTCTAAACGCGTTG
TCAGAGTCGTGAGGTCCAGGGGAGGCTTCAGGGTGGTACTGTAGAGACATGACATTCATA
GCCGGGAAAGACAGACCCGCACAGCTTCCATCATTGAGATTGACATGTGTCACTTCTACC
CCTCCTGGAAGTGAAGCCGGGTCAACCGCATAGTTGTGGTTCTGAGCACTGATCTCCACC
TGGCCAGTTCTGTTATTACGAACTGGGTGGTTCCCTCCATGATGACCAAACTTCATCTTA
TAGGTTTTACCACCCAAAGCTTGTCCGAGCAACTGATGGCCCATACAGATCCCGTAAACA
GGAGCTTTACCAAGAAGCTCCTTGACCGTCTCAACAGCATACGGAACAGCAGAAGGGTCT
CCAGGACCGTTGCTGAACAAGATCCCGTCTGGATTCATTTTAAGAGCCTCGGAAGCTGGA
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TGCTTGATGC

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DS 

RD RS1FX34JQ 759 0 0
GG
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AATCTCAGGAGCTCTGTT*CGACCTCTTCATAAGCTCTATGAACTCTCTAAACGCGTTGT
CAGAGTCGTGAGGTCCAGGGGAGGCTTCAGGGTGGTACTGTAGAGACATGACATTCATAG
CCGG*AAAGACAGACCCGCACAGCTTCCATCATTGAGATTGACATGTGTCACTTCTACCC
CTCCTGGAAGTGAAGCCGGGTCAACCGCATAGTTGTGGTTCTGAGCACTGATCTCCACCT
GGCCAGTTCTGTTATTACGAACTGGGTGGTTCCCTCCATGATGACCAAACTTCATCTTAT
AGGTTTTACCACCCAAAGCTTGTCCGAACAACTGATGGCCCATACAGATCCCGTAAACAG
GAGCTTTACCAAGAAGCTCCTTGACCGTCTCCACAGCATACGGAACAGCAGAAGGGTCTC
CAGGACCGTTGCTGAACAAGATCCCGTCTGGATTCATTTTAAGAGCCTCGGAAGCTGGAA
ATGAGGACGGGACAACGGTGATTTGGCATCCGTAAGAGGACAGGCGTCTTAGGATGTTAT
GCTTAATGCCAAAATCGTATGCTATAACTCTGTAGGACTTCCCATCGCGTGTGTTGGTAT
TAAAATCCCATTCAGAGTCTGTTTTGTCGACCCACTC

QA 3 759 3 759
DS 

RD RS1AP90TFB 723 0 0
CATTAAATAGTACTACAAAACAAAGAAACAGTTCTTGTTTGCTGCTTCCCATTAATCTCA
GGAGCTCTGTTTCGACCTCTTCATAAGCTCTATGAACTCTCTAAACGCGTTGTCAGAGTC
GTGAGGTCCAGGGGAGGCTTCAGGGTGGTACTGTAGAGACATGACATTCATAGCCGGGAA
AGACAGACCCGCACAGCTTCCATCATTGAGATTGACATGTGTCACTTCTACCCCTCCTGG
AAGTGAAGCCGGGTCAACCGCATAGTTGTGGTTCTGAGCACTGATCTCCACCTGGCCAGT
TCTGTTATTACGAACTGGGTGGTTCCCTCCATGATGACCAAACTTCATCTTATAGGTTTT
ACCACCCAAAGCTTGTCCGAGCAACTGATGGCCCATACAGATCCCGTAAACAGGAGCTTT
ACCAAGAAGCTCCTTGACCGTCTCAACAGCATACGGAACAGCAGAAGGGTCTCCAGGACC
GTTGCTGAACAAGATCCCGTCTGGATTCATTTTAAGAGCCTCGGAAGCTGGAAATGAAGA
CGGGACAACGGTGATTTGGCATCCGTAAGAGGACAGGCGTCTTAGGATGTTATGCTTGAT
GCCAAAATCGTATGCTATAACTCTGTAGGACTTCCCATCGCGTGTGTTAGTGTTGAAATC
CCATTCAGGGTCTGTTTTGTCGACCCACTCGTAGGGAGATTTGCAGGAGACATCACTTAT
TAC

QA 1 723 1 723
DS 



CO CL153Contig2 985 2 2 U
CGTTGTTCATATGTTGGCTAATCTTATTGTTCATCACTCCCAAAGTTCCTCTTCATTCTT
TCCGTCATCATGTCTTCGCTGACAAGCGCAATTTCATGGGAGTGCCAAACACATTAAATG
TGATGACCAACTTTCCTTTTCTTATTATTGGAGTTTCTCGGTTTCGTTCTTTGCATTGGA
GGAAGCTTCTTTAATATCAGTTTGAAAGGTGAGATCTGGGGATGGACACTGTTCTACGCA
AGCGTTTCAAGCTTGGCCTTTGACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGGACC
AAACCTCAGTGAGAGTGAGAAAACAACAACCATGGCGGCTACAACGACTCCTCTTGGCTT
TGTTTTGCCGACGGGTTTATCTCCCCGTCGCGGTGGATTCAGGTTTTCATTCGTCCGATG
CTCCGCTTCTCCTCTCACTTCATCCACCGCCTCTGGTATAGTGGAGAAGCCGTGGAGTTC
GTATAACGCTAGGCTTGTGTTGGAAGACGGCTCCATCTGGCCTGCTAAGTCCTTTGGTGC
TCCTGGAACCCGTGTTGCTGAATTGGTCTTTAACACCTCCTTGACAGGGTATCAAGAGAT
TCTGACTGATCCTAGTTATGCTGGACAGTTTGTGCTTATGACAAACCCACAAATTGGTAA
CACCGGTGTCAATCTCGATGATGAAGAATCTGAGCAATGCTTCCTTGCTGGTTTGGTCAT
AAGAAGTCTAAGCATCAGTACCTCGAACTGGAGATGCAAGAAGACACTTGCTGACTATCT
AACCGAGAGGAACCTCATGGGAATCTATGATCTTGACACTCGAGCAATAACTCGTCGACT
AAGAGAAGAAGGTAGTCTTAACGGTGTGCTAAGCACAGAGCAAACCAAAACAGACGATGA
GCTTCTCCAAATGTCCCGTTCTTGGGATATCGTAGTATTGATCTAATAAGTGATGTCTCC
TGCAAATCTCCCTACGAGTGGGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FD74TF U 1
AF RS1DQ73TF U 299
BS 1 387 RS1FD74TF
BS 388 985 RS1DQ73TF

RD RS1FD74TF 387 0 0
CGTTGTTCATATGTTGGCTAATCTTATTGTTCATCACTCCCAAAGTTCCTCTTCATTCTT
TCCGTCATCATGTCTTCGCTGACAAGCGCAATTTCATGGGAGTGCCAAACACATTAAATG
TGATGACCAACTTTCCTTTTCTTATTATTGGAGTTTCTCGGTTTCGTTCTTTGCATTGGA
GGAAGCTTCTTTAATATCAGTTTGAAAGGTGAGATCTGGGGATGGACACTGTTCTACGCA
AGCGTTTCAAGCTTGGCCTTTGACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGGACC
AAACCTCAGTGAGAGTGAGAAAACAACAACCATGGCGGCTACAACGACTCCTCTTGGCTT
TGTTTTGCCGACGGGTTTATCTCCCCG

QA 1 387 1 387
DS 

RD RS1DQ73TF 687 0 0
GGAAACCTC
AGTGAGAGTGAGAAAACAACAACCATGGCGGCTACAACGACTCCTCTTGGCTTTGTTTTG
CCGACGGGTTTATCTCCCCGTCGCGGTGGATTCAGGTTTTCATTCGTCCGATGCTCCGCT
TCTCCTCTCACTTCATCCACCGCCTCTGGTATAGTGGAGAAGCCGTGGAGTTCGTATAAC
GCTAGGCTTGTGTTGGAAGACGGCTCCATCTGGCCTGCTAAGTCCTTTGGTGCTCCTGGA
ACCCGTGTTGCTGAATTGGTCTTTAACACCTCCTTGACAGGGTATCAAGAGATTCTGACT
GATCCTAGTTATGCTGGACAGTTTGTGCTTATGACAAACCCACAAATTGGTAACACCGGT
GTCAATCTCGATGATGAAGAATCTGAGCAATGCTTCCTTGCTGGTTTGGTCATAAGAAGT
CTAAGCATCAGTACCTCGAACTGGAGATGCAAGAAGACACTTGCTGACTATCTAACCGAG
AGGAACCTCATGGGAATCTATGATCTTGACACTCGAGCAATAACTCGTCGACTAAGAGAA
GAAGGTAGTCTTAACGGTGTGCTAAGCACAGAGCAAACCAAAACAGACGATGAGCTTCTC
CAAATGTCCCGTTCTTGGGATATCGTAGTATTGATCTAATAAGTGATGTCTCCTGCAAAT
CTCCCTACGAGTGGGTCG

QA 10 687 10 687
DS 



CO CL153Contig3 769 4 24 U
GGCTTAGTGAGAGTGAGAAAACAACGGAACCATGGCGGCTACAACGACTCCTCATGGCTT
TGTCTTGCCGACGGGTTTATCTCCCCGTCGCGGTGGATTCAGGTTTTCACTCGTCCGATG
CTCCGCTTCTCCTCTCACTTCATCCACCGCCTCTGTGGAGAAGCCGTGGAGTTCGTATAA
CGCTAGGCTTGTGTTGGAAGACGGTTCCATCTGGCCTGCTAAGTCCTTTGGTGCTCCTGG
AACCCGTGTTGCTGAATTAGTCTTCAACACCTCCTTGACAGGGTATCAAGAGATTCTGAC
TGATCCTAGTTATGCTGGACAGTTTGTGCTTATGACAAACCCACAAATCGGTAACACCGG
TGTCAATCTCGATGATGAAGAATCTGAGCAATGCTTCCTTGCTGGTTTGGTCATAAGAAG
TCTAAGCATCAGTACCTCGAACTGGAGATGCACGAAGACACTTGCTGACTATCTAACCGA
AAGGAACCTCATGGGAATCTATGATCTTGACACTCGAGCAATAACTCGTCGACTAAGAGA
AGAAGGTAGTCTTAACGGTGTGCTAAGCACAGAGCAAACCAAAACAGACGAAGAGCTTCT
CCAAATGTCCCGTTCTTGGGATATCGTAGTATTGATCTAATAAGTGATGTCTCCTGCAAA
TCTCCCTACGAGTGGGTCGACAAACAGACCCTGAATGGGATTTTAACACCAACACACGCG
ATGGAAACTCCTACAGAGTATAGCATACGATTTGGCATCAAGCACACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 0 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FT50TF U -4
AF RS1FL11TF U 1
AF RS1DM26TF U -9
AF RS1FX34TF U -5
BS 1 25 RS1FL11TF
BS 26 27 RS1FX34TF
BS 28 53 RS1FL11TF
BS 54 54 RS1FX34TF
BS 55 63 RS1FL11TF
BS 64 64 RS1FX34TF
BS 65 117 RS1FL11TF
BS 118 118 RS1DM26TF
BS 119 458 RS1FL11TF
BS 459 459 RS1DM26TF
BS 460 536 RS1FL11TF
BS 537 537 RS1DM26TF
BS 538 684 RS1FL11TF
BS 685 694 RS1DM26TF
BS 695 695 RS1FX34TF
BS 696 703 RS1DM26TF
BS 704 704 RS1FX34TF
BS 705 709 RS1DM26TF
BS 710 710 RS1FX34TF
BS 711 725 RS1DM26TF
BS 726 726 RS1FX34TF
BS 727 741 RS1DM26TF
BS 742 742 RS1FX34TF
BS 743 769 RS1DM26TF

RD RS1FT50TF 101 0 0
GGAACCTCAGTGA
GAGAGTGAGAAAACAACGGAACCATGGCGGCTACGACGACTCCTCATGGCTTTGTCTTGC
*GACGGGTTTATCTCCCCGTCGCGGTGG

QA 14 101 14 101
DS 

RD RS1FL11TF 699 0 0
GGCTTAGTGAGAGTGAGAAAACAAC**AACCATGGCGGCTACAACGACTCCTCTTGGCTT
TGTTTTGCCGACGGGTTTATCTCCCCGTCGCGGTGGATTCAGGTTTTCACTCGTCCGGTG
CTCCGCTTCTCCTCTCACTTCATCCACCGCCTCTGTGGAGAAGCCGTGGAGTTCGTATAA
CGCTAGGCTTGTGTTGGAAGACGGTTCCATCTGGCCTGCTAAGTCCTTTGGTGCTCCTGG
AACCCGTGTTGCTGAATTAGTCTTCAACACCTCCTTGACAGGGTATCAAGAGATTCTGAC
TGATCCTAGTTATGCTGGACAGTTTGTGCTTATGACAAACCCACAAATCGGTAACACCGG
TGTCAATCTCGATGATGAAGAATCTGAGCAATGCTTCCTTGCTGGTTTGGTCATAAGAAG
TCTAAGCATCAGTACCTCGAACTGGAGATGCACGAAGATACTTGCTGACTATCTAACCGA
AAGGAACCTCATGGGAATCTATGATCTTGACACTCGAGCAATAACTCGTCGACTAATAGA
AGAAGGTAGTCTTAACGGTGTGCTAAGCACAGAGCAAACCAAAACAGACGAAGAGCTTCT
CCAAATGTCCCGTTCTTGGGATATCGTAGTATTGATCTAATAAGTGATGTCTCCTGCAAA
TCTCCCTACGAGTGGGTCGACAAA
ACAGACCCTGATTGG

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1DM26TF 779 0 0
GGCTTACCAAACCTCAGT
GAGAGTGAGAAAACAAC**AACCATGGCGGCTACAACGACTCCTCTTGGCTTTGTTTTGC
CGACGGGTTTATCTCCCCGTCGCGGTGGATTCAGGTTTTCACTCGTCCGATGCTCCGCTT
CTCCTCTCACTTCATCCACCGCCTCTGTGGAGAAGCCGTGGAGTTCGTATAACGCTAGGC
TTGTGTTGGAAGACGGTTCCATCTGGCCTGCTAAGTCCTTTGGTGCTCCTGGAACCCGTG
TTGCTGAATTAGTCTTCAACACCTCCTTGACAGGGTATCAAGAGATTCTGACTGATCCTA
GTTATGCTGGACAGTTTGTGCTTATGACAAACCCACAAATCGGTAACACCGGTGTCAATC
TCGATGATGAAGAATCTGAGCAATGCTTCCTTGCTGGTTTGGTCATAAGAAGTCTAATCA
TCATTACCTCGAACTGGAGATGCACGAAGACACTTGCTGACTATCTAACCGAAAGGAACC
TCATGGGAATCTATGATCTTGACACTCGAGCAATAACTCGTCGACTAAGAGAAGAAGGTA
GTCTTAACGGTGTGCTAAGCACAGAGCAAACCAAAACAGACGAAGAGCTTCTCCAAATGT
CCCGTTCTTGGGATATCGTAGTATTGATCTAATAAGTGATGTCTCCTGCAAATCTCCCTA
CGAGTGGGTCGACAAACAGACCCTGATTGGGATTT*AACACTAACACACGCGATGGAGAC
TCCTACAGAGTATCGCATACGATTTGGCATCAAGCACACAT

QA 19 779 19 779
DS 

RD RS1FX34TF 759 0 0
GGAAACCTCAGTGA
GAGAGTGAGAAAACAACGGAACCATGGCGGCTACGACGACTCCTCATGGCTTTGTCTTGC
CGACGGGTTTATCTCCCCGTCGCGGTGGATTCAGGTTTTCACTCGTCCGATGCTCCGCCT
CTCCT*TCACTTCATCCACCGCCTCTGTGGAGAAGCCGTGGAGTTCGTATAACGCTAGGC
TTGTGTTGGAAGACGGTTCCATCTGGCCTGCTAAGTCCTTTGGTGCTCCTGGAACCCGTG
CTGCTGAATTGGTCTTTAACACC*CCTTGACAGGGTATCAAGAGATTCTGACTGATCCTA
GTTATGCTGGACAGTTTGTGCTTATGACAAACCCACAAATCGGTAACACCGGTGTCAATC
TCGATGATGAAGAATCTGAGCAATGCTTCCTTGCTGGTTTGGTCATAAGAAGTCTAAGCA
TCAGTACCTCGAACTGGAGATGCAAGAAAACACTTGCTGACTATCTAACCGAAAGGAACC
TCATGGGAATCTATGATCTTGACACTCGAGCAATAACTCGTCGGTTAAGAGAAGAAGGTA
GTCTTAACGGTGTGCTAAGCACAGAGCAAACCAAAACAGACGATGAGCTTCTGCAAATGT
CCCGTTCTTGGGATATCGTAGTATTGATCTAATAAGTGATGTCTCCTGCAAATCTCCCTA
CGAGTGGGTCGACAAACAGACTCTGAATGGGATTTTAATACCAACACACGCGATGGGAAG
TCCTACAGAGTATAGCATACGATTT

QA 15 759 15 759
DS 



AS 2 13

CO CL154Contig1 1042 11 20 U
TTTTTTTTTCCACCGTCGAAGCGATGACCACCACTCAGATTTCGGAGATTGAGCAAGAAC
AGCTAATCGAGAAGCTTGAGATCTTTAAGATCCATGGCAGAGACAAACGCGGCCGTAAGA
TCCTTCGGATCATCGGCAAATTCTTTCCAGCTCGATTTCTGTCACTGGATGTGTTAAACA
AGTATCTAGAGGAAAAGATCTTTCCTCGATTAGGGAGAAAACCATTCGCCGTGCTTTACG
TTCACACCGGCGTGCAGAGGAGCGAGAATTTCCCGGGAATCTCAGCTCTACGAGCAATCT
ACGACGCGATTCCCGTTAACGTCAGAGACAATCTCCAGGAGGTTTACTTCCTCCACCCAG
GCCTCCAGTCACGTCTCTTCCTCGCCACTTGCGGCCGATTCCTCTTCTCCGGCGGGTTGT
ACGGGAAGCTAAGGTACATAAGCAGAGTTGACTACTTGTGGGAACACGTGAGGAGGAACG
AGATAGAGATGCCGGAGTTTGTGTACGACCACGACGACGATCTAGAGTACCGTCCGATGA
TGGATTACGGTCAAGAGAGCGATCACGCTAGGGTTTACGCCGGAGCCGCCGTAGATTCAT
CAGTCTCCAGTTTCTCCATGAGGTGTATCTCTTAGCGTATAAAAAAAAAA*TACACCCAC
CAGATCTCCGATCGCATCTTTTAAAAACCATATAATATACGATTAAAATATCAAAAAGTC
ACGATAGATGTGCTTCTCGCAGCCAGTGAGCGTTTTTTACGGGGGAAAAAAAA*GAAAGC
TGTTGGCGTGGATAAGGAAAGGTTGAGAATCTTTAGATTTTTTTTCCCGTAAACCTGTTC
TTTTCTGTTTTTAATGTTTCTTTGTGGAAATTTGTAGATCTTTTCTTTAGTGGTAGTAGT
GGGTGTGAGTTTGATGTCGGAAATCTTGTGTATATGTTAATATAAAAATGTTAGTGTAAC
ATTAGTTCCATAAAAAATATGTGTAACAATCCAAGACAGAAAAACAACCATCTGTTGCTA
TAAACAACCGATTTCAATGGCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 
60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 55 55 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B382TF U 61
AF RS1E214TF U 2
AF RS1H637TF U 2
AF RS1AU15TF U 10
AF RS1BS31TF U 1
AF RS1BJ42TF U 77
AF RS1BS31JQ C 380
AF RS1DW77TF U 238
AF RS1BJ42JQ C 303
AF RS1DW77JQ C 378
AF RS1AU15JQ C 403
BS 1 8 RS1BS31TF
BS 9 9 RS1E214TF
BS 10 599 RS1BS31TF
BS 600 600 RS1BJ42TF
BS 601 649 RS1BS31TF
BS 650 650 RS1BJ42TF
BS 651 686 RS1BS31TF
BS 687 687 RS1BJ42TF
BS 688 707 RS1BS31TF
BS 708 708 RS1BJ42TF
BS 709 716 RS1BS31TF
BS 717 717 RS1BJ42TF
BS 718 757 RS1BS31TF
BS 758 759 RS1BJ42TF
BS 760 761 RS1DW77TF
BS 762 772 RS1BS31TF
BS 773 915 RS1DW77TF
BS 916 928 RS1BJ42JQ
BS 929 969 RS1DW77JQ
BS 970 1042 RS1AU15JQ

RD RS1B382TF 402 0 0
G
GCTAATCGAGAAGCTTGAGATCTTTAAGATCCATGGCAGAGACAAACGCGGCCGTAAGAT
CCTTCGGATCATCGGCAAATTCTTTCCAGCTCGATTTCTGTCACTGGATGTGTTAAACAA
GTATCTAGAGGAAAAGATCTTTCCTCGATTAGGGAGAAAACCATTCGCCGTGCTTTACGT
TCACACCGGCGTGCAGAGGAGCGAGAATTTCCCGGGAATCTCAGCTCTACGAGCAATCTA
CGACGCGATTCCCGTTAACGTCAGAGACAATCTCCAGGAGGTTTACTTCCTCCACCCAGG
CCTCCAGTCACGTCTCTTCCTCGCCACTTGCGGCCGATTCCTCTTCTCCGGCGGGTTGTA
CGGGAAGCTAAGGTACATAAGCAGAGTTGACTACTTGTGGG

QA 2 402 2 402
DS 

RD RS1E214TF 635 0 0
TTTTTTTTCCACCGTCGAAGCGATGACCACCACTCAGATTTCGGAGATTGAGCAAGAACA
GCTAATCGAGAAGCTTGAGATCTTTAAGATCCATGGCAGAGACAAACGCGGCCGTAAGAT
CCTTCGGATCATCGGCAAATTCTTTCCAGCTCGATTTCTGTCACTGGATGTGTTAAACAA
GTATCTAGAGGAAAAGATCTTTCCTCGATTAGGGAGAAAACCATTCGCCGTGCTTTACGT
TCACACCGGCGTGCAGAGGAGCGAGAATTTCCCGGGAATCTCAGCTCTACGAGCAATCTA
CGACGCGATTCCCGTTAACGTCAGAGACAATCTCCAGGAGGTTTACTTCCTCCACCCAGG
CCTCCAGTCACGTCTCTTCCTCGCCACTTGCGGCCGATTCCTCTTCTCCGGCGGGTTGTA
CGGGAAGCTAAGGTACATAAGCAGAGTTGACTACTTGTGGGAACACGTGAGGAGGAACGA
GATAGAGATGCCGGAGTTTGTGTACGACCACGACGACGATCTAGAGTACCGTCCGATGAT
GGATTACGGTCAAGAGAGCGATCACGCTAGGGTTTACGCCGGAGCCGCCGTAGATTCATC
AGTCTCCAGTTTCTCCATGAG*TGTATCTCTTAGC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1H637TF 637 0 0
TTTTTTTTCCACCGTCGAAGCGATGACCACCACTCAGATTTCGGAGATTGAGCAAGAACA
GCTAATCGAGAAGCTTGAGATCTTTAAGATCCATGGCAGAGACAAACGCGGCCGTAAGAT
CCTTCGGATCATCGGCAAATTCTTTCCAGCTCGATTTCTGTCACTGGATGTGTTAAACAA
GTATCTAGAGGAAAAGATCTTTCCTCGATTAGGGAGAAAACCATTCGCCGTGCTTCACGT
TCACACCGGCGTGCAGAGGAGCGAGAATTTCCCGGGAATCTCAGCTCTACGAGCAATCTA
CGACGCGATTCCCGTTAACGTCAGAGACAATCTCCAGGAGGTTTACTTCCTCCACCCAGG
CCTCCAGTCACGTCTCTTCCTCGCCACTTGCGGCCGATTCCTCTTCTCCGGCGGGTTGTA
CGGGAAGCTAAGGTACATAAGCAGAGTTGACTACTTGTGGGAACACGTGAGGAGGAACGA
GATAGAGATGCCGGAGTTTGTGTACGACCACGACGACGATCTAGAGTACCGTCCGATGAT
GGATTACGGTCAAGAGAGCGATCACGCTAGGGTTTACGCCGGAGCCGCCGTAGATTCATC
AGTCTCCAGTTTCTCCATGAGGTGTATCTCTTAGCGT

QA 1 637 1 637
DS 

RD RS1AU15TF 634 0 0
CCACCGTCGAAGCGATGACCACCACTCAGATTTCGGAGATTGAGCAAGAACAGCTAATCG
AGAAGCTTGAGATCTTTAAGATCCATGGCAGAGACAAACGCGGCCGTAAGATCCTTCGGA
TCATCGGCAAATTCTTTCCAGCTCGATTTCTGTCACTGGATGTGTTAAACAAGTATCTAG
AGGAAAAGATCTTTCCTCGATTAGGGAGAAAACCATTCGCCGTGCTTTACGTTCACACCG
GCGTGCAGAGGAGCGAGAATTTCCCGGGAATCTCAGCTCTACGAGCAATCTACGACGCGA
TTCCCGTTAACGTCAGAGACAATCTCCAGGAGGTTTACTTCCTCCACCCAGGCCTCCAGT
CACGTCTCTTCCTCGCCACTTGCGGCCGATTCCTCTTCTCCGGCGGGTTGTACGGGAAGC
TAAGGTACATAAGCAGAGTTGACTACTTGTGGGAACACGTGAGGAGGAACGAGATAGAGA
TGCCGGAGTTTGTGTACGACCACGACGACGATCTAGAGTACCGTCCGATGATGGATTACG
GTCAAGAGAGCGATCACGCTAGGGTTTACGCCGGAGCCGCCGTAGATTCATCAGTCTCCA
GTTTCTCCATGAGGTGTATCTCTTAGCGTATAAA

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1BS31TF 772 0 0
TTTTTTTTCCCACCGTCGAAGCGATGACCACCACTCAGATTTCGGAGATTGAGCAAGAAC
AGCTAATCGAGAAGCTTGAGATCTTTAAGATCCATGGCAGAGACAAACGCGGCCGTAAGA
TCCTTCGGATCATCGGCAAATTCTTTCCAGCTCGATTTCTGTCACTGGATGTGTTAAACA
AGTATCTAGAGGAAAAGATCTTTCCTCGATTAGGGAGAAAACCATTCGCCGTGCTTTACG
TTCACACCGGCGTGCAGAGGAGCGAGAATTTCCCGGGAATCTCAGCTCTACGAGCAATCT
ACGACGCGATTCCCGTTAACGTCAGAGACAATCTCCAGGAGGTTTACTTCCTCCACCCAG
GCCTCCAGTCACGTCTCTTCCTCGCCACTTGCGGCCGATTCCTCTTCTCCGGCGGGTTGT
ACGGGAAGCTAAGGTACATAAGCAGAGTTGACTACTTGTGGGAACACGTGAGGAGGAACG
AGATAGAGATGCCGGAGTTTGTGTACGACCACGACGACGATCTAGAGTACCGTCCGATGA
TGGATTACGGTCAAGAGAGCGATCACGCTAGGGTTTACGCCGGAGCCGCCGTAGATTCAC
CAGTCTCCAGTTTCTCCATGAGGTGTATCTCTTAGCGTATAAAAAAAAA**TACACCCAC
CAGATCTCCGATCGCATCTTTTAAAA*CCATATAATATACGATTAAA*TATCAAAA*GTC
ACGATAGATGTGCTTCTCGCAGCCAGTGAGCGTTTTTAC**GGGGAAAAAAA

QA 1 772 1 772
DS 

RD RS1BJ42TF 683 0 0
G
GAGATCTTTAAGATCCATGGCAGAGACAAACGCGGCCGTAAGATCCTTCGGATCATCGGC
AAATTCTTTCCAGCTCGATTTCTGTCACTGGATGTGTTAAACAAGTATCTAGAGGAAAAG
ATCTTTCCTCGATTAGGGAGAAGACCATTCGCCGTGCTTTACGTTCACACCGGCGTGCAG
AGGAGCGAGAATTTCCCGGGAATCTCAGCTCTACGAGCAATCTACGACGCGATTCCCGTT
AACGTCAGAGACAATCTCCAAGAGGTTTACTTCCTCCACCCAGGCCTCCAGTCACGTCTC
TTCCTCGCCACTTGCGGCCGATTCCTCTTCTCCGGCGGGTTGTACGGGAAGCTAAGGTAC
ATAAGCAGAGTTGACTACTTGTGGGAACACGTGAGGAGGAACGAGATAGAGATGCCGGAG
TTTGTGTACGACCACGACGACGATCTAGAGTACCGTCCGATGATGGATTA*GGTCAAGAG
AGCGATCACGCTAGGGTTTACGCCGGAGCCGCCGTAGATTCATCAGTCTCCAGTTTCTCC
ATGAGGTGTATCTCTTAGCGTATAAAAAAAAAA*TACACCCACCAGATCTCCGATCGCAT
CTTCTAAAAACCATATAATATACGATTAAAATATCAAAAAGTCACGATAGATGTGCTTCT
CGCAGCCAGTGAGCGTTTTTTA

QA 2 683 2 683
DS 

RD RS1BS31JQ 495 0 0
CCTCGCCACTTGCGGCCGATTCCTCTTTTCCGGCGGGTTGTACGGGAAGTTAAGGTACAT
AAGCAGAGTTGACTACTTGTGGGAACACGTGAGGAGGAACGAGATAGAGATGCCGGAGTT
TGTGTACGACCACGACGACGATCTAGAGTACCGTCCGATGATGGATTACGGTCAAGAGAG
CGATCACGCTAGGGTTTACGCCGGAGCCGCCGTAGATTCACCAGTCTCCAGTTTCTCCAT
GAGGTGTATCTCTTAGCGTATAAAAAAAAAA*TACACCCCCCAGATCTCCGATCGCATCT
TTTAAAAACCATATAATATACGATTAAAATATCAAAAAGTCACGATAGATGTGCTTCTCG
CAGCCAGTGAGCGTTTTTTACGGGGGAAAAAAAA*GAAAGCTGTTGGCGTGGATAAGGAA
AGGTTGAGAATCTTTAGATTTTTTT*CCCGTAAACCTGTTCTTTTCTGTTTTTAATGTTT
CTTTGTGGAAATTTG

QA 1 495 1 495
DS 

RD RS1DW77TF 678 0 0
GG
GTTCACACCGGCGTGCAGAGGAGCGAGAATTTCCCGGGAATCTCAGCTCTACGAGCAATC
TACGACGCGATTCCCGTTAACGTCAGAGACAATCTCCAGGAGGTTTACTTCCTCCACCCA
GGCCTCCAGTCACGTCTCTTCCTCGCCACTTGCGGCCGATTCCTCTTCTCCGGCGGGTTG
TACGGGAAGCTAAGGTACATAAGCAGAGTTGACTACTTGTGGGAACACGTGAGGAGGAAC
GATATAGAGATGCCGGAGTTTGTGTACGACCACGACGACGATCTAGAGTACCGTCCGATG
ATGGATTACGGTCAAGAGAGCGATCACGCTAGGGTTTACGCCGGAGCCGCCGTAGATTCA
TCAGTCCCCAGTTTCTCCATGAGGTGTATCTCTTAGCGTATAAAAAAAAAA*TACACCCA
CCAGATCTCCGATCGCATCTTTTAAAAACCATATAATATACGATTAAAATATCAAAAAGT
CACGATAGATGTGCTTCTCGCAGCCAGTGAGCGTTTTTTACGGGGGAAAAAAAA*GAAAG
CTGTTGGCGTGGATAAGGAAAGGTTGAGAATCTTTAGATTTTTTTTCCCGTAAACCTGTT
CTTTTCTGTTTTTAATGTTTCTTTGTGGAAATTTGTAGATCTTTTCTTTAGTGGTAGTAG
TGGGTGTGAGTTTGAT

QA 3 678 3 678
DS 

RD RS1BJ42JQ 626 0 0
GACGCGATTCCCGTTAACGTCAGAGACAATCTCCAAGAGGTTTACTTCCTCCACCCAGGC
CTCCAGTCACGTCTCTTCCTCGCCACTTGCGGCCGATTCCTCTTCTCCGGCGGGTTGTAC
GGGAAGCTAAGGTACATAAGCAGAGTTGACTACTTGTGGGAACACGTGAGGAGGAACGAG
ATAGAGATGCCGGAGTTTGTGTACGACCACGACGACGATCTAGAGTACCGTCCGATGATG
GATTA*GGTCAAGAGAGCGATCACGCTAGGGTTTACGCCGGAGCCGCCGTAGATTCATCA
GTCTCCAGTTTCTCCATGAGGTGTATCTCTTAGCGTATAAAAAAAAAA*TACACCCACCA
GATCTCCGATCGCATCTTCTAAAAACCATATAATATACGATTAAAATATCAAAAAGTCAC
GATAGATGTGCTTCTCGCAGCCAGTGAGCGTTTTTTACGGGGGAAAAAAAA*GAAAGCTG
TTGGCGTGGATAAGGAAAGGTTGAGAATCTTTAGATTTTTTTTCCCGTAAACCTGTTCTT
TTCTGTTTTTAATGTTTCTTTGTGGAAATTTGTAGATCTTTTCTTTAGTGGTAGTAGTGG
GTGTGAGTTTGATGTCGGAAATCTTG

QA 1 626 1 626
DS 

RD RS1DW77JQ 592 0 0
TTCCTCGCCACTTGCGGCCGATTCCTCTTCTCCGGCGGGTTGTACGGGAAGCTAAGGTAC
ATAAGCAGAGTTGACTACTTGTGGGAACACGTGAGGAGGAACGATATAGAGATGCCGGAG
TTTGTGTACGACCACGACGACGATCTAGAGTACCGTCCGATGATGGATTACGGTCAAGAG
AGCGATCACGCTAGGGTTTACGCCGGAGCCGCCGTAGATTCATCAGTCCCCAGTTTCTCC
ATGAGGTGTATCTCTTAGCGTATAAAAAAAAAA*TACACCCACCAGATCTCCGATCGCAT
CTTTTAAAAACCATATAATATACGATTAAAATATCAAAAAGTCACGATAGATGTGCTTCT
CGCAGCCAGTGAGCGTTTTTTACGGGGGAAAAAAAA*GAAAGCTGTTGGCGTGGATAAGG
AAAGGTTGAGAATCTTTAGATTTTTTTTCCCGTAAACCTGTTCTTTTCTGTTTTTAATGT
TTCTTTGTGGAAATTTGTAGATCTTTTCTTTAGTGGTAGTAGTGGGTGTGAGTTTGATGT
CGGAAATCTTGTGTATATGTTAATATAAAAATGTTAGTGTAACATTAGTTCC

QA 1 592 1 592
DS 

RD RS1AU15JQ 640 0 0
TCTTCTCCGGCGGGTTGTACGGGAAGCTAAGGTACATAAGCAGAGTTGACTACTTGTGGG
AACACGTGAGGAGGAACGAGATAGAGATGCCGGAGTTTGTGTACGACCACGACGACGATC
TAGAGTACCGTCCGATGATGGATTACGGTCAAGAGAGCGATCACGCTAGGGTTTACGCCG
GAGCCGCCGTAGATTCATCAGTCTCCAGTTTCTCCATGAGGTGTATTTCTTAGCGTATAA
AAAAAAAAATACACCCACCAGATCTCCGATCGCATCTTTTAAAAACCGTATAATATACGA
TTAAAATATCAAAAAGTCACGATAGATGTGCTTCTCGCAGCCAGTGAGCGTTTTTTACGG
GGGAAAAAAAAAGAAAGCTGTTGGCGTGGATAAGGAAAGGTTGAGAATCTTTAGATTTTT
TT*CCCGTAAACCTGTTCTTTTCTGTTTTTAATGTTTCTTTGTGTAAATTTGTAGATCTT
TTCTTTAGTGGTAGTAGTGGGTGTGAGTTTGATGTCGGAAATCTTGTGTATATGTTAATA
TAAAAATGTTAGTGTAACATTAGTTCCATAAAAAATATGTGTAACAATCCAAGACAGAAA
AACAACCATCTGTTGCTATAAACAACCGATTTCAATGGCC

QA 1 640 1 640
DS 



CO CL154Contig2 603 2 2 U
GGGAGCGAGAATTTCCCGGGAATCTCAGCTCTACGAGCGATCTACGACGCGATTCCGGTT
AACGTAAGAGACAATAATCTCCAGGAGGTTTACTTCCTCCACCCAGGCCTTCAATCACGT
CTCTTCCTCGCCACTTGCGGACGATTCCTCTTCTCCGGCGGGTTGTACGGGAAGCTAAGG
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GAGTTTGTGTACGATCACGACGACGATCTGGAGTATCGTCCGATGATGGATTACGGTCAA
GAGAGCGATCATGCTAGGGTCTACGCCGGAGCCGCTGTAGATTCATCAGTCTCCAGTTTC
TCCATGAGGTGTATCTCTTAGCGCAGATCACGGATCGTGTATTATAAACCATATAATATA
CGATTAAGAAAATATTAAATATAGATGTGCTTTTCGAAGTCAGTGAGCGCTTTTCACGGA
AAAGAATAGACAGCTGTTGGCGTTTTGTATTAGGAGAGGTTGAGATTAGGATCTGTAGAT
TTTTTTTTTTCTTCTTAAACCTGTTCTCTTTTGTTTTTAATTACATATCGGTTTATCTGG
TTT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RS1C784JQ C 1
AF RS1C784TF U 1
BS 1 1 RS1C784JQ
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TTT

QA 1 603 1 603
DS 

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G
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AGAGCGATCATGCTAGGGTCTACGCCGGAGCCGCTGTAGATTCATCAGTCTCCAGTTTCT
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TTTTTTTTTCTTCTTAAACCTGTTCTCTTTTGTTTTTAATTACATATCGGTTTATCTGGT
TT

QA 2 603 2 603
DS 



AS 2 12

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ACATGATGCAGAAAGAGCCAAAGCCCCTATTCCTTATCACGAACAGGAGAACCCTTGCAT
GAAGCAGAAGATAACATAAATAATCCAGGCTCAATCCCAACGCAAACGAAGACAAGGAAT
AGCACACCCTCCAACCTCGGCGGAACCACCACAAGAGGTAACATCGAACATGCAACCAGA
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BQ
10 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D361TF C 3
AF RS1E325JQ U 1
AF RS1B561JQ U 24
AF RS1BH65JQ U 1
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TG
C

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DS 

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A
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GAAGCAAATGCACCTCATTATATTGCTAGTAAGATTACTTCAACTAGCCACGAGGAAAAA
ACGCAAACAGCAAACCCAAGGAGATGAAGGACACACCTTTTAACTCTCAATCTCCCACGA
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AAGCAAAAAATAACATAAATAATCCAGGCTCAATCCCAACGCAAACGAAGACAAGGAATA
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GT

QA 2 663 2 663
DS 

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QA 1 746 1 746
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CAACCTCTAAAAGCGAGATCTGATGATCTAGAAAGCTATCTGAAA*TCTAAAACCCGAGC
AAAGACATGCACCACG

QA 1 796 1 796
DS 



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AGCCACCGCCGGTCGGGATTTGACTTATTT*CTCTGTTTGTCCGTGGTTGCATGTCTTTT
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GCGATTTGTCGATGGAGGTTCAATCGGCGGTCCGTATGTCTCCGGTTCTCCTTTCTCGAC
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CCTCTGGCTTGGGTTTTTATTTGTTTTGATCTAGATTAGTTTGTTTGTCTGTTCTTAAAA
CCTCATTTGTAAAATTCTATGCCTTTGTTTCCGGAGATTCTCATATGTCTGCCGGCTAAT
GCTTCTGGAGGAAGGTTGTTTCCTGCCAGCTATGTTTCTAAGAGTCATTATGACTCGTTA
GCTTTGTATCTCATCATCATGTGTATTCCCCTGTTTAGTAATGAATGAATCCTCTAGTGT
T


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
20 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 20 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

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AF RS1GB52TF U 41
AF RS1DC02TF U 41
AF RS1DZ34TF U 41
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AF RS1DZ34JQ C 212
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GCTCGGGTTTTTAGATTTTCAGATAGCTTTCTAGATCATCAGATCTCGCTTTTAGAGGTT
GCGATATGTCGATCGAGGTTTAATCGGTGGTCCGTATGTCTCCGGTTCTCCTTTCTCGAC
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ATCTGGTTGCATGTTCGATGTTACCTCTTGTGGTGGTTCCGCCGAGGTTGGAGGGTGTGC
TATTCCTTGTCTTCGTTTGCGTTGGGATTGAGCCTGGATTATTTATGTTATCTTCTGCTT
CATGCAAGGGTTCTCCTGTTCGTGAT*AAGGAATAGGGGCTTTGGCTCTTTCTGCATCAT
GTCGTG
TGA

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DS 

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AGCCACCGCCGGTCGGGATTTGTCTTATTTTCTCTGTTTGTCCGTGGTTGCATGTCTTTT
GCTCGGGTTTTTAGATTTTCAGATAGCTTTCTAGATCATCAGATCTCGCTTTTAGAGGTT
GCGATATGTCGATCGAGGTTTAATCGGTGGTCCGTATGTCTCCGGTTCTCCTTTCTCGAC
TTGGTTTCTTCCTCTTGAGTTTCAATCGGTGTTATTTGCGTCGATGGTTTCTCTTCCCAG
ATCTGGTTGCATGTTCGATGTTACCTCTTGTGGTGGTTCCGCCGAGGTTGGAGGGTGTGC
TATTCCTTGTCTTCGTTTGCGTTGGGATTGAGCCTGGATTATTTATGTTATCTTCTGCTT
CATGCAAGGGTTCTCCTGTTCGTGAT*AAGGAATAGGGGCTTTGGCTCTTTCTGCATCAT
GTCGTGGGAGATTGAGAGTTAAAAGGTGTGTCCTTCATCTCCTTGGGTTTGCTGTCTGCG
TTTCTTCCTCGTGGCTAGTTGAAGTAATCTTACTAGCAATATAA

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DS 

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TCCGGTTCTCCTTTCTCGACTTGGTTTCTTCCTCTTGAGTTTCAATCGGTGTTATTTGCG
TCGATGGTTTCTCTTCTCAGATCTGGTTGCATGTTCGATGTTACCTCTTGTGGTGGTTCC
GCCGAGGTTGGAGGGTGTGCTATTTCTTGTCTTCGTTTGCGTTGGGATTGAGCCTGGATT
ATTTATGTTATCTTCTGCTTCATGCAAGGGTTCTCCTGTTCGTGATCAAGGAATAGGGGC
TTTGGCTTTTTCTGCATCATGTCGTGGGAGATTGAGAGTAAAAAGGTGTGTCCCTCATCT
CCTTGGGTTTGCTGTCTGCGTTTCTTCCTCGTGGCTAGTTGAA

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TCCGGTTCTCCTTTCTCGACTTGGTTTCTTCCTCTTGAGTTTCAATCGGTGTTATTTGCG
TCGATGGTTTCTCTTCTCAGATCTGGTTGCATGTTCGATGTTACCTCTTGTGGTGGTTCC
GCCGAGGTTGGAGGGTGTGCTATTTCTTGTCTTCGTTTGCGTTGGGATTGAGCCTGGATT
ATTTATGTTATCTTCTGCTTCATGCAAGGGTTCTCCTGTTCGTGATCAAGGAATAGGGGC
TTTGGCTCTTTCTGCATCATGTCGTGGGAGATTGAGAGTAAAAAGGTGTGTCCTTCATCT
CCTTGGGTTTGCTGTCTGCGTTTCTTCCTCGTGGCTAGTTGAAGTGATCTTACTAGCAAT
ATAATGAGGTGCATCTGCTTCCCAAATAAAGTTCGATTATATGATGTGCGCTTATT

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DS 

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TCCGTGGTTGCATGTCTTTTGCTCGGGTTTTTAGAATTTCAGATAGCTTTCTAGATCATC
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TCCGGTTCTCCTTTCTCGACTTGGTTTCTTCCTCTTGAGTTTCAATCGGTGTTATTTGCG
TCGATGGTTTCTCTTCTCAAATCTGGTTGCATGTTCGATGTTACCTCTTGTGGTGGTTCC
GCCGAGGTTGGAGGGTGTGCTATTTCTTGTCTTCGTTTGCGTTGGGATTGAGCCTGGATT
ATTTATGTTATCTTCTGCTTCATGCAAGGGTTCTCCTGTTCGTGATCAAGGAATAGGGGC
TTTGGCTCTTTCTGCATCATGTCGTGGGAGATTGAGAGTAAAAAGGTGTGTCCTTCATCT
CCTTGGGTTTGCTGTCTGCGTTTCTTCCTCGTGGCTAGTTGAAGTGATCTTACTAGCAAT
ATAATGAGGTGCATCTGCTTCCCAAATAAAGTTCGATTATATGATGTGCGCTTATTCTCT
CCTTCCTCC

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DS 

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CTTGAGTTTCAATCGGTGTTATTTGCGTCGATGGTTTCTCTTCTCAGATCTGGTTGCATG
TTCGATGTTACCTCTTGTGGTGGTTCCGCCGAGGTTGGAGGGTGTGCTATTTCTTGTCTT
CGTTTGCGTTGGGATTGAGCCTGGATTATTTATGTTATCTTCTGCTTCATGCAAGGGTTC
TCCTGTTCGTGATCAAGGAATAGGGGCTTTGGCTTTTTCTGCATCATGTCGTGGGAGATT
GAGAGTAAAAAGGTGTGTCCCTCATCTCCTTGGGTTTGCTGTCTGCGTTTCTTCCTCGTG
GCTAGTTGAAGTGATCTTACTAGCAATATAATGAGGTGCATCTGCTTCCCAAATAAAGTT
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ATTCTATGCCTTTGTTTCCGGAGATTCTCATATGTCTGCCGGCTAATGCTTCTGGAGGAA
GGTTGTTTCCTGCCAGCTATGTTTCTAAGAGTCATTATGACTCGTTAGCTTTGTATCTCA
TCATCATGTGTATTCC
GCTGC

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DS 

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TGGAGGTTCAATCGGCGGTCCGTATGTCTCCGGTTCTCCTTTCTCGACTTGGTTTCTTCC
TCTTGAGTTTCAATCGGTGTTATTTGCGTCGATGGTTTCTCTTCTCAGATCTGGTTGCAT
GTTCGATGTTACCTCTTGTGGTGGTTCCGCCGAGGTTGGAGGGTGTGCTATTTCTTGTCT
TCGTTTGCGTTGGGATTGAGCCTGGATTATTTATGTTATCTTCTGCTTCATGCAAGGGTT
CTCCTGTTCGTGATCAAGGAATAGGGGCTTTGGCTCTTTCTGCATCATGTCGTGGGAGAT
TGAGAGTAAAAAGGTGTGTCCTTCATCTCCTTGGGTTTGCTGTCTGCGTTTCTTCCTCGT
GGCTAGTTGAAGTGATCTTACTAGCAATATAATGAGGTGCATCTGCTTCCCAAATAAAGT
TCGATTATATGATGTGCGCTTATTCTCTCCTTCCTCCTTCGGTGGTTTCCTCTGGCTTGG
GTTTTTATTTGTTTTGATCTAGATTAGTTTGTTTGTCTGTTCTTAAAACCTCATTTGTAA
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DS 

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TTATTTGCGTCGATGGTTTCTCTTCTCAGATCTGGTTGCATGTTCGATGTTACCTCTTGT
GGTGGTTCCGCCGAGGTTGGAGGGTGTGCTATTTCTTGTCTTCGTTTGCGTTGGGATTGA
GCCTGGATTATTTATGTTATCTTCTGCTTCATGCAAGGGTTCTCCTGTTCGTGATCAAGG
AATAGGGGCTTTGGCTCTTTCTGCATCATGTCGTGGGAGATTGAGAGTAAAAAGGTGTGT
CCTTCATCTCCTTGGGTTTGCTGTCTGCGTTTCTTCCTCGTGGCTAGTTGAAGTGATCTT
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TTATTCTCTCCTTCCTCCTTCGGTGGTTTCCTCTGGCTTGGGTTTTTATTTGTTTTGATC
TAGATTAGTTTGTTTGTCTGTTCTTAAAACCTCATTTGTAAAATTCTATGCCTTTGTTTC
CGGAGATTCTCATATGTCTGCCGGCTAATGCTTCTGGAGGAAGGTTGTTTCCTGCCAGCT
ATGTTTTTAAGAGTCATTATGACTCGTTAGCTTTGTATCTCATCATCATGTGTATTCCTC
TGTTTAGTAATGAATGAATCCTCTAGTGTT

QA 1 750 1 750
DS 



AS 2 13

CO CL156Contig1 711 3 14 U
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GTGCAAGAACCCGGTTGATGGTTTCTCTGCTGGTCTCGTTAATGAGAATAACGTTTTCCA
GTGGAGCGTTTCGATTATGGGTCCTCCTGATACCTTGTATGAAGGGGGATTCTTTAATGC
AATTATGACGTTTCCACCGGATTATCCTAATAATCCACCAACTGTCAAGTTCACCTCCGA
GGTGTGGCATCCTAATGTTTATTCTGATGGAAAAGTTTGCATATCGATTCTTCATCCTCC
TGGTAATGATCCTAATGGATACGAGCTTGCCTCTGAACGTTGGAACCCTGTTCACACGGT
AGAGAGCATTGTGTTGAGTATCATATCGATGCTCTCGGGTCCCAACGACGAGTCACCGGC
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TCGCTGTGTTCGAAGATCGCAAGAGATGCTGTGATTCATCTCTCCTGCGTTTTTATGTAT
CGTAGAAATTAATTTCTATCCTAAGCTAAGAGAGAGAGAGAAGGTAAGAAGAAGCAGCAG
ATGAATCTGTGTGCTCATCAAAAGCTTTTCTTTTGGTTTTGGATTTGTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EH85TF U 1
AF RS1DH74TF U 1
AF RS1BV63TF U 7
BS 1 31 RS1DH74TF
BS 32 32 RS1EH85TF
BS 33 160 RS1DH74TF
BS 161 161 RS1EH85TF
BS 162 227 RS1DH74TF
BS 228 228 RS1EH85TF
BS 229 639 RS1DH74TF
BS 640 640 RS1EH85TF
BS 641 643 RS1BV63TF
BS 644 688 RS1DH74TF
BS 689 689 RS1BV63TF
BS 690 699 RS1DH74TF
BS 700 700 RS1BV63TF
BS 701 711 RS1DH74TF

RD RS1EH85TF 640 0 0
GGCTCCCC
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TTGTGTTGAGTATCACATCGATGCTCTCGGGTCCCAACGACGAGTCACCGGCCAATGTGG
AAGCAGCAAAAGAATGGAGAGACAACAGAGCAGAGTTTAGGAAGAAAGTGAGTCGCTGTG
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TTAATTTCTATCCTAAGCTAAGAGAGAGAGAG

QA 9 640 9 640
DS 

RD RS1DH74TF 711 0 0
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GTGGCTTGTGATGGCAAAGGATCAAGCAAGCCTTCTTCTTCAGAAACAGCTCAAAGATCT
GTGCAAGAACCCGGTTGATGGTTTCTCTGCTGGTCTCGTTCATGAGAATAACGTTTTCCA
GTGGAGCGTTTCGATTATGGGTCCTCCTGATACCTTGTATGAAGGGGAATTCTTTAATGC
AATTATGACGTTTCCACCGGATTATCCTAATAATCCACCAACTGTCAAGTTCACCTCCGA
GGTGTGGCATCCTAATGTTTATTCTGATGGAAAAGTTTGCATATCGATTCTTCATCCTCC
TGGTAATGATCCTAATGGATACGAGCTTGCCTCTGAACGTTGGAACCCTGTTCACACGGT
AGAGAGCATTGTGTTGAGTATCATATCGATGCTCTCGGGTCCCAACGACGAGTCACCGGC
CAATGTGGAAGCAGCAAAAGAATGGAGAGACAACAGAGCAGAGTTTAGGAAGAAAGTGAG
TCGCTGTGTTCGAAGATCGCAAGAGATGCTGTGATTCATCTCTCCTGCGTTTTTATGTAT
CGTAGAAATTAATTTCTATCCTAAGCTAAGAGAGAGAGAA***GTAAGAAGAAGCAGCAG
ATGAATCTGTGTGCTCATCAAAAGCTTT*CTTTTGGTTT*GGATTTGTCTT

QA 1 711 1 711
DS 

RD RS1BV63TF 704 0 0
GG
GAATCTACTTCTCTCTCTCTCTG**TCTCTCTCTCTAGGATCTCTATCGCCGGTGGCTTG
TGATGACAAAGGATCAAGCAAGCCTTCTTCTTCAGAAACAGCTCAAAGATCTGTGCAAGA
ACCCGGTTGATGGTTTCTCTGCTGGTCTCGTTAATGAGAATAACGTTTTCCAGTGGAGCG
TTTCGATTATGGGTCCTCCTGATACCTTGTATGAAGGGGGATTCTTTAATGCAATTATGA
CGTTTCCACCGGATTATCCTAATAATCCACCAACTGTCAAGTTCACCTCCGAGGTGTGGC
ATCCTAATGTTTATTCTGATGGAAAAGTTTGCATATCGATTCTTCATCCTCCTGGTAATG
ATCCTAATGGATACGAGCTTGCCTCTGAACGTTGGAACCCTGTTCACACGGTAGAGAGCA
TTGTGTTGAGTATCATATCGATGCTCTCGGGTCCCAACGACGAGTCACCGGCCAATGTGG
AAGCAGCAAAAGAATGGAGAGACAACAGAGCAGAGTTTAGGAAGAAAGTGAGTCGCTGTG
TTCGAAGATCGCAAGAGATGCTGTGATTCATCTCTCCTGCGTTTTTATGTATCGTAGAAA
TTAATTTCTATCCTAAGCTAAGAGAGAGAGAGAAGGTAAGAAGAAGCAGCAGATGAATCT
GTGTGCTCATCAAAAGCTTTTCTTTTGGTTTTGGATT
GTCTT

QA 3 699 3 699
DS 



CO CL156Contig2 803 10 27 U
AAAAGAGGAATATGAAAAGGAATCCATTAACGAGTGTGAAAATATAATCCTAAAAGGTGG
TTTAGATTTGATTCCACCACAATATTCCAAACCCTTAAAGACAAATCCAAAACCAAAAGA
AAAGCTTTTGATGAGCACACAGATTCATCTGCTGCTTCTTCTT***ACCTTCTCTCTCTC
TCTCTTAGCTTAGGATAGAAATTAATTTCTAAGATACATAAAAACGCAGGAGAGATGAAT
CACA**GCATCTCTTGCGATCTTCTCACACAGCGACTCACTTTCTTCCTAAACTCTGCTC
TGTTGTCTCTCCATTCCTTTGCTGCTTCCACGTTCGCCGGTGACTCGTCGTTGGGACCCG
AGAGCATCGATATGATACTCAACACAATGCTCTCTACCGTGTGAACAGGGTTCCAACGTT
CAGAGGCAAGCTCGTATCCATTAGGATCGTTACCAGGAGGATGAAGAATCGATATGCAAA
CTTTTCCATCGGAATAAACATTAGGATGCCACACCTCGGAGGTGAACTTGACAGTTGGTG
GATTATTAGGATAATCCGGTGGAAACGTCATAATTGCATTAAAGAAGCCCCCTTCATACA
AGGTATCAGGAGGACCCATAATCGAAACGCTCCACTGGAAAACGTTATTTTCATCAACGA
GACCAGCAGAGAAACCATCAACCGGGTTCTTGCACAGATCTTTGAGCTGTTTCTGAAGAA
GAAGGCTTGCTTGATCCTTTGCCATCTCAAGCCACCGGCGATAGAGATCCTAGAGAGAGA
GAGAGAAGTAGATTCGGGGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 15 30 30 5 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 30 
0 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 30 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 0 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RS1GI09JQ U 8
AF RS1E433JQ U 1
AF RS1EH85JQ U 7
AF RS1DH74JQ U 12
AF RS1CP46JQ U 83
AF RS1EI11JQ U 1
AF RS1CP46TF C 72
AF RS1EI11TF C 372
AF RS1E433TF C 218
AF RS1GI09TF C 224
BS 1 37 RS1E433JQ
BS 38 38 RS1EI11JQ
BS 39 93 RS1E433JQ
BS 94 94 RS1EI11JQ
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BS 167 178 RS1E433JQ
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BS 741 803 RS1CP46TF

RD RS1GI09JQ 217 0 0
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TTGTTGAGCACACAGATTCATCTGCTGCTTCTTCTT***ACCTTCTCTCTCTCTCTCTTA
GCTTAGGATAGAAATTAATTTCTAAGATACATAAAAA

QA 1 217 1 217
DS 

RD RS1E433JQ 636 0 0
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TTTAGATTTGATTCCACCACAATATTCCAAACC*TTAAAGACAAATCCAAAACCAAAAGA
AAAGCTTTTGATGAGCACACAGATTCATCTGCTGCTTCTTCTTCTTACCTTCTCTCTCAC
TCT**TAGCTTAGGATAGAAATTAATTTCTACGATACATAAAAACGCAGGAGAGATGAAT
CTCATAGCATCTCTTGCGATCTTCTCACACAGCGACTCACTTTCTTCCTAAACTCTGCTC
TGTTGTCTCTCCATTCCTTTGCTGCTTCCACGTTCGCCGGTGACTCGTCGTTGGGACCTG
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CAGAGGCAAGCTCGTATCCATTAGGATCATTACCAGGAGGATGAAGAATCGATATGCAAA
CTTTTCCATCGGAATAAACATTAGGATGCCACACCTCGGAGGTGAACTTGACAGTTGGTG
GATTATTAGGATAATCCGGTGGAAACGTCATAATTGCATTAAAGAAACCCCCTTCATACA
AGGTATCAGGAGGACCCATAATCGAAACGCTCCACT

QA 1 636 1 636
DS 

RD RS1EH85JQ 697 0 0
G
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TTGATGAGCACACAGATTCATCTGCTGCTTCTTCTT***ACCTTCTCTCTCTCTCT**TA
GCTTAGGATAGAAATTAATTTCTACGATACATAAAAACGCAGGAGAGATGAATCACA**G
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TCTCCATTCTTTTGCTGCTTCCACATTGGCCGGTGACTCGTCGTTGGGACCCGAGAGCAT
CGATGTGATACTCAACACAATGCTCTCTACCGTGTGAACAGGGTTCCAACGTTCAGAGGC
AAGCTCGTATCCATTAGGATCATTACCAGGAGGATGAAGAATCGATATGCAAACTTTTCC
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AGGATAATCCGGTGGAAACGTCATAATTGCATTAAAGAATCCCCCTTCATACAAGGTATC
AGGAGGACCCATAATCGAAACGCTCCACTGGAAAACGTTATTCTCATTAACGAGACCAGC
AGAGAAACCATCAACCGGGTTCTTGCACAGATCTTT

QA 2 697 2 697
DS 

RD RS1DH74JQ 684 0 0
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TTCCACCACAATATTCCAAACC*TTAAAGACAAATCCAAAACCAAAAGAAAAGCTTTTGA
TGAGCACACAGATTCATCTGCTGCTTCTTCTT***ACCTTCTCTCTCTCT****TAGCTT
AGGATAGAAATTAATTTCTACGATACATAAAAACGCAGGAGAGATGAATCACA**GCATC
TCTTGCGATCTTCGAACACAGCGACTCACTTTCTTCCTAAACTCTGCTCTGTTGTCTCTC
CATTCTTTTGCTGCTTCCACATTGGCCGGTGACTCGTCGTTGGGACCCGAGAGCATCGAT
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TCGTATCCATTAGGATCATTACCAGGAGGATGAAGAATCGATATGCAAACTTTTCCATCA
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GGACCCATAATCGAAACGCTCCACTGGAAAACGTTATTCTCATGAACGAGACCAGCAGAG
AAACCATCAACCGGGTTCTTGCAC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1CP46JQ 637 0 0
TATTCCAAACCCTTAAAGACAAATCCAAAACCAAAAGAAAAGCTTTTGATGAGCACACAG
ATTCAT**GCTGCTTCTTCTT***ACCTTCTCTCTCTCTCTCTTAGCTTAGGATAGAAAT
TAATTTCTAAGATACATAAAAACGCAGGAGAGATGAATCACA**GCATCTCTTGCGATCT
TCTCACACAGCGACTCACTTTCTTCCTAAACTATGCTCTGTTGTCTCTCCATTCCTTTGC
TGCTTCCACGTTCGCCGGTGACTCGTCGTTGGGACCCGAGAGCATCGATATGATACTCAA
CACAATGCTCTCTACCGTGTGAAAAGGGTTCCAACGTTCAAAGGCAAGCTCGTATCCATT
AGGATCGTTACCAGGAGGATGAAGAATCGATATGCAAACTTTTCCATCGGAATAAACATT
AGGATGCCACACCTCGGAGGTGAACTTGACAGTTGGTGGATTATTAGGATAATCCGGTGG
AAACGTCATAATTGCATTAAAGAAGCCCCCTTCATACAAGGTATCAGGAGGACCCATAAT
CGAAACGCTCCACTGGAAAACGTTATTTTCATCAACGAGACCAGCAGAGAAACCATCAAC
CGGGTTCTTGCACAGATCTTCGAGCTGTTTCTGAAGA

QA 1 637 1 637
DS 

RD RS1EI11JQ 740 0 0
AAAAGAG
GAATATGAAAAGGAATCCATTAACGAGTGTGAAAATATAATCCTAAAAGGTGGTTTAGAT
TTGATTCCACCACAATATTCCAAACCCTTAAAGACAAATCCAAAACCAAAAGAAAAGCTT
TTGATGAGCACACAGATTCATCTGCTGCTTCTTCTT***ACCTTCTCTCTCTCTCT**TA
GCTTAGGATAGAAATTAATTTCTAAGATACATAAAAACGCAGGAGAGATGAATCACA**G
CATCTCTTGCGATCTTCTCACACAGCGACTCACTTTCTTCCTAAACTCTGCTCTGTTGTC
TCTCCATTCCTTTGCTGCTTCCACGTTCGCCGGTGACTCGTCGTTGGGACCCGAGAGCAT
CGATATGATACTCAACACAATGCTCTCTACCGTGTGAACAGGGTTCCAACGTTCAGAGGC
AAGCTCGTATCCATTAGGATCGTTACCAGGAGGATGAAGAATCGATATGCAAACTTTTCC
ATCGGAATAAACATTAGGATGCCACACCTCGGAGGTGAACTTGACAGTTGGTGGATTATT
AGGATAATCCGGCGGAAACGTCATAATTGCATTAAAGAAGCCCCCTTCATACAAGGTATC
AGGAGGACCCATAATCGAAACGCTCCACTGGAAAACGTTATTTTCATCAACGAGACCAGC
AGAGAAACCATCAACCGGGTTCTTGCACAGATCTTTGAGCTGTTTCTGAAGAAGAAGGCT
TGCTTGATCCTTT

QA 8 740 8 740
DS 

RD RS1CP46TF 732 0 0
TTCCACCACAATATTCCAAACCCTTAAAGACAAATCCAAAACCAAAAGAAAAGCTTTTGA
TGAGCACACAGATTCAT**GCTGCTTCTTCTT***ACCTTCTCTCTCTCTCTCTTAGCTT
AGGATAGAAATTAATTTCTAAGATACATAAAAACGCAGGAGAGATGAATCACA**GCATC
TCTTGCGATCTTCTCACACAGCGACTCACTTTCTTCCTAAACTATGCTCTGTTGTCTCTC
CATTCCTTTGCTGCTTCCACGTTCGCCGGTGACTCGTCGTTGGGACCCGAGAGCATCGAT
ATGATACTCAACACAATGCTCTCTACCGTGTGAAAAGGGTTCCAACGTTCAGAGGCAAGC
TCGTATCCATTAGGATCGTTACCAGGAGGATGAAGAATCGATATGCAAACTTTTCCATCG
GAATAAACATTAGGATGCCACACCTCGGAGGTGAACTTGACAGTTGGTGGATTATTAGGA
TAATCCGGTGGAAACGTCATAATTGCATTAAAGAAGCCCCCTTCATACAAGGTATCAGGA
GGACCCATAATCGAAACGCTCCACTGGAAAACGTTATTTTCATCAACGAGACCAGCAGAG
AAACCATCAACCGGGTTCTTGCACAGATCTTCGAGCTGTTTCTGAAGAAGAAGGCTTGCT
TGATCCTTTGCCATCTCAAGCCACCGGCGATAGAGATCCTAGAGAGAGAGAGAGAAGTAG
ATTCGGGGAGCC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1EI11TF 432 0 0
ATGATACTCAACACAATGCTCTCTACCGTGTGAACAGGGTTCCAACGTTCAGAGGCAAGC
TCGTATCCATTAGGATCGTTACCAGGAGGATGAAGAATCGATATGCAAACTTTTCCATCG
GAATAAACATTAGGATGCCACACCTCGGAGGTGAACTTGACAGTTGGTGGATTATTAGGA
TAATCCGGCGGAAACGTCATAATTGCATTAAAGAAGCCCCCTTCATACAAGGTATCAGGA
GGACCCATAATCGAAACGCTCCACTGGAAAACGTTATTTTCATCAACGAGACCAGCAGAG
AAACCATCAACCGGGTTCTTGCACAGATCTTTGAGCTGTTTCTGAAGAAGAAGGCTTGCT
TGATCCTTTGCCATCTCAAGCCACCGGCGATAGAGATCCTAGAGAGAGAGAGAGAAGTAG
ATTCGGGG
AGCC

QA 1 428 1 428
DS 

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ATAAAAACGCAGGAGAGATGAATCTCATAGCATCTCTTGCGATCTTCTCACACAGCGACT
CACTTTCTTC*TAAACTCTGCTCTGTTGTCTCTCCATTCCTTTGCTGCTTCCACGTTCGC
CGGTGACTCGTCGTTGGGACCTGAGAGCATCGATATGATACTCAACACAATGCTCTCAAC
CGTGTGAACAGGGTTCCAACGTTCAGAGGCAAGCTCGTATCCATTAGGATCATTACCAGG
AGGATGAAGAATCGATATGCAAACTTTTCCATCGGAATAAACATTAGGATGCCACACCTC
GGAGGTGAACTTGACAGTTGGTGGATTATTAGGATAATCCGGTGGAAACGTCATAATTGC
ATTAAAGAAACCCCCTTCATACAAGGTATCAGGAGGACCCATAATCGAAACGCTCCACTG
GAAAACGTTATTTTCATCAACGAGACCAGCAGAGAAACCATCAACCGGGTTCTTGCACAG
ATCTTTGAGCTGTTTCTGAAGAAGAAGGCTTGCTTGATCCTTTGCCATCTCAAGCCACCG
GCGATAGAGATCCTAGAGAGAGAGAGAGAAGTAGATTCGGGG
CC

QA 1 582 1 582
DS 

RD RS1GI09TF 580 0 0
ACGCAGGAGAGATGAATCACA**GCATCTCTTGCGATCTTCTCACACAGCGACTCACTTT
CTTCGTAAACTCTGCTCTGTTGTCTCTCCATTCCTTTGCTGCTTCCACGTTCGCCGGTGA
CTCGTCGTTGGGACCCGAGAGCATCGATATGATACTCAACACAATGCTCTCTACCGTGTG
AACAGGGTTCCAACGTTCAGAGGCAAGCTCGTATCCATTAGGATCGTTACCAGGAGGATG
AAGAATCGATATGCAAACTTTTCCATCGGAATAAACATTAGGATGCCACACCTCGGAGGT
GAACTTGACAGTTGGTGGATTATTAGGATAATCCGGTGGAAACGTCATAATTGCATTAAA
GAAGCCCCCTTCATACAAGGTATCAGGAGGACCCATAATCGAAACGCTCCACTGGAAAAC
GTTATTTTCATCAACGAGACCAGCAGAGAAACCATCAACCGGGTTCTTGCACAGATCTTT
GAGCTGTTTCTGAAGAAGAAGGCTTGCTTGATCCTTTGCCATCTCAAGCCACCGGCGATA
GAGATCCTAGAGAGAGAGAGA**AGTAGATTCGGGG
AGCC

QA 1 576 1 576
DS 



AS 3 11

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AGTATGTTTTCTTTTTTCAATTTGTTCCCTTTTCTCCTCCCGACATTTGAGGTTATCAAG
ATGGTTGTTGCTTCCGTCGCCTCAGCAGTCTATTTAGGCTTCGCCGGTGTAACACTCAGT
GGTTCAGCCGTGGCATTAGCCGTATCTACCCCCCTTTTCATCATATTCAGTCCGATTCTC
TTACCTGCCATTGCAGCCACTACTGTCCTAGCCGCTGGGCTCGGCGGTAAAAAAGCGGAT
CAGCAGGCTCAGGCAGGTTCGCCGTCCCTATCTCTGTTGGGCATACCAGAGGCTATTAAA
CCAAGTAATATTATACCAGAGGCTGTTAAACCAAGTAATATTATACCAGAGGCTGTTAAA
CCAAGTAATATTATACCAGAGGGTATTAAACCAAGTACTATTAAGGACAAAATCAAGGAA
ACGTTAGGCAAAGTCAAGAATAAGATCAAAGAGAAAAAGGAAGAAAAATCTAAAGAAAAA
GGTAAATCTGGAGGTGGAGGTTCTCCTAAGGGTGAAGATTCGTCTTCTTCGGATGAGAGT
AAACACAAGAGTGAAGGTAAACACGGAAAGGGTGAGAGTAAACACGAAGGCGGAGGTAAA
CATGGAGGTGGAGGTTCGTCAATGGATAAAGGTAAGCACGGAAGCGGAGTAAACATGGAA
GTGGAGGTTCGTCGACGATGAAGCTAAGCATGGAGTGGAGGTTCTTCTACGGTGGA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DJ96TF U 1
AF RS1DD04TF U 12
AF RS1CL40TF U 72
AF RS1BX25TF U 1
AF RS1CH80TF U 1
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RD RS1DJ96TF 613 0 0
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AAACACAAGAGTG

QA 1 613 1 613
DS 

RD RS1DD04TF 634 0 0
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QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1CL40TF 575 0 0
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TGCAGCCACTACTGTTCTAGCCGCTGGGCTCGGCGGTAAAAAAGCGGATCAGCAGGCTCA
GGCAGGTTCGCCATCCCTATCTCTGCTGGGCATACCAGAGGCTATTAAACCAAGTAATAT
TATACCAGAGGCTGTTAAACCAAGTAATATTATACCAGAGGCTGTTAAACCAAGTAATAT
TATACCAGAGGGTATTAAACCAAGTACTATTAAGGACAAAATCAAGGAAACGATAGGCAA
AGTCAAGAATAAGATCAAAGAGAAAAAGGAAGAAAAACCTAAAGAAAAAGGTAAATCTGA
AGGTGGAGGTTCTCCTAAGGGTGGAGATTCGTCTTCTTCGGATGAGAGTAAACACAAAAG
TGAAGGTAAACACGGAAAGGGTGAGAGTAAACACG

QA 1 575 1 575
DS 

RD RS1BX25TF 733 0 0
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TTACCTGCCATTGCGGCCACTACTGTCCTAGCCGCTGGGCTCGGCGGTAAAAAAGCGGAT
CAGCAGGCTCAGGCAGGTTCGCCGTCCCTATCTCTGTTGGGCATACCAGAGGCTATTAAA
CCAAGTAATATTATACCAGAGGCTGTTAAACCAAGTAATATTATACCAGAGGCTGTTAAA
CCAAGTAATATTATACCAGAGGGTATTAAACCAAGTACTATTAAGGACAAAATCAAGGAA
ACGTTAGGCAAAGTCAAGAATAAGATCAAAGAGAAAAAGGAAGAAAAATCTAAAGGAAAA
GGTAAATCTGGAGGTGGAGGTTCTCCTAAGGGTGAAGATTCGTCTTCTTCGGATGAGAGT
AAACACAAGAGTGAAGGTAAACACGGAAAGGGTGAGAGTAAACACGAAGGCGGAGGTAAA
CATGGAGGTGGAGGTTCGTCAATGGATAAAGGTAAGCACGGAAGCGGAGTAAACATGGAA
GTGGAGGTTCGTC

QA 1 733 1 733
DS 

RD RS1CH80TF 776 0 0
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ATGGTTGTTGCTTCCGTTGCCTCAGCAGTCTATTTAGGCTTCGCCGGTGTAACACTCAGT
GGTTCAGCCGTGGCATTAGCCGTATCTACCCCCCTTTTCATCATATTCAGTCCGATTCTC
TTACCTGCCATTGCAGCCACTACTGTTCTAGCCGCTGGGCTCGGCGGTAAAAAAGCGGAT
CAGCAGGCTCAGGCAGGTTCGCCATCCCTATCTCTGTTGGGCATACCAGAGGCTATTAAA
CCAAGTAATATTATACCAGAGGCTGTTAAACCAAGTAATATTATACCAGAGGCTGTTAAA
CCAAGTAATATTATACCAGAGGGTATTAAACCAAGTACTATTAAGGACAAAATCAAGGAA
ACGATAGGCAAAGTCAAGAATAAGATCAAAGAGAAAAAGGAAGAAAAATCTAAAGAAAAA
GGTAAATCTGAAGGTGGAGGTTCTCCTAAGGGTGGAGATTCGTCTTCTTCGGATGAGAGT
AAACACAAAAGTGAAGGTAAACACGGAAAGGGTGAGAGTAAACACGAAGGCGGAGGTAAA
*ATGGAGGTGGAGGTTCGTCAATGGATAAAG*TAAGCACGGAAGCGGAGTAA*CATGGAA
GTGGAG*TTCGTCGACGATGAAGCTAAGCATGGAGTGGAGGTTCTTCTACGGTGGA

QA 1 776 1 776
DS 



CO CL157Contig2 764 3 7 U
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AGTCTTTCTGTCTTATCATATTAATCAGTTTTAACCATTACATATATTAACATAAAAATT
GTAAAAAGTTTTTTTTCCCTTACAATGCCGTACAATTCATGACACGTCATATGCTAAACA
TTGGAATAGGTCCACCAATGTCTTTTATTCTTCCATGAATTCACGTTTACTCACATGTGT
TTACCACCACTCCCATGTGAACTTTCACCATCTGAACTTCCATCTGAACTTCCATCTGAA
CTTTCACTTGAACTACTTGCATCCATAGATGAACCTGCATAATGGAATTCTTTTTTCTCC
TTTTTAGAAGAGCCTCCACCCCCGTGTTTACCTTCACCCATTGACGAACCTACACTTCCG
TGTTTGTCTCCACTTCCATGTTTGCCTCCACTCTCGTGTTTGCCTCCACTTCCGTGTTTG
TCTCCACTTCCGTGTTTGTCTCCACTTCCGTGTTTGTCTCCACTTCCGTGTTTGCCTCCA
CTTCCGTGTTTACCTTCACCCATTGATGAACCTCCACTTCCGTGTTTACCTCCACCTCCA
TGCTTAGCTTCATCCGTCGACGAACCTCCACTTCCATGTTTACCTCCGCTTCCGTGCTTA
CCTTTATCCATTGACGAACCTCCACCTCCATGTTTACCTCCGCCTTCGTGTTTACTCTCA
CCCTTTCCGTGTTTACCTTCACTCTTGTGTTTACTCTCATCCGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1CK27JQ U 1
AF RS1DJ96JQ U 53
AF RS1DD04JQ U 53
BS 1 410 RS1CK27JQ
BS 411 411 RS1DJ96JQ
BS 412 424 RS1CK27JQ
BS 425 425 RS1DJ96JQ
BS 426 453 RS1CK27JQ
BS 454 455 RS1DJ96JQ
BS 456 764 RS1CK27JQ

RD RS1CK27JQ 764 0 0
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AGTCTTTCTGTCTTATCATATTAATCAGTTTTAACCATTACATATATTAACATAAAAATT
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TTGGAATAGGTCCACCAATGTCTTTTATTCTTCCATGAATTCACGTTTACTCACATGTGT
TTACCACCACTCCCATGTGAACTTTCACCATCTGAACTTCCATCTGAACTTCCATCTGAA
CTTTCACTTGAACTACTTGCATCCATAGATGAACCTGCATAATGGAATTCTTTTTTCTCC
TTTTTAGAAGAGCCTCCACCCCCGTGTTTACCTTCACCCATTGACGAACCAACACTTCCG
TGTTCGTCTCCACTTCCATGTTTGCCTCCACTC**GTGTTTGCCTCCACTTCCGTGTTTG
TCTCCACTTCCGTGTTTGTCTCCACTTCCGTGTTTGTCTCCACTTCCGTGTTTGCCTCCA
CTTCCGTGTTTACCTTCACCCATTGATGAACCTCCACTTCCGTGTTTACCTCCACCTCCA
TGCTTAGCTTCATCCGTCGACGAACCTCCACTTCCATGTTTACCTCCGCTTCCGTGCTTA
CCTTTATCCATTGACGAACCTCCACCTCCATGTTTACCTCCGCCTTCGTGTTTACTCTCA
CCCTTTCCGTGTTTACCTTCACTCTTGTGTTTACTCTCATCCGA

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1DJ96JQ 709 0 0
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TAAAAATTGTAAAAAGTTTTTTTTCCCTTACAATGCCGTACAATTCATGACACGTCATAT
GCTAAACATTGGAATAGGTCCACCAATGTCTTTTATTCTTCCATGAATTCACGTTTACTC
ACATGTGTTTACCACCACTCCCATGTGAACTTTCACCATCTGAACTTCCATCTGAACTTC
CATCTGAACTTTCACTTGAACTACTTGCATCCATAGATGAACCTGCATAATGGAATTCTT
TTTTCTCCTTTTTAGAAGAGCCTCCACCCCCGTGTTTACCTTCACCCATTGACGAACCTA
CACTTCCGTGTTTGTCTCCACTTCCATGTTTGCCTCCACTCTCGTGTTTGCCTCCACTTC
CGTGTTTGTCTCCACTTCCGTGTTTGTCTCCACTTCCGTGTTTGTCTCCACTTCCGTGTT
TGCCTCCACTTCCGTGTTTACCTTCACCCATTGATGAACCTCCACTTCCGTGTTTACCTC
CACCTCCATGCTTAGCTTCATCCGTCGACGAACCTCCACTTCCATGTTTACCTCCGCTTC
CGTGCTTACCTTTATCCATTGACGAACCTCCACCTCCATGTTTACCTCCGCCTTCGTGTT
TAATCTCACCCTTTCCGTGTTTACCTTCACTCTTGTGTTTACTCTCATC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1DD04JQ 699 0 0
ATCATAATAGTCTTTCTGTCTTATCATATTAATCAGTTTTAACCATTACATATATTAACA
TAAAAATTGTAAAAAGTTTTTTTTCCCTTACAATGCCGTACAATTCATGACACGTCATAT
GCTAAACATTGGAATAGGTCCACCAATGTCTTTTATTCTTCCATGAATTCACGTTTACTC
ACATGTGTTTACCACCACTCCCATGTGAACTTTCACCATCTGAACTTCCATCTGAACTTC
CATCTGAACTTTCACTTGAACTACTTGCATCCATAGATGAACCTGCATAATGGAATTCTT
TTTTCTCCTTTTTAGAAGAGCCTCCACCCCCGTGTTTACCTTCACCCATTGACGAACCTA
CACTTCCGTGTTTGTCTCCACTTCCATGTTTGCCTCCACTCTCGTGTTTGCCTCCACTTC
CGTGTTTGTCTCCACTTCCGTGTTTGTCTCCACTTCCGTGTTTGTCTCCACTTCCGTGTT
TGCCTCCACTTCCGTGTTTACCTTCACCCATTGATGAACCTCCACTTCCGTGTTTACCTC
CACCTCCATGCTTAGCTTCATCCGTCGACGAACCCCCACTTCCATGTTTACCTCCGCTTC
CGTGCTTACCTTTATCCATTGACGAACCTCCACCTCCATGTTTACCTCCGCCTTCGTGTT
TACTCTCACCCTTTCCGTGTTTACCTTCACTCTTGTGTT

QA 1 699 1 699
DS 



CO CL157Contig3 820 3 8 U
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GAATGGAAATAATTGTTACCACATTACATTATTTTTATATTTTCACTATACATTGTATCA
TAATAGTCTTTCTGTCTTATCATATTAATCAGTTTTAACCATTACATATATTAACATAAA
AATTGTAAAAAGTTTTTTTTCCCTTACAATGCCGTACAATTCATGACACGTCATATGCTA
AACATTGGAATAGGTCCACCAATGTCTTTTATTCTTCCATGAATTCACGTTTACTCACAT
GTGTTTACCACCACTCCCATGTGAACTTTCACCATCTGAACTTCCATCTGAACTTCCATC
TGAACTTTCACTTGAACTACTTGCATCCATAGATGAACCTGCATAATGGAATTCTTTTTT
CTCCTTTTTAGAAGAGCCTCCACCCCCGTGTTTACCTTCACCCATTGACGAACCTCCACT
TCCGTGTTTGTCTCCACTTCCATGTTTGCCTCCACTCTCGTGTTTGCCTCCACTCTCGTG
TTTGCCTCCACTTCCGTGTTTGTCTCCACTTCCGTGTTTGCCTCCACTTCCGTGTTTGTC
TCCACTTCCGTGTTTGCCTCCACTTCCATGTTTACCTTCACCCATTGATGAACCTCCACT
TCCGTGTTTACCTCCACCCGTAGAAGAACCTCCACCTCCATGCTTAGCTTCATCCGTCGA
CGAACCTCCACTTCCATGTTTACCTCCGCTTCCGTGCTTACCTTTATCCATTGACGAACC
TCCACCTCCATTTTTACCTCCGCCTTCGTGTTTACTCTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C730TF C 310
AF RS1CL40JQ U 1
AF RS1CH80JQ U 42
BS 1 222 RS1CL40JQ
BS 223 223 RS1CH80JQ
BS 224 258 RS1CL40JQ
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BS 260 365 RS1CL40JQ
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BS 367 717 RS1CL40JQ
BS 718 820 RS1CH80JQ

RD RS1C730TF 267 0 0
CA
CACTCCCATGTGA*CTTTCACCATCTGAA*TTCCATCTGAACTTCCATCTGAACTTTCAC
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AAGAGCCTCCACCCCCGTGTTTACCTTCACCCATTGACGAACCTCCACTTCCGTGTTTGT
CTCCACTTCCATGTTTGCCTCCACTCTCGTGTTTGCCTCCACTCTCGTGTTTGCCTCCAC
TTCCGTGTTTGTCTCCACTTCCGT
C

QA 3 266 3 266
DS 

RD RS1CL40JQ 717 0 0
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GAATGGAAATAATTGTTACCACATTACATTATTTTTATATTTTCACTATACATTGTATCA
TAATAGTCTTTCTGTCTTATCATATTAATCAGTTTTAACCATTACATATATTAACATAAA
AATTGTAAAAAGTTTTTTTTCCCTTACAATGCCGTACAATTCGTGACACGTCATATGCTA
AACATTGGAATAGGTCCATCAATGTCTTTTATTCTTCCATGAATTCACGTTTACTCACAT
GTGTTTACCACCACTCCCATGTGAACTTTCACCATCTGAACTTCCATCTGAACTTCCATC
TGAACATTCACTTGAACTACTTGCATCCATAGATGAACCTGCATAATGGAATTCTTTTTT
CTCCTTTTTAGAAGAGCCTCCACCCCCGTGTTTACCTTCACCCATTGACGAACCTCCACT
TCCGTGTTTGTCTCCACTTCCATGTTTGCCTCCACTCTCGTGTTTGCCTCCACTCTCGTG
TTTGCCTCCACTTCCGTGTTTGTCTCCACTTCCGTGTTTGCCTCCACTTCCGTGTTTGTC
TCCACTTCCGTGTTTGCCTCCACTTCCATGTTTACCTTCACCCATTGATGAACCTCCACT
TCCGTGTTTACCTCCACCCGTAGAAGAACCTCCACCTCCATGCTTAGCTTCATCCGT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1CH80JQ 779 0 0
G
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TCACTATACATTGTATCATAATAGTCTTTCTGTCTTATCATATTAATCAGTTTTAACCAT
TACATATATTAACATAAAAATTGTAAAAAGTTTTTTTTCCCTTACAATGCCGTACAATTC
ATGACACGTCATATGCTAAACATTGGAATAGGTCCACCAATGTCTTTTATTCTTCCATGA
ATTCACGTTTACTCACATGTGTTTACCACCACTCCCATGTGAACTTTCACCATCTGAACT
TCCATCTGAACTTCCATCTGAACTTTCACTTGAACTACTTGCATCCATAGATGAACCTGC
ATAATGGAATTCTTTTTTCTCCTTTTTAGAAGAGCCTCCACCCCCGTGTTTACCTTCACC
CATTGACGAACCTCCACTTCCGTGTTTGTCTCCACTTCCATGTTTGCCTCCACTCTCGTG
TTTGCCTCCACTCTCGTGTTTGCCTCCACTTCCGTGTTTGTCTCCACTTCCGTGTTTGCC
TCCACTTCCGTGTTTGTCTCCACTTCCGTGTTTGCCTCCACTTCCGTGTTTACCTTCACC
CATTGATGAACCTCCACTTCCGTGTTTACCTCCACCCGTAGAAGAACCTCCACCTCCATG
CTTAGCTTCATCCGTCGACGAACCTCCACTTCCATGTTTACCTCCGCTTCCGTGCTTACC
TTTATCCATTGACGAACCTCCACCTCCATTTTTACCTCCGCCTTCGTGTTTACTCTCA

QA 2 779 2 779
DS 



AS 1 11

CO CL158Contig1 825 11 12 U
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AGGCTACGATGCAGTCTTCTATGGTAGGAGAGCTTGAGGTAGATGTTGAAATCAAAACCC
CCGCCC*ACAAGTACTACCACATGCTCACCGGAAGACCACAGGATCTTCCGAAAGTCACT
CCTGACAACATCAAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAGAAGTTGGAAGTATC
CTATTCTTCAACTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCA
CTGGAGCCGGAGAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATCTAATGCAAGAG
TTCAAGAGCTTCTTGATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTG
GTTAAGTGTCAGATGAAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTA
CTTGCGGCTTTTGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAA
GAGGATTCTTTGGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTC
CATCTATTTATCTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTC
TAAGACTGAAGAGATCTAAATATGTAAGTTTGTAATAATTATACACGATGTCTAGCGTGT
TACGTCCGTTTGAAGTTGTGAAAGTTGTAAACCGAATAAGTTGTGTGATGCAACGTGTTC
TCTTCCCAGATCTTAAATTAAGTCCCACAATTCCTCTCAAAGAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 40 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 40 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DC96TF U 5
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AF RS1BT03TF U 1
AF RS1F682TF U 2
AF RS1FP79TF U 5
AF RS1GQ10TF U 13
AF RS1AJ58TF U 9
AF RS1F682JQ C 39
AF RS1D162TF U 445
AF RS1C696JQ C 72
AF RS1AJ58JQ C 122
BS 1 111 RS1BT03TF
BS 112 112 RS1F682TF
BS 113 339 RS1BT03TF
BS 340 340 RS1F682TF
BS 341 723 RS1BT03TF
BS 724 750 RS1F682TF
BS 751 751 RS1D162TF
BS 752 773 RS1FP79TF
BS 774 796 RS1AJ58TF
BS 797 797 RS1D162TF
BS 798 818 RS1AJ58TF
BS 819 825 RS1AJ58JQ

RD RS1DC96TF 679 0 0
GG
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CGATGCAGTCTTCTATGGTAGGAGAGCTTGAGGTAGATGTTGAAATCAAAACCCCCGCCC
*ACAAGTACTACCACATGCTCACCGGAAGACCACAGGATCTTCCGAAAGTCACTCCTGAC
AACATCAAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAGAAGTTGGAAGTATCCTATTC
TTCAACTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTGGAG
CCGGAGAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATCTAATGCAAGAGTTCAAG
AGCTTCTTGATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTAAG
TGTCAGATGAAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTACTTGCG
GCTTTTGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGGAT
TCTTTGGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCTA
TTTATCTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCTAAGAC
TGAAGAGATCTAAATAT

QA 3 679 3 679
DS 

RD RS1C696TF 674 0 0
GG
ACTCACATAAACACCTAAAGAAGAAAAACATCAGTCTGAAAAAATGGCACAGGCTACGAT
GCAGTCTTCTATGGTAGGAGAGCTTGAGGTAGATGTTGAAATCAAAACCCCCGCCC*ACA
AGTACTACCACATGCTCACCGGAAGACCACAGGATCTTCCGAAAGTCACTCCTGACAACA
TCAAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAGAAGTTGGAAGTATCCTATTCTTCA
ACTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTGGAGCCGG
AGAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATCTAATGCAAGAGTTCAAGAGCT
TCTTGATCACTGCCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTAAGTGTC
AGATGAAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTACTTGCGGCTT
TTGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGGATTCTT
TGGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCTATTTA
TCTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCTAAGACTGAA
GAGATCTAAATA

QA 3 674 3 674
DS 

RD RS1BT03TF 723 0 0
GGACTCACTCACTCACATAAACACCTAAAGAAGAAAAACATCAGTCTGAAAAAATGGCAC
AGGCTACGATGCAGTCTTCTATGGTAGGAGAGCTTGAGGTAGATGTTGAAAACAAAACCC
CCGCCC*ACAAGTACTACCACATGCTCACCGGAAGACCACAGGATCTTCCGAAAGTCACT
CCTGACAACATCAAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAGAAGTTGGAAGTATC
CTATTCTTCAACTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCA
CTGGAGCCGGAGAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTTACGGAGATCTAATGCAAGAG
TTCAAGAGCTTCTTGATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTG
GTTAAGTGTCAGATGAAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTA
CTTGCGGCTTTTGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAA
GAGGATTCTTTGGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTC
CATCTATTTATCTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTC
TAAGACTGAAGAGATCTAAATATGTAAGTTTGTAATAATTATACACGATGTCTAGCGTGT
TAC

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1F682TF 753 0 0
AGGGG
ACTCACTCACATAAACACCTAAAGAAGAAAAACATCAGTCTGAAAAA*TGGCACAGGCTA
CGATGCAGTCTTCTATGGTAGGAGAGCTTGAGGTAGATGTTGAAATCAAAACCCCCGCCC
*ACAAGTACTACCACATGCTCACCGGAAGACCACAGGATCTTCCGAAAGTCACTCCTGAC
AACATCAAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAGAAGTTGGAAGTATCCTATTC
TTCAACTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTGGAG
CCGGAGAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATCTAATGCAAGAGTTCAAG
AGCTTCTTGATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTAAG
TGTCAGATGAAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTACTTGCG
GCTTTTGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGGAT
TCTTTGGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCTA
TTTATCTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCTAAGAC
TGAAGAGATCTAAATATGTAAGTTTGTAATAATTATACACGATGTCTAGCGTGTTACGTC
CGTTTGAAGTTGTGAAAGTTGTAA
CCGA

QA 6 749 6 749
DS 

RD RS1FP79TF 776 0 0
GG
ACTCACTCACATAAACACCTAA*GAAGAAAAACATCAGTCTGAAAAAATGGCACAGGCTA
CGATGCAGTCTTCTATGGTAGGAGAGCTTGAGGTAGATGTTGAAATCAAAACCCCCGCCC
*ACAAGTACTACCACATGCTCACCGGAAGACCACAGGATCTTCCGAAAGTCACTCCTGAC
AACATCAAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAGAAGTTGGAAGTATCCTATTC
TTCAACTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTGGAG
CCGGAGAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATCTAATGCAAGAGTTCAAG
AGCTTCTTGATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTAAG
TGTCAGATGAAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTACTTGCG
GCTTTTGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGGAT
TCTTTGGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCTA
TTTATCTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCTAAGAC
TGAAGAGATCTAAATATGTAAGTTTGTAATAATTATACACGATGTCTAGCGTGTTACGTC
CGTTTGAAGTTGTGAAAGT*GTAA*CCGAATAAGTTGTGTGATGCAA
AAAAAAA

QA 3 769 3 769
DS 

RD RS1GQ10TF 721 0 0
GG
ACATAAACACCTAAAGAAGAAAAACATCAGTCTGAAAAAATGGCACAGGCTACGATGCGG
CCTTCTATGGTAGGAGAGCTTGAGGTAGATGTTGAAATCAAAACCCCCGCCC*ACAAGTA
CTACCACATGCTCACCGGAAGACCACAGGATCTTCCGAAAGTCACTCCTGACAACATCAA
GAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAGAAGTTGGAAGTATCCTATTCTTCAACTA
TGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTGGAGCCGGAGAA
GAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATCTAATGCAAGAGTTCAAGAGCTTCTT
GATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGCGGTTAAGTGTCAGAT
GAAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTACTTGCGGCTTTTGT
CAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGGATTCTTTGGA
TATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCTATTTATCTA
TTGTGTCCGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCTAAGACTGAAGAGA
TCTAAATATGTAAGTTTGTAATAATTATACACGATGTCTAGCGTGTTACGTCCGTTTGA

QA 3 721 3 721
DS 

RD RS1AJ58TF 816 0 0
GG
ACTCACATAAACACCTAAAGAAGAAAAACATCAGTCTGAAAAAATGGCACAGGCTACGAT
GCAGTCTTCTATGGTAGGAGAGCTTGAGGTAGATGTTGAAATCAAAACCCCCGCCC*ACA
AGTACTACCACATGCTCACCGGAAGACCACAGGATCTTCCGAAAGTCACTCCTGACAACA
TCAAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAGAAGTTGGAAGTATCCTATTCTTCA
ACTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTGGAGCCGG
AGAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATCTAATGCAAGAGTTCAAGAGCT
TCTTGATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTAAGTGTC
AGATGAAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTACTTGCGGCTT
TTGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGGATTCTT
TGGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCTATTTA
TCTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCTAAGACTGAA
GAGATCTAAATATGTAAGTTTGTAATAATTATACACGATGTCTAGCGTGTTACGTCCGTT
TGAAGTTGTGAAAGTTGTAA*CCGAATAAGTTGTGTGATGCAACGTGTTCTCTTCCCAGA
TCTTAA*TTAAGTCCCACAATTCCTCTC
AAGAAA

QA 3 810 3 810
DS 

RD RS1F682JQ 783 0 0
AACATCAGTCTG
AAAATGGCACAGGCTACGATGCAGTCTTCTATGGTAGGAGAGCTTGAGGTAGATGTTGAA
ATCAAAACCCCCGCCC*ACAAGTACTACCACATGCTCACCGGAAGACCACAGGATCTTCC
GAAAGTCACTCCTGACAACATCAAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAGAAGT
TGGAAGTATCCTATTCTTCAACTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAG
GATTGAGGCACTGGAGCCGGAGAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATCT
AATGCAAGAGTTCAAGAGCTTCTTGATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACC
TGGAAGTGTGGTTAAGTGTCAGATGAAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCC
AGAGAATCTACTTGCGGCTTTTGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTC
TGAAGTCTAAGAGGATTCTTTGGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTA
TCTGTCCGTCCATCTATTTATCTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAAT
GTGCTCTCTCTAAGACTGAAGAGATCTAAATATGTAAGTTTGTAATAATTATACACGATG
TCTAGCGTGTTACGTCCGTTTGAAGTTGTGAAAGTTGTAAACCGAATAAGTTGTGTGATG
CAACGTGTTCTCTTCCCAGATCTTAAATTAAGTCCCACAATTCCTCTC
TTC

QA 13 780 13 780
DS 

RD RS1D162TF 376 0 0
G
GGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTACTTGCGGCTTTTGTCAAAGCATCCA
AAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGGATTCTTTGGATATCTGTTTAT
CCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCTATTTATCTATTGTGTCTGGG
TGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCTAAGACTGAAGAGATCTAAATATGT
AAGTTTGTAATAATTATACACGATGTCTAGCGTGTTACGTCCGTTTGAAGTTGTGAAAGT
TGTAAACCGAATAAGTTGTGTGATGCAACGTGTTCTCTTCCCAGATCTTAAATTAAGTCC
CACAATTCCTCTC
TT

QA 2 374 2 374
DS 

RD RS1C696JQ 737 0 0
CAGTCTTCTATGGTAGGAGAGCTTGAGGTAGATGTTGAAATCAAAACCCCCCCCCCACAA
GTACTACCACATGCTCACCGGAAGACCACAGGATCTTCCGAAAGTCACTCCTGACAACAT
CAAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAGAAGTTGGAAGTATCCTATTCTTCAA
CTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTGGAGCCGGA
GAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATCTAATGCAAGAGTTCAAGAGCTT
CTTGATCACTGCCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTAAGTGTCA
GATGAAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTACTTGCGGCTTT
TGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTCTGAAGTCTAAGAGGATTCTTT
GGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATCTATTTAT
CTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCTAAGACTGAAG
AGATCTAAATATGTAAGTTTGTAATAATTATACACGATGTCTAGCGTGTTACGTCCGTTT
GAAGTTGTGAAAGTTGTAAACCGAATAAGTTGTGTGATGCAACGTGTTCTCTTCCCAGAT
CTTAAATTAAGTCCCAC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RS1AJ58JQ 704 0 0
CGC
CCCACAAGTACTACCACATGCTCACCGGAAGACCACAGGATCTTCCGAAAGTCACTCCTG
ACAACATCAAGAGATGTGATGTGCTCGAGGGAGAGCCTGGAGAAGTTGGAAGTATCCTAT
TCTTCAACTATGTCGTTGATGGACAGCCAAAGGTGGCTAAGAAGAGGATTGAGGCACTGG
AGCCGGAGAAGAATCTGATGGTGGCTAGGATAATTGACGGAGATCTAATGCAAGAGTTCA
AGAGCTTCTTGATCACTGTCCAGGCGACCCCAATGCAAAGAGGACCTGGAAGTGTGGTTA
AGTGTCAGATGAAGTATGAGAGGATTGACGAGAAGGTGGCTGACCCAGAGAATCTACTTG
CGGCTTTTGTCAAAGCATCCAAAGACATGGACAAAATGCTTTCTTTTGAAGTCTAAGAGG
ATTCTTTGGATATCTGTTTATCCATCCATCTATCTATGATCTATTATCTGTCCGTCCATC
TATTTATCTATTGTGTCTGGGTGTTTCGCTTGTACTTATCAATAATGTGCTCTCTCTAAG
ACTGAAGAGATCTAAATATGTAAGTTTGTAATAATTATACACGATGTCTAGCGTGTTACG
TCCGTTTGAAGTTGTGAAAGTTGTAAACCGAATAAGTTGTGTGATGCAACGTGTTCTCTT
CCCAGATCTTAAATTAAGTCCCACAATTCCTCTCAAAGAAA

QA 4 704 4 704
DS 



AS 1 11

CO CL159Contig1 719 11 12 U
GGGTAAAATAAAAGTTACTGCGCTGTAGTTATATAGGACCCAAGTAGCAGTAATCACGGT
AGATCAGGTTTTTTACAGTGAGTCCAAGTTTAGAGAGAGAGAAAGAATGTCTCACAGTCA
CGGGAACGCTCCATCGGCGAACGATCCACGTCAGCCATCGGCGGCGAAACCTTACACTCC
GCGGCCTATTGCGCCTGAGGATCTCCCCGTTGACTACTCCGGATTCATCGCCGTTATCCT
CGGCGTCTCTGGCGTTATGTTCAGGTACAAGATATGCTCGTGGCTTGCGCTTATATTCTG
TGCTCAGTCGCTGGCCAATATGAGGAACTTGGAGACTGATTTGAAGCAGATCTCCATGGC
TATGATGTTTGCTATAATGGGAATGGTCACAAACTACTTGGGACCTAATAGACCCGCGAC
AAAGAAATGATTCTCTCAACTGCTCTGCTTTCTTTTTATATTACATCTTTTTTTATAAAA
CCTTGTTTGGTTCCTTGTTTCAGTACTTTTTAAGTTATAAATTGCGACATGGTGAGATTT
GAAGCCTAGCGTTTTGTTTTGGTGAAAACTTGTGTTCGATTCTCATTATTCTTTACGTGT
TATGTGTAACGAACTATAGACCAGAGCTCATGTTATAAGGTTCTCATTTCAGACATAGAG
AGAATTTGAATTCCAACTTTATGTTTTATATCCATTATTTATGATATGAAAAGTTTGAA


BQ
10 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 45 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 0 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 10 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H785TF U -1
AF RS1CB14JQ C 1
AF RS1CB14TF U 1
AF RS1BW11JQ C 69
AF RS1BH06JQ C 2
AF RS1BH06TF U 2
AF RS1CP22TF U 69
AF RS1CJ78TF U 70
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AF RS1G109TF U 70
AF RS1G109JQ C 161
BS 1 1 RS1CB14JQ
BS 2 19 RS1CB14TF
BS 20 20 RS1BH06TF
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BS 674 719 RS1CP22TF

RD RS1H785TF 566 0 0
GGGT
GTAAAATAAAAGTTACTGCGCTGTAGTTATATAGGACCCAAGTAGCAGTAATCACGGTAG
ATCAGGTTTTTTACAGTGAGTCGAAGTTTAGAGAGAGAGAAAGAATGTCTCACAGTCACG
GGAACGCTCCATCGGCGAACGATCCACGTCAGCCATCGGCGGCGAAACCTTACACTCCGC
GGCCTATTGCGCCTGAGGATCTCCCCGTTGACTACTCCGGATTCATCGCTGTTATCCTCG
GCGTCTCTGGCGTTATGTTCAGGTACAAGATATGCTCGTGGCTTGCGCTTATATTCTGTG
CTCAGTCGCTGGCCAATATGAGGAACTTGGAGACTGATTTGAAGCAGATCTCCATGGCTA
TGATGTTTGCTGTAATGGGATTGGTCACAAACTACTTGGGACCTAATAGACCCGCGACTA
AGAAATGATTCTCTCAACTGCTCTGCTTTCTTTTTATATTACATCCTTTTTTATAAAACC
TTGTTTGGTTCCTTGTTTCAGTACTTTTTAAGTTATAAATTGCGACATGGTGAGATTTGA
AGCCTAGCGTTTTGTTTTGGTG

QA 5 566 5 566
DS 

RD RS1CB14JQ 654 0 0
GGGTAAAATAAAAGTTACTACGCTGTAGTTATATAGGACCCAAGTAGCAGTTATCACGGT
AGATCAGGTTTTT*ACAGTGATTCCAAGTTTAGAGAGAGAGAAAGAATGTCTCACAGTCA
CGGGAACGCTCCATCGGCGAACGATCCACGTCAGCCATCGGCGGCGAAACCTTACACTCC
GCGGCCTATTGCGCCTGAGGATCTCCCCGTTGACTACTCCGGATTCATCGCCGTTATCCT
CGGCGTCTCTGGCGTTATGTTCAGGTACAAGATATGCTCGTGGCTTGCGCTTATATTCTG
TGCTCAGTCGCTGGCCAATATGAGGAACTTGGAGACTGATTTGAAGCAGATCTCCATGGC
TATGATGTTTGCTATAATGGGAATGGTCACAAACTACTTGGGACCTAATAGACCCGCGAC
AAAGAAATGATTCTCTCAACTGCTCTGCTTTCTTTTTATATTACATCTTTTTTTATAAAA
CCTTGTTTGGTTCCTTGTTTCAGTACTTTTTAAGTTATAAATTGCGACATGGTGAGATTT
GAAGCCTAGCGTTTTGTTTTGGTGAAAACTTGTGTTCGATTCTCATTATTCTTTACGTGT
TATGTGTAACGAACTATAGACCAGAGCTCATGTTATAAGGTTCTCATTTCAGAC

QA 1 654 1 654
DS 

RD RS1CB14TF 654 0 0
G
GGTAAAATAAAAGTTACTACGCTGTAGTTATATAGGACCCAAGTAGCAGTTATCACGGTA
GATCAGGTTTTT*ACAGTGATTCCAAGTTTAGAGAGAGAGAAAGAATGTCTCACAGTCAC
GGGAACGCTCCATCGGCGAACGATCCACGTCAGCCATCGGCGGCGAAACCTTACACTCCG
CGGCCTATTGCGCCTGAGGATCTCCCCGTTGACTACTCCGGATTCATCGCCGTTATCCTC
GGCGTCTCTGGCGTTATGTTCAGGTACAAGATATGCTCGTGGCTTGCGCTTATATTCTGT
GCTCAGTCGCTGGCCAATATGAGGAACTTGGAGACTGATTTGAAGCAGATCTCCATGGCT
ATGATGTTTGCTATAATGGGAATGGTCACAAACTACTTGGGACCTAATAGACCCGCGACA
AAGAAATGATTCTCTCAACTGCTCTGCTTTCTTTTTATATTACATCTTTTTTTATAAAAC
CTTGTTTGGTTCCTTGTTTCAGTACTTTTTAAGTTATAAATTGCGACATGGTGAGATTTG
AAGCCTAGCGTTTTGTTTTGGTGAAAACTTGTGTTCGATTCTCATTATTCTTTACGTGTT
ATGTGTAACGAACTATAGACCAGAGCTCATGTTATAAGGTTCTCATTTCAGAC

QA 2 654 2 654
DS 

RD RS1BW11JQ 584 0 0
TTTTTTACAGTGAGTCGAAGTTTAGAGAGAGAGAAAGAATGTCTCACAGTCACGGGAACG
CTCCATCGGCGAACGATCCACGTCAGCCATCGGCGGCGAAACCTTACACTCCGCGGCCTA
TTGCGCCTGAGGATCTCCCCGTTGACTACTCCGGATTCATCGCTGTTATCCTCGGCGTCT
CTGGCGTTATGTTCAGGTACAAGATATGCTCGTGGCTTGCGCTTATATTCTGTGCTCAGT
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TTGCTGTAATGGGATTGGTCACAAACTACTTGGGACCTAATAGACCCGCGACAAAGAAAT
GATTCTCTCAACTGCTCTGCTTTCTTTTTATATTACATCTTTTTTTATAAAACCTTGTTT
GGTTCCTTGTTTCAGTACTTTTTAAGTTATAAATTGCGACATGGTGAGATTTGAAGCCTA
GCGTTTTGTTTTGGTGAAAACTTGTGTTCGATTCTCATTGTTCTTTACGTGTTTTGTGTA
ACGAACTATAGACCAGAGCTCATGTTATAAGGTTCTCATTTCAG

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CGGCCTATTGCGCCTGAGGATCTCCCCGTTGACTACTCCGGATTCATCGCTGTTATCCTC
GGCGTTTCTGGCGTTATGTTCAGGTACAAGATATGCTCGTGGCTTGCGCTTATATTCTGT
GCTCAGTCGCTGGCCAATATGAGGAACTTGGAGACTGATTTGAAGCAGATCTCCATGGCT
ATGATGTTTGCTGTAATGGGATTGGTCACAAACTACTTGAGACCTAATAGACCCGCGACA
AAGAAATGATTCTCTCAACTGCTCTGCTTTCTTTTTATATTACATCTTTTTTTATAAAAC
CTTGTTTGGTTCCTTGTTTCAGTACTTTTTAAGTTATAAATTGCGACATGGTGAGATTTG
AAGCCTAGCGTTTTGTTTTGGTGAAAACTTGTGTTCGATTCTCATTGTTCTTTACGTGTT
TTGTGTAACGAACTATAGACCAGGGCTCATGTTATAAGGTTCTCATTTCAGACATAGAGA
GAATTTGAATTC

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DS 

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GATCAGGTTTTTTACAGTGAGTCGAAGTTTAGAGAGAGAGAAAGAATGTCTCACAGTCAC
GGGAACGCTCCATCGGCGAACGATCCACGTCAGCCATCGGCGGCGAAACCTTACACTCCG
CGGCCTATTGCGCCTGAGGATCTCCCCGTTGACTACTCCGGATTCATCGCTGTTATCCTC
GGCGTCTCTGGCGTTATGTTCAGGTACAAGATATGCTCGTGGCTTGCGCTTATATTCTGT
GCTCAGTCGCTGGCCAATATGAGGAACTTGGAGACTGATTTGAAGCAGATCTCCATGGCT
ATGATGTTTGCTGTAATGGGATTGGTCACAAACTACTTGAGACCTAATAGACCCGCGACA
AAGAAATGATTCTCTCAACTGCTCTGCTTTCTTTTTATATTACATCTTTTTTTATAAAAC
CTTGTTTGGTTCCTTGTTTCAGTACTTTTTAAGTTATAAATTGCGACATGGTGAGATTTG
AAGCCTAGCGTTTTGTTTTGGTGAAAACTTGTGTTCGATTCTCATTGTTCTTTACGTGTT
TTGTGTAACGAACTATAGACCAGGGCTCATGTTATAAGGTTCTCATTTCAGACATAGAGA
GAATTTGAATTC

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DS 

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CTCCATCGGCGAACGATCCACGTCAGCCATCGGCGGCGAAACCTTACACTCCGCGGCCTA
TTGCGCCTGAGGATCTCCCCGTTGACTACTCCGGATTCATCGCTGTTATCCTCGGCGTCT
CTGGCGTTATGTTCAGGTACAAGATATGCTCGTGGCTTGCGCTTATATTCTGTGCTCAGT
CGCTGGCCAATGTGAGGAACTTGGAGACTGATTTGAAGCAGATCTCCATGGCTATGATGT
TTGCTGTAATGGGATTGGTCACAAACTACTTGGGACCTAATAGACCCGCGACAAAGAAAT
GATTCTCTCAACTGCTCTGCTTTCTTTTTATATTACATC*TTTTTTATAAAACCTTGTTT
GGTTCCTTGTTTCAGTACTTTTTAAGTTATAAATTGCGACATGGTGAGATTTGAAGCCTA
GCGTTTTGTTTTGGTGAAAACTTGTGTTCGATTCTCATTGTTCTTTACGTGTTTTGTGTA
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CGTTTTGTTTTGGTGAAAACTTGTGTTCGATTCTCATTATTCTTTACGTGTTATGTGCAA
CGAACTATAGACCAGAGCTCATGTTATAAGGTTCTCATTTCAGACATAGAGAGAATTTGA
ATTCCAACTTTATGTTTTATATCCATTATTTATG
A

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DS 

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TCCATCGGCGAACGATCCACGTCAGCCATCGGCGGCGAAACCTTACACTCCGCGGCCTAT
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TGGCGTTATGTTCAGGTACAAGATATGCTCGTGGCTTGCGCTTATATTCTGTGCTCAGTC
GCTGGCCAATATGAGGAACTTGGAGACTGATTTGAAGCAGATCTCCATGGCTATGATGTT
TGCTATAATGGGAATGGTCACAAACTACTTGGGACCTAATAGACCCGCGACAAAGAAATG
ATTCTCTCAACTGCTCTGCTTTCTTTTTATATTACATCTTTTTTTATAAAACCTTGTTTG
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CGTTTTGTTTTGGTGAAAACTTGTGTTCGATTCTCATTATTCTTTACGTGTTATGTGCAA
CGAACTATAGACCAGAGCTCATGTTATAAGGTTCTCATTTCAGACATAGAGAGAATTTGA
ATTCCAACTTTATGTTTTATATCCATTATTTATG

QA 1 634 1 634
DS 

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TCCATCGGCGAACGATCCACGTCAGCCATCGGCGGCGAAACCTTACACTCCGCGGCCTAT
TGCGCCTGAGGATCTCCCCGTTGACTACTCCGGATTCATCGCCGTTATCCTCGGCGTCTC
TGGCGTTATGTTCAGGTACAAGATATGCTCGTGGCTTGTGCTTATATTCTGTGCTCAGTC
GCTGACCAATATGAGGAACTTGGAGACTGATTTGAAGCAGATCTCCATGGCTATGATGTT
TGCTATAATGGGAATGGTCACAAACTACTTGGGACCTAATAGACCCGCGACAAAGAAATG
ATTCTCTCAACTGCTCTGCTTTCTTTTTATATTACATCTTTTTTTATAAAACCTTGTTTG
GTTCCTTGTTTCAGTACTTTTTAAGTTATAAATTGCGACATGGTGAGATTTGAAGCCTAG
CGTTTTGTTTTGGTGAAAACTTGTGTTCGATTCTCATTATTCTTTACGTGTTATGTGTAA
CGAACTATAGACCAGAGCTCATGTTATAAGGTTCTCATTTCAGACATAGAGAGAATTTGA
ATT
TCAAAAAA

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TGGCTTGTGCTTATATTCTGTGCTCAGTCGCTGACCAATATGAGGAACTTGGAGACTGAT
TTGAAGCAGATCTCCATGGCTATGATGTTTGCTATAATGGGAATGGTCACAAACTACTTG
GGACCTAATAGACCCGCGACAAAGAAATGATTCTCTCAACTGCTCTGCTTTCTTTTTATA
TTACATCTTTTTTTATAAAACCTTGTTTGGTTCCTTGTTTCAGTACTTTTTAAGTTATAA
ATTGCGACATGGTGAGATTTGAAGCCTAGCGTTTTGTTTTGGTGAAAACTTGTGTTCGAT
TCTCATTATTCTTTACGTGTTATGTGTAACGAACTATAGACCAGAGCTCATGTTATAAGG
TTCTCATTTCAGACATAGAGAGAATTTGAATT
TC

QA 1 512 1 512
DS 



AS 3 11

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AAAATGTAACTGTATGCCAAACCTTTAGATGGACAGTTTAAGGACATGAAACTTTTAAAG
AGAGGATGACAGACCACGAATATCAACATAACCAGATAACACGGCCTTGTTCCTTTCCTT
CACTTTCGTCTGATATATCACCCTCAAGCCTTGGAGCCACAATTCGGTTATCAAAGTTTC
ACCAGGGAAAACACTCGCGAGGAATCTTCCGGATATGGTTTTGACAGCAGCTGGGTCACC
CTTGCATATACACTTGATGATTGCCTTTATTGCAAACCCGAGCGTACAAAGTCCATGCAA
TATCGGGCGTGGGAATCCGGCAAGTTTTGCAACGTTTGGATCAAAATGCAAAGGATTATA
GTCACCAAAAAGCCTATAGAGCAATGCCTGTGATGGTTGGGTGCGCTCTTCCAACACTGC
AAACGGTTGTGTTTGGGGGATTTTCACAGCTAAGCCCTGGTTACTTGGATAGTTTTTGTA
AGAAAATGGCGGAAATGAGTTTGAGAAACCACCAGCTCCTCGTAAGAAAACAGTCGTCCT
ACGGAGTAAAGTCCCAAATGAGTTGACGAGTTCCGAAGCTAAAACTCCCAGAGAAAAAAT
TAGTACTTACAGAGAGACATTACCGATTCATGCATAACAGTTCCTCTGAATCTTTCTCGT
AACTTCTGGTTTCTATTTCAAGGATAGCTGCTTTACCTATAAGATCGTATTATTTTTTTC
AAAAGCCTTAAAATCTACTATTCTCAATGCTGAATGTAGCTCATTTTCTCTTTTAAGTTG
GGCGAAGTAAAAGGTGTCACACAAACACACAACAGTAGTGAAAAGTACCTTTATCCTGCA
GTCCAGCTAGGCTTACTTTGTTAATTAAAGAAGCCTTGGAAGGTAATGGCCTGTAAACTT
CAATGTACTGCTGTCCATGCAACAGGAGACTAGGATCATACTTAAAAACTGACAAGTCCA
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GTTCCTGGCCATTCTCGTGATAGACAAACTTGAGCTCATCGGAATCAACAGCATCTTGGC
CACAAGCTCCTACTCCCAAAGCATAGATTGCTACATCTCTTTCGTTGTAGGTGTAACACG
TCTCGGGAAGCTTGTGAGCGAGAAGGAGATCGGGGTTGAATTCAGAATCGCTACTCGCCA
TCTTTCTCCGATATCAGGATCAGCGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DT90JQ U 3
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AF RS1DL46TF C 636
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GTTTGAGAAACCACCAGCTCCTCGTAA

QA 17 583 17 583
DS 

RD RS1DL46JQ 775 0 0
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AGAGGATGACAGACCACGAATATCAACATAACCAGATAACACGGCCTTGTTCCTTTCCTT
CACTTTCGTCTGATATATCACCCTCAAGCCTTGGAGCCACAATTCGGTTATCAGAGTTTC
ACCAGGGAAAACACTCGCGAGGAATCTTCCGGATATGGTTTTGACAGCAGTTGGGTCACC
CTTGCATATACACTTGATGATTGCCTTTATTGCAAACCCGAGCGTACAAAGTCCATGCAA
TATCGGGCGTGGGAATCCGGCAAGTTTTGCAACGTTTGGATCAGGATGCAAAGGATTATA
GTCACCAGAGAGCCTATAGAGCAATGCCTGTGATGGTTGGGTGCGCTCTTCCAACACTGC
AAACGGTTGTGTTTGGGGGATTTTCACAGCTAAGCCCTGGTTACTTGGATAGTTTTTGTA
AGAAAATGGCGGAGATGATTTTGAGAAACCACCAGCTCCTCGTAAGAAAACAGTCGTCCT
ACGGAGTAAAGTCCCAAATGAGTTGACGAGTTCCGAAGCTAAAACTCCCAGAGAAAAAAT
TAGTACTTACAGAGAGACATTACCGATTCATGCATAACAGTTCCTCTGAATCTTTCTCGT
AACTTCTGGTTTCTATTTCAAGGATAGCTGCTTTACCTATAAGATCGTATTATTT

QA 1 775 1 775
DS 

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AAGCTAAAACTCCCAGAGAAAAAATTAGTACTTACAGAGAGACATTACCGATTCATGCAT
AACAGTTCCTCTGAATCTTTCTCGTAACTTCTGGTTTCTATTTCAAGGATAGCTGCTTTA
CCTATAAGATCGTATTATTTTTTTCAAAAGCCTTAAAATCTACTATTCTCAATGCTGAAT
GTAGCTCATTTTCTCTTTTAAGTTGGGCGAAGTAAAAGGTGTCACACAAACACACAACAG
TAGTGAAAAGTACCTTTATCCTGCAGTCCAGCTAGGCTTACTTTGTTAATTAAAGAAGCC
TTGGAAGGTAATGGCCTGTAAACTTCAATGTACTGCTGTCCATGCAACAGGAGACTAGGA
TCATACTTAAAAACTGACAAGTCCAGTCCATTCGACAGAGACCCAAGTGTTAACAGCGAA
GCAAAAGTTGGTAGAACCTGGATATGTTCCTGGCCATTCTCGTGATAGACAAACTTGAGC
TCATCGGAATCAACAGCATCTTGGCCACAAGCTCCTACTCCCAAAGCATAGATTGCTACA
TCTCTTTCGTTGTAGGTGTAACACGTCTCGGGAAGCTTGTGAGCGAGAAGGAGATCGGGG
TTGAATTCAGAATCGCTACTCGCCATCTTTCTCCGATATCAGGATCAGCGTTTCC

QA 1 655 1 655
DS 



CO CL160Contig2 768 3 15 U
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ACGGTGATCCTGATATCTGAGAAAGATGGCGAGTAGCGATTCTGAATTCAACCCCGATCT
CCTTCTCGCTCACAAGCTTCCAGAGACGTTTTACACCTACAACGAAAGAGATGTAGCAAT
ATATGCTTTGGGAGTAGGAGCTTGTGGCCAAGATGCTGTTGATTCCCATGAGCTCAAGTT
TGTCTATCACGAGAATGGCCAGGAACATATCCAGGTTCTACCAACTTTTGCTTCGCTGTT
AACACTTGGGTCTCTGTCGAATGGACTGGACTTGCCAGGTTTTAAGTATGATCCTAGTCT
CCTGTTGCATGGACAGCAGTACATTGAAGTTTACAGGCCATTACCTTCCAAGGCTTCTTT
AATTAACAAAGTAAGCCTAGCTGGACTGCAGGATAAAGGTAAAGCAGCTATCCTTGAAAT
AGAAACCAGAAGTTACGAAAAAGGTTCAGAGGAACTGTTATGCATGAATCGGACGACTGT
TTTCTTACGAGGAGCTGGTGGTTTCTCAAACTCATCTCAGCCATTCTCTTACAAAAACTA
TCCAAGCAACCAGGGCTTAGCTGTGAAAATCCCCCAAACACAACCCTCCGCAGTGTGCGA
AGAGCGCACCCAACCATCACAGCATTGCTCTATAGCTCTCTGGTGACTATAATCCTTTGC
ATCTGATCCAAACGTTGCAAACTTGCCGATTCCACGCCCGATATTGCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 0 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AY43TF U 257
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AF RS1DT90TF U 1
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C

QA 1 181 1 181
DS 

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G
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AACTTTTGCTTCGCTGTTAACACTTGGGTCTCTGTCAAATGGACTGGACTTGCCAGGTTT
TAAGTATGATCCTAGTCTCCTGTTGCATGGACAGCAGTACATTGAAGTTTACAGGCCATT
ACCTTCCAAGGCTTCTTTAATTAACAAAGTAAGCCTAGCTGGACTGCAGGATAAAGGTAA
AGCAGCTATCCTTGAAATAGAGACCAGAAGTTACGAAAAAGGTTCAGAGGAACTGTTATG
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ATTCTCTTACAAAAACTATCCAAGTAACCAGGGCTTAGCTGTGAAAATCCCCCAAACACA
ACCCTCCGCTGTGTGCGAAGAGCGCACCCAACCATCA

QA 2 638 2 638
DS 

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CCTTCTCGCTCACAAGCTTCCAGAGACGTTTTACACCTACAACGAAAGAGATGTAGCAAT
ATATGCTTTGGGAGTAGGAGCTTGTGGCCAAGATGCTGTTGATTCCCATGAGCTCAAGTT
TGTCTATCACGAGAATGGCCAGGAACATATCCAGGTTCTACCAACTTTTGCTTCGCTGTT
AACACTTGGGTCTCTGTCGAATGGACTGGACTTGCCAGGTTTTAAGTATGATCCTAGTCT
CCTGTTGCATGGACAGCAGTACATTGAAGTATACAGGCCATTACCTTCCAAGGCTTCTTT
AATTAACAAAGTAAGCCTAGCTGGACTGCAGGATAAAGGTAAAGCAGCTATCCTTGAAAT
AGAAACCAGAAGTTACGAGCAAGGTTCAGAGGAACTGTTATGCATGAATCGGACGACTGT
TTTCTTACGAGGAGCTGGTGGTTTCTCAAACTCATCTCAGCCATTTTCTTACAAAAACTA
TCCAAGCAACCAGGGCTTAGCTGTGAAAATCCCCCAAACACAACCGTCTGCAGTGTTGGA
AGAGCGCACCCAACCATCACAGCATTGCTCTATAGCTCTCTGGTGACTATAATCCTTTGC
ATCTGATCCAAACGTTGCAAACTTGCCGATTCCACGCCCGATATTGCA

QA 1 768 1 768
DS 



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AGAGGATGACAGACCACGAATATCAACATAACCAGATAACACGGCCTTGTTCCTTTCCTT
CACTTTCGTCTGATATATCACCCTCAAGCCTTGGAGCCACATTTCGGTTATCAGAGTTTC
ACCAGGGAAAACAGTCGCGAGGAATCTTCCAGATATGGTTTTGACAGCAGTTGGGTCACC
CTTGCATATACACTTGATGATTGCCTTTATTGCAAACCCGAGCGTACAAAGTCCATGCAA
TATCGGGCGTGGGAATCCGGCAAGTTTTGCAACGTTTGGATCAGAATGCAAAGGATTATA
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GGAGGGTTGTGTTTGGGGGATTTTCACAGCTAAGCCCTGGTTACTTGGATAGTTTTTGTA
AGAAAATGGCTGAGATGAGTTTGAGAAACCACCAGCTCCTCGTAAGAAAACAGTAGTCCG
ATTCATGCATAACAGTTCCTCTGAACCTTTCTCGTAACTTCTGGTTTCTATTTCAAGGAT
AGCTGCTTTACCTTTATCCTGCAGTCCAGCTAGGCTTACTTTGTTAATTAAAGAAGCCTT
GGAAGGTAATGGCCTGTAAACTTCAATGTACTGCTGTCCATGCAACAGGAGACTAGGATC
ATACTTAAAACCTGGCAAGTCCAGTCCATTCGACAGAGACCCAAGTGTTAACAGCGAAGC
AAAAGTTGGTAGAACCCGGATATGTTCCTGGCCATTCTCGTGATAGACAAACTTGAGCTC
ATCGGAATCAACAGCATCTTGGCCACAAGCTCCTACTCCCAAAGCATAGATTGCTACATC
TCTTTCGTTGTAGGTGTAAAACGTCTCGGGAAGCTTGTGAGCGAGAAGGAGATCGGGGTT
GAATTCAGAATCGCTACTCGCCATCTTTCTCCGATATCAGGATCAGCGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 20 35 35 
5 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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AF RS1B935JQ U 7
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BS 702 772 RS1B935JQ
BS 773 856 RS1C766TF
BS 857 857 RS1B935TF
BS 858 948 RS1C766TF
BS 949 949 RS1B935TF
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BS 980 980 RS1B935TF
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RD RS1E246JQ 701 0 0
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AAAATGTAACTGTATGCCAGACCTTTAGATGGACAGTTTAAGGACATGAAACTTTTAAAG
AGAGGATGACAGACCACGAATATCAACATAACCAGATAACACGGCCTTGTTCCTTTCCTT
CACTTTCGTCTGATATATCACCCTCAAGCCTTGGAGCCACATTCCGGTTATCAGAGTTTC
ACCAGGGAAAACAGTCGCGAGGAATCTTCCAGATATGGTTTTGACAGCAGTTGGGTCACC
CTTGCATATACACTTGATGATTGCCTTTATTGCAAACCCGAGCGTACAAAGTCCATGCAA
TATCGGGCGTGGGAATCCGGCAAGTTTTGCAACGTTTGGATCAGAACGCAAAGGATTATA
GTCACCAGAGAGCCTATAGAGCAATGCCTGTGATGGTTGGGTGCGCTCTTCGCACACAGC
GGAGGGTTGTGTTTGGGGGATTTTCACAGCTAAGCCCTGGTTACTTGGATAGTTTTTGTA
AGAGAATGGCTGAGATGAGTTTGAGAAACCACCAGCTCCTCGTAAGAAAACAGTCGTCCG
ATTCATGCATAACAGTTCCTCTGAACCTTTTTCGTAACTTCTGGTCTCTATTTCAAGGAT
AGCTGCTTTACCTTTATCCTGCAGTCCAGCTAGGCTTACTT

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DS 

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ATGG
AACTGTATGCCAGACCTTTAGATGGACAGTTTAAGGACATGAAACTTTTAAAGAGAGGAT
GACAGACCACGAATATCAACATAACCAGATAACACGGCCTTGTTCCTTTCCTTCACTTTC
GTCTGATATATCACCCTCAAGCCTTGGAGCCACAATTCGGTTATCAGAGTTTCACCAGGG
AAAACACTCGCGAGGAATCTTCCGGATATGGTTTTGACAGCAGTTGGGTCACCCTTGCAT
ATACACTTGATGATTGCCTTTATTGCAAACCCGAGCGTACAAAGTCCATGCAATATCGGG
CGTGGGAATACGGCAAGTTTTGCAACGTTTGGATCAGAATGCAAAGGATTATAGTCACCA
GAGAGCCTATAGAGCAATGCCTGTGATGGTTGGGTGCGCTCTTCCAACACTGCAGACGGT
TGTGTTTGGGGGATTTTCACAGCTAAGCCCTGGTTACTTGGATAGTTTTTGTAAGAAAAT
GGCGGAGATGATTTTGAGAAACCACCAGCTCCTCGTAAGAAAACAGTCGTCCGATTCATG
CATAACAGTTCCTCTGAATCTTTCTCGTAACTTCTGGTTTCTATTTCAAGGATAGCTGCT
TTACCTTTATCCTG

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DS 

RD RS1B935JQ 766 0 0
GAAACGGAGGGAA
ATTATTTATGGCTGTTTCCAACAAGCAAACGTCAAGAGTCTAAAATGTAACTGTATGCCA
GACCTTTAGATGGACAGTTTAAGGACATGAAACTTTTAAAGAGAGGATGACAGACCACGA
ATATCAACATAACCAGATAACACGGCCTTGTTCCTTTCCTTCACTTTCGTCTGATATACC
ACCCTCAAGCCTTGGAGCCACATTTCGGTTATCAGAGTTTCACCAGGGAAAACAGTCGCG
AGGAATCTTCCAGATATGGTTTTGACAGCAGTTGGGTCACCCTTGCATATACACTTGATG
ATTGCCTTTATTGCAAACCCGAGCGTACAAAGTCCATGCAATATCGGGCGTGGGAATCCG
GCAAGTTTTGCAACGTTTGGATCAGAATGCAAAGGATTATAGTCACCAGAAAGCCTATAG
AGCAATGCCTGTGATGGTTGGGTGCGCTCTTCGCACACAGCGGAGGGTTGTGTTTGGGGG
ATTTTCACAGCTAAGCCCTGGTTACTTGGATAGTTTTTGTAAGAAAATGGCTGAAATGAG
TTTGAGAAACCACCAGCTCCTCGTAAGAAAACAGTAGTCCGATTCATGCATAACAGTTCC
TCTGAACCTTTCTCGTAACTTCTGGTTTCTATTTCAAGGATAGCTGCTTTACCTTTATCC
TGCAGTCCAGCTAGGCTTACTTTGTTAATTAAAGAAGCCTTGGAAGGTAATGGCCTGTAA
ACTTCAATGTACTGCTGTCCATGCAACAGGAGA

QA 14 766 14 766
DS 

RD RS1B935TF 632 0 0
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TAGAGCAATGCCTGTGATGGTTGGGTGCGCTCTTCGCACACAGCGGAGGGTTGTGTTTGG
GGGATTTTCACAGCTAAGCCCTGGTTACTTGGATAGTTTTTGTAAGAAAATGGCTGAGAT
GAGTTTGAGAAACCACCAGCTCCTCGTAAGAAAACAGTAGTCCGATTCATGCATAACAGT
TCCTCTGAACCTTTCTCGTAACTTCTGGTTTCTATTTCAAGGATAGCTGCTTTACCTTTA
TCCTGCAGTCCAGCTAGGCTTACTTTGTTAATTAAAGAAGCCTTGGAAGGTAATGGCCTG
TAAACTTCAATGTACTGCTGTCCATGCAACAGGAGACTAGGATCATACTTAAAACCTGGC
AAGTCCAGTCCATTTGACAGAGACCCAAGTGTTAACAGCGAAGCAAAAGTTGGTAGAACC
CGGATATGTTCCTGTCCATTCTCGTGATAGACAAACTTGAGCTCATCGGAATCAACAGCA
TCTTGGTCACAAGCTCCTACTCCCAAAGCATAGATTGCTACATCTCTTTCGTTGTAGGTG
TAAAACGTCTCTGGAAGCTTGTGAGCGAGAAG

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1C766TF 731 0 0
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TCAGAATGCAAAGGATTATAGTCACCAGAGAGCCTATAGAGTAATGCCTGTGATGGTTGG
GTGCGCTCTTCGCACACAGCTGAGGGTTGTGTTTGGGGGATTTTCACAGCTAAGCCCTGG
TTACTTGGATAGTTTTTGTAAGAAAAGGGCTGAGATGAGTTTGAGAAACCACCAGCTCCT
CGTAAGAAAACAGTGGTCCGATTCATGCATAGCAGTTCATCTGAACCTTTCTCGTAACTT
CTGGTTTCTATTTCAAGGATAGCTGCTTTACCTTTATCCTGCAGTCCAGCTAGGCTTACT
TTGTTAACTAAAGAAGCCTTGGAAGGTAACGGCCTGTAAACTTCAATGTACTGCTGTCCA
TGCAACAGGAGACTAGGATCATACTTAAAACCTGGCAAGTCCAGTCCATTCGACAGAGAC
CCAAGTGTTAACAGCGAAGCAAAAGTTGGTAGAACCTGGATATGTTCCTGGCCATTCTCG
TGATAGACAAACTTGAGCTCATCGGAATCAACAGCATCTTGGCCACAAGCTCCTACTCCC
AAAGCATATATTGCTACATCTCTTTCGTTGTAGGTGTAACACGTCTCGGGAAGCTTGTGA
GCGAGAAGGAGATCGGGGTTGAATTCAGAATCGCTACTCGCCATCTTTCTCCGATATCAG
GATCAGCGTTC

QA 1 731 1 731
DS 



AS 2 9

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GGAGGTAAAATTGAAGAGGGTGTTGGTTCGTGAGGTGTGGTAGTAAGTAGATCTGAGGGG
GTTGGATTTTTAAGAAATGAGCGCATCAAGGTTCATAAAGTGCGTGACCGTCGGTGACGG
AGCAGTGGGCAAAACCTGTCTCCTCATCTCTTACACCAGCAACACTTTCCCTACGGATTA
TGTTCCCACCGTTTTCGATAACTTTAGCGCTAATGTTGTTGTTAACGGAGCCACTATCAA
CCTTGGCTTGTGGGATACCGCTGGGCAGGAGGATTATAACAGATTGAGACCCTTGAGTTA
CCGCGGTGCTGACGTTTTCATCTTAGCCTTCTCTCTTATCAGTAAGGCTAGTTATGAGAA
CGTCTCCAAGAAGTGGATCCCAGAGCTGACCCACTATGCCCCTGGTGTCCCTATTGTTCT
TGTTGGAACCAAACTAGATCTTAGGGATGACAAACAGTTCTTCGTTGACCACCCTGGTGC
TGTACCTATTACCACTGTGCAGGGAGAGGAATTAATGAAGCTAATTGGAGCTCCTTCCTA
CATTGAGTGCAGTTCAAAGTCACAGCAGAACGTGAAGGGGGTGTTTGATGCAGCGATCAG
AGTGGTACTTCAACCTCCAAAGCAGAAGAAAAAGAAGAGCAAAGCACAAAAGGCCTGCTC
CATTTTGTGATTTCTCTGCTTCTCTTGTCTCTCTCTTTCCACTCTCTAGTGAAGGCTTAA
GAAGAAGAAACACATTGGGCTTAAAAGACGGTTCGTTGTGATAAGTTCCTTTAATCCGTA
GAAAACGATTACTTCTGGTTTTTACTGATAAAATAGTTTCCAGCTTTAGCTGAGAGCTAA
TATTGCACTACCACTACTTGTCTCTTTGTCTTTATCTCTACTCTTCCTCCCATTTCGTTC
AGTAACAAAAGTTGACACTAAAACGGCAACACTATTGTATAATGCATGTTACATGAGTGA
CGAGTGGACTCATTTTTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DE46TF U 1
AF RS1DE46JQ C 120
AF RS1BJ39TF U 181
AF RS1BJ39JQ C 246
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RD RS1DE46TF 715 0 0
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GTTGGATTTTTAAGAAATGAGCGCATCAAGGTTCATAAAGTGCGTGACCGTCGGTGACGG
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TGTTCCCACCGTTTTCGATAACTTTAGCGCTAATGTTGTTGTTAACGGAGCCACTATCAA
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TGTTGGAACCAAACTAGATCTTAGGGATGACAAACAGTTCTTCGTTGACCACCCTGGTGC
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CATTTTGTGATTTCTCTGCTTCTCTTGTCTCTCTCTTTCCACTCTCTAGTGAAG
C

QA 1 714 1 714
DS 

RD RS1DE46JQ 730 0 0
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ATGTTCCCACCGTTTTCGATAACTTTAGCGCTAATGTTGTTGTTAACGGAGCCACTATCA
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ACCGCGGTGCTGACGTTTTCATTTTAGCCTTTTTTTTTATCAGTAAGGCTAGTTATGAGA
ACGTTTCCAAGAAGTGGATCCCAGAGCTGACCCACTATGCCCCTGGTGTCCCTATTGTTT
TTGTTGGAACCAAACTAGATTTTAGGGATGACAAACAGTTTTTCGTTGACCACCCTGGTG
CTGTACCTATTACCACTGTGCAGGGAGAGGAATTAATGAAGCTAATTGGAGCTCCTTTTT
ACATTGAGTGCAGTTCAAAGTCACAGCAGAACGTGAAGGGGGTGTTTGATGCAGCGATCA
GAGTGGTACTTCAACCTCCAAAGCAGAAGAAAAAGAAGAGCAAAGCACAAAAGGCCTGCT
CCATTTTGTGATTTTTTTGCTTTTCTTGTCTCTCTCTTTCCACTCTTTAGTGAAGGCTTA
AGAAGAAGAAACACATTGGGCTTAAAAGATGGTTCGTTGTGATAAGTTCCTTTAATCCGT
AGAAAACGATTACTTTTGGTTTTTACTGATAAAATAGTTTCCAGCTTTAGCTGAGAGCTA
ATATTGCACT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RS1BJ39TF 702 0 0
G
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CTTGGCTTGTGGGATACCGCTGGGCAGGAGGATTATAACAGATTGAGACCCTTGAGTTAC
CGCGGTGCTGACGTTTTCATCTTAGCCTTCTCTCTTATCAGTAAGGCTAGTTATGAGAAC
GTCTCCAAGAAGTGGATCCCAGAGCTGACCCACTATGCCCCTGGTGTCCCTATTGTTCTT
GTTGGAACCAAACTAGATCTTAGGGATGACAAACAGTTCTTCGTTGACCACCCTGGTGCT
GTACCTATTACCACTGTGCAGGGAGAGGAATTAATGAAGCTAATTGGAGCTCCTTCCTAC
ATTGAGTGCAGTTCAAAGTCACAGCAGAACGTGAAGGGGGTGTTTGATGCAGCGATCAGA
GTGGTACTTCAACCTCCAAAGCAGAAGAAAAAGAAGAGCAAAGCACAAAAGGCCTGCTCC
ATTTTGTGATTTCTCTGCTTCTCTTGTCTCTCTCTTTCCACTCTCTAGTGAAGGCTTAAG
AAGAAGAAACACATTGGGCTTAAAAGACGGTTCGTTGTGATAAGTTCCTTTAATCCGTAG
AAAACGATTACTTCTGGTTTTTACTGATAAAATAGTTTCCAGCTTTAGCTGAGAGCTAAT
ATTGCACTACCACTACTTGTCTCTTTGTCTTTATCTCTACT

QA 2 702 2 702
DS 

RD RS1BJ39JQ 735 0 0
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GTGCTGACGTTTTCATCTTAGCCTTCTCTCTTATCAGTAAGGCTAGTTATGAGAACGTCT
CCAAGAAGTGGATCCCAGAGCTGACCCACTATGCCCCTGGTGTCCCTATTGTTCTTGTTG
GAACCAAACTAGATCTTAGGGATGACAAACAGTTCTTCGTTGACCACCCTGGTGCTGTAC
CTATTACCACTGTGCAGGGAGAGGAATTAATGAAGCTAATTGGAGCTCCTTCCTACATTG
AGTGCAGTTCAAAGTCACAGCAGAACGTGAAGGGGGTGTTTGATGCAGCGATCAGAGTGG
TACTTCAACCTCCAAAGCAGAAGAAAAAGAAGAGCAAAGCACAAAAGGCCTGCTCCATTT
TGTGATTTCTCTGCTTCTCTTGTCTCTCTCTTTCCACTCTCTAGTGAAGGCTTAAGAAGA
AGAAACACATTGGGCTTAAAAGACGGTTCGTTGTGATAAGTTCCTTTAATCCGTAGAAAA
CGATTACTTCTGGTTTTTACTGATAAAATAGTTTCCAGCTTTAGCTGAGAGCTAATATTG
CACTACCACTACTTGTCTCTTTGTCTTTATCTCTACTCTTCCTCCCATTTCGTTCAGTAA
CAAAAGTTGACACTAAAACGGCAACACTATTGTATAATGCATGTTACATGAGTGACGAGT
GGACTCATTTTTGGT

QA 1 735 1 735
DS 



CO CL161Contig2 1001 5 10 U
GGACACACTTGTTCTCTCATTCTCTCACATTTCCAACTTCGCTTAGAGTTTCCTATTCTA
AACATCATCTTTCCTAGGGTTCTTTTTTGCGCCGAATGATTGAAATGGGGAGCAGGGAGA
CACTTTGTTTCGATTGAGGACGATCTTGTTGTTGTTGTTGTTGTGTTCCTCAGGTGTAGA
AGATCTGAGGTTTTGATACTTCGGAGGAAAAATGAGCGCTTCGAGGTTCATAAAGTGTGT
TACCGTCGGTGACGGAGCAGTGGGTAAAACCTGCTTGCTCATTTCTTACACTAGCAACAC
TTTCCCTACGGATTATGTTCCGACTGTTTTCGATAACTTTAGCGCTAATGTTGTTGTTAA
CGGAGCCACTGTCAACCTTGGCTTGTGGGATACCGCTGGGCAGGAGGATTATAACAGGTT
AAGACCATTGAGTTACCGTGGTGCTGACGTTTTCATCTTAGCCTTCTCCCTCATCAGTAA
GGCTAGTTATGAGAATGTCTCCAAGAAGTGGATCCCTGAGCTGACTCACTATGCCCCTGG
TGTCCCAATTGTTCTTGTTGGAACCAAACTAGATCTTAGGGATGACAAACAGTTCTTTGT
TGACCACCCTGGTGCTGTACCTATTACCACTGCTCAGGGCGAGGAGCTAATGAAGCTAAT
TGGAGCTCCTTCGTACATCGAGTGCAGTTCAAAATCACAGGAGAACGTGAAAGGGGTGTT
TGATGCAGCGATTAGAGTGGTACTTCAACCTCCAAAGCAGAAGAAAAAGAAGGGAAAAGT
ACAAAAGGCCTGCTCCATTTTGTAATTTCTCTCTTCTTTCTGCCACTCTCTAGTGAAGTG
TTAAGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGACACATTGGTGTTAAA
GATGGTTCAAATTTGGTTGTGATAAAGCTCTCTTAATCCTTGAAAAAGACATGATTACTT
CTGTTTTACTGATAAATTGTTTCCAGCTTTAGCTGAGACTC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GB41TF U 3
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TCATCTTTCCTAGGGTTCTTTTTTGCGCCGAATGATTGAAATGGGGAGCAGGGAGACACT
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CTGAGGTTTTGATACTTCGGAGAAAAAATGAGCGCTTCGAGGTTCATAAAGTGTGTTACC
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CCTACGGATTATGTTCCGACTGTTTTCGATAACTTTAGCGCTAATGTTGTTGTTAACGGA
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AGTTATGAGAATGTCTCCAAGAAGTGGATCCCTGAGCTGACTCACTATGCCCCTGGTGTC
CCAATTGTTCTTGTT

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CATTTCTTACACTAGCAACACTTTCCCTACGGATTATGTTCCGACTGTTTTCGATAACTT
TAGCGCTAATGTTGTTGTTAACGGAGCCACTGTCAACCTTGGCTTGTGGGATACCGCTGG
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AGCCTTCTCCCTCATCAGTAAGGCTAGTTATGAGAATGTCTCCAAGAAGTGGATCCCTGA
GCTGACTCACTATGCCCCTGGTGTCCCAATTGTTCTTGTTGGAACCAAACTAGATCTTAG
GGATGACAAACAGTTCTTTGTTGACCACCCTGGTGCTGTACCTATTACCACTGCTCAGGG
CGAGGAGCTAATGAAGCTAATTGGAGCTCCTTCGTACATCGAGTGCAGTTCAAA
TC

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DS 

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GG
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GTTCTTTTTTGCGCCGAATGATTGAAATGGGGAGCAGGGAGACACTTTGTTTCGATTGAG
GACGATCTTGTTGTTGTTGTTGTTGTGTTCCTCAGGTGTAGAAGATCTGAGGTTTTGATA
CTTCGGAGGAAAAATGAGCGCTTCGAGGTTCATAAAGTGTGTTACCGTCGGTGACGGAGC
AGTGGGTAAAACCTGCTTGCTCATTTCTTACACTAGCAACACTTTCCCTACGGATTATGT
TCCGACTGTTTTCGATAACTTTAGCGCTAATGTTGTTGTTAACGGAGCCACTGTCAACCT
TGGCTTGTGGGATACCGCTGGGCAGGAGGATTATAACAGGTTAAGACCATTGAGTTACCG
TGGTGCTGACGTTTTCATCTTAGCCTTCTCCCTCATCAGTAAGGCTAGTTATGAGAATGT
CTCCAAGAAGTGGATCCCTGAGCTGACTCACTATGCCCCTGGTGTCCCAATTGTTCTTGT
TGGAACCAAACTAGATCTTAGGGATGACAAACAGTTCTTTGTTGACCACCCTGGTGCTGT
ACCTATTACCACTGCTCAGGGCGAGGAGCTAATGAAGCTAATTGGAG

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AACATCATCTTTCCTAGGGTTCTTTTTTGCGCCGAATGATTGAAATTGGGAGCAGGGAGA
CACTTTGTTTCGATTGAGGACGATCTTGTTGTTGTTGTTGTTGTGTTCCTCAGGTGTAGA
AGATCTGAGGTTTTGATACTTCGGAGGAAAAATGAGCGCTTCGAGGTTCATAAAGTGTGT
TACCGTCGGTGACGGAGCAGTGGGTAAAACCTGCTTGCTCATTTCTTACACTAGCAACAC
TTTCCCTACGGATTATGTTCCGACTGTTTTCGATAACTTTAGCGCTAATGTTGTTGTTAA
CGGAGCCACTGTCAACCTTGGCTTGTGGGATACCGCTGGGCAGGAGGATTATAACAGGTT
AAGGCCATTGAGTTACCGTGGTGCTGACGTTTTCATCTTAGCCTTCTCCCTCATCAGTAA
GGCTAGTTATGAGAATGTCTCCAAGAAGTGGATCCCTGAGCTGACTCACTATGCCCCTGG
TGTCCCAATTGTTCTTGTTGGAACCAAACTAGATCTTAGGGATGACAAACAGTTCTTTGT
TGACCACCCTGGTGCTGTACCTATTACCACTGCTCAGG*CGAGGAGCTAATGAAGCTAAT
TGGAGCTCCTTCGTACATCGAGTGCAGTTCAAAATCACAG*AGAACGTGAAAGGGGTGTT
TGATGCAGCGATTAGAGTGGTACT

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DS 

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GTGGGATACCGCTGGGCAGGAGGATTATAACAGGTTAAGACCATTGAGTTACCGTGGTGC
TGACGTTTTCATCTTAGCCTTCTCCCTCATCAGTAAGGCTAGTTATGAGAATGTCTCCAA
GAAGTGGATCCCTGAGCTGACTCACTATGCCCCTGGTGTCCCAATTGTTCTTGTTGGAAC
CAAACTAGATCTTAGGGATGACAAACAGTTCTTTGTTGACCACCCTGGTGCTGTACCTAT
TACCACTGCTCAGGGCGAGGAGCTAATGAAGCTAATTGGAACTCCTTCGTACATCGAGTG
CAGTTCAAAATCACAGGAGAACGTGAAGGGGGTGTTTGATGCAGCGATTAGAGTGGTACT
TCAACCTCCAAAGCAGAAGAAAAAGAAGGGAAAAGTACAAAAGGCCTGCTCCATTTTGTA
ATTTCTCTCTTCTTTCTGCCACTCTCTAGTGAAGTGTTAAGAGGAAGAAGAAGAAGAAGA
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGACACATTGGTGTTAAAGATGGTTCAAATTTGGTTGTGATA
AAGCTCTCTTAATCCTTGAAAAAGACATGATTACTTCTGTTTTACTGATAAATTGTTTCC
AGCTTTAGCTGAGACTC

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 5

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GTGCGGTTGATCGTACAAAGCTAAGATAGAGAGAGAGAAAATGTGGGGAATCTTGAGGCG
AAGAGCCGTCGTTGATGGAGGCTTGTCTCTCAGGAGGACACGATCCGCATTGGTTTCAGC
AAGGAGCTACGCAGCTGGTTCAAAAGAGATGACAGTCAGAGATGCCCTAAATTCTGCAAT
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TCAAGGTGCCTACAAGATAACTAAAGGACTTTTGGAGAAATATGGTCCTGAGAGAGTTTA
TGATACCCCTATTACCGAGGCTGGATTCACTGGAATTGGAGTTGGTGCCGCCTATGCTGG
CTTAAAGCCTGTTGTAGAATTTATGACCTTTAACTTTTCAATGCAGGCAATTGATCATAT
CATTAATTCTGCTGCAAAGTCAAACTACATGTCTGCTGGACAGATAAATGTACCCATCGT
CTTTAGAGGACCCAATGGTGCTGCTGCTGGTGTTGGTGCTCAGCATTCTCAGTGCTATGC
AGCCTGGTACGCCTCAGTTCCTGGTTTGAAAGTTCTCGCTCCATATTCAGCTGAAGATGC
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TCCCATAGGCAAAGCCAAGATTGAACGAGAAGGAAAGGATGTAACAATAGTAACTTTCTC
GAAGATGGTCGGTTTTGCCCTCAAGGCAGCTGAGAAGCTCGCAGAAGAGGGAATAAGTGC
TGAGGTAATAAATCTACGGTCAATCCGTCCGCTAGACAGAGCAACCATCAATGCTTCAGT
GAGAAAAACAAGTAGATTGGTAACAGTTGAAGAAGGTTTCCCTCAGCATGGAGTCTGTGC
AGAAATCTGTGCGTCGGTTGTGGAGGAGAGCTTTTCATACTTGGATGCACCGGTGGAGAG
GATAGCAGGAGCTGATGTACCAATGCCTTATGCAGCTAACCTAGAGAGATTGGCTCTTCC
TCAGGTAGAGGATATCGTTCGAGCAGCCAAGAGAGCTTGTTACAGATCCAAATGAAAAAA
AAATGATCATCGTCAAGAACACATTTTTTCTTTGATCTTTTAAAGGAAAGGAAAATAAGA
AAAAAAAAAGAGAAATTGATGTCTCTTTTGCTACCAAACCACCATTCGTGATTTTTATTT
GATATTTTGCTATTATCT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1CM25TF U 292
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TCAAGGTGCCTACAAGATAACTAAAGGACTTTTGGAGAAATATGGTCCTGAGAGAGTTTA
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GG
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ACAAAGCTAAGATAGAGAGAGAGAAAATGTGGGGAATCTTGAGGCGAAGAGCCGTCGTTG
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CTGGTTCAAAAGAGATGACAGTCAGAGATGCCCTAAATTCTGCAATTGATGAGGAAATGT
CTGCAGATCCTAAAGTATTTGTCATGGGTGAAGAGGTTGGACAATATCAAGGTGCCTACA
AGATAACTAAAGGACTTTTGGAGAAATATGGTCCTGAGAGAGTTTATGATACCCCTATTA
CCGAGGCTGGATTCACTGGAATTGGAGTTGGTGCCGCCTATGCTGGCTTAAAGCCTGTTG
TAGAATTTATGACCTTTAACTTTTCAATGCAGGCAATTGATCATATCATTAATTCTGCTG
CAAAGTCAAACTACATGTCTGCTGGACAGATAAATGTACCCATCGTCTTTAGAGGACCCA
ATGGTGCTGCTGCTGGTGTTGGTGCTCAGCATTCTCAGTGCTATGCAGCCTGGTACGCCT
CAGTTCCTGGTTTGAAAGTTCTCGCTCCATATTCAGCTGA*GATGCTCGTGGTCTTCTTA
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AATCATTTCCAATTT

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DS 

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G
GGACAATATCAAGGTGCCTACAAGATAACTAAAGGACTTTTGGAGAAATATGGTCCTGAG
AGAGTTTATGATACCCCTATTACCGAGGCTGGATTCACTGGAATTGGAGTTGGTGCCGCC
TATGCTGGCTTAAAGCCTGTCGTAGAATTTATGACCTTTAACTTTTCAATGCAGGCAATT
GATCATATCATTAATTCTGCTGCAAAGTCAAACTACATGTCTGCTGGACAGATAAATGTA
CCCATCGTCTTTAGAGGACCCAATGGTGCTGCTGCTGGTGTTGGTGCTCAGCATTCTCAG
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GTCTGTGCAGAA
TCTGTGC

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TAAAGCTGCCATTAGAGACCCTGACCCTGTTGTCTTCCTTGAAAACGAGTTACTATATGG
TGAATCATTTCCAATTTCAGAAGAAGCACTTGATTCAAGTTTCTGTCTTCCCATAGGCAA
AGCCAAGATTGAACGAGAAGGAAAGGATGTAACAATAGTAACTTTTTCGAAGATGGTCGG
TTTTGCCCTCAAGGCAGCTGAGAAGCTCGCAGAAGAGGGAATAAGTGCTGAGGTAATAAA
TCTACGGTCAATCCGTCCGCTAGACAGAGCAACCATCAATGCTTCAGTGAGAAAAACAAG
TAGATTGGTAACAGTTGAAGAAGGTTTCCCTCAGCATGGAGTCTGTGCAGAAATCTGTGC
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TATCGTTCGAGCAGCCAAGAGAGCTTGTTACAGATCC

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DS 

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AGCTGAGAAGCTCGCAGAAGAGGGAATAAGTGCTGAGGTAATAAATTTACGGTCAATCCG
TCCGCTAGACAGAGCAACCATCAATGCTTCAGTGAGAAAAACAAGTAGATTGGTAACAGT
TGAAGAAGGTTTCCCTCAGCATGGAGTCTGTGCAGAAATCTGTGCGTCGGTTGTGGAGGA
GAGCTTTTCATACTTGGATGCACCGGTGGAGAGGATAGCAGGAGCTGATGTACCAATGCC
TTATGCAGCTAACCTAGAGAGATTGGCTCTTCCTCAGGTAGAGGATATCGTTCGAGCAGC
CAAGAGAGCTTGTTACAGATCCAAATGAAAAAAAAATGATCATCGTCAAGAACACATTTT
TTCTTTGATCTTTTAAAGGAAAGGAAAATAAGAAAAAAAAAAGAGAAATTGATGTCTCTT
TTGCTACCAAACCACCATTCGTGATTTTTATTTGATATTTTGCTATTATCT

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DS 



AS 3 10

CO CL163Contig1 939 3 2 U
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GTTTCGAGAAGAAACCAAAGACAAATATAACAAAACATAAACTTTGGAAGTAAAAAAACA
AGCCCCCTTCATAGACGATTCAATTATACAAAAGACTTATAACCCTAAGAGAAGCTAAAC
CATCATCACTTCTTCCTCGTCGAAGCCCTTTTCGCCGGAGACTTCACCTTCGCACTCTTA
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GGAGCAGCCTTCTTCCCTGGAGACGTCCTACTCGAAGTCCTCGAAGCTTTAGCAGGTCTC
TCCTTCGCCTTAGGCTTCGCAGCAACCGCCTTGGTCTTCGAGACAGCAGCTACACTCTTC
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ACTGGTTTCGTCGCCGCAGCCGGTTTAGCAGACGGAATCTTGAAAGAGGCTAGATCCGGT
CCTCTCCTTCAACGTCACGATCGCATCCTTTATCATCTCTTCGTAAGGAGGATGAGACGA
AGTGGTTCTCTTCCTCGGTGCAGCAGCAGCAGCAGGCTTCTTCTTAGCTTCCTTCGTCTT
CTTAGCTTTGGCTTTAGCAGGTTTCTTCTCCGTCGTCGTCACCGTGGCTTCGGCTTCGGC
TTCGGCGTCTCCTGACTCCACGACCTTGGGTTCTTCCTCCGTCGACATCTTTTTAGGGAT
TTGAATTTTTTTTTTTTGTTTTTGTTGGTTTTGAGATCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EM40JQ U 1
AF RS1BY79JQ U 1
AF RS1BY79TF C 232
BS 1 729 RS1BY79JQ
BS 730 939 RS1BY79TF

RD RS1EM40JQ 488 0 0
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TTAGGCTT

QA 1 488 1 488
DS 

RD RS1BY79JQ 729 0 0
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GTTTCGAGAAGAAACCAAAGACAAATATAACAAAACATAAACTTTGGAAGTAAAAAAACA
AGCCCCCTTCATAGACGATTCAATTATACAAAAGACTTATAACCCTAAGAGAAGCTAAAC
CATCATCACTTCTTCCTCGTCGAAGCCCTTTTCGCCGGAGACTTCACCTTCGCACTCTTA
GCCGGAACCTTCTTACTCGCCGCAGCTTTCTTAGCCGCAGGAGCAGCCGCTTTCTTAGCA
GGAGCAGCCTTCTTCCCTGGAGACGTCCTACTCGAAGTCCTCGAAGCTTTAGCAGGTCTC
TCCTTCGCCTTAGGCTTCGCAGCAACCGCCTTGGTCTTCGAGACAGCAGCTACACTCTTC
GTCTTAGGCTTCGCAGTAACTTTCGGCTTCGCAGCAGCTTTAGTTGACGTTGTCTTTGAC
TTAGGCTTAGCAGCAGAAGCAGCAGGTTTCTTGGTTCCTTTAGCAGCTGGTTTGGCCTTA
GCAGGAGCAGCAGCTGCTTTACCCTTCGGTTTAGTAACAGCAGCAGCCGGTTTCTTCTTA
ACTGGTTTCGTCGCCGCAGCCGGTTTAGCAGACGGAATCTTGAAAGAGGCTAGATCCGGT
CCTCTCCTTCAACGTCACGATCGCATCCTTTATCATCTCTTCGTAAGGAGGATGAGACGA
AGTGGTTCT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RS1BY79TF 708 0 0
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TTCTTAGCAGGAGCAGCCTTCTTCCCTGGAGACGTCCTACTCGAAGTCCTCGAAGCTTTA
GCAGGTCTCTCCTTCGCCTTAGGCTTCGCAGCAACCGCCTTGGTCTTCGAGACAGCAGCT
ACACTCTTCGTCTTAGGCTTCGCAGTAACTTTCGGCTTCGCAGCAGCTTTAGTTGACGTT
GTCTTTGACTTAGGCTTAGCAGCAGAAGCAGCAGGTTTCTTGGTTCCTTTAGCAGCTGGT
TTGGCCTTAGCAGGAGCAGCAGCTGCTTTACCCTTCGGTTTAGTAACAGCAGCAGCCGGT
TTCTTCTTAACTGGTTTCGTCGCCGCAGCCGGTTTAGCAGACGGAATCTTGAAAGAGGCT
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QA 1 708 1 708
DS 



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TTTTAGGGATTTGAATTTTTTTTTTTGTTTTTGTTGGTTTTGAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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GA

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DS 

RD RS1BZ52JQ 676 0 0
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ACGAGTCCCCTGA

QA 4 676 4 676
DS 

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CG
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RD RS1GV66TF 765 0 0
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TGGCTTCGGCTTCGGCGTCTCCCGACTCCACGACCTTGGGTTCCTCCGTCGACATCTTTT
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DS 



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GAGATGATAAAGGATGCGATCGTGACGTTGAAGGAGAGGACCGGATCTAGCCAATACGCG
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CTCGTCAATCTCAGGAGACTCGTCGCTTCCGGGAAGCTCGTCAAAGTCAAAGCCTCTTTC
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BQ
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15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AAGCCTGCTGCTGCTGCTGCACCGAGGAAGAGAACCACTTCGTCTCATCCTCCTTACGAA
GAGATGATAAAGGATGCGATCGTGACGTTGAAGGAGAGGACCGGATCTAGCCAATACGCG
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CTCGTCAATCTCAGGAGACTCGTCGCTTCCGGGAAGCTCGTCAAAGTCAAAGCCTCTTTC
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GCTGTTACTAAACCGAAGGGTAAAGCAGCTGCTGCTCCTGCTAAGGCCAAACCAGCTGCT
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AAAGCTGCTGCGAAGCCGAAAGTTACTGCGAAGCCTAAGACGAAGAGTGTAGCTGCTGTC
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DS 

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GCTCCTGCTAAGGCCAAACCAGCTGCTAAAGGAACCAAGAAACCTGCTGCTTCTGCTGCT
AAGCCTAAGGCAAAGACAACGACAACTAAAGCTGCTGCGAAGCCGAAAGTTACTGCGAAG
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GTTCCGGCTAAGAGTGCGAAGGTGAAGTCTCCGGCGAAAAGGGC

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DS 



AS 1 12

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ATCTGTTCTGGTCTGCCCGGATGGGAAGACAATTGAAGCTGAAGCAGCCCATGGAACCGT
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BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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GG
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GAGATGGATGGTGATGAAATGACCCGAGTTATCTGGAAGTCTATCAAGGACAAGCTTATT
ACTCCTTTTGTGGAGTTGGATATCAAGTACTTCGACCTTGGTCTTCCTCACCGTGATGCT
ACCGATGACAAAGTTACTATTGAAAGTGCTGAAGCCACTAAGAAGTATAATGTGGCGATC
AAGTGTGCCACCATCACTCCAGATGAAGGCCGTGTCACGGAATTTGGCTTGAAGCAGATG
TGGAGAAGTCCCAATGGTACCATCAGGAATATTCTGAATGGAACTGTGTTTAGAGGACCA
ATTCTCTGCAAAAACGTTCCTAAGCTTGCCCCAGGCTGGACAAAGCCAATCTGCATTGGA
AGGCATGCTTTTGGTGATCAGTACCGTGCCACTGATGCTGTTATCAGGGGACCAGGAAGA
CTGACTATGACTTTCGAGGGAAAAGATGGGAAAACTGAAACTGAAGTGTTCACATTTACC
GGTGAA

QA 3 668 3 668
DS 

RD RS1FM19TF 760 0 0
GGGCACCTACTCCTCGCACTCACCAAACCAGCGCGATCCGATCCGCATATCTCGCCCGAA
AACCTTGTCTCGTTTTGTAGATCGCCGACGAGGTTGACATACCTTTCTGATCTACTGAAT
CAGTCTTTCTAACG*AAAAAAAACAATGGCGTTTGAGAAGATCAAGGTTGCAAATCCCAT
CGTCGAGATGGATGGTGATGAAATGACCCGAGTTATCTGGAAGTCCATCAAGGACAAGCT
TATTACTCCTTTTGTGGAGTTGGATATCAAGTACTTCGACCTTGGTCTTCCTCACCGTGA
TGCTACCGATGACAAAGTTACTATTGAAAGTGCTGAAGCCACTAAGAAGTATAATGTGGC
GATCAAGTGTGCCACCATCACTCCAGATGAAGGCCGTGTCACGGAATTTGGCTTGAAGCA
GATGTGGAGAAGTCCCAATGGTACCATCAGGAATATTCTGAATGGAACTGTGTTTAGAGA
ACCAATTCTCTGCAAAAACGTTCCTAAGCTTGTCCCAGGCTGGACAAAGCCAATCTGCAT
TGGAAGGCATGCTTTTGGTGATCAGTACCGTGCCACTGATGCTGTTATCAAGGGACCAGG
AAGACTGACTATGACTTTCGAGG*AAAAGATGGGAAAACTGAAACTGAAGTGTT*ACATT
TACCGGTGAAGGCGGTGTTGCTATGGCCATGTACA*CACTGATGAGTCCATCCGTGCTTT
*GCTGACGCATCGATGAACACTGCTTATGAGAAAA
GTGGC

QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1GY64TF 763 0 0
GG
ACCTACTCCTC*CACTCACCAAACCAGCGCGATCCGATCCGCATCTCTCGCCCGAAAACC
TTGTCTCGTTTTGTAGATCGCCGACGAGGTTGACATACCTTTCTGATCTACTGAATCAGT
CTTTCTAACGCAAAAAAAACAATGGCGTTTGAGAAGATCAAGGTTGCAAATCCCATCGTT
GAGATGGATGGTGATGAAATGACCCGCGTTATCTGGAAGTCCATCAAGGACAAGCTTATC
ACTCCTTTTGTGGAGTTGGATATCAAGTACTTCGGCCTTGGTCTTCCTCACCGTGATGCT
ACCGATGACAAAGTTACTATTGAAAGTGCTGAAGCCACTAAGAAGTATAATGTGGCGATC
AAGTGTGCCACCATCACTCCAGATGAAGGCCGTGTCACGGAATTTGGCTTGAAGCAGATG
TGGAGAAGTCCCAATGGTACCATCAGGAATATTCTGAATGGAACTGTGTTTAGAGAACCA
ATTCTCTGCGAAAACGTTCCTAAGCTTGTCCCAGGCTGGACAAAGCCAATCTGCATTGGA
AGGCATGCTTTTGGTGATCAGTACCGTGCCACTGATGCTGTTATCAAGGGACCAGGAAGA
CTGACTATGACTTTCGAGGGAAAAGATGGGAAAACTGAAACTGAAGTGTTCACATTTACC
GGTGAACGCGGTGTTGCTATGGCCATGTACA*CACTGATGAGTCCATCCGTGCTTT*GCT
GACGCATCGATGA*CACTGCTTATGAGAAAA*GTGGC
CACT

QA 3 759 3 759
DS 

RD RS1E851TF 762 0 0
G
ACCGATGACAAAGTTACTATTGAAAGTGCTGAAGCCACTAAGAAGTATAATGTGGCGATC
AAGTGTGCCACCATCGCTCCAGATGAAG*CCGTGTCACGGAATTTGGCTTGAAGCAGATG
TGGAGAAGTCCCAATGGTACCATCAGGAATATTCTGAATGAAACTGTGTTTAGAGAACCA
ATTCTCTGC*AAAACGTTCCTAAGCTTGTCCCAGGCTGGACAAAGCCAATCTGCATTGGA
AGGCATGCTTTTGGTGATCAGTACCGTGCCACTGATGCTGTTATCAAGGGACCAGGGAGA
CTGACTATGACTTTCGAGGGAAAAGATGGGAAAACTGAAACTGAAGTGTTCACATTTACC
GGTGAAGGCGGTGTTGCTATGGCCATGTACAACACTGATGAGTCCATCCGTGCTTTTGCT
GACGCGTCGATGAACACTGCTTATGAGAAAAAGTGGCCACTTTATCTTAGCACAAAGAAC
ACCATTCTTAAGAAATACGATGGCAGATTCAAAGACATCTTCCAGGAAGTGTATGAATCC
AGCTGGAAGTCAAAGTATGAAGCTGCTGGAATATGGTATGAGCACCGTCTCATTGATGAT
ATGGTGGCTTACGCTCTTAAGAGCGAGGGAGGCTATGTGTGGGCATGCAAAA*CTATGAT
GGTGATGTCCAGAGCGATTTCCTGGCACAAGGATTCGG*TCACTTGGATTGATGACATCT
GTTCTGGTCTGCCCGGATGGGAAGACAATTGAAGCTGAAGC

QA 2 762 2 762
DS 

RD RS1B361TF 274 0 0
G
CGATGGCAGATTCAAAGACATCTTCCAGGAAGTGTATGAAGCCAGCTGGAAGTCAAAGTA
TGCAGCTGCTGGAATATGGTATGAGCACCGTCTCATTGATGATATGGTGGCTTACGCTCT
TAAGAGCGAGGGAGGCTATGTGTGGGCATGCAAAA*CTATGATGGTGATGTCCAGAGCGA
TTTCCTGGCACAAGGATTCGGGTCACTTGGATTGATGACATCTGTTCTGGTCTGCCCGGA
TGGGAAGACAATTGAAGCTGAAGCAGCCCATGG

QA 2 274 2 274
DS 

RD RS1CD90TF 695 0 0
G
GTCACGGAATTTGGCTTGAAGCAGATGTGGAGAAGTCCCAATGGTACCATCAGGAATATT
CTGAATGGAACTGTGTTTAGAGAACCAATTCTCTGCAAAAACGTTCCTAAGCTTGTCCCA
GGCTGGACAAAGCCAATCTGCATTGGAAGGCATGCTTTTGGTGATCAGTACCGTGCCACT
GATGCTGTTATCAAGGGACCAGGAAGACTGACTATGACTTTCGAGGGAAAAGATGGGAAA
ACTGAAACTGAAGTGTTCACATTTACCGGTGAAGGCGGTGTTGCTATGGCCATGTACAAC
ACTGATGAGTCCATCCGTGCTTTTGCTGACGCATCGATGAACACTGCTTATGAGAAAAAG
TGGCCACTTTATCTTAGCACAAAGAACACCATTCTTAAGAAGTACGATGGCAGATTCAAA
GACATCTTCCAGGAAGTGTATGAAGCCAGCTGGAAGTCAAAGTATGAAGCTGCTGGAATA
TGGTATGAGCACCGTCTCATTGATGATATGGTGACTTACGCTCTTAAGAGCGAGGGAGGC
TATGTGTGGGCATGCAAAAACTATGATGGTGATGTCCAGAGCGATTTCCTGGCACAAGGA
TTCGGGTCACTTGGATTGATGACATCTGTTCTGGTCTGCCCGGATGGGAAGACAATTGAA
GCTGAAGCAGCTCATGGAACCGTTACCCGTCACT

QA 2 695 2 695
DS 

RD RS1BH10TF 678 0 0
G
CACCATTCTTAAGAAATACGATGGCAGATTCAAAGACATCTTCCAGGAAGTGTATGAAGC
CAGCTGGAAGTCAAAGTACGAGGCTGCTGGAATATGGTATGAGCACCGTCTCATTGATGA
TATGGTGGCTTACGCTCTTAAGAGCGAGGGAGGCTATGTGTGGGCATGCAAAAACTATGA
TGGTGATGTCCAGAGCGATTTCCTGGCACAAGGATTCGGGTCACTTGGATTGATGACATC
TGTTCTGGTCTGCCCGGATGGCAAGACAATTGAAGCTGAAGCAGCCCATGGAACCGTTAC
CCGTCACTACAGGGTTCACCAGAAAGGTGGAGAGACCAGCACAAACAGCATAGCCTCCAT
CTTTGCTTGGACTCGTGGACTTGCACACAGAGCTAAGCTGGATGACAACTCAAAACTCTT
GGAGTTTACTGAGAAGCTCGAAGCTGCTTGTGTTGGTACAGTGGAGTCTGGAAAAATGAC
CAAAGATCTTGCGCTCATCATTCACGGCTCAAAGCTCTCGAGGGATACTTACCTCAACAC
GGAGGAGTTCATCGATGCAGTTGCGGAAGAGCTCAAAACAAGACTCGGCGCTTAAGAAAA
*CATTCGACGACTTAGTCATAAGTGTCTAATCTGGTGGGTTTGTGAGAGTTGAAGGAATA
AAAGAGAGAACGTTTGC

QA 2 678 2 678
DS 

RD RS1E851JQ 779 0 0
ACAAAGAA
CACCATTCTTAAGAAATACGATGGCAGATTCAAAGACATCTTCCAGGAAGTGTATGAATC
CAGCTGGAAGTCAAAGTATGAAGCTGCTGGAATATGGTATGAGCACCGTCTCATTGATGA
TATGGTGGCTTACGCTCTTAAGAGCGAGGGAGGCTATGTGTGGGCATGCAAAAACTATGA
TGGTGATGTCCAGAGCGATTTCCTGGCACAAGGATTCGGGTCACTTGGATTGATGACATC
TGTTCTGGTCTGCCCGGATGGGAAGACAATTGAAGCTGAAGCAGCCCATGGAACCGTTAC
CCGTCACTACAGGGTTCACCAGAAAGGTGGCGAGACCAGCACAAACAGCATAGCCTCCAT
CTTTGCTTGGACCCGTGGACTTGCACACAGAGCTAAGCTGGATGACAACGCAAAACTCTT
GGAGTTTACTGAGAAGCTCGAAGCTGCTTGTGTTGGTACAGTGGAGTCTGGAAAAATGAC
CAAAGATCTTGCGCTCATCATTCACGGCTCAAAGCTCTCGAGGGATACTTACCTCAACAC
GGAGGAGTTCATCGATGCAGTTGCGGCTGAGCTCAAAACAAGACTCGGCGCTTAAGAAAA
ACATTCGACGACTTAGTCATAAGTGTCTAATCTGGTGGGTTTGTGAGAGTTGAAGGAATA
AAAGAGAGAACGTTTGCGTTTTGAGAACGATTTGTTTCATCTGCTATAATATTTTCAAAA
CATTGTTACATGTTTCCCTTTCTTATGCAGATTTCAAATAATTTT
TCATCG

QA 9 773 9 773
DS 

RD RS1DC59JQ 590 0 0
AGAGCGAGGGAGGCTATGTGTGGGCATGCAAAAACTATGATGGTGATGTCCAGAGCGATT
TCCTGGCACAAGGATTCGGGTCACTTGGATTGATGACATCTGTTCTGGTCTGCCCGGATG
GGAAGACAATTGAAGCTGAAGCAGCCCATGGAACCGTTACCCGTCACTACAGGGTTCACC
AGAAAGGTGGCGAGACCAGCACAAACAGCATAGCCTCCATCTTTGCTTGGACCCGTGGAC
TTGCACACAGAGCTAAGCTGGATGACAACGCAAAACTCTTGGAGTTTACTGAGAAGCTCG
AAGCTGCTTGTGTTGGTACAGTGGAGTCTGGAAAAATGACCAAAGATCTTGCGCTCATCA
TTCACGGCTCAAAGCTCTCGAGGGATACTTACCTCAACACGGAGGAGTTCATCGATGCAG
TTGCGGCTGAGCTCAAAACAAGACTCGGCGCTTAAGAAAAACATTCGACGACTTAGTCAT
AAGTGTCTAATCTGGTGGGTTTGTGAGAGTTGAAGGAATAAAAGAGAGAACGTTTGCGTT
TTGAGAACGATTTGTTTCATCTGCTATAATATTTTCAAAACATTGTTACA

QA 1 590 1 590
DS 

RD RS1GY64JQ 657 0 0
CTCATTGATGATATGGTGGCTTACGCTCTTAAGAGCGAGGGAGGCTATGTGTGGGCATGC
AAAAACTATGATGGTGATGTCCAGAGCGATTTCCTGGCACAAGGATTCGGGTCACTTGGA
TTGATGACATCTGCTCTGGTCTGCCCGGATGGGAAGACAATTGAAGCTGAAGCAGCCCAT
GGAACCGTTACCCGTCACTACAGGGTTCACCAGAAAGGTGGCGAGACCAGCACAAACAGC
ATAGCCTCCATCTTTGCTTGGACCCGTGGACTTGCACACAGAGCTAAGCTGGATGACAAC
GCAAAACTCTTGGAGTTTACTGAGAAGCTCGAAGCTGCTTGTGTTGGTACAGTGGAGTCT
GGAAAAATGACCAAAGATCTTGCGCTCATCATTCACGGCTCAAAGCTCTCGAGGGATACT
TACCTCAACACGGAGGAGTTCATCGATGCAGTTGCGGCTGAGCTCAAAACAAGACTCGGC
GCTTAAGAAAAACATTCGACGACTTAGTCATAAGTGTCTAATCTGGTGGGTTTGTGAGAG
TTGAAGGAATAAAAGAGAGAACGTTTGCGTTTTGAGAACGATTTGTTTCATCTGCTATAA
TATTTTCAAAACATTGTTACATGTTTCCCTTTCTTATGCAGATTTCAAATAATTTT
C

QA 1 656 1 656
DS 

RD RS1FM19JQ 665 0 0
GGAATATGGTATGAGCACCGTCTCATTGATGATATGGTGGCTTACGCTCTTAAGAGCGAG
GGAGGCTATGTGTGGGCATGCAAAAACTATGATGGTGATGTCCAGAGCGATTTCCTGGCA
CAAGGATTCGGGTCACTTGGATTGATGACATCTGTTCTGGTCTGCCCGGATGGGAAGACA
ATTGAAGCTGAAGCAGCCCATGGAACCGTTACCCGTCACTACAGGGTTCACCAGAAAGGT
GGCGAGACCAGCACAAACAGCATAGCCTCCATCTTTGCTTGGACCCGTGGACTTGCACAC
AGAGCTAAGCTGGATGACAACGCAAAACTCTTGGAGTTTACTGAGAAGCTCGAAGCTGCT
TGTGTTGGTACAGTGGAGTCTGGAAAAATGACCAAAGATCTTGCGCTCATCATTCACGGC
TCAAAGCTCTCGAGGGATACTTACCTCAACACGGAGGAGTTCATCGATGCAGTTGCGGCT
GAGCTCAAAACAAGACTCGGCGCTTAAGAAAAACATTCGACGACTTAGTCATAAGTGTCT
AATCTGGTGGGTTTGTGAGAGTTGAAGGAATAAAAGAGAGAACGTTTGCGTTTTGAGAAC
GATTTGTTTCATCTGCTATAATATTTTCAAAACATTGTTACATGTTTCCCTTTCTTATGC
AGATT

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1BH10JQ 706 0 0
CAAAGTACGAGGCTGCTGGAATATGGTATGAGCACCGTCTCATTGATGATATGGTGGCTT
ACGCTCTTAAGAGCGAGGGAGGCTATGTGTGGGCATGCAAAAACTATGATGGTGATGTCC
AGAGCGATTTCCTGGCACAAGGATTCGGGTCACTTGGATTGATGACATCTGTTCTGGTCT
GCCCGGATGGCAAGACAATTGAAGCTGAAGCAGCCCATGGAACCGTTACCCGTCACTACA
GGGTTCACCAGAAAGGTGGAGAGACCAGCACAAACAGCATAGCCTCCATCTTTGCTTGGA
CTCGTGGACTTGCACACAGAGTTAAGCTGGATGACAACTCAAAACTCTTGGAGTTTACTG
AGAAGCTCGAAGCTGCTTGTGTTGGTACAGTGGAGTCTGGAAAAATGACCAAAGATCTTG
CGCTCATCATTCACGGCTCAAAGCTCTCGAGGGATACTTACCTCAACACGGAGGAGTTCA
TCGATGCAGTTGCGGAAGAGCTCAAAACAAGACTCGGCGCTTAAGAAAA*CATTCGACGA
CTTAGTCATAAGTGTCTAATCTGGTGGGTTTGTGAGAGTTGAAGGAATAAAAGAGAGAAC
GTTTGCGTTTTGAGAACGATTTGTTTCATCTGCTATAATATTTTCAAAACATTGTTACAT
GTTTCCCTTTCTTATGCAGATTTCAAATAATTTTTCATTGGTTACC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 12

CO CL165Contig1 685 12 22 U
GGGAGAAAAAAAACACAAAACTGAAAGAAGATGAGACTTAAATGTCTGATGACACAAACA
GAAAGATATATGAGTGCAAGTCTCAGCAATGATATTGGTAAAAGATTTAACACTAAAAAC
AACACATTGGTTTCAAAAGTAGTAGAAGAAAAAA*CTCAAAACACTATTTTGATTCTTCA
AACTTCAACCGCAATACGTCCAGCGACTTGGTCCAAATCCCTTTGCCCACTGGAAGTGAT
TCTTCTTCCTCCTTTGGTGTCAATCTCAACAATGTTCATAGTCTCCAACTGCTGGAGGAT
GTGACGGGCAATGCCACCGCTGCTTTTGCAGAAATGTGGTGGGCGACTTCCGTTTCTCTT
GCTTCCACCATAGATTCTACGGAAAGCACCAACTCCAAGACCTCCCCTCAGGTACACCTT
CCTTGCCATAGATGCAGCTCTGATGTAGTACCAATCAGGATCATATGGGGCAAGCTCCTT
CAGCTTACCAGTCTTCACAATGTCTGTCCATGAGGGAAGCTCGATCTTGCCAGATCGCTT
GAGATGAGAAGCGTAAGCCTTGACGAAGTCGTGAGGAGATACGTCTTTCACAGTCTTACC
AGTTGCCATGGCTAAAGGGAAGAGATCTTCGTCTAGAGGGGTTTTGCCGCTGAATCTCTC
TCTCTCAGACCGCAAAGACTAGCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 10 25 35 35 35 35 35 35 5 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 
55 55 55 55 55 55 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 50 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 25 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 40 70 70 70 
70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 60 60 60 
60 60 10 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 50 50 50 50 10 

AF RS1GD63JQ U 15
AF RS1GD63TF C 15
AF RS1GN59JQ U 1
AF RS1GN59TF C 176
AF RS1AP64JQ U 23
AF RS1AV43JQ U 24
AF RS1AV43TF C 60
AF RS1AP64TFB C 23
AF RS1F283JQ U 34
AF RS1C821JQ U 65
AF RS1C821TF C 65
AF RS1F283TF C 34
BS 1 20 RS1GN59JQ
BS 21 21 RS1GD63JQ
BS 22 47 RS1GN59JQ
BS 48 48 RS1GD63JQ
BS 49 49 RS1GN59JQ
BS 50 50 RS1GD63JQ
BS 51 159 RS1GN59JQ
BS 160 160 RS1GD63JQ
BS 161 510 RS1GN59JQ
BS 511 511 RS1GD63JQ
BS 512 534 RS1GN59JQ
BS 535 535 RS1GD63JQ
BS 536 546 RS1GN59JQ
BS 547 547 RS1GD63JQ
BS 548 561 RS1GN59JQ
BS 562 562 RS1GD63JQ
BS 563 579 RS1GN59JQ
BS 580 580 RS1GD63JQ
BS 581 663 RS1GN59JQ
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BS 666 684 RS1GN59JQ
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RD RS1GD63JQ 646 0 0
G
CAAAACTGAAAGAGGATGAGACTTAAATGTCTGATGACACAAACAGAAAGATATATGAGT
GCAAGTCTCAGCAATGATATTGGTAAAAGATTTAACACTAAAAACAACACATTGGTTTCA
AAAGTAGTAGAAGAAAAAA*CTCAAAACACTATTTTGATTCTTCAAACTTCAACCGCAAT
ACGTCCAGCGACTTGGTCCAAATCCCTTTGCCCACTGGAAGTGATTCTTCTTCCTCCTTT
GGTGTCAATCTCAACAATGTTCATAGTCTCCAACTGCTGGAGGATGTGACGGGCAATGCC
ACCGCTGCTTTTGCAGAAATGTGGTGGGCGACTTCCGTTTCTCTTGCTTCCACCATAGAT
TCTACGGAAAGCACCAACTCCAAGACCTCCCCTCAGGTACACCTTCCTTGCCATAGATGC
AGCCCTGATGTAGTACCAATCAGGATCATATGGGGCAAGCTCCTTCAGCTTACCAGTCTT
CACAATGTCTGTCCATGAGGGAAGCTCGATCTTGCCAGATCGTTTGAGATGAGAAGCGTA
AGCCTTGACGAAGTCGTGAGGAGATACGTCTTTCACAGTCTTACCAGTTGCCATGGCTAA
AGGGAAGAGATCTTCGTCTAGAGGGGTTTTGCCGCTGAATCTC
CC

QA 2 644 2 644
DS 

RD RS1GD63TF 646 0 0
G
CAAAACTGAAAGAGGATGAGACTTAAATGTCTGATGACACAAACAGAAAGATATATGAGT
GCAAGTCTCAGCAATGATATTGGTAAAAGATTTAACACTAAAAACAACACATTGGTTTCA
AAAGTAGTAGAAGAAAAAA*CTCAAAACACTATTTTGATTCTTCAAACTTCAACCGCAAT
ACGTCCAGCGACTTGGTCCAAATCCCTTTGCCCACTGGAAGTGATTCTTCTTCCTCCTTT
GGTGTCAATCTCAACAATGTTCATAGTCTCCAACTGCTGGAGGATGTGACGGGCAATGCC
ACCGCTGCTTTTGCAGAAATGTGGTGGGCGACTTCCGTTTCTCTTGCTTCCACCATAGAT
TCTACGGAAAGCACCAACTCCAAGACCTCCCCTCAGGTACACCTTCCTTGCCATAGATGC
AGCCCTGATGTAGTACCAATCAGGATCATATGGGGCAAGCTCCTTCAGCTTACCAGTCTT
CACAATGTCTGTCCATGAGGGAAGCTCGATCTTGCCAGATCGTTTGAGATGAGAAGCGTA
AGCCTTGACGAAGTCGTGAGGAGATACGTCTTTCACAGTCTTACCAGTTGCCATGGCTAA
AGGGAAGAGATCTTCGTCTAGAGGGGTTTTGCCGCTGAATCTC
CC

QA 2 644 2 644
DS 

RD RS1GN59JQ 684 0 0
GGGAGAAAAAAAACACAAAATTGAAAGAAGATGAGACTTAAATGTCTAAAGACACAAACA
GAAAGATATATGAGTGCAAGTCTCAGCAATGATATTGGTAAAAGATTTAACACTAAAAAC
AACACATTGGTTTCAAAAGTAGTAGAAGAAAAAA*CTCATAACACTATTTTGATTCTTCA
AACTTCAACCGCAATACGTCCAGCGACTTGGTCCAAATCCCTTTGCCCACTGGAAGTGAT
TCTTCTTCCTCCTTTGGTGTCAATCTCAACAATGTTCATAGTCTCCAACTGCTGGAGGAT
GTGACGGGCAATGCCACCGCTGCTTTTGCAGAAATGTGGTGGGCGACTTCCGTTTCTCTT
GCTTCCACCATAGATTCTACGGAAAGCACCAACTCCAAGACCTCCCCTCAGGTACACCTT
CCTTGCCATAGATGCAGCTCTGATGTAGTACCAATCAGGATCATATGGGGCAAGCTCCTT
CAGCTTACCAGTCTTCACAATGTCTGTCCACGAGGGAAGCTCGATCTTGCCAGAACGCTT
GAGATGGGAAGCGTAAGCCTTCACGAAGTCGTGAGGAGAGACGTCTTTCACAGTCTTACC
AGTTGCCATGGCTAAAGGGAAGAGATCTTCGTCTAGAGGGGTTTTGCCGCTGAATCTCTC
TCT**CAGACCGCAAAGACTAGCC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1GN59TF 509 0 0
CTTCAAACTTCAACCGCAATACGTCCAGCGACTTGGTCCAAATCCCTTTGCCCACTGGAA
GTGATTCTTCTTCCTCCTTTGGTGTCAATCTCAACAATGTTCATAGTCTCCAACTGCTGG
AGGATGTGACGGGCAATGCCACCGCTGCTTTTGCAGAAATGTGGTGGGCGACTTCCGTTT
CTCTTGCTTCCACCATAGATTCTACGGAAAGCACCAACTCCAAGACCTCCCCTCAGGTAC
ACCTTCCTTGCCATAGATGCAGCTCTGATGTAGTACCAATCAGGATCATATGGGGCAAGC
TCCTTCAGCTTACCAGTCTTCACAATGTCTGTCCACGAGGGAAGCTCGATCTTGCCAGAA
CGCTTGAGATGGGAAGCGTAAGCCTTCACGAAGTCGTGAGGAGAGACGTCTTTCACAGTC
TTACCAGTTGCCATGGCTAAAGGGAAGAGATCTTCGTCTAGAGGGGTTTTGCCGCTGAAT
CTCTCTCT**CAGACCGCAAAGACTAGCC

QA 1 509 1 509
DS 

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TCAGCAATGATATTGGTAAAAGATTTAACACTAAAAACAACACATTGGTTTCAAAAGTAG
TAGAAGAAAAA**CTCATAATACTATTTTGATTCTTCAAACTTCAACCGCAATACGTCCA
GCGACTTGGTCCAAATCCCTTTGCCCACTGGAAGTGATTCTTCTTCCTCCTTTGGTGTCA
ATCTCAACAATGTTCATAGTCTCCAACTGCTGGAGGATGTGACGGGCAATGCCACCGCTG
CTTTTGCAGAAATGTGGTGGGCGACTTCCGTTTCTCTTGCTTCCACCATAAATTCTACGG
AAAGCACCAACTCCAAGACCTCCCCTCAGGTACACCTTCCTTGCCATAGATGCAGCTCTG
ATGTAGTACCAATCAGGATCATATGGGGCAAGCTCCTTCAGCTTACCAGTCTTCACAATG
TCTGTCCATGAGGGAAGCTCGATCTTGCCAGAACGCTTGAGATGGGAAGCGTAAGCCTTC
ACGAAGTCGTGAGGAGAGACGTCTTTCACAGTCTTACCAGTTGCCATGGCTAAAGGGAAG
AGATCTTCGTCTAGAGGGGTTTTGCCGCTGAATCTCTCTCT**CAGACCGCAAAGACTAG
CC

QA 1 662 1 662
DS 

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CTTGAG
GATGAGACTTAAATGTCTGATGACACAAACAGAAAGATATATGAGTGCAAGTCTCAGCAA
TGATATTGGTAAAAGATTTAACACTAAAAACAACACATTGGTTTCAAAAGTAGTAGAAGA
AAAAA*CTCAAAACACTATTTTGATTCTTCAAACTTCAACCGCAATACGTCCAGCGACTT
GGTCCAAATCCCTTTGCCCACTGGAAGTGATTCTTCTTCCTCCTTTGGTGTCAATCTCAA
CAATGTTCATAGTCTCCAACTGCTGGAGGATGTGACGGGCAATGCCACCGCTGCTTTTGC
AGAAATGTGGTGGGCGACTTCCGTTTCTCTTGCTTCCACCATAGATTCTACGGAAAGCAC
CAACTCCAAGACCTCCCCTCAGGTACACCTTCCTTGCCATAGATGCAGCTCTGATGTAGT
ACCAATCAGGATCATATGGGGCAAGCTCCTTCAGCTTACCAGTCTTCACAATGTCTGTCC
ATGAGGGAAGCTCGATCTTGCCAGATCGCTTGAGATGAGAAGCGTAAGCCTTGGCGAAGT
CGTGAGGAGATACGTCTTTCGCAGTCTTACCAGTTGCCATGGCTAAAGGGAAGAGATCTT
CGTCTAGAGGGGTTTTGCCGCTGAATCTCTCTCTCTCAGACCGCAAAGACTAGCC

QA 7 661 7 661
DS 

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AGAAAGATATATGAGTGCAAGTCTCAGCAATGATATTGGTAAAAGATTTAACACTAAAAA
CAACACATTGGTTTCAAAAGTAGTAGAAGAAAAAA*CTCAAAACACTATTTTGATTCTTC
AAACTTCAACCGCAATACGTCCAGCGACTTGGTCCAAATCCCTTTGCCCACTGGAAGTGA
TTCTTCTTCCTCCTTTGGTGTCAATCTCAACAATGTTCATAGTCTCCAACTGCTGGAGGA
TGTGACGGGCAATGCCACCGCTGCTTTTGCAGAAATGTGGTGGGCGACTTCCGTTTCTCT
TGCTTCCACCATAGATTCTACGGAAAGCACCAACTCCAAGACCTCCCCTCAGGTACACCT
TCCTTGCCATAGATGCAGCTCTGATGTAGTACCAATCAGGATCATATGGGGCAAGCTCCT
TCAGCTTACCAGTCTTCACAATGTCTGTCCATGAGGGAAGCTCGATCTTGCCAGATCGCT
TGAGATGAGAAGCGTAAGCCTTGGCGAAGTCGTGAGGAGATACGTCTTTCGCAGTCTTAC
CAGTTGCCATGGCTAAAGGGAAGAGATCTTCGTCTAGAGGGGTTTTGCCGCTGAATCTCT
CTCTCTCAGACCGCAAAGACTAGCC

QA 1 625 1 625
DS 

RD RS1AP64TFB 662 0 0
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TCAGCAATGATATTGGTAAAAGATTTAACACTAAAAACAACACATTGGTTTCAAAAGTAG
TAGAAGAAAAA**CTCATAATACTATTTTGATTCTTCAAACTTCAACCGCAATACGTCCA
GCGACTTGGTCCAAATCCCTTTGCCCACTGGAAGTGATTCTTCTTCCTCCTTTGGTGTCA
ATCTCAACAATGTTCATAGTCTCCAACTGCTGGAGGATGTGACGGGCAATGCCACCGCTG
CTTTTGCAGAAATGTGGTGGGCGACTTCCGTTTCTCTTGCTTCCACCATAGATTCTACGG
AAAGCACCAACTCCAAGACCTCCCCTCAGGTACACCTTCCTTGCCATAGATGCAGCTCTG
ATGTAGTACCAATCAGGATCATATGGGGCAAGCTCCTTCAGCTTACCAGTCTTCACAATG
TCTGTCCATGAGGGAAGCTCGATCTTGCCAGAACGCTTGAGATGGGAAGCGTAAGCCTTC
ACGAAGTCGTGAGGAGAGACGTCTTTCACAGTCTTACCAGTTGCCATGGCTAAAGGGAAG
AGATCTTCGTCTAGAGGGGTTTTGCCGCTGAATCTCTCTCT**CAGACCGCAAAGACTAG
CC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RS1F283JQ 652 0 0
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ATTGGTAAAAGATTTAACACTAAAAACAACACATTGGTTTCAAAAGTAGTAAAAGAAAAA
A*CTCAAAACACTATTTTGATTCTTCAAACTTCAACCGCAATACGTCCAGCGACTTGGTC
CAAATCCCTTTGCCCACTGGAAGTGATTCTTCTTCCTCCTTTGGTGTCAATCTCAACAAT
GTTCATAGTCTCCAACTGCTGGAGGATGTGACGGGCAATGCCACCGCTGCTTTTGCAAAA
ATGTGGTGGGCGACTTCCGTTTCTCTTGCTTCCACCATAGATTCTACGGAGAGCACCAAC
TCCAAGACCTCCCCTCAGGTACACCTTCCTTGCCATAAATGCAGCTCTGATGTAGTACCA
ATCAGGATCATATGGGGCAAGCTCCTTCAGCTTACCAGTCTTCACAATGTCTGTCCATGA
GGGAAGCTCGATCTTGCCAGATCGCTTGAGATGAGAAGCGTAAGCCTTGACGAAGTCGTG
AGGAGATACGTCTTTCACAGTCTTACCAGTTGCCATGGCTAAAGGGAAGAGATCTTCGTC
TAGAGGGGTTTTGCCGCTGAATCTCTCTCTCTCAGACCGCAAAGGCTAGCCT

QA 1 652 1 652
DS 

RD RS1C821JQ 618 0 0
GG
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TTGGTTTCAAAAGTAGTAAAAAAAAAAAACTCAAAACACTATTTTGATTCTTCAAACTTC
AACCGCAATACGTCCAGCGACTTGGTCCAAATCCCTTTGCCCACTGGAAGTGATTCTTCT
TCCTCCTTTGGTGTCAATCTCAACAATGTTCATAGTCTCCAACTGCTGGAGGATGTGACG
GGCAATGCCACCGCTGCTTTTGCAGAAATGTGGTGGGCGACTTCCGTTTCTCTTGCTTCC
ACCATAGATTCTACGGAAAGCACCAACTCCAAGACCTCCCCTCAGGTACACCTTCCTTGC
CATAGATGCAGCTCTGATGTAGTACCAATCAGGATCATATGGGGCAAGCTCCTTCAGCTT
ACCAGTCTTCACAATGTCTGTCCATGAGGGAAGCTCGATCTTGCCAGATCGCTTGAGATG
AGAAGCGTAAGCCTTGACGAAGTCGTGAGGAGATACGTCTTTCACAGTCTTACCAGTTGC
CATGGCTAAAGGGAAGAGATCTTCGTCTAGAGGGGTTTTGCCGCTGAATCTCTCTCTCTC
AGACCGCAAAGGCT
CC

QA 3 616 3 616
DS 

RD RS1C821TF 618 0 0
GG
TATATGAGTGCAAGTCTCAGCAATGATATTGGTAAAAGATTTAACACTAAAAACAACACA
TTGGTTTCAAAAGTAGTAGAAGAAAAAAACTCAAAACACTATTTTGATTCTTCAAACTTC
AACCGCAATACGTCCAGCGACTTGGTCCAAATCCCTTTGCCCACTGGAAGTGATTCTTCT
TCCTCCTTTGGTGTCAATCTCAACAATGTTCATAGTCTCCAACTGCTGGAGGATGTGACG
GGCAATGCCACCGCTGCTTTTGCAGAAATGTGGTGGGCGACTTCCGTTTCTCTTGCTTCC
ACCATAGATTCTACGGAAAGCACCAACTCCAAGACCTCCCCTCAGGTACACCTTCCTTGC
CATAGATGCAGCTCTGATGTAGTACCAATCAGGATCATATGGGGCAAGCTCCTTCAGCTT
ACCAGTCTTCACAATGTCTGTCCATGAGGGAAGCTCGATCTTGCCAGATCGCTTGAGATG
AGAAGCGTAAGCCTTGACGAAGTCGTGAGGAGATACGTCTTTCACAGTCTTACCAGTTGC
CATGGCTAAAGGGAAGAGATCTTCGTCTAGAGGGGTTTTGCCGCTGAATCTCTCTCTCTC
AGACCGCAAAGGCT
CC

QA 3 616 3 616
DS 

RD RS1F283TF 652 0 0
AGACTTAAATGTCTGATGACACAAACAGAAAGATATATGAGTGCAAGTCTCAGCAATGAT
ATTGGTAAAAGATTTAACACTAAAAACAACACATTGGTTTCAAAAGTAGTAGAAGAAAAA
A*CTCAAAACACTATTTTGATTCTTCAAACTTCAACCGCAATACGTCCAGCGACTTGGTC
CAAATCCCTTTGCCCACTGGAAGTGATTCTTCTTCCTCCTTTGGTGTCAATCTCAACAAT
GTTCATAGTCTCCAACTGCTGGAGGATGTGACGGGCAATGCCACCGCTGCTTTTGCAGAA
ATGTGGTGGGCGACTTCCGTTTCTCTTGCTTCCACCATAGATTCTACGGAGAGCACCAAC
TCCAAGACCTCCCCTCAGGTACACCTTCCTTGCCATAGATGCAGCTCTGATGTAGTACCA
ATCAGGATCATATGGGGCAAGCTCCTTCAGCTTACCAGTCTTCACAATGTCTGTCCATGA
GGGAAGCTCGATCTTGCCAGATCGCTTGAGATGAGAAGCGTAAGCCTTGACGAAGTCGTG
AGGAGATACGTCTTTCACAGTCTTACCAGTTGCCATGGCTAAAGGGAAGAGATCTTCGTC
TAGAGGGGTTTTGCCGCTGAATCTCTCTCTCTCAGACCGCAAAGGCTAGCC
T

QA 1 651 1 651
DS 



AS 3 11

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AACAAACAGAATCGAGAGTCTTGACCCGGCACTTCTTAGACCTGGACGTATTGATAGGAA
GATCGAGTTCCCACTTCCAGATATCAAAACCAGAAGACGCATCTTCCAGATACACACATC
AAAGATGACACTATCGGAAGATGTAAACTTGGAAGAGTTTGTGATGACGAAAGACGAGTT
CTCAGGAGCTGATATAAAGGCTATTTGCACTGAGGCTGGTCTACTTGCTCTCAGGGAGCG
CCGTATGAAGGTGACGCATCCGGATTTCAAGAAAGCAAAGGAAAAGGTTATGTTCAAGAA
GAAAGAAGGCGTCCCTGAAGGCCTTTACATGTAAAACCATCATCATATACATTTGCTTCT
GCGTCTGGTGGTATAAACTGTTGCCATCTGATATTCTTCGAAATAACAATTCCTCATTTT
GCATTTACATGCCCTACTTCGGAGTCTCGTATTAATACTAAGATCAGATGAAACCAGAAG
ACGAAATATATAGTTATTACATAGTAGAAGTCTTGCAAAAACACATTATTTAGATCTTAA
GATTCAGCTGTTTCTTTTGACAAAATCAAAATTTTCTTTATTAGACGTAAATGAACAAGA
TGATCTTGTGTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1C140JQ C 1
AF RS1C140TF U 1
BS 1 672 RS1C140TF

RD RS1C140JQ 672 0 0
GGAACTTCTGAACCAGCTTGATGGATTTGATTCAAGAGGAGACGTTAAGGTCATCCTTGC
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AAAGATGACACTATCGGAAGATGTAAACTTGGAAGAGTTTGTGATGACGAAAGACGAGTT
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GCATTTACATGCCCTACTTCGGAGTCTCGTATTAATACTAAGATCAGATGAAACCAGAAG
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GATTCAGCTGTTTCTTTTGACAAAATCAAAATTTTCTTTATTAGACGTAAATGAACAAGA
TGATCTTGTGTG

QA 1 672 1 672
DS 

RD RS1C140TF 672 0 0
GGAACTTCTGAACCAGCTTGATGGATTTGATTCAAGAGGAGACGTTAAGGTCATCCTTGC
AACAAACAGAATCGAGAGTCTTGACCCGGCACTTCTTAGACCTGGACGTATTGATAGGAA
GATCGAGTTCCCACTTCCAGATATCAAAACCAGAAGACGCATCTTCCAGATACACACATC
AAAGATGACACTATCGGAAGATGTAAACTTGGAAGAGTTTGTGATGACGAAAGACGAGTT
CTCAGGAGCTGATATAAAGGCTATTTGCACTGAGGCTGGTCTACTTGCTCTCAGGGAGCG
CCGTATGAAGGTGACGCATCCGGATTTCAAGAAAGCAAAGGAAAAGGTTATGTTCAAGAA
GAAAGAAGGCGTCCCTGAAGGCCTTTACATGTAAAACCATCATCATATACATTTGCTTCT
GCGTCTGGTGGTATAAACTGTTGCCATCTGATATTCTTCGAAATAACAATTCCTCATTTT
GCATTTACATGCCCTACTTCGGAGTCTCGTATTAATACTAAGATCAGATGAAACCAGAAG
ACGAAATATATAGTTATTACATAGTAGAAGTCTTGCAAAAACACATTATTTAGATCTTAA
GATTCAGCTGTTTCTTTTGACAAAATCAAAATTTTCTTTATTAGACGTAAATGAACAAGA
TGATCTTGTGTG

QA 1 672 1 672
DS 



CO CL166Contig2 727 2 2 U
GAACTGGGAAGACACTCCTTGCTAAGGCGGTGGCTAACTCTACATCAGCTACTTTCTTGA
GAGTTGTTGGTAGCGAACTGATTCAGAAGTATTTGGGAGATGGTCCCAAGCTTGTGAGGG
AGCTTTTCAGAGTTGCTGATGACCTTTCACCATCAATCGTCTTCATAGACGAGATTGATG
CTGTTGGTACCAAACGGTATGATGCTAACTCAGGAGGTGAGCGTGAGATCCAAAGAACTA
CGCTGGAACTTCTGAACCAGCTTGATGGATTCGATTCAAGAGGTGACGTCAAGGTCATCC
TTGCAACGAATAGAATCGAAAGTCTTGACCCGGCACTTCTTAGACCTGGACGTATTGATA
GGAAGATCGAGTTCCCACTTCCAGATATCAAGACGAGGAGACGCATCTTCCAGATACACA
CATCAAAGATGACTCTTTCGGAGGATGTAAACTTGGAAGAGTTTGTGATGACCAAAGACG
AGTTCTCAGGAGCTGACATCAAGGCTATTTGCACCGAGGCTGGTCTGCTTGCTCTCAGGG
AGCGCCGTATGAAGGTGACGCATCCGGATTTCAAGAAAGCAAAGGAGAAGGTTATGTTCA
AGAAGAAAGAAAGCGTCCCCGAAGGCCTTTACATGTAAAATCATCACATCATATACATTT
GCTTATGCGTCTGTTCGTATGAACTGTTACCATCTGATATTCTTCGAAATAATTTTTGCA
TTTACAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DS62TF U 1
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DS 

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GAGTTGTTGGTAGCGAACTGATTCAGAAGTATTTGGGAGATGGTCCCAAGCTTGTGAGGG
AGCTTTTCAGAGTTGCTGATGACCTTTCACCATCAATCGTCTTCATAGACGAGATTGATG
CTGTTGGTACCAAACGGTATGATGCTAACTCAGGAGGTGAGCGTGAGATCCAAAGAACTA
CGCTGGAACTTCTGAACCAGCTTGATGGATTCGATTCAAGAGGTGACGTCAAGGTCATCC
TTGCAACGAATAGAATCGAAAGTCTTGACCCGGCACTTCTTAGACCTGGACGTATTGATA
GGAAGATCGAGTTCCCACTTCCAGATATCAAGACGAGGAGACGCATCTTCCAGATACACA
CATCAAAGATGACTCTTTCGGAGGATGTAAACTTGGAAGAGTTTGTGATGACCAAAGACG
AGTTCTCAGGAGCTGACATCAAGGCTATTTGCACCGAGGCTGGTCTGCTTGCTCTCAGGG
AGCGCCGTATGAAGGTGACGCATCCGGATTTCAAGAAAGCAAAGGAGAAGGTTATGTTCA
AGAAGAAAGAAGGCGTCCCCGAAGGCCTTTACATGTAAAATCATCACATCATATACATTT
GCTTATGCGTCTGTTCGTATGAACTGTTACCATCTGATATTCTTCGAAATAATTTTTGCA
TTTACAT

QA 1 727 1 727
DS 



CO CL166Contig3 1472 7 28 U
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GAGGTTTGAATCGCCAGGGAGATAAGAAGCCCGATGGCGACAAGAAAGAGAAGAAGTTCG
AGCCGGCGGCACCACCGTCTCGCGTCGGGAGGAAGCAGCGTCGTCAAAAAGGACCCGAGG
CGGCGGCGCGGCTCCCGACGGTGACTCCTTCCACCAAGTGCAAGCTCAGGCTGCTGAAGA
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TGAAGCCTCAGGAGGAGAAGGCGGAGGAAGATAGATCTAAGGTCGACGATCTCCGCGGGA
CGCCGATGAGCGTCGGGAACCTCGAGGAACTGATCGATGAGAATCACGCCATCGTGTCGT
CCTCCGTTGGGCCTGAGTACTACGTCGGGATCTTGTCCTTCGTTGATAAAGATCAGCTCG
AGCCCGGTTGCTCGATCTTGATGCATAATAAGGTTCTGTCTGTTGTTGGGATACTGCAAG
ATGAAGTGGATCCGATGGTGTCTGTGATGAAAGTTGAGAAGGCGCCTTTGGAGTCGTATG
CTGATATTGGAGGTTTAGAAGCTCAGATTCAGGAGATTAAGGAAGCCGTTGAGTTGCCTT
TAACTCATCCTGAGTTGTATGAGGATATTGGTATTAAGCCTCCCAAGGGTGTGATTTTGT
ATGGTGAGCCTGGAACTGGGAAGACTCTGCTTGCTAAGGCGGTGGCGAACTCTACATCAG
CTACTTTCTTGAGAGTTGTTGGTAGTGAACTGATTCAGAAGTATCTGGGAGATGGTCCCA
AGCTTGTGAGGGAGCTTTTCAGAGTTGCTGATGACCTTTCACCTTCAATAGTCTTCATTG
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TCCAAAGGACTATGTTGGAACTTCTGAACCAGCTTGATGGATTCGATTCAAGAGGAGACG
TAAAGGTCATCCTTGCAACAAACAGAATCGAGAGTCTTGACCCTGCACTTCTTCGACCTG
GACGTATTGATAGGAAGATCGAGTTCCCACTTCCAGACATCAAAACGAGAAGACGCATCT
TCCAGATACACACATCAAAGATGACTCTGTCGGAAGATGTAAACTTGGAAGAGTTTGTGA
TGACGAAGGATGAGTTCTCAGGAGCTGATATCAAGGCTATTTGCACTGAGGCTGGTCTTC
TTGCTCTCAGGGAGCGTCGTATGAAGGTGACTCATCCGGATTTCAAGAAAGCCAAAGAGA
AGGTTATGTTCAAGAAGAAAGAAGGCGTCCCTGAAGGCCTTTACATGTAAAATCATCATC
ATATCGTCATCCTCCTCTACACTTTGCTTATGTTACATTTGCTTCTGCTTAGGATCTTGA
CTTATGTCGTATGATTTTCCTTCAAATAACAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1DZ74TF U 1
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AGCCGGCGGCACCACCGTCTCGCGTCGGGAGGAAGCAGCGTCGTCAAAAAGGACCCGAGG
CGGCGGCGCGGCTCCCGACGGTGACTCCTTCCACCAAGTGCAAGCTCAGGCTGCTGAAGA
TGGAGCGGATCAAGGACTACCTCCTGATGGAGGAGGAGTTCGTGGCGAATCAGGAGAGGC
TGAAGCCTCAGGAGGAGAAGGCGGAGGAAGATAGATCTAAGGTCGACGATCTCCGCGGGA
CGCCGATGAGCGTCGGGAACCTCGAGGAACTGATCGATGAGAATCACGCCATCGTGTCGT
CCTCCGTTGGGCCTGAGTACTACGTCGGGATCTTGTCCTTCGTTGATAAAGATCAGCTCG
AGCCTGGTTGCTCGATCTTGATGCATAATAAGGTTCTGTCTGTTGTTGGGATACTGCAAG
ATGAAGTGGATCCGATGGTGTCTGTGATGAGAGTTGAGAAAGCGCCTTTGGAGTCGTATG
CTGATATTGGAGGTTTAGAAGCTCAGATTCAG
AGATTA

QA 1 632 1 632
DS 

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GAGGTTTAGAAGCTCAGATTCAGGAGATTAAGGTAGCTGTTGAGTTGCCTTTAACTCATC
CTGAGTTGTATGAGGATATTGGTATTAAGCCTCCCAAGGGTGTGATTTTGTATGGTGAGC
CTGGAACTGGGAAGACTCTGCTTGCTAAGGCGGTGGCGAACTCTACATCAGCTACTTTCT
TGAGAGTTGTTGGTAGTGAACTGATTCAGAAGTATCTGGGAGATGGTCCCAAGCTTGTGA
GGGAGCTTTTCAGAGTTGCTGATGACCTTTCACCTTCAATAGTCTTCATTGACGAGATTG
ATGCTGTTGGTACCAAGCGGTATGATGCTAACTCAGGAGGTGAGCGTGAGATCCAAAGGA
CTATGTTGGAACTTCTGAACCAGCTTGATGGATTCGATTCAAGAGGAGACGTAAAGGTCA
TCC

QA 1 483 1 483
DS 

RD RS1BA15TF 787 0 0
G
GGGACGCCGATGAGCGTCGGGAACCTCGAGGAGCTGATCGATGAGAATCACGCCATCGTG
TCGTCCTCCGTTGGGCCTGAGTACTACGTCGGGATCTTGTCCTTCGTTGATAAAGATCAG
CTCGAGCCCGGTTGCTCGATCTTGATGCATAATAGGGTTCTGTCTGTTGTTGGGATACTG
CAAGATGAAGTGGATCCGATGGTGTCTGTGATGAAAGTTGAGAAGGCGCCTTTGGAGTCG
TATGCTGATATTGGAGGTTTAGAAGCTCAGATTCAGGAGATTAAGGAAGCCGTTGAGTTG
CCTTTAACTCATCCTGAGTTGTATGAGGATATTGGTATTAAGCCTCCCAAGGGTGTGATT
TTGTATGGTGAGCCTGGAACTGGGAAGACTCTGCTTGCTAAGGCGGTGGCGAACTCTACA
TCAGCTACTTTCTTGAGAGTTGTCGGTAGTGAACTGATTCAGAAGTATCTGGGAGATGGT
CCCAAGCTTGTGAGGGAGCTTTTCAGAGTTGCTGATGACCTTTCACCTTCAATAGCCTTC
ATTGACGAGATTGATGCTGTTGGTACCAAGCGGTATGATGCTAACTCAGGAGGTGAGCGT
GAGATCCAAAGGACTATGTTGGAACTTCTGA*CCAGCTTGATGGATTCGATTCAAGAGGA
GACGTAAAGGTCATCCTTGCA*CAAACAGAATCGAGAGTCTTGACCCTGCACTTCT*CGA
CCTGGACGTATTGATAGGAAGATCGAGTTCTCACTTC*AGACATCAAA*CGAGAAGACGC
ATCTTC

QA 2 787 2 787
DS 

RD RS1E064TF 640 0 0
GAGCT
GTTGAGTTGCCTTTAACTCATCCTGAGTTGTATGAGGATATTGGTATTAAGCCTCCCAAG
GGTGTGATTTTGTATGGTGAGCCTGGAACTGGGAAGACTCTGCTTGCTAAGGCGGTGGTG
AACTCTACATCAGCTACTTTCTTGAGAGTTGTTGGTAGTGAACTGATTCAGAAGTATCTG
GGAGATGGTCCCAAGCTTGTGAGGGAGCTTTTCAGAGTTGCTGATGACCTTTCACCTTCA
ATAGTCTTCATTGACGAGATTGATGCTGTTGGTACCAAGCGGTATGATGCTAACTCAGGA
GGTGAGCGTGAGATCCAAAGGACTATGTTGGAACTTCTGAACCAGCTTGATGGATTCGAT
TCAAGAGGAGACGTAAAGGTCATCCTTGCAACAAACAGAATCGAGAGTCTTGACCCTGCA
CTTCTTCGACCTGGACGTATTGATAGGAAGATCGAGTTCCCACTTCCAGACATCAAAACG
AGAAGACGCATCTTCCAGATACACACATCAAAGATGACTCTGTCGGAAGATGTAAACTTG
GAAGAGTTTGTGATGACGAAGGATGAGTTCTCAGGAGCTGATATCAAGGCTATTTGCACT
GAGGCTGGTCTTCTTGCTCTCACGGAGCGTCGTAT

QA 6 640 6 640
DS 

RD RS1BA15JQ 737 0 0
CTGGGAAGACTCTGCTTGCTAAGGCGGTGGCGAACTCTACATCAGCTACTTTCTTGAGAG
TTGTCGGTAGTGAACTGATTCAGAAGTATCTGGGAGATGGTCCCAAGCTTGTGAGGGAGC
TTTTCAGAGTTGCTGATGACCTTTCACCTTCAATAGCCTTCATTGACGAGATTGATGCTG
TTGGTACCAAGCGGTATGATGCTAACTCAGGAGGTGAGCGTGAGATCCAAAGGACTATGT
TGGAACTTCTGAACCAGCTTGATGGATTCGATTCAAGAGGAGACGTAAAGGTCATCCTTG
CAACAAACAGAATCGAGAGTCTTGACCCTGCACTTCTTCGACCTGGACGTATTGATAGGA
AGATCGAGTTCCCACTTCCAGACATCAAAACGAGAAGACGCATCTTCCAGATACACACAT
CAAAGATGACTCTGTCGGAAGATGTAAACTTGGAAGAGTTTGTGATGACGAAGGATGAGT
TCTCAGGAGCTGATATCAAGGCTATTTGCACTGAGGCTGGTCTTCTTGCTCTCAGGGAGC
GTCGTATGAAGGTGACTCATCCGGATTTCAAGAAAGCCAAAGAGAAGGTTATGTTCAAGA
AGAAAGAAGGCGTCCCTGAAGGCCTTTACATGTAAAATCATCATCATATCGTCATCCTCC
TCTACACTTTGCTTATGTTACATTTGCTTCTGCTTAGGATCTTGACTTATGTCGTATGAT
TTTCCTTCAAATAACAA

QA 1 737 1 737
DS 

RD RS1DZ74JQ 695 0 0
CAGCTACTTTCTTGAGAGTTGTTGGTAGTGAACTGATTCAGAAGTATCTGGGAGATGGTC
CCAAGCTTGTGAGGGAGCTTTTCAGAGTTGCTGATGACCTTTCACCTTCAATAGTCTTCA
TTGACGAGATTGATGCTGTTGGTACCAAGCGGTATGATGCTAACTCAGGAGGTGAGCGTG
AGATCCAAAGGACTATGTTGGAACTTCTGAACCAGCTTGATGGATTCGATTCAAGAGGAG
ACGTAAAGGTCATCCTTGCAACAAACAGAATCGAGAGTCTTGACCCTGCACTTCTTCGAC
CTTGACGTATTGATAGGAAGATCGAGTTCCCACTTCCAGACATCAAAACGAGAAGACGCA
TCTTCCAGATACACACATCAAAGATGACTCTGTCGGAAGATGTAAACTTGGAAGAGTTTG
TGATGACGAAGGATGAGTTCTCAGGAGCTGATATCAAGGCTATTTGCACTGAGGCTGGTC
TTCTTGCTCTCAGGGAGCGTCGTATGAAGGTGACTCATCCGGATTTCAAGAAAGCCAAAG
AGAAGGTTATGTTCAAGAAGAAAGAAGGCGTCCCTGAAGGCCTTTACATGTAAAATCATC
ATCATATCGTCATCCTCCTCTACACTTTGCTTATGTTACATTTGCTTCTGCTTAGGATCT
TGACTTATGTCGTATGATTTTCCTTCAAATAACAA

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1EN85JQ 685 0 0
CTTGAGAGTTGTTGGTAGTGAACTGATTCAGAAGTATCTGGGAGATGGTCCCAAGCTTGT
GAGGGAGCTTTTCAGAGTTGCTGATGACCTTTCACCTTCAATAGTCTTCATTGACGAGAT
TGATGCTGTTGGTACCAAGCGGTATGATGCTAACTCAGGAGGTGAGCGTGAGATCCAAAG
GACTATGTTGGAACTTCTGAACCAGCTTGATGGATTCGATTCAAGAGGAGACGTAAAGGT
CATCCTTGCAACAAACAGAATCGAGAGTCTTGACCCTGCACTTCTTCGACCTGGACGTAT
TGATAGGAAGATCGAGTTCCCACTTCCAGACATCAAAACGAGAAGACGCATCTTCCAGAT
ACACACATCAAAGATGACTCTGTCGGAAGATGTAAACTTGGAAGAGTTTGTGATGACGAA
GGATGAGTTCTCAGGAGCTGATATCAAGGCTATTTGCACTGAGGCTGGTCTTCTTGCTCT
CAGGGAGCGTCGTATGAAGGTGACTCATCCGGATTTCAAGAAAGCCAAAGAGAAGGTTAT
GTTCAAGAAGAAAGAAGGCGTCCCTGAAGGCCTTTACATGTAAAATCATCATCATATCGT
CATCCTCCTCTACACTTTGCTTATGTTACATTTGCTTCTGCTTAGGATCTTGACTTATGT
CGTATGATTTTCCTTCAAATAACAA

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 10

CO CL167Contig1 997 10 19 U
GGAAAGACATAAATGTGCACCTCACCTTATCAAACCTAAAAGTCAGCAAACCAAAGGCAT
ATTCCTCTTTTCCTCATAAGCCTTATTTTCCACATTCAGATTCAAGAATCCATGGCGATC
ACGAAGCTCCTCTTAGCTTCACTTCTAATATGCTCCATGATCCAATCC*AGTCATGGTGC
TACCAAAGAGAGACTCTTCACCGACCTGGAGAAAGGTGCACTTGAAGTCACCGCTACACC
CAGCCGAACTGGAGGTGTCGTTTTGGCTGCCGGAGTTGATAAGCTGAGCATTACATGGAA
GGTAAGCTCGACGGCTACAAAGGAGGCTGAATTTAAGATCATTAAAGTAAAGCTATGCTA
CGCTCCGGTCAGCCAA*GTGGACCGACCATGGCGCAAGACCCATAATGAGCTCTTCAAGG
ACAAGAGCTGCCCACACAAGATCTCTTCATTT*CCCTATGACCCC*ACTGTCAAAACCGC
TCAATCATTCGACTATACCC*TCGAGCGCGACATCCCC*ACAGGGACCTACTACGTTCGT
GCCTACGCAGTTGATGCCCAGGACCATGAAGTTGCCTTTGGACAGACCACAAACGAGGCC
AAAACAACCAATCTCTTCAGCGTTCAGGCTATTAGTGGCCGCCACAAATCCTTAGATATT
GCCTCTGTCTGTTTCAGCATCTTCTCCGTCGTGGCTCTTCTCGTCTTCTTTGTTAACGAA
AAGAGGAAGGCCAAGATAGAGCAAAGCAAATGAGCCGTTTGCGTATTGCGACGTTGAACA
AAAAGGCGTTGACTTTAAATTTTCATTCCTATCAATTGCGTATGTTTGTTAAAGTTTCTT
TGTTAAAACGCTTACTTCTTACTTCTTACTTCCTCTTTCCTTTGTACCTTTATTTACATG
TTTGTATGGTTATATAAGCCACTCATATGGGACCAAAAAGAACTACTAATCCTACGGTGG
TGATGTGTTATATGCTTTCTAAATTCTTACCACAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 20 50 20 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 15 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 0 45 45 45 45 15 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AE42JQ C 94
AF RS1AE42TF U 164
AF RS1F036TF U 1
AF RS1DF69TF U 29
AF RS1D424TF U 30
AF RS1GY02TF U 30
AF RS1FA70TF U 32
AF RS1F763TF U 28
AF RS1F036JQ C 332
AF RS1DF69JQ C 307
BS 1 238 RS1F036TF
BS 239 239 RS1F763TF
BS 240 464 RS1F036TF
BS 465 465 RS1F763TF
BS 466 587 RS1F036TF
BS 588 588 RS1F763TF
BS 589 602 RS1F036TF
BS 603 603 RS1F763TF
BS 604 635 RS1F036TF
BS 636 777 RS1F763TF
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BS 784 807 RS1DF69JQ
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BS 809 864 RS1DF69JQ
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BS 868 874 RS1F036JQ
BS 875 997 RS1DF69JQ

RD RS1AE42JQ 297 0 0
ATTCAGATTCAAGAATCCATGGCGATCACGAAGCTCCTCTTAGCTTCACTTCTAATATGC
TCCATGATCCAATCCCAGTCATGGTGCTACCAAAGAGAGACTCTTCACCGACCTGGAGAA
AGGTGCACTTGAAGTCACCGCTACACCCAGCCGAACTGGAGGTGTCGTTTTGGCTGCCGG
AGTTGATAAGCTGAGCATTACATGGAAGGTAAGCTCGACGGCTACAAAGGAGGCTGAATT
TAAGATCATTAAAGTAAAGCTATGCTACGCTCCGGTCAGCCAAAGTGGACCGACCAT

QA 1 297 1 297
DS 

RD RS1AE42TF 414 0 0
AATCC*AGTCATGGTGCTACCAAAGAGAGACTCTTCACCGACCTGGAGAAAGGTGCACTT
GAAGTCACCGCTACACCCAGCCGAACTGGAGGTGTCGTTTTGGCTGCCGGAGTTGATAAG
CTGAGCATTACATGGAAGGTAAGCTCGACGGCTACAAAGGAGGCTGAATTTAAGATCATT
AAAGTAAAGCTATGCTACGCTCCGGTCAGCCAA*GTGGACCGACCATGGCGCAAGACCCA
TAATGAGCTCTTCAAGGACAAGAGCTGCCCACACAAGATCTCTTCATTTTCCCTATGACC
CCCACTGTCAAAACCGCTCAATCATTCGACTATACCCCTCGAGCGCGACATCCCCCACAG
GGACCTACTACGTTCGTGCCTACGCAGTTGATGCCCAGGACCATGAAGTTGCCT

QA 1 414 1 414
DS 

RD RS1F036TF 635 0 0
GGAAAGACATAAATGTGCACCTCACCTTATCAAACCTAAAAGTCAGCAAACCAAAGGCAT
ATTCCTCTTTTCCTCATAAGCCTTATTTTCCACATTCAGATTCAAGAATCCATGGCGATC
ACGAAGCTCCTCTTAGCTTCACTTCTAATATGCTCCATGATCCAATCC*AGTCATGGTGC
TACCAAAGAGAGACTCTTCACCGACCTGGAGAAAGGTGCACTTGAAGTCACCGCTACATC
CAGCCGAACTGGAGGTGTCGTTTTGGCTGCCGGAGTTGATAAGCTGAGCATTACATGGAA
GGTAAGCTCGACGGCTACAAAGGAGGCTGAATTTAAGATCATTAAAGTAAAGCTATGCTA
CGCTCCGGTCAGCCAA*GTGGACCGACCATGGCGCAAGACCCATAATGAGCTCTTCAAGG
ACAAGAGCTGCCCACACAAGATCTCTTCATTT*CCCTATGACCCA*ACTGTCAAAACCGC
TCAATCATTCGACTATACCC*TCGAGCGCGACATCCCC*ACAGGGACCTACTACGTTCGT
GCCTACGCAGTTGATGCCCAGGACCATGAAGTTGCCTTTGGACAGACTACAAACGAGGCC
AAGACAACCAATCTCTTCAGCGTTCAGGCTATTAG

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1DF69TF 678 0 0
GGA
AAACCTAAAAGTCAGCAAACCAAAGGCATATTCCTCTTTTCCTCATAAGCCTTATTTTCC
ACATTCAGATTCAAGAATCCATGGCGATCACGAAGCTCCTCTTAGCTTCACTTCTAATAT
GCTCCATGATCCAATCC*AGTCATGGTGCTACCAAAGAGAGACTCTTCACCGACCTGGAG
AAAGGTGCACTTGAAGTCACCGCTACACCCAGCCGAA*TGGAGGTGTCGTTTTGGCTGCC
GGAGTTGATAAGCTGAGCATTACATGGAAGGTAAGCTCGACGGCTACAAAGGAGGCTGAA
TTTAAGATCATTAAAGTAAAGCTATGCTACGCTCCGGTCAGCCAA*GTGGACCGACCATG
GCGCAAGACCCATAATGAGCTCTTCAAGGACAAGAGCTGCCCACACAAGATCTCTTCACT
T*CCCTATGACCCC*ACTGTCAAAACCGCTCAATCATTCGACTATACCC*TCGAGCGCGA
CATCCCC*ACAGGGACCTACTACGTTCGTGCCTACGCAGTTGATGCCCAGGACCATGAAG
TTGCCCTTGGACAGACCACAAACGAGGCCAAAACAACCAATCTCTTCAGTGTTCAGGCTA
TTAGTGGCCGCCACAAATCCTTAGATATTGCCTCTGTCTGTTTCAGCATCTTCTCCGTCG
TGGCTCTTCTCGTCT

QA 4 678 4 678
DS 

RD RS1D424TF 688 0 0
GG
AAACCTAAAAGTCAGCAAACCAAAGGCATATTCCTCTTTTCCTCATAAGCCTTATTTTCC
ACATTCAGATTCAAGAATCCATGGCGATCACGAAGCTCCTCTTAGCTTCACTTCTAATAT
GCTCCATGATCCAATCC*AGTCATGGTGCTACCAAAGAGAGACTCTTCACCGACCTGGAG
AAAGGTGCACTTGAAGTCACCGCTACACCCAGCCGAACTGGAGGTGCCGTTTTGGCTGCC
GGAGTTGATAAGCTGAGCATTACATGGAAGGTAAGCTCGACGGCTACAAAGGAGGCTGAA
TTTAAGATCATTAAAGTAAAGCTATGCTACGCTCCGGTCAGCCAA*GTGGACCGACCATG
GCGCAAGACCCATAATGAGCTCTTCAAGGACAAGAGCTGCCCACACAAGATCTCTTCATT
T*CCCTATGACCCC*ACTGTCAAAACCGCTCAATCATTCGACTATACCC*TCGAGCGCGA
CATCCCC*ACAGGGACCTACTACGTTCGTGCCTACGCAGTTGATGCCCAGGACCATGAAG
TTGCCTTTGGACAGACCACAAACGAGGCCAAAACAACCAATCTCTTCAGTGTTCAGGCTA
TTAGTGGCCGCCACAAATCCTTAGATATTGCCTCTGTCTGTTTCAGCATCTTCTCCGTCG
TGGCTCTTCTCGTCTTCTTTGTTAAC

QA 3 688 3 688
DS 

RD RS1GY02TF 697 0 0
GG
AAACCTAAAAGTCAGCAAACCAAAGGCATATTCCTCTTTTCCTCATAAGCCTTATTTTCC
ACATTCAGATTCAAGAATCCATGGCGATCACGAAGCTCCTCTTAGCTTCACTTCTAATAT
GCTCCATGATCCAATCC*AGTCATGGTGCTACCAAAGAGAGACTCTTCACCGACCTGGAG
AAAGGTGCACTTGAAGTCACCGCTACACCCAGCCGAACTGGAGGTGTCGTTTTGGCTGCC
GGAGTTGATAAGCTGAGCATTACATGGAAGGTAAGCTCGACGGCTACAAAGGAGGCTGAA
TTTAAGATCATTAAAGTAAAGCTATGCTACGCTCCGGTCAGCCAA*GTGGACCGACCATG
GCGCAAGACCCATAATGAGCTCTTCAAGGACAAGAGCTGCCCACACAAGATCTCTTCATT
T*CCCTATGACCCA*ACTGTCAAAACCGCTCAATCATTCGACTATACCC*TCGAGCGCGA
CATCCCC*ACAGGGACCTACTACGTTCGTGCCTACGCAGTTGATGCCCAGGACCATGAAG
TTGCCTTTGGACAGACTACAAACGAGGCCAAGACAACCAATCTCTTCAGCGTTCAGGCTA
TTAGTGGCCGCCACAAATCCTTAGATATTGCCTCTGTCTGTTTCAGCGTCTTCTCCGTCG
TGGCTCTTCTCGTCTTCTTTGTTAACGAAAAGAGG

QA 3 697 3 697
DS 

RD RS1FA70TF 694 0 0
GG
ACCTAAAAGTCAGCAAACCAAAGGCATATTCCTCTTTTCCTCATAAGCCTTATTTTCCAC
ATTCAGATTCAAGAATCCATGGCGATCACGAAGCTCCTCTTAGCTTCACTTCTAATATGC
TCCATGATCCAATCC*AGTCATGGTGCTACCAAAGAGAGACTCTTCACCGACCTGGAGAA
AGGTGCACTTGAAGTCACCGCTACACCCAGCCGAACTGGAGGTGTCGTTTTGGCTGCCGG
AGTTTATAAGCTGAGCATTACATGGAAGGTAAGCTCGACGGCTACAAAGGAGGCTGAATT
TAAGATCATTAAAGTAAAGCTATGCTACGCTCCGGTCAGCCAA*GTGGACCGACCATGGC
GCAAGACCCATAATGAGCTCTTCAAGGACAAGAGCTGCCCACACAAGATCTCTTCATTT*
CCCTATGACCCA*ACTGTCAAAACCGCTCAATCATTCGACTATACCC*TCGAGCGCGACA
TCCCC*ACAGGGACCTACTACGTTCGTGCCTACGCAGTTGATGCCCAGGACCATGAAGTT
GCCTTTGGACAGACTACAAACGAGGCCAAGACAACCAATCTCTTCAGCGTTCAGGCTATT
AGTGGCCGCCACAAATCCTTAGATATTGCCTCTGTCTGTTTCAGCGTCTTCTCCGTCGTG
GCTTCT*TCGTCTTCTTTGTTAACGAAAAGAG

QA 3 694 3 694
DS 

RD RS1F763TF 756 0 0
GGGA
AAACCTAAAAGTCAGCAAACCAAAGGCATATTCCTCTTTTCCTCATAAGCCTTATTTTCC
ACATTCAGATTCAAGAATCCATGGCGATCACGAAGCTCCTCTTAGCTTCACTTCTAATAT
GCTCCATGATCCAATCC*AGTCATGGTGCTACCAAAGAGAGACTCTTCACCGACCTGGAG
AAAGGTGCACTTGAAGTCACCGCTACACCCAGCCGAACTGGAGGTGTCGTTTTGGCTGCC
GGAGTTGATAAGCTGAGCATTACATGGAAGGTAAGCTCGACGGCTACAAAGGAGGCTGAA
TTTAAGATCATTAAAGTAAAGCTATGCTACGCTCCGGTCAGCCAA*GTGGACCGACCATG
GCGCAAGACCCATAATGAGCTCTTCAAGGACAAGAGCTGCCCACACAAGATCTCTTCATT
T*CCCTATGACCCC*ACTGTCAAAACCGCTCAATCATTCGACTATACCC*TCGAGCGCGA
CATCCCC*ACAGGGACCTACTACGTTCGTGCCTACGCAGTTGATGCCCAGGACCATGAAG
TTGCCTTTGGACAGACCACAAACGAGGCCAAAACAACCAATCTCTTCAGTGTTCAGGCTA
TTAGTGGCCGCCACAAATCCTTAGATATTGCCTCTGTCTGTTTCAGCATCTTCTCCGTCG
TGGCTCTTCTCGTCTTCTTTGTTAACGAAAAGAGGAAGGCCAAGATAGAGCAAAGCAAAT
GAGCCGTTTGCGTATTGCGACGTTGAGCAAAA

QA 5 756 5 756
DS 

RD RS1F036JQ 592 0 0
TTTAAGATCATTAAAGTAAAGCTATGCTACGCTCCGGTCAGCCAA*GTGGACCGACCATG
GCGCAAGACCCATAATGAGCTCTTCAAGGACAAGAGCTGCCCACACAAGATCTCTTCATT
T*CCCTATGACCCA*ACTGTCAAAACCGCTCAATCATTCGACTATACCC*TCGAGCGCGA
CATCCCC*ACAGGGACCTACTACGTTCGTGCCTACGCAGTTGATGCCCAGGACCATGAAG
TTGCCTTTGGACAGACTACAAACGAGGCCAAGACAACCAATTTTTTCAGCGTTCAGGCTA
TTAGTGGCCGCCACAAATCCTTAGATATTGCCTCTGTCTGTTTCAGCGTTTTTTCCGTCG
TGGCTCTTTTCGTTTTCTTTGTTAACGAAAAGAGGAAGGCCAAGATAGAGCAAAGCAAAT
GAGCCGTTTGCGTATTGCGACGTTGAACAAAAAGGCGTTGACTTTAAATTTTCATTCCTA
TCAATTGCGTATGTTTGTTAAAGTTTCTTTGTTAAAACGCTTACTTCTTACTTCTTACTT
CCTCTTTCCTTTGTACCTTTATTTACATGTTTGTATGGTTATATAAGCCACT

QA 1 592 1 592
DS 

RD RS1DF69JQ 691 0 0
CTCGACGGCTACAAAGGAGGCTGAATTTAAGATCATTAAAGTAAAGCTATGCTACGCTCC
GGTCAGCCAA*GTGGACCGACCATGGCGCAAGACCCATAATGAGCTCTTCAAGGACAAGA
GCTGCCCACACAAGATCTCTTCACTT*CCCTATGACCCC*ACTGTCAAAACCGCTCAATC
ATTCGACTATACCC*TCGAGCGCGACATCCCC*ACAGGGACCTACTACGTTCGTGCCTAC
GCAGTTGATGCCCAGGACCATGAAGTTGCCCTTGGACAGACCACAAACGAGGCCAAAACA
ACCAATTTTTTCAGTGTTCAGGCTATTAGTGGCCGCCACAAATCCTTAGATATTGCCTCT
GTCTGTTTCAGCATTTTTTCCGTCGTGGCTCTTTTCGTTTTCTTTGTTAACGAAAAGAGG
AAGGCCAAGATAGAGCAAAGCAAATGAGCCGTTTGCGTATTGCGACGTTGAACAAAAAGG
CGTTGACTTTAAATTTTCATTTCTATCAATTGCGTATGTTTGTTAAAGTTTCTTTGTTAA
AACGCTTACTTCTTACTTTTT*******CTTTCCTTTGTACCTTTATTTACATGTTTGTA
TGGTTATATAAGCCACTCATATGGGACCAAAAAGAACTACTAATCCTACGGTGGTGATGT
GTTATATGCTTTCTAAATTCTTACCACAGAG

QA 1 691 1 691
DS 



AS 2 7

CO CL168Contig1 994 5 21 U
CATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATCAGTCGACGGTACCGGACATATGCC
CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGCCGACAATGGCGATTTCCGCAACTCATTGCTTC
TCCTTCTCCTCTTCATCGCTCTATCCGTCTCCATCTTCAAGATCTCCATTATTTTCGAAA
CTAAACCGTGGGGTTCAATTCATGTATCTATCTCGGAAAAATGACGTATCATGTCTCTCT
GCCCACCAAGCTTCACCAACTAATCGTGAAGAAACGAATTCAAAGCACCCACCAGATGTA
AAAACCCTGATTAAAGCTTATAAACAAGCTCTCTTCAATGGAGACGAACTCACCGTTACA
GAGATCGAAACGGTTTTTTGTGAAATCGAGAAGGAAAAGAATAGATTCGACCACAAGGTT
TTATCATTATCAATGAAGGTAGCTTCAGAGAAGGACACGAAAATCAGGTTGCAGGCTGAT
TTTGACAATACAAGGAAAAAGCTTGACAAGGATCGGCTTAGCACAGAGTCAAACGCAAAA
GTGCAAATCATGAAGAGTCTCTTGCCACTCGTTGATAGTTTTGAGAGCGCTAGGCAACAG
ACTAAACCCAATACAGAAATGGAGAAGAAGATCGATACGAGTTATCAGGGAATTTACAGG
CAATTCGTTGAAGTGTTGAGACACCTTCGTGTTAAAGCCATTCCAACTCTGGGCAAGCCT
TTTGATCCTTTGTTGCACGAGGCTACTTCGCGAGAAGAATCCGAGGCGGTTAAAGTAGGG
ATAATAACCGAGGATCTTACCCGGGGTTTTCTTCTAGGAGATCGGGTTTTGAGACCAGCA
AAGGTTAAAGTCTCTCTAGGACCCATCAAGAAGAAGACTGCTTCACCTTTTGCTTGAGTT
GATGTTTGGTAAATGGTTCTATGTGTCTTTGTGTTTAACTCAACTTCTTTCTTTTTCAAC
GGTAAACACACAAACATAGCTATATCTGATTAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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QA 1 342 1 342
DS 

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QA 12 589 12 589
DS 

RD RS1A302TV 776 0 0
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GCGATTTCCGCAACTCATTGCTTCTCCTTCTCCTCTTCATCGCTCTATCCGTCTCCATCT
TCAAGATCTCCATTATTTTCGAAACTAAACCGTGGGGTTCAATTCATGTATCTATCTCGG
AAAAATGACGTATCATGTCTCTCTGCCCACCAAGCTTCACCAACTAATGGTGAAGAAACG
AATTCAAAGCACCCACCAGATGTAAAAACCCTGATTAAAGCTTATAAACAAGCTCTCTTC
AATGGAGACGAACTCACCGTTACAGAGATCGAAACGGTTTTTTGTGAAATCGAGAAGGAA
AAGAATAGATTCGACCACAAG*TTTTATCATTATCAATGAAGATAGCTTCAGAGAAGGAC
ACGAAAATCAGGTTGCAGGCTGATTTTGACAATACAAGGAAAAAGCTTGACAAGGATCGG
CTTAGCACAGAGTCAAACGCAAAAGTGCAAATCATGAAGAGTCTCTTGCCGCTCGTTGAT
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GAATCTGAGGCGGTTAAAGTAGGGATGATAACCGAGGGGCTTACCCGGGGTTTTCT

QA 1 776 1 776
DS 

RD RS1EM37TF 735 0 0
GGAAATCCGGT
CCGACAATGGCGATTTCCGTAACTCATTGCTTCTCCTTCTCCTCTTCATCGCTCTATCCG
TCTCCATCTTCAAGATCTCCATTATTTTCGAAACTAAACCGTGGGGTTCAATTCATGTAT
CTATCTCGGAAAAATGACGTATCATGTCTCTCTGCCCACCAAGCTTCACCAACTAATCGT
GAAGAAACGAATTCAAAGCACCCACCAGATGTAAAAACCCTGATTAAAGCTTATAAACAA
GCTCTCTTCAATGGAGACGAACTCACCGTTACAGAGATCGAAACGGTTTTTTGTGAAATC
GAGAAGGAAAAGAATAGATTCGACCACAAGGTTTTATCATTATCAATGAAGGTAGCTTCA
GAGAAGGACACGAAAATCAGGTTGCAGGCTGATTTTGACAATACAAGGAAAAAGCTTGAC
AAGGATCGGCTTAGCACAGAGTCAAACGCAAAAGTGCAAATCATGAAGAGTCTCTTGCCA
CTCGTTGATAGTTTTGAGAGCGCTAGGCAACAGACTAAACCCAATACAGAAATGGAGAAG
AAGATCGATACGAGTTATCAGGGAATTTACAGGCAATTCGTTGAAGTGTTGAGACACCTT
CGTGTTAAAGCCATTCCAACTCTGGGCAAGCCTTTTGATCCTTTGTTGCACGAG*CTACT
TCGCGAGAAGAATCCGAGGCGGTTAA*GTAGGGATAATAACCGAGGATCTTACCCGGG
TTTCTT

QA 12 729 12 729
DS 

RD RS1EM37JQ 816 0 0
AACTAAACCGTGGGGTTCAATTCATGTATCTATCTCGGAAAAATGACGTATCATGTCTCT
CTGCCCACCAAGCTTCACCAACTAATCGTGAAGAAACGAATTCAAAGCACCCACCAGATG
TAAAAACCCTGATTAAAGCTTATAAACAAGCTCTCTTCAATGGAGACGAACTCACCGTTA
CAGAGATCGAAACGGTTTTTTGTGAAATCGAGAAGGAAAAGAATAGATTCGACCACAAGG
TTTTATCATTATCAATGAAGGTAGCTTCAGAGAAGGACACGAAAATCAGGTTGCAGGCTG
ATTTTGACAATACAAGGAAAAAGCTTGACAAGGATCGGCTTAGCACAGAGTCAAACGCAA
AAGTGCAAATCATGAAGAGTCTCTTGCCACTCGTTGATAGTTTTGAGAGCGCTAGGCAAC
AGACTAAACCCAATACAGAAATGGAGAAGAAGATCGATACGAGTTATCAGGGAATTTACA
GGCAATTCGTTGAAGTGTTGAGACACCTTCGTGTTAAAGCCATTCCAACTCTGGGCAAGC
CTTTTGATCCTTTGTTGCACGAGGCTACTTCGCGAGAAGAATCCGAGGCGGTTAAGGTAG
GGATAATAACCGAGGATCTTACCCGGGGTTTTCTTCTAGGAGATCGGGTTTTGAGACCAG
CAAAGGTTAAAGTCTCTCTAGGACCCATCAAGAAGAAGACTGCTTCACCTTTTGCTTGAG
TTGATGTTTGGTAAATGGTTCTATGTGTCTTTGTGTTTAACTCAACTTCTTTCTTTTTCA
ACGGTAAACACACAAACATAGCTATATCTGATTAGG

QA 1 816 1 816
DS 



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TAGCCATGTTTGTGTGTTACCATTGAAAAAAAAGAAATTGACTAGAACACAAAGAAACAT
AGAACCACTTTCCAAACATATCAACTTAAGCAGAAGGTGTAGTCTCGTCAGCAGGTGATC
AAGCAGTTTTCTTCTTGATGGGTCCTAGAGAGACTTTAACCTTTGCTGGTCTCAGAACCC
GATCTCCTAGAAGAAAACCCCTGGTAAAGCTCCCGGTTATCATCCCTACCTTAACCGCCT
CAGATTCTTCTCGCGAAATAGCCTCGTGCAACAAAGGATCAAATGGCTTGCCCAAAGTTG
GAATGGCTTTAACACGAAGGTGTCTCAAGACTTCAACGAATTGCCTGTAAATTCCCTGAT
AACTCGTATCGATCTTCTTCTCCATCTCTGTATCGGATTTAATCTGTTGCCTAGCGCTCT
CAAAACTATCAATGAGTGGCAAGAGACTCTTCATGATTTGCAATTTAGCGTTTGACTCTG
TGCTAAGCCGATCCTTGTCAAGCTTTTTCCTTGTATTGTCAAAATCAGCCTGCAACCTGA
TTTTCGTGTCCTTCTCTGAAGCTATCTTCATTGATAATGACAAAACCTTATGGTCGAATC
TGTTCTTTTCCTTCTCGATTTCGCAAAATACCGTTTCGATTTCCGTAACGGAGAGTTCGT
CTCCGTTGGAGAGAGCTTGTTTATAAGCTTTAATCAGGGCTTTTACATCTGGTGGTTGCT
TTGAATTCGTTTCTTCACCATTATTATTAGTTGGTGAAGAAGCTTGGTGAGCAGAGAGAG
ATGATACGTAACTTCTCCGACTAGATACACACATGAACTGAACACCTCGGTTTAGTTTCG
AAATGAATGGAGATGAAGGTCGTCTGCAATGGAAATGGATGGGTATGATTCTCGATTTTC
CTGATGAAGATGGCGGAGGAGGATAGAGCGACGATGAAGAGGATGAGGAGGAGAAGCAAT
GAGTTACGGAAATCGCCATTGTCGGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TTCAACGAATTGCCTGTAAATTCCCTGATAACTCGTATCGATCTTCTTCTCCATCTCTGT
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DS 



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BQ
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AF RS1DY21JQ U 94
AF RS1DV73JQ U 94
AF RS1DV73TF C 313
AF RS1EU85TF C 443
AF RS1E830TF C 652
AF RS1GF59TF C 680
AF RS1DY21TF C 704
BS 1 117 RS1GF59JQ
BS 118 118 RS1E830JQ
BS 119 240 RS1GF59JQ
BS 241 241 RS1E830JQ
BS 242 363 RS1GF59JQ
BS 364 364 RS1DV73JQ
BS 365 390 RS1GF59JQ
BS 391 391 RS1DV73JQ
BS 392 432 RS1GF59JQ
BS 433 433 RS1DV73JQ
BS 434 714 RS1GF59JQ
BS 715 780 RS1E830JQ
BS 781 807 RS1DV73JQ
BS 808 954 RS1DV73TF
BS 955 955 RS1EU85TF
BS 956 966 RS1DV73TF
BS 967 967 RS1EU85TF
BS 968 978 RS1DV73TF
BS 979 979 RS1EU85TF
BS 980 1014 RS1DV73TF
BS 1015 1172 RS1EU85TF
BS 1173 1342 RS1E830TF
BS 1343 1363 RS1DY21TF

RD RS1GF59JQ 714 0 0
GCTCTCAGAAAGCCGTTCTTTATTATCTAATATACAAAAGAGGCAAATAGATTTTTTTTC
CGGTTTTTCCCTTTTTTGAATTTTAAATAAAAATATAAAAACATGGTTACACTTAAAGGT
TAAAAGTAAGCACACTGTTTTAGCATGTATACATAAACCCGACACAACAAAACAAACAAT
CAAAGTTCTAAAAGACATAACATTTCATTTATTTCTATTGGCAATAAAATTAGTAAGAGC
CACTAAAGGTGCCACCTTCTCCGTAGTAAACCCATGAAGATGTTGACGTGCATCTATAGT
CAATCTCTTAACAAATTCTTTGGATTTCTCCAACCCCATCAGCTTGGGGTACGTCAGCTT
TCCCAGTAGCTGATCTTTTCCGGCGGTTTTTCCCAATTCCTCCGACGACTTGGTCTCGTC
CAAAATATCATCCACCACCTGAAACAACAATCCAATGCACCTGGCAAACTTTCTTACACT
CTCAATCTCTTCATCAGATCCACCACCAATAATGGCTCCAAGAACCGCAGCAGTTTCCAA
CAAAACAGCAGTTTTGTGTACATGGATAAACTCCAAATGCTCTAAACCGACGTCGTTCAA
CTCCAAACCTTCACTACTTATGTCCTTGGCTTGTCCCGCGACTAACCCTCTAGTTCCAAT
GGACCTAGCCAGTTCCCTGACCGCCCAAACCATTCTATCCGAGGATATCTCCGC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RS1EU85JQ 613 0 0
AC
AAAAACATGGTTACACTTAAAAGTTAAAAGTAAGCACACTGTTTTAGCATGTATACATAA
ACCCGACACAACAAAACAAACAATCAAAGTTCTAAAAGACATAACATTTCATTTATTTCT
ATTGGCAATAAAATTAGTAAGAGCTACTAAAGGTGCCACCTTCTCCGTAGTAAACCCATG
AAGATGTTGACGTGCATCTATAGTCAATCTCTTAACAAATTCTTTGGATTTCTCCAACCC
CATCAGCTTGGGGTACGTCAGCTTTCCCAGTAGCTGATCTTTTCCGGCGGTTTTTCCCAA
TTCCTCCGACGACTTGGTCTCGTCCAAAATATCATCCACCACCTGAAACAACAATCCAAT
GCACCTGGCAAACTTTCTTACACTCTCAATCTCTTCATCAGATCCACCACCAATAATGGC
TCCAAGAACCGCAGCAGTTTCCAACAAAACAGCAGTTTTGTGTACATGGATAAACTCCAA
ATGCTCTAAACCGACGTCGTTCAACTCCAAACCTTCACTACTTATGTCCTTGGCTTGTCC
CGCGACTAACCCTCTAGTTCCAATGGACCTAGCCAGTTCCCTGACCGCCCAAACCATTCT
ATCCGAGGATA

QA 3 613 3 613
DS 

RD RS1E830JQ 703 0 0
GAATTTTAAATAAAAATATAAAAACATGGTTACACTTAAAAGTTAAAAGTAAGCACACTG
TTTTAGCATGTATACATAAACCCGACACAACAAAACAAACAATCAAAGTTCTAAAAGACA
TAACATTTCATTTATTTCTATTGGCAATAAAATTAGTAAGAGCTACTAAAGGTGCCACCT
TCTCCGTAGTAAACCCATGAAGATGTTGACGTGCATCTATAGTCAATCTCTTAACAAATT
CTTTGGATTTCTCCAACCCCATCAGCTTGGGGTACGTCAGCTTTCCCAGTAGCTGATCTT
TTCCGGCGGTTTTTCCCAATTCCTCCGACGACTTGGTCTCGTCCAAAATATCATCCACCA
CCTGAAACAACAATCCAATGCACCTGGCAAACTTTCTTACACTCTCAATCTCTTCATCAA
ATCCACCACCAATAATGGCTCCAAGAACCGCAGCAGTTTCCAACAAAACAGCAGTTTTGT
GTACATGGATAAACTCCAAATGCTCTAAACCGACGTCGTTCAACTCCAAACCTTCACTAC
TTATGTCCTTGGCTTGTCCCGCGACTAACCCTCTAGTTCCAATGGACCTAGCCAGTTCCC
TGACCGCCCAAACCATTCTATCCGAGGATATCTCCGCCGTTGTCATGTGCTCAAACGCAA
GAGACAAGAGAGCTCCTCCGGAGAGAATGGCGACTCCTTCGCC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1GC58JQ 693 0 0
GAATTTTAAATAAGAATATAAAAACATGGTTACACTTAAAAGTTAAAAGTAAGCACACTG
TTTTAGCATGTATACATAAACCCGACACAACAAAACAAACAATCAAAGTTCTAAAAGACA
TAACATTTCATTTATTTCTATTGGCAATAAAATTAGTAAGAGCTACTAAAGGTGCCACCT
TCTCCGTAGTAAACCCATGAAGATGTTGACGTGCATCTATAGTCAATCTCTTAACAAATT
CTTTGGATTTCTCCAACCCCATCAGCTTGGGGTACGTCAGCTTTCCCAGTAGCTGATCTT
TTCCGGCGGTTTTTCCCAATTCCTCCGACGACTTGGTCTCGTCCAAAATATCATCCACCA
CCTGAAACAACAATCCAATGCACCTGGCAAACTTTCTTACACTCTCAATCTCTTCATCAG
ATCCACCACCAATAATGGCTCCAAGAACCGCAGCAGTTTCCAACAAAACAGCAGTTTTGT
GTACATGGATAAACTCCAAATGCTCTAAACCGACGTCGTTCAACTCCAAACCTTCACTAC
TTATGTCCTTGGCTTGTCCCGCGACTAACCCTCTAGTTCCAATGGACCTAGCCAGTTCCC
TGACCGCCCAAACCATTCTATCCGAGGATATCTCCGCCGTTGTCATGTGCTCAAACGCAA
GAGACAAGAGAGCTCCTCCGGAGAGAATGGCGA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RS1DY21JQ 634 0 0
TATAAAAACGTGGTTACACTTAAAAGTTAAAAGTAAGCACACTATTTTAGCATGTATGCA
TAAACCCGACACAACAAAACAAACAATCGAAGTTCTAAAAGACATAACATTTCATTTATT
TCTATTGGCAATAAAATTAGTAAGAGCTACTAAAGGTGCCACCTTCTCCGTAGTAAACCC
ATGAAGATGTTGACGTGCATCTTTAGTCAATCTCTTAACAAATTCTTTGGATTTCTCCAA
CCCCATCAGCTTGGGGTACGTCAGCTTTCCAAGTAGCTGATCTTTTCCGGCGGTTTTCCC
CAATTCCTCCGACGACTTGGTCTCGTCCAAAATATCATCAACCACCTGAAACAACAATCC
AATGCACCTAGCAAACTTTCTTACACTCTCAATCTCTTCATCAGATCCACCACCAATAAT
GGCTCCAAGAACCGCAGCAGTTTCCAACAAAACCGCAGTTTTGTGTACATGGATAAACTC
CAAATGCTCTAAACCGACGTCGTTCAGCTCCAAACCTTCACTACTTATGTCCTTGGCTTG
TCCCGCGACTAACCCTCTAGTTCCAATGGACCTAGCCAGTTCCCTGACCGCCCAAACCAT
TCTATCCGAGGATATCTCCGCCGCTGTCATGTGC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1DV73JQ 714 0 0
TATAAAAACGTGGTTACACTTAAAAGTTAAAAGTAAGCACACTATTTTAGCATGTATGCA
TAAACCCGACACAACAAAACAAACAATCGAAGTTCTAAAAGACATAACATTTCATTTATT
TCTATTGGCAATAAAATTAGTAAGAGCTACTAAAGGTGCCACCTTCTCCGTAGTAAACCC
ATGAAGATGTTGACGTGCATCTTTAGTCAATCTCTTAACAAATTCTTTGGATTTCTCAAA
CCCCATCAGCTTGGGGTACGTCAGCTTTCCAAGTAGCTGATCTTTTCCGGCGGTTTTCCC
CAATTCCTCCGACGACTTGGTCTCGTCCAAAATATCATCAACCACCTGAAACAACAATCC
AATGCACCTAGCAAACTTTCTTACACTCTCAATCTCTTCATCAGATCCACCACCAATAAT
GGCTCCAAGAACCGCAGCAGTTTCCAACAAAACCGCAGTTTTGTGTACATGGATAAACTC
CAAATGCTCTAAACCGACGTCGTTCAACTCCAAACCTTCACTACTTATGTCCTTGGCTTG
TCCCGCGACTAACCCTCTAGTTCCAATGGACCTAGCCAGTTCCCTGACCGCCCAAACCAT
TCTATCCGAGGATATCTCCGCCGTTGTCATGTGCTCAAACGCAAGAGACAAGAGAGCTCC
TCCGGAGAGAATGGCGACTCCTTCGCCGTAGGCTTTGTGAGTGGTGGGCTTCCC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RS1DV73TF 702 0 0
AAATTCTTTGGATT*CTCAAACCCCATCAGCTTGGGGTACGTCAGCTTTCCAAGTAGCTG
ATCTTTTCCGGCGGTTTTCCCCAATTCCTCCGACGACTTGGTCTCGTCCAAAATATCATC
AACCACCTGAAACAACAATCCAATGCACCTAGCAAACTTTCTTACACTCTCAATCTCTTC
ATCAGATCCACCACCAATAATGGCTCCAAGAACCGCAGCAGTTTCCAACAAAACCGCAGT
TTTGTGTACATGGATAAACTCCAAATGCTCTAAACCGACGTCGTTCAACTCCAAACCTTC
ACTACTTATGTCCTTGGCTTGTCCCGCGACTAACCCTCTAGTTCCAATGGACCTAGCCAG
TTCCCTGACCGCCCAAACCATTCTATCCGAGGATATCTCCGCCGTTGTCATGTGCTCAAA
CGCAAGAGACAAGAGAGCTCCTCCGGAGAGAATGGCGACTCCTTCGCCGTAGGCTTTGTG
AGTGGTGGGCTTCCCACGACGCAGATCGTCATTGTCCATACAAGGCAAGTCGTCTTTGAT
AAGAGACATGGTGTGGATCATCTCAACCGCACAAGCCGCTGGCATCGCGGCGTTTTCTTC
GCCGCCTACTAGCTCACAAGAAGCGAGGCAGAGAATAGGCCTAACACGTTTACCAGCTGC
AAGAACAGAGTAACGCATGGCTTCGTGGATCTTGAGTGGCTC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RS1EU85TF 733 0 0
AACAACAATCCAATGCACCTGGCAAACTTTCTTACACTCTCAATCTCTTCATCAGATCCA
CCACCAATAATGGCTCCAAGAACCGCAGCAGTTTCCAACAAAACAGCAGTTTTGTGTACA
TGGATAAACTCCAAATGCTCTAAACCGACGTCGTTCAACTCCAAACCTTCACTACTTATG
TCCTTGGCTTGTCCCGCGACTAACCCTCTAGTTCCAATGGACCTAGCCAGTTCCCTGACC
GCCCAAACCATTCTATCCGAGGATATCTCCGCCGTTGTCATGTGCTCAAACGCAAGAGAC
AAGAGAGCTCCTCCGGAGAGAATGGCGACTCCTTCGCCGTAGGCTTTGTGAGTGGTGGGC
TTCCCACGACGCAGATCGTCATTGTCCATACAAGGCAAGTCGTCTTTGATAAGAGACATG
GTGTGGATCATCTCAACCGCACAAGCCGCTGGCATCGCGGCGTTTT**TCGCCGCCTACT
AGCTCACAAGAAGCGAGGCAGAGAATAGGCCTTACACGTTTACCGGCTGCAAGAACCGAG
TAACGCATGGCTTCGTGGATCTTGGGTGGCTCCCCGACAGGTATGGCTTCTTCTAGAGCT
TTGTTCACTGCATCGGCTTTACTCGTCATGTATGGATCAAAATCGAACGTGGAACTAGAA
GTTGTGTATATATCTTCATCTTCTACTACTTCCACAATGGGAGAATCAAGAAACTCGGCT
ACTTCTTTTC
CTC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RS1E830TF 701 0 0
AGTTCCAATGGAC*TAGCCAGTTCCCTGACCGCCCAAACCATTCTATCCGAGGATATCTC
CGCCGTTGTCATGTGCTCAAACGCAAGAGACAAGAGAGCTCCTCCGGAGAGAATGGCGAC
TCCTTCGCCGTAGGCTTTGTGAGTGGTGGGCTTCCCACGACGCAGATCGTCATTGTCCAT
ACAAGGCAAGTCGTCTTTGATAAGAGACATGGTGTGGATCATCTCAACCGCACAAGCCGC
TGGCATCGCGGCGTTTTCTTCGCCGCCTACTAGCTCACAAGAAGCGAGGCAGAGAATAGG
CCTTACACGTTTACCGGCTGCAAGAACCGAGTAACGCATGGCTTCGTGGATCTTGAGTGG
CTCCCCGACAGGTATGGCTTCTTCTAGAGCTTTGTTCACTGCATCGGCTTTACTCGTCAT
GTATGGATCAAAATCGAACGTGGAACTAGAAGTTGTGTATATATCTTCATCTTCTACTAC
TTCCACAATGGGAGAATCAAGAAACTCGGCTACTTCTTTTCTTGATAAAATGGCGGCCTT
GGCTTGAGTTTCAAGAGAAGGCTGGAACACGCGGCTTAGCCTTGGTTTGATATACTGAAA
TAAGAAATTTAGAGAGAGAACGAGGAGTGAGAAATAGAGAAACAGAATTTGAGCTTCCAT
TTCTCATCAAGACAAACTTCT*CTAGCTCGG
ACTATTTTCC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1GF59TF 675 0 0
ACCGCCCAAACCATTCTATCCGAGGATATCTCCGCCGTTGTCATGTGCTCAAACGCAAGA
GACAAGAGAGCTCCTCCGGAGAGAATGGCGACTCCTTCGCCGTAGGCTTTGTGAGTGGTG
GGCTTCCCACGACGCAGATCGTCATTGTCCATACAAGGCAAGTCGTCTTTGATAAGAGAC
ATGGTGTGGATCATCTCAACCGCACAAGCCGCTGGCATCGCGGCGTTTTCTTCGCCGCCT
ACTAGCTCACAAGAAGCGAGGCAGAGAATAGGCCTTACACGTTTACCGGCTGCAAGAACC
GAGTAACGCATGGCTTCGTGGATCTTGAGTGGCTCCCCGACAGGTATGGCTTCTTCTAGA
GCTTTGTTAACTGCATCGGCTTTACTCGTCATGTATGGATCAAAATCGAACGTGGAACTA
GAAGTTGTGTATATATCTTCATCTTCTACTACTTCCACAATGGGAGAATCAAGAAACTCG
GCTACTTCTTTTCTTGATAAAATGGCGGCCTTGGCTTGAGTTTCAAGAGAAGGCTGGAAC
ACGCGGCTTAGCCTTGGTTTGATATACTGAAATAAGAAATTTAGAGAGAGAACGAGGAGT
GAGAAATAGAGAAACAGAATTTGAGCTTCCATTTCTCATCAAGACAAACTTCT*CTAGCT
CGG
ACTATTTGTCCC

QA 1 663 1 663
DS 

RD RS1DY21TF 660 0 0
GATATCTCCGCCGCTGTCATGTGCTCAAACGCAAGAGACAAGAGAGCTCCTCCGGAGAGA
ATGGCGACTCCTTCGCCGTAGGCTTTGTGAGTGGTGGGCTTCCCACGACGCAGATCGTCA
TTGTCCATACAAGGCAAGTCGTCTTTGATAAGAGACATGGTGTGGATCATCTCAACCGCA
CAAGCCGCTGGCATCGCGGCGTTTTCTTCGCCGCCTACTAGCTCACAAGAAGCGAGGCAG
AGAATAGGCCTAACACGTTTACCGGCTGCAAGAACAGAGTAACGCATGGCTTCGTGGATC
TTGAGTGGCTCCCCGGCAGGTATGGCTTCGTCTAGAGCTTTGTTCACTGCATCGGCTTTA
CTCGTCATGTATGGATCAAAATCGAACGTGGAACTAGAAGTGGTATTTATATCTTCATCT
TCTACTACTTCCACAATGGGAGAATCAAGAAACTCGGCTACTTCTTTTCTTGATAAAATG
GCGGCCTTGGCTTGAGTTTCAAGAGAAGGCTGGAACATGCGGCTTAGGCTCGGTTTGATA
TACTGAAATAAGAAATTTAGAGAGAGAACGAGGAGTGAGAAATAGAGCAACAGAATTTGA
GCTTCCATTTTTCATCAAGACAAACTTCTTCTAGCTCGGTGCTATTTCACGTTTGTCTAA

QA 1 660 1 660
DS 



AS 2 12

CO CL170Contig1 561 4 1 U
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ATGACTGACTACAAAGGAATCACAAAGAGGCAGCACGAGGCTGTGTTGGACTGTGTTGAA
GAGATGGGAGATACTGTTGACAGGTTGAGCAAGTCGCTGAAGGAATTGAAGAATCTGGAG
GAAGGAGAGAGCAAAGAAGACTTCTGGTTCTGTTTGAGCAATGTCAGGACATGGACAAGC
GCGGCGCTTACAGATGAGACCACTTGTCTTGATGGGTTTGGAGGGAAAGGCATGGATGGG
GAGCTGAAAAGCTTAGTCAGAGCACACATTGTGCGTGTGGCGCAAGATACCAGCAATGCC
TTGGCTTTGATCAATGTCTATGCTTCCAAGCATTGAAAAATGTTTAAGTTTGGTCTCGAG
GACTTCATGAGTTTCTTTTTATACTTTTGGATTTGGTTTGTATTGTGTTTTCAAGAAATG
TGTTTTTGTTTGATTCAGAGTCATACCAGTTTCTCTTTCCATCTTGTTATATCATCTACG
GTCTATATAGTCTGAAGCTGT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1F619JQ C 1
AF RS1G009JQ C 54
AF RS1F619TF U 1
AF RS1G009TF U 1
BS 1 561 RS1F619TF

RD RS1F619JQ 561 0 0
GAGACAGCGCTTGCCGTTAGCATTGCCCGAGCAAAGTCAGCCAAAACCTATATTTCGGAC
ATGACTGACTACAAAGGAATCACAAAGAGGCAGCACGAGGCTGTGTTGGACTGTGTTGAA
GAGATGGGAGATACTGTTGACAGGTTGAGCAAGTCGCTGAAGGAATTGAAGAATCTGGAG
GAAGGAGAGAGCAAAGAAGACTTCTGGTTCTGTTTGAGCAATGTCAGGACATGGACAAGC
GCGGCGCTTACAGATGAGACCACTTGTCTTGATGGGTTTGGAGGGAAAGGCATGGATGGG
GAGCTGAAAAGCTTAGTCAGAGCACACATTGTGCGTGTGGCGCAAGATACCAGCAATGCC
TTGGCTTTGATCAATGTCTATGCTTCCAAGCATTGAAAAATGTTTAAGTTTGGTCTCGAG
GACTTCATGAGTTTCTTTTTATACTTTTGGATTTGGTTTGTATTGTGTTTTCAAGAAATG
TGTTTTTGTTTGATTCAGAGTCATACCAGTTTCTCTTTCCATCTTGTTATATCATCTACG
GTCTATATAGTCTGAAGCTGT

QA 1 561 1 561
DS 

RD RS1G009JQ 508 0 0
CTCGGACATGACTGACTACAAAGGAATCACAAAGAGGCAGCACGAGGCTGTGTTGGACTG
TGTTGAAGAGATGGGAGATACTGTTGACAGGTTGAGCAAGTCGCTGAAGGAATTGAAGAA
TCTGGAGGAAGGAGAGAGCAAAGAAGACTTCTGGTTCTGTTTGAGCAATGTCAGGACATG
GACAAGCGCGGCGCTTACAGATGAGACCACTTGTCTTGATGGGTTTGGAGGGAAAGGCAT
GGATGGGGAGCTGAAAAGCTTAGTCAGAGCACACATTGTGCGTGTGGCGCAAGATACCAG
CAATGCCTTGGCTTTGATCAATGTCTATGCTTCCAAGCATTGAAAAATGTTTAAGTTTGG
TCTCGAGGACTTCATGAGTTTCTTTTTATACTTTTGGATTTGGTTTGTATTGTGTTTTCA
AGAAATGTGTTTTTGTTTGATTCAGAGTCATACCAGTTTCTCTTTCCATCTTGTTATATC
ATCTACGGTCTATATAGTCTGAAGCTGT

QA 1 508 1 508
DS 

RD RS1F619TF 561 0 0
GAGACAGCGCTTGCCGTTAGCATTGCCCGAGCAAAGTCAGCCAAAACCTATATCTCGGAC
ATGACTGACTACAAAGGAATCACAAAGAGGCAGCACGAGGCTGTGTTGGACTGTGTTGAA
GAGATGGGAGATACTGTTGACAGGTTGAGCAAGTCGCTGAAGGAATTGAAGAATCTGGAG
GAAGGAGAGAGCAAAGAAGACTTCTGGTTCTGTTTGAGCAATGTCAGGACATGGACAAGC
GCGGCGCTTACAGATGAGACCACTTGTCTTGATGGGTTTGGAGGGAAAGGCATGGATGGG
GAGCTGAAAAGCTTAGTCAGAGCACACATTGTGCGTGTGGCGCAAGATACCAGCAATGCC
TTGGCTTTGATCAATGTCTATGCTTCCAAGCATTGAAAAATGTTTAAGTTTGGTCTCGAG
GACTTCATGAGTTTCTTTTTATACTTTTGGATTTGGTTTGTATTGTGTTTTCAAGAAATG
TGTTTTTGTTTGATTCAGAGTCATACCAGTTTCTCTTTCCATCTTGTTATATCATCTACG
GTCTATATAGTCTGAAGCTGT

QA 1 561 1 561
DS 

RD RS1G009TF 561 0 0
GAGACAGCGCTTGCCGTTAGCATTGCCCGAGCAAAGTCAGCCAAAACCTATATCTCGGAC
ATGACTGACTACAAAGGAATCACAAAGAGGCAGCACGAGGCTGTGTTGGACTGTGTTGAA
GAGATGGGAGATACTGTTGACAGGTTGAGCAAGTCGCTGAAGGAATTGAAGAATCTGGAG
GAAGGAGAGAGCAAAGAAGACTTCTGGTTCTGTTTGAGCAATGTCAGGACATGGACAAGC
GCGGCGCTTACAGATGAGACCACTTGTCTTGATGGGTTTGGAGGGAAAGGCATGGATGGG
GAGCTGAAAAGCTTAGTCAGAGCACACATTGTGCGTGTGGCGCAAGATACCAGCAATGCC
TTGGCTTTGATCAATGTCTATGCTTCCAAGCATTGAAAAATGTTTAAGTTTGGTCTCGAG
GACTTCATGAGTTTCTTTTTATACTTTTGGATTTGGTTTGTATTGTGTTTTCAAGAAATG
TGTTTTTGTTTGATTCAGAGTCATACCAGTTTCTCTTTCCATCTTGTTATATCATCTACG
GTCTATATAGTCTGAAGCTGT

QA 1 561 1 561
DS 



CO CL170Contig2 1013 8 31 U
GGAAGACAAACTGTTCCAGCTTATCCTCCTCTCTTATTGATATCCTCATTGCTTCACATT
TATTAACTTTTCAACTAACTCCAGTTTGTGCTCTAGATTCTATTATTTGTATCTGGAACA
TTCTTTAAGCCTCTCTCTCTATAAATCCCTGAACCCTTTTGCTGCTACTCACATTTGTGT
TTGGAACCCAAAATGGCGAAATGTTTAGATCTATCTCTGATTCTCTTTGTTCTGTATGTG
TCCACTGCAGCAATAGCCATGGCCAGAAACCTTGGAGAGGAATCTAGTGAAGATACAGAG
TTCATTAAAGCCTCTTGTGAGACAGCAACGTACCCGAAACTGTGCTTTCAATCTCTGTCT
TCTTACGCAAGCCAGATCAAGAAGCGGCCACTACAGCTCGCGGAGACAGCGCTTGCCGTT
AGCATGGCCCGAGCAAAGTCAGCCAAAACCTATATCTCGGACATGACTGACTACAAAGGA
ATCACAAAGAGGCAGCACGGGGCTGTGTTGGACTGTGCTGAAGAGATGGGAGATACTGTT
GACAGGTTGAGCAAGTCGCTGAAGGAACTGAAGAGTCTGGAGGAAGGGGAAAGGGAAGAA
GACTTCTGGTTCTGTTTGAGCAATGTCAGGACGTGGACAAGCGCGGCGCTTACAGATGAG
ACCACTTGTCTTGATGGGTTTGGAGGGAAAGGCATGGATGGGGAGCTGAAAAGCTTAGTC
AGAGCACACATTGTGCGTGTGGCTCAACATACGAGTAATGCATTGGCTTTGATCAATGTC
TATGCTTCCAAGCATTGAAAAATGTTGCAAAAGTTTGGTCTTGTGGACTTGAGTTTTTTT
TAATACTTTTGGATTTGGTTTGTACTGTGTTTCTATAAGAAGTGTGTTTTGGTTTTGTTC
AGTCATATCTGTTTTCTCTCGCCACCTTGTTATATCATCTATGGTCTACGTAGTTTCAAG
CTGTTGATTTTGATGTTTGATTGGTGATATTTTATATAGTATTGTAAGCCATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 
40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 30 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GGG
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GG
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GG
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CTTGTCTTGATGGGTTTGGAGGGAAAGGCATGGATGGGGAGCTGAAAAGCTTAGTCAGAG
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ACTTTTGGATTTGGTTTGTACTGTGTTTCTATAAGAAGTGTTTTTTGGTTTTGTTCAGT

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ATCTATGGTCTACGTAGTTTCAAGCTGTTGATTTTGATGTTTGATTGGTGATATTTTATA
TAG
C

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DS 

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AGTCAGAGCACACATTGTGCGTGTGGCTCAACATACGAGTAATGCATTGGCTTTGATCAA
TGTCTATGCTTCCAAGCATTGAAAAATGTTGCAAAAGTTTGGTCTTGTGGACTTGAGTTT
TTTTTAATACTTTTGGATTTGGTTTGTACTGTGTTTCTATAAGAAGTGTGTTTTGGTTTT
GTTCAGTCATATCTGTTTTCTCTCGCCACCTTGTTATATCATCTATGGTCTACGTAGTTT
CAAGCTGTTGATTTTGATGTTTGATTGGTGATATTTTATATAGTATTGTAAGCCATG

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DS 



AS 1 8

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GTGTCACACAACGAACATATATATATATA****CTGTTACATAATAGATGTGATATTTTG
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BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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TAGGGATTGGACCAGTCAATTGGTTGTCGTTGAGTCGTAGAAAGACCAGAGACTTCAGTT
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CACACAACGAACATATATATATATATATACTGTTACATAATAGATGTGATATTTTGATAA
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TGCCAGTTGTTTCAGTTGCAGTTGGTGTCGTAGCTTGCAAGACCGATTAGTTCCGGCCCC
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TTCAGTTGCAGTTGGTGTCGTAGCTTGCAAGACCGATTAGTTCCGGCCCCTCCAATCTCG
AGTTGTTCTCAAAGTTCTGCAAAGGAATGTGTCCGAAAGGTCCTTCTGTTGGGATAGTTC
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TAGGGATTGGACCAGTCAATTGGTTGTCGTTGAGTCGTAAAAAGACCAGAGACTTCAGTT
TTCCCAAAGAAGAAGGGATTTTCCCAGTAAGATTGTTGTTGTACAGATCCAAGCTGATGA
GGTTCTTCAGATTTTCAAGTTCAGAAGGTATAGTCCCTTCCATTTTGTTTTTGTACAGCT
CCAAATACTGTAAATGCTCGAGCTTCCCGAGCTCAGGTGCAAGATGTCCTGAAAGGTTTG
AATTACCCAAATCCACACGAGTGACGCGGCTGTCTTGGTTACAGGTGACATGGAACCAGG
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GTGTCACACAACGAACATATATATATA******CTGTTACATAATAGATGTGATATTTTG
ATAAAGTGGTGAAGTGTTCTTCTAAGGTCTCACCCCCTCATTTCTTGTTTTTTTTCAGGT
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TTTCGTGAGTTCTTTAGGGATTGGACCAGTCAATTGGTTGTCGTTGAGTCGTAGAAAGAC
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GTTTTTGTACAGCTCCAAATACTGTAAATGCTCGAGCTTCCCGAGCTCAGGTGCAAGATG
TCCTGAAAGGTTTGAATTACCCAAATCCACACGAGTGACGCGGCTGTCTTGGTTACAGGT
GACATGGAACCAGGTACAAGGGTTAACAAGAGTTGGATCCCAGCTCTGGAGCACATGGTC
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CGAGCTTCCCGAGCTCAGGTGCAAGATGTCCTGAAAGGTTTGAATTACCCAAATCCACAC
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CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT
CTCTGTGTTGAAGT

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TTACCCAAATCCACACGAGTGACGCGGCTGTCTTGGTTACAGGTGACATGGAACCAGGTA
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GCTAAAGTCAGGGCTAGAGAAGCCGCGAGGAGCTCCCACCGACAGTTTCGGAACGCCATC
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AATTGATTGATTAT
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CTCTCT****CTGTGTTGAAGTTCAATTGATTGATTATCCCCCGGCCGTAATGGCCGAAT
TCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

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TCCCGAGCTCAGGTGCAAGATGTCCTGAAAGGTTTGAATTACCCAAATCCACACGAGTGA
CGCGGCTGTCTTGGTTACAGGTGACATGGAACCAGGTACAAGGGTTAACAAGAGTTGGAT
CCCAGCTCTGGAGCACATGGTCTGGATCCGATAAGCTCCTGCGAAGAGCGTAAAGGGCAT
CTCCTTCCGAGTTCGCATCCACCGGGTGGTGAATCAGAGCTAAAGTCAGGGCTAGAGAAG
CCGCGAGGAGCTCCCACCGACAGTTTCGGAACGCCATCGTGAGCTAATCGAGAAAAAGGG
AATTGAAGTAAAGTTAGTTTCTTTTTTTTTACGATCAGAGAAA**AGGGTTTCGCTCTCT
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCT****CTGTGTTGAAGTTCAATTGATTGATTATCCCCCGGC
CGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACTGATAACTTCGTATAATG
TATGCTATACGAAGTTATG

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 11

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GCGTATGCATTCCAGAGGAAAGGGTATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGCTCGCC
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GGTGAAGAGTGTTACCGGAAACAAGATCTTGCGTATTCTCAAAGCTCACGGTCTTGCTCC
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GGAGAGGAACAGGAAGGACAAAGACTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGAT
CCACCGTCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGA
GTCTACTACTGCTTCTACTCTTGTGGCTTAGATCAGCTCTTCAAGAACACTACTGTTTCT
TTTTTGATGTCTTATCTATGAACCTAGTTTCTATGTTTCTCAGTACTTTTGTTTTGTCAA
GTTACAATGATGTTTTTGATGATTTCAAGGAACCAACAATGTGTTTAATCTTTTGTCAGA
ATTGCTTATGTTTGCGTGTCTTTTCAA


BQ
10 10 30 30 50 0 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
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65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
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65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 
65 65 65 65 35 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 25 65 65 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BD53JQ C 1
AF RS1DY96JQ C 92
AF RS1AZ12JQ C 5
AF RS1AZ12TF U 5
AF RS1DY96TF U 2
AF RS1EK27TF U 3
AF RS1BD53TF U 1
AF RS1CL05TF U 5
AF RS1CL05JQ C 92
AF RS1GU88TF U 5
AF RS1GU88JQ C 92
BS 1 2 RS1BD53JQ
BS 3 4 RS1DY96TF
BS 5 5 RS1AZ12TF
BS 6 6 RS1DY96TF
BS 7 50 RS1AZ12TF
BS 51 51 RS1DY96TF
BS 52 536 RS1AZ12TF
BS 537 537 RS1DY96TF
BS 538 544 RS1AZ12TF
BS 545 545 RS1DY96TF
BS 546 546 RS1AZ12TF
BS 547 547 RS1DY96TF
BS 548 569 RS1AZ12TF
BS 570 571 RS1DY96TF
BS 572 589 RS1AZ12TF
BS 590 590 RS1DY96TF
BS 591 598 RS1AZ12TF
BS 599 599 RS1DY96TF
BS 600 614 RS1AZ12TF
BS 615 630 RS1DY96TF
BS 631 680 RS1CL05TF
BS 681 687 RS1GU88TF

RD RS1BD53JQ 630 0 0
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GCGTATGCATTCCAGAGGAAAGGGTATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGCTCGCC
TCCGACATGGCTCAAGACCACGGCCGTCGATGTTGATGAGTCGATCTGCAAGTTTGCGAA
GAAGGGTTTGACACCATCTCAGATTGGTGTGATTCTTCGTGACTCTCACGGTATTCCTCA
GGTGAAGAGTGTTACCGGAAACAAGATCTTGCGTATTCTCAAAGCTCACGGTCTTGCTCC
TGAGATTCCTGAGGATCTGTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTT
GGAGAGGAACAGGAAGGACAAAGACTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGAT
CCACCGTCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGA
GTCTACTACTGCTTCTACTCTTGTGGCTTAGATCAGCTCTTCAAGAACACTACTGTTTCT
TTTTTGATGTCTTATCTATGAACCTAGTTTCTATGTTTCTCAGTACTTTTGTTTTGTCAA
GTTACAATGACGTTTTTGATGATTTCAAGG

QA 1 630 1 630
DS 

RD RS1DY96JQ 539 0 0
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GTTGATGAGTCGATCTGCAAGTTTGCGAAGAAGGGCTTGACACCATCTCAGATTGGTGTG
ATTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTGAAGAGCGTTACCGGAAACAAGATCTTG
CGTATTCTCAAAGCTCACGGTCTTGCTCCTGAGATTCCTGAGGATCTGTACCACTTGATC
AAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAGAGGAACAGGAAGGACAAAGACTCCAAG
TTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCACCGTCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACC
AAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCTACTACTGCTTCTACTCTTGTGGCTTAG
ATCAGCTCTTCAAGAACACTACTGTTTCTTTTTTGATGTCTTATCTATGAACCTAGTTTC
TATGTTTCTCAGTACTTTTGTTTTGTCAAGTTACAATGAT*TTTTTGATGATTTCAAGG

QA 1 539 1 539
DS 

RD RS1AZ12JQ 610 0 0
GGAGAGGAAACAATCTCATCGAGACAGTGAACAAACCCTAAGTTCTCCAAGATGGGGCGT
ATGCATTCCAGAGGAAAGGGTATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGCTCGCCTCCG
ACATGGCTCAAGACCACGGCCGTCGATGTTGATGAGTCGATCTGCAAGTTTGCGAAGAAG
GGTTTGACACCATCTCAGATTGGTGTGATTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTG
AAGAGTGTTACCGGAAACAAGATCTTGCGTATTCTCAAAGCTCACGGTCTTGCTCCTGAG
ATTCCTGAGGATCTGTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAG
AGGAACAGGAAGGACAAAGACTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCAC
CGTCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCT
ACTACTGCTTCTACTCTTGTGGCTTAGATCAGCTCTTCAAGAACACTACTGTCTCTTTTT
*GCTGTCTTATCTATGAACCTAGTTCTTATGTTTCTCAGTACTTT*GTTTTGTCGAGTTA
CAATGATGTT

QA 1 610 1 610
DS 

RD RS1AZ12TF 610 0 0
GGAGAGGAAACAATCTCATCGAGACAGTGAACAAACCCTAAGTTCTCCAAGATGGGGCGT
ATGCATTCCAGAGGAAAGGGTATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGCTCGCCTCCG
ACATGGCTCAAGACCACGGCCGTCGATGTTGATGAGTCGATCTGCAAGTTTGCGAAGAAG
GGTTTGACACCATCTCAGATTGGTGTGATTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTG
AAGAGTGTTACCGGAAACAAGATCTTGCGTATTCTCAAAGCTCACGGTCTTGCTCCTGAG
ATTCCTGAGGATCTGTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAG
AGGAACAGGAAGGACAAAGACTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCAC
CGTCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCT
ACTACTGCTTCTACTCTTGTGGCTTAGATCAGCTCTTCAAGAACACTACTGTCTCTTTTT
*GCTGTCTTATCTATGAACCTAGTTCTTATGTTTCTCAGTACTTT*GTTTTGTCGAGTTA
CAATGATGTT

QA 1 610 1 610
DS 

RD RS1DY96TF 629 0 0
G
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GTATGCATTCCAGAGGAAAGGGTATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGCTCGCCTC
CGACATGGCTCAAGACCACGGCCGTCGATGTTGATGAGTCGATCTGCAAGTTTGCGAAGA
AGGGCTTGACACCATCTCAGATTGGTGTGATTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGG
TGAAGAGCGTTACCGGAAACAAGATCTTGCGTATTCTCAAAGCTCACGGTCTTGCTCCTG
AGATTCCTGAGGATCTGTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGG
AGAGGAACAGGAAGGACAAAGACTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCC
ACCGTCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGT
CTACTACTGCTTCTACTCTTGTGGCTTAGATCAGCTCTTCAAGAACACTACTGTTTCTTT
TTTGATGTCTTATCTATGAACCTAGTTTCTATGTTTCTCAGTACTTTTGTTTTGTCAAGT
TACAATGAT*TTTTTGATGATTTCAAGG

QA 2 629 2 629
DS 

RD RS1EK27TF 628 0 0
GAGCAAAGGAAACAATCTCATCGAGACAGTGAACAAACCCTAAGTTCTTCAAGATGGGGC
GTATGCATTCCAGAGGAAAGGGTATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGCTCGCCTC
CGACATGGCTCAAGACCACGGCCGTCGATGTTGATGAGTCGATCTGCAAGTTTGCGAAGA
AGGGCTTGACACCATCTCAGATTGGTGTGATTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGG
TGAAGAGTGTTACCGGAAACAAGATCTTGCGTATTCTCAAAGCTCACGGTCTTGCTCCTG
AGATTCCTGAGGATCTGTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGG
AGAGGAACAGGAAGGACAAAGACTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCC
ACCGTCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGT
CTACTACTGCTTCTACTCTTGTGGCTTAGATCAGCTCTTCAAGAACACTACTGTTTCTTT
TTTGATGTCTTATCTATGAACCTAGTTTCTATGTTTCTCAGTACTTTTGTTTTGTCAAGT
TACAATGAT*TTTTTGATGATTTCAAGG

QA 1 628 1 628
DS 

RD RS1BD53TF 630 0 0
GG
GAGCAGAGGAAACAATCTCATCGAGACAGTGAACAAACCCTAAGTTCTTCAAGATGGGGC
GTATGCATTCCAGAGGAAAGGGTATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGCTCGCCTC
CGACATGGCTCAAGACCACGGCCGTCGATGTTGATGAGTCGATCTGCAAGTTTGCGAAGA
AGGGTTTGACACCATCTCAGATTGGTGTGATTCTTCGTGACTCTCACGGTATTCCTCAGG
TGAAGAGTGTTACCGGAAACAAGATCTTGCGTATTCTCAAAGCTCACGGTCTTGCTCCTG
AGATTCCTGAGGATCTGTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGG
AGAGGAACAGGAAGGACAAAGACTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCC
ACCGTCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGT
CTACTACTGCTTCTACTCTTGTGGCTTAGATCAGCTCTTCAAGAACACTACTGTTTCTTT
TTTGATGTCTTATCTATGAACCTAGTTTCTATGTTTCTCAGTACTTTTGTTTTGTCAAGT
TACAATGACGTTTTTGATGATTTCAAGG

QA 3 630 3 630
DS 

RD RS1CL05TF 677 0 0
GGAGAGGAAACAATCTCATCGAGACAGTGAACAAACCCTAAGTTCTTCAAGATGGGGCGT
ATGCATTCCAGAAGAAAGGGTATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGCTCGCCTCCG
ACATGGCTCAAGACCACGGCCGTCGATGTTGATGAGTCGATCTGCAAGTTTGCGAAGAAG
GGTTTGACACCATCTCAGATTGGTGTGATTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTG
AAGAGTGTTACCGGAAACAAGATCTTGCGTATTCTCAAAGCTCACGGTCTTGCTCCTGAG
ATTCCTGAGGGTCTGTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAG
AGGAACAGGAAGGACAAAGACTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCAC
CGTCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCT
ACTACTGCTTCTACTCTTGTGGCTTAGATCAGCTCTTCAAGAACACTACTGTTTCTTTTT
TGATGTCTTATCTATGAACCTAGTTTCTATGTTTCTCAGTACTTTTGTTTTGTCAAGTTA
CAATGATGTTTTTGATGATTTCAAGGAACCAACAATGTGTTTAATCTTTTGTCAGAATTG
CTTATGTTTGCGTGTC
A

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1CL05JQ 589 0 0
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GTTGATGAGTCGATCTGCAAGTTTGCGAAGAAGGGTTTGACACCATCTCAGATTGGTGTG
ATTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTGAAGAGTGTTACCGGAAACAAGATCTTG
CGTATTCTCAAAGCTCACGGTCTTGCTCCTGAGATTCCTGAGGGTCTGTACCACTTGATC
AAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAGAGGAACAGGAAGGACAAAGACTCCAAG
TTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCACCGTCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACC
AAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCTACTACTGCTTCTACTCTTGTGGCTTAG
ATCAGCTCTTCAAGAACACTACTGTTTCTTTTTTGATGTCTTATCTATGAACCTAGTTTC
TATGTTTCTCAGTACTTTTGTTTTGTCAAGTTACAATGATGTTTTTGATGATTTCAAGGA
ACCAACAATGTGTTTAATCTTTTGTCAGAATTGCTTATGTTTGCGTGTC

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1GU88TF 683 0 0
GGAGAGGAAACAATCTCATCGAGACAGTGAACAAACCCTAAGTTCTTCAAGATGGGGCGT
ATGCATTCCAGAGGAAAGGGTATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGCTCGCCTCCG
ACATGGCTCAAGACCACGGCCGTCGATGTTGATGAGTCGATCTGCAAGTTTGCGAAGAAG
GGTTTGACACCATCTCAGATTGGTGTGATTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTG
AAGAGTGTTACCGGAAACAAGATCTTGCGTATTCTCAAAGCTCACGGTCTTGCTCCTGAG
ATTCCTGAGGATCTGTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAG
AGGAACAGGAAGGACAAAGACTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCAC
CGTCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCT
ACTACTGCTTCTACTCTTGTGGCTTAGATCAGCTCTTCAAGAACACTACTGTTTCTTTTT
TGATGTCTTATCTATGAACCTAGTTTCTATGTTTCTCAGTACTTTTGTTTTGTCAAGTTA
CAATGATGTTTTTGATGATTTCAAGGAACCAACAATGTGTTTAATCTTTTGTCAGAATTG
CTTATGTTTGCGTGTCTTTTCAA

QA 1 683 1 683
DS 

RD RS1GU88JQ 594 0 0
GCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGCTCGCCTCCGACATGGCTCAAGACCACGGCCGTCGAT
GTTGATGAGTCGATCTGCAAGTTTGCGAAGAAGGGTTTGACACCATCTCAGATTGGTGTG
ATTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTGAAGAGTGTTACCGGAAACAAGATCTTG
CGTATTCTCAAAGCTCACGGTCTTGCTCCTGAGATTCCTGAGGATCTGTACCACTTGATC
AAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAGAGGAACAGGAAGGACAAAGACTCCAAG
TTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCACCGTCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACC
AAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCTACTACTGCTTCTACTCTTGTGGCTTAG
ATCAGCTCTTCAAGAACACTACTGTTTCTTTTTTGATGTCTTATCTATGAACCTAGTTTC
TATGTTTCTCAGTACTTTTGTTTTGTCAAGTTACAATGATGTTTTTGATGATTTCAAGGA
ACCAACAATGTGTTTAATCTTTTGTCAGAATTGCTTATGTTTGCGTGTC
TTTTC

QA 1 589 1 589
DS 



AS 2 11

CO CL173Contig1 343 2 3 U
GGATCATCAGATGATAAATTTTATGAAATCAAAGATATTGAGAGAGCGATCAAAGAAGCA
ATTGGATTTGCTCCGGGAATAGAATGTAACAAGGATTCGTCGCATAACAGCCAACTTTAT
CAGATCTATCTATGCGTTGAAACTTCGGCCTCCAATTTCATCAACTGTCCTGTTATGCCA
CATGGTCGATGCGACTCTCGAGTTCAATTTCCCAGATTCTAGATCTCGCCGCTGATTTTT
TCATTTTATTTACGACAGCAATATTGTACTTATTTGCTTTTTGTTTGTGTTTCTCTGCAA
CTTTTAACTGCAATAAAAATGTATGATCGGATGATACCCTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RS1A526JQ C 1
AF RS1A526TF U 1
BS 1 7 RS1A526JQ
BS 8 338 RS1A526TF
BS 339 343 RS1A526JQ

RD RS1A526JQ 343 0 0
GGATCATCAGATGATAAATTTTATGAAATCAAAGATATTGAGAGAGCGATCAAAGAAGCA
ATTGGATTTGCTCCGGGAATAGAATGTAACAAGGATTCGTCGCATAACAGCCAACTTTAT
CAGATCTATTTATGCGTTGAAACTTCGGCCTCCAATTTCATCAACTGTCCTGTTATGCCA
CATGGTCGATGCGACTCTCGAGTTCAATTTCCCAGATTCTAGATCTCGCCGCTGATTTTT
TCATTTTATTTACGACAGCAATATTGTACTTATTTGCTTTTTGTTTGTGTTTCTTTGCAA
CTTTTAACTGCAATAAAAATGTATGATCGGATGATACCCTTTG

QA 1 343 1 343
DS 

RD RS1A526TF 343 0 0
GGATCAT
CAGATGATAAATTTTATGAAATCAAAGATATTGAGAGAGCGATCAAAGAAGCAATTGGAT
TTGCTCCGGGAATAGAATGTAACAAGGATTCGTCGCATAACAGCCAACTTTATCAGATCT
ATCTATGCGTTGAAACTTCGGCCTCCAATTTCATCAACTGTCCTGTTATGCCACATGGTC
GATGCGACTCTCGAGTTCAATTTCCCAGATTCTAGATCTCGCCGCTGATTTTTTCATTTT
ATTTACGACAGCAATATTGTACTTATTTGCTTTTTGTTTGTGTTTCTCTGCAACTTTTAA
CTGCAATAAAAATGTATGATCGGATGATACC
CTTTG

QA 8 338 8 338
DS 



CO CL173Contig2 868 9 9 U
GGATTCATCTTCTCTACATTTATTAGTTTCTTTGAGAAAAAATGAAATTCTTCATTTGTA
TTCTTGCGTTACAACAACTGTACGTACTAAGTGTCGCTCAAGATTTCGATTTCTTCTACT
TTGTTGTACAGTGGCCTGGAGCGTATTGTGATTCAAGACATACTTGTTGCTATCCGAAAA
CCGGGAAACCAGCTGCGGATTTTGGAATTCATGGTCTTTGGCCTAACTACAAAACTGGTG
GATGGCCTCAGAACTGTAATCCTGATAGCACATTTGATGAATTACGGGTATCTGATCTGG
TGAGCAACTTACAAAGAGAATGGCCAACATTGTCGTGTCCCAGCAACGATGGTGTGCACT
TTTGGACACACGAATGGGAGAAGCACGGAACGTGTGCTGAATCTGAGCTCGACCAACACG
ATTATTTTGAAGCCGCTCTCAAACTCAAACAGAAAGCTAACCTCCTTCATGCCCTTACCA
ATGCTGGTATCAAACCAGATGATAAATTTTATGAAATAAAAGATATTGAGAGAGTGATCA
AAGAAGCAATTGGATTTGCTCCGGGAATAGAATGTAACAAGGATTCGTCGCATAATAGCC
AACTTTATCAGATTTATTTATGCGTTGACACTTCGGCCTCCAATTTCATCAACTGTCCTG
TTATGCTACATGGTCGATGCGACTCTCGAGTTCAATTTCCCAAGTTCTAGATCTCGCGGC
TGATTTTTTATTTTATTTACATAAACAGTATTGTACTTATTTGGTTTCTGTTTGTGTTTC
TGCAACTTCTAATTGCAATAAAAATGTATGATCCCATGATACCGTTTAATTATTTGCTTG
GTAACAGAATTATATATGTGATTTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 
50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 35 50 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DI14TF U 5
AF RS1E382TF U 4
AF RS1BA94TF U 1
AF RS1BF92TF U 5
AF RS1BY94TF U 1
AF RS1BY94JQ C 44
AF RS1E382JQ C 141
AF RS1BF92JQ C 65
AF RS1BA94JQ C 304
BS 1 457 RS1BA94TF
BS 458 458 RS1BY94TF
BS 459 642 RS1BA94TF
BS 643 643 RS1BY94TF
BS 644 728 RS1BA94TF
BS 729 804 RS1BY94TF
BS 805 841 RS1BY94JQ
BS 842 855 RS1BF92JQ
BS 856 868 RS1BA94JQ

RD RS1DI14TF 573 0 0
GG
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AACCAGCTGCGGATTTTGGAATTCATGGTCTTTGGCCTAACTACAAAACTGGTGGATGGC
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CAATTGGATTTGCTCCGGGAATAGAATGTAA

QA 3 573 3 573
DS 

RD RS1E382TF 697 0 0
GGC
ATCTTCTCTACATTTATTAGTTTCTTTGAGAAAAAATGAAATTCTTCATTTGTATTCTTG
CGTTACAACAACTGTACGTACTAAGTGTCGCTCAAGATTTCGATTTCTTCTACTTTGTTG
TACAGTGGCCTGGAGCGTATTGTGATTCAAGACATACTTGTTGCTATCCGAAAACCGGGA
AACCAGCTGCGGATTTTGGAATTCATGGTCTTTGGCCTAACTACAAAACTGGTGGATGGC
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ACTTACAAAGAGAATGGCCAACATTGTCGTGTCCCAGCAACGATGGTGTGCACTTTTGGA
CACACGAATGGGAGAAGCACGGAACGTGTGCTGAATCTGAGCTCGACCAACACGATTATT
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CAATTGGATTTGCTCCGGGAATAGAATGTAACAAGGATTCGTCGCATAATAGCCAACTTT
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TACATGGTCGATGCGACTCTCGAGTTCAATTTCC

QA 4 697 4 697
DS 

RD RS1BA94TF 729 0 0
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TTGTTGTACAGTGGCCTGGAGCGTATTGTGATTCAAGACATACTTGTTGCTATCCGAAAA
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GATGGCCTCAGAACTGTAATCCTGATAGCACATTTGATGAATTACGGGTATCTGATCTGG
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AAGAAGCAATTGGATTTGCTCCGGGAATAGAATGTAACAAGGATTCGTCGCATAATAGCC
AACTTTATCAGATTTATTTATGCGTTGACACTTCGGCCTCCA*TTTCATCAACTGTCCTG
TTATGCTACATGGTCGATGCGACTCTCGAGTTCAATTTCCCAAGTTCTAGATCTCGCGGC
TGATTTTT
A

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1BF92TF 757 0 0
GG
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CGTTACAACAACTGTACGTACTAAGTGTCGCTCAAGATTTCGATTTCTTCTACTTTGTTG
TACAGTGGCCTGGAGCGTATTGTGATTCAAGACATACTTGTTGCTATCCGAAAACCGGGA
AACCAGCTGCGGATTTTGGAATTCATGGTCTTTGGCCTAACTACAAAACTGGTGGATGGC
CTCAGAACTGTAATCCTGATAGCACATTTGATGAATTACGGGTATCTGATCTGGTGAGCA
ACTTACAAAGAGAATGGCCAACATTGTCGTGTCCCAGCAACGATGGTGTGCACTTTTGGA
CACACGAATGGGAGAAGCACGGAACGTGTGCTGAATCTGAGCTCGACCAACACGATTATT
TTGAAGCCGCCCTCAAACTCAAACAGAAAGCTAACCTCCTTCATGCCCTTACCAATGCTG
GTATCAAACCAGATGATAAATTTTATGAAATAAAAGATATTGAGAGAGTGATCAAAGAAG
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ATCAGATTTATTTATGCGTTGACACTTCGGCCTCCAATTTCATCAACTGTCCTGTTATGC
TACATGGTCGATGCGACTCTCGAGTTCATTT**CCAAGTTCTAGATCTCGCGGCTGATTT
TT*ATTTT*TTTACATAAACAGTATTGTACTTATT

QA 3 757 3 757
DS 

RD RS1BY94TF 804 0 0
GGATTC
ATCTTCTCTACATTTATTAGTTTCTTTGAGAAAAAATGAAATTCTTCATTTGTATTCTTG
CGTTACAACAACTGTACGTACTAAGTGTCGCTCAAGATTTCGATTTCTTCTACTTTGTTG
TACAGTGGCCTGGAGCGTATTGTGATTCAAGACATACTTGTTGCTATCCGAAAACCGGGA
AACCAGCTGCGGATTTTGGAATTCATGGTCTTTGGCCTAACTACAAAACTGGTGGATGGC
CTCAGAACTGTAATCCTGATAGCACATTTGATGAATTACGGGTATCTGATCTGGTGAGCA
ACTTACAAAGAGAATGGCCAACATTGTCGTGTCCCAGCAACGATGGTGTGCACTTTTGGA
CACACGAATGGGAGAAGCACGGAACGTGTGCTGAATCTGAGCTCGACCAACACGATTATT
TTGAAGCCGCTCTCAAACTCAAACAGAAAGCTAACCTCCTTCATGCCCTTACCAATGCTG
GTATCAAACCAGATGATAAATTTTATGAAATAAAAGATATTGAGAGAGTGATCAAAGAAG
CAATTGGATTTGCTCCGGGAATAGAATGTAACAAGGATTCGTCGCATAATAGCCAACTTT
ATCAGATTTATTTATGCGTTGACACTTCGGCCTCCAATTTCATCAACTGTCCTGTTATGC
TACATGGTCGATGCGACTCTCGAGTTCAATTTCCCTAGTTCTAGATCTCGCGGCTGATTT
TTTATTTTATTTACATAAACAGTATTGTACTTATTTGGTTTCTGTTTGTGTTTCTGCAAC
TTCTAATTGCAATAAAAA

QA 7 804 7 804
DS 

RD RS1BY94JQ 799 0 0
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TTTCGATTTCTTCTACTTTGTTGTACAGTGGCCTGGAGCGTATTGTGATTCAAGACATAC
TTGTTGCTATCCGAAAACCGGGAAACCAGCTGCGGATTTTGGAATTCATGGTCTTTGGCC
TAACTACAAAACTGGTGGATGGCCTCAGAACTGTAATCCTGATAGCACATTTGATGAATT
ACGGGTATCTGATCTGGTGAGCAACTTACAAAGAGAATGGCCAACATTGTCGTGTCCCAG
CAACGATGGTGTGCACTTTTGGACACACGAATGGGAGAAGCACGGAACGTGTGCTGAATC
TGAGCTCGACCAACACGATTATTTTGAAGCCGCTCTCAAACTCAAACAGAAAGCTAACCT
CCTTCATGCCCTTACCAATGCTGGTATCAAACCAGATGATAAATTTTATGAAATAAAAGA
TATTGAGAGAGTGATCAAAGAAGCAATTGGATTTGCTCCGGGAATAGAATGTAACAAGGA
TTCGTCGCATAATAGCCAACTTTATCAGATTTATTTATGCGTTGACACTTCGGCCTCCAA
TTTCATCAACTGTCCTGTTATGCTACATGGTCGATGCGACTCTCGAGTTCAATTTCCCTA
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GTTTCTGTTTGTGTTTCTGCAACTTCTAATTGCAATAAAAATGTATGATCCCATGATACC
GTTTAATTATTTGCTTGG
G

QA 1 798 1 798
DS 

RD RS1E382JQ 702 0 0
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TTTGGAATTCATGGTCTTTGGCCTAACTACAAAACTGGTGGATGGCCTCAGAACTGTAAT
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AAACTCAAACAGAAAGCTAACCTCCTTCATGCCCTTACCAATGCTGGTATCAAACCAGAT
GATAAATTTTATGAAATAAAAGATATTGAGAGAGTGATCAAAGAAGCAATTGGATTTGCT
CCGGGAATAGAATGTAACAAGGATTCGTCGCATAATAGCCAACTTTATCAGATTTATTTA
TGCGTTGACACTTCGGCCTCCAATTTCATCAACTGTCCTGTTATGCTACATGGTCGATGC
GACTCTCGAGTTCAATTTCCCAAGTTCTAGATCTCGCGGCTGATTTTTTATTTTATTTAC
ATAAACAGTATTGTACTTATTTGGTTTCTGTTTGTGTTTCTGCAACTTCTAATTGCAATA
AAAATGTATGATCCCATGATACCGTTTAATTATTTGCTTGG
T

QA 1 701 1 701
DS 

RD RS1BF92JQ 791 0 0
TCTGCGTAC
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GCCTGGAGCGTATTGTGATTCAAGACATACTTGTTGCTATCCGAAAACCGGGAAACCAGC
TGCGGATTTTGGAATTCATGGTCTTTGGCCTAACTACAAAACTGGTGGATGGCCTCAGAA
CTGTAATCCTGATAGCACATTTGATGAATTACGGGTATCTGATCTGGTGAGCAACTTACA
AAGAGAATGGCCAACATTGTCGTGTCCCAGCAACGATGGTGTGCACTTTTGGACACACGA
ATGGGAGAAGCACGGAACGTGTGCTGAATCTGAGCTCGACCAACACGATTATTTTGAAGC
CGCCCTCAAACTCAAACAGAAAGCTAACCTCCTTCATGCCCTTACCAATGCTGGTATCAA
ACCAGATGATAAATTTTATGAAATAAAAGATATTGAGAGAGTGATCAAAGAAGCAATTGG
ATTCGCTCCGGGAATAGAATGTAACAAGGATTCGTCGCATAATAGCCAACTTTATCAGAT
TTATTTATGCGTTGACACTTCGGCCTCCAATTTCATCAACTGTCCTGTTATGCTACATGG
TCGATGCGACTCTCGAGTTCAATTTCCCAAGTTCTAGATCTCGCGGCTGATTTTTTATTT
TATTTACATAAACAGTATTGTACTTATTTGGTTTCTGTTTGTGTTTCTGCAACTTCTAAT
TGCAATAAAAATGTATGATCCCATGATACCGTTTAATTATTTGCTTGGTAACAGAATTAT
AT

QA 10 791 10 791
DS 

RD RS1BA94JQ 565 0 0
GCAACTTACAAAGAGAATGGCCAACATTGTCGTGTCCCAGCAACGATGGTGTGCACTTTT
GGACACACGAATGGGAGAAGCACGGAACGTGTGCTGAATCTGAGCTCGACCAACACGATT
ATTTTGAAGCCGCTCTCAAACTCAAACAGAAAGCCAACCTCCTTCATGCCCTTACCAATG
CTGGTATCAAACCAGATGATAAATTTTATGAAATAAAAGATATTGAGAGAGTGATCAAAG
AAGCAATTGGATTTGCTCCGGGAATAGAATGTAACAAGGATTCGTCGCATAATAGCCAAC
TTTATCAGATTTATTTATGCGTTGACACTTCGGCCTCCAATTTCATCAACTGTCCTGTTA
TGCTACATGGTCGATGCGACTCTCGAGTTCAATTTCCCAAGTTCTAGATCTCGCGGCTGA
TTTTTTATTTTATTTACATAAACAGTATTGTACTTATTTGGTTTCTGTTTGTGTTTCTGC
AACTTCTAATTGCAATAAAAATGTATGATCCCATGATACCGTTTAATTATTTGCTTGGTA
ACAGAATTATATATGTGATTTAAGC

QA 1 565 1 565
DS 



AS 1 11

CO CL174Contig1 303 11 7 U
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GCG


BQ
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RS1GR03JQ C 1
AF RS1B781JQ C 1
AF RS1B781TF U 1
AF RS1CA27JQ C 1
AF RS1CA27TF U 1
AF RS1BV90JQ C 1
AF RS1BV90TF U 1
AF RS1G151TF U 1
AF RS1GH70TF U 1
AF RS1AA62JQ C 1
AF RS1AA62TF U 1
BS 1 13 RS1B781TF
BS 14 14 RS1CA27TF
BS 15 159 RS1B781TF
BS 160 160 RS1BV90TF
BS 161 263 RS1B781TF
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QA 1 107 1 107
DS 

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DS 

RD RS1B781TF 263 0 0
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C

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DS 

RD RS1CA27TF 291 0 0
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C

QA 1 290 1 290
DS 

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QA 1 287 1 287
DS 

RD RS1BV90TF 287 0 0
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QA 1 287 1 287
DS 

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QA 1 287 1 287
DS 

RD RS1GH70TF 287 0 0
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QA 1 287 1 287
DS 

RD RS1AA62JQ 303 0 0
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GCG

QA 1 303 1 303
DS 

RD RS1AA62TF 303 0 0
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GCG

QA 1 303 1 303
DS 



AS 2 10

CO CL175Contig1 892 7 7 U
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AGGAATTAAAATAAAATATCCAAAGAGAGGGAAATTCAAACTTCATCCACAAGTCATAAC
ATAACATCAGAGAATGAATGGTTCTGTGATTAAACCGGATTACAGCGAAAAACATCTTGG
ATGAAAGCAGATGATGATGGCAATCGGATCAGTCCATCCTTCCCTTTAGGATCCTCTCTT
TAATCTCCGTTGGTGTTACAACGTAAACATGCCCTCCCCAACCACTCAGACAATCACGGT
CAACTGACGATAGAAGAGCCTGTGAAATAGTCTCGAACAATTCCTCAGCTTCCATATCTG
GCTTGTACATAGCTTCGCAGGCACCATAAAGTGATTCTGAAGCAGTTCCAGAGACAACAA
AATCTTTAGCCAACTCCTTGGCTCCAATGGAGTCCATGGTGCAGATGAAAGGCTTGTCAT
CTTCTCCCAATCCGGCAATCACTGGTTGGCATAGGTAAGGACCAAATCTTTTCTCGTAGA
GAATGGCGGAGACGAGACTGGCGAAAGTCTCAGGCTTCATGTCTCTCTCTTCACGAAGCT
GGTACAGCTTATGACGAAACACCAAGCGCTGGTACAGTGTTTGGACATCGGTGGCGAGAC
CAGAGAGGCCGATGAAGACACGGTCGTGGATCTTGGAGATTCTCTGGAAATCGGTAGCGA
TCGTCTGGAGCTGCACACCGAGCCTACGATCACTGGCGATGGCGAAGCAGTTCTTCCCAA
CCATAGCCACAACGGCACTTCCATTGTACTCGAAGATCGACATCGGGAAGATTATTAGGG
TTCTCTGAGTGGGAGATTTGGAGTTTTCCTAACGGAGAAGAAATCTGAGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 
30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EC04TF C 47
AF RS1EC04JQ U 47
AF RS1AR67JQ U 60
AF RS1CM79JQ U 1
AF RS1AH34JQ U 60
AF RS1AH34TF C 89
AF RS1AY57TF C 177
BS 1 288 RS1CM79JQ
BS 289 289 RS1AR67JQ
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DS 

RD RS1EC04JQ 191 0 0
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CCACAAGTCATAACATAACATCAGAGAATGAATGGTTCTGTGATTAAACCGGATTACAGC
GAAAAACATCTTGGATGAAAGCAGATGATGATGGCAATCGGATCAGTCCATCCTTCCCTT
TAGGATCCTC
C

QA 1 190 1 190
DS 

RD RS1AR67JQ 491 0 0
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GATGAAAGCAGATGATGATGGCAATCGGATCAGTCCATCCTTCCCTTTAGGATCCTCTCT
TTAATCTCCGTTGGTGTTACAACGTAAACATGCCCTCCCCAACCACTCAGACAATCACGG
TCAACTGACGATAGAAGAGCCTGTGAAATAGTCTCGAACAATTCCTCAGCTTCCATATCT
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DS 

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GT
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AATCTCCGTTGGTGTTACAACGTAAACATGCCCTCCCCAACCACTCAGACAATCACGGTC
AACTGACGATAGAAGAGCCTGTGAAATAGTCTCGAACAATTCCTCAGCTTCCATATCTGG
CTTGTACATAGCTTCCCAGGCACCATAAAGTGATTCTGAAGCAGTTCCAGAAACAACAAA
ATCTTTAGCCAACTCCTTGGCTCCAATGGAGTCCATGGTGCAGATGAAAGGCTTGTCATC
TTCTCCCAATCCGGCAATCACTGGTTGGCATAGGTAAGGACCAAATCTTTTCTCGTAAAG
AATGGCGGAAACGAAACTGGCGAAAGTCTCAGGCTTCATGTCTCTCTCTTCACGAAGCTG
GTACAGCTTATGACGAAACACCAAGCGCTGGTACAGTGTTTGGACATCGGTGGCGAGACC
AGAGAGGCCGATGAAGACACGGTCGTGGATCTTGGAGATTCTCTGGAAATCGGTAGCGAT
CGTCTGGAGCTGCACACCGAGCCTACGATCACTGGCGATGGCGAAGCAGTTCTT

QA 3 716 3 716
DS 

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GGGAAATTCAAACTTCATCCACA*GTCATAACATAACATCAGAGAATGAATGGTTCTGTG
ATTAAACCGGATTACAGCGAAAAACATCTTGGATGAAAGCAGATGATGATGGCAATCGGA
TCAGTCCATCCTTCCCTTTAGGATCCTCTCTTTAATCTCCGTTGGTGTTACAACGTAGAC
ATGCCCTCCCCAACCACTCAGACAATCACGGTCAACTGACGATAGAAGAGCCTGTGAAAT
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AAGTGATTCTGAAGCAGTTCCAGAGACAACAAAATCTTTAGCCAACTCCTTGGCTCCAAT
GGAGTCCATGGTGCAGATGAAAGGCTTGTCATCTTCTCCCAATCCGGCAATCACTGGTTG
GCATAGGTAAGGACCAAATCTTTTCTCGTAGAGAATGGCGGAGACGAGACTGGCGAAAGT
CTCAGGCTTCATGTCTCTCTCTTCACGAAGCTGGTACAGCTTATGACGAAACACCAAGCG
CTGGTACAGTGTTTGGACATCGGTGGCGAGACCAGAGAGGCCGATGAAGACACGGTCGTG
GATCTTGGAGATTCTCTGGAAATCGGTAGCGATCGTCTGGAGCTGCACACCGAGCCTACG
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CTCGAAGATCGACATCGGGAAGATTATTAGGGTTCTCTGAGTGG*AGATTTGGAGTTTTC
CTAACGGAGAAGAAATCTGAGACG

QA 1 804 1 804
DS 

RD RS1AY57TF 712 0 0
CTTGGATG
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CTCCGTTGGTGTTACAACGTAGACATGCCCTCCCCAACCACTCAGACAATCACGATCAAC
TGACGATAGAAGAGCCTGTGAAATAGTCTCGAACAATTCCTCAGCTTCCATATCTGGCTT
GTACATAGCTTCGCAGGCACCATAAAGTGATTCTGAAGCAGTTCCAGAGACAACAAAATC
TTTAGCCAACTCCTTGGCTCCAATGGAGTCCATGGTGCAGATGAAAGGCTTGTCATCT*C
TCCCAATCCGGCAATCACTGGTTGGCATAGGTAAGGACCAAATCTTTTCTCGTAGAGAAT
GGCGGAGACGAGACTGGCGAAAGTCTCAGGCTTCATGTCTCTCTCTTCACGAAGCTGGTA
CAGCTTATGACGAAACACCAAGCGCTGGTACAGTGTTTGGACATCGGTGGCGAGACCAGA
GAGGCCGATGAAGACACGGTCGTGGATCTTGGAGATTCTCTGGAAATCGGTAGCGATCGT
CTGGAGCTGCACACCGAGCCTACGATCACTGGCGATGGCGAAGCAGTTCTTCCCAACCAT
AGCCACAACGGCACTTCCATTGTACTCGAAGATCGACATCGGGAGGATTATTAGGGTTCT
CTGAGTGGGAGATTTGGAGTTTTCCTAACGGAGAAGAAATCT
CC

QA 9 710 9 710
DS 



CO CL175Contig2 946 3 12 U
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TCTTCTCCTTTAGGAAAACTCCAAATCTCCACTCAGAGAACCCTAATAATCTTCCCGATG
TCGATCTTCGAGTACAATGGAAGTGCCGTTGTGGCTATAGTTGGGAAGAACTGTTTCGCC
ATCGCCAGTGATCGTAGGCTCGGTGTGCAGCTCCAGACGATCGCTACCGATTTCCAGAGA
ATCTCCAAGATCCACGACCGTGTCTTCATCGGCCTCTCTGGTCTCGCCACCGATGTCCAA
ACACTGTACCAGCACTTGGTGTTTCGTCATAAGCTGTATCAGCTTCGTGAAGAGAGAGAC
ATGAAGCCTGAGACTTTCGCTAGTCTTGTCTCTGCCATTCTTTACGAGAAAAGATTTGGT
CCTTACTTATGCCAACCAGTTATTGCCGGTTTGGGGGAAGATGACAAGCCCTTTATTTGC
ACCATGGACTCCATTGGAGCCAAGGAGTTGGCCAAAGATTTTGTTGTATCTGGAACTGCT
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CTGTTTGAGACGATATCCCAAGCACTTCTATCGTCAGTTGACCGTGATTGTCTGAGCGGT
TGGGGAGGGCATGTCTACGTTGTAACACCAACGGAGATTAAAGAGAGGATCCTAAAGGGA
AGGATGGACTGATCCGACTCGCCACGCCACCATCATCTGCTTCCATCCAAGATGTTTTTC
GCTGTAATCCGGTTTAATCATAGAACCATTCATTCTCTGATGTTATGTTATGACTTGTGG
ATGAAGTTTGAATTTCCCTCTCTTTGGATATTTTATTTTGATTCCTACTAGAGTCAACGC
ATGCACTGTCTGTACCCAATGGTTCTATCTTCATTTTATTTTTACT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GL75TF U 1
AF RS1EG23TF U 1
AF RS1GL75JQ C 388
BS 1 18 RS1EG23TF
BS 19 19 RS1GL75TF
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BS 160 313 RS1EG23TF
BS 314 314 RS1GL75TF
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BS 322 733 RS1EG23TF
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RD RS1GL75TF 655 0 0
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ATCTCCAAGATCCTCGACCGTGTCTTCATCGGCCTCTCTGGTCTCGCCACCGATGTCCAA
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ATGAAGCCTGAGACTTTCGCTAGTCTTGTCTCTGCCATTCTTTACGAGAAAAGATTTGGT
CCTTACTTATGCCAACCAGTTATTGCCGGTTTGGGGGAAGATGACAAGCCCTTTATTTGC
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TCAGAATCACTGTATGGTGCCTGCGAAGCAATGTACAAGCCAGATATGGAAGCGGAGGAA
CTGTTTGAGACGATATCCCAAGCACTTCTATCGTCAGTTGACCGTGATTGTCTGA

QA 1 655 1 655
DS 

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TCTTCTCCTTTAGGAAAACTCCAAATCTCCACTCAGAGAACCCTAATAATCTTCCCGATG
TCGATCTTCGAGTACAATGGAAGTGCCGTTGTGGCTATGGTTGGGAAGAACTGTTTCGCC
ATCGCCAGTGATCGTAGGCTCGGTGTGCAGCTCCAGACGATCGCTACCGATTTCCAGAGA
ATCTCCAAGATCCACGACCGTGTCTTCATCGGCCTCTCTGGTCTCGCCACCGATGTCCAA
ACACTGTACCAGCGCTTGGT*TTTCGTCATAAGCTGTATCAGCTTCGTGAAGAGAGAGAC
ATGAAGCCTGAGACTTTCGCTAGTCTTGTCTCTGCCATTCTTTACGAGAAAAGATTTGGT
CCTTACTTATGCCAACCAGTTATTGCCGGTTTGGGGGAAGATGACAAGCCCTTTATTTGC
ACCATGGACTCCATTGGAGCCAAGGAGTTGGCCAAAGATTTTGTTGTATCTGGAACTGCT
TCAGAATCACTGTATGGTGCCTGCGAAGCAATGTACAAGCCAGATATGGAAGCGGAGGAA
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TGGGGAGGGCATGTCTACGTTGTAACACCAACGGAGATTAAAGAGAGGATCCTAAAGGGA
AGGATGGACTGAT

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DS 

RD RS1GL75JQ 559 0 0
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GGTTTGGGGGAAGATGACAAGCCCTTTATTTGCACCATGGACTCCATTGGAGCCAAGGAG
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GCAATGTACAAGCCAGATATGGAAGCGGAGGAACTGTTTGAGACGATATCCCAAGCACTT
CTATCGTCAGTTGACCGTGATTGTCTGAGTGGTTGGGGAGGGCATGTTTACGTTGTAACA
CCAACGGAGATTAAAGAGAGGATCCTAAAGGGAAGGATGGACTGATCCGACTCGCCACGC
CACCATCATCTGCTTCCATCCAAGATGTTTTTCGCTGTAATCCGGTTTAATCATAGAACC
ATTCATTCTCTGATGTTATGTTATGACTTGTGGATGAAGTTTGAATTTCCCTCTCTTTGG
ATATTTTATTTTGATTCCTACTAGAGTCAACGCATGCACTGTCTGTACCCAATGGTTCTA
TCTTCATTTTATTTTTACT

QA 1 559 1 559
DS 



AS 2 11

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CTCATCATCAATTCATCATGACTACCGAAGAGAAAGATATCCTCGCCGCCAAATTGGAAG
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ACTCCGACGATGATGATGATGACGCAGAGGGACAAGAAGGAGAAGCAGGAGGCAAGTCAA
AGCAAAGCAGAAGCGAGAAGAAGAGTCGCAAAGCTATGCTAAAGCTTGGAATGAAACCCA
TCACTGGTGTCAGCCGTGTTACCGTCAAGAAGAGCAAGAATATCATGTTTGTCATATCAA
AACCTGATGTGTTCAAGAGTCCAGCATCAGACACGTACGTGATCTTCGGAGAGGCCAAGA
TAGAGGACTTGAGCTCTCAGATCCAGTCACAAGCGGCGGAGCAGTTCAAGGCTCCAGATC
TCAGCAGCATGATCTCAAAGGGTGAGTCGTCCTCTAGCGCTGCAGTGGTGCAGGATGATG
ATGAGGAGGTTGACGAGGAAGGAGTTGAGCCAAAAGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAG
CAGGAGTGCCTAGGCCAAGAGCGGTGAAGGCTCTCAAGGCTGCTGATGGAGATATTGTCT
CTGCTATCATGGAGCTTACCACCTAAACAAACTTCTTTTGTGCGGTTTAACTTGAGTTAT
GTCCCAGTGATTGTCAAAAAGGATTCGGATTTTTTTGTCTTTCATGCTTTCTTTTTTAAG
TATTTTCAATGTTGTAGTAGTAAACCTCATGAATTATTGAATTTAAGTGTTTGCAATTTA
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 5 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 

AF RS1C771TF U 1
AF RS1AF16JQ C 10
AF RS1EK34TF U 10
AF RS1AF16TF U 19
AF RS1EK34JQ C 149
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RD RS1C771TF 733 0 0
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CTCGTCATCAATTCATCATGACTACCGAAGAGAAAGAGATCCTCGCCGCCAAATTGGAAG
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AGCAAAGCAGAAGCGAGAAGAAGAGTCGCAAAGCTATGCTAAAGCTTGGAATGAAACCCA
TCACTGGTGTCAGCCGTGTTACCGTCAAGAAGAGCAAGAATATCATGTTTGTCATATCAA
AACCTGATGTGTTCAAGAGTCCAGCATCAGACACGTACGTGATCTTCGGAGAGGCCAAGA
TAGAGGACTTGAGCTCTCAGATCCAGTCACAAGCGGCGGAGCAGTTCGAGGCTCCAGATC
TCAGCAGCATGATCTCAAAGGGTGAGTCGTCCTCTAGCGCTGCAGTGGTGCAGGATGATG
ATGAGGAGGTTGACGAGGAAGGAGTTGAGCCAAAAGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAG
CAGGAGTGCCTAGGCCAAGAGCGGTGAAAGCTCTCGAGGCTGCTGATGGAGATATTGTCT
CTGCTATCATGGAGCTTACCACCTAAACAAACTTCTTTTGTGCGGTTTAACTTGAGTTAT
GTCCCAGTGATTG

QA 1 733 1 733
DS 

RD RS1AF16JQ 762 0 0
GG
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AGGCCAAGAGCGGTGAAGGCTCTCAAGGCTGCTGATGGAGATATTGTCTCTGCTATCATG
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TGTCAAAAAGGATTCGGATTTTTTTGTCTTTCATGCTTTC

QA 3 762 3 762
DS 

RD RS1EK34TF 743 0 0
GG
AAGGTTTCCGCATTGTTCACACACACTCTCGACTTCAACCGACGCACATCTCATCATCAA
TTCATCATGACTACCGAAGAGAAAGAGATCCTCGCCGCCAAATTGGAAGAGCAGAAGATC
GATCTTGATAAGCCTGAAGTTGAGGACGCTGATGACAACGATGAGGATGACTCCGACGAT
GATGATGATGACGCAGAGGGACAAGAAGGAGAAGCAGGAGGCAAGTCAAAGCAAAGCAGA
AGCGAGAAGAAGAGTCGCAAAGCTATGCTAAAGCTTGGAATGAAACCCATCACTGGTGTC
AGCCGTGTTACCGTCAAGAAGAGCAAGAATATCATGTTTGTCATATCAAAACCTGATGTG
TTCAAGAGTCCAGCATCAGACACGTACGTGATCTTCGGAGAGGCCAAGATAGAGGACTTG
AGCTCTCAGATCCAGTCACAAGCGGCGGAGCAGTTCAAGGCTCCAGATCTCAGCAGCATG
ATCTCAAAGGGTGAGTCGTCCTCTAGCGCTGCAGTGGTGCAGGATGATGATGAGGAGGTT
GACGAGGAAGGAGTTGAGCCAAAAGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTGCCT
AGGCCAAGAGCGGTGAAGGCTCTCAAGGCTGCTGATGGAGATATTGTCTCTGCTATCATG
GAGCTTACCACCTAAACAAACTTCTTTTGTGCGGTTTAACTTGAGTTATGTCCCAGTGAT
TGTCAAAA*GGATTCGGATTT

QA 3 743 3 743
DS 

RD RS1AF16TF 757 0 0
CCGCATTGTTCA
CACACACTCTCGACTTCAACCGACGCACATCTCATCATCAATTCATCATGACTACCGAAG
AGAAAGATATCCTCGCCGCCAAATTGGAAGAGCAGAAGATCGATCTTGATAAGCCTGAAG
TTGAGGACGCTGATGACAACGATGAGGATGACTCCGACGATGATGATGATGACGCAGAGG
GACAAGAAGGAGAAGCAGGAGGCAAGTCAAAGCAAAGCAGAAGCGAGAAGAAGAGTCGCA
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AGAGCAAGAATATCATGTTTGTCATATCAAAACCTGATGTGTTCAAGAGTCCAGCATCAG
ACACGTACGTGATCTTCGGAGAGGCCAAGATAGAGGACTTGAGCTCTCAGATCCAGTCAC
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CAAAAGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTGCCTAGGCCAAGAGCGGTGAAGG
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ACTTCTTTTGTGCGGTTTAACTTGAGTTATGTCCCAGTGATTGTCAAAA**GATTCGGAT
TTTTTTGTCTTTCATGCTTTC
AAAA

QA 13 753 13 753
DS 

RD RS1EK34JQ 691 0 0
AGTTGAGGACGCTGATGACAACGATGAGGATGACTCCGACGATGATGATGATGACGCAGA
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CAAAGCTATGCTAAAGCTTGGAATGAAACCCATCACTGGTGTCAGCCGTGTTACCGTCAA
GAAGAGCAAGAATATCATGTTTGTCATATCAAAACCTGATGTGTTCAAGAGTCCAGCATC
AGACACGTACGTGATCTTCGGAGAGGCCAAGATAGAGGACTTGAGCTTTCAGATCCAGTC
ACAAGCGGCGGAGCAGTTCAAGGCTCCAGATTTCAGCAGCATGATCTCAAAGGGTGAGTC
GTCCTCTAGCGCTGCAGTGGTGCAGGATGATGATGAGGAGGTTGACGAGGAAGGAGTTGA
GCCAAAAGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTGCCTAGGCCAAGAGCGGTGAA
GGCTCTCAAGGCTGCTGATGGAGATATTGTTTCTGCTATCATGGAGCTTACCACCTAAAC
AAACTTCTTTTGTGCGGTTTAACTTGAGTTATGTCCCAGTGATTGTCAAAAAGGATTCGG
ATTTTTTTGTCTTTCATGCTTTCTTTTTTAAGTATTTTCAATGTTGTAGTAGTAAACCTC
ATGAATTATTGAATTTAAGTGTTTGCAATTT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1C771JQ 700 0 0
GCCTGAAGTTGAGGACGCTGATGACAACGATGAGGATGACTCCGACGATGATGATGATGG
CGCAGAGGGACAAGAAGGAGAAGCAGGAGGCAAGTCAAAGCAAAGCAGAAGCGAGAAGAA
GAGTCGCAAAGCTATGCTAAAGCTTGGAATGAAACCCATCACTGGTGTCAGCCGTGTTAC
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AGCATCAGACACGTACGTGATCTTCGGAGAGGCCAAGATAGAGGACTTGAGCTCTCAGAT
CCAGTCACAAGCGGCGGAGCAGTTCGAGGCTCCAGATCTCAGCAGCATGATCTCAAAGGG
TGAGTCGTCCTCTAGCGCTGCAGTGGTGCAGGATGATGATGAGGAGGTTGACGAGGAAGG
AGTTGAGCCAAAAGACATTGAGTTGGTGATGACCCAAGCAGGAGTGCCTAGGCCAAGAGC
GGTGAAGGCTCTCGAGGCTGCTGATGGAGATATTGTCTCTGCTATCATGGAGCTTACCAC
CTAAACAAACTTCTTTTGTGCGGTTTAACTTGAGTTATGTCCCAGTGATTGTCAAAAAGG
ATTCGGATTTTTTTGTCTTTCATGCTTTCTTTTTTAAGTATTTTCAATGTTGTAGTAGTA
AACCTCATGAATTATTGAATTTAAGTGTTTGCAATTTACC

QA 1 700 1 700
DS 



CO CL176Contig2 791 5 10 U
TTATGAGGTTTACTAATACAACATTGAAAACACTTAAAAGAAAGCATGAAAGTCAAAAAA
AAAAAA*TTCCGAATCCTTTTTGACAATCTCTGGGACATATAACTCAAGTTAAACCACAC
AAAAGAAGTTTGTTTAGGTGGTAAGCTCCATGATAGCAGAAACAATATCTCCATCAGCAG
CCTTGAGAGCCTTCACTGCTCTTGGCCTAGGCACACCTGCTTGGGTCATCACCAACTCAA
TGTCTTTTGGCTCAACTCCTTCCTCGTCAACCTCCTCATCATCATCCTGCACCACTGCTG
CAGCGCTGGAGGACGACTCACCCTTTGAGATCATGCTGCTGAAATCTGGAGCCTTGAACT
GCTCGGCCGCTTGTGACTGGATCTGAAAGCTCAAGTCCTCGATCTTGGCCTCTCCGAAGA
TCACGTATGTGTCTGATGCAGGGCTCTTGAACACATCAGGTTTTGATATGACAAACATGA
TATTCTTGCTCTTCTTGACGGTAACACGGCTGACACCAGTGATGGGTTTCATTCCAAGCT
TCAGCATAGCTTTGCGACTCTTCTTCTCGCTTCTGCTTTGCTTTGACTTGCCTCCTGCTT
CTCCATCTTGTCCCTCTGCGTCATCATCATCATCGTCGGAGTCATCCTCATCGTTGTCAT
CAGCGTCCTCAACTTCAGGCTTATCAAGATCGATCTTCTGCTCTTCCAATTTGGCGGCGA
GGATCTCTTTCTCTTCGGTAGTCATGATAATGATATGTGCGTCGGTTGAAGTCGAGAGTG
TGTGTGTGAAC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RS1EV95JQ U 1
AF RS1H051JQB U 1
AF RS1H051TF C 186
AF RS1CV56JQ U 1
AF RS1EV95TF C 78
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CAGCGTCCTCAACTTCAGG

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CC

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TCTTTTGGCTCAACTCCTTCCTCGTCAACCTCCTCATCATCATCCTGCACCACTGCTGCA
GCGCTGGAGGACGACTCACCCTTTGAGATCATGCTGCTGAAATCTGGAGCCTTGATCTGC
TCGGCCGCTTGTGACTGGATCTGAAAACTCAAGTCCTCGATCTTGGCCTCTCCGAAAATC
ACGTATGTGTCTGATGCAGGGCTCTTGAACACATCAGGTTTTGATATGACAAACATGATA
TTCTTGCTCTTCTTGACGGTAACACGGCTGACTCCAGTGATGGGTTTCATTCCAAGCTTC
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CCATCTTGTCCCTCTGCGTCATCATCATCATCGTCGGAGTCATCCTCATCGTTGTCATCA
GCGTCCTCAACTTCAGGCTTATCAAGATCGATCTTCTGCTCTTCCAATTTGGCGGCGAGG
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TGTGTGAAC

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GGCTTATCAAGATCGACCTTCTGCTCTTCCAATTTGGCGGCGAGGATCTCTTTCTCTTCG
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C

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DS 



AS 2 10

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CTTTTGAGAAACAATAACAGATAACAAGGTTCAAAGTTCAAACATGACAGTAACCTAAAA
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ATAATTCATGTGTTCAACATGTTTCTCTCTTGGAGGAATACAATCTTTCACAGCCTCAAC
CTTCTCCAAGTTCTTCACCCATCTGCTGTATTCTGGAAACTTCTCCTCCGTAATCACTTT
CAATCCCATTCCTTCCCAACCTCTCTCCAAACAAAACGGAATCATACTTCCGGCAACTAA
ATCCAAGAACCCGACACTCTTACCGCCGAAAAAATCTTTTTCCTTCCTTCTAAATGATTA
CAACCACGATCTCCAGACTCCATTACTTCCTCTTCTTCAAACTCTTCCCAGTAACCGGAT
AACGTCTCTCTTCCCTTCTTCTCTCGCTCTTCCTTCTTCACAAAGTAATACACTTCCGTG
TTCTTATCTCCTAGCAAGTCCCAGGGATCAACATTGCAAGAACGGAGCTCAGGGAGGTCA
AAGTCCATCGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H283JQB U 25
AF RS1E758JQ U 1
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CTCCAAACAAAACGGAAT

QA 1 318 1 318
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CAATCCCATTCCTTCCCAACCTCTCTCCAAACAAAACGGAATCATACTTCCGGCAACTAA
ATCCAAGAACCCGACACTCTTACCGCCGAAAAAATCTTTTTCCTTCCTTCTAAATGATTA
CAACCACGATCTCCAGACTCCATTACTTCCTCTTCTTCAAACTCTTCCCAGTAACCGGAT
AACGTCTCTCTTCCCTTCTTCTCTCGCTCTTCCTTCTTCACAAAGTAATACACTTCCGTG
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AAGTCCATCGGA

QA 1 612 1 612
DS 



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CAGCAGATGGGTGAAGAACTTGGAGAAGGTTGAGGCTGTGAAAGATTGTATTCCTCCAAG
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CTTGTTATCTGTTAT*GTTTCTCTAAAAGCTCATCTTTATTCTTCTAATAAACAAATTCA
TCTTATAGAAGTATGAGTGATTTAAGTT


BQ
10 10 10 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 0 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EL58TF U 2
AF RS1H283TF U 1
AF RS1FU16TF U 1
AF RS1AD13TF U 2
AF RS1CV78JQ C 345
AF RS1AD13JQ C 2
AF RS1BR45JQ C 91
AF RS1FU16JQ C 91
BS 1 55 RS1FU16TF
BS 56 56 RS1EL58TF
BS 57 171 RS1FU16TF
BS 172 172 RS1EL58TF
BS 173 215 RS1FU16TF
BS 216 216 RS1EL58TF
BS 217 329 RS1FU16TF
BS 330 330 RS1EL58TF
BS 331 334 RS1FU16TF
BS 335 335 RS1EL58TF
BS 336 340 RS1FU16TF
BS 341 341 RS1H283TF
BS 342 408 RS1FU16TF
BS 409 409 RS1H283TF
BS 410 521 RS1FU16TF
BS 522 522 RS1H283TF
BS 523 619 RS1FU16TF
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BS 621 728 RS1FU16TF
BS 729 753 RS1AD13TF
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BS 796 796 RS1BR45JQ
BS 797 803 RS1AD13JQ
BS 804 804 RS1BR45JQ
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BS 808 808 RS1BR45JQ
BS 809 811 RS1AD13JQ
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BS 819 819 RS1BR45JQ
BS 820 843 RS1AD13JQ
BS 844 868 RS1BR45JQ

RD RS1EL58TF 402 0 0
GA
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GCTTTTGGGAATATGGGCGAGCCCTTTCAGCCGTCGGATCGAGATGGCTCTCAAACTCAA
AGGCATACCGTACGATTACGTTGAAGAAATACTAGAGCACAAAAGCCCTTTGCTTCTTGC
ACTCAACCCTATCCACAAGAAGGTCCCTGTTCTTGTCCACAATGGCAAA*CCATTCTCGA
GTCTCAAGTGATTCTTCA*TACATCGATGAGACTTGGAAACAGA*TCCAATTCTCCCTGA
AGATCCTTACGAGAGATCCAAGGCTCGATTCTTAGCT*AACTCGTCGATGA*CAGATTAT
CACTGCGGGTTT*GTATCA*TGGCAAGAGCAGACGA
AAAA

QA 3 398 3 398
DS 

RD RS1H283TF 626 0 0
GGAG
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CTTTTGGGAATATGGGCGAGCCCTTTCAGCCGTCGGATCGAGATGGCTCTCAAACTCAAA
GGCATACCGTACGATTACGTTGAAGAAATACTAGAGCACAAAAGCCCTTTGCTTCTTGCA
CTCAACCCTATCCACAAGAAGGCCCCTGTTCTTGTCCACAATGGCAAAACCATTCTCGAG
TCTCAAGTGATTCTTCAATACATCGATGAGACTTGGAAACAGAATCCAATTCTCCCTGAA
GATCCTTACGAGAGATCCAAGGCTCGATTCTTAGCTAAACTCGTCGATGAACAGATTATC
ACTGCGGGTTTTGTATCAATGGCAAGAGCAGACGAGAAAGGAAGAGAGGCTTTGGCGGAG
CAGACAAGAGAACTGATTGTGAATCTGGAGAAGGAACTTGTCGGAAAAGATTTCTTCGGC
GGTAAGAGTGTCGGGTTCTTGGATTTAGTTGCCGGAAGTATGATTCCGTTTTGTTTGGAG
AGAGGTTGGGAAGGAATGGGATTGAAAGTGATTACGGAGGAGAAGTTTCCAGAATACAGC
AGATGGGTGAAGAACTTGGAGA

QA 5 626 5 626
DS 

RD RS1FU16TF 728 0 0
GGAACACATTTCTAGGAGACAGATAGAAATAAAACAAGTAATGGCGGAGAAAGAATAAGT
GAAGCTTTTGGGAATATGGGCGAGCCCTTTCAGCCGTCGGATCGAGATGGCTCTCAAACT
CAAAGGCATACCGTACGATTACGTTGAAGAAATACTAGAGCACAAAAGCCCCTTGCTTCT
TGCACTCAACCCTATCCACAAGAAGGTCCCTGTTCGTGTCCACAATGGCAAAACCATTCT
CGAGTCTCAAGTGATTCTTCAATACATCGATGAGACTTGGAAACAGAATCCAATTCTCCC
TGAAGATCCTTACGAGAGATCCAAGGCTCAATTCCTAGCTGAACTCGTCGATGAACAGAT
TATCACTGCGGGTTTTGTATCAATGGCAAGAGCAGACGAGAAAGGAAGGGAGGCTTTGGC
GGAGCAGACAAGAGAACTGATTATGAATCTGGAGAAGGAACTTGTCGGAAAAGATTTCTT
CGGCGGTAAGAGTGTCGGGTTCTTGGATTTAGTTGCCGGAAATATGATTCCGTTTTGTTT
GGAGAGAGGTTGGGAAGGAATGGGATTGAAAGTGATTACGGAGGAGAAGTTTCCAGAATA
CAGCAGATGGGTGAAGAACCTGGAGAAGGTTGAGGCTGTGAAAGATTGTATTCCTCCAAG
AGAGAAACATGTTGAACACATGAATTATATGGGGGAAAGAATCAGATCCGCTTAGTCGAA
AGTCATAT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1AD13TF 752 0 0
GG
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GCTTTTGGGAATATGGGCGAGCCCTTTCAGCCGTCGGATCGAGATGGCTCTCAAACTCAA
AGGCATACCGTACGATTACGTTGAAGAAATACTAGAGCACAAAAGCCCTTTGCTTCTTGC
ACTCAACCCTATCCACAAGAAGGTCCCTGTTCTTGTCCACAATGGCAAAACCATTCTCGA
GTCTCAAGTGATTCTTCAATACATCGATGAGACTTGGAAACAGAATCCAATTCTCCCTGA
AGATCCTTACGAGAGATCCAAGGCTCGATTCTTAGCTAAACTCGTCGATGAACAGATTAT
CACTGCGGGTTTTGTATCAATGGCAAGAGCAGACGAGAAAGGAAGAGAGGCTTTGGCGGA
GCAGACAAGAGAACTGATCGTGAATCTGGAGAAGGAACTTGTCGGAAAAGATTTCTTCGG
CGGTAAGAGTGTCGGGTTCTTGGATTTAGTTGCCGGAAGTATGATTCCGTTTTGTTTGGA
GAGAGGTTGGGAAGGAATGGGATTGAAAGTGATTACGGAGGAGAATTTTCCAGAATACAG
CAGATGGGTGAAGAACTTGGAGAAGGTTGAGGCTGTGAAAGATTGTATTCCTCCAAGAGA
GAAACATGTTGAACACATGAATTATATGGGGGAAAGAATCAGATCCGCTTAGTCGGAAGT
CATATTTGGTTCTGTGTTTCAATGTTTTTA

QA 3 752 3 752
DS 

RD RS1CV78JQ 473 0 0
TTTTTAAGAG
ACAGATTATCACTGCGGGTTTTGTATCAATGGCAAGAGCAGACGAGAAAGGAAGAGAGGC
TTTGGCGGAGCAGACAAGAGAACTGATCATGAATCTGGAGAAGGAACTTGTCGGAAAAGA
TTTCTTCGGCGGTAAGAGTGTCGGGTTCTTGGATTTAGTTGCCGGAAGTATGATTCCGTT
TTGTTTGGAGAGAGGTTGGGAAGGAATGGGATTGAAAGTGATAACAGAGGAGAAGTTTCC
AGAATACAGCAGATGGGTGAAGAACTTGGAGAAGGTTGAGGCTGTGAAAGATTGTATTCC
TCCAAGAGAGAAACATGTTGAACACATGAATTATATGGGGGAAAGAATCAGATCCGCTTA
GTCGAAAGTCATATCTGGTTCTGTGTTTCAATGTTTTTAAGTTACTGTCATGTTTGAACT
TCGGACCTTGTTATCTGTTAT*GTTTCTCTAAAAGCTCATCTT

QA 11 473 11 473
DS 

RD RS1AD13JQ 843 0 0
GG
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GCTTTTGGGAATATGGGCGAGCCCTTTCAGCCGTCGGATCGAGATGGCTCTCAAACTCAA
AGGCATACCGTACGATTACGTTGAAGAAATACTAGAGCACAAAAGCCCTTTGCTTCTTGC
ACTCAACCCTATCCACAAGAAGGTCCCTGTTCTTGTCCACAATGGCAAAACCATTCTCGA
GTCTCAAGTGATTCTTCAATACATCGATGAGACTTGGAAACAGAATCCAATTCTCCCTGA
AGATCCTTACGAGAGATCCAAGGCTCGATTCTTAGCTAAACTCGTCGATGAACAGATTAT
CACTGCGGGTTTTGTATCAATGGCAAGAGCAGACGAGAAAGGAAGAGAGGCTTTGGCGGA
GCAGACAAGAGAACTGATCGTGAATCTGGAGAAGGAACTTGTCGGAAAAGATTTCTTCGG
CGGTAAGAGTGTCGGGTTCTTGGATTTAGTTGCCGGAAGTATGATTCCGTTTTGTTTGGA
GAGAGGTTGGGAAGGAATGGGATTGAAAGTGATTACGGAGGAGAATTTTCCAGAATACAG
CAGATGGGTGAAGAACTTGGAGAAGGTTGAGGCTGTGAAAGATTGTATTCCTCCAAGAGA
GAAACATGTTGAACACATGAATTATATGGGGGAAAGAATCAGATCCGCTTAGTCGGAAGT
CATATTTGGTTCTGTGTTTCAATGTTTTTAAGTTACTGTCATGTTTGAACTTTGACCCTT
GTTATCTGTTATTGTTTCTCAAAAGGCTTATCTTTTTTCTTCTAATAAACAAATTCATCT
C

QA 3 842 3 842
DS 

RD RS1BR45JQ 778 0 0
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AATACTAGAGCACAAAAGCCCTTTGCTTCTTGCACTCAACCCTATCCACAAGAAGGTCCC
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TGAGACTTGGAAACAGAATCCAATTCTCCCTGAAGATCCTTACTAGAGATCCAAGGCTCG
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GGAGAAGGAACTTGTCGGAAAAGATTTCTTCGGCGGTAAGAGTGTCGGGTTCTTGGATTT
AGTTGCCGGAAATATGATTCCGTTTTGTTTGGAGAGAGGTTGGGAAGGAATGGGATTGAA
AGTGATTACGGAGGAGAAGTTTCCAGAATACAGCAGATGGGTGAAGAACCTGGAGAAGGT
TGAGGCTGTGAAAGATTGTATTCCTCCAAGAGAGAAACATGTTGAACACATGAATTATAT
GGGGGAAAGAATCAGATCCGCTTAGTCGAAAGTCATATTTGGTTCTGTGTTTCAATGTTT
TTAAGTTACTGTCATGTTTGAACTTCGGACCTTGTTATCTGTTAT*GTTTCTCTAAAAGC
TCATCTTTATTCTTCTAATAAACAAATTCATCTTATAGAAGTATGAGTGATTTAAGTT

QA 1 778 1 778
DS 

RD RS1FU16JQ 762 0 0
CAGCCGTCGGATCGAGATGGCTCTCAAACTCAAAGGCATACCGTACGATTACGTTGAAGA
AATACTAGAGCACAAAAGCCCCTTGCTTCTTGCACTCAACCCTATCCACAAGAAGGTCCC
TGTTCGTGTCCACAATGGCAAAACCATTCTCGAGTCTCAAGTGATTCTTCAATACATCGA
TGAGACTTGGAAACAGAATCCAATTCTCCCTGAAGATCCTTACGAGAGATCCAAGGCTCA
ATTCCTAGCTGAACTCGTCGATGAACAGATTATCACTGCGGGTTTTGTATCAATGGCAAG
AGCAGACGAGAAAGGAAGGGAGGCTTTGGCGGAGCAGACAAGAGAACTGATTATGAATCT
GGAGAAGGAACTTGTCGGAAAAGATTTCTTCGGCGGTAAGAGTGTCGGGTTCTTGGATTT
AGTTGCCGGAAATATGATTCCGTTTTGTTTGGAGAGAGGTTGGGAAGGAATGGGATTGAA
AGTGATTACGGAGGAGAAGTTTCCAGAATACAGCAGATGGGTGAAGAACCTGGAGAAGGT
TGAGGCTGTGAAAGATTGTATTCCTCCAAGAGAGAAACATGTTGAACACATGAATTATAT
GGGGGAAAGAATCAGATCCGCTTAGTCGAAAGTCATATTTGGTTCTGTGTTTCAATGTTT
TTAAGTTACTGTCATGTTTGAACTTCGGGCCTTGTTATCTGTTAT*GTTTCTCTAAAAGC
TCATCTTTATTCTTCTAATAAACAAATTCATCTTAT
AGAAGT

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 12

CO CL178Contig1 715 12 12 U
GGACAAGAAAAAGAAATAGCCTTTGTTGACATCTTCTCTCTGTTAAAGAGTTTCATCCTT
ATCCGTTCCATCAATTTCTCTCTCTGTTAGCTTTGAGTTTGATTTGATCTTCTTGTATTC
TTGTTACGTTCGACTTTAGATTTGGTGTAAATTCTCACGAGTAAAGATGAACAAAGGCAG
CAGCTTTAAGCTTGACAACGATTACGAAAAGAGGAAAGCTGAAGCTGATAGGATCAGGGA
GAAGTACCCTGATAGAATCCCGGTGATTGTGGAAAAGGCAGAGAAAAGTGATATCCCAAA
CATTGACAAGAAAAAA*TACCTGGTGCCATCAGACCTAACAGTAGGGCAATTCGTGTATG
TGATTCGGAAGAGGATCAAACTGAGTGCCGAGAAAGCTATCTTCATATTCGTAGACAATG
TTCTTCCTCCTACTGGAGAGATCATGTCAAGCGTCTACGAGGAGAAGAAAGACCAAGATG
GCTTCCTTTACATTACTTACAGTGGCGAGAACACGTTTGGTGCTTCTTCATTCTGAATCC
TCTAACCTGAGAAACGCATGTATTCTGATGTTTCCCACAATCTTTCAACTTTGTGTATAT
AATAAGTATCGTTCTCTCAGCATAATCTTCTCAAGATTTGTGATTTTTTTT*CTTCTTCA
CTTTGTGTTCAATAATGTAAAGTAAGACTAATATGAAATATTCGCTTCATTGGCA


BQ
35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 50 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 25 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 35 35 35 30 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BT11TF U 12
AF RS1DQ12TF U 10
AF RS1BW59JQ C 1
AF RS1BW59TF U 1
AF RS1FO35JQ C 3
AF RS1FO35TF U 3
AF RS1FG61JQ C 1
AF RS1FG61TF U 1
AF RS1DQ12JQ C 10
AF RS1FS91TF U 1
AF RS1CP02TF U 44
AF RS1BT11JQ C 36
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BS 185 616 RS1BW59TF
BS 617 643 RS1FO35TF
BS 644 650 RS1FG61TF
BS 651 651 RS1FS91TF
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BS 667 667 RS1FS91TF
BS 668 707 RS1FG61TF
BS 708 715 RS1FS91TF

RD RS1BT11TF 191 0 0
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CAATTTCTCTCTCTGTTAGCTTTGAGTTTGATTTGATCTTCTTGTATTCTTGTTACGTTC
GACTTTAGATTTGGTGTAAATTCTCACGAGTAAAGATGAACAAAGGCAGCAGCTTTAAGC
TTGACAACGAT

QA 1 191 1 191
DS 

RD RS1DQ12TF 567 0 0
G
AAGAAATAGCCTTTGTTGACATCTTCTCTCTGTTAAAGAGTTTCATCCTTATCCGTTCCA
TCAATTTCTCTCTCTGTTAGCTTTGAGTTTGATTTGATCTTCTTGTATTCTTGTTACGTT
CGACTTTAGATTTGGTGTAAATTCTCACGAGTAAAGATGAACAAAGGCAGCAGCTTTAAG
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GATAGAATCCCGGTGATTGTGGAAAAGGCAGAGAAAAGTGATATCCCAAACATTGACAAG
AAAAAA*TACCTGGTGCCATCAGACCTAACAGTAGGGCAATTCGTGTATGTGATTCGGAA
GAGGATCAAACTGAGTGCCGAGAAAGCTATCTTCATATTCGTAGACAATGTTCTTCCTCC
TACTGGAGAGATCATGTCAAGCGTCTACGAGGAGAAGAAAGACCAAGATGGCTTCCTTTA
CATTACTTACAGTGGCGAGAACACGTTTGGTGCTTCTTCATTCTGAATCCTCTAACCTGA
GAAACGCATGTATTCTGATGTTTCCC

QA 2 567 2 567
DS 

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TGATTCGGAAGAGGATCAAACTGAGTGCCGAGAAAGCTATCTTCATATTCGTAGACAATG
TTCTTCCTCCTACTGGAGAGATCATGTCAAGCGTCTACGAGGAGAAGAAAGACCAAGATG
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TCTAACCTGAGAAACGCATGTATTCTGATGTTTCCCACAATCTTTCAACTTTGTGTATAT
AATAAGTATCGTTCTC
CC

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DS 

RD RS1BW59TF 618 0 0
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TTGTTACGTTCGACTTTAGATTTGGTGTAAATTCTCACGAGTAAAGATGAACAAAGGCAG
CAGTTTTAAGCTTGACAACGATTACGAAAAGAGGAAAGCTGAAGCTGATAGGATCAGGGA
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CATTGACAAGAAAAAA*TACCTGGTGCCATCAGACCTAACAGTAGGGCAATTCGTGTATG
TGATTCGGAAGAGGATCAAACTGAGTGCCGAGAAAGCTATCTTCATATTCGTAGACAATG
TTCTTCCTCCTACTGGAGAGATCATGTCAAGCGTCTACGAGGAGAAGAAAGACCAAGATG
GCTTCCTTTACATTACTTACAGTGGCGAGAACACGTTTGGTGCTTCTTCATTCTGAATCC
TCTAACCTGAGAAACGCATGTATTCTGATGTTTCCCACAATCTTTCAACTTTGTGTATAT
AATAAGTATCGTTCTC
CC

QA 1 616 1 616
DS 

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GG
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TTTAAGCTTGACAACGATTACGAAAAGAGGAAAGCTGAAGCTGATAGGATCAGGGAGAAG
TACCCTGATAGAATCCCGGTGATTGTGGAAAAGGCAGAGAAAAGTGATATCCCAAACATT
GACAAGAAAAAA*TACCTGGTGCCATCAGACCTAACAGTAGGGCAATTCGTGTATGTGAT
TCGGAAGAGGATCAAACTGAGTGCCGAGAAAGCTATCTTCATATTCGTAGACAATGTTCT
TCCTCCTACTGGAGAGATCATGTCAAGCGTCTACGAGGAGAAGAAAGACCAAGATGGCTT
CCTTTACATTACTTACAGTGGCGAGAACACGTTTGGTGCTTCTTCATTCTGAATCCTCTA
ACCTGAGAAACGCATGTATTCTGATGTTTCCCACAATCTTTCAACTTTGTGTATATAATA
AGTATCGTTCTCTCAGCATAATCTTCTCAAGATTTGTGA
CT

QA 3 641 3 641
DS 

RD RS1FO35TF 643 0 0
GG
AAGAAAAAGAAATAGCCTTTGTTGACATCTTCTCTCTGTTAAAGAGTTTCATCCTTATCC
GTTCCATCAATTTCTCTCTCTGTTAGCTTCGAGTTTGATTTGATCTTCTTGTATTCTTGT
TACGTTCGACTTTAGATTTGGTGTAAATTCTCACGAGTAAAGATGAACAAAGGCAGCAGC
TTTAAGCTTGACAACGATTACGAAAAGAGGAAAGCTGAAGCTGATAGGATCAGGGAGAAG
TACCCTGATAGAATCCCGGTGATTGTGGAAAAGGCAGAGAAAAGTGATATCCCAAACATT
GACAAGAAAAAA*TACCTGGTGCCATCAGACCTAACAGTAGGGCAATTCGTGTATGTGAT
TCGGAAGAGGATCAAACTGAGTGCCGAGAAAGCTATCTTCATATTCGTAGACAATGTTCT
TCCTCCTACTGGAGAGATCATGTCAAGCGTCTACGAGGAGAAGAAAGACCAAGATGGCTT
CCTTTACATTACTTACAGTGGCGAGAACACGTTTGGTGCTTCTTCATTCTGAATCCTCTA
ACCTGAGAAACGCATGTATTCTGATGTTTCCCACAATCTTTCAACTTTGTGTATATAATA
AGTATCGTTCTCTCAGCATAATCTTCTCAAGATTTGTGA
CT

QA 3 641 3 641
DS 

RD RS1FG61JQ 708 0 0
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ATCCGTTCCATCAATTTCTCTCTCTGTTAGCTTTGAGTTTGATTTGATCTTCTTGTATTC
TTGTTACGTTCGACTTTAGATTTGGTGTAAATTCTCACGAGTAAAGATGAACAAAGGCAG
CAGCTTTAAGCTTGACAACGATTACGAAAAGAGGAAAGCTGAAGCTGATAGGATCAGGGA
GAAGTACCCTGATAGAATCCCGGTGATTGTGGAAAAGGCAGAGAAAAGTGATATCCCAAA
CATTGACAAGAAAAAA*TACCTGGTGCCATCAGACCTAACAGTAGGGCAATTCGTGTATG
TGATTCGGAAGAGGATCAAACTGAGTGCCGAGAAAGCTATCTTCATATTCGTAGACAATG
TTCTTCCTCCTACTGGAGAGATCATGTCAAGCGTCTACGAGGAGAAGAAAGACCAAGATG
GCTTCCTTTACATTACTTACAGTGGCGAGAACACGTTTGGTGCTTCTTCATTCTGAATCC
TCTAACCTGAGAAACGCATGTATTTTGATGTTTCCCACAATCTTTCAACTTTGTGTATAT
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CTTTGTTTTCAATAATGTAAAGTAAGACTAATATGAAATATTCGCTTC

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DS 

RD RS1FG61TF 707 0 0
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CAGCTTTAAGCTTGACAACGATTACGAAAAGAGGAAAGCTGAAGCTGATAGGATCAGGGA
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CATTGACAAGAAAAAA*TACCTGGTGCCATCAGACCTAACAGTAGGGCAATTCGTGTATG
TGATTCGGAAGAGGATCAAACTGAGTGCCGAGAAAGCTATCTTCATATTCGTAGACAATG
TTCTTCCTCCTACTGGAGAGATCATGTCAAGCGTCTACGAGGAGAAGAAAGACCAAGATG
GCTTCCTTTACATTACTTACAGTGGCGAGAACACGTTTGGTGCTTCTTCATTCTGAATCC
TCTAACCTGAGAAACGCATGTATTCTGATGTTTCCCACAATCTTTCAACTTTGTGTATAT
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CTTTGTTTTCAATAATGTAAAGTAAGACTAATATGAAATATTCGCTT

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DS 

RD RS1DQ12JQ 695 0 0
G
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CGACTTTAGATTTGGTGTAAATTCTCACGAGTAAAGATGAACAAAGGCAGCAGCTTTAAG
CTTGACAACGATTACGAAAATAGGAAAGCTGAAGCTGATAGGATCAGGGAGAAGTACCCT
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AAAAAA*TACCTGGTGCCATCAGACCTAACAGTAGGGCAATTCGTGTATGTGATTCGGAA
GAGGATCAAACTGAGTGCCGAGAAAGCTATCTTCATATTCGTAGACAATGTTCTTCCTCC
TACTGGAGAGATCATGTCAAGCGTCTACGAGGAGAAGAAAGACCAAGATGGCTTCCTTTA
CATTACTTACAGTGGCGAGAACACGTTTGGTGCTTCTTCATTCTGAATCCTCTAACCTGA
GAAACGCATGTATTCTGATGTTTCCCACAATCTTTCAACTTTGTGTATATAATAAGTATC
GTTCTCTCAGCATAATCTTCTCAAGATTTGTGATTTTTTTT*CTTCTTCACTTTGTGTTC
AATAATGTAAAGTAAGACTAATATGAAATATTCG

QA 2 695 2 695
DS 

RD RS1FS91TF 715 0 0
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TTGTTACGTTCGACTTTAGATTTGGTGTAAATTCTCACGAGTAAAGATGAACAAAGGCAG
CAGCTTTAAGCTTGACAACGATTACGAAAAGAGGAAAGCTGAAGCTGATAGGATCAGGGA
GAAGTACCCTGATAGAATCCCGGTGATTGTGGAAAAGGCAGAGAAAAGTGATATCCCAAA
CATTGACAAGAAAAAA*TACCTGGTGCCATCAGACCTAACAGTAGGGCAATTCGTGTATG
TGATTCGGAAGAGGATCAAACTGAGTGCCGAGAAAGCTATCTTCATATTCGTAGACAATG
TTCTTCCTCCTACTGGAGAGATCATGTCAAGCGTCTACGAGGAGAAGAAAGACCAAGATG
GCTTCCTTTACATTACTTACAGTGGCGAGAACACGTTTGGTGCTTCTTCATTCTGAATCC
TCTAACCTGAGAAACGCATGTATTCTGATGTTTCCCACAATCTTTCAACTTTGTGTATAT
AATAAGTATCGTTCTCTCAGCATAATCTTCTCAAGATTTGTGATTTTTTTT*CTTCTTCA
CTTTGTGTTCAATAATGTAAAGTAAGACTAATATGAA*TATTCGCTTCATTGGCA

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1CP02TF 671 0 0
G
AAAGAGTTTCATCCTTATCCGTTCCATCAATTTCTCTCTCTGTTAGCTTTGAGTTTGATT
TGATCTTCTTGTATTCTTGTTACGTTCGACTTTAGATTTGGTGTAAATTCTCACGAGTAA
AGATGAACAAAGGCAGCAGCTTTAAGCTTGACAACGATTACGAAAAGAGGAAAGCTGAAG
CTGATAGGATCAGGGAGAAGTACCCTGATAGAATCCCGGTGATTGTGGAAAAGGCAGAGA
AAAGTGATATCCCAAACATTGACAAGAAAAAA*TACCTGGTGCCATCAGACCTAACAGTA
GGGCAATTCGTGTATGTGATTCGGAAGAGGATCAAACTGAGTGCCGAGAAAGCTATCTTC
ATATTCGTAGACAATGTTCTTCCTCCTACTGGAGAGATCATGTCAAGCGTCTACGAGGAG
AAGAAAGACCAAGATGGCTTCTTTTACATTACTTACAGTGGCGAGAACACGTTTGGTGCT
TCTTCATTCTGAATCCTCTAACCTGAGAAACGCATGTATTCTGATGTTTCCCACAATCTT
TCAACTTTGTGTATATAATAAGTATCGTTCTCTCAGCATAATCTTCTCAAGATTTGTGAT
TTTTTTTTCTTCTTCACTTTGTGTTCAATAATGTAAAGTAAGACTAATATGAAATATTCG
CTTC
ATTGGC

QA 2 665 2 665
DS 

RD RS1BT11JQ 679 0 0
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AGTTTGATTTGATCTTCTTGTATTCTTGTTACGTTCGACTTTAGATTTGGTGTAAATTCT
CACGAGTAAAGATGAACAAAGGCAGCAGCTTTAAGCTTGACAACGATTACGAAAGGAGGA
AAGCTGAAGCTGATAGGATCAGGGAGAAGTACCCTGATAGAATCCCGGTGATTGTGGAAA
AGGCAGAGAAAAGTGATATCCCAAACATTGACAAGAAAAAAATACCTGGTGCCATCAGAC
CTAACAGTAGGGCAATTCGTGTATGTGATTCGGAAGAGGATCAAACTGAGTGCCGAGAAA
GCTATCTTCATATTCGTAGACAATGTTCTTCCTCCTACTGGAGAGATCATGTCAAGCGTC
TACGAGGAGAAGAAAGACCAAGATGGCTTCCTTTACATTACTTACAGTGGCGAGAACACG
TTTGGTGCTTCTTCATTCTGAATCCTCTAACCTGAGAAACGCATGTATTCTGATGTTTCC
CACAATCTTTCAACTTTGTGTATATAATAAGTATCGTTCTCTCAGCATAATCTTCTCAAG
ATTTGTGATTTTTTTT*CTTCTTCACTTTGTGTTCAATAATGTAAAGTAAGACTAATATG
AAATATTCGCTTC
ATTGGC

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 12

CO CL179Contig1 646 12 5 U
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CAAAATACCATCTACCAAAATCCTCAAATTTGTTTGTGATATATTTCGAACTCGAACAAG
ATTCAAAAAAACAACCAAACGCACGACAACAAAGACCAACTAATGATTGATTGCAACTAT
CTTTAGACGATGGCATTGGCAGCACTAGCAATCCTTGGCCAGAGATCAGCGCACTCTTTA
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GCATTATCATCCTTTCGGCGCCAAGGCTTCCTCTGCCTAACGATGACAGCTGGAAGGACC
TTCTTACGGAGATCGGGCTTTCCCTTCTTGACGGTGGCCATCACCATGTCGCCGACGCAA
GCAGAAGGCAACCTGTTGAGACGACCCTTGATCCCTTTCACAGAAATGATGTAAAGGTTC
TTGGCACCTGTGTTGTCAGCACAGTTCACCGTCGCCGCCACGGGTAGACCCAGCGACATC
CTGAACTTGTTACCCGACGTACCTCCACGTCCTCGCTTCGACATTTTGGATCTGTTGTCC
GAAAATTAGTAGGGGTTTGCGGCTTTTGTATATAGGGACGCAATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 50 65 65 65 
65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AI80TF C 21
AF RS1DB89JQ U 1
AF RS1AI80JQ U 21
AF RS1AJ32JQ U 21
AF RS1DB89TF C 1
AF RS1AJ32TF C 20
AF RS1F903JQ U 57
AF RS1F903TF C 57
AF RS1EG93JQ U 68
AF RS1EG93TF C 67
AF RS1BX61JQ U 67
AF RS1BX61TF C 67
BS 1 438 RS1DB89JQ
BS 439 439 RS1AI80JQ
BS 440 599 RS1DB89JQ
BS 600 600 RS1F903JQ
BS 601 646 RS1BX61JQ

RD RS1AI80TF 354 0 0
AACAAAAATATTTGATCGTCGTTGAGATTGTAAAGAAAATCAAAATACCATCTACCAAAA
TCCTCAAATTTGTTTGTGATATATTTCGAACTCGAACAAGATTCAAAAAAACAACCAAAC
GCACGACAACAAAGACCAGCTAATGATTGATTGCAACTATCTTTAGACGATGGCATTGGC
AGCACTAGCAATCCTTGGCCAGAGATCAGCGCACTCTTTACCAATGGGACCAGTGATTGC
AGAACCTTTCATTTCTCCCTTGGGGTTGACGATGACTCCAGCATTATCATCCTTTCGGCG
CCAAGGCTTCCTCTGCCTAACGATGACAGCTGGAAGGACCTTCTTACGGAG
GTC

QA 1 351 1 351
DS 

RD RS1DB89JQ 599 0 0
GGCTAAGGATTTGTCTAAATAACAAAAATATTTGATCGTCGTTGAGATTGTAAAGAAAAT
CAAAATACCATCTACCAAAATCCTCAAATTTGTTTGTGATATATTTCGAACTCGAACAAG
ATTCAAAAAAACAACCAAACGCACGACAACAAAGACCAACTAATGATTGATTGCAACTAT
CTTTAGACGATGGCATTGGCAGCACTAGCAATCCTTGGCCAGAGATCAGCGCACTCTTTA
CCAATGGGACCAGTGATTGCAGAACCTTTCATTTCTCCCTTGGGGTTGACGATGACTCCA
GCATTATCATCCTTTCGGCGCCAAGGCTTCCTCTGCCTAACGATGACAGCTGGAAGGACC
TTCTTACGGAGATCGGGCTTTCCCTTCTTGACGGTGGCCATCACCATGTCGCCGACGCAA
GCAGAAGGCAACCTGTTGGGACGACCCTTGATCCCTTTCACAGAAATGATGTAAAGGTTC
TTGGCACCTGTGTTGTCAGCACAGTTCACCGTCGCCGCCACGGGTAGACCCAGCGACATC
CTGAACTTGTTACCCGACGTACCTCCACGTCCTCGCTTCGACATTTTGGATCTGTTGTC

QA 1 599 1 599
DS 

RD RS1AI80JQ 558 0 0
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TCCTCAAATTTGTTTGTGATATATTTCGAACTCGAACAAAATTCAAAAAAACAACCAAAC
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CCAAGGCTTCCTCTGCCTAACGATGACAGCTGGAAGGACCTTCTTACGGAAATCGGGCTT
TCCCTTCTTGACGGTGGCCATCACCATGTCCCCGACGCAAGCAAAAGGCAACCTGTTGAA
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ACTTCCACGTCCTCGCTT

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TTGGCACCTGTGTTGTCAGCACAGTTCACCGTCGCCGCCACGGGTAGACCCAGCGACATC
CTGAACTTGTTACCCGACGTACCTCCACGTCCTCGCTTCGACATTTTGGATCTGTTGTC

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TCCACGTCCTCGCTTCGACATTTTGGATCTGTTGTC

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GACCTTCTTACGGAGATCGGGCTTTCCCTTCTTGACGGTGGCCATCACCATGTCGCCGAC
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GACCTTCTTACGGAGATCGGGCTTTCCCTTCTTGACGGTGGCCATCACCATGTCGCCGAC
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GTCC

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CCT

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G
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GGAGATCGGGCTTTCCCTTCTTGACGGTGGCCATCAC*ATGTCGCCGACGCAAGCAGAAG
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G
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GGAGATCGGGCTTTCCCTTCTTGACGGTGGCCATCAC*ATGTCGCCGACGCAAGCAGAAG
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AGTAGGGGTTTGCGGCTTTTGTATATAGGGACGCAATCC

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DS 



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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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BS 400 443 RS1B784JQ
BS 444 444 RS1D577JQ
BS 445 697 RS1B784JQ
BS 698 752 RS1D577JQ
BS 753 823 RS1BD36JQ
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BS 1095 1135 RS1D577TF
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RD RS1G078JQ 306 0 0
GG
TAGTATTTTAGTGAAATAAAAAA*GCAGAAAAAAGAGAACAAATAGTTTTGTTATACATT
GAAAGAGGGGTGGAGAGAAAGATGGAGAAACAGGGATATGAATTAGATCCGGGAAGGAAT
GAGAGGGATCTGGTGCTGAAGATAAGTAGAAGCAGCTGCAACTCCACTTCCCAATACAAT
TGGGTAGCCAACATCCTTGAGTATCATCTCCACTCCAGCCAAACACCCAAGAAGTTGCAA
CTCATTAAGATTTCCAAGGGGCCCAATTCTGAAAACCTTGCCAGCCACTTTGTTGAGACC
AAGA

QA 3 306 3 306
DS 

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TTTTGTTATACATGGAAAGAGGGGTGGAGAGAAAGATGGAGAAACAGGGATATGAATTAG
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CTTCCCAATACAATTGGGTAGCCAACATCCTTGAGTATCATCTCCACTCCAGCCAAACAC
CCAAGAAGTTGCAACTCATTAAGATTTCCAAGGTGCCCAATTCTGAAAACCTTGCCAGCC
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TCAGTACTGTCTATATTCGGCGGCACCACGACCGCTGTCACTGTGTTACTGATCCACTCC
TCCTTTTGTGTACAGTTTTTCAGCCCCCACGCTTCCACCGCGAGCCTTGTGGCCTTTCCC
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GCTCTAAGACCGTAGAGGAGTTGAATGGAAGGTGTGTATGGCCAATATGTCCCGAGCTTG
TAAAACTTGAGGTAGTCATTCCAATCAAAGAAGACTT

QA 1 697 1 697
DS 

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AATGGTATTGATATGAATAAAAATAAATCTGACATAAGTTTTTTGGAATAATTGCACATA
AAATAGATAGTATTTTAGTGAAATAAAAAAAGCAGAGAAAAGAGAACAAATAGTTTTGTT
ATACATTGAAAGAGGGGTGGAGAGAAAGATGGAGAAACAGGGATATGAATTAGATCCGGG
AAGGAATGAGAGGGATCTGGTGCTGAAGATAAGTAGAAGCAGCTGCAACTCCACTTCCCA
ATACAATTGGGTAGCCAACATCCTTGAGTATCATCTCCACTCCAGCCAAACACCCAAGAA
GTCGCAACTCATTAAGATTTCCAAGGTGCCCAATTCTGAAAACCTTGCCAGCCACTTTGT
TGAGACCAAGACCAAGACTAAGGTTGTACCTCCTCCACGCCCTTTTCACAATCTCAGTAC
TGACTATATTCGGCGGTACCACGACCGCTGTCACTGTGTTACTGATCCACTCCTCCTTTT
GTGTACAGTTTTTCAGCCCCCACGCTTCCACCGCGAGCCTTGTGGCCTTTCCCAAACGGG
CGTGACGGGCGATGACATTTTCAAGTCCTTCTTCAAAGATAAGATCAAGAGCAGCTCTAA
GACCGTAGAGGAGTTGAATGGAAGGTGTGTATGGCCAATATGTCCCGAGCTTGTAAAACT
TGAGGTAGTCATTCCAATCAAAGAAGACTTTGAGGGATTTTGAAGTTTTGGTAGCTTCCA
AAGCTTTTGGACTGGCGCACACAAT

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DS 

RD RS1BD36JQ 763 0 0
GCACATAAA
ATAGATAGTATTTTAGTGAAATAAAAAAAGCAGAGAAAAGAGAACAAATAGTTTTGTTAT
ACATTGAAAGAGGGGTGGAGAGAAAGATGGAGAAACAGGGATATGAATTAGATCCGGGAA
GGAATGAGAGGGATCTGGTGCTGAAGATAAGTAGAAGCAGCTGCAACTCCACTTCCCAAT
ACAATTGGGTAGCCAACATCCTTGAGTATCATCTCCACTCCAGCCAAACACCCAAGAAGT
TGCAACTCATTAAGATTTCCAAGGTGCCCAATTCTGAAAACCTTGCCAGCCACTTTGTTG
AGACCAAGACCAAGACTAAGGTTGTACCTCCTCCACGCCCTTTTCACAATCTCAGTACTG
TCTATATTCGGCGGTACCACGACCGCTGTCACTGTGTTACTGATCCACTCCTCCTTTTGT
GTACAGTTTTTCAGCCCCCACGCTTCCACCGCGAGCCTTGTGGCCTTTCCCAAACGGGCG
TGACGGGCGATGTCATTTTCAAGTCCTTCTTCAAAGATAAGATCAAGAGCAGCTCTAAGA
CCGTAGAGGAGTTGAATGGAAGGTGTGTATGGCCAATATGTCCCGAGCTTGTAAAACTTG
AGGTAGTCATTCCAATCAAAGAAGACTTTGAGGGATTTTGAAGTTTTGGTAGCTTCCAAA
GCTTTTGGACTGGCGCACACAATACCAAGGCCTGTTGGAAGGGATAAAGCTTTCTGAGAT
CCGGTCAAGGCCACATCCACTCCCCACTCATCCA

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DS 

RD RS1DG89JQ 684 0 0
GG
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TATGAATTAGATCCGGGAAGGAATGAGAGGGATCTGGTGCTGAAGATAAGTAGAAGCAGC
TGCAACTCCACTTCCCAATACAATTGGGTAGCCAACATCCTTGAGTATCATCTCCACTCC
AGCCAAACACCCAAGAAGTTGCAACTCATTAAGATTTCCAAGGTGCCCAATTCTGAAAAC
CTTGCCAGCCACTTTGTTGAGACCAAGACCAAGACTAAGGTTGTACCTCCTCCACGCCCT
TTTCACAATCTCAGTACTGTCTATATTCGGCGGTACCACGACCGCTGTCACTGTGTTACT
GATCCACTCCTCCTTTTGTGTACAGTTTTTCAGCCCCCACGCTTCCACCGCGAGCCTTGT
GGCCTTTCCCAAACGGGCGTGACGGGCGATGACATTTTCAAGTCCTTCTTCAAAGATAAG
ATCAAGAGCAGCTCTAAGACCGTAGAGGAGTTGAATGGAAGGTGTGTATGGCCAATATGT
CCCGAGCTTGTAAAACTTGAGGTAGTCATTCCAATCAAAGAAGACTTTGAGGGATTTTGA
AGTTTTGGTGGCTTCCAAAGCTTTTGGACTGGCGCACACAATACCAAGGCCTGTTGGAAG
GGATAAAGCTTTCTGAGATCCG

QA 3 684 3 684
DS 

RD RS1DG89TF 619 0 0
CCAATTCTGAAAAC*TTGCCAGCCACTTTGTTGAGACCAAGACCAAGACTAAGGTTGTAC
CTCCTCCACGCCCTTTTCACAATCTCAGTACTGTCTATATTCGGCGGTACCACGACCGCT
GTCACTGTGTTACTGATCCACTCCTCCTTTTGTGTACAGTTTTTCAGCCCCCACGCTTCC
ACCGCGAGCCTTGTGGCCTTTCCCAAACGGGCGTGACGGGCGATGACATTTTCAAGTCCT
TCTTCAAAGATAAGATCAAGAGCAGCTCTAAGACCGTAGAGGAGTTGAATGGAAGGTGTG
TATGGCCAATATGTCCCGAGCTTGTAAAACTTGAGGTAGTCATTCCAATCAAAGAAGACT
TTGAGGGATTTTGAAGTTTTGGTGGCTTCCAAAGCTTTTGGACTGGCGCACACAATACCA
AGGCCTGTTGGAAGGGATAAAGCTTTCTGAGATCCGGTCAAGGCCACATCCACTCCCCAC
TCATCCATTCGGAAATCAAGCGCACATATGGACGAGACACCGTCCACAAGCAGCAAAGCC
GGGTGCTTGTAGTGATCGAGGAGGGTTCGGACGGCAGAGATGTCATTAGTGACTCCAGTC
GCGGTCTCGTTGTGGACA
C

QA 1 618 1 618
DS 

RD RS1BD36TF 697 0 0
TCCTCCACGCCCTTTTCACAATCTCAGTACTGTCTATATTCGGCGGTACCACGACCGCTG
TCACTGTGTTACTGATCCACTCCTCCTTTTGTGTACAGTTTTTCAGCCCCCACGCTTCCA
CCGCGAGCCTTGTGGCCTTTCCCAAACGGGCGTGACGGGCGATGTCATTTTCAAGTCCTT
CTTCAAAGATAAGATCAAGAGCAGCTCTAAGACCGTAGAGGAGTTGAATGGAAGGTGTGT
ATGGCCAATATGTCCCGAGCTTGTAAAACTTGAGGTAGTCATTCCAATCAAAGAAGACTT
TGAGGGATTTTGAAGTTTTGGTAGCTTCCAAAGCTTTTGGACTGGCGCACACAATACCAA
GGCCTGTTGGAAGGGATAAAGCTTTCTGAGATCCGGTCAAGGCCACATCCACTCCCCACT
CATCCATTCGGAAATCAAGCGCACATATGGACGAGACACCGTCCACAAGCAGCAAAGCCG
GGTGCTTGTAGTGATCGAGGAGGGTTCGGACGGCAGAGATGTCATTAGTGACTCCAGTCG
CGGTCTCGTTGTGGACAATACAAATGGCTTTGATGGAATGATTTTGGTCCTGTGAGAGCT
TTGAGGCCAAGACTTGGAGATTAGCACCTTGTCCCCAATCACTCTCCACCACATCAACGT
TGAAGTTTAGCCTCTTCTGCTGGTCAATCCACAGCAA

QA 1 697 1 697
DS 

RD RS1D577TF 605 0 0
GCCTTTCCCAAACGGGCGTGACGGGCGATGACATTTTCAAGTCCTTCTTCAAAGATAAGA
TCAAGAGCAGCTCTAAGACCGTAGAGGAGTTGAATGGAAGGTGTGTATGGCCAATATGTC
CCGAGCTTGTAAAACTTGAGGTAGTCATTCCAATCAAAGAAGACTTTGAGGGATTTTGAA
GTTTTGGTAGCTTCCAAAGCTTTTGGACTGGCGCACACAATACCAAGGCCTGTTGGAAGG
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TCAAGCGCACATATGGACGAGACACCGTCCACAAGCAGCAAAGCCGGGTGCTTGTAGTGA
TCGAGGAGGGTTCGGACGGCAGAGATGTCATTAGTGACTCCAGTCGCGGTCTCGTTGTGG
ACAATACAAATGGCTTTGATGGAATGATTTTGGTCCTGTGAGAGCTTTGAGGCCAAGACT
TGGAGATTAGCACCTTGTCCCCAATCACTCTCCACCACATCAAC**TGAAGTTTAGCCTC
TTCTGCTGGTAAATCCACAGCAAGCTAAACTGCCCAATCAGAAACGAGACGATCCTGTCT
CCAG
C

QA 1 604 1 604
DS 

RD RS1B784TF 634 0 0
CCACATCCACTCCCCACTCATCCATTCGGAAATCAAGCGCACATATGGACGAGACACCGT
CCACAAGCAGCAAAGCCGGGTGCTTGTAGTGATCGAGGAGGGTTCGGACGGCAGAGATGT
CATTAGTGACTCCAGTCGCGGTCTCGTTGTGGACAATACAAATGGCTTTGATGGAATGAT
TTTGGTCCTGTGAGAGCTTTGAGGCCAAGACTTGGAGATTAGCACCTTGTCCCCAATCAC
TCTCCACCACATCAACGTTGAAGTTTAGCCTCTTCTGCTGGTCAATCCACAGCAAGCTAA
ACTGCCCAATCAGAAACGAGACGATCCTGTCTCCAGGAGATAGCGTGTTGGTCAAGGCAC
TCTCCCAAGCACCAGTACCAGTAGTTGGAAACATAAACGGTGTTCCAGATGTTGTCTTGA
ATATCTTCTTCACGTCCTCCAACAACGTTTTTGTAAGTGCCGGGATGGCTGGTGACCGGT
AATCCTCGTTGTTTCTGTTCATCGCCCGGATCACCTGCTCCGGTATGTTCACTGGTCCTG
GCACGAAAAGATGGTGTCTCCCGGGTGCATTCATATAGTCCATTTTTGCCCTGTTCTTGT
TTCTCCTCCTCTGAGTAAGGCGGAAGCTCCTCCC

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DS 



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AGTTTTGTTATACATGGAAAGAGGGGTGGAGAGAAAGATGAAGAAACAGGGATATGAATT
AGATCCGGGAAGGAATGAGAGGGATCTGGTGCTGAAAATAAGTAAAAGCAGCTGCAACTC
CACTTCCCAATACAATTGGGTAGCCAACATCCTTGAGTATCATCTCCACTCCAGCCAAAC
ACCCAAGAAGTTGCAACTCATTAAGATTTCCAAGGTGCCCAATTCTGAAAACCTTGCCAG
CCACTTTGTTGAGACCAAAACTTGGAGATTAGCACCTTGTCCCCAATCACTCTCCACCAC
ATCAACGTTGAAGTTTAGCCTCTTCTGCTGGTCAATCCACAGCAAGCTAAACTGCCCAAT
CAAAAACGAGACGATCCTGTCTCCAGGAGATAGCGTGTTGGTCAAGGCACTCTCCCAAGC
ACCAGTACCAGTAGTTGGAAACATAAACGGTGTTCCAGATGTTGTCTTGAATATCTTCTT
CACGTCCTCCAACAACGTTTTTGTAAGTGCCGGGATGGCTGGTGACCGGTAATCCTCGTT
GTTTCTGTTCATCGCCCGGATCACCTGCTCCGGTATGTTCACTGGTCCTGGCACGAAAAG
ATGGTGTCTCCCGGGTGCATTCATATAGTCCATTTTTGCCCTGTTCTTGTTTCTCCTCCT
CTGAGTAAGGCGGAAGCTCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F235JQ U 10
AF RS1F235TF C 1
BS 1 11 RS1F235TF
BS 12 720 RS1F235JQ
BS 721 743 RS1F235TF

RD RS1F235JQ 712 0 0
CC
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ACATGGAAAGAGGGGTGGAGAGAAAGATGAAGAAACAGGGATATGAATTAGATCCGGGAA
GGAATGAGAGGGATCTGGTGCTGAAAATAAGTAAAAGCAGCTGCAACTCCACTTCCCAAT
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TGCAACTCATTAAGATTTCCAAGGTGCCCAATTCTGAAAACCTTGCCAGCCACTTTGTTG
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AGTTTAGCCTCTTCTGCTGGTCAATCCACAGCAAGCTAAACTGCCCAATCAAAAACGAGA
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TCGCCCGGATCACCTGCTCCGGTATGTTCACTGGTCCTGGCACGAAAAGATGGTGTCTCC
CGGGTGCATTCATATAGTCCATTTTTGCCCTGTTCTTGTTTCTCCTCCT
C

QA 3 711 3 711
DS 

RD RS1F235TF 743 0 0
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AGTTTTGTTATACATGGAAAGAGGGGTGGAGAGAAAGATGAAGAAACAGGGATATGAATT
AGATCCGGGAAGGAATGAGAGGGATCTGGTGCTGAAGATAAGTAGAAGCAGCTGCAACTC
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ACCAGTACCAGTAGTTGGAAACATAAACGGTGTTCCAGATGTTGTCTTGAATATCTTCTT
CACGTCCTCCAACAACGTTTTTGTAAGTGCCGGGATGGCTGGTGACCGGTAATCCTCGTT
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ATGGTGTCTCCCGGGTGCATTCATATAGTCCATTTTTGCCCTGTTCTTGTTTCTCCTCCT
CTGAGTAAGGCGGAAGCTCCTCC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 12

CO CL181Contig1 1548 12 14 U
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GAAAGATATGAATTTTACTGATCAGTAATAATAATGGTAGTTTTTTTGTACAAGGATCCG
AATTTAATTATCAAATTCTTAATTCTTAATTTTATAAATTAAAAGTTTTAATTTCGATCT
AAAAAAGGAGGATTTTAAAAATTTATTTATGGATCCGCTCTGAGTGGTATCTATATCATT
AATTCAATGAATCTCATGTATAAAGATTTAATTTAAAGCAATACCTCACATTTGTGCATC
CAATTGTTTTCATATACCGTAACTTAATATTATATATATATAGTCAAAATATAGTAAAAA
GGATCTACCATTAATGCATTTGAAATCGCGTATACATGTGTATTCTTATCATACTGAAAT
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AATTGGGCCAAAGAAAGGATTTTAATTTAATTAGGTTTTTTTT*ATCCTTATCAAGATCT
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TCCCTTGCACTTTTTTTTTTTAAATTGAAACAAATTAGAATTCGAAATTCTTTACGTCGT
TTAGGGGATAGAATAGTTTCAGGGACAAAGAAATCATAATTATTTTTTTTATAAATATAG
CTTTTTTTTTTTGATCTTTTACTTATTTTTTGTTTATTTTTATGAACCAATGAAATCCCG
ATGGTTCTATATATAATAAGTTGTCCATCGTTTTTTACAGACAAACGAACAGGTTCAACA
ATCAATATTCCTTTTTTCATTAATTTTGAAAAAAGTGCAA*TTCTTCTCAATCATTAGAA
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GTCTAATCAAGAGACAGTATACTCTTATATTATTGATAATTTTTTGATTAAAACAATTCC
ATCGAAATTGAAAACGCGAATACCTTTTGAGAAATAAGTCAAGTTCCTCGTCGGTATTGC
TTTTTGGTTGTTTTTTATTTTGACTTTTTTTTATCTTCGATTCTGTATAATTTTCTTCAA
TATTTTTTTCTTGCTTTGATAGAGCTGATTCCATATTTATTTTTGTTTCTTTATCTGATT
CAAACTCTTCTTGACCTGCCGATTCGTTTTCTTCTTTATTTAGATTAAACAACCGAAGGA
ATTTGTTTTCGTTTGATGATATAAAACCTTTTTTCTTTAGGGTGATCTGTTTATTCACAT
TTTTTGTTTCATTAAAATTGAAAAGAAGTAATTTAATTGGTATGACCCACGGTTTCATTT
TATATGTACTAGAAAATAAGGAAAATTCTGGAAAGAAAAAAAAGTCAAAATTTGTTATAC
GATGATTTAGTATTTCTTCATTCATTCCCATCCAATCAAAAAAGTTTATTTTTTGATTGG
CAAGACTCGTCTTAGTTATTTTATCAATTCTTTGATAATTCTGAACTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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C

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C

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C

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DS 

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C

QA 1 572 1 572
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GG
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CCTGCCGATTCGTTTTCTTCTTTATTTAGATTAAACAACCGAAGGAATTTGTTTTCGTTT
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AAATTGAAAAGAAG
C

QA 3 616 3 616
DS 

RD RS1AG15JQ 676 0 0
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AATAAGTCAAGTTCCTCGTCGGTATTGCTTTTTGGTTGTTTTTTATTTTGACTTTTTTTT
ATCTTCGATTCTGTATAATTTTCTTCAAAATTTTTTTCTTGCTTTGATAGAGCTGATTCC
ATATTTATTTTTGTTTCTTTATCTGATTCAAACTCTTCTTGACCTGCCGATTCGTTTTCT
TCTTTATTTAGATTAAACAACCGAAGGAATTTGTTTTCGTTTGATGATATAAAACCTTTT
TTCTTTAGGGTGATCTGTTTATTCACATTTTTTGTTTCATTAAAATTGAAAAGAAGTAAT
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TGATAATTCTGAACTC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1AG15TF 676 0 0
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TTGATAATTTTTTGATTAAAACAATTCCATCGAAATTGAAAACGCGAATACCTTTTGAGA
AATAAGTCAAGTTCCTCGTCGGTATTGCTTTTTGGTTGTTTTTTATTTTGACTTTTTTTT
ATCTTCGATTCTGTATAATTTTCTTCAAAATTTTTTTCTTGCTTTGATAGAGCTGATTCC
ATATTTATTTTTGTTTCTTTATCTGATTCAAACTCTTCTTGACCTGCCGATTCGTTTTCT
TCTTTATTTAGATTAAACAACCGAAGGAATTTGTTTTCGTTTGATGATATAAAACCTTTT
TTCTTTAGGGTGATCTGTTTATTCACATTTTTTGTTTCATTAAAATTGAAAAGAAGTAAT
TTAATTGGTATGACCCACGGTTTCATTTTATATGTACTAGAAAATAAGGAAAATTCTGGA
AAGAAAAAAAAGTCAAAATTTGTTATACGATGATTTAGTATTTCTTCATTCATTCCCATC
CAATCAAAAAAGTTTATTTTTTGATTGGCAAGACTCGTCTTAGTTATTTTATCAATTCTT
TGATAATTCTGAACTC

QA 1 676 1 676
DS 



AS 2 11

CO CL182Contig1 806 7 4 U
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GACATACTGAAAGACAAGTGGAGTCCTGCGCTTCAAATAAGAACTGTGCTCTTGAGTATT
*AAGCTCTTCTAAGTGCACCAAACCCAGACGATCCACTCTCTGAGAACATAGCTAAACAT
TGGAAGAGTAATGAAGCAGAAGCCGTGGAGACAGCTAAGGAGTGGACTCGTCTATATGCA
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TATATGGTGAAACTCTTTAAGGT***TTTATCTGAATCCTTTTTCTTTAAAAAAAAAACT
GGGGAAAAAGATTTGTACTCTCTGAATCTTCTTTGTATAACTAGAAGAATTTAAGACTCG
TTTATCCATGCAAACTAACGTTCTTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 10 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 20 
30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A353TF U 1
AF RS1G424TF U 46
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RD RS1A353TF 779 0 0
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QA 1 779 1 779
DS 

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GGACTC
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QA 7 723 7 723
DS 

RD RS1CG39TF 721 0 0
GACTC
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AAAAAAACTGGGGAAAA*GATTTGTACTCTCTGAATCTTCTTTGTATA
CTGAGATT

QA 6 713 6 713
DS 

RD RS1A353TV 779 0 0
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ATCAAGGAAACTCAACGTCTACTTAGTGAACCTGCTCCGGGGATAAGTGCGTCTCCGTCA
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GACATACTGAAAGACAAGTGGAGTCCTGCGCTTCAAATAAGAACTGTGCTCTTGAGTATT
*AAGCTCTTCTAAGTGCACCAAACCCAGACGATCCACTCTCTGAGAACATAGCTAAACAT
TGGAAGAGTAATGAAGCAGAAGCCGTGGAGACAGCTAAGGAGTGGACTCGTCTATATGCA
AGTGGCGCTTGATGATGGAGCCGCAAAAGGAGAACGATCGTTGTCATTTAAATAACATTA
TATATGGTGAAACTCTTTAAGGT***TTTATCTGAATCCTTTTTCTTTAAAAAAAAAACT
GGGGAAAAAGATTTGTACTCTCTGAATCTTCTTTGTATAACTAGAAGA*TTTAAGACTC

QA 1 779 1 779
DS 

RD RS1A353JQ 730 0 0
GG
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DS 

RD RS1A353TR 730 0 0
GG
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CGAAGAATCATCAAGGAAACTCAACGTCTACTTAGTGAACCTGCTCCGGGGATAAGTGCG
TCTCCGTCAGAGGAAAATATGCGTTATTTCAATGTCATGATCCTTGGTCCTACCCAGTCT
CCTTATGAAGGAGGAGTTTTCAAGTTGGAGCTCTTTTTGCCTGAAGAATACCCTATGGCA
GCTCCTAAAGTTAGGTTTCTCACCAAGATATACCATCCTAACATTGACAAGCTCGGAAGG
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CTATATGCAAGTGGCGCTTGATGATGGAGCCGCAAAAGGAGAACGATCGTTGTCATTTAA
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TAAGACTC

QA 3 730 3 730
DS 

RD RS1EQ96TF 758 0 0
GTC
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TCTCCGTCAGAGGAAAATATGCGTTATTTCAATGTCATGATCCTTGGTCCTACCCAGTCT
CCTTATGAAGGAGGAGTTTTCAAGTTGGAGCTCTTTTTGCCTGAAGAATACCCTATGGCA
GCTCCTAAAGTTAGGTTTCTCACCAAGATATACCATCCTAACATTGACAAGCTCGGAAGG
ATCTGCCTTGACATACTGAAAGACAAGTGGAGTCCTGCGCTTCAAATAAGAACTGTGCTC
TTGAGTATTCAAGCTCTTCTAAGTGCACCAAACCCAGACGATCCACTCTCTGAGAACATA
GCTAAGCATTGGAAGAGTAATGAAGCAGAAGCCGTGGAGACAGCTAAGGAGTGGACTCGT
CTATATGCAAGTGGCGCTTGATGATGGAGTCGCAAAAGGAGAACGATCGTTGTCATTTAA
ATAACATTATATATGGTGAAACTCTTTAAGGTTATTTTATCTGAATCCTTTTTCTT**AA
AAAAAAACCGGG**AAAAGATTTGTACTCTCTGAATCTTCTTTGTATAACTAGAAGAATT
GAAGTCTCGTTTATCCATGCAAACTAACGTTCTTC

QA 4 758 4 758
DS 



CO CL182Contig2 749 4 5 U
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CACTCCATCATCAAGCGCCACTTGCATATAGACGAGTCCACTCCTTAGCTGTCTCCACGG
CTTCTGCTTCATTACTCTTCCAATGCTTAGCTATGTTCTCAGACAGTGGATCATCTGGGT
TTGGTGCACTTAGAAGAGCTTGAATACTCAAGAGGACAGTTCTTATTTGAAGCGCAGGAC
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ATATCTTGGTGAGAAACCTAACTTTGGGAGCTGCCATAGGGTATTCTTCAGGCAAAAAGA
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GTAGACGTTGAGTTTCCTCGATGATTCTTCGTGGAAGATTGCTATTCGCCATTACTAACG
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TAAAGCTCGAGACGGACGGTGGTTATCGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RS1A984JQ U 119
AF RS1CZ73JQ U 1
AF RS1CZ73TF C 114
AF RS1A984TF C 127
BS 1 415 RS1CZ73JQ
BS 416 618 RS1CZ73TF
BS 619 619 RS1A984TF
BS 620 744 RS1CZ73TF
BS 745 749 RS1A984TF

RD RS1A984JQ 160 0 0
AAAACCTT
AAGAGTTTCAGCATATATAATGTTATTTAAATGACAACGATCGTTCTCCTTTTGCACTCC
ATCATCAAGCGCCACTTGCATATAGACGAGTCCACTCCTTAACTGTCTCCACGGCTTCTG
CTTCATTACTCTTCCAATGCTTAGCTATGTTC

QA 9 160 9 160
DS 

RD RS1CZ73JQ 415 0 0
CGAAGAACGTTAGATTGCATGGATAAACGAGTCTTCAATTCTTCTAGTTATACAAAGAAG
ATTCAGAGAGTACAAATCTTTTTCCCCAGTTTTTTTTTTTAAGAAAAAGGATTCAAATAA
AACCTTAAGAGTTTCAGCATATATAATGTTATTTAAATGACAACGATCGTTCTCATTTTG
CACTCCATCATCAAGCGCCACTTGCATATAGACGAGTCCACTCCTTAGCTGTCTCCACGG
CTTCTGCTTCATTACTCTTCCAATGCTTAGCTATGTTCTCAGACAGTGGATCATCTGGGT
TTGGTGCACTTAGAAGAGCTTGAATACTCAAGAGGACAGTTCTTATTTGAAGCGCAGGAC
TCCACTTGTCTTTCAGTATGTCAAGGCAGATCCTTCCGAGCTTGTCAATGTTAGG

QA 1 415 1 415
DS 

RD RS1CZ73TF 634 0 0
CAGATAAAACCTTAAGAGTTTCAGCATATATAATGTTATTTAAATGACAACGATCGTTCT
CATTTTGCACTCCATCATCAAGCGCCACTTGCATATAGACGAGTCCACTCCTTAGCTGTC
TCCACGGCTTCTGCTTCATTACTCTTCCAATGCTTAGCTATGTTCTCAGACAGTGGATCA
TCTGGGTTTGGTGCACTTAGAAGAGCTTGAATACTCAAGAGGACAGTTCTTATTTGAAGC
GCAGGACTCCACTTGTCTTTCAGTATGTCAAGGCAGATCCTTCCGAGCTTGTCAATGTTA
GGATGGTATATCTTGGTGAGAAACCTAACTTTGGGAGCTGCCATAGGGTATTCTTCAGGC
AAAAAGAGCTCCAACTTGAAAACTCCTCCTTCATAAGGAGACTGGGTAGGACCAAGGATC
ATGACATTGAAATAACGCATATTTTCCTCTGACGGAGACGCGCTTATCCCCGGAGCAGGT
TCACTAAGTAGACGTTGAGTTTCCTTGATGATTCTTCGTGGAAGATTGCTATTCGCCATT
ACTAACGGATTCGATCGATCGATCTCCAGAGATGATTTTTTTTAGGGTTTTTGAGAGAGA
AGGAAGGTAAAGCTCGAGACGGACGGTGGTT
CCC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RS1A984TF 623 0 0
AAGAGTTTCAGCATATATAATGTTATTTAAATGACAACGATCGTTCTCCTTTTGCACTCC
ATCATCAAGCGCCACTTGCATATAGACGAGTCCACTCCTTAGCTGTCTCCACGGCTTCTG
CTTCATTACTCTTCCAATGCTTAGCTATGTTCTCAGACAGTGGATCATCTGGGTTTGGTG
CACTTAGAAGAGCTTGAATACTCAAGAGGACAGTTCTTATTTGAAGCGCAGGACTCCACT
TGTCTTTCAGTATGTCAAGGCAGATCCTTCCGAGCTTGTCAATGTTAGGATGGTATATCT
TGGTGAGAAACCTAACTTTGGGAGCTGCCATAGGGTATTCTTCAGGCAAAAAGAGCTCCA
ACTTGAAAACTCCTCCTTCATAAGGAGACTGGGTAGGACCAAGGATCATGACATTGAAAT
AACGCATATTTTCCTCTGACGGAGACGCGCTTATCCCCGGAGCAGGTTCACTAAGTAGAC
GTTGAGTTTCCTCGATGATTCTTCGTGGAAGATTGCTATTCGCCATTACTAACGGATTCG
ATCGATCGATCTCCAGAGATGATTTTTTTTAGGGTTTTTGAGAGAGAAGGAAGGTAAAGC
TCGAGACGGACGGTGGTTATCGA

QA 1 623 1 623
DS 



AS 2 9

CO CL183Contig1 776 3 5 U
AGAAAGAAACATAGAAAGCATCAAAGATGTCTAATATCATCGAATACAATTAACAGAGAA
GATGTTTGATATAGATAACATGATCACTCAAGTTGACCATACCACACCCCTTGGATCTTA
ACATCCTTTGGTACCTTGGCACCCAAGTCAGTATCCGACGGCTGAAGACTCTCAAACACT
CCGATCACTTCTCCAGTTTCCGGTTTGCTCTTTGTCACTTTCAAAGCGATCTGTCCCACT
GAAGCTGCCGTGTTCTTGACGTTCTCCTTTGAAAGCTCCTCCTCGTCTCCTCTGCCTCCA
GCTGGCAATGCAACTGCGTTGTCATATCCTGTGGAACCACCACGACCCTTTGGGTCCAAG
AAGGAGGAGCCACGGTATGAAGGGACCAAGAATTTGCCAGTGAAGCTGTCTGGTTTGCCT
GAGGCGTCAAGCTGCTTGACTGTGAAGAGGAAGGGCACACGCTCGCCTCCCTGGAAGCTG
GACAGTGACTGCAGCGTAGTCGATGCCGTCTTCTTCCTTGAAGTTCACACTTCCGTCAGA
AGAAACCTCAAAGGGGCCTTCGATCTCGTCGAGAGTGTAGGTGAGACGGGTCATGAGCTT
GGTGTTCTGGAAGTCAGGAGGAGCATTCTTGCTAACACTCTCAGCCTTGACGGTGAAGGA
AGTAGGCTCGAAGCAGAACTTCTTGCCAGCGTACTTTCCCGGTTTGAAGGAGAAAGTCTC
AGAGCCACCGTCAATAGTTGGGCACTGGTTAGCCGTTCCAGTTCCCTTGACTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BT53JQ U 120
AF RS1BL28JQ U 120
AF RS1BT53TF C 1
BS 1 120 RS1BT53TF
BS 121 226 RS1BL28JQ
BS 227 227 RS1BT53JQ
BS 228 537 RS1BL28JQ
BS 538 776 RS1BT53TF

RD RS1BT53JQ 278 0 0
A
ACATCCTTTGGTACCTTGGCACCCAAGTCAGTATCCGACGGCTGAAGACTCTCAAACACT
CCGAACACTTCTCCAGTTTCCGGTTTGCTCTTTGTCACTTTCAAAGCGATCTGTCCCACT
GAAGCTGCCGTGTTCTTGACGTTCTCCTTTGAAAGCTCCTCCTCGTCTCCTCTGCCTCCA
GCTGGCAATGCAACTGCGTTGTCATATCCTGTGGAACCACCACGACCCTTTGGGTCCAAG
AAGGAGGAGCCACGGTATGAAGGGACCAAGAATTTGC

QA 2 278 2 278
DS 

RD RS1BL28JQ 418 0 0
A
ACATCCTTTGGTACCTTGGCACCCAAGTCAGTATCCGACGGCTGAAGACTCTCAAACACT
CCGATCACTTCTCCAGTTTCCGGTTTGCTCTTTGTCACTTTCAAAGTGATCTGTCCCACT
GAAGCTGCCGTGTTCTTGACGTTCTCCTTTGAAAGCTCCTCCTCGTCTCCTCTGCCTCCA
GCTGGCAATGCAACTGCGTTGTCATATCCTGTGGAACCACCACGACCCTTTGGGTCCAAG
AAGGAGGAGCCACGGTATGAAGGGACCAAGAATTTGCCAGTGAAGCTGTCTGGTTTGCCT
GAGGCGTCAAGCTGCTTGACTGTGAAGAGGAAGGGCACACGCTCGCCTCCCTGGAAGCTG
GACAGTGACTGCAGCGTAGTCGATGCCGTCTTCTTCCTTGAAGTTCACACTTCCGTC

QA 2 418 2 418
DS 

RD RS1BT53TF 776 0 0
AGAAAGAAACATAGAAAGCATCAAAGATGTCTAATATCATCGAATACAATTAACAGAGAA
GATGTTTGATATAGATAACATGATCACTCAAGTTGACCATACCACACCCCTTGGATCTTA
ACATC*TTTGGTACCTTGGCACCCAAGTCAGTATCCGACGGCTGAAGACTCTCAAACACT
CCGATCACTTCTCCAGTTTCCGGTTTGCTCTTTGTCACTTTCAAAGCGATCTGTCCCACT
GAAGCTGCCGTGTTCTTGACGTTCTCCTTTGAAAGCTCCTCCTCGTCTCCTCTGCCTCCA
GCTGGCAATGCAACTGCGTTGTCATATCCTGTGGATCCACCACGACCCTTTGGGTCCAAG
AAGGAGGAGCCACGGTATGAAGGGACCAAGAATTTGCCAGTGAAGCTGTCTGGTTTGCCT
GAGGCGTCAAGCTGCTTGACTGTGAAGAGGAAGGGCACACGCTCGCCTCC*TGGAAGCTG
GACAGTGACTGCAGCGTAGTCGATGCCGTCTTCTTCCTTGAAGTTCACACTTCCGTCAGA
AGAAACCTCAAAGGGGCCTTCGATCTCGTCGAGAGTGTAGGTGAGACGGGTCATGAGCTT
GGTGTTCTGGAAGTCAGGAGGAGCATTCTTGCTAACACTCTCAGCCTTGACGGTGAAGGA
AGTAGGCTCGAAGCAGAACTTCTTGCCAGCGTACTTTCCCGGTTTGAAGGAGAAAGTCTC
AGAGCCACCGTCAATAGTTGGGCACTGGTTAGCCGTTCCAGTTCCCTTGACTTCCC

QA 1 776 1 776
DS 



CO CL183Contig2 1215 6 21 U
GCACAAGTTATTTCTCAGCATTAGACCATATGATTAAAGTTACATAGAGAACTATGGATA
CAAAAAGAAACAATTCAAGATTTAGGGCATGTGCATTTTTATAATAGAAAAAGAAGAAAA
TGTACTCATTGTAATGAAATACAAACAGAAGATGATTAGATATGATAACATGATCACTCA
AGTTGACCATACCACACCCCTTGGATCTTCACATCCTTTGGTACCTTGGCACCTAGGTCA
GTATCCGAGGGCTGAAGACTCTCGAACACTCCGATCACTTCTCCAGTCTCTGGTTTGCTC
TTTGTCACTTTGAGAGTGATCTCTCCCACTGAAGCTGCCGTGTTCTTCACGTTCTCCTTT
GAAAGCTCCTCTTCATCTCCTCTGCCTCCAGCTGGCAATGCCACGGCATTGTCATATCCT
GTGGATCCACCACGGCCCTTTGGGTCCAGGAAGGAGGAGCCACGGTATGAAGGGACTAAA
AATTTGCCAGTGAAGTTGTCTGGTTTGCCAGAGGCGTCAAGCTGCTTGACTGTGAAGAGG
AAGGGCACACGCTCGCCTCCTGGAAGCTGGACAGTGACTGCAGCGTAGTCGATGCCGTCT
TCTTCCTTGAAGTTGACGCTTCCGTCAGAAGAAACCTCGAAGGGGCCTTCGATTTCGTCA
AGGGTGTAAGTGAGACGGGTCATGAGCTTGGTGTTCTGGAAATCGGGAGGAGCATTCTTG
CTAACACTCTCAGCCTTGACGGTGAAGGAAGTAGGCTCGAAGCAGAACTTCTTGCCAGCG
TACTTACCAGGCTTGAAGGAGAAAGTCTCAGAGCCACCGTCAATAGTTGGGCACTGGTTG
GCAGTTCCAGTTCCCTTAACTTACATGTAAGTCTTGCTTTGAATCTCGTCGTAAGTCAGT
CTCCTCGGAGCTCCCTCTGCACTTGCACCCGAGACGACGAGAGCAGAGGTTGCGAGAGCG
AATCCAGCGATTTTGACAGCGTCGGAGCATTTACCGGCGAAGTCCTTGAAGTCAGATTGG
AAGGAACATGTGAGGCGAGCAGAGGATGTTTCTAGCCCGAATGATTTGCCGACTGTCTGA
GTCGACCGGAGGTGACCACTGCCGCGACAAGGAGCGTTGGAGATTTTAGCGGACTGGAGG
AACGTGGCGGCGGATTGGAAAGAGGCTGCCATGGCCACAAAGTCTCTCAAAACTAATGTT
AATGGGTTGTCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AE50JQ U 193
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AF RS1ER89JQ U 82
AF RS1AE50TF C 1081
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TCATCTCCTCTGCCTCCAGCTGGCAATGCCACGGCATTGTCATATCCTGTGGATCCACCA
CGACCCTTTGGGTCCAGGAAGGAGGAGCCACGGTATGAAGGGACTAATAATTTGCCAGTG
A

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DS 

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AGTTGACCATACCACACCCCTTGGATCTTCACATCCTTTGGTACCTTGGCACCCAAGTCA
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TTTGTCACTTTGAGAGTGATCTCTCCCACTGAAGCTGCCGTGTTTTTCACGTTCTCCTTT
GAAAGCTCCTCTTCATCTCCTCTGCCTCCAGCTGGCAATGCAACGGCGTTGTCATATCCT
GTGGATCCACCACGGCCCTTTGGGTCCAAGAAGGAGGAGCCACGGTATGAAGGGACTAAG
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AAGGGCACACGCTCGCCTCCTGGAAGCTGGACAGTGACTGCAGCGTAGTCGATGCCGTCT
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GA

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CGAGCATGTGCATT
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TTAGATATGATAACATGATCACTCAAGTTGACCATACCACACCCCTTGGATCTTCACATC
CTTTGGTACCTTGGCACCTAGGTCAGTATCCGAGGGCTGAAGACTCTCGAACACTCCGAT
CACTTCTCCAGTCTCTGGTTTGCTCTTTGTCACTTTGAGAGTGATCTCTCCCACCGAAGC
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GACTGCAGCGTAGTCGATGCCGTCTTCTTCCTTGAAGTTGACGCTTCCGTCAGAAGAAAC
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CTGGAAATCGGGAGGAGCATTCTTGCTAACACTCTCAGCCTTGACGGTGAAGGAAGTAGG
CTCGAAGCAGAACTTCTTGCCAGCGTACTT
ACCAGGCTT

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AACGTGGCGGCGGATTGGAGAGAGGCTGCCATGGCCACAAAGTCTCTC

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TCAAGGGTGTAAGTGAGACGGGTCATGAGCTTGGTGTTCTGGAAATCGGGAGGAGCATTC
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AGTCTCCTCGGAGCTCCCTCTGCACTTGCACCCGAGACGACGAGAGCAGAGGTTGCGAGA
GTGAATCCAGCGATTTTGACAGCGTCGGAGCATTTACCGGCGAAGTCCTTGAAGTCAGAT
TGGAAGGAACATGTGAGGCGAGCAGAGGATGTTTCTAGCCCGAATGATTTGCCGACTGTC
TGAGTCGACCGGAGGTGACCACTGCCGCGACAAGGAGCGTTGGAGATTTTAGCGGACTGG
AGGAACGTGGCGGCGGATTGGAAAGAGGCTGCCATGGCCACAAAGTCTCTCAAAACTAAT
GTTAATGGGTTGTCCTCC

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DS 

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ATTTCGTCAAGG
GTGTAAGTGAGACGGGTCATGAGCTTGGTGTTCTGGAAATCGGGAGGAGCATTCTTGCTA
ACACTCTCAGCCTTGACGGTGAAGGAAGTAGGCTCGAAGCAGAACTTCTTGCCAGCGTAC
TTACCAGGCTTGAAGGAGAAAGTCTCAGAGCCACCGTCAATAGTTGGGCACTGGTTGGCA
GTTCCAGTTCCCTTAACTTCCATGTAAGTCTTGTTTTGAATCTCGTCGTAAGTCAGTCTC
TTCGGAGCTCCCTCTGCACTTGCTCCCGAGACGACGAGAGCAGAGGTTGCGGGAGCGAAT
CCAGCGATTTTGACAGCGTCGGAGCATTTACCGGCGAAGTCCTTGAAGTCAGATTGGAAG
GAACATGTGAGGCGAGCAGAGGATGTTTCTAGCCCGAATGATTTGCCGACTGTCTGAGTC
GACCGGAGGTGAGCACTGCCGCGACAAGGAGCGTTGGAGATTTTAGCGGACTGGAGGAAC
GTGGCGGCGGATTGGAAAGAGGCTGCCATGGCCACAAAGTCTCTCAAAACTAATGTTAAT
GGGTTGTCCTCC

QA 13 564 13 564
DS 



AS 1 10

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AAAATTTTATAAATTAGTTAAAAGATTAAATTCATAAGCATATTTTTCAGACTTCATTGT
TTCATGTAGACTTTTCGTAAATGTACTTTAATATTTTTGTATCACATATATCGGGTCCAT
AGCCACATTTAGAGGCTCCTCATGAGAAATCCCTCGAACGTAATTCCCGGTCCGAAGGCT
AAACCTAGACCCCACTCTTCTCCACCTCTGCCTTTCTTCTCAAGCTCACCTCTTACTTTG
TCCATTATGTAGAAGATGGTGTTGCTGCTTGCGTTCCCATAATCCATCAACGCCTGTCTG
CTGCATTCCAACTTCTCTGGTTTCAGCTTCAGTTTCGTCTCTAGCCCGTTCAGGATGGCC
GGTCCACCGGGATGAACGGTCCAGAACAGGTCATTCAACTCCAATGAACCAGAGCCAGCC
TTTGCCACCAGCTTCTTGCAGAACTCCTCTATGTTGTCTTCGATCTTCTGAGGTAGTTCT
CTTCCTAGCTTGAAGCTTATGCCCTCCTCTGACAACCGCCCGTCAATCACCCCATGCGTT
CCTGGTAGGAACTGCTGCAGCGCATAGTGAAGCTCCATGAAGGGACTTTCTGACTCTGTA
GGGTCTGCTCCGATGATCAGGGCAGCTGCTCCGTCTCCAAAGAGAGCAGCCCCGACTAAG
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AGCAGCACCCGACTCCCTGGGTTGTTCTCAGCAATGTCCTTGGCCACGCGCATCCCACTC
ACACCTCCGTAGCATCCCAGAAAATAAAACAACACCCTCTGCACCTCGTTGCTAAGGCCC
AGTTGTGCCGAGAGGTAGAGGTCACCCCCGGGCAAACGGAACTCACTGGATGAAACATAG
ACGAGATGAGTGATATCTTCCACTGTCCTTCCCCATTCCTTGATGCAAGCCAAGCTCGCT
TCATATGCCATCTGCACAACCGCCTCGTTTGCGATCTCAAGCCTCTGTTTGATGGTTGGG
GAACCCTCCGTTGCTAGCTCAGGGTATTTTTGCATCGTCTCGCTGGACATGACCGTGTAG
CGTGTCTTCACAGTT*GTGGTTTTACACAAGTGTTGCAGCTTCTCTTTGATAGAGGGGTC
ATCGCATTTGATTTCACGGAGATACTCCTCCACGAGATTCTCTTGAGAGACTACATTGCT
GGGGAAGGCCTTACCAAGAGCAAGCACAGTTGCCTTTCCTTTATTGGCAACACGCCTTGT
ACTTTGGGATATTTCCTTTTCTTTTCCTACCCTTCCGGTGGCCAACATATTTGTCAGGTT
TCACAACACAAAGAGTTGGTCC


BQ
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D208JQ U 1
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AF RS1A963JQ U 254
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AF RS1A826TF C 24
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BS 1097 1199 RS1AK55JQ
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TTCATGTAGACTTTTCGTAAATGTACTTTAATATTTTTGTATCACATATATCGGGTCCAT
AGCCACATTTAGAGGCTCCTCATGAGAAATCCCTCGAACGTAATTCCCGGTCCGAAGGCT
AAACCTAGACCCCACTCTTCTCCACCTCTGCCTTTCTTCTCAAGCTCACCTCTTACTTTG
TCCATTATGTAGAAAATGGTGTTGCTGCTTGCGTTCCCATAATCCATCAACGCCTGTCTG
CTGCATTCCAACTTCTCTGGTTTCAGCTTCAGTTTCGTCTCTAGCCCGTTCAGGATGGCC
GGTCCACCGGGATGAACGGTCCAGAACAGGTCATTCAACTCCAATGAACCAGAGCCAGCC
TTTGCCACCAGCTTCTTGCAGAACTCCTCTATGTTGTCTTCGATCTTCTGAGGTAGATCT
CTTCCTAGCTTGAAGCTTATGCCCTCCTCTGACAACCGCCCGTCAATCACCCCATGCGTT
CCTGGTAGGAACTGCTGCAGCGCATAGTGAAGCTCCATGAAGGGACTTTCTGACTCTGTA
GGGTCTGCTCCGATGATCAGGGCAGCTGCTCCGTCTCCAAAGAGAGCAGCCCC

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DS 

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TCAGCTTCAGTTTCGTCTCTAGCCCGTTCAGGATGGCCGGTCCACCGGGATGAACGGTCC
AGAACAGGTCATTCAACTCCAATGAACCAGAGCCAGCCTTTGCCACCAGCTTCTTGCAGA
ACTCCTCTATGTTGTCTTCGATCTTCTGAGGTAGTTCTCTTCCTAGCTTGAAGCTTATGC
CCTCCTCTGACAACCGCCCGTCAATCACCCCATGCGTTCCTGGTAGGAACTGCTGCAGCG
CATAGTGAAGCTCCATGAAGGGACTTTCTGACTCTGTAGGGTCTGCTCCGATGATCAGGG
CAGCTGCTCCGTCTCCAAAGA

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DS 

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AA
ATGGTGTTGCTGCTTGCGTTCCCATAATCCATCAACGCCTGTCTGCTGCATTCCAACTTC
TCTGGTTTCAGCTTCAGTTTCGTCTCTAGCCCGTTCAGGATGGCCGGTCCACCGGGATGA
ACGGTCCAGAACAGGTCATTCAACTCCAATGAACCAGAACCAGCCTTTGCCACCAGCTTC
TTGCAGAACTCCTCTATGTTGTCTTCGATCTTCTGAGGTAGTTCTCTTCCTAGCTTGAAG
CTTATGCCCTCCTCTGACAACCGCCCGTCAATCACCCCATGCGTTCCTGGTAGGAACTGC
TGCAGCGCATAGTGAAGCTCCATGAAGGGACTTTCTGACTCTGTAGGGTCTGCTCCGATG
ATCAGGGCAGCTGCTCCGTCTCCAAAGAGAGCAGCCCC

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DS 

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AAAATTTTATAAATTAGTTAAAAGATTAAATTCATAAGCATATTTTTCAGACTTCATTGT
TTCATGTAGACTTTTCGTAAATGTACTTTAATATTTTTGTATCACATATATCGGGTCCAT
AGCCACATTTAGAGGCTCCTCATGAGAAATCCCTCGAACGTAATTCCCGGTCCGAAGGCT
AAACCTAGACCCCACTCTTCTCCACCTCTGCCTTTCTTCTCAAGCTCACCTCTTACTTTG
TCCATTATGTAGAAGATGGTGTTGCTGCTTGCGTTCCCATAATCCATCAACGCCTGTCTG
CTGCATTCCAACTTCTCTGGTTTCAGCTTCAGTTTCGTCTCTAGCCCGTTCAGGATGGCC
GGTCCACCGGGATGAACGGTCCAGAACAGGTCATTCAACTCCAATGAACCAGAGCCAGCC
TTTGCCACCAGCTTCTTGCAGAACTCCTCTATGTTGTCTTCGATCTTCTGAGGTAGTTCT
CTTCCTAGCTTGAAGCTTATGCCCTCCTCTGACAACCGCCCGTCAATCACCCCATGCGTT
CCTGGTAGGAACTGCTGCAGCGCATAGTGAAGCTCCATGAAGGGACTTTCTGACTCTGTA
GGGTCTGCTCCGATGATCAGGGCAGCTGCTCCGTCTCCAAAGAGAGCAGCCCCGACTAAG
TCGTAAGGGCGAGCTTTGTTGGGGGGACGGAACCCAAGAACCATAG

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DS 

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GG
TTAAATTCATAAGCATATTTTTCAGACTTCATTGCTTCATGTAGACTTTTCGTAAATGTA
CTTTAATATTTTTGTATCACATGTATCGGGTCCATAGCCACATTTAGAGGCTCCTCATGA
GAAATCCCTCGAACGTAATTCCCGGTCCGAAGGCTAAACCTAGACCCCACTCTTCTCCAC
CTCTGCCTTTCCTCTCAAGCTCACCTCTTACTTTGTCCATTATGTAGAAGATGGTGTTGC
TGCTTGCGTTCCCATAATCCATCAACGCCTGTCTGCTGCATTCCAACTTCTCTGGTTTCA
GCTTCAGTTTCGTCTCTAGCCCGTTCAGGATGGCCGGTCCACCGGGATGAACGGTCCAGA
ACAGGTCATTCAACTCCAATGAACCAGAGCCAGCCTTTGCCACCAGCTTCTTGCAGAACT
CCTCTATGTTGTCTTCGATCTTCTGAGGTAGTTCTCTTCCTAGCTTGAAGCTTATGCCCT
CCTCTGACAACCGCCCGTCAATCACCCCATGCGTTCCTGGTAGGAACTGCTGCAGCGCAT
AGTGAAGCTCCATGAAGGGACTTTCTGACTCTGTAGGGTCTGCTCCGATGATCAGGGCAG
CTGCTCCGTCTCCAAAGAGAGCAGCCCCGACTAAGTCGTAAGGGCGAGCTTTGTTGGGGG
GACGGAACCCAAGAACCATAGTCTCAGAGGTGGTGAGCAGCACCCGGCTCCCTGGGTTGT
TCTCAGCAATGTCCTTGGCCACGCGCATCCC
C

QA 3 753 3 753
DS 

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CAA
ACTTCATTGTTTCATGTAGACTTTTCGTAAACGTACTTTAATATTTTTGTATCACATATA
TCGGGTCCATAGCCACATTTAGAGGCTCCTCGTGAGAAATCCCTCGAACGTAATTCCCGG
TCCGAAGGCTAAACCTAGACCCCACTCTTCTCCACCTCTGCCTTTCTTCTCAAGCTCACC
TCTTACTTTGTCCATTATGTAGAAGATGGTGTTGCTGCTTGCGTTCCCATAATCCATCAA
CGCCTGTCTGCTGCATTCCAACTTCTCTGGTTTCAGCTTCAGTCTCGTCTCTAGCCCGTT
CAGGATGGCCGGTCCACCGGGATGAACGGTCCAAAACAGGTCATTCAACTCCAATGAACC
AGAGCCAGCCTTTGCCACCAGCTTCTTGCAGAACTCCTCTATGTTGTCTTCGATCTTCTG
AGGTAGTTCTCTTCCTAGCTTGAAGCTTATGCCCTCCTCTGACAACCGCCCGTCAATCAC
CCCATGCGTTCCTGGTAGGAACTGCTGCAGCGCATAGTGAAGCTCCATGAAGGGACTTTC
TGACTCTGTAGGGTCTGCTCCGATGATCAGGGCAGCTGCTCCGTCTCCAAAGAGAGCAGC
CCCGACTAAGTCGTAAGGGCGAGCTTTGTTGGGGGGACGGAACCCAAGAACCATAGTCTC
AGAGGTGGTGAGCAGCACCCGACTCCCTGGGTTGTTCTCAGCAATGTCCTTGGCCACGCG
CATCCCACTCACACCTCCGTAGCATCCCAGAAAATAAA*CAACACCCTCTGCACCTCGTT
GCTAGGGCCCAGTTGTGCCGAGAG

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DS 

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TGTTGCAGCTTCTCTTTGATAGAGGGGTCATCGCATTTGATTTCACGGAGATACTCCTCC
ACGAGATTCTCTTGAGAGACTACATTGC
CTGGG

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DS 

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AGGGCGAGCTTTGTTGGGGGGACGGAACCCAAGAACCATAGTCTCAGAGGTGGTGAGCAG
CACCCGGCTCCCTGGGTTGTTCTCAGCAATGTCCTTGGCCACGCGCATCCCACTCACACC
TCCGTAGCATCCCAGAAAATAAAACAACACCCTCTGCACCTCGTTGCTAAGGCCCAGTTG
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TGCCATCTGCACAACCGCCTCGTTTGCGATCTCAAGCCTCTGTTTGATGGTTGGGGAACC
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CTTCACAGTT*GTGGTTTTACACAAGTGTTGCAGCTTCTCTTTGATAGAGGGGTCATCGC
ATTTGATTTCACGGAGATACTCCTCCACGAGATTCTCTTGAGAGACTACATTGCTGGGGA
AGGCCTTACCAAGAGCAAGCACAGTTGCCTTTCCTTTATTGGCAACACGCCTTGTACTTT
GGGATATTTCCTTTTCTTTTCCTACCCTTCCGGTGGCCAACATATTTGTCAGGTTTCACA
ACACAAAGAGTTGGTCC

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DS 

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TCTCAGCAATGTCCTTGGCCACGCGCATCCCACTCACACCTCCGTAGCATCCCAGAAAAT
AAAACAACACCCTCTGCACCTCGTTGCTAAGGCCCAGTTGTGCCGAGAGGTAGAGGTCAC
CCCCGGGCAAACGGAACTCACTGGATGAAACATAGACGAGATGAGTGATATCTTCCACTG
TCCTTCCCCATTCCTTGATGCAAGCCAAGCTCGCTTCATATGCCATCTGCACAACCGCCT
CGTTTGCGATCTCAAGCCTCTGTTTGATGGTTGGGGAACCCTCCGTTGCTAGCTCAGGGT
ATTTTTGCATCGTCTCGCTGGACATGACCGTGTAGCGTGTCTTCACAGTT*GTGGTTTTA
CACAAGTGTTGCAGCTTCTCTTTGATAGAGGGGTCATCGCATTTGATTTCACGGAGATAC
TCCTCCACGAGATTCTCTTGAGAGACTACATTGCTGGGGAAGGCCTTACCAAGAGCAAGC
ACAGTTGCCTTTCCTTTATTGGCAACACGCCTTGTACTTTGGGATATTTCCTTTTCTTTT
CCTACCCTTCCGGTGGCCAACATATTTGTCAGGTTTCACGACACAAAGAGT
TAGTCC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1AS96TF 677 0 0
G
CCCGACTAAGTCGTAAGGGCGAGCTTTGTTGGGGG*ACGGAACCCAAGAACCATAGTCTC
AGAGGTGGTGAGCAGCACCCGACTCCCTGGGTTGTTCTCAGCAATGTCCTTGGCCACGCG
CATCCCACTCACACCTCCGTAGCATCCCAGAAAATAAAACAACACCCTCTGCACCTCGTT
GCTAAGGCCCAGTTGTGCCGAGAGGTAGAGGTCACCCCCGGGCAAACGGAACTCACTGGA
TGAAACATAGACGAGATGAGTGATATCTTCCACTGTCCTTCCCCATTCCTTGATGCAGGC
CAAACTCGCTTCATATGCCATCTGCACAACCGCCTCGTTTGCGATCTCAAGCCTCTGTTT
GATGGTTGGGGAACCCTCCGTTGCTAGCTCAGGGTATTTTTGCATCGTCTCGCTGGACAT
GACCGTGTAGCGTGTCTTCACAGTT*GTGGTTTTACACAAGTGTTGCAACTTCTCTTTGA
TAGAGGGGTCATCGCATTTGATTTCACGGAGATACTCCTCCACGAGATTCTCTTGAGAGA
CTACATTGCTGGGGAAGGCCTTACCAAGAGCAAGCACAGTTGCCTTTCCTTTATTGGCAA
CACGCCTTGTACTTTGGGATATTTCCTTTTCTTTTCCTACCCTTCCGGTGGCCAACATAT
TTGTCAGGTTTCAC
CC

QA 2 675 2 675
DS 



AS 1 11

CO CL185Contig1 846 11 5 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGCTCACACAC
TCTGTTTCGATTGAGAAGAAGCGATCACGAAGATGGCGAGACCAACCTCCATTCTCTTCC
TCACGCTACTCCTCTTCGCTGCTCTGGCTTTGATCCAGGCAAAGGAAGATTTAAAGGAGA
TCACTCACAAAGTTTACTTCGATGTTGAGATTGACGGCAAAGAAGCTGGTCGAGTTGTTA
TTGGCCTATTCGGCAAGACAGTTCCTAAAACTGCAGAAAACTTCAGAGCTCTTTGCACTG
GGGAGAAAGGTGTTGGGAAGAGCGGGAAGCCTCTACACTACAAGGGGAGCAAGTTCCATA
GAATCATTCCTAGTTTTATGATCCAGGGAGGTGACTTCACCCACGGAAACGGTATGGGTG
GAGAATCCATCTATGGTCAGAAGTTTGCTGATGAGAACTTCAAGCTCAAGCATACCGGAC
CAGGTTTTCTTTCGATGGCAAACTCTGGTGAGGACACAAACGGTTCGCAGTTTTTCATCA
CGACGGTGACAACAAGCTGGTTAGATGGAAGGCATGTGGTGTTTGGGAAAGTGGTACAAG
GAATGGATGTTGTCTACAAGATTGAAGCTGAGGGGAAGCAAAGTGGAACTCCTAAGAGCA
AAGTTGTTATTGCTGACAGTGGAGAGCTTCCTCTCTAAATCCTAAGCACTTCTTCTTCAT
GAAGAGGATTGTGGGGTTTTTAAGTTGTTTTGTATTTTAAACACACTCGAATGCTATCCA
ACCGAACAAAAGCACTTCAGTTTCAGAGCTTTTTTTTAATAAATCATTTTCTAAATAGAT
TTTGTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 20 20 20 30 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 50 50 50 50 50 55 55 55 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 25 25 65 65 65 65 65 65 65 
50 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 50 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 45 45 40 40 10 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

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AF RS1A143TV U 1
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AF RS1A065TR C 50
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GG
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TCTTCCTCACGCTACTCCTCTTCGCTGCTCTGACTTTGATCCAGGCAAAGGAAGATCCGA
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TTGTTATTGGCCTTTTCGGCAAGACAGTTCCCAAAACTGCAGAAAACTTCAGAGCTCTTT
GCACTGGGGAGAAAGGTGTTGGGAAGAGCGGGAAACCTCTACGCTACAAGGGGAGCAAAT
TCCATAGAATCATTCCTAGTTTTATGATCCAGGGAGGTGACTTCACCCACGGAAACGGTA
TGGGTGGAGAATCCATCTATGGTCAGAAGTTTGCTGATGAGAACTTCAAGCTCAAGCATA
CCGGACCAGGTTTGCTTTCGATGGCAAATTCTGGAGAGGACACAAACGGTTCGCAGTTTT
TCATCACGACGGTGACAACAAGCTGGTTAGATGGAAGGCATGTGGTGTTTGGGAAAGTGG
TACAGGGAATGGATGTTGTCTACAAGATTGAAGCTGAGGGGAAGCAAA

QA 3 590 3 590
DS 

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TCTGTTTCGATTGAGAAGAAGCGATCACGAAGATGGCGAGACCAACCTCCATTCTCTTCC
TCACGCTACTCCTCTTCGCTGCTCTGGCTTTGATCCAGGCAAAGGAAGATTTAAAGGAGA
TCACTCACAAAGTTTACTTCGATGTTGAGATTGACGGCAAAGAAGCTGGTCGAGTTGTTA
TTGGCCTATTCGGCAAGACAGTTCCTAAAACTGCAGAAAACTTCAGAGCTCTTTGCACTG
GGGAGAAAGGTGTTGGGAAGAGCGGGAAGCCTCTACACTACAAGGGGAGCAAGTTCCATA
GAATCATTCCTAGTTTTATGATCCAGGGAGGTGACTTCACCCACGGAAACGGTATGGGTG
GAGAATCCATCTATGGTCAGAAGTTTGCTGATGAGAACTTCAAGCTCAAGCATACCGGAC
CAGGTTTTCTTTCGATGGCAAACTCTGGTGAGGACACAAACGGTTCGCAGTTTTTCATCA
CGACGGTGACAACAAGCTGGTTAGATGGAAGGCATGTGGTGTTTGGGAAAGTGGTACAAG
GAATGGATGTTGTCTACAAGATTGAAGCTGAGGGGAAGCAAAGTGGAACTCCTAAGAGCA
AAGTTGTTATTGCTGACAGTGGAGAGCTTCCTCTCTAAATCCTAAGCACTTCTTCTTCAT
GAAGAGGATTGTGGGGTTTTTAAGTTGTTTTGTATTTTAAACACACTCGAATGCTATCCA
ACCGAACAAAAGCACTTCA

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DS 

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TCTGTTTCGATTGAGAAGAAGCGATCACGAAGATGGCGAGACCAACCTCCATTCTCTTCC
TCACGCTACTCCTCTTCGCTGCTCTGGCTTTGATCCAGGCAAAGGAAGATTTAAAGGAGA
TCACTCACAAAGTTTACTTCGATGTTGAGATTGACGGCAAAGAAGCTGGTCGAGTTGTTA
TTGGCCTATTCGGCAAGACAGTTCCTAAAACTGCAGAAAACTTCAGAGCTCTTTGCACTG
GGGAGAAAGGTGTTGGGAAGAGCGGGAAGCCTCTACACTACAAGGGGAGCAAGTTCCATA
GAATCATTCCTAGTTTTATGATCCAGGGAGGTGACTTCACCCACGGAAACGGTATGGGTG
GAGAATCCATCTATGGTCAGAAGTTTGCTGATGAGAACTTCAAGCTCAAGCATACCGGAC
CAGGTTTTCTTTCGATGGCAAACTCTGGTGAGGACACAAACGGTTCGCAGTTTTTCATCA
CGACGGTGACAACAAGCTGGTTAGATGGAAGGCATGTGGTGTTTGGGAAAGTGGTACAAG
GAATGGATGTTGTCTACAAGATTGAAGCTGAGGGGAAGCAAAGTGGAACTCCTAAGAGCA
AAGTTGTTATTGCTGACAGTGGAGAGCTTCCTCTCTAAATCCTAAGCACTTCTTCTTCAT
GAAGAGGATTGTGGGGTTTTTAAGTTGTTTTGTATTTTAAACACACTCGAATGCTATCCA
ACCGAACAAAAGCACTTCAGTTTCAGAGCTTT

QA 1 812 1 812
DS 

RD RS1A143TV 814 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGG*****ACAC
TCTGTTTTGATTGAGAAGAAGCGATCACGAAGATGGCGAGACCAACCTCCATTCTCTTCC
TCACGCTACTCCTCTTCGCTGCTCTGGCTTTGATCCAGGCAAAGGAAGATTTAAAGGAGA
TCACTCACAAAGTTTACTTCGATGTTGAGATTGACGGCAAAGAAGCTGGTCGAGTTGTTA
TTGGCCTATTCGGCAAGACAGTTCCTAAAACTGCAGAAAACTTCAGAGCTCTTTGCACTG
GGGAGAAAGGTGTTGGGAAGAGCGGGAAGCCTCTACACTACAAGGGGAGCAAGTTCCATA
GAATCATTCCTAGTTTTATGATCCAGGGAGGTGACTTCACCCACGGAAACGGTATGGGTG
GAGAATCCATCTATGGTCAGAAGTTTGCTGATTAGAACTTCAAGCTCAAGCATACCGGAC
CAGGTTTTCTTTCGATGGCAAACTCTGGTGAGGACACAAACGGTTCGCAGTTTTTCATCA
CGACAGTGACAACAAGCTGGTTAGATGGAAGGCATGTGGTGTTTGGGAAAGTGGTACAAG
GAATGGATGTTGTCTACAAGATTGAAGCTGAGGGGAAGCAAAGTGGAACTCCTAAGAGCA
AAGTTGTTATTGCTGACAGTGGAGAGCTTCCTCTCTAAATCCTAAGCACTTCTTCTTCAT
GAAGAGGATTGTGGGGTTTTTAAGTTGTTTTGTATTTTAAACACACTCGAATGCTATCCA
ACCGAACAAAAGCACTTCAGTTTCAGAGCTTTTT

QA 1 814 1 814
DS 

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CATTCTCTTCCTCACGCTACTCCTCTTCGCTGCTCTGGCTTTGATCCAGGCAAAGGAAGA
TTTAAAGGAGATCACTCACAAAGTTTACTTCGATGTTGAGATTGACGGCAAAGAAGCTGG
TCGAGTTGTTATTGGCCTATTCGGCAAGACAGTTCCTAAAACTGCAGAAAACTTCAGAGC
TCTTTGCACTGGGGAGAAAGGTGTTGGGAAGAGCGGGAAGCCTCTACACTACAAGGGGAG
CAAGTTCCATAGAATCATTCCTAGTTTTATGATCCAGGGAGGTGACTTCACCCACGGAAA
CGGTATGGGTGGAGAATCCATCTATGGTCAGAAGTTTGCTGATGAGAACTTCAAGCTCAA
GCATACCGGACCAGGTTTTCTTTCGATGGCAAACTCTGGTGAGGACACAAACGGTTCGCA
GTTTTTCATCACGACGGTGACAACAAGCTGGTTAGATGGAAGGCATGTGGTGTTTGGGAA
AGTGGTACAAGGAATGGATGTTGTCTACAAGATTGAAGCTGAGGGGAAGCAAAGTGGAAC
TCCTAAGAGCAAAGTTGTTATTGCTGACAGTGGAGAGCTTCCTCTCTAAATCCTAAGCAC
TTCTTCTTCATGAAGAGGATTGTGGGGTTTTTAAGTTGTTTTGTATTTTAAACACACTCG
AATGCTATCCAACCGAACAAAAGCACTTCAGTTTCAGAGCTTTTTTTTAATAAATCATTT
TCT

QA 1 783 1 783
DS 

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GACGGCAAAGAAGCTGGTCGAGTTGTTATTGGCCTATTCGGCAAGACAGTTCCTAAAACT
GCAGAAAACTTCAG*GCTCTTTGCGCTGGGGAGAAAGGTGTTGGGAAGAGCGGGAAGCCA
CTACACTACAAGGGGAGCAAGTTCCATAGAATCATTCCTAGTTTTATGATCCAGGGAGGT
GACTTCACCCACGGAAACGGTATGGGTGGAGAATCCATGTATGGTCAGAAGTTTGCTGAT
GAGAACTTCAAGCTCAAGCATACCGGACCAGGTTTTCTTTCGATGGCAAACTCTGGTGAG
GACACAAACGGTTCGCAGTTTTTCATCACGACGGTGACAACAAGCTGGTTAGATGGAAGG
CATGTGGTGTTTGGGAAAGTGGTACAAGGAATGGATGTTGTCTACAAGATTGAAGCTGAG
GGGAAGCAAAGTGGAACTCCTAAGAGCAAAGTTGTTATTGCTGACAGTGGAGAGCTTCCT
CTCTAAATCCTAAGCACTTCTTCTTCATGAAGAGGATTGTGGGGTTTTTAAGTTGTTTTG
TATTTTAAACACACTCGAATGCTATCCAGCCGAACAAAAGCACTTCAGTTTCAGAGCTTT
TTTTTAATAAA

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DS 

RD RS1EV86TF 759 0 0
GG
ACACACTCTGTTTCGATTGAGAAGAAGCGATCACGAAGATGGCGAGACCAACCTCCATTC
TCTTCCTCACGCTACTCCTCTTCGCTGCTCTGGCTTTGATCCAGGCAAAGGAAGATTTAA
AGGAGATCACTCACAAAGTTTACTTCGATGTTGAGATTGACGGCAAAGAAGCTGGTCGAG
TTGTTATTGGCCTATTCGGCAAGACAGTTCCTAAAACTGCAGAAAACTTCAGAGCTCTTT
GCACTGGGGAGAAAGGTGTTGGGAAGAGCGGGAAGCCTCTACACTACAAGGGGAGCAAGT
TCCATAGAATCATTCCTAGTTTTATGATCCAGGGAGGTGACTTCACCCACGGAAACGGTA
TGGGTGGAGAATCCATCTATGGTCAGAAGTTTGCTGATGAGAACTTCAAGCTCAAGCATA
CCGGACCAGGTTTTCTTTCGATGGCAAACTCTGGTGAGGACACAAACGGTTCGCAGTTTT
TCATCACGACGGTGACAACAAGCTGGTTAGATGGAAGGCATGTGGTGTTTGGGAAAGTGG
TACAAGGAATGGATGTTGTCTACAAGATTGAAGCTGAGGGGAAGCAAAGTGGAACTCCTA
AGAGCAAAGTTGTTATTGCTGACAGTGGAGAGCTTCCTCTCTAAATCCTAAGCACTTCTT
CTTCATGAAGAGGATTGTGGGGTTTTTAAGTTGTTTTGTATTTTAAACACACTCGAATGC
TATCCAACCGAACAAAAGCACTTCAGTTTCAGAGCTT

QA 3 759 3 759
DS 

RD RS1A065TR 783 0 0
GGCTCACACACTCTGTTTCGATTGAGAAGAAGCGATCACGAAGATGGCGAGACCAACCTC
CATTCTCTTCCTCACGCTACTCCTCTTCGCTGCTCTGGCTTTGATCCAGGCAAAGGAAGA
TTTAAAGGAGATCACTCACAAAGTTTACTTCGATGTTGAGATTGACGGCAAAGAAGCTGG
TCGAGTTGTTATTGGCCTATTCGGCAAGACAGTTCCTAAAACTGCAGAAAACTTCAGAGC
TCTTTGCACTGGGGAGAAAGGTGTTGGGAAGAGCGGGAAGCCTCTACACTACAAGGGGAG
CAAGTTCCATAGAATCATTCCTAGTTTTATGATCCAGGGAGGTGACTTCACCCACGGAAA
CGGTATGGGTGGAGAATCCATCTATGGTCAGAAGTTTGCTGATGAGAACTTCAAGCTCAA
GCATACCGGACCAGGTTTTCTTTCGATGGCAAACTCTGGTGAGGACACAAACGGTTCGCA
GTTTTTCATCACGACGGTGACAACAAGCTGGTTAGATGGAAGGCATGTGGTGTTTGGGAA
AGTGGTACAAGGAATGGATGTTGTCTACAAGATTGAAGCTGAGGGGAAGCAAAGTGGAAC
TCCTAAGAGCAAAGTTGTTATTGCTGACAGTGGAGAGCTTCCTCTCTAAATCCTAAGCAC
TTCTTCTTCATGAAGAGGATTGTGGGGTTTTTAAGTTGTTTTGTATTTTAAACACACTCG
AATGCTATCCAACCGAACAAAAGCACTTCAGTTTCAGAGCTTTTTTTTAATAAATCATTT
TCT

QA 1 783 1 783
DS 

RD RS1A143TF 685 0 0
CAGGCAAAGGAAGATTTAAAGGAGATCACTCACAAAGTTTACTTCGATGTTGAGATTGAC
GGCAAAGAAGCTGGTCGAGTTGTTATTGGCCTATTCGGCAAGACAGTTCCTAAAACTGCA
GAAAACTTCAGAGCTCTTTGCACTGGGGAGAAAGGTGTTGGGAAGAGCGGGAAGCCTCTA
CACTACAAGGGGAGCAAGTTCCATAGAATCATTCCTAGTTTTATGATCCAGGGAGGTGAC
TTCACCCACGGAAACGGTATGGGTGGAGAATCCATCTATGGTCAGAAGTTTGCTGATTAG
AACTTCAAGCTCAAGCATACCGGACCAGGTTTTCTTTCGATGGCAAACTCTGGTGAGGAC
ACAAACGGTTCGCAGTTTTTCATCACGACAGTGACAACAAGCTGGTTAGATGGAAGGCAT
GTGGTGTTTGGGAAAGTGGTACAAGGAATGGATGTTGTCTACAAGATTGAAGCTGAGGGG
AAGCAAAGTGGAACTCCTAAGAGCAAAGTTGTTATTGCTGACAGTGGAGAGCTTCCTCTC
TAAATCCTAAGCACTTCTTCTTCATGAAGAGGATTGTGGGGTTTTTAAGTTGTTTTGTAT
TTTAAACACACTCGAATGCTATCCAACCGAACAAA*GCACTTCAGTTTCAGAGCTTTTTT
TTAATAAATCATTTTCTA
AATAGAT

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1BN33TF 676 0 0
GGCAAAGGAAGATCCGAAGGAGAACACTCGCAAAGTTTACTTCGATGTTGAGATTGATGG
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AAACTTCAGAGCTCTTTGCACTGGGGAGAAAGGTGTTGGGAAGAGCGGGAAACCTCTACA
CTACAAGGGGAGCAAATTCCATAGAATCATTCCTAGTTTTATGATCCAGGGAGGTGACTT
CACCCACGGAAACGGTATGGGTGGAGAATCCATCTATGGTCAGAAGTTTGCTGATGAGAA
CTTCAAGCTCAAGCATACCGGACCAGGTTTGCTTTCGATGGCAAATTCTGGAGAGGACAC
AAACGGTTCGCAGTTTTTCATCACGACGGTGACAACAAGCTGGTTAGATGGAAGGCATGT
GGTGTTTGGGAAAGTGGTACAGGGAATGGATGTTGTCTACAAGATTGAAGCTGAGGGGAA
GCAAAGTGGAACTCCTAAGAGCAAAGTTGTTATTGCTGACAGTGGAGAGCTTCCTCTCTA
AACCCTAAGCACTTCTTCTTCATGAAGAGGATTGTGGGGTTTTTAAGTTGTTCTGTATGT
TAAACACTCTCGAATGCTATCCAACCGAACAAAAGCACTTCAGTTTCAGAGCTTTTTTT*
AATAAATCATTTTCT
A

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1GA94JQ 702 0 0
TGA
CTTTGATCCAGGCAAAGGAAGATCCGAAGGAGATCACTCACAAAGTTTACTTCGATGTTG
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AAACTGCAGAAAACTTCAGAGCTCTTTGCACTGGGGAGAAAGGTGTTGGGAAGAGCGGGA
AACCTCTACGCTACAAGGGGAGCAAATTCCATAGAATCATTCCTAGTTTTATGATCCAGG
GAGGTGACTTCACCCACGGAAACGGTATGGGTGGAGAATCCATTTATGGTCAGAAGTTTG
CTGATGAGAACTTCAAGCTCAAGCATACCGGACCAGGTTTGCTTTCGATGGCAAATTCTG
GAGAGGACACAAACGGTTCGCAGTTTTTCATCACGACGGTGACAACAAGCTGGTTAGATG
GAAGGCATGTGGTGTTTGGGAAAGTGGTACAGGGAATGGATGTTGTTTACAAGATTGAAG
CTGAGGGGAAGCAAAGTGGAACTCCTAAGAGCAAAGTTGTTATTGCTGACAGTGGAGAGC
TTCCTCTCTAAACCCTAAGCACTTTTTCTTCATGAAGAGGATTGTGGGGTTTTTAAGTTG
TTCTGTATGTTAAACACTCTCGAATGCTATCCAACCGAACAAAAGCACTTCAGTTTCAGA
GCTTTTTTT*AATAAATCATTTTCTAAATAGATTTTGTG

QA 4 702 4 702
DS 



AS 1 12

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TCTCCTCCACCAATCTCATCGCAATCATGATTATGTCAGAGGAGAACCGTCGCGCAATCT
CCAAGTACCTCTTCCAAGAGGGAGTGCTGTTTGCGAAAAAGGATTTCAATTTGGCGCAGC
ATCCTTTGATCGAAGGAGTTCCGAATCTGCAAGTCATCAAGTTGATGCAGAGCTTCAAGT
CCAAGGAGTACGTTCGTGAGACGTTTGCGTGGATGCACTACTACTGGTTCCTCACTAACG
AAGGCATTGACTTTTTGAGGACTTACCTCAACTTACCTTCTGAGATTGTTCCCGCCACTT
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TATTGTACCTTGGATTTGAGATGGAATTGTCTTTTACTCAATATGATTGTTTTTTTACGT
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TTATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 30 30 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 60 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 35 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 35 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
40 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1GM71TF U 13
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BS 762 786 RS1DZ75JQ

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ATCTCATCGCAATCATGATTATGTCAGAGGAGAACCGTCGCGCAATCTCCATGTACCTCT
TCCAAGAGGGAGTGCTGTTTGCGAAAAAGGATTTCAATTTGGCGCAGCATCCTTTGATCG
AAGGAGTTCCGAATCTACAAGTCATCAAGTTGATGCAGAGCTTCAAGTCCAAGGAGTACG
TTCGTGAGACGTTTGCGTGGATGCACTACTACTGGTTCCTCACTAACGAAGGCATTGACT
TTTTGAGGACTTACCTCAACTTACCTTCTGAGATTGTTCCCGCCACTTTGAAGAAGCAGC
AGAAGCCTCTTGGTCGTCCCATGGGTGACCGTCCTCGTGGCCCACCTCGTTCTGATGGAG
AGAGGAGATTTGGTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGCACCTAGGTCTGGTGGTGAGT
TTGGTGATAAGAGTGGAGCTCCTGCTGATTAC

QA 1 512 1 512
DS 

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G
GAGAACGCCGTCACATACACAACACGCAAGACACCTTCTCCGTCGTCTCCTCCACCAATC
TCATCGCAATCATGATTATGTCAGAGGAGAACCGTCGCGCAATCTCCAAGTACCTCTTCC
AAGAGGGAGTGCTGTTTGCGAAAAAGGATTTCAATTTGGCGCAGCATCCTTTGATCGAAG
GAGTTCCGAATCTGCAAGTCATCAAGTTGATGCAGAGCTTCAAGTCCAAGGAGTACGTTC
GTGAGACGTTTGCGTGGATGCACTACTACTGGTTCCTCACTAACGAAGGCATTGACTTTT
TGAGGACTTACCTCAACTTACTTTCTGAGATTGTTCCCGCCACTTTGAAGAAGCAGCAGA
AGCCTCTTGGTCGTCCCATGGGTGACCGTCCTCGTGGCCCACCTCGTTCTGATGGAGAGA
GGAGATTTGGTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGCACCTAGGTCTGGTGGTGAGTTTG
GTGATAAGAGTGGAGCTCCTGCTGATTACCAGCCTTCCT

QA 2 520 2 520
DS 

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CCAAGTACCTCTTCCAAGAGGGAGTGCTGTTTGCGAAAAAGGATTTCAATTTGGCGCATC
ATCCTTTGATCGAAGGAGTTCCGAATCTGCAAGTCATCAAGTTGATGCAGAGCTTCAAGT
CCAAGGAGTACGTTCGTGAGACGTTTGCGTGGATGCACTACTACTGGTTCCTCACTAACG
AAGGCATTGACTTTTTGAGGACTTGCCTCAACTTACCTTCTGAGATTGTTCCCGCCACTT
TGAAGAAGCAGCAGAAGCCTCTTGGTCGTCCCATGGGTGACCGTCCTCGTGGCCCACCTC
GTTCTGATGGAGAGAGGAGATTTGGTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGCACCTAGGT
CTGGTGGTGAGTTTGGTGATAAGAGTGGAGCTCCTGCTGATTACCAGCCTTCCTTCAGGG
CACCTGGAGCTG

QA 1 552 1 552
DS 

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GGGAGTA
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TCGAAGGAGTTCCGAATCTGCAAGTCATCAAGTTGATGCAGAGCTTCAAGTCCAAGGAGT
ACGTTCGTGGGACGTTTGCGTGGATGCACTACTACTGGTTCCTCACTAACGAAGGCATTG
ACTTTTTGAGGACTTACCTCAACTTACCTTCTGAGATTGTTCCCGCCACTTTGAAGAAGC
AGCAGAAGCCTCTTGGTCGTCCCATGGGTGACCGTCCTCGTGGCCCACCTCGTTCTGATG
GAGAGAGGAGATTTGGTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGCACCTAGGTCTGGTGGTG
AGTTTGGTGATAAGAGTGGAGCTCCTGCTGATTACCAGCCTTCCTTCAGGGCACCTGGAG
CTGGATCTAGGCCTG
TG

QA 8 562 8 562
DS 

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GGAGAGTA
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CCAATCTCATCGCAATCATGATTATGTCAGAGGAGAACCGTCGCGCAATCTCCAAGTACC
TCTTCCAAGAGGGAGTGCTGTTTGCGAAAAAGGATTTCAATTTGGCGCAGCATCCTTTGA
TCGAAGGAGTTCCGAATCTGCAAGTCATCAAGTTGATGCAGAGCTTCAAGTCCAAGGAGT
ACGTTCGTGAGACGTTTGCGTGGATGCACTACTACTGGTTCCTCACTAACGAAGGCATTG
ACTTTTTGAGGACTTACCTCAACTTACCTTCTGAGATTGTTCCCGCCACTTTGAAGAAGC
AGCAGAAGCCTCTTGGTCGTCCCATGGGTGACCGTCCTCGTGGCCCACCTCGTTCTGATG
GAGAGAGGAGATTTGGTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGCACCTAGGTCTGGTGGTG
AGTTTGGTGATAAGGGTGGAGCTCCTGCTGATTACCAGCCTTCCTTCAGGGCACCTGGAG
CTGGATCTAG*CCTGGGTTTGGCCGTGGAGCTGGTGGGTATGGTGCTGGTCCAGCTGCTG
GATCTGATCTTCCTTGAAAGGGAA*TGTAATCCTTGTC

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DS 

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CCAAGTACCTCTTCCAAGAGGGAGTGCTGTTTGCGAAAAAGGATTTCAATTTGGCGCAGC
ATCCTTTGATCGAAGGAGTTCCGAATCTGCAAGTCATCAAGTTGATGCAGAGCTTCAAGT
CCAAGGAGTACGTTCGTGGGACGTTTGCGTGGATGCACTACTACTGGTTCCTCACTAACG
AAGGCATTGACTTTTTGAGGACTTACCTCAACTTACCTTCTGAGATTGTTCCCGCCACTT
TGAAGAAGCAGCAGAAGCCTCTTGGTCGTCCCATGGGTGACCGTCCTCGTGGCCCACCTC
GTTTTGATGGAGAGAGGAGATTTGGTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGCACCTAGGT
CTGGTGGTGAGTTTGGTGATAAGAGTGGAGCTCCTGCTGATTACCAGCCTTCCTTCAGGG
CACCTGGAGCTGGATCTAGGCCTGTGTTTGGCCGTGGAGCTGGTGGGTATGGTGCTGGTC
CAGCTGCTGGATCTGATCTTCCTTGAAAGGGAAATGTAATCCTTGTCTCTTTTTTGGTTA
TATTGTACCTTGGATTTGAGATGGAATTGTCTTTTACTCAATATGATTGTTTTTTTACGT

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DS 

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G
GAAGGAGAGAACGCCGTCACATACACAACACGCAAGACACCTTCTCCGTCGTCTCCTCCA
CCAATCTCATCGCAATCATGATTATGTCAGAGGAGAACCGTCGCGCAATCTCCAAGTACC
TCTTCCAAGAGGGAGTGCTGTTTGCGAAAAAGGATTTCAATTTGGCGCAGCATCCTTTGA
TCGAAGGAGTTCCGAATCTGCAAGTCATCAAGTTGATGCAGAGCTTCAAGTCCAAGGAGT
ACGTTCGTGAGACGTTTGCGTGGATGCACTACTACTAGTTCCTCACTAACGAAGGCATTG
ACTTTTTGAGGACTTACCTCAACTTACCTTCTGAGATTGTTCCCGCCACTTTGAAGAAGC
AGCAGAAGCCTCTTGGTCGTCCCATGGGTGACCGTCCTCGTGGCCCACCTCGTTCTGATG
GAGAGAGGAGATTTGGTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGCACCTAGGTCTGGTGGTG
AGTTTGGTGATAAGAGTGGAGCTCCTGCTGATTACCAGCCTTCCTTCAGGGCACCTGGAG
CTGGATCTAGGCCTGGGTTTGGCCGTGGAGCTGGTGGGTATGGTGCTGGTCCAGCTGCTG
GATCTGATCTTCCTTGAAAGGGAAATGTAATCCTTGTCTCTTTTTTGGTTATATTGTACC
TTGGATTTGAGATGGAATTGTCTTTTACTCAATATGATTGTTTTTTTACGTTACAAAGAA

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DS 

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CGCAATCTCCATGTACCTCTTCCAAGAGGGAGTGCTGTTTGCGAAAAAGGATTTCAATTT
GGCGCAGCATCCTTTGATCGAAGGAGTTCCGAATCTACAAGTCATCAAGTTGATGCAGAG
CTTCAAGTCCAAGGAGTACGTTCGTGAGACGTTTGCGTGGATGCACTACTACTGGTTCCT
CACTAACGAAGGCATTGACTTTTTGAGGACTTACCTCAACTTACCTTCTGAGATTGTTCC
CGCCACTTTGAAGAAGCAGCAGAAGCCTCTTGGTCGTCCCATGGGTGACCGTCCTCGTGG
CCCACCTCGTTCTGATGGAGAGAGGAGATTTGGTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGC
ACCTAGGTCTGGTGGTGAGTTTGGTGATAAGAGTGGAGCTCCTGCTGATTACCAGCCTTC
CTTCAGGGCACCTGGAGCTGGATCTAGGCCTGGGTTTGGCCGTGGAGCTGGTGGGTATGG
TGCTGGTCCAGCTGCTGGATCTGATCTTCCTTGAAAGGGAAATGTAATCCTTGTCTCTTT
TTTGGTTATATTGTACCTTGGATTTGAGATGGAATTGTCTTTTACTCAATATGATTGTTT
TTTTACGTT

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DS 

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GG
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TCATCGCAATCATGATTATGTCAGAGGAGAACCGTCGCGCAATCTCCAAGTACCTCTTCC
AAGAGGGAGTGCTGTTTGCGAAAAAGGATTTCAATTTGGCGCAGCATCCTTTGATCGAAG
GAGTTCCGAATCTGCAAGTCATCAAGTTGATGCAGAGCTTCAAGTCCAAGGAGTACGTTC
GTGAGACGTTTGCGTGGATGCACTACTACTGGCTCCTCACTAACGAAGGCATTGACTTTT
TGAGGACTTACCTCAACTTACCTTTTGAGATTGTTCCCGCCACTTTGAAGAAGCAGCAGA
AGCCTCTTGGTCGTCCCATGGGTGACCGTCCTCGTGGCCCACCTCGTTTTGATGGAGAGA
GGAGATTTGGTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGCACCTAGGTCTGGTGGTGAGTTTG
GTGATAAGAGTGGAGCTCCCGCTGATTACCAGCCTTCCTTCAGGGCACCTGGAGCTGGAT
CTAGGCCTGGGTTTTGCCGTGGAGCTGGTGGGTATGGTGCTGGTCCAGCTGCTGGATCTG
ATCTTCCTTGAAAGGGAAATGTAATCCTTGTCTCTTTTTTGGTTATATTGTACCTTGGAT
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ATGTTCTGGATCGTTACAAATTTTTT

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DS 

RD RS1AY38JQ 688 0 0
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TCCAAGTACCTCTTCCAAGAGGGAGTGCTGTTTGCGAAAAAGGATTTCAATTTGGCGCAG
CATCCTTTGATCGAAGGAGTTCCGAATCTGCAAGTCATCAAGTTGATGCAGAGCTTCAAG
TCCAAGGAGTACGTTCGTGAGACGTTTGCGTGGATGCACTACTACTGGTTCCTCACTAAC
GAAGGCATTGACTTTTTGAGGACTTACCTCAACTTACCTTCTGAGATTGTTCCCGCCACT
TTGAAGAAGCAGCAGAAGCCTCTTGGTCGTCCCATGGGTGACCGTCCTCGTGGCCCACCT
CGTTCTGATGGAGAGAGGAGATTTGGTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGCACCTAGG
TCTGGTGGTGAGTTTGGTGATAAGGGTGGAGCTCCTGCTGATTACCAGCCTTCCTTCAGG
GCACCTGGAGCTGGATCTAGGCCTGGGTTTGGCCGTGGAGCTGGTGGGTATGGTGCTGGT
CCAGCTGCTGGATCTGATCTTCCTTGAAAGGGAAATGTAATCCTTGTCTCTTTTTTGGTT
ATATTGTACCTTGGATTTGAGATGGAATTGTCTTTTACTCAATATGATTGTTTTTTTACG
TTACAAAGAATGTTCGATGTTCTGGATC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RS1FQ80TF 735 0 0
GG
GAGAACGCCGTCACATACACAACACGCAAGACACCTTCTCCGTCGTCTCCTCCACCAATC
TCATCGCAATCATGATTATGTCAGAGGAGAACCGTCGCGCAATCTCCAAGTACCTCTTCC
AAGAGGGAGTGCTGTTTGCGAAAAAGGATTTCAATTTGGCGCAGCATCCTTTGATCGAAG
GAGTTCCGAATCTGCAAGTCATCAAGTTGATGCAGAGCTTCAAGTCCAAGGAGTACGTTC
GTGAGACGTTTGCGTGGATGCACTACTACTGGCTCCTCACTAACGAAGGCATTGACTTTT
TGAGGACTTACCTCAACTTACCTTCTGAGATTGTTCCCGCCACTTTGAAGAAGCAGCAGA
AGCCTCTTGGTCGTCCCATGGGTGACCGTCCTCGTGGCCCACCTCGTTCTGATGGAGAGA
GGAGATTTGGTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGCACCTAGGTCTGGTGGTGAGTTTG
GTGATAAGAGTGGAGCTCCCGCTGATTACCAGCCTTCCTTCAGGGCACCTGGAGCTGGAT
CTAGGCCTGGGTTTTGCCGTGGAGCTGGTGGGTATGGTGCTGGTCCAGCTGCTGGATCTG
ATCTTCCTTGAAAGGGAAATGTAATCCTTGTCTCTTTTTTGGTTATATTGTACCTTGGAT
TTGAGATGGAATTGTCTTTTACTCAATATGATTGTTTTTT*ACGTTACAAAGAATGTTCA
ATGTTCTGGATC
G

QA 3 734 3 734
DS 

RD RS1DZ75JQ 716 0 0
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CTTCCAAGAGGGAGTGCTGTTTGCGAAAAAGGATTTCAATTTGGCGCATCATCCTTTGAT
CGAAGGAGTTCCGAATCTGCAAGTCATCAAGTTGATGCAGAGCTTCAAGTCCAAGGAGTA
CGTTCGTGAGACGTTTGCGTGGATGCACTACTACTGGTTCCTCACTAACGAAGGCATTGA
CTTTTTGAGGACTTGCCTCAACTTACCTTCTGAGATTGTTCCCGCCACTTTGAAGAAGCA
GCAGAAGCCTCTTGGTCGTCCCATGGGTGACCGTCCTCGTGGCCCACCTCGTTTTGATGG
AGAGAGGAGATTTGGTGGTGACAGAGATGGATACCGTGGAGCACCTAGGTCTGGTGGTGA
GTTTGGTGATAAGAGTGGAGCTCCTGCTGATTACCAGCCTTCCTTCAGGGCACCTGGAGC
TGGATCTAGGCCTGGGTTTGGCCGTGGAGCTGGTGGGTATGGTGCTGGTCCAGCTGCTGG
ATCTGATCTTCCTTGAAAGGGAAATGTAATCCTTGTCTCTTTTTTGGTTATATTGTACCT
TGGATTTGAGATGGAATTGTCTTTTACTCAATATGATTGTTTTTTTACGTTACAAAGAAT
GTTCAATGTTCTGGATCGTTACAAATTTTTTAGTGTCTGATGGTTTAAAGTTATAG

QA 1 716 1 716
DS 



AS 3 10

CO CL187Contig1 1375 5 9 U
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GAGAGAGAAACATCCCTCAAAGCTCTCTCTCTCCCTCTCTCTTTCTCAGGCGATGGTTGT
CGCTATGGACCAGCGTAGCAATGTGAACGGACATTCCAGTGAAGAAAGGTTTGATCCGAG
CGCACAACCACCGTTTAAGATCGGAGATATAAGAGCGGCCATTCCTAAGCATTGTTGGGT
AAAGAGTCCTTTGAGATCCATGAGCTACGTCGCGAGAGACATTTTCGCCGTCGTGGCTCT
GGCCGTCGCCGCCGTGTATTTTGATAGCTGGTTCTTCTGGCCTCTTTATTGGGCCGCCCA
AGGAACCCTTTTCTGGGCTATCTTCGTACTCGGCCACGACTGTGGACATGGAAGCTTCTC
AGACATTCCTCTTCTGAATACTGCGGTTGGTCATATTCTCCATTCCTTCATCCTCGTTCC
ATACCATGGTTGGAGAATAAGCCATCGGACACACCACCAGAACCATGGCCATGTTGAAAA
CGACGAGTCTTGGGTTCCGTTGCCAGAAAAATTATACAAGAAATTGTCCCACAGTACACG
GATGCTCAGATACACTGTCCCTCTCCCCATGCTCGCTTACCCTCTCTATCTGTGGTACAG
AAGTCCTGGTAAAGAAGGGTCACATTATAACCCATACAGTAGTTTGTTTGCTCCAAGCGA
GAGAAAGCTTATTGCAACTTCAACTACTTGCTGGTCGATCATGTTGGCCACTCTTCTTTA
TCTATCATTCCTCGTTGGTCCAGTCACAGTTCTCAAAGTCTATGGTGTTCCTTACATCAT
CTTTGTGATGTGGTTGGACGCTGTCACGTACTTGCATCATCATGGCCACGATGATAAGTT
GCCTTGGTACAGAGGCAAGGAATGGAGTTATTTACGTGGAGGATTAACAACTGTTGATAG
AGATTACGGAATCTTCAACAACATTCATCACGATATTGGAACTCACGTGATCCATCATCT
TTTCCCACAAATCCCTCACTATCACTTGGTCGAAGCCACGAAAGCAGCTAAACATGTGTT
GGGTAGATACTACAGAGAACCAAAGACGTCAGGAGCAATACCGATCCACTTGGTGGAAAG
TTTGGTGGCAAGTATTAAGAAAGATCATTATGTCAGTGACACTGGTGATATTGTCTTCTA
CGAGACAGATCCAGATCTCTACGTTTATGCTTCTGACAAATCCAAAATCAATTAACCTTT
CTTCCTAGCTCTATTTAGGAATAAAACAGTACTTTGTTCTCTACTTATTTCTTGTTGTTT
TTAAGTTATAAATGTACTCATGAAACTTTTTTTTAATTAAATGTATTTACATTTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AX57TF U 1
AF RS1AM64TF U 1
AF RS1FJ64TF U 62
AF RS1GA48TF U 535
AF RS1AM64JQ C 773
BS 1 61 RS1AM64TF
BS 62 62 RS1AX57TF
BS 63 93 RS1AM64TF
BS 94 94 RS1AX57TF
BS 95 885 RS1AM64TF
BS 886 969 RS1GA48TF
BS 970 970 RS1AM64JQ
BS 971 1125 RS1GA48TF
BS 1126 1375 RS1AM64JQ

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CGCTATGGACCAGCGTAGCAATGTGAACGGACATTCCAGTGAAGAAAGGTTTGATCCGAG
CGCACAACCACCGTTTAAGATCGGAGATATAAGAGCGGCCATTCCTAAGCATTGTTGGGT
AAAGAGTCCTTTGAGATCCATGAGCTACGTCGCGAGAGACATTTTCGCCGTCGTGGCTCT
GGCCGTCGCCGCCGTGTATTTTGATAGCTGGTTCTTCTGGCCTCTTTATTGGGCCGCCCA
AGGAACCCTTTTCTGGGCTATCTTCGTACTCGGCCACGACTGTG*ACATGGAAGCTTCTC
AGACATTCCTCTTCTGAATACTGCGGTTGGTCATATTCTCCATTCCTTCATCCTCGTTCC
ATACCATGGTTGGAGAATAAGCCATCGGACACACCACCAGAACCATGGCCATGTTGAAAA
CGACGAGTCTTGGGTTCCGTTGCCAGAAAAATTATACAAGAAATTGTCCCACAGTACACG
GATGCTCAGATACACTGTCCCTCTCCCCATGCTCGCTTACCCTCTCTATCTGTGGTACAG
AAGTCCTGGTAAAGAAGG*TCACATTATAACCCATACAGTAG

QA 1 702 1 702
DS 

RD RS1AM64TF 885 0 0
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GGGAGAGAAACATCCCTCAAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCAGGCGATGGTTGT
CGCTATGGACCAGCGTAGCAATGTGAACGGACATTCCAGTGAAGAAAGGTTTGATCCGAG
CGCACAACCACCGTTTAAGATCGGAGATATAAGAGCGGCCATTCCTAAGCATTGTTGGGT
AAAGAGTCCTTTGAGATCCATGAGCTACGTCGCGAGAGACATTTTCGCCGTCGTGGCTCT
GGCCGTCGCCGCCGTGTATTTTGATAGCTGGTTCTTCTGGCCTCTTTATTGGGCCGCCCA
AGGAACCCTTTTCTGGGCTATCTTCGTACTCGGCCACGACTGTGGACATGGAAGCTTCTC
AGACATTCCTCTTCTGAATACTGCGGTTGGTCATATTCTCCATTCCTTCATCCTCGTTCC
ATACCATGGTTGGAGAATAAGCCATCGGACACACCACCAGAACCATGGCCATGTTGAAAA
CGACGAGTCTTGGGTTCCGTTGCCAGAAAAATTATACAAGAAATTGTCCCACAGTACACG
GATGCTCAGATACACTGTCCCTCTCCCCATGCTCGCTTACCCTCTCTATCTGTGGTACAG
AAGTCCTGGTAAAGAAGGGTCACATTATAACCCATACAGTAGTTTGTTTGCTCCAAGCGA
GAGAAAGCTTATTGCAACTTCAACTACTTGCTGGTCGATCATGTTGGCCACTCTTCTTTA
TCTATCATTCCTCGTTGGTCCAGTCACAGTTCTCAAAGTCTATGGTGTTCCTTACATCAT
CTTTGTGATGTGGTTGGACGCTGTCACGTACTTGCATCATCATGG

QA 1 885 1 885
DS 

RD RS1FJ64TF 794 0 0
G
GAGAGAAACATCCCTCAAAGCTCTCTCTCTC**TCTCTCTTTCTCAGGCGATGGTTGTCG
CTATGGACCAGCGTAGCAATGTGAACGGACATTCCAGTGAAGAAAGGTTTGATCCGAGCG
CACAACCACCGTTTAAGATCGGAGATATAAGAGCGGCCATTCCTAAGCATTGTTGGGTAA
AGAGTCCTTTGAGATCCATGAGCTACGTCGCGAGAGACATTTTCGCCGTCGTGGCTCTGG
CCGTCGCCGCCGTGTATTTTGATAGCTGGTTCTTCTGGCCTCTTTATTGGGCCGCCCAAG
GAACCCTTTTCTGGGCTATCTTCGTACTCGGCCACGACTGTGGACATGGAAGCTTCTCAG
ACATTCCTCTTCTGAATACTGCGGTTGGTCATATTCTCCATTCCTTCATCCTCGTTCCAT
ACCATGGTTGGAGAATAAGCCATCGGACACACCACCAGAACCATGGCCATGTTGAAAACG
ACGAGTCTTGGGTTCCGTTGCCAGAAAAATTATACAAGAAATTGTCCCACAGTACACGGA
TGCTCAGATACACTGTCCCTCTCCCCATGCTCGCTTACCCTCTCTATCTGTGGTACAGAA
GTCCTGGTAAAGAAGGGTCACATTATAACCCATACAGTAGTTTGTTTGCTCCAAGCGAGA
GAAAGCTTATTGCAACTTCAACTACTTGCTGGTCGATCATGTTGGCCACTCTTCTTTATC
TATCATTCCTCGTTGGTCCAGTCACAGTTCTCAAAGTCTATGGTGT*CCTTACATCATCT
TTGTGATGTGGT
G

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DS 

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G
GAAAACGACGAGTCTTGGGTTCCGTTGCCAGAAAAATTATACAAGAAATTGTCCCACAGT
ACACGGATGCTCAGATACACTGTCCCTCTCCCCATGCTCGCTTACCCTCTCTATCTGTGG
TACAGAATTCCTGGTAAAGAAGGGTCACATTATAACCCATACAGTAGTTTGTTTGCTCCA
AGCGAGAGAAAGCTTATTGCAACTTCAACTACTTGCTGGTCGATCATGTTGGCCACTCTT
CTTTATCTATCATTCCTCGTTGGTCCAGTCACAGTTCTCAAAGTCTATGGTGTTCCTTAC
ATCATCTTTGTGATGTGGTTGGACGCCGTCACGTACTTGCATCATCATGGCCACGATGAT
AAGTTGCCTTGGTACAGAGGCAAGGAATGGAGTTATTTACGTGGAGGATTAACAACTGTT
GATAGAGATTACGGGATCTTCAACAACATTCATCACGATATTGGAACTCACGTGATCCAT
CATCTTTTCCCACAAATCCCTCACTATCACTTGGTCGAAGCCACGAAAGCAGCTAAACAT
GTGTTGGGTAGATACTACAGAGAACCAAAGACGTCAGGAGCAATACCGAT
CCA

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DS 

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TACATCATCTTTGTGATGTGGTTGGACGCTGTCACGTACTTGCATCATCATGGCCACGAT
GATAAGTTGCCTTGGTACAGAGGCAAGGAATGGAGTTATTTACGTGGAGGATTAACAACT
GTTGATAGAGATTACGGAATCTTCAACAACATTCATCACGATATTGGAACTCACGTGATC
CATCATCTTTTCCCACAAATCCCTCACTATCACTTGGTCGAAGCCACGAAAGCAGCTAGA
CATGTGTTGGGTAGATACTACAGAGAACCAAAGACGTCAGGAGCAATACCGATCCACTTG
GTGGAAAGTTTGGTGGCAAGTATTAAGAAAGATCATTATGTCAGTGACACTGGTGATATT
GTCTTCTACGAGACAGATCCAGATCTCTACGTTTATGCTTCTGACAAATCCAAAATCAAT
TAACCTTTCTTCCTAGCTCTATTTAGGAATAAAACAGTACTTTGTTCTCTACTTATTTCT
TGTTGTTTTTAAGTTATAAATGTACTCATGAAACTTTTTTTTAATTAAATGTATTTACAT
TTC

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DS 



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CGTAAAAATCTGGATCTGTCTCGTAAAAAACAATATCACCAGTGTCACTGACGTAGTGAT
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GATAGTGAGGGATTTGTGGGAAAAAATGATGGATCACGTGAGTTCCAATGTCGTGATGGA
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BQ
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AF RS1F904JQ U 1
AF RS1GC78JQ U 1
BS 1 102 RS1F904JQ
BS 103 103 RS1GC78JQ
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RD RS1F904JQ 582 0 0
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QA 1 582 1 582
DS 

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GTTCCACGAGTACATTTTAAACTTAAAAACAGCAACAAATAAACAAAAAAAAAGGAGTGC
TTATTCCTAATAAAGCCAGGGAGAAGGGTTAATTGATTTTAAATTTGTCAAAAGCATAAA
CGTAAAAATCTGGATCTGTCTCGTAAAAAACAATATCACCAGTGTCACTGACGTAGTGAT
CTTTTTTAATACTTGCGACCAAACTCTCCACCAAGTGAATCGGTATTGCTCCTGACGTCT
TCGGCTCTCTGTAGTATCTTCCCAGCACATGTTTAGCTGCTTTCGTGGCGTCCACCAAGT
GATAGTGAGGGATTTGTGGGAAAAAATGATGGATCACGTGAGTTCCAATGTCGTGATGGA
TGTTGTTGAAAATTCCATAATCTCTATCAATAGTTGTTAATCCTCCACGTAAATAACTCC
ATTCCTTGCCTCTGTACCACGGCAACTTCTCATCATGACCATGATGATGCAAGTACGTGA
CA

QA 1 542 1 542
DS 



CO CL187Contig3 784 3 2 U
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TGGTGGAGAGTTTGGTCGCAAGTATTAAAAAAGATCACTACGTCAGTGACACTGGTGATA
TTGTCTTCTACGAGACAGATCCAGATCTCTACGTTTATGCTTCTGACAAATCTAAAATCA
ATTAACCCTTCTCCCTGGCTCTATTAGGAATAAGCACTCCTTTTCTTTTGCTTATTTGTT
GCTGTTTTTAAGTTTAAAATGTACTCGTGGAACCTTTCTTTT*ATTAATGTATTTACATT
ATGTTTTTATTTTTTTTTAATATTAAATGATGTATTTGTAATACTTAAATATAAATTTAG
ATCG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 5 5 25 5 5 25 5 25 25 5 25 25 5 5 5 25 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 5 5 25 25 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1F904TF U 1
AF RS1GC78TF U 1
AF RS1DJ48JQ C 21
BS 1 720 RS1F904TF
BS 721 784 RS1DJ48JQ

RD RS1F904TF 726 0 0
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TCCATCATCTTTTCCCACAAATCCCTCACTATCACTTGGTCGACGCCACGAAAGCAGCTA
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TTGTCTTCTACGAGACAGATCCAGATCTCTACGTTTATGCTTCTGACAAATCTAAAATCA
ATTAACCCTTCTCCCTGGCTCTATTAGGAATAAGCACTCCTTTTCTTTTGCTTATTTGTT
GCTGTTTTTAAGTTTAAAATGTACTCGTGGAACCTTTCTTTT*ATTAATGTATTTACATT
ACAAAA

QA 1 720 1 720
DS 

RD RS1GC78TF 720 0 0
G
GTGGTACAGAAGTCCTGGAAAAGAAGGGTCACATTATAACCCATACAGTAGTTTATTTGC
TCCAAGCGAGAGGAAGCTTATTGCAACTTCAACTACTTGCTGGTCCATAATGCTGGCCAC
TCTTGTTTATCTATCGTTCCTCCTTGGTCCAGTCACAGTTCTCAAAGTCTATGGTGTTCC
TTACATTATCTTTGTGATGTGGTTGGACGCTGTCACGTACTTGCATCATCATGGTCATGA
TGAGAAGTTGCCGTGGTACAGAGGCAAGGAATGGAGTTATTTACGTGGAGGATTAACAAC
TATTGATAGAGATTATGGAATCTTCAACAACATCCATCACGACATTGGAACTCACGTGAT
CCATCATCTTTTCCCACAAATCCCTCACTATCACTTGGTCGACGCCACGAAAGCAGCTAA
ACATGTGCTGGGAAGATACTACAGAGAGCCGAAGACGTCAGGAGCAATACCGATTCACTT
GGTGGAGAGTTTGGTCGCAAGTATTAAAAAAGATCACTACGTCAGTGACACTGGTGATAT
TGTCTTCTACGAGACAGATCCAGATCTCTACGTTTATGCTTCTGACAAATCTAAAATCAA
TTAACCCTTCTCCCTGGCTCTATTAGGAATAAGCACTCCTTTTCTTTTGCTTATTTGTTG
CTGTTTTTAAGTTTAAAATGTACTCGTGGAACCTTTCTTTTTATTAATGTATTTACATT

QA 2 720 2 720
DS 

RD RS1DJ48JQ 764 0 0
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ATTGCAACTTCAACTACTTGCTGGTCCATAATGCTGGCCACTCTTGTTTATCTATCGTTC
CTCCTTGGTCCAGTCACAGTTCTCAAAGTCTATGGTGTTCCTTACATTATCTTTGTGATG
TGGTTGGACGCTGTCACGTACTTGCATTATCATGGTCATGATGAGAAGTTGCCGTGGTAC
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TACAGAGAGCCGAAGACGTCAGGAGCAATACCGATTCACTTGGTGGAGAGTTTGGTCGCA
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CCAGATCTCTACGTTTATGCTTCTGACAAATCTAAAATCAATTAACCCTTCTCCCTGGGT
CTATTAGGGATAAGCACTCCTTTTCTTTTGCTTATTTGTTGCTGTTTT*AAGTTTAAAAC
TAGATTTTTGACCCGCCCGACC*GGGCGGGTATTTATTTTATGTTTTTATTTTTTTTTAA
TATTAAATGATGTATTTGTAATACTTAAATATAAATTTAGATCG

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DS 



AS 2 11

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CGAAAAACAGTCGCAAAGAGGTAGAAGTTCTCTTAACAAAACTCCACAACATTAGTTTTT
CTTGCCAAACATGAAAAAAA*CAAATCTATAAATCTTCTATGCTCCGATGATTTCAGTTG
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AGTCACCATGAACCTCCATGAGCTTTCCAAGGTCAAACTTAGGAGCCTTGAGGATCTTGA
CTTTACGGATGAACACATTCTGCAATGGGTAGATGTTCTGTGTAGCCTTCTCAATCGCCT
TCCCAATGGACTCTGGGATGAACTTGGCCACAAGCTCCTTAAGGTCACATGATGAAGCCT
CCTTCACCATAATCTCACTCATCTTTCTCCGAATCTGGCGGACTTGGCTGGACTGAGCAT
AGCAAGTACGCTTCACCTGGTTAGCACGCCTCTTGGTGAAACCAATGCAGAACATCCTCA
AGGTGTAGCTGTCAGTGGTCTTCACATCGACATGGGCTTCAATCAAAGTCTGCCACTTCT
TCACCAACGACCTCACCTTGTCGGTTGTGAAATCCATACCCCAGAACTGGGTCAACACAT
TCCTTCCCTGAACATCTTCAGCTCTGAGACGGATCTTCCTGTAAGAATGATCCTCATCGC
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TGGTACCCTGAGTTCTGGAAACAAGGGTCTTTCCGACATTTCTGTGAGTGAAGTTAGAGG
GCGCCTTGATATCATACCAATCCTTCTTGGAGAAAGGATCAACAATCTTCTTCTTGCCTC
CTTTACGACCCTTGGAGATCCTCTTGTTCTTCCCGACAGCCATGGTTAGAGAACTTCAGG
GCAACAGTGAAGAAGAAGAAGCGGCTTCGACAACTGGAGAGAGAGGAAGACCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 
40 20 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 15 45 45 15 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 15 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
15 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 30 25 25 25 25 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BQ44TF C 7
AF RS1FT05JQ U 28
AF RS1AK85JQ U 1
AF RS1AX19JQ U 28
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AF RS1D004TF C 201
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AG
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AGTCGCAAAGAGGTAGAAGTTCTCTTAACAAAACTCCACAACATTAGTTTTTCTTGCCAA
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ATGAGCACATTCTGCAATGGGTAGATGTTCTGTGTCGCCTTCTCAATCGCCTTCCCAATG
GACTCCGGGATGAACTTGGCCACAAGCTCCTTAAGGTCACATGATGAAGCC
C

QA 3 413 3 413
DS 

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GACGGATCTTCCTGTAAGAATGATCC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1AK85JQ 745 0 0
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CGAAAAACAGTCGCAAAGAGGTAGAAGTTCTCTTAACAAAACTCCACAACATTAGTTTTT
CTTGCCAAACATGAAAAAA**CAAATTTATAAATCTTCTATGCTCCGATGATTTCAGTTG
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AGTCACCATGAACCTCCATGAGCTTTCCAAGGTCAAACTTAGGAGCCTTGAGGATCTTGA
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AGCAAGTACGCTTCACCTGGTTAGCACGCCTCTTGGTGAAACCAATGCAGAACATCCTCA
AGGTGTAGCTGTCAGTGGTCTTCACATCGACATGGGCTTCAATCAAAGTCTGCCACTTCT
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TCCTTCCCTGAACATCTTCAGCTCTGAGACGGATCTTCCTGTAAGAATGATCCTCATCGC
TTTGAAGATCAGCGAGAGACACCTC

QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1AX19JQ 717 0 0
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CCACAAGCTCCTTAAGGTCACATGATGAAGCCTCCTTCACCATAATCTCACTCATCTTTC
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QA 1 717 1 717
DS 

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TATAAATCTTCTATGCTCCGATGATTTCAGTTGGTTCCTCAGCTGTCTCTTCAGCTGGCC
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CCACAAGCTCCTTAAGGTCACATGATGAAGCCTCCTTCACCATAATCCCACTCATCTTTC
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GCCTCTTGGTGAAACCAATGCAGAACATCCTCAAGGTGTAGCTGTCAGTGGTCTTCACAT
CGACATGGGCTTCAATCAAAGTCTGCCACTTCTTCACCAACGACCTCACCTTGTCGGTTG
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GACGGATCTTCCTGTAAGAATGATCCTCATCGCTTTGAAGATCAGCGAGAGACACCT

QA 1 717 1 717
DS 

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TTCTCTTAACAAAACTCCACAACATTAGTTTTTCTTGCCAAACATGAAAAAAAACAAATC
TATAAATCTTCTATGCTCCGATGATTTCAGTTGGTTCCTCAGCTGTCTCTTCAGCTGGCC
TGTCTACCTTCACACCAACATCCTCTGCTGTGTAGTCACCATGAACCTCCATGAGCTTTC
CAAGGTCAAACTTAGGAGCCTTGAGGATCTTGACTTTACGGATGAACACATTCTGCAATG
GGTAGATGTTCTGTGTAGCCTTCTCAATCGCCTTCCCAATGGACTCTGGGATGAACTTGG
CCACAAGCTCCTTAAGGTCACATGATGAAGCCTCCTTCACCATAATCTCACTCATCTTTC
TCCGAATCTGGCGGACTTGGCTGGACTGAGCATAGCAAGTACGCTTCACCTGGTTAACAC
GCCTCTTGGTGAAACCAATGCAGAACATCCTCAAGGTGTAGCTGTCAGTGGTCTTCACAT
CGACATGGGCTTCAATCAAAGTCTGCCACTTCTTCACCAACGACCTCACCTTGTCGGTTG
TGAAATCCATACCCCAGAACTGGGTCAACACATTCCTTCCCTGAACATCTTCAGCTCTGA
GACGGATCTTCCTGTAAGAATGATCCTCATCGCTTTGAAGATCAGCGAGAGACACCTCAA
AAGCCCTGTGTTTCA

QA 1 735 1 735
DS 

RD RS1DM88TF 691 0 0
GAAC
AAAACAGTCGCAAAGAGGTAGAAGTTCTCTTAACAAAACTCCACAACATTAGTTTTTCTT
GCCAAACATGAAAAAAA*CAAATCTATAAATATTCTATGCTCCGATGATTTCAGTTGGTT
CCTCAGCTGTCTCTTCAGCTGGCCTGTCTACATTCACACCAACATCCTCCGCTGTGTAGT
CACCATGAACCTCCATGAGCTTTCCAAGGTCAAACTTAGGAGCCTTGAGGATCTTGACTT
TACGGATGAACACATTCTGCAATGGGTAGATGTTCTGTGTCGCCTTCTCAATCGCCTTCC
CAATGGACTCCGGGATGAACTTGGCCACAAGCTCCTTAAGGTCACATGATGAAGCCTCCT
TCACCATAATCTCACTCATCTTTCTGCGGATCTGGCGGACTTGGCTGGACTGAGCGTAGC
AAGTACGCTTGACCTGGTTAGCACGCCTCTTGGTGAAACCAATGCAGAACATCCTCAAAG
TGTAGCTGTCTGTGGTCTTCACATCGACATGGGCTTCAATCAAAGTCTGCCACTTCTTCA
CCAACGACCTCACCTTGTCGGTTGTGAAATCCATACCCCAGAACTGGGTCAACACATTCC
TTCCCTGAACATCTTCAGCTCTGAGACGGATCTTCCTGTAAGAATGATCCTCATCGCTTT
GAAGATCAGCAAGAGAGACCTCAAAAA

QA 5 691 5 691
DS 

RD RS1D004TF 815 0 0
TCAGCTGCCTGTCTAC
TCACACCAACA*CCTCCGCTGTGTAGTCACCATGAAC*TCCATGAGCT**CCAAGGTCAA
ACTTAGGAGCCTTGAGGATCTTGACTTTACGGATGAACACATTCTGCAATGGGTAGATGT
TCTGTGTCGCCTTCTCAATCGCCTTCCCAATGGACTCCGGGATGAACTTGGCCACAAGCT
CCTTAAGGTCACATGATGAAGCCTCCTTCACCATAATCTCACTCATCTT*CTGCGGATCT
GGCGGACTTGGCTGGACTGAGCGTAGCAAGTACGCTTGACCTGGTTAGCACGCCTCTTGG
TGAAACCAATGCAGAACATCCTCAAAGTGTAGCTGTCTGTGGTCTTCACATCGACATGGG
CTTCAATCAAAGTCTGCCACTTCTTCACCAACGACCCCACCTTGTCGGTTGTGAAATCCA
TACCCCAGAACTGGGTCAACACATTCCTTCCCTGAACATCTTCAGCTCTGAGACGGATCT
TCCTGTAAGAATGATCCTCATCGCTTTGAAGATCAGCAAGAGAGACCTCAAAAACCCTGT
GTTTCAACCCCTCAGAGGCAATCTTGGTACCCTGAGTTCTGGAAACAAGGGTCTTTCCGA
CATTTCTGTGAGTGAAGTTAGAGGGCGCCTTGATATCATACCAATCCTTCTTGGAGAAAG
GATCAACAATCTTCTTCTTGCCTCCTTTACGACCCTTGGAGATCCTCTTGTTCTTCCCGA
CAGCCATGGTTAGAGAACTTCAGGGCAACAGTGAAGAAGAAGAAGCGGCTTCGACAACTG
GAGAGAGAGGAAGACCTCC

QA 17 815 17 815
DS 



CO CL188Contig2 657 3 10 U
GGAGGTCTTCCTCTCTCCAGTTGTTGAAGCCGCTTCTTCTTCTTCACTGTTGCCCTTGAA
GCTCCCTAACCATGGCTGTCGGGAAGAACAAGAGGATCTCTAAGGGTCGTAAAGGAGGCA
AGAAGAAGATTGTTGATCCTTTCTCCAAGAAGGATTGGTATGATATCAAGGCTCCCTCTA
ACTTCACTCACAGAAATGTCGGAAAGACCCTTGTTTCCAGAACTCAGGGTACCAAGATTG
CCTCTGAGGGGTTGAAACACAGGGTTTTTGAGGTGTCTCTCGCTGATCTTCAAAGCGATG
AGGATCATTCTTACAGGAAGATCCGTCTCAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGT
TGACCCAGTTCTGGGGTATGGATTTCACAACCGACAAGGTGAGGTCGTTGGTGAAGAAGT
GGCAGACTTTGATTGAAGCCCATGTCGATGTGAAGACCACTGACAGCTACACCTTGAGGA
TGTTCTGCATTGGTTTCACCAAGAGGCGTGCTAACCAGGTGAAGCGTACTTGCTATGCTC
AGTCCAGCCAAGTCCGCCAGATTCGGAGAAAGATGAGTGAGATTATGGTGAAGGAGGCTT
CATCATGTGACCTTAAAGAGCTTGTGGCCAAGTTCATCCCAGAGTCCATTGGGAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AX19TF U 1
AF RS1ET33TF U 6
AF RS1AK85TF U 8
BS 1 468 RS1AX19TF
BS 469 469 RS1ET33TF
BS 470 559 RS1AX19TF
BS 560 560 RS1ET33TF
BS 561 564 RS1AX19TF
BS 565 565 RS1ET33TF
BS 566 616 RS1AX19TF
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BS 618 624 RS1AX19TF
BS 625 657 RS1ET33TF

RD RS1AX19TF 624 0 0
GGAGGTCTTCCTCTCTCCAGTTGTTGAAGCCGCTTCTTCTTCTTCACTGTTGCCCTTGAA
GCTCCCTAACCATGGCTGTCGGGAAGAACAAGAGGATCTCTAAGGGTCGTAAAGGAGGCA
AGAAGAAGATTGTTGATCCTTTCTCCAAGAAGGATTGGTATGATATCAAGGCTCCCTCTA
ACTTCACTCACAGAAATGTCGGAAAGACCCTTGTTTCCAGAACTCAGGGTACCAAGATTG
CCTCTGAGGGGTTGAAACACAGGGTTTTTGAGGTGTCTCTCGCTGATCTTCAAAGCGATG
AGGATCATTCTTACAGGAAGATCCGTCTCAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGT
TGACCCAGTTCTGGGGTATGGATTTCACAACCGACAAGGTGAGGTCGTTGGTGAAGAAGT
GGCAGACTTTGATTGAAGCCCATGTCGATGTGAAGACCACTGACAGCTGCACCTTGAGGA
TGTTCTGCATTGGTTTCACCAAGAGGCGTGCTAACCAGGTGAAGCGTACTTGCTATGCTC
AGTCCAGCCAAGTCCGCCAAATTCAGAGAAAGATGAGTGAGATTATGGTGAAGGAGGCTT
CATCATGTGACCTTAACGAGCTTG

QA 1 624 1 624
DS 

RD RS1ET33TF 652 0 0
GCTTC
CTCTCTCCAGTTGTTGAAGCCGCTTCTTCTTCTTCACTGTTGCCCTTGAAGCTCCCTAAC
CATGGCTGTCGGGAAGAACAAGAGGATCTCTAAGGGTCGTAAAGGAGGCAAGAAGAAGAT
TGTTGATCCTTTCTCCAAGAAGGATTGGTATGATATCAAGGCTCCCTCTAACTTCACTCA
CAGAAATGTCGGAAAGACCCTTGTTTCCAGAACTCAGGGTACCAAGATTGCCTCTGAGGG
GTTGAAACACAGGGCTTTTGAGGTGTCTCTCGCTGATCTTCAAAGCGATGAGGATCATTC
TTACAGGAAGATCCGTCTCAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTT
CTGGGGTATGGATTTCACAACCGACAAGGTGAGGTCGTTGGTGAAGAAGTGGCAGACTTT
GATTGAAGCCCATGTCGATGTGAAGACCACTGACAGCTACACCTTGAGGATGTTCTGCAT
TGGTTTCACCAAGAGGCGTGTTAACCAGGTGAAGCGTACTTGCTATGCTCAGTCCAGCCA
AGTCCGCCAGATTCGGAGAAAGATGAGTGAGATTATGGTGAAGGAGGCTTCATCATGTGA
CCTTAAAGAGCTTGTGGCCAAGTTCATCCCAGAGTCCATTGGGAAGG

QA 6 652 6 652
DS 

RD RS1AK85TF 641 0 0
GTC
CTCTCTCCAGTTGTTGAAGCCGCTTCTTCTTCTTCACTGTTGCCCTTGAAACTCCCTAAC
CATGGCTGTCGGGAAGAACAAGAGGATCTCTAAGGGTCGTAAAGGAGGCAATAAGAAGAT
TGTTGATCCTTTCTCCAAGAAGGATTGGTATGATATCAAGGCTCCCTCTAACTTCACTCA
CAGAAATGTCGGAAAGACCCTTGTTTCCAGAACTCAGGGTACCAAGATTGCCTCTGAGGG
GTTGAAACACAGGGTTTTTGAGGTGTCTCTCGCTGATCTTCAAAGCGATGAGGATCATTC
TTACAGGAAGATCCGTCTCAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTTACCCAGTT
CTGGGGTATGGATTTCACAACCGACAAGGTGAGGTCGTTGGTGAAGAAGTGGCAGACTTT
GATTGAAGCCCATGTCGATGTGAAGACCACTGACAGCTACACCTTGAGGATGTTCTGCAT
TGGTTTCACCAAGAGGCGTGCTAACCAGGTGAAGCGTACTTGCTATGCTCAGTCCAGCCA
AGTCCGCCAGATTCGGAGAAAGATGAGTGAGATTATGGTGAAGGAGGCTTCATCATGTGA
CCTTAAGGAGCTTGTGGCCAAGTTCATCCCAGAGTCCA

QA 4 641 4 641
DS 



AS 2 9

CO CL189Contig1 1073 7 10 U
GAGAAAACCAATTAAGAATTTAGGACAAGTATTCGTTGAATTCATCAATCTCTAGATGAT
GTTAAAGACTCTTGCTTAGGAGAACAATTCAATCACAGAGTAGAGAGAGAGAGAGAGAAA
TAAAAACTCCGAGAGAACCAACGAGAAGGGTAGTTTACAAACGACAACGCTTTGAGTTGA
GAAGACCAGAACAAGTCCTCTTCTGTGTGACTAGTCGACAAATGTGGAGATGAGTTAGCA
AAAAAAAAGATGGTCTTCAAAAAGACTATGAAGTGGGGACTCCATAGTTGTTTGAAGAAG
TCGACGTCTCGTGAGCACCTGACTGAGCATTGTTCTTCCTCCTGTTTCTTCTCCCGCCAT
TGTTCTTCCCCTTCTTGAAATCCTGCTGATGTTCCACCCCTAAAGAGAAGGTGTGAGCTC
TGGGATCAAACGCGAAAGGATCATTCGTCCCCATCGAGTTTGTCACAAACGGTGACTGCT
GAACATTGGTGTCAAAAGCAAAGCTACAAGAGGAAGTGAAAGTTGAAGAAGATGAAGACG
AGGAGAATGCTGAAGCGTCTCCTTGAAACATCTCATTAAACAGATCTTGTAACTGTTCGA
AACTGTCCCCTGAGTTATTCTCACTAGGCTTTGACTGGTTCATCATGGTAGCCATCTCGT
TCAAAAAATCTCCCATTCCGTTTTGGTAATGATCATCATCATCACTATTGTAAGCTCCAA
CGTCGTAGAGGAACCTCTTGTTGGAGTCAGACAAAACAGAATAAGCCTCTTGGATAGCCT
GAAACTTCTTCTTTGATTCATCTACAAACTCCGAATCCCCCATTGATGAACAACGATCTG
GATGCCATCTAAGAGCAAGCTTCTTGTAAGCAGAACGAAGCTCCGTGGTGGTGCATTCCT
TCTTCAAACCCAGAACACCATACAAATCATCGTTGCCTTTCGACGCCATTACTCGAGGCA
ATGATCTTCTGGATGATTAGGGATTGATAGGAGATCGTAGACGATCAAAGAAGAAGTTTG
GAGACGAGAGGGGAGAAAAATGTTTTTTTTTTTTTTTGGTGTCTCCTCTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 0 0 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F179JQ U 110
AF RS1FZ33JQ U 1
AF RS1GG70JQ U 34
AF RS1ED18JQ U 109
AF RS1ED18TF C 377
AF RS1GG70TF C 457
AF RS1F179TF C 523
BS 1 38 RS1FZ33JQ
BS 39 39 RS1GG70JQ
BS 40 58 RS1FZ33JQ
BS 59 59 RS1GG70JQ
BS 60 115 RS1FZ33JQ
BS 116 117 RS1GG70JQ
BS 118 518 RS1FZ33JQ
BS 519 633 RS1GG70JQ
BS 634 898 RS1ED18JQ
BS 899 1073 RS1ED18TF

RD RS1F179JQ 336 0 0
G
GAGAG**AAATAAAAACTCCGAGAGAACCAACGAGAAGGGTAGTTTACAAACGACAACGC
TTTGAGTTGAGAAGACCAGAACAAGTCCTCTTCTGTGTGACTAGTCGACAAATGTGGAGA
TGAGTTAGCAAAAAAAAAGATGGTCTTCAAAAAGACTATGAAGTGGGGACTCCATAGTTG
TTTGAAGAAGTCGACGTCTCGTGAGCACCTGACTGAGCATTGTTCTTCCTCCTGTTTCTT
CTCCCGCCATTGTTCTTCCCCTTCTTGAAATCCTGATGATGTTCTACCCCTAAAGAGAAG
GTGTGAGCTCTGGGATCAAACGCCAAAGGATCATT

QA 2 336 2 336
DS 

RD RS1FZ33JQ 518 0 0
GAGAAAACCAATTAAGAATTTAGGACAAGTATTCGTTGGATTCATCAATCTCTAGATGCT
GTTAAAGACTCTTGCTTAGGAGAACAATTCAATCACAGAGTAGAGAGAGAGAGAG**AAA
TAAAAACTCCGAGAGAACCAACGAGAAGGGTAGTTTACAAACGACAACGCTTTGAGTTGA
GAAGACCAGAACAAGTCCTCTTCTGTGTGACTAGTCGACAAATGTGGAGATGAGTTAGCA
AAAAAAAAGATGGTCTTCAAAAAGACTATGAAGTGGGGACTCCATAGTTGTTTGAAGAAG
TCGACGTCTCGTGAGCACCTGACTGAGCATTGTTCTTCCTCCTGTTTCTTCTCCCGCCAT
TGTTCTTCCCCTTCTTGAAATCCTGCTGATGTTCCACCCCTAAAGAGAAGGTGTGAGCTC
TGGGATCAAACGCGAAAGGATCATTCGTCCCCATCGAGTTTGTCACAAACGGTGACTGCT
GAACATTGGTGTCAAAAGCAAAGCTACAAGAGGAAGTG

QA 1 518 1 518
DS 

RD RS1GG70JQ 600 0 0
CGTTGAATTCATCAATCTCTAGATGATGTTAAAGACTCTTGCTTAGGAGAACAATTCAAT
CACAGAGTAGAGAGAGAGAGAGAGAAATAAAAACTCCGAGAGAACCAACGAGAAGGGTAG
TTTACAAACGACAACGCTTTGAGTTGAGAAGACCAGAACAAGTCCTCTTCTGTGTGGCTA
GTCGACAAATGTGGAGATGAGTTAGCAAAAAAAAAGATGGTCTTCAAAAAGACTATGAAG
TGGGGACTCCATAGTTGTTTGAAGAAGTCGACGTCTCGTGAGCACCTGACTGAGCATTGT
TCTTCCTCCTGTTTCTTCTTCCGCCATTGTTCTTCCCCTTCTTGAAATCCTGCTGATGTT
CCACCCCTAAAGAGAAGGTGTGAGCTCTGGGATCAAACGCGAAAGGATCATTCGTCCCCA
TCGAGTTTGTCACAAACGGTGACTGCTGAACATTGGTGTCAAAAGCAAAGCTACAAGAGG
AAGTGAAAGTTGAAGAAGATGAAGACGAGGAGAATGCTGAAGCGTCTCCTTGAAACATCT
CATTAAACAGATCTTGTAACTGTTCGAAACTGTCCCCTGAGTTATTCTCACTAGGCTTTG

QA 1 600 1 600
DS 

RD RS1ED18JQ 792 0 0
GG
GAGAGAGAAATAAAAACTCCGAGAGAACCAACGAGAAGGGTAGTTTACAAACGACAACGC
TTTGAGTTGAGAAGACCAGAACAAATCCTCTTCTGTGTGACTAGTCGACAAATGTGGAGA
TGAGTTAGCAAAAAAAAAGATGGTCTTCAAAAAGACTATGAAGTGGGGACTCCATAGTTG
TTTGAAGAAGTCGACGTCTCGTGAGCACCTGACTGAGTATTGTTCTTCCTCCTGTTTCTT
CTCCCGCCATTGTTCTTCCCCTTCTTGAAATCCTGCTGATGTTCCACCCCTAAAGAGAAG
GTGTGAGCTCTGGGATCAAACGCGAAAGGATCATTCGTCCCCATCGAGTTTGTCACAAAC
GGTGACTGCTGAACATTGGTGTCAAAAGCAAAGCTACAAGAGGAAGTGAAAGTTGAAGAA
GATGAAGACGAGGAGAATGCCGAAGCGTCTCCTTGAAACATCTCATTAAACAGATCTTGT
AACTGTTCGAAACTGTCCCCTGAGTTATTCTCACTAGGCTTTGACTGGTTCATCATGGTA
GCCATCTCGTTCAAAAAATCTCCCATTCCGTTTTGGTAATGATCATCATCATCACTATTG
TAAGCTCCAACGTCGTAGAGGAACCTCTTGTTGGAGTCAGACAAAACAGAATAAGCCTCT
TGGATAGCCTGAAACTTCTTCTTTGATTCATCTACAAACTCCGAATCCCCCATTGATGAA
CAACGATCTGGATGCCATCTAAGAGCAAGCTTCTTGTAAGCAGAACGAAGCTCCGTGGTG
GTGCATTC
TT

QA 3 790 3 790
DS 

RD RS1ED18TF 697 0 0
TGAAAT
CTGCTGATGTTCCACCC*TAAAGAGAAGGTGTGAGCTCTGGGATCAAACGCGAAAGGATC
ATTCGTCCCCATCGAGTTTGTCACAAACGGTGACTGCTGAACATTGGTGTCAAAAGCAAA
GCTACAAGAGGAAGTGAAAGTTGAAGAAGATGAAGACGAGGAGAATGCCGAAGCGTCTCC
TTGAAACATCTCATTAAACAGATCTTGTAACTGTTCGAAACTGTCCCCTGAGTTATTCTC
ACTAGGCTTTGACTGGTTCATCATGGTAGCCATCTCGTTCAAAAAATCTCCCATTCCGTT
TTGGTAATGATCATCATCATCACTATTGTAAGCTCCAACGTCGTAGAGGAACCTCTTGTT
GGAGTCAGACAAAACAGAATAAGCCTCTTGGATAGCCTGAAACTTCTTCTTTGATTCATC
TACAAACTCCGAATCCCCCATTGATGAACAACGATCTGGATGCCATCTAAGAGCAAGCTT
CTTGTAAGCAGAACGAAGCTCCGTGGTGGTGCATTCCTTCTTCAAACCCAGAACACCATA
CAAATCATCGTTGCCTTTCGACGCCATTACTCGAGGCAATGATCTTCTGGATGATTAGGG
ATTGATAGGAGATCGTAGACGATCAAAGAAGAAGTTTGGAGACGAGAGGGGAGAAAAATG
TTTTTTTTTTTTTTTGGTGTCTCCTCTTCCC

QA 7 697 7 697
DS 

RD RS1GG70TF 605 0 0
AGTTTGTCACAAACGGTGACTGCTGAACATTGGTGTCAAAAGCAAAGCTACAAGAGGAAG
TGAAAGTTGAAGAAGATGAAGACGAGGAGAATGCTGAAGCGTCTCCTTGAAACATCTCAT
TAAACAGATCTTGTAACTGTTCGAAACTGTCCCCTGAGTTATTCTCACTAGGCTTTGACT
GGTTCATCATGGTAGCCATCTCGTTCAAAAAATCTCCCATTCCGTTTTGGTCATGATCAT
CATCATCACTATTGTAAGCTCCAACGTCGTAGAGGAACCTCTTGTTGGAGTCAGACAAAA
CAGAATAAGCCTCTTGGATAGCCTGAAACTTCTTCTTTGATTCATCTACAAACTCCGAAT
CCCCCATTGATGAACAACGATCTGGATGCCATCTAAGAGCAAGCTTCTTGTAAGCAGAAC
GAAGCTCCGTGGTGGTGCATTCCTTCTTCAAACCCAGAACACCATACAAATCATCGTTGC
CTTTCGACGCCATTACTCGAGGCAATGATCTTCTGGATGATTAGGGATTGATAGGAGATC
GTAGACGATCAAAGAAGAAGTTTGGAGACGAGAGGGGAGAAAAATGTTTTTTTTTTT
TTTTTTGG

QA 1 597 1 597
DS 

RD RS1F179TF 518 0 0
TTGAAGAAGATGAAGACGAGGAGAATGCTGAAGCGTCTCCTTGAAACATCTCATTAAACA
GATCTTGTAACTGTTCGAAACTGTCCCCTGAGTTATTCTCACTAGGCTTTGACTGGTTCA
TCATGGTAGCCATCTCGTTCAAAAAATCTCCCATTCCGTTTTGGTCATGATCATCATCAT
CACTATTGTAAGCTCCAACGTCGTAGAGGAACCTCTTGTTGGAGTCAGACAAAACAGAAT
AAGCCTCTTGGATAGCCTGAAACTTCTTCTTTGATTCATCTACAAACTCCGAATCCCCCA
TTGATGAACAACGGTCTGGATGCCATCTAAGAGCAAGCTTCTTGTAAGCAGAACGAAGCT
CCGTGGTGGTGCATTCCTTCTTCAAACCCAGAACACCATACAAATCATCGTTGCCTTTCG
ACGCCATTACTCGAGGCAATGATCTTCTGGATGATTAGGGATTGATAGGAGATCGTAGAC
GATCAAAGAAGAAGTTTGGAGACGAGAGGGGAGAA
AAA

QA 1 515 1 515
DS 



CO CL189Contig2 625 2 7 U
GGAGTTCCATTCTCTCTAAAACGTGTATGTTTGAGAGATACAGAGGAGAGAAGAGGAGAC
ACCAAAAAAAAAAAAAACATTTTTCTCCCCTCTCGTCTCCAAACTTCTTCTTTGATCGTC
TACGATCTCCTATCAATCCCTAATCATCCAGAAGATCATTGCCTCGAGTCCGTTGAATCC
ACTATAGTACCAAAGTTCTTATAGATATTGAACTGTGGCTCTGTTTTTTTTGGTAGTTGA
ATTCATCGAAAGAATATATATATTTTTTTTTTGTCTTCTTGTAAGGTAATGGCGTCGAAA
GGCAACGATGATTTGTATGGTGTTCTGGGTTTGAAGAAGGAATGCACCACCACGGAGCTT
CGTTCTGCTTACAAGAAGCTTGCTCTTAGATGGCATCCAGATCGTTGTTCATCAATGGGG
GATTCGGAGTTTGTAGATGAATCAAAGAAGAAGTTTCAGGCTATCCAAGAGGCTTATTCT
GTTTTGTCTGACTCCAACAAGAGGTTCCTCTACGACGTTGGAGCTTACAATAGTGATGAT
GATGATCATGACCAAAACGGAATGGGAGATTTTTTGAACGAGATGGCTACCATGATGAAC
CAGTCAAAGCCTAGTGAGAATAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1G363TF U 1
AF RS1FZ33TF U 16
BS 1 76 RS1G363TF
BS 77 77 RS1FZ33TF
BS 78 129 RS1G363TF
BS 130 130 RS1FZ33TF
BS 131 271 RS1G363TF
BS 272 272 RS1FZ33TF
BS 273 625 RS1G363TF

RD RS1G363TF 625 0 0
GGAGTTCCATTCTCTCTAAAACGTGTATGTTTGAGAGATACAGAGGAGAGAAGAGGAGAC
ACCAAAAAAAAAAAAA*CATTTTTCTCCCCTCTCGTCTCCAAACTTCTTCTTTGATCGTC
TACGATCTCTTATCAATCCCTAATCATCCAGAAGATCATTGCCTCGAGTCCGTTGAATCC
ACTATAGTACCAAAGTTCTTATAGATATTGAACTGTGGCTCTGTTTTTTTTGGTAGTTGA
ATTCATCGAAAGAATATATATATTTTTTTTT*GTCTTCTTGTAAGGTAATGGCGTCGAAA
GGCAACGATGATTTGTATGGTGTTCTGGGTTTGAAGAAGGAATGCACCACCACGGAGCTT
CGTTCTGCTTACAAGAAGCTTGCTCTTAGATGGCATCCAGATCGTTGTTCATCAATGGGG
GATTCGGAGTTTGTAGATGAATCAAAGAAGAAGTTTCAGGCTATCCAAGAGGCTTATTCT
GTTTTGTCTGACTCCAACAAGAGGTTCCTCTACGACGTTGGAGCTTACAATAGTGATGAT
GATGATCATGACCAAAACGGAATGGGAGATTTTTTGAACGAGATGGCTACCATGATGAAC
CAGTCAAAGCCTAGTGAGAATAACT

QA 1 625 1 625
DS 

RD RS1FZ33TF 609 0 0
GG
AAAACGTGTATGTTTGAGAGATACAGAGGAGAGAAGAGGAGACACCAAAAAAAAAAAAAA
CATTTTTCTCCCCTCTCGTCTCCAAACTTCTTCTTTGATCGTCTACGATCTCCTATCAAT
CCCTAATCATCCAGAAGATCATTGCCTCGAGTCCGTTGAATCCACTATAGTACCAAAGTT
CTTATAGATATTGAACTGTGGCTCTGTTTTTTTTGGTAGTTGAATTCATCGAAAGAATAT
ATATATTTTTTTTTTGTCTTCTTGTAAGGTAATGGCGTCGAAAGGCAACGATGATTTGTA
TGGTGTTCTGGGTTTGAAGAAGGAATGCACCACCACGGAGCTTCGTTCTGCTTACAAGAA
GCTTGCTCTTAGATGGCATCCAGATCGTTGTTCATCAATGGGGGATTCGGAGTTTGTAGA
TGAATCAAAGAAGAAGTTTCAGGCTATCCAAGAGGCTTATTCTGTTTTGTCTGACTCCAA
CAAGAGGTTCCTCTACGACGTTGGAGCTTACAATAGTGATGATGATGATCATGACCAAAA
CGGAATGGGAGATTTTTTGAACGAGATGGCTACCATGATGAACCAGTCAAAGCCTAGTGA
GAATAAC

QA 3 609 3 609
DS 



AS 1 12

CO CL190Contig1 609 12 9 U
TTTTTGGGAGGAGGCAGAGCAATGTACGCGAGGAGGAAGTCATGTGCAAAATTTGGGGGG
AGACGACCACATCCCGGTACTTTTCGGCGTAAAAAGCATACGGGGCTGTCTGATCTTTTG
CCCGCCGGCCGAGAACTCCGATTTAACAGATGTTTGAGGATGAAAAAGTCATCACTTGCT
GCTACAAATTCGACCATACCCTGTCTGCATGGTCCTCCTTTAGTGATGAAGAAAATGTCA
TCACTTACTACTACTTCCACCATGCCCTGTCTTGATGCTCCTTTGAAAATATCATCACCT
CACGATGTTACTACCACCACCACCATACCTCAGTCGCCATCAAGCGTAGCTGAGCTCAGC
TCCGATCAAGTTTAGAGATGTGATTCCTCCATAAGCGGCATCTTGATGATCAACAGCATA
GCCTAATCCACCACCTAAGTTCTTATAACTATATTATATTTCAATATATTTTGTAACTTC
AAAAAAAGACCTGTGTT*GCTTTATCACGACTTATTGAAAAATAAAGAACTTTTCCTATG
TGATATTGATAAATCTTTTGTAATGATTAAGTCGTTTTCTTGTATTATTTTATACAATGT
GTTGGCTAT


BQ
55 55 55 55 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 30 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 50 50 50 50 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BY11TF U 1
AF RS1BY11JQ C 1
AF RS1BZ20TF U 1
AF RS1BZ20JQ C 1
AF RS1EF68JQ C 1
AF RS1EF68TF U 1
AF RS1FM85JQ C 1
AF RS1FM85TF U 1
AF RS1AF67JQ C 6
AF RS1AF67TF U 6
AF RS1AA39TF U 6
AF RS1GK18TF U 1
BS 1 119 RS1BY11TF
BS 120 120 RS1BZ20TF
BS 121 263 RS1BY11TF
BS 264 264 RS1BZ20TF
BS 265 274 RS1BY11TF
BS 275 544 RS1BZ20TF
BS 545 563 RS1EF68TF
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BS 584 609 RS1GK18TF

RD RS1BY11TF 274 0 0
TTTTTGGGAGGAGGCAGAGCAATGTACGCGAGGAGGAAGTCATGTGCAAAATTTGGGGGG
AGACGACCACATCCCGGTACTTTTCGGCGTAAAAAGCATACGGGGCTGTCTGATCTTTTA
CCCGCCGGCCGAGAACTCCGATTTAACAGATGTTTGAGGATGAAAAAGTCATCACTTGCT
GCTACAAATTCGACCATACCCTGTCTGCATGGTCCTCCTTTAGTGATGAAGAAAATGTCA
TCACTTACTACTACTTCCACCATACCCTGTCTTG

QA 1 274 1 274
DS 

RD RS1BY11JQ 583 0 0
TTTTTGGGAGGAGGCAGAGCAATGTACGCGAGGAGGAAGTCATGTGCAAAATTTGGGGGG
AGACGACCACATCCCGGTACTTTTCGGCGTAAAAAGCATACGGGGCTGTCTGATCTTTTA
CCCGCCGGCCGAGAACTCCGATTTAACAGATGTTTGAGGATGAAAAAGTCATCACTTGCT
GCTACAAATTCGACCATACCCTGTCTGCATGGTCCTCCTTTAGTGATGAAGAAAATGTCA
TCACTTACTACTACTTCCACCATACCCTGTCTTGATGCTCCTTTGAAAATATCATCACCT
CACGATGTTACTACCACCACCACCATACCTCAGTCGCCATCA*****AGCTGAGCTCAGC
TCCGATCAAGTTTAGAGATGTGATTCCTCCATAAGCGGCATCTTGATGATCAACAGCATA
GCCTAATCCACCACCTAAGTTCTTATAACTATATTATATTTCAATATATTTTGTAACTTC
AAAAAAAGACCTGTGTT*GCTTTATCACGACTTATTGAAAAATAAAGAACTTTTCCTATG
TGATATTGATAAATCTTTTGTAATGATTAAGTCGTTTTCTTG
C

QA 1 582 1 582
DS 

RD RS1BZ20TF 544 0 0
TTTTTGGGAGGAGGCAGAGCAATGTACGCGAGGAGGAAGTCATGTGCAAAATTTGGGGGG
AGACGACCACATCCCGGTACTTTTCGGCGTAAAAAGCATACGGGGCTGTCTGATCTTTTG
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GCTACAAATTCGACCATACCCTGTCTGCATGGTCCTCCTTTAGTGATGAAGAAAATGTCA
TCACTTACTACTACTTCCACCATGCCCTGTCTTGATGCTCCTTTGAAAATATCATCACCT
CACGATGTTACTACCACCACCACCATACCTCAGTCGCCATCAAGCGTAGCTGAGCTCAGC
TCCGATCAAGTTTAGAGATGTGATTCCTCCATAAGCGGCATCTTGATGATCAACAGCATA
GCCTAATCCACCACCTAAGTTCTTATAACTATATTATATTTCAATATATTTTGTAACTTC
AAAAAAAGACCTGTGTT*GCTTTATCACGACTTATTGAAAAATAAAGAACTTTTCCTATG
TGAT

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TCACTTACTACTACTTCCACCATGCCCTGTCTTGATGCTCCTTTGAAAATATCATCACCT
CACGATGTTACTACCACCACCACCATACCTCAGTCGCCATCAAGCGTAGCTGAGCTCAGC
TCCGATCAAGTTTAGAGATGTGATTCCTCCATAAGCGGCATCTTGATGATCAACAGCATA
GCCTAATCCACCACCTAAGTTCTTATAACTATATTATATTTCAATATATTTTGTAACTTC
AAAAAAAGACCTGTGTT*GCTTTATCACGACTTATTGAAAAATAAAGAACTTTTCCTATG
TGAT

QA 1 544 1 544
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AAAAAAAGACCTGTGTT*GCTTTATCACGACTTATTGAAAAATAAAGAACTTTTCCTATG
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CG

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GCTACAAATTCGACCATACCCTGTCTGCATGGTCCTCCTTTAGTGATGAAGAAAATGTCA
TCACTTACTACTACTTCCACCATGCCCTGTCTTGATGCTCCTTTGAAAATATCATCACCT
CACGATGTTACTACCACCACCACCATACCCCAGTCGCCATCAAGCGTAGCTGAGCTCAGC
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GCCTA*TCCACCACCTAAGTTCTTATAACTATATTATATTTCAATATATTTTGTAACTTC
AAAAAAAGACCTGTGTT*GCTTTATCACGACTTATTGAAAAATAAAGAACTTTTCCTATG
TGATATTGATAAATCTTTTGTAA
CG

QA 1 563 1 563
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TCACTTACTACTACTTCCACCATGCCCTGTCTTGATGCTCCTTTGAAAATATCATCACCT
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AAAAAAAGACCTGTGTT*GCTTTATCACGACTTATTGAAAAATAAAGAACTTTTCCTATG
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QA 1 583 1 583
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AAAACCTGTGTTTGCTTTATCACGACTTATTGAAAAATAAAGAACTTTTCCTATGTG

QA 1 537 1 537
DS 

RD RS1AF67TF 537 0 0
GGGAGGAGGCAGAGCAATGTACCCGAGGAGGAAGTCATGTGAAAAATTTGGGGGGAGACG
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CGGCCGAGAACTCCGATTTAACAGATGTTTGAGGATGAAAAAGTCATCACTTGCTGCTAC
AAATTCGACCATACCCTGTCTGCATGGTCCTCCTTTGGTGATGAAGAAAATGTCATCACT
TACTACTACTTCCACCATGCCCTGTCTTGATGCTCCTTTGAAAATATCATCACCTCACGA
TGTTACTGCCACCACCACCATACCTCAGTCGCCATCAAGCGTA*CTGAGCTCAGCTCCGA
TCAAGTTTAGAGATGTGATTCCTCCATAAGCGGCATCTTGATGATCAACAGCATAGCCTA
ATCCACCACCTAAGTTCTTATAACTATATTATATTTCAATATATTTTGTAACTTCAAAAA
AAAACCTGTGTTTGCTTTATCACGACTTATTGAAAAATAAAGAACTTTTCCTATGTG

QA 1 537 1 537
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CGGCCGAGAACTCCGATTTAACAGATGTTTGAGGATGAAAAAGTCATCACTTGCTGCTAC
AAATTCGACCATACCCTGTCTGCATGGTCCTCCTTTGGTGATGAAGAAAATGTCATCACT
TACTACTACTTCCACCATGCCCTGTCTTGAT*CTCCTTTGAAAATATCATCACCTCACGA
TGTTACTGCCACCACCACCATACCTCAGTCGCCATCAAGCGTAGCTGAGCTCAGCTCCGA
TCAAGTTTAGAGATGTGATTCCTCCATAAGCGGCATCTTGATGATCAACAGCATAGCCTA
ATCCACCACCTAAGTTCTTATAACTATATTATATTTCAATATATTTTGTAACTTCAAAAA
AAAACCTGTGTT*GCTTTATCACGACTTATTGAAAAATAAAGAACTTTTCCTATGTGATA
TTGATAAATCTTTTGTAATGATTAAGTCGTTTTCTTGT

QA 1 578 1 578
DS 

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AAAAAAAGACCTGTGTT*GCTTTATCACGACTTATTGAAAAATAAAGAACTTTTCCTATG
TGATATTGATAAATCTTTTGTAATGATTAAGTCGTTTTCTTGTATTATTTTATACAATGT
GTTGGCTAT

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 12

CO CL191Contig1 876 12 20 U
GCTTTGTAAAAATGTTGCTCGACCGCATGTGAAAACTCAAATATATAGAACATAACAGTG
GGTTTTGCGGAAAGAGATCCGATTACGTGGGGAAGTTCACACATTACAACAAATGGTTCG
AGCCACGAAACATACTTGAAAAGAAAGTCTTGAAAGTTTGAAACAAAAGCACTACAACAT
AATAAAGAAAGAAAAATTACATCCCTAATGTCACTTGTGCCTCAGCAAAACCTCACGTGC
TTAGCTACCGTCTATGCCAAAGCCATCCTAGGCAAGGTCGAGACGAAGGAGACGGTAATC
AAAGCGATGGCTAGAGCCACAACGAGGTGACCATCTTTTATGGAAGCTGATCCTCCTTTC
TCCGCAGACGTCGCTGGAGTTGCCGGAGACTTCCCTGCCGGCGCCTCCGGTGTCATTGTT
GTGGCATTGCTTGTGAATACGGCTGCGTCTGGCGAGCTCGGCGAAATCCCGAGAAGCTTT
GGACAATTGGAGATGCTAGCGTTTTGGAGCTGACAAGCAGTTGGAAGTTGAATAAGCTTG
GCTTCTTGAACACCAAGATCCTTCATAGCTTGTCCTCCTGTCTTCGCTTGTTGTACCAAG
AAACACAAACACTTTGGATCCTTCTCTTTTATATCTTCGATAGCGTCACAACACTTCTCA
GACGGTTTTGGTGCTTTCCCGGTCGCGAAATCCAAACACAAACTTACCTTTGGAATAACT
TGGCTACATTTCTCAGCCAATGCTCCTCCGCCCGCCGGAGCGGCTGGTGTTTCCGCGGAG
ATGGATGCAGCGACCGTCATGGTGACTAGGAAGAGGTGGAAATGAAGACCCTTCATTATC
AGATTCTTTCTCTAGCTTTTTCTTGCTCTGTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 25 45 45 45 10 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 
45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 50 50 50 50 50 50 50 5 25 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
35 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 0 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 30 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 20 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 
60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 
60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FR43JQ U 29
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AF RS1H139JQB U 1
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AF RS1EU76TF C 272
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RD RS1FR43JQ 337 0 0
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CTTGAAAGTTTGAAACAAAAGAACTACAACATAATAAAGAAAGAAAAATTACATCCCTAA
TGTCACTTGTGCCTCAGCAAAACCTCACGTGCTTAGCTACCGTCTATGCCAAAGCCATCC
TAGGCAAGGTCGAGACGAAGGAGACGGTAATCAAAGCGATGGCTAGAGCCACAACGAGGT
GACCATCTTTTATGGAAGCTGATCCTCCTTTCTCCGC

QA 1 337 1 337
DS 

RD RS1F159JQ 592 0 0
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AAAGAAAAATTACATCCCTAATGTCACTTGTGCCTCAGCAAAACCTCACGTGCTTAGCTA
CCGTCTATGCCAAAGCCATCCTAGGCAAGGTCGAGACGAAGGAGACGGTAATCAAAGCAA
TGGCTAGAGCCACAACGCGGTGACCATCTTTTATGGAAGCTGATCCTCCTTTCTCCGCAA
ACGTCGCTGGAGTTGCCGGAAACTTCCCTGCCGGCGCCTCCGGTGTCATTGTTGTGGCAT
TGCTTGTGAATACGGCTGCGTCTGGCGAGCTTGGCGAAATCCCGAGAAGCTTTGGACAAT
TGGAGATGCTAGCGTTTTGGAGCTGACAAGCAGTTGGAAGTTGAATAAGCTTGGCTTCTT
GAACACCAAGATCCTTCATAGCTTGTCCTCCTGTCTTCGCTTGTTGTACCAAGAAACACA
AACACTTTGGATCCTTCTCTTTTATATCTTCGATAGCGTCACAACACTTCTC

QA 1 592 1 592
DS 

RD RS1H139JQB 753 0 0
GCTTTGTAAAAATGTTGCTCGACCGCATGTGAAAACTCAAATATATAGAACATAACAGTG
GGTTTTGCGGAAAGAGATCCGATTACGTGGGGAAGTTCACACATTACAACAAATGGTTCG
AGCCACGAAACATACTTGAAAAGAAAGTCTTGAAAGTTTGAAACAAAAGCACTACAACAT
AATAAAGAAAGAAAAATTACATCCCTAATGTCACTTGTGCCTCAGCAAAACCTCACGTGC
TTAGCTACCGTCTATGCCAAAGCCATCCTAGGCAAGGACGAGACGAAGGAGACGGTAATC
AAAGCGATGGCTAGAGCCACAACGAGGTGACCATCTTTTATGGAAGCTGATCCTCCTTTC
TCCGCAGACGTCGCTGGAGTTGCCGGAAACTTCCCTGCCGGCGCCTCCGGTGTCATTGTT
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GGACAATTGGAGATGCTAGCGTTTTGGAGCTGACAAGCAGTTGGAAGTTGAATAAGCTTG
GCTTCTTGAACACCAAGATCCTTCATAGCTTGTCCTCCTGTCTTCGCTTGTTGTACCAAG
AAACACAAACACTTTGGATCCTTCTCTTTTATATCTTCGATAGCGTCACAACACTTCTCA
GACGGTTTTGGTGCTTTCCCGGTCGAGAAATCCAAACACAAACTTACCTTTGGAA*AACT
TGGCTACATTTCTCAGCCAATGCTCCTCTGCCC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1CG94JQ 710 0 0
GCGGAAAGAGATCCGATTACGTGGGGAAGTTCACACATTACAACAAATGGTTCGAGCCAC
GAAACATACTTGAAAAGAAAGTCTTGAAAGTTTGAAACAAAAGCACTACAACATAATAAA
GAAAGAAAAATTACATCCCTAATGTCACTTGTGCCTCAGCAAAACCTCACGTGCTTAGCT
ACCGTCTATGCCAAAGCCATCCTAGGCAAGGTCGAGACGAAGGAGACGGTAATCAAAGCG
ATGGCTAGAGCCACAACGAGGTGACCATCTTTTATGGAAGCTGATCCTCCTTTCTCCGCA
GACGTCGCTGGAGTTGCCGGAGACTTCCCTGCCGGCGCCTCCGGTGTCATTGTTGTGGCA
TTGCTTGTGAATACGGCTGCGTCTGGCGAGCTCGGCGAAATCCCGAGAAGCTTTGGACAA
TTGGAGATGCTAGCGTTTTGGAGCTGACAAGCAGTTGGAAGTTGAATAAGCTTGGCTTCT
TGAACACCAAGATCCTTCATAGCTTGTCCTCCTGTCTTCGCTTGTTGTACCAAGAAACAC
AAACACTTTGGATCCTTCTCTTTTATATCTTCGATAGCGTCACAACACTTCTCAGACGGT
TTTGGTGCTTTCCCGGTCGCGAAATCCAAACACAAACTTACCTTTGGAATAACTTGGCTA
CATTTCTCAGCCAATGCTCCTCTGCCCGCCGGAGCGGCTGGTGTTTCCGC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1B004JQ 739 0 0
GCGGAAAGAGATCCGATTACGTGGGAAAGTTCACTCATTACAACAAATGGTTCGAACCAC
GAAACATACTTGAAAAGAAAGTCTTGAAAGTTTGAAACAAAAACACCACAACATAATAAA
GAAAGAAAAATTACATCCCTAACGTCACTTGTGCCTCAGCAAAACCTCACGTGCCTAGCT
ACCGTCTATGCCAAAGCCATCCTAAGCAAGGTCGAGACGAAGGAGACGGTAATCAAAGCG
ATGGCTAGAGCCACAACGCGGTGACCATCTTTTATGGAAGCTGATCCTCCTTTCTCCGCA
GACGTCGCTGGAGTTGCCGGAGACTTCCCTGCCGGCGCCTCCGGTGTCATTGTTGTGGCA
TTGCTTGTGAATACGGCTGCGTCTGGCGAGCTCGGCGAAATCCCGAGAAGCTTTGGACAA
TTGGAGATGCTAGCGTTTTGGAGCTGACAAGCAGTTGGAAGTTGAATAAGCTTGGCTTCT
TGAACACCAAGATCCTTCATAGCTTGTCCTCCTGTCTTCGCTTGTTGTACCAAGAAACAC
AAACACTTTGGATCCTTCTCTTTTATATCTTCGATAGCGTCACAACACTTCTCAGACGGT
TTTGGTGCTTTCCCGGTCGCGAAATCCAAACACAAACTTACCTTTGGAATAACTTGGCTA
CATTTCTCAGCCAATGCTCCTCCGCCCGCCGGAGCGGC***TGTTTCCGCGGAGATGGAT
GCAGCGACCGTCATGGTGA

QA 1 739 1 739
DS 

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AAACATACTTGAAAAGAAAGTCTTGAAAGTTTGAAACAAAAACACCACAACATAATAAAG
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TGGCTAGAGCCACAACGCGGTGACCATCTTTTATGGAAGCTGATCCTCCTTTCTCCGCAA
ACGTCGCTGGAGTTGCCGGAAACTTCCCTGCCGGCGCCTCCGGTGTCATTGTTGTGGCAT
TGCTTGTGAATACGGCTGCGTCTGGCGAGCTCGGCGAAATCCCGAGAAGCTTTGGACAAT
TGGAGATGCTAGCGTTTTGGAGCTGACAAGCAGTTGGAAGTTGAATAAGCTTGGCTTCTT
GAACACCAAGATCCTTCATAGCTTGTCCTCCTGTCTTCGCTTGTTGTACCAAGAAACACA
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TTGGTGCTTTCCCGGTCGCGAAATCCAAACACAAACTTACCTTTGGAATAACTTGGCTAC
ATTTCTCAGCCAATGCTCCTCCGCCCGCCGGAGCGGCTGGTGTTTCCGCGGAGATGGATG
CAGCGACCGTCATGGTGACTAGGAAGAGGTGGAGATGAAGACCCTTCATTATCAGATTCT
TTCTCTAGCTTTTTCTTGCTCT
CC

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DS 

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GCAAGGTCGAGACGAAGGAGACGGTAATCAAAGCGATGGCTAGAGCCACAACGCGGTGAC
CATCTTTTATGGAAGCTGATCCTCCTTTCTCCGCAGACGTCGCTGGAGTTGCCGGAGACT
TCCCTGCCGGCGCCTCCGGTGTCATTGTTGTGGCATTGCTTGTGAATACGGCTGCGTCTG
GCGAGCTCGGCGAAATCCCGAGAAGCTTTGGACAATTGGAGATGCTAGCGTTTTGGAGCT
GACAAGCAGTTGGAAGTTGAATAAGCTTGGCTTCTTGAACACCAAGATCCTTCATAGCTT
GTCCTCCTGTCTTCGCTTGTTGTACCAAGAAACACAAACACTTTGGATCCTTCTCTTTTA
TATCTTCGATAGCGTCACAACACTTCTCAGGCGGTTTTGGTGCTTTCCCGGTCGCGAAAT
CCAAACACAAACTTACCTTTGGAATAACTTGGCTACATTTCTCAGCCAATGCTCCTCCGC
CCGCCGGAGCGGCTGGTGTTTCCGCGGAGATGGATGCAGCGACCGTCATGGTGACTAGGA
AGAGGTGGAGATGAAGACCCTTCATTATCAGATTCTTTCTCTAGCTTTTTCTTGCTCT
CC

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DS 

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GCCAAAGCCATCCTAGGCAAGGTCGAGACGAAGGAGACGGTAATCAAAGCAATGGCTAGA
GCCACAACGCGGTGACCATCTTTTATGGAAGCTGATCCTCCTTTCTCCGCAGACGTCGCT
GGAGTTGCCGGAGACTTCCCTGCCGGCGCCTCCGGTGTCATTGTTGTGGCATTGCTTGTG
AATACGGCTGCGTCTGGCGAGCTTGGCGAAATCCCGAGAAGCTTTGGACAATTGGAGATG
CTAGCGTTTTGGAGCTGACAAGCAGTTGGAAGTTGAATAAGCTTGGCTTCTTGAACACCA
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GGATCCTTCTCTTTTATATCTTCGATAGCGTCACAACACTTCTCAGACGGTTTTGGTGCT
TTCCCGGTCGCGAAATCCAAACACAAACTTACCTTTGGAATAACTTGGTTACATTTCTCA
GCCAATGCTCCTCCGCCCGCCGGAGCGGCTGGTGTTTCCGCGGAGATGGATGCAGCGACC
GTCATGGTGACTAGGAAGAGGTGGAAATGAAGACCCTTCATTATCAGATTCTTTCTCTAG
CTTTTTCTTGCTCT
CC

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DS 

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AACCTCACGTGCCTAGCTACCGTCTATGCCAAAGCCATCCTAAGCAAGGTCGAGACGAAG
GAGACGGTAATCAAAGCGATGGCTAGAGCCACAACGCGGTGACCATCTTTTATGGAAGCT
GATCCTCCTTTCTCCGCAGACGTCGCTGGAGTTGCCGGAGACTTCCCTGCCGGCGCCTCC
GGTGTCATTGTTGTGGCATTGCTTGTGAATACGGCTGCGTCTGGCGAGCTCGGCGAAATC
CCGAGAAGCTTTGGACAATTGGAGATGCTAGCGTTTTGGAGCTGACAAGCAGTTGGAAGT
TGAATAAGCTTGGCTTCTTGAACACCAAGATCCTTCATAGCTTGTCCTCCTGTCTTCGCT
TGTTGTACCAAGAAACACAAACACTTTGGATCCTTCTCTTTTATATCTTCGATAGCGTCA
CAACACTTCTCAGACGGTTTTGGTGCTTTCCCGGTCGCGAAATCCAAACACAAACTTACC
TTTGGAATAACTTGGCTACATTTCTCAGCCAATGCTCCTCCGCCCGCCGGAGCGGC***T
GTTTCCGCGGAGATGGATGCAGCGACCGTCATGGTGACTAGGAAGAGGTGGAAATGAAGA
CCCTTCATTATCAGATTCTTTCTCTAGCTTTTTCTT
C

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DS 

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CCTAATGTCACTTGTGCCTCAGCAAAACCTCACGTGCTTAGCTACCGTCTATGCCAAAGC
CATCCTAGGCAAGGTCGAGACGAAGGAGACGGTAATCAAAGCGATGGCTAGAGCCACAAC
GAGGTGACCATCTTTTATGGAAGCTGATCCTCCTTTCTCCGCAGACGTCGCTGGAGTTGC
CGGAGACTTCCCTGCCGGCGCCTCCGGTGTCATTGTTGTGGCATTGATTGTGAATACGGC
TGCGTCTGGCGAGCTCGGCGAAATCCCGAGAAGCTTTGGACAATTGGAGATGCTAGCGTT
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CATAGCTTGTCCTCCTGTCTTCGCTTGTTGTACCAAGAAACACAAACACTTTGGATCCTT
CTCTTTTATATCTTCGATAGCGTCACAACACTTCTCAGACGGTTTTGGTGCTTTCCCGGT
CGCGAAATCCAAACACAAACTTACCTTTGGAATAACTTGGCTACATTTCTCAGCCAATGC
TCCTCTGCCCGCCGGAGCGGCTGGTGTTTCCGCGGAGATGGATGCAGCGACCGTCATGGT
GACTAGGAAGAGGTGGAAATGAAGACCCTTCATTATCAGATTCTTTCTTTAGCTTTTTCT
T
CC

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DS 

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CGCCTCCGGTGTCATTGTTGTGGCATTGCTTGTGAATACGGCTGCGTCTGGCGAGCTCGG
CGAAATCCCGAGAAGCTTTGGACAATTGGAGATGCTAGCGTTTTGGAGCTGACAAGCAGT
TGGAAGTTGAATAAGCTTGGCTTCTTGAACACCAAGATCCTTCATAGCTTGTCCTCCTGT
CTTCGCTTGTTGTACCAAGAAACACAAACACTTTGGATCCTTCTCTTTTATATCTTCGAT
AGCGTCACAACACTTCTCAGACGGTTTTGGTGCTTTCCCGGTCGCGAAATCCAAACACAA
ACTTACCTTTGGAATAACTTGGCTACATTTCTCAGCCAATGCTCCTCTGCCCGCCGGAGC
GGCTGGTGTTTCCGCGGAGATGGATGCAGCGACCGTCATGGTGACTAGGAAGAGGTGGAA
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DS 

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AATAAGCTTGGCTTCTTGAACACCAAGATCCTTCATAGCTTGTCCTCCTGTCTTCGCTTG
TTGTACCAAGAAACACAAACACTTTGGATCCTTCTCTTTTATATCTTCGATAGCGTCACA
ACACTTCTCAGACGGTTTTGGTGCTTTCCCGGTCGAGAAATCCAAACACAAACTTACCTT
TGGAATAACTTGGCTACATTTCTCAGCCAATGCTCCTCTGCCCGCCGGAGCGGCTGGTGT
TTCCGCGGAGATGGATGCAGCGACCGTCATGGTGACTAGGAAGAGGTGGAAATGAAGACC
CTTCATTATCAGATTCTTTCTCTAGCTTTTTCTTGCTCT
GTTTTC

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 9

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GAAAAGTCTGCTCCTTTATCATATTGACCGTGGATAGTGGATGCACTGTGTCACACTCAC
ACCTAACAAAGGCTCATGGCTTCATCTGATCAAACGGCGAAGATAATCGATGGGAAGGCG
ATTGCTCAAACCATCCGATCAGAGATCGCCGAGGAAGTTCGCGATCTATCTGAGAAACAC
GGCA***AGGTCCCAGGACTAGCGGTAGTTATAGTTGGTGCACGGAAGGATTCACAGACA
TATGTGACTATGAAGAGGAAAGCGTGTGCTGAGGTTGGGATCAAATCATTTGATGTGGAC
CTACCAGAGGATGTTTCTGAAGCTGATCTTATAACCAAAGTTCATCTACTCAATTCAGAT
CCTGATGTCCATGGTATATTAGTTCAACTCCCATTGCCGAAACATATTAATGAGGAGAAT
GTTTTAAGTGCAATCAGCATTGATAAAGATGTAGATGGCTTCCATCCTCTGAATATTGGT
AAGCTTGCCATGAAAGGCAGAGAACCCCTCTTCCTTCCATGCACCCCTAAGGGATGTTTG
GAACTCTTAGTAAGAAGTGGCATAAAGATAAAAGGGCAACGAGCTGTTGTAGTAGGTCGA
AGTAACATCGTTGGATTGCCTGTTTCGCTTCTATTGCTCAAGGCTGATGCTACTGTTACC
ACTGTACATTCCCACACCAGAGATCCTGAGGCTATCATACGGGAAGCTGACATCGTTATT
GCTGCAGCCGGACAACCCTGCATGATTAAGGGGGACTGGATTAAGCCAGGGGCTGCGGTG
ATCGATGTTGGAACCAATGCAGTCAGCGACCCCAGCAGGAAATCAGGATACCGGTTGGTT
GGAGATGTGGATTACGCAGAGGCTTGTAAAGTTGCAGGGTTCATAACTCCGGTCCCTGGT
GGTGTAGGTCCAATGACCGTGGCAATGCTGCTGAGGAACACCTTAGACGGCGCCAAGCGG
GTCATCGGCCAATAAGATATCTATCCTACTGTATGTTAAAAAATGAATCTGAAGTTTATC
CATTATATAATTACGCTCTCGCTTTGATTACATTATTCCTCTCAAATAAATTGAAGCTTG
CATGTCTTTTGGAATGTCTGTTTCCCACAAATTTGTACACAACATGAGGCTTAGCATCAT
TTTAACAAAATAAAAAACATCTGTATTTTCCTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 40 40 
40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 35 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1ET76TF U 30
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AF RS1FT93TF U 28
AF RS1FT01TF U 51
AF RS1FT93JQ C 306
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AF RS1BH78TF U 415
AF RS1BH78JQ C 531
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RD RS1ET76TF 492 0 0
GG
GGATAGTGGATGCACTGTGTCACACTCACACCTAACAAAGGCTCATGGCTTCATCTGATC
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TAACCAAAGTTCATCTACTCAATTCAGATCCTGATGTCCATGGTATATTAGTTCAACTCC
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TAGATGGCTTCCATCCTCTGAATATTGGTAAGCTTGCCATGAAAGGCAGAGAACCCCTCT
TCCTTCCATG

QA 3 492 3 492
DS 

RD RS1G575TF 713 0 0
GAAAAGTCTGCTCCTTTATCATATTGACCGTGGATAGTGGATGCACTGTGTCACACTCAC
ACCTAACAAAGGCTCATGGCTTCATCTGATCAAACGGCGAAGATAATCGATGGGAAGGCG
ATTGCTCAAACCATCCGATCAGAGATCGCCGAGGAAGTTCGCGATCTATCTGAGAAACAC
GGCA***AGGTCCCAGGACTAGCGGTAGTTATAGTTGGTGCACGGAAGGATTCACAGACA
TATGTGACTATGAAGAGGAAAGCGTGTGCTGAGGTTGGGATCAAATCATTTGATGTGGAC
CTACCAGAGGATGTTTCTGAAGCTGATCTTATAACCAAAGTTCATCTACTCAATTCAGAT
CCTGATGTCCATGGTATATTAGTTCAACTCCCATTGCCGAAACATATTAATGAGGAGAAT
GTTTTAAGTGCAATCAGCATTGATAAAGATGTAGATGGCTTCCATCCTCTGAATATTGGT
AAGCTTGCCATGAAAGGCAGAGAACCCCTCTTCCTTCCATGCACCCCTAAGGGATGTTTG
GAACTCTTAGTAAGAAGTGGCATAAAGATAAAAGGGCAACGAGCTGTTGTAGTAG*TCGA
AGTAACATCGTTGGATTGCCTGTTTCGCTTCTATTGCTCAAG*CTGATGCTACTGTTACC
ACTGTACATTCCCACACCGGAGATCCTGAG*CTATCATACGG*AAGCTGACAT

QA 1 713 1 713
DS 

RD RS1FT93TF 747 0 0
GGGT
GGATAGTGGATGCACTGTGTCACACTCACACCTAACAAAGGCTCATGGCTTCATCTGATC
AAACGGCGAAGATAATCGATGGGAAGGCGATTGCTCAAACCATCCGATCAGAGATCGCCG
AGGAAGTTCGCGATCTATCTGAGAAACACGGCAAGCAGGTCCCAGGACTAGCGGTAGTTA
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AGGTTGGGATCAAATCATTTGATGTGGACCTACCAGAGGATGTTTCTGAAGCTGATCTTA
TAGCCAAAGTTCATCTACTCAATTCATATCCTGATGTCCATGGTATACTAGTTCAACTCC
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TAGATGGCTTCCATCCTCTGAATATTGGTAAGCTTGCCATGAAAGGCAGAGAACCCCTCT
TCCTTCCATGCACCCCTAAGGGATGTTTGGAACTCTTAGTAAGAAGTGGCATAAAGATAA
AAGGGCAACGAGCTGTTGTAGTAGGTCGAAGTAACATCGTTGGATTGCCTGTTTCGCTTC
TATTGCTCAAGGCTGATGCTACTGTTACCACTGTACATTCCCACACCAGAGATCCTGAGG
CTATCATACGGGAAGCTGACATCGTTATTGCTGCAGCCG*ACA*CCCTGCATGATTAA*G
GGGATTGGAT*AAGC
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QA 5 739 5 739
DS 

RD RS1FT01TF 763 0 0
GG
ACACTCACACCTAACAAAGGCTCATGGCTTCATCTGATCAAACGGCGAAGATAATCGATG
GGAAGGCGATTGCTCAAACCATCCGATCAGAGATCGCCGAGGAAGTTCGCGATCTATCTG
AGAAACACGGCA***AGGTCCCAGGACTAGCGGTAGTTATAGTTGGTGCACGGAAGGATT
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ATGTGGACCTACCAGAGGATGTTTCTGAAGCTGATCTTATAACCAAAGTTCATCTACTCA
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ATATTGGTAAGCTTGCCATGAAAGGCAGAGAACCCCTCTTCCTTCCATGCACCCCTAAGG
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TAGGTCGAAGTAACATCGTTGGATTGCCTGTTTCGCTTCTATTGCTCAAGGCTGATGCTA
CTGTTACCACTGTACATTCCCACACCAGAGATCCTGAGGCTATCATACGGGAAGCTGACA
TCGTTATTGCTGCAGCCGGACAACCCTGCATGATTAAAGGGGACTGGAT*AAGC*AGGGG
CTGCGGTGATCGATGTTGGAACCA*TGCAGTCAGCGACCC
A

QA 3 762 3 762
DS 

RD RS1FT93JQ 744 0 0
AGAGGATGTTTCTGAAGCTGATCTTATAGCCAAAGTTCATCTACTCAATTCATATCCTGA
TGTCCATGGTATACTAGTTCAACTCCCATTGCCGAAACATATTAATGAGGAGAATGTTTT
AAGTGCAATCAGCATTGATAAAGATGTAGATGGCTTCCATCCTCTGAATATTGGTAAGCT
TGCCATGAAAGGCAGAGAACCCCTCTTCCTTCCATGCACCCCTAAGGGATGTTTGGAACT
CTTAGTAAGAAGTGGCATAAAGATAAAAGGGCAACGAGCTGTTGTAGTAGGTCGAAGTAA
CATCGTTGGATTGCCTGTTTCGCTTCTATTGCTCAAGGCTGATGCTACTGTTACCACTGT
ACATTCCCACACCAGAGATCCTGAGGCTATCATACGGGAAGCTGACATCGTTATTGCTGC
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TGTTGGAACCAATGCAGTCAGCGACCCCAGCAGGAAATCAGGATACCGGTTGGTTGGAGA
TGTGGATTACGCAGAGGCTTGTAAAGTTGCAGGGTTCATAACTCCGGTCCCTGGTGGTGT
AGGTCCAATGACCGTGGCAATGCTGCTGAGGAACACCTTAGACGGCGCCAAGCGGGTCAT
CGGCCAATAAGATATCTATCCTACTGTATGTTAAAAAATGAATCTGAAGTTTATCCATTA
TATAATTACGCTCTCGCTTTGATT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1ET76JQ 753 0 0
ATGTGGA
CTACCAGAGGATGTTTCTGAAGCTGATCTTATAACCAAAGTTCATCTACTCAATTCAGAT
CCTGATGTCCATGGTATATTAGTTCAACTCCCATTGCCGAAACATATTAATGAGGAGAAT
GTTTTAAGTGCAATCAGCATTGATAAAGATGTAGATGGCTTCCATCCTCTGAATATTGGT
AAGCTTGCCATGAAAGGCAGAGAACCCCTCTTCCTTCCATGCACCCCTAAGGGATGTTTG
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AGTAACATCGTTGGATTGCCTGTTTCGCTTCTATTGCTCAAGGCTGATGCTACTGTTACC
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GCTGCAGCCGGACAACCCTGCATGATTAAGGGGGACTGGATTAAGCCAGGGGCTGCGGTG
ATCGATGTTGGAACCAATGCAGTCAGCGACCCCAGCAGGGAATCAGGATACCGGTTGGTT
GGAGATGTGGATTACGCAGAGGCTTGTAAAGTTGCAGGGTTCATAACTCCGGTCCCTGGT
GGTGTAGGTCCAATGACCGTGGCAATGCTGCTGAGGAACACCTTAGACGGCGCCAAGCGG
GTCATCGGCCAATAAGATATCTATCCTACTGTATGTTAAAAAATGAATCTGAAGTTTATC
CATTATATAATTACGCTCTCGCTTTG

QA 8 753 8 753
DS 

RD RS1D562JQ 870 0 0
GTGCTGAGTTGGATC
AATCATTTGATGTGGAC*TACCAGAGGATGTTTCTGAAGCTGATCT*ATAACCAAAGTTC
ATCTACTCAATTCAGATC*TGATGTCCATGGTATATTAGTCCAACTCCCATTGCCGAAAC
ATATTAATGAGGAGAATGTTTTAAGTGCAATCAGCATTGATAAAGATGTAGATGGCTTCC
ATCCTCTGAATATTGGTAAGCTTGCCATGAAAGGCAGAGAACCCCTCTTCCTTCCATGCA
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CTGTTGTAGTAGGTCGAAGTAACATCGTTGGATTGCCTGTTTCGCTTCTATTGCTCAAGG
CTGATGCTACTGTTACCACTGTACATTCCCACACCAGAGATCCTGAGGCTATCATACGGG
AAGCTGACATCGTTATTGCTGCAGCCGGACAACCCTGCATGATTAAGGGGGACTGGATTA
AGCCAGGGGCTGCGGTGATCGATGTTGGAACCAATGCAGTCAGCGACCCCAGCAGGAAAT
CAGGATACCGGTTGGTTGGAGATGTGGATTACGCAGAGGCTTGTAAAGTTGCAGGGTTCA
TAACTCCGGTCCCTGGTGGTGTAGGTCCAATGACCGTGGCAATGCTGCTGAGGAACACCT
TAGACGGCGCCAAGCGGGTCATCGGCCAATAAGATATCTATCCTACTGTATGTTAAAAAA
TGAATCTGAAGTTTATCCATTATATAATTACGCTCTCGCTTTGATTACATTATTCCTCTC
AAATAAATTGAAGCTTGCATGCCTTTTGGAATGTTTGTTTCCCACAAATTTGTACACAAC
ATGAGGCTTAGCATC

QA 16 870 16 870
DS 

RD RS1BH78TF 762 0 0
GG
GAATGTTTTAAGTGCAATCAGCATTGATAAAGATGTAGATGGCTTCCATCCTCTGAATAT
TGGTAAGCTTGCCATGAAAGGCAGAGAACCCCTCTTCCTTCCATGCACCCCTAAGGGATG
TTTGGAACTCTTAGTAAGAAGTGGCATAAAGATAAAAGGGCAACGAGCTGTTGTAGTGGG
TCGAAGTAACATCGTTGGATTGCCTGTTTCGCTTCTATTGCTCAAGGCTGATGCTACTGT
TACCACTGTACATTCCCACACCAGAGATCCTGAGGCTATCATACGGGAAGCTGACATCGT
TATTGCTGCAGCCGGACAACCCTGCATGATTAAGGGGGACTGGATTAAGCCAGGGGCTGC
GGTGATCGATGTTGGAACCAATGCAGTCAGCGACCCCAGCAGGAAATCAGGATACCGGTT
GGTTGGAGATGTGGATTACGCAGAGGCTTGTAAAGTTGCAGGGTTCATAACTCCGGTCCC
TGGTGGTGTAGGTCCAATGACCGTGGCAATGCTGCTGAGGAACACCTTAGACGGCGCCAA
G*GGGTCATCGGCCAATAAGATATCTATCCTACTGTATGTTAAAAAATGAATCTGAAGTT
TATCCATTATATAATTACGCTCTCGCTTTGATTACATTATTCCTCTCAAATAAATTGAAG
CTTGCATGTCTTTTGGAATGTCTGTTTCCCACAAATTTGTACACAACATGAG*CTTAGCA
TCATTTTAACAAAT**AAAAACATCTGTATTTTCCTTGCC

QA 3 762 3 762
DS 

RD RS1BH78JQ 646 0 0
GGGATGTTTGGAACTCTTAGTAAGAAGTGGCATAAAGATAAAAGGGCAACGAGCTGTTGT
AGTGGGTCGAAGTAACATCGTTGGATTGCCTGTTTCGCTTCTATTGCTCAAGGCTGATGC
TACTGTTACCACTGTACATTCCCACACCAGAGATCCTGAGGCTATCATACGGGAAGCTGA
CATCGTTATTGCTGCAGCCGGACAACCCTGCATGATTAAGGGGGACTGGATTAAGCCAGG
GGCTGCGGTGATCGATGTTGGAACCAATGCAGTCAGCGACCCCAGCAGGAAATCAGGATA
CCGGTTGGTTGGAGATGTGGATTACGCAGAGGCTTGTAAAGTTGCAGGGTTCATAACTCC
GGTCCCTGGTGGTGTAGGTCCAATGACCGTGGCAATGCTGCTGAGGAACACCTTAGACGG
CGCCAAG*GGGTCATCGGCCAATAAGATATCTATCCTACTGTATGTTAAAAAATGAATCT
GAAGTTTATCCATTATATAATTACGCTCTCGCTTTGATTACATTATTCCTCTCAAATAAA
TTGAAGCTTGCATGTCTTTTGGAATGTCTGTTTCCCACAAATTTGTACACAACATGAGGC
TTAGCATCATTTTAACAAAATAAAAAACATCTGTATTTTCCTTGCC

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 12

CO CL193Contig1 771 12 11 U
GGGTATGTCACACAGACAATAAGTCTAAAGCCATCAAATCCATAAACTCTTGTTTTAAAT
TTGAAGTTCATCAATGGCAAATCAAGCAGCTGTTGCAGCATTCTTCCTTTTCGTTTTGGC
TGTCTTCTCCAACTTCGAGCTCTCAGCTTCAACCCTTGTCATTGGCAAGGTCTCTTGCCT
TGACTGCCACAGCGATTTCGACTTCTCAGGCGTTAAGTTTCTCCTTAAGTGCGACGGAGA
GAAGAAACCAATAACCGCAATGGCAGCTTCTGACGGAACTTTCCGGTCAGTGCTTCCAAC
TACTGACAAAAAACACTCCATGAACTGTCTTGCAAAGATCTTGGGAGGTCCTGAACAACT
TTATGCTCACAAACACAACATGGTCTCTGAACTAGTTAAGTCCAAACACGACACCAAGGT
TCTTATTACCTCAAACCCACTTTCCTTCTCTCTTTCATGCCCCAAACCAACGGGAGATAA
TGTCGGAAATATGATCGGAGATTCGAAGACTGTTAACTTTCCGGGGACAGGAGGTTTTGG
ATTCCCACCTGCTAGCTTCTTTCCTTTCTTACCAATCATTGGCATCCCATGATTTAATTA
AATGTGATTGATAAGACTTGAAAACGTATTTATTCATATATTTAAATTTGTTGTTATGTG
AATCTAAGAGAGCCAAGACAATAATACGGCAAGTTATAAAGTTTTTTGTTTTGTTTTGTG
AGATATTAACTAAGATAAGTTTATGTGATAAAAAATGTTGTTTATTGGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 30 65 30 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 70 70 35 70 10 70 35 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 55 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 25 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 35 70 70 70 70 70 70 70 70 35 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 25 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 40 55 55 55 55 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G123TF U 1
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AF RS1G123JQ C 299
AF RS1G282TF U 30
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AF RS1F770JQ C 253
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RD RS1G123TF 693 0 0
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TGACTGCCACAGCGATTTCGACTTCTCAGGCGTTAAGTTTCTCCTTAAGTGCGACGGAGA
GAAGAAACCAATAACCGCAATGGCAGCTTCTGACGGAACCTTCCGGTCAGTGCTTCCAAC
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TCTTATTACCTCAAACCCACTTTCCTTCTCTCTTTCATGCCCCAAACCAACGGGAGATAA
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AATCTAAGAGAGCCAAGACA*TAATACGGCAAG

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DS 

RD RS1D259TF 701 0 0
GGAT
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CAAAAAACACTCCATGAACTC*CTTGCAAAGATCTTGGGAGGTCCTGAACAACTTTATGC
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TACCTCAAACCCACTTTCCTTCTCTCTTTCATGCCCCAAACCAACGGGAGATAATGTCGG
AAATATGATCGGAGATTCGAAGACTGTTAACTTTCCGGGGACAGGAGGTTTTGGATTCCC
ACCTGCTAGCTTCTTTCCTTTCTTACCAATCATTGGCATCCCATGATTTAATTAAATGTG
ATTGATAAGACTTGAAAACGTATTTATTCATATATTTAAATTTGTTGTTATGTGAATCTA
AGAGAGCCAAGACAATAATACGGCAAGTTATAAAGTT

QA 5 701 5 701
DS 

RD RS1G123JQ 405 0 0
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CTTTATGCTCACAAACACAACATGGTCTCTGAACTAGTTAAGTCCAAACACGACACCAAG
GTTTTTATTACCTCAAACCCACTTTCCTTCTTTCTTTCATGCCCCAAACCAACGGGAGAT
AATGTCGGAAATATGATCGGAGATTCGAAGACTGTTAACTTTCCGGGGACAGGAGGTTTT
GGATTCCCACCTGCTAGCTTCTTTCCTTTCTTACCAATCATTGGCATCCCATGATTTAAT
TAAATGTGATTGATAAGACTTGAAAACGTATTTATTCATATATTTAAATTTGTTGTTATG
TGAATCTAAGAGAGCCAAGACAATAATACGGCAAGTTAAAAAG
CC

QA 1 403 1 403
DS 

RD RS1G282TF 653 0 0
GG
CATCAAATCCATAAACTCTTGTTTTAAATTTGAAGTTCATCAATGGCAAATCAAGCAGCT
GTTGCAGCATTCTTCCTTTTCGTTCTGGCTGTCTTCTCCAACTTCGAGCTCTCAGCTTCA
ACCCTTGTCATTGGCAAGGTCTCTTGCCTTGACTGCCACAGCGATTTCGACTTCCCAGGC
GTTAAGTTTCTCCTTAAGTGCGACGGAGAGAAGAAACCAATAACCGCAATGGCAGCTTCT
GACGGAACTTTCCGGTCAGTGCTTCCAACTACTGACAAAAAACACTCCATGAACTGTCTT
GCAAAGATCTTGGGAGGTCCTGAACAACTTTATGCTCACAAACACAACATGGTCTCTGAA
CTAGTTAAGTCCAAACACGACACCAAGGTTCTTATTACCTCAAACCCACTTTCCTTCTCT
CTTTCATGCCCCAAACCAACGGGAGATAATGTCGGAAATATGATCGGAGATTCGAAGACT
GTTAACTTTCCGGGGACAGGAGGTTTTGGATTCCCACCTGCTAGCTTCTTTCCTTTCTTA
CCAATCATTGGCATCCCATGATTTAATTAAATGTGATTGATAAGACTTGAAAACGTATTT
ATTCATGTATTTAAATTTGTTGTTATGTGAATCTAAGAGAGCCAAGACAAT

QA 3 653 3 653
DS 

RD RS1FM66TF 661 0 0
GG
ACAGACAATAAGTCTAAAGCCATCAAATCCATAAACTCTTGTTTTAAATTTGAAGTTCAT
CAATGGCAAATCAAGCAGCTGTTGCAGCATTCTTCCTTTTCGTTTTGGCTGTCTTCTCCA
ACTTCGAGCTCTCAGCTTCAACCCTTGTCATTGGCAAGGTCTCTTGCCTTGACTGCCACA
GCGATTTCGACTTCTCAGGCGTTAAGTTTCTCCTTAAGTGCGACGGAGAGAAGAAACCAA
TAACCGCAATGGCGGCTTCTGACGGAACTTTCCGGTCAGTGCTTCCAACTACTGACAAAA
AACACTCCATGAACTGTCTTGCAAAGATCTTGGGAGGTCCTGAACAACTTTATGCTCACA
AACACAACATGGTCTCTGAACTAGTTAAGTCCAAACACGACACCAAGGTTCTTATTACCT
CAAACCCACTTTCCTTCTCTCTTTCATGCCCCAAACCAACGGGAGATAATGTCGGAAATA
TGATCGGAGATTCGAAGACTGTTAACTTTCCGGGGACAGGAGGTTTTGGATTCCCACCTG
CTAGCTTCTTTCCTTTCTTACCAATCATTGGCATCCCATGATTTAATTAAATGTGATTGA
TAAGACTTGACAACGTATTTATTCATATATTTAAATTTGTTGTTATGTGAATCTA
GAGA

QA 3 657 3 657
DS 

RD RS1F770TF 745 0 0
GGG
GTCACACAGACAATAAGTCTAAAGCCATCAAATCCATAAACTCTTGTTTTAAATTTGAAG
TTCATCAATGGCAAATCAAGCAGCTGTTGCAGCATTCTTCCTTTTCTTTTTGGCTGTCTT
CTCCAACTTCGAGCTCTCAGCTTCAACCCTTGTCATTGGCAAGGTCTCTTGCCTTGACTG
CCACAGCGATTTCGACTTCTCAGGCGTTAAGTTTCTCCTTAAGTGCGACGGAGAGAAGAA
ACCAATAACCGCAATGGCAGCTTCTGACGGAACTTTCCGGTCAGTGCTTCCAACTACTGA
CAAAAAACACTCCATGAACTGTCTTGCAAAGATCTTGGGAGGTCCTGAACAACTTTATGC
TCACAAACACAACATGGTCTCTGAACTAGTTAAGTCCAAACACGACACCAAGGTTCTTAT
TACCTCAAACCCACTTTCCTTCTCTCTTTCATGCCCCAAACCAACGGGAGATAATGTCGG
AAATATGATCGGAGATTCGAAGACTGTTAACTTTCCGGGGACAGGAGGTTTTGGATTCCC
ACCTGCTAGCTTCTTTCCTTTCTTACCAATCATTGGCATCCCATGATTTAATTAAATGTG
ATTGATAAGACTTGAAAACGTATTTATTCATATATTTAAATTTGTTGTTATGTGAATCTA
AGAGAGCCAAGACAATAATACGGCAAGTTATAAAGTTTTTTGTTTTGTTTTGTGAGATAT
TAACTAAGATAAGTTTATGTGA

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DS 

RD RS1EJ22TF 751 0 0
GG
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TTCATCAATGGCAAATCAAGCAGCTGTTGCAGCATTCTTCCTTTTCGTTTTGGCTGTCTT
CTCCAACTTCGAGCTCTCAGCTTCAACCCTTGTCATTGGCAAGGTCTCTTGCCTTGACTG
CCACAGCGATTTCGACTTCTCAGGCGTTAAGTTTCTCCTTAAGTGCGACGGAGAGAAGAA
ACCAATAACCGCAATGGCAGCTTCTGACGGAACTTTCCGGTCAGTGCTTCCAACTACTGA
CAAAAAACACTCCATGAACTGTCTTGCAAAGATCTTGGGAGGTCCTGAACAACTTTATGC
TCACAAACACAACATGGTCTCTGAACTAGTTAAGTCCAAACACGACACCAAGGTTCTTAT
TACCTCAAACCCACTTTCCTTCTCTCTTTCATGCCCCAAACCAACGGGAGATAATGTCGG
AAATATGATCGGAGATTCGAAGACTGTTAACTTTCCGGGGACAGGAGGTTTTGGATTCCC
ACCTGCTAGCTTCTTTCCTTTCTTACCAATCATTGGCATCCCATGATTTAATTAAATGTG
ATTGATAAGACTTGAAAACGTATTTATTCATATATTTAAATTTGTTGTTATGTGAATCTA
AGAGAGCCAAGACAATAATACGGCAAGTTATAAAGTTTTTTGTTTTGTTTTGTGAGATAT
TAACTAAGATAAGTTTATGTGAT
AAAAAA

QA 3 745 3 745
DS 

RD RS1G282JQ 309 0 0
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TGAT
AAAAA

QA 1 304 1 304
DS 

RD RS1BV21TF 643 0 0
G
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AAGGTCTCTTGCCTTGACTGCCACAGCGATTTCGACTTCTCAGGCGTT****TTCTCCTT
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TGTTTTGTTTTGTGAGATATTAACTAAGATAAGTTTATGTGA

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DS 

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ATTTAAGAGAGCCAAGACAATAATACGGCAAGTTATAAAGTTTTTTGTTTTGTTTTGTGA
GATATTAACTAAGATAAGTTTATGTGATAAAAAATGTTGTTTATTGGCTT

QA 1 530 1 530
DS 

RD RS1BV21JQ 438 0 0
TCCAACTACTGACAAAAAACACTCCATGAACTGTCTTGCAAAGATCTTGGGAGGTCCTGA
ACAACTTTATGCTCACAAACACAACATGGTTTTTGAACTAGTTAAGTCCAAACACGACAC
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TTA

QA 1 435 1 435
DS 

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AACCGCAATGGCAGCTTTTGACGGAACTTTCCGGTCAGTGCTTCCAACTACTGACAAAAA
ACACTCCATGAACTGTCTTGCAAAGATCTTGGGAGGTCCTGAACAACTTTATGCTCACAA
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CCAAGACAATAATACGGCAAGTTATAAAGTTTTTTGTTTTGTTTTGTGAGATATTAACTA
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QA 1 497 1 497
DS 



AS 2 11

CO CL194Contig1 1014 7 6 U
GGATATACAGATCAATTCGATCGTCTTTCTCAAAAACAGAACAGCAAGAACATTACGAGG
AACCATGTCATCGAACCAAGAAAATGTGAAGAAAGAGAAACTTCATATAACAATGAAGAC
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BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 0 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FN50JQ C 24
AF RS1FN50TF U 21
AF RS1DG80TF U 1
AF RS1H728TF U 5
AF RS1G002JQ C 448
AF RS1AG48TF U 216
AF RS1DG80JQ C 418
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DS 

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TGGT**TGGAAGAGGAAGATAAGAAACAAAAGAAGAAAAAGAAAGATAAGGAGAAGAAAG
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DS 

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GA

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DS 

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GG
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QA 3 680 3 680
DS 

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DS 

RD RS1AG48TF 711 0 0
G
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TGAAAAAAAGAAACATGGGAAAGATGATGAAGGCCATGGAGATATGGAAGTGGAAGAGGA
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TAAGAAAGAAAA*GAAGCTGAAAAAAGAGGAGAAGGATGAGCATGGAGAAGAAGAGGAAG
GGGAGAAGAAAGAAGATCAGAAGGAGGGAAAGAAGAAAGATAAAGAGAAGAAACTAAAAG
AAGAATCAAAGAAAGTGAAGAAAGGAGAGAAAGATGAGCATGGAGAAGAA

QA 2 711 2 711
DS 

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TTTAGAAGAAGAAGAAAGTAATAAAAAGAAGAAGAAAGATAAGGATGAATCAGGTGCAGA
CGGAAAAGACAAGAAGAAACTGAAAGAAGAATCAAAGGATAAGAAAAAAAAAGAAGCTGA
AAAAAGAGGAGAAGGATGAGCATGGAGAAGAAGAGGAAGGGGAGAAGAAAGAAGATCAGA
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AAGGAGAGAAGGATGAGCATGGAGAAGAAGAAGGGGAGAAGAAAGAAGATCATAAGGAGG
GAAAGAAGAAGAGTAAATATAAGGCGAAGACGAAGGAGACTGATGAGGATGAAGGAG

QA 1 597 1 597
DS 



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GATCTTTCTTCTCATCTTCATCCTTTGTTTTTTTCTTTTCCTTTGGGTCTTTTTTTTTGT
TCTTCTTTTTGTCTCTCTTCTTGTTTTTCTTCCCATCTTCACCCTCTCCGCCTTCATCTT
TGTTTTGGTTCTCTTCTTCACTACCATTTTCTCCCTCGGTGTCTTTTCCATTCTTAGTTT
TCTTGTCCTTGGACTTGCCTTCCTCTCCTTCAGCTCCTGGTTCTTCAAATGTAATATCTC
TAGACAACACTTCAACTTCTTTGTTATCTTTTTCACCTTTCTCCTTCTTCTTTTTTTTGC
TTCTTTTCTCCTTCATCCTCATCAGTCTCCTTCGTCTTCGCCTTATCTTTACTCTTCTTC
TTTCCCTCCTTATGATCTTCTTTCTTCTCCCCTTCTTCTTCTCCATGCTCATCCTTCTCT
CCTTTCTTCACCTTCTTTGATTCTTCTTTCAGTTTCTTCTCTTTATCTTTCTTCTTTCCC
TCCTTCTGATCTTCTTTCTTCTCCCCTTCCTCTTCTTCTCCATGCTCATCCTTCTCCTCT
TTTTTCAGCTTCTTTTCTTTCTTATCCTTTGATTCTTCTTTCAGTTTCTTCTTGTCTTTT
CCGTCTGCACCTGATTCATCCTTATCTTTCTTCTTCTTTTTATTACTTTCTTCTTCTTCT
AAATCCTCTTTTTGTTGTGATACATCCTCATCCTTCTTCTCCTTACCTTTCTTTTTCTTC
TTGTGTTCCTTCTCTGTTTCTTCATCTTTTACATCAGAGTCTTTCCTCAGGCTCATCCTT
CTCTTCCTTTTTCTTCTTCTTTTCTTCCTTACCCTTGGAATCTTCTTTCGTTTTCTTCTC
TTTATTCGCCTTCTTCTTACCTTCTTTGTCATCTTCTAACTCCTCATTTCCTTGTGACAC
ATCCTCATCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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TCTTGTCCTTGGACTTGCCTTCCTCTCCTTCAGCTCCTGGTTCTTCAAATGTAATATCTC
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CCTTCTTTGATTCTTCTTTTAGTTTCTTCTCTTTATCTTTCTTCTTTCCCTCCTTCTGAT
CTTCTTTCTTCTCCCCTTCCTCTTCTTCTCCATGCTCATCCTTCTCCTCTTTTTTCAGCT
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CCTTCTTCTCCTTACCTTTCTTTTTCTTCTTGTGTTCCTTCTCTGTTTCTTCATC
C

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CTTTTCTTT*TTATCCTTTGATTCTTCTTTCAGTTTCTTCTTGTCTTTTCCGTCTGCACC
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TCTTCTTCTTTTCTTCCTTACCCTTGGAATCTTCTTTCGTTTTCTTCTCTTTATTCGCCT
TCTTCTTACCTTCTTTGTCATCTTCTAACTCCTCATTTCCTTGTGACACATCCTCATCTT
C

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DS 



AS 2 10

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ACTTGTTGTTACCCATCAGCCCCCCAAAATCGACGACGAACGTGATCTCGGGTCTGTCTC
AGCTATCGGTTTCCAGACATCGAAAAAA*TGGCTGTCTGCGCCAAACTCGGGGTTTTACA
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TTTTGTATCAGCCTCGAAGTCATGTTTTCAATTTTTATAATGATACGAAGTATGGGACAT
TAGATC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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ACTTGTTGTTACCCATCTGCCCCCCAAAATCGACGACGAACGTGATCTCGGGTCTGTCTC
AGCTATCGGTTTCCAGACATCGAAAAAA*TGGCTGTCTGCGCCAAACTCGGGGTTTTACA
GAACAGAAATGTTCCAGTGACATCAATGCTCCGCTACATGTCCACAAAACTTTTCATTGG
TGGCCTATCGCCAGGAACTGACGACCATTCCTTGAAGGATGCTTTCTCTACCTTCAATGG
AGTGACAGAGGCAAGAGTCATGACAAACAAAGTGACAGGAAGGTCAAGGGGTTATGGATT
TGTCAATTTCACAAGTGAGGAGTCTGCCAAGTCTGCTATTTCAGCTATGGATGGACAGGA
GTTGAATGGGTGTAACATCCGTGTGGATGCTGCAAAAGAATGGCCAAGCTTGCCGTTATC
TTTGGTCGAAGGTACAGAAGATGAGAAGAAAGGCAATAAGATGGTGAGCCGATCTGTATG
GAAAGATCCGTTCGTTGACGCCTTCTTGATGAAGAAGAAAAACGCAGCTCTGAACAGGAA
AATATGGTCAAGGAGGTCGACGATTCTGCCAGAGTATGTTGATTCG

QA 1 646 1 646
DS 

RD RS1DO24TF 670 0 0
GAACCGGGCTTGGTTCAGATCGCGACAAGCCCTAACGAGTGTAAACTTGTTGTTACCCAT
CAGCCCCCCAAAATCGACGACGAACGTGATCTCGGGTCTGTCTCAGCTATCGGTTTCCAG
ACATCGAAAAAA*TGGCTGTCTGCGCCAAACTCGGGGTTTTACAGAACAGAAACGTTCCA
GTGACATCAATGCTCCGCTACATGTCCACAAAACTTTTCATTGGTGGCCTATCGCCAGGA
ACTGACGACCATTCCTTGAAGGATGCTTTCTCTACCTTCAATGGAGTGACAGAGGCAAGA
GTCATGACAAACAAAGTGACAGGAAGGTCAAGGGGTTATGGATTTGTCAATTTCACAAGT
GAGGAGTCTGCCAAGTCTGCTATTTCAGCTATGGATGGACAGGAGTTGAATGGGTGTAAC
ATCCGTGTGGATGCTGCAAAAGAATGGCCAAGCTTGCCGTTATCTTTGGTCGAAGGTACA
GAAGATGAGAAGAAAGGCAATAAGATGGTGAGCCGATCTGTATGGAAAGATCCGTTCGTT
GACGCCTTCTTGATGAAGAAGAAAAACGCAGCTCTGAACAGGAAAATATGGTCAAGGAGG
TCGACGATTCTGCCAGAGTATGTTGATTCGTCGGTGAGGATCTACAATGGCAAAACTCAT
GTGCGTTGTA

QA 1 670 1 670
DS 

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AACAGAAATGTTCCAGTGACATCAATGCTCCGCTACATGTCCACAAAACTTTTCATTGGT
GGCCTATCGCCAGGAACTGACGACCATTCCTTGAAGGATGCTTTCTCTACCTTCAATGGA
GTGACAGAGGCAAGAGTCATGACAAACAAAGTGACAGGAAGGTCAAGGGGTTATGGATTT
GTCAATTTCACAAGTGAGGAGTCTGCCAAGTCTGCTATTTCAGCTATGGATGGACAGGGG
TTGAATGGGTGTAACATCCGTGTGGATGCTGCAAAAGAATGGCCAAGCTTGCCGTTATCT
TTGGTCGAAGGTACAGAAGATGAGAAGAAAGGCAATAAGATGGTGAGCCGATCTGTATGG
AAAGATCCGTTCGTTGACGCCTTCTTGATGAAGAAGAAAAACGCAGCTCTGAACAGGAAA
ATATGGTCAAGGAGGTCGACGATTCTGCCAGAGTATGTTGATTCGTCGGTGAGGATCTAC
AATGGCAAAACTCATGTGCGTTGTAAGATCACAGAGGGG*AAAGTTGGGCATAAGTTTGG
AGAGTTTGCGTTTACAAGAAAAGTGACCAAGCATCCTAGAGCAAAGTAAGTTTAATGTTT
TTTGAGAATGAATTGGGTCAGCTTGA

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1A953TF 844 0 0
GG
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GCTGTCTGCGCCAAACTCGGGGTTTTACAGAACAGAAATGTTCCAGTGACATCAATGCTC
CGCTACATGTCCACAAAACTTTTCATTGGTGGCCTATCGCCAGGAACTGACGACCATTCC
TTGAAGGATGCTTTCTCTACCTTCAATGGAGTGACAGAGGCAAGAGTCATGACAAACAAA
GTGACAGGAAGGTCAAGGGGTTATGGATTTGTCAATTTCACAAGTGAGGAGTCTGCCAAG
TCTGCTATTTCAGCTATGGATGGACAGGAGTTGAATGGGTGTAACATCCGTGTGGATGCT
GCAAAAGAATGGCCAAGCTTGCTGTTATCTTTGGTCGAAGGTACAGAAGATGAGAAGAAA
GGCAATAAGATGGTGAGCCGATCTGTATGGAAAGATCCGTTCGTTGACGCCTTCTTGATG
AAGAAGAAAAACGCAGCTCTGAACAGGAAAATATGGTCAAGGAGGTCGACGATTCTGCCA
GAGTATGTTGATTCGTCGGTGAGGATCTACAATGGCAAAACTCATGTGCGTTGTAAGATC
ACAGAGGGGGAAAGTTGGGCATAAGTTTGGAGAGTTTGCGTTTACAAGAAAAGTGACCAA
GCATCCTAGAGCAAAGTAAGTTTAATGTTTTTTGAGAATGAATTGGGTCAGCTTGAGAGG
ATTTGTTGGAGTAAGAAAAA*CAAAAACGATTCAATAAGAATTTCCAAGTAGGGATAATT
CATT*GAGCTTAGAAGTGTTGTTTTTATTTTT*GTATCAGCCTCGAAGTCATGTTTTCA
TTT

QA 3 841 3 841
DS 

RD RS1BS36JQ 749 0 0
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CCTTGAAGGATGCTTTCTCTACCTTCAATGGAGTGACAGAGGCAAGAGTCATGACAAACA
AAGTGACAGGAAGGTCAAGGGGTTATGGATTTGTCAATTTCACAAGTGAGGAGTCTGCCA
AGTCTGCTATTTCAGCTATGGATGGACAGGGGTTGAATGGGTGTAACATCCGTGTGGATG
CTGCAAAAGAATGGCCAAGCTTGCCGTTATCTTTGGTCGAAGGTACAGAAGATGAGAAGA
AAGGCAATAAGATGGTGAGCCGATCTGTATGGAAAGATCCGTTCGTTGACGCCTTCTTGA
TGAAGAAGAAAAACGCAGCTCTGAACAGGAAAATATGGTCAAGGAGGTCGACGATTCTGC
CAGAGTATGTTGATTCGTCGGTGAGGATCTACAATGGCAAAACTCATGTGCGTTGTAAGA
TCACAGAGGGG*AAAGTTGGGCATAAGTTTGGAGAGTTTGCGTTTACAAGAAAAGTGACC
AAGCATCCTAGAGCAAAGTAAGTTTAATGTTTTTTGAGAATGAATTGGGTCAGCTTGAGA
GGATTTGTTGGAGTAAGAAAAAACAAAAACGATTCAATAAGAATTTCCAAGTAGGGATAA
TTCATCTGAGCTTAGAAGTGTTGTTTTTATTTTTTGTATCAGCCTCGAAGTCATGTTTTC
AATTTTTATAATGATACGAAGTATGGGAC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RS1AT17JQ 825 0 0
ATCGAAAAAT
GCTGTCTGCGCCAAACTCGGGGTTT*ACAGAACAGAAATGTTCCAGTGACATCAATGCTC
CGCTACATGTCCACAAAACTTTTCATTGGTGGCCTATCGCCAGGAACTGACGACCATTCC
TTGAAGGATGCTTTCTCTACCTTCAATGGAGTGACAGAGGCAAGAGTCATGACAAACAAA
GTGACAGGAAGGTCAAGGGGTTATGGATTTGTCAATTTCACAAGTGAGGAGTCTGCCAAG
TCTGCTATTTCAGCTATGGATGGACAGGAGTTGAATGGGTGTAACATCCGTGTGGATGCT
GCAAAAGAATGGCCAAGCTTGCCGTTATCTTTGGTCGAAGGTACAGAAGATGAGAAGAAA
GGCAATAAGATGGTGAGCCGATCTGTATGGAAAGATCCGTTCGTTGACGCCTTCTTGATG
AAGAAGAAAAACGCAGCTCTGAACAGGAAAATATGGTCAAGGAGGTCGACGATTCTGCCA
GAGTATGTTGATTCGTCGGTGAGGATCTACAATGGCAAAACTCATGTGCGTTGTAAGATC
ACAGAGGGG*AAAGTTGGGCATAAGTTTGGAGAGTTTGCGTTTACAAGAAAAGTGACCAA
GCATCCTAGAGCAAAGTAAGTTTAATGTTTTTTGAGAATGAATTGGGTCAGCTTGAGAGG
ATTTGTTGGAGTAAGAAAAAACAAAAACGATTCAATAAGAATTTCCAAGTAGGGATAATT
CATTTGAGCTTAGAAGTGTTGTTTTTATTTTTTGTATCAGCCTCGAAGTCATGTTTTCAA
TTTTTATAATGATACGAAGTATGGGACATTAGATC

QA 11 825 11 825
DS 



CO CL195Contig2 895 4 23 U
ATGTCCCATACTTCGTATCATTATAAAAATTGAAAACATGACTTCGGAGGCTGATACAAA
AAAACAATTCTAAGCTCAAATGGGTTATATCCCTACTTGGAAATTCTTATTGATTCGCTT
CTGTTTTTCTTTCTCCAACAAATCCTCTCAAGCCGACCCAATTCATTCCCAAAAACATTA
AACTTACTTTGCTCTAGGATGCTTGGTCACTTTTCTTGTAAACGCAAACTCTCCAAACTT
ATGCCCAACTTTCCCCTCTGTGATCTTACAACGCACATGAGTTTTGCCATTGTAGATCCT
CGCCGACGAATCAACATACTCTGGCAGAATCGTCGACCTCCTTGACCATATTTTCCTGTT
CAGAGCTGCGTTTTTCTTCTTCATCAAGAAGGCGTCAACGAACGGATCTTTCCATACAGA
TCGGCCCACCATCTTATTGCCTTTCTTCTCATCTTCTTTACCTTCAACCAAAGATAACGG
CAAGCTTGGCCATTCTTTTGCAGCATCCACACGGATGTTACACCCATTCAACTCCTGTCC
ATCCATAGCTGAAATAGCAGACTTGGCAGACTCCTCACTTGTGAAATTGACAAATCCATA
ACCCCTTGACCTTCCTGTCACTTTGTTTGTCATGACTCTTGCCTCTGTCACTCCATTGAA
GGTAGAGAAAGCATCCTTCAAGGAATGGTCGTCAGTTCCGGGCGACAGGCCACCAATGAA
AAGTTTTGTGGACATGTAGCGGAGCATTGATGTCACTGGAACATTTCTGTTCTGTAAAAC
CCCGAGTTTGGTGCAGACAGCCATTTTTTCGATGTCTGGAAATCGATAGCTGAGATCACG
TTCGTCGTCGATTTTTGGGGGCAGATGGTAACCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B240JQ U 1
AF RS1A064JQ U 82
AF RS1A064TR U 82
AF RS1A064TF C 83
BS 1 82 RS1B240JQ
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BS 875 895 RS1A064TF

RD RS1B240JQ 857 0 0
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AAAACAATTCTAAGCTCAAATGAGTTATATCCCTACTTGGAAATTCTTATTGATTCGCTT
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AACTTACTTTGCTCTAGGATGCTTGGTCACTTTTCTTGTAAACGCAAACTCTCCAAGCTT
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AAGTTTTGTGGACATGTAGCGGAGCATTGATGTCACTGGAACATTTCTGTTCTGTAAA*C
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TTCGTCGTCGATTTT
GC

QA 1 855 1 855
DS 

RD RS1A064JQ 793 0 0
G
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TTGGCAGACTCCTCACTTGTGAAATTGACAAATCCATAACCCCTTGACCTTCCTGTCACT
TTGTTTGTCATGACTCTTGCCTCTGTCACTCCATTGAAGGTAGAGAAAGCATCCTTCAAG
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ATTTTTTCGATGTCTGGAAATCGATAGCTGAGATCACGTTCGTCGTCGATTTTTGGGGGC
AGATGGTAACCC

QA 2 793 2 793
DS 

RD RS1A064TR 767 0 0
G
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TCCTCTCAAGCCGACCCAATTCATTCCCAAAAACATTAAACTTACTTTGCTCTAGGATGC
TTGGTCACTTTTCTTGTAAACGCAAACTCTCCAAACTTATGCCCAACTTTCCCCTCTGTG
ATCTTACAACGCACATGAGTTTTGCCATTGTAGATCCTCGCCGACGAATCAACATACTCT
GGCAGAATCGTCGACCTCCTTGACCATATTTTCCTGTTCAGAGCTGCGTTTTTCTTCTTC
ATCAAGAAGGCGTCAACGAACGGATCTTTCCATACAGATCGGCCCACCATCTTATTGCCT
TTCTTCTCATCTTCTTTACCTTCAACCAAAGATAACGGCAAGCTTGGCCATTCTTTTGCA
GCATCCACACGGATGTTACACCCATTCAACTCCTGTCCATCCATAGCTGAAATAGCAGAC
TTGGCAGACTCCTCACTTGTGAAATTGACAAATCCATAACCCCTTGACCTTCCTGTCACT
TTGTTTGTCATGACTCTTGCCTCTGTCACTCCATTGAAGGTAGAGAAAGCATCCTTCAAG
GAATGGTCGTCAGTTCCGGGCGACAGGCCACCAATGAAAAGTTTTGTGGACATGTAGCGG
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ATTTTTTCGATGTCTGGAAATCGATAGCTGAGATCACGTTCGTCGT

QA 2 767 2 767
DS 

RD RS1A064TF 813 0 0
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ATCTTACAACGCACATGAGTTTTGCCATTGTAGATCCTCGCCGACGAATCAACATACTCT
GGCAGAATCGTCGACCTCCTTGACCATATTTTCCTGTTCAGAGCTGCGTTTTTCTTCTTC
ATCAAGAAGGCGTCAACGAACGGATCTTTCCATACAGATCGGCCCACCATCTTATTGCCT
TTCTTCTCATCTTCTTTACCTTCAACCAAAGATAACGGCAAGCTTGGCCATTCTTTTGCA
GCATCCACACGGATGTTACACCCATTCAACTCCTGTCCATCCATAGCTGAAATAGCAGAC
TTGGCAGACTCCTCACTTGTGAAATTGACAAATCCATAACCCCTTGACCTTCCTGTCACT
TTGTTTGTCATGACTCTTGCCTCTGTCACTCCATTGAAGGTAGAGAAAGCATCCTTCAAG
GAATGGTCGTCAGTTCCGGGCGACAGGCCACCAATGAAAAGTTTTGTGGACATGTAGCGG
AGCATTGATGTCACTGGAACATTTCTGTTCTGTAAAACCCCGAGTTTGGTGCAGACAGCC
ATTTTTTCGATGTCTGGAAATCGATAGCTGAGATCACGTTCGTCGTCGATTTTTGGGGGC
AGATGGTAACCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATT

QA 1 813 1 813
DS 



AS 1 12

CO CL196Contig1 2394 12 27 U
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CTTCTCGAGACACAGTTCGAATTTGATTAATCAAAGCAAAGTCGTGTCTGGTTTTTAGAT
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GTTACGGTGACCATGAATGAACCAATGGATGCTGAAGTTTTCACCCATAGGCTCAGGGCT
TCTCTTTCCCATTGGAGACAAGAGGGGAAGAAGGGGATTTGGATAAAGCTACCTCTTGGT
TTAGCTAACCTTGTTGAATCTGCTGTTAGTGAAGGGTTTAGATATCATCACGCAGAGCCA
GAGTACTTGATGCTTGTGTCTTGGATCTCTAACACCCCTGACACTATCCCTGCCAATGCT
TCTCACATTGTTGGTGTTGGTGCTCTTGTCCTCAACAAAGCCACTCGAGAGGTCCTCGTT
GTCCAGGAAAAGAGCGGTTATTTCAGAGACAAAAATGTCTGGAAGCTCCCTACTGGTGTT
ATCCACGAGGGTGAGGATATTTGCGATGGAGTAGCTAGGGAAGTGGAAGAAGAAACTGGT
ATTAGCGCAGATTTTGTTGAAGTGTTGTCCTTCAGGCAAAGCCACAAAGCATTCTTGAAA
CAGAAAACGGATCTGTTTTTCCTGTGCGTCTTGGCTCCACGCTCCTACGATATCACTGAA
CAAAAATCTGAGATCTTGGAAGCTAAGTGGATGCCGATCAAAGAATACGTAGATCAGCCA
TGGAACCAGAAGAAGGAGATGTTCAAGATCATGGCTGAAATCTGCGAGAAGAAGTGTGAT
GAAGACTACGTTGGATTCTCCGCTGTTGAAACTGTCACAGGAACTGGTAAAAAGAGCTTC
GTCTACTGCAATGCTGATCACGCCAAGAACCTTATAGCAGCGCGTGACCAAGCATCATCC
TCTTCTCTCTGAATCACATTCTCATGGAATCTCTGCATTTGTCAATTATTGTGTGTATCC
TTTGTATTTGTATCTCAAATAAAAAAAA*CAAAACCATCTTTCTGAGACAATTGCTTCTT
CCTTTTGGCATTGTCTTAACCGGTTTTAAATTCTCAGCTTTATATTTTTCATGGTTATTT
CTGGTTTAATCCACTTTCGTTTGATTATTCCCCGGGCTTTTTTATTTATCCGATATATTT
GAAATCTCATTGAACAAGCACATTTATGTAAAAAATACTAAAATGTAATGTTGTAAAACA
CAAAGACGTTAAATCCGTTTTTCATTTATTTAAATAAAAGTAGATTTTTGATTTTTAGAG
AAACTTTTGGAAGAAGCTGTGAATGTGTTGATTGATCTCCTCAGGCTTCTCCTCGTGGAG
GAAATGTCCCACTCCCTCGAGCACTACGGTTTCATCAAGCAACGGTACGTCCTTCTCGAA
TCCCCCACCGTTGATGTACTCCTTAGCCCCCGGCGAATTGTACGTCAAATCCTGATCTCC
TACTATGAACTTCACCGGTACACCAATCTTAGCACCGGTCCAAGGTGCAGTCAGCTCCCA
ATTTCGGTCAATGTTGCGGTAGTAGTTAATTGGTCCAGTGAAGCCTTTGTTCTCGTACTT
GGTGACGTAATAGTCGAGGTCTTCTTGTGTTAGCCACGGTGGTAACGCAGAAGACGCACC
ACCGTTTTCTGAGCTTTTGAATAGTTTGCCTTTGGGGAGGTAAAGCGGTCCAGGCGTTTT
GTAAGTAAAGAAATCTTTCAACACCTTGGCTGTTCCCAATGTTTCGAACTCTGCTTCTAT
CTCTCCAGGTTTCTGAAACCTGCAGATGTAATAATCGTCACCAAGGAAACGTCTCAAGGT
CGGAATCGGGACACGATCTGGGTTCCTCGGAGAGAAGAGGACACTCATGTTGACCAGTGC
TTTGACTTTCTCCGGTCGGTACATACACAACTGCCACGCGATCACCGCTCCCCAGTCATG
GCCCACCACGAAAACCGGCTCGTCTCCACCGGTCACTGCGTCGATGAGTGCCACAAAGTC
TCCGACCATGTTGAAGTAAGTATAGTCCTCCACTTTCTCCGGCGCGTCTGTGTCTCCGTA
TCCTCTAAGATCCGGCGCGATGGTACGGTACCCTAGGGACGAAAGCGCAGTCATCTGGTG
CCGCCACGTGTACCAAAGCTCAGGGAATCCGTGGATGAAGAGGATGATCGGGTCTCCTCC
AGATCCGGATCCGGGAAGCTCGGCCACGTGCATGTTTATGCCGTTTACTTTGAGGGTTTT
GTGCTCTACGCCGTCGAGTCCTGACATGTTCACGGTGGTGGTAGGTTTGTTTGTTTGATC
TGGTTGTTGTTTCCCGAGAAAGTGAAGGAATCTATAAAAGAAATGGTTTAGATC


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BS 630 630 RS1B748TF
BS 631 635 RS1G651TF
BS 636 638 RS1B748TF
BS 639 659 RS1G651TF
BS 660 725 RS1B748TF
BS 726 726 RS1DA95TF
BS 727 787 RS1B748TF
BS 788 1235 RS1EV51TF
BS 1236 1431 RS1DE14JQ
BS 1432 1432 RS1GB91JQ
BS 1433 1436 RS1DE14JQ
BS 1437 1437 RS1GB91JQ
BS 1438 1849 RS1DE14JQ
BS 1850 2034 RS1DE14TF
BS 2035 2035 RS1GB91TF
BS 2036 2394 RS1DE14TF

RD RS1G651TF 659 0 0
TTTTTTCAGTTACAAATAGACAAAAACAAAAATGACGAATCAAAGCAAAGTCTATATCCT
CTTCTCGAGACACAGTTCGAATTTGATTAATCAAAGCAAAGTCGTGTCTGGTTTTTAGAT
TTGCTTGAGAGAGAGAGGGAGATGGATATACTTATCGGGGAGACAGACAATTACGATGGC
GTTACGGTGACCATGAATGAACCAATGGATGCTGAAGTTTTCACCCATAGGCTCAGGGCT
TCTCTTTCCCATTGGAGACAAGAGGGGAAGAAGGGGATTTTGATAAAGCTACCTCTTGGT
TTAGCTAACCTTGTTGAATCTGCTGTTAGTGAAGGGTTTAGATATCATCACGCAGAGCCA
GAGTACTTGATGCTTGTGTCTTGGATCTCTAACACCCCTGACACTATCCCTGCCAATGCT
TCTCACATTGTTGGTGTTGGTGCTCTTGTCCTCAACAAAGCCACTCGAGAGGTTCTCGTT
GTCCAGGAAAAGAGCGGTTATTTCAGAGACAAAAATGTCTGGAAGCTCCCTACTGGTGTT
GTCCACGAGGGTGAGGATATTTGCGATGGAGTAGCTAGGGAAGTGGAAGAAGAAACTGGT
ATTAGTGCAGATTTTGTTGAAGTGTTGTCTTTCAGC**AAGCCACAAAGCATTCTTGAA

QA 1 659 1 659
DS 

RD RS1G555TF 470 0 0
G
ATACTTATCGGGGAGACAGACAATTACGATGGCGTTACGGTGACCATGAATGAACCAATG
GATGCTGAAGTTTTCACCCATAGGCTCAGGGCTTCTCTTTCCCATTGGAGACAAGAGGGG
AAGAAGGGGATTTGGATAAAGCTACCTCTTGGTTTAGCTAACCTTGTTGAATCTGCTGTT
AGTGAAGGGTTTAGATATCATCACGCAGAGCCAGAGTACTTGATGCTTGTGTCTTGGATC
TCTAACACCCCTGACACTATCCCTGCCAATGCTTCTCACATTGTTGGTGTTGGTGCTCTT
GTCCTCAACAAAGCCACTCGAGAGGTTCTCGTTGTCCAGGAAAAGAGCGGTTATTTCAGA
GACAAAAATGTCTGGAAGCTCCCTACTGGTGTTGTCCACGAGGGTGAGGATATTTGCGAT
GGAGTAGCTAGGGAAGTGGAAGAAGAAACTGGTATTAGTGCAGATTTTG

QA 2 470 2 470
DS 

RD RS1B748TF 677 0 0
AGATTTGCTTGAGAGA
GAGAGAGAGAGAGAGATGGATATACTTATCGGGGAGACAGACAATTACGATGGCGTTACG
GTGACCATGAATGAACCAATGGATGCTGAAGTTTTCACCCATAGGCTCAGGGCTTCTCTT
TCCCATTGGAGACAAGAGGGGAAGAGGGGGATTTGGATAAAGCTACCTCTTGGTTTAGCT
AACCTTGTTGAATCTGCAGTTAGTGAAGGGTTTAGATATCATCACGCAGAGCCAGAGTAC
TTGATGCTTGTGTCTTGTATCTCTAACACCCCTGACACGATCCCTGCCAATGCTTCTCAC
ATTGTTGGTGTTGGTGCTCTTGTCCTCAACAAAGCCACTCGTGAGGTCCTCGTTGTCCAG
GAAAAGAGCGGTTATTTCAGAGACAAAAATGTCTGGAAGCTCCCTACTGGTGTTATCCAC
GAGGGTGAGGATATTTGCGATGGAGTAGCTAGGGAAGTGGAAGAAGAAACTGGTATTATC
GCAGATTTTGTTGAAGTGTTGTCCTTCAGGCAAAGTCACAAAGCATTCTTGAAACAGAAA
ACGGATCTGTTTTTCCTGTGCGTCTTGGCTCCACGCTCCTACGATATCACTGAACAAAA*
TCTGAGATCTTGGAAGCTAAGTGGATGCCGATCAAAGAATACGTAGATCAGCCATGGAAC
C

QA 17 677 17 677
DS 

RD RS1DA95TF 659 0 0
GAGAGATAGAGAGAGATGGATATACTTATCGGGGAGACAGACAATTACGATGGCGTTACG
GTGACCATGAATGAACCAATGGATGCTGAAGTTTTCACCCATAGGCTCAGGGCTTCTCTT
TCCCATTGGAGACAAGAGGGGAAGAAGGGGATTTGGATAAAGCTACCTCTTGGTTTAGCT
AACCTTGTTGAATCTGCTGTTAGTGAAGGGTTTAGATATCATCACGCAGAGCCAGAGTAC
TTGATGCTTGTGTCTTGGATCTCTAACACCCCTGACACTATCCCTGCCAATGCTTCTCAC
ATTGTTGGTGTTGGTGCTCTTGTCCTCAACAAAGCCACTCGAGAGGTTCTCGTTGTCCAG
GAAAAGAGCGGTTATTTCCGAGACAAAAATGTCTGGAAGCTCCCTACTGGTGTTGTCCAC
GAGGGTGAGGATATTTGCGATGGAGTAGCTAGGGAAGTGGAAGAAGAAACTGGTATTAGT
GCAGATTTTGTTGAAGTGTTGTCTTTCAGGCAAAGCCACAAAGCATTCTTGAAACAGAAA
ACGGATCTGTTTTTCCTTTGCGTCTTGACTCCACGCTCCTACGATATCACTGAACAAAAA
TCTGAGATCTTGGAAGCTAAGTGGATGCCGATCAAAGAATACGTAGATCAGCCATGGAA

QA 1 659 1 659
DS 

RD RS1B748JQ 726 0 0
CTCACATTGTTGGTGTTGGTGCTCTTGTCCTCAACAAAGCCACTCGTGAGGTCCTCGTTG
TCCAGGAAAAGAGCGGTTATTTCAGAGACAAAAATGTCTGGAAGCTCCCTACTGGTGTTA
TCCACGAGGGTGAGGATATTTGCGATGGAGTAGCTAGGGAAGTGGAAGAAGAAACTGGTA
TTATCGCAGATTTTGTTGAAGTGTTGTCCTTCAGGCAAAGTCACAAAGCATTCTTGAAAC
AGAAAACGGATCTGTTTTTCCTGTGCGTCTTGGCTCCACGCTCCTACGATATCACTGAAC
AAAAATCTGAGATCTTGGAAGCTAAGTGGATGCCGATCAAAGAATACGTAGATCAGCCAT
GGAACCAGAAGAAGGAGATGTTCAAGATCATGGCTGAAATCTGCGAGAAGAAGTGTGATG
AAGACTACGTTGGATTCTCCGCTGTTGAAACTGTCACAGGAACTGGTAAAAAGAGCTTCG
TCTACTGCAATGCTGATCACGCCAAGAACCTTATAGCAGCGCGTGACCAAGCATCATCCT
CTTCTCTCTGAATCACATTCTCATGGAATCTCTGCATTTGTCAATTATTGTGTGTATCCT
TTGTATTTGTATCTCAAATAAAAAAAA*CAAAACCATCTTTCTGAGACAATTGCTTCTTC
CTTTTGGCATTGTCTTAACCGGTTTTAAATTCTCAGCTTTATATTTTTCATGGTTATTTC
TGGTTT

QA 1 726 1 726
DS 

RD RS1G555JQ 441 0 0
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AAGAAGGAGATGTTCAAGATCATGGCTGAAATCTGCGAGAAGAAATGTGATGAACAATAC
GTTGGATTCTCCGCTGTTGAAACTGTCACAGGAACTGGTAAAAAGAGCTTCGTTTACTGC
AATGCTGATCACGCCAAGAACCTTATAGCAGCGCGTGACCAAGCATCATCCTCTTCTCTC
TGAATCACATTCTCATGGAATCTCTGCATTTGTCAATTATTGTGTGTATCCTTTGTATTT
GTATCTCAAATAAAAAAAAACAAAACCATCTTTCTGAGACAATTGCTTCTTCCTTTTGGC
ATTGTCTTAACCGGTTTTAAATTCTCAGCTTTTTATTTTCCATGGTTATTTCTGGTTTAA
TCCACTTTCGTTTGATTATTC

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DS 

RD RS1EV51TF 636 0 0
GATTATC
GCAGATTTTGTTGAAGTGTTGTCCTTCAGGCAAAGCCACAAAGCGTTCTTGAAACAGAAA
ACGGATCTGTTTTTCCTGTGCGTCTTGGCTCCACGCTCCTACGATATCACTGAACAAAAA
TCTGAGATCTTGGAAGCTAAGTGGATGCCGATCAAAGAATACGTAGATCAGCCATGGAAC
CAGAAGAAGGAGATGTTCAAGATCATGGCTGAAATCTGCGAGAAGAAGTGTGATGAAGAC
TACGTTGGATTCTCCGCTGTTGAAACTGTCACAGGAACTGGTAAAAAGAGCTTCGTCTAC
TGCAATGCTGATCACGCCAAGAACCTTATAGCAGCGCGTGACCAAGCATCATCCTCTTCT
CTCTGAATCACATTCTCATGGAATCTCTGCATTTGTCAATTATTGTGTGTATCCTTTGTA
TTTGTATCTCAAATAAAAAAAA*CAAAACCATCTTTCTGAGACAATTGCTTCTTCCTTTT
GGCATTGTCTTAACCGGTTTTAAATTCTCAGCTTTATATTTTTCATGGTTATTTCTGGTT
TAATCCACTTTCGTTTGATTATTCCCCGGGCTTTTTTATTTATCCGATATATTTGAAATC
TCATTGAACAAGCACATTTATGTAAAAAA

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DS 

RD RS1EV51JQ 677 0 0
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GCTCCACGCTCCTACGATATCACTGAACAAAAATCTGAGATCTTGGAAGCTAAGTGGATG
CCGATCAAAGAATACGTAGATCAGCCATGGAACCAGAAGAAGGAGATGTTCAAGATCATG
GCTGAAATCTGCGAGAAGAAGTGTGATGAAGACTACGTTGGATTCTCCGCTGTTGAAACT
GTCACAGGAACTGGTAAAAAGAGCTTCGTCTACTGCAATGCTGATCACGCCAAGAACCTT
ATAGCAGCGCGTGACCAAGCATCATCCTCTTCTCTTTGAATCACATTCTCATGGAATCTC
TGCATTTGTCAATTATTGTGTGTATCCTTTGTATTTGTATCTCAAATAAAAAAAA*CAAA
ACCATCTTTTTGAGACAATTGCTTCTTCCTTTTGGCATTGTTTTAACCGGTTTTAAATTT
TCAGCTTTATATTTTTCATGGTTATTTCTGGTTTAATCCACTTTCGTTTGATTATTCCCC
GGGCTTTTTTATTTATCCGATATATTTGAAATCTCATTGAACAAGCACATTTATGTAAAA
AATACTAAAATGTAATGTTGTAAAACACAAAGACGTTAAATCCGTTTTTCATTTATTTAA
ATAAAAGTAGATTTTTG

QA 1 677 1 677
DS 

RD RS1GB91JQ 452 0 0
CACATTTATGT
AAAATACTAAAATGTAATGTTGTAAAACACAAAGACGTTAAATCCGTTTTTCATTTATTT
AAATAAAAGTAGATTTTTGATTTTTAGAGAAACTTTTGGAAGAAGCTGTGAATGTGTTGA
TTGATCTCCTCAGGCTTCTCCTCGTGGAGGAAATGTCCCACTCCCTCGAGCACTACGGTT
TCATCAAGCAACGGTACGTCCTTCTCGAATCCCCCACCGTTGATGTACTCCTTAGCCCCC
GGCGAATTGTACGTCAAATCCTGATCTCCTACTATGAACTTCACCGGTACACCAATCTTA
GCACCGGTCCAAGGTGCAGTCAGCTCCCAATTTCGGTCAATGTTGCGGTAGTAGTTAATT
GGTCCAGTGAAGCCTTTGTTCTCGTACTTGGTGACGTAATAGTCGAGGTCTTCTTGTGTT
AGCCACGGTGGTAACGCAGAA

QA 12 452 12 452
DS 

RD RS1DE14JQ 638 0 0
GAACAAG
CACATTTATGTAAAA**TACTAAAATGTAATGTTGTAAAACACAAAGACGTTAAATCCGT
TTTTCATTTATTTAAATAAAAGTAGATTTTTGATTTTTAGAGAAACTTTTGGAAGAAGCT
GTGAATGTGTTGATTGATCTCCTCAGGCTTCTCCTCGTGGAGGAAATGTCCCACTCCCTC
GAGCACTACGGTTTCATCAAGCAACGGTACGTCTTTCTTGAATCCCCCACCGTTGATGTA
CTCCTTAGCCCCCGGCGAATTGTACGTCAAATCCTGATCTCCTACTATGAACTTCACCGG
TACACCAATCTTAGCACCGGTCCAAGGTGCAGTCAGCTCCCAATTTCGGTCAATGTTGCG
GTAGTAGTTAATTGGTCCAGTGAAGCCTTTGTTCTCGTACTTGGTGACGTAATAGTCGAG
GTCTTCTTGTGTTAGCCACGGTGGTAACGCAGAAGACGCACCACCGTTTTCTGAGCTTTT
GAATAGTTTGCCTTTGGGGAGGTAAAGCGGTCCAGGCGTTTTGTAAGTAAAGAAATCTTT
CAACACCTTGGCTGTTCCCAATGTTTCGAACTCTGCTTCTATCTCTCCAGGTTTCTGAAA
CCTGCAGATGTAATAATCGTCACCAAGGAAA

QA 8 638 8 638
DS 

RD RS1DE14TF 624 0 0
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ATAATCGTCACCAAGGAAACGTCTCAAGGTCGGAATCGGGACACGATCTGGGTTCCTCGG
AGAGAAGAGGACACTCATGTTGACCAGTGCTTTGACTTTCTCCGGTCGGTACATACACAA
CTGCCACGCGATCACCGCTCCCCAGTCATGGCCCACCACGAAAACCGGCTCGTCTCCACC
GGTCACTGCGTCGATGAGTGCCACCAAGTCTCCGACCATGTTGAAGTAAGTATAGTCCTC
CACTTTCTCCGGCGCGTCTGTGTCTCCGTATCCTCTAAGATCCGGCGCGATGGTACGGTA
CCCTAGGGACGAAAGCGCAGTCATCTGGTGCCGCCACGTGTACCAAAGCTCAGGGAATCC
GTGGATGAAGAGGATGATCGGGTCTCCTCCAGATCCGGATCCGGGAAGCTCGGCCACGTG
CATGTTTATGCCGTTTACTTTGAGGGTTTTGTGCTCTACGCCGTCGAGTCCTGACATGTT
CACGGTGGTGGTAGGTTTGTTTGTTTGATCTGGTTGTTGTTTCCCGAGAAAGTGAAGGAA
TCTATAAAAGAAATGGTTTAGATC

QA 1 624 1 624
DS 

RD RS1GB91TF 567 0 0
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CCTCGGAGAGAAGAGGACACTCATGTTGACCAGTGCTTTGACTTTCTCCGGTCGGTACAT
ACACAACTGCCACGCGATCATCGCTCCCCAGTCATGGCCCACCACGAAAACCGGCTCGTC
TCCACCGGTCACTGCGTCGATGAGTGCCACAAAGTCTCCGACCATGTTGAAGTAAGTATA
GTCCTCCACTTTCTCCGGCGCGTCTGTGTCTCCGTATCCTCTAAGATCCGGCGCGATGGT
ACGGTACCCTAGGGACGAAAGCGCAGTCATCTGGTGCCGCCACGTGTACCAAAGCTCAGG
GAATCCGTGGATGAAGAGGATGATCGGGTCTCCTCCAGATCCGGATCCGGGAAGCTCGGC
CACGTGCATGTTTATGCCGTTTACTTTGAGGGTTTTGTGCTCTACGCCGTTGAGTCCTGA
CATGTTCACGGTGGTGGTAGGTTTGTTTGTTTGATCTGGTTGTTGTTTCCCGAGAAAGTG
AAGGAATCTATAAAAGAAATGGTTTA
C

QA 1 566 1 566
DS 



AS 1 9

CO CL197Contig1 887 9 8 U
AGGGGACAGCAAAGAAGATGTTTCAAAAAAACACAGTGAAGATGTACCTCATATTTTTTG
CGTTTCTCTTCAATAGTTGCACAGCCAACAAAGTGGCAGATTCTCTGATTCAAAAATCTT
GCAAGAAAGCTGCAGAGTTTCTAGGTGAAGAAAACGAGCCACATTTCGAAAAGGATTGCA
TTGCATCTCTCAGAGAGAATCCAGAGAGCCAGAAAGTGAGAAATCTCGAAGAACTGACCA
TGGTGGGAGTGAATAATGCCATATCTAACTTAACGAACGTGAGAAGAATTGTGGAGAATA
TTATAAAAGAGAAGAAATATAAGAGTAATCTTAGTAAGAAGCTTTTGGAAGATTGCCTTA
AACTTTACTCCAAGAGCTTTAAATCGTTAAGTTCAGGTTTGAATCACTGCAAGGTGCGGA
ATTTCGAAAAGGCTAAAAATAATTTTTATGATGCAGAGGATGCACCGATATTTTGCGGAA
TGAAATTCAACGGCGACAATCAACAGATATCTCCCGTGAAAAAGGAGAATGATTTTCTCA
TAACAATGATCGAAATACCTTTGCAGTTTGCTATAGATATCATTAGCCAGAGTGGAAGAT
TCTCCACAGTAAAAGATTAAAAATAAAAACAATGAGGAAGAAATAAGCTAGTGGAGTCTC
TCATTAGAAATAAATTAGGTTTTTGGAGATGCTTACCAGGCTAGCATCCAATTAAAGATA
AGGGTGTTAAGTGAGTTCTACTTAAGCAAAAGTTATGAAAATATAGTTAGTTCTTCTTAA
CAATAACTTTTTTTTGTTAGAAAATTGTTTTTTGTTTGGATCATGTAGTCAAATGATATT
TTCTGGTTATAAGGAAATTATGCATATAAGAACATTACTTTTTGACC


BQ
10 10 10 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GJ11TF U 4
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AF RS1D163TF U 5
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RD RS1GJ11TF 515 0 0
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AGAAAGCTGCAGAGTTTCTAGGTGAAGAAAACGAGCCACATTTCGAAAAGGATTGCATTG
CATCTCTCAGAGAGAATCCAGAGAGCCAGAAAGTGAGAAATCTCGAAGAACTGACCATGG
TGGGAGTGAATAATGCCATATCTAACTTAACGAACGTGAGAAGAATTGTGGAGAATATTA
TAAAAGAGAAGAAATATAAGAGTAATCTTAGTAAGAAGCTTTTGGAAGATTGCCTTAAAC
TTTACTCCAAGAGCTTTAAATCGTTAAGTTCAGGTTTGAATCACTGCAAGGTGCGGAATT
TCGAAAAGGCTAAAAATAATTTTTATGATGCAGAGGATGCACCGATATTTTGCGGAATGA
AATTCAACGGCGACAATCAT*AGATATCTCCCGTG

QA 1 515 1 515
DS 

RD RS1BP92TF 662 0 0
AGGGGACAGCAAAGAAGATGTTTCAAAAAAACACAGTGAAGATGTACCTCATATTTTTTG
CGTTTCTCTTCAATAGTTGCACAGCCAACAAAGTGGCAGATTCTCTGATTCAAAAATCTT
GCAAGAAAGCTGCAGAGTTTCTAGGTGAAGAAAACGAGCCACATTTCGAAAAGGATTGCA
TTGCATCTCTCAGAGAGAATCCAGAGAGCCAGAAAGTGAGAAATCTCGAAGAACTGACCA
TGGTGG*AGTGAATAATGCCATATCTAACTTAACGAACGTGAGAAGAATTGTGGAGAATA
TTATAAAAGAGAAGAAATATAAGAGTAATCTTAGTAAGAAGCTTTTGGAAGATTGCCTTA
AACTTTACTCCAAGAGCTTTAAATCGTTAAGTTCAGGTTTGAATCACTGCAAGGTGCGGA
ATTTCGAAAAGGCTAAAAATAATTTTTATGATGCAGAGGATGCACCGATATTTTGCGGAA
TGAAATTCAACGGCGACAATCAACAGATATCTCCCGTGAAAAAGGAGAATGATTTTCTCA
TAACAATGATCGAAATACCTTTGCAGTTTGCTATAGATATCATTAGCCAGAGTGGAAGAT
TCTCCACAGTAAAAGATTAAAAATAAAA*CAATGAGGAAGAAATAAGCTAGTGGAGTCTC
TC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RS1CU57TF 715 0 0
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TTCTCTTCAATAGTTGCACAGCCAACAAAGTGGCAGATTCTCTGATTCAAAAATCTTGCA
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TTAGAAATAAATTAGGTTTTTGGAGATGCTTACCAGGCTAGCATCCAATTAAA
TA

QA 1 713 1 713
DS 

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TTCTCTTCAATAGTTGCACAGCCAACAAAGTGGCAGATTCTCTGATTCAAAAATCTTGCA
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CAATGATCGAAATACCTTTGCAGTTTGCTATAGATATCATTAGCCAGAGTGGAAGATTCT
CCACAGTAAAAGATTAAAAATAAAAACAATGAGGAAGAAATAAGCTAGTGGAGTCTCTCA
TTAGAAATAAA

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DS 

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TCTCTTCAATAGTTGCACAGCCAACAAAGTGGCAGATTCTCTGATTCGAAAATCTTGCAA
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DS 

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TGCATTGCATCTCTCAGAGAGAATCCAGAGAGCCAGAAAGTGAGAAATCTCGAAGAACTG
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TTAACAATAACTTTTTTTTGTTAGAAAATTGTTTTTTGTTTGGATCATGTAGTCAAATGA
TATTTTCTGGTTATAAGGAAATTATGCATAT

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DS 

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DS 

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TCTACTTAAGCAAAAGTTATGAAAATATAGTTAGTTCTTCTTAACAATAACTTTTTTTTG
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ATTATGCATAT

QA 1 731 1 731
DS 

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TTGTGGAGAATATTATAAAAGAGAAGAAATATAAGAGTAATCTTAGTAAGAAGCTTTTGG
AAGATTGCCTTAAACTTTACTCCAAGAGCTTTAAATCGTTAAGTTCAGGTTTGAATCACT
GCAAGGTGCGGAATTTCGAAAAGGCTAAAAATAATTTTTATGATGCAGAGGATGCACCGA
TATTTTGCGGAATGAAATTCAACGGCGACAATCAACAGATATCTCCCGTGAAAAAGGATA
ATGATTTTCTCATAACAATGATCGAAATACCTTTGCAGTTTGCTATAGATATCATTAGCC
AGAGTGGAAGATTCTCCACAGTAAAAGATTAAAAATAAAAACAATGAGGAAGAAATAAGC
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TCAAATGATATTTTCTGGTTATAAGGAAATTATGCATATAAGAACATTACTTTTTGACC

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DS 



AS 1 12

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TCTCTTTTTTGGAACTAATAAGAAACATAGCTAAACAATAGAATAATAACATAAATATAG
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GAACAGATGCATAATACTCATAATAATCCGGTCCATTGAGAGTTTTGAAACCTTAAATAG
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GGCATCAAGGTCACGGAACTCATTCTGGTCCCACCACATGCGGCCTTGGGTAGCACAGTA
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GGGTGCATTAGCCCAATTGGTTTTCTCTAGACCTCCTCTGGTGGCCCAATCGTCAGCGTT
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TGCGTTCTTGAACACACGGATTGGTATGTTGTCAACAAAGAATACAATTTGGTAGAGATT
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CCTGTTACCGAGAAACTCGAAGTCTATCTCGTCATGCTCGTTGTTAGTCGACGACAGATA
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GGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 30 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 50 50 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 25 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 
55 55 25 55 55 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A344JQ U 94
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RD RS1A344JQ 234 0 0
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QA 1 234 1 234
DS 

RD RS1EG78JQ 658 0 0
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TACTCACACGTCTCTGTCCCGTTTACATTCGGCTGGCATAACTGGGAACCTTGTACGGTC
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GGCATCA*GGTCACGGAACTCATTCTGGTCCCACCACATGCGGCCTTGGGTAGCACAGTA
CTTGGCCTCCAAGGAAGCTTGGCACCCGTCGATGTGGAATCCTCTGTAGGAAGCTATGAA
GGGTGCATTAGCCCAATTGGTTTTCTCTAGACCTCCTCTGGTGGCCCAATCGTCAGCGTT
CCAAAGGCTCGAGTATAGCTTCATCGGTTGGTTGAATGGGAAACGTACTCCTAGATCCTT
TGCGTTCTTGAACACACGGATTGGTATGTTGTCAACAAAGAATACAATTTGGTAGAGA

QA 1 658 1 658
DS 

RD RS1A344TR 563 0 0
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AGCATCAACATAACGTAACAACAGGCATACATATTTCATAGCAATCTTTTGAACAGATGC
ATAATACTCATAATAATCCGGTCCATTGAGAGTTTTGAAACCTTAAATAGTACTCACACG
TCTCTGTCCCGTTTACATTCGGCTGGCATAACTGGGAACCTTGTACGGTCGGTACAGTAG
TTGTAGATGGTCCATTTCATGCGAACCCATTTGAGACGACGATATTGTTCGGCATCAAGG
TCACGGAACTCATTCTGGTCCCACCACATGCGGCCTTGGGTAGCACAGTACTTGGCCTCC
ACAGAAGCTTGGCACCCGTCGATGTGGAATCCTCGGTAGGAAGCTATGAAGGGTGCATTA
GCCCAATTGGTTTTCTCTAGACCTCCTCTGGTGGCCCAATCGTCAGCGTTCCAAAGGCTC
GAGTATAGCTTCATCGGTTGGTTGAATGGGAAACGTACTCCTAGACCCTTTGCGTTCTTG
AACACACGGATTGGTATGTTGTC

QA 1 563 1 563
DS 

RD RS1GY74JQ 573 0 0
G
AACAATAGGATAATAACATAAATATAGGTCCAAACAAAGCATCAACATAACGTACCAACA
GGCATACATATTTCATAGCAATCTTTTGAACAGATGCATAATACTCATAATAATCCGGTC
CATTGAGAGTTTTGAAACCTTAAATAGTACTCACACGTCTCTGTCCCGTTTACATTCGGC
TGGCATAACTGGGAACCTTGTACGGTCGGTACAGTAGTTGTAGATGGTCCATTTCATGCG
AACCCATTTGAGACGACGATATTGTTCGGCATCAAGGTCACGGAACTCATTCTGGTCCCA
CCACATGCGGCCTTGGGTAGCGCAGTACTTGGCCTCCAAGGAAGCTTGGCACCCGTCGAT
GTGGAATCCTCTGTAGGAAGCTATGAAGGGTGCATTAGCCCAATTGGTTTTCTCTAGACC
TCCTCTGGTGGCCCAATCGTCAGCGTTCCAAAGGCTCGAGTATAGCTTCATCGGTTGGTT
GAATGGGAAACGTACTCCTAGATCCTTTGCGTTCTTGAACACACGGATTGGTATGTTGTC
AACAAAGAATACAATTTGGTAGAGATTCCAGA

QA 2 573 2 573
DS 

RD RS1DO90JQ 876 0 0
GCCAACAAAAGACTTGTAAGTTTTATAAATCACGTGACAGATAAGAAACGTAGCTCTCTT
TTTTGGAACTAATAAGAAACATAGCTAAACAATAGAATAATAACATAAATATAGGTCCAA
ACAAAGCATCAACATAACGTAACAACAGGCATACATATTTCATAGCAATCTTTTGAACAG
ATGCATAATACTCATAATAATCCGGTCCATTGAGAGTTT*GAAACCTTAAATAGTACTCA
CACGTCTCTGTCCCGTTTACATTCGGCTGGCATAACTGGGAACCTTGTACGGTCGGTACA
GTAGTTGTAGATGGTCCATTTCATGCGAACCCATTTGAGACGACGATATTGTTCGGCATC
AAGGTCACGGAACTCATTATGGTCCCACCACATGCGGCCTTGGGTAGCACAGTACTTGGC
CTCCACAGAAGCTTGGCACCCGTCGATGTGGAATCCTCGGTAGGAAGCTATGAAGGGTGC
ATTAGCCCAATTGGTTTTCTCTAGACCTCCTCTGGTGGCCCAATCGTCAGCGTTCCAAAG
GCTCGAGTATAGCTTCATCGGTTGGTTGAATGGGAAACGTACTCCTAGATCCTTTGCGTT
CTTGAACACACGGATTGGTATGTTGTCAACAGAGAATACAATTTGGTAGAGATTCCGGAA
GATGGAGTAAGTATGATAAGCCTTTGAAGGGTCGAACCAGAGATAAATGCGTTGCTCTCT
GTTTCCCTTTCCTCCTGTGAACACATTAGTCTGCAATATTGCTGGCTGGCCTGTCCTGTT
CCCGAGAAACTCGAAGTCTATCTCGTCATGCTCGTTGTTAGTCGACGACAGATAAA*TGC
AGTGACGACCC*AGCGGTATCACCAGCTGGCAGCTT

QA 1 876 1 876
DS 

RD RS1CB07JQ 865 0 0
CGTAGCTCTCTTTTTTGGAACTAATAAGAAACATAGCTAAACAATAGAATAATAACATAA
ATATAGGTCCAAACAAAGCATCAACATAACGTACCAACAGGCATACATATTTCATAGCAA
TCTTTTGAACAGATGCATAATACTCATAATAATCCGGTCCATTGAGAGTTTTGAAACCTT
AAATAGTACTCACACGTCTCTGTCCCGTTTACATTCGGCTGGCATAACTGGGAACCTTGT
ACGGTCGGTACAGTAGTTGTAGATGGTCCATTTCATGCGAACCCATTTGAGACGACGATA
TTGTTCGGCATCAAGGTCACGGAACTCATTCTGGTCCCACCACATGCGGCCTTGGGTAGC
ACAGTACTTGGCCTCCAAGGAAGCTTGGCACCCGTCGATGTGGAATCCTCTGTAGGAAGC
TATGAAGGGTGCATTAGCCCAATTGGTTTTCTCTAGACCTCCTCTGGTGGCCCAATCGTC
AGCGTTCCAAAGGCTCGAGTATAGCTTCATCGGTTGGTTGAATGGGAAACGTACTCCTAG
ATCCTTTGCGTTCTTGAACACACGGATTGGTATGTTGTCAACAAAGAATACAATTTGGTA
GAGATTCCAGAGGATGGAGTAAGTATGATAAGCCTTTGAAGGGTCGAACCAGAGATAAAT
GCGTTGCTCTCTGTTTCCCTTCCCTCCTGTGAACACATTCGTCTGCAATATTGCTGGCTG
GCCTGTCCTGTTACCGAGAAACTCGAAGTCTATCTCGTCATGCTCGTTGTTAGTCGACGA
CAGATAAAATGCAGTGACGACCCCAGCGGTATCACCAGCTGGCAGCTTT*TGTGCATACT
GAAATGTCCGAACAA*TATGACCCT

QA 1 865 1 865
DS 

RD RS1EG78TF 672 0 0
CTCTGGTGGCCCAATCGTCAGCGTTCCAAAGGCTCGAGTATAGCTTCATCGGTTGGTTGA
ATGGGAAACGTACTCCTAGATCCTTTGCGTTCTTGAACACACGGATTGGTATGTTGTCAA
CAAAGAATACAATTTGGTAGAGATTCCAGAGGATGGAGTAAGTATGATAAGCCTTTGAAG
GGTCGAACCAGAGATAAATGCGTTGCTCTCTGTTTCCCTTCCCTCCTGTGAACACATTCG
TCTGCAATATTGCTGGCTGGCCTGTCCTGTTACCGAGAAACTCGAAGTCTATCTCGTCAT
GCTCGTTGTTAGTCGACGACAGATAAAATGCAGTGACGACCCCAGCGGTATCACCAGCTG
GCAGCTTTATGTGCATACTGAAATGTCCGAACAAATATGACCCTTTGGATTGAAACCCTG
TCCCAGTGTATTTGTCGAGGATGAGTTGGAGTTCAGAACCGCCATTGAGTTGCTTCTGGT
GGCCAAAAGCCCAAGTTGGGACGTAGTTTCGGCCGAATGGCGCATCAATGGCCTTCCTTG
GAGGAATTGCCATTACAGTAGAAGAGGCCATCAGAAACAGAGCTATGAGAGCCCATGGAC
TTGAAGAAACAGCCATTGCTGGTTTGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGTGATGATGGTGA
ATGATGTGGTCC

QA 1 672 1 672
DS 

RD RS1GY74TF 669 0 0
GGTGGCCCAATCGTCAGCGTTCCAAAGGCTCGAGTATAGCTTCATCGGTTGGTTGAATGG
GAAACGTACTCCTAGATCCTTTGCGTTCTTGAACACACGGATTGGTATGTTGTCAACAAA
GAATACAATTTGGTAGAGATTCCAGAGGATGGAGTAAGTATGATAAGCCTTTGAAGGGTC
GAACCAGAGATAAATGCGTTGCTCTCTGTTTCCCTTCCCTCCTGTGAACACATTCGTCTG
CAATATTGCTGGCTGGCCTGTCCTGTTACCGAGAAACTCGAAGTCTATCTCGTCATGCTC
GTTGTTAGTCGACGACAGATAAAATGCAGTGACGACCCCAGCGGTATCACCAGCTGGCAG
CTTTATGTGCATACTGAAATGTCCGAACAAATATGACCCTTTGGATTGAAACCCCGTCCC
AGTGTGTTTGTCGAGGATGAGTTGGAGTTCAGAACCGCCATTGAGTTGCTTCTGGTGGTC
AAAAACCCAAGTTGGGACGTAGTTTCGGCCGAATGGCACATCAATAGCCTTCCTTGGAGG
AATTGCCATTACAGTAGAAGAGGCCATCAGAAACAGAGCTATGAGAGCCCATGGACTTGA
AGAAACAGCCATTGCTGGTTTGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGTGATGATGGTGAATGA
TGTGGTCC
C

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1CB07TF 725 0 0
TCTGTAGGAAGCTATGAAGGGTGCATTAGCCCAATTGGTTTTCTCTAGAC*TCCTCTGGT
GGCCCAATCGTCAGCGTTCCAAAGGCTCGAGTATAGCTTCATCGGTTGGTTGAATGGGAA
ACGTACTCCTAGATCCTTTGCGTTCTTGAACACACGGATTGGTATGTTGTCAACAAAGAA
TACAATTTGGTAGAGATTCCAGAGGATGGAGTAAGTATGATAAGCCTTTGAAGGGTCGAA
CCAGAGATAAATGCGTTGCTCTCTGTTTCCCTTCCCTCCTGTGAACACATTCGTCTGCAA
TATTGCTGGCTGGCCTGTCCTGTTACCGAGAAACTCGAAGTCTATCTCGTCATGCTCGTT
GTTAGTCGACGACAGATAAAATGCAGTGACGACCCCAGCGGTATCACCAGCTGGCAGCTT
TATGTGCATACTGAAATGTCCGAACAAATATGACCCTTTGGATTGAAACCCTGTCCCAGT
GTATTTGTCGAGGATGAGTTGGAGTTCAGAACCGCCATTGAGTTGCTTCTGGTGGTCAAA
AGCCCAAGTTGGGACGTAGTTTCGGCCGAATGGCACATCAATGGCCTTCCTTGGAGGAAT
TGCCATTACAGTAGAAGAGGCCATCAGAAACAGAGCTATGAGAGCCCATGGACTTGAAGA
AACAGCCATTGCTGGTTTGGAGAGAGAGAGAG****AGATGTGATGATGGT
GAATGATGTGGTCC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RS1DO90TF 791 0 0
TAT
GTCCCACCACATGCGGCTT**GGTAGCACAGTACTTGGCCTCCACAGAAGCTTGGCACC*
GTCGATGTGGA*TCCTCGGTAGGAAGCTATGAAGGGTGCATTAGCCCAATTGGTTTTCTC
TAGAC*TCCTCTGGTGGCCCAATCGTCAGCGTTCCAAAGGCTCGAGTATAGCTTCATCGG
TTGGTTGAATGGGAAACGTACTCCTAGATCCTTTGCGTTCTTGAACACACGGATTGGTAT
GTTGTCAACAGAGAATACAATTTGGTAGAGATTCCGGAGGATGGAGTAAGTATGATAAGC
CTTTGAAGGGTCGAACCAGAGATAAATGCGTTGCTCTCTGTTTCCCTTTCCTCCTGTGAA
CACATTAGTCTGCAATATTGCTGGCTGGCCTGTCCTGTTCCCGAGAAACTCGAAGTCTAT
CTCGTCATGCTCGTTGTTAGTCGACGACAGATAAAATGCAGTGACGACCCCAGCGGTATC
ACCAGCTGGCAGCTTTATGTGCATACTGAAATGTCCGAACAAATATGACCCTTTGGATTG
AAACCCTGTCCCAGTGTATTTGTCGAGGATGAGTTGGAGTTCAGAACCACCATTGAGTTG
CTTCTGGTGGTCAAAAGCCCAAGTTGGGACGTAGTTTCGGCCGAATGGCACATCAATGGC
CTTCCGTGGAGGAATTGCCATTACAGTAGAAGAGGCCATCAGAAACAGAGCTATGAGAGC
CCATGGACTTGAAGAAACAGCCATTGCTGGTTTGAAGAGAGAGAGA*****AGATGTGAT
GATGGT
CC

QA 4 789 4 789
DS 

RD RS1A344TF 736 0 0
CCTCGGTAGGAAGCTATGAAGGGTGCATTAGCCCAATTGGTTTTCTCTAGACCTCCTCTG
GTGGCCCAATCGTCAGCGTTCCAAAGGCTCGAGTATAGCTTCATCGGTTGGTTGAATGGG
AAACGTACTCCTAGACCCTTTGCGTTCTTGAACACACGGATTGGTATGTTGTCAACAAAG
AATACAATTTGGTAGAGATTCCAGAGGATGGAGTAAGTATGATAAGCCTTTGAAGGGTCG
AACCAGAGATAAATGCGTTGCTCTCTGTTTCCCTTTCCTCCTGTGAGCACATTAGTCTGC
AATATTGCTGGCTGGCCTGTCCTGTTCCCGAGAAACTCGAAGTCTATCTCGTCATGCTCG
TTGTTAGTCGACGACAGATAAAATGCAGTGACGACCCCAGCGGTATCACCAGCTGGCAGC
TTTATGTGCATACTGAAATGTCCGAACAAATATGACCCTTTGGATTGAAACCCTGTCCCA
GTGTATTTGTCGAGGATGAGTTGGAGTTCAGAACCACCATTGAGTTGCTTCTGGTGGTCA
AAAGCCCAAGTTGG*ACGTAGTTTCGGCCGAATGGCACATCAATGGCCTTCCGTGGAGGA
ATTGCCATTACAGTAGAAGAGGCCATCAGAAACAGAGCTATGAGAGCCCATGGACTTGAA
GAAACAGCCATTGCTGGTTTGAAGAGAGAGAGA*****AGATGTGATGATGGTCCCCCG*
GCCGTAATGGCCGAAT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RS1A344TV 925 0 0
GGTACAGTAGTTGTAGATGGTCCATTTCATGCGAACCCATTTGAGACGACGATATTGTTC
GGCATCAAGGTCACGGAACTCATTCTGGTCCCACCACATGCGGCTTTGGGTAGCACAGTA
CTTGGCCTCCACAGAAGCTTGGCACCCGTCGATGTGGAATCCTCGGTAGGAAGCTATGAA
GGGTGCATTAGCCCAATTGGTTTTCTCTAGACCTCCTCTGGTGGCCCAATCGTCAGCGTT
CCAAAGGCTCGAGTATAGCTTCATCGGTTGGTTGAATGGGAAACGTACTCCTAGACCCTT
TGCGTTCTTGAACACACGGATTGGTATGTTGTCAACAAAGAATACAATTTGGTAGAGATT
CCAGAGGATGGAGTAAGTATGATAAGCCTTTGAAGGGTCGAACCAGAGATAAATGCGTTG
CTCTCTGTTTCCCTTTCCTCCTGTGAGCACATTAGTCTGCAATATTGCTGGCTGGCCTGT
CCTGTTCCCGAGAAACTCGAAGTCTATCTCGTCATGCTCGTTGTTAGTCGACGACAGATA
AAATGCAGTGACGACCCCAGCGGTATCACCAGCTGGCAGCTTTATGTGCATACTGAAATG
TCCGAACAAATATGACCCTTTGGATTGAAACCCTGTCCCAGTGTATTTGTCGAGGATGAG
TTGGAGTTCAGAACCACCATTGAGTTGCTTCTGGTGGTCAAAAGCCCAAGTTGG*ACGTA
GTTTCGGCCGAATGGCACATCAATGGCCTTCCGTGGAGGAATTGCCATTACAGTAGAAGA
GGCCATCAGAAACAGAGCTATGAGAGCCCATGGACTTGAAGAAACAGCCATTGCTGGTTT
GAAGAGAGAGAGA*****AGATGTGATGATGGTCCCCCG*GCCGTAATGGCCGAATTCCC
GGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 925 1 925
DS 



AS 2 12

CO CL199Contig1 1525 10 22 U
CCTCAAATATAAAAGTCAACCACACATAGAAATCAAAAACCAAACATAGACCAGACTCCA
GAGTTACTTGGTTCGACTAAAGCAAGAAGCAACAAAAACAAAAAAAGAAAACAGATAATT
TAAATTCTTCTTCATTTCCTTACAAACGAAGTCTTTTTTTTTT**TCTTAATAATAATTA
TCTCAGAAGCTAAAGATGTAGAATGCTTTGATTTAAAACACCACCAAAAGGGAATTGCAC
ATATTTAGTAATAATTAGAAAGCTTCTGAATCATTCATTTTCCAACGAAGTCTTTTAAGC
TCTCATCTTCGATTTCTCCATAGTTCTCGGTGCTGGAGCTGCAGCTAACCCAATGGCATC
AGAGCCTTTCATTATCTTGAGCTTCTTGCAGACACCAATAAATATCTCCCATGAAAAATC
GCCAACAAGCATCCAGTCCCCATCCTTGTCCTCATAGGTGAGCACATAGTCCTTTCCATT
CAGAAGATCCTTGAGTCTGGTCTCATTACGCACATCTTTCCCTGTAGCTCCGCTAGATCC
AGGTTGACCAAGAGTGAAAGTGCTGAACATTTTCTCCAAGGCTGCAGAAAGCTCCCCATA
GTTAGTGTAGCTCCTCAGGTCAACTTTCCTCAGATATGGAGCACCATCCATACTGACCTT
CACAAAGAGAGGCCCAGAACCTGGCTTCCCATCAACTTCATCACTGTTCTTACAAGTGGT
GGCCAATGTGTTCTTCCTGTAGGATCTCACTGGAGGCCAACCAACAATCTGTGCCTTGGC
CGCAGGTGGGCTAGAGCTATTGTTTGTAGTGCTCTGCTTTCCTTTAGGTATACTCTGTGG
CACTTCATTCTTCACAACAGATTGGTTGGCTACCACCGCTTCAGGAAACATCCAGTTTTT
CTCAGTATAAACAGAGACTTTAGCTTCAGAGAACTTATCCATAGTGTCAGAGAAGCCTCT
TTTGTTCCCCGAGGCAATGTTCTTCTGAGAAGAGGAGCAGCTGATCTCATCCTTGGAAGG
AAGCAAAGGAAAGAAAGGTTTCTCATCGAGCTTAGCCGGGCCAAGCAAGTTGAGCTCAGT
GTTGTCTCTAGGAGGAGACTGTGATCCAGGAAGGCCGAGTGTGAGCTCAGTGGCCTTGAG
GCTGATAGTGGCTTTGTCATCATCTGCAAGGCCGGAGAGATTTGAGCTTCCAACAGAGGA
ACAATCAGAGAGACCCAAGTAGTTGTGCTCCTTGAGTCCTCCTTCAGAGACATTGCTCTG
TAGCTTCTCTTCCGGTGACATTTTGGAAACTTATGGTTGTTTCTTCAACTCAAAGAGAAA
ACGAATCGCTGATTGAAAATGGAGCTCGCGAAGAAGAAGAAGATCGATTAGATTCAGATA
TTAGCAGAGAAGGAGAATAATCAAGGAGCTGTAGAGAGAGAGAGAGAGGTGTTAAGTTCC
TTCCATTAAAGCACAAAAGCTTTATTATCATCACCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCC
GGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 5 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 35 
35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1CB33JQ U 1
AF RS1GW31JQ U 117
AF RS1B211JQ U 109
AF RS1D388JQ U 117
AF RS1A283JQ U 117
AF RS1A283TR U 167
AF RS1B211TF C 827
AF RS1D388TF C 784
AF RS1A283TV C 713
AF RS1A283TF C 741
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TAAATTCTTCTTCATTTCCTTACAAACGAAGTCTTTTTTTTCT**TCTTAATAATAATTA
TCTCAAAAGCTAAAGATGTAGAATGCTTTGATTTAAAACACCACCAAAAGGGAATTGCAC
ATATTTAGTAATAATTAGAAAGCTTCTGAATCATCCATTTTCCAACAAAGTCTTTTAAGC
TCTCATCTTCGATTTCTCCATAGTTCTTGGTGCTGGAGCTGCAGCTAACCCAATGGCATC
AGAGCCTTTCATTATCTTGAGCTTCTTGCAGACACCAATAAATATCTCCCATGAGAAATC
GCCAACAAGCATCCAGTCCCCATCCTTGTCCTCATAGGTGAGCACATAGTCCT

QA 1 473 1 473
DS 

RD RS1GW31JQ 365 0 0
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ATTATCTCAAAAGCTAAAGATGTAGAATGCTTTGATTTAAAACACCACCAAAAGGGAATT
GCACATATTTAGTAATAATTAGAAAGCTTCTGAATCATCCATTTTCCAACAAAGTCTTTT
AAGCTCTCATCTTCGATTTCTCCATAGTTCTTGGTGCTGGAGCTGCAGCTAACCCAATGG
CATCAGAGCCTTTCATTATCTTGAGCTTCTTGCAGACACCAATAAATATCTCCCATGAAA
AATCGCCAACAAGCATCCAGTCCCCATCCTTGTCCTCATAGGTGAGCACATAGTCCTTTC
CATTC

QA 1 365 1 365
DS 

RD RS1B211JQ 673 0 0
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TAATAATAATTATCTCAGAAGCTAAAGATGTAGAATGCTTTGATTTAAAACACCACCAAA
AGGGAATTGCACATATTTAGTAATAATTAGAAAGCTTCTGAATCATTCATTTTCCAACGA
AGTCTTTTAAGCCCTCATCTTCGATTTCTCCATAGTTCTCGGTGCTGGAGCTGCAGCTAA
CCCAATGGCATCAGAGCCTTTCATTATCTTGAGCTTCTTGCAGACACCAATAAATATCTC
CCATGAAAAATCGCCAACAAGCATCCAGTCCCCATCCTTGTCCTCATAGGTGAGCACATA
GTCCTTTCCATTCAGAAGATCCTTGAGTCTGGTCTCATTACGCACATCTTTCCCTGTAGC
TCCGCTAGATCCAGGTTGACCAAGAGTGAAAGTGCTGAACATTTTCTCCAAGGCTGCAGA
AAGCTCCCCATAGTTAGTGTAGCTCCTCAGGTCAACTTTCCTCAGATATGGAGCACCATC
CATACTGACCTTCACAAAGAGAGGCCCAGAACCTGGCTTCCCATCAACTTCATCACTGTT
CTTACAAGTGGTGGCCAATGTGTTCTTCCTGTAGGATCTCACTGGAGGCCAACCAACAAT
CTGTGCCTTGGCC

QA 1 673 1 673
DS 

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AATTTAAATTCTTCTTCATTTCCTTACAAACGAAGTCTTTTTTTTTT**TCTTAATAATA
ATTATCTCAGAAGCTAAAGATGTAGAATGCTTTGATTTAAAACACCACCAAAAGGGAATT
GCACATATTTAGTAATAATTAGAAAGCTTCTGAATCATTCATTTTCCAACGAAGTCTTTT
AAGCTCTCATCTTCGATTTCTCCATAGTTCTCGGTGCTGGAGCTGCAGCTAACCCAATGG
CATCAGAGCCTTTCATTATCTTGAGCTTCTTGCAGACACCAATAAATATCTCCCATGAAA
AATCGCCAACAAGCATCCAGTCCCCATCCTTGTCCTCATAGGTGAGCACATAGTCCTTTC
CATTCAGAAGATCCTTGAGTCTGGTCTCATTACGCACATCTTTCCCTGTAGCTCCGCTAG
ATCCAGGTTGACCAAGAGTGAAAGTGCTGAACATTTTCTCCAAGGCTGCAGAAAGCTCCC
CATAGTTAGTGTAGCTCCTCAGGTCAACTTTCCTCAGATATGGAGCACCATCCATACTGA
CCTTCACAAAGAGAGGCCCAGAACCTGGCTTCCCATCAACTTCATCACTGTTCTTACAAG
TGGTGGCCAATGTGTTCTTCCTGTAGGATCTCACTGGAGGCCAACCAACAATCTGTGCCT
TGGCCGCAGGTGGGCTAGAGCTATTGTTTGTAGTGCTCTGCTTTCCTTTAGGTATGCTCT
GTGGCACTTCATTCTTCACAACAG

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1A283JQ 779 0 0
AT
TTTAAATTCTTCTTCATTTCCTTACAAACGAAGTCTTTTTTTTT***TCTTAATAATAAT
TATCTCAGAAGCTAAAGATGTAGAATGCTTTGATTTAAAACACCACCAAAAGGGAATTGC
ACATATTTAGTAATAATTAGAAAGCTTCTGAATCATTCATTTTCCAACGAAGTCTTTTAA
GCTCTCATCTTCGATTTCTCCATAGTTCTCGGTGCTGGAGCTGCAGCTAACCCAATGGCA
TCAGAGCCTTTCATTATCTTGAGCTTCTTGCAGACAC*AATAAATATCTCCCATGAAAAA
TCGCCAACAAGCATCCAGTCCCCATCCATGTCCTCATAGGGGAGCACATAGTCCTTTCCA
TTCAGAAGATCCTTGAGTCTGGTCTCATTACGCACATCTTTCCCTGTAGCTCCGCTAGAT
CCAGGTTGACCAAGAGTGAAAGTGCTGAACATTTTCTCCAAGGGTGCAGAAAGCTCCCCA
TAGTTAGTGTAGCTCCTCAGGTCAACTTTCCTCAGATATGGAGCACCATCCATACTGACC
TTCACAAAGAGAGGCCCAGAACCTGGCTTCCCATCAACTTCATCACTGTTCTTACAAGTG
GTGGCCAATGTGTTCTTCCTGTAGGATCTCACTGGAGGCCAACCAACAATCTGTGCCTTG
GCCGCAGGTGGGCTAGAGCTATTGTTTGTAGTGCTCTGCTTTCCTTTAGGTATACTCTGT
GGCACTTCATTCTTCACAACAGATTGGTTGGCTACCACCGCTTCAGGAAACATCCAG

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DS 

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CTTAATAATAATTATCTCAGAAGCTAAAGATGTAGAATGCTTTGATTTAAAACACCACCA
AAAGGGAATTGCACATATTTAGTAATAATTAGAAAGCTTCTGAATCATTCATTTTCCAAC
GAAGTCTTTTAAGCTCTCATCTTCGATTTCTCCATAGTTCTCGGTGCTGGAGCTGCAGCT
AACCCAATGGCATCAGAGCCTTTCATTATCTTGAGCTTCTTGCAGACAC*AATAAATATC
TCCCATGAAAAATCGCCAACAAGCATCCAGTCCCCATCCATGTCCTCATAGGTGAGCACA
TAGTCCTTTCCATTCAGAAGATCCTTGAGTCTGGTCTCATTACGCACATCTTTCCCTGTA
GCTCCGCTAGATCCAGGTTGACCAAGAGTGAAAGTGCTGAACATTTTCTCCAAGGCTGCA
GAAAGCTCCCCATAGTTAGTGTAGCTCCTCAGGTCAACTTTCCTCAAATATGGAGCACCA
TCCATACTGACCTTCACAAAGAGAGGCCCAGAACCTGGCTTCCCATCAACTTCATCACTG
TTCTTACAAGTGGTGGCCAATGTGTTCTTCCTGTAGGATCTCACTGGAGGCCAACCAACA
ATCTGTGCCTTGGCCGCAGGTGGGCTAGAGCTATTGTTTGTAGTGCTCTGCTTTCCTTTA
GGTATACTCTGTGGCACTTCATTCTTCACAACAGATTGGTTGGCTACCACCGCTTCAGGA
AACATCCAGTTTTTCTCAGTATAAACAGAGACTTTAGCTTCAGAGAACTTATCCATAGTG
TCAGAGAAGCCTCTTTTGTTCCCCGAGGCAATGT

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DS 

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AACATCCAGTTTTTCTCAGTATAAACAGAGACTTTAGCTTCAGAGAACTTATCCATAGTG
TCAGAGAAGCCTCTTTTGTTCCCCGAGGCAATGTTCTTCTGAGAAGAGGAGCAGCTGATC
TCATCCTTGGAAGGAAGCAAAGGAAAGAAAGGTTTCTCATCGAGCTTAGCCGGGCCAAGC
AAGTTGAGCTCAGTGTTGTCTCTAGGAGGAGACTGTGATCCAGGAAGGCCGAGTGTGAGC
TCAGTGGCCTTGAGGCTGATAGTGGCTTTGTCATCATCTGCAAGGCCGGAGAGATTTGAG
CTTCCAACAGAGGAACAATCAGAGAGACCCAAGTAGTTGTGCTCCTTGAGTCCTCCTTCA
GAGACATTGCTCTGTAGCTTCTCTTCCGGTGACATTTTGGAAACTTATGGTTGTTTCTTC
AACTCAAAGAGAAAACGAATCGCTGATTGAAAATGGAGCTCGCGAAGAAGAAGAAGATCG
ATTAGATTCAGATATTAGCAGAGAAGGAGAATAATCAAGGAGCTGTAGAGAGAGAGAGAG
AGGTGTTAAGTTCCTTCCATTAAAGCACAAAAGCTTTATTATCATCACACCCC

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DS 

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TTCATTCTTCACAACAGATTGGTTGGCTACCACCGCTTCAGGAAACATCCAGTTTTTCTC
AGTATAAACAGAGACTTTAGCTTCAGAGAACTTATCCATAGTGTCAGAGAAGCCTCTTTT
GTTCCCCGAGGCAATGTTCTTCTGAGAAGAGGAGCAGCTGATCTCATCCTTGGAAGGAAG
CAAAGGAAAGAAAGGTTTCTCATCGAGCTTAGCCGGGCCAAGCAAGTTGAGCTCAGTGTT
GTCTCTAGGAGGAGACTGTGATCCAGGAAGGCCGAGTGCGAGCTCAGTGGCCTTGAGGCT
GATAGTGGCTTTGTCATCATCTGCAAGGCCGGAGAGATTTGAGCTTCCAACAGAGGAACA
ATCAGAGAGACCCAAGTAGTTGTGCTCCTTGAGTCCTCCTTCAGAGACATTGCTCTGTAG
CTTCTCTTCCGGTGACATTTTGGAAACTTATGGTTGTTTCTTCAACTCAAAGAGAAAACG
AATCGCTGATTGAAAATGGAGCTCGCGAAGAAGAAGAAGATCGATTAGATTCAGATATTA
GCAGAGAAGGAGAATAATCAAGGAGCTGTAGAGAGAGAGAGAGAGGTGTTAAGTTCCTTC
CATTAAAGCACAAAAGCTTTATTATCATCAC
CC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1A283TV 813 0 0
CAAGTGGTGGCCAATGTGTTCTTCCTGTAGGATCTCACTGGAGGCCAACCAACAATCTGT
GCCTTGGCCGCAGGTGGGCTAGAGCTATTGTTTGTAGTGCTCTGCTTTCCTTTAGGTATA
CTCTGTGGCACTTCATTCTTCACAACAGATTGGTTGGCTACCACCGCTTCAGGAAACATC
CAGTTTTTCTCAGTATAAACAGAGACTTTAGCTTCAGAGAACTTATCCATAGTGTCAGAG
AAGCCTCTTTTGTTCCCCGAGGCAATGTTCTTCTGAGAAGAGGAGCAGCTGATCTCATCC
TTGGAAGGAAGCAAAGGAAAGAAAGGTTTCTCATCGAGCTTAGCCGGGCCAAGCAAGTTG
AGCTCAGTGTTGTCTCTAGGAGGAGACTGTGATCCAGGAAGGCCGAGTGTGAGCTCAGTG
GCCTTGAGGCTGATAGTGGCTTTGTCATCATCTGCAAGGCCGGAGAGATTTGAGCTTCCA
ACAGAGGAACAATCAGAGAGACCCAAGTAGTTGTGCTCCTTGAGTCCTCCTTCAGAGACA
TTGCTCTGTAGCTTCTCTTCCGGTGACATTTTGGAAACTTATGGTTGTTTCTTCAACTCA
AAGAGAAAACGAATCGCTGATTGAAAATGGAGCTCGCGAAGAAGAAGAAGATCGATTAGA
TTCAGATATTAGCAGAGAAGGAGAATAATCAAGGAGCTGTAGAGAGAGAGA****GGTGT
TAAGTTCCTTCCATTAAAGCACAAAAGCTTTATTATCATCACCCCCCGGCCGTAATGGCC
GAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 813 1 813
DS 

RD RS1A283TF 785 0 0
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TGTTTGTAGTGCTCTGCTTTCCTTTAGGTATACTCTGTGGCACTTCATTCTTCACAACAG
ATTGGTTGGCTACCACCGCTTCAGGAAACATCCAGTTTTTCTCAGTATAAACAGAGACTT
TAGCTTCAGAGAACTTATCCATAGTGTCAGAGAAGCCTCTTTTGTTCCCCGAGGCAATGT
TCTTCTGAGAAGAGGAGCAGCTGATCTCATCCTTGGAAGGAAGCAAAGGAAAGAAAGGTT
TCTCATCGAGCTTAGCCGGGCCAAGCAAGTTGAGCTCAGTGTTGTCTCTAGGAGGAGACT
GTGATCCAGGAAGGCCGAGTGTGAGCTCAGTGGCCTTGAGGCTGATAGTGGCTTTGTCAT
CATCTGCAAGGCCGGAGAGATTTGAGCTTCCAACAGAGGAACAATCAGAGAGACCCAAGT
AGTTGTGCTCCTTGAGTCCTCCTTCAGAGACATTGCTCTGTAGCTTCTCTTCCGGTGACA
TTTTGGAAACTTATGGTTGTTTCTTCAACTCAAAGAGAAAACGAATCGCTGATTGAAAAT
GGAGCTCGCGAAGAAGAAGAAGATCGATTAGATTCAGATATTAGCAGAGAAGGAGAATAA
TCAAGGAGCTGTAGAGAGAGAGA****GGTGTTAAGTTCCTTCCATTAAAGCACAAAAGC
TTTATTATCATCACCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGT
CGACT

QA 1 785 1 785
DS 



CO CL199Contig2 650 2 3 U
GGGGTGTGATGATAATAAAGCTTTTGTGCTTTAATGGAAGGAACTTAACACCCCTCTCTC
TCTCTCTCTACAGCTCCTTGATTATTCTCCCTCTCTGGTAATATCTGAATCTAATCGATC
TTCTTCGCGAGCTCCATTTTCAACCAGCGATTCGTTTTCTCTCTGAGTTGAAGAAACAAC
CATAAGTTTTCAAAATGTCACCGGAAGAGAAGCTACAGAGCAATGTCTCTGATGGAGGAC
TGAAGGAGCATAACTACTTGGGTCTCTCTGACTGTTCCTCTGTTGGAAGCTCAAATCTCT
CCGGCCTTGCAGATGATGACAAAGCCACTATCAGCCTCAAGGCCACTGAGCTCACACTTG
GCCTTCCTGGATCACAGTCTCCTCCTCGAGACAACACCGAGCTCAACTTACTTGGCCCGG
CTAAGCTCGATGAGAAGCCTTTCTTTCCTTTGCTTCCTTCCAAGGATGAGATAAGCTGCT
CCTCTTCTCAGAAGAACATTGCCTCGGGGAACAAAAGAGGCTTCTCTGACACTATGGATA
AGTTCTCTGAAGCTAAAGTCTCTGTTTATTCTGAGAAAAACTGGATGTTTCCTGAAGCGG
TGGTAGCCAACCAATCTGTTGTGAAGAAGAAGTGCCACAGAACATTCCTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CB33TF U 1
AF RS1GW31TF U 48
BS 1 579 RS1CB33TF
BS 580 580 RS1GW31TF
BS 581 650 RS1CB33TF

RD RS1CB33TF 650 0 0
GGGGTGTGATGATAATAAAGCTTTTGTGCTTTAATGGAAGGAACTTAACACCCCTCTCTC
TCTCTCTCTACAGCTCCTTGATTATTCTCCCTCTCTGGTAATATCTGAATCTAATCGATC
TTCTTCGCGAGCTCCATTTTCAACCAGCGATTCGTTTTCTCTCTGAGTTGAAGAAACAAC
CATAAGTTTTCAAAATGTCACCGGAAGAGAAGCTACAGAGCAATGTCTCTGATGGAGGAC
TGAAGGAGCATAACTACTTGGGTCTCTCTGACTGTTCCTCTGTTGGAAGCTCAAATCTCT
CCGGCCTTGCAGATGATGACAAAGCCACTATCAGCCTCAAGGCCACTGAGCTCACACTTG
GCCTTCCTGGATCACAGTCTCCTCCTCGAGACAACACCGAGCTCAACTTACTTGGCCCGG
CTAAGCTCGATGAGAAGCCTTTCTTTCCTTTGCTTCCTTCCAAGGATGAGATAAGCTGCT
CCTCTTCTCAGAAGAACATTGCCTCGGGGAACAAAAGAGGCTTCTCTGACACTATGGATA
AGTTCTCTGAAGCTAAAGTCTCTGTTTATTCTGAGAAAA*CTGGATGTTTCCTGAAGCGG
TGGTAGCCAACCAATCTGTTGTGAAGAAGAAGTGCCACAGAACATTCCTA

QA 1 650 1 650
DS 

RD RS1GW31TF 579 0 0
TAACACCC
CTCTCTCTCTCTCTACAGCTCCTTGATTATTCTCCCTCTCTGGTAATATCTGAATCTAAT
CGATCTTCTTCGCGAGCTCCATTTTCAACCAGCGATTCGTTTTCTCTCTGAGTTGAAGAA
ACAACCATAAGTTTTCAAAATGTCACCGGAAGAGAAGCTACAGAGCAATGTCTCTGATGG
AGGACTGAAGGAGCATAACTACTTGGGTCTCTCTGACTGTTCCTCTGTTGGAAGCTCAAA
TCTCTCCGGCCTTGCAGATGATGACAAAGCCACTATCAGCCTCAAGGCCACTGAGCTCAC
ACTTGGCCTTCCTGGATCACAGTCTCCTCCTCGAGACAACACCGAGCTCAACTTACTTGG
CCCGGCTAAGCTCGATGAGAAGCCTTTCTTTCCTTTGCTTCCTTCCAAGGATGAGATAAG
CTGCTCCTCTTCTCAGAAGAACATTGCCTCGGGGAACAAAAGAGGCTTCTCTGACACTAT
GGATAAGTTCTCTGAAGCTAAAGTCTCTGTTTATTCTGAGAAAAACTGGATGTTTCCTGA
AGCGGTGGTAGCCAACCAATCTGTTGTGAAG

QA 9 579 9 579
DS 



AS 1 12

CO CL200Contig1 1313 12 20 U
GGATAGAGCTCGATAAGCGCGGCTTCTGTAAAGCTCCGTCGCCGTATCCGAAGCTCAAAA
AGCTTCATCAATGGCGTCTCTTGTCCTACCTTCATCTAAACTTCTCCTCCATAGTCGAAC
CCAACATAATGTCCAACCATTTCTTCTCCCTCGCTCCTCCCCTAAAACACCATTCTTCAT
CTCCTCACCGTCTTTCCGTCGTCAACACTCTACTTGCTCCTCAGCTTCCAAGAACCCATC
GGAAGCTCTCACGGCGGAGAAGACGACTGAGAACAAGAAACAGCCGGAGAAGAAGCATTT
GAGCGAGGAGGAAGAAGCAGAAGAGGAAGTAGAGGAGGATATGTTGTGGATTCAAGAGAA
GGCGTTAGAGCTAGCCCAGTTCACTGGTTCGGTGGCTCAGGCGCTTCCAGGTCCCCGAGT
CGGAAGCACCAAGCTGCCGTGGATGCTCGCCGTCCCGTTAACTTACGCCGGCGCCACTTT
AGCCACTGCCGTCGTCAAAACCGTTAATAACTTCTCTTCTCCTAACGCACAACGCAAGAA
ACTAGTGAATCAGAATGCAATGCTGTGTAGATCTATCGACGAGTTGTTACAGAGAGAAGG
CACTGTGAGTAGCTTTGAGCTTAAGGCACTTGAAGAAAAGACAGAGTTTAACATGG*AGG
AGATCTTGCGGAAGTACATTCACTACGCCCTGAATGAGAAACCGTTTAATCCTGACCTTG
TTGCAAGTCTTATACATCTCAGAAGAGCTTCTGGTTTGAATGAGTCTCAGATTCCTGAGG
TTTTAAATGAGATCTCCCGTGGTATTGTTAAAGACAAAGGTCCTGTTGTGATGAATAAGC
AGGGGTTTACAGAGAAAGGTTTCAAGAGAAAACTAGCCGTGCAGACGCTTTTTGGAAAAA
TTTACTATCTTTCCGAGCTTCCTGACTTCTGCTTGAAAGACAATTCCTTGGTTGTCAAGG
AAATATTCGGAGTTACAGATGAAGAGGCAGAGAAGCTGAGGATACAGGCGCTTGCTGAAG
CTGGAGACTTGGACTCACTTGAGAAAATGGTGGAGTTTGAGAAAGCGGCTGATTCTTCTT
CTTCGGATAGAGAAGATTCAAATGAAGAAGATGATTCCACTACTATTCCTTAAGATACAT
GTTCAAGAAACCACAACTTCAATACTAATAAAAAATACTTTTCCAAATGTTTTTTTGTTT
CTTCTGATTTTTACTCAATCACAAACGTTTGTATCCAACCAACTAAACTCTGTCTAATGT
GTAGAACAACAATACAAATTGTGGCTAATATATAAATGAAAAGTTGAAACCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 
5 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 40 40 
40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 40 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1GB24TF U 9
AF RS1GM11TF U 10
AF RS1CB67TF U 1
AF RS1AT88TF U 4
AF RS1BZ89TF U 13
AF RS1AT88JQ C 495
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AF RS1BZ89JQ C 553
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AF RS1BV01TF U 606
BS 1 621 RS1CB67TF
BS 622 622 RS1AT88TF
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BS 745 759 RS1AT88TF
BS 760 760 RS1BZ89TF
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BS 773 777 RS1BZ89TF
BS 778 1256 RS1BV01TF
BS 1257 1257 RS1BZ89JQ
BS 1258 1298 RS1BV01TF
BS 1299 1311 RS1BZ89JQ
BS 1312 1313 RS1BV01JQ

RD RS1GB24TF 583 0 0
GCG
GATAAGCGCGGCTTCTGTAAAGCTCCGTCGCCGTATCCGAAGCTCAAAAAGCTTCATCAA
TGGCGTCTCTTGTCCTACCTTCATCTAAACTTCTCCTCCATAGTCGAACCCAACATAATG
TCCAACCATTTCTTCTCCCTCGCTCCTCCCCTAAAACACCATTCTTCATCTCCTCACCGT
CTTTCCGTCGTCAACACTCTACTTGCTCCTCAGCTTCCAAGAACCCATCGGAAGCTCTCA
CGGCGGAGAAGACGACTGAGAACAAGAAACAGCCGGAGAAGAAGCATTTGAGCGAGGAGG
AAGAAGCAGAAGAGGAAGTAGAGGAGGATATGTTGTGGATTCAAGAGAAGGCGTTAGAGC
TAGCCCAGTTCACTGGTTCGGTGGCTCAGGCGCTTCCAGGTCCCCGAGTCGGAAGCACCA
AGCTGCCGTGGATGCTCGCCGTCCCGTTAACTTACGCCGGCGCCACTTTAGCCACTGCCG
TCGTCAAAACCGTTAATAACTTCTCTTCTCCTAACGCACAACGCAAGAAACTAGTGAATC
AGAATGCAATGCTGTGTAGATCTATCGACGAGTTGTTACA

QA 4 583 4 583
DS 

RD RS1GM11TF 589 0 0
GG
GATAAGCGCGGCTTCTGTAAAGCTCCGTCGCCGTATCCGAAGCTCAAAAAGCTTCATCAA
TGGCGTCTCTTGTCCTACCTTCATCTAAACTTCTCCTCCATAGTCGAACCCAACACAATG
TCCAACCATTTCTTCTCCCTCGCTCCTCCCCTAAAACACCATTCTTCATCTCCTCACCGT
CTTTCCGTCGTCAACACTCTACTTGCTCCTCAGCTTCCAAGAACCCATCGGAAGCTCTCA
CGGCGGAGAAGACGACTGAGAACAAGAAACAGCCGGAGAAGAAGCATTTGAGCGAGGAGG
AAGAAGCAGAAGAGGAAATAGAGGAGGATATGCTGTGGATTCAAGAGAAGGCGTTAGAGC
TAGTCCAGTTCACTGGTTCAGTGGCTCAGGCGCTTCCAGGTCCCCGAGTCGGAAGCACCA
AGTTGCCGTGGATGCTCGCCGTCCCGTTAACTTATGCCGGCGCCACTCTCGTCACTGCCG
TCGTCAAAACCGTTAATAACTTCTCTTCTCCTAACGCACAACGCAAGAAACTAGTGAATC
AGAATGCAATGCTGTGTAGATCTATCGACGAGCTGTTACAGAGAGAA

QA 3 589 3 589
DS 

RD RS1CB67TF 704 0 0
GGATAGAGCTCGATAAGCGCGGCTTCTGTAAAGCTCCGTCGCCGTATCCGAAGCTCAAAA
AGCTTCATCAATGGCGTCTCTTGTCCTACCTTCATCTAAACTTCTCCTCCATAGTCGAAC
CCAACATAATGTCCAACCATTTCTTCTCCCTCGCTCCTCCCCTAAAACACCATTCTTCAT
CTCCTCACCGTCTTTCCGTCGTCAACACTCTACTTGCTCCTCAGCTTCCAAGAACCCATC
GGAAGCTCTCACGGCGGAGAAGACGACTGAGAACAAGAAACAGCCGGAGAAGAAGCATTT
GAGCGAGGAGGAAGAAGCAGAAGAGGAAGTAGAGGAGGATATGTTGTGGATTCAAGAGAA
GGCGTTAGAGCTAGCCCAGTTCACTGGTTCGGTGGCTCAGGCGCTTCCAGGTCCCCGAGT
CGGAAGCACCAAGCTGCCGTGGATGCTCGCCGTCCCGTTAACTTACGCCGGCGCCACTTT
AGCCACTGCCGTCGTCAAAACCGTTAATAACTTCTCTTCTCCTAACGCACAACGCAAGAA
ACTAGTGAATCAGAATGCAATGCTGTGTAGATCTATCGACGAGTTGTTACAGAGAGAAGG
CACTGTGAGTAGCTTTGAGCTCAAGGCACTTGAA***AAGACAGAGT**AACATGGGAGG
AGATCTTGCGGAAGTACATTCACTACGCCCTGAATGAGAAACCG

QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1AT88TF 785 0 0
GGGAGCTC
GATAAGCGCGGCTTCTGTAAAGCTCCGTCGCCGTATCCGAAGCTCAAAAAGTTTCATCAA
TGGCGTCTCTTGTCCTACCTTCATCTAAACTTCTCCTCCATAGTCGAACCCAACACAATG
TCCAACCATTTCTTCTCCCTCGCTCCTCCCCTAAAACACCATTCTTCATCTCCTCACCGT
CTTTCCGTCGTCAACACTCTACTTGCTCCTCAGCTTCCAAGAACCCATCGGAAGCTCTCA
CGGCGGAGAAGACGACTGAGAACAAGAAACAGCCGGAGAAGAAGCATTTGAGCGAGGAGG
AAGAAGCAGAAGAGGAAATAGAGGAGGATATGCTGTGGATTCAAGAGAAGGCGTTAGAGC
TAATCCAGTTCACTGGTTCAGTGGCTCAGGCGCTTCCAGGTCCCCGAGTCGGAAGCACCA
AGTTGCCGTGGATGCTCGCCGTCCCGTTAACTTACGCCGGCGCCACTCTCGTCACTGCCG
TCGTCAAAACCGTTAATAACTTCTCTTCTCCTAACGCACAACGCAAGAAACTAGTGAATC
AGAATGCAATGCTGTGTAGATCTATCGACGAGCTGTTACAGAGAGAAGGCACTGTGAGTA
GCTTTGAGCTTAAGGCACTTGAAGAAAAGACAGAGTTTAACATGG*AGGAGATCTTGCGG
AAGTACATTCACCACGCCCTGAATGAGAA*CCGTTTAATCCTGACCTTGTTGCAAGTCTT
ATACATCTCAGA*GAGCTTCTGGTTTGA*TGAGTCTCAGAT
CCTGAGTTTAATGAGA

QA 9 769 9 769
DS 

RD RS1BZ89TF 765 0 0
GG
AAGCGCGGCTTCTGTAAAGCTCCGTCGCCGTATCCGAAGCTCAAAAAGCTTCATCAATGG
CGTCTCTTGTCCTACCTTCATCTAAACTTCTCCTCCATAGTCGAACCCAACATAATGTCC
AACCATTTCTTCTCCCTCGCTCCTCCCCTAAAACACCATTCTTCATCTCCTCACCGTCTT
TCCGTCGTCAACACTCTACTTGCTCCTCAGCTTCCAAGAACCCATCGGAAGCTCTCACGG
CGGAGAAGACGACTGAGAACAAGAAACAGCCGGAGAAGAAGCATTTGAGCGAGGAGGAAG
AAGCAGAAGAGGAAGTAGAGGAGGATATGTTGTGGATTCAAGAGAAGGCGTTAGAGCTAG
CCCAGTTCACTGGTTCGGTGGCTCAGGCGCTTCCAGGTCCCCGAGTCGGAAGCACCAAGC
TGCCGTGGATGCTCGCCGTCCCGTTAACTTACGCCGGCGCCACTTTAGCCACTGCCGTCG
TCAAAACCGTTAATAACTTCTCTTCTCCTAACGCACAACGCAAGAAACTAGTGAATCAGA
ATGCAGTGCTGTGTAGATCTATCGACGAGTTGTTACAGAGAGAAGGCACTGTGAGTAGCT
TTGAGCTCAAGGCACTTGAAGAAAAGACAGAGTTTAACATGGGAGGAGATCTTGCGGAAG
TACATTCACTACGCCCTGAATGAGAAACCGTTTAATCCTGACCTTGTTGCAAGTCTTATA
CATCTCAGAAGAGCTTCTGGTTTGAATGAGTCTCAGATTCCTG

QA 3 765 3 765
DS 

RD RS1AT88JQ 690 0 0
TCAAAACCGTTAATAACTTCTCTTCTCCTAACGCACAACGCAAGAAACTAGTGAATCAGA
ATGCAATGCTGTGTAGATCTATCGACGAGCTGTTACAGAGAGAAGGCACTGTGAGTAGCT
TTGAGCTTAAGGCACTTGAAGAAAAGACAGAGTTTAACATGG*AGGAGATCTTGCGGAAG
TACATTCACCACGCCCTGAATGAGAAACCGTTTAATCCTGACCTTGTTGCAAGTCTTATA
CATCTCAGAAGAGCTTCTGGTTTGAATGAGTTTCAGATTCCTGAGGTTTTAAATGAGATC
TCCCGTGGTATTGTTAAAGACAAAGGTCCTGTTGTGATGAATAAGCAGGGGTTTACAGAG
AAAGGTTTCAAGAGAAAACTAGCCGTGCAGACGCTTTAA**AAAAATTTACTATCTTTCC
GAGCTTCCTGACTTCTGCTTGAAAGACAATTCCTTGGTTGTCAAGGAAATATTCGGAGTT
ACAGATGAAGAGGCAGAGAAGCTGAGGATACAGGCGCTTGCTGAAGCTGGAGACTTGGAC
TCACTTGAGAAAATGGTGGAGTTTGAGAAAGCGGCTGATTCTTCTTCTTCGGATAGAGAA
GATTCAAATGAAGAAGATGATTCCACTACTATTCCTTAAGATACATGTTCAAGAAACCAC
AACTTCAATACTAATAAAAAATACTTTTCC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1GB24JQ 406 0 0
GGTTTTAAATGAGATCTCCCGTGGTATTGTTAAAGACAAAGGTCCTGTTGTGATGAATAA
GCAGGGGTTTACAGAGAAAGGTTTCAAGAGAAAACTAGCCGTGCAGACGCTTTTTGGAAA
AATTTACTATCTTTCCGAGCTTCCTGACTTCTGCTTGAAAGACAATTCCTTGGTTGTCAA
GGAAATATTCGGAGTTACAGATGAAGAGGCAGAGAAGCTGAGGATACAGGCGCTTGCTGA
AGCTGGAGACTTGGACTCACTTGAGAAAATGGTGGAGTTTGAGAAAGCGGCTGATTCTTC
TTCTTCGGATAGAGAAGATTCAAATGAAGAAGATGATTCCACTACTATTCCTTAAGATAC
ATGTTCAAGAAACCACAACTTCAATACTAATAAAAAATACTTTTCC

QA 1 406 1 406
DS 

RD RS1BZ89JQ 759 0 0
GAATGCAGTGCTGTGTAGATCTATCGACGAGTTGTTACAGAGAGAAGGCACTGTGAGTAG
CTTTGAGCTCAAGGCACTTGAAGAAAAGACAGAGTTTAACATGG*AGGAGATCTTGCGGA
AGTACATTCACTACGCCCTGAATGAGAAACCGTTTAATCCTGACCTTGTTGCAAGTCTTA
TACATCTCAGAAGAGCTTCTGGTTTGAATGAGTCTCAGATTCCTGAGGTTTTAAATGAGA
TCTCCCGTGGTATTGTTAAAGACAAAGGTCCTGTTGTGATGAATAAGCAGGGGTTTACAG
AGAAAGGTTTCAAGAGAAAACTAGCCGTGCAGACGCTTTTTGGAAAAATTTACTATCTTT
CCGAGCTCCCTGACTTCTGCTTGAAAGACAATTCCTTGGTTGTCAAGGAAATATTCGGAG
TTACAGATGAAGAGGCAGAGAAGCTGAGGATACAGGCGCTTGCTGAAGCTGGAGACTTGG
ACTCACTTGAGAAAATGGTGGAGTTTGAGAAAGCGGCTGACTCTTCTTCTTCGGATAGAG
AAGATTCAAATGAAGAAGATGATTCCACTACTATTCCTTAAGATACATGTTCAAGAAACC
ACAACTTCAATACTAATAAAAAATACTTTTCCAAATGTTTTTTTGTTTCTTCTGATTTTT
ACTCAATCACAAACGTTTGTATCCAACCAACTAAACTCTGTCTAATGTGTAGAACAACAA
TACAAATTGTGGCTAATATATAAATGAAAAGTTGAAACC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RS1GM11JQ 727 0 0
TGTTACAGAGAGAAGGCACTGTGAGTAGCTTTGAGCTTAAGGCACTTGAAGAAAAGACAG
AGTTTAACATGG*AGGAGATCTTGCGGAAGTACATTCACTACGCCCTGAATGAGAAACCG
TTTAATCCTGACCTTGTTGCAAGTCTTATACATCTCAGAAGAGCTTCTGGTTTGAATGAG
TCTCAGATTCCTGAGGTTTTAAATGAGATCTCCCGTGGTATTGTTAAAGACAAAGGTCCT
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G
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G
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TCGGAGTTACAGATGAAGAGGCAGAGAAGCTGAGGATACAGGCGCTTGCTGAAGCTGGAG
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ATTTTTACTCAATCACAAACGTTTGTATCCAACCAACTAAACTCTGTCTA*TGTGTAGAA
CAACAATACAAATTGTGGCTAATATATAAATG

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AS 1 10

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ATCGTAGTAGGGGTTAATGTTCAGACAACAGATCTCCAGAAGAGAACAACAACAACAACA
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AATAGCTCGTGCGCGTAGAAAACAACCTGGAAGAACAGGTTCCTGCATGATGACTAGCAC
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CAGTCC


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 20 20 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 25 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 

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TT
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GAT

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ACAGCAACTTCCTTGTTCTCATTCTTCTTGTAATCTTCAAAGAATCGCCGGATTTCTGAG
AGACGATGCGGTGGAAGTTCTTTTATGTCAGTGTAATGCTTATACTCAGGATCATCAACA
CAAACCGAAATGATCTTGTCATCTTTTTCTCCCTGATCAATCATAGGCATTAATCCAATA
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CCGATTTCAAG

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TCTCCCTGATCAATCATAGGCATTAATCCAATAGCTCGTGCGCGTAGAAAACAACCTGGA
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CGGGGGATAAAACCATAGTTATGAGGATACACGACCGATGAATATAGAATACGATCAACC
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CCCTTGGAACGGATGTTTCAAGAACAGAACAGT

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AATCATTTACAGCAACTTCCTTGTTCTCATTCTTCTTGTAATCTTCAAAGAATCGCCGGA
TTTCTGAGAGACGATGCGGTGGAAGTTCTTTTATGTCAGTGTAATGCTTATACTCAGGAT
CATCAACACAAACCGCAATGATCTTGTCATCTTTTTCTCCCTGATCAATCATAGGCATTA
ATCCAATAGCTCGTGCGCGTAGAAAACAACCTGGAAGAACAGGTTCCTGCATGATGACTA
GCACATCTAAAGGGTCATTGTCTTCACATAATGTGCGGGGGATAAAACCATAGTTATGAG
GATACACGACCGATGAATATAGAATCCGATCAACCTTGATGAGTTCTGTCTTTTTGTCAA
GTTCGTATTTGACCTTGCTACCCTTTGAGATCTCAATAACCACATTGAAGATCGCCGGAG
CTCCAGGTCCGATTTCAAGATCATGCCATGGATGAGCAGCAACCGATCTCCTTGATAAAG
ATGAGAGTATCCTCTCGTTCAAACGTGGAGCTGTTCTCTGAAGCTTGTCAGATTGATTCT
CTTTCATTTTTTCACTCATCAAAGAAAGTCGTCGCCCCTTGGAACGGATGTTTCAAGAAC
AGAACAGT
CC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1C863TF 653 0 0
ATTGAGTATTGAATGGCTTCAACGGCAGGACCATTAGGTAGAAAATCATTTACAGCAACT
TCCTTGTTCTCATTCTTCTTGTAATCTTCAAAGAATCGCCGGATTTCTGAGAGACGATGC
GGTGGAAGTTCTTTTATGTCAGTGTAATGCTTATACTCAGGATCATCAACACAAACCGAA
ATGATCTTGTCATCTTTTTCTCCCTGATCAATCATAGGCATTAATCCAATAGCTCGTGCG
CGTAGAAAACAACCTGGAAGAACAGGTTCCTGCATGATGACTAGCACATCTAAAGGGTCA
TTGTCTTCACATAATGTGCGGGGGATAAAACCATAGTTATGAGGATACACGACCGATGAA
TATAGAATCCGATCAACCTTGATGAGTCCTGTCTTTTTGTCAAGTTCGTATTTGACCTTG
CTACCCTTTGAGATCTCAATAACCACATTGAAGATCGCCGGAGCTCCAGGTCCGATTTCA
AGATCATGCCATGGATGAGCAGCAACCGATCTCCTTGATAAAGATGAGAGTATCCTCTCG
TTCAAACGTGGAGCTGTTCTCTGAAGCTTGTCAGATTGATTCTCTTTCATTTTTTCACTC
ATCAAAGAAAGTCGTCGCCCCTTGGAACGGATGTTTCAAGAACAGAACAGTCC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 2 12

CO CL202Contig1 526 4 12 U
GGGAATCATCAAACTAGTAAACATAAAATCCAAAAAACAAGAATAAACGTATTTATATCG
TAAGAATATAAAAAAAGAACAATATGTCGTCATCCAAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCC
TAGTTGCTTTGTTTCCTCTACATAAATTTGTTGATGGACAAGCGAGCGATGCATCTAAAG
CAAGTTGCAAGCAAATCCAATGCGATAAAGTAGATAAAAAA*TGTGTTCTTGTTGTGTCT
CCGAAGCTGGAACTCAGAACAGGTGTTACAAGAACGAGGGAGAATGTGCCCAGAGGTGCG
GCAAGCCATTACAAGTTCGAAAGCCTACAAAAGGCTAGAATTAAAAAAAATTTGAATAAA
TATTTTATTTAATACCTAATATTGTATCTATTTTCATTTTCTGTTGTATGAATAACGCTG
GAGCCTTCCTTAGAAAAGAATTTTGAAAGCATCAGCTTATAACATCATTTTTGTAAACTT
TGTAAGGCATATTTTTAATAATATTATTTTGTATGGATTATTGGTG


BQ
15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RS1AV57TF U 1
AF RS1CZ42TF U 1
AF RS1A751JQ C -1
AF RS1A751TF U -1
BS 1 75 RS1AV57TF
BS 76 76 RS1A751TF
BS 77 221 RS1AV57TF
BS 222 222 RS1A751TF
BS 223 256 RS1AV57TF
BS 257 257 RS1CZ42TF
BS 258 280 RS1AV57TF
BS 281 349 RS1CZ42TF
BS 350 350 RS1A751TF
BS 351 424 RS1CZ42TF
BS 425 425 RS1A751TF
BS 426 526 RS1CZ42TF

RD RS1AV57TF 280 0 0
GGGAATCATCAAACTAGTAAACATAAAATCCAAAAAACAAGAATAAACGTATTTATATCG
TAAGAATATAAAAAA*GAACAATATGTCGTCATCCAAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCC
TAGTTGCTTTGTTTCCTCTACATAAATTTGTTGATGGACAAGCGAGCGATGCATCTAAAG
CAAGTTGCAAGCAAATCCAATGCGATAAAGTAGATAAAAAAATGTGTTCTTGTTGTGTCT
CCGAAGCTGGAACTCA*AACAGGTGTTACAAGAACGAGGG

QA 1 280 1 280
DS 

RD RS1CZ42TF 526 0 0
GGGAATCATCAAACTAGTAAACATAAAATCCAAAAAACAAGAATAAACGTATTTATATCG
TAAGAATATAAAAAA*GAACAATATGTCGTCATCCAAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCC
TAGTTGCTTTGTTTCCTCTACATAAATTTGTTGATGGACAAGCGAGCGATGCATCTAAAG
CAAGTTGCAAGCAAATCCAATGCGATAAAGTAGATAAAAAAATGTGTTCTTGTTGTGTCT
CCGAAGCTGGAACTCAGAACAGGTGTTACAAGAACGAGGGAGAATGTGCCCAGAGGTGCG
GCAAGCCATTACAAGTTCGAAAGCCTACAAAAGGCTAGAATTAAAAAAA*TTTGAATAAA
TATTTTATTTAATACCTAATATTGTATCTATTTTCATTTTCTGTTGTATGAATAACGCTG
GAGCTTTCCTTAGAAAAGAATTTTGAAAGCATCAGCTTATAACATCATTTTTGTAAACTT
TGTAAGGCATATTTTTAATAATATTATTTTGTATGGATTATTGGTG

QA 1 526 1 526
DS 

RD RS1A751JQ 527 0 0
GGCT
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AGAATATAAAAAAAGAACAATATGTCGTCATCCAAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCCTA
GTTGCTTTGTTTCCTCTACATAAATTTGTTGATGGACAAGCGAGCGATGCATTTAAAGCA
AGTTGCAAGCAAATCCAATGCGATAAAGTAGATAAAAAA*TGTGTTCTTGTTGTGTCTCC
GAAGCTGGAACTCAGAACAGGTGTTACAAGAACGAGGGAGAATGTGCCCAGAGGTGCGGC
AAGCCATTACAAGTTCGAAAGCCTACAAAAGGCTAGAATTAAAAAAAATTTGAATAAATA
TTTTATTTAATACCTAATATTGTATCTATTTTCATTTTCTGTTGTATGAATAACGCTGGA
GCCTTCCTTAGAAAAGAATTTTGAAAGCATCAGCTTATAACATCATTTTTGTAAACTTTG
TAAGGCATATTTTTAATAATATTATTTTGTATGGATTATTGG
G

QA 5 526 5 526
DS 

RD RS1A751TF 527 0 0
GGCT
GAATCATCAAACTAGTAAACATAAAATCCAAAAAACAAGAATAAACGTATTTATATCGTA
AGAATATAAAAAAAGAACAATATGTCGTCATCCAAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCCTA
GTTGCTTTGTTTCCTCTACATAAATTTGTTGATGGACAAGCGAGCGATGCATCTAAAGCA
AGTTGCAAGCAAATCCAATGCGATAAAGTAGATAAAAAA*TGTGTTCTTGTTGTGTCTCC
GAAGCTGGAACTCAGAACAGGTGTTACAAGAACGAGGGAGAATGTGCCCAGAGGTGCGGC
AAGCCATTACAAGTTCGAAAGCCTACAAAAGGCTAGAATTAAAAAAAATTTGAATAAATA
TTTTATTTAATACCTAATATTGTATCTATTTTCATTTTCTGTTGTATGAATAACGCTGGA
GCCTTCCTTAGAAAAGAATTTTGAAAGCATCAGCTTATAACATCATTTTTGTAAACTTTG
TAAGGCATATTTTTAATAATATTATTTTGTATGGATTATTGG
G

QA 5 526 5 526
DS 



CO CL202Contig2 528 8 5 U
GGGGAATCATCAAACTAGTAAACGTAAAATTCAAAAAAAAAAA**CAAGAATAAACGTAT
TTGTATCGTAAGAATATAAAAAGGAAAAAAATGTCATCATCCAAGTTCGCTATCTTTTGC
ATCATCCTAATTGCTTTGTTTCCTCTACATAAATTTGTTGATGGACAAGCGAGCGATGCA
TCTAAAGCAAGTTGCAAGCAAATCCAATGCGATAAAGTAGATAAAAAATTGTGTTCTTGT
TGTGTCTCCCAAGCTGGAACTCAGAACAGGTGTTACAAGAACGAGGCAGAATGTGCTCAG
AGGTGCGGCAAGCCATTACAAGTTCTAAAACCTACAAAAGGCTAGAATTAAAAAGTATGA
ATAAATATTTTATTTAATACCTAATATCTATTTTTTGTTTTTTGTTGTATGAATAACACT
GGAGCTGTCCTTAGAAAGGAATTTTGAAAGCATTAGCTTATAACATCATTTTT*GTAAAC
TTTGTAAGGCATATTTTTAATAATATTATTTTGTATGGATTATTGGTG


BQ
10 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 35 50 50 20 50 50 20 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 35 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 30 30 25 25 25 10 10 

AF RS1CF30TF U 4
AF RS1BK27TF U 1
AF RS1AA48JQ C 2
AF RS1AA48TF U 2
AF RS1AI60JQ C 2
AF RS1AI60TF U 2
AF RS1H417TF U 2
AF RS1H417JQB C 25
BS 1 82 RS1BK27TF
BS 83 84 RS1AA48TF
BS 85 521 RS1BK27TF
BS 522 526 RS1AI60TF
BS 527 528 RS1AI60JQ

RD RS1CF30TF 436 0 0
GAATCATCAAACTAGTAAACGTAAAATTCAAAAAAAAAAA**CAAGAATAAACGTATTTG
TATCGTAAGAATATAAAAAGGAAAAAAATGTCATCATCCAAGTTCGCTATCTTTTGCATC
ATCCTAATTGCTTTGTTTCCTCTACATAAATTTGTTGATGGACAAGCGAGCGATGCATCT
AAAGCAAGTTGCAAGGAAATCCAATGCGATAAAGTAGATAAAAAATTGT*TTCTTGTTGT
GTCTCCCAAGCTGGAACTCAGAACAGGTGTTACAAGAACGAGGCAGAATGTGCTCAGAGG
TGCGGCAAGCCATTACAAGTTCTAAAACCTACAAAAGGCTAGAATTAAAAAGTATGAATA
AATATTTTATTTAATACCTAATATCTATTTTTTGTTTTTTGTTGTATGAATAACACTGGA
GCTGTCCTTAGAAAGG

QA 1 436 1 436
DS 

RD RS1BK27TF 521 0 0
GGGGAATCATCAAACTAGTAAACGTAAAATTCAAAAAAAAAAA**CAAGAATAAACGTAT
TTGTATCGTAAGAATATAAAAA**AAAAAAATGTCATCATCCAAGTTCGCTATCTTTTGC
ATCATCCTAATTGCTTTGTTTCCTCTACATAAATTTGTTGATGGACAAGCGAGCGATGCA
TCTAAAGCAAGTTGCAAGCAAATCCAATGCGATAAAGTAGATAAAAAATTGTGTTCTTGT
TGTGTCTCCCAAGCTGGAACTCAGAACAGGTGTTACAAGAACGAGGCAGAATGTGCTCAG
AGGTGCGGCAAGCCATTACAAGTTCTAAAACCTACAAAAGGCTAGAATTAAAAAGTATGA
ATAAATATTTTATTTAATACCTAATATCTATTTTTTGTTTTTTGTTGTATGAATAACACT
GGAGCTGTCCTTAGAAAGGAATTTTGAAAGCATTAGCTTATAACATCATTTTT*GTAAAC
TTTGTAAGGCATATTTTTAATAATATTATTTTGTATGGATT

QA 1 521 1 521
DS 

RD RS1AA48JQ 520 0 0
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TGTATCGTAAGAATATAAAAAGGAAAAAAATGTCATCATCCAAGTTCGCTATCTTTTGCA
TCATCCTAATTGCTTTGTTTCCTCTACATAAATTTGTTGATGGACAAGCGAGCGATGCAT
CTAAAGCAAGTTGCAAGCAAATTTAATGCGATAAAGTAGATAAAAAATTGTGTTCTTGTT
GTGTCTCCCAAGCTGGAACTCAGAACAGGTGTTACAAGAACGAGGCAGAATGTGCTCAGA
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TAAATATTTTATTTAATACCTAATATCTATTTTTTGTTTTTTGTTGTATGAATAACACTG
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TTGTAAGGCATATTTTTAATAATATTATTTTGTATGGA
GT

QA 1 518 1 518
DS 

RD RS1AA48TF 520 0 0
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TGTATCGTAAGAATATAAAAAGGAAAAAAATGTCATCATCCAAGTTCGCTATCTTTTGCA
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CTAAAGCAAGTTGCAAGCAAATCTAATGCGATAAAGTAGATAAAAAATTGTGTTCTTGTT
GTGTCTCCCAAGCTGGAACTCAGAACAGGTGTTACAAGAACGAGGCAGAATGTGCTCAGA
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TAAATATTTTATTTAATACCTAATATCTATTTTTTGTTTTTTGTTGTATGAATAACACTG
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GT

QA 1 518 1 518
DS 

RD RS1AI60JQ 527 0 0
GGGAATCATCAAACTAGTAAACGTAAAATTCAAAAAAAAAA***CAAGAATAAACGTATT
TGTATCGTAAGAATATAAAAAGGAAAAAAATGTCATCATCCAAGTTCGCTATCTTTTGCA
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TTAAAGCAAGTTGCAAGCAAATCCAATGCGATAAAGTAGATAAAAAATTGTGTTCTTGTT
GTGTCTCCCAAGCTGGAACTCAGAACAGGTGTTACAAGAACGAGGCAGAATGTGCTCAGA
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QA 1 527 1 527
DS 

RD RS1AI60TF 527 0 0
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TGTATCGTAAGAATATAAAAAGGAAAAAAATGTCATCATCCAAGTTCGCTATCTTTTGCA
TCATCCTAATTGCTTTGTTTCCTCTACATAAATTTGTTGATGGACAAGCGAGCGATGCAT
CTAAAGCAAGTTGCAAGCAAATCCAATGCGATAAAGTAGATAAAAAATTGTGTTCTTGTT
GTGTCTCCCAAGCTGGAACTCAGAACAGGTGTTACAAGAACGAGGCAGAATGTGCTCAGA
GGTGCGGCAAGCCATTACAAGTTCTAAAACCTACAAAAGGCTAGAATTAAAAAGTATGAA
TAAATATTTTATTTAATACCTAATATCTATTTTTTGTTTTTCGTTGTATGAATAACACTG
GAGCTGTCCTTAGAAAGGAATTTTGAAAGCATTAGCTTATAACATCATTTTT*GTAAACT
TTGTAAGGCATATTTTTAATAATATTATTTTGTATGGATTATTGG
TG

QA 1 525 1 525
DS 

RD RS1H417TF 526 0 0
GGGAATCATCAAACTAGTAAACGTAAAATTCAAAAAAAAAA***CAAGAATAAACGTATT
TGTATCGTAAGAATATAAAAAAGAACAATATGTCGTCATCCAAGTTCGCTATCTTTTGCA
TCATCCTAATTGCTTTGTTTCCTCTACATAAATTTGTTGATGGACAAGCGAGCGATGCAT
CTAAAGCAAGTTGCAAGCAAATCCAATGCGATAAAGTAGATAAGAAATTGTGTTCTTGTT
GTGTCTCTGAAGCTGGAACTCAGAACAGGTGTTACAAGAACGAGGGAGAATGTGCCCAGA
GGTGCGGCAAGCCATTACAAGTTCGAAAACCTACAAAAGGCTAGAATTAAAAAATATGAA
TAAATATTTTATTTAATACCTAATATCTATTTTTCGTTTTCTGTTGTATGAATAACACTG
GAGCTGTCCTTAGAAAGGAATTTTGAAAGCATTAGCTTATAACATCATTTTTTGTAAACT
TTGTGAGGCATATTTTTAATAATATTATTTTGTATGGATTATTGG
C

QA 1 525 1 525
DS 

RD RS1H417JQB 499 0 0
TAAAATTCAAAAAAAAAA***CAAGAATAAACGTATTTGTATCGTAAGAATATAAAAAAG
AACAATATGTCGTCATCCAAGTTCGCTATCTTTTGCATCATCCTAATTGCTTTGTTTCCT
CTACATAAATTTGTTGATGGACAAGCGAGCGATGCATCTAAAGCAAGTTGCAAGCAAATC
CAATGCGATAAAGTAGATAAGAAATTGTGTTCTTGTTGTGTCTCTGAAGCTGGAACTCAG
AACAGGTGTTACAAGAACGAGGGAGAATGTGCCCAGAGGTGCGGCAAGCCATTACAAGTT
CGAAAACCTACAAAAGGCTAGAATTAAAAAATATGAATAAATATTTTATTTAATACCTAA
TATCTATTTTTCGTTTTCTGTTGTATGAATAACACTGGAGCTGTCCTTAGAAAGGAATTT
TGAAAGCATTAGCTTATAACATCATTTTTTGTAAACTTTGTGAGGCATATTTTTAATAAT
ATTATTTTGTATGGATTAT

QA 1 499 1 499
DS 



AS 1 12

CO CL203Contig1 899 12 28 U
GGAGTAAAAGAATCTAAAGCTCTCATCTCTCCGCTTCTCCACACTTGCCCCTCAACGAGT
TTCGAAACCCGAGTAGCCATGTCGCTCACGATCCCGACGAACCTCGTCCTCAACCCGAGA
GCCAACAAATCTCTCACTCAATCATTGCCTAAATCCACCGCGAGGTTCGTCTGCTCCGAT
GACAAATCCGCGACGCAGCAACAGCAGTCCATGAAGGCTTTCTCCGCCGCAGTGGCTCTC
TCTTCCATCCTCCTCTCAGCTCCGATGCCAGCCGTCGCTGATATCTCGGGGTTGACCCCT
TGCAAGGAGTCGAAACAGTTCGCCAAGAGGGAGAAGCAACAGATCAAGAAGCTTGAATCA
TCTCTTAAGCTCTACGCTCCTGAAAGTGCTCCTGCTCTTGCTCTTAACGCTCAGATCGAG
AAGACCAAACGCAGGTTCGACAACTACGGCAAGTATGGACTTCTGTGTGGTGCAGACGGT
CTACCACACCTGATAGTGAACGGAGACCAGCGGCATTGGGGAGAGTTCATAACTCCAGGC
CTTCTCTTCCTCTACATTGCTGGATGGATCGGGTGGGTTGGGAGAAGCTACTTGATAGCG
ATCAGTGATGAGAAGAAACCAGCGATGAAAGAGATCATTATTGATGTTCCTTTGGCTAGT
CGTCTCATCTTCCGTGGTTTCATTTGGCCTGTTGCTGCTTACAGAGCGTTACTCAACGGC
GATCTCATTGCCAAAGATGTCTAGAAAA*CAAAAAACAAATCTATATTTGTTGTTTTGTT
TGCTTCTCTTTCTCTCATGTTTTCCATTGTATGTATTGATATCTCTAATTAACTCTTCCT
TCAAAGAATATCTTTGCATTATGGAAAAACTTGTATTTTGGATTAAATGTTAATTGCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 40 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 50 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 60 60 55 55 55 55 40 40 55 55 55 40 40 10 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1GU51TF U 35
AF RS1CP23TF U 1
AF RS1CF26TF U 29
AF RS1B901TF U 29
AF RS1CF83TF U 45
AF RS1CT24JQ C 45
AF RS1CT24TF U 45
AF RS1DQ55TF U 35
AF RS1DQ55JQ C 109
AF RS1CF83JQ C 241
AF RS1CP23JQ C 283
AF RS1GU51JQ C 740
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BS 121 121 RS1CF26TF
BS 122 161 RS1CP23TF
BS 162 162 RS1CF26TF
BS 163 164 RS1CP23TF
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BS 177 177 RS1CF26TF
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BS 225 225 RS1CF26TF
BS 226 600 RS1CP23TF
BS 601 601 RS1CF26TF
BS 602 641 RS1CP23TF
BS 642 642 RS1CF26TF
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BS 759 776 RS1DQ55TF
BS 777 777 RS1DQ55JQ
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BS 803 803 RS1DQ55JQ
BS 804 816 RS1DQ55TF
BS 817 897 RS1DQ55JQ
BS 898 899 RS1CP23JQ

RD RS1GU51TF 670 0 0
GG
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TGGGGAGAGTTCATAACTCCAGGCCTTCTCTTCCTCTACATTGCTGGATGGATCGGGTGG
GTTGGGAGAAGCTACTTGATAGCGATCAGTGATGAGAAGAAACCAGCGATGAAAGAGATC
ATTATTGATGTTCCTTTGGCTAGTCGTCTCATCTTCCGTGGTTTCATTTGGCCTGTTGCT
GCTTACAG

QA 3 670 3 670
DS 

RD RS1CP23TF 758 0 0
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TCCAACAAATCTCTCACTCAATCATTGCCTAAATCCACCGCCAGATTCGTCTGCTC*GAT
GACAAATCCGCGACGCAGCAACAGCAGTCCATGAAGGCGTTCTCTGCCGCAGTGGCTCTC
TCTTCCATCCTCCTCTCAGCTCCGATGCCAGCCGTCGCTGATATCTCGGGGTTGACCCCT
TGCAAGGAGTCGAAACAGTTCGCCAAGAGGGAGAAGCAACAGATCAAGAAGCTTGAATCA
TCTCTTAAGCTCTACGCTCCTGAAAGTGCTCCTGCTCTTGCTCTTAACGCTCAGATCGAG
AAGACCAAACGCAGGTTCGACAACTACGGCAAGTATGGACTTCTGTGTGGTGCAGACGGT
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CTTCTCTTCCTCTACATTGCTGGATGGATCGGGTGGGTTGGGAGAAGCTACTTGATAGCG
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CGTCTCATCTTCCGTGGTTTCATTTGGCCTGTTGCTGCTTACAGAGCGTTACTCAACGGC
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DS 

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GGATACTC
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ACCGCGAGGTTCGTCTGCTCCGATGACAAATCCGCGACGCAGCAACAGCAGTCCATGAAG
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GCTGATATCTCGGGGTTGACCCCTTGCAAGGAGTCGAAACAGTTCGCCAAGAGGGAGAAG
CAACAGATCAAGAAGCTTGAATCATCTCTTAAGCTCTACGCTCCTGAAAGTGCTCCTGCT
CTTGCTCTTAACGCTCAGATCGAGAATACCAAACGCAGGTTCGACAACTACGGCAAGTAT
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TGGGGAGAGTTCATAACTCCAGGCCTTCTCTTCCTCTACATTGCTGGATGGATCGGGTGG
GTTGGGAGAAGCTACTTGATAGCGATCAGTGATGAGAAGAAACCAGCGATGAAAGAGATC
ATTATTGATGTTCCTTTGGCTAGTCGTCTCATCTTCCGTGGTTTCATTTGGCCTGTTGCT
GCTTACAGAGCGTTACTCAACGGCGATCTCATTGCCAAAGATGTCTAGAAAA*CAAAA
A

QA 9 726 9 726
DS 

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GGATACTC
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ACGAACCTCGTCCTCAACCCGAGAGCCAACAAATCTCTCACTCAATCATTGCCTAAATCC
ACCGCGAGGTTCGTCTGCTCCGATGACAAATCCGCGACGCAGCAACAGCAGTCCATGAAG
GCTTTCTCCGCCGCAGTGGCTCTCTCTTCCATCCTCCTCTCAGCTCCGATGCCAGCCGTC
GCTGATATCTCGGGGTTGACCCCTTGCAAGGAGTCGAAACAGTTCGCCAAGAGGGAGAAG
CAACAGATCAAGAAGCTTGAATCATCTCTTAAGCTCTACGCTCCTGAAAGTGCTCCTGCT
CTTGCTCTTAACGCTCAGATCGAGAAGACCAAACGCAGGTTCGACAACTACGGCAAGTAT
GGACTTCTGTGTGGTGCAGACGGTCTACCACACCTGATAGTGAACGGAGACCAGCGGCAT
TGGGGAGAGTTCATAACTCCAGGCCTTCTCTTCCTCTACATTGCTGGATGGATCGGGTGG
GTTGGGAGAAGCTACTTGATAGCGATCAGTGATGAGAAGAAACCAGCGATGAAAGAGATC
ATTATTGATGTTCCTTTGGCTAGTCGTCTCATCTTCCGTGGTTTCATTTGGCCTGTTGCT
GCTTACAGAGCGTTACTCAACGGCGATCTCGTTGCCAAAGATGTCTAGAAAA*CAAAA

QA 9 726 9 726
DS 

RD RS1CF83TF 711 0 0
GG
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TCCTCAACCCGAGATCCAACAAATCTCTCACTCAATCATTGCCTAAATCCACCGCCAGAT
TCGTCTGCTCCGATGACAAATCCGCGACGCAGCAACAGCAGTCCATGAAGGCGTTCTCTG
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CGGGGTTGACCCCTTGCAAGGAGTCGAAACAGTTCGCCAAGAGGGAGAAGCAACAGATCA
AGAAGCTTGAATCATCTCTTAAGCTCTACGCTCCTGAAAGTGCTCCTGCTCCTGCTCTTA
ACGCTCAGATCGAGAAGACCAAACGCAGGTTCGACAACTACGGCAAGTATGGACTTCTGT
GTGGTGCAGACGGTCTACCACACCTGATAGTGAACGGAGACCAGCGGCATTGGGGAGAGT
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A

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DS 

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GG
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CCGCAGTGGCTCTCTCTTCCATCCTCCTCTCAGCTCCGATGCCAGCCGTCGCTGATATCT
CGGGGTTGACCCCTTGCAAGGAGTCGAAACAGTTCGCCAAGAGGGAGAAGCAACAGATCA
AGAAGCTTGAATCATCTCTTAAGCTCTACGCTCCTGAAAGTGCTCCTGCTCTTGCTCTTA
ACGCTCAGATCGAGAAGACCAAACGCAGGTTCGACAACTACGGCAAGTATGGACTTCTGT
GTGGTGCAGACGGTCTACCACACCTGATAGTGAACGGAGACCAGCGGCATTGGGGAGAGT
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GCTACTTGATAGCGATCAGTGATGAGAAGAAACCAGCGATGAAAGAGATCATTATTGATG
TTCCTTTGGCTAGTCGTCTCATCTTCCGTGGTTTCATTTGGCCTGTTGCTGCTTACAGAG
CGTTACTCAACGGCGATCTCATTGCCAAAGATGTCTAG

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DS 

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GG
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TCCTCAACCCGAGATCCAACAAATCTCTCACTCAATCATTGCCTAAATCCACCGCCAGAT
TCGTCTGCTCCGATGACAAATCCGCGACGCAGCAACAGCAGTCCATGAAGGCGTTCTCTG
CCGCAGTGGCTCTCTCTTCCATCCTCCTCTCAGCTCCGATGCCAGCCGTCGCTGATATCT
CGGGGTTGACCCCTTGCAAGGAGTCGAAACAGTTCGCCAAGAGGGAGAAGCAACAGATCA
AGAAGCTTGAATCATCTCTTAAGCTCTACGCTCCTGAAAGTGCTCCTGCTCTTGCTCTTA
ACGCTCAGATCGAGAAGACCAAACGCAGGTTCGACAACTACGGCAAGTATGGACTTCTGT
GTGGTGCAGACGGTCTACCACACCTGATAGTGAACGGAGACCAGCGGCATTGGGGAGAGT
TCATAACTCCAGGCCTTCTCTTCCTCTACATTGCTGGATGGATCGGGTGGGTTGGGAGAA
GCTACTTGATAGCGATCAGTGATGAGAAGAAACCAGCGATGAAAGAGATCATTATTGATG
TTCCTTTGGCTAGTCGTCTCATCTTCCGTGGTTTCATTTGGCCTGTTGCTGCTTACAGAG
CGTTACTCAACGGCGATCTCATTGCCAAAGATGTCT

QA 3 698 3 698
DS 

RD RS1DQ55TF 794 0 0
GG
CTCCACACTTCCCCCTCAACGAGTTTCAAAACCCGAGTAGCCATGTCGCTCACGTTCCCG
ACGAACCTCGTCCTCAACCCGAGAGCCAACAAATCTCTCACTCAATCATTGCCTAAATCC
ACCGCGAGGTTCGTCTGCTCCGATGACAAATCCGCGACGCAGCAACAGCAGTCCATGAAG
GCTTTCTCCGCCGCAGTGGCTCTCTCTTCCATCCTCCTCTCAGCTCCGATGCCAGCCGTC
GCTGATATCTCGGGGTTGACCCCTTGCAAGGAGTCGAAACAGTTCGCCAAGAGGGAGAAG
CAACAGATCAAGAAGCTTGAATCATCTCTTAAGCTCTACGCTCCTGAAAGTGCTCCTGCT
CTTGCTCTTAACGCTCAGATCGAGAAGACTAAACGCAGGTTCGACAACTACGGCAAGTAT
GGACTTCTGTGTGGTGCAGACGGTCTACCACACCTGATAGTGAACGGAGACCAGCGGCAT
TGGGGAGAGTTCATAACTCCAGGCCTTCTCTTCCTCTACATTGCTGGATGGATCGGGTGG
GTTGGGAGAAGCTACTTGATAGCGATCAGTGATGAGAAGAAACCAGCGATGAAAGAGATC
ATTATTGATGTTCCTTTGGCTAGTCGTCTCATCTTCCGTGGTTTCATTTGGCCTGTTGCT
GCTTACAGAGCGTTACTCAACGGCGATCTCATTGCCAAAGATGTCTAGAAAA*CAAAAAA
*AAATCTATATTTGTTGTTT*GTTTGCTTCTCTTTCTCTCATGTTT*CCATTGTATGTAT
GATATCTCTAAT

QA 3 782 3 782
DS 

RD RS1DQ55JQ 790 0 0
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GTCTGCTCCGATGACAAATCCGCGACGCAGCAACAGCAGTCCATGAAGGCTTTCTCCGCC
GCAGTGGCTCTCTCTTCCATCCTCCTCTCAGCTCCGATGCCAGCCGTCGCTGATATCTCG
GGGTTGACCCCTTGCAAGGAGTCGAAACAGTTCGCCAAGAGGGAGAAGCAACAGATCAAG
AAGCTTGAATCATCTCTTAAGCTCTACGCTCCTGAAAGTGCTCCTGCTCTTGCTCTTAAC
GCTCAGATCGAGAAGACTAAACGCAGGTTCGACAACTACGGCAAGTATGGACTTCTGTGT
GGTGCAGACGGTCTACCACACCTGATAGTGAACGGAGACCAGCGGCATTGGGGAGAGTTC
ATAACTCCAGGCCTTCTCTTCCTCTACATTGCTGGATGGATCGGGTGGGTTGGGAGAAGC
TACTTGATAGCGATCAGTGATGAGAAGAAACCAGCGATGAAAGAGATCATTATTGATGTT
CCTTTGGCTAGTCGTCTCATCTTCCGTGGTTTCATTTGGCCTGTTGCTGCTTACAGAGCG
TTACTCAACGGCGATCTCATTGCCAAAGATGTCTAGAAAAACAAAAAACAAATCTATATT
TGTTGTTTTGTTTGCTTCTCTTTCTCTCATGTTTTCCATTGTATGTATTGATATCTCTAA
TTAACTCTTCCTTCAAAGAATATCTTTGCATTATGGAAAAACTTGTATTTTGGATTAAAT
GTTAATTGC
C

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DS 

RD RS1CF83JQ 602 0 0
TCTTCCATCCTCCTCT*AGCTCCGATGCCAGCCGTCGCTGATATCTCGGGGTTGACCCCT
TGCAAGGAGTCGAAACAGTTCGCCAAGAGGGAGAAGCAACAGATCAAGAAGCTTGAATCA
TCTCTTAAGCTCTACGCTCCTGAAAGTGCTCCTGCTCCTGCTCTTAACGCTCAGATCGAG
AAGACCAAACGCAGGTTCGACAACTACGGCAAGTATGGACTTCTGTGTGGTGCAGACGGT
CTACCACACCTGATAGTGAACGGAGACCAGCGGCATTGGGGAGAGTTCATAACTCCAGGC
CTTCTCTTCCTCTACATTGCTGGATGGATCGGGTGGGTTGGGAGAAGCTACTTGATAGCG
ATCAGTGATGAGAAGAAACCAGCGATGAAAGAGATCATTATTGATGTTCCTTTGGCTAGT
CGTCTCATCTTCCGTGGTTTCATTTGGCCTGTTGCTGCTTACAGAGCGTTACTCAACGGC
GATCTCATTGCCAAAGATGTCTAGAAAAACAAAAAACAAATCTATATTTGTTGTTTTGTT
TGCTTCTCTTTCTCTCATGTTTTCCATTGTATGTATTTATATCTCTAATTAACTCTTCCT
TC

QA 1 602 1 602
DS 

RD RS1CP23JQ 617 0 0
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ATCAAGAAGCTTGAATCATCTCTTAAGCTCTACGCTCCTGAAAGTGCTCCTGCTCTTGCT
CTTAACGCTCAGATCGAGAAGACCAAACGCAGGTTCGACAACTACGGCAAGTATGGACTT
CTGTGTGGTGCAGACGGTCTACCACACCTGATAGTGAACGGAGACCAGCGGCATTGGGGA
GAGTTCATAACTCCAGGCCTTCTCTTCCTCTACATTGCTGGATGGATCGGGTGGGTTGGG
AGAAGCTACTTGATAGCGGTCAGTGATGAGAAGAAACCAGCGATGAAAGAGATCATTATC
GATGTTCCTTTGGCTAGTCGTCTCATCTTCCGTGGTTTCATTTGGCCTGTTGCTGCTTAC
AGAGCGTTACTCAACGGCGATCTCATTGCCAAAGATGTCTAGAAAAACAAAAAACAAATC
TATATTTGTTGTTTTGTTTGCTTCTCTTTCTCTCATGTTTTCCATTGTATGTATTGATAT
CTCTAATTAACTCTTCCTTCAAAGAATGTCTTTGCATTATGGAAAAACTTGTATTTTGGA
TTAAATGTTAATTGCGC

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DS 

RD RS1GU51JQ 103 0 0
TCTAGAAAAACAAAAAACAAATCTATATTTGTTGTTTTGTTTGCTTCTCTTTCTCTCATG
TTTTCCATTGTATGTATTGATATCTCTAATTAACTCTTCCTTC

QA 1 103 1 103
DS 



AS 1 9

CO CL204Contig1 1005 9 46 U
AAAGGAATACAGCCACACATATATAGCATAGCAAGGTTTACACACTTTTGTGTTCATCAA
ATAAATGGGAGAAAAATACCAACAAAATCAACACACCAGATGATACCAAAGGTTTTAGTG
CATAAACCAGAGTACAAATACTTGCAAAGCAACCCCATAACTGAAGAAAATAGCTGAACA
ATAGTAACAACAACACTTTGACACACGATATGAAGATATTGGTTTGAATTTTCTCAATGT
TGGGGATAACCGGGAGGCGGGTAAGATGCAGGAGGGTAGCCTTGAGCCGGTGGGTAAGGT
GCAGGAGGGTAGCCTTGAGCCGGTGGGTAAGACGCAGGAGGGTAGCCGACTGGAGGGGCA
GGTTGGTCAAAACGGGACATCTGCTGTGCCGGTGGAACGCCCATTGGCTGAGGACCAAAC
ACTCCATCTCTTTTGTCCATTTCAAGCTTGTGTTGAGTCTGCATACACGCGCAGACCGTG
CAGTAGACCATATCGGCACAGCAAGAGAGTATCTGAGAAGCTTCAGAGAGTTCCTCGCTA
CCAACGAGGCAAGCAACAATAGAGAAAATGCAAGCGACTTGGCTTAGGCAGAACATAAAT
CCAATAATGCAATTGTCGCATTTTGTAGTCTGGATGTTGAATTCATCCTGGAGAAGAAAG
CGAGTAGAGGCCACAGAGTTTCCGAAACAGAGGAAAACCTCAGTAGCAAGGCAGAGTTCA
GGGCATTTGCTTTCTCCACACCTCCCACTACAGGGCATGTATCCAGCACAGCAAGTATAC
CTGGACATGTCATTGTAAAGTGCTCTTCTCCGAAGCAAGTAAGAAACACACGGTCCACAC
ACACACGACAAGCAACAATAGGGAGTGTCGGCGGTGACGGTTCCCATGAGATCGGAGTGC
CATAAGTTCCGGTAATCTTGCCGGAGCTTCATCTTCTCGGCCTTATCCGCCATTGCTAAA
CACAAGACCCAAAAACCCTAAAAATCAAACTAAAAACTTGTCTGT


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 25 40 40 40 40 40 20 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 20 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 50 35 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 50 50 25 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 0 25 25 
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CCAATGATGCAATTGTCGCATTTTGTAGTCTGGATGTTGAATTCATCCTGGAGAAGAAAG
CGAGTAGAGGCCAC

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AG
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TGAATTTTCTCAATGTTGGGGATAACCGGGAGGCGGGTAAGATGCAGGAGGGTAGCCTTG
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AGCAAGGCAGAGT

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CTTAGGCAGAACATAAATCCAATAATGCAATTGTCGCATTTTGTAGTCTGGATGTTGAAT
TCATCCTGGAGAAGAAAGCGAGTAGAGGCCACAGAGTTTCCGAAACAGAGGAAAACCTCA
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CCAGCACAGCAAGTATACCTGGACATGTCATTGTAAAGTGCTCTTCTCCGAAGCAAGTAA
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CCCATGAGATCAGAGTGCCATAAGTTCCGGTAATCTTGCCGGAGCTTCATCTTCTCGGCC
TTATCCGCCATTGCTAAACAGAAGATCCAAAAACCCTAAAAATCAG**TAAAAA

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DS 

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GGT
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CGGTGGAACGCCCATTGGCTGAGGACCAAACACTCCATCTCTTTTGTCCATTTCAAGCTT
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CTGCAAACTTGTCTGT

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GCAGAGTTCAGGGCATTTGCTTTCTCCACACCTCCCACTACAGGGCATGTATCCAGCACA
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DS 



AS 1 10

CO CL205Contig1 1010 10 11 U
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TACCTACCATGGGATCCACTGTTGATGCAGCAGCAAACAAGGGTGTCAATGGAACCGCAA
CTGCCAAGAAACCCACTGTTATATTTGTCCTTGGTGGCCCAGGAAGTGGGAAAGGTACAC
AGTGTGCCTATATCGTTGAACATTATGGCTACACACATCTGAGTGCTGGAGACCTTCTTA
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TTCGTAAAACAAATTCATTGGATTTTTCTAATATATACTAAGATTAATGG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1GO47TF U 1
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CTGCCAAGAAACCCACTGTTATATTTGTCCTTGGTGGCCCAGGAAGTGGGAAAGGTACAC
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AGAAAGTTACTGAGATTGAACCCAAGTTTGTCTTGTTCTTTGATTGTCCTGAGGAAGAGA
TGGAGAGGCGCCTGTTGGGCAGAAACCAGGGGAGAGAGGATGATAATATCGAGACTA

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ACCTACCATGGGATCCACTGTTGATGCAGCAGCAAACAAGGGTGTTAATGGAACCGCAAC
TGCCAAGAAACCCACTGTTATATTTGTCCTTGGTGGCCCAGGAAGTGGGAAAGGTACACA
GTGTGCCTATATCGTTGAACATTATGGCTACACACATCTGAGTGCTGGAGACCTTCTTAG
AGCTGAAATTAAATCTGGCAATGAAAATGGAACTATGATCCAGAATATGATTAAAGAAGG
GAAGATTGTACCATCTGAGGTTACAATCAAGCTTCTTCAGAAAGCAATTCAGGAAAACGG
GAATGACAAGTTCCTCATTGATGGTTTCCCTCGCAATGAGGAAAACCGAGCTGCCTTTGA
GAAAGTTACTGAGATTGAACCCAAGTTTGTCTTGTTCTTTGATTGTCCTGAGGAAGAGAT
GGAGAGGCGCCTGTTGGGCAGAAACCAGGGGAGAGAGGATGACAATATCGAGACTAT

QA 1 597 1 597
DS 

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GGTTTCCCTCGTAATGAGGAGAACCGAGCTGCCTTTGAGAAAGTTACTGAGATTGAACCC
AAGTTTGTCTTGTTCTTTGATCGTCCTGAGGAAGAGATGGAGAGGCGCCTGTTGGGCAGA

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GAACCGCAACTGCCAAGAAACCCACTGTTATATTTGTCCTTGGTGGCCCAGGAAGTGGGA
AAGGTACACAGTGTGCCTATATCGTTGAACATTATGGCTACACACATCTGAGTGCTGGAG
ACCTTCTTAGAGCTGAAATTAAATCTGGCAATGAAAATGGAACTATGATCCAGAATATGA
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AGGAAAACGGGAATGACAAGTTCCTCATTGATGGTTTCCCTCGTAATGAGGAGAACCGAG
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AGACTATAAGGAAGCGTTTCAAGGTGTTTCTTGAATCTAGCTTGCCTGTTATTCAGTACT
ACGAAGCTAAGGGGAAAGTTAGGAAGATTCATGCCGCAAAGCCCATTGAAGATGTGTT

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DS 

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AGTGCTGGAGACCTTCTTAGAGCTGAAATTAAATCTGGCAATGAAAATGGAACTATGATC
CAGAATATGATTAAAGAAGGGAAGATTGTACCATCTGAGGTTACAATCAAGCTTCTTCAG
AAAGCAATTCAGGAAAACGGGAATGACAAGTTCCTCATTGATGGTTTCCCTCGTAATGAG
GAGAACCGAGCTGCCTTTGAGAAAGTTACTGAGATTGAACCCAAGTTTGTCTTGTTCTTT
GATTGTCCTGAGGAAGAGATGGAGAGGCGCCTGTTGGGCAGAAACCAGGGGAGAGAGGAT
GATAATATCGAGACTATAAGGAAGCGTTTCAAGGTGTTTCTTGAATCTAGCTTGCCTGTT
ATTCAGTACTACGAAGCTAAGGGGAAAGTTAGGAAGATTCATGC

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DS 

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GGACTTTTC
AGCGTTGAATCAAATCTCTTCGTGTTCCCCTCTTTCCTTCTTCAGGTGTAATATTTGAAC
CAAATTGCTTACCTACCATGGGATCCACTGTTGATGCAGCAGCAAACAAGGGTGTCAATG
GAACCGCAACTGCCAAGAAACCCACTGTTATATTTGTCCTTGGTGGCCCAGGAAGTGGGA
AAGGTACACAGTGTGCCTATATCGTTGAACATTATGGCTACACACATCTGAGTGCTGGAG
ACCTTCTTAGAGCTGAAATTAAATCTGGCAATGAAAATGGAACTATGATCCAGAATATGA
TTAAAGAAGGGAAGATTGTACCATCTGAGGTTACAATCAAGCTTCTTCAGAAAGCAATTC
AGGAAAACGGGAATGACAAGTTCCTCATTGATGGTTTCCCTCGTAATGAGGAGAACCGAG
CTGCCTTTGAGAAAGTTGCTGAGATTGAACCCAAGTTTGTCTTGTTCTTTGATTGTCCTG
AGGAAGAGATGGAGAGGCGCCTGTTGGGCAGAAACCAGGGGAGAGAGGATGATAATATCG
AGACTATAAGGAAGCGTTTCAAGGTGTTTCTTGAATCTAGCTTGCCTGTTATTCAGTACT
ACGAAGCTAAGGGGAAAGTTAGGAAGATTCATGCCG

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TTTGTCCTTGGTGGCCCAGGAAGTGGGAAAGGTACACAGTGTGCCTATATCGTTGAACAT
TATGGCTACACACATCTGAGTGCTGGAGACCTTCTTAGAGCTGAAATTAAATCTGGCAAT
GAAAATGGAACTATGATCCAGAATATGATTAAAGAAGGGAAGATTGTACCATCTGAGGTT
ACAATCAAGCTTCTTCAGAAAGCAATTCAGGAAAACGGGAATGACAAGTTCCTCATTGAT
GGTTTCCCTCGTAATGAGGAGAACCGAGCTGCCTTTGAGAAAGTTACTGAGATTGAACCC
AAGTTTGTCTTGTTCTTTGATTGTCCTGAGGAAGAGATGGAGAGGCGCCTGTTGGGCAGA
AACCAGGGGAGAGAGGATGATAATATCGAGACTATAAGGAAGCGTTTCAAGGTGTTTCTT
GAATCTAGCTTGCCTGTTATTCAGTACTACGAAGCTAAGGGGAAAGTTAGGAAGATTCAT
GCCGCAAAGCCCATTGAAGATGTGTTT

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DS 

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AAATCTGGCAATGAAAATGGAACTATGATCCAGAATATGATTAAAGAAGGGAAGATTGTA
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GAGATTGAACCCAAGTTTGTCTTGTTCTTTGATTGTCCTGAGGAAGAGATGGAGAGGCGC
CTGTTGGGCAGAAACCAGGGGAGAGAGGATGACAATATCGAGACTATAAGGAAGCGTTTC
AAGGTGTTTCTTGAATCTAGCTTGCCTGTTATTCAGTACTACGAAGCTAAGGGGAAAGTT
AGGAAGATTCATGCCGCAAAGCCCATTGAAGATGTGTTTCAGGAGGTGAAGGCAGTCTTT
ACTCCTGAAGCTGAGAAGGTTGAAGCCTAGGCTGAAGACATATACGGATAAATTGATCAG
GTAGCTGGGTGGGTGGCATCTTCTTTACTGGGAAGTCTCTGCTTGGCCTTACCTTTTTTC
TATATAACTATATATGATATGATTACTGTTATTATTATACAGATTGTTACCTATTGATAT
CATTTTTGATTTTGTACTTGATGGGATTTGTGATTGGCTTTTCTGTAATTTCATAAAACA
AATTCATTGGATTTTTCTAATATATACTAAGATTAATGG

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DS 

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AGGGAAGATTGTACCATCTGAGGTTACAATCAAGCTTCTTCAGAAAGCAATTCAGGAAAA
CGGGAATGACAAGTTCCTCATTGATGGTTTCCCTCGTAATGAGGAGAACCGAGCTGCCTT
TGAGAAAGTTGCTGAGATTGAACCCAAGTTTGTCTTGTTCTTTGATTGTCCTGAGGAAGA
GATGGAGAGGCGCCTGTTGGGCAGAAACCAGGGGAGAGAGGATGATAATATCGAGACTAT
AAGGAAGCGTTTCAAGGTGTTTCTTGAATCTAGCTTGCCTGTTATTCAGTACTACGAAGC
TAAGGGGAAAGTTAGGAAGATTCATGCCGCAAAGCCCATCGAAGATGTGTTTCAGGAGGT
GAAGGCAGTCTTTACTCCTGAAGCTGAGAAGGTTGAAGCCTAGGCTGAAGACATATACGG
ATAAATTGATCAGGTAGCTGGGTGGGTGGCATCTTCTTTACTGGGAAGTCTCTGCTTGGC
CTTACCTTTTTTCTATATAACTATATATGATATGATTACTGTTATTATTATACAGATTGT
TACCTATTGATATCATTTTTGATTTTGTACTTGATGGGATTTGTGATTGGCTTTTCTGCA
ATTTCGTAAAACAAATTCATTGGATTTTTCTAATATATACTAAGATTAAT
GG

QA 1 710 1 710
DS 

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GGAGAGAGGATGATAATATCGAGACTATAAGGAAGCGTTTCAAGGTGTTTCTTGAATTTA
GCTCGCCTGTTATTCAGTACTACGAAGCTAAGGGGAAAGTTAGGAAGATTCATGCCGCAA
AGCCCATTGAAGATGTGTTTCAGGAGGTGAAGGCAGTCTTTACTCCTGAAGCTGAGAAGG
TTGAAGCCTGGGCTGAAGACATATACGGATAAATTGATCAGGTAGCTGGGTGGGTGGCAC
CTTCTTTACTGGGAAGTTTTTGCTTGGCCTTACCTTTTTTCTATATAACTATATATGATA
TGATTACTGTTATTATTATACAGATTGTTACCTATTGATATCATTTTTGATTTTGTACTT
GATGGGATTTGTGATTGGCTTTTTTGCAATTTCGTAAAACAAATTCATTGGATTTTTCTA
ATATATACTAAGATTAAT
AG

QA 1 498 1 498
DS 



AS 3 8

CO CL206Contig1 1145 2 2 U
GATCTCTTCCCGACCTCTCCATTCCTATCAAGAAAATGGAGATCACAAGCGTTACTGAGT
ATGAAGCAATCGCAAGAGAAGTTGCCTAAGATGGTATATGACTACTATGCGTCCGGAGCA
GAGGACCAATGGACTCTTCAGGAGAACAGAAACGCTTTCGCTAGGATCCTCTTTCGGCCT
AGGATTCTGATTGATGTGAGCAAGATTGATATGACAACAAACGTCTTGGGTTTCAAGATC
TCCATGCCCATCATGGTTGCTCCTACTGCCATGCAGAAGATGGCTCATCCTGAAGGTGAA
TATGCTACGGCTAGAGCTGCGTCTGCCGCTGGAACCATCATGACACTCTCTTCATGGGCT
ACTTCCAGCGTTGAAGAAGTTGCTTCCACAGGTCCAGGGATCCGATTCTTCCAGCTCTAT
GTATACAAGAACAGGAAAGTGGTTGAGCAGCTCGTGAGAAGAGCAGAGAAGGCAGGGTTC
AAAGCCATTGCTCTCACTGTAGACACCCCAAGGCTAGGTCGCAGAGAGTCTGATATCAAG
AACAGATTCACTTTGCCTCCAAACTTGACATTGAAGAACTTTGAAGGTCTTGACCTCGGA
AAGATGGACGAGGCCAATGACTCTGGCTTGGCTTCATATGTTGCTGGTCAAATTGACCGT
ACCTTGAGCTGGAAGGACGTCCAGTGGCTCCAGACAATCACCAGCATGCCAATTCTTGTC
AAGGGTGTTCTTACAGGAGAAGATGCAAGGATAGCGATTCAAGCTGGAGCAGCAGGGATC
ATTGTGTCAAACCATGGAGCTCGTCAGCTTGACTATGTCCCAGCAACAATTTCAGCCCTT
GAAGAGGTTGTTAAAGCGACACAAGGACGAGTTCCTGTCTTCTTGGACGGTGGTGTTCGA
CGTGGAACTGATGTCTTCAAGGCACTTGCACTTGGAGCTTCCGGGATATTCATTGATAGA
CCAGTGGTGTTCTCACTAGCCGCTGAAGGAGAAGCTGGAGTCAGAAAAGTGCTTCAAATG
TTACGCGATGAGTTCGAGCTAACCATGGCACTAAGTGGGTACAGGTCTCTCAGTGAGATC
ACTCGGAACCACATTATCACCGAGTGGGAGACTCCACGCCATTTGCCCAAGTTATAGAGA
GAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 

AF RS1A625TF U 1
AF RS1A625JQ C 267
BS 1 732 RS1A625TF
BS 733 1145 RS1A625JQ

RD RS1A625TF 732 0 0
GATCTCTTCCCGACCTCTCCATTCCTATCAAGAAAATGGAGATCACAAGCGTTACTGAGT
ATGAAGCAATCGCAAGAGAAGTTGCCTAAGATGGTATATGACTACTATGCGTCCGGAGCA
GAGGACCAATGGACTCTTCAGGAGAACAGAAACGCTTTCGCTAGGATCCTCTTTCGGCCT
AGGATTCTGATTGATGTGAGCAAGATTGATATGACAACAAACGTCTTGGGTTTCAAGATC
TCCATGCCCATCATGGTTGCTCCTACTGCCATGCAGAAGATGGCTCATCCTGAAGGTGAA
TATGCTACGGCTAGAGCTGCGTCTGCCGCTGGAACCATCATGACACTCTCTTCATGGGCT
ACTTCCAGCGTTGAAGAAGTTGCTTCCACAGGTCCAGGGATCCGATTCTTCCAGCTCTAT
GTATACAAGAACAGGAAAGTGGTTGAGCAGCTCGTGAGAAGAGCAGAGAAGGCAGGGTTC
AAAGCCATTGCTCTCACTGTAGACACCCCAAGGCTAGGTCGCAGAGAGTCTGATATCAAG
AACAGATTCACTTTGCCTCCAAACTTGACATTGAAGAACTTTGAAGGTCTTGACCTCGGA
AAGATGGACGAGGCCAATGACTCTGGCTTGGCTTCATATGTTGCTGGTCAAATTGACCGT
ACCTTGAGCTGGAAGGACGTCCAGTGGCTCCAGACAATCACCAGCATGCCAATTCTTGTC
AAGGGTGTTCTT

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1A625JQ 879 0 0
TGCCATGCAGAAGATGGCTCATC*TGAAGGTGAATATGCTACGGCTAGAGCTGCGTCTGC
CGCTGGAACCATCATGACACTCTCTTCATGGGCTACTTCCAGCGTTGAAGAAGTTGCTTC
CACAGGTCCAGGGATCCGATTCTTCCAGCTCTATGTATACAAGAACAGGAAAGTGGTTGA
GCAGCTCGTGAGAAGAGCAGAGAAGGCAGGGTTCAAAGCCATTGCTCTCACTGTAGACAC
CCCAAGGCTAGGTCGCAGAGAGTCTGATATCAAGAACAGATTCACTTTGCCTCCAAACTT
GACATTGAAGAACTTTGAAGGTCTTGACCTCGGAAAGATGGACGAGGCCAATGACTCTGG
CTTGGCTTCATATGTTGCTGGTCAAATTGACCGTACCTTGAGCTGGAAGGACGTCCAGTG
GCTCCAGACAATCACCAGCATGCCAATTCTTGTCAAGGGTGTTCTTACAGGAGAAGATGC
AAGGATAGCGATTCAAGCTGGAGCAGCAGGGATCATTGTGTCAAACCATGGAGCTCGTCA
GCTTGACTATGTCCCAGCAACAATTTCAGCCCTTGAAGAGGTTGTTAAAGCGACACAAGG
ACGAGTTCCTGTCTTCTTGGACGGTGGTGTTCGACGTGGAACTGATGTCTTCAAGGCACT
TGCACTTGGAGCTTCCGGGATATTCATTGATAGACCAGTGGTGTTCTCACTAGCCGCTGA
AGGAGAAGCTGGAGTCAGAAAAGTGCTTCAAATGTTACGCGATGAGTTCGAGCTAACCAT
GGCACTAAGTGGGTACAGGTCTCTCAGTGAGATCACTCGGAACCACATTATCACCGAGTG
GGAGACTCCACGCCATTTGCCCAAGTTATAGAGAGAGCC

QA 1 879 1 879
DS 



CO CL206Contig2 732 3 21 U
GGATTCTCTCCGGAGAGCTTATTTCCCCGTCAAAGATTAACATCTGAAAATGGAGATCAC
AAACGTTACCGAGTATGAAGCGATTGCAAAGGAGAAGTTGCCAAAGATGGTATACGACTA
CTATGCCTCCGGAGCAGAGGACCAATGGACTCTTCAAGAGAACCGAAACGCTTTTGCAAG
GATCCTCTTTCGTCCACGGATTCTGATTGATGTGAGCAAGATTGATATGACAACAACCAT
ATTGGGGTTCAAGATCTCCATGCCCATCATGGTTGCTCCTACTGCCATGCAGAAGATGGC
TCACCCGGAAGGAGAATACGCTACGGCTAGAGCTGCCTCTGCTGCTGGAACCATCATGAC
GCTATCTTCATGGGCTACTTCCAGTGTTGAGGAAGTTGCTTCCACAGGGCCAGGGATTCG
TTTTTTTCCAGCTCTATGTATACAAGAACAGGAACGTCGTTGAGCAGCTGGTGAGAAGAG
CGGAGAGAGCAGGGTTCAAAGCCATTGCTCTCACTGTAGACACCCCAAGGCTAGGTCGCA
GAGAGTCTGATATCAAGAACAGATTTACTTTGCCTCCAAACCTGACATTGAAGAACTTTG
AAGGTCTTGACCTCGGAAAGATGGACGAGGCCAATGACTCTGGCTTGGCTTCATATGTTG
CTGGTCAAATTGACCGTACCTTGAGCTGGAAGATGTCCAGTGGCTCCAGACATTACCAAA
TGCCGATTCTTG


BQ
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5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D917TF U 4
AF RS1DJ81TF U 4
AF RS1AW36TF U 1
BS 1 21 RS1AW36TF
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BS 23 36 RS1AW36TF
BS 37 37 RS1D917TF
BS 38 129 RS1AW36TF
BS 130 130 RS1D917TF
BS 131 156 RS1AW36TF
BS 157 157 RS1D917TF
BS 158 225 RS1AW36TF
BS 226 226 RS1D917TF
BS 227 240 RS1AW36TF
BS 241 241 RS1D917TF
BS 242 246 RS1AW36TF
BS 247 247 RS1D917TF
BS 248 318 RS1AW36TF
BS 319 319 RS1D917TF
BS 320 457 RS1AW36TF
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BS 459 487 RS1AW36TF
BS 488 488 RS1DJ81TF
BS 489 732 RS1AW36TF

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GG
CTCTCCGGAGAGCTTATTTCCCCGTCAAAGATTAACATCTGAAAATGGAGATCACAAACG
TTACCGAGTATGAAGCGATTGCAAAGGAGAAGTTGCCAAAGATGGTATACGACTACTATG
CCTCCGGAGCAGAGGACCAATGGACTCTTCAAGAGAACCGAAACGCTTTTGCAAGGATCC
TCTTTCGTCCACGGATTCTGATTGATGTGAGCAAGATTGATATGACAACAACCATATTGG
GGTTCAAGATCTCCATGCCCATCATGGTTGCTCCTACTGCCATGCAGAAGATGGCTCACC
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CTTCATGGGCTACTTCCAGTGTTGAGGAAGTTGCTTCCACAGGGCCAGGGA

QA 3 413 3 413
DS 

RD RS1DJ81TF 686 0 0
GG
CTCTCCGGAGAGCTTATTTCCCCGTCAAAGATTAACATCTGAAAATGGAGATCACAAACG
TTACCGAGTATGAAGCGATTGCAAAGGAGAAGTTGCCAAAGATGGTATACGACTACTATG
CCTCCGGAGCAGAGGACCAATGGACTCTTCAAGAGAACCGAAACGCTTTTGCAAGGATCC
TCTTTCGTCCACGGATTCTGATTGATGTGAGCAAGATTGATATGACAACAACCATATTGG
GGTTCAAGATCTCCATGCCCATCATGGTTGCTCCTACTGCCATGCAGAAGATGGCTCACC
CGGAAGGAGAATACGCTACGGCTAGAGCTGCCTCTGCTGCTGGAACCATCATGACGCTAT
CTTCATGGGCTACTTCCAGTGTTGAGGAAGTTGCTTCCACAGGGCCAGGGATTCGTTTTT
T*CCAGCTCTATGTATACAAGAACAGGAACGTCGTTGAGCAGCTGGTGAGAAGAGCTGAG
AGAGCAGGGTTCAAAGCCATTGCTCTCACTGTAGACACCCCAAGGCTAGGTCGCAGAGAG
TCTGATATCAAGAACAGATTTACTTTGCCTCCAAACCTGACATTGAAGAACTTTGAAGGT
CTTGACCTCGGAAAGATGGA***GGCCAATGACTCTGGCTTGGCTTCATATGTTGCTGGT
CAAATTGACCGTACCTTGAGCTGG

QA 3 686 3 686
DS 

RD RS1AW36TF 732 0 0
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AAACGTTACCGAGTATGAAGCGATTGCAAAGGAGAAGTTGCCAAAGATGGTATACGACTA
CTATGCCTCTGGAGCAGAGGACCAATGGACTCTTCAGGAGAACCGAAACGCTTTTGCAAG
GATCCTCTTTCGTCCACGGATTCTGATTGATGTGAGCAAGATTGACATGACAACAACCAT
CTTGGGTTTCAAGATCTCCATGCCCATCATGGTTGCTCCTACTGCCATGCAGAAGATGGC
TCACCCGGAAGGAGAATATGCTACGGCTAGAGCTGCCTCTGCTGCTGGAACCATCATGAC
GCTATCTTCATGGGCTACTTCCAGTGTTGAGGAAGTTGCTTCCACAGGGCCAGGGATTCG
TTTTTTTCCAGCTCTATGTATACAAGAACAGGAACGTGGTTGAGCAGCTGGTGAGAAGAG
CGGAGAGGGCAGGGTTCAAAGCCATTGCTCTCACTGTAGACACCCCAAGGCTAGGTCGCA
GAGAGTCTGATATCAAGAACAGATTTACTTTGCCTCCAAACCTGACATTGAAGAACTTTG
AAGGTCTTGACCTCGGAAAGATGGACGAGGCCAATGACTCTGGCTTGGCTTCATATGTTG
CTGGTCAAATTGACCGTACCTTGAGCTGGAAGATGTCCAGTGGCTCCAGACATTACCAAA
TGCCGATTCTTG

QA 1 732 1 732
DS 



CO CL206Contig3 716 3 12 U
TGGAATGTAGGTAGAAAGAAGCCAAATAACATTACAGAATCACTAGGCATCGTTTTGCGA
TTCAGACATAAAAGGAGAAACAAGTTTTAGATAGGTAGTAGCAAAGTAGACCGAATCAGA
ATATGAGAGAAAGTGTAGCCACATATTACATTACATGTTCTCTGGTTGTTTTTGGTGTCT
CTCTATAACCTGGCCGAAGGACGTGGAGTGTCCCATTCGGTGGTGATGTGGTTACGGGTG
ATTTCCTTGAGAGCCCTGCACCCACTTAACGCCATTGTCAGCTCGAACTCATCGCGTAGC
ATTTGCAGCACTTTTCTGACTCCAGCCTCTCCTTCAGCAGCAAGTGAGAATACCACTGGT
CTTCCAATAAATATCCCGGAGGCTCCAAGAGCAAGTGCCTTGAAAACATCGGTGCCAAGT
CTAACACCACCATCCAAGAAGACAGGGATACGTCCTTGTGTCGCTTTGACAACCTCTTCC
AGGGCTGAAATTGTTGCAGGGACATAGTCAAGCTGGCGAGCTCCATGGTTTGACACAATG
ATCCCGACTGCTCCAGCTTGAACCGCTATCCTTGCACCCTCTCCTGTAATAACACCCTTG
ACAAGAATCGGCATTTTGGTAATTGTCTGGAGCCACTGGACATCCTTCCAGCTCAAGGTA
CGGTCAATTTGACCAGCAACATATGAAGCCAAGCCAGAGTCATTGGCCTCGTCCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D917JQ U 96
AF RS1DE63TF C 1
AF RS1DJ81JQ U 96
BS 1 97 RS1DE63TF
BS 98 385 RS1D917JQ
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GG
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GG
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AGTCATTGGCCTC
CATCTTTCCGA

QA 3 615 3 615
DS 



AS 1 12

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ATT


BQ
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55 55 55 55 55 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
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65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 35 65 50 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 35 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1ET58TF U 1
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BS 674 714 RS1AO36TFB
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CCTCATGTTACACCTCCCAATCAAGAGGGGATTGTCAAAGTTTTATGAAGGAAAATCTCA
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AAATACAAGTAATAAAGCAAGAAGAAAGGCATGTAAGAGCACCGGAGAAATAATAGATCA
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TTCTTTTGTTCT

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DS 

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ATAGCCCAAAAGCTACAATCTCCAAGAAAGCCAACAAAACACCTTCTTTTGTTCTCTCTT
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A

QA 6 661 6 661
DS 

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CTG
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DS 

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DS 

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G
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DS 

RD RS1DL40TF 638 0 0
G
ATCTGAATATAAAGCACATGGGCAAAATGATCTATCAAGATTCAAGTAGGACAGAAGAAG
AAGAAGACCTTGTTGAAGGAGTTTCAAGATCAATGTTTGAAGCTGAAACATTCTCCGGGG
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AAAAATAAAACATGTTCACCTTAAATCTTAAGCCTGT

QA 2 638 2 638
DS 

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TCCTGTTTCAAGAATTCGTTTTTCTTGATTTCTGTTGGAAGATGAATCTGAATATAAAGC
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TCACCTTAAATCTTAAGCCTGTAAGAA*GATATTCCCAGTGT

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DS 

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ATCAAGATTCAAGTAGGACAGAAGAAGAAGAAGACCTTGTTGAAGGAGTTTCAAGATCAA
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DS 

RD RS1AO36JQ 821 0 0
CCCAATTGTAGAACAACAACACACATCTTGACATAAGAACTCTCCTGTTCTGTTTCTTAT
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TAAATATTTGTACACCCTTTTTGTTGGAACTATTTTTTAGC

QA 1 821 1 821
DS 

RD RS1AW64JQ 831 0 0
TCTGTGTCCCAATGTAG
ACAACAACACACATCTTGACATAG**ACTCTCTTGTTCTGTTTCTTATCCTGTTTCAAGA
ATTCGTTTTTCTTGATTTCTGTTGGAAGATGAATCTGAATATAAAGCACATGGGCAAAAT
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AATGT

QA 18 826 18 826
DS 

RD RS1F334JQ 342 0 0
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CATGTTCATTAACTTAATCATATAAACCAAATATATGTGATT

QA 1 342 1 342
DS 



AS 1 11

CO CL208Contig1 1345 11 8 U
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BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 

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AF RS1EF96TF C 75
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A
GTACAGAAATAAACATAGGTTACGCTATTTTAACATCTTAACACAAAAGCAAAGTCTAAT
TTAATACATACAAAGTGCATAATTTATATTTTTTCAAAAAAAAAAAAGTGCATAATTTAT
TGGATCAAAAATATGGGAAGTGAAGCCCTGTAGACAAGCCCTAATAATAATATAACTCTC
CTCTCCATCCTCCGTTCTCCAGACACACACACATAAATCATTACAGGAAGTCGGAGAATG
TGTCGTTCATGAGAAAATTGGCCATGATGCGATGAGTCTTCTGTGTTGGATGAAATGAGT
CCCAAAACACATACTTGTCTGCGTTGGAACATGTGAATGGGTTATTCCTTTGGCAACTAT
ATCCCAT

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DS 

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C
GTACAAAAATAAACATAGGTTACGCTATTTTAACATCTTAACACAAAAGCAAAGTCTAAT
TTAATACATACAAAGTGCATAATTTACATTTTTTCAAAAAAAAA***GTGCATAATTTAT
TGGATCAAAAATATGGGAAGTGAAGCCCTGTAAACAAGCCCTAATAATAATATAACTCTC
CTCTCCATCCTCCGTTCTCCAGACACACACACATAAATCATTACAGGAAGTCAGAGAATG
TGTCGTTCATGAAAAAATTGGCCATGATGCGATGAGTCTTCTGTGTTGGATGAAATGAGT
CCCAAAACACATACTTGTCTGCGTTGGAACATGTGAATGGGTTATTCCTTTGGCAACTAT
ATCCCATCTCGAACATCCCCGTCGCACAGCAAGCAGCTGCGGCCACCTCGAACCCAAAAG
AGGAAGGGTTCTTGATGATTCGCATAAATGGTTCATAGGGATTTGAAAAAACAAGGACGG
AACCAGAAAGCTCTTTGCTCAGCTTCTCAACAAGCCTCTCAAGCTTGCCGTTGAACTGGA
CCGCAATGTCGTTAAAGCGTCCAACGCACTCACCTCCCGTGCCAATGTTGGTGGCTCTCT
CTAAAGGCATGCATCCCATTGGAGGCAAT

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DS 

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GC
CTAATAAAATAAGCTATATAGGCACACCATAGTACAGAAATAAACATAGGTTACGCTATT
TTAACATCTTAACACAAAAGCAAAGTCTAATTTAATACATACAAAGTGCATAATTTATAT
TTTTTCAAAAAAAAAAA*GTGCATAATTTATTGGATCAAAAATATGGGAAGTGAAGCCCT
GTAGACAAGCCCTAATAATAATATAACTCTCCTCTCCATCCTCCGTTCTCCAGACACACA
CACATAAATCATTACAGGAAGTCAGAAAATGTGTCGTTCATGAAAAAATTGGCCATGATG
CGATGAGTCTTCTGTGTTGGATGAAATGAGTCCCAAAACACATACTTGTCTGCGTTGGAA
CATGTGAATGGGTTATTCCTTTGGCAACTATATCCCATCTCGAACATCCCCGTCGCACAG
CAAGCAGCTGCGGCCACCTCGAACCCAAAAGAGGAAGGGTTCTTGATGATTCCCATAAAT
GGTTCATAGGGATTTGAAAAAACAAGGACGGAACCAGAAAGCTCTTTGCTCAGCTTCTCA
ACAAGCCTCTCAAGCTTGCCGTTGAACTGGACCGCAATGTCGTTAAAGCGTCCAACGCAC
TCACCTCCCGTGCCAATGTTGGTGGCTCTCTCTAAAGGCATGCATCCCATTGGAGGCAAT
CCACCTAGTGAAATCTTCCTAGCTCCAAGTCCGTGCAGCTTCTTCAC
C

QA 3 709 3 709
DS 

RD RS1EF96TF 636 0 0
CACAAAAGCAAAGTCTAATTTAATACATACAAAGTGCATAATTTATATTTTTTCAAAAAA
AAAAA*GTGCATAATTTATTGGATCAAAAATATGGGAAGTGAAGCCCTGTAGACAAGCCC
TAATAATAATATAACTCTCCTCTCCATCCTCCGTTCTCCAGACACACACACATAAATCAT
TACAGGAAGTCAGAGAATGTGTCGTTCATGAGAAAATTGGCCATGATGCGATGAGTCTTC
TGTGTTGGATGAAATGAGTCCCAAAACACATACTTGTCTGCGTTGGAACATGTGAATGGG
TTATTCCTTTGGCAACTATATCCCATCTCGAACATCCCCGTCGCACAGCAAGCAGCTGCG
GCCACCTCGAACCCAAAAGAGGAAGGGTTCTTGATGATTCGCATAAATGGTTCATAGGGA
TTTGAAAAAACAAGGACGGAACCAGAAAGCTCTTTGCTCAGCTTCTCAACAAGCCTCTCA
AGCTTGCCGTTGAACTGGACCGCAATGTCGTTAAAGCGTCCAACGCACTCACCTCCCGTG
CCAATGTTGGTGGCTCTCTCTAAAGGCATGCATCCCATTGGAGGCAATCCACCTAGTGAA
ATCTTCCTAGCTCCAAGTCCGTGCAGCTTCTTCAC
C

QA 1 635 1 635
DS 

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C
GTACAGAAATAAACATAGGTTACGCTATTTTAACATCTTAACACAAAAGCAAAGTCTAAT
TTAATACATACAAAGTGCATAATTTATATTTTTTCAAAAAAAAAAA*GTGCATAATTTAT
TGGATCAAAAATATGGGAAGTGAAGCCCTGTAGACAAGCCCTAATAATAATATAACTCTC
CTCTCCATCCTCCGTTCTCCAGACACACACACATAAATCATTACAGGAAGTCAGAGAATG
TGTCGTTCATGAGAAAATTGGCCATGATGCGATGAGTCTTCTGTGTTGGATGAAATGAGT
CCCAAAACACATACTTGTCTGCGTTGGAACATGTGAATGGGTTATTCCTTTGGCAACTAT
ATCCCATCTCGAACATCCCCGTCGCACAGCAAGCAGCTGCGGCCACCTCGAACCCAAAAG
AGGAAGGGTTCTTGATGATTCGCATAAATGGTTCATAGGGATTTGAAAAAACAAGGACGG
AACCAGAAAGCTCTTTGCTCAGCTTCTCAACAAGCCTCTCAAGCTTGCCGTTGAACTGGA
CCGCAATGTCGTTAAAGCGTCCAACGCACTCACCTCCCGTGCCAATGTTGGTGGCTCTCT
CTAAAGGCATGCATCCCATTGGAGGCAATCCACCTAGTGAAATCTTCCTAGCTCCAAGTC
CGTGCAGCTTCTTCACAAAGTCTTTGGCGATTCCAGCTAGAAAATCTTGGTAAAGATCGA
CCGAGTATTGAGA

QA 2 734 2 734
DS 

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TTTTAACATCTTAACACAAAAGCAAAGTCTAATTTAATACATACAAAGTGCATAATTTAT
ATTTTTTCAAAAAAAAAAA*GTGCATAATTTATTGGATCAAAAATATGGGAAGTGAAGCC
CTGTAGACAAGCCCTAATAATAATATAACTCTCCTCTCCATCCTCCGTTCTCCAGACACA
CACACATAAATCATTACAGGAAGTCAGAGAATGTGTCGTTCATGAGAAAATTGGCCATGA
TGCGATGAGTCTTCTGTGTTGGATGAAATGAGTCCCAAAACACATACTTGTCTGCGTTGG
AACATGTGAATGGGTTATTCCTTTGGCAACTATATCCCATCTCGAACATCCCCGTCGCAC
AGCAAGCAGCTGCGGCCACCTCGAACCCAAAAGAGGAAGGGTTCTTGATGATTCGCATAA
ATGGTTCA**GGGATTTGAAAAAACAAGGACGGAACCAGAAAGATCTTTGCTCAGCTTCT
CAACAAGCCTCTCAAGCTTGCCGTTGAACTGGACCGCAATGTCGTTAAAGCGTCCAACGC
ACTCACCTCCCGTGCCAATGTTGGTGGCTCTCTCTAAAGGCATGCATCCCATTGGAGGCA
ATCCACCTAGTGAAATCTTCCTAGCTCCAAGTCCGTGCAGCTTCTTCACAAAGTCTTTGG
CGATTCCAGCTAGAAAATCTTGGTAAAGATCGACCGAGTATTGAGAAGAACGTCCAGGAA
AGGCAAAGTAGTTCTCCGGGAAGTCGTTGGTCCCTACGCTTATGAGGTACAGAGAG

QA 1 836 1 836
DS 

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CC
AAAAAAAAAAGTGCATAATTTATTGGATCAAAAATATGGGAAGTGAAGCCCTGTAGACAA
GCCCTAATAATAATATAACTCTCCTCTCCATCCTCCGTTCTCCAGACACACACACATAAA
TCATTACAGGAAGTCAGAGAATGTGTCGTTCATGAAAAAATTGGCCATGATGCGATGAGT
CTTCTGTGTTGGATGAAATGAGTCCCAAAACACATACTTGTCTGCGTTGGAACATGTGAA
TGGGTTATTCCTTTGGCAACTATATCCCATCTCGAACATCCCCGTCGCACAGCAAGCAGC
TGCGGCCACCTCGAACCCAAAAGAGGAAGGGTTCTTGATGATTCGCATAAATGGTTCATA
GGGATTTGAAAAAACAAGGACGGAACCAGAAAGCTCTTTGCTCAGCTTCTCAACAAGCCT
CTCAAGCTTGCCGTTGAACTGGACCGCAATGTCGTTAAAGCGTCCAGCGCACTCACCTCC
CGTGCCAATGTTGGTGGCTCTCTCTAAAGGCATGCATCCCATTGGAGGCAATCCACCTAG
TGAAATCTTCCTAGCTCCAAGTCCGTGCAGCTTCTTCACAAAGTCTTTGGCGATTCCAGC
TAGAAAATCTTGGTAAAGATCGACCGAGTATTGAGAAGAACGTCCAGGAAAGGCAAAGTA
GTTCTCCAGGAAGTCGTTGGTCCCTACGCTTATGAG

QA 3 698 3 698
DS 

RD RS1GG73TF 769 0 0
CAATGTCGTTAAAGCGTCCAACGCACTCACCTCCCGTGCCAATGTTGGTGGCTCTCTCTA
AAGGCATGCATCCCATTGGAGGCAATCCAC*TAGTGAAATCTTCCTAGCTCCAAGTCCGT
GCAGCTTCTTCACAAAGTCTTTGGCGATTCCAGCTAGAAAATCTTGGTAAAGATCGACCG
AGTATTGAGAAGAACGTCCAGGAAAGGCAAAGTAGTTCTCCAGGAAGTCGTTGGTCCCTA
CGCTTATGAGGTACAGAGAGTTGGTTATCGTTTCTGTGGCTTGGTCTTTTCCTTGGTATG
CTTCTAGTTTTGTTTGGTATTCTTTGTAGTATTCAAGTTGTTTCCACAGTGGTAGAACCG
ACAGCACATCGGAAGTGGCGTTGTCATAGCCGGTGGCAGCAGAAGCAAAAGTAACACCTG
TTGCAAAATCTGAAATGTTGTAAGAAGGATCCAAGTATGCCGGAATTATTGGTTTGAGCC
CTATGGCTTCCGACATAAAGTCCGTCGCAATCTTTCCGTTACAAAACCTCCCAGTCGGTT
TCCCACCAACAAAGTCCCGTCCGTATGGCTCAAAGTTGCTTCTTGCCACTGTTGGGATGT
AGTTGTTGTTACCCGCATCAACGGTTGAGTCGCCAAACACGATGATGGCGGGTATTTTAC
CGGCAAACGTTACTGCTAGCGACGTGGTTATTATGAAGAAGAGAAGTGTGAAAAGACTTT
TGATGTTTCCCATAGTGTAATTTGTGTCTTGTGATTTTGATTGTGATCC

QA 1 769 1 769
DS 

RD RS1DF61TF 746 0 0
CACTCACCTCCCGTGCCAATGTTGGTGGCTCTCTCTAAAGGCATGCATCCCATTGGAGGC
AATCCACCTAGTGAAATCTTCCTAGCTCCAAGTCCGTGCAGCTTCTTCACAAAGTCTTTG
GCGATTCCAGCTAGAAAATCTTGGTAAAGATCGACCGAGTATTGAGAAGAACGTCCAGGA
AAGGCAAAGTAGTTCTCCAGGAAGTCGTTGGTCCCTACGCTTATGAGGTACAGAGAGTTG
GTTATCGTTTCTGTGGCTTGGTCTTTTCCTTGGTATGCTTCTAGTTTTGTTTGGTATTCT
TTGTAGTATTCAAGTTGTTTCCACAGTGGTAGAACCGACAGCACATCGGAAGTGGCGTTG
TCATAGCCGGTGGCAGCAGAAGCAAAAGTAACACCTGTTGCAAAATCTGAAATGTTGTAA
GAAGGATCCAAGTATGCCGGAATTATTGGTTTGAGCCCTATGGCTTCCGACATAAAGTCC
GTCGCAATCTTTCCGTTACAAAACCTCCCAGTCGGTTTCCCACCAACAAAGTCCCGTCCG
TATGGCTCAAAGTTGCTTCTTGCCACTGTTGGGATGTAGTTGTTGTTACCCGCATCAACG
GTTGAGTCGCCAAACACGATGATGGCGGGTATTTTACCGGCAAACGTTACTGCTAGCGAC
GTGGTTATTATGAAGAAGAGAAGTGTGAAAAGACTTTTGATGTTTCCCATAGTGTAATTT
GTGTCTTGTGATTTTGATTGTGATCC

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1E511TF 564 0 0
GGCAAAGTAGTTCTCCGGGAAGTCGTTGGTCCCTACGCTTATGAGGTACAGAGAGTTGGT
TATCGTTTCTGTGGCTTGGTCTTTTCCTTGGTATGCTTCTAGTTTTGTTTGGTATTCTTT
GTAGTATTCAAGTTGTTTCCACAGTGGTAGAACCGACAGCACATCGGAAGTGGCGTTGTC
ATAGCCGGTGGCAGCAGAAGCAAAAGTAACACCTGTTGCAAAATCTGAAATGTTGTAAGA
AGGATCCAAGTATGCCGGAATTATTGGTTTGAGCCCTATGGCTTCCGACATAAAGTCCGT
CGCAATCTTTCCGTTACAAAACCTCCCAGTCGGTTTCCCACCAACAAAGTCCCGTCCGTA
TGGCTCAAAGTTGCTTCTTGCCACTGTTGGGATGTAGTTGTTGTTACCCGCATCAACGGT
TGAGTCGCCAAACACGATGATGGCGGGTATTTTACCGGCAAACGTTACTGCTAGCGACGT
GGTTATTATGAAGAAGAGAAGTGTGAAAAGACTTTTGATGTTTCCCATAGTGTAATTTGT
GTCTTGTGATTTTGATTGTGATCC

QA 1 564 1 564
DS 

RD RS1GY05TF 670 0 0
AATC
TCCTAGCTCCAAGTCCGTGCAGCTTCTTCACAAAGTCTTTGGCGATTCCAGCTAGAAAAT
CTTGGTAAAGATCGACCGAGTATTGAGAAGAACGTCCAGGAAAGGCAAAGTAGTTCTCCA
GGAAGTCGTTGGTCCCTACGCTTATGAGGTACAGAGAGTTGGTTATCGTTTCTGTGGCTT
GGTCTTTTCCTTGGTATGCTTCTAGTTTTGTTTGGTATTCTTTGTAGTATTCAAGTTGTT
TCCACAGTGGTAGAACCGACAGCACATCGGAAGTGGCGTTGTCATAGCCGGTGGCAGCAG
AAGCAAAAGTAACACCTGTTGCAAAATCTGAAATGTTGTAAGAAGGATCCAAGTATGCCG
GAATTATTGGTTTGAGCCCTATGGCTTCCGACATAAAGTCCGTCGCAATCTTTCCGTTAC
AAAACCTCCCAGTCGGTTTCCCACCAACAAAGTCCCGTCCGTATGGCTCAAAGTTGCTTC
TTGCCACTGTTGGGATGTAGTTGTTGTTACCCGCATCAACGGTTGAGTCGCCAAACACGA
TGATGGCGGGTATTTTACCGGCAAACGTTACTGCTAGCGACGTGGTTATTATGAAGAAGA
GAAGTGTGAAAAGACTTTTGATGTTTCCCATAGTGTAATTTGTGTCTTGTGATTTTGATT
GTGATC

QA 5 670 5 670
DS 



AS 1 12

CO CL209Contig1 611 12 4 U
GGGTCAGAAAATAAAATAAAAGAGATCGGTCTGGGAGAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGG
CAGCAACATTTGCAGCTCCATCGACAGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCTCCCA
TCAAGGCCAAAGCTCTCTCTTCATCATTTATAAAACCAACAATAAGAGCAAAGAACCCTC
TGAAAGTCGCCGGAGCATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAACAGAACTGGCTGAGGA
GAGATCTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGG
CGATAAACGGGAAGAGCCTGTCGGGTCTCTTCTTCGAGAGCATAGGAACTGAGCTCGCTC
ACTTCCCAACTCCTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACT
TAGGTCTCTTCATCTGCCTCACCTTCGGACAAATCGGATTTAAGGGCAGGACCGAAGATT
ACTTCAAGAAATAAATCATCCATCTTATTCCATCTTTACTTATTATCTTACATCTCTCTC
TTTGTTCTTCTCCGTGTAATATTATGAATCAAAACTTT*CTTTCTTTCGGTTTCCATATT
TTGATGTTTCA


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 10 50 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 65 65 50 
65 65 65 65 65 65 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 20 70 70 70 70 55 55 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 20 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 
60 60 10 60 60 60 60 60 10 10 10 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 5 60 60 55 55 55 55 5 55 5 55 5 55 55 50 0 0 30 25 25 25 25 25 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CZ24TF U 29
AF RS1CZ24JQ C 68
AF RS1CD08TF U 1
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TATAAAACCAACAATAAGAGCAAAGAACCCTCTGAAAGTCGCCGGAGCATCGGGAGGAAG
AGTCACTTGCTTTGAACAGAACTGGCTGAGGAGAGATCTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCT
GATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATAAACGGGAAGAGCCTGTCGGGTCT
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GCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAGGTCTCTTCATCTGCCTCACCTTCGG
ACAAATCGGATTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACTTCA

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DS 

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GAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATAAA
CGGGAAGAGCCTGTCGGGTCTCTTCTTCGAGAGCATAGGAACTGAGCTCGCTCACTTCCC
AACTCCTCCTGCTCTCGCTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAGGTCT
CTTCATCTGCCTCACCTTCGGACAAATCGGATTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACTTCAA
GAAATAAATCATCCATCTTATTCCATCTTTACTTATTATCTTACATCTCTC

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DS 

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CAGCAACATTTGCAGCTCCATCGACAGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCTCCCA
TCAAGGCCAAAGCTCTCTCTTCATCATTTATAAAACCAACAATAAGAGCAAAGAACCCTC
TGAAAGTCGCCGGAGCATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAACAGAACTGGCTGAGGA
GAGATCTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGG
CGATAAACGGGAAGAGCCTGTCGGGTCTCTTCTTCGAGAGCATAGGAACTGAGCTCGCTC
ACTTCCCAACTCCTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACT
TAGGTCTCTTCATCTGCCTCACCTTCGGACAAATCGGATTTAAGGGCAGGACCGAAGATT
ACTTCAAGAAATAAATCATCCATCTTATTCCATCTTTACTTATTATCTTACATCTCTCTC
TTTGTTCTTCTCCGTGTAATATTATGAATCAAAACTTT*CTTTCTTTCGGTT

QA 1 592 1 592
DS 

RD RS1A766TF 571 0 0
GG
AAAATAAAAGAGATCGGTCTGGGAGAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGGCAGCAACATTTG
CAGCTCCATCGACAGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCTCCCATCAAGGCCAAAG
CTCTCTCTTCATCATTTATAAAACCAACAATAAGAGCAAAGAACCCTCTGAAAGTCGCCG
GAGCATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAACAGAACTGGCTGAGGAGAGATCTGAACG
TGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATAAACGGGA
AGAGCCTGTCGGGTCTCTTCTTCGAGAGCATAGGAACTGAGCTCGCTCACTTCCCAACTC
CTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAGGTCTCTTCA
TCTGCCTCACCTTCGGACAAATCGGATTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACTTCAAGAAAT
AAATCATCCATCTTATTCCATCTTTACTTATTATCTTACATCTCTCTCTTTGTTCTTCTC
CGTGTAATATTATGAATCAAAACTTT*CT

QA 3 571 3 571
DS 

RD RS1FJ47JQ 577 0 0
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CTTCATCATTTATAAAACCAACAATAAGAGCAAAGAACCCTCTGAAAGTCGCCGGAGCAT
CGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAACAGAACTGGCTGAGGAGAGATCTGAACGTGGTGG
GGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATAAACGGGAAGAGCC
TGTCGGGTCTCTTCTTCGAGAGCATAGGAACTGAGCTCGCTCACTTCCCAACTCCTCCTG
CTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAGGTCTCTTCATCTGCC
TCACCTTCGGACAAATCGGATTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACTTCAAGAAATAAATCA
TCCATCTTATTCCATCTTTACTTATTATCTTACATCTCTCTCTTTGTTCTTCTCCGTGTA
ATATTATGAATCAAAACTTT*CTTTCTTTCGGTTTTC

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DS 

RD RS1FJ47TF 577 0 0
AAAGAGATCGGTCTGGGGGAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGGCAGCAACATTTGCAGCTC
CATCGACAGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCTCCCATCAAGGCCAAAGCTCTCT
CTTCATCATTTATAAAACCAACAATAAGAGCAAAGAACCCTCTGAAAGTCGCCGGAGCAT
CGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAACAGAACTGGCTGAGGAGAGATCTGAACGTGGTGG
GGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATAAACGGGAAGAGCC
TGTCGGGTCTCTTCTTCGAGAGCATAGGAACTGAGCTCGCTCACTTCCCAACTCCTCCTG
CTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAGGTCTCTTCATCTGCC
TCACCTTCGGACAAATCGGATTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACTTCAAGAAATAAATCA
TCCATCTTATTCCATCTTTACTTATTATCTTACATCTCTCTCTTTGTTCTTCTCCGTGTA
ATATTATGAATCAAAACTTT*CTTTCTTTCGGTTTTC

QA 1 577 1 577
DS 

RD RS1BH68JQ 539 0 0
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CCATCAAGGCCAAAGCTCTCCCTTCATCATTTATAAAACCAACAATAAGAGCAAAGAACC
CTCTGAAAGTCGCCGGAGCATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAACAGAACTGGCTGA
GGAGAGATCTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTC
CGGCGATAAACGGGAAGAGCCTGTCGGGTCTCTTCTTCGAGAGCATAGGAACTGAGCTCG
CTCACTTCCCAACTCCTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGC
ACTTAGGTCTCTTCATCTGCCTCACCTTCGGACAAATCGGATTTAAGGGCAGGACCGAAG
ATTACTTCAAGAAATAAATCATCCATCTTATTCCATCTTTACTTATTATCTTACATCTCT
CTCTTTGTTCTTCTGCGTGTAATATTATGAATCAAAACTTT*CTTTCTTTCGGTTTTC
C

QA 1 538 1 538
DS 

RD RS1BH68TF 539 0 0
TGGCAGCAACATTTGCAGCTCCATCGACAGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCTC
CCATCAAGGCCAAAGCTCTCCCTTCATCATTTATAAAACCAACAATAAGAGCAAAGAACC
CTCTGAAAGTCGCCGGAGCATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAACAGAACTGGCTGA
GGAGAGATCTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTC
CGGCGATAAACGGGAAGAGCCTGTCGGGTCTCTTCTTCGAGAGCATAGGAACTGAGCTCG
CTCACTTCCCAACTCCTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGC
ACTTAGGTCTCTTCATCTGCCTCACCTTCGGACAAATCGGATTTAAGGGCAGGACCGAAG
ATTACTTCAAGAAATAAATCATCCATCTTATTCCATCTTTACTTATTATCTTACATCTCT
CTCTTTGTTCTTCTGCGTGTAATATTATGAATCAAAACTTT*CTTTCTTTCGGTTTTC
C

QA 1 538 1 538
DS 

RD RS1AE40TF 563 0 0
GG
GAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGGCAGCAACATTTGCAGCTCCATCGACGGTGATAGGTC
TCGGAGGATCATCTGTTTCTCCCATCAAGGCCAAAGCTCTCTCGTCAT***TTATAAAAC
CAACAATAAGAGCGAAGAACCCTCTGAAAGTCGCCGGAGCATCGGGAGGAAGAGTCACTT
GCTTTGAGCAGAACTGGCTGAGGAGAGATCTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGAT
GGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATAAACGGGAAGAGCCTGTCGGGTCTCTTCTTCG
AGAGCATAGGAACTGAACTCGCTCACTTCCCAACTCCTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTCT
GGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAGGTCTCTTCATCTGCCTCGCCTTCGGACAAATCG
GGTTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACTTCAAGAAATAAATCATCCATCTTGTTCCATCTT
TACTTATTATCTTACATCTCTCTCTTGGTTCT***CCGTGTAATATTATGAATCAAAACT
CAGCTTTCTATGGTTTTCTA
C

QA 3 562 3 562
DS 

RD RS1AJ67TF 608 0 0
GG
AGAAAATAAAATAAAAGAGATCGGTCTGTGAGAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGTCAGCA
ACATTTGCAGCTCCATCGACGGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCTCCCATCAAG
GCCAAAGCTCTCTCGTCATCATTTATAAAACCAACAATAAGAGCGAAGAACCCTCTGAAA
GTCGCCGGAGCATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAGCAGAACTGGCTGAGGAGAGAT
CTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATA
AACGGGAAGAGCCTGTCGGGTCTCTTCTTCGAGAGCATAGGAACTGAACTCGCTCACTTC
CCAACTCCTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAGGT
CTCTTCATCTGCCTCACCTTCGGACAAATCGGGTTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACTTC
AAGAAATAAATCATCCATCTTGTTCCATCTTTACTTATTATCTTACATCTCTCTCTTGGT
TCT***CCGTGTAATATTATGAATCAAAACTCAGCTTTCTATGGTTTTCTATATTTTGAT
GTTTCA

QA 3 608 3 608
DS 

RD RS1DD87JQ 606 0 0
GG
AGAAAATAAAATAAAAGAGATCGGTCTGTGAGAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGGCAGCA
ACATTTGCAGCTCCATCGACGGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCTCCCATCAAG
GCCAAAGCTCTCTCGTCATCATTTATAAAACCAACAATAAGAGCGAAGAACCCTCTGAAA
GTCGCCGGAGCATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAGCAGAACTGGCTGAGGAGAGAT
CTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATA
AACGGGAAGGGCCTGTCGGGTCTCTTCTTCGAGAGCATAGGAACTGAACTCGCTCACTTC
CCAACTCCTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAGGT
CTCTTCATCTGCCTCACCTTCGGACAAATCGGGTTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACTTC
AAGAAATAAATCATCCATCTTGTTCCATCTTTACTTATTATCTTACATCTCTCTCTTGGT
TCT***CCGTGTAATATTATGAATCAAAACTCGGCTTTCTATGGTTTTCTATATTT
GATGTTTC

QA 3 598 3 598
DS 

RD RS1DD87TF 606 0 0
GG
AGAAAATAAAATAAAAGAGATCGGTCTGTGAGAAAGAAGCAAAGAAGAAAAATGGCAGCA
ACATTTGCAGCTCCATCGACGGTGATAGGTCTCGGAGGATCATCTGTTTCTCCCATCAAG
GCCAAAGCTCTCTCGTCATCATTTATAAAACCAACAATAAGAGCGAAGAACCCTCTGAAA
GTCGCCGGAGCATCGGGAGGAAGAGTCACTTGCTTTGAGCAGAACTGGCTGAGGAGAGAT
CTGAACGTGGTGGGGTTTGGTCTGATCGGATGGCTAGCTCCGTCGAGTATTCCGGCGATA
AACGGGAAGGGCCTGTCGGGTCTCTTCTTCGAGAGCATAGGAACTGAACTCGCTCACTTC
CCAACTCCTCCTGCTCTCACTTCGCAGTTCTGGTTGTGGTTGATCACCTGGCACTTAGGT
CTCTTCATCTGCCTCACCTTCGGACAAATCGGGTTTAAGGGCAGGACCGAAGATTACTTC
AAGAAATAAATCATCCATCTTGTTCCATCTTTACTTATTATCTTACATCTCTCTCTTGGT
TCT***CCGTGTAATATTATGAATCAAAACTCGGCTTTCTATGGTTTTCTATATTT
GATGTTTC

QA 3 598 3 598
DS 



AS 1 12

CO CL210Contig1 761 12 5 U
AAAACCTAATAGCCATCGAAAAATACCCAAGAAAAAGAAGCGATGCAGAAATTACATATA
TATCCATAAATCAGACATTTGACAATCCGATAGAAAATGTCTCAGACAGAAATCCAAAGA
GGATAAAAACAGGCAACTGGAAGTGAAATGAGCATAGATTATTATATGAGTGTTTTAGAA
AGGAAATTAAGCATCGGTGAAGCTTGGTGGCTTGTAGGCGATGAAACTGATGCACTGGAC
CTGACGGTTGTTGTCGAATCCAATGATTCTAATGAAGGCGTTAGGGTACTCCTTCTTGCA
CTCTTGCACTTCCTTCAATACTTGAGCAGAGTCAGTGCATCCGAACAAGGGAAGCTTCCA
CATTGTCCAATAACGTCCATCATAGTATCCGGGTGTGCTTCCGTGCTCACGGTAGACAAA
TCCATGCTCCAACTCAAATTCAACACAAGGAATCCACTTGTTGCGGAGAAGGTAGTCAAC
TTCTTTAGCCAATTCGACGTCACTAAGGTCAGGAAGATAAGATAAAGTCTCAAACTTCTT
CTTTCCGATTGGTGGCCACACCTTCATGCAGCTAACTCTTCCCCCGTTGCTTGCAATGGA
AGTAATGTCAGTGTTGGTTTTGCGGGTGACTGGGAATGCAGCGGATGACTTCAAGCCGGT
GAATGGAGCAACCATGGTGGCTTGAGCTGGGGAGGTAACCACAGCGGCGGAGGAGAGCAT
AGAGGAAGCCATTACTACTTTTTCTCTTTTCTCTTACTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 45 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 65 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 45 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 70 
70 0 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 40 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 35 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 
70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 70 55 70 70 70 70 55 70 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 55 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 

AF RS1CG86JQ U 25
AF RS1BD69JQ U 45
AF RS1F728JQ U 64
AF RS1AI16JQ U 53
AF RS1H188JQB U 1
AF RS1AK62JQ U 45
AF RS1AK62TF C 45
AF RS1H188TF C 34
AF RS1BD69TF C 45
AF RS1F728TF C 65
AF RS1BO70TF C 64
AF RS1AI16TF C 53
BS 1 201 RS1H188JQB
BS 202 202 RS1CG86JQ
BS 203 446 RS1H188JQB
BS 447 447 RS1CG86JQ
BS 448 761 RS1H188JQB

RD RS1CG86JQ 498 0 0
AGG
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CGATAGAAAATGTCTCAAACAGAAATCCAAAGAGGATAAAAACAGGCAACTGGAAGTGAA
ATGAGCATAGATTATTATATGAGTGTTTTAGAAAGGAAATTAAGCATCAGTGAAGCTTGG
TGGCTTGTAGGCGATGAAACTGATGCACTGGACCTGACGGTTGTTGTCGAATCCAATGAT
TCTAATGAAGGCGTTAGGGTACTCCTTCTTGCACTCTTGCACTTCCTTCAATACTTGAGC
AGAGTCAGTGCATCCGAACAAGGGAAGCTTCCACATTGTCCAATAACGTCCATCATAGTA
TCCGGGTGTGCTTCCGTGCTCACGGTAGACAAATCCATGCTCCAACTCAAATTCAACACA
AGGAATCCACTTGTTGCGGAGAAGGTAGTCAACTTCTTTAGCCAATTCGACGTCACTAAG
GTCAGGAAGATAAGA

QA 4 498 4 498
DS 

RD RS1BD69JQ 672 0 0
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GACAGAAATCCAAAGAGGATAAAAACAGGCAACTGGAAGTGAAATGAGCATAGATTATTA
TATGAGTGTTTTAGAAAGGAAATTAAGCATCGGTGAAGCTTGGTGGCTTGTAGGCGATGA
AACTGATGCACTGGACCTGACGGTTGTTGTCGAATCCAATGATTCTAATGAAGGCGTTAG
GGTACTCCTTCTTGCACTCTTGCACTTCCTTCAATACTTGAGCAGAGTCAGTGCATCCGA
ACAAGGGAAGCTTCCACATTGTCCAATAACGTCCATCATAGTATCCGGGTGTGCTTCCGT
GCTCACGGTAGACAAATCCATGCTCCAACTCAAATTCAACACAAGGAATCCACTTGTTGC
GGAAAAGGTAGTCAACTTCTTTAGCCAATTCGACGTCACTAAGGTCAGGAAGATAAGATA
AAGTCTCAAACTTCTTCTTTCCGATTGGTGGCCACACCTTCATGCAGCTAACTCTTCCCC
CGTTGCTTGCAATGGAAGTAATGTCAGTGTTGGTTTTGCGGGTGACTGGGAATGCAGCGG
ATGACTTCAAGCCGGTGAATGGAGCAACCATGGTGGCTTGAGCTGGGGAGGTAACCACAG
CGGCGGAAGAGA

QA 1 672 1 672
DS 

RD RS1F728JQ 654 0 0
CCATAAATCAAACATTTGACAATCCGATAAAAAATGTCTCAAACAGAAATCCAAAGAGGA
TAAAAACAGGCAACTGGAAGTGAAATGAGCATAAATTATTATATGAGTGTTTTAAAAAGG
AAATTAACCATCGGTGAAGCTTGGTGGCTTGTAGGCGATGAAACTGATGCACTGGACCTG
ACGGTTGTTGTCAAATCCAATGATTCTAATGAAGGCGTTAGGGTACTCCTTCTTGCACTC
TTGCACTTCCTTCAATACTTGAGCAAAGTCAGTGCATCCAAACAAGGGAAGCTTCCACAT
TGTCCAATAACGTCCATCATAGTATCCGGGTGTGCTTCCGTGCTCACGGTAAACAAATGC
ATGCTCCAACTCAAATTCAACACAAGGAATCCACTTGTTGCGGAAAAGGTAGTCAACTTC
TTTAGCCAATTCGACGTCACTAAGGTCAGGAAAATAAAATAAAGTCTCAAACTTCTTCTT
TCCAATTGGTGGCCACACCTTCATGCAGCTAACTCTTCCCCCGTTGCTTGCAATGGAAGT
AATGTCAGTGTTGGTTTTGCGGGTGACTGGGAATGCAGCGGATGACTTCAAGCCGGTGAA
TGGAGCAACCATGGTGGCTTGAGCTGGGGAGGTAACCACAGCGGCGGAGGAGAG

QA 1 654 1 654
DS 

RD RS1AI16JQ 654 0 0
TACATATATATCCATAAATCAGACATTTGACTATCCGATAGAAAATGTCTCAGACAGAAA
TCCAAAGAGGATAAAAACAGGCAACTGGAAGTGAAATGAGCATAGATTATTATATGAGTG
TTTTAAAAAGGAAATTAAGCATCGGTGAAGCTTGGTGGCTTGTAGGCGATGAAACTGATG
CACTGGACCTGACGGTTGTTGTCGAATCCAATGATTCTAATGAAGGCGTTAGGGTACTCC
TTCTTGCACTCTTGCGCTTCCTTCAATACTTGAGCAGAGTCAGTGCATCCGAACAAGGGA
AGCTTCCACATTGTCCAATAACGTCCATCATAGTATCCGGGTGTGCTTCCGTGCTCACGG
TAGACAAATGCATGCTCCAACTCAAATTCAACACAAGGAATCCACTTGTTGCGGAAAAGG
TAGTCAACTTCTTTAGCCAATTCGACGTCACTAAGGTCAGGAAGATAAGATAAAGTCTCA
AACTTCTTCTTTCCGATTGGTGGCCACACCTTCATGCAGCTAACTCTTCCCCCGTTGCTT
GCAATGGAAGTAATGTCAGTGTTGGTTTTGCGGGTGACTGGGAATGCAGCGGATGACTTC
AAGCCGGTGAATGGAGCAACCATGGTGGCTTGAGCTGGGGAGGTAACCACAGCG

QA 1 654 1 654
DS 

RD RS1H188JQB 761 0 0
AAAACCTAATAGCCATCGAAAAATACCCAAGAAAAAGAAGCGATGCAGAAATTACATATA
TATCCATAAATCAGACATTTGACAATCCGATAGAAAATGTCTCAGACAGAAATCCAAAGA
GGATAAAAACAGGCAACTGGAAGTGAAATGAGCATAGATTATTATATGAGTGTTTTAGAA
AGGAAATTAAGCATCGGTGAAACTTGGTGGCTTGTAGGCGATGAAACTGATGCACTGGAC
CTGACGGTTGTTGTCGAATCCAATGATTCTAATGAAGGCGTTAGGGTACTCCTTCTTGCA
CTCTTGCACTTCCTTCAATACTTGAGCAGAGTCAGTGCATCCGAACAAGGGAAGCTTCCA
CATTGTCCAATAACGTCCATCATAGTATCCGGGTGTGCTTCCGTGCTCACGGTAGACAAA
TCCATGCTCCAACTCAAATTCAACACGAGGAATCCACTTGTTGCGGAGAAGGTAGTCAAC
TTCTTTAGCCAATTCGACGTCACTAAGGTCAGGAAGATAAGATAAAGTCTCAAACTTCTT
CTTTCCGATTGGTGGCCACACCTTCATGCAGCTAACTCTTCCCCCGTTGCTTGCAATGGA
AGTAATGTCAGTGTTGGTTTTGCGGGTGACTGGGAATGCAGCGGATGACTTCAAGCCGGT
GAATGGAGCAACCATGGTGGCTTGAGCTGGGGAGGTAACCACAGCGGCGGAGGAGAGCAT
AGAGGAAGCCATTACTACTTTTTCTCTTTTCTCTTACTTCC

QA 1 761 1 761
DS 

RD RS1AK62JQ 721 0 0
GCAGAAATTACATATATATCCATAAATCAGACATTTGACAATCCGATAGAAAATGTCTCA
GACGGAAATCCAAAGAGGATAAAAACAGGCAACTGGAAGTGAAATGAGCATAGATTATTA
TATGAGTGTTTTAGAAAGGAAATTAAGCATCGGTGAAGCTTGGTGGCTTGTAGGCGATGA
AACTGATGCACTGGACCTGACGGTTGTTGTCGAATCCAATGATTCTAATGAAGGCGTTAG
GGTACTCCTTCTTGCACTCTTGCACTTCCTTCAATACTTGAGCAGA*TCAGTGCATCCGA
ACAAGGGAAGCTTCCACATTGTCCAATAACGTCCATCATAGTATCCGGGTGTGCTTCCGT
GCTCACGGTAGACAAATGCATGCTCCAACTCAAATTCAACACAAGGAATCTACTTGTTGC
GGAGAAGGTAGTCAACTTCTTTAGCCAATTCGACGTCACTAAGGTCAGGAAGATAAGATA
AAGTCTCAAACTTCTTCTTTCCGATTGGTGGCCACACCTTCATGCAGCTAACTCTTCCCC
CGTTGCTTGCAATGGAAGTAATGTCAGTGTTGGTTTTGCGGGTGACTGGGAATGCAGCGG
ATGACTTCAAGCCGGTGAATGGAGCAACCATGGTGGCTTGAGCTGGGGAGGTAACCACAG
CGGCGGAGGAGAGCATAGAGGAAGCCATTACTACTTTTTCTCTTTTCTCTTACTT
ACTTCC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1AK62TF 721 0 0
GCAGAAATTACATATATATCCATAAATCAGACATTTGACAATCCGATAGAAAATGTCTCA
GACGGAAATCCAAAGAGGATAAAAACAGGCAACTGGAAGTGAAATGAGCATAGATTATTA
TATGAGTGTTTTAGAAAGGAAATTAAGCATCGGTGAAGCTTGGTGGCTTGTAGGCGATGA
AACTGATGCACTGGACCTGACGGTTGTTGTCGAATCCAATGATTCTAATGAAGGCGTTAG
GGTACTCCTTCTTGCACTCTTGCACTTCCTTCAATACTTGAGCAGA*TCAGTGCATCCGA
ACAAGGGAAGCTTCCACATTGTCCAATAACGTCCATCATAGTATCCGGGTGTGCTTCCGT
GCTCACGGTAGACAAATGCATGCTCCAACTCAAATTCAACACAAGGAATCTACTTGTTGC
GGAGAAGGTAGTCAACTTCTTTAGCCAATTCGACGTCACTAAGGTCAGGAAGATAAGATA
AAGTCTCAAACTTCTTCTTTCCGATTGGTGGCCACACCTTCATGCAGCTAACTCTTCCCC
CGTTGCTTGCAATGGAAGTAATGTCAGTGTTGGTTTTGCGGGTGACTGGGAATGCAGCGG
ATGACTTCAAGCCGGTGAATGGAGCAACCATGGTGGCTTGAGCTGGGGAGGTAACCACAG
CGGCGGAGGAGAGCATAGAGGAAGCCATTACTACTTTTTCTCTTTTCTCTTACTT
ACTTCC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1H188TF 728 0 0
AAAGAAGCGATGCAGAAATTACATATATATCCATAAATCAGACATTTGACAATCCGATAG
AAAATGTCTCAGACAGAAATCCAAAGAGGATAAAAACAGGCAACTGGAAGTGAAATGAGC
ATAGATTATTATATGAGTGTTTTAGAAAGGAAATTAAGCATCGGTGAAACTTGGTGGCTT
GTAGGCGATGAAACTGATGCACTGGACCTGACGGTTGTTGTCGAATCCAATGATTCTAAT
GAAGGCGTTAGGGTACTCCTTCTTGCACTCTTGCACTTCCTTCAATACTTGAGCAGAGTC
AGTGCATCCGAACAAGGGAAGCTTCCACATTGTCCAATAACGTCCATCATAGTATCCGGG
TGTGCTTCCGTGCTCACGGTAGACAAATCCATGCTCCAACTCAAATTCAACACGAGGAAT
CCACTTGTTGCGGAGAAGGTAGTCAACTTCTTTAGCCAATTCGACGTCACTAAGGTCAGG
AAGATAAGATAAAGTCTCAAACTTCTTCTTTCCGATTGGTGGCCACACCTTCATGCAGCT
AACTCTTCCCCCGTTGCTTGCAATGGAAGTAATGTCAGTGTTGGTTTTGCGGGTGACTGG
GAATGCAGCGGATGACTTCAAGCCGGTGAATGGAGCAACCATGGTGGCTTGAGCTGGGGA
GGTAACCACAGCGGCGGAGGAGAGCATAGAGGAAGCCATTACTACTTTTTCTCTTTTCTC
TTACTTCC

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1BD69TF 717 0 0
GCAGAAATTACATATATATCCATAAATCAGACATTTGACAATCCGATAGAAAATGTCTCA
GACAGAAATCCAAAGAGGATAAAAACAGGCAACTGGAAGTGAAATGAGCATAGATTATTA
TATGAGTGTTTTAGAAAGGAAATTAAGCATCGGTGAAGCTTGGTGGCTTGTAGGCGATGA
AACTGATGCACTGGACCTGACGGTTGTTGTCGAATCCAATGATTCTAATGAAGGCGTTAG
GGTACTCCTTCTTGCACTCTTGCACTTCCTTCAATACTTGAGCAGAGTCAGTGCATCCGA
ACAAGGGAAGCTTCCACATTGTCCAATAACGTCCATCATAGTATCCGGGTGTGCTTCCGT
GCTCACGGTAGACAAATCCATGCTCCAACTCAAATTCAACACAAGGAATCCACTTGTTGC
GGAGAAGGTAGTCAACTTCTTTAGCCAATTCGACGTCACTAAGGTCAGGAAGATAAGATA
AAGTCTCAAACTTCTTCTTTCCGATTGGTGGCCACACCTTCATGCAGCTAACTCTTCCCC
CGTTGCTTGCAATGGAAGTAATGTCAGTGTTGGTTTTGCGGGTGACTGGGAATGCAGCGG
ATGACTTCAAGCCGGTGAATGGAGCAACCATGGTGGCTTGAGCTGGGGAGGTAACCACAG
CGGCGGAGGAGAGCATAGAGGAAGACATTACTACTTTTTCTCTTTTCTCTTACTTCC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1F728TF 701 0 0
CATAAATCAGACATTTGACAATCCGATAGAAAATGTCTCAGACAGAAATCCAAAGAGGAT
AAAAACAGGCAACTGGAAGTGAAATGAGCATAGATTATTATATGAGTGTTTTAGAAAGGA
AATTAAGCATCGGTGAAGCTTGGTGGCTTGTAGGCGATGAAACTGATGCACTGGACCTGA
CGGTTGTTGTCGAATCCAATGATTCTAATGAAGGCGTTAGGGTACTCCTTCTTGCACTCT
TGCACTTCCTTCAATACTTGAGCAGAGTCAGTGCATCCGAACAAGGGAAGCTTCCACATT
GTCCAATAACGTCCATCATAGTATCCGGGTGTGCTTCCGTGCTCACGGTAGACAAATGCA
TGCTCCAACTCAAATTCAACACAAGGAATCCACTTGTTGCGGAGAAGGTAGTCAACTTCT
TTAGCCAATTCGACGTCACTAAGGTCAGGAAGATAAGATAAAGTCTCAAACTTCTTCTTT
CCGATTGGTGGCCACACCTTCATGCAGCTAACTCTTCCCCCGTTGCTTGCAATGGAAGTA
ATGTCAGTGTTGGTTTTGCGGGTGACTGGGAATGCAGCGGATGACTTCAAGCCGGTGAAT
GGAGCAACCATGGTGGCTTGAGCTGGGGAGGTAACCACAGCGGCGGAGGAGAGCATAGAG
GAAGTCATTACTACTTTTTCTCTTTTCTCTTACTT
ACTTCC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1BO70TF 698 0 0
CCATAAATCAGACATTTGACAATCCGATAGAAAATGTCTCAGACAGAAATCCAAAGAGGA
TAAAAACAGGCAACTGGAAGTGAAATGAGCATAGATTATTATATGAGTGTTTTAGAAAGG
AAATTAAGCATCGGTGAAGCTTGGTGGCTTGTAGGCGATGAAACTGATGCACTGGACCTG
ACGGTTGTTGTCGAATCCAATGATTCTAATGAAGGCGTTAGGGTACTCCTTCTTGCACTC
TTGCACTTCCTTCAATACTTGAGCAGAGTCAGTGCATCCGAACAAGGGAAGCTTCCACAT
TGTCCAATAACGTCCATCATAGTATCCGGGTGTGCTTCCGTGCTCACGGTAGACAAATCC
ATGCTCCAACTCAAATTCAACACAAGGAATCCACTTGTTGCGGAGAAGGTAGTCAACTTC
TTTAGCCAATTCGACGTCACTAAGGTCAGGAAGATAAGATAAAGTCTCAAACTTCTTCTT
TCCGATTGGTGGCCACACCTTCATGCAGCTAACTCTTCCCCCGTTGCTTGCAATGGAAGT
AATGTCAGTGTTGGTTTTGCGGGTGACTGGGAATGCAGCGGATGACTTCAAGCCGGTGAA
TGGAGCAACCATGGTGGCTTGAGCTGGGGAGGTAACCACAGCGGCGGAGGAGAGCATAGA
GGAAGCCATTACTACTTTTTCTCTTTTCTCTTACTTCC

QA 1 698 1 698
DS 

RD RS1AI16TF 709 0 0
TACATATATATCCATAAATCAGACATTTGACTATCCGATAGAAAATGTCTCAGACAGAAA
TCCAAAGAGGATAAAAACAGGCAACTGGAAGTGAAATGAGCATAGATTATTATATGAGTG
TTTTAGAAAGGAAATTAAGCATCGGTGAAGCTTGGTGGCTTGTAGGCGATGAAACTGATG
CACTGGACCTGACGGTTGTTGTCGAATCCAATGATTCTAATGAAGGCGTTAGGGTACTCC
TTCTTGCACTCTTGCGCTTCCTTCAATACTTGAGCAGAGTCAGTGCATCCGAACAAGGGA
AGCTTCCACATTGTCCAATAACGTCCATCATAGTATCCGGGTGTGCTTCCGTGCTCACGG
TAGACAAATGCATGCTCCAACTCAAATTCAACACAAGGAATCCACTTGTTGCGGAGAAGG
TAGTCAACTTCTTTAGCCAATTCGACGTCACTAAGGTCAGGAAGATAAGATAAAGTCTCA
AACTTCTTCTTTCCGATTGGTGGCCACACCTTCATGCAGCTAACTCTTCCCCCGTTGCTT
GCAATGGAAGTAATGTCAGTGTTGGTTTTGCGGGTGACTGGGAATGCAGCGGATGACTTC
AAGCCGGTGAATGGAGCAACCATGGTGGCTTGAGCTGGGGAGGTAACCACAGCGGCGGAG
GAGAGCATAGAGGAAGCCATTACTACTTTTTCTCTTTTCTCTTACTTCC

QA 1 709 1 709
DS 



AS 2 10

CO CL211Contig1 1090 8 17 U
GGTTTGGTTTGGAAATGTAATTAGCTTTTAAGAAAATTTCTGAGTCTCATGAGAGTGGTG
GAATCCTAAAAAGATGGGACAGAGCCACAAGATTTTGGAATGATCCTTAAAACATTTCAT
TGGTAAAGAAAGACAAGACTGATATGTCTCACGCACGCACATTTCGCTCTTCATTTACTC
TTCCATGGCTTCACCACCCACTTCTGTAATTTCAACTCGCTCCATCAATGGGGTGATTTT
GGTGCGAAGAATCTCGGTTTTCTTGGTGAACGAATAGCCTTTGCTGCTGACATAGGTTCT
TGGGTTTGGTTCCATGTAGTTCCTCAGATATTCCTTGTTCCCCTTAGTGATAACGCAGAT
GTCCACGTTGCTACCACTACCCAGGTCGTTGAATATACCCGAGCAAATGGCCTCAGCGAC
CAGCTTAATTCCTTCATCCCTAGTTAGACCTTCTTTGTACTTTGCCTCAAACACAGACAT
AGCAGCAAGAGACCCAGAACCCATTGTGGCGAATGGTAGAGTGTCCGTGGAACCATGTGG
GTATATAGTGTGAAGATGAGGCCCAGTGATGTCAACTCCACCAAGGACGAGAGCAGCTGA
GACATGACCTTGATAGCTGAAAAGGTGTTTCTTGAGAAGGGTCAAGGCAGTAATAACTCG
AGAGTCTCGGCCAGTCTGGTAACGATGCAACCGCAACTGTGAGCTGACCATATCAGTGAC
AGCTTCAGTGTCAGCAGCAGTACCAGCACCACAGCAATAAATGTTAGGAGCCATGTAGTG
AATTTTCTCACAGTTCTTATCAGCAACAATAGGCCCTTCAGTTGCTCGCGTATCCGCACC
CAGTATCACACCGTCCTTGAAGATCAAACCGACGATGGTGGTTCCGGTCTTCAAAAAGGA
GGGAGCTTTAAGACCCTTTTGTATAAGCATATCGTTTCGCTTGCACAGATCGAAGCTGAA
CCCACCCTTTCGCGGAACTTCCGACATTTTTTTTTTCTGGACACGACGAACTCTGCTCGA
ATCGGAAACGAAAGTAGAAGACGACGGGAAAGAGAGACCTAGAGCTTCTTCTTTTTTTTG
CTTCGTTCCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 
35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GV57JQ U 42
AF RS1DB40JQ U 1
AF RS1G880TF C 14
AF RS1AQ53JQ U 3
AF RS1EJ32JQ U 11
AF RS1DB40TF C 301
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BS 1 496 RS1DB40JQ
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BS 498 641 RS1DB40JQ
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BS 876 952 RS1EJ32TF
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BS 997 1078 RS1EJ32TF
BS 1079 1090 RS1AQ53TFB

RD RS1GV57JQ 369 0 0
GAGTCTCATGAGAGTGGTGGAATCCTAAAAAGATGGGACAGAGCCACAAGATTTTGGAAT
GATCCTTAAAACATTTCATTGGTAAAGAAAGACAAGACTGATATGTCTCACGCACGCACA
TTTCGCTCTTCATTTACTCTTCCATGGCTTCACCACCCACTTCTGTAATTTCAACTCGCT
CCATCAATGGGGTGATTTTGGTGCGAAGAATCTCGGTTTTCTTGGTGAACGAATAGCCTT
TGCTGCTGACATAGGTTCTTGGGTTTGGTTCCATGTAGTTCCTCAGATATTCCTTGTTCC
CCTTAGTGATAACGCAAATGTCCACGTTGCTACCACTACCCAGGTCGTTGAATATACCCG
AGCAAATGG

QA 1 369 1 369
DS 

RD RS1DB40JQ 648 0 0
GGTTTGGTTTGGAAATGTAATTAGCTTTTAAGAAAATTTCTGAGTCTCATGAGAGTGGTG
GAATCCTAAAAAGATGGGACAGAGCCACAAGATTTTGGAATGATCCTTAAAACATTTCAT
TGGTAAAGAAAGACAAGACTGATATGTCTCACGCACGCACATTTCGCTCTTCATTTACTC
TTCCATGGCTTCACCACCCACTTCTGTAATTTCAACTCGCTCCATCAATGGGGTGATTTT
GGTGCGAAGAATCTCGGTTTTCTTGGTGAACGAATAGCCTTTGCTGCTGACATAGGTTCT
TGGGTTTGGTTCCATGTAGTTCCTCAGATATTCCTTGTTCCCCTTAGTGATAACGCAGAT
GTCCACGTTGCTACCACTACCCAGGTCGTTGAATATACCCGAGCAAATGGCCTCAGCGAC
CAGCTTAATTCCTTCATCCCTAGTTAGACCTTCTTTGTACTTTGCCTCAAACACAGACAT
AGCAGCAAGAGACCCAAAACCCATTGTGGCGAATGGTAGAGTGTCCGTGGAACCATGTGG
GTATATAGTGTGAAGATGAGGCCCAGTGATGTCAACTCCACCAAGGACGAGAGCAGCTGA
GACATGACCTTGATAGCTGAAAAGGTGTTTCTTGAGAAGGG
GTCAAGG

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1G880TF 604 0 0
AATGTAATTAGCTTTTAAGAAAATTTCTGAGTCTCATGAGAGTGGCGGAGTCCTAAAAAG
ATGGGACAGAGCCACAAGATTTTGGAATGATCCTTAAAACATTTCATTGGTAAAGAAAGA
CAAGACTGATATGTCTCACGCACGCACATTTCGCTCTTCATTTACTCTTCCATGGCTTCA
CCACCCACTTCTGTAATTTCAACTCGCTCCATCAATGGGGTGATTTTGGTGCGAAGAATC
TCGGTTTTCTTGGTGAACGAATAGCCTTTGCTGCTGACATAGGTTCTTGGGTTTGGTTCC
ATGTAGTTCCTCAGATATTCCTTGTTCCCCTTAGTGATAACGCAGATGTCCACGTTGCTA
CCACTACCCAGGTCGTTGAATATACCCGAGCAAATGGCCTCAGCGACCAGCTTAATTCCT
TCATCCCTAGTTAGACCTTCTTTGTACTTTGCCTCAAACACAGACATAGCAGCAAGAGAC
CCAGAACCCATTGTGGCGAATAGTAGAGTGTCCGTGGAACCATGTGGGTATATAGTGTGA
AGATGAGGCCCAGTGATGTCAACTCCACCAAGGACGAGAGCAGCTGAGACATGACCTTGA
TAGC

QA 1 604 1 604
DS 

RD RS1AQ53JQ 866 0 0
TTTGGTTTGGAAATGTAATTAGCTTTTAAGAAAATTTCTGAGTCTCATGAGAGTGGTGGA
ATCCTAAAAAGATGGGACAGAGCCACAAGATTTTGGAATGATCCTTAAAACATTTCATTG
GTAAAGAAAGACAAGACTGATATGTCTCACGCACGCACATTTCGCTCTTCATTTACTCTT
CCATGGCTTCACCACCCACTTCTGTAATTTCAACTCGCTCCATCAATGGGGTGATTTTGG
TGCGAAGAATCTCGGTTTTCTTGGTGAACGAATAGCCTTTGCTGCTGACATAGGTTCTTG
GGTTTGGTTCCATGTAGTTCCTCAAATATTCCTTGTTCCCCTTAGTGATAACGCAGATGT
CCACGTTGCTACCACTACCCAGGTCGTTGAATATACCCGAGCAAATGGCCTCAGCGACCA
GCTTAATTCCTTCATCCCTAGTTAGACCTTCTTTGTACTTTGCCTCAAACACAGACATAG
CAGCAAGAGACCCAGAACCCATTGTGGCGAATGGTAGAGTGTCCGTGGAACCATGTGGGT
ATATAGTGTGAAGATGAGGCCCAGTGATGTCAACTCCACCAAGGACGAGAGCAGCTGAGA
CATGACCTTGATAGCTGAAAAGGTGTTTCTTGAGAAGGGTCAAGGCAGTAATAACTCGAG
AGTCTCGGCCAGTCTGGTAACGATGCAACCGCAACTGTGAGCTGACCATATCAGTGACAG
CTTCAGTGTCAGCAGCAGTACCAGCACCACAGCAATAAATGTTAG*AGCCATGTAGTGAA
TTTTCTCACAGTTCTTATCAGCAACAATAG*CCCTTCAGTTGCTCGCGTATCCGCACCCA
GTATCACAC
GTCCTTGAGATCAAACG

QA 1 849 1 849
DS 

RD RS1EJ32JQ 865 0 0
GGA
AATGTAATTAGCTTTTAAGAAAATTTCTGAGTCTCATGAGAGTGGTGGAATCCTAAAAAG
ATGGGACAGAGCCACAAGATTTTGGAATGATCCTTAAAACATTTCATTGGTAAAGAAAGA
CAAGACTGATATGTCTCACGCACGCACATTTCGCTCTTCATTTACTCTTCCATGGCTTCA
CCACCCACTTCTGTAATTTCAGCTCGCTCCATCAATGGGGTGATTTTGGTGCGAAGAATC
TCGGTATTCTTGGTGAACGAATAGCCTTTGCTGCTGACATAGGTTCTTGGGTTTGGTTCC
ATGTAGTTCCTCAGATATTCCTTGTTCCCCTTAGTGATAACGCAGATGTCCACGTTGCTA
CCACTACCCAGGTCGTTGAATATACCCGAGCAAATGGCCTCAGCGACCAGCTTAATTCCT
TCATCCCTAGTTAGACCTTCTTTGTACTTTGCCTCAAACACAGACATAGCAGCAAGAGAC
CCAGAACCCATTGTGGCGAATGGTAGAGTGTCCGTGGAACCATGTGGGTATATAGTGTGA
AGATGAGGCCCAGTGATGTCAACTCCACCAAGGACGAGAGCAGCTGAGACATGACCTTGA
TAGCTGAAAAGGTGTTTCTCGAGAAGGGTCAAGGCAGTAATAACTCGAGAGTCTCGGCCA
GTCTGGTAACGATGCAACCGCAACTGTGAGCTGACCATATCAGTGACAGCTCCAGTGTCA
GCAGCAGTACCAGCACCACAGCAATAAATGTTAGGAGCCATGTAGTGAATTTTCTCACAG
TTCTTATCAGCAACATAGG*CCCTTCAGTTGCTCGCGTATCCGCACC*AGTATCACACCG
TCCTTGAAGATCAAACCGACGA

QA 4 865 4 865
DS 

RD RS1DB40TF 582 0 0
TGGGTTTGGTTCCATGTAGTTCCTCAGATATTCCTTGTTCCCCTTAGTGATAACGCAGAT
GTCCACGTTGCTACCACTACCCAGGTCGTTGAATATACCCGAGCAAATGGCCTCAGCGAC
CAGCTTAATTCCTTCATCCCTAGTTAGACCTTCTTTGTACTTTGCCTCAAACACAGACAT
AGCAGCAAGAGACCCAAAACCCATTGTGGCGAATGGTAGAGTGTCCGTGGAACCATGTGG
GTATATAGTGTGAAGATGAGGCCCAGTGATGTCAACTCCACCAAGGACGAGAGCAGCTGA
GACATGACCTTGATAGCTGAAAAGGTGTTTCTTGAGAAGGGTCAAGGCAGTAATAACTCG
AGAGTCTCGGCCAGTCTGGTAACGATGCAACCGCAACTGTGAGCTGACCATATCAGTGAC
AGCTTCAGTGTCAGCAGCAGTACCAGCACCACAGCAATAAATGTTAGGAGCCATGTAGTG
AATTTTCTCACAGTTCTTATCAGCAACAATAGGCCCTTCAGTTGCTCGCGTATCCGCACC
CAGTATCACACCGTCCTTGAAGATCAAACCGACGATGGTGG
C

QA 1 581 1 581
DS 

RD RS1EJ32TF 806 0 0
GCTGCTGACATAGGT*CTTGGGTT*GGTTCCATGTAGT*CCTCAGATAT*CCTTGTTCCC
*TTAGTGATAACGCAGATGTCCACGT*GCTACCACTACCCAGGTCGT*GAATATACCCGA
GCAAATGGCCTCAGCGACCAGCTTAAT*CCTTCATCCCTAGTTAGACTTTCTTTGTACTT
TGCCTCAAACACAGACATAGCAGCAAGAGACCCAGAACCCATTGTGGCGAATGGTAGAGT
GTCCGTGGAACCATGTGGGTATATAGTGTGAAGATGAGGCCCAGTGATGTCAACTCCACC
AAGGACGAGAGCAGCTGAGACATGACCTTGATAGCTGAAAAGGTGTTTCTCGAGAAGGGT
CAAGGCAGTAATAACTCGAGAGTCTCGGCCAGTCTGGTAACGATGCAACCGCAACTGTGA
GCTGACCATATCAGTGACAGCTCCAGTGTCAGCAGCAGTACCAGCACCACAGCAATAAAT
GTTAGGAGCCATGTAGTGAATTTTCTCACAGTTCTTATCAGCAACAATAGGCCCTTCAGT
TGCTCGCGTATCCGCACCCAGTATCACACCGTCCTTGAAGATCAAACCGACGATGGTGGT
TCCGGTCTTCAAAAAGGAGGGAGCTTTAAGACCCTTTTGTATAAGCATATCGTTTCGCTT
GCACAGATCGGAGCTGAACCCACCCTTTCGCGGAGCTTCCGACATTTTTTTTT*CTGGAC
ACGACGAACTCTGCTCGAATCGGAAACGAAAGTAGAAGACGACGGGAAAGAGAGACCTAG
AGCTTCTTCTTTTTTT
GCTTCGTTCC

QA 1 796 1 796
DS 

RD RS1AQ53TFB 754 0 0
TTCCCCT
TTAGTGATAACGCAGATGTCCACGTTGCTACCACTACCCAGGTCGTTGAATATACCCGAG
CAAATGGCCTCAGCGACCAGCTTAATTCCTTCATCCCTAGTTAGACCTTCTTTGTACTTT
GCCTCAAACACAGACATAGCAGCAAGAGACCCAGAACCCATTGTGGCGAATGGTAGAGTG
TCCGTGGAACCATGTGGGTATATAGTGTGAAGATGAGGCCCAGTGATGTCAACTCCACCA
AGGACGAGAGCAGCTGAGACATGACCTTGATAGCTGAAAAGGTGTTTCTTGAGAAGGGTC
AAGGCAGTAATAACTCGAGAGTCTCGGCCAGTCTGGTAACGATGCAACCGCAACTGTGAG
CTGACCATATCAGTGACAGCTTCAGTGTCAGCAGCAGTACCAGCACCACAGCAATAAATG
TTAGGAGCCATGTAGTGAATTTTCTCACAGTTCTTATCAGCAACAATAGGCCCTTCAGTT
GCTCGCGTATCCGCACCCAGTATCACACCGTCCTTGAAGATCAAACCGACGATGGTGGTT
CCGGTCTTCAAAAAGGAGGGAGCTTTAAGACCCTTTTGTATAAGCATATCGTTTCGCTTG
CACAGATCGAAGCTGAACCCACCCTTTCGCGGAACTTCCGACATTTTTTTTTTCTGGACA
CGACGAACTCTGCTCGAATCGGAAACGAGAGTAGAAGACGACGGGAAAGAGAGACCTAGA
GCTTCTTCTTTTTTTTGCTTCGTTCCC

QA 8 754 8 754
DS 



CO CL211Contig2 642 2 2 U
AGGGATTGAACGAAGCAAAAAAAAAAAAAGCTCTAGCTCTCTCTTTCCCGTCGTCTTCTA
CTTTCGTTTCCGATTCGAGCAGAGTTCGTCGTGTCCAGAAAAAAAAAATGTCGGAAGTTC
CGCCAAAGGGTGGGTTCAGCTTCGATCTGTGCAAGCGAAACGATATGCTTATACAAAAGG
GTCTTAAAGCTCCCTCCTTTTTGAAGACCGGAACCACCATCGTCGGTTTGATCTTCAAGG
ACGGTGTGATACTAGGTGCGGATACCCGAGCAACTGAAGGGCCTATTGTTGCTGATAAGA
ATTGTGAGAAAATTCACTACATGGCTCCTAACATTTATTGCTGTGGTGCTGGAACCGCTG
CTGACACTGAAGCTGTCACTGATATGGTCAGCTCACAGCTGCGGTTGCATCGTTACCAGA
CTGGCCGAGACTCTCGGGTTATCACTGCTTTGACCCTTCTCAAAAAAACACCTCTTCAGC
TATCAAGGTCATGTCTCAGCTGCTCTTGTCCTTGGTGGAGTTGACATCACTGGTCCTCAT
CTTCATACTATATACCCACACGGTTCAACGGACACTCTACCATTCGCTACAATGGGTTCT
GGGTCTCTTGCTGCTATGTCTGTGTTTGAGCAAAGTACAAAG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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G
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DS 



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BQ
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GATCGTATGGTGTCAAGAACAGTCTTACAGGTATCGATTCACCTCTAACGGGAGCGCCAT
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AATATATCTTCCCAAGGATAACATCTTTCAGGTGGTACTTGCTTTTGTTGTACTCAAACT
CGATATGCAGGCAGTCCTCGATTCCAACTTCCATCTTGATGCTGTTGTTGATTGGAGGTA
GTGGAGAATAGTTGCGGACCACAAAGTCCTGATACTCCACGAT
ACT

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1DB83JQ 681 0 0
AG
TAAAAGTCGTATGACTCAACACGAAGCAAACAACATTATGGTCGTTGAACAAACTACATG
ATTTAACTTTTCATCACTCCAAGTCCTCAAACCAATTGCATACAGAAAAAAAACTTTACA
AAGTTCTGAAAATTTATCATTTCTCTCTTCCAGTTTTGTTAACATCAAGATGTCTCCTCC
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GTCAGATCGTATGGTGTCAAGAATAGTCTCACAGGTATCGATTCACCTCTAACGGGAGCG
CCATCCATTAACTCAAACTTGGCTAGTGTTTCTGTCTCGACGTGAGTATTAGCTCCTGCT
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AACTCGATATGCAGGCAGTCCTCGATTCCAACTTCCATCTTGATGCTGTTGTTGATTGGA
GGTAGTGGAGAATAGTTACGGACCACAAAGTCCTGATACTCCACGATGCTTCCCCCATAG
CCACGTGTAACTGTAACTT

QA 3 681 3 681
DS 

RD RS1E549JQ 805 0 0
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AGTCGTATGACTCAACACGAAGAAAACAACATTATGGTCGTTGAACAAACTACATGATTT
AACTTT*CATCACTCCAAGTCCTCAAACCAATTGCATACAGAAACAAAACTTTACAAAGT
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GCCTGTACAGCGTGATTTCTTGCTGCTTGAAGTAACGGCGATCCTCCTCGTCCACCAGAA
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GATCGTATGGTGTCAAGAACAGTCTTACAGGTATCGATTCACCTCTAACGGGAGCGCCAT
CCATTAACTCAAATTTGGCTAGTGTTTCTGTCTCGACGTGAGTATTAGCTCCTGCTCCTG
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AATATATCTTCCCAAGGATAACATCTTTCAGGTGGTACTTGCTTTTGTTGTACTCAAACT
CGATATGCAGGCAGTCCTCGATTCCAACTTCCATCTTGATGCTGTTGTTGATTGGAGGTA
GTGGAGAATAGTTGCGGACCACAAAGTCCTGATACTCCACGATACTTCCCCCATAACCAC
GTGTAACTGTTACTTTGAGGACATACCTTAGTCGCACATTGACGCCATTGTAGGTCTCAT
GTGGCATCTCAACAGTGGAAA
CTCA

QA 1 801 1 801
DS 

RD RS1A338JQ 872 0 0
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GGTCGTTGAACAAACTACATGATTTAACTTTTCATCACTCCAAGTCCTCAAACCAATTGC
ATACAGAAAAAAAACTTTACAAAGTTCTGAAAATTTATCATTTCTCTCTTCCAGTTTTGT
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CGGCGATCCTCCTCGTCCACCAGAACAAGATTCAGATAATACTTAACGCTGAATTTGTTG
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ACATTGACGCCATTGTAGGTCTCATGTGGCATCTCAACAGTCGAAAACTCAAAAGGGTAT
GCCTTCTTTTCATATATCTCTCCCGGTACATCAAGCTCACGCACCAAGGAAGTGAAGTCG
TAGAAGTTTCCTCTGTCAAAGTACATTTCTAT

QA 1 872 1 872
DS 

RD RS1A338TR 875 0 0
GTGTTCCAAAAACAAAGAGAATAAAAGTCGTATGACTCAACACGAAGCAAACAACATTAT
GGTCGTTGAACAAACTACATGATTTAACTTTTCATCACTCCAAGTCCTCAAACCAATTGC
ATACAGAAAAAAAACTTTACAAAGTTCTGAAAATTTATCATTTCTCTCTTCCAGTTTTGT
TAACATCAAGATGTCTCCTCCTTGAGCCTGTATAGCGTGATTTCTTGCTGCTTGAAGTAA
CGGCGATCCTCCTCGTCCACCAGAACAAGATTCAGATAATACTTAACGCTGAATTTGTTG
TTTATGTTCGTAAGTGTTGGTGTCAGATCGTATGGTGTCAAGAATAGTCTCACAGGTATC
GATTCACCTCTAACGGGAGCGCCATCCATTAACTCAAACTTGGCTAGTGTTTCTGTCTCG
ACGTGAGTATTAGCTCCTGCTCCTGTTGATTCTCGCCTTCTGATCTCAAGATCCATATTC
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TTGATGCTGTTGTTGATTGGAGGTAGTGGAGAATAGTTACGGACCACAAAGTCCTGATAC
TCCACGATGCTTCCCCCATAGCCACGTGTAACTGTAACTTTGAGGACATACCTTAGTCGC
ACATTGACGCCATTGTAGGTCTCATGTGGCATCTCAACAGTCGAAAACTCAAAAGGGTAT
GCCTTCTTTTCATATATCTCTCCCGGTACATCAAGCTCACGCACCAAGGAAGTGAAGTCG
TAGAAGTTTCCTCTGTCAAAGTACATTTCTATTTG

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DS 

RD RS1E549TF 508 0 0
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GGTATGCCTTCTTTTCATATATCTCTCCCGGTACATCAAGCTCACGCACCAAGGAAGTGA
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CACCATTGTGCTCCACCTTTTTCCCTTGATATGGCTCAATAATAACCTTGCCAGCAATAG
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GATCGGAGACGGAAAGAGGAATCGGATCAAATCAAATCGAAAGACGAAAGTTTCTTACAG
TTGTTGGGTTGAAGA
AGACGATCGACCC

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DS 

RD RS1DB83TF 760 0 0
AGATCCATATTCTTTATCTTGATTCTCACCAGAAGAAAGTATATTTTCCCAAGGATAACA
TCTTTCAGGTGGTACTTACTTTTGTTGTACTCAAACTCGATATGCAGGCAGTCCTCGATT
CCAACTTCCATCTTGATGCTGTTGTTGATTGGAGGTAGTGGAGAATAGTTACGGACCACA
AAGTCCTGATACTCCACGATGCTTCCCCCATAGCCACGTGTAACTGTAACTTTGAGGACA
TACCTTAGTCGCACATTGACGCCATTGTAGGTCTCATGTGGCATCTCAACAGTCGAAAAC
TCAA**GGGTATGCCTTCTTTTCATATATCTCTCCCGGTACATCAAGCTCACGCACCAAG
GAAGTGAAGTCGTAGAAGTTTCCTCTGTCAAAGTACATTTCTATTTGACCAAGGAGCTCA
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GCAATAGTTTCTTGACTCTGGAAAAGCGGGTTCATAACCGTCTGTCCATTATCTTTCTTA
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TCAATTCGATCGGAGACGGAAAGAGGAATCGGATCAAA*****TCGAAGGACGAAAGTTT
CTTACAGTTGTTGGGTTGAAGA
CGATCGACAGACTCCCCC

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DS 

RD RS1A338TF 821 0 0
TGATCTCAAGATCCATATTCTTTATCTTGATTCTCACCAGAAGAAAGTATATTTTCCCAA
GGATAACATCTTTCAGGTGGTACTTGCTTTTGTTGTACTCAAACTCGATATGCAGGCAGT
CCTCGATTCCAACTTCCATCTTGATGCTGTTGTTGATTGGAGGTAGTGGAGAATAGTTAC
GGACCACAAAGTCCTGATACTCCACGATGCTTCCCCCATAGCCACGTGTAACTGTAACTT
TGAGGACATACCTTAGTCGCACATTGACGCCATTGTAGGTCTCATGTGGCATCTCAACAG
TCGAAAACTCAAAAGGGTATGCCTTCTTTTCATATATCTCTCCCGGTACATCAAGCTCAC
GCACCAAGGAAGTGAAGTCGTAGAAGTTTCCTCTGTCAAAGTACATTTCTATTTGACCAA
GGAGCTCAACTTTAACACCATTGTGCTCCACCTTTTTCCCTTGATATGGCTCAATAATAA
CCTTGCCAGCAATAGTTTCTTGACTCTGGAAAAGCGGGTTCATAACCGTCTGTCCATTAT
CTTTCTTAATGGGAACCTGTTTACGATTCTTCCCATCAGTAAAGGTGATTGAAACATTAC
ACGCCGGCTTGAAAGCTCCAAGAAGATAGTTCATGAT*GAGAAGATTCGATCTTAATCAC
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GAAAATTTCTTACAGTTGTTGGGTTGAAGACGATCGACAGACTCCCATTTCCCCCGGCCG
TAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 821 1 821
DS 

RD RS1A338TV 733 0 0
TTTGTTGTACTCAAACTCGATATGCAGGCAGTCCTCGATTCCAACTTCCATCTTGATGCT
GTTGTTGATTGGAGGTAGTGGAGAATAGTTACGGACCACAAAGTCCTGATACTCCACGAT
GCTTCCCCCATAGCCACGTGTAACTGTAACTTTGAGGACATACCTTAGTCGCACATTGAC
GCCATTGTAGGTCTCATGTGGCATCTCAACAGTCGAAAACTCAAAAGGGTATGCCTTCTT
TTCATATATCTCTCCCGGTACATCAAGCTCACGCACCAAGGAAGTGAAGTCGTAGAAGTT
TCCTCTGTCAAAGTACATTTCTATTTGACCAAGGAGCTCAACTTTAACACCATTGTGCTC
CACCTTTTTCCCTTGATATGGCTCAATAATAACCTTGCCAGCAATAGTTTCTTGACTCTG
GAAAAGCGGGTTCATAACCGTCTGTCCATTATCTTTCTTAATGGGAACCTGTTTACGATT
CTTCCCATCAGTAAAGGTGATTGAAACATTACACGCCGGCTTGAAAGCTCCAAGAAGATA
GTTCATGAT*GAGAAGATTCGATCTTAATCACAGCAACCTTCAATTCGATCGGAGACGGA
AAGAGGAATCGGATCAAA*****TCGAAGGACGAAAATTTCTTACAGTTGTTGGGTTGAA
GACGATCGACAGACTCCCATTTCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCC
GGTACCGTCGACT

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 8

CO CL213Contig1 888 8 19 U
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GAAAATGGCAGAATCTAAGATGGTGGTTCCAGAGTCTGTCTTGAAAAAGATCAAGAGGGA
AGAGGAATGGGCATTGGCCAAGAAGCAAGAAGCTGAAGCTGCTAAGAAGAAGAGCGTTGA
GACCCGCAAGCTTATCTTCAAGAGAGCTGAGCAATACGCTAAAGAATACGCTGAGAAGGA
CAATGAGTTGATCAGGTTGAAGCGTGAGGCTAAGTTGAAAGGAGGGTTCTACGTTGATCC
AGAGGCTAAACTTCTCTTTATCATTCGTATCCGTGGAATCAACGCTATTGATCCAAAAAC
CAAGAAGATTCTGCAGCTCCTGCGTTTGAGACAAATCTTCAATGGTGTGTTCCTTAAGGT
GAACAAGGCAACAATCAACATGCTGCGTCGCGTTGAGCCTTACGTGACTTACGGGTACCC
AAACCTGAAGAGCGTTAAGGAACTGATCTACAAGAGAGGATTTGGAAAGCTGAACCACCA
GAGGATAGCGCTCACGGACAACTCTATAGTGAGCCAAGGTCTAGGAAAGCACAACATCAT
CTGCGTGGAGGATCTGATCCACGAGATCATGACCGTTGGACCTCACTTCAAAGAAGCCAA
CAACTTCCTTTGGCCCTTCCAGCTGAAGGCGCCGCTCGGTGGACTTAAGAAGAAGAGGAA
CCACTACGTTGAAGGTGGTGATGCTGGGAACAGAGAGAACTTCATCAACGAGCTTGTCAG
GAGAATGAACTGACTGATCAAAAGCTT*TCCTTATTTTGTCTTTGTTCTTATATCAGTGA
CCGTGTTATGATGATTATGTTACTTGTTTACGATCATCTTATTTGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 20 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 35 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D808TF U 1
AF RS1BU02TF U 3
AF RS1H365TF U 1
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AF RS1GT18TF U 11
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RD RS1D808TF 583 0 0
GGCTCTGCGCCGCGCTCACTCTCTCTCTCTCTCTCAGATAATAGCTTCCGCTCAAAGGAA
GAAA*TGGCAGAATCTAAGATGGTGGTTCCAGAGTCTGTCTTGAAAAAGATCAAGAGGGA
AGAGGAATGGGCATTGGCCAAGAAGCAAGAAGCTGAAGCTGCTAAGAAGAAGAGCGTTGA
GACCCGCAAGCTTATCTTCAAGAGAGCTGAGCAATACGCTAAAGAATACGCTGAGAAGGA
CAATGAGTTGATCAGGTTGAAGCGTGAGGCTAAGTTGAAAGGAGGGTTCTACGTTGATCC
AGAGGCTAAACTTCTCTTTATCATTCGTATCCGTGGAATCAACGCTATTGATCCAAAAAC
CAAGAAGATTCTGCAGCTCCTGCGTTTGAGACAAATCTCCAATGGTGTGTTCCTTAAGGT
GAACAAGGCAACAATCAACATGCTGCGTCGCGTTGAGCCTTACGTGACTTACGGGTACCC
AAACCTGAAGAGCGTTAAGGAGCTGATCTACAAGAGAGGATTTGGAAAGCTGAACCACCA
GAGGATAGCGCTCACGGACAACTCTATAGTGAGCCAAGGTCTA

QA 1 583 1 583
DS 

RD RS1BU02TF 680 0 0
GGGCGCCGCGCTCACT
CTCTCTCTCTCTCTCTCAGATAATAGCTTCCGCTCAAAGGAAGAAA*TGGCAGAATCTAA
GATGGTGGTTCCAGAGTCTGTCTTGAAAAAGATCAAGAGGGAAGAGGAATGGGCATTGGC
CAAGAAGCAAGAAGCTGAAGCTGCTAAGAAGAAGAGCGTTGAGACCCGCAAGCTTATCTT
CAAGAGAGCTGAGCAATACGCTAAAGAATACGCTGAGAAGGACAATGAGTTGATCAGGTT
GAAGCGTGAGGCTAAGTTGAAAGGAGGGTTCTACGTTGATCCAGAGGCTAAACTTCTCTT
TATCATTCGTATCCGTGGAATCAACGTTATTGATCCAAAAACCAAGAAGATTCTGCAGCT
CCTGCGTTTGAGACAAATCTC*AATGGTGTGTTCCTTAAGGTGAACAAGGCAACAATCAA
CATGCTGCGTCGCGTTGAGCCTTACGTGACTTACGGGTACCCAAACCTGAAGAGCGTTAA
GGAACTGATCTACAAGAGAGGATTTGGAAAGCTGAACCACCAGAGGATAGCGCTCACGGA
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CCACGAGATCATGACCGTTGGACCTCACTTCAAAGAAGCCAACAACTTCCTTTGGCCCTT
CCAG

QA 17 680 17 680
DS 

RD RS1H365TF 709 0 0
GGGCGCCGCGCTCACTCT
CTCTCTCTCTCTCTCTCAGATAATAGCTTCCGCTCAAAGGAAGAAA*TGGCAGAATCTAA
GATGGTGGTTCCAGAGTCTGTCCTGAAAAAGATCAAGAGGGAAGAGGAATGGGCATTGGC
CAAGAAGCAAGAAGCTGAAGCTGCTAAGAAGAAGAGCGTTGAGACCCGCAAGCTTATCTT
CAAGAGAGCTGAGCAATACGCTAAAGAATACGCTGAGAAGGACAATGAGTTGATCAGGTT
GAAGCGCGAGGCTAAGTTGAAAGGAGGGTTCTACGTTGATCCAGAGGCTAAACTTCTCTT
TATCATTCGTATCCGTGGAATCAGCGCTATTGATCCAAAAACCAAGAAGATTCTGCAGCT
CCTGCGTTTGAGACAAATCTTCAATGGTGTGTTCCTTAAGGTGAACAAGGCAACAATCAA
CATGCTGCGTCGCGTTGAGCCTTACGTGACTTACGGGTACCCAAACCTGAAGAGCGTTAA
GGAGTTGATCTACAAGAGAGGATTTGGAAAGCTGAACCACCAGAGGATAGCGCTCACGGA
CAACTCTATAGTGAGCCAAGGTCTAGGAAAGCACAACATCATCTGCGTGGAGGATCTGAT
CCACGAGATCATGACCGTTGGACCTCACTTCAAAGAAGCCAACAACTTCCTTTGGCCCTT
CCAGCTGAAG*CGCCGCTCGGTGGACTTAAG

QA 19 709 19 709
DS 

RD RS1F137TF 673 0 0
GGGCGCCGCGCTCA
CTCTCTCTCTCAGATAATACCTTCCGCTCAAAGGAAGAAAATGGCAGAATCTAAGATGGT
GGTTCCAGAGTCTGTCTCGAAAAAGATCAAGAGGGAAGAGGAATGGGCATTGGCCAAGAA
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AGCTGAGCAATACGCTAAAGAATACGCTGAGAAGGACAATGAGTTGATCAGGTTGAAGCG
TGAGGCTAAGTTGAAAGGAGGGTTCTACGTTGATCCAGAGGCTAAACTTCTCTTTATCAT
TCGTATCCGTGGAATCAACGCTATTGATCCAAAAACCAAGAAGATTCTGCAGCTCCTGCG
TTTGAGACAAATCTTCAATGGTGTGTTCCTTAAGGTGAACAAGGCAACAATCAACATGCT
GCGTCGCGTTGAGCCTTACGTGACTTACGGGTACCCAAACTTGAAGAGCGTTAAGGAACT
TATCTACAAGAGAGGATTTGGAAAGCTGAACCACCAGAGGATAGCGCTCACGGACAACTC
TATAGTGAGCCAAGGTCTAGGAAAGCACAACATCATCTGCGTGGAGGATCTGATCCACGA
GATCATGACCTTTGGACCTCACTTCAAAGAAGCCAACAACTTCCTGTGGCTCTTCCAGC

QA 15 673 15 673
DS 

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GGGCGCCGCGCTCA
CTCTCTCTCTCAGATAATACCTTCCGCTCAAAGGAAGAAAATGGCAGAATCTAAGATGGT
GGTTCCAGAGTCTGTCTTGAAAAAGATCAAGAGGGAAGAGGAATGGGCATTGGCCAAGAA
GCAAGAAGCTGAAGCTGCTAAGAAGAAGAGCGTTGAGACCCGCAAGCTTATCTTCAAGAG
AGCTGAGCAATACGCTAAAGAATACGCTGAGAAGGACAATGAGTTGATCAGGTTGAAGCG
TGAGGCTAAGTTGAAAGGAGGGTTCTACGTTGATCCAGAGGCTAAACTTCTCTTTATCAT
TCGTATCCGTGGAATCAACGCTATTGATCCAAAAACCAAGAAGATTCTGCAGCTCCTGCG
TTTGAGACAAATCTTCAATGGTGTGTTCCTTAAGGTGAACAAGGCAACAATCAACATGCT
GCGTCGCGTTGAGCCTTACGTGACTTACGGGTACCCAAACTTGAAGAGCGTTAAGGAACT
TATCTACAAGAGAGGATTTGGAAAGCTGAACCACCAGAGGATAGCGCTCACGGACAACTC
TATAGTGAGCCAAGGTCTAGGAAAGCACAACATCATCTGCGTGGAGGATCTGATCCACTA
GATCATGACCGTTGGACCTCACTTCAAAGAAGCCAACAACTTCCTGTGGCCCTTCCAG

QA 15 672 15 672
DS 

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AGTTGATCTACAAGAGAGGATTTGGAAAGCTGAACCACCAGAGGATAGCGCTCACGGACA
ACTCTATAGTGAGCCAAGGTCTAGGAAAGCACAACATCATCTGCGTGGAGGATCTGATCC
ACGAGATCATGACCGTTGGACCTCACTTCAAAGAAGCCAACAACTTCCTTTGGCCCTTCC
AGCTGAAGGCGCCGCTCGGTGGACTTAAGAAGAAGAGGAACCACTACGTTGAAGGTGGTG
ATGCTGGGAACAGAGAGAACTTCATCAACGAGCTTGTCAGGAGAATGAACTGACTGATCA
AAAGCTT*TCCTTATTTTGTCTTTGTTCTTAT

QA 1 392 1 392
DS 

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A
AAATGGCAGAATCTAAGATGGTGGTTCCAGAGTCTGTCTTGAAAAAGATCAAGAGGGAAG
AGGAATGGGCATTGGCCAAGAAGCAAGAAGCTGAAGCTGCTAAGAAGAAGAGCGTTGAGA
CCCGCAAGCTTATCTTCAAGAGAGCTGAGCAATACGCTAAAGAATACGCTGAGAAGGACA
ATGAGTTGATCAGGTTGAAGCGTGAGGCTAAGTTGAAAGGAGGGTTCTACGTTGATCCAG
AGGCTAAACTTCTCTTTATCATTCGTATCCGTGGAATCAACGCTATTGATCCAAAAACCA
AGAAGATTCTGCAGCTCCTGCGTTTGAGACAAATCTTCAATGGTGTGTTCCTTAAGGTGA
ACAAGGCAACAATCAACATGCTGCGTCGCGTTGAGCCTTACGTGACTTACGGGTACCCAA
ACTTGAAGAGCGTTAAGGAACTTATCTACAAGAGAGGATTTGGAAAGCTGAACCACCAGA
GGATAGCGCTCACGGACAACTCTATAGTGAGCCAAGGTCTAGGAAAGCACAACATCATCT
GCGTGGAGGATCTGATCCACTAGATCATGACCGTTGGACCTCACTTCAAAGAAGCCAACA
ACTTCCTGTGGCCCTTCCAGCTGAAGGCGCCGCTCGGTGGACTTAAGAAGAAGAGGAACC
ACTACGTTGAAGGTGGTGATGCTGGGAACAGGGAGAACTTCATCAACGAGCTTGTCAGGA
GAATGAACTGACTTATCAAAAGCTTCTCCTTATTTTGTCTTTGTTCTTATATCAGTGACC
GTGTTATGATGATTATGTTACTTGTT

QA 2 807 2 807
DS 

RD RS1BU02JQ 574 0 0
TCTTTATCATTCGTATCCGTGGAATCAACGTTATTGATCCAAAAACCAAGAAGATTTTGC
AGCTCCTGCGTTTGAGACAAATCT*CAATGGTGTGTTCCTTAAGGTGAACAAGGCAACAA
TCAACATGCTGGGTCGCGTTGAGCCTTACGTGACTTACGGGTACCCAAACCTGAAGAGCG
TTAAGGAACTGATCTACAAGAGAGGATTTGGAAAGCTGAACCACCAGAGGATAGCGCTCA
CGGACAACTCTATAGTGAGCCAAGGTCTAGGAAAGCACAACATCATCTGCGTGGAGGATC
TGATCCACGAGATCATGACCGTTGGACCTCACTTCAAAGAAGCCAACAACTTCCTTTGGC
CCTTCCAGCTGAAGGCGCCGCTCGGTGGACTTAAGAAGAAGAGGAACCACTACGTTGAAG
GTGGTGATGCTGGGAACAGAGAGAACTTCATCAACGAGCTTGTCAGGAGAATGAACTGAC
TGATCAAAAGCTT*TCCTTATTTTGTCTTTGTTCTTATATCAGTGACCGTGTTATGATGA
TTATGTTACTTGTTTACGATCATCTTATTTGACT

QA 1 574 1 574
DS 



AS 1 11

CO CL214Contig1 933 11 15 U
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AGTAAACGACGAAACAAAAGAACCGCAAAATAACGAAGGAATACACTTAAGTATCTACTC
CGTTTACATCATCGGACGTCTCCGGGAGAGGTGGCGGGGGGGAGATTAGGCATTCTGACG
CTCGGATTCGATCCGGGTTTCAGAGTGGTAGTCTCGAGCTATTAAAGCAGGAATGCCGGG
ATAGATCTGGATTCCAGACCTGGTGTAGGCATCGGGGAATATGTTCCAAAAAGTACCGCG
ACAGGTCGCGGCCATAGCAGCTTCAGACTCAGCAAGATTGATGTTGTACGTGAGGGCTGA
GTAGTAGTGTGCGAGCGGCAGCTCGTGAACAGAAGTGGTGGCCTGAAAAGTCAGGTGAGC
ATTGTGGCGCATATTGTAGTGGCCAGCTTGGTTGGCGTCTCCATGGGTGAAGGACGTGTG
CGTACCCTGTTGCGCGTTCCACTCGGGAGGAGTGAAGATGTTTGTGTCAGTCGCAATACA
GCGGACTGAGCCAGCGGCGGAGCTAGCGGGTGAGCACTCGTATAGAGTTGTGGAGCCTTT
CCAAAATTGGCAGTATTTAACCATCATGGCGTTTATTGATCCAAACCAGTCGGATCGTTC
TGAAAAGCCTAAAAAGGCAGTCCAGTTATCAGAGACATCGGTGACCGCAGAGTCGAGGAG
AGCGAGCGGACCGACGAAAGAGAGGCGAGCAGAAGCAAGTTTCCAGAGTCTGAGATCTCC
GGAGTAAGAGAGGTTTGAGCCAGGAGAGATGAGATTGGCTATCTCATTGGCTGTGTGAGA
GCAGGGTTGGGCGAAAAGAGTCGCCAAGTACTGCGGACCGTCAATATCTCGCAGGAAAGA
GTCTTCAGTAGCGCCGCTGCGGGAGGCAGCAGC


BQ
40 40 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 40 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GY53JQ U 66
AF RS1AD84JQ U 1
AF RS1AD84TF C 1
AF RS1AH89JQ U 1
AF RS1AH89TF C 1
AF RS1B476JQ U 1
AF RS1B476TF C 1
AF RS1CG71JQ U 1
AF RS1BB04JQ U 5
AF RS1CG71TF C 130
AF RS1BB04TF C 173
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DS 

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ATTG

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DS 

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C

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CGTACC

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DS 

RD RS1AH89TF 486 0 0
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CTCGGATTCGATCCGGGTTTCAGAGTGGTAGTCTCGAGCTATTAAAGCAGGAATGCCGGG
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CGTACC

QA 1 486 1 486
DS 

RD RS1B476JQ 643 0 0
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CTCGGATTCGATCAGGGTTTCAGAGTGGTAGTCTCGAGCTATTAAAGCAGGAATGCCGGG
ATAGATCTGGATTCCAGACCTGGTGTAGGCATCGGGGAATATGTTCCAAAAAGTACCGCG
ACAGGTCGCGGCCATAGCAGCTTCAGACTCAGCAAGATTGATGTTGTACGTGAGGGCTGA
GTAGTAGTGTGCGAGCGGCAGCTCGTGAACAGAAGTGGTGGCCTGAAAAGTCAGGTGAGC
ATTGTGGCGCATATTGTAGTGGCCAGCTTGGTTGGCGTCTCCATGGGTGAAGGACGTGTG
CGTACCCTGTTG*GCGTTCCACTCGGGAGGAGTGAAGATGTTTGTGTCAGTCGCAATACA
GCGGACTGAGCCAGCGGCGGAGCTAGCGGGTGAGCACTCGTATAGAGTTGTGGAGCCTTT
CCAAAATTGGCAGTATTTAACCATCATGGCGTTTATTGATCC
C

QA 1 642 1 642
DS 

RD RS1B476TF 643 0 0
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CTCGGATTCGATCAGGGTTTCAGAGTGGTAGTCTCGAGCTATTAAAGCAGGAATGCCGGG
ATAGATCTGGATTCCAGACCTGGTGTAGGCATCGGGGAATATGTTCCAAAAAGTACCGCG
ACAGGTCGCGGCCATAGCAGCTTCAGACTCAGCAAGATTGATGTTGTACGTGAGGGCTGA
GTAGTAGTGTGCGAGCGGCAGCTCGTGAACAGAAGTGGTGGCCTGAAAAGTCAGGTGAGC
ATTGTGGCGCATATTGTAGTGGCCAGCTTGGTTGGCGTCTCCATGGGTGAAGGACGTGTG
CGTACCCTGTTG*GCGTTCCACTCGGGAGGAGTGAAGATGTTTGTGTCAGTCGCAATACA
GCGGACTGAGCCAGCGGCGGAGCTAGCGGGTGAGCACTCGTATAGAGTTGTGGAGCCTTT
CCAAAATTGGCAGTATTTAACCATCATGGCGTTTATTGATCC
C

QA 1 642 1 642
DS 

RD RS1CG71JQ 672 0 0
GC
TAAAAAGTTACTTAATAAAGGGTTTACATTAGATTCGATAGAAAATAAGAAAAGTCGAAG
TAAACGACGAAACAAAAGAACCGCAAAATAACGAAGGAATACACTTAAGTATCTACTCCG
TTTACATCATCGGACGTCTCCGGGAGAGGTGGCGGGGGGGAGATTAGGCATTCTGACGCT
CGGATTCGATCCGGGTTTCAGAGTGGTAGTCTCGAGCTATTAAAGCAGGAATGCCGGGAT
AGATCTGGATTCCAGACCTGGTGTAGGCATCGGGGAATATGTTCCAAAAAGTACCGCGAC
AGGTCGCGGCCATAGCAGCTTCAGACTCAGCAAGATTGATGTTGTACGTGAGGGCTGAGT
AGTAGTGTGCGAGCGGCAGCTCGTGAACAGAAGTGGTGGCCTGAAAAGTCAGGTGAGCAT
TGTGGCGCATATTGTAGTGGCCAGCTTGGTTGGCGTCTCCATGGGTGAAGGACGTGTGCG
TACCCTGTTGCGCGTTCCACTCGGGAGGAGTGAAGATGTTTGTGTCAGTCGCAATACAGC
GGACTGAGCCAGCGGCGGAGCTAGCGGGTGAGCACTCGTATAGAGTTGTGGAGCCTTTCC
AAAATTGGCAGTATTTAACCATCATGGCGTTTATTGATCCAAACCAGTCGGATCGTTCTG
AAAAGCCTAA

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RD RS1BB04JQ 774 0 0
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AACGACGAAACAAAAGAACCGCAAAATAACGAAGGAATACACTTAAGTATCTACTCCGTT
TACATCATCGGACGTCTCCGGGAGAGGTGGCGGGGGGGAGATTAGGCATTCTGACGCTCG
GATTCGATCCGGGTTTCAGAGTGGTAGTCTCGAGCTATTAAAGCAGGAATGCCGGGATAG
ATCTGGATTCCAGACCTGGTGTAGGCATCGGGGAATATGTTCCAAAAAGTACCGCGACAG
GTCGCGGCCATAGCAGCTTCAGACTCAGCAAGATTGATGTTGTACGTGAGGGCTGAGTAG
TAGTGTGCGAGCGGCAGCTCGTGAACAGAAGTGGTGGCCTGAAAAGTCAGGTGAGCATTG
TGGCGCATATTGTAGTGGCCAGCTTGGTTGGCGTCTCCATGGGTGAAGGACGTGTGCGTA
CCCTGTTGCGCGTTCCACTCGGGAGGAGTGAAGATGTTTGTGTCAGTCGCAATACAGCGG
ACTGAGCCAGCGGCGGAGCTAGCGGGTGAGCACTCGTATAGAGTTGTGGAGCCTTTCCAA
AATTGGCAGTATTTAACCATCATGGCGTTTATTGATCCAAACCAGTCGGATCGTTCTGAA
AAGCCTAAAAAGGCAGTCCAGTTATCAGAGACATCGGTGACCGCAGAGTCGAGGAGAGCG
AGCGGACCGACGAAAGAGAGGCGAGCAGAAGCAAGTTTCCAGAGTCTGAGATCT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RS1CG71TF 793 0 0
CATCGGACGTCTCCGG*AGAGG*GGCGGGGGGGAGATTAGGCAT*CTGACGCTCGGATTC
GATCCGGGTTTCAGAGTGGTAGTCTCGAGCTAT*AAAGCAGGAATGCCGGGATAGATCTG
GATTCCAGACCTGGTGTAGGCATCGGGGAATATGTTCCAAAAAGTACCGCGACAGGTCGC
GGCCATAGCAGCTTCAGACTCAGCAAGATTGATGTTGTACGTGAGGGCTGAGTAGTAGTG
TGCGAGCGGCAGCTCGTGAACAGAAGTGGTGGCCTGAAAAGTCAGGTGAGCATTGTGGCG
CATATTGTAGTGGCCAGCTTGGTTGGCGTCTCCATGGGTGAAGGACGTGTGCGTACCCTG
TTGCGCGTTCCACTCGGGAGGAGTGAAGATGTTTGTGTCAGTCGCAATACAGCGGACTGA
GCCAGCGGCGGAGCTAGCGGGTGAGCACTCGTATAGAGTTGTGGAGCCTTTCCAAAATTG
GCAGTATTTAACCATCATGGCGTTTATTGATCCAAACCAGTCGGATCGTTCTGAAAAGCC
TAAAAAGGCAGTCCAGTTATCAGAGACATCGGTGACCGCAGAGTCGAGGAGAGCGAGCGG
ACCGACGAAAGAGAGGTGAGCAGAAGCAAGTTTCCAGAGTCTGAGATCTCCGGAGTAAGA
GAGGTTTGAGCCAGGAGAGATGAGATTGGCTATCTCATTGGCTGTGTGAGAGCAGGGTTG
GGCGAAAAGAGTCGCCAAGTACTGCGGACCGTCAATATCTCGCAGGAAGGAGTCTTCAGT
AGCGCCGTTGCG
C

QA 1 792 1 792
DS 

RD RS1BB04TF 761 0 0
A
TCTGACGCTCGGATTCGATCCGGGTTTCAGAGTG*TAGTCTCGAGCTATTAAAGCAGGA*
TGCCGGGATAGATCTGGATTCCAGACCTGGTGTAGGCATCGGGGAATATGTTCCAAAAAG
TACCGCGACAGGTCGCGGCCATAGCAGCTTCAGACTCAGCAAGATTGATGTTGTACGTGA
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GGTGAGCATTGTGGCGCATATTGTAGTGGCCAGCTTGGTTGGCGTCTCCATGGGTGAAGG
ACGTGTGCGTACCCTGTTGCGCGTTCCACTCGGGAGGAGTGAAGATGTTTGTGTCAGTCG
CAATACAGCGGACTGAGCCAGCGGCGGAGCTAGCGGGTGAGCACTCGTATAGAGTTGTGG
AGCCTTTCCAAAATTGGCAGTATTTAACCATCATGGCGTTTATTGATCCAAACCAGTCGG
ATCGTTCTGAAAAGCCTAAAAAGGCAGTCCAGTTATCAGAGACATCGGTGACCGCAGAGT
CGAGGAGAGCGAGCGGACCGACGAAAGAGAGGCGAGCAGAAGCAAGTTTCCAGAGTCTGA
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TGTGAGAGCAGGGTTGGGCGAAAAGAGTCGCCAAGTACTGCGGACCGTCAATATCTCGCA
GGAAAGAGTCTTCAGTAGCGCCGCTGCGGGAGGCAGCAGC

QA 2 761 2 761
DS 



AS 2 9

CO CL215Contig1 1194 6 11 U
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GCAATACCAGTTTT**TACTCAAATACTGAATTCCATAAGATTAAAATTGCGTTAACATA
AAAGCACTTCCCACAAGGAGATAAAACATAAAATAAAACCGGTTTTAGTTCCAAGAACAT
CTACTAAAAAACCAAAACATCTCATTGCTCCCTCCACTTCACTTAGGCTCTGCCCTTTCC
TTTTCCCTTGTTGCCCTTGTTGTTAGAACCAAACTGCTTGCCTCCTGAGTTGAATGGCTT
CTTGTTACTACCAGATGATTGACCTCCAGATTTGGGGCTCTGGTTAGCATTCATAGGACT
CTTTCCACCCTTTTTAGCTGGGTGTGGTGTAGCTGTGTGCCCTCCTTTCTTCTTCTCCTC
TGATTTCTGAGGGGTAGCTGCTACTGCGGGCTTGGCCTTCTTTGCAGAGACAGTTGTTGC
AGATTCATTCTGCCTCTTCTTGTTGCTGCTTGGCTCAGGCTTCTTAGGGGTATCATCCTC
TTCTTCCTCCTCAGAATCATCTGCATCATCAT*GGAATCAACATCCATTCCTTTCTCAGA
ATCAGATTCATCGTCTTCAGAATCACCCTCCTCGTCAGAGTCATCATCATCCTCGTCTGA
TTCAGGCTTCACCTCAGGAACCTTAGCCTTTGGTTTCGAGTCAATGGTAACAGCACTCGA
AGCAGGTGCGGCTTTAGCGCTTCCATTGGTAGTGACAGTGGAGACAGTCGAAGCTGCGGG
AACTGCAACTTCCTCCTCCTCTTCCTCTGAATCAGAAGGGAAATCCTCCTCTTCATCGAG
GTTGGGAGACTTGTATACAATGAAGTGGACGATTCCCTTCGAGGAGTGGGAGAGCTCAAA
CTCCTTCTCAAAGACGAGATCGAAGCTGATCTGGGGGATGTTGTCCTGAGAAAGAGTTCC
AATCACAAGCTTCTTCCCATCAACGGTCACGTACAAGAGGGCAGTCTCACCCTTCTTCCC
TTTATCAAGAGATGCCTGTGAAACGTGGATGAGACAGTTCTCTTCGGGTTCCACTTTAAG
TGGCTTCCCTGCCTTAACCTCAGCTCCCCAGAATTCCATTTGATGTTGAAGGTGGAAGAG
AGATTCGAGAGGGAGAGGCAAAGGAGTTTAGGGCTGCGAGATAGAAAGCTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 30 15 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A636JQ U 1
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AF RS1FO61JQ U 31
AF RS1G659JQ U 75
AF RS1A636TF C 289
AF RS1FK59TF C 545
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RD RS1A636JQ 465 0 0
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GCAATACCAGTTTTCTTACTCAAATACTGAATTCCATAAGATTAAAATTGCGTTAACATA
AAAGCACTTCCCACAAGGAGATAAAACATAAAATAAAACCGGTTTTAGTTCCAAGAACAT
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DS 

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GG
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*GGAATCAACATCCATTCCTTTC

QA 3 565 3 565
DS 

RD RS1FO61JQ 571 0 0
GG
GCCAGTACATGATGATGTTTTCATGATTGCAATACCAGTTTT**TACTCAAATACTGAAT
TCCATAAGATTAAAATTGCGTTAACATAAAAGCACTTCCCACAAGGAGATAAAACATAAA
ATAAAACCGGTTTTAGTTCCAAGAACATCTACTAAAAAACCAAAACATCTCATTGCTCCC
TCCACTTCACTTAGGCTCTGCCCTTTCCTTTTCCCTTGTTGCCCTTGTTGTTAGAACCAA
ACTGCTTGCCTCCTGAGTTGAATGGCTTCTTGTTACTACCAGATGATTGACCTCCAGATT
TGGGGCTCTGGTTAGCATTCGTAGGACTCTTTCCACCCTTTTTAGCTGGGTGCGGTGTAG
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TGGCCTTCTTTGCAGAAACAGTTGTTGCAAATTCATTCTGCCTCTTCTTGTTGCTGCTTG
GCTCAGGCTTCTTAGGGGTATCATCCTCTTCTTCCTCCTCAGAATCATCTGCATCATCAT
*GGAATCAACATCCATTCCTTTCTCAGAA

QA 3 571 3 571
DS 

RD RS1G659JQ 527 0 0
CG
TACTCAAATACTGAATTCCATAAGATTAAAATTGCGTTAACATAAAAGCACTTCCCACAA
GGAGATAAAACATAAAATAAAACCGGTTTTAGTTCCAAGAACATCTACTAAAAAACCAAA
ACATCTCATTGCTCCCTCCACTTCACTTAGGCTCTGCCCTTTCCTTTTCCCTTGTTGCCC
TTGTTGTTAGAACCAAACTGCTTGCCTCCTGAGTTGAATGGCTTCTTGTTACTACCAGAT
GATTGACCTCCAGATTTGGGGCTCTGGTTAGCATTCATAGGACTCTTTCCACCCTTTTTA
GCTGGGTGTGGTGTAGCTGTGTGCCCTCCTTTCTTCTTCTCCTCTGATTTCTGAGGGGTA
GCTGCTACTGCGGGCTTGGCCTTCTCTGCAAAGACAGTTGTTGCAAATTCATTCTGCCTC
TTCTTGTTGCTGCTTGGCTCAGGCTTCTTAGGGGTATCATCCTCTTCTTCCTCCTCAGAA
TCATCTTCATCATAATCGGAATCAACATCCATTCCTTTCTCAGAA

QA 3 527 3 527
DS 

RD RS1A636TF 690 0 0
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CTTCTTCTCCTCTGATTTCTGAGGGGTAGCTGCTACTGCGGGCTTGGCCTTCTTTGCAGA
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GGTATCATCCTCTTCTTCCTCCTCAGAATCATCTTCATCATCATCGGAATCAACATCCAT
TCCTTTCTCAGAATCAGATTCATCGTCTTCAGAATCACCCTCCTCGTCAGAGTCATCATC
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AACAGCACTCGAAGCAGGTGCGGCTTTAGCGCTTCCATTGGTAGTGACAGTGGAGACAGT
CGAAGCTGCGGGAACTGCAACTTCCTCCTCCTCTTCCTCTGAATCAGAAGGGAAATCCTC
CTCTTCATCGAGGTTGGGAGACTTGTATACAATGAAGTGGACGCTTCCCTTCGAGGAGTG
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AGAAAGAGTTCCAATCACAAGCTTCTTCCC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1FK59TF 650 0 0
CT
CTCCTCAGAATCATCTGCATCATCAT*GGAATCAACATCCAT*CCTTTCTCAGAATCAGA
TTCATCGTCTTCAGAATCACCCTCCTCGTCAGAGTCATCATCATCCTCGTCTGATTCAGG
CTTCACCTCAGGAACCTTAGCCTTTGGTTTCGAGTCAATGGTAACAGCACTCGAAGCAGG
TGCGGCTTTAGCGCTTCCATTGGTAGTGACAGTGGAGACAGTCGAAGCTGCGGGAACTGC
AACTTCCTCCTCCTCTTCCTCTGAATCAGAAGGGAAATCCTCCTCTTCATCGAGGTTGGG
AGACTTGTATCCAATGAAGTGGACGATTCCCTTCGAGGAGTGGGAGAGCTCAAACTCCTT
CTCAAAGACGAGATCGAAGCTGATCTGGGGGATGTTGTCCTGAGAAAGAGTTCCAATCAC
AAGCTTCTTCCCATCAACGGTCACGTACAAGAGGGCAGTCTCACCCTTCTTCCCTTTATC
AAGAGATGCCTGTGAAACGTGGATGAGACAGTTCTCTTCGGGTTCCACTTTAAGTGGCTT
CCCTGCCTTAACCTCAGCTCCCCAGAATTCCATTTGATGTTGAAGGTGGAAGAGAGATTC
GAGAGGGAGAGGCAAAGGAGTTTAGGGCTGCGAGATAGAAAGCTGTCC

QA 3 650 3 650
DS 



CO CL215Contig2 1110 3 11 U
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ACCTTCAACATCAAATGGAATTCTGGGGAGCTGAGGTTAAGGCAGGGAAGCCACTTAAAG
TGGAACCCGAAGAGAACTGTCTCATCCACGTTTCACAGGCATCTCTTGACAAAGGGAAGA
AGGGTGAGACTGCCCTCTTGTACGTGACCGTTGATGGGAAGAAGCTTGTGATTGGAACTC
TTTCTCAGGATAACATCCCTCAGATCAGCTTCGATCTCGTCTTTGAGAAGGAGTTTGAGC
TCTCCCACTCCTCGAAGGGAAGCGTCCACTTCATTGGATACAAGTCTCCCAACCTCGATG
AAGAGGAGGATTTCCCTTCTGATTCTGAGGAAGAGGAGGAGGAAGTGGCGGTTCCCGCAG
CTTCCACTGTCTCCACTGTCACGACGACCAATGGAAGTGCTAAAGCAGCACCTGCTTCGA
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AGGAGAAGAAGAAAGGAGGGCACACAGCTACACCACACCCAGCTAAAAAGGGTGCAAAGA
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AGCCGCAGTTTGGTTTTAACAACAAGGGCAACAAGGGAAAAGGAAAGGGCAGAGCCTAAG
TGAAGTGGGGGGGGGGGGAGCAATGAGATGTTTTGGGTTTTTAGTAGATGTTCTTGGAAC
AAAGACCGGTTTTATTTTATGTTTTATCTCCTTGTGGGAAGTGCTTTTATGTTAACGCAA
TTTTAATCTTATGGAATTCAGTATTTGAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B717TF U 1
AF RS1AB73TF U 10
AF RS1AB73JQ C 334
BS 1 27 RS1B717TF
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BS 698 730 RS1AB73TF
BS 731 1110 RS1AB73JQ

RD RS1B717TF 704 0 0
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ACCTTCAACATCAAATGGAATTCTGGGGAGCTGAGGTTAAGGCAGGGAAGCCACTTAAAG
TGGAACCTGAAGAGAACTGTCTCATCCACGTTTCACAGGCATCTCTTGATAAAGGGAAGA
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TCTCCCACTCCTCGAAGGGAAGCGTCCACTTCATTGGATACAAGTCTCCCAACCTCGATG
AAGAGGAGGATTTCCCTTCTGATTCTGAGGAAGAGGAGGAGGAAGTGGCGGTTCCCGCAG
CTTCCACTGTCTCCACTGTCACGACGACCAATGGAAGTGCTAAAGCAGCACCTGCTTCGA
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AGGATGATACCCCTAAGAAGCCTGAGCCAAGCAGCAA
AGAAAGC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RS1AB73TF 723 0 0
GG
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GAGAACTGTCTCATCCACGTTTCACAGGCGTCTCTTGACAAAGGGAAGAAGGGTGAGACT
GCTCTCTTGTACGTGACCGTTGATGGGAAGAAGCTTGTGATTGGAACTCTTTCTCAGGAT
AGCATCCCTCAGATCAGCTTCGATCTCGTCTTTGAGAAGGAGTTTGAGCTCTCCCACTCC
TCGAAGGGAAGCGTCCACTTCATTGGATACAAGTCTCCCAACCTCGATGAAGAGGAGGAT
TTCCCTTCTGATTCTGAGGAAGAGGAGGAGGAAGTGGCGGTTCCCGCAGCTTCCACTGTC
TCCACTGTCACGACGACCAATGGAAGTGCTAAAGCAGCACCTGCTTCGAGTGCTGTTACC
ATTGACTCGAAACCAAAGGCCAAGGTTCCTGAGGTGAAGCCTGAATCAGACGAGGATGAT
GATGACTCTGACGAGGAGGGTGATTCTGAAGATGATGAATCTGATTCTGAGAAAGGAATG
GATGTTGATGAGGATGATTCAGATGAAGATGATTCTGAGGAGGAAGAAGAGGATGATACC
CCTAAGAAGCCTGAGCCAAGCAGCAACAAGAAGAGGCAGAATGAATCCGCAACACCTGT
CT

QA 3 721 3 721
DS 

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TTGGATACAAGTCTCCCAACCTCGATGAAGAGGAGGATTTCCCTTCTGATTCTGAGGAAG
AGGAGGAGGAAGTGGCGGTTCCCGCAGCTTCCACTGTCTCCACTGTCACGACGACCAATG
GAAGTGCTAAAGCAGCACCTGCTTCGAGTGCTGTTACCATTGACTCGAAACCAAAGGCCA
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ATTCTGAAGATGATGAATTTGATTTTGAGAAAGGAATGGATGTTGATGAGGATGATTCAG
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GCAACAAGAAGAGGCAGAATGAATCCGCAACACCTGTTTTTGCAAAGAAAGCTAAGCCCG
CAGTAGCAGCTACCCCTCAGAAATCAGAGGAGAAGAAGAAAGGAGGGCACACAGCTACAC
CACACCCAGCTAAAAAGGGTGCAAAGAGTCCTATGAATGCTAACCAGAGCCCCAAATCTG
GTGGTCAATCATCCGGTGCTAACAAGAAGCCGCAGTTTGGTTTTAACAACAAGGGCAACA
AGGGAAAAGGAAAGGGCAGAGCCTAAGTGAAGTGGGGGGGGGGGGAGCAATGAGATGTTT
TGGGTTTTTAGTAGATGTTCTTGGAACAAAGACCGGTTTTATTTTATGTTTTATCTCCTT
GTGGGAAGTGCTTTTATGTTAACGCAATTTTAATCTTATGGAATTCAGTATTTGAGG

QA 1 777 1 777
DS 



AS 2 9

CO CL216Contig1 809 7 10 U
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CATGGGTATCGATCTTATCGCCGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAAAGGACAGCTCCAAA
GTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTATACCGGTTTTTGGTAAGGAGAAC
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GTTGGTTGGGACAATCACTGATGATCTGAGAGTGCATGAGATTCCTGCAATGAAGGTTAC
TGCCTTGAGGTTTACGGAGCGAGCTAGGGCTAGGATTGAGAAAGCTGGTGGGGAGTGCTT
GACCTTTGACCAGCTTGCTCTCGTTGCTCCATTGGGACAGAACACGGTTCTTCTTAGAGG
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CCACTCCAAGCCTTATGTTAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAAGCTAGAGGAAAGCG
AAAGAGTCGTGGTTTCAAGGTCTAAGAAAGTCCTCAAAACTGTTTTCGAGTTTGTTGTTT
CTTTATATGGTTGCTGCTTTCAGAATCCAAGTTTTTGTAGACCACTTTTGTTACTCTTTG
CCTTTTGCAGACATTGTTTTGAGTTTTCTGTCTTTCTGTTCTAATCGACAATTGAATGTT
TTGCTTTCGCCATATTCTTGATATAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 0 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A090TR C 169
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AF RS1A090TV U 1
AF RS1A090JQ C 500
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AF RS1GH43JQ C 183
BS 1 62 RS1A090TV
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AGTCAACAAGGCTCCTCTTTCACTTTCCAAGCTCGTTGAGTTCATGAACGACAAGGATGG
TAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACAATCACTGATGATTTGAGAGGGCATGAGATTCCTGC
AATGAAGTTTACTGCCTTGAGGTTTACGGAGCGAGCTAGGGCTAGGATTGAGAAAGCTGG
TGGGGAGTGCTTGACCTTTGACCAGCTTGCTTTCGTTGCTCCATTGGGACAGAACACGGT
TTTTTTTAGAGGACCGAAGAAC

QA 1 322 1 322
DS 

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GGGT
AACAGACGCCATGGGTATCGATCTTATCGCCGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAAAGGAC
AGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTATACCGGTTTTTGGT
AAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTCAAGAGGCTTTTCATGAGCAAAGT
CAACAAGGCTCCTCTTTCACTCTCCAAGCTCGTTGAGTTCATGAACGGCAAGGATGGTAA
GATTGCTGTGTTGGTTGGGACAATCACTGATGATCTGAGAGTGCATGAGATTCCTGCAAT
GAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACGGAGCGAGCTAGGGCTAGGATTGAGAAAGCTGGTGG
GGAGTGCTTGACCTTTGACCAGCTTGCTCTCGTTGCTCCATTGGGACAGAACACGGTTCT
TCTTAGAGGACCGAAGAACTCCCGTGAGGCAGTGAAGCACTTTGGTCCAGCTCCTGGTGA
GCCACACAGCCAC

QA 5 497 5 497
DS 

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AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAACAGACGC
CAAGGGTATCGATCTTATCGCCGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAAAGGACAGCTCCAAA
GTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTATATCGGTTTTTGGTAAGGAGAAC
CGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTCAAGAGGCTTTTCATGAGCAAAGTCAACAAGGC
TCCTCTTTCACTCTCCAAGCTCGTTGAGTTCATGAACGACAAGGATGGTAAGATTGCTGT
GTTGGTTGGGACAATCACTGATGATCTGAGAGTGCATGAGATTCCTGCAATGAAGTTTAC
TGCCTTGAGGTTTACGGAGCGAGCTAGGGCTAGGATTGAGAAAGCTGGTGGGGAGTGCTT
GACCTTTGACCAGCTTGCTCTCGTTGCTCCATTGGGACAGAACACGGTTCTTCTTAGAGG
ACCGAAGAACTCTCGTGAGGCAGTGAAGCACTTTGGTCCAGCTCCTGGTGTGCCACACAG
CCACTCCAAGCCTTATGTTAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAAGCTAGAGGAAAGCG
AAAGAGTCGTGGTTTCAAGGTCTAAGAAAGTCCTCAAAACTGTTTTCGAGTTTGTTGTTT
CTTTATATGGTTGCTGCTTTCAGAATCCAAGTTTTTGTAGACCACTTTTGTTACTCTTTG
CCTTTTGCAGACATTGTTTTGAGTTTTCTGTCTTTCTGTTCTAATCGACAATTGAATG
AGAAA

QA 1 778 1 778
DS 

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GCAGTGAAGCACTTTGGTCCAGCTCCTGGTGTGCCACACAGCCACTCCAAGCCTTATGTT
AGGTTTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAAGCTAGAGGAAAGGGAAAGAGTCGTGGTTTCAAG
GTTTAAGAAAGTCCTCAAAACTGTTTTTGAGTTTGTTGTTTCTTTATATGGTTGCTGCTT
TCAGAATCCAAGTTTTTGTAGACCACTTTTGTTACTTTTTGCCTTTTGCAGACATTGTTT
TGAGTTTTTTGTCTTTTTGTTTTAATCGACAATTGAATG
GG

QA 1 279 1 279
DS 

RD RS1A090TF 703 0 0
TATCGCCGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAAAGGACAGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTA
CCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTATATCGGTTTTTGGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGA
TGCTGTGATCCTCAAGAGGCTTTTCATGAGCAAAGTCAACAAGGCTCCTCTTTCACTCTC
CAAGCTCGTTGAGTTCATGAACGACAAGGATGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACAAT
CACTGATGATCTGAGAGTGCATGAGATTCCTGCAATGAAGTTTACTGCCTTGAGGTTTAC
GGAGCGAGCTAGGGCTAGGATTGAGAAAGCTGGTGGGGAGTGCTTGACCTTTGACCAGCT
TGCTCTCGTTGCTCCATTGGGACAGAACACGGTTCTTCTTAGAGGACCGAAGAACTCTCG
TGAGGCAGTGAAGCACTTTGGTCCAGCTCCTGGTGTGCCACACAGCCACTCCAAGCCTTA
TGTTAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAAGCTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGTTT
CAAGGTCTAAGAAAGTCCTCAAAACTGTTTTCGAGTTTGTTGTTTCTTTATATGGTTGCT
GCTTTCAGAATCCAAGTTTTTGTAGACCACTTTTGTTACTCTTTGCCTTTTGCAGACATT
GTTTTGAGTTTTCTGTCTTTCTGTTCTAATCGACAATTGAATG

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1CE79TF 772 0 0
GGGTTTTCCTCCGT
AACAGACGCCATGGGTATCGGTCTTATCGCCGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAAAGGAC
AGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTATACCGGTTTTTGGT
AAGAAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTCAAGAGGCTTTTCATGAGTAAAGT
CAACAAGGCTCCTCTTTCACTCTCCAAGCTCGTTGAGTTCATGAACGGCAAGGATGGTAA
GATTGCTGTGTTGGTTGGGACAATCACTGATGATCTGAGAGTGCATGAGATTCCTGCAAT
GAAGGTTACTGCCTTGAGGTTTACGGAGCGAGCTAGGGCTAGGATTGAGAAAGCTGGTGG
GGAGTGCTTGACCTTTGACCAGCTTGCTCTCGTTGCTCCATTGGGACAGAACACGGTTCT
TCTTAGAGGACCGAAGAACTCTCGTGAGGCAGTGAAGCACTTTGGTCCAGCTCCTGGTGT
GCCACACAGCCACTCCAAGCCTTATGTTAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAAGCTAG
AGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGTTTCAAGGTCTAAGAAAGTCCTCAAAACTGTTTTCGAGT
TTGTTGTTTCTTTATATGGTTGCTGCTTTCAGAATCCAAGTTTT*GTAGACCACTTTTGT
TACTCTTTGCCTTTTGCAGACATTGTTTTGAGTTT*CTGTCTTTCTGTTCTAATCGACAA
TTGAATGTTTTGCTTTCGCCATATTCTTGATATAAAAA

QA 15 772 15 772
DS 

RD RS1GH43JQ 609 0 0
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CTCTTTCACTCTCCAAGCTCGTTGAGTTCATGAACGGCAAGGATGGTAAGATTGCTGTGT
TGGTTGGGACAATCACTGATGATCTGAGAGTGCATGAGATTCCTGCAATGAAGGTTACTG
CCTTGAGGTTTACGGAGCGAGCTAGGGCTAGGATTGAGAAAGCTGGTGGGGAGTGCTTGA
CCTTTGACCAGCTTGCTCTCGTTGCTCCATTGGGACAGAACACGGTTCTTCTTAGAGGAC
CGAAGAACTCCCGTGAGGCAGTGAAGCACTTTGGTCCAGCTCCTGGTGAGCCACACAGCC
ACTCCAAGCCTTATGTTAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAAGCTAGAGGAAAGCGAA
AGAGTCGTGGTTTCAAGGTCTAAGAAAGTCCTCAAAACTGTTTTCGAGTTTGTTGTTTCT
TTATATGGTTGCTGCTTTCAGAATCCAAGTTTTTGTAGACCACTTTTGTTACTCTTTGCC
TTTTGCAGACATTGTTTTGAGTTTTCTGTCTTTCTGTTCTAATCGACAATTGAATGTTTT
GCTTTCGCC

QA 1 609 1 609
DS 



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AACTCAAAACAATGTCTGCAAAAGGCAAAGAGTAACAATAAGCGGTCTACAAAAAACTTG
GATTCTGAAAGCAGCAACCATAAGGAAACACAACAACCTCGAAACAGTATTGAGGACTTT
CTTAGACCTTGAAACCACGACTCTTTCGCTTTCCTCTAGCTTTCTCAAACTTCCTTCCCT
TAGACCTAACATAAGGCTTGGAGTGGCTGTGTGGCACACCAGGAGCTGGACCAAAGTGCT
TCACTGCCTCACGAGAGTTCTTCGGTCCTCTAAGAAGAACCGTGTTCTGTCCCAATGGAG
CAACGAGAGCAAGCTGGTCAAAGGTCAAGCACTCTCCACCAGCTTTCTCAATCCTAGCCC
TAGCTCGCTCCGTAAACCTCAAGGCAGTAACCTTCATTGCAGGAATCTCATGCACTCTCA
GATCATCAGTGATTGTCCCAACCAACACAGCAATCTTACCATCCTTGCCGTTCATGAACT
CAACGAGCTTGGAGAGTGAAAGAGGGGCCTTGTTGACTTTGCTCATGAAAAGCCTCTTGA
GGATCACAGCATCGAACCTGCTTCCGGTTCTCCTTACCAAAAACCGGTACAGCTTAACGA
GAAGCTTGAGGTAGACATCATCGGACTTTGGAGCTGTCCTTTTGGTCTTCTTGCTCTTAC
CTCCGGCGATAAGATCGATACCCATGGCGTCTGTTACGGAGGAAAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AP19JQ U 40
AF RS1AP19TFB C 1
BS 1 39 RS1AP19TFB
BS 40 454 RS1AP19JQ
BS 455 769 RS1AP19TFB

RD RS1AP19JQ 415 0 0
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AAGCGGTCTACAAAAAACTTGGATTCTGAAAGCAGCAACCATAAGGAAACACAACAACCT
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CTTTCTCAAACTTCCTTCCCTTAGACCTAACATAAGGCTTGGAGTGGCTGTGTGGCACAC
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CCGTGTTCTGTCCCAATGGAGCAACGAGAGCAAGCTGGTCAAAGGTCAAGCACTCTCCAC
CAGCTTTCTCAATCCTAGCCCTAGCTCGCTCCGTAAACCTCAAGGCAGTAACCTT

QA 1 415 1 415
DS 

RD RS1AP19TFB 769 0 0
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AACTCAAAACAATGTCTGCAAAAGGCAAAGAGTAACAATAAGCGGTCTACAAAAAACTTG
GATTCTGAAAGCAGCAACCATAAGGAAACACAACAACCTCGAAACAGTATTGAGGACTTT
CTTAGACCTTGAAACCACGACTCTTTCGCTTTCCTCTAGCTTTCTCAAACTTCCTTCCCT
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TCACTGCCTCACGAGAGTTCTTCGGTCCTCTAAGAAGAACCGTGTTCTGTCCCAATGGAG
CAACGAGAGCAAGCTGGTCAAAGGTCAAGCACTCTCCACCAGCTTTCTCAATCCTAGCCC
TAGCTCGCTCCGTAAACCTCAAGGCAGTAACCTTCATTGCAGGAATCTCATGCACTCTCA
GATCATCAGTGATTGTCCCAACCAACACAGCAATCTTACCATCCTTGCCGTTCATGAACT
CAACGAGCTTGGAGAGTGAAAGAGGGGCCTTGTTGACTTTGCTCATGAAAAGCCTCTTGA
GGATCACAGCATCGAACCTGCTTCCGGTTCTCCTTACCAAAAACCGGTACAGCTTAACGA
GAAGCTTGAGGTAGACATCATCGGACTTTGGAGCTGTCCTTTTGGTCTTCTTGCTCTTAC
CTCCGGCGATAAGATCGATACCCATGGCGTCTGTTACGGAGGAAAACCC

QA 1 769 1 769
DS 



AS 2 10

CO CL217Contig1 1206 3 5 U
GAGCAGAGGAAGACTCCTTTTATTCATGTTTAGACTCGAGTTTGTAGAAGTACCAAAGAT
ATAGCAAATACCAGGTTTCAAAGAGGTATATGAACAAACTCAAACACAAAACATCTAACA
GAGCTTCGGACAAAAAAAAAGTGTGTAATAATAAGCTCTCAGACATAGCTTACTCAACTT
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AGGTTTCTAGGAAATGTCTACTACACATAGCTTATACAACATATATAGCTTTTAGCCTAG
ATCAGGGACAATGAAGTGCTCTTCATCATCATCCTCATCATCTCTGATCTCTAACCTCGG
CTTCTTGTACGAAACGTTGGACTTCATTGGTCTGTACGAATGAACATGACCTAAATGCGC
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CCAGTTCAATCTCTACCTTATCTGTGAACTCAGGATCAGAGAAGTGGAAGAAATCGTCAA
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TAGCTGCAGGAATCTCCTTAGCTTTCTGTTGGTTGTTCGAAGGCTCAGATTGATGATTCT
TCTCTGTTTCTTTACTGCAGCTGCTCGAGCTCAGAGCCACTTTGATCCCAGTGGCTAAGA
ACCTCTGGTGATTTGCAGATCTAGAGTTAGCCACGTGGATTGATTCATCACAGTCCCTGC
AAAGCAGAGCTCTATCCTCCACACAGAATATAAAAGCTGCCTTCTCTTGGCAGATATCGC
AACGAGGGAACTTGGTGGAGAGAGAGTTGAGATGGAGGCGTTGGTGCTTGCTTGCGAGTT
TGTTAGCTGCGTGGATCTCCACGTCGCATTTAGGGCACAGAGCTGCTTCGTCGGCGCAAC
ATATCACCGTGGCTGGAGCATTCTCACACACATCACACTGTATCTTCATCTCTTTTTTCT
TTCCAAACACAGTTCTTGATTCTAGGTTTTAATAGATCAAGAACACCTGAATATCTACCT
TTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

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AGGTTTCTAGGAAATGTCTACTACACATAGCTTATACAACATATATAGCTTTTAGCCTAG
ATCAGGGACAATGAAGTGCTCTTCATCATCATCCTCATCATCTCTGATCTCTAACCTCGG
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GG
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GGACTTCATTGGTCTGTACGAATGAACATGACCTAAATGCGCAACGGAAAGCTCTGGAAC
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TATCTGTGAACTCAGGATCAGAGAAGTGGAAGAAATCGTCAACAGCCCATGGAAGAGGAG
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AGTTCAATCTCTACATTATCTGTGAACTCAGGATCAGAGAAGTGGAAGAAATCGTCAACA
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TCTGTTTCTTTACTGCAGCTGCTCGAGCTCAGAGCCACTTTGATCCCAGTGGCTAAGAAC
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AGCAGAGCTCTATCCTCCACACAGAATATAAAAGCTGCCTTCTCTTGGCAGATATCGCAA
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CCAAACACAGTTCTTGATTCTAGGTTTTAATAGATCAAGAACACCTGAATATCTACCTTT
CTCC

QA 1 724 1 724
DS 



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GGACACCACCCAGTTGTTCACTCACCAACAACTTGTCCTTCTTTAGTTGTTTACAATCTC
TTGATTAATATCTCAAAACATTTTCTCTTCGCCTATATTTTTTTTTGCTAACCTATTCTC
AGAGGAGAAAGGTAGATATTCAGGTGTTCTTGATCTATTAAAACCTAGAATCAAGAACTG
TGTTTGGAAAGAAAAAAGAGATGAAGATACAGTGTGATGTGTGTGAGAATGCTCCAGCCA
CGGTGATATGTTGCGCCGACGAAGCAGCTCTGTGCCCTAAATGCGACGTGGAGATCCACG
CAGCTAACAAACTCGCAAGCAAGCACCAACGCCTCCATCTCAACTCTCTCTCCACCAAGT
TCCCTCGTTGCGATATCTGCCAAGAGAAGGCAGCTTTTATATTCTGTGTGGAGGATAGAG
CTCTGCTTTGCAGGGACTGTGATGAATCAATCCACGTGGCTAACTCTAGATCTGCAAATC
ACCAGAGGTTCTTAGCCACTGGGATCAAAGTGGCTCTGAGCTCGAGCAGCTGCAGTAAAG
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TATATATGTTGTATAAGCTATGTGTAGTAGACATTTCCTAGAAACCTATCTGCATAAGGA
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TATGTCTGAGAGCTTATTATTACACACTTTCTTTTCGTCCGAATCTCTGTTAGATGTTTT
GTGTTTGAGTTTGTTCATATACCTCTTTGAAACCTGGTATTTGCTATATCTTTGGTACTT
CTACAAACTCGAGTCAAAACATGAATAAAAGGAGTCTTCCTCTGCTTATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 25 25 40 40 40 40 5 25 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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CAGCTAAAACCCCAAGCCAACAACAGCAACAGCCTGCACCTGCTGCTGCTCCTCTTCCAT
GGGCTGTTGACGATTTCT

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DS 

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GG
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TTAGCCACTGGGATCAAAGTGGCTCTGAGCTCGAGCAGCTGCAGTAAAGAAACAGAGAAG
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ACCCCAAGCCAACAACAGCAACAGCCTGCACCTGCTGCTGCTCCTCTTCCATGGGCTGTT
GACGATTTCTTCCACTTCTCTGATCCTGAGTTCACAGATA*GCAGAA*G*ACAGCTTGAT
CTTGGGGAGCTAGAG
GGT

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DS 

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GG
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TCTCTTCGCCTATATTTTTTTTTGCTAACCTATTCTCAGAGGAGAAAGGTAGATATTCAG
GTGTTCTTGATCTATTAAAACCTAGAATCAAGAACTGTGTTTGGAAAGAAAAAAGAGATG
AAGATACAGTGTGATGTGTGTGAGAATGCTCCAGCCACGGTGATATGTTGCGCCGACGAA
GCAGCTCTGTGCCCTAAATGCGACGTGGAGATCCACGCAGCTAACAAACTCGCAAGCAAG
CACCAACGCCTCCATCTCAACTCTCTCTCCACCAAGTTCCCTCGTTGCGATATCTGCCAA
GAGAAGGCAGCTTTTATATTCTGTGTGGAGGATAGAGCTCTGCTTTGCAGGGACTGTGAT
GAATCAATCCACGTGGCTAACTCTAGATCTGCAAATCACCAGAGGTTCTTAGCCACTGGG
ATCAAAGTGGCTCTGAGCTCGAGCAGCTGCAGTAAAGAAACAGAGAAGAATCATCAATCT
GAGCCTTCGAACAACCAACAGAAAGCTAAGGAGATTCCTGCAGCTAAAACCCCAAGCCAA
CAACAGCAACAGCCTGCACCTGCTGCTGCTCCTCTTCCATGGGCTGTTGACGATTTCTTC
CACTTCTCTGATCCTGAGTTCACAGTAA*GCAGAA*AGACAGCTTGATCTTGGGGA

QA 3 718 3 718
DS 

RD RS1FJ22TF 811 0 0
GGACACCACCCAGTTGTTCACTCACCAACAACTTGTCCTTCTTTAGTTGTTTACAATCTC
TTGATTAATATCTCAAAACATTTTCTCTTCGCCTATATTTTTTTT*GCTAACCTATTCTC
AGAGGAGAAAGGTAGATATTCAGGTGTTCTTGATCTATTAAAACCTAGAATCAAGAACTG
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CAGCTAACAAACTCGCAAGCAAGCACCAACGCCTCCATCTCAACTCTCTCTCCACCAAGT
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CTCTGCTTTGCAGGGACTGTGATGAATCAATCCACGTGGCTAACTCTAGATCTGCAAATC
ACCAGAGGTTCTTAGCCCCTGGGATCAAAGTGGCTCTGAGCTCGAGCAGCTGCAGTAAAG
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CTGCAGCTAAAACCCCAAGCCAACAACAGCAACAGCCTGCACCTGCTGCTGCTCCTCTTC
CATGGGCTGTTGACGATTTCTTCCACTTCTCTGATCCTGAGTTCACAGATA*GCAGAA*G
GACAGCTTGATCTTGGGGAGCTAGAGTGGTTTTCAGACATGGGTTTCTTCGGTGATGAGA
T*AGTCAGGAGACCCTTCCCGCAGCTGA
GTT

QA 1 808 1 808
DS 

RD RS1DC79TF 761 0 0
GG
ACCAACAACTTGTCCTTCTTTAGTTGTTTACAATCTCTTGATTAATATCTCAAAACATTT
TCTCTTCGCCTATATTTTTTTT*GCTAACCTATTCTCAGAGGAGAAAGGTAGATATTCAG
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AAGATACAGTGTGATGTGTGTGAGAATGCTCCAGCCACGGTGATATGTTGCGCCGACGAA
GCAGCTCTGTGCCCTAAATGCGACGTGGAGATCCACGCAGCTAACAAACTCGCAAGCAAG
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GAGAAGGCAGCTTTTATATTCTGTGTGGAGGATAGAGCTCTGCTTTGCAGGGACTGTGAT
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ATCAAAGTGGCTCTGAGCTCGAGCAGCTGCAGTAAAGAAACAGAGAAGAATCATCAATCT
GAGCCTTCGAACAACCAACAGAAAGCTAAGGAGATTCCTGCAGCTAAAACCCCAAGCCAA
CAACAGCAACAGCCTGCACCTGCTGCTACTCCTCTTCCATGGGCTGTTGACGATTTCTTC
CACTTCTCTGATCCTGAGTTCACAGATAAGCAGAAAGGACAGCTTGATCTTGGGGAGCTA
GAGTGGTTT*CAGACATGGGTTTCTTCG*TGATGAGAT
A

QA 3 760 3 760
DS 

RD RS1FJ22JQ 764 0 0
TTTTATATTCTGTGTGGAGGATAGAGCTCTGCTTTGCAGGGACTGTGATGAATCAATCCA
CGTGGCTAACTCTAGATCTGCAAATCACCAGAGGTTCTTAGCCCCTGGGATCAAAGTGGC
TCTGAGCTCGAGCAGCTGCAGTAAAGAAACAGAGAAGAATCATCAATCTGAGCCTTCGAA
CAACCAACAGAAAGCTAAGGAGATTCCTGCAGCTAAAACCCCAAGCCAACAACAGCAACA
GCCTGCACCTGCTGCTGCTCCTCTTCCATGGGCTGTTGACGATTTCTTCCACTTCTCTGA
TCCTGAGTTCACAGATAAGCAGAAAGGACAGCTTGATCTTGGGGAGCTAGAGTGGTTTTC
AGACATGGGTTTTTTCGGTGATGAGATTAGTCAGGAGACCCTTCCCGCAGCTGAAGTTCC
AGAGCTTTCCGTTGCGCATTTAGGTCATGTTCATTCGTACAGACCAATGAAGTCCAACGT
TTCGTACAAGAAGCCGAGGTTAGAGATCAGAGATGATGAGGATGATGATGAAGAGCACTT
CATTGTCCCTGATTTAGGCTAAAAGCTATATATGTTGTATAAGCTATGTGTAGTAGACAT
TTCCTAGAAACCTATCTGCATAAGGAGAATGATGTGTGAAGTCGTCAATGTCGTATCTTT
TTAGTTTCGTCTAAAGTTGAGTAAGCTATGTTTGAGAGCTTATTATTACACACTTTTTTT
TCGTCCGAATCTCTGTTAGATGTTTTGTGTTTGAGTTTGTTCAT

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1GH96JQ 599 0 0
TCCTCTTCCATGGGCTGTTGACGATTTCTTCCACTTCTCTGATCCTGAGTTCACAGATA*
**AGAAAGGACAGCTTGATCTTGGGGAGCTAGAGTGGTTTTCAGACATGGGTTTCTTCGG
TGATGAGATTAGTCAGGAGACCCTTCCCGCAGCTGAAGTTCCAGAGCTTTCCGTTGCGCA
TTTAGGTCGTGTTCATTCGTACAGACCAATGAAGTCCAACGTTTCGTACAAGAAGCCGAG
GTTAGAGGTCAGAGATGATGAGGATGATGATGAAGAGCACTTCATTGTCCCTGATCTAGG
CTAAAAGCTATATATGTTGTATAAGCTATGTGTAGTAGACATTTCCTAGAAACCTATCTG
CATAAGGAGAATGATGTGTGAAGTCGTCAATGTCGTATCTTTTTAGTTTCGTCTAAAGTT
GAGTAAGCTATGTCTGAGAGCTTATTATTACACACTTTCTTTT*GTCCGAATCTCTGTTA
GATGTTTTGTGTTTGAGTTTGTTCATATACCTCTTTGAAACCTGGTATTTGCTATATCTT
TGGTACTTCTACAAACTCGAGTCAAAACATGAATAAAAGGAGTCTTCCTCTGCTTATAC

QA 1 599 1 599
DS 



AS 2 10

CO CL218Contig1 1146 8 25 U
GGATATTGTAAAACCCCAATCTCTCTCCCTCACTTTCTCGTACGCCGCACCAACTGTTGA
ATCCACGAAGAAACCTCACCTCAGTCCCTAGATTCTATGGCGACCAACGAACCCGAGCAC
GAGAACAGAGACGCAGAAGAATCCGGAGCTAACGAGGATGAGGACACCGGAGCTCAGGTC
GCTCCGATCGTTAGGCTTGAGGAAGTTGCCGTCACTACCGGCGAGGAAGACGAAGACGCA
ATCCTCGATCTGAAATCGAAGCTGTATCGCTTCGACAAGGAAGCGAATCAGTGGAAGGAG
AGAGGAGCTGGTACTGTGAAGCTCTTGAAGCATAAGAGCACTGGCAAGATTCGTCTCGTT
ATGAGGCAATCCAAAACTCTCAAGATCTGTGCCAATCATTTCGTTAAACAGGGCATGTCT
GTTCAGGAACACGTTGGAAACGAGAAGTCGTGTGTGTGGCACGCTCGTGACTTTGCTGAT
GGTGAGCTGAAGGATGAGCTTTTCTGCATCCGATTTGCTTCAATTGAGAACTGCAAAGCA
TTTATGCAGAAGTTCAATGAAGTTGCTGAATCTGAAGTAGAGAAAGAAGAGAGCAAAGAC
GCATCTGACACCGCTGGTCTTCTTGAGAAGTTGACCGTTGAAGAGACAAAAACAGAGGAG
AAACCTGTGGAGAAGGTGAAGGCCGAAGTTGAAGCAGAGGAAAAGACAAAAAGCGAGCCA
GAGAAAGCTGATGAAGAAAAGAAAACCGAAGAGGCTGTTGCTCCCTCAACTTAAGATGCA
TCAATGTTTAAGCTCCTTTGGCGAGGTATTATTAGCCTTGTTTTGATGCATCCATCTCGA
GTCTACTAGTGTCTTGGCACTAACTATCTACATGTGTTGTCGGATCATATCAAGTGGTTT
GGGGTTGGGTTTTGCTGAGTCGTTTTGGGTTTTATAGTTTTGAGTCTAAAGTGTGGGCGA
GTGATATGAGAGATTACGGTTTGGTTATCAGTAAGAATACATTGAATTCATTGTTTTCAG
CGTTTGTTATGGGTTGTTTTTGGATGGTCTTTATTTTGAGGACAGGGATGGTTGTTTGTT
CATGGACATGTCAGAAGTCTTCATTTCTTTGAATTACAAAATTATACGCATTGTTGATTT
TAATTT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 15 15 0 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 30 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1G770TF U 3
AF RS1CI59TF U 1
AF RS1GH25TF U 16
AF RS1F572TF U 18
AF RS1F769TF U 18
AF RS1CI59JQ C 343
AF RS1F572JQ C 431
AF RS1F769JQ C 406
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BS 1130 1146 RS1F769JQ

RD RS1G770TF 191 0 0
GGG
TTGTAAAACCCCAATCTCTCTCGCTCTCTTTCTCGTACGCCGCACCAACTGTTGAATCCA
CGAAGAAACCTCACCTCAGTCCCTAGATTCTATGGCGACCAACGAACCCGAGCACGAGAA
CAGAGACGCAGAAGAATCCGGAGCTAACGAGGATGAGGACACCGGAGCTCAGGTCGCTCC
GATCGT
AG

QA 4 189 4 189
DS 

RD RS1CI59TF 608 0 0
GGATATTGTAAAACCCCAATCTCTCC**CTCACTTTCTCGTACGCCGCACCAACTGTTGA
ATCCACGAAGAAACCTCACCTCAGTCCCTAGATTCTATGGCGACCAACGAACCCGAGCAC
GAGAACAGAGACGCAGAAGAATCCGGAGCTAACGAGGATGAGGACACCGGAGCTCAGGTC
GCTCCGATCGTTAGGCTTGAGGAAGTTGCCGTCACTACCGGCGAGGAAGACGAAGACGCA
ATCCTCGATCTGAAATCGAAGCTGTATCGCTTCGACAAGGAAGCGAATCAGTGGAAGGAG
AGAGGAGCTGGTACTGTGAAGCTCTTGAAGCATAAGAGCACTGGCAAGATTCGTCTCGTT
ATGAGGCAATCCAAAACTCTCAAGATCTGTGCCAATCATTTCGTTAAACAGGGCATGTCT
GTTCAGGAACACGTTGGAAACGAGAAGTCGTGTGTGTGGCACGCTCGTGACTTTGCTGGT
GGTGAGCTGAAGGATGAGCTTTTCTGCATCCGATTTGCTTCAATTGAGAACTGCAAAGCA
TTTATGCAGAAGTTCAATGAAGTTGCTGAATCTGAAGTAGAGAAAGAAGAGAGCAAAGAC
GCATCTGA

QA 1 608 1 608
DS 

RD RS1GH25TF 627 0 0
GGAATC
TCTCTCGCTCTCTTTCTCGTACGCCGCACCAACTGTTGAATCCACGAAGAAACCTCACCT
CAGTCCCTAGATTCTATGGCGACCAACGAACCCGAGCACGAGAACAGAGACGCAGAAGAA
TCCGGAGCTAACGAGGATGAGGACACCGGAGCTCAGGTCGCTCCGATCGTTAGGCTTGAG
GAGGTTGCCGTCACTACCGGCGAGGAAGACGATGACGCAATCCTCGATCTGAAATCGAAG
CTGTATCGGTTCGACAAGGAAGCGAATCAGTGGAAGGAGAGAGGAGCTGGTACTGTGAAG
CTCTTGAAGCATAAGAGCACTGGCAAGATTCGTCTCGTTATGAGGCAATCCAAAACTCTC
AAGATCTGTGCCAATCATTTCGTTAAAGAGGGCATGTCTGTTCAGGAACACGTTGGAAAC
GAGAAGTCGTGTGTGTGGCACGCTCGTGGCTTTGCTGATGGTGAGCTAAAGGATGAGCTT
TTCTGCATCCGATTTGCTTCAATTGAGAACTGCAAAGCATTTATGCAGAAGTTCAATGAA
GTTGCTGAATCTGAAGTAGAGAAAGAAGAGAGCAAAGATGCCTCTGACACCGCTGGTCTT
CTTGAGAAGTTGACCGTGGAA

QA 7 627 7 627
DS 

RD RS1F572TF 767 0 0
GGAA
TCTCTCCCTCACTTTCTCGTACGCCGCACCAACTGTTGAATCCACGAAGAAACCTCACCT
CAGTCCCTAGATTCTATGGCGACCAACGAACCCGAGCACGAGAACAGAGACGCAGAAGAA
TCCGGAGCTAACGAGGATGAGGACACCGGAGCTCAGGTCGCTCCGATCGTTAGGCTTGAG
GAAGTTGCCGTCACTACCGGCGAGGAAGACGAAGACGCAATCCTCGATCTGAAATCGAAG
CTGTATCGCTTCGACAAGGAAGCGAATCAGTGGAAGGAGAGAGGAGCTGGTACTGTGAAG
CTCTTGAAGCATAAGAGCACTGGCAAGATTCGTCTCGTTATGAGGCAATCCAAAACTCTC
AAGATCTGTGCCAATCATTTCGTTAAACAGGGCATGTCTGTTCAGGAACACGTTGGAAAC
GAGAAGTCGTGTGTGTGGCACGCTCGTGACTTTGCTGCTGGTGAGCTGAAGGATGAGCTT
TTCTGCATCCGATTTGCTTCAATTGAGAACTGCAAAGCATTTATGCAGAAGTTCAATGAA
GTTGCTGAATCTGAAGTAGAGAAAGAAGAGAGCAAAGACGCATCTGACACCGCTGGTCTT
CTTGAGAAGTTGACCGTTGAAGAGACAAAAACAGAGGAGAAACCTGTGGAGAAG*TGAAG
*CCGAAGTTGAAGCAGAGGAAA*GACAAAA*GCGAGCCAGAGAAAGCTGATGAAGAAA*G
AAA*CCGAAGAGGCTGTTGCTCCCTCAACTTAAGATGCATCAA

QA 5 767 5 767
DS 

RD RS1F769TF 773 0 0
GGAA
TCTCTCCCTCACTTTCTCGTACGCCGCACCAACTGTTGAATCCACGAAGAAACCTCACCT
CAGTCCCTAGATTCTATGGCGACCAACGAACCCGAGCACGAGAACAGAGACGCAGAAGAA
TCCGGAGCTAACGAGGATTAGGACACCGGAGCTCAGGTCGCTCCGATCGTTAGGCTTGAG
GAAGTTGCCGTCACTACCGGCGAGGAAGACGAAGACGCAATCCTCGATCTGAAATCGAAG
CTGTATCGCTTCGACAAGGAAGCGAATCAGTGGAAGGAGAGAGGAGCTGGTACTGTGAAG
CTCTTGAAGCATAAGAGCACTGGCAAGATTCGTCTCGTTATGAGGCAATCCAAAACTCTC
AAGATCTGTGCCAATCATTTCGTTAAACAGGGCATGTCTGTTCAGGAACACGTTGGAAAC
GAGAAGTCGTGTGTGTGGCACGCTCGTGACTTTGCTGATGGTGAGCTGAAGGATGAGCTT
TTCTGCATCCGATTTGCTTCAATTGAGAACTGCAAAGCATTTATGCAGAAGTTCAATGAA
GTTGCTGAATCTGAAGTAGAGAAAGAAGAGAGCAAAGACGCATCTGACACCGCTGGTCTT
CTTGAGAAGTTGACCGTTGAAGAGACAAAAACAGAGGAGAAACCTGTGGAGAAG*TGAAG
GCCGAAGTTGAAGCAGAGGAAAAGACAAAA*GCGAGCCAGAGAAAGCTGATGAAGAAAAG
AAA*CCGAAGAGGCTGTTGCTCCCTCAACTTAAGATGCATCAATGTTTA

QA 5 773 5 773
DS 

RD RS1CI59JQ 787 0 0
GGCAAGATTCGTCTCGTTATGAGGCAATCCAAAACTCTCAAGATCTGTGCCAATCATTTC
GTTAAACAGGGCATGTCTGTTCAGGAACACGTTGGAAACGAGAAGTCGTGTGTGTGGCAC
GCTCGTGACTTTGCTGGTGGTGAGCTGAAGGATGAGCTTTTCTGCATCCGATTTGCTTCA
ATTGAGAACTGCAAAGCATTTATGCAGAAGTTCAATGAAGTTGCTGAATCTGAAGTAGAG
AAAGAAGAGAGCAAAGACGCATCTGACACCGCTGGTCTTCTTGAGAAGTTGACCGTTGAA
GAGACAAAAACAGAGGAGAAACCTGTGGAGAAGGTGAAGGCCGAAGTTGAAGCAGAGGAA
AAGACAAAAAGCGAGCCAGAGAAAGCTGATGAAGAAAAGAAAACCGAAGAGGCTGTTGCT
CCCTCAACTTAAGATGCATCAATGTTTAAGCTCCTTTGGCGAGGTATTATTAGCCTTGTT
TTGATGCATCCATCTCGAGTCTACTAGTGTCTTGGCACTAACTATCTACATGTGTTGTCG
GATCATATCAAGTGGTTTGGGGTTGGGTTTTGCTGAGTCGTTTTGGGTTTTATAGTTTTG
AGTCTAAAGTGTGGGCGAGTGATATGAGAGATTACGGTTTGGTTATCAGTAAGAATACAT
TGAATTCATTGTTTTCAGCGTTTGTTATGGGTTGTTTTTGGATGGTCTTTATTTTGAGGA
CAGGGATGGTTGTTTGTTCATGGACATGTCAGAAGTCTTCATTTCTTTGAATTACAAAAT
TATACGC

QA 1 787 1 787
DS 

RD RS1F572JQ 707 0 0
ACGTTGGAAACGAGAAGTCGTGTGTGTGGCACGCTCGTGACTTTGCTGCTGGTGAGCTGA
AGGATGAGCTTTTCTGCATCCGATTTGCTTCAATTGAGAACTGCAAAGCATTTATGCAGA
AGTTCAATGAAGTTGCTGAATCTGAAGTAGAGAAAGAAGAGAGCAAAGACGCATCTGACA
CCGCTGGTCTTCTTGAGAAGTTGACCGTTGAAGAGACAAAAACAGAGGAGAAACCTGTGG
AGAAGGTGAAGGCCGAAGTTGAAGCAGAGGAAAAGACAAAAAGCGAGCCAGAGAAAGCTG
ATGAAGAAAAGAAAACCGAAGAGGCTGTTGCTCCCTCAACTTAAGATGCATCAATGTTTA
AGCTCCTTTGGCGAGGTATTATTAGCCTTGTTTTGATGCATCCATCTCGAGTTTACTAGT
GTCTTGGCACTAACTATCTACATGTGTTGTCGGATCATATCAAGTGGTTTGGGGTTGGGT
TTTGCTGAGTCGTTTTGGGTTTTATAGTTTTGAGTTTAAAGTGTGGGCGAGTGATATGAG
AGATTACGGTTTGGTTATCAGTAAGAATACATTGAATTCATTGTTTTCAGCGTTTGTTGT
GGGTTGTTTTTGGATGGTCTTTATTTTGAGGACAGGGATGATTGTTTGTTCGTGGACATG
TCAGAAGTTTTCATTTCTTTGAATTACAAAATTATACGCATTGTTGA

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1F769JQ 741 0 0
AAACAGGGCATGTCTGTTCAGGAACACGTTGGAAACGAGAAGTCGTGTGTGTGGCACGCT
CGTGACTTTGCTGATGGTGAGCTGAAGGATGAGCTTTTCTGCATCCGATTTGCTTCAATT
GAGAACTGCAAAGCATTTATGCAGAAGTTCAATGAAGTTGCTGAATCTGAAGTAGAGAAA
GAAGAGAGCAAAGACGCATCTGACACCGCTGGTCTTCTTGAGAAGTTGACCGTTGAAGAG
ACAAAAACAGAGGAGAAACCTGTGGAGAAGGTGAAGGCCGAAGTTGAAGCAGAGGAAAAG
ACAAAAAGCGAGCCAGAGAAAGCTGATGAAGAAAAGAAAACCGAAGAGGCTGTTGCTCCC
TCAACTTAAGATGCATCAATGTTTAAGCTCCTTTGGCGAGGTATTATTAGCCTTGTTTTG
ATGCATCCATCTCGAGTCTACTAGTGTCTTGGCACTAACTATCTACATGTGTTGTCGGAT
CATATCAAGTGGTTTGGGGTTGGGTTTTGCTGAGTCGTTTTGGGTTTTATAGTTTTGAGT
CTAAAGTGTGGGCGAGTGATATGAGAGATTACGGTTTGGTTATCAGTAAGAATACATTGA
ATTCATTGTTTTCAGCGTTTGTTATGGGTTGTTTTTGGATGGTCTTTATTTTGAGGACAG
GGATGGTTGTTTGTTCATGGACATGTCAGAAGTCTTCATTTCTTTGAATTACAAAATTAT
ACGCATTGTTGATTTTAATTT

QA 1 741 1 741
DS 



CO CL218Contig2 767 2 11 U
TATCATCAACAATGCGTATAATTTTGTAATTCAAAGAAATGAAGACTTCTGACTCATGTC
CATGAACAAACAACCATCTCTATCCTCAAAACAAAGACGATCCAGAAACAACCCATAACA
AACGCTGAAAACAATGAATTCAATGTACTCTTACTGATAAGCAAACCTTAATCTCTCAGA
TCACTCACCCACACTTTCGACTCAAAACTATAAAACCCAAAACGACTCAGCAAAACCCAA
CCCCAAACCACTTGATATGATCCGACAACACATGTAGATAGTTAGTGCCAAGACACTAGT
AGACTCGAGATGGATGCATCAAAACAAGGCTAATAATACCTCGCCAAAGGAGCTTAAACA
TTGATGCATCTCAAGTTGAGGGAGCAACAGCCTCTTCGGTTTTCTTTTCTTCATCAGCTT
TCTCTGGCTCGCTTTTTGTCTTTTCCTCTGCTTCAACTTCGGCCTTCACCTTCTCCACAG
GTTTCTCCACAGTTTTTGCCTCTTCCACGGTCAACTTCTCAAGAAGACCAGCGGTGTCAG
AGGCATCTTTGCTCTCTTCTTTCTCTACTTCAGATTCAGCAACTTCATTGAACTTCTGCA
TAAATGCTTTGCAGTTCTCAATTGAAGCAAATCGGATGCAGAAAAGCTCATCCTTTAGCT
CACCATCAGCAAAGCCACGAGCGTGCCACACACACGACTTCTCGTTTCCAACGTGTTCCT
GAACAGACATGCCCTCTTTAACGAGATGATTGGCACAGATCTTGAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GH25JQ U 35
AF RS1G770JQ U 1
BS 1 61 RS1G770JQ
BS 62 62 RS1GH25JQ
BS 63 147 RS1G770JQ
BS 148 148 RS1GH25JQ
BS 149 230 RS1G770JQ
BS 231 231 RS1GH25JQ
BS 232 498 RS1G770JQ
BS 499 499 RS1GH25JQ
BS 500 674 RS1G770JQ
BS 675 675 RS1GH25JQ
BS 676 767 RS1G770JQ

RD RS1GH25JQ 656 0 0
G
GAAATGAAGACTTCTGACTCATGTCCATGAACAAACAACCATCTCTATCCTCAAAACAAA
GACGATCCAGAAACAACCCATAACAAACGCTGAAAACAATGAATTCAATGTACTCTTACT
GATAAGCAAACCTTAATCTCTCAGATCACTCACCCACACTTTCGACTCAAAACTATAAAA
CCCAAAACGACTCAGCAAAACCCAACCCCAAACCACTTGATATGATCCGACAACACATGT
AGATAGTTAGTGCCAAGACACTAGTAGACTCGAGATGGATGCATCAAACCAAGGCTAATA
ATACCTCGCCAAAGGAGCTTAAACATTGATGCATCTTAAGTTGAGGGAGCAACAGCCTCT
TCGGTTTTCTTTTCTTCATCAGCTTTCTCTGGCTCGCTTTTTGTCTTTTCCTCTGCTTCA
ACTTCGGCCTTCACCTTCTCCACAGGTTTCTCCTCAGTTTTTGCCTCTTCCACGGTCAAC
TTCTCAAGAAGACCAGCGGTGTCAGAGGCATCTTTGCTCTCTTCTTTCTCTACTTCAGAT
TCAGCAACTTCATTGAACTTCTGCATAAATGCTTTGCAGTTCTCAATTGAAGCAAATCGG
ATGCAGAAAAGCTCATCCTTTAGCTCACCATCAGCAAAGCCACGAGCGTGCCACA

QA 2 656 2 656
DS 

RD RS1G770JQ 767 0 0
TATCATCAACAATGCGTATAATTTTGTAATTCAAAGAAATGAAGACTTCTGACTCATGTC
CGTGAACAAACAACCATCTCTATCCTCAAAACAAAGACGATCCAGAAACAACCCATAACA
AACGCTGAAAACAATGAATTCAATGTATTCTTACTGATAAGCAAACCTTAATCTCTCAGA
TCACTCACCCACACTTTCGACTCAAAACTATAAAACCCAAAACGACTCAGTAAAACCCAA
CCCCAAACCACTTGATATGATCCGACAACACATGTAGATAGTTAGTGCCAAGACACTAGT
AGACTCGAGATGGATGCATCAAAACAAGGCTAATAATACCTCGCCAAAGGAGCTTAAACA
TTGATGCATCTCAAGTTGAGGGAGCAACAGCCTCTTCGGTTTTCTTTTCTTCATCAGCTT
TCTCTGGCTCGCTTTTTGTCTTTTCCTCTGCTTCAACTTCGGCCTTCACCTTCTCCACAG
GTTTCTCCACAGTTTTTGTCTCTTCCACGGTCAACTTCTCAAGAAGACCAGCGGTGTCAG
AGGCATCTTTGCTCTCTTCTTTCTCTACTTCAGATTCAGCAACTTCATTGAACTTCTGCA
TAAATGCTTTGCAGTTCTCAATTGAAGCAAATCGGATGCAGAAAAGCTCATCCTTTAGCT
CACCATCAGCAAAGTCACGAGCGTGCCACACACACGACTTCTCGTTTCCAACGTGTTCCT
GAACAGACATGCCCTCTTTAACGAGATGATTGGCACAGATCTTGAGA

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 10

CO CL219Contig1 508 10 4 U
GGACAAGTCACAATTACAAAAACTAGATAAGTTCACAACATCAAATTACAAGCTTTTATT
CTGCAGAGAATGTCTAACAACAGTCAGAGCATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGC
CAGACCCAGGAGAAAGCAAGCAACCTGATGGACAAGGCCTCCAATGCTGCCCAATCTGCT
AAGGAATCTCTCCAAGAGGGTGGACAGCAGCTGAAGCAGAAGGCACAGGGTGCGACTGAG
GCCATCAAGGAAAAGACGGGCATGAACAAATGAGAAGCACGTTCCAAATAAAATTTTACG
TTTCCTTTTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTC
GAAGCCATTAGGCATCTTTTTGTTCTCTGAATTTATTCAATATCTATCGAAGGGTTGTTG
GCCCTTGTCTCTTGATCAATATGTAGCCGTGCACTTATTTATTTATGTAATAAAGTATTT
TGAAATACATAAAGGGAAATTGCACCGT


BQ
40 40 40 40 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
40 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 40 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 40 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
25 60 60 60 60 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1FP39JQ C 3
AF RS1FP39TF U 3
AF RS1C095TF U 1
AF RS1BE67TF U 1
AF RS1CL23TF U 1
AF RS1GU67TF U 3
AF RS1AM61TF U 1
AF RS1B302TF U 1
AF RS1CM94TF U 1
AF RS1G871TF U 1
BS 1 434 RS1AM61TF
BS 435 435 RS1BE67TF
BS 436 490 RS1AM61TF
BS 491 508 RS1CM94TF

RD RS1FP39JQ 423 0 0
GG
AAGTCACAATTACAAAAACTAGATAAGTTCACAACATCAAATTACAAGCTTTTATTTTGC
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TCAAGGAAAAGACGGGCATGAACAAATGAGAAGCACGTTCCAAATAAAATTTTACGTTTC
CTTTTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTCGAAG
CCATTAGGCATCTTTTTGTTCTTTGAATTTATTCAATATCTATCGAAGGGTTGTTGACCC
T

QA 3 423 3 423
DS 

RD RS1FP39TF 423 0 0
GG
AAGTCACAATTACAAAAACTAGATAAGTTCACAACATCAAATTACAAGCTTTTATTCTGC
AGAGAATGTCTAACAACAGTCAGAGCATGAGCTTCAGCGCTGGCCAAGCTAAAGGCCAGA
CCCAGGAGAAAGCAAGCAACCTGATGGACAAGGCCTCCAATGCTGCCCAATCTGCTAAGG
AATCTCTCCAAGAGGGTGGACAGCAGCTGAAGCAGAAGGCACAGGGTGCGACTGAGGCCA
TCAAGGAAAAGACGGGCATGAACAAATGAGAAGCACGTTCCAAATAAAATTTTACGTTTC
CTTTTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTCGAAG
CCATTAGGCATCTTTTTGTTCTCTGAATTTATTCAATATCTATCGAAGGGTTGTTGACCC
T

QA 3 423 3 423
DS 

RD RS1C095TF 434 0 0
GGACAAGTCACAATTACAAAAACTAGATAAGTTCACAACATCAAATTACAAGCTTTTATT
CTGCAGAGAATGTCTAACAACAGTCAGAGCATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGC
CAGACCCAGGAGAAAGCAAGCAACCTGATGGACAAGGCCTCCAATGCTGCCCAATCTGCT
AAGGAATCTCTCCAAGAGGGTGGACAGCAGCTGAAGCAGAAGGCACAGGGTGCGACTGAG
GCCATCAAGGAAAAGACGGGCATGAACAAATGAGAAGCACGTTCCAAATAAAATTTTACG
TTTCCTTTTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTC
GAAGCCATTAGGCATCTTTTTGTTCTCTGAATTTATTCAATATCTATCGAAGGGTTGTTG
GCCCTTGTCTCTTG

QA 1 434 1 434
DS 

RD RS1BE67TF 437 0 0
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GCCATCAAGGAAAAGACGGGCATGAACAAATGAGAAGCACGTTCCAAATAAAATTTTACG
TTTCCTTTTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTC
GAAGCCATTAGGCATCTTTTTGTTCTCTGAATTTATTCAATATCTATCGAAGGGTTGTTG
GCCCTTGTCTCTTGATC

QA 1 437 1 437
DS 

RD RS1CL23TF 437 0 0
GGACAAGTCACAATTACAAAAACTAGATAAGTTCACAACATCAAATTACAAGCTTTTATT
CTGCAGAGAATGTCTAACAACAGTCAGAGCATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGC
CAGACCCAGGAGAAAGCAAGCAACCTGATGGACAAGGCCTCCAATGCTGCCCAATCTGCT
AAGGAATCTCTCCAAGAGGGTGGACAGCAGCTGAAGCAGAAGGCACAGGGTGCGACTGAG
GCCATCAAGGAAAAGACGGGCATGAACAAATGAGAAGCACGTTCCAAATAAAATTTTACG
TTTCCTTTTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTC
GAAGCCATTAGGCATCTTTTTGTTCTCTGAATTTATTCAATATCTATCGAAGGGTTGTTG
GCCCTTGTCTCTTGATC

QA 1 437 1 437
DS 

RD RS1GU67TF 465 0 0
GG
AAGTCACAATTACAAAAACTAGATAAGTTCACAACATCAAATTACAAGCTTTTATTCTGC
AGAGAATGTCTAACAACAGTCAGAGCATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGCCAGA
CCCAGGAGAAAGCAAGCAACCTGATGGACAAGGCCTCCAATGCTGCCCAATCTGCTAAGG
AATCTCTCCGAGAGGGTGGACAGCAGCTGAAGCAGAAGGCACAGGGTGCGACTGAGGCCA
TCAAGGAAAAGACGGGCATGAACAAATGAGAAGCACGTTCCAAATAAAATTTTACGTTTC
CTTTTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTCGAAG
CCATTAGGCATCTTTTTGTTCTCTGAATTTATTCAATATCTATCGAAGGGTTGTTGGCCC
TTGTCTCTTGATCAATATGTAGCCGTGCACTTATTTATTTATG

QA 3 465 3 465
DS 

RD RS1AM61TF 490 0 0
GGACAAGTCACAATTACAAAAACTAGATAAGTTCACAACATCAAATTACAAGCTTTTATT
CTGCAGAGAATGTCTAACAACAGTCAGAGCATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGC
CAGACCCAGGAGAAAGCAAGCAACCTGATGGACAAGGCCTCCAATGCTGCCCAATCTGCT
AAGGAATCTCTCCAAGAGGGTGGACAGCAGCTGAAGCAGAAGGCACAGGGTGCGACTGAG
GCCATCAAGGAAAAGACGGGCATGAACAAATGAGAAGCACGTTCCAAATAAAATTTTACG
TTTCCTTTTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTC
GAAGCCATTAGGCATCTTTTTGTTCTCTGAATTTATTCAATATCTATCGAAGGGTTGTTG
GCCCTTGTCTCTTGGTCAATATGTAGCCGTGCACTTATTTATTTATGTAATAAAGTATTT
TGAAATACAT

QA 1 490 1 490
DS 

RD RS1B302TF 490 0 0
GGACAAGTCACAATTACAAAAACTAGATAAGTTCACAACATCAAATTACAAGCTTTTATT
CTGCAGAGAATGTCTAACAACAGTCAGAGCATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGC
CAGACCCAGGAGAAAGCAAGCAACCTGATGGACAAGGCCTCCAATGCTGCCCAATCTGCT
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GCCATCAAGGAAAAGACGGGCATGAACAAATGAGAAGCACGTTCCAAATAAAATTTTACG
TTTCCTTTTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTC
GAAGCCATTAGGCATCTTTTTGTTCTCTGAATTTATTCAATATCTATCGAAGGGTTGTTG
GCCCTTGTCTCTTGATCAATATGTAGCCGTGCACTTATTTATTTATGTAATAAAGTATTT
TGAAATACAT

QA 1 490 1 490
DS 

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CTGCAGAGAATGTCTAACAACAGTCAGAGCATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGC
CAGACCCAGGGGAAAGCAAGCAACCTGATGGACAAGGCCTCCAATGCTGCCCAATCTGCT
AAGGAATCTCTCCAAGAGGGTGGACAGCAGCTGAAGCAGAAGGCACAGGGTGCGACTGAG
GCCATCAAGGAAAAGACGGGCATGAACAAATGAGAAGCACGTTCCAAATAAAATTTTACG
TTTCCTTTTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTC
GAAGCCATTAGGCATCTTTTTGTTCTCTGAATTTATTCAATATCTATCGAAGGGTTGTTG
GCCCTTGTCTCTTGATCAATATGTAGCCGTGCACTTATTTATTTATGTAATAAAGTATTT
TGAAATACATAAAGGGAAATTGCACCGT

QA 1 508 1 508
DS 

RD RS1G871TF 507 0 0
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CTGCAGAGAATGTCTAACAACAGTCAGAGCATGAGCTTCAACGCTGGCCAAGCTAAAGGC
CAGACCCAGGAGAAAGCAAGCAACCTGATGGACAAGGCCTCCAATGCTGCCCAATCTGCT
AAGGAATCTCTCCAAGAGGGTGGACAGCAGCTGAAGCAGAAGGCACAGGGTGCGACTGAG
GCCATCAGGGAAAAGACGGGCATGAACAAATGAGAAGCACGTTCCAAATAAAATTTTACG
TTTCCTTTTACTACCAATAATAATAACTAGATAGATTTTGTCTGTCTAAATCCTAAGTTC
GAAGCCATTAGGCATCTTTTTGTTCTCTGAATTTATTCAATATCTATCGAAGGGTTGTTG
GCCCTTGTCTCTTGATCAATATGTAGCCGTGCACTTATTTATTTATGTAATAAAGTATTT
TGAAATACATAAAGGGAAATTGCACCG

QA 1 507 1 507
DS 



AS 1 6

CO CL220Contig1 1254 6 37 U
GGCTCCCAAGAGAGAGAGAAAGACAGATCTCTCTAGGAGGATCGATCTCAACACATCTGT
TGCCTTGGTCTGTGAGAAGCGGACAAACCAAAGAAAGAGAAAACACAACCGGAGCTGCTG
GTGTGTGACATATGGGTGGATTCAGAGAGTTCGGTGGTGATGAACATTATTCATCCTCAA
ACCTATTCCACTCGGTGACCGCCATAGTCATCTGGCTTGGCTCCGTTCACTTGAACGTCG
CTATTGTTCTCTCTTCCCTCATTTTCCCTCCTCCTTCTCTCTCTCTCCTCGTCTTCGGTC
TGCTTTTTCTCTTAATCTTCAGCCCCATCGATGATCGTAGCAAATACGGTCGTATGCTCG
CTAGGTACATATGTAAGCACGCATGTAGTTATTTCCCCGTTACTCTCCATGTCGAGGATT
ACGAATCTTTCCAGCCTACTCGTGCCTACGTTTTTGGTTATGAACCACATTCCGTGTGGC
CTATTGGAGCTGTTGCACTTGCTGATCTTACTGGTTTCATGCCTCTTCATAACATCAAAG
TTCTTGCTAGTTCCGCTGTTTTCTACACACCGTTTCTGAGGCAAATATGGACGTGGTTAG
GGCTCGCCCCTGCTTCTAGGAAGAATTTCTCTTCCTATTTGGAGTCTGGTTATAGTTGTA
TCCTCGTACCTGGTGGTGTGCAAGAGACATTCCACATGAAACATGATGTTGAGAACGTCT
TCCTTTCGTCGAGAAGAGGATTTGTGCGCATAGCCATGGAACATGGGACACCTCTGGTTC
CTGTTTTCTGCTTTGGTCAGTCAAGAGTGTACAAGTGGTGGAAGCCGGATTGGAACCTCT
ACCTTAAACTATCAAGAGCCATCAAGTTTACTCCCATCTGTTTCTGGGGTGTTTTTGGAT
CCCCAATCCCATTTCAACACCCTCTGCATGTGGTGGTTGGGAAACCAATAGAAGTTAGAA
AAACTCTGCAGCCTACTGATGAAGAGATTGCTAAGGTGCAAGGACAGTTTGTGGAAGCGC
TTAAGGATCTGTTTGAGAGGCACAAGGCCAGAGCAGGCTTCCCTGATCTGCAGTTGAACA
TTCTTTGAAATCAACAAGTTGTCAAAAATGGTTTTATAGTTTTATCCTCAAATCTTCTGT
TAACTTTGGCACTGGCTTTGGATTTACCTTATGTATGTATGTCTTGTCTTATACGTCTCT
GTATCAACTTTGGATTATAAAGACCCATCGACTCTGAAATATAATTGGTAGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 15 40 40 15 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 25 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 15 40 40 40 40 
25 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1GX01TF U 1
AF RS1EW59TF U 44
AF RS1H271TF U 412
AF RS1FS03TF U 412
AF RS1FS03JQ C 485
AF RS1H271JQB C 535
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BS 217 267 RS1GX01TF
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RD RS1GX01TF 796 0 0
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TGCCTTGGTCTGTGAGAAGCGGACAAACCAAAGAAAGAGAAAACACAACCGGAGCTGCTG
GTGTGTGACATATGGGTGGATTCAGAGAGTTCGGTGGTGATGAACATTATTCATCCTCAA
ACCTATTCCACTCGGTGACCGCCATAGTCATCTGGTTTGGCTCCGTTCACTTGAACGTCG
CTATTGTTCTCTCTTCCCTCATTTTCCTTCCTCCTTCTCTCTCTCTCCTCGTCTTCGGTC
TGCTTTTTCTCTTAATCTTCAGCCCCATCGATGATCGTAGCAAATACGGTCGTATGCTCG
CTAGGTACATATGTAAGCACGCATGTAGTTATTTCCCCGTTACTCTCCATGTCGAGGATT
ACGAATCTTTCCAGCCTACTCGTGCCTACGTTTTTGGTTATGAACCACATTCGGTGTGGC
CTATTGGAGCCGTTGCACTTGCTGATCTTACTGGTTTCATGCCTCTTCATAACATCAAAG
TTCTTGCTAGTTCCGCTGTTTTTTACACACCGTTTCTGAGGCAAATATGGACGTGGTTAG
GGCTTGCTCCTGCGTCTAGGAAGAATTTCTCTTCCTATTTGGAGTCTGGTTATAGTTGTA
TCCTCGTACCTGGTGGTGTGCAGGAGACATTTCACATGAAACATGATGTTGAGAACGTCT
TCCTTTCATCGAGA*GAGGATTTGTGCGCATAGCCATGGAACATGGGACACCTCTCGTTC
*AGTTTTCTGCTTTGG

QA 1 796 1 796
DS 

RD RS1EW59TF 776 0 0
GG
TCTCAACACATCTGTTGCCTTGGTCTGTGAGAAGCGGACAAACCAAAGAAAGAGAAAACA
CAACCGGAGCTGCTGGTGTGTGACATATGGGTGGATTCAGAGAGTTCGGTGGTGATGAAC
ATTATTCATCCTCAAACCTATTCCACTCGGTGACCGCCATAGTCATCTGGCTTGGCTCCG
TTCACTTGAACGTCGCTATTGTTCTCTCTTCCCTCATTTTCCCTCCTCCTTCTCTCTCTC
**CTCGTCTTCGGTCTGCTTTTTCTCTTAATCTTCAGCCCCATCGATGATCGTAGCAAAT
ACGGTCGTATGCTCGCTAGGTACATATGTAAGCACGCATGTAGTTATTTCCCCGTTACTC
TCCATGTCGAGGATTACGAATCTTTCCAGCCTACTCGTGCCTACGTTTTTGGTTATGAAC
CACATTCGGTGTGGCCTATTGGAGCTGTTGCACTTGCTGATCTTACTGGTTTCATGCCTC
TTCATAACATCAAAGTTCTTGCTAGTTCCGCTGTTTTTTACACACCGTTTCTGAGGCAAA
TATGGACGTGGTTAGGGCTTGCTCCTGCGTCTAGGAAGAATTTCTCTTCCTATTTGGAGT
CTGGTTATAGTTGTATCCTCGTACCTGGTGGTGTGCAG*AGACATTTCACATGAAACATG
ATGTTGAGAACGTCTTCCTTTCATCGAGAAGAGGATT*GTGCGCATAGCCATGGAACATG
GGACAC*TCTCGTTCCAGTTTTCTGCTTTGGTCAGTCAAG
GGTACAAGTGGTGG

QA 3 762 3 762
DS 

RD RS1H271TF 552 0 0
GGTCGAGGATTA
AATCTTTCCAGCCTACTCGTGCCTATGTTTTTGGTTATGAACCACATTCCGTGTGGCCTA
TTGGAGCTGTTGCACTTGCTGATCTTACTGGTTTCATGCCTCTTCATAACATCAAAGTTC
TTGCTAGTTCCGCTGTTTTCTACACACCGTTTCTGAGGCAAATATGGACGTGGTTAGGGC
TCGCCCCTGCTTCTAGGAAGAATTTCTCTTCCTATTTGGAGTCTGGTTATAGTTGTATCC
TCGTACCTGGTGGTGTGCAAGAGACATTCCACATGAAACATGATGTTGAGAACGTCTTCC
TTTCGTCGAGAAGAGGATTTGTGCGCATAGCCATGGAACATGGGACACCTCTGGTTCCTG
TTTTCTGCTTTGGTCAGTCAAGAGTGTACAAGTGGTGGAAGCCGGATTGGAACCTCTACC
TTAAACTATCAAGAGCCATCAAGTTTACTCCCATCTGTTTCTGGGGTGTTTTTGGATCCC
CAATCCCATTTCAACACCCTCTGCATGTGGTGGTTGGGAAACCAATAGAAGTTAGAAAAA

QA 13 552 13 552
DS 

RD RS1FS03TF 778 0 0
GGTCGAGGATTA
AATCTTTCCAGCCTACTCGTGCCTATGTTTTTGGTTATGAACCACATTCCGTGTGGCCTA
TTGGAGCTGTTGCACTTGCTGATCTTACTGGTTTCATGCCTCTTCATAACATCAAAGTTC
TTGCTAGTTCCGCTGTTTTCTACACACCGTTTCTGAGGCAAATATGGACGTGGTTAGGGC
TCGCCCCTGCTTCTAGGAAGAATTTCTCTTCCTATTTGGAGTCTGGTTATAGTTGTATCC
TCGTACCTGGTGGTGTGCAAGAGACATTCCACATGAAACATGATGTTGAGAACGTCTTCC
TTTCGTCGAGAAGAGGATTTGTGCGCATAGCCATGGAACATGGGACACCTCTGGTTCCTG
TTTTCTGCTTTGGTCAGTCAAGAGTGTACAAGTGGTGGAAGCCGGATTGGAACCTCTACC
TTAAACTATCAAGAGCCATCAAGTTTACTCCCATCTGTTTCTGGGGTGTTTTTGGATCCC
CAATCCCATTTCAACACCCTCTGCATGTGGTGGTTGGGAAACCAATAGAAGTTAGAAAAA
CTCTGCAGCCTACTGATGAAGAGATTGCTAAGGTGCAAGGACAGTTTGTGGAAGCGCTTA
AGGATCTGTTTGAGAGGCACAAGGCCAGAGCACGCTTCCCTGATCTGCAGTTGAACATTC
TTTGAAATCAACAAGTTGTCAAAA*TGGTTTTATAGTTTTATCCTCAAATCTTCTGTTAA
CTTTGGCACTGGCTTTGGATTTACCTTATGTATGTATGTCT
GTCTT

QA 13 773 13 773
DS 

RD RS1FS03JQ 770 0 0
TGGAGCTGTTGCACTTGCTGATCTTACTGGTTTCATGCCTCTTCATAACATCAAAGTTCT
TGCTAGTTCCGCTGTTTTCTACACACCGTTTCTGAGGCAAATATGGACGTGGTTAGGGCT
CGCCCCTGCTTCTAGGAAGAATTTCTCTTCCTATTTGGAGTCTGGTTATAGTTGTATCCT
CGTACCTGGTGGTGTGCAAGAGACATTCCACATGAAACATGATGTTGAGAACGTCTTCCT
TTCGTCGAGAAGAGGATTTGTGCGCATAGCCATGGAACATGGGACACCTCTGGTTCCTGT
TTTCTGCTTTGGTCAGTCAAGAGTGTACAAGTGGTGGAAGCCGGATTGGAACCTCTACCT
TAAACTATCAAGAGCCATCAAGTTTACTCCCATCTGTTTCTGGGGTGTTTTTGGATCCCC
AATCCCATTTCAACACCCTCTGCATGTGGTGGTTGGGAAACCAATAGAAGTTAGAAAAAC
TCTGCAGCCTACTGATGAAGAGATTGCTAAGGTGCAAGGACAGTTTGTGGAAGCGCTTAA
GGATCTGTTTGAGAGGCACAAGGCCAGAGCAGGCTTCCCTGATCTGCAGTTGAACATTCT
TTGAAATCAACAAGTTGTCAAAAATGGTTTTATAGTTTTATCCTCAAATCTTCTGTTAAC
TTTGGCACTGGCTTTGGATTTACCTTATGTATGTATGTCTTGTCTTATACGTCTCTGTAT
CAACTTTGGATTATAAAGACCCATCGACTCTGAAATATAATTGGTAGAGC

QA 1 770 1 770
DS 

RD RS1H271JQB 720 0 0
TCAAAGTTCTTGCTAGTTCCGCTGTTTTCTACACACCGTTTCTGAGGCAAATATGGACGT
GGTTAGGGCTCGCCCCTGCTTCTAGGAAGAATTTCTCTTCCTATTTGGAGTCTGGTTATA
GTTGTATCCTCGTACCTGGTGGTGTGCAAGAGACATTCCACATGAAACATGATGTTGAGA
ACGTCTTCCTTTCGTCGAGAAGAGGATTTGTGCGCATAGCCATGGAACATGGGACACCTC
TGGTTCCTGTTTTCTGCTTTGGTCAGTCAAGAGTGTACAAGTGGTGGAAGCCGGATTGGA
ACCTCTACCTTAAACTATCAAGAGCCATCAAGTTTACTCCCATCTGTTTCTGGGGTGTTT
TTGGATCCCCAATCCCATTTCAACACCCTCTGCATGTGGTGGTTGGGAAACCAATAGAAG
TTAGAAAAACTCTGCAGCCTACTGATGAAGAGATTGCTAAGGTGCAAGGACAGTTTGTGG
AAGCGCTTAAGGATCTGTTTGAGAGGCACAAGGCCAGAGCAGGCTTCCCTGATCTGCAGT
TGAACATTCTTTGAAATCAACAAGTTGTCAAAAATGGTTTTATAGTTTTATCCTCAAATC
TTCTGTTAACTTTGGCACTGGCTTTGGATTTACCTTATGTATGTATGTCTTGTCTTATAC
GTCTCTGTATCAACTTTGGATTATAAAGACCCATCGACTCTGAAATATAATTGGTAG
AGC

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 7

CO CL221Contig1 828 7 4 U
CATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATCAGTCGACGGTACCGGACATATGCC
CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGCCGACTCAAAGACAAATCATTTCGCATTTTGC
AATCAATTCCTTCACAAACTTTCTCGCGAGTTTCAAGAAGCTAATCGCTGAAATCATCCA
TGGCGCTCACCGACTTCCTCCCTAACGAGTACGGATACGTGGCTCTTGTCCTCGTCTTCT
ACTGCTTCCTCAACCTCTGGATGGGAGCTCAAGTCGGCATGGCCCGCAAAAGGTACAATG
TGCCGTATCCAACTCTATACGCCATAGAATCAGAAAACAAAGATGCTAAACGCTTCAACT
GCGTTCAGAGAGGTCATCAAAACTCTCTGGAGATGATGCCAATGTACTTCATACTGATGA
TCCTTGGTGGAATGAAACACCCTTGTGTCTGCGCTGGTTTGGGTTTGCTCTACAATATCA
CTCGTTTCTTCTACTTCAAAGGCTACTCTACTGGAGATCCCATGAAACGCCTTACCATCG
GGAAATACGGTTTCTTGGGATTGCTTGGTCTCATGATCTGCACCATCTCATTTGGAGTAA
GTCTGATCCGTGGAGGTTAAGCCAGTTTTTTTGTGAGGTTGATGGTTCTTTGTGTTTGTT
CATGAACTTTTGATCCAGTCCTTGTAAGTTGTCTACAGACTTGTGTAATAAGTTGTCTAC
AGACTTGTGTAATAATCATGTTATGTAGAACAATAAAAGTTCACATCCCTAAGCAAATAT
TGCAAGCCTTACCTCCTCTTTGATGGGGTGGGCATTTCGGTTTAAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G842TF U 115
AF RS1GG08TF U 69
AF RS1GG08JQ C 232
AF RS1A027TF U 1
AF RS1A027TV U 37
AF RS1CJ42JQ C 80
AF RS1CJ42TF U 80
BS 1 709 RS1A027TF
BS 710 710 RS1GG08TF
BS 711 815 RS1A027TF
BS 816 828 RS1CJ42JQ

RD RS1G842TF 559 0 0
TTTTTCAATCAATTCCTTCACAAACTTTCTTGCCAGTTTCAAGAAGCTAATCGCTGAAAT
CATCCATGGCGCTCACCGACTTCCTGCCTAACGAGTACGGATACGTGGCTCTCGTCCTCG
TCTTCTACTGCTTCCTCAACCTCTGGATGGGAGCTCAAGTCGGCATGGCTCGCAAAAGGT
ACAATGTGCCGTATCCAACTCTATACGCCATAGAATCAGAAAACAAAGATGCTAAACGCT
TCAACTGCGTTCAGAGAGGTCATCAAAACTCTCTGGAGATGATGCCAATGTACTTCATAC
TGATGATCCTTGGTGGAATGAAACACCCTTGTGTCTGCGCTGGTTTGGGTTTGCTCTACA
ATATCACTCGATTCTTCTACTTCAAAGGCTACTCTACTGGAGATCCAATGAAACGCCTCA
CCATCGGGAAATACGGTTTCTTGGGATTGCTTGGTCTCATGATCTGCACCATCTCGTTTG
GAGTTAGTCTGATCCGTGGAGGTTAAGCCAGTTTTTTTGTGAGGTTGATGGTTTTCTGTG
TT*GTTCATGAACTTTTGA

QA 1 559 1 559
DS 

RD RS1GG08TF 697 0 0
GGAAATCAGAAATACATCT
GCCGACTCAAAGACAAATCATTTCGCATTTTGCAATCAATTCCTTCACAAACTTTCTCGC
GAGTTTCAAGAAGCTAATCGCTGAAATCATCCATGGCGCTCACCGACTTCCTCCCTAACG
AGTACGGATACGTGGCTCTTGTCCTCGTCTTCTACTGCTTCCTCAACCTCTGGATGGGAG
CTCAAGTCGGCATGGCCCGCAAAAGGTACAATGTGCCGTATCCAACTCTATACGCCATAG
AATCAGAAAACAAAGATGCTAAACGCTTCAACTGCGTTCAGAGAGGTCATCAAAACTCTC
TGGAGATGATGCCAATGTACTTCATACTGATGATCCTTGGTGGAATGAAACACCCTTGTG
TCTGCGCTGGTTTGGGTTTGCTCTACAATATCACTCGTTTCTTCTACTTCAAAGGCTACT
CTACTGGAGATCCCATGAAACGCCTTACCATCGGGAAATACGGTTTCTTGGGATTGCTTG
GTCTCATGATCTGCACCATCTCATTTGGAGTAAGTCTGATCCGTGGAGGTTAAGCAAGTT
TTTTTGTGAGGTTGATGGTTCTTTGTGTTTGTTCATGAACTTTTGATCCAGTCCTTGTAA
GTTGTCTACAGACTTGTGTAATAAGTTGTCTACAGACTTGTGTAATAATCATGTTATGTA
GA
CATAAAGTTCACATCC

QA 20 681 20 681
DS 

RD RS1GG08JQ 543 0 0
TCGTCTTCTACTGCTTCCTCAACCTCTGGATGGGAGCTCAAGTCGGCATGGCCCGCAAAA
GGTACAATGTGCCGTATCCAACTCTATACGCCATAGAATCAGAAAACAAAGATGCTAAAC
GCTTCAACTGCGTTCAGAGAGGTCATCAAAACTCTCTGGAGATGATGCCAATGTACTTCA
TACTGATGATCCTTGGTGGAATGAAACACCCTTGTGTCTGCGCTGGTTTGGGTTTGCTCT
ACAATATCACTCGTTTCTTCTACTTCAAAGGCTACTCTACTGGAGATCCCATGAAACGCC
TTACCATCGGGAAATACGGTTTCTTGGGATTGCTTGGTCTCATGATCTGCACCATCTCAT
TTGGAGTAAGTCTGATCCGTGGAGGTTAAGCAAGTTTTTTTGTGAGGTTGATGGTTCTTT
GTGTTTGTTCATGAACTTTTGATCCAGTCCTTGTAAGTTGTCTACAGACTTGTGTAATAA
GTTGTCTACAGACTTGTGTAATAATCATGTTATGTAGAACAATAAAAGTTCACATCCCTA
AGC

QA 1 543 1 543
DS 

RD RS1A027TF 815 0 0
CATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATCAGTCGACGGTACCGGACATATGCC
CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGCCGACTCAAAGACAAATCATTTCGCATTTTGC
AATCAATTCCTTCACAAACTTTCTCGCGAGTTTCAAGAAGCTAATCGCTGAAATCATCCA
TGGCGCTCACCGACTTCCTCCCTAACGAGTACGGATACGTGGCTCTTGTCCTCGTCTTCT
ACTGCTTCCTCAACCTCTGGATGGGAGCTCAAGTCGGCATGGCCCGCAAAAGGTACAATG
TGCCGTATCCAACTCTATACGCCATAGAATCAGAAAACAAAGATGCTAAACGCTTCAACT
GCGTTCAGAGAGGTCATCAAAACTCTCTGGAGATGATGCCAATGTACTTCATACTGATGA
TCCTTGGTGGAATGAAACACCCTTGTGTCTGCGCTGGTTTGGGTTTGCTCTACAATATCA
CTCGTTTCTTCTACTTCAAAGGCTACTCTACTGGAGATCCCATGAAACGCCTTACCATCG
GGAAATACGGTTTCTTGGGATTGCTTGGTCTCATGATCTGCACCATCTCATTTGGAGTAA
GTCTGATCCGTGGAGGTTAAGCCAGTTTTTTTGTGAGGTTGATGGTTCTTTGTGTTTGTT
CATGAACTTTTGATCCAGTCCTTGTAAGTTGTCTACAGACTTGTGTAATGAGTTGTCTAC
AGACTTGTGTAATAATCATGTTATGTAGAACAATAAAAGTTCACATCCCTAAGCAAATAT
TGCAAGCCTTACCTCCTCTTTGATGGGGTGGGCAT

QA 1 815 1 815
DS 

RD RS1A027TV 779 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGCCGACTCA
AAGACAAATCATTTCGCATTTTGCAATCAATTCCTTCACAAACTTTCTCGCGAGTTTCAA
GAAGCTAATCGCTGAAATCATCCATGGCGCTCACCGACTTCCTCCCTAACGAGTACGGAT
ACGTGGCTCTTGTCCTCGTCTTCTACTGCTTCCTCAACCTCTGGATGGGAGCTCAAGTCG
GCATGGCCCGCAAAAGGTACAATGTGCCGTATCCAACTCTATACGCCATAGAATCAGAAA
ACAAAGATGCTAAACGCTTCAACTGCGTTCAGAGAGGTCATCAAAACTCTCTGGAGATGA
TGCCAATGTACTTCATACTGATGATCCTTGGTGGAATGAAACACCCTTGTGTCTGCGCTG
GTTTGGGTTTGCTCTACAATATCACTCGTTTCTTCTACTTCAAAGGCTACTCTACTGGAG
ATCCCATGAAACGCCTTACCATCGGGAAATACGGTTTCTTGGGATTGCTTGGTCTCATGA
TCTGCACCATCTCATTTGGAGTAAGTCTGATCCGTGGAGGTTAAGCCAGTTTTTTTGTGA
GGTTGATGGTTCTTTGTGTTTGTTCATGAACTTTTGATCCAGTCCTTGTAAGTTGTCTAC
AGACTTGTGTAATGAGTTGTCTACAGACTTGTGTAATAATCATGTTATGTAGAACAATAA
AAGTTCACATCCCTAAGCAAATATTGCAAGCCTTACCTCCTCTTTGATGGGGTGGGCAT

QA 1 779 1 779
DS 

RD RS1CJ42JQ 749 0 0
GGACATCT
GCCGACTCAAAGACAAATTATTTCGCATTTTGCAATCAATTCCTTCACAAACTTTCTCGC
GAGTTTCAAGAAGCTAATCGCTGAAATCATCCATGGCGCTCACCGACTTCCTCCCTAACG
AGTACGGATACGTGGCTCTTGTCCTCGTCTTCTACTGCTTCCTCAACCTCTGGATGGGAG
CTCAAGTCGGCATGGCCCGCAAAAGGTACAATGTGCCGTATCCAACTCTATACGCCATAG
AATCAGAAAACAAAGATGCTAAACGCTTCAACTGCGTTCAGAGAGGTCATCAAAACTCTC
TGGAGATGATGCCAATGTACTTCATACTGATGATCCTTGGTGGAATGAAACACCCTTGTG
TTTGCGCTGGTTTGGGTTTGCTCTACAATATCACTCGTTTCTTCTACTTCAAAGGCTACT
CTACTGGAGATCCCATGAAACGCCTTACCATCGGGAAATACGGTTTCTTGGGATTGCTTG
GTCTCATGATCTGCACCATCTCATTTGGAGTAAGTCTGATCCGTGGAGGTTAAGCCAGTT
TTTTTGTGAGGTTGATGGTTCTTTGTGTTTGTTCATGAACTTTTGATCCAGTCCTTGTAA
GTTGTCTACAGACTTGTGTAATAAGTTGTCTACAGACTTGTGTAATAATCATGTTATGTA
GAACAATAAAAGTTCACATCCCTAAGCAAATATTGCAAGCCTTACCTCCTCTTTGATGGG
GTGGGCATTTCGGTTTAAAGA

QA 9 749 9 749
DS 

RD RS1CJ42TF 736 0 0
GGACATCT
GCCGACTCAAAGACAAATTATTTCGCATTTTGCAATCAATTCCTTCACAAACTTTCTCGC
GAGTTTCAAGAAGCTAATCGCTGAAATCATCCATGGCGCTCACCGACTTCCTCCCTAACG
AGTACGGATACGTGGCTCTTGTCCTCGTCTTCTACTGCTTCCTCAACCTCTGGATGGGAG
CTCAAGTCGGCATGGCCCGCAAAAGGTACAATGTGCCGTATCCAACTCTATACGCCATAG
AATCAGAAAACAAAGATGCTAAACGCTTCAACTGCGTTCAGAGAGGTCATCAAAACTCTC
TGGAGATGATGCCAATGTACTTCATACTGATGATCCTTGGTGGAATGAAACACCCTTGTG
TCTGCGCTGGTTTGGGTTTGCTCTACAATATCACTCGTTTCTTCTACTTCAAAGGCTACT
CTACTGGAGATCCCATGAAACGCCTTACCATCGGGAAATACGGTTTCTTGGGATTGCTTG
GTCTCATGATCTGCACCATCTCATTTGGAGTAAGTCTGATCCGTGGAGGTTAAGCCAGTT
TTTTTGTGAGGTTGATGGTTCTTTGTGTTTGTTCATGAACTTTTGATCCAGTCCTTGTAA
GTTGTCTACAGACTTGTGTAATAAGTTGTCTACAGACTTGTGTAATAATCATGTTATGTA
GAACAATAAAAGTTCACATCCCTAAGCAA*TATTGCAAGCCTTACCTCCTCTTTGATGGG
GTGGGCAT

QA 9 736 9 736
DS 



AS 1 11

CO CL222Contig1 1424 11 13 U
GGATGAACTTGTAAACCTTACTCTTGAAGACTCCTCTTTTACACATTTCTCTACGTGAAT
AAGAATCTGAAGAGCCATTTCTCAAGGATGGTGAGGCTGAAGCAAGTATGGTCAAGTCTC
CTGGTCTTAGCCGTAGTTGTGCTCGGGGCTGGATCTGTGCCCATCACATATCTTGAATCT
GCTGTGGCTAAAGGAGCTGTGTGCTTGGACGGTAGTGCGCCAGCGTACCATTTCGATAAA
GGATCTGGCTCAGGAGCAAACAACTGGATCGTTCATATGGAGGGAGGAGGATGGTGCACG
GATATAGCTACATGCGTAAAACGTAAAACTACGATGAAGGGTTCGTCTAAGTTTATGAAC
AAAGACTTTGGTTTCTCTGGTATCTTGGGGGGCAAGCAAAGCACCAATCCAGACTTCTAT
AACTGGAATAGAATCAAAGTTCGATATTGTGATGGTTCATCTTTCACCGGTGATATAGAA
GCCGTTGATCCGACAAACAAGCTCTTCTTCCGCGGTGCTAGGGTTTGGCGTGCGGTGATC
GATGATCTTATGGCCAAGGGAATGAGCAACGCTCAAAACGCGATACTCTCTGGTTGTTCA
GCCGGAGCATTGGCTTCTATTCTACATTGCGACCAGTTCAAGTCCATTCTCCCTAAAACA
GCTAAGGTCAAGTGTGTTTCCGACGCCGGTTTCTTCATCCACGGTAAGGATATCAGTGGA
GGATCTTACATAGAATCATACTACAGCAAAGTTGTAGCGACCCACGGATCTGCAAAGAGT
CTTCCTGCTTCATGTACCTCAAGTATGAAGCCAGAACTGTGTTTCTTCCCGCAATACGTT
GTAAAGACCATGCAAACACCACTTTTCGTAATCAATGCCGCCTTCGATTCTTGGCAGATC
AAGAATGTTTTGGCTCCAACCTCTGTTGATAAACGCAAAGAGTGGAAGGATTGTAAGCTT
GATCTTAAGAAGTGTACAGCCGCTCAGCTTCAAACCGTTCAAGGGTATAGAGACCAAATG
CTGGCTGCGTTGGCACCTGTTCAAGCAACGACGACTAGCGGATTATTCCTAGATTCATGC
CACGCTCATTGCCAAGGTGGAAGTGCAGCCACTTGGTCCGGTGCTCAAGGCCCACAAGTC
GGCAATACGAAAATGGCAAAAGCAGTTGGAGACTGGTTTTATGAGCGGAGTACATTTCAG
AACATAGATTGCCCATCCTTGAATTGCAACCCTACTTGTCCTGCAGTATCTACTGAAGAA
TAAAATGTATTGATGTTTTAAAATTCCAAAAAAAAA*TATTTCTTTGAATATGTTGTTTA
AATTTTTAATATGATGCATAACTGATGCAATTATTTTAAAAACATGAATAATAAATAATC
ATTTCCACTTTATCACCTTTCTAATCATGTATTACCGATTTTAT


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 35 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1GY70TF U 3
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GG
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ATCTGAAGAGCCATTTCTCAAGGGTGGTGAGGCTGAAGCAAGTATGGTCAAGTCTCCTGG
TCTT

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DS 

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G
GAACTTGTAAACCTTACTCTTGAAGACTCCTCTTTTACACATTTCCCTACGTGAATAAGA
ATCTGAAGAGCCATTTTTCAAGGATGGTGAGGCTGAAGCAAGTATGGTCAAGTCTCCTGG
TCTTAGCCGTAGTTGTGCTCGGGGCTGGATCTGTTCCCATCACATATCTTGAATCTGCTG
TGGCTAAAGGAGCTGTGTGCTTGGACGGTAGTGCGCCAGCGTACCATTTCGATAAAGGAT
CTGGCTCAGGAGCAAACAACTGGATCGTTCATATGGAGGGAGGAGGATGGTGCACGGATA
TAGCTACATGCGTAAAACGTAAAACTACGATGAAGGGTTTGTCTAAGTTTATGAACAAAG
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TTGATCCGACAAACAAGCTCTTCTTCCGCGGTGCTAGGGTTTGGCGTGCG*TGATCGATG
ATCTTATGGCCAAGGGGATTAGCAACGCTCAAAACGCGATACTCTCTGGTTGTTCAGCCG
GAGCATTGGCTTCTATTCTACATTGCGACCAGTTCAAGTCCATTCTCCCTAAAACA

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DS 

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CTGGTCTTAGCCGTAGTTGTGCTCGGGGCTGGATCTGTGCCCATCACATATCTTGAATCT
GCTGTGGCTAAAGGAGCTGTGTGCTTGGACGGTAGTGCGCCAGCGTACCATTTCGATAAA
GGATCTGGCTCAGGAGCAAACAACTGGATCGTTCATATGGAGGGAGGAGGATGGTGCACG
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GATGATCTTATGGCCAAGGGAATGAGCAACGCTCAAAACGCGATACTCTCTGGTTGTTCA
GCCGGAGCATTGGCTTCTATTCTACATTGCGACCAGTTCAAGTCCATTCTCCCTAAAACA
GCTAAG*TCAAGTGTGTTTCCGACGCCG*TTTCTTCATC

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GGAT
GAACTTGTAAACCTTACTCTTGAAGACTCCTTTTTTACACATTTCTCTACGTGAATAAGA
ATCTGAAGAGCCATTTCTCAAGGATGGTGAGGCTGAAGCAAGTATGGTCAAGTCTCCTGG
TCTTAGCCGTAGTTGTGCTCGGGGCTGGATCTGTGCCCATCACATATCTTGAATCTGCTG
TGGCTAAAGGAGCTGTGTGCTTGGACGGTAGTGCGCCAGCGTACCATTTCGATAAAGGAT
CTGGCTCAGGAGCAAACAACTGGATCGTTCATATGGAGGGAGGAGGATGGTGCACGGATA
TAGCTACATGCGTAAAACGTAAAACTACGATGAAGGGTTCGTCTAAGTTTATGAACAAAG
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GGAATAGAATCAAAGTTCGATATTGTGATGGTTCATCTTTCACCGGTGATATAGAAGCCG
TTGATCCGACAAACAAGCTCTTCTTCCGCGGTGCTAGGGTTTGGCGTGCGGTGATCGATG
ATCTTATGGCCAAGGGAATGAGCAACGCTCAAAACGCGATACTCTCTGGTTGTTCAGCCG
GAGCATTGGCTTCTATTCTACATTGCGACCAGTTCAAGTCCATTCTCCCTAAAACAGCTA
AG*TCAAGTGTGTTTCCG

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DS 

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G
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TCCGACGCCGGTTTCTTCATCCACGGTAAGGATATCAGTGGAGGATCTTACATAGAATCA
TACTACAGCAAAGTTGTAGCGACCCACGGATCTGCAAAGAGTCTTCCTGCTTCATGTACC
TCAAGTATGAAGCCAGAACTGTGTTTCTTCCCGCAATACGTTGTAAAGACCATGCAAACA
CCACTTTTCGTAATCAATGCCGCCTTCGATTCTTGGCAGATCAAGAATGTTTTGGCTCCA
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GCCGCTCAGCTTCAAACCGTTCAAGGGTATAGAGACCAAATGCTGGCTGCGTTGGCACCT
GTTCAAGCAACGACGACTAGCGGATTATTCCTAGATTCATGCCACGCCCATTGCCAAGGT
GGAAGTGCAGCCACTTGGTCCGGTGCTCAAGGCCCA

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DS 

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GAGTCTTCCTGCTTCATGTACCTCAAGTATGAAGCCAGAACTGTGTTTCTTCCCGCAATA
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GATCAAGAATGTTTTGGCTCCAACCTCTGTTGATAAACGCAAAGAGTGGAAGGATTGTAA
GCTTGATCTTAAGAAGTGTACAGCCGCTCAGCTTCAAACCGTTCAAGGGTATAGAGACCA
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ATGCCACGCTCATTGCCAAGGTGGAAGTGCAGCCACTTGGTCCGGTGCTCAAGGCCCACA
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AATCATTTCCA
T

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DS 

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TTCTTTGAATATGTTGTTTAAATTTTTAATATGATGCATAACTGATGCAATTATTTTAAA
AACATGAATAATAAATAATCATTTCC

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AGAGACCAAATGCTGGCTGCGTTGGCACCTGTTCAAGCAACGACGACTAGCGGATTATTC
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AGTACATTTCAGAACATAGATTGCCCATCCTTGAATTGCAACCCTACTTGTCCTGCAGTA
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ATATGTTGTTTAAATTTTTAATATGATGCATAACTGATGCGATTATTTTAAAAACATGAA
TAATAAATAATCATTTCCACT
G

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DS 

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TGTTGTTTAAATTTTTAATATGATGCATAACTGATGCAATTATTTTAAAAACATGAATAA
TAAATAATCATTTCCACT
TT

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G
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G
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TTCAGAACATAGATTGCCCATCCTTGAATTGCAACCCTACTTGTCCTGCAGTATCTACTG
AAGAATAAAATGTATTGATGTTTTAAAATTCCAAAAAAAAA*TATTTCTTTGAATATGTT
GTTTAAATTTTTAATATGATGCATAACTGATGCAATTATTTTAAAAACATGAATAATAAA
TAATCATTTCCACTTTATCACCTTTCTAATCATGTATTACCGATTTTAT

QA 2 350 2 350
DS 



AS 1 10

CO CL223Contig1 1333 10 22 U
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TTCAGTCAAGTACGCCCCACAGAGACTCCCTGTTTTCGTTTTCAGATCAGCTCGTGCATC
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TGAACCACTGCCTCTTTCAATCGAGTTATTCAGGAATCCATTAGTCTCTTTCCTTTACGA
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AATGGCTAAGGAATACTTGAAGCATGTTTTGGGAGGTAATATTATTGACGCCAGTTGCGG
AAGCGGCATGTTCTCGAGATTATTTGGTAAGAGTGAGCATTTTGCTATGGTGTTCGCCCT
TGACTACTCGGAGAATATGCTGCGACAGTGTTACGAGTTCTTGAAACAGGAAGCTAACCT
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GGGCTCAGTTGATGCTGTCCATGCTGGTGCTGCGTTACATTGCTGGCCTTCACCATCTTC
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GAGATATTCTGGTTCTCACATGTTTCTGAGCGAACGTGAGCTGGAAGATCTCTGCAAATC
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GCATTTTAAATTTAAAACCTATATTGTAAAGTATTTTGCAAATGTTATTTTATCTACCAC
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TGGTGTTTGAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 10 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1AB82JQ C 483
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CATTCTAGCTTGTCCCATCTGTTATAACTCCTTAAAATCATTGATTAGTCATCCCCGTGG
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TTACTCAGCTAATGAGACACATCTTGATTTGGCTGTGGCTAGTGGAACCAAGCATTACAC
TGAACCACTGCCTCTTTCAATCGAGTTATTCAGGAATCCATTAGTCTCTTTCCTTTACGA
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AATGGCTAAGGAATACTTGAAGCATGTTTTGGGAGGTAATATTATTGACGCCAGTTGCGG
AAGCGGCATGTTCTCGAGATTATTTGGTAAGAGTGAGCATTTTGCTATGGTGTTCGCCCT
TGACTACTCGGAGAATATGCTGCGACAGTG

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GATTTTCTCAGCTAATGAGACACATCTTGATTTGGCTGTGGCTAGTGGAACCAAGCATTA
CACTGAACCACTGCCTCTTTCAATCGAGTTATTCAGGAATCCATTAGTCTCTTTCCTTTA
CGAGAGAGGTTGGCGTCAAAATTTCATATGGGGTGGTTTTCCAGGACCAGAGAAAGAGTT
TGAAATGGCTAAGGAATACTTGAAGCACGTTTTGGGAGGTAATATTATTGACGCCAGTTG
CGGAAGCGGCATGTTCTCGAGATTATTTGGTAAGAGTGAGCATTTTGCTATGGTGTTCGC
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DS 

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CG
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CAAACAGTTTATCAGTTTCGCGGTTGGTTTCAGTCAAGTACGCCCCACAGAGACTCCCTG
TTTTCGTTTTCAGATCAGCTCGTGCATCTTATGACTCCGTTGAGACGAACCCTAGTGTGG
ATTCTGTGATCGAGAAAGAGGAGAAGAGCATTCTAGCTTGTCCCATCTGTTATAACTCCT
TAAAATCATTGATTAGTCATCCCCATGGATCAGTAGGATCTCCTGCCTCTGGTAGTACTC
AACTACAATGCAGTACCTGTAAAAAGATTTTCTCAGCTAATGAGACACATCTTGATTTGG
CTGTGGCTAGTGGAACCAAGCATTACACTGAACCACTGCCTCTTTCAATCGAGTTATTCA
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GTTTTCCAGGACCAGAGAAAGAGTTTGAAATGGCTAAGGAATACTTGAAGCATGTTTTGG
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ACGAGTTCTTGAAACAGGAAGCTAACCTAACCGACAAAAAGATCGTTGTGCTGGCTCGAG
CAGACGTAGCTAGACTCCCGTTTCTTTCGGGCTCAGTTGATGCTGTCCATGCTGGTGCTG
CGTTACATTGCTGGCCTTCACCATCTTCAGCTGTTGCTGAGATAAGCCGTGTTCT

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G
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TTTGGTAAGAGTGAGCATTTTGCTATGGTGTTCGCCCTTGACTACTCGGAGAATATGCTG
CGACAGTGTTACGAGTTCTTGAAACAGGAAGCTAACCTAATCGACAAAAAGATCGTTGTG
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GCTGGTGCTGCGTTACATTGCTGGCCTTCACCATCTTCAGCTGTTGCTGAGATAAGCCGT
GTTCTTAGACCTGGAGGAGTATTTGTTGCCACCACGTTCATCTATGATGGCCTTTTCCGT
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TTTCTGAGCGAACGTGAGCTGGAAGATCTCTGCAAATCATGTGGACTCGTTGGTTTCACT
TGTGTTAGAAACGGGCTATTTATAATGCTTTCGGCCACAAAACCCAGCCAGAT

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GTTTCACTTGTGTTAGAAACGGGCTATTTATAATGCTTTCGGCCACAAAACCCAGCCAGA
TAAGCTCAGCTTCCTGTGAAGAGCTTTAGTCCTCGGAAGTATATATACACAATCTTTCCG
CTGTTGAAAATTTGGTTTAATTAGA

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G
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DS 

RD RS1GE76TF 197 0 0
G
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ATTTGGTTTAATTAGAGTTTTAACAATGTAATAACATGCATTTTAAATTTAAAACCTATA
TTGTAAAGTATTTTGC

QA 2 197 2 197
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GATATTCTGGTTCTCACATGTTTCTGAGCGAACGTGAGCTGGAAGATCTCTGCAAATCAT
GTGGACTCGTTGGTTTCACTTGTGTTAGAAACGGGCTATTTATAATGCTTTCGGCCACAA
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ACAATCTTTCCGTTGTTGAAAATTTGGTTTAATTAGAGTTTTAACAATGTAATAACATGC
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GCTTGT

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TTTTGCTATGGTGTTCGCCCTTGACTACTCGGAGAATATGCTGCGACAGTGTTACGAGTT
CTTGAAACAGGAAGCTAACCTAACCGACAAAAAGATCGTTGTGCTGGCTCGAGCAGACGT
AGCTAGACTCCCGTTTCTTTCGGGCTCAGTTGATGCTGTCCATGCTGGTGCTGCGTTACA
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AGTATTTGTTGCCACCATGTTCATCTATGATGGCCTTTTCCGTTTTATACCGTTCTTGGA
GGATCTTCGCCAGGAAGTAATGAGATATTCTGGTTCTCACATGTTTCTGAGCGAACGTGA
GCTGGAAGATCTCTGCAAATCATGTGGACTCGTTGGTTTCACTTGTGTTAGAAACGGGCT
ATTTATAATGCTTTCGGCCACAAAACCCAGCCAGATAAGCTCAGCTTCCTGTGAAGAGCT
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GTTTTAACAATGTAATAACATGCATTTTAAATTTAAAACCTATATTGTAAAGTATTTTGC
AAATGTTATTTTATCTACCACTGGCTTGT
AC

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DS 

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TGACTACTCGGAGAATATGCTGCGACAGTGTTACGAGTTCTTGAAACAGGAAGCTAACCT
AATCGACAAAAAGATCGTTGTGCTGGCTCGAGCAGACGTAGCTAGACTCCCGTTTCTTTC
GGGCTCAGTTGATGCTGTCCATGCTGGTGCTGCGTTACATTGCTGGCCTTCACCATCTTC
AGCTGTTGCTGAGATAAGCCGTGTTCTTAGACCTGGAGGAGTATTTGTTGCCACCACGTT
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GAGATATTCTGGTTCTCACATGTTTCTGAGCGAACGTGAGCTGGAAGATCTCTGCAAATC
ATGTGGACTCGTTGGTTTCACTTGTGTTAGAAACGGGCTATTTATAATGCTTTCGGCCAC
AAAACCCAGCCAGATAAGCTCAGCTTCCTGTGAAGAGCTTTAGTCCTCGGAAGTATATAT
ACACAATCTTTCCGTTGTTGAAAATTTGGTTTAATTAGAGTTTTAACAATGTAATAACAT
GCATTTTAAATTTAAAACCTATATTGTAAAGTATTTTGCAAATGTTATTTTATCTACCAC
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TGGTGTTTGAGAC

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DS 



AS 2 11

CO CL224Contig1 1360 4 20 U
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GTTTCCCAGCATCGTGGGCCGTCCTCGTCACACCGGAGTGATGGTTGGTATGGGACAAAA
AGATGCTTACGTTGGCGACGAAGCTCAATCCAAACGTGGTATTCTAACTCTCAAGTACCC
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TAACCCGAAAGCTAACCGTGAGAAGATGACTCAGACCATGTTTGAGACTTTCAATGCTCC
GGCTATGTATGTGGCTATTCAGGCTGTGCTTTCCCTTTACGCCAGTGGTCGTACAACCGG
TATTGTACTCGACTCTGGAGATGGCGTGAGCCACACGGTTCCTATCTACGAGGGTTATGC
ACTTCCACATGCCATCCTACGTCTTGATCTCGCGGGTCGTGACCTCACGGACGCGTTCAT
GAAGATCCTAACCGAGCGTGGCTACTCTTTCACCACCACAGCAGAGCGCGAAATCGTCAG
AGACATCAAGGAGAAGCTCTGCTACATTGCTCTTGACTACGAGCAGGAGCTAGAGACATC
CAAAACTAGCTCATCCGTTGAGAAGAACTACGAGATGCCTGATGGACAAGTGATCACCAT
CGGTGCTGAACGGTTCCGTTGTCCTGAGGTCCTTTACCAGCCGTCTATGATTGGTATGGA
GAATCCAGGTATCCATGAAACAACCTATAACTCCATAATGAAGTGTGATGTCGACATCAG
AAAGGACTTGTATGGTAACATTGTGCTTAGTGGTGGAACCACAATGTTCCCGGGGATTGC
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TACCTTCCAGCAGATGTGGATCGCAAAGGCAGAGTATGATGAGTCAGGCCCATCCATTGT
TCACAGGAAGTGCTTCTAAGCTCAAAATTCATCATTCTTCTGAAAAGAAGTGGTTATGCT
GCTCTTTGTTTTTTCTTTTCTTTTATGTTCTTTTTTTTTTGAAATTCTGGCATAAGACTT
TTTCAAGGATTTATTTTCTTAATTCTTTTTTAGTTTCAACCGTCTTTTTGGTGAATAAAA
GACTTCTATGATTATCATAAAGAAATTTGTTTCAAGTTCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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CGACAACGGAACTGGAATGGTTAAGGCTGGTTTTGCTGGTGATGATGCACCTCGAGCTGT
GTTTCCCAGCATCGTGGGCCGTCCTCGTCACACCGGAGTGATGGTTGGTATGGGACAAAA
AGATGCTTACGTTGGCGACGAAGCTCAATCCAAACGTGGTATTCTAACTCTCAAGTACCC
TATTGAACACGGTATTGTCAACAACTGGGACGACATGGAGAAGATTTGGCATCATACTTT
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TAACCCGAAAGCTAACCGTGAGAAGATGACTCAGATCATGTTTGAGACTTTCAATGCTCC
GGCTATGTATGTGGCTATTCAGGCTGTGCTTTCCCTTTACGCCAGTGGTCGTACAACCGG
TATTGTGCTCGACTCTGGAGATGGCGTGAGCCACACGGTTCCTATCTACGAGGGTTATGC
ACTTCCACATGCCATCCTACGTCTTGATCTCGCGGGTCGTGACCTCACGGACGCGTTCAT
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CG
TGCTGA

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AGAGATCACTGCTTTGGCTCCAAGCAGCATGAAGATCAAAGTTGTTGCTCCTCCTGAGAG
GAAATACTCTGTCTGGATCGGAGGGTCTATCTTGGCCTCACTCAGTACCTTCCAGCAGAT
GTGGATCGCAAAGGCAGAGTATGATGAGTCAGGCCCATCCATTGTTCACAGGAAGTGCTT
CTAAGCTCAAAATTCATCATTCTTCTGAAAAGAAGTGGTTATGCTGCTCTTTGTTTTTTC
TTTTCTTTTATGTTCTTTTTTTTT*GAAATTCTGGCATAAGACTTTTTCAAGGATTTATT
TTCTTAATTCTTTTTTAGTTTCAACCGTCTTTTTGGTGAATAAAAGACTTCTATGATTAT
CATAAAGAAATTTGTTTCAAGTTCG

QA 1 805 1 805
DS 



CO CL224Contig2 1328 7 23 U
GGGAATCTTTTCTGGTTTCAAGAAACGTATCAACAATGGCTGACGGTGAAGACATTCAAC
CTCTTGTTTGCGACAACGGAACTGGAATGGTTAAAGCTGGTTTTGCTGGGGATGATGCAC
CTCGAGCTGTGTTCCCCAGCATTGTTGGTCGTCCACGTCACACCGGTGTGATGGTTGGAA
TGGGACAAAAGGATGCGTACGTTGGTGATGAAGCTCAATCCAAACGTGGTATTCTAACTC
TCAAGTACCCTATTGAGCACGGTATTGTCAACAACTGGGACGACATGGAGAAGATCTGGC
ATCACACTTTCTACAACGAGCTCCGTGTTGCACCCGAGGAGCATCCCGTTCTCCTCACGG
AAGCACCTCTCAACCCTAAAGCTAACCGTGAGAAGATGACTCAGATCATGTTTGAGACTT
TCAATGCCCCTGCCATGTACGTGGCTATTCAGGCTGTGCTCTCCCTTTATGCCAGTGGTC
GTACAACCGGTATTGTGCTTGACTCTGGAGATGGTGTGAGCCACACGGTTCCTATCTACG
AGGGCTATGCACTCCCACATGCTATCCTACGTCTTGATCTCGCGGGTCGTGACCTCACGG
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AAATCGTCAGAGACATAAAGGAGAAGCTCTGCTACATTGCTCTTGACTAC*AGCAGGAGC
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TGATCACCATCGGTGCTGAACGTTTCCGTTGTCCTGAGGTTCTTTACCAGCCGTCTATGA
TTGGTATGGAGAATCCAGGTATCCATGAAACGACCTACAACTCCATAATGAAATGTGATG
TCGACATCAGAAAGGACTTGTATGGTAACATCGTCCTCAGTGGTGGAACCACAATGTTCC
CGGGGATCGCTGATAGAATGAGCAAGGAGATCACTGCATTGGCTCCAAGCAGCATGAAGA
TCAAAGTTGTTGCACCTCCTGAGAGGAAATACTCTGTTTGGATTGGAGGGTCCATCTTGG
CTTCACTCAGTACCTTCCAGCAGATGTGGATTGCTAAGGCAGAGTATGACGAGTCAGGCC
CGTCCATTGTTCACAGGAAGTGCTTCTAAGTAATGAAGTTCATCATTTTTCAGACAAGAA
GCAAGCTACTCTTTG**TTTTGGTTCTTTTATATTCATTTTATTTGAGTTCAACTTTCTT
TTGAGTTAATAATGATTGATGACACATCTTTCTCTTTTAACTATTATATAGCAATGTGGT
TCATGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 20 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 
30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 10 10 10 

AF RS1FP47TF U 1
AF RS1FM06TF U 32
AF RS1CI57TF U 288
AF RS1FP47JQ C 748
AF RS1CI57JQ C 534
AF RS1FM06JQ C 936
AF RS1A579TF U 786
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BS 1174 1214 RS1A579TF
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BS 1268 1324 RS1A579TF
BS 1325 1328 RS1CI57JQ

RD RS1FP47TF 807 0 0
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CTCTTGTTTGCGACAACGGAACTGGAATGGTTAAAGCTGGTTTTGCTGGGGATGATGCAC
CTCGAGCTGTGTTCCCCAGCATTGTTGGTCGTCCACGTCACACCGGTGTGATGGTTGGAA
TGGGACAAAAGGATGCGTACGTTGGTGATGAAGCTCAATCCAAACGTGGTATTCTAACTC
TCAAGTACCCTATTGAGCACGGTATTGTCAACAACTGGGACGACATGGAGAAGATCTGGC
ATCACACTTTCTACAACGAGCTCCGTGTTGCACCCGAGGAGCATCCCGTTCTCCTCACGG
AAGCACCTCTCAACCCTAAAGCTAACCGTGAGAAGATGACTCAGATCATGTTTGAGACTT
TCAATGCCCCTGCCATGTACGTGGCTATTCAGGCTGTGCTCTCCCTTTATGCCAGTGGTC
GTACAACCGGTATTGTGCTTGACTCTGGAGATGGTGTGAGCCACACGGTTCCTATCTACG
AGGGCTATGCACTCCCACATGCTATCCTACGTCTTGATCTCGCGGGTCGTGACCTCACGG
ACGCGTTTATGAAGATCCTAACCGAGCGTGGGTACTCTTTCACCACCACAGCGGAGCGTG
AAATCGTCAGAGACATAAAGGAGAAGCTCTGCTACATTGCTCTTGACTACGAGCAG*AGC
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DS 

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GGG
AATGGCTGACGGTGAAGACATTCAACCTCTTGTTTGCGACAATGGAACTGGAATGGTTAA
AGCTGGTTTTGCTGGGGATGATGCACCTCGAGCTGTGTTCCCCAGCATTGTTGGTCGTCC
ACGTCACACCGGTGTGATGGTTGGAATGGGACAAAAGGATGCGTACGTTGGTGATGAAGC
TCAATCCAAACGTGGTATTCTAACTCTCAAGTACCCTATTGAGCACGGTATTGTCAACAA
CTGGGACGACATGGAGAAGATCTGGCATCACACTTTCTACAACGAGCTCCGTGTTGCACC
CGAGGAGCATCCCGTTCTCCTCACGGAAGCACCTCTCAACCCTAAAGCTAACCGTGAGAA
GATGACTCAGATCATGTTTGAGACTTTCAATGCCCCTGCCATGTACGTGGCTATTCAGGC
TGTGCTCTCCCTTTATGCCAGTGGTCGTACAACCGGTATTGTGCTTGACTCTGGAGATGG
TGTGAGCCACACGGCTCCTATCTACGAGGGCTATGCACTCCCACATGCTATCCTACGTCT
TGATCTCGCGGGTCGTGACCTCACGGACGCGTTTATGAAGATCCTAACCGAGCGTGGGTA
CTCTTTCACCACCACAGCGGAGCGTGAAATCGTCAGAGACATAAAGGAGAAGCTCTGCTA
CATTGCTCTTGACTACGAGCAGGAGCTAGAGACATCCAAAACAAGCTCATCTGTTGAGAA
GA*CTACGAGATGCCTGATGGACAAGTGATCACCATCGGTGCTGAACGTTTCCGTTGTCC

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DS 

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GTTCTCCTCACGGAAGCACCTCTCAACCCTAAAGCTAACCGTGAGAAGATGACTCAGATC
ATGTTTGAGACTTTCAATGCCCCTGCCATGTACGTGGCTATTCAGGCTGTGCTCTCCCTT
TATGCCAGTGGTCGTACAACCGGTATTGTGCTTGACTCTGGAGATGGTGTGAGCCACACG
GTTCCTATCTACGAGGGCTATGCACTCCCACATGCTATCCTACGTCTTGATCTCGCGGGT
CGTGACCTCACGGACGCGTTTATGAAGATCCTAACCGAGCGTGGGTACTCTTTCACCACC
ACAGCGGAGCGTGAAATCGTCAGAGACATAAAGGAGAAGCTCTGCTACATTGCTCTTGAC
TAC*AGCAGGAGCTAGAGACATCCAAAACAAGCTCATCTGTTGAGAAGAACTACGAGATG
CCTGATGGACAAGTGATCACCATCGGTGCTGAACGTTTCCGTTGTCCTGAGGTTCTTTAC
CAGCCGTCTATGATTGGTATGGAGAATCCAGGTATCCATGAAACGACCTACAACTCCATA
ATGAAATGTGATGTCGACATCAGAAAGGACTTGTATGGTAACATCGTCCTCAGTGGTGGA
ACCACAATGTTCCCGGG*ATCGCTGATAGAATGAGCAAG
AGATCACT

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DS 

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TA
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TGTCCTGAGGTTCTTTACCAGCCGTTTATGATTGGTATGGAGAATCCAGGTATCCATGAA
ACGACCTACAACTCCATAATGAAATGTGATGTCGACATCAGAAAGGACTTGTATGGTAAC
ATCGTCCTCAGTGGTGGAACCACAATGTTCCCGGGGATCGCTGATAGAATGAGCAAGGAG
ATCACTGCATTGGCTCCAAGCAGCATGAAGATCAAAGTTGTTGCACCTCCTGAGAGGAAA
TACTTTGTTTGGATTGGAGGGTCCATTTTGGCTTCACTCAGTACCTTCCAGCAGATGTGG
ATTGTTAAGGCAGAGTATGACGAGTCAGGCCCGTCCATTGTTCACAGGAAGTGCTTTTAA
GTAATGAAGTTCATCATTTTTCAGACAAGAAGCAAGCTACTCTTTG**TTTTGGTTTTTT
TATATTCATTTTATTTGAGTTCAACTTTTTTTTGAGTTAATAATGATTGATGACACAT
TTT

QA 3 540 3 540
DS 

RD RS1CI57JQ 795 0 0
ATCTACGAGGGCTATGCACTCCCACATGCTATC*TACGTCTTGATCTCGCGGGTCGTGAC
CTCACGGACGCGTTTATGAAGATCCTAACCGAGCGTGGGTACTCTTTCACCACCACAGCG
GAGCGTGAAATCGTCAGAGACATAAAGGAGAAGCTCTGCTACATTGCTCTTGACTAC*AG
CAGGAGCTAGAGACATCCAAAACAAGCTCATCTGTTGAGAAGAACTACGAGATGCCTGAT
GGACAAGTGATCACCATCGGTGCTGAACGTTTCCGTTGTCCTGAGGTTCTTTACCAGCCG
TCTATGATTGGTATGGAGAATCCAGGTATCCATGAAACGACCTACAACTCCATAATGAAA
TGTGATGTCGACATCAGAAAGGACTTGTATGGTAACATCGTCCTCAGTGGTGGAACCACA
ATGTTCCCGGGGATCGCTGATAGAATGAGCAAGGAGATCACTGCATTGGCTCCAAGCAGC
ATGAAGATCAAAGTTGTTGCACCTCCTGAGAGGAAATACTCTGTTTGGATTGGAGGGTCC
ATCTTGGCTTCACTCAGTACCTTCCAGCAGATGTGGATTGCTAAGGCAGAGTATGACGAG
TCAGGCCCGTCCATTGTTCACAGGAAGTGCTTCTAAGTAATGAAGTTCATCATTTTTCAG
ACAAGAAGCAAGCTACTCTTTG**TTTTGGTTCTTTTATATTCATTTTATTTGAGTTCAA
CTTTCTTTTGAGTTAATAATGATTGATGACACATCTTTCTCTTTTAACTATTATATAGCA
ATGTGGTTCATGTGC

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DS 

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GTTTGGATTGGAGGGTCCATTTTGGCTTCACTCAGTACCTTCCAGCAGATGTGGATTGTT
AAGGCAGAGTATGACGAGTCAGGCCCGTCCATTGTTCACAGGAAGTGCTTTTAAGTAATG
AAGTTCATCATTTTTCAGACAAGAAGCAAGCTACTCTTTG**TTTTGGTTTTTTTATATT
CATTTTATTTGAGTTCAACTTTTTTTTGAGTTAATAATGATTGATGACACATTTTTTTTT
TTTAACTATTATATAGCAATGTGGTTCAT

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DS 

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ATGGAGAATCCAGGTATCCATGAAACGACCTACAACTCCATAATGAAATGTGATGTCGAC
ATCAGAAAGGACTTGTATGGTAACATCGTCCTCAGTGGTGGAACCACAATGTTCCCGGGG
ATCGCTGATAGAATGAGCAAGGAGATCACTGCATTGGCTCCAAGCAGCATGAAGATCAAA
GTTGTTGCACCTCCTGAGAGGAAATACTCTGTTTGGATTGGAGGGTCCATCTTGGCTTCA
CTCAGTACCTTCCAGCAGATGTGGATTGCTAAGGCAGAGTATGACGAGTCAGGCCCGTCC
ATTGTTCACAGGAAGTGCTTCTAAGTAGTGAAGTTCATCATTTTTCAGACAAGAAGCAAG
CTACTCTTTTGTTTTTGGTTCTTTTATATTCATTTTATTTGAGTTCAACTTTCTTTTGAG
TAAATAATGATTGATGACACATCTTTCTCTTTTAACTATTATATAGCAATGTGGTTCAT
GT

QA 1 539 1 539
DS 



AS 2 11

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TCCAAGGTAAACGATCTTCGTCCTCTTCTGCTCGATCGATCAGTTTCTGTTCTCATTTTC
TTCGTAGTTATTGGATATTGATGATTATGTGTGGTTTCCCGGAAAGTTTTTTTGAAAAAT
TTGAAGATAGCGATCGCTCGATCTTATAGCTTGCGATCTGTGTGGTGATCGTCGATCTAG
CTAGTAGTTGTTCGATTCTTCAATCAACCTTCACGTTATCTATATTTACGATCGATCGAG
AGCTTATAACTATGATCGGTTTGATTGATAGCTTCGTTTTCAGATCTGATGATTGTGGAA
TCAGATCTTATCATTGATATCGATATTGATGATTGATCGGAAGTTTTGTAGCTAAATTAG
AAGCTGTGATCGTAGTATTGAGCTGTTTGATTGATTGATCTATTCGTTTTAGCTTTGTGA
TTGATATATTCGATCTTTTGGTTGTTGTTTGTTTGTGTGCACAGATCTAAAGATTCAGAG
TTATACAAAGCAAAATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGTTCTACGCTAAACCCCAACGCAC
CTCTCTTCGTTCCAGCAGCCGCTAGACAAGTGGAAGATTTCTCTCCGGAGTGGTGGCAGT
TGGTGACGACCTCCACTTGGTACCATGACTACTGGATCAGCCAGCACCAGGGAGCTGATG
GTTTCTACGACAACGGAGAGAATCAGGAAGTCGATGTAGCTGATCTTCTTCCGGAATCGT
TTGATTTCGATGACATTGAAGATGTCTTCCAAGCTGAGTTTGATCATCATCAAGGATACG
TT*GGGCAACAAATGTATCAGGCACCTTCTGAGTTTGGTTTAGGGAAGAATGGTGAGATG
GTGAGGAAATCGAGTGGGAACAGGAGCCCTAGGTCGATTGTTGAACCGGCCAAGTATGCA
GAGAAGCCAGCCAAATGGGGAAACCAGAAGGTTGCTCCACGAAACATCCACCAGCCTCGT
TGAAGTGGGTTGTGATAACTAGGCAGAGTATGTTGTATCTTTAGCCACCTGTGCCTTTGT
AATTTTTAGTATTTTCTGCTTTCCCCCAAGAGAGAAGCTGTAACTTCTTTGTATCTTTAT
GATGTTCAGCTCAAAACTTGTTATCTCAAAAAAAATGTAAAAACATAAAAAAAAATTGTA
TAATTTGAAGAGTAATGAGAAGTAGCGTTTCGCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BJ46TF U 1
AF RS1CH96TF U 751
AF RS1EX95TF U 732
AF RS1BJ46JQ C 337
AF RS1E932JQ C 867
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TTGAAGATAGCGATCGCTCGATCTTATAGCTTGCGATCTGTGTGGTGATCGTCGATCTAG
CTAGTAGTTGTTCGATTCTTCAATCAACCTTCACGTTATCTATATTTACGATCGATCGAG
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AAGCTGTGATCGTAGTATTGAGCTGTTTGATTGATTGATCTATTCGTTTTAGCTTTGTGA
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GTTTCTACGAC

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DS 

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G
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AGCTGAGTTTGATCATCATCAAGGATACGTTTGGGCAACAAATGTATCAGGCACCTTCTG
AGTTTGGTTTAGGGAAGAATGGTGAGATGGTGAGGAAATCGAGTGGGAACAGGAGCCCTA
GGTCGATTGTTGAACCGGCCAAGTATGCAGAGAAGCCAGCCAAATGGGGAAACCAGAAGG
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DS 

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G
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ATGTATCAGGCACCTTCTGAGTTTGGTT*AGGGAAGAATGGTGAGATGGTGAGGAAATCG
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TTTCTGCTTTCCCCCAAGAGAGAAGCTGTAACTTCTTTGTATCTTTATGATGTTCAGCTC
AAAACTTGTTATCTC

QA 2 436 2 436
DS 

RD RS1BJ46JQ 894 0 0
G
TTTCAGATCTGATGATTGTG**ATCAGATCTTATCATTGATATCGATAT*GATGAT*GAT
CGGAAGTTTTGTAGCTAA*TTAGAAGCTGTGATCGTAGTATTGAGCTGTTTGATTGATTG
ATCTATTCGTTT*AGCTTTGTGATTGATATATTCGATCTTTTGGTTGTTGTTTGTTTGTG
TGCACAGATCTAAAGATTCAGAGTTATACAAAGCAAAATGGCGATGGTTTCAGGAAGACG
TTCTACGCTAAACCCCAACGCACCTCTCTTCGTTCCAGCAGCCGCTAGACAAGTGGAAGA
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TCTTTAGCCCCCTGTGCCTTTGTAATTTTTAGTATTTTCTGCTTTCCCCCAAGAGAGAAG
CTGTAACTTCTTTGTATCTTTATGATGTTCAGCTCAAAACTTGTTATCTCAAAAAAA*TG
TAAAAACATAAAAAAAAATTGTATAATTTGAAGAGTAATGAGAAGTAGC
GTTT

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DS 

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TTT
TGAGTTTGGTTTAGGGAAGAATGGTGAGATGGTGAGGAAATCGAGTGGGAACAGGAGCCC
TAGGTCGATTGTTGAACCGGCCAAGTATGCAGAGAAGCCAGCCAAATGGGGAAACCAGAA
GGTTGCTCCACGAAACATCCACCAGCCTCGTTGAAGTGGGTTGTGATAACTAGGCAGAGT
ATGTTGTATCTTTAGCCACCTGTGCCTTTGTAATTTTTAGTATTTTCTGCTTTCCCCCAA
GAGAGAAGCTGTAACTTCTTTGTATCTTTATGATGTTCAGCTCAAAACTTGTTATCTCAA
AAAAAATGTAAAAACATAAAAAAAAATTGTATAATTTGAAGAGTAATGAGAAGTAGCGTT
TCGCAC

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DS 



CO CL225Contig2 780 6 26 U
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CAACAAGATCTAAT*ATTCAGAGTTATACAAAGCAAAATGGCGATGGTTTCAGGAAGACG
TTCTACGCTAAACCCCAACGCACCTCTCTTCGTCCCAGCAGCCGTTAGACAAGTGGAAGA
TTTCTCTCCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACCTCCACTTGGTACCATGACTACTGGAT
CAGCCAGCACCAGGGAGCTGACGGTTTCTACGACAACGGAGAGAATCAGGAAGTCGATGT
AGCTGATCTTCTTCCGGAATCGTTTGATTTCGATGACATTGAAGATGTCTTCCAAGCTGA
GTTTGATCATCATCAAGGATACGTTGGGCAACAAATGTATCAGGCACCTTCTGAGTTTGG
TTTAGGGAAGAATGGTGAGATGGTGAGGAAATCGAGTGGGAACAGGAGCCCTAGGTCGAT
TGTTGAACCAGCAAAGTATGCAGAGAAGCCAGCCAAATGGGGAAACCAGAAGGTTGCTCC
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TCTTTTAGCCACCTGTACCTTTGTAATTTTTAGTATTTTCTGCCTTCCCCCAAGAGAGAA
GCTGTAACTTCTTTGTATCTTTATGATGTTCAGTCTCAAAACTTGTTATCAGCAAAAAAA
ATGTAAAAACATAAAAAAATTGTATAATTTGAAGAGTAATGAGAAATAGCCTTTCGCACC


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 0 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G922TF U 2
AF RS1E932TF U 4
AF RS1CZ16JQ C 1
AF RS1CZ16TF U 1
AF RS1G922JQ C 130
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RD RS1G922TF 512 0 0
GGTC
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QA 5 512 5 512
DS 

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GG
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ATCATCATCAAGGATACGTTGGGCAACAAATGTATCAGGCACCTTCTGAGTTTGGTTTAG
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*AGCCACCTGTGCCTTTGTAATTTTTAGTATTTTCTGCTTTCCCCCAAGAGAGAAGCTGT
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AAAAAAA

QA 3 709 3 709
DS 

RD RS1CZ16JQ 759 0 0
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CAACAAGATCTAAT*ATTCAGAGTTATACAAAGCAAAATGGCGATGGTTTCAGGAAGACG
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TTTCTCTCCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACCTCCACTTGGTACCATGACTACTGGAT
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AGCTGATCTTCTTCCGGAATCGTTTGATTTCGATGACATTGAAGATGTCTTCCAAGCTGA
GTTTGATCATCATCAAGGATACGTTGGGCAACAAATGTATCAGGCACCTTCTAAGTTTGG
TTTAGGGAAGAATGGTGAGATGGTGAGGAAATCGAGTGGGAACAGGAGCCCTAGGTCGAT
TGTTGAACCAGCAAAGTATGCAGAGAAGCCAGCCAAATGGGGAAACCAGAAGGTTGCTCC
ACGAAACATCCACCAGCCTCGTTGAAGTGGGTTTGTGATAACTAGGCAGAGTATGTTGTA
TCTTTTAGCCACCTGTACCTTTGTAATTTTTAGTATTTTCTGCCTTCCCCCAAGAGAGAA
GCTGTAACTTCTTTGTATCTTTATGATGTTCAGTCTCAAAACTTGTTATCAGCAAAAAAA
ATGTAAAAACATGAAAAAATTGTATAATTTGAAGAGTAA

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DS 

RD RS1CZ16TF 757 0 0
GGGTC
ACATCGTGTTTTCATCCTTATCAACTTGA*GCGAGTTGCAGATATTTTCTCAGGCCAACA
AGATCTAAT*ATTCAGAGTTATACAAAGCAAAATGGCGATGGTTTCAGGAAGACGTTCTA
CGCTAAACCCCAACGCACCTCTCTCCGTCCCAGCAGCCGTTAGACAAGTGGAAGATTTCT
CTCCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACCTCCACTTGGTACCATGACTACTGGATCAGCC
AGCACCAGGGAGCTGACGGTTTCTACGACAACGGAGAGAATCAGGAAGTCGATGTAGCTG
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ATCATCATCAAGGATACGTTGGGCAACAAATGTATCAGGCACCTTCTAAGTTTGGTTTAG
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AACCAGCAAAGTATGCAGAGAAGCCAGCCAAATGGGGAAACCAGAAGGTTGCTCCACGAA
ACATCCACCAGCCTCGTTGAAGTGGGTTTGTGATAACTAGGCAGAGTATGTTGTATCTTT
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AACTTCTTTGTATCTTTATGATGTTCAGTCTCAAAACTTGTTATCAGCAAAAAAA*TGTA
AAA*CATGAAAAA*TTGTATAATTTGA
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QA 6 752 6 752
DS 

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GGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACCTCCACTTGGTACCATGACTACTGGATCAGCCAGCA
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TCTTCCGGAATCGTTTGATTTCGATGACATTGAAGATGTCTTCCAAGCTGAGTTTGATCA
TCATCAAGGATACGTTGGGCAACAAATGTATCAGGCACCTTCTGAGTTTGGTTTAGGGAA
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TCTTCGTATCTTTATGATGTTCAGTCTCAAAACTTGTTATCAGCAAAAAAAATGTAAAAA
CATAAAAAAATTGTATAATTTGAAGAGTAATGAGAAATAGCCTTTCGCACC

QA 1 651 1 651
DS 

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G
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TCGAGTGGGAACAGGAGCCCTAGGTCGATTGTTGAACCAGCAAAGTATGCAGAGAAGCCA
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AGTCTCAAAACTTGTTATCAGCAAAAAAAATGTAAAAACATAAAAAAATTGTATAATTTG
AAGAGTAA

QA 2 369 2 369
DS 



AS 1 11

CO CL226Contig1 1189 11 25 U
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AATGGTGTTTGTGAAGCCATCCAAGTCGAATGCTTACTTCAAGAGGTACCAAGTCAAGTT
CAGGAGAAGAAGAGCTGGTAAGACCGATTACAG*AGCAAGAATCCGTCTCATTAACCAAG
ACAAAAACAAGTACAACACGCCCAAGTACCGTTTCGTCGTCCGGTTCACCAACAAAGACA
TCGTGGCCCAAATCGTGTCCGCAAGCATAGCCGGTGACATTGTCAAGGCCTCTGCTTACG
CACACGAGTTGCCTCAGTATGGACTCACTGTTGGTCTTACCAACTACGCTGCAGCTTACT
GTACCGGCCTTCTTTTGGCTCGCCGTGTTCTCAAGATGTTGGAAATGGATGCCGAGTATG
AGGGCAACGTTGAGGCCACTGGAGAAGACTTTTCCGTTGAACCAACTGAGTCAAGGAGGC
CTTTCCGTGCTCTTCTTGATGTTGGACTCATCAGGACCACCACAGGGAACCGTGTCTTCG
GTGCCCTCAAGGGTGCTTTGGATGGAGGACTTGATATCCCCCACAGTGACAAGAGGTTTG
CAGGTTTCAACAAAGAAAACAAACAGCTCGATGCTGAGACCCACAGGAACTACATCTTTG
GTGGTCACGTCTCAAACTACATGAAGATGTTGAACGAAGATGAGCCAGAGAAGTTTCAGA
CTCACTTCAGTCAGTACTTGAAGAAAGGAGTTGACGCTGAGAAGATGGAGGAGCTGTACA
AGAAGGTTCATGCAGCTATCCGTGCTGACCCCAACCCCAAGAAGACCGTGAAACCTGCCC
CCAAGGCACACAAGAGGTACAATTTGAAGAAGTTGACCTATGAGGAGAGGAAGAACAATT
TGATCGAGAGAGTCAAGGCATTGAACGGAGCAGCAGGTGGTGATGATGATGATGAGGACG
ACGAAGAGTAAATCACCACAGCTTTCGTTGCCTCGTAATGATGTTTAGCTGTTTACTTCT
TAAGCTTATTATTGCCTCAGTTTTTCTATCTTTCAGACCTAAACACTTGGTTTCTTTCAC
ATTTCATTTGCGTTCGAGGATTTTGAATTTAAGGATACTTTTCTCTCTTTTAAGTTGTTA
TCTTCTATTACATTGTTTAACAGTTGAATCTTTTGTCATCAAGTTTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 30 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 30 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 
50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 
40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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DS 

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GG
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AGGGTGCTTTGGATGGAGGACTTGATATCCCCCACAGTGACAAGAGGTTTGCAGGTTTCA
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GG
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AAGAGCTGGTAAGACCGATTACAG*AGCAAGAATCCGTCTCATTAACCAAGACAAAAACA
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TTCTTTTGGCTCGCCGTGTTCTCAAGATGTTGGAAATGGATGCCGAGTATGAGGGCAACG
TTGAGGCCACTGGAGAAGACTTTTCCGTGGAACCAACTGAGTCAAGGAGGCCTTTCCGTG
CTCTTCTTGATGTTGGACTCATCAGGACCACCACAGGGAACCGTGTCTTCGGTGCCCTCA
AGGGTGCTTTGGATGGAGGACTTGATATCCCCCACAGTGACAAGAGGTTTGCAGGTTTCA
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GG
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AGACCGATTACAG*AGCAAGAATCCGTCTCATTAACCAAGACAAAAACAAGTACAACACG
CCCAAGTACCGTTTCGTCGTCCGGTTCACCAACAAAGACATCGTGGCCCAAATCGTGTCC
GCAAGCATAGCCGGTGACATTGTCAAGGCCTCTGCTTACGCACACGAGTTGCCTCAGTAT
GGACTCACTGTTGGTCTTACCAACTACGCTGCAGCTTACTGTACCGGCCTTCTTTTGGCT
CGCCGTGTTCTCAAGATGTTGGAAATGGATTCCGAGTATGAGGGCAACGTTGAGGCCACT
GGAGAAGACTTTTCCGTTGAACCAACTGAGTCAAGGAGGCCTTTCCGTGCTCTTCTTGAT
GTTGGACTCATCAGGACCACCACAGGGAACCGTGTCTTCGGTGCCCCCAAGGGTGCTTTG
GATGGAGGACTTGATATCCCCCACAGTGACAAGAGGTTTGCAGGTTTCAACAAAGAAAAC
AAACAGCTCGATGCTGAGACCCACAGGAACTACATCTTTGGTGGTCACGTCTCAAACTAC
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AAGAAAGGAGTTGACGCTGAGAAGATGGAGGAGCTGTACAAGAA*GTTCATGCAGCTATC
CGTGCTGACC

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DS 

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AAGCCATCCAAGTCGAATGCTTACTTCAAGAGGTACCAAGTCAAGTTCAGGAGAAGAAGA
GCTGGTAAGACCGATTACATTAGCAAGAATCCGTCTCATTAACCAAGACAAAAACAAGTA
CAACACGCCCAAGTACCGTTTCGTCGTCCGGTTCACCAACAAAGACATCGTGGCCCAAAT
CGTGTCCGCAAGCATAGCCGGTGACATTGTCAAGGCCTCTGCTTACGCACACGAGTTGCC
TCAGTATGGACTCACTGTTGGTCTTACCAACTACGCTGCAGCTTACTGTACCGGCCTTCT
TTTGGCTCGCCGTGTTCTCAAGATGTTGGAAATGGATGCCGAGTATGAGGGCAACGTTGA
GGCCACTGGAGAAGACTTTTCCGTTGAACCAACTGAGTCAAGGAGGCCTTTCCGTGCTCT
TCTTGATGTTGGACTCATCAGGACCACCACAGGGAACCGTGTCTTCGGTGCCCTCAAGGG
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AGAAAACAAACAGCTCGATGCTGAGACCCACAGGAACTACATCTTTGGTGGTCACGTCTC
AAACTACATGAAGATGTTGAACGAAGATGAGCCAGAGAAGTTTCAGACTCACTTCAGTCA
GTACTTGAAGAAAGGAGTTGACGCTGAGAAGATGGAG*AGCTGTACAAGAACGTTCATGC
AGCTATCCGTGCTGACCCCA**CCCAAGA*GACCGTGAAACCTG

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DS 

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G
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CGTGTCCGCAAGCATAGCCGGTGACATTGTCAAGGCCTCTGCTTACGCACACGAGTTGCC
TCAGTATGGACTCACTGTTGGTCTTACCAACTACGCTGCAGCTTACTGTACCGGCCTTCT
TTTGGCTCGCCGTGTTCTCAAGATGTTGGAAATGGATGCCGAGTATGAGGGCAACGTTGA
GGCCACTGGAGAAGACTTTTCCGTTGAACCAACTGAGTCAAGGAGGCCTTTCCGTGCTCT
TCTTGATGTTGGA*TCATCAGGACCACCACAGGGAACCGTGTCTTCGGTGCCCTCAAGGG
TGCTTTGGATGGAGGACTTGATATCCCCCACAGTGACAAGAGGTTTGCAGGTTTCAACAA
AGAAAACAAACAGCTCGATGCTGAGACCCACAGGAACTACATCTTTGGTGGTCACGTCTC
AAACTACATGAAGATGTTGAACGAAGATGAGCCAGAGAAGTTTCAGACTCACTTCAGTCA
GTACTTGAAGAAAGGAGTTGACGCTGAGAAGGTGGAGGAGCTGTACAAGAAGGTTCATGC
AGCTATCCGTGCTGACCCCAACCCCAAGAAGACCGTGAAACCTGCCCCCAAG*CACACAA
GAG*TACAATTTGAAGAAGTTGACCTATGAG
AGAGG

QA 2 692 2 692
DS 

RD RS1A467JQ 724 0 0
AAATCGTGTCCGCAAGCATAGCCGGTGACATTGTCAAGGC*TCTGCTTACGCACACGAGT
TGC*TCAGTATGGACTCACTGTTGGTCTTACCAACTACGCTGCAGCTTACTGTACCGGCC
TTCTTTTGGCTCGCCGTGTTCTCAAGATGTTGGAAATGGATGCCGAGTATGAGGGCAACG
TTGAGGCCACTGGAGAAGACTTTTCCGTTGAACCAACTGAGTCAAGGAGGCCTTTCCGTG
CTCTTCTTGATGTTGGACTCATCAGGACCACCACAGGGAACCGTGTCTTCGGTGCCCTCA
AGGGTGCTTTGGATGGAGGACTTGATATCCCTCACAGTGACAAGAGGTTTACAGGTTTCA
ACAAAGAAAACAAACAGCTCGATGCTGAGACCCACAGGAACTACATCTTTGGTGGTCACG
TCTCAAACTACATGAAGATGTTGAACGAAGATGAGCCAGAGAAGTTTCAGACTCACTTCA
GTCAGTACTTGAAGAAAGGAGTTGACGCTGAGAAGATGGAGGAGCTGTACAAGAAGGTTC
ATGCAGCTATCCGTGCTGACCCCAACCCCAAGAAGACCGTGAAACCTGCCCCCAAGGCAC
ACAAGAGGTACAATTTGAAGAAGTTGACCTATGAGGAGAGGAAGAACAATTTGATCGAGA
GAGTCAAGGCATTGAACGGAGCAGCAGGTGGTGATGATGATGATGAGGACGACGAAGAGT
AAAT

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DS 

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G
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GCGTTCGAGGATTTTGAATTTAAGGATACTTTTCTCTCTTTT

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DS 

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GTGTCTTCGGTGCCCTCAAGGGTGCTTTGGATGGAGGACTTGATATCCCCCACAGTGACA
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A***GGACGACGAAGAGTAAATCACCACAGCTTTCGTTGCCTCGTAATGATGTTTAGCTG
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TTCTTTCACATTTCATTTGCGTTCGAGGATTTTGAATTTAAGGATACTTTTCTCTCTTTT
AAGTTGTTATCTTCTATTACATTGTTTAACAGT
CG

QA 1 753 1 753
DS 

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GCTCTTCTTGATGTTGGACTCATCAGGACCACCACAGGGAACCGTGTCTTCGGTGCCCCC
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TGCGTTCGAGGATTTTGAATTTAAGGATACTTTTCTCTCTTTTAAGTTGTTATCTTCTAT
TACATTGTTTAACAGTTGAATCTTTTGTCATC

QA 1 752 1 752
DS 

RD RS1CJ73JQ 750 0 0
CT
GAGAAGACTTTTCCGTTGAACCAACTGAGTCAAGGAGGCCTTTCCGTGCTCTTCTTGATG
TTGGACTCATCAGGACTACCACAGGGAACCGTGTCTTCGGTGCCCTCAAGGGTGCTTTGG
ATGGAGGACTTGATATCCCCCACAGTGACAAGAGGTTTGCAGGTTTCAACAAAGAAAACA
AACAGCTCGATGCTGAGACCCACAGGAACTACATCTTTGGTGGTCACGTCTCAAACTACA
TGAAGATGTTGAACGAAGATGAGCCAGAGAAGTTTCAGACTCACTTCGGTCAGTACTTGA
AGAAAGGAGTTGACGCTGAGAAGATGGAGGAGCTGTACAAGAAGGTTCATGCAGCTATCC
GTGCTGACCCCAACCCCAAGAAGACCGTGAAACCTGCCCCCAAGGCACACAAGAGGTACA
ATTTGAAGAAGTTGACCTATGAGGAGAGGAAGAACAATTTGATCGAGAGAGTCAAGGCAT
TGAACGGAGCAGCAGGTGGTGATGATGATGATGAGGACGACGAAGAGTAAATCACCACAG
CTTTCGTTGCCTCGTAATGATGTTTAGCTGTTTACTTCTTAAGCTTATTATTGCCTCAGT
TTTTCTATCTTTCAGACCTAAACACTTGGTTTCTTTCACATTTCATTTGCGTTCGAGGAT
TTTGAATTTAAGGATACTTTTCTCTCTTTTAAGTTGTTATCTTCTATTACATTGTTTAAC
AGTTGAATCTTTTGTCATCAAGTTTGAT

QA 3 750 3 750
DS 



AS 2 11

CO CL227Contig1 822 9 9 U
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TGGCGGGCCGTGACATCTTCCAGCTGCGTTTTGCGGCTGTCGCGGTATCCGTCGCCGTAT
TGACCTTCCTCTTCTCCACTCAAGTCACAGAAGCGTCACGTGTGATGAACCTCTGCTCAC
ACACCGCGTATCCATCCCTATGCCAACCTTTGATTAAACGTATCACGAACCCAAGACGTG
CCACGCACCGAACCATTCAGGCTTTGGAAGCTAAGACAAAAGTGGCTTTAGCTGAAGCGG
CTAGGTACAAAGACGGTAACCAAGCAATCGCGACGTGTTACGCGACGTTTAGCGATGCAG
TTTATAATCTTGCGAACGCGAGGAAGAGTATAAGGAAACGTGACGTGATGGGGATGAACA
CGTTTTTGACCGCGGCTGTGTCTGATTACGGTGTATGTGTTGAAGGGTTTATTGACGCGA
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TGTCGTTGTCTACATTGGTTTAGATGATTGATTACAGATTACCATTTATTTAATTTTTTC
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TGGATCATCGTTTGTCATGTAAAACGCCACTGGGTGGTTATTAATTATACTTGGTTTCTT
GTAAATTAATTGCTGATAGAATTCTTTTTCTTATGGTAATTT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 
50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

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DS 

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DS 

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TGGCGGGCCGTGACATCTTCCAGCTGCGTTTTGCGGCTGTCGCGGTATCCGTCGCCGTAT
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CGTTTTTGACCGCGGCTGTGTCTGATTACGGTGTATGTGTTGAAGGGTTTATTGACGCGA
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TGTCGTTGTCTACATTGGTTTAGATGATTGATTACAGATTACCATTTATTTAATTTTTTC
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TGGCGGGCCGTGACATCTTCCAGCTGCGTTTTGCGGCTGTCGCGGTATCCGTCGCCGTAT
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ACACCGCGTATCCATCCCTATGCCAACCTTTGATTAAACGTATCGCGAACCCAAGACGTG
CCACGCACCGAACCATTCAGGCTTTGGAAGCTAAGACAAAAGTGGCTTTAGCTGAAGCGG
CTAGGTACAAAGACGGTAACCAAGCAATCGCGACGTGTTACGCGACGTTTAGCGATGCAG
TTTATAATCTTGCGAACGCGAGGAAGAGTATAAGGAAACGTGACGTGATGGGGATGAACA
CGTTTTTGACCGCGGCTGTGTCTGATTACGGTGTATGTGTTGAAGGGTTTATTGACGCGA
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TGTCGTTGTCTACATTGGTTTAGATGATTGATTACAGATTACCATTTATTTAATTTTTTC
TCAA

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DS 

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AGATGATTGATTACAGATTACCATTTATTTAATTTTTTCTCAAAACAAACAAAAAACTAA
TTAATTTCGTCTAAATGAATAAGAAGGAAAAAAAATCTTGAATAATTAAAAATGTTTTTT
CTTATGTTGCAACTTTTGTTTTGAGGGGGAGATGTTTGCTGGATCATCGTTTGTCATGTA
AAACGCCACTGGGTGGTTATTAATTATACTTGGTTTCTTGT

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DS 

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TGCTCACACACCGCGTATCCATCCCTATGCCAACCTTTGATTAAACGTATCGCGAACCCA
AGACGTGCCACGCACCGAACCATTCAGGCTTTGGAAGCTAAGACAAAAGTGGCTTTAGCT
GAAGCGGCTAGGTACAAAGACGGTAACCAAGCAATCGCGACGTGTTACGCGACGTTTAGC
GATGCAGTTTATAATCTTGCGAACGCGAGGAAGAGTATAAGGAAACGTGACGTGATGGGG
ATGAACACGTTTTTGACCGCGGCTGTGTCTGATTACGGTGTATGTGTTGAAGGGTTTATT
GACGCGAACCAAGTTAATACGGTTCAGAATGTAGCGGTTGACCTGAGAAAAATTAGCAGC
AACTGCTTGTCGTTGTCTACATTGGTTTAGATGATTGATTACAGATTACCATTTATTTAA
TTTTTTCTCAAAACAAACAAAAAACTAATTAATTTCGTCTAAATGAATAAGAAGGAAAAA
AAATCTTGAATAATTAAAAATGTTTTTTCTTATGTTGCAACTTTTGTTTTGAGGGGGAGA
TGTTTGCTGGATCATCGTTTGTCATGTAAAACGCCACTGGGTGGTTATTAATTATACTTG
GTTTCTTGTAAATTAATTGCTGATAGAATTCTTTTTCTTATGG
G

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1BQ12JQ 645 0 0
GCTCACACACCGCGTATCCATCCCTATGCCAACCTTTGATTAAACGTATCACGAACCCAA
GACGTGCCACGCACCGAACCATTCAGGCTTTGGAAGCTAAGACAAAAGTGGCTTTAGCTG
AAGCGGCTAGGTACAAAGACGGTAACCAAGCAATCGCGACGTGTTACGCGACGTTTAGCG
ATGCAGTTTATAATCTTGCGAACGCGAGGAAGAGTATAAGGAAACGTGACGTGGTGGGGA
TGAACACGTTTTTGACCGCGGCTGTGTCTGATTACGGTGTATGTGTTGAAGGGTTTATTG
ACGCGAACCAAGTTAATACGGTTCAGAATGTAGCGGTTGACCTGAGAAAAATTAGCAGCA
ACTGCTTGTCGTTGTCTACATTGGTTTAGATGATTGATTACAGATTACCATTTATTTAAT
TTTTTCTCAAAACAAACAAAAAACTAATTAATTTCGTCTAAATGAATAAGAAGGAAAAAA
AATCTTGAATAATTAAAAATGTTTTTTCTTATGTTGCAACTTTTGTTTTGAGGGGGAGAT
GTTTGCTGGATCATCGTTTGTCATGTAAAACGCCACTGGGTGGTTGTTAATTATACTTGG
TTTCTTGTAAATTAATTGCTGATAGAATTCTTTTTCTTATGG
TAA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RS1AE27JQ 621 0 0
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CTTTGGAAGCTAAGACAAAAGTGGCTTTAGCTGAAGCGGCTAGGTACAAAGACGGTAACC
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CTGATTACGGTGTATGTGTTGAAGGGTTTATTGACGCGAACCAAGTTAATACGGTTCAGA
ATGTAGCGGTTGACCTGAGAAAAATTAGCAGCAACTGCTTGTCGTTGTCTACATTGGTTT
AGATGATTGATTACAGATTACCATTTATTTAATTTTTTCTCAAAACAAACAAAAAACTAA
TTAATTTCGTCTAAATGAATAAGAAGGAAAAAAAATCTTGAATAATTAAAAATGTTTTTT
CTTATGTTGCAACTTTTGTTTTGAGGGGGAGATGTTTGCTGGATCATCGTTTGTCATGTA
AAACGCCACTGGGTGGTTATTAATTATACTTGGTTTCTTGTAAATTAATTGCTGATAGAA
TTCTTTTTCTTATGGTAATTT

QA 1 621 1 621
DS 



CO CL227Contig2 597 2 2 U
GGAACTACACCAAGCTAATTTATTCTCAGTTAAACTAAAACAGATTTAAACACAAAAATA
AAAATGGCGGGCCGTGACATCTTCCAGCTGCGTTTTGCGGCTGTCGCGGTATCCGTCGCC
GTATTGACCATCCCTATGCCAACCTTTGATTAAACGTATCACGAACCCAAGACGTGCCAC
GCACCGAACCATTCAGGCTTTGGAAGCTAAGACAAAAGTGGCTTTAGCTGAAGCGGCTAG
GTACAAAGACGGTAACCAAGCAATCGCGACGTGTTACGCGACGTTTAGCGATGCAGTTTA
TAATCTTGCGAACGCGAGGAAGAGTATAAGGAAACGTGACGTGATGGGGATGAACACGTT
TTTGACCGCGGCTGTGTCTGATTACGGTGTATGTGTTGAAGGGTTTATTGACGCGAACCA
AGTTAATACGGTTCAGAATGTAGCGGTTGACCTGAGAAAAATTAGCAGCAACTGCTTGTC
GTTGTCTACATTGGTTTAGATGATTGATTACAGATTACCATTTATTTAATTTTTTCTCAA
AACAAACAAAAAACTAATTAATTTCGTCTAAATGAATAAGAAGGAAAAAAAATCTTG


BQ
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TATTTACTCGACTATGACGACGTCACTTTCTCTACCATTTACACAATAAAAACTATTTTT
TTTGAATGAACACAATAAAAACTATTGAGAAGTAGATCGAGTAAAATTAACCATAAAAGC
TTGATGAAATACCCAAGGAGGTGTGTTTGTCATCATCATCATCATCATATTATTGTGTCG
TAGTAAAGGGAAAATAGG

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DS 

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CCTCCACCTCAATACTCTCAAGCTCCGCAGCAAAAGCAACAAGCTGGTATGCTCGAAGGA
TGTTTGGCTGCGCTCTGCTGTTGCTGTCTCTTGGATGCTTGTTTCTGATCGGTGAATATA
TCAGTTCAACGATTTCTTTTCCTCTGCATGCAATGAAAAAGACATGTGTATCGTTCAACA
ATCTGCTGTTAATCTTCTTTCTTTTCGTATTTGTCTTTTAAACTTTTGTATTTTATGGAT
TATTTACTCGACTATGACGACGTCACTTTCTCTACCATTTACACAATAAAAACTATTTTT
TTTGAATGAACACAATAAAAACTATTGAGAAGTAGATCGAGTAAAATTAACCATAAAAGC
TTGATGAAATACCCAAGGAGGTGTGTTTGTCATCATCATCATCATCATATTATTGTGTCG
TAGTAAAGGGAAAATAGG

QA 1 618 1 618
DS 

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CTCGA
GTAAAATTAACCATAAAAGCTTGATGAAATACCCAAGGAGGTGTGTTTGTCATCATCATC
ATCATCATATTATTGTGTCGTAGTAAAGGGAAAATAGGAAAAAAATAAAAGTAAAATCCA
ACCATGGATATAATTCAGTGAAAAAGCTCACAGATGCTAAAATAACGAATAAAAATGAGA
GCCTTCACAGCGAAGTGTCTCCTTTTGGCCGAAAGATGGACGACGATGATGTAGTGATCA
GTTCTGTGGTTGAGGCTTGCCTTTCCACTTGAAGTTGTCAGAGTAAGACTTAGCCTTCAA
CAACGGTGTTTTGGGCTCCTTGACCACATAATCCCAGCCATGACGCTGAGCAAAAGACTT
GGCAGCTTCCTCGGAACCAAAACCAAGAGCGGAGTCACCAACATTGGCATAAGGGTCACC
CGTAGAAGTCCACCCCATCAATGGGTTCTCCCACTTGAGGGTGGAGACGAAATTGATCTT
CCATTTCCCAGGTTTTCCAGATCCTTGCTGTGTCGCCGTTCTTGCAGGTGAGTATATTAT
CACCTTTCGTGCAAGATGCTCCTCTGGGATTCCGGAGACACTACCGATCTCACCGCGCTC
GTAATCCGACGACTCCACCACCGCGTCACTTGAG

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DS 

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AGGAAAAAAATAAAAGTAAAATCCAACCATGGATATAATTCAGTGAAAAAGCTCACAGAT
GCTAAAATAACGAATAAAAATGAGAGCCTTCACAGCGAAGTGTCTCCTTTTGGCCGAAAG
ATGGACGAAGATGATGTAGTGATCAGTTCTGTGGTTGAGGCTTGCCTTTCCACTTGAAGT
TGTCAGAATAAGACTTAGCCTTCAACAACGGTGTTTTGGGCTCCTTGACCACATAATCCC
AGCCATGACGCTGAACAAAAGACTTGGCAGCTTCCTCGGAATCAAAACCAAGAGCGGAGT
CACCAACATTGGCATAAGGGTCACCCGTAGAAGTCCACCCCATCAATGGGTTCTCCCACT
TGAGGGTGGAGACGAAATTGATCTTCCATTTCCCAAGTTTTCCAGATCCTTGCTGTGTCG
CCGTTCTTGCAGGTGAGTATATTATCACCTTTCGTGCAAGATGCTCCTCTGGGATTCCGG
AGACACTACCGATCTCACCGCGCTTGTAATCCGACGACTCCACCACCGCGTCACTTGAGA
AA

QA 1 602 1 602
DS 

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TTTTTTTT
TAAAATTAACCATAAAAGCTTGATGAAATACCCAAGGAGGTGTGTTTGTCATCATCATCA
TCATCATATTATTGTGTCGTAGTAAAGGGAAAATAGGAAAAAAATAAAAGTAAAATCCAA
CCATGGATATAATTCAGTGAAAAAGCTCACAGATGCTAAAATAACGAATAAAAATGAGAG
CCTTCACAGCGAAGTGTCTCCTTTTGGCCGAGAGATGGACGAAGATGATGTAGTGATCAG
TTCTGTGGTTGAGGCTTGCCTTTCCACTTGAAGTTGTCAGAGTAAGACTTAGCCTTCAAC
AACGGTGTTTTGGGCTCCTTGACCACATAATCCCAGCCATGACGCTGAGCAAAAGACTTG
GCAGCTTCCTCGGAATCAAAACCAAGAGCGGAGTCACCAACATTGGCATAAGGGTCACCC
GTAGAAGTCCACCCCATCAATGGGTTCTCCCACTTGAGGGTGGAGACGAAATTGATCTTC
CATTTCCCAAGTTTTCCAGATCCTTGCTGTGTCGCCGTTCTTGCAGGTGAGTATATTATC
ACCTTTCGTGCAAGATGCTCCTCTGGGATTCCGGAGACACTACCGATCTCACCGCGCTTG
TAATCCGACGACTCCACCACCGCGTCACTTGAGAAAGGCCGAGCTACACGTCCGAGATTC
GCCGCGATACGAGCAGTCGCTTGAGTAGTAGCACGAAGCGCCATCGTCACGTAGAAAGTT
TGGAAATCTGGGAAAT
CC

QA 9 744 9 744
DS 

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CATCATATTATTGTGTCGTAGTAAAGGGAAAATAGGAAAAAAATAAAAGTAAAATCCAAC
CATGGATATAATTCAGTGAAAAAGCTCACAGATGCTAAAATAACGAATAAAAATGAGAGC
CTTCACAGCGAAGTGTCTCCTTTTGGCCGAGAGATGGACGAAGATGATGTAGTGATCAGT
TCTGTGGTTGAGGCTTGCCTTTCCACTTGAAGTTGTCAGAGTAAGACTTAGCCTTCAACA
ACGGTGTTTTGGGCTCCTTGACCACATAATCCCAGCCATGACGCTGAGCAAAAGACTTGG
CAGCTTCCTCGGAATCAAAACCAAGAGCGGAGTCACCAACATTGGCATAAGGGTCACCCG
TAAAAGTCCACCCCATCAATGGGTTCTCCCACTTGAGGGTGGAAACGAAATTGATCTTCC
ATTTCCCAAGTTTTCCAGATCCTTGCTGTGTCGCCGTTCTTGCAGGTGAGTATATTATCA
CCTTTCGTGCAAGATGCTCCTCTGGGATTCCGGAGACACTACCGATCTCACCGCGCTTGT
AATCCGACGACTCCACCACCGCGTCACTTGAGAAAGGCCGAGCTACACGTCCGAGATTCG
CCGCGATACGAGCAGTCGCTTGAGTAGTAGCACGAAGCGCCATCGTCACGTAGAAAGTTT
GGAAATCTGGGAAAT
CC

QA 1 735 1 735
DS 

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TGTCGTAGTAAAGGGAAAATAGGAAAAAAATAAAAGTAAAATCCAACCATGGATATAATT
CAGTGAAAAAGCTCACAGATGCTAAAATAACGAATAAAAATGAGAGCCTTCACAGCGAAG
TGTCTCCTTTTGGCCGAGAGATGGACGAAGATGATGTAGTGATCAGTTCTGTGGTTGAGG
CTTGCCTTTCCACTTGAAGTTGTCAGAGTAAGACTTAGCCTTCAACAACGGTGTTTTGGG
CTCCTTGACCACATAATCCCAGCCATGACGCTGAGCAAAAGACTTGGCAGCTTCCTCGGA
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CATCAATGGGTTCTCCCACTTGAGGGTGGAGACGAAATTGATCTTCCATTTCCCAAGTTT
TCCAGATCCTTGCTGTGTCGCCGTTCTTGCAGGTGAGTATATTATCACCTTTCGTGCAAG
ATGCTCCTCTGGGATTCCGGAGACACTACCGATCTCACCGCGCTTGTAATCCGACGACTC
CACCACCGCGTCACTTGAGAAAGGCCGAGCTACACGTCCGAGATTCGCCGCGATACGAGC
AGTCGCTTGAGTAGTAGCACGAAGCGCCATCGTCACGTAGAAAGTTTGGAAATCTGGGAA
ATAATCTCTTTGGAGCTTTTAAGTTTTTCCTCTCCTGTCCTGTCTC
CC

QA 1 766 1 766
DS 

RD RS1GB80TF 655 0 0
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CAGTTCTGTGGTTGAGGCTTGCCTTTCCACTTGAAGTTGTCAGAGTAAGACTTAGCCTTC
AACAACGGTGTTTTGGGCTCCTTGACCACATAATCCCAGCCATGACGCTGAGCAAAAGAC
TTGGCAGCTTCCTCGGAACCAAAACCAAGAGCGGAGTCACCAACATTGGCATAAGGGTCA
CCCGTAGAAGTCCACCCCATCAATGGGTTCTCCCACTTGAGGGTGGAGACGAAATTGATC
TTCCATTTCCCAGGTTTTCCAGATCCTTGCTGTGTCGCCGTTCTTGCAGGTGAGTATATT
ATCACCTTTCGTGCAAGATGCTCCTCTGGGATTCCGGAGACACTACCGATCTCACCGCGC
TCGTAATCCGACGACTCCACCACCGCGTCACTTGAGAAAGGCCGAGCTACACGTCCGAGA
TTCGCCGCGATACGAGCAGTCGCTTGAGTAGTAGCACGAAGCGTCATCGTCACGTAGAAA
GTTTGGAAATCTGGGAAATAATCTCTTTGGAGCTTTTAAGTTTTTCCTCTCCT
CC

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G
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ATCATCATATTATTGTGTCGTAGTAAAGGGAAAATAGGAAAAAAATAAAAGTAAAATCCA
ACCATGGATATAATTCAGTGAAAAAGCTCACAGATGCTAAAATAACGAATAAAGATGAGA
GCCTTCACAGCGAAGTGTCTCCTTTTGGCCGAGAGATGGACGAAGATGATGTAGTGATCA
GTTCTGTGGTTGAGGCTTGCCTTTCCACTTGAAGTTGTCAGAGTAAGACTTAGCCTTCAA
CAACGGTGTTTTGGGCTCCTTGACCACATAATCCCAGCCATGACGCCGAGCAAAAGACTT
GGCAGCTTCCTCGGAATCAAAACCAAGAGCGGAGTCACCAACATTGGCATACGGGTCACC
CGTAGAAGTCCACCCCATCAATGG*TTCTCCCACTTGAGGGTGGAGACGAAATTGATCTT
CCATTTCCCAAGTTTTCCAGATCCTTGCTGTGTCGCCGTTCTTGCAGGTGAGTATATTAT
CACCTTTCGTGCAAGATGCTCCTCTGGGATTCCGGAGACACTACCGATCTCACCGCGCTT
GTAATCCGACGACTCCACCACCGCGTCACTTGAGAAAGGCCGAGCTACACGTCCGAGATT
CGCCGCGATACGAGCAGTCGCTTGAGTAGTAGCACGAAGCGCCATCGTCACGTAGAAAGT
TTGGAAATCTGGGAAATAATCTCTTTGGAGCTTTTAAGTTTTTCCTCTCCTGTCCTGTCT
CGAGAGAGATTTGTAAGAACAAAATG

QA 2 807 2 807
DS 

RD RS1E959TF 747 0 0
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CTCACAGATGCTAAAATAACGAATAAAGATGAGAGCTTTCACAGCGAAGTGTCTC*TTTT
GGCCGAGAGATGGACGAAGATGATGTAGTGATCAGTTCTGTGGTTGAGGCTTGCCTTTCC
ACTTGAAGTTGTCAGAGTAAGACTTAGCCTTCAACAACGGTGTTTTGGGCTCCTTGACCA
CATAATCCCAGCCATGACGCCGAGCAAAAGACTTGGCAGCTTCCTCGGAATCAAAACCAA
GAGCGGAGTCACCAACATTGGCATACGGGTCACCCGTAGAAGTCCACCCCATCAATGG*T
TCTCCCACTTGAGGGTGGAGACGAAATTGATCTTCCATTTCCCAAGTTTTCCAGATCCTT
GCTGTGTCGCCGTTCTTGCAGGTGAGTATATTATCACCTTTCGTGCAAGATGCTCCTCTG
GGATTCCGGAGACACTACCGATCTCACCGCGCTTGTAATCCGACGACTCCACCACCGCGT
CACTTGAGAAAGGCCGAGCTACACGTCCGAGATTCGCCGCGATACGAGCAGTCGCTTGAG
TAGTAGCACGAAGCGCCATCGTCACGTAGAAAGTTTGGAAATCTGGGAAATAATCTCTTT
GGAGCTTTTAAGTTTTTCCTCTCCTGTCCTGTCTCGAGAGAGATTTGTAAGAACAAAATG
GGCAAGAGAGAAGTGGGGAAAAGTTCC

QA 1 747 1 747
DS 



AS 2 9

CO CL229Contig1 1161 7 13 U
GGGGAGCGTGCATAGCACACGAAAATGGTGCGATCACCACGAAAAGGTTATCCCTTTGCA
AGGCTTTCACACATCCACTAAAAAATAAAAAACCTTCTCTTTACTCTTTGCTTCATCTCA
AAAAACGCATGCAACAACAACACCATCGAAGTCCATCCATCTTCACGTATTAACTAGAAT
CAAAACAAGCTTCTTCTTGGTTTGAGATGGCATCCTCTGGTGCGGTTTCAGGAGCTACTA
CTGTCTCTTCCTTCTTCACCAAAACCTCTTCAACTTCAAACCCATCTCCCAAACTCCACT
CCTCCTCTCCTCTTCTCTTTCCCCAGAAAACTGTGTTTCATGGAGTTTCGTTGGGAGATT
CGAAGAAGAGTGTATCAGAGATCTTCGCTGTATCCGACAGAAAGATCGGTGCGTTATTAA
ACGGGTCGAGAAGATTCGAAGTCAAAGCGAGGACAGCGGCTTCGAAAACCATAGAGGTTG
AAGTGGACAAGCCTTTGGGCCTGACTCTTGGACAGAAGCAAGGTGGTGGAGTTGTCATCA
CTGGTGTGGAAGGAGGTGGAAACGCAGCAAAAGCTGGGCTTAAATCTGGAGATCAAGTTC
TGTACACAAGCAGCTTTTTTGGAGATGAGCTTTGGCCTGCTGATAAGTTGGGTTTTACTA
AAACCGCTATTCAGGCCAAACCTGATTCTGTCTACTTTGTTGTCAGCAGAGGTGCAGAAG
TTGATGTGAAGAAGCTAAATAAGCGTCCAGCTCCTCCTCGGTTTGGAAGAAAGTTAACCG
AGACTCAGAAGACAAGAGCTACTCACATTTGTCTTGATTGTGGATTCATATACACTTTAC
CAAAACCTTTTGATGAACAGCCGGATACATACGTATGTCCTCAATGTATAGCACCAAAGA
AAAGGTTTGCGAGGTACGACGTGAACACAGGGAAGGCCATAGGAGGAGGACTGCCTCCGA
TCGGTGTTATCGTTGGCTTATTGGCCGGTCTTGGAGCTGTTGGAGCTCTGCTTGTGTATG
GTCTTCAGTGATATTTTATAGAACTTGTATAAATTGTCTATCAAACAAGTCCCTACTTAA
GTTTTGTGATTCCAAACCAAGAATGAATGTTGATGACTTGATGACATCAACTTGAGAATT
TAATTCAGTTATTTTATGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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CTGGTGTGGAA
AG

QA 1 551 1 551
DS 

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GGATCTC
AAAAAACGCATGCAACAACAACACCATCGAAGTCCATCCATCTTCACGTATTAACTAGAA
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TCCTCCTCTCCTCTTCTCTTTCCCCAGAAAACTGTGTTTCATGGAGTTTCGTTGGGAGAT
TCGAAGAAGAGTGTATCAGAGATCTTCGCTGTATCCGACAGAAAGATCGGTGCGTTATTA
AACGGGTCGAGAAGATTCGAAGTCAAAGCGAGGACAGCGGCTTCGAAAACCATAGAGGTT
GAAGTGGACAAGCCTTTGGGCCTGACTCTTGGACAGAAGCAAGGTGGTGGAGTTGTCATC
ACTGGTGTGGAAGGAGGTGGAAACGCAGCAAAAGCTGGGCTTAAATCTGGAGATCAAGTT
CTGTACACAAGCAGCTTTTTTGGAGATGAGCTTTGGCCTGCTGATAAGTTGGGTTTTACT
AAAACCGCTATTCAGGCCAAACCTGATTCTGTCTACTTTGTTGTCAGCAGAGGTGCAGAA
GTTGATGTGAAGAAGCTAAATAAGCGTCCAGCTCCTCCTCGGTTTGGAAGAAAGTTAACC
GAGACTCAGAAGACA*GAGCTACTCACATTTGTCTTGATTGTGGATTCATATACACTTTA

QA 8 727 8 727
DS 

RD RS1AC92TF 257 0 0
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GAGATCAAGTTCTGTACACAAGCAGCTTTTTTGGAGATGAGCTTTGGCCTGCTGATAAGT
TGGGTTTTACTAAAACCGCTATTCACGCCAAACCTGATTCTGTCTACTTTGTTGTCAGCA
GAGGTGCAGAAGTTGATGTGAAGAAGCTAAATAAGCGTCCAGCTCCTCCTCGGTTTGGAA
GAAAGTTAACCGAGACT

QA 1 257 1 257
DS 

RD RS1A408TF 808 0 0
GG
AAAAAACGCATGCAACAACAACACCATCGAAGTCCATCCATCTTCACGTATTAACTAGAA
TCAAAACAAGCTTCTTCTTGGTTTGAGATGGCATCCTCTGGTGCGGTTTCAGGAGCTACT
ACTGTCTCTTCCTTCTTCACCAAAACCTCTTCAACTTCAAACCCATCTCCCAAACTCCAC
TCCTCCTCTCCTCTTCTCTTTCCCCAGAAAACTGTGTTTCATGGAGTTTCGTTGGGAGAT
TCGAAGAAGAGTGTATCAGAGACCTTCGCTGTATCCGACAGAAAGATCGGTGCGTTATTA
AACGGGTCGAGAAGATTCGAAGTCAAAGCGAGGACAGCGGCTTCGAAAACCATAGAGGTT
GAAGTGGACAAGCCTTTGGGCCTGACTCTTGGACAGAAGCAAGGTGGTGGAGTTGTCATC
ACTGGTGTGGAAGGAGGTGGAAACGCAGCAAAAGCTGGGCTTAAATCTGGAGATCAAGTT
CTGTACACAAGCAGCTTTTTTGGAGATGAGCTTTGGCCTGCTGATAAGTTGGGTTTTACT
AAAACCGCTATTCAGGCCAAACCTGATTCTGTCTACTTTGTTGTCAGCAGAGGTGCAGAA
GTTGATGTGAAGAAGCTAAATAAGCGTCCAGCTCCTCCTCGGTTTGGAAGAAAGTTAACC
GAGACTCAGAAGACAAGAGCTACTCACATTTGTCTTGATTGTGGATTCATATACACTTTA
CCAAAACCTTTTGATGAACAGCCGGATACATACGTATGTTCTCAATGTATAGCACCAAAG
AAAAGGTTTGCGAGGTACGACGTGA
C

QA 3 807 3 807
DS 

RD RS1AC92JQ 606 0 0
TTCGTTGGGAGATTCGAAGAAGAGTGTATCAGAGATCTTCGCTGTATCCGACAGAAAGAT
CGGTGCGTTATTAAACGGGTCGAGAAGATTCGAAGTCAAAGCGAGGACAGCGGCTTCGAA
AACCATAGAGGTTGAAGTGGACAAGCCTTTGGGCCTGACTCTTGGACAGAAGCAAGGTGG
TGGAGTTGTCATCACTGGTGTGGAAGGAGGTGGAAACGCAGCAAAAGCTGGGCTTAAATC
TGGAGATCAAGTTCTGTACACAAGCAGCTTTTTTGGAGATGAGCTTTGGCCTGCTGATAA
GTTGGGTTTTACTAAAACCGCTATTCAGGCCAAACCTGATTCTGTTTACTTTGTTGTCAG
CAGAGGTGCAGAAGTTGATGTGAAGAAGCTAAATAAGCGTCCAGCTCCTCCTCGGTTTGG
AAGAAAGTTAACCGAGACTCAGAAGACAAGAGCTACTCACATTTGTCTTGATTGTGGATT
CATATACACTTTACCAAAACCTTTTGATGAACAGCCGGATACATACGTATGTCCTCAATG
TATAGCACCAAAGAAAAGGTTTGCGAGGTACGACGTGAACACAGGGAAGGCCATAGG
AGGAGGACT

QA 1 597 1 597
DS 

RD RS1GB08JQ 513 0 0
TTTTTTGGAGATGAGCTTTGGCCTGCTGATAAGTTGGGTTTTACTAAAACCGCTATTCAG
GCCAAACCTGATTCTGTTTACTTTGTTGTCAGCAGAGGTGCAGAAGTTGATGTGAAGAAG
CTAAATAAGCGTCCAGCTCCTCCTCGGTTTGGAAGAAAGTTAACCGAGACTCAGAAGACA
AGAGCTACTCACATTTGTTTTGATTGTGGATTCATATACACTTTACCAAAACCTTTTGAT
GAACAGCCGGATACATACGTATGTCCTCAATGTATAGCACCAAAGAAAAGGTTTGCGAGG
TACGACGTGAACACAGGGAAGGCCATAGG**GAGGACTGCCTCCGATCGGTGTTATCGTT
GGCTT**TGGCCGGTCTTGGAGCTGTTGGAGCTTTGCTTGTGTATGGTTTTCAGTGATAT
TTTATAGAACTTGTATAAATTGTCTATCAAACAAGTCCCTAGTTAAGTTTTGTGATTCCA
AACCAAGAATGAATGTTGATGACTTGA
TGACAT

QA 1 507 1 507
DS 

RD RS1D639JQ 821 0 0
TTCATGAGTTCGTGGGAGA
TCGAAGAAGAGTGTATCAGAGATCTTCGCTGTATCCGACAGAAAGATCGGTGCGTT*TTA
AACGGGTCGAGAAGATTCGAAGTCAAAGCGAGGACAGCGGCTTCGAAAACCATAGAGGTT
GAAGTGGACAAGCCTTTGGGCCTGACTCTTGGACAGAAGCAAGGTGGTGGAGTTGTCATC
ACTGGTGTGGAAGGAGGTGGAAACGCAGCAAAAGCTGGGCTTAAATCTGGAGATCAAGTT
CTGTACACAAGCAGCTTTTTTGGAGATGAGCTTTGGCCTGCTGATAAGTTGGGTTTTACT
AAAACCGCTATTCAGGCCAAACCTGATTCTGTTTACTTTGTTGTCAGCAGAGGTGCAGAA
GTTGATGTGAAGAAGCTAAATAAGCGTCCAGCTCCTCCTCGGTTTGGAAGAAAGTTAACC
GAGACTCAGAAGACAAGAGCTACTCACATTTGTCTTGATTGTGGATTCATATACACTTTA
CCAAAACCTTTTGATGAACAGCCGGATACATACGTATGTCCTCAATGTATAGCACCAAAG
AAAAGGTTTGCGAGGTACGACGTGAACACAGGGAAGGCCATAGGAGGAGGACTGCCTCCG
ATCGGTGTTATCGTTGGCTTATTGGCCGGTCTTGGAGCTGTTGGAGCTCTGCTTGTGTAT
GGTCTTCAGTGATATTTTATAGAACTTGTATAAATTGTCTATCAAACAAGTCCCTACTTA
AGTTTTGTGATTCCAAACCAAGAATGAATGTTGATGACTTGATGACATCAACTTGAGAAT
TTAATTCAGTTATTTTATGTCG

QA 20 821 20 821
DS 



CO CL229Contig2 688 2 2 U
GGGTGGTCAGAGTGGAGCGTGCATAGCACACGAAAATGGTGCTATCACCACGAAAAGGTT
ATCCCTTTGCAAGGCTTTCACACATCCACTAAAAAATAAAAAACCTTCTCTTTACTCTTT
GCTTCATCTCAAAAAACGCATGCAACAACAACACCATCGAAGTCCATCCATCTTCACGTA
TTAACTAGAATCAAAACAAAGCTTCTTCTTCTTCTTGGTTTGAGATGGCATCCTCTGGTG
CGGTTTCAGGAGCTACTACTGTCTCTTCCTTCTTCACCAAAACCTCTTCAGTTTCAAACC
CATCTCCCAAACTTCAGTCCTCGTCTCCTCTTCTCTTTCCCCAGAAAACTGTGTTTCATG
GAGTTTCGTTGGGAGATTCGAAGAGGAGTGTATCAGAGACCTTCGCTGTATCCGACCGAA
AGATCGGTGTGTTATTAAACGGGTCGAGAAGATTCCAAGTCAAAGCGAGGACAGCAGCTT
CGAAAACCATAGAGGTTGAAGTGGACAAGCCTTTGGGCCTGACTCTTGGACAGAAGCAAG
GTGGTGGAGTTGTCATCACTGGTGTGGAAGGAGGTGGAAACGCAGCAAAAGCTGGGCTTA
AATCTGGAGATCAAGTTCTGTACACAAGCAGCTTTTTTGGAGATGAGCTTTGGCCTGCTG
ATAAGTTGGGTTTTACTAAAACCGCTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GB08TF U 1
AF RS1FO77TF U 143
BS 1 661 RS1GB08TF
BS 662 688 RS1FO77TF

RD RS1GB08TF 661 0 0
GGGTGGTCAGAGTGGAGCGTGCATAGCACACGAAAATGGTGCTATCACCACGAAAAGGTT
ATCCCTTTGCAAGGCTTTCACACATCCACTAAAAAATAAAAAACCTTCTCTTTACTCTTT
GCTTCATCTCAAAAAACGCATGCAACAACAACACCATCGAAGTCCATCCATCTTCACGTA
TTAACTAGAATCAAAACAAAGCTTCTTCTTCTTCTTGGTTTGAGATGGCATCCTCTGGTG
CGGTTTCAGGAGCTACTACTGTCTCTTCCTTCTTCACCAAAACCTCTTCAGTTTCAAACC
CATCTCCCAAACTTCAGTCCTCGTCTCCTCTTCTCTTTCCCCAGAAAACTGTGTTTCATG
GAGTTTCGTTGGGAGATTCGAAGAGGAGTGTATCAGAGACCTTCGCTGTATCCGACCGAA
AGATCGGTGTGTTATTAAACGGGTCGAGAAGATTCCAAGTCAAAGCGAGGACAGCAGCTT
CGAAAACCATAGAGGTTGAAGTGGACAAGCCTTTGGGCCTGACTCTTGGACAGAAGCAAG
GTGGTGGAGTTGTCATCACTGGTGTGGAAGGAGGTGGAAACGCAGCAAAAGCTGGGCTTA
AATCTGGAGATCAAGTTCTGTACACAAGCAGCTTTTTTGGAGATGAGCTTTGGCCTGCTG
A

QA 1 661 1 661
DS 

RD RS1FO77TF 546 0 0
G
AACAACAACACCATCGAAGTCCATCCATCTTCACGTATTAACTAGAATCAAAACAAAGCT
TCTTCTTCTTCTTGGTTTGAGATGGCATCCTCTGGTGCGGTTTCAGGAGCTACTACTGTC
TCTTCCTTCTTCACCAAAACCTCTTCAGTTTCAAACCCATCTCCCAAACTTCAGTCCTCG
TCTCCTCTTCTCTTTCCCCAGAAAACTGTGTTTCATGGAGTTTCGTTGGGAGATTCGAAG
AGGAGTGTATCAGAGACCTTCGCTGTATCCGACCGAAAGATCGGTGTGTTATTAAACGGG
TCGAGAAGATTCCAAGTCAAAGCGAGGACAGCAGCTTCGAAAACCATAGAGGTTGAAGTG
GACAAGCCTTTGGGCCTGACTCTTGGACAGAAGCAAGGTGGTGGAGTTGTCATCACTGGT
GTGGAAGGAGGTGGAAACGCAGCAAAAGCTGGGCTTAAATCTGGAGATCAAGTTCTGTAC
ACAAGCAGCTTTTTTGGAGATGAGCTTTGGCCTGCTGATAAGTTGGGTTTTACTAAAACC
GCTAT

QA 2 546 2 546
DS 



AS 2 11

CO CL230Contig1 1196 9 30 U
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ATGGGACCAGTGAAGAAGGCCATGGATGATGCTGGTCTACAGAAGAGTCAGATTGATGAG
ATTGTCCTTGTTGGTGGAAGTACTAGAATCCCCAAGGTTCAGCAGCTGTTGAAGGACTTC
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CGGCTGTTCAGGGTGGTATTCTGAGCGGAGAAGGTGGTGACGAGACCAAAGACATCCTTC
TTCTTGACGTTGCACCACTCACTTTGGGTATTGAGACCGTGGGAGGAGTGATGACCAAAC
TTATCCCGAGAAACACAGTTATTCCGACCAAGAAGTCTCAGGTGTTCACGACATACCAAG
ACCAACAGACCACCGTCTCCATTCAGGTCTTT*GAAGGTGAGCGAAGTCTCACCAAGGAC
TGCAGACTGCTCGGAAACTTCGACCTCACCGGAATCCCACCAGCACCAAGAGGAACACCT
CAAATCGAGGTTACCTTTGAAGTTGACGCCAACGGTATCCTGAACGTGAAAGCAGAGGAC
AAGGCAAGTGGTAAATCAGAGAAGATCACAATCACAAACGAGAAGGGACGTCTGAGCCAG
GAAGAGATTGACCGGATGGTGAAGGAGGCAGAGGAGTTTGCAGAGGAAGACAAGAAGGTG
AAGGAGAGAATCGACGCAAGGAACAGCCTCGAGACTTACGTGTACAACATGAAGAACCAA
ATAAACGACAAGGACAAGCTCGCAGACAAACTTGAGGGTGACGAGAAGGAGAAGATTGAG
GCAGCGACGAAAGAAGCCTTGGAGTGGCTCGACGAGAACCAAAACTCGGAGAAGGAAGAG
TACGACGAGAAGTTGAAGGAAGTAGAGGCAGTTTGTAACCCAATCATCACGGCCGTTTAT
CAGAGGTCAGGTGGTGCGCCAGGTGGTGCTGG*TGGAGAAGGAGCGACCGAAGAGGAGGA
TGAGTCTCACGATGAGCTCTAAGTTGTTTAATGTTGTTTTTATTGTTAATTTGATTAGAC
AGACCTCTTGGTGAAAGTTTTGAGGGATAAAGAAGAAGAAGAACTCTTTTGTTTCCTTTT
TTATATGTATTATTTTGGTTTTAGACCAAGTAGTATCCTTTTGTCCGTTCCATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 10 10 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CR29TF U 110
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AF RS1B577TF U 1
AF RS1BF47TF U 338
AF RS1GY23TF U 926
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TGCTTACGGTGCGGCTGTTCAGGGTGGTATTCTGAGCGGAGAAGGTGGTGACGAGACCAA
AGACATCCTTCTTCTTGACGTTGCACCACTCACTTTGGGTATTGAGACCGTGGGAGGAGT
GATGACCAAACTTATCCCGAGAAACACAGTTATTCCGACCAAGAAGTCTCAGGTGTTCAC
GACATACCAAGACCAACAGACCACCGTCTCCATTCAGGTCTTTTGAAGGTGAGCGAAGTC
TCACCAAGGACTGCAGACTGCTCGGAAACTTCGGCCTCACCGGAATCCCACCAGCACCAA
GAGGAACACCTCAAATCGAGGT*ACCTTTGAAGTTGACGCCAACGGTATCCTGAGCGTGA
AAGC

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DS 

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ATCCTTCTTCTTGACGTTGCACCACTCACTTTGGGTATTGAGACCGTGGGAGGAGTGATG
ACCAAACTTATCCTGAGAAACGCAGTTATTCCGACCAAGAAGTCTCAGGTGTTCACGACA
TACCAAGACCAACAGACCACCGTCTCCATTCAG*TCTTTTGAAGGTGAGCGAAGTCTCAC
CAAGGACTGCAGACTGCCCGGAAACTTCGACCTCACCGGAATCCCACCAGCACCAAGAGG
AGCACCTCAAATCGAGGT*ACCTTTGAAGTTG

QA 1 332 1 332
DS 

RD RS1B577TF 682 0 0
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ATGGGACCAGTGAAGAAGGCCATGGATGATGCTGGTCTACAGAAGAGTCAGATTGATGAG
ATTGTCCTTGTTGGTGGAAGTACTAGAATCCCCAAGGTTCAGCAGCTGTTGAAGGACTTC
TTCGAAGGGAAAGAGCCAAACAAGGGTGTGAACCCC*GACGAAGCTGTT*GCTTACGGTG
CGGCTGTTCAGGGTGGTATTCTGAGCGGAGAAGGTGGTGACGAGACCAAAGACATCCTTC
TTCTTGACGTTGCACCACTCACTTTGGGTATTGAGACCGTGGGAGGAGTGATGACCAGAC
TTATCCCGAGAAACACAGTTATTCCGACCAAGAAGTCTCAGGTGTTCACGACATACCAAG
ACCAACAGACCACCGTCTCCATTCAGGTCTTT*GAAGGTGAGCGAAGTCTCACCAAGGAC
TGCAGACTGCTCGGAAACTTCGACCTCACCGGAATCCCACCAGCACCAAGAGGAACACCT
CAAATCGAGGTTACCTTTGAAGTTGACGCCAACGGTATCCTGAACGTGAAAGCAGAGGAC
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GA*GAGATTGACCGGATGGTGA

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1BF47TF 718 0 0
G
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CAGGTGTTCACGACATACCAAGACCAACAGACCACCGTCTCCATTCAGGTCTTT*GAAGG
TGAGCGAAGTCTCACCAAGGACTGCAGACTGCTCGGAAACTTCGACCTCACCGGAATCCC
ACCAGCACCAAGAGGAACACCTCAAATCGAGGTTACCTTTGAAGTTGACGCCAACGGTAT
CCTGAACGTGAAAGCAGAGGACAAGGCAAGTGGTAAATCAGAGAAGATCACAATCACAAA
CGAGAAGGGACGTCTGAGCCAGGAAGAGATTGACCGGATGGTGAAGGAGGCAGAGGAGTT
TGCAGAGGAAGACAAGAAGGTGAAGGAGAGAATCGACGCAAGGAACAGCCTCGAGACTTA
CGTGTACAACATGAAGAACCAAATAAACGACAAGGACAAGCTCGCAGACAAACTTGAGGG
TGACGAGAAGGGGAAGATTGAGGCAGCGACGAAAGAAGCCTTGGAGTGGCTCGACGAGAA
CCAAAACTCGGAGAAGGAAGAGTACGACGAGAAGTTGAAGGAAGTAGAGGCAGTTTGTAA
CCCAATCATCACGGCCGTTTATCAGAGGTCAGGTGGTGCGCCAGGTGGTGCTGGGTGGAG
AAGGAGCGACCGAAGAGGAG*ATGAGTCTCACGATGAGCTCTA*GTTGTTTAATGTT

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DS 

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G
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TGCTGG*TGGAGAAGGAGCGACCTAAGAGGAGGATGAGTCTCACGATGAGCTCTAAGTTG
TTTAATGTTGTTTTTATTGTTAATTTGATTAAACAGACCTCTTGGTGAAAGTTTTGAGGG
ATAAAGAAGA

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ACCAAGAGGAGCACCTCAAATCGAGGTTACCTTTGAAGTTGACGCCAACGGTATCCTGAA
CGTGAAAGCAGAGGACAAGGCAAGTGGTAAATCAGAGAAGATCACAA******ACGAGAA
GGGACGTTTGAGCCAGGAAGAGATTGACCGGATGGTGAAGGAGGCAGAGGAGTTTGCAGA
GGAAGACAAGAAGGTGAAGGAGAGAATCGACGCAAGGAACAGCCTCGAGACTTACGTGTA
CAACATGAAGAACCAAATAAACGACAAGGACAAGCTCGCAGACAAACTTGAGGGTGACGA
GAAGGAGAAGATTGAGGCAGCGACGAAAGAAGCCTTGGAGTGGCTTGACGAGAACCAAAA
CTCGGAGAAGGAAGAGTACGACGAGAAGTTGAAGGAAGTAGAGGCAGTTTGTAACCCAAT
CATCACGGCCGTTTATCAGAGGTCAGGTGGTGCGCCAGGTGGTGCTGG*TGGAGAAGGAG
CGACCGAAGAGGAGGATGAGTCTCACGATGAGCTCTAAGTTGTTTAATGTTGTTTTTATT
GTTAATTTGATTAGACAGACCTCTTGGTGAAAGTTTTGAGGGATAAAGAAGAAGAAG

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DS 

RD RS1BF47JQ 759 0 0
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CTTCGACCTCACCGGAATCCCACCAGCACCAAGAGGAACACCTCAAATCGAGGTTACCTT
TGAAGTTGACGCCAACGGTATCCTGAACGTGAAAGCAGAGGACAAGGCAAGTGGTAAATC
AGAGAAGATCACAATCACAAACGAGAAGGGACGTCTGAGCCAGGAAGAGATTGACCGGAT
GGTGAAGGAGGCAGAGGAGTTTGCAGAGGAAGACAAGAAGGTGAAGGAGAGAATCGACGC
AAGGAACAGCCTCGAGACTTACGTGTACAACATGAAGAACCAAATAAACGACAAGGACAA
GCTCGCAGACAAACTTGAGGGTGACGAGAAGGGGAAGATTGAGGCAGCGACGAAAGAAGC
CTTGGAGTGGCTCGACGAGAACCAAAACTCGGAGAAGGAAGAGTACGACGAGAAGTTGAA
GGAAGTAGAGGCAGTTTGTAACCCAATCATCACGGCCGTTTATCAGAGGTCAGGTGGTGC
GCCAGGTGGTGCTGG*TGGAGAAGGAGCGACCGAAGAGGAGGATGAGTCTCACGATGAGC
TCTAAGTTGTTTAATGTTGTTTTTATTGTTAATTTGATTAGACAGACCTCTTGGTGAAAG
TTTTGAGGGATAAAGAAGAAGAGAA*CTCTTTTGTTTCCTTTT**ATATGTATTATTTTG
GTTTTAGACCAAGTAGTATCCTTTTGTCCGTTCCATTTT

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DS 

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GACTGCTCGGAAACTTCGACCCCACCGGAATCCCACCAGCACCAAGAGGAACACCTCAAA
TCGAGGTTACCTTTGAAGTTGACGCCAACGGTATCCTGAACGTGAAAGCAGAGGACAAGG
CAAGTGGTAAATCAGAGAAGATCACAATCACAAACGAGAAGGGACGTCTGAGCCAGGAAG
AGATTGACCGGATGGTGAAGGAGGCAGAGGAGTTTGCAGAGGAAGACAAGAAGGTGAAGG
AGAGAATCGACGCAAGGAACAGCCTCGAGACTTACGTGTACAACATGAAGAACCAAATAA
ACGACAAGGACAAGCTCGCAGACAAACTTGAGGGTGACGAGAAGGAGAAGATTGAGGCAG
CGACGAAAGAAGCCTTGGAGTGGCTTGACGAGAACCAAAACTCGGAGAAGGAAGAGTACG
ACGAGAAGTTGAAGGAAGTAGAGGCAGTTTGTAACCCAATCATCACGGCCGTTTATCAGA
GGTCAGGTGGTGCGCCAGGTGGTGCTGG*TGGAGAAGGAGCGACCGAAGAGGAGGATGAG
TCTCACGATGAGCTCTAAGTTGTTTAATGTTGTTTTTATTGTTAATTTGATTAGACAGAC
CTCCTGGTGAAAGTTTTGAGGGATAAAGAAGAAGAAGAACTCTTTTGTTTCCTTTTTTAT
ATGTATT

QA 1 667 1 667
DS 

RD RS1CR29JQ 714 0 0
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CTTCGGCCTCACCGGAATCCCACCAGCACCAAGAGGAACACCTCAAATCGAGGTTACCTT
TGAAGTTGACGCCAACGGTATCCTGAGCGTGAAAGCAGAGGACAAGGTAAGTGGTAAATC
AGAGAAGATCACAATCACAAACGAGAAGGGACGTCTGAGCCAGGAAGAGATTGACCGGAT
GGTGAAGGAGGCAGAGGAGTTTGCAGAGGAAGACGAGAAGGTGAAGGAGGGAATCGACGC
AAGGAACAGCCTCGAGACTTACGTGTACAACATGAAGAACCAAATAAACGACAAGGACAA
GCTCGCAGACAAACTTGAGGGTGACGAGAAGGAGAAGATTGAGGCAGCTACGAAAGAAGC
CTTGGAGTGGCTTGACGAGAACCAAAACTCGGAGAAGGAAGAGTACGACGAGAAGTTGAA
GGAAGTAGAGGCAGTTTGTAACCCAATCATCACGGCCGTTTATCAGAGGTCAGGTGGTGC
GCCAGGTGGTGCTGG*TGGAGAAGGAGCGACCGAAGAGGAGGATGAGTCTCACGATGAGC
TCTAAGTTGTTTAATGTTGTTTTTATTGTTAATTTGATTAGACAGACCTCTTGGTGAAAG
TTTTGAGGGATAAAGAAGAAGAAGAACTCTTTTGTTTCCTTTTTTATATGTATT

QA 1 714 1 714
DS 



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AAAACCAAAATAATACATATAAAAAAGGAAACAAAAGAGTTCTTCTTCTTCTTTATCCCT
CAAAACTTTCACCAAGAGGTCTGTCTAATCAAATTAACAATAAAAACAACATTAAACAAC
TTAGAGCTCATCGTGAGACTCATCCTCCTCTTCGGTCGCTCCTTCTCCACCAGCACCACC
TGGCGCACCACCTGACCTCTGATAAA


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BH39TF C 1
AF RS1BH39JQ U 2
BS 1 1 RS1BH39TF
BS 2 266 RS1BH39JQ

RD RS1BH39TF 266 0 0
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AAAACCAAAATAATACATATAAAAAAGGAAACAAAAGAGTTCTTCTTCTTCTTTATCCCT
CAAAACTTTCACCAAGAGGTCTGTCTAATCAAATTAACAATAAAAACAACATTAAACAAC
TTAGAGCTCATCGTGAGACTCATCCTCCTCTTCGGTCGCTCCTTCTCCACCAGCACCACC
TGGCGCACCACCTGACCTCTGATAAA

QA 1 266 1 266
DS 

RD RS1BH39JQ 265 0 0
AGAAAAATGGATCAAGATAATATGGATAAAATGGAACGGACAAAGGGATACTACTGTCTA
AAACCAAAATAATACATATAAAAAAGGAAACAAAAGAGTTCTTCTTCTTCTTTATCCCTC
AAAACTTTCACCAAGAGGTCTGTCTAATCAAATTAACAATAAAAACAACATTAAACAACT
TAGAGCTCATCGTGAGACTCATCCTCCTCTTCGGTCGCTCCTTCTCCACCAGCACCACCT
GGCGCACCACCTGACCTCTGATAAA

QA 1 265 1 265
DS 



AS 1 11

CO CL231Contig1 841 11 24 U
GGAGAGCGATATATTATCTCTCCGTCTCTCTCTCACACCAGATTTCAATCATCGACTCGA
TT*TCAGATCCGAGATACAAACTCCGAACATGTCTACCTTCAGCGGCGATGAAACAGCTC
CCTTCTTCGGTTTCCTCGGCGCCGCAGCCGCACTCGTCTTCTCCTGTATGGGAGCTGCAT
ATGGAACAGCAAAGAGTGGTGTAGGTGTGGCTTCGATGGGAGTGATGAGACCCGAGCTTG
TGATGAAATCCATCGTCCCTGTCGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATCTACGGTTTGATTA
TTGCTGTTATCATCAGTACCGGGATTAACCCCAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTCGACG
GATACGCACATCTCTCCTCCGGTCTCGCTTGTGGTCTTGCTGGTCTTTCCGCTGGAATGG
CCATTGGTATTGTGGGTGATGCTGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTCTTTG
TCGGGATGATTCTTATCCTTATTTTCGCTGAAGCGCTTGCTCTTTATGGGCTTATTGTAG
GTATCATCCTTTCCTCTAGAGCTGGTCAGTCTAGAGCTGAATGAGAAAGTTATCTCAAGA
TTTACCACCCCAATTGTACTACTTGCTTTACTTTCTGTGTGCGTTCTTTAGTATGTATCG
TCGACACTGAAACATTTACTGGATTCTTGGAGCTTTGTTTCAGAAACAAAACCAGCTATG
GGTTATTTATTGTTTGGTTATGTAATAAAGAGCTCAGAGCAGCTTTGATTTTTTTTTTTG
TATTCTTGTATTGTCCTGAGGAATTTAAAATACATTTATTTGTAAAGAAGTATGCTTTCT
G


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 40 40 40 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 
5 65 65 65 65 65 5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
5 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 55 55 40 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1D792TF U 1
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BS 449 449 RS1GM43TF
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CCTTCTTCGGTTTCCTCGGCGCCGCAGCCGCACTCGTCTTCTCCTGTATGGGAGCGGCAT
ACGGAACCGCAAAGAGTGGTGTAGGTGTGGCTTCGATGGGAGTGATGAGACCCGAGCTTG
TAATGAAATCCATCGTCCCTGTCGTTATGGCTGGTGTGTTGG

QA 1 282 1 282
DS 

RD RS1GM43TF 434 0 0
GGG
TCGACTCGATT*TCAGATCCGAGATACAAACTCCGAACATGTCTACCTTCAGCGGCGATG
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CCGAGCTTGTAATGAAATCCATCGTCCCTGTCGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATCTACG
GTTTGATTATTGCTGTTATCATCAGTACCGGGATTAACCCCAAGGCTAAGTCTTACTACC
TCTTCGACGGATACGCACATCTCTCCTCCGGTCTCGCTTGTGGTCTTGCTGGTCTTTCCG
CTGGAATGGCCATTGGTATTGTGGGTGATGCTGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTA
AGCTCTTTGTC

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DS 

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TT*TCAGATCCGAGATACGAACTCCGAACATGTCTACCTTCAGCGGCGATGAAACAGCTC
CCTTCTTCGGTTTCCTCGGCGCCGCAGCCGCACTCGTCTTCTCCTGTATGGGAGCGGCAT
ACGGAACCGCAAAGAGTGGTGTAGGTGTGGCTTCGATGGGAGTGATGAGACCCGAGCTTG
TAATGAAATCCATCGTCCCTGTCGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATCTACGGTTTGATTA
TTGCTGTTATCATCAGTACCGGGATTAACCCCAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTCGACG
GATACGCACATCTCTCCTCCGGTCTCGCTTGTGGTCTTGCTGGTCTTTCCGCTGGAATGG
CCATTGGTATTGTGGGTGATGCTGGTGTTAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTCTTTG
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GTATCATCCTTTCCTCTAGAGCTGGTCAGTCTAGAGCTGAATGAGAAAGTTATCTCAAGA
TTTACCACCCCAATTGTACTACTTGCTTTACTTTCTGTGTGCGTTCTTTAGTATGTATCG
TCGACACTGAAACATTTACTGGATTCTTGGAGCTTTGTTTCAGAAAC

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DS 

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GG
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GAGACCCGAGCTTGTGATGAAATCCATCGTCCCTGTCGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTAT
CTACGGTTTGATTATTGCTGTTATCATCAGTACCGGGATTAACCCCAAGGCTAAGTCTTA
CTACCTCTTCGACGGATACGCACATCTCTCCTCCGGTCTCGCTTGTGGTCTTGCTGGTCT
TTCCGCTGGAATGGCCATTGGTATTGTGGGTGATGCTGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCA
GCCTAAGCTCTTTGTCGGGATGATTCTTATCCTTATTTTCGCTGAAGCGCTTGCTCTTTA
TGGGCTTATTGTAGGTATCATCCTTTCCTCTAGAGCTGGTCAGTCTAGAGCTGAATGAGA
AAGTTATCTCAAGATTTACCACCCCAATTGTACTACTTGCTTTACTTTCTGTGTGCGTTC
TTTAGTATGTATCGTCGACACTGAAACATTTACTGGATTCTTGGAGCTTTGCTTCAGAAA
CAAAACCAGCTATGGGT

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DS 

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GG
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AGACCCGAGCTTGTGATGAAATCCATCGTCCCTGTCGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATC
TACGGTTTGATTATTGCTGTTATCATCAGTACCGGGATTAACCCCAAGGCTAAGTCTTAC
TACCTCTTCGACGGATACGCACATCTCTCCTCCGGTCTCGCTTGTGGTCTTGCTGGTCTT
TCCGCTGGAATGGCCATTGGTATTGTGGGTGATGCTGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCAG
CCTAAGCTCTTTGTCGGGATGATTCTTATCCTTATTTTCGCTGAAGCGCTTGCTCTTTAT
GGGCTTATTGTAGGTATCATCCTTTCCTCTAGAGCTGGTCAGTCTAGAGCTGAATGAGAA
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AAAACCAGCTATGGGTTATTTATTGTTTGGTTATGTAATAAAGAGCTCAGAGCAGCTTTG
A
GTAAAAAAA

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DS 

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GG
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GATGAAACAGCTCCCTTCTTCGGTTTCCTCGGCGCCGCAGCCGCACTCGTCTTCTCCTGT
ATGGGAGCTGCATATGGAACAGCAAAGAGTGGTGTAGGTGTGGCTTCGATGGGAGTGATG
AGACCCGAGCTTGTGATGAAATCCATCGTCCCTGTCGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATC
TACGGTTTGATTATTGCTGTTATCATCAGTACCGGGATTAACCCCAAGGCTAAGTCTTAC
TACCTCTTCGACGGATACGCACATCTCTCCTCCGGTCTCGCTTGTGGTCTTGCTGGTCTT
TCCGCTGGAATGGCCATTGGTATTGTGGGTGATGCTGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCAG
CCTAAGCTCTTTGTCGGGATGATTCTTATCCTTATTTTCGCTGAAGCGCTTGCTCTTTAT
GGGCTTATTGTAGGTATCATCCTTTCCTCTAGAGCTGGTCAGTCTAGAGCTGAATGAGAA
AGTTATCTCAAGATTTACCACCCCAATTGTACTACTTGCTTTACTTTCTGTGTGCGTTCT
TTAGTATGTATCGTCGACACTGAAACATTTACTGGATTCTTGGAGCTTTGTTTCAGAAAC
AAAACCAGCTATGGGTTATTTATTGTTTGGTTATGTAATAAAGAGCTCAGAGCAGCTTTG
A
GT

QA 3 723 3 723
DS 

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GG
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CGTTGAAACAGCTCCCTTCTTCGGTTTCCTCGGCGCCGCAGCCGCACTCGTCTTCTCCTG
TATGGGAGCTGCATATGGAACAGCAAAGAGTGGTGTAGGTGTGGCTTCGATGGGAGTGAT
GAGACCCGAGCTTGTGATGAAATCCATCGTCCCTGTCGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTAT
CTACGGTTTGATTATTGCTGTTATCATCAGTACCGGGATTAACCCCAAGGCTAAGTCTTA
CTACCTCTTCGACGGATACGCACATCTCTCCTCCGGTCTCGCTTGTGGTCTTGCTGGTCT
TTCCGCTGGAATGGCCATTGGTATTGTGGGTGATGCTGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCA
GCCTAAGCTCTTTGTCGGGATGATTCTTATCCTTATTTTCGCTGAAGCGCTTGCTCTTTA
TGGGCTTATTGTAGGTATCATCCTTTCCTCTAGAGCTGGTCAGTCTAGAGCTGAATGAGA
AAGTTATCTCAAGATTTACCACCCCAATTGTACTACTTGCTTTACTTTCTGTGTGCGTTC
TTTAGTATGTATCGTCGACACTGAAACATTTACTGGATTCTTGGAGCTTTGCTTCAGAAA
CAAAACCAGCTATGGGTTATTTATTGTTTGGTTATGTAATAAAGAGCTCAGAGCAGCTTT
GATTTTTTTTTTTGTATTCTTGTATTGTCCTGAGGA*TTTAAAATACATTTATTTG
C

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DS 

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GTGATGAGACCCGAGCTTGTAATGAAATCCATCGTCCCTGTCGTTATGGCTGGTGTGTTG
GGTATCTACGGTTTGATTATTGCTGTTATCATCAGTACCGGGATTAACCCCAAGGCTAAG
TCTTACTACCTCTTCGACGGATACGCACATCTCTCCTCCGGTCTCGCTTGTGGTCTTGCT
GGTCTTTCCGCTGGAATGGCCATTGGTATTGTGGGTGATGCTGGTGTCAGGGCAAATGCT
CAGCAGCCTAAGCTCTTTGTCGGGATGATTCTTATCCTTATTTTCACTGAAGCGCTTGCT
CTTTATGGGCTTATTGTAGGTATCATCCTTTCCTCTAGAGCTGGTCAGTCTAGAGCTGAA
TGAGAAAGTTATCTCAAGATTTACCACCCCAATTGTACTACTTGCTTTACTTTCTGTGTG
CGTTCTTTAGTATGTATCGTCGACACTGAAACATTTACTGGATTCTTGGAGCTTTGTTTC
AGAAACAAAACCAGCTATGGGTTATTTATTGTTTGGTTATGTAATAAAGAGCTCAGAGCA
GCTTTGATTTTTTTTT**GTATTCTTGTATTGTCCTGAGGAATTTAAAATACATTTATTT
GTAAAGAAGTATGCTTT
TTG

QA 1 737 1 737
DS 

RD RS1GL86JQ 666 0 0
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GGGAGTGATGAGACCCGAGCTTGTGATGAAATCCATCGTCCCTGTCGTTATGGCTGGTGT
GTTGGGTATCTACGGTTTGATTATTGCTGTTATCATCAGTACCGGGATTAACCCCAAGGC
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TGCTGGTCTTTCCGCTGGAATGGCCATTGGTATTGTGGGTGATGCTGGTGTCAGGGCAAA
TGCTCAGCAGCCTAAGCTCTTTGTCGGGATGATTTTTATCCTTATTTTCGCTGAAGCGCT
TGCTCTTTATGGGCTTATTGTAGGTATCATCCTTTCCTCTAGAGCTGGTCAGTCTAGAGC
TGAATGAGAAAGTTATCTCAAGATTTACCACCCCAATTGTACTACTTGCTTTACTTTCTG
TGTGCGTTCTTTAGTATGTATCGTCGACACTGAAACATTTACTGGATTCTTGGAGCTTTG
CTTCAGAAACAAAACCAGCTATGGGTTATTTATTGTTTGGTTATGTAATAAAGAGCTCAG
AGCAGCTTTGATTTTTTTTTTTGTATTCTTGTATTGTCCTGAGGAATTTAAAATACATTT
ATTTG
C

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1GM37JQ 663 0 0
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AGTGATGAGACCCGAGCTTGTGATGAAATCCATCGTCCCTGTCGTTATGGCTGGTGTGTT
GGGTATCTACGGTTTGATTATTGCTGTTATCATCAGTACCGGGATTAACCCCAAGGCTAA
GTCTTACTACCTCTTCGACGGATACGCACATCTCTCCTCCGGTCTCGCTTGTGGTCTTGC
TGGTCTTTCCGCTGGAATGGCCATTGGTATTGTGGGTGATGCTGGTGTCAGGGCAAATGC
TCAGCAGCCTAAGCTCTTTGTCGGGATGATTCTTATCCTTATTTTCGCTGAAGCGCTTGC
TCTTTATGGGCTTATTGTAGGTATCATCCTTTCCTCTAGAGCTGGTCAGTCTAGAGCTGA
ATGAGAAAGTTATCTCAAGATTTACCACCCCAATTGTACTACTTGCTTTACTTTCTGTGT
GCGTTCTTTAGTATGTATCGTCGACACTGAAACATTTACTGGATTCTTGGAGCTTTGCTT
CAGAAACAAAACCAGCTATGGGTTATTTATTGTTTGGTTATGTAATAAAGAGCTCAGAGC
AGCTTTGATTTTTTTTTTTGTATTCTTGTATTGTCCTGAGGAATTTAAAATACATTTATT
TG
C

QA 1 662 1 662
DS 

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ACCGCAAAGAGTGGTGTAGGTGTGGCTTCGATGGGAGTGATGAGACCCGAGCTTGTAATG
AAATCCATCGTCCCTGTCGTTATGGCTGGTGTGTTGGGTATCTACGGTTTGATTATTGCT
GTTATCATCAGTACCGGGATTAACCCCAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTCGACGGATAC
GCACATCTCTCCTCCGGTCTCGCTTGTGGTCTTGCTGGTCTTTCCGCTGGAATGGCCATT
GGTATTGTGGGTGATGCTGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTCTTTGTCGGG
ATGATTCTTATCCTTATTTTCGCTGAAGCGCTTGCTCTTTATGGGCTTATTGTAGGTATC
ATCCTTTCCTCTAGAGCTGGTCAGTCTAGAGCTGAATGAGAAAGTTATCTCAAGATTTAC
CACCCCAATTGTACTACTTGCTTTACTTTCTGTGTGCGTTCTTTAGTATGTATCGTCGAC
ACCGAAACATTTACTGGATTCTTGGAGCTTTGTTTCAGAAACAAAACCAGCTATGGGTTA
TTTATTGTTTGGTTATGTAATAAAGAGCTCAGAGCAGCTTTGATTTTTTTTT**GTATTC
TTGTATTGTCCTGAGGAATTTAAAATACATTTATTTGTAAAGAAGTATGCTTTCTG

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 9

CO CL232Contig1 837 9 10 U
TTTTTAAACAGGGGTTCAATTCACTGAAACCAATGAAAATGCAAGCAGTTCTCATCATCC
TGGTTTTCTCCGGTTTACTGGCAGTTAAGACAACGTTAGCAGCACAACATGTGATAGGCG
GGAGCCAAGGCTGGGAACAATCCGTTGACTTTGATTCTTGGACGTCCGATAAATCTTTCA
AAGTCGGGGACCAACTTGTTTTTAAGTATTCCGGACTACACAGCGTTGTGGAGCTGGGAA
GCGAAACGGCATACAAGAGCTGTGACCTGGGAACACCTGTAAATTCCTTAAGCTCTGGGA
ACGACGTCGTTAAGCTTTCTAAAACCGGTGCTCGTTATTTCGCATGTGGGACCCCAGGGC
ATTGCGAATCAGGCATGAAGGTTAAAGTCAATGTTGTCTCTGCTGACTCTACCGCCGTTT
CCTCTCCGGGTTCGGATTCAAGCTCCGACTCAGATTCCGGTTCGAACAGCGGCTCATCTC
CGGGTTCGGGCTCGAGCTCCGGGTCGAGTTCGAGTTCGGGTCATGGGTTACGTGTTTCCA
TTGGGTATATATTGGCCGTTGGATCGTTGGTTATTGGTCTTATTTGGGCTTTCTGAGGAC
TAAGGCTTTTGTATTGTTGCATCGAGGAATATATTTTGGGAGGGGAGAATATAAATAAAC
TTTCGAATTATTAATCCGTATTTGTTGTATTTTGCGAATTTGCGTCATTATGTATTTCGA
ATAGTGCATTTCTGATTTTGTTATTGTATCCGTATTTCTCAGTTACTATGGTTTTCTCAC
CCTCTTGTCCACTTGATTGGTCCGGTTGGAATATTTTTTTTTTTGTAAAAGAGAATA


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

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TGGTTTTCTCCGGTTTACTGGCAGTTAAGACAACGTTAGCAGCACAACATGTGATAGGCG
GGAGC*AAGGCTGGGAACA
TC

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DS 

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TTTTTAA
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ACCAACTTGTTTTTAAGTATTCCGGACTACACAGCGTTGTGGAGCTGGGAAGCGAAACGG
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TTAAGCTTTCTAAAACCGGTGCTCGTTATTTCGCATGTGGGACCCCAGGGCATTGCGAAT
CAGGCATGAAGGTTAAAGTCAATGTTGTCTCTGCTGACTCTACCGCCGTTTCCTCTCCGG
GTTCGGATTCAAGCTCCGACTCAGATTCCGGTTCGAACAGCGGCTCATCTCCGGGTTCGG
GCTCGAGCTCCGGGTCGAGTTCGAGTTCGGGTCATTGGTTACGTGTTTCCATTGGGTATA
TATTGGCCGTTGGATCGTTGGTTATTGGTCTTATTTGGGCTTTCTGAGGACTAAGGCTTT
TGTATTGTTGCATCGAGGAATATATTTTGGGAGGG*AGAATATAAATAAACTTTCGAATT
ATTAATCCGTATTTGT

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DS 

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TGGTTTTCTCCGGTTTACTGGCAGTTAAGACAACGTTAGCAGCACAACATGTGATAGGCG
GGAGCCAAGGCTGGGAACAATCCGTTGACTTTGATTCTTGGACGTCCGATAAATCTTTCA
AAGTCGGGGACCAACTTGTTATTAAGTATTCCGGACTACACAGCGTTGTGGAGCTGGGAA
GCGAAACGGCATACAAGAGCTGTGACCTGGGAACACCTGTAAATTCCTTAAGCTCTGGGA
ACGACGTCGTTAAGCTTTCTAAAACCGGTGCTCGTTATTTCGCATGTGGGACCCCAGGGC
ATTGCGAATCAGGCATGAAGGTTAAAGTCAATGTTGTCTCTGCTGACTCTACCGCCGTTT
CCTCTCCGGGTTCGGATTCAAGCTCCGACTCAGATTCCGGTTCGAACAGCGGCTCATCTC
CGG*TTCGGGCTCGAGCTCCGGGTCGAGTTCGAGTTCGGGTCATGGGTTACGT*TTTCCA
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TAAGGCTTTTGTATTGTTGCATCGAGGAATATATTTTGGGAGGGGAGAATATAAATAAAC
TTTCGAATTATTAATCCGTATTTGTTGTATTTTGCGAATTTGCGTCATTATGTATTTCGA
ATAGTGCATTTCTGATTTTGTTATTGTATCCGTATTTCTCAGTTACTATGG

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DS 

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TGGTTTTCTCCGGTTTACTGGCAGTTAAGACAACGTTAGCAGCACAACATGTGATAGGCG
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AAGTCGGGGACCAACTTGTTTTTA****TTCCGGACTACACAGCGTTGTGGAGCTGGGAA
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ACGACGTCGTTAAGCTTTCTAAAACCGGTGCTCGTTATTTCGCATGTGGGACCCCAGGGC
ATTGCGAATCAGGCATGAAGGTTAAAGTCAATGTTGTCTCTGCTGACTCTACCGCCGTTT
CCTCTCCGGGTTCGGATTCAAGCTCCGACTCAGATTCCGGTTCGAACAGCGGCTCATCTC
CGGGTTCGGGCTCGAGCTCCGGGTCGAGTTCGAGTTCGGGTCATGGGTTACGTGTTTCCA
TTGGGTATATATTGGCCGTTGGATCGTTGGTTATTGGTCTTATTTGGGCTTTCTGAGGAC
TAAG*CTTTTGTATTGTTGCATCGAGGAATATATTTTGGGAGGGGAGAATATAAATAAAC
TTTCGAATTATTAATCCGTATTTGTTTTATTTTGCGAATTTGCGTCATTATGTATTTCGA
ATAGTGCATTTCTGATTT*GTTATTGTATCCGTATTTCTC

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DS 

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TGGTTTTCTCCGGTTTACTGGCAGTTAAGACAACGTTAGCAGCACAACATGTGATAGGCG
GGAGCCAAGGCTGGGAACAATCCGTTGACTTTGATTCTTGGACGTCCGATAAATCTTTCA
AAGTCGGGGACCAACTTGTTTTTAAGTATTCCGGACTACACAGCGTTGTGGAGCTGGGAA
GCGAAACGGCATACAAGAGCTGTGACCTGGGAACACCTGTAAATTCCTTAAGCTCTGGGA
ACGACGTCGTTAAGCCTTCTAAAACCGGTGCTCGTTATTTCGCATGTGGGACCCCAGGGC
ATTGCGAATCAGGCATGAAGGTTAAAGTCAATGTTGTCTCTGCTGACTCTACCGCCGTTT
CCTCTCCGGGTTCGGATTCAAGCTCCGACTCAGATTCCGGTTCGAACAGCGGCTCATCTC
CGGGTTCGGGCTCGAGCTCCGGGTCGAGTTCGAGTTCGGGTCATGGGTTACGTGTTTCCA
TTGGGTATATATTGGCCGTTGGATCGTTGGTTATTGGTCTTATTTGGGCTTTCTGAGGAC
TAAGGCTTTTGTATTGTTGCATCGAGGAATATATTTTGGGAGGGGAGAATATAAATAAAC
TTTCGAATTATTAATCCGTATTTGTTGTATTTTGCGAATTTGCGTCATTATGTATTTCGA
ATAGTGCATTTCTG

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DS 

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CTGGGAACGACGTCGTTAAGCTTTCTAAAACCGGTGCTCGTTATTTCGCATGTGGGACCC
CAGGGCATTGCGAATCAGGCATGAAGGTTAAAGTCAATGTTGTCTCTGCTGACTCTACCG
CCGTTTCCTCTCCGGGTTCGGATTCAAGCTCCGACTCAGATTCCGGTTCGAACAGCGGCT
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GAGGACTAAGGCTTTTGTATTGTTGCATCGAGGAATATATTTTGGGAGGGGAGAATATAA
ATAAACTTTCGAATTATTAATCCGTATTTGTTGTATTTTGCGAATTTGCGTCATTATGTA
TTTCGAATAGTG

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DS 

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TAA
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CCGGTTTACTGGCAGTTAAGACAACGTTAGCAGCACAACATGTGATAGGCGGGAGCCAAG
GCTGGGAACAATCCGTTGACTTTGATTCTTGGACGTCCGATAAATCTTTCAAAGTCGGGG
ACCAACTTGTTTTTAAGTATTCCGGACTACACAGCGTTGTGGAGCTGGGAAGCGAAACGG
CATACAAGAGCTGTGACCTGGGAACACCTGTAAATTCCTTAAGCTCTGGGAACGACGTCG
TTAAGCTTTCTAAAACCGGTGCTCGTTATTTCGCATGTGGGACCCCAGGGCATTGCGAAT
CAGGCATGAAGGTTAAAGTCAATGTTGTCTCTGCTGACTCTACCGCCGTTTCCTCTCCGG
GTTCGGATTCAAGCTCCGACTCAGATTCCGGTTCGAACAGCGGCTCATCTCCGGGTTCGG
GCTCGAGCTCCGGGTCGAGTTCGAGTTCGGGTCATTGGTTACGTGTTTCCATTGGGTATA
TATTGGCCGTTGGATCGTTGGTTATTGGTCTTATTTGGGCTTTCTGAGGACTAAGGCTTT
TGTATTGTTGCATCGAGGAATATATTTTGGGAGGGGAGAATATAAATAAACTTTCGAATT
ATTAATCCGTATTTGTTGTATTTTGCGAATTTGCGTCATTATGTATTTCGAATAGTGCAT
TTC

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DS 

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GCTGTGACCTGGGAACACCTGTAAATTCCTTAAGCTCTGGGAACGACGTCGTTAAGCTTT
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CAAGCTCCGACTCAGATTCCGGTTCGAACAGCGGCTCATCTCCGG*TTCGGGCTCGAGCT
CCGGGTCGAGTTCGAGTTCGGGTCATGGGTTACGT*TTTCCATTGGGTATATATTGGCCG
TTGGATCGTTGGTTATTGGTCTTATTTGGGCTTTCTGAGGACTAAGGCTTTTGTATTGTT
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DS 

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GGACCCCAGGGCATTGCGAATCAGGCATGAAGGTTAAAGTCAATGTTGTTTCTGCTGACT
CTACCGCCGTTTCCTCTCCGGGTTCGGATTCAAGCTCCGACTCAGATTCCGGTTCGAACA
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CTTTCTGAGGACTAAGGCTTTTGTATTGTTGCATCGAGGAATATATTTTGGGAGGGGAGA
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TATGTATTTCGAATAGTGCATTTCTGATTTTGTTATTGTATCCGTATTTCTCAGTTACTA
TGGTTTTCTCACCCTCTTGTCCACTTGATTGGTCCGGTTGGAATATTTTTTTTTTTGTAA
AAGAGAATA

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DS 



AS 1 11

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AGTGAGCAACAAGCAAGTCATCTTTAGAGACTACGTTACCGGATTCCTTAGCGAATCCGA
CCTTTTGATCAACAACTCTACCACCGTAAATCTTAAGGTACCGGCTGGATCAATGACAGC
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TGGAGTGTCTAAAGTGATGGATTCAGGGCACCCAGATTACAAAGAAGGTGACTTGCTTTG
GGGAGCTGTTGGATGGGAAGAGTACAGTGTTATCACTCCTATTCCTAATATTCACTTCAA
GATCCATCATACAGATGTTCCCTTATCCCACTACACTGGTCTTCTTGGTATGCCTGGTAT
GACCGCATATGCTGGGTTTTATGAGATCTGTTCACCAAAGAAAGGAGAGACTGTGTTTGT
GTCAGCTGCATCCGGTGCTGTTGGTCAGCTTGTGGGACAGTTTGCTAAGCTGATGGGTTG
CTACGTCGTTGGAAGCGCCGGAAGCAAAGAAAAGGTTGATCTTCTCAAGAACAAGTTTGG
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GATCCTAAACATGAGACCACACGGGCGTATCGCAGCATGCGGTATGATCTCACAGTACAA
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AATAAAATAAACTCTGTTGCTTCAACAATATAAAATCAATTGCC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A018TF U 391
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T

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TGAAGAATCTCTACTTGTCTTGCGATCCTTACATGCGCAACCGTATGAGAAAGCCTGATC
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AACAAGCAAGTCATCTTTAGAGACTACGTTACCGGATTCCTTAGCGAATCCGACCTTTTG
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GG
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GCAACAAGCAAGTCATCTTTAGAGACTACGTTACCGGATTCCTTAGCGAATCCGACCTTT
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CT

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TGATCAACAACTCTACCACCGTAAATCTTAAGGTACCGGCTGGATCAATGACAGCGTTGG
TGAAGAATCTCTACTTGTCTTGCGATCCTTACATGCGCAACCGTATGAGAAAGCCTGATC
CCTCTTGTCCCGCTACTGCTCTATCTTTTGTTCCCGGCAAGCCTATCTCAGGGTTTGGAG
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CTGTTGGATGGGAAGAGTACAGTGTTATCACTCCTATTCCTAATATTCACTTCAAGATCC
ATCATACAGATGTTCCCTTATCCCACTACACTGGTCTTCTTGGTATGCCTGGTATGACCG
CATATGCTGGGTTTTATGAGATCTGTTCACCAAAGAAAGGAGAGACTGTGTTTGTGTCAG
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GTATTCAAGGGTTTAACACCATCGATTACTTGCCCAAATACTCGGAGTTCTTGGAGTTTG
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AACTGTTGAACTATATGGTCTTGTTTTCTTGTGTAATAAGTAAGAAATAGACTAAAACTC
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AGTGAGGGTCTTAATCTCTCTCTTTATAAATAAAATAAACTCTGTTGCTTCAACAATATA
AAATCAATTGCC

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DS 



AS 1 11

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BQ
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 25 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 30 65 65 65 
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65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
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65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 50 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1E208TF U 1
AF RS1E133TF U 175
AF RS1ER90JQ C 5
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GAAACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTCTTGGCAACGAAGAAGACCTCATTAA
CCCTTTTCATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGACTGTTCA
TAGCGACAACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTCACCGCCAGCCACTTTCTCCATCTAC
GAGGAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAAAATCTTTTATAAT
AGAGACGATGAGGAATCTCCATGAGATGTTCTTCAGATGTTTCGATTATTTATAATAATG
AAGACACAAATGAAATGAGAAATGGTAGAGTGTGACACCATTACACTTATATTTTTCTGC
GGAAGCAGTAAAGTGTTAATCAAGTTTGTCTGCTGTTTATTGTTATCTTCTAATGTCTAA
CTATGTTTTTGGTATTAATTTGAAGTGTAGTTTTAACT

QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1E208TF 638 0 0
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TCAGAAAGGAGGAACCATTCCTGACTACTCAATGGATTTCACAAAGATCAGAGAGATGAG
GAAACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTCTTGGCAACGAAGAAGACCTCATTAA
CCCTTTTCATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGACTGTTCA
TAGCGACAACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTCACCGCCAGCCACTTTCTCCATCTAC
GAGGAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAAAATCTTTTATAAT
AGAGACGATGAGGAATCTCCATGAGATGTTCTTCAGATGTTTCGATTATTTATAATAATG
AAGACACAAATGAAATGAGAAATGGTAGAGTGTGACACCATTACACTTATATTTTTCTGC
GGAAGCAGTAAAGTGTTAATCAAGTTTGTCTGCTGTTTATTGTTATCTTCTAATGTCTAA
CTATGTTTTTGGTATTAATTTGAAGTGTAGTTTTAACT

QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1E133TF 466 0 0
GATGAGGAAACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTCTTGGCAACGAAGAAGACCT
CATTAACCCTTTTCATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGAC
TGTTCATAGCGACAACAACAGAACCAACGCTGAATTCTCTCACCACCAGCCACTTTCTCC
ATCTACGAGGAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAAAATCTTT
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ATAATGAAGACACAAATGAAATGAGAAATGGTATAGTGTGACACCATTACACTTATATTT
TTCTGCGGAAGCAGTAAAGTGTTAATCAAGTTTGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTCTAAT
GTCTAACTATGTTTTTGGTATTAATTTGAAGTGTAGTTTTAACTTT

QA 1 466 1 466
DS 

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GG
AAGAAAACGAGATACAGTAGCGCTCTCTTCGCACTACAGCCTTGACCATATGGATGATCC
AAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGACTGGGATCAGAA
AGGAGGAACCATTCCTGACTACTCAATGGATTTCACAAAGATCAGAGAGATGAGGAAACA
GAACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTCTTGGCAACGAAGAAGACCTCATTAACCCTTT
TCATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGACTGTTCATAGCGA
CAACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTCACCACCAGCCACTTTCTCCATTTACGAGGAG
AGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAAAATCTTTTATAATAGAGAC
GATGAGGAATCTCCATGAGATGTTCTTCAGATGTTTCGATTATTTATAATAATGAAGACA
CAAATGAAATGAGAAATGGTAGAGTGTGACACCATTACACTTATATTTTTTTGCGGAAGC
AGTAAAGTGTTAATCAAGTTTGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTCTAATGTCTAACTATGT
TTTTGGTATTAATTTGAAGTGTAGTTTTAACTTTTAAGTCTCTCCTTTCTATTTTGTTGT
AATTTTCGTTTTGTTTGGAGATTGATAAGTTTTCAG
C

QA 3 698 3 698
DS 

RD RS1ER90TF 699 0 0
GG
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AAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGACTGGGATCAGAA
AGGAGGAACCATTCCTGACTACTCAATGGATTTCACAAAGATCAGAGAGATGAGGAAACA
GAACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTCTTGGCAACGAAGAAGACCTCATTAACCCTTT
TCATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGACTGTTCATAGCGA
CAACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTCACCACCAGCCACTTTCTCCATCTACGAGGAG
AGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAAAATCTTTTATAATAGAGAC
GATGAGGAATCTCCATGAGATGTTCTTCAGATGTTTCGATTATTTATAATAATGAAGACA
CAAATGAAATGAGAAATGGTAGAGTGTGACACCATTACACTTATATTTTTCTGCGGAAGC
AGTAAAGTGTTAATCAAGTTTGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTCTAATGTCTAACTATGT
TTTTGGTATTAATTTGAAGTGTAGTTTTAACTTTTAAGTCTCTCCTTTCTATTTTGTTGT
AATTTTCGTTTTGTTTGGAGATTGATAAGTTTTCAG
C

QA 3 698 3 698
DS 

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G
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ATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGACTGTTCATAGCGACA
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GAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAAAATCTTTTATAATAGAGACGA
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AATGAAATGAGAAATGGTAGAGTGTGACACCATTACACTTATATTTTTCTGCGGAAGCAG
TAAAGTGTTAATCAAGTTTGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTCTAATGTCTAACTATGTTT
TTGGTATTAATTTGAAGTGTAGTTTTAACTTTTAAGTCTCTCCTTTCTATTTTGTTGTAA
TTTTCGTTTTGTTTGGAGATTGATAAGTTTTCA

QA 2 694 2 694
DS 

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ATACTAGTGTTTGCT
TATCT

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DS 

RD RS1E280TF 735 0 0
TTTTTCAAGAAAACGAGATACAGTAGCGCTCTCTTCGCACTACAGCCTTGACCATATGGA
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TCATAAAGGAGGAACCATTCCTGACTACTCAATGGATTTCACAAAGATCAGAGAGATGAG
GAAACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTCTTGGCAACGAAGAAGACCTCATTAA
CCCTTTTCATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGACTGTTCA
TAGCGACAACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTCACCACCAGCCACTTTCTCCATCTAC
GAGGAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAAAATCTTTTATAAT
AGAGACGATGAGGAATCTCCATGAGATGTTCTTCAGATGTTTCGATTATTTATAATAATG
AAGACACAAATGAAATGAGAAATGGTAGAGTGTGACACCATTACACTTATATTTTTCTGC
GGAAGCAGTAAAGTGTTAATCAAGTTTGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTCTAATGTCTAA
CTATGTTTTTGGTATTAATTTGAAGTGTAGTTTTAACTTTTAAGTCTCTCCTTTCTATTT
TGTTGTAATTTTCGTTTTGTTTGGAGATTGATAAGTTTTCAGTATTGTGTAATGCAGAGT
ATACTAGTGTTTGCT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RS1EZ92TF 501 0 0
G
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TGTTCATAGCGACAACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTCACCACCAGCCACTTTCTCC
ATCTACGAGGAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAAAATCTTT
TATAATAGAGACGATGAGGAATCTCCATGAGATGTTCTTCAGATGTTTCGATTATTTATA
ATAATGAAGACACAAATGAAATGAGAAATGGTAGAGTGTGACACCATTACACTTATATTT
TTCTGCGGAAGCAGTAAAGTGTTAATCAAGTTTGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTCTAAT
GTCTAACTATTTTTTTGGTATTAATTTGAAGTGTAGTTTTAACTTTTAAGTCTCTCCTTT
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CAGAGTATACTAGTGTTTGC

QA 2 501 2 501
DS 

RD RS1DJ37JQ 734 0 0
G
GAAAACGAGATACAGTAGCGCTCTCTTCGCACTACAGCCTTGACCATATGGATGATCCAA
AGGAGAACAAGAACTCGCCAAGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGACTGGGATCAGAAAG
GAGGAACCATTCCTGACTACTCAATGGATTTCACAAAGATCAGAGAGATGATGAAACAGA
ACAAGAGAGATCCTTCTCGAGCCAGTCTTGGCAACGAAGAAGACCTCATTAACCCTTTTC
ATAACCAACCTACTTCAGTTGGTAATACTAAGCCTAAACTCACGACTGTTCATAGCGACA
ACAACAGAACCAACACTGAATTCTCTCACCACCAGCCACTTTCTCCATTTACGAGGAGAG
GAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAAAATCTTTTATAATAGAGACGA
TGAGGAATCTCCATGAGATGTTCTTCAGATGTTTCGATTATTTATAATAATGAAGACACA
AATGAAATGAGAAATGGTAGAGTGTGACACCATTACACTTATATTTTTCTGCGGAAGCAG
TAAAGTGTTAATCAAGTTTGTCTGCTGTTTACTGTTATCTTCTAATGTCTAACTATGTTT
TTGGTATTAATTTGAAGTGTAGTTTTAACTTTTAAGTCTCTCCTTTCTATTTTGTTGTAA
TTTTCGTTTTGTTTGGAGATTGATAAGTTTTCAGTATTGTGTAATGCAGAGTATACTAGT
GTTTGCT
TATCCC

QA 2 728 2 728
DS 

RD RS1DE32JQ 405 0 0
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TAATAATGAAGACACAAATGAAGTGAGAAATGGTAGAGTGTGACACCATTACACTTATAT
TTTTTTGCGGAAGCAGTAAAGTGTTAATCAAGTTTGTTTGCTGTTTACTGTTATTTTTTA
ATGTCTAACTATGTTTTTGGTATTAATTTGAAGTGTAGTTTTAACCTTTAAGTCTCTCCT
TTTTATTTTGTTGTAATTTTCGTTTTGTTTGGAGATTGATAAGTTTTCAGTATTGTGTAA
TGCAGAGTATACTAGTGTTTGCTTATCTCAAGGATTGGGTTTGCC

QA 1 405 1 405
DS 



AS 1 11

CO CL235Contig1 1053 11 29 U
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GAGTAGAGTAAACTGTCTTTGGGAAGACAACAATCATTTTAGTTTTTTCTTTTCCAATAG
TTTAACTACTACTCCCTGGAGAATTTCACAGCCTCAATCACAGCAGAAAAGTCCAGATCT
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GAAACAGCGTTTTCATCGCCAAGAGCAAGAGCTAGCCTCATGTCCTTCTGCTGATGTTTC
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GGGTTAGTCATTGCACCAAGATCCAGAATATCAAGAAGAGTGTCAGAGCTAAGTCCACTC
TTGTCAGCTAATACAAGCCCCTCGGAGAAGGCGTTCATCATGCTTCCCATGACCATGTTG
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ATGAGCTGGCCATCTTCTGCCGGCTTCTTGCTACCTGAAACCGGACCTTCTACAAACCGA
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TTTCCCATGATACCCAAGCCCAGAAACCCAATCTCCATTTTTTTTT*CTCTCTCTCCTTT
GTGTGTTTGAGCGATGATGATGAGGATGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 15 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 20 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 5 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 0 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 35 0 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 35 50 50 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BI48JQ U 1
AF RS1FK82JQ U 10
AF RS1G073JQ U 10
AF RS1FR03JQ U 26
AF RS1GE14JQ U 50
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AF RS1G073TF C 346
BS 1 65 RS1BI48JQ
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RD RS1BI48JQ 230 0 0
GACTGTTTTAAAAGACGTCTTATTTGGTGAAGGATTAAAATGTGTTCTTGGCCAAATCAT
GAGTAAAGTAAACTGGCTTTGGGAAGACAACAATCATTTTAGTTTTTTCTTTTCCAATAG
TTTAACTACTACTCCCTGGAGAATTTCACAGCCTCAATCACAGCAAAAAAGTCCAGATCT
CCAAGTCCCAAGCTTCTTGCCTTCTTAAAAGCCTCATTTGCAGCTGCAGC

QA 1 230 1 230
DS 

RD RS1FK82JQ 393 0 0
AAAAGACGTCTTATTTGGTGAAGGATTAAAATGTGTTCTTGGCCAAATCATGAGTAGAGT
AAACTGTCTTTGGGAAGACAACAATCATTTTAGTTTTTTCTTTTCCAATAGTTTAACTAC
TACTCCCTGGAGAATTTCACAGCCTCAATCACAGCAGAAAAGTCCAGATCTCCAAGTCCC
AAGCTTCTTGCCTTCTTAAAAGCCTCATTTGCAGCTGCAGCTACAGGCATGGAAACAGCG
TTTTCATCGCCAAGAGCAAGAGCTAGCCTCATGTCCTTCTGCTGATGTTACAACGGGAAC
GCTGGTGGGTAACTACTCTTATTCATCGAAGGTCCTTTCCCTTTGAACATCGGGTTAGTC
ATTGCACCAAGATCCAGAATATCAAGAAGAGTG

QA 1 393 1 393
DS 

RD RS1G073JQ 597 0 0
AAAAGACGTCTTATTTGGTGAAGGATTAAAATGTGTTCTTGGCCAAATCATGAGTAGAGT
AAACTGTCTTTGGGAAGACAACAATCATTTTAGTTTTTTCTTTTCCAATAGTTTAACTAC
TACTCCCTGGAGAATTTCACAGCCTCAATCACAGCAGAAAAGTCCAGATCTCCAAGTCCC
ATGCTTCTTGCCTTCTTAAAAGCCTCATTTGCGGCTGCAGCTACAGGCGTGGAAACAGCG
TTTTCATCGCCAAGAGCAAGAGCTAGCCTCATGTCCTTCTGCTGATGTTTCAACGGGAAC
GCTGGTGGGTAATTACTCTTATTCATCGAAGGTCCTTTCCCTTTGAACATTGGGTTAGTC
ATTGCACCAAGATCCAGAATATCAAGAAGAGTGTCAGAGCTAAGTCCACTCTTGTCAGCT
AATACAAGCCCCTCGGAGAAGGCGTTCATCATGCTTCCCATGACCATGTTGATAACAAGT
TTCATCTTAGCTCCGTTCCCAACTTGTCCCAAGTAAAAAGACTTCTTCCCCAAGACGTCA
AAAGCTGGGACCGATTCATCGAAAAGGGACTTGTCACCAGCAGCAAGTATGATGAGC

QA 1 597 1 597
DS 

RD RS1FR03JQ 748 0 0
GGTGAAGGATTAAAATGTGTTCTTGGCCAAATCATGAGTAGAGTAAACTGTCTTTGGGAA
GACAACAATCATTTTAGTTTTTTCTTTTCCAATAGTTTAACTACTACTCCCTGGAGAATT
TCACAGCCTCAATCACAGCAGAAAAGTCCAGATCTCCAAGTCCCATGCTTCTTGCCTTCT
TAAAAGCCTCATTTGCGGCTGCAGCTACAGGCATGGAAACAGCGTTCTCATCGCCAAGAG
CAAGAGCTAGCCTCATGTCCTTCTGCTGATGTTTCAACGGGAACGCTGGTGGGTAATTAC
TCTTATTCATCGAAGGTCCTTTCCCTTTGAACATTGGGTTAGTCATTGCACCAAGATCCA
GAATATCAAGAAGAGTGTCAGAGCTAAGTCCACTCTTGTCAGCTAATACAAGCCCCTCGG
AAAAGGCGTTCATCATGCTTCCCATGACCATGTTGACAACAAGTTTCATCTTAGCTCCGT
TCCCAACTTGTCCCAAGTAAAAAGACTTCTTCCCCAAGACGTCAAAAGCTGGGACCGATT
CATCGAAAAGGGACTTGTCACCAGCAGCAAATATGATGAGCTGGCCATCTTCTGCCGGCT
TCTTGCTACCTGAAACCGGACCTTCTACAAACCGACCACCTTTCCCGGTGATAGCCTCAT
TGATCTTTAAGGAGGTCTCAGCATCAACAGTTGACATATCGATATAGCCTTTCCCTTCAC
AGATTTGCTCCAAAACGCCATCTTTATC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RS1GE14JQ 717 0 0
GGCCAAATCATGAGTAGAGTAAACTGTCTTTGGGAAGACAACAATCATTTTAGTTTTTTC
TTTTCCAATAGTTTAACTACTACTCCCTGGAGAATTTCACAGCCTCAATCACAGCAGAGA
AGTCCAGATCTCCAAGTCCCATGCTTCTTGCCTTCTTAAAAGCCTCATTTGCGGCTGCAG
CTACAGGCATGGAAACAGCGTTTTCATCGCCAAGAGCAAGAGCTAGCCTCATGTCCTTCT
GCTGATGTTTCAACGGGAACGCTGGTGGGTAATTACTCTTATTCATCGAAGGTCCTTTCC
CTTTGAACATTGGGTTAGTCATTGCACCAAGATCCAGAATATCAAGAAGAGTGTCAGAGC
TAAGTCCACTCTTGTCAGCTAATACAAGCCCCTCGGAGAAGGCGTTCATCATGCTTCCCA
TGACCATGTTGACAACAAGTTTCATCTTAGCTCCGTTCCCAACTTGTCCCAAGTAAAAAG
ACTTCTTCCCCAAGACGTCAAAAGCTGGGACCGATTCATCGAAAAGGGACTTGTCACCAG
CAGCAAGTATGATGAGCTGGCCATCTTCTGCCGGCTTCTTGCTACCTGAAACCGGACCTT
CTACAAACCGACCACCTTTCCCGGTGATTGCCTCATTGATCTTTAAGGAGGTCTCAGCAT
CAACAGTTGACATACCGATATAGCCTTTCCCTTCACAGATTTGCTCCAAAACGCCAT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1FR30JQ 754 0 0
GTGTTATTGGCCAAATCATGAGTAGAGTAAACTGTCTTTGGGAAGACAACAATCATTTTA
GTTTTTTCTTTTCCAATAGTTTAACTACTACTCCCTGGAGAATTTCACAGCCTCAATCAC
AGCAGAAAAGTCCAGATCTCCAAGTCCCATGCTTCTTGCCTTCTTAAAAGCCTCATTTGC
GACTGCAGCTACAGGCATGGAAACAGCGTTTTCATCGCCAAGAGCAAGAGCTAGCCTCAT
GTCCTTCTGCTGATGTTTCAACGGGAACGCTGGTGGGTAATTACTCTTATTCATCGAAGG
TCCTTTCCCTTTGAACATTGGGTTAGTCATTGCACCAAGATCCAGAATATCAAGAAGAGT
GTCAGAACTAAGTCCACTCTTGTCAGCTAATACAAGCCCCTCGGAAAAGGCGTTCATCAT
GCTTCCCATGACCATGTTGACAACAAGTTTCATCTTAGCTCCGTTCCCAACTTGTCCCAA
GTAAAAAGACTTCTTCCCCAAGACGTCAAAAGCTGGGACCGATTCATCGAAAAGGGACTT
GTCACCAGCAGCAAGTATGATGAGCTGGCCATCTTCTGCCGGCTTCTTGCTACCTGAAAC
CGGACCTTCTACAAACCGACCACCTTTCCCGGTGATTGCCTCATCGATCTTTAAGGAGGT
CTCAGCATCAACAGTTGACATATCGATATAGCCTTTCCCTTCACAGATTTGCTCCAAAAC
GCCATCTTTATCGAAAACAACCGAAAGAGCAGCA

QA 1 754 1 754
DS 

RD RS1BI48TF 703 0 0
TGGGTAACTACTCTTATTCATCGAAGGTCCTTTCCCTTTGAACATCGGGTTAGTCATTGC
ACCAAGATCCAGAATATCAAGAAGAGTGTCAGAGCTAAGTCCACTCTTGTCAGCTAATAC
AAGCCCCTCGGAGAAGGCGTTCATCATGCTTCCCATGACCATGTTGACAACAAGTTTCAT
CTTAGCTCCGTTCCCAACTTGTCCCAAGTAAAAAGACTTCTTCCCCAAGACGTCAAAAGC
TGGGACCGATTCATCGAAAAGAGACTTGTCACCAGCAGCAAGTATGATGAGCTGGCCATC
TTCTGCCGGCTTCTTGCTACCTGAAACCGGACCTTCTACAAACCGACCACCTTTCCCGGT
GATTGCCTCATTGATCTTTAAGGAGGTCTCAGCATCAACAGTTGACATATCGATATAGCC
TTTTCCTTCACAGATTTGCTCCAAAACACCATCTTTATCGAAAACAACCGAAAGAGCAGC
GGAAGGGTCAGAGAGCATAGCGATAGTGTATTTGCATTTCTTGATCACTTCAGCTGGAGT
CTCGCATACTGAAGCTCCATGCTCCACAAGTTCATCGCACTTGGAGAGTGTCCTGTTCCA
GACGGTTAGTTTGAAACCATGTTTCAGTAGATTCATTGACATGGCCTTTCCCATGATACC
CAAGCCCAGAAACCCAATCCCCATTTTT
CTCTCTCTCCTTTCC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RS1FR03TF 818 0 0
GCTACAGCAT
GAAACAGCGT*CTCATCGCCAAGAGCAAGAGCTA*CCTCATGTCCTTCTGCTGATGTT*C
AACGGGAACGCTGGTGGGTAA*TACTCTTATTCATCGAAGGTCCTTTCCCTTTGAACATT
GGGTTAGTCATTGCACCAAGATCCAGAATATCAAGAAGAGTGTCAGAGCTAAGTCCACTC
TTGTCAGCTAATACAAGCCCCTCGGAGAAGGCGTTCATCATGCTTCCCATGACCATGTTG
ACAACAAGTTTCATCTTAGCTCCGTTCCCAACTTGTCCCAAGTAAAAAGACTTCTTCCCC
AAGACGTCAAAAGCTGGGACCGATTCATCGAAAAGGGACTTGTCACCAGCAGCAAATATG
ATGAGCTGGCCATCTTCTGCCGGCTTCTTGCTACCTGAAACCGGACCTTCTACAAACCGA
CCACCTTTCCCGGTGATAGCCTCATTGATCTTTAAGGAGGTCTCAGCATCAACAGTTGAC
ATATCGATATAGCCTTTCCCTTCACAGATTTGCTCCAAAACGCCATCTTTATCGAAAACA
ACCGAAAGAGCAGCAGAAGGGTCAGAGAGCATAGCGATAGTGTATTTGCATTTCTTGATT
ACTTCAGCTGGAGTCTCGCATACTGAAGCTCCATGCTCCACAAGTTCATCGCACTTGGAG
AGTGTCCTGTTCCAGACGGTTAGCTTGAAACCATGTTTCAGTAGATTCATTGACATGGCC
TTTCCCATGATACCCAAGCCCAGAAACCCAATCTCCATTTTTTTTTTCTCTCTCTCCTTT
GTGTGTTTGAGCGATGATGATGAGGAT
C

QA 11 817 11 817
DS 

RD RS1FK82TF 796 0 0
CATCGCCAAGAGCAAGAGCTA*CCTCATGTC*TTCTGCTGATGT*ACAACGGGAACGCTG
GTGGGTA*CTACTCTTATTCATCGAAGGTCCTTTCCCTTTGAACATCGGGTTAGTCATTG
CACCAAGATCCAGAATATCAAGAAGAGTGTCAGAGCTAAGTCCACTCTTGTCAGCTAATA
CAAGCCCCTCGGAGAAGGCGTTCATCATGCTTCCCATGACCATGTTGACAACAAGTTTCA
TCTTAGCTCCGTTCCCAACTTGTCCCAAGTAAAAAGACTTCTTCCCCAAGACGTCAAAAG
CTGGGACCGATTCATCGAAAAGGGACTTGTCACCAGCAGCAAGTATGATGAGCTGGCCAT
CTTCTGCCGGCTTCTTGCTACCTGAAACCGGACCTTCTACAAACCGACCACCTTTCCCGG
TGATTGCCTCATTGATCTTTAAGGAGGTCTCAGCATCAACAGTTGACATATCGATATAGC
CTTTTCCTTCACAGATTTGCTCCAAAACACCATCTTTATCGAAAACAACCGAAAGAGCAG
CGGAAGGGTCAGAGAGCATAGCGATAGTGTATTTGCATTTCTTGATCACTTCAGCTGGAG
TCTCGTATACTGAAGCTCCATGCTCCACAAGTTCATCGCACTTGGAGAGTGTCCTGTTCC
AGACGGTTAGTTTGAAACCATGTTTCAGTAGATTCATTGACATGGCCTTTCCCATGATAC
CCAAGCCCAGAAACCCAATCTCCATTTTT*****CTCTCTCTCCTTTGTGTGTTTCAGCG
ATGATGATGAGGAT
CC

QA 1 794 1 794
DS 

RD RS1FR30TF 732 0 0
TTACTCTTATTCATCGAAGGTCCTTTCCCTTTGAACATTGGGTTAGTCATTGCACCAAGA
TCCAGAATATCAAGAAGAGTGTCAGAGCTAAGTCCACTCTTGTCAGCTAATACAAGCCCC
TCGGAGAAGGCGTTCATCATGCTTCCCATGACCATGTTGACAACAAGTTTCATCTTAGCT
CCGTTCCCAACTTGTCCCAAGTAAAAAGACTTCTTCCCCAAGACGTCAAAAGCTGGGACC
GATTCATCGAAAAGGGACTTGTCACCAGCAGCAAGTATGATGAGCTGGCCATCTTCTGCC
GGCTTCTTGCTACCTGAAACCGGACCTTCTACAAACCGACCACCTTTCCCGGTGATTGCC
TCATCGATCTTTAAGGAGGTCTCAGCATCAACAGTTGACATATCGATATAGCCTTTCCCT
TCACAGATTTGCTCCAAAACGCCATCTTTATCGAAAACAACCGAAAGAGCAGCAGAAGGG
TCAGAGAGCATAGCGATAGTGTATTTGCATTTCTTGATTACTTCAGCTGGAGTCTCGCAT
ACTGAAGCTCCATGCTCCACAAGTTCATCGCACTTGGAGAGTGTCCTGTTCCAGACGGTT
AGCTTGAAACCATGTTTCAGTAGATTCCTTGACATGGCCTTTCCCATGATACCCAAGCCC
AGAAACCCAATCTCCATTTTTTTTT*CTCTCTCTCCTTTGTGTGTTTGAGCGATGATGAT
GAGGATGAAAAA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1G073TF 708 0 0
TTCCCTTTGAACATTGGGTTAGTCATTGCACCAAGATCCAGAATATCAAGAAGAGTGTCA
GAGCTAAGTCCACTCTTGTCAGCTAATACAAGCCCCTCGGAGAAGGCGTTCATCATGCTT
CCCATGACCATGTTGATAACAAGTTTCATCTTAGCTCCGTTCCCAACTTGTCCCAAGTAA
AAAGACTTCTTCCCCAAGACGTCAAAAGCTGGGACCGATTCATCGAAAAGGGACTTGTCA
CCAGCAGCAAGTATGATGAGCTGGCCATCTTCTGCCGGCTTCTTGCTACCTGAAACCGGA
CCTTCTACAAACCGACCACCTTTCCCGGTGATTGCCTCATTGATCTTTAAGGAGGTCTCA
GCATCAACAGTTGACATATCGATATAGCCTTTCCCTTCACAGATTTGCTCCAAAACGCTA
TCTTTATCGAAAACAACCGAAAGAGCAGCAGAAGGGTCAGAGAGCATAGCGATAGTGTAT
TTGCATTTCTTGATTACTTCAGCTGGAGTCTCGCATACTGAAGCTCCATGCTCCACAAGT
TCATCGCACTTGGAGAGTGTCCTGTTCCAGACGGTTAGCTTGAAACCATGTTTCAGTAGA
TTCATTGACATGGCCTTTCCCATGATACCCAAGCCCAGAAACCCAATCTCCATTTTTTTT
T*CTCTCTCTCCTTTGTGTGTTTGAGCGATGATGATGAGGAT
GAAAAA

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 11

CO CL236Contig1 898 11 14 U
TTTTTCAACTTTGAAATACTATTTGCTAGAAATACTCTCTGCTCCAAATCGCCTTAATTA
ATTAACCATGGTGAAGAGCATCATTGTCATCGTAGCTATCCTATGCCTCATCTCTCTACC
AAATCCAACCGTGGGATCACAAAAGAAACCGTGGCCTATGCCGTCTGACCTAGCCAACCA
CAATGGAAAGTTTGGTGACTCTAAGATTTCTTGGGCTTGCTCCGAGGTCTCCGATCCAAA
TGCTCCTCCTTCACCTCCTGGCTCATTCCCCACTATCCCAAACATTCCAGGGATACCAAA
CATCCCACAGATTCCAGCGATACCAAACATCCCTCAAATCCCACAGATTCCAGGGATACC
AAACATCCCTATCCCACAGATCCCAGGAATACCGAACATCCCTATCCCACAGATTCCAGA
GATACCAAACATTCCTATCCCACAGATCCCAAGTATACCGAACATCCCTAACCTTCCTGG
TCTTGGAGGATCATTTAGCCCGTTCCAGTCTGTTCTCGTGTCGCAGTCCGGTGAGTTAAA
GAAGTGTTTGACTGGGG*ATAAGTCGAAGGTGTCAGAGAAATGTTTCTCGCAGGTGTTTT
CCAGTTGGGCAGAGAACGACTTGGCTTTGGACAAGGAGTGTTGTGAGATCGTTTTGAATA
TGGACAAGAAGTGCTATGGCCATCTCCACATGATGTTCAAGAGCCATTTCTTTACTCCTC
TCCTTCAGTACTCTTGTCACATCAAGCATGCCAAGAAGAACTAAGCTCGTCTCCTCCGTT
TTGGATTTTCTTTCATTTTCATTTAGTTTTCTGTTAGGGTTTGTTTTGTTTTGTCCATTT
CTAATGGACATAACTTGATTAGTTCTTTGTTTAATTAATAAAATAGTAGTTTTTAACT


BQ
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 10 

AF RS1CS09TF U 1
AF RS1G891TF U 1
AF RS1EM21TF U 1
AF RS1FM30TF U 1
AF RS1GS78TF U 1
AF RS1CS09JQ C 111
AF RS1GS78JQ C 166
AF RS1FM30JQ C 173
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AF RS1BI78TF U 526
BS 1 5 RS1CS09TF
BS 6 6 RS1EM21TF
BS 7 117 RS1CS09TF
BS 118 118 RS1EM21TF
BS 119 386 RS1CS09TF
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BS 388 419 RS1CS09TF
BS 420 420 RS1EM21TF
BS 421 569 RS1CS09TF
BS 570 570 RS1EM21TF
BS 571 589 RS1CS09TF
BS 590 725 RS1EM21TF
BS 726 897 RS1BI78TF
BS 898 898 RS1BI78JQ

RD RS1CS09TF 589 0 0
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ATTAACCATGGTGAAGAGCATCATTGTCATCGTAGCTATCCTATGCCTCATCTCTCTGCC
AAATCCAACCGTGGGATCACAAAAGAAACCGTGGCCTATGCCGTCTGACCTAGCCAACCA
CAATGGAAAGTTTGGTGACTCTAAGATTTCTTGGGCTTGCTCCGAGGTCTCCGATCCAAA
TGCTCCTCCTTCACCTCCTGGCTCATTCCCCACTATCCCAAACATTCCAGGGATACCAAA
CATCCCACAGATTCCAGCGATACCAAACATCCCTCAAATCCCACAGATTCCAGGGATACC
AAACATCCCTATCCCACAGATCCCAGTAATACCGAACATCCCTATCCCACAGATTCCAGG
GATACCAAACATTCCTATCCCACAGATCCCAAGTATACCGAACATCCCTAACCTTCCTGG
TCTTGGAGGATCATTTAGCCCGTTCCAGTCTGTTCTCGTGTCGCAGTCCGGTGAGTTAAA
GAAGTGTTTGACTGGGG*ATAAGTCGAAGATGTCAGAGAAATGTTTCTC

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1G891TF 589 0 0
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AAATCCAACCGTGGGATCACAAAAGAAACCGTGGCCTATGCCGTCTGACCTAGCCAACCA
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AAACATCCCTATCCCACAGATCCCAGGAATACCGAACATCCCTACCCCACAGATTCCAGA
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GAAGTGTTTGACTGGGG*ATAAGTCGAAAGTGTCAGAGAAATGTTTCTC

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1EM21TF 725 0 0
TTTTTCAACTTTGAAATACTATTTGCTAGAAGTACTCTCTGCTCCAAATCGCCTTAATTA
ATTAACCATGGTGAAGAGCATCATTGTCATCGTAGCTATCCTATACCTCATCTCTCTACC
AAATCCAACCGTGGGATCACAAAAGAAACCGTGGCCTATGCCGTCTGACCTAGCCAACCA
CAATGGAAAGTTTGGTGACTCTAAGATTTCTTGGGCTTGCTCCGAGGTCTCCGATCCAAA
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AAACATCCCTATCCCACAGATCCCAGGAATACCGAACATCCCTATCCCACAGATTCCAGA
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TCTTGGAGGATCATTTAGCCCGTTCCAGTCTGTTCTCGTGTCGCAGTCCGGTGAGTTAAA
GAAGTGTTTGACTGGGG*ATAAGTCGAAGGTGTCAGAGAAATGTTTCTCGCAGGTGTTTT
CCAGTTGGGCAGAGAACGACTTGGCTTTGGACAAGGAGTGTTGTGAGATCGTTTTGAATA
TGGACAAGAAGTGCTATGGCCATCTCCACATGATGTTCAAGAGCCATTTCTTTACTCCTC
TCCTT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1FM30TF 725 0 0
TTTTTCAACTTTGAAATACTATTTGCTAGAAATACTCTCTGCTCCAAATCGCCTTAATTA
ATTAACCATGGTGAAGAGCATCATTGTCATCGTAGCTATCCTATGCCTCATCTCTCTACC
AAATCCAACCGTGGGATCACAAAAGAAACCGTGGCCTATGCCGTCTGACCTAGCCAACCA
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TGCTCCTCCTTCACCTCCTGGCTCATTCCCCACTATCCCAAACATTCCAGGGATACCAAA
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TCTTGGAGGATCATTTAGCCCGTTCCATTCTGTTCTCGTGTCGCAGTCCGGTGAGTTAAA
GAAGTGTTTGACTGGGGGATAAGTCGAAGGTGTCAGAGAAATGTTTCTCACAGGTGTTTT
CCAGTTGGGCAGAGAACGACTTGGCTTTGGACAAGGAGTGTTGTGAGATCGTTTTGAATA
TGGACAAGAAGTGCTATGGCCATCTCCACATGATGTTCAAGAGCCATTTCTTTACTCCTC
TCCTT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1GS78TF 725 0 0
TTTTTCAACTTTGAAATACTATTTGCTAGAAATACTCTCTGCTCCAAATCGCCTTAATTA
ATTAACCATGGTGAAGAGCATCATTGTCATCGTAGCTATCCTATGCCTTATCTCTCTACC
AAATCCAACCGTGGGATCACAAAGGAAACCGTGGCCTATGCCGTCTGACCTAGCCAACCA
CAATGGAAAGTTTGGTGACTCTAAGATTTCTTGGGCTTGCTCCGAGGTCTCCGATCCAAA
TGCTCCTCCTTCACCTCCTGGCTCATTCCCCACTATCCCAAACATTCCAGGGATACCAAA
CATCCCACAGATTCCAGCGATACCAAACATCCCTCAAATCCCACAGATTCCAGGGATACC
AAACATCCCTATCCCACAGATCCCAGGAATACCGAACATCCCTATCCCACAGATTCCAGA
GATACCAAACATTCCTATCCCACAGATCCCAAGTATACCGAACATCCCTAACCTTCCTGG
TCTTGGAGGATCATTTAGCCCGTTCCAGTCTGTTCTCGTGTCGCAGTCCGGTGAGTTAAA
GAAGTGTTTGACTGGGG*ATAAGTCGAAGGTGTCAGAGAAATGTTTCTCGCACGTGTTTT
CCAGTTGGGCAGAGAACGACTTGGCTTTGGACAAG*AGTGTTGTGAGATCGTTTTGAATA
TGGACAAGAAGTGCTATGGCCATCTCCACATGATGTTCAAGAGCCATTTCTTTACTCCTC
TCCTT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1CS09JQ 780 0 0
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TAGCCAACCACAATGGAAAGTTTGGTGACTCTAAGATTTCTTGGGCTTGCTCCGAGGTCT
CCGATCCAAATGCTCCTCCTTCACCTCCTGGCTCATTCCCCACTATCCCAAACATTCCAG
GGATACCAAACATCCCACAGATTCCAGCGATACCAAACATCCCTCAAATCCCACAGATTC
CAGGGATACCAAACATCCCTATCCCACAGATCCCAGTAATACCGAACATCCCTATCCCAC
AGATTCCAGGGATACCAAACATTCCTATCCCACAGATCCCAAGTATACCGAACATCCCTA
ACCTTCCTGGTCTTGGAGGATCATTTAGCCCGTTCCAGTCTGTTCTCGTGTCGCAGTCCG
GTGAGTTAAAGAAGTGTTTGACTGGGG*ATAAGTCGAAGATGTCAGAGAAATGTTTCTCG
CAGGTGTTTTCCAGTTGGGCAGAGAACGACTTGGCTTTGGACAAGGAGTGTTGTGAGATC
GTTTTGAATATGGACAAGAAGTGCTATGGCCATCTCCACATTATGTTCAAGAGCCATTTC
TTTACTCCTCTCCTTCAGTACTCTTGTCACATCAAGCATGCCAAGAAGAACTAAGCTCGT
CTCCTCCGTTTTGGATTTTCTTTCATTTTCATTTAGTTTTCTGTTAGGGTTTGTTTTGTT
TTGTCCATTTCTAATGGACATAACTTGATTAGTTCTTTGTTTAATTAATAAAATAGTAGT

QA 1 780 1 780
DS 

RD RS1GS78JQ 733 0 0
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GGTCTCCGATCCAAATGCTCCTCCTTCACCTCCTGGCTCATTCCCCACTATCCCAAACAT
TCCAGGGATACCAAACATCCCACAGATTCCAGCGATACCAAACATCCCTCAAATCCCACA
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CCCTAACCTTCCTGGTCTTGGAGGATCATTTAGCCCGTTCCAGTCTGTTCTCGTGTCGCA
GTCCGGTGAGTTAAAGAAGTGTTTGACTGGGG*ATAAGTCGAAGGTGTCAGAGAAATGTT
TCTCGCAGGTGTTTTCCAGTTGGGCAGAGAACGACTTGGCTTTGGACAAGGAGTGTTGTG
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TTGTTTTGTCCATTTCTAATGGACATAACTTGATTAGTTCTTTGTTTAATTAATAAAATA
GTAGTTTTTAAC
T

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1FM30JQ 726 0 0
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GATCCAAATGCTCCTCCTTCACCTCCTGGCTCATTCCCCACTATCCCAAACATTCCAGGG
ATACCAAACATCCCACAGATTCCAGCGATACCAAACATCCCTCAAATCCCACAGATTCCA
GGGATACCAAACATCCCTATCCCACAGATCCCAGGAATACCGAACATCCCTACCCCACAG
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GAGTTAAAGAAGTGTTTGACTGGGG*ATAAGTCGAAGGTGTCAGAGAAATGTTTCTCACA
GGTGTTTTCCAGTTGGGCAGAGAACGACTTGGCTTTGGACAAGGAGTGTTGTGAGATCGT
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TACTCCTCTCCTTCAGTACTCTTGTCACATCAAGCATGCCAAGAAGAACTAAGCTCGTCT
CCTCCGTTTTGGATTTTCTTTCATTTTCATTTAGTTTTCTGTTAGGGTTTGTTTTGTTTT
GTCCATTTCTAATGGACATAACTTGATTAGTTCTTTGTTTAATTAATAAAATAGTAGTTT
TTAAC
C

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1G891JQ 701 0 0
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CTGGCTCATTCCCCACTATCCCAAACATTCCAGGGATACCAAACATCCCACAGATTCCAG
CGATACCAAACATCCCTCAAATCCCACAGATTCCAGGGATACCAAACATCCCTATCCCAC
AGATCCCAGGAATACCGAACATCCCTACCCCACAGATTCCAGAGATACCAAACATTCCTA
TCCCACAGATCCCAAGTATACCGAACATCCCTAACCTTCCTGGTCTTGGAGGATCATTTA
GCCCGTTCCATTCTGTTCTCGTGTCGCAGTCCGGTGAGTTAAAGAAGTGTTTGACTGGGG
*ATAAGTCGAAGGTGTCAGAGAAATGTTTCTCACAGGTGTTTTCCAGTTGGGCAGAGAAC
GACTTGGCTTTGGACAAGGAGTGTTGTGAGATCGTTTTGAATATGGACAAGAAGTGCTAT
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CACATCAAGCATGCCAAGAAGAACTAAGCTCGTCTCCTCCGTTTTGGATTTTCTTTCATT
TTCATTTAGTTTTCTGTTAGGGTTTGTTTTGTTTTGTCCATTTCTAATGGACATAACTTG
ATTAGTTCTTTGTTTAATTAATAAAATAGTAGTTTTTAAC
C

QA 1 700 1 700
DS 

RD RS1BI78JQ 373 0 0
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TCTCGCAGGTGTTTTCCAGTTGGGCAGAGAACGACTTGGCTTTGGACAAGGAGTGTTGTG
AGATCGTTTTGAATATGGACAAGAAGTGCTATGGCCATCTCCACATGATGTTCAAGAGCC
ATTTCTTTACTCCTCTCCTCCAGTACTCTTGTCACATCAAGCATGCCAAGAAGAACTAAG
CTCGTCTCCTCCGTTTTGGATTTTCTTTCATTTTCATTTAGTTTTCTGTTAGGGTTTGTT
TTGTTTTGTCCATTTCTAATGGACATAACTTGATTAGTTCTTTGTTTAATTAATAAAATA
GTAGTTTTTAACT

QA 1 373 1 373
DS 

RD RS1BI78TF 373 0 0
GTCCGGTGAGTTAA*GAAGTGTTTGACTGGGG*ATAAGTCGAAGGTGTCAGAGAAATGTT
TCTCGCAGGTGTTTTCCAGTTGGGCAGAGAACGACTTGGCTTTGGACAAGGAGTGTTGTG
AGATCGTTTTGAATATGGACAAGAAGTGCTATGGCCATCTCCACATGATGTTCAAGAGCC
ATTTCTTTACTCCTCTCCTCCAGTACTCTTGTCACATCAAGCATGCCAAGAAGAACTAAG
CTCGTCTCCTCCGTTTTGGATTTTCTTTCATTTTCATTTAGTTTTCTGTTAGGGTTTGTT
TTGTTTTGTCCATTTCTAATGGACATAACTTGATTAGTTCTTTGTTTAATTAATAAAATA
GTAGTTTTTAAC
T

QA 1 372 1 372
DS 



AS 2 9

CO CL237Contig1 952 7 14 U
ATGGACGAATCCACGAACAAAGGTGGTCTGGAATCGAAGGGTAGTAGTGATGCAGAGATT
CCAAAACGCAGGAGCTTTGGTGTAAGGCCCGGGGGATATCGGTCCAGGATGTACAAAGTT
CCGGAATTGAACGATAGTTACGCAGGGAGCAGCATTATTAAGAGGATGGTGGTCAAGGGA
TACGACACGTCCCCTCCTACTCATAGGGTGGATGTGGAAGAGGCTCTGAGGAAACACTTC
GCATCACGTGGAATAAAGTTAATACATGCTTATGTTCCCGTAGACTACGAAACTCTTACC
CTCTGCAGTTACGGCTTTATCTATGTATATGAAGAATATGAAGCAGAGGCGTTGAAGCTT
GGGGGAAGTGACATAGGAGGAGGACGTATTTTAGAAATTAAGTCTTACCCTTTTGAAGAC
AATCACCTTGACCATGTCTTTCCTCCTACCAATCCCTCAGACGATATCCAACAGCGCACG
TTGAAAATTACAGGAGTTGATATTTCCCTTGATAAGGATGATATCGAGAAGATGCTACTT
GAGTTTATTCCTGACCCTGAATCCGGTATTATCACTGTCTCTAACGGCTCAGTTCTCCTT
GCTATCTCTGGACTAGATACTATGGACAAGGCTCTGAAACTTAGCGGAACTTCTGTACGC
GGCTCTAAAATTGCAGTCACTAAGGTCCTCCCAGAAAAATTGGTGAGGTGTGGCTTATCT
CACGCTGCTAGGTTCGCTTTGGGTAAGAAAGAAGCTTAAACCTGTTCTATGTGAGGAGAA
ATCAGAAGATGATCAAGACTACGGATTAGAAATGCTCCCTCTCTCTCAAAAATAAATGCT
CTCTCTCTCTCCCGTGTTATTAACTACTACTTTTTGTTATGATAATCTGTTTGCCATCTC
TATCAACTAGTCTTCTATTATAATAAAATAGAATCATACATATTTTATGCTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G736TF U 1
AF RS1EZ70TF U 1
AF RS1AF28TF U 1
AF RS1AF28JQ C 667
AF RS1DW01TF U 135
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AF RS1AX12TF U 711
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BS 942 952 RS1FA32JQ

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GGGGGAAATGACATGGGAGGAGGACGTATTTTAGAAATTAAGTCTTACCCTTTTGAAGAC
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GAGTTTATCCCTGACCCTGAATCCGGTATTATCACTGTCTCTAACGGCTCAGTTCTCCTT
GCTATC

QA 1 606 1 606
DS 

RD RS1EZ70TF 681 0 0
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CCAAAACGCAGGAGCTTTGGTGTAAGGCCCGGGGGATATCGGTCCAGGATGTACAAAGTT
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TACGACACGTCCCCTCCTACTCATAGGGTGGATGTGGAAGGGGCTCTGAGGAAACACTTC
GCATCACGTGGAATAAAGTTAATACATGCTTATGTTCCCGTAGACTACGAAACTCTTACC
CTCTGCAGTTACGGCTTTATCTATGTATATGAAGAATATGAAGCAGAGGCGTTGAAGCTT
GGGGGAAGTGACATAGGAGGAGGACGTATTTTAGAAATTAAGTCTTACCCTTTTGAAGAC
AATCACCTTGACCATGTCTTTCCTCCTACCAATCCCTCAGACGATATCCAACAGCGCACG
TTGAAAATTACAGGAGTTGATATTTCCCTTGATAAGGATGATATCGAGAAGATGCTACTT
GAGTTTATTCCTGACCCTGAATCCGGTATTATCACTGTCTCTAACGGCTCAGTTCTCCTT
GCTATCTCTGGACTAGATACTATGGACAACGCTCTGAAACTTAGCGGAACTTCTGTACGC
GGCTCTAAAATTGCAGTCACT

QA 1 681 1 681
DS 

RD RS1AF28TF 751 0 0
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CCAAAACGCAGGAGCTTTGGTGTAAGGCCCGGGGGATATCGGTCCAGGATGTACAAAGTT
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TACGACACGTCCCCTCCTACTCATAGGGTGGATGTGGAAGAGGCTCTGAGGAAACACTTC
GCATCACGTGGAATAAAGTTAATACATGCTTATGTTCCCGTAGACTACGAAACTCTTACC
CTCTGCAGTTACGGCTTTATCTATGTATATGAAGAATATGAAGCAGAGGCGTTGAAGCTT
GGGGGAAGTGACATAGGAGGAGGACGTATTTTAGAAATTAAGTCTTACCCTTTTGAAGAC
AATCACCTTGACCATGTCTTTCCTCCTACCAATCCCTCAGACGATATCCAACAGCGCACG
TTGAAAATTACAGGAGTTGATATTTCCCTTGATAAGGATGATATCGAGAAGATGCTACTT
GAGTTTATTCCTGACCCTGAATCCGGTATTATCACTGTCTCTAACGGCTCAGTTCTCCTT
GCTATCTCTGGACTAGATACTATGGACAAGGCTCTGAAACTTAGCGGAACTTCTGTACGC
GGCTCTAAAATTGCAGTCACTAAGGTCCTCCCAGAAAATTGGGTGAGGTGTGGCTTATCT
CACGCTGCTAG*TTCGCTTTGGGTAAGAAAG

QA 1 751 1 751
DS 

RD RS1AF28JQ 111 0 0
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GCTAGGTTCGCTTTGGGTAAGAAAGAAGCTTAAACCTGTTCTATGTGAGGA

QA 1 111 1 111
DS 

RD RS1DW01TF 736 0 0
G
AGTTACGCAGGGAGCAGCATTATTAAGAGGATGGTGGTCAAGGGATACGACACGTCCCCT
CCTACTCATAGGGTGGATGTGGAAGAGGCTCTGAGGAAACACTTCGCATCACGTGGAATA
AAGTTAATACATGCTTATGTTCCCGTAGACTACGAAACTCTTACCCTCTGCAGTTACGGC
TTTATCTATGTATATGAAGAATATGAAGCAGAGGCGTTGAAGCTTGGGGGAAGTGACATA
GGAGGAGGACGTATTTTAGAAATTAAGTCTTACCCTTTTGAAGACAATCACCTTGACCAT
GTCTTTCCTCCTACCAATCCCTCAGACGATATCCAACAGCGCACGTTGAAAATTACAGGA
GTTGATATTTCCCTTGATAAGGATGATATCGAGAAGGTGCTACTTGAGTTTATTCCTGAC
CCTGAATCCGGTATTATCACTGTCTCTAACGGCTCAGTTCTCCTTGCTATCTCTGGACTA
GATACTATGGACAAGGCTCTGAAACTTAGCGGAACTTCTGTACGCGGCTCTAAAATTGCA
GTCACTAAGGTCCTCCCAGAAAAATTGGTGAGGTGTGGCTTATCTCACGCTGCTAGGTTC
GCTTTGGGTAAGAAAGAAGCTTAAACCTGTTCTATGTGAGGAGAAATCAGAAGATGATCA
AGACTACGGATTAGAAATGCTCCCTCTCTCTCAAAA*TAAATGCTCTCTCTCT**CCCGT
GTTATTAACTACTAC

QA 2 736 2 736
DS 

RD RS1FA32JQ 811 0 0
GCAGGGAGCAGCATTATTAAGAGGATGGTGGTCAAGGGATACGACACGTCCCCTCCTACT
CATAGGGTGGATGTGGAAGAGGCTCTGAGGAAACACTTCACATCACGTGGAATAAAGTTA
ATACATGCTTATGTTCCCGTAGACTACGAAACTCTTACCCTCTGCAGTTACGGCTTTATC
TATGTATATGAAGAATATGAAGCAGAGGCGTTGAAGCTTGGGGGAAGTGACATAGGAGGA
GGACGTATTTTAGAAATTAAGTTTTACCCTTTTGAAGACAATCACCTTGACCATGTCTTT
CCTCCTACCAATCCCTCAGACGATATCCAACAGCGCACGTTGAAAATTACAGGAGTTGAT
ATTTCCCTTGATAAGGATGATATCGAGAAGATGCTACTTGAGTTTATTCCTGACCCTGAA
TCCGGTATTATCACTGTCTCTAACGGCTCAGTTCTCCTTGCTATCTCTGGACTAGATACT
ATGGACAAGGCTTTGAAACTTAGCGGAACTTCTGTACGCGGCTCTAAAATTGTAGTCACT
AAGGTCCTCCCAGAAAAATTGGTGAGGTGTGGCTTATCTCACGCTGCTAGGTTCGCTTTG
GGTAAGAAAGAAGCTTAAACCTGTTTTATGTGAGGAGAAATCAGAAGATGATCAAGACTA
CGGATTAGAAATGCTCCCTCTCTCTCAAAAATAAATGCTCTCTCTCTCTCCCGTGTTATT
AACTACTACTTTTTGTTATGATAATCTGTTTGCCATCTCTATCAACTAGTCTTCTATTAT
AATAAAATAGAATCATACATATTTTATGCTG

QA 1 811 1 811
DS 

RD RS1AX12TF 231 0 0
G
GGCTTATCTCACGCTGCTAGGTTCGCTTTGGGTAAGAAAGAAGCTTAAACCTGTTCTATG
TGAGGAGAAATCAGAAGATGATCAAGACTACGGATTAGAAATGCTCCCTCTCTCTCAAAA
ATAAATGCTCTCTCTCTCTCCCGTGTTATTAACTACTACTTTTTGTTATGATAATCTGTT
TGCCATCTCTATCAACTAGTCTTCTATTATAATAAAATAGAATCATACAT

QA 2 231 2 231
DS 



CO CL237Contig2 920 2 2 U
GAGCATAAAATATGTATGATTCTATTTTATTATAATAGAAGACTAGTTGATAGAGATGGC
AAACAGATTATCATAACAAAAAGTAGTAGTTAATAACACGGGAGAGAGAGAGAGCATTTA
TTTTTGAGAGAGAGGGAGCATTTCTAATCCGTAGTCTTGATCATCTTCTGATTTCTCCTC
ACATAGAACAGGTTTAAGCTTCTTTCTTACCCAAAGCGAACCTAGCTGAAACAAACAAAC
AAAGAGACGCAATGAATCTTTTGTTTCTCAAAGAAAGAAAGAAAAAAAAGAAACGAATAA
AAGGTAACGTACCAGCGTGAGATAAGCCACACCTCACCAATTTTTCTGGGAGGACCTTAG
TGACTGCAATTTTAGAGCCGCGTACAGAAGTTCCGCTAAGTTTCAGAGCCTTGTCCATAG
TATCTAGTCCAGAGATAGCAAGGAGAACTGAGCTGCAAAAAAAAAAAAACTCAAACAAGG
GGTGGCTTTAGTTAGCAAGTGATAAAAAAATTAACCAGCAAACTTGGTGGGAGGAAGAAA
ACACTCACCCGTTAGAGACAGTGATAATACCGGATTCAGGGTCAGGAATAAACTCAAGTA
GCATCTTCTCGATATCATCCTTATCAAGGGAAATATCAACTCCTGTAATTTTCAACCTAT
AGCAGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATCATATTATCAAACACGGTTACAATTAATTCTC
CATTGAAAAAAAAGAATCAATTTACGTGCGCTGTTGGATATCGTCTGAGGGATTGGTAGG
AGGAAAGACATGGTCAAGGTGATTGTCTTCAAAAGGGTAAGACTTAATTTCTAAAATACG
TCCTCCTCCTATGTCACTTCCCCCAAGCTTCAACGCCTCTGCTTCATATTCTTCATATAC
ATAGATAAAGCCGTAACTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F311TF U 1
AF RS1F311JQ C 273
BS 1 580 RS1F311TF
BS 581 920 RS1F311JQ

RD RS1F311TF 580 0 0
GAGCATAAAATATGTATGATTCTATTTTATTATAATAGAAGACTAGTTGATAGAGATGGC
AAACAGATTATCATAACAAAAAGTAGTAGTTAATAACACGGGAGAGAGAGAGAGCATTTA
TTTTTGAGAGAGAGGGAGCATTTCTAATCCGTAGTCTTGATCATCTTCTGATTTCTCCTC
ACATAGAACAGGTTTAAGCTTCTTTCTTACCCAAAGCGAACCTAGCTGAAACAAACAAAC
AAAGAGACGCAATGAATCTTTTGTTTCTCAAAGAAAGAAAGAAAAAAAAGAAACGAATAA
AAGGTAACGTACCAGCGTGAGATAAGCCACACCTCACCAATTTTTCTGGGAGGACCTTAG
TGACTGCAATTTTAGAGCCGCGTACAGAAGTTCCGCTAAGTTTCAGAGCCTTGTCCATAG
TATCTAGTCCAGAGATAGCAAGGAGAACTGAGCTGCAAAAAAAAAAAAACTCAAACAAGG
GGTGGCTTTAGTTAGCAAGTGATAAAAAAATTAACCAGCAAACTTGGTGGGAGGAAGAAA
ACACTCACCCGTTAGAGACAGTGATAATACCGGATTCAGG

QA 1 580 1 580
DS 

RD RS1F311JQ 648 0 0
GAAAGAAAGAAAAAAAAGAAACGAATAAAAGGTAACGTACCAGCGTGAGATAAGCCACAC
CTCACCAATTTTTCTGGGAGGACCTTAGTGACTGCAATTTTAGAGCCGCGTACAGAAGTT
CCGCTAAGTTTCAGAGCCTTGTCCATAGTATCTAGTCCAGAGATAGCAAGGAGAACTGAG
CTGCAAAAAAAAAAAAACTCAAACAAGGGGTGGCTTTAGTTAGCAAGTGATAAAAAAATT
AACCAGCAAACTTGGTGGGAGGAAGAAAACACTCACCCGTTAGAGACAGTGATAATACCG
GATTCAGGGTCAGGAATAAACTCAAGTAGCATCTTCTCGATATCATCCTTATCAAGGGAA
ATATCAACTCCTGTAATTTTCAACCTATAGCAGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATCATA
TTATCAAACACGGTTACAATTAATTCTCCATTGAAAAAAAAGAATCAATTTACGTGCGCT
GTTGGATATCGTCTGAGGGATTGGTAGGAGGAAAGACATGGTCAAGGTGATTGTCTTCAA
AAGGGTAAGACTTAATTTCTAAAATACGTCCTCCTCCTATGTCACTTCCCCCAAGCTTCA
ACGCCTCTGCTTCATATTCTTCATATACATAGATAAAGCCGTAACTGC

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 11

CO CL238Contig1 745 11 13 U
GGCTAACGAACTCAAAGGTCGAGCCTTTTCGCAGTTGCAGCAGCATCTCTGTTCCGTCTA
TCTCGCCGTCGTCAACATGGGTAAGACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAAGAG
GCTTAGGATTAACCAGAGGTGGGCGGACAAGCAGTACAAGAAGAGTCACCAAGGCAATGA
GTGGAAGAAGCCTTTTGCTGGATCTTCTCACGCTAAGGGTATCGTCCTTGAGAAAATAGG
TATTGAGGCCAAGCAGCCTAACTCTGCCATTCGTAAATGTGCTAGAGTTCAGTTGATCAA
GAACGGCAAAAAGATTGCTGCTTTCGTCCCTAATGATGGTTGCTTGAACTACATTGAAGA
AAATGACGAAGTGTTGATTGCTGGGTTCGGGCGTAAAGGTCATGCCGTCGGAGATATTCC
CGGAGTCAGGTTCAAGGTGGTGAAGGTCTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTCTTCAAGGA
AAAGAAGGAGAAGCCTAGGTCTTAGAGACTCC*TACTGCTTCTAATGGATTTTGATATTT
GAAACACTCCTCTGTTCTACTTAAAGATAATCTGTTTGGATCCAGTTGACTCTTTTT*GA
GTATTCTCTCCTCCTCCACTAGAGCTTCCTCATTTTCTCTTTTATTTTACCACTCTCAAT
ATGTCTCACATAATCCTATTGAAACCTT*GTTTTGAAATGTTAATCTTCTAAGTTTTCAC
AGATCGTATATAACTGTATATTAAA


BQ
10 10 10 10 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 20 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 15 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 15 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FD44TF U 487
AF RS1DB68JQ C 28
AF RS1DB68TF U 3
AF RS1GE52TF U 3
AF RS1GE52JQ C 29
AF RS1EH13JQ C 1
AF RS1FD44JQ C 71
AF RS1EH13TF U 1
AF RS1C359JQ C 5
AF RS1C359TF U 56
AF RS1C550TF U 7
BS 1 4 RS1EH13JQ
BS 5 210 RS1DB68TF
BS 211 211 RS1GE52TF
BS 212 493 RS1DB68TF
BS 494 512 RS1FD44TF
BS 513 513 RS1DB68TF
BS 514 597 RS1FD44TF
BS 598 598 RS1GE52TF
BS 599 688 RS1FD44TF
BS 689 689 RS1DB68TF
BS 690 714 RS1FD44TF
BS 715 725 RS1EH13TF
BS 726 745 RS1C550TF

RD RS1FD44TF 228 0 0
AGAAAGC
CCTAGGTCTTAGAGACTCCCTACTGCTTCTAATGGATTTTGATATTTGAAACACTCCTCT
GTTCTACTTAAAGATAATCTGTTTGGATCCAGTTGACTCTTTTTTGAGTATTCTCTCCTC
CTCCACTAGAGCTTCCTCATTTTCTCTTTTATTTTACCACTCTCAATATGTCTCACATAA
TCCTATTGAAACCTTTGTTTTGAAATGTTAATCTTCTAAGT

QA 8 228 8 228
DS 

RD RS1DB68JQ 675 0 0
TTCGCAGTTGCAGCAGCATCTCTGTTCCGTCTATCTCGCCGTCGTCAACATGGGTAAGAC
ACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAAGAGGCTTAGGATTAACCAGAGGTGGGCGGA
CAAGCAGTACAAGAAGAGTCACCAAGGCAATGAGTGGAAGAAGCCTTTTGCTGGATCTTC
TCATGCTAAGGGTATCGTCCTTGAGAAAATAGGTATTGAGGCCAAGCAGCCTAACTCTGC
CATTCGTAAATGTGCTAGAGTTCAGTTGATCAAGAACGGCAAAAAGATTGCTGCTTTCGT
CCCTAATGATGGTTGCTTGAACTACATTGAAGAAAATGACGAAGTGTTGATTGCTGGGTT
CGGGCGTAAAGGTCATGCCGTCGGAGATATTCCCGGAGTCAGGTTCAAGGTGGTGAAGGT
CTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTCTTCAAGGAAAAGAAGGAGAAGCCTAGGTCTTAGAG
ACTAC*TACTGCTTTTAATGGATTTTGATATTTGAAACACTCCTCTGTTCTACTTAAAGA
TAATCTGTTTGGATCCAGTTGACTCTTTTT*GAGTATTCTCTCCTCCTCCACT*GAGCTT
CCTCATTTTCTCTTTTATTTTACCACTCTCAATATGTCTCATCTAATCCTATTGAAACCT
T*GTTTTGAAATGTT

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1DB68TF 700 0 0
GG
AACGAACTCAAAGGTCGAGCCTTTTCGCAGTTGCAGCAGCATCTCTGTTCCGTCTATCTC
GCCGTCGTCAACATGGGTAAGACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAAGAGGCTT
AGGATTAACCAGAGGTGGGCGGACAAGCAGTACAAGAAGAGTCACCAAGGCAATGAGTGG
AAGAAGCCTTTTGCTGGATCTTCTCATGCTAAGGGTATCGTCCTTGAGAAAATAGGTATT
GAGGCCAAGCAGCCTAACTCTGCCATTCGTAAATGTGCTAGAGTTCAGTTGATCAAGAAC
GGCAAAAAGATTGCTGCTTTCGTCCCTAATGATGGTTGCTTGAACTACATTGAAGAAAAT
GACGAAGTGTTGATTGCTGGGTTCGGGCGTAAAGGTCATGCCGTCGGAGATATTCCCGGA
GTCAGGTTCAAGGTGGTGAAGGTCTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTCTTCAAGGAAAAG
AAGGAGAAGCCTAGGTCTTAGAGACTAC*TACTGCTTCTAATGGATTTTGATATTTGAAA
CACTCCTCTGTTCTACTTAAAGATAATCTGTTTGGATCCAGTTGACTCTTTTTTGAGTAT
TCTCTCCTCCTCCACT*GAGCTTCCTCATTTTCTCTTTTATTTTACCACTCTCAATATGT
CTCATCTAATCCTATTGAAACCTT*GTTTTGAAATGTT

QA 3 700 3 700
DS 

RD RS1GE52TF 699 0 0
GG
AACGAACTCAAAGGTCGAGCCTTTTCGCAGTTGCAGCAGCATCTCTGTTCCGTCTATCTC
GCCGTCGTCAACATGGGTAAGACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAAGAGGCTT
AGGATTAACCAGAGGTGGGCGGACAAGCAGTACAAGAAGAGTCACCAAGGCAATGAGTGG
AAGAAGCCTTTTGCTGGATCTTCTCACGCTAAGGGTATCGTCCTTGAGAAAATAGGTATT
GAGGCCAAGCAGCCTAACTCTGCCATTCGTAAATGTGCTAGAGTTCAGTTGATCAAGAAC
GGCAAAAAGATTGCTGCTTTCGTCCCTAATGATGGTTGCTTGAACTACATTGAAGAAAAT
GACGAAGTGTTGATTGCTGGGTTCGGGCGTAAAGGTCATGCCGTCGGAGATATTCCCGGA
GTCAGGTTCAAGGTGGTGAAGGTCTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTCTTCAAGGAAAAG
AAGGAGAAGCCTAGGTCTTAGAGACTCC*TACTGCTTCTAATGGATTTTGATATTTGAAA
CGCTCCTCTGTTCTACTTAAAGATAATCTGTTTGGATCCAGTTGACTCTTTTT*GAGTAT
TCTCTCCTCCTCCACTAGAGCTTCCTCATTTTCTCTTTTATTTTACCACTCTCAATATGT
CTCACATAATCCTATTGAAACCTT*GTTTTGAA
TGTC

QA 3 695 3 695
DS 

RD RS1GE52JQ 674 0 0
TCGCAGTTGCAGCAGCATCTCTGTTCCGTCTATCTCGCCGTCGTCAACATGGGTAAGACA
CGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAAGAGGCTTAGGATTAACCAGAGGTGGGCGGAC
AAGCAGTACAAGAAGAGTCACCAAGGCAATGAGTGGAAGAAGCCTTTTGCTGGATCTTCT
CACGCTAAGGGTATCGTCCTTGAGAAAATAGGTATTGAGGCCAAGCAGCCTAACTCTGCC
ATTCGTAAATGTGCTAGAGTTCAGTTGATCAAGAACGGCAAAAAGATTGCTGCTTTCGTC
CCTAATGATGGTTGCTTGAACTACATTGAAGAAAATGACGAAGTGTTGATTGCTGGGTTC
GGGCGTAAAGGTCATGCCGTCGGAGATATTCCCGGAGTCAGGTTCAAGGTGGTGAAGGTC
TCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTCTTCAAGGAAAAGAAGGAGAAGCCTAGGTCTTAGAGA
CTCC*TACTGCTTCTAATGGATTTTGATATTTGAAACGCTCCTCTGTTCTACTTAAAGAT
AATCTGTTTGGATCCAGTTGACTCTTTTT*GAGTATTCTCTCCTCCTCCACTAGAGCTTC
CTCATTTTCTCTTTTATTTTACCACTCTCAATATGTCTCACATAATCCTATTGAAACCTT
*GTTTTGAAATGT
C

QA 1 673 1 673
DS 

RD RS1EH13JQ 725 0 0
GGCTAACGAACTCAAAGGTCGAGCCTTTTCGCAGTTGCAGCAGCATCTCTGTTCCGTCTA
TCTCGCCGTCGTCAACATGGGTAAGACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAAGAG
GCTTAGGATTAACCAGAGGTGGGCGGACAAGCAGTACAAGAAGAGTCACCAAGGCAATGA
GTGGAAGAAGCCTTTTGCTGGATCTTCTCC*GCTAAGGGTATCGTCCTTGAGAAAATAGG
TATTGAGGCCAAGCAGCCTAACTCTGCCATTCGTAAATGTGCTAGAGTTCAGTCGATCAA
GAACGGCAAAAAGATTGCTGCTTTCGTCCCTAATGATGGTTGCTCGAACTACATTGAAGA
AAATGACGAAGTGTTGATTGCTGGGTTCGGGCGTAAAGGTCATGCCGTCGGAGATATTCC
CGGAGTCAGGTTCAAGGTGGTGAAGGTCTCTGGTGTCTCGCTCTTGGCCCTCTTCAAGGA
AAAGAAGGAGAAGCCTAGGTCTTAGAGACTCC*TACTGCTTCTAATGGATTTTGATATTT
GAAACACTCCTCTGTTCTACTTAAAGATAATCTGTTTGGATCCAGTTGACTCTTTTT*GA
GTATTCTCTCCTCCTCCACTAGAGCTTCCTCATTTTCTCTTTTATTTTACCACTCTCAAT
ATGTCTCACATAATCCTATTGAAACCTT*GTTTTGAAATGTTAATCTTCTAAGTTTTCAC
AGATC

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1FD44JQ 655 0 0
GTCAACATGGGTAAGACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAAGAGGCTTAGGATT
AACCAGAGGTGGGCGGACAAGCAGTACAAGAAGAGTCACCAAGGCAATGAGTGGAAGAAG
CCTTTTGCTGGATCTTCTCC*GCTAAGGGTATCGTCCTTGAGAAAATAGGTATTGAGGCC
AAGCAGCCTAACTCTGCCATTCGTAAATGTGCTAGAGTTCAGTCGATCAAGAACGGCAAA
AAGATTGCTGCTTTCGTCCCTAATGATGGTTGCTCGAACTACATTGAAGAAAATGACGAA
GTGTTGATTGCTGGGTTCGGGCGTAAAGGTCATGCCGTCGGAGATATTCCCGGAGTCAGG
TTCAAGGTGGTGAAGGTCTCTGGTGTCTCGCTCTTGGCCCTCTTCAAGGAAAAGAAGGAG
AAGCCTAGGTCTTAGAGACTCC*TACTGCTTCTAATGGATTTTGATATTTGAAACACTCC
TCTGTTCTACTTAAAGATAATCTGTTTGGATCCAGTTGACTCTTTTT*GAGTATTCTCTC
CTCCTCCACTAGAGCTTCCTCATTTTCTCTTTTATTTTACCACTCTCAATATGTCTCACA
TAATCCTATTGAAACCTT*GTTTTGAAATGTTAATCTTCTAAGTTTTCACAGATC

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1EH13TF 725 0 0
GGCT
AACGAACTCAAAGGTCGAGCCTTTTCGCAGTTGCAGCAGCATCTCTGTTCCGTCTATCTC
GCCGTCGTCAACATGGGTAAGACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAAGAGGCTT
AGGATTAACCAGAGGTGGGCGGACAAGCAGTACAAGAAGAGTCACCAAGGCAATGAGTGG
AAGAAGCCTTTTGCTGGATCTTCTCC*GCTAAGGGTATCGTCCTTGAGAAAATAGGTATT
GAGGCCAAGCAGCCTAACTCTGCCATTCGTAAATGTGCTAGAGTTCAGTCGATCAAGAAC
GGCAAAAAGATTGCTGCTTTCGTCCCTAATGATGGTTGCTCGAACTACATTGAAGAAAAT
GACGAAGTGTTGATTGCTGGGTTCGGGCGTAAAGGTCATGCCGTCGGAGATATTCCCGGA
GTCAGGTTCAAGGTGGTGAAGGTCTCTGGTGTCTCGCTCTTGGCCCTCTTCAAGGAAAAG
AAGGAGAAGCCTAGGTCTTAGAGACTCC*TACTGCTTCTAATGGATTTTGATATTTGAAA
CACTCCTCTGTTCTACTTAAAGATAATCTGTTTGGATCCAGTTGACTCTTTTT*GAGTAT
TCTCTCCTCCTCCACTAGAGCTTCCTCATTTTCTCTTTTATTTTACCACTCTCAATATGT
CTCACATAATCCTATTGAAACCTT*GTTTTGAAATGTTAATCTTCTAAGTTTTCACAGAT
C

QA 5 725 5 725
DS 

RD RS1C359JQ 723 0 0
AACGAACTCAAAGGTCGAGCCTTTTCGCAGTTGCAGCAGCATCTCTGTTCCGTCTATCTC
GCCGTCGTCAACATGGGTAAGACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAAGAGGCTT
AGGATTAACCAGAGGTGGGCGGACAAGCAGTACAAGAAGAGTCACCAAGGCAATGAGTGG
AAGAAGCCTTTTGCTGGATCTTCTCACGCTAAGGGTATCGTCCTTGAGAAAATAGGTATT
GAGGCCAAGCAGCCTAACTCTGCCATTCGTAAATGTGCTAGAGTTCAGTTGATCAAGAAC
GGCAAAAAGATTGCTGCTTTCGTCCCTAATGATGGTTGCTTGAACTACATTGAAGAAAAT
GACGAAGTGTTGATTGCTGGGTTCGGGCGTAAAGGTCATGCCGTCGGAGATATTCCCGGA
GTCAGGTTCAAGGTGGTGAAGGTCTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTCTTCAAGGAAAAG
AAGGAGAAGCCTAGGTCTTAGAGACTAC*TACTGCTTCTAATGGATTTTGATATTTGAAA
CACTCCTCTGTTCTACTTAAAGATAATCTGTTTGGATCCAGTTGACTCTTTTT*GAGTAT
TCTCTCCTCCTCCACTAGAGCTTCCTCATTTTCTCTTTTATTTTACCACTCTCAATATGT
CTCATATAATCCTATTGAAACCTT*GTTTTGAAATGTTAATCTTCTAAGTTTTCACAGAT
C
GT

QA 1 721 1 721
DS 

RD RS1C359TF 672 0 0
GTCTATCTCGCCGTCGTCAACATGGGTAAGACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTG
AAGAGGCTTAGGATTAACCAGAGGTGGGCGGACAAGCAGTACAAGAAGAGTCACCAAGGC
AATGAGTGGAAGAAGCCTTTTGCTGGATCTTCTCACGCTAAGGGTATCGTCCTTGAGAAA
ATAGGTATTGAGGCCAAGCAGCCTAACTCTGCCATTCGTAAATGTGCTAGAGTTCAGTTG
ATCAAGAACGGCAAAAAGATTGCTGCTTTCGTCCCTAATGATGGTTGCTTGAACTACATT
GAAGAAAATGACGAAGTGTTGATTGCTGGGTTCGGGCGTAAAGGTCATGCCGTCGGAGAT
ATTCCCGGAGTCAGGTTCAAGGTGGTGAAGGTCTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTCTTC
AAGGAAAAGAAGGAGAAGCCTAGGTCTTAGAGACTAC*TACTGCTTCTAATGGATTTTGA
TATTTGAAACACTCCTCTGTTCTACTTAAAGATAATCTGTTTGGATCCAGTTGACTCTTT
TT*GAGTATTCTCTCCTCCTCCACTAGAGCTTCCTCATTTTCTCTTTTATTTTACCACTC
TCAATATGTCTCATATAATCCTATTGAAACCTT*GTTTTGAAATGTTAATCTTCTAAGTT
TTCACAGATC
GT

QA 1 670 1 670
DS 

RD RS1C550TF 739 0 0
G
GAACTCAAAGGTCGAGCCTTTTCGCAGTTGCAGCAGCATCTCTGTTCCGTCTATCTCGCC
GTCGTCAACATGGGTAAGACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAAGAGGCTTAGG
ATTAACCAGAGGTGGGCGGACAAGCAGTACAAGAAGAGTCACCAAGGCAATGAGTGGAAG
AAGCCTTTTGCTGGATCTTCTCACGCTAAGGGTATCGTCCTTGAGAAAATAGGTATTGAG
GCCAAGCAGCCTAACTCTGCCATTCGTAAATGTGCTAGAGTTCAGTTGATCAAGAACGGC
AAAAAGATTGCTGCTTTCGTCCCTAATGATGGTTGCTTGAACTACATTGAAGAAAATGAC
GAAGTGTTGATTGCTGGGTTCGGGCGTAAAGGTCATGCCGTCGGAGATATTCCCGGAGTC
AGGTTCAAGGTGGTGAAGGTCTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTCTTCAAGGAAAAGAAG
GAGAAGCCTAGGTCTTAGAGACTCC*TACTGCTTCTAATGGATTTTGATATTTGAAACAC
TCCTCTGTTCTACTTAAAGATAATCTGTTTGGATCCAGTTGACTCTTTTT*GAGTATTCT
CTCCTCCTCCACTAGAGCTTCCTCATTTTCTCTTTTATTTTACCACTCTCAATATGTCTC
ACATAATCCTATTGAAACCTT*GTTTTGAAATGTTAATCTTCTA*GTTTTCACAGATCGT
ATATAACTGTATATTAAA

QA 2 739 2 739
DS 



AS 3 9

CO CL239Contig1 779 3 12 U
GGTCGTCGTCGTCTCGCATCTCGCGTATCTCTCTCTCTCTCTCTCAGATCTCTCGGTTAC
ATTCTACAGAGTAAGATGGGGTTGAGTTTCGCAAAGCTGTTTAGCAGGCTCTTTGCAAAG
AAGGAGATGAGGATTCTGATGGTTGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACCACTATCTTGTAC
AAGCTCAAGCTCGGTGAGATTGTCACCACCATCCCCACTATTGGTTTCAATGTGGAAACT
GTGGAGTGCAAGAACATCAGTTTCACTGTGTGGGATGTTGGGGGTCAGG*CAAGATTCGT
CCCTTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACTCAGGGTCTGATCTTTGTCGTGGACAGCAAC
GACAGAGACAGAGTTGTTGAGGCTAGAGATGACCTGCACAGGATGCTCAATGAGGACGAG
CTGCGTGATGCTGTGCTGCTTGTGTTTGCCAACAAGCAAGATCTTCCAAATGCGATGAAT
GCAGCTGAAATCACAGATAAGCTTGGTCTTCACTCCCTGCGTCAGCGTCACTGGTACATT
CAGAGCACATGCGCCACTTCAGGTGAAGGACTGTACGAAGGTCTGGACTGGCTGTCCAAC
AACATCGCTGGCAAGGCGTAATGAGGGTGAGTTGCATTTGCATCGAGATGATTGTATCTG
CTGTGATGCAAAGAAACGATTATAAATATTATCTGGACCTTTTTGCATATTGGGTATGTG
AATGTTTTGATTGTGCAAGTAGATGTCTTGTCTCTAAAACTTACTAGAAGAACCCATTT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G345TF U 3
AF RS1EA49TF U 1
AF RS1G345JQ C 180
BS 1 247 RS1EA49TF
BS 248 248 RS1G345TF
BS 249 289 RS1EA49TF
BS 290 290 RS1G345TF
BS 291 350 RS1EA49TF
BS 351 351 RS1G345TF
BS 352 392 RS1EA49TF
BS 393 393 RS1G345TF
BS 394 469 RS1EA49TF
BS 470 470 RS1G345TF
BS 471 758 RS1EA49TF
BS 759 779 RS1G345JQ

RD RS1G345TF 532 0 0
GG
GTCGTCGTCTCGCATCTCGCGTATCTCTCTCTCTCTCTCTCAGATCTCTCGGTTACATTC
TACAGAGTAAGATGGGGTTGAGTTTCGCAAAGCTGTTTAGCAGGCTCTTTGCAAAGAAGG
AGATGAGGATTCTGATGGTTGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACCACTATCTTGTACAAGC
TCAAGCTCGGTGAGATTGTCACCACCATCCCCACTATTGGTTTCAATGTGGAAACTGTGG
AGTGCAAGAACATCAGTTTCACTGTGTGGGATGTTGGGGGTCAGG*CAAGATTCGTCCCT
TGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACTCAGGGTCTGATCTTTGTCGTGGACAGCAACGACA
GAGACAGAGTTGTTGAGGCTAGAGATGACCTGCACAGGATGCTCAATGAGGACGAGCTGC
GTGATGCTGTGCTGCTTGTGTTTGCCAACAAGCAAGATCTTCCAAATGCGATGAATGCAG
CTGAAATCACAGATAAGCTTGGTCTTCACTCCCTGCGTCAGCGTCACTGG

QA 3 532 3 532
DS 

RD RS1EA49TF 763 0 0
GGTCGTCGTCGTCTCGCATCTCGCGTATCTCTCTCTCTCTCTCTCAGATCTCTCGGTTAC
ATTCTACAGAGTAAGATGGGGTTGAGTTTCGCAAAGCTGTTTAGCAGGCTCTTTGCAAAG
AAGGAGATGAGGATTCTGATGGTTGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACCACTATCTTGTAC
AAGCTCAAGCTCGGTGAGATTGTCACCACCATCCCCACTATTGGTTTCAATGTGGAAACT
GTGGAGTACAAGAACATCAGTTTCACTGTGTGGGATGTTGGGGGTCAGGACAAGATTCGT
CCCTTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACTCAGGGTCTGATCTTTGTCGTTGACAGCAAC
GACAGAGACAGAGTTGTTGAGGCTAGAGATGAACTGCACAGGATGCTCAATGAGGACGAG
CTGCGTGATGCTGTGCTGCTTGTGTTTGCCAACAAGCAAGATCTTCCAAGTGCGATGAAT
GCAGCTGAAATCACAGATAAGCTTGGTCTTCACTCCCTGCGTCAGCGTCACTGGTACATT
CAGAGCACATGCGCCACTTCAGGTGAAGGACTGTACGAAGGTCTGGACTGGCTGTCCAAC
AACATCGCTGGCAAGGCGTAATGAGGGTGAGTTGCATTTGCATCGAGATGATTGTATCTG
CTGTGATGCAAAGAAACGATTATAAATATTATCTGGACCTTTTTGCATATTGGGTATGTG
AATGTTTTGATTGTGCAAGTAGATGTCTTGTCTCTAAA
CTTAC

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1G345JQ 600 0 0
CAAGCTCAAGCTCGGTGAGATTGTCACCACCATCCCCACTATTGGTTTCAATGTGGAAAC
TGTGGAGTGCAAGAACATCAGTTTCACTGTGTGGGATGTTGGGGGTCAGG*CAAGATTCG
TCCCTTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACTCAGGGTCTGATCTTTGTCGTGGACAGCAA
CGACAGAGACAGAGTTGTTGAGGCTAGAGATGACCTGCACAGGATGCTCAATGAGGACGA
GCTGCGTGATGCTGTGCTGCTTGTGTTTGCCAACAAGCAAGATCTTCCAAATGCGATGAA
TGCAGCTGAAATCACAGATAAGCTTGGTCTTCACTCCCTGCGTCAGCGTCACTGGTACAT
TCAGAGCACATGCGCCACTTCAGGTGAAGGACTGTACGAAGGTCTGGACTGGCTGTCCAA
CAACATCGCTGGCAAGGCGTAATGAGGGTGAGTTGCATTTGCATCGAGATGATTGTATCT
GCTGTGATGCAAAGAAACGATTATAAATATTATCTGGACCTTTTTGCATATTGGGTATGT
GAATGTTTTGATTGTGCAAGTAGATGTCTTGTCTCTAAAACTTACTAGAAGAACCCATTT

QA 1 600 1 600
DS 



CO CL239Contig2 896 4 3 U
GCAAATGAAAATAGGCGATAACAAGAAAGCAATAACATTCAATCATCAATCCAGGTGTGA
ACAACACGAAAGCTATTTAAAAGGGGGCTCATACTAGTAAGTTTTTAGGTACATATCTAC
TTGCAACAATCTCAGAACATTCATAAAGCCAGTAGCAAAAAGGTTCATATAATATTTATA
AATCTCTCTCTCTTGCATCCAGAAACTTTACCAACATACAGTAGGAAGAATCATCTCCGA
TGCAGTGCTGTTTTTACTTCATTACGCCTTGCCAGCGATGTTGTTGGACAGCCAGTCAAG
ACCTTCGTAAAGTCCTTCACCTGAAGTGGCGCATGTGCTCTGAATGTACCAGTGACGCTG
ACGCAGGGAGTGAAGGCCAAGCTTATCAGTGATTTCAGCGGCATTCATGGCGTTTGGAAG
ATCTTGCTTGTTGGCAAACACAAGCAACACAGCATCACGCAGCTCATCCTCATTGAGCAT
CCTGTGAAGTTCATCTCTAGCCTCAACAACTCTGTCTCTGTCGTTGCTGTCGACGACAAA
GATCAGACCCTGAGTGTTCTGGAAGTAGTGCCTCCACAAAGGACGGATCTTGTCCTGACC
CCCGACATCCCAGACAGTGAAACTGATGTTCTTGTACTCCACAGTTTCCACATTGAAACC
AATAGTGGGGATGGTGGTGACAATCTCACCGAGCTTGAGCTTGTAGAGAATGGTGGTCTT
ACCAGCAGCATCAAGACCAACCATCAGAATCCTCATCTCTTTCTTGGCAAAGAGCCTGCT
GAACAGCTTCGCGAAACTCAACCCCATCCCTCTTCTGCTTTATAAACTCTGGAGAGAAAC
TGAGCTCTGCTTAAGAGAAACGCTAAATGCGCGACGACGATGAATAGAGGGGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1EV79JQ U 1
AF RS1AO66JQ U 19
AF RS1AO66TFB C 18
AF RS1EV79TF C 86
BS 1 533 RS1EV79JQ
BS 534 561 RS1AO66JQ
BS 562 896 RS1AO66TFB

RD RS1EV79JQ 533 0 0
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ACAACACGAAAGCTATTTAAAAGGGGGCTCATACTAGTAAGTTTTTAGGTACATATCTAC
TTGCAACAATCTCAGAACATTCATAAAGCCAGTAGCAAAAAGGTTCATATAATATTTATA
AATCTCTCTCTCTTGCATCCAGAAACTTTACCAACATACAGTAGGAAGAATCATCTCCGA
TGCAGTGCTGTTTTTACTTCATTACGCCTTGCCAGCGATGTTGTTGGACAGCCAGTCAAG
ACCTTCGTAAAGTCCTTCACCTGAAGTGGCGCATGTGCTCTGAATGTACCAGTGACGCTG
ACGCAGGGAGTGAAGGCCAAGCTTATCAGTGATTTCAGCGGCATTCATGGCGTTTGGAAG
ATCTTGCTTGTTGGCAAACACAAGCAACACAGCATCACGCAGCTCATCCTCATTGAGCAT
CCTGTGAAGTTCATCTCTAGCCTCAACAACTCTGTCTCTGTCGTTGCTGTCGA

QA 1 533 1 533
DS 

RD RS1AO66JQ 543 0 0
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AAAAGGGGGCTCATACTAGTAAGTTTTTAGGTACATATCTACTTGCAACAATCTCAGAAC
ATTCATAAAGCCAGTAGCAAAAAGGTTCATATAATATTTATAAATCTCTCTCTCTTGCAT
CCAGAAACTTTACCAACATACAGTAGGAAGAATCATCTCCGATGCAGTGCTGTTTTTACT
TCATTACGCCTTGCCAGCGATGTTGTTGGACAGCCAGTCAAGACCTTCGTAAAGTCCTTC
ACCTGAAGTGGCGCATGTGCTCTGAATGTACCAGTGACGCTGACGCAGGGAGTGAAGGCC
AAGCTTATCAGTGATTTCAGCGGCATTCATGGCGTTTGGAAGATCTTGCTTGTTGGCAAA
CACAAGCAACACAGCATCACGCAGCTCATCCTCATTGAGCATCCTGTGAAGTTCATCTCT
AGCCTCAACAACTCTGTCTCTGTCGTTGCTGTCGACGACAAAGATCAGACCCTGAGTGTT
CTG

QA 1 543 1 543
DS 

RD RS1AO66TFB 879 0 0
A
TAACAAGAAAGCAATAACATTCAATCATCAATCCAGGTGTGAACAACACGAAAGCTATTT
AAAAGGGGGCTCATACTAGTAAGTTTT*AGGTACATATCTACTTGCAACAATCTCAGAAC
ATTCATAAAGCCAGTAGCAAAAAGGTTCATATAATATTTATAAATCTCTCTCTCTTGCAT
CCAGAAACTTTACCAACATACAGTAGGAAGAATCATCTCCGATGCAGTGCTGTTTTTACT
TCATTACGCCTTGCCAGCGATGTTGTTGGACAGCCAGTCAAGACCTTCGTAAAGTCCTTC
ACCTGAAGTGGCGCATGTGCTCTGAATGTACCAGTGACGCTGACGCAGGGAGTGAAGGCC
AAGCTTATCAGTGATTTCAGCGGCATTCATGGCGTTTGGAAGATCTTGCTTGTTGGCAAA
CACAAGCAACACAGCATCACGCAGCTCATCCTCATTGAGCATCCTGTGAAGTTCATCTCT
AGCCTCAACAACTCTGTCTCTGTCGTTGCTGTCGACGACAAAGATCAGACCCTGAGTGTT
CTGGAAGTAGTGCCTCCACAAAGGACGGATCTTGTCCTGACCCCCGACATCCCAGACAGT
GAAACTGATGTTCTTGTACTCCACAGTTTCCACATTGAAACCAATAGTGGGGATGGTGGT
GACAATCTCACCGAGCTTGAGCTTGTAGAGAATGGTGGTCTTACCAGCAGCATCAAGACC
AACCATCAGAATCCTCATCTCTTTCTTGGCAAAGAGCCTGCTGAACAGCTTCGCGAAACT
CAACCCCATCCCTCTTCTGCTTTATAAACTCTGGAGAGAAACTGAGCTCTGCTTAAGAGA
AACGCTAAATGCGCGACGACGATGAATAGAGGGGGTCC

QA 2 879 2 879
DS 

RD RS1EV79TF 781 0 0
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AAGCCAGTAGCAAAAAGGTTCATATAATATT*ATAAATCTCTCTCTCTTGCATCCAGAAA
CTTTACCAACATACAGTAGGAAGAATCATCTCCGATGCAGTGCTGTTTTTACTTCATTAC
GCCTTGCCAGCGATGTTGTTGGACAGCCAGTCAAGACCTTCGTAAAGTCCTTCACCTGAA
GTGGCGCATGTGCTCTGAATGTACCAGTGACGCTGACGCAGGGAGTGAAGGCCAAGCTTA
TCAGTGATTTCAGCGGCATTCATGGCGTTTGGAAGATCTTGCTTGTTGGCAAACACAAGC
AACACAGCATCACGCAGCTCATCCTCATTGAGCATCCTGTGAAGTTCATCTCTAGCCTCA
ACAACTCTGTCTCTGTCGTTGCTGTCGACGACAAAGATCAGACCCTGAGTGTTCTGGAAG
TAGTGCCTCCACAAAGGACGGATCTTGTCCTGACCCCCGACATCCCAGACAGTGAAACTG
ATGTTCTTGTACTCCACAGTTTCCACATTGAAACCAATAGTGGGGATGGTGGTGACAATC
TCACCGAGCTTGAGCTTGTAGAGAATGGTGGTCTTACCAGCAGCATCAAGACCAACCATC
AGAATCCTCATCTCTTTCTTGGCAAAGAGCCTGCTGAACAGCTTCGCGAAACTCAACCCC
ATCCCTCTTCTGCTTTATAAACTCTGGAGAGAAACTGAGCTCTGCTTAAGAGAAACGCT
CC

QA 1 779 1 779
DS 



CO CL239Contig3 779 2 2 U
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AAGAGATGAGGATTCTGATGGTTGGTCTCGATGCTGCTGGTAAGACCACCATTCTCTACA
AGCTCAAGCTCGGTGAGATTGTCACCACCATCCCCACTATTGGTTTCAATGTGGAAACTG
TGGAGTACAAGAACACCAGTTTCACTGTGTGGGATGTCGGGGGTCAGGACAAGATCCGTC
CTTTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACTCAGGGTCTGATCTTTGTCGTCGACAGCAACG
ACAGAGACAGAGTTGTTGAAGCTAGAGATGAACTTCACAGGATGCTCAATGAGGATGAGC
TGCGTGATGCTGTGTTGCTTGTGTTTGCCAACAAGCAAGATCTTCCAAATGCCATGAATG
CAGCTGAAATCACAGATAAGCTTGGCCTTCACTCCCTGCGTCAGCGTCACTGGTACATTC
AGAGCACATGCGCCACTTCAGGTGAAGGACTCTACGAAGGTCTTGACTGGCTGTCCAACA
ACATCGCTGGCAAGGCTTAATGAAGTGAAAGCAGCATTGCATCGAGAGATGATTCTTCCT
GCTGTATGTTGGTAAAGTTTCTGGATGCAAGAGAGAGATTATAAATATTATATGAACCTT
TTTGCTACTGGCTTTATGAATGTTCTGGTTGTGCAAGTAGTAGATATGTACCGAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FR96TF U 1
AF RS1BH32JQ C 131
BS 1 727 RS1FR96TF
BS 728 779 RS1BH32JQ

RD RS1FR96TF 727 0 0
GGATCGTCGTCGCGCATTTAGCGTCTCTTAAGCTGAGCTCAGTTTCTCCAGAGTTTAAAG
AGCAAAAAAAAGGGATGGGGTTGAGTTTCGCGAAGCTGTTCAGCAGGCTCTTTGCCAAGA
AAGAGATGAGGATTCTGATGGTTGGTCTCGATGCTGCTGGTAAGACCACCATTCTCTACA
AGCTCAAGCTCGGTGAGATTGTCACCACCATCCCCACTATTGGTTTCAATGTGGAAACTG
TGGAGTACAAGAACACCAGTTTCACTGTGTGGGATGTCGGGGGTCAGGACAAGATCCGTC
CTTTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACTCAGGGTCTGATCTTTGTCGTCGACAGCAACG
ACAGAGACAGAGTTGTTGAAGCTAGAGATGAACTTCACAGGATGCTCAATGAGGATGAGC
TGCGTGATGCTGTGTTGCTTGTGTTTGCCAACAAGCAAGATCTTCCAAATGCCATGAATG
CAGCTGAAATCACAGATAAGCTTGGCCTTCACTCCCTGCGTCAGCGTCACTGGTACATTC
AGAGCACATGCGCCACTTCAGGTGAAGGACTCTACGAAGGTCTTGACTGGCTGTCCAACA
ACATCGCTGGCAAGGCTTAATGAAGTGAAAGCAGCATTGCATCGAGAGATGATTCTTCCT
GCTGTATGTTGGTAAAGTTTCTGGATGCAAGAGAGAGATTATAAATATTATATGAACCTT
TTTGCTA

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1BH32JQ 649 0 0
GATTCTGATGGTTGGTCTCGATGCTGCTGGTAAGACCACCATTCTCTACAAGCTCAAGCT
CGGTGAGATTGTCACCACCATCCCCACTATTGGTTTCAATGTGGAAACTGTGGAGTACAA
GAACATCAGTTTCACTGTGTGGGATGTCGGGGGTCAGGACAAGATCCGTCCTTTGTGGAG
GCACTACTTCCAGAACACTCAGGGTTTGATTTTTGTCGTCGACAGCAACGACAGAGACAG
AGTTGTTGAAGCTAGAGATGAACTTCACAGGATGCTCAATGAGGATGAGCTGCGTGATGC
TGTGTTGCTTGTGTTTGCCAACAAGCAAGATTTTCCAAATGCCATGAATGCAGCTGAAAT
CACAGATAAGCTTGGCCTTCACTCCCTGCGTCAGCGTCACTGGTACATTCAGAGCACATG
CGCCACTTCAGGTGAAGGACTCTACGAAGGTCTTGACTGGCTGTCCAACAACATCGCTGG
CAAGGCTTAATGAAGTGAA*GCAGCATTGCATCGAGAGATGATTTTTCCTGCTGTATGTT
GGTAAAGTTTCTGGATGCAAGAGAGAGATTATAAATATTATATGAACCTTTTTGCTACTG
GCTTTATGAATGTTCTGGTTGTGCAAGTAGTAGATATGTACCGAAAAAA

QA 1 649 1 649
DS 



AS 2 9

CO CL240Contig1 879 5 7 U
AATTTGAAAAATTACTGATATCTCAATCTTACAAAAAACTTCTAGGAAGTAGAGACATGT
GTGAAATGATCTTTTTCCATAAAATTCAAAAGCAAGTAGCAGCAAAATATTTCAAGGATA
AAAAAAACAGAGTCTGATACACAAAGATTAAAGATCAAAACGATGAAGGCAAGATAGAGA
GGAAGGATCTCCTCACTTCTTCTCCTCTTTCTCAGCATCGGCAGCTCTCTTGGCTCTAGC
ACCTGCATGTCTCTTGTTAGTGCGCTCGAGACGAATCTTGTCATAAGCGTTGAACGATTT
CATCTCAGCGGTAAGCTTCACAAGCTCCGTTGCAGGCTTCTCACGGACAATAGGCATGTA
GTCACCCTGGACTAGAGTGGCATTGGCCAACTCTTCTGGAGTAGAATCACCAGCCTTGAC
CTTCCTGGCACGACGCGGGAAGATGACCAACTTAGCCTTGTAGGTTTTAAGCCTCTGGAC
ATTGGATTGAAGACCCTCGAGAGATCTGTTCTTGCGGCGATGGTCAACAGAAATACCGAT
GGTTGGTGCCAACTTCTTGGGGATTCCAGCAGCCTTGAGCTCTTCAAGGGTGAACCCTTT
ACCGGTTCTGACCTTCATGTTGTACTTGAGGGTCTGACCGTGCACAACAGGACGGAGAGG
TCCAGAAGTGGGACGGGGGAAGATCTTCACAGCCTTCTTTTGCCTCGCAACTCTTCTTCT
GGTTTTCCTGGCAGGCTGGTTGAACCAAGTCTTGACATAGTTCTGCCAGTGCTTCTTGAA
GTGACCATTCGGGATAACATTGTTGTGCTTCATTCCTTCAACTCAGAAGTTGCTTCGTTC
CTTCTTCCTGCGGCGAGACGAGAGAAATGTCTTCTCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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GACGGGGGAAGATCTTCACAGCCTTCTTTTGCCTCG

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CAGCCTTCTTTTGCCTCGCAACTCTTCTTCTGGTTTTCCTGGCAGGCTGGTTGAACCAAG
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TCATTCCTTCAACTCAGAAGTTGCTTCGTTCCTTCTTCCTGCGGCGAGACGAGAGAAATG
TCTTC
C

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CTCTC
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AACTTAGCCTTGTAGGTTTTAAGCCTCTGGACATTGGATTGAAGACCCTCGAGAGATCTG
TTCTTGCGGCGATGGTCAACAGAAATACCGATGGTTGGTGCCAACTTCTTGGGGATTCCA
GCAGCCTTGAGCTCTTCAAGGGTGAACCCTTTACCGGTTCTGACCTTCATGTTGTACTTG
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GTCTTCTCCCT

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TCC

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DS 



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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
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5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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CTGCTGATGCTGAGAAAGAAGAGAAGAAGTGAGGGATACCTTCTTGTTTAG
T

QA 1 711 1 711
DS 

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GGA
TAGACATTTTATCTCGTCTCGCCGCAGGAGGAACGAAGCTCTCTTCAGTAACATTCTGAG
GTGGAGAAATGAAGCACAACAATGTTATCCCGAATGGTCATTTCAAGAAGCACTGGCAGA
ACTATGTCAAGACATGGTTCAACCAGCCTGCCAGGAAAACCAGAAGAAGAGCTGCGAGAC
AAAAGAAGGCTGTGAAGATCTTCCCCCGTCCCACCGCAGGACCTCTCCGCCCTGTTTTGC
ACGGTCAGACCCTTAAGTACAACATGAAGGTCAGGACTGGTAAAGGATTCACTCTTGTAG
AGCTTAAGGCTGCTGGAATCCCAAAAAAGTTGGCACCAACCATTGGTATCTCTGTTGACC
ATCGTCGCAAGAACAGATCTTTGGAGGGTCTTCAGTCCAATGTCCAGAGGCTTAAAACCT
ACAAGGCTAAGTTGGTCATCTTCCCACGTCGTGCCAGGAAGGTCAAGGCTGGTGATTCTA
CTGCCGAAGAGTTGGCTAATGCCACTCAAGTCCAGGGAGACTACATGCCTATCGTACGTG
AGAAGCAAGCAACGGAGCTAGTGAAGCTGACCGCTGAGATGAAATCGTTCAAAGCTTATG
ACAAGATCCGTCTAGAGCGTACAAACAAGAGACATGCAG*TGCTAGAGCCAAGAGGGCTG
CTGATGCTGAGAAAGAAGAGAAGAAGTGAGGGATACCTTCTTGTTTAG*TTTTATCTTGT
CGTCGTTTGA
CCTCTGGACTTTTGTGTA

QA 4 733 4 733
DS 

RD RS1EQ39TF 796 0 0
GGC
TAGACATTTTATCTCGTCTCGCCGCAGGAGGAACGAAGCTCTCTTCAGTAACATTCTGAG
GTGGAGAAATGAAGCACAACAATGTTATCCCGAATGGTCATTTCAAGAAGCACTGGCAGA
ACTATGTCAAGACATGGTT*AACCAGCCTGCCAGGAAAACCAGAAGAAAAGCTGCGAGAC
AAAAGAAGGCTGTGAAGATCTTCCCCCGTCCCACCGCTGGACCTCTCCGCCCTGTTGTGC
ACGGTCAGACCCTTAAGTACAACATGAAGGTCAGGACTGGTAAAGGATTCACTCTTGAAG
AGCTTAAGGCTGCTGGAATCCCAAAAAAGTTGGCACCAACCATTGGTATCTCTGTTGACC
ACCGTCGCAAGAACAGATCTTTGGAGGGTCTTCAGTCCAATGTCCAGAGGCTTAAAACCT
ACAAGGCTAAGTTGGTCATCTTCCCACGTCGTGCCAGGAAGGTCAAGGCTGGTGATTCTA
CTGCCGAAGAGTTGGCTAATGCCACTCAAGTCCAGGGAGACTACATGCCTATCGTACGTG
AGAAGCAAGCAACTGAGCTAGTGAAGCTGACCGCTGAGATGAAATCGTTCAAGGCTTATG
ACAAGATCCGTCTAGAGCGTACAAACAAGAGACATGCAG*TGCTAGAGCCAAGAGGGCTG
CTGATGCTGAGAAAGAAGAGAAGAAGTGAGGGATACCTTCTTGTTTAG*TTTTATCTTGT
CGTCGTTTGAATCTCTGGATTTTTGTGTATCGGACCTTTTTTTTT****TTGCTTCGTCA
GTTTTTATCACTA

QA 4 796 4 796
DS 

RD RS1GS22JQ 666 0 0
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CACCGCAGGACCTCTCCGCCCTGTTTTGCACGGTCAGACCCTTAAGTACAACATGAAGGT
CAGGACTGGTAAAGGATTCACTCTTGTAGAGCTTAAGGCTGCTGGAATCCCAAAAAAGTT
GGCACCAACCATTGGTATCTCTGTTGACCATCGTCGCAAGAACAGATCTTTGGAGGGTCT
TCAGTCCAATGTCCAGAGGCTTAAAACCTACAAGGCTAAGTTGGTCATCTTCCCACGTCG
TGCCAGGAAGGTCAAGGCTGGTGATTTTACTGCCGAAGAGTTGGCTAATGCCACTCAAGT
CCAGGGAGACTACATGCCTATCGTACGTGAGAAGCAAGCAACGGAGCTAGTGAAGCTGAC
CGCTGAGATGAAATCGTTCAAAGCTTATGACAAGATCCGTCTAGAGCGTACAAACAAGAG
ACATGCAGGTGCTAGAGCCAAGAGGGCTGCTGATGCTGAGAAAGAAGAGAAGAAGTGAGG
GATACCTTCTTGTTTAGGTTTTATCTTGTCGTCGTTTGAACCTCTGGACTTTTGTGTATC
AGACCTTTTTTTTTTTTTTTGCTTCGTCAGTTTTTATCAGTACTTGCTTTTCTGGATTAT
GGAAAA

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 11

CO CL241Contig1 1075 11 10 U
GGGCCTCTCTCTCTCTCACACACAAAAATCTTCTCTGTCATCGTTCTCTCTCTCTCCCCT
CTCTCGGAGATTTTACTCAGGGCGTTTGATCAAAGATGAATCAATACAACCTTCACCAGA
AGAACGCCTTCGTGTCTCGCGAGGAGGAGATGATGGGACTTGATCGCAGCAACAAGGAGG
ATCTTGTCGTTTGTCCTAAGCCCCGACGTGTCGGCTTACTCGTCACGCGCCCTCTCAGAT
TACATTTGAGTCAAGCTGCTGCTGATCTGTGTGATTCCAAAGCGGGTGCAGAGCTTTTAG
ACATCATCCGTAGAAAGGAGGACAATGGTACAATAGGACAGCCACCGTACTTTCGCGGTT
CTCCCCCGAGCAGAGCAGCGAACCCATTAGCCCAAGATGCACGCTTTCGTGACAACGAGA
AGCTCAACTACCCACTCGCTTCACCCAACTCTCCTTTCCTTCAGCCCGGTTCATCATCAT
CAGCCGGCTTCCCTTATCCATCACCATCAACAGCATCTTCGTCGTCGTCTCGTGGTTGCG
CTCGAATGAAATTTGGGCTCAAACCACCTGCAGTTAGAGTAGAAGGGTTCGATTGCTTGA
ACCGTGACCGCCAGAGCTCCAGCATCCCCGCCATGGCTTAGTAGACCAAAGCCAACAACA
AAAACAAGTGTATATAGAGAGAGATTCCAGACCAA*GGCCCTAACAGAGAGAAGGATTTG
ATTACTAGTGTTACTACTACATTTTTGAAGCAAATGAATATGTGATATCTATTTAGTGTT
TTCTTTTTTATCTTTTCCTGAGAGAGAGAGAGGGAGGATGAAGATGAAGATCGGGTCACC
GTTTTGTTTATACATTAATAATAATTAAGGAGAAGATTAGAAGAAGAATCTGTAAAATTT
TATCTTGGAAAAGAGGTCTGGTTTGTATCTTTTTCCTTTTGATTTCGTTGTAATATAAAA
ATTATCTTCTTTACGCCATTGTGTATAGTAGTGGGCTTGAGTTTAAGCTTTCTCCCACAA
CACCTTTGTATATGTATCTTTTGTGATTTGATAAATCTGTATATTAAAGCACCAC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GB69TF U 1
AF RS1AK04TF U 1
AF RS1DW49TF U 16
AF RS1D409TF U 1
AF RS1BN61TF U 1
AF RS1BN61JQ C 280
AF RS1AK04JQ C 45
AF RS1EA26TF U 544
AF RS1F786TF U 544
AF RS1D409JQ C 132
AF RS1DW49JQ C 533
BS 1 632 RS1AK04TF
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BS 713 748 RS1BN61TF
BS 749 972 RS1EA26TF
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TACATTTGAGTCAAGCTGCTGCTGATCTGTGTGATTCCAAAGCGGGTGCAGAGCTTTTAG
ACATCATCCGTAGAAAGGAGGACAATGGTACAATAGGACAGCCACCGTACTTTCGCGGTT
CTCCCCCGAGCAGAGCAGCGAACCCATTAGCCCAAGATGCACGCTTTCGTGACAACGAGA
AGCTCAACTACCCACTCGCTTCACCCAACTCTCCTTTCCTTCAGCCCGGTTCATCATCAT
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CTCGAATGAAATTTGGGCTCAAACCACCTGCA

QA 1 572 1 572
DS 

RD RS1AK04TF 712 0 0
GGGCCTCTCTCTCTCTCACACACAAAAATCTTCTCTGTCATCGTTCTCTCTCTCTCCCCT
CTCTCGGAGATTTTACTCAGGGCGTTTGATCAAAGATGAATCAATACAACCTTCACCAGA
AGAACGCCTTCGTGTCTCGCGAGGAGGAGATGATGGGACTTGATCGCAGCAACAAGGAGG
ATCTTGTCGTTTGTCCTAAGCCCCGACGTGTCGGCTTACTCGTCACGCGCCCTCTCAGAT
TACATTTGAGTCAAGCTGCTGCTGATCTGTGTGATTCCAAAGCGGGTGCAGAGCTTTTAG
ACATCATCCGTAGAAAGGAGGACAATGGTACAATAGGACAGCCACCGTACTTTCGCGGTT
CTCCCCCGAGCAGAGCAGCGAACCCATTAGCCCAAGATGCACGCTTTCGTGACAACGAGA
AGCTCAACTACCCACTCGCTTCACCCAACTCTCCTTTCCTTCAGCCCGGTTCATCATCAT
CAGCCGGCTTCCCTTATCCATCACCATCAACAGCATCTTCGTCGTCGTCTCGTGGTTGCG
CTCGAATGAAATTTGGGCTCAAACCACCTGCAGTTAGAGTAGAAGGGTTCGATTGCTTGA
ACCGTGACCGCCAGAGCTCCAGCATCCCCGCCGTGGCTTAGTAGACCAAAGCCAACAACA
AAAACAAGTGTATATAGAGAGAGATTCCAGACCAAAG*CCCTAACAGAGAGA

QA 1 712 1 712
DS 

RD RS1DW49TF 649 0 0
GG
ACACACAAAAATCTTCTCTGTCATCGTTCTCTCTCTCTCCCCTCTCTCGGAGATTTTACT
CAGGGCGTTTGATCTAAGATGAATCAATACAACCTTCACCAGAAGAACGCCTTCGTGTCT
CGCGAGGAGAAGATGATGGGACTTGATCGCAGCAACAAGGAGGATCTTGTCGTTTGTCCT
AAGCCCCGACGTGTCGGCTTACTCGTCACGCGCCCTCTCAGATTACATTTGAGTCAAGCT
GCTGCTGATCTGTGTGATTCCAAAGCGGGTGCAGAGCTTTTAGACATCATCCGTAGAAAG
GAGGACAATGGTACAATAGGACAGCCACCGTACTTTCGCGGTTCTCCCCCGAGCAGAGCA
GCGAACCCATTAGCCCAAGATGCACGCTTTCGTGACAACGAGAAGCTCAACTACCCACTC
GCTTCACC*AACTCTCCTTTCCTTCAGCCCGGTTCATCATCATCAGCCGGCTTCCCTTAT
CCATCACCATCAACAGCATCTTCGTCGTCGTCTCGTGGTTGCGCTCGAATGAAATTTGGG
CTCAAACCACCTGCAGTTAGAGTAGAAGGGTTCGATTGCTTGAACCGTGACCGCCAGAGC
TCCAGCATCCCCGCCATGGCTTAGTAGACCAAAGCCAACAACAAAAA

QA 3 649 3 649
DS 

RD RS1D409TF 664 0 0
GGGCCTCTCTCTCTCTCACACACAAAAATCTTCTCTGTCATCGTTCTCTCTCTCTCCCCT
CTCTCGGAGATTTTACTCAGGGCGTTTGATCAAAGATGAATCAATACAACCTTCACCAGA
AGAACGCCTTCGTGTCTCGCGAGGAGGAGATGATGGGACTTGATCGCAGCAACAAGGAGG
ATCTTGTCGTTTGTCCTAAGCCCCGACGTGTCGGCTTACTCGTCACGCGCCCTCTCAGAT
TACATTTGAGTCAAGCTGCTGCTGATCTGTGTGACTCCAAAGCGGGTGCAGAGCTTTTAG
ACATCATCCGTAGAAAGGAGGACAATGGTACAATAGGACAGCCACCGTACTTTCGCGGTT
CTCCCCCGAGCAGAGCAGCGAACCCATTAGCCCAAGATGCACGCTTTCGTGGCAACGAGA
AGCTCAACTACCCACTCGCTTCACCCAACTCTCCTTTCCTTCAGCCCGGTTCATCATCAT
CAGCCGGCTTCCCTTATCCATCACCATCAACAGCATCTTCGTCGTCGTCTCGTGGTTGCG
CTCGAATGAAATTTGGGCTCAAACCACCTGCAGTTAGAGTAGAAGGGTTCGATTGCTTGA
ACCGTGACCGCCAGAGCTCCAGCATCCCCGCCATGGCTTAGTAGACCAAAGCCAACAACA
AAAA

QA 1 664 1 664
DS 

RD RS1BN61TF 748 0 0
GGGCCTCTCTCTCTCTCACACACAAAAATCTTCTCTGTCATCGTTCTCTCTCTCTCCCCT
CTCTCGGAGATTTTACTCAGGGCGTTTGATCAAAGATGAATCAATACAACCTTCACCAGA
AGAACGCCTTCGTGTCTCGCGAGGAGGAGATGATGGGACTTGATCGCAGCAACAAGGAGG
ATCTTGTCGTTTGTCCTAAGCCCCGACGTGTCGGCTTACTCGTCACGCGCCCTCTCAGAT
TACATTTGAGTCAAGCTGCTGCTGATCTGTGTGATTCCAAAGCGGGTGCAGAGCTTTTAG
ACATCGTCCGTAGAAAGGAGGACAATGGTACAATAGGACAGCCACCGTACTTTCGCGGTT
CTCCCCCGAGCAGAGCAGCGAACCCATTAGCCCAAGATGCACGCTTTCGTGACAACGAGA
AGCTCAACTACCCACTCGCTTCACCCAACTCTCCTTTCCTTCAGCCCGGTTCATCATCAT
CAGCCGGCTTCCCTTATCCATCACCATCGACAGCATCTTCGTCGTCGTCTCGTGGTTGCG
CTCGAATGAAATTTGGGCTCAAACCACCTGCAGTTAGAGTAGAAGGGTTCGATTGCTTGA
ACCGTGACCTCCAGAGCTCCAGCATCCCCGCCATGGCTTAGTAGACCAAAGCCGACAACA
AAAACAAGTGTATATAGAGAGAGATTCCAGACCAAAGGCCCTAACAGAGAGAAGGATTTG
ATTACTAGTGTTACTACTACATTTTTGA

QA 1 748 1 748
DS 

RD RS1BN61JQ 656 0 0
AAGCGGGTGCAGAGCTTTTAGACATCGTCCGTAGAAAGGAGGACAATGGTACAATAGGAC
AGCCACCGTACTTTCGCGGTTCTCCCCCGAGCAGAGCAGCGAACCCATTAGCCCAAGATG
CACGCTTTCGTGACAACGAGAAGCTCAACTACCCACTCGCTTCACCCAACTCTCCTTTCC
TTCAGCCCGGTTCATCATCATCAGCCGGCTTCCCTTATCCATCACCATCGACAGCATCTT
CGTCGTCGTCTCGTGGTTGCGCTCGAATGAAATTTGGGCTCAAACCACCTGCAGTTAGAG
TAGAAGGGTTCGATTGCTTGAACCGTGACCTCCAGAGCTCCAGCATCCCCGCCATGGCTT
AGTAGACCAAAGCCGACAACAAAAACAAGTGTATATAGAGAGAGATTCCAGACCAA*GGC
CCTAACAGAGAGAAGGATTTGATTACTAGTGTTACTACTACATTTTTGAAGCAAATGAAT
ATGTGATATCTATTTAGTGTTTTCTTTTTTATCTTTTCCTGAGAGAGAGAGAGGGAGGAT
GAAGATGAAGATCGGGTCACCGTTTTGTTTATACATTAATAATAATTAAGGAGAAGATTA
GAAGAAGAATCTGTAAAATTTTATCTTGGAAAAGAGGTCTGGTTTGTATCTTTTTC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RS1AK04JQ 933 0 0
TCTCTCTCTCTCCCCTCTCTCGGAGATTT*ACTCAGG*CGTTTGATCAAAGATGAATCAA
TACAACCTTCACCAGAAGAACGCTTTCGTGTCTCGCGAGGAGGAGATGATGGGACTTGAT
CGCAGCAACAAGGAGGATCTTGTCGTTTGTCCTAAGCCCCGACGTGTCGGCTTACTCGTC
ACGCGCCCTCTCAGATTACATTTGAGTCAAGCTGCTGCTGATCTGTGTGATTCCAAAGCG
GGTGCAGAGCTTTTAGACATCATCCGTAGAAAGGAGGACAATGGTACAATAGGACAGCCA
CCGTACTTTCGCGGTTCTCCCCCGAGCAGAGCAGCGAACCCATTAGCCCAAGATGCACGC
TTTCGTGACAACGAGAAGCTCAACTACCCACTCGCTTCACCCAACTCTCCTTTCCTTCAG
CCCGGTTCATCATCATCAGCCGGCTTCCCTTATCCATCACCATCAACAGCATCTTCGTCG
TCGTCTCGTGGTTGCGCTCGAATGAAATTTGGGCTCAAACCACCTGCAGTTAGAGTAGAA
GGGTTCGATTGCTTGAACCGTGACCGCCAGAGCTCCAGCATCCCCGCCGTGGCTTAGTAG
ACCAAAGCCAACAACAAAAACAAGTGTATATAGAGAGAGATTCCAGACCAA*GGCCCTAA
CAGAGAGAAGGATTTGATTACTAGTGTTACTACTACATTTTTGAAGCAAATGAATATGTG
ATATCTATTTAGTGTTTTCTTTTTTATCTTTTCCTGAGAGAGAGAGAGGGAGGATGAAGA
TGAAGATCGGGTCACCGTTTTGTTTATACATTAATAATAATTAAGGAGAAGATTAGAAGA
AGAATCTGTAAAATTTTATCTTGGAAAAGAGGTCTGGTTTGTATCTTTTTCCTTTTGATT
TCGTTGTAATATAAAAATTATCTTCTTT
ACGCC

QA 1 928 1 928
DS 

RD RS1EA26TF 429 0 0
GAATGAAATTTGGGCTCAAACCACCTGCAGTTAGAGTAGAAGGGTTCGATTGCTTGAACC
GTGACCGCCAGAGCTCCAGCATCCCCGCCATGGCTTAGTAGACCAAAGCCAACAACAAAA
ACAAGTGTATATAGAGAGAGATTCCAGACCAA*GGCCCTAACAGAGAGAAGGATTTGATT
ACTAGTGTTACTACTACATTTTTGAAGCAAATGAATATGTGATATCTATTTAGTGTTTTC
TTTTTTATCTTTTCCTGAGAGAGAGAGAGGGAGGATGAAGATGAAGATCGGGTCACCGTT
TTGTTTATACATTAATAATAATTAAGGAGAAGATTAGAAGAAGAATCTGTAAAATTTTAT
CTTGGAAAAGAGGTCTGGTTTGTATCTTTTTCCTTTTGATTTCGTTGTAATATAAAAATT
ATCTTCTTT

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DS 

RD RS1F786TF 429 0 0
GAATGAAATTTGGGCTCAAACCACCTGCAGTTAGAGTAGAAGGGTTCGATTGCTTGAACC
GTGACCGCCAGAGCTCCAGCATCCCCGCCATGGCTTAGTAGACCAAAGCCAACAACAAAA
ACAAGTGTATATAGAGAGAGATTCCAGACCAA*GGCCCTAACAGAGAGAAGGATTTGATT
ACTAGTGTTACTACTACATTTTTGAAGCAAATGAATATGTGATATCTATTTAGTGTTTTC
TTTTTTATCTTTTCCTGAGAGAGAGAGAGGGAGGATGAAGATGAAGATCGGGTCACCGTT
TTGTTTATACATTAATAATAATTAAGGAGAAGATTAGAAGAAGAATCTGTAAAATTTTAT
CTTGGAAAAGAGGTCTGGTTTGTATCTTTTTCCTTTTGATTTCGTTGTAATATAAAAATT
ATCTTCTTT

QA 1 429 1 429
DS 

RD RS1D409JQ 841 0 0
GTGTCTCGCGAGGAGGAGATGATGAGACTTGATCGCAGCAACAAGGAGGATCTTGTCGTT
TGTC*TAAGCCCCGACGTGTCGGCTTACTCGTCACGCGCCCTCTCAGATTACATTTGAGT
CAAGCTGCTGCTGATCTGTGTGACTCCAAAGCGGGTGCAGAGCTTTTAGACATCATCCGT
AGAAAGGAGGACAATGGTACAATAGGACAGCCACCGTACTTTCGCGGTTCTCCCCCGAGC
AGAGCAGCGAACCCATTAGCCCAAGATGCACGCTTTCGTGGCAACGAGAAGCTCAACTAC
CCACTCGCTTCACCCAACTCTCCTTTCCTTCAGCCCGGTTCATCATCATCAGCCGGCTTC
CCTTATCCATCACCATCAACAGCATTTTCGTCGTCGTCTCGTGGTTGCGCTCGAATGAAA
TTTGGGCTCAAACCACCTGCAGTTAGAGTAGAAGGGTTCGATTGCTTGAACCGTGACCGC
CAGAGCTCCAGCATCCCCGCCATGGCTTAGTAGACCAAAGCCAACAACAAAAACAAGTGT
ATATAGAGAGAGATTCCAGACCAA*GGCCCTAACAGAGAGAAGGATTTGATTACTAGTGT
TACTACTACATTTTTGAAGCAAATGAATATGTGATATCTATTTAGTGTTTTCTTTTTTAT
CTTTTCCTGAGAGAGAGAGAGGGAGGATGAAGATGAAGATCGGGTCACCGTTTTGTTTAT
ACATTAATAATAATTAAGGAGAAGATTAGAAGAAGAATCTGTAAAATTTTATCTTGGAAA
AGAGGTCTGGTTTGTATCTTTTTCCCTTTGATTTCGTTGTAATATAAAAATTATCTTCTT
T

QA 1 841 1 841
DS 

RD RS1DW49JQ 543 0 0
TGGTTGCGCTCGAATGAAATTTGGGCTCAAACCACCTGCAGTTAGAGTAGAAGGGTTCGA
TTGCTTGAACCGTGACCGCCAGAGCTCCAGCATCCCCGCCATGGCTTAGTAGACCAAAGC
CAACAACAAAAACAAGTGTATATAGAGAGAGATTCCAGACCAA*GGCCCTAACAGAGAGA
AGGATTTGATTACTAGTGTTACTACTACATTTTTGAAGCAAATGAATATGTGATATCTAT
TTAGTGTTTTTTTTTTTATCTTTTCCTGAGAGAGAG****GGAGGATGAAGATGAAGATC
GGGTCACCGTTTTGTTTATACATTAATAATAATTAAGGAGAAGATTAGAAGAAGAATCTG
TAAAATTTTATCTTGGAAAAGAGGTCTGGTTTGCATCTTTTTCCTTTTGATTTCGTTGTA
ATATAAAAATTATTTTCTTTACGCCATTGTGTATAGTAGTGGGCTTGAGTTTAAGCTTTC
TCCCACAACACCTTTGTATATGTATCTTTTGTGATTTGATAAATCTGTATATTAAAGCAC
CAC

QA 1 543 1 543
DS 



AS 2 10

CO CL242Contig1 706 4 7 U
CGATCAATAACTTTTTCGAATAATATAATTCAAAATAACAGCAAACATGATTATAAATTA
TTTGAGTGGCATCATTTTATACATAAACTGGCAAGTTCAATAGATAGAGTAACCTCCCAT
TATTGACAAAACAAATAGATTAGTTGAAATATCATATCTCGCCATCCCATAACTCTTCAA
AAGACTTATAAGGGCTCAGTGTCTCATGAACAAAGAACGGAGCAGTCAATAACCTAGCCT
GTTCAATATCAAAAAACTTGGCGAACAAGTCATCGGGTATTGACCAGTCGAAAACTTCAA
AGTTCTTTCTAATTCTTCCTTCATTAGTACTCTTGGGAAGTACGCTGTTACCCATTTGGA
GTCCCCAGCGAAGCGCAACTTGCGCAGGAAACTTTCCAAGTTTCTCAGCAACAGTGTTTA
GTATGAGGTTCTTCAGCACATCGCTCTTGAGCCACGTTGTTCCTGGAGAGCCCAAGGGCG
AGTATGCGGTGAGGTGAACTCCTTTGGATTTGCAGAACTCTCGTAGCTTAGTCTGTCGCC
AAAAAGGATGACATTCGACTTGAACAACGGCAGGAGGAACACGGGCTAACTCCAAAAGAT
CAGCTAGCTTCTTGGTGGAGAAGTTGCTTACACCTATGGCTCGTGCCTTGCCCGAATCGT
GGAGTGCTTCCATTGCTTTCCATGTGCTAGGAATATCGACAGGTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D473JQ U 32
AF RS1GA67JQ U 37
AF RS1CI67JQ U 1
AF RS1FA85JQ U 55
BS 1 251 RS1CI67JQ
BS 252 252 RS1D473JQ
BS 253 389 RS1CI67JQ
BS 390 390 RS1GA67JQ
BS 391 542 RS1CI67JQ
BS 543 543 RS1FA85JQ
BS 544 706 RS1CI67JQ

RD RS1D473JQ 505 0 0
AAAATAA
CAGCAAACATGATTATAAATTATTTGAGTGGCATCATTTTATACATAAACTGGCAAGTTC
AATAAATAGAGTAACCTCCCATTATTGACAAAACAAATAGATTAGTTGAAATATCATATC
TCGCCATCCCATAACTCTTCAAAAGACTTATAAGGGCTCAGTGTCTCATGAACAAAGAAC
GGAGCAGTCAATAACCTAGCCTGTTCAATATCAAAAAACTTGGCGAACAAGTCATCGGGT
ATCGACCAGTCGAAAACTTCAAAGTTCTTTCTAATTCTTCCTTCATTAGTACTCTTGGGA
AGTACGCTGTTACCCATTTGGAGTCCCCAGCGAAGCGCAACTTGCGCAA***ACTTTCCA
AGTTTCTCAGCAACAGTGTTTAGTATGAGGTTCTTCAGCACATCGCTCTTGAGCCACGTT
GTTCCTGGAGAGCCCAAGGGCGAGTATGCGGTGAGGTGAACTCCTTTGGATTTGCAGAAC
TCTCGTAGCTTAGTCTGT

QA 8 505 8 505
DS 

RD RS1GA67JQ 488 0 0
GG
CAGCAAACATGATTATAAATTATTTGAGTGGCATCATTTTATACATAAACTGGCAAGTTC
AATAGATAGAGTAACCTCCCATTATTGACAAAACAAATAGATTAGTTGAAATATCATATC
TCGCCATCCCATAACTCTTCAAAAGACTTATAAGGGCTCAGTGTCTCATGAACAAAGAAC
GGAGCAGTCAATAACCTAGCCTGTTCAATATCAAAAAACTTGGCGAACAAGTCATCGGGT
ATTGACCAGTCGAAAACTTCAAAGTTCTTTCTAATTCTTCCTTCATTAGTACTCTTGGGA
AGTACGCTGTTACCCATTTGGAGTCCCCAGCGAAGCGCAACTTGCGCAGGAAACTTTCCA
AGTTTCTCAGCAACAGTGTTTAGTATGAGGTTCTTCAGCACATCGCTCTTGAGCCACGTT
GTTCCTGGAGAGCCCAAGGGCGAGTATGCGGTGAGGTGAACTCCTTTGGATTTGCAGAAC
TCTCGT

QA 3 488 3 488
DS 

RD RS1CI67JQ 706 0 0
CGATCAATAACTTTTTCGAATAATATAATTCAAAATAACAGCAAACATGATTATAAATTA
TTTGAGTGGCATCATTTTATACATAAACTGGCAAGTTCAATAGATAGAGTAACCTCCCAT
TATTGACAAAACAAATAGATTAGTTGAAATATCATATCTCGCCATCCCATAACTCTTCAA
AAGACTTATAAGGGCTCAGTGTCTCATGAACAAAGAACGGAGCAGTCAATAACCTAGCCT
GTTCAATATCAGAAAACTTGGCGAACAAGTCATCGGGTATTGACCAGTCGAAAACTTCAA
AGTTCTTTCTAATTCTTCCTTCATTAGTACTCTTGGGAAGTACGCTGTTACCCATTTGGA
GTCCCCAGCGAAGCGCAACTTGCGCAGGAGACTTTCCAAGTTTCTCAGCAACAGTGTTTA
GTATGAGGTTCTTCAGCACATCGCTCTTGAGCCACGTTGTTCCTGGAGAGCCCAAGGGCG
AGTATGCGGTGAGGTGAACTCCTTTGGATTTGCAGAACTCTCGTAGCTTAGTCTGTCGCC
AAGAAGGATGACATTCGACTTGAACAACGGCAGGAGGAACACGGGCTAACTCCAAAAGAT
CAGCTAGCTTCTTGGTGGAGAAGTTGCTTACACCTATGGCTCGTGCCTTGCCCGAATCGT
GGAGTGCTTCCATTGCTTTCCATGTGCTAGGAATATCGACAGGTAA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RS1FA85JQ 634 0 0
GG
ATTATTTGAGTGGCATCATTTTATACATAAACTGGCAAGTTCAATAGATAGAGTAACCTC
CCATTATTGACAAAACAAATAGATTAGTTGAAATATCATATCTCGCCATCCCATAACTCT
TCAAAAGACTTATAAGGGCTCAGTGTCTCATGAACAAAGAACGGAGCAGTCAATAACCTA
GCCTGTTCAATATCAAAAAACTTGGCGAACAAGTCATCGGGTATTGACCAGTCGAAAACT
TCAAAGTTCTTTCTAATTCTTCCTTCATTAGTACTCTTGGGAAGTACGCTGTTACCCATT
TGGAGTCCCCAGCGAAGCGCAACTTGCGCAGGAAACTTTCCAAGTTTCTCAGCAACAGTG
TTTAGTATGAGGTTCTTCAGCACATCGCTCTTGAGCCACGTTGTTCCTGGAGAGCCCAAG
GGCGAGTATGCGGTGAGGTGAACTCCTTTGGATTTGCAGAACTCTCGTAGCTTAGTCTGT
CGCCAAAAAGGATGACATTCGACTTGAACAACGGCAGGAGGAACACGGGCTAACTCCAAA
AGATCAGCTAGCTTCTTGGTGGAGAAGTTGCTTACACCTATGGCTCGTGCCTTGCCCGAA
TCGTGGAGTGCTTCCATTGCTTTCCATGTGCT

QA 3 634 3 634
DS 



CO CL242Contig2 947 6 5 U
GGGATGAGTGGATGTAGTTGAGAAACGCACTGTGCGCTTTAAAACCGACACAACACAAGC
GATCTTTATCTCAAATCTCTCTGATAATGGCGAACGCAATCAGATTCTTTGAGCTAAACA
CCGGCGCTAAGATCCCCTCGGTGGGACTCGGAACCTGGCAAGCCTCTCCAGGCCTTGTCG
GCGAGGCTGTGGCTGCCGCTGTTAAGATCGGATATCGTCATATTGATTGCGCTCAGATCT
ATGGCAACGAGAAAGAGATAGGGGCAGTTTTGAAAAAGTTGTTTGAAGACAATGTAGTGA
AACGCGAGGAGTTGTTCATCACTTCCAAACTCTGGTGTACTGATCATGACCCTCAAGATG
TGCCAGAGGCACTAAATAGAACTCTACAGGATCTACAGTTTGACTATGTTGATCTCTATC
TGATGCATTGGCCTGTAAGGATGAAGAAAGGTTCTGTTGGAGTTAAGCCAGAGAACCTTT
TACCTGTCGATATTCCTAGCACATGGAAAGCAATGGAAGCACTCCACGATTCGGGCAAGG
CACGAGCCATAGGTGTAAGCAACTTCTCCACCAAGAAGCTAGCTGATCTTTTGGAGTTAG
CCCGTGTTCCTCCTGCCGTTGTTCAAGTCGAATGTCATCCTTCTTGGCGACAGACTAAGC
TACGAGAGTTCTGCAAATCCAAAGGAGTTCACCTCACCGCATACTCGCCCTTGGGCTCTC
CAGGAACAACGTGGCTCAAGAGCGATGTGCTGAAGAACCTCATACTAAACACTGTTGCTG
AGAAACTTGGAAAGTCTCCTGCGCAAGTTGCGCTTCGCTGGGGACTCCAAATGGGTAACA
GCGTACTTCCCAAGAGTACTAATGAAGAAGATTAGAAAGAACTTTGAAGTTTCGACTGGT
CATACCCGATGACTTGTTCGCCAGTTTTCTGATATGAACAGGCTAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GA67TF U 71
AF RS1H573TF U 1
AF RS1FA85TF U 44
AF RS1D473TF U 66
AF RS1CI67TF U 79
AF RS1GF50TF U 154
BS 1 662 RS1H573TF
BS 663 733 RS1FA85TF
BS 734 797 RS1D473TF
BS 798 830 RS1CI67TF
BS 831 947 RS1GF50TF

RD RS1GA67TF 574 0 0
GG
AAATCTCTCTGATGATGGCGAACGCAATCAGATTCTTCGAGCTAAACACCGGCGCTAAGA
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DS 

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QA 1 662 1 662
DS 

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DS 

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GGCTCAAGAGCGATGTGCTGAAGAACCTCATACTAAACACTGTTGCTGAGAAACTTGGAA
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DS 

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GC
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GTGGGACTCGGAACCTGGCAAGCCTCTCCAGGCCTTGTCGGCGAGGCTGTGGCTGCCGCT
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GCGCAAGTTGCGCTTCGCTGGGGACTCCAA
TGGGTACAGCGTAC

QA 3 752 3 752
DS 

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G
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QA 2 794 2 794
DS 



AS 1 11

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BQ
10 10 10 10 10 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 15 15 30 15 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 15 30 30 
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30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 50 50 50 50 50 50 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 
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55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DL92TF U 1
AF RS1ES32TF U 4
AF RS1CF17TF U 4
AF RS1C752TF U 6
AF RS1H790TF U 4
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AF RS1DH24TF C 1499
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BS 772 772 RS1ES32JQ
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BS 951 1674 RS1DH24JQ
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TTCTCGATTCTCAGCTTCTGGCTTCTTTGTGTTCAAAAAGATCTTCTGAAAACGATGTCG
CTTTTGTCGAAGCTACGGTGTATCACAGTAGATGTAACTGGCACGCTCATTGCATACAAA
GGGGAGCTTGGTGATTACTACTGTATGGCTGCTAAAGCCGTTGGCTTGCCTTGTCCTGAT
TACACACGAGTTCACGAAGGCTTCGAAATTGCTTATACAGACATGGCTCAGAAGTACCCT
TGTTTCGGTTTCTCCAAAATGTCAAACATTGTTTGGTGGAAAACCTGCGTGAGAGATTCA
TTCGTCAAGGCAGGGTATGACTATGATGAGGAGACATTTGAGAAAGTGTTTAGAAGAATC
TATTCAACGTTTGGTTCTGCTGCACCTTACTCTGTGTTTCAGGACTCTCGACCTTTCTTG
AGATGGGCACGCGAGAAAGGGCTTATCGTTGGACTTGTTAGCAACGCCGAGTATCGATAT
CAAGAAGTTATTTTACCTGCCTTAGGTTTGAACAAGGGAGAGTGGGACTTTGGTGTGTTC
TCTGG*TATGGAAGGTGTAGAGAAGCCAAATCCGAGGATATACGAGCTGGCTTTAGAAAG
AGCGGGGAACAACATTGCGCCTGGAGAGGT*CTGCATATTGGAGATAGTATGCGTAAAGA
TTATGT

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DS 

RD RS1ES32TF 722 0 0
GG
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GTCGAAGCTACGGCGTATCACAGTAGATGTAACTGGCGCGCTCATTGCATACAAAGGGGA
GCTTGGTGATTACTACTGTATGGCTGCTAAAGCCGTTGGCTTGCCTTGTCCTGATTACAC
ACGAGTTCACGAAGGCTTCAAAATTGCTTATACAGACATGGCTCAGAAGTACCCTTGTTT
CGGTTTCTCCAAAATGTCAAACATTGTTTGGTGGAAAACCTGCGTGAGAGATTCATTCGT
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*TATGGAAGGTGTAGAGAAGCCAAATCCGAGGATATACGAGCTGGCTTTAGAAAGAGCGG
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QA 3 722 3 722
DS 

RD RS1CF17TF 724 0 0
GG
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GATTCTCAGCTTCTGGCTTCTTTGTGTTCAAAAAGATCTTCTGAAAACGATGTCGCTTTT
GTCGAAGCTACTGTGTATCACAGTAGATGTAACTGGCACGCTCATTGCATACGAAGGGGA
GCTTGGTGATTACTACTGTATGGCTGCTAAAGCCGTTGGCTTGCCTTGTCCTGATTACAC
ACGAGTTCACGAAGGCTTCAAAATTGCTTATACAGACATGGCTCAGAAGTACCCTTGTTT
CGGTTTCTCCAAAATGTCAAACATTGTTGGGTGGAAAACCTGCGTGAGAGATTCATTCTT
CAAGGCAGGGTATGACTATGATGAGGAGACATTTGAGAAAGTGTTTAGAAGAATCTATTC
AACGTTTGGTTCTGCTGCACCTTACTCTGTGTTTCAGGACTCTCGACCTTTCTTGAGATG
GGCACGCGAGAAAGGGCTTATCGTTGGACTTGTTAGCAACGCCGAGTATCGATATCAAGA
AGTTATTTTACCTGCCTTAGGTTTGAACAAGGGAGAGTGGGACTTTGGTGTGTTCTCTGG
GTATGGAAGGTGTAGAGAAGCCAAATCCGAGGATATACGAGCTGGCTTTAGAAAGAGCGG
GGAACAACATTGCGCCTGGAGAGGT*CTGCATATTGGAGATAGTATGCGTAAAGATTATG
T
C

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DS 

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GG
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TTCTCAGCTTCTGGCTTCTTTGTGTTCAAAAAGATCTTCTGAAAACGATGTCGCTTTTGT
CGAAGCTACGGTGTATCACAGTAGATGTAACTGGCACGCTCATTGCATACAAAGGGGAGC
TTGGTGATTACTACTGTATGGCTGCTAAAGCCGTTGGCTTGCCTTGTCCTGATTACACAC
GAGTTCACGAAGGCTTCAAAATTGCTTATACAGACATGGCTCAGAAGTACCCTTGTTTCG
GTTTCTCCAAAATGTCAAACATTGTTTGGTGGAAAACCTGCGTGAGAGATTCATTCGTCA
AGGCAGGGTATGACTATGATGAGGAGACATTTGAGAAAGTGTTTATAAGAATCTATTCAA
CGTTTGGTTCTGCTGCACCTTACTCTGTGTTTCAGGACTCTCGACCTTTCTTGAGATGGG
CACGCGAGAAAGGGCTTATCGTTGGACTTGTTAGCAACGCCGAGTATCGATATCAAGAAG
TTATTTTACCTGCCTTAGGTTTGAACAAGGGAGAGTGGGACTTTGGTGTGTTCTCTGG*T
ATGGAAGGTGTAGAGAAGCCAAATCCGAGGATATACGAGCTGGCTTTAGAAAGAGCGGGG
AACAACATTGCGCCTGGAGAGGT*CTGCATATTGGAGATAGTATGCGTAAAGATTATGT*
CCGGCAAAGAGTATTGGGATGCATTCTTT*TTGCTTGATAGGTT

QA 3 766 3 766
DS 

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GG
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GATTCTCATCTTCTGGCTTCTTTGTGTTCAAAAAGATCTTCTGAAAACGATGTCGCTTTT
GTCGAAGCTACGGTGTATCACAGTAGATGTAACTGGCACGCTCATAGCTTACAAAGGGGA
GCTTGGTGATTACTACTGTATGGCAGCTAAAGCCGTTGGCTTGCCTTGTCCTGATTACAC
ACGAGTCCACGAAGGTTTCAAAATTGCTTACACAGACATGGCTCAGAAGTACCCTTGTTT
CGGTTTCTCCAAAATGTCAAACATTGTTTGGTGGAAAACCTGCGTGAGAGATTCATTCGT
CAAGGCAGGGTATGACTATGATGAGGAGACATTTGAGAAAGTGTTTAGAAGAATCTATTC
AACGTTTGGTTCTGCTGCACCTTACTCTGTGTTTCAGGACTCTCGACCTTTCTTGAGATG
GGCACGCGAGAAAGGGCTTATCGTTGGACTTGTTAGCAACGCCGAGTATCGATATCAAGA
AGTTATTTTACCTGCCTTAGGTTTGAACAAGGGAGAGTGGGACTTTGGTGTGTTCTCTGG
*TATGGAAGGTGTAGAGAAGCCAAATCCGAGGATATACGAGCTGGCTTTAGAAAGAGCGG
GGAACAACATTGCGCCTGGAGAGGTTCTGCATATTGGAGATAGTATGCGTAAAGATTATG
TTCCGGCAAAGAGTATTGGGATGCATTCTTTGTTGCTTGATAGGTT*AAGACCGAAGCTG
CTAAAGACTGG

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DS 

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AGAAGTTATTTTCCCTCCCTTAGGTTTGAACAAGGGAGAGTGGGACTTTGGTGTGTTTTT
TGG*TATGGAAGGTGTAGAGAAGCCAAATCCGAGGATATACGAGCTGGCTTTAGAAAGAG
CGGGGAACAACATTGCGCCTGGAGAGGTTTTGCATATTGGAGATAGTATGCGTAAAGATT
ATGTTCCGGCAAAGAGTATTGGGATGCATTTTTTGTTGCTTGATAGGTTTAAGACCGAAG
CTGCTAAAGACTGGAGAGAAGCTGGAGCTGTTGTGCTTCCTGATTTAGTTGCTGTTCAAC
AGCTTTTGGAGTTTGATAAGTTGAAATGTTAATGAAGAGACCTCTCTTTAATGTATTGTA
GTATTGCACATGTTGGCTCTTT
TT

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DS 

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TCAACGTTTGGTTCTGCTGCCCCTTACTCTGTGTTTCAGGACTCTCGACCTTTCTTGAGA
TGGGCACGCGAGAAAGGGCTTATCGTTGGACTTGTTAGCAACGCCGAGTATCGATATCAA
GAAGTTATTTTACCTGCCTTAGGTTTGAACAAGGGAGAGTGGGACTTTGGTGTGTTTTCT
GG*TATGGAAGGTGTAGAGAAGCCAAATCCGAGGATATACGAGCTGGCTTTAGAAAGAGC
GGGGAACAACATTGCGCCTGGAGAGGTTCTGCATATTGGAGATAGTATGCGTAAAGATTA
TGTTCCGGCAAAGAGTATTGGGATGCATTCTTTGTTGCTTGATAGGTTTAAGACCGAAGC
TGCTAAAGACTGGAGAGAAGCTGGAGCTGTTGTGCTTCCTGATTTAGTTGCTGTTCAACA
GCTTTTGGAGTCTGATAAGTTGAAATGTTAATGAAGAGACCTCTCTCTAATGTATTGTAG
TATTGCACATGTTGGCTCTTTCTTCTTCTTCTTCTTATGAGTAAAAAGAGTTTCAAAGGC
CTATGATTTAAGTCC

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DS 

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CC
CCTTACTCTGTGTTTCAGGACTCTCGACCTTTCTTGAGATGGGCACGCGAGAAAGGGCTT
ATCGTTGGACTTGTTAGCAACGCCGAGTATCGATATCAAGAAGTTATTTTACCTGCCTTA
GGTTTGAACAAGGGAGAGTGGGACTTTGGTGTGTTTTCTGG*TATGGAAGGTGTAGAGAA
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GAAATGTTAATGAAGAGACCTCTCTCTAATGTATTGTAGTATTGCACATGTTGGCTCTTT
CTTCTTCTTCTTCTTATGAGTAAAAAGAGTTTCAAAGGCC
C

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DS 

RD RS1DL92JQ 574 0 0
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TAGAGAAGCCAAATCCGAGGATATACGAGCTGGCTTTAGAAAGAGCGGGGAACAACATTG
CGCCTGGAGAGGTTTTGCATATTGGAGATAGTATGCGTAAAGATTATGTTCCGGCAAAGA
GTATTGGGATGCATTCTTTGTTGCTTGATAGGTTTAAGACCGAAGCTGCTAAAGACTGGA
GAGAAGCTGGAGCTGTTGTGCTTCCTGATTTAGTTGCTGTTCAACAGCTTTTGGAGTTTG
ATAAGTTGAAATGTTAATGAAGAGACCTCGCTCTAATGTATTGTAGTATTGCACATGTTG
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DS 

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TAAGAAAGTATCTTTGTCTACTTTATTTTTAGATGATTACTCAACACAGCATAGGTTTAT
ATTTTATGACTTTAAGTAGCTGCTTCGGTTATGGAAGAGATCTTACTTAGGACAGAGATG
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GTGTCTGATCTAAATTTCCTAAGAGTTTGGATTGGTTCAGTGGACGGAACCCCGGTTTCT
TGATCTACAGTTGTTATCTTGCAGCGGTAACATAGCCTAACTCCTTTGAAGATTAAGTCA
TTTATCTTGATCTCGTCCCAAAGATCTTCATCAAAAGGATCACCATTCTCCACAACAATG
TTGGCTCTAAAGCGGTTCATAGGAATTGGTTCTGGCAGAAGTGTATTCAGATGGTCCAAA
GACGCCTGAGATGAAACCAGAAACGGAAACGTATTTGAAAATGTTGTAGAGTAACCTGAT
GCATAAGCAGGAGGTGTAGCTCTACATTCGGTTTCTTTGTTAAACCGGACCAGACGGCTT
TGTTTTCCAAGGTAGTCAGAAAACCACTTAGCAGCTTCTTCTCCTTCATCAAAAGCAGAG
CCAG

QA 1 724 1 724
DS 

RD RS1DH24TF 611 0 0
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AGGAGGTGTAGCTCTACATTCGGTTTCTTTGTTAAACCGGACCAGACGGCTTTGTTTTCC
AAGGTAGTCAGAAAACCACTTAGCAGCTTCTTCTCCTTCATCAAAAGCAGAGCCAGACCA
TTCCCCCATGGACACACCTTCTGCCACCCCGCTTGGTTTAGTCAATGGGATCTTTAAAGG
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GAAAGCTTCCTTGGGCAGCTCTGGTTCAACAAGAACAAGCTTTGGCTCAACGTTTAGAGT
GCATGCTCTTCCTTTATGGTTCACAACTAACCAATACCGGTCCCATTCAAATCCAGTCTG
AGTTACGGTTGCTTGAGGGACAGAGATCCCACGGCAAGATTTGATCGGAAAAATGATTAA
TGATTGAATCTTCAGACCTTGCTCCTCCATTTTTTCTCTCTCTCAAAAGTGCTAAAGCAC
ACTAGAGGAATCTTGTGGTTTTCTTTTTAGTGTTCAAGAATTCTACAACTCTTTAAAATG
TGGTTACACCC

QA 1 611 1 611
DS 



AS 3 11

CO CL244Contig1 1356 4 5 U
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ACATATTCTTCACTAAGAGATTGAAGATGCCAATCTCAGAGGAAGCTTCTGGTAAGAAGA
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GAAGAAGCATAGGAAGGTTTGAGTTGAGATACTTCGACCCATTTCTTGTTTTGGATGAGT
TCTCAGGTCAGCCATCTTTCTTTTGTTTGTCTTTGCTTCCTTCTTTCGAATCCAACTTGT
CAGAGATAGCTAACAGAACATCTTTAAAACTTGCAGTTTCGGCTCCTGCAGGATTCCCAG
ATCATCCACACAGAGGTTGGTTTAGTTTACCGAATATCCTAAACGTGGTTTTACTCGTTT
TCGTTTGTGTCTACATGATATTTTTATATTTTTATTTAATATTTTGAGTTTTCATGAAAA
CATTGCAACTATACTTCATCTGCGTTTGAATTTTTTTTTTTACTATTAACAAATAATTTG
CTTAAAATACTCTCTTCTTTTTTCTGAACAAAAAATACTCTCTTCTATGGTCTAAATTTT
GTTAAAAATACTCAAGTTGCGATAATAAGAAAACGATCGAAGCATTAATGGAAAGTAACA
AACAGAGTATGACTACTAACCAAACCTATTGCTATATAACATTGTTCTTTCGCGTTTAAT
ATTTTTTTTTT*CAAAAGCAGGATTTGAGACGGTCACTTACATGTTAGAGGTATTCATTG
CTCTTTTCATCTTCAAATTCACGTCGAAGATTATATCAGTGACACCTCTAATCGGAGTCA
TTCTGACCACTCTTCTCTGTGCTAGCCCTATTGGACAAGTTTCAGCCGTTTTGAAAACAC
AAGGAGCTCAACTTATACTCCCTGTGGCACTCCTTCACGCTGCAGCCTTTGCTATTGGCT
ATTGGATTTCAAAGTTCTCTTTTCGGCGAGTCTACGTCCCGTACCATTTCTATAGAGTGT
GGAATGCAAAGCTCAGCGCTGGGGTTCTTGCTAGCACAAAAGCATTTCACAAACCCTCTT
GTGGCTGTTCCTTCTGCAGTCAGTGTCGTCTGCATGGCGCTCGGCGGGAGTGGCTTAGCC
GTGTTCTGGAGGAACCAACCGATTCCAGAAGATGACAAGGATGACTTCAAAGAGTGAAAG
AATGAAGTAGGAGAATCTATTTTGTGTGCTTTGTTGTAATGTTTGTAGACTTTACTCCCT
TGGATTTTTATTGAAAGACATAAAACAAGATCTGTGTTAGGAAGACAAAAGCAAGATCTG
GCATGTTTGATTCGTTGTCAATTTTTGTTTTGGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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C

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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CGCTTGACTCAGCTTCCTCCAGGAGCAGCAAGGTTGCTTGCAATGCTGCTGCAGATTTGT
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CCACTCTTTTCCCACTTTGGGTTATTTTGGGAACACTTGTTGGCATCTTCAAGCCATCTT
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TGGGGTTAACTCTTACCTTTGAAGACTTCAGAAGATGTTTACGTAACCCTTGGACGGTTG
GGGTTGGTTTTCTTGCTCAGTACATGATCAAACCAGTGCTAGGCTTTCTCATTGCAATGA
CACTTAAGCTTTCGGCACCTCTTGCGACTGGTCTTATCCTGGTCTCATGCTGCCCTGGAG
GACAGGCCTCCAACGTTGCAACCTACATTTCCAAGGGGAACGTTGCGCTCTCTGT*CTCA
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CTGGC*AGCTTGTTCCTGTTGATGCTGCTGGACT
GCTCTTAG

QA 1 754 1 754
DS 

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TCTTTGCGCTTGACTCAGCTTCCTCCAGGAGCAGCAAGGTTGCTTGCAATGCTGCTGCAG
ATTTGTCAGGTGAAAGCAGCAGTCCTAAAGAACTTAGCCAGTACGAGAAGACTATTGAGC
TTTTGACCACTCTTTTCCCACTTTGGGTTATTTTGGGAACACTTGTTGGCATCTTCAAGC
CATCTTTGGTTACATGGCTGGAAACAGACCTTTTTACTCTAGGTCTGTGGTTTCTCATGC
TCTCCATGGGGTTAACTCTTACCTTTGAAGACTTCAGAAGATGTTTACGTAACCCTTGGA
CGGTTGGGGTTGGTTTTCTTGCTCAGTACATGATCAAACCAGTGCTAGGCTTTCTCATTG
CAATGACACTTAAGCTTTCGGCACCTCTTGCGACTGGTCTTATCCTGGTCTCATGCTGCC
CTGGAGGACAGGCCTCCAACGTTGCAACCTACATTTCCAAGGGGAACGTTGCGCTCTCTG
TTCTCATGACAACGTGTTCAACCATTGGAGCTATTATAATGACTCCTCTTCTCACTAAGC
TTCTTGCTGGCCAGCTTGTTCCTGTTGATGCTGCTGGACTTGCTCTTAGCACTTTTCAAG
TAGTGTTGGTGCCTACCATAGTTGGAGTTCTGGCCAATGAGTTCTTTCCTAAATTCACGT

QA 1 660 1 660
DS 

RD RS1FT25TF 805 0 0
G
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TCCTAAAGAACTTAGCCAGTACGAGAAGACTATTGAGCTTTTGACCACTCTTTTCCCACT
TTGGGTTATTTTGGGAACACTTGTTGGCATCTTCAAGCCATCTTTGGTTACATGGCTGGA
AACAGACCTTTTTACTCTAGGTCTGGGGTTTCTCATGCTCTCCATGGGGTTAACTCTTAC
CTTTGAAGACTTCAGAAGATGTTTACGTAACCCTTGGACGGTTGGGGTTGGTTTTCTTGC
TCAGTACATGATCAAACCAGTGCTAGGTTTTCTCATTGCAATGACACTTAAGCTTTCGGC
ACCTCTTGCGACTGGTCTTATCCTGGTCTCATGCTGCCCTGGAGGGCAGGCCTCCAACGT
TGCAACCTACATTTCCAAGGGGAACGTTGCGCTCTCTGTTCTCATGACAACGTGTTCAAC
CATTGGAGCTATTATAATGACTCCTCTTCTCACTAAGCTTCTTGCTGGCCAGCTTGTTCC
TGTTGATGCTGCTGGACTTGCTCTTAGCACTTTTCAAGTAGTGTTGGTGCCTACCATAGT
TGGAGTTCTGGCCAATGAGTTCTTTCCTAAATTCACGTCGAAGATTATATCAGTGACACC
TCTGATCGGAGTCATTCTGACCACTCTTCTCTGTGCTAGCCCTATTGGACAGTTTCAGCG
GTTTGAAACACAAGGAGCTCACTTATACTCCCTGTGGCACTCCTTCACGCTGCAGCCTTT
GCTATTGGCTATTGGATTCAAAGT

QA 2 805 2 805
DS 



CO CL244Contig3 827 4 8 U
ACAGCAGGAGGCATGTCTTGCCAAATAAATTAATACAAGTAGATGGATAATCTATAGTTC
AGCATAATAACCCAAAACAAAAATTGACAACAAATTGAACATGCAAGATCTTGCTTTTGT
CTTCCTAACACAGATCTTGTTTTATGTCTTTCAATAAAAATCCAAGGGAGCAAAGTCTAC
AAACATTACAACAAACCACACAAAATAGATTCTCCTACTTCATTCTTTCACTCTTTGAAG
TCATCCTTGTCATCTTCTGGAATCGGTTGGTTCCTCCAGAACACGGCTAAGCCACTCCCG
CCGAGCGCCATGCAGACGACACTGACTGCAGAAGGAACAGCCACAAGAGGGTTTGTGAAA
TGCTTTTGTGCTAGCAAGAACCCCAGCGCTGAGCTTTGCATTCCACACTCTATAGAAATG
GTACGGGACGTAGACTCGCCGAAAGAGAACTTTGAAATCCAATAGCCAATAGCAAAGGCT
GCAGCGTGAAGGAGTGCCACAGGGAGTATAAGTTGAGCTCCTTGTGTTTTCAAAACCGCT
GAAACTTGTCCAATAGGGCTAGCACAGAGAAGAGTGGTCAGAATGACTCCGATCAGAGGT
GTCACTGATATAATCTTCGACGTGAATTTAGGAAAGAACTCATTGGCCAGAACTCCAACT
ATGGTAGGCACCAACACTACTTGAAAAGTGCTAAGAGCAAGTCCAGCAGCATCAACAGGA
ACAAGCTGGCCAGCAAGAAGCTTAGTGAGAAGAGGAGTCATTATAATAGCTCCAATGGTT
GAACACGTTGTCATGAGAACAGAGAGCGCAACGTTCCCCTTGGAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CO36TF C 32
AF RS1FT25JQ U 1
AF RS1B553JQ U 97
AF RS1BX24JQ U 97
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RD RS1CO36TF 446 0 0
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AAATTGAACATGCAAGATCTTGCTTTTGTCTTCCTAACACAGATCTTGTTTTATGTCTTT
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AGCTTTGCATTCCACACTCTATAGAAATGGTACGGGACGTAGACTCGCCGAAAGAGAACT
TTGAAATCCAATAGCCAATAGCAAA
C

QA 1 445 1 445
DS 

RD RS1FT25JQ 816 0 0
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CTTCCTAACACAGATCTTGTTTTATGTCTTTCAATAAAAATCCAAGGGAGCAAAGTCTAC
AAACATTACAACAAACCACACAAAATAGATTCTCCTACTTCATTCTTTCACTCTTTGAAG
TCATCCTTGTCATCTTCTGGAATCGGTTGGTTCCTCCAGAACACGGCTAAGCCACTCCCG
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TGCTTTTGTGCTAGCAAGAACCCCAGCGCTGAGCTTTGCATTCCACACTCTATAGAAATG
GTACGGGACGTAGACTCGCCGAAAGAGAACTTTGAAATCCAATAGCCAATAGCAAAGGCT
GCAGCGTGAAGGAGTGCCACAGGGAGTATAAGTTGAGCTCCTTGTGTTTTCAAAACCGCT
GAAACTTGTCCAATAGGGCTAGCACAGAGAAGAGTGGTCAGAATGACTCCGATCAGAGGT
GTCACTGATATAATCTTCGACGTGAATTTAGGAAAGAACTCATTGGCCAGAACTCCAACT
ATGGTAGGCACCAACACTACTTGAAAAGTGCTAAGAGCAAGTCCAGCAGCATCAACAGGA
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GAACACGTTGTCATGAGAACAGAGAGCGCAACGTTC

QA 1 816 1 816
DS 

RD RS1B553JQ 717 0 0
GAACATGCAAGATCTTGCTTTTGTCTTCCTAACACAGATCTTGTGTTATGTCTTTCAATA
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TGCATTCCACACTCTATAGAAATGGTACGGGACGTAGACTCGCCGAAAGAGAACTTTGAA
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GTCATTATAATAGCTCCAATGGTTGAACACGTTGTCATGAGAACAGAGAGCGCAACG

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1BX24JQ 731 0 0
GAACATGCAAGATCTTGCTTTTGTCTTCCTAACACAGATCTTGTGTTATGTCTTTCAATA
AAAATCCAAGGGAGCAAAGTCTACAAACATTACAACAAACCACACAAAATAGATTCTCCT
ACTTCATTCTTTCACTCTTTGAAGTCATCCTTGTCATCTTCTGGAATAGGTTGGTTCCTC
CAGAACACGGCTAAGCCACTCCCGCCGAGCGCCATGCAGACGACACTGACTGCAGAAGGA
ACAGCCACAAGAGGGTTTGTGAAATGCTTTTGTGCTAGCAAGAACCCCAGCGCTGAGCTT
TGCATTCCACACTCTATAGAAATGGTACGGGACGTAGACTCGCCGAAAGAGAACTTTGAA
ATCCAATAGCCAATAGCAAAGGCTGCAGCGTGAAGGAGTGCCACAGGGAGTATAAGTTGA
GCTCCTTGTGTTTTCAAAACCGCTGAAACTTGTCCAATAGGGCTAGCACAGAGAAGAGTG
GTCAGAATGACTCCGATCAGAGGTGTCACTGATATAATCTTCGACGTGAATTTAGGAAAG
AACTCATTGGCCAGAACTCCAACTATGGTAGGCACCAACACTACTTGAAAAGTGCTAAGA
GCAAGTCCAGCAGCATCAACAGGAACAAGCTGGCCAGCAAGAAGCTTAGTGAGAAGAGGA
GTCATTATAATAGCTCCAATGGTTGAACACGTTGTCATGAGAACAGAGAGCGCAACGTTC
CCCTTGGAAAT

QA 1 731 1 731
DS 



AS 3 10

CO CL245Contig1 785 6 4 U
GGCTATAAAAAGGATTTGAGATTGTCGTTTAAAACATAAAAATTTTCATTGGAATCAAAG
TTTGAGTTTTGGATCCGATGTCAAAAGTACAACAAACCAGATACCACATACAAAAACAAA
AGCTTATCCAAAACCAGGTAACTAGTCTTCACTAAACTTGATCTTCTTAGGTAATGGCTG
GGTATTTCCAACAAGCTCGGGGCATTGATATTCTATTCCAGCAGCTTCGATTCTCTTTCT
CCTTTTCTGATCACGTTTCACAACCTTGTTCAGCATTTTCCTATGTTCTTCCAGTGTCCT
TTCCTTGTTGTGTTGTTTACGCTCGATCTGAACCCAATCAACTGGTTTGTACTGGCACTT
AAAACCTTTCCACAGATTAGGTTTAACATCCTCTGGTGGAATAACACGGACTTGAAGCAT
GTGCTCGAGCAACAGATAGTCATTCATTGCACCCGCTGCAATCTCCGCCACCTCAGGGTC
CTCAAACTGAATGAATCCAAAATGTTTTGATTTCCCAGTCTTTTTGTTTCGTGCGACTCT
GACTCTCTTTACTGTTCCAAACTGTGTGAAGAAAGCTTCAATCTCAGTCTCGTAAAAACC
GTGAGGGAGGCGACCGATGTACAGCACGGTGGATTTGTTCTCGATAGGTTTGGTCGCTGG
AGCTTTTCGAGCTGGACCGCCTTCTAGTGGCAAAAAGTCAGCTGACGGTTTGGGTTTCTG
GGGAATAGCTAGCTGAGATGAGGAAGAAGTAGCAGCGGAAGCAGAGATCTTCTTCATGTT
CTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 15 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1EO92JQ U 298
AF RS1CT57JQ U 232
AF RS1BM46TF C 70
AF RS1B542JQ U 1
AF RS1BM46JQ U 65
AF RS1BD49JQ U 24
BS 1 561 RS1B542JQ
BS 562 562 RS1BD49JQ
BS 563 590 RS1B542JQ
BS 591 785 RS1BD49JQ

RD RS1EO92JQ 118 0 0
CCTTTCCTTGTTGGGTTGTTTACCCCCCATCTGAACCCAATCAACTGGTTTGTACTGGCA
CTTAAAACCTTTCCACAAATTAGGTTTAACATCCCCTGGGGGAATAACACGGACTTGA

QA 1 118 1 118
DS 

RD RS1CT57JQ 200 0 0
TCC
CTTTCCCCTTTTCTGATCACGTTTCACAACCTTGTTCAGCATTTTCCTATGTTCTTCCAG
TGTCCTTTCCTTGTTGGGTTGTTTACCCCCGATCTGAACCCAATCAACTGGTTTGTACTG
GCACTTAAAACCTTTCCACAAATTAGGTTTAACATCCTCTGGGGGAATAACACGGACTTG
AAGCATGTGCTCCAGCA

QA 4 200 4 200
DS 

RD RS1BM46TF 466 0 0
TGGATCCGATGTCAAAAGTACAACAAACCAGATACCACATACAAAAACAAAAGCTTATCC
AAAACCAGGTAACTAGTCTTCACTAAACTTGATCTTCTTAGGTAATGGCTGGGTATTTCC
AACAAGCTCGGGGCATTGATATTCTATTCCAGCAGCTTCGATTCTCTTTCTCCTTTTCTG
ATCACGTTTCACAACCTTGTTCAGCATTTTCCTATGTTCTTCTAGTGTCCTTTCCTTGTT
GTGTTGTTTACGCTCGATCTGAACCCAATCAACTGGTTTGTACTGGCACTTAAAACCTTT
CCACAGATTAGGTTTAACATCCTCTGGTGGAATAACACGGACTTGAAGCATGTGCTCGAG
CAACAGATAGTCATTCATTGCACCCGCTGCAATCTCCGCCACCTCAGGGTCCTCAAACTG
AATGAATCCAAAATGTTTTGATTTCCCAGTCTTTTTGTTTCGTGCG

QA 1 466 1 466
DS 

RD RS1B542JQ 590 0 0
GGCTATAAAAAGGATTTGAGATTGTCGTTTAAAACATAAAAATTTTCATTGGAATCAAAG
TTTGAGTTTTGGATCCGATGTCAAAAGTACAACAAACCAGATACCACATACAAAAACAAA
AGCTTATCCAAAACCAGGTAACTAGTCTTCACTAAACTTGATCTTCTTAGGTAATGGCTG
GGTATTTCCAACAAGCTCGGGGCATTGATATTCTATTCCAGCAGCTTCGATTCTCTTTCT
CCTTTTCTGATCACGTTTCACAACCTTGTTCAGCATTTTCCTATGTTCTTCCAGTGTCCT
TTCCTTGTTGTGTTGTTTACGCTCGATCTGAACCCAATCAACTGGTTTGTACTGGCACTT
AAAACCTTTCCACAGATTAGGTTTAACATCCTCTGGTGGAATAACACGGACTTGAAGCAT
GTGCTCGAGCAACAGATAGTCATTCATTGCACCCGCTGCAATCTCCGCCACCTCAGGGTC
CTCAAACTGAATGAATCCAAAATGTTTTGATTTCCCAGTCTTTTTGTTTCGTGCGACTCT
GACTCTCTTTACTGTTCCAAAATGTGTGAAGAAAGCTTCAATCTCAGTCT

QA 1 590 1 590
DS 

RD RS1BM46JQ 632 0 0
AGTTT
TGGAACCGATGTCAAAAGTACAACAAACCAGATACCACATACAAAAACAAAAGCTTATCC
AAAACCAGGTAACTAGTCTTCACTAAACTTGATCTTCTTAGGTAATGGCTGGGTATTTCC
AACAAGCTCGGGGCATTGATATTCTATTCCAGCAGCTTCGATTCTCTTTCTCCTTTTCTG
ATCACGTTTCACAACCTTGTTCAGCATTTTCCTATGTTCTTCTAGTGTCCTTTCCTTGTT
GTGTTGTTTACGCTCGATCTGAACCCAATCAACTGGTTTGTACTGGCACTTAAAACCTTT
CCACAGATTAGGTTTAACATCCTCTGGTGGAATAACACGGACTTGAAGCATGTGCTCGAG
CAACAGATAGTCATTCATTGCACCCGCTGCAATCTCCGCCACCTCAGGGTCCTCAAACTG
AATGAATCCAAAATGTTTTGATTTCCCAGTCTTTTTGTTTCGTGCGACTCTGACTCCCTT
TACTGTTCCAAACTGTGTGAAGAAAGCTTCAATCTCAGTCTCGTAGAAACCGTGAGGGAG
GCGACCGATGTACAGCACGGTGGATTTGTTCTCGATAGGTTTGGTCGCTGGAGCTTTTCG
AGCTGGACCGCCTTCTAGTGGCAAAAA

QA 6 632 6 632
DS 

RD RS1BD49JQ 762 0 0
GTCGTTTAAAACATAAAAATTTTCATTGGAATCAAAGTTTGAGTTTTGGATCCGATGTCA
AAAGTACAACAAACCAGATACCACATACAAAAACAAAAGCTTATCCAAAACCAGGTAACT
AGTCTTCACTAAACTTGATCTTCTTAGGTAATGGCTGGGTATTTCCAACAAGCTCGGGGC
ATTGATATTCTATTCCAGCAGCTTCGATTCTCTTTCTCCTTTTCTGATCACGTTTCACAA
CCTTGTTCAGCATTTTCCTATGTTCTTCCAGTGTCCTTTCCTTGTTGTGTTGTTTACGCT
CGATCTGAACCCAATCAACTGGTTTGTACTGGCACTTAAAACCTTTCCACAGATTAGGTT
TAACATCCTCTGGTGGAATAACACGGACTTGAAGCATGTGCTCGAGCAACAAATAGTCAT
TCATTGCACCCGCTGCAATCTCCGCCACCTCAGGGTCCTCAAACTGAATGAATCCAAAAT
GTTTTGATTTCCCAGTCTTTTTGTTTCGTGCGACTCTGACTCTCTTTACTGTTCCAAACT
GTGTGAAGAAAGCTTCAATCTCAGTCTCGTAAAAACCGTGAGGGAGGCGACCGATGTACA
GCACGGTGGATTTGTTCTCGATAGGTTTGGTCGCTGGAGCTTTTCGAGCTGGACCGCCTT
CTAGTGGCAAAAAGTCAGCTGACGGTTTGGGTTTCTGGGGAATAGCTAGCTGAGATGAGG
AAGAAGTAGCAGCGGAAGCAGAGATCTTCTTCATGTTCTTCT

QA 1 762 1 762
DS 



CO CL245Contig2 725 2 2 U
TTTTTATAAAACCCTACCTTTGAAAATCTCGACTCTCTCTCTCTTTCGCCGCCGACGACA
GTAAAAATGGGTGCTAAGGCAAAAAAAGCCCTGAAGAAGAACATGAAGAAGATCTCTGCT
TCCGCTGCTACTTCTTCCTCATCTCAGCTAGCTATTCCCCAGAAACCCAAACCGTCAGCT
GACTTTTTGCCACTAGAAGGCGGTCCAGCTCGAAAAGCTCCAGCGACCAAACCTATCGAG
AACAAATCCACCGTGCTGTACATCGGTCGCCTCCCTCACGGTTTCTACGAGACTGAGATT
GAAGCTTTCTTCACACAGTTTGGAACAGTAAAGAGAGTCAGAGTCGCACGAAACAAAAAG
ACTGGGAAATCAAAACATTTTGGATTCATTCAGTTTGAGGACCCTGAGGTGGCGGAGATT
GCAGCGGGTGCAATGAATGACTATCTGTTGCTCGAGCACATGCTTCAAGTCCGTGTTATT
CCACCAGAGGATGTTAAACCTAATCTGTGGAAAGGTTTTAAGTGCCAGTACAAACCAGTT
GATTGGGTTCAGATCGAGCGTAAACAACACAACAAGGAAAGGACACTGGAAGAACATAGG
AAATGCTGAACAAGTTGTGAAACGTGATCAGAAAAGAGAAAGAGATCGAAGCTGCTGGAT
AGATATCATGCCCCGAGCTTGTTGGAAATACCAGCATACTAGAGATCAGTTTAGTGAGAC
TAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1CT57TF U 1
AF RS1B542TF U 6
BS 1 589 RS1CT57TF
BS 590 725 RS1B542TF

RD RS1CT57TF 589 0 0
TTTTTATAAAACCCTACCTTTGAAAATCTCGACTCTCTCTCTCTTTCGCCGCCGACGACA
GTAAAAATGGGTGCTAAGGCAAAAAAAGCCCTGAAGAAGAACATGAAGAAGATCTCTGCT
TCCGCTGCTACTTCTTCCTCATCTCAGCTAGCTATTCCCCAGAAACCCAAACCGTCAGCT
GACTTTTTGCCACTAGAAGGCGGTCCAGCTCGAAAAGCTCCAGCGACCAAACCTATCGAG
AACAAATCCACCGTGCTGTACATCGGTCGCCTCCCTCACGGTTTCTACGAGACTGAGATT
GAAGCTTTCTTCACACAGTTTGGAACAGTAAAGAGAGTCAGAGTCGCACGAAACAAAAAG
ACTGGGAAATCAAAACATTTTGGATTCATTCAGTTTGAGGACCCTGAGGTGGCGGAGATT
GCAGCGGGTGCAATGAATGACTATCTGTTGCTCGAGCACATGCTTCAAGTCCGTGTTATT
CCACCAGAGGATGTTAAACCTAATCTGTGGAAAGGTTTTAAGTGCCAGTACAAACCAGTT
GATTGGGTTCAGATCGAGCGTAAACAACACAACAAGGAAAGGACACTGG

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1B542TF 720 0 0
ATAAAACCCTACCTTTGAA
AATCTCGACTCTCTCTCTCTTTCGCCGCCGACGACAGTAAAAATGGGTGCTAAGGCAAAA
AAAGCCCTGAAGAAGAACATGAAGAAGATCTCTGCTTCCGCTGCTACTTCTTCCTCATCT
CAGCTAGCTATTCCCCAGAAACCCAAACCGTCAGCTGACTTTTTGCCACTAGAAGGCGGT
CCAGCTCGAAAAGCTCCAGCGACCAAACCTATCGAGAACAAATCCACCGTGCTGTACATC
GGTCGCCTCCCTCACGGTTTCTACGAGACTGAGATTGAAGCTTTCTTCACACATTTTGGA
ACAGTAAAGAGAGTCAGAGTCGCACGAAACAAAAAGACTGGGAAATCAAAACATTTTGGA
TTCATTCAGTTTGAGGACCCTGAGGTGGCGGAGATTGCAGCGGGTGCAATGAATGACTAT
CTGTTGCTCGAGCACATGCTTCAAGTCCGTGTTATTCCACCAGAGGATGTTAAACCTAAT
CTGTGGAAAGGTTTTAAGTGCCAGTACAAACCAGTTGATTGGGTTCAGATCGAGCGTAAA
CAACACAACAAGGAAAGGACACTGGAAGAACATAGGAAATGCTGAACAAGTTGTGAAACG
TGATCAGAAAAGAGAAAGAGATCGAAGCTGCTGGATAGATATCATGCCCCGAGCTTGTTG
GAAATACCAGCATACTAGAGATCAGTTTAGTGAGACTAGTT

QA 20 720 20 720
DS 



CO CL245Contig3 770 2 5 U
GGAGGAGGTGTCTGAAGGATACAAGCCGCAGATTTTTATAAACCCTAACTTTGAATCTCG
ACTCTCTCCCTCATTCGCCGCCGACGACAACAGCAACAATGGGTGCCAAGGCGAAGAAAG
CTTTGAAGAAGAACATGAAGAAGATCTCTGCTTCCGCTGCTACTTCTTCCTCATCTCAGC
TAGTTGTTCCCCAGAAACCCAAACCATCAGCCGACTTTTTGCCACTAGAAGGCGGTCCAG
CTCGAAAAGCTCCACTTACAAAACCTATCGAGAACAAATCCACGGTGCTATACATCGGTC
GCCTCCCTCACGGTTTCTACGAGACTGAGATTGAAGCTTTCTTCACCCAGTTTGGAACAG
TGAAGAGAGTCAGAGTCGCACGAAACAAAAAGACGGGGAAATCAAAACATTTTGGATTCA
TTCAGTTTGAGGACCCTGAGGTGGCGGAGATTGCAGCGGGTGCAATGAATGACTATCTGT
TGCTCGAGCACATGCTTCAAGTCCGTGTTATTCCACCAGAGGATGTTAAACCTAATCTGT
GGAAAGGTTTTAAGTGCCAGTACAAACCAGTTGATTGGGTTCAGATCGAGCGTAAACAAC
ACAACAAGGAAAGGACACTGGAAGAACATAGGAAAATGCTGAACAAGTTGTGAAACGTGA
TCAGAAAAGAGAAAGAGAATCGAAGCTGCTGGAATAGATATCAATGCCCCGAGCTTGTTG
GAAATACCCAGCCTTTACCTAAGAAGATCAAGTTTAGTGAGACTAGTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DE79TF U 33
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DS 

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TGGTTGTTCCCCAGAAACCCAAACCATCAGCCGACTTTTTGCCACTAGAAGGCGGTCCAG
CTCGAAAAGCTCCACTTACAAAACCTATCGAGAACAAATCCACGGTGCTATACATCGGTC
GCCTCCCTCACGGTTTCTACGAGACTGAGATTGAAGCTTTCTTCACCCAGTTTGGAGCAG
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GAAATACCCAGCCTTTACCTAAGAAGATCAAGTTTAGTGAGACTAGTTAC

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 9

CO CL246Contig1 1288 9 37 U
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GCATCTTCTCGTAATCTCCGCGAGTGTCTTTGGTAATGGCCTTCTCCAGTGGAATGCTGT
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CAAAGTAGAGCTCTGGTCTTGTCAAGCATTGAATGGTTGACCTCAACAGTCCGAGGAACT
TGTCGTCCTCATCTCCTTCCTCAAGACTCTTGAGGATTTCCTCGCCGTGCTCATCTTGGT
AGCGATTGAAAGTAGCATTGATCTGAGCTCTGCTCCTTGTGGACAAAATCCTAATGACAT
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AGATGGAACCTTAAGGGTCGCCATTTTTTTGCTGTTGCAGGTTCTTAGATCTTTCAACTG
TCTCGCTGGTGAAGTGTATGTATGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
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55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 0 55 55 55 55 55 55 55 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 25 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 30 15 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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RD RS1B153JQ 787 0 0
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TTTTGAAAGCACTATTTTTATTAGTTTATATAACTTAAGAGACAGACTCTCTTTCTCTCT
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AGAATCAAACGATTTCAAGACAAGAAAGAGAGAGAGGGAGATGAGAGAAAACAGAAGCCA
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GCATCTTCTCGTAATCTCCGCGAGTGTCTTTGGTAATGGCCTTCTCCAGTGGAATGCTGT
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CAAAGTAGAGCTCTGGTCTTGTCAAGCATTGAATGGTAGACCTCAACAATCCAAGGAACT
TGTCGTCATCATCTCCTTCCTCAAGACTCTTGAGGATTTCCTCGCCGTGCTCATCTTGGT
AGCGATTGAAAGTAGCATTGATCTGAGCTCTGCTCCTTGTGGACAAAATCCTAATGACAT
CCTCATCGCTGTAGTGCTTGTCCTTGATTTTCTCATGGATCAGCTTCGCCTCTTGCTTCG
CCAATGTCATGTTCACCTCGTCTC*TTCGTACCTGTATGAGGTAACTAGAGATACCAAAA
GCTTTCT

QA 1 787 1 787
DS 

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TCTTTCTCTCTCGCGCATTATTTGGAAACTCAAAACACACAATAGAAACAACAGACAAGT
TTTCAAAGAACAGAATCAAACGATTTCAAGACAAGAAAGAGAGAG**GGAGATGAGAGAA
AACAGAAGCCAGCGAAGCTTTTGTTTCTCTCTAGAGGATTTAAGCATCATCTTCACCGAG
AAGTGCGACGAGCATCTTCTCGTAATCTCCGCGAGTGTCTTTGGTAACGGCCTTCTCCAG
TGGAATGCTGTTCCTCCTCTGATACTCGTCTCCGATCACCTTCAAGTCAATCTCAGCTCT
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AAGAACATCCACAAAGTAGAGCTCTGGTCTTGTCAAGCATTGAATGGTTGACCTCAACAG
TCCGAGGAACTTGTCGTCCTCATCTCCTTCCTCAAGACTCTTGAGGATCTCCTCGCCGTG
CTCATCTTGGTAGCGATTGAAAGTAGCATTGATCTGAGCTCTGCTCCTTGTGGACAAAAT
CCTAATGACATCCTCATCGCTGTAGTGCTTGTCCTTGATTTTCTCATGGATCAGCTTTGC
TTCTTGCTTCGCCAATGTCATGTTCACCTCGTCTCCTTCGTACCTGTATGAGGTAACAAG
AGAGACCAAAAGCTTTC

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DS 

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CATTATTTGGAAACTCAAAACACACAACAGAAACAACAGACAAGTTTTCAAAGAACAGAA
TCAAACGATTTCAAGACAAGAAAGAGAGAGAGGGAGATGAGAGAAAACAGAAGCCAGAGA
AGCTTTTGTTTCTCTCTGGAGGATTTAAGCATCATCTTCACCGAGAAGTGCGACGAGCAT
CTTCTCGTAATCTCCGCGAGTGTCTTTGGTAATGGCCTTCTCCAGTGGAATGCTGTTCCT
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GTAAAGCTCTGGTCTTGTCAAGCATTGAATGGTTGACCTCAACAGTCCGAGGAACTTGTC
GTCCTCATCTCCTTCCTCAAGACTCTCGAGGATTTCCTCGCCGTGCTCATCTTGGTAGCG
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ATCGCTGTAGTGCTTGTCCTTGATTTTCTCATGGATCAGCTTTGCTTCTTGCTTCGCCAA
TGTCATGTTCACCTCGTCTCCTTCGTACCTGTACGAGGTAACAAGAGACACCAAAAGCTT
TCTGAAGTCACCGGTGGTGTGGTGAGCGACATCCTCTTCAATAGACTTCTTGTAACGAGC
ATGGTAAGCTTG

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DS 

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GAAACAACAGACAAGTTTTCAAAGAACAGAATCAAACGATTTCAAGACAAGAAAGAGAGA
GAGGGAGATGAGAGAAAACAGAAGCCAGAAAAGCTTTTGTTTCTCTCTGGAGGATTTAAG
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TGTTGATAGCAGAACGAAAAACATCCACAAAGTAAAGCTCTGGTCTTGTCAAGCATTGAA
TGGTTGACCTCAACAGTCCGAGGAACTTGTCGTCCTCATCTCCTTCCTCAAGACTCTCGA
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TCCTTGTGGACAAAATCCTAATGACATCCTCATCGCTGTAGTGCTTGTCCTTGATTTTCT
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TGTACGAGGTAACAAGAGACACCAAAAGCTTTCTGAAGTCACCGGTGGTGTGGTGAGCGA
CATCCTCTTCAATAGACTTCTTGTAACGAGCATGGTAA

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DS 

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TGGAATGCTGTTCCTCCTCTGATACTCGTCTCCGATCACCTTCAAGTCAATCTCAGCTCT
TGTAGTCACAATTCTAGTGAGAGCTCCTTCGTCTGTTCCGGTTTTGTTGATAGCAGAACG
AAGAACATCCACAAAGTAGAGCTCTGGTCTTGTCAAGCATTGAATGGTAGACCTCAACAA
TCCAAGGAACTTGTCGTCATCATCTCCTTCCTCAAGACTCTTGAGGATTTCCTCGCCGTG
CTCATCTTGGTAGCGATTGAAAGTAGCATTGATCTGAGCTCTGCTCCTTGTGGACAAAAT
CCTAATGACATCCTCATCGCTGTAGTGCTTGTCCTTGATTTTCTCATGGATCAGCTTCGC
CTCTTGCTTCGCCAATGTCATGTTCACCTCGTCTCCTTCGTACCTGTATGAGGTAACTAG
AGATACCAAAAGCTTTCTGAAGTCACCGGTGGTGTGGTGAGCGACATCCTCTTCAATAGA
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AAGAACAGAATCAAACGATTTCAAGACAAGAAAGAGAGAGAGGGAGATGAGAGAAAACAG
AAGCCAGAGAAGCTTTTGTTTCTCTCTGGAGGATTTAAGCATCATCTTCACCGAGAAGTG
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TGCTGTTCCTCCTCTGATACTCTTCTCCGATCACCTTCAAGTCAATCTCAGCTCTTGTAG
TCACAATTCTAGTGAGAGCTCCTTCGTCTGTTCCGGTTTTGTTGATAGCAGAACGAAGAA
CATCCACAAAGTAGAGCTCTGGTCTTGTCAAGCATTGAATGGTTGACCTCAACAGTCCGA
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CTTGGTAGCGATTGAAAGTAGCATTGATCTGAGCTCTGCTCCTTGTGGACAAAATCCTAA
TGACATCCTCATCGCTGTAGTGCTTGTCCTTGATTTTCTCATGGATCAGCTTTGCTTCTT
GCTTCGCCAATGTCATGTTCACCTCGTCTCCTTCGTACCTGTACGAGGTAACAAGAGACA
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*CTACTTCCATGAGCACTTGGTTGCTTGAAGTC*ATCTTTTGGT

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CTCATCTCCTTCCTCAAGACTCTCGAGGATTTCCTCGCCGTGCTCATCTTGGTAGCGATT
GAAAGTAGCATTGATCTGAGCTCTGCTCCTTGTGGACAAAATCCTAATGACATCCTCATC
GCTGTAGTGCTTGTCCTTGATTTTCTCATGGATCAGCTTTGCTTCTTGCTTCGCCAATGT
CATGTTCACCTCGTCTCCTTCGTACCTGTACGAGGTAACAAGAGACACCAAAAGCTTTCT
GAAGTCACCGGTGGTGTGGTGAGCGACATCCTCTTCAATAGACTTCTTGTAACGAGCATG
GTAAGCTTGCCTAGCGTGAAGCAGCTGCGTTGAGGCCCTCGTGCAGGGCTACTTCCATGA
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TCATCGCTGTAGTGCTTGTCCTTGATTTTCTCATGGATCAGCTTTGCTTCTTGCTTCGCC
AATGTCATGTTCACCTCGTCTCCTTCGTACCTGTACGAGGTAACAAGAGACACCAAAAGC
TTTCTGAAGTCACCGGTGGTGTGGTGAGCGACATCCTCTTCAATAGACTTCTTGTAACGA
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CATGAGCACTTGGTTGCTTGAAGTCCATCTTTTGG*TAGCTTCATTGGCCAACAAGGCAT
CACGCTCACCAGGTTCAAGGGTCCAGAGCAAGATGGCTCTCTCGAAGTCGCTGGTGAGTT
CCTTGTCAAGAGTCTTGAGGAGGTCTTCTCCACAGGCTTCATGGTATGTCTGCCTGATTA
GCTTCCTCTGTTCAGCGCTTCTGTGAGCCAAAATTGATATGATCAAGTCCTCGTTTGTAC
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TCGCTGGTGAAGTGTAT
GTATGTCC

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DS 

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TTCGCCAATGTCATGTTCACCTCGTCTCCTTCGTACCTGTATGAGGTAACAAGAGAGACC
AAAAGCTTTCTGAAGTCACCGGTGGTGTGGTGAGCGACATCCTCTTCAATAGACTTCTTG
TAACGAGCATGGTAAGCTTGCCTAGCGTGAAGCAGCTGCGTTGAGGTCCTTGTGCAGG*C
TACTTCCATAAGCACTTGGTTGCTTGAAGTCCATCTTTTGG*TAGCTTCATTGGCCAACA
AGGCATCACGCTCACCGGGTTCAAGGGTCCAGAGCAAGATGGCTCTCTCGAAGTCGCTAG
TGAGTTCCTTGTCAAGAGTCTTGAGAAGGTCTTCTCCACAGGCTTCATGGTATGTCTGCC
TGATCAGCTTCCTCTGTTCAGCGCTTCTGTGTGCCAAAATTGATATGATCAAGTCCTCGT
TGGTACCCCATCCCTCAAAGGCGCTTTTCAGTTGCTCAGCATCTTCGGATGGGGAAGGAA
CATGAGATGGAACCTTAAGGGTCGCCATTTTTTTGCT*TTGCAGGTTCTTAGATCTTTTA
ACTGTCTCGCTGGTGAAGTGTATGTATGTTCC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 9

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GTTTTTCTGGGAAACAGAGAGACAATCAAGAGCAAGAAGACAAACAAGAGTGGAGACAAA
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TGTTTGAAGATGTTCTTCTTCCCTCCAGACGAACCTTCAGCAGTAAGACTCGGTGTTTCC
AAAATCTTAAGAACAAGCTCTTCAAAACATTGCTCAACATTGACTCGGGTCTTTGCACTG
CACTCCAAAAACAAACATCCATACTCCCGAGCAAAGTCAATGCCTTCTTTTTTAGATACA
GCTCGTTCACTCTCCTTGTCGACTTTATTCCCAACAAGCATCTTGATGCAATCCTGATTA
GTCGAGTACAGGTCGATTTCCTTAGCCCATATATCTGATAGATTGGTGAATGTATCTCGT
CGTGTCACATCATATACCATTATGATGCCCTGAGCTCCTCTGTAGTACGAACTTGTTAAC
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ATGGTAAGATATTTGACCTTGAAATCAACCCCGATTGTGGG*AGAAAGATCATCAAACGT
ATTGGATGTGAAACTAAGCAAAAGAGAGCTTTTGCCAACACCAGAATCTCCGATCAATAA
AACTTTGAACAAGTAATCAAACTCGGGTTGCCCCGACGAAGAACCCATCGAGAAAAACGA
ACCTTTTTTACTCTGCCAAAAAAAAAAAACCCAAGAAAAAACAAAAATCTAAAAAAACAT
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GGGCTCTCTTCGAGATCTGCGAAAAAAAATGACACGAAGCAGAGGACAAAGCGGAGATAT
CTCAGAAAATGTATCCCCCGGCCGTAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTCCGAAGATGATG
ATTCCTCAGATGAGTCTTCATCATCTTCTTCATCATCATCACCCCATCTCATCATACATT
TCTTCATGGCACAAAATGCTAACAACTCTTGTCTGGGCAGTCCAAGTTGGAAGGTGGACG
ATTCGCGGCGGAGACCACGACGGCGAATCCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 35 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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G
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GAGAAAG

QA 2 639 2 639
DS 

RD RS1FL59JQ 700 0 0
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QA 1 700 1 700
DS 

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GG
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GTCACATCATATACCATTATGATGCCCTGAGCTCCTCTGTAGTACGAACTTGTTAACGTC
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GGATGTGAAACTAAGCAAAAGAGAGCTTTTGCCAACACCAGAATCTC

QA 3 709 3 709
DS 

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TGGTAAGATATTTGACCTTGAAATCAACCCCGATTGTGGG*AGAAAGATCATCAAACGTA
TTGGATGTGAAACTAAGCAAAAGAGAGCTTTTGCCAACACCAGAATCTCCGATCAATAA

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DS 

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AAGATGTCTAAGACGAGCAGCAGTAACTCGATGAAGCATTGCTGGTCTGTGCTGGGTTTT
GTTTGAAGATGTTCTTCTTCCCTCCAGACGAACCTTCAGCAGTAAGACTCGGTGTTTCCA
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TTGGATGTGAAACTAAGCAAAAGAGAGCTTTTGCCAACACCAGAATCTCCGATCAATAAA
ACTTTGAACAAGTAATCAAACTCGGGTTGCCCCGACGAAGAACCCATCGAGAAAA

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GAATGTATCTCGTCGTGTCACATCATATACCATTATGATGCCATGAGCTCCTCTGTAGTA
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CTCCGATCAATAAAACTTTGAACAAGTAATCAAACTCGGGTTGCCCCGACGAAGAACCCA
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DS 

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TTGACTCGGGTCTTTGCACTGCACTCCAAAAACAAACATCCATACTCCCGAGCAAAGTCA
ATGCCTTCTTTTTTAGATACAGCTCGTTCACTCTCCTTGTCGACTTTATTCCCAACAAGC
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AGAACCCATCGAGAAAAACGAACCTTTTTTACTCTGCC

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DS 

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CAAAACATTGCTCAACAT*GACTCGGGTCTTTGCACTGCACTCCAAAAACAAACATCCAT
ACTCCCGAGCAAAGTCAATGCCTTCTTTTTTAGATACAGCTCGTTCACTCTCCTTGTCGA
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TGATGCCCTGAGCTCCTCTGTAGTACGAACTTGTTAACGTCCTAAATCTCTCTTGCCCAG
CTGTGTCCCAAATCGCGAGCTTCAGTTTCTTCTCTCCAATGGTAAGATATTTGACCTTGA
AATCAACCCCGATTGTGGG*AGAAAGATCATCAAACGTATTGGATGTGAAACTAAGCAAA
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AAAAAAACCCAAGAAAAAACAAAAATCTAAAAAAACATATAAACTTTTGAGTCAAAGGAT
CGTTTAAGTTTTCCCTGCGGAATCGATGAGAAATTTACGGGCTCTCTT

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DS 

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GCT
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CAAGCTTCAGTTTCTTCTCTCCAATGGTAAGATATTTGACTTTGAAATCAACTCCGATTG
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GAAGAACCCATCGAGGAAAACGAACCTTTTTTACTCTGCCAAAAAAAAAA**CCCAAGAA
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ATCACCCCATCTCATCATACATTTCTTCATGGCACAAAATGCTAACAACTCTTGTCTGGG
CAGTCCAAGTTGGAAGGTGGACGATTCGCGGCGGAGACCACGACGGCGAATCCC

QA 4 657 4 657
DS 



AS 1 11

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TAGTGTTTGGAGATTCCCTCGTAGACAATGGTAACAATGACTTTCTAGTGACCACTGCTC
GTGCCGATAACTACCCTTACGGTATCGACTTCCCAACTCACCTTCCCACCGGCAGATTCT
CCAATGGTCTTAACATTCCAGATCTCATCAGTGAGCATTTGGGTCAAGCTTCTCCATTGC
CTTACCTGAGTCCTATGCTCAAGAAAGACAAGCTCCTGATTGGCGCCAACTTTGCTTCCG
CTGGTATTGGAATCCTTAACGACACCGGTATCCAGTTTCTGAACATAATTCGGATCACGA
AGCAGTTGGAGTACTTCGAGCAGTACAAAGTAAGGGTGAGTGGATTGGTCGGAGAAGAAG
AGATGGAGCGGCTCGTTAACGGAGCACTGGTTCTAATAACACTAGGAGGCAACGATTTCG
TCAACAACTACTACTTGGTCCCTTTCTCCGCAAGATCTCGTCAATTCTCTCTCCCCGACT
ACGTTGTCTATGTCGTTTCTGAATATCGCAAAGTCTTACGGAAAATGTACGATTTGGGTG
CTCGACGTGTCCTGGTGACTGGGACAGGGCCCATGGGTTGCGTCCCGGCCGAGCTGGCTC
AACGTAGCCGCAGTGGCGAGTGTTCTACGGAACTACAACGAGCCGCATCGCTATTCAACC
CACAGCTTGTTCAGATGATCAACGACCTCAACAATGAAGTTGGATCTTCGGCCTTCATTG
CCGCTAATACTCAACAAATGCACATGGACTTTATCAGCGACCCACAAGCATATGGATTCG
TAACGTCGAAGGTGGCGTGTTGTGGACAAGGACCGTATAATGGGATAGGACTATGCACAG
CGTTATCAAATCTCTGCCCAAACAGAGATCTCTTCGCCTTTTGGGATCCTTTTCATCCAT
CAGAGAAAGCTAGTAGAATCATTGCTCAACAAATCCTCAACGGTTCTCCCGAGTACATGC
ATCCCATGAACCTCAGCACTATCCTCACCCTTGATTCCACAACTTAATCTTCTGTTCATC
TCTCCAAATTCCCACTCTATGTTCTCTTTTAATTGTTTGATTTTCTCTTTAATTATGTAT
TCGACATGGCTGCTTTAAATAGTTTCCATGAGTTATGTTGTGTGTTTTGTCTTCTTTATC
AATAATTGAATCGCCAATTGTTACTTCAGAAGT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 30 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 45 45 45 15 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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QA 1 402 1 402
DS 

RD RS1BD37TF 659 0 0
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TACAATTCTTTAGCCGTTTGAGTACAACAATGACGAACTCGGTGGCTAATGTTGCACTAC
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GTGCCGATAACTACCCTTACGGTATCGACTTCCCAACTCACCTTCCCACCGGCAGATTCT
CCAATGGTCTTAACATTCCAGATCTCATCAGTGAGCATTTGGGTCAAGCTTCTCCATTGC
CTTACCTGAGTCCTATGCTCAAGAAAGACAAGCTCCTGATTGGCGCCAACTTTGCTTCCG
CTGGTATTGGAATCCTTAACGACACCGGTATCCAGTTTCTGAACATAATTCGGATCACGA
AGCAGTTGGAGTACTTCGAGCAGTACAAAGTAAGGGTGAGTGGATTGGTCGGAGAAGAAG
AGATGGAGCGGCTCGTTAACGGAGCACTGGTTCTAATAACACTAGGAGGCAACGATTTCG
TCAACAACTACTACTTGGTCCCTTTCTCCACAAGATCTCGTCA*TTCTCTCTCCC
GACT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1F876TF 733 0 0
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CCTGCAAATGATGAGCTTACTTGTGCTGCAAGCCAACGCCAGGGCTTTCCTAGTGTTTGG
AGATTCCCTCGTAGACAATGGTAACAATGACTTTCTAGTGACCACTGCTCGTGCCGATAA
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TCCTATGCTCAAGAAAGACAAGCTCCTGATTGGCGCCAACTTTGCTTCCGCTGGTATTGG
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TGTCGTTTCTGA*TATCGCAAAGTCTTACG*AAA*TGTACGATTTGGGTGCTCGACGTGT
CCTGGTGACTGGG

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DS 

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GGATCCCATCTCCAAGCAAGCACCTAAACAGAGTTCACAGCCTCATATACATACAGATTA
TACAATTCTTTAGCCGTTTGAGTACAACAATGACGAACTCGGTGGCTAATGTTGCACTAC
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CTCGACGTGTCCTG*TGACTGGGACAGG*CCCATGGGTTGCGTCCCGGC*GAGCTG*CTC
A*CGTAGC*GCAGTGGCGAGTGTTCTACGG

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DS 

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GG
AGCCAACGCCAGGGCTTTCCTAGTGTTTGGAGATTCCCTCGTAGACAATGGTAACAATGA
CTTTCTAGTGACCACTGCTCGTGCCGATAACTACCCTTACGGTATCGACTTCCCAACTCA
CCTTCCCACCGGCAGATTCTCCAATGGTCTTAACATTCCAGATCTCATCAGTGAGCATTT
GGGTCAAGCTTCTCCATTGCCTTACCTGAGTCCTATGCTCAAGAAAGACAAGCTCCTGAT
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AGCCGCATCGCTATCCAACCCACAGCTTGTTCAGATGATCAACGAC*TCA*CAATGAAGT
TGGATCTTCG
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G
GGAGCACTGGTTCTAATAACACTAGGAGGCAACGATTTCGTCAACAACTACTACTTGGTC
CCTTTCTCCGCAAGATCTCGTCAATTCTCTCTCCCCGACCACGTTGTCTATGTCGCTTCT
GAATATCGCAAAGTCTTACGGAAAATGTACGATTTGGGTGCTCGACGTGTCCTGGTGACT
GGGACAGGGCCCATGGGTTGCGTCCCGGCCGAGCTGGCTCAACGTAGCCGCAGTGGCGAG
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AACAGAGATCTCTTCGCCTTTTGGGATCCTTTTCATCCATCAGAGAAGGCTAGTAGAATC
ATTGCTCAACAAATCCT

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DS 

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G
GATCTCGTCAATTCTCTCTCCCCGACTACGTTGTCTATGTCGTTTCTGAACATCGCAAAG
TCTTACGGAAAATGTACGATTTGGGTGCTCGACGTGTCCTGGTGACTGGGACAGGGCCCA
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TCCTCAACGGTTCTCCCGAGTACATGCATCCCATGAACCTCAGCACTATCCTCACCCTTG
ATTCCACAACTTAATCTTCTGTTCATCTCTCCAAATTCCCACTCTATGTTCTCTTTTAAT
TGTTTG

QA 2 607 2 607
DS 

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GAGTGATT
GTCGGAGAAGAAGAGATGGAGCGGCTCGT*AACGGAGCACTGGTTCTAATAACACTAGGA
GGCAACGATTTCGTCAACAACTACTACTTGGTCCCTTTCTCCGCAAGATCTCGTCAATTC
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AG

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DS 

RD RS1DQ36JQ 722 0 0
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TCGCAAAGTCTTACGGAAAATGTACGATTTGGGTGCTCGACGTGTCCTGGTGACTGGGAC
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TACGGAACTACAACGAGCCGCATCGCTATTCAACCCACAGCTTGTTCAGATGATCAACGA
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CCATGAGTTATGTTGTGTGTTTTGTCTTCTTTATCAATAATTGAATCGCCAATTGTTACT
TC

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DS 

RD RS1G729JQ 610 0 0
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TCTACGGAACTACAACGAGCCGCATCGCTACTCAACCCACAGCTTGTTCAGATGATCAAC
GACCTCAACAATGAAGTTGGATCTTCGGCCTTCATTGCCGCTAATACTCAACAAATGCAC
ATGGACTTTATCAGCGACCCACAAGCATATGGATTCGTAACGTCGAAGGTGGCGTGTTGT
GGACAAGGACCGTATAATGGGATAGGACTATGCACAGCGTTATCAAATCTCTGCCCAAAC
AGAGATCTCTTCGCCTTTTGGGATCCTTTTCATCCATCAGAGAAAGCTAGTAGAATCATT
GCTCAACAAATCCTCAACGGTTCTCCCGAGTACATGCATCCCATGAACCTCAGCACTATC
CTCACCCTTGATTCCACAACTTAATCTTCTGTTCATCTCTCCAAATTCCCACTCTATGTT
CTCTTTTAATTGTTTGATTTTCTCTTTAATTATGTATTCGACATGGCTGCTTTAAATAGT
TTCCATGAGTTATGTTGTGTGTTTTGTCTTCTTTATCAATAATTGAATCGCCAATTGTTA
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DS 

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AAGTTGGATCTTCGGCCTTCATTGCCGCTAATACTCAACAAATGCACATGGACTTTATCA
GCGACCCACAAGCATATGGATTCGTAACGTCGAAGGTGGCGTGTTGTGGACAAGGACCGT
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CCTTTTGGGATCCTTTTCATCCATCAGAGAAAGCTAGTAGAATCATTGCTCAACAAATCC
TCAACGGTTCTCCCGAGTACATGCATCCCATGAACCTCAGCACTATCCTCACCCTTGATT
CCACAACTTAATCTTCTGTTCATCTCTCCAAATTCCCACTCTATGTTCTCTTTTAATTGT
TTGATTTTCTCTTTAATTATGTATTCGACATGGCTGCTTTAAATAGTTTCCATGAGTTAT
GTTGTGTGTTTTGTCTTCTTTATCAATAATTGAATCGCCAATTGTTACTTC
AG

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DS 



AS 2 11

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ATGATTTTATTCTGATGGTAAGTTTAAATAAAGATCGGTTGCTTGAATCTTCACGTTGCA
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GTCTAAGTTATTAACTGTCGTAGCCACATTAACCTTGGAAATATCAAACTGGAACTTGTT
TCTCGATAAATCAATGGACCATGACGTCTTTTTGTCTCCAAACATCATTGAAGCATCACC
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GAGTTTAGGTAACAAAGAGAGAGAACCGGGTATGGAACCAGAGAGGTCATTGAAGGAAAG
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GTCATCTTTGTGACAGAGATCTTTAGACAAAGATGTCGTGAGGAGGAGAGTGAACAAGGG
AAAGAGAAATGTCGTTATCTTATCCATGGTGTATCTCCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 15 15 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GE69JQ U 1
AF RS1GN69JQ U 1
AF RS1FH21JQ U 27
AF RS1EZ50JQ U 1
AF RS1EA94JQ U 27
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AA
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TCGATAAATCAATGGACCATGACGTCTTTTTGTCTCCAAACATCATTGAAGCATCACCTT
CTAGCTTGTTACGGGAGAAATCAATCCGGTAAAAA

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DS 

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AA
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TAATGTACTC

QA 3 672 3 672
DS 

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AATAAAGATCGGTTGCTTGAATCTTCACGTTGCAACTCGGAAGAGGTGCATCACATAGGC
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CCGGGATACTCCCTGTGATCCTATTGTGATTCAAGTCTAAGTAATTAACTGTCGTAGCCA
CATTAACCTTGGAAATATCAAACTGGAACTTGTTTCTCGATAAATCAATGGACCATGACG
TCTTTTTGTCTCCAAACATCATTGAAGCATCACCTTCTAGCTTGTTACGGGAGAAATCAA
TCCGGTAAAAATCCAGGTTGCCTAGTGATTTTGGTATCGAACCTGATAGCTTGTTGTGCG
ATAGAAAAAGCTCAGGAGGTAACACTCCTTTAAACGATCCAAATGACTCTGGTATTGAAC
CTGTAACCTTGTTCCTGCTTAGTTCAAGAATCCTGAGTTTAGGTAACAAAGAGAGAGAAC
CGGGTATGGAACCAGAGAGGTCATTGAAGGAAAGGTTAATGTACTCTAGATCCTTGAGCT
GACTCAAAAA

QA 1 670 1 670
DS 

RD RS1EZ50JQ 738 0 0
AGTTAAAATTTATTCGTTTTTATTAATCATTTTGAATATAACATACAGATGTCATTATGC
ATGATTTTATTCTGATGGTAAGTTTAAATAAAGATCGGTTGCTTGAATCTTCACGTTGCA
ACTCGGAAGAGGTGCATCACATAGGCACTTGTTGTGTAAATATGCGTAAGCATCAAATCT
CTGAAGGTCACCTCCCTGGGGGATGCGTCCACAAAGTTTGTTATAGCTAACATTGAAAGA
CTGAAGAGTAAGCTCGGTCCATTGAACCGGGATACTCCCTGTGATCCTATTGTGATTCAA
GTCTAAGTTATTAACTGTCGTAGCCACATTAACCTTGGAAATATCAAACTGGAACTTGTT
TCTCGATAAATCAATGGACCATGACGTCTTTTTGTCTCCAAACATCATTGAAGCATCACC
TTCTAGCTTGTTACGGGAGAAATCAATCCGGTAAAAATCGAGGTTGCTTAGTGATTTTGG
TATCGAACCTGATAGCTTGTTGTGCGATAGAAAAAGCT***GAGGTACCACTCCTTTAAA
CGATCCAAATGACTCTGGTATTGAACCTGTAAGCTTGTTCCTGCTTAGTTCAAGAATCCC
GAGTTTAGGTAACAAAGAGAGAGAACCGGGTATGGAACCAGAGAGGTCATTGAAGGAAAG
GTTAATGTACTCTAGATCCTTGAGCTGACTCAAAAATTCAGGAACCGGACCGGTCAGGTT
GGTCCAGCTGAGCCAGAG

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1EA94JQ 724 0 0
TCATTTTGAATATAACATACAGATGTCATTATGCATGATTTTATTCTGATGGTAAGTTTA
AATAAAGATCGGTTGCTTGAATCTTCACGTTGCAACTCGGAAGAGGTGCATCACATAGGC
ACTTGTTGTGTAAATATGCGTAAGCATCAAATCTCTGAAGGTCACCTCCCTGGGGGATGC
GTCCACAAAGTTTGTTATAGCTAACATTGAAAGACTGAAGAGTAAGCTCGGTCCATTGAA
CCGGGATACTCCCTGTGATCCTATTGTGATTCAAGTCTAAGTAATTAACTGTCGCAGCCA
CATTAACCTTGGAAATATCAAACTGGAACTTGTTTCTCGATAAATCAATGGACCATGACG
TCTTTTTGTCTCCAAACATCATTGAAGCATCACCTTCTAGCTTGTTACGGGAGAAATCAA
TCCGGTAAAAATCCAGGTTGCCTAGTGATTTTGGTATCGAACCTGATAGCTTGTTGTGCG
ATAGAAAAAGCTCAGGAGGTAACACTCCTTTAAACGATCCAAATGACTCTGGTATTGAAC
CTGTAACCTTGTTCCTGCTTAGTTCAAGAATCCTGAGTTTAGGTAACAAAGAGAGAGAAC
CGGGTATGGAACCAGAGAGGTCATTGAAGGAAAGGTTAATGTACTCTAGATCCTTGAGCT
GACTCAAAAATTCAGGAACCGGACCGGTCAGGTTGGTCCAGCTGAGCCAGAGAAAACGAA
GATA

QA 1 724 1 724
DS 

RD RS1EA94TF 723 0 0
CTCC
AACATCATTGAAGCATCAC*TTCTAGCTTGTTACGGGAGAAATCAATCCGGTAAAAATCC
AGGTTGC*TAGTGATTTTGGTATCGAACC*GATAGCTTGTTGTGCGATAGAAAAAGCTCA
GGAGGTAACACTCCTTTAAACGATCCAAATGACTCTGGTATTGAACCTGTAACCTTGTTC
CTGCTTAGTTCAAGAATCCTGAGTTTAGGTAACAAAGAGAGAGAACCGGGTATGGAACCA
GAGAGGTCATTGAAGGAAAGGTTAATGTACTCTAGATCCTTGAGCTGACTCAAAAATTCA
GGAACCGGACCGGTCAGGTTGGTCCAGCTGAGCCAGAGAAAACGAAGATACTTAAGCTTG
GCGATGGTAGGTTGGATTTCACCGGTGAGGTTAGGGAGTTTGCGGAATATGAGGGTTTGT
AGATACGACAAGTCGCCGACTTCAGGCGGGATATGAGCGGAGACATCATCGTCTGATATA
TATAGGGAGATGACACGGTGGTTAACAGTAGAGTCACCGCACTCAACGGAGACCCAGGTA
CAGCAGTCGTCTTTGGGGTCCCAGGAGATGATGGTGTAAGGGTTGTTAAGGGACTTCTTG
ATCTTGGGGAGGGTGTTTTCGTCATCTTCGTGACAGAGATCTTTAGACAAAGATGTCGTG
AGGAGGAGAGTGAACAAGGGAAAGAGAAATGTCGTTATCTTATCCATGGTGTATCTCCC

QA 5 723 5 723
DS 

RD RS1FH21TF 665 0 0
AAAATCCAGGTTGC*TAGTGATTTTGGTATCGAAC*TGATAGCTTGTTGTGCGATAGAAA
AAGCTCAGGAGGTAACACTCCTTTAAACGATCCAAATGACTCTGGTATTGAACCTGTAAC
CTTGTTCCTGCTTAGTTCAAGAATCCTGAGTTTAGGTAACAAAGAGAGAGAACCGGGTAT
GGAACCAGAGAGGTCATTGAAGGAAAGGTTAATGTACTCTAGATCCTTGAGCTGACTCAA
AAATTCAGGAACCGGACCGGTCAGGTTGGTCCAGCTGAGCCAGAGAAAACGAAGATACTT
GAGCTTGGCGATGGTAGGTTGGATTTCACCGGTGAGGTTAGGGAGTTTGCGGAATATGAG
GGTTTGTAGATACGACAAGTCGCCGACTTCAGGCGGGATATGAGCGGAGACATCATCGTC
TGATATATATAGGGAGATGACACGGTGGTTAACAGTAGAGTCACCGCACTCAACGGAGAC
CCAGGTACAGCAGTCGTCTTTGGGGTCCCAGGAGATGATGGTGTAAGGGTTGTTAAGGGA
CTTCTTGATCTTGAGGAGGGTGTTTTCGTCATCTTTGTGACAGAGATCTTTAGACAAAGA
TGTCGTGAGGAGGAGAGTGAACAAGGGAAAGAGAAATGTCGTTATCTTATCCATGGTGT
ATCTCC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RS1AA54TF 189 0 0
AACAGTAGAGTCACCGCACTCAACGGAGACCCAGGTACAGCAGTCGTCTTTGGGGTCCCA
GGAGATGATGGTGTAAGGGTTGTTAAGGGACTTCTTGATCTTGAGGAGGGTGTTTTCGTC
ATCTTTGTGACAGAGATCTTTAGACAAAGATGTCGTGAGGAGGAGAGTGAACAAGGGAAA
GAGAAATGT

QA 1 189 1 189
DS 



CO CL249Contig2 785 3 5 U
GGGACACCATGGATAAGATAACGACATTGCTCTTTCCCTTGTTCACTCTCCTCCTCACGA
CATCTTTGGCTAAAGATCTCTGTCACAAAGATGACGAAAACACCCTCCTCAAGATCAAGA
AATCCCTTAACAACCCTTACACCATCATCTCCTGGGATCCCAAAGACGACTGCTGTACCT
GGGTCTCCGTTGAGTGCGGTGACTCTACTGTTAACCACCGTGTCATCTCCCTATATATAT
CAGACGACGATGTCTCCGCTCAGATCCCTCCTGAAGTAGGTGACTTATCGTATCTACAAA
CCCTTATATTCCGCAAACTCCCTAACCTCACCGGTGAAATCCAACCTACCATCGCCAAGC
TCAAGTATCTTCGTTTTCTCTGGCTCAGCTGGACCAACCTGACCGGTCCGGTTCCTGAAT
TTTTGAGTCAGCTCAAGGATCTAGAGTACATTAACCTTTCCTTCAATGACCTCTCTGGTT
CCATACCCGGTTCTCTCTCTTTGTTACCTAAACTCGGGATTCTTGAACTAAGCAGGAACA
AGCTTACAGGTTCAATACCAGAGTCATTTGGATCGTTTAAAGGAGTGGTACCTCAGCTTT
TTCTATCGCACAACAAGCTATCAGGTTCGATACCAAAATCACTAAGCAACCTCGATTTTT
ACCGGATTGATTTCTCCCGTACAAGCTAGAAAGTGATGCTTCAATGATGTTTGGAGACAA
AAGACGTCATGGTCCATTGATTTATCGAGAACAAGTTCCAGTTTGATATTTCCAAGTTAT
GTGGC


BQ
10 10 10 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1GE69TF U 2
AF RS1GN69TF U -2
AF RS1EZ50TF U 1
BS 1 117 RS1EZ50TF
BS 118 118 RS1GE69TF
BS 119 350 RS1EZ50TF
BS 351 351 RS1GN69TF
BS 352 785 RS1EZ50TF

RD RS1GE69TF 238 0 0
GG
ACACCATGGATAAGATAACGACATTGCTCTTTCCCTTGTTCACTCTCCTCCTCACGACAT
CTTTGGCTAAAGATCTCTGTCACAAAGATGACGAAAACACCCTCCTCAAGATCAAGAAAT
CCCTTAACAACCCTTACACCATCATCTCCTGGGATCCCAAAGACGACTGCTGTACCTGGG
TCTCCGTTGAGTGCGGTGACTCTACTGTTAACCACCGTGTCATCTCCCTATATATA

QA 3 238 3 238
DS 

RD RS1GN69TF 534 0 0
GGAGATACG
CCATGGATAAGATAACGACATTGCTCTTTCCCTTGTTCACTCTCCTCCTCACGACATCTT
TGGCTAAAGATCTCTGTCACAAAGATGACGAAAACACCCTCCTCAAGATCAAGAAATCCC
TTAACAACCCTTACACCATCATCTCCTGGGATCCCAAAGACGACTGCTGTACCTGGGTCT
CCGTTGAGTGCGGTGACTCTACTGTTAACCACCGTGTCATCTCCCTATATATATCAGACG
ACGATGTCTCCGCTCAGATCCCTCCTGAAGTAGGTGACTTATCGTATCTACAAACCCTTA
TATTCCGCAAACTCCCTAACCTCACCGGTGAAATCCAACCTACCATCGCCAAGCTCAAGT
ATCTTCGTTTTCTCTGGCTCAGCTGGACCAACCTGACCGGTCCGGTTCCTGAATTTTTGA
GTCAGCTCAAGGATCTAGAGTACATTAACCTTTCCTTCAATGACCTCTCTGGTTCCATAC
CCGGTTCTCTCTCTTTGTTACCTAAACTCGGGATTCTTGAACTAA

QA 10 534 10 534
DS 

RD RS1EZ50TF 785 0 0
GGGACACCATGGATAAGATAACGACATTGCTCTTTCCCTTGTTCACTCTCCTCCTCACGA
CATCTTTGGCTAAAGATCTCTGTCACAAAGATGACGAAAACACCCTCCTCAAGATCAGGA
AATCCCTTAACAACCCTTACACCATCATCTCCTGGGATCCCAAAGACGACTGCTGTACCT
GGGTCTCCGTTGAGTGCGGTGACTCTACTGTTAACCACCGTGTCATCTCCCTATATATAT
CAGACGACGATGTCTCCGCTCAGATCCCTCCTGAAGTAGGTGACTTATCGTATCTACAAA
CCCTTATATTCCGCAAACTCCCTAACCTCACCGGTGAAATCCAACCTACCGTCGCCAAGC
TCAAGTATCTTCGTTTTCTCTGGCTCAGCTGGACCAACCTGACCGGTCCGGTTCCTGAAT
TTTTGAGTCAGCTCAAGGATCTAGAGTACATTAACCTTTCCTTCAATGACCTCTCTGGTT
CCATACCCGGTTCTCTCTCTTTGTTACCTAAACTCGGGATTCTTGAACTAAGCAGGAACA
AGCTTACAGGTTCAATACCAGAGTCATTTGGATCGTTTAAAGGAGTGGTACCTCAGCTTT
TTCTATCGCACAACAAGCTATCAGGTTCGATACCAAAATCACTAAGCAACCTCGATTTTT
ACCGGATTGATTTCTCCCGTACAAGCTAGAAAGTGATGCTTCAATGATGTTTGGAGACAA
AAGACGTCATGGTCCATTGATTTATCGAGAACAAGTTCCAGTTTGATATTTCCAAGTTAT
GTGGC

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 9

CO CL250Contig1 1262 9 15 U
GGTCTCCTATCATTTTCAGCTAAGCTCTCGCTTTATCTCTCTTAATCTATCTACTGATGA
AGATCAGGTGCGACGTCTGCGATAAAGAAGAAGCCTCGGTGTTCTGCACCGCCGACGAAG
CGTCTCTGTGCGACGGCTGCGATCACCAAGTCCACCACGCTAACAAACTCGCCTCAAAAC
ATCTCCGTTTCTCTCTCCTCTGTCCTTCTTCCTCCGAGAACTCCTCTCCTATCTGCGACA
TCTGTCAGGAGAAGAAAGCTGTGTTGTTTTGTCAACAAGATAGGGCTATTTTATGCGCAA
ACTGTGATTCATCGATCCACTCGGCGAACGAACACACCAAGAAACACGATAGGTTTCTTC
TCACAGGGGTTAAGCTATCTCCAACCTCCTCTGTTTACAAACCAACTTCAGAATCTCCTT
TAAATAGTCAAGATTGCTCTGTCCCTGCTCTTTCCAAGAAACCTATCTCAGCTCCTCGGA
GTCAGATCAAGAACTCCAAGATCCAACCCTCTAAGATCAGTAGCGATGTAGGCATGAATC
AGTGGGGATCCACAAGCACGATTTCAGAGTACTTGATCGATACGTTACCTGGTTGGCACG
TTGAGGATTTTCTTGATTCCTCACTTCCTCCTTTTGGTTTCTCTAAGAGTGGTGATGATG
ATGGAGTGTTACCATATATGGAAGCAAAAGATGACAGCACTAAGAGAAACAACAACAATA
CAGTGTCACTTCCATCTAAGAATATGGGGATTTGGGTCCCTCAGATTCCACAAACTCTTC
CTTCTTCATACACAAACCAGTACTTTTCTCAGGACAACAATATTCAGTTTGGGATGTACA
ACAACAAAGAAGCATCACATGGAGTAGAGACTTATGCTCCAATACAAAACATGAAACAAC
AAGGACAGAACAAGAGATGGTATGATGATGGTGGCTTCACTGTCCCACAGATAACTACTA
CTTTTACTCATCCTCCTCCTATTACTTCTAATAAAAGGTCCAGGTCCTTCTGGTAATCTA
CCTGGTGTTTTCTGTTTTGTTTGTTTGTTGGCCTTTT*GGTCTTTCTTGATTTCTCTGAA
CTTCGTTCTTTGTAGAACTAGGTTTACTTCTTGGTGTATTTTGTAAATTTTGAGTGTGAT
TGCAAATGTTCTTTCTTATCCTCTATTGCAAGTTTTCGTGTAATAAAAGCCCCGTGACTT
ATATTGTGAATCACGGCGCAAGATTTCTCCGTTTTTTGTGGAAGCAAGACTTCATTTCAT
AG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 
50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 20 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1EQ27TF U 1
AF RS1AY91TF U 81
AF RS1FK50TF U 10
AF RS1DI51TF U 112
AF RS1BZ82TF U 322
AF RS1FI52TF U 721
AF RS1EQ27JQ C 479
AF RS1BZ82JQ C 449
AF RS1AY91JQ C 458
BS 1 768 RS1EQ27TF
BS 769 769 RS1DI51TF
BS 770 780 RS1EQ27TF
BS 781 785 RS1FK50TF
BS 786 786 RS1DI51TF
BS 787 812 RS1FK50TF
BS 813 813 RS1BZ82TF
BS 814 816 RS1FK50TF
BS 817 817 RS1BZ82TF
BS 818 838 RS1FK50TF
BS 839 881 RS1DI51TF
BS 882 994 RS1BZ82TF
BS 995 1156 RS1FI52TF
BS 1157 1206 RS1BZ82JQ
BS 1207 1262 RS1AY91JQ

RD RS1EQ27TF 789 0 0
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AGATCAGGTGCGACGTCTGCGATAAAGAAGAAGCCTCGGTGTTCTGCACCGCCGACGAAG
CGTCTCTGTGCGACGGCTGCGATCACCAAGTCCACCACGCTAACAAACTCGCCTCAAAAC
ATCTCCGTTTCTCTCTCCTCTGTCCTTCTTCCTCCGAGAACTCCTCTCCTATCTGCGACA
TCTGTCAGGAGAAGAAAGCTGTGTTGTTTTGTCAACAAGATAGGGCTATTTTATGCGCAA
ACTGTGATTCATCGATCCACTCGGCGAACGAACACACCAAGAAACACGATAGGTTTCTTC
TCACAGGGGTTAAGCTATCTCCAACCTCCTCTGTTTACAAACCAACTTCAGAATCTCCTT
TAAATAGTCAAGATTGCTCTGTCCCTGCTCTTTCCAAGAAACCTATCTCAGCTCCTCGGA
GTCAGATCAAGAACTCCAAGATCCAACCCTCTAAGATCAGTAGCGATGTAGGCATGAATC
AGTGGGGATCCACAAGCACGATTTCAGAGTACTTGATCGATACGTTACCTGGTTGGCACG
TTGAGGATTTTCTTGATTCCTCACTTCCTCCTTTTGGTTTCTCTAAGAGTGGTGATGATG
ATGGAGTGTTACCATATATGGAAGCAAAAGATGACAGCACTAAGAGAAACAACAACAATA
CAGTGTCACTTCCATCTAAGAATATGGGGATTTGGGTCCCTCAGATTC*ACAAACTCTTC
TTCTCATAC

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DS 

RD RS1AY91TF 668 0 0
GGA
AAAGAAGAAGCCTCGGTGTTCTGCACCGCCGACGAAGCGTCTCTGTGCGACGGCTGCGAT
CACCAAGTCCACCACGCTAACAAACTCGCCTCAAAACATCTCCGTTTCTCTCTCCTCTGT
CCTTCTTCCTCCGAGAACTCCTCTCCTATCTTCGACATCTGTCAGGAGAAGAAAGCTGTG
TTGTTTTGTCAACAAGATAGGGCTATTTTATGCGCAAACTGTGATTCATCGATCCACTCG
GCGAACGAACACACCAAGAAACACGATAGGTTTCTTCTCACAGGGGTTAAGCTATCTCCA
ACCTCCTCTGTTTACAAACCAACTTCAGAATCTCCTTTAAATAGTCAAGATTGCTCTGTC
CCTGCTCTTTCCAAGAAACCTATCTCAGCTCCTCGGAGTCAGATCAAGAACTCCAAGATT
CAACCCTCTAAGATCAGTAGCGATGTAGGCATGAATCAGTGGGGATCCACAAGCACGATT
TCAGAGTACTTGATCGATACGTTACCTGGTTGGCACGTTGAGGATTTTCTTGATTCCTCA
CTTCCTCCTTTTGGTTTCTCTAAGAGTGGTGATGATGATGGAGTGTTACCATATATGGAA
GCAAAAGATGACAGCACTAAGAGAAACAACAACAATACAGTGTCACTTCCATCTA
GATATGGGGA

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DS 

RD RS1FK50TF 829 0 0
GG
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GACGTCTGCGATAAAGAAGAAGCCTCGGTGTTCTGCACCGCCGACGAAGCGTCTCTGTGC
GACGGCTGCGATCACCAAGTCCACCACGCTAACAAACTCGCCTCAAAACATCTCCGTTTC
TCTCTCCTCTGTCCTTCTTCCTCCGAGAACTCCTCTCCTATCTGCGACATCTGTCAGGAG
AAGAAAGCTGTGTTGTTTTGTCAACAAGATAGGGCTATTTTATGCGCAAACTGTGATTCA
TCGATCCACTCGGCGAACGAACACACCAAGAAACACGATAGGTTTCTTCTCACAGGGGTT
AAGCTATCTCCAACCTCCTCTGTTTACAAACCAACTTCAGAATCTCCTTTAAATAGTCAA
GATTGCTCTGTCCCTGCTCTTTCCAAGAAACCTATCTCAGCTCCTCGGAGTCAGATCAAG
AACTCCAAGATCCAACCCTCTAAGATCAGTAGCGATGTAGGCATGAATCGGTGGGGATCC
ACAAGCACGATTTCAGAGTACTTGATCGATACGTTACCTGGTTGGCACGTTGAGGATTTT
CTTGATTCCTCACTTCCTCCTTTTGGTTTCTCTAAGAGTGGTGATGATGATGGAGTGTTA
CCATACATGGAAGCAAA*GATGACAGCACTAAGAGAAACAACAACAATACAGTGTCACTT
CCATCTAAGA*TATGGGGATTTGGGTCCCTCAGATTC*ACAAACTCTTCCTTCT*CATAC
ACAAACCAGTACTTTTCTCAG*ACA*CAATATTCAGTTTGGGATGTA

QA 3 829 3 829
DS 

RD RS1DI51TF 782 0 0
GA
GACGAAGCGTCTCTGTGCGACGGCTGCGATCACCAAGTCCACCACGCTAACAAACTCGCC
TCAAAACATCTCCGTTTCTCTCTCCTCTGTCCTTCTTCCTCCGAGAACTCCTCTCCTATC
TGCGACATCTGTCAGGAGAAGAAAGCTGTGTTGTTTTGTCAACAAGATAGGGCTATTTTA
TGCGCAAACTGTGATTCATCGATCCACTCGGCGAACGAACACACCAAGAAACACGATAGG
TTTCTTCTCACAGGGGTTAAGCTATCTCCAACCTCCTCTGTTTACAAACCAACTTCAGAA
TCTCCTTTAAATAGTCAAGATTGCTCTGTCCCTGCTCTTTCCAAGAAACCTATCTCAGCT
CCTCGGAGTCAGATCAAGAACTCCAAGATCCAACCCTCTAAGATCAGTAGCGATGTAGGC
ATGAATCAGTGGGGATCCACAAGCACGATTTCAGAGTACTTGATCGATACGTTACCTGGT
TGGCACGTTGAGGATTTTCTTGATTCCTCACTTCCTCCTTTTGGTTTCTCTAAGAGTGGT
GATGATGATGGAGTGTTACCATATATGGAAGCAAAAGATGACAGCACTAAGAGAAACAAC
AACAATACAGTGTCACTTCCATCTAAGAATATGGGGATTTGGGTCCCTCAGATTCCACAA
ACTCTTCCTTCTTCATACACAAACCAGTACTTTTCTCAG*ACA*CAATATTCAGTTTGGG
ATGTACAACAACAAAGAAGCATCACATGGAGTAGAGACTTATGCTCCA
TACAAACATGAA

QA 3 770 3 770
DS 

RD RS1BZ82TF 673 0 0
GGGCC
AACGAACACACCAAGAAACACGATAGGTTTCTTCTCACAGGGGTTAAGCTATCTCCAACC
TCCTCTGTTTACAAACCAACTTCAGACTCTCCTTTAAATAGTCAAGATTGCTCTGTCCCT
GCTCTCTCAAAGAAACCTATCTCAGCTCCTCAGAGTCAGATCAAGAGCTCCAAGATCCAA
CCCTCTAAGATCAGTAGCGATGTAGGCATGAATCAGTGGGGATCCACAAGCACGATTTCA
GAGTACTTGATCGACACGTTACCTGGTTGGCACGTTGAGGATTTTCTTGATTCCTCACTT
CCTCCTTTTGGTTTCTCTAAGAGTGGTGATGATGATGGAGTGTTACCATATATGGAAGCA
AAAGATGACAGCACTAAGAGAAACAACAGCAATACAGTGTCACTTCCATCTAAGAATATG
GGGATTTGGGTCCCTCAGATTCCACAAACTCTTCCTTCTTCATACACAAACCAGTACTTT
TCTCAGGACAACAATATTCAGTGTGGGATGTACAACAACAAAGAAGCATCACATGGAGTA
GAGACTTATGCTCCAATACAAAACATGAAACAACAAGGACAGAACAAGAGATGGTATGAT
GATGGTGGCTTCACTGTCCCACAGATAACTACTACTTTTACTCATCCTCCTCCTATTACT
TCTAATAA

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DS 

RD RS1FI52TF 437 0 0
G
AGTGTCACTTCTATCTAAGAATATGGGGATTTGGGTCCCTCAGATTCCACAAACTCTTCC
TTCTTCATACACAAACCAGTACTTTTCTCAAGACAACAATATTCAGTTTGGGATGTACAA
CAACAAAGAAGCATCACATGGAGTAGAGACTTATGCTCCAATACAAAACATGAAACAACA
AGGACAGAACAAGAGATGGTATGATGATGGTGGCTTCACTGTCCCACAGATAACTACTAC
TTTTACTCATCCTCCTCCTATTACTTCTAATAAAAGGTCCAGGTCCTTCTGGTAATCTAC
CTGGTGTTTTCTGTTTTGTTTGTTTGTTGGCCTTTT*GGTCTTTCTTGATTTCTCTGAAC
TTCGTTCTTTGTAGAACTAGGTTTACTTCTTGGTGTATTTTGTAAATTTTGAGTGTGATT
GCAAATGTTCTTTCT
T

QA 2 436 2 436
DS 

RD RS1EQ27JQ 678 0 0
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TCAGTGGGGATCCACAAGCACGATTTCAGAGTACTTGATCGATACGTTACCTGGTTGGCA
CGTTGAGGATTTTCTTGATTCCTCACTTCCTCCTTTTGGTTTCTCTAAGAGTGGTGATGA
TGATGGAGTGTTACCATATATGGAAGCAAAAGATGACAGCACTAAGAGAAACAACAACAA
TACAGTGTCACTTCCATCTAAGAATATGGGGATTTGGGTCCCTCAGATTCCACAAACTCT
TCCTTCTTCATACACAAACCAGTACTTTTCTCAAGACAACAATATTCAGTTTGGGATGTA
CAACAACAAAGAAGCATCACATGGAGTAGAGACTTATGCTCCAATACAAAACATGAAACA
ACAAGGACAGAACAAGAGATGGTATGATGATGGTGGCTTCACTGTCCCACAGATAACTAC
TACTTTTACTCATCCTCCTCCTATTACTTCTAATAAAAGGTCCAGGTCCTTCTGGTAATC
TACCTGGTGTTTTCTGTTTTGTTTGTTTGTTGGCCTTTT*GGTCTTTCTTGATTTCTCTG
AACTTCGTTCTTTGTAGAACTAGGTTTACTTCTTGGTGTATTTTGTAAATTTTGATTGTG
ATTGCAAATGTTCTTTCT

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1BZ82JQ 759 0 0
TCTCTCA
AAGAAACCTATCTCAGCTCCTCAGAGTCAGATCAAGAGCTCCAAGATCCAACCCTCTAAG
ATCAGTAGCGATGTAGGCATGAATCAGTGGGGATCCACAAGCACGATTTCAGAGTACTTG
ATCGACACGTTACCTGGTTGGCACGTTGAGGATTTTCTTGATTCCTCACTTCCTCCTTTT
GGTTTCTCTAAGAGTGGTGATGATGATGGAGTGTTACCATATATGGAAGCAAAAGATGAC
AGCACTAAGAGAAACAACAGCAATACAGTGTCACTTCCATCTAAGAATATGGGGATTTGG
GTCCCTCAGATTCCACAAACTCTTCCTTCTTCATACACAAACCAGTACTTTTCTCAGGAC
AACAATATTCAGTGTGGGATGTACAACAACAAAGAAGCATCACATGGAGTAGAGACTTAT
GCTCCAATACAAAACATGAAACAACAAGGACAGAACAAGAGATGGTATGATGATGGTGGC
TTCACTGTCCCACAGATAACTACTACTTTTACTCATCCTCCTCCTATTACTTCTAATAAA
AGGTCCAGATCCTTCTGGTAATCTACCTGGTGTTTTCTGTTTTGTTTGTTTGTTGGCCTT
TTTGGTCTTTCTTGATTTCTCTGAACTTCGTTCTTTGTAGAACTAGGTTTACTTCTTGGT
GTATTTTGTAAATTTTGAGTGTGATTGCAAATGTTTTTTCTTATCCTCTATTGCAAGTTT
TCGTGTAATAAAAGCCCCGTGACTTATATTG
G

QA 8 758 8 758
DS 

RD RS1AY91JQ 805 0 0
AGAAA
CTATCTCAGCTCCTCGGAGTCAGATCAAGAACTCCAAGATCCA*CCCTCTAAGATCAGTA
GCGATGTAGGCATGAATCAGTGGGGATCCACAAGCACGATTTCAGAGTACTTGATCGATA
CGTTACCTGGTTGGCACGTTGAGGATTTTCTTGATTCCTCACTTCCTCCTTTTGGTTTCT
CTAAGAGTGGTGATGATGATGGAGTGTTACCATATATGGAAGCAAAAGATGACAGCACTA
AGAGAAACAACAACAATACAGTGTCACTTCCATCTAAGAATATGGGGATTTGGGTCCCTC
AGATTCCACAAACTCTTCCTTCTTCATACACAAACCAGTACTTTTCTCAAGACAACAATA
TTCAGTTTGGGATGTACAACAACAAAGAAGCATCACATGGAGTAGAGACTTATGCTCCAA
TACAAAACATGAAACAACAAGGACAGAACAAGAGATGGTATGATGATGGTGGCTTCACTG
TCCCACAGATAACTACTACTTTTACTCATCCTCCTCCTATTACTTCTAATAAAAGGTCCA
GGTCCTTCTGGTAATCTACCTGGTGTTTTCTGTTTTGTTTGTTTGTTGGCCTTTT*GGTC
TTTCTTGATTTCTCTGAACTTCGTTCTTTGTAGAACTAGGTTTACTTCTTGGTGTATTTT
GTAAATTTTGAGTGTGATTGCAAATGTTCTTTCTTATTCTCTATTGCAAGTTTTCGTGTA
ATAAAAGCCCCGTGACTTATATTGTGAATCACGGCGCAAGATTTCTCCGTTTTTTGTGGA
AGCAAGACTTCATTTCATAG

QA 6 805 6 805
DS 



AS 2 11

CO CL251Contig1 1134 6 17 U
AAGAATTTCTTTTTGCTAATATATGTTTTAGTTTAATTAAAAACAGAAACATCTTTCTTT
TCTTGGGGGGCCGACACTCCTTGCTAACAGATTGATTGGACAACGAATAAAAATTAGCGT
AATTATTATTTTTGTTAAAATATAATAAACTAAAATACGTGTTTAGATAGCATTATTGCT
ACCATATGGGTAAAGTTTTTCGCAAAAGACTTTATTTAACTTGATCATCATCTGCAGCAC
CACTATTATTAAAAACAACAAGTTAAGTTTTGTTGTTGTTGTTGTGCTTATGTTGCTATG
GCAAACCCAACTCTGGGTTTCTTCTGGTCTTGGAGGTCGAAAATTGTGTGATAGGCTCGC
ATAAAAGCGAGGCCTAAAAACCAGCGATGTGACTCCACAAAACGACTGAAGCACTTTCCA
CCATCCTTGGCTATGTAATCATCTGGCGTGAGGGGAAAAAGCTTTCCCCCGATCGTGAAA
AAAATAGTGGGCATCGTACGCATGGTAGAGCAACTCACCTTTCCAAGTGCTTTATTTATG
TCGCTGATAGGTTTCTTTGGACCCAGAATGTCAGTTATCCCAGAATCAACAATTGCTACG
CATTGTGCTGCACAATGTCGAGTTGGTGTTTCACCAATGTGAATAGTTGTCATTTTAATT
CTCCAGAAATCTCTTATTCTCCCATAGACGGGAACATACGTATGTTCCCCTTTAAAGTGG
TTTGGGTCGAATCCACCAAACACTATTTGTCCACCATTTGGATCTTCATGTCTTCCGTCA
CCGTGGTAACTTCTAATCCAAAAAGAAAATACGTTTTTATTAATCAGTCTTTTGTTCATC
ATATTTTCCAAGACCGTAGTTGTTCCTTTCACCGCAAGGCTTGGAAATCCCAATCCTAGG
ATGCCATCATATACCACGTCTTCTATATGAGGACCAGGTTTTGTTGCCTGTATAAACTCT
TGTCTATCGAGTAAAACTCCACCCACCATTACTTTATCTCGACCTAGGAAACCTGTTGGC
TCCCCCTTTTCATATTTAAGATCCAAAACTCCTCCTCCGCTCTGTATATAGGTTCTTGAT
GCTTTGGGATTGAACTTTTGATGCGGATGGACCGTTTTAGGATATGTACTAGAA


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FW18JQ U 1
AF RS1FV62JQ U 109
AF RS1BM30JQ U 1
AF RS1D966JQ U 579
AF RS1DL64JQ U 144
AF RS1DD06JQ U 559
BS 1 121 RS1BM30JQ
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BS 148 148 RS1FV62JQ
BS 149 206 RS1BM30JQ
BS 207 207 RS1FV62JQ
BS 208 251 RS1BM30JQ
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BS 253 320 RS1BM30JQ
BS 321 321 RS1FV62JQ
BS 322 664 RS1BM30JQ
BS 665 670 RS1DL64JQ
BS 671 671 RS1DD06JQ
BS 672 773 RS1DL64JQ
BS 774 774 RS1DD06JQ
BS 775 858 RS1DL64JQ
BS 859 1134 RS1DD06JQ

RD RS1FW18JQ 482 0 0
AAA
AATTTCTTTTTGCTAATATATGTTTTAGTTTAATTAAAAACAGAAACATCTTTCTTTTCT
TGGGGG*CCGACACTCCTTGCTAACAGATTGATTGGACAACGAATAAAAATTAGCGTAAT
TATTATTTTTGTTAAAATATAATAAACTAAAATACGTGTTTAGATAGCACTATTGCTACC
ATATGGGTAAAGTTTTTCGCAAAAGACTTTATTTAACTTGATCATCATCTGCAGTACCAC
TATTATTAAAAACAACAAGTTAAGTTTTGTTGTTGTTGTTGTGCTTATGTTGCTATGGCA
AACCCAACTCTGGGTTTCTTCTGGTCTTGGAGGTCGAAAATTGTGTGATAGGCTCGCATA
AAAGCGAGGCCTAAAAACCAGCGATGTGACTCCACAAAACGACTGAAGCACTTTCCACCA
TCCTTGGCTATGTAATCATCTGGCGTGAGGGGAAAAAGCTTTCCCCCGATCGTGAA
AAA

QA 4 479 4 479
DS 

RD RS1FV62JQ 408 0 0
CG
AAATTAGCGTATTTATTATTTTTGTTAAAATATAATAAACTAAAATACGTGTTTAGATAG
CATTATTGCTACCATATGGGTAAAGTTTTTCGCAAAAGACTTTATTTAACTTGATCATCA
TCTGCAGCACCACTATTATTAAAAACAACAAGTTAAGTTTTGTTGTTGTTGTTGTGCTTA
TGTTGCTATGGCAAACCCAACTCTGGGTTTCTTCTGGTCTTGGAGGTCGAGGATTGTGTG
ATAGGCTCGCATAAAAGCGAGGCCTAAAAACCAGCGATGTGACTCCACAAAACGACTGAA
GCACTTTCCACCATCCTTGGCTATGTAATCATCTGGCGTGAGGGGAAAAAGCTTTCCCCC
GATCGTGAAAAAGGTAGTGGGCATCGTACCCATGGTA
AAACAACTC

QA 3 399 3 399
DS 

RD RS1BM30JQ 664 0 0
AAGAATTTCTTTTTGCTAATATATGTTTTAGTTTAATTAAAAACAGAAACATCTTTCTTT
TCTTGGGGGGCCGACACTCCTTGCTAACAGATTGATTGGACAACGAATAAAAATTAGCGT
AGTTATTATTTTTGTTAAAATATAATAGACTAAAATACGTGTTTAGATAGCATTATTGCT
ACCATATGGGTAAAGTTTTTCGCAAACGACTTTATTTAACTTGATCATCATCTGCAGCAC
CACTATTATTAGAAACAACAAGTTAAGTTTTGTTGTTGTTGTTGTGCTTATGTTGCTATG
GCAAACCCAACTCTGGGTTTATTCTGGTCTTGGAGGTCGAAAATTGTGTGATAGGCTCGC
ATAAAAGCGAGGCCTAAAAACCAGCGATGTGACTCCACAAAACGACTGAAGCACTTTCCA
CCATCCTTGGCTATGTAATCATCTGGCGTGAGGGGAAAAAGCTTTCCCCCGATCGTGAAA
AAAATAGTGGGCATCGTACGCATGGTAGAGCAACTCACCTTTCCAAGTGCTTTATTTATG
TCGCTGATAGGTTTCTTTGGACCCAGAATGTCAGTTATCCCAGAATCAACAATTGCTACG
CATTGTGCTGCACAATGTCGAGTTGGTGTTTCACCAATGTGAATAGTTGTCATTTTAATT
CTCC

QA 1 664 1 664
DS 

RD RS1D966JQ 221 0 0
TCCCA
AATCAACAATTGCTACGCATTGTGCTGCACAATGTC*AGTTGGTGTTTCACCAATGTGAA
TA*TTGTCATTTTAATTCTCCA*AAATCTCTTATTCTCCCATA*ACGGGAACATACGTAT
GTTCCCCTTTAAAGTGGTTTGGGTCGAATCCACCAAACACTATTTGTCCACCATTTGGAT
CTTCATGTCTTCCGTCACCGTGGTAACTTCTAATCC

QA 6 221 6 221
DS 

RD RS1DL64JQ 715 0 0
AATAGACTAAAATACGTGTTTAGATAGCATTATTGCTACCATATGGGTAAAGTTTTTCGC
AAAAGACTTTATTTAACTTGATCATCATCTGCAGCACCACTATTATTAGAAACAACAAGT
TAAGTTTTGTTGTTGTTGTTGTGCTTATGTTGCTATGGCAAACCCAACTCTGGGTTTCTT
CTGGTCTTGGAGGTCGAAAATTGTGTGATAGGCTCGCATAAAAGCGAGGCCTAAAAACCA
GCGATGTGACTCCACAAAACGACTGAAGCACTTTCCACCATCCTTGGCTATGTAATCATC
TGGCGTGAGGGGAAAAAGCTTTCCCCCGATCGTGAAGAAAATAGTGGGCATCGTACGCAT
GGTAGAGCAACTCACCTTTCCAAGTGCTTTATTTATGTCGCTGATAGGTTTCTTTGGACC
CAGAATGTCAGTTATCCCAAAATCAACAATTGCTACGCATTGTGCTGCACAATGTCGAGT
TGGTGTTTCACCAATGTGAATAGTTGTCATTTTAATTCTCCAGAAATTTCTTATTCTCCC
ATAGACGGGAACATACGTATGTTCCCCTTTAAAGTGGTTTGGGTCGAATCCACCAAACAC
TATTTGTCCACCATTTGGATCTTCATGTCTCCCGTCACCGTGGTAACTTCTAATCCAAAA
AGAAAATACGTTTTTATTAATCAGTCTTTTGTTCATCATATTTTCCAAGACCGTA

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1DD06JQ 576 0 0
GGACCCAGAATGTCAGTTATCCCAGAATCAACAATTGCTACGCATTGTGCTGCACAATGT
CGAGTTGGTGTTTCACCAATGTGAATAGTTGTCATTTTAATTCTCCAGAAATCTCTTATT
CTCCCATAGACGGGAACATACGTATGTTCCCCTTTAAAGTGGTTTGGGTCGAATCCACCA
AACACTATTTGTCCACCATTTGGATCTTCATGTCTTCCGTCACCGTGGTAACTTCTAATC
CAAAAAGAAAATATGTTTTTATTAATCAGTCTTTTGTTCATCATATTTTCCAAGACCGTA
GTTGTTCCTTTCACCGCAAGGCTTGGAAATCCCAATCCTAGGATGCCATCATATACCACG
TCTTCTATATGAGGACCAGGTTTTGTTGCCTGTATAAACTCTTGTCTATCGAGTAAAACT
CCACCCACCATTACTTTATCTCGACCTAGGAAACCTGTTGGCTCCCCCTTTTCATATTTA
AGATCCAAAACTCCTCCTCCGCTCTGTATATAGGTTCTTGATGCTTTGGGATTGAACTTT
TGATGCGGATGGACCGTTTTAGGATATGTACTAGAA

QA 1 576 1 576
DS 



CO CL251Contig2 823 5 5 U
GGAAACTTTAACCTTCAGAAAATGGAAAGTATATGGTTTTTTGTCATATCAGCTGTGCTA
CTATCTGGATCCTGTCACGGATTATCGAATGGAACTGTCAAAGTCATTCTGAAAAAA*TA
TATCAATGGTAACCGCTTTATAGGTTTAGTGAATTATCGTGATGTAGTCCTCTACGGTGA
TATTGATGTGGGTGATCCACCTCAGAGATTCAGAGTTGTTTTTGATACGGGAAGTGCCGA
TCTTTGGATACCTTCTAGTACATATCCTAAAACGGTCCATCCGCATCAAAAGTTCAATCC
CAAAGCATCAAGAACCTATATACAGAGCGGAGGAGGAGTTTTGGATCTTAAATATGAAAA
GGGGGAGCTAACAGGTTTCCTAGGTCGAGATAAAGTAATGGTGGGTGGAGTTTTACTCGA
TAGACAAGAGTTTATACAGGCAACAAAACCTGGTCCTCATATAGAAGACGTGGTATATGA
TGGCATCCTAGGATTGGGATTTCCAAGCCTTGCGGTGAAAGGAACAACTACGGTCTTGGA
AAATATGATGAACAAAAGACTGATTAATAAAAACATATTTTCTTTTTGGATTAGAAGTTA
CCACGGTGACGGAAGACATGAAGATCCAAATGGTGGACAAATAGTGTTTGGTGGATTCGA
CCCAAACCACTTTAAAGGGGAACATACGTATGTTCCCGTCTATGGGAGAATAAGAAATTT
CTGGAGATTAAATGACAACTATTCACATTGGTGAACACCAACTCGACATTGTGCAGCACA
ATGCGTAGCAATTGTTGATCTGGGATACTGACATTCTGGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BM30TF U 1
AF RS1DL64TF U 37
AF RS1DD06TF U 37
AF RS1D966TF U 37
AF RS1FW18TF U 37
BS 1 656 RS1BM30TF
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BS 717 751 RS1D966TF
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RD RS1BM30TF 656 0 0
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TATTGATGTGGGTGATCCACCTCAGAGATTCAGAGTTGTTTTTGATACGGGAAGTGCCGA
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GGGGGAGCTAACAGGTTTCCTAGGTCGAGATAAAGTAATGGTGGGTGGAGTTTTACTCGA
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CCACGGTGACGGAAGACATGAAGATCCAAATGGTGGACAAATAGTGTTTGGTGGAT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RS1DL64TF 644 0 0
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ATTTTCTTTTTGGATTAGAAGTTACCACGGTGACGGGAGACATGAAGATCCAAATGGTGG
ACAAATAGTGTTTGGTGGATTCGACCCAAACCACTTTAAAGGG
A

QA 1 643 1 643
DS 

RD RS1DD06TF 637 0 0
TTTTTTGTCATATCAGCTGTGCTACTATCTGGATCCTGTCACGGATTATCGAATGGAACT
GTCAAAGTCATTCTGAAAAAA*TATATCAATGGTAACCGCTTTATAGGTTTAGTGAATTA
TCGTGATGTAGTCCTCTACGGTGATATTGATGTGGGTGATCCACCTCAGAGATTCAGAGT
TGTTTTTGATACGGGAAGTGCCGATCTTTGGATACCTTCTAGTACATATCCTAAAACGGT
CCATCCGCATCAAAAGTTCAATCCCAAAGCATCAAGAACCTATATACAGAGCGGAGGAGG
AGTTTTGGATCTTAAATATGAAAAGGGGGAGCCAACAGGTTTCCTAGGTCGAGATAAAGT
AATGGTGGGTGGAGTTTTACTCGATAGACAAGAGTTTATACAGGCAACAAAACCTGGTCC
TCATATAGAAGACGTGGTATATGATGGCATCCTAGGATTGGGATTTCCAAGCCTTGCGGT
GAAAGGAACAACTACGGTCTTGGAAAATATGATGAACAAAAGACTGATTAATAAAAACAT
ATTTTCTTTTTGGATTAGAAGTTACCACGGTGACGGAAGACATGAAGATCCAAATGGTGG
ACAAATAGTGTTTGGTGGATTCGACCCAAACCACTTT

QA 1 637 1 637
DS 

RD RS1D966TF 715 0 0
TTTTTTGTCATATCAGCTGTGCTACTATCTGGATCCTGTCACGGATTATCGAATGGAACT
GTCAAAGTCATTCTGAAAAAA*TATATCAATGGTAACCGCTTTATAGGTTTAGTGAATTA
TCGTGATGTAGTCCTCTACGGTGATATTGATGTGGGTGATCCACCTCAGAGATTCAGAGT
TGTTTTTGATACGGGAAGTGCCGATCTTTGGATACCTTCTAGTACATATCCTAAAACGGT
CCATCCGCATCAAAAGTTCAATCCCAAAGCATCAAGAACCTATATACAGAGCGGAGGAGG
AGTTTTGGATCTTAAATATGAAAAGGGGGAGCCAACAGGTTTCCTAGGTCGAGATAAAGT
AATGGTGGGTGGAGTTTTACTCGATAGACAAGAGTTTATACAGGCAACAAAACCTGGTCC
TCATATAGAAGACGTGGTATATGATGGCATCCTAGGATTGGGATTTCCAAGCCTTGCGGT
GAAAGGAACAACTACGGTCTTGGAAAATATGATGAACAAAAGACTGATTAATAAAAACAT
ATTTTCTTTTTGGATTAGAAGTTACCACGGTGACGGAAGACATGAAGATCCAAATGGTGG
ACAAATAGTGTTTGGTGGATTCGACCCAAACCACTTTAAAGGGGAACATACGTATGTTCC
CGTCTATGGGAGAATAAGAGATTTCTGGAGATTAAATGACAACTATTCACATTGG

QA 1 715 1 715
DS 

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TTTTTTGTCATATCAGCTGTGCTACTATCTGGATCCTGTCACGGATTATCGAATGGAACT
GTCAAAGTCATTCTGAAAAAAATATATCAATGGTAACCGCTTTATAGGTTTAGTGAATTA
TCGTGATGTAGTCCTCTACGGTGATATTGATGTGGGTGATCCACCTCAGAGATTCAGAGT
TGTTTTTGATACGGGAAGTGCCGATCTTTGGATACCTTCTAGTACATATCCTAAAACGGT
CCATCCGCATCAAAAGTTCAATCCCAAAGCATCAAGAACCTATATACAGAGCGGAGGAGG
AGTTTTGGATCTTAAATATGAAAAGGGGTAGCTAACAGGTTTCCTAGGTCGAGATAAAGT
AATGGTGGGTGGAGTTTTACTCGATAGACAAGAGTTTATACAGGCAACAAAACCTGGTCC
TCATATAGAAGACGTGGTATATGATGGCATCCTAGGATTGGGATTTCCAAGCCTTGCGGT
GAAAGGAACAACTACGGTCTTGGAAAATATGATGAACAAAAGACTGATTAATAAAAACAT
ATTTTCTTTTTGGATTAGAAGTTACCACGGTGACGGAAGACATGAAGATCCAAATGGTGG
ACAAATAGTGTTTGGTGGATTCGACCCAAACCACTTTAAAGGGGAACATACGTATGTTCC
CGTCTATGGGAGAATAAGAAATTTCTGGAGATTAAATGACAACTATTCACATTGGTGAAC
ACCAACTCGACATTGTGCAGCACAATGCGTAGCAATTGTTGATCTGGGATACTGACATTC
TGGGTCC

QA 1 787 1 787
DS 



AS 3 11

CO CL252Contig1 752 5 1 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGACTTTCGTC
TGAAGGAGGTCGACTTGTTGTCAAGGGAAACAAACCCCCCTAGATATGGCGGAGAAGCTT
GCGCCAGAGAAGCGACATGATTTCGTTCATAACGGGCAAAAGGTGTTTGAATGGGATCAA
ACCCTCGAAGAAGTGAACCTGTACATAACTCTGCCGCCTAATGTTCACTCAAAGGCATTC
CACTGCAAAATCCAGTCGAAACATCTCGAAGCTGGCATCAAAGGCAACCCTCCTTATCTC
AATCACGATCTTAGTGCTCCTGTGAAGACGGATTGCTCGTTCTGGACTCTAGAGGACGAT
ATAATGCACATAACCCTGCAGAAGAGGGAGAAAGGGCAGACATGGGCATCTCCAATTCTC
GGACAGGGTCAGTTAGATCCGTACGCCACTGATCTAGAGCAGAAGCGTCTCATGCTTCAG
AGGTTTCAAGAAGAGAATCCAGGATTCGACTTTTCACAAGCTCAGTTCACGGGTAACTGT
CCAGATCCGAGTAGCTTCATGGGTGGTATTCGTTCTGACTAGTCAGTCCTTCCTACTCTT
TTTGTTTCCATGAAAATGTCCCCATGGCTTGACTGACTGACTCTCTTCTGTTTAATCAAA
ATCAAATCATCTCTAAACTATTTTTCATTCACTTACGAATAAATGCTTTTGTCTTGTATT
GTCGTCTCTGCTTAGTTATTCTTTTATTCCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1BU54TF U 83
AF RS1A051TV U 1
AF RS1A051JQ C 50
AF RS1A051TF U 81
AF RS1A051TR C 50
BS 1 752 RS1A051TV

RD RS1BU54TF 353 0 0
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TGAAGACGGATTGCTCGTTCTGGACTCTAGAGGATGATATAATGCACATAACCCTGCAGA
AGAGGGAGAAAGGGCAGACATGGGCATCTCCAATTCTCGGACAGGGTCAGTTA

QA 1 353 1 353
DS 

RD RS1A051TV 752 0 0
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TGAAGGAGGTCGACTTGTTGTCAAGGGAAACAAACCCCCCTAGATATGGCGGAGAAGCTT
GCGCCAGAGAAGCGACATGATTTCGTTCATAACGGGCAAAAGGTGTTTGAATGGGATCAA
ACCCTCGAAGAAGTGAACCTGTACATAACTCTGCCGCCTAATGTTCACTCAAAGGCATTC
CACTGCAAAATCCAGTCGAAACATCTCGAAGCTGGCATCAAAGGCAACCCTCCTTATCTC
AATCACGATCTTAGTGCTCCTGTGAAGACGGATTGCTCGTTCTGGACTCTAGAGGACGAT
ATAATGCACATAACCCTGCAGAAGAGGGAGAAAGGGCAGACATGGGCATCTCCAATTCTC
GGACAGGGTCAGTTAGATCCGTACGCCACTGATCTAGAGCAGAAGCGTCTCATGCTTCAG
AGGTTTCAAGAAGAGAATCCAGGATTCGACTTTTCACAAGCTCAGTTCACGGGTAACTGT
CCAGATCCGAGTAGCTTCATGGGTGGTATTCGTTCTGACTAGTCAGTCCTTCCTACTCTT
TTTGTTTCCATGAAAATGTCCCCATGGCTTGACTGACTGACTCTCTTCTGTTTAATCAAA
ATCAAATCATCTCTAAACTATTTTTCATTCACTTACGAATAAATGCTTTTGTCTTGTATT
GTCGTCTCTGCTTAGTTATTCTTTTATTCCCG

QA 1 752 1 752
DS 

RD RS1A051JQ 703 0 0
GGAC
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GGATCAAACCCTCGAAGAAGTGAACCTGTACATAACTCTGCCGCCTAATGTTCACTCAAA
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TTATCTCAATCACGATCTTAGTGCTCCTGTGAAGACGGATTGCTCGTTCTGGACTCTAGA
GGACGATATAATGCACATAACCCTGCAGAAGAGGGAGAAAGGGCAGACATGGGCATCTCC
AATTCTCGGACAGGGTCAGTTAGATCCGTACGCCACTGATCTAGAGCAGAAGCGTCTCAT
GCTTCAGAGGTTTCAAGAAGAGAATCCAGGATTCGACTTTTCACAAGCTCAGTTCACGGG
TAACTGTCCAGATCCGAGTAGCTTCATGGGTGGTATTCGTTCTGACTAGTCAGTCCTTCC
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AATCAAAATCAAATCATCTCTAAACTATTTTTCATTCACTTACGAATAAATGCTTTTGTC
TTGTATTGTCGTCTCTGCTTAGTTATTCTTTTATTCCCG

QA 5 703 5 703
DS 

RD RS1A051TF 672 0 0
TCAAGGGAAACAAACCCCCCTAGATATGGCGGAGAAGCTTGCGCCAGAGAAGCGACATGA
TTTCGTTCATAACGGGCAAAAGGTGTTTGAATGGGATCAAACCCTCGAAGAAGTGAACCT
GTACATAACTCTGCCGCCTAATGTTCACTCAAAGGCATTCCACTGCAAAATCCAGTCGAA
ACATCTCGAAGCTGGCATCAAAGGCAACCCTCCTTATCTCAATCACGATCTTAGTGCTCC
TGTGAAGACGGATTGCTCGTTCTGGACTCTAGAGGACGATATAATGCACATAACCCTGCA
GAAGAGGGAGAAAGGGCAGACATGGGCATCTCCAATTCTCGGACAGGGTCAGTTAGATCC
GTACGCCACTGATCTAGAGCAGAAGCGTCTCATGCTTCAGAGGTTTCAAGAAGAGAATCC
AGGATTCGACTTTTCACAAGCTCAGTTCACGGGTAACTGTCCAGATCCGAGTAGCTTCAT
GGGTGGTATTCGTTCTGACTAGTCAGTCCTTCCTACTCTTTTTGTTTCCATGAAAATGTC
CCCATGGCTTGACTGACTGACTCTCTTCTGTTTAATCAAAATCAAATCATCTCTAAACTA
TTTTTCATTCACTTACGAATAAATGCTTTTGTCTTGTATTGTCGTCTCTGCTTAGTTATT
CTTTTATTCCCG

QA 1 672 1 672
DS 

RD RS1A051TR 703 0 0
GGAC
TTTCGTCTGAAGGAGGTCGACTTGTTGTCAAGGGAAACAAACCCCCCTAGATATGGCGGA
GAAGCTTGCGCCAGAGAAGCGACATGATTTCGTTCATAACGGGCAAAAGGTGTTTGAATG
GGATCAAACCCTCGAAGAAGTGAACCTGTACATAACTCTGCCGCCTAATGTTCACTCAAA
GGCATTCCACTGCAAAATCCAGTCGAAACATCTCGAAGCTGGCATCAAAGGCAACCCTCC
TTATCTCAATCACGATCTTAGTGCTCCTGTGAAGACGGATTGCTCGTTCTGGACTCTAGA
GGACGATATAATGCACATAACCCTGCAGAAGAGGGAGAAAGGGCAGACATGGGCATCTCC
AATTTTCGGACAGGGTCAGTTAGATCCGTACGCCACTGATCTAGAGCAGAAGCGTCTCAT
GCTTCAGAGGTTTCAAGAAGAGAATCCAGGATTCGACTTTTCACAAGCTCAGTTCACGGG
TAACTGTCCAGATCCGAGTAGCTTCATGGGTGGTATTCGTTCTGACTAGTCAGTCCTTCC
TACTCTTTTTGTTTCCATGAAAATGTCCCCATGGCTTGACTGACTGACTCTCTTCTGTTT
AATCAAAATCAAATCATCTCTAAACTATTTTTCATTCACTTACGAATAAATGCTTTTGTC
TTGTATTGTCGTCTCTGCTTAGTTATTCTTTTATTCCCG

QA 5 703 5 703
DS 



CO CL252Contig2 677 2 2 U
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ATAGATTAACAGAAGAGAGTCAAGCCATGGGGACATTTTCCTTTTCGCAGTTTTATTATA
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GAAACCTCTGCAGCATGAGACGCTTCTGCTCTAGATCAGTGACGTAAGGATCTAACTGAC
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GCATTATATCATACTCTAGAGTCAGAACGAGCAATCCGTCTTCACAGGAGCACTAAGATC
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TGGCGCAAGCTTCTCCGCCATATCTAAGGGGTCTGTTTGTTTCCCCTGACAAGTCGATCT
CCTTCAGACAAATGTCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CB63TF C 1
AF RS1CB63JQ U 5
BS 1 4 RS1CB63TF
BS 5 677 RS1CB63JQ

RD RS1CB63TF 677 0 0
TTTTCACAAGACAAACGCATTTATTCGTAAGTGAATGAAATATAGTTTAGAGATGATTTG
ATAGATTAACAGAAGAGAGTCAAGCCATGGGGACATTTTCCTTTTCGCAGTTTTATTATA
ATGGAAACAAAAAGAGTAGGAAGGACTAGTCAGAACGAATACCACCCATGAAGCTACTCG
GATCTGGACAGTTACCCGTGAACTGAGCTTGTGAAAAGTCGAATCCTGGGTTCTCTTCTT
GAAACCTCTGCAGCATGAGACGCTTCTGCTCTAGATCAGTGACGTAAGGATCTAACTGAC
CCTGTCCAAGAATCGGAGATGCCCATGTCTGCCCTTTCTCCCTCTTCTGCAGGGTTATGT
GCATTATATCATACTCTAGAGTCAGAACGAGCAATCCGTCTTCACAGGAGCACTAAGATC
GTGATTGAGATAAGGAGGGTTGCCTTTGATGCCAACTTCGAGATGTTTCGACTGGATTTT
GCAGTGGAATGCCTTTGAGTGAACATTAGGCGGCAGAGTTATGTACAGGTTCACTTCTTC
AAGTGTTTGATCCCATTCAAACACCTTTTGCCCGTTGTGAATGAAATCATGTCGCTTCTC
TGGCGCAAGCTTCTCCGCCATATCTAAGGGGTCTGTTTGTTTCCCCTGACAAGTCGATCT
CCTTCAGACAAATGTCC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RS1CB63JQ 673 0 0
CACAAGACAAACGCATTTATTCGTAAGTGAATGAAATATAGTTTAGAGATGATTTGATAG
ATTAACAGAAGAGAGTCAAGCCATGGGGACATTTTCCTTTTCGCAGTTTTATTATAATGG
AAACAAAAAGAGTAGGAAGGACTAGTCAGAACGAATACCACCCATGAAGCTACTCGGATC
TGGACAGTTACCCGTGAACTGAGCTTGTGAAAAGTCGAATCCTGGGTTCTCTTCTTGAAA
CCTCTGCAGCATGAGACGCTTCTGCTCTAGATCAGTGACGTAAGGATCTAACTGACCCTG
TCCAAGAATCGGAGATGCCCATGTCTGCCCTTTCTCCCTCTTCTGCAGGGTTATGTGCAT
TATATCATACTCTAGAGTCAGAACGAGCAATCCGTCTTCACAGGAGCACTAAGATCGTGA
TTGAGATAAGGAGGGTTGCCTTTGATGCCAACTTCGAGATGTTTCGACTGGATTTTGCAG
TGGAATGCCTTTGAGTGAACATTAGGCGGCAGAGTTATGTACAGGTTCACTTCTTCAAGT
GTTTGATCCCATTCAAACACCTTTTGCCCGTTGTGAATGAAATCATGTCGCTTCTCTGGC
GCAAGCTTCTCCGCCATATCTAAGGGGTCTGTTTGTTTCCCCTGACAAGTCGATCTCCTT
CAGACAAATGTCC

QA 1 673 1 673
DS 



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GAAGCTTGCGCCAGAGAAGCGACATGATTTCGTTCATAACGGGCAAAAGGTGTTTGAATG
GGATCAAACCCTCGAAGAAGTGAACCTGTACATAACTCTGCCGCCTAATGTTCACTCAAA
GGCATTCCACTGCAAAATCCAGTCGAAACATCTCGAAGTTGGCATCAAAGGCAACCCTCC
TTATCTCAATCACGATCTTAGTGCTCCTGTGAAGACGGATTGCTCGTTCTGGACTCTAGA
GGATGATATAATGCACATAACCCTGCAGAAGAGGGAGAAAGGGCAGACATGGGCATCTCC
AATTCTCGGACAGGGTCAGTTAGATCCGTACGCCACTGATCTAGAGCAGAAGCGTCTCAT
GCTTCAGAGGTTTCAAGAAGAGGTTAGCTTTGCAAACAATCTTCTCGTTTTTTATTTTTG
CACATTTTTGTTTTCTTGTTGAAGGATATCTAAAGCAATCTTGGCACCACCTATGAATGG
TATGTCCAAATAATAATTACACTGCCAAAGATTATCTGATTTGGATGGGTTGTGTCATGT
CTAATCACATTGATTGTTTCCTTTGTTAAAGCTCCTTTTATAATTTTGGTTTCTCGTATC
TCTGGTAAAACAGTCTGCATAGAACTGGTGATAGGGGTAACTCGTGTGGTGGGTGTTTTG
CTATGTTGATGAGATTGCTTACTCTTTGTCTAACTGGATTCTTAGCGGCCGTGCCCTATT
GTTTTTGTTCTACTTGTATCCATGGCTTCTATATAGCATTTGATGCTTTCCCTTTTATTT
TTTATTTTTTTTCTGTCTCTGTGTTTGCAGAATCCAGGATTCGACTTTTCACAAGCTCAG
TTCACGGGTAACTGTCCAGATCCGAGTAGCTTCATGGGTGGTATTCGTTCTGACTAGTCA
GTCCTTCCTACTCTTTTTGTTTCCATGAAAATGTCCCCATGGCTTGACTGACTGACTCTC
TTCTGTTTAATCAAAATCAAATCATCTCTAAACTATTTTTCATTCACTTACGAATAAATG
CTTTTGTCTTGTATTGTCGTCTCTGCTTAGTTATTCTTTTATTCCCGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GA39TF U 7
AF RS1D635TF U 1
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AF RS1GA39JQ C 529
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GG
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DS 

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GGATCAAACCCTCGAAGAAGTGAACCTGTACATAACTCTGCCGCCTAATGTTCACTCAAA
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TTATCTCAATCACGATCTTAGTGCTCCTGTGAAGACGGATTGCTCGTTCTGGACTCTAGA
GGATGATATAATGCACATAACCCTGCAGAAGAGGGAGAAAGGGCAGACATGGGCATCTCC
AATTCTCGGACAGGGTCAGTTAGATCCGTACGCCACTGATCTAGAGCAGAAGCGTCTCAT
GCTTCAGAGGTTTCAAGAAGAGGTTAGCTTTGCAAACAATCTTCTCGTTTTTTATTTTTG
CACATTTTTGTTTTCTTGTTGAAGGATATCTAAAGCAATCTTGGCACCACCTATGAATGG
TATGTCCAAATAATAATTACACTGCCAAAGATTATCTGATTTGGATGGGTTGTGTCATGT
CTAATCACATTGATTGTTTCCTTTGTTAAAGCTCCTTTTATAATTTTGGTTTCTCGTATC
TCTGGTAAA*CAGTCTGCATAGAACTGGTGATATGGGTAACTCGTGTGGTGGGTGTTTTG
CTATGT

QA 1 726 1 726
DS 

RD RS1D635JQ 622 0 0
ATCTAAAGCAATCTTGGCACCACCTATGAATGGTATGTCCAAATAATAATTACACTGCCA
AAGATTATCTGATTTGGATGGGTTGTGTCATGTCTAATCACATTGATTGTTTCCTTTGTT
AAAGCTCCTTTTATAATTTTGGTTTCTCGTATCTCTGGTAAAACAGTCTGCATAGAACTG
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GTCTAACTGGATTCTTAGCGGCCGTGCCCTATTGTTTTTGTTCTACTTGTATCCATGGCT
TCTATATAGCATTTGATGCTTTCCCTTTTATTTTTTATTTTTTTTCTGTCTCTGTGTTTG
CAGAATCCAGGATTCGACTTTTCACAAGCTCAGTTCACGGGTAACTGTCCGGATCCGAGT
AGCTTCATGGGTGGTATTCGTTCTGACTAGTCAGTCCTTCCTACTCTTTTTGTTTCCATG
AAAATGTCCCCATGGCTTGACTGACTGACTCTCTTCTGTTTAATCAAAATCAAATCATCT
CTAAACTATTTTTCATTCACTTACGAATAAATGCTTTTGTCTTGTATTGTCGTCTCTGCT
TAGTTATTCTTTTATTCCCGAC

QA 1 622 1 622
DS 

RD RS1GA39JQ 564 0 0
ACCTATGAATGGTATGTCCAAATAATAATTACACTGCCAAAGATTATCTGATTTGGATGG
GTTGTGTCATGTCTAATCACATTGATTGTTTCCTTTGTTAAAGCTCCTTTTATAATTTTG
GTTTCTCGTATCTCTGGTAAAACAGTCTGCATAGAACTGGTGATAGGGGTAACTCGTGTG
GTGGGTGTTTTGCTATGTTGATGAGATTGCTTACTCTTTGTCTAACTGGATTCTTAGCGG
CCGTGCCCTATTGTTTTTGTTCTACTTGTATCCATGGCTTCTATATAGCATTTGATGCTT
TCCCTTTTATTTTTTATTTTTTTTCTGTCTCTGTGTTTGCAGAATCCAGGATTCGACTTT
TCACAAGCTCAGTTCACGGGTAACTGTCCAGATCCGAGTAGCTTCATGGGTGGTATTCGT
TCTGACTAGTCAGTCCTTCCTACTCTTTTTGTTTCCATGAAAATGTCCCCATGGCTTGAC
TGACTGACTCTCTTCTGTTTAATCAAAATCAAATCATCTCTAAACTATTTTTCATTCACT
TACGAATAAATGCTTTTGTCTTGT

QA 1 564 1 564
DS 



AS 1 9

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GGATTCCACCCTCGCTACAAAAAGTCACTCAAGCAACAAAAGAAAAAGCGAAATCAAACA
AAAATAAGATGGTTCTGCTAGACAAGCTCTGGGATGATGTTGTGGCCGGACCTCAACCC*
GACCGTGGCCTTGCCCGCCTCCGGAAGATCACTACCCAACCCATTAATATCAGAGGAGAA
GGAAGCAACAAGATGATGCTTAGGTCGTTGACTATGCCGACGGTAGTGAGCCCCGGTACT
CCAACTACTCCGACCACTCCGACAACGCCACACAAGGATAACGTGTGGAGGAGCGTCTTT
AATCCTGGAAGCAACCTCGCCACAAGAGCCATCGGCTCCAACATCTTTGATAAACCAACC
CACCCAAATTCTCCATCCGTCTACGACTGGTTGTACAGCGG*CGAGTCAAGGAGTCAGCA
CCGTTAAAAGCGAGTCAGAGGGAGTGACACAAGTGGGTGATATAAATATGGTGTCTAGAT
CTACCTTCACGAGTTCACGTGTCTGTTTTGCTTGTGTACATAACTGTCTTCCACCTATGC
AATAAGTTGTCACGTTGTTAACTTTCCACTTTGGGCTGTGTTTTGCAAGTTTTCCTTTGT
GTGTTTTGTACTTGTAACTTGCAAGTGACGGGTTTGAACCAAAAAAAAGCTTGCAAGTGA
CGGCTGAATCTTCACTGTCCCGTTGGATTTTGGTTGTGAAAATGCCTCTGCTTTTT*CTA
GTGCTAATAAGATCTTGTTTATAT


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 0 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 30 30 30 30 

AF RS1CQ63TF U 116
AF RS1CT73JQ C 1
AF RS1G343TF U 1
AF RS1CT73TF U 1
AF RS1E042TF U 1
AF RS1BZ07TF U 9
AF RS1BZ07JQ C 240
AF RS1F477JQ C 373
AF RS1F477TF U 386
BS 1 4 RS1CT73JQ
BS 5 53 RS1CT73TF
BS 54 55 RS1E042TF
BS 56 128 RS1CT73TF
BS 129 129 RS1E042TF
BS 130 407 RS1CT73TF
BS 408 408 RS1E042TF
BS 409 623 RS1CT73TF
BS 624 624 RS1E042TF
BS 625 738 RS1CT73TF
BS 739 740 RS1E042TF
BS 741 744 RS1BZ07TF

RD RS1CQ63TF 321 0 0
ACCC*GACCGTGGCCTTGCCCGCCTCCGGAAGATCACTACCCAACCCATTAATATCAGAG
GAGAAGGAAGCAACAAGATGATGCTTAGGTCGTTGACTATGCCGACGGTAGTGAGCCCCG
GTACTCCAACTACTCCGACCACTCCGACAACGCCACACAAGGATAACGTGTGGAGGAGCG
TCTTTAATCCTGGAAGCAACCTCGCCACAAGAGCCATCGGCTCCAACATCTTTGATAAAC
CAACCCACCCAAATTCTCCATCCGTCTACGACTGGTTGTACAGCGG*CGAGTCAAGGAGT
CAGCACCGTTAAAAGCGAGTC

QA 1 321 1 321
DS 

RD RS1CT73JQ 648 0 0
GGATTCCACCCTCGCTACAAAAAGTCACTCAAGCAACAAAAGAAAAAGCGAAA**AAACA
AAAATAAGATGGTTCTGCTAGACAAGCTCTGGGATGATGTTGTGGCCGGACCTCAACCCC
GACCGTGGTCTTGCCCGCCTCCGGAAGATCACTACCCAACCCATTAATATCAGAGGAGAA
GGAAGCAACAAGATGATGCTTAGGTCGTTGACTATGCCGACGGTAGTGAGCCCCGGTACT
CCAACTACTCCGACCACTCCGACAACGCCACACAAGGATAACGTGTGGAGGAGCGTCTTT
AATCCTGGAAGCAACCTCGCCACAAGAGCCATCGGCTCCAACATCTTTGATAAACCAACC
CACCCAAATTCTCCATCCGTCTACGACTGGTTGTACAGCGG*CGAGTTAAGGAGTCAGCA
CCGTTAAAAGCGAGTCAGAGGGAGTGACACAAGTGGGTGATATAAATATGGTGTCTAGAT
CTACCTTCACGAGTTCACGTGTCTGTTTTGCTTGTGTACATAACTGTCTTCCACCTATGC
AATAAGTTGTCACGTTGTTAACTTTCCACTTTGGGCTGTGTTTTGCAAGTTTTCCTTTGT
GTGTTTTGTACTTGTAACTTGCAGGTGACGGGTTTGAACCAAAAAAAA

QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1G343TF 697 0 0
GGAC
TCCACCCTCGCTACAAAAAGTCACTCAAGCAACAAAAGAAAAAGCGAAATCAAACAAAAA
TAAGATGGTTCTGCTAGACATGCTCTGGGATGATGTTGTGGCCGGACCTCAACCC*GACC
GTGGCCTTGCCCGCCTCCGGAAGATCACTACCCAACCCATTAATATCAGAGGAGAAGGAA
GCAACAAGATGATGCTTAGGTCGTTGACTATGCCGACGGTAGTGAGCCCCGGTACTCCAA
CTACTCCGACCACTCCGACAACGCCACACAAGGATAACGTGTGGAGGAGCGCCTTTAATC
CTGGAAGCAACCTCGCCACAATAGCCATCGGCTCCAACATCTTTGATAAACCAACCCACC
CAAATTCTCCATCCGTCTACGACTGGTTGTACAGCGG*CGAGTCAAGGAGTCAGCACCGT
TAAAAGCGAGTCAGAGGGAGTTACACAAGTGGGTGATATAAATATGGTGTCTAGATCTAC
CTTCACGAGTTCACGTGTCTGTTTTGCTTGTGTACATAACTGTTTTCCACCTATGCAATA
AGTTGTCACGTTGTTAACTTTCCACTTTGGGCTGTGTTTTGCAAGTTTTCCTTTGTGTGT
TTTGTACTTGTAACTTGCAAGTGACGGGTTTGAACCAAAAAAA*GCTTGCAAGTGACGGC
TGAATCTTCACTGTCCCGTTGGATTTTGGTTGT

QA 5 697 5 697
DS 

RD RS1CT73TF 738 0 0
GGAT
TCCACCCTCGCTACAAAAAGTCACTCAAGCAACAAAAGAAAAAGCGAAA**AAACAAAAA
TAAGATGGTTCTGCTAGACAAGCTCTGGGATGATGTTGTGGCCGGACCTCAACCC*GACC
GTGGTCTTGCCCGCCTCCGGAAGATCACTACCCAACCCATTAATATCAGAGGAGAAGGAA
GCAACAAGATGATGCTTAGGTCGTTGACTATGCCGACGGTAGTGAGCCCCGGTACTCCAA
CTACTCCGACCACTCCGACAACGCCACACAAGGATAACGTGTGGAGGAGCGTCTTTAATC
CTGGAAGCAACCTCGCCACAAGAGCCATCGGCTCCAACATCTTTGATAAACCAACCCACC
CAAATTCTCCATCCGTCTACGACTGGTTGTACAGCGG*CGAGTTAAGGAGTCAGCACCGT
TAAAAGCGAGTCAGAGGGAGTGACACAAGTGGGTGATATAAATATGGTGTCTAGATCTAC
CTTCACGAGTTCACGTGTCTGTTTTGCTTGTGTACATAACTGTCTTCCACCTATGCAATA
AGTTGTCACGTTGTTAACTTTCCACTTTGGGCTGTGTTTTGCAAGTTTTCCTTTGTGTGT
TTTGTACTTGTAACTTGCAGGTGACGGGTTTGAACCAAAAAAAAGCTTGCAAGTGACGGC
TGAATCTTCACTGTCCCGTTGGATTTTGGTTGTGAAAATGCCTCTGCTTTTT*CTAGTGC
TAATAAGATCTTGT

QA 5 738 5 738
DS 

RD RS1E042TF 740 0 0
GGAC
TCCACCCTCGCTACAAAAAGTCACTCAAGCAACAAAAGAAAAAGCGAAATCAAACAAAAA
TAAGATGGTTCTGCTAGACAAGCTCTGGGATGATGTTGTGGCCGGACCTCAACCC*GACC
GTGGCCTTGCCCGCCTCCGGAAGATCACTGCCCAACCCATTAATATCAGAGGAGAAGGAA
GCAACAAGATGATGCTTAGGTCGTTGACTATGCCGACGGTAGTGAGCCCCGGTACTCCAA
CTACTCCGACCACTCCGACAACGCCACACAAGGATAACGTGTGGAGGAGCGTCTTTAATC
CTGGAAGCAACCTCGCCACAAGAGCCATCGGCTCCAACATCTTTGATAAACCAACCCACC
CAAATTCTCCATCCGTCTACGACTGGTTGTACAGCGG*CGAGTCAAGGAGTCAGCACCGT
TAAAAGCGAGTCAGAGGGAGTGACACAAGTGGGTGATATAAATATGGTGTCTAGATCTAC
CTTCACGAGTCCACGTGTCTGTTTTGCTTGTGTACATAACTGTCTTCCACCTATGCAATA
AGTTGTCACGTTGTTAACTTTCCACTTTGGGCTGTGTTTTGCAAGTTTTCCTTTGTGTGT
TTTGTACTTGTAACTTGCAAGTGACGGGTTTGAACCAAAAAA**GCTTGCAAGTGACGGC
TGAATCTTCACTGTCCCGTTGGATTTTGGTTGTGAAAATGCCTCTGCTTTTTTCTAGTGC
TAATAAGATCTTGTTT

QA 5 740 5 740
DS 

RD RS1BZ07TF 736 0 0
CCCTCGCTACAAAAAGTCACTCAAGCAACAAAAGAAAAAGCGAAATCAAACAAAAATAAG
ATGGTTCTGCTAGACAATCTCTGGGATGATGTTGTGGCCGGACCTCAACCC*GACCGTGG
CCTTGCCCGCCTCCGGAAGGTCACTACCCAACCCATTAATATCAGAGGAGAAGGAAGCAA
CAAGATGATGCTTAGGTCGTTGACTATGCCGACGGTAGTGAGCCCCGGTACTCCAACTAC
TCCGACCACTCCGACAACGCCACACAAGGATAACGTGTGGAGGAGCGTCTTTAATCCTGG
AAGCAACCTCGCCACAAGAGCCATCGGCTCCAACATCTTTGATAAACCAACCCACCCAAA
TTCTCCATCCGTCTACGACTGGTTGTACAGCGG*CGAGTCAAGGAGTCAGCACCGTTAAA
AGCGAGTCAGAGGGAGTGACACAAGTGGGTGATATAAATATGGTGTCTAGATCTACCTTC
ACGAGTTCACGTGTCTGTTTTGCTTGTGTACATAACTGTCTTCCACCTATGCAATAAGTT
GTCACGTTGTTAACTTTCCACTTTGGGCTGTGTTTTGCAAGTTTTCCTTTGTGTGTTTTG
TACTTGTAACTTGCAAGTGACGGGTTTGAACCAAAAAAAAGCTTGCAAGTGACGGCTGAA
TCTTCACTGTCCCGTTGGATTTTGGTTGTGAAAATGCCTCTGCTTTTT*CTAGTGCTAAT
AAGATCTTGTTTATAT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RS1BZ07JQ 505 0 0
TCCAACTACTCCGACCACTCCGACAACGCCACACAAGGATAACGTGTGGAGGAGGGTCTT
TAATCCTGGAAGCAACCTCGCCACAAGAGCCATCGGCTCCAACATCTTTGATAAACCAAC
CCACCCAAATTCTCCATCCGTTTACGACTGGTTGTACAGCGG*GGAGTCAAGGAGTCAGC
ACCGTTAAAAGCGAGTCAGAGGGAGTGACACAAGTGGGTGATATAAATATGGTGTCTAGA
TCTACCTTCACGAGTTCACGTGTCTGTTTTGCTTGTGTACATAACTGTCTTCCACCTATG
CAATAAGTTGTCACGTTGTTAACTTTCCACTTTGGGCTGTGTTTTGCAAGTTTTCCTTTG
TGTGTTTTGTACTTGTAACTTGCAAGTGACGGGTTTGAACCAAAAAAAAGCTTGCAAGTG
ACGGCTGAATTTTCACTGTCCCGTTGGATTTTGGTTGTGAAAATGCCTTTGCTTTTT*CT
AGTGCTAATAAGATCTTGTTTATAT

QA 1 505 1 505
DS 

RD RS1F477JQ 372 0 0
G
CATCCGTTTACGACTGGTTGTACAGCGTACGAGTCAAGGAGTCAGCACCGTTAAAAGCGA
GTCAGAGGGAGTGACACAAGTGGGTGATATAAATATGGTGTCTAGATCTACCTTCACGAG
TTCACGTGTCTGTTTTGCTTGTGTACATAACTGTTTTCCACCTATGCAATAAGTTGTCAC
GTTGTTAACTTTCCACTTTGGGCTGTGTTTTGCAAGTTTTCCTTTGTGTGTTTTGTACTT
GTAACTTGCAAGTGACGGGTTTGAACCAAAAAAA*GCTTGCAAGTGACGGCTGAATTTTC
ACTGTCCCGTTGGATTTTGGTTGTGAAAATGCCTTTGCTTTTT*CTAGTGCTAATAAGAT
CTTGTTTATAT

QA 2 372 2 372
DS 

RD RS1F477TF 359 0 0
ACTGGTTGTACAGCGTACGAGTCAAGGAGTCAGCACCGTTAAAAGCGAGTCAGAGGGAGT
GACACAAGTGGGTGATATAAATATGGTGTCTAGATCTACCTTCACGAGTTCACGTGTCTG
TTTTGCTTGTGTACATAACTGTCTTCCACCTATGCAATAAGTTGTCACGTTGTTAACTTT
CCACTTTGGGCTGTGTTTTGCAAGTTTTCCTTTGTGTGTTTTGTACTTGTAACTTGCAAG
TGACGGGTTTGAACCAAAAAAA*GCTTGCAAGTGACGGCTGAATCTTCACTGTCCCGTTG
GATTTTGGTTGTGAAAATGCCTCTGCTTTTT*CTAGTGCTAATAAGATCTTGTTTATAT

QA 1 359 1 359
DS 



AS 2 10

CO CL254Contig1 739 8 22 U
TTTTTTTAGATAATATAAAGACCTGTTACAGGATTTATTGCATTTAGAAAAATATATTAC
ATAGATCTTACAAGACATCAAACTCGGTTCTGGATTTAGCAAGAGCTCTTGTTAGGACTA
AGCAGAACTGACTTTGTCAGTTTGGTCATCTTTAAACTCAATGTCAACAACTCTTGGACC
CTTGACTTTGTCTGTCGAAATCTTGTTGATGGTAATGGTGAGCACACCGTTCTCAAGCTT
GGCCTTGATAGTGTCCAAATCCACGTTGTCAGGCATTCTAAACTGTCTCCAGAACTTTCC
GTAAGACCTCTCAACTCTGTGCCAATGATCTCCTTCTTTCTCTTCCTCTCGTATCCTCTC
GCCGCTTATCTGCACAACTCGATTCTCCTCCACTTCTATCTTTATCTCATCCTTCTTCAT
CCCCGGCACATCGAGCCTGATCACATGCTCTTCTGGTGTTTCTTTCCAGTCCACTCTCGC
TGGAGACAGAGCCACGCTCTGATCCCTGTCAAGACCTAATGGGATTTGCTCCAATACTCT
GAAAGGATCCCGCAAGGACCCTTCAATTGTTCTGATGTTCCCGAGGAACAAAGTTATTAC
GAAAAGAGCTAACAAAGAAAGGGAGAACTGCTTCATCTTAAGCCTTTACTGCAGAACTTC
TGATATTGGAATGATATTGGATTTTTAAATTTGATTACTTTTAGTGATGAGCTTGTTTCT
TTCTCTTCTCTACGAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 
50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EW51JQ U 8
AF RS1DL20JQ U 44
AF RS1EW51TF C 1
AF RS1DL20TF C 5
AF RS1E122JQ U 12
AF RS1E122TF C 177
AF RS1DO10JQ U 15
AF RS1DO10TF C 248
BS 1 11 RS1EW51TF
BS 12 46 RS1EW51JQ
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BS 491 571 RS1DL20JQ
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BS 700 739 RS1E122JQ

RD RS1EW51JQ 486 0 0
AAAT
AATATAAAGACCTGTTACAGGATTTATTGCATTTAAAAAAATATATTACATAAATCTTAC
AAGACATCAAACTCGGTTCTGGATTTAGCAAGAGCTCTTGTTAGGACTAAGCAAAACTGA
CTTTGTCAGTTTGGTCATCTTTAAACTCAATGTCAACAACTCTTGGACCCTTGACTTTGT
CTGTTGAAATCTTGTTGATGGTAATGGTGAGCACACCGTTCTCAAGCTTGGCCTTGATAG
TGTCCAAATCCACGTTGTCAGGCATTCTAAACTGTCTCCAGAACTTTCCGTAAAACCTCT
CAACTCTGTGCCAATGATCTCCTTCTTTCTCTTCCTCTCGTATCCCCTCGCCGCTTATCT
GCACAACTCGATTCTCCTCCACTTCTATCTTTATCTCATCCTTCTTCATCCCCGGCACAT
CGAGCCTGATCACATGCTCTTCTGGTGTTTCTTTCCAGTCCACTCTCGCTGGAAACAGA
ACC

QA 5 483 5 483
DS 

RD RS1DL20JQ 559 0 0
TTAGAAAAATATATTACATAGATCTTACAAGACATCAAACTCGGTTCTGGATTTAGAAAG
AGCTCTTGTTAGGACTAAGCAAAACTGACTTTGTCAGTTTGGTCATCTTTAAACTCAATG
TCAACAACTCTTGGACCCTTGACTTTGTCTGTCGAAATCTTGTTGATGGTAATGGTGAGC
ACACCGTTCTCAAGCTTGGCCTTGATAGTGTCCAAATCCACGTTGTCAGGCATTCTGAAC
TGTCTCCAGAACTTTCCGTAAGACCTCTCAACTCTGTGCCAATGATCTCCTTCTTTCTCT
TCCTCTCGTATCCTCTCGCCGCTTATCTGCACAACTCGACTCTCCTCCACTTCTATCTTT
ATCTCATCCTTCTTCATCCCCGGCACATCGAGCCTGATCACATGCTCTTCTGGTGTTTCT
TTCCAGTCCACTCTCGCTGGAGACAGAGCCACGCTCTGATCCCTGTCAAGACCTAATGGG
ATTTGCTCCAATACTCTGAAAGGATCCCGCAAGGACCCTTCAATTGTTATGATGTTCCCG
AGGAACAAAGTTATTACGA

QA 1 559 1 559
DS 

RD RS1EW51TF 735 0 0
TTTTTTTAGATAATATAAAGAC*TGTTACAGGATTTATTGCATTTAGAAAAATATATTAC
ATAGATCTTACAAGACATCAAACTCGGTTCTGGATTTAGCAAGAGCTCTTGTTAGGACTA
AGCAGAACTGACTTTGTCAGTTTGGTCATCTTTAAACTCAATGTCAACAACTCTTGGACC
CTTGACTTTGTCTGTTGAAATCTTGTTGATGGTAATGGTGAGCACACCGTTCTCAAGCTT
GGCCTTGATAGTGTCCAAATCCACGTTGTCAGGCATTCTAAACTGTCTCCAGAACTTTCC
GTAAGACCTCTCAACTCTGTGCCAATGATCTCCTTCTTTCTCTTCCTCTCGTATCCTCTC
GCCGCTTATCTGCACAACTCGATTCTCCTCCACTTCTATCTTTATCTCATCCTTCTTCAT
CCCCGGCACATCGAGCCTGATCACATGCTCTTCTGGTGTTTCTTTCCAGTCCACTCTCGC
TGGAGACAGAGCCACGCTCTGATCCCTGTCAAGACCTAATGGGATTTGCTCCAATACTCT
GAAAGGATCCCGCAAGGACCCTTCAATTGTTCTGATGTTCCCGAGGAACAAAGTTATTAC
GAAAAGAGCTAACAAAGAAAGGGAGAACTGCTTCATCTTAAGCCTTTACTGCAGAAATTC
TGATATTGGAATGATATTGGATTTTTAAATTTGATTACTTTTAGTGA*GAGCTTGTTTCT
TTCTCTTCTCTAC
CC

QA 1 733 1 733
DS 

RD RS1DL20TF 731 0 0
TTTTTTT
AATATAAAGAC*TGTTACAGGATTTATTGCATTTAGAAAAATATATTACATAGATCTTAC
AAGACATCAAACTCGGTTCTGGATTTAGAAAGAGCTCTTGTTAGGACTAAGCAGAACTGA
CTTTGTCAGTTTGGTCATCTTTAAACTCAATGTCAACAACTCTTGGACCCTTGACTTTGT
CTGTCGAAATCTTGTTGATGGTAATGGTGAGCACACCGTTCTCAAGCTTGGCCTTGATAG
TGTCCAAATCCACGTTGTCAGGCATTCTGAACTGTCTCCAGAACTTTCCGTAAGACCTCT
CAACTCTGTGCCAATGATCTCCTTCTTTCTCTTCCTCTCGTATCCTCTCGCCGCTTATCT
GCACAACTCGACTCTCCTCCACTTCTATCTTTATCTCATCCTTCTTCATCCCCGGCACAT
CGAGCCTGATCACATGCTCTTCTGGTGTTTCTTTCCAGTCCACTCTCGCTGGAGACAGAG
CCACGCTCTGATCCCTGTCAAGACCTAATGGGATTTGCTCCAATACTCTGAAAGGATCCC
GCAAGGACCCTTCAATTGTTATGATGTTCCCGAGGAACAAAGTTATTACGAAAAGAGCTA
ACAAAGAAAGGGAGAACTGCTTCATCTTAAGCCTTTACTGCAGAACTTCTGATATTGGAA
TGATATTGGATTTTTAAATTTGATTACTTTTAGTGATGAGCTTGTTTCTTTCTCTTCTCT
AC
CC

QA 8 729 8 729
DS 

RD RS1E122JQ 728 0 0
AATATAAAGACCTGTTACAGGATTTATTGCATTTAGAAAAATATATTACATAGATCTTAC
AAGACATCAAACTCGGTTCTGGATTTAGCAAGAGCTCTTGTTAGGACTAAGCAGAACTGA
CTTTGTCAGTTTGGTCATCTTTAAACTCAATGTCAACAACTCTTGGACCCTTGACTTTGT
CTGTCGAAATCTTGTTGATGGTAATGGTGAGCACACCGTTCTCAAGCTTGGCCTTGATAG
TGTCCAAATCCACGTTGTCAGGCATTCTAAACTGTCTCCAGAACTTTCCGTAAGACCTCT
CAACTCTGTGCCAATGATCTCCTTCTTTCTCTTCCTCTCGTATCCTCTCGCCGCTTATCT
GCACAACTCGATTCTCCTCCACTTCTATCTTTATCTCATCCTTCTTCATCCCCGGCACAT
CGAGCCTGATCACATGCTCTTCTGGTGTTTCTTTCCAGTCCACTCTCGCTGGAGACAGAG
CCACGCTCTGATCCCTGTCAAGACCTAATGGGATTTGCTCCAATACTCTGAAAGGATCCC
GCAAGGACCCTTCAATTGTTCTGATGTTCCCGAGGAACAAAGTTATTACGAAAAGAGCTA
ACAAAGAAAGGGAGAACTGCTTCATCTTAAGCCTTTACTGCAGAACTTCTGATATTGGAA
TGATATTGGATTTTTAAATTTGATT***TTTAGTGATGAGCTTGTTTCTTTCTCTTCTCT
ACGAGTCC

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1E122TF 563 0 0
ACCCT
TTGACTTTGTCTGTCGAAATCTTGTTGATGGTAATGGTGAGCACACCGTTCTCAAGCTTG
GCCTTGATAGTGTCCAAATCCACGTTGTCAGGCATTCTAAACTGTCTCCAGAACTTTCCG
TAAGACCTCTCAACTCTGTGCCAATGATCTCCTTCTTTCTCTTCCTCTCGTATCCTCTCG
CCGCTTATCTGCACAACTCGATTCTCCTCCACTTCTATCTTTATCTCATCCTTCTTCATC
CCCGGCACATCGAGCCTGATCACATGCTCTTCTGGTGTTTCTTTCCAGTCCACTCTCGCT
GGAGACAGAGCCACGCTCTGATCCCTGTCAAGACCTAATGGGATTTGCTCCAATACTCTG
AAAGGATCCCGCAAGGACCCTTCAATTGTTCTGATGTTCCCGAGGAACAAAGTTATTACG
AAAAGAGCTAACAAAGAAAGGGAGAACTGCTTCATCTTAAGCCTTTACTGCAGAACTTCT
GATATTGGAATGATATTGGATTTTTAAATTTGATT***TTTAGTGATGAGCTTGTTTCTT
TCTCTTCTCTAC
GAGTCC

QA 6 557 6 557
DS 

RD RS1DO10JQ 719 0 0
ATAAAGACCTGTTACAGGATTTATTGCATTTAGAAAAATATATTACATAGATCTTACAAG
ACATCAAACTCGGTTCTGGATTTAGCAAGAGCTCTTGTTAGGACTAAGCAGAACTGACTT
TGTCAGTTTGGTCATCTTTAAACTCAATGTCAACAACTCTTGGACCCTTGACTTTGTCTG
TCGAAATCTTGTTGATGGTAATGGTGAGCACACCGTTCTCAAGCTTGGCCTTGATAGTGT
CCAAATCCACGTTGTCAGGCATTCTAAACTGTCTCCAGAACTTTCCGTAAGACCTCTCAA
CTCTGTGCCAATGATCTCCTTCTTTCTCTTCCTCTCGTATCCTCTCGCCGCTTATCTGCA
CAACTCGATTCTCCTCCACTTCTATCTTTATCTCATCCTTCTTCATCCCCGGCACATCGA
GCCTGATCACATGCTCTTCTGGTGTTTCTTTCCAGTCCACTCTCGCTGGAGACAGAGCCA
CGCTCTGATCCCTGTCAAGACCTAATGGGATTTGCTCCAATACTCTGAAAGGATCCCGCA
AGGACCCTTCAATTGTTCTGATGTTCCCGAGGAACAAAGTTATTACGAAAAGAGCTAACA
AAGAAGGGGAGAACTGCTTCATCTTAAGCCTTTACTGCAGAACTTCTGATATTGGAATGA
TATTGGATTTTTAAATTTGATTACTTTTAGTGATGAGCTTGTTTCTTTCTCTTCTCT
CC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1DO10TF 486 0 0
ATAGTGTCCAAATCCACGTTGTCAGGCATTCTAAACTGTCTCCAGAACTTTCAGTAAGAC
CTCTCAACTCTGTGCCAATGATCTCCTTCTTTCTCTTCCTCTCGTATCCTCTCGCCGCTT
ATCTGCACAACTCGATTCTCCTCCACTTCTATCTTTATCTCATCCTTCTTCATCCCCGGC
ACATCGAGCCTGATCACATGCTCTTCTGGTGTTTCTTTCCAGTCCACTCTCGCTGGAGAC
AGAGCCACGCTCTGATCCCTGTCAAGACCTAATGGGATTTGCTCCAATACTCTGAAAGGA
TCCCGCAAGGACCCTTCAATTGTTCTGATGTTCCCGAGGAACAAAGTTATTACGAAAAGA
GCTAACAAAGAAGGGGAGAACTGCTTCATCTTAAGCCTTTACTGCAGAACTTCTGATATT
GGAATGATATTGGATTTTTAAATTTGATTACTTTTAGTGATGAGCTTGTTTCTTTCTCTT
CTCT
CC

QA 1 484 1 484
DS 



CO CL254Contig2 691 2 8 U
GGACTCGTAGAGAAGAGAAAGAAACAAGCTCATCACTAAAAGTAATCAAAGTTAAAAATC
CAATATCATTCCAATATCAGAAGTTCTGCAGTAAAGGCTTAAGATGAAGCAGTTCTCCCT
TTCTTTGTTAGCTCTTTTCCTAATAACTTTGTTCCTCGGGAACATCAGAACAATTGAAGG
GTCCTTGCGGGATCCTTTCAGAGTATTGGAGCAAATCCCATTAGGTCTTGATAGGGATCA
GAGCGTGGCTCTGTCTCCAGCGAGAGTGGACTGGAAAGAAACACCAGAAGAGCATGTGAT
CAGGCTCGATGTGCCGGGGATAAAGAAGGAAGAGATAAAGATAGAAGTGGAGGAGAATCG
AGTTGTGCAGATAAGCGGCGAGAGGATACGAGAGGAAGAGAAAGAAGGAGATCATTGGCA
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TTTGGACACTATCAAGACTAAGCTTGAGAACGGTGTGCTCACCATTACTATAAACAAGAT
TTCCACAGACAAAGTCAAGGGTCCTAGAGTTGTTGACATTGAGTTTGAAGAGGACAAAAC
TGGCAAAGTCAGCTCTGCCTAGTCCTAACAAGAGCTCTTGCTAAATCCAGAACCGAGTTT
GATGTCTTGTAAGATCTATGTAATATATCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1GW65TF U 1
AF RS1G878TF U 5
BS 1 496 RS1GW65TF
BS 497 497 RS1G878TF
BS 498 595 RS1GW65TF
BS 596 596 RS1G878TF
BS 597 644 RS1GW65TF
BS 645 645 RS1G878TF
BS 646 688 RS1GW65TF
BS 689 691 RS1G878TF

RD RS1GW65TF 691 0 0
GGACTCGTAGAGAAGAGAAAGAAACAAGCTCATCACTAAAAGTAATCAAAGTTAAAAATC
CAATATCATTCCAATATCAGAAGTTCTGCAGTAAAGGCTTAAGATGAAGCAGTTCTCCCT
TTCTTTGTTAGCTCTTTTCCTAATAACTTTGTTCCTCGGGAACATCAGAACAATTGAAGG
GTCCTTGCGGGATCCTTTCAGAGTATTGGAGCAAATCCCATTAGGTCTTGATAGGGATCA
GAGCGTGGCTCTGTCTCCAGCGAGAGTGGACTGGAAAGAAACACCAGAAGAGCATGTGAT
CAGGCTCGATGTGCCGGGGATAAAGAAGGAAGAGATAAAGATAGAAGTGGAGGAGAATCG
AGTTGTGCAGATAAGCGGCGAGAGGATACGAGAGGAAGAGAAAGAAGGAGATCATTGGCA
CAGAGTTGAGAGATCTTACGGAAAGTTCTGGAGACAGTTTAGAATGCCAGATAACGTGGA
TTTGGACACTATCAAGGCTAAGCTTGAGAACGGTGTGCTCACCATTACTATAAACAAGAT
TTCCACAGACAAAGTCAAGGGTCCTAGAGTTGTTGACATTGAGTTTGAAGAGGACCAAAC
TGGCAAAGTCAGCTCTGCCTAGTCCTAACAAGAGCTCTTGCTAA*TCCAGAACCGAGTTT
GATGTCTTGTAAGATCTATGTAATATAT
CTT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RS1G878TF 687 0 0
GG
GTAGAGAAGAGAAAGAAACAAGCTCATCACTAAAAGTAATCAAAGTTAAAAATCCAATAT
CATTCCAATATCAGAAGTTCTGCAGTAAAGGCTTAAGATGAAGCAGTTCTCCCTTTCTTT
GTTAGCTCTTTTCCTAATAACTTTGTTCCT*GGGAACATCAGAACAATTGAAGGGTCCTT
GCGGGATCCTTTCAGAGTATTGGAGCAAATCCCATTAGGTCTTGATAGGGATCAGAGCGT
GGCTCTGTCTCCAGCGAGAGTGGACTGGAAAGAAACACCAGAAGAGCATGTGATCAGGCT
CGATGTGCCGGGGATAAAGAAGGAAGAGATAAAGGTAGAAGTGGAGGAGAATCGAGTTGT
GCAGATAAGCGGCGAGAGGATACGAGAGGAAGAGAAAGAAGGAGATCATTGGCACAGAGT
TTAGAGATCTTACGGAAAGTTCTGGAGACAGTTTAGAATGCCAGATAACGTGGATTTGGA
CACTATCAAGACTAAGCTTGAGAACGGTGTGCTCACCATTACTATAAACAAGATTTCCAC
AGACAAAGTCAAGGGTCCTAGAGTTGTTGACATTGAGTTTGAAGAGGACAAAACTGGCAA
AGTCAGCTCTGCTTAGTCCTAACAAGAGCTCTTGCTAAATCCAGAACCGAGTTTGATGTC
TTGTAAGATCTATGTAATATATCTT

QA 3 687 3 687
DS 



AS 2 9

CO CL255Contig1 759 5 16 U
GGAGCCCCTCTCTCCATCTCTTGGTCTCTCACTTGAATCTCTCCTCACAAACACGTAGTA
CGATTCCTTTTGCTCTCTCCTCTCTCTCTCTCTACAACCCCTACGATCTTCTTCGTCAAG
ATTCGAGTATGAAGGGAGGTAAATCAAAGACTGAAACCAGGAGCTCCAAGCTCTCTGTGG
CCAAGAAGCCCGCTAAAGCAGCAGGTCGTAGCAAAGCGGTGGCTAAGGATCCTAACAAAC
CAAAGAGGCCTGCTAGTGCCTTCTTCGTGTTCATGGAGGACTTCCGTCAGACTTACAAGA
AAGATCACCCCAACAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGTAAAGCTGGTGGAGAAAAGTGGA
AATCCTTGTCTGACTCTGAGAAGGCTCCCTTTGTAGCTAAGGCTGATAAGCGCAAGGTTG
AGTATGAGAAGACCATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGAAGGTCCAAAGGAGGACG
AGGAGGAATCTGACAAGTCCGTGTCTGAGGTGAATGATGAGGATGATGCCGATGATGGTA
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CAAGGATCTCTGGGATGTTTTTTTTTTCTTTCTTTCTTATTTACTGATGTTTCAAGTTAG
TAAGCTTGCCACTATCTCTTACTGATTCTGATTCTACGTGTAATGGAAAAAGTGTGTAGA
CTGTTTGAATGAGAGATTTGCAGCTCTATGTAACAATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 5 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 10 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AJ48TF U 1
AF RS1AJ48JQ C 225
AF RS1CW05TF U 45
AF RS1BF26TF U 45
AF RS1BF26JQ C 71
BS 1 219 RS1AJ48TF
BS 220 220 RS1BF26TF
BS 221 317 RS1AJ48TF
BS 318 318 RS1BF26TF
BS 319 438 RS1AJ48TF
BS 439 439 RS1BF26TF
BS 440 657 RS1AJ48TF
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BS 681 706 RS1AJ48TF
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RD RS1AJ48TF 706 0 0
GGAGCCCCTCTCTCCATCTCTTGGTCTCTCACTTGAATCTCTCCTCACAAACACGTAGTA
CGATTCCTTTTGCTCTCTCCTCTCTCTCTCTCTACAACCCCTACGATCTTCTTCGTCAAG
ATTCGAGTATGAAGGGAGGTAAATCAAAGACTGAAACCAGGAGCTCCAAGCTCTCTGTGG
CCAAGAAGCCCGCTAAAGCAGCAGGTCGTAGCAAAGCGGCGGCTAAGGATCCTAACAAAC
CAAAGAGGCCTGCTAGTGCCTTCTTCGTGTTCATGGAGGACTTCCGTCAGACTTACAAGA
AAGATCACCCCAACAACTAATCTGTTGCTGCTGTTGGTAAAGCTGGTGGAGAAAAGTGGA
AATCCTTGTCTGACTCTGAGAAGGCTCCCTTTGTAGCTAAGGCTGATAAGCGCAAGGTTG
AGTATGAGAAGACCATGAGAGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGAAGGTCCAAAGGAGGACG
AGGAGGAATCTGACAAGTCCGTGTCTGAGGTGAATGATGAGGATGATGCCGATGATGGTA
GTGATGAGGAGGAAGACGATGACTAAAGAAGTTGAAGCTGGTAGCATAATAGGGGCGCTA
CAAGGATCTCTGGGATGTTTTTTTTTTCTTTCTTTCTTATTTACTGATGTTTCAAGTCAG
TAAGCTTGCCACTATCTCTCACTGATTCTGATTCTACGTGTAATGG

QA 1 706 1 706
DS 

RD RS1AJ48JQ 456 0 0
AAGGATCCTAACAAACCAAAGAGGCCTGCTAGTGCCTTTTTTGTGTTCATGGAGGACTTC
CGTCAGACTTACAAGAAAGATCACCCCAACAAATAATTTGTTGCTGCTGTTGGTAAAGCT
GGTGGAGAAAAGTGGAAATCCTTGTTTGACTTTGAGAAGGCTCCCTTTGTAGCTAAGGCT
GATAAGCGCAAGGTTGAGTATGAGAAGACCATGAGAGCCTACAACAAGAAGGTGGAGGAA
GGTCCAAAGGAGGACGAGGAGGAATTTGACAAGTCCGTGTTTGAGGTGAATGATGAGGAT
GATGCCGATGATGGTAGTGATGAGGAGGAAGACGATGACTAAAGAAGTTGAAGCTGGTAG
CATAATAGGGGCGCTACAAGGATTTTTGGGATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTTAC
TGATGTTTCAAGTCAGTAAGCTTGCCACTAT
TTTTC

QA 1 451 1 451
DS 

RD RS1CW05TF 667 0 0
GGACAAACACGTA
GTACGATTCCTTTTGCTCTCTCCTCTCTCTCTCTCTACAACCCCTACGATCTTCTTCGTC
AAGATTCGAGTATGAAGGGAGGTAAATCAAAGACTGAAACCAGGAGCTCCAAGCTCTCTG
TGGCCAAGAAGCCCGCTAAAGCAGCAGGTCGTAGCAAAGCGGCGGCTAAGGATCCTAACA
AACCAAAGAGGCCTGCTAGTGCCTTCTTCGTGTTCATGGAGGACTTCCGTCAGACTTACA
AGAAAGATCACCCCAACAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGTAAAGCTGGTGGAGAAAAGT
GGAAATCCTTGTCTGACTCTGAGAAGGCTCCCTTTGTAGCTAAGGCTGATAAGCGCAAGG
TTGAGTATGAGAAGACCATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGAAGGTCCAAAGGAGG
ACGAGGAGGAATCTGACAAGTCCGTGTCTGAGGTGAATGATGAGGATGATGCTGATGATG
GTAGTGATGAGGAGGAAGACGATGACTAAAGAAGTTGAAGCTGGTAGTATAATAGGGGCG
CTACAAGGATCTCTGGGATGTTTTTTTTTTCTTTCTTTCTTATTTACTGATGTTTCAAGT
TAGTAAGCTTGCCACTATCTCTCACTGATTCTGATTCTACGTGTAATGGAAAAA

QA 14 667 14 667
DS 

RD RS1BF26TF 714 0 0
GGACAAACACGTA
GTACGATTCCTTTTGCTCTCTCCTCTCTCTCTCTCTACAACCCCTACGATCTTCTTCGTC
AAGATTCGAGTATGAAGGGAGGTAAATCAAAGACTGAAACCAGGAGCTCCAAGCTCTCTG
TGGCCAAGAAGCCCGCTAAAGCAGCAGGTCGTAGCAAAGCGGTGGCTAAGGATCCTAACA
AACCAAAGAGGCCTGCTAGTGCCTTCTTCGTGTTCATGGAGGACTTCCGTCAGACTTACA
AGAAAGATCACCCCAACAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGTAAAGCTGGTGGAGAAAAGT
GGAAATCCTTGTCTGACTCTGAGAAGGCTCCCTTTGTAGCTAAGGCTGATAAGCGCAAGG
TTGAGTATGAGAAGACCATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGAAGGTCCAAAGGAGG
ACGAGGAGGAATCTGACAAGTCCGTGTCTGAGGTGAATGATGAGGATGATGCCGATGATG
GTAGTGATGAGGAGGAAGACGATGACTAAAGAAGTTGAAGCTGGTAGCATAATAGGGGCG
CTACAAGGATCTCTGGGATGTTTTTTTTTTCTTTCTTTCTTATTTACTGATGTTTCAAGT
TAGTAAGCTTGCCACTATCTCTTACTGATTCTGATTCTACGTGTAATGGAAAAG*TGTGT
AGACTGTTTGAATGAGAGATTTGCAGCTCTATGTA
CATTTA

QA 14 708 14 708
DS 

RD RS1BF26JQ 689 0 0
TGCTCTCTCCTCTCTCTCTCTCTACAACCCCTACGATCTTCTTCGTCAAGATTCGAGTAT
GAAGGGAGGTAAATCAAAGACTGAAACCAGGAGCTCCAAGCTCTCTGTGGCCAAGAAGCC
CGCTAAAGCAGCAGGTCGTAGCAAAGCGGTGGCTAAGGATCCTAACAAACCAAAGAGGCC
TGCTAGTGCCTTCTTCGTGTTCATGGAGGACTTCCGTCAGACTTACAAGAAAGATCACCC
CAACAACAAATCTGTTGCTGCTGTTGGTAAAGCTGGTGGAGAAAAGTGGAAATCCTTGTC
TGACTCTGAGAAGGCTCCCTTTGTAGCTAAGGCTGATAAGCGCAAGGTTGAGTATGAGAA
GACCATGAAAGCCTACAACAAGAAGCTGGAGGAAGGTCCAAAGGAGGACGAGGAGGAATC
TGACAAGTCCGTGTCTGAGGTGAATGATGAGGATGATGCCGATGATGGTAGTGATGAGGA
GGAAGACGATGACTAAAGAAGTTGAAGCTGGTAGCATAATAGGGGCGCTACAAGGATCTC
TGGGATGTTTTTTTTTTCTTTCTTTCTTATTTACTGATGTTTCAAGTTAGTAAGCTTGCC
ACTATCTCTTACTGATTCTGATTTTACGTGTAATGGAAAAAGTGTGTAGACTGTTTGAAT
GAGAGATTTGCAGCTCTATGTAACAATTT

QA 1 689 1 689
DS 



CO CL255Contig2 750 4 1 U
GAAAGAGATGATAACATATTTTAGAACGAAAAGCTAAATTGTTACATAGAGCTGCAAATC
TCTCATTCAAACAGTCTACACACTTTTTCCATTACACGTAGAATCAGAATCAGTGAGAGA
TAGTGGCAAGCTTACTAACTTGAAACATCAGTAAATAAGAAAGAAAAAAAAA*GAAAAAG
ACATCCCAGAGATCCTTGTAGCGCCCCTATTATGCTACCAGCCTCAACTTCTTTAGTCAT
CGTCTTCCTCCTCACCACTACCATCATCGGCATCATCCTCATCATTCACCTCGGACACGG
ACTTGTCAGATTCCTCCTCGTCCTCCTTTGGACCTTCCTCCAGCTTCTTGTTGTAGGCTT
TCATGGTCTTCTCATACTCAACCTTGCGCTTATCAGCCTTAGCTACAAAGGGAGCTTTCT
CAGAGTCAGACAAGGATTTCCACTTTTCTCCACCAGCTTTACCAACAGCAGCAACAGATT
TGTTGTTGGGGTGGTCCTTCTTGTAAGTCTGACGGAAGTCCTCCATGAAAACGAAGAAGG
CACTAGCAGGCCTCTTTGGTTTGTTAGGATCCTTAGCCGCCGCTTTGCTACGACCTGCTG
CTTTAGCTGGCTTCTTCGCCACAGAGAGCTTGGAGCTCCTGGTTTCAGTCTTTGATTTAC
CTCCCTTCATACTCGAATCTTGACGAAGAAGATCGTAGGGGTTGTAGAGAGAGAGAGAGG
AGAGAGCAAAAGGAATCGTACGTGTTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CJ16JQ U 151
AF RS1CM77JQ U 115
AF RS1AN16TF C 195
AF RS1AN16JQ U 1
BS 1 750 RS1AN16JQ

RD RS1CJ16JQ 220 0 0
TAAATAAGA
AAGAAAAAAAAAA*GAAAAAGACATCCCAGAGATCCTTGTAGCGCCCCTATTATGCTACC
AGCTTCAACTTCTTTAGTCATCGTCTTCCTCCTCATCACTACCATCATCGGCATCATCCT
CATCATTCACCTCGGACACGGACTTGTCAGATTCCTCCTCGTCCTCCTTTGGACCTTCCT
CCAGCTTCTTGTTGTAGGCTTTCATGGTCTT

QA 10 220 10 220
DS 

RD RS1CM77JQ 256 0 0
GAGAGATAGTGGCAAGCTTACTAACTTGAAACATCAGTAAATAAGAAAGAAAAAAAAAAG
AAAAAGACATCCCAGAGATCCTTGTAGCGCCCCTATTATGCTACCAGCTTCAACTTCTTT
AGTCATCGTCTTCCTCCTCATCACTACCATCATCGGCATCATCCTCATCATTCACCTCGG
ACACGGACTTGTCAGATTCCTCCTCGTCCTCCTTTGGACCTTCCTCCAGCTTCTTGTTGT
AGGCTTTCATGGTCTT

QA 1 256 1 256
DS 

RD RS1AN16TF 507 0 0
CTTGTAGCGCCCCTATTATGCTACCAGCCTCAACTTCTTTAGTCATCGTCTTCCTCCTCA
CCACTACCATCATCGGCATCATCCTCATCATTCACCTCGGACACGGACTTGTCAGATTCC
TCCTCGTCCTCCTTTGGACCTTCCTCCAGCTTCTTGTTGTAGGCTTTCATGGTCTTCTCA
TACTCAACCTTGCGCTTATCAGCCTTAGCTACAAAGGGAGCTTTCTCAGAGTCAGACAAG
GATTTCCACTTTTCTCCACCAGCTTTACCAACAGCAGCAACAGATTTGTTGTTGGGGTGG
TCCTTCTTGTAAGTCTGACGGAAGTCCTCCATGAAAACGAAGAAGGCACTAGCAGGCCTC
TTTGGTTTGTTAGGATCCTTAGCCGCCGCTTTGCTACGACCTGCTGCTTTAGCTGGCTTC
TTCGCCACAGAGAGCTTGGAGCTCCTGGTTTCAGTCTTTGATTTACCTCCCTTCATACTC
GAATCTTGACGAAGAAGATCGTAGGGG

QA 1 507 1 507
DS 

RD RS1AN16JQ 750 0 0
GAAAGAGATGATAACATATTTTAGAACGAAAAGCTAAATTGTTACATAGAGCTGCAAATC
TCTCATTCAAACAGTCTACACACTTTTTCCATTACACGTAGAATCAGAATCAGTGAGAGA
TAGTGGCAAGCTTACTAACTTGAAACATCAGTAAATAAGAAAGAAAAAAAAA*GAAAAAG
ACATCCCAGAGATCCTTGTAGCGCCCCTATTATGCTACCAGCCTCAACTTCTTTAGTCAT
CGTCTTCCTCCTCACCACTACCATCATCGGCATCATCCTCATCATTCACCTCGGACACGG
ACTTGTCAGATTCCTCCTCGTCCTCCTTTGGACCTTCCTCCAGCTTCTTGTTGTAGGCTT
TCATGGTCTTCTCATACTCAACCTTGCGCTTATCAGCCTTAGCTACAAAGGGAGCTTTCT
CAGAGTCAGACAAGGATTTCCACTTTTCTCCACCAGCTTTACCAACAGCAGCAACAGATT
TGTTGTTGGGGTGGTCCTTCTTGTAAGTCTGACGGAAGTCCTCCATGAAAACGAAGAAGG
CACTAGCAGGCCTCTTTGGTTTGTTAGGATCCTTAGCCGCCGCTTTGCTACGACCTGCTG
CTTTAGCTGGCTTCTTCGCCACAGAGAGCTTGGAGCTCCTGGTTTCAGTCTTTGATTTAC
CTCCCTTCATACTCGAATCTTGACGAAGAAGATCGTAGGGGTTGTAGAGAGAGAGAGAGG
AGAGAGCAAAAGGAATCGTACGTGTTTGTC

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 11

CO CL256Contig1 1231 11 25 U
GCCTCGAAACCCAAAAGGCCAAAAGTATATGGTGAGACGTTTTTACAAAGTTACTAAAGA
CAAATAATCACAAACCATAATAAAACAAAGGTGGCTCCGAAGGTAGAATTTTTATTTTTA
AAAGTTTTCACCATCGCACTTGAGTAGCAGAAATATTTACAAAGCCAATGCCTTCAAAAC
TACAAAGGCCT**CTTTTTTTTTAGGTCGTTAGGAAACCACTGAAAAGATAAAAGTAGCT
GCGCCACCATTTCTACCACGACTCAGTTTTTAACACAAACCCTTCCAGAAACTTACAAAC
GAGACACATATTGTTCACATA***AACCCAACTAAAAACCAGCCCAACTGTATGTTTAGG
CTGCTTCTGCAAATCCAACCTGCGCTTTCCCAAAGTCAAACACGGTGTGGTATTTGCCCA
TGAACACATCTCCCAAGATCCAGAGAGGTCCACGGGGTGGAGCAACGTCGAGTGCAATAA
AGCCACTGATGCACTGTGCTGCAGCGCCCTCACCAACCTTCAGAACATACTCCTCTGGAG
CAAGATCAAAGACTTTGCCTCCGATGGTGAGCGAAACAGTTGGCATGGTCGAGAGTTGTG
CACAGTCCACTGCAGACTCTCCCATTGGGCTGGGAATACGCTCGCATAGCTCGTTGACGT
ATTCCAATATGCGTTCCTGGGTCATGTTCTGCCTCAACTGGCTCTGAATCCAAACAACTG
CCATCTCGCATGCAGAACACGCGGCATCTCCTACACCATTCGACAATTTGGCGTTTTCCT
TGTCCACCACCGACTCAATGCCCATACTGACACCACGTTTACCATCGAAAGTGCACAGAC
CAATCTGCGAGCAGATTTTCTTCGGCTGGGTTTCAGACAAAAGCAGATCCAAGATGGTCT
GCCCGTACTGATCTACGACAGTCTTGCACTGCTGGCTAGCAATTCCAGCTGCTCCAATAG
CATGGTTTATCATGGTGATTATAGTTGTTGGACCCGCAAGCAAAGATGTTCCAGAATCTG
CTATAGCAGAGCAGCCACTTTCGCAGTATCCAGTGGGTGCACCGTCAATGAGAACATCAC
CCATATCAAACTGCCAGTAACCCTTTTGTGTCACAGGGACATAAGTATGTTGTCCCTTGA
AATGTTTTGGATCAACACCTCCAAACACAAGTTCACCACCTTCTTCATCCGCAGCGTTAC
GGTTAAGCCAAAATGAAAACACTGGCTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 5 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 15 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 40 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 50 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C809JQ U 1
AF RS1C809TF C 51
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AF RS1GJ28JQ U 93
AF RS1GJ28TF C 292
AF RS1FY61TF C 563
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CAAATAATCACAAACCATAATAAAACAAAGGTGGCTCCGAAGGTAGAATTTTTATTTT*A
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TACAAAGGCCT**TTTTTTTTTTATGTCGTTAGGAAACCACTGAAAAGATAAAAGTAGCT
GCGCCACCATTTCTACCACGACTCAGTTTTTAACACAAACCCTTCCAGAAACTTACAAAC
GAGACACATATTGTCCACATA***AACCCAACTAAAAACCAGCCCGACTGTATGTTTAGG
CTGCTTCTGCAAATCCAACCTGCGCTTTCCCAAAGTCAAACACGGTGTGGTATTTGCCCA
TGAACACATCTCCCAAGATCCAAAAAGGTCCACGGGGTGGAGCAACGTCGAGTGCAATAA
AGCCACTGATGCACTGTGCTGCAGCGCCCTCACCAACCTTCAGAACATACTCCTCTGGAG
CAAGATCAAAGACTTTGCCTCCGATGGTGAGCGAAACAGTTGGCATGGTCGAGAGTTGTG
CACAGTCCACTGCAGACTCTCCCATTGGGCTGGGAATACGCTCGCATAGCTCGTTGACGT
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CCATCTCGCATGCAGAA

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DS 

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TTTATTTT*AAAAGTTTTCACCATCGCACTTGAGTAGCAGAAATATTTACAAAGCCAATG
CCTTCAAAACTACAAAGGCCT**TTTTTTTTTTATGTCGTTAGGAAACCACTGAAAAGAT
AAAAGTAGCTGCGCCACCATTTCTACCACGACTCAGTTTTTAACACAAACCCTTCCAGAA
ACTTACAAACGAGACACATATTGTCCACATA***AACCCAACTAAAAACCAGCCCGACTG
TATGTTTAGGCTGCTTCTGCAAATCCAACCTGCGCTTTCCCAAAGTCAAACACGGTGTGG
TATTTGCCCATGAACACATCTCCCAAGATCCAGAGAGGTCCACGGGGTGGAGCAACGTCG
AGTGCAATAAAGCCACTGATGCACTGTGCTGCAGCGCCCTCACCAACCTTCAGAACATAC
TCCTCTGGAGCAAGATCAAAGACTTTGCCTCCGATGGTGAGCGAAACAGTTGGCATGGTC
GAGAGTTGTGCACAGTCCACTGCAGACTCTCCCATTGGGCTGGGAATACGCTCGCATAGC
TCGTTGACGTATTCCAATATGCGTTCCTGGGTCATGTTCTGCCTCAACTGGCTCTGAATC
CAAACAACTGCCATCTCGCATGCAGAACACGCGGCATCTCCTACACCATTCGACAATTTG
GCGTTTTCCTTGTCCACCACCGACT
TC

QA 1 745 1 745
DS 

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ATATTTACAAAGCCAATGCCTTCAAAACTACAAAGGCCTTCTTTTTTTTTTATGTCGTTA
GGAAACCACTGAAAAGATAAAAGTAGCTGCGCCACCATTTCTACCACGACTCAGTTTTTA
ACACAAACCCTTCCAGAAACTTACAAACGAGACACATATTGTTCACATAATAAACCCAAC
TAAAAACCAGCCCAACTGTATGTTTAGGCTGCTTCTGCAAATCCAACCTGCGCTTTCCCA
AAGTCAAACACGGTGTGGTATTTGCCCATGAACACATCTCCCAAGATCCAGAAAGGTCCA
CGGGGTGGAGCAACGTCGAGTGCAATAAAGCCACTGATGCACTGTGCTGCAGCGCCCTCA
CCAACCTTCAGAACATACTCCTCTGGAGCAAGATCAAAGACTTTGCCTCCGATGGTGAGC
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ACACCATTCGACAATTTGGCGTTTTCCTTGTCCACCACCGACTCAATGCCCATACTGACA
CCACGTTTACCATCGAAAGTGCACAGA

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CGTCGAGTGCAATAAAGCCACTGATGCACTGTGCTGCAGCGCCCTCACCAACCTTCAGAA
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TGGTCGAGAGTTGTGCACAGTCCACTGCAGACTCTCCCATTGGGCTGGGAATACGCTCGC
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ATT*GGCGTTTTCCTTGTCCACCACCGACTCAATGCC

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DS 

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AACTGTATGTTTAGGCTGCTTCTGCAAATCCAACCTGCGCCTTCCCAAAGTCAAACACGG
TGTGGTATTTGCCCATGAACACATCTCCCAAGATCCAGAGAGGTCCACGGGGTGGAGCAA
CGTCGAGTGCAATAAAGCCACTGATGCACTGTGCTGCAGCGCCCTCACCAACCTTCAGAA
CATACTCCTCTGGAGCAAGATCAAAGACTTTGCCTCCGATGGTGAGCGAAACAGTTGGCA
TGGTCGAGAGTTGTGCACAGTCCACTGCAGACTCTCCCATTGGGCTGGGAATACGCTCGC
ATAGCTCGTTGACGTATTCCAATATGCGTTCCTGGGTCATGTTCTGCCTCAACTGGCTCT
GAATCCAAACAACTGCCATCTCGCATGCAGAACACGCGGCATCTCCTACACCATTCGACA
ATT*GGCGTTTTCCTTGTCCACCACCGACTCAATGCC

QA 1 577 1 577
DS 

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AG
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GAAACTTACAAACGAGACACATATTGTTCACATAATAAACCCAACTAAAAACCAGCCCAA
CTGTATGTTTAGGCTGCTTCTGCAAATCCAACCTGCGCTTTCCCAAAGTCAAACACGGTG
TGGTATTTGCCCATGAACACATCTCCCAAGATCCAAAAAGGTCCACGGGGTGGAGCAACG
TCGAGTGCAATAAAGCCACTGATGCACTGTGCTGCAACGCCCTCACCAACCTTCAAAACA
TACTCCTCTGGAGCAAGATCAAAGACTTTGCCTCCGATGGTGAGCGAAACAGTTGGCATG
GTCGAAAGTTGTGCACAGTCCACTGCAGACTCTCCCATTGGGCTGGGAATACGCTCGCAT
AGCTCGTTGACGTATTCCAATATGCGTTCCTGGGTCATGTTCTGCCTCAACTGGCTCTGA
ATCCAAACAACTGCCATCTCGCATGCAGAACACGCGGCATCTCCTACACCATTCGACAAT
TTGGCGTTTTCCTTGTCCACCACCGACTCAATGC

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DS 

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AGCTGCGCCACCATTTCTACCACGACTCAGTTTTTAACACAAACCCTTCCAGAAACTTAC
AAACGAGACACATATTGTTCACATA***AACCCAACTAAAAACCAGCCCAACTGTATGTT
TAGGCTGCTTCTGCAAATCCAACCTGCGCTTTCCCAAAGTCAAACACGGTGTGGTATTTG
CCCATGAACACATCTCCCAAGATCCAGAGAGGTCCACGGGGTGGAGCAACGTCGAGTGCA
ATAAAGCCACTGATGCACTGTGCTGCAGCGCCCTCACCGACCTTCAGAACATACTCCTCT
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TGTGCACAGTCCACTGCAGACTCTCCCATTGGGCTGGGAATACGCTCGCATAGCTCGTTG
ACGTATTCCAATATGCGTTCCTGGGTCATGTTCTGCCTCAACTGGCTCTGAATCCAAACA
ACTGCCATCACGCATGCAGAACACGCGGCATCTCCTACACCATTCGACAATTTGGCGTTT
TCCTTGTCCACCACCGACTCAATGCC

QA 1 686 1 686
DS 

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AAAAGTTTTCACCATCGCACTTGAGTAGCAGAAATATTTACATAGCCAATGCCTTCAAAA
CTACAAAGGCCTT*CTTTTTTTTTAGGTCGTTAGGAAACCACTGAAAAGATAAAAGTAGC
TGCGCCACCATTTCTACCACGACTCAGTTTTTAACACAAACCCTTCCAGAAACTTACAAA
CGAGACACATATTGTTCACATA***AACCCAACTAAAAACCAGCCCAACTGTATGTTTAG
GCTGCTTCTGCAAATCCAACCTGCGCTTTCCCAAAGTCAAACACGGTGTGGTATTTGCCC
ATGAACACATCTCCCAAGATCCAGAAAGGTCCACGGGGTGGAGCAACGTCGAGTGCAATA
AAGCCACTGATGCACTGTGCTGCAGCGCCCTCACCGACCTTCAAAACATACTCCTCTGGA
GCAAGATCAAAGACTTTGCCTCCGATGGTGAGCGAAACAGTTGGCATGGTCGAGAGTTGT
GCACAGTCCACTGCAGACTCTCCCATTGGGCTGGGAATACGCTCGCATAGCTCGTTGACG
TATTCCAATATGCGTTCCTGGGTCATGTTCTGCCTCAACTGGCTCTGAATCCAAACAACT
GCCATCACGCATGCAGAACACGCGGCATCTCCTACACCATTCGACAATTTGGCGTTTTCC
TTGTCCACCACCGACTCAATGCC

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DS 

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GGAAACCACTGAAAAGATAAAAGTAGCTGCGCCACCATTTCTACCACGACTCAGTTTTTA
ACACAAACCCTTCCAGAAACTTACAAACGAGACACATATTGTTCACATA***AACCCAAC
TAAAAACCAGCCCAACTGTATGTTTAGGCTGCTTCTGCAAATCCAACCTGCGCTTTCCCA
AAGCCAAACACGGTGTGGTATTTGCCCATGAACACATCTCCCAAGATCCAGAGAGGTCCA
CGGGGTGGAGCAACGTCGAGTGCAATAAAGCCACTGATGCACTGTGCTGCAGCGCCCTCA
CCAACCTTCAGAACATACTCCTCTGGAGCAAGATCAAAGACTTTGCCTCCGATGGTGAGC
GAAGCAGTTGGCATGGTCGAAAGTTGTGCACAGTCCACTGCGGACTCTCCCATTGGGCTG
GGAATACGCTCGCATAGCTCGTTGACGTATTCCAATACGCGTTCCTGGGTCATGTTCTGC
CTCAACTGGCTCTGAATCCAGACAACTGCCATCTCGCATGCAGAACACGCGGCATCTCCT
ACACCATTCGACAATTTGGCGTTTTCCTTGTCCACCACCGACTCAATGCCCATACTGACA
CCACGTTTACCATCGAAAGTGCACAGACCAATCTGCGAGCAGATTTTCTTCG*CTGGGTT
TCAGACAAA*GCAGATCCA*GATGGTCTGCCCGTACTGATCTACGACAGTCTTGCACTGC
TGGCT

QA 1 845 1 845
DS 

RD RS1GJ28TF 688 0 0
CTTACAAACGAGACACATATTGTTCACATA***AACCCAACTAAAAACCAGCCCAACTGT
ATGTTTAGGCTGCTTCTGCAAATCCAAC*TGCGCTTTCCCAAAGCCAAACACGGTGTGGT
ATTTGCCCATGAACACATCTCCCAAGATCCAGAGAGGTCCACGGGGTGGAGCAACGTCGA
GTGCAATAAAGCCACTGATGCACTGTGCTGCAGCGCCCTCACCAACCTTCAGAACATACT
CCTCTGGAGCAAGATCAAAGACTTTGCCTCCGATGGTGAGCGAAGCAGTTGGCATGGTCG
AGAGTTGTGCACAGTCCACTGCGGACTCTCCCATTGGGCTGGGAATACGCTCGCATAGCT
CGTTGACGTATTCCAATACGCGTTCCTGGGTCATGTTCTGCCTCAACTGGCTCTGAATCC
AGACAACTGCCATCTCGCATGCAGAACACGCGGCATCTCCTACACCATTCGACAATTTGG
CGTTTTCCTTGTCCACCACCGACTCAATGCCCATACTGACACCACGTTTACCATCGAAAG
TGCACAGACCAATCTGCGAGCAGATTTTCTTCGGCTGGGTTTCAGACAAAAGCAGATCCA
AGATGGTCTGCCCGTACTGATCTACGACAGTCTTGCACTGCTGGCTAGCAATTCCAGCTG
CTCCAATAGCATGGTTTATCATGGTGA
C

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1FY61TF 669 0 0
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CATTGGGCTGGGAATACGCTCGCATAGCTCGTTGACGTATTCCAATATGCGTTCCTGGGT
CATGTTCTGCCTCAACTGGCTCTGAATCCAAACAACTGCCATCTCGCATGCAGAACACGC
GGCATCTCCTACACCATTCGACAATTTGGCGTTTTCCTTGTCCACCACCGACTCAATGCC
CATACTGACACCACGTTTACCATCGAAAGTGCACAGACCAATCTGCGAACAGATTTTCTT
CGGCTGGGTTTCAGACAAAAGCAGATCCAAGATGGTCTGCCCGTACTAATCTACGACAGT
CTTGCACTGCTGGCTAGCAATTCTGGCTGCTCCAATAGCATGGTTTATCATGGTGATTAT
AGTTGTTGGACCCGCAAGCAAAGATGTTCCAGAATCTGCTATAGCAGAGCAGCCACTTTC
GCAGTATCCAGTGGGTGCACCGTCAATGAGAACATCACCCATATCAAACTGCCAGTAACC
CTTTTGTGTCACAGGGACATAAGTATGTTGTCCCTTGAAATGTTTTGGATCAACACCTCC
AAACACAAGTTCACCACCTTCTTCATCCGCAGCGTTACGGTTAAGCCAAAATGAAAACAC
TGGCTCCCC

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 7

CO CL257Contig1 951 7 28 U
GGGAAACACTCCACTCAACTCTCGTCACCTGTCTCTTACCTCTACTCTTGGGCTCTCAAC
CTTTCCCTCTTTGATCCGTTTCCTTCTCCAACCTCAGGTAAAAAAAGATGCAAGCTGTGA
TTCGTTCGTTCGTGTCCGGTGGAAATGTTGTCAGATCGTCTCTGCTGCAACATCTCCGCG
TGATCAACCCTGCGATTCAGCCCTCTGTGTTGTTGTCTTCACGCTCTGAGTCCACTCAGC
CTGCTCGTATGGAGGAGCATGGATTCGAGAGCACGACCATTTCCGATGTTATGAACGCTA
AAGGCAAAAGCGCTGATGGATCTT**GGCTTTGGTGTACCACTGATGACACTGTTTACGA
CGCCGTTAAATCCATGACACAACACAATGTTGGTGCCTTGGTGGTTGTGAAACCTGGTGA
GCAACAATCTCTTGCTGGTATCATTACAGAGAGAGATTATCTGCGAAAGATCATTGTGCA
AGGTAGATCATCCAAATCAACGAAAGTAGGAGACATTATGACTGAAGAGAATAAGCTTAT
CACCGTGACACCAGAGACCAAGGTGTTGGTCGCTATGCAGCTGATGACAGATAACAGGAT
CAGGCACATTCCGGTGATCAAAGACAAGGGTATGATAGGAATGGTGTCCATAGGAGATGT
GGTCCGTGCAGTGGTGACTGAGCATCGTGAGGAGCTTAACCGCCTAAATGCCTTTATTCA
GGGAGGTTACTAGACGCTAGCTACCCCTTTGCGTGTGGTGGTTGTTGATGAATCTCGAAA
GCTTTTAAGATGTATGTATATATATGGAGATCTTGGTTGTTTGTCTCATGTTTGTTTGTT
GTTTTTAATCTGCTGTTTCAATTTGGTTAACTTGCAAGACTAAGCTCTTGTGCTTTCCCT
TCTTTTTATGCTGCTACTTCTGCAAGATAATAAAACCAAGACTCCCCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 
25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 20 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1D228TF U 36
AF RS1FB94TF U 1
AF RS1AE70TF U 121
AF RS1BZ95TF U 7
AF RS1EI71JQ C 199
AF RS1BZ95JQ C 335
AF RS1D228JQ C 462
BS 1 48 RS1FB94TF
BS 49 49 RS1BZ95TF
BS 50 70 RS1FB94TF
BS 71 71 RS1BZ95TF
BS 72 91 RS1FB94TF
BS 92 92 RS1BZ95TF
BS 93 169 RS1FB94TF
BS 170 170 RS1BZ95TF
BS 171 178 RS1FB94TF
BS 179 179 RS1BZ95TF
BS 180 202 RS1FB94TF
BS 203 203 RS1BZ95TF
BS 204 263 RS1FB94TF
BS 264 264 RS1BZ95TF
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BS 284 284 RS1BZ95TF
BS 285 294 RS1FB94TF
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BS 296 323 RS1FB94TF
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BS 380 501 RS1FB94TF
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BS 624 785 RS1BZ95TF
BS 786 950 RS1EI71JQ
BS 951 951 RS1BZ95JQ

RD RS1D228TF 297 0 0
GG
ACCTCTACTCTTGGGCTCTCAACCTTTCCCTCTTTGATCCGTTT*CTTCTCCAACCTCAG
GTAAAAAAAGATGCAAGCTGTGATTCGTTCGTTCGTGTCCGGTGGAAATGT*GTCAGATC
GTCTCTGCTGCAACATCTCCGCGTGATCACCCCTGCGATTCA*CCCTCTGTGTTGT*GTC
TTCACGCTCTGAGTCCACTCAGCCTGCTCGTATGGAGGAGCATGGATTC*AGAGCACGAC
CATTTCCGATGTTATGAACGCTAAAGGCAAAAGCGCTGATGGATCTT**GGCTTT

QA 3 297 3 297
DS 

RD RS1FB94TF 623 0 0
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CTTTCCCTCTCTGATCCGTTTCCTTCTCCAAGCTCAGGTAAAAAAAGATGCAAGCTGTGA
TTCGTTCGTTCGTGTCCGGTGGAAATGTTGTCAGATCGTCTCTGCTGCAGCATCTCCGTG
TGATCAACCCTGCGATTCAGCCTTCTGTGTTGTTGTCTTCACGCTCTGAGTCCACTCAGC
CTGCTCGTATGGAGGAGCATGGACTCGAGAGCACGACCATTTCTGATGTTATGAGCGCTA
AAGGCAAAAGCGCTGATGGATCTAAAGGCTTTGGTGTACCACTGATGACACTGTTTACGA
CGCCGTTAAATCCATGACGCAACACAATGTTGGTGCCTTGGTGGTTGTGAAACCTGGTGA
GCAACAATCTCTTGCTGGTATCATTACAGAGAGAGATTATCTGCGAAAGATCATTGTGCA
AGGTAGATCATCCAAATCAACAAAAGTAGGAGACATTATGACTGAAGAGAATAAGCTTAT
CACCGTGACACCAGAGACCAAGGTGTTGGTCGCTATGCAGCTGATGACAGATAACAGGAT
CAGGCACATTCCGGTGATCAAAG

QA 1 623 1 623
DS 

RD RS1AE70TF 529 0 0
TTCGTTCGTTCGTGTCCGGTGGAAATGTTGTCAGATCGTCTCTGCTGCAGCATCTCCGTG
TGATCAACCCTGCGATTCAGCCTTCTGTGTTGTTGTCTTCACGCTCTGAGTCCACTCAGC
CTGCTCGTATGGAGGAGCATGGATTCGAGAGCACGACCATTTCTGATGTTATGAGCGCTA
AAGGCAAAAGCGCTGATGGATCTT**GGCTTTGGTGTACCACTGATGACACTGTTTACGA
CGCCGTTAAATCCATGACGCAACACAATGTTGGTGCCTTGGTGGTTGTGAAACCTGGTGA
GCAACAATCTCTTGCTGGTATCATTACAGAGAGAGATTATCTGCGAAAGATCATTGTGCA
AGGTAGATCATCCAAATCAACAAAAGTAGGAGACATTATGACTGAAGAGAATAAGCTTAT
CACCGTGACACCAGAGACCAAGGTGTTGGTCGCTATGCAGCTGATGACAGATAACAGGAT
CAGGCACATTCCGGTGATCAAAGACAAAGGTATGATAGGAATGGTGTCC

QA 1 529 1 529
DS 

RD RS1BZ95TF 779 0 0
G
ACTCCACTCAACTCTCGTCACCTGTCTCTTACCTCTACTCTTGGGCTCTCAACCTTTCCC
TCTTTGATCCGTTTTCTTCTCCAACCTCAGGTAAAAAAAGATGCAAGCTGTGATTCGTTC
GTTCGTGTCCGGTGGAAATGTTGTCAGATCGTCTCTGCTGCAACATCTCCGCGTGATCAC
CCCTGCGATTCAGCCCTCTGTGTTGTTGTCTTCACGCTCTGAGTCCACTCAGCCTGCTCG
TATGGAGGAGCATGGATTCGAGAGCACGACCATTTCCGATGTTATGAACGCTAAAGGCAA
AAGCGCTGATGGATCTT**GGCTTTGGTGTACCACTGATGACACTGTTTACGACGCCGTT
AAATCCATGACACAACACAATGTTGGTGCCTTGGTGGTTGTGAAACCTGGTGAGCAACAA
TCTCTTGCTGGTATCATTACAGAGAGAGATTATCTGCGAAAGATCATTGTGCAAGGTAGA
TCATCCAAATCAACGAAAGTAGGAGACATTATGACTGAAGAGAATAAGCTTATCACCGTG
ACACCAGAGACCAAGGTGTTGGTCGCTATGCAGCTGATGACAGATAACAGGATCAGGCAC
ATTCCGGTGATCAAAGACAAGGGTATGATAGGAATGGTGTCCATAGGAGATGTGGTCCGT
GCAGTGGTGACTGAGCATCGTGAGGAGCTTAACCGCCTAAATGCCTTTATTCAGGGAGGT
TACTAGACGCTAGCTACCCCTTTGCGTGTGGTGGTTGTTGATGAATCTCGAAAGCTTT

QA 2 779 2 779
DS 

RD RS1EI71JQ 753 0 0
AGCCCTCTGTGTTGTTGTCTTCACGCTCTGAGTCCACTCAGCCTGCTCGTATGGAGGAGC
ATGGATTCGAGAGCACGACCATTTCCGATGTTATGAACGCTAAAGGCAAAAGCGCTGATG
GATCTT**GGCTTTGGTGTACCACTGATGACACTGTTTACGACGCCGTTAAATCCATGAC
ACAACACAATGTTGGTGCCTTGGTGGTTGTGAAACCTGGTGAGCAACAATCTCTTGCTGG
TATCATTACAGAGAGAGATTATCTGCGAAAGATCATTGTGCAAGGTAGATCATCCAAATC
AACGAAAGTAGGAGACATTATGACTGAAGAGAATAAGCTTATCACCGTGACACCAGAGAC
CAAGGTGTTGGTCGCTATGCAGCTGATGACAGATAACAGGATCAGGCACATTCCGGTGAT
CAAAGACAAGGGTATGATAGGAATGGTGTCCATAGGAGATGTGGTCCGTGCAGTGGTGAC
TGAGCATCGTGAGGAGCTTAACCGCCTAAATGCCTTTATTCAGGGAGGTTACTAGACGCT
AGCTACCCCTTTGCGTGTGGTGGTTGTTGATGAATCTCGAAAGCTTTTAAGATGTATGTA
TATATATGGAGATCTTGGTTGTTTGTCTCATGTTTGTTTGTTGTTTTTAATCTGCTGTTT
CAATTTGGTTAACTTGCAAGACTAAGCTCTTGTGCTTTCCCTTCTTTTTATGCTGCTACT
TCTGCAAGATAATAAAACCAAGACTCCCCATC
G

QA 1 752 1 752
DS 

RD RS1BZ95JQ 617 0 0
TGTACCACTGATGACACTGTTTACGACGCCGTTAAATCCATGACACAACACAATGTTGGT
GCCTTGGTGGTTGTGAAACCTGGTGAGCAACAATCTCTTGCTGGTATCATTACAGAGAGA
GATTATCTGCGAAAGATCATTGTGCAAGGTAGATCATCCAAATCAACGAAAGTAGGAGAC
ATTATGACTGAAGAGAATAAGCTTATCACCGTGACACCAGAGACCAAGGTGTTGGTCGCT
ATGCAGCTGATGACAGATAACAGGATCAGGCACATTCCGGTGATCAAAGACAAGGGTATG
ATAGGAATGGTGTCCATAGGAGATGTGGTCCGTGCAGTGGTGACTGAGCATCGTGAGGAG
CTTAACCGCCTAAATGCCTTTATTCAGGGAGGTTACTAGACGCTAGCTACCCCTTTGCGT
GTGGTGGTTGTTGATGAATCTCGAAAGCTTTTAAGATGTATGTATATATATGGAGATCTT
GGTTGTTTGTCTCATGTTTGTTTGTTGTTTTTAATCTGCTGTTTCAATTTGGTTAACTTG
CAAGACTAAGCTCTTGTGCTTTCCCTTCTTTTTATGCTGCTACTTCTGCAAGATAATAAA
ACCAAGACTCCCCATCC

QA 1 617 1 617
DS 

RD RS1D228JQ 490 0 0
TGG
GAAAGATCATTGTGCAAGGTAGATCATCCAAATCAACGAAAGTAGGAGACATTATGACTG
AAGAGAATAAGCTTATCACCGTGACACCAGAGACCAAGGTGTTGGTCGCTATGCAGCTGA
TGACAGATAACAGGATCAGGCACATTCCGGTGATCAAAGACAAGGGTATGATAGGAATGG
TGTCCATAGGAGATGTGGTCCGTGCAGTGGTGACTGAGCATCGTGAGGAGCTTAACCGCC
TAAATGCCTTTATTCAGGGAGGTTACTAGACGCTAGCTACCCCTTTGCGTGTGGTGGTTG
TTGATGAATCTCGAAAGCTTTTAAGATGTATGTATATATATGGAGATCTTGGTTGTTTGT
CTCATGTTTGTTTGTTGTTTTTAATCTGCTGTTTCAATTTGGTTAACTTGCAAGACTAAG
CTCTTGTGCTTTCCCTTCTTTTTATGCTGCTACTTTTGCAAGATAATAAAACCAAGACTC
CCCATC
T

QA 4 489 4 489
DS 



AS 2 11

CO CL258Contig1 760 7 8 U
CGAGAAAATAAATGTTAATTTATTAAATTACTAAAACAAGGGGAGATAGTGCAACACATT
ATAAACTGAATAGTTTTGTCGAAATTATTCTAAAAGACATGCATATTAATACGTTACGTG
ATTCTCACAAAAGATGACAGTTTATAGGAAAAACAAAAAAACAATCAGACCGGAATAACC
ACTTGAAGATTTTCAGCACGTCGGTATTAGCTAAACCAAGACTCCGAAGATGTTCTGAAC
CAGCTAAAATGACGCTTCAAGGCACGATGGTGAACAGAGGCGTGTCAACGCTAACCGGTT
TTCCATCTTCAGCTAGTAGTTCAGTGATGGTTCCTGATTTCTCAGCCTCAATCTCATTCA
TTAGTTTCATAGCTTCGATAATACAAACAACTTGACCCTTCTGCACCTTATCACCAACCT
TGACAAAAGGGGGTTCACCAGGTCCAGGAGATCTGTAGAAAGTACCAGCCATAGGACTCT
TGAGTGGAGGATGAGAAGAGGCAGGTGGGGTTGCTGGTTTTGCTGTTTCAGGGGCTGAGG
AGGGAGTAGGAGAAGCAGGAGGAGCAGCTGGTTGAGAAGGAGGCATTGGATATCCTGTCA
CTGGAGGAGGCATGGAGTGGTAAACTGGAGCTGCTGTTGGTGCAGGTTGCTGCTGCTGTA
AAGCTTCCTTCTTGCGAATAACAATCTCACAGTCGAGTTGCTTCAGTTCAAGTTCCACTA
TATCTCTTGAATCCACAAGCTTAAGAAGACGAGAGACTTT


BQ
10 10 10 10 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GU18JQ U 3
AF RS1GU18TF C 3
AF RS1FF10JQ U 4
AF RS1B603JQ U 1
AF RS1B603TF C 2
AF RS1FZ87JQ U 30
AF RS1DY04JQ U 48
BS 1 167 RS1B603JQ
BS 168 168 RS1FF10JQ
BS 169 494 RS1B603JQ
BS 495 495 RS1FF10JQ
BS 496 610 RS1B603JQ
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BS 612 716 RS1B603JQ
BS 717 760 RS1FZ87JQ

RD RS1GU18JQ 446 0 0
AA
AAAATAAATGTTAATTTATTAAATTACTAAAACAAGGGGAGATAGTGCAACACATTATAA
ACTGAATAGTTTTGTCGAAATTATTCTAAAAGACATGCATATTAATACGTTACGTGATTC
TCACAAAAGATGACAGTTTATAGGAAAAACAAAAAAACAATCAAACCGGAATAACCACTT
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TAAAATGACCCTTCAAGGCACGATGGTGAACAGAGGCGTGTCAACGCTAACCGGTTTTCC
ATCTTCAGCTAGTAGTTCAGTGATGGTTCCTGATTTCTCAGCCTCAATCTCATTCATTAG
TTTCATAGCTTCCATAATACAAACAACTTGACCCTTCTGCACCTTATCACCAACCTTGAC
AAAAGGGGGTTCACCAGGTCCAGG

QA 3 446 3 446
DS 

RD RS1GU18TF 492 0 0
AG
AAAATAAATGTTAATTTATTAAATTACTAAAACAAGGGGAGATAGTGCAACACATTATAA
ACTGAATAGTTTTGTCGAAATTATTCTAAAAGACATGCATATTAATACGTTACGTGATTC
TCACAAAAGATGACAGTTTATAGGAAAAACAAAAAAACAATCAGACCGGAATAACCACTT
GAAGATTTTCAGCACGTCGGTATTAGCTAAACCAAGACTCCGAAGATGTTCTGAACCAGC
TAAAATGACGCTTCAAGGCACGATGGTGAACAGAGGCGTGTCAACGCTAACCGGTTTTCC
ATCTTCAGCTAGTAGTTCAGTGATGGTTCCTGATTTCTCAGCCTCAATCTCATTCATTAG
TTTCATAGCTTCGATAATACAAACAACTTGACCCTTCTGCACCTTATCACCAACCTTGAC
AAAAGGGGGTTCACCAGGTCCAGGAGATCTGTAGAAAGTACCAGCCATAGGACTCTTGAG
TGGAGGATG
C

QA 3 491 3 491
DS 

RD RS1FF10JQ 638 0 0
G
AAAATAAATGTTAATTTATTAAATTACTAAAACAAGGGGAGATAGTGCAACACATTATAA
ACTGAATAGTTTTGTCGAAATTATTCTAAAAGACATGCATATTAATACGTTACGTGATTC
TCACAAAAGATGACAGTTTATAGGAAAAACAAAAAAACAATCAGACCGGAATAACCACTT
GAAGATTTTCAGCACGTCGGTATTAGCTAAACCAAGACTCCGAAGATGTTCTGAACCAGC
TAAAATGACGCTTCAAGGCACGATGGTGAACAGAGGCGTGTCAACGCTAACCGGTTTTCC
ATCTTCAGCTAGTAGTTCAGTGATGGTTCCTGATTTCTCAGCCTCAATCTCATTCATTAG
TTTCATAGCTTCGATAATACAAACAACTTGACCCTTCTGCACCTTATCACCAACCTTGAC
AAAAGGGGGTTCACCAGGTCCAGGAGATCTGTAGAAAGTACCAGCCATAGGACTCTTGAG
TGGAGGATGAGAAGAGGCAGGTGGGGTTGCTGGTTTTGCTGTTTCAGGGGCTGAGGAGGG
AGTAGGAGAAGCAGGAGGAGCAGCTGGTTGAGAAGGAGGCATTGGATATCCTGTCACTGG
AGGAGGCGTGGAGTGGTAAACTGGAGCTGCTGTTGGT

QA 2 638 2 638
DS 

RD RS1B603JQ 718 0 0
CGAGAAAATAAATGTTAATTTATTAAATTACTAAAACAAGGGGAGATAGTGCAACACATT
ATAAACTGAATAGTTTTGTCGAAATTATTCTAAAAGACATGCATATTAATACGTTACGTG
ATTCTCACAAAAGATGACAGTTTATAGGAAAAACAAAAAAACAATCAAACCGGAATAACC
ACTTGAAGATTTTCAGCACGTCGGTATTAGCTAAACCAAGACTCCGAAGATGTTCTGAAC
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TTAGTTTCATAGCTTCGATAATACAAACAACTTGACCCTTCTGCACCTTATCACCAACCT
TGACAAAAGGGGGTTCACCAGGTCCAGGAGATCTGTAGAAAGTACCAGCCATAGGACTCT
TGAGTGGAGGATGAAAAGAGGCAGGTGGGGTTGCTGGTTTTGCTGTTTCAGGGGCTGAGG
AGGGAGTAGGAGAAGCAGGAGGAGCAGCTGGTTGAGAAGGAGGCATTGGATATCCTGTCA
CTGGAGGAGGTATGGAGTGGTAAACTGGAGCTGCTGTTGGTGCAGGTTGCTGCTGCTGTA
AAGCTTCCTTCTTGCGAATAACAATCTCACAGTCGAGTTGCTTCAGTTCAAGTTCC
CC

QA 1 716 1 716
DS 

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CGAG
AAATAAATGTTAATTTATTAAAT*ACTAAAACAAGGGGAGATAGTGCAACACAT*ATAAA
CTGAATAGTTTTGTCGAAATTATTCTAAAAGACATGCATATTAATACGTTACGTGATTCT
CACAAAAGATGACAGTTTATAGGAAAAACAAAAAAACAATCAGACCGGAATAACCACTTG
AAGATTTTCAGCACGTCGGTATTAGCTAAACCAAGACTCCGAAGATGTTCTGAACCAGCT
AAAATGACGCTTCAAGGCACGATGGTGAACAGAGGCGTGTCAACGCTAACCGGTTTTCCA
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CCC

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DS 

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CTAAAAGACATGCATATTAATACGTTACGTGATTCTCA***AAGATGACAGTTTATAGGA
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GCTAAACCAAGACTCCGAAGATGTTCTGAACCAGCTAAAATGACGCTTCAAGGCACGATG
GTGAACAGAGGCGTGTCAACGCTAACCGGTTTTCCATCTTCAGCTAGTAGTTCAGTGATG
GTTCCTGATTTCTCAGCCTCAATCTCATTCATTAGTTTCATAGCTTCGATAATACAAACA
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GTTGCTGGTTTTGCTGTTTCAGGGGCTGAGGAGGGAGTAGGAGAAGCAGGAGGAGCAGCT
GGTTGAGAAGGAGGCATTGGATATCCTGTCACTGGAGGAGGCATGGAGTGGTAAACTGGA
GCTGCTGTTGGTGCAGGTTGCTGCTGCTGTAAAGCTTCCTTCTTGCGAATAACAATCTCA
CAGTCGAGTTGCTTCAGTTCAAGTTCCACTATATCTCTTGAATCCACAAGCTTAAGAAGA
CGAGAGACTTT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RS1DY04JQ 698 0 0
GGG
GCAACACATTATAAACTGAATAGTTTTGTCGAAATTATTCTAAAAGACATGCATATTAAT
ATGTTACGTGATTCTCACAAAAGATGACAGTTTATAGGAAAAACAAAAAAACAATCAGAC
CGGAATAACCACTTGAAGATTTTCAGCACGTCGGTATTAGCTAAACCAAGACTCCGAAGA
TGTTCTGAACCAGCTAAAATGACGCTTCAAGGCACGATGGTGAACAGAGGCGTGTCAACG
CTAACCGGTTTTCCATCTTCAGCTAGTAGTTCAGTGATGGTTCCTGATTTCTCAGCCTCA
ATCTCATTCATTAGTTTCATGGCTTCGATAACACAAACAACTTGACCCTTCTGCACCTTA
TCACCAACCTTGACAAAAGGGGGTTCACCAGGTCCAGGAGATCTGTAGAAAGTACCAGCC
ATAGGACTCTTGAGTGGAGGATGAAAAGAGGCAGGTGGGGTTGCTGGTTTTGCTGTTTCA
GGGGCTGAGGAGGGAGTAGGAGAAGCAGGAGGAGCAGCTGGTTGAGAAGGAGGCATTGGA
TATCCTGTCACTGGAGGAGGCATGGAGTGGTAAACTGGAGCTACTGTTGGTGCAGGTTGC
TGCTGCTGTAAAGCTTCCTTCTTGCGAATAACAATCTCACAGTCGAGTTGCTTCAGTTCA
AGTTCCACTATATCTCTTGAATCCACAAGCTTAAG

QA 4 698 4 698
DS 



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GGATAGTTGTTTGGTTTTCTTCGTAACCATCGAAATCAGATTCCTTTACCCGAAAAATAA
CCATCAACCTTTTTCTTATTTATCTCTCTCTATCTCTCTCTTAGCTTCCTCGGTTTCATC
GTCAACTGCATTTCATCTGTCTCAACAATGGCGTCATTTTCTGTATCTTACGCCAAGATC
TGTGCTCCGAACCAGCGGTTCGGATCTTTTCCTGGAACCCGACGGCAGCCGCAACTCAAT
GGCGTATCCTTTCCCTCCGATGTATCTCAGAATCAATCTACAATCTGGAAGTTGCGTGCG
ACAACCAATGAGGCTGTCTCTAACTCAACCCCAATGACAAACGGTAACGGGAAAGTGAAG
AGCAATGTTCCTGAACCTGCCGAACTCTCTGACTTTATGGCCAAAGTCTCTCGTCTTCTT
AAGCTTGTGGATTCAAGAGATATAGTGGAACTTGAACTGAAGCAACTCGACTGTGAGATT
GTTATTCGCAAGAAGGAAGCTTTACAGCAGCAGCAACCTGCACCAACAGCAGCTCCAGTT
TACCACTCCATGCCTCCTCCAGTGACAGGATATCCAATGCCTCCTTCTCAACCAGCTGCT
CCTCCTGCTTCTCCTACTCCCTCCTCAGCCCCTGAAACAGCAAAACCAGCAACCCCACCT
GCCTCTTCTCATCCTCCACTCAAGAGTCCTATGGCTGGTACTTTCTACAGATCTCCTGGA
CCTGGTGAACCCCCTTTTGTCAAGGTTGGTGATAAGGTGCAGAAGGGTCAAGTTGTTTGT
ATTATCGAAGCCATGAAACTAATGAATGAGATTGAGGCTGAGAAATCAGAAACATCACTG
AACTACTAGCTGAGATGGAAACCGGTAGCGTGACACGCCTCTGTCACCATCGTGCCTTGA
GCGTCATTTAGCTGGTCAGACATCTTCGGAGTCTTGGTTAGCTATACCGACGTGCTGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FZ87TF U 1
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AF RS1BC29TF U 152
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RD RS1FZ87TF 739 0 0
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GCCTCTTCTCATCCTCCACTCAAGAGTCCTATGGCTGGTACTTTCTACAGATCTCCTGGA
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TTTTGT

QA 1 733 1 733
DS 

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GG
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ATAGTGGAACTTGAACTGAAGCAACTCGACTGTGAGATTGTTATTCGCAAGAAGGAAGCT
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AAGAGTCCTATGGCTGGTACTTTCTACAGATCTCCTGGACCTGGTGAACCCCCTTTTGTC
AAG*TTGGTGATAAG*TGCAGAAGG*TCAAGTTGTT
GTATATC

QA 3 698 3 698
DS 

RD RS1DY04TF 763 0 0
GG
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GCTCCGAACCAGCGGTTCGGATCTTTTCCTGGAACCCGACGGCAGCCGCAACTCAATGGC
GTATCCTTTCCCTCCGATGTATCTCAGAATCAATCTACAATCTGGAAGTTGCGTGCGACA
ACCAATGAGGCTGTCTCTAACTCAACCCCAATGACAAACGGTAACGGGAAAGTGAAGAGC
AATGTTCCTGAACCTGCCGAACTCTCTGACTTTATGGCCAAAGTCTCTCGTCTTCTTAAG
CTTGTGGATTCAAGAGATATAGTGGAACTTGAACTGAAGCAACTCGACTGTGAGATTGTT
ATTCGCAAGAAGGAAGCTTTACAGCAGCAGCAACCTGCACCAACAGTAGCTCCAGTTTAC
CACTCCATGCCTCCTCCAGTGACAGGATATCCAATGCCTCCTTCTCAACCAGCTGCTCCT
CCTGCTTCTCCTACTCCCTCCTCAGCCCCTGAAACAGCAAAACCAGCAACCCCACCTGCC
TCTTCTCATCCTCCACTCAAGAGTCCTATGGCTGGTACTTTCTACAGATCTCCTGGACCT
GGTGAACCCCCTTTTGTCAAGGTTGGTGATAAGGTGCAGAAGGGTCAAGTTGTTTGTGTT
ATCGAAGCCATGAAACTAATGAATGAGATTGAGGCTGAGAAATCAGAACCATCACTGAAC
TACTAGCTGAGATGGAAACCGGTAGCGTGACACGCCTCTGT

QA 3 763 3 763
DS 

RD RS1BC29TF 808 0 0
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ATCAATCTACAATCTGGAAGTTGCGTGCGACAACCAATGAGGCTGTCTCTAACTCAACCC
CAATGACAAACGGTAACGGGAAAGTGAAGAGCAATGTTCCTGAACCTGCCGAACTCTCTG
ACTTTATGGCCAAAGTCTCTCGTCTTCTTAAGCTTGTGGATTCAAGAGATATAGTGGAAC
TTGAACTGAAGCAACTCGACTGTGAGATTGTTATTCGCAAGAAGGAAGCTTTACAGCAGC
AGCAACCTGCACCAACAGCAGCTCCAGTTTACCACTCCATGCCTCCTCCAGTGACAGGAT
ATCCAATGCCTCCTTCTCAACCAGCTGCTCCGCCTGCTTCTCCTACTCCCTCCTCAGCCC
CTGAAACAGCAAA*CCAGCAACCCCACCTGCCTCTTCTCATCCTCCACTCAAGAGTCCTA
TGGCTGGTACTTTCTACAGATCTCCTGGACCTGGTGAACCCCCTTTTGTCAAGGTTGGTG
ATAAGGTGCAGAAGGGTCAAGTTGTTTGTATTATCGAAGCTATGAAACTAATGAATGAGA
TTGAGGCTGAGAAATCAGGGACATCACTGAACTACTAGCTGAGATGGAAACCGGTAGCGT
GACACGCCTCTGTCACCATCGTGCCTTGAGCGTCATTTAGCTGGTCAGACATCTTCGGAG
TCTTGGTTAGCTATACCGACGTGCTGAA

QA 1 808 1 808
DS 



AS 2 11

CO CL259Contig1 741 6 11 U
GGGATCCAATAACAATTACTTGGACGGTCTCTTCTTCCTCAGATAAACGAGAAAAAAATC
TCTAAATGGCGTCAGTTTCTGCAAGTTTGCCTCCACCATTGCTGCTCACTCAGAGAAAAC
CTTACCTCACATCAGTTCAGAAACTCCCATTTTCTCTTATTCGAGATAGAAGAAGCCCTA
GCAGGGGTCTTATGGTGAAAGCTAATGGTAAAAGTTCCGAATCATCATCGACTGATCTTG
ACGTTATTAGTTCAATTCAGAATGTTTGGGATAAGTCTGAAGATCGTTTAGGTCTTATTG
GTTTGAGTTTTGCTGCTATTGTAGCTCTTTGGGCTTCACTTAACATAATCACGGCAATCG
ATAAATTGCCTGTTATCTCCTCTGGGTTTGAGCTAGTTGGTATCTTGTTCTCCACGTGGT
TTACATATCGATATCTCTTGTTCAAACCCGACAGAGAGGAGCTATCCCAAATTGTCAAGA
AATCAGTGGCGAATATACTTGGCCAGTAGAAAACCCTTCTAAAAAAAAAAA**GATATAC
TTGGCCAGTAAGGCAGCAAATGCATGTGGTATCCTGAGATGATTTGTGTTTGTGACTGTG
ACATGATAGATGTTGTTATCTCTGGTTCATGTTCATGCGCTGAACCTGTAAATACTGTAT
TTGGGTTTTGGTTGCTGTTTCTTGTGAACAAATCAATCATTTCATACAAAGAATTAAGAC
ATCAATATCAGTTTTAGCTTG


BQ
10 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 10 

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AF RS1E961JQ C 2
AF RS1G485JQ C 159
AF RS1E961TF U 2
AF RS1A738TF U 1
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CC

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TC

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TGGGTTTTGGTTGCTGTTTCTTGTGAACAAATCAATCATTTCATACAAAGAATTAAGACA
TCAATATCAGTTTTAGC
CC

QA 1 737 1 737
DS 

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TATCAGTTTTAGCTT
G

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DS 



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BQ
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15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RS1DF54TF U 1
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AF RS1C057JQ C 151
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GG
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GCCAAAA

QA 3 714 3 714
DS 

RD RS1C057JQ 582 0 0
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TGCC

QA 1 578 1 578
DS 

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TCCT
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CTGAGATGATTTGTGTTTGTGACATGATAGATGTTGTTATCTCTGGTTCATGTTCATGTT
CTGAACCTGTAAATACTGTATTTGGGGTTTTGGTTGCTGCTTCTTGTGAACAAATCAATC
ATTTCATATAAAGAATTAAGACATCAAGATCAGTTTTTGCTTAAACGCAGTTTATTTATT
TACAAAA

QA 5 671 5 671
DS 

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AATCATCGACTGATCTTGACGTCATTAGTTCAATTCAGAATGTTTGGGATAAGTCTGAAG
ATCGTTTAGGTCTTATTGGTTTGAGTTTTGCTGCTATTGTAGCTCTTTGGGCGTCACTTA
ACATAATCACGGCAATCGACAAATTGCCTGTTATCTCCTCTGGGTTTGAACTAGTTGGTA
TCTTGTTCTCCACGTGGTTTACATATCGATATCTCTTGTTCAAACCCGACAGAGAGGAGC
TATCCCAAATTGTCAAGAAATCAGTGACGAATATACTTGGCCAGTAGAAAACCCTTTCTC
AAAAGGAAAAAAAAAA**TATACTTGGCCAGTAAGGCAGTAAATGCATGTGGTATCCTGA
GATGATTTGTGTTTGTGACATGATAGATGTTGTTATCTCTGGTTCATGTTCATGTTCTGA
ACCTGTAAATACTGTATTTGGG*TTTTGGTTGCTGCTTCTTGTGAACAAATCAATCATTT
CATATAAAGAATTAAGACATCAAGATCAGTTTTTGCTTAAACGCAGTTTATTTATTTAC

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 11

CO CL260Contig1 712 11 5 U
GGGACATCCAACAGGAAAACACAAGCTTCTAAACACCAATTAAAAGCAACTAAGTTTTCA
TATTTTCTTATCACACAAAAAAAGAAGAAGAAGAGGGAAGCAAGCAAGAAGCAATGGCTT
CGGCTCTGAAACTCTTCACATGCCTTGTTTTGACGGTTTACATAGCTGCATCGGTAGATG
CATCAATCTCATGTAACGCAGTGGCAAGTTGCATAGCTCCTTGTGTCCCCTACCTAAGAC
AAGGCGGGGTCGTGACGCCTGCATGTTGTGGAGGAATGAGAAATTTGAATGGTTTAGCTC
AAACCACACTAGACCGTCAACAAGCATGCAAATGCGTACAGTCCATTATAAGTTCCATCC
CTGGTCTCAACCCAAATCTAGCTGCTGGTCTTCCTGGACGGTGCGGTGTTAGCTTTCCCT
ATCCTATCTCGGCGAGCAATAACTGCGACAGAGTCAGGGGAAGTTGGAACTCATATATCA
TCATGAAGATGAATGGTATAGTCTAGAATAAATAAAACAACAAGCCTATGTACGTTAATC
TGAGCATGCCCTACGTTTTTGTCTTGTATTTATTTTGTTGTTGAAAAGTTTGTCAAGTTG
TAATCTTTTGAGTCATCTCGTTGTAATGACAACTTCCCAATCATTTATGTCCAACTTACA
AAAATAAACAAGATTCTGAAGTAACCATTTATATATAAGTCTATCGATCCTC


BQ
10 30 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 35 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 55 55 55 55 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H607JQB C 136
AF RS1H607TF U 4
AF RS1EQ11JQ C 2
AF RS1EQ11TF U 2
AF RS1CI42TF U 1
AF RS1GC50JQ C 139
AF RS1G319JQ C 4
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AF RS1GC50TF U 2
AF RS1DT28JQ C 11
AF RS1DT28TF U 11
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TCTCGTTGTAATGACAACTTCCCAATCATT

QA 1 510 1 510
DS 

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GG
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TCTTATCACACAAAAAA*GAAGAAGAAGAGGGAAGCAAGCAAGAAGCAATGGCTTCGGCT
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ATCTCGGCGAGCAATAACTGCGACAGAGTCAGGGGAAGTTGGAACTCATATATCATCATG
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QA 3 639 3 639
DS 

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CACGAAGATGAATGGTATAGTCTAGAATAAATAAAACAACAAGCCTATGTACGTTAATCT
GAGCATGCCCTACGTTTTTGTCTTGTATTTATTTTGTTGTTGAAAAGTTTGTCAAGTTGT
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QA 1 637 1 637
DS 

RD RS1EQ11TF 637 0 0
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ATTTTCTTATCACACAAAAAAAGAAGAAGAAGAGGGAAGCAAGCAAGAAGCAATGGCTTC
GGCTCTGAAACTCTTCACATGCCTTGTTTTGACGGTTTACATAGCTGCATCGGTAGATGC
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AGGCGGGGTCGTGGCGCCTGCATGTTGTGGAGGAATGAGAAATTTGAATGGTTTAGCTCA
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TGGTCTCAACCCAAATCTAGCTGCTGGTCTTCCTGTACGGTGCGGTGTTAGCTTTCCCTA
TCCTATCTCGGCGAGCAATAACTGCGACAGAGTCAGGGGAAGTTGGAACTCATATATCAT
CACGAAGATGAATGGTATAGTCTAGAATAAATAAAACAACAAGCCTATGTACGTTAATCT
GAGCATGCCCTACGTTTTTGTCTTGTATTTATTTTGTTGTTGAAAAGTTTGTCAAGTTGT
AATCTTTTGAGTCATCTCGTTGTAATGACAACTTCCC

QA 1 637 1 637
DS 

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TATTTTCTTATCACACAAAAAAAGAAGAAGAAGAGGGAAGCAAGCAAGAAGCAATGGCTT
CGGCTCTGAAACTCTTCACATGCCTTGTTTTGACGGTTTACATAGCTGCATCGGTAGATG
CATCAATCTCATGTAACGCAGTGGCAAGTTGCATAGCTCCTTGTGTCCCCTACCTAAGAC
AAGGCGGGGTCGTGACGCCTGCATGTTGTGGAGGAATGAGAAATTTGAATGGTTTAGCTC
AAACCACACTAGACCGTCAACAAGCATGCAAATGCGTACAGTCCATTATAAGTTCCATCC
CTGGTCTCAACCCAAATCTAGCTGCTGGTCTTCCTGGACGGTGCGGTGTTAGCTTTCCCT
ATCCTATCTCGGCGAGCAATAACTGCGACAGAGTCAGGGGAAGTTGGAACTCATATATCA
TCATGAAGATGAATGGTATAGTCTAGAATAAATAAAACAACAAGCCTATGTACGTTAATC
TGAGCATGCCCTACGTTTTTGTCTTGTATTTATTTTGTTGTTGAAAAGTTTGTCAAGTTG
TAATCTTTTGAGTCATCTCGTTGTAATGACAACTTCCCAATCATTTATGTCCAACTTACA
AAA*TAAACAAGATTCTGAAGTAACCATTTATATATAAGTCTATCGATCCTC

QA 1 712 1 712
DS 

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CAGTGGCAAGTTGCATAGCTCCTTGTGTCCCCTACCTAAGACAAGGCGGGGTCGTGACGC
CTGCATGTTGTGGAGGAATGAGAAATTTGAATGGTTTAGCTCAAACCACACTAGACCGTC
AACAAGCATGCAAATGCGTACAGTCCATTATAAGTTCCATCCCTGGTCTCAACCCAAATC
TAGCTGCTGGTCTTCCTGGACTGTGCGGTGTTAGCTTTCCCTATCCTATCTCGGCGAGCA
ATAACTGCGACAGAGTCAGGGGAAGTTGGAACTCATATATCATCATGAAGATGAATGGTA
TAGTCTAGAATAAATAAAACAACAAGCCTATGTACGTTAATCTGAGCATGCCCTACGTTT
TTGTCTTGTATTTATTTTGTTGTTGAAAAGTTTGTCAAGTTGTAATCTTTTGAGTCATCT
CGTTGTAATGACAACTTCCCAATCATTTATGTCCAACTTACAAAAATAAACAAGATTCTG
AAGTAACCATTTATATA
C

QA 1 557 1 557
DS 

RD RS1G319JQ 674 0 0
GG
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TCTTATCACACAAAAAAAGAAGAAGAAGAGGGAAGCAAGCAAGAAGCAATGGCTTCGGCT
CTGAAACTCTTCACATGCCTTGTTTTGACGGTTTACATAGCTGCATCGGTAGATGCATCA
ATCTCATGTAGCGCAGTGGCAAGTTGCATAGCTCCTTGTGTCCCCTACCTAAGACAAGGC
GGGGTCGTGACGCCTGCATGTTGTGTAGGAATGAGAAATTTGAATGGTTTAGCTCAAACC
ACACTAGACCGTCAACAAGCATGCAAATGCGTACAGTCCATTATAAGTTCCATCCCTGGT
CTCAACCCAAATCTAGCTGCTGGTCTTCCTGGACGGTGCGGTGTTAGCTTTCCCTATCCT
ATCTCGGCGAGCAATAACTGCGACAGAGTCAGGGGAAGTTGGAACTCATATATCATCATG
AAGATGAATGGTCTATTCTAGAATAAATAAAACAACAAGCCTATGTACGTTAATCTGAGC
ATGCCCTACGTTTTTGTCTTGTATTTATTTTGTTGCTGAAAAGTTTGTCAAGTTGTAATC
TTTTGAGTCATCTCGTTGTAATGACAACTTCCCAATCATTTATGTCCAACTTACAAAAAT
AAACAAGATTCT

QA 3 674 3 674
DS 

RD RS1G319TF 674 0 0
GG
ATCCAACAGGAAAACACAAGCTTCTAAACACCAATTAAAAGCAACTAAGTTTTCATATTT
TCTTATCACACAAAAAAAGAAGAAGAAGAGGGAAGCAAGCAAGAAGCAATGGCTTCGGCT
CTGAAACTCTTCACATGCCTTGTTTTGACGGTTTACATAGCTGCATCGGTAGATGCATCA
ATCTCATGTAGCGCAGTGGCAAGTTGCATAGCTCCTTGTGTCCCCTACCTAAGACAAGGC
GGGGTCGTGACGCCTGCATGTTGTGTAGGAATGAGAAATTTGAATGGTTTAGCTCAAACC
ACACTAGACCGTCAACAAGCATGCAAATGCGTACAGTCCATTATAAGTTCCATCCCTGGT
CTCAACCCAAATCTAGCTGCTGGTCTTCCTGGACGGTGCGGTGTTAGCTTTCCCTATCCT
ATCTCGGCGAGCAATAACTGCGACAGAGTCAGGGGAAGTTGGAACTCATATATCATCATG
AAGATGAATGGTCTATTCTAGAATAAATAAAACAACAAGCCTATGTACGTTAATCTGAGC
ATGCCCTACGTTTTTGTCTTGTATTTATTTTGTTGCTGAAAAGTTTGTCAAGTTGTAATC
TTTTGAGTCATCTCGTTGTAATGACAACTTCCCAATCATTTATGTCCAACTTACAAAAAT
AAACAAGATTCT

QA 3 674 3 674
DS 

RD RS1GC50TF 695 0 0
GGACATCCAACAGGAAAACACAAGCTTCTAAACACCAATTAAAAGCAACTAAGTTTTCAT
ATTTTCTTATCACACAAAAAAAGAAGAAGAAGAGGGAAGCAAGCAAGAAGCAATGGCTTC
GGCTCTGAAACTCTTCACATGCCTTGTTTTGACGGTTTACATAGCTGCATCGGTAGATGC
ATCAATCTCATGTAACGCAGTGGCAAGTTGCATAGCTCCTTGTGTCCCCTACCTAAGACA
AGGCGGGGTCGTGACGCCTGCATGTTGTGGAGGAATGAGAAATTTGAATGGTTTAGCTCA
AACCACACTAGACCGTCAACAAGCATGCAAATGCGTACAGTCCATTATAAGTTCCATCCC
TGGTCTCAACCCAAATCTAGCTGCTGGTCTTCCTGGACTGTGCGGTGTTAGCTTTCCCTA
TCCTATCTCGGCGAGCAATAACTGCGACAGAGTCAGGGGAAGTTGGAACTCATATATCAT
CATGAAGATGAATGGTATAGTCTAGAATAAATAAAACAACAAGCCTATGTACGTTAATCT
GAGCATGCCCTACGTTTTTGTCTTGTATTTATTTTGTTGTTGAAAAGTTTGTCAAGTTGT
AATCTTTTGAGTCATCTCGTTGTAATGACAACTTCCCAATCATTTATGTCCAACTTACAA
AAATAAACAAGATTCTGAAGTAACCATTTATATA
C

QA 1 694 1 694
DS 

RD RS1DT28JQ 672 0 0
GG
AGGAAAACACAAGCTTCTAAACACCAATTAAAAGCAACTAAGTTTCCATATTTTCTTATC
ACACAAAAAAAGAAGAAGAAGAGGGAAGCAAGCAAGAAGCAATGGCTTCGGCTCTGAAAC
TCTTCACATGCCTTGTTTTGACGGTTTACATAGCTGCATCGGTAGATGCATCAATCTCAT
GTAACGCAGTGGCAAGTTGCATAGCTCCTTGTGTCCCCTACCTAAGACAAGGCGGGGTCG
TGACGCCTGCATGTTGTGGAGGAATGGGAAATTTGAATGGTTTAGCTCAAACCACACTAG
ACCGTCAACAAGCATGCAAATACGTACAGTCCATTATAAGTTCCATCCCTGGTCTCAACC
CAAATCTAGCTGCTGGTCTTCCTGGACGGTGCGGTGTTAGCTTTCCCTATCCTATCTCGG
CGAGCAATAACTGCGACAGAGTCAGGGGAAGTTGGAACTCATATATCATCATGAAGATGA
ATGGTATAGTCTAGAATAAATAAAACAACAAGCCTATGTACGTTAATCTGAGCATGCCCT
ACGTTTTTGTCTTGTATTTATTTTGTTGTTGAAAAGTTTGTCAAGTTGTAATCTTTTGAG
TCATCTCGTTGTAATGACAACTTCCCAATCATTTATGTCCAACTTACAAAAATAAACAAG
ATTCTGAAGT

QA 3 672 3 672
DS 

RD RS1DT28TF 672 0 0
GG
AGGAAAACACAAGCTTCTAAACACCAATTAAAAGCAACTAAGTTTCCATATTTTCTTATC
ACACAAAAAAAGAAGAAGAAGAGGGAAGCAAGCAAGAAGCAATGGCTTCGGCTCTGAAAC
TCTTCACATGCCTTGTTTTGACGGTTTACATAGCTGCATCGGTAGATGCATCAATCTCAT
GTAACGCAGTGGCAAGTTGCATAGCTCCTTGTGTCCCCTACCTAAGACAAGGCGGGGTCG
TGACGCCTGCATGTTGTGGAGGAATGGGAAATTTGAATGGTTTAGCTCAAACCACACTAG
ACCGTCAACAAGCATGCAAATACGTACAGTCCATTATAAGTTCCATCCCTGGTCTCAACC
CAAATCTAGCTGCTGGTCTTCCTGGACGGTGCGGTGTTAGCTTTCCCTATCCTATCTCGG
CGAGCAATAACTGCGACAGAGTCAGGGGAAGTTGGAACTCATATATCATCATGAAGATGA
ATGGTATAGTCTAGAATAAATAAAACAACAAGCCTATGTACGTTAATCTGAGCATGCCCT
ACGTTTTTGTCTTGTATTTATTTTGTTGTTGAAAAGTTTGTCAAGTTGTAATCTTTTGAG
TCATCTCGTTGTAATGACAACTTCCCAATCATTTATGTCCAACTTACAAAA*TAAACAAG
ATTCTGAAGT

QA 3 672 3 672
DS 



AS 1 10

CO CL261Contig1 1092 10 20 U
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ATGTCGGCAGAGGAAGCAACCGTTCCAACCAACGTCGAAGAGACGGTGACTGCACCGGCT
GCGAGTGAGAAGAAAGCGAAGAAGACGAAGGAAGCTAAAGCTCCGAAGAAGAAGCCTGCA
GCGAAAGCTCCAAGGAAGAGATCTTCTTCTTCTCACCCAACCTACGAAGAGATGATTAAA
GACGCGATCACGACGTTGAAGGAGAGAACCGGATCTAGCCAATACGCGATTCAGAAGTTC
ATAGAGGAGAAGCAGAAGACGCTTCCTCCAACGTTCAGGAAGCTTCTCCTCGTCAATCTC
AAGAGACTCGTCGCTTCAGGGAAGCTCGTCAAAGTCAAAGGCTCCTTCAAGCTCCCCTCC
GCTACTAAATCAACCGCCGTTGCTGCTCCTGCTGCTCCTAAACCGGCTCCGGTTAAGAAG
AAGGCGACCGTTGCTAAACCGAAGGCTGCTAAACCGGCGGCGAAAGGATCCAAGAAGACC
AAAGCTGCTGTAGCTGTGAAGCCCAAGGCTAAAGTAGTCGCTGCTAAACCTAAACCGAAG
ACGAAGACAGTGGCTGCTGTGTCCAAGACCAAAGCTGTTGCTGCTGCTGCTAAGCCTAAG
GCTAAAGAGAGACCTGCTAAAGCGGCGAGGACTTCGACTAGAACTTCTCCAGGGAAGAAG
AAGGCTGCTCCTGCTGCTAAGAAAGCCGCCGCGGCTGTAACTAAGAAGGCTAAAGCTAAG
GCTCCGGCTAAGAGTGTGAAGGCGAAGGCTGTAAAGTCTCCGGCGAAGAGGGTTTCAACG
AGGAAGGTGAAGAAGTGAAAGAAGATTTGGGTTTAGGGTAGTGAATTGGGGAGATTGAAT
GAATGAATGAATACATGGTTGTAATGGTGGTTAGAGAGCTTCTCTTAGGGGTAGTCTTTG
TATAATTTGAATCATATCCTTTGAAGAAGCTTTTTGCTTTTATCTCTGTTTCTGGTTTCT
TCTTGAAACCCCCCTTTTGTTCCTTGTTGTAATTTTTGTGTTTGTTTTGAGATTAAAGCT
TCTTACATGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 5 30 5 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 10 
50 50 10 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 0 0 50 50 50 50 45 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 20 30 
30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AGTCGCTGCTAAACCTAAACCGAAGACGAAGACAGTGGCTGCTGTGTCCAAGACCAAAGC
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GCTGCTAAGAA*GCCGCCGCGGCTGTAACT

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TGAATGAATGAATACATGGTTGTAATGGTGGTTAGAGAGCTTCTCTTAGGGGTAGTCTTT
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AAGAAGATTTGGGTTTAGGGTAGTGAATTGGGGAGATTGAATGAATGAATGAATACATGG
TTGTAATGGTGGTTAGAGAGCTTCTCTTAGGGGTAGTCTTTGTATAATTTGAATCATATC
CTTTGAAGAAGCTTTTTGCTTTT

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AAGTCAAAGGCTCCTTCAAGCTCCCCTCCGCTACTAAATCAACCGCCGTTGCTGCTCCTG
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AACCGGCGGCGAAAGGATCCAAGAAGACCAAAGCTGCTGTAGCTGTGAAGCCCAAGGCTA
AAGTAGTCGCTGCTAAACCTAAACCGAAGACGAAGACAGTGGCTGCTGTGTCCAAGACCA
AAGCTGTTGCTGCTGCTGCTAAGCCTAAGGCTAAAGAGAGACCTGCTAAAGCGGCGGGGA
CTTCGACTAGAACTTCTCCAGGGAAGAAGAAGGCTGCTCCTGCTGCTAAGAAAGCCGCCG
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TTTAGGGTAGTGAATTGGGGAGATTGAATGAATGAATGAATACATGGTTGTAATGGTGGT
TAGAGAGCTTCTCTTAGGGGTAGTCTTTGTATAATTTGAATCATATCCTTTGAAGAAGCT
TTTTGCTTTTATCTCTGTTTCTGGTTTCTTCTTGAAACCCCCCTTTTGTTCCTTGTTGTA
ATTTTTGTGTTTGTTTTGAGATTAAAGCTTCTTACATGGCT

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CG
ACGAGGAAGGTGAAGAAGTGAAAGAAGATTTGGGTTTAGGGTAGTGAATTGGGGAGATTG
AATGAATGAATGAATACATGGTTGTAATGGTGGTTAGAGAGCTTCTCTTAGGGGTAGTCT
TTGTATAATTTGAATCATATCCTTTGAAGAAGCTTTTTGCTTTTATCTCTGTTTCTGGTT
TCTTCTTGAAACCCCCCTTTTGTTCCTTGTTGTAATTTTTGTGTTTGTTTTGAGATTAAA
GCTTCTT
ACATGGC

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DS 



AS 2 11

CO CL262Contig1 923 9 11 U
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CATCGACAAGTACAACAAACTTCTTATTCAAGACATAACCGAAACAGCAACATAA*CGAA
AAGTGACGACGTCTCATTTGACCTCGATCTGGCGAACATCGTTTCTCTCCTCTTCTTTCA
TCTTCGGAACCACAACTCTCAAAACACCGTTCTTCATCTCCGCCTTAATCTCATCGGTCT
TGTATACCTTCTCCGGCAACCCAATCCGACTTGTGAACCTCCTACTATTACCAGTCTCTC
CACCTTCCTCGCCACCATCCTCCACATCTTTCCCTTCTCCTCTTATAACCAGAGTGTCGT
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GAGCATCGTCTTTCTCTTTGATGTCCCAACCACGCCGAGTTCCAGATGCTCCCATGCCAC
GGCTGGCTGATAACAGAGGATTCTCCATGAACTGATCCATAAGGTTCAGCACCTGGCTAA
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AAACAGAGCGATCAGAGCGTCGGTGTACATCAACACCGCGTTCATTTTCGCCTCCGTCGT
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GGGAAGCAGGAGCCACGGTGGAAGCGAGAAGTCTCCTGAGAGCGAGGGATGACGCCATGT
GTACTGGAAACAGTAAAGTTTGTCTTAGGAACTTTAGCTGAGAGTGTAGTTATTATGATA
TTATCTGAGTTAGTAGTGTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 25 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 40 55 55 55 55 
55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 35 50 
50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RS1F393JQ U 6
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AF RS1DR77JQ U 1
AF RS1CU49JQ U 77
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GCACACAGCTTCAATAAACACAAGAGCTTCCCTTAGCTTTAGAGTACATGACTCGCATCG
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ACGACGTCTCATTTGACCTCGATCTGGCGAACATCGTTTCTCTCCTCTTCTTTCATCTTC
GGAACCACAACTCTCAAAACACCGTTCTTCATCTCCGCCTTAATCTCATCGGTCTTGTAT
ACCTTCTCCGGCAACCCAATCCGACTTGTGAACCTCCTACTATTACCAGTCTCTCCACCT
TCCTCGCCACCATCCTCCACATCTTTCCCTTCTCCTCTTATAACCAGAGTGTCGTTCTCC
AAAGCCAGCTTTACATCCTCTCTGCTCAGCCCAGGCATGTCGATCCTCAGGTAGAGAGCA
TCGTCTTTCTCTTTGATGTCCCAACCACGCCGAGTTCCAGATGCTCCCATG

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AACATAAA
AGCTTCCCTTAGCTTTAGAGTACATGACTCGCATCGACAAGTACAACAAACTTCTTATTC
AAGACATAACCGAAACAGCAACATAAACGAAAAGTGACGACGTCTCAGTTGACCTCGATC
TGGCGAACATCGTTCCTCTCCTCTTCCTTCATCTTCGGAACCACAACTTTCAAAACACCG
TTCTTCATCTCCGCCTTAATCTCATCGGTCTTGTATACCTTCTCCGGCAACCCAATCCGA
CTTGTGAACCTCCTACTATTACCAGTCTCTCCACCTTCCTCGCCACCATCCTCCACATCT
TTCCCTTCTCCCCTTATAACCAGAGTGTCGTTCTCCAAAGCCAGCTTCACATCCTCTCTG
CTGAGCCCAGGCATGTCGATCCTCAAGCAGAGAGCGTCGTCTTTCTCTTTGATGTCCCAA
CCACGCCGAGCTCCAGATGCTCCCATGCCACGGCTCGATGATAACAGAGGATTCTCCATG
AACTGATCCATAAGGTTCAGCACCTGGCTAATACTCCTCGTCGGTGAAAATGGGTCAAAC
ACGTCTGTGAAGAAATCATCACCACGGCGAGAAACAGAGCGATCAGAGCGTCGGTCTACG
TCAACACCGCGTTCATTTTCGCCTC

QA 9 633 9 633
DS 

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TAAACGCACACAGCTTCAATAAACACAAGAGCTTCCCTTAGCTTTAGAGTACATGACTCG
CATCGACAAGTACAACAAACTTCTTATTCAAGACATAACCGAAACAGCAACATAA*CGAA
AAGTGACGACGTCTCATTTGACCTCGATCTGGCGAACATCGTTTCTCTCCTCTTCTTTCA
TCTTCGGAACCACAACTCTCAAAACACCGTTCTTCATCTCCGCCTTAATCTCATCGGTCT
TGTATACCTTCTCCGGCAACCCAATCCGACTTGTGAACCTCCTACTATTACCAGTCTCTC
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TCTCCAAAGCCAGCTTT***TCCTCTCTGCTCAGCCCAGGCATGTCGATCCTCAGGTAGA
GAGCGTCGTCTTTCTCTTTGATGTCCCAACCACGCCGAGTTCCAGATGCTCCCATGCCAC
GGCTGGCTGATAACAGAGGATTCTCCATGAACTGATCCATAAGGTTCAGCACCTGGCTAA
TACTCCTCGTCGGCGAAAAAGGGTCGAACACGTCTGTGAAGAAATCATCACCACGGCGAG
AAACAGAGCGATCAGAGCGTCGGTGTACATCAACACCGCGTTCATTTTCGCCTCCGTCGT
AGCTCCTGACCGCGTTAGTGT

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AGCTTCCCTTAGCTTTAGAGTACATGACTCGCATCGACAAGTACAACAAACTTCTTATTC
AAGACATAACCGAAACAGCAACATAA*CGAAAAGTGACGACGTCTCATTTGACCTCGATC
TGGCGAACATCGTTTCTCTCCTCTTCTTTCATCTTCGGAACCACAACTCTCAAAACACCG
TTCTTCATCTCCGCCTTAATCTCATCGGTCTTGTATACCTTCTCCGGCAACCCAATCCGA
CTCGTGAACCTCCTACTATTACCAGTCTCTCCACCTTCCTCGCCACCATCCTCCACATCT
TTCCTTTCTCCTCTTATAACCAGAGTGTCGTTCTCCAAAGCCAGCTTTACATCCTCTCTG
CTCAGCCCAGGCATGTCGATCCTCAGGTAGAGAGCATCGTCTTTCTCTTTGATGTCCCAA
CCACGCCGAGTTCCAGATGCTCCCATGCCACGGCTGGCTGATAACAGAGGATTCTCCATG
AACTGATCCATAAGGTTCAGCACCTGGCTAATACTCCTCGTCGGCGAAAAAGGGTCGAAC
ACGTCTGTGAAGAAATCATCACCACGGCGAGAAACAGAGCGATCAGAGCGTCGGTGTACA
TCAACACCGCGTTCATTTTCGCCTCCGTCGTAGCTCCTGACCGCGCTAGTGTTTAGGAGG
CGAGAGGCAGCTTGTG

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DS 

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CAAGACATAACCGAAACAGCAACATAA*CGAAAAGTAACGACGTCTCATTTGACCTCGAT
CTGGCGAACATCGTTTCTCTCCTCTTCTTTCATCTTCGGAACCACAACTCTCAAAACACC
GTTCTTCATCTCCGCCTTAATCTCATCGGTCTTGTATACCTTCTCCGGCAACCCAATCCG
ACTTGTGAACCTCCTACTATTACCAGTCTCTCCACCTTCCTCGCCACCATCCTCCACATC
TTTCCCTTCTCCTCTTATAACCAGAGTGTCGTTCTCCAAAGCCAGCTTTACATCCTCTCT
GCTCAGCCCAGGCATGTCGATCCTCAGGTAGAGAGCATCGTCTTTCTCTTTGATGTCCCA
ACCACGCCGAGTTCCAGATGCTCCCATGCCACGGCTGGCTGATAACAGAGGATTCTCCAT
GAACTGATCCATAAGGTTCAGCACCTGGCTAATACTCCTCGCCGGCGAAAAAGGGTCGAA
CACGTCTGTGAAGAAATCATCACCACGGCGAGAAACAGAGCGATCAGAGCGTCGGTGTAC
ATCAACACCGCGTTCATTTTCGCCTCCGTCGTAGCTCCTGACCGCGTTAGTGTTTAGGAG
GCGAGAGGCAGCTTGTGGACGAAGAAAGCTGCGGGGAGCAGGAGCCACGGTGGAAGCGAG
AAGTCTCCTGAGAGCGAGGGA

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DS 

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AT
ACGAAAAGTGACGACGTCTCATTTGACCTCGATCTGGCGAACATCGTTTCTCTCCTCTTC
TTTCATCTTCGGAACCACAACTCTCAAAACACCGTTCTTCATCTCCGC*TTAATCTCATC
GGTCTTGTATACCTTCTCCGGCAACCCAATCCGACTCGTGAACCTCCTACTATTACCAGT
CTCTCCACCTTCCTCGCCACCATCCTCCACATCTTTCCTTTCTCCTCTTATAACCAGAGT
GTCGTTCTCCAAAGCCAGCTTTACATCCTCTCTGCTCAGCCCAGGCATGTCGATCCTCAG
GTAGAGAGCATCGTCTTTCTCTTTGATGTCCCAACCACGCCGAGTTCCAGATGCTCCCAT
GCCACGGCTGGCTGATAACAGAGGATTCTCCATGAACTGATCCATAAGGTTCAGCACCTG
GCTAATACTCCTCGTCGGCGAAAAAGGGTCGAACACGTCTGTGAAGAAATCATCACCACG
GCGAGAAACAGAGCGATCAGAGCGTCGGTGTACATCAACACCGCGTTCATTTTCGCCTCC
GTCGTAGCTCCTGACCGCGCTAGTGTTTAGGAGGCGAGAGGCAGCTTGTGGACGAAGAAA
GCTGCGGGAAGCAGGAGCCACGGTGGAAGCGAGAAGTTTCCTGAGAGCGAGGGATGACGC
CATGTGTACTGGAAACAGTAAAGTTTGTCTTAGGAACTTTAGCTGAGAGTGTAGT

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TCTTTCATCTTCGGAACCACAACTCTCAAAACACCGTTCTTCATCTCCGC*TTAATCTCA
TCGGTCTTGTATACTTTCTCCGGCAACCCAATCCGACTTGTGAACCTCCTACTATTACCA
GTCTCTCCACCTTCCTCGCCACCATCCTCCACATCTTTCCCTTCTCCTCTTATAACCAGA
GTGTCGTTCTCCAAAGCCAGCTTTACATCCTCTCTGCTCAGCCCAGGCATGTCGATCCTC
AGGTAGAGAGCATCGTCTTTCTCTTTGATGTCCCAACCACGCCGAGTTCCAGATGCTCCC
ATGCCAAGGCTGGCTGATAACAGAGGATTCTCCATGAACTGATCCATAAGGTTCAGCACC
TGGCTAATACTCCTCGTCGGCGAAAAAGGGTCGAACACGTCTGTGAAGAAATCATCACCA
CGGCGAGAAACAGAGCGATCAGAGCGTCGGTGTACATCAACACCGCGTTCATCTTCGCCT
CCGTCGTAGCTCCTGACCGCGTTAGTGTTTAGGAGGCGAGAGGCAGCTTGTGGACGAAGA
AAGCTGCGGGAAGCAGGAGCCACGGTGGAAGCGAGAAGTCTCCTGAGAGCGAGGGATGAC
GCCATGTGTACTGGAAACAGTAAAGTTTGTCTTAGGAACTTTAGCTGAGAGTGTAGTTAT
TATGATATTATCTGAGTTAGTAGTGT
GCCC

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DS 

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CTTTCTCCGGCAACCCAATCCGACTTGTGAACCTCTTACTATTACCAGTCTCTCCACCTT
CCTCGCCACCATCCTCCACATCTTTCCCTTCTCCTCTTATAACCAGAGTGTCGTTCTCCA
AAGCCAGCTTT***TCCTCTCTGCTCAGCCCAGGCATGTCGATCCTCAGGTAGAGAGCGT
CGTCTTTCTCTTTGATGTCCCAACCACGCCGAGTTCCAGATGCTCCCATGCCACGGCTGG
CTGATAACAGAGGATTCTCCATGAACTGATCCATAAGGTTCAGCACCTGGCTAATACTCC
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TGACCGCGTTAGTGTTTAGGAGGCGAGAGGCAGCTTGTGGACGAAGAAAGCTGCGGGAAG
CAGGAGCCACGGTGGAAGCGAGAAGTCTCCTGAGAGCGAGGGATGACGCCATGTGTACTG
GAAACAGTAAAGTTTGTCTTAGGAACTTTAGCTGAGAGTGTAGTTATTATGATATTATCT
GAGTTAGTAGTGT
CC

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AGCTTTACATCCTCTCTGCTCAGCCCAGGCATGTCGATCCTCAGGTAGAGAGCATCGTCT
TTCTCTTTGATGTCCCAACCACGCCGAGTTCCAGATGCTCCCATGCCACGGCTGGCTGAT
AACAGAGGATTCTCCATGAACTGATCCATAAGGTTCAGCACCTGGCTAATACTCCTCGCC
GGCGAAAAAGGGTCGAACACGTCTGTGAAGAAATCATCACCACGGCGAGAAACAGAGCGA
TCAGAGCGTCGGTGTACATCAACACCGCGTTCATTTTCGCCTCCGTCGTAGCTCCTGACC
GCGTTAGTGTTTAGGAGGCGAGAGGCAGCTTGTGGACGAAGAAAGCTGCGGGGAGCAGGA
GCCACGGTGGAAGCGAGAAGTCTCCTGAGAGCGAGGGATGACGCCATGTGTACTGGAAAC
AGTAAAGTTTGTTTTAGGAACTTTAGCTGAGAGTGTAGTTATTATGATATTATCTGAGTT
AGTAGTGTGCCC

QA 1 552 1 552
DS 



CO CL262Contig2 722 2 7 U
GGCACACTAACTCAGATAGAGACTATACTCACTGATAAACTTTCCAAGACAAGCTTTCTG
TTTCTACTACACATGGCGTCATCCCTCGCTCTCAGGAGACTTCTCGCTTCCACCGTTGCT
CCTGCTTCCCGTGGCTTTCTTCGTCCACAAGCTACTTCTCGCCTCCTAAACACTAACGCG
GTCAGGAGCTACGACGGAGGCGAAAATGAACGCGGTGTTGACGTAGACCGACGCTCTGAT
CGCTCTGTTTCTCGCCGTGGTGATGATTTCTTCACAGACGTGTTTGACCCATTTTCACCG
ACGAGGAGTATTAGCCAGGTGCTGAACCTTATGGATCAGTTCATGGAGAATCCTCTGTTA
TCAGCGAGCCGTGGCATGGGAGCATCTGGAGCCCGGCGTGGTTGGGACATCAAAGAGAAA
GACGACGCTCTCTGCTTGAGGATCGACATGCCTGGGCTCAGCAGAGAGGATGTGAAGCTG
GCTTTGGAGAACGACACTCTGGTTATAAGGGGAGAAGGGAAAGATGTGGAGGATGGTGGC
GAGGAAGGTGGAGAGACTGGTAATAGTAGGAGGTTCACAAGTCGGATTGGGTTGCCGGAG
AAAGTATACAAGACCGATGAGATTAAAGCGGAGATGAAGAACGGTGTTTTGAAAGTTGTG
GTTCCGAAGATGAAGGAGAGGAGAGGAACGATGTTCGCCAGATCGAGGTCAACTGAGACG
TC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1FO73TF U 2
AF RS1EM24TF U 1
BS 1 106 RS1EM24TF
BS 107 107 RS1FO73TF
BS 108 363 RS1EM24TF
BS 364 364 RS1FO73TF
BS 365 392 RS1EM24TF
BS 393 393 RS1FO73TF
BS 394 722 RS1EM24TF

RD RS1FO73TF 563 0 0
GG
ACACTAACTCAGATAGAGACTATACTCACTGATAAACTTTCCAAGACAAGCTTTCTGTTT
CTACTACACATGGCGTCATCCCTCGCTCTCAGGAGACTTCTCGCTTCCACCGTTGCTCCT
GCTTCCCGTGGCTTTCTTCGTCCACAAGCTACTTCTCGCCTCCTAAACACTAACGCGGTC
AGGAGCTACGACGGAGGCGAAAATGAACGCGGTGTTGACGTAGACCGACGCTCTGATCGC
TCTGTTTCTCGCCGTGGTGATGATTTCTTCACAGACGTGTTTGACCCATTTTCACCGACG
AGGAGTATTAGCCAGGTGCTGAACCTTATGGATCAGTTCATGGAGAATCCTCTGTTATCA
GCGAGCCGTGGCATGGGAGCATCTGGAGCCCGGCGTGGTTGGGACATCAAAGAGAAAGAC
GACGCTCTCTGCTTGAGGATCGACATGCCTGGGCTCAGCAGAGAGGATGTGAAGCTGGCT
TTGGAGAACGACACTCTGGTTATAAGGGGAGAAGGGAAAGATGTGGAGGATGGTGGCGAG
GAAGGTGGAGAGACTGGTAAT

QA 3 563 3 563
DS 

RD RS1EM24TF 722 0 0
GGCACACTAACTCAGATAGAGACTATACTCACTGATAAACTTTCCAAGACAAGCTTTCTG
TTTCTACTACACATGGCGTCATCCCTCGCTCTCAGGAGACTTCTCGTTTCCACCGTTGCT
CCTGCTTCCCGTGGCTTTCTTCGTCCACAAGCTACTTCTCGCCTCCTAAACACTAACGCG
GTCAGGAGCTACGACGGAGGCGAAAATGAACGCGGTGTTGACGTAGACCGACGCTCTGAT
CGCTCTGTTTCTCGCCGTGGTGATGATTTCTTCACAGACGTGTTTGACCCATTTTCACCG
ACGAGGAGTATTAGCCAGGTGCTGAACCTTATGGATCAGTTCATGGAGAATCCTCTGTTA
TCATCGAGCCGTGGCATGGGAGCATCTGGAGCTCGGCGTGGTTGGGACATCAAAGAGAAA
GACGACGCTCTCTGCTTGAGGATCGACATGCCTGGGCTCAGCAGAGAGGATGTGAAGCTG
GCTTTGGAGAACGACACTCTGGTTATAAGGGGAGAAGGGAAAGATGTGGAGGATGGTGGC
GAGGAAGGTGGAGAGACTGGTAATAGTAGGAGGTTCACAAGTCGGATTGGGTTGCCGGAG
AAAGTATACAAGACCGATGAGATTAAAGCGGAGATGAAGAACGGTGTTTTGAAAGTTGTG
GTTCCGAAGATGAAGGAGAGGAGAGGAACGATGTTCGCCAGATCGAGGTCAACTGAGACG
TC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 11

CO CL263Contig1 651 11 20 U
GAACTTCACAAGAATAGAAACAATGAAATGTGAAAAGAAAATTGAAAGGAGAAA*GTATA
ACACACAAGATTTGCGAAATGCCGACAGAGTCAAGACCAAAAACGAATTGAAAAAAA*GC
TTGAGAACTGCGACGAATACATAATGTTTCTCTCATATTCTGCAACCAGTAACTATTGCT
AGAACAAAGCCACAACATTTTTTAATAAAATAAAAAGTGAAAATAGGATTTCTAGTTCTT
GGGAGCGACCTTTTCCTTGGCCTTTTGGAGTTTCAAGACCTTCTTCACAATCTTTTGCTC
CTCCACAAGGAAAGCACGGACGATTCTCTCCCTAACAGCCAAAGCAGACAAAACACCACC
GTACGCACGGTTCACGGTTCTCCTGTTTCTGGATAATCGAGACCTCTTGTACTCAGCAGG
CCTCAAGTGAGGGATACCCTGAATACGCTTGCCGGTAACGGGGCATTTAGGTCCACTGGC
ACGCTTCTTGGTGGTCTGGAATGTCAATTTACCACCAGGGGTTTTGAGGATCCTGTGCTG
GTTGGATTTGGTGGCGTAGCTGTGACGAGAACGGTATACAAGACGCTGCACCATTTTTCA
CGCTCTTTCTTTATCCTCCTTTTAGGGTTTTATCCTGACAGGAGCAGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 
60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 25 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 

AF RS1H025JQB U 30
AF RS1BK43TF C 1
AF RS1FS71JQ U 22
AF RS1BK46TF C 25
AF RS1AN53JQ U 328
AF RS1CZ40JQ U 7
AF RS1H025TF C 30
AF RS1BK43JQ U 253
AF RS1CZ40TF C 7
AF RS1BK46JQ U 74
AF RS1AN53TF C 430
BS 1 6 RS1BK43TF
BS 7 21 RS1CZ40JQ
BS 22 68 RS1FS71JQ
BS 69 69 RS1CZ40JQ
BS 70 124 RS1FS71JQ
BS 125 125 RS1CZ40JQ
BS 126 134 RS1FS71JQ
BS 135 135 RS1CZ40JQ
BS 136 181 RS1FS71JQ
BS 182 182 RS1CZ40JQ
BS 183 247 RS1FS71JQ
BS 248 248 RS1H025JQB
BS 249 346 RS1FS71JQ
BS 347 347 RS1CZ40JQ
BS 348 554 RS1FS71JQ
BS 555 556 RS1CZ40JQ
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BS 558 609 RS1CZ40JQ
BS 610 610 RS1BK43JQ
BS 611 651 RS1CZ40JQ

RD RS1H025JQB 391 0 0
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GTCAAGACCAAAAACGAATTGAAAAAAA*GCTTGAGAACTGCGACGAATACATAATGTTT
CTCTCATATTCTGCAACCAGTAACTATTGCTAGAACAAAGCCACAACATTTTTTAATAAA
ATAAAAAGTGAAA*TAGGATTTCTAGTTCTTGGGAGCGACCTTTTCCTTGGCCTTTTGGA
GCTTCAAGACCTTCTTCACAATCTTTTGCTCCTCCACAAGGAAAGCACGGACGATTCTCT
CCCTAACAGCCAAAGCAAACAAAACACCACCGTACGCACGGGTCACGGTTCTCCTGTTTC
TGGATAATCCAGACCTCTTGTACTCCGCAGG

QA 1 391 1 391
DS 

RD RS1BK43TF 576 0 0
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ACGCACAAGATTTGCGAAATGCCGACAGAGTCAAGACCAAAAACGAATTGAAAAAAA*GC
TTGAGAACTGCGACGAATACATAATGTTTCTCTCATATTCTGCAACCAGTAACTATTGCT
AGAACAAAGCCACAACATTTTTTAATAAAATAAAAAGTGAAAATAGGATTTCTAGTTCTT
GGGAGCGCCCTTTTCCTTGGCCTTTTGGAGTTTCAAGACCTTCTTCACAATCTTTTGCTC
CTCCACAAGGAAAGCACGGACGATTCTCTCCCTAACAGCCAAAGCAGACAAAACACCACC
GCACGCACGGTTCACGGTTCTCCTGTTTCTGGATAATCGAGACCTCTTGTACTCAGCAGG
CCTCAAGTGAGGGATACCCTGAATACGCTTGCCGGTAACGGGGCATTTAGGTCCACTGGC
ACGCTTCTTGGTGGTCTGGAATGTCGATTTACCACCAGGGGTTTTGAGGATCCTGTGCTG
GTTGGATTTGGTGGCGTAGCTGTGACGAGAACGGTA

QA 1 576 1 576
DS 

RD RS1FS71JQ 533 0 0
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CCGACAGAGTCAAGACCAAAAACGAATTGAAAAAAA*GCTTGAAAACTGCGACAAATACA
TAATGTTTCTCTCATATTCTGCAACCAGTAACTATTGCTAAAACAAAGCCACAACATTTT
TTAATAAAATAAAAAGTGAAAATAGGATTTCTAGTTCTTGGGAGCGCCCTTTTCCTTGGC
CTTTTGGAGTTTCAAGACCTTCTTCACAATCTTTTGCTCCTCCACAAGGAAAGCACGGAC
GATTCTCTCCCTAACAGCCAAAGCAAACAAAACACCACCGTACGCACGGTTCACGGTTCT
CCTGTTTCTGGATAATCGAGACCTCTTGTACTCAGCAGGCCTCAAGTGAGGGATACCCTG
AATACGCTTGCCGGTAACGGGGCATTTAGGTCCACTGGCACGCTTCTTGGTGGTCTGGAA
TGTCAATTTACCACCAGGGGTTTTGAGGATCCTGTGCTGGTTGGATTTGGTGG

QA 1 533 1 533
DS 

RD RS1BK46TF 563 0 0
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ACAGAGTCAAGACCAAAAACGAATTGAAAAAAA*GCTTGAGAACTGCGACGAATACATAA
TGTTTCTCTCATATTCTGCAACCAGTAACTATTGCTAGAACAAAGCCACAACATTTTTTA
ATAAAATAAAAAGTGAAAATAGGATTTCTAGTTCTTGGGAGCGACCTTTTCCTTGGCCTT
TTGGAGTTTCAAGACCTTCTTCACAATCTTTTGCTCCTCCACAAGGAAAGCACGGACGAT
TCTCTCCCTAACAGCCAAAGCAGACAAAACACCACCGTACGCACGGTTCACGGTTCTCCT
GTTTCTGGATAATCGAGACCTCTTGTACTCAGCAGGCCTCAAGTGAGGGATACCCTGAAT
ACGCTTGCCGGTAACGGGGCATTTAGGTCCACTGGCACGCTTCTTGGTGGTCTGGAATGT
CAATTTACCACCAGGGGTTTTGAGGATCCTGTGCTGGTTGGATTTGGTGGCGTAGCTGTG
ACGAGAACGGTATACAAGACGCT

QA 1 563 1 563
DS 

RD RS1AN53JQ 256 0 0
CTCCCTAACAGCCAAAGCAGACAAAACACCACCGTACGCACGGTTCACGGTTCTCCTGTT
TCTGGATAATCGAGACCTCTTGTACTCAGCAGGCCTCAAGTGAGGGATACCCTGAATACC
CTTGCCGGTAACGGGGCATTTAGGTCCACTGGCACGCTTCTTGGTGGTCTGGAATGTCAA
TTTACCACCAGGGGTTTTGAGGATCCTGTGCTGGTTGGATTTGGTGGCGTAACTGTGACG
AGAACGGTATACAAGA

QA 1 256 1 256
DS 

RD RS1CZ40JQ 645 0 0
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AAGATTTGCGAAATGCCGACAGAGTCAAGACCAAAAACGAATTGAAAAAAAAGCTTGAGA
ACTGCGACGAATACATAATGTTTCTCTCATATCCTGCAACCAGTAACTATTGCTAGAACA
AAGCCACAACATTTTTTAATAAAATAAAAAGTGAAAATAGGATTTCTAGTTCTTGGGAGC
GCCCTTTTCCTTGGCCTTTTGGAGTTTCAAGACCTTCTTCACAATCTTTTGCTCCTCCAC
AAGGAAAGCACGGACGATTCTCTCCCTAACAGCCAAAGCAGACAAAACACCACCGTACGC
ACGGTTCACGGTTCTCCTGTTTCTGGATAATCGAGACCTCTTGTACTCAGCAGGCCTCAA
GTGAGGGATACCCTGAATACGCTTGCCGGTAACGGGGCATTTAGGTCCACTGGTACGCTT
CTTGGTGGTCTGGAATGTCAATTTACCACCAGGGGTTTTGAGGATCCTGTGCTGGTTGGA
TTTGGTGGCGCAGCTGTGACGAGAACGGTATACAAGACGCTGCACCATTTTTCACGCTCT
TTCCTTATCCTCCTTTTAGGGTTTTATCCTGACAGGAGCAGAGCC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1H025TF 618 0 0
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GTCAAGACCAAAAACGAATTGAAAAAAA*GCTTGAGAACTGCGACGAATACATAATGTTT
CTCTCATATTCTGCAACCAGTAACTATTGCTAGAACAAAGCCACAACATTTTTTAATAAA
ATAAAAAGTGAAA*TAGGATTTCTAGTTCTTGGGAGCGACCTTTTCCTTGGCCTTTTGGA
GCTTCAAGACCTTCTTCACAATCTTTTGCTCCTCCACAAGGAAAGCACGGACGATTCTCT
CCCTAACAGCCAAAGCAGACAAAACACCACCGTACGCACGGTTCACGGTTCTCCTGTTTC
TGGATAATCGAGACCTCTTGTACTCAGCAGGCCTCAAGTGAGGGATACCCTGAATACGCT
TGCCGGTAACGGGGCATTTAGGTCCACTGGCACGCTTCTTGGTGGTCTGGAATGTCAATT
TACCACCAGGGGTTTTGAGGATCCTGTGCTGGTTGGATTTGGTGGCGTAGCTGTGACGAG
AACGGTATACAAGACGCTGCACCATTTTTCACGCTCTTTCTTTATCCTCCTTTTAGGGTT
TTATCCTGACGGGAGC
CC

QA 1 616 1 616
DS 

RD RS1BK43JQ 393 0 0
TTCCTTGGCCTTTTGGAGTTTCAAGACCTTCTTCACAATCTTTTGCTCCTCCACAAGGAA
AGCACGGACGATTCTCTCCCTAACAGCCAAAGCAGACAAAACACCACCGCACGCACGGTT
CACGGTTCTCCTGTTTCTGGATAATCGAGACCTCTTGTACTCAGCAGGCCTCAAGTGAGG
GATACCCTGAATACGCTTGCCGGTAACGGGGCATTTAGGTCCACTGGCACGCTTCTTGGT
GGTCTGGAATGTCAATTTACCACCAGGGGTTTTGAGGATCCTGTGCTGGTTGGATTTGGT
GGCGTAGCTGTGACGAGAACGGTATACAAGACGCTGCACCATTTTTCACGCTCTTTCTTT
ATCCTCCTTTTAGGGTTTTATCCTGACAGGAGC

QA 1 393 1 393
DS 

RD RS1CZ40TF 645 0 0
CACAAGAATAGAAACAATGAAATGTGAAAAGAAAATTGAAAGGAGAAA*GTATAACACAC
AAGATTTGCGAAATGCCGACAGAGTCAAGACCAAAAACGAATTGAAAAAAAAGCTTGAGA
ACTGCGACGAATACATAATGTTTCTCTCATATCCTGCAACCAGTAACTATTGCTAGAACA
AAGCCACAACATTTTTTAATAAAATAAAAAGTGAAAATAGGATTTCTAGTTCTTGGGAGC
GCCCTTTTCCTTGGCCTTTTGGAGTTTCAAGACCTTCTTCACAATCTTTTGCTCCTCCAC
AAGGAAAGCACGGACGATTCTCTCCCTAACAGCCAAAGCAGACAAAACACCACCGTACGC
ACGGTTCACGGTTCTCCTGTTTCTGGATAATCGAGACCTCTTGTACTCAGCAGGCCTCAA
GTGAGGGATACCCTGAATACGCTTGCCGGTAACGGGGCATTTAGGTCCACTGGTACGCTT
CTTGGTGGTCTGGAATGTCAATTTACCACCAGGGGTTTTGAGGATCCTGTGCTGGTTGGA
TTTGGTGGCGCAGCTGTGACGAGAACGGTATACAAGACGCTGCACCATTTTTCACGCTCT
TTCCTTATCCTCCTTTTAGGGTTTTATCCTGACAGGAGCAGAGCC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1BK46JQ 578 0 0
GCGAAATGTCGACAGAGTCAAGACCAAAAACGAATTGAAAAAAA*GCTTGAGAACTGCGA
CGAATACATAATGTTTCTCTCATATTCTGCAACCAGTAACTATTGCTAGAACAAAGCCAC
AACATTTTTTAATAAAATAAAAAGTGAAAATAGGATTTCTAGTTCTTGGGAGCGACCTTT
TCCTTGGCCTTTTGGAGTTTCAAGACCTTCTTCACAATCTTTTGCTCCTCCACAAGGAAA
GCACGGACGATTCTCTCCCTAACAGCCAAAGCAGACAAAACACCACCGTACGCACGGTTC
ACGGTTCTCCTGTTTCTGGATAATCGAGACCTCTTGTACTCAGCAGGCCTCAAGTGAGGG
ATACCCTGAATACGCTTGCCGGTAACGGGGCATTTAGGTCCACTGGCACGCTTCTTGGTG
GTCTGGAATGTCAATTTACCACCAGGGGTTTTGAGGATCCTGTGCTGGTTGGATTTGGTG
GCGTAGCTGTGACGAGAACGGTATACAAGACGCTGCACCATTTTTCACGCTCTTTCTTTA
TCCTCCTTCTAGGGTTTTATCCTGACGGGAGCAGAGCC

QA 1 578 1 578
DS 

RD RS1AN53TF 222 0 0
AGGGATACCCTGAATACGCTTGCCGGTAACGGGGCATTTAGGTCCACTGGCACGCTTCTT
GGTGGTCTGGAATGTCAATTTACCACCAGGGGTTTTGAGGATCCTGTGCTGGTTGGATTT
GGTGGCGTAGCTGTGACGAGAACGGTATACAAGACGCTGCACCATTTTTCACGCTCTTTC
TTTATCCTCCTTTTAGGGTTTTATCCTGACGGGAGCAGAGCC

QA 1 222 1 222
DS 



AS 1 11

CO CL264Contig1 1882 11 34 U
GGTCTCTTATCTGAAACTAGAGACTGTTGTGAAAAGCAAAACTAAAGTCATCTTCTTAGT
CACCAATCAATGGCGTCTCTGTCTTCAATGCAGATGGTTCACACTTCTCGCTCTGTTGCT
CAGATTGTTGTCAAATCGCAGTTAGTTTCTGCAAAGCAAACAACTCAATCAGTTTGTGTC
GGCGGTTCTGCATTGTCTTCGAGGCTACACTATGCAGCAAGTTTCCCTCTTAAGCAATTC
TCCGGAGCTTCTTATGCGACCATCAAGAACCAAAGAACAGCTTGCGTTAAATCAATGGCT
GCTGAGGAAGAAGAAGTACTGGAACCACCTCAGGCTAAGGTGACACACAAGGTTTACTTT
GATGTGGAGATTGGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTGTGATGGGTCTGTTTGGTGATGTC
GTGCCTAAAACCGTTGATAACTTCCGTGTCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGTTAC
AAGGGTTCTTCTTTCCATCGTATCATCAAAGATTTCATGATCCAAGGAGGTGACTTCACT
GAGGGAAATGGTACAGGAGGTATTAGTATCTACGGTGCCAAATTCGAAGACGAAAACTTC
ACATTGAAGCATACTGGACCTGGAATCTTGAGCATGGCCAACGCTGGTCCTAATACTAAT
GGAAGCCAGTTCTTCATTTGCACTGTCCAAACTTCATGGTTAGATAACAAGCATGTTGTG
TTCGGACAAGTCCTTGAAGGTATGAAGCTTGTGAGGACACTTGAATCTCAGGAGACACGC
GCCTTCAATGTTCCCAAGAAAGGTTGCAGAATCTATGCCTGTGGAGAGCTCCCACTTGAA
GCTTGAAGCCTTCAATGTTGTATCTTTGTTTTTGCTATTATGAGAGTTTCAAGTTATGAT
GGTCTTATGTTTTTATTTATTTATGATTACATATGAGTTTGAAAGTACAATGAAAGGTTC
CTCTTAATCACATGTAAGATTCTTATTTAAAAGTGTCTGTCTTTTAAGCTTGAACC*ATG
GTTTCAACCGCCACTTGCTGAACAATCGCCTCGAGCTTATCATCTTTGTTGTCTTCCCAT
AGATCAGGTATAGCTTCCTTAAGGTTGTGAATGCTGCTTAGTGCATGGTCTGCACCTGGA
ACTAGCACCGAGTCACCCACGAACACGGTTTTTAGCCCTGCTGCTTTAGCACTAGCGATG
TTACGAACACTGTCATCCAAGAACATCGTTTTGCGTGGATCGATGATGCCTACTATGCGT
ATGGCTGCTTCAAAGGCTTGAACAGAGGGTTTACAGAGGATCTGAGTGGTTGTGTCAGAA
GAAGGGTTTAGTGTTTCGAAGCAAATGATTCCTTCAAAGCAGTCTTCTAGACCCAAACGG
CTAAGTGTTCGTGTCGCGTGAGCTTTGTCTGCATTAGTAAAGATGATCTTACGGTGAGGC
ATAGAGAGAAGAAGGTTACGGAGGATGGGATCAGGCTTTAGTTTCTCGTAGGGAAGTCTT
CCATGCACATACTCGTGGAACTCATCGTTGTCGAACTCATAACCCATGAGCTTGAGACCA
GCCATGGTGGTTCCATATTCTTTGTAAAGATCAAGACACATCTTCGGAACTTCACTCTCT
TCGATCCCTAGTTGATTAAGCATGAACTCTTGGATGTTGTTTCGACATGCTAAGTTGATT
CCAATGCTCAAAGGGTATAGAGTATCGTCCATATCAAAGAACAAACATTCGTACTTAGCT
CCAAATTCATTCATCCTTAATCTCGTGAAGAAGAACAAGAAGAAGAGAGTTAAGAGATAT
ATTTAGTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGCTTCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGG
CATATGTCCGGTACCGTCGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

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GG
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CC

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AAATGATTCCTTCAAAGCAGTCTTCTAGACCCAAACGGCTAAGTGTTCGTGTCGCGTGAG
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DS 

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TGAAAGGTTCCTCTTAATCACATGTAAGATTCTTATTTAAAAGTGTCTGTCTTTTAAGCT
TGAACC*ATGGTTTCAACCGCCACTTGCTGAACAATCGCCTCGAGCTTATCATCTTTGTT
GTCTTCCCATAGATCAGGTATAGCTTCCTTAAGGTTGTGAATGCTGCTTAGTGCATGGTC
TGCACCTGGAACTAGCACCGAGTCACCCACGAACACGGTTTTTAGCCCTGCTGCTTTAGC
ACTAGCGATGTTACGAACACTGTCATCCAAGAACATCGTTTTGCGTGGATCGATGATGCC
TACTATGCGTATGGCTGCTTCAAAGGCTTGAACAGAGGGTTTACAGAGGATCTGAGTGGT
TGTGTCAGAAGAAGGGTTTAGTGTTTCGAAGCAAATGATTCCTTCAAAGCAGTCTTCTAG
ACCCAAACGGCTAAGTGTTCGTGTCGCGTGAGCTTTGTCTGCATTAGTAAAGATGATCTT
ACGGTGAGGCATAGAGAGAAGAAGGTTACGGAGGATGGGATCAGGCTTTAGTTTCTCGTA
GGGAAGTCTTCCATGCACATACTCGTGGAACTCATCGTTGTCGAACTCATAACCCATGAG
CTTGAGACCAGCCATGGTGGTTCCATATTCTTTGTAAAGATCAAGACACATCTTCGGAAC
TTCACTCTCTTCGATCCCTAGTTGATTAAGCATGAACTCTTGGATGTTGTTTCGACATGC
TAAGTTGATTCCAATGCTCAAAGGGTATAGAGTATCGTCCATATCAAAGAACAAACATTC
GTACTTAGCTC

QA 1 851 1 851
DS 

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AAGTTATGATGGTCTTATGTTTTTATTTATTTATGATTACATATGAGTTTGAAAGTACAA
TGAAAGGTTCCTCTTAATCACATGTAAGATTCTTATTTAAAAGTGTCTGTCTTTTAAGCT
TGAACC*ATGGTTTCAACCGCCACTTGCTGAACAATCGCCTCGAGCTTATCATCTTTGTT
GTCTTCCCATAGATCAGGTATAGCTTCCTTAAGGTTGTGAATGCTGCTTAGTGCATGGTC
TGCACCTGGAACTAGCACCGAGTCACCCACGAACACGGTTTTTAGCCCTGCTGCTTTAGC
ACTAGCGATGTTACGAACACTGTCATCCAAGAACATCGTTTTGCGTGGATCGATGATGCC
TACTATGCGTATGGCTGCTTCAAAGGCTTGAACAGAGGGTTTACAGAGGATCTGAGTGGT
TGTGTCAGAAGAAGGGTTTAGTGTTTCGAAGCAAATGATTCCTTCAAAGCAGTCTTCTAG
ACCCAAACGGCTAAGTGTTCGTGTCGCGTGAGCTTTGTCTGCATTAGTAAAGATGATCTT
ACGGTGAGGCATAGAGAGAAGAAGGTTACGGAGGATGGGATCAGGCTTTAGTTTCTCGTA
GGGAAGTCTTCCATGCACATACTCGTGGAACTCATCGTTGTCGAACTCATAACCCATGAG
CTTGAGACCAGCCATGGTGGTTCCATATTCTTTGTAAAGATCAAGACACATCTTCGGAAC
TTCACTCTCTTCGATCCCTAGTTGATTAAGCATGAACTCTTGGATGTTGTTTCGACATGC
TAAGTTGATTCCAATGCTCAAAGGGTATAGAGTATCGTCCATATCAAAGAACAAACATTC
GTACTTAGCTCCAAATTCATTCATCCTTAATCTCGTGAAGAAGAACA

QA 1 887 1 887
DS 

RD RS1BX64TF 871 0 0
CTCT
ATCACATGTAAGATTCT*ATTTAAAAGTGTCTGTCTTTTAAGCTTGAACC*ATGGTTTCA
ACCGCCACTTGCTGAACAATCGCCTCGAGCTTATCATCTTTGTTGTCTTCCCATAGATCA
GGTATAGCTTCCTTAAGGTTGTGAATGCTGCTTAGTGCATGGTCTGCACCTGGAACTAGC
ACCGAGTCACCCACGAACACGGTTTTTAGCCCTGCTGCTTTCGCACTAGCGATGTTACGA
ACACTGTCATCCAAGAACATCGTTTTGCGTGGATCGATGATGCCTACTATGCGTATGGCT
GCTTCAAAGGCTTGAACAGAGGGTTTACAGAGGATCTGAGTGGTTGTGTCAGAAGAAGGG
TTTAGTGTTTCGAAGCAAATGATTCCTTCAAAGCAGTCTTCTAGACCCAAACGGCTAAGT
GTTCGTGTCGCGTGAGCTTTGTCTGCATTAGTAAAGATGATCTTACGGTGAGGCATAGAG
AGAAGAAGGTTACGGAGGATGGGATCAGGCTTTAGTTTCTCGTAGGGAAGTCTTCCATGC
ACATACTCGTGGAACTCATCGTTGTCGAACTCATAACCCATGAGCTTGAGACCAGCCATG
GTGGTTCCATATTCTTTGTAAAGATCAAGACACATCTTCGGAACTTCACTCTCTTCGATA
CCTAGTTGATTAAGCATGAACTCTTGGATGTTGTTTCGACATGCTAAGTTGATTCCAATG
CTCAAAGGGTATAGAGTATCGTCCATATCAAAGAACAAACATTCGTACTTAGCTCCAAAT
TCATTCATCCTTAATCTCGTGAAGAAGAACAAGAAGAAGAGAGTTAAGAGATATATTTAG
TAAGAGAGAGAGAGAGAG
AGAGCTTCC

QA 5 862 5 862
DS 

RD RS1D536TF 704 0 0
GTCTGCACCTGGAACTAGCACCGAGTCACCCACGAACACGGTTTTTAGCCCTGCTGCTTT
AGCACTAGCGATGTTACGAACACTGTCATCCAAGAACATCGTTTTGCGTGGATCGATGAC
GCCTACTATGCGTATGGCTGCTTCAAAGGCTTGAACAGAGGGTTTACAGAGGATCTGAGT
GGTTGTGTCAGAAGAAGGGTTTAGTGTTTCGAAGCAAATGATTCCTTCAAAGCAGTCTTC
TAGACCCAAACGGCTAAGTGTTCGTGTCGCGTGAGCTTTGTCTGCATTAGTAAAGATGAT
CTTACGGTGAGGCATAGAGAGAAGAAGGTTACGGAGGATGGGATCAGGCTTTAGTTTCTC
GTAGGGAAGTCTTCCATGCACATACTCGTGGAACTCATCGTTGTCGAACTCATAACCCAT
GAGCTTGAGACCAGCCATGGTGGTTCCATATTCTTTGTAAAGATCAAGACACATCTTCGG
AACTTCACTCTCTTCGATACCTAGTTGATTAAGCATGAACTCTTGGATGTTGTTTCGACA
TGCTAAGTTGATTCCAATGCTCAAAGGGTATA*AGTATCGTCCATATCAAAGAACAAACA
TTCGTACTTAGCTCCAAATTCATTCATCCTTAATCTCGTGAAGAAGAACAAGAAGAAGAG
AGTTAAGAGATATATTTAGTAAGAGAGAGAGAGAGAG
CGCTTCC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RS1A056TV 899 0 0
TATTTAAAAGTGTCTGTCTTTTAAGCTTGAACCCATGGTTTCAACCGCCACTTGCTGAAC
AATCGCCTCGAGCTTATCATCTTTGTTGTCTTCCCATAGATCAGGTATAGCTTCCTTAAG
GTTGTGAATGCTGCTTAGTGCATGGTCTGCACCTGGAACTAGCACCGAGTCACCCACGAA
CACGGTTTTTAGCCCTGCTGCTTTAGCACTAGCGATGTTACGAACACTGTCATCCAAGAA
CATCGTTTTGCGTGGATCGATGATGCCTACTATGCGTATGGCTGCTTCAAAGGCTTGAAC
AGAGGGTTTACAGAGGATCTGAGTGGTTGTGTCAGAAGAAGGGTTTAGTGTTTCGAAGCA
AATGATTCCTTCAAAGCAGTCTTCTAGACCCAAACGGCTAAGTGTTCGTGTCGCGTGAGC
TTTGTCTGCATTAGTAAAGATGATCTTACGGTGAGGCATAGAGAGAAGAAGGTTACGGAG
GATGGGATCAGGCTTTAGTTTCTCGTAGGGAAGTCTTCCATGCACATACTCGTGGAACTC
ATCGTTGTCGAACTCATAACCCATGAGCTTGAGACCAGCCATGGTGGTTCCATATTCTTT
GTAAAGATCAAGACACATCTTCGGAACTTCACTCTCTTCGATCCCTAGTTGATTAAGCAT
GAACTCTTGGATGTTGTTTCGACATGCTAAGTTGATTCCAATGCTCAAAGGGTATAGAGT
ATCGTCCATATCAAAGAACAAACATTCGTACTTAGCTCCAAATTCATTCATCCTTAATCT
CGTGAAGAAGAACAAGAAGAAGAGAGTTAAGAGATATATTTAGTAAGAGAGAGAGAGAGA
GAGCGCTTCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 899 1 899
DS 

RD RS1A056TF 863 0 0
GGTTTCAACCGCCACTTGCTGAACAATCGCCTCGAGCTTATCATCTTTGTTGTCTTCCCA
TAGATCAGGTATAGCTTCCTTAAGGTTGTGAATGCTGCTTAGTGCATGGTCTGCACCTGG
AACTAGCACCGAGTCACCCACGAACACGGTTTTTAGCCCTGCTGCTTTAGCACTAGCGAT
GTTACGAACACTGTCATCCAAGAACATCGTTTTGCGTGGATCGATGATGCCTACTATGCG
TATGGCTGCTTCAAAGGCTTGAACAGAGGGTTTACAGAGGATCTGAGTGGTTGTGTCAGA
AGAAGGGTTTAGTGTTTCGAAGCAAATGATTCCTTCAAAGCAGTCTTCTAGACCCAAACG
GCTAAGTGTTCGTGTCGCGTGAGCTTTGTCTGCATTAGTAAAGATGATCTTACGGTGAGG
CATAGAGAGAAGAAGGTTACGGAGGATGGGATCAGGCTTTAGTTTCTCGTAGGGAAGTCT
TCCATGCACATACTCGTGGAACTCATCGTTGTCGAACTCATAACCCATGAGCTTGAGACC
AGCCATGGTGGTTCCATATTCTTTGTAAAGATCAAGACACATCTTCGGAACTTCACTCTC
TTCGATCCCTAGTTGATTAAGCATGAACTCTTGGATGTTGTTTCGACATGCTAAGTTGAT
TCCAATGCTCAAAGGGTATAGAGTATCGTCCATATCAAAGAACAAACATTCGTACTTAGC
TCCAAATTCATTCATCCTTAATCTCGTGAAGAAGAACAAGAAGAAGAGAGTTAAGAGATA
TATTTAGTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGCTTCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGG
GCTTATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 863 1 863
DS 



AS 4 11

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GAAACCTGTCCACAAGGTCCTCGGCGGTGGAAAGCCTGCTGATGTGTTCTTGTGGAGGGA
TAAAAAACTGTCAGCTGCTGTTCTTGGTGTGGCCACTCTCATCTGGGTTCTCTTTGAACT
GGTTGAGTATCACTTGTTGAGTCTTTTGTGTCACGTTTCGATACTTGCTCTTGGAGGCTT
GTTTCTCTGGTCCAATGCTCACACTTTCATCAAAAAGTAATCATCAGATTTCTCTGAGAC
TTGATTAATGCCTTATTTTTGTTTTTCTCAGATCCTTGTTTTCTTTTTTGGAACAGGAGT
CCATCTCAGATTCCAGAAATCCATGTTCCAGAGGAGCCTTTCCTTTTGATTGCTTCTTCC
CTCAGAAACGAACTAAACCAAGGTTTTGTTATCCTGCGAAGCATTGCCTTAGGCAGGGAC
CTTAAAAAATTCTTCATGGTCGTTGTTGGTCTATGGATCATCTCGGTGGTAGGCAACTGG
TTCAACTTCCTGACTCTGGTGTACATCTGCTTCGTGTTGTTGCACACAGTGCCAATGATG
TACGAGAAACACGAGGACAAGGTTGATCCATTTGCAGAGAAAGCGTTCAAAGAGTTGCAC
AAACATTACCTTGTGTTTGATGAAAAGGTTGTTTCTAAGATCCCCATTGCTTCCCTCAAA
GCTAAGTTGGGTTAACCAGAGACTTGTGTCTGTTTCCTTTCGTATACTTGTTTTTGTTTT
TTGTTTTGATATTTTGATCAATGTGAAATTGGTGGGTCATTTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CR42TF U 1
AF RS1CR42JQ C 40
BS 1 408 RS1CR42TF
BS 409 765 RS1CR42JQ

RD RS1CR42TF 408 0 0
GAAACCTGTCCACAAGGTCCTCGGCGGTGGAAAGCCTGCTGATGTGTTCTTGTGGAGGGA
TAAAAAACTGTCAGCTGCTGTTCTTGGTGTGGCCACTCTCATCTGGGTTCTCTTTGAACT
GGTTGAGTATCACTTGTTGAGTCTTTTGTGTCACGTTTCGATACTTGCTCTTGGAGGCTT
GTTTCTCTGGTCCAATGCTCACACTTTCATCAAAAAGTAATCATCAGATTTCTCTGAGAC
TTGATTAATGCCTTATTTTTGTTTTTCTCAGATCCTTGTTTTCTTTTTTGGAACAGGAGT
CCATCTCAGATTCCAGAAATCCATGTTCCAGAGGAGCCTTTCCTTTTGATTGCTTCTTCC
CTCAGAAACGAACTAAACCAAGGTTTTGTTATCCTGCGAAGCATTGCC

QA 1 408 1 408
DS 

RD RS1CR42JQ 726 0 0
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CATCTGGGTTCTCTTTGAACTGGTTGAGTATCACTTGTTGAGTCTTTTGTGTCACGTTTC
GATACTTGCTCTTGGAGGCTTGTTTCTCTGGTCCAATGCTCACACTTTCATCAAAAAGTA
ATCATCAGATTTCTCTGAGACTTGATTAATGCCTTATTTTTGTTTTTCTCAGATCCTTGT
TTTCTTTTT*GGAACAGGAGTCCATCTCAGATTCCAGAAATCCATGTTCCAGAGGAGCCT
TTCCTTTTGATTGCTTCTTCCCTCAGAAACGAACTAAACCAAGGTTTTGTTATCCTGCGA
AGCATTGCCTTAGGCAGGGACCTTAAAAAATTCTTCATGGTCGTTGTTGGTCTATGGATC
ATCTCGGTGGTAGGCAACTGGTTCAACTTCCTGACTCTGGTGTACATCTGCTTCGTGTTG
TTGCACACAGTGCCAATGATGTACGAGAAACACGAGGACAAGGTTGATCCATTTGCAGAG
AAAGCGTTCAAAGAGTTGCACAAACATTACCTTGTGTTTGATGAAAAGGTTGTTTCTAAG
ATCCCCATTGCTTCCCTCAAAGCTAAGTTGGGTTAACCAGAGACTTGTGTCTGTTTCCTT
TCGTATACTTGTTTTTGTTTTTTGTTTTGATATTTTGATCAATGTGAAATTGGTGGGTCA
TTTCCG

QA 1 726 1 726
DS 



CO CL265Contig2 694 2 14 U
GGATTCACGTTCCATATATTTTCAAAAATCCTCTGTTGAATTTCGAAACTCGTGAAAACC
AATGGCGGAGGAAATTGAGAAATCGATGCCCGCGGAGCAGTCTCTGATGGACAAGATCTC
CGAGAAGATCCACCAACACGACTCGTCGTCCGACTCCGAGTACGAGAAACCTGATTCGCC
ATCGGCTGTGAAAGCGAAGATCTATCGCTCGTTTGGCAGAGAGAAACCTGTCCACAAGGT
CCACGGCGGTGGAAAGCCTGCTGATGTGTTCTTGTGGAGGGATAAAAAAACTGTCAGCTG
CTGTTCTTGGTGTGGCCACTCTCATCTGGGTTCTCTTTGAGCTGGTTGAGTATCACTTGT
TGAGTCTTTTGTGTCACGTTTCGATACTTGCTCTTGGAGGCTTGTTTCTCTGGTCCAATG
CTCACACTTTCATCAAAAAGAGTCCACCTCAGATTCCAGAAATCCATGTTCCAGAGGAGC
CTTTCCTTTTGATTGCTTCTTCCCTCAGAAACGAACTAAACCAAGGTTTTGTTATCCTGC
GAAGCATTGCCTTAGGCAGGGACCTTAAAAAATTCTTCATGGTCGTTGTTGGTCTATGGA
TCATCTCGGTGGTAGGCAACTGGTTCAACTTCCTGACTCTGGTGTACATCTGCTTCGTGT
TGTTGCACACAGTGCCAATGATGTACGAGAAACA


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CW44TF U 1
AF RS1DY73TF U 1
BS 1 150 RS1CW44TF
BS 151 151 RS1DY73TF
BS 152 166 RS1CW44TF
BS 167 167 RS1DY73TF
BS 168 209 RS1CW44TF
BS 210 210 RS1DY73TF
BS 211 243 RS1CW44TF
BS 244 244 RS1DY73TF
BS 245 289 RS1CW44TF
BS 290 290 RS1DY73TF
BS 291 473 RS1CW44TF
BS 474 474 RS1DY73TF
BS 475 521 RS1CW44TF
BS 522 694 RS1DY73TF

RD RS1CW44TF 521 0 0
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CGAGAAGATCCACCAACACGACTCGTCGTCTGACTCCGAGTACGAGCAACCTGATTCGCC
ATCGGCTGTGAAAGCGAAGATCTATCGCTTGTTTGGCAGAGAGAAACCTGTCCACAAGGT
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CTGTTCTTGGTGTGGCCACTCTCATCTGGGTTCTCTTTGAGCTGGTTGAGTATCACTTGT
TGAGTCTTTTGTGTCACGTTTCGATACTTGCTCTTGGAGGCTTGTTTCTCTGGTCCAATG
CTCACACTTTCATCAAAAAGAGTCCACCTCAGATTCCAGAAATCCATGTTCCATAGGAGC
CTTTCCTTTTGATTGCTTCTTCCCTCAGAAACGAACTAAAC

QA 1 521 1 521
DS 

RD RS1DY73TF 694 0 0
GG
ATTCACGTTCCATATATTTTCAAAAATCCTCTGTTGAATTTCGAAACTCGTGAAAACCAA
TGGCGGAGGAAATTGAGAAATCGATGCCCGCGGAGCAGTCTCTGATGGACAAGATCTCCG
AGAAGATCCACCATCACGACTCGTCGTCCGACTCCGAGTACGAGAAACCTGATTCGCCAT
CGGCTGTGAAAGCGAAGATCTATCGCTCGTTTGGCAGAGAGAAACCTGTCCACAAGGTCC
TCGGCGGTGGAAAGCCTGCTGATGTGTTCTTGTGGAGGGATAAAAAAACTGTCAGCTGCT
GTTCTTGGTGTGGCCACTCTCATCTGGGTTCTCTTTGAGCTGGTTGAGTATCACTTGTTG
AGTCTTTTGTGTCACGTTTCGATACTTGCTCTTGGAGGCTTGTTTCTCTGGTCCAATGCT
CACACTTTCATCAAAAAGAGTCCACCTCAGATTCCAGAAATCCATGTTCCAGAGGAGCCT
TTCCTTTTGATTGCTTCTTCCCTCAGAAACGAACTAAACCAAGGTTTTGTTATCCTGCGA
AGCATTGCCTTAGGCAGGGACCTTAAAAAATTCTTCATGGTCGTTGTTGGTCTATGGATC
ATCTCGGTGGTAGGCAACTGGTTCAACTTCCTGACTCTGGTGTACATCTGCTTCGTGTTG
TTGCACACAGTGCCAATGATGTACGAGAAACA

QA 3 694 3 694
DS 



CO CL265Contig3 888 3 12 U
AATTCAAGTATTCTCCATAAATAACCGGAAAGGCAAATGTGTAATATCTTTTTAATTCGA
AAAATTACAACAAAAAAAACTGCAAACAAAATGTGATGCAGAACATTTGGGTCATTAGCG
TGCAAAACTCTGAAAATGACCCACCAATTTCACATTGATCAAAATATCAAAACAAAAAAC
AAAAACAAGTATACGAAAGGAAACAGACACAAGTCTCTGGTTAACCCAACTTAGCTTTGA
GGGAAGCAATGGGGATCTTAGAAACAACCTTTTCATCAAACACAAGGTAATGTTTGTGCA
ACTCTTTGAACGCTTTCTCTGCAAATGGATCAACCTTGTCCTCGTGTTTCTCGTACATCA
TTGGCACTGTGTGCAACAACACGAAGCAGATGTACACCAGAGTCAGGAAGTTGAACCAGT
TGCCTACCACCGAGATGATCCATAGACCAACAACGACCATGAAGAATTTTTTAAGGTCCC
TGCCTAAGGCAATGCTTCGCAGGATAACAAAACCTTGGTTTAGTTCGTTTCTGAGGGAAG
AAGCAATCAAAAGGAAAGGCTCCTATGGAACATGGATTTCTGGAATCTGAGGTGGACTCT
TTTTGATGAAAGTGTGAGCATTGGACCAGAGAAACAAGCCTCCAAGAGCAAGTATCGAAA
CGTGACACAAAAGACTCAACAAGTGATACTCAACCAGCTCAAAGAGAACCCAGATGAGAG
TGGCCACACCAAGAACAGCAGCTGACAGTTTTTTATCCCTCCACAAGAACACATCAGCAG
GCTTTCCACCGCCCTGGACCTTGTGGACAGGTTTCTCTCTGCCAACAAGCGATAGATCTT
CGCTTTCACAGCCGATGGCGATCAGTTGCTCGTACTCGGAGTCAGACG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GD37JQ U 32
AF RS1DY73JQ U 1
AF RS1CW44JQ U 5
BS 1 23 RS1DY73JQ
BS 24 24 RS1CW44JQ
BS 25 100 RS1DY73JQ
BS 101 101 RS1CW44JQ
BS 102 109 RS1DY73JQ
BS 110 110 RS1CW44JQ
BS 111 388 RS1DY73JQ
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BS 390 564 RS1DY73JQ
BS 565 565 RS1CW44JQ
BS 566 712 RS1DY73JQ
BS 713 888 RS1CW44JQ

RD RS1GD37JQ 466 0 0
GGCAAATGTGTAATATCTTTTTAATTCGAAAAATTACAACAAAAAAA*CTGCAAACAAAA
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ACATTGATCAAAATATCAAAACAAAAAACAAAAACAAGTATACGAAAGGAAACAGACACA
AGTCTCTGGTTAACCCAACTTAGCTTTGAGGGAAGCAATGGGGATCTTAGAAACAACCTT
TTCATCAAACACAAGGTAATGTTTGTGCAACTCTTTGAACGCTTTCTCTGCAAATGGATC
AACCTTGTCCTCGTGTTTCTCGTACATCATTGGCACTGTGTGCAACAACACGAAGCAGAT
GTACACCAGAGTCAGGAAGTTGAACCAGTTGCCTACCACCGAGATGATCCATAGACCAAC
AACGACCATGAAGAATTTTTTAAGGTCCCTGCCTAAGGCAATGCTT

QA 1 466 1 466
DS 

RD RS1DY73JQ 712 0 0
AATTCAAGTATTCTCCATAAATAGCCGGAAAGGCAAATGTGTAATATCTTTTTAATTCGA
AAAATTACAACAAAAAAAACTGCAAACAAAATGTGATGCAAAACATTTGAGTCATTAGCG
TGCAAAACTCTGAAAATGACCCACCAATTTCACATTGATCAAAATATCAAAACAAAAAAC
AAAAACAAGTATACGAAAGGAAACAGACACAAGTCTCTGGTTAACCCAACTTAGCTTTGA
GGGAAGCAATGGGGATCTTAGAAACAACCTTTTCATCAAACACAAGGTAATGTTTGTGCA
ACTCTTTGAACGCTTTCTCTGCAAATGGATCAACCTTGTCCTCGTGTTTCTCGTACATCA
TTGGCACTGTGTGCAACAACACGAAGCAAATGTACACCAGAGTCAGGAAGTTGAACCAGT
TGCCTACCACCGAGATGATCCATAGACCAACAACGACCATGAAGAATTTTTTAAGGTCCC
TGCCTAAGGCAATGCTTCGCAGGATAACAAAACCTTGGTTTAGTTCGTTTCTGAGGGAAG
AAGCAATCAAAAGGAAAGGCTCCTCTGGAACATGGATTTCTGGAATCTGAGGTGGACTCT
TTTTGATGAAAGTGTGAGCATTGGACCAGAGAAACAAGCCTCCAAGAGCAAGTATCGAAA
CGTGACACAAAAGACTCAACAAGTGATACTCAACCAGCTCAAAGAGAACCCA

QA 1 712 1 712
DS 

RD RS1CW44JQ 884 0 0
CAAGTATTCTCCATAAATAACCGGAAAGGCAAATGTGTAATATCTTTTTAATTCGAAAAA
TTACAACAAAAAAAACTGCAAACAAAATGTGATGCAGAACATTTGGGTCATTAGCGTGCA
AAACTCTGAAAATGACCCACCAATTTCACATTGATCAAAATATCAAAACAAAAAACAAAA
ACAAGTATACGAAAGGAAACAGACACAAGTCTCTGGTTAACCCAACTTAGCTTTGAGGGA
AGCAATGGGGATCTTAGAAACAACCTTTTCATCAAACACAAGGTAATGTTTGTGCAACTC
TTTGAACGCTTTCTCTGCAAATGGATCAACCTTGTCCTCGTGTTTCTCGTACATCATTGG
CACTGTGTGCAACAACACGAAGCAGATGTACACCAGAGTCAGGAAGTTGAACCAGTTGCC
TACCACCGAGATGATCCATAGACCAACAACGACCATGAAGAATTTTTTAAGGTCCCTGCC
TAAGGCAATGCTTCGCAGGATAACAAAACCTTGGTTTAGTTCGTTTCTGAGGGAAGAAGC
AATCAAAAGGAAAGGCTCCTATGGAACATGGATTTCTGGAATCTGAGGTGGACTCTTTTT
GATGAAAGTGTGAGCATTGGACCAGAGAAACAAGCCTCCAAGAGCAAGTATCGAAACGTG
ACACAAAAGACTCAACAAGTGATACTCAACCAGCTCAAAGAGAACCCAGATGAGAGTGGC
CACACCAAGAACAGCAGCTGACAGTTTTTTATCCCTCCACAAGAACACATCAGCAGGCTT
TCCACCGCCCTGGACCTTGTGGACAGGTTTCTCTCTGCCAACAAGCGATAGATCTTCGCT
TTCACAGCCGATGGCGATCAGTTGCTCGTACTCGGAGTCAGACG

QA 1 884 1 884
DS 



CO CL265Contig4 1055 4 9 U
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GAAACCTGATTCGCCATCGGCTGCGAAAGCGAAGATCTATCGCTTGTTTGGCAGAGAGAA
ACCTGTTCACAAGGTCCTCGGCGGTGGAAAGCCTGCTGATGTGTTCTTGTGGAGGGATAA
AAAACTGTCAGCTGCTGTTCTTGGTGTGGCCACTCTCATCTGGGTTCTCTTTGAGCTGGT
TGAGTATCATTTGTTGAGTCTTTTGTGTCACGTTTCCATACTTGCTCTTGGAGGCTTGTT
TCTCTGGTCCAATGCTCACACTTTCGTCAAAAAGAGTCCACCTCAGATTCCAGAAATCCA
TGTTCCAGAGGAGCCTTTCCTTTTGATTGCTTCTTCCCTCAGAAACGAACTAAACCAAGG
TTTTGTTATCCTACGAAGCATTGCCTTAGGCAGGGACCTTAAAAAATTCTTCATGGTCGT
TGTTGGTCTATGGATCATCTCGGTGGTGGGG*AACTGGTTCAACTTCCTGACTCTGGTGT
ACATCTGCTTCGTGTTGCTGCACACAGTGCCAATGATGTATGAGAAGCACGAGGACAAGG
TTGACCCGTTTGCAGAGAAAGCGTTCAAGGAGTTGCACAAACATTACCTTGTGTTTGATG
AAAAGGTTGTTTTTAAGATCCCCATTGCTTCCCTCAAAGCTAAGTTGGGTTAAACAGACA
CTTATGTCTTGTTTCCTTTCGCTTACTTTTTTTTTTTTTTTTTGATATTTTGTTCAATGT
GAAATTGGTGGGTCATTTTCAGAGTTTTGCACGCTAATGACCCAAATGTTCTGCATCACA
TTTTGTTTGCAGTTTTTTTTGTTGTAATTTTGGGAATTAAAAAGATATTACACATTTGCC
TTTCCGGCTATTTATGGAGAATACTTGAATTAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

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AF RS1H572JQB C 549
AF RS1G340TF U 458
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G
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C
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G
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AAAAAGATATTACACATTTGCCTTTCCGGCTATTTATGGAGAATACTTGAATT
AATT

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DS 



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BQ
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10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

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AF RS1FN30TF C 64
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TCCGTTTGAATGAGCACACCCGTCGATCTTAATGTT
TCTG

QA 1 336 1 336
DS 

RD RS1FY94JQ 556 0 0
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CTGTGGAAACCTCTTAGTATCCGTACAGTAATTGTAGATCATGTAGTTCTTCTGAACCCA
TCTGAGTCTAGCTTGGCTCGTTGAATCCATTTCTTGAGTGTACCAATTAGAGCTTGGTTT
CGCCGTGGTACAAGACGACCTTCCGTTTGAATGAGCACACCCGTCGATCTTAATGTTCCT
GTAAGAAGCAGTGAATGGAGCTTTGGACCAATCCGTTTTAACCAGACCGCCTCTAGTTGC
CCAATCGTCTGCGTTCCATAAACTTGCGTACATCCTCATTGGCTTGCTCTTTGGAAACAA
GACACCGAGAGACTCCGAGTTCTTAAACTCTCTAATTGGCGTGTTATCAACAGTTAGTAT
GATTCTTTGAGGGTTC

QA 1 556 1 556
DS 

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AATCGAACACAATTGACAAAAGAGGAAGGAGAGCATTATACATATAGAAGAAAAAGAAAG
CAGAGGAGGAGGATAAATAGATAAAATGTATATGATCCCTCTATGACCTTGTTGCACATT
CCCGAGGGATTCCATGTGGAAACCTCTTAGTATCCGTACAGTAATTGTAGATCATGTAGT
TCTTCTGAACCCATCTGAGTCTAGCTTGGCTCGTTGAATCCATTTCTTGAGTGTACCAAT
TAAAGCTTGGTTTCCCCGTGGTACAAGACGACCTTCCGTTTGAATGAGCACACCCGTCGA
TCTTAATGTTCCTGTAAGAAGCAGTGAATGGAGCTTTGGACCAATCCGTTTTAACCAGAC
CGCCTCTAGTTGCCCAATCGTCTGCGTTCCATAAACTTGCGTACATCCTCATCGGCTTGC
TCTTTGGAAACAAGACAGCAAGAGACTCCGAGTTTTTAAACTCTCTAATTGGCGTGTTAT
CGAC
C

QA 1 544 1 544
DS 

RD RS1FN30TF 545 0 0
GTATAAATATATAGGCACGCCTTTAATTTGCTTTATTGGACAAAGATATACAATCGAAAG
AATCGAACACAATTGACAAAAGAGGAAGGAGAGCATTATACATATAGAAGAAAAAGAAAG
CAGAGGAGGAGGATAAATAGATAAAATGTATATGATCCCTCTATGACCTTGTTGCACATT
CCCGAGGGATTCCATGTGGAAACCTCTTAGTATCCGTACAGTAATTGTAGATCATGTAGT
TCTTCTGAACCCATCTGAGTCTAGCTTGGCTCGTTGAATCCATTTCTTGAGTGTACCAAT
TAGAGCTTGGTTTCGCCGTGGTACAAGACGACCTTCCGTTTGAATGAGCACACCCGTCGA
TCTTAATGTTCCTGTAAGAAGCAGTGAATGGAGCTTTGGACCAATCCGTTTTAACCAGAC
CGCCTCTAGTTGCCCAATCGTCTGCGTTCCATAAACTTGCGTACATCCTCATCGGCTTGC
TCTTTGGAAACAAGACAGCAAGAGACTCCGAGTTTTTAAACTCTCTAATTGGCGTGTTAT
CGAC
C

QA 1 544 1 544
DS 

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GGAAGGAGAGCATTATACATATAGAAGAAAAAGAAAGCAGAGGAGGAGGATAAATAGATA
AAATGTATATGATCCCTCTATGACCTTGTTGCACATTCCCGAGGGATTCCCTGTGGAAAC
CTCTTAGTATCCGTACAGTAATTGTAGATCATGTAGTTCTTCTGAACCCATCTGAGTCTA
GCTTGGCTCGTTGAATCCATTTCTTGAGTGTACCAATTAGAGCTTGGTTTCGCCGTGGTA
CAAGACGACCTTCCGTTTGAATGAGCACACCCGTCGATCTTAATGTTCCTGTAAGAAGCA
GTGAATGGAGCTTTGGACCAATCCGTTTTAACCAGACCGCCTCTAGTTGCCCAATCGTCT
GCGTTCCATAAACTTGCGTACATCCTCATCGGCTTGCTCTTTGGAAACAAGACACCAAGA
GACTCCGAGTTTTTAAACTCTCTAATTGGCGTGTTATCGACGGTTAATATGATTCTTTGA
GGGTTCCAGAGGATTGAGTAAGTGTGGAAATTTGCTGTTGGGTCGAA

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DS 

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CATGTATAAATATATAGGCACGCCTTTAATTTGCTTTATTGGGCAAAGATATACAATCGA
AAGAATCGAACACAATTGACAAAAGAGGAAGGAGAGCATTATACATATAGAAGAAAAAGA
AAGCAGAGGAGGAGGATAAATAGATAAAATGTATATGATCCCTCTATGACCTTGTTGCAC
ATTCCCGAGGGATTCCCTGTGGAAACCTCTTAGTATCCGTACAGTAATTGTAGATCATGT
AGTTCTTCTGAACCCATCTGAGTCTAGCTTGGCTAGTTGAATCCATTTCTTGAGTGTACC
AATTAGAGCTTGGTTTCGCCGTGGTACAAGACGACCTTCCGTTTGAATGAGCACACCCGT
CGATCTTAATGTTCCTGTAAGAAGCAGTGAATGGAGCTTTGGACCAATCCGTTTTAACCA
GACCGCCTCTAGTTGCCCAATCGTCTGCGTTCCATAAACTTGCGTACATCCTCATCGGCT
TGCTCTTTGGAAACAAGACACCAAGAGACTCCGAGTTTTTAAACTCTCTAATTGGCGTGT
TATCGACGGTTAATATGATTCTTTGAGGGTTCCAGAGGATTGAGTAAGTGTGGAAATTTG
CTGTTGGGTCGAACCAGAGATGGAATTGTTGCTCTTTATCACCTTTACCTTGAGTGTAAA
CATAG*TGTGTAGAGTA

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DS 

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AAAAAGAAAGCAGAGGAGGAGGATAAATAGATAAAATGTATATGATCCCTCTATGACCTT
GTTGCACATTCCCGAGGGATTCCCTGTGGAAACCTCTTAGTATCCGTACAGTAATTGTAG
ATCATGTAGTTCTTCTGAACCCATCTGAGTCTAGCTTGGCTCGTTGAATCCATTTCTTGA
GTGTACCAATTAGAGCTTGGTTTCGCCGTGGTACAAGACGACCTTCCGTTTGAATGAGCA
CACCCGTCGATCTTAATGTTCCTGTAAGAAGCAGTGAATGGAGCTTTGGACCAATCCGTT
TTAACCAGACCGCCTCTAGTTGCCCAATCGTCTGCGTTCCATAAACTTGCGTACATCCTC
ATCGGCTTGCTCTTTGGAAACAAGACACCAAGAGACTCCGAGTTTTTAAACTCTCTAATT
GGCGTGTTATCGACGGTTAATATGATTCTTTGAGGGTTCCAGAGGATTGAGTAAGTGTGG
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GTGTAAACATTGGTGTGTAGAGTATAAGGATCTCCACTCATGTTACCCAAGAACTCAAAA
TCAATCTCATCCCAGGTCGTTCCTTCCGATTTCAAATAGAAAGTTGTGACTGTGCCTGCT
G

QA 1 721 1 721
DS 

RD RS1AW23TF 643 0 0
TGTGGAAA
CTCTTAGTATCCGTACAGTAATTGTAGATCATGTAGTTCTTCTGAACCCATCTGAGTCTA
GCTTGGCTAGTTGAATCCATTTCTTGAGTGTACCAATTAGAGCTTGGTTTCGCCGTGGTA
CAAGACGACCTTCCGTTTGAATGAGCACACCCGTCGATCTTAATGTTCCTGTAAGAAGCA
GTGAATGGAGCTTTGGACCAATCCGTTTTAACCAGACCGCCTCTAGTTGCCCAATCGTCT
GCGTTCCATAAACTTGCGTACATCCTCATCGGCTTGCTCTTTGGAAACAAGACACCAAGA
GACTCCGAGTTTTTAAACTCTCTAATTGGCGTGTTATCGACGGTTAATATGATTCTTTGA
GGGTTCCAGAGGATTGAGTAAGTGTGGAAATTTGCTGTTGGGTCGAACCAGAGATGGAAT
TGTTGCTCTTTATCACCTTTACCTTGAGTGTAAACATAGGTGTGTAGAGTATAAGGATCT
CCACTCATGTTACCCAAGAACTCAAAATCAATCTCATCCCAGGTCGTTCCTTCCGATTTC
AAATAGAAAGTTGTGACTGTGCCTGCTGAGTTACCAGGAACAAGCTTAATCTGCATATCA
ATCTTACCAAACAAATACTCTGTTTTGGATTGAAA

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DS 

RD RS1G366TF 706 0 0
TCTTAATG
TCCTGTAAGAAGCAGTGAATGGAGCTTTGGACCAATCCGTTTTAACCAGACCGCCTCTAG
TTGCCCAATCGTCTGCGTTCCATAAACTTGCGTACATCCTCATCGGCTTGCTCTTTGGAA
ACAAGACACCAAGAGACTCCGAGTTTTTAAACTCTCTAATTGGCGTGTTATCGACGGTTA
ATATGATTCTTTGAGGGTTCCAGAGGATTGAGTAAGTGTGGAAATTTGCTGTTGGGTCGA
ACCAGAGATGGAATTGTTGCTCTTTATCACCTTTACCTTGAGTGTAAACATTGGTGTGTA
GAGTATAAGGATCTCCACTCATGTTACCCAAGAACTCAAAATCAATCTCATCCCAGGTCG
TTCCTTCCGATTTCAAATAGAAAGTTGTGACTGTGCCTGCTGAGTTACCAGGAACAAGCT
TAATCTGCATATCAATCTTACCAAACAAATACTCTGTTTTGGATTGAAAACCAGAACCAG
ATGATTTGTCTAAGGTGAGAGTAAGAAGCTGGCCGTTGTTGAGTATCTTCCCACGGCCGT
TTCCCCAAGCCACGTTGACGTCGCTGTTGAAGTCAGCGGTGGAGGCTGAAAACGCCACCG
CGAGGAGAGCTGTGAATAATAATATTTTGAAAGGAGACATTGTTGTGTGTGCGTACGTGT
GGGTGTATGTGTTTGGAGTTCGGTGAGGAATGTGAGCC

QA 9 706 9 706
DS 

RD RS1FY94TF 616 0 0
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CGAGTTCTTAAACTCTCTAATTGGCGTGTTATCAACAGTTAGTATGATTCTTTGAGGGTT
CCAGAGGATTGAGTAAGTGTGGAAATTTGCTGTTGGGTCGAACCAGAGATGGAATTGTTG
CTCTTTATCACCTTTACCTTGAGTGTAAACATTGGTGTGTAGAGTATAAGGATCTCCACT
CATGTTACCCAAGAACTCAAAATCAATCTCATCCCAGGTCGTTCCTTCCGATTTCAAATA
GAAAGTTGTGACTGTGCCTGCTGAGTTACCAGGAAAAAGCTTAATCTGCATATCAATCTT
ACCAAACAAATACTCTGTTTTGGATTGAAAACCAGAACCAGATGATTTGTCTAAGGTGAG
AGTAAGAAGCTGGCCGTTGTTGAGTATCTTCCCACGGCCGTTTCCCCAAGCCACGTTGAC
GTCGCTGTTGAAGTCAGCGGTGGAGGCTGAAAACGCCGCCGCGAGGAGAGCTGTGAATAA
TAATATTTTGAAAGGAGACATTGTTGTGTGTGCGTACGTGTGGGTGTATGTGTTTGGAGT
TCGGTGAGGAATGT
CC

QA 1 614 1 614
DS 

RD RS1D672TF 594 0 0
ATCGGCTTGCTCTTTGGAAACAAGACACCAAGAGACTCCGAGTTTTTAAACTCTCTAATT
GGCGTGTTATCGACGGTTAATATGATTCTTTGAGGGTTCCAGAGGATTGAGTAAGTGTGG
AAATTTGCTGTTGGGTCGAACCAGAGATGGAATTGTTGCTCTTTATCACCTTTACCTTGA
GTGTAAACATTGGTGTGTAGAGTATAAGGATCTCCACTCATGTTACCCAAGAACTCAAAA
TCAATCTCATCCCAGGTCGTTCCTTCCGATTTCAAATAGAAAGTTGTGACTGTGCCTGCT
GAGTTACCAGGAACAAGCTTAATCTGCATATCAATCTTACCAAACAAATACTCTGTTTTG
GATTGAAAACCAGAACCAGATGATTTGTCTAAGGTGAGAGTAAGAAGCTGGCCGTTGTTG
AGTATCTTCCCACGGCCGTTTCCCCAAGCCACGTTGACGTCGCTGTTGAAGTCAGCGGTG
GAGGCTGAAAACGCCGCCGCGAGGAGAGCTGTGAATAATAATATTTTGAAAGGAGACATT
GTTGTGTGTGCGTACGTGTGGGTGTATGTGTTTGGAGTTCGGTGAGGAATGT
CC

QA 1 592 1 592
DS 



AS 3 9

CO CL267Contig1 987 3 18 U
CGCTGAGGAATTGATTTATTAGAATGTCTAACCAGCAAAATCAAAACGTACCAACGTCAA
AATCACAAGACCCCAAACAAAAGAAAAAGCTACGCAAATCCGAGAGTACATAAAACAATC
AAATGACAAAAATTCAAATGCAATGCGAATCCTCCGAGTCTTGGAGACACCACATCCACA
CATGTCGCAGCTCAAGCATCAGCAAACCCGAGCTCAGAAAGCTTCAAGTGGGCCTCAGCG
TAATCATTGAAAAAGGCTTCCTCATCAGCAGCGTATTTCTCAACCAAAGAACGGAATTTG
GGATCGTCCAATAGTGACTTGTCAGAAACAAGTTGAATAAGACCTTCCTTCTCACCGCTC
AGGAGCTCCTTGAAATAAGAGTTGTCGAAAATAAGAGGGTTTGAAGTCCAAGGACCTTCA
AAGCCAGACCTATCCTTGTGGCATCTCCCCAGAGTGTGGGCACCAGATAAAGCCACGATG
TCATTGTCAGTCAAACCCATCTGCTTTGCAA*GACTTCTCTCAAGTGGTTACAACCCTTT
GTAGCATCAGGAAGACGACCCTCTGGAGGTGGCTGAGGCTTGTCCTCTCTTCCAGGGTGG
AACTGAATTTCAGGTCCACCAGTGACTTCAACAGCAACAACACCAGCAAGCTGATGGAAA
TCAGCAAAAGAGATGGTAGGGAACTGCACCCTGATGGGCTCCAACAACCCAAGAGCAATC
TGGATACCACTGTTGGCCTCATGAGCTTGCTCATCGGTGAACCTCATTGTTCCAAAGGGA
CCACCAGTCTTTGTGGCAGAGTCAAATGTTCCAGCAGAGTGCCATGCGAGGCGGACCATG
ATAGGTGCACAATGCTTCTCAGCGATCAAGCCTCTGAGCTTCCTCCTGCACTTCTCAATA
GCCTTCTTGTAGTCCGCGCTCACATTTGGGTAGTTCTTCGTCATCTCTGCTAAAAATCTG
AAACACTTTCTCGAGAGAGGATAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GS69JQ U 3
AF RS1BT47JQ U 1
AF RS1BT47TF C 359
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BS 59 59 RS1GS69JQ
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RD RS1GS69JQ 770 0 0
GGGAGA
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GACCCCAAACAAAAGAAAAAGCTACGCAAATCCGAGAGTACATTAAGCAATCAAATGACA
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GAAAAAGGCTTCCTCATCAGCAGCGTATTTCTCAACCAAAGAACGGAATTTGGGATCGTC
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CTTGAAATAAGAGTTGTCGAAAATAAGAGGGTTTGAAGTCCAAGGACCTTCAAAGCCAGA
CCTATCCTTGTGGCATCTCCCCAGAGTGTGGGCACCAGATAAAGCCACAATGTCATTGTC
AGTCAAACCCATCTGCTTTGCAAAGACTTCTCTCAAGTGGTTACAACCCTTTGTAGCATC
AGGAAGACGACCCTCTGGAGGTGGCTGAGGCTTGTCCTCTCTTCCAGGGTGGAACTGAAT
TTCAGGTCCACCAGTGACTTCAACAGCAACAACACCAGCAAGCTGATGGAAATCAGCAAA
AGAGATGGTAGGGAACTGCACCCTGATGGGCTCCAACAACCCAAGAGCAATCTGGATACC
ACTGTTGGCCTCATGAGCTTGCTCATCGGTGAACCTCATTGTTC

QA 7 770 7 770
DS 

RD RS1BT47JQ 790 0 0
CGCTGAGGAATTGATTTATTAGAATGTCTAACCAGCAAAATCAAAACGTACCAACGTCCA
AATCACAAGACCCCCAACAAAAGAAAAGGCTACGCAAATCCGAGAGTACATAAAACAATC
AAATGACAAACGTTCAAATGCAATGCGAATCCTCCGAGTCTTGGAGACACCATATCCACA
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TAATCATTGAAAAGGGCTTCTTCATCAGCAGCGTATTTCTCAACCAAAGAACGGAATTTG
GGATCGTCCAATAGTGACTTGTCAGAGACAAGTTGAATAAGACCTTCCTTCTCACCGCTC
AGGAGCTCCTTGAAATAAGAGTTGTCGAAAATAAGAGGGTTTGAAGTCCAAGGACCTTCA
AAGCCAGACCTATCCTTGTGGCATCTCCCCAGAGTGTGGGCACCAGATAAAGCCACGATG
TCATTGTCAGTCAAACCCATCTGCTTTGCAA*GACTTCTCTCAAGTGGTTACAACCCTTT
GTAGCATCAGGAAGACGACCCTCTGGAGGTGGCTGAGGCTTGTCCTCTCTTCCAGGGTGG
AACTGAATTTCAGGTCCACCAGTGACTTCAACAGCAACAACACCAGCAAGCTGATGGAAA
TCAGCAAAAGAGATGGTAGGGAACTGCACCCTGATGGGCTCCAACAACCCAAGAGCAATC
TGGATACCACTGTTGGCCTCATGAGCTTGCTCATCGGTGAACCTCATTGTTCCAAAGGGA
CCACCAGTC
T

QA 1 789 1 789
DS 

RD RS1BT47TF 629 0 0
CTCAGGAGC
TCTTGAAATAAGAGTTGTCGAAAATAAGAGGGTTTGAAGTCCAAGGACTTTCAAAGCCAG
ACCTATCCTTGTGGCATCTCCCCAGAGTGTGGGCACCAGATAAAGCCACGATGTCATTGT
CAGTCAAACCCATCTGCTTTGCAA*GACTTCTCTCAAGTGGTTACAACCCTTTGTAGCAT
CAGGAAGACGACCCTCTGGAGGTGGCTGAGGCTTGTCCTCTCTTCCAGGGTGGAACTGAA
TTTCAGGTCCACCAGTGACTTCAACAGCAACAACACCAGCAAGCTGATGGAAATCAGCAA
AAGAGATGGTAGGGAACTGCACCCTGATGGGCTCCAACAACCCAAGAGCAATCTGGATAC
CACTGTTGGCCTCATGAGCTTGCTCATCGGTGAACCTCATTGTTCCAAAGGGACCACCAG
TCTTTGTGGCAGAGTCAAATGTTCCAGCAGAGTGCCATGCGAGGCGGACCATGATAGGTG
CACAATGCTTCTCAGCGATCAAGCCTCTGAGCTTCCTCCTGCACTTCTCAATAGCCTTCT
TGTAGTCCGCGCTCACATTTGGGTAGTTCTTCGTCATCTCTGCTAAAAATCTGAAACACT
TTCTCGAGAGAGGATAAAAA

QA 10 629 10 629
DS 



CO CL267Contig2 782 3 4 U
GGATGAGCTAGCTCATGGAGCCAACAATGGTCTCCACATTGCTCTTAGGCTGTTGGAGCC
TATCAGGGAGCAGTTCCCTACCATCTCACATGCTGATTTCCATCAGCTTGCTGGTGTTGT
GGCTGTTGAAGTCACTGGTGGACCTGAAATTCCTTTCCACCCTGGTAGAGAGGACAAGCC
CCAGCCACCTCCAGAGGGACGTCTCCCTGATGCCACCAAGGGTTGTGACCACTTGAGGCA
GGTCTTCTTAAAGCAGATGGGTTTAACTGACCAGGACATTGTCGCTTTGCCTGGTGCCCA
CACTCTGGGAAGATGCCACAAGGATAGGTCTGGCTTCGAAGGTGCCTGGACTTCAAACCC
TCTCATCTTCGACAACTCTTACTTCAAGGAACTCTTGAGCGGTGAGAAGGAGGGTCTTCT
TCAGCTTCCTTCCGACAAGGCTCTATTGGACGATCCCGTGTTCCGTCCTCTTGTTGAGAA
ATACGCTGCTGACGAGGAAGCATTTTTCGCTGACTACGCTGAGGCCCACTTGAAGCTTTC
TGAGCTCGGGTATGCTGATGCGTAAGCTGCGTCATTCCTTGTGTGATCCCCCCGACACTC
TTGGCTGCTTTTGGGTTGGTGGAGGGTTTGCATTCCGTTTGAACTTTTGTCATTTGATTT
GCTTAATGTACTCTCGACGGATCTGCGTAGCTTGTTTTTTGGGTGGTGTTGTGAGATTGT
CGCAGTTATGTTTTTCTTTTGCTATTCTCAGACATTTTAATAAATTAATAACTCTCACTA
TT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 

AF RS1D869TF U 1
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AF RS1CF16TF U 273
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BS 633 782 RS1CF16TF

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GGCTGTTGAAGTCACTGGTGGACCTGAAATTCCTTTCCACCCTGGTAGAGAGGACAAGCC
CCAGCCACCTCCAGAGGGACGTCTCCCTGATGCCACCAAGGGTTGTGACCACTTGAGGCA
GGTCTTCTTAAAGCAGATGGGTTTAACTGACCAGGACATTGTCGCTTTGCCTGGTGCCCA
CACTCTGGGAAGATGCCACAAGGATAGGTCTGGCTTCGAAGGTGCCTGGACTTCAAACCC
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TCAGCTTCCTTCCGACAAGGCTCTATTGGACGATCCCGTGTTCCGTCCTCTTGTTGAGAA
ATACGCTGCTGACGAGGAAGCATTTTTCGCTGACTACGCTGAGGCCCACTTGAAGCTTTC
TGAGCTCGGGTATGCTGATGCGTAAGCTGCGTCATTCCTTGTGTGATCCCCCCGACACTC
TTGGCTGCTTTTGG

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DS 

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GCTGATGCGTAAGCTGCGTCATTCCTTGTGTGATCCCCCCGACACTCTTGGCTGCTTTTG
GGTTGGTGGAGGGTTTGCATTCCGTTTGAACTTTTGTCATTTGATTTGCTTAATGTACTC
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TTCTTTTGCTATTTTCAGACATTTTAATAAATTAATAACTCT
C

QA 1 402 1 402
DS 

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G
GGACATTGTCGCTTTGTCTGGTGCCCACACTCTGGGAAGATGCCACAAGGATAGGTCTGG
CTTCGAAGGTGCCTGGACTTCAAACCCTCTCATCTTCGACAACTCTTACTTCAAGGAACT
CTTGAGCGGTGAGAAGGAGGGTCTTCTTCAGCTTCCTTCCAACAAGGCTCTATTGGACGA
TCCCGTGTTCCGTCCTCTTGTTGAGAAATACGCTGCTGACGAGGAAGCATTTTTCGCTGA
CTACGCTGAGGCCCACTTGAAGCTTTCTGAGCTCGGGTATGCTGATGCGTAAGCTGCGTC
ATTCCTTGTGTGATCCCCCCGACACTCTTGGCTGCTTTTGGGTTGGTGGAGGGTTTGCTT
TCCGTTTGAACTTTTGTCATTTGATTTGCTTAATGTACTCTCGACGGATCTGCGTAGCTT
GTTTTTTGGGTGGTGTTGTGAGATTGTCGCAGTTATGTTTTTCTTTTGCTATTCTCAGAC
ATTTTAATAAATTAATAACTCTCACTATT

QA 2 510 2 510
DS 



CO CL267Contig3 1070 3 14 U
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GCGACAAACTCACAATACCACCCAAAAAAACAAGCTACGCAGATCCGTCGAGAGTACACA
TTAAGCAAATCAAATGACAAAAGTTCAAACGGAATGCAAAACCCTCCACCAACCCAAAAG
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CGAACTCAGAAAGCTTCAAGTGGGCCTCAGCGTAATCAGCGAAAAATGCTTCCTCGTCAG
CAGCGTATTTCTCAACAAGAGGACGGAAAACGGGATCGTCCAATAAAGCCTTGTCGGAAG
GAAGCTGAAAAAAACCCTCCTTCTCACCGCTCAAGAGTTCCTTGAAGTAAGAGTTGTCGA
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GTGGCTGGGGCTTGTCCTCTCTTCCAGGGTGGAAAGGAATTTCAGGTCCACCAGTGACTT
CAACGGCCACAACACCAGCAAGCTGATGGAAATCAGCATGGGAGATGGTAGGGAACTGCT
CCCTGATAAGCTCCAACAGCCTAAGAGCAATGTGGAGACCATTGTTGGCTCCATGAGCTA
GCTCATCGTCAAACCTCATTGTTCCGAAGGGACCACCAGTCCTCGAGGCGCAATCGAATG
TTCCAGCAGAGTGCCATGCGAGGCGGACCATGATGGGTGCACAGTTCTTCTCAGCGATTA
AACTTCTGAGCTTCCTCTTGCACTTCTCAATCTCCTTCTGGTACTCTTCGCTAACAGCTG
GGTAGTTCTTAGTCATCTTTGCTTAAACCTTTTTCGAGAGAAGATAAGAATCTGGGAAAA
TGAGGAGTGGATGGGCACGAGGTGAACACGGGACACTTTTTATTTCCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1D940JQ U 7
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AF RS1EF53TF C 383
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GA
AGAGTTATTAATTTATTAAAATGTCTGAGCATAGCAAA*GAGCAACATAACTGCGACAAA
CTCACAATACCACCCAAAAAAACAAGCTACGCAGATCCGTCGAGAGTACA**TTAAGCAA
ATCAAATGACAAAAGTTCAAACGGAATGCAAAACCCTCCACCAACCCAAAAGCAGCCATG
AGTGTCGAGGGGGATCACACAAGGAATGACGCTGCTTACGCATCAGCAAACCCGAACTCA
GAAAGCTTCAAGTGGGCCTCAGCGTAATCAGCGAAAAATGCTTCCTCGTCAGCAGCGTAT
TTCTCAACAAGAGGACGGAACACGGGATCGTCCAATAGAGCCTTGTCGGAAGGAAGCTGA
AGAAGACCCTCCTTCTCACCGCTCAAGAGTTCCTTGAAGTAAGAGTTGTCGAAGATGAGA
GGGTTTGAAGTCCAGGCACCTTCGAAGCCAGACCTATCCTTGTGGCATCTTCCCAGAGTG
TGGGCACCAGACAAAGCGACGATGTCCTG*TCAGTTAAACCCATCTGCTTTAAGAAGACC
TGCCTCAAGTGGTCACAGACCTTGGTGGCATCAGGAAGACGACCCTCTGGAGGTGGCTGG
GGCTTGTCCTCTCTTCCAGGGTGGAAAGGAATTTCAGGTCCACCAGTGACTTCAACGGCC
ACAACACCAGCAAGCTGATGGAAATCAGCATGGGAGATGGTAGGGAACTGCTC

QA 3 715 3 715
DS 

RD RS1EF53JQ 795 0 0
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GCGACAAACTCACAATACCACCCAAAAAAACAAGCTACGCAGATCCGTCGAGAGTACACA
TTAAGCAAATCAAATGACAAAAGTTCAAACGGAATGCAAAACCCTCCACCAACCCAAAAG
CAGCCATGAGTGTCGAGGGGGATCACACAAGGAATGACGCAGCTTACGCATCAGCAAACC
CGAGCTCAGAAAGCTTCAAGTGGGCCTTAGCGTAATCAGCGAAAAATGCTTCCTCGTCAG
CAGCGTATTTCTCAACAAGAGGACGGAAAACGGGATCGTCCAATAAAGCCTTGTCGGAAG
GAAGCTGAAAAAAACCTTCCTTCTCACCGCTCAAGAGTTCCTTGAAGTAAGAGTTGTCGA
AAATGAAAGGGTTTGAAGTCCAAGCACCTTCGAAACCAGACCTATCCTTGTGGCATCTTC
CCAGAGTATGGGCACCAAACAAAGCGACGATGTCCTGGTCAGTTAAACCCATCTGCTTTA
AGAAGACCTGCCTCAAGTGGTCACAGCCCTTGGTGGCATCAGGAAGACGACCCTCTGGAG
GTGGCTGGGGCTTGTCCTCTCTTCCAGGGTGGAAAGGAATTTCAGGTCCACCAGTGACTT
CAACGGCCACAACACCAGCAAGCTGATGGAAATCAGCATGGGAGATGGTAGGGAACTGCT
CCCTGATAAGCTCCAACAGCCTAAGAGCAATGTGGAGACCATTGTTGGCTCCATGAGCTA
GCTCATCG
TCAAACC

QA 1 788 1 788
DS 

RD RS1EF53TF 688 0 0
CTCACCGCTCAAGAGTTCCTTGAAGTAAGAGTTGTCGAAGATGAGAGGGTTTGAAGTCCA
AGCACCTTCGAAACCAGACCTATCCTTGTGGCATCTTCCCAGAGTATGGGCACCAGACAA
AGCGACGATGTCCTGGTCAGTTAAACCCATCTGCTTTAAGAAGACCTGCCTCAAGTGGTC
ACAGCCCTTGGTGGCATCAGGAAGACGACCCTCTGGAGGTGGCTGGGGCTTGTCCTCTCT
TCCAGGGTGGAAAGGAATTTCAGGTCCACCAGTGACTTCAACGGCCACAACACCAGCAAG
CTGATGGAAATCAGCATGGGAGATGGTAGGGAACTGCTCCCTGATAAGCTCCAACAGCCT
AAGAGCAATGTGGAGACCATTGTTGGCTCCATGAGCTAGCTCATCGTCAAACCTCATTGT
TCCGAAGGGACCACCAGTCCTCGAGGCGCAATCGAATGTTCCAGCAGAGTGCCATGCGAG
GCGGACCATGATGGGTGCACAGTTCTTCTCAGCGATTAAACTTCTGAGCTTCCTCTTGCA
CTTCTCAATCTCCTTCTGGTACTCTTCGCTAACAGCTGGGTAGTTCTTAGTCATCTTTGC
TTAAACCTTTTTCGAGAGAAGATAAGAATCTGGGAAAATGAGGAGTGGATGGGCACGAGG
TGAACACGGGACACTTTTTATTTCCCCT

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 7

CO CL268Contig1 1056 7 16 U
GGAGGGCTTTCTCTCTGAGTTGTCGAAGCCGCTTCTTCTTCTTCTTCATCTTCTTAGCTG
TTGCTCGTTCGTCAGCAGCAGCTTCTGAAGATCACCAAACCATGGCTGTCGGGAAGAACA
AGAGGATCTCAAAGGGTCGTAAAGGAGGGAAGAAGAAGATTGTTGATCCTTTCTCCAAGA
AGGATTGGTATGACATCAAGGCTCCCTCTAACTTCACTCACAGAAATGTCGGAAAGACAC
TTGTTTCCAGAACTCAGGGTACCAAGATTGCATCTGAGGGGTTGAAACACAGAGTTTTCG
AGGTGTCTCTTGCTGATCTCAACAAGGATGAGGACCACTCTTACAGGAAGATCCGTCTCA
GAGCTGAAGATGTCCAGGGCAGGAATGTCTTGACCCAGTTCTGGGGTATGGATTTCACAA
CTGACAAGCTGAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGACACTGATTGAAGCTCATGTAGATG
TGAAGACCACTGACAGTTACACCTTGAGGCTGTTCTGCATTGGTTTCACCAAGAGGCGTG
CTAACCAGGTCAAGCGTACTTGTTATGCTCAATCCAGCCAAGTCCGCCAGATCCGCAGGA
AGATGAGTGAGATTATGGTGAAGGAGGCTTCGTCTTGTGACCTTAAGGAGCTTGTGGCTA
AGTTCATCCCTGAGGCCATTGGAAAAGAGATTGAGAAGGCGACTCAGAACATCTACCCGT
TGCAGAACGTGTTCATCCGTAAAGTCAAGATCCTCAAGGCTCCCAAGTTTGACCTCGGCA
AGCTCATGGAGGTTCATGGTGACTACACAGCAGAGGATGTTGGTGTGAAAGTAGACAGGC
CAGATGAAACAGTGGCTGAGGAACCAACCGAAATCATCGGAGCTTAGAGGATTATAGATT
TGTTTCTTTCTTTTTTTCTCCGTTATGTAGCCATTGATATGGAGTTCTTTGATAAGAGAA
CTTCCACTTCAGTGTGACTGTGTTTGGACTCGTTTTTGATGGATTATTACTCTTGTTTAT
CCTGTTTTTTATATTAAGTACCTCATTTCTATTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RS1EL59TF U 66
AF RS1E581TF U 10
AF RS1DD84TF U 1
AF RS1G038TF U 9
AF RS1DD84JQ C 331
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AF RS1E581JQ C 448
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RD RS1EL59TF 529 0 0
G
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TCTCAAAGGGTCGTAAAGGAGGGAAGAAGAAGATTGTTGATCCTTTCTCCAAGAAGGATT
GGTATGACATCAAGGCCCCCTCTAACTTCACTCACAGAAATGTCGGAAAGACACTTGTTT
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GTCC

QA 2 525 2 525
DS 

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GG
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GACATCAAGGCTCCCTCTAACTTCACTCACAGAAATGTCGGAAAGACACTTGTTTCCAGA
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GACAGTTACACCTTGAGGCTGTTCTGCATTGGTTTCACCAAGAGGCGTGCTAACCAGGTC
AAGCGTACTTGTTATGCTCAA

QA 3 563 3 563
DS 

RD RS1DD84TF 627 0 0
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TTGCTCGTTCGTCAGCAGCAGCTTCTGAAGATCACCAAACCATGGCTGTCGGGAAGAACA
AGAGGATCTCAAAGGGTCGTAAAGGAGGGAAGAAGAAGATTGTTGATCCTTTCTCCAAGA
AGGATTGGTATGACATCAAGGCTCCCTCTAACTTCACTCACAGAAATGTCGGAAAGACAC
TTGTTTCCAGAACTCAGGGTACCAAGATTGCATCTGAGGGGTTGAAACACAGAGTTTTCG
AGGTGTCTCTTGCTGATCTCAACAAG*ATGAGGACCACTCTTACAGGAAGATCCGTCTCA
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TGAAGACCACTGACAGTTACACCTTGAGGCTGTTCTGCATTGGTTTCACCAAGAGGCGTG
CTAACCAGGTCAAGCGTACTTTTTATGCTCAATCCAGCCAAGTCCGCCAGATCCGCAG*A
AGATGAGTGAGATTATGGTGAAGGAGG

QA 1 627 1 627
DS 

RD RS1G038TF 663 0 0
GGC
TCTCTGAGTTGTCGAAGCCGCTTCTTCTTCTTCTTCATCTTCTTAGCTGTTGCTCGTTCG
TCAGCAGCAGCTTCTGAAGATCACCAAACCATGGCTGTCGGGAAGAACAAGAGGATCTCA
AAGGGTCGTAAAGGAGGGAAGAAGAAGATTGTTGATCCTTTCTCCAAGAAGGATTGGTAT
GACATCAAGGCTCCCTCTAACTTCACTCACAGAAATGTCGGAAAGACACTTGTTTCCAGA
ACTCAGGGTACCAAGATTGCATCTGAGGGGTTGAAACACAGAGTTTTCGAGGTGTCTCTT
GCTGATCTCAACAAGGATGAGGACCACTCTTACAGGAAGATCCGTCTCAGAGCTGAAGAT
GTCCAGGGCAGGAATGTCTTGACCCAGTTCTGGGGTATGGACTTCACAACTGACAAGCTG
AGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGACACTGATTGAAGCTCATGTAGATGTGAAGACCACT
GAC*GTTACACCTTGAGGCTGTTCTGCATTGGTTTCACCAAGAGGCGTGCTAACCAGGTC
AAGCGTACTTGTTATGCTCAATCCAGCCAAGTCCGCCAGATCCGCAGGAAGATGAGTGAG
ATTATGGTGAAGGAGGCTTCGTCTTGTGACCTTAAAGAGCTTGTGGCTAAGTTCATCCCT

QA 4 663 4 663
DS 

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AGGACCACTCTTACAGGAAGATCCGTCTCAGAGCTGAAGATGTCCAGGGCAGGAATGTCT
TGACCCAGTTCTGGAGTATGGATTTCACAACTGACAAGCTGAGGTCATTGGTGAAGAAGT
GGCAGACACTGATTGAAGCTCATGTAGATGTGAAGACCACTGACAGTTACACCTTGAGGC
TGTTCTGCATTGGTTTCACCAAGAGGCGTGCTAACCAGGTCAAGCGTACTTTTTATGCTC
AATCCAGCCAAGTCCGCCAGATCCGCAGGAAGATGAGTGAGATTATGGTGAAGGAGGCTT
CGTCTTGTGACCTTAAGGAGCTTGTGGCTAAGTTCATCCCTGAGGCCATTGGAAAAGAGA
TTGAGAAGGCGACTCAGAACATCTACCCGTTGCAGAACGTGTTCATCCGTAAAGTCAAGA
TCCTCAAGGCTCCCAAGTTTGACCTCGGCAAGCTCATGGAGGTTCATGGTGACTACACAG
CAGAGGATGTTGGTGTGAAAGTAGACAGGCCAGATGAAACAGTGGCTGAGGAACCAACCG
AAATCATCGGAGTTTAGAGGATTATAGATTTGTTTCTTTCTTTTTTTCTCCGTTATGTAG
CCATTGATATGGAGTTCTTTGATAAGAGAACTTCCACTTCAGTGTGACTGTGTTTGGACT
CGTTTTTGATGGATTATTACTCTTGTTTATCCTGTTTTTTATATTAAGTACCTCATTTCT
A
CT

QA 1 721 1 721
DS 

RD RS1G038JQ 680 0 0
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GTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGACACTGATTGAAGCTCATGTAGATGTGAAGACCACTGA
C*GTTACACCTTGAGGCTGTTCTGCATTGGTTTCACCAAGAGGCGTGCTAACCAGGTCAA
GCGTACTTGTTATGCTCAATCCAGCCAAGTCCGCCAGATCCGCAGGAAGATGAGTGAGAT
TATGGTGAAGGAGGCTTCGTCTTGTGACCTTAAGGAGCTTGTGGCTAAGTTCATCCCTGA
GGCCATTGGAAAAGAGATTGAGAAGGCGACTCAGAACATCTACCCGTTGCAGAACGTGTT
CATCCGTAAAGTCAAGATCCTCAAGGCTCCCAAGTTTGACCTCGGCAAGCTCATGGAGGT
TCATGGTGACTACACAGCAGAGGATGTTGGTGTGAAAGTAGACAGGCCAGATGAAACAGT
GGCTGAGGAACCAACCGAAATCATCGGAGCTTAGAGGATTATAGATTTGTTTCTTTCTTT
TTTTTTCCGTTATGTAGCCATTGATATGGAGTTCTTTGATAAGAGAACTTCCACTTCAGT
GTGACTGTGTTTGGACTCGTTTTTGATGGATTATTACTCTTGTTTATCCTGTTTTTTATA
TTAAGTACCTCATTTCTA
TT

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1E581JQ 609 0 0
AGTGGCAGACACTGATTGAAGCTCATGTAGATGTGAAGACCACTGACAGTTACACCTTGA
GGCTGTTCTGCATTGGTTTCACCAAGAGGCGTGCTAACCAGGTCAAGCGTACTTGTTATG
CTCAATCCAGCCAAGTCCGCCAGATCCGCAGGAAGATGAGTGAGATTATGGTGAAGGAGG
CTTCGTCTTGTGACCTTAAGGAGCTTGTGGCTAAGTTCATCCCTGAGGCCATTGGAAAAG
AGATTGAGAAGGCGACTCAGAACATCTACCCGTTGCAGAACGTGTTCATCCGTAAAGTCA
AGATCCTCAAGGCTCCCAAGTTTGACCTCGGCAAGCTCATGGAGGTTCATGGTGACTACA
CAGCAGAGGATGTTGGTGTGAAAGTAGACAGGCCAGATGAAACAGTGGCTGAGGAACCAA
CCGAAATCATCGGAGCTTAGAGGATTATAGATTTGTTTCTTTCTTTTTTTCTCCGTTATG
TAGCCATTGATATGGAGTTCTTTGATAAGAGAACTTCCACTTCAGTGTGACTGTGTTTGG
ACTCGTTTTTGATGGATTATTACTCTTGTTTATCCTGTTTTTTATATTAAGTACCTCATT
TCTATTATT

QA 1 609 1 609
DS 



AS 2 5

CO CL269Contig1 746 3 23 U
GGACAACCCCCCAAAGTGCTCAGATAAGAGATCTCAACGCAGCAGCACAAACCCTAATTT
CGAGAAAGAGGAGATTCGATTTCAAAAAA*TGGCGTACGCTTCTCGTTTCCTCTCCAGAT
CTAAGCAGCTACAAGGGAGTCTGGTTATTATGCAGCAGCACCATGCTATTCCCGTCCGCG
CTTTTGCCAAGGAAGCTGCTCGTCCTACTTTTAAAGGAGATGAGATGTTGAAGGGTGTTT
TCACGGAGATCAAGAACAAATTTCAGGCTGCAGTTGATATTCTCCGTAAGGAAAAGATCA
CCCTTGATCCTGAGGACCCTGCTGCCGTCAAACAGTATGCTAATGTCATGAAGACCATCA
GGCAAAAGGCAGACATGTTCTCCGAATCTCAACGCATCAAATATGATATTGAGAACGAGA
CTAAGGAGATCCCAGATGCTCGTGCTTACCTCTTGAAGTTGAAGGAGATCCGCACCAGGA
GAGGGCTTACTGATGAGCTAGGTGCTGAGGCTATGATGTTCGAGGCTTTGGAGAAAGTTG
AAAAGGATATTAAGAAGCCTCTCTTGAGAAGCGACAAGAAAGGAATGGATCTTTTGGTTG
CAGAATTCGAAAAAGGCAACAAAAAGCTTGGGATTAGGAAAGAAGATCTTCCCAAGTACG
AGGAGAACTTGGAGCTCAGCATTGCCAAAGCACAGTTGGATGAGCTGAAGAGTGATGCTC
TTGAAGCAATGGAATCTCAGAAAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B086TF U 1
AF RS1FB15TF U 20
AF RS1CH67TF U 24
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CTTTTGCCAAGGAAGCTGCTCGTCCTACTTTTAAAGGAGATGAGATGTTGAAGGGTGTTT
TTACGGAGATCAAGAACAAATTTCAGGCTGCAGTTGATATTCTCCGTAAGGAAAAGATCA
CCCTTGATCCTGAGGACCCTGCTGCCGTCAAACAGTATGCTAATGTCATGAAGACCATAA
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CTAAGGAGATCCCAGATGCTCGTGCTTACCTCTTGAAGTTGAAGGATATCCGCACCAGGA
GAGGGCTTACTGATGAGCTAGGTGCTGAGGCTATGATGTTCGAGGCTTTGGAGAAAGTTG
AAA*GGATATTAAGAAGCCTCTCTTGAGAAGCGACAAGAAAGGAATGGATCTTTTGGTTG
CAGAATT

QA 1 607 1 607
DS 

RD RS1FB15TF 724 0 0
GGAGAT
AAGGGATCTCAACGCAGCAGCACAAACCCTAATTTCGAGAAAGAGGAGATTCGATTTCAA
AAAA*TGGCGTACGCTTCTCGTTTCCTCTCCAGATCTAAGCAGCTACGAGGGAGTCTGGT
TATTATGCAGCAGCACCATGCTATTCCCGTCCGCGCTTTTGCCAAGGAAGCTGCTCGTCC
TACTTTTAAAGGAGATGAGATGTTGAAGGGTGTTTTCACGGAGATCAAGAACAAATTTCA
GGCTGCAGTTGATATTCTCCGTAAGGAAAAGATCACCCTTGATCCTGAGGACCCTGCTGC
CGTCAAACAGTATGCTAATGTCATGAAGACCATCAGGCAAAAGGCAGACATGTTCTCCGA
ATCTCAACGCATCAAATATGATATTGGGAACGAGACTAAGGAGATCCCAGATGCTCGTGC
TTACCTCTTGAAGCTGAAGGAGATCCGCACCAGGAGAGGGCTTACTGATGAGCTAGGTGC
TGAGGCTATGATGTTCGAGGCTTTGGAGAAAGTTGAAAAGGATATTAAGAAGCCTCTCTT
GAGAAGCGACAAGAAAGGAATGGATCTTTTGGTTGCAGAATTCGAAAAAGGCAACAAAAA
GCTTGGGATTAGGAAAGAAGATCTTCCCAAGTACGAG*AGAACTTGGAGCTCAGCATTGC
CAAAGCACAGTTGGATGAGCTGAAGAGTGATGCTCTTGA
GCATGGATCTCAGAAAAGA

QA 7 705 7 705
DS 

RD RS1CH67TF 723 0 0
GGAAGG
GATCTCAACGCAGCAGCACAAACCCTAATTTCGAGAAAGAGGAGATTCGATTTCAAAAAA
*TGGCGTACGCTTCTCGTTTCCTCTCCAGATCTAAGCAGCTACAAGGGAGTCTGGTTATT
ACGCAGCAGCACCATGCTATTCCCGTCCGCGCTTTTGCCAAGGAAGCTGCTCGTCCTACT
TTTAAAGGAGATGAGATGTTGAAGGGTGTTTTCACGGAGATCAAGAACAAATTTCAGGCT
GCAGTTGATATTCTCCGTAAGGAAAAGATCACCCTTGATCCTGAGGACCCTGCTGCCGTC
AAACAGTATGCTAATGTCATGAAGACCATCAGGCAAAAGGCAGACATGTTCTCCGAATCT
CAACGCATCAAATATGATATTGAGAACGAGACTAAGGAGATCCCAGATGCTCGTGCTTAC
CTCTTGAAGTTGAAGGAGATCCGCACCCGGAGAGGGCTTACTGATGAGCTAGGTGCTGAG
GCTATGATGTTCGAGGCTTTGGAGAAAGTTGAGAAGGATATTAAGAAGCCTCTCTTGAGA
AGCGACAAGAAAGGAATGGATCTTTTGGTTGCAGAATTCGAAAAAGGCAGCAAAAAGCTT
GGGATTAGGAAAGAAGATCTTCCCAAGTACGAGGAGAACTTGGAGCTCAGCATTGCCAAA
GCACAGTTGGATGAGCTGAAGAGTGATGCTCTTGAAGCAATGGAATCTCAGAAAAGA

QA 7 723 7 723
DS 



CO CL269Contig2 1021 2 2 U
GGGCAACAGCAACAGCACAAACCCTAGAGAGATTCGATTTTGAAGAAAATGGCCTACGCT
TCTCGTTTCCTCTCCAGATCTAAGCAGCAGCTACAAGGGAGTCTGGGCGTTTTGCAGCAG
CACAATGCTATTCCAGTCCGCGCTTTTGCCAAAGAAGCTGCTCGTCCTTCTTTTAAAGGA
GACGAGATGTTGAAGGGCGTCTTTACGGAGATCAAAAACAAGTTTCAGGCTGCAGTTGAT
ATTCTCCGTAAGGAAAAGATCACCCTTGCTCCTGAGGACCCTGCTGCGGTTAAACAGTAT
GCTAATGTCATGAAGACCATCAGGCAAAAGGCAAACATGTTCTCCGAATCTCAACGCATT
AAATATGATATTGAGAACGAGACTAAAGAGATCCCAGACGCTCGTGCTTACCTCTTGAAG
TTGAAGGACATCCGCACCAGGAGGGGTCTTACTGATGAGCTTGGTGCTGAGGCCATGATG
TTCGAGGCTTTGGAGAAAGTTGAAAAGGATATCAAAAAGCCTCTCTTGAGAAGCGACAAG
AAAGGAATGGATCTTTTGGTTGCCGAGTTCGAAAAAGGCAACAAAAAGCTTGGGGATCAG
GAAAGAAGATCTTCCTAAATATGAGGAGAACATGGAGCTAAGCATTGCCAAAGCACAACT
GGATGAGCTGAAGAGTGATGCTCTTGAAGCGATGGAATCTCAGAAAAAGAAGGAGGAATT
CAAAGATGAAGAAATGCCTTACGTGAAATCTTTGGACATCCGTAACTTTATCTAAGGTCT
GATGATCATTTTTATTTTGTTGTAAGAAAGGTAGAAGAAAGATCTTTCTCTCTCTCTCTT
TTGAAAGGGAAGATCTTTGTTCCCTTTTACTGTTTTTTGGTTTGTCGAGTAATAAGGGGT
CTCTCTCTCACCATGGATTTGAAATACCAAATGGTGTCTAACTTTCTCAGTGTTTATTAC
GCCTGAGATTTTTTTTAGACAGAAGCGTGGTCTTCCATGTTTTTGATAATGGTGATAAAT
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1D862TF U 1
AF RS1D862JQ C 460
BS 1 648 RS1D862TF
BS 649 1021 RS1D862JQ

RD RS1D862TF 648 0 0
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CACAATGCTATTCCAGTCCGCGCTTTTGCCAAAGAAGCTGCTCGTCCTTCTTTTAAAGGA
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ATTCTCCGTAAGGAAAAGATCACCCTTGCTCCTGAGGACCCTGCTGCGGTTAAACAGTAT
GCTAATGTCATGAAGACCATCAGGCAAAAGGCAAACATGTTCTCCGAATCTCAACGCATT
AAATATGATATTGAGAACGAGACTAAAGAGATCCCAGACGCTCGTGCTTACCTCTTGAAG
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TTCGAGGCTTTGGAGAAAGTTGAAAAGGATATCAAAAAGCCTCTCTTGAGAAGCGACAAG
AAAGGAATGGATCTTTTGGTTGCCGAGTTCGAAAAAGGCAACAAAAAGCTTGGGGATCAG
GAAAGAAGATCTTCCTAAATATGAGGAGAACATGGAGCTAAGCATTGC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1D862JQ 562 0 0
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AACAAAAAGCTTGGG*ATCAGGAAAGAAGATCTTCCTAAATATGAGGAGAACATGGAGCT
AAGCATTGCCAAAGCACAACTGGATGAGCTGAAGAGTGATGCTCTTGAAGCGATGGAATC
TCAGAAAAAGAAGGAGGAATTCAAAGATGAAGAAATGCCTTACGTGAAATCTTTGGACAT
CCGTAACTTTATCTAAGGTCTGATGATCATTTTTATTTTGTTGTAAGAAAGGTAGAAGAA
AGATCTTTCTCTCTCTCTCTTTTGAAAGGGAAGATCTTTGTTCCCTTTTACTGTTTTTTG
GTTTGTCGAGTAATAAGGGGTCTCTCTCTCACCATGGATTTGAAATACCAAATGGTGTCT
AACTTTCTCAGTGTTTATTACGCCTGAGATTTTTTTTAGACAGAAGCGTGGTCTTCCATG
TTTTTGATAATGGTGATAAATG

QA 1 562 1 562
DS 



AS 2 10

CO CL270Contig1 1207 8 11 U
GGGCTTCTGCATTCTTCCTTCCCAAGATTCTTATCTTATATAGAGAGAGAGAAAACTCTT
CTTCATTGTTGTGTTCTCTTCTCTCTCTCTCGCTGGAGAAAAATGTTGGCTATATTTCAC
GAGGCCTTTGCTCACCCGCCGGAGGAACTTAACAGTCCAGCGTCTGAGAAATGCTCCAAA
CAGCCCAAACTTCCAGAAGAAACCTTAAACGACTTCTTATCTCGTTACCCTCAAAACACT
TTCTCCATGTCTTTCGGAAAAGCAGCTGTTCTTGCTTATGTTCGTCCTTCTACTTCCTTC
TCCGTCCACCAGAGGTTGTTTTGTGGGTTTGATGACATCTACTGTCTCTTCTTTGGGAGC
TTAAACAATCTGTGTCAGCTAAACAAGCAATATGGTCTTACTAAGACAACAAACGAGGCC
ATGTTTGTGATTGAAGCTTATAGGACTCTTAGAGACAGAGGTCCTTATCCAGCTGATCAG
GTTGTCAAGGATTTAGACGGTAGCTTTGCCTTCGTTGTTTATGATAGCAAAGCTGGTTCT
GTCTTCACGGCTCTGGGATCTGATGGAGGAGTGAAGCTGTTTTGGGGAATAGCTGCTGAT
GGATCTGTTGTGATATCAGATGATTTGGATGTTATCAAAGAGGGTTGCGCTAAATCTTTT
GCTCCGTTTCCTACTGGATGTATGTTCCACAGTGAAGGAGGGCTAATGAGCTTTGAGCAT
CCGATGAACAAGATAAAGGCGATGCCGAGAGTGGACAGTGAAGGAGTCCTGTGTGGTGCT
AACTTCAAGGTGGATGTGTATACGCGTGTTAACAGTATCCCTCGTCGTGGAAGTGAAGCC
AATTGGTCTCTCTGAACAATTGCATTCTCGCAACTTCCTAATGATACTTTCTTTTCTTTT
TCGCACTTTCATGTTCCGTTCTCGTTCTTGTCCACTTTTTCTTTTATGGAATAAGCCATG
AATAAAACTGTGAATAGCTTTGGAAGTTCTATATAAAAATAAACTTGTTCTGTTTCTTGA
TATGATTTTCAGAGAAATGTAAACAACATGCTCGACGACCAGGAACTGCTTGAGAGAGAA
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GTAGTATAATGTGTTACGAATGTAGTAGTTCATACCAGTTCTTTAAGGGATAAACCAACT
TTATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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T

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TTATTTC

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DS 



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ATAAAAATAAACTTGTTCTGTTTCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GL03TF U 1
AF RS1GL03JQ C 328
BS 1 724 RS1GL03TF
BS 725 725 RS1GL03JQ
BS 726 749 RS1GL03TF
BS 750 1047 RS1GL03JQ

RD RS1GL03TF 750 0 0
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TGGAGAAAAATGTTGGCTATATTTCACGAGGCCTTTGCTCACCCGCCGGAGGAACTTAAC
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TTCTTATCTCGTTACCCTCAAAACACTTTCTCCATGTCTTTCGGAAAAGCAGCTGTCCTT
GCTTATGTTCGTCCTTCTACTTCCTTCTCCGTCCACCAGAGGTTGTTTTGTGGGTTTGAT
GACATCTACTGTCTCTTCTTTGGGAGTTTGAACAACCTGTGTCAGCTAAACAAGCAATAT
GGTCTCACCAAGACAACAAACGAGGCCATGTTTGTGATTGAAGCTTACAGGACTCTTAGA
GACAGAGGTCCTTATCCAGCTGATCAGGTTGTCAAGGATTTAGACGGTAGCTTTGCCTTT
GTTGTTTATGATAGCAAAGCTGGTTCTGTCTTCACGGCTCTGGGATCTGATGGAGGAGTG
AAGCTGTTTTGGGGAATAGCTGCTGACGGATCTGTTGTGATCTCAGATGATTTGGATGTC
ATCAAAGAGGGTTGTGCTAAATCTTTTGCTCCGTTTCCTACTGGATGTATGTTCCACAGT
GAAG*AGGGCTAATGAGCTTTGAGCATCC
A

QA 1 749 1 749
DS 

RD RS1GL03JQ 720 0 0
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TTGAACAACCTGTGTCAGCTAAACAAGCAATATGGTCTCACCAAGACAACAAACGAGGCC
ATGTTTGTGATTGAAGCTTACAGGACTCTTAGAGACAGAGGTCCTTATCCAGCTGATCAG
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GTCTTCACGGCTCTGGGATCTGATGGAGGAGTGAAGCTGTTTTGGGGAATAGCTGCTGAC
GGATCTGTTGTGATCTCAGATGATTTGGATGTCATCAAAGAGGGTTGTGCTAAATCTTTT
GCTCCGTTTCCTACTGGATGTATGTTCCACAGTGAAGGAGGGCTAATGAGCTTTGAGCAT
CCAATGAACAAGATAAAGGCGATGCCGAGAGTGGACAGTGAAGGAGTCCTATGTGGTGCT
AACTTCAAGGTGGATGTGTATACGCGTGTTAACAGTATCCCTCGTCGCGGAAGTGAAGCC
AACTGGTCTCTTTGAATAGTTGCATTGTCGCAACTTCCTAATGACATTTTCTTTTTTCTT
TCCGCACTTTCATGTTCCGTTGTTGTTCTTGTCCACTTTTCTTTTTAGAATAAGCCCTGA
ATAAAACTGTGAATAGCTTTCGAGGTTCTATATATAAAAATAAACTTGTTCTGTTTCTTG

QA 1 720 1 720
DS 



AS 2 9

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TCGCAGTTTCCACATCCAGAAGAGCCGTTGCTCCGCCTGTGCTTACCCCGCCGCTCGCAA
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GAGGTATCTTCGCAATGTGCCTCGCAGGTTCAAGACCGGTTTCAGAGAAGGTACTGAAGC
CAAGCCAAGGAACAAGTCAGCAGCTTCATCAGCTTAAACTCTAGATTTATGGCTTATGAG
TTTGTTTGCAAGATCACTCTGTTTTATTATTCAGTATCTGATTACAATTTCTCTTTTTGG
TGTGTTATCTACTCTCTATATAAACTTTTGGACTTGAATGAGATTTCTGTTAAGTTTGC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1D970TF U 1
AF RS1C132JQ C 1
AF RS1GU31JQ C 44
AF RS1GU31TF U 44
AF RS1EN94JQ C 32
AF RS1EN94TF U 32
AF RS1C132TF U 1
BS 1 103 RS1D970TF
BS 104 104 RS1GU31TF
BS 105 155 RS1D970TF
BS 156 479 RS1GU31TF

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AACGGGGAGTTTCGGAAAGAGGAGGAACAAGAGTCACACTCTCCGTGTGAGATGTGGCCG
TCGCAGTTTCCACATCCAGAAGAGCCGTTGCTCCG

QA 1 155 1 155
DS 

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AACGGGGAGTTTCGGAAAGAGGAGGAACAAGAGTCACACTCTCTGTGTGAGATGTGGCCG
TCGCAGTTTCCACATCCAGAAGAGCCGTTGCTCCGCCTGTGCTTACCCCGCCGCTCGCAA
GAGAACCTACAACTGGAGTGTGAAGGCAATCCGTAGAAAGACCACAGGAACTGGAAGGAT
GAGGTATCTTCGCAATGTGCCTCGCAGGTTCAAGACCGGTTTCAGAGAAGGTACTGAAGC
CAAGCCAAGGAACAAGTCAGCAGCTTCATCAGCCTAAACTCTAGATTTATGGCTTATGAG
TTTGTTTGCAAGATCACTCTGTTTTATTATTCAGTATCTGATTACAATTTCTCTTTTTGG
TGTGTTATCTACTCTCTATATCAACTTTTGGACTTGAATGAGATTTCTGTTAAGTTTGC

QA 1 479 1 479
DS 

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AGG
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GTGAGATGTGGCCGTCGCAGTTTCCACATCCAGAAGAGCCGTTGCTCCGCCTGTGCTTAC
CCCGCCGCTCGCAAGAGAACCTACAACTGGAGTGTGAAGGCAATCCGTAGAAAGACCACA
GGAACTGGAAGGATGAGGTATCTTCGCAATGTGCCTCGCAGGTTCAAGACCGGTTTCAGA
GAAGGTACTGAAGCCAAGCCAAGGAACAAGTCAGCAGCTTCATCAGCTTAAACTCTAGAT
TTATGGCTTATGAGTTTGTTTGCAAGATCACTCTGTTTTATTATTCAGTATCTGATTACA
ATTTCTCTTTTTGGTGTGTTATCTACTCTCTATATAAACTTTTGGACTTGAATGAGATTT
CTGTTAAGTTTGC

QA 4 436 4 436
DS 

RD RS1GU31TF 436 0 0
AGG
GCAATGACGAAGGGAACGGGGAGTTTCGGAAAGAGGAGGAACAAGAGTCACACTCTCTGT
GTGAGATGTGGCCGTCGCAGTTTCCACATCCAGAAGAGCCGTTGCTCCGCCTGTGCTTAC
CCCGCCGCTCGCAAGAGAACCTACAACTGGAGTGTGAAGGCAATCCGTAGAAAGACCACA
GGAACTGGAAGGATGAGGTATCTTCGCAATGTGCCTCGCAGGTTCAAGACCGGTTTCAGA
GAAGGTACTGAAGCCAAGCCAAGGAACAAGTCAGCAGCTTCATCAGCTTAAACTCTAGAT
TTATGGCTTATGAGTTTGTTTGCAAGATCACTCTGTTTTATTATTCAGTATCTGATTACA
ATTTCTCTTTTTGGTGTGTTATCTACTCTCTATATAAACTTTTGGACTTGAATGAGATTT
CTGTTAAGTTTGC

QA 4 436 4 436
DS 

RD RS1EN94JQ 440 0 0
G
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GTCACACTCTCTGTGTGAGATGTGGCCGTCGCAGTTTCCACATCCAGAAGAGCCGTTGCT
CCGCCTGTGCTTACCCCGCCGCTCGCAAGAGAACCTACAACTGGAGTGTGAAGGCAATCC
GTAGAAAGACCACAGGAACTGGAAGGATGAGGTATTTTCGCAATGTGCCTCGCAGGTTCA
AGACCGGTTTCAGAGAAGGTACTGAAGCCAAGCCAAGGAACAAGTCAGCAGCTTCATCAG
CTTAAACTCTAGATTTATGGCTTATGAGTTTGTTTGCAAGATCACTCTGTTTTATTATTC
AGTATCTGATTACAATTTCTCTTTTTGGTGTGTTATCTACTCTCTATATAAACTTTTGGA
CTTGAATGAGATTTCTGTT

QA 2 440 2 440
DS 

RD RS1EN94TF 440 0 0
G
AACTCGCATCCGCTGCAATGACGAAGGGAACGGGGAGTTTCGGAAAGAGGAGGAACAAGA
GTCACACTCTCTGTGTGAGATGTGGCCGTCGCAGTTTCCACATCCAGAAGAGCCGTTGCT
CCGCCTGTGCTTACCCCGCCGCTCGCAAGAGAACCTACAACTGGAGTGTGAAGGCAATCC
GTAGAAAGACCACAGGAACTGGAAGGATGAGGTATCTTCGCAATGTGCCTCGCAGGTTCA
AGACCGGTTTCAGAGAAGGTACTGAAGCCAAGCCAAGGAACAAGTCAGCAGCTTCATCAG
CTTAAACTCTAGATTTATGGCTTATGAGTTTGTTTGCAAGATCACTCTGTTTTATTATTC
AGTATCTGATTACAATTTCTCTTTTTGGTGTGTTATCTACTCTCTATATAAACTTTTGGA
CTTGAATGAGATTTCTGTT

QA 2 440 2 440
DS 

RD RS1C132TF 479 0 0
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AACGGGGAGTTTCGGAAAGAGGAGGAACAAGAGTCACACTCTCTGTGTGAGATGTGGCCG
TCGCAGTTTCCACATCCAGAAGAGCCGTTGCTCCGCCTGTGCTTACCCCGCCGCTCGCAA
GAGAACCTACAACTGGAGTGTGAAGGCAATCCGTAGAAAGACCACAGGAACTGGAAGGAT
GAGGTATCTTCGCAATGTGCCTCGCAGGTTCAAGACCGGTTTCAGAGAAGGTACTGAAGC
CAAGCCAAGGAACAAGTCAGCAGCTTCATCAGCCTAAACTCTAGATTTATGGCTTATGAG
TTTGTTTGCAAGATCACTCTGTTTTATTATTCAGTATCTGATTACAATTTCTCTTTTTGG
TGTGTTATCTACTCTCTATATCAACTTTTGGACTTGAATGAGATTTCTGTTAAGTTTGC

QA 1 479 1 479
DS 



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AAGTAAACAACACAACGAAAGATATTACTAATCAAATGATCAATAATAGTGTAGTACTGC
GAACAAACTCAGAAGCCAAAAACTAAGTTTTACTCTTTTCCCTGCGAATACTCAAACAAC
AGTTTAAGCTGATGAAGCCGCTCCCTTGTTCCTTGGCTTGGCTTCCGTACCTTCTCTGAA
ACCGGTCTTGAACCTGCGAGGCACATTGCGAAAATACCTCATCCTTCCAGTTCCTGTAGT
CTTTCTACGGATGGCCTTCACACTCCAATTGTAGGTTCTCTTGCGAGCGGCGGGGTAAGC
ACAGGCGGAGCAACGGCTCTTCTGGATGTGGAAACTGCGGCGGCCACATCTCACACAGAG
AGTGTGACTCTTGTTCCTCCTCTTTCCGAAACTCCCCGTTCCCTTCGTCATTGCAGAGGA
TGCGAAATAACTTTAGGTCTCTCTCTGAAAAGTCC


BQ
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AF RS1GW47TF C 1
AF RS1EF38JQ U 209
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RD RS1GW47TF 514 0 0
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AAGTAAACAACACAACGAAAGATATTACTAATCAAATGATCAATAATAGTGTAGTACTGC
GAACAAACTCAGAAGCCAAAAACTAAGTTTTACTCTTTTCCCTGCGAATACTCAAACAAC
AGTTTAAGCTGATGAAGCCGCTCCCTTGTTCCTTGGCTTGGCTTCCGTACTTTCTCTGAA
ACCGGTCTTGAACCTGCGAGGCACATTGCGAAGATACCTCATCCTTCCAGTTCCTGTAGT
CTTTCTACGGATGGCCTTCACACTCCAATTGTAGGTTCTCTTGCGAGCGGCGGGGTAAGC
ACAGGCGGAGCAACGGCTCTTCTGGATGTGGAAACTGCGGCGGCCACATCTCACACAGAG
AGTGTGACTCTTGTTCCTCCTCTTTCCGAAACTCCCCGTTCCCTTCGTCATTGCAGAGGA
TGCGAAATAACTTTAGGTCTCTCTCTGAGAAGTC

QA 1 514 1 514
DS 

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CGAAAATACCTCATCCTTCCAGTTCCTGTAGTCTTTCTACGGATGGCCTTCACACTCCAA
TTGTAGGTTCTCTTGCGAGCGGCGGGGTAAGCACAGGCGGAGCAACGGCTCTTCTGGATG
TGGAAACTGCGGCGGCCACATCTCACACAGAGAGTGTGACTCTTGTTCCTCCTCTT*CCG
AAACTCCCCGTTCCCTTCGTCATTGCAGAGGATGCGAAATAACTTTAGGTCTCTCTCTGA
AAAGTCC

QA 1 307 1 307
DS 



AS 2 9

CO CL272Contig1 515 2 2 U
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TGCTCAGATTGCGATAGGGACGGATGACGTGTACAAAACCGCAGAGGCTGTAAAACTCTT
TGGTGGGAAAATCACGAGGGAGCCTGGTCCCTTACCAGGTATAAGCACGAAGATCACCGC
GTGTTTGGATCCTGATGGTTGGAAGTCGGTGTTTGTGGACAACGTTGACTTTCTCAAAGA
ACTGGAGTGATAGGAGAAAGGAGGCCACCAAAACGGCTAGTTTCATAGCTATGAAGGAAA
CAGGAGGATGGGTTTTTCGTTTTTACATCAGCTGGGGTTTCGTATATCTATCTCTCAGTG
TGAGTATCTAGTTTGTTCAAAGTGAATGATTTGTTTTTCAGAGTTCAGTATAGTTATTCT
GCAGAATTATCCCATGTTGCGTCTTGTATATCAGTTTTACTTGAACCATTATTGCCGTTG
AAATAAGATGATAAATGAATGATCGATAAGAACCG


BQ
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AF RS1C783JQ C 1
AF RS1C783TF U 1
BS 1 1 RS1C783JQ
BS 2 515 RS1C783TF

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GTGTTTGGATCCTGATGGTTGGAAGTCGGTGTTTGTGGACAACGTTGACTTTCTCAAAGA
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CAGGAGGATGGGTTTTTCGTTTTTACATCAGCTGGGGTTTCGTATATCTATCTCTCAGTG
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GCAGAATTATCCCATGTTGCGTCTTGTATATCAGTTTTACTTGAACCATTATTGCCGTTG
AAATAAGATGATAAATGAATGATCGATAAGAACCG

QA 1 515 1 515
DS 

RD RS1C783TF 515 0 0
G
GCAGTCCTGGAGCTGACATATAACTATGGTGTCACTGAATATGATAAAGGAAATGCTTAT
GCTCAGATTGCGATAGGGACGGATGACGTGTACAAAACCGCAGAGGCTGTAAAACTCTTT
GGTGGGAAAATCACGAGGGAGCCTGGTCCCTTACCAGGTATAAGCACGAAGATCACCGCG
TGTTTGGATCCTGATGGTTGGAAGTCGGTGTTTGTGGACAACGTTGACTTTCTCAAAGAA
CTGGAGTGATAGGAGAAAGGAGGCCACCAAAACGGCTAGTTTCATAGCTATGAAGGAAAC
AGGAGGATGGGTTTTTCGTTTTTACATCAGCTGGGGTTTCGTATATCTATCTCTCAGTGT
GAGTATCTAGTTTGTTCAAAGTGAATGATTTGTTTTTCAGAGTTCAGTATAGTTATTCTG
CAGAATTATCCCATGTTGCGTCTTGTATATCAGTTTTACTTGAACCATTATTGCCGTTGA
AATAAGATGATAAATGAATGATCGATAAGAACCG

QA 2 515 2 515
DS 



CO CL272Contig2 1368 7 22 U
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TGTGAGGATGAGGTTAATTTCAATGGCGTCCACCACCATCCGACCTTCCCTGGGCTGCTT
CTCTGCATCTCCTCGCTTCCCCTTCGTCTCCTCCCGGAATCTCTCTCGCCCCACCCTCTC
TTCTTTCTCCCATGTTAATCAGTCAAAGCCTTTGACTGTGAGAAGAAGCGTAAGGTGCTT
AGGAG***TAGCCGAATCAGGAAACGCGGCTCAAGCAGTTACCGAAGAGGATCTTCTCAA
GTGGGTCAAAAATGATAACAGAAGAATGCTTCATGTCGTTTACCGTGTTGGCGATTTGGA
CCGAACTATTAAATTCTATACGGAATGTCTTGGGATGAAGCTTCTACGCAAGCGTGATAT
ACCCGAAGAGAAGTATACTAATGCTTTCCTTGGTTATGGTCCTGAAGATTCACACTTCGT
CATTGAGCTCACTTATAATTATGGAGTTGACAAGTATGACATTGGGGCAGGTTTTGGTCA
CTTTGGTATTGCCGTCGACGACGTGGCGAAAACTGTAGAACTGATAAAAGCCAAGGGAGG
GAAAGTAACAAGGGAGCCTGGTGCTGTCAAAGGTGGCAAAACTGTAATCGCCTTCATTGA
AGATCCTGATGGTTACAAATTCGAACTCTTGGAAAGAGGTCCTACACCCGAACCTCTTTG
TCAAGTTATGCTCCGTGTTGGTGATCTCGACAAGTCCATCAAATTCTATGAGAAAGCTTT
TGGAATGGAGCTTCTGCGCACAAGAGACAACCCAGAGTACAAGTACACAATAGCTATGAT
GGGATATGGTCCAGAAGATAAAACTGCAGTCCTGGAGCTGACATATAACTATGGTGTCAC
TGAATATGATAAAGGAAATGCTTATGCTCAGATTGCAATAGGGACGGATGACGTGTACAA
AACCGCAGAGGCTGTAAAACTCTTTGGTGGGAAAATCACGAGGGAACCTGGTCCTTTACC
AGGTATAAGCACGAAGATCACCGCGTGTTTGGATCCTGATGGTTGGAAGTCGGTGTTTGT
GGACAACGTTGACTTTCTCAAAGAACTTGAGTGAGATGAGAAAGGAGGCCACCAAAATGG
CTAGTTTCATAGCTATGAAGGAAACAGGAGGATGGGTTTTTCGTTTTACATCAGCTGGGG
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TCTGAGTCTAGTGTAGTTATTCTACAGAATTATCCCATGTTGCGTCTTGTATATCACTTT
TACTTGAACCATTATTGCCGTTGAAATAAGATGATAAATGAATGATCG


BQ
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10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GH15TF U 44
AF RS1GJ88TF U 1
AF RS1EZ84TF U 40
AF RS1DW40TF U 536
AF RS1AK76TF U 40
AF RS1AK76JQ C 796
AF RS1GJ88JQ C 968
BS 1 197 RS1GJ88TF
BS 198 198 RS1EZ84TF
BS 199 216 RS1GJ88TF
BS 217 217 RS1AK76TF
BS 218 276 RS1GJ88TF
BS 277 277 RS1EZ84TF
BS 278 310 RS1GJ88TF
BS 311 311 RS1EZ84TF
BS 312 607 RS1GJ88TF
BS 608 627 RS1AK76TF
BS 628 628 RS1DW40TF
BS 629 645 RS1AK76TF
BS 646 646 RS1DW40TF
BS 647 693 RS1AK76TF
BS 694 694 RS1DW40TF
BS 695 708 RS1AK76TF
BS 709 709 RS1DW40TF
BS 710 855 RS1AK76TF
BS 856 856 RS1AK76JQ
BS 857 910 RS1AK76TF
BS 911 1360 RS1AK76JQ
BS 1361 1368 RS1GJ88JQ

RD RS1GH15TF 548 0 0
GG
ATCACAGAGACAGACTGTGAGGATGAGGTTAATTTCAATGGCGTCCACCACCATCCGACC
TTCCCTGGGCTGCTTCTCTGCATCTCCTCGCTTCCCCTTCGTCTCCTCCCGGAATCTCTC
TCGCCCCACCCTCTCTTCTTTCTCCCATGTTAATCAGTCAAAGGCTTTGACTCTGAGAAG
AAGCGTAAGGTGCTTAGGAG***TAGCTGAATCTGGAAACGCGGCTCAAACAGTTACGGA
AGAGGATCTTCTCAAGTGGGTCAGAAATGATAACAGAAGAATGCTTCACGTCGTTTACCG
TGTTGGCGATTTGGACCGGACTATTAAATTCTATACGGAATGTCTTGGGATGAAGCTTCT
ACGCAAGCGTGATATACCGGAAGAGAAGTATACTAATGCTTTCCTTGGTTATGGTCCTGA
AGATTCTCACTTCGTCATTGAGCTCACTTATAATTATGGAGTTGACAAGTATGACATTGG
GGCAGGTTTTGGTCACTTTGGTATTGCCGTCGACGACGTGGCGAAAACTGTAGAACTGAT
AAAAGC

QA 3 548 3 548
DS 

RD RS1GJ88TF 607 0 0
GAGAGCTTTATCTTCACCGTTGGCTTCACTCGACGGAGGTTCAGAATCACAGAGACAGAC
TGTGAGGATGAGGTTAATTTCAATGGCGTCCACCACCATCCGACCTTCCCTGGGCTGCTT
CTCTGCATCTCCTCGCTTCCCCTTCGTCTCCTCCCGGAATCTCTCTCGCCCCACCCTCTC
TTCTTTCTCCCATGTTACTCAGTCAAAGCCTTTGAC*GTGAGAAGAAGCGTAAGGTGCTT
AGGAG***TAGCCGAATCAGGAAACGCGGCTCAAGCGGTTACCGAAGAGGATCTTCTCAA
GTGGGTCAAAGATGATAACAGAAGAATGCTTCATGTCGTTTACCGTGTTGGCGATTTGGA
CCGAACTATTAAATTCTATACGGAATGTCTTGGGATGAAGCTTCTACGCAAGCGTGATAT
ACCCGAAGAGAAGTATACTAATGCTTTCCTTGGTTATGGTCCTGAAGATTCACACTTCGT
CATTGAGCTCACTTATAATTATGGAGTTGACAAGTATGACATTGGGGCAGGTTTTGGTCA
CTTTGGTATTGCCGTCGACGACGTGGCGAAAACTGTAGAACTGATAAAAGCCAAGGGAGG
GAAAGTA

QA 1 607 1 607
DS 

RD RS1EZ84TF 614 0 0
GGGAGA
ATCACAGAGACAGACTGTGAGGATGAGGATAATTTCAATGGCGTCCACCACCATCCGACC
TTCCCTGGGCTGCTTCTCTGCATCTCCTCGCTTCCCCTTCGTCTCCTCCCGGAATCTCTC
TCGCCCCACCCTCTCTTCTTTCTCCCATGTTAATCAGTCAAAGCCTTTGACTGTGAGAAG
AAGCGTAAGGTGCTTAGGAGGAGTAGCTGAATCTGGAAACGCGGCTCAAGCAGTTACGGA
AGAGGATCTTCTCAAGTGGGTCAAAAATGATAACAGAAGAATGCTTCATGTCGTTTACCG
TGTTGGCGATTTGGACCGCACTATTAAATTCTATACGGAATGTCTTGGGATGAAGCTTCT
ACGCAAGCGTGATATACCCGAAGAGAAGTATACTAATGCTTTCCTTGGTTATGGTCCTGA
AGATTCTCACTTCGTCATTGAGCTCACTTATAATTATGGAGTTGACAAGTATGACATTGG
GGCAGGTTTTGGTCACTTTGGTATTGCTGTCGACGACGTGGCGAAAACTGTAGAACTGAT
AAAAGCCAAGGGAGGGAAAGTAACAAGGGAGCCTGGTGCTGTCAAAGGTGGCAAAACTGT
AATCGCCT

QA 7 614 7 614
DS 

RD RS1DW40TF 233 0 0
GGTCACTTTGGTATTGCCGTCGACGACGTGGCGAAAACTGTAGAACTGATAAAAGCCAAG
GGAGGGAAAGTAACAAGGGAGCCTGGTGCCGTCAAAGGTGGCAAAACTGTAATCGCCTTC
ATTGAAGATCCTGATGGTTACAAATTCGAACTCTTGGAAAGAGGTCCTACACCCGAACCT
CTTTGTCAAGTTATGCTCCGTGTTGGTGATCTCGACAAGTCCATCAAATTCTA

QA 1 233 1 233
DS 

RD RS1AK76TF 871 0 0
GGGAGA
ATCACAGAGACAGACTGTGAGGATGAGGTTAATTTCAATGGCGTCCACCACCATCCGACC
TTCCCTGGGCTGCTTCTCTGCATCTCCTCGCTTCCCCTTCGTCTCCTCCCGGAATCTCTC
TCGCCCCACCCTCTCTTCTTTCTCCCATGTTACTCAGTCAAAGCCTTTGACTGTGAGAAG
AAGCGTAAGGTGCTTAGGAG***TAGCCGAATCAGGAAACGCGGCTCAGGCGGTTACCGA
AGAGGATCTTCTCAAGTGGGTCAAAGATGATAACAGAAGAATGCTTCATGTCGTTTACCG
TGTTGGCGATTTGGACCGAACTATTAAATTCTATACGGAATGTCTTGG*ATGAAGCTTCT
ACGCAAGCGTGATATACCCGAAGAGAAGTATACTAATGCTTTCCTTGGTTATGGTCCTGA
AGATTCACACTTCGTCATTGAGCTCACTTATAATTATGGAGTTGACAAGTATGACATTGG
GGCAGGTTTTGGTCACTTTGGTATTGCCGTCGACGACGTGGCGAAAACTGTAGAACTGAT
AAAAGCCAAGGGAGGGAAAGTAACAAGGGAGCCTGGTGCTGTTAAAGGTGGCAAAACTGT
TATCGCCTTCATTGAAGATCCTGATGGTTACAAATTCGAACTCTTGGAGAGAGGTCCTAC
ACCTGAACCTCTTTGTCAAGTTATGCTCCGTGTTGGTGATCTCGACAAGTCCATCAAATT
CTATGAGAAAGCTTTTGGAATGGAGCTTCTGCGCACAAGAGACAACCCAGAGTACAAGTA
CACAATAGCTATGATGGGATATGGTCCAGA*GATAAAACTGCAGTCCTGGAGCTGACATA
TAACTATGGTGTCACTGAATATGAT

QA 7 871 7 871
DS 

RD RS1AK76JQ 565 0 0
GCGCACAAGAGACAACCCAGAGTACAAGTACACAATAGCTATGATGGGATATGGTCCAGA
AGATAAAACTGCAGTCCTGGAGCTGACATATAACTATGGTGTCACTGAATATGATAAAGG
AAATGCTTATGCTCAGATTGCAATAGGGACGGATGACGTGTACAAAACCGCAGAGGCTGT
AAAACTCTTTGGTGGGAAAATCACGAGGGAACCTGGTCCTTTACCAGGTATAAGCACGAA
GATCACCGCGTGTTTGGATCCTGATGGTTGGAAGTCGGTGTTTGTGGACAACGTTGACTT
TCTCAAAGAACTTGAGTGAGATGAGAAAGGAGGCCACCAAAATGGCTAGTTTCATAGCTA
TGAAGGAAACAGGAGGATGGGTTTTTCGTTTTACATCAGCTGGGGTTTCGTATATCTATC
TCTCAGTGTGAGTATCTAGTTTGTTCAAAGTGAATGATTTGCTTTTCTGAGTCTAGTGTA
GTTATTCTACAGAATTATCCCATGTTGCGTCTTGTATATCACTTTTACTTGAACCATTAT
TGCCGTTGAAATAAGATGATAAATG

QA 1 565 1 565
DS 

RD RS1GJ88JQ 401 0 0
GAGGCTGTAAAACTCTTTGGTGGGAAAATCACGAGGGAACCTGGTCCTTTACCAGGTATA
AGCACGAAGATCACCGCGTGTTTGGATCCTGATGGTTGGAAGTCGGTGTTTGTGGACAAC
GTTGACTTTCTCAAAGAACTTGAGTGAGATGAGAAAGGAGGCCACCAAAATGGCTAGTTT
CATAGCTATGAAGGAAACAGGAGGATGGGTTTTTCGTTTTACATCAGCTGGGGTTTCGTA
TATCTATCTCTCAGTGTGAGTATCTAGTTTGTTCAAAGTGAATGATTTGCTTTTCTGAGT
CTAGTGTAGTTATTCTACAGAATTATCCCATGTTGCGTCTTGTATATCACTTTTACTTGA
ACCATTATTGCCGTTGAAATAAGATGATAAATGAATGATCG

QA 1 401 1 401
DS 



AS 2 10

CO CL273Contig1 746 3 2 U
GGATTCAATCGCAAAATAGTCACAAATTTATCATTTCTTCATGCTGGACCGATGACCTAA
TCGGTCAAGAGACTACGTCGTTGAGACACATTCCGGTTAGCTCCAAATCGGAAACTCATC
ATTAGTTTAACACTCACTTCCCTCCTAATCAATTAATTTAATAATTACAAGTCATTTATT
ACTTGCGTCACACACAATCACACGACTGTTACAGCTGCATGACGGCCCATACCAGTGGAC
AAACTACCAACCAGACCATCGTAGTTCAACATAAAAACCCTAGGCTTTGCCCTCGGCACC
CAATTATCCGGCTCCGTTGTCTCCGAAACCGCCGCTTCCAAGGAGTTCGATCTCTCGCAC
GTGCCAAGCCACTTGGCTTGCATGTACTTGTGTTTTCTCCATGGTCCCATATGCATTTTA
TTGTCTCCCAAGCATTTCTTTCCCGCGATGCACAATATCTTGATCAAAGATCGGAGCCTA
TCGGTTTTTCCGACGTAAACCTCCGGCAATCGGCTGATAAGCCTTTTGTACTCTTCACCG
CCTTTTGCAATCTCGAACTCTGCCCTGAATGATAATTCGACCACGACTCGCATCTCGCCT
TTCTTGGAATCAGATCGGTCCACGATCTCTATGTATTCGTGTTCCCCTGCAGGGATGTCT
TGAGAGCTTCTCCATTTGGATTTGAAGATGACGCAGTCGTAGCCGGCCACATCTCGGAGA
TGTCGAGAGATTTCTCCACGTAAGCA


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GK91JQ U 1
AF RS1EP37JQ U 1
AF RS1CP56JQ U 6
BS 1 575 RS1EP37JQ
BS 576 746 RS1CP56JQ

RD RS1GK91JQ 513 0 0
GGATT
CAATCGCAAAATAGTCACAAATTTATCATTTCTTCATGCTGGACCGATGACCTAATCGGT
CAAGAGACTACGTCGTTGAGACACATTCCGGTTAGCTCCAAATCGGAAACTCATCATTAG
TTTAACACTCACTTCCCTCCTAATCAATTAATTTAATAATTACAAGTCATTTATTACTTG
CGTCACACACAATCACACGACTGTTACAGCTGCATGACGGCCCATACCAGTGGACAAACT
ACCAACCAGACCATCGTAGTTCAACATAAAAACCCTAGGCTTTGCCCTCGGCACCCAATT
ATCCGGCTCCGTTGTCTCCGAAACCGCCGCTTCCAAGGAGTTCGATCTCTCGCACGTGCC
AAGCCACTTGGCTTGCATGTACTTGTGTTTTCTCCATGGTCCCATATGCATTTTATTGTC
TCCCAAGCATTTCTTTCCCGCGATGCACAATATCTTGATCAAAGATCGGAGCCTATCGGT
TTTTCCGACGTAAACCTCCGGCAATCGG

QA 6 513 6 513
DS 

RD RS1EP37JQ 575 0 0
GGATTCAATCGCAAAATAGTCACAAATTTATCATTTCTTCATGCTGGACCGATGACCTAA
TCGGTCAAGAGACTACGTCGTTGAGACACATTCCGGTTAGCTCCAAATCGGAAACTCATC
ATTAGTTTAACACTCACTTCCCTCCTAATCAATTAATTTAATAATTACAAGTCATTTATT
ACTTGCGTCACACACAATCACACGACTGTTACAGCTGCATGACGGCCCATACCAGTGGAC
AAACTACCAACCAGACCATCGTAGTTCAACATAAAAACCCTAGGCTTTGCCCTCGGCACC
CAATTATCCGGCTCCGTTGTCTCCGAAACCGCCGCTTCCAAGGAGTTCGATCTCTCGCAC
GTGCCAAGCCACTTGGCTTGCATGTACTTGTGTTTTCTCCATGGTCCCATATGCATTTTA
TTGTCTCCCAAGCATTTCTTTCCCGCGATGCACAATATCTTGATCAAAGATCGGAGCCTA
TCGGTTTTTCCGACGTAAACCTCCGGCAATCGGCTGATAAGCCTTTTGTACTCTTCACCG
CCTTTTGCAATCTCGAACTCTGCCCTGAATGATAA

QA 1 575 1 575
DS 

RD RS1CP56JQ 741 0 0
CAATCGCAAAATAGTCACAAATTTATCATTTCTTCATGCTGGACCGATGACCTAATCGGT
CAAGAGACTACGTCGTT*AGACACATTCCGGTTAGCTCCAAATCGGAAACTCATCATTAG
TTTAACACTCACTTCCCTCCTAATCAATTAATTTAATAATTACAAGTCATTTATTACTTG
CGTCACACACAATCACACGACTGTTACAGCTGCATGACGGCCCATACCAGTGGACAAACT
ACCAACCAGACCATCGTAGTTCAACATAAAAACCCTAGGCTTCGCCCTCGGCACCCAATT
ATCCGGCTCCGTTGTCTCCGAGACCGCCGCTTCCAAGGAGTTCGATCTCTCGCACGTGTC
AAGCCACTTGGCTTGCATGTACTCGTGTTTTCTCCATGGTCCCATATGCATTTTATTGTC
TCCCAAGCATTTCTTTCCCGCGATGCACAATATCTTGATCAAAGATCGGAGCCTATCGGT
TTTTCCGACGTAAACCTCCGGCAATCGGCTGATAAGCCTTTTGTACTCTTCACCGCCTTT
TGCAATCTCGAACTCTGCCCTGAATGATAATTCGACCACGACTCGCATCTCGCCTTTCTT
GGAATCAGATCGGTCCACGATCTCTATGTATTCGTGTTCCCCTGCAGGGATGTCTTGAGA
GCTTCTCCATTTGGATTTGAAGATGACGCAGTCGTAGCCGGCCACATCTCGGAGATGTCG
AGAGATTTCTCCACGTAAGCA

QA 1 741 1 741
DS 



CO CL273Contig2 1211 7 30 U
GGATAAATAAATACAAACAAAAAAACATTTCTTTTCCTTCTATTCTTTAAATTTTTAAAC
AGATGGATCGGCAAAGTTCCGATGACATCATGAGATTTCTGGATGGAATGGCTAGCTCTG
ACGACGTTCTCTTCGGTTTCCTTGATGAAGGAAACCAGTCACCGGAAGACTTCAACCTCA
ACGGCGGCTTAGATATAGAAAACGTCGACGACAATAGCAATTGCAATTCTGAAGAAAACA
AAGTTTTCTGGCAGGAACAAGAACAACTTCTCCAGGGGACACTGTATAGAACAAGTTCGA
TTGAGACAAAGATTAGACAAGCGACAAAGGAGGCTTTGAAACAAGTTACATCAAAGGGTC
TTCATTGTGTCTGCCAGCGACCTGTTGCTGGCGGTTGCCGGAGCTGCTTACGTGGAGAAA
TCTCTCGACATCTCCGAGATGTGGCCGGCTACGACTGCGTCATCTTCAAATCCAAATGGA
GAAGCTCTCAAGACATCCCTGCAGGGGAACACAAATACATAGAGATCGTGGACCGATCTG
ATTCCAAGAAAGGCGAGATGCGAGTCGTGGTCGAGTTATCATTCAGGGCAGAGTTCGAGA
TTGCAAAAGGCGGTGAAGAGTACAAAAGGCTTATCAGCCGATTGCCGGAGGTTTACGTCG
GAAAAACCGATAGGCTCCGATCTTTGATCAAGATATTATGCACCGCGGG*AAAAAAATGT
TTAAGAGACAATAAAATGCATATGGGACCATGGAGAAAACACAAGTACATGCAAGCCAAG
TGGCTTGGCACGTGCGATAGATCGAACTCCTTGGAAGCGACGGTCTCAGAGACAACAGAG
CCGGAGAATTGGGTGCCGCGGGCAAAGCCTAGGGTTTCTATGTTGAACTACGATGGTCTG
GTTGGTAGTTTGCCCACTGGTATGGGCCGTCATGCAGCTGTAACAGTCGTGTGATTGTGT
GTGACGCAAGTAATAAATGACTTGTAATTATTACATTAATTGATTAGGAGGGAAGTGAGT
GTTAAACTAATGATGAGTTTTCGATTTGGAGCTAACCGGAATGTGTCTCAACGACGTAGT
CTCTTCTTGACCGATTAGGTCATCGGTCCAGCATGAAGAAATGATAAATTTGTGACTATT
TTGCGATTGAATTCAGATTGTATACTATAGATTTTTGAATCTCCACTTTTGTATGAAAAT
TTCATTCATTC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 5 35 35 10 35 35 20 35 35 10 5 
35 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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CA
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G
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DS 



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BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 15 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 40 20 55 55 15 15 55 55 40 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 35 35 35 10 10 10 

AF RS1G613TF U 49
AF RS1A205TF U 1
AF RS1EH15TF U 49
AF RS1DM28TF U 49
AF RS1A205TV U 1
AF RS1DM28JQ C 247
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AF RS1CR84TF U 844
BS 1 734 RS1A205TF
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RD RS1G613TF 670 0 0
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AACGCCTCCTTTTGGTCCCTATCTTGGCTGTGGTGGCCATACAACTTCTATTTGTACGCG
CTGCTTCGTCAGTGAACATGACAAATACGTATCTACACCACAAATGCTTTGTCAGTCAAG
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CTCCTGAAAGTTTTAAAAGAGGTTACAACTCTACGCACCTTGGTGCAGGTCCCGATTTCA
TAATCATGTTCCTTCAATGCCGCGGAGACACCCACGGGCCCAAATGCCGTTCTTGCTATG
CTAACGCCCAACCCGAGTTTTTTAAGAGATGTCCAAGATATAAAGGTGGAATAATATGGT
ACGACCAATGTTCTTTATATTTTTCTACGATCGATTCTATAGGGATGATCGATTACGACA
ACAATTTCTGTATGTCCAATAAAAAGAAAGTAGACGACTATCTATATAACGATTTCAAAC
CGCGGTATTTCATCGACGATTTGATACAAAATACCACTCGTGAAGCTAAACCGAAAGCGC
CGTACTACAC

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DS 

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CTTCTACACAAACATCACAGTCTTATAACGCTTATTTTACTGAGCAACAAGCATTAAAGA
AGAGCAAAAAAGTATCCACAACAATGTATATGTCACCGTCTGTATCAAAACGCCTCCTTT
TGGTCCCTATCTTGGCTGTGGTGGCCATACAACTTCTATTTGTATGCGCTGCTTCGTCAG
TGAACATGACAAATACGTATCTACACCACCAATGCTTTGTCAGTCAAGGGAAATACAAAC
CGGGAAGTCAGTATGAGAAAAACCTAAAACGTATCAGGAATGAAATCTCTCCTGAAAGTT
TTAAAAGAGGTTACAACTCTACGCACCTTGGTGCAGGTCCCGATTTCATAATCATGTTCC
TTCAATGCCGCGGAGACACCCACGGGCCCAAATGCCGTTCTTGCTATGCTAACGCCCAAC
CCGAGTTTTTTAAGAGATGTCCAAGATATAAAGGTGGAATAATATGGTACGACCAATGTT
CTTTATATTTTTCTACGATCGATTCTATAGGGATGATCGATTACGACAACAATTTCTGTA
TGTCCAATAAAAAGAAAGTAGACGACTATCTATATAACCATTTAAAACCGCGGTATTTCA
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TGTCGCAA
GAACT

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AACGCCTCCTTTTGGTCCCTATCTTGGCTGTGGTGGCCATACAACTTCTATTTGTACGCG
CTGCTTCGTCAGTGAACATGACAAATACGTATCTACACCACAAATGCTTTGTCAGTCAAG
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CTCCTGAAAGTTTTAAAAGAGGTTACAACTCTACGCACCTTGGTGCAGGTCCCGATTTCA
TAATCATGTTCCTTCAATGCCGCGGAGACACCCACGGGCCCAAATGCCGTTCTTGCTATG
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ACGACCAATGTTCTTTATATTTTTCTACGATCGATTCTATAGGGATGATCGATTACGACA
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CGCGGTATTTCATCGACGATTTGATACAAAATACCACTCGTGAAGCTAAACCGAAAGCGC
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AA

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DS 

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AAGCATTAAAGAAGAGCAAAAAAGTATCCACAACAATGTATATGTCACCGTCTGTATCAA
AACGCCTCCTTTTGGTCCCTATCTTGGCTGTGGTGGCCATACAACTTCTATTTGTATGCG
CTGCTTCGTCAGTGAACATGACAAATACGTATCTACACCACCAATGCTTTGTCAGTCAAG
GGAAATACAAACCGGGAAGTCAGTATGAGAAAAACCTAAAACGTATCAGGAATGAAATCT
CTCCTGAAAGTTTTAAAAGAGGTTACAACTCTACGCACCTTGGTGCAGGTCCCGATTTCA
TAATCATGTTCCTTCAATGCCGCGGAGACACCCACGGGCCCAAATGCCGTTCTTGCTATG
CTAACGCCCAACCCGAGTTTTTTAAGAGATGTCCAAGATATAAAGGTGGAATAATATGGT
ACGACCAATGTTCTTTATATTTTTCTACGATCGATTCTATAGGGATGATCGATTACGACA
ACAATTTCTGTATGTCCAATAAAAAGAAAGTAGACGACTATCTATATAACCATTTAAAAC
CGCGGTATTTCATCGACGATTTGATACAAAATACCACTCGTGAAGCTAACCCGAAAGCGC
CGTACTACACGGTGGAGGAGAAGAG**TGGCGA*TGTAACGATATATGGAATGGCTGAGT
GCTCCTTCGACATGTCGCAAAGAA*CTGTAGGA*GTGTTTAGAACG

QA 1 766 1 766
DS 

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CTTCTACACAAACATCACAGTCTTATAACGCTTATTTTACTGAGCAACAAGCATTAAAGA
AGAGCAAAAAAGTATCCACAACAATGTATATGTCACCGTCTGTATCAAAACGCCTCCTTT
TGGTCCCTATCTTGGCTGTGGTGGCCATACAACTTCTATTTGTATGCGCTGCTTCGTCAG
TGAACATGACAAATACGTATCTACACCACCAATGCTTTGTCAGTCAAGGGAAATACAAAC
CGGGAAGTCAGTATGAGAAAAACCTAAAACGTATCAGGAATGAAATCTCTCCTGAAAGTT
TTAAAAGAGGTTACAACTCTACGCACCTTGGTGCAGGTCCCGATTTCATAATCATGTTCC
TTCAATGCCGCGGAGACACCCACGGGCCCAAATGCCGTTCTTGCTATGCTAACGCCCAAC
CCGAGTTTTTTAAGAGATGTCCAAGATATAAAGGTGGAATAATATGGTACGACCAATGTT
CTTTATATTTTTCTACGATCGATTCTATAGGGATGATCGATTACGACAACAATTTCTGTA
TGTCCAATAAAAAGAAAGTAGACGACTATCTATATAACCATTTAAAACCGCGGTATTTCA
TCGACGATTTGATACAAAATACCACTCGTGAAGCTAACCCGAAAGCGCCGTACTACACGG
TGGAGGAGAAGAAGGTGGCGAATGTAACGATATATGGAATGGCTGAGTGCTCCTTCGACA
TGTCGCAAAGAAACTGTAGGAAGTGTTTAGAACGAAATAATTTCTATTTTAGAAGATGTT
TTCATAATAAAA

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DS 

RD RS1DM28JQ 842 0 0
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GAGGTTACAACTCTACGCACCTTGGTGCAGGTCCCGATTTCATAATCATGTTCCTTCAAT
GCCGCGGAGACACCCACGGGCCCAAATGCCGTTCTTGCTATGCTAACGCCCAACCCGAGT
TTTTTAAGAGATGTCCAAGATATAAAGGTGGAATAATATGGTACGACCAATGTTCTTTAT
ATTTTTCTACGATCGATTCTATAGGGATGATCGATTACGACAACAATTTCTGTATGTCCA
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ATTTGATACAAAATACCACTCGTGAAGCTAACCCGAAAGCGCCGTACTACACGGTGGAGG
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ATAAAATAGGAGCCAGAGTTTTGGGTAAAAGCTGTAGTTTTAGGTACGAGCTTTATCCTT
TCATTTCCCCTGAGGCCGGTCCTAAATATTTGAAGTCTTAAAAAGCAATTTATAGAAAAA
GTATGCGGATCTTTTCTTTTATGAAAGTTTTAAATTTTATTTTGTATTGATATCTTTGTA
TTTATTATTTTATTTAGACAAAAGTGTATGATGTAGTTTAAATAAATCTATACTCCTCG
TAC

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DS 

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ATATGGAATGGCTGAGTGCTCCTTCGACATGTCGCAAAGAAACTGTAGGAAGTGTTTAGA
ACGAAATAATTTCTATTTTAGAAGATGTTTTCATAATAAAATAGGAGCCAGAGTTTTGGG
TAAAAGCTGTAGTTTTAGGTATGAGCTTTATCCTTTCATTTCCCCTGAGGCCGGTCCTAA
ATATTTGAAGTCTTAAAAAGCAATTTATAGAAAAAGTATGCGGATCTTTTCTTTTATGAA
AGTCT*AAATTTTATATTGTATTGATATCTTTGTATTTATTATTTTATTTAAACAAAAGT
GTATGATGTAGTTTAAATAAATCTATACTCCTCG
TAC

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DS 

RD RS1A205JQ 833 0 0
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TGAGAAAAACCTAAAACGTATCAGGAATGAAATCTCTCCTGAAAGTTTTAAAAGAGGTTA
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AGACACCCACGGGCCCAAATGCCGTTCTTGCTATGCTAACGCCCAACCCGAGTTTTTTAA
GAGATGTCCAAGATATAAAGGTGGAATAATATGGTACGACCAATGTTCTTTATATTTTTC
TACGATCGATTCTATAGGGATGATCGATTACGACAACAATTTCTGTATGTCCAATAAAAA
GAAAGTAGACGACTATCTATATAACCATTTAAAACCGCGGTATTTCATCGACGATTTGAT
ACAAAATACCACTCGTGAAGCTAACCCGAAAGCGCCGTACTACACGGTGGAGGAGAAGAA
GGTGGCGAATGTAACGATATATGGAATGGCTGAGTGCTCCTTCGACATGTCGCAAAGAAA
CTGTAGGAAGTGTTTAGAACGAAATAATTTTTATTTTAGAAGATGTTTTCATAATAAAAT
AGGAGCCAGAGTTTTGGGTAAAAGCTGTAGTTTTAGGTACGAGCTTTATCCTTTCATTTC
CCCTGAGGCCGGTCCTAAATATTTGAAGTCTTAAAAAGCAATTTATAGAAAAAGTATGCG
GATCTTTTCTTTTATGAAAGTTTTAAATTTTATTTTGTATTGATATCTTTGTATTTATTA
TTTTATTTAGACAAAAGTGTATGATGTAGTTTAAATAAATCTATACTCCTCG
C

QA 1 832 1 832
DS 

RD RS1EH15JQ 448 0 0
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TAAACCGAAAGCGCCGTACTACACGGTGGAGGAGAAGAAGGTGAAGAATGAAACGATATA
TGGAATGGCTGAGTGCTCCTTCGACATGTCGCAAAGAAACTGTAGGAAGTGTTTAGAACG
AAATAATTTTTATTTTAGAAGATGTTTTCATAATAAAATAGGAGCCAGAGTTTTGGGTAA
AAGCTGTAGTTTTAGGTATGAGCTTTATCCTTTCATTTCCCCTGAGGCCGGTCCTAAATA
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CT*AAATTTTATATTGTATTGATATCTTTGTATTTATTATTTTATTTAAACAAAAGTGTA
TGATGTAGTTTAAATAAATCTATACTCC

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DS 

RD RS1A205TR 794 0 0
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TGAAAGTTTTAAAAGAGGTTACAACTCTACGCACCTTGGTGCAGGTCCCGATTTCATAAT
CATGTTCCTTCAATGCCGCGGAGACACCCACGGGCCCAAATGCCGTTCTTGCTATGCTAA
CGCCCAACCCGAGTTTTTTAAGAGATGTCCAAGATATAAAGGTGGAATAATATGGTACGA
CCAATGTTCTTTATATTTTTCTACGATCGATTCTATAGGGATGATCGATTACGACAACAA
TTTCTGTATGTCCAATAAAAAGAAAGTAGACGACTATCTATATAACCATTTAAAACCGCG
GTATTTCATCGACGATTTGATACAAAATACCACTCGTGAAGCTAACCCGAAAGCGCCGTA
CTACACGGTGGAGGAGAAGAAGGTGGCGAATGTAACGATATATGGAATGGCTGAGTGCTC
CTTCGACATGTCGCAAAGAAACTGTAGGAAGTGTTTAGAACGAAATAATTTCTATTTTAG
AAGATGTTTTCATAATAAAATAGGAGCCAGAGTTTTGGGTAAAAGCTGTAGTTTTAGGTA
CGAGCTTTATCCTTTCATTTCCCCTGAGGCCGGTCCTAAATATTTGAAGTCTTAAAAAGC
AATTTATAGAAAAAGTATGCGGATCTTTTCTTTTATGAAAGTTTTAAATTTTATTTTGTA
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TCTATACTCCTCG
C

QA 1 793 1 793
DS 

RD RS1CR84TF 245 0 0
G
TAATAAAATAGGAGCCAGAGTTTTGGGTAAAAGCTGTAGTTTTAGGTACGAGCTTTATCC
TTTCATTTCCCCTGAGGCCGGTCCTAAATATTTGAAGTCTTAAAAAGCAATTTATAGAAA
AAGTATGCGGATCTTTTCTTTTATGAAAGTTTTAAATTTTATTTTGTATTGATATCTTTG
TATTTATTATTTTATTTAGACAAAAGTGTATGATGTAGTTTAAATAAATCTATACTCCTC
GTAC

QA 2 245 2 245
DS 



AS 2 11

CO CL275Contig1 625 6 16 U
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CAATCTAAGAAGAGGCTTGAGCTTAAGGAGAAAATGGTGAGAATCAGTGTACTCAACGAT
GCTCTCAAGAGCATGTACAATGCCGAGAAACGTGGCAAGAGGCAAGTCATGATCAGGCCT
TCCTCAAAAGTCATCATCAAGTTTCTCATCGTCATGCAGAAGCACGGTTACATTGGTGAG
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AACAAGTGTGGTGTTATCAGTCCTCGTTTTGATGTTGGTGTTAAGGAGATTGAAAGTTGG
ACTGCTCGTTTGCTTCCCTCCCGACAGTTCGGTTACATCGTGTTGACTACTTCAGCTGGG
ATTATGGACCATGAAGAAGCGAGGAGAAAGAATGTCGGAGGCAAGGTCCTCGGTTTCTTC
TATTGAAGTTCTCTGTGGGGAAAAGAGACTTTTCATTCTATTATGTTTAACTATTGTTAT
CAATTTGTCTTTTGAATTTTTGTGGTAACTCTGTTGGATAGTTCTGAAATTACTCCCTTT
TTAATCTTGATTGCTTGAAAGATTC


BQ
10 10 20 20 20 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1E510TF U 4
AF RS1AF18JQ C 1
AF RS1FU12TF U 64
AF RS1E510JQ C 49
AF RS1BH80TF U 7
AF RS1AF18TF U 1
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GG
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DS 

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CAATCTAAGAAGAGGCTTGAGCTTAAGGAGAAAATGGTGAGAATCAGTGTACTCAACGAT
GCTCCCAAGAGCATGTACAATGCCGAGAAACGTGGCAAGAGGCAAGTCATGATCAGGCCT
TCCTCAAAAGTCATCATCAAGTTTCTCATCGTCATGCAGAAGCACGGTTACATTGGTGAG
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TATTGAAGTTCTCTGTGGGGAAAAGAGACTTTTCATTCTATTATGTTTAACTATTGTTAT
CAATTTGTCTTTTGAATTTTTGTGGTAACTCTGTTGGATAGTTCTGAAATTACTCCCTTT
TTAATCTTGATTGCTTGAAAGATTC

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DS 

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CTCAAGAGCATGTTCAATGCCGAGAAACGTGGCAAGAGGCAGGTCATGATCAGGCCTTCC
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AAGTGTGGTGTTATCAGTCCTCGTTTTGATGTTGGTGTCAAGGAGATTGAAGGTTGGACT
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TGAAGTTCTCTGTGGGGAAAAGAGACTTTTCATTCTATTATGTTTAACTATTGTTATCAA
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TTTGGTCTCGAGTT

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DS 

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ATTGAAAGTTGGACTGCTCGTTTGCTTCCCTCCCGACAGTTCGGTTACATCGTGTTGACT
ACTTCAGCTGGGATTATGGACCATGAAGAAGCGAGGAGAAAGAATGTCGGAGGCAAGGTC
CTCGGTTTCTTCTATTGAAGTTCTCTGTGGGGAAAAGAGACTTTTCATTCTATTATGTTT
AACTATTGTTATCAATTTGTCTTTTGAATTTTTGTGGTAACTCTGTCGGATAGTTCTGAA
ATTACTCCCTTTTT
AACC

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DS 

RD RS1BH80TF 602 0 0
GG
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GAGCATGTTCAATGCCGAGAAACGTGGCAAGAGGCAGGTCATGATCAGGCCTTCCTCAAA
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TGGTGTTATCAGTCCTCGTTTTGATGTTGGTGTCAAGGAGATTGAAGGTTGGACTGCTCG
TTTGCTTCCTTCCCGACAGTTCGGGTACATCGTGTTGACTACTTCAGCTGGGATTATGGA
CCATGAAGAAGCGAGGAGAAAGAACGTCGGAGGCAAGGTCCTCGGTTTCTTCTATTGAAG
TTCTCTGTGGGGAAAAGAGACTTTTCATTCTATTATGTTTAACTATTGTTATCAATTTGT
CTTTTGAATTTTTGTGGCAACTCTGTTGGATAGTTCTGAAATTACTCCCTTTTT
TTTGGT

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DS 

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GG
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ATCTAAGAAGAGGCTTGAGCTTAAGGAGAAAATGGTGAGAATCAGTGTACTCAACGATGC
TCCCAAGAGCATGTACAATGCCGAGAAACGTGGCAAGAGGCAAGTCATGATCAGGCCTTC
CTCAAAAGTCATCATCAAGTTTCTCATCGTCATGCAGAAGCACGGTTACATTGGTGAGTT
TGAGTATGTCGATGACCACCGATCTGGCAAAATCGTTGTGGAATTGAACGGGAGGTTGAA
CAAGTGTGGTGTTATCAGTCCTCGTTTTGATGTTGGTGTTAAGGAGATTGAAAGTTGGAC
TGCTCGTTTGCTTCCCTCCCGACAGTTCGGTTACATCGTGTTGACTACTTCAGCTGGGAT
TATGGACCATGAAGAAGCGAGGAGAAAGAATGTCGGAGGCAAGGTCCTCGGTTTCTTCTA
TTGAAGTTCTCTGTGGGGAAAAGAGACTTTTCATTCTATTATGTTTAACTATTGTTATCA
ATTTGTCTTTTGAATTTTTGTGGTAACTCTGTTGGATAGTTCTGAAATTACTCCCTTTTT
AATCTTGATTGCTTGAAAGATTC

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DS 



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CTTCTTAGACTGGCAGCTCGGGAGGCAGGTCGCTTAGTGACGGAGGAGAAGCAGAGAGAC
GGAGAAGAGAAAGAGCC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A647JQ U 3
AF RS1BC71JQ U 138
AF RS1FO27JQ U 1
AF RS1A647TF C 4
AF RS1FO27TF C 1
BS 1 115 RS1FO27JQ
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RD RS1A647JQ 588 0 0
T
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CTTAGACTGGCAGCTCGGGAGGCAGGTCGCTTAGTGACGGAGGAGAA

QA 2 588 2 588
DS 

RD RS1BC71JQ 453 0 0
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CAATGTAACCGTGCTTCTGCATGACGATGAAAAACTTAATGATGACTTTTGAGGAAGGCC
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DS 

RD RS1FO27JQ 617 0 0
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ATGGTCCATAATCCCAGCTGAAGTAGTCAACACGATGTACCCAAACTGTCTGGAAGGGAG
CAAACGAGCAGTCCAACTTTCAATCTCCTTAACACCAACATCAAAACGAGGACTGATAAC
ACCACACTTGTTCAACCTCCCGTTCAATTCCACAACGATTTTGCCAGATCGGTGGTCATC
GACGTACTCAAACTCACCAATGTAACCGTGCTTCTGCATGACGATGAGAAACTTAATGAT
GACTTTTGAGGAAGGCCTGATCATGACCTGCCTCTTGCCACGTTTCTCTGCATTGAACAT
GCTCTTGAGAGCATCGTTGAGCACACTGATTCTTACCATTTTCTCCTTAAGCTCAAGCCT
CTTCTTAGACTGGCAGCTCGGGAGGCAGGTCGCTTAGTGACGGAGGAGAAGCAGAGAGAC
GGAGAAGAGAAAGAGCC

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DS 

RD RS1A647TF 601 0 0
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CTTGAGAGCATCGTTGAGCACACTGATTCTTACCATTTTCTCCTTAAGCTCAAGCCTCTT
CTTAGACTGGCAGCTCGGGAGGCAGGTCGCTTAGTGACGGAGGAGAAGCAGAGAGACGG
CC

QA 1 599 1 599
DS 

RD RS1FO27TF 617 0 0
AAT
GTGAATCCAAATAAATATTTCAAGAAAGTTACCACAAAAATTCAAAAGACAAAGTTTCAA
AGAAAATTGATAACAATAGCTAAACATAATAGAATGAAAAGTCTCTTTTCCC*ATAGAAA
ACTTCAATAGAAGAAACCGAGGACCTTGCCTCCAACATTCTTTCTCCTCGCTTCTTCATG
GTCCATAATCCCAGCTGAAGTAGTCAACACGATGTACCCAAACTGTCTGGAAGGGAGCAA
ACGAGCAGTCCAACTTTCAATCTCCTTAACACCAACATCAAAACGAGGACTGATAACACC
ACACTTGTTCAACCTCCCGTTCAATTCCACAACGATTTTGCCAGATCGGTGGTCATCGAC
GTACTCAAACTCACCAATGTAACCGTGCTTCTGCATGACGATGAGAAACTTAATGATGAC
TTTTGAGGAAGGCCTGATCATGACCTGCCTCTTGCCACGTTTCTCTGCATTGAACATGCT
CTTGAGAGCATCGTTGAGCACACTGATTCTTACCATTTTCTCCTTAAGCTCAAGCCTCTT
CTTAGACTGGCAGCTCGGGAGGCAGGTCGCTTAGTGACGGAGGAGAAGCAGAGAGACGGA
GAAGAGA
AAGAGCC

QA 4 610 4 610
DS 



AS 1 11

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CAAGTGATACTACAAATGGATTTTGGTAGGTTCCCTATAATCTCAATCCTCGAAGACATG
CTCGAAGTCCCTGAGGATCACAACGAGAAGAGCCGCAACAATCCATCGAGAGCGTACATG
CGAGACGCAAAGGCGATGGCAGCCACACCAGCCGACGTGATGGAGCATCCGAACGCGTAC
GTTTTCGTGGTGGACATGCCTGGGATCAAAGGAAACGAGATCAAGGTTCAGGTAGAGAAC
GAGAATGTGCTTGTGGTGAGCGGAGAGAGGCAGAGAGAGAAGAACAAAGAGAACGAAGGC
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GAGAATGCAGATTTGGAGAAGATCACTGCTGTTTGTCACGATGGTGTTTTGAGGGTGACT
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TGAGTTTCTGGATTTCTCCTTTTGTGTGGTTCTCAGGGTCTCAATGTGATCGGAATGTGA
GAGATTGCGTGTTGTCTGATCTAAAATGTAATAAAAGTGTCTGCTCTGTTTTAATTTTTT
TTTT*CATCACTGTTTTAATTCTCTCTCTCTTTCTATTTGGTTTAAGTGTATGCTGTTGA
ACATCTATGTGAGTTCTGAGACACGTTGTACTAAGTTTGAGACTGGTTTCTATCTTCGAA
AGTACAAAAAACAAATTAGTACC


BQ
25 25 25 35 35 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 25 65 50 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 
65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 65 65 65 65 50 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 50 35 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 65 0 
25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 25 55 25 55 55 25 25 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 
35 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1BF49TF U 1
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AF RS1H402TF U 1
AF RS1BF83JQ C 4
AF RS1BF49JQ C 110
AF RS1F902JQ C 5
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GAGATTGCGTGTTGTCTGATCTAAAATGTAATAAAAGTGTCTGCTCTGTTTTAATTTTT

QA 1 659 1 659
DS 

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CAAGTGATACTACAAATGGATTTTGGTAGGTTCCCTATAATCTCAATCCTCGAAGACATG
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CGAGACGCAAAGGCGATGGCAGCCACACCAGCCGACGTGATGGAGCATCCGAACGCGTAC
GTTTTCGTGGTGGACATGCCTGGGATCAAAGGAAACGAGATCAAGGTTCAGGTAGAGAAC
GAGAATGTGCTTGTGGTGAGCGGAGAGAGGCAGAGAGAGAAGAACAAAGAGAACGAAGGC
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GAGAATGCAGATTTGGAGAAGATCACTGCTGTTTGTCACGATGGTGTTTTGAGGGTGACT
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TGAGTTTCTGGATTTCTCCTTTTGTGTGGTTCTCAGGGTCTCAATGTGATCGGAATGTGA
GAGATTGCGTGTTGTCTGATCTAAAATGTAATAAAAGTGTCTGCTCTGTTTTAATTTTT

QA 1 659 1 659
DS 

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TCCCTTTTTATTTGGTTTAAGTGTATGCTGTTGAACATCTTTG**AGTTTTGAGACACGT
TGTACTAAGTTTGAGACTGGTT

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DS 

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G
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GGGTCTCAATGTGATCGGAATGTGAGAGATTGCGTGTTGTCTGATCTAAAATGTAATAAA
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ATTTGGTTTAAGTGTATGCTGTTGAACATCTATGTGAGTTCTGAGACACGTTGTACT

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DS 

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TGCTCTGTTTTAATTTTTTTTTTTCATCACTGTTTTAATTCTCTCTCTCTTTCTATTTGG
TTTAAGTGTATGCTGTTGAACATCTATGTGAGTTCTGAGACACGTTGTACT

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DS 

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GG
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TGTGCTTGTGGTGAGCGGAGAGAGGCAGAGAGAGAAGAACAAAGAGAACGAAGGCGTGAA
GTATGTGAGGATGGAGAGGAGAATGGGTAAGTTTATGAGGAAGTTTCAGCTGCCTGAGAA
TGCAGATTTGGAGAAGATCACTGCTGTTTGTCACGATGGTGTTTTGAGGGTGACTGTTCA
GAAGCTTCCTCCTCCTGAGCCTAAGAAACCGAAGACTATTCAGGTCCAAGTTGCTTGAGT
TTCTGGATTTCTCCTTTTGTGTGGTTCTCAGGGTCTCAATGTGATCGGAATGTGAGAGAT
TGCGTGTTGTCTGATCTAAAATGTAATAAAAGTGTCCGCTCTGTTTTAATTTTTTTTTT*
CATCACTGTTTTAATTCTCTCTCTCTTTCTATTTGGTTTAAGTGTATGCCGTTGAACATC
TATGTGAGTTCTGAGACACGTTGTACTAAGTTTGAGACTGGTTTCTATCTTCGAA
GTGCAAAAAAAA

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DS 

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GAGAATGTGCTTGTGGTGAGCGGAGAGGGGCAGAGAGAGAAGAACAAAGAGAACGAAGGC
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TGAGTTTCTGGATTTCTCCTTTTGTGTGGTTCTCAGG*TCTCAATGTGATCGGAATGTGA
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TTTT*CATCACTGTTTTAATTCTCTCTCTCTTTCTATTTGGTTTAAGTGTATGCTGTTGA
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AGT
A

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CGAGACGCAAAGGCGATGGCAGCCACACCAGCCGACGTGATGGAGCATCCGAACGCGTAC
GTTTTCGTGGTGGACATGCCTGGGATCAAAGGAAACGAGATCAAGGTTCAGGTAGAGAAC
GAGAATGTGCTTGTGGTGAGCGGAGAGAGGCAGAGAGAGAAGAACAAAGAGAACGAAGGC
GTGAAGTATGTGAGGATGGAGAGGAGAATGGGTAAGTTTATGAGGAAGTTTCAGCTGCCT
GAGAATGCGGATTTGGAGAAGATCACTGCTGTTTGTCACGATGGTGTTTTGAGGGTGACT
GTTCAGAAGCTTCCTCCTCCTGAGCCTAAGAAACCGAAGACTATTCAGGTCCAAGTTGCT
TGAGTCTCTGGATTTCTCCTTTTGTGTGGTTCTCAGGGTCTCAATGTGATCGGAATGTGA
GAGATTGCGTGTTGTCTGATCTAAAATGTAATAAAAGTGTCTGCTCTGTTTTAATTTTT*
*TTT*CATCACTGTTTTAATTCTCTCTCCCTTTCTATTTGGTTTAAGTGTATGCTGTTGA
ACATCTTTG**AGTTCTGAGACACGTTGTACTAAGTTTGAGACTGGTTTCTATCTTCGAA
AG

QA 1 782 1 782
DS 

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AATGTGCTTGTGGTGAGCGGAGAGGGGCAGAGAGAGAAGAACAAAGAGAACGAAGGCGTG
AAGTATGTGAGGATGGAGAGGAGAATGGGTAAGTTTATGAGGAGGTTTCAGCTGCCTGAG
AATGCAGATTTGGAGAAGATCACTGCTGTTTGTCACGATGGTGTTTTGAGGGTGACTGTT
CAGAAGCTTCCTCCTCCTGAGCCTAAGAAACCGAAGACTATTCAGGTCCAAGTTGCTTGA
GTTTCTGGATTTCTCCTTTTGTGTGGTTCTCAGGGTCTCAATGTGATCGGAATGTGAGAG
ATTGCGTGTTGTCTGATCTAAAATGTAATAAAAGTGTCTGCTCTGTTTTAATTTTTCTTT
T*CATCACTGTTTTAATTCTCTCTCTCTTTCTATTTGGTTTAAGTGTATGCTGTTGAACA
TTTATGTGAGTTCTGAGACACGTTGTACTAAGTTTGAGACTGGTTTCTATCTTCGAAAGT
ACAAAAAACAAATTAGTACC

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DS 

RD RS1BF49JQ 693 0 0
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CGAACGCGTACGTTTTCGTGGTGGACATGCCTGGGATCAAAGGAAACGAGATCAAGGTTC
AGGTAGAGAACGAGAATGTGCTTGTGGTGAGCGGAGAGAGGCAGAGAGAGAAGAACAAAG
ATAACGAAGGCGTGAAGTATGTGAGGATGGAGAGGAGAATGGGTAAGTTTATGAGGAAGT
TTCAGCTGCCTGAGAATGCAGATTTGGAGAAGATCACTGCTGTTTGTCACGATGGTGTTT
TGAGGGTGACTGTTCAGAAGCTTCCTCCTCCTGAGCCTAAGAAACCGAAGACTATTCAGG
TCCAAGTTGCTTGAGTTTCTGGATTTCTCCTTTTGTGTGGTTCTCAGGGTCTCAATGTGA
TCGGAATGTGAGAGATTGCGTGTTGTCTGATCTAAAATGTAATAAAAGTGTCTGCTCTGT
TTTAATTTTTTTTTTTCATCACTGTTTTAATTCTCTCTCTCTTTCTATTTGGTTTAAGTG
TATGCTGTTGAACATCTATGTGAGTTCTGAGACACGTTGTACTAAGTTTGAGACTGGTTT
CTATCTTCGAAAGTACAAAAAACAAATTAGT
GC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1F902JQ 781 0 0
G
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AGTCCCCGAGGATCACAACGAGAAGAGCCGCAACAATCCATCGAGAGCGTACATGCGAGA
CGCAAAGGCGATGGCAGCCACACCAGCCGACGTGATGGAGCATCCGAACGCGTACGTTTT
CGTGGTGGACATGCCTGGGATCAAAGGAAACGAGATCAAGGTTCAGGTAGAGAACGAGAA
TGTGCTTGTGGTGAGCGGAGAGAGGCAGAGAGAGAAGAACAAAGAGAACGAAGGCGTGAA
GTATGTGAGGATGGAGAGGAGAATGGGTAAGTTTATGAGGAAGTTTCAGCTGCCTGAGAA
TGCAGATTTGGAGAAGATCACTGCTGTTTGTCACGATGGTGTTTTGAGGGTGACTGTTCA
GAAGCTTCCTCCTCCTGAGCCTAAGAAACCGAAGACTATTCAGGTCCAAGTTGCTTGAGT
TTCTGGATTTCTCCTTTTGTGTGGTTCTCAGGGTCTCAATGTGATCGGAATGTGAGAGAT
TGCGTGTTGTCTGATCTAAAATGTAATAAAAGTGTCCGCTCTGTTTTAATTTTTTTTTT*
CATCACTGTTTTAATTCTCTCTCTCTTTCTATTTGGTTTAAGTGTATGCCGTTGAACATC
TATGTGAGTTTTGAGACACGTTGTACTAAGTTTGAGACTGGTTTCTATCTTCGAAAGT
GC

QA 2 779 2 779
DS 



AS 2 10

CO CL277Contig1 1011 8 28 U
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CAGTGGACGTCCAAAAGGCTGTAGAGAAAGAATATGAGATGGCTCTGCAAGACAGAGTTA
TGGAGGAGACTAAGGACAAGAAGAATGCTGTCGAGTCACATGTTTATGATATGAGAAACA
AACTGAGTGACAAATACCATGAGTACATAACGGAGTCAGAGAGGGAGGCTTTCCTAGCGA
AGCTCCAGGAAGTAGAGGATTGGTTGTATGAAGACGGAGAAGATGAAACTAAAGGTGTTT
ATGTCGCAAAGCTTGAGGAGCTGAAGAAGGTGGGTGACCCAGTTGAAATGCGGTTCAAGG
AGTCGCGGGAGAGAGGGACGGTCATTGGACAGCTTGGTCACTGTGTTAACAGCTACAGAG
AGGCAGCTGTCTCGAATGATTCCAAGTTTGACCACATTGAACTAGAAGAGAAGCAAAAGG
TGTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGCGTGGATGAGGGAGAAGCAGCAGCAGCAGGAGG
CACTTCCCAAGTACGCAACACCAGCTTTCCTGTCAGCTGACGTTACAAAGAAGGCTGAGG
CGCTGGACAAGTTCTGCAGGCCTATAATGACCAAACCAAAGCCGGTTGCGAAACCGGAAG
CACCACCAGCTAAGGCGGCTGATGAGGAGAAGAGTGAGCCACAGCCAGAACCGGCCTCTG
GTGAAGAACCAATGGAGACTGAGAAGCCTACCGAAGATAGTGCCTAAGAGATGATGGTGC
TGTGTATCGATTTTGTTTTTAATTTCTTGTTTCCCCCCCAAAAGAATCTTATATTGAAAC
TCTCTTTTCTTTGCGGTTACAGTTTTCAGGAAGTATTATTTTCTCTTTGTGTTTTCTTTA
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TTTTTTTTATCAACAAAGCAAATGAAATATGCATATACTAGCATTTCTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 25 40 25 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 5 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CT52JQ C 367
AF RS1FA12TF U 1
AF RS1FA12JQ C 429
AF RS1F927JQ C 161
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AF RS1AX95JQ C 367
AF RS1CT52TF U 367
AF RS1AX95TF U 367
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DS 

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CAGTGGACGTCCAAAAGGCTGTAGAGAAAGAATATGAGATGGCTCTGCAAGACAGAGTTA
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QA 1 762 1 762
DS 

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AAGTTTTGCAGGCCTATAATGACCAAACCAAAGCCGGTTGGGAAACCGGAAGCACCACCA
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DS 

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G
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GATGAAACTAAAGGTGTTTATGTCGCAAAGCTTGAGGAGCTGAAGAAGGTGGGTGACCCA
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AC

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DS 

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G
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GATGAAACTAAAGGTGTTTATGTCGCAAAGCTTGAGGAGCTGAAGAAGGTGGGTGACCCA
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CTAGAAGAGAAGCAAAAGGTGTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGCGTGGATGAGGGAG
AAGCAGCAGCAGCAGGAGGCACTTCCCAAGTACGCAACACCAGCTTTCCTGTCAGCTGAC
GTTACAAAGAAGGCTGAGGCGCTGGACAAGTTCTGCAGGCCTATAATGACCAAACCAAAG
CCGGTTGCGAAACCGGAAGCACCACCAGCTAAGGCGGCTGATGAGGAGAAGAGTGAGCCA
CAGCCAGAACCGGCCTCTGGTGAAGAACCAATGGAGGCTGAGAAGCCTACCGAAGATAGT
GCCTAAGAGATGATGGTGCTGTGTATCGATTTTGTTTTTAATTTCTTGTTTCCCCCC*AA
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TCTCTTTGTGTTT*CTTTATAA*CTATTTATCGTGTGTGAGATGAGTATTTGTCT*ACTT
GTTACATGTTTCTGAGCTGTTTTTT
ATCACAAGCAAA

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DS 

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DS 

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ACAAGTTCTGCAGGCCTATAATGACCAAACCAAAGCCGGTTGCGAAACCGGAAGCACCAC
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AACCAATGGAGACTGAGAAGCCTACCGAAGATAGTGCCTAAGAGATGATGGTGCTGTGTA
TCGATTTTGTTTTTAATTTCTTGTTTCCCCCCCAAAAGAATCTTATATTGAAACTCTCTT
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CCAAGTACGCAACACCAGCTTTCCTGTCAGCTGACGTTACAAAGAAGGCTGAGGCGCTGG
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CAGCTAAGGCGGCTGATGAGGAGAAGAGTGAGCCACAGCCAGAACCGGCCTCTGGTGAAG
AACCAATGGAGACTGAGAAGCCTACCGAAGATAGTGCCTAAGAGATGATGGTGCTGTGTA
TCGATTTTGTTTTTAATTTCTTGTTTCCCCCCCAAAAGAATCTTATATTGAAACTCTCTT
TTCTTTGCGGTTACAGTTTTCAGGAAGTATTATTTTCTCTTTGTGTTTTCTTTATAAACT
ATTTATCGTGTGTGAGATGAGTATTTGTTCTACTTGTTACATGTTTCTGAGCTGTTTTTT
TTATCAACAAAGCAAATGAAATATGCATATACTAGCAT

QA 1 638 1 638
DS 



CO CL277Contig2 756 2 2 U
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TCTGCAGGCCTATAATGACCAAACCAAAGCCGGTTGCTAAACCGGAAGCACCACCAGCCA
AGGCGGCTGATGAGGAGAAGAGTGAGCCACAGCCAGAACCGGCCTCTGGTGAAGAACCTA
TGGAGACTGAGAAGCCCGCCGAAGATAGTGCCTAAGAGATGATGGTGTGCTGTGTATCGA
TTTTGTTTCTACTTTTTTTCTTGGTTCTTGTTTTTCCCCAAAAGAATCTAATATTCAAAC
TCTTTCCAGGAAGTATTGTATTTTCTTTATAAACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GD47TF U 1
AF RS1GD47JQ C 86
BS 1 588 RS1GD47TF
BS 589 756 RS1GD47JQ

RD RS1GD47TF 588 0 0
GGGACCGGAAGAATGCTGTTGAGTCATATGTTTATGATATGCGAAACAAACTGAGTGACA
AATACCATGAGTACATGACCGAGTCAGACAGAGAAGCATTCCTGGCAAGGCTGCAGGAAG
TGGAGGACTGGTTGTATGAAGATGGAGAAGATGAGACTAAAGGCGTCTACGTTGCAAAGC
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TCTGCAGGCCTATAATGACCAAACCAAAGCCGGTTGCTAAACCGGAAGCACCACCAGCCA
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DS 

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TCTTGTTTTTCCCCAAAAGAATCTAATATTCAAACTCTTTCCAGGAAGTATTGTATTTTC
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QA 1 671 1 671
DS 



AS 2 9

CO CL278Contig1 1542 7 8 U
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GCGTTGCATACGGCTCTACAATGGAATTTACGTTTTTGAACT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AY49JQ U 38
AF RS1CG63JQ U 1
AF RS1DA60JQ U 1
AF RS1CG63TF C 1
AF RS1DW44JQ U 38
AF RS1DW44TF C 341
AF RS1AP66JQ U 963
BS 1 551 RS1CG63JQ
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BS 1002 1002 RS1DW44TF
BS 1003 1542 RS1AP66JQ

RD RS1AY49JQ 297 0 0
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CTGTTCATGGATTAACGAAAATGTGCAAACGCTCTATTTGCCTCTGCCATTCTATGAGTC
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AATTTGAAAGCCATATTTCGACCCGGACGTTTTCGGGATGCCCCTAATAACCAACGAATG
GCAAGTGCTTTTCCTTGCGTGGATCCTATTTCAATGGGAACTTGATGAGTTGATCCG

QA 1 297 1 297
DS 

RD RS1CG63JQ 622 0 0
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GCCACTCCCTTTGGCAGCATCCACTAATTCGGAACTTAATTTGAAAGCCATATTTCGACC
CGGACGTTTTCGGGATGCCCCTAATAACCAACGAATGGCAAGTGCTTTTCCTTGCGTGGA
TCCTATTTCAATGGGAACTTGATGAGTTGATCCGCCTACACGTCTTGCTTTTACTGCTAT
ATCGGGAGTTACTCCACGTATTGCTTGACGTAAAACAGATAGTGGATTTGTTTCTGTCTT
TTGTTGAATCTTTTTCAAGGCTCGATAGATAATTTGATAAGCCAATGATTTTTTTCCGTG
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TGCAGTTTTTT*TTCTGCAGTACCTCGACGTGACATGAGCGTGAAAGGGGTTCAAGAATC
TGTTTTCTTTTTATAAGGGCTC

QA 1 622 1 622
DS 

RD RS1DA60JQ 612 0 0
CGAGAAAGAGATCGATCAATTCCGATTTTTTCTTTTTCTATTGATTCTTTTCGGATCGAG
ATGTATGGATCCACGGATCTATGTGTCTATATAGATCCTGTTCATGGATTAACGAAAATG
TGCAAACGCTCTATTTGCCTCTGCCATTCTATGAGTCTCTTCCTTTT*GCGTATGGCATC
GCCACTCCCTTTGGCAGCATCCACTAATTCGGAACTTAATTTGAAAGCCATATTTCGACC
CGGACGTTTTCGGGATGCCCCTAATAACCAACGAATGGCAAGTGCTTTTCCTTGCGTGGA
TCCTATTTCAATGGGAACTTGATGAGTTGATCCGCCTACACGTCTTGCTTTTACTGCTAT
ATCGGGAGTTACTCCACGTATTGCTTGACGTAAAACAGATAGTGGATTTGTTTCTGTCTT
TTGTTGAATCTTTTTCAAGGCTCGATAGATAATTTGATAAGCCAATGATTTTTTTCCGTG
TTTCAGAATACGGTTAACCAACATGTTAACTAATCGATTACGATAAATTGGATCGGATTT
TGCAGTTTTTTCTTCTGAAGTACCTCGACGTGACATGAGCGTGAAAGGGGTTCAAGAATC
TGTTTTCTTTTT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RS1CG63TF 622 0 0
CGAGAAAGAGATCGATCAATTCCGATTTTT*CTTTTTCTATTGATTCTTTTCGGATCGAG
ATGTATGGATCCACGGATCTATGTGTCTATACAGATCCTGTTCATGGATTAACGAAAATG
TGCAAACGCTCTATTTGCCTCTGCCATTCTATGAGTCTCTTCCTTTTTGCGTATGGCATC
GCCACTCCCTTTGGCAGCATCCACTAATTCGGAACTTAATTTGAAAGCCATATTTCGACC
CGGACGTTTTCGGGATGCCCCTAATAACCAACGAATGGCAAGTGCTTTTCCTTGCGTGGA
TCCTATTTCAATGGGAACTTGATGAGTTGATCCGCCTACACGTCTTGCTTTTACTGCTAT
ATCGGGAGTTACTCCACGTATTGCTTGACGTAAAACAGATAGTGGATTTGTTTCTGTCTT
TTGTTGAATCTTTTTCAAGGCTCGATAGATAATTTGATAAGCCAATGATTTTTTTCCGTG
TTTCAGAATACGGTTAACCAACATGTTAACTAATCGATTACGATAAATTGGATCGGATTT
TGCAGTTTTTT*TTCTGCAGTACCTCGACGTGACATGAGCGTGAAAGGGGTTCAAGAATC
TGTTTTCTTTTTATAAGGGCTC

QA 1 622 1 622
DS 

RD RS1DW44JQ 741 0 0
CTATTGATTCTTTTCGGATCGAGATGTATGGATCCACGGATCTATGTGTCTATATAGATC
CTGTTCATGGATTAACGAAAATGTGCAAACGCTCTATTTGCCTCTGCCATTCTATGAGTC
TCTTCCTTTTTGCGTATGGCATCGCCACTCCCTTTGGCAGCATCCACTAATTCGGAACTT
AATTTGAAAGCCATATTTCGACCCGGACGTTTTCGGGATGCCCCTAATAACCAACGAATG
GCAAGTGCTTTTCCTTGCGTGGATCCTATTTCAATGGGAACTTGATGAGTTGATCCGCCT
ACACGTCTTGCTTTTACTGCTATATCGGGAGTTACTCCACGTATTGCTTGACGTAAAACA
GATAGTGGATTTGTTTCTGTCTTTTGTTGAATCTTTTTCAAGGCTCGATAGATAATTTGA
TAAGCCAATGATTTTTT*CCGTGTTTCAGAATACGGTTAACCAACATGTTAACTAATCGA
TTACGATAAATTGGATCGGATTTTGCAGTTTTTTCTTCTGCAGTACCTCGACGTGACATG
AGCGTGAAAGGGGTTCAAGAATCTGTTTTCTTTTTATAAGGGCTCAAATCTTTTATTTTG
GCTTTTTGACCCCATATTTAGAACGCCCTTGTTGACGATCCTTTACTCCGACAGCATCTA
GGGTTCCTCGAACAATGTGATATCTCACACCGGGTAAATCCTTAACCCTTCCCCCTCTTA
CTAAGACTACAGAATGTTCTT

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1DW44TF 708 0 0
ACGTC
TGCTTTTACTGCTATATCGGGAGTTACTCCACGTATTGCTTGACGTAAA*CAGATAGTGG
ATTTGTTTCTGTCTTTTGTTGAATCTTTT*CAAGGCTCGATAGATAATTTGATAAGCCAA
TGATTTTTT*CCGTGTTTCAGAATACGGTTAACCAACATGTTAACTAATCGATTACGATA
AATTGGATCGGATTTTGCAGTTTTTTCTTCTGCAGTACCTCGACGTGACATGAGCGTGAA
AGGGGTTCAAGAATCTGTTTTCTTTTTATAAGGGCTCAAATCTTTTATTTTGGCTTTTTG
ACCCCATATTTAGAACGCCCTTGTTGACGATCCTTTACTCCGACAGCATCTAGGGTTCCT
CGAACAATGTGATATCTCACACCGGGTAAATCCTTAACCCTTCCCCCTCTTACTAAGACT
ACAGAATGTTCTTGTAAATTATGGCCAATACCAGGTATATAAGCAGTGATTTCAAATCCC
GAGGTTAATCGTACTCTGGCAACTTTACGTAAGGCAGAGTTTGGTTTTTTGGGGGTGATA
GTATACACCCGAGTACATGTTCCTCGTCGCTGAGGGCATCCCCGAAGCGCTGGGGATTTC
GTGACATTTCGGATTGGCTGTCTTGTATTTCTAAGTTGTTTAATGGTTGGCATACGGAAT
CATATAAATAATGGGCTGGTTTAGATGGGTTCTAACCGGCTA
C

QA 6 707 6 707
DS 

RD RS1AP66JQ 580 0 0
TCTTGTATTTCTAA
TAAGTTGTTTAATGGTTGGCATACGTAATCATATAAATAATGGGCTGGTTTAGATGGGTT
CTAACCGGCTAATTATTTATTACTTCTCTTCAAGATTCTCTTCAATATATTTTTTTTATA
TTGAAGAGAATATGAAACTAAACCTTTAATCTAAAAAGATATAAAATTAGCAATGGTAGA
TTTGCATGAAATCGCTCCTATTTTATTGAACCGCTACAAGATCAACAATTCCATGAGCTT
GGGCTTCTGTTGCTGACATAAAAACATCCCTTTCCATGTCTTCGGATACAACCCATATAG
GTTTGCCCGTTCTTTGTACATAAACCCTTGTGATGGTTTCGCGAAGTTTTAGTAGTTCTT
CCGCTTCCAAGATAACTTCTCCCGTTTGTGCCTCATAAAACGAACTAGCGGGTTGATGGA
TCATTACCCTGATGATATAATAGAAAAGGTTTTTCTATTTCGCAGAATGAGGCGAGATAA
CCAAAAAAACAGAGAAATTTGAATAACCGTACAGGCTTTTTTGTGCGTTGCATACGGCTC
TACAATGGAATTTACGTTTTTGAACT

QA 15 580 15 580
DS 



CO CL278Contig2 520 2 1 U
GGGGGACCCAATGACTTCGAAAGAATTGAACGAGGAGCCGTATGAGGTGAAAATCTCATG
TCCGGTTCTGTAGAGTGGCAGTAAGGGTGACTTATCTGTCAACTTTTCCACTATCACCCC
CAAAAAACCAAACTCTGCCTTACGTAAAGTTGCCAGAGTACGATTAACCTCGGGATTTGA
AATCACTGCTTATATACCTGGTATTGGCCATAATTTACAAGAACATTCTGTAGTCTTAGT
AAGAGGGGTAAGGGTTAAGGATTTACCCGGTGTGAGATATCACATTGTTCGAGGAACCCT
AGATGCTGTCGGAGTAAAGGATCGTCAACAAGGGCGTTCTAAATATGGGGTCAAAAAGCC
AAAATAAAAGATTTGAGCCCTTATAAAAAGAAAACAGATTCTTGAACCCCTTTCACGCTC
ATGTCACGTCGAGGTACTACAGAAGAAAAAACTGCAAAATCCGATCCAATTTATCGTAAT
CGATTAGTTAACATGTTGGTTAACCGTATTCTGAAACACG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1D738JQ C 1
AF RS1D738TF U 1
BS 1 520 RS1D738TF

RD RS1D738JQ 520 0 0
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TCCGGTTCTGTAGAGTGGCAGTAAGGGTGACTTATCTGTCAACTTTTCCACTATCACCCC
CAAAAAACCAAACTCTGCCTTACGTAAAGTTGCCAGAGTACGATTAACCTCGGGATTTGA
AATCACTGCTTATATACCTGGTATTGGCCATAATTTACAAGAACATTCTGTAGTCTTAGT
AAGAGGGGTAAGGGTTAAGGATTTACCCGGTGTGAGATATCACATTGTTCGAGGAACCCT
AGATGCTGTCGGAGTAAAGGATCGTCAACAAGGGCGTTCTAAATATGGGGTCAAAAAGCC
AAAATAAAAGATTTGAGCCCTTATAAAAAGAAAACAGATTCTTGAACCCCTTTCACGCTC
ATGTCACGTCGAGGTACTACAGAAGAAAAAACTGCAAAATCCGATCCAATTTATCGTAAT
CGATTAGTTAACATGTTGGTTAACCGTATTCTGAAACACG

QA 1 520 1 520
DS 

RD RS1D738TF 520 0 0
GGGGGACCCAATGACTTCGAAAGAATTGAACGAGGAGCCGTATGAGGTGAAAATCTCATG
TCCGGTTCTGTAGAGTGGCAGTAAGGGTGACTTATCTGTCAACTTTTCCACTATCACCCC
CAAAAAACCAAACTCTGCCTTACGTAAAGTTGCCAGAGTACGATTAACCTCGGGATTTGA
AATCACTGCTTATATACCTGGTATTGGCCATAATTTACAAGAACATTCTGTAGTCTTAGT
AAGAGGGGTAAGGGTTAAGGATTTACCCGGTGTGAGATATCACATTGTTCGAGGAACCCT
AGATGCTGTCGGAGTAAAGGATCGTCAACAAGGGCGTTCTAAATATGGGGTCAAAAAGCC
AAAATAAAAGATTTGAGCCCTTATAAAAAGAAAACAGATTCTTGAACCCCTTTCACGCTC
ATGTCACGTCGAGGTACTACAGAAGAAAAAACTGCAAAATCCGATCCAATTTATCGTAAT
CGATTAGTTAACATGTTGGTTAACCGTATTCTGAAACACG

QA 1 520 1 520
DS 



AS 1 10

CO CL279Contig1 1604 10 25 U
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GGAGGAAGGGGCTGTAGAGGAACAAGTGGATACTACTTCACAGATCAGTGAATGTCCAGT
GAGCTTGGAGCACAGTCAGCATGCAGAAGAGAACAACATGGTATCTGACACTAAAACGGA
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ACAGCCAGTAGCCGAAGCAGAAGAAGTAACTGGGTTTTCTGAGACCTTGGCGAAGGATCC
TGAGCCAGCGGCTGAAACAGACATATGTGAAGCGGTCGTCTCGACAACCATTCCAGAGAA
AATTGAAGCGGCTGAGGCTGTGTCACCAACCGATCCATCATCAGCTGATGGAAATGAAAT
GACAGTGACGAACAAGGAAGACAAAGCCATAGTGGAGAACTTGGAGGAGGCATTACCACA
AGTGGTGGAAACAACCCTTGGCTCGGAAAATGCTACCGAAGTCTCTGAAACTGTTGCCAA
TGAGTATGAGAAGGAAGACAGAAAGGGAGACGATGATTCCGTATTGTCTTCGGAGAGAAT
TGAAGCGGTTGAGAATCAGTCGTCAGCTGATGGAAACGAAATAACAAGGACCAGTATTGA
TGATGAAAAAGTCGTGGTGGAGAAGGTGGAGGAGCCCGTGCCGGAGTTGCTACAAGTTAT
GGAAACAGCTCCTGGACCGCATTTTAAAGACCAGGAAAATGCTACTGAAGTCTCTGAAAC
TGCGGACAACGCGTCGGAGAATGAAAATGAAGACGATTACATTTTGCATTCTGAGAAAAA
TGAAGCGGTTGAGACTGTTGGACCAGTCAATTTATCATCAGCTGATGCAGATGAAATGAC
TATTGAAGAAGACCAAGTCATGGTGGAGAAGCTGGAGGAGCCGCAAGTGGTGGTGGAAAC
GACTCATGGACAAGCTCTTGAAGGCCTGGAAAATGCTATCGAAGTCTCTGAAACTGTGAC
CAACGTGTCTGATACTGAGGACAGAAAGGGAGACGATGATTACGTATTGCCTTCAGAGAA
AGATGTGGAATTCTCCGAGCTACCTGCTGGAGTGATTGACGATAGAATGCAGCTTCTTTC
ACAAGATTCGTTATCATCTCCCGAAGCGGAGAAGACTGTAGCGGACCCTGAGACAGCGAG
CAAGGAGGAAACTAACGTTGGCCACTCGAGCGATCATTCCAGTGGCATAGGCCAAGAGAC
ACAGGTCACTGAACATGAGATGTCAGAAGAAACAAAAAAGCTGATGGAGGAGAACCAACG
GTTCAAGGAAACAATGGAGACGCTAGTAAAGGCAGGAAGAGAACAACTAGAAGTTATATC
AAAACTAACAGGCAGGGTCAAAAGCCTAGAGAAGAAACTGTCACAGAAGAAGAGGACCCA
CGTTGGACGTCGTAAACCCAACCGTGGAAAGCAAACAACCAAACAAGTGTCTGCGAGTTG
TACTGATGCCGTAATGTAAAACAACATAAACCTCTGCAATTTTTGTGTGATTTTCCTTTG
TATCCGTATCTGTATAAAAGTGTGTTTTTGAAGATTGCCCTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RS1EE21TF U 1
AF RS1BF51TF U 316
AF RS1AZ72TF U 441
AF RS1CA11TF U 568
AF RS1GW44TF U 733
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AF RS1EE21JQ C 1007
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AF RS1DT35TF U 1375
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GGAGGAAGGGGCTGTAGAGGAACAAGTGGATACTACTTCACAGATCAGTGAATGTCCAGT
GAGCTTGGAGCACAGTCAGCATGCAGAAGAGAACAACATGGTATCTGACACTAAAACGGA
GAAGGTATGTCTGCCTTCTCCGGAGGAACATCTTACGAGTCTCGAGAACACAATAGAAGG
ACAGCCAGTAGCCGAAGCAGAAGAAGTAACTGGGTTTTCTGAGACCTTGGCGAAGGATCC
TGAGCCAGCGGCTGAAACAGACATATGTGAAGCGGTCGTCTCGACAACCATTCCAGAGAA
AATTGAAGCGGCTGAGGCTGTGTCACCAACCGATCCATCATCAGCTGATGGAAATGAAAT
GACAGTGACGAACAAGGAAGACAAAGCCATAGTGGAGAACTTGGAGGAGGCATTACCACA
AGTGGTGGAAACAACCCTTGTCTCGGAAAATGCTACCGAAGTCTCTGAAACTGTTGCCAA
TGAGTATGAGAAGGAAGACAGAAAGGGAGACGATGATTCCGTATTGTCTTCGGAGAGAAT
TGAAGCGGTTGAGAATCAGTCGTCAGCTGATGGAAACGAAATAACAAGGACCAGTATTGA
TGATGAAAA*GTCGTGGTGGAGA

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DS 

RD RS1BF51TF 669 0 0
GG
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CTGTGTCACCAACCGATCCATCATCAGCTGATGGAAATGAAATGACAGTGACGAACAAGG
AAGACAAAGCCATAGTGGAGAACTTGGAGGAGGCATTACCACAAGTGGTGGAAACAACCC
TTGGCTCGGAAAATGCTACCGAAGTCTCTGAAACTGTTGCCAATGAGTATGAGAAGGAAG
ACAGAAAGGGAGACGACGATTCCGTATTGTCTTCGGAGAGAATTGAAGCGGTTGAGAATC
AGTCGTCAGCTGATGGAAACGAAATAACAAGGACCAGTATTGGTGATGAAAAAGTCGTGG
TGGAGAAGGTGGAGGAGCCCGTGCCGGAGTTGCTACAAGTTATGGAAACAGCTCCTGGAC
CGCATTTTAAAGACCAGGAAAATGCTACTGAAGTCTCTGAAACTGCGGACAACGCGTCGG
AGAATGAAGATGAAGACGATTACATTTTGCATTCTGAGAAAAATGAAGCGGTTGAGACTG
TTGGACCAGTCAATTTATCATCAGCTGATGCAGATGAAATGACTATTGAAGAAGACCAAG
TCATGGTGGAGAAGCTGGAGGAGCCGCAAGTGGTGGTGGAAACGACTCATGGACAAGCTC
TTGAAG
C

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DS 

RD RS1AZ72TF 760 0 0
G
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CTCGGAAAATGCTACCGAAGTCTCTGAAACTGTTGCCAATGAGTATGAGAAGGAAGACAG
AAAGGGAGACGATGATTCCGTATTGTCTTCGGAGAGAATTGAAGCGGTTGAGAATCAGTC
GTCAGCTGATGGAAACGAAATAACAAGGACCAGTATTGATGATGAAAAAGTCGTGGTGGA
GAGGGTGGAGGAGCCCGTGCCGGAGTTGCTACAAGTTATGGAAACAGCCCCTGGACCGCA
TTTTAAAGACCAGGAAAATGCTACTGAAGTCTCTGAAACTGCGGACAACGCGTCGGAGAA
TGAAAATGAAGACGATTACATTTTGCATTCTGAGAAAAATGAAGCGGTTGAGACTGTTGG
ACCAGTCAATTTATCATCAGCTGATGCAGATGAAATGACTATTGAAGAAGACCAAGTCAT
GGTGGAGAAGCTGGAGGAGCCGCAAGTGGTGGTGGAAACGACTCATGGACAAGCTCTTGA
AGGCCTGGAAAATGCTATCGAAGTCTCTGAAACTGTGACCAACGTGTCTGATACTGAGGA
CAGAAAGGGAGACGATGATTACGTATTGCCTTCAGAGAAAGATGTGGAATTCTCCGAGCT
ACCTGCTGGAGTGATTGACGATAGAATGCAGCTTCTTTCACA*GATTCGTTATCATCTCC
CGAAGCGGAGA*GACTGTAGCGGACCCTGAGACAGCGAG

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DS 

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G
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GATGGAAACGAAATAACAAGGACCATTATTGATGATGAAAAAGTCGTGGTGGAGAAGGTG
GAGGAGCCCGTGCCGGAGTTGCTACAAGTTATGGAAACAGCTCCTGGACCGCATTTTAAA
GACCAGGAAAATGCTACTGAAGTCTCTGGAACTGCGGACAACGCGTCGGAGAATGAAAAT
GAAGACGATTACATTTTGCATTCTGAGAAAAATGAAGCGGTTGAGACTGTTGGACCAGTC
AATTTATCATCAGCTGATGCAGATGAAATGACTATTGAAGAAGACCTAGTCATGGTGGAG
AAGCTGGAGGAGCCGCAAGTGGTGGTGGAAACGACTCATGGACAAGCTCTTGAAGGCCTG
GAAAATGCTATCGAAGTCTCTGAAACTGTGACCAACGTGTCTGATACTGAGGACAGAAAG
GGAGACGATGATTACGTATTGCCTTCAGAGAAAGATGTGGAATTCTCCGAGCTACCTGCT
GGAGTGATTGACGATAGAATGCAGCTTCTTTCACAAGATTCGTTATCATCTCCCGAAGCG
GAGAAGACTGTAGCGGACCCTGAGACAGCGAGCAAGGAGGAAACTAACGTTGGCCACTCG
AGCGATCATTCCAGTGACATAG*CCAAGAGACACAGGTCACTGAACATGAGATGTCAG

QA 2 719 2 719
DS 

RD RS1GW44TF 698 0 0
G
GGACCGCATTCTAAAGACCAGGAAAATGCTACTGAAGTCTCTGAAACTGCGGACAACGCG
TCGGAGAATGAAAATGAAGACGATTACATTTTGCATTCTGAGAAAAATGAAGCGGTTGAG
ACTGTTGGACCAGTCAATTTATCATCAGCTGATGCAGATGAAATGACTATTGAAGAAGAC
CAAGTCATGGTGGAGAAGCTGGAGGAGCCGCAAGTGGTGGTGGAAACGACTCATGGACAA
GCTCTTGAAGGCCTGGAAAATGCTATCGAAGTCTCTGAAACTGTGACCAACGTGTCTGAT
ACTGAGGACAGAAAGGGAGACGATGATTACGTATTGCCTTCAGAGAAAGATGTGGAATTC
TCCGAGCTACCTGCTGGAGTGATTGATGATAGAATGCAGCTTCTTTCACAAGATTCGTTA
TCATCTCCCGAAGCGGAGAAGACTGTAGCGGACCCTGAGACAGCGAGCAAGGAGGAAACT
AACGTTGGCCACTCGAGCGATCATTCCAGTGGCATAGGCCAAGAGACACAGGTCACTGAA
CATGAGATGTCAGAAGAAACAAAAAAGCTGATGGAGGAGAACCAACGGTTCAAGGAAACA
ATGGAGACGCTAGTAAAGGCAGGAAGAGAACAACTAGAAGTTATATCAAAACTAACATGC
AGGGTCAAA*GCCTAGAGAAGAAACTGTCACAGAAGA

QA 2 698 2 698
DS 

RD RS1CA11JQ 843 0 0
AGACCAGGAAAATGCTACTGAAGTCTCTGGAACTGCGGACAACGCGTCGGAGAATGAAAA
TGAAGACGATTACATTT*GCAT*CTGAGAAAAATGAAGCGGTTGAGACTGTTGGACCAGT
CAATTTATCATCAGCTGATGCAGATGAAATGACTATTGAAGAAGACCTAGTCATGGTGGA
GAAGCTGGAGGAGCCGCAAGTGGTGGTGGAAACGACTCATGGACAAGCTCTTGAAGGCCT
GGAAAATGCTATCGAAGTCTCTGAAACTGTGACCAACGTGTCTGATACTGAGGACAGAAA
GGGAGACGATGATTACGTATTGCCTTCAGAGAAAGATGTGGAATTCTCCGAGCTACCTGC
TGGAGTGATTGACGATAGAATGCAGCTTCTTTCACAAGATTCGTTATCATCTCCCGAAGC
GGAGAAGACTGTAGCGGACCCTGAGACAGCGAGCAAGGAGGAAACTAACGTTGGCCACTC
GAGCGATCATTCCAGTGACATAGGCCAAGAGACACAGGTCACTGAACATGAGATGTCAGA
AGAAACAAAAAAGCTGATGGAGGAGAACCAACGGTTCAAGGAAACAATGGAGACGCTAGT
AAAGGCAGGAAGAGAACAACTAGAAGTTATATCAAAACTAACAGGCAGGGTCAAAAGCCT
AGAGAAGAAACTGTCACAGAAGAAGAGGACCCACGTTGGACGTCGTAAACCCAACCGTGG
AAAGCAAACAACCAAACAAGTGTTTGCGAGTTGTACTGATGCCGTAATGTAAAACAACAT
AAACCTCTGCAATTTTTGTGTGATTTTCCTTTGTATCCGTATCTGTATAAAAGTGTGTTT
TTG

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DS 

RD RS1AZ72JQ 756 0 0
GAG
AAAATGAAGCGGT*GAGACTGTTGGACCAGTCAATTTATCATCAGCTGATGCAGATGAAA
TGACTATTGAAGAAGACCAAGTCATGGTGGAGAAGCTGGAGGAGCCGCAAGTGGTGGTGG
AAACGACTCATGGACAAGCTCTTGAAGGCCTGGAAAATGCTATCGAAGTCTCTGAAACTG
TGACCAACGTGTCTGATACTGAGGACAGAAAGGGAGACGATGATTACGTATTGCCTTCAG
AGAAAGATGTGGAATTCTCCGAGCTACCTGCTGGAGTGATTGACGATAGAATGCAGCTTC
TTTCACAAGATTCGTTATCATCTCCCGAAGCGGAGAAGACTGTAGCGGACCCTGAGACAG
CGAGCAAGGAGGAAACTAACGTTGGCCACTCGAGCGATCATTCCAGTGGCATAGGCCAAG
AGACACAGGTCACTGAACATGAGATGTCAGAAGAAACAAAAAAGCTGATGGAGGAGAACC
AACGGTTCAAGGAAACAATGGAGACGCTAGTAAAGGCAGGAAGAGAACAACTAGAAGTTA
TATCAAAACTAACAGGCAGGGTCAAAAGCCTAGAGGAGAAACTGTCACAGAAGAAGAGGA
CCCACGTTGGACGTCGTAAACCCAACCGTGGAAAGCAAACAACCAAACAAGTGTTTGCGA
GTTGTACTGATGCCGTAATGCAAAACAACATAAACCTCTGCAATTTTTGTGTGATTTTCC
TTTGTATCCGTATCTGTATAAAAGTGTGTTTTT

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DS 

RD RS1EE21JQ 593 0 0
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TTGCCTTCAGAGAAAGATGTGGAATTCTCCGAGCTACCTGCTGGAGTGATTGACGATAGA
ATGCAGCTTCTTTTACAAGATTCGTTATCATCTCCCGAAGCGGAGAAGACTGTAGCGGAC
CCTGAGACAGCGAGCAAGGAGGAAACTAACGTTGGCCACTCGAGCGATCATTCCAGTGGC
ATAGGCCAAGAGACACAGGTCACTGAACATGAGATGTCAGAAGAAACAAAAAAGCTGATG
GAGGAGAACCAACGGTTCAAGGAAACAATGGAGACGCTAGTAAAGGCAGGAAGAGAACAA
CTAGAAGTTATATCAAAACTAACAGGCAGGGTCAAAAGCCTAGAGAAGAAACTGTCACAG
AAGAAGAGGACCCACGTTGGACGTCGTAAACCCAACCGTGGAAAGCAAACAACCAAACAA
GTGTCTGCGAGTTGTACTGATGCCGTAATGTAAAACAACATAAACCTCTGCAATTTTTGT
GTGATTTTCCTTTGTATCCGTATCTGTATAAAAGTGTGTTTTTGAAGATTGCC

QA 1 593 1 593
DS 

RD RS1DT35JQ 230 0 0
G
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ACCCACGTTGGACGTCGTAAACCCAACCGTGGAAAGCAAACAACCAAACAAGTGTCTGCG
AGTTGTACTGATGCCGTAATGTAAAACAACATAAACCTCTGCAATTTTTGTGTGATTTTC
CTTTGTATCCGTATCTGTATAAAAGTGTGTTTTTGAAGATTGCCCTTCT

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DS 

RD RS1DT35TF 230 0 0
G
ATATCAAAACTAACAGGCAGGGTCAAAAGCCTAGAGAAGAAACTGTCACAGAAGAAGAGG
ACCCACGTTGGACGTCGTAAACCCAACCGTGGAAAGCAAACAACCAAACAAGTGTCTGCG
AGTTGTACTGATGCCGTAATGTAAAACAACATAAACCTCTGCAATTTTTGTGTGATTTTC
CTTTGTATCCGTATCTGTATAAAAGTGTGTTTTTGAAGATTGCC
CTTCT

QA 2 225 2 225
DS 



AS 3 8

CO CL280Contig1 894 3 10 U
GCAAGGAGATTAATCCAGCGTCCTCTCTCCGGAGGAGCTTCAACCTATTCATCATCTTCT
CTCAGATCGCTCCATGGAGTCTCAGATCGCCTTAATGGAAGTGATAATCGTCGCTACTCG
TCTTCCCTGGCTACTAAGGGAGTTGGACACCTCGCTCGCAAGGGTACTGGTGGCAGATCT
TCCGTCAGCGGCATTGTTGCTACGGTGTTTGGAGCCACTGGGTTTCTTGGTCGTTATCTT
GTGCAACAACTAGCTAAAATGGGGTCGCAAGTGCTAGTTCCTTTCCGAGGCTCAGAGGAC
AATCCTCGCCATCTCAAGTTGATGGGAGATTTAGGACAGGTAGTACCCATGAAATTTGAC
CCAAGAGATGAAGACTCAATTAAGGCTGTCATGGCAAAGGCTAATGTCGTTATCAATCTC
ATTGGAAGAGAGTACGAGACCAGAAATTTCAGTTTCGAAGAGGTGAATCATCACATGGCC
GAGAAACTTGCATTGGTGGCCAAGGAACATGGTGGAATAATGAGATTTATTCAAGTTTCT
TGTCTGGGAGCTTCTGTATCATCTCCTTCAAGAATGCAGAGGGCAAAGGCTGCTGCTGAG
GAAGCTGTCTTGAGCGCCCTTCCTGAGGCGACAGTCATGAGACCTGCGACCATGATTGGT
ACAGAGGACAGAATCTTGAACCCCTGGGCAATGTTCGTTAAGAAATATGGTTTCCTCCCG
CTCATAGGTGGCGGGACCAACAAATTCCAGCCCGTATATGTGGTTGATGTTGCTGCTGCA
ATTGTTGCAGCTCTCAAGGATGATGGCTCTAGCATGGGGAAAACCTATGAATTGGGTGGT
CCAGATGTCTTTACCCCTCATGATTTGGCAGAGATCATGTTTGATATGATCCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D336TF U 250
AF RS1C007TF U 1
AF RS1FR73TF U 193
BS 1 287 RS1C007TF
BS 288 288 RS1FR73TF
BS 289 690 RS1C007TF
BS 691 691 RS1FR73TF
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BS 701 701 RS1FR73TF
BS 702 706 RS1C007TF
BS 707 707 RS1FR73TF
BS 708 727 RS1C007TF
BS 728 894 RS1FR73TF

RD RS1D336TF 451 0 0
GTA
GCTAAAATGGGATCGCAAGTGCTAGTTCCTTTCCGAGGCTCAGAGGACAATCCTCGCCAT
CTCAAGTTGATGGGAGATTTAGGACAGGTAGTACCGATGAAATTTGACCCAAGAGATGAA
GACTCAATTAAGGCTGTCATGGCAAAGGCTAATGTCGTTATCAATCTCATTGGAAGAGAG
TACGAGACCAGAAATTTCAGTTTCGAAGAGGTGAATCATCACATGGCCGAGAAACTTGCA
TTGGTGGCCAAGGAACATGGTGGAATAATGAGATTTATTCAAGTTTCTTGTCTGGGAGCT
TCTGTATCATCTCCTTCAAGAATGCAGAGGGCAAAGGCTGCTGCTGAGGAAGCTGTCTTG
AGCGCCCTTCCTGAGGCGACAGTCATGAGACCTGCGACCATGATTGGTACAGAGGACAGA
ATCTTGAACCCCTGGGCAATGTTCGTTA

QA 4 451 4 451
DS 

RD RS1C007TF 737 0 0
GCAAGGAGATTAATCCAGCGTCCTCTCTCCGGAGGAGCTTCAACCTATTCATCATCTTCT
CTCAGATCGCTCCATGGAGTCTCAGATCGCCTTAATGGAAGTGATAATCGTCGCTACTCG
TCTTCCCTGGCTACTAAGGGAGTTGGACACCTCGCTCGCAAGGGTACTGGTGGCAGATCT
TCCGTCAGCGGCATTGTTGCTACGGTGTTTGGAGCCACTGGGTTTCTTGGTCGTTATCTT
GTGCAACAACTAGCTAAAATGGGGTCGCAAGTGCTAGTTCCTTTCCG*GGCTCAGAGGAC
AATCCTCGCCATCTCAAGTTGATGGGAGATTTAGGACAGGTAGTACCCATGAAATTTGAC
CCAAGAGATGAAGACTCAATTAAGGCTGTCATGGCAAAGGCTAATGTCGTTATCAATCTC
ATTGGAAGAGAGTACGAGACCAGAAATTTCAGTTTCGAAGAGGTGAATCATCACATGGCC
GAGAAACTTGCATTGGTGGCCAAGGAACATGGTGGAATAATGAGATTTATTCAAGTTTCT
TGTCTGGGAGCTTCTGTATCATCTCCTTCAAGAATGCAGAGGGCAAAGGCTGCTGCTGAG
GAAGCTGTCTTGAGCGCCCTTCCTGAGGCGACAGTCATGAGACCTGCGACCATGATTGGT
ACAGAGGACAGAATCTTGAACCCCTGGGCA*TGTTCGTTA*GAAAT*TGGTTTCCTCCCG
CTCATAG
TGGCGGGACC

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1FR73TF 702 0 0
GGTGTT
GCTACGGTGTTTGGAGCCACTGGGTTTCTTGGTCGTTATCTTGTGCAGCAACTAGCTAAA
ATGGGGTCGCAAGTGCTAGTTCCTTCCCGAGGCTCAGAGGACAATCCTCGCCATCTCAAG
TTGATGGGAGATTTAGGACAGGTAGTACCCATGAAATTTGACCCAAGAGATGAAGACTCA
ATTAAGGCTGTCATGGCAAAGGCTAATGTCGTTATCAATCTCATTGGAAGAGAGTACGAG
ACCAGAAATTTCAGTTTCGAAGAGGTGAATCATCACATGGCCGAGAAACTTGCATTGGTG
GCCAAGGAACATGGTGGAATAATGAGATTTATTCAAGTTTCTTGTCTGGGAGCTTCTGTA
TCATCTCCTTCAAGAATGCAGAGGGCAAAGGCTGCTGCTGAGGAAGCTGTCTTGAGCGCC
CTTCCTGAGGCGACAGTCATGAGACCTGCGACCATGATTGGTACAGAGGACAGAATCTTG
AACCCCTGGGCAATGTTCGTTAAGAAATATGGTTTCCTCCCGCTCATAGGTGGCGGGACC
AACAAATTCCAGCCCGTATATGTGGTTGATGTTGCTGCTGCAATTGTTGCAGCTCTCAAG
GATGATGGCTCTAGCATGGGGAAAACCTATGAATTGGGTGGTCCAGATGTCTTTACCCCT
CATGATTTGGCAGAGATCATGTTTGATATGATCCGT

QA 7 702 7 702
DS 



CO CL280Contig2 448 2 2 U
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AGCTTCCATTTCCAATTGCTAAGGCAATGGCGGGTCCTCGGGATTTCATGGTGAACAAAG
TACCGTTCCCTCTACCCTCTCCCCAGATATTCAATTTGGATCAAATCAATGCGCTTACAA
CCGATACACTTGTATCTGACAAGGCCTTGACGTTTCAGGATCTGGACCTTGTCCCTCATA
AACTGAAGGGATATCCGGTCGAGTTTCTTATCCAATATCGCAAGGGTGGTCCTAACTTCG
GTTCCACTGTTAGTGAAAAGATACCAACAGACTTCTACAATTGATGCTCAAAGCTCTTTT
TTTCCTGGATTAACTTCTCATGCAAGTGTCACAATGAAATCTCCGGAAACGAGATTTGGT
ATTTTGATGCCTTTTCATTTGTTTCTGT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CI48JQ C 1
AF RS1CI48TF U 1
BS 1 1 RS1CI48JQ
BS 2 448 RS1CI48TF

RD RS1CI48JQ 448 0 0
GCCCTCATGATTTGGCAGAGATCATGTTTGATATGATTCGTGAATGGCCTCGATATGTGA
AGCTTCCATTTCCAATTGCTAAGGCAATGGCGGGTCCTCGGGATTTCATGGTGAACAAAG
TACCGTTCCCTCTACCCTCTCCCCAGATATTCAATTTGGATCAAATCAATGCGCTTACAA
CCGATACACTTGTATCTGACAAGGCCTTGACGTTTCAGGATCTGGACCTTGTCCCTCATA
AACTGAAGGGATATCCGGTCGAGTTTCTTATCCAATATCGCAAGGGTGGTCCTAACTTCG
GTTCCACTGTTAGTGAAAAGATACCAACAGACTTCTACAATTGATGCTCAAAGCTCTTTT
TTTCCTGGATTAACTTCTCATGCAAGTGTCACAATGAAATCTCCGGAAACGAGATTTGGT
ATTTTGATGCCTTTTCATTTGTTTCTGT

QA 1 448 1 448
DS 

RD RS1CI48TF 448 0 0
G
CCCTCATGATTTGGCAGAGATCATGTTTGATATGATTCGTGAATGGCCTCGATATGTGAA
GCTTCCATTTCCAATTGCTAAGGCAATGGCGGGTCCTCGGGATTTCATGGTGAACAAAGT
ACCGTTCCCTCTACCCTCTCCCCAGATATTCAATTTGGATCAAATCAATGCGCTTACAAC
CGATACACTTGTATCTGACAAGGCCTTGACGTTTCAGGATCTGGACCTTGTCCCTCATAA
ACTGAAGGGATATCCGGTCGAGTTTCTTATCCAATATCGCAAGGGTGGTCCTAACTTCGG
TTCCACTGTTAGTGAAAAGATACCAACAGACTTCTACAATTGATGCTCAAAGCTCTTTTT
TTCCTGGATTAACTTCTCATGCAAGTGTCACAATGAAATCTCCGGAAACGAGATTTGGTA
TTTTGATGCCTTTTCATTTGTTTCTGT

QA 2 448 2 448
DS 



CO CL280Contig3 1043 3 3 U
GCAGGTTTCTTGTCTGGGAGCGTCTGCGTCATCCCCTTCAAGAATGCAGAGGTCAAAAGC
TGCTGCTGAGGAAGCTGTCTTCAGCGCGCTGCCTGAGGCGACAGTCATGAGGCCTGCGAC
CACGATTGGCACAGAGGACAGAATCTTGAACCCTGGGGCAATGTTCGTTAAAAAATATGG
TTTCCTCCCGCTCATAGGTGGTGGTACAAACAAATTCCAGCCCGTATATGTGGTTGATGT
TGCTGCGGCAATCGTTGCAGCTCTAAAGGATGATGGTTCCAGCATGGGGAAAACGTATGA
ATTGGGTGGTCCAGATGTCTTTACCCCTCATGATTTGGCGGAGATCATGTTTGATATGAT
ACGTGAATGGCCTCGATATGTGAAGCTTCCATTTCCAATTGCTAAGGCAATGGCGGGTCC
TCGTGATTTCATGGTGAACAAAGCCCCGTTCCCTCTACCATCCCCCCAGATCTTCAATTT
GGATCAAATCAATGCGCTTACAACCGATACACTTGTATCTGACAAGGCCTTGACGTTTCA
GGATTTGGACCTTGTCCCTCATAAATTGAAAGGATATCCAGTCGAGTTTCTTATCCAATA
TCGCAAGGGTGGTCCTAATTTCGGCTCTACTGTCAGTGAAAAGATACCAACAGACTTCTA
CAATTGATGCTGCTCCTGCTCAAAGGTCGTTTCCTGGGACTAATTTTATTCATGCAATTG
CTGCAATGAAATCTCGGAAACTAGATTTGGTATTTTGATGCGTTTCATTTTCTTCTGTCA
ATAATAAAATGGTTTCCCTCTCTTTTTTTGTGTTATGGAAAAAAAATATAACCCATCAGC
ATGATCATAACTTAGAGAGGTGGGGCGATTTGGTCCCCTGGAAACTGGTTAAACTTCATG
TGCTACTTTACTATGGAGCATAGCCAAAGCCATGTGCTTTCATCTTTGCATTCCATGTAG
CTCAGAGTTGTATGTTTTACTTGCACAAACACGTTTCAGCTTGTATCTTTTTTGCAATAT
AAAAGTCAAGCCTGAGAAAATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F388TF U 1
AF RS1FM93TF U 296
AF RS1FM93JQ C 476
BS 1 538 RS1F388TF
BS 539 1014 RS1FM93TF
BS 1015 1043 RS1FM93JQ

RD RS1F388TF 538 0 0
GCAGGTTTCTTGTCTGGGAGCGTCTGCGTCATCCCCTTCAAGAATGCAGAGGTCAAAAGC
TGCTGCTGAGGAAGCTGTCTTCAGCGCGCTGCCTGAGGCGACAGTCATGAGGCCTGCGAC
CACGATTGGCACAGAGGACAGAATCTTGAACCCTGGGGCAATGTTCGTTAAAAAATATGG
TTTCCTCCCGCTCATAGGTGGTGGTACAAACAAATTCCAGCCCGTATATGTGGTTGATGT
TGCTGCGGCAATCGTTGCAGCTCTAAAGGATGATGGTTCCAGCATGGGGAAAACGTATGA
ATTGGGTGGTCCAGATGTCTTTACCCCTCATGATTTGGCGGAGATCATGTTTGATATGAT
ACGTGAATGGCCTCGATATGTGAAGCTTCCATTTCCAATTGCTAAGGCAATGGCGGGTCC
TCGTGATTTCATGGTGAACAAAGCCCCGTTCCCTCTACCATCCCCCCAGATCTTCAATTT
GGATCAAATCAATGCGCTTACAACCGATACACTTGTATCTGACAAGGCCTTGACGTTT

QA 1 538 1 538
DS 

RD RS1FM93TF 719 0 0
G
ATGAATTGGGTGGTCCAGATGTCTTTACCCCTCATGATTTGGCGGAGATCATGTTTGATA
TGATACGTGAATGGCCTCGATATGTGAAGCTTCCATTTCCAATTGCTAAGGCAATGGCGG
GTCCTCGTGATTTCATGGTGAACAAAGTCCCGTTCCCTCTACCATCCCCCCAGATCTTCA
ATTTGGATCAAATCAATGCGCTTACAACCGATACACTTGTATCTGACAAGGCCTTGACGT
TTCAGGATTTGGACCTTGTCCCTCATAAATTGAAAGGATATCCAGTCGAGTTTCTTATCC
AATATCGCAAGGGTGGTCCTAATTTCGGCTCTACTGTCAGTGAAAAGATACCAACAGACT
TCTACAATTGATGCTGCTCCTGCTCAAAGGTCGTTTCCTGGGACTAATTTTATTCATGCA
ATTGCTGCAATGAAATCTCGGAAACTAGATTTGGTATTTTGATGCGTTTCATTTTCTTCT
GTCAATAATAAAATGGTTTCCCTCTCTTTTTTTGTGTTATGGAAAAAAAATATAACCCAT
CAGCATGATCATAACTTAGAGAGGTGGGGCGATTTGGTCCCCTGGAAACTGGTTAAACTT
CATGTGCTACTTTACTATGGAGCATAGCCAAAGCCATGTGCTTTCATCTTTGCATTCCAT
GTAGCTCAGAGTTGTATGTTTTACTTGCACAAACACGTTTCAGCTTGTATCTTTTTTG

QA 2 719 2 719
DS 

RD RS1FM93JQ 568 0 0
AATTTGGATCAAATCAATGCGCTTACAACCGATACACTTGTATCTGACAAGGCCTTGACG
TTTCAGGATTTGGACCTTGTCCCTCATAAATTGAAAGGATATCCAGTCGAGTTTCTTATC
CAATATCGCAAGGGTGGTCCTAATTTCGGCTCTACTGTCAGTGAAAAGATACCAACAGAC
TTCTACAATTGATGCTGCTCCTGCTCAAAGGTCGTTTCCTGGGACTAATTTTATTCATGC
AATTGCTGCAATGAAATCTCGGAAACTAGATTTGGTATTTTGATGCGTTTCATTTTCTTC
TGTCAATAATAAAATGGTTTCCCTCTCTTTTTTTGTGTTATGGAAAAAAAATATAACCCA
TCAGCATGATCATAACTTAGAGAGGTGGGGCGATTTGGTCCCCTGGAAACTGGTTAAACT
TCATGTGCTACTTTACTATGGAGCATAGCCAAAGCCATGTGCTTTCATCTTTGCATTCCA
TGTAGCTCAGAGTTGTATGTTTTACTTGCACAAACACGTTTCAGCTTGTATCTTTTTTGC
AATATAAAAGTCAAGCCTGAGAAAATCG

QA 1 568 1 568
DS 



AS 2 9

CO CL281Contig1 850 6 25 U
TTTTTTTCTTCCTTCCACCAATCAAATTTTTTAACGGGATAAATCGCTTTTGTTGGCTAA
TTCGATCTAACCGGTGTGGAGTTTCAGGAGATGGTGTCGCCCGAAAACCCTAATTGGATA
TCCGACCTGATCGATGCCGAGCTTGGAAGCTTCACCATCCAAGGCCCTGGTTTCTCTTGG
CCCCTTCACCAACAACCTCTTGGAAACGTTTCTTCCAATTCCAGCGCGGGAGTTGATGGT
TCGGCTGCAAATTCAGAAGCCAGCAAGGAACCTGGCTCCAAAAAGAGGGCGAGATGTGAA
TCATCCTCTGCCACTAGCTCAAAAGCATGTAGAGAGAAGCAGCGCCGAGACAGGCTTAAT
GACAAGTTTACCGAATTGAGTGTAATTCTGGAGCCTGGAAATCCTCCCAAAACAGACAAG
GCTGCAATCTTGGTCGATGCTGTCCGCATGGTGACACAGCTACGCGGCGAGGCTCAGAAG
TTGAATGACTCCAATTCAAGTCTTCAGGACAAAATCAAAGAGTTAAAGACCGAGAAAAAC
GAGCTGCGAGATGAGAAACAGAGGCTGAAGACAGAGAAAGAGAAGCTGGAGCAGCAGCTG
AAAGCCATGAATGCTCCTCAACCAAGCTTTTTCCCAGCTCCACCTATGATGCCAACTGCT
TTTGCTTCTCCGCAAGGCCAAGCTCCCGGAAACAAGATGGTGCCAATCATCAGTTACCCT
GGAGTTGCCATGTGGCAGTTCATGCCTCCTACTTCGGTCGATACCTCTCAGGATCATGTC
CTTCGTCCACCAGTTGCTTAAATTGGACAAAAAAAAAAAATCATCAACTGGTTTGCTTCT
TGCTTCCGCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 0 25 25 10 25 25 25 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 15 35 10 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TTA

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TCCGACCTGATCGATGCCGAGCTTGGAAGCTTCACCATCCAAGGCCCTGGTTTCTCTTGG
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TTTGCTTCTGCG

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DS 

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GG
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GGCCCCTTCACCAACAACCTCTTGGAAACGTTTCTTCCAATTCCAGCGCGGGAGTTGATG
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AATCATCCTCTGCCACTAGCTCAAAAGCATGTAGAGAGAAGCAGCGCCGAGACAGGCTTA
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DS 

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AGT

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GATGAGAAACAGAGGCTGAAGACAGAGAAAGAGAAGCTGGAGCAGCAGCTGAAAGCCATG
AATGCTCCTCAACCAAGCTTTTTCCCAGCTCCACCTATGATGCCAACTGCTTTTGCTTTT
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CCAGTTGCTTAAATTGGACAAAAAAAAAAAATCATCAACTGGTTTGCTTCTTGCTTCCGC
T

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DS 



CO CL281Contig2 971 3 4 U
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TACAATGTGCATATCATTGTTCAGCAGATAACAGTTGTTGTTCATACGACCATAACATGA
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GGACTTTTCTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTCAGCGGAAGCAAGAAGCAAACCAGTTGATGA
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CGCTGCTTCTCTCTACATGCTTTTGAGCTAGTGGCAGAAGATGATTCACATCTCGCCCTC
TTTTTGGAGCCAGGTTCCTTGCTGGCTTCTGAATTTGCAGCCGAACCATCAACTCCCGCG
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CCTTGGATGGTGAAGCTTCCAAGCTCGGCATCGATCAGGTCGGATATCCAATTAGGGTTT
TCGGGCGACACCATCTCCTGAAACTCCACACCGGTTAGATCGAATTAGCCAACAAAAGCG
ATTTATCCCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BV29JQ U 251
AF RS1E352JQ U 1
AF RS1E352TF C 248
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BS 786 786 RS1E352TF
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DS 

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TAAAACAAAAGTAACGATAAGACTAAGAAAGCTGAGAAAGAGGAAGTGAGCAAAACAAAT
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TTCTCTGTCTTCAGCCTCTGTTTCTCATCTCGCAGCTCGTTTTTCTCGGTCTTTAACTCT
TTGATTTTGTCCTGAAGACTTGAATTTGAGTCCTTCAACTTCTGAGCCTCGCCGCGTAGC
TGTGTCACCATGCGGACAGCATCGACCAAGATTGCAGCCTTGTCATTCAGCCTGTCTCGA
CGCTGCTTCTCTCTACATGCTTTTGAGCTAGTGGCAGAAGATGATTCACATCTCGCCCTC
TTTTTGGAGCCAGGTTCCTTGCTGGCTTCTGAATTTGCAGCCGAACCATCAACTCCCGCG
CTGGA*TTGGAAGAA
CGTT

QA 1 795 1 795
DS 

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TAGGAGGCATGAACTGCCACATGGCAACTCCAGGGTAACTGATGATTGGCACCATCTTGT
TTCCGGGAGCTTGGCCTTGCGCAGAAGCAAAAGCAGTTGGCATCATAGGTGGAGCTGGGA
AAAAGCTTGGTTGAGGAGCATTCATGGCTTTCAGCTGCTGCTCCAGCTTCTCTTTCTCTG
TCTTCAGCCTCTGTTTCTCATCTCGCAGCTCGTTTTTCTCGGTCTTTAACTCTTTGATTT
TGTCCTGAAGACTTGAATTTGAGTCCTTCAACTTCTGAGCCTCGCCGCGTAGCTGTGTCA
CCATGCGGACAGCATCGACCAAGATTGCAGCCTTGTCATTCAGCCTGTCTCGACGCTGCT
TCTCTCTACATGCTTTTGAGCTAGTGGCAGAAGATGATTCACATCTCGCCCTCTTTTTGG
AGCCAGGTTCCTTGCTGGCTTCTGAATTTGCAGCCGAACCATCAACTCCCGCGCTGGAAT
TGGAAGAAACGTTTCCAAGAGGTTGTTGGTGAAGGGGCCAAGAGAAACCAGGGCCTTGGA
TGGTGAAGCTTCCAAGCTCGGCATCGATCAGGTCGGATATCCAATTAGGGTTTTCGGGCG
ACACCATCTCCTGAAACTCCACACCGGTTAGATCGAATTAGCCAACAAAAGCGATTTATC
CCGC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 2 8

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ACTCTAACGGTCATGTCAACTAATACCGTCGTCCCTCTCCGTCGCAGATCTAACGGATAT
CACACTAACGGAGTGGCCTTAAACGGAATGGAGAACGTTGTCAAGAAAACCGACGACTGC
TACACCAACGGCAACGGAGGAGAAGGAGGGAAGAGCAAGGCGTCGTTTCTGACGTGGACT
ATGCGTGACGTTGTCTACGTGGCGAGATTCCATTGGATACCGTGTTTCTTTGCGCTCGGA
GTTCTGTTCTTTATGGGCGTTGAGTACACGCTCCAGATGGTTCCGGCGAAGTCTGAGCCG
TTTGATATTGGGTTTGTTGTCACGCGCTCTCTGAACCGTGTCTTGGCGAGTTCACCGGAT
CTTAACACCCTTTTAGCGGCTCTAAACACGGTATTCGTCGCGATGCAAACGACGTATATT
GTATGGACATGGTTGATGGAAGGAAGACCACGAGCCACTATCTCGGCTTGCTTCATGTTT
ACTTGTCGCGGCATTCTTGGTTACTCTACTCAGCTCCCTCTCCCTCAGGATTTTTTAGGA
TCAGGAGTTGATTTTCCGGTGGGAAATGTCTCATTCTTCCTCTTCTATTCTGGTCACGTC
GCTGGTTCAATGATCGCGTCCTTGGACATGAGGAGAATGCAGAGGTTAAGACTAGCGATG
CTTTTTGACATCCTCAACGTATTACAATCGATCAGGCTGCTTGGGACGAGAGGACACTAC
ACAATCGATCTTGCGGTAGGAGTTGGAGCTGGGATTCTCTTTGACTCTTTGGCCGGGAAA
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ATAGGGTTTCATTAGTTGAACCTAACTAAATGTGTACGTTATTGTGAATTATAGGAGTGT
ATTTTGTGATCTTCCTACAACTATTTCATTCAATTCGATATTAGGAGTTGCATGCG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
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AF RS1DI68TF U 1
AF RS1FA47TF U 3
AF RS1CT53TF U 2
AF RS1AA07JQ C 603
AF RS1FA47JQ C 415
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RD RS1DI68TF 584 0 0
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TACACCAACGGCAACGGAGGA***GGAGGGAAGAGCAAGGCGTCGTTTCTGACGTGGACT
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GTTCTGTTCTTTATGGGCGTTGAGTACACGCTCCAGATGGTTCCGGCGAAGTCTGAGCCG
TTTGATATTGGGTTTGTGGTCACGCGCTCTCTGAACCGTGTCTTGGCGAGTTCACCGGAT
CTTAACACCCTTTTAGCGGCTCTAAACACGGTATTCGTCGCGATGCAAACGACGTATATT
GTATGGACATGGTTGATGGAAGGAAGACCACGAGCCACTATCTCGGCTTGCTTCATGTTT
ACTTGTCGCGGCATTCTTGGTTACTCTACTCAGCTGCCTCTCCC

QA 1 584 1 584
DS 

RD RS1FA47TF 582 0 0
GG
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TAACGGTCATGTCAACTAATACCGTCGTCCCTCTCCGTCGCAGATCTAACGGATATCATA
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CCAACGGCAACGGAGGAGAAGGAGGGAAGAGCAAGGCGTCGTTTCTGACGTGGACTATGC
GTGACGTTGTCTACGTGGCGAGATTCCATTGGATACCGTGTTTTTTTGCGCTCGGAGTTC
TGTTCTTTATGGGCGTTGAGTACACGCTCCAGATGGTTCCGGCGAAGTCTGAGCCGTTTG
ATATTGGGTTTGTTGTCACGCGCTCTCTGAACCGTGTCTTGGCGAGTTCACCGGATCTTA
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GGACATGGTTGATGGAAGGAAGACCACGAGCCACTATCTCGGCTTGCTTCATGTTTACTT
GTCGCGGCATTCTTGGTTACTCTACTCAGCTCCCTCTCCC

QA 3 582 3 582
DS 

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GGG
ATCGTATCTCTTATATAACTCATCTCTCTAAACATAAAAAATGTTCCTCTCCGTTAACTC
TAACGGTCATGTCAACTAATACCGTCGTCCCTCTCCGTCGCAGATCTAACGGATATCACA
CTAACGGAGTGGCCTTAAACGGAATGGAGAACGTTGTCAAGAAAACCGACGACTGCTACA
CCAACGGCAACGGAGGAGAAGGAGGGAAGAGCAAGGCGTCGTTTCTGACGTGGACTATGC
GTGACGTTGTCTACGCGGCGAGATTCCATTGGATACCGTGTTTCTTTGCGCTCGGAGTTC
TGTTCTTTATGGGCGTTGAGTACACGCTCCAGATGGTTCCGGCGAAGTCTGAGCCGTTTG
ATATTGGGTTTGTTGTCACGCGCTCTCTGAACCGTGTCTTGGCGAGTTCACCGGATCTTA
ACACCCTTTTAGCGGCTCTA**CACGGTATTCGTCGCGATGCAAACGACGTATATTGTAT
GGACATGGTTGATGGAAGGAAGACCACGAGCCACTATCTCGGCTTGCTTCATGTTTACTT
GTCGCGGCATTCTTGGTTACTCTACTCAGCTCCCTCTCCCTCAGGATTTTTTAGGATCAG
GAGTTGATTTTCCGGTGGGAAATGTCTCATTCTTCCTCTTCTATTCTGGTCACGTCGCTG
GTTCAATGATCGCGTCCTTGGACATGAG
AGAA

QA 4 691 4 691
DS 

RD RS1AA07JQ 177 0 0
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TGGTTCAATGATCGCGTCCTTGGACATGAGGAGAATGCAGAGGTTAAGACTAGCGATGCT
TTTTGACATCCTCAACGTATTACAATCGATCAGGCTGCTTGGGACGAGAGGACA
CTA

QA 1 174 1 174
DS 

RD RS1FA47JQ 722 0 0
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TATATTGTATGGACATGGTTGATGGAAGGAAGACCACGAGCCACTATCTCGGCTTGCTTC
ATGTTTACTTGTCGCGGCATTCTTGGTTACTCTACTCAGCTCCCTCTCCCTCAGGATTTT
TTAGGATCAGGAGTTGATTTTCCGGTGGGAAATGTCTCATTCTTCCTCTTCTATTCTGGT
CACGTCGCTGGTTCAATGATCGCGTCCTTGGACATGAGGAGAATGCAGAGGTTAAGACTG
GCGATGCTTTTTGACATCCTCAACGTATTACAATCGATCAGGCTGCTTGGGACGAGAGGA
CACTACACAATCGATCTTGCGGTAGGAGTTGGAGCTGGGATTCTCTTTGACTCTTTGGCC
GGGAAATACGAGGAGATGATGAGCAAGAGACAGAATTTAGGCAATGGTTTTAGTTTGATT
TCTAAAGACTCGCTACTCAATTAATCTTTTGTTTTCATTTTAAATGTTTAGTTGAACTTC
AACATAATTGGTTTAGTTAAAGTTTAATATGAATTACATTTATTTCTTTCAAATGACTTC
AATCGTATAGGGTTTCATTAGTTGAACCTAACTAAATGTGTACGTTATTGTGAATTATAG
GAGTGTATTTTGTGATCTTCCTACAACTATTTCATTCAATTCGATATTAGGAGTTGCATG
CG

QA 1 722 1 722
DS 



CO CL282Contig2 955 3 8 U
TTAATTCATTTTGACTTCAACTAAATTTAATATGTTCAAGTTCAACTAAACATTTCAAAA
GAAAACAAAATTAAATTACTGGCGAATCTTTGGAAACCAAACTAAAACCATTGCCTAAAT
TGTGTCTCTTGCTCATCATCTCTTCGTACTTCCCGGCCAGTGAGTCAAAGAGAATCCCAG
CACCAACTCCGACCGCAAGATCGATAGTGTAATGTCCTCTCGTCCCGAGCAACCTGATGG
ATTGTAACACATTGAGGATATCAAAAAGCATCGCTAGTCTCAACCTTTGCATTCTCCTCA
TATCCAAGGATGCTATCATAGAACCAGCGACCTGACCCGAGTAGAAGAGGAAGAATGAGA
CGTTTCCCACTGGAAAATCGACTCCTGATCCTAAAAACTCCTGAGGGAGAGGGAGCTGAG
TAGAGTAACCAAGAATGCCGCGACAAGTAAACATGAAGCACGCCGAGATGGTGGCTCGTG
GTCTTCCTTCCATCAACCATGTCCATACAATATAGGTCGTTTGCATCGCTACGAATACCG
TGTTTAGTGCGGCTAAAACGGTGTTAAGATCCGGTGAATTTGCCAAGACGCGGTTCAGTG
AGCGCGTGGCCACAAACCCAATATCGAACGGCTCAGACCTTGCGGGAATCATCTGAAGCG
TATACTCCACGCCCATGAAGAACAGAACTCCGACCGCGAACAAACACGGTATCCAATGGA
CTCTCGCCACGTAGATAACATCACGCGCCGTCCATGTCATAAAAGACGCCTTGCTTTTCC
CTCCTCCTCCTCCGCTGGCGTAGCCGTCGTCTGTTTTCTTAACAGTGCTCTCCATTGATG
GGACGGTTCCGTCAAATGCGACGCCGTTACTGTGGTGTCCGTTAAGAGAGTTAGATCTGC
GACGGAGAGGGACGCCAGTTTCAGTTGACATAAGCGTCAGGTATGGGTTATGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1H180JQB U 184
AF RS1E558JQ U 1
AF RS1E558TF C 405
BS 1 319 RS1E558JQ
BS 320 320 RS1H180JQB
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BS 336 814 RS1E558JQ
BS 815 955 RS1E558TF

RD RS1H180JQB 286 0 0
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GTAACACATTGAGGGTGTCAAAAAGCATCGCTAGTCTCAACCTTTGCATTCTCCTCATAT
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C

QA 1 285 1 285
DS 

RD RS1E558JQ 814 0 0
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TATACTCCACGCCCATGAAGAACAGAACTCCGACCGCGAACAAACACGGTATCCAATGGA
CTCTCGCCACGTAGATAACATCACGCGCCGTCCATGTCATAAAAGACGCCTTGCTTTTCC
CTCCTCCTCCTCCGCTGGCGTAGCCGTCGTCTGT

QA 1 814 1 814
DS 

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ATCGCTACGAATACCGTGTTTAGTGCGGCTAAAACGGTGTTAAGATCCGGTGAATTTGCC
AAGACGCGGTTCAGTGAGCGCGTGGCCACAAACCCAATATCGAACGGCTCAGACCTTGCG
GGAATCATCTGAAGCGTATACTCCACGCCCATGAAGAACAGAACTCCGACCGCGAACAAA
CACGGTATCCAATGGACTCTCGCCACGTAGATAACATCACGCGCCGTCCATGTCATAAAA
GACGCCTTGCTTTTCCCTCCTCCTCCTCCGCTGGCGTAGCCGTCGTCTGTTTTCTTAACA
GTGCTCTCCATTGATGGGACGGTTCCGTCAAATGCGACGCCGTTACTGTGGTGTCCGTTA
AGAGAGTTAGATCTGCGACGGAGAGGGACGCCAGTTTCAGTTGACATAAGCGTCAGGTAT
GGGTTATGTCC

QA 1 551 1 551
DS 



AS 1 8

CO CL283Contig1 872 8 25 U
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AGATTCTCCTCTCTGCATCCTCCGTCGTCTCTTACAACTCTCCTCTCTGCCGAGTGTTTC
TGAGCGAAACTCTAATTTGCTTGCGACTCGTATCACTTGCAGGGGAACTTGTAAGGAGGA
GACAAGATGAGATTGGTCAAGTGTTGGTTTTGCTCTTCTACAATATATCCTGGACATGGT
ATTCAGTTTGTCCGCAACGATGCCAAGATTTTCCGGTTCTGTAGGTCTAAGTGCCACAAG
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CACGGAAAGGACATGACTCAGGATAAAACATTTGAGTTTGAGAAGAAGAGAAACAGACCC
GAGAGGTATGATAGGAACGTTACGGAGGATACTCTCAAGGCCATTAAGAAGATTGATAAG
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TCACTATACTCCAAAGCTGGGTGTTGTCTTTTAAAAAAAAAGAGTTTTAAGATTGTTTTG
ATTTTGCAATGTATTAAATTACCTGATACAACGAAAACAAATTTAAGTAGTATTTTATGT
CTGCCTTCTTTTAAGTATATTTCTTTTCTTTT


BQ
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45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
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GG
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GCAAAGATTTTCCGGTTCTGTAGGTCTAAGTGCCACAAGAACTTCAAGATGAAGAGGAAC
CCTCGTAAAGTGAAGTGGACTAAAGCCTACAGAGCTGCACACGGAAAGGACATGACTCAG
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ACGGAGGATACTCTCAAGGCCATTAAGAAGATTGATAAGATCAGAAGCACTAGAGAAGCT
GACCAC

QA 3 428 3 428
DS 

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GGATAAACC
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GTGTTTCTGAGCGAAACTCTAATTTGCTTGCGACTCGTATCACTTGCAGGGGAACTTGTA
AGGAGGAGACAAGATGAGATTGGTCAAGTGTTGGTTTTGCTCTTCTACAATATATCCTGG
ACATGGTATTCAGTTTGTCCGCAACGATGCCAAGATTTTCCGGTTCTGTAGGTCTAAGTG
CCACAAGAACTTCAAGATGAAGAGGAACCCTCGTAAAGTGAAGTGGACTAAGGCCTACAG
AGCTGCACACGGAAAGGACATGACTCAGGATAAAACATTTGAGTTTGAGAAGAAGAGAAA
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TGATAAGATCAGAAGCACTAGACAAGCTGACCACATCAGCAAGAGGTTGAAGCCAAACAA
ACAGAAGGCACTCAAGAGTGATCTCAAGGAGATAGACCAGCACATTAATTTGATCAAGGC
ACCAGGTTCGCAGCAACAAGACTCAGAGAAGGCGAAAGTTTTGGTCTCCAGCAACAAGTC
TGTTCAAAACGAAGCCATGGAAGAGTGATTATGTGGTAACATTTGAGGATCCATTTAGAA
GATGTATTCACTATACTC*AAAGCTGGGTGTTGTCTTT

QA 10 707 10 707
DS 

RD RS1CB35TF 677 0 0
GG
CTAAGGGAGATTCTCCTCTCTGCATCCTCCGTCGTCTCTTACAACTCTCCTCTCTGCCGA
GTGTTTCTGAGCGAAACTCTAATTTGCTTGCGACTCGTATCACTTGCAGGGGAACTTGTA
AGGAGGAGACAAGATGAGATTGGTCAAGTGTTGGTTTTGCTCTTCTACAATATATCCTGG
ACATGGTATTCAGTTTGTCCGCAACGATGCCAAGATTTTCCGGTTCTGTAGGTCTAAGTG
CCACAAGAACTTCAAGATGAAGAGGAACCCTCGTAAAGTGAAGTGGACTAAAGCCTACAG
AGCTGCACACGGAAAGGACATGACTCAGGATAAAACATTTGATTTTGAGAAGAAGAGAAA
CAGACCCGAGAGGTATGATAGGAACGTTACGGAGGATACTCTCAAGGCCATTAAGAAGAT
TGATAAGATCAGAAGCACTAGACAAGCTGACCACATCAGCAAGAGGTTGAAGCCAAACAA
ACAGAAGGCACTCAAGAGTGATCTCAAGGAGATAGACCAGCACATTAATTTGATCAAGGC
ACCAGGTTCGCCGCAACAAGACTCAGAGAAAGCGAAAGTTTTGGTCTCCA*CAACAAGTC
TGTTCAAA*CGAAGCCATGGAAGAGTGATTATGTGGTAACATTTGAG*ATCCATTTAGA*
GATGTATTCACTATA

QA 3 677 3 677
DS 

RD RS1D313TF 701 0 0
GGC
CTAAGGGAGATTCTCCTCTCTGCATCCTCCGTCGTCTCTTACAACTCTCCTCTCTGCCGA
GTGTTTCTGAGCGAAACTCTAATTTGCTTGCGACTCGTATCACTTGCAGGGGAACTTGTA
AGGAGGAGACAAGATGAGATTGGTCAAGTGTTGGTTTTGCTCTTCTACGATATATCCTGG
ACATGGTATTCAGTTTGTCCGCAACGATGCAAAGATTTTCCGGTTCTGTAGGTCTAAGTG
CCACAAGAACTTCAAGATGAAGAGGAACCCTCGTAAAGTGAAGTGGACTAAAGCCTACAG
AGCTGCACACGGAAAGGACATGGCTCAGGATAAAACATTTGAGTTTGAGAAGAAGAGAGA
CAGACCCGAGAGGTATGATAGGAACGTTACGGAGGATACTCTCAAGGCCATTAAGAAGAT
TGATAAGATCAGAAGCACTAGAGAAGCTGACCACATCAGTAAGAGGTTGAAGCCAAACAA
ACAGAAGGCACTCAAGAGTGATCTCAAGGAGATAGACCAGCACATTAATTTGATCAAGGC
ACCAGGTTCGCAGCAACAAGACTCAGAGAAGGTGAAAGTTTTGGTCTCCAGCAACAAGCC
TGTTCAAAACGAAGCCATGGAAGAGTGATTCTGTGGTAACATTTGAGGATCCATTTAGAA
GATGTATTCACTATACTCCAAAGCTGG*TGTTGTCTTT

QA 4 701 4 701
DS 

RD RS1A061TV 872 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGCCCTAAGGG
AGATTCTCCTCTCTGCATCCTCCGTCGTCTCTTACAACTCTCCTCTCTGCCGAGTGTTTC
TGAGCGAAACTCTAATTTGCTTGCGACTCGTATCACTTGCAGGGGAACTTGTAAGGAGGA
GACAAGATG******GTCAAGTGTTGGTTTTGCTCTTCTACGATATATCCTGGACATGGT
ATTCAGTTTGTCTGCAACGATGCAAAGATTTTCCGGTTCTGTAGGTCTAAGTGCCACAAG
AACTTCAAGATGAAGAGGAACCCTCGTAAAGTGAAGTGGACTAAAGCCTACAGAGCTGCA
CACGGAAAGGACATGACTCAGGATAAAACATTTGAGTTTGAGAAGAAGAGAAACAGACCC
GAGAGGTATGATAGGAACGTTACGGAGGATACTCTCAAGGCCATTAAGAAGATTGATAAG
ATCAGAAGCACTAGAGAAGCTGACCACATCAGTAAGAGGTTGAAGCCAAACAAACAGAAG
GCACTCAAGAGTGATCTCAAGGAGATAGACCAGCACATTAATTTGATCAAGGCACCAGGT
TCGCAGCAACAGGACTCAGAGAAGGTGAAAGTTTTGGTCTCCAGCAACAAGCCTGTTCAA
AACGAAGCCATGGAAGATTGATTCTGTGGTAACATTTGAGGATCCATTTAGAAGATGTAT
TCACTATACTCCAAAGCTGG*TGTTGTCTTTTAAAAAAAAAGAGTTTTAAGATTGTTTTG
ATTTTGCAATGTATTAAATTACCTGATACAACGAAAACAAATTTAAGTAGTATTTTATGT
CTGCCTTCTTTTAAGTATATTTCTTTTCTTTT

QA 1 872 1 872
DS 

RD RS1BD58JQ 704 0 0
TGCGACTCGTATCACTTGCAGGGGAACTTGTAAGGAGGAGACAAGATGAGATTGGTCAAG
TGTTGGTTTTGCTCTTCTACAATATATCCTGGACATGGTATTCAGTTTGTCCGCAACGAT
GCCAAGATTTTCCGGTTCTGTAGGTCTAAGTGCCACAAGAACTTCAAGATGAAGAGGAAC
CCTCGTAAAGTGAAGTGGACTAAGGCCTACAGAGCTGCACACGGAAAGGACATGACTCAG
GATAAAACATTTGAGTTTGAGAAGAAGAGAAACAGACCCGAGAGGTATGATAGGAACGTT
ACGGAGGATACTCTCAAGGCCATTAAGAAGATTGATAAGATCAGAAGCACTAGACAAGCT
GACCACATCAGCAAGAGGTTGAAGCCAAACAAACAGAAGGCACTCAAGAGTGATCTCAAG
GAGATAGACCAGCACATTAATTTGATCAAGGCACCAGGTTCGCAGCAACAAGACTCAGAG
AAGGCGAAAGTTTTGGTCTCCAGCAACAAGTCTGTTCAAAACGAAGCCATGGAAGAGTGA
TTATGTGGTAACATTTGAGGATCCATTTAGAAGATGTATTCACTATACTCCAAAGCTGGG
TGTTGTCTTTTAAAAAAA**GAGTTTTAAGATTGTTTTGTTTTTGCAATGTATTAAATTA
CCTGATACAACGAAAACAAATTTAAGTAGTATTTTATGTCT
GCC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RS1BD06JQ 630 0 0
CTTCTACAATATATCCTGGACATGGTATTCAGTTTGTCCGCAACGATGCCAAGATTTTCC
GGTTCTGTAGGTCTAAGTGCCACAAGAACTTCAAGATGAAGAGGAACCCTCGTAAAGTGA
AGTGGACTAAAGCCTACAGAGCTGCACACGGAAAGGACATGACTCAGGATAAAACATTTG
AGTTTGAGAAGAAGAGAAACAGACCCGAGAGGTATGATAAGAACGTTACGGAGGATACTC
TCAAGGCCATTAAGAAGATTGATAAGATCAGAAGCAATAGACAAGCTGACCACATCAGCA
AGAGGTTGAAGCCAAACAAACAGAAGGCACTCAAGAGTGATCTCAAGGAGATAGACCAGC
ACATTAATTTGATCAAGGCACCAGGTTCGCAGCAACAAGACTCAGAGAAGGCGAAAGTTT
TGGTCTCCAGCAACAAGTCTGTTCAAAACGAAGCCATTGAAGAGTGATTATGTGGTAACA
TTTGAGGATCCATTTAGAAGATGTATTCACTATACTCCAAAGCTGGGTGTTGTCTCTTAA
AAAA***GAGTTTTAAGATTGTTTTGTTTTTGCAATGTATTAAATTACCTGATACAACGA
AAACAAATTTAAGTAGTATTTTATGTCT
AC

QA 1 628 1 628
DS 

RD RS1A061TF 643 0 0
GTTTTGCTCTTCTACGATATATCCTGGACATGGTATTCAGTTTGTCTGCAACGATGCAAA
GATTTTCCGGTTCTGTAGGTCTAAGTGCCACAAGAACTTCAAGATGAAGAGGAACCCTCG
TAAAGTGAAGTGGACTAAAGCCTACAGAGCTGCACACGGAAAGGACATGACTCAGGATAA
AACATTTGAGTTTGAGAAGAAGAGAAACAGACCCGAGAGGTATGATAGGAACGTTACGGA
GGATACTCTCAAGGCCATTAAGAAGATTGATAAGATCAGAAGCACTAGAGAAGCTGACCA
CATCAGTAAGAGGTTGAAGCCAAACAAACAGAAGGCACTCAAGAGTGATCTCAAGGAGAT
AGACCAGCACATTAATTTGATCAAGGCACCAGGTTCGCAGCAACAGGACTCAGAGAAGGT
GAAAGTTTTGGTCTCCAGCAACAAGCCTGTTCAAAACGAAGCCATGGAAGATTGATTCTG
TGGTAACATTTGAGGATCCATTTAGAAGATGTATTCACTATACTCCAAAGCTGG*TGTTG
TCTTTTAAAAAAAAAGAGTTTTAAGATTGTTTTGATTTTGCAATGTATTAAATTACCTGA
TACAACGAAAACAAATTTAAGTAGTATTTTATGTCT
GCCTTCT

QA 1 636 1 636
DS 



AS 2 10

CO CL284Contig1 781 6 6 U
TCTATTTATTAAACAAGCAGCAAGAGTCACACAAGTACATAAAGATATTCTCTTAATATC
ATACCGAGTCTTAAATCGAAACAAACCAAGCAGCAACAAGAGATCAAAGAAGAAGTTCGA
GGAAATGTTTTGGAATGGGAAGGATAACAAGAGTGATACACACTTTATAACAGAATAAGG
CAAACAGACTAGGGACAATGCAGCTCAAAAACCATGGATCTTGATGTTGTCTTTCTTCAC
TAGGCCAGCCTGGACTAGGAACGTGGAGACGTTCTTCCTCTGGTCTCCTTGAAGCTGAAT
AACCTGTCCGAGTTCAGAGTCTCGAACGACTGTTCCGTTGCAACAAAACTCTTTCTTGAG
ATCCTTAAGTATCTTGCTGTAACTATACTCTTTCTTCAACCCCTGGACAGTTGTCAAGCT
TTTCCTACCATTGCGCTGCTGCACACGGATGTGGACGTACTCTTTTGTTCCTGCACCTGA
GTCCTCAACATTCGCATCAGCAAACGGGTCGAAGGCAGTAGGGATCTGGGAATCAAGTTC
AGACATGAAACTTTGTTGATCTGAGGGGCAAACGACGGAGAAGCTAAGACCTGATTCGAA
AAGTAGGGTTTCGATGATCTGATTGTAGGAGAAGAAACCCTGGATTTGGATACTCTGAAA
CTTTTTGCTTCGGTGCAGACAAAAGTAATGAGAGCCCTCGGCCGTAATGGCCGAATTCCC
GGGCATATGTCCGGTACCGTCGACTGATAACTTCGTATAATGTATGCTATACGAAGTTAT
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1BH46JQ U 138
AF RS1A239TR U 1
AF RS1A239JQ U 14
AF RS1BH46TF C 31
AF RS1A239TV C 14
AF RS1A239TF C 19
BS 1 125 RS1A239TR
BS 126 126 RS1A239JQ
BS 127 316 RS1A239TR
BS 317 317 RS1A239JQ
BS 318 696 RS1A239TR
BS 697 781 RS1A239TF

RD RS1BH46JQ 488 0 0
GGAAGGATAACAAGAGTGATACACACTTTATAACAGAATAAGGCAAACAGACTAGGGACA
ATGCAGCTCAAAAGCCATGGATCTTGATGTTGTCTTTCTTCACTAGGCCAGCCTGGACTA
GGAACGTGGAGACGTTCTTCCTCTGGTCTCCTTGAAGCTGAATAACCTGTCCGAGTTCAG
AGTCTTGAACGACTGTTCCGTTGCAACAAAACTCTTTCTTGAGATCCTTAAGTATCTTGC
TGTAACTATACTCTTTCTTCAACCCCTGGACAGTTGTCAAGCTTTTCCTACCATTGCGCT
GCTGCACACGGATGTGGACGTACTCTTTTGTTCCTGCACCTGAGTCCTCAACATTCGCAT
CAGCAAACGGGTCGAAGGGAGTAGGGATTTGGGAATCAAGTTCAGACATGAAACTTTGTT
GATCTGAGGGGCAAACGACGGAGAAGCTAAGACCTGACTCGAAAAGTAGGGTTTCGATGA
TCTGATTG

QA 1 488 1 488
DS 

RD RS1A239TR 698 0 0
TCTATTTATTAAACAAGCAGCAAGAGTCACACAAGTACATAAAGATATTCTCTTAATATC
ATACCGAGTCTTAAATCGAAACAAACCAAGCAGCAACAAGAGATCAAAGAAGAAGTTCGA
GGAAAGGTTTTGGAATGGGAAGGATAACAAGAGTGATACACACTTTATAACAGAATAAGG
CAAACAGACTAGGGACAATGCAGCTCAAAAACCATGGATCTTGATGTTGTCTTTCTTCAC
TAGGCCAGCCTGGACTAGGAACGTGGAGACGTTCTTCCTCTGGTCTCCTTGAAGCTGAAT
AACCTGTCCGAGTTCAAAGTCTCGAACGACTGTTCCGTTGCAACAAAACTCTTTCTTGAG
ATCCTTAAGTATCTTGCTGTAACTATACTCTTTCTTCAACCCCTGGACAGTTGTCAAGCT
TTTCCTACCATTGCGCTGCTGCACACGGATGTGGACGTACTCTTTTGTTCCTGCACCTGA
GTCCTCAACATTCGCATCAGCAAACGGGTCGAAGGCAGTAGGGATCTGGGAATCAAGTTC
AGACATGAAACTTTGTTGATCTGAGGGGCAAACGACGGAGAAGCTAAGACCTGATTCGAA
AAGTAGGGTTTCGATGATCTGATTGTAGGAGAAGAAACCCTGGATTTGGATACTCTGAAA
CTTTTTGCTTCGGTGCAGACAAAAGTAATGAGAGCC
CT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RS1A239JQ 685 0 0
CAAGC
AGCAAGAGTCACACAAGTACATAAAGATATTCTCTTAATATCATACCGAGTCTTAAATCG
AAACAAACCAAGCAGCAACAAGAGATCAAAGAAGAAGTTCGAGGAAATGTTTTGGAATGG
GAAGGATAACAAGAGTGATACACACTTTATAACAGAATAAGGCAAACAGACTAGGGACAA
TGCAGCTCAAAAACCATGGATCTTGATGTTGTCTTTCTTCACTAGGCCAGCCTGGACTAG
GAACGTGGAGACGTTCTTCCTCTGGTCTCCTTGAAGCTGAATAACCTGTCCGAGTTCAGA
GTCTCGAACGACTGTTCCGTTGCAACAAAACTCTTTCTTGAGATCCTTAAGTATCTTGCT
GTAACTATACTCTTTCTTCAACCCCTGGACAGTTGTCAAGCTTTTCCTACCATTGCGCTG
CTGCACACGGATGTGGACGTACTCTTTTGTTCCTGCACCTGAGTCCTCAACATTCGCATC
AGCAAACGGGTCGAAGGCAGTAGGGATCTGGGAATCAAGTTCAGACATGAAACTTTGTTG
ATCTGAGGGGCAAACGACGGAGAAGCTAAGACCTGATTCGAAAAGTAGGGTTTCGATGAT
CTGATTGTAGGAGAAGAAACCCTGGATTTGGATACTCTGAAACTTTTTGCTTCGGTGCAG
ACAAAAGTAATGAGAGCC
CT

QA 6 683 6 683
DS 

RD RS1BH46TF 666 0 0
TTTTTTG
CATAAAGATATTCTCTTAATATCATACCGAGTCTTAAATCGAAACAAATCAAGCAGCAAC
AAGAGATCAAAGAAGAAGTTCGAGGAAATGTTTTGGAATGGGAAGGATAACAAGAGTGAT
ACACACTTTATAACAGAATAAGGCAAACAGACTAGGGACAATGCAGCTCAGAAGCCATGG
ATCTTGATGTTGTCTTTCTTCACTAGGCCAGCCTGGACTAGGAACGTGGAGACGTTCTTC
CTCTGGTCTCCTTGAAGCTGAATAACCTGTCCGAGTTCAGAGTCTTGAACGACTGTTCCG
TTGCAACAAAACTCTTTCTTGAGATCCTTAAGTATCTTGCTGTAACTATACTCTTTCTTC
AACCCCTGGACAGTTGTCAAGCTTTTCCTACCATTGCGCTGCTGCACACGGATGTGGACG
TACTCTTTTGTTCCTGCACCTGAGTCCTCAACATTCGCATCAGCAAACGGGTCGAAGGCA
GTAGGGATCTGGGAATCAAGTTCAGACATGAAACTTTGTTGATCTGAGGGGCAAACGACG
GAGAAGCTAAGACCTGACTCGAAAAGTAGGGTTTCGATGATCTGATTGTAGGAGAAGAAA
CCCTGGATTTGGATACTCTGAAACTTTTTGCTTCGGTGCAGACAAAAGTAATGAGAGCC

QA 8 666 8 666
DS 

RD RS1A239TV 666 0 0
CAAGC
AGCAAGAGTCACACAAGTACATAAAGATATTCTCTTAATATCATACCGAGTCTTAAATCG
AAACAAACCAAGCAGCAACAAGAGATCAAAGAAGAAGTTCGAGGAAATGTTTTGGAATGG
GAAGGATAACAAGAGTGATACACACTTTATAACAGAATAAGGCAAACAGACTAGGGACAA
TGCAGCTCAGAAACCATGGATCTTGATGTTGTCTTTCTTCACTAGGCCAGCCTGGACTAG
GAACGTGGAGACGTTCTTCCTCTGGTCTCCTTGAAGCTGAATAACCTGTCCGAGTTCAGA
GTCTCGAACGACTGTTCCGTTGCAACAAAACTCTTTCTTGAGATCCTTAAGTATCTTGCT
GTAACTATACTCTTTCTTCAACCCCTGGACAGTTGTCAAGCTTTTCCTACCATTGCGCTG
CTGCACACGGATGTGGACGTACTCTTTTGTTCCTGCACCTGAGTCCTCAACATTCGCATC
AGCAAACGGGTCGAAGGCAGTAGGGATCTGGGAATCAAGTTCAGACATGAAACTTTGTTG
ATCTGAGGGGCAAACGACGGAGAAGCTAAGACCTGATTCGAAAAGTAGGGTTTCGATGAT
CTGATTGTAGGAGAAGAAACCCTGGATTTGGATACTCTGAAACTTTTTGCTTCGGTGCAG
A

QA 6 666 6 666
DS 

RD RS1A239TF 763 0 0
AGCAAGAGTCACACAAGTACATAAAGATATTCTCTTAATATCATACCGAGTCTTAAATCG
AAACAAACCAAGCAGCAACAAGAGATCAAAGAAGAAGTTCGAGGAAATGTTTCGGAATGG
GAAGGATAACAAGAGTGATACACACTTTATAACAGAATAAGGCAAACAGACTAGGGACAA
TGCAGCTCAGAAACCATGGATCTTGATGTTGTCTTTCTTCACTAGGCCAGCCTGGACTAG
GAACGTGGAGACGTTCTTCCTCTGGTCTCCTTGAAGCTGAATAACCTGTCCGAGTTCAGA
GTCTCGAACGACTGTTCCGTTGCAACAAAACTCTTTCTTGAGATCCTTAAGTATCTTGCT
GTAACTATACTCTTTCTTCAACCCCTGGACAGTTGTCAAGCTTTTCCTACCATTGCGCTG
CTGCACACGGATGTGGACGTACTCTTTTGTTCCTGCACCTGAGTCCTCAACATTCGCATC
AGCAAACGGGTCGAAGGCAGTAGGGATCTGGGAATCAAGTTCAGACATGAAACTTTGTTG
ATCTGAGGGGCAAACGACGGAGAAGCTAAGACCTGATTCGAAAAGTAGGGTTTCGATGAT
CTGATTGTAGGAGAAGAAACCCTGGATTTGGATACTCTGAAACTTTTTGCTTCGGTGCAG
ACAAAAGTAATGAGAGCCCTCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACC
GTCGACTGATAACTTCGTATAATGTATGCTATACGAAGTTATG

QA 1 763 1 763
DS 



CO CL284Contig2 668 4 8 U
GGCTCTCATTACTTTTGTCTGCACCGAAGCAAAAAGTTTCAGACTATCCAAATCCAGGGT
TTCTTCTCCTACAATCAGATCATCGAAACCCTACTTTTCGAATCAGGTCTTAGCTTCTCC
GTCGTTTGCCCCTCAGATCAACAAAGTTTCATGTCTGAGCTTGATTCCCAGATCCCTACT
GCCTTCGACCCGTTTGCTGATGCGAATGTTGAGGACTCAGGTGCAGGAACAAAAGAGTAC
GTCCACATACGTGTGCAGCAGCGGAATGGTAGGAAAAGCTTGACAACTGTCCAGGGGTTG
AAGAAAGAGTATAGTTACAGCAAGATACTTAAGGATCTCAAGAAAGAGTTTTGTTGCAAC
GGAACAGTGGTTCAAGACTCTGAACTCGGACAGGTTATTCAGCTTCAAGGAGACCAGAGG
AAGAACGTCTCCACGTTCCTAGTCCAGGCTGGGCTAGTGAAGAAGGACAACATCAAGATC
CATGGATTCTGAGCTGCATTGTCCCTAAGTCTGTTTGCCTTATATTCTGTTATTAAGTGT
GTATCACTATTGTTATCCTTCCCTTTCCAAAACATTTCCTCGAACTTCTTCTTTGATCTC
TTGTTGCTTGGTTTGTTTCGATTTAGACTCGGTAAGAGACTATCTTTTATGTACTTGTTT
GCTACTTG


BQ
20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 0 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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GCTACTTG

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DS 



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BQ
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20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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TCCTACAGTTGATTCAGTTGTCTCGTGGAGTGAGAGCGGCAAGAGTTTCGTCGT

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AAGGAAGGAAGGAA****CGAACGAAGATTAAATCGAAGAGGGGTTTCATTAGGAGGGAG
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TGACATCCCTCACCACCCAGTTTCATGCCATTGGCTATACTAAAGTTGAAGA
TCT

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DS 

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DS 

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GG
AGGTTTGGTTTCAGAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAACGAACGAAGATCAAATCGAAG
AGGGGTTTCATTAGGAGGGAGGAAGGATGTATCGTGACAAAAAGGGAGAAGCCTTTGTCT
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CGTGGAGCGAGAGCGGGAAGAGTTTCATCGTTTGGGATGACGTGGAGTTTAGAAAAGCTC
TTCTTCTTCCCGGAGGGTGCCTTGGATACTTGGGCTTTTCACAATCTCAATCTCAATCTC
ATGAGCAATGCGAATACGCATGCCCTTATTTTATGAGAGGCCAGCCTGACCTTAAACCGT
CACAAGACGACCTCATTAGAAAGATTGAGACCGACAACAACAAGGGCTTGGACAGTAGCA
ATGATGATGGACTTATTCGCTTTAGCAGCCTTTCTTGCTACCAAGAGATGGCTAGGCTTG
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GCAAGAGTTTCGTCGTTTGGAATGAATCTAAGTTCCTCGTAGATGTTCTTCCTAGTCGCT
TACCCTTCAATTACAAAGATATGACATCCCTCACCACCCAGTTTCATGCCATTGGCTATA
CTAAAGTTGAAGA*TCTGAGCATTG

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G
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TTGGGATGACGTGGAGTTTAGAAAAGCTCTTCTTCTTCCCGGAGGGTGCCTTGGATACTT
GGGCTTTTCACAATCTCAATCTCAATCTCATGAGCAATGTGAATACGCATGCCCTTATTT
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TCCTTGCTACCAAGAGATGGCTAGGCTTGCCAAGAAGGAGCGTCCCCCTTTCTCATCAAT
TCGATGCCCTCCCCCCCTTTTCATCAGAGACGTGTACGATATGTTGGATGATCCTACAGT
TGATTCAGTTGTCTCGTGGAGTGAGAGCGGCAAGAGTTTCGTCGTTTG*AATGAATCTAA
GTTCCTCGGAGATGTTCTTCCTAGTCGCTTACCCTTCAATTACAAAGATATGACATCCCT
CACCACCCAGTTTCATGCCATTGGCTATAATAAAGTTGAAGAATCTGAGCATTGGGAATA
CGCATCCGATTATTTGGTGGGAGGTCAGCCTCCCCCCCCTAAGGATAAATCCCCATGCAC
TCCTGGCGGTCTTATGATTACTCCAGAACTTGCCAGACTCATCGAGAGATCCTTTGCTTG
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CTTATCGTATT

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CACTCCTGGCGGTCTTATGATTACTCCAGAACTTGCCAGACTCATCGAGAGATCCTTTGC
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TTAATAAGATAGATCATTATGG
C

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DS 

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TTGGATGATCCTACAGTTGATTCAGTTGTTTCGTGGAGTGAGAGCGGCAAGAGTTTTGTC
GTTTGGAATGAATTTAAGTTCCTCGGAGATGTTTTTCCTAGTCGCTTACCCTTCAATTAC
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TGTTGTTGTTTTTTTAATCGTATTTTATCGTCCTGTTTGAAAAACATTATTATGTTTGGT
CTCTCTCTTTTCTTTTAACTTATGGTTTGTAAGATACAAAGATGGTTGATGTTTTTTATT
TTTTTTTTGCATTTTTAATAAGATAGATCATTATGGTTG

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DS 



AS 2 10

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TTAGTCCATTATACAAGTTATTAAAGAGTAATAAGAGTAGTACGAAAGACTAACAAGATC
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GACGGCAAGGACACACACTCCTGCGAACCCCAAGTACACACTGCTGATTCCGAATTTAGT
CACAACGCTCAGGAAGTAGAGTCCAATCACAAAGTTTGAGATCCAGTGCATGCCGAGAGA
AAGAGCAACGGCTTTTGCTCTGATCCGGGATGCGAATATCTCTGGAAGAAGAAGAGCCGG
TACTGGGCCCGCACCAAGTGAGAATGACAAGACATATAGAACAGTTCCAACAACAGCGAG
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CGACGAAGCAACAGCAGTTCCAAACACGTTTGATGCTCCAACAAGAGCACTGGCTGCAAC
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TCCCGGCTAACTGTTGAAACAAGAAGAGCGCCGCACCTACACTTACAACTTTCCAGTAGC
GGCTGCTGAATAGATCAAACCATCCTGCTTCTGGCTCAGAAGTACCTTGGCCAGAGGTTG
ATAAGTCACGAACTAGTTCAACCACTTTTTCTTTACCGTAAAGAGTTTTGATAGCCTTTT
CGGCTTGAGTAAGTTTTCCTTGCTGAACGAGCCACCTTGGGCTTTCTGGAGAAAAAGCCA
TTCCTATGGCTAAAAGAAGGGAAGGGATAACTGCAACACCAAACATCGTCCTCCACCATA
GAGGGTTAGCTGCAAGTGGTAAACCAGCTATCAAGGCTGCAAGTATTCCTATACAGATGA
ACAACTGGTTCACAGATCCGAGTGCTCCACGGATTTCAGTTGGTGATATCTCGGATATGT
AAAGTGGTACAATGGCTGATGAGATTCCAATTCCAATTCCTGCGAGCAGGCGTCCCACAA
TCATTGTCTGCACACTCTGCGCTGTTGCACATAAGAAAGCTCCAATAGCAAGTGGGATAG
CATCCAATTGAAACGTTCTAGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DF30JQ U 7
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AF RS1AQ67JQ U 23
AF RS1AQ67TFB C 23
AF RS1A952TF C 225
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RD RS1DF30JQ 601 0 0
GGA
AAAGCCAACATGTAGTGATAGAATCGATTCCTCGTTATTGATTGATTACACTTAGTCCAT
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TCCACCAAAGCTAGTAAGTAGAAGACTTTTCCTTCCCATTTTGTCCATCAACGACGAA

QA 4 601 4 601
DS 

RD RS1EU67JQ 771 0 0
GGGAAAGGAAAAGCCAACATGTAGTGATAGAATCGATTCCTCGTTATTGATTGATTACAC
TTAGTCCATTATACAAGTTATTAAAGAGTAATAAGAGTAGTACGAAAGACTAACAAGATC
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GACGGCAAGGACACACACTCCTGCGAACCCCAAGTACACACTGCTGATTCCGGATTTAGT
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AAGAGCAACGGCTTTTGCTCTGATCCGGGATGCGAATATCTCTGGAAGAAGAAGAGCCGG
TACTGGGCCCGCACCAAGTGAGAATGACAAGACATATAGAACAGTTCCAACAACAGCGAG
AGCGCCAGAATATGCAGCTAGAGCCTTCCATGTGAAGGACAAAGAAAGTAACATCATAGA
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TCCCGGCTAACTGTTGAAACAAGAAGAGCGCCGCACCTACACTTACAACTT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RS1EV67JQ 713 0 0
G
AAAGCCAACATGTAGTGATAGAATCGATTCCTCGTTATTGATTGATTACACTTAGTCCAT
TATACAAGTTATTAAAGAGTAATAAGAGTAGTACGAAAGACTAACAAGATCAGTGATGAA
ACAAAGTGGGATTGTTCTCTCTGTTTAATTTCAAGCACCGGAGGTAAGAGCAAGCTCTAT
TTCCTCGAGCGATCGTCCTTTAGTCTCCACCACGTTTCCTGCGATGTACATGACGGCAAG
GACACACACTCCTGCGAACCCCAAGTACACACTGCTGATTCCGAATTTAGTCACAACGCT
CAGGAAGTAGAGTCCAATCACAAAGTTTGAGATCCAGTGCATGCCGAGAGAAAGAGCAAC
GGCTTTTGCTCTGATCCGGGATGCGAATATCTCTGGAAGAAGAAGAGCCGGTACTGGGCC
CGCACCAAGTGAGAATGACAAGACATATAGAACAGTTCCAACAACAGCGGGAGTGCCAGA
ATATGCAGCTAGAGCCTTCCATGTGAAGGACAAAGAAAGTAACATCATAGACAACGCCAT
TCCACCAAAGCTAGTAAGTAGAAGACTTTTCCTTCCCATTTTGTCCATCAACGACGAAGC
AACAGCAGTTCCAAACACGTTTGATGCTCCAACAAGAGCACTGGCTGCAACATCAGATTG
GATTCCGGCACTGCGGAACACGGATGTAGAG*TAGTATACAACTGCATTTAT

QA 2 713 2 713
DS 

RD RS1AQ67JQ 783 0 0
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AAAGAGTAATAAGAGTAGTACGAAAGACTAACAAGATCAGTGATGAAACAAAGTGGGATT
GTTCTCTCTGTTTAATTTCAAGCACCGGAGGTAAGAGCAAGCTCTATTTCCTCGAGCGAT
CGTCCTTTAGTCTCCACCACGTTTCCTGCGATGTACATGACGGCAAGGACACACACTCCT
GCGAACCCCAAGTACACACTGCTGATTCCGAATTTAGTCACAACGCTCAGGAAGTAGAGT
CCAATCACAAAGTTTGAGATCCAGTGCATGCCGAGAGAAAGAGCAACGGCTTTTGCTCTG
ATCCGGGATGCGAATATCTCTGGAAGAAGAAGAGCCGGTACTGGGCCCGCACCAAGTGAG
AATGACAAGACATATAGAACAGTTCCAACAACAGCGAGAGTGCCAGAATATGCAGCTAGA
GCCTTCCATGTGAAGGACAAAGAAAGTAACATCATAGACAACGCCATTCCACCAAAGCTA
GTAAGTAGAAGACTTTTCCTTCCCATTTTGTCCATCAACGACGAAGCAACAGCAGTTCCA
AACACGTTTGATGCTCCAACAAGAGCACTGGCTGCAACATCAGATTGGATTCCGGCACTG
CGGAACACAGATGTAGGGGTAGTATACAACTGCATTTATCCCGGCTAACTGTTGAAACAA
GAAGAGCGCCGCACCTACACTTACAACTTTCCAGTAGCGGCTGCTGAATAGATCAAACCA
TCC

QA 1 783 1 783
DS 

RD RS1AQ67TFB 783 0 0
AGTGATAGAATCGATTCCTCGTTATTGATTGATTACACTTAGTCCATTATACAAGTTATT
AAAGAGTAATAAGAGTAGTACGAAAGACTAACAAGATCAGTGATGAAACAAAGTGGGATT
GTTCTCTCTGTTTAATTTCAAGCACCGGAGGTAAGAGCAAGCTCTATTTCCTCGAGCGAT
CGTCCTTTAGTCTCCACCACGTTTCCTGCGATGTACATGACGGCAAGGACACACACTCCT
GCGAACCCCAAGTACACACTGCTGATTCCGAATTTAGTCACAACGCTCAGGAAGTAGAGT
CCAATCACAAAGTTTGAGATCCAGTGCATGCCGAGAGAAAGAGCAACGGCTTTTGCTCTG
ATCCGGGATGCGAATATCTCTGGAAGAAGAAGAGCCGGTACTGGGCCCGCACCAAGTGAG
AATGACAAGACATATAGAACAGTTCCAACAACAGCGAGAGTGCCAGAATATGCAGCTAGA
GCCTTCCATGTGAAGGACAAAGAAAGTAACATCATAGACAACGCCATTCCACCAAAGCTA
GTAAGTAGAAGACTTTTCCTTCCCATTTTGTCCATCAACGACGAAGCAACAGCAGTTCCA
AACACGTTTGATGCTCCAACAAGAGCACTGGCTGCAACATCAGATTGGATTCCGGCACTG
CGGAACACAGATGTAGGG*TAGTATACAACTGCATTTATCCCGGCTAACTGTTGAAACAA
GAAGAGCGCCGCACCTACACTTACAACTTTCCAGTAGCGGCTGCTGAATAGATCAAACCA
TCC

QA 1 783 1 783
DS 

RD RS1A952TF 884 0 0
TTT
CTGCGATGTACATGACG*CAAGGACACACACTCCTGCGAACCCCA*GTACACACTGCTGA
T**CGAATTTAGTCACAACGCTCAGGAAGTAGAGTCCAATCACAAAGTT*GAGATCCAGT
GCATGCCGAGAGAAAGAGCAACGGCTTTTGCTCTGATCCGGGATGCGAATATCTCTGGAA
GAAGAAGAGCCGGTACTGGGCCCGCACCAAGTGAGAACGACAAGACATATAGAACAGTTC
CAACAACAGCGAGAGTGCCAGAATATGCAGCTAGAGC*TTCCATGTGAAGGACAAAGAAA
GTAACATCATAGACAACGCCATTCCACCAAAGCTAGTAAGTAGAAGACTTTTCCTTCCCA
TTTTGTCCATCAACGACGAAGCAACAGCAGTTCCAAACACGTTTGATGCTCCAACAAGAG
CACTGGCTGCAACATCAGATTGGATTCCGGCACTGCGGAACACAGATGTAGAG*TAGTAT
ACAACTGCATTTATCCCGGCTAACTGTTGAAACAAGAAGAGCGCCGCACCTACACTTACA
ACTTTCCAGTAGCGGCTGCTGAATAGATCAAACCATCCTGCTTCTGGCTCAGAAGTACCT
TGGCCAGAGGTTGATAAGTCACGAACTAGTTCAACCACTTTTTCTTTACCGTAAGGAGTT
TTGATAGCCTTTTCGGCTTGAGTAAGTTTTCCTTACTGAACGAGCCACCTTGGGCTTTCT
GGAGAAAAAGCCATTCCTATGGCTAAAAGAAGGGAAGGGATAACTGCAACACCAAACATC
GTCCTCCACCATAGAGGGTTAGCTGCAAGTGGTAAACCAGCTATCAAGGCTGCAAGTATT
CCTATACAGATGAACAACTGGTTCACAGATCCGAGTGCTCC

QA 4 884 4 884
DS 

RD RS1EV67TF 802 0 0
AGTAGAGTCCA*TCACAAAGTT*GAGATCCAGTGCATGCCGAGAGAAAGAGCAACGGCTT
T*GCTCTGATCCGGGATGCGAATATCTCTG*AAGAAGAAGAGCCGGTACTGGGCCCGCAC
CAAGTGAGAATGACAAGACATATAGAACAGTTCCAACAACAGCGGGAGTGCCAGAATATG
CAGCTAGAGCCTTCCATGTGAAGGACAAAGAAAGTAACATCATAGACAACGCCATTCCAC
CAAAGCTAGTAAGTAGAAGACTTTTCCTTCCCATTTTGTCCATCAACGACGAAGCAACAG
CAGTTCCAAACACGTTTGATGCTCCAACAAGAGCACTGGCTGCAACATCAGATTGGATTC
CGGCACTGCGGAACACGGATGTAGAG*TAGTATACAACTGCATTTATCCCGGCTAACTGC
TGAAACAAGAAGAGCGCCGCACCTACACTTACAACTTTCCAGTAGCGGCTGCTGAATAGA
TCAAACCATCCTGCTTCTGGCTCAGAAGTACCTTGGCCAGAGGTTGATAAGTCACGAACT
AGTTCAACCACTTTTTCTTTACCGTAAAGAGTTTTGATAGCCTTTTCGGCTTGAGTAAGT
TTTCCTTGCTGAACGAGCCACCTTGGGCTTTCTGGAGAAAAAGCCATTCCTATGGCTAAA
AGAAGGGAAGGGATAACTGCAACACCAAACATCGTCCTCCACCATAGAGGGTTAGCTGCA
AGTGGTAAACCAGCTATCAAGGCTGCAAGTATTCCTATACAGATGAACAACTGGTTCACA
GATCCGAGTGCTCCACGGATT
C

QA 1 801 1 801
DS 

RD RS1DF30TF 615 0 0
GATTCCGGCACTGCGGAACACAGATGTAGAG*TAGTATACAACTGCATTTATCCCGGCTA
ACTGTTGAAACAAGAAGAGCGCCGCACCTACACTTACAACTTTCCAGTAGCGGCTGCTGA
ATAGATCAAACCATCCTGCTTCTGGCTCAGAAGTACCTTGGCCAGAGGTTGATAAGTCAC
GAACTAGTTCAACCACTCTTTCTTTACCGTAAAGAGTTTTGATAGCCTTTTCGGCTTGAG
TAAGTTTTCCTTGCTGAACGAGCCACCTTGGGCTTTCTGGAGAAAAAGCCATTCCTATGG
CTAAAAGAAGGGAAGGGATAACTGCAACACCAAACATCGTCCTCCACCATAGAGGGTTAG
CTGCAAGTGGTAAACCAGCTATCAAGGCTGCAAGTATTCCTATACAGATGAACAACTGGT
TCACAGATCCGAGTGCTCCACGGATTTCAGTTGGTGATATCTCGGATATGTAAAGTGGTA
CAATGGCTGATGAGATTCCAATTCCAATTCCTGCGAGCAGGCGTCCCACAATCATTGTCT
GCACACTCTGCGCTGTTGCACATAAGAAAGCTCCAATAGCAAGTGGGATAGCATCCAATT
GAAACGTTCTAGTTC

QA 1 615 1 615
DS 



CO CL286Contig2 864 2 8 U
GGGAGGGAGCGTTTACTCTCTTTCACCATCAATCAATATACGGTTATAAAAAGAAAAATG
CAGACGTCAACGTATGCGGTAAAAGGAAACGCCGCGTTTGCGTTTCAGAGACGTAGCAGC
TTCTCTAACCTCCACCACAACAGATCGGCCACTACCACAACCACTACCGGAATCCGCTTC
TTCTCCACCGGCTCTTGCTTCACGCCACTCCACTGTTCCCGCTCGAAGGCCATGGGAGCG
AAACTTGCTCGCGGTGAAAACGGGATCCACAGTCTCTCCTCCTCGGTCAAAGCTCGATCG
GTCAGAGCTCAATCCTCCTCCTCTGGTGGTGGTGGCGGAGATGAGGAAGAAGCTATACCT
CTGAGATCTCAACAAGGGAATAGCTCCGGGACTGTTTTACCCTTTGTTGGTGTTACTTGT
CTTGGTGCTATACTGTTTGGCTATCATCTCGGGGTAGTTAACGGTGCTCTTGAGTACCTT
GCTAAGGATCTTGGTATCGCCGATAATGCTGTTTTGCAAGGCTGGATTGTTAGCGCGTTG
CTTGCTGGTGCAACGGTCGGTTCTTTCACCGGTGGTGCATTAGCTGACAAATTCGGACGA
ACTAGAACGTTTCAATTGGATGCTATCCCACTTGCTATTGGAGCTTTCTTATGTGCAACA
GCGCAGAGTGTGCAGACAATGATTGTGGGACGCCTGCTCGCAGGGATTGGAATTGGAATC
TCATCAGCCATTGTACCACTTTACCACTTGCAGCTAACCCTCTATGGTGGAGACGATGTT
TGGGTGTTGCAGTTATCCCTTCCCTTCTTTTAGCCATAGAATGGCTTTTTCTCCAGAAAG
CCCAAGTGGCTCGTTCAGCAAGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EU67TF U 1
AF RS1AE44TF U 65
BS 1 82 RS1EU67TF
BS 83 83 RS1AE44TF
BS 84 296 RS1EU67TF
BS 297 297 RS1AE44TF
BS 298 316 RS1EU67TF
BS 317 317 RS1AE44TF
BS 318 659 RS1EU67TF
BS 660 864 RS1AE44TF

RD RS1EU67TF 659 0 0
GGGAGGGAGCGTTTACTCTCTTTCACCATCAATCAATATACGGTTATAAAAAGAAAAATG
CAGACGTCAACGTATGCGGTAACAGGAAACGCCGCGTTTGCGTTTCAGAGACGTAGCAGC
TTCTCTAACCTCCACCACAACAGATCGGCCACTACCACAACCACTACCGGAATCCGCTTC
TTCTCCACCGGCTCTTGCTTCACGCCACTCCACTGTTCCCGCTCGAAGGCCATGGGAGCG
AAACTTGCTCGCGGTGAAAACGGGATCCACAGTCTCTCCTCCTCGGTCAAAGCTCGGTCG
GTCAGAGCTCAATCCTTCTCCTCTGGTGGTGGTGGCGGAGATGAGGAAGAAGCTATACCT
CTGAGATCTCAACAAGGGAATAGCTCCGGGACTGTTTTACCCTTTGTTGGTGTTACTTGT
CTTGGTGCTATACTGTTTGGCTATCATCTCGGGGTAGTTAACGGTGCTCTTGAGTACCTT
GCTAAGGATCTTGGTATCGCCGATAATGCTGTTTTGCAAGGCTGGATTGTTAGCGCGTTG
CTTGCTGGTGCAACGGTCGGTTCTTTCACCGGTGGTGCATTAGCTGACAAATTCGGACGA
ACTAGAACGTTTCAATTGGATGCTATCCCACTTGCTATTGGAGCTTTCTTATGTGCAAC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RS1AE44TF 800 0 0
G
GTCAACGTATGCGGTAAAAGGAAACGCCGCGTTTGCGTTTCAGAGACGTAGCAGCTTCTC
TAACCTCCACCACAACAGATCGGCCACTACCACAACCACTACCGGAATCCGCTTCTTCTC
CACCGGCTCTTGCTTCACGCCACTCCACTGTTCCCGCTCGAAGGCCATGGGAGCGAAACT
TGCTCGCGGTGAAAACGGGATCTACAGTCTCTCCTCCTCGGTCAAAGCTCGATCGGTCAG
AGCTCAATCCTCCTCCTCTGGTGGTGGTGGCGGAGATGAGGAAGAAGCTATACCTCTGAG
ATCTCAACAAGGGAATAGCTCCGGGACTGTTTTACCCTTTGTTGGTGTTACTTGTCTTGG
TGCTATACTGTTTGGCTATCATCTCGGGGTAGTTAACGGTGCTCTTGAGTACCTTGCTAA
GGATCTTGGTATCGCCGATAATGCTGTTTTGCAAGGCTGGATTGTTAGCGCGTTGCTTGC
TGGTGCAACGGTCGGTTCTTTCACCGGTGGTGCATTAGCTGACAAATTCGGACGAACTAG
AACGTTTCAATTGGATGCTATCCCACTTGCTATTGGAGCTTTCTTATGTGCAACAGCGCA
GAGTGTGCAGACAATGATTGTGGGACGCCTGCTCGCAGGGATTGGAATTGGAATCTCATC
AGCCATTGTACCACTTTACCACTTGCAGCTAACCCTCTATGGTGGAGACGATGTTTGGGT
GTTGCAGTTATCCCTTCCCTTCTTTTAGCCATAGAATGGCTTTTTCTCCAGAAAGCCCAA
GTGGCTCGTTCAGCAAGAA

QA 2 800 2 800
DS 



AS 1 10

CO CL287Contig1 985 10 17 U
GGAACGCTCTTTCCATAAAAACCCTAGACGACGACAATGTTGGAGCTACGTCTCGTTCAG
GGCTCTCTGCTAAAAAAAGTTCTCGAATCGGTCAAGGATCTGGTCAACGATGCCAACTTC
GACTGCTCCAGCACCGGCTTCTCCCTCCAAGCCATGGACTCCAGCCACGTGGCCCTCGTC
TCCCTCCTGCTCAGATCCGAAGGCTTCGAGCACTACAGGTGCGACAGGAACCTCTCCATG
GGGATGAATCTCGGCAACATGTCCAAGATGCTCAAGTGCGCCGGAAACGATGACATCATC
ACCATCAAAGCTGATGACGGCGGCGACACTGTCACCTTCATGTTCGAGAGTCCCACGCAA
GACAAGATTGCGGATTTTGAGATGAAGCTGATGGATATAGACAGTGAGCATTTGGGGATA
CCTGATGCTGAGTACCATTCCATTGTGAGGATGCCGTCTGGTGAGTTCTCGAGGATTTGC
AAGGATCTCAGTACCATCGGTGACACTGTTGTGATCTCTGTGACTAAAGAAGGGG*TTAA
GTTTTCTACTGCTGGTGACATTGGGACAGCTAACATTGTCTTAAGACAGAACACAACTGT
AGACAAGCCGGAAGATGCGATTGTGATAGAGATGAACGAGCCTGTGTCACTCTCATTTGC
CCTGAGGTACATGAATTCCTTCACAAAGGCAACTCCATTGTCGGACACAGTGACAATCAG
CTTATCCTCGGAGCTGCCAGTGGTGGTGGAGTATAAGGTGGCTGAGATGGGTTACATCCG
TTACTACTTGGCTCCTAAGATTGAGGAAGAAGAAGATGACAACAAGGCCTAAGAACCAGT
TTGTATCCCAACAGCTTCTATTCATCTTTGTTGCTGTCATTGTGTGTTTCCGTTGTATTC
CCCTCTAGAATCAGTTGTTTTTTCTTAGACTTATTATGCTTCATGATACCAATGTTTGAC
AAAGTTATTGCAACTCTGATTACCG


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 
55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 25 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 40 50 25 50 50 35 50 50 50 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1B820TF U 1
AF RS1CF54TF U 1
AF RS1FT26TF U 1
AF RS1EY21TF U 1
AF RS1D435TF U 1
AF RS1FT26JQ C 191
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DS 

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GTTTTCTACTGCTGGTGACATTGGGACAGCTAACATTGTCTTAAGACAGAACACAACTGT
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CCTGAGT*ACATGAATTCCTTCACAAGG*CA*CTCCATTGTCGGACACAGTGACA
TCAG

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DS 

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GTTTTCTACTGCTGGTGACATTGGGACAGCTAACATTGTCTTAAGACAGAACACAACTGT
AGACAAGCCGGAAGATGCGATTGTGATAGAGATGAACGAGCCTGTGTCACTCTCATTTGC
CCTGAGT*ACATGAATTCCTTCACAAAGGCAACTC

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ACCATCAAAGCTGATGACGGCGGCGACACTGTCACCTTCATGTTCGAGAGTCCCACGCAA
GACAAGATTGCGGATTTTGAGATGAAGCTGATGGATATAGACAGTGAGCATTTGGGGATA
CCTGATGCTGAGTACCATTCCATTGTGAGGATGCCGTCTGGTGAGTTCTCGAGGATTTGC
AAGGATCTCAGTACCATCGGTGACACTGTTGTGATCTCTGTGACTAAAGAAGGGG*TTAA
GTTTTCTACTGCTGGTGACATTGGGACAGCTAACATTGTCTTAAGACAGAACACAACTGT
AGACAAGCCGGAAGATGCGATTGTGATAGAGATGAACGAGCCTGTGTCACTCTCATTTGC
CCTGAGGTACATGAATTCCTTCAC

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DS 

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CTGATGACGGCGGCGACACTGTCACCTTCATGTT*GAGAGTCCCACGCAAGACAAGATTG
CGGATTTTGAGATGAAGCTGATGGATATAGACAGTGAGCATTTGGGGATACCTGATGCTG
AGTACCATTCCATTGTGAGGATGCCGTTTGGTGAGTTCTCGAGGATTTGCAAGGATTTCA
GTACCATCGGTGACACTGTTGTGATCTCTGTGACTAAAGAAGGGG*TTAAGTTTTTTACT
GCTGGTGACATTGGGACAGCTAACATTGTCCTAAGACAGAACACAACTGTAGACAAGCCG
GAAGATGCGATTGTGATAGAGATGAACGAGCCTGTGTCACTTTCATTTGCCCTGAGGCAC
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GAGCTGCCAGTGGTGGTGGAGTATAAGGTGGCTGAGATGGGTTACATCCGTTACTACTTG
GCTCCTAAGATTGAGGAAGAAGAAGATGACAACAAGGCCTAAGAACCAGTTTGTATCCCA
ACAGCTTCTATTCATCTTTGTTGCTGTCATTGTGTGTTTCCGTTGTATTCCCCTCTAGAA
TCAGTTGTTTTTT
CTG

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DS 

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GCTCAAGTGCGCCGGAAACGATGACATCATCACCATCAAAGCTGATGACGGCGGCGACAC
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GATGGATATAGACAGTGAGCATTTGGGGATACCTGATGCTGAGTACCATTCCATTGTGAG
GATGCCGTCTGGTGAGTTCTCGAGGATTTGCAAGGATCTCAGTACCATCGGTGACACTGT
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AGTATAAGGTGGCTGAGATGGGTTACATCCGTTACTACTTGGCTCCTAAGATTGAGGAAG
AGGAAGATGACAACAAGGCCTAAGAACCAGTTTGTATCCCAACAGCTTCTATTCATCTTT
GTTGCTGTCATTGTGTGTTTCCGTTGTATTCCCCTCTAGAATCAGTTGTTTTTTCTTAGA
CTTATTATG
G

QA 1 729 1 729
DS 

RD RS1EY21JQ 607 0 0
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ATGAAGCTGATGGATATAGACAGTGAGCATTTGGGGATACCTGATGCTGAGTACCATTCC
ATTGTGAGGATGCCGTTTGGTGAGTTCTCGAGGATTTGCAAGGATTTCAGTACCATCGGT
GACACTGTTGTGATCTCTGTGACTAAAGAAGGGG*TTAAGTTTTTTACTGCTGGTGACAT
TGGGACAGCTAACATTGTTTTAAGACAGAACACAACTGTAGACAAGCCGGAAGATGCGAT
TGTGATAGAGATGAACGAGCCTGTGTCACTTTCATTTGCCCTGAGGTACATGAATTCCTT
CACAAAGGCAACTCCATTGTCGGACACAGTGACAATCAGCTTATCCTCGGAGCTGCCAGT
GGTGGTGGAGTATAAGGTGGCTGAGATGGGTTACATCCGTTACTACTTGGCTCCTAAGAT
TGAGGAAGAAGAAGATGACAACAAGGCCTAAGAACCAGTTTGTATCCCAACAGCTTCTAT
TCATCTTTGTTGCTGTCATTGTGTGTTTCCGTTGTATTCCCCTCTAGAATCAGTTGTTTT
TTTTTAG

QA 1 607 1 607
DS 

RD RS1CF54JQ 805 0 0
TCTCCT
CTGCTCAGATC*GAAGGCTTCGAGCACTACAGGTGCGACAGGAACCTCTCCATGGGGATG
AATCTCGGCAACATGTCCAAGATGCGCAAGTGCGC*GGAAACGATGACATCATCACCATC
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ATTGCGGATTTTGAGATGAAGCTGATGGATATAGACAGTGAGCATTTGGGGATACCTGAT
GCTGAGTACCATTCCATTGTGAGGATGCCGTCTGGTGAGTTCTCGAGGATTTGCAAGGAT
CTCAGTACCATCGGTGACACTGTTGTGATCTCTGTGACTAAAGAAGGGG*TTAAGTTTTC
TACTGCTGGTGACATTGGGACAGCTAACATTGTCTTAAGACAGAACACAACTGTAGACAA
GCCGGAAGATGCGATTGTGATAGAGATGAACGAGCCTGTGTCACTCTCATTTGCCCTGAG
GTACATGAATTCCTTCACAAAGGCAACTCCATTGTCGGACACAGTGACAATCAGCTTATC
CTCGGAGCTGCCAGTGGTG***GAGTATAAGGTGGCTGAGATGGGTTACATCCGTTACTA
CTTGGCTCCTAAGATTGAGGAAGAAGAAGATGACAACAAGGCCTAAGAACCAGTTTGTAT
CCCAACAGCTTCTATTCATCTTTGTTGCTGTCATTGTGTGTTTCCGTTGTATTCCCCTCT
AGAATCAGTTGTTTTTTCTTAGACTTATTATGCTTCATGATACCAATGTTTGACAAAGTT
ATTGCAACTCTGATTAC
TC

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DS 

RD RS1B820JQ 762 0 0
GACAGG
ACCTCTCCATGGGGATGA*TCTCGGCAACATGTCCAAGATGCTCAAGTGCGCGGGAAACG
ATGACATCATCACTATCAAAGCTGATGACGGCGGCGACACTGTCACTTTCATGTTCGAGA
GTCCCACGCAAGACAAGATTGCGGATTTTGAGATGAAGCTGATGGATATAGACAGTGAGC
ATTTGGGGATACCTGATGCTGAGTACCATTCCATTGTGAGGATGCCGTCTGGTGAGTTCT
CGAGGATTTGCAAGGATCTCAGTACCATCGGTGACACTGTTGTGATCTCTGTGACTAAAG
AAGGGG*TTAAGTTTTCTACTGCTGGTGACATTGGGACAGCTAACATTGTCTTAAGACAG
AACACAACTGTAGACAAGCCGGAAGATGCGATTGTGATAGAGATGAACGAGCCTGTGTCA
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GGTTACATCCGTTACTACTTGGCTCCTAAGATTGAGGAAGAAGAAGATGACAACAAGGCC
TAAGAACCAGTTTGTATCCCAACAGCTTCTATTCATCTTTGTTGCTGTCATTGTGTGTTT
CCGTTGTATTCCCCTCTAGAATCAGTTGTTTTTTTTTAGACTTATTATGCTTCATGATAC
CAATGTTTGACAAAGTTATTGCAACTTTGATTACCG

QA 7 762 7 762
DS 



AS 1 10

CO CL288Contig1 825 10 11 U
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TCTTACTAAACCAGACCAAGACCAAGCCCAATGATGGAAGACAAGAAGCTTAGACACAAC
AGTACACAAGAAGAGAGTCTGAAAGCGATTGAATTATACATTACAAAAAAA*AGAAAACA
TTATATCTGTCCATGTTGTTTACGCAGCCATGGTGACAGCTTCTGCTGCTGCGGCAGGGA
CATACCAACCGTGGTGGATCTCAACGGCCTTTTTCCTCCTAGCCAACCGAGACTTCCTAC
GTGCACCAGTGTTCTTGTGTAGCGCTCTAACCTTGACTGCTTTGTCTATAGCAGAATAAG
CCTCTCCTATAAGTTTCTCCACGGTTACAATCTCGTCAGGTACCGCATCTGTCTTCTTCT
TGAGCCCATCAAGTGCTTCCAAAACCTTCTTCATCCGTGTGCGGGCTTCGGACTTTTTAG
ACTTGTTGTAAACGCGCCTCTTCTCAGCTTGGCGAGCTCTCTTGGCAGCTGAATCAGCTT
TCTTCGTGGGAGCAGCCTCGCACACAATCGATTGCCTTGCTGGCTTATTCTTCTCTACCC
ACATATTCCCGGAGGAGAAGGCGACACATTGAGAAACGCTCTGAGAGAAGCTAAGGGAGG
AGCATACACCACGACGAGTGGACAAGGAAGAAGAAGCTCCGTTAAGAGAAAGGGATTTGA
ATTTGGGATTGAGTGTCGCACAGGAAGAAAGACACTGGACTAATGTCGCCATGGATCCTC
TTCTACTACCGAACAACACCAGTTCTCTGCTCTTGTAATTGGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 10 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1E884TF C 111
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TACACAAGAAGAGAGTCTGAAAGCGATTGAATTATACATTACAAAAAAAAAGAAAACATT
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TACCAACCGTGGTGGAACTCAACAGCCTTTTTCCTCCTAGCCAACCGAGACTTCCTACGT
GCACCAGTGTTCTTGTGTAGCGCTCTAACCTTGACTGCTTTGTCTATAGCAGAGTAAGCC
TCTCCTATAAGTTTCTCCACGGTTACAATCTCGTCAGGTACCGCATCTGCCTTCTTCTTG
AGCCCATCAAGTGCTTCCAAAACCTTCTTCATCCGTGTGCGGGCTTCGGACTTTTTAGAC
TTGTTGTAAACGCGCCTCTTCTCGGCTTGGCGAGCTCTCTTGGCAGCTGAATCAGCTTTC
TTCGTGGGAGCAGCCTCGCACACAATCGATTGCCTTGCTGGCTTATTCTTCTCTAC

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GGTGACAGCTTCTGCTGCTGCGGCAGGGACATACCAACCGTGGTGGATCTCAACAGCCTT
TTTCCTCCTAGCCAACCGAGACTTCCTACGTGCACCAGTGTTCTTGTGTAGCGCTCTAAC
CTTGACTGCTTTGTCTATAGCAGAGTAAGCCTCTCCTATAAGTTTCTCCACGGTTACAAT
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CATCCGTGTGCGGGCTTCGGACTTTTTAGACTTGTTGTAAACGCGCCTCTTCTCGGCTTG
GCGAGCTCTCTTGGCAGCTGAATCAGCTTTCTTCGTGGGAGCAG
ACCCCTCTTAAAGACCGAC

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DS 

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ATTATACATTACAAAAAAA*AGAAAACATTATATCTGTCCATGTTGTTTACGCAGCCATG
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ATCCGTGTGCGGGCTTCGGACTTTTTAGACTTGTTGTAAACGCGCCTCTTCTCGGCTTGG
CGAGCTCTCTTGGCAGCTGAATCAGCTTTCTTCGTGGGAGCAG
ACCCCTCTTAAAGACCGAC

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DS 

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GTGACAGCTTCTGCTGCTGCGGCAGGGACATACCAACCGTGGTGGATCTCAACGGCCTTT
TTCCTCCTAGCCAACCGAGACTTCCTACGTGCACCAGTGTTCTTGTGTAGCGCTCTAACC
TTGACTGCTTTGTCTATAGCAGAATAAGCCTCTCCTATAAGTTTCTCCACGGTTACAATC
TCGTCAGGTACCGCATCTGTCTTCTTCTTGAGCCCATCAAGTGCTTCCAAAACCTTCTTC
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CGAGCTCTCTTGGCAGCTGAATCAGCTTTCTTCGTGGGAGCAGCCTCGCACACAATCGAT
TGCCTTGCTGGCTTATTCTTCTCTACCCACATATTCCC

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DS 

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TCTTACTAAACCAGACCAAGACCAAGCCCAATGATGGAAGACAAGAAGCTTAGACACAAC
AGTACACAAGAAGAGAGTCTGAAAGCGATTGAATTATACATGACAAAAAA**AGAAAACA
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CATACCAACCGTGGTGGATCTCAACGGCCTTTTTCCTCCTAGCCAACCGAGACTTCCTAC
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CCTCTCCTATAAGTTTCTCCACGGTTACAATCTCGTCAGGTACCGCATCTGTCTTCTTCT
TGGGCCCATCAAGTGCTTCCAAAACCTTCTTCATCCGTGTGCGGGCTTCGGACTTTTTAG
ACTTGTTGTAAACGCGCCTCTTTTCAGCTTGGCGAGCTCTCTTGGCAGCTGAATCAGCTT
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AGCATACACCACGACGAGTGGA

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DS 

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GTGACAGCTTCTGCTGCTGCGGCAGGGACATACCAACCGTGGTGGATCTCAACGGCCTTT
TTCCTCCTAGCCAACCGAGACTTCCTACGTGCACCAGTGTTCTTGTGTAGCGCTCTAACC
TTGACTGCTTTGTCTATAGCAGAATAAGCCTCTCCTATGAGTTTCTCCACGGTTACAATC
TCGTCAGGTACTGCATCTGTCTTCTTCTTGAGCCCATCAAGTGCTTCCAAAACCTTCTTC
ATCCGTGTGCGGGCTTCGGACTTTTTAGACTTGTTGTAAACGCGCCTCTCCTCAGCTTGG
CGAGCTCTCTTGGCAGCTGAATCAGCTTTCTTCGTGGGAGCAGCCTCGCACACAATCGAT
TGCCTTGCTGGCTTATTCTTCTCTACCCACATATTCCCGGAGGAGAAGGCGACACATTGA
GAAACGCTCTGAGAGAAGCTAAGGGAGGAGCATACACCACGACGAGTGGACAAGGAAGAA
GAA

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DS 

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GAT
GAAGACAAGAAGCTTAGACACAACAGTACACAAGAAGAGAGTCTGAAAGCGATTGAATTA
TACATGACAAAAAA**AGAAAACATTATATCTGTCCATGTTGTTTACGCAGCCATGGTGA
CAGCTTCTGCTGCTGCGGCAGGGACATACCAACCGTGGTGGATCTCAACGGCCTTTTTCC
TCCTAGCCAACCGAGACTTCCTACGTGCACCAGTGTTCTTGTGTAGCGCTCTAACCTTGA
CTGCTTTGTCTATAGCAGAATAAGCCTCTCCTATAAGTTTCTCCACGGTTACAATCTCGT
CAGGTACCGCATCTGTCTTCTTCTTGAGCCCATCAAGTGCTTCCAAAACCTTCTTCATCC
GTGTGCGGGCTTCGGACTTTTTAGACTTGTTGTAAACGCGCCTCTTTTCAGCTTGGCGAG
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CGCTCTGAGAGAAGCTAAGGGAGGAGCATACACCACGACGAGTGGACAAGGAAGAAGAAG
CTCCGTTAAGAGAAAGGGATTTGAATTTGGGATTGAGTGTCGCACAGGAAGAAAGACACT
GGACTAATGTCGCCAT

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ATATCTGTCCATGTTGTTTACGCAGCCATGGTGACAGCTTCTGCTGCTGCGGCAGGGACA
TACCAACCGTGGTGGATCTCAACAGCCTTTTTCCTCCTAGCCAACCGAGACTTCCTACGT
GCACCAGTGTTCTTGTGTAGCGCTCTAACCTTGACTGCTTTGTCTATAGCAGAGTAAGCC
TCTCCTATAAGTTTCTCCACGGTTACAATCTCGTCAGGTACCGCATCTGCCTTCTTCTTG
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TTGTTGTAAACGCGCCTCTTCTCGGCTTGGCGAGCTCTCTTGGCAGCTGAATCAGCTTTC
TTCGTGGGAGCAGCCTCGCACACAATCGATTGCCTTGCTGGCTTATTCTTCTCTACCCAC
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TTGGGATTGAGTGTCGCACAGGAAGAAAGACACTGGACTAATGTCGCCATGGATCCTCTT
CTACTACCGAACAACACCAGTTCTCTGCTCTTGTAATTGGCCC

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DS 

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TTTTTTTT
TGATGGAAGACAAGAAGCTTAGACACAACAGTACACAAGAAGAGAGTCTGAAAGCGATTG
AATTATACATTACAAAAAA**AGAAAACATTATATCTGTCCATGTTGTTTACGCAGCCAT
GGTGACAGCTTCTGCTGCTGCGGCAGGGACATACCAACCGTGGTGGATCTCAACGGCCTT
TTTCCTCCTAGCCAACCGAGACTTCCTACGTGCACCAGTGTTCTTGTGTAGCGCTCTAAC
CTTGACTGCTTTGTCTATAGCAGAATAAGCCTCTCCTATGAGTTTCTCCACGGTTACAAT
CTCGTCAGGTACTGCATCTGTCTTCTTCTTGAGCCCATCAAGTGCTTCCAAAACCTTCTT
CATCCGTGTGCGGGCTTCGGACTTTTTAGACTTGTTGTAAACGCGCCTCTCCTCAGCTTG
GCGAGCTCTCTTGGCAGCTGAATCAGCTTTCTTCGTGGGAGCAGCCTCGCACACAATCGA
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AGAAGCTCCGTTAAGAGAAAGGGATTTGAATTTGGGATTGAGTGTCGCACAGGAAGAAAG
ACACTGGACTAGTGTCGCCATGGATCCTCTTCTACTACCGAACAACACCAGTTCTCTGC
CC

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DS 

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**AGAAAACATTATATCTGTCCATGTTGTTTACGCAGCCATGGTGACAGCTTCTGCTGCT
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GCAGAATAAGCCTCTCCTATAAGTTTCTCCACGGTTACAATCTCGTCAGGTACCGCATCT
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GACTTTTTAGACTTGTTGTAAACGCGCCTCTTTTCAGCTTGGCGAGCTCTCTTGGCAGCT
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CTAAGGGAGGAGCATACACCACGACGAGTGGACAAGGAAGAAGAAGCTCCGTTAAGAGAA
AGGGATTTGAATTTGGGATTGAGTGTCGCACAGGAAGAAAGACACTGGACTAATGTCGCC
ATGGATCCTCTTCTACTACCGAACAACACCAGTTCTCTGC
C

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 9

CO CL289Contig1 1158 9 24 U
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GCTGATGGTGATGCAGACCGTAACATGATCCTTGGTAAAAGGTTCTTTGTAACTCCTTCT
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GCTGGAATGTGTTCTGTTTGTGGGGAAGAGAGTTTTGGAACTGGCTCTGATCATATCCGT
GAGAAAGATGGGATTTGGGCAGTTCTTGCGTGGTTGTCCATACTTGCTCACAAGAACAAG
GGAAATCTTGAAGGTGACAATAAATTGGTGACGGTTGAAGACATTGTCCGCAAACACTGG
GCTACCTATGGCCGTCACTATTACACTCGTTACGACTATGAGAATGTAGATGCAGGTAAA
GCTAAGGAACTGATGGAGCATTTGGTCAAACTGCAATCTTCAATCCCTGAAGTCAACAAG
ATGGTGAAAGGAATTCGTTCGGACGTGGCGAATGTATCCAGTGCAGATGAATTCGAGTAC
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GGTTCACGACTTGTCTTCCGTCTGTCTGGAACTGGCTCGGAAGGAGCAACCATCCGACTA
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GTTATTGCGGTTTTAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 5 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1GL56TF U 420
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AF RS1F105JQ C 359
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G
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GTGATGCAGACCGTAACATGATCCTTGGTAAAAGGTTCTTTGTAACTCCTTCTGATTCAG
TTGCTATAATTGCTGCAAATGCTATTGGGGCCATACCGTACTTCAGCTCTGGTTTGAAAG
GTGTTGCAAGGAGCATGCCGACCTCAGCTGCTCTTGATGTCGTTGCAAAAAGCTTGAATT
TGAAGTTCTTTGAGGTTCCAACAGGCTGGAAGTTTTTCGGTAATCTGATGGATGCTGGAA
TGTGTTCTGTTTGTGGGGAAGAGAGTTTTGGAACTGGCTCTGATCATATCCGTGAGAAAG
ATGGGATTTGGGCAGTTCTTGCGTGGTTGTCCATACTTGCTCACAAGAACAAGGGAAATC
TTGATGGTGACAATAAATTGGTGACGGTTGAAGACATTGTCCGCAAACACTGGGCTACCT
ATGGTCGTCACTATTACACTCGTTACGACTATGAGAATGTAGATG

QA 2 526 2 526
DS 

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GCTGATGGTGATGCAGACCGTAACATGATCCTTGGTAAAAGGTTCTTTGTAACTCCTTCT
GATTCAGTTGCTATAATTGCTGCAAATGCTATTGGGGCCATACCGTACTTCAGCTCTGGT
TTGAAAGGTGTTGCAAGGAGCATGCCGACCTCAGCTGCTCTTGATGTCGTTGCAAAAAGC
TTGAATTTGAAGTTCTTTGAGGTTCCAACAGGCTGGAAGTTTTTCGGTAATCTGATGGAT
GCTGGAATGTGTTCTGTTTGTGGGGAAGAGAGTTTTGGAACTGGCTCTGATCATATCCGT
GAGAAAGATGGGATTTGGGCAGTTCTTGCGTGGTTGTCCATACTTGCTCACAAGAACAAG
GGAAATCTTGAAGGTGACAATAAATTGGTGACGGTTGAAGACATTGTCCGCAAACACTGG
GCTACCTATGGCCGTCACTATTACACTCGTTACGACTATGAGAATGTAGATGCAGGTAAA
GCTAAGGAACTGATGGAGCATTTGGTCAAACTGCAATCTTCAATCCCTGAAGTCAACAAG
ATGGCGAAAGGAATTCGTTCGGACGTGGCGAATGTATCCAGTGCAGATGAATTCGAGTAC
AAAGATCCAGTTGATGGCTCCATCTCCAAGCACCAGGGAATCCGTTACTTGTTTGAAGAT
GGTTCACGACTTGTCTTC*GTCTGTCTGGA
C

QA 1 750 1 750
DS 

RD RS1CE01TF 732 0 0
G
CACCGGAGTTGAACCTCCAGAGTTTGGTGCCGCTGCTGATGGTGATGCAGACCGTAACAT
GATCCTT***AAAAGGTTCTTTGTAACTCCTTCTGATTCAGTTGCTATAATTGCTGCAAA
TGCTATTGGGGCCATACCGTACTTCAGCTCTGGTTTGAAAGGTGTTGCAAGGAGCATGCC
GACCTCAGCTGCTCTTGATGTCGTTGCAAAAAGCTTGAATTTGAAGTTCTTTGAGGTTCC
AACAGGCTGGAAGTTTTTCGGTAATCTGATGGATGCTGGAATGTGTTCTGTTTGTGGGGA
AGAGAGTTTTGGAACTGGCTCTGATCATATCCGTGAGAAAGATGGGATTTGGGCAGTTCT
TGCGTGGTTGTCCATACTTGCTCACAAGAACAAGGGAAATCTTGAAGGTGACAATAAATT
GGTGACGGTTGAAGACATTGTCCGCAAACACTGGGCTACCTATGGCCGTCACTATTACAC
TCGTTACGACTATGAGAATGTAGATGCAGGTAAAGCTAAGGAACTGATGGAGCATTTGGT
CAAACTGCAATCTTCAATCCCTGAAGTCAACAAGATGGTGAAAGGAATTCGTTCGGACGT
GGCGAATGTATCCAGTGCAGATGAATTCGAGTACAAAGATCCAGTTGATGGCTCCATCTC
CAAGCACCAGGGAATCCGTTACTTGTTTGAAGATGGTTCACGACTTGTCTTCCGTCTGTC
TGGAACTGGCT

QA 2 732 2 732
DS 

RD RS1DE60TF 681 0 0
ATTTGAAGTTCTTTGAGGTTCCAACAGGCTGGAAGTTTTTCGGTAATCTGATGGATGCTG
GAATGTGTTCTGTTTGTGGGGAAGAGAGTTTTGGAACTGGCTCTGATCATATCCGTGAGA
AAGATGGGATTTGGGCAGTTCTTGCGTGGTTGTCCATACTTGCTCACAAGAACAAGGGAA
ATCTTGATGGTGACAATAAATTGGTGACGGTTGAAGACATTGTCCGCAAACACTGGGCTA
CCTATGGTCGTCACTATTACACTCGTTACGACTATGAGAATGTAGATGCAGGTAAAGCTA
AGGAACTGATGGAGCATTTGGTCAAACTGCAATCTTCAATCCCTGAAGTCAACAAGATGG
TGAAAGGAATTCGTTCGGACGTGGCGAATGTATCCAGTGCAGATGAATTCGAGTACAAAG
ATCCAGTTGATGGCTCCATCTCCAAGCACCAGGGAATCCGTTACTTGTTTGAAGATGGAT
CACGACTTGTCTTCCGTCTATCTGGAACTGGCTCGGAAGGAGCAACCATCCGACTATACA
TTGAACAGTACGAGAAGGATGCTTCGAAAACCGGACGAGAGTCTCATGAAGCTCTGTCTC
CTCTGGTGGACATAGCTCTGAAGCTGTCCAAGATGGAGGAGTTCACTGGCCGATCAGCCC
CCACCGTCATAACATAA
GAGA

QA 1 677 1 677
DS 

RD RS1F105TF 796 0 0
G
GAATTTGAAGTTCTTTGAGGTTCCAACAGGCTGGAAGTTTTTCGGTAATCTGATGGATGC
TGGAATGTGTTCTGTTTGTGGGGAAGAGAGTTTTGGAACTGGCTCTGATCATATCCGTGA
GAAAGATGGGATTTGGGCAGTTCTTGCGTGGTTGTCCATACTTGCTCACAAGAACAAGGG
AAATCTTGAAGGTGACAATAAATTGGTGACGGTTGAAGACATTGTCCGCAAACACTGGGC
TACCTATGGCCGTCACTATTACACTCGTTACGACTATGAGAATGTAGATGCAGGTAAAGC
TAAGGAACTGATGGAGCATTTGGTCAAACTGCAATCTTCAATCCCTGAAGTCAACAAGAT
GGTGAAAGGAATTCGTCCGGACGTGGCGAATGTATCCAGTGCAGATGAATTCGAGTACAA
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TTCACGACTTGTCTTCCGTCTGTCTGGAACTGGCTCGGAAGGAGCAACCATCCGACTATA
CATTGAACAGTACGAGAAGGATGCTTCGAAAACCGGACGAGAGTCCCATGAAGCTCTGTC
TCCTCTGGTGGACATAGCTCTGAAGTTGTCCAAGATGGAGGAGTTCACTGGCCGATCAGC
CCC*ACCGTCATAACATAAAAAAA**GCGGGTCAAGTGCAACGGTCTCAAATCATTCACT
TCTTTGTCTGCGTCTTT*GGGATGCTTTT*TTTCTTCTCAT*ATATGACGATGCTATGA
TATTTAGTCTCTGGGG

QA 2 780 2 780
DS 

RD RS1GL56JQ 711 0 0
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GGCTACCTATGGCCGTCACTATTACACTCGTTACGACTATGAGAATGTAGATGCAGGTAA
AGCTAAGGAACTGATGGAGCATTTGGTCAAACTGCAATCCTCAATCCCTGAAGTCAACAA
GATGGTGAAAGGAATTCGTTCGGATGTGGCGAATGTATCCAGTGCAGATGAATTCGAGTA
CAAAGATCCAGTTGATGGCTCCATCTCCAAGCACCAGGGAATCCGTTACTTGTTTGAAGA
TGGTTCACGACTTGTCTTCCGTCTGTCTGGAACTGGCTCGGAAGGAGCAACCATCCGACT
ATACATT*AACAGTACGAGAAGGATGCTTCGAAAACCGGACGAGAGTCCCATGAAGCTCT
GTCTCCTCTGGTGGACATAGCTCTGAAGTTGTCCAAGATGGAGGAGTTCACTGGCCGATC
AGCCCCCACCGTCATAACATAAAAAA**GGCGGGTCAAGTGCAACGGTCTCAAATCATTC
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GAATAATTTAGTCTCTGGGGGGGCTTTCATATTTCATGAGTTATCGTGAAGCTTATACTT
GGATTTGTCTTTCTCGGTTTTGTTATTTTACATGTATTACGTACTTACGTG

QA 1 711 1 711
DS 

RD RS1GL56TF 711 0 0
GGGAAATCTTGAAGGTGACAATAAATTGGTGACGGTTGAAGACATTGTCCGCAAACACTG
GGCTACCTATGGCCGTCACTATTACACTCGTTACGACTATGAGAATGTAGATGCAGGTAA
AGCTAAGGAACTGATGGAGCATTTGGTCAAACTGCAATCCTCAATCCCTGAAGTCAACAA
GATGGTGAAAGGAATTCGTTCGGATGTGGCGAATGTATCCAGTGCAGATGAATTCGAGTA
CAAAGATCCAGTTGATGGCTCCATCTCCAAGCACCAGGGAATCCGTTACTTGTTTGAAGA
TGGTTCACGACTTGTCTTCCGTCTGTCTGGAACTGGCTCGGAAGGAGCAACCATCCGACT
ATACATT*AACAGTACGAGAAGGATGCTTCGAAAACCGGACGAGAGTCCCATGAAGCTCT
GTCTCCTCTGGTGGACATAGCTCTGAAGTTGTCCAAGATGGAGGAGTTCACTGGCCGATC
AGCCCCCACCGTCATAACATAAAAAA**GGCGGGTCAAGTGCAACGGTCTCAAATCATTC
ACTTCTTTGTCTGCGTCTTTTGGGATGCTTTTCTTTCTTCTCATTATATGACGATGCTAT
GAATAATTTAGTCTCTGGGGGGGCTTTCATATTTCATGAGTTATCGTGAAGCTTATACTT
GGATTTGTCTTTCTCGGTTTTGTTATTTTACATGTATTACGTACTTACGTG

QA 1 711 1 711
DS 

RD RS1DJ30JQ 828 0 0
AAGAGAG
TTTGGAACTGGCTCTGATCATATCCGTGAGAAAGATGGGATTTGGGCAGTTCTTGCGTGG
TTGTCCATACTTGCTCACAAGAACAAGGGAAATCTTGAAGGTGACAATAAATTGGTGACG
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GACTATGAGAATGTAGATGCAGGTAAAGCTAAGGAACTGATGGAGCATTTGGTCAAACTG
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GTATCCAGTGCAGATGAATTCGAGTACAAAGATCCAGTTGATGGCTCCATCTCCAAGCAC
CAGGGAATCCGTTACTTGTTTGAAGATGGTTCACGACTTGTCTTCCGTCTGTCTGGAACT
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TCAAGTGCAACGGTCTCAAATCATTCACTTCTTTGTCTGCGTCTTTTGGGATGCTTTTCT
TTCTTCTCATTATATGACGATGCTATGAATAATTTAGTCTCTGGGGGGGCTTTCATATTT
CATGAGTTATCGTGAAGCTTATACTTGGATTTGTCTTTCTCGGTTTTGTTATTTTACATG
TATTACGTACTTACGTGATTAAGATTTGTTATTGC
GGTTTT

QA 8 822 8 822
DS 

RD RS1F105JQ 800 0 0
GTGAGAAAGATGGGATTTGGGCAGTTCTTGCGTGGTTGTCCATACTTGCTCACAAGAACA
AGGGAAATCTTGAAGGTGACAATAAATTGGTGACGGTTGAAGACATTGTCCGCAAACACT
GGGCTACCTATGGCCGTCACTATTACACTCGTTACGACTATGAGAATGTAGATGCAGGTA
AAGCTAAGGAACTGATGGAGCATTTGGTCAAACTGCAATCTTCAATCCCTGAAGTCAACA
AGATGGTGAAAGGAATTCGTCCGGACGTGGCGAATGTATCCAGTGCAGATGAATTCGAGT
ACAAAGATCCAGTTGATGGCTCCATCTCCAAGCACCAGGGAATCCGTTACTTGTTTGAAG
ATGGTTCACGACTTGTCTTCCGTCTGTCTGGAACTGGCTCGGAAGGAGCAACCATCCGAC
TATACATTGAACAGTACGAGAAGGATGCTTCGAAAACCGGACGAGAGTCCCATGAAGCTC
TGTCTCCTCTGGTGGACATAGCTCTGAAGTTGTCCAAGATGGAGGAGTTCACTGGCCGAT
CAGCCCCCACCGTCATAACATAAAAAAAAGGCGGGTCAAGTGCAACGGTCTCAAATCATT
CACTTCTTTGTTTGCGTCTTTTGGGATGCTTTTCTTTCTTCTCATTATATGACGATGCTA
TGAATAATTTAGTCTCTGGGGGGGCTTTCATATTTCATGAGTTATCGTGAAGCTTATACT
TGGATTTGTCTTTCTCGGTTTTGTTATTTTACATGTATTACGTACTTACGTGATTAAGAT
TTGTTATTGCGGTTTTAATG

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 9

CO CL290Contig1 1271 9 25 U
GTTAAATCTTGATGGCTTATATAGAGAAGAAATGTGAAGTTTTAGAAGACGATTTAAGGA
AAAGCTACAGTTTTGGTTTGGGTTATAAAACGACAAACGAAAATAAACACAAAACTTGGG
GTGAAGACACAGCAGCATTCAATCACAAGAAGAACCTCCTCCTGCTCGTGTCCATTTCAG
GCTTATGAACCCATTCAAACTCTCCGCCTTTTGTGTCAAAGGTTCCATGCTGCAAAGTCA
CTAGCTTAAGCGTGAATTTTGGACCACATTCCTGAAGACGAGGCTTGACTCT*TCTTTAG
CAACACCATCTTTTCCTTTCGCACCACTTTGTTTGTCTTCCTTTACGTCGAATATGTAAC
GATGATGTCTGAAAAGTATAAAGTCACGCTGGTTATGGAACGTTACAACTCTCCTACCAC
GGAAGTTAGGTTCTTGAGGAAACAGTGACTGGAAAAACCTCCCAACACGGTTTCCTAGAC
GAGTTGTGAAGTTATTTAAAATCAGTTACGGTTCATGGCTTGTAGGGTTTCCATGATTCT
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GATAATCAGAGTTCGGGATCACCGACTGTAACTCCGATATAAACGCAGGTCCTCTAGTGG
AATTGAAACGACATGTAGTGATCAAGACCTTAGGAGTAACTTCACGTCTCAGGACAGGAT
TAAACTCATCAGCATCGATATCCGCAAACAATTCTTCATCATCAGGTCTGCAAACAGTCT
CATCAGCTTCTCTCGTATTCTCAATCGTCTTCGGAACCATCTTCTGTGGAGGCTCTTCGC
CAAGCTCGAGAGCTTGTTTCTCAGCGGCGTCACGAGCTTTGATCTTCTTCTGCTTCTCGA
CTTTCTTCTCGTGTTTCTGCTTCGCGTACACTTTGGCTCTTTTGTCTTTGTTCTTTATCA
TCGACGGCAGTATCACGTTCCTCCTCTCCGCCGTGTTGAAGATGGGTCTTCTGTTATCTT
CGGCTTCCATTTCCTCTCCGTCGCCGTCGCCCTTCTTCCTCTTGAAACCCATTCTCTTTT
TTTGATCGGATCTTTCCCTCTCGTTGGTTCGGTGGAAGCGGCAAGCTGAAGAAGAATAGA
GACGACGGGCC


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 15 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
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DS 

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GCTACAGTTTTGGTTTGGGTTATAAAACGACAAACGAAAATAAACACAAAACTTGGGGTG
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TATGAACCCATTCAAACTCTCCGCCTTTTGTGTCAAAGGTTCCATGCTGCAAAGTCACTA
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CACCATCTTTTCCTTTCGCACCACTTTGTTTGTCTTCCTTTACGTCGAATATGTAACGAT
GATGTCTGAAAAGTATAAAGTCACGCTGGTTATGGAACGTTACAACTCTCCTACCACGGA
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GATGATGTCTGAAAAGTATAAAGTCACGCTGGTTATGGAGCGTTACAACTCTCCTACCAC
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TAATATCCTTCCTTAGAACAAGATTTGACAATTTGAAATGAGCAGTAGGACCGTTTGGCA
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TATGAACCCATTCAAACTCTCCGCCTTTTGTGTCAAAGGTTCCATGCTGCAAAGTCACTA
GCTTAAGCGTGAATTTTGGACCGCATTCCTGAAGACGAGGCTTGACTCTCTCTTTAGCAA
CACCATCTTTTCCTTTCGCACCACTTTGTTTGTCTTCCTTTACGTCGAATATGTAACGAT
GATGTCTGAAAAGTATAAAGTCACGCTGGTTATGGAACGTTACAACTCTCCTACCACGGA
AGTTAGGTTCTTGAGGAAACAGTGACTGGAAAAACCTCCCAACACGGTTTCCTAGACGAG
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TATCCTTCCTTAGAACAAGATTTGACAATTTGAAATGAGCAGTAGGACCGTTTGGCAAAC
CAATGATAAGGAGCGCATCAGGCTCTCTGCGATTAGTATGAACTACAATAAGAGATGTAT
AATCCTTCTTCTTTGCGTACTCTACAATCTTCTTCAAATCATAAGTTCCTCTCTTGCGAT
AATCAGAGTTCGGGATCACCGACTGTAACTCCGATATAAACGCAG*TCCTCTAGTGGAAT
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ACCGTTTGGCAAACCAATGATAAGGAGCGCATCAGGCTCTCTGCGATTAGTATGAACTAC
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TCCTCTAGTGGAATTGAAACGACATGTAGTGATCAA

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AA
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GTTACAACTCTCCTACCACGGAAGTTAGGTTCTTGAGGAAACAGTGACTGGAAAAACCTC
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GTAGGGTTTCCATGATTCTTAATATCCTTCCTTAGAACAAGATTTGACAATTTGAAATGA
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TGAACTACAATAAGAGATGTATAATCCTTCTTCTTTGCGTACTCTACAATCTTCTTCAAA
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AACGCAGGTCCTCTAGTGGAATTGAAACGACATGTAGTGATCAAGACCTTAGGAGTAACT
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C

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DS 

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TAAAGTCACGCTGGTTATGGAACGTTACAACTCTCCTACCACGGAAGTTAGGTTCTTGAG
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TCTCAGCGGCGTC
C

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AGAGACCC

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TTGCGTACTCTACAATCTTCTTCAAATCATAAGTTCCTCTCTTGCGATAATCAGAGTTCG
GGATCACCGACTGTAACTCCGATATAAACGCAGGTCCTCTAGTGGAATTGAAACGACATG
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TATTCTCAATCGTCTTCGGAACCATCTTCTGTGGAGGCTCTTCGCCAAGCTCGAGAGCTT
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QA 1 716 1 716
DS 



AS 2 9

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TCTTGTTCTCTTGCCATCCGGTTGGGTTGACGACACTGGACATCTCAGTGTAGGCATAGA
CGACCTTAGGGTGGCTCATCCATGCCCTACCCAAGTAGATCCCCGTTCCAACTCCAGTAA
TCTTGCAATGCACGAATGAATACCCATTCTGCTGGTTCTCACTCTGTCGATTGTGTGCTG
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CTCTTCCGAAGATAAAATCATAGGTTCCCTCGATGTAACAGTCCTTGAAGAAATGGTTGC
CTATATCATCACAAAGAGTGTCTTGGAAGCCATAGAATCTGCAGTTGTAGAAAGCCGCTT
TATCGCCGTTGATCCTCATAGCGAGCGCTTGTCCTTGTGATCCTGCT


BQ
10 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D962JQ U 1
AF RS1DH38JQ U 1
AF RS1FP15JQ U 1
AF RS1FP15TF C 1
AF RS1AU08JQ U 1
BS 1 542 RS1AU08JQ
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AC
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AU08TF U 6
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AF RS1AG05JQ C 507
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ATCA

QA 1 615 1 615
DS 

RD RS1DH38TF 762 0 0
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AACTATG

QA 1 755 1 755
DS 

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TAACTCCGATTCCAGAAGACAAAGGCCAAGTCGAGGCATGGTTCAAGGCCAACGTTCAAC
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AGAGCATTCCGACAGGGAACACAAAGCGCGTGATCATCAAGTTGGCTCCTGGTGTATACC
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ACCATTTCTTCAAGGACTGTTACATCGAGGGAACCTATGATTTTATCT

QA 1 768 1 768
DS 

RD RS1AG05JQ 795 0 0
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TCTATGGTTTCCAAGACACTCTTTGTGATGATATAGGCAACCATTTCTTCAAGGACTGTT
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AATTGCACGCTGTTGGAGATGGATTAAGAGTGATCTACTTGGGTAGGGCATGGATGAGCC
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AAGAGAACAAGAACCGCGCCCATGACAAGACGGTGTTCTATGGAGAATACATGTGTACGG
GACCAGGATCACACAAAGAGAAGAGAGTGGCCCACACACAAGACATTGACAAAAACGAAG
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CTTACTAAACCACACCCATCTCATAACTATTATTCTATACTTTTGACTGAAAATACATGT
GTATAAATGTATGTCTTGCATGCATTATTTCTTCTTGAATTTATTTCGAAAGTCCTCTCT
TTCTGTATGTAATGGAAGAGTAGAGACTTGTGTGATTTTGGTTGCACTATAATAAAATAC
ATCAACATTCATAAG

QA 1 795 1 795
DS 



AS 1 10

CO CL292Contig1 592 10 7 U
GGAATAAACTCATCCCATATTTAATCAAAAAAAGAACAGCCCCTAAAAATGGCAAGCTTA
TCAGCTATTGCAATTTCCCTCCGCAACAAGGCACTCATCACTCCAAGAGTTTTCTCTTCC
GTCCCGACAAGACTCATCCATGGGAGTACGATGAAAGAAGCTTCCGTCTGTGACAAAGCC
ACCGAGGCTCAACAAAAGGTGGCCAAGAAGGCGGACGAAGGAGCACAAACCATCTCCGAG
GCCGCCGGTAACTTGAAGGATAAGGCGAAGAACACTGCAGAGGAGGCCTGGGATAAGGTG
AAGGACACTACAGAAAAGATCAAAGATACCGTCACAGGAAAAACTGAGGAAACCAAGGAG
TCTATCAAAGCCAAAGCCAAGACCGTCGAGAAAAGCATGAATACCAAGAACCTCAAATAA
TAAACATACTGTCAGTTTTAAGTTATCCATAAATCAAATAATTAATTTTAAGAAACAAAT
CAAATAAAATGTACTTACGTAATGTATGGAGCTTGGTTCAGTATGTTTACACCTGGTTTT
GTATTAACAAAATAAATTACTTTATCAGGTAAGAATAAATCTGGGGTTATCG


BQ
10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1EY95JQ C 1
AF RS1EY95TF U 1
AF RS1DH04JQ C 367
AF RS1DH04TF U 4
AF RS1CJ82TF U 4
AF RS1FW92TF U 10
AF RS1F953TF U 5
AF RS1EG32JQ C 358
AF RS1EG32TF U 358
AF RS1F118TF U 358
BS 1 5 RS1EY95JQ
BS 6 323 RS1EY95TF
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BS 325 500 RS1EY95TF
BS 501 564 RS1CJ82TF
BS 565 574 RS1F953TF
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RD RS1EY95JQ 500 0 0
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TCAGCTATTGCAATTTCCCTCCGCAACAAGGCACTCATCACTCCAAGAGTTTTTTCTTCC
GTCCCGACAAGACTCATCCATGGGAGTACGATGAAAGAAGCTTCCGTCTGTGACAAAGCC
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GCCGCCGGTAACTTGAAGGATAAGGCGAAGAACACTGCAGAGGAGGCCTGGGATAAGGTG
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TCTATCAAAGCCAAAGCCAAGACCGTCGAGAAAAGCATGAATACCAAGAACCTCAAATAA
TAAACATACTGTCAGTTTTAAGTTATCCATAAATCAAATAATTAATTTTAAGAAACAAAT
CAAATAAAATGTACTTACGT

QA 1 500 1 500
DS 

RD RS1EY95TF 500 0 0
GGAAT
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TATTGCAATTTCCCTCCGCAACAAGGCACTCATCACTCCAAGAGTTTTCTCTTCCGTCCC
GACAAGACTCATCCATGGGAGTACGATGAAAGAAGCTTCCGTCTGTGACAAAGCCACCGA
GGCTCAACAAAAGGTGGCCAAGAAGGCGGACGAAGGAGCACAAACCATCTCCGAGGCCGC
CGGTAACTTGAAGGATAAGGCGAAGAACACTGCAGAGGAGGCCTGGGATAAGGTGAAGGA
CACTACAGAAAAGATCAA*GATACCGTCACAGGAAAAACTGAGGAAACCAAGGAGTCTAT
CAAAGCCAAAGCCAAGACCGTCGAGAAAAGCATGAATACCAAGAACCTCAAATAATAAAC
ATACTGTCAGTTTTAAGTTATCCATAAATCAAATAATTAATTTTAAGAAACAAATCAAAT
AAAATGTACTTACGT

QA 6 500 6 500
DS 

RD RS1DH04JQ 149 0 0
AAAGCCAAAGCCAAGCCCGTCGAGAAAAGCATGAATACCAAGAACCTCAAATAATAAACA
TACTGTCAGTTTTAAGTTATCCATAAATCAAATAATTAATTTTAAGAAACAAATCAAATA
AAATGTACTTACGTAATGTATGGAGCTTG

QA 1 149 1 149
DS 

RD RS1DH04TF 512 0 0
GG
AAACTCATCCCATATTTAATCAAAAAAAGAACAGCCCCTAAAAATGGCAAGCTTATCAGC
TATTGCAATTTCCCTCCGCAACAAGGCACTCATCACTCCAAGAGTTTTCTCTTCCGTCCC
GACAAGACTCATCCATGGGAGTACGATGAAAGAAGCTTCCGTCTGTGACAAAGCCACCGA
GGCTCAACAAAAGGTGGCCAAGAAGGCGGACGAAGGAGCACAAACCATCTCCGAGGCCGC
CGGTAACTTGAAGGATAAGGCGAAGAACACTGCAGAGGAGGCCTGGGATAAGGTGAAGGA
CACTACAGAAAAGATCAAAGATACCGTCACAGGAAAAACTGAGGAAACCAAGGAGTCTAT
CAAAGCCAAAGCCAAGACCGTCGAGAAAAGCATGAATACCAAGAACCTCAAATAATAAAC
ATACTGTCAGTTTTAAGTTATCCATAAATCAAATAATTAATTTTAAGAAACAAATCAAAT
AAAATGTACTTACGTAATGTATGGAGCTTG

QA 3 512 3 512
DS 

RD RS1CJ82TF 561 0 0
GG
AAACTCATCCCATATTTAATCAAAAAAAGAACAGCCCCTAAAAATGGCAAGCTTATCAGC
TATTGCAATTTCCCTCCGCAACAAGGCACTCATCACTCCAAGAGTTTTCTCTTCCGTCCC
GACAAGACTCATCCATGGGAGTACGATGAAAGAAGCTTCCGTCTGTGACAAAGCCACCGA
GGCTCAACAAAAGGTGGCCAAGAAGGCGGACGAAGGAGCACAAACCATCTCCGAGGCCGC
CGGTAACTTGAAGGATAAGGCGAAGAACACTGCAGAGGAGGCCTGGGATAAGGTGAAGGA
CACTACAGAAAAGATCAAAGATACCGTCACAGGAAAAACTGAGGAAACCAAGGAGTCTAT
CAAAGCCAAAGCCAAGACCGTCGAGAAAAGCATGAATACCAAGAACCTCAAATAATAAAC
ATACTGTCAGTTTTAAGTTATCCATAAATCAAATAATTAATTTTAAGAAACAAATCAAAT
AAAATGTACTTACGTAATGTATGGAGCTTGGTTCAGTATGTTTACACCTGGTTTTGTATT
AACAAAATAAATTACTTTA

QA 3 561 3 561
DS 

RD RS1FW92TF 543 0 0
GG
ATCCCATATTTAATCAAAAAAAGAACAGCCCCTAAAAATGGCAAGCTTATCAGCTATTGC
AATTTCCCTCCGCAACAAGGCACTCATCACTCCAAGAGTTTTCTCTTCCGTCCCGACAAG
ACTCATCCATGGGAGTACGATGAAAGAAGCTTCCGTCTGTGACAAAGCCACCGAGGCTCA
ACAAAAGGTGGCCAAGAAGGCGGACGAAGGAGCACAAACCATCTCCGAGGCCGCCGGTAA
CTTGAAGGATAAGGCGAAGAACACTGCAGAGGAGGCCTGGGATAAGGTGAAGGACACTAC
AGAAAAGATCAAAGATACCGTCACAGGAAAAACTGAGGAAACCAAGGAGTCTATCAAAGC
CAAAGCCAAGACCGTCGAGAAAAGCATGAATACCAAGAACCTCAAATAATAAACATACTG
TCAGTTTTAAGTTATCCATAAATCAAATAATTAATTTTAAGAAACAAATCAAATAAAATG
TACTTACGTAATGTATGGAGCTTGGTTCAGTATGTTTACACCTGGTTTTGTATTAACAAA
A

QA 3 543 3 543
DS 

RD RS1F953TF 570 0 0
G
AAACTCATCCCATATTTAATCAAAAAAAGAACAGCCCCTAAAAATGGCAAGCTTATCAGC
TATTGCAATTTCCCTCCGCAACAAGGCACTCATCACTCCAAGAGTTTTCTCTTCCGTCCC
GACAAGACTCATCCATGGGAGTACGATGAAAGAAGCTTCCGTCTGTGACAAAGCCACCGA
GGCTCAACAAAAGGTGGCCAAGAAGGCGGACGAAGGAGCACAAACCATCTCCGAGGCCGC
CGGTAACTTGAAGGATAAGGCGAAGAACACTGCAGAGGAGGCCTGGGATAAGGTGAAGGA
CACTACAGAAAAGATCAAAGATACCGTCACAGGAAAAACTGAGGAAACCAAGGAGTCTAT
CAAAGCCAAAGCCAAGACCGTCGAGAAAAGCATGAATACCAAGAACCTCAAATAATAAAC
ATACTGTCAGTTTTAAGTTATCCATAAATCAAATAATTAATTTTAAGAAACAAATCAAAT
AAAATGTACTTACGTAATGTATGGAGCTTGGTTCAGTATGTTTACGCCTGGTTTTGTATT
AACAAAATAAATTACTTTATCAGGTAAGA

QA 2 570 2 570
DS 

RD RS1EG32JQ 235 0 0
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TAATAAACATACTGTCAGTTTTAAGTTATCCATAAATCAAATAATTAATTTTAAGAAACA
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TTTGTATTAACAAAATAAATTACTTTATCAGGTAAGAATAAATCTGGGGTTATCG

QA 1 235 1 235
DS 

RD RS1EG32TF 235 0 0
GAGTCTATCAAAGCCAAAGCCAAGACCGTCGAGAAAAGCATGAATACCAAGAACCTCAAA
TAATAAACATACTGTCAGTTTTAAGTTATCCATAAATCAAATAATTAATTTTAAGAAACA
AATCAAATAAAATGTACTTACGTAATGTATGGAGCTTGGTTCAGTATGTTTACACCTGGT
TTTGTATTAACAAAATAAATTACTTTATCAGGTAAGAATAAATCTGGGGTTATCG

QA 1 235 1 235
DS 

RD RS1F118TF 235 0 0
GAGTCTATCAAAGCCAAAGCCAAGACCGTCGAGAAAAGCATGAATACCAAGAACCTCAAA
TAATAAACATACTGTCAGTTTTAAGTTATCCATAAATCAAATAATTAATTTTAAGAAACA
AATCAAATAAAATGTACTTACGTAATGTATGGAGCTTGGTTCAGTATGTTTACACCTGGT
TTTGTATTAACAAAATAAATTACTTTATCAGGTAAGAATAAATCTGGGGTTATCG

QA 1 235 1 235
DS 



AS 1 10

CO CL293Contig1 744 10 23 U
GGCTCGTTATTTCCTCCCAAGAACATCTCAAACATTTTTATTCTTCATTCAATATTTGAA
CCCCCCACGCACACTCCTATAGTCATATATCCTCATAAACCCTAAACCCTACCTAGCTTC
AACAACTATATTTTCCAAATCCAAGAAAAAGGGTTAGATTCTTCATCAATGGCCAAAGTT
GGGAAGCTGACAAAGCTCAAGTCGGCGATAAAGAAATGGCCTTCATTTGCCAAGAACCAC
CACCACTCATCCTCCTCAGCCGCCGTATCCGATGAGCTCTCAGAGGACAACAATCTCCAT
GTTGTTTATGTTGGTCAGACTCGAAGACCTTACATGCTTAGAACGGACATCATCTCTCAC
CCACTCTTTCAAGAACTGGTGGATCGGTCTTCTAGATCTGCAGAACAAGAACGTGAGATT
GTTGTAGCTTGTGAAGTTGTGTTATTCGAGCACTTGTTGTGGATGCTTAAGAGTGGTCAA
GAAGGAGGATCCGTTGAAGAATTGGCGGAGTTCTATACTTGTTGACATTGACCT*ATCGA
TTTTTACGCATTTATTTCGTATGATATATATGTACTTTCTATGGGTGTTATCTTTGTTGT
TGCTACTGATTTGTATTTTTGACTCGATCCGGTGTGTAACCAAAACGTGATCTCGTAAAC
CATATCATTTGCTTTGTTTTTCTTTTTTCGAGCAATTTTATGATAATGATGAGCATGTGT
AGCTTCTTACTTTGTTACTCTACC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1B533JQ C 40
AF RS1B533TF U 40
AF RS1E369TF U 35
AF RS1D729JQ C 250
AF RS1D729TF U 250
AF RS1EI81TF U 35
AF RS1BN23JQ C 1
AF RS1FL27TF U 1
AF RS1BN23TF U 1
AF RS1FL27JQ C 1
BS 1 34 RS1FL27TF
BS 35 39 RS1E369TF
BS 40 62 RS1B533TF
BS 63 63 RS1E369TF
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BS 82 82 RS1E369TF
BS 83 153 RS1B533TF
BS 154 154 RS1E369TF
BS 155 163 RS1B533TF
BS 164 164 RS1FL27TF
BS 165 250 RS1B533TF
BS 251 340 RS1D729TF
BS 341 341 RS1B533TF
BS 342 343 RS1D729TF
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BS 345 441 RS1D729TF
BS 442 442 RS1B533TF
BS 443 534 RS1D729TF
BS 535 535 RS1E369TF
BS 536 573 RS1D729TF
BS 574 574 RS1E369TF
BS 575 709 RS1D729TF
BS 710 744 RS1FL27TF

RD RS1B533JQ 616 0 0
ATTCTTCATTCAATATTTGAACCTCCCACGCACACTCCTATAATCATATATCCTCATAAA
CCCTAAACCCTACCTAGCTTCAACAACTATATTTTCCAAATCCAAGAAAAAGGGCTAGAT
TCTTTATCAATGGCCAAAGTTGGGAAGCTGACAAAGCTCAAGTCGGCGATAAAGAAATGG
CCTTCATTTGCCAAGAACCACCACCACTCATCCTCCTCAGCCACCGTATCCGATGAGCTC
TCAGAGGACAACAATCTCCATGTTGTTTATGTTGGTCAGACTCGAAGACCTTACATGCTT
AGAACGGACATCATCTCTCACCCACTCTTTCAAGAACTGGTGGATCGGTCTTCTAGATCT
GCAGAACAAGAACGTGAGATTGTTGTAGCTTGTGAAGTTGTGTTATTCGAGCACTTGTTG
TGGATGCTTAAGAGTGGTCAAGAAGGAGGATCCGTTGAAGAATTGGCGGAGTTCTATACT
TGTTGACATTGACCTTATCGATTTTTACGCATTTATTTCGTATGATATATATGTGCTTTC
TATGGGTGTTATCTTTGTTGTTGCTACTGATTTGTATTTTTGACTCGATCCGGTGTGTAA
CCAAAACGTGATCTCG

QA 1 616 1 616
DS 

RD RS1B533TF 616 0 0
ATTCTTCATTCAATATTTGAACCTCCCACGCACACTCCTATAATCATATATCCTCATAAA
CCCTAAACCCTACCTAGCTTCAACAACTATATTTTCCAAATCCAAGAAAAAGGGCTAGAT
TCTTTATCAATGGCCAAAGTTGGGAAGCTGACAAAGCTCAAGTCGGCGATAAAGAAATGG
CCTTCATTTGCCAAGAACCACCACCACTCATCCTCCTCAGCCACCGTATCCGATGAGCTC
TCAGAGGACAACAATCTCCATGTTGTTTATGTTGGTCAGACTCGAAGACCTTACATGCTT
AGAACGGACATCATCTCTCACCCACTCTTTCAAGAACTGGTGGATCGGTCTTCTAGATCT
GCAGAACAAGAACGTGAGATTGTTGTAGCTTGTGAAGTTGTGTTATTCGAGCACTTGTTG
TGGATGCTTAAGAGTGGTCAAGAAGGAGGATCCGTTGAAGAATTGGCGGAGTTCTATACT
TGTTGACATTGACCTTATCGATTTTTACGCATTTATTTCGTATGATATATATGTGCTTTC
TATGGGTGTTATCTTTGTTGTTGCTACTGATTTGTATTTTTGACTCGATCCGGTGTGTAA
CCAAAACGTGATCTCG

QA 1 616 1 616
DS 

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ATAAACCCTAAACCCTACCTAGCTTCAACAACTATATTTTCCAAATCCAAGAAAAAGGGT
TAGATTCTTTATCAATGGCCAAAGTTGGGAAGCTGACAAAGCTCAAGTCGGCGATAAAGA
AATGGCCTTCATTTGCCAAGAACCACCACCACTCATCCTCCTCAGCCGCCGTATCCGATG
AGCTCTCAGAGGACAACAATCTCCATGTTGTTCATGTTGGTCAGACTCGAAGACCTTACA
TGCTTAGAACGGACATCATCTCTCACCCACTCTTTCAAGAACTGGTGGATCGGTCTTCTA
GATCTGCAGAACAAGAACGTGAGATTGTTGTAGCTTGTGAAGTTGTGTTATTCGAGCACT
TGTTGTGGATGCTTAAGAGTGGTCAAGAAGGAGGATCCGTTGAAGAATTGGCGGAGTTCT
ATACTTGTTGACATTGACCT*ATCGATTTTTACGCATTTATTTCGTATGATATATATGTA
CTTTCTATGGGTGTTATCTTTGTTGTTGCTACTGATTTGTATTTTTGACTCGATCCGGTG
TGTAACCAAAACGTGATCT

QA 1 619 1 619
DS 

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G
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TTGGTCAGACTCGAAGACCTTACATGCTTATAATGGACATCATCTCTCACCCACTCTTTC
AAGAACTGGTGGATCGGTCTTCTAGATCTGCAGAACAAGAACGTGAGATTGTTGTAGCTT
GTGAAGTTGTGCTATTCGAGCACTTGTTGTGGATGCTTAAGAGTGGTCAAGAAGGAGGAT
CCGTTGAAGAATTGGCGGAGTTCTATACTTGTTGACATTGACCTTATCGATTTTTACGCA
TTTATTTCGTATGATATATATGTGCTTTCTATGGGTGTTATCTTTGTTGTTGCTACTGAT
TTGTATTTTTGACTCGATCCGGTGTGTAACCAAAACGTGATCTCGTAAACCATATCATTT
GCTTTGTTTTTCTTTTTTCGAGCAATTTTATGATAATGA

QA 2 460 2 460
DS 

RD RS1D729TF 460 0 0
G
CCTCCTCAGCCGCCGTATCCGATGAGCTCTCAGAGGACAACAATCTCCATGTTGTTTATG
TTGGTCAGACTCGAAGACCTTACATGCTTATAATGGACATCATCTCTCACCCACTCTTTC
AAGAACTGGTGGATCGGTCTTCTAGATCTGCAGAACAAGAACGTGAGATTGTTGTAGCTT
GTGAAGTTGTGCTATTCGAGCACTTGTTGTGGATGCTTAAGAGTGGTCAAGAAGGAGGAT
CCGTTGAAGAATTGGCGGAGTTCTATACTTGTTGACATTGACCTTATCGATTTTTACGCA
TTTATTTCGTATGATATATATGTGCTTTCTATGGGTGTTATCTTTGTTGTTGCTACTGAT
TTGTATTTTTGACTCGATCCGGTGTGTAACCAAAACGTGATCTCGTAAACCATATCATTT
GCTTTGTTTTTCTTTTTTCGAGCAATTTTATGATAATGA

QA 2 460 2 460
DS 

RD RS1EI81TF 642 0 0
TTTTTATTCTTCATCCAATATTTGAACCCCCCACGCACACTCCTATAGTCATATATCCTC
ATAAACCCTAAACCCTACCTAGCTTCAACAACTATATTTTCCAAATCCAAGAAAAAGGGT
TAGATTCTTTATCAATGGCCAAAGTTGGGAAGCTGACAAAGCTCAAGTCGGCGATAAAGA
AATGGCCTTCATTTGCCAAGAACCACCACCACTCATCCTCCTCAGCCGCCGTATCCGATG
AGCTCTCAGAGGACAACAATCTCCATGTTGTTTATGTTGGTCAGACTCGAAGACCTTACA
TGCTTAGAACGGACATCATCTCTCACCCACCCTTTCAAGAACTGGTGGATCGGTCTTCTA
GATCTGCGGAACAAGAACGTGAGATTGTTGTAGCTTGTGAAGTTGTGTTATTCGAGCACT
TGTTGTGGATGCTTAAGAGTGGTCAATAAGGAGGATCCGTTGAAGAATTGGCGGAGTTCT
ATACTTGTTGACATTGACCT*ATCGATTTTTACGCATTTATTTCGTATGATATATATGTA
CTTTCTATGGGTGTTATCTTTGTTGTTGCTACTGATTTGTATTTTTGACTCGATCCGGTG
TGTAACCAAA*CGTGATCTCGTAGACCATATCATTTGCTTTG

QA 1 642 1 642
DS 

RD RS1BN23JQ 744 0 0
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GGGAAGCTGACAAAGCTCAAGTCGGCGATAAAGAAATGGCCTTCATTTGCCAAGAACCAC
CACCACTCATCCTCCTCAGCCGCCGTATCCGATGAGCTCTCAGAGGACAACAATCTCCAT
GTTGTTTATGTTGGTCAGACTCGAAGACCTTACATGCTTAGAACGGACATCATCTCTCAC
CCACTCTTTCAAGAACTGGTGGATCGGTCTTCTAGATCTGCAGAACAAGAACGTGAGATT
GTTGTAGCTTGTGAAGTTGTGTTATTCGAGCACTTGTTGTGGATGCTTAAGAGTGGTCAA
GAAGGAGGATCCGTTGAAGAATTGGCGGAGTTCTATACTTGTTGACATTGACCT*ATCGA
TTTTTACGCATTTATTTCGTATGATATATATGTACTTTCTATGGGTGTTATCTTTGTCGT
TGCTACTGATTTGTATTTTTGACTCGATCCGGTGTGTAACCAAAACGTGATCTCGTAAAC
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AGCTTCTTACTTTGTTACTCTACC

QA 1 744 1 744
DS 

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AACAACTATATTTTCCAAATCCAAGAAAAAGGGTTAGATTCTTCATCAATGGCCAAAGTT
GGGAAGCTGACAAAGCTCAAGTCGGCGATAAAGAAATGGCCTTCATTTGCCAAGAACCAC
CACCACTCATCCTCCTCAGCCGCCGTATCCGATGAGCTCTCAGAGGACAACAATCTCCAT
GTTGTTTATGTTGGTCAGACTCGAAGACCTTACATGCTTAGAACGGACATCATCTCTCAC
CCACTCTTTCAAGAACTGGTGGATCGGTCTTCTAGATCTGCAGAACAAGAACGTGAGATT
GTTGTAGCTTGTGAAGTTGTGTTATTCGAGCACTTGTTGTGGATGCTTAAGAGTGGTCAA
GAAGGAGGATCCGTTGAAGAATTGGCGGAGTTCTATACTTGTTGACATTGACCT*ATCGA
TTTTTACGCATTTATTTCGTATGATATATATGTACTTTCTATGGGTGTTATCTTTGTCGT
TGCTACTGATTTGTATTTTTGACTCGATCCGGTGTGTAACCAAAACGTGATCTCGTAAAC
CATATCATTTGCTTTGTTTTTCTTTTT*CGAGCAATTTTATGATAATGATGAGCATGTGT
AGCTTCTTACTTTGTTACTCTACC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1BN23TF 744 0 0
GGCTCGTTATTTCCTCCCAAGAACATCTCAAACATTTTTATTCTTCATTCAATATTTGAA
CCCCCCACGCACACTCCTATAGTCATATATCCTCATAAACCCTAAACCCTACCTAGCTTC
AACAACTATATTTTCCAAATCCAAGAAAAAGGGTTAGATTCTTCATCAATGGCCAAAGTT
GGGAAGCTGACAAAGCTCAAGTCGGCGATAAAGAAATGGCCTTCATTTGCCAAGAACCAC
CACCACTCATCCTCCTCAGCCGCCGTATCCGATGAGCTCTCAGAGGACAACAATCTCCAT
GTTGTTTATGTTGGTCAGACTCGAAGACCTTACATGCTTAGAACGGACATCATCTCTCAC
CCACTCTTTCAAGAACTGGTGGATCGGTCTTCTAGATCTGCAGAACAAGAACGTGAGATT
GTTGTAGCTTGTGAAGTTGTGTTATTCGAGCACTTGTTGTGGATGCTTAAGAGTGGTCAA
GAAGGAGGATCCGTTGAAGAATTGGCGGAGTTCTATACTTGTTGACATTGACCT*ATCGA
TTTTTACGCATTTATTTCGTATGATATATATGTACTTTCTATGGGTGTTATCTTTGTCGT
TGCTACTGATTTGTATTTTTGACTCGATCCGGTGTGTAACCAAAACGTGATCTCGTAAAC
CATATCATTTGCTTTGTTTTTCTTTTTTCGAGCAATTTTATGATAATGATGAGCATGTGT
AGCTTCTTACTTTGTTACTCTACC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1FL27JQ 744 0 0
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AACAACTATATTTTCCAAATCCAAGAAAAAGGGTTAGATTCTTCATCAATGGCCAAAGTT
GGGAAGCTGACAAAGCTCAAGTCGGCGATAAAGAAATGGCCTTCATTTGCCAAGAACCAC
CACCACTCATCCTCCTCAGCCGCCGTATCCGATGAGCTCTCAGAGGACAACAATCTCCAT
GTTGTTTATGTTGGTCAGACTCGAAGACCTTACATGCTTAGAACGGACATCATCTCTCAC
CCACTCTTTCAAGAACTGGTGGATCGGTCTTCTAGATCTGCAGAACAAGAACGTGAGATT
GTTGTAGCTTGTGAAGTTGTGTTATTCGAGCACTTGTTGTGGATGCTTAAGAGTGGTCAA
GAAGGAGGATCCGTTGAAGAATTGGCGGAGTTCTATACTTGTTGACATTGACCT*ATCGA
TTTTTACGCATTTATTTCGTATGATATATATGTACTTTCTATGGGTGTTATCTTTGTCGT
TGCTACTGATTTGTATTTTTGACTCGATCCGGTGTGTAACCAAAACGTGATCTCGTAAAC
CATATCATTTGCTTTGTTTTTCTTTTTTCGAGCAATTTTATGATAATGATGAGCATGTGT
AGCTTCTTACTTTGTTACTCTACC

QA 1 744 1 744
DS 



AS 3 6

CO CL294Contig1 855 2 3 U
CATATAACATTGGCCACTGCAAAAAGATATTGAGATTTTCAAAATACCAATGCATAGGCC
ATCAAGCTGCGTAGTCAGGCATTGCTTTCTTGAGGAATGTTATAGGTTGCGACTCCTCTG
GGGCTAATCGGTCAAAAGGAATGTAGTTCTCCTCTTTGTCATAGACATGAACTAACATGT
TGGTTTTGGCGTGATGGCGGCCATGCTTAAACCTCCATGGCTCATACGGGTATACAAGAG
GTAGAAATGCTAGAGTACCCACAATGTCTTCAACCAATTTGTTCTTTGAAAATGATTTAT
GAGCGCAATCATGCCCTATCACAAAGAACCCTGTAACTGCAGTTCCTGTCCAAGCCCAAG
CCAACGGAAGCATATACCAAGAGCGCTTTCGCAATCATGAAGAGCCCCAAAGCGTAGGAC
GTCACAGATACCAACACAGACTTCCAAGCCTTCACATCATCAATCTCAAACACCTCTTTG
GGAAGAGTATCCATGATATCTTTTAAAGTAACATTATCAGGAAGATCTTGTCCAATTTGT
TTGAACCCATAGCTTTCTGCTAACTGTTCCCTCTCTTCCGCACTGTCAGCTGAAGGAGGT
GCGGCTGGAGCAGCCACCGCTTTTATACATCCAACCCTTTTCTTTGCAGAAACCAAGAAC
GTTCTCCTTCTATGCGCATGACCTCTTAACAGAAGATCAATAGGTCTCACAGCATACACA
CCTGGAGAAAGACGAGCAGGAGCAACTTGAGGAGCCCTAGGGAGACATTGTTGTGGGCCC
GTGAAGGCGAATAGAGAATCAGCAATTCTCGAAGCCATGGAAGAGGAGGGGGCGCACAAG
TTGGAGAAGCCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AQ68JQ U 159
AF RS1AQ68TFB C 1
BS 1 158 RS1AQ68TFB
BS 159 441 RS1AQ68JQ
BS 442 855 RS1AQ68TFB

RD RS1AQ68JQ 283 0 0
TCATAGACATGAACTAACATGTTGGTTTTGGCGTGATGGCGGCCATGCTTAAACCTCCAT
GGCTCATACGGGTATACAAGAGGTAGAAATGCTAGAGTACCCACAATGTCTTCAACCAAT
TTGTTCTTTGAAAATGATTTATGAGCGCAATCATGCCCTATCACAAAGAACCCTGTAACT
GCAGTTCCTGTCCAAGCCCAAGCCAACGGAAGCATATACCAAGAGCGCTTTCGCAATCAT
GAAGAGCCCCAAAGCGTAGGACGTCACAGATACCAACACAGAC

QA 1 283 1 283
DS 

RD RS1AQ68TFB 855 0 0
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ATCAAGCTGCGTAGTCAGGCATTGCTTTCTTGAGGAATGTTATAGGTTGCGACTCCTCTG
GGGCTAATCGGTCAAAAGGAATGTAGTTCTCCTCTTTGTCATAGACATGAACTAACATGT
TGGTTTTGGCGTGATGGCGGCCATGCTTAAACCTCCATGGCTCATACGGGTATACAAGAG
GTAGAAATGCTAGAGTACCCACAATGTCTTCAACCAATTTGTTCTTTGAAAATGATTTAT
GAGCGCAATCATGCCCTATCACAAAGAACCCTGTAACTGCAGTTCCTGTCCAAGCCCAAG
CCAACGGAAGCATATACCAAG*GCGCTTTCGCAATCATGAAGAGCCCCAAAGCGTAGGAC
GTCACAGATACCAACACAGACTTCCAAGCCTTCACATCATCAATCTCAAACACCTCTTTG
GGAAGAGTATCCATGATATCTTTTAAAGTAACATTATCAGGAAGATCTTGTCCAATTTGT
TTGAACCCATAGCTTTCTGCTAACTGTTCCCTCTCTTCCGCACTGTCAGCTGAAGGAGGT
GCGGCTGGAGCAGCCACCGCTTTTATACATCCAACCCTTTTCTTTGCAGAAACCAAGAAC
GTTCTCCTTCTATGCGCATGACCTCTTAACAGAAGATCAATAGGTCTCACAGCATACACA
CCTGGAGAAAGACGAGCAGGAGCAACTTGAGGAGCCCTAGGGAGACATTGTTGTGGGCCC
GTGAAGGCGAATAGAGAATCAGCAATTCTCGAAGCCATGGAAGAGGAGGGGGCGCACAAG
TTGGAGAAGCCACCC

QA 1 855 1 855
DS 



CO CL294Contig2 593 2 2 U
GTGCCGTGGTTGGGCTATCACTTTTGGATGAGCACGTTCACGATGGTTCATCATACAGCT
CCACACATTCCTTTCAAGCCTGCGGATGAGTGGAACGCGGCTCAGGCACAGCTTAACGGA
ACTGTTCATTGTGATTATCCTAGTTGGATTGAGATTTTGTGCCATGATATCAATGTACAC
ATCCCACATCACCTTAGCCCAATGATACCGAGCTACAATCTCCGTGCGGCTCATGAGTCT
ATTCAAGAGAACTGGGGAAAGTATACAAACTTGGCTACATGGAACTGGCGCTTGATGAAG
ACAATAATGACTGTGTGCCATGTCTATGACAAAGAGGAGAACTACATTCCTTTTGACCGA
TTAGCCCCAGAGGAGTCGCAGCCGATAACATTCCTCAAGAAAGCAATGCCTGACTACGCA
GCTTGATGGCCTATGCATTGGTCTTTTAAAAAATCTCAATATCTTTTTTTGCAGTGGCCA
ATGTTATATGTAAGATTCTCCAACGTTTCACCAAACGCTTTATACTGTATCTTATTCCGA
AACTTATCAGCATAGAGTAAACTAATTGCAAGTCCTTGATCAGTTTCTTAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GC91TF U 1
AF RS1DV84TF U 367
BS 1 567 RS1GC91TF
BS 568 593 RS1DV84TF

RD RS1GC91TF 567 0 0
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CCACACATTCCTTTCAAGCCTGCGGATGAGTGGAACGCGGCTCAGGCACAGCTTAACGGA
ACTGTTCATTGTGATTATCCTAGTTGGATTGAGATTTTGTGCCATGATATCAATGTACAC
ATCCCACATCACCTTAGCCCAATGATACCGAGCTACAATCTCCGTGCGGCTCATGAGTCT
ATTCAAGAGAACTGGGGAAAGTATACAAACTTGGCTACATGGAACTGGCGCTTGATGAAG
ACAATAATGACTGTGTGCCATGTCTATGACAAAGAGGAGAACTACATTCCTTTTGACCGA
TTAGCCCCAGAGGAGTCGCAGCCGATAACATTCCTCAAGAAAGCAATGCCTGACTACGCA
GCTTGATGGCCTATGCATTGGTCTTTTAAAAAATCTCAATATCTTTTTTTGCAGTGGCCA
ATGTTATATGTAAGATTCTCCAACGTTTCACCAAACGCTTTATACTGTATCTTATTCCGA
AACTTATCAGCATAGAGTAAACTAATT

QA 1 567 1 567
DS 

RD RS1DV84TF 227 0 0
G
CAGAGGAGTCGCAGCCGATAACATTCCTCAAGAAAGCAATGCCTGACTACGCAGCTTGAT
GGCCTATGCATTGGTCTTTTAAAAAATCTCAATATCTTTTTTTGCAGTGGCCAATGTTAT
ATGTAAGATTCTCCAACGTTTCACCAAACGCTTTATACTGTATCTTATTCCGAAACTTAT
CAGCATAGAGTAAACTAATTGCAAGTCCTTGATCAGTTTCTTAGCC

QA 2 227 2 227
DS 



CO CL294Contig3 754 2 27 U
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AACATTAGCAGAGAAACTCCTGTGGCTTCTCCAACTTGTGCGCCCCCTCTTCCATGGCTT
CGAGAATTGCTGATTCTCTATTCGCCTTCACGGGCCCACAACAATGTCTCCCTAGGGCTC
CTCAAGTTGCTCCTGCTCGTATTTCTCCAGGTGTGTATGCTGTGAGACCGATTGATCTTC
TGTTAAGAGGTCATACGCATAGAAGGAGAACGTTCTTGGTTCCTGCAAAGAAAAGGGTTG
GATGTATAAAAGCGGTGGCTGCTCCAGCCGCACCTCCTTCAGCTGACAGTGCAGAAGAGA
GGGAACAGTTAGCAGAAAGCTATGGGTTCAAACAAATTGGACAAGATCTTCCTGATAATG
TCACTTTAAAAGATATCATGGATACACTTCCCAAAGAGGTGTTTGAGATTGATGATGTCA
AAGCTTGGAAGTCTGTGTTGGTATCTGTGACATCCTACGCTTTAGGGCTCTTCATGATCG
CAAAAGCCCCTTGGTATCTGCTTCCGTTGGCTTGGGCTTGGACAGGAACTGCAGTTACAG
GGTTCTTTGTGATAGGACATGATTGTGCTCATAAATCATTTTCCAAGAACAAATTGGTTG
AAGACATTGTGGGTACTCTAGCATTCCTACCTCTTGTATACCCCTATGAGCCATGGAGAT
TTAAGCACGACCGTCATCACGCCAAACCAACATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GG48TF U 1
AF RS1EY29TF U 51
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AAGACATTGTGGGTACTCTAGCATTTCTACCTCTTGTATACCCGTATGAGCCATGGGGGT
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QA 1 754 1 754
DS 

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TTAAGAGGTCATGCGCATAGAAGGAGAACGTTCTTGGTTCCTGCAAAGAAAAGGGTTGGA
TGTATAAAAGCGGTGGCTGCTC*AGCCGCACCTCCTTCAGCTGACAGTGCGGAAGAGAGG
GAGCAGTTAGCAGAAAGCTATGGGTTCAAACAAATTGGACAAGATCTTCCTGATAATGTC
ACTTTAAAAGATATCATGGATACACTTCCCAAAGAGGTGTTTGAGATTGATGATGTCAAG
GCTTGGAAGTCTGTGTTGGTATCTGTGACTTCCTACGCTTTAGGGCTCTTCATGATCGCA
AAAGCCCCTTGGTATCTGCTTCCGTTGGCTTGGGCTTGGACAGGAACTGCAGTTACAGGG
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GACATTGTGGGTACTCTAGCCTTCCTACCTCTTGTATACCCCTATGAGCCATGGAGATTT
AAGCACGACCGTCATCACG

QA 13 691 13 691
DS 



AS 2 9

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AAGTGTGGCTCCATGTGTGTTGTATGGAAGCAATGCAGAGAGGCTTGGGTCTGCTCCCGG
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TGGTTGGAACTGTCTTGCTCCTTGGTTCTCTTATTCCAGCCGCTCTGCCATTCGCCGAAG
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TCTTTGCCATACATGTGCACTTTGCCAAGAAGGCCGTGAGATCCGCAGGAAGGTTCTTCA
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ACGTAAGTGAAAGCTTGCGTTGAGTCATGTG*TC***AATAACACTTGTTACACTTGTAT
ACGCACAGTGAAGTGTGAACTATGATGTTTGTCTTTTGCTTGCTTTTGTCGCATGTTCTG
TTCTTTTATTTTCTTTTCTTTCTTCAACGCATGCAACACATATGTATATCTTTATTGTTA
CGCACTTTGTTTTGATATGGTAATGTAATATTCAATAAAGTTTTAAAACTGATCTCCAAT
TTCAAGAG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 10 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1BJ08TF U 1
AF RS1FG69TF U 11
AF RS1H479TF U 11
AF RS1A058TF U 340
AF RS1A058TV U 385
AF RS1FG69JQ C 297
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RD RS1BJ08TF 644 0 0
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TGGTTGGAACTGTCTTGCTCCTTGGTTCTCTTATTCCAGCCGCTCTGCCATTCGCCGAAG
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TCTTTGCCATACATGTGCACTTTGCCAAGAAGGCCGTGAGATCC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1FG69TF 824 0 0
GG
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GCTTGCGTTGAGTCATGTG*TC****ATAACACTTGTTACACTTGTATACGCACAGTGA*
GTGTG*ACTATGATGTTTGTCTTT*GCTTGCTTTTGTCGCAT

QA 3 824 3 824
DS 

RD RS1H479TF 794 0 0
GG
AAGAACATAAAACATGGCGGGAGAAGACAGCCGCGAAGCTCAACGATGCGAGGAATCGAG
TCCTCTCTTGCAAGTGAACGAAAGCAAGATCTGCTCCAAAGGAGACGACAACACCAAGAC
GACGAAAGCGGCGGAGGAACACGGATGGACGGCGGATGGATTGCCGGTGAGCCACGGGAG
CGTGATCGGAGAGCCGATCGGGAGAAACCAGTGGAGTTCCGGTCTTTTTTCCTGTCTCGG
CCGAAACGATGAGTTCTGCAGCAGCGATCTCGAAATTTGTCTCCTTGGAAGTGTGGCTCC
ATGTGTGTTGTATGGAAGCAATGCAGAGAGGCTTGGGTCTGCTCCCGGAACGTTTTCCAA
TCACTGCTTGACGTACTTAGGGTTGTACTTTGTCGGCAACTCTTTGTTTGGTTGGAACTG
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GATGCAAAGGGAGCATATGGAGACGACTTGTGACTTTGTGACGCATGTTCTTTGCCATAC
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TGCTCAGTCCACTGTGGTCGTGCTTCCACCAAGTGAACAAACCATGGGACGTAAGTGAAA
GCTTGCGTTGAGTCATGTGGTCCTAAATAACACTTGTTACATTTGTATACGCACAGCGA*
GTGTGGACTATG

QA 3 794 3 794
DS 

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CTTTGTTGGCAACTCTTTGTTTGGTTGGAACTGTCTTGCTCCTTGGTTCTCTTATTCCAG
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GATCCGCAGGAAGGTTCTTCACCCTGGTTTCAATGCTCAGTCCACCGTTGTCGTGCTTCC
ACCAAGTGAACAAACCATGGGACGTAAGTGAAAGCTTGCGTTGAGTCATGTG*TC***AA
TAACACTTGTTACACTTGTATACGCACAGTGAAGTGTGAACTATGATGTTTGTCCTTTGC
TTGCTTTTGTCGCATGTTCTGTTCTTTTATTTTCTTTTCTTTCTTCAACGCATGCAACAC
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QA 1 597 1 597
DS 

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CGTTGTCGTGCTTCCACCAAGTGAACAAACCATGGGACGTAAGTGAAAGCTTGCGTTGAG
TCATGTG*TC***AATAACACTTGTTACACTTGTATACGCACAGTGAAGTGTGAACTATG
ATGTTTGTCCTTTGCTTGCTTTTGTCGCATGTTCTGTTCTTTTATTTTCTTTTCTTTCTT
CAACGCATGCAACACATATGTATATCTTTATTGTTACGCACTTTGTTTTGATATGGTAAT
GTAATATTCA

QA 1 550 1 550
DS 

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CCGGAACGTTTTCCAATCACTGCTTGACGTACTTAGGGTTGTACTTTGTCGGCAACTCTT
TGTTTGGTTGGAACTGTCTTGCTCCTTGGTTCTCTTATTCCAGCCGCTCTGCCATTCGCC
GAAGGTTTAACCTTGAGGGAAGCTTTGAGGCGATGAACAGGTCATGTGGTTGCTGCGGTA
GCTGCATAGAAGACGAGATGCAAAGGGAGCATATGGAGACGACTTGTGACTTTGTGACGC
ATGTTCTTTGCCATACATGTGCACTTTGCCAAGAAGGCCGTGAGATCCGCAGGAAGGTTC
TTCACCCTGGTTTCAATGCTCAGTCCACCGTGGTCGTGCTTCCACCAAGTGAACAAACCA
TGGGACGTAAGTGAAAGCTTGCGTTGAGTCATGTG*TC***AATAACACTTGTTACACTT
GTATACGCACAGTGAAGTGTGAACTATGATGTTTGTCTTTTGCTTGCTTTTGTCGCATGT
TCTGTTCTTTTATTTTCTTTTCTTTCTTCAACGCATGCAACACATATGTATATCTTTATT
GTTACGCACTTTGTTTTGATATGGTAATGTAATATTCAATAAAGTTTTAAAACTGATCTC
CAATTTCAAGAG

QA 1 672 1 672
DS 



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TTTGGTTTTAAAACTTTATTGAATATTACATTACCGTATCAAAACAAAGTGCCTAACAAT
AAAGATATACATATGTGTTGCATGCGTTGAAGAAAAAGAAAATAAAAGAAAAGAACATGC
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GTAACAAGTATTATTTAGGACCACATGACTCAACGCAAGCTTTTCACTTACGTCCCATGG
TTTGTTCACTTGGTGGAAGCACGACCACAGTGGACTGAGCATTGAAACCAGGGTGAAGAA
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TCACAAAGTCACAAGTCGTCTCCATATGCTCCCTTTGCATCTCGTCTTCTATGCAGCTAC
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GAATGGCAGAGCGGCTGGAATAAGAGAACCAAGGAGCAAGACAGTTCCAACCAAACAAAG
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AAGAGAGGACTCGATTCCTCGCATCGTTGAGCTTCGCGGCTGTCTTCTCCCGCCATGTTT
TATGTTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1H479JQB U 10
AF RS1E052TF C 1
AF RS1E052JQ U 10
BS 1 9 RS1E052TF
BS 10 671 RS1E052JQ

RD RS1H479JQB 517 0 0
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AGCGGCTGGAATAAGAGAACCAAGGAGCAAGACAGTT

QA 1 517 1 517
DS 

RD RS1E052TF 671 0 0
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AAAGATATACATATGTGTTGCATGCGTTGAAGAAAAAGAAAATAAAAGAAAAGAACATGC
GACAAAAGCAAAGCAAGAGAACAAACATCATAGTCCACACTTCGTTGTGCGTATACAAAT
GTAACAAGTATTATTTAGGACCACATGACTCAACGCAAGCTTTTCACTTACGTCCCATGG
TTTGTTCACTTGGTGGAAGCACGACCACAGTGGACTGAGCATTGAAACCAGGGTGAAGAA
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TCACAAAGTCACAAGTCGTCTCCATATGCTCCCTTTGCATCTCGTCTTCTATGCAGCTAC
CGCAGCAACCACATGACCTGTTCATCGCCTCAAAGCTTCCCTCAAGGTTAAACCTTCGGC
GAATGGCAGAGCGGCTGGAATAAGAGAACCAAGGAGCAAGACAGTTCCAACCAAACAAAG
AGTTGCCGACAAAGTACAACCCTAAGTACGTCAAGCAGTGATCGGAAAACGTTCACTTGC
AAGAGAGGACTCGATTCCTCGCATCGTTGAGCTTCGCGGCTGTCTTCTCCCGCCATGTTT
TATGTTCTTCC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1E052JQ 662 0 0
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GGATCTCACGGCCTTCTTGGCAAAGTGCACATGTATGGCAAAGAACATGCGTCACAAAGT
CACAAGTCGTCTCCATATGCTCCCTTTGCATCTCGTCTTCTATGCAGCTACCGCAGCAAC
CACATGACCTGTTCATCGCCTCAAAGCTTCCCTCAAGGTTAAACCTTCGGCGAATGGCAG
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CAAAGTACAACCCTAAGTACGTCAAGCAGTGATCGGAAAACGTTCACTTGCAAGAGAGGA
CTCGATTCCTCGCATCGTTGAGCTTCGCGGCTGTCTTCTCCCGCCATGTTTTATGTTCTT
CC

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 9

CO CL296Contig1 1631 9 16 U
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AAACTTAGATAAGTTTGATAAGGTGTCGAAGGTTACAAAGGTGCCACTCACGAGTAACCA
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TCCCAAACGAGCCATCACACCAGATAACAAAACGTTAGGCAAAGGACGATACTCCTTGGT
TTTGAAACCAAGAGAGAGGTACTTCTCAGAAAGAAGAATTTTGATGAAAAGATTCACTTC
TATAAGGAGAAGAGATGGTGAAAATGATCTCTCATGGCCCCGGCATGAGGAAGTTTGATT
AGCCTTTTCTGTTAAGGCTATGGGACTGCAATCTTCAAGCTTTAAAAGACTCCGAACTAC
ACTTTGAATTTGTTTAGTAGTTTTACTTGTCGGGTTTTCTGGTTGATGACGAAACTTGCT
TGACCTTGGTGTTCTATCACCATCGACTGCATCAAAAACATACAACACTCCATCTATGCC
CAGAACATAGGTTTTCTCTGATGAGATTTCCATCTTTACATCTGTAGCAGCATTTGACTG
AGAGCGCAAGACCAGAAAATATTGAAGAAGTAAACGCTGCTGGGAGTGGATCACGGTGGT
AAGAGCCACCTTAACAACGGCATTGAGGTATATGAGCTTGACAAGAGTTGACAAGGAAGC
TGTACCTGAGGTCAAACAGAGGCTTCGGCTACCAACGTTACCGCGTCGGAGCCAAAGATT
TTT*GCTGAAACCACACATAAGCCACTGGTCAACTGAATCTGTCCAGCTGAGAAGGGGAG
AGCAGTAGCCGGAAATTGCAGGTCTGCACAGTAGGAGCGTCGAAATCGAATGGACCTGTG
GGTCTTTAACTTGTGGTGAACTCGTCATGAAGGTTTGTATTGAGCACACAGAGCTGTCAA
ACTTACAGACCTTGCAGGAAGAGGGAACATCCTGTGTCTCCGGTGGAGCGTCCGGTGGGT
CAGGAGGTTCTGGCGGTTGGGCAAGGCCGGGAAGCTCCGGAGAAAACAGATTTGGAGACT
CCGGAACAAGCGACTTCGAGTTTGAACCCTTCACCTTCAGACTTGAACCAGTGGTAGCAG
TATTGGAAGAAAGGTTTCTCACCGGAGCCATAGATCTTTCAGGAGCACAGCCGGACGAGA
AGCGCAGTCTTCTAAGTTGTACAAAGTCTTCACCTTTTGGTGAGAGGATTCTTCGGGTAA
ACCCAGACGGAGTCCCGAGAGTGAGAAGCATAACTTCTTAGGAGAGAAGAACAACAGAGA
GGATGAAGCACCGGACGTCCATACTAGATCGGAGTTGAAGCTTTGTGTTGATGACGGCCG
CCTTGGAAATCGTGCCAGAGAGAAAAGTCTCTAGGGCGAACTCTCGTCGAACACGACGTT
TTCTACAATTATTTCATACTGCACTGTGGTCTGATAATTGGCTTCTATATCCATAAACAC
CTCCATACATG


BQ
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GTGCCAGAGAGA
GACGTCCTTTTTATCCC

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DS 

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TGAGAGGATTCTTCGGGTAAACCCAGACGGAGTCCCGAGAGTGAGAAGCATAACTTCTTA
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GCTTCTATATCCATAAACACCTCCATACATG

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 10

CO CL297Contig1 1814 10 16 U
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CTCCTTGGTTTGGTTCTTTTCCTCGGCTTTATTGGCTCACCGACCACGGCCATTGTACAT
GCTTGCTCCAGTACAGAACTAACCTTTAGTCGTGCCAACTTCCCTGAGGGTTTCATTTTT
GGTACCTCGACCGCAGCTTTTCAGGTTGAAGGAGCTGTACATGAAGGATGTAGAGGTCCA
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GTTGCCGTCGATTTCTACCATCGTTACAAGGAAGATATCAAGTTGATAAAAGATCTGAAC
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CAATTTGCGATGATAAAGTAAACGTTACAGGGTATTTTCTTTGGTCATTGATGGATAATT
TTGAATGGCAAGAGGGGTACAGCGCGAGATTTGGACTATACTACGTCGATTACAATAATA
ATTTGACACGCCATGAAAAATTATCAGCCCAGTGGTACTCGAGTTTTCTCCAAGATGGAC
TAAAAGAGTTCGAGTATGATCAGCACGATGAGCAACACGAGCACGATGAGTTGTAGTGCG
AATGCTCTACTACAGACTTTGATATTTTGAGTCATAAACTACACTCAACTGATGTATTTA
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AGATTTATCGATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 

AF RS1FY96TF U 1
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GGTACCTCGACCGCAGCTTTTCAGGTTGAAGGAGCTGTACATGAAGGATGTAGAGGTCCA
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ACTGATGGATTTAGATTTTCCATTGCATGGCCTAGAATATTCCCACATGGTAGGATGGAG
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AATGAAATAACACCGTTAGTAACCGTTTTTCACTGGGACACTCCTCAAGACTTGGAAGAT
GAAT

QA 1 544 1 544
DS 

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GGAAGATGAATACGGTGGCTTCTTAAGCGACCGTATAATAAAGGATTATACGGAGTACGC
AAACTTCACATTCCAAGAGTACGGACACAAAGTGAAGCATTGGATCACATTTAACGAGCC
CATGGGTGTTCAGTCGAGCTGGCTACGACATTGGGAAAACAGCACCGGGGACGTTGTTCA
AAGTACATCAAAGAGCACGGAGAGTTGTGTCACGATGGGACGATCAGGACACGATGCTTA
TATCGTTAGCCATAACATGCTCTTGGCACATGCTGATGCCGTAGAGGCCTTTAGAAA
TGCGAC

QA 8 364 8 364
DS 

RD RS1AQ92TFB 780 0 0
G
ATTCCCACATGGTAGGATGGAGAAAGGAGTAAGCAAAGCAGGTGTGCAGTTTTACCACGA
CCTAATTGATGAGCTCCTCAAAAATGAAATAACACCGTTAGTAACCGTTTTTCACTGGGA
CACTCCTCAAGACTTGGAAGATGAATACGGTGGCTTCTTAAGCGACCGTATAATAAAGGA
TTATACGGAGTACGCAAACTTCACATTCCAAGAGTACGGACACAAAGTGAAGCATTGGAT
CACATTTAACGAGCC*ATGGGTGTTCAGTCGAGCTGGCTACGACATTGGGAAAACAGCAC
CGGG*ACGTTGTTCAAAGTACATCAAAGAGCACGGAGAGTTGTGTCACGATGG*ACGATC
AGGACACGAGGCTTATATCGTTAGCCATAACATGCTCTTGGCACATGCTGATGCCGTAGA
GGCCTTTAGAAAATGCGACAAGTGTAAAGGTGGTAAAATTGGGATTGCTCATACTCCCGC
TTGGTTTGACCAGCGCGACCTCACGGATGACCCGCGCCAGCACTCGAAGAAGAACACGAA
ACTCCTGCAACTAATTTGATTGACTTCGTCATGGGATGGCATTTGAATCCGACCACGTAT
GGAGATTATCCACAATCGATGAAAGATCATGTCGGAGATCGACTACCAGAATTTACTGAG
GCACAGAAGAACAAGTTGAAAAATTCTGCTGATTTTGTAGGAATCAATTACTATAATTCA
CTATTTGCATTGCACGGCGAAGAGCCAGATCCTTCGAAACCTAGTTGGCAGAGTGATTC

QA 2 780 2 780
DS 

RD RS1A433JQ 610 0 0
TATAATTCACTATTTGCATTGCACGGCGAAGAGCCAGATCCTTCGAAACCTAGTTGGCAG
AGTGATTCTCTCATTGACTATGAACCTAGGTATGTGGATAAATTCAATGCATTTACAATC
AAGCCTGATGTTGCCAGAGTTGAAGTCTACGCAAATGGTTTGAGAAGACTTTTGAACTAC
ATAAAGGATAAATACGGCAATCCTGAAGTCATTATCACCGGGAATGGATACGGAGAAGAT
TTAGGTGAGCAAGACAGAAGTCTTGTACTGGCGCTTTCAGATGACCACATAACATGCTAC
ATTCAGAAGCATTTCTTGAGCTTGCACCAAGCAATTTGGGATGATAAAGTAAACGTTACA
GGGTATTTTCTTTGGTCATTGATGGATAATTTTGAATGGCAAGAGGGGTACAGCGCGAGA
TTTGGACTATACTACGTCGATTACAATAATAATTTGACACGCCATGAAAAATTATCAGCC
CAGTGGTACTCGAGTTTTTTCCAAGATGGACTAAAAGAGTTCGAGTATGATCAGCACGAT
GAGCAACACGAGCACGATGAGTTGTAGTGCGAATGCTTTACTACAGACTTTGATATTTTG
AGTCATAAAC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RS1AQ92JQ 782 0 0
CACAATCGATGAAAGATCATGTCGGAGATCGACTACCAGAATTTACTGAGGCACAGAAGA
ACAAGTTGAAAAATTCTGCTGATTTTGTAGGAATCAATTACTATAATTCACTATTTGCAT
TGCACGGCGAAGAGCCAGATCCTTCGAAACCTAGTTGGCAGAGTGATTCTCTCATTGACT
ATGAACCTAGGTATGTGGATAAATTCAATGCATTTACAATCAAGCCTGATGTTGCCAGAG
TTGAAGTCTACGCAAATGGTTTGAGAAGACTTTTGAACTACATAAAGGATAAATACGGCA
ATCCTGAAGTCATTATCACCGGGAATGGATACGGAGAAGATTTAGGTGAGCAAGACAGAA
GTCTTGTACTGGCGCTTTCAGATGACCACAGAACATACTACATTCAGAAGCATCTCTTGA
GCTTGCACCAAGCAATTTGCGATGATAAAGTAAACGTTACAGGGTATTTTCTTTGGTCAT
TGATGGATAATTTTGAATGGCAAGAGGGGTACAGCGCGAGATTTGGACTATACTACGTCG
ATTACAATAATAATTTGACACGCCATGAAAAATTATCAGCCCAGTGGTACTCGAGTTTTC
TCCAAGATGGACTAAAAGAGTTCGAGTATGATCAGCACGATGAGCAACACGAGCACGATG
AGTTGTAGTGCGAATGCTTTACTACAGACTTTGATATTTTGAGTCATAAACTACACTCAA
CTGATGTATTTATTTTAACATTTTAGACCAAAAAAAAA*CCTAATGTATTTCCATACTCC
AG

QA 1 782 1 782
DS 

RD RS1AE71TF 630 0 0
TTGCACGGCGAAGAGCCAGATCCTTCGAAACCTAGTTGGCAGAGTGATTCTCTCATTGAC
TACGAACCTAGGTATGTGGATAAATTCAATGCATTTACAATCAAGCCTGATGTTGCCAGA
GTTGAAGTCTACGCAAATGGTTTGAGAAGACTTCTGAACTACATAAAGGATAAATACGGC
AATCCTGAAGTCATTATCACCGGGAATGGATACGGAGAAGATCTAGGTGAGCAAGACAGA
AGTCTTGTACTGGCGCTCTCAGATGACCACAGAACATACTACATTCAGAAGCATCTCTTG
AGCTTGCACCAAGCAATTTGCGATGATAAAGTAAACGTTACAGGGTATTTTCTTTGGTCA
TTGATGGATAATTTTGAATGGCAAGAGGGGTACAGCGCGAGATTTGGACTATACTACGTC
GATTACAATAATAATTTGACACGCCATGAAAAATTATCAGCCCAGTGGTACTTGAGTTTT
CTCCAAGATGGACTAAAAGAGTTCGAGTATGATCAGCACGATGAGCAACACGAGCACGAT
GAGTTGTAGTGCGAATGCTCTACTACAGACTTTGATATTTTGAGTCATAAACTACACTCA
ACTGATGTATTTATTTTAACATTTTAGACC

QA 1 630 1 630
DS 

RD RS1AE71JQ 753 0 0
G
AGAAGAACAAGTTGAAAAATTCTGCTGATTTTGTAGGAATCAATTACTATAATTCACTAT
TTGCATTGCACGGCGAAGAGCCAGATCCTTCGAAACCTAGTTGGCAGAGTGATTCTCTCA
TTGACTACGAACCTAGGTATGTGGATAAATTCAATGCATTTACAATCAAGCCTGATGTTG
CCAGAGTTGAAGTCTACGCAAATGGTTTGAGAAGACTTCTGAACTACATAAAGGATAAAT
ACGGCAATCCTGAAGTCATTATCACCGGGAATGGATACGGAGAAGATCTAGGTGAGCAAG
ACAGAAGTCTTGTACTGGCGCTCTCAGATGACCACAGAACATACTACATTCAGAAGCATC
TCTTGAGCTTGCACCAAGCAATTTGCGATGATAAAGTAAACGTTACAGGGTATTTTCTTT
GGTCATTGATGGATAATTTTGAATGGCAAGAGGGGTACAGCGCGAGATTTGGACTATACT
ACGTCGATTACAATAATAATTTGACACGCCATGAAAAATTATCAGCCCAGTGGTACTTGA
GTTTTTTCCAAGATGGACTAAAAGAGTTCGAGTATGATCAGCACGATGAGCAACACGAGC
ACGATGAGTTGTAGTGCGAATGCTCTACTACAGACTTTGATATTTTGAGTCATAAACTAC
ACTCAACTGATGTATTTATTTTAACATTTTAGACCAAAAAAAAA*CCTAATGTATTTCCA
TACTCCAGAAAAATAATCAGATTTATCGATAT

QA 2 753 2 753
DS 

RD RS1G905JQ 495 0 0
AAGTCATTATCACCGGGAATGGATACGGAGAAGATCTAGGTGAGCAAGACAGAAGTCTTG
TACTGGCGCTTTCAGATGACCACAGAACATACTACATTCAGAAGCATTTCTTGAGCTTGC
ACCAAGCAATTTGCGATGATAAAGTAAACGTTACAGGGTATTTTCTTTGGTCATTGATGG
ATAATTTTGAATGGCAAGAGGGGTACAGCGCGAGATTTGGACTATACTACGTCGATTACA
ATAATAATTTGACACGCCATGAAAAATTATCAGCCCAGTGGTACTCGAGTTTTCTCCAAT
ATGGACTAAAAGAGTTCGAGTATGATCAGCACGATGAGCAACACGAGCACGATGAGCTGT
AGTGCGAATGCTCTACTACAGACTTTGATATTTTGAGTCATAAACTACACTCAACTGATG
TATTTATTTTAACATTTTAGACCAAAAAAAAAACCTAATGTATTTCCATACTCCAGAAAA
ATAATCAGATTTATC

QA 1 495 1 495
DS 

RD RS1BT58TF 511 0 0
G
GGCAATCCTGAAGTCATTATCACCGGGAATGGATACGGAGAAGATCTAGGTGAGCAAGAC
AGAAGTCTTGTACTGGAGCTCTCAGATGACCACAGAACATACTACATTCAGAAGCATCTC
TTGAGCTTGCACCAAGCAATTTGCGATGATAAAGTAAACGTTACAGGGTATTTTCTTTGG
TCATTGATGGATAATTTTGAATGGCAAGAGGGGTACAGCGCGAGATTTGGACTATACTAC
GTCGATTACAATAATAATTTGACACGCCATGAAAAATTATCAGCCCAGTGGTACTCGAGT
TTTCTCCAAGATGGACTAAAAGAGTTCGAGTATGATCAGCACGATGAGCAACACGAGCAC
GATGAGTTGTAGTGCGAATGCTCTACTACAGACTTTGATATTTTGAGTCATAAACTACAC
TCAACTGATGTATTTATTTTAACATTTTAGACCAAAAAAAAAACCTAATGTATTTCCATA
CTCCAGAAAAATAATCAGATTTATC
GATAT

QA 2 506 2 506
DS 

RD RS1G905TF 606 0 0
G
GGATAAATTCAATGCATTTACAATCAAGCCTGATGTTGCCAGAGTTGAAGTCTACGCAAA
TGGGTTGAGAAGACTTCTGAACTACATAAAGGATAAATACGGCAATCCTGAAGTCATTAT
CACCGGGAATGGATACGGAGAAGATCTAGGTGAGCAAGACAGAAGTCTTGTACTGGCGCT
CTCAGATGACCACAGAACATACTACATTCAGAAGCATCTCTTGAGCTTGCACCAAGCAAT
TTGCGATGATAAAGTAAACGTTACAGGGTATTTTCTTTGGTCATTGATGGATAATTTTGA
ATGGCAAGAGGGGTACAGCGCGAGATTTGGACTATACTACGTCGATTACAATAATAATTT
GACACGCCATGAAAAATTATCAGCCCAGTGGTACTCGAGTTTTCTCCAATATGGACTAAA
AGAGTTCGAGTATGATCAGCACGATGAGCAACACGAGCACGATGAGCTGTAGTGCGAATG
CTCTACTACAGACTTTGATATTTTGAGTCATAAACTACACTCAACTGATGTATTTATTTT
AACATTTTAGACCAAAAAAAAAACCTAATGTATTTCCATACTCCAGAAAAATAATCAGAT
TTATC

QA 2 606 2 606
DS 



AS 1 10

CO CL298Contig1 694 10 2 U
CATGTTGTCAAAGAGTTGAACAATGGTTTTTTCGTGTTGTCAAAGAGTTGAACTATGAAA
ATAGATGGCGAGTGCCTGATCGAATTGATCAGGTCATGTAGGAACAAGGTTCAAGTCTAC
CGGTCTGTTAGGATGCCTCAGCTGCATACATCACTGCACTTCCACTTGACACCTATCGTA
ATGATAAACGGCTCGTCTCGCCGTGACCTTCTCTTGAATTCTCAAAACTTCTGTCACTCC
ATCCCCGCAGGGGCGGAGAACCCGTTGCTGTCTCGGCTGTGCTACCGGAGGCTCTGGGGA
AGTCGGAATAGGAGAGCACTCATCTTGGGGTGGGCTTACTACTTAGATGCTTTCAGCAGT
TATCCGCTCCGCACTTGGCTACCCAGCGTTTACCGTGGGCACGATAACTGGTACACCAGA
GGTGCGTCCTTCCCGGTCCTCTCGTACTAGGGAAAGGTCCTCTCAATGCTCTAACGCCCA
CACCGGATATGGACCGAACTGTCTCACGACGTTCTGAACCCAGCTCACGTACCGCTTTAA
TGGGCGAACAGCCCAACCCTTGGAACATACTACAGCCCCAGGTGGCGAAGAGCCGACATC
GAGGTGCCAAACCTTCCCGTCGATGTGAGCTCTTGGGGAAGATCAGCCTGTTATCCCTAG
AGTAACTTTTATCCGTTGAGCGACGGCCCTTCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1C822JQ U 1
AF RS1C822TF C 1
AF RS1E187JQ U 33
AF RS1E187TF C 33
AF RS1G114JQ U 33
AF RS1G114TF C 33
AF RS1C949TF C 177
AF RS1C949JQ U 33
AF RS1B958JQ U 33
AF RS1B958TF C 37
BS 1 309 RS1C822JQ
BS 310 694 RS1B958JQ

RD RS1C822JQ 311 0 0
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ATGATAAACGGCTCGTCTCGCCGTGACCTTCTCTTGAATTCTCAAAACTTCTGTCACTCC
ATCCCCGCAGGGGCGGAGAACCCGTTGCTGTCTCGGCTGTGCTACCGGAGGCTCTGGGGA
AGTCGGAAT
CC

QA 1 309 1 309
DS 

RD RS1C822TF 311 0 0
CATGTTGTCAAAGAGTTGAACAATGGTTTTTTCGTGTTGTCAAAGAGTTGAACTATGAAA
ATAGATGGCGAGTGCCTGATCGAATTGATCAGGTCATGTAGGAACAAGGTTCAAGTCTAC
CGGTCTGTTAGGATGCCTCAGCTGCATACATCACTGCACTTCCACTTGACACCTATCGTA
ATGATAAACGGCTCGTCTCGCCGTGACCTTCTCTTGAATTCTCAAAACTTCTGTCACTCC
ATCCCCGCAGGGGCGGAGAACCCGTTGCTGTCTCGGCTGTGCTACCGGAGGCTCTGGGGA
AGTCGGAAT
CC

QA 1 309 1 309
DS 

RD RS1E187JQ 410 0 0
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TCGGCTGTGCTACCGGAGGCTCTGGGGAAGTCGGAATAGGAGAGCACTCATCTTGGGGTG
GGCTTACTACTTAGATGCTTTCAGCAGTTATCCGCTCCGCACTTGGCTACCCAGCGTTTA
CCGTGGGCACGATAACTGGTACACCAGAGGTGCGCCCTTCCCGGTCC
CCC

QA 1 407 1 407
DS 

RD RS1E187TF 410 0 0
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GTCATGTAGGAACAAGGTTCAAGTCTACCGGTCTGTTAGGATGCCTCAGCTGCATACATC
ACTGCACTTCCACTTGACACCTATCGTAATGATAAACGGCTCGTCTCGCCGTGACCTTCT
CTTGAATTCTCAAAACTTCTGTCACTCCATCCCCGCAGGGGCGGAGAACCCGTTGCTGTC
TCGGCTGTGCTACCGGAGGCTCTGGGGAAGTCGGAATAGGAGAGCACTCATCTTGGGGTG
GGCTTACTACTTAGATGCTTTCAGCAGTTATCCGCTCCGCACTTGGCTACCCAGCGTTTA
CCGTGGGCACGATAACTGGTACACCAGAGGTGCGCCCTTCCCGGTCC
CCC

QA 1 407 1 407
DS 

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CTTGAATTCTCAAAACTTCTGTCACTCCATCCCCGCAGGGGCGGAAAACCCGTTGCTGTC
TCGGCTGTGCTACCGGAGGCTCTGGGGAAGTCGGAATAGGAGAGCACTCATCTTGGGGTG
GGCTTACTACTTAGATGCTTTCAGCAGTTATCCGCTCCGCACTTGGCTACCCAGCGTTTA
CCGTGGGCACGATAACTGGTACACCAGAGGTGCGTCCTTCCCGGTCCTCTCGTACTAGGG
AAAGGTCCTCTCAATGCTCTAACGCCCACACCGGATATGGACCGAACTGTCTCACGACGT
TCTGAACCC
C

QA 1 489 1 489
DS 

RD RS1G114TF 490 0 0
CGTGTTGTCAAAGAGTTGAACTATGAAAATAGATGGCGAGTGCCTGATCGAATTGATCAG
GTCATGTAGGAACAAGGTTCAAGTCTACCGGTCTGTTAGGATGCCTCAGCTGCATACATC
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CTTGAATTCTCAAAACTTCTGTCACTCCATCCCCGCAGGGGCGGAGAACCCGTTGCTGTC
TCGGCTGTGCTACCGGAGGCTCTGGGGAAGTCGGAATAGGAGAGCACTCATCTTGGGGTG
GGCTTACTACTTAGATGCTTTCAGCAGTTATCCGCTCCGCACTTGGCTACCCAGCGTTTA
CCGTGGGCACGATAACTGGTACACCAGAGGTGCGTCCTTCCCGGTCCTCTCGTACTAGGG
AAAGGTCCTCTCAATGCTCTAACGCCCACACCGGATATGGACCGAACTGTCTCACGACGT
TCTGAACCC
C

QA 1 489 1 489
DS 

RD RS1C949TF 422 0 0
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CTCCATCCCCGCAGGGGCGGAGAACCCGTTGCTGTCTCGGCTGTGCTACCGGAGGCTCTG
GGGAAGTCGGAATAGGAGAGCACTCATCTTGGGGTGGGCTTACTACTTAGATGCTTTCAG
CAGTTATCCGCTCCGCACTTGGCTACCCAGCGTTTACCGTGGGCACGATAACTGGTACAC
CAGAGGTGCGTCCTTCCCGGTCCTCTCGTACTAGGGAAAGGTCCTCTCAATGCTCTAACG
CCCACACCGGATATGGACCGAACTGTCTCACGACGTTCTGAACCCAGCTCACGTACCGCT
TTAATGGGCGAACAGCCCAACCCTTGGAGCATACTACAGCCCCAGGTGGCGAAGAGCCGA
C
C

QA 1 421 1 421
DS 

RD RS1C949JQ 554 0 0
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CTTGAATTCTCACAACTTCTGTCACTCCATCCCCGCAGGGGCGGAAAACCCGTTGCTGTC
TCGGCTGTGCTACCGGAGGCTCTGGGGAAGTCGGAATAGGAGAGCACTCATCTTGGGGTG
GGCTTACTACTTAAATGCTTTCAGCAGTTATCCGCTCCGCACTTGGCTACCCAGCGTTTA
CCGTGGGCACGATAACTGGTACACCAGAGGTGCGTCCTTCCCGGTCCTCTCGTACTAGGG
AAAGGTCCTCTCAATGCTCTAACGCCCACACCGGATATGGACCGAACTGTCTCACGACGT
TCTGAACCCAGCTCACGTACCGCTTTAATGGGCGAACAGCCCAACCCTTGGAGCATACTA
CAGCCCCAGGTGGC

QA 1 554 1 554
DS 

RD RS1B958JQ 662 0 0
CGTGTTGTCAAAGAGTTGAACTATGAAAATAGATGGCGAGTGCCTGATCGAATTGATCAG
GTCATGTAGGAACAAGGTTCAAGTCTACCGGTCTGTTAGGATGCCTCAGCTGCATACATC
ACTGCACTTCCACTTGACACCTATCGTAATGATAAACGGCTCGTCTCGCCGTGACCTTCT
CTTGAATTCTCAAAACTTCTGTCACTCCATCCCCGCAGGGGCGGAGAACCCGTTGCTGTC
TCGGCTGTGCTACCGGAGGCTCTGGGGAAGTCGGAATAGGAGAGCACTCATCTTGGGGTG
GGCTTACTACTTAGATGCTTTCAGCAGTTATCCGCTCCGCACTTGGCTACCCAGCGTTTA
CCGTGGGCACGATAACTGGTACACCAGAGGTGCGTCCTTCCCGGTCCTCTCGTACTAGGG
AAAGGTCCTCTCAATGCTCTAACGCCCACACCGGATATGGACCGAACTGTCTCACGACGT
TCTGAACCCAGCTCACGTACCGCTTTAATGGGCGAACAGCCCAACCCTTGGAACATACTA
CAGCCCCAGGTGGCGAAGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACCTTCCCGTCGATGTGAGCTC
TTGGGGAAGATCAGCCTGTTATCCCTAGAGTAACTTTTATCCGTTGAGCGACGGCCCTTC
CC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RS1B958TF 658 0 0
TTGTCAAAGAGTTGAACTATGAAAATAGATGGCGAGTGCCTGATCGAATTGATCAGGTCA
TGTAGGAACAAGGTTCAAGTCTACCGGTCTGTTAGGATGCCTCAGCTGCATACATCACTG
CACTTCCACTTGACACCTATCGTAATGATAAACGGCTCGTCTCGCCGTGACCTTCTCTTG
AATTCTCAAAACTTCTGTCACTCCATCCCCGCAGGGGCGGAGAACCCGTTGCTGTCTCGG
CTGTGCTACCGGAGGCTCTGGGGAAGTCGGAATAGGAGAGCACTCATCTTGGGGTGGGCT
TACTACTTAGATGCTTTCAGCAGTTATCCGCTCCGCACTTGGCTACCCAGCGTTTACCGT
GGGCACGATAACTGGTACACCAGAGGTGCGTCCTTCCCGGTCCTCTCGTACTAGGGAAAG
GTCCTCTCAATGCTCTAACGCCCACACCGGATATGGACCGAACTGTCTCACGACGTTCTG
AACCCAGCTCACGTACCGCTTTAATGGGCGAACAGCCCAACCCTTGGAACATACTACAGC
CCCAGGTGGCGAAGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACCTTCCCGTCGATGTGAGCTCTTGG
GGAAGATCAGCCTGTTATCCCTAGAGTAACTTTTATCCGTTGAGCGACGGCCCTTCCC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 10

CO CL299Contig1 1107 10 10 U
GTAATGGATTTAATAATATTGTAACTGTAAAGAGGAAAAAAGTATTAACCAGCCCGGATT
CATATCCCATAGGCCATAGAACAAGTGTAAGCCAATCTTTATTCGTTGTTTATAGGTTTG
GCCAATAAATTACAACATGAAAGTTCTGTATGTGAATATTGCCTCTAAGAAGAGAAGAAA
TATCTTATTCATCTGTTGGCATCTTCAGAACCATAGCCTCACCATCCAATGGCGTGTATT
CCGGCAAACTGACGTACTTGGGACATGATTTTTTCGACGTCATGTCTTTTGAACCAACAC
AGTCCCTGGGCTTGAAATCTTTATAGAAGCATATACGTATTTCATCGATTGCATCTCTTT
TGCATACTACTTCAGGGGTGATATGAAATGCATTCTGAATGGCTGTGACAATACCTCCTA
GAGGATACTTCTCGCTGTTGGAAGCAACATAGCCAGCTTTATAAAGGACATCCGTGACAT
TATGCTTGAAGTAGATATTAAGCGTGGTAACGAAGTAACTATACTCATCACGAATAACAG
GAGAAGAGCAAGTCCCATGTTTCTCCCACTCATGGCCCCAAAATGATCCTTTTCCACCAT
GGCAAGATGATGGAGAACCACAACTGAGACTGGGCCAGTACTTTTCCATGCCATCCATCA
ACGTTGAGATCTCCTTCTCATTGAAGTCGGATCTATAGCAACATGAAGGCCAGGAACCGT
CGTTATAGTCCGGCCATAGTCCA*TGGATGGTGAATTGAGTTGGAGTGTTCGAGCCTCTA
CAGCAAGCGTTTTTGGAGCAGCAATGGCGAGTTCCACGGCAGTAGGTTCCAGGCCACTGG
AGAGAGAGAGCGAAATAATCAAACTCTCTCTGTGAGCGATTGACTTCGACGACGTTGTCT
CCGGCAAGTCTTCCAGTCTCCGCTAGATAGGCCGAGACAGAAAGAACCGTAACCAAAAGG
ACTTGGAGGAGGAGGAGGAGGAGAAGAAGAGATCTACGCAACGCCATTGACTCTATTCGG
ATTGGAAACCCGACTCAGATCGGGTCACTGTAGCCTTTTCTTTATAGGTGGACGGAAAAC
GAGGGCATTGTAGTCTTTCAGATCAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 45 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 30 10 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 
60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EC44JQ U 184
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AF RS1FR26JQ U 12
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BS 791 877 RS1AC38JQ
BS 878 1031 RS1AC38TF
BS 1032 1107 RS1BM53TF

RD RS1EC44JQ 309 0 0
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GCTTGAAGT

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CCGGCAAACTGACGTACTTGGGACATGATTTTTTCGACGTCATGTCTTTTGAACCAACAC
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GGCAAGATGATGGAGAACCACAACTGAGACTGGGCCAGTACTTTTCCATGCCATCCATCA
ACGTTGAGATCT

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ACAACATGAAAGTTCTGTATGTGAATATTGCCTCTAAGAAGAGAAAAAATATCTTATTCA
TCTGTTGGCATCTTCAGAACCATAGCCTCACCATCCAATGGCGTGTATTCCGGCAAACTG
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TTGAAATCTTTATAGAAGCATATACGTATTTCATCGATTGCATCTCTTTTGCATACTACT
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GTCCCATGTTTCTCCCACTCATGGCACCAAAATGATCCTTTTCCACCATGGCAAGATGAT
GGAGAACCACAACTGAGACTGGGCCAGTACTTTTCCATGCCATCCATCAACGTTGAGATC
TCCTTCTCATTGAAGTC

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AGTTCTGTATGTGAATATTGCCTCTAAGAAGAGAAGAAATATCTTATTCATCTGTTGGCA
TCTTCAGAACCATAGCCTCACCATCCAATGGCGTGTATTCCGGCAAACTGACGTACTTGG
GACATGATTTTTTCGACGTCATGTCTTTTGAACCAACACAGTCCCTGGGCTTGAAATCTT
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TATGAAATGCATTCTGAATGGCTGTGACAATACCTCCTAGAGGATACT**TCGCTGTTGG
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GCGTGGTAACGAAGTAACTATACTCATCACGAATAACAGGAGAAGAGCAAGTCCCATGTT
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TGAAGTCGGATCTATAGCAACATGAAGGCCAGGAACCGTCGTTATAGTCCGGCCATAGTC
CA*TGGATGGTGA*TTGAGTTGGAGTGTCCGAGCCTCTACAGCAAGCGT

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DS 

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ATATTGCCTCTAAGAAGAGAAGAAATATCTTATTCATCTGTTGGCATCTTCAGAACCATA
GCCTCACCATCCAATGGCGTGTATTCCGGCAAACTGACGTACTTGGGACATGATTTTTTC
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ACGGCAGTAGGTTCCAGGCCACTGGAGAGAGAGAGCGAAATAATCAAACTCTCTCTGTGA
GC

QA 1 842 1 842
DS 

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GCC

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DS 

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C

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GCATTCTGAATGGCTGTGACAATACCTCCTAGAGGATACTTCTCGCTGTTGGAAGCAACA
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GGCCGAGACAGAAAGAACCGTAACCAAAAGGACTTGGAGGAGGAGGAGGAGGAGAAGAAG
AGATCTACGCAACGCCAT*GACTCTATTCGGATTGGAAACCC
CC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1FR26TF 764 0 0
TTTTTCGACGTCATGTCTTT*GAACCAACACAGTCCCTGGGCTTGAA*TCTTTATAGAAG
CATATACGTATTTCATCGATTGCATCTCTTTTGCATACTACTTCAGGGGTGATATGAAAT
GCATTCTGAATGGCTGTGACAATACCTCCTAGAGGATAC**CTCGCTGTTGGAAGCAACA
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GATCTATAGCAACATGAAGGCCAGGAACCGTCGTTATAGTCCGGCCATAGTCCA*TGGAT
GGTGAATTGAGTTGGAGTGTTCGAGCCTCTACAGCAAGCGTTTTTGGAGCAGCAATGGCG
AGTTCCACGGCAGTAGGTTCCAGGCCACTGGAGAGAGAG**CGAAATAATCAAACTCTCT
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GGCCGAGACAGAAAGAACCGTAACCAAAAGGACTTGGAGGAGGAGGAG******AAGAAG
AGATCTACGCAACGCCATTGACTCTATTCGGATTGGAA
GCCCCC

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1BM53TF 798 0 0
GCTTGAAATCTTTATAGAGGCATATAAGTATTTCATCGATTGCATCTCTTTTGCATACTA
CTTCAGGGGTGATATGAAATGCATTCTGAATGGCTGTGACAATACCTCCTAGAGGATACT
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CCGGCCATAGTCCA*TGGATGGTGAATTGAGTTGGAGTGTCCGAGCCTCTACAGCAAGCG
TTTTTGGAGCAGCAATGGCGAGTTCCACGGCAGTAGGTTCCAGGCCATTGGAGAGAGAGA
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CTTCCAGTCTCCGCTAGATAGGCCGAGACAGAAAGAACCGTAACCAAAAGGACTTGGAGG
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CCGACTCAGATCGGGTCACTGTAGCCTTTTCTTTATAGGTGGACGGAAAACGAGGGCATT
GTAGTCTTTCAGATCAAC

QA 1 798 1 798
DS 



AS 1 8

CO CL300Contig1 1172 8 20 U
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ATTTGCCACTTAATTAAGCAATTGGATAATAAGCATTCTGAGCCACACCACACATGCCCT
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GCATGAAACCGGGTCCATCTGCGTCAATGGAAACCGAGACAGGCTGTCTCGACACAGCCT
CGAGCAACGCACGCTCGTTGTTGCTTGGAACAGTCTGGAAACCTCTGATTGATGCGGCGG
GTCTCGCATTAAACCGGCACATCTCGTATGTCCATAGGAAAGGGTACGCTTGCTCTGAGA
AAGGGTAAGCTTCTTCTGAGGCAATGCCTTGGTTTTGGACTATGTAGTCGAAAGCTTCTG
TCATTATCCCACCTCCACAACCATTATTATACCCTCTGTCGCAATCTATAAGCTGTTGTT
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CTGAGAACGCCCAACAACCTCCGCATAGGCCTTGGTATCTAACCGGTGTTACAGCTCCTT
CGTTTCTCCAATCTTTGGTCTCATGAGGGGCGACATCAGTGACGTTCCAGTCCTGATACG
GTTCCACTTCATACATAAATCCACTTGGTGAATATCCGCCAGTGCTCCTAAGACCGGTAT
GTGTGGCAATGAAATCCTCTTCGGGCCAATCCGCAAACTCGTTGACACCAAGCTTGTAGG
TTCTGTCTCCCTTTCTATTAAATTCCTCAATGAATTTAAAGTTCTTCTTGAACATGTCGA
ATCTCATCTGTTTCTCGAGCTCGCTGTTATAAACTCGAGAGAATCGATTCATCCATTGTT
GATGGTGGTCAGCCAATAGTGGCTCGTGGAAGGTGACACGAGATGTCGCTTGAGAGACGT
TCAAACCCATGGAAAGAATGGTTAGAACCACAAACATGAGCACTATCGATGACATTTTTT
TTATGAATAAGGTTTTGAGTTTGTTGTTGTCC


BQ
10 10 10 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GS47JQ U 1
AF RS1GS47TF C 1
AF RS1FY33JQ U 4
AF RS1G342JQ U 6
AF RS1AT81JQ U 4
AF RS1C925TF C 217
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AF RS1G342TF C 512
BS 1 229 RS1GS47JQ
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BS 345 440 RS1GS47JQ
BS 441 478 RS1AT81JQ
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BS 906 944 RS1C925TF
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RD RS1GS47JQ 440 0 0
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CAGGCCAGTCCACATCTCTACGAATCCTAATGTAACCATTCTCTCCCCAAGTCTCACCCC
AAGAATTCTTAGCTAGCCAATACTTGATCCCTTCAGGGCTAGTCCCGTAACCAACGAACG
TCACCGCATGATTCACTCTGGTCCCACAGTACGGCTCATCGTACACTCCCCCTGAGTAAT
GCATGAAACCGAGTCCATCTGCGTCAATGGAAACCGAAACAGGGTGTCTCGACACAGCCT
CGAGCAACGCACGCTCGTTGTTGCTTGGAACAGTCTGGAAACCTCTGATTGATGCGGCGG
GTCTCGCATTAAACCGGCAC

QA 1 440 1 440
DS 

RD RS1GS47TF 492 0 0
AAT
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TGCCACTTAATTAAGCAATTGGATAATAAGCATTCTGAGCCACACCACACATGCCCTCAG
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AATTCTTAGCTAGCCAATACTTGATCCCTTCAGGGCTAGTCCCGTAGCCAACGAACGTCA
CCGCATGATTCACTCTGGTCCCACAGTACGGCTCATCGTACACTCCCCCTGAGTAATGCA
TGAAACCGAGTCCATCTGCGTCAATGGAAACCGAGACAGGCTGTCTCGACACAGCCTCGA
GCAACGCACGCTCGTTGTTGCTTGGAACAGTCTGGAAACCTCTGATTGATGCGGCGGGTC
TCGCATTAAACCGGCACATCTCGTATGTCCATAGGAAAGGGTACGCTTGCTCTGAGAAAG
GGTAAGCT
C

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DS 

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TGCCACTTAATTAAGCAATTGGATAATAAGCATTCTGAGCCACACCACACATGCCCTCAG
GCCAGTCCACATCTCTACGAATCCTAATGTAACCATTCTCTCCCCAAGTCTCACCCCAAG
AATTCTTAGCTAGCCAATACTTGATCCCTTCAGGGCTAGTCCCGTAGCCAACGAACGTCA
CCGCATGATTCACTCTGGTCCCACAGTACGGCTCATCGTACACTCCCCCTGAGTAATGCA
TGAAACCGGGTCCATCTGCGTCAATGGAAACCGAGACAGGCTGTCTCGACACAGCCTCGA
GCAACGCACGCTCGTTGTTGCTTGGAACAGTCTGGAAACCTCTGATTGATGCGGCGGGTC
TCGCATTAAACCGGCACATCTCGTATGTCCATAGGAAAGGGTACGCTTGCTCTGAGAAAG
GGTAAGCTTCTTCTGAGGCAATGCCTTGGTTTTGGACTATGTAGTCGAAAGCTTCTGTCA
TTATCCCACCTCCACAACCATTATTATACCCTCTGTCGCAATCTATAAGCTGTTGT

QA 1 596 1 596
DS 

RD RS1G342JQ 603 0 0
G
CCAAACTAGTCACTTTTGTTATTCTAGTGTTATATAACACTTAAACAATAAGCCATTTGC
CACTTAATTAAGCAATTGGATAATAAGCATTCTGAGCCACACCACACATGCCCTCAGGCC
AGTCCACATCTCTACGAATCCTAATGTAACCATTCTCTCCCCAAGTCTCACCCCAAGAAT
TCTTAGCTAGCCAATACTTGATCCCTTCAGGGCTAGTCCCGTAGCCAACGAACGTCACCG
CATGATTCACTCTGGTCCCACAGTACGGCTCATCATACACTCCCCCTGAGTAATGCATGA
AACCGGGTCCATCTGCGTCAATGGAAACCGAGACAGGCTGTCTCGACACAGCCTCGAGCA
ACGCACGCTCGTTGTTGCTTGGAACAGTCTGGAAACCTCTGATTGATGCGGCGGGTCTCG
CATTAAACCGGCACATCTCGTATGTCCATAGGAAAGGGTACGCTTGCTCTGAAAAAGGGT
AAGCTTCTTCTGAGGCAATGCCTTGGTTTTGGACTATGTAGTCGAAAGCTTCTGTCATTA
TCCCACCTCCACAACCATTATTATACCCTCTGTCGCAATCTATAAGCTGTTGTTCAGATA
AT

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DS 

RD RS1AT81JQ 773 0 0
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TGCCACTTAATTAAGCAATTGGATAATAAGCATTCTGAGCCACACCACACATGCCCTCAG
GCCAGTCCACATCTCTACGAATCCTAATGTAACCATTCTCTCCCCAAGCCTCACCCCAAG
AATTCTTAGCTAGCCAATACTTGATCCCTTCAGGGCTAGTCCCGTAGCCAACGAACGTCA
CCGCATGATTCACTCTGGTCCCACAGTACGGCTCATCGTACACTCCCCCTGAGTAATGCA
TGAAACCGGGTCCATCTGCGTCAATGGAAACCGAGACAGGCTGTCTCGACACAGCCTCGA
GCAACGCACGCTCGTTGTTGCTTGGAACAGTCTGGAAACCTCTGATTGATGCGGCGGGTC
TCGCATTAAACCGGCACATCTCGTATGTCCATAGGAAAGGGTACGCTTGCTCTGAAAAAG
GGTAAGCTTCTTCTGAGGCAATGCCTTGGTTTTGGACTATGTAGTCGAAAGCTTCTGTCA
TTATCCCACCTCCACAACCATTATTATACCCTCTGTCGCAATCTATAAGCTGTTGTTCAG
ATAATGGTATAAGTTTGCCTCCGGCAATCTTTGTCACACCTTCCACAGCGGCAACAGCTG
AGAACGCCCAATAACCTCCGCATAGGCCTTGGTATCTAACCGGTGTTACAGCTCCTTCGT
TTCTCCAATCTTTGGTCTCATGAGGGGCGACATCAGTGACGTTCCAGTCCTGA

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DS 

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CTCCCC*TGAGTAATGCATGAAACCGGGTCCATCTGCGTCAATGGAAACCGAGACAGGCT
GTCTCGACACAGCCTCGAGCAACGCACGCTCGTTGTTGCTTGGAACAGTCTGGAAACCTC
TGATTGATGCGGCGGGTCTCGCATTAAACCGGCACATCTCGTATGTCCATAGGAAAGGGT
ACGCTTGCTCTGAGAAAGGGTAAGCTTCCTCTGAGGCAATGCCTTGGTTTTGGACTATGT
AGTCGAAAGCTTCTGTCATTATCCCACCTCCACAACCATTATTATACCCTCTGTCGCAAT
CTATAAGCTGTTGTTCAGATAATGGTATAAGGTTGCCTCCGGCAATCTTTGTAACACCTT
CCACAGCGGCAACAGCTGAGAACGCCCAACAACCTCCGCATAGGCCTTGGTATCTAACCG
GTGTTACAGCTCCTTCGTTTCTCCAATCTTTGGTCTCATGAGGGGCGACATCAGTGACGT
TCCAGTCCTGATACGGTTCCACTTCATACATCAATCCACTTGGTGAATATCCGCCAGTGC
TCCTAAGACCGGTATGTGTGGCAATGAAATCCTCTTCGGGCCAATCCGCAAACTCGTTGA
CACCAAGCTTGTAGGTTCTATCTCCCTTTCTATTAAATTCCTCAATGAATTTAAAGTTC
C

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DS 

RD RS1FY33TF 712 0 0
AGGGTACGCTTGCTCTGAGAAAGGGTAAGCTTCTTCTGAGGCAATGCCT*GGTTTTGGAC
TATGTAGTCGAAAGCTTCTGTCATTATCCCACCTCCACAACCATTATTATACCCTCTGTC
GCAATCTATAAGCTGTTGTTCAGATAATGGTATAAGTTTGCCTCCGGCAATCTTTGTCAC
ACCTTCCACAGCGGCAACAGCTGAGAACGCCCAACAACCTCCGCATAGGCCTTGGTATCT
AACCGGTGTTACAGCTCCTTCGTTTCTCCAATCTTTGGTCTCATGAGGGGCGACATCAGT
GACGTTCCAGTCCTGATACGGTTCCACTTCATACATAAATCCACTTGGTGAATATCCGCC
AGTGCTCCTAAGACCGGTATGTGTGGCAATGAAATCCTCTTCGGGCCAATCCGCAAACTC
GTTGACACCAAGCTTGTAGGTTCTGTCTCCCTTTCTATTAAATTCCTCAATGAATTTAAA
GTTCTTCTTGAACATGTCGAATCTCATCTGTTTCTCGAGCTCGCTGTTATAAACTCGAGA
GAATCGATTCATCCATTGTTGATGGTGGTCAGCCAATAGTGGCTCGTGGAAGGTGACACG
AGATGTCGCTTGAGAGACGTTCAAACCCATGGAAAGAATGGTTAGAACCACAAACATGAG
CACTATCGATGACATTTTTTTTATGAATAAGGTTTTGAGTTTGTTGTTGTCC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RS1G342TF 636 0 0
GTTTTGGACTATGTAGTCGAAAGCTTCTGTCATTATCCCACCTCCACAACCATTATTATA
CCCTCTGTCGCAATCTATAAGCTGTTGTTCAGATAATGGTATAAGTTTGCCTCCGGCAAT
CTTTGTCACACCTTCCACAGCGGCAACAGCTGAGAACGCCCAACAACCTCCGCATAGGCC
TTGGTATCTAACCGGTGTTACAGCTCCTTCGTTTCTCCAATCTTTGGTCTCATGAGGGGC
GACATCAGTGACGTTCCAGTCCTGATACGGTTCCACTTCATACATAAATCCACTTGGTGA
ATATCCGCCAGTGCTCCTAAGACCGGTATGTGTGGCAATGAAATCCTCTTCGGGCCAATC
CGCAAACTCGTTGACACCAAGCTTGTAGGTTCTGTCTCCCTTTC*ATTAAATTCCTCAAT
GAATTTAAAGTTCTTCTTGAACATGTCGAATCTCATCTGTTTCTCGAGCTCGCTGTTATA
AACTCGAGAGAATCGATTCATCCATTGTTGATGGTGGTCAGCCAATAGTGGCTCGTGGAA
GGTGACACGAGATGTCGCTTGAGAGACGTTCAAACCCATGGAAAGAATGGTTAGAACCAC
AAACATGAGCACTATCGATGACATTTTTTTT
ATCAC

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 10

CO CL301Contig1 905 10 16 U
GAGTACTCAACATTTTAAACAATGAAATCAATTGATCTATTCCTCACCTATGCCTTCCCT
TACAGAGAGGTTTGGTCTGATGACATCCTTTGTACTTACAAGGAATACATCCCCAATGTA
AAGGTGATTTGTAGGCACATATACACAGCAAAGCTCCTCCTCTATCTGTGTCGAGCTCAT
TATCCGAAATCGAATTGATCGGATTTGATCATTTTGTGAGTTTCGTCAAACGGAAGAGAA
AGATGGTTGTGAGGCTGCGATTATCGAGACTCGGATGCAAGAACCGACCCTTCTTTAGGG
TAATGGCGGCGGATAGCAGATCTCCGAGAGACGGGAAGCACATCGAGGTCTTGGGTTACT
TCAATCCTTTGCCAGGGCAGGACGGTGGTAAGAGAATGGGTCTCAAGTTCGATCGAATCA
AGTACTGGTTATCTGTTGGTGCTCAAGCATCAGACCCGGTTCAGCGTCTCCTTTTCAGAT
CCGGTTTACTTCCTCCTCCTCCAATGGTGGCTATGGGACGTAAAGGTGGAGAACGAGACA
CTCGCCCTGTTGATCCAATGACTGGTCGCTTTGTCGACGCTGAGAAGAAACCACCCGTTA
TAGATAATCAGCCCAAGGAAGAAGACAAGAGTCCATGATTCCTTAAACAAGAAGAAGAAG
ATGCAGAAGACGAGAGAGTGAGTTCGTGAACTAATGGCGTTAGCCTTTTGTCTTTGTAGC
TTCGAAAATTCAGTTTGGTACTTTCTAGTTGATCTTGGTTCTATTTTATTCCTTTGCAAA
AATTCACTATGTTTGATGTGTTTAAACGGAAAGGCGTGTTGAGGTCTTGAGGGACTCAGG
TTATAAGTTTTGAGGTTTATGACTGTGCTTATTACCACTACCTATATAAGCTATTCTTTA
ACCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 35 35 45 45 15 45 45 15 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 30 30 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 40 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 
55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 25 
25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1DL68TF U 1
AF RS1DL68JQ C 63
AF RS1BQ67TF U 157
AF RS1GK86TF U 168
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AF RS1FN29JQ C 325
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AF RS1BQ67JQ C 164
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BS 561 613 RS1DL68TF
BS 614 738 RS1BQ67TF
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BS 806 839 RS1GK86TF
BS 840 905 RS1BQ67JQ

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TACAGAGAGGTTTGGTCTGATGACATCCTTTGTACTTACAAGGAATACATCCCCAATGTA
AAGGTGATTTGTAGGCACATATACACAGCAAAGCTCCTCCTCTATCTGTGTCGAACTCAT
TATCCGAAATCGAATTGATCGGATTTGATCATTTTGTGAGTTTCGTCAAACGGAAGAGAA
AGATGGTTGTGAGGCCGCGATTATCGAGACTCGGATGCAAGAACCGACCCTTCTTTAGGG
TAATGGCGGCGGATAGCAGATCTCCGAGAGACGGGAAGCACATCGAGGTCTTGGGTTACT
TCAATCCTTTGCCAGGGCAGGACGGTGGTAAGAGAATGGGTCTCAAGTTCGATCGAATCA
AGTACTGGTTATCTGTTGGTGCTCAAGCATCAGACCCGGTTCAGCGTCTCCTTTTCAGAT
TCGGTTTACTTCCTCCTCCTCCAATGGTGGCTATGGGACGTAAAGGTGGAGAACGAGACA
CTCGCCCTGTTGATCCAATTACTGGTCGCTTTGTCGACGCTGAGAAGAAACCACCCGTTA
TAGATAATCAGCC

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DS 

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GGTGATTTGTAGGCACATATACACAGCAAAGCTCCTCCTCTATCTGTGTCGAACTCATTA
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ATGGTTGTGAGGCCGCGATTATCGAGACTCGGATGCAAGAACCGACCCTTCTTTAGGGTA
ATGGCGGCGGATAGCAGATCTCCGAGAGACGGGAAGCACATCGAGGTCTTGGGTTACTTC
AATCCTTTGCCAGGGCAGGACGGTGGTAAGAGAATGGGTCTCAAGTTCGATCGAATCAAG
TACTGGTTATCTGTTGGTGCTCAAGCATCAGACCCGGTTCAGCGTCTCCTTTTCAGATTC
GGTTTACTTCCTCCTCCTCCAATGGTGGCTATGGGACGTAAAGGTGGAGAACGAGACACT
CGCCCTGTTGATCCAATTACTGGTCGCTTTGTCGACGCTGAGAAGAAACCACCCGTTATA
GATAATCAGCCCAAGGAAGAAGACAAGAGTCCATGATTCCTTAAACAAGAAGAA***GAT
GCAGAAGACGAGAGAGTGAGTTCGTGAACTAATGGCGTTAGCCTTTTGTCTTTGTAGCTT
CGAAAATTCAGTTTGGTACTTTCTAGTTGATCTTGGTTCTATTTTATTCCTTTGCAAAAA
TTCACTATGTTTGATGTGTTTAAACGGAAAGGCGTGTTGAGGTCTTGAGG

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DS 

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GGCCTCT
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CCGACCCTTCTTTAGGGTAATGGCGGCGGATAGCAGATCTCCGAGAGACGGGAAGCACAT
CTAGGTCTTGGGTT***TCAATCCTTTGCCAGGGCAGGACGGTGGTAAGAGAATGGGTCT
CAAGTTCGATCGAATCAAGTACTGGTTATCTGTTGGTGCTCAAGCATCAGACCCGGTTCA
GCGTCTCCTTTTCAGATCCGGTTTACTTCCTCCTCCTCCAATGGTGGCTATGGGACGTAA
AGGTGGAGAACGAGACACTCGCCCTGTTGATCCAATGACTGGTCGCTTTGTCGACGCTGA
GAAGAAACCACCCGTTATAGATAATCAGCCCAAGGAAGAAGACAAGAGTCCATGATTCCT
TAAACAAGAAGAAGAAGATGCAGAAGACGAGAGAGTGAGTTCGTGAACTAATGGCGTTAG
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TTTTATTCCTTTGCAAAA*TTCACTATGTTTGATGTGTTTAA
CGG

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GG
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CTTGGGTTACTTCAATCCTTTGCCAGGGCAGGACGGTGGTAAGAGAATGGGTCTCAAGTT
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CCTTTTCAGATCCGGTTTACTTCCTCCTCCTCCAATGGTGGCTATGGGACGTAAAGGTGG
AGAACGAAACACTCGCCCTGTTGATCCAATGACTGGTCGCTTTGTCGACGCTGAGAAGAA
ACCACCCGTTATAGATAATCAGCCCAAGGAAGAAGACAAGAGTCCATGATTCCTTAAACA
AGAAGAAGAAGATGCAGAAGACGAGAGAGTGAGTTCGTGAACTAATGGCGTTAGCCTTT*
GTCTTTGTAGCTTCGAAAATTCAGTTTGGTACTTTCTAGTTGATCTTGGTTCTATTTTAT
TCCTTTGCAAGAATTCACTATGTTTGATGTGTTTAAACGGAAAGGCGTGTTGAGGTCTTG
AGGGACTCAG
TTATG

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DS 

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GG
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AAACGGAAGAGAAAGATGGTTGTGAGGCTGCGATTATCGAGACTCGGATGCAAGAACCGA
CCCTTCTTTAGGGTAATGGCGGCGGATAGCAGATCTCCGAGAGACGGGAAGCACATCGAG
GTCTTGGGTTACTTCAATCCTTTGCCAGGGCAGGACGGTGGTAAGAGAATGGGTCTCAAG
TTCGATCGAATCAAGTACTGGTTATCTGTTGGTGCTCAAGCATCAGACCCGGTTCAGCGT
CTCCTTTTCAGATCCGGTTTACTTCCTCCTCCTCCAATGGTGGCTATGGGACGTAAAGGT
GGAGAACGAGACACTCGCCCTGTTGATCCAATGACTGGTCGCTTTGTCGACGCTGAGAAG
AAACCACCCGTTATAGATAATCAGCCCAAGGAAGAAGACAAGAGTCCATGATTCCTTAAA
CAAGAAGAAGAAGATGCAGAAGACGAGAGAGTGAGTTCGTGAACTAATGGCGTTAGCCTT
TTGTCTTTGTAGCTTCGAAAATTCAGTTTGGTACTTTCTAGTTGATCTTGGTTCTATTTT
ATTCCTTTGCAAAAATTCACTATGTTTGATGTGTTTAAACGGAAAGGCGTGTTGAGGTCT
TGAGGGACTCAG
TTAT

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DS 

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GG
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GCGATTATCGAGACTCGGATGCAAGAACCGACCCTTCTTTAGGGTAATGGCGGCGGATAG
CAGATCTCCGAGAGACGGGAAGCACATCGAGGTCTTGGGTTACTTCAATCCTTTGCCAGG
GCAGGACGGTGGTAAGAGAATGGGTCTCAAGTTCGATCGAATCAAGTACTGGTTATCTAT
TGGTGCTCAAGCATCAGACCCGGTTCAGCGTCTCCTTTTCAGATCCGGTTTACTTCCTCC
TCCTCCAATGGTGGCTATGGGACGTAAAGGTGGAGAACGAGACACTCGCCCTGTTGATCC
AATGACTGGTCGCTTTGTCGACGCTGAGAAGAAACCACCCGTTATAGATAATCAGCCCAA
GGAAGAAGACAAGAGTCCATGATTCCTTAAACAAGAAGAAGAAGATGCAGAAGACGAGAG
AGTGAGTTCGTGAACTAATGGCGTTAGCCTTTTGTCTTTGTAGCTTCGAAAATTCAGTTT
GGTACTTTCTAGTTGATCTTGGTTCTATTTTATTCCTTTGCAAAAATTCACTATGTTTGA
TGTGTT

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DS 

RD RS1BH19JQ 519 0 0
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TGGTAAGAGAATGGGTCTCAAGTTCGATCGAATCAAGTACTGGTTATCTATTGGTGCTCA
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GGTGGCTATGGGACGTAAAGGTGGAGAACGAGACACTCGCCCTGTTGATCCAATGACTGG
TCGCTTTGTCGACGCTGAGAAGAAACCACCCGTTATAGATAATCAGCCCAAGGAAGAAGA
CAAGAGTCCATGATTCCTTAAACAAGAAGAAGAAGATGCAGAAGACGAGAGAGTGAGTTC
GTGAACTAATGGCGTTAGCCTTTTGTCTTTGTAGCTTCGAAAATTCAGTTTGGTACTTTC
TAGTTGATCTTGGTTTTATTTTATTCCTTTGCAAAAATTCACTATGTTTGATGTGTTTAA
ACGGAAAGGCGTGTTGAGGTCTTGAGGGACTCAGGTTAT

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DS 

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GTGGTAAGAGAATGGGTCTCAAGTTCGATCGAATCAAGTACTGGTTATCTGTTGGTGCTC
AAGCATCAGACCCGGTTCAGCGTCTCCTTTTCAGATCCGGTTTACTTCCTCCTCCTCCAA
TGGTGGCTATGGGACGTAAAGGTGGAGAACGAGACACTCGCCCTGTTGATCCAATGACTG
GTCGCTTTGTCGACGCTGAGAAGAAACCCCCCGTTATAGATAATCAGCCCAAGGAAGAAG
ACAAGAGTCCATGATTCCTTAAACAAGAAGAAGAAGATGCAGAAGACGAGAGAGTGAGTT
CGTGAACTAATGGCGTTAGCCTTTTGTTTTTGTAGCTTCGAAAATTCAGTTTGGTACTTT
CTAGTTGATCTTGGTTTTATTTTATTCCTTTGCAAAAATTCACTATGTTTGATGTGTTTA
AACGGAAAGGCGTGTTGAGGTCTTGAGGGACTCAGGTTAT

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DS 

RD RS1GK86JQ 678 0 0
GG
GTCGAGCTCATTATCCGAAATCGAATTGATCGGATTTGATCATTTTGTGAGTTTCGTCAA
ACGGAAGA*AAAGATGGTTGTGAGGCTGCGATTATCGAGACTCGGATGCAAGAACCGACC
CTTCTTTAGGGTAATGGCGGCGGATAGCAGATCTCCGAGAGACGGGAAGCACATCGAGGT
CTTGGGTTACTTCAATCCTTTGCCAGGGCAGGACGGTGGTAAGAGAATGGGTCTCAAGTT
CGATCGAATCAAGTACTGGTTATCTGTTGGTGCTCAAGCATCAGACCCGGTTCAGCGTCT
CCTTTTCAGATCCGGTTTACTTCCTCCTCCTCCAATGGTGGCTATGGGACGTAAAGGTGG
AGAACGAAACACTCGCCCTGTTGATCCAATGACTGGTCGCTTTGTCGACGCTGAGAAGAA
ACCACCCGTTATAGATAATCAGCCCAAGGAAGAAGACAAGAGTCCATGATTCCTTAAACA
AGAAGAAGAAGATGCAGAAGACGAGAGAGTGAGTTCGTGAACTAATGGCGTTAGCCTTT*
GTCTTTGTAGCTTCGAAAATTCAGTTTGGTACTTTCTAGTTGATCTTGGTTCTATTTTAT
TCCTTTGCAAGAATTCACTATGTTTGATGTGTTTAAACGGAAAGGCGTGTTGAGGTCTTG
AGGGACTCAGGTTAT
G

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DS 

RD RS1BQ67JQ 742 0 0
ATCTGTGTTGAGCTCATTATCCGAAATCGAATTTATCGGATTTGATCATTTTGTGAGTTT
CGTCAAACGGAAGAGAAAGATGGTTGTGAGGCTGCGATTATCGAGACTCGGATGCAAGAA
CCGACCCTTCTTTAGGGTAATGGCGGCGGATAGCAGATCTCCGAGAGACGGGAAGCACAT
CTAGGTCTTGGGTT***TCAATCCTTTGCCAGGGCAGGACGGTGGTAAGAGAATGGGTCT
CAAGTTCGATCGAATCAAGTACTGGTTATCTGTTGGTGCTCAAGCATCAGACCCGGTTCA
GCGTCTCCTTTTCAGATCCGGTTTACTTCCTCCTCCTCCAATGGTGGCTATGGGACGTAA
AGGTGGAGAACGAGACACTCGCCCTGTTGATCCAATGACTGGTCGCTTTGTCGACGCTGA
GAAGAAACCACCCGTTATAGATAATCAGCCCAAGGAAGAAGACAAGAGTCCATGATTCCT
TAAACAAGAAGAAGAAGATGCAGAAGACGAGAGAGTGAGTTCGTGAACTAATGGCGTTAG
CCTTTTGTCTTTGTAGCTTCGAAAATTCAGTTTGGCACTTTCTAGTTGATCTTGGTTCTA
TTTTATTCCTTTGCAAAAATTCACTATGTTTGATGTGTTTAAACGGAAAGGCGTGTTGAG
GTCTTGAGGGACTCAGGTTATAAGTTTTGAGGTTTATGACTGTGCTTATTACCACTACCT
ATATAAGCTATTCTTTAACCAA

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 9

CO CL302Contig1 660 9 2 U
GGAGGGTTTCAGCTGCTTCACCATCTCTCCAGATTTAGTGTCGGAAGGATCGTTCAGAAG
CAATGTCTCCGGCTAAAGTTGATACCACGAAGAAGGCCGACCCAAAGGCCAAGGCCTTGA
AGGCTGCGAAGGCAGTGAAGTCTGGTCAGGCCTTCAAGAAGAAGGACAAGAAGATCAGGA
CAAAGGTCACCTTCCACAGGCCGAAGACCTTGACCAAGGCTAGAGACCCCAAGTACCCGA
GAATCAGTGCTACTCCAAGGAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACTCA
CCACTGAGTCTGCGATGAAGAAGATCGAGGACAACAACACTCTTGTCTTCATTGTTGACA
TTCGTGCCGATAAGAAGAAGATCAAAGATGCTGTTAAGAAAATGTACGACATTCAGACCA
AGAAAGTTAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACAC
CGGACTATGATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATTGGCATCATCTAAGTTTTATCTACCT
CTCTCTACTATTGTGAAAC*AGTGTTTTTGTCACTTTCTTGTAGACTCCAGTTTTGCATT
GAGATATTTATTATCTACCATCGTCGTTTAATGTTGAATTCAAGTTCTATGTTTAAAAAA


BQ
35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 25 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 25 25 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DX03TF U 1
AF RS1GR33JQ C 181
AF RS1GR33TF U 181
AF RS1F912JQ C 1
AF RS1F912TF U 1
AF RS1DR80JQ C 7
AF RS1DR80TF U 7
AF RS1E784JQ C 1
AF RS1E784TF U 1
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AGAAAGTTAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACAC
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CTCTCTACTATTGTGAAAC*AGTGTTTTTGTCACTTTCTTGTAGACTCCAGTTTTGCATT
GAGATATTTATTATCTACCATCGTCGTTTAATGTTGAATTCAAGTTCTATG
GTTA

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DS 

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G
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AATCAGTGCTACTCCAAGGAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACTCAC
CACTGAGTCTGCGATGAAGAAGATCGAGGACAACAACACTCTTGTCTTCATTGTTGACAT
TCGTGCCGATAAGAAGAAGATCAAAGATGCTGTTAAGAAAATGTACGACATTCAGACCAA
GAAAGTTAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACACC
GGACTATGATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATTGGCATCATCTAAGTTTTATCTACCTC
TCTCTACTATTGTGAAAC*AGTGTTTTTGTCACTTTCTTGTAGACTCCAGTTTTGCATTG
AGATATTTATTATCTACCATCGTCGTTTAATGTTGAATT

QA 2 460 2 460
DS 

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G
AAAGGTCACCTTCCACAGGCCGAAGACCTTGACCAAGGCTAGAGACCCCAAGTACCCAAG
AATCAGTGCTACTCCAAGGAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACTCAC
CACTGAGTCTGCGATGAAGAAGATCGAGGACAACAACACTCTTGTCTTCATTGTTGACAT
TCGTGCCGATAAGAAGAAGATCAAAGATGCTGTTAAGAAAATGTACGACATTCAGACCAA
GAAAGTTAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACACC
GGACTATGATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATTGGCATCATCTAAGTTTTATCTACCTC
TCTCTACTATTGTGAAAC*AGTGTTTTTGTCACTTTCTTGTAGACTCCAGTTTTGCATTG
AGATATTTATTATCTACCATCGTCGTTTAATGTTGAATT

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CCACTGAGTCTGCCATGAAGAAGATCGAGGACAACAACACTCTTGTCTTCATTGTTGACA
TTCGTGCCGACAAGAAGAAGATCAAAGATGCTGTTAAAAAGATGTACGACATTCAGACCA
AGAAAGTTAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACAC
CGGACTATGATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATTGGCATCATCTAAGTTTTATCTACCT
CT****ACTATTGTGAAACCAGTGTTTTTGTCACTTGCTTGTAGACTCCAGTTTTGCATT
GAGATATT*ATTATCTACCA
CC

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DS 

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AGAAAGTTAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACAC
CGGACTATGATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATTGGCATCATCTAAGTTTTATCTACCT
CT****ACTATTGTGAAACCAGTGTTTTTGTCACTTGCTTGTAGACTCCAGTTTTGCATT
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CC

QA 1 620 1 620
DS 

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GG
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T

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RD RS1DR80TF 646 0 0
GG
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AAGGCAGTGAAGTCTGGTCAGGCCTTCAAGAAGAAGGACAAGAAGATCAGGACAAAGGTC
ACCTTCCACAGGCCGAAGACCTTGACCAAGGCTAGAGACCCCAAGTACCCGAGAATCAGT
GCTACTCCAAGGAACAAGTTGGACCATTACGGTATCCTCAAGTACCCACTCACCACTGAG
TCTGCGATGAAGAAGATCGAGGACAACAACACTCTTGTCTTCATTGTTGACATTCGTGCC
GATAAGAAGAAGATCAAAGATGCTGTTAAGAAAATGTACGACATTCAGACCAAGAAAGTT
ACCACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACACCGGACTAT
GATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATTGGCATCATCTAAGTTTTATCTACCTCTCTCTAC
TATTGTGAAAC*AGTGTTTTTGTCACTTTCTTGTAGACTCCAGTTTTGCATTGAGATATT
TATTATCTACCATCGTCGTTTAATGTTGAATTCAAGTTCTATG
T

QA 3 645 3 645
DS 

RD RS1E784JQ 646 0 0
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DS 

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CTCTCTACTATTGTGAAAC*AGTGTTTTTGTCACTTTCTTGTGGACTCCAGTTTTGCATT
GAGATATTTATTATCTACCATCGTCGTTTAATGTTGAATTCAAGTTCTATGTTTAAAAAA

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 10

CO CL303Contig1 974 10 31 U
GGATTTTCGTTTTGTTCGGACTTGTCTCTCGCTCGCAGGAAGGTTAGTCGAGATACTGCT
TTCGATTCAGA*CGATGGCTTCCGCGGCTCTTCTCCGATCGCTTCGCCGACGCGACGTCG
TCTCTGCGCCTCTTTCCGTCTACAAATCTCTTGCTGGTAACGCTCAACCTTCATTGGGTA
GTGGTCAAAACTATGCAAGTTTGTGTAGAGCTTTCGGATCAAAATCTGGTTTGAACGACA
ATTTTGGGACTGGTTTTGGAACTACTAACATAAGCAATGCCTTAAGAGAGGAGAGAGAGC
ACTCAAGAGCTACTGTGAATGCTATGGGAGCTCATTTGAGAGCTCTTGGTGTGGGAACAC
CGAGACGCGTGTTGTCTACAGTCGCAGAGGGTATCAAGATGACAGAGGAAGATCAGACTT
CTCCAAAACCCCAAAGCTTTCGCCCTTTATCTCCTCACCTCACTGTTTACCAGCCTCAGA
AGAACTCAATGCTATCCATTTTCAACAGAATCTCGGGGATTTACTTGACCGGAGTCTTTT
ATGGCGGATACCTTCTCTACCTGAAGATGGGTATGATCTGCCTCACTTACCCAAGCTTCT
ACCAGGTTCATTACCTTGTACAGCAGCAACTCCCTGTCATCACCTCGGTTACTGCGTTAG
CCGCGCTTTACCATACTATCAAGAGTATTCACTCGCTCTTGACCCATTGAAAACAACCTC
CTCCCAAA*GCTCTTTCGTTGTTTGGTTAAAGC*ACCGCCAAAGTCTCCAGTAAGAGTTT
CCTTGAGATGCACAAGATTTAATAAAAGAGAGTAGAAACGTTTTGTCAAACTCTCATCGT
CTTTTTGACAAAGCAAAGTGTCTAGCTTTTGTTTTGGGATTT*CAGGCTTTGAAAGCTTT
ATGTTTGTTTGCTTTTTCTTTGTTGTAAGACCTAATTGAAGGGGTTGGAATGTAATAAAA
TGTTTACCAGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 15 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 10 10 30 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RS1DE59TF U 39
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AF RS1B114TF U 6
AF RS1BA34TF U 8
AF RS1CD80TF U 1
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RD RS1DE59TF 505 0 0
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GCCTTAAGAGAGGAGAGAGAGCACTCAAGAGCTACTGTGAATGCTATGGGAGCTCATTTG
AGAGCTCTTGGTGTGGGAACACCGAGACGCGTGTTGTCTACAGTCGCAGAGGGTATCAAG
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ATTTACTTGACCGGAGTCTTTTATG

QA 1 505 1 505
DS 

RD RS1CS80TF 666 0 0
ATTTCG
TTTTGTTCGGACTTGTCTCTCGCTCGCGGGAAGGTTAGTCGAGATACTGCTTTCGATTCA
GA*CGATGGCCGCCACGGCTCTTCTCCGATCGCTTCGTCGACGCGACGTCGTCTCTGCGC
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CTACTGTGAATGCTATGGGAGCTCATTTGAGAGCTCTTGGTGTGGGAACACCGAGACGCG
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CCCAGAGCTTTCGCCCTCTATCTCCTCACCTCACTGTTTACCAGCCTCAGAAGAACTCCA
TGTTATCCATTTTCAACAGAATCTCGGGGATTTACTTGACCGGAGTCTTTTATGGCGGAT
ACCTTCTCTACCTGAAGATGGGTATGATCTGCCTCACTTACCCAAGCTTCTACCAGGTTC
ATTACCTCGTACAGCAGCAACTCCCTGTCATCACCTCGGTTAC*GCGTTAGCCGCGCTTT

QA 7 666 7 666
DS 

RD RS1B114TF 748 0 0
GGCC
TTTTGTTCGGACTTGTCTCTCGCTCGCAGGAAGGTTAGTCGAGATACTGCTTTCGATTCA
GA*CGATGGCTTCCGCGGCTCTTCTCCGATCGCTTCGCCGACGCGACGTCGTCTCCGCGC
CTCTTTCCGTCTACAAATCTCTTGCTGGTAACGCTCAACCTTCATTGGGTAGTGGTCAAA
ACTATGCAAGTTTGTGTAGAGCTTTCGGATCAAAATCTGGTTTGAACGACAATTTTGGGA
CTGGTTTTGGAACTACTAACATAAGCAATGCCTTAAGAGAGGAGAGAGAGCACTCGAGAG
CTACTGTGAATGCTATGGGAGCTCATTTGAGAGCTCTTGGTGTGGGAACACCGAGACGCG
TGTTGTCTACAGTCGCAGAGGGTATCAAGATGACAGAGGAAGATCAGACTTCTCCAAAAC
CCCAAAGCTTTCGCCCTTTATCTCCTCACCTCACTGTTTACCAGCCTCAGAAGAACTCAA
TGCTATCCATTTTCAACAGAATCTCGGGGATTTACTTGACCGGAGTCTTTTATGGCGGAT
ACCTTCTCTACCTGAAGATGGGTATGATCTGCCTCACTTACCCAAGCTTCTACCAGGTTC
ATTACCTTGTACAGCAGCAACTCCCTGTCATCACCTCGGTTACTGCGTTAGCCGCGCTTT
ACCATACTATCAAGAGTATTCACTCGCTCTTGACCCATTGAAA*CA*CCTCCTCCCAAA*
GCTCTTTCGTTGTTTGGT
AAAGCC

QA 5 742 5 742
DS 

RD RS1BA34TF 721 0 0
CC
TTTTGTTCGGACTTGTCTCTCGCTCGCAGGAAGGTTAGTCGAGATACTGCTTTCGATTCA
GA*CGATGGCTTCCGCGGCTCTTCTCCGATCGCTTCGCCGACGCGACGTCGTCTCTGCGC
CTCTTTCCGTCTACAAATCTCTTGCTGGTAACGCTCAACCTTCATTGGGTAGTGGTCAAA
ACTATGCAAGTTTGTGTAGAGCTTTCGGATCAAAATCTGGTTTGAACGACAATTTTGGGA
CTGGTTTTGGAACTACTAACATAAGCAATGCCTTAAGAGAGGAGAGAGAGCACTCAAGAG
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TGTTGTCTACAGTCGCAGAGGGTATCAAGATGACAGAGGAAGATCAGACTTCTCCAAAAC
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ATTACCTTGTACAGCAGCAACTCCCTGTCATCACCTCGGTTACTGCGTTAGCCGCGCTTT
AC*ATACTATCAAGAGTATTCACTCGCTCTTGACCCATTGAAA*CAACCTCCTCCCAAA

QA 3 721 3 721
DS 

RD RS1CD80TF 797 0 0
GGATTTTCGTTTTGTTCGGACTTGTCTCTCGCTCGCAGGAAGGTTATTCGAGATGCTGCT
TTCGATTCAGAACGATGGCTGCCACGGCTCTTCTCCGATCGCTTCGCCGACGCGACGTCG
TCTCTGCGCCTCTTTCCGTCTACAAATCTCTTGCTGGTAACGCTCAAGCTTCTTTGGGTA
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ATGGCGGATACCTTCTCTACCTGAAGATGGGTATGATCTGCCTCACTTACCCAAGCTTCT
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CCTTGAGATGCACA
GAT

QA 1 794 1 794
DS 

RD RS1BA34JQ 802 0 0
ATTGGGTAGTG*TCAAAACTATGCAAGTTTGTGTAGAGCTTTCGGATCAAAATCTGGTTT
GAACGACAATTTTGGGACTGGTTTTGGAACTACTAACATAAGCAATGCCTTAAGAGAGGA
GAGAGAGCACTCAAGAGCTACTGTGAATGCTATGGGAGCTCATTTGAGAGCTCTTGGTGT
GGGAACACCGAGACGCGTGTTGTCTACAGTCGCAGAGGGTATCAAGATGACAGAGGAAGA
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CTCATCGTCTTTTTGACAAAGCAAAGTGTCTAGCTTTTGTTTTGGGATTT*CAGGCTTTG
AAAGCTTTATGTTTGTTTGCTTTTTCTTTGTTGTAAGACCTAATTGAAGGGGTTGGAATG
TAATAAAATGTTTACCAGTT
CT

QA 1 800 1 800
DS 

RD RS1DE59JQ 634 0 0
AGCTCTTGGTGTGGGAACACCGAGACGCGTGTTGTCTACAGTCGCAGAGGGTATCAAGAT
GACAGAGGAAGATCAGACTTCTCCAAAACCCCAAAGCTTTCGCCCTTTATCTCCTCACCT
CACTGTTTACCAGCCTCAGAAGAACTCAATGCTATCCATTTTCAACAGAATCTCGGGGAT
TTACTTGACCGGAGTCTTTTATGGCGGATACCTTCTCTACCTGAAGATGGGTATGATCTG
CCTCACTTACCCAAGCTTCTACCAGGTTCATTACCTTGTACAGCAGCAACTCCCTGTCAT
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GACCCATTGAAAACAACCTCCTCCCAAAAGCTCTTTCGTTGTTTGGTTAAAGC***CGCC
AAAGTCTCCAGTAAGAGTTTCCTTGAGATGCACAAGATTTAATAAAAGAGAGTAGAAACG
TTTTGTCAAACTCTCATCGTCTTTTTGACAAAGCAAAGTGTCTAGCTTTTGTTTTGGGAT
TT*CAGGCTTTGAAAGCTTTATGTTTGTTTGCTTTTTCTTTGTTGTAAGACCTAATTGAA
GGGGTTGGAATGTAATAAAATGTTTACCAGTT
CT

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1CD80JQ 743 0 0
TCTGG
TTGAACGACAATTTTGGGACTGGTTTTGGAACTACTAACATAAGCAATGCCTTCAGAGAG
GAGAGAGAGCACTCAAGAGCTACTGTGAATGCTATGGGAGCTCATTTGAGAGCTCTTGGT
GTGGGAACACCGAGACGCGTGTTGTCTACAGTCGCAGAGGGTATAAAGATGACAGAGGAA
GATCAGACTTCTCCAAAACCCCAAAGCTTTCGCCCTTTATCTCCTCACCTCACTGTTTAC
CAGCCTCAGAAGAACTCAATGCTATCCATTTTCAACAGAATCTCGGGGATTTACTTGACC
GGAGTCTTTTATGGCGGATACCTTCTCTACCTGAAGATGGGTATGATCTGCCTCACTTAC
CCAAGCTTCTACCAGGTTCATTACCTTGTACAGCAGCAACTCCCTGTCATCACCTCGGTT
ACTGCATTAGCCGCGCTTTACCATACTATCAAGAGTATTCACTCGCTCTTGACCCATTGA
AAACAACCTCCTCCCAAA*GCTCTTTCGTTGTTTGGTTAAAGCCACCGCCAAAGTCTCCA
GTAAGAGTTTCCTTGAGATGCACAAGATTTAATAAAAGAGAGTAGAAACGTTTTGTCAAA
CTCTCATCGTCTTTTTGACAAAGCAA*GTGTCTAGCTTTTGTTTTGGGATTTTCAGGCTT
TGAA*GCTTTATGTTTGTTTGCTTTTTCTTTGTTATAAGACCTAATTGAAGGGGTTGGAA
TGTAATAAAATGTTT
ATC

QA 6 740 6 740
DS 

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AAACAAAGGGTT
TAGCTTTTGTTTTGGGATTT*CAGGCTTTGAAAGCTTTATGTTTGTTTGCTTTTTTTTTG
TTGTAAGACCTAATTGAAGGGGTTGGAATGTAATAAAATGTTTCCCAGTTTT

QA 13 124 13 124
DS 

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TTTTGTTTTGGGATTT*CAGGCTTTGAAAGCTTTATGTTTGTTTGCTTTTTTTTTGTTGT
AAGACCTAATTGAAGGGGTTGGAATGTAATAAAATGTTTCCCAGTT
TT

QA 1 106 1 106
DS 



AS 1 9

CO CL304Contig1 879 9 19 U
TTTTTTTTTCCCAAAACTGAATAAACTGATGCGAAATCGCTTGAAGCATCAAATACTTAT
CTATTCGAAAGTAGTTCAGACGAAATAAACACCATAAGACAAGAACAAAACATCTGTAAC
ATAGTGAAAACAAAACATAAATTTCATTGATAAGATTGTATCCATCAGGGCAAAAGGAAA
CTCCTTAACGGTTGGCCTTGGCAACTCTCTCGATCTCATCCTTCTTTTTGATGGCATAGC
TGTTGGAGGAGCCCTTGGCTGCGTTGATCAACTCATCGGCAAGACACTCAGCAATAGTCT
TAATGTTTCTGAAAGCAGCCTCACGAGCCCCGGTTGTGAGCAAGAAGATCGCCTGGTTAA
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TGGTAGCATCTTCACGTGGACCACTGTTAACAATGGCATCAATGATGATCTGAATCGGGT
TGGCATCAGTCAAGAGGTGGATGATCTCCATGGCGTGCTTGATGATCCTCACCGCCATCA
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TGGCGTGTTTGGCTGCCTGAACTCCAATGTAGTCAACAAGACTGATGTCTGCAACCGAGA
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CTGCGTCGATTTCTGCGGCGGCGGCCATGGCTGAGATCGGTAAGCGACGCGCGGGAGAGA
GTGACGGCGGGGAGAGAGAGAGAGAGATCAAAAGCTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 20 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 35 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C779JQ U 84
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AF RS1GG25JQ U 10
AF RS1GL76TF C 1
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TCATTGATAAGATTGTATCCACCAGGTCAAAAGGAAACTCCTTAACGGTTGGCCTTGGCA
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QA 1 233 1 233
DS 

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C
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CAAAACATAAATTTCATTGATAAGATTGTATCCATCAGGGCAAAAGGAAACTCCTTAACG
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GTTGTTTCTTCCGTGCATCATGAGAGAGTTGGTGAGCCTCTCAACAATGGGGCACTGAGC
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DS 

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G
CCAAAACTGAATAAACTGATGCGAAATCGCTTGAAGCATCAAATACTTATCTATTCGAAA
GTAGTTCAGACGAAATAAACACCATAAGACAAGAACAAAACATCTGTAACATAGTGAAAA
CAAAACATAAATTTCATTGATAAGATTGTATCCATCAGGGCAAAAGGAAACTCCTTAACG
GTTGGCCTTGGCAACTCTCTCGATCTCATCCTTCTTTTTGATGGCATAGCTGTTGGAGGA
GCCCTTGGCTGCGTTGATCAACTCATCGGCAAGACACTCAGCAATAGTCTTAATGTTTCT
GAAAGCAGCCTCACGAGCCCCGGTTGTGAGCAAGAAGATCGCCTGGTTAACACGTCTCAG
AGGAGAGATATCAACGGCTTGTCTCCTAACGACACCAGCAGATCCAATTCTGGTAGCATC
TTCACGTGGACCACTGTTAACAATGGCATCAATGATGATCTGAATCGGGTTGGCATCAGT
CAAGAGGTGGATGATCTCCATGGCGTGCTTGATGATCCTCACCGCCATCAACTTCTTCCC
GTTGTTTCTTCCGTGCATCATGAGAGAGTTGGTGAGCCTCTCAACAATGGGGCACTGAGC
CTTCCTGAATCTCTTCACAGAGTATCTTCCCGTAGTGTGGGGGACAAAGGTGGCGTGTTT
GGCTGCCTGAACTCCAATGTAGTCAACAAGACTGATGTCTGCAACCGAGACGTCATCGTA
GGTCCAGCGGTTGA

QA 2 735 2 735
DS 

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CTATTCGAAAGTAGT*CAGACGAAATAAACACCATAAGACAAGAACAAAACATCTGTAAC
ATAGTGAAAACAAAACATAAATTTCATTGATAAGATTGTATCCATCAGGGCAAAAGGAAA
CTCCTTAACGATTGGCCTTGGCAACTCTCTCGACCTCATCCTTCTTTTTGATGGCATAGC
TGTTGGAGGAGCCCTTGGCTGCGTTGATCAACTCATCGGCAAGACACTCAGCAATAGTCT
TAATGTTTCTGAAAGCAGCCTCACGAGCCCCGGTTGTGAGCAAGAAGATCGCCTGGTTAA
CGCGTCTCAGAGGAGAGATATCAACGGCTTGTCTCCTAACGACACCAGCAGATCCAATT*
TGGTAGCATCTTCACGTGGACCACTGTTAACAATGGCATCAATGATGATCTGAATCGGGT
TGGCATCAGTCAAGAGGTGGATGATCTCCATGGCGTGCTTGATGATCCTCACCGCCATCA
ACTTCTTCCCGTTGTTTCTTCCGTGCATCATGAGAGAGTTGGTGAGCCTCTCAACAATGG
GGCACTGAGCCTTCCTGAATCTCTTCACAGAGTATCTTCCCGCAGTGTGGGGGACAAAGG
TGGCGTGTTTGGCTGCCTGAACTCCAATGTAGTCAACAAGACTGATGTCTGCAACCGAGA
CGTCATCGTAGGTCCAGCGGTTGAAGAGCTTGACCTCGTTGGTAAGCTGCTGCTGAATCT
CTGCGTCGATTTCTGCGGCGGCG
C

QA 1 803 1 803
DS 

RD RS1H316JQB 762 0 0
GGCT
TGAAGCATCAAATACTTATCTATTCGAAAGTAGTTCAGACGAAATAAACACCATAAGACA
AGAACAAAACATCTGTAACACAGTGAAAACAAAACATAAATTTCATTGATAAGATTGTAT
CCATCAGGGCAAAAGGAAACTCCTTAACGGTTGGCCTTGGCAACTCTCTCGATCTCATCC
TTCTTTTTGATGGCATAGCTGTTGGAGGAGCCCTTGGCTGCGTTGATCAACTCATCGGCA
AGACACTCAGCAATAGTCTTAATGTTTCTGAAAGCAGCCTCACGAGCCCCGGTTGTGAGC
AAGAAGATCGCCTGGTTAACACGTCTCAGAGGAGAGATATCAACGGCTTGTCTCCTAACG
ACACCAGCAGATCCAATTCTGGTAGCATCTTCACGTGGACCACTGTTAACAATGGCATCA
ATGATGATCTGAATCGGGTTGGCATCAGTCAAGAGGTGGATGATCTCCATGGCGTGCTTG
ATGATCCTCACCGCCATCGACTTCTTCCCGTTGTTTCTTCCGTGCATCATGAGAGAGTTG
GTGAGCCTCTCAACAATGGGGCACTGAGCCTTCCTGAATCTCTTCACAGAGTATCTTCCC
ACAGTGTGGGGGACAAAGGTGGCGTGTTTGGCTGCCTGAACTCCAATGTAGTCAACAAGA
CTGATGTCTGCAACCGAGACGTCATCGTAGGTCCAGCGGTTGAAGAGCTTGACCTCGTTG
GTAAGCTGCTGCTGAATCTCTGCGTCGATTTCTG
TGGC

QA 5 758 5 758
DS 

RD RS1B778JQ 837 0 0
GG
AGCATCAAATACTTATCTATTCGAAAGTAGTTCAGACGAAATAAACACCATAAGACAAGA
ACAAAACATCTGTAACATAGTGAAAACAAAACATAAATTTCATTGATAAGATTGTATCCA
TCAGGGCAAAAGGAAACTCCTTAACGGTTGGCCTTGGCAACTCTCTCGATCTCATCCTTC
TTTTTGATGGCATAGCTGTTGGAGGAGCCCTTGGCTGCGTTGATCAACTCATCGGCAAGA
CACTCAGCAATAGTCTTAATGTTTCTGAAAGCAGCCTCACGAGCCCCGGTTGTGAGCAAG
AAGATCGCCTGGTTAACACGTCTCAGAGGAGAGATATCAACGGCTTGTCTCCTAACGACA
CCAGCAGATCCAATTCTGGTAGCATCTTCACGTGGACCACTGTTAACAATGGCATCAATG
ATGATCTGAATCGGGTTGGCATCAGTCAAGAGGTGGATGATCTCCATGGCGTGCTTGATG
ATCCTCACCGCCATCAACTTCTTCCCGTTGTTTCTTCCG*GCATCATGAGAGAGTCGGTG
AGCCTCTCAACAATGGGGCACTGAGCCTTCCTGAATCTCTTCACAGAGTATCTTCCCGCA
GTGTGGGGGACAAAGGTGGCGTGTTTGGCTGCCTGAACTCCAATGGAGTCAGCAAGACTG
ATGTCTGCAACCGAGACGTCATCGTAGGTCCAGCGGTTGAAGAGCTTGACCTCGTTGGTA
AGCTGCTGCTGAATCTCTGCGTCGATTTCTGCGGCGGCGGC*ATGGCTGAGATCGGTAAG
CGACGCGCGGGAGAGAGTGACGGCGGG*AGAGAGAGAGAGAGATCAAAAGCTACC

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DS 

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TGGTTAACACGTCTCAGAGGAGAGATATCAACGGCTTGTCTCCTAACGACACCAGCAGAT
CCAATTCTGGTAGCATCTTCACGTGGACCACTGTTAACAATGGCATCAATGATGATCTGA
ATCGGGTTGGCATCAGTCAAGAGGTGGATGATCTCCATGGCGTGCTTGATGATCCTCACC
GCCATCGACTTCTTCCCGTTGTTTCTTCCGTGCATCATGAGAGAGTTGGTGAGCCTCTCA
ACAATGGGGCACTGAGCCTTCCTGAATCTCTTCACAGAGTATCTTCCCACAGTGTGGGGG
ACAAAGGTGGCGTGTTTGGCTGCCTGAACTCCAATGTAGTCAACAAGACTGATGTCTGCA
ACCGAGACGTCATCGTAGGTCCAGCGGTTGAAGAGCTTGACCTCGTTGGTAAGCTGCTGC
TGAATCTCTGCGTCGATTTCTGTGGCGGCGGCCATGGCTGAGATCGGTAAGCGACGCGCG
GGAGAGAGTGACGGCGGGGAGAGAGAGAGAGAGATC
AAAAA

QA 1 576 1 576
DS 

RD RS1B778TF 666 0 0
ACTCTCTCGATCTCATCCTTCTTTT*GATGGCATAGCTGTTGGAGGAGCCCTTGGCTGCG
TTGATCAACTCATCGGCAAGACACTCAGCAATAGTCTTAATGTTTCTGAAAGCAGCCTCA
CGAGCCCCGGTTGTGAGCAAGAAGATCGCCTGGTTAACACGTCTCAGAGGAGAGATATCA
ACGGCTTGTCTCCTAACGACACCAGCAGATCCAATTCTGGTAGCATCTTCACGTGGACCA
CTGTTAACAATGGCATCAATGATGATCTGAATCGGGTTGGCATCAGTCAAGAGGTGGATG
ATCTCCATGGCGTGCTTGATGATCCTCACCGCCATCAACTTCTTCCCGTTGTTTCTTCCG
*GCATCATGAGAGAGTCGGTGAGCCTCTCAACAATGGGGCACTGAGCCTTCCTGAATCTC
TTCACAGAGTATCTTCCCGCAGTGTGGGGGACAAAGGTGGCGTGTTTGGCTGCCTGAACT
CCAATGGAGTCAGCAAGACTGATGTCTGCAACCGAGACGTCATCGTAGGTCCAGCGGTTG
AAGAGCTTGACCTCGTTGGTAAGCTGCTGCTGAATCTCTGCGTCGATTTCTGCGGCGGCG
GCCATGGCTGAGATCGGTAAGCGACGCGCGGGAGAGAGTGACGGCGGGGAGAGAGAGAGA
GAGATC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RS1GG25TF 613 0 0
TGCGTTGATCAACTCATCGGCAAGACACTCAGCAATAGTCTTAATGTTTCTGAAAGCAGC
CTCACGAGCCCCGGTTGTGAGCAAGAAGATCGCCTGGTTAACACGTCTCAGAGGAGAGAT
ATCAACGGCTTGTCTCCTAACGACACCAGCAGATCCAATTCTGGTAGCATCTTCACGTGG
ACCACTGTTAACAATGGCATCAATGATGATCTGAATCGGGTTGGCATCAGTCAAGAGGTG
GATGATCTCCATGGCGTGCTTGATGATCCTCACCGCCATCAACTTCTTCCCGTTGTTTCT
TCCGTGCATCATGAGAGAGTTGGTGAGCCTCTCAACAATGGGGCACTGAGCCTTCCTGAA
TCTCTTCACAGAGTATCTTCCCGTAGTGTGGGGGACAAAGGTGGCGTGTTTGGCTGCCTG
AACTCCAATGTAGTCAACAAGACTGATGTCTGCAACCGAGACGTCATCGTAGGTCCAGCG
GTTGAAGAGCTTGACCTCGTTGGTAAGCTGCTGCTGAATCTCTGCGTCGATTTCTGCGGC
GGCGGCCATGGCTGAGATCGGTAAGCGACGCGCGGGAGAGAGTGACGGCGGGGAGAGAGA
GAGAGA
TCAAAAA

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 10

CO CL305Contig1 1420 10 38 U
GGGCTCCACACTAATTTCATTACCAAATGTATTGAAGAGTGGGTGAGTTACGTCTGCTAA
ATTGTACGCCTTTCTTTTACGAAGAACTTGGTCTCAACAAAGGCTATATAAAGTCTTTAA
GTTGGAATCATAAACAAGAGCATTCTTCTTCATTTTGCACAGGTAGATTGGTATCAAGAT
GGTGATGAGAATCGTGGATCTACGTTCAGACACCGTGACAAGACCCACCGACGCAATGCG
CGAAGCAATGGCTAGTGCAGAGGTGGACGATGACGTCCTCGGCTACGACCCGACGGCTCG
ACGTCTTGAAGAGGAGATGGCCAAGATGATGGGGAAAGAGGCGGCTCTGTTCGTTCCATC
TGGTACGATGGGGAATCTGATATGCGTTATGGTTCACTGCGACGTGAGAGGCAGCGAGGT
GATTCTTGGGGACACTTGTCACATCCATGTGTACGAGAACGGAGGGATATCGACAATAGG
TGGCGTGCATCCCAAGACGATCAAGAATGAAGAAGACGGGACAATGGACTTGGTGGCTAT
AGAAGCAGCCATTAGAGATCCTAAAGGAAGCACGTTTTATCCATCAACAAGGTTGATTTG
TTTGGAGAACACACATGCCAACTCTGGTGGGAGATGTTTGAGTGCTGAATACACAGATAG
AGTTGGAGAGATTGCTAAGAGACATGGATTGAAGCTTCATATCGATGGAGCTCGCATTTT
TAATGCTTCCGTTGCACTTGGAGTTCCAGTCCATAGACTTGTAAAGGCTGCTGACTCTGT
TTCGGTGTGTCTCTCTAAAGGTCTTGGAGCTCCGATAGGATCAGTAATCGTTGGTTCACA
GAGTTTCATAGAAAAGGCGAAAACATTAAGGAAAACATTGGGTGGAGGAATGAGACAGAT
AGGCGTCCTGTGTGCAGCCGCTTTGGTCGCACTCCAAGAGAACCTGCCGAAGCTACAATC
TGACCACAAGAAGACAAAGTTGTTAGCTGAAGGGTTGAACAAAATGAAAGGGATTAGAGT
GAACGTTGAAGCCATGGAGACCAACATGATATTCATGGATATGGAGGATGGATCAAGACT
TACCGCTGAAAAACTCCGCAAGAGTCTAACCGAGCATGGCATTCTCGTCATCCCTGAAAA
CTCTTCCCGGATCAGAATGGTTATACACCACCAGATAACAACAAGTGATGTGCATTACAC
ATTGTCTTGCTTGCAACAAGCTGTGCAGACGATTCAGGAACCATGCCAAAACTAAATTGG
CAAACCACAATGCTCTCTCTTTTTTAAATATTGTTTGTAT*AAGTTTTTAATTAAAAGTT
ACAAGGACCGATCTATCTCTCAATGAAATTGTCACCCTCATGTCATCCATTTTTATTATT
GTATTTTTGGTTTATATCTTGTTTACACATGCATAAGCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FI17TF U 6
AF RS1AH48TF U 1
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AF RS1AB01JQ C 943
AF RS1AB01TF U 943
AF RS1FU01JQ C 807
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AF RS1AH48JQ C 1081
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BS 355 355 RS1C075TF
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BS 1391 1420 RS1AH48JQ

RD RS1FI17TF 582 0 0
GG
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GGGGACACTTGTCACATCCATGTGTACGAGAACGGAGGGATATCGACAATAGGTGGCGTG
CATCCCAAGACGATCAAGAATGAAGAAGACGGGACAATGGACTTGGTGGCTATAGAAGCA
GCCATTAGAGATCCTAAAGGAAGCACGTTTTATCCATCAA

QA 3 582 3 582
DS 

RD RS1AH48TF 668 0 0
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ATTGTACGCCTTTCTTTTACGAAGAACTTGGTCTCAACAAAGGCTATATAAAGTCTTTAA
GTTGGAATCATAAACAAGAGCATCCTTCTTCATTTTGCACAGGTAGATTGATATCAAGAT
GGTGATGAGAATCGTGGATCTACGTTCGGACACCGTGACAAGGCCCACTGACGCAATGCG
CGAAGCAATGGCTAGTGCAGAGGTGGACGATGACGTCCTCGGCTACGACCCGACGGCTCG
ACGTCTCGAAGAGGAGATGGCCAAGATGATGGGGAAAGAGGCGGCTCTGTTCGTGCCATC
CGGTACGATGGGGAATCTGATTTGCGTTATGGTTCATTGCGACGTGAGAGGCAGCGAGGT
GATTCTTGGGGACACTTGTCACATCCACGTGTACGAGAACGGAGGGATATCGACAATAGG
TGGCGTGCATCCCAAGACGATCAAGAATGAAGAAGACGGGACAATGGACTTGGTGGCTAT
AGAAGCAGCCATTAGAGATCCTAAAGGAAGCACGTTTTATCCATCAACAAGGTTGATTTG
TTTGGAGAACACACATGCCAACTCTGGTGGGAGATGTTTGAGTGCTGAATACACAGATAG
AGTTGGAG

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1EU89TF 687 0 0
GG
ACACTAATTTCATTACCAAATGTATTGAAGAGTGGGTGAGTTACGTCTGCTAAATTGTAC
GCCTTTCTTTTACGAAGAACTTGGTCTCAACAAAGGCTATATAAAGTCTTTAAGTTGGAA
TCATAAACAAGAGCATTCTTCTTCATTTTGCACAGGTAGATTGGTATCAAGATGGTGATG
AGAATCGTGGATCTACGTCCAGACACCGTGACAAGACCCACCGACGCAATGCGCGAAGCA
ATGGCTAGTGCAGAGGTGGACGATGACGTCCTCGGCTACGACCCGACGGCTCGACGTCTT
GAAGAGGAGACGGCCAAGATGGTGGGGAAAGAGGCGGCTCTGTTCGTTCCATCTGGTACG
ATAGGGAATCTGATATGCGTTATGGTTCACTGCGACGTGAGAGGCAGCGAGGTGATTCTT
GGGGACACTTGTCACATCCATGTGTACGAGAACGGAGGGATATCGACAATAGGTGGCGTG
CATCCCAAGACGATCAAGAATGAAGAAGACGGGACAATGGACTTGGTGGCTATAGAAGCA
GCCATTAGAGATCCTAAAGGAAGCACGTTTTATCCATCAACAAGGTTGATTTGTTTGGAG
AACACACATGCCAACTCTGGTGGGAGATGTTTGAGTGCTGAATACACAGATAGAGTTGGA
GAGATTGCTAAGAGACATGGATTGA

QA 3 687 3 687
DS 

RD RS1C075TF 755 0 0
GG
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GCCTTTCTTTTACGAAGAACTTGGTCTCAACAAAGGCTATATAAAGTCTTTAAGTTGGAA
TCATAAACAAGAGCATTCTTCTTCATTTTGCACAGGTAGATTGGTATCAAGATGGTGATG
AGAATCGTGGATCTACGTTCAGACACCGTGACAAGACCCACCGACGCAATGCGCGAAGCA
ATGGCTAGTGCAGAGGTGGACGATGACGTCCTCGGCTACGACCCGACAGCTCGACGTCTT
GAAGAGGAGATGGCCAAGATGATGGGGAAAGAGGCGGCTCTGTTCGTTCCATCTGGTACG
ATGGGGAATCTGATATGCGTTATGGTTCACTGCGACGTGAGAGGCGGCGAGGTGATTCTT
GGGGACACTTGTCACATCCATGTGTACGAGAACGGAGGGATATCGACAATAGGTGGCGTG
CATCCCAAGACGATCAAGAATGAAGAAGACGGGACAATGGACTTGGTGGCTATAGAAGCA
GCCATTAGAGATCCTAAAGGAAGCACGTTTTATCCATCAACAAGGTTGATTTGTTTGGAG
AACACACATGCCAACTCTGGTGGGAGATGTTTGAGTGCTGAATACACAGATAGAGTTGGA
GAGAT*GCTAAGAGACATGGATTGAAGCTTCATATCGATGGAGCTCGCATTTT*AATGCT
TCCGT*GCACTTGGAGT
CCAGTCCATAGCTTGT

QA 3 739 3 739
DS 

RD RS1FU01TF 671 0 0
G
AAGGAAGCACGTTTTATCCATCAACAAGGTTGATTTGTTTGGAGAACACACATGCCAACT
CTGGTGGGAGATGTTTGAGTGCGGAATACACAGATAGAGTTGGAGAGATTGCTAAGAGAC
ATGGATTGAAGCTTCATATCGATGGAGCTCGCATTTTTAATGCTTCCGTTGCACTTGGAG
TTTCAGTCCATAGACTTGTAAAGGCTGCTGACTCTGTTTCGGTGTGTCTCTCTAAAGGTC
TTGGAGCTCCGATAGGATCAGTAATCGTTGGTTCACAGAGTTTCATAGAAAAGGCGAAAA
CATTAAGGAAAACATTGGGTGGAGGAATGAGACAGATAGGCGTCCTGTGTGCAGCCGCTT
TGGTCGCACTCCAAGAGAACCTGCCGAAGCTACAATCTGACCACAAGAAGACAAAGTTGT
TAGCTGAAGGGTTGAACAAAATGAAAGGGATTAGAGTGAACGTTGAAGCCATGGAGACCA
ACATGATATTCATGGATATGGAGGATGGATCAAGACTTACCGCTGAAAAACTCCGCAAGA
GTCTAACCGAGCATGGCATTCTCGTCATCCCTGAAAACTCTTCCCGGATCAGAATGGTTA
TACACCACCAGATAACAACAAGTGATGTGCATTACACATTATCTTGCTTGCAACAAGCTG
TGCAGACGAT

QA 2 671 2 671
DS 

RD RS1AB01JQ 426 0 0
G
CTGCCGAAGCTACAATCTGACCACAAGAAGACAAAGTTGTTAGCTGAAGGGTTGAACAAA
ATGAAAGGGATTAGAGTGAACGTTGAAGCCATGGAGACCAACATGATATTCATGGATATG
GAGGATGGATCAAGACTTACCGCTGAAAAACTCCGCAAGAGTCTAACCGAGCATGGCATT
CTCGTCATCCCTGAAAACTCTTCCCGGATCAGAATGGTTATACACCACCAGATAACAACA
AGTGATGTGCATTACACATTGTCTTGCTTGCAACAAGCTGTGCAGACGATTCAGGAACCA
TGCCAAAACTAAATTGGCAAACCACAATGCTCTCTCTTTTTTAAATATTGTTTGTAT*AA
GTTTTTAATTAAAAGTTACAAGGACCGATCTATCTCTCAATGAAATTGTCACCCTCATGT
CATCC

QA 2 426 2 426
DS 

RD RS1AB01TF 426 0 0
G
CTGCCGAAGCTACAATCTGACCACAAGAAGACAAAGTTGTTAGCTGAAGGGTTGAACAAA
ATGAAAGGGATTAGAGTGAACGTTGAAGCCATGGAGACCAACATGATATTCATGGATATG
GAGGATGGATCAAGACTTACCGCTGAAAAACTCCGCAAGAGTCTAACCGAGCATGGCATT
CTCGTCATCCCTGAAAACTCTTCCCGGATCAGAATGGTTATACACCACCAGATAACAACA
AGTGATGTGCATTACACATTGTCTTGCTTGCAACAAGCTGTGCAGACGATTCAGGAACCA
TGCCAAAACTAAATTGGCAAACCACAATGCTCTCTCTTTTTTAAATATTGTTTGTAT*AA
GTTTTTAATTAAAAGTTACAAGGACCGATCTATCTCTCAATGAAATTGTCACCCTCATGT
CATCC

QA 2 426 2 426
DS 

RD RS1FU01JQ 553 0 0
GAGT
TCCGATAGGATCAGTAATCGTTGGTTCACAGAGTTTCATAGAAAAGGCGAAAACATTAAG
GAAAACATTGGGTGGAGGAATGAGACAGATAGGCGTCCTGTGTGCAGCCGCTTTGGTCGC
ACTCCAAGAGAACCTGCCGAAGCTACAATCTGACCACAAGAAGACAAAGTTGTTAGTTGA
AGGGTTGAACAAAATGAAAGGGATTAGAGTGAACGTTGAAGCCATGGAGACCAACATGAT
ATTCATGGATATGGAGGATGGATCAAGACTTACCGCTGAAAAACTCCGCAAGAGTCTAAC
CGAGCATGGCATTCTGGTCATCCCTGAAAACTCTTCCCGGATCAGAATGGTTATACACCA
CCAGATAACAACAAGTGATGTGCATTACACATTATCTTGCTTGCAACAAGCTGTGCAGAC
GATTCAGGAACCATGCCAAAACTAAATTGGCAAACCAAAATGCTCTCTCTTTTTTAAGTA
TTGTTTGTATCAAGTTTTTAATTAAAAGTTGCAAGGACCGATCTATCTCTCAATGAAATT
GTCACCC
GC

QA 5 551 5 551
DS 

RD RS1EU89JQ 770 0 0
CTCTGG
GGGAGATGTTTGAGTGCTGAATACACAGATAGAGTTGGAGAGATTGCTAAGAGACATGGA
TTGAAGCTTCATATCGATGGAGCTCGCATTTTTAATGCTTCCGTTGCACTTGGAGTTCCA
GTCCATAGGCTTGTAAAGGCTGCTGACTCTGTTTCGGTGTGTCTCTCTAAAGGTCTTGGA
GCTCCGATAGGATCAGTAATCGTTGGTTCACAGAGTTTCATAGAAAAGGCGAAAACATTA
AGGAAAACATTGGGTGGAGGAATGAGACAGATAGGCGTCCTGTGTGCAACCGCTTTGGTC
GCACTCCAAGAGAACCTGCCGAAGCTACAATCTGACCACAAGAAGACAAAGTTGTTAGCT
GAAGGGTTGAACAAAATGAAAGGGATTAGAGTGAACGTTGAAGCCATGGAGACCAACATG
ATATTCATGGATATGGAGGATGGATCAAGACTTACCGCTGAAAAACTCCGCAAGAGTCTA
ACCGAGCATGGCATTCTCGTCATCCCTGAAAACTCTTCCCGGATCAGAATGGTTATACAC
CACCAGATAACAACAAGTGATGTGCATTACACATTGTCTTGCTTGCAACAAGCTGTGCAG
ACGATTCAGGAACCATGCCAAAACTAAATTGGCAAACCACAATGCTCTCTCTTTTTTAAA
TATTGTTTGTAT*AAGTTTTTAATTAAAAGTTACAAGGACCGATCTATCTCTCAATGAAA
TTGTCACCCTCATGTCATCCATTTTTATTATTGTATTTTTGG
GC

QA 7 768 7 768
DS 

RD RS1AH48JQ 340 0 0
TACCGCTGAAAAACTCCGCAAGAGTCTAACCGAGCATGGCATTCTGGTCATCCCTGAAAA
CTTTTCCCGGATCAGAATGGTTATACACCACCAGATAACAACAAGTGGTGTGCATTACAC
ATTGTCTTGCTTGCAACAAGCTGTGCAGACGATTCAGGAACCATGCCAAAACTAAATTGG
CAAACCACAATGCTCTCTCTTTTTTAAATATTGTTTGTAT*AAGTTTTTAATTAAAAGTT
CCAAGGACCGATCTATCTCTCAATGAAATTGTCACCCTCATGTCATCCATTTTTATTATT
GTATTTTTGGTTTATATCTTGTTTACACATGCATAAGCCA

QA 1 340 1 340
DS 



AS 1 10

CO CL306Contig1 584 10 10 U
GGGACAACCATCAAACTAGTAAACCAAAAAAAAAGAAAACTCTAATTAATAAACCTGTCT
TTATCATAATAATATCACAAAGATCAAAATGTCTTCATCACAGTTTGCTATCTTTTGCAT
CATCCTGATTGCATTATTTCCTCTTCATGAATTTGTCGATGGCCAAAACACTCAAGGGAA
ACCATTCTGCGCACCAGTCAATTGCGACACTAAAGACAAAAATCGCAGTTGTGCTCACTG
TCACTATATCTCCCCACGCAAGACAACTATTTTCAAGAGCTTAGCAGAATGTAATGCTGG
GTGCAAGTAGGGTGCAAGGCATAAGTTATCTCAGAGGCATGAAAATAATACCTAATTTAT
CTGCTTCCTACTTTGATTATAACACATAAGCTTATTTTAAGTCCAACAAATAAAATTTAT
GCATAATGTATGTATGTTTAAAGATTTCCATAGTCTACACAATAGTTTAACCTATTTTCT
CTCCTTCTGTTTTGTTTTAATTTTCTTAAAAGAATATTTTCTTCTGATTAATGACTAATA
AGAGTAAGTTTTTATGGTAAATGGTAAGTTTTTTTTTCTAGTTT


BQ
10 35 40 40 50 60 60 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 0 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 60 
60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 25 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 40 40 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AK67JQ C 5
AF RS1F957TF U 5
AF RS1ES80JQ C 4
AF RS1ES80TF U 4
AF RS1H386JQB C 2
AF RS1AK67TF U 1
AF RS1AY93TF U 3
AF RS1H241JQB C 2
AF RS1H241TF U 2
AF RS1H386TF U 2
BS 1 11 RS1AK67TF
BS 12 12 RS1H241TF
BS 13 64 RS1AK67TF
BS 65 65 RS1H241TF
BS 66 118 RS1AK67TF
BS 119 119 RS1H241TF
BS 120 323 RS1AK67TF
BS 324 324 RS1H241TF
BS 325 558 RS1AK67TF
BS 559 584 RS1H241TF

RD RS1AK67JQ 453 0 0
CAACCATTAAACTAGTAAACCAAAAAAAAAGAAAACTTTAATTAATAAACCTGTCTTTAT
TATAATAATATCACAAAGATCAAAATGTCTTCATCACAGTTTGCTATCTTTTGCGTCATC
CTGATTGCATTATTTCCTCTTCATGAATTTGTCGATGGCCAAAACACTCAAGGGAAACCA
TTTTGCGCACCAGTCAATTGGGACACTAAAGACAAAAATCGCAGTTGTGCTCACTGTCAC
TATATCTCCCCACGCAAGACAACTATTTTCAAGAGCTTAGCAGAATGTAATGCTGGGTGC
AAGTAGGGTGCAAGGCATACGTTATTTCAGAGGCATGAAAATAATACCTAATTTATTTGC
TTCCTACTTTGATTATAACACATAAGCTTATTTTAAGTCCAACAAATAAAATTTATGCAT
AATGTATGTATGTTTAAAGATTTCCATAGTCTA

QA 1 453 1 453
DS 

RD RS1F957TF 468 0 0
CAACCATCAAACTAGTAAACCAAAAAAA**GAAAACTCTAATTAATAAACCTGTCTTTAT
CATAATAATATCACGAAGATCAAAATGTCTTCATCACAGTTTGCTATCTTTTGCATCATC
CTGATTGCATTATTTCCTCTTCATGAATTTGTCGATGGCCAAAACACTCAAGGGAAACCA
TTCTGCGCACCAGTCAATTGCGACGCTAAAGACAAAAATCGCAGTTGTGCTCACTGTCAC
TATATCTCCCCACGCAAGACAACTATTTTCAAGAGCTTAGCAGAATGTAATGCTGGGTGC
AAGTAGGGTGCAAGGCATAAGTTATCTCAGAGGCATGAAAATAATACCTAATTTATCTGC
TTCCTACTTTGATTATAACACATAAGCTTATTTTAAGTCCAACAAATAAAATTTATGCAT
AATGTATGTATGTTTAAAGATTTCCATAGTCTACACAATAGTTTAACC

QA 1 468 1 468
DS 

RD RS1ES80JQ 533 0 0
GG
AACCATTAAACTAGTAAACCAAAAAAAAAGAAAACTCTAATTAATAAACCTGTCTTTATT
ATAATAATATCACAAAGATCAAAATGTCTTCATCACAGTTTGCTATCTTTTGCGTCATCC
TGATTGCATTATTTCCTCTTCATGAATTTGTCGATGGCCAAAACACTCAAGGGAAACCAT
TCTGCGCACCAGTCAATTGCGACACTAAAGACAAAAATCGCAGTTGTGCTCACTGTCACT
ATATCTCCCCACGCAAGACAACTATTTTCAAGAGCTTAGCAGAATGTAATGCTGGGTGCA
AGTAGGGTGCAAGGCATACGTTATTTCAGAGGCATGAAAATAATACCTAATTTATCTGCT
TCCTACTTTGATTATAACACATAAGCTTATTTTAAGTCCAACAAATAAAATTTATGCATA
ATGTATGTATGTTTAAAGATTTCCATAGTCTACACAATAGTTTAACCTATTTTCTCTCCT
TCTGTTTTGTTTTAATTTTCTTAAAAGAATATTTTCTTCTGATTAATGACT

QA 3 533 3 533
DS 

RD RS1ES80TF 536 0 0
GG
AACCATTAAACTAGTAAACCAAAAAAAAAGAAAACTCTAATTAATAAACCTGTCTTTATT
ATAATAATATCACAAAGATCAAAATGTCTTCATCACAGTTTGCTATCTTTTGCGTCATCC
TGATTGCATTATTTCCTCTTCATGAATTTGTCGATGGCCAAAACACTCAAGGGAAACCAT
TCTGCGCACCAGTCAATTGCGACACTAAAGACAAAAATCGCAGTTGTGCTCACTGTCACT
ATATCTCCCCACGCAAGACAACTATTTTCAAGAGCTTAGCAGAATGTAATGCTGGGTGCA
AGTAGGGTGCAAGGCATACGTTATCTCAGAGGCATGAAAATAATACCTAATTTATCTGCT
TCCTACTTTGATTATAACACATAAGCTTATTTTAAGTCCAACAAATAAAATTTATGCATA
ATGTATGTATGTTTAAAGATTTCCATAGTCTACACAATAGTTTAACCTATTTTCTCTCCT
TCTGTTTTGTTTTAATTTTCTTAAAAGAATATTTTCTTCTGATTAATGACTAA
A

QA 3 535 3 535
DS 

RD RS1H386JQB 506 0 0
GGACAACCATCAAACTAGTAAACCAAAAAAA**GAAAACTCTAATTAATAAACCTGTCTT
TATCATAATAATATCACGAAGATCAAAATGTCTTCATCACAGTTTGCTATCTTTTGCATC
CTCCTGATTGCATTATTTCCTCTTCATGAATTTGTCGATGGCCAAAACACTCAAGGGAAA
CCATTTTGCGCACCAGTCAATTGGGACGCTAAAGACAAAAATCGCAGTTGTGCTCACTGT
CACTATATCTCCCCACGCAAGACAACTATTTTCAAGAGCTTAGCAGAATGTAATGCTGGG
TGCAAGTAGGGTGCAAGGCATAAGTTATTTCAGAGGCATGAAAATAATACCTAATTTATC
TGCTTCCTACCTTGATTATAACACGTAAGCTTATTTTAAGTCCAACAAATAAAATTTATG
CATAATGTATGTATGTTTGAAGATTTCCATAGTCTACACAATAGTTTAACCTATTTTCTC
TCCTTCTGTTTTGTTTTAATTTTCTT

QA 1 506 1 506
DS 

RD RS1AK67TF 558 0 0
GGGACAACCATTAAACTAGTAAACCAAAAAAAAAGAAAACTCTAATTAATAAACCTGTCT
TTATTATAATAATATCACAAAGATCAAAATGTCTTCATCACAGTTTGCTATCTTTTGCGT
CATCCTGATTGCATTATTTCCTCTTCATGAATTTGTCGATGGCCAAAACACTCAAGGGAA
ACCATTCTGCGCACCAGTCAATTGCGACACTAAAGACAAAAATCGCAGTTGTGCTCACTG
TCACTATATCTCCCCACGCAAGACAACTATTTTCAAGAGCTTAGCAGAATGTAATGCTGG
GTGCAAGTAGGGTGCAAGGCATACGTTATCTCAGAGGCATGAAAATAATACCTAATTTAT
CTGCTTCCTACTTTGATTATAACACATAAGCTTATTTTAAGTCCAACAAATAAAATTTAT
GCATAATGTATGTATGTTTAAAGATTTCCATAGTCTACACAATAGTTTAACCTATTTTCT
CTCCTTCTGTTTTGTTTTAATTTTCTTAAAAGAATATTTTCTTCTGATTAATGACTAATA
AGAGTAAGTTTTTATGGT

QA 1 558 1 558
DS 

RD RS1AY93TF 555 0 0
GACAACCATTAAACTAGTAAACCAAAAAAAAAGAAAACTCTAATTAATAAACCTGTCTTT
ATTATAATAATATCACAAAGATCAAAATGTCTTCATCACAGTTTGCTATCTTTTGCGTCA
TCCTGATTGCATTATTTCCTCTTCATGAATTTGTCGATGGCCAAAACACTCAAGGGAAAC
CATTCTGCGCACCAGTCAATTGCGACACTAAAGACAAAAATCGCAGTTGTGCTCACTGTC
ACTATATCTCCCCACGCAAGACAACTATTTTCAAGAGCTTAGCAGAATGTAATGCTGGGT
GCAAGTAGGGTGCAAGGCATACGTTATCCCAGAGGCATGAAAATAATACCTAATTTATCT
GCTTCCTACTTTGATTATAACACATAAGCTTATTTTAAGTCCAACAAATAAAATTTATGC
ATAATGTATGTATGTTTAAAGATTTCCATAGTCTACACAATAGTTTAACCTATTTTCTCT
CCTTCTGTTTTGTTTTAATTTTCTTAAAAGAATATTTTCTTCTGATTAATGACTAATAAG
AGTAAGTTTTTATGG

QA 1 555 1 555
DS 

RD RS1H241JQB 583 0 0
GGACAACCATCAAACTAGTAAACCAAAAAAA**GAAAACTCTAATTAATAAACCTGTCTT
TATCATAATAATATCACGAAGATCAAAATGTCTTCATCACAGTTTGCTATCTTTTGCATC
ATCCTGATTGCATTATTTCCTCTTCATGAATTTGTCGATGGCCAAAACACTCAAGGGAAA
CCATTTTGCGCACCAGTCAATTGCGACGCTAAAGACAAAAATCGCAGTTGTGCTCACTGT
CACTATATCTCCCCACGCAAGACAACTATTTTCAAGAGCTTAGCAGAATGTAATGCTGGG
TGCAAGTAGGGTGCAAGGCATAAGTTATCTCAGAGGCATGAAAATAATACCTAATTTATC
TGCTTCCTACTTTGATTATAACACATAAGCTTATTTTAAGTCCAACAAATAAAATTTATG
CATAATGTATGTATGTTTAAAGATTTCCATAGTTTACACAATAGTTTAACCTATTTTCTC
TCCTTCTGTTTTGTTTTAATTTTCTTAAAAGAATATTT*CTTCTGATTAATGGCTAATAA
GAGTAAGTTTTTATGGTAAATGGTAAGTTTTTTTTTCTAGTTT

QA 1 583 1 583
DS 

RD RS1H241TF 583 0 0
GGACAACCATCAAACTAGTAAACCAAAAAAA**GAAAACTCTAATTAATAAACCTGTCTT
TATCATAATAATATCACGAAGATCAAAATGTCTTCATCACAGTTTGCTATCTTTTGCATC
ATCCTGATTGCATTATTTCCTCTTCATGAATTTGTCGATGGCCAAAACACTCAAGGGAAA
CCATTCTGCGCACCAGTCAATTGCGACGCTAAAGACAAAAATCGCAGTTGTGCTCACTGT
CACTATATCTCCCCACGCAAGACAACTATTTTCAAGAGCTTAGCAGAATGTAATGCTGGG
TGCAAGTAGGGTGCAAGGCATAAGTTATCTCAGAGGCATGAAAATAATACCTAATTTATC
TGCTTCCTACTTTGATTATAACACATAAGCTTATTTTAAGTCCAACAAATAAAATTTATG
CATAATGTATGTATGTTTAAAGATTTCCATAGTCTACACAATAGTTTAACCTATTTTCTC
TCCTTCTGTTTTGTTTTAATTTTCTTAAAAGAATATTT*CTTCTGATTAATGGCTAATAA
GAGTAAGTTTTTATGGTAAATGGTAAGTTTTTTTTTCTAGTTT

QA 1 583 1 583
DS 

RD RS1H386TF 557 0 0
GGACAACCATCAAACTAGTAAACCAAAAAAA**GAAAACTCTAATTAATAAACCTGTCTT
TATCATAATAATATCACGAAGATCAAAATGTCTTCATCACAGTTTGCTATCTTTTGCATC
CTCCTGATTGCATTATTTCCTCTTCATGAATTTGTCGATGGCCAAAACACTCAAGGGAAA
CCATTCTGCGCACCAGTCAATTGCGACGCTAAAGACAAAAATCGCAGTTGTGCTCACTGT
CACTATATCTCCCCACGCAAGACAACTATTTTCAAGAGCTTAGCAGAATGTAATGCTGGG
TGCAAGTAGGGTGCAAGGCATAAGTTATCTCAGAGGCATGAAAATAATACCTAATTTATC
TGCTTCCTACCTTGATTATAACACGTAAGCTTATTTTAAGTCCAACAAATAAAATTTATG
CATAATGTATGTATGTTTGAAGATTTCCATAGTCTACACAATAGTTTAACCTATTTTCTC
TCCTTCTGTTTTGTTTTAATTTTCTTAAAAGAATATTT*CTTCTGATTAATGACTAATAA
GAGTAAGTTTTTATGGT

QA 1 557 1 557
DS 



AS 2 10

CO CL307Contig1 591 2 2 U
GGATCCAGAAACTAAACTTCAAATGACTGTCTGAAGGCGAAATCCTTCTGTACCAAGAAG
ATGTCTCTTCTCTGTTTCAATTCTCTCGCTCCTCTCTCTCCTCCAAGGCTTCAAGTTTCG
TCTTTCGCTTCACCAGTTTTAGGCCTTAAATCAAACACGGTGGAGACCAAGAACAGAGTC
TCTCTCAGTGCGTACAGCTTGAGCATCAGCAATGGAAAAAAAGCGATTCTGAAGGCAGCT
GCTTCTGGTGTGGACGGAGCAGCTGAGCCAGAGAGCAGTGAGGAACCACCTAAGACTGTT
GACAAACTACCGTTGGAGTCGAAAGAAGCTAAAGAGAAGATGCTGCTGGAACAGAGGATG
AAGATGAAGCTGGCCAAGAAGATTAGGCTAAGGAGGAAACGTCTGGTTCGTAAGCGTAAG
TTGAGGAAGAAGGGTCGATGGCCACCTTCCAAGATGAAGAAGCTCAAGAATGTCTAGAGA
TGACACTCTCTTCGCTGTCTCAACTTTTATTGTAATGTTGTTTGTAAACTTTCCGGAATT
TGAAATGTAGACATTGTTTTTGGATTTAATCTCAAGCTGAGAGAGTTCTTT


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1A777JQ C 1
AF RS1A777TF U 1
BS 1 2 RS1A777JQ
BS 3 591 RS1A777TF

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ATGTCTCTTCTCTGTTTCAATTCTCTCGCTCCTCTCTCTCCTCCAAGGCTTCAAGTTTCG
TCTTTCGCTTCACCAGTTTTAGGCCTTAAATCAAACACGGTGGAGACCAAGAACAGAGTC
TCTCTCAGTGCGTACAGCTTGAGCATCAGCAATGGAAAAAAAGCGATTCTGAAGGCAGCT
GCTTCTGGTGTGGACGGAGCAGCTGAGCCAGAGAGCAGTGAGGAACCACCTAAGACTGTT
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AAGATGAAGCTGGCCAAGAAGATTAGGCTAAGGAGGAAACGTCTGGTTCGTAAGCGTAAG
TTGAGGAAGAAGGGTCGATGGCCCCCTTCCAAGATGAAGAAGCTCAAGAATGTCTAGAGA
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TGAAATGTAGACATTGTTTTTGGATTTAATCTCAAGCTGAGAGAGTTCTTT

QA 1 591 1 591
DS 

RD RS1A777TF 591 0 0
GG
ATCCAGAAACTAAACTTCAAATGACTGTCTGAAGGCGAAATCCTTCTGTACCAAGAAGAT
GTCTCTTCTCTGTTTCAATTCTCTCGCTCCTCTCTCTCCTCCAAGGCTTCAAGTTTCGTC
TTTCGCTTCACCAGTTTTAGGCCTTAAATCAAACACGGTGGAGACCAAGAACAGAGTCTC
TCTCAGTGCGTACAGCTTGAGCATCAGCAATGGAAAAAAAGCGATTCTGAAGGCAGCTGC
TTCTGGTGTGGACGGAGCAGCTGAGCCAGAGAGCAGTGAGGAACCACCTAAGACTGTTGA
CAAACTACCGTTGGAGTCGAAAGAAGCTAAAGAGAAGATGCTGCTGGAACAGAGGATGAA
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ACACTCTCTTCGCTGTCTCAACTTTTATTGTAATGTTGTTTGTAAACTTTCCGGAATTTG
AAATGTAGACATTGTTTTTGGATTTAATCTCAAGCTGAGAGAGTTCTTT

QA 3 591 3 591
DS 



CO CL307Contig2 627 8 8 U
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CAAGAAGATGTCTCTTCTCTGTTTCAATTCTCTCGCTCCTCTCTCTCCTCCAAGGCTTCA
AGTTTCGTCTTTCGCTTCACCAGTTTTAGGCCTTAAACCCAACACCGTCGAGACCAAGAA
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GGCAGCTGCTTCTTCTGGTGTGGACGGAGCAGCTGAGCCCGAGAGCAGTGAGGAACCGCC
TAAGACTGTTGACAAACTACCGTTGGAGTCAAAAGAAGCTAAAGAGAAGCTGCTGATGGA
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TCCGGAATTTGAAATGTAGACATTGTTTTTGGATTTAATCTCAAGCTGAGAGAGTTCTTT
ACTTCTTTAAAAGGATTCATTACAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 20 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1D841TF U 1
AF RS1AL15TF U 8
AF RS1AL15JQ C 79
AF RS1D841JQ C 21
AF RS1B010JQ C 55
AF RS1BQ70JQ C 57
AF RS1BQ70TF U 57
AF RS1B010TF U 55
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GGCAGCTGCTTCTTCTGGTGTGGACGGAGCAGCTGAGCCCGAGAGCAGTGAGGAACCGCC
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TCCGGAATTTGAAAT

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DS 

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GG
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TCTGAGTGCGTACAGCTTGAGCATCAGCAATGGAAGAGCAGCGATTGTGAAGGCAGCTGC
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GATGACTCTCTTCGCTCTCTCAACTTTTATTGTAATGTTGTTTGTAAACTTTCCGGAATT
TGAAATGTAGACATTGTTTTTGGATTT

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DS 

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GACATTGTTTTTGGATTT

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DS 

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AAG
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CTCTCTCAACTTTTATTGTAATGTTGTTTGTAAACTTTCCGGAATTTGAAATGTAGACAT
TGTTTTTGGATTTAATCTCAAGCTGAGAGAGTTCTTTAC
CT

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AAGGCAGCTGCTTCTTCTGGTGTGGACGGAGCAGCTGAGCCCGAGAGCAGTGAGGAACCG
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TTACTTCTT

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RD RS1BQ70TF 551 0 0
GG
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CCTAAGACTGTTGACAAACTACCGTTGGAGTCAAAAGAAGCTAAAGAGAAGCTGCTGATG
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GAATGTCTAGAGATGACTCTCTTCGCTCTCTCAACTTTTATTGTAATGTTGTTTGTAAAC
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TTACTTCTT

QA 3 551 3 551
DS 

RD RS1B010TF 573 0 0
GG
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AGAACAGAGTCTCTCTGAGTGCGTACAGCTTGAGCATCAGCAATGGAAGAGCAGCGATTG
TGAAGGCAGCTGCTTCTTCTGGTGTGGACGGAGCAGCTGAGCCCGAGAGCAGTGAGGAAC
CGCCTAAGACTGTTGACAAACTACCGTTGGAGTCAAAAGAAGCTAAAGAGAAGCTGCTGA
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AAGAATGTCTAGAGATGACTCTCTTCGCTCTCTCAACTTTTATTGTAATGTTGTTTGTAA
ACTTTCCGGAATTTGAAATGTAGACATTGTTTTTGGATTTAATCTCAAGCTGAGAGAGTT
CTTTACTTCTTTAAAAGGATTCATTACAAAG

QA 3 573 3 573
DS 



AS 1 9

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AAGGGACAGACAAAGGAAGGACCCGCACATGGTGTGAAAGGAGCTAGATCTTCCATCAAA
ACTTTTGAGATAAATCATCCCGACGAGTATCTCGTGTCCGTGAAAGGTTGGTCCAATTCA
TCCAACAAGATTGTCGGAATTGAGTTCATAACCAACACAAGGACTTCAGAATATTATGGG
TTTGAAAAACTTCCCGGAGAAGAAGGTACAGATATTTTACTCGAAGTGAAAGACAAGAAG
ATTGTCGGCTTTCATGGGTTCGCAGACACTCATCTCAACTCTCTCGGAGCTTACTTCGCT
CCCATCGCCTCAACTCCGTTGAAACCAAGCAAGAAGCTGACAGCAGTAGGTGGTGATGAA
GGAGCTTCATGGGATGATGGTGCTTTCGACGGAGTTAAGAAAATACAAGTCGGACAGAAC
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GCTAGCGATTGGGTTCATCAAATTGGAGTCTATGTTGCACCAGTCACCAAATGAAAAGCT
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TGGATTGAGGCCTCTTGATGGCTATGTTTTTCTGTTTGTGCTTGAGTGTGATGTTTGTGG
AGTGTGATGTTTGTGTTGTCGCTTGTGGAATTTAATAAAAGGGGTTTTGCGTTTATTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

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BS 1172 1215 RS1CK88TF
BS 1216 1254 RS1BZ47JQ
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AAGGGACAGACAAAGGAAGGACCCGCACATGGTGTGAAAGGAGCTAGATCTTCCATCAAA
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TTTGAAAAACTTCCCGGAGAAGAAGGTACAGATATTTTACTCGAAGTGAAAGACAAGAAG
ATTGTCGGCTTTCATGGGTTCGCAGACACTCATCTCAACTCTCTCGGAGCTTACTTCG

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DS 

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G
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GTGTCCGTGAAAGGTTGGTCCAATTCATCCAACAAGATTGTCGGAATTGAGTTCATAACC
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ATTTTACTCGAAGTGAAAGACAAGAAGATTGTCGGCTTTCATGGGTTCGCAGACACTCAT
CTCAACTCTCTCGGAGCTTACTTCGCTCCCATCGCCTCAACTCCGTTGAAACCAAGCAAG
AAGCTGACAGCAGTAGGTGGTGATGAAGGAGCTTCATGGGATGATGGTGCTTTC

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G
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TGGCTCTAAACCTGGTGGCCCTGACGGCAGTGGAAGTGGATCCAGCAATGGTTCTAGTCC
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TTATGTCAAGAAGGGACAGACAAAGGAAGGACCCGCACATGGTGTGAAAGGAGCTAGATC
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GTCCAATTCATCCAACAAGATTGTCGGAATTGAGTTCATAACCAACACAAGGACTTCAGA
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AGACAAGAAGATTGTCGGCTTTCATGGGTTCGCAGACACTTATCTCAACTCTCTCGGAGC
TTACTTCGCTCCCATCGCCTCAACTCCGTTGAAACCAAGCAAGAAGCTGACAGCAGTAGG
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DS 

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TGTGAAAGGAGCTAGATCTTCCATCAAAACTTTTGAGATAAATCATCCCGACGAGTATCT
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TATTTTACTCGAAGTGAAAGACAAGAAGATTGTCGGCTTTCATGGGTTCGCAGACACTCA
TCTCAACTCTCTCGGAGCTTACTTCGCTCCCATCGCCTCAACTCCGTTGAAACCAAGCAA
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CGAGAATGGCTCTCAGAAAGTTGTTGGCGATGGTCATGGAAAACAATCGGCGCTTGGAGT
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AATCCATGCAGAGGGACGCGGTGTGACAGTGGTGACGTCTTTGGTATTCAAGACTAACAA
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T

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DS 

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TGAAAAACTTCCCGGAGAAGAAGGTACAGATATTTTACTCGAAGTGAAAGACAAGAAGAT
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TGATGGTGTATCTTTCGTGGCGGTTGAGTACGAGAATGGCTCTCAGAAAGTTGTTGGCGA
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CATTACGTCTGTTGGTGTCTACTATGATAAAATCCATGCAGAGGGACGCGGTGTGACAGT
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TGGAGAATATGTTGAGCTTAAG
AAG

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G
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GGTTCCATGGGAAAGCTAGCGATTGGGTTCATCAAATTGGAGTCTATGTTGCACCAGTCA
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TATCTTTCGTGGCGGTTGAGTACGAGAATGGCTCTCAGAAAGTTGTTGGCGATGGTCATG
GAAAACAATCGGCGCTTGGAGTTGAAACGTTTGAGCTTACGGATGGTGAGTACATTACGT
CTGTTGGTGTCTACTATGATAAAATCCATGCAGAGGGACGCGGTGTGACAGTGGTGACGT
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ATGTTGAGCTTAAGGAAGAAGGTAACAAGATCGTTGGGTTCCATGGGAAAGCTAGCGATT
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TGGTTCTTTGATTTCCAAATATGAATAAAGTTATGTCAGAGGCCTACTGGTGGATTGAGG
CCTCTTGATGGCTATGTTTTTCTGTTTGTGCTTGAGTGTGATGTTTGTGGAGTGTGATGT
TTGTGTTGTCGCTTGTGGAATTTAATAAAAGGGGTTTTGCGTTT
ATT

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DS 

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AACAATGATGGTGTATCTTTCGTGGCGGTTGAGTACGAGAATGGCTCTCAGAAAGTTGTT
GGCGATGGTCATGGAAAACAATCGGCGCTTGGAGTTGAAACGTTTGAGCTTACGGATGGT
GAGTACATTACGTCTGTTGGTGTCTACTATGATAAAATCCATGCAGAGGGACGCGGTGTG
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GCTTGTTGTGGGTTGGTTCTTTGATTTCCAAATATGAATAAAGTTATGTCAGAGGCCTAC
TGGTGGATTGAGGCCTCTTGATGGCTATGTTTTTCTGTTTGTGCTTGAGTGTGATGTTTG
TGGAGTGTGATGTTTGTGTTGTCGCTTGTGGAATTTAATAAAAGGGGTTTTGCGTTT

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DS 

RD RS1CG79JQ 742 0 0
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TGACAGCAGTAGGTGGTGATGAAGGAGCTTCATGGGATGATGGTGCTTTCGACGGAGTTA
AGAAAATACAAGTCGGACAGAACAATGATGGTGTATCTTTCGTGGCGGTTGAGTACGAGA
ATGGCTCTCAGAAAGTTGTTGGCGATGGTCATGGAAAACAATCGGCGCTTGGAGTTGAAA
CGTTTGAGCTTACGGATGGTGAGTACATTACGTCTGTTGGTGTCTACTATGATAAAATCC
ATGCAGAGGGACGCGGTGTGACAGTGGTGACGTCTTTGGTATTCAAGACTAACAAGCTAG
TATCACAACCATTTGGAATGACCGGTGGAGAATATGTTGAGCTTAAGGAAGAAGGTAACA
AGATCGTTGGGTTCCATGGGAAAGCTAGCGATTGGGTTCATCAAATTGGAGTCTATGTTG
CACCAGTCACCAAATGAAAAGCTTGTTGTGGGTTGGTTCTTTGATTTCCAAATATGAATA
AAGTTATGTCAGAGGCCTACTGGTGGATTGAGGCCTCTTGATGGCTATGTTTTTCTGTTT
GTGCTTGAGTGTGATGTTCGTGGAGTGTGATGTTTGTGTTGTCGCTTGTGGAATTTAATA
AAAGGGGTTTTGCGTTTATTAG

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 10

CO CL309Contig1 1119 10 20 U
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CTTTCAAAATATTCCTCTTCACAGCCTTTCTCGTGGCGGCCTTTTCATTCTCCGCCGCTG
ATTTCAACAGCGACGTCAACGTAGCTTGGGGAAACGGCCGTGGGAAGATACTCAACAATG
GGCAGCTTCTTACTCTCTCCTTAGATAAGTCCTCTGGTTCTGGTTTTCAATCCAAAACAG
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CCGTCACAACTTTTTACCTGAAATCTGAAGGATCGACTTGGGATGAGATTGATTTTGAGT
TCTTGGGTAATATGAGTGGAGATCCTTATACTTTACACACTAATGTTTACACTCAAGGTA
AAGGTGACAAAGAGCAACAATTCTATCTCTGGTTCGACCCAACAGCGAACTTCCACACTT
ACTCAATCCTCTGGAACCCTCAAAGAATCATATTGACAGTCGACGATACACCAATTAGAG
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ACGCGAGTCTATGGAACGCAGACGACTGGGCGACAAGAGGTGGTCTGGTTAAAACGGATT
GGTCCAAAGCTCCGTTCATGGCTTCTTACAGGAACATTAAGATCGACGGGTGTGCTCATA
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CTAGCCAAGCTAGACTCAGATGGGTTCAGAAGAATTACATGATCTACAACTATTGTACGG
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AGCTGCTTGGGTTTGATTCTTTCGAGTGTATATCTATGTCCAATAACGCAAAAGGTGTGT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 
45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 15 40 
40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EV32TF U 1
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GGCAGCTTCTTACTCTCTCCTTAGATAAGTCCTCTGGTTCTGGTTTTCAATCCAAAACAG
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TCTTGGGTAATATGAGTGGAGATCCTTATACTTTACACACTAATGTTTACACCCAAGGTA
A*GGTGACAAAGAGCAACAGTTCTATCTCTGGTTCGACCCAACAGCGAACTTCCA

QA 1 475 1 475
DS 

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GG
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AATATTCCTCTTCACAGCCTTTCTCGTGGCGGCCTTTTCATTCTCCGCCGCTGATTTCAA
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TCTTACTCTCTCCTTAGATAAGTCCTCTGGTTCTGGTTTTCAATCCAAAACAGAGTACTT
GTTTGGAAAGATCGATATGCAGATTAAGCTTGTTCCTGGTAACTCAGCAGGAACCGTCAC
AACTTTTTACCTGAAATCTGAAGGATCGACTTGGGATGATATTGATTTTGAGTTCTTGGG
TAATATGAGTGGAGATCCTTATACTTTACACACTAATGTTTACACTCAAGGTAAAGGTGA
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CCTCTGGAACCCTCAAAGAATCATATTGACAGTCGACGATACACCAATTAGAGAGT

QA 3 538 3 538
DS 

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GGAC
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AATATTCCTCTTCACAGCCTTTCTCGTGGCGGCCTTTTCATTCTCCGCCGCTGATTTCAA
CAGCGACGTCAACGTAGCTTGGGGAAACGGCCGTGGGAAGGTACTCAACAATGGGCAGCT
TCTTACTCTCTCCTTAGATAAGTCCTCTGGTTCTGGTTTTCAATCCAAAACAGAGTACTT
GTTTGGAAAGATCGATATGCAGATTAAGCTTGTTCCTGGTAACTCAGCAGGAACCGTCAC
AACTTTTTACCTGAAATCTGAAGGATCGACTTGGGATGAGATTGATTTTGAGTTCTTGGG
TAATATGAGTGGAGATCCTTATACTTTACACACTAATGTTTACACTCAAGGTAAAGGTGA
CAAAGAGCAACAATTCTATCTCTGGTTCGACCCAACAGCGAACTTCCACACTTACTCAAT
CCTCTGGAACCCTCAAAGAATCATATTGACAGTCGACGATACACCAATTAGAGAGTTTAA
AAACTCAGAGTCAATCGGTGTTTTGTTTCCAAAGAGCAAGCCGATGAGGATGTACGCGAG
TCTATGGAACGCAGACGACTGGGCGACAAGAGGTGGTCTGGTTAA

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DS 

RD RS1EN09TF 639 0 0
GAA
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CCGCCGCTGATTTCAACAGCGACGTCAACGTAGCTTGGGGAAACGGCCGTGGGAAGATAC
TCAACAATGGGCAGCTTCTTACTCTCTCCTTAGATAAGTCCTCTGGTTCTGGTTTTCAAT
CCAAAACAGAGTACTTGTTTGGAAAGATCGATATGCAGATTAAGCTTGTTCCTGGTAACT
CAGCAGGAACCGTCACAACTTTCTACCTGAAATCTGAAGGATCGACTTGGGATGAGATTG
ATTTTGAGTTCTTGGGTAATATGAGTGGAGATCCTTATACTTTACACACTAATGTTTACA
CTCAAGGTAATGGTGACAAAGAGCAACAGTTCTATCTCTGGTTCGACCCAACAGCGAACT
TCCACACTTACTCAATCCTCTGGAACCCTCAAAGAATCATATTGACAGTCGATGATACAC
CAATTAGAGAGTTTAAAAACTCAGAGTCAATCGGTGTTTTGTTTCCAAAGAGCAAGCCGA
TGAGGATGTACGCGAGTCTATGGAACGCAGACGACTGGGCAACAAGAGGTGGTCTGGTTA
AAACGGATTGGTCCAAAGCTCCGTTCATGGCTTCTT

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DS 

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G
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TCATTCTCCGCCGCTGATTTCAACAGCGACGTCAACGTAGCTTGGGGAAACGGCCGTGGG
AAGATACTCAACAATGGGCAGCTTCTTACTCTCTCCTTAGATAAGTCCTCTGGTTCTGGT
TTTCAATCCAAAACAGAGTACTTGTTTGGAAAGATCGATATGCAGATTAAGCTTGTTCCT
GGTAACTCAGCAGGAACCGTCACAACTTTTTACCTGAAATCTGAAGGATCGACTTGGGAT
GAGATTGATTTTGAGTTCTTGGGTAATATGAGTGGAGATCCTTATACTTTACACACTAAT
GTTTACACTCAAGGTAAAGGTGACAAAGAGCAACAATTCTATCTCTGGTTCGACCCAACA
GCGAACTTCCACACTTACTCAATCCTCTGGAACCCTCAAAGAATCATATTGACAGTCGAC
GATACACCAATTAGAGAGTTTAAAAACTCAGAGTCAATCGGTGTTTTGTTTCCAAAGAGC
AAGCCGATGAGGATGTACGCGAGTCTATGGAACGCAGACGACTGGGCGACAAGAGGTGGT
CTGGTTAAAACGGATTGGTCCAAAGCTCCGTTCATGGCTTCTTACAGGAACATTAAGATC
GACGGGTGTGCTCATATCAA

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DS 

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CTGGTAACTCAGCAGGAACCGTCACAACTTTTTACCTGAAATCTGAAGGATCGACTTGGG
ATGAGATTGATTTTGAGTTCTTGGGTAATATGAGTGGAGATCCTTATACTTTACACACTA
ATGTTTACACTCAAGGTAAAGGTGACAAAGAGCAACAATTCTATCTCTGGTTCGACCCAA
CAGCGAACTTCCACACTTACTCAATCCTCTGGAACCCTCAAAGAATCATATTGACAGTCG
ACGATACACCAATTAGAGAGTTTAAAAACTCAGAGTCAATCGGTGTTTTGTTTCCAAAGA
GCAAGCCGATGAGGATGTACGCGAGTCTATGGAACGCAGACGACTGGGCGACAAGAGGTG
GTCTGGTTAAAACGGATTGGTCCAAAGCTCCGTTCATGGCTTCTTACAGGAACATTAAGA
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CTCAACAAATGGATGCAACTAGCCAAGCTAGACTCAGATGGGTTCAGAAGAATTACATGA
TCTACAACTATTGTACGGACCGTAAGAGGTTCCCACAGGGAATCCCTCGTGAATGTGCAA
CAAGCGCATAAAATATTTTAATTATGAAGTATATAATGCATACTTCTGTGTGTGGTAAAT
GCTCTATGTTTCTTCTTTAGCTGCTTGGGTTTGATTCTTTCGAGTGTATATCTATG

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DS 

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GATGCAACTAGCCAAGCTAGACTCAGATGGGTTCAGAAGAATTACATGATCTACAACTAT
TGTACGGACCGTAAGAGGTTCCCACAGGGAATCCCTCGTGAATGTGCAACAAGCGCATAA
AATATTTTAATTATGAAGTATATAATGCATACTTCTGTGTGTGGTAAATGCTCTATGTTT
CTTCTTTAGCTGCTTGGGTTTGATTCTTTCGAGTGTATATCTATGTCCAATAACGCAAAA
GGTGTGTATATATATAAATCTATATATATGTAAGAGAGTCTTAAAGATGTCTTT

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DS 

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ACAACTTTCTA
CTGAAATCTGAAGGGTCGACTTGGGATGAGATTGATTTTGAGTTCTTGGGTAATATGAGT
GGAGATC*TTATACTTTACACACTAATGTTTACACCCAAGGTAA*GGTGACAAAGAGCAA
CAGTTCTATCTCTGGTTCGACCCAACAGCGAACTTCCACACTTACTCAATCCTCTGGAAC
CCTCAAAGAATCATATTGACAGTTGATGATACACCAATTAGAGAGTTTAAAAACTCAGAG
TCAATCAGTGTTTTGTTTCCAAAGAGCAAGCCGATGAGGATGTACGCGAGTCTATGGAAC
GCAGACGACTGGGCAACAAGAGGTGGTCTGGTTAAAACGGATTGGTCCAAAGCTCCGTTC
ATGGCTTCTTACAGGAACATTAAGATCGACGGGTGTGTTCACATCAACGGAAGATCGTCT
TGTAGCCCAAGCTCTAGTTGGTACACTCAACAAATGGATGCAACTAGCCAAGCTAGACTC
ATATGGGTTCAGAAGAATTACATGATCTACAACTATTGTACGGACCGTAAGAGGTTCCCA
CAGGGAATCCCTCGTGAATGTGCAACAAGCGCATAGAATATTTTATTTATGAAGTATATA
ATGCATACTTCTGTGTGTGGTAAATGCTCTATGTTTCTTCTTTAGCTGCTTGGGTTTGAT
TCTTTCGAGTGTATATCTATGTCCAATAACGGAAAAGGTGTGTATATATATAAATCTATA
TATATGTAAGAGAGTCTTAAAGATGTCTTTGTCTGTAAAATAACATGTTTATGAAAATGA
TACTACTT
TC

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RD RS1FG12JQ 595 0 0
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CTGGTTAAAACGGATTGGTCCAAAGCTCCGTTCATGGCTTCTTACAGGAACATTAAGATC
GACGGGTGTGCTCATATCAATGGAAGATCGTCTTGTAGCCCAAGCTCTAGTTGGTACACT
CAACAAATGGATGCAACTAGCCAAGCTAGACTCAGATGGGTTCAGAAGAATTACATGATC
TACAACTATTGTACGGACCGTAAGAGGTTCCCACAGGGAATCCCTCGTGAATGTGCAACA
AGCGCATAAAATATTTTAATTATGAAGTATATAATGCATACTTCTGTGTGTGGTAAATGC
TCTATGTTTCTTCTTTAGCTGCTTGGGTTTGATTCTTTCGAGTGTATATCTATGTCCAAT
AACGCAAAAGGTGTGTATATATATAAATCTATATATATGTAAGAGAGTCTTAAAGATGTC
TTTGTCTGTAAAATAACATGTTTATGAAAATGATACTACTTTCAATTTGTTTCAG

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DS 

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CGTTCATGGCTTCTTACAGGAACATTAAGATCGACGGGTGTGTTCACATCAACGGAAGAT
CGTCTTGTAGCCCAAGCTCTAGTTGGTACACTCAACAAATGGATGCAACTAGCCAAGCTA
GACTCAGATGGGTTCAGAAGAATTACATGATCTACAACTATTGTACGGACCGTAAGAGGT
TCCCACAGGGAATCCCTCGTGAATGTGCAACAAGCGCATAGAATATTTTATTTATGAAGT
ATATAATGCATACTTCTGTGTGTGGTAAATGCTCTATGTTTCTTCTTTAGCTGCTTGGGT
TTGATTCTTTCGAGTGTATATCTATGTCCAATAACGGAAAAGGTGTGTATATATATAAAT
CTATATATATGTAAGAGAGTCTTAAAGATGTCTTTGTCTGTAAAATAACATGTTTATGAA
AATGATACTACTT
CC

QA 1 493 1 493
DS 



AS 2 10

CO CL310Contig1 1362 7 8 U
TTTTTTCGCACGTGTTCCTAAGAAAAGGGAATTTGTTAATTTTTCGGGGTCTTAGAGGGG
CGCGGGAACACATAAGAACTCTTGAATGGAAATGGAAAAGAGATGTAACTCCAGTTCCTT
TGGAAATAGGAAGATCTTTGGCGCAAGAATAAAGGATTAATCCGTATCATCTTGACTTGG
TTCTGATTTCTCTATTTTTTTAAGTTTAAGAAAAGAATACCGTTTCTCCTACCCGTATCG
AATAGAACATGCTGAGTAAAATCTTCTTCATGTAAAACCGGCTTGATTTAGATCGGGAGA
ATCGTACGGTTTTATGAAACCATGTGCTATGGCTCGAATCCGTAGTCAATCCTATTTCCG
ATAGGAGTAGTTGACAATTGAATCCAACTTTTTCCATTATTTTCATTTCATACCCGTAAT
AGTGCGAAAGGAAAGCCCGGCTCCAATCCAAGTTGTTCAAGAATAGTGGCCTTGAGTTTC
TCGACCCTTTGACTTAGGATTAGTCAGTTCTATTTCTTGATGGGGGAAGGGATATAACTC
AGCGGTAGAGTGTCACCTTGACGTGGTGGAAGTCATAAGTTCGAGCCTGATTATCCCTAA
ACCCAATGAATGTGAGTTTTTCTATTTTGACTTGCTCCCTCGCTGTGATCGAATAAGAAT
GGATAAGAGGCTCGTGGGATTGACGTGAGGGGGTAGGGGTAGCTATATTTCTGGGAGCGA
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GAATCAGCTTTGTCTACGAAGAAGGAAGCTATAAGTAATGCAACTATGAATCTCATGGAG
AGTTCGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCATGCTTAACACATGCAAGTCGGACGG
GAAGTGGTGTTTCCAGTGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTAAGAACCTGCCCTTGGGAGGG
GAACAACAGCTGGAAACGGCTGCTAATACCCCGTAGGCTGAGGAGCAAAAGGAGGAATCC
GCCCGAGGAGGGGCTCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGCAATAGCTTACCAAGGCGA
TGATCAGTAGCTGGTCCGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGAC
TCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAAAAGAAGATTGAGAGTAGTCTAAAGAGGAAGTTTGA
AGCCAAGTCTCAGTTTGCTCTTGCCGTCTCTAACGGCTTCTTTTCTGCTTAACTATATTT
ATGGTTTCTTTCTTCTACAAACTTGATTGGCGATGTGTGTAGCCGACTTGTAAATTAAAT
ATAGTTGTCTGATGTATTATGGTTAGAGGAGATACTACTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BW15TF C 1
AF RS1BW15JQ U 7
AF RS1DM25JQ U 7
AF RS1DM25TF C 123
AF RS1B174JQ C 828
AF RS1B174TF U 828
AF RS1GF92TF U 714
BS 1 8 RS1BW15TF
BS 9 647 RS1BW15JQ
BS 648 648 RS1DM25JQ
BS 649 691 RS1BW15JQ
BS 692 799 RS1DM25JQ
BS 800 1160 RS1GF92TF
BS 1161 1161 RS1B174TF
BS 1162 1362 RS1GF92TF

RD RS1BW15TF 692 0 0
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CGCGGGAACACATAAGAACTCTTGAATGGAAATGGAAAAGAGATGTAACTCCAGTTCCTT
TGGAAATAGGAAGATCTTTGGCGCAAGAATAAAGGATTAATCCGTATCATCTTGACTTGG
TTCTGATTTCTCTATTTTTTTAAGTTTAAGAAAAGAATACCGTTTCTCCTACCCGTATCG
AATAGAACATGCTGAGTAAAATCTTCTTCATGTAAAACCGGCTTGATTTAGATCGGGAGA
ATCGTACGGTTTTATGAAACCATGTGCTATGGCTCGAATCCGTAGTCAATCCTATTTCCG
ATAGGAGTAGTTGACAATTGAATCCAACTTTTTCCATTATTTTCATTTCATACCCGTAAT
AGTGCGAAAGGAAAGCCCGGCTCCAATCCAAGTTGTTCAAGAATAGTGGCCTTGAGTTTC
TCGACCCTTTGACTTAGGATTAGTCAGTTCTATTTCTTGATGGGGGAAGGGATATAACTC
AGCGGTAGAGTGTCACCTTGACGTGGTGGAAGTCATAAGTTCGAGCCTGATTATCCCTAA
ACCCAATGAATGTGAGTTTTTCTATTTTGACTTGCTCCCTCGCTGTGGTCGAATAAGAAT
GGATAAGAGGCTCGTGGGATTGACGTGAGGG
C

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1BW15JQ 686 0 0
CG
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CACATAAGAACTCTTGAATGGAAATGGAAAAGAGATGTAACTCCAGTTCCTTTGGAAATA
GGAAGATCTTTGGCGCAAGAATAAAGGATTAATCCGTATCATCTTGACTTGGTTCTGATT
TCTCTATTTTTTTAAGTTTAAGAAAAGAATACCGTTTCTCCTACCCGTATCGAATAGAAC
ATGCTGAGTAAAATCTTCTTCATGTAAAACCGGCTTGATTTAGATCGGGAGAATCGTACG
GTTTTATGAAACCATGTGCTATGGCTCGAATCCGTAGTCAATCCTATTTCCGATAGGAGT
AGTTGACAATTGAATCCAACTTTTTCCATTATTTTCATTTCATACCCGTAATAGTGCGAA
AGGAAAGCCCGGCTCCAATCCAAGTTGTTCAAGAATAGTGGCCTTGAGTTTCTCGACCCT
TTGACTTAGGATTAGTCAGTTCTATTTCTTGATGGGGGAAGGGATATAACTCAGCGGTAG
AGTGTCACCTTGACGTGGTGGAAGTCATAAGTTCGAGCCTGATTATCCCTAAACCCAATG
AATGTGAGTTTTTCTATTTTGACTTGCTCCCTCGCTGTGGTCGAATAAGAATGGATAAGA
GGCTCGTGGGATTGACGTGAGGG
C

QA 3 685 3 685
DS 

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CT
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CACATAAGAACTCTTGAATGGAAATGGAAAAGAGATGTAACTCCAGTTCCTTTGGAAATA
GGAAGATCTTTGGCGCAAGAATAAAGGATTAATCCGTATCATCTTGACTTGGTTCTGATT
TCTCTATTTTTTTAAGTTTAAGAAAAGAATACCGTTTCTCCTACCCGTATCGAATAGAAC
ATGCTGAGTAAAATCTTCTTCATGTAAAACCGGCTTGATTTAGATCGGGAGAATCGTACG
GTTTTATGAAACCATGTGCTATGGCTCGAATCCGTAGTCAATCCTATTTCCGATAGGAGT
AGTTGACAATTGAATCCAACTTTTTCCATTATTTTCATTTCATACCCGTAATAGTGCGAA
AGGAAAGCCCGGCTCCAATCCAAGTTGTTCAAGAATAGTGGCCTTGAGTTTCTCGACCCT
TTGACTTAGGATTAGTCAGTTCTATTTCTTGATGGGGGAAGGGATATAACTCAGCGGTAG
AGTGTCACCTTGACGTGGTGGAAGTCATCAGTTCGAGCCTGATTATCCCTAAACCCAATG
AATGTGAGTTTTTCTATTTTGACTTGCTCCCTCGCTGTGATCGAATAAGAATGGATAAGA
GGCTCGTGGGATTGACGTGAGGGGGTAGGGGTAGCTATATTTCTGGGAGCGAACTCCATG
CGAATATGAAGCGCATGGATACAAGTTATGACTTGGAATGAAAGACAATTTCGAATCAGC
TTTGTCTACGA

QA 3 793 3 793
DS 

RD RS1DM25TF 723 0 0
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CTGATTTCTCTATTTTTT*AAGTTTAAGAAAAGAATACCGTTTCTCCTACCCGTATCGAA
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CGTACGGTTTTATGAAACCATGTGCTATGGCTCGAATCCGTAGTCAATCCTATTTCCGAT
AGGAGTAGTTGACAATTGAATCCAACTTTTTCCATTATTTTCATTTCATACCCGTAATAG
TGCGAAAGGAAAGCCCGGCTCCAATCCAAGTTGTTCAAGAATAGTGGCCTTGAGTTTCTC
GACCCTTTGACTTAGGATTAGTCAGTTCTATTTCTTGATGGGGGAAGGGATATAACTCAG
CGGTAGAGTGTCACCTTGACGTGGTGGAAGTCATCAGTTCGAGCCTGATTATCCCTAAAC
CCAATGAATGTGAGTTTTTCTATTTTGACTTGCTCCCTCGCTGTGATCGAATAAGAATGG
ATAAGAGGCTCGTGGGATTGACGTGAGGGGGTAGGGGTAGCTATATTTCTGGGAGCGAAC
TCCATGCGAATATGAAGCGCATGGATACAAGTTATGACTTGGAATGAAAGACAATTTCGA
ATCAGCTTTGTCTACGAAGAAGGAAGCTATAAGTAATGCAACTATGAATCTCATGGAGAG
TTC

QA 1 723 1 723
DS 

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AGTCGGACGGGAAGTGGTGTTTCCAGTGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTAAGAACCTGCC
CTTGGGAGGGGAACAACAGCTGGAAACGGCTGCTAATACCCCGTAGGCTGAGGAGCAAAA
GGAGGAATCCGCCCGAGGAGGGGCTCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGCAATAGCTT
ACCAAGGCGATGATCAGTAGCTGGTCCGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACA
CGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAA
TTTTCCGCAATGGGCG

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DS 

RD RS1B174TF 354 0 0
GGC
TCTCATGGAGAGTTCGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCATGCTTAACACATGCA
AGTCGGACGGGAAGTGGTGTTTCCAGTGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTAAGAACCTGCC
CTTGGGAGGGGAACAACAGCTGGAAACGGCTGCTAATACCCCGTAGGCTGAGGAGCAAAA
GGAGGAATCCGCCCGAGGAGGGGCTCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGCAATAGCTT
ACCAAGGCGATGATCAGTAGCTGGTCCGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACA
CGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAA
TTTTCCGCAATGGGCG

QA 4 338 4 338
DS 

RD RS1GF92TF 649 0 0
GGAGCGAACTCCATGCGAATATGAAGCGCATGGATACAAGTTATGACTTGGAATGAAAGA
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CGGACGGGAAGTGGTGTTTCCAGTGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTAAGAACCTGCCCTT
GGGAGGGGAACAACAGCTGGAAACGGCTGCTAATACCCCGTAGGCTGAGGAGCAAAAGGA
GGAATCCGCCCGAGGAGGGGCTCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGCAATAGCTTACC
AAGGCGATGATCAGTAGCTGGTCCGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGG
CCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGAGGAAAAGAAGATTGAGAGTAGTCTAAAGAGGA
AGTTTGAAGCCAAGTCTCAGTTTGCTCTTGCCGTCTCTAACGGCTTCTTTTCTGCTTAAC
TATATTTATGGTTTCTTTCTTCTACAAACTTGATTGGCGATGTGTGTAGCCGACTTGTAA
ATTAAATATAGTTGTCTGATGTATTATGGTTAGAGGAGATACTACTTTC

QA 1 649 1 649
DS 



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ATACTACTTTCAGAAACTTGTGGGGATAATTACAAAACAGAGAAGTTTTCGTCTTTAATT
TATTAAGTATGAAGAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H639JQB C 1
AF RS1H639TF U 1
AF RS1CF40TF U 200
BS 1 416 RS1H639TF
BS 417 436 RS1CF40TF

RD RS1H639JQB 416 0 0
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AACGGCTTCTTTTCTGCTTAACTATATTTATGGTTTCTTTCTTCTACAAACTTGATTGGC
GATGTGTGTAGCCGACTTGTAAATTAAATATAGTTGTCTGATGTATTATGGTTAGAGGAG
ATACTACTTTCAGAAACTTGTGGGGATAATTACAAAACAGAGAAGTTTTCGTCTTT

QA 1 416 1 416
DS 

RD RS1H639TF 416 0 0
GGATAAAGATTGGAAGATAACCAATAGAGAGATTGAAAAAAATGGCTGACATAGCACTGC
TAGTGGTGGAGGAATACGGGCGGATGGTGAAGCTAAAGTCGGAGAAAGCGTCAAACTCGG
CGGAGGTCGGGGGATGGAATTTTCCGGCGAGGATGAAGATTTGGGAGTGAGGAAAAGAAG
ATTGAGAGTAGTCTAAAGAGGAAGTTTGAAGCCAAGTCTCT*TTTGCTCTTGCCGTCTCT
AACGGCTTCTTTTCTGCTTAACTATATTTATGGTTTCTTTCTTCTACAAACTTGATTGGC
GATGTGTGTAGCCGACTTGTAAATTAAATATAGTTGTCTGATGTATTATGGTTAGAGGAG
ATACTACTTTCAGAAACTTGTGGGGATAATTACAAAACAGAGAAGTTTTCGTCTTT

QA 1 416 1 416
DS 

RD RS1CF40TF 237 0 0
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AACTATATTTATGGTTTCTTTCTTCTACAAACTTGATTGGCGATGTGTGTAGCCGACTTG
TAAATTAAATATAGTTGTCTGATGTATTATGGTTAGAGGAGATACTACTTTCAGAAACTT
GTGGGGATAATTACAAAACAGAGAAGTTTTCGTCTTTAATTTATTAAGTATGAAGAG

QA 1 237 1 237
DS 



AS 1 8

CO CL311Contig1 652 8 3 U
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TCAGCTGCTTTGTTAGCTAAAAATATGGGAAGCGATACAGAAGCAGAGAAGTCGATTCAA
AAGGAGAAGAAGAAGGTCATCTCTCTTGCTCCTATCGCTAAACCTCTGGCCGGGAAAAAG
CTCCAGAAGAGGACATTCAAGCTCATTCAAAAAGCTGCTGGAAAGAAGTGTCTGAAGAGG
GGCGTTAAAGAAGTGGTTAAGAGCATTCGACGTGGTCAGAAAGGAATATGTGTTATAGCT
GGAAACATATCTCCCATCGATGTGATTACCCATGTTCCAATCTTGTGTGAGGAAGCTGGT
ATTCCTTACGTCTACGTTCCATCAAAAGAGGATCTTGCGCAAGCCGGTGCTACAAAACGA
CCAACTTGCTGTGTCTTGGTCATGCTTAAACCTGCAAAAGGAGAGCTAAGTGCAGAGGAT
CTCGAAAAGTTGAAGTCAGACTACGAGCAAGTCGCTGATGATGTTAAAGAGCTTTCATCA
TCTGTAATCTGAATCAGAAAACACACGAACATGTGTTTCTACTTATTTGGTTTGTTGCTT
AATGAATATGATGAGATTTTAAAGCCTTGGGAAATGCTTATTCTATTTGCCA


BQ
25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AU93TF U 1
AF RS1B685JQ C -3
AF RS1B685TF U -3
AF RS1F338JQ C 1
AF RS1AU93JQ C 54
AF RS1GN77TF U -3
AF RS1F338TF U 1
AF RS1ED76TF U 138
BS 1 626 RS1AU93TF
BS 627 632 RS1GN77TF
BS 633 652 RS1ED76TF

RD RS1AU93TF 626 0 0
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CTCCAGAAGAGGACATTCAAGCTCATTCAAAAAGCTGCTGGAAAGAAGTGTCTGAAGAGG
GGCGTTAAAGAAGTGGTTAAGAGCATTCGACGTGGTCAGAAAGGAATATGTGTTATAGCT
GGAAACATATCTCCCATCGATGTGATTACCCATGTTCCAATCTTGTGTGAGGAAGCTGGT
ATTCCTTACGTCTACGTTCCATCAAAAGAGGATCTTGCGCAAGCCGGTGCTACAAAACGA
CCAACTTGCTGTGTCTTGGTCATGCTTAAACCTGCAAAAGGAGAGCTAAGTGCAGAGGAT
CTCGAAAAGTTGAAGTCAGACTACGAGCAAGTCGCTGATGATGTTAAAGAGCTTTCATCA
TCTGTAATCTGAATCAGAAAACACACGAACATGTGTTTCTACTTATTTGGTTTGTTGCTT
AATGAATATGATGAGATTTTAAAGCC

QA 1 626 1 626
DS 

RD RS1B685JQ 630 0 0
GGGCTC
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GGAGAAGAAGAAGGTCATCTCTCTTGCTCCTATCGCTAAACCTCTGGCCGGGAAAAAGCT
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CGTTAAAGAAGTGGTTAAGAGCATTCGACGTGGTCAGAAAGGAATATGTGTTATAGCTGG
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TCCTTACGTCTACGTTCCATCAAAAGAGGATCTTGCGCAAGCCGGTGCTACAAAACGACC
AACTTGCTGTGTCTTGGTCATGCTTAAACCTGCAAAAGGAGAGCTAAGTGCAGAGGATCT
CGAAAAGTTGAAGTCAGACTACGAGCAAGTCGCTGATGATGTTAAAGAGCTTTCATCATC
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TGAATATGATGAGATTTTAAAGCC

QA 7 630 7 630
DS 

RD RS1B685TF 630 0 0
GGGCTC
GAGCAACCGCTTAAACCACTACCTCTACTTGTTTCCGCTACTCTTCCGCCATTTTCACTC
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GGAGAAGAAGAAGGTCATCTCTCTTGCTCCTATCGCTAAACCTCTGGCCGGGAAAAAGCT
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CGTTAAAGAAGTGGTTAAGAGCATTCGACGTGGTCAGAAAGGAATATGTGTTATAGCTGG
AAACATATCTCCCATTGATGTGATTACCCATGTTCCAATCTTGTGTGAGGAAGCTGGTAT
TCCTTACGTCTACGTTCCATCAAAAGAGGATCTTGCGCAAGCCGGTGCTACAAAACGACC
AACTTGCTGTGTCTTGGTCATGCTTAAACCTGCAAAAGGAGAGCTAAGTGCAGAGGATCT
CGAAAAGTTGAAGTCAGACTACGAGCAAGTCGCTGATGATGTTAAAGAGCTTTCATCATC
TGTAATCTGAATCAGAAAACACACGAACATGTGTTTCTACTTATTTGGTTTGTTGCTTAA
TGAATATGATGAGATTTTAAAGCC

QA 7 630 7 630
DS 

RD RS1F338JQ 638 0 0
GGGAGCAACCGCTTAAACCACTACCTCTACCTGTTTCCGCTACTCTTCCGCCATTTTCAC
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AAGGAGAAGAAGAAGGTCATCTTTCTTGCTCCTATCGCTAAACCTCTGGCCTGGAAAAAG
CTCCAGAAGAGGACATTCAAGCTCATTCAAAAAGCTGCTGGAAAGAAGTGTTTGAAGAGG
GGCGTTAAAGAAGTGGTTAAGAGCATTCGACGTGGTCAGAAGGGAATATGTGTTATAGCT
GGAAACATATCACCCATCGATGTGATTACCCATGTTCCAATCTTGTGTGAGGAAGCTGGT
ATTCCTTACGTTTACGTTCCATCAAAAGAGGATCTTGCGCAAGCCGGTGCTACAAAACGA
CCAACTTGCTGTGTCTTGGTCATGCTTAAACCTGCAAAAGGAGAGCTAAGTGCAGAGGAT
CTCGAAAAGTTGAAGTCAGACTACGAGCAAGTCGCTGATGATGTTAAAGAGCTTTCATCA
TCTGTAATTTGAATCAGAAAACACACGAACATGTGTTTCTACTTATTTGGTTTGTTGCTT
AATGAATATGATGAGATTTTAAAGCCTTGGGA
AATGCT

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1AU93JQ 573 0 0
TTTTCACTCAGCTGCTTTGTTAGCTAAAAATATGGGAAGCGATACAGAAGCAGAGAAGTC
GATTCAAAAGGAGAAGAAGAAGGTCATCTCTCTTGCTCCTATCGCTAAACCTCTGGCCGG
GAAAAAGCTCCAGAAGAGGACATTCAAGCTCATTCAAAAAGCTGCTGGAAAGAAGTGTCT
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TATAGCTGGAAACATATCTCCCATCGATGTGATTACCCATGTTCCAATCTTGTGTGAGGA
AGCTGGTATTCCTTACGTCTACGTTCCATCAAAAGAGGATCTTGCGCAAGCCGGTGCTAC
AAAACGACCAACTTGCTGTGTCTTGGTCATGCTTAAACCTGCAAAAGGAGAGCTAAGTGC
AGAGGATCTCGAAAAGTTGAAGTCAGACTACGAGCAAGTCGCTGATGATGTTAAAGAGCT
TTCATCATCTGTAATCTGAATCAGAAAACACACGAACATGTGTTTCTACTTATTTGGTTT
GTTGCTTAATGAATATGATGAGATTTTAAAGCC

QA 1 573 1 573
DS 

RD RS1GN77TF 636 0 0
GGTCTC
GAGCAACCGCTTAAACCACTACCTCTACTTGTTTCCGCTACTCTTCCGCCATTTTCACTC
GGCTGCTTTGTTAGCTAAAAATATGGGAAGCGATACAGAAGCAGAGAAGTCGATTCAAAA
GGAGAAGAAGAAGGTCATCTCTCTTGCTCCTATCGCTAAACCTCTGGCCGGGAAAAAGCT
CCAGAAGAGGACATTCAAGCTCATTCAAAAAGCTGCTGGAAAGAAGTGTCTGAAGAGGGG
CGTTAAAGAAGTGGTTAAGAGCATTCGACGTGGTCAGAAGGGAATATGTGTTATAGCTGG
AAACGTATCTCCCATCGATGTGATTACCCATGTTCCAATCTTGTGTGAGGAAGCTGGTAT
TCCTTACGTCTACGTTCCATCAAAAGAGGATCTTGCGCAAGCCGGTGCTACAAAACGACC
AACTTGCTGTGTCCTGGTCATGCTTAAACCTGCAAAAGGAGAGCTAAGTGCAGAGGATCT
CGAAAAGTTGAAGTCAGACTACGAGCAAGTCGCTGATGATGTTAAATAGCTTTCATCATC
TGTAATCTGAATCAGAAAACACACGAACATGTGTTTCTACTTATTTGGTTTGTTGCTTAA
TGAATATGATGAGATTTTAAAGCCTTGGGA

QA 7 636 7 636
DS 

RD RS1F338TF 638 0 0
GGGAGCAACCGCTTAAACCACTACCTCTACCTGTTTCCGCTACTCTTCCGCCATTTTCAC
TCAGCTGCTTTGTTAGCTAAAAATATGGGAAGCGATACAGAAGCAGAGAAGTCGATTCAA
AAGGAGAAGAAGAAGGTCATCTCTCTTGCTCCTATCGCTAAACCTCTGGCCTGGAAAAAG
CTCCAGAAGAGGACATTCAAGCTCATTCAAAAAGCTGCTGGAAAGAAGTGTCTGAAGAGG
GGCGTTAAAGAAGTGGTTAAGAGCATTCGACGTGGTCAGAAGGGAATATGTGTTATAGCT
GGAAACATATCACCCATCGATGTGATTACCCATGTTCCAATCTTGTGTGAGGAAGCTGGT
ATTCCTTACGTCTACGTTCCATCAAAAGAGGATCTTGCGCAAGCCGGTGCTACAAAACGA
CCAACTTGCTGTGTCTTGGTCATGCTTAAACCTGCAAAAGGAGAGCTAAGTGCAGAGGAT
CTCGAAAAGTTGAAGTCAGACTACGAGCAAGTCGCTGATGATGTTAAAGAGCTTTCATCA
TCTGTAATCTGAATCAGAAAACACACGAACATGTGTTTCTACTTATTTGGTTTGTTGCTT
AATGAATATGATGAGATTTTAAAGCCTTGGGA
AATGCT

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1ED76TF 515 0 0
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TAAGAGCATTCGACGTGGTCAGAAAGGAATATGTGTTATAGCTGGAAACATATCTCCCAT
CGATGTGATTACCCATGTTCCAATCTTGTGTGAGGAAGCTGGTATTCCTTACGTCTACGT
TCCATCAAAAGAGGATCTTGCGCAAGCCGGTGCTACAAAACGACCAACTTGCTGTGTCTT
GGTCATGCTTAAACCTGCAAAAGGAGAGCTAAGTGCAGAGGATCTCGAAAAGTTGAAGTC
AGACTACGAGCAAGTCGCTGATGATGTTAAAGAGCTTTCATCATCTGTAATCTGAATCAG
AAAACACACGAACATGTGTTTCTACTTATTTGGTTTGTTGCTTAATGAATATGATGAGAT
TTTAAAGCCTTGGGAAATGCTTATTCTATTTGCCA

QA 1 515 1 515
DS 



AS 2 10

CO CL312Contig1 781 4 9 U
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TGCGCATCTTTTTAAGGTCAAAAGAAGAAAAATAAGAAGAAGAAGAAACTCAATTTTCTC
CGCAGAGAAAATAAATCCATGGCTTCTTTGCGATTCTCGGTCACCTTCCACACCTTCCTG
TTCTTCTCTCTGTGGGTCGTGGAGGCACGCACGTCAAGAAAGCTGATATCAACCAAGGAA
CAAGAAATTCAGAACAATAGCCATTTGCTCAAAGATGGTGAATTCGAGGATCCTACGCTA
TACATGTTTTTCAAAATCAATGATCTTAAAATAGGAACCAAATTGCCCATTTACTTCAAC
AAAAACGATCTTAGAAAAGTTCCTCCACTTCTCACAAGACAAGAAGCTGATCTCATTCCT
TTCACTAAGTCTAAGCTTGACTTCCTTCTGAATCACTTCTCTATCTCCAAAGACTCTCCC
CAAGCTAAAGCCATGAAGGAGACTCTGGTACGTTGTAACTACAAGGCCATTGAAGGAGAG
TACAAGTTTTGTGGGACATCTTTGGAGTCAATGCTTGATCTCGCCAAGAAAACAATAGCG
TCTAATTCAGATCTCGAAGTCATGACAACAAAAGTAATGGTACCTTCCCAAGACACAATA
AGCTATGCTTTGCATAACTATACATTCGCCGAGCTCCTAAAGAGCTTGTTGGGATAAGAT
GTTGGGGTGTCATAGAATGCATACCCTTATGTCGTTATATTGCATGGTCATAAAAGTGGA
A


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 

AF RS1EB23TF U 2
AF RS1GG66TF U 100
AF RS1CW28TF U 3
AF RS1E928TF U 1
BS 1 102 RS1E928TF
BS 103 105 RS1EB23TF
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BS 702 715 RS1E928TF
BS 716 716 RS1CW28TF
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BS 746 746 RS1CW28TF
BS 747 781 RS1E928TF

RD RS1EB23TF 708 0 0
GAT
AGTTCATTGAGATCTAAGATCAGTTGGATACCTTCTTCTATTTTCTTTAAAGAATTTGCG
CATCTTTTTAAGGTCAAAAGAAGAAAATTAAGAAGAAGAAGAAACTCAATTTTCTCCGCA
GAGAAAATAAATCCATGGCTTCTTTGCGATTCTCGGTCACCTTCCACACCTTCCTGTTCT
TCTCTCTGTGGGTCGTGGAGGCACGCACGTCAAGAAAGCTGATATCAACCAAGGAACAAG
AAATTCAGAACAATAGCCATTTGCTCAAAGATGGTGAATTCGAGGATCCTACGCTATACA
TGTTTTTCAAAATCAATGATCTTAAAATAGGAACCAAATTGCCCATTTACTTCAACAAAA
ACGATCTTAGAAAAGTTCCTCCACTTCTCACAAGACAAGAAGCTGATCTCATTCCTTTCA
CTAAGTCTAAGCTTGACTTCCTTCTGAATCACTTCTCTATCTCCAAAGACTCTCCCCAAG
CTAAAGCCATGAAGGAGACTCTGGTACGTTGTAACTACAAGGCCATTGAAGGAGAGTACA
AGTTTTGTGGGACATCTTTGGAGTCAATGCTTGATCTCGCCAAGAAAACAATAGCGTCTA
ATTCAGATCTCGAAGTCATGACAACAAAAGTAATGGTACCTTCCCAAGACACAATAAGCT
ATGCTTTGCATAACTATACATTCGCCGAG
CTCCTAAGAGCTTGCT

QA 4 692 4 692
DS 

RD RS1GG66TF 585 0 0
GG
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CACCTTCCACACCTTCCTGTTCTTCTCTCTGTGGGTCGTGGAGGCACGCACGTCAAGAAA
GCTGATATCAACCAAGGAACAAGAAATTCAGAACAATAGCCATTTGCTCAAAGATGGTGA
ATTCGAGGATCCTACGCTATACATGTTTTTCAAAATCAATGATCTTAAAATAGGAACCAA
ATTGCCCATTTACTTCAACAAAAACGATCTTAGAAAAGTTCCTCCACTTCTCACAAGACA
AGAAGCTGATCTCATTCCTTTCACTAAGTCTAAGCTTGACTTCCTTCTGAATCACTTCTC
TATCTCCAAAGACTCTCCCCAAGCTAAAGCCATGAAGGAGACTCTGGTACGTTGTAACTA
CGAGGCCATTGAAGGAGAGTACAAGTTTTGTGGGACATCTTTGGAGTCAATGCTTGATCT
CGCCAAGAAAACAATAGCGTCTAATTCAGATCTCGAAGTCATGACAACAAAAGTAATGGT
ACCTTCCCAAGACACAATAAGCTATGCTTTGCATAACTATACA

QA 3 585 3 585
DS 

RD RS1CW28TF 778 0 0
GG
AGTTCATTGAGATCTAAGATCAGTTGGATACCTTCTTCTATTTTCTTTAAAGAATTTGCG
CATCTTTTTAAGGTCAAAAGAAGAAAAATAAGAAGAAGAAGAAACTCAATTTTCTCCGCA
GAGAAAATAAATCCATGGCTTCTTTGCGATTCTCGGTCACCTTCCACACCTTCCTGTTCT
TCTCTCTGTGGGTCGTGGAGGCACGCACGTCAAGAAAGCTGATATCAACCAAGGAACAAG
AAATTCAGAACAATAGCCATTTGCTCAAAGATGGTGAATTCGAGGATCCTACGCTATACA
TGTTTTTCAAAATCAATGATCTTAAAATAGGAACCAAATTGCCCATTTACTTCAACAAAA
ACGATCTTAGAAAAGTTCCTCCACTTCTCACAAGACAAGAAGCTGATCTCATTCCTTTCA
CTAAGTCTAAGCTTGACTTCCTTCTGAATCACTTCTCTATCTCCAAAGACTCTCCCCAAG
CTAAAGCCATGAAGGAGACTCTGGTACGTTGTAACTACAAGGCCATTGAAGGAGAGTACA
AGTTTTGTGGGACATCTTTGGAGTCAATGCTTGATCTCGCCAAGAAAACAATAGCGTCTA
ATTCAGATCTCGAAGTCATGACAACAAAAGTAATGGTACCTTCCCAAGACACAATAAGCT
ATGCTTTGCATAACTATACATTCGCCGAGCTCCTAAAGAGCTTGTTGGGATAAGATGTTG
GGGTGTCATAGAATGCATACCCTTATGTCGTTATATTGCATGGTCATAAAAGTGGA

QA 3 778 3 778
DS 

RD RS1E928TF 781 0 0
GGATAGTTCATTGAGATCTAAGATCAGTTGGATACCTTCTTCTATTTTCTTTAAAGAATT
TGCGCATCTTTTTAAGGTCAAAAGAAGAAAAATAAGAAGAAG***AAACTCAATTTTCTC
CGCAGAGAAAATAAATCCATGGCTTCTTTGCGATTCTCGGTCACCTTCCACACCTTCCTG
TTCTTCTCTCTGTGGGTCGTGGAGGCACGCACGTCAAGAAAGCTGATATCAACCAAGGAA
CAAGAAATTCAGAACAATAGCCATTTGCTCAAAGATGGTGAATTCGAGGATCCTACGCTA
TACATGTTTTTCAAAATCAATGATCTTAAAATAGGAACCAAATTGCCCATTTACTTCAAC
AAAAACGATCTTAGAAAAGTTCCTCCACTTCTCACAAGACAAGAAGCTGATCTCATTCCT
TTCACTAAGTCTAAGCTTGACTTCCTTCTGAATCACTTCTCTATCTCCAAAGACTCTCCC
CAAGCTAAAGCCATGAAGGAGACTCTGGTACGTTGTAACTACAAGGCCATTGAAGGAGAG
TACAAGTTTTGTGGGACATCTTTGGAGTCAATGCTTGATCTCGCCAAGAAAACAATAGCG
TCTAATTCAGATCTCGAAGTCATGACAACAAAAGTAATGGTACCTTCCCAAGACACAATA
AGCTATGCTTTGCATAACTATACATTCGCCGAGCTCCTAA*GAGCTTGTTGGGATTAGAT
GTTGGGGTGTCATAGAATGCATACC*TTATGTCGTTATATTGCATGGTCATAAAAGTGGA
A

QA 1 781 1 781
DS 



CO CL312Contig2 1162 6 11 U
ACATCATAATTATATAGTATTATATCGGGACGCATGAGATATATATGTTACATTAATCGT
AGTAGTATTTTCACGTTAGAAGCTGCAAGTCACACAAAAGTGGCAATACCAAACCAACAG
ACTCTCTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTCCTTCTCAAGCCATAGTTATTAGAAGGC
ACATACTCACATCACGTCGAGCTAAGTTTATTTTTCTACTTCGCTACCCACACAATGTTA
TCAAGAGGGAAGAAGTGGCAAACTGGTGCGGACCTTGGCTCTATTTTCAACACCTTAAAA
GCTTCATGATCAACGTTCCACATAGACGTGTTCATGTGACAAACAGCAGGTCCCACAACC
CGATGTTTCCCATCATCTGTCACCAAGTTAACCTCAAAGACTTTGGTTCCACTTTTATGA
CCATGGCAATAATAAACGACATAAGGGTATGGCATTCTATGACACCCCAACATCTTAATC
CCAACAAGCTCCTTAGGAGCCTCGGCGAATGTATAGTTATGCAAAGCATAGCTTATTGTG
TCTTGGGAAGGTACCATTACTTTTGTTGTCATGACTTCGAGATCTGAATTAGACGCTATT
GTTTTCTTGGCGAGATCAAGCATTGACTCCAAAGATGTCCCACAAAACTTGTACTCTCCT
TCAATGGCCTTGTAGTTACAACGTACCAGAGTCTCCTTCATGGCTTTAGCTTGGGGAGAG
TCTTTGGAGATAGAGAAGTGATTCAGAAGGAAGTCAAGCTTAGACTTAGTGAAAGGAATG
AGATCAGCTTCTTGTCTTGTGAGAAGTGGAGGAACTTTTCTAAGATCGTTTTTGTTGAAG
TAAATGGGCAACTTGGTTCCTATTTTAAGATCATTGATTTTGAAAAACATGTATAGTGTA
GGATCCTCGAATTCACCATCTTTGAACAAATGGCTATTGTTCTGAATTTCTTGTTCCTTG
GTTGATATCAGCTTTCTTGACGTGCGTGCCTCCACGACCCACAGAGAGAAGAAGAGGAAG
GTGTGGAAGGTGACCGAGAATCGCAAAGAAGCCATGGATTTATTTTCTCTGCGGAGAAAA
TTGAGTTTCTTCTTCTTCTTTTGACCTTAAAAAATGCCCAAATTCTTTAAAGAAAATAGA
AGAAGGTATCCAACTGATCTTA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1GG66JQ U 2
AF RS1E928JQ U 153
AF RS1EB23JQ U 1
AF RS1CW28JQ U 153
AF RS1A280TF C 329
AF RS1A280TV C 716
BS 1 112 RS1EB23JQ
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BS 114 188 RS1EB23JQ
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BS 190 483 RS1EB23JQ
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BS 485 716 RS1EB23JQ
BS 717 738 RS1CW28JQ
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BS 1147 1162 RS1A280TF

RD RS1GG66JQ 588 0 0
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GTAGTATTTTCACGTTAGAAGCTGCAAGTCACACAAAAGTGGCAATACCAAACCAACAGA
CTCTCTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTTT*CCTTCTCAAGCCATAGTTATTAGAAGGCA
CATACTCACATCACGTCGAGCTAAGTTTATTTTTCTACTTCGCTACCCACACAATGTTAT
CAAGAGGGAAGAAGTGGCAAACTGGTGCGGACCTTGGCTCTATTTTCAACACCTTAAAAG
CTTCATGATCAACGTTCCACATAGACGTGTTCATGTGACAAACAGCAGGTCCCACAACCC
GATGTTTCCCATCATCTGTCACCAAGTTAACCTCAAAGACTTTGGTTCCACTTTTATGAC
CATGGCAATAATAAACGACATAAGGGTATGGCATTCTATGACACCCCAACATCTTAATCC
CAACAAGCTCCTTAGGAGCCTCGGCGAATGTATAGTTATGCAAAGCATAGCTTATTGTGT
CTTGGGAAGGTACCATTACTTTTGTTGTCATGACTTCGAGATCTGAAT

QA 1 588 1 588
DS 

RD RS1E928JQ 425 0 0
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TTTCTACTTCGCTACCCACACAATGTTATCAAGAGGGAAAAAGTGGCAAACTGGTGCGGA
CCTTGGCTCTATTTTCAACACCTTAAAAGCTTCATGATCAACGTTCCACATAAACGTGTT
CATGTGACAAACAGCAGGTTCCACAACCCGATGTTTCCCATCATCTGTCACCAAGTTAAC
CTCAAAGACTTTGGTTCCACTTTTATGACCATGGCAATAATAAACGACATAAGGGTATGG
CATTCTATGACACCCCAACATCTTAATCCCAACAAGCTCCTTAGGAGCCTCGGCGAATGT
ATAGTTATGCAAAGCATAGCTTATTGTGTCTTGGGAAGGTACCATTACTTTTGTTGTCAT
GACTT

QA 1 425 1 425
DS 

RD RS1EB23JQ 716 0 0
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AGTAGTATTTTCACGTTAGAAGCTGCAAGTCACACAAAAGTGGCAATACCAAGCCAACAG
ACTCTCTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTCCTTCTCAAGCCATAGTTATTAGAAGGC
ACATACTCCCATCACGTCGAGCTAAGTTTATTTTTCTACTTCGCTACCCACACAATGTTA
TCAAGAGGGAAGAAGTGGCAAACTGGTGCGGACCTTGGCTCTATTTTCAACACCTTAAAA
GCTTCATGATCAACGTTCCACATAGACGTGTTCATGTGACAAACAGCAGGTCCCACAACC
CGATGTTTCCCATCATCTGTCACCAAGTTAACCTCAAAGACTTTGGTTCCACTTTTATGA
CCATGGCAATAATAAACGACATAAGGGTATGGCATTCTATGACACCCCAACATCTTAATC
CCAGCAAGCTCCTTAGGAGCCTCGGCGAATGTATAGTTATGCAAAGCATAGCTTATTGTG
TCTTGGGAAGGTACCATTACTTTTGTTGTCATGACTTCGAGATCTGAATTAGACGCTATT
GTTTTCTTGGCGAGATCAAGCATTGACTCCAAAGATGTCCCACAAAACTTGTACTCTCCT
TCAATGGCCTTGTAGTTACAACGTACCAGAGTCTCCTTCATGGCTTTAGCTTGGGG

QA 1 716 1 716
DS 

RD RS1CW28JQ 586 0 0
CCTTCTCAAGCCATAGTTATTAGAAGGCACATACTCACATCACGTCGAGCTAAGTTTATT
TTTCTACTTCGCTACTCACACAATGTTATCAAGAGGGAAGAAGTGGCAAACTGGTGCGGA
CCTTGGCTCTATTTTCAACACCTTAAAAGCTTCATGATCAACGTTCCACATAGACGTGTT
CATGTGACAAACAGCAGGTCCCACAACCCGATGTTTCCCATCATCTGTCACCAAGTTAAC
CTCAAAGACTTTGGTTCCACTTTTATGACCATGGCAATAATAAACGACATAAGGGTATGG
CATTCTATGACACCCCAACATCTTAATCCCAACAAGCTCCTTAGGAGCCTCGGCGAATGT
ATAGTTATGCAAAGCATAGCTTATTGTGTCTTGGGAAGGTACCATTACTTTTGTTGTCAT
GACTTCGAGATCTGAATTAAACGCTATTGTTTTCTTGGCGAGATCAAGCATTGACTCCAA
AGATGTCCCACAAAACTTGTACTCTCCTTCAATGGCCTTGTAGTTACAACGTACCAGAGT
CTCCTTCATGGCTTTAGCTTGGGGAGAGTCTTTGGAGATAGAGAAG

QA 1 586 1 586
DS 

RD RS1A280TF 834 0 0
TGTTCATGTGACAAACAGCAGGTCCCACAACCCGATGTTTCCCATCATCTGTCACCAAGT
TAAC*TCAAAGACTTTGGTTCCACTTTTATGACCATGGCAATAATAAACGACATAAGGGT
ATGGCATTCTATGACACCCCAACATCTTAATCCCAACAAGCTCCTTAGGAGCCTCGGCGA
ATGTATAGTTATGCAAAGCACAGCTTATTGTGTCTTGGGAAGGTACCATTACTTTTGTTG
TCATGACCTTGAGATCTGAATTAGACGCTATTGTTTTCTTGGCGAGATCAAGCATTGACT
CCAAAGATGTCCCACAAAACTTGTACTCTCCTTCAATGGCCTTGTAGTTACAACGTACCA
GAGTCTCCTTCATGGCTTTAGCTTGGGGAGAGTCTTTGGAGATAGAGAAGTGATTCAGAA
GGAAGTCAAGCTTAGACTTAGTGAAAGGAATGAGATCAGCTTCTTGTCTTGTGAGAAGTG
GAGGAACTTTTCTAAGATCGTTTTTGTTGAAGTAAATGGGCAACTTGGTTCCTATTTTAA
GATCATTGATTTTGAAAAACATGTATAGTGTAGGATCCTCGAATTCACCATCTTTGAACA
AATGGCTATTGTTCTGAATTTCTTGTTCCTTGGTTGATATCAGCTTTCTTGACGTGCGTG
CCTCCACGACCCACAGAGAGAAGAAGAGGAAGGTGTGGAAGGTGACCGAGAATCGCAAAG
AAGCCATGGATTTATTTTCTCTGCGGAGAAAATTGAGTTTCTTCTTCTTCTTTTGACCTT
AAAAAATGCCCAAATTCTTTAAAGAAAATAGAAGAAG*TATCCAACTGATCTTA

QA 1 834 1 834
DS 

RD RS1A280TV 447 0 0
GAGAGTCTTTGGAGATAGAGAAGTGATTCAGAAGGAAGTCAAGCTTAGACTTAGTGAAAG
GAATGAGATCAGCTTCTTGTCTTGTGAGAAGTGGAGGAACTTTTCTAAGATCGTTTTTGT
TGAAGTAAATGGGCAACTTGGTTCCTATTTTAAGATCATTGATTTTGAAAAACATGTATA
GTGTAGGATCCTCGAATTCACCATCTTTGAACAAATGGCTATTGTTCTGAATTTCTTGTT
CCTTGGTTGATATCAGCTTTCTTGACGTGCGTGCCTCCACGACCCACAGAGAGAAGAAGA
GGAAGGTGTGGAAGGTGACCGAGAATCGCAAAGAAGCCATGGATTTATTTTCTCTGCGGA
GAAAATTGAGTTTCTTCTTCTTCTTTTGACCTTAAAAAATGCCCAAATTCTTTAAAGAAA
ATAGAAGAAGGTATCCAACTGATCTTA

QA 1 447 1 447
DS 



AS 1 10

CO CL313Contig1 996 10 35 U
CGTAAACAAATCTTGCAATGTGATTTCTTAAATAAAATTTCTAGAAGTTGACATGAAAAT
GGCATTATTAGAAGTTTATTCTCTTCGTCAAGATGAAAATAACTAGACATATTAAAAAAA
A*GTGATGATCCTTTTGAATGTCACTTATTAAGGGGCTTAAGCAAGCTTGGTTTGGTAGT
ATCATGCTCTTGAGATTTCAGGAGCTCCAACGAGGCGTGTCCGGATCTGGGGAAGCTTCT
GTCTGAAGGCAACGTCTAGACGTGCGTCTAAAGTGTTCTCGCAGACAATCTTTCCATCTT
GAGACGCCAGCACCACCCCGCCCGAGCAGTGGGGGTCATGGGAGTCAGGGAGCTTAGGGT
TAGGAGGTGGAGGGAGGAACACTTTTTCGTCGATTGTGATCTTAGGAGACGCGACTTTGG
CTTTGTCTGCATACTGTTTCTTAGCATCCTCAATGATGGATTCAACAACCCTCTTGTCCA
TCTCTCTGCATCTCAGCAGCACTGATGGCTCTTTCAGCCGCAGCAAACTCTCAACGATGA
GAGCCTTGAGAAGTTTCTTGTATGCGTTCTTGTCGTTGGAAACACGAAGGAGATCCTTAG
CCGCAGAGTCTTTCATGGAGGTGACAACGTCATCTTGTGCTTGAAGGTACTTAATCCTAC
TTGCATTCAGCTGCGTCGAGTAGTCGATGCGCTTGCGGATATCGACCTGCTTGAGCTTGC
GGTCATAATCTTGACGGAGCTTACGCTTGGCATTCTCAAGAAGCTGAAGTTTCTCTATGT
TGAATTCCTCCTCAGCAGAGATTGAGATCTCGTTAGCTTTCTCGTCAGCCTCTTGCCGGA
TGAACCGGACCATCTGTTGTATCTGCTTTGACACATCTGCGTCGTTCATATCTCTTTCTC
GCACACACAAACAAAAACAATCACAAACTTCCTTCTCAAACGCACTTTTATAACTCTTGA
GAAAGGAGGAGGAGCTAGACCCACTTTTTAGTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 40 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BI47JQ U 44
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AF RS1EB08JQ U 30
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AF RS1EU49TF C 304
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ACGAA

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AAGTGATGATCCTTTTGAATGTCACTTATTAAGGGGATTAAGCAAGAGAG*TTTGGTAGT
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GTCTGAAGGCAACGTCTAGACGTGCGTCTAAAGTGTTCTCGCAAACAATCTTTCCATCTT
GAGAAGCCAGCACCACCCCGCCCGAGCAGTGGGGGTCATGGGAGTCAGGGAGCTTAGGGT
TAGGAGGTGGAGGGAGGAACACTTTTTCGTCGATTGTGATCTTAGGAGACGCGACTTTGG
CTTTGTCTGCATACTGTTTCTTAGCATCCTCAATGATGGATTCAACAACCCTCTTGTCCA
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GAGCCTTGAGAAGTTTCTTGTATGCGTTCTTGTCGTTGGAAACACGAAGGAGATCCTTAG
CCG

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AAGATGAAAATAACTAGACATATTAAAAAAAA*GTGATGATCCTTTTGAATGTCACTTAT
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AAAGTGTTCTCGCAGACAATCTTTCCATCTTGAGACGCCAGCACCACCCCGCCCGAGCAG
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AAGATGAAAATAACTAGACATATTAAAAAAAA*GTGATGATCCTTTTGAATGTCACTTAT
TAAGGGGCTTAAGCAAGCTTGGTTTGGTAGTATCATGCTCTTGAGATTTCAGGAGCTCCA
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AAAGTGTTCTCGCAGACAATCTTTCCATCTTGAGACGCCAACACCACCCCGCCCGAGCAG
TGGGGGTCATGGGAGTCAGGGAGCTTAGGGTTAGGAGGTGGAGGGAGGAACACTTTTTCG
TCGATTGTGATCTTAGGAGACGCGACTTTGGCTTTGTCTGCATACTGTTTCTTAGCATCC
TCAATGATGGATTCAACAACCCTCTTGTCCATCTCTCTGCATCTCAGCAGCACTGATGGC
TCTTTCAGCCGCAGCAAACTCTCAACGATGAGAGCCTTGAGAAGTTTCTTGTATGCGTTC
TTGTCGTTGGAAACACGAAGGAGATCCTTAGCCGCAGAGTCTTTCATGGAGGTGACAACG
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TCGTTAGCTT*CTCGTCAGC
TCTTG

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TAAGGGGCTTAAGCAAGCTTGGTTTGGTAGTATCATGCTCTTGAGATTTCAGGAGCTCCA
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AAAGTGTTCTCGCAAACAATCTTTCCATCTTGAGACGCCAGCACCACCCCGCCCGAGCAG
TGGGGGTCATGGGAGTCAGGGAGCTTAGGGTTAGGAGGTGGAGGGAGGAACACTTTTTCG
TCGATTGTGATCTTAGGAGACGCGACTTTGGCTTTGTCTGCATACTGTTTCTTAGCATCC
TCAATGATGGATTCAACAACCCTCTTGTCCATCTCTCTGCATCTCAGCAGCACTGATGGC
TCTTTCAGCCGCAGCAAACTCTCAACGATGAGAGCCTTGAGAAGTTTCTTGTATGCGTTC
TTGTCGTTGGAAACACGAAGGAGATCCTTAGCCGCAGAGTCTTTCATGGAGGTGACAACG
TCATCTTGTGCTTGAAGGTACTTAATCCTACTTGCATTCAGCTGCGTCGAGTAGTCGATG
CGCTTGCGGATATCGACCTGCTTGAGCTTGCGGTCATAATCTTGACGGAGCTTACGCTTG
GCATTCTCAAGAAGCTGAAGTTTCTCTATGTTGAATTCCTCCTCAGCAGAGATTGAGATC
TCGTTAGCTTTCTCGTCAGCCTCTTG

QA 1 806 1 806
DS 

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GATCTGGGGAAGCTTCTGTCTGAAGGCAACGTCTAGACGTGCGTCTAAAGTGTTCTCGCA
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GTCAGGGAGCTTAGGGTTAGGAGGTGGAGGGAGGAACACTTTTTCGTCGATTGTGATCTT
AGGAGACGCGACTTTGGCTTTGTCTGCATACTGTTTCTTAGCATCCTCAATGATGGATTC
AACAACCCTCTTGTCCATCTCTCTGCATCTCAGCAGCACTGATGGCTCTTTCAGCCGCAG
CAAACTCTCAACGATGAGAGCCTTGAGAAGTTTCTTGTATGCGTTCTTGTCGTTGGAAAC
ACGAAGGAGATCCTTAGCCGCAGAGTCTTTCATGGAGGTGACAACGTCATCTTGTGCTTG
AAGGTACTTAATCCTACTTGCATTCAGCTGCGTCGAGTAGTCGATGCGCTTGCGGATATC
GACCTGCTTGAGCTTGCGGTCATAATCTTGACGGAGCTTACGCTTGGCATTCTCAAGAAG
CTGAAGTTTCTCTATGTTGAATTCCTCCTCAGCAGAGATTGAGATCTCGTTAGCTTTCTC
GTCAGCCTCTTGCCGGATGAACCGGAACATCTGTTGTATCTGCTTTGACACATCTGCGTC
GTTCATATCTCTTTCTCGCACACACAAACAAAAA

QA 1 814 1 814
DS 

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ACAATCTTTCCATCTTGAGACGCCAACACCACCCCGCCCGAGCAGTGGGGGTCATGGGAG
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GGAGACGCGACTTTGGCTTTGTCTGCATACTGTTTCTTAGCATCCTCAATGATGGATTCA
ACAACCCTCTTGTCCATCTCTCTGCATCTCAGCAGCACTGATGGCTCTTTCAGCCGCAGC
AAACTCTCAACGATGAGAGCCTTGAGAAGTTTCTTGTATGCGTTCTTGTCGTTGGAAACA
CGAAGGAGATCCTTAGCCGCAGAGTCTTTCATGGAGGTGACAACGTCATCTTGTGCTTGA
AGGTACTTAATCCTACTTGCATTCAGCCGAGTCGAGTAGTCGATGCGCTTGCGGATATCG
ACCTGCTTGAGCTTGCGGTCATAATCTTGACGGAGCTTACGCTTGGCATTCTCAAGAAGC
TGAAGTTTCTCTATGTTGAATTCCTCCTCAGCAGAGATTGAGATCTCGTTAGCTTTCTCG
TCAGCCTCTTGCCGGATGAACCGGACCATCTGTTGTATCTGCTTTGACACATCTGCGTCG
TTCATATCTCTTTCTCGCA

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DS 

RD RS1CQ53TF 813 0 0
TAGACATA
TAAAAAAAA*GTGATGATCCTTTTGAATGTCACTTATTAAGGGGCTTAAGCAAGCTTGGT
TTGGTAGTATCATGCTCTTGAGATTTCAGGAGCTCCAACGAGGCGTGTCCGGATCTGGGG
AAGCTTCTGTCTGAAGGCAACGTCTAGACGCGCGTCTAAAGTGTTCTCGCAGACAATCTT
TCCATCTTGAGACGCCAGCACCACCCCGCCCGAGCAGTGGGGGTCATGGGAGTCAGGGAG
CTTAGGGTTAGGAGGTGGAGGGAGGAACACTTTTTCGTCGATTGTGATCTTAGGAGACGC
GACTTTGGCTTTGTCTGCATACTGTTTCTTAGCATCCTCAATGATGGATTCAACAACCCT
CTTGTCCATCTCTCTGCATCTCAGCAGCACTGATGGCTCTTTCA*CCGCAGCAAACTCTC
AACGATGAGAGCCTTGAGAAGTTTCTTGTATGCGTTCTTGTCGTTGGAAACACGAAGGAG
GTCCTTAGCCGCAGAGTCTTTCATGGAGGTGACAACGTCATCTTGTGCTTGAAGGTACTT
AATCCTACTTGCATTCAGCTGCGTCGAGTAGTCGATGCGCTTGCGGATATCGACCTGCTT
GAGCTTGCGGTCATAATCTTGACGGAGCTTACGCTTGGCATTCTCAAGAAGCTGAAGTTT
CTCTATGTTGAATTCCTCCTCAGCAGAGATTGAGATCTCGTTAGCTCTCTCGTCAGCCTC
TTGCCGGATGAACCGGACCATCTGTTGTATCTGCTTTGACACATCTGCGTCGTTCATATC
TCTTTCTCGCACACACAAACAAAAA

QA 9 813 9 813
DS 

RD RS1EU49TF 614 0 0
AA
GCCAGCACCACCCCGCCCGAGCAGTGGGGGTCATGGGAGTCAGGGAGCTTAGGGTTAGGA
GGTGGAGGGAGGAACACTTTTTCGTCGATTGTGATCTTAGGAGACGCGACTTTGGCTTTG
TCTGCATACTGTTTCTTAGCATCCTCAATGATGGATTCAACAACCCTCTTGTCCATCTCT
CTGCATCTCAGCAGCACTGACGGCTCTTTCAGCCGCAGCAAACTCTCAACGATGAGAGCC
TTGAGAAGTTTCTTGTATGCGTTCTTGTCGTTGGAAACACGAAGGAGATCCTTAGCCGCA
GAGTCTTTCATGGAGGTGACAACGTCATCTTGTGCTTGAAGGTACTTAATCCTACTTGCA
TTCAGCTGCGTCGAGTAGTCGATGCGCTTGCGGATATCGACCTGCTTGAGCTTGCGGTCA
TAATCTTGACGGAGCTTACGCTTGGCATTCTCAAGAAGCTGAAGTTTCTCTATGTTGAAT
TCCTCCTCAGCAGAGATTGAGATCTCGTTAGCTTTCTCGTCAGCCTCTTGCCGGATGAAC
CGGACCATCTGTTGTATCTGCTTTGACACATCTGCGTCGTTCATATCTCTTTCTCGCACA
CACAAACAAAAA

QA 3 614 3 614
DS 

RD RS1BI47TF 701 0 0
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AGGGTTAGGAGGTGGAGGGAGGAACACTTTTTCGTCGATTGTGATCTTAGGAGACGCGAC
TTTGGCTTTGTCTGCATACTGTTTCTTAGCATCCTCAATGATGGATTCAACAACCCTCTT
GTCCATCTCTCTGCATCTCAGCAGCACTGATGGCTCTTTCAGCCGCAGCAAACTCTCAAC
GATGAGAGCCTCGAGAAGTTTCTTGTATGCGTTCTTGTCGTTGGAAACACGAAGGAGATC
CTTAGCCGCAGAGTCTTTCATGGAGGTGACAACGTCATCTTGTGCTTGAAGGTACTTAAT
CCTACTTGCATTCAGCTGCGTCGAGTAGTCGATGCGCTTGCGGATATCGACCTGCTTGAG
CTTGCGGTCATAATCTTGACGGAGCTTACGCTTGGCATTCTCAAGAAGCTGAAGTTTCTC
TATGTTGAATTCCTCCTCAGCAGAGATTGAGATCTCGTTAGCTTTCTCGTCAGCCTCTTG
CCGGATGAACCGGACCATCTGTTGTATCTGCTTTGACACATCTGCGTCGTTCATATCTCT
TTCTCGCACACACAAACAAAAACAATCACAAACTTCCTTCTCAAACGCACTTTTATAACT
CTTGAGAAAGGAGGAGGAGCTAGACCCACTTTTTAGTGCCC

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 9

CO CL314Contig1 1196 9 22 U
GGGAACCTCATCAACTAATCCACTACAATGTCTTCTTCTTATTCTTCACTCACACTCTTC
TTCTTCTTCTTTGCTTCCACATTCCTCTACACTTCATCAAACTCATTCAACATCACAAAC
ATCTTAAACCAGAACAATGAGTTCTCCACTTTCAACAACCTCCTCTCCCAAACCGGACTC
GCTTCCACCATCAACTCCCGTCAAACCATAACCGTCCTCGCCCTTTCCAACGACGCAATG
ACCATGTTTTCCTCCCAATCAACCGAAGACAACAAGAAAAGCCTCGGCCTCCACATCGTT
CTAGACTACTACGACATCAAGAAACTCAGAAGCATAAAATCAGTGATACTCACCACTCTC
TTCCAAGCAAGCGGTCAAGCTAAAGGCCTCCAAGGGTTCGTGAACGCAACCGTTATGAAC
AACGGTGACGTTATGTTCGGATCTGCGGTTCGTGGATCCGGCCTTGACTCTAAGCTTATA
GACTCTGTTGCAACACATCCATATAACATCTCGGTGCTTCATATTAGTAGTTACATATCT
ATCATGGATCCCGAAGGTCCTAAAGATCATGGTTCTTCATCTTCACCACTTCCTGTACAA
CCTCCTGGTGATGATGATTATGAATATGACGAGCCACCGTCTCCACCTTCCTCTACTACT
AAGCCTTTTGTTGCTGCTGCTACTGCTGCTACCGCTAAGCCACCTTCTTCTGCAAAAGAC
AACTCAACAACAAGTGGAGTTTCAGCGATTAGTATTCCTAACCTGGCGTTTGTGTTTGTG
ATCTCATCCTTTTGGTGCTTCATGACGGTCTGGTGATGTGATGGCTAAGATTTGATGAAT
AAACCAGATCAGCTTTCTGAAAGCCAGAAAAAAAGA***ATGGAGATTAGCAGCAAAGCT
TTCAAGCTTTTTTTCACACAAAAGAACACTTCAAGCTTCACAAACTCTATGGAATAAAGC
AACAAAATCCAAAGAAGAAATAAAGTGATTGATGATTTAATAAGGGATGAAGAATGTTGT
AAAACTCAAAAGTTCTTTATTTATTTGGAAGCTTGGATAAGTTTGTAAGAGATTTCAATT
GGAACCAATAAAAGAAAACACAAACTTGCAACGCTTTTCTGGTGCATTGTTTTTTGGTTG
TATTACATGTAATAGAAGAGACAAAAGGAATGCAACACTAAAGATTAAAGATGTTT


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 
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G

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G
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GA

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G
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CT

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QA 1 730 1 730
DS 



AS 2 8

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EL96TF U 21
AF RS1EM29TF U 21
AF RS1DX78TF U 1
AF RS1AO80TFB U 16
BS 1 55 RS1DX78TF
BS 56 57 RS1AO80TFB
BS 58 60 RS1DX78TF
BS 61 61 RS1AO80TFB
BS 62 186 RS1DX78TF
BS 187 187 RS1AO80TFB
BS 188 287 RS1DX78TF
BS 288 288 RS1AO80TFB
BS 289 321 RS1DX78TF
BS 322 322 RS1EL96TF
BS 323 331 RS1DX78TF
BS 332 332 RS1AO80TFB
BS 333 337 RS1DX78TF
BS 338 338 RS1AO80TFB
BS 339 694 RS1DX78TF
BS 695 695 RS1AO80TFB
BS 696 730 RS1DX78TF
BS 731 731 RS1AO80TFB
BS 732 744 RS1DX78TF
BS 745 745 RS1AO80TFB
BS 746 759 RS1DX78TF
BS 760 760 RS1AO80TFB
BS 761 765 RS1DX78TF
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BS 775 796 RS1DX78TF
BS 797 869 RS1AO80TFB

RD RS1EL96TF 630 0 0
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CATTTCGACACCGCAAAGATATATGGATCAGAAGAAGCTCTAGGAACTGCATTAGGTCAA
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AGTGATCACCATGACCCTATCTCTGCTCTCACACAAACTCTCAAGACAATGGGGCTAGAG
TATCTAGATAACTACTTGGTGCATTGGCCAATAAAGCTTAAACCAGGAGTGAGTGAGCCC
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AAGATCTATGATCTCCTCGATTTTGCTTCTGTCTATCCTTCCGTTAACCAGGTGGAGATG
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DS 

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GTTGCACGGCTCAGGTGTGGGAAGATGATTCCATTGCTTGGAATGGGAACTTATTGTCCT
CAAAAAGATCGAGAGAGCACCATCTTAGCCGTCCATCAAGCCATCAAGATAGGGTATAGA
CATTTCGACACCGCAAAGATATATGGATCAGAAGAAGCTCTAGGAACTGCATTAGGTCAA
GCTATCTCCTATGGAACTGTCCCAAGAGAAGACATCTTTGTGACTTCAAAGTTATGATCT
AGTGATCACCATGACCCTATCTCTGCTCTCACACAAACTCTCAAGACAATGGGGCTAGAG
TATCTAGATAACTACTTGGTGCATTGGCCAATAAAGCTTAAACCAGGAGTGAGTGAGCCC
ATCCCAAAGGAAGAAGAGTTTGAGAAAGATGTAGGAATTGAAGAAACTTGGCAAGGCATG
GAGAGATGCTTAGAGATGGGTTTGTGTAGATCCATTGGTGTTAGCAACTTCTCTTCTAAA
A*GATCTATGATCTCCTCGATTTTGCTTCTGTCTATCCTTCCGTTAACCAGGTGGAGATG
CATCCATTGTGGAGACAAAGCAAGC

QA 6 630 6 630
DS 

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TCAAGCGATCAAGATAGGGTATAGACATTTCGACACCGCAAAGATATATGGATCAGAAGA
AGCTCTAGGAACTGCATTAGGTCAAGCTATCTCCTATGGAACTGTCCAAAGAGAAGACAT
CTTTGTGACTTCAAAGTTATGGTCTAGTGATTACCATAACCCTATCTCTGCCCTCACACA
AACTCTCAAGACAATGGGGCTAGAGTATCTAGATAACTACTTGGTGCATTGGCCAATAAA
GCTTAAACCAGGAGTGAGTGAGCCCATCCCAAAGGAAGAAGAGTTTGAGAAAGATGTAGG
AATTGAAGAAACTTGGCAAGGCATGGAGAGATGCTTAGAGATGGGTTTGTGTAGATCCAT
TGGTGTTAGCAACTTCTCTTCTAAAAAGATCTATGATCTCCTCGATTTTGCTTCTGTCTA
TCCTTCCGTTAACCAGGTGGAGATGCATCCATTGTGGAGACAAAGCAAGCTAAAGAAAGT
GTGTAACGAGAACAAGATCCATGTAAGTGGATAT*CACCACTTGGTGGGCCAGGAAATTG
TTGGGGATCA*CGGCTGTGATTGA*CATCCTGTCATCAA*TCTAT*GCTCTCA*GCATAG
TGTCACTCCAGCTCAG
TGG

QA 1 796 1 796
DS 

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AGACATTTCGACACCGCAAAGATATATGGATCAGAAGAAGCTCTAGGAACTGCATTAGGT
CAAGCTATCTCCTATGGAACTGTCCCAAGAGAAGACATCTTTGTGACTTCAAAGTTATGG
TCTAGTGATCACCATGACCCTATCTCTGCCCTCACACAAACTCTCAAGACAATGGGGCTA
GAGTATCTAGATAACTACTTGGTGCATTGGCCAATAAAGCTTAAACCAGGAGTGAGTGAG
CCCATCCCAAAGGAAGAAGAGTTTGAGAAAGATGTAGGAATTGAAGAAACTTGGCAAGGC
ATGGAGAGATGCTTAGAGATGGGTTTGTGTAGATCCATTGGTGTTAGCAACTTCTCTTCT
AAAAAGATCTATGATCTCCTCGATTTTGCTTCTGTCTATCCTTCCGTTAACCAGGTGGAG
ATGCATCCATTGTGGAGACAAAGCAAGCTAAGGAAAGTGTGTAACGAGAACAAGATCCAT
GTAAGTGGATATTCACCACTTGGTGGGCCAGGAAATTGTTGGGGATCAACGGCTGTGATT
GAACATCCTGTCATCAAATCTATTGCTCTCAAGCATAGTGTCACTCCAGCTCAGTATCTT
CGTTATTCGTTCTGATTCGATTCGAAAATTCCGGATATCCGTAAGCTACCGAAGCAAAGT
AAATACT

QA 8 854 8 854
DS 



CO CL315Contig2 747 4 4 U
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TCTTTCATGTTGTAATGACTTTATATACCAAATGAGAAAACCATGATCATAAGCAACATA
ACAGAAGATGAAATTACATTTTGGATGAAGTTATGTGAATCCCTAATCAATTATATCTCA
TCGTCCCAAAGTTGTTGGATCGATTTGTAAGGGCTTGTAGTTTGATTAACAAGGAAATCT
CCCCTCATGATCTTCCTCTCCTCCAATTGGTCAATGAATGATAAGTCTTGATCATCCAAT
TTTATATCCAAGGCTCTCTTGTTTTCTCTCATTCTTTCTCCATTAAAACTTTTCACTATC
ACACTTGCTCCCTTTGACATTCCCCACCTTAAAGCCACCTGAGCTGGAGTGACACTATGC
TTGAGAGCAATAGAATTGATGACAGGATGTTCAATCACAGCCGTTGATCCCCAACAATTT
CCTGGCCCACCAAGTGGTGAATATCCACTTACATGGATCTTGTTCTCGTTACACACTTTC
CTTAGCTTGCTTTGTCTCCACAATGGATGCATCTCCACCTGGTTAACGGAAGGATAGACA
GAAGCAAAATCGAGGAGATCATAGATCTTTTTAGAAGAGAAGTTGCTAACACCAATGGAT
CTACACAAACCCATCTCTAAGCATCTCTCCATGCCTTGCCAAGTTTCTTCAATTCCTACA
TCTTTCTCAAACTCTTCTTCCTTTGGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B452TF C 86
AF RS1EL96JQ U 1
AF RS1EM29JQ U 1
AF RS1DX78JQ U 86
BS 1 434 RS1EL96JQ
BS 435 435 RS1DX78JQ
BS 436 462 RS1EL96JQ
BS 463 747 RS1DX78JQ

RD RS1B452TF 210 0 0
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C

QA 1 209 1 209
DS 

RD RS1EL96JQ 462 0 0
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TCTTTCATGTTGTAATGACTTTATATACCAAATGAGAAAACCATGATCATAAGCAACATA
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CCCCTCATGATCTTCCTCTCCTCCAATTGGTCAATGAATGATAAGTCTTGATCATCCAAT
TTTATATCCAAGGCTCTCTTGTTTTCTCTCATTCTTTCTCCATTAAAACTTTTCACTATC
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TTGAGAGCAATAGATTTGATGACAGGATGTTCAATCACAGCC

QA 1 462 1 462
DS 

RD RS1EM29JQ 423 0 0
GGAAAAAAACTATATGTTGCGTGAAAAAAGAGGATCAAACCAAATCAAGCAAGATGGTGT
TCTTTCATGTTGTAATGACTTTATATACCAAATGAGAAAACCATGATCATAAGCAACATA
ACAGAAGATGAAATTACATTTTGGATGAAGTTATGTGAATCCCTAATCAATTATATCTCA
TCGTCCCAAAGTTGTTGGATCGATTTGTAAGGGCTTGTAGTTTGATTAACAAGGAAATCT
CCCCTCATGATCTTCCTCTCCTCCAATTGGTCAATGAATGATAAGTCTTGATCATCCAAT
TTTATATCCAAGGCTCTCTTGTTTTCTCTCATTCTTTCTCCATTAAAACTTTTCACTATC
ACACTTGCTCCCTTTGACATTCCCCACCTTAAAGCCACCTGAGCTGGAGTGACACTATGC
TTG

QA 1 423 1 423
DS 

RD RS1DX78JQ 662 0 0
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TGAAGTTATGCGAAACCCTAATCAATTATATCTCATCGTCCCAAAGTTGTTGGATCGATT
TGTAAGGGCTTGTAGTTTGATTAACAAGGAAATCTCCCCTCATGATCTTCCACTCCTCCA
ATTGGTCAATGAATGATACGTCTTGATCATCCAATTTTATATCCAAGGCTCTCTTGTTTT
CTCTCATT**TTCTCCATTAAAACTTTTAACTATCACACTTGCCCCCTTTGACATTCCCC
ACCTTAGAGCCACCTGAGCTGGAGTGACACTATGCTTGAGAGCAATAGAATTGATGACAG
GATGTTCAATCACAGCCGTTGATCCCCAACAATTTCCTGGCCCACCAAGTGGTGAATATC
CACTTACATGGATCTTGTTCTCGTTACACACTTTCCTTAGCTTGCTTTGTCTCCACAATG
GATGCATCTCCACCTGGTTAACGGAAGGATAGACAGAAGCAAAATCGAGGAGATCATAGA
TCTTTTTAGAAGAGAAGTTGCTAACACCAATGGATCTACACAAACCCATCTCTAAGCATC
TCTCCATGCCTTGCCAAGTTTCTTCAATTCCTACATCTTTCTCAAACTCTTCTTCCTTTG
GG

QA 1 662 1 662
DS 



AS 2 9

CO CL316Contig1 1087 3 7 U
GGAGAGAGAGGGAGAAAGAATCGTCCCGTTGAGATTGCTCTTGTTGGATAAATTGTGATT
TTCTTAGCATAAGCAAGAAAAAAGAAAATGAGCGGGAGTAGAAAGAAGACAACGCCGGCG
AGCCGGACGCGAGTGGGGAACTACGAGATGGGACGAACTCTAGGCGAAGGAAGCTTCGCT
AAGGTCAAATACGCTAGGAACACCATCACCGGAGATCTAGCCGCTTTCAAAATCCTCGAC
CGAGATAAGGTTCTCCGCCACAAAATGGTCGAACAGCTTAAACGAGAAATATCGACAATG
AAACTGATTAAACATCCAAATGTGGTCGAAATAATCGAGGTTATGGCGAGCAAAACGAAG
ATCTATATCGTTCTCGAGCTGGTCAGCGGAGGTGAACTATTTGATAAAATCGCCCAACAG
GGGAAACTAAAGGAGGATGAAGCTCGGAGTTATTTTCATCAGCTCATAAATGCTGTGGAT
TACTGCCACAGTCGAGGGGTCTACCACAGAGATCTCAAGCCTGAAAATCTTATCCTTGAT
GCTAATGGGATTTTAAAAGTTTCTGATTTTGAGTTAAGCGCGTTTTCACTACAAGTTCGG
GGAGATGGTTTGCTTCACACTGCTTGTGGAACGCCGAACTATGTTGCTCCTGAGGTTCTG
TCGGACAAAGGCTATGACGGTGCAGCAGCAGACGTCTGGTCCTGTGGTATTATTCTATTT
GTGCTCATGGCTGGTTACTTACCTTTTGATGAGCCAAATCTCATGACATTATACAAACGT
ATATGCAAGGCTGAGTTCAGCTGCCCATCATGGTTCTCGCCAGGTGCCAAGGGAGTCATT
AAGCGTATTCTTGATCCCAGCCCTATAACCAGAATAAGTATTGCAGAGTTGCTAGAAGAT
GAATGGTTCAAGCAAGGGTACAAGCCACCATCGTTTGGTCAAGATGATGAAGACATAAAT
ATTGATGATGTCGATGCTGCTTTCAGTAACTCCAAGGAGTCTCTTGTAACTGAGAAGAAG
AGAAACCGGAATCGATGACGCTTTTGACTTATCTCGAGCTCAACAGTCTTGAAACTTGTT
CGAGAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DK89TF U 1
AF RS1DJ09TF U 240
AF RS1D034TF U 280
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QA 1 509 1 509
DS 

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G
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ATCTATATCGTTCTCGAGCTGGTCAGCGGAGGTGAACTATTTGATAAAATCGCCCAACAG
GGGAAACTAAAGGAGGATGAAGCTCGGAGTTATTTTCATCAGCTCATAAATGCTGTGGAT
TACTGCCACAGTCGAGGGGTCTACCACAGAGATCTCAAGCCTGAAAATCTTATCCTTGAT
GCTAATGGGATTTTAAAAGTTTCTGATTTTGGGTTAAGCGCGTTTTCACTACAAGTTCGG
GGATATGGTTTGCTTCACACTGCTTGTGGAACGCCGAACTATGTTGCTCCTGAGGTTCTG
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GTGCTCATGGCTGGTTACTTACCTTTTGATGAGCCAAATCTCATGACATTATACAAACGT
ATATGCAAGGCTGAGTTCAGCTGCCCATCATGGTTCTCGCCAGGTGCCAAGGGAGTCATT
AAGCGTATTCTTGATCCCAGCCCTATAACCAGAATAAGTATTGCAGAGTTGCTAGAAGAT
GAATGGTTCAAGCAAGGGTACAAGCCACCATCGTTTGGTCAAGATGATGAAGACATAAAT
ATTGATGATGTCGATGCTGCTTTCAGTAACTCCAAGGAGTCTCTTGTAACTGAGAA
AAGAGAAACCGGAT

QA 2 777 2 777
DS 

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G
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TTATGGCGAGCAAAACGAAGATCTATATCGTTCTCGAGCTGGTCAGCGGAGGTGAACTAT
TTGATAAAATCGCCCAACAGGGGAAACTAAAGGAGGATGAAGCTCGGAGTTATTTTCATC
AGCTCATAAATGCTGTGGATTACTGCCACAGTCGAGGGGTCTACCACAGAGATCTCAAGC
CTGAAAATCTTATCCTTGATGCTAATGGGATTTTAAAAGTTTCTGATTTTGAGTTAAGCG
CGTTTTCACTACAAGTTCGGGGAGATGGTTTGCTTCACACTGCTTGTGGAACGCCGAACT
ATGTTGCTCCTGAGGTTCTGTCGGACAAAGGCTATGACGGTGCAGCAGCAGACGTCTGGT
CCTGTGGTATTATTCTATTTGTGCTCATGGCTGGTTACTTACCTTTTGATGAGCCAAATC
TCATGACATTATACAAACGTATATGCAAGGCTGAGTTCAGCTGCCCATCATGGTTCTCGC
CAGGTGTCAAGGGAGTCATTAAGCGTATTCTTGATCCCAGCCCTATAACCAGAATAAGTA
TTGCAGAGTTGCTAGAAGATGAATGGTTCAAGCAAGGGTACAAGCCACCATCGTTTGGTC
AAGATGATGAAGACATAAATATTGATGATGTCGATGCTGCTTTCAGTA*CTCCAAG*AGT
CTCTTGTA*CTGAGAAGAAGAGAAACCGGAATCGATGACGCTTTTGACTTATCTCGAGCT
CAACAGTCTTGAAACTTGTTCGAGAAG

QA 2 808 2 808
DS 



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AAGCAAAGCCATCTTTTGAGGAAAATTGCATGTGGATATATATCTACGTTTATAGCCCAC
TACCAGGTTTTCCTTTATTTTTTGGTTGTCAATCTTTGAAGCTTCATGTTACAGTTTTCA
ACCATTTCAACTATCTTTCATGATTTAATATATTTTGTTTCGAATAGAACAACTTGCTAT
TAACTTGTTAAGCTTTATGTTCTTGAGCTGCTCCATCAGAATTCCAGACTACATCCTTTA
ATCCAGATGAGAAGTTTTTGTAGAACTTGTGAAACTCGAGGGTATCACCGCCGGTTTTCC
TAAGCTCTACTACATGCAACGATGGCGCAACTTCAAACACCTCTGTAGCAACTGAGAGCT
GGCCTTTACGACCACTTTTGTCTCCTTTCATTTTTATCTTGTACTTGTCTTTACGGACAT
TGAAGCCTAATGGCTTTGCGGTTTCTTCCATTTTGGACATTATTTCGCTCGCAGGTCGTT
GAGAAGTAAACCGTGTCTCTTTCTTCACAAGTTGGGCTTGCTTCTCGAACAAGTTTTCAA
GACTGTTTGAGCTCGAGATAAGTTCAAAAGCGTTCATCGATTCCGGTTTCTCCTTCTTCT
CAGTTACAAGAGACTCCTTGGAGTTACTGAAAGCAGCATCGACATCATCAATATTTATGT
CTTCATCATCTTGACCAAACGATGGTGGCTTGTACCCTTGCTTGAACCATTCATCTTCTA
GCAACTCTGCAATACTTATTCTGGTTATAGGGCTGGGATCAAGAATACGCTTAATGACTC
CCTTGACACCTGGCGAGAACCATGATGGGCAGCTGAACTCAGCCTTGCATATACGTTTGT
ATAATGTCATGAGATTTGGCTCATCAAAAGGTAAGTAACCAGCCATGAGCACAAATAGAA
TAATACCACAGGACCAGACGTCTGCTGCTGCACCGTCATAGCCTTTGTCCGAC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EK87JQ U 1
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AF RS1BP59TF C 122
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TACCAGGTTTTCCTTTATTTTTTGGTTGTCAATCTTTGAAGCTTCATGTTACAGTTTTCA
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TAACTTGTTAAGCTTTATGTTCTTGAGCTGCTCCATCAAAATTCCAGACTACATCCTTTA
ATCCAGATGAAAAGTTTTTGTAAAACTTGTGAAACTCGAGGGTATCACCGCCGGTTTTCC
TAAGCTCTACTACATGCAACGATGGCGCAACTTCAAACACCTCTGTAGCAACTGAAAGCT
GGCCTTTACGACCACTTTTGTCTCCTTTCATTTTTATCTTGTACTTGTCTTTACGGACAT
TGAAGCCTAATGGCTTTGCGGTTTCTTCCATTTTGGACATTATTTCGCTCGCAGGTCGTT

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DS 

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ATTTTTTGGTTGTCAATCTTTGAAGCTTCATGTTACAGTTTTCAACCATTTCAACTATCT
TTCATGATTTAATATATTTTGTTTCGAATAGAACAACTTGCTATTAACTTGTTAAGCTTT
ATGTTCTTGAGCTGCTCCATCAGAATTCCAGACTACATCCTTTAATCCAGATGAAAAGTT
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TGCGGTTTCTTCCATTTTGGACATTATTTCGCTCGCAGGTCATTGAGAAGTAAACCGTGT
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GATAAGTTCAAAAGCGTTCATCGATTCCGGTTTCTCCTTCTTCTCAGTTACA

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DS 

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TTTTTTTGTTTTCTTTA
TTTTTGGTTGTCAATCTTTGAAGCTTCATGTTACAGTTTTCAACCATTTCAACTATCTTT
CATGATTTAATATATTTTGTTTCGAATAGAACAACTTGCTATTAACTTGTTAAGCTTTAT
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CTTTCTTCACAAGTTGGGCTTGCTTCTCGAACAAGTTTTCAAGACTGTTTGAGCTCGAGA
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TGGAGTTACTGAAAGCAGCATCGACATCATCAATATTTATGTCTTCATCATCTTGACCAA
ACGATGGTGGCTTGTACCCTTGCTTGAACCATTCATCTTCTAGCAACTCTGCAATACTTA
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C

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DS 

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GGTGGCTTGTACCCTTGCTTGAACCATTCATCTTCTAGCAACTCTGCAATACTTATTCTG
GTTATAGGGCTGGGATCAAGAATACGCTTAATG
C

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DS 

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TTTAATATATTTTGTTTCGAATAGAACAACTTGCTATTAACTTGTTAAGCTTTATGTTCT
TGAGCTGCTCCATCAGAATTCCAGACTACATCCTTTAATCCAGATGAGAAGTTTTTGTAG
AACTTGTGAAACTCGAGGGTATCACCGCCGGTTTTCCTAAGCTCTACTACATGCAACGAT
GGCGCAACTTCAAACACCTCTGTAGCAACTGAGAGCTGGCCTTTACGACCACTTTTGTCT
CCTTTCATTTTTATCTTGTACTTGTCTTTACGGACATTGAAGCCTAATGGCTTTGCGGTT
TCTTCCATTTTGGACATTATTTCGCTCGCAGGTCGTTGAAAAGTAAACCGTGTCTCTTTC
TTCACAAGTTGGGCTTGCTTCTCGAACAAGTTTTCAAGACTGTTTGAGCTCGAGATAAGT
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GTTATAGGGCTGGGATCAAGAATACGCTTAATGACTCCCTTGGCACCTGGCGAGAACCAT
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DS 

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C
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TACGGACATTGAAGCCTAATGGCTTTGCGGTTTCTTCCATTTTGGACATTATTTCGCTCG
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CCTTCTTCTCAGTTACAAGAGACTCCTTGGAGTTACTGAAAGCAGCATCGACATCATCAA
TATTTATGTCTTCATCATCTTGACCAAACGATGGTGGCTTGTACCCTTGCTTGAACCATT
CATCTTCTAGCAACTCTGCAATACTTATTCTGGTTATAGGGCTGGGATCAAGAATACGCT
TAATGACTCCCTTGACACCTGGCGAGAACCATGATGGGCAGCTGAACTCAGCCTTGCATA
TACGTTTGTATAATGTCATGAGATTTGGCTCATCAAAAGGTAAGTAACCAGCCATGAGCA
CAAATAGAATAATACCACAGGACCAGACGTCTGCTGCTGCACCGTCATAGCCTTTGTCCG
AC

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DS 



AS 1 9

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CTTCTTATGTGAAGTCACCTTATTCATCTAAACGACTGATTTAAAAGCATAACCCGGATG
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CCCTGTGCCTTAACGTCGATTAGGAAACGTCCCTTGCTGGCGCTTCAGGGTATTGAATGT
ACGCGTCACTAGCATCAGTCTCGGATCATCCTCTGGTATCTCACGTTCTTTCAGTCCCTT
GTAGTAAGCTTCAACAGAAGCTAGTGTCTGTGGAATATTCCGAGCTTGCATGAGATCCCA
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GAGTTCCATGGCAGGGGTTTTGTCTGAGTTCATGTAATCTCCAAACCATTTGAGACCATT
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ATTTTTTCCGTCTTTCTTAAGCATCTCAAGAAGAGCTTCCGTTGCTTGTACATCCTTAAT
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CCTGTGAGAATATTCAGCGGTCGGAACATTGTACAGCTCTTCTTCACTGATGTTAAACAT
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TATGAGTCCTGCATAGCAGAACTGGTTCAAACCAACACCAGCAGCAGTCATATCTCTAAC
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CTTCCCATTCTTGCATTTACCACAAGTGGAAATCAAGAAGTTGTACAAGTTCACATCTGG
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CAGTGAAAACGAGACGACGAGATGGAGGAGGAGTTGTATATCC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RS1B146JQ U 2
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AF RS1CN06TF C 45
AF RS1B119JQ U 1
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BS 979 979 RS1EG76TF
BS 980 1067 RS1EG76JQ
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CCTGTGCCTTAACGTCGATTAGGAAACGTCCCTTGCTGGCGCTTCAGGGTATTGAATGTA
CGCGTCACTAGCATCAGTCTCGGATCATCCTCTGGTATCTCACGTTCTTTCAGTCCCTTG
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CTTCCAGTTCTTGCATCT

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G
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TTCTTATGTGAAGTCACCTTATTCATCTAAACGACTGATTTAAAAGCATAACCCGGATGG
TTTACAGAGATCATAATAAGCAAATAAGGGCAGAAAAACGAAGAACCCGTCCTCCATGTC
CCTGTGCCTTAACGTCGATTAGGAAACGTCCCTTGCTGGCGCTTCAGGGTATTGAATGTA
CGCGTCACTAGCATCAGTCTCGGATCATCCTCTGGTATCTCACGTTCTTTCAGTCCCTTG
TAGTAAGCTTCAACAGAAGCTAGTGTCTGTGGAATATTCCGAGCTTGCATGAAATCCCAT
GTCATATTGGCAACCGTGTACCCTCCGGTCTTTTCACCAGCAGCTTTGAGTAGCAGATTG
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AGTTCCATGGCAGGGGGTTTGTCTGAGTT

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C

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AAGCATAACCCGGATGGTTTACAGAGATCATAATAAGCAAATAAGGGCAGAAAAACGAAG
AACCCGTCCTCCATGTCCCTGTGCCTTAACGTCGATTAGGAAGCGTCCCTTGCTGGCGCT
TCAGGGTATTGAATGTACGCATCACTAGCATCAGTCTCGGATCATCCTCTGGTATCTCAC
GTTCTTTCAGTCCCTTGTAGTAAGCTTCAACAGAAGCTAGTGTCTGTGGAATATTCCGAG
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CTTTGAGTAGCAGATTGCTTCCAGTTCTTGCATCTAAGAAGAAATTTCTATCGTTCATGC
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CTATAAGAGT*GTGTAGAGTTCCATGGCAGGGGTTTTGTCTGAGTTCATGTAATCTCCAA
ACCATTTGAGACCATTTTTAAAGTCTTTCGAGT
C

QA 1 573 1 573
DS 

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GTTTACAGAGATCATAATAAGCAAATAAGGGCAGAAAAACGAAGAACCCGTCCTCCATGT
CCCTGTGCCTTAACGTCGATTAGGAAACGTCCCTTGCTGGCGCTTCAGGGTATTGAATGT
ACGCGTCACTAGCATCAGTCTCGGATCATCCTCTGGTATCTCACGTTCTTTCAGTCCCTT
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TGTCATATTGGCAACCGTGTACCCTCCGGTCTTTTCACCAGCAGCTTTGAGTAGCAGATT
GCTTCCAGTTCTTGCATCTAAGAAGAAATTTCTATCGTTCATGCTGACCAGAGTCTCTTG
AGCAATCTTCATTCCTTCCTCTGTGTAATCTGTCATGGCTCCTTCTATAAGAGTCGTGTA
GAGTTCCATGGCAGGGGTTTTGTCTGAGTTCATGTAATCTCCAAACCATTTGAGACCATT
TTTAAAGTCTTTCGAGTGTAGGTAGCACCTCATAATCTGTATCACGCAGTAAGTATCCGT
ATTTTTTCCGTCTTTCTTAAGCATCTCAAGAAGAGCTTCCGTTGCTTGTACATCCTTAAT
ATCAGCAAGCGCACTGAATGCTACGTGGTAAACGGTCAA*TTCCTCTGGAGAAACCTGCT
CCTGTGAGAATATTCAGCGGTCGGAACAT*GTACAGCTCTTCTTCACTGATGT
AACATCATATCTCTGCACT

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TCCCATGTCATATTGGCAACCGTGTACCCTCCGGTCTTTTCACCAGCAGCTTTGAGTAGC
AGATTGCTTCCAGTTCTTGCATCTAAGAAGAAATTTCTATCGTTCATGCTGACCAGAGTC
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CCATTTTTAAAGTCTTTCGAGTGTAGGTAGCACCTCATAATCTGTATCACGCAGTAAGTA
TCCGTATTTTTTCCGTCTTTCTTAAGCATCTCAAGAAGAGCTTCCGTTGCTTGTACATCC
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CTGCTCCTGTGAGAATATTCAGCGGTCGGAACAT
TGT

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AATATTCAGCGGTCGGAACATTGTACAGCTCTTCTTCACTGATGTTAAACATCATATCTT
CTGCACTCTTCCTTGATGAATCAATTGATGACCAGCCTTTTGACTGCTCCACCAACTCGA
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CTGCATAGCAAAACTGGTTCAAACCAACACCAGCAGCAGTCATATCTCTAACAATCGCAT
ACACAAGATCTAATTGGCCAGAAACAGCGCAGGCATTCAAAAGGCAAACAAAAGTCTGTC
CATTTGGTTTCACATCATATCTCTTCATCTCCTCGAAAACTCGGATCGCCTCCTTCCCAT
TCTTGCATTTACCACAAGTGGAAATCAAGAAGTTGTACAAGTTCACATCTGGGGAAATAC
CCATGGACTTCATTTCTTCACGGAAAAAGAAAGCATCACTTAAACGAGCACCCTTCATCA
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AAGTTCACATCTGGGGAAATACCCATGGACTTCATTTCTTCACGGAAAAAGAAAGCATCA
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CC

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DS 

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TCATATCTCTAACAATCGCATACACAAGATCTAATTGGCCAGAAACAGCGCAGGCATTCA
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CTCGGATCGCCTCCTTCCCATTCTTGCATTTACCACAAGTGGAAATCAAGAAGTTGTACA
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TTAAACGAGCACCCTTCATCACTCCCACAACAAACGAATGGAATATATCAGCTGTAGGCT
GCACACCATCTAGCTTCATATCATCATACACATCCCTCAACAGATAGTGCCTGCGCTGAG
CTGTGACGGAGTTAACAACTGAGTTGTACTCCGACAGATCGTTGGCGTAGTTTCTCTTCG
CGAGTTCCTCCGGCGATGAAGAAGAAGAAGCGAAGAAACGACGACTAACCAGAGCTCGAA
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TTCCGGCGGAGCTCAGTGAAAACGAGACGACGAGATGGAGGAGGAGTTGTATATCC

QA 1 656 1 656
DS 



AS 2 8

CO CL318Contig1 1013 3 4 U
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GCCACTTCAACAGCCGCTGCTGCTTCTTCTATCATGGGTACTCGGGTGGTTTCCGACATC
AACTCCGGTTCAGGCCGGTTCACAGCCCGGTTTGGATTCGGGACCAAGAAAGCAGCCGCT
CCCAAGAAGGCTAAGACGGTTTTCTCAGACCGGCCTCTGTGGTTCCCGGGCGCGAAATCC
CCCGAGTATCTGGACGGTTCGCTGGTCGGAGACTACGGCTTCGACCCTTTCGGTTTAGGT
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ATAGCCGGAGACGTGATCGGGACACGTACGGAGGCCGTTGACTCCAAGTCGACGCCGTTT
CAGCCTTACAGCGAGGTATTTGGGATCCAGAGGTTCATAGAGTGTGAGCTGATCCATGGG
AGATGGGCTATGCTTGCAACTCTCGGTGCTCTCTCCGTCGAATGGCTCACCGGTGTTACT
TGGCAAGACGCTGGAAAGGTAGAGCTAGTGGATGGATCGTCCTATTTAGGACAGCCACTA
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CGTCCTCTTGATCTGGTTGCTTTAGCTTTTTATTGGTGTAATGTAATGATGTAATGATGT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E729TF U 6
AF RS1BW39TF U 1
AF RS1BW39JQ C 228
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BS 812 855 RS1BW39TF
BS 856 1013 RS1BW39JQ

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GG
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CTGAGTATCTCCAGTTCGATCTCGACTCTCTGGACCAGAACTTAGCCAAGAACATAGCCG
GAGACGTGATCGGGACACGTACGGAGGCCGTTGACCCCAAGTCGACGCCGTTTCAGCCTT
ACAGCGAGGTATTTGGGATCCAGAGGTTCAGAGAGTGTGAGCTGATCCATGGGAGATGGG
CTATGCTTGCAACTCTCGGTGCTCTCTCCGTCGAATGGCTCATCGGTGTTACTTGGCAAG
ACGCTGGAAAGGTAGAGCTAGTGGATGGATCGTCCTATTTAG*ACAGCCACTACCGTTCT
CGATCTCGACACTGATTTGGATCGAAGTGTTGGTGATTGGT

QA 3 643 3 643
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AACTCCGGTTCAGGCCGGTTCACAGCCCGGTTTGGATTCGGGACCAAGAAAGCAGCCGCT
CCCAAGAAGGCTAAGACGGTTTTCTCAGACCGGCCTCTGTGGTTCCCGGGCGCGAAATCC
CCCGAGTATCTGGACGGTTCGCTGGTCGGAGACTACGGCTTCGACCCTTTCGGTTTAGGT
AAACCGGCTGAGTATCTCCAGTTCGATCTCGACTCTCTGGACCAGAACTTAGCCAAGAAC
ATAGCCGGAGACGTGATCGGGACACGTACGGAGGCCGTTGACTCCAAGTCGACGCCGTTT
CAGCCTTACAGCGAGGTATTTGGGATCCAGAGGTTCATAGAGTGTGAGCTGATCCATGGG
AGATGGGCTATGCTTGCAACTCTCGGTGCTCTCTCCGTCGAATGGCTCACCGGTGTTACT
TGGCAAGACGCTGGAAAGGTAGAGCTAGTGGATGGATCGTCCTATTTAGGACAGCCACTA
CCGTTCTCGATCTCGACACTGATTTGGATCGAAGTGTTGGTGATTGGTTACATCGAGTTC
CAAAGAAACGCTGAGCTGGACTCGGAGAAGCGTTTGTATCCAGGAGGCAAGTTTTTCGAC
CCGCTGGGTCTAGCTTCTTGGGATTTGCGGTTCGGGCGGCTGCAACGGGTAAAGGACCGC
TCAACAACTGGGCGACTCACCTTAGTGACC*GCTTCACACCACCATCATCGACACCTTCT
CGTCCTCTTGATCTG
TGCT

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CTTAGCCAAGAACATAGCCGGAGACGTGATCGGGACACGTACGGAGGCCGTTGACTCCAA
GTCGACGCCGTTTCAGCCTTACAGCGAGGTATTTGGGATCCAGAGGTTCATAGAGTGTGA
GCTGATCCATGGGAGATGGGCTATGCTTGCAACTCTCGGTGCTCTCTCCGTCGAATGGCT
CACCGGTGTTACTTGGCAAGACGCTGGAAAGGTAGAGCTAGTGGATGGATCGTCCTATTT
AGGACAGCCACTACCGTTCTCGATCTCGACACTGATTTGGATCGAAGTGTTGGTGATTGG
TTACATCGAGTTCCAAAGAAACGCTGAGCTGGACTCGGAGAAGCGTTTGTATCCAGGAGG
CAAGTTTTTCGACCCGCTGGGTCTAGCTTCTTGGGATTTGCGGTTCGGGCGGCTGCAACG
GGTAAAGGACCGCTCAACAACTGGGCGACTCACCTTAGTGACCCGCTTCACACCACCATC
ATCGACACCTTCTCGTCCTCTTGATCTGGTTGCTTTAGCTTTTTATTGGTGTAATGTAAT
GATGTAATGATGTCCATCTTTAAGACAAGTTTGTATAACTATAAACAAACTTCTTGAAAG
GTTTAGTGCTGAAATCTTCGAGTGTCAGTGGATTAATGATTATGAGCCGTAACCTCATTT
TCACTG

QA 1 786 1 786
DS 



CO CL318Contig2 943 5 18 U
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TTCAGCACTAAACCTTTCAAGAAGTTTGTTTATAGTTATACAAACTTGTCTTAAAGATGG
ACATCATTACATCATTACATTACACCAATAAAAAGCTAAAGCAACCAGATCAAGAGGACG
AGAAGGTGTCGATGATGGTGGTGTGAAGCGGGTCACTAAGGTGAGTCGCCCAGTTGTTGA
GCGGTCCTTTACCCGTTGCAGCCGCCTGAACCGCAAATCCCAAGAAGGCAACCATGGCTA
AACGAGCGTGTTTGATCTCAGCCAACTGAAGCTGAGCCTTCTTCTCCGGGTCAGAAGCTA
GACCCAGCGGGTCGAAAAACTTGCCTCCTGGATACAAACGCTTCTCCGAGTCCAGCTCAG
CGTTTCTTTGGAACTCGATGTAACCAATCACCAACACTTCGATCCAAATCAGTGTCGAGA
TCGAGAACGGTAGTGGCTGTCCTAAATAGGACGATCCATCCACTAGCTCTACCTTTCCAG
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TAGCCCATCTCCCATGGATCAGCTCACACTCTCTGAACCTCTGGATCCCAAATACCTCGC
TGTAAGGCTGAAACGGCGTCGACTTGGGGTCAACGGCCTCCGTACGTGTCCCGATCACGT
CTCCGGCTATGTTCTTGGCTAAGTTCTGGTCCAGAGAGTCGAGATCGAACTGGAGATACT
CAGCCGGTTTACCTAAACCGAAAGGGTCGAAGCCGTAGTCTCCGACCAGCGAACCGTCCA
GATACTCGGGGGATTTCGCGCCCGGGAACCACAGAGGCCGGTCTGAGAAAACCGTCTTAG
CCTTCTTGGGAGCGACTGCTTTCTTGGTCCCGAATCCAAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 
25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FC90JQ U 1
AF RS1A055TF C 58
AF RS1D290JQ U 18
AF RS1E729JQ U 64
AF RS1BA19TF C 168
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TCGAAAACGGTAGTGGCTGTCCTAAATAGGACGATCCATCCACTAGCTCTACCTTTCCAG
CGTCTTGCCAAGTAACACCGGTGAGCCATTCGACGGGGAGAGCACCGAGAGTTGCAAGCA
TAGCCCA

QA 1 607 1 607
DS 

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TGGACAT***********TACATTACACCAATAAAAAGCTAAAGCAACCAGATCAAGAGG
ACGAGAAGGTGTCGATGATGGTGGTGTGAAGCGGGTCACTAAGGTGAGTCGCCCAGTTGT
TGAGCGGTCCTTTACCCGTTGCAGCCGCCTGAACCGCAAATCCCAAGAAGGCAACCATGG
CTAAACGAGCGTGTTTGATCTCAGCCAACTGAAGCTGAGCCTTCTTCTCCGGGTCAGAAG
CTAGACCCAGCGGGTCGAAAAACTTGCCTCCTGGATACAAACGCTTCTCCGAGTCCAGCT
CAGCGTTTCTTTGGAACTCGATGTAACCAATCACCAACACTTCGATCCAAATCAGTGTCG
AGATCGAGAACGGTAGTGGCTGTCCTAAATAGGACGATCCATCCACTAGCTCTACCTTTC
CAGCGTCTTGCCAAGTAACACCGGTGAGCCATTCGACGGAGGGAGCACCGAGAGTTGCAA
GCATAGCCCATCTCCCATGGGTCAGCTCACACTCTCTGAACCTCTG
CCCCGGCCGTA

QA 1 586 1 586
DS 

RD RS1D290JQ 763 0 0
GG
GGTTACGGCTCATAATCATTAATCCACTGACACTCGAAGATTTCAGCACTAAACCTTTCA
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GGTGTGAAGCGGGTCACTAAGGTGAGTCGCCCAGTTGTTGAGCGGTCCTTTACCCGTTGC
AGCCACCTGAACCGCAAATCCCAAGAAGGCAACCATGGCTAAACGAGCGTGTTTGATCTC
AGCCAACTGAAGCTGAGCCTTCTTCTCCGGGTCAGAAGCTAGACCCAGCGGGTCGAAAAA
CTTGCCTCCTGGATACAAACGCTTCTCCGAGTCCAGCTCAGCGTTTCTTTGGAACTCGAT
GTAACCAATCACCAACACTTCGATCCAAATCAGTGTCGAGATCGAGAACGGTAGTGACTG
TCCTAAATAGGACGATCCATCCACTAGCTCTACCTTTCCAGCGTCTTGCCAAGTAACACC
GGTGAGCCATTCGACGGAGAGAGCACCGAGAGTTGCAAGCATAGCCCATCTCCCATGGAT
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CGACTTGGGGTCAACGGCCTCCGTACGTGTCCCGATCACGTCTCCGGCTATGTTCTTGGC
TAAGTTCTGGTCCAGAGAGTCGAGATCGAACTGGAGATACT

QA 3 763 3 763
DS 

RD RS1E729JQ 738 0 0
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AGGTGTCGATGATGGTGGTGCGAAGCGGGTCACTAAGGTGAGTCGCCCAGTTGTTGAGCG
GTCCTTTACCCGTTGCAGCCGCCTGAACCGCAAATCCCAAGAAGGCAACCATGGCTAAAC
GAGCGTGTTTGATCTCAGCCAACTGAAGCTGAGCCTTCTTCTCCGGGTCAGAAGCTAGAC
CCAGCGGGTCGAAAAACTTGCCTCCTGGATACAAACGCTTCTCCGAGTCCAGCTCAGCGT
TTCTTTGGAACTCGATGTAACCAATCACCAACACTTCGATCCAAATCAGTGTCGAGATCG
AGAACGGTAGTGGCTGTCCTAAATAGGACGATCCATCCACTAGCTCTACCTTTCCAGCGT
CTTGCCAAGTAACACCGATGAGCCATTCGACGGAGAGAGCACCGAGAGTTGCAAGCATAG
CCCATCTCCCATGGATCAGCTCACACTCTCTGAACCTCTGGATCCCAAATACCTCGCTGT
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CGGCTATGTTCTTGGCTAAGTTCTGGTCCAGAGAGTCGAGATCGAACTGGAGATACTCAG
CCGGTTTACCTAAACCGA

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1BA19TF 776 0 0
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GCCCAGTTGTTGAGCG*TCCTTTACCCGTTGCAGCCGC*TGAACCGCAAATCCCAAGAAG
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GGGTCAGAAGCTAGACCCAGCGGGTCGAAAAACTTGCCTCCTGGATACAAACGCTTCTCC
GAGTCCAGCTCAGCGTTTCTTTGGAACTCGATGTAACCAATCACCAACACTTCGATCCAA
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TCTACCTTTCCAGCGTCTTGCCAAGTAACACCGGTGAGCCATTCGACGGAGAGAGCACCG
AGAGTTGCAAGCATAGCCCATCTCCCATGGATCAGCTCACACTCTCTGAACCTCTGGATC
CCAAATACCTCGCTGTAAGGCTGAAACGGCGTCGACTTGGGGTCAACGGCCTCCGTACGT
GTCCCGATCACGTCTCCGGCTATGTTCTTGGCTAAGTTCTGGTCCAGAGAGTCGAGATCG
AACTGGAGATACTCAGCCGGTTTACCTAAACCGAAAGGGTCGAAGCCGTAGTCTCCGACC
AGCGAACCGTCCAGATACTCGGGGGATTTCGCGCCCGGGAACCACAGAGGCCGGTCTGAG
AAAACCGTCTTAGCCTTCTTGGGAGCGACTGCTTTCTTGGTCCCGAATCCAAACCC

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 9

CO CL319Contig1 942 9 22 U
GGAAACCAGGTAAGCCTCAGATATTAACGAGAAAGATTAATAAGAAAGGACGTGTTGGCA
TCTCGTTTCATTCAACAAGACGCTCTCCTGACTTCTCTCCGATCTAGGGTTTGCTCACAC
CGACAACGATGATCCAGCTCCTCTACTCGGTGATCTTCGCCGAAATGGCCTTAATCCTCC
TTCTCCTCTTCAAGACGCCTCTCCGGAAGCTAATCATCCTCACCTTCGATCGCATCAAAC
GCGGCCGCGGCCCCGTCGTCGTCAAAACCATCGGCGCCACCGTCTTCGTCGTTCTTATGT
CCAGCGTCTACAGTTTGCTTAGTATCCAACGCCGATCTGAGGATGGTGCCGTCCTCAATC
CTACCGATCAGGTCCTCGCCTCCAAGCATCTTCTCGAAGCTTCTCTCATGGGGTTTGTGC
TATTTCTCTCGCTCATGATTGATCGGCTACACCATTACATAAGGGAGTTGCGGTTGCTTA
GGAAGACAATGGAGACTGCAAAGAAACAGAACAGAAGTTTCGAGGATGGCAAGAACACGA
GTGGGGAAGAAGTTAAAGCGCTCGGGGAAGAAATCGCAGCGTTGAAGGCAAAGATCAAGA
AATTAGAATCTGAAAGTGAAAGCAAAGGCAAAGAACTGAAAAGTGCACAAGCTGAAACAG
AGGCTCTGAGAAAATCAGCTGATGGGTTTCTCATGGAGTATGATAGGCTGCTTGAGGATA
ATCAGAATCTCAGGAACCAGTTGGAGTCTATCGGCCATAGCCCAGAGGGAAAGAAGAGTA
TGTGAAACAGAGAAATACAATGGTATTAATGTAATATTTTCTTTTGTAGAGCACAAAGAA
ACTTTAGGAAATGTGGATTTTCTGATCTTTGCTTTCTTACATTATGATATGTTTTCTTAT
CTACTTTAATGTGTTTTGATATATAGTAGACATAATTGTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 35 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 5 20 20 5 20 20 5 5 20 5 5 20 20 20 5 20 20 5 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

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GG
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CTACCGATCAGGTCCTCGCCTCCAAGCATCTTCTCGAAGCTTCTCTCATGGGGTTTGTGC
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DS 

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GGGG
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ATCAAACGCGGCCGCGGCCCCGTCGTCGTCAAAACCATCGGCGCCACCGTCTTCGTCGTT
CTTATGTCCAGCGTCTACAGTTTGCTTAGTATCCAACGCCGATCTGAGGATGGTGCCGTC
CTCAATCCTACCGATCAGGTCCTCGCCTCCAAGCATCTTCTCGAAGCTTCTCTCATGGGG
TTTGTGCTATTTCTCTCGCTCATGATTGATCGGCTACACCATTACATAAGGGAGTTGCGG
TTGCTTAGGAAGACAATGGAGACTGCAAAGAAACAGAACAGAAGTTTCGAGGATGGCAAG
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GG
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TCCTGACTTCTCCTCGATCTAGGGTTTGCTCACACCGACAACGATGATCCAGCTCCTCTA
CTCGGTGATCTTCGCCGAAATGGCCTTAATCCTCCTTCTCCTCTTCAAGACGCCTCTCCG
GAAGCTAATCATCCTCACCTTCGATCGCATCAAACGCGGCCGCGGCCCCGTCGTCGTCAA
AACCATCGGCGCCACCGTCTTCGTCGTTCTTATGTCCAGCGTCTACAGTTTGCTTAGTAT
CCAACGCCGATCTGAGGATGGTTCCGTCCTCAATCCTACCGATCAGGTCCTCGCCTCCAA
GCATCTTCTCGAAGCTTCTCTCATGGGGTTTGTGCTATTTCTCTCGCTCATGATTGATCG
GCTACACCATTACATAAGGGAGTTGCGGTTGCTTAGGAAGACAATGGAGACTGCAAAGAA
ACAGAACAGAAGTTTCGAGGATGGCAAGAACACGAGTGGGGAAGAAGTTAAAGCGCTCGG
GGAAGAAATCGCAGCGTTGAAGGCAAAGATCAAGAAATTAGAATCTGAAAGTGAAAGCAA
AG*CAAAGAACTGAAAAGTGCACAAGCTGAAACAGAG*CTCTGAGAAA*TCAGCTGATGG
G

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GG
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AGGTCCTCGCCTCCAAGCATCTTCTCGAAGCTTCTCTCATGGGGTTTGTGCTATTTCTCT
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TCTTACATTA

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DS 

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TCTTATGTCCAGCGTCTACAGTTTGCTTAGTATCCAACGCCGATCTGAGGATGGTGCCGT
CCTCAATCCTACCGATCAGGTCCTCGCCTCCAAGCATCTTCTCGAAGCTTCTCTCATGGG
GTTTGTGCTATTTCTCTCGCTCATGATTGATCGGCTACACCATTACATAAGGGAGTTGCG
GTTGCTTAGGAAGACAATGGAGACTGCAAAGAAACAGAACAGAAGTTTCGAGGATGGCAA
GAACACGAGTGGGGAAGAAGTTAAAGCGCTCGGGGAAGAAATCGCAGCGTTGAAGGCAAA
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TGAGGATAATCAGAATCTCAGGAACCAGTTGGAGTCTATCGGCCATAGCCCAGAGGGAAA
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ACAAAGAAACTTTAGGAAATGTGGATTTTCTGATCTTTGCTTTCTTACATTATGATATGT
TTTCTTATCT**TTGAAAATACTTTAATGT
AT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1EM91JQ 700 0 0
GGCCGCGGCCCCGTCGTCGTCAAAACCATCGGCGCCACCGTCTTCGTCGTTCTTATGTCC
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ACCGATCAGGTCCTCGCCTCCAAGCATCTTCTCGAAGCTTCTCTCATGGGGTTTGTGCTA
TTTCTCTCGCTCATGATTGATCGGCTACACCATTACATAAGGGAGTTGCGGTTGCTTAGG
AAGACAATGGAGACTGCAAAGAAACAGAACAGAAGTTTCGAGGATGGCAAGAACACGAGT
GGGGAAGAAGTTAAAGCGCTCGGGGAAGAAATCGCAGCGTTGAAGGCAAAGATCAAGAAA
TTAGAATCTGAAAGTGAAAGCAAAGGCAAAGAACTGAAAAGTGCACAAGCTGAAACAGAG
GCTCTGAGAAAATCAGCTGATGGGTTTCTCATGGAGTATGATAGGCTGCTTGAGGATAAT
CAGAATCTCAGGAACCAGTTGGAGTCTATCGGCCATAGCCCAGAGGGAAAGAAGAGTATG
TGAAACAGAGAAATACAATGGTATTAATGTAATATTTTCTTTTGTAGAGCACAAAGAAAC
TTTAGGAAATGTGGATTTTCTGATCTTTGCTTTCTTACATTATGATATGTTTTCTTATCT
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DS 

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GTATCCAACGCCGATCTGAGGATGGTGCCGTCCTCAATCCTACCGATCAGGTCCTCGCCT
CCAAGCATCTTCTCGAAGCTTCTCTCATGGGGTTTGTGCTATTTCTCTCGCTCATGATTG
ATCGGCTACACCATTACATAAGGGAGTTGCGGTTGCTTAGGAAGACAATGGAGACTGCAA
AGAAACAGAACAGAAGTTTCGAGGATGGCAAGAACACGAGTGGGGAAGAAGTTAAAGCGC
TCGGGGAAGAAATCGCAGCGTTGAAGGCAAAGATCAAGAAATTAGAATCTGAAAGTGAAA
GCGAAGGCAAAGAACTGAAAAGTGCACAAGCTGAAACAGAGGCTCTGAGAAAATCAGCTG
ATGGGTTTCTCATGGAGTATGATAGGCTGCTTGAGGATAATCAGAATCTCAGGAACCAGT
TGGAGTCTATCGGCCATAGCCCAGAGGGAAAGAAGAGTATGTGAAACAGAGAAATACAAT
GGTATTAATGTAATATTTTCTTTTGTAGAGCACAAAGAAACTTTAGGAAATGTGGATTTT
CTGATCTTTGCTTTCTTACATTATGATATGTTTTCTTATCTACTTTAATGTGTTTTGATA
TATAGTAGACATAATTGTGG
C

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 10

CO CL320Contig1 972 10 17 U
GGAATTTAACTCCTCACTCACTTTAGATTCTTCTACTCTCAAAACACACAATTTCCACCT
CTT*AAGAGAACAAAGGTAAGAGATCCTCATGTCGATGTCTATTTCTGGAGCCATGCTTA
GTGGGGTTGGCTCTTCGTTATTGATCAACGGAAGCAAGAAAAGCGACGGCGTAAGCGGTG
GATCAATGAGTGTTGGCCGGAAGTATGCGACCATTACACCTCAGCGCAAGAAGTCATGGG
TCCTAGCCGCCGTGAAAGGTGATGGAAAATCAAAGAACGACCCCAAATGGCTAGATGATG
CCTCACAGAAAGCTGGCGAGTTCGTGAAGGACATGGGGAGCGAAGTGGGGCACGTGACTG
CTCAGAAAGGACAAGAAGTTAAAGATCATATGGAGAGCGCAAGAAACTATATTGTTGAGA
AAGCTGGTGAAGCGATGGACACGGTGGCTGAAACTGCTAAGAAAGCTTCGGAGTTTGTGA
CGGATAAAGGCAAAGAGACCAAGGAAGAAACTGTTTTAATGACTGAAAAAGCTAAAGATT
TCATTGTTGAAAAAGCTGATGAAGCCAAAGATTCGGCGACTGACATGCGCAAGAAAACCG
CTAAGTACGTTGGAGATAAAGCAGCACAGGCTAAAGAAGCTATATTTCCTCCAAAAAACG
AAGAATAGAATATTGTATATTTAGGACACTAAACATATAAAGAACTTTGAGGCAGTAATC
TCATAAGTATATTTTTACTT*CTGAGAATATAGTATGTTTATTTTGTGAGAGAATAAACT
GATACATAAATAAGTACTGATATAGTCAGTGGCTAATCTTTTTTTTTTGGTCATTCAAAT
TAGTCAGTGGCTAATCTAATCATTCAAATTAAGTGCTAATCTTTAGCTTACAAACTATGA
TATTGTACAATGGTACATAAATAAGTACTGATTTAGTCAGTGGCTAATCTAATCATTCAA
ATTAAGTGCTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 15 35 
35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AY95TF U 1
AF RS1CM73TF U 6
AF RS1CY43TF U 2
AF RS1CC66TF U 14
AF RS1AY95JQ C 32
AF RS1BE91TF U 410
AF RS1DT93TF U 103
AF RS1CC66JQ C 148
AF RS1DT93JQ C 138
AF RS1CM73JQ C 328
BS 1 17 RS1AY95TF
BS 18 18 RS1CM73TF
BS 19 268 RS1AY95TF
BS 269 269 RS1CM73TF
BS 270 652 RS1AY95TF
BS 653 657 RS1CC66TF
BS 658 658 RS1BE91TF
BS 659 703 RS1CC66TF
BS 704 704 RS1BE91TF
BS 705 711 RS1CC66TF
BS 712 712 RS1BE91TF
BS 713 717 RS1CC66TF
BS 718 718 RS1BE91TF
BS 719 773 RS1CC66TF
BS 774 803 RS1BE91TF
BS 804 827 RS1DT93TF
BS 828 972 RS1CM73JQ

RD RS1AY95TF 652 0 0
GGAATTTAACTCCTCACCCACTTTAGATTCTTCTACTCTCAAAACACACAATTTCCACCT
CTT*AAGAGAACAAAGGTAAGAGATCCTCATGTCGATGTCTATTTCTGGAGCCATGCTTA
GTGGGGTTGGCTCTTCGTTATTGATCAACGGAAGCAAGAAAAGCGACGGCGTAAGCGGTG
GATCAATGAGTGTTGGCCGGAAGTATGCGACCATTACACCTCAGCGCAAGAAGTCATGGG
TCCTAGCCGCCGTGAAAGGTGATGGAAAGTCAAAGAACGACCCCAAATGGCTAGATGATG
CCTCACAGAAAGCTGGCGAGTTCGTGAAGGACATGGGGAGCGAAGTGGGGCACGTGACTG
CTCAGAAAGGACAAGAAGTTAAAGATCATATGGAGAGCGCAAGAAACTATATTGTTGAGA
AAGCTGGTGAAGCGATGGACACGGTGGCTGAAACTGCTAAGAAAGCTTCGGAGTTTGTGA
CGGATAAAGGCAAAGAGACCAAGGAAGAAACTGTTTTAATGACTGAAAAAGCTAAAGATT
TCATTGTTGAAAAAGCTGATGAAGCCAAAGATTCGGCGACTGACATGCGCAAGAAAACCG
CTAAGTACGTTGGAGATAAAGCAGCACAGGCTAAAGAAGCTATATTTCCTCC

QA 1 652 1 652
DS 

RD RS1CM73TF 620 0 0
GG
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TGGCTCTTCGTTATTGATCAACGGAAGCAAGAAAAGCGACGGCGTAAGCGGTGGATCAAT
GAGTGTTGGCCGGAAGTATGCGACCATTACACCTCAGCGCAAGAAGTCATGGGTCCTAGC
CGCCGTGAAAGGTGATGGAAAATCAAAGAACGACCCCAAATGGCTAGATGATGCCTCACA
GAAAGCTGGCGAGTTCGTGAAGGACATGGGGAGCGAAGTGGGGCACGTGACTGCTCAGAA
AGGACAAGAAGTTAAAGATCATATGGAGAGCGCAAGAAACTATATTGTTGAGAAAGCTGG
TGAAGCGATGGACACGGTGGCTGAAACTGCTAAGAAAGCTTCGGAGTTTGTGACGGATAA
AGGCAAAGAGACCAAGGAAGAAACTGTTTTAATGACTGAAAAAGCTAAAGATTTCATTGT
TGAAAAAGCTGATTAAGCCAAAGATTCGGCGACTGGCATGCGCAAGAAAACCGCTAAGTA
CGTTGGAGATAAAGCAGC

QA 3 620 3 620
DS 

RD RS1CY43TF 631 0 0
GGATTT
AACTCCTCACTCACTTTAGATTCTTCTACTCTCAAAACACACAATTTCCACCTCTT*AAG
AGAACAAAGGTAAGAGATCCTCATGTCGATGTCTATTTCTGGAGCCATGCTTAGTGGGGT
TGGCTCTTCGTTATTGATCAACGGAAGCAAGAAAAGCGACGGCGTAAGCGGTGGATCAAT
GAGTGTTGGCCGGAAGTATGCGACCATTACACCTCAGCGCAAGAAGTCATGGGTCCTAGC
CGCCGTGAAAGGTGATGGAAAGTCAAAGAACGACCCCAAATGGCTAGATGATGCCTCACA
GAAAGCTGGCGAGTTCGTGAAGGACATGGGGAGCGAAGTGGGGCACGTGACTGCTCAGAA
AGGACAAGAAGTTAAAGATCATATGGAGAGCGCAAGAAACTATATTGTTGAGAAAGCTGG
TGAAGCGATGGACACGGTGGCTGAA*CTGCTAAGAAAGCTTCGGAGTTTGTGACGGATAA
AGGCAAAGAGACCAAGGAAGAAACTGTTTTAATGACTGAAAAAGCTAAAGATTTCATTGT
TGAAAAAGCTGATGAAGCCAAAGATTCGGCGACTGACATGCGCAAGAAAACCGCTAAGTA
CGTTGGAGATAAAGCAGCACAG
CTA

QA 7 628 7 628
DS 

RD RS1CC66TF 760 0 0
GGACT
CACTTTAGATTCTTCTACTCTCAAAACACACAATTTCCACCTCTTTAAGAGAACAAAAGT
AAGAGATTCTCATGTCGATGTCTATTTCTGGAGCCATGCTTAGTGGGGTTGGCTCTTCGT
TATTGATCAACGGAAGCAAGAAAAGCGACGGCGTAAGCGGTGGATCAATGAGTGTTGGCC
GGAAGTATGCGACCATTACACCTCAGCGCAAGAAGTTATGGGTCCTAGCCGCCGTGAAAG
GTGGTGGAAAATCAAAGAACGACCCCAAATGGCTAGATGATGCCTCACAGAAAGCTGGCG
AGTTCGTGAAGGACATGGGGAGCGAAGTGGGGCACGTGACTGCTCAGAAAGGACAAGAAG
TTAAAGATCATATGGAGAGCGCAAGAAACTATATTGTTGAGAAAGCTGGTGAAGCGGTGG
ACACGGTGGCTGAAACTGCTAAGAAAGCTTCGGAGTTTGTGACGGATAAAGGCAAAGAGA
CCAAGGAAGAAACTGTTTTAATGACTGAAAAAGCTAAAGATTTCATTGTTGAAAAAGCTG
ATGAAGCCAAAGATTCGGCGACTGACATGCGCAAGAAAACCGCTAAGTACGTTGGAGATA
AAGCAGCACAGGCTAAAGAAGCTATATTTCCTCCAAAAA*CGAAGAATAGAATATTGTAT
ATTTAGGACACTAAACATATAAAGA*CTTTGAG*CAGTA*TCTCATAAGTATATTTTTAC
TT*CTGAGAATATAGTATGTTTATTTTGTGAGAGA

QA 6 760 6 760
DS 

RD RS1AY95JQ 799 0 0
TCTACTCTCAAA*CACACAATTTCCAC*TCT**AAGAGAACAAAGGTAAGAGATCCTCAT
GTCGATGTCTATTTCTGGAGCCATGCTTAGTGGGGTTGGCTCTTCGTTATTGATCAACGG
AAGCAAGAAAAGCGACGGCGTAAGCGGTGGATCAATGAGTGTTGGCCGGAAGTATGCGAC
CATTACACCTCAGCGCAAGAAGTCATGGGTCCTAGCCGCCGTGAAAGGTGATGGAAAGTC
AAAGAACGACCCCAAATGGCTAGATGATGCCTCACAGAAAGCTGGCGAGTTCGTGAAGGA
CATGGGGAGCGAAGTGGGGCACGTGACTGCTCAGAAAGGACAAGAAGTTAAAGATCATAT
GGAGAGCGCAAGAAACTATATTGTTGAGAAAGCTGGTGAAGCGATGGACACGGTGGCTGA
AACTGCTAAGAAAGCTTCGGAGTTTGTGACGGATAAAGGCAAAGAGACCAAGGAAGAAAC
TGTTTTAATGACTGAAAAAGCTAAAGATTTCATTGTTGAAAAAGCTGATGAAGCCAAAGA
TTCGGCGACTGACATGCGCAAGAAAACCGCTAAGTACGTTGGAGATAAAGCAGCACAGGC
TAAAGAAGCTATATTTCCTCCAAAAAACGAAGAATAGAATATTGTATATTTAGGACACTA
AACATATAAAGAACTTTGAGGCAGTAATCTCAAAAGTATATTTTTACTTTCTGAGAATAT
AGTATGTTTATTTTGTGAGAGAATAAACTGATACATAAATAAGTACTGATATAGTCAGTG
GCTAATCTTTTTTTT
GGTC

QA 1 795 1 795
DS 

RD RS1BE91TF 394 0 0
G
ATTGTTGAGAAAGCTGGTGAAGCGATGGACACGGTGGCTGAAACTGCTAAGAAAGCTTCG
GAGTTTGCGACGGATAAAGGCAAAGAGACCAAGGAAGAAACTGTTTTAATGACTGAAAAA
GCTAAAGATTTCATTGTTGAAAAAGCTGATGAAGCCAAAGATTCGGCGACTGACATGCGC
AAGAAAACCGCTAAGTACGTTGGAGATAAAGCAGCACAGGCTAAAGAAGCTATATTTCCT
CCAAAAAACGAAGAATAGAATATTGTATATTTAGGACACTAAACATATAAAGAACTTTGA
GGCAGTAATCTCAAAAGTATATTTTTACTTTCTGAGAATATAGTATGTTTATTTTGTGAG
AGAATAAACTGATACATAAATAAGTACTGATAT

QA 2 394 2 394
DS 

RD RS1DT93TF 737 0 0
GG
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GACGGCGTAAGCGGTGGATCAATGAGTGTTGGCCGGAAGTATGCGACCATTACACCTCAG
CGCAAGAAGTCATGGGTCCTAGCCGCCGTGAAAGGTGATGGAAAATCAAAGAACGACCCC
AAATGGCTAGATGATGCCTCACAGAAAGCTGGCGAGTTCGTGAAGGACATGGGGAGCGAA
GTGGGGCACGTGACTGCTCAGAAAGGACAAGAAGTTAAAGATCATATGGAGAGCGCAAGA
AACTATATTGTTGAGAAAGCTGGTGAAGCGATGGACACGGTGGCTGAAACTGCTAAGAAA
GCTTCGGAGTTTGTGACGGATAAAGGCAAAGAGACCAAGGAAGAAACTGTTTTAATGACT
GAAAAAGCTAAAGATTTCATTGTTGAAAAAGCTGATGAAGCCAAAGATTCGGCGACTGAC
ATGCGCAAGAAAACCGCTAAGTACGTTGGAGATAAAGCAGCACAGGCTAAAGAAGCTATA
TTTCCTCCAAAAAACGAAGAATAGAATATTGTATATTTAGGACACTAAACATATAAAGAA
CTTTGAGGCAGTAATCTCATAAGTATATTTTTACTT*CTGAGAATATAGTATGTTTATTT
TGTGAGAGAATAAACTGATACATAAATAAGTACTGATATAGTCAGTGGCTAATCTTTTTT
TTT
GGCCAAAAAAAA

QA 3 725 3 725
DS 

RD RS1CC66JQ 667 0 0
ACGGAAGCAAGAAAAGCGACGGCGTAAGCGGTGGATCAATGAGTGTTGGCCGGAAGTATG
CGACCATTACACCTCAGCGCAAGAAGTTATGGGTCCTAGCCGCCGTGAAAGGTGGTGGAA
AATCAAAGAACGACCCCAAATGGCTAGATGATGCCTCACAGAAAGCTGGCGAGTTCGTGA
AGGACATGGGGAGCGAAGTGGGGCACGTGACTGCTCAGAAAGGACAAGAAGTTAAAGATC
ATATGGAGAGCGCAAGAAACTATATTGTTGAGAAAGCTGGTGAAGCGGTGGACACGGTGG
CTGAAACTGCTAAGAAAGCTTCGGAGTTTGTGACGGATAAAGGCAAAGAGACCAAGGAAG
AAACTGTTTTAATGACTGAAAAAGCTAAAGATTTCATTGTTGAAAAAGCTGATGAAGCCA
AAGATTCGGCGACTGACATGCGCAAGAAAACCGCTAAGTACGTTGGAGATAAAGCAGCAC
AGGCTAAAGAAGCTATATTTCCTCCAAAAAACGAAGAATAGAATATTGTATATTTAGGAC
ACTAAACATATAAAGAACTTTGAGGCAGTAATCTCATAAGTATATTTTTACTT*CTGAGA
ATATAGTATGTTTATTTTGTGAGAGAATAAACTGATACATAAATAAGTACTGATATAGTC
AGTGGC
C

QA 1 666 1 666
DS 

RD RS1DT93JQ 695 0 0
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CGGAAGTATGCGACCATTACACCTCAGCGCAAGAAGTCATGGGTCCTAGCCGCCGTGAAA
GGTGATGGAAAATCAAAGAACGACCCCAAATGGCTAGATGATGCCTCACAGAAAGCTGGC
GAGTTCGTGAAGGACATGGGGAGCGAAGTGGGGCACGTGACTGCTCAGAAAGGACAAGAA
GTTAAAGATCATATGGAGAGCGCAAGAAACTATATTGTTGAGAAAGCTGGTGAAGCGATG
GACACGGTGGCTGAAACTGCTAAGAAAGCTTCGGAGTTTGTGACGGATAAAGGCAAAGAG
ACCAAGGAAGAAACTGTTTTAATGACTGAAAAAGCTAAAGATTTCATTGTTGAAAAAGCT
GATGAAGCCAAAGATTCGGCGACTGACATGCGCAAGAAAACCGCTAAGTACGTTGGAGAT
AAAGCAGCACAGGCTAAAGAAGCTATATTTCCTCCAAAAAACGAAGAATAGAATATTGTA
TATTTAGGACACTAAACATATAAAGAACTTTGAGGCAGTAATCTCATAAGTATATTTTTA
CTT*CTGAGAATATAGTATGTTTATTTTGTGAGAGAATAAACTGATACATAAATAAGTAC
TGATATAGTCAGTGGCTAATCTTTTTTTT
TTGGCC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1CM73JQ 645 0 0
AGGACATGGGGAGCGAAGTGGGGCACGTGACTGCTCAGAAAGGACAAGAAGTTAAAGATC
ATATGGAGAGCGCAAGAAACTATATTGTTGAGAAAGCTGGTGAAGCGATGGACACGGTGG
CTGAAACTGCTAAGAAAGCTTCGGAGTTTGTGACGGATAAAGGCAAAGAGACCAAGGAAG
AAACTGTTTTAATGACTGAAAAAGCTAAAGATTTCATTGTTGAAAAAGCTGATTAAGCCA
AAGATTCGGCGACTGGCATGCGCAAGAAAACCGCTAAGTACGTTGGAGATAAAGCAGCAC
AGGCTAAAGAAGCTATATTTCCTCCAAAAAACGAAGAATAGGATATTGTATATTTAGGAC
ACTAAACATATAAAGAACTTTGAGGCAGTAATCTCATAAGTATATTTTTACTT*CTGAGA
ATATAGTATGTTTATTTTGTGAGAGAATAAACTGATACATAAATAAGTACTGATATAGTC
AGTGGCTAATCTTTTTTTTTTGGTCATTCAAATTAGTCAGTGGCTAATCTAATCATTCAA
ATTAAGTGCTAATCTTTAGCTTACAAACTATGATATTGTACAATGGTACATAAATAAGTA
CTGATTTAGTCAGTGGCTAATCTAATCATTCAAATTAAGTGCTAG

QA 1 645 1 645
DS 



AS 2 7

CO CL321Contig1 1336 5 6 U
GGGGAGGTGTGCCTCTTGTTAAGCTCCACTTCCCCCACTACTCTCTCTCTCTCTCTCTGC
ATCTCATCTCAGTTCGGTTGCACAATGTCGAAATCTGGCGCTATGGATCTCGCCTCCAAC
CTTGGTGGAAAGATCGATAAATCCGATGTTCTCTCCGCCGTCGAAAAGTATGAACAATAT
CATGTCTTCCACGGCGGAGAAGAAGAAGAGAGGAAAGCTAATTACACTGACATGGTTAAT
AAGTATTATGACCTTGCTACTAGCTTTTATGAGTACGGTTGGGGAGAGTCCTTCCATTTT
GCGCACAGATGGAATGGAGAATCACTTCGAGAGAGTATCAAACGTCACGAGCACTTTCTT
GCTCTTCAGCTTGGCGTTAAACCTGGACAAAAGGTACTGGATGTAGGATGTGGGATTGGT
GGACCACTGAGAGAAATTGCACGATTCAGCAATTCATCTGTTACCGGGATCAACAATAAT
GAATACCAGATCACCAGAGGCAAGGAACTAAACCGACTTGCAGGTGTCGATAAGACATGT
AGCTTTGTCAAGGCTGACTTCATGAAGATGCCATTCCCTGAAAACACTTTTGATGCAGTT
TATGCTATAGAGGCAACCTGCCACGCACCTGATGCATATGGATGCTACAAAGAGATCTAC
AGGGTGCTAAAGCCGGGGCAATGTTTTGCTGCCTATGAGTGGTGCATGACTGATGCGTTT
GACCCTGATAACGCCCAACATCAGAAGATAAAGGCAGAGATAGAGATTGGAGATGGTCTC
CCTGACATTAGGCTGACTTCAAAGTGCCTAGAAGCTCTGAAGCAGGCCGGTTTTGAAGTA
ATATGGGAAAAGGATTTGGCCAAGGACTCGCCAGTCCCATGGTACTTACCTCTAGACAAA
AACCACTTTTCGCTCAGTAGCTTCCGCCTAACAGCTGTTGGACGATTCATAACCAAAAAC
ATGGTGAAGCTCCTTGAGTACATAAGACTGGCACCTAAAGGAAGCCAAAGGGTTTCAGAC
TTTTTGGAGAAGGCCGCGGAAGGATTAGTCGACGGTGGAAGGAGAGAGATATTCACGCCA
ATGTATTTTTTCTTGGCACGGAAGCCAGAATGAGCGTGATGAGAGATTGATGATCATCGT
AGGTCGAGTGAAGTTGACAGATTTTTTCAACTTGCTATTTGTTTGTTCTGTTTCATCTCC
TTTTGTTGCAGTGTTCCTAAAAAAACCTTTGTTGCAACTTGTTTTGTTTTGGATAAGTCT
TAACATGTCACGTGCTGCAGCTCTCTGTGACTCTGTCAGTGAATAACGTCAAAATATCTT
GGAATCCTTTCTCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1EC78JQ C 669
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GACC
TGAT

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CG

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G
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DS 



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CTCTGTCT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DU59TF U 1
AF RS1DU59JQ C 135
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RD RS1DU59TF 788 0 0
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GAAGGATTAGTCGACGGTGGAAGGAGGGAGATTTTCACGCCAATGTACTTCTTCTTGGCT
CGGAAGCCAGAATGAGAGATGGTCGAGTGAAGCTGGCCATATTTCTTCTTGATTTTTCTA
GTTTCATGTCCTTTTGTTGCAGTGTTTTTCATGTCTTTTATTTT*CTTTGGAAAA*GAAA
ACCTTGTCGTCACCAAACTTGTTT*GGATGGATTCT*AAGATGTCACGTGCTGCTGCACT
CTCTGTCT

QA 1 780 1 780
DS 

RD RS1DU59JQ 654 0 0
TGCATATGGATGCTACAAAGAGATCTTCAGAGTGCTAAAGCCCGGACAATGTTTTGCTGC
CTATGAGTGGTGCATGACTGATGCATTTGACCCTGCTAACGCCCAGCATCAGAAAATAAA
GGCAGAGATAGAGATCGGAGATGGTCTCCCTGATATTAGGCTGACTTCAAAATGCCTCGA
AGCCCTGAAACAGGCTGGTTTTGAAGTGATATGGGAAAAGGATCTGGCAGAAGACTCGCC
AGTCCCATGGTACTTACCTCTGGACAAGAACCACTTCTCGCTCAGTAGCTTCCGCCTAAC
AGCTGTTGGACGATTCATAACTAAAAACATGGTGAAGGTCCTCGAGTACATAAGACTCGC
GCCTAAAGGAAGCCAAAGAGTTTCAGATTTTCTGGAGAAGGCCGCAGAAGGATTAGTCGA
CGGTGGAAGGAGGGAGATTTTCACGCCAATGTACTTCTTCTTGGCTCGGAAGCCAGAATG
AGAGATGGTCGAGTGAAGCTGGCCATATTTCTTCTTGATTTTTCTAGTTTCATGTCCTTT
TGTTGCAGTGTTTTTCATGTCTTTTATTTTTCTTTGGAAAAAGAAAACCTTGTCGTCACC
AAACTTGTTTTGGATGGATTCTTAAGATGTCACGTGCTGCTGCACTCTCTGTCT

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 10

CO CL322Contig1 1123 10 25 U
GAAACGATAAATCTTAAGTCTTATTCGAAAATTATTTTTATACATTTGATTAAAAGAAAC
GAAATGTAAACATCGTCACTGTCATCATACATTAACATCGTCATTGCGTATTCACATTTG
GTGTCCAGATGGGATGAATATTAATATCCTCCACCACCTCTATTATTTTATTCACATGCA
TTTTAGACATTTAACGCCATCTGTGCAATCCCAACCACTAAACGTTAAAATATCCAACGG
CCACGATTCGCACGTCACGCACCGACGGCTGTGATTGAAGCCATACCTTCAAGCTCACTC
TTGCTCCGTCTGATCCTCTCACCGCCGTCATCGCATCCGCTCGTAGCCGTCGCCCAAATA
TCCGGCACCGCTGTAGCTATATCAGTTACACTCTCCACTGCATAATCCGCATCTTTAGTC
TTTTCTGATCTTCCCACCAGGATTGTGTGAAGCCCCACAGATTTACCGGCGGTAATATTG
TGGACATTATCATCCAAAAATACCGCCCGGCGAGGGTCAACGTTGGCGATACGAATGCAC
ACATCCATCGCGGTCAACGAAGGCTTGAGCACGACGGGATGCTCATCGGGTCGGGTTGTT
GGCCCGAATAAATTCGGGTTCATTGTCTCGAAACAGATTATCTCTTCGAAACAATCTTCT
AAACCCAATCTCTCAAGAACCTTCATCGCATGGTTCCTGTCTGAATTCGTGAAAATGATT
TTTCTCTGTTTGATTTTGTTCAGAAGGTTTCGTAGTTTGCTGTTAGGTTGGATCGAACCA
TACGGCAACCTTCCGTGCACGACACTGTGATATTCATCAGGATGAACATCGTGACCTAAT
GCCCTAAGACCAGCGAGAGTACTTCCATAAGTCTTGAAGAGTTCAACTCTTAGGCTTGAA
GCTTTACTTTCAGAGAATCCAAACTTCTCCATTAGAAAATCGTCGATGTTTTTCTTGACG
GCTGGAGCTATTCCCGTTTTCAGAGGGTATAATGTGTCATCCAAATCGAAAATGAGGCAG
TTGATCGGGGAGGAAGCCATTACAAGAAAATAAAGTAAGCAAAAATACTGTTTTCAATAT
TTGAGAAAATGGAGTAAATAACAAAACAAAGAGGAAGAGGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 35 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 25 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1G536JQ U 1
AF RS1B301JQ U 40
AF RS1C495JQ U 40
AF RS1BB80JQ U 66
AF RS1AX83JQ U 23
AF RS1B301TF C 331
AF RS1BB80TF C 352
AF RS1AF61TF C 366
AF RS1G536TF C 482
AF RS1AX83TF C 369
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BS 70 101 RS1G536JQ
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BS 468 468 RS1AX83JQ
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BS 726 778 RS1AX83JQ
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BS 883 1123 RS1B301TF

RD RS1G536JQ 625 0 0
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GAAATGTACACATCGTCACTGTCATCATACATTAACATCGTAGTTGCGTATTCACATTTG
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TTTTAGACATTTAACGCCATCTGTGCAATCCCAACCACTAAACGTTAAAATATCCAACGG
CCACGATTCGCACGTCACGCACCGACGGCTGTGATTGAAGCCATACCTTCAAGCTCACTC
TTGCTCCGTCTGATCCTCTCACCGCCGTCATCGCATCCGCTCGTAGCCGTCGCCCAAATA
TCCGGTACCGCTGTAGCTATATCAGTTACACTCTCCACTGCATAATCCGCATCTTTAGTC
TTTTCTGATCTTCCCACCAGGATTGTGTGAAGCCCCACAGATTTACCAGCGGTAATATTG
TGGACATTATCATCCAAAAATACCCCCCGACGAGGGTCAACGTTGGCGATACGAATGCAC
ACATCCATCGCGGTCAACGAAGGCTTGAGCACGACGGGATGCTCATCGGGTCGGGTTGTT
GGCCCGAATAAATTCGGGTTCATTG

QA 1 625 1 625
DS 

RD RS1B301JQ 668 0 0
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GTCATTGCGTATTCACATTTGGTGTCCAGATGGGATGAATATTAATATCCTCCACCACCT
CTATTATTTTATTCACATGCATTTTAGACATTTAACGCCATCTGTGCAATCCCAACCACT
AAACGTTAAAATATCCAACGGCCACGATTCGCACGTCACGCACCGACGGCTGTGATTGAA
GCCATACCTTCAAGCTCACTCTTGCTCCGTCTGATCCTCTCACCGCCGTCATCGCATCCG
CTCGTAGCCGTCGCCCAAATATCCGGCACCGCTGTAGCTATATCAGTTACACTCTCCACT
GCATAATCCGCATCTTTAGTCTTTTCTGATCTTCCCACCAGGATTGTGTGAAGCCCCACA
GATTTACCGGCGGTAATATTGTGGACATTATCATCCAAAAATACCGCCCGGCGAGGGTCA
ACGTTGGCGATACGAATGCACACATCCATCGCGGTCAACGAAGGCTTGAGCACGACGGGA
TGCTCATCGGGTCGGGTTGTTGGCCCGAATAAATTCGGGTTCATTGTCTCGAAACAGATT
ATCTCTTCGAAACAATCTTCTAAACCCAATCTCTCAAGAACCTTCATCGCATGGTTCCTG
TCTGAATT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1C495JQ 702 0 0
ATACATTTGATTAAAAGAAACGAAATGTAAACATCGTCACTGTCATCATACATTAACATC
GTCATTGCGTATTCACATTTGGTGTCCAGATGGGATGAATATTAATATCCTCCACCACCT
CTATTATTTTATTCACATGCATTTTAGACATTTAACGCCATCTGTGCAATCCCAACCACT
AAACGTTAAAATATCCAACGGCCACGATTCGCACGTCACGCACCGACGGCTGTGATTGAA
GCCATACCTTCAAGCTCACTCTTGCTCCGTCTGATCCTCTCACCGCCGTCATCGCATCCG
CTCGTAGCCGTCGCCCAAATATCCGGCACCGCTGTAGCTATATCAGTTACACTCTCCACT
GCATAATCCGCATCTTTAGTCTTTTCTGATCTTCCCACCAGGATTGTGTGAAGCCCCACA
GATTTACCGGCGGTAATATTGTGGACATTATCATCCAAAAATACCGCCCGGCGAGGGTCA
ACGTTGGCGATACGAATGCACACATCCATCGCGGTCAACGAAGGCTTGAGCACGACGGGA
TGCTCATCGGGTCGGGTTGTTGGCCCGAATAAATTCGGGTTCATTGTCTCGAAACAGATT
ATCTCTTCGAAACAATCTTCTAAACCCAATCTCTCAAGAACCTTCATCGCATGGTTCCTG
TCTGAATTCGTGAAAATGATTTTTCTCTGTTTGATTTTGTTC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RS1BB80JQ 671 0 0
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CAGATGGGATGAATATTAATATCCTCCACCACCTCTATTATTTTATTCACATGCATTTTA
GACATTTAACGCCATCTGTGCAGTCCCAACCACTAAACGTTAAAATATCCAACGGCCACG
ATTCGCACGTCACGCACCGACGGCTGTGATTGAAGCCATACCTTCAAGCTCACTCTTGCT
CCGTCTGATCCTCTCACCGCCGTCATCGCATCCGCTCGTAGCCGTCGCCCAAATATCCGG
CACCGCTGTAGCTATATTAGTTACACTCTCCACTGCATAATCCGCATCTTTAGTCTTTTC
TGATCTTCCCACCAGGATTGTGTGAAGCCCCACAGATTTACCGGCGGTAATATTGTGGAC
ATTATCATCCAAAAATACCGCCCGGCGAGGGTCAACGTTGGCGATACGAATGCACACATC
CATCGCGGTCAACGAAGGCTTGAGCACGACGGGATGCTCATCGGGTCGGGTTGTTGGTCC
GAATAAATTCGGGTTCATTGTCTCGAAACAGATTATCTCTTCGAAACAATCTTCTAAACC
CAATCTCTCAAGAACCTTCATCGCATGGTTCCTGTCTGAATTCGTGAAAATGATTTTTCT
CTGTTTGATTT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1AX83JQ 867 0 0
ATTCGAAAATTATTTTTATACATTTGATTAAAAGAAACGAAATGTAAACATCGTCACTGT
CATCATACATTAACATCGTCATTGCGTATTCACATTTGGTGTCCAGATGGGATGAATATT
AATATCCTCCACCACCTCTATTATTTTATTCACATGCATTTTAGACATTTAACGCCATCT
GTGCAATCCCAACCACTAAACGTTAAAGTATCCAACGGCCACGATTCGCACGTCACGCAC
CGACGGCTGTGATTGAAGCCATACCTTCAAGCTCACTCTTGCTCCGCCTGATCCTCTCAC
CGCCGTCATCGCATCCGCTCGTAGCCGTCGCCCAAATATCCGGCACCGCTGTAGCTACAT
CAGTTACACTCTCCACTGCATAATCCGCATCTTTAGTCTTTTCTGATCTTCCCACCAGGA
TTGTGTGAAGCCCCACAGATTTACCGGCGGTAATATTGTGGACATTATCATCCAAAAATA
CCGCCCGGCGAGGGTCAACGTTGGCGATACGAATGCACACATCCATCGCGGTCAACGAAG
GCTTGAGCACGACGGGATGCTCATCGGGTCGGGTTGTTGGCCCGAATAAATTCGGGTTCA
TTGTCTCGAAACAGATTATCTCTTCGAAACAATCTTCTAAACCCGATCTCTCAAGAACCT
TCATCGCATGGTTCCTGTCTGAATTCGTGAAAATGATTTTTCACTGTTTGATTTTGTTCA
GAAGGTTTCGTAGTTTGCTGTTAGGTTGGATCGAAC*ATACGGCAACCTTCCGTGCACGA
CACTGTGATATTCATCAG*ATGAACATCGTGACCTA*TGCCCTAAGACCAGCGAGAGTAC
TTCCATAAGTCTTGAAGAGT
CACTCTT

QA 1 860 1 860
DS 

RD RS1B301TF 793 0 0
ATCGCAT
CGCTCGTAGC*GTCGCCCAAATATC*GGCACCGCTGTAGCTATATCAGT*ACACTCTCCA
CTGCATAATCCGCATCTTTAGTCTTT*CTGATCTTCCCACCAGGATTGTGTGAAGCCCCA
CAGATTTACCGGCGGTAATATTGTGGACATTATCATCCAAAAATACCGCCCGGCGAGGGT
CAACGTTGGCGATACGAATGCACACATCCATCGCGGTCAACGAAGGCTTGAGCACGACGG
GATGCTCATCGGGTCGGGTTGTTGGCCCGAATAAATTCGGGTTCATTGTCTCGAAACAGA
TTATCTCTTCGAAACAATCTTCTAAACCCAATCTCTCAAGAACCTTCATCGCATGGTTCC
TGTCTGAATTCGTGAAAATGATTTTTCTCTGTTTGATTTTGTTCAGAAGGTTTCGTAGTT
TGCTGTTAGGTTGGATCGAACCATACGGCAACCTTCCGTGCACGACACTGTGATATTCAT
CAGGATGAACATCGTGACCTAATGCCCTAAGACCAGCGAGAGTACTTCCATAAGTCTTGA
AGAGTTCAACTCTTAGGCTTGAAGCTTTACTTTCAGAGAATCCAAACTTCTCCATTAGAA
AATCGTCGATGTTTTTCTTGACGGCTGGAGCTATTCCCGTTTTCAGAGGGTATAATGTGT
CATCCAAATCGAAAATGAGGCAGTTGATCGGGGAGGAAGCCATTACAAGAAAATAAAGTA
AGCAAAAATACTGTTTTCAATATTTGAGAAAATGGAGTAAATAACAAAACAAAGAGGAAG
AGGCCC

QA 8 793 8 793
DS 

RD RS1BB80TF 772 0 0
GCCCAAATATCCGGCACCGCTGTAGCTATATTAGTTACACTCTCCACTGCATA*TCCGCA
TCTTTAGTCTTT*CTGATCTTCCCACCAGGATTGTGTGAAGCCCCACAGATTTACCGGCG
GTAATATTGTGGACATTATCATCCAAAAATACCGCCCGGCGAGGGTCAACGTTGGCGATA
CGAATGCACACATCCATCGCGGTCAACGAAGGCTTGAGCACGACGGGATGCTCATCGGGT
CGGGTTGTTGGTCCGAATAAATTCGGGTTCATTGTCTCGAAACAGATTATCTCTTCGAAA
CAATCTTCTAAACCCAATCTCTCAAGAACCTTCATCGCATGGTTCCTGTCTGAATTCGTG
AAAATGATTTTTCTCTGTTTGATTTTGTTCAGAAGGTTTCGTAGTTTGCTGTTAGGTTGG
ATCGAACCATACGGCAACCTTCCGTGCACGACACTGTGATATTCATCAGGATGAACATCG
TGACCTAATGCCCTAAGACCAGCGAGAGTACTTCCATAAGTCTTGAAGAGTTCAACTCTT
AGGCTTGAAGCTTTACTTTCAGAGAATCCAAACTTCTCCATTAGAAAATCGTCGATGTTT
TTCTTGACGGCTGGAGCTATTCCCGTTTTCAGAGGGTATAATGTGTCATCCAAATCGAAA
ATGAGGCAGTTGATCGGGGAGGAAGCCATTACAAGAAAATAAAGTAAGCAAAAATACTGT
TTTCAATATTTGAGAAAATGGAGTAAATAACAAAACAAAGAGGAAGAGGCCC

QA 1 772 1 772
DS 

RD RS1AF61TF 758 0 0
CACCGCTGTAGCTATATCAGTTACACTCTCCACTGCATAATCCGCATCTTTAGTCTTT*C
TGATCTTCCCACCAGGATTGTGTGAAGCCCCACAGATTTACCGGTGGTAATATTGTGGAC
ATTATCATCCAAAAATACCGCCCGGCGAGGGTCAACGTTGGCGATACGAATGCACACATC
CATCGCGGTCAACGAAGGCTTGAGCACGACGGGATGCTCATCGGGTCGGGTTGTTGGCCC
GAATAAATTCGGGTTCATTGTCTCGAAACAGATTATCTCTTCGAAACAATCTTCTAAACC
CAATCTCTCAAGAACCTTCATCGCATGGTTCCTGTCTGAATTCGTGAAAATGATTTTTCT
CTGTTTGATTTTGTTCAGAAGGTTTCGTAGTTTGCTGTTAGGTTGGATCGAACCATACGG
CAACCTTCCGTGCACGACACTGTGATATTCATCAGGATGAACATCGTGACCTAATGCCCT
AAGACCAGCGAGAGTACTTCCATAAGTCTTGAAGAGTTCAACTCTTAGGCTTGAAGCTTT
ACTTTCAGAGAATCCAAACTTCTCCATTAGAAAATCGTCGATGTTTTTCTTGACGGCTGG
AGCTATTCCCGTTTTCAGAGGGTATAATGTGTCATCCAAATCGAAAATGAGGCAGTTGAT
CGGGGAGGAAGCCATTACAAGAAAATAAAGTAAGCAAAAATACTGTTTTCAATATTTGAG
AAAATGGAGTAAATAACAAAACAAAGAGGAAGAGGCCC

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1G536TF 642 0 0
GGACATTATCATCCAAAAATACC*CCCGACGAGGGTCAACGTTGGCGATACGAATGCACA
CATCCATCGCGGTCAACGAAGGCTTGAGCACGACGGGATGCTCATCGGGTCGGGTTGTTG
GCCCGAATAAATTCGGGTTCATTGTCTCGAAACAGATTATCTCTTCGAAACAATCTTCTA
AACCCAATCTCTCAAGAACCTTCATCGCATGGTTCCTGTCTGAATTCGTGAAAATGATTT
TTCTCTGTTTGATTTTGTTCAGAAGGTTTCGTAGTTTGCTGTTAGGTTGGATCGAACCAT
ACGGCAACCTTCCGTGCACGACACTGTGATATTCATCAGGATGAACATCGTGACCTAATG
CCCTGAGACCAGCGAGAGTACTTCCATAAGTCTTGAAGAGTTCAACTCTTAGGCTTGAAG
CTTTACTTTCAGAGAATCCAAACTTCTCCATTAGAAAATCGTCGATGTTTTTCTTGACGG
CTGGAGCTATTCCCGTTTTCAGAGGGTATAATGGGTCATCCAAATCGAAAATGAGGCAGT
TGATCGGGGAGGAAGCCATTACAAGAAAATAAAGTAAGCAAAAATACTGTTTTCAATATT
TGAGAAAATGGAGTAAATAACAAAACAAAGAGGAAGAGGCCC

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DS 

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ATCATCCAAAAATACCGCCCGGCGAGGGTCAACGTTGGCGATACGAATGCACACATCCAT
CGCGGTCAACGAAGGCTTGAGCACGACGGGATGCTCATCGGGTCGGGTTGTTGGCCCGAA
TAAATTCGGGTTCATTGTCTCGAAACAGATTATCTCTTCGAAACAATCTTCTAAACCCGA
TCTCTCAAGAACCTTCATCGCATGGTTCCTGTCTGAATTCGTGAAAATGATTTTTCACTG
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CCTTCCGTGCACGACACTGTGATATTCATCAGGATGAACATCGTGACCTAATGCCCTAAG
ACCAGCGAGAGTACTTCCATAAGTCTTGAAGAGTTCAACTCTTAGGCTTGAAGCTTTACT
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TATTCCCGTTTTCAGAGGGTATAATGTGTCATCCAAATCGAAAATGAGGCAGTTGATCGG
GGAGGAAGCCATTACAAGAAAATAAAGTAAGCAAAAATACTGTTTTCAATATTTGAGAAA
ATGGAGTAAATAACAAAACAAAGAGGAAGAGGCCC

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 10

CO CL323Contig1 1186 10 18 U
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TTTGTGTTTGTTGAATTGACTGGCTGGTTTGAGCGGTTCAAGATTCAGCCTAAGATGAAG
TATTCATTGTCTGATATGTTTCGGTGTTATAAAGATGTCATGAAGCTGTTCCTTCTTGTA
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TTGCCATTACCATCGTTAATGGAGACTGTAGCACAATTAGTGGTTTACTTCTTGATAGAA
GATTACACTAACTACTGGATCCATAGATGGTTGCATTGCAAATGGGGTTATGAGATGATA
CATCGAGTTCACCACGAGTACACTTCTCCAATCGGATATGCATCACCTTATGCACATTGG
GCCGAGGTCTTGCTTCTTGGTATTCCGACGTTTCTTGGACCGGCGATTGCACCTGGCCAC
ATTATGACCTTTT*GGTTGTGGATAACTTTACGTCAAATGGAGGCTATAGAAACTCACAG
CGGATATGATTTTCCATGGGCTCTGACAAAACTTGTTCCGTTCTACGGTGGAGCTGAGTA
TCATGATTATCATCACTACGTTGGAGGACAAAGCCAGAGTAACTTTGCTTCGGTTTTCAC
TTATTGCGACTATATCTATGGGACCGACAAAGGTTATCGAGTCCATAAGAAGCTTCTTCA
GCAGATTACGGAGGAAGCTGAGCAGAAGGGAGGAACGAAAGACGATTAGTAACAAATCAG
AAGAGGGTCGAAAGTATCAATCCATTGATAAGATTAAATAATTGTATATGATCCTATATA
TATAT**GTTAATTAACTAGAAGTGGATTGCTTGTGTTAATAATTTTCCACAATTAAAAA
ATATGTATGTTTTTTATTATTATTTAAAATATGTATGGTGTTAACTATAGTTACGTATGA
GATTACGTGGGGAATATTATTCGAATAAAAACAATTTATTCTTCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 10 60 60 60 60 15 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 10 

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AF RS1H586TF U 1
AF RS1E738TF U 21
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RD RS1D207TF 773 0 0
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CATCGAGTTCACCACGAGTACACTTCTCCAATCGGATATGCATCACCTTATGCACATTGG
GCCGAGGTCTTGCTTCTTGGTATTCCGACGTTCCTTGGACCGGCGATTGCGCCTGGCCAC
ATTATGACCTTTT*GGTTGTGGATAACTTTACGTCAAATGGAGGCTATAGAAACTCACAG
CGGATATGATTT*CCATGGGCTCTGACAAA*CTTGTTCCGTTCTACG
TGGAGC

QA 1 767 1 767
DS 

RD RS1H586TF 757 0 0
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CGGAACCTGACTTGGTTCGAGACTGTTTGGTTTGATTACTCAGCCACCAAATCTGATTTC
CATGTTTACTGCCACACCATTTTAGTACTCTTCCTCGTCTTCTCTCTCGCTCCTCTTCCT
TTTGTGTTTGTTGAATTGACTGGCTGGTTTGAGCGGTTCAAGATTCAGCCTAAGATGAAG
TATTCATTGTCTGATATGTTTCGGTGTTATAAAGATGTCATGAAGCTGTTCCTTCTTGTA
GTCGGCACGTTGCAATTCGTTACTTATCCTTCCATCCAGCTGGTTGGGATTCGAAGTGGG
TTGCCATTACCATCGTTAATGGAGACTGTAGCACAATTAGTGGTTTACTTCTTGATAGAA
GATTACACTAACTACTGGATCCATAGATGGTTGCATTGCAAATGGGGTTATGAGATGATA
CATCGAGTTCACCACGAGTACACTTCTCCAATCGGATATGCATCACCTTATGCACATTGG
GCCGAGGTCTTGCTTCTTGGTATTCCGACGTTTCTTGGACCGGCGATTGCACCTGGCCAC
ATTATGACCTTTT*GGTTGTGGATAACTTTACGTCAAATGGAGGCTATAGAAACTCACAG
CGGATATGATTTTCCATGGGCTCTGACAAAACTTGTT

QA 1 757 1 757
DS 

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GGG
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TGACAAA*CTTGTTCCGTTCTACG*TGGAGCTGAGTATCATGATTATCATCACT

QA 4 777 4 777
DS 

RD RS1AI17TF 806 0 0
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AGTACTCTTCCTCGTCTTCTCTCTCGCTCCTCTTCCTTTTGTGTTTGTTGAATTGACTGG
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GTGTTATAAAGATGTCATGAAGCTGTTCCTTCTTGTAGTCGGCACGTTGCAATTCGTTAC
TTATCCTTCCATCCAGCTGGTTGGGATTCGAAGTGGGTTGCCATTACCATCGTTAATGGA
GACTGTAGCACAATTAGTGGTTTACTTCTTGATAGAAGATTACACTAACTACTGGATCCA
TAGATGGTTGCATTGCAAATGGGGTTATGAGATGATACATCGAGTTCACCACGAGTACAC
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TCCGACGTTTCTTGGACCGGCGATTGCACCTGGCCACATTATGACCTTTTTGGTTGTGGA
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TCTCAAA*CTTGTTCCGTTCTACGGTGGAGCTGAGTATCATGATTATCATCACTACGTTG
GAGGACAA*GCCAGAGTA
CTTTGCTT

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DS 

RD RS1BG67TF 779 0 0
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TGTTTGGTTTGATTACTCAGCCACCAAATCTGATTTCCATGTTTACTGCCACACCATTTT
AGTACTCTTCCTCGTCTTCTCTCTCGCTCCTCTTCCTTTTGTGTTTGTTGAATTGACTGG
CTGGTTTGAGCGGTTCGAGATTCAGCCTAAGATGAAGTATTCATTGTCTGATATGTTTCG
GTGTTATAAAGATGTCATGAAGCTGTTCCTTCTTGTAGTCGGCACGTTGCAATTCGTTAC
TTATCCTTCCATCCAGCTGGTTGGGATTCGAAGTGGGTTGCCATTACCATCGTTAATGGA
GACTGTAGCACAATTAGTGGTTTACTTCTTGATAGAAGATTACACTAACTACTGGATCCA
TAGATGGTTGCATTGCAAATGGGGTTATGAGATGATACATCGAGTTCACCACGAGTACAC
TTCTCCAATCGGATATGCATCACCTTATGCACATTGGGCCGAGGTCTTGCTTCTTGGTAT
TCCGACGTTTCTTGGACCGGCGATTGCACCTGGCCACATTATGACCTTTT*GGTTGTGGA
TAACTTTACGTCAAATGGAG*CTATAGAAACTCACAGCGGATATGATTTTCCATGGGCTC
TCTCAAA*CTTGTTCCGTTCTACG*TGGAGCTGAGTATCATGATTATCATCACTACGTT

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DS 

RD RS1E738JQ 795 0 0
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TGCATTGCAAATGGGGTTATGAGATGATACATCGAGTTCACCACGAGTACACTTCTCCAA
TCGGATATGCATCACCTTATGCACATTGGGCCGAGGTCTTGCTTCTTGGTATTCCGACGT
TTCTTGGACCGGCGATTGCACCTGGCCACATTATGACCTTTT*GGTTGTGGATAACTTTA
CGTCAAATGGAGGCTATAGAAACTCACAGCGGATATGATTTTCCATGGGCTCTGACAAAA
CTTGTTCCGTTCTACGGTGGAGCTGAGTATCATGATTATCATCACTACGTTGGAGGACAA
AGCCAGAGTAACTTTGCTTCGGTTTTCACTTATTGCGACTATATCTATGGGACCGACAAA
GGTTATCGAGTCCATAAGAAGCTTCTTCAGCAGATTACGGAGGAAGCTGAGCAGAAGGGA
GGAACGAAAGACGATTAGTAACAAATCAGAAGAGGGTCGAAAGTATCAATCCATTGATAA
GATTAAATAATTGTATATGATCCTATATATATATATGTTAATTAACTAGAAGTGGATTGC
TTGTGTTAATAATTTTCCACAATTAAAAAATATGTATGTTTTTTATTATTATTTAAAATA
TGTATGGTGTTAACTATAGTTACGTATGAGATTACGTGGGGAATATTATTCGAATAAAAA
CAATTTATTCTTCC
G

QA 1 794 1 794
DS 

RD RS1AI17JQ 618 0 0
CCAATCGGATATGCATCACCTTATGCACATTGGGCCGAGGTCTTGCTTCTTGGTATTCCG
ACGTTTCTTGGACCGGCGATTGCACCTGGCCACATTATGACCTTTT*GGTTGTGGATAAC
TTTACGTCAAATGGAGGCTATAGAAACTCACAGCGGATATGATTTTCCATGGGCTCTCTC
AAAACTTGTTCCGTTTTACGGTGGAGCTGAGTATCATGATTATCATCACTACGTTGGAGG
ACAAAGCCAGAGTAACTTTGCTTCGGTTTTCACTTATTGCGACTATATTTATGGGACCGA
CAAAGGTTATCGAGTCCATAAGAAGCTTCTTCAGCAGATTACGGAGGAAGCTGAGCAGAA
GGGAGGAACGAAAGACGATTAGTAACAAATCAGAAGAGGGTCGAAAGTATCAATCCATTG
ATAAGATTAAATAATTGTATATGATCCTATATATATAT**GTTAATTAACTAGAAGTGGA
TTGCTTGTGTTAATAATTTTCCACAATTAAAAAATATGTATGTTTTTTATTATTATTTAA
AATATGTATGGTGTTAACTATAGTTACGTATGAGATTACGTGGGGAATATTATTGGAATA
AAAACAATTTATTCTTCC

QA 1 618 1 618
DS 

RD RS1BG67JQ 625 0 0
CACTTCTCCAATCGGATATGCATCACCTTATGCACATTGGGCCGAGGTCTTGCTTCTTGG
TATTCCGACGTTTCTTGGACCGGCGATTGCACCTGGCCACATTATGACCTTTT*GGTTGT
GGATAACTTTACGTCAAATGGAGGCTATAGAAACTCACAGCGGATATGATTTTCCATGGG
CTCTCTCAAAACTTGTTCCGTTTTACGGTGGAGCTGAGTATCATGATTATCATCACTACG
TTGGAGGACAAAGCCAGAGTAACTTTGCTTCGGTTTTCACTTATTGCGACTATATCTATG
GGACCGACAAAGGTTATCGAGTCCATAAGAAGCTTCTTCAGCAGATTACGGAGGAAGCTG
AGCAGAAGGGAGGAACGAAAGACGATTAGTAACAAATCAGAAGAGGGTCGAAAGTATCAA
TCCATTGATAAGATTAAATAATTGTATATGATCCTATATATATAT**GTTAATTAACTAG
AAGTGGATTGCTTGTGTTAATAATTTTCCACAATTAAAAAATATGTATGTTTTTTATTAT
TATTTAAAATATGTATGGTGTTAACTATAGTTACGTATGAGATTACGTGGGGAATATTAT
TCGAATAAAAACAATTTATTCTTCC

QA 1 625 1 625
DS 

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TACACTAACTACTGGATCCATAGATGGTTGCATTGCAAATGGGGTTATGAGATGATACAT
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GAGGTCTTGCTTCTTGGTATTCCGACGTTTCTTGGACCGGCGATTGCACCTGGCCACATT
ATGACCTTTT*GGTTGTGGATAACTTTACGTCAAATGGAGGCTATAGAAACTCACAGCGG
ATATGATTTTCCATGGGCTCTGACAAAACTTGTTCCGTTCTACGGTGGAGCTGAGTATCA
TGATTATCATCACTACGTTGGAGGACAAAGCCAGAGTAACTTTGCTTCGGTTTTCACTTA
TTGCGACTATATCTATGGGACCGACAAAGGTTATCGAGTCCATAAGAAGCTTCTTCAGCA
GATTACGGAGGAAGCTGAGCAGAAGGGAGGAACGAAAGACGATTAGTAACAAATCAGAAG
AGGGTCGAAAGTATCAATCCATTGATAAGATTAAATAATTGTATATGATCCTATATATAT
AT**GTTAATTAACTAGAAGTGGATTGCTTGTGTTAATAATTTTCCACAATTAAAAAATA
TGTATGTTTTTTATTATTATTTAAAATATGTATGGTGTTAACTATAGTTACGTATGAGAT
TACGTGGGGAATATTATTCGAATAAAAACAATTTATTCT
CC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RS1D207JQ 747 0 0
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TCCATAGATGGTTGCATTGCAAATGGGGTTATGAGATGATACATCGAGTTCACCACGAGT
ACACTTCTCCAATCGGATATGCATCACCTTATGCACATTGGGCCGAGGTCTTGCTTCTTG
GTATTCCGACGTTCCTTGGACCGGCGATTGCGCCTGGCCACATTATGACCTTTT*GGTTG
TGGATAACTTTACGTCAAATGGAGGCTATAGAAACTCACAGCGGATATGATTTTCCATGG
GCTCTGACAAAACTTGTTCCGTTCTACGGTGGAGCTGATTATCATGATTATCATCACTAC
GTTGGAGGACAAAGCCAGAGTAACTTTGCTTCGGTTTTCACTTATTGCGACTATATCTAT
GGGACCGACAAAGGTTATCGAGTCCATAAGAAGCTTCTTCAGCAGATTACGGAGGAAGCT
GAGCAGAAGGGAGGAACGAAAGACGATTAGTAACAAATCAGAAGAGGGTCGAAAGTATCA
ATCCATTGATAAGATTAAATAATTGTATATGATCCTATATATATAT**GTTAATTAACTA
GAAGTGGATTGCTTGTGTTAATAATTTTCCACAATTAAAAAATATGTATGTTTTGTATTA
TTATTTAAAATATGTATGGTGTTAACTATAGTTACGTATGAGATTACGTGGGGAATATTA
TTCGAATAAAAACAATTTATTCTTCCC

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 8

CO CL324Contig1 610 8 10 U
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CCAGGATTTCTTTTATAAATTTATTTATTTAATTTATTTGGAAGATAAAAAATAATTAGT
AATAATACGAGGATGTCTAAAAATGTCAAAGTGTTTGTTTCTCTAGTTCTTGTAGTGTTC
TTGGCTCTTGCAGCAACCAATATTGAAGCAAGATACATAAATTATGGTGATCTTAATGGT
GGAGATCACGCTTTGGCTTGCGATAAAGCGAATCCTGGTTCCTGCAAGAAGCAAGAAGCC
AATCATTACCGCAGAGGATGCGAGACGGAAGAACGTTGCCGTGGATCTCGTTGATTTATA
CAGATGATAACCGAAGCTCATGCATCAAATTAGGTTCCTGATTATTATAATATATTGACA
GGCTTCTAACTTGGAGAACAACTATTGGTTAATTTATACGAAGGCAATCATATTAATTTG
AGATGATCAAATTAATTTCCTTGTTATTTATTTAGTATTGTTATTTATTTAGTCTGTTAT
TGGTTTTATAATTGATTTTAACCCAATGATGTTATGATCAAATAAATATAAATATCTTTG
TTCCTATTCC


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 10 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 15 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 35 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FA49TF U 1
AF RS1GN15TF U 11
AF RS1AM19JQ C 2
AF RS1AM19TF U 2
AF RS1CJ55TF U 292
AF RS1DZ68TF U 2
AF RS1BF43JQ C 13
AF RS1BF43TF U 13
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QA 1 590 1 590
DS 

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GG
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QA 3 536 3 536
DS 

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GT

QA 1 590 1 590
DS 

RD RS1AM19TF 592 0 0
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GGTTTTATAATTGATTTTAACCCAATGATGTTATGATCAAATAAATATAA
GT

QA 1 590 1 590
DS 

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G
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QA 2 299 2 299
DS 

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ATAATACGAGGATGTCTAAAAATGTCAAAGTGTTTGTTTCTCTAGTTCTTGTAGTGTTCT
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GAGATCACGCTTTGGCTTGCGATAAAGCGAATCCTGGTTCCTGCAAGAAGCAAGAAGTCA
ATCATTACCGCAGAGGATGCGAGACGGAAGAACGTTGCCGTGGATCTCGTTGATTTATAC
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GCTTCTAACTTGGAGAACAACTATTGGTTAATTTATACGAAGGCAATCATATTAATTTGA
GATGATCAAATTAATTTCCTTGTTATTTATTTAGTATTGTTATTTATTTAGTCTGTTATT
GGTTTTATAATTGATTTTAACCCAATGATGTTATGATCAAATAAATATAAATATCTTTGT
T

QA 1 601 1 601
DS 

RD RS1BF43JQ 598 0 0
G
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TGGCTTGCGATAAAGCGAATCCTGGTTCCTGCAAGAAGCAAGAAGCCAATCATTACCGCA
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QA 2 598 2 598
DS 

RD RS1BF43TF 594 0 0
G
ACTCCAAATAAAATTAAATATATAAATAAAATAAATTGAACTCCTATCCAGGATTTCTTT
TATAAATTTATTTATTTAATTTATTTGGAAGATAAAAAATAATTAGTAATAATACGAGGA
TGTCTAAAAATGTCAAAGTGTTTGTTTCTCTAGTTCTTATAGTGTTCTTGGCTCTTGCAG
CAACCAATATTGAAGCAAGATACATAAATTATGGTGATCTTAATGGTGGAGATCACGCTT
TGGCTTGCGATAAAGCGAATCCTGGTTCCTGCAAGAAGCAAGAAGCCAATCATTACCGCA
GAGGATGCGAGACGGAAGAACGTTGCCGTGGATCTCGTTGATTTATACAGATGATAACCG
AAGCTCATGCATCAAATTAGGTTCCTGATTATTATAATATATTGACAGGCTTCTAACTTG
GAGAACAACTATTGGTTAATTTATACGAAGGCAATCATATTAATTTGAGATGATCAAATT
AATTTCCTTGTTATTTATTTAGTATTGTTATTTATTTAGTCTGTTATTGGTTTTATAATT
GATTTTAACCCAATGATGTTATGATCAAATAAATATAAATATCTTTGTT
CCTA

QA 2 590 2 590
DS 



AS 2 10

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TCTGTTCTTGTAACCATCTTGCCACTCAAAGTTATCCAACAAGGACCACACAAAGTATCC
AGTAACATTCACCTTGTCGATGCAAATAGCTTCATTCATACTCAAAAGATGCCTCTGAAG
ATAATATTTCCTGTTGTGATCAGCTGTACCAACTGCAATTGAATCTGCAGCCCCAAGTTC
TTCTCCATATCCGTTTTCCATTATCATAATTTCTGGGTTGCCATACTTATCCTTGATGTA
CTTCAAAAGACTTCTAAAGCCTCTCGCAAAAACGGGAAGTGCACCGGTGATAGGCTTGCT
ACCAATGCTGTAATTGTACGCATTCTTAGTTTCCCAGTTAACTAGAGAATCTTGCATCCA
TCTTGGTTTAGAAGGATCTGGCTTCTCCAGATAGTTTGAAAACATTGAAGTATAGTAGTT
GAGTCCAACGAAATCGGCTGAGTTTTTCAGTTTCGCTTTCTGTTCATCGGTAAATTTAGG
TAATCTGTGTCCAACAATATCTTTCATGATCTGTGGATAATCTCCATACATAGTTGTGTC
CAGATGCCATCCCAAAACAAAGTCAAGTGCACGGTCTATGGACGCACCATCCTGTGAATC
AGCAAGGTCATGTGGTTCAAACC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EP25JQ U 21
AF RS1GQ06JQ U 1
AF RS1DG53JQ U 1
AF RS1FM15JQ U 1
AF RS1G889JQ U 21
AF RS1DG53TF C 132
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AAG
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TGAGGTTATTCTTGAAATCAATGTAGTAAAGTCCAAATCTGTTCTTGTAACCATCTTGCC
ACTCAAAGTTATCCAACAAGGACCATACAAAGTATCCAGTAACATTCACCTTGTCGATGC
AAATAGCCTCATTCATACTCAAAAGATGCCTCTGAAAATAATATTTCCTGTTGTGATCAG
CTGTACCAACTGCAATTGAATCTGAAGCCCCAAGTTCTTCTCCATATCCGTTCTCCATTA
TCATAATTTCGGGGTTGCCATACTTATCCTTGATGTACTTCAAAAGACTTCTAAAGCCTC
TCGCAAAAACGGGAAGTGCACCGGTGATAGGCTTGCTACCAATGCTGTAATTGTACGCAT
TCTTAGTTTCCCAGTTAA
TG

QA 4 561 4 561
DS 

RD RS1GQ06JQ 681 0 0
G
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CGGATACAAAGAGAGATAGACATTAAAACATGAAAACAAATCCTCAAAACAGCTCAAAGC
TCATCCCTCTTGATCATGGATGGACGAACACCTTGACTTAGGAAGTCTTTGTAATACTTG
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CTGTTCTTGTAACCATCTTGCCACTCAAAGTTATCCAACAAGGACCACACAAAGTATCCA
GTAACATTCACCTTGTCGATGCAAATAGCTTCATTCATACTCAAAAGATGCCTCTGAAGA
*AATATTTCCTGTTGTGATCAGCTGTACCAACTGCAATTGAATCTGCAGCCCCAAGTTCT
TCTCCATATCCGTTTTCCATTATCATAATTTCTGGGTTGCCATACTTATCCTTGATGTAC
TTCAAAAGACTTCTAAAGCCTCTCGCAAAAACGGGAAGTGCACCGGTGATAGGCTTGCTA
CCAATGCTGTAATTGTACGCATTCTTAGTTTCCCAGTTAACTAGAGAATCTTGCATCCAT
ATTGGTTTAGAAGGATCTGGCTTCTCCAGATAGTTTGAAAACATTGAAGTATAGTAGTTG
AGTCCAACGAAATCGGCTGA

QA 2 681 2 681
DS 

RD RS1DG53JQ 841 0 0
AGTAAAAAGACAATTCTTTATTATTATAACCAGGACCTCATCGATCTTGGTCAATCACAA
ACGGATACAAAGAGAGATAGACATTAAAACATGAAAACAAATCCTCAAAACAGCTCAAAG
CTCATCCCTCTTGATCATGGATGGACGAACACCTTGACTTAGGAAGTCTTTGTAATACTT
GCCCGATTCTTTCTCATATCGTGTGAGGTTATTCTTGAAATCAATGTAGTAGAGTCCAAA
TCTGTTCTTGTAACCATCTTGCCACTCAAAGTTATCCAACAAGGACCACACAAAGTATCC
AGTAACATTCACCTTGTCGATGCAAATAGCTTCATTCATACTCAAAAGATGCCTCTGAAG
ATAATATTTCCTGTTGTGATCAGCTGTACCAACTGCAATTGAATCTGCAGCCCCAAGTTC
TTCTCCATATCCGTTTTCCATTACCATAATTTCTGGGTTGCCATACTTATCCTTGATGTA
CTTCAAAAGACTTCTAAAGCCTCTCGCAAAAACGGGAAGTGCACCGGTGATAGGCTTGCT
ACCAATGCTGTAATTGTACGCATTCTTAGTTTCCCAGTTAACTAGAGAATCTTGCATCCA
TCTTGGTTTAGAAGGATCTGGCTTCTCCAGATAGTTTGAAAACATTGAAGTATAGTAGTT
GAGTCCAACGAAATCGGCTGAGTTTTTCAGTTTCGCTTTCTGTTCATCGGTAAATTTAGG
TAATCTGTGTCCAACAATATCTTTCATGATCTGTGGATAATCTCCATACATAGTTGTGTC
CAGATGCCATCCCAAAACAAAGTCAAGTGCACGGTCTATGGACGCACCATCCTGTGA
TCAG

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DS 

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G
GTAAAAAGACAATTCTTTATTATTATAACCAGGACCTCATCGATCTTGGTCAATCACAAA
CGGATACAAAGAGAGATAGACATTAAAACATGAAAACAAATCCTCAAAACAGCTCAAAGC
TCATCCCTCTTGATCATGGATGGACGAACACCTTGACTTAGGAAGTCTTTGTAATACTTG
CCCGATTCTTTCTCGTATCGTGTGAGGTTATTCTTGAAATCAATGTAGTAAAGTCCAAAT
CTGTTCTTGTAACCATCTTGCCACTCAAAGTTATCCAACAAGGACCACACAAAGTATCCA
GTAACATTCACCTTGTCGATGCAAATAGCTTCATTCATACTCAAAAGATGCCTCTGAAGA
*AATATTTCCTGTTGTGATCAGCTGTACCAACTGCAATTGAATCTGCAGCCCCAAGTTCT
TCTCCATATCCGTTTTCCATTATCATAATTTCTGGGTTGCCATACTTATCCTTGATGTAC
TTCAAAAGACTTCTAAAGCCTCTCGCAAAAACGGGAAGTGCACCGGTGATAGGCTTGCTA
CCAATGCTGTAATTGTACGCATTCTTAGTTTCCCAGTTAACTAGAGAATCTTGCATCCAT
ATTGGTTTAGAAGGATCTGGCTTCTCCAGATAGTTTGAAAACATTGAAGTATAGTAGTTG
AGTCCAACGAAATCGGCTGAGTTTTTCAGTTTTGCTTTCTGTTCATCGGTAAATTTAGGT
AATCTGTGTCCAACAATATCTTTCATGATCTGTGGATAATCTCCATACATAGTTGTGTCC
AGATGCCATCCCAAA
CA

QA 2 796 2 796
DS 

RD RS1G889JQ 825 0 0
AAG
TTATAACCAAGACCTCATCGATCTTGGTCAATCACAAACGGATACAAAGAGAGATAGACA
TTAAAACATGAAAACAAATCCTCAAAACAGCTCAAAGCTCATCCCTCTTGATCATGGATG
GACGAACACCTTGACTTAGGAAGTCTTTGTAATACTTGCCCGATTCTTTCTCATATCGTG
TGAGGTTATTCTTGAAATCAATGTAGTAGAGTCCAAATCTGTTCTTGTAACCATCTTGCC
ACTCAAAGTTATCCAACAAGGACCATACAAAGTATCCAGTAACATTCACCTTGTCGATGC
AAATAGCTTCATTCATACTCAAAAGATGCCTCTGAAGATAATATTTCCTGTTGTGATCAG
CTGTACCAACTGCAATTGAATCTGAAGCCCCAAGTTCTTCTCCATATCCGTTTTCCATTA
TCATAATTTCGGGGTTGCCATACTTATCCTTGATGTACTTCAAAAGACTTCTAAAGCCTC
TCGCAAAAACGGGAAGTGCACCGGTGATAGGCTTGCTACCAATGCTGTAATTGTACGCAT
TCTTAGTTTCCCAGTTAATGAGAGAATCTTGCATCCATCTTGGTTTAGAAGGATCTGGCT
TCTCCAGATAGTTTGAAAACATTGAAGTATAATAGTTGAGCCCAACGAAATCGGCTGAGT
TTTTCAGTTTTGCTTTCTGTGCATCGGTAAATTTAGGTAATCTGTGTCCAACAATATCTT
TCATGACCTGTGGATAATCTCTATACATAGTTGTGTCCAGATGCCATCCCAAAATAAAGT
CAAGTGCACGGTCTATGGATGCACCGTCCTGTGAATCAGCAA

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DS 

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TGATCATGGATGGACGAACAC*TTGACTTAG*AAGTCTTTGTAATACTTGCCCGATTCTT
TCTCATATCGTGTGAGGTTATTCTTGAAATCAATGTAGTAGAGTCCAAATCTGTTCTTGT
AACCATCTTGCCACTCAAAGTTATCCAACAAGGACCACACAAAGTATCCAGTAACATTCA
CCTTGTCGATGCAAATAGCTTCATTCATACTCAAAAGATGCCTCTGAAGATAATATTTCC
TGTTGTGATCAGCTGTACCAACTGCAATTGAATCTGCAGCCCCAAGTTCTTCTCCATATC
CGTTTTCCATTACCATAATTTCTGGGTTGCCATACTTATCCTTGATGTACTTCAAAAGAC
TTCTAAAGCCTCTCGCAAAAACGGGAAGTGCACCGGTGATAGGCTTGCTACCAATGCTGT
AATTGTACGCATTCTTAGTTTCCCAGTTAACTAGAGAATCTTGCATCCATCTTGGTTTAG
AAGGATCTGGCTTCTCCAGATAGTTTGAAAACATTGAAGTATAGTAGTTGAGTCCAACGA
AATCGGCTGAGTTTTTCAGTTTCGCTTTCTGTTCATCGGTAAATTTAGGTAATCTGTGTC
CAACAATATCTTTCATGATCTGTGGATAATCTCCATACATAGTTGTGTCCAGATGCCATC
CCAAAACAAAGTCAAGTGCACGGTCTATGGACGCACCATCCTGTGAATCAGCAAGGTCAT
GTGGTTCAAACC

QA 1 732 1 732
DS 



CO CL325Contig2 1441 4 12 U
GGATACCAAAACATATTCTTGAAGAAAACGAAAACAAACTAAAAGGCAAAAATGGCTTTG
CATAAGTTTCCTCTCATGGGGCTGCTTTTGCTCCTAACCGTCGTAGTCTCTCCGGCAATA
GCCGATGGACCTGTTTGCCCGACGACGACCAAACTAAGCCGGGCAAGTTTCCCTGAAGGT
TTTTTATTTGGCACGGCTACGGCAGCATATCAGGTTGAAGGTGCAGTGAATGAAACTTGT
CGTGGACCGTCCTTATGGGATATCTACTGCAAGAGATTTCCATCCAGATGCAACAACGAT
AACGGCGATGTGGCCGTTGATTTCTTCCATCGTTATAAGGAAGATATCCAACTAATGAAG
AATCTGAACACAGATGCCTTCAGAATGTCTATCGCATGGCCAAGAATATTTCCTCATGGG
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TTAGAGGACGAATATGGCGGCTTTTTAAGTGAAAGAATTGTAAAAGATTTCCGAGAATAT
GCAGATTTTGTTTTCCAAGAATATGGTGGAAAAGTGAAACATTGGATCACTTTCAACGAA
CCATGGGTTTTCTCCCACGCTGGTTATGATGTAGGCAAGAAAGCACCAGGACGTTGCTCA
AAGTATGTCAAAGAAGAATGTCGCGAAGGACGATCAGGATTCGAGGCTTACCTTGTCACT
CACAATCTCCTTAACTCTCACGCAGAAGCGGTTGAAGCTTTCCGACAATGCGAAAAGTGT
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GATTCACAGGATGGTGCGTCCATAGACCGTGCACTTGACTTTGTTTTGGGATGGCATCTG
GACACAACTATGTATGGAGATTATCCACAGATCATGAAAGATATTGTTGGACACAGATTA
CCTAAATTTACCGATGAACAGAAAGCAAAACTGAAAAACTCAGCCGATTTCGTTGGACTC
AACTACTATACTTCAATGTTTTCAAACTATCTGGAGAAGCCAGATCCTTCTAAACCAATA
TGGATGCAAGATTCTCTAGTTAACTGGGAAACTAAGAATGCGTACAATTACAGCATTGGT
AGCAAGCCTATCACCGGTGCACTTCCCGTTTTTGCGAGAGGCTTTAGAAGTCTTTTGAAG
TACATCAAGGATAAGTATGGCAACCCAGAAATTATGATAATGGAAAACGGATATGGAGAA
GACTTGGGGCTGCAGATTCAATTGCAGTTGGTACAGCTGATCACAACAGAAATATTTCTC
AGAGCATCTTTTGAGTATGATGAGCTATTTGCATCGACAGTGATGTTACTGGATACTTTG
T


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1G889TF U 2
AF RS1EP25TF U 1
AF RS1GQ06TF U 622
AF RS1FM15TF U 622
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BS 641 694 RS1EP25TF
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BS 696 737 RS1EP25TF
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BS 1321 1365 RS1FM15TF
BS 1366 1366 RS1GQ06TF
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TTTTATTTGGCACGGCTACGGCAGCATATCAGGTTGAAGGTGCAGTGAATGAAACTTGTC
GTGGACCGTCCTTATGGGATATCTACTGCAAGAGATTTCCATCCAGATGCAACAACGATA
ACGGCGATGTGGCCGTTGATTTCTTCCATCGTTATAAGGAAGATATCCAACTAATGAAGA
ATCTGAACACAGATGCCTTCAGAATGTCTATCGCATGGCCAAGAATATTTCCTCATGGGA
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TCCTAAAAAATGGTATAACTCCGTTCGTGACAGTTTTTCACTGGGACACTCCACAAGATT
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CAGATTTTGTTTTCCAAGAAT

QA 1 621 1 621
DS 

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CATAAGTTTCCTCTCATGGGGCTGCTTTTGCTCCTAACCGTCGTAGTCTCTCCGGCAATA
GCCGATGGACCTGTTTGCCCGACGACGACCAAACTAAGCCGGGCAAGTTTCCCTGAAGGT
TTTTTATTTGGCACGGCTACGGCAGCATATCAGGTTGAAGGTGCAGTGAATGAAACTTGT
CGTGGACCGTCCTTATGGGATATCTACTGCAAGAGATTTCCATCCAGATGCAACAACGAT
AACGGCGATGTGGCCGTTGATTTCTTCCATCGTTATAAGGAAGATATCCAACTAATGAAG
AATCTGAACACAGATGCCTTCAGAATGTCTATCGCATGGCCAAGAATATTTCCTCATGGG
AGAAAGGAGAAAGGAGTGAGTCAAGCTGGTGTGCAATTTTACCACGACCTCATCGACGAG
CTCCTAAAAAATGGTATAACTCCGTTCGTGACAGTTTTTCACTGGGACACTCCACAAGAT
TTAGAGGACGAATATGGCGGCTTTTTAAGTGAAAGAATTGTAAAAGATTTCCGAGAATAT
GCAGATTTTTTTTTCCAAGAATATGGTGGAAAAGTGAAAAATTGGATCACTTTCAACGAA
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AAGTATGTCAAAGAAGA
T

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DS 

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G
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CACATAGTCCGGCTTGGTTTGGACCACATGACCTTGCTGATTCACAGGATGGTGCGTCCA
TAGACCGTGCACTTGACTTTGTTTTGGGATGGCATCTGGACACAACTATGTATGGAGATT
ATCCACAGATCATGAAAGATATTGTTGGACACAGATTACCTAAATTTACCGATGAACAGA
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CAAACTATCTGGAGAAGCCAGATCCTTCTAAACCAATATGGATGCAAGATTCTCTAGTTA
ACTGGGAAACTAAGAATGCGTACAATTACAGCATTGGTAGCAAGCCTATCACCGGTGCAC
TTCCCGTTTTTGCGAGAGGCTTTAGAAGTCTTTTGAAGTACATCAAGGATAAGTATGGCA
ACCCAGAAATTATGATAATGGAAAACGGATATGGAGAAGACTTGGGGCTGCAGATTCA*T
TGCAGTTGGTACAGCTGATCACAACAGAAATATTTCT
TC

QA 2 758 2 758
DS 

RD RS1FM15TF 820 0 0
G
ATGGTGGAAAAGTGAAACATTGGATCACTTTCAACGAACCATGGGTTTTCTCCCACGCTG
GTTATGATGTAGGCAAGAAAGCACCAGGACGTTGCTCAAAGTATGTCAAAGAAGAATGTC
GCGAAGGACGATCAGGATTCGAGGCTTACCTTGTCACTCACAATCTCCTTAACTCTCACG
CAGAAGCGGTTGAAGCTTTCCGACAATGCGAAAAGTGTAAAGGTGGTAGGATCGGTATAG
CACATAGTCCGGCTTGGTTTGGACCACATGACCTTGCTGATTCACAGGATGGTGCGTCCA
TAGACCGTGCACTTGACTTTGTTTTGGGATGGCATCTGGACACAACTATGTATGGAGATT
ATCCACAGATCATGAAAGATATTGTTGGACACAGATTACCTAAATTTACCGATGAACAGA
AAGCAAAACTGAAAAACTCAGCCGATTTCGTTGGACTCAACTACTATACTTCAATGTTTT
CAAACTATCTGGAGAAGCCAGATCCTTCTAAACCAATATGGATGCAAGATTCTCTAGTTA
ACTGGGAAACTAAGAATGCGTACAATTACAGCATTGGTAGCAAGCCTATCACCGGTGCAC
TTCCCGTTTTTGCGAGAGGCTTTAGAAGTCTTTTGAAGTACATCAAGGATAAGTATGGCA
ACCCAGAAATTATGATAATGGAAAACGGATATGGAGA*GACTTGGGGCTGCAGATTCAAT
TGCAGTTGGTACAGCTGATCACA*CAGAAATATTTCTCAGAGCATCTTTTGAGTATGATG
AGCTATTTGCATCGACAGTGATGTTACTGGATACTTTGT

QA 2 820 2 820
DS 



AS 1 9

CO CL326Contig1 1519 9 33 U
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TATTTTCATTTATTCGGCTCTCATCCTCAGATCAGACCCACCTCAAAGGTTTTTCGTTTG
ATTAAAGTGTGTAGCAAAGCAATAGCCATGGACGGTGGAGCGGAAGGAACTCAGCAGCCT
CACCTTATTCTAGCTCACAAGCTCTTCCTCCTCACTCATCCCGATGTCCAGGACATCGAG
AAAGTCCAGCTCAAGTCTGACGTCTTGGATTCCATCAAATCCGATGGTATGGCTCCATTG
TACGAAACCCTAACGGCGTCTTCAGTGCTGGAATTGGATCAGAGCTTGTTAGATTCTATG
CGTGCCACCAACGAGGAAGAGCTTAAAAAGCTCGACGACAAGATTGCAGATGCTGAAGAA
AATTTGGGCGAAAGTGAAGTCCGTGAAGCTCATCTTGCTAAGGCTCTATATTTCGTCAGG
ATTAGCGATAAGGAGAAAGCTTTGGAGCAACTGAAACTCACTGAAGGAAAAACCGTCGCT
GTTGGCCAAAAAATGGACCTTGTGTTCTACACCTTGCAGCTTGCCTTTTTCTACATGGAT
TTCGACCTTGTCTCCAAAAGCATTGACAAAGCTAAAAAGTTGTTTGAAGAGGGTGGTGAC
TGGGAGAGGAAGAACAGGCTAAAGGTCTATGAAGGCTTGTATTGCATGTCCACCAGAAAT
TTTAACAAGGCTGCCAGCTTATTTTTGGATTCTATCTCAACCTTCACGACTTATGAGATT
TTTCCTTACGAGACCTTCATTTTCTACACCGTCCTGACAAGCATCATAACTCTCGACAGA
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GACTTCTTACTTAACCGGATCCAGAAGCTGTCACGAGTCATCGATCTGTGAGCGTGTCTC
ACATGTTTCTGTTTAGCACTTTTCTTCAAAACTGCAACGACTTGCAAAACTCAAATGGGT
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CAAATAGCAAGTTTTATCC


BQ
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15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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BS 537 537 RS1FK43TF
BS 538 616 RS1AX96TF
BS 617 617 RS1FK43TF
BS 618 624 RS1AX96TF
BS 625 638 RS1FK43TF
BS 639 704 RS1GU63TF
BS 705 705 RS1ER27TF
BS 706 729 RS1GU63TF
BS 730 730 RS1CP10TF
BS 731 782 RS1GU63TF
BS 783 783 RS1CP10TF
BS 784 798 RS1GU63TF
BS 799 853 RS1CP10TF
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BS 1188 1188 RS1DY95JQ
BS 1189 1193 RS1CP10TF
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BS 1467 1501 RS1ER27JQ
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TATTTTCATTTATTCGGCTCTCATCCTCAGATCC*ACCCACCTCAAAGGTTTTTCGTGTG
ATTAAAGTGTGTAGCAAAGCAATAGCCATGGACGGTGGAGCGGAAGGAACTTAGCAGCCT
CACCTTATTCTAGCTCACAAGCTCTTCCTCTTCACTCATCCCGATGTCCAGGACATCGAG
AAAGTCCAGCTCAAGTCTGACGTCTTGGATTCCATCAAATCCGATGGTATGGCTCCATTG
TACGAAACCCTAACGGCGTCTTCTGTGCTGGAATTGGATCAGAGCTTGTTAGATTCTATG
CGTGCCACCAACGAGGAAGAGCTTAAAAAGCTCGACGACAAGATTGCAGATGCTGAAGAA
AATTTGGGCGAAAGTGAAGTCCGTGAAGCTCATCTTGCTAAGGCTCTGTATTTCGTCAGG
ATTAGCGATAAGGAGAAAGCTTTGGAGCAACTGAAACTCACTGAAGGAAAAACCGTTGCT
GTTGGCCAAAAAATGGACCTTGTGTTCTACACCTTGCAGCTTGCCTTTTTCTACATGGAT
TTCGACCTTGTCTCCAGAAGCATT

QA 1 624 1 624
DS 

RD RS1FK43TF 569 0 0
GG
ATTCGTCTCTTATCCTCCTCTCAGATCCAGCTCAA*GGTTTTTCGTTTGATTAAAGTGTG
TAGCAAAGCAATAGCCATGGACGGTGGAGCGGAAGGAACTCAGCAGCCTCACCTTATTCT
AGCTCACAAGCTCTTCCTCCTCACTCATCCCGATGTCCAGGACATCGAGAAAGTCCAGCT
CAAGTCTGACGTCTTGGATTCCATCAAATCCGATGGTATGGCTCCATTGTACGAAACCCT
AACGGCGTCTTCAGTGCTGGAATTGGATCAGAGCTTGTTAGATTCTATGCGTGCTACCAA
CGAGGCAGAGCTTAAAAAGCTCGACGACAAGATTGCAGATGCTGAAGAAAATTTGGGCGA
AAGTGAAGTCCGTGAAGCTCATCTTGCTAAGGCTCTATATTTCGTCAGGATTAGTGATAA
GGAGAAAGCTTTGGAGCAACTGAAACTCACTGAAGGAAAAACCGTCGCTGTTGGCCAAAA
AATGGACCTTGTGTTCTACACCTTGCAGCTTGCCTTTTTCTACATGGATTTCGACCTTGT
GTCCAAAAGCATTGACAAAGCTAAAAA

QA 3 569 3 569
DS 

RD RS1ER27TF 615 0 0
TTTTTCGCG
TGATTAAAGTGTGTAGCAAAGCAATAGCCATGGACGGTGGAGCGGAAGGAACTCAGCAGC
CTCACCTTATTCTAGCTCACAAGCTCTTCCTCTTCACTCATCCCGATGTCCAGGACATCG
AGAAAGTCCAGCTCAAGTCTGACGTCTTGGATTCCATCAAATCCGATGGTATGGCTCCAT
TGTACGAAACCCTAACGGCGTCTTCTGTGCTGGAATTGGATCAGAGCTTGTTAGATTCTA
TGCGTGCCACCAACGAGGAAGAGCTTAAAAAGCTCGACGACAAGATTGCAGATGCTGAAG
AAAATTTGGGCGAAAGTGAAGTCCGTGAAGCTCATCTTGCTAAGGCTCTGTATTTCGTCA
GGATTAGCGATAAGGAGAAAGCTTTGGAGCAACTGAAACTCACTGAAGGAAAAACCGTTG
CTGTTGGCCAAAAAATGGACCTTGTGTTCTACACCTTGCAGCTTGCCTTTTTCTACATGG
ATTTCGACCTTGTCTCCAAAAGCATTGACAAAGCTAAAAAGTTGTTTGAAGAGGTTGGTG
ACTGGGAGAGGAAGAACAGGCTAAAGGTCTATGAAGGCTTGTATTGCATGTCCACCAGAA
ATTTTA

QA 10 615 10 615
DS 

RD RS1GU63TF 689 0 0
TTTTTCGTTTGATTAAAGTGTGTAGCAAAGCAATAGCCATGGACGGTGGAGCGGAAGGAA
CTCAGCAGCCTCACCTTATTCTAGCTCACAAGCTCTTCCTCCTCACTCATCCCGATGTCC
AGGACATCGAGAAAGTCCAGCTCAAGTCTGACGTCTTGGATTCCATCAAATCCGATGGTA
TGGCTCCATTGTACGAAACCCTAACGGCGTCTTCAGTGCTGGAATTGGATCAGAGCTTGT
TAGATTCTATGCGTGCTACCAACGAGGCAGAGCTTAAAAAGCTCGACGACAAGATTGCAG
ATGCTGAAGAAAATTTGGGCGAAAGTGAAGTCCGTGAAGCTCATCTTGCTAAGGCTCTAT
ATTTCGTCAGGATTAGTGATAAGGAGAAAGCTTTGGAGCAACTGAAACTCACTGAAGGAA
AAACCGTCGCTGTTGGCCAAAAAATGGACCTTGTGTTCTACACCTTGCAGCTTGCCTTTT
TCTACATGGATTTCGACCTTGTGTCCAAAAGCATTGACAAAGCTAAAAAGTTGTTTGAAG
AGGGTGGTGACTGGGAGAGGAAGAACAGGCTAAAGGTCTATGAAGGCTTGTATTGTATGT
CCACCAGAAATTTTAACAAG*CTGCCAGCTTATTTTTGGATTCTATCTCAACCTTCACGA
CTTATGAGATTTT*CCTTACGAGACCTTC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1CP10TF 608 0 0
TTTTTCTACATGGATTTCGACCTTGTCTCCAAAAGCATTGACAAAGCTAAAAAGTTGTTT
GAAGAGGGTGGTGACTGGGAGAGGAAGAACAGGCTAAAGGTCTATGAAGGCTTGTATTGC
ATGTCCACCAGAAATTTTAACAAGGCTGCCAGCTTATTTTTGGATTCTATCTCAACCTTC
ACGACTTATGAGATTTTTCCTTACGAGACCTTCATTTTCTACACCGTCCTGACAAGCATC
ATAACTCTCGACAGAGTTTCGCTTAAGCGGAAGGTTGTTGACGCACCTGAGATCTTAACC
GTGCTTGGGAAGATACCATTCCTTTCTGAGTTCCTCAACTCCTTGTACGAGTGCCAATAC
AAGGCGTTTTTCTCAGCATTCGCTGGAATGGCGGAGCAGATAAAGTTCGACCGCTATTTG
AACCCACATTTCCGGTTCTATATGAGGGAAGTGAGAACGGTGGTGTACTCTCAGTTTTTG
GAGTCTTACAAGAGCGTAACGGTGGATGCGATGGCAAATGCCTTTGGTGTTTCCGTGGAT
TTCATCGATCAGGAGCTGTCACGCTTCATTGCAGCTGGGAAGCTTCACTGCAAGATAGAC
AAAGTTGC

QA 1 608 1 608
DS 

RD RS1DY95JQ 765 0 0
TTGC
ATGTCCACCAGAAATTTTAACAAGGCTGCCAGCTTATTTTTGGATTCTATCTCAACCTTC
ACGACTTATGAGATTTTTCCTTACGAGACCTTCATTTTCTACACCGTCCTGACAAGCATC
ATAACTCTCGACAGAGTTTCGCTTAAGCAGAAGGTTGTTGACGCACCTGAGATCTTAACC
GTGCTTGGGAAGATACCATTCCTTTCTGAGTTCCTCAACTCCTTGTACGAGTGCCAATAC
AAGGCGTTTTTCTCAGCATTCGCTGGAATGGCGGAGCAGATAAAGTTCGACCGCTATTTG
AACCCACATTTCCGGTTCTATATGAGGTAAGTGAGAACGGTGGTGTACTCTCAGTTTTTG
GAGTCTTACAAGAGCGTAACGGTGGATGCGATGGCAAATGCCTTTGGTGTTTCCGTGGAT
TTCATCGATCAGGAGCTGTCACGCTTCATTGCAGCTGGGAAGCTTCACTGCAAGATAGAC
AAGGTTGCAGGTGTTTTGGAGACTAACCGTCCAGATGCAAAGAATGCACTTTACCAGGCA
ACAATCAAGCAAGGGGACTTCTTACTTAACCGGATCCAGAAGCTGTCACGAGTCATCGAT
CTGTGAGCGTGTCTCACATGTTTCTGTTTAGCACTTTTCTTCAAAACTGCAACGACTTGC
AAAACTCAAATGGGTAGAATCTTAAGGTGTGAGAAACGATGTTTGAGATCAACACCCGCC
TGTTCTTTCTTATGACTCTAGTTCTTATCTCTTTTGAATCT

QA 5 765 5 765
DS 

RD RS1AX96JQ 675 0 0
TCATTTTCTACACCGTCCTGACAAGCATCATAACTCTCGACAGAGTTTCGCTTAAGCAGA
AGGTTGTTGACGCACCTGAGATCTTAACCGTGCTTGGGAAGATACCATTCCTTTCTGAGT
TCCTCAACTCCTTGTACGAGTGCCAATACAAGGCGTTTTTCTCAGCATTCGCTGGAATGG
CGGAGCAGATAAAGTTCGACCGCTATTTGAACCCACATTTCCGGTTCTATATGAGGGAAG
TGAGAACGGTGGTGTACTCTCAGTTTTTGGAGTCTTACAAGAGCGTAACGGTGGATGCGA
TGGCAATTGCCTTTGGTGTTTCCGTGGATTTCATCGATCAGGAGCTGTCACGCTTCATTG
CAGCTGGGAAGCTTCACTGCAAGATAGACAAGGTTGCAGGTGTTTTGGAGACTAACCGTC
CAGATGCAAAGAATGCACTTTACCAGGCAACAATCAAGCAAGGGGACTTCTTACTTAACC
GGATCCAGAAGCTGTCACGAGTCATCGATCTGTGAGCGTGTCTCACATGTTTCTGTTTAG
CACTTTTCTTCAAAACTGCAACGACTTGCAAAACTCAAATGGGTAGAATCTTAAGGTGTG
AGAAACGATGTTTGAGATCAACACCCGCCTGTTCTTTCTTATGACTCTAGTTCTTATCTC
TTTTGAATCT
AGTTG

QA 1 670 1 670
DS 

RD RS1ER27JQ 718 0 0
CCTTACGAGACCTTCATTTTCTACACCGTCCTGACAAGCATCATAACTCTCGACAGAGTT
TCGCTTAAGCAGAAGGTTGTTGACGCACCTGAGATCTTAACCGTGCTAGGGAAGATACCA
TTCCTTTCTGAGTTCCTCAACTCCTTGTACGAGTGCCAATACAAGGCGTTTTTCTCAGCA
TTCGCTGGAATGGCGGAGCAGATAAAGTTCGACCGCTATTTGAACCCACATTTCCGGTTC
TATATGAGGGAAGTGAGAACGGTGGTGTACTCTCAGTTTTTGGAGTCTTACAAGAGCGTA
ACGGTGGATGCGATGGCAAATGCCTTTGGTGTTTCCGTGGATTTCATCGATCAGGAGCTG
TCACGCTTCATTGCAGCTGGGAAGCTTCACTGCAAGATAGACAAGGTTGCAGGTGTTTTG
GAGACTAACCGTCCAGATGCAAAGAATGCACTTTACCAGGCAACAATCAAGCAAGGTGAC
TTCTTACTTAACCGGATCCAGAAGCTGTCACGAGTCATCGATCTGTGAGCGTGTCTCACA
TGTTTCTGTTTAGCACTTTTCTTCAAAACTGCAACGACTTGCAAAACTCAAATGGGTAGA
ATCTTAAGGTGTGAGAAACGATGTTTGAGATCAACACCCGCCTGTTCTTTCTTATGACTC
TAGTTCTTATCTCTTTTGAATCTAGTTGATTTGTTTCAGTGGTGAACTTCCCACGAGC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1FK43JQ 605 0 0
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GGCGGAGCAGATAAAGTTCGACCGCTATTTGAACCCACATTTCCGGTTCTATATGAGGGA
AGTGAGAACGGTGGTGTACTCTCAGTTTTTGGAGTCTTACAAGAGCGTAACGGTGGATGC
GATGGCAAATGCCTTTGGTGTTTCCGTGGATTTCATCGATCAGGAGCTGTCACGCTTCAT
TGCAGCTGGGAAGCTTCACTGCAAGATAGACAAGGTTGCAGGTGTTTTGGAGACTAACCG
TCCAGATGCAAAGAATGCACTTTACCAGGCAACAATCAAGCAAGGGGACTTCTTACTTAA
CCGGATCCAGAAGCTGTCACGAGTCATCGATCTGTGAGCGTGTCTCACGTGTTTCTGTTT
AGCACTTTTCTTCAAAACTGCAACGACTTGCAAAACTCAAATGGGTAGAATCTTAAGGTG
TGAGAAACGATGTTTGAGATCAACACCCGCCTGTTCTTTCTTATGACTCTAGTTCTTATC
TCTTTTGAATCTAGTTGATTTGTTTCAGTGGTGAACTTCCCACGAGCAAATAGCAAGTTT
TATCC

QA 1 605 1 605
DS 



AS 2 9

CO CL327Contig1 737 4 6 U
GGAAAGGGATTCTGTAATCCATGATATATATAAGTTTATTATTACATCCCAAAAGTCATG
TTCTTGGATAAAACACAAACAACATAACAACTCGAATCAACAACCACTATGAACCATGAT
ATCAACGCACATTTCTCCTCGCAAAATGTAACTTTCAAGCTTGCTTTTACTTAGATCCAT
ACCTCTCAACCCTCTCATCAATCCACTCTCTCATATCCTTCAACACGATTGCAACATTCT
CATCTGGCTCTCCCTGAATCAATGAATGGTACATCCCATCATACAGCTTCAGTGTTTTAT
CAGCGCTAGATGCCTTCTCATATAGTAGCTTTGACGATGAAGGACACGTCACTCCATCAG
CTGTCCCGTGCACCGTCAGAAACGGAATAGTTACTCTCCCGAAGTTCTCCTGCACGTATA
GAGTCTTCCTTAGTAACTCTCTCATTGTTCCAACTCTAGGCTTCCCTGTGTACCTTTGTG
GGTTAGCTGCGATGATCTTGAGCTTTTCCGGGTCATGGATAGCTTTGCCAACCATCTTGT
TATCCGGCATTGCAGCCCACGTGTCAGCCAAGCCAAAGAGGAGACCGTAGGCGAAAAGAT
GAGTCTTGCTCGGTTTCATATCCTCCGGGATAACAAAGAGAGGAGCCGAAAAGATCAAAC
CGGTCCAAGTATCCGGTTCGGATTGAAAGTACATGAGAAGTGTGGCAAGACCTCCCATAG
ATTCACCAAAGAGGAAA


BQ
20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GX56JQ U 1
AF RS1B511JQ U 1
AF RS1BM51JQ U 1
AF RS1BH07JQ U 1
BS 1 54 RS1B511JQ
BS 55 57 RS1BH07JQ
BS 58 431 RS1B511JQ
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BS 433 719 RS1B511JQ
BS 720 737 RS1BH07JQ

RD RS1GX56JQ 477 0 0
A
GAAAGGGATTCTGTAATCCATGATATATATAAGTTTATTATTACATCCCAAAAGTCATGT
TCTTGGATAAAACACAAACAACATAACAACTCGAATCAACAACCACTATGAACCATGATA
TCAACGCACATTTCTCCTCGCAAAATGTAACTTTCAAGCTTGCTTTTACTTAGATCCATA
CCTCTCAACCCTCTCATCAATCCACTCTCTCATATCCTTCAACACGATTGCAACATTCTC
ATCTGGCTCTCCCTGAATCAATGAATGGTACATCCCATCATACAGCTTCAGTGTTTTATC
AGCGCTAGATGCCTTCTCATATAGTAGCTTTGACGATGAAGGACACGTCACTCCATCAAC
TGTCCCGTGCACCGTCAGAAACGGAATAGTTACTCTCCCGAAGTTCTCCTGCACGTATAG
AGTCTTCCTTATTAACTCTCTCATTGTTCCAACTCTAGGCTTCCCTGTGTACCTTT

QA 2 477 2 477
DS 

RD RS1B511JQ 719 0 0
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TTCTTGGATAAAACACAAACAACATAACAACTCGAATCAACAACCACTATGAACCATGAT
ATCAACGCACATTTCTCCTCGCAAAATGTAACTTTCAAGCTTGCTTTTACTTAGATCCAT
ACCTCTCAACCCTCTCATCAATCCACTCTCTCATATCCTTCAACACGATTGCAACATTCT
CATCTGGCTCTCCCTGAATCAATGAATGGTACATCCCATCATACAGCTTCAGTGTTTTAT
CAGCGCTAGATGCCTTCTCATATAGTAGCTTTGACGATGAAGGACACGTCACTCCATCAG
CTGTCCCGTGCACCGTCAGAAACGGAATAGTTACTCTCCCGAAGTTCTCCTGCACGTATA
GAGTCTTCCTTGGTAACTCTCTCATTGTTCCAACTCTAGGCTTCCCTGTGTACCTTTGTG
GGTTAGCTGCGATGATCTTGAGCTTTTCCGGGTCATGGATAGCTTTGCCAACCATCTTGT
TATCCGGCATTGCAGCCCACGTGTCAGCCAAGCCAAAGAGGAGACCGTAGGCGAAAAGAT
GAGTCTTGCTCGGTTTCATATCCTCCGGGATAACAAAGAGAGGAGCCGAAAAGATCAAAC
CGGTCCAAGTATCCGGTTCGGATTGAAAGTACATGAGAAGTGTGGCAAGACCTCCCATA

QA 1 719 1 719
DS 

RD RS1BM51JQ 719 0 0
GGAAAGGGATTCTGTAATCCATGATATATATAAGTTTATTATTACATCCCAAAAGTCATG
TTCTTGGATAAAACACAAACAACATAACAACTCGAATCAACAACCACTATGAACCATGAT
ATCAACGCACATTTCTCCTCGCAAAATGTAACTTTCAAGCTTGCTTTTACTTAGATCCAT
ACCTCTCAACCCTCTCATCAATCCACTCTCTCATATCCTTCAACACGATTGCAACATTCT
CATCTGGCTCTCCCTGAATCAATGAATGGTACATCCCATCATACAGCTTCAGTGTTTTAT
CAGCGCTAGATGCCTTCTCATATAGTAGCTTTGACGATGAAGGACACGTCACTCCATCAG
CTGTCCCGTGCACCGTCAGAAACGGAATAGTTACTCTCCCGAAGTTCTCCTGCACGTATA
GAGTCTTCCTTAGTAACTCTCTCATTGTTCCAACTCTAGGCTTCCCTGTGTACCTTTGTG
GGTTAGCTGCGATGATCTTGAGCTTTTCCGGGTCATGGATAGCTTTGCCAACCATCTTGT
TATCCGGCATTGCAGCCCACGTGTCAGACAAGCCAAAGAGGAGACCGTAGGCGAAAGGAT
GAGTCTTGCTCGGTTTCATATCCTCCGGGATAACAAAGAGAGGAGCCGAAAAGATCAAAC
CGGTCCAAGTATCCGGTTCGGATTGAAAGTACATGAGAAGTGTGGCAAGACCTCCCATA

QA 1 719 1 719
DS 

RD RS1BH07JQ 737 0 0
GGAAAGGGATTCTGTAATCCATGATATATATAAGTTTATTATTACATCCCAAAAGTCATG
TTCTTGGATAAAACACAAACAACATAACAACTCGAATCAACAACCACTATGAACCATGAT
ATCAACGCACATTTCTCCTCGCAAAATGTAACTTTCAAGCTTGCTTTTACTTAGATCCAT
ACCTCTCAACCCTCTCATCAATCCACTCTCTCATATCCTTCAACACGATTGCAACATTCT
CATCTGGCTCTCCCTGAATCAATGAATGGTACACCCCATCATACAGCTTCAGTGTTTTAT
CAGCGCTAGATGCCTTCTCATATAGTAGCTTTGACGATGAAGGACACGTCACTCCATCAG
CTGTCCCGTGCACCGTCAGAAACGGAATAGTTACTCTCCCGAAGTTCTCCTGCACGTATA
GAGTCTTCCTTAGTAACTCTCTCATTGTTCCAACTCTAGGCTTCCCTGTGTACCTTTGTG
GGTTAGCTGCGATGATCTTGAGCTTTTCCGGGTCATGGATAGCTTTGCCAACCATCTTGT
TATCCGGCATTGCAGCCCACGTGTCAGCCAAGCCAAAGAGGAGACCGTAGGCGAAAAGAT
GAGTCTTGCTCGGTTTCATATCCTCCGGGATAACAAAGAGAGGAGCCGAAAAGATCAAAC
CGGTCCAAGTATCCGGTTCGGATTGAAAGTACATGAGAAGTGTGGCAAGACCTCCCATAG
ATTCACCAAAGAGGAAA

QA 1 737 1 737
DS 



CO CL327Contig2 840 5 5 U
GGACTTTTCCAAACTCCACCAACCATTCAGTGAAGAAGAAGAAAAGGAAGCAAAAACGAT
GTCGTCTGAGGGGGATAAGTCAACAAATTCAGCTCCTCCGGCGACACCGCCGCCGTATTT
CTGGGGAGACATGCCGGAGGAAGAGTACTACACATCTCAAGGTGTGCGCAACACCAAATC
CTACTTCGAAACACCCAACGGCAAGCTCTTCACGCAGAGCTTCCTTCCCTTAGATGGTGA
GATCAAAGGGACGGTTTACATGTCTCACGGGTACGGATCCGACACGAGCTGGATGTTCCA
GAAGATCTGCATGAGTTTCTCCAATTGGGGCTACGCCGTTTTCGCCGCCGATCTTCTCGG
TCACGGCCGCTCCGATGGCATCCGCTGCTACTTGGGTGATATGGAGAAAGTTGCAGCAAC
ATCATTGTCATTCTTTAAGCATGTACGTTACAGCGAGCCGTATAAGCATCTCCCTGCTTT
CCTCTTTGGTGAATCTATGGGAGGTCTTGCCACACTTCTCATGTACTTTCAATCCGAACC
GGATACTTGGACCGGTTTGATCTTTTCGGCTCCTCTCTTTGTTATCCCGGAGGATATGAA
ACCGAGCAAGACTCATCTTTTCGCCTACGGTCTCCTCTTTGGCTTGGCTGACACGTGGGC
TGCAATGCCGGATAACAAGATGGTTGGCAAAGCTATCCATGACCCGGAAAAGCTCAAGAT
CATCGCAGCTAACCCACAAATGTACACAGGAAGCCTAGAGTTGGACAATGAGAGAGTACT
AAGAGACTCTATACGTGCAGGAGACTTCTGAGAGTACTATTCCGTTTCTGACGTGCACGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GX56TF U 1
AF RS1BH07TF U 215
AF RS1B511TF U 31
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AF RS1GF16TF U 1
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QA 1 689 1 689
DS 

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G
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AGCCGTATAAGCATCTCCCTGCTTTCCTCTTTGGTGAATCTATGGGAGGTCTTGCCACAC
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TCTTTGGCTTGGCTGACACGTGGGCTGCAATGCCGGATAACTAGATGGTTGGCAAAGCTA
TCCATGACCCGGAAAAGCT

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DS 

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G
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TACGGATCCGACACGAGCTGGATGTTCCAGAAGATCTGCATGAGTTTCTCCAATTGGGGC
TACGCCGTTTTCGCCGCCGATCTTCTCGGTCACGGCCGCTCCGATGGCATCCGCTGCTAC
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AGCGAGCCGTATAAGCATCTCCCTGCTTTCCTCTTTGGTGAATCTATGGGAGGTCTTGCC
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CCTCTCTTTGTTATCCCGGAGGATATGAAACCGAGCAAGACTCATCTTTTCGCCTACGGT
CTCCTCTTTGGCTTGGCTGACACGTGGGCTGCAATGCCGGATAACAAGATGGTTGGCAAA
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QA 2 715 2 715
DS 

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A
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TTCCCTTAGATGGTGAGATCAAAGGGACGGTTTACATGTCTCACGGGTACGGATCCGACA
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CCGCCGATCTTCTCGGTCACGGCCGCTCCGATGGCATCCGCTGCTACTTGGGTGATATGG
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ACTTTCAATCCGAACCGGATACTTGGACCGGTTTGATCTTTTCGGCTCCTCTCTTTGTTA
TCCCGGAGGATATGAAACCGAGCAAGACTCATCCTTTCGCCTACGGTCTCCTCTTTGGCT
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QA 2 702 2 702
DS 

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CTGGGGAGACATGCCGGAGGAAGAGTACTACACATCTCAAGGTGTGCGCAACACCAAATC
CTACTTCGAAACACCCAACGGCAAGCTCTTCACGCAGAGCTTCCTTCCCTTAGATGGTGA
GATCAAAGGGACGGTTTACATGTCTCACGGGTACGGATCCGACACGAGCTGGATGTTCCA
GAAGATCTGCATGAGTTTCTCCAATTGGGGCTACGCCGTTTTCGCCGCCGATCTTCTCGG
TCACGGCCGCTCCGATGGCATCCGCTGCTACTTGGGTGATATGGAGAAAGTTGCAGCAAC
ATCATTGTCATTCTTTAAGCATGTACGTTACAGCGAGCCGTATAAGCATCTCCCTGCTTT
CCTCTTTGGTGAATCTATGGGAGGTCTTGCCACACTTCTCATGTACTTTCAATCCGAACC
GGATACTTGGACCGGTTTGATCTTTTCGGCTCCTCTCTTTGTTATCCCGGAGGATATGAA
ACCGAGCAAGACTCATCTTTTCGCCTACGGTCTCCTCTTTGGCTTGGCTGACACGTGGGC
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AAGAGACTCTATACGTGCAGGAGACTTCTGAGAGTACTATTCCGTTTCTGACGTGCACGG

QA 1 840 1 840
DS 



AS 2 10

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TT


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EJ37TF U 1
AF RS1EZ62TF U 1
AF RS1AH93TF U 51
AF RS1EJ37JQ C 1
BS 1 4 RS1EJ37JQ
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RD RS1EJ37TF 583 0 0
GGAA
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DS 

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GGAA
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QA 5 554 5 554
DS 

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TATAAATTTTGCGACAATTAATGTATGTTTAAACTGTT

QA 1 578 1 578
DS 

RD RS1EJ37JQ 662 0 0
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ATCTTTCTCGTAATTAGTGATGGTAAAAAAGATAAAGAGGATCTTCCGGATAAATATTGT
CCAAGAATAGAAGATATCGAAGGAAACTGCAAAGATAATGGCCGGAAAGTGTGTGCGAAG
TATATGACGTCAACTTATAAGTTGAATTATTTTAATTGCACATGTGACAACATCAACATG
TTACATAAGATCAAGCGTTATTGCGAATGTCAGTCACTATGTAGCGACCTCCCTCCACCT
TCACCGATCCATCCCCCCCCTGCT**GATCCATTCTCGTTAATTAACATCTCATTAGTCC
TTCCTAATAACAAATTAAAGTGAAGTTTTGAGACTTTGTAGTGTGGAGATCACACACAGA
TAAATTCTGTTAGTTGTCAATCTTTCTTTTGTAATAAAGTCATGAGGATATTTTATAACT
AGTATGAGTTTCTCAATCAATCTGTTTTCCAGATTTTGTAGAATACAGATTATAAATTTT
GCGACAATTAATGTATGTTTAAACTGTTAATATATTCTATAAATGAATAACTTTTAGAAC
TT

QA 1 662 1 662
DS 



CO CL328Contig2 583 6 11 U
TTTTCTACCAAATCTGGAAAATAGATTGATTGAGAAACTCATACTAGTTATAAAATATCC
TCATGACTTTATTACAAAAGAAAGATTGGTGACTAACAGAACTTATCTGTGTGTGATCTC
CACACTACAAAGTATCAGAACTTCACTTTAATTTGTTATCAGGAAGGACTAATGAGATGT
TATTTAACGAGAGTGGATCGGTGCAGGTGGAGGATGGATCGGTGAAGGTGGAGGCTGGTC
GGCACATAGTGACTGACATTCGCAATAACGCTTGATCTTATGTAACATGTTGATGTTGTT
ACATGTGCAATTAAAATAATTCAACTTATAAGTTGACGTCATAAACTTCGCACACACTTT
CCGTCCATTATCTTTGCAGTTTCCTTCGATATCTTCTAATCTTGGACAATATTTTTGTGG
AAGATCCTCTTTATCTTTTTTACCATCACTAATTACGAGAAAGATGAGAACACAAAAAGT
TATACACCAGGTAGAAGATCTCATGGTTAAAGAATAAAGATAGAAATGGTGATAAACAAT
CTTTTACTTGCAGAGTACTTTAACTTGTGTCTCTCTTTTGCCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 

AF RS1GW91JQ U 5
AF RS1GW91TF C 1
AF RS1AO79JQ U 28
AF RS1ED29JQ U 46
AF RS1ED29TF C 46
AF RS1AO79TFB C 28
BS 1 4 RS1GW91TF
BS 5 88 RS1GW91JQ
BS 89 89 RS1AO79JQ
BS 90 137 RS1GW91JQ
BS 138 138 RS1AO79JQ
BS 139 175 RS1GW91JQ
BS 176 176 RS1AO79JQ
BS 177 261 RS1GW91JQ
BS 262 262 RS1AO79JQ
BS 263 275 RS1GW91JQ
BS 276 583 RS1AO79JQ

RD RS1GW91JQ 271 0 0
CTACCAAATCTGGAAAATAGATTGATTGAGAAACTCATACTAGTTATAAAATATCCTCAT
GACTTTATTACAAAAGAAAGATTGCTGACTAACAGAACTTATCTGTGTGTGATCTCCACA
CTACAAAGTATCAAAACTTCACTTTAATTTGTTATCAGGAAGGACTAATGAAATGTTATT
TAACGAGAGTGGATCGGTGCAGGTGGAGGATGGATCGGTGAAGGTGGAGGCTGGTCGGCA
CATAGTGACTGACATTCCCAATAACGCTTGA

QA 1 271 1 271
DS 

RD RS1GW91TF 583 0 0
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TCATGACTTTATTACAAAAGAAAGATTGCTGACTAACAGAACTTATCTGTGTGTGATCTC
CACACTACAAAGTATCAGAACTTCACTTTAATTTGTTATCAGGAAGGACTAATGAGATGT
TATTTAACGAGAGTGGATCGGTGCAGGTGGAGGATGGATCGGTGAAGGTGGAGGCTGGTC
GGCACATAGTGACTGACATTCGCAATAACGCTTGATCTTATGTAACATGTTGATGTTGTT
ACATGTGCAATTAAAATAATTCAACTTATAAGTTGACGTCATAAACTTCGCACACACTTT
CCGTCCATTATCTTTGCAGTTTCCTTCGATATCTTCTAATCTTGGACAATATTTTTGTGG
AAGATCCTCTTTATCTTTTTTACCATCACTAATTACGAGAAAGATGAGAACACAAAAAGT
TATACACCAGGTAGAAGATCTCATGGTTAAAGAATAAAGATAGAAATGGTGATAAACAAT
CTTTTACTTGCAGAGTACTTTAACTTGTGTCTCTCTTTTGCCC

QA 1 583 1 583
DS 

RD RS1AO79JQ 556 0 0
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GGTGACTAACAGAACTTATCTGTGTGTGATCTCCACACTACAAAGTATCAGAACTTCACT
TTAATTTGTTATCAGGAAGGACTAATGAGATGTTATTTAACGAGAGTGGATCGGTGCAGG
TGGAGGATGGATCGGTGAAGGTGGAGGCTGGTCGGCACATAGTGACTGACATTCGCAATA
ACGCTTGATCTTATGTAACATGTTGATGTTGTTACATGTGCAATTAAAATAATTCAACTT
ATAAGTTGACGTCATAAACTTCGCACACACTTTCCGTCCATTATCTTTGCAGTTTCCTTC
GATATCTTCTAATCTTGGACAATATTTTTGTGGAAGATCCTCTTTATCTTTTTTACCATC
ACTAATTACGAGAAAGATGAGAACACAAAAAGTTATACACCAGGTAGAAGATCTCATGGT
TAAAGAATAAAGATAGAAATGGTGATAAACAATCTTTTACTTGCAGAGTACTTTAACTTG
TGTCTCTCTTTTGCCC

QA 1 556 1 556
DS 

RD RS1ED29JQ 538 0 0
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TCTGTGTGTGATCTCCACACTACAAAGTATCAGAACTTCACTTTAATTTGTTATCAGGAA
GGACTAATGAGATGTTATTTAACGAGAGTGGATCGGTGCAGGTGGAGGATGGATCGGTGA
AGGTGGAGGCTGGTCGGCACATAGTGACTGACATTCGCAATAACGCTTGATCTTATGTAA
CATGTTGATGTTGTTACATGTGCAATTAAAATAATTCAACTTATAAGTTGACGTCATAAA
CTTCGCACACACTTTCCGTCCATTATCTTTGCAGTTTCCTTCGATATCTTCTAATCTTGG
ACAATATTTTTGTGGAAGATCCTCTTTATCTTTTTTACCATCACTAATTACGAGAAAGAT
GAGAACACAAAAAGTTATACACCAGGTAGAAGATCTCATGGTTAAAGAATAAAGATAGAA
ATGGTGATAAACAATCTTTTACTTGCAGAGTACTTTAACTTGTGTCTCTCTTTTGCCC

QA 1 538 1 538
DS 

RD RS1ED29TF 538 0 0
AGTTGTAAAATATCCTCATGACTTTATTACAAAAGAAAGATTGGTGACTAACAGAACTTA
TCTGTGTGTGATCTCCACACTACAAAGTATCAGAACTTCACTTTAATTTGTTATCAGGAA
GGACTAATGAGATGTTATTTAACGAGAGTGGATCGGTGCAGGTGGAGGATGGATCGGTGA
AGGTGGAGGCTGGTCGGCACATAGTGACTGACATTCGCAATAACGCTTGATCTTATGTAA
CATGTTGATGTTGTTACATGTGCAATTAAAATAATTCAACTTATAAGTTGACGTCATAAA
CTTCGCACACACTTTCCGTCCATTATCTTTGCAGTTTCCTTCGATATCTTCTAATCTTGG
ACAATATTTTTGTGGAAGATCCTCTTTATCTTTTTTACCATCACTAATTACGAGAAAGAT
GAGAACACAAAAAGTTATACACCAGGTAGAAGATCTCATGGTTAAAGAATAAAGATAGAA
ATGGTGATAAACAATCTTTTACTTGCAGAGTACTTTAACTTGTGTCTCTCTTTTGCCC

QA 1 538 1 538
DS 

RD RS1AO79TFB 556 0 0
GATTGAGAAACTCATACTAGTTATAAAATATCCTCATGACTTTATTACAAAAGAAAGATT
GGTGACTAACAGAACTTATCTGTGTGTGATCTCCACACTACAAAGTATCAGAACTTCACT
TTAATTTGTTATCAGGAAGGACTAATGAGATGTTATTTAACGAGAGTGGATCGGTGCAGG
TGGAGGATGGATCGGTGAAGGTGGAGGCTGGTCGGCACATAGTGACTGACATTCGCAATA
ACGCTTGATCTTATGTAACATGTTGATGTTGTTACATGTGCAATTAAAATAATTCAACTT
ATAAGTTGACGTCATAAACTTCGCACACACTTTCCGTCCATTATCTTTGCAGTTTCCTTC
GATATCTTCTAATCTTGGACAATATTTTTGTGGAAGATCCTCTTTATCTTTTTTACCATC
ACTAATTACGAGAAAGATGAGAACACAAAAAGTTATACACCAGGTAGAAGATCTCATGGT
TAAAGAATAAAGATAGAAATGGTGATAAACAATCTTTTACTTGCAGAGTACTTTAACTTG
TGTCTCTCTTTTGCCC

QA 1 556 1 556
DS 



AS 2 10

CO CL329Contig1 497 3 2 U
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AAAAGGTCCAAATGTTGAAAGAAAATTGCGATTGTAAGAAAAGTATATGTTTTGGTGCAC
AAAAAAAAGAACGAAAAGTATTAGTTCTCTATTGAGTAAGGACTTGGTCTTTGCCGTGGA
GTGGAGTAACCACACCGAGCACCACGAAACCGCCGAGAACAAGAATCAGAACACCCATCG
TGTTAACTAACATGGCCTCTGTGGAATACCGAGTTATCACTTGGTTCACTTGCAGGAACG
TCAACTTCTCCAGTATCCCTGTGGTTACAGTCACCAAAGCCAATGCATAGATGGCGACCC
CTAAGAACACGTGCCAAGGCATTAAGCTGGCTCGGCTGTTTCTTGAACCACCCGGGTACC
AGTAAGTCACAAACCCTGAAGCCCACTGAAAAGCGAAGAGAAAGAGACAAGCCAAGCCGA
GCCATGAATGCAAACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FK72JQ U 55
AF RS1D244JQ U 1
AF RS1GP50JQ U 24
BS 1 457 RS1D244JQ
BS 458 497 RS1GP50JQ

RD RS1FK72JQ 144 0 0
G
TTCGAAAAAGGTCCAAATGTTGAAAGAAAATTGCGATTGTAAGAAAAGTATATGTTTTGG
TGCACAAAAAAAAAAACGAAAAGTATTAGTTCTCTATTGAGTAAGGACTTGGTCTTTGCC
GTGGAGTGGAGTAACCACACCGA

QA 2 144 2 144
DS 

RD RS1D244JQ 463 0 0
GGTTCTTAACAAGGTCTCCGATTAAATATATGTAGCAAGATTTTATCGCAGATGATTCGA
AAAAGGTCCAAATGTTGAAAGAAAATTGCGATTGTAAGAAAAGTATATGTTTTGGTGCAC
AAAAAAAAGAACGAAAAGTATTAGTTCTCTATTGAGTAAGGACTTGGTCTTTGCCGTGGA
GTGGAGTAACCACACCGAGCACCACGAAACCGCCGAGAACAAGAATCAGAACACCCATCG
TGTTAACTAACATGGCCTCTGTGGAATACCGAGTTATCACTTGGTTCACTTGCAGGAACG
TCAACTTCTCCAGTATCCCTGTGGTTACAGTCACCAAAGCCAATGCATAGATGGCGACCC
CTAAGAACACGTGCCAAGGCATTAAGCTGGCTCGGCTGTTTCTTGAACCACCCGGGTACC
AGTAAGTCACAAACCCTGAAGCCCACTGAAAAGCGAA
AAAAAA

QA 1 457 1 457
DS 

RD RS1GP50JQ 474 0 0
AAATATATGTAGCAAGAT
TTTATCGCAGATGATTCGAAAAAGGTCCAAATGTTGAAAGAAAATTGCGATTGTAAGAAA
AGTATATGTTTTGGTGCACAAAAAAA*GAACGAAAAGTATTAGTTCT**ATTGAGTAAGG
ACTTGGTCTTTGCCGTGGAGTGGAGTAACCACACCGAGCACCACGAAACCGCCGAGAACA
AGAATCAGAACACCCATCGTGTTAACTAACATGGCCTCTGTGGAATACCGAGTTATCACT
TGGTTCACTTGCAGGAACGTCAACTTCTCCAGTATCCCTGTGGTTACAGTCACCAAAGCC
AATGCATAGATGGCGACCCCTAAGAACACGTGCCAAGGCATTAAGCTGGCTCGGCTGTTT
CTTGAACCACCCGGGTACCAGTAAGTCACAAACCCTGAAGCCCACTGAAAAGCGAAGAGA
AAGAGACAAGCCAAGCCGAGCCATGAATGCAAACTG

QA 19 474 19 474
DS 



CO CL329Contig2 921 7 28 U
GGATGACGAGATCACTTGGGTTGACCCGAACATCGCCGATCTAAGGAGAGACGGTGGTTT
CGATTTTTGATTTGGTCGTAATATGGTAGTTCCGATGCTTGGTGGGTTTCCGATATTCTT
GGTGGTGAGAGTTCTGGGTTTCACCATTGCAGTTTTGGTTCTGACATGGACTGTCCACTA
CAGAGGAGGACTAGCTCTTTCCTCCGATAACAAAGATCTCATCTTCAATGTTCATCCAGT
TTTGATGGTGATTGGGCTCATACTCTTCAATGGTGAAGCTATGTTAGCATACAAGTCAGT
TCAAGGAACAAAGAACTTGAAGAAACTGGTTCATCTTACACTGCAATTCGCAGCTTTTAT
ACTAAGTTTAGTCGGAGTCTGGGCTGCTCTTAAGTTCCACATCGACAAAGGGATTGAAAA
TTTCTACAGTCTGCATTCATGGCTCGGCTTAGCTTGTCTCTTTCTCTTCGCTTTCCAGTG
GGCTTCAGGGTTTGTGACTTACTGGTACCCGGGTGGTTCAAGAAACAGCCGAGCCAGCTT
AATGCCTTGGCACGTGTTCTTAGGGGTCGCCATCTATGCATTGGCTTTGGTGACTGTAAC
CACAGGGATACTGGAGAAGTTGACGTTCCTGCAAGTGAACCAGGTGATAACTCGGTACTC
CACAGAGGCCATGTTAGTTAACACGATGGGTGTTCTGATTCTTGTTCTCGGCGGTTTCGT
GGTGCTCGGTGTGGTTACTCCCCTCCACGGCAAAGACCAAGTCCTTACTCAATAGAGAGA
ACAAATACTTTTCGTTTTTTTTATTCACCAAAACAAATACTTTTCTTACAATCGCAATTT
TCTTTCAACGTTTGGACCTTTTTCGAATCAGATGCGATAAATCTTGTTACATATATTTTA
TCGGAGACCTTATTAAGAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 0 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 10 35 35 35 35 35 
35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G910TF U 190
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AF RS1FK72TF U 1
AF RS1D244TF U 1
AF RS1FU02TF U 6
AF RS1FU02JQ C 47
AF RS1G910JQ C 224
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AT
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TCGGAGTCTGGGCTGCTCTTAAGTTCCACATCGACA

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DS 

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GGTAGTTCCGATGCTTGGTGGGTTTCCGATCTTCTTGGTGGTGAGAGTTCTGGGTTTCAT
CATTGCAGTTTTGGTTCTGACATGGACTGTCCACTACAGAGGAGGCCTAGCTCTTTCCTC
CGATAACAAAGATCTCATCTTCAATGTTCATCCAGTTTTGATGGTGATTGGGCTCATACT
CTTCAATGGTGAAGCTATGTTAGCATACAAGTCAGTTCAAGGTACAAAGAACTTGAAGAA
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CGGCTTGGCTTGTCTCTTTCTCTTCGCTTT

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DS 

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GGCCTAGCTCTTTCCTCCGATAACAAAGATCTCATCTTCAATGTTCATCCAGTTTTGATG
GTGATTGGGCTCATACTCTTCAATGGTGAAGCTATGTTAGCATACAAGTCAGTTCAAGGT
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AGTTTGCATTCATGGCTCGGCTTGGCTTGTCTCTTTCTCTTCACTTTTCAGTGGGC

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DS 

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GGTGGTGAGAGTTCTGGGTTTCATCATTGCAGTTTTGGTTCTGACATGGACTGTCCACTA
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TCAAGGTACAAAGAACTTGAAGAAACTGGTTCATCTTACACTGCATTTCGCAGCTTTTAT
CCTAAGTTTAGTCGGAGTATGGGCTGCTCTTAAGTTCCATATCGACAAAGGGATTGAAAA
TTTCTACAGTTTGCATTCATGGCTCGGCTTGGCTTGTCTCTTTCTCTTCGCTTTTCAGTG
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AATGCCTTGGCACGTGTTCTTAGGGGTCGCCATCTATGCATTGGCTTTGGTGACTGTAAC
CACAGGG

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DS 

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GG
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TGATTTGGTCGTAATATGGTAGTTCCGATGCTTGGTGGGTTTCCGATATTTTTGGTGGTG
AGAGTTCTGGGTTTCACCATTGCTGTTTTGGTTCTGACATGGACTGTTCACTACAGAGGA
GGATTAGCTCTTTCCTCCGATAACAAAGATCTCATCTTCAATGTTCATCCAGTTTTGATG
GTGATTGGGCTCATACTCTTCAATGGTGAAGCTATGTTAGCATACAAGTCAGTTCAAGGA
ACAAAGAACTTGAAGAAACTGGTTCATCTTACACTGCAATTCGCAGCTTTTATACTAAGT
TTAGTCGGAGTCTGGGCTGCTCTTAAGTTCCACATCGACAAAGGGATTGAAAATTTCTAC
AGTCTGCATTCATGGCTCGGCTTAGCTTGTCTCTTTCTCTTCGCTTTCCAGTGGGCTTCA
GGGTTTGTGACTTACTGGTACCCGGGTGGTTCAAGAAACAGCCGAGCCAGCTTAATGCCT
TGGCACGTGTTCTTAGGGGTCGCCATCTATGCATTGGCTTTGGTGACTGTAACCACAGGG
ATACTGGAGAAGTTGACGTTCCTGCAAGTGAA

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DS 

RD RS1FU02JQ 846 0 0
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TTTCCGATATTTTTGGTGGTGAGAGTTCTGGGTTTCACCATTGCTGTTTTGGTTCTGACA
TGGACTGTTCACTACAGAGGAGGATTAGCTCTTTCCTCCGATAACAAAGATCTCATCTTC
AATGTTCATCCAGTTTTGATGGTGATTGGGCTCATACTCTTCAATGGTGAAGCTATGTTA
GCATACAAGTCAGTTCAAGGAACAAAGAACTTGAAGAAACTGGTTCATCTTACACTGCAA
TTCGCAGCTTTTATACTAAGTTTAGTCGGAGTCTGGGCTGCTCTTAAGTTCCACATCGAC
AAAGGGATTGAAAATTTCTACAGTCTGCATTCATGGCTCGGCTTAGCTTGTCTCTTTCTC
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AGCCGAGCCAGCTTAATGCCTTGGCACGTGTTCTTAGGGGTCGCCATCTATGCATTGGCT
TTGGTGACTGTAACCACAGGGATACTGGAGAAGTTGACGTTCCTGCAAGTGAACCAGGTG
ATAACTCGGTACTCCACAGAGGCCATGTTAGTTAACACGATGGGTGTTCTGATTCTTGTT
CTCGGCGGTTTCGTGGTGCTCGGTGTGGTTACTCCCCTCCACGGCAAAGACCAAGTCCTT
ACTCAATAGAGAGAACAAATACTTTTCGTTTTTTTTATTCACCAAAACAAATACTTTTCT
TACAATCGCAATTTTCTTTCAACGTTTGGACCTTTTTCGAATCAGATGCGATAAA
TCTTGTTACAT

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DS 

RD RS1G910JQ 698 0 0
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TTAGCATACAAGTCAGTTCAAGGAACAAAGAACTTGAAGAAACTGGTTCATCTTACACTG
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GACAAAGGGATTGAAAATTTCTACAGTCTGCATTCATGGCTCGGCTTAGCTTGTCTCTTT
CTCTTCGCTTTCCAGTGGGCTTCAGGGTTTGTGACTTACTGGTACCCGGGTGGTTCAAGA
AACAGCCGAGCCAGCTTAATGCCTTGGCACGTGTTCTTAGGGGTCGCCATCTATGCATTG
GCTTTGGTGACTGTAACCACAGGGATACTGGAGAAGTTGACGTTCCTGCAAGTGAACCAG
GTGATAACTCGGTACTCCACAGAGGCCATGTTAGTTAACACGATGGGTGTTCTGATTCTT
GTTCTCGGCGGTTTCGTGGTGCTCGGTGTGGTTACTCCCCTCCACGGCAAAGACCAAGTC
CTTACTCAATAGAGAGAACAAATACTTTTCGTTTTTTT*ATTCACCAAAACAAATACTTT
TCTTACAATCGCAATTTTCTTTCAACGTTTGGACCTTTTTCGAATCAGATGCGATAAATC
TTGTTACATATATTTTATCGGAGACCTTATTAAGAACC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 10

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GGATCCTTGTAAAACTTCGCAAGATATTGCGATGTCGAAAGCTATTATTCTGGTTGCTCT
CTGCTTTTTACCGGCTCTAGTCATGTCGGCTCGTCCGAACAGGAACCCGTTTGTAGTCAG
AGGACGTGTCTATTGCGATACTTGCCTGGCTGGTTTCGAAACTTCTGCCTCTACTTTCAT
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ACGTTTCGCTAACAACTTGGGGTTCCTAAGGGATGCAGCTTCACCAGGCTGTGCAGAGAT
CATGAAGCAATATCAAGAAACTGAAGACTAAAAATGCTCAATCAGTATGTTTTATCCATG
TTCCTGCGACATGTGGGATTTCAATTATAATCGCCAGCTTGTGTTTCGTGCATTGTATGG
TTTGTTTACTTCTGAAATATTAAAAATATATATATGATGAGAAAACATAGAATGTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
15 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 40 40 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RS1BM77TF U 1
AF RS1BM77JQ C 69
AF RS1D861JQ C 295
AF RS1CL95TF U 141
AF RS1CL95JQ C 185
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AF RS1D861TF U 121
AF RS1BP74TF U 121
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AF RS1DO95TF U 121
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RD RS1BM77TF 778 0 0
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CTCTCCTTGTAAAACTTCGCAAGATATTGCGATGTCGAAAGCTATTATTCTGGTTGCTCT
CTGCTTTTTACCGGCTCTAGTCATGTCGGCTCGTCCGAACAGGAACCCGTTTGTAGTCAG
AGGACGTGTCTATTGCGATACTTGCCTGGCTGGTTTCGAAACTTCTGCCTCTACTTTCAT
CCCTGGTGCGGTGGTTAGATTGGAGTGCAAAGACAGGAGAACAATGGAGTTAACCTACAG
GCACGAGGCGAGAACCGACTCAACAGGATCATACAAGATCTTGGTTAGCGAAGACCATGA
GGATCAGTTCTGTGATACCATGTTGGTTAGTAGCTCTCAGTTACGCTGCTCTAATGTCTC
ACCTGGTCATGACCGTGCCCGTGTGACCCTCACTCGTTTCAACGGCATTGCTTCAGACGA
ACGTTTCGCTAACAACTTGGGGTTCCTAAGGGATGCAGCTTCACCAGGCTGTGCAGAGAT
CATGAAGCAATATCAAGAAACTGAAGACTAAAAATGCTCAATCAGTATGTTTTATCCATG
TTCCTGCGACATGTGGGATTTCAATTATAATCGCCAGCTTGTGTTTCGTGCATTGTATGG
TTTGTTTACTTCTGAAATATTAAAAATATATATATGATGAGAAAACATAGAATGTC
TC

QA 1 776 1 776
DS 

RD RS1BM77JQ 710 0 0
TTACTCTCTTGCTTTCTCTCTTTCAAATCTCAGATCTTCCGTAACAAAAAAGCTCTCCTT
GTAAAACTTCGCAAGATATTGCGATGTCGAAAGCTATTATTCTGGTTGCTCTCTGCTTTT
TACCGGCTCTAGTCATGTCGGCTCGTCCGAACAGGAACCCGTTTGTAGTCAGAGGACGTG
TCTATTGCGATACTTGCCTGGCTGGTTTCGAAACTTCTGCCTCTACTTTCATCCCTGGTG
CGGTGGTTAGATTGGAGTGCAAAGACAGGAGAACAATGGAGTTAACCTACAGGCACGAGG
CGAGAACCGACTCAACAGGATCATACAAGATCTTGGTTAGCGAAGACCATGAGGATCAGT
TCTGTGATACCATGTTGGTTAGTAGCTCTCAGTTACGCTGCTCTAATGTCTCACCTGGTC
ATGACCGTGCCCGTGTGACCCTCACTCGTTTCAACGGCATTGCTTCAGACGAACGTTTCG
CTAACAACTTGGGGTTCCTAAGGGATGCAGCTTCACCAGGCTGTGCAGAGATCATGAAGC
AATATCAAGAAACTGAAGACTAAAAATGCTCAATCAGTATGTTTTATCCATGTTCCTGCG
ACATGTGGGATTTCAATTATAATCGCCAGCTTGTGTTTCGTGCATTGTATGGTTTGTTTA
CTTCTGAAATATTAAAAATATATATATGATGAGAAAACATAGAATGTCTC

QA 1 710 1 710
DS 

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TTTCATCCCTGGTGCGGTGGTTAGATTGGAGTGCAAAGACAGGAGAACAATGGAGTTAAC
CTACAGGCACGAGGCGAGAACCGACTCAACAGGATCATACAAGATTTTGGTTAGGGAAGA
CCATGAGGATCAGTTTTGTGATACCATGTTGGTTAGTAGCTCACAGTTACGCTGCTTTAA
TGTCTCACCTGGTCATGACCGTGCCCGTGTGACCCTCACTCGTTTCAACGGCATTGCTTC
AGACGAACGTTTCGCTAACAACTTGGGGTTCCTAAGGGAGGCAGCTTCACCAGGCTGTGC
AGAGATCATGAAGCAATATCAAGAAACTGAAGACTAAAAATGCTCAATCAGTATGTTTTA
TCCATGTTCCTGGGACATGTGGGATTTCAATTATAATCCCCAGCTTGTGTTTCGTGCATT
GTATGGTTTGTTTACTTTTGAAATATTAAAAATATATATATGATG
GG

QA 1 465 1 465
DS 

RD RS1CL95TF 625 0 0
G
AGATATTGCGATGTCGAAAGCTATTACTCTGGTTGCTCTCTGCTTTTTACCGGCTCTAGT
CATGTCGGCTCGTCCGAACAGGAACCCGTTTGTAGTCAGAGGACGTGTCTATTGCGATAC
TTGCCTGGCTGGTTTCGAAACTTCTGCCTCTACTTTCATCCCTGGAGCGGTGGTTAGATT
GGAGTGCAAAGACAGGAGAACAATGGAGTTAACCTACAGGCACGAGGCGAGAACCGACTC
AACAGGATCATACAAGATCTTGGTTAGCGAAGACCATGAGGATCAGTTCTGTGATACCAT
GTTGGTTAGTAGCTCTCAGTTACGCTGCACTAATGTCTCACCTGGTCATGACCGTGCCCG
TGTGACCCTCACTCGTTTCAACGGCATTGCTTCAGACGAACGTTTCGCTAACAACTTGGG
GTTCCTAAGGGATGCAGCTTCACCAGGCTGTGCAGAGATCATGAAGCAATATCAAGAAAC
TGAAGACTAAAAATGCTCAATCAGTATGTTTTATCCATGTTCCTGCGACATGTGGGATTT
CAATTATAATCGCCAGCTTGTGTTTCGTGCATTGTATGGTTTGTTTACTTCTGAAATATT
AAAAATATATATATGA
AAGAAAAA

QA 2 617 2 617
DS 

RD RS1CL95JQ 556 0 0
TTTTTACCGGCTCTAGTCATGTCGGCTCGTCCGAACAGGAACCCGTTTGTAGTCAGAGGA
CGTGTCTATTGCGATACTTGCCTGGCTGGTTTCGAAACTTCTGCCTCTACTTTCATCCCT
GGAGCGGTGGTTAGATTGGAGTGCAAAGACAGGAGAACAATGGAGTTAACCTACAGGCAC
GAGGCGAGAACCGACTCAACAGGATCATACAAGATCTTGGTTAGCGAAGACCATGAGGAT
CAGTTCTGTGATACCATGTTGGTTAGTAGCTCTCAGTTACGCTGCACTAATGTCTCACCT
GGTCATGACCGTGCCCGTGTGACCCTCACTCGTTTCAACGGCATTGCTTCAGACGAACGT
TTCGCTAACAACTTGGGGTTCCTAAGGGATGCAGCTTCACCAGGCTGTGCAGAGATCATG
AAGCAATATCAAGAAACTGAAGACTAAAAATGCTCAATCAGTATGTTTTATCCATGTTCC
TGCGACATGTGGGATTTCAATTATAATCGCCAGCTTGTGTTTCGTGCATTGTATGGTTTG
TTTACTTCTGAAATAT

QA 1 556 1 556
DS 

RD RS1BP74JQ 641 0 0
GGATCCTTGTAAAACTTCGCAAGATATTGCGATGTCGAAAGCTATTATTCTGGTTGCTCT
CTGCTTTTTACCGGCTCTAGTCATGTCGGCTCGTCCGAACAGGAACCCGTTTGTAGTCAG
AGGACGTGTCTATTGCGATACTTGCCTGGCTGGTTTCGAAACTTCTGCCTCTACTTTCAT
CCCTGGTGCGGTGGTTAGATTGGAGTGCAAAGACAGGAGAACAATGGAGTTAACCTACAG
GCACGAGGCGAGAACCGACTCAACAGGATCATACAAGATCTTGGTTAGCGAAGACCATGA
GGATCAGTTCTGTGATACCATGTTGGTTAGTAGCTCTCAGTTACGCTGCTCTAATGTCTC
ACCTGGTCATGACCGTGCCCGTGTGACCCTCACTCGTTTCAACGGCATTGCTTCAGACGA
ACGTTTCGCTAACAACTTGGGGTTCCTAAGGGATGCAGCTTCACCAGGCTGTGCAGAGAT
CATGAAGCAATATCAAGAAACTGAAGACTAAAAATGCCCAATCAGTATGTTTTATCCATG
TTCCTGCGACATGTGGGATTTCAATTATAATCGCCAGCTTGTGTTTCGTGCATTGTATGG
TTTGTTTACTTCTGAAATATTAAAAATATATATATGATGAG

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1D861TF 626 0 0
GGATCCTTGTAAAACTTCGCAAGATATTGCGATGTCGAAAGCTATTATTCTGGTTGCTCT
CTGCTTTTTACCGGCTCTAGTCATGTCGGCTCGTCCGAACAGGAACCCGTTTGTAGTCAG
AGGACGTGTCTATTGCGATACTTGCCTGGCTGGTTTCGAAACTTCTGCCTCTACTTTCAT
CCCTGGTGCGGTGGTTAGATTGGAGTGCAAAGACAGGAGAACAATGGAGTTAACCTACAG
GCACGAGGCGAGAACCGACTCAACAGGATCATACAAGATCTTGGTTAGCGAAGACCATGA
GGATCAGTTCTGTGATACCATGTTGGTTAGTAGCTCACAGTTACGCTGCTCTAATGTCTC
ACCTGGTCATGACCGTGCCCGTGTGACCCTCACTCGTTTCAACGGCATTGCTTCAGACGA
ACGTTTCGCTAACAACTTGGGGTTCCTAAGGGATGCAGCTTCACCAGGCTGTGCAGAGAT
CATGAAGCAATATCAAGAAACTGAAGACTAAAAATGCTCAATCAGTATGTTTTATCCATG
TTCCTGCGACATGTGGGATTTCAATTATAATCGCCAGCTTGTGTTTCGTGCATTGTATGG
TTTGTTTACTTCTGAAATATTAAAAA

QA 1 626 1 626
DS 

RD RS1BP74TF 647 0 0
GGATCCTTGTAAAACTTCGCAAGATATTGCGATGTCGAAAGCTATTATTCTGGTTGCTCT
CTGCTTTTTACCGGCTCTAGTCATGTCGGCTCGTCCGAACAGGAACCCGTTTGTAGTCAG
AGGACGTGTCTATTGCGATACTTGCCTGGCTGGTTTCGAAACTTCTGCCTCTACTTTCAT
CCCTGGTGCGGTGGTTAGATTGGAGTGCAAAGACAGGAGAACAATGGAGTTAACCTACAG
GCACGAGGCGAGAACCGACTCAACAGGATCATACAAGATCTTGGTTAGCGAAGACCATGA
GGATCAGTTCTGTGATACCATGTTGGTTAGTAGCTCTCAGTTACGCTGCTCTAATGTCTC
ACCTGGTCATGACCGTGCCCGTGTGACCCTCACTCGTTTCAACGGCATTGCTTCAGACGA
ACGTTTCGCTAACAACTTGGGGTTCCTAAGGGATGCAGCTTCACCAGGCTGTGCAGAGAT
CATGAAGCAATATCAAGAAACTGAAGACTAAAAATGCCCAATCAGTATGTTTTATCCATG
TTCCTGCGACATGTGGGATTTCAATTATAATCGCCAGCTTGTGTTTCGTGCATTGTATGG
TTTGTTTACTTCTGAAATATTAAAAATATATATATGATGAGAAAA
AA

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1DO95JQ 658 0 0
GGATCCTTGTAAAACTTCGCAAGATATTGCGATGTCGAAAGTTATTATTCTGGTTGCTCT
CTGCTTTTTACCGGCTCTAGTCATGTCGGCTCGTCCGAACAGGAACCCGTTTGTAGTCAG
AGGACGTGTCTATTGCGATACTTGCCTGGCTGGTTTCGAAACTTCTGCCTCTACTTTCAT
CCCTGGTGCGGTGGTTAGATTGGAGTGCAAAGACAGGAGAACAATGGAGTTAACCTACAG
GCACGAGGCGAGAACCGACTCAACAGGATCATACAAGATCTTGGTTAGCGAAGACCATGA
GGATCAGTTCTGTGATACCATGTTGGTTAGTAGCTCTCAGTTACGCTGCTCTAATGTCTC
ACCTGGTCATGACCGTGCCCGTGTGACCCTCACTCGTTTCAACGGCATTGCTTCAGACGA
ACGTTTCGCTAACAACTTGGGGTTCCCAAGGGATGCAGCTTCACCAGGCTGTGCAGAGAT
CATGAAGCAATATCAAGAAACTGAAGACTAAAAATGCTCAATCAGTATGTTTTATCCATG
TTCCTGCGACATGTGGGATTTCAATTATAATCGCCAGCTTGTGTTTCGTGCATTGTATGG
TTTGTTTACTTCTGAAATATTAAAAATATATATATGATGAGAAAACATAGAATGTC
CC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RS1DO95TF 657 0 0
GGATCCTTGTAAAACTTCGCAAGATATTGCGATGTCGAAAGTTATTATTCTGGTTGCTCT
CTGCTTTTTACCGGCTCTAGTCATGTCGGCTCGTCCGAACAGGAACCCGTTTGTAGTCAG
AGGACGTGTCTATTGCGATACTTGCCTGGCTGGTTTCGAAACTTCTGCCTCTACTTTCAT
CCCTGGTGCGGTGGTTAGATTGGAGTGCAAAGACAGGAGAACAATGGAGTTAACCTACAG
GCACGAGGCGAGAACCGACTCAACAGGATCATACAAGATCTTGGTTAGCGAAGACCATGA
GGATCAGTTCTGTGATACCATGTTGGTTAGTAGCTCTCAGTTACGCTGCTCTAATGTCTC
ACCTGGTCATGACCGTGCCCGTGTGACCCTCACTCGTTTCAACGGCATTGCTTCAGACGA
ACGTTTCGCTAACAACTTGGGGTTCCCAAGGGATGCAGCTTCACCAGGCTGTGCAGAGAT
CATGAAGCAATATCAAGAAACTGAAGACTAAAAATGCTCAATCAGTATGTTTTATCCATG
TTCCTGCGACATGTGGGATTTCAATTATAATCGCCAGCTTGTGTTTCGTGCATTGTATGG
TTTGTTTACTTCTGAAATATTAAAAATATATATATGATGAGAAAACATAGAATGTC
C

QA 1 656 1 656
DS 



AS 3 10

CO CL331Contig1 504 4 5 U
CATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATCAGTCGACGGTACCGGACATATGCC
CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAGCACATAAAAGCATCAGAAGAAGAAACAAATT
ACAAGTTTTAAATCAAAGAGAAGTAAGAGAAGCAATGGCAGGTTCTAACTGTGGATGTGG
TTCCGCTTGCAAATGTGGTGACTCTTGCAGCTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGA
CAACTGCAGCTGTGGATCAAACTGCAGCTGCGGTGACAGCTGCAGCTGTTGAAGAAATTG
TGGTTTAAATCACATGCGTGCAGGGAAAACTGGGGGAAAAGTGTGTTTGATGTTAAGAG*
*ATGTGTGTGTTTGAATAAAGATTTGGCATGATGTTGCCTAATTACTCTCTTAGCCTTGG
CCTTTTCTCTATGTGTTTTTATTGTGTAATGTTTTCATTTGTAACGTAAGAAAAAAATAT
CTATTGACTTTTGTGATTGTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 

AF RS1A016TF U 1
AF RS1B825JQ C 251
AF RS1B825TF U 251
AF RS1A016TV U 37
BS 1 324 RS1A016TF
BS 325 325 RS1B825TF
BS 326 359 RS1A016TF
BS 360 361 RS1B825TF
BS 362 504 RS1A016TF

RD RS1A016TF 504 0 0
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CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAGCACATAAAAGCATCAGAAGAAGAAACAAATT
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TTCCGCTTGCAAATGTGGTGACTCTTGCAGCTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGA
CAACTGCAGCTGTGGATCAAACTGCAGCTGCGGTGACAGCTGCAGCTGTTGAAGAAATTG
TGGTTTAAATCACATGCGTGCAGGAAAAACTGGGGGAAAAGTGTGTTTGATGTTAAGAGG
TATGTGTGTGTTTGAATAAAGATTTGGCATGATGTTGCCTAATTACTCTCTTAGCCTTGG
CCTTTTCTCTATGTGTTTTTATTGTGTAATGTTTTCATTTGTAACGTAAGAAAAAAATAT
CTATTGACTTTTGTGATTGTTATT

QA 1 504 1 504
DS 

RD RS1B825JQ 253 0 0
G
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TGTGTTTTTATTGTGTAATGTTTTCATTTGTAACGTAAGAAAAAAATATCTATTGACTTT
TGTGATTGTT
GC

QA 2 251 2 251
DS 

RD RS1B825TF 253 0 0
G
GTGGATCAAACTGCAGCTGCGGTGACAGCTGCAGCTGTTGAAGAAATTGTGGTTTAAATC
ACATGCGTGCAGGGAAAACTGGGGGAAAAGTGTGTTTGATGTTAAGAG**ATGTGTGTGT
TTGAATAAAGATTTGGCATGATGTTGCCTAATTACTCTCTTAGCCTTGGCCTTTTCTCTA
TGTGTTTTTATTGTGTAATGTTTTCATTTGTAACGTAAGAAAAAAATATCTATTGACTTT
TGTGATTGTT
GC

QA 2 251 2 251
DS 

RD RS1A016TV 468 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAGCACATAA
AAGCATCAGAAGAAGAAACAAATTACAAGTTTTAAATCAAAGAGAAGTAAGAGAAGCAAT
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GAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGTGGATCAAACTGCAGCTGCGGTGA
CAGCTGCAGCTGTTGAAGAAATTGTGGTTTAAATCACATGCGTGCAGGAAAAACTGGGGG
AAAAGTGTGTTTGATGTTAAGAGGTATGTGTGTGTTTGAATAAAGATTTGGCATGATGTT
GCCTAATTACTCTCTTAGCCTTGGCCTTTTCTCTATGTGTTTTTATTGTGTAATGTTTTC
ATTTGTAACGTAAGAAAAAAATATCTATTGACTTTTGTGATTGTTATT

QA 1 468 1 468
DS 



CO CL331Contig2 426 2 6 U
GGACAGCAAATAAAGGCATCAAAAAGACAAAAAAAGAATTACAAGTTTACAATCAAAGAG
AAGTAAGAGAAGCAATGGCAGGTTCTAACTGTGGATGTGGTTCCGCTTGCAAATGTGGTG
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ATCAAACTGCAGCTGCGGTGACAGCTGCAGCTGTTGAAAAAATTGTGGTTTAAATCACAT
GCGTGCAGGAAAAACTGGGGGAAAAGTGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTTTGA
ATAAAGATTTGGCATGATGTTGCCTAATTACTCTCTTAGCCTTGGCCTTTTCTCTATGTG
TTTTTATTGTGTAATGTTTTCATTTGTAACGTAAGAAAAAAATATTTATTGACTTTTGTG
ATTGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1C563TF U 1
AF RS1C563JQ C 1
BS 1 130 RS1C563TF
BS 131 131 RS1C563JQ
BS 132 218 RS1C563TF
BS 219 219 RS1C563JQ
BS 220 345 RS1C563TF
BS 346 426 RS1C563JQ

RD RS1C563TF 345 0 0
GGACAGCAAATAAAGGCATCAAAAAGACAAAAAAAGAATTACAAGTTTACAATCAAAGAG
AAGTAAGAGAAGCAATGGCAGGTTCTAACTGTGGATGTGGTTCCGCTTGCAAATGTGGTG
ACTCTTGCAGTGAAGTTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGTGG
ATCAAACTGCAGCTGCGGTGACAGCTGCAGCTGTTGAAGAAATTGTGGTTTAAATCACAT
GCGTGCAGGAAAAACTGGGGGAAAAGTGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTTTGA
ATAAAGATTTGGCATGATGTTGCCTAATTACTCTCTTAGCCTTGG

QA 1 345 1 345
DS 

RD RS1C563JQ 426 0 0
GGACAGCAAATAAAGGCATCAAAAAGACAAAAAAAGAATTACAAGTTTACAATCAAAGAG
AAGTAAGAGAAGCAATGGCAGGTTCTAACTGTGGATGTGGTTCCGCTTGCAAATGTGGTG
ACTCTTGCAGGGAAGTTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGTGG
ATCAAACTGCAGCTGCGGTGACAGCTGCAGCTGTTGAAAAAATTGTGGTTTAAATCACAT
GCGTGCAGGAAAAACTGGGGGAAAAGTGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTTTGA
ATAAAGATTTGGCATGATGTTGCCTAATTACTTTTTTAGCCTTGGCCTTTTCTCTATGTG
TTTTTATTGTGTAATGTTTTCATTTGTAACGTAAGAAAAAAATATTTATTGACTTTTGTG
ATTGTT

QA 1 426 1 426
DS 



CO CL331Contig3 426 4 1 U
CTAATAACAATCACAAAAGTCAATAGATATTTTTTTCTTACGTTACAAATGAAAACATTA
CACAATAAAAACACATAGAGAAAAGGCCAAGGCTAAGAGAGTAATTAGGCAACATCATGC
CAAATCTTTATTCAAACACACACATATCTCTTAACATCAAACACACTTTTCCCCCAGTTT
TTCCTGCACGCATGTGATTTAAACCACAATTTCTTCAACAGCTGCAGCTGTCACCGCAGC
TGCAGTTTGATCCACAGCTGCAGTTGTCGCACTCCGTGTTGTAGTTCTTCTCGCAACTGC
AAGAGTCACCACATTTGCAAGCGGAACCACATCCACAGTTAGAAACTGCCATTGCTTATC
TTACTTCTCTTTGATTGTAAACTTGTAATTCTTTTTTTGTCTTTTTGATGCCTTTATTTG
CTGTCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 

AF RS1DQ58JQ U 1
AF RS1DQ58TF C 1
AF RS1BB32JQ U 6
AF RS1BB32TF C 6
BS 1 426 RS1DQ58JQ

RD RS1DQ58JQ 426 0 0
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CT
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GTCC

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RD RS1BB32TF 421 0 0
GG
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TCTTTGATTGTAAACTTGTAATTCTTTTTTTGTCTTTTTGATGCCTTTATTTGCTGTCC

QA 3 421 3 421
DS 



AS 1 10

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TCTTAGCCTTGAAAGAAGATTGTAGTGTTCTTATTCTGAGATTGGTGAAGCC


BQ
10 10 10 30 35 35 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 30 30 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 15 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 15 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 30 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DB85JQ U 4
AF RS1GI63JQ U 9
AF RS1G788JQ U 4
AF RS1C615JQ U 103
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DS 

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DS 

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DS 

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AAAA
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AAA

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DS 

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CC

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CC

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AGCCTTGAAAGA

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DS 

RD RS1FB46TF 644 0 0
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GACC

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DS 

RD RS1DB85TF 631 0 0
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TCCTCATCCACCAGTTCAAAGACGAGAAGATAA*AAAAAAAACACAGGAAACACAAACAA
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TGAGAAATTAAGGGCATTGGAAGCCGCGTGGAGCCTTTCTGCTGCAAACGTTGAGAAGCA
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AAAGACAAACCGCAGCTTCTAGATCGACCAAACCGTCAATGAGGCTGCAACACGGTTTAA
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TTATTGTATCTTTTGGGCATGTCTGGATGGCTGGAGGGGTTGGAGAAGGCGGCTTGGGTT
TGTATGACCCAGGTGGACAACCAGAGCGGGCGGCTTCTGTTATTGTGAAGAGGATGATGT
TCAAGGCAAAGAAGATGGCAAGAGAGTTTCTAAAAGCCATTTTTCTTAGCCTTGAAAGAA
GATTGTAGTGTTCTTATTCTGAGATTGGT
CC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 10

CO CL333Contig1 1395 10 12 U
GGTGGATGAGATCGGTCGAGTGGTCTCAGTTGGAGATGGGATTGCACAAGTTTATGGATT
GAACGAGATTCAAGCTGGGGAAATGGTTCTTTTTGCCAACGGTGTGAAAGGAATGGCCTT
GAATCTTGAGAATGAGAATGTCGGGATTGTTGTCTTTGGTGGTGATACCGCTATAAAAGA
AGGAGATCTTGTCAAGCGCACTGGATCTATTGTGGATGTTCCCGCGGGAAAGGCTATGCT
AGGGCGTGTGGTCGACGCGATGGGAGTACCTATTGATGGAAGAGGGGCTCTAAGCGATCA
CGAGCAAAGACGTGTCGAAGTGAAAGCCCCTGGGATTCTTGAACGTAAATCAGTGCACGA
GCCTATGCAAACAGGGTTAAAAGCGGTAGATAGCCTGGTTCCTATAGGCCGTGGTCAACG
AGAACTTCTAATCGGGGACCGACAAACTGGAAAAACGACTATTGCTATCGATACCATATT
AAACCAAAAGCAAATAAACTCAAGGGCCACCTCTGAGAGTGAGACAATGTATTGTGTCTA
TGTAGCGATTGGACAGAAACGCTCGACTGTGGGACAATTAATTCAAACTCTTGAAGAAGC
GAATGCTTTGGAATATTCCATTCTTGTAGCAGCCACCGCTTCGGATCCTGCTCCTCTGCA
ATTTTTGGCCCCATATTCCGGGTGTGCCATGGGGAAATATTTCCGCGATAATGGAATGCA
CGCATTAATAATCTATGATGATCTTAGTAAACAGGCGGTGGCATATCGACAAATGTCATT
ATTGTTACGCCGACCACCAGGCCGTGAGGCTTTCCCAGGTGATGTTTTCTATTTACATTC
CCGTCTCTTAGAAAGAGCGGCTAAACGATCGGACCAGACAGGTGCAGGTAGCTTGACCGC
CTTACCCGTCATTGAAACACAAGCTGGAGACGTATCGGCCTATATTCCCACCAATGTGAT
CTCCATTACTGATGGACAAATCTGTTTGGAAACAGAGCTCTTTTATCGCGGAATTAGACC
TGCTATTAACGTCGGCTTATCTGTCAGTCGCGTCGGGTCTGCCGCTCAGTTGAAAGCTAT
GAAACAAGTATGCGATAGTTTAAAACTGGAATTGGCACAATATCGCGAAGTGGCCGCCTT
TGCTCAATTTGGCTCAGACCTTGATGCTGCGACTCAGGCATTACTCAATAGAGGTGCAAG
GCTGACAGAAGTACTGAAACAACCACAATATGCACCACTTCCAATTGAAAAACAAATACT
AGTCATTTATGCAGCTGTCAATGGATTCTGTGATCGAATGCCACTAGACAGAATCTCTCA
ATATGAGAAAGCCATTCTAAATAGTGTCAAACCTGAATTACTACAAGCCCTTAAAGGTGG
ATTAACTAACGAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 10 

AF RS1AA06TF U 127
AF RS1DD23TF U 1
AF RS1G959TF U 254
AF RS1G959JQ C 1055
AF RS1DD23JQ C 784
AF RS1B549JQ C 874
AF RS1AX60JQ C 987
AF RS1B527JQ C 1131
AF RS1B527TF U 1131
AF RS1AX60TF U 987
BS 1 422 RS1DD23TF
BS 423 423 RS1AA06TF
BS 424 488 RS1DD23TF
BS 489 489 RS1G959TF
BS 490 694 RS1DD23TF
BS 695 695 RS1G959TF
BS 696 750 RS1DD23TF
BS 751 860 RS1G959TF
BS 861 987 RS1DD23JQ
BS 988 1131 RS1AX60TF
BS 1132 1391 RS1B527TF
BS 1392 1395 RS1AX60JQ

RD RS1AA06TF 365 0 0
G
GAGAATGAGAATGTCGGGATTGTTGTCTTTGGTGGTGATACCGCTATAAAAGAAGGAGAT
CTTGTCAAGCGCACTGGATCTATTGTGGATGTTCCCGCGGGAAAGGCTATGCTAGGGCGT
GTGGTCGACGCGATGGGAGTACCTATTGATGGAAGAGGGGCTCTAAGCGATCACGAGCAA
AGACGTGTCGAAGTGAAAGCCCCTGGGATTCTTGAACGTAAATCAGTGCACGAGCCTATG
CAAACAGGGTTAAAAGCGGTAGATAGCCTGGTTCCTATAGGCCGTGGTCAACGAGAACTT
CTAATCGGGGACCGACAAACTGGAAAAACGACTATTGCTATCGATACCATATTAAACCAA
A
AGC

QA 2 362 2 362
DS 

RD RS1DD23TF 750 0 0
GGTGGATGAGATCGGTCGAGTGGTCTCAGTTGGAGATGGGATTGCACAAGTTTATGGATT
GAACGAGATTCAAGCTGGGGAAATGGTTCTTTTTGCCAACGGTGTGAAAGGAATGGCCTT
GAATCTTGAGAATGAGAATGTCGGGATTGTTGTCTTTGGTGGTGATACCGCTATAAAAGA
AGGAGATCTTGTCAAGCGCACTGGATCTATTGTGGATGTTCCCGCGGGAAAGGCTATGCT
AGGGCGTGTGGTCGACGCGATGGGAGTACCTATTGATGGAAGAGGGGCTCTAAGCGATCA
CGAGCAAAGACGTGTCGAAGTGAAAGCCCCTGGGATTCTTGAACGTAAATCAGTGCACGA
GCCTATGCAAACAGGGTTAAAAGCGGTAGATAGCCTGGTTCCTATAGGCCGTGGTCAACG
AGGACTTCTAATCGGGGACCGACAAACTGGAAAAACGACTATTGCTATCGATACCATATT
AAACCAAA*GCAAATAAACTCAAGGGCCACCTCTGAGAGTGAGACAATGTATTGTGTCTA
TGTAGCGATTGGACAGAAACGCTCGACTGTGGGACAATTAATTCAAACTCTTGAAGAAGC
GAATGCTTTGGAATATTCCATTCTTGTAGCAGCCACCGCTTCGGATCCTGCTCCTCTGCA
ATTTTTGGCCCCATATTCCGGGTGTGCCATGGGGGAATATTTCCGCGATAATGGAATGCA
CGCATTAATAATCTATGATGATCTTAGTAA

QA 1 750 1 750
DS 

RD RS1G959TF 607 0 0
GACGCGATGGGAGTACCTATTGATGGAAGAGGGGCTCTAAGCGATCACGAGCAAAGACGT
GTCGAAGTGAAAGCCCCTGGGATTCTTGAACGTAAATCAGTGCACGAGCCTATGCAAACA
GGGTTAAAAGCGGTAGATAGCCTGGTTCCTATAGGCCGTGGTCAACGAGAACTTCTAATC
GGGGACCGACAAACTGGAAAAACGACTATTGCTATCGATACCATATTAAACCAAAAGCAA
ATAAACTCAAGGGCCACCTCTGAGAGTGAGACAATGTATTGTGTCTATGTAGCGATTTGA
CAGAAACGCTCGACTGTGGGACAATTAATTCAAACTCTTGAAGAAGCGAATGCTTTGGAA
TATTCCATTCTTGTAGCAGCCACCGCTTCGGATCCTGCTCCTCTGCAATTTTTGGCCCCA
TATTCCGGGTGTGCCATGGGGAAATATTTCCGCGATAATGGGATGCACGCATTAATAATC
TATGATGATCTTAGTAAACAGGCGGTGGCATATCGACAAATGTCATTATTGTTACGCCGA
CCACCAGGCCGTGAGGCTTTCCCAGGTGATGTTTTCTATTTACATTCCCGTCTCTTAGAA
AGAGCGG

QA 1 607 1 607
DS 

RD RS1G959JQ 296 0 0
GGGTCTGCCGCTCAGTTGAAAGCTATGAAACAAGTATGCGGTAGTTTAAAACTGGAATTG
GCACAATATCGCGAAGTGGCCGCCTTTGCTCAATTTGGCTCAGACCTTGATGCTGAGACT
CAGGCATTACTCAATAGAGGTGCAAGGCTGACAGAAGTACTGAAACAACCACAATATGCA
CCACTTCCAATTGAAAAACAAATACTAGTCATTTATGCAGCTGTCAATGGATTCTGTGAT
CGATTGCCACTAGACAGAATCTCTCAATATGAGAAAGCCATTTTAAATAGTGTCAA

QA 1 296 1 296
DS 

RD RS1DD23JQ 608 0 0
GTTACGCCGACCACCAGGCCGTGAGGCTTTCCCAGGTGATGTTTTCTATTTACATTCCCG
TCTCTTAGAAAGAGCGGCTAAACGATCGGACCAGACAGGTGCAGGTAGCTTGACCGCCTT
ACCCGTCATTGAAACACAAGCTGGAGACGTATCGGCCTATATTCCCACCAATGTGATCTC
CATTACTGATGGACAAATCTGTTTGGAAACAGAGCTCTTTTATCGCGGAATTAGACCTGC
TATTAACGTCGGCTTATCTGTCAGTCGCGTCGGGTCTGCCGCTCAGTTGAAAGCTATGAA
ACAAGTATGCGGTAGTTTAAAACTGGAATTGGCACAATATCGCGAAGTGGCCGCCTTTGC
TCAATTTGGCTCAGACCTTGATGCTGCGACTCAGGCATTACTCAATAGAGGTGCAAGGCT
GACAGAAGTACTGAAACAACCACAATATGCACCACTTCCAATTGAAAAACAAATACTAGT
CATTTATGCAGCTGTCAATGGATTCTGTGATCGAATGCCACTAGACAGAATCTCTCAATA
TGAGAAAGCCATTCTAAATAGTGTCAAACCTGAATTACTACAAGCCCTTAAAGGTGGATT
AACTAACG

QA 1 608 1 608
DS 

RD RS1B549JQ 518 0 0
G
CAGACAGGTGCAGGTAGCTTGACCGCCTTACCCGTCATTGAAACACAAGCTGGAGACGTA
TCGGCCTATATTCCCACCAATGTGATCTCCATTACTGATGGACAAATCTGTTTGGAAACA
GAGCTCTTTTATCGCGGAATTAGACCTGCTATTAACGTTGGCTTATCTGTCAGTCACGTC
GGGTCTGCCGCTCAGTTGAAAGCTATGAAACAAGTATGCGGTAGTTTAAAACTGGAATTG
GCACAATATCGCGAAGTGGCCGCCTTTGCTCAATTTGGCTCAGACCTTGATGCTGCGACT
CAGGCATTACTCAATAGAGGTGCAAGGCTGACAGAAGTACTGAAACAACCACAATATGCA
CCACTTCCAATTGAAAAACAAATACTAGTCATTTATGCAGCTGTCAATGGATTCTGTGAT
CGAATGCCACTAGACAGAATCCCTCAATATGAGAAAGCCATTCTAAATAGTGTCAAACCT
GAATTACTACAAGCCCTTAAAGGTGGATTAACTAACG

QA 2 518 2 518
DS 

RD RS1AX60JQ 409 0 0
G
GGAAACAGAGCTCTTTTATCGCGGAATTAGACCTGCTATTAACGTCGGCTTATCTGTCAG
TCGCGTCGGGTCTGCCGCTCAGTTGAAAGCTATGAAACAAGTATGCGATAGTTTAAAACT
GGAATTGGCACAATATCGCGAAGTGGCCGCCTTTGCTCAATTTGGCTCAGACCTTGATGC
TGCGACTCAGGCATTACTCAATAGAGGTGCAAGGCTGACAGAAGTACTGAAACAACCACA
ATATGCACCACTTCCAATTGAAAAACAAATACTAGTCATTTATGCAGCTGTCAATGGATT
CTGTGATCGAATGCCACTAGACAGAATCTCTCAATATGAGAAAGCCATTCTAAATAGTGT
CAAACCTGAATTACTACAAGCCCTTAAAGGTGGATTAACTAACGAAAG

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DS 

RD RS1B527JQ 261 0 0
G
GGCCGCCTTTGCTCAATTTGGCTCAGACCTTGATGCTGCGACTCAGGCATTACTCAATAG
AGGTGCAAGGCTGACAGAAGTACTGAAACAACCACAATATGCACCACTTCCAATTGAAAA
ACAAATACTAGTCATTTATGCAGCTGTCAATGGATTCTGTGATCGAATGCCACTAGACAG
AATCTCTCAATATGAGAAAGCCATTTTAAATAGTGTCAAACCTGAATTACTACAAGCCCT
TAAAGGTGGATTAACTAACG

QA 2 261 2 261
DS 

RD RS1B527TF 261 0 0
G
GGCCGCCTTTGCTCAATTTGGCTCAGACCTTGATGCTGCGACTCAGGCATTACTCAATAG
AGGTGCAAGGCTGACAGAAGTACTGAAACAACCACAATATGCACCACTTCCAATTGAAAA
ACAAATACTAGTCATTTATGCAGCTGTCAATGGATTCTGTGATCGAATGCCACTAGACAG
AATCTCTCAATATGAGAAAGCCATTCTAAATAGTGTCAAACCTGAATTACTACAAGCCCT
TAAAGGTGGATTAACTAACG

QA 2 261 2 261
DS 

RD RS1AX60TF 409 0 0
G
GGAAACAGAGCTCTTTTATCGCGGAATTAGACCTGCTATTAACGTCGGCTTATCTGTCAG
TCGCGTCGGGTCTGCCGCTCAGTTGAAAGCTATGAAACAAGTATGCGATAGTTTAAAACT
GGAATTGGCACAATATCGCGAAGTGGCCGCCTTTGCTCAATTTGGCTCAGACCTTGATGC
TGCGACTCAGGCATTACTCAATAGAGGTGCAAGGCTGACAGAAGTACTGAAACAACCACA
ATATGCACCACTTCCAATTGAAAAACAAATACTAGTCATTTATGCAGCTGTCAATGGATT
CTGTGATCGAATGCCACTAGACAGAATCTCTCAATATGAGAAAGCCATTCTAAATAGTGT
CAAACCTGAATTACTACAAGCCCTTAAAGGTGGATTAACTAACG
AAAG

QA 2 405 2 405
DS 



AS 1 9

CO CL334Contig1 1208 9 20 U
ACCGAAAAGAATTAGCTGTTGTGGTATTTTAATCTTTTTCAATTTTGCAGCAGCAGTTAT
GAACTCAAATAAGCAACACAAACTTTTCTAATCAAGAATAAGCAACACAAACTTTTCTAA
TCAAGAATGTGAAGAAATATCACATATAGAAATCTTATTTCAAGAGTTATCATTATTCGT
GTATAGAGAATCATAGGAAGTGCAAATTCTTTGAAAGGAGAAACAGAGGCTTCTGAGAGA
TGAAATATGAATATGAAACAATTATTCTGCAGGCCCTAGAGAACCATCTTCTTCCTGCTT
CAAGGTGTCTTGACCTTGGGACGTGCAGGGAGTAGCTGATAACAAGAGATAAGAGAGGTG
GTAAAACCGAGAGCGCCAGTGACGCGAGGAGTAACAGTCTTTGGAGCTAACTGAAGCAGA
CCAATGGCTACAACAATGTCTATGCTTGTTTTAACCAAAGCTAGAGTTCGGTCGTTTGAT
TTCTGAAGCTTAGCACGGTACACCTCATCATGCTGCTTTTCAGCACCTTTGAGTTCCTTC
TCCATCTTCTTGATAGATGAAGAGAGTCTTCCAAGCTCACCAATCTCGACTGCTGTTGTA
CAGACAGATGACCCAAGCCAGCAGAAAA*GTGATATACGTCCAAGCAACTCAGTTCGTTC
TTTGTTCTTGTATATGCCGGATCTACCAAGCCAAACGATTTGATCAAGAAACAAGAAGGT
AGACAAGAGCGCATTCTTGGACTTCCCGAGTAAGACAAGAGGAAGTGGGGTCCCTTTAGG
CACAGGGCTGATTAGACCGTGAAAATCATTGACAAACTTGAAAAGACGAAAGACTTTTCT
AGCCAAGCTGGTGTTTTTGTCAACAGTTTGAGCAGTACCAGGCTGGCCACCGCTCAAGAA
CTTGGAACCATATTGTATAGCTCTGCATATCTTATCTCTAGCCTCAGCTTTGTTCAAG*A
CAGAACTATAAGAGCTAGCTCGGCTCTGGTCAAATCTAACGTTGTCATCTTCTCTCCTTA
ATGATCTCTATTAGGATCCTGCAGATTATACAAAATGAGATCGATTCAGGTTTCCAAGAC
GCAAACACACAAAAGATTAAAGATAGAAAGCTATCGAATTTTCAAGAGAAGGGATCCAGT
GCCTTAATATATGGGAAGATCGTGAGCTGTTCTTCCTTATTACGTCATTATCTTTCTTAC
TCGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 
35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1DW14JQ U 150
AF RS1EF49JQ U 1
AF RS1B284JQ U 130
AF RS1F929JQ U 146
AF RS1EF49TF C 398
AF RS1DW13JQ U 135
AF RS1F929TF C 320
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AF RS1DW13TF C 538
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BS 1116 1208 RS1DW13TF

RD RS1DW14JQ 233 0 0
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TTTGAAAGGAGAAACAGAGGCTTCTGAGAGATGAAATATGAATATGAAACAATTATTCTG
CAGGCCCTAAAGAACCATCTTCTTCCTGCTTCAAGGTGTCTTGACCTTGGGACGTGCAGG
GAGTAGCTGATAACAAGAGATAAAAGAGGTGGTAAAACCGAGAGCGCCAGTGA

QA 1 233 1 233
DS 

RD RS1EF49JQ 757 0 0
ACCGAAAAGAATTAGCTGTTGTGGTATTTTAATCTTTTTCAATTTTGCAGCAGCAGTTAT
GAACTCAAATAAGCAACACAAACTTTTCTAATCAAGAATAAGCAACACAAACTTTTCTAA
TCAAGAATGTGAAGAAATATCACATATAGAAATCTTATTTCAAGAGTTATCATTATTCGT
GTATAGAGAATCATAGGAAGTGCAAATTCTTTGAAGGGAGAAACAGAGGCTTCTGAGAGA
TGAAATATGAATATGAAACAATTATTCTGCAGGTCCTAGAGAACCATCTTCTTCCTGCTT
CAAGGTGTCTTGACCTTGGGACGTGCAGGGAGTAGCTGATAACAAGAGATAAGGGAGGTG
GTAAAACCGAGAGCGCCAGTGACGCGAGGAGTAACAGTCTTTGGAGCTAACTGAAGCAGA
CCAATGGCTACAACAATGTCTATGCTTGTTTTAACCAAAGCTAGAGTTCGGTCGTTTGAT
TTCTGAGGCTTAGCACGGTACACCTCATCATGCTGCTTTTCAGCACCTTTGAGTTCCTTC
TCCATCTTCTTGATAGATGAAGAG**TCTTCCAAGCTCACCAATCTCGACTGCTGTTGTA
CAGACAGATGACCCAAGCCAGCAGAAAA*GTGATATACGTCCAAGCAACTCAGTTCGTTC
TTTGTTCTTGTATATGCCGGATCTACCAAGCCAAACGATTTGATCAAGAAACAAGAAGGT
AGACAAGAGCGCATTCTTGGACTTCCCGAGTAAGACA

QA 1 757 1 757
DS 

RD RS1B284JQ 697 0 0
TGAAGA
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GGAAGTGCAAATTCTTTGAAAGGAGAAACAGAGGCTTCTGAGAGATGAAATATGAATATG
AAACAATTATTCTGCAGGCCCTAGAGAACCATCTTCTTCCTGCTTCAAGGTGTCTTGACC
TTGGGACGTGCAGGGAGTAGCTGATAACAAGAGATAAGAGAGGTGGTAAAACCGAGAGCG
CCAGTGACGCGAGGAGTAACAGTCTTTGGAGCTAACTGAAGCAGACCAATGGCTACAACA
ATGTCTATGCTTGTTTTAACCAAAGCTAGAGTTCGGTCGTTTGATTTCTGAAGCTTAGCA
CGGTACACCTAATCATGCTGCTTTTCAGCCCCTTTGAGTTCCTTCTCCATCTTCTTGATA
GATGAAGAGAGTCTTCCAAGCTCACCAATCTCGACTGCTGTTGTACAGACAGATGACCCA
AGCCAGCAGAAAA*GTGATATACGTCCAAGCAACTCAGTTCGTTCTTTGTTCTTGTATAT
GCCGGATCTACCAAGCCAAACGATTTGATCAAGAAACAAGAAGGTAGACAAGAGCGCATT
CTTGGACTTCCCGAGTAAGACAAGAGGAAGTGGGGTCCCTTTAGGCACAGGGCTGATTAG
ACCGTGAAAATCATTGACAAACTTGAAAAGA

QA 7 697 7 697
DS 

RD RS1F929JQ 750 0 0
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ATTCTTTGAAAGGAGAAACAGAGGCTTCTGAGAGATGAAATATGAATATGAAACAATTAT
TCTGCAGGCCCTAGAGAACCATCTTCTTCCTGCTTCAAGGTGTCTTGACCTTGGGACGTG
CAGGGAGTAGCTGATAACAAGAGATAAGAGAGGTGGTAAAACCGAGAGCGCCAGTGACGC
GAGGAGTAACAGTCTTTGGAGCTAACTGAAGCAAACCAATGGCTACAACAATGTCTATGC
TTGTTTTAACCAAAGCTAGAGTTCGGTCGTTTGATTTCTGAAGCTTAGCACGGTACACCT
CATCATGCTGCTTTTCAGCACCTTTGAGTTCCTTCTCCATCTTCTTGATAGATGAAGAGA
GTCTTCCAAGCTCACCAATCTCGACTGCTGTTGTACAGACAGATGACCCAAGCCAGCAGA
AAA*GTGATATACGTCCAAGCAACTCAGTTCGTTCTTTGTTCTTGTATATGCCGGATCTA
CCAAGCCAAACGATTTGATCAAGAAACAAGAAGGTAGACAAGAGCGCATTCTTGGACTTC
CCGAGTAAGACAAGAGGAAGTGGGGTCCCTTTAGGCACAGGGCTGATTAGACCGTGAAAA
TCATTGACAAACTTGAAAAGACGAAAGACTTTTCTAGCCAAGCTGGTGTTTTTGTCAACA
GTTTGAGCAGTACCAGGCTGGCCACCGCTC

QA 1 750 1 750
DS 

RD RS1EF49TF 506 0 0
GTC
TTGGAGCTAACTGAAGCAGACCAATGGCTACAACAATGTCTATGCTTGTTT*AACCAAAG
CTAGAGTTCGGTCGTT*GATT*CTGAGGCTTAGCACGGTACACCTCATCATGCTGCTTT*
CAGCACCTTTGAGTTC*TTCTCCATCTTCTTGATAGATGAAGAG**TCTTCCAAGCTCAC
CAATCTCGACTGCTGTTGTACAGACAGATGACCCAAGCCAGCAGAAAAAGTGATATACGT
CCAAGCAACTCAGTTCGTTCTTTGTTCTTGTATATGCCGGATCTACCAAGCCAAACGATT
TGATCAAGAAACAAGAAGGTAGACAAGAGCGCATTCTTGGACTTCCCGAGTAAGACAAGA
GGAAGTGGGGTCCCTTTAGGCACAGGGCTGATTAGACCGTGAAAATCATTGACAAACTTG
AAAAGACGAAAGACTTTTCTAGCCAAGCTGGTGTTTTTGTCAACAGTTTGAGCAGTACCA
GGCTGGCCACCGCTCAAGAACTT

QA 4 506 4 506
DS 

RD RS1DW13JQ 875 0 0
G
AATATCACATATAGAAATCTTATTTCAAGAGTTATCATTATTCGTGTATAGAGAATCATA
GGAAGTGCAAATTCTTTGAAAGGAGAAACAGAGGCTTCTGAGAGATGAAATATGAATATG
AAACAATTATTCTGCAGGCCCTAGAGAACCATCTTCTTCCTGCTTCAAGGTGTCTTGACC
TTGGGACGTGCAGGGAGTAGCTGATAACAAGAGATAAGAGAGGGGGTAAAACCGAGAGCG
CCAGTGACGCGAGGAGTAACAGTCTTTGGAGCTAACTGAAGCAGACCAATGGCTACAACA
ATGTCTATGCTTGTTTTAACCAAAGCTAGAGTTCGGTCGTTTGATTTCTGAAGCTTAGCA
CGGTACACCTCATCATGCTGCTTTTCAGCACCTTTGAGTTCCTTCTCCATCTTCTTGATA
GATGAAGAGAGTCTTCCAAGCTCACCAATCTCGACTGCTGTTGTACAGACAGATGACCCA
AGCCAGCAGAAAA*GTGATATACGTCCAAGCAACTCAGTTCGTTCTTTGTTCTTGTATAT
GCCGGATCTACCAAGCCAAACGATTTGATCAAGAAACAAGAAGGTAGACAAGAGCGCATT
CTTGGACTTCCCGAGTAAGACAAGAGGAAGTGGGGTCCCTTTAGGCACAGGGCTGATTAG
ACCGTGAAAATCATTGACAAACTTGAAAAGACGAAAGACTTTTCTAGCCAAGCTGGTGTT
TTTGTCAAAAGTTTGAGCAGTACCAGGCTGGCCACCGCTCAAGAACTTGGAACCATATTG
TATAGCTCTGCATATCTTATCTCTAGCCTCAGCTTTGTTCAAG*ACAGAACTATAAGAGC
TAGCTCGGCTCTGGTCAAATCTAACGTTGTCATC

QA 2 875 2 875
DS 

RD RS1F929TF 711 0 0
GACGTGCAGGGAGTAGCTGATAACAAGAGATAAGAGAGGTGGTAAA*CCGAGAGCGCCAG
TGACGCGAGGAGTAACAGTCTTTGGAGCTAACTGAAGCAGACCAATGGCTACAACAATGT
CTATGCTTGTTTTAACCAAAGCTAGAGTTCGGTCGTTTGATTTCTGAAGCTTAGCACGGT
ACACCTCATCATGCTGCTTTTCAGCACCTTTGAGTTCCTTCTCCATCTTCTTGATAGATG
AAGAGAGTCTTCCAAGCTCACCAATCTCGACTGCTGTTGTACAGACAGATGACCCAAGCC
AGCAGAAAA*GTGATATACGTCCAAGCAACTCAGTTCGTTCTTTGTTCTTGTATATGCCG
GATCTACCAAGCCAAACGATTTGATCAAGAAACAAGAAGGTAGACAAGAGCGCATTCTTG
GACTTCCCGAGTAAGACAAGAGGAAGTGGGGTCCCTTTAGGCACAGGGCTGATTAGACCG
TGAAAATCATTGACAAACTTGAAAAGACGAAAGACTTTTCTAGCCAAGCTGGTGTTTTTG
TCAACAGTTTGAGCAGTACCAGGCTGGCCACCGCTCAAGAACTTGGAACCATATTGTATA
GCTCTGCATATCTTATCTCTAGCCTCAGCTTTGTTCAAGTACAGAACTATAAGAGCTAGC
TCGGCTCTGGTCAAATCTAACGTTGTCATCTTCTCTCCTTAATGATCTCT
C

QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1B284TF 653 0 0
AGTTCGGTCGTT*GATTTCTGAAGCTTAGCACGGTACAC*TAATCATGCTGCTTTTCAGC
CCCTTTGAGTTC*TTCTCCATCTTCTTGATAGATGAAGAGAGTCTTCCAAGCTCACCAAT
CTCGACTGCTGTTGTACAGACAGATGACCCAAGCCAGCAGAAAA*GTGATATACGTCCAA
GCAACTCAGTTCGTTCTTTGTTCTTGTATATGCCGGATCTACCAAGCCAAACGATTTGAT
CAAGAAACAAGAAGGTAGACAAGAGCGCATTCTTGGACTTCCCGAGTAAGACAAGAGGAA
GTGGGGTCCCTTTAGGCACAGGGCTGATTAGACCGTGAAAATCATTGACAAACTTGAAAA
GACGAAAGACTTTTCTAGCCAAGCTGGTGTTTTTGTCAACAGTTTGAGCAGTACCAGGCT
GGCCACCGCTCAAGAACTTGGAACCATATTGTATAGCTCTGCATATCTTATCTCTAGTCT
CAGATTTGTTCAAGTACAGAACTATAAGAGCTAGCTCGGCTCTGGTCAAATCTAACGTTG
TCATCTTCTCTCCTTAATGATCTCTATTAGGATCCTGCAGATTATACAAAATGAGATCGA
TTCAGGTTTCCAAGACGCAAACACACAGAAGATTAAAGATAGAAAGCTATC
CC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1DW13TF 671 0 0
TTCTCCATCT*CTTGATAGATGAAGAGAGTCTTCCAAGCTCACCAATCTCGACTGCTGTT
GTACAGACAGATGACCCAAGCCAGCAGAAAA*GTGATATACGTCCAAGCAACTCAGTTCG
TTCTTTGTTCTTGTATATGCCGGATCTACCAAGCCAAACGATTTGATCAAGAAACAAGAA
GGTAGACAAGAGCGCATTCTTGGACTTCCCGAGTAAGACAAGAGGAAGTGGGGTCCCTTT
AGGCACAGGGCTGATTAGACCGTGAAAATCATTGACAAACTTGAAAAGACGAAAGACTTT
TCTAGCCAAGCTGGTGTTTTTGTCAAAAGTTTGAGCAGTACCAGGCTGGCCACCGCTCAA
GAACTTGGAACCATATTGTATAGCTCTGCATATCTTATCTCTAGCCTCAGCTTTGTTCAA
G*ACAGAACTATAAGAGCTAGCTCGGCTCTGGTCAAATCTAACGTTGTCATCTTCTCTCC
TTAATGATCTCTATTAGGATCCTGTAGATTATACAAAATGAGATCGATTCAGGTTTCCAA
GACGCAAACACACAAAAGATTAAAGATAGAAAGCTATCGAATTTTCAAGAGAAGGGATCC
AGTGCCTTAATATATGGGAAGATCGTGAGCTGTTCTTCCTTATTACGTCATTATCTTTCT
TACTCGTTTCC

QA 1 671 1 671
DS 



AS 2 10

CO CL335Contig1 879 4 10 U
GGACCGCAAACGCAGCTAAGGGGTTTCCCTATAAGATCACGTCGTGCGAAAGTGATATTG
GAACTGATAGGGAAGAAATAAGAAGAAGAAAAGATGGTGTTGACAATCTATGCGCCTTTA
TTCGCATCTTCCAAGAGAGCTGTGGTGACGTTAGTGGAGAAGGGAGTAGAGTTCGAGACT
GTCAATGTCGATCTCTTGAAAGGAGAGCAGAGGCAGCCTGAGTATATCGCCATTCAGCCT
TTCGGTAAGATCCCTGTGCTCGTCGACGGTGACTACAAAATCTTTGAGTCGCGTGCCATC
ATGAGGTACATAGCAGAGAAATACAGATCACAAGGACCAGACTTGTTGGGAAAGACAATT
GAAGAGAGGGGACAAGTGGAGCAATGGCTTGACGTGGAAGCAACAAGCTACCATCCACCA
CTACTAGCACTAACGCTGAACATTGTCTTTGCACCACTCATGGGCCTTCCTGCTGATGAG
AAAGTTATAAAAGAGAGTGAAGAGAAGCTTGCTGAAGTGCTTGACGTGTACGAAGCACAG
CTTTCAAAGAACGAATACTTGGCTGGAGATTTCGTGAGTCTAGCTGATTTGGCTCACCTT
CCCTTCACCGAGTACCTCGTGGGTGCTATTGGGAAGGCTTATATGATCAAAGATAGGAAG
CATGTGAGCGCGAGGAGGGATAAGATTAGTAACCGTGCTGCGTGGAA*GGAAGTTTCTGA
GAAATACGCATTGCCGGTTTAGAAAGAAGAAAACAATGAGTCGATGTGGTTTGTTTGTTG
TTGTGATGTTGATTTGGGGTTTGTGTGAGGCTTTCTGTACTGTGTGGGTGTCTGGTTTCA
GTTTAATGTCTTTTGGTTCTAATAAAAACTCTGTTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1DO40TF U 67
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GG
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CATT

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GA
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BQ
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G

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DS 

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C

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CTTTTCTTCTTCTTATTTCTTCCCT
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ATATACTCAGGCTGCCTCTGCTCTCCTTTCAAGAGATCGACATTGACAGTCTCGAACTCT
ACTCCCTTCTCCACTAACGTCACCACAGCTCTCTTGGAAGATGCGAATAAAGGCGCATAG
ATTGTCAACACCATCTTTTCTTCTTCTTATTTCTTCCCT
CC

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DS 



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CAAACCAGGTTTGGAACTTTTCATTTTTTTGGGTCCAAAACCTTAATCACTTAGCCATCA
TGACCTTGACAAACTCCTCATAGTTAATCTGGCCATCACCATCAACATCAGCTTCCTTGA
TCATCTCATCAACCTCTTCGTCAGTGAGCTTCTCACCTAGGTTTGTCATCACATGACGGA
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GCTCTTCCTCGGAGTCGGTGTCCTTCATCTTGCGAGCCATGAGGTTCAAGAACTCGGGGA
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GTAATGG


BQ
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50 50 35 50 25 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 25 50 25 50 50 25 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 15 55 55 
55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

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GA
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C

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DS 

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AG
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TCAATAAGAAACCACCGAAACTAGACCAAGTTACAACTGACAAAAGATCAATGA*AAAAA
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TGAGTCCCATGAATAAGAATTTTAAAACATAACAGTAATATAAGAATAGAGGCAGCAGCA
AACCAGGTTTGGAACTTTTCATTTTTTTGGGTCCAAAACCTTAATCACTTAGCCATCATG
ACCTTGACAAACTCCTCATAGTTAATCTGGCCATCACCATCAACATCAGCTTCCTTGATC
ATCTCATCAACCTCTTCGTCAGTGAGCTTCTCACCTAGGTTTGTCATCACATGACGGAGC
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AATGTTCAGACTTCAAATGTAGAGCATACAAGGAAGTAGACATGAGTCCCATGAATAAGA
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TCATTTTTTTGGGTCCAAAACCTTAATCACTTAGCCATCATGACCTTGACAAACTCCTCA
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AGCCATCATGACCTTGACAAACTCCTCATAGTTAATCTGGCCATCACCATCAACATCAGC
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AATGCAACCGTCACCATCCTTGTCGAATAAGCTGAAGGCTTCCTTGAACTCGGAGATCTG
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ACCCC

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DS 

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TGA*AAAAAAACAAAGCAAAGACTTGAAATGTTCAGACTTCAAATGTAGAGCATACAAGG
AAGTAGACATGAGTCCCATGAATAAGAATTTTAAAACATAACAGTAATATAAGAATAGAG
GCAGCAGCAAACCAGGTTTGGAACTTTTCATTTTTTTGGGTCCAAAACCTTAATCACTTA
GCCATCATGACCTTGACAAACTCCTCATAGTTAATCTGGCCATCACCATCAACATCAGCT
TCCTTGATCATCTCATCAACCTCTTCGTCAGTGAGCTTCTCACCTAGGTTTGTCATCACA
TGACGGAGCTCCGCAGCTGAGATGAAACCGTTCTGGTCCTTGTCAAACACCCGGAACGCC
TCCTTGAGCTCTTCCTCGGAGTCGGTGTCCTTCATCTTGCGAGCCATGAGGTTCAAGAAC
TCGGGGAAATCAATGGTGCCGTTACCATCAGCGTCAACTTCATTGATCATGTCTTGAAGC
TCTGCTTCGGTTGGGTTCTGTCCTAGAGAACGCATCACAGTTCCCAGCTCCTTGGTGGTA
ATGCAACCGTCACCATCCTTGTCGAATAAGCTGAAGGCTTCCTTGAACTCGGAGATCTGA
TCGTCGGTGAGCTGATCCGCCATTGTTCCTTTTTCTTTTCTTTTCTTTTGTTTTTGAAAG
AGGAAGAAGAAAAAGAAGAAGAGAGATTAGAGAAGTGTCAGCGAGGAAACGAGAGAGAC
ACCCC

QA 1 779 1 779
DS 

RD RS1A168TV 845 0 0
CCACTTTAATGGAGAACTGCATTTAACAAAACCATGATACAATGCTTTTACTAGAGACCA
TCAATAAGAAACCACCGAAACTAGACCAAGTTACAACTGACAAAAGATCAATGA*AAAAA
AACAAAGCAAAGACTTGAAATGTTCAGACTTCAAATGTAGAGCATACAAGGAAGTAGACA
TGAGTCCCATGAATAAGAATTTTAAAACATAACAGTAATATAAGAATAGAGGCAGCAGCA
AACCAGGTTTGGAACTTTTCATTTTTTTGGGTCCAAAACCTTAATCACTTAGCCATCATG
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ATCTCATCAACCTCTTCGTCAGTGAGCTTCTCACCTAGGTTTGTCATCACATGACGGAGC
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GTTGGGTTCTGTCCTAGAGAACGCATCACAGTTCCCAGCTCCTTGGTGGTAATGCAACCG
TCACCATCCTTGTCGAATAAGCTGAAGGCTTCCTTGAACTCGGAGATCTGATCGTCGGTG
AGCTGATCCGCCATTGTTCCTTTTTCTTTTCTTTTCTTTTGTTTTTGAAAGAGGAAGAAG
AAAAAGAAGAAGAGAGATTAGAGAAGTGTCAGCGAGGAAACGAGAGAGACCCCCGGCCGT
AATGG

QA 1 845 1 845
DS 



AS 1 10

CO CL337Contig1 531 10 13 U
AGGGGAACACAAACTAACAAAGAATTTCTTTGCAAAGAAGAATTAAAATGTCAACATCTA
AATTTGCTTTCTTTTGTATCGTTTTGGTTTTTTTTGCTACTTTTCATGAATATGTCAATC
AAGCCGATGCAGCAGCACCAACATGCACTAGAGCACTAAATTCTGACTGGTGCTGCAGCT
TGAAACCAAAACGGTGCCTAGGTAGCAAAGTGGAATGTGACGCAATTTGTAAACCGAGAC
GCCGTCTTTGAATTTTTCAAAAACAAATTTCTATATTATATATTTCAGTTTTATTCTAAT
CTAAATAATACATAGAAAGTTCTCTACGGAAACAACTAGTATTGTCTGCTAAAAGACGTT
GGTATCTCGTGGAAGAGCTCAAGTTTTTTTCTTTTCTATTTATGACCTTTTACAATTGGA
TTCAAGAAATTCATATATGTTTCGGGAAAACAAGAATAAAACAATTATTGAATGTTTATT
TTAGTTTTAGTTTAATGATGTAAAGACTCAGATGATTGAATAAAATAAAAA


BQ
10 10 10 45 45 45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 0 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 45 45 45 45 45 45 35 35 35 
35 35 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BD05TF U 9
AF RS1BH50TF U 9
AF RS1FR58JQ C 3
AF RS1FR58TF U 3
AF RS1A724TF U 14
AF RS1E583TF U 1
AF RS1DH80JQ C 4
AF RS1E173JQ C 4
AF RS1DH80TF U 4
AF RS1E173TF U 4
BS 1 22 RS1E583TF
BS 23 23 RS1BH50TF
BS 24 92 RS1E583TF
BS 93 93 RS1BH50TF
BS 94 131 RS1E583TF
BS 132 132 RS1BD05TF
BS 133 409 RS1E583TF
BS 410 410 RS1BH50TF
BS 411 470 RS1E583TF
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GG
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ACGGTGCCTAGGTAGCAAAGTGGATTGTGACGCAATTTGTAAACCGAAACGCCGTCTTTG
AATTTTTCAAAAATAAATTTCTATATTATATATTTCAGTTTTATTCT

QA 3 289 3 289
DS 

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GG
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CTTTTGTATCGTTTTGGTTTTTTTTGCTACTTTTCATGAATATGTCAATCAAGCCGATGC
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ACGGTGCCTAGGTAGCAAAGTGGAATGTGACGCAATTTGTAAACCGAGACGCCGTCTTTG
AATTTTTCAAAAACAAATTTCTATATTATATATTTCAGTTTTATTCTAATCTAAATAATA
CATAGAAAGTTCTCTACGGAAACAACTAGTATTGTCTGCTAAAAGACGTTGGTATCTCGT
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TCATATATGTTTCGGGAAAACAAGAATAAAACAATTATTG

QA 3 462 3 462
DS 

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G
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QA 2 475 2 475
DS 

RD RS1FR58TF 475 0 0
G
GGAACACAAACTAACAAAGCATTTCTTTGCAAAGAAGAATTAAAATGTCAACATCTAAAT
TTGCTTTCTTTTGTATCGTTTTGGTTTTT*TTGCTACTTTTCATGAATATGTCAATCAAG
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AACCAAAACGGTGCCTAGGTAGCAAAGTGGAATGTGACGCAATTTGTAAACCGAGACGCC
GTCTTTGAATTTTTCAAAAACAAATTTCTATATTATATATTTCAGTTTTATTCTAATCTA
AATAATACATAGAAAGTTCTCTACGGAAACAACTAGTATTGTCTGCTAAAAGACGTTGGT
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AAGAAATTCATATATGTTTCGGGAAAACAAGAATAAAACAATTATTGAATGTTT

QA 2 475 2 475
DS 

RD RS1A724TF 457 0 0
GG
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GTATCGTTTTGGTTTTTCTTGCTACTTTTCATGAATATGTCAATCAAGCCGATGCAGCAG
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TATGTTTCGGGAAAACAAGAATAAAACAATTATTG

QA 3 457 3 457
DS 

RD RS1E583TF 531 0 0
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AATTTGCTTTCTTTTGTATCGTTTTGGTTTTT*TTGCTACTTTTCATGAATATGTCAATC
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TGAAACCAAAACGGTGCCTAGGTAGCAAAGTGGAATGTGACGCAATTTGTAAACCGAGAC
GCCGTCTTTGAATTTTTCAAAAACAAATTTCTATATTATATATTTCAGTTTTATTCTAAT
CTAAATAATACATAGAAAGTTCTCTACGGAAACAACTAGTATTGTCTGCTAAAAGACGTT
GGTATCTCGTGGAAGAGCTCAAGTTTTTTTCTTTTCTATTTATGACCTTCTACAATTGGA
TTCAAGAAATTCATATATGTTTCGGGAAAACAAGAATAAAACAATTATTGGATGTTTATT
TTTATTTTAGTTTAATGATGTAAAGACTCAGATGATTGAATAAAATAAAAA

QA 1 531 1 531
DS 

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TTGCTTTCTTTTGTATCGTTTTGGTTTTTTTTGCTACTTCTCATGAATATGTCAATCAAG
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AATAATACATAGAAAGTTCTCTACGGAAACAACTAGTATTGTCTGCTAAAAGACGTTGGT
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G

QA 1 481 1 481
DS 

RD RS1E173JQ 481 0 0
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AATAATACATAGAAAGTTCTCTACGGAAACAACTAGTATTGTCTGCTAAAAGACGTTGGT
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G

QA 1 481 1 481
DS 

RD RS1DH80TF 481 0 0
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AAGAAATTCATATATGTTTCGGGAAAACAAGAATAAAACAATTATTGAATGTTTATTTTA
G

QA 1 481 1 481
DS 

RD RS1E173TF 481 0 0
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AATAATACATAGAAAGTTCTCTACGGAAACAACTAGTATTGTCTGCTAAAAGACGTTGGT
ATCTCGTGGAAGAGCTCAAGTTTTTTTCTTTTCTATTTATGACCTTTTACAATTGGATTC
AAGAAATTCATATATGTTTCGGGAAAACAAGAATAAAACAATTATTGAATGTTTATTTTA
G

QA 1 481 1 481
DS 



AS 1 9

CO CL338Contig1 898 9 11 U
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TTTGCAGAGATGAGTTTTTATCAGCTGGAGGATGTCTTGTTCGGATTGATGATGGGGCCC
GATGGTTACTGTGTCCAGGCGCTAAGCCGCTGTGAGTATAAAGGGACTAAATCCCTTACC
ATGGACGAAGAGTATCGCCTCATGAAGAAACAAGTCGAGGAGACCGAGGGCTTCGACATG
GATTTCAGTCAGTTTCGCTACGCTTTTAATTACAAACCCGTTAATTTCGATGACAACAAG
TTGCCCATGGACGATGGAGAAACCATTAGAGAGTTATTGGACAGGCTCTCTCGTAAATCC
CTTGAGCTATACAATAAGGAGATGAAAACATCATCATATGGGTTTGTGGAGGTTAGCAAA
GCCAACTATCACATGGCTGGTGCCGGCGTCATGTTTTTCATTACCTTTCTAGCTAAAGAA
GATTCTTCTGATAATGAGCCAAAAACATTCCAAGCTAAGGTCCACTATTCCTGCGTTGAC
GACAATAAGTACCTCACCTGCGATCTCAAACCACCACCACCTACGAAAAATGTTCACTCC
ATTGATACTGCGGACAAAGAAGATGCCAAGAAACCAAGGTTGATTCAGGAGAAGGATGCA
AGCAACCACTGGTACACGAGTCTTGTTATATAACGATGACTTGCAACTATTTGCCCTTTC
GTTCGTTGTTTTTCAGAGATCCGGATTGTTGTTCATGCTTTAACAAGAGCTCAGTTTCTG
TGTTTTCACAAACTTTGAAATAATCTTTTTTTAAGAAAAACTATTGTGTATTTTGATTGG
GCCACGTGGTCCATGTTTAACTACTTAATGAATAAACTAAGCAAGCCGTATGAAGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1C749TF U 17
AF RS1D235TF U 6
AF RS1AL22TF U 1
AF RS1F702TF U 6
AF RS1FY08JQ C 139
AF RS1C749JQ C 182
AF RS1AT83JQ C 355
AF RS1F702JQ C 219
AF RS1BP06TF U 458
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BS 487 487 RS1C749TF
BS 488 670 RS1AL22TF
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GG
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TATCAGCTGGGGGATGTCTTGTTTGGATTGATGATGGGGCCCGATGGTTACTGTGTCCAG
GCGCTAAGCCGCTGTGAGTATAAAGGGACTAAATCCCTTACCATGGACGAAGAGTATCGC
CTCATGAAGAAACAAGTCGAGGAGACCGAGGGCTTCGACATGGATTTCAGTCAGTTTCGC
TACGCTTTTAATTACAAACCCGTTAATTTCGATGACAACAAGTTGCCCATGGACGATGGA
GAAACCATTAGAGAGTTATTGGACAGGCTCTCTCGTAAATCCCTTGAGCTATACAATAAG
GAGATGAAAACATCATCATATGGGTTTGTGGAGGTTAGCAAAGCCAACTATCACATGGCT
GGTGCCGGCGTCATGTTTTTCATTACCTTTCTAGCTAAAGAAGATTCTTCTGATAATGAG
CCAAAAACATTCCAAGCTAAGGTCCACTATTCCTGCGTTGACGACAATAAGTACCTCACC
TGCGATCTCAAACCACCACCACCTACGAAAAATGTTCACTCCATTGATACTGCGGACAAA
GAAGAT

QA 3 608 3 608
DS 

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GG
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AGATGAGTTTTTATCAGCTGGAGGATGTCTTGTTCGGATTGATGATGGGGCCCGATGGTT
ACTGTGTCCAGGCGCTAAGCCGCTGTGAGTATAAAGGGACTAAATCCCTTACCATGGACG
AAGAGTATCGCCTCATGAAGAAACAAGTCGAGGAGACCGAGGGCTTCGACATGGATTTCA
GTCAGTTTCGCTACGCTTTTAATTACAAACCCGTTAATTTCGATGACAACAAGTTGCCCA
TGGACGATGGAGAAACCATTAGAGAGTTATTGGACAGGCTCTCTCGTAAATCCCTTGAGC
TATACAATAAGGAGATGAAAACATCATCATATGGGTTTGTGGAGGTTAGCAAAGCCAACT
ATCACATGGCTGGTGCCGGCGTCATGTTTTTCATTACCTTTCTAGCTAAAGAAGATTCTT
CTGATAATGAGCCAAAAACATTCCAAGCTAAGGTCCACTATTCCTGCGTTGACGACAATA
AGTACCTCACCTGCGATCTCAAACCACCACCACCTACGAAAAATGTTCACTCCATTGATA
CTGCTGACAAAGAAGATGCCAAGA

QA 3 626 3 626
DS 

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TTTGCAGAGATGAGTTTTTATCAGCTGGAGGATGTCTTGTTCGGATTGATGATGGGGCCC
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ATGGACGAAGAGTATCGCCTCATGAAGAAACAAGTCGAGGAGACCGAGGGCTTCGACATG
GATTTCAGTCAGTTTCGCTACGCTTTTAATTACAAACCCGTTAATTTCGATGACAACAAG
TTGCCCATGGACGATGGAGAAACCATTAGAGAGTTATTGGACAGGCTCTCTCGTAAATCC
CTTGAGCTATACAATAAGGAGATGAAAACATCATCATATGGGTTTGTGGAGGTTAGCAAA
GCCAACTATCACATGGCTGGTGCCGGCGTCATGTTTTTCATTACCTTTCTAGCTAAAGAA
GATTCTCCTGATAATGAGCCAAAAACATTCCAAGCTAAGGTCCACTATTCCTGCGTTGAC
GACAATAAGTACCTCACCTGCGATCTCAAACCACCACCACCTACGAAAAATGTTCACTCC
ATTGATACTGCGGACAAAGAAGATGCCAAGAAACCAAGGTTGATTCAGGAGAAGGATGCA
AGCAACCACTTGTACACGAGTCTTGTTATATAACGATGACTTGCAACTATTTGCCCTTT

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DS 

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GG
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AGATGAGTTTTTATCAGCTGGAGGATGTCTTGT*CGGATTGATGATGGGGCCCGATGGTT
ACTGTGTCCAGGCGCTAAGCCGCTGTGAGTATAAAGGGACTAAATCCCTTACCATGGACG
AAGAGTATCGCCTCATGAAGAAACAAGTCGAGGAGACCGAGGGCTTCGACATGGATTTCA
GTCAGTTTCGCTACGCTTTTAATTACAAACCCGTTAATTTCGATGACAACAAGTTGCCCA
TGGACGATGGAGAAACCATTAGAGAGTTATTGGACAGGCTCTCTCGTAAATCCCTTGAGC
TATACAATAAGGAGATGAAAACATCATCATATGGGTTTGTGGAGGTTAGCAAAGCCAACT
ATCACATGGCTGGTGCCGGCGTCATGTTTTTCATTACCTTTCTAGCTAAAGAAGATTCTT
CTGATAATGAGCCAAAAACATTCCAAGCTAAGGTCCACTATTCCTGCGTTGACGACAATA
AGTACCTCACCTGCGATCTCAAACCACCACCACCTACGAAAAATGTTCACTCCATTGATA
CTGCGGACAAAGAAGATGCCAAGAAACCAAGGTTGATTCAGGAGAAGGATGCAAGCAACC
ACTGGTACACGAGTCTTGTTATATAACGATGACTTGCAACTATTTGCCCTTTCGTTCGTT
GTTTT*CAGAGATCCGGATTGTTGTTCATGCTTTA
CAG

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DS 

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CTCATGAAGAAACAAGTCGAGGAGACCGAGGGCTTCGACATGGATTTCAGTCAGTTTCGC
TACGCTTTTAACTACAAACCCGTTAATTTCGATGACAACAAGTTGCCCATGGACGATGGA
GAAACCATTAGAGAGTTATTGGACAGGCTCTCTCGTAAATCCCTTGAGCTATACAATAAG
GAGATGAAAACATCATCACATGGGTTTGTGGAGGTTAGCAAAGCCAACTATCACATGGCT
GGTGCCGGCGTCATGTTTTTCATTACCTTTCTAGCTAAAGAAGATTCTTCTGATAATGAG
CCAAAAACATTCCAAGCTAAGGTCCACTATTCCTGCGTTGACGACAATAAGTACCTCACC
TGCGATCTCAAACCACCACCACCTACGAAAAATGTTCACTCCATTGATACTGCGGACAAA
GAAGATGCCAAGAAACCAAGGTTGATTCAGGAGAAGGATGCAAGCAACCACTGGTACACG
AGTCTTGTTATATAACGATGACTTGCAACTATTTGCCCTTTCGTTCGTTGTTTTTCAGAG
ATCCGGATTGTTGTTCATGCTTTAACAAGAGCTCAGTTTCTGTGTTTTCACAAACTTTGA
AATAATCTTTTTTT

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DS 

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ATTTCAGTCAGTTTCGCTACGCTTTTAATTACAAACCCGTTAATTTCGATGACAACAAGT
TGCCCATGGACGATGGAGAAACCATTAGAGAGTTATTGGACAGGCTCTCTCGTAAATCCC
TTGAGCTATACAATAAGGAGATGAAAACATCATCATATGGGTTTGTGGAGGTTAGCAAAG
CCAACTATCACATGGCTGGTGCCGGCGTCATGTTTTTCATTACCTTTCTAGCTAAAGAAG
ATTCTTCTGATAATGAGCCAAAAACATTCCAAGCTAAGGTCCACTATTCCTGCGTTGACG
ACAATAAGTACCTCACCTGCGATCTCAAACCACCACCACCTACGAAAAATGTTCACTCCA
TTGATACTGCGGACAAAGAAGATGCCAAGAAACCAAGGTTGATTCAGGAGAAGGATGCAA
GCAACCACTGGTACACGAGTCTTGTTATATAACGATGACTTGCAACTATTTGCCCTTTCG
TTCGTTGTTTTTCAGAGATCCGGATTGTTGTTCATGCTTTAACAAGAGCTCAGTTTCTGT
GTTTTCACAAACTTTGAAATAATCTTTTTTTAAGAAAAACTATTGTGTATTTTGATTGGG
CCACGTGGTCCATGTTTAACTACTTAATGAATAAACTAAGCAAGCCGTATGAAGAG
C

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DS 

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AGCAAAGCCAACTATCACATGGCTGGTGCCGGCGTCATGTTTTTCATTACCTTTCTAGCT
AAAGAAGATTCTTCTGATAATGAGCCAAAAACATTCCAAGCTAAGGTCCACTATTCCTGC
GTTGACGACAATAAGTACCTCACCTGCGATCTCAAACCACCACCACCTACGAAAAATGTT
CACTCCATTGATACTGCGGACAAAGAAGATGCCAAGAAACCAAGGTTGATTCAGGAGAAG
GATGCAAGCAACCACTGGTACACGAGTCTTGTTATATAACGATGACTTGCAACTATTTGC
CCTTTCGTTCGTTGTTTTTCAGAGATCCGGATTGTTGTTCATGCTTTAACAAGAGCTCAG
TTTCTGTGTTTTCACAAACTTTGAAATAATCTTTTTTTAAGAAAAACTATTGTGTATTTT
GATTGGGCCACGTGGTCCATGTTTAACTACTTAATGAATAAACTAAGC

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DS 

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GGACAGGCTCTCTCGTAAATCCCTTGAGCTATACAATAAGGAGATGAAAACATCATCATA
TGGGTTTGTGGAGGTTAGCAAAGCCAACTATCACATGGCTGGTGCCGGCGTCATGTTTTT
CATTACCTTTCTAGCTAAAGAAGATTCTTCTGATAATGAGCCAAAAACATTCCAAGCTAA
GGTCCACTATTCCTGCGTTGACGACAATAAGTACCTCACCTGCGATCTCAAACCACCACC
ACCTACGAAAAATGTTCACTCCATTGATACTGCGGACAAAGAAGATGCCAAGAAACCAAG
GTTGATTCAGGAGAAGGATGCAAGCAACCACTGGTACACGAGTCTTGTTATATAACGATG
ACTTGCAACTATTTGCCCTTTCGTTCGTTGTTTTTCAGAGATCCGGATTGTTGTTCATGC
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AACTATTGTGTATTTTGATTGGGCCACGTGGTCCATGTTTAACTACTTAATG

QA 1 652 1 652
DS 

RD RS1BP06TF 441 0 0
G
CATTACCTTTCTAGCTAAAGAAGATTCTTCTGATAATGAGCCAAAAACATTCCAAGCTAA
GGTCCACTATTCCTGCGTTGACGACAATAAGTACCTCACCTGCGATCTCAAACCACCACC
ACCTACGAAAAATGTTCACTCCATTGATACTGCGGACAAAGAAGATGCCAAGAAACCAAG
GTCGATTCAGGAGAAGGATGCAAGCAACCACTGGTACACGAGTCTTGTTATATAACGATG
ACTTGCAACTATTTGCCCTTTCGTTCGTTGTTTTTCAGAGATCCGGATTGTTGTTCATGC
TTTAACAAGAGCTCAGTTTCTGTTTTTTCACAAACTTTGAAATAATCTTTTTTTAAGAAA
AACTATTGTGTATTTTGATTGGGCCACGTGGTCCATGTTTAACTACTTAATGAATAAACT
AAGCAAGCCGTATGAAGAGT

QA 2 441 2 441
DS 



AS 1 10

CO CL339Contig1 686 10 3 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAACCATCAA
ACAAGTAAAAGATTATTCAAAAGAATTAATAATAAAGCGTGTGTATCATAAACAATATGT
CATCATCACAGTTTGCTATCTTTTGCATTATCTTGGTTGCTTTATTTCCTCTTCATGAAT
GTGTCGATGCAGCTAAAGATTCTTGCAACCATACCACATGCGGCAAAAACACCAAAGTTA
AGAATTGCTTTTGTTGTTCCTACAATAAGGGTTGTTTCCCGACCAGAAAAGGGTGTGCAG
TTTGGTGTCCAACTCGATAAGCTACATCAAGGATTTAAGAAAACCCGAATAACTATTTTA
TTTAATTATTCCTAATATCTACTTTTGTTTTATATGGAAAAACATGCTCATCTGAAGACC
ACAAAATACATATGCATATTGTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTTTATTCTATATAA
TGCACATAAGTTAAACTTATTTTCTCTTATTTTGTTTTAATTTGTTATTAATTTCTTAAT
ATTTTCCGGGTTAATAGCTAACAATAAATTTTTAAATTTCATAGTTTTTATAGTACATGA
TATGTTTTTTTTTCTATTTTCTTCTACACCATATCACTACCACTTGTGAACAAGGGAAAT
AAACTATCAAAAAGAAAATTTAGAGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 45 
60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
45 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D287JQ C 50
AF RS1D287TF U 50
AF RS1A365TF U 1
AF RS1A365TR C 50
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AGGGTGTGCAGTTTGGTGTCCAACTCGATAAGCTACATCAAGGATTTAAGAAAACCCGAA
TAACTATTTTATTTAATTATTCCTAATATCTACTTTTGTTTTATATGGAAAAACATGCTC
ATCTGAAGACCACAAAATACATATGCATATTGTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTTT
ATTCTATATAATGCACATAAGTTAAACTTATTTTCTCTTATTTTGTTTTAATTTGTTATT
AATTTCTTAATATTTTCCGGGTTAATAGCTAACAATAAATTTTTAAATTTCATAGTTTTT
AT

QA 1 542 1 542
DS 

RD RS1A365TV 591 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAACCATCAA
ACAAGTAAAAGATTATTCAAAAGAATTAATAATAAAGCGTGTGTATCATAAACAATATGT
CATCATCACAGTTTGCTATCTTTTGCATTATCTTGGTTGCTTTATTTCCTCTTCATGAAT
GTGTCGATGCAGCTAAAGATTCTTGCAACCATACCACATGCGGCAAAAACACCAAAGTTA
AGAATTGCTTTTGTTGTTCCTACAATAAGGGTTGTTTCCCGACCAGAAAAGGGTGTGCAG
TTTGGTGTCCAACTCGATAAGCTACATCAAGGATTTAAGAAAACCCGAATAACTATTTTA
TTTAATTATTCCTAATATCTACTTTTGTTTTATATGGAAAAACATGCTCATCTGAAGACC
ACAAAATACATATGCATATTGTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTTTATTCTATATAA
TGCACATAAGTTAAACTTATTTTCTCTTATTTTGTTTTAATTTGTTATTAATTTCTTAAT
ATTTTCCGGGTTAATAGCTAACAATAAATTTTTAAATTTCATAGTTTTTAT

QA 1 591 1 591
DS 

RD RS1A365JQ 542 0 0
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TAACTATTTTATTTAATTATTCCTAATATCTACTTTTGTTTTATATGGAAAAACATGCTC
ATCTGAAGACCACAAAATACATATGCATATTGTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTTT
ATTCTATATAATGCACATAAGTTAAACTTATTTTCTCTTATTTTGTTTTAATTTGTTATT
AATTTCTTAATATTTTCCGGGTTAATAGCTAACAATAAATTTTTAAATTTCATAGTTTTT
AT

QA 1 542 1 542
DS 

RD RS1E662TF 524 0 0
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ATCTGAAGACCA*AAAATACATATGCATATTGTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTTT
ATTCTATATAACACACATAAGTTAAACTTATTTTCTCTTATTTTGTTTTAATTTGTTATT
AATTTCTTAATATTTTCCGGGTTAATAGCTAACAATAAATTTTT

QA 1 524 1 524
DS 

RD RS1A802TF 528 0 0
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AACAATATGTCATCATCACAGTTTGCCATCTTTTGCATTATCTTGGTTGCTTTATTTCCT
CTTCATGAATGTGTCGATGCAGCTAAAGATTCTTGCAACCATACCACATGCGGCAAAAAC
ACCAAAGTTAAGAATTGCTTTTGTTGTTCCTACAATAAGGGTTGTTTCCCGACCAGAAAA
GGGTGTGCAGTTTGGTGTCCAACTCGATAAGCTACATCAAGGATTTAAGAAAACCCGAAT
AACTATTTTATTTAATTATTCCTAATATCTACTTTTGTTTTATATGGAAAAACATGCTCA
TCTGAAGAC*ACAAAATACATATGCATATTGTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTTTA
TTCTATATAATGCACATAAGTTAAACTTATTTTCTCTTATTTTGTTTTAATTTGTTATTA
ATTTCTTAATATTTTCCGGGTTAATAGCTAACAATAAATTTTTAAATT

QA 1 528 1 528
DS 

RD RS1EU54JQ 637 0 0
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AAACAATATGTCATCATCACAGTTTGCTATCTTTTGCATTATCTTGGTTGCTTTATTTCC
TCTTCATGAATGTGTCGATGCAGCTAAAGATTCTTGCAACCATACCACATGCGGCAAAAA
CACCAAAGTTAAGAATTGCTTTTGTTGTTCCTACAATAAGGGTTGTTTCCCGACCAGAAA
AGGGTGTGCAGTTTGGTGTCCAACTCGATAAGCTACATCAAGGATTTAAGAAAACCCGAA
TAACTATTTTATTTAATTATTCCTAATATCTACTTTTGTTTTATATGGAAAAACATGCTC
ATTTGAAGACCACAAAATACATATGCATATTGTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTTT
ATTCTATATAATGCACATAAGTTAAACTTATTTTCTCTTATTTTGTTTTAATTTGTTATT
AATTTCTTAATATTTTCCGGGTTAATAGCTAACAATAAATTTTTAAATTTCATAGTTTTT
ATAGTACATGATATGTTTTTTTTTCTATTTTCTTCTACACCATATCACTACCACTTGTGA
ACAAGGGAAATAAACTATCAAAAAGAAAATTTAGAGT

QA 1 637 1 637
DS 

RD RS1EU54TF 624 0 0
GGAACCATCAAACAAGTAAAAGATTATTCAAAAGAATTAATAATAAAGCGTGTGTATCAT
AAACAATATGTCATCATCACAGTTTGCTATCTTTTGCATTATCTTGGTTGCTTTATTTCC
TCTTCATGAATGTGTCGATGCAGCTAAAGATTCTTGCAACCATACCACATGCGGCAAAAA
CACCAAAGTTAAGAATTGCTTTTGTTGTTCCTACAATAAGGGTTGTTTCCCGACCAGAAA
AGGGTGTGCAGTTTGGTGTCCAACTCGATAAGCTACATCAAGGATTTAAGAAAACCCGAA
TAACTATTTTATTTAATTATTCCTAATATCTACTTTTGTTTTATATGGAAAAACATGCTC
ATCTGAAGACCACAAAATACATATGCATATTGTATTTGTGTTTAGAAACTTTCATATTTT
ATTCTATATAATGCACATAAGTTAAACTTATTTTCTCTTATTTTGTTTTAATTTGTTATT
AATTTCTTAATATTTTCCGGGTTAATAGCTAACAATAAATTTTTAAATTTCATAGTTTTT
ATAGTACATGATATGTTTTTTTTTCTATTTTCTTCTACACCATATCACTACCACTTGTGA
ACAAGGGAAATAAACTATCAAAAA

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 10

CO CL340Contig1 1023 10 16 U
GGACACAAGAAAACACCAAAATCCTTCTAAAAATGGCTCAACACTTATCTCTTCTCTTTT
GCCTCTTTCTCTCATTCTTCTCAATACTGTTTTCCAACCAAACCGAGGCTACCACAGTCG
CGCGTCTGGTGCCAAAATCGCTTTACGACTCAATGTTCATCCACAAGGAAAATACTGCTT
GTCCAGCAAATGGTTTCTACACTTACGAATCCTTTGTGAAGGCAACGAGGCGGTTTCCAA
GATTTGGAAGCATCGGATCCATGGAGACACGAAGACGCGAGGTGGCAGCGTTTTTGGCTC
AGATTTCACACGAAACAACTGGAGGGTGGCCAACGGCACCGGACGGACCGTATGCTTGGG
GGTTGTGTTTTAAAGAAGAAATAAGTCCACAAAGCAATTATTGTGATTCTTCTAATACTG
AATGGCCTTGTTTCTCTAACAAGACTTACCATGGTAGAGGTCCAATTCAACTCTCGTGGA
ACTATAACTACGGACCGGCCGGTCGAGCTTTAGGATTCGACGGTCTAAGGAATCCCGAGA
TAGTGGCGAATAATTCAGTGATAGCTTTCCAAACAGCACTTTGGTTTTGGATGACGGAGC
AGAGTCCCAAACCTTCGTGCCATGACGTTATGATCGGTAGATACAGACCTACAGAGGCGG
ATTTGGCAGCTAACCGGACCGGTGGATTCGGTTTAACCACGAACATTATAAACGGCGGTT
TAGAGTGCGGGATTGCTGGAGATGGGCGGGTCAATGACCGGATCGGGTTTTATCAGAGAT
ATGCTGGGCTGTTAAATGTAGGAACTGGGCCTAACTTGGACTGTGAAAACCAGAGGCCCT
TCGCTTAAATAACAATTTGGTTGACCCAAGATTTTATTTACTTTGAATAAGCAAAAAAGG
TTAAACATGTATGCACATGCATTGTGCCCACACATGGATGGATTTGATTGAATATTGTCT
ATTTCCTTTTTTTATTTTCTATGGATCATCTTTCAATTTAATGTGATTTGGTTTTAATTG
GCC


BQ
10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 45 45 45 45 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 

AF RS1DB12TF U -2
AF RS1B466TF U 1
AF RS1E982TF U 1
AF RS1D285TF U 5
AF RS1DX68TF U 2
AF RS1F093TF U 2
AF RS1F093JQ C 353
AF RS1D285JQ C 479
AF RS1DX68JQ C 421
AF RS1E982JQ C 466
BS 1 189 RS1B466TF
BS 190 190 RS1E982TF
BS 191 307 RS1B466TF
BS 308 308 RS1E982TF
BS 309 584 RS1B466TF
BS 585 585 RS1E982TF
BS 586 672 RS1B466TF
BS 673 673 RS1E982TF
BS 674 685 RS1B466TF
BS 686 689 RS1E982TF
BS 690 690 RS1F093JQ
BS 691 702 RS1E982TF
BS 703 849 RS1F093JQ
BS 850 850 RS1DX68JQ
BS 851 998 RS1F093JQ
BS 999 1023 RS1DX68JQ

RD RS1DB12TF 665 0 0
GGACACAAAAAAAAC
ACACCGAAATCCTTCTAAAAATGGCTCAACACCTACCTCTGCTCTTTTGCATCTTTCTCT
CATTCTTCTCAATACTGTCTTCCAACCAAACCGAGGCTACCACAGTCGCGCGTCTGGTGC
CAAAATCTCTTTACGACTTAATGTTCATCCACAAGGACAATACTGCTTGTCCAGCAAATG
GTTTCTACACTTACGAATCCTTTGTGAAGGCAACGAGGCGGTTTCCAAGATTTGGAAGCG
TCGGATCCATGGAGACACGAAGACGCGAGGTGGCAGCGTTTTTGGCTCAGATTTCACACG
AAACAACTGGAGGGTGGCCAACGGCACCGGACGGACCGTATGCTTGGGGGTTGTGTTTTA
AAGAAGAAATAAGTCCACAAAGCAATTATTGTGATTCTTCTAATACTGAATGGCCTTGTT
TCTCTAACAAGACTTACCATGGAAGAGGTCCAATTCAACTCTCGTGGAACTATAACTACG
GACCGGCCGGTCGAGCTTTAGGATTCGACGGTCTAAGGAATCCCGAGATAGTGGCGAATA
ATTCAGTGATAGCTTTCCAAACAGCACTTTGGTTTTGGATGACGGAGCAGAGTCCCAAAC
CTTCGTGCCATGACGTTATGATCGGTAGATACAGACCTACAGAGGC
AGAT

QA 16 661 16 661
DS 

RD RS1B466TF 685 0 0
GGACACAAGAAAACACCAAAATCCTTCTAAAAATGGCTCAACACTTATCTCTTCTCTTTT
GCCTCTTTCTCTCATTCTTCTCAATACTGTTTTCCAACCAAACCGAGGCTACCACAGTCG
CGCGTCTGGTGCCAAAATCGCTTTACGACTCAATGTTCATCCACAAGGAAAATACTGCTT
GTCCAGCAAGTGGTTTCTACACTTACGAATCCTTTGTGAAGGCAACGAGGCGGTTTCCAA
GATTTGGAAGCATCGGATCCATGGAGACACGAAGACGCGAGGTGGCAGCGTTTTTGGCTC
AGATTTCGCACGAAACAACTGGAGGGTGGCCAACGGCACCGGACGGACCGTATGCTTGGG
GGTTGTGTTTTAAAGAAGAAATAAGTCCACAAAGCAATTATTGTGATTCTTCTAATACTG
AATGGCCTTGTTTCTCTAACAAGACTTACCATGGTAGAGGTCCAATTCAACTCTCGTGGA
ACTATAACTACGGACCGGCCGGTCGAGCTTTAGGATTCGACGGTCTAAGGAATCCCGAGA
TAGTGGCGAATAATTCAGTGATAGCTTTCCAAACAGCACTTTGGCTTTGGATGACGGAGC
AGAGTCCCAAACCTTCGTGCCATGACGTTATGATCGGTAGATACAGACCTACAGAGGCGG
ATTTGGCAGCTA*CCGGACCGGTGG

QA 1 685 1 685
DS 

RD RS1E982TF 717 0 0
G
GACACAAGAAAACACCAAAATCCTTCTAAAAATGGCTCAACACTTATCTCTTCTCTTTTG
CCTCTTTCTCTCATTCTTCTCAATACTGTTTTCCAACCAAACCGAGGCTACCACAGTCGC
GCGTCTGGTGCCAAAATCGCTTTACGACTCAATGTTCATCCACAAGGAAAATACTGCTTG
TCCAGCAAATGGTTTCTACACTTACGAATCCTTTGTGAAGGCAACGAGGCGGTTTCCAAG
ATTTGGAAGCATCGGATCCATGGAGACACGAAGACGCGAGGTGGCAGCGTTTTTGT*TCA
GATTTCACACGAAACAACTGGAGGGTGGCCAACGGCACCGGACGGACCGTATGCTTGGGG
GTTGTGTTTTAAAGAAGAAATAAGTCCACAAAGCAATTATTGTGATTCTTCTAATACTGA
ATGGCCTTGTTTCTCTAACAAGACTTACCATGGTAGAGGTCTAATTCAACTCTCGTGGAA
CTATAACTACGGACCGGCCGGTCGAGCTTTAGGATTCGACGGTCTAAGGAATCCCGAGAT
AGTGGCGAATAATTCAGTGATAGCTTTCCAAACAGCACTTTGGTTTTGGATGACGGAGCA
GAGTCCCAGACCTTCGTGCCATGACGTTATGATCGGTAGATACAGACCTACAGAGGCGGA
TTTGGCAGCTAACCGGACCGGTGGATTCTGTTTAACCACGA
CATATAAACGCGGTT

QA 2 702 2 702
DS 

RD RS1D285TF 688 0 0
GG
AAGAAAACACCAAAATCCTTCTAAAAATGGCTCAACACTTATCTCTTCTCTTTTGCCTCT
TTCTCTCATTCTTCTCAATACTGTTTTCCAACCAAACCGAGGCTACCACAGTCGCGCGTC
TGGTGCCAAAATCGCTTTACGACTCAATGTTCATCCACAAGGAAAATACTGCTTGTCCAG
CAAATGGTTTCTACACTTACGAATCCTTTGTGAAGGCAACGAGGCGGTTTCCAAGATTTG
GAATCATCGGATCCATGGAGACACGAAGACGCGAGGTGGCAGCGTTTT*GGCTCAGATTT
CATACGAAACAACTGGAGGGTGGCCAACGGCACCGGACGGACCGTATGCTTGGGGGTTGT
GTTTTAAAGAAGAAATAAGTCCACAAAGCAATTATTGTGATTCTTCTAATACTGAATGGC
CTTGTTTCTCTAACAAGACTTACCATGGTAGAGGTCCAATTCAACTCTCGTGGAACTATA
ACTACGGACCGGCCGGTCGAGCTTTAGGATTCGACGGTCTAAGGAATCCCGAGATAGTGG
CGAATAATTCAGTGATAGCTTTCCAAACAGCACTTTGGTTTTGGATGACGGAGCAGAGTC
CCAAACCTTCGTGCCATGACGTTATGATCGGTAGATACAGACCTACAGAGGCGGATTTGG
CAGCTAACCGGACCGGTGGATTC
AGT

QA 3 685 3 685
DS 

RD RS1DX68TF 701 0 0
GACACAAGAAAACACCAAAATCCTTCTAAAAATGGCTCAACACTTATCTCTTCTCTTTTG
CCTCTTTCTCTCATTCTTCTCAATACTGTTTTCCAACCAAACCGAGGCTACCACAGTCGC
GCGTCTGGTGCCAAAATCGCTTTACGACTCAATGTTCATCCACAAGGAAAATACTGCTTG
TCCAGCAAATGGTTTCTACACTTACGAATCCTTTGTGAAGGCAACGAGGCGGTTTCCAAG
ATTTTGAAGCATCGGATCCATGGAGACACGAAGACGCGAGGTGGCAGCGTTTTTGGCTCA
GATTTCACACGAAACAACTGTAGGGTGGCCAACGGCACCGGACGTACCGTATGCTTGGGG
GTTGTGTTTTAAAGAAGAAATAAGTCCACAAAGCAATTATTGTGATTCTTCTAATACTGA
ATGGCCTTGTTTCTCTAACAAGACTTACCATGGTAGAGGTCCAATTCAACTCTCGTGGAA
CTATAACTACGGACCGGCCGGTCGAGCTTTAGGATTCGACGGTCTAAGGAATCCCGAGAT
AGTGGCGAATAATTCAGTGATAGCTTTCCAAACAGCACTTTGGTTTTGGATGACGGAGCA
GAGTCCCAAACCTTCGTGCCATGACGTTATGATCGGTAGATACAGACCTACAGAGGCGGA
TTTGGCAGCTAACCGGACCGGTGGATTC*GTTTAACCACGA

QA 1 701 1 701
DS 

RD RS1F093TF 679 0 0
GACACAAGAAAACACCAAAATCCTTCTAAAAATGGCTCAACACTTATCTCTTCTCTTTTG
CCTCTTTCTCTCATTCTTCTCAATACTGTTTTCCAACCAAACCGAGGCTACCACAGTCGC
GCGTCTGGTGCCAAAATCGCTTTACGACTCAATGTTCATCCACAAGGAAAATACTGCTTG
TCCAGCAAATGGTTTCTACACTTACGAATCCTTTGTGAAGGCAACGAGGCGGTTTCCAAG
ATTTGGAAGCATCGGATCCATGGAGACACGAAGACGCGAGGTGGCAGCGTTTTTGGCTCA
GATTTCACACGAAACAACTGGAGGGTGGCCAACGGCACCGGACGGACCGTATGCTTGGGG
GTTGTGTTTTAAAGAAGAAATAAGTCCACAAAGCAATTATTGTGATTCTTCTAATACTGA
ATGGCCTTGTTTCTCTAACAAGACTTACCATGGTAGAGGTCCAATTCAACTCTCGTGGAA
CTATAACTACGGACCGGCCGGTCGAGCTTTAGGATTCGACGGTCTAAGGAATCCCGAGAT
AGTGGCGAATAATTCAGTGATAGCTTTCCAAACAGCACTTTGGTTTTGGATGACGGAGCA
GAGTCCCAAACCTTCGTGCCATGACGTTATGATCGGTAGATACAGACCTACAGAGGCGGA
TTTGGCAGCTAACCGGACC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1F093JQ 647 0 0
TGCTTGGGGGTTGTGTTTTAAAGAAGAAATAAGTCCACAAAGCAATTATTGTGATTCTTC
TAATACTGAATGGCCTTGTTTCTCTAACAAGACTTACCATGGTAGAGGTCCAATTCAACT
CTCGTGGAACTATAACTACGGACCGGCCGGTCGAGCTTTAGGATTCGACGGTCTAAGGAA
TCCCGAGATAGTGGCGAATAATTCAGTGATAGCTTTCCAAACAGCACTTTGGTTTTGGAT
GACGGAGCAGAGTCCCAAACCTTCGTGCCATGACGTTATGATCGGTAGATACAGACCTAC
AGAGGCGGATTTGGCAGCTAACCGGACCGGTGGATTCGGTTTAACCACGAACATTATAAA
CGGCGGTTTAGAGTGCGGGATTGCTGGAGATGGGCGGGTCAATGACCGGATCGGGTTTTA
TCAGAGATATGCTGGGCTGTTAAATGTAGGAACTGGGCCTAACTTGGACTGTGAAAACCA
GAGGCCCTTCGCTTAAACAACAATTTGGTTGACCCAAGATTTTATTTACTTTGAATAAGC
AAAAAAGGTTAAACATGTATGCACATGCATTGTGCCCACACATGGATGGATTTGATTGAA
TATTGTCTATTTCCTTTTTTTATTTTCTATGGATCATCTTTCAATT
T

QA 1 646 1 646
DS 

RD RS1D285JQ 521 0 0
GAACTATAACTACGGACCGGCCGGTCGAGCTTTAGGATTCGACGGTCTAAGGAATCCCGA
GATAGTGGCGAATAATTCAGTGATAGCTTTCCAAACAGCACTTTGGTTTTGGATGACGGA
GCAGAGTCCCAAACCTTCGTGCCATGACGTTATGATCGGTAGATACAGACCTACAGAGGC
GGATTTGGCAGCTAACCGGACCGGTGGATTCGGTTTAACCACGAACATTATAAACGGCGG
TTTAGAGTGCGGGATTGCTGGAGATGGGCGGGTCAATGACCGGATCGGGTTTTATCAGAG
ATATGCTGGGCTGTTAAATGTAGGAACTGGGCCTAACTTGGACTGTGAAAACCAGAGGTC
CTTCGCTTAAATAACAATTTGGTTGACCCAAGATTTTATTTACTTTGAATAAGCAAAAA*
GGTTAAACATGTATGCACATGCATTGTGCCCACACATGGATGGATTTGATTGAATATTGT
CTATTTCCTTTTTTTATTTTCTATGGATCATCTTTCAATT
C

QA 1 520 1 520
DS 

RD RS1DX68JQ 603 0 0
AATGGCCTTGTTTCTCTAACAAGACTTACCATGGTAGAGGTCCAATTCAACTCTCGTGGA
ACTATAACTACGGACCGGCCGGTCGAGCTTTAGGATTCGACGGTCTAAGGAATCCCGAGA
TAGTGGCGAATAATTCAGTGATAGCTTTCCAAACAGCACTTTGGTTTTGGATGACGGAGC
AGAGTCCCAAACCTTCGTGCCATGACGTTATGATCGGTAGATACAGACCTACAGAGGCGG
ATTTGGCAGCTAACCGGACCGGTGGATTCGGTTTAACCACGAACATTATAAACGGCGGTT
TAGAGTGCGGGATTGCTGGAGATGGGCGGGTCAATGACCGGATCGGGTTTTATCAGAGAT
ATGCTGGGCTGTTAAATGTAGGAACTGGGCCTAACTTGGACTGTGAAAACCAGAGGCCCT
TCGCTTAAATAACAATTTGGTTGACCCAAGATTTTATTTACTTTGAATAAGCAAAAAAGG
TTAAACATGTATGCACATGCATTGTGCCCACACATGGATGGATTTGATTGAATATTGTCT
ATTTCCTTTTTTTATTTTCTATGGATCATCTTTCAATTTAATGTGATTTGGTTTTAATTG
GCC

QA 1 603 1 603
DS 

RD RS1E982JQ 558 0 0
TTCAACTCTCGTGGAACTATAACTACGGACCGGCCGGTCGAGCTTTAGGATTCGACGGTC
TAAGGAATCCCGAGATAGTGGCGAATAATTCAGTGATAGCTTTCCAAACAGCACTTTGGT
TTTGGATGACGGAGCAGAGTCCCAGACCTTCGTGCCATGACGTTATGATCGGTAGATACA
GACCTACAGAGGCGGATTTGGCAGCTAACCGGACCGGTGGATTCGGTTTAACCACGAACA
TTATAAACGGCGGTTTAGAGTGCGGGATTGCTGGAGATGGGCGGGTCAATGACCGGATCG
GGTTTTATCAGAGATATGCTGGGCTGTTAAATGTAGGAACTGGGCCTAACTTGGACTGTG
AAAACCAGAGGCCCTTCGCTTAAATAACAATTTGGTTGACCCAAGATTTTATTTACTTTG
AATAAGCAAAAAAGGTTAAACATGTATGCACATGCATTGTGCCCACACATGGATGGATTT
GATTGAATATTGTCTATTTCCTTTTTTTATTTTCTATGGATCATCTTTCAATTTAATGTG
ATTTGGTTTTAATTGG
AC

QA 1 556 1 556
DS 



AS 1 10

CO CL341Contig1 1329 10 23 U
CCTGGAAGTTAATAGATGCCCTTATTAATTTAGAAGAAGAAAATTATTCAAAATCCTTTT
TATAGGAATCACTCGCTTCTGTATGTAACATACAGAGCGGTTACATTCTATCTGTATTGT
CTTACAGAGTTATTACATGCATACGTCGGTCTTTAGCTAGACACTCCTGGCCTATACCGA
TCTTAGTTTTATATACAAAAAAAATATCTGATAGTTTAGCTACTAATTAAAATAAGTATT
TTGGCATTACTGGATGGTCATACTTGCTGATTTTCCGCGTATTAATGCAGCTTCTCAATT
GGTCTTGAGCCTACCCATACTGTTCTCCTGCTGAGAAGAAGCAGCGGTCTCCTGCTGAGA
AGAAGCAGTCTGTTTCTGAGAAGAAGCAGCTGTATGTTTCTGAGAAGAAGCAGCGGTCTG
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ATGTAGATGAAGATGAAGCTGAGCTTGAAGAAGCAGCAGTCTCAACAAACTGGGTCGTGA
CTTTTTCAATCTTTGACATGGTCTGCTTAATCTGTGACTCTTTTGTCGATGATACTTTCT
GTTCGCCCACGATTTTGCTGTTGAGATCTTGAAATTCTTTAATATTCTTCATCAACTCTT
CTTGGGTAGTCTTGATGGTGCTCTTCATCTCTTCTGATTTGCTAAATCTTGAACCCACGA
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CGGATTTGGTGGAAGAAACCCTTGAGGAGGCAGTCATGGAAGCCTTGAGCTTCTCGAAGA
AGGGTTTGAGTTCTTGCTTTTGTGCAAACCTTTTCTCAAGTCCAGATATGAATGAACTTG
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TCTCGCTTTTCTCGCTTTTGGATTGTTGTTGATTCATGGAAGAAGCAGCACTTCCAGCGT
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TGGTCGAAGAACTAGCACCAGCTTTGGTCGAAGAACTAGCACCAGCTTTGCTCGAGGAGG
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TCTTCGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H125JQB U 32
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AF RS1DU30JQ U 1
AF RS1DM06JQ U 49
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AF RS1DU30TF C 542
AF RS1H125TF C 417
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AF RS1DP24TF C 684
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AAAATAAGTATTTTGGCATTACTGGATGGTCATACTTGCTGATTTTCCGCGTATTAATGC
AGCTTCTCAATTGGTCTTGAGCCTACCCATACTGTTCTCCTTCTGAGAAGAAGCAGCGGT
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TCATCAACTCTTCTTGGGTAG

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CTTACAGAGTTATTACATGCATACGTCGGTCTTTAGCTAGACACTCCTGGCCTATACCGA
TCTTAGTTTTATATACAAAAAAAATATCTGATAGTTTAGCTACTAATTAAAATAAGTATT
TTGGCATTACTGGATGGTCATACTTGCTGATTTTCCGCGTATTAATGCAGCTTCTCAATT
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TTTCTGAGAAGAAGCAGCGTTCTGTTCCTGAGAGGAACC*AGCGTTTTGTTGCTGAGAGG
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CTTTTTCAATCTTTGACATGGTCTGCTTAATCTGTGACTCTTTTGTCGATGATACTTTCT
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CTTGGGTAGTCTTGATGGTGCTCTTCATCTCTTCTGATTTGCTAAATCTTGAACCCACGA
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CGGATTTGGTGGAAGAA*CCCTTGAGGAGGCAGTCATGGAAGC*TTGAGCTTCTCGA

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TATCTGTATTGTCTTACAGAGTTATTACATGCATACGTCGGTCTTTAGCTAGACACTCCT
GGCCTATACCGATCTTAGTTTTATATACAAAAAAAATATCTGATAGTTTAGCTACTAATT
AAAATAAGTATTTTGGCATTACTGGATGGTCATACTTGCTGATTTTCCGCGTATTAATGC
AGTTTCTCAATTGGTCTTGAGCCTACCCATACTGTTCTCCTTCTGAGAAGAAGCAGCGGT
CTCCTGCTGAGAAGAAGCAGTCTGTTTCTGAGAAGAAGCAGCTGTATGTTTCTGAGAAGA
AGCAGCGGTCTGTTTCTGAGAAGAAGCAGCGTTCTGTTCCTGAGAGGAACC*AGCGTTTT
GTTGCTGAGAGGATGTAGATGAAGATGAAGCTGAGCTTGAAGAAGCAGCAGTCTCAACAA
ACTGGGTCGTGACTTTTTCAATCTTTGACATGGTCTGCTTAATCTGTGACTCTTTTGTCG
ATGATACTTTCTGTTCGCCCACGATTTTGCTGTTGAGATCTTGAAATTCTTTAATATTCT
TCATCAACTCTTCTTGGGTAGTCTTGATGGTGCTCTTCATCTCTTCTGATTTGCTAAATC
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GCTTCTCGAA

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ACG
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CCTGGCCTATACCGATCTTAGTTTTATATACAAAAAAAATATCTGATAGTTTAGCTACTA
ATTAAAATAAGTATTTTGGCATTACTGGATGGTCATACTTGCTGATTTTCCGCGTATTAA
TGCAGCTTCTCAATTGGTCTTGAGCCTACCCATACTGTTCTCCTGCTGAGAAGAAGCAGC
GGTCTCCTGCTGAGAAGAAGCAGTCTGTTTCTGAGAAGAAGCAGATGTATGTTTCTGAGA
AGAAGCAGCGGTCTGTTTCTGAGAAGAAGCAGCGTTCTGTTCCTGAGAGGAACC*AGCGT
TTTGTTGCTGAGAGGATGTAGATGAAGATGAAGCTGAGCTTGAAGAAGCAGCAGTCTCAA
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TCTTCATCAACTCTTCTTGGGTAGTCTTGATGGTGCTCTTCATCTCTTCTGATTTGCTAA
ATCTTGAACCCACGAAAGTCATGGCATCAGATAGTTTACCAGTGGTTGATCTAGCTGTAG
AAGAATATTCTTGTGCGGATTTGGTGGAAGAAACCCTTGAGGAGGCAGTCATGGAAGCCT
TGAGCTTCTCGAAGAAGGGTTTGAGTTCTTGCTTTTGTGCAAACCTTTTCTCAAGTCCAG
ATATGAATGAACTTGTTTCTTGTGAAGTCTCTTTCTCGATTTCCGTCACTGATGTGGTCG
CTGATGA

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GCGTTCTGTTCCTGAGAGGAACC*AGCGTTTTGTTGCTGAGAGGATGTAGATGAAGATGA
AGCTGAGCTTGAAGAAGCAGCAGTCTCAACAAACTGGGTCGTGACTTTTTCAATCTTTGA
CATGGTCTGCTTAATCTGTGACTCTTTTGTCGATGATACTTTCTGTTCGCCCACGATTTT
GCTGTTGAGATCTTGAAATTCTTTAATATTCTTCATCAACTCTTCTTGGGTAGTCTTGAT
GGTGCTCTTCATCTCTTCTGATTTGCTAAATCTTGAACCCACGAAAGTCATGGCATCAGA
TAGTTTACCAGTGGTTGATCTAGCTGTAGAAGAATATTCTTGTGCGGATTTGGTGGAAGA
AACCCTTGAGGAGGCAGTCATGGAAGCCTTGAGCTTCTCGAAGAAGGGTTTGAGTTCTTG
CTTTTGTGCAAACCTTTTCTCAAGTCCAGATATGAATGAACTTGTTTCTTGTGAAGTCTC
TTTCTCGATTTCCGTCACTGATGTGGTCGCTGATGAACTTGAGCTCTC

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DS 

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TTGGGTAGTCTTGATGGTGCTCTTCATCTCTTCTGATTTGCTAAATCTTGAACCCACGAA
AGTCATGGCATCAGATAGTTTACCAGTGGTTGATCTAGCTGTAGAAGAATATTCTTGTGC
GGATTTGGTGGAAGAAACCCTTGAGGAGGCAGTCATGGAAGCCTTGAGCTTCTCGAAGAA
GGGTTTGAGTTCTTGCTTTTGTGCAAACCTTTTCTCAAGTCCAGATATGAATGAACTTGT
TTCTTGTGAAGTCTCTTTCTCGATTTCCGTCACTGATGTGGTCGCTGATGAACTTGAGCT
CTCGCTTTTCTCGCTTTTGGATTGTTG
C

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DS 

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GTGACTTTTTCAATCTTTGACATGGTCTGCTTAATCTGTGACTCTTTTGTCGATGATACT
TTCTGTTCGCCCACGATTTTGCTGTTGAGATCTTGAAATTCTTTAATATTCTTCATCAAC
TCTTCTTGGGTAGTCTTGATGGTGCTCTTCATCTCTTCTGATTTGCTAAATCTTGAACCC
ACGAAAGTCATGGCATCAGATAGTTTACCAGTGGTTGATCTAGCTGTAGAAGAATATTCT
TGTGCGGATCTGGTGGAAGAAACCCTTGAGGAGGCAGTCATGGAAGCCTTGAGCTTCTCG
AAGAAGGGTTTGAGTTCTTGCTTTTGTGCAAACCTTTTCTCAAGTCCAGATATGAATGAA
CTTGTTTCTTGTGAAGTCTCTTTCTCGATTTCCGTCACTGATGTGGTCGCTGATGAACTT
GAGCTCTCGCTTTTCTCGCTTTTGGATTGTTGTTGATTCATGGAAGAAGCGGCACTTCCA
GCGTTGGATTCTTGCTTACTGGAAGAAGCAGCAGCCTTTCCACTCTCTTTTTTAGAGGAC
TTACCCTTAGCAGAAGCGGGACTTGCTTCCGGGCTTCCTGAGGTTCTATCCTCACCAGAA
GTGGGACTTCCTGTCGGGCTTCCCGCAGATGCACCTGTCGTGTCATCAAAAGTAACACCA
GCTTTG
C

QA 1 786 1 786
DS 

RD RS1CG54TF 743 0 0
GTGAC
TTTTCAATCTT*GACATGGT*TGCTTAATCTGTGACTCTTT*GTCGATGATACTTTCTGT
TCGCCCACGATTTTGCTGTTGAGATCTTGAAATTCTTTAATATTCTTCATCAACTCTTCT
TGGGTAGTCTTGATGGTGCTCTTCATCTCTTCTGATTTGCTAAATCTTGAACCCACGAAA
GTCATGGCATCAGATAGTTTACCAGTGGTTGATCTAGCTGTAGAAGAATATTCTTGTGCG
GATTTGGTGGAAGAAACCCTTGAGGAGGCAGTCATGGAAGCCTTGAGCTTCTCGAAGAAG
GGTTTGAGTTCTTGCCTTTGTGCAAACCTTTTCTCAAGTCCAGATATGAATGAACTTGTT
TCTTGTGAAGTCTCTTTCTCGATTTCCGTCACTGATGTGGTCGCTGATGAACTTGAGCTC
TCGCTTTTCTCGCTTTTGGATTGTTGTTGATTCATGGAAGAAGCAGCACTTCCAGCGTTG
GATTCTTGCTTACTGGAAGAAGCAGCAGCCTTTCCACTCTCTTTTTTAGAGGACTTACCC
TTAGCAGAAGTGGGACTTGCTTCCGGGCTTCCTGAGGTTCTATCCTCACCAGAAGTGGGA
CTTCCTGTCGGGCTTCCCGCAGATGCACCTGTCGTGTCATCAAAAGTAACACCAGCTTTG
GTCGAAGAACTAGCACCAGCTTTGGTCGAAGAACTAGCACCAGCTTTGCTCGAGGAGGCT
TCTTTGGTTTTGGCTGA
C

QA 6 742 6 742
DS 

RD RS1DP24TF 646 0 0
TTCATCTCTTCTGATTTGCTAAATCTTGAACCCACGAAAGTCATGGCATCAGATAGTTTA
CCAGTGGTTGATCTAGCTGTAGAAGAATATTCTTGTGCGGATTTGGTGGAAGAAACCCTT
GAGGAGGCAGTCATGGAAGCCTTGAGCTTCTCGAAGAAGGGTTTGAGTTCTTGCTTTTGT
GCAAACCTTTTCTCAAGTCCAGATATGAATGAACTTGTTTCTTGTGAAGTCTCTTTATCG
ATTTCCGTCACTGATGTGGTCGCTGATGAACTTGAGCTCTCGCTTTTCTCGCTTTTGGAT
TGTTGTTGATTCATGGAAGAAGCAGCACTTCCAGCGTTGGATTCTTGCTTACTGGAAGAA
GCAGCAGCCTCTCCACTCTCTTTTTTAGAGGACTTACCCTTAGCAGAAGTGGGACTTGCT
TCCGGGCTTCCTGAGGTTCTATCCTCACCAGAAGTGGGACTTCCTGTCGGGCTTCCCGCA
GATGCACCTGTCGTGTCATCAAAAGTAACACCAGCTTTGGTCGAAGAACTAGCACCAGCT
TTGGTCGAAGAACTAGCACCAGCTTTGCTCGAGGAGGCTTCTTTGGTTTTGGCTGATGAA
CCACTCTTCTCCTTCTGCTCCTCCTTCTTCTCCTCCTTCTTCGCCC

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 10

CO CL342Contig1 797 10 15 U
GGACGTCGAAACAACAACACGAAGACATCTCCACAAAGATTTTTTTTCCTTTTTCCATAG
CTTCGATCTTCCTCCAATGTCTGTCAACGCTCCCATATCGTCTCACCCGAGAACACAGTT
CCTCTCCAACCCCGTTCTCCCTCGCTTTCGTCGGTCATACTCCGCCGTGAAATCACCAGC
AGCCTTCTCCGTCGTCTCAATGGCTCCCCAGAAAAAGGTGAACAAGTACGATGCCAAGTG
GAAGAAACAATGGTACGGAGCGGGACTATTCTTCGAAGGGAGCGAAGAAGTAAACGTCGA
CGTTTTCAAGAAGCTGGAGAAGCGAAAAGTACTAAGCAACGTTGAGAAATCCGGCTTGCT
CTCAAAAGCAGAAGACTTGGGAGTCACGTTGTCATCTCTTGAGAAGCTTGGTGTTTTCTC
CAAAGCAGAGGAGCTCGGTCTTCTCAGTCTCCTTGAGACTTTAGCCGGTACATCTCCTGC
TGTCTTGGCCTCGGCTGCATTACCGGCTCTGACGGCTGCTATTGTAGCCGTGGTGCTGAT
TCCTGATGACTCAACTACTCTGGTGGTTGCTCAAGCGGTTTTGGGCGGTGCTTTTGCTCT
TGGAGCTGTTGTTTTGTTGGTGGGTTCTGTTGTTTTGGATGGACTTCAAGAAGCTGATTG
AGT*TTTCCTCTGTAAACAAAACACAACTAAAAACATTGCTGTACAATTGTTTTTTTT*G
TAATAAAGTTTCTATAGAAGGACTATAGCTTATTAAAGCCTTATTGACACAAAATGAAAA
TAGTATCTGGTTCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 35 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 30 60 60 60 60 60 
30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 25 35 35 
50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 40 40 40 40 40 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1EG48TF U 41
AF RS1GG41TF U 41
AF RS1EV09TF U 1
AF RS1GU66TF U 40
AF RS1GU66JQ C 53
AF RS1EG48JQ C 273
AF RS1FI05JQ C 84
AF RS1FI05TF U 84
AF RS1EV09JQ C 192
AF RS1GG41JQ C 277
BS 1 676 RS1EV09TF
BS 677 677 RS1FI05TF
BS 678 680 RS1EV09TF
BS 681 681 RS1GU66TF
BS 682 717 RS1EV09TF
BS 718 718 RS1GU66TF
BS 719 719 RS1EV09TF
BS 720 720 RS1FI05TF
BS 721 730 RS1EV09TF
BS 731 731 RS1GU66JQ
BS 732 740 RS1EV09TF
BS 741 741 RS1GU66JQ
BS 742 755 RS1EV09TF
BS 756 768 RS1GU66TF
BS 769 797 RS1EV09JQ

RD RS1EG48TF 539 0 0
TTTTTTCCT
TTTTTCCATAGCTTCGATCTTCCTCCAATGGCTGTCAACGCTCCCATATCGTCTCACCCG
AGAACACAGTTTCTCTCCAACCCCGTTCTCCCTCGCTTTCGCCGGTCATACTCCGCCGTG
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GATGCCAAGTGGAAGAAACAATGGTACGGAGCGGGACTACTCTTCGAAGGGAGCGAAGAA
GTAAACGTCGACGTTTTCAAGAAGCTGGAGAAGCGAAAAGTACTAAGCAACGTTGAGAAA
TCCGGCTTGCTCTCAAAAGCAGAAGACTTGGGAGTCACGTTGTCATCTCTTGAGAAGCTT
GGTGTTTTCTCCAAAGCAGAGGAGCTCGGTCTTCTCAGTCTCCTTGAGACTTTAGCCGGT
ACTTCCCCTGCGGTCTTGGCCTCGGCTGCATTACCGGCTCTGACGGCTGCTATTGTAGCC
GTGGTGCTGATTCCTGATGACTCAACTACTCTGGTGGTTGCTCAAGCGGT

QA 10 539 10 539
DS 

RD RS1GG41TF 506 0 0
TTTTTTTCC
TTTTTCCATAGCTTCGATCTTCCTCCAATGTCTGTCAACGCTCCCATATCGTCTCACCCG
AGAACACAGTTCCTCTCCAACCCCGTTCTCCCTCGCTTTCGTCGGTCATACTCCGCCGTG
AAATCACCAGCAGCCTTCTCCGTCGTCTCAATGGCTCCCCAGAAAAAGGTGGACAAGTAC
GATGCCAAGTGGAAGAAACAATGGTACGGAGCGGGACTATTCTTCGAAGGGAGCGAAGAA
GTAAACGTCGACGTTTTCAAGAAGCTGGAGAAGCGAAAAGTACTAAGCAACGTTGAGAAA
TCCGGCTTGCTCTCAAAAGCAGAAGACTTGGGAGTCACGTTGTCATCTCTTGAGAAGCTT
GGTGTTTTCTCCAAAGCAGAGGAGCTCGGTCTTCTCAGTCTCCTTGAGACTTTAGCCGGT
ACATCTCCTGCTGTCTTGGCCTCGGCTGCATTGCCGGCTCTGACGGCTGCTATTGTAGCC
GTGGTGCTGATTCCTGA

QA 10 506 10 506
DS 

RD RS1EV09TF 755 0 0
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CTTCGATCTTCCTCCAATGTCTGTCAACGCTCCCATATCGTCTCACCCGAGAACACAGTT
CCTCTCCAACCCCGTTCTCCCTCGCTTTCGTCGGTCATACTCCGCCGTGAAATCACCAGC
AGCCTTCTCCGTCGTCTCAATGGCTCCCCAGAAAAAGGTGAACAAGTACGATGCCAAGTG
GAAGAAACAATGGTACGGAGCGGGACTATTCTTCGAAGGGAGCGAAGAAGTAAACGTCGA
CGTTTTCAAGAAGCTGGAGAAGCGAAAAGTACTAAGCAACGTTGAGAAATCCGGCTTGCT
CTCAAAAGCAGAAGACTTGGGAGTCACGTTGTCATCTCTTGAGAAGCTTGGTGTTTTCTC
CAAAGCAGAGGAGCTCGGTCTTCTCAGTCTCCTTGAGACTTTAGCCGGTACATCTCCTGC
TGTCTTGGCCTCGGCTGCATTACCGGCTCTGACGGCTGCTATTGTAGCCGTGGTGCTGAT
TCCTGATGACTCAACTACTCTGGTGGTTGCTCAAGCGGTTTTGGGCGGTGCTTTTGCTCT
TGGAGCTGTTGTTTTGTTGGTGGGTTCTGTTGTTTTGGATGGACTTCAAGAAGCTGATTG
AGT*TTTCCTCTGTAA*CAAGACACAACTAAAAACATTGCTGTACAATTGTTTTTTTG**
TAATAAAGTT*CTATAGAAG*ACTATAGCTTATTA

QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1GU66TF 729 0 0
TTTTTTTTCC
TTTTTCCATAGCTTCGATCTTCCTCCAATGTCTGTCAACGCTCCCATATCGTCTCACCCG
AGAACACAGTTCCTCTCCAACCCCGTTCTCCCTCGCTTTCGTCGGTCATACTCCGCCGTG
AAATCACCAGCAGCCTTCTCCGTCGTCTCAATGGCTCCC*AGAAAAAGGTGAACAAGTAC
GATGCCAAGTGGAAGAAACAATGGTACGGAGCGGGACTATTCTTCGAAGGGAGCGAAGAA
GTAAACGTCGACGTTTTCAAGAAGCTGGAGAAGCGAAAAGTACTAAGCAACGTTGAGAAA
TCCGGCTTGCTCTCAAAAGCAGAAGACTTGGGAGTCACGTTGTCATCTCTTGAGAAGCTT
GGTGTTTTCTCCAAAGCAGAGGAGCTCGGTCTTCTCAGTCTCCTTGAGACTTTAGCCGGT
ACATCTCCTGCTGTCTTGGCCTCGGCTGCATTACCGGCTCTGACGGCTGCTATTGTAGCC
GTGGTGCTGATTCCTGATGACTCAACTACTCTGGTGGTTGCTCAAGCGGTTTTGGGCGGT
GCTTTTGCTCTTGGAGCTGTTGTTTTGTTGGTGGGTTCTGTTGTTTTGGATGGACTTCAA
GAAGCTGATTGAGT*TTTCCTCTGTAA*CAAAACACAACTAAAAACATTGCTGTACAATT
GTTTTTTTT**GTATAAAGTT*CTATAGAAG*ACTATAGCTTATTAAAGCCTTATTGAC

QA 11 729 11 729
DS 

RD RS1GU66JQ 716 0 0
TTCCATAGCTTCGATCTTCCTCCAATGTCTGTCAACGCTCCCATATCGTCTCACCCGAGA
ACACAGTTCCTCTCCAACCCCGTTCTCCCTCGCTTTCGTCGGTCATACTCCGCCGTGAAA
TCACCAGCAGCCTTCTCCGTCGTCTCAATGGCTCCC*AGAAAAAGGTGAACAAGTACGAT
GCCAAGTGGAAGAAACAATGGTACGGAGCGGGACTATTCTTCGAAGGGAGCGAAGAAGTA
AACGTCGACGTTTTCAAGAAGCTGGAGAAGCGAAAAGTACTAAGCAACGTTGAGAAATCC
GGCTTGCTCTCAAAAGCAGAAGACTTGGGAGTCACGTTGTCATCTCTTGAGAAGCTTGGT
GTTTTCTCCAAAGCAGAGGAGCTCGGTCTTCTCAGTCTCCTTGAGACTTTAGCCGGTACA
TCTCCTGCTGTCTTGGCCTCGGCTGCATTACCGGCTCTGACGGCTGCTATTGTAGCCGTG
GTGCTGATTCCTGATGACTCAACTACTCTGGTGGTTGCTCAAGCGGTTTTGGGCGGTGCT
TTTGCTCTTGGAGCTGTTGTTTTGTTGGTGGGTTCTGTTGTTTTGGATGGACTTCAAGAA
GCTGATTGAGT*TTTCCTCTGTAAACAAAACACAACTAAAAACATTGCTGTACAATTGTT
TTTTTTTGTAATAAAGTTTCTATAGAAGGACTATAGCTTATTAAAGCCTTATTGAC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RS1EG48JQ 486 0 0
TCGAAGGGAGCGAAGAAGTAAACGTCGACGTTTTCAAGAAGCTGGAGAAGCGAAAAGTAC
TAAGCAACGTTGAGAAATCCGGCTTGCTCTCAAAAGCAGAAGACTTGGGAGTCACGTTGT
CATCTCTTGAGAAGCTTGGTGTTTTCTCCAAAGCAGAGGAGCTCGGTCTTTTCAGTCTCC
TTGAGACTTTAGCCGGTACTTCCCCTGCGGTCTTGGCCTCGGCTGCATTACCGGCTCTGA
CGGCTGCTATTGTAGCCGTGGTGCTGATTCCTGATGACTCAACTACTCTGGTGGTTGCTC
AAGCGGTTTTGGGCGGTGCTTTTGCTCTTGGAGCTGTTGTTTTGTTGGTTGGGTCTGTTG
TTTTGGATGGACTCCAAGAAGCTGATTGAGTGTTTCCTCTGTAAACAAAACACAACTAAA
AACATTGTTGTACAATTGTTTTTTTTTGTAATAAAGTTTCTATAGAAG
AAGGATTCTTTTTTTGAT

QA 1 468 1 468
DS 

RD RS1FI05JQ 652 0 0
GG
AACGCTCCCATATCGTCTCACCCGAGAACACAGTTTCTCTCCAACCCCGTTCTCCCACGC
TTTCGCCGGTCATACTCCGCCGTGAAATCACCAGCAGCCTTCTCCGTCGTCTCAATGGCT
CCCCAGAAAAAGGTGAACAAGTACGATGCCAAGTGGAAGAAACAATGGTACGGAGCGGGA
CTATTCTTCGAAGGGAGCGAAGAAGTAAACGTCGACGTTTTCAAGAAGCTGGAGAAGCGA
AAAGTACTAAGCAACGTTGAGAAATCCGGCTTGCTCTCAAAAGCAGAAGACTTAGGAGTC
ACGTTGCCATCTCTTGAGAAGCTTGGTGTTTTCTCCAAAGCAGAGGAGCTCGGTCTTCTC
AGTCTCCTTGAGACTTTAGCCGGTACATCTCCTGCTGTCTTGGCCTCGGCTGCATTACCG
GCTCTGACGGCTGCTATTGTAGCCGTGGTGCTGATTCCTGATGACTCAACTACTCTGGTG
GTTGCTCAAGCGGTTTTGGGCGGTGCTTTTGCTCTTGGAGCTGTTGTTTTGTTGGTGGGT
TCTGTTGTTTTGGATGGACTTCAAGAAGCTGATTGAGT*TTTCCTCTGTAAACAAAACAC
AACTAAAAACATTGCTGTACAATTGTTTTTTTT*GTAATAAAGTTCCTAT

QA 3 652 3 652
DS 

RD RS1FI05TF 652 0 0
GG
AACGCTCCCATATCGTCTCACCCGAGAACACAGTTTCTCTCCAACCCCGTTCTCCCACGC
TTTCGCCGGTCATACTCCGCCGTGAAATCACCAGCAGCCTTCTCCGTCGTCTCAATGGCT
CCCCAGAAAAAGGTGAACAAGTACGATGCCAAGTGGAAGAAACAATGGTACGGAGCGGGA
CTATTCTTCGAAGGGAGCGAAGAAGTAAACGTCGACGTTTTCAAGAAGCTGGAGAAGCGA
AAAGTACTAAGCAACGTTGAGAAATCCGGCTTGCTCTCAAAAGCAGAAGACTTAGGAGTC
ACGTTGCCATCTCTTGAGAAGCTTGGTGTTTTCTCCAAAGCAGAGGAGCTCGGTCTTCTC
AGTCTCCTTGAGACTTTAGCCGGTACATCTCCTGCTGTCTTGGCCTCGGCTGCATTACCG
GCTCTGACGGCTGCTATTGTAGCCGTGGTGCTGATTCCTGATGACTCAACTACTCTGGTG
GTTGCTCAAGCGGTTTTGGGCGGTGCTTTTGCTCTTGGAGCTGTTGTTTTGTTGGTGGGT
TCTGTTGTTTTGGATGGACTTCAAGAAGCTGATTGAGT*TTTCCTCTGTAAACAAAACAC
AACTAAAAACATTGCTGTACAATTGTTTTTTTT*GTAATAAAGTTCCTAT

QA 3 652 3 652
DS 

RD RS1EV09JQ 606 0 0
TCGTCTCAATGGCTCCCCAGAAAAAGGTGAACAAGTACGATGCCAAGTGGAAGAAACAAT
GGTACGGAGCGGGACTATTCTTCGAAGGGAGCGAAGAAGTAAACGTCGACGTTTTCAAGA
AGCTGGAGAAGCGAAAAGTACTAAGCAACGTTGAGAAATCCGGCTTGCTCTCAAAAGCAG
AAGACTTGGGAGTCACGTTGTCATCTCTTGAGAAGCTTGGTGTTTTCTCCAAAGCAGAGG
AGCTCGGTCTTTTCAGTCTCCTTGAGACTTTAGCCGGTACATCTCCTGCTGTCTTGGCCT
CGGCTGCATTACCGGCTCTGACGGCTGCTATTGTAGCCGTGGTGCTGATTCCTGATGACT
CAACTACTCTGGTGGTTGCTCAAGCGGTTTTGGGCGGTGCTTTTGCTCTTGGAGCTGTTG
TTTTGTTGGTGGGTTCTGTTGTTTTGGATGGACTTCAAGAAGCTGATTGAGT*TTTCCTC
TGTAAACAAGACACAACTAAAAACATTGCTGTACAATTGTTTTTTTT*GTAATAAAGTTT
CTATAGAAGGACTATAGCTTATTAAAGCCTTATTGACACAAAATGAAAATAGTATCTGGT
TCACCC

QA 1 606 1 606
DS 

RD RS1GG41JQ 521 0 0
AGGGAGCGAAGAAGTAAACGTCGACGTTTTCAAGAAGCTGGAGAAGCGAAAAGTATTAAG
CAACGTTGAGAAATCCGGCTTGCTCTCAAAAGCAGAAGACTTGGGAGTCACGTTGTCATT
TCTTGAGAAGCTTGGTGTTTTCTCCAAAGCAGAGGAGCTCGGTCTTCTCAGTCTCCTTGA
GACTTTAGCCGGTACATCTCCTGCTGTCTTGGCCTCGGCTGCATTGCCGGTTCTGACGGC
TGCTATTGTAGCCGTGGTGCTGATTCCTGATGACTCGACTACTCTGGTGGTTGCTCAAGC
GGTTTTGGGCGGTGCTTTTGCTCTTGGAGCTGTTGTTTTGTTGGTGGGTTCTGTTGTTTT
GGATGGACTTCAAGAAGCTGATTGAGT*TTTCCTCTGTAAACAAAACACAACTAAAAACA
TTGCTGTACAATTGTTTTTTTT*GTAATAAAGTTTCTATAGAAGGACTATAGCTTATTAA
AGCCTTATTGACACAAA*TGAAAATAGTATCTGGTTCACCC

QA 1 521 1 521
DS 



AS 1 10

CO CL343Contig1 884 10 13 U
GGGATCACACATACATCTCCTCCATCCATCCCACAAGAAGTAAGATAAAAA*GATACCTT
TTCACCAATGTCCAAAGACTGTGAGAAGCATGGAGGAGGCGGGGGAGGAACCGCCGGGAG
AATATGCGGAGTGATCATCGGCTTCATCATCATTGTCTTGATAACAATCTTCCTCGTCTG
GGTAATCCTCCAGCCGACAAAACCAAGATTCATCCTCCAAGATGCCACCGTCTTCGCTTT
CAACCTCACGCAACCTAACCTCCTAACCTCAAACTTCCAAGTCACGCTCGTTATACGAAA
CCGAAACTCCAGGATCGGAATCTACTACGACCGTCTTCACGTCTACGCCACTTACCGGAA
CCAGCAAATCACTTTCCCTACGGCCATTCCACCGAGCTACCAAGGCCATAAAGAAGACAG
TGTTTGGTCTCCTATTATCTACGGAAACGCCGTCCCCGTCGCTCCTTATAACGCCGTCGC
TCTCGGAGACGAGCAGAGTCGTGGGTTTGTTGATCTGGTTATACGCGCTGACGGGCGCGT
GAGGTGGAAGGTCGGGACTCTTATTACCGGGAAGTATCATCTTCATGTTCGTTGTCATAC
TTTTATCAATCTTGCGGATAAATCTAACGGAGTTATTGTCGGGGAAAATATCGTTAAGTA
CACTGTGGACTACCAATGCAGTGTCGACGTTTAGATGACGGTGAAATGGGATACAGCTCT
GACGCCGTTAAGTTTGCTTTTTTT*CTTTATTCACTCGTTTTTCTGCTACTCTTTGCTTC
TGTATCGTTTAATTTGTCTACTTTTATCTTTATCTCGTAAACTATACCACTCATGACGTT
ACAGCGTCGCTAAATTATTTTAAATGAACTATAACTTACATCCC


BQ
10 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 40 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 45 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 30 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 15 60 60 60 55 40 55 55 55 55 55 20 50 50 50 50 50 50 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1F746TF U 5
AF RS1EZ72TF U 2
AF RS1AZ92TF U 3
AF RS1BZ55TF U 1
AF RS1GZ71TF U 125
AF RS1GQ76TF U 2
AF RS1GZ71JQ C 171
AF RS1BZ55JQ C 125
AF RS1AZ92JQ C 120
AF RS1GQ76JQ C 444
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BS 757 817 RS1BZ55TF
BS 818 844 RS1AZ92JQ
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BS 883 884 RS1GQ76JQ

RD RS1F746TF 751 0 0
GG
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AATGTCCAA*GACTGTGAGAAGCATGGAGGAGGCGGGGGAGGAACCGCCGGGAGAATATG
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GGACTACCAATGCAGTGTCGACGTTTAGATGACGGTGAAATGGGATACAGCTCTGACGCC
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G
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CACCAATGTCCAAAGACTGTGAGAAGCACGGAGGAGGCGGGGGAGGAACCGCCGGGAGAA
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ACCTCACGCAACCTAACCTCCTAACCTCAAACTTCCAAGTCACGCTCGTTATACGAAACC
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ACCTCACGCAACCTAACCTCCTAACCTCAAACTTCCAAGTCACGCTCGTTATACGAAACC
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TTTGGTCTCCTATTATCTACGGAAACGCCGTCCCCGTCGCTCCTTATAACGCCGTCGCTC
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GGTGGAAGGTCGGGACTCTTATTACCGGGAAGTATCATCTTCATGTTCGTTGTCATACTT
TTATCAATCTTGCGGATAGATCTAACGGAGTTATTGTCGGGGAAAATATCGTTAAGTACA
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CGCCGTTAAGTTTGCTTTTTT**CTT
ATTCACTC

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DS 

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TTCACCAATGTCCAAAGACTGTGAGAAGCATGGAGGAGGCGGGGGAGGAACCGCCGGGAG
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GGTAATCCTCCAGCCGACAAAACCAAGATTCATCCTCCAAGATGCCACCGTCTTCGCTTT
CAACCTCACGCAACCTAACCTCCTAACCTCAAACTTCCAAGTCACGCTCGTTATACGAAA
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CCAGCAAATCACTTTCCCTACGGCCATTCCACCGAGCTACCAAGGCCATAAAGAAGACAG
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TCTCGGAGACGAGCAGAGTCGTGGGTTTGTTGATCTGGTTATACGCGCTGACGGGCGCGT
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TGTATCGTTTAATTTGTCTACTTTTATCTTTATCTCG
C

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G
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TCACGCAACCTAACCTCCTAACCTCAAACTTCCAAGTCACGCTCGTTATACGAAACCGAA
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TGGACTACCAATGCAGTGTCGACGTTTAGATGACG*TGAAATGGGATACAGCTCTGACGC
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CGTTTAATTTGTCTACTTTTAT

QA 2 683 2 683
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G
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CACCAATGTCCAAAGACTGTGAGAAGCATGGAGGAGGCGGGGGAGGAACCGCCGGGAGAA
TATGCGGAGTGATCATCGGCTTCATCATCATTGTCTTGATAACAATCTTCCTCGTCTGGG
TAATCCTCCAGCCGACAAAACCAAGATTCATCCTCCAAGATGCCACCGTCTTCGCTTTCA
ACCTCACGCAACCTAACCTCCTAACCTCAAACTTCCAAGTCACGCTCGTTATACGAAACC
GAAACTCCAGGATCGGAATCTACTACGACCGTCTTCACGTCTACGCCACTTACCGGAACC
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TTTGGTCTCCTATTATCTACGGAAACGCCGTCCCCGTCGCTCCTTATAACGCCGTCGCTC
TCGGAGACGAGCAGAGTCGTGGGTTTGTTGATCTGGTTATACGCGCTGACGGGCGCGTGA
GGTGGAAGGTCGGGACTCTTATTACCGGGAAGTATCATCTTCATGTTCGTTGTCATACTT
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CTGTGGACTACCAATGCAGTGTCGACGTTTAGATGACG*TGAAATGGGATACAGCTCTGA
CGCCGTTAAGTTTGCTTTTTT**CTTT*TTCACTCGTTTT*CTGCTACTCTTTGCTTCTG
TATCGTT*AATTTGTCTACTTT
ATCTT

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TCTTCGCTTTCAACCTCACGCAACCTAACCTCCTAACCTCAAACTTCCAAGTCACGCTCG
TTATACGAAACCGAAACTCCAGGATCGGAATCTACTACGACCGTCTTCACGTCTACGCCA
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TCTTTGCTTCCGTATCGTTTAATTTGTCTACTTTTATCTTTATCTCGTAAACTATACCAC
TCATG

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1BZ55JQ 694 0 0
TGCGGAGTGATCATCGGCTTCATCATCATTGTCTTGATAACAATCTTCCTCGTCTGGGTA
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CTCACGCAACCTAACCTCCTAACCTCAAACTTCCAAGTCACGCTCGTTATACGAAACCGA
AACTCCAGGATCGGAATTTACTACGACCGTCTTCACGTTTACGCCACTTACCGGAACCAG
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TGGTCTCCTATTATTTACGGAAACGCCGTCCCCGTCGCTCCTTATAACGCCGTCGCTCTC
GGAGACGAGCAGAGTCGTGGGTTTGTTGATCTGGTTATACGCGCTGACGGGCGCGTGAGG
TGGAAGGTCGGGACTCTTATTACCGGGAAGTATCATCTTCATGTTCGTTGTCATACTTTT
ATCAATCTTGCGGATAAATCTAACGGAGTTATTGTCGGGGAAAATATCGTTAAGTACACT
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CCGTTAAGTTTGCTTTTTTTTCTTTATTCACACGTTTTTCTGCTACTCTTTGCTTCTGTA
TCGTTTAATTTGTCTACTTTTATCTTTATCTCG
C

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DS 

RD RS1AZ92JQ 764 0 0
AGAA
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CCTCACGCAACCTAACCTCCTAACCTCAAACTTCCAAGTCACGCTCGTTATACGAAACCG
AAACTCCAGGATCGGAATCTACTACGACCGTCTTCACGTTTACGCCACTTACCGGAACCA
GCAAATCACTTTCCCTACGGCCATTCCACCGAGCTACCAAGGCCATAAAGAAGACAGTGT
TTGGTCTCCTATTATCTACGGAAACGCCGTCCCCGTCGCTCCTTATAACGCCGTCGCTCT
CGGAGACGAGCAGAGTCGTGGGTTTGTTGATCTGGTTATACGCGCTGACGGGCGCGTGAG
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TATCAATCTTGCGGATAGATCTAACGGAGTTATTGTCGGGGAAAATATCGTTAAGTACAC
TGTGGACTACCAATGCAGTGTCGACGTTTAGATGACGGTGAAATGGGATACAGCTCTGAC
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ATCGTTTAATTTGTCTACTTTTATCTTTATCTCGTAAACTATACCACTCATGACGTTACA
GTGTCGCTAAATTATTTTAAATGAACTATAACTTACATC
T

QA 5 763 5 763
DS 

RD RS1GQ76JQ 441 0 0
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GGTTTGTTGATCTGGTTATACGCGCTGACGGGCGCGTGAGGTGGAAGGTCGGGACTCTTA
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CTAACGGAGTTATTGTCGGGGAAAATATCGTTAAGTACACTGTGGACTACCAATGCAGTG
TCGACGTTTAGATGACGGTGAAATGGGATACAGCTCTGACGCCGTTAAGTTTGCTTTTTT
T*CTTTATTCACTCGTTTTTCTGCTACTCTTTGCTTCTGTATCGTTTAATTTGTCTACTT
TTATCTTTATCTCGTAAACTATACCACTCATGACGTTACAGCGTCGCTAAATTATTTTAA
ATGAACTATAACTTACATCCC

QA 1 441 1 441
DS 



AS 2 6

CO CL344Contig1 1045 4 6 U
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CTTCAAAGAAAGGAGAAGAACCAAAGCGCACACCGAAGAACATAAATGTAACAATGTAAG
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TCAGTCATTACATTGATAACGAAGCTTTTTATGACCTGAAGATCTTTTTCTTTAACAACA
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TTTCTTTGGCTTTCTGGAACACAACAAACCCGTCCTTCATTTCCCACTCAGGGTGCTCCT
CATTGACATAGGTCAAGAGTTCTTGATCAGAAGAGAAGAGCAACATCTGCCTGGCATCGC
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TCACAAACGCTGCCTTGAACCTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EL16JQ U 138
AF RS1DZ05JQ U 1
AF RS1E067JQ U 138
AF RS1DZ05TF C 323
BS 1 272 RS1DZ05JQ
BS 273 273 RS1E067JQ
BS 274 274 RS1DZ05JQ
BS 275 275 RS1E067JQ
BS 276 682 RS1DZ05JQ
BS 683 1045 RS1DZ05TF

RD RS1EL16JQ 115 0 0
GCCAAACCCGATTAACCAAAAACAAGTACTGAGTCTCTCCAAATCAGTCATTACATTGAT
AACGAAGCTTTTTATGACCTGAAAATCTTTTTCTTTAACAACAAAATGGAA
AAAA

QA 1 111 1 111
DS 

RD RS1DZ05JQ 682 0 0
GCAATGTCTAAGCCTAGTTAAAAATAGCAAATTCAGGGACAACATTTTCCAAAAATAAAG
CTTCAAAGAAAGGAGAAGAACCAAAGCGCACACCGAAGAACATAAATGTAACAATGTAAG
AGCGAATAATCTCATTTGCCAAACCCGATTAACCAAAGACAAGTACTGAGTCTCTCCAAA
TCAGTCATTACATTGATAACGAAGCTTTTTATGACCTGAAGATCTTTTTCTTTAACAACA
AAATGGAAGAGACGAGCAATGAGTAAAAGTCCCA*TCTTACACGATACGCTCCAGCTCTC
TGGCGTAGCTTAAAGTCTGGTTGATGAGTTGAAGAGATGGAATCTCTTTGCAGGGTGCAG
TTTCTTTGGCTTTCTGGAACACAACAAACCCGTCCTTCATTTCCCACTCAGGGTGCTCCT
CATTGACATAGGTCAAGAGTTCTTGATCAGAAGAGAAGAGCAACATCTGCCTGGCATCGC
TGATAGAGACATAATCATAAGCTTTCTCGCTGCATCCAGCTATTTCATCTCTAATGGTCT
TTGCCAAGAGGTCCATGAAATAGACGTAAGTAGCATCAGGTGCGGTCTGCCTAGCACTGA
GCACACGGTTATAGGCACCTTCCATGAAGGACTGCTCAAGCTCAACGGCATGCTTGATGC
AAGGATTGTCCAGAGTAGCAGA

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1E067JQ 532 0 0
GCCAAACCCGATTAACCAAAGACAAGTACTGAGTCTCTCCAAATCAGTCATTACATTGAT
AACAAAGCTTTTTATGACCTGAAGATCTTTTTCTTTAACAACAAAATGGAAGAGACGAGC
AATTAGTAAAAGTCCATCTCTTACACGATACGCTCCAGCTCTCTGGCGTAGCTTAAAGTC
TGGTTGATGAGTTGAAGAGACGGAATCTCTTTGCAAGGTGCAGTTTCTTTGGCTTTCTGG
AACACAACAAACCCTTCCTTCACTTCCCACTCAGGGTGCTCCTCATTGACATAGGTCAAG
AGTTCTTGATCAGAAGAAAAGAGCAACATCTGCCGAGCATCGCTGATAGAGACATAATCA
TAAGCTTTCTCGCTGCATCCAGCTATTTCATCTCTAATGGTCTTCGCCAAGAGATCCATG
AAATAGACGTAAGTGGCATCAGGTGCGGTCTGTCTAGCACTGAGCACACGGTTATAAGCA
CCTTCCATGAAGGACTGCTCAAGCTCAACGGCATGCTTGATGCAAGGATTCT

QA 1 532 1 532
DS 

RD RS1DZ05TF 723 0 0
TGATGAG
TGAAGAGATGGAATCTCTTTGCAGGGTGCAGTTTCTTTGGCTTTCTGGAACACAACAAAC
CCGTCCTTCATTTCCCACTCAGGGTGCTCCTCATTGACATAGGTCAAGAGTTCTTGATCA
GAAGAGAAGAGCAACATCTGCCTGGCATCGCTGATAGAGACATAATCATAAGCTTTCTCG
CTGCATCCAGCTATTTCATCTCTAATGGTCTTTGCCAAGAGGTCCATGAAATAGACGTAA
GTAGCATCAGGTGCGGTCTGCCTAGCACTGAGCACACGGTTATAGGCACCTTCCATGAAG
GACTGCTCAAGCTCAACGGCATGCTTGATGCAAGGATTGTCCAGAGTAGCAGAGGAGAGT
AACTCGAGCTCGGTGTGGAATTCAGCAATTCGGTCTTGCACAAGCAGCCTGAGGAGATTG
AGACCAAGGATAAGATCCTCCTGTGGGGATGGTGGAAGACGGTTCCTGGCATCGACATAG
TAGGGTTTGAGCTGGAAGAAATCTCTCTCGAAAGCGTCTTGATCCTCGGTTTTGACACTT
AGAACAACAGCGTGCTCATAGATATCCCTTGCAAGAGTGAGCTCCTGAGCTGCATTAGGT
GTGTTCTCAAACAACGGAGGAAGACTTGTGAATTTCGTCAGAAGAACCTTAAGCCGGGAC
AAGAGATCACTGCAGGTACTGTGATCTTTCCTCACAAACGCTGCCTTGAACCTCTC

QA 8 723 8 723
DS 



CO CL344Contig2 733 2 9 U
GGGCAATTAAGCCAGTTCGGAAAGAAAAAAAAAAGATAATCGTCGCCGGAAAAGAAGAAA
GGAATGGATCCGCAGCTCACAGAAGTATCGCAGCAGTTGGAGAGATTCAAGGCGGCGTTT
GTTAGGAAGGATTACAATACCTGCTCTGATCTATTGTCTCGGCTTAAGGTTCTTCTGACG
AAATTCACAAGCCTTCCTCCATTGTTTGAGAATACTCCAAATGCTGCACACGAGCTCACT
CTTGCAAGGGATATTTACGAGCACGCTGTTGTTCTAAGCGTTAAAACTGAGGACCAAGAC
GCTTTCGAGAGAGATTTCTTCCAGCTCAAACCCTACTATGTCGATGCCAGGAACGGTCTG
CCACCGTCTCCACAGGAGAATCTTATCCTTGGTCTAAACCTCCTGAGGCTGCTTGTTCAA
AACAGAATTACTGAATTCCACACCGAGCTCGAGCTGCTCTCCTCTGCTACTCTGGAGAAT
CCTTGCATCAAGCATGCCGTTGAGCTTGAGCAGTCCTTCATGGAAGGTGCTTATAACCGT
GTGCTCAGTGCTAGACAGACCGCACCTGATGCCACTTACGTCTATTTCATGGATCTCTTG
GCGAAGACCATTAGAGATGAAATAGCTGGATGCAGCGAGAAAGCTTATGATTATGTCTCT
ATCAGCGATGCTCGGCAGATGTTGCTCTTCTCTTCTGATCAAGAACTCTTGACCTATGTC
AATGAGGAGCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E067TF U 8
AF RS1EP55TF U 1
BS 1 227 RS1EP55TF
BS 228 228 RS1E067TF
BS 229 293 RS1EP55TF
BS 294 294 RS1E067TF
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BS 430 430 RS1E067TF
BS 431 733 RS1EP55TF

RD RS1E067TF 700 0 0
GGAAGCCAGTTCGGAAAG
AAAAAAAAAGATAATCGTCGCCGGAAAAGAAGAAAGGAATGGATCCGCAGCTCACAGAAG
TATCGCAGCAGTTGGAGAGATTCAAGGCGGCGTTTGTTAGGAAGGATTACAATACCTGCT
CTGATCTATTGTCTCGGCTTAAGGTTCTTCTGACGAAATTCACAAGCCTTCCTCCATTGT
TTGAGAATACTCCAAATGCTGCACACGAGCTCACTCTTGCAAGGGATATTTACGAGCACG
CTGTTGTTCTAAGCGTTAAAACTGAGGACCAGGACGCTTTCGAGAGAGATTTCTTCCAGC
TCAAACCCTACTATGTCGATGCCAGGAACGGTCTGCCACCGTCTCCACAGGAGAATCTTA
TCCTTGGTCTAAACCTCCTGAGGCTGCTTGTTCAAAACAGAATTACTGAATTCCACACCG
AGCTCGGGCTGCTCTCCTCTGCTACTCTGGAGAATCCTTGCATCAAGCATGCCGTTGAGC
TTGAGCAGTCCTTCATGGAAGGTGCTTATAACCGTGTGCTCAGTGCTAGACAGACCGCAC
CTGATGCCACTTACGTCTATTTCATGGATCTCTTGGCGAAGACCATTAGAGATGAAATAG
CTGGATGCAGCGAGAAAGCTTATGATTATGTCTCTATCAGCGATGCTCGGCAGATGTTGC
TCTTCTCTTCTGATCA
GACTCT

QA 19 694 19 694
DS 

RD RS1EP55TF 733 0 0
GGGCAATTAAGCCAGTTCGGAAAGAAAAAAAAAAGATAATCGTCGCCGGAAAAGAAGAAA
GGAATGGATCCGCAGCTCACAGAAGTATCGCAGCAGTTGGAGAGATTCAAGGCGGCGTTT
GTTAGGAAGGATTACAATACCTGCTCTGATCTATTGTCTCGGCTTAAGGTTCTTCTGACG
AAATTCACAAGCCTTCCTCCATTGTTTGAGAATACTCCAAATGCTGCTCACGAGCTCACT
CTTGCAAGGGATATTTACGAGCACGCTGTTGTTCTAAGCGTTAAAACTGAGGATCAAGAC
GCTTTCGAGAGAGATTTCTTCCAGCTCAAACCCTACTATGTCGATGCCAGGAACGGTCTT
CCACCGTCTCCACAGGAGAATCTTATCCTTGGTCTAAACCTCCTGAGGCTGCTTGTTCAA
AACAGAATTGCTGAATTCCACACCGAGCTCGAGCTGCTCTCCTCTGCTACTCTGGAGAAT
CCTTGCATCAAGCATGCCGTTGAGCTTGAGCAGTCCTTCATGGAAGGTGCTTATAACCGT
GTGCTCAGTGCTAGACAGACCGCACCTGATGCCACTTACGTCTATTTCATGGATCTCTTG
GCGAAGACCATTAGAGATGAAATAGCTGGATGCAGCGAGAAAGCTTATGATTATGTCTCT
ATCAGCGATGCTCGGCAGATGTTGCTCTTCTCTTCTGATCAAGAACTCTTGACCTATGTC
AATGAGGAGCACC

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 10

CO CL345Contig1 1166 10 15 U
GTCAAACTGTTTTCTTACTTATTACATTGTTCAATGCGAAAGTTCATCCCTCACATCATT
TATTACATAAAATTATTTTACTTAAGTCCCTATAAAACCCAAAAACCCGACAACCTACAA
AGGAAACTAAACTCCAGCTAACACTATACCTCATCCCCAACGACACCATTGTTAATCCAA
ATAAGATTTAGCAATTTCTCCATCAGCTCCTTTAGGGTAAAATCCACCAGGGGTACGTTC
ATCTCCACTTCCATACACAATCCGTAGAATTTCCTCCGGAGTGCGATCAAACGCAAGCGA
CATCTCGTCACCCGCCAATACATTTCCAGCCACTTGTCCCTCAGCACCCATGGCTTTATG
CACAACCAACCCCTCATCTTTCACACCCATTTTCCCCAATTTGTTCCTCAGATCCGAGAT
CCTATCCGTAAAAGCTGCAACAGAGACACCATAAGGATGGACTATGTGTTTGGCCTTTGC
ATATAACATTGTTCTTATCACCGCGTCCTGGCCTGATTCTACTCCCAAAA*GTCCGGCTA
CTAACTTCCTTGACGCGGGACATTTCAGTTTCGGGTTTGCGCCAACGTAGCCGGTGAGAC
CAACATAAGGGACCAAATATGAAGCAATGAGGTAATTGTAAGAGTTGGCATAAGGATCAA
ATGGTGGCACAAATTTTCGTCCGAATGCATCATCCATCACTTTCGCAAATGATTTTTTAC
TTAAATCAAGAAGTGGCCGTGCAAATCCTCTCACCGTTTTCTTGATTGCCCTCAAGTGGC
CAACCTCTTGCCAAGCAAATTGCAAAACAATATCTCTTGTCAAACGATCGAGATTAGCTA
TCTGAGCTCCAATAGGACTTGGCCCTCCCATCGTTAAATTTGGTGCGACTTTATCAAGAC
CAAACCCTAATGCTCCGAACAAGAAAAACTCAGCTTCAAGATACTCCAAATTCAACGGAA
ACTCCAATAATTTTCTGTCTTGATCGGTACAGTTCGTCTTTTCCAAGGGGCAACTCATAA
CCTGAAGATGACGAGTGTTGAAGAAGAACAACACCATCACTATTGAAACCAACAAGCTTC
TTCTCTCTTCTGTGATTCTCATTTCTACAAAAGAAAAGTTTTCGTTTTCTTATATTCGTT
TCTGATTTACGTGTTTCTGGTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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A
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TACACAATCCGTAGAATTTCCTCCGGAGTGCGATCAAACGCAAGCGACATCTCGTCACCC
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T

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ATTTCTCCATCAGCTCCTTTAGGGTAAAATCCACCAGGGGTACGTTCATCTCCACTTCCA
TACACAATCCGCAGAATTTCCTCCGGAGTGCGATCAAACGCAAGCGACATCTCGTCACCC
GCCAATACATTTCCAGCCACTTGTCCCTCAGCACCCATGGCTTTATGCACAACCAACCCC
TCATCTTTCACACCCATTTTCCCCAATTTGTTACTTAGATCCGAGATCCTATCCGTAAAA
GCTGCAACCGAGACACCATAAGGATGGACTATGTGTTTGGCCTTTGCATATAACATTGTT
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CGCGGGACATTTCAGTTTCGGGTTTGCGCCAACGTAGCCGGTGAGACCAACATAAGGGAC
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CGGCCGTGCAAATCCTCTCACCGTTTTCTTGATTGCCCTCAA

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CACAACCAACCCCTCATCTTTCACACCCATTTTCCCCAATTTGTTCCTCAGATCCGAGAT
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CTAACTTCCTTGACGCGGGACATTTCAGTTTCGGGTTTGCGCCAACGTAGCCGGTGAGAC
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ATGGTGGCACAAATTTTCGTCCGAATGCATCATCCATCACTTTCGCAAATGATTTTTTAC
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CAACCTCTTGCCAAGCAAATTGCAAAACAATATCTCTTGTCAA*CGATCGAGATTAGCTA
TCTGAGCTCCA*TAGGACTTGGCC

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TCACTATTGAAACC

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TCTACTCCCAAAA*GTCCGGCTACTAACTTCCTTGACGCGGGACATTTCAGTTTCGGGTT
TGCGCCAACGTAGCCGGTGAGACCAACATAAGGGACCAAATATGAAGCAATGAGGTAATT
GTAAGAGTTGGCATAAGGATCAAATGGTGGCACAAATTTTCGTCCGAATGCATCATCCAT
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CACTATTGAAACCAACAAGCTTCTTCTCTCTTCTGTGATTCTCATTTCTACGAAAGAAAA
GTTTTCGTTTTCTTATATTCGTTTCT
CC

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CATCACTTTCGCAAATGGTTTTTTACTTAAATCAAGAAGTGGCCGTGCAAATCCTCTCAC
CGTTTTCTTGATTGCCCTCAAGTGGCCAACCTCTTGCCAAGCAAATTGCGAAACAATATC
TCTTGTCAAACGATCGAGATTAGCTATCTGAGCTCCAATAGGACTTGGCCCTCCCATCGT
TAAATTTGGTGCGACTTTATCAAGACCAAACCCTAATGCTCCGAACAAGAAAAACTCAGC
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CGTCTTTTCCAAGGGGCAACTCATAACCTGAAGATGACGAGTGTTGAAGAAGAACAACAC
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AAAGTTTTCGTTTTCTTATATTCGTTTCT
GATTTACCC

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AAGCAAATTGCAAAACAATATCTCTTGTCAAACGATCGAGATTAGCTATCTGAGCTCCAA
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CTCCGAACAAGAAAAACTCAGCTTCAAGATACTCCAAATTCAACGGAAACTCCAATAATT
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GATTTTCC

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AGGACTTGGCCCTCCCATCGTTAAATTTGGTGCGACTTTATCAAGACCAAACCCTAATGC
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TCTGTCTTGATCGGTACAGTTCGTCTTTTCCAAGGGGCAACTCATAACCTGAAGATGACG
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GATTCTCATTTCTACAAAAGAAAAGTTTTCGTTTTCTTATATTCGTTTCTGATTTACGTG
TTTCTGGTTTTCC

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 10

CO CL346Contig1 1219 10 8 U
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TGGGTCATACGCGATTGATCCCTCGACTTCGGTGAAAGCTAAATTCAACAGCCGTGGCAC
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AGTTCCGACGCAGTGCAATTGACGGATTAACTATTTTACGAATATGGTTCTTCTTATTGA
CATATTTTCAAAAAGTAATTTTCTTGGTATATTTTCACTAAACCCTTTTAAACAAGATGA
AATCCATTTCTTAATCCCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 
40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 
35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 15 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1B575TF U 85
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AF RS1BP70TF U 50
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AF RS1BP70JQ C 448
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AF RS1BV18JQ C 1023
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AF RS1A369TR C 421
BS 1 807 RS1A369TF
BS 808 894 RS1A369TV
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RD RS1B575TF 621 0 0
GG
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CTGTCTTCGATGTCAAAGTCGACACTGATTCCACTATTTTGACAACTGTCACTTTCACTG
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AAGCTGGATACGACACCTCCTCCAAAACTTTCACCAAGTACAACGCTGGCATCAGTGTCA
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CTTACCTTCATCACCTCGA

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CACACCAGTCATCTCCTTTGGTGCTGAAGCTGGATACGACACCTCCTCCAAAACTTTCAC
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TGGGTCATACGCGATTGATCCCTCGAC

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AAAAAATCCAAAGATCTGTTGACGAGAGACTACACCTCCGATCACAAATTCAGTATCTCC
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DS 

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CTTCTACCTCTTCACAGCCTCTCCTCCTCCTCCAAAATTTGGCTGATCTCTCTCACAAAA
TCGCGGATCAACCATGAGCAAAGGTCCAGGAATGTTCTCGGACATCGGCAAAAAATCCAA
AGATCTGTTGACGAGAGACTACACCTCCGATCACAAATTCAGTATCTCCACTTACAGTGC
CTCCGGCGTGGCACTTACGTCTACTGCTCTCAAGAAAGGAGGCGTGCATGCTGCTGATGT
TTCCACTCAATACAAATACAAGAATGCTGTCTTCGATGTCAAAGTCGACACTGATTCCAC
TATTTTGACAACTGTCACTTTCACTGAGATCCTCCCATCCACCAAAGCCATCGTCTCCTT
CAAAGTCCCTGACAACAGTTCTGGCAAGCTCGAGGTCCAGTACTTCCACGACCACGCCAC
TGTTACCGCTGCTGCAGCTTTGAAGCAGAACCCATTGATCGACATAACAGCCACTCTAGG
CACACCAGTCATCTCCTTTGGTGCTGAAGCTGGATACGACACCTCCTCCAAAACTTTCAC
CAAGTACAACGCTGGCATCAGTGTCACCAAACCAGATGCTTCCGCTACCATTATTTTGGG
AGACAAAGGAGACTCAATCAAAGCATCTTACCTTCATCACCTCGACGAATCCAAGAGAAG
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TGGGTCATACGCGATTGATCCCTCGACTTCGGTGAAAGCTAAATTCAACAGCCGTGGCAC
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AGCTGGATACGACACCTCCTCCAAAACTTTCACCAAGTACAACGCTGGCATCAGTGTCAC
CAAACCAGATGCTTCCGCTACCATTATTTTGGGAGACAAAGGAGACTCAATCAAAGCATC
TTACCTTCATCACCTCGACGAATCCAAGAGAAGTGCTGCAGTTGGTGAGGTTTACAGGAA
ATTCTCGACTAATGAGAACACGATAACTGTTGGTGGGTCATACGCGATTGATCCCTCGAC
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TAACTATTT*ACGAATATGGTTCTTCTTATTGACATATTTTC

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TACGCGATTGATCCCTCGACTTCGGTGAAAGCTAAATTCAACAGCCGTGGCACACTCGGT
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ATTTGTTGAATTTTACGGCAGGATCCGTGGGTTTACTTTCCCCACGAATAAGTAGTTCCG
ACGCAGTGCAATTGACGGATTAACTATTTTACGAATATGGTTCTTCTTATTGACATATTT
TCAAAAAGTAATTTTCTTGGTATATTTTCACT

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TTCCGACGCAGTGCAATTGACGGATTAACTATTTTACGAATATGGTTTTTTTTATTGACA
TATTTTC

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DS 

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TACAACGCTGGCATCAGTGTCACCAAACCAGATGCTTCCGCTACCATTATTTTGGGAGAC
AAAGGAGACTCAATCAAAGCATCTTACCTTCATCACCTCGACGAATCCAAGAGAAGTGCT
GCAGTTGGTGAGGTTTACAGGAAATTCTCGACTAATGAGAACACGATAACTGTTGGTGGG
TCATACGCGATTGATCCCTCGACTTCGGTGAAAGCTAAATTCAACAGCCGTGGCACACTC
GGTGCTCTTCTTCAGCACGAGGTCTTGCCCAAATCGCTAGTGACTGTTTCCAGTGAGGTC
GACACTAGGGCCTTAGACAAGCATCCAAGGTTTGGTCTTTCACTTGCTCTCAAACCTTGA
GAGAACACACACACACACACGCAACACATGGGATGAGTCTCCGTACCATTCTTCTCTTCT
CTCATTTGTTGAATTCTACGGCAGGATCCGTGGGTTTACTTTCCACACGAATAAGTAGTT
CCGACGCAGTGCAATTGACGGATTAACTATTTTACGAATATGGTTCTTCTTATTGACATA
TTTTC

QA 1 665 1 665
DS 

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ACGCCACTGTTACCGCTGCTGCAGCTTTGAAGCAGAACCCATTGATCGACATAACAGCCA
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CTTTCACCAAGTACAACGCTGGCATCAGTGTCACCAAACCAGATGCTTCCGCTACCATTA
TTTTGGGAGACAAAGGAGACTCAATCAAAGCATCTTACCTTCATCACCTCGACGAATCCA
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TCAAACCTTGAGAGAACACACACACACAC**GCAACACATGAGATGAGTCTCCGTACCAT
TCTTCTCTTCTCTCATTTGTTGAATTCTACGGCAGGATCCGTGGGTTTACTTTCCACACG
AATAAGTAGTTCCGACGCAGTGCAATTGACGGATTAACTATTTTACGAATATGGTTCTTC
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AAGATGAAATCCATTTCTTAATCCCG

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DS 

RD RS1A369TR 799 0 0
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TGTTACCGCTGCTGCAGCTTTGAAGCAGAACCCATTGATCGACATAACAGCCACTCTAGG
CACACCAGTCATCTCCTTTGGTGCTGAAGCTGGATACGACACCTCCTCCAAAACTTTCAC
CAAGTACAACGCTGGCATCAGTGTCACCAAACCAGATGCTTCCGCTACCATTATTTTGGG
AGACAAAGGAGACTCAATCAAAGCATCTTACCTTCATCACCTCGACGAATCCAAGAGAAG
TGCTGCAGTTGGTGAGGTTTACAGGAAATTCTCGACTAATGAGAACACGATAACTGTTGG
TGGGTCATACGCGATTGATCCCTCGACTTCGGTGAAAGCTAAATTCAACAGCCGTGGCAC
ACTCGGTGCTCTTCTTCAGCACGAGGTCTTGCCCAAATCGCTAGTGACTGTTTCCAGTGA
GATCGACACTAGGGCCTTAGACAAGCATCCAAGGTTTGGTCTTTCACTTGCTCTCAAACC
TTGAGAGAACACACACACACAC**GCAACACATGAGATGAGTCTCCGTACCATTCTTCTC
TTCTCTCATTTGTTGAATTCTACGGCAGGATCCGTGGGTTTACTTTCCACACGAATAAGT
AGTTCCGACGCAGTGCAATTGACGGATTAACTATTTTACGAATATGGTTCTTCTTATCGA
CATATTTTCAAAAAGTAATTTTCTTGGTATATTTTCACTAAACCCTTTTAAACAAGATGA
AATCCATTTCTTAATCCCG

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 10

CO CL347Contig1 769 10 8 U
TTTTTTTTTAGCAGAGACTGATTACTTTATTTCATAGTTTATCATGGATACATCATAACA
AGCTGAGAAATAACGGAAAGACACTTTATTTATTTATTTATTTTTATTTTTTTTGTCTCT
GAAAGACACTTTATTTAGTAAAACCATATAGTATAAGATCAAGAACGCTTCACAGCTAGC
TTGTTGAAACATCTTACCCTTTGATGGCCTTAACATTTGGGATCACAGGCCTCACATAGA
AACCAATAGATTTCAACTGACCATGTTCGATAGTTCCAAAGAAACCTCCAAACTCACGGC
GTTCAAGTATCCCTGAATGAAACTCCATCTTCTTAAGACCAAATTCTCCTGGATCGACTG
TCCAGTGAACCGCATAGTGAGTACGTTCATTTGTATGAAACGCCAGCGAGGAAATGTAAC
CATTGTATACCTCCCCGTGAATCCCAGTCACAAACTCTGTCTCATGATTTAGCCTCAAAA
TTCGCCTGCTACAGTCAGATGATGATGAACCGTACGTTTCAGACATGACAACAGATCCAT
CCTCGACATATCCAAACTGAATTGAAGTTACTCCGTGTTTGTTAAAGGATACGTTTATAT
GAGATATTACATTGTGGAGCGTTTCTGCCCATTCGAAGCACCCAGAGCCTCTACTGGATT
GACCAATCGGGCCCATTGCTATCATCTGCATAACATTTTTTATTTATTTTTTTCTGTCAC
GAACCATCTGCATAACTATAAAGCAAGGTATGTACTCTGTAGTCTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 35 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 55 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 0 0 0 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 

AF RS1EN64JQ U 10
AF RS1EE10JQ U 10
AF RS1F804TF C 1
AF RS1G504JQ U 5
AF RS1F804JQ U 10
AF RS1EE10TF C 3
AF RS1EN64TF C 108
AF RS1C543JQ U 10
AF RS1G504TF C 213
AF RS1C543TF C 10
BS 1 9 RS1F804TF
BS 10 66 RS1EN64JQ
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BS 746 747 RS1G504JQ
BS 748 769 RS1F804JQ

RD RS1EN64JQ 233 0 0
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ATAACGGAAAGACACTTTATTTATTTATTTATTTTTATTTTTTTTGTCTCTGAAAGACAC
TTTATTTAGTAAAACCATATAGTATAAGATCAAGAACGCTTCACAGCTAGCTTGTTGAAA
CATCTTACCCTTTGATGGCCTTAACATTTGGGATCACAGGCCTCACATA
AAAA

QA 1 229 1 229
DS 

RD RS1EE10JQ 701 0 0
CGCAA
AGACTGATTACTTTATTTCATAGTTTATCATGGATACATCATAACAAGCTGAGAAATAAC
GGAAAGACACTTTATTTATTTATTTATTTTTATTTTTTTTGTCTCTGAAAGACACTTTAT
TTAGTAAAACCATATAGTATAAGATCAAGAACGCTTCACAGCTAGCTTGTTGAAACATCT
TACCCTTTGATGGCCTTAACATTTGGGATCACAGGCCTCACATAGAAACCAATAGATTTC
AACTGACCATGTTCGATAGTTCCAAAGAAACCTCCAAACTCACGGCGTTCAAGTATCCCT
GAATGAAACTCCATCTTCTTAAGACCAAATTCTCCTGGATCGACTGTCCAGTGAACCGCA
TAGTGAGTACGTTCATTTGTATGAAACGCCAGCGAGGAAATGTAACCATTGTATACCTCC
CCGTGAATCC*AGTCACAAACTCTGTCTCATGATTTAGCCTCAAAATTCGCCTGCTACAG
TCAGATGATGATGAACCGTACGTTTCAAACATGACAACAGATCCATCCTCGACATATCCA
AACTGAATTGAAGTTACTCCGTGTTTGTTAAAGGATACGTTTATATGAGATATTACATTG
TGGAGCGTTTCTGCCCATTCGAAGCACCCAGAGCCTCTACTGGATTGACCAATCGGGCCC
ATTGCTATCATCTGCATAACATTTTTTATTTATTTT

QA 6 701 6 701
DS 

RD RS1F804TF 769 0 0
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AGCTGAGAAATAACGGAAAGACACTTTATTTATTTATTTATTTTTATTTTTTT*GTCTCT
GAAAGACACTTTATTTAGTAAAACCATATAGTATAAGATCAAGAACGCTTCACAGCTAGC
TTGTTGAAACATCTTACCCTTTGATGGCCTTAACATTTGGGATCACAGGCCTCACATAGA
AACCAATAGATTTCAACTGACCATGTTCGATAGTTCCAAAGAAACCTCCAAACTCACGGC
GTTCAAGTATCCCTGAATGAAACTCCATCTTCTTAAGACCAAATTCTCCTGGATCGACTG
TCCAGTGAACCGCATAGTGAGTACGTTCATTTGTATGAAACGCCAGCGAGGAAATGTAAC
CATTGTATACCTCCCCGTGAATCCCAGTCACAAACTCTGTCTCATGATTTAGCCTCAAAA
TTCGCCTGCTACAGTCAGATGATGATGAACCGTACGTTTCAGACGTGACAACAGATCCAT
CCTCGACATATCCAAACTGAATTGAAGTTACTCCGTGTTTGTTAAAGGATACGTTTATAT
GAGATATTACATTGTGGAGAGTTTCTGCCCATTCGAAGCACCCAGAGCCTCTACTGGATT
GACCAATCGGGCCCATTGCTATCATCTGCATAACATTTTTTATTTATTTTTTTCTGTCAC
GAACCATCTGCATAACTATAA****AGGTATGTACTCTGTAGTCTGTCC

QA 1 769 1 769
DS 

RD RS1G504JQ 743 0 0
GTCAT
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ATAACGGAAAGACACTTTATTTATTTATTTATTTTTATTTTTTTTGTCTCTGAAAGACAC
TTTATTTAGTAAAACCATATAGTATAAGATCAAGAACGCTTCACAGCTAGCTTGTTGAAA
CATCTTACCCTTTGATGGCCTTAACATTTGGGATCACAGGCCTCACATAGAAACCAATAG
ATTTCAACTGACCATGTTCGATAGTTCCAAAGAAACCTCCAAACTCACGGCGTTCAAGTA
TCCCTGAATGAAACTCCATCTTCTTAAGACCAAATTCTCCTGGATCGACTGTCCAGTGAA
CCGCATAGTGAGTACGTTCATTTGTATGAAACGCCAGCGAGGAAATGTAACCATTGTATA
CCTCCCCGTGAATCCCAGTCACAAACTCTGTCTCATGATTTAGCCTCAAAATTCGCCTGC
TACAGTCAGATGATGATGAACCGTACGTTTCAGACATGACAACAGATCCATCCTCGACAT
ATCCAAACTGAATTGAAGTTACTCCGTGTTTGTTAAAGGATACGTTTATATGAGATATTA
CATTGTGGAGCGTTTCTGCCCATTCGAAGCACCCAGAGCCTCTACTGGATTGACCAATCG
GGCCCATTGCTATCATCTGCATAACATTTTTTATTTATTTTTTTCTGTCACGAACCATCT
GCATAACTATAA****AG

QA 6 743 6 743
DS 

RD RS1F804JQ 760 0 0
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ATAACGGAAAGACACTTTATTTATTTATTTATTTTTATTTTTTTTGTCTCTGAAAGACAC
TTTATTTAGTAAAACCATATAGTATAAGATCAAGAACGCTTCACAGCTAGCTTGTTGAAA
CATCTTACCCTTTGATGGCCTTAACATTTGGGATCACAGGCCTCACATAGAAACCAATAG
ATTTCAACTGACCATGTTCGATAGTTCCAAAGAAACCTCCAAACTCACGGCGTTCAAGTA
TCCCTGAATGAAACTCCATCTTCTTAAGACCAAATTCTCCTGGATCGACTGTCCAGTGAA
CCGCATAGTGAGTACGTTCATTTGTATGAAACGCCAGCGAGGAAATGTAACCATTGTATA
CCTCCCCGTGAATCCCAGTCACAAACTCTGTCTCATGATTTAGCCTCAAAATTCGCCTGC
TACAGTCAGATGATGATGAACCGTACGTTTCAGACGTGACAACAGATCCATCCTCGACAT
ATCCAAACTGAATTGAAGTTACTCCGTGTTTGTTAAAGGATACGTTTATATGAGATATTA
CATTGTGGAGAGTTTCTGCCCATTCGAAGCACCCAGAGCCTCTACTGGATTGACCAATCG
GGCCCATTGCTATCATCTGCATAACATTTTTTATTTATTTTTTTCTGTCACGAACCATCT
GCATAACTATAA****AGGTATGTACTCTGTAGTCTGTCC

QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1EE10TF 767 0 0
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GCAGAGACTGATTACTTTATTTCATAGTTTATCATGGATACATCATAACAAGCTGAGAAA
TAACGGAAAGACACTTTATTTATTTATTTATTTTTATTTTTTT*GTCTCTGAAAGACACT
TTATTTAGTAAAACCATATAGTATAAGATCAAGAACGCTTCACAGCTAGCTTGTTGAAAC
ATCTTACCCTTTGATGGCCTTAACATTTGGGATCACAGGCCTCACATAGAAACCAATAGA
TTTCAACTGACCATGTTCGATAGTTCCAAAGAAACCTCCAAACTCACGGCGTTCAAGTAT
CCCTGAATGAAACTCCATCTTCTTAAGACCAAATTCTCCTGGATCGACTGTCCAGTGAAC
CGCATAGTGAGTACGTTCATTTGTATGAAACGCCAGCGAGGAAATGTAACCATTGTATAC
CTCCCCGTGAATCC*AGTCACAAACTCTGTCTCATGATTTAGCCTCAAAATTCGCCTGCT
ACAGTCAGATGATGATGAACCGTACGTTTCAGACATGACAACAGATCCATCCTCGACATA
TCCAAACTGAATTGAAGTTACTCCGTGTTTGTTAAAGGATACGTTTATATGAGATATTAC
ATTGTGGAGCGTTTCTGCCCATTCGAAGCACCCAGAGCCTCTACTGGATTGACCAATCGG
GCCCATTGCTATCATCTGCATAACATTTTTTATTTATTTTTTTCTGTCACGAACCATCTG
CATAACTATAAAGCAAGGTATGTACTCTGTAGTCTGTCC

QA 9 767 9 767
DS 

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CCAAACTCACGGCGTTCAAGTATCCCTGAATGAAACTCCATCTTCTTAAGACCAAATTCT
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GAGGAAATGTAACCATTGTATACCTCCCCGTGAATCCCAGTCACAAACTCTGTCTCATGA
TTTAGCCTCAAAATTCGCCTGCTACAGTCAGATGATGATGAACCGTACGTTTCAGACGTG
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GATACGTTTATATGAGATATTACATTGTGGAGAGTTTCTGCCCATTCGAAGCACCCAGAG
CCTCTACTGGATTGACCAATCGGGCCCATTGCTATCATCTGCATAACATTTTTTATTTAT
TTTTTTCTGTCACGAACCATCTGCATAACTATAA****AGGTATGTACTCTGTAGTCTGT
CC

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DS 

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GT
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AACGGAAAGACACTTTATTTATTTATTTATTTTTATTTTTTTTGTCTCTGAAAGACACTT
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TTCAACTGACCATGTTCGATAGTTCCAAAGAAACCTCCAAACTCACGGCGTTCAAGTATC
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TCCCCGTGAATCCCAGTCACAAACTCTGTCTCATGATTTAGCCTCAAAATTCGCCTGCTA
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CCAAACTGAATTGAAGTTACTCCGTGTTTGTTAAAGGATACGTTTATATGAGATATTACA
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CCCATTGCTATCATCTGCATAACATTTTTTATTTATTTTTTTCTGTCACGAACCATCTGC
ATAACTATAAAGCAAGGTATGTACTCTGTAGTCTGTCC

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DS 

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GTATGAAACGCCAGCGAGGAAATGTAACCATTGTATACCTCCCCGTGAATCCCAGTCACA
AACTCTGTCTCATGATTTAGCCTCAAAATTCGCCTGCTACAGTCAGATGATGATGAACCG
TACGTTTCAGACATGACAACAGATCCATCCTCGACATATCCAAACTGAATTGAAGTTACT
CCGTGTTTGTTAAAGGATACGTTTATATGAGATATTACATTGTGGAGCGTTTCTGCCCAT
TCGAAGCACCCAGAGCCTCTACTGGATTGACCAATCGGGCCCATTGCTATCATCTGCATA
ACATTTTTTATTTATTTTTTTCTGTCACGAACCATCTGCATAACTATAAAGCAAGGTATG
TACTCTGTAGTCTGTCC

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DS 

RD RS1C543TF 760 0 0
GT
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A*CGGAAAGACACTTTATTTATTTATTTATTTT*ATTTTTTT*GTCTCTGAAAGACACTT
TATTTAGTAAAACCATATAGTATAAGATCAAGAACGCTTCACAGCTAGCTTGTTGAAACA
TCTTACCCTTTGATGGCCTTAACATTTGGGATCACAGGCCTCACATAGAAACCAATAGAT
TTCAACTGACCATGTTCGATAGTTCCAAAGAAACCTCCAAACTCACGGCGTTCAAGTATC
CCTGAATGAAACTCCATCTTCTTAAGACCAAATTCTCCTGGATCGACTGTCCAGTGAACC
GCATAGTGAGTACGTTCATTTGTATGAAACGCCAGCGAGGAAATGTAACCATTGTATACC
TCCCCGTGAATCCCAGTCACAAACTCTGTCTCATGATTTAGCCTCAAAATTCGCCTGCTA
CAGTCAGATGATGATGAACCGTACGTTTCAGACATGACAACAGATCCATCCTCGACATAT
CCAAACTGAATTGAAGTTACTCCGTGTTTGTTAAAGGATACGTTTATATGAGATATTACA
TTGTGGAGCGTTTCTGCCCATTCGAAGCACCCAGAGCCTCTACTGGATTGACCAATCGGG
CCCATTGCTATCATCTGCATAACATTTTTTATTTATTTTTTTCTGTCACGAACCATCTGC
ATAACTATAAAGCAAGGTATGTACTCTGTAGTCTGTCC

QA 3 760 3 760
DS 



AS 3 10

CO CL348Contig1 588 4 1 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAAACGAGAG
AAATTGAGAGGGGCTAGGGTTTGCGAATCAAGAAAGAGGGGAAAAAGATGATAGAGGTGG
TGCTGAACGATCGTCTTGGGAAGAAAGTAAGGGTGAAGTGCAACGAAGACGACACGATCG
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AGAAGTGGTACAACATCTACAAGGATCACATCACTCTCAAGGACTACGAGATCCACGACG
GCATGGGTCTCGAGCTCTACTACAATTAAGGCGAACCGGAGGGGGTGCTAAGCAAGTGTG
AGCTGAAGGAATGTTGTTGATTTGCACACCTCCATAAATAAAATTAAAAAACAAAAAAAA
GTACGTCTGTAAAATTGGGTAATTGGTTTCTGATTATGTATTGCTTTGGTAAAAACTAAA
ATCAAATGTGTTGTAATAAGCTATACTCTTCCAACTTTTGTCTACGGTAAAGTCTCTTGG
TGTTGTGCTCAAGTTGCTATATTTCTAAATGTTGCCCATATCTTTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1A244TV U 1
AF RS1A244JQ C 64
AF RS1A244TF U 123
AF RS1A244TR C 64
BS 1 588 RS1A244TV

RD RS1A244TV 588 0 0
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AAATTGAGAGGGGCTAGGGTTTGCGAATCAAGAAAGAGGGGAAAAAGATGATAGAGGTGG
TGCTGAACGATCGTCTTGGGAAGAAAGTAAGGGTGAAGTGCAACGAAGACGACACGATCG
GCGATCTGGAGAAGCTGGTGGCGGCGCAGACGGGAACGAGAGCGGAGAAGATTCGAATCC
AGAAGTGGTACAACATCTACAAGGATCACATCACTCTCAAGGACTACGAGATCCACGACG
GCATGGGTCTCGAGCTCTACTACAATTAAGGCGAACCGGAGGGGGTGCTAAGCAAGTGTG
AGCTGAAGGAATGTTGTTGATTTGCACACCTCCATAAATAAAATTAAAAAACAAAAAAAA
GTACGTCTGTAAAATTGGGTAATTGGTTTCTGATTATGTATTGCTTTGGTAAAAACTAAA
ATCAAATGTGTTGTAATAAGCTATACTCTTCCAACTTTTGTCTACGGTAAAGTCTCTTGG
TGTTGTGCTCAAGTTGCTATATTTCTAAATGTTGCCCATATCTTTGCT

QA 1 588 1 588
DS 

RD RS1A244JQ 525 0 0
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TGAACGATCGTCTTGGGAAGAAAGTAAGGGTGAAGTGCAACGAAGACGACACGATCGGCG
ATCTGGAGAAGCTGGTGGCGGCGCAGACGGGAACGAGAGCGGAGAAGATTCGAATCCAGA
AGTGGTACAACATCTACAAGGATCACATCACTCTCAAGGACTACGAGATCCACGACGGCA
TGGGTCTCGAGCTTTACTACAATTAAGGCGAACCGGAGGGGGTGCTAAGCAAGTGTGAGC
TGAAGGAATGTTGTTGATTTGCACACCTCCATAAATAAAATTAAAAAACAAAAAAAAGTA
CGTCTGTAAAATTGGGTAATTGGTTTCTGATTATGTATTGCTTTGGTAAAAACTAAAATC
AAATGTGTTGTAATAAGCTATACTCTTCCAACTTTTGTTTACGGTAAAGTCTCTTGGTGT
TGTGCTCAAGTTGCTATATTTCTAAATGTTGCCCATATCTTTGCT

QA 1 525 1 525
DS 

RD RS1A244TF 466 0 0
CTGAACGATCGTCTTGGGAAGAAAGTAAGGGTGAAGTGCAACGAAGACGACACGATCGGC
GATCTGGAGAAGCTGGTGGCGGCGCAGACGGGAACGAGAGCGGAGAAGATTCGAATCCAG
AAGTGGTACAACATCTACAAGGATCACATCACTCTCAAGGACTACGAGATCCACGACGGC
ATGGGTCTCGAGCTCTACTACAATTAAGGCGAACCGGAGGGGGTGCTAAGCAAGTGTGAG
CTGAAGGAATGTTGTTGATTTGCACACCTCCATAAATAAAATTAAAAAACAAAAAAAAGT
ACGTCTGTAAAATTGGGTAATTGGTTTCTGATTATGTATTGCTTTGGTAAAAACTAAAAT
CAAATGTGTTGTAATAAGCTATACTCTTCCAACTTTTGTCTACGGTAAAGTCTCTTGGTG
TTGTGCTCAAGTTGCTATATTTCTAAATGTTGCCCATATCTTTGCT

QA 1 466 1 466
DS 

RD RS1A244TR 525 0 0
TTGAGAGGGGCTAGGGTTTGCGAATCAAGAAAGAGGGGAAAAAGATGATAGAGGTGGTGC
TGAACGATCGTCTTGGGAAGAAAGTAAGGGTGAAGTGCAACGAAGACGACACGATCGGCG
ATCTGGAGAAGCTGGTGGCGGCGCAGACGGGAACGAGAGCGGAGAAGATTCGAATCCAGA
AGTGGTACAACATCTACAAGGATCACATCACTCTCAAGGACTACGAGATCCACGACGGCA
TGGGTCTCGAGCTTTACTACAATTAAGGCGAACCGGAGGGGGTGCTAAGCAAGTGTGAGC
TGAAGGAATGTTGTTGATTTGCACACCTCCATAAATAAAATTAAAAAACAAAAAAAAGTA
CGTCTGTAAAATTGGGTAATTGGTTTCTGATTATGTATTGCTTTGGTAAAAACTAAAATC
AAATGTGTTGTAATAAGCTATACTCTTCCAACTTTTGTTTACGGTAAAGTCTCTTGGTGT
TGTGCTCAAGTTGCTATATTTCTAAATGTTGCCCATATCTTTGCT

QA 1 525 1 525
DS 



CO CL348Contig2 562 3 1 U
CCAGAAAGATATGGGCAACATTTAGAATTATAGCAATCGTGCACAACACCGAGAGACTTT
ACCGTAGACAAAAGTTGGAAAAGTAGCTTATTACAACACATTTGATTTTAGTTTACCAAA
GCAAATACATAATCAGAAACCAATTACCCAATTTTACAGACGTACTTTTTTTTGTTTTTA
ATTTTATTTATGGAGGTGTGCAAATCAACAACATTCCTTCAGCTCACACTTGCTTTATCA
CCTCCGGTTCGCCTCAATTGTAGTAGAGCTCGAGACCCATGCCGTCGTGGATCTCGTAGT
CCTTGAGAGTGATGTGATCCTTGTAGATATTGTACCACTTCTGGATTCGAATCTTCTCCG
CTCTCGTTCCCGTCTGCGCCGCCACCAGCTTCTTCAGATCACCGATCGTGTCGTCTTCGT
TGCACTTCACCCTTACTTTCTTCCCCAGTCGATCGTTCAGCACCACCTCTATCATCTTTT
TCCCCTCTTTCTTGGATTCGAATCGCAAACCCTAGCCCCTCTCGATTTCTCTCGTTTGTT
TAACGCAGACTTTTATCTATCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 10 10 10 10 

AF RS1BW62JQ U 1
AF RS1FC91JQ U 13
AF RS1BW62TF C 1
BS 1 562 RS1BW62JQ

RD RS1BW62JQ 562 0 0
CCAGAAAGATATGGGCAACATTTAGAATTATAGCAATCGTGCACAACACCGAGAGACTTT
ACCGTAGACAAAAGTTGGAAAAGTAGCTTATTACAACACATTTGATTTTAGTTTACCAAA
GCAAATACATAATCAGAAACCAATTACCCAATTTTACAGACGTACTTTTTTTTGTTTTTA
ATTTTATTTATGGAGGTGTGCAAATCAACAACATTCCTTCAGCTCACACTTGCTTTATCA
CCTCCGGTTCGCCTCAATTGTAGTAGAGCTCGAGACCCATGCCGTCGTGGATCTCGTAGT
CCTTGAGAGTGATGTGATCCTTGTAGATATTGTACCACTTCTGGATTCGAATCTTCTCCG
CTCTCGTTCCCGTCTGCGCCGCCACCAGCTTCTTCAGATCACCGATCGTGTCGTCTTCGT
TGCACTTCACCCTTACTTTCTTCCCCAGTCGATCGTTCAGCACCACCTCTATCATCTTTT
TCCCCTCTTTCTTGGATTCGAATCGCAAACCCTAGCCCCTCTCGATTTCTCTCGTTTGTT
TAACGCAGACTTTTATCTATCC

QA 1 562 1 562
DS 

RD RS1FC91JQ 548 0 0
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AGTTGGAAAAGTAGCTTATTACAACACATTTGATTTTAGTTTACCAAAGCAAATACATAA
TCAGAAACCAATTACCCAATTTTACAGACGTACTTTTTTTTGTTTTTAATTTTATTTATG
GAGGTGTGCAAATCAACAACATTCCTTCAGCTCACACTTGCTTTATCACCTCCGGTTCGC
CTCAATTGTAGTAGAGCTCGAGACCCATGCCGTAGTGGATCTCGTAGTCCTTGAGAGTGA
TGTGATCCTTGTAGATGTTGTACCACTTCTGGATTCGAATCTTCTCCGCTCTCGTTCCCG
TCTGCGCCGCCACCAGCTTCTTCAGATCACCGATCGTGTCGTCTTCGTTGCACTTCACCC
TTACTTTCTTCCCCAGTCGATCGTTCAGCACCACCTCTATCATCTTTTTCCCCTCTTTCT
TGGATTCGAATCGCAAACCCTAGCCCCTCTCGATTTCTCTCGTTTGTTTAACGCAGACTT
TTAT
CTCC

QA 1 544 1 544
DS 

RD RS1BW62TF 562 0 0
CCAG
AAAGATATGGGCAACATTTAGAATTATAGCAATCGTGCACAACACCGAGAGACTTTACCG
TAGACAAAAGTTGGAAAAGTAGCTTATTACAACACATTTGATTTTAGTTTACCAAAGCAA
ATACATAATCAGAAACCAATTACCCAATTTTACAGACGTACTTTTTTTTGTTTTTAATTT
TATTTATGGAGGTGTGCAAATCAACAACATTCCTTCAGCTCACACTTGCTTTATCACCTC
CGGTTCGCCTCAATTGTAGTAGAGCTCGAGACCCATGCCGTCGTGGATCTCGTAGTCCTT
GAGAGTGATGTGATCCTTGTAGATATTGTACCACTTCTGGATTCGAATCTTCTCCGCTCT
CGTTCCCGTCTGCGCCGCCACCAGCTTCTTCAGATCACCGATCGTGTCGTCTTCGTTGCA
CTTCACCCTTACTTTCTTCCCCAGTCGATCGTTCAGCACCACCTCTATCATCTTTTTCCC
CTCTTTCTTGGATTCGAATCGCAAACCCTAGCCCCTCTCGATTTCTCTCGTTTGTTTAAC
GCAGACTTTTATCT
ATCC

QA 5 558 5 558
DS 



CO CL348Contig3 555 3 8 U
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TTCCAAGAAAGAAAGAGGGAAAAAGATGATAGAGGTGGTGCTGAACGATCGTCTGGGGAA
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GGCGCAGACGGGAACGAGAGCGGAGAAGATTCGAATCCAGAAGTGGTACAACATCTACAA
GGATCACATCACTCTCAAGGACTACGAGATCCACGACGGCATGGGTCTCGAGCTCTACTA
CAATTAAGGCGAACCGGAGGGGGTGCTAAGCAAGTGTGAGCTGAAGGAATGTTGTTGATT
TGCACACCTCCATAAATAAAATTAAAAACAAAAAAAAAGTACCGTCTGTAAAATTGGGTA
ATTGGTTTCTGATTATGTATTGCTTTGGTAAAAACTAAAATCAAATGTGTTGTAATAAGC
TATACTCTTCCAACTTTTGTCTACGGTAAAGTCTCTTGGTGTTGTGCTCAAGTTGCTATA
TTTCTAAATGTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 

AF RS1EW85TF U 1
AF RS1GH73JQ C -1
AF RS1GH73TF U -1
BS 1 71 RS1EW85TF
BS 72 72 RS1GH73TF
BS 73 79 RS1EW85TF
BS 80 82 RS1GH73TF
BS 83 397 RS1EW85TF
BS 398 398 RS1GH73TF
BS 399 553 RS1EW85TF
BS 554 555 RS1GH73TF

RD RS1EW85TF 553 0 0
GGATAAATAAAAGTCTGCGTTAAACTAACGAGAGAAATCGAGAGGGGCTAGGGTTTGTGA
TTCCAAGAAAGGAAGAGGG***AAGATGATAGAGGTGGTGCTGAACGATCGTCTGGGGAA
GAAAGTAAGGGTGAAGTGCAACGAAGACGACACGATCGGGGATCTGAAGAAGCTGGTGGC
GGCGCAGACGGGAACGAGAGCGGAGAAGATTCGAATCCAGAAGTGGTACAACATCTACAA
GGATCACATCACTCTCAAGGACTACGAGATCCACGACGGCATGGGTCTCGAGCTCTACTA
CAATTAAGGCGAACCGGAGGGGGTGCTAAGCAAGTGTGAGCTGAAGGAATGTTGTTGATT
TGCACACCTCCATAAATAAAATTAAAAACAAAAAAAA*GTACCGTCTGTAAAATTGGGTA
ATTGGTTTCTGATTATGTATTGCTTTGGTAAAAACTAAAATCAAATGTGTTGTAATAAGC
TATACTCTTCCAACTTTTGTCTACGGTAAAGTCTCTTGGTGTTGTGCTCAAGTTGCTATA
TTTCTAAATGTTG

QA 1 553 1 553
DS 

RD RS1GH73JQ 557 0 0
GGGCATAA
ATAAAAGTCTGCGTTAAACTAACGAGAGAAATCGAGAGGGGCTAGGGTTTGTGATTCCAA
GAAAGAAAGAGGGAAAAAGATGATAGAGGTGGTGCTGAACGATCGTCTGGGGAAGAAAGT
AAGGGTGAAGTGCAACGAAGACGACACGATCGGGGATCTGAAGAAGCTGGTGGCGGCGCA
GACGGGAACGAGAGCGGAGAAGATTCGAATCCAGAAGTGGTACAACATCTACAAGGATCA
CATCACTCTCAAGGACTACGAGATCCACGACGGCATGGGTCTCGAGCTCTACTACAATTA
AGGCGAACCGGAGGGGGTGCTAAGCAAGTGTGAGCTGAAGGAATGTTGTTGATTTGCACA
CCTCCATAAATAAAATTAAAAACAAAAAAAAAGTACCGTCTGTAAAATTGGGTAATTGGT
TTCTGATTATGTATTGCTTTGGTAAAAACTAAAATCAAATGTGTTGTAATAAGCTATACT
CTTCCAACTTTTGTCTACGGTAAAGTCTCTTGGTGTTGTGCTCAAGTTGCTATATTTCTA
AATGTTGCC

QA 9 557 9 557
DS 

RD RS1GH73TF 557 0 0
GGGCATAA
ATAAAAGTCTGCGTTAAACTAACGAGAGAAATCGAGAGGGGCTAGGGTTTGTGATTCCAA
GAAAGAAAGAGGGAAAAAGATGATAGAGGTGGTGCTGAACGATCGTCTGGGGAAGAAAGT
AAGGGTGAAGTGCAACGAAGACGACACGATCGGGGATCTGAAGAAGCTGGTGGCGGCGCA
GACGGGAACGAGAGCGGAGAAGATTCGAATCCAGAAGTGGTACAACATCTACAAGGATCA
CATCACTCTCAAGGACTACGAGATCCACGACGGCATGGGTCTCGAGCTCTACTACAATTA
AGGCGAACCGGAGGGGGTGCTAAGCAAGTGTGAGCTGAAGGAATGTTGTTGATTTGCACA
CCTCCATAAATAAAATTAAAAACAAAAAAAAAGTACCGTCTGTAAAATTGGGTAATTGGT
TTCTGATTATGTATTGCTTTGGTAAAAACTAAAATCAAATGTGTTGTAATAAGCTATACT
CTTCCAACTTTTGTCTACGGTAAAGTCTCTTGGTGTTGTGCTCAAGTTGCTATATTTCTA
AATGTTGCC

QA 9 557 9 557
DS 



AS 1 10

CO CL349Contig1 1217 10 29 U
GGCCATAAATAATTAGTTGGGGCAGATCACTGGATATATCAATATCAATCTGCATTGCAG
ATACAATAACATCGATTGAGATCAAACTGCAGTAATTGCACCTTTTTTTAACTACCAAAC
TTTGTAGGGAACTACTTATTTCAGGCATGAAGACAAAAAGCTACATATGCAGAGGACTTT
ACTTACCATAGGAACAATCACATCATCCTGACCAGTTCGCCTAAGGAACGTGTAAGACAG
AAGGCCGATACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGAATCTCGATCTTAATCT
TTTCCAAGAATCATAAAAGGAAAAGAGAGAGACAGAGATTCATCTTCGTCAAAAAAACAA
AAGAGACAGAGATTCATAAATAAACAAAAAAA*TGGCGATCGTGGGCCCTCAATTTTGCG
CACCGTACCCAGTAGATTTGGGTATCGTACGTAAGGTGATGACAATAACAGACGGTAACT
TTGCCGTCACTGACGTCAACGGAAACCTCCTTTTCAAAGTCAAAGAACCATTGTTTAGCC
TCTCCGACAAAAGGATCTTACTTGATGCTTCAGACAATCCGATTCTGACCTTGAGAGAAA
ATAGGGTGAGCCTGCACGATAGATGGCAAGTATTTAGAGGAAAGAGCACAGACCAAAATG
ATTTGGTGTACACGTTGAAACGATCGTCAATGATTCAATTGATCAAGCCAAAACTAGATG
TGTTTTTGGCTCAAAACAAGGAAATGAAGGTATGTGACTTCCATGTTAAAGGAAGTTGGA
TTGACCGGTCATGTGTCGTCTACGCCGGGAAATCTGATGCCATTGTTGCTCAGATGCACA
AGAACCATACCGCACAAAGCATATTAATAGGAAAGAGTAACTTCTCGGTCACGGTTTATC
CGAATGTTGATTATGCGTTTATAGTATCTCTCATTGTAATTCTTGATGACATTAACCGAG
AAGATTCTGATGACTAAACTAATGTTTTTTTAACTAATGATTCTTGATTTTAATATGAAA
CAAGAATTCATGAAAGTGTTGAGGTTTTGTTTGGATATGAATACAATTCTCTCTGTCTCG
ACAGAGGATTATTGAACACAGTTTCAAGTTTATTCAGTTCCTTGAATAAGCAATCGATTG
TACTCTTGATACGTGCAACATTTGACTTATAGATAATACTTATAATTTATCTAAATATCT
ATAAAAGGGATTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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CCGAATGTTGATTATGCGTTTATAGTATCTCT

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G
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CTTGATTTTA
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CTTGATTTTA
TATGA

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DS 

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G

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QA 1 780 1 780
DS 

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*TGGCGATCGTGGGCCCTCAATTTTGCGCACCGTACCCAGTAGATTTGGGTATCGTACGT
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TTCAAAGTCAAAGAACCATTGTTTAGCCTCTCCGACAAAAGGATCTTACTTGATGCTTCA
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TCTGATGCCATTGTTGCTCAGACGCACAAGAACCATACCGCACAAAGCATATTAATAGGA
AAGAGTAACTTCTCGGTCACGGTTTATCCGAATGTTGATTATGCGTTTATAGTATCCCTC
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GGATATGAATACAATTCTCTCTGTCTCGACAGAGGATTATTGAACACAGTTTCAAGTTTA
TTC
G

QA 1 843 1 843
DS 

RD RS1C410JQ 791 0 0
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AGGCAGAGATTCATAAATAAACAAAAAAA*TGGCGATCGTGGGCCCTCAATTTTGCGCAC
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TGGTGTACACGTTGAAACGATCGTCAATGATTCAATTGATCAAGCCAAAACTAGATGTGT
TTTTGGCTCAAAACAAGGAGATGAAGGTATGTGACTTCCATGTTAAAGGAAGTTGGATTG
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ATTCTGATGACTAAACTAATGTTTTTTTAACTAATGATTCTTGATTTTAATATGAAACAA
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GAGGATTAT
GG

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DS 

RD RS1FN69JQ 504 0 0
CCTT
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TGCACAAGAACCATACCGCACAAAGCATATTAATAGGAAAGAGTAACTTTTCGGTCACGG
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ATGAAACAAGAATTCATGAAAGTGTTGAGGTTTTGTTTGGATATGAATACAATTCTTTCT
GTCTCGACAGAGGATTAT
TG

QA 5 502 5 502
DS 

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ATTCTTGATTTTAATATGAAACAAGAATTCATGAAAGTGTTGAGGTTTTGTTTGGATATG
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CCTTGAATAAGCAATCGATTGTACTCTTGATACGTGCAACATTTGACTTATAGATAATAC
TTATAATTTATCTAAATATCTATAAAAGGGATTTTACC

QA 1 398 1 398
DS 



AS 1 7

CO CL350Contig1 1277 7 30 U
GGCCAAGTCGAAAAAAAATACTTCATTGCAAAACCATAAAAGAAAATATCCATTTACTCT
TTCTTAATATTTTCTTTTTTCCAAAGGTAATATTGAAAAAGACCAAGTCGAAGGTGTGTA
GAAAGCAATGGCCTGTGAAACTATTACAGAACACAGAAGAGCCACAAGACATGTTCCCAA
ATCTCTTAAAGGAATGCATCCTTCTCAAGGAGCTTCACAACTTCGAGCTGATTGTTAAGC
TTTGCCACATCAACCGGAGTTTTACTGTCTGTGTTTTGCAGAGTGACTGCAGCACCATTC
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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

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CACACAC
CC

QA 1 667 1 667
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TCAT
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AAACATCTTTATCATTCCAGTACTTCATCATGGCGGAAGGATCAGCATCTATCTCAGCTA
ATATAGGTTTCAAGGTAGGATCTTCTTTCATCTGTGCCATACGCTCAGTAAACTGCTCTG
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CAGCCAATTCCTTGATGCTTGGGTCATTGAGAATACCCGCCATGCTTGAGAAATCGAAAG
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AACAAAAG
CTCC

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GCCT
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TCCCAGCTTCTTCAAAACATCTTTATCATTCCAGTACTTCATCATGACGGAAGGATCAGC
ATCTATCTCAGCTAATATAGGTTTCAAGGTAGGATCTTCTTTCATCTGTGCCATACGCTC
AGTAAACTGCTCTGTTGCTCCAGGGTTAGCAAAAGCCTCCATAAACGAAGACATTTGTGG
ATCCTGTACCAAGGCGTTGCCGAGTTTCTCAGCCATGGTTCTGAACTCAGGGTTTCCCAT
AACCTGATTCATTGTGGCCATGTACTGTTCCGGATCAAAGTTAGGGAGACCTCCTCCTTC
ACCTGATGCACTTGGAACAGATTTCTGAAGCTGCTCAGCTAACTGGTTAAAGGTGGGATC
TTTGGCAATTTGCTCAGCCAATTCCTTGATGCTTGGGTCATTGAGGATACCCGCCATGCT
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ACCGCACACACGAAAACAAAAGACGGAGCC

QA 5 694 5 694
DS 



AS 2 10

CO CL351Contig1 617 3 4 U
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ACAGGTGCACTAATGTCGGCTGTGTACGAAGAGAAAAAGGATGATGATGGCTTTCTCTAT
GTCACTTACAGCGGAGAGAACACATTTGGATCTCCATAGAAGATCTCTTGCTGGATATTT
CGTTTCTCTTTTACTTATTATATCGCCGAGTATTTCATATCTTCTTATTAGTTATATGCA
CTACTTTTCCAAGAACTTAATGTGTACAGAGAACATAAAAATAATGTATATAAAATCTCA
AAACCTACTTTCTCACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RS1D538TF U 1
AF RS1G730JQ C 42
AF RS1G730TF U 42
BS 1 228 RS1D538TF
BS 229 229 RS1G730TF
BS 230 615 RS1D538TF
BS 616 617 RS1G730JQ

RD RS1D538TF 615 0 0
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AAAAAATACCTAGTCCCAGCTGATTTGACAGTGGGGCAGTTCGTGTATGTCATTCGCAAA
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CGTTTCTCTTTTACTTATTATATCGCCGAGTATTTCATATCTTCTTATTAGTTATATGCA
CTACTTTTCCAAGAACTTAATGTGTACAGAGAACATAAAAATAATGTATATAAAATCTCA
AAACCTACTTTCTCA

QA 1 615 1 615
DS 

RD RS1G730JQ 576 0 0
GG
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ATGTATATAAAATCTCAAAACCTACTTTCTCACG

QA 3 576 3 576
DS 

RD RS1G730TF 576 0 0
GG
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TACCAGCCATCGACAAGAAAAAATACCTAGTCCCAGCTGATTTGACAGTGGGGCAGTTCG
TGTATGTCATTCGCAAAAGAATCAAACTGAGTGCAGAGAAGGCTATCTTTATCTTTGTGG
ACAATGTTCTTCCTCCAACAGGTGCACTAATGTCGGCTGTGTACGAAGAGAAAAAGGATG
ATGATGGCTTTCTCTATGTCACTTACAGCGGAGAGAACACATTTGGATCTCCATAGAAGA
TCTCTTGCTGGATATTTCGTTTCTCTTTTACTTATTATATCGCCGAGTATTTCATATCTT
CTTATTAGTTATATGCACTACTTTTCCAAGAACTTAATGTGTACAGAGAACATAAAAATA
ATGTATATAAAATCTCAAAACCTACTTTCTCA
CG

QA 3 574 3 574
DS 



CO CL351Contig2 755 7 5 U
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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E060JQ U 1
AF RS1E060TF C 1
AF RS1AI22TF C 263
AF RS1A240TR U 116
AF RS1AI22JQ U 12
AF RS1A240JQ U 59
AF RS1A240TF C 453
BS 1 524 RS1E060JQ
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BS 653 670 RS1AI22JQ
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RD RS1E060JQ 652 0 0
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CGGATCAGACACACTTTCCTAGAGCTCAACACAATTAACAAAACGAATATCC

QA 1 652 1 652
DS 

RD RS1E060TF 652 0 0
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CCAGCAAAAGATCTTTCTATGGAGATCCAAATGTGTTCTCTCCGCTGTAAGTGACATAGA
GGAAGCCATCATCATCCTTTTTCTCTTCGTACACAGCCGACATTAGTGCACCTGTTGGAG
GAAGAACATTGTCCACAAAGATAAAGATAGCCTTCTCTGCACTCAGTTTGATTCTTTTGC
GAATGACATACACGAATTGCCCCACTGTCAAATCAGCTGGGACTAGGTACTTTTTCTTGT
CGATGGTTGGTATATCACTCTTCTCACCCTTCTCAACAATCACCGGAATCCTATCTGGAT
ATTTCTCTCTAATCCGAGCAGCCTCTGCACTTCTCTTCTCTAGGCCATGCTCTTCCTTGA
ACGTGCTCTTTGCCATTCTTTCCACTCCCTGTTGTAAGAGACAGACACGAAGCCTTCCTG
CGGATCAGACACACTTTCCTAGAGCTCAACACAATTAACAAAACGAATATCC

QA 1 652 1 652
DS 

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AAAGATAGCCTTCTCTGCACTCAGTTTGATTCTTTTGCGAATGACATACACGAATTGCCC
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CACTCCCTGTTGTAAGAGACAGACACGAAGCCTTCCTGC

QA 1 339 1 339
DS 

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TAA
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AGGAAGAACATTGTCCACAAAGATAAAGATAGCCTTCTCTGCACTCAGTTTGATTCTTTT
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QA 4 538 4 538
DS 

RD RS1AI22JQ 659 0 0
C
GGTTTTGAGATTTTATATACATTATTTTTATGTTGAATTGTTCTCTGTACACATTAACGG
CCATCTTAAAGTTCTTGGAAAAGTAGTACACATAGGGCTTGCTTAGATAACTACTAATAA
GAAGATATGAAATACTCGGCGATATAATTAAAAAGAGAAGCGGAGTATCCAGCAAAAGAT
CTTTCTATGGAGATCCAAATGTGTTCTCTCCGCTGTAAGTGACATAGAGGAAGCCATCAT
CATCCTTTTTCTCTTCGTACACAGCCGACATTAGTGCACCTGTTGGAGGAAGAACATTGT
CCACAAAGATAAAGATAGCCTTCTCTGCACTCAGTTTGATTCTTTTGCGAATGACATACA
CGAATTGCCCCACTGTCAAATCAGCTGGGACTAGGTACTTTTTCTTGTCGATGGTTGGTA
TATCACTCTTCTCACCCTTCTCAACAATCACCGGAATCCTATCTGGATATTTCTCTCTAA
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CCATTCTTTCCACTCCCTGTTGTAAGAGACAGACACGAAGCCTTCCTGCGGATCAGACAC
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QA 2 659 2 659
DS 

RD RS1A240JQ 612 0 0
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GAGGAAGCCATCATCATCCTTTTTCTCTTCGTACACAGCCGACATCAGTGCACCTGTTGG
AGGAAGAACATTGTCCACAAAGATAAAGATAGCCTTCTCTGCACTCAGTTTGATTCTTTT
GCGAATGACATACACGAATTGCCCCACTGTCAAATCAGCTGGGACTAGGTACTTTTTCTT
GTCGATGGTTGGTAGACCACTCTTCTCACCCTTCTCAACAATCACCGGAATCCTATCTGG
ATATTTCTCTCTAATCCGAGCAGCCTCTGCACTTCTCTTCTCTAGGTCATGCTCTTCCTT
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ACCGCAAATTCC

QA 1 612 1 612
DS 

RD RS1A240TF 303 0 0
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AATTAACAAAACGAATATCCTAGAAAACCGCAAATTCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTC
CCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACTGATAACTTCGTATAATGTATGCTATACGAAGTT
ATG

QA 1 303 1 303
DS 



AS 2 9

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TATTTGGTTAAAAGCAAAGTGCATTTCTTCTTTCTTCTTCTTCTGATTGCCATCATGAAT
AAGGAGAAAAAAAAGGATGTGTGGTGAAGAAGGAGAAAAACTCTTCAGTATAAACGGAAC
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TTGATCACCAAGTTAGATTTCTGGTAAACACCGGTTCCTCTCAGAGCATCAGCTATGAAG
TCATCAAACCCGATTGCTATGGCTGCTTCAGCTTTCGCTCCATATACCAATCTCTTGAGT
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CATTCTGAGAGCTCGATTTTGTTAAGTTTCTTGCATGCCTCTCGAATGGCAGTGACTTCG
GCATGGGCAGTAGGGTCAGTGTACTTGAGAACCATGTTGTGGCAGCTAGCGACGACCTCG
TTATTGTGGACAATAACAGCACCAAAAGGGCCACCATCACCACAGTCAACACCCTTGTAA
GCTTCTTCAACAGCTTGGGTTAGGAACTTGTGGTCACTGTCTTGCACAGCTTGTTGGTGA
CCGGCAAAAGCAGTAGCAACGGAGATGGTTCCGTCTTTTGCTTCCACTTTAGCTTCTTCC
ATTGACTTATTGATGAGAATTTGACGAATTGATTTTTTTTTTTTGTTGCTGGGGGAGAAT
TCTCGAAGAGGCGATTGTGTTTGTGTGGTGGGTCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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CTC
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GTTTGTGTGGTGGGTGAAGGTTGACCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 5 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

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TT

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TTTTT

QA 1 725 1 725
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TTCGCTCCATATGCCAATCTCTTGAGTC*GGAGAGATGGATGGCTCCGAAGCACATGGGA
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TCTTTTGCTTCCACTTTAGCTTCTTCCATTGACTTATTGATGAGAATTTGACGAATTGAT
TTTTTTTTTTTTTTGCTGGGGGAGAATTCTAGAAGAGGCGATTGTGTTTGTGTGGTGGGT
GAAGGTTGACCC

QA 1 732 1 732
DS 

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QA 1 593 1 593
DS 

RD RS1GV07TF 583 0 0
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CTATGAAGTCATCAAACCCGATTGCTATGGCTGCTTCAGCTTTCGCTCCATATACCAATC
TCTTGAGTCTGGAGAGATGGGTGGCTCCGAAGCACATGGGACACGGCTCACAGGATGCGT
AAATCTCGCATTCTGAGAGTTCGATTTGGTTAAGTTTCTTGCATGCCTCTCGAATGGCAG
TGACTTCGGCATGAGCAGTAGGGTCAGTGTACTTGAGAACCATGTTGTGGCAGCTAGCGA
CGACTTCGTTATTGTGGACAATAACAGCACCGAAAGGGCCACCATCACCACAGTCAACAC
CCTTGTAAGCTTCTTCAACAGCTTGGGTTAGGAACGTGTGGTCACTGTCTTGCACAGCTT
GTTGGTGACCGGCAAAAGCAGTAGCAACGGAGATGGTTCCGTCTTTTGCTTCCACTTTAG
CTTCTTCCATTGACTTATTGATGAGAATTTGACGAATTGATTTTTTTTTT*****GCTGG
GGGAGAATTCTAGAAGAGGCGATTGTGTTTGTGTGGTGGGT
CC

QA 1 581 1 581
DS 



AS 2 9

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TTGCAACACAACGGGCTCAAATCTAGTATAAATATAAAAATAACTTAGGTTCTTTTTTCA
ACACACACAAGAGTTTCTTTTATTGTAGATTAACATGATACATAAACAAATCCACCTTAG
AATTCAGGTTCAGGTTCTTCTTCAACTGCAGCAATGAGCCATTCACCATTTTCATCCTTG
ATCATTCCTTTGTTCTTCTCCACCCACCAAGAACCTGGAACTAAACACTCATCTTTCAAG
AACTCACATGACTTGTTCACTAATGCAATACTTCTCTTCACCATCAGCTTAAACTCTCCT
TTCTTCCCATTCCATCCTGCAACCACATGGAGCATTGCCTGAAGATTGTGCCAGTCCCCT
GGATTCCTTGAATCCTTCAGGTAAGGTGACTTCTTTGTATCGATCACAAAGTTGGTTCCT
ATATCAACATACCCCAATAGTCCTCCTGGATATCGAGTCAAGAGATCAATCGTGTTCCTC
ACATGAAGGATCTTCAAGTTCTTGTGACGCGTTACTTCGTCCTTGAACTCCCTGTTACCC
ACCTGTGGACAGCCAAACACGATCCCAGTGACCGGAACATCATCACCGGAAGCGTTCTCA
GCTATGTCATAGGCCGCGAGGACAGCCTCAGTGGCTCCCAAGCTATGTCCAGTCAACACA
ATGCTCGGCTTCTCGTCCTTATACTTCAACAGAAGCTCCTTGATCCTAGTTAACAACTGT
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CATCCGAGCATCACCTTACACCCTT*CTTCGTCTTCACTGCCCCGGCCGTAATGGCCGAA
TTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A307JQ U 1
AF RS1EC37JQ U 2
AF RS1A307TR U 58
AF RS1BL46JQ U 115
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BS 881 930 RS1A307TV

RD RS1A307JQ 750 0 0
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ACCTGTGGACAGCCAAACACGATCCCAGTGACCGGAACATCATCACCGGAAGCGTTCTCA
GCTATGTCATAGGCCGCGAGGACAGCCTCAGTGGCTCCCAAGCTATGTCCAGTCAACACA
ATGCTCGGCTTCTCGTCCTTATACTTCAAC

QA 1 750 1 750
DS 

RD RS1EC37JQ 732 0 0
G
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CTTCCCATTCCATCCTGCAACCACATGGAGCATTGCCTGAAGATTGTGCCAGTCCCCTGG
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ATCAACATACCCCAATAGTCCTCCTGGATATCGAGTCAAGAAATCAATCGTGTTCCTCAC
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GCTCGGCTTCT

QA 2 732 2 732
DS 

RD RS1A307TR 824 0 0
CTG
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AACTCACATGACTTGTTCACTAATGCAATACTTCTCTTCACCATCAGCTTAAACTCTCCT
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C

QA 4 823 4 823
DS 

RD RS1BL46JQ 760 0 0
CTCAAC
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AACTCACATGACTTGTTCACTAGTGCAATACTTCTCTTCACCATCAGCTTAAACTCTCCT
TTCTTCCCATTCCATCCTGCAACCACATGGAGCATTGCCTGAAGATTGTGCCAGTCCCCT
GGATTCCTTGAATCCTTCAGGTAAGGTGACTTCTTTGTATCGATCACAAAGTTGGTTCCG
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ACATGAAGGATCTTCAAGTTCTTGTGACGCGTTACTTCGTCATTGAACTCCCTGTTACCC
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ATGCTCGGCTTCTCGTCCTTATACTTGAACAGAAGCTCCTTGATCCTAGTTAACAACTGT
AGCCGTAGACTTATCTTAGTGAACTTCGATTCTGAGTGATCAGAAGTGTAGATTGTGAGC
CATCCGAGCATCACCTTACACCCTT*CTTCGTCT

QA 7 760 7 760
DS 

RD RS1A307TV 870 0 0
TTGCAACACAACGGGCTCAAATCTAGTATAAATATAAAAATAACTTAGGTTCTTTTTTCA
ACACACACAAGAGTTTCTTTTATTGTAGATTAACATGATACATAAACAAATCCACCTTAG
AATTCAGGTTCAGGTTCTTCTTCAACTGCAGCAATGAGCCATTCACCATTTTCATCCTTG
ATCATTCCTTTGTTCTTCTCCACCCACCAAGAACCTGGAACTAAACACTCATCTTTCAAG
AACTCACATGACTTGTTCACTAATGCAATACTTCTCTTCACCATCAGCTTAAACTCTCCT
TTCTTCCCATTCCATCCTGCAACCACATGGAGCATTGCCTGAAGATTGTGCCAGTCCCCT
GGATTCCTTGAATCCTTCAGGTAAGGTGACTTCTTTGTATCGATCACAAAGTTGGTTCCT
ATATCAACATACCCCAATAGTCCTCCTGGATATCGAGTCAAGAGATCAATCGTGTTCCTC
ACATGAAGGATCTTCAAGTTCTTGTGACGCGTTACTTCGTCCTTGAACTCCCTGTTACCC
ACCTGTGGACAGCCAAACACGATCCCAGTGACCGGAACATCATCACCGGAAGCGTTCTCA
GCTATGTCATAGGCCGCGAGGACAGCCTCAGTGGCTCCCAAGCTATGTCCAGTCAACACA
ATGCTCGGCTTCTCGTCCTTATACTTCAACAGAAGCTCCTTGATCCTAGTTAACAACTGT
AGCCGTAGACTTATCTTAGTGAACTTCGATTCTGAGTGATCAGAAGTGTAGATTGTGAGC
CATCCGAGCATCACCTTACACCCTT*CTTCGTCTTCACTGCCCCGGCCGTAATGGCCGAA
TTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

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DS 

RD RS1A307TF 751 0 0
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GAACTCACATGACTTGTTCACTAATGCAATACTTCTCTTCACCATCAGCTTAAACTCTCC
TTTCTTCCCATTCCATCCTGCAACCACATGGAGCATTGCCTGAAGATTGTGCCAGTCCCC
TGGATTCCTTGAATCCTTCAGGTAAGGTGACTTCTTTGTATCGATCACAAAGTTGGTTCC
TATATCAACATACCCCAATAGTCCTCCTGGATATCGAGTCAAGAGATCAATCGTGTTCCT
CACATGAAGGATCTTCAAGTTCTTGTGACGCGTTACTTCGTCCTTGAACTCCCTGTTACC
CACCTGTGGACAGCCAAACACGATCCCAGTGACCGGAACATCATCACCGGAAGCGTTCTC
AGCTATGTCATAGGCCGCGAGGACAGCCTCAGTGGCTCCCAAGCTATGTCCAGTCAACAC
AATGCTCGGCTTCTCGTCCTTATACTTCAACAGAAGCTCCTTGATCCTAGTTAACAACTG
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CCATCCGAGCATCACCTTACACCCTT*CTTCGTCTTCACTGCCCCGGCCGTAATGGCCGA
ATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 751 1 751
DS 



CO CL353Contig2 795 3 4 U
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AGGCTCCAAGAACTGGGACACTCTCCTAGACCCACTAGACCAATCACTTCGCCAGCTCAT
CCTCCGTTGCGGCGACTTTTGCCAAGCCACCTACGACGCTTTCGTCAACGACCAGAACTC
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GTCAGCTTCTGACTACACGGTCACGAGCTTCCTCTACGCCACGGCTCGTGTCTCTCTCCC
CGAAGGTTTGCTTCTCCGCTCGCAGTCACGAGACTCTTGGGACCGTGAGTCTAACTGGTT
CGGTTACATCGCTGTGACGTCTGACGAACGTACCAAGGCTTTAGGACGCCGTGAGATCTA
CGTGGCTCTTAGAGGGACGAGTAGGAACTATGAGTGGATTAATGTTTTGGGAGCTAGGCC
TACTTCAGCTGACCCGCTGCTGACCGGACCGGAACAGAACGGTTCTGGTTCGAAGTTAGT
TGAAGCTGGTAGTACTTTTGGTAGCGACAGTGAAGACGAAGAAGGGTGTAAGGTGATGCT
CGGATGGCTCACAATCTACACTTCTGATCACTCAGAATCGAAGTTCACTAAGATAAGTCT
ACAGCTACAGTTGTTAACTAGGATCAAGGAGCTTCTGTTCAAGTATAAAGACGAGAAGCC
GAGCATTGTGTTGACTGGACATAGCTTGGGAGCCACTGAGCTGTTCTCGCGGCCTATGAC
ATAGCTGAGAACGCT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 5 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GGG
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TA

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DS 

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DS 



AS 1 7

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 
25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 15 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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C

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C

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ATACAAAAAGATAAGATGAAATCTAGAAAACAAGCTCATGGGGTTTCATTCCTTGAGACA
AAGAGAACCTGGCGCCGAGGTAAGTCTTGAGCTCTGGCACTGATTCAATGGCTTTGATCA
AAGCTGCGTCCACAGTTTTCTGGTCTTCTTTCTTCTCCTGTGGGATCTCTTTCTTCACCT
CTTTCTCAGCTTCAAAGAACTCTCCTTCTCCTTTCTTGGTCTTCTTCTCAGCAACCTTTC
CGAAGTACTTGTCATCGAACTTCTCGATGCTGACTCCAGAAATGTCAACCTTGGTGGAGG
TTCCAATCACATAGGACTGGTTAACACGTCTCAGTGGAACACCATTGATCTTGAATGGCC
CTGTAACCAAAAGCAAACCAGAAGCAAGTTGCTTAAGAAACACAACTCTCTTTCCCTTGA
ATCGACCAGCAAGGATGATCAACACAGTTCCTGGAGTAATGCTTGCTTTGAGCTTGGTAA
GCTTAGGTTTGCATCTGTTGGCGAGCGGCTTCTTAACGTCTTCCGCGGGATAAAACTTAG
CCGGCTTCTCAACGGGAGCTTCGACCTTGGACTTAGCGTCGTGACGTGGGAAAACGCCGC
CGTTTT*GGCCTTGATTGCCCACAAACCTCTCTTGTGGTACATTTGAGAACGGGAGTATT
TTCCTACACCC
TGA

QA 1 791 1 791
DS 

RD RS1BB47TF 727 0 0
CAAATGTTGTTGAACAGTGATGATGATGGGATACAAAAAGATAAGATGAAATCTAGAAAA
CAAGCTCATGGGGTTTCATTCCTTGAGACAAAGAGAACCTGGCGCCGAGGTAAGTCTTGA
GCTCTGGCACTGATTCAATGGCTTTGATCAAAGCTGCGTCCACAGTTTTCTGGTCTTCTT
TCTTCTCCTGTGGGATCTCTTTCTTCACCTCTTTCTCAGCTTCAAAGAACTCTCCTTCTC
CTTTCTTGGTCTTCTTCTCAGCAACCTTTCCGAAGTACTTGTCATCGAACTTCTCGATGC
TGACTCCAGAAATGTCAACCTTGGTGGAGGTTCCAATCACATAGGACTGGTTAACACGTC
TCAGTGGAACACCATTGATCTTGAATGGCCCTGTAACCAAAAGCAAACCAGAAGCAAGTT
GCTTAAGAAACACAACTCTCTTTCCCTTGAATCGACCAGCAAGGATGATCAACACAGTTC
CTGGAGTAATGCTTGCTTTGAGCTTGGTAAGCTTAGGTTTGCATCTGTTGGCGAGCGGCT
TCTTAACGTCTTCCGCGGGATAAAACTTAGCCGGCTTCTCAACGGGAGCTTCGACCTTGG
ACTTAGCGTCGTGACGTGGGAAAACGCCGCCGTTTTTGGCCTTGATTGCCCACAAACCTC
TCTTGTGGTACATTTGAGAACGGGAGTATTTTCCTACACCCCTGATTAGATCAGGGTTTC
GGCT
CAC

QA 1 724 1 724
DS 

RD RS1AQ95TFB 616 0 0
CCTGTGGGATCTCTTTCTTCACCTCTTTCTCAGCTTCAAAGAACTCTCATTCTCCTTTCT
TGGTCTTCTTCTCAGCAACCTTTCCGAAGTACTTGTCATCAAACTTCTCGATGCTGACTC
CAGAAATGTCAACCTTGGTGGAGGTTCCAATCACATAGGACTGGTTAGCACGTCTCAGTG
GAACACCATTGATCTTGAATGGTCCTGTAACCAAAAGCAAACCAGAAGCAAGTTGCTTGA
GAAACACAACTCTCTTTCCCTTGAATCTACCAGCAAGGATGATCAACACAGTTCCTGGAG
TAATGCTTGCTTTGAGCTTGGTAAGCTTAGGTTTGCGTCTGTTAGCGAGCGGCTTCTTAA
CGTCTTCCGCCGGATAAAACTTAGCCGGCTTCTCAACGGGAGCTTCGACCTTGGACTTAG
CGTCGTGACGTGGGAAAACGCCGCCGTTTTTGGCCTTGATTGCCCACAAACCTCTCTTGT
GGTACATTTGAGAACGGGAGTATTTGCCTACACCCCTGATTAGATCAGGGTTTCGGCTTA
CTTTGGGGCTCCTCTGCTTCGCCGGCGCCATCTTTCTCTTTTTGTTTTTTTTCTTCTCTG
TGACAAAATACTCTCC

QA 1 616 1 616
DS 



AS 2 9

CO CL355Contig1 831 2 2 U
AAACGGAGGGAGGGTGAGAGGAAGCCTTAGATTAGTATAGTTCCCGCCGCCATGGCCGTT
ACGGCGTCTGGATTCATCGGCAAAGCTACAATCTCCTCCGTTCGAGTAGAGTTCTCTTCC
AAATTATCATACCTGAAACGTCCCTTCTCTTCCTCAAAGCCTCCGGTGGTTCGGTCCGTA
GCTTTATCGCCGCCGGCGAGAACAGTTGAGTCGCCGCCGGTTGGTTACCGGAAAAATGTT
GGGATTTGTCTTGTTAGTCCATGCAGAAAGATTTTTACTGCATCAAAGATTCACGTTCCG
GATACATGGCAGATGCCTCAGGGTGGTGCTGATGAGGGAGAAGATCTTAGAAATGCTGCT
TTTAGAGAGCTCAGAGAAGAAACAGGGGTTACCTCTGCTGAATTCATTGCCGAGGACAAA
CTGAATCGGAAATGGCGAACAAGTTACAAAGGCCAAGCTCAGAAATGGTTTCTCTTCAAG
TTCACTGGCAAGGAAGAAGAAATAAATCTCCTAGGAGATGGTACTGCAAAACCAGAGTTT
AAGGTGTGGTCCTGGATGCTACCCGAACAAGTGATTGAACATGCTGTATATTTCAAGAGA
CCTGTCTATGAGCATGTCATAAATCAATTCAATCCTTACTTTGTGGATGAAGACAAGGAA
CTCCCCTAAGAATTGAAACGTACACAAGATCGGTCAAAAAAAAAGTGAATACTGATTAGG
AGGAAATCAACCAATCATTATACCCCAACATCATAGATGAAATTGCTTCATTATCTTTAT
GTTTGGACACTTCAAAAATTGTACTTATGAAATGCAAACTACTGTTCTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GE45TF U 1
AF RS1GE45JQ C 184
BS 1 514 RS1GE45TF
BS 515 831 RS1GE45JQ

RD RS1GE45TF 522 0 0
AAACGGAGGGAGGGTGAGAGGAAGCCTTAGATTAGTATAGTTCCCGCCGCCATGGCCGTT
ACGGCGTCTGGATTCATCGGCAAAGCTACAATCTCCTCCGTTCGAGTAGAGTTCTCTTCC
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GCTTTATCGCCGCCGGCGAGAACAGTTGAGTCGCCGCCGGTTGGTTACCGGAAAAATGTT
GGGATTTGTCTTGTTAGTCCATGCAGAAAGATTTTTACTGCATCAAAGATTCACGTTCCG
GATACATGGCAGATGCCTCAGGGTGGTGCTGATGAGGGAGAAGATCTTAGAAATGCTGCT
TTTAGAGAGCTCAGAGAAGAAACAGGGGTTACCTCTGCTGAATTCATTGCCGAGGACAAA
CTGAATCGGAAATGGCGAACAAGTTACAAAGGCCAAGCTCAGAAATGGTTTCTCTTCAAG
TTCACTGGCAAGGAAGAAGAAATAAATCTCCTAG
AGATGGTA

QA 1 514 1 514
DS 

RD RS1GE45JQ 648 0 0
TTATCGCCGCCGGCGAGAACAGTTGAGTCGCCGCCGGTTGGTTACCGGAAAAATGTTGGG
ATTTGTCTTGTTAGTCCATGCAGAAAGATTTTTACTGCATCAAAGATTCACGTTCCGGAT
ACATGGCAGATGCCTCAGGGTGGTGCTGATGAGGGAGAAGATCTTAGAAATGCTGCTTTT
AGAGAGCTCAGAGAAGAAACAGGGGTTACCTCTGCTGAATTCATTGCCGAGGACAAACTG
AATCGGAAATGGCGAACAAGTTACAAAGGCCAAGCTCAGAAATGGTTTCTCTTCAAGTTC
ACTGGCAAGGAAGAAGAAATAAATCTCCTAGGAGATGGTACTGCAAAACCAGAGTTTAAG
GTGTGGTCCTGGATGCTACCCGAACAAGTGATTGAACATGCTGTATATTTCAAGAGACCT
GTCTATGAGCATGTCATAAATCAATTCAATCCTTACTTTGTGGATGAAGACAAGGAACTC
CCCTAAGAATTGAAACGTACACAAGATCGGTCAAAAAAAAAGTGAATACTGATTAGGAGG
AAATCAACCAATCATTATACCCCAACATCATAGATGAAATTGCTTCATTATCTTTATGTT
TGGACACTTCAAAAATTGTACTTATGAAATGCAAACTACTGTTCTTAG

QA 1 648 1 648
DS 



CO CL355Contig2 950 7 24 U
GGGCTAAACGGAGGGAGGGTGAGAGGAAGCCTTAGATTAGAATAGTTCCCGCCGCCATGG
CCGTTACGGCGTCTGGATTCATCGGCAAAGCTACAATCTCCTCCGTTCGAGTAGAGTTCT
CTTCCAAATTATCATACCTGAAACGTCCCTTCTCTTCCTCAAAGCCTCCGGTGGTTCGGT
CCGTAGCTTTATCGCCGCCGGCGAGAACAGTTGAGTCGCCGCCGGTTGGTTACCGGAAAA
ATGTTGGGATTTGTCTCGTTAGTCCATGTAGAAAGATTTTTACTGCATCAAAGATTCACG
TTCCGGATACATGGCAGATGCCTCAGGGTGGTGCTGATGAGGGAGAAGATCTGAGAAATG
CTGCTTTTAGAGAGCTCAGAGAAGAAACAGGGGTTACCTCTGCTGAATTCATTGCCGAGA
TACCAAACTGGCTGACCTATGATTTCCCCCGGGATGTGAAGGACAAACTGAATCGGAAAT
GGCGAACAAGTTACAAAGGCCAAGCTCAGAAATGGTTTCTCTTCAAGTTCACTGGCAAGG
AAGAAGAAATAAATCTCCTAGGAGATGGTACTGCAAAACCAGAGTTTAAGGTGTGGTCCT
GGATGCTACCCGAACAAGTGATTGAACATGCTGTATATTTCAAGAGACCTGTCTATGAGC
ATGTCATAAATCAATTCAATCCTTACTTTGTGGATGAAGACAAGGAACTCCCCTAAGAAT
TGAAACGTACACAAGATCGGTCAAAAAAAAAGTGAATACTGATTAGGAGGAAATCAACCA
ATCATTATACCCCAACATCATAGATGAAATTGCTTCATTATCTTTATGTTTGGACACTTC
AAAAATTGTACTTATGAAATGCAAACTACTGTTCTTAGAGAGTCATAATCGAAGTTTTCA
TGGCATTGGATAATTAATTATCCAGCAATATTTAAGCATTTTTATTCCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 10 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 5 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 20 20 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GF14TF U 1
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BS 258 352 RS1GF14TF
BS 353 353 RS1CI34TF
BS 354 694 RS1GF14TF
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BS 719 719 RS1AN68TF
BS 720 724 RS1CI34TF
BS 725 725 RS1AN68TF
BS 726 733 RS1CI34TF
BS 734 734 RS1AN68TF
BS 735 748 RS1CI34TF
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BS 819 819 RS1GM82JQ
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RD RS1GF14TF 694 0 0
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CCGTTACGGCGTCTGGATTCATCGGCAAAGCTACAATCTCCTCCGTTCGAGTATAGTTCT
CTTCCAAATTATCATACCTGAAACGTCCCTTCTCTTCCTCAAAGCCTCCGGTGGTTCGGT
CCGTAGCTTTATCGCCGCCGGCGAGAACAGTTGAGTCGCCGCCGGTTGGTTACCGGAAAA
ATGTTGGGATTTGTCTTGTTAGTCCATGTAGAAAGATTTTTACTGCATCAAAGATTCACG
TTCCGGATACATGGCAGATGCCTCAGGGTGGTGCTGATGAGGGAGAAGATCTTAGAAATG
CTGCTTTTAGAGAGCTCAGAGAAGAAACAGGGGTTACCTCTGCTGAATTCATTGCCGAGA
TACCAAACTGGCTGACCTATGATTTCCCCCGGGATGTGAAGGACAAACTGAATCGGAAAT
GGCGAACAAGTTACAAAGGCCAAGCTCAGAAATGGTTTCTCTTCAAGTTCACTGGCAAGG
AAGAAGAAATAAATCTCCTAGGAGATGGTACTGCAAAACCAGAGTTTAAGGTGTGGTCCT
GGATGCTACCCGAACAAGTGATTGAACATGCTGTATATTTCAAGAGACCTGTCTATGAGC
ATGTCATAAATCAATTCAATCCTTACTTTGTGGA

QA 1 694 1 694
DS 

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GGAAGCGGAGGAG
GGAGGGAGGG*GAGAGGAAGGCTTAGATTAGAATAGTTCCCGCCGCCATGGCCGTTACGG
CGTCTGGATTCATCGGCAAAGCTACAATCTCCTCCGTTCGAGTAGAGTTCTCTTCCAAAT
TATCATACCTGAAACGTCCCTTCTCTGCCTCAAAGCCTCCGGTGGTTCGGTCCGTAGCTT
TATCGCCGCCGGCGAGAACAGTTGAGTCGCCGCCGGTTGGTTACCGGAAAAATGTTGGGA
TTTGTCTCGTTAGTCCATGTAGAAAGATTTTTACTGCATCGAAGATTCATGTTCCGGATA
CGTGGCAGATGCCTCAGGGTGGTGCTGATGAGGGAGAAGATCTGAGAAATGCTGCTTTTA
GAGAGCTCAGAGAAGAAACAGGGGTTACCTCTGCTGAATTCATTGCCGAGATACCAAACT
GGCTGACGTATGATTTCCCCCGGGATGTGAAGGACAAACTTAATCGGAAATGGCGAACAA
GTTACAAAGGCCAAGCTCAGAAATGGTTTCTCTTCAAGTTCACTGGCAAGGAAGAAGAAA
TAAATCTCCTAGGAGATGGTACTGCAAAACCAGAGTTTAAGGTGTGGTCCTGGATGCTAC
CCGAACAAGTGATTGAACATGCTGTATATTTCAAGAGACCTGTCTACGAGCATGTCATAA
ATCAATTCAATCCTTACTTTGTGGATGA

QA 14 701 14 701
DS 

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GGAAGCGGAGGAG
GGAGGGAGGG*GAGAGGAAGGCTTAGATTAGAATAGTTCCCGCCGCCATGGCCGTTACGG
CGTCTGGATTCATCGGCAAAGCTACAATCTCCTCCGTTCGAGTAGAGTTCTCTTCCAAAT
TATCATACCTGAAACGTCCCTTCTCTGCCTCAAAGCCTCCGGTGGTTCGGTCCGTAGCTT
TATCGCCGCCGGCGAGAACAGTTGAGTCGCCGCCGGTCGGTTACCGGAAAAATGTTGGGA
TTTGTCTCGTTAGTCCATGTAGAAAGATTTTTACTGCATCGAAGATTCATGTTCCGGATA
CGTGGCAGATGCCTCAGGGTGGTGCTGATGAGGGAGAAGATCTGAGAAATGCTGCTTTTA
GAGAGCTCAGAGAAGAAACAGGGGTTACCTCTGCTGAATTCATTGCCGAGATACCAAACT
GGCTGACGTATGATTTCCCCCGGGATGTGAAGGACAAACTTAATCGGAAATGGCGAACAA
GTTACAAAGGCCAAGCTCAGAAATGGTTTCTCTTCAAGTTCACTGGCAAGGAAGAAGAAA
TAAATCTCCTAGGAGATGGTACTGCAAAACCAGAGTTTAAGGTGTGGTCCTGGATGCTAC
CCGAACAAGTGATTGAACATGCTGTATATTTCAAGAGACCTGTCTACGAGCATGTCATAA
ATCAATTCAATCCTTACTTTGTGGATGAAGACAAG*AACTCCCGTAAGA*TTGAA*CGTA
CACA*GATCGGTCAAAAAA

QA 14 752 14 752
DS 

RD RS1AN68TF 745 0 0
GGATCGCTAAAC
GGAGGGAGGGTGAGAGGAAGCCTTAGATTAGTATAGTTCCCGCCGCCATGGCCGTTACGG
CGTCTGGATTCATCGGCAAAGCTACAATCTCCTCCGTTCGAGTAGAGTTCTCTTCCAAAT
TATCATACCTGAAACGTCCCTTCTCTTCCTCAAAGCCTCCGGTGGTTCGGTCCGTAGCTT
TATCGCCGCCGGCGAGAACAGTTGAGTCGCCGCCGGTTGGTTACCGGAAAAATGTTGGGA
TTTGTCTTGTTAGTC*ACGTAGAAAGATTTTTACTGCATCAAAGATTCACGTTCCGGATA
CATGGCAGATGCCTCAGGGTGGTGCTGATGAGGGAGAAGATCTTAGAAATGCTGCTTTTA
GAGAGCTCAGAGAAGAAACAGGGGTTACCTCTGCTGAATTCATTGCCGAGATACCAAACT
GGCTGACCTATGATTTCCCCCGGGATGTGAAGGACAAACTGAATCGGAAATGGCGAACAA
GTTACAAAGGCCAAGCTCAGAAATGGTTTCTCTTCAAGTTCACTGGCAAGGAAGAAGAAA
TAAATCTCCTAGGAGATGGTACTGCAAAACCAGAGTTTAAGGTGTGGTCCTGGATGCTAC
CCGAACAAGTGATTGAACATGCTGTATATTTCAAGAGACCTGTCTATGAGCATGTCATAA
ATCAATTCAATCCTTACTTTGTGGATGAAGACAAGGAACTCCCCTAAGAATTGAAACGTA
CACAAGATCGGTC

QA 13 745 13 745
DS 

RD RS1AN68JQ 770 0 0
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CGAGAACAGTTGAGTCGCCGCCGGTTGGTTACCGGAAAAATGTTGGGATTTGTCTTGTTA
GTC*ACGTAGAAAGATTTTTACTGCATCAAAGATTCACGTTCCGGATACATGGCAGATGC
CTCAGGGTGGTGCTGATGAGGGAGAAGATCTTAGAAATGCTGCTTTTAGAGAGCTCAGAG
AAGAACCAGGGGTTACCTTTGCTGAATTCATTGCCGAGATACCAAACTGGCTGACCTATG
ATTTCCCCCGGGATGTGAAGGACAAACTGAATCGGAAATGGCGAACAAGTTACAAAGGCC
AAGCTCAGAAATGGTTTCTCTTCAAGTTCACTGGCAAGGAAGAAGAAATAAATCTCCTAG
GAGATGGTACTGCAAAACCAGAGTTTAAGGTGTGGTCCTGGATGCTACCCGAACAAGTGA
TTGAACATGCTGTATATTTCAAGAGACCTGTCTATGAGCATGTCATAAATCAATTCAATC
CTTACTTTGTGGATGAAGACAAGGAACTCCCCTAAGAATTGAAACGTACACAAGATCGGT
CAAAAAAAAAGTGAATACTGATTAGGAGGAAATCAACCAATCATTATACCCCAACATCAT
AGATGAAATTGCTTCATCATCTTTATGTTTGGACACTTCAAAAATTGTACTTATGAAATG
CAAACTACTGTTCTTAGAGAGTCATAATCGAAGTTTTCATGGCATTGGAT

QA 1 770 1 770
DS 

RD RS1GM82JQ 506 0 0
AATTCATTGCCGAGATACCAAACTGGCTGACCTATGATTTCCCCCGGGATGTGAAGGACA
AACTGAATCGGAAATGGCGAACAAGTTACAAAGGCCAAGCTCAGAAATGGTTTCTCTTCA
AGTTCACTGGCAAGGAAGAAGAAATAAATCTCCTAGGAGATGGTACTGCAAAACCAGAGT
TTAAGGTGTGGTCCTGGATGCTACCCGAACAAGTGATTGAACATGCTGTATATTTCAAGA
GACCTGTCTATGAGCATGTCATAAATCAATTCAATCCTTACTTTGTGGATGAAGACAAGG
AACTCCCCTAAGAATTGAAACGTACACAAGATCGGTCAAAAAAAAAGTGAATACTGATTA
GGAGGAAATCAACCAATCATTATACCCCAACATCATAGATGAAATTGCTTCATTATCTTT
ATGTTTGGACACTTCAAAAATTGTACTTATGAAATGCAAACTACTGTTCTTAGAGAGTCA
TAATCGAAGTTTTCATGGCATTGGAT

QA 1 506 1 506
DS 

RD RS1CI34JQ 784 0 0
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CGGTTACCGGAAAAATGTTGGGATTTGTCTCGTTAGTCCATGTAGAAAGATTTTTACTGC
ATCGAAGATTCATGTTCCGGATACGTGGCAGATGCCTCAGGGTGGTGCTGATGAGGGAGA
AGATCTGAGAAATGCTGCTTTTAGAGAGCTCAGAGAAGAAACAGGGGTTACCTTTGCTGA
ATTCATTGCCGAGATACCAAACTGGCTGACGTATGATTTCCCCCGGGATGTGAAGGACAA
ACTTAATCGGAAATGGCGAACAAGTTACAAAGGCCAAGCTCAGAAATGGTTTTTTTTCAA
GTTCACTGGCAAGGAAGAAGAAATAAATTTCCTAGGAGATGGTACTGCAAAACCAGAGTT
TAAGGTGTGGTCCTGGATGCTACCCGAACAAGTGATTGAACATGCTGTATATTTCAAGAG
ACCTGTTTACGAGCATGTCATAAATCAATTCAATCCTTACTTTGTGGATGAAGACAAGGA
ACTCCCGTAAGGATTGAAACGTACACAAGATCGGTCAAAAAAAA*GTGAATACTGATTAG
GAGGAAATCAACCAATCATTATACCCCAACATCATAGATGAAATTGCTTCATTATCTTTA
TGTTTGGACACTTCAAAAATTGTACTTATGAAATGCAAACTACTGTTTTTAGAGAGTCAT
AATCGAAGTTTTCATGGCATTGGATAATTAATTATCCAGCAATATTTAAGCATTTTTATT
CCCG

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 8

CO CL356Contig1 1037 8 9 U
TGTTATAGCTTATTCATTTAATTTTAAACATAAAAGATGAGATTATACAAGAAACTGAAG
TTGAGTAAAAAAACAAAAAAAGACAAGAAACCGAAGGTAAAGAAAGATGATTATTGATGA
AAAATTGAAAACACACTTAGAAGCAACATAAAGAGAAAACATGAGTAGAACTCTTTTATG
ACAAGGCAAAAGCTGGGGTGGTCTTGAAGTCAAGTTCCCAGAGATCAAACGTCCCTTTCA
CAAAATCATAGTGAGCGCCTCTTATGGCGAGCTTGTTTTTCACCACTCGCTCTCTCACGA
ACGGGTACGATAACAGGTTCCCCAGCGACACGTTCACAGCTTCCTTCTCACAGTTGGTGC
ACTGGTCGTCAAAGCTCAGGTCTTTACAATCCTGCCTGGTCTTGTTCTTGGCCGATGCAC
AGATCTGGATCCAGTCTTCTATGAATTCACTCTTAAAGGGAGCCGCATCATCTTCAATTG
CCATGAGTCCTTTTATTCCACCACAACAGCTGTGACCAATCACCAGAATGCTCTCCACAT
TGAGGACTGTGATTGGATATTCAAGGGCGGCACCAATATTACAGTGTTTTGTCTTATCAT
AAGGTGGCACCATGTTTGCAATGTTTCTAACGATAAATGCTTCCCCAAGTTGAAAATTCA
AGATGTGAGACGGGCAAACTCGAGAATCCGCACAAGCAAACACCAGAAACTTGGGGCTCT
GGCTCTTGGCAAGTGCACTGTACAACGAAGGATTTTTCTCATAATTATGAGTCTTGAAAT
GGTTGAATCCAGACTTGATCCTTTCTACAGAATCTATCTTGCTGGAATCAAGTTCCTCTA
GCTCACTGGTTAACTGCTTGATCTTTGCGGCTGCGACGTTACCTAGATCCGATTTCTTGG
TGAGAAGCTCTCCAAGTTTTTTAAGGGCATCTTCGTACGAGTCCGTCGACATATCTTTTC
GTTCCTTGGAAAGAGTATTTGGAAACAGAAGATTTAAAGCGTGGTACCTGAAAATTGATA
TAGTTTTATTGATATCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
0 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RS1GG80JQ U 1
AF RS1F381JQ U 1
AF RS1EY89JQ U 35
AF RS1GG80TF C 201
AF RS1ER24JQ U 96
AF RS1EY89TF C 284
AF RS1F381TF C 394
AF RS1ER24TF C 396
BS 1 308 RS1F381JQ
BS 309 309 RS1EY89JQ
BS 310 525 RS1F381JQ
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BS 748 866 RS1ER24JQ
BS 867 1037 RS1EY89TF

RD RS1GG80JQ 524 0 0
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TTGAGTAAAAAAACAAAAAAAGACAAAAAACCGAAGGTAAAGAAAGATGATTATTGATGA
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CCATGAGTCCTTTTATTCCACCACAACAGCTGTGACCAATCACC

QA 1 524 1 524
DS 

RD RS1F381JQ 747 0 0
TGTTATAGCTTATTCATTTAATTTTAAACATAAAAGATGAGATTATACAAGAAACTGAAG
TTGAGTAAAAAAACAAAAAAAGACAAGAAACCGAAGGTAAAGAAAGATGATTATTGATGA
AAAATTGAAAACACACTTAGAAGCAACATAAAGAGAAAACATGAGTAGAACTCTTTTATG
ACAAGGCAAAAGCTGGGGTGGTCTTGAAGTCAAGTTCCCAGAGATCAAACGTCCCTTTCA
CAAAATCATAGTGAGCGCCTCTTATGGCGAGCTTGTTTTTCACCACTCGCTCTCTCACGA
ACGGGTACAATAACAGGTTCCCCAGCGACACGTTCACAGCTTCCTTCTCACAGTTGGTGC
ACTGGTCGTCAAAGCTCAGGTCTTTACAATCCTGCCTGGTCTTGTTCTTGGCCGATGCAC
AGATCTGGATCCAGTCTTCTATGAATTCACTCTTAAAGGGAGCCGCATCATCTTCAATTG
CCATGAGTCCTTTTATTCCACCACAACAGCTGTGACCAATCACCAAAATGCTCTCCACAT
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AAGGTGGCACCATGTTTGCAATGTTTCTAACGATATATGCTTCCCCAAGTTGAAAATTCA
AGATGTGAGACGGGCAAACTCGAGAATCCGCACAAGCAAACACCAGAAACTTGGGGCTCT
GGCTCTTGGCAAGTGCACTGTACAACG

QA 1 747 1 747
DS 

RD RS1EY89JQ 710 0 0
AG
ATGAGATTATACAAGAAACTGAAGTTGAGTAGAAAAACAAAAAAAGACAAGAAACCGAAG
GTAAAGAAAGATGATTATTGATGAGAAATTGAGAACACACTTAGAAGCAACATAGAGAGA
AAACATGAGTAGAACTCTTTTATGACAAGGCAAAAGCTGGGGGGGTCTTGAAGTCAAGTT
CCCAGAGATCAAACGTCCCTTTCACAAAATCATAGTGAGCGCCTCTTATGGCGAGCTTGT
TTTTCACCACTCGCTCTCTCACGAACGGGTACGATAACAGGTTCCCCAGCGACACGTTCA
CAGCTTCCTTCTCACAGTTGGTGCACTGGTCGTCAAAGCTCAGGTCTTTACAATCCTGCC
TGGTCTTGTTCTTGGCCGATGCACAGATCTGGATCCAGTCTTCTATGAATTTACTCTTAA
AGGGAGCCGCATCATCTTCAATTGCCATGAGTCCTTTTATTCCACCACAGCAGCTGTGAC
CAATCACCAGAATGCTCTCCACATTGAGAACTGTGATTGGATATTCAAGGGCGGCACCAA
TATTACAGTGTTTTGTCTTATCATAAGGTGGCACCATGTTTGCAATGTTTCTAACGATAA
ATGCTTCCCCAAGTTGAAAATTCAAGATGTGAGACGGGCAAACTCGAGAATCCGCACAAG
CAAACACCAGAAACTTGGGGCTCTGGCTCTTGGCAAGTGCACTGTACA

QA 3 710 3 710
DS 

RD RS1GG80TF 640 0 0
GGTC
TGAAGTCAAGTTCCCAGAGATCAAACGTCCCTTTCACAAAATCATAGTGAGCGC*TCTTA
TGGCGAGCTTGTTTTTCACCACTCGCTCTCTCACGAACGGGTACGATAACAGGTTCCCCA
ACGACACGTTCACAGCTTCCTTCTCACAGTTGGTGCACTGGTCGTCAAAGCTCAGGTCTT
TACAATCCTGCCTGGTCTTGTTCTTGGCCGATGCACAGATCTGGATCCAGTCTTCTATGA
ATTCACTCTTAAAGGGAGCCGCATCATCTTCAACTGCCATGAGTCCTTTTATTCCACCAC
AACAGCTGTGACCAATCACCAGAATGCTCTCCACATTGAGGACTGTGATTGGATATTCAA
GGGCGGCACCAATATTACAGTGTTTTGTCTTATCATAAGGTGGCACCATGTTTGCAATGT
TTCTAACGATAAATGCTTCCCCAAGTTGAAAATTCAAGATGTGAGACGGGCAAACTCGAG
AATCCGCACAAGCAAACACCAGAAACTTGGGGCTCTGGCTCTTGACAAGTGCACTGTACA
ACGAAGGATTTTTCTCATAATTATGAGTCTTGAAATGGTTGAATCCAGACTTGATCCTTT
CTACAGAATCTATCTTGCTGGAATCAAGTTCCTCT
C

QA 5 639 5 639
DS 

RD RS1ER24JQ 771 0 0
GGTAAAGAAAGATGATTATTGATGAGAAATTGAGAACACACTTAGAAGCAACATAGAGAG
AAAACATGAGTAGAACTCTTTTATGACAAGGCAAAAGCTGGGGTGGTCTTGAAGTCAAGT
TCCCAGAGATCAAACGTCCCTTTCACAAAATCATAGTGAGCGCCTCTTATGGCGAGCTTG
TTTTTCACCACTCGCTCTCTCACGAACGGGTACGATAACAGGTTCCCCAGCGACACGTTC
ACAGCTTCCTTCTCACAGTTGGTGCACTGGTCGTCAAAGCTCAGGTCTTTACAATCCTGC
CTGGTCTTGTTCTTGGCCGATGCACAGATCTGGATCCAGTCTTCTATGAATTCACTCTTA
AAGGGAGCCGCATCATCTTCAATTGCCATGAGTCCTTTTATTCCACCACAACAGCTGTGA
CCAATCACCAGAATGCTCTCCACATTGAGGACTGTGATTGGATATTCAAGGGCGGCACCA
ATATTACAGTGTTTTGTCTTATCATAAGGTGGCACCATGTTTGCAATGTTTCTAACGATA
AATGCTTCCCCAAGTTGAAAATTCAAGATGTGAGACGGGCAAACTCGAGAATCCGCACAA
GCAAACACCAGAAACTTGGGGCTCTGGCTCTTGGCAAGTGCACTGTACAACGAAGGATTT
TTCTCATAATTATGAGTCTTGAAATGGTTGAATCCAGACTTGATCCTTTCTACAGAATCT
ATCTTGCTGGAATCAAGTTCCTCTAGCTCACTGGTTAACTGCTTGATCTTT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RS1EY89TF 754 0 0
CACTCGCTCTCTCACGAACGGGTACGATAACAGGTTCCCCAGCGACACGTTCACAGCT*C
CTTCTCACAGTTGGTGCACTGGTCGTCAAAGCTCAGGTCTTTACAATCCTGCCTGGTCTT
GTTCTTGGCCGATGCACAGATCTGGATCCAGTCTTCTATGAATTTACTCTTAAAGGGAGC
CGCATCATCTTCAATTGCCATGAGTCCTTTTATTCCACCACAGCAGCTGTGACCAATCAC
CAGAATGCTCTCCACATTGAGAACTGTGATTGGATATTCAAGGGCGGCACCAATATTACA
GTGTTTTGTCTTATCATAAGGTGGCACCATGTTTGCAATGTTTCTAACGATAAATGCTTC
CCCAAGTTGAAAATTCAAGATGTGAGACGGGCAAACTCGAGAATCCGCACAAGCAAACAC
CAGAAACTTGGGGCTCTGGCTCTTGGCAAGTGCACTGTACAACGAAGGATTTTTCTCATA
ATTATGAGTCTTGAAATGGTTGAATCCAGACTTGATCCTTTCTACAGAATCTATCTTGCT
GGAATCAAGTTCCTCTAGCTCACTAGTTAACTGCTTGATCTTTGCGGCTGCGACGTTACC
TAGATCCGATTTCTTGGTGAGAAGCTCTCCAAGTTTTTTAAGGGCATCTTCGTACGAGTC
CGTCGACATATCTTTTCGTTCCTTGGAAAGAGTATTTGGAAACAGAAGATTTAAAGCGTG
GTACCTGAAAATTGATATAGTTTTATTGATATCC

QA 1 754 1 754
DS 

RD RS1F381TF 641 0 0
GCCTGGTCTTGTTCTTGGCCGATGCACAGATCTGGATCCAGTCTTCTATGAATTCACTCT
TAAAGGGAGCCGCATCATCTTCAATTGCCATGAGTCCTTTTATTCCACCACAACAGCTGT
GACCAATCACCAGAATGCTCTCCACATTGAGGACTGTGATTGGATATTCAAGGGCGGCAC
CAATATTACAGTGTTTTGTCTTATCATAAGGTGGCACCATGTTTGCAATGTTTCTAACGA
TATATGCTTCCCCAAGTTGAAAATTCAAGATGTGAGACGGGCAAACTCGAGAATCCGCAC
AAGCAAACACCAGAAACTTGGGGCTCTGGCTCTTGGCAAGTGCACTGTACAACGAAGGAT
TTTTCTCATAATTATGAGTCTTGAAATGGTTGAATCCAGACTTGATCCTTTCTACAGAAT
CTATCTTGCTGGAATCAAGTTCCTCTAGCTCACTAGTTAACTGCTTGATCTTTGCGGCTG
CGACGTTACCTAGATCCGATTTCTTGGTGAGAAGCTCTCCAAGTTTTTTAAGGGCATCTT
CGTACGAGTCCGTCGACATATCTTTTCGTTCCTTGGAAAGAGTATTTGGAAACAGAAGAT
TTAAAGCGTGGTACCTGAAAATTGATATAGTTTTATTGAT
C

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1ER24TF 640 0 0
CTGGTCTTGTTCTTGGCCGATGCACAGATCTGGATCCAGTCTTCTATGAATTCACTCTTA
AAGGGAGCCGCATCATCTTCAATTGCCATGAGTCCTTTTATTCCACCACAACAGCTGTGA
CCAATCACCAGAATGCTCTCCACATTGAGGACTGTGATTGGATATTCAAGGGCGGCACCA
ATATTACAGTGTTTTGTCTTATCATAAGGTGGCACCATGTTTGCAATGTTTCTAACGATA
AATGCTTCCCCAAGTTGAAAATTCAAGATGTGAGACGGGCAAACTCGAGAATCCGCACAA
GCAAACACCAGAAACTTGGGGCTCTGGCTCTTGGCAAGTGCACTGTACAACGAAGGATTT
TTCTCATAATTATGAGTCTTGAAATGGTTGAATCCAGACTTGATCCTTTCTACAGAATCT
ATCTTGCTGGAATCAAGTTCCTCTAGCTCACTGGTTAACTGCTTGATCTTTGCGGCTGCG
ACGTTACCTAGATCCGATTTCTTGGTGAGAAGCTCTCCAAGTTTTTTAAGGGCATCTTCG
TACGAGTCCGTCGACATATCTTTTCGTTCCTTGGAAAGAGTATTTGGAAACAGAAGATTT
AAAGCGTGGTACCTGAAAATTGATATAGTTTTATTGAT
CC

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 10

CO CL357Contig1 775 10 18 U
AAAAAAAACATTTTTGTAACGATCCAAAACACTGAAACGTCCTTT*ATAAAATTTTAACT
TACGTAAAAACAATCATGTTGAGTAAAAGACATTCCTTCTCAAATCCGAAGTGCAATTTA
GCCAAAAAGAAACAAGGATTACATTTCCCTTTCAAGGAAGATCTGATCCAGCAGCTGGAC
CAGCACCAAACCC*ACCGGCTCCACGGCCAAACCCAGGCCTAGATCCAGCTCCAGGTCCC
CTGAAGGAAGGCTGGTAATCAGCAGGGGCCCCACTTTTGTCACCAAACTCTCCACCTGAT
CTTGGTACTCCACGGTATCCATCTCTGTCACCAAACCTCCTCTCTCCATCAGAACGAGGT
GGGCCACGGGG*ACGGTCACCA*CCATGGGACGACCAAGAGGCTTCTGTTGTTTCTTCAA
AGTGGCGGGAACAATCTCAGAAGGTAAATTGAGGTAAGTCCTCAGAAAGTCAATGCCTTC
GTTGGTGAGAAACCAGTAGTAATGCATCCATGCAAACGTCTCGCGAACGTACTCCTTAGA
CTTGAAGCTCTGCATCAATTTTATGACTTGCAGATTCGGTACACCTTCCACCAAAGGATG
CTGCGCTAAATTGAAATCTTTTTTCGCAAACAGAACTCCCTCTTGGAAGAGGTACTTGGA
GATTGCGCGACGGTTCTCCTCTGACATAATCATGGTTACGATAGAGAAGACGACGGAGAA
GGTGTCTACGTGTTGTGTTAGCGTGACGGCGTTCTCTCTTTCTCCTTTCGCGTCC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 10 50 
50 50 50 50 50 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 45 10 60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 5 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 10 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 5 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 

AF RS1E822JQ U 2
AF RS1A288TF C 29
AF RS1ES25JQ U 1
AF RS1BE11JQ U 47
AF RS1A288JQ U 29
AF RS1ES25TF C 41
AF RS1E822TF C 71
AF RS1BE11TF C 47
AF RS1A288TR U 67
AF RS1A288TV C 29
BS 1 222 RS1ES25JQ
BS 223 223 RS1E822JQ
BS 224 351 RS1ES25JQ
BS 352 352 RS1A288JQ
BS 353 382 RS1ES25JQ
BS 383 383 RS1A288JQ
BS 384 398 RS1ES25JQ
BS 399 399 RS1A288JQ
BS 400 439 RS1ES25JQ
BS 440 440 RS1A288JQ
BS 441 464 RS1ES25JQ
BS 465 465 RS1A288JQ
BS 466 677 RS1ES25JQ
BS 678 697 RS1A288JQ
BS 698 698 RS1BE11JQ
BS 699 711 RS1A288JQ
BS 712 712 RS1BE11JQ
BS 713 775 RS1A288JQ

RD RS1E822JQ 227 0 0
GGAG
AAACATTTTTGTAACGATCCAAAACACTGAAACGTCCTTT*ATAAAATTTTAACTTACGT
AAAAACAATCATGTTGAGTAAAAGACATTCCTTCTCAAATCCGAAGTGCAATTTAGCCAA
AAAGAAACAAGGAT*ACATTTCCCTTTCAAGGAAGATCTGATCCAGCAGCTGGACCAGCA
CCAAACCC*ACCGGCTCCACGGCCAAACCCAGGCCTAGATCCA

QA 5 227 5 227
DS 

RD RS1A288TF 366 0 0
GT
ACTGAAACGTCCTTT*ATAAAATTCTAACGTACGTAAAAACAATCATGTTGAGTAAAAGA
CATTCCTTCTCAAATCTGAAGTGCAATTTGGCCAAAAAGAAACAAGGATTACATTTCCCT
TTCAAGGAAGATCTGATCCAGCAGCTGGACCAGCACCAAACCCCACCGGCTCCACGGCCA
AACCCAGGCCTAGGTCCAGCTCCAGGTCCCCTGAAGGAAGGCTGGTAATCAGCAGGAGCC
CCACTCTTGTCACCAAACTCTCCACCTGATCTTGGTACTCCACGGTATCCATCTCTGTCA
CCAAACCTCCTCTCTCCATCAGAACGAGGTGGGCCACGGGGGACGGTCACC***CATGGG
GACG

QA 3 362 3 362
DS 

RD RS1ES25JQ 677 0 0
AAAAAAAACATTTTTGTAACGATCCAAAACACTGAAACGTCCTTT*ATAAAATTTTAACT
TACGTAAAAACAATCATGTTGAGTAAAAGACATTCCTTCTCAAATCCGAAGTGCAATTTA
GCCAAAAAGAAACAAGGATTACATTTCCCTTTCAAGGAAGATCTGATCCAGCAGCTGGAC
CAGCACCAAACCC*ACCGGCTCCACGGCCAAACCCAGGCCTAAATCCAGCTCCAGGTCCC
CTGAAGGAAGGCTGGTAATCAGCAGGGGCCCCACTTTTGTCACCAAACTCTCCACCTGAT
CTTGGTACTCCACGGTATCCATCTCTGTCACCAAACCTCCTCTCTCCATCAAAACGAGGT
GGGCCACGGGG*ACGGTCACCATCCATGGGACGACCAAAAGGCTTCTGTTGTTTCTTCAA
AGTGGCGGGAACAATCTCAAAAGGTAAATTGAGGTAAGTCCTCAAAAAGTCAATGCCTTC
GTTGGTGAGAAACCAGTAGTAATGCATCCATGCAAACGTCTCGCGAACGTACTCCTTAGA
CTTGAAGCTCTGCATCAATTTTATGACTTGCAGATTCGGTACACCTTCCACCAAAGGATG
CTGCGCTAAATTGAAATCTTTTTTCGCAAACAGAACTCCCTCTTGGAAGAGGTACTTGGA
GATTGCGCGACGGTTCT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RS1BE11JQ 672 0 0
ATAAAATTTTAACTTACGTAAAAACAATCATGTTGAGTAAAAGACATTCCTTCTCAAATC
CGAAGTGCAATTTAGCCAAAAAGAAACAAGGATTACATTTCCCTTTCAAGGAAGATCTGA
TCCAGCAGCTGGACCAGCACCAAACCC*ACCGGCTCCACGGCCAAACCCAGGCCTAGATC
CAGCTCCAGGTCCCCTGAAGGAAGGCTGGTAATCAGCAGGGGCCCCACTTTTGTCACCAA
ACTCTCCACCTGATCTTGGTACTCCACGGTATCCATCTCTGTCACCAAACCTCCTCTCTC
CATCAGAACGAGGTGGGCCACGGGG*ACGGTCACCACCCATGGGACGACCAAGAGGCTTC
TGTTGTTTCTTCAAAGTGGCGGGAACAATCTCAGAAGGTAAATTGAGGTAAGTCCTCAGA
AAGTCAATGCCTTCGTTGGTGAGAAACCAGTAGTAATGCATCCATGCAAACGTCTCGCGA
ACGTAATCCTTAGACTTGAAGCTCTGCATCAATTTTATGACTTGCGGATTCGGTACACCT
TCCACCAAAGGATGCTGCGCTAAATTGAAATCTTTTTTCGCAAACAGAACTCCCTCTTGG
AAGAGGTACTTGGAGATTGCGCGACGGTTCTCCTCTGACATAATCATGGTTACGATAGAG
AAGACGACGGAG

QA 1 672 1 672
DS 

RD RS1A288JQ 747 0 0
GT
ACTGAAACGTCCTTT*ATAAAATTCTAACGTACGTAAAAACAATCATGTTGAGTAAAAGA
CATTCCTTCTCAAATCTGAAGTGCAATTTGGCCAAAAAGAAACAAGGATTACATTTCCCT
TTCAAGGAAGATCTGATCCAGCAGCTGGACCAGCACCAAACCC*ACCGGCTCCACGGCCA
AACCCAGGCCTAGGTCCAGCTCCAGGTCCCCTGAAGGAAGGCTGGTAATCAGCAGGAGCC
CCACTCTTGTCACCAAACTCTCCACCTGATCTTGGTACTCCACGGTATCCATCTCTGTCA
CCAAACCTCCTCTCTCCATCAGAACGAGGTGGGCCACGGGG*ACGGTCACC***CATGGG
ACGACCAAGAGGCTTCTGTTGTTTCTTCAAAGTGGCGGGAACAATCTCAGAAGGGAGATT
GAGGTAAGTCCTGAGAAAGTCAATGCCTTCGTTGGTGAGAAACCAGTAGTAATGCATCCA
TGCAAACGTCTCGCGAACGTACTCCTTAGACTTGAAGCTCTGCATCAATTTTATTACTTG
CAGATTCGGTACACCTTCCACCAAAGGATGCTGCGCTAAATTGAAATCCTTTTTCGCAAA
CAGAGCTCCCTCTTGGAAGAGGTACTTGGAGATTGCGCGACGGTTCTCCTCTGACATAAT
CATGGTTGCGATAGAGAAGACAACGGAGAAGGTGTCTACGTGTTGTGTTAGCGTGACGGC
GTTCTCTCTTTCTCCTTTCGCGTCC

QA 3 747 3 747
DS 

RD RS1ES25TF 742 0 0
CCTTT*ATAAAATT*TAACTTACGTAAAAACAATCATGTTGAGTAAAAGACAT*CCTTCT
CAAATCCGAAGTGCAATTTAGCCAAAAAGAAACAAGGATTACATTTCCCTTTCAAGGAAG
ATCTGATCCAGCAGCTGGACCAGCACCAAACCC*ACCGGCTCCACGGCCAAACCCAGGCC
TAGATCCAGCTCCAGGTCCCCTGAAGGAAGGCTGGTAATCAGCAGGGGCCCCACTTTTGT
CACCAAACTCTCCACCTGATCTTGGTACTCCACGGTATCCATCTCTGTCACCAAACCTCC
TCTCTCCATCAGAACGAGGTGGGCCACGGGG*ACGGTCACCATCCATGGGACGACCAAGA
GGCTTCTGTTGTTTCTTCAAAGTGGCGGGAACAATCTCAGAAGGTAAATTGAGGTAAGTC
CTCAGAAAGTCAATGCCTTCGTTGGTGAGAAACCAGTAGTAATGCATCCATGCAAACGTC
TCGCGAACGTACTCCTTAGACTTGAAGCTCTGCATCAATTTTATGACTTGCAGATTCGGT
ACACCTTCCACCAAAGGATGCTGCGCTAAATTGAAATCTTTTTTCGCAAACAGAACTCCC
TCTTGGAAGAGGTACTTGGAGATTGCGCGACGGTTCTCCTCTGACATAATCATGGTTACG
ATAGAGAAGACGACGGAGAGGGTGTCTGCGTGTTGTGTTAGCGTGACGGCGTTCTCTCTT
TCTCCTTTCGCGT
AACCCTCCC

QA 1 733 1 733
DS 

RD RS1E822TF 711 0 0
CAATCATGTTGAGTAAAAGACATTC*TTCTCAAATCCGAAGTGCAATTTAGCCAAAAAGA
AACAAGGAT*ACATTTCCCTTTCAAGGAAGATCTGATCCAGCAGCTGGACCAGCACCAAA
CCC*ACCGGCTCCACGGCCAAACCCAGGCCTAGATCCAGCTCCAGGTCCCCTGAAGGAAG
GCTGGTAATCAGCAGGGGCCCCACTTTTGTCACCAAACTCTCCACCTGATCTTGGTACTC
CACGGTACCCATCTCTGTCACCAAACCTCCTCTCTCCATCAGAACGAGGTGGGCCACGGG
G*ACGGTCACCACCCATGGGACGACCAAGAGGCTTCTGTTGTTTCTTCAAAGTGGCGGGA
ACAATCTCAGAAGGTAAATTGAGGTAAGTCCTCAGAAAGTCAATGCCTTCGTTGGTGAGA
AACCAGTAGTAATGCATCCATGCAAACGTCTCGCGAACGTACTCCTTAGACTTGAAGCTC
TGCATCAATTTTATGACTTGCAGATTCGGTACACCTTCCACCAAGGGATGCTGCGCTAAA
TTGAAATCTTTTTTCGCAAACAGAACTCCCTCTTGGAAGAGGTACTTGGAGATTGCGCGA
CGGTTCTCCTCTGACATAATCATGGTTACGATAGAGAAGACGACGGAGAAGGTGTCTGCG
TGTTGTGTTAGCGTGACGGCGTTCTCTCTTTCTCCTTTCGCGT
AACCCTCC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1BE11TF 729 0 0
ATAAAATTTTAACTTACGTAAAAACAATCATGTTGAGTAAAAGACAT*CCTTCTCAAATC
CGAAGTGCAATTTAGCCAAAAAGAAACAAGGATTACATTTCCCTTTCAAGGAAGATCTGA
TCCAGCAGCTGGACCAGCACCAAACCC*ACCGGCTCCACGGCCAAACCCAGGCCTAGATC
CAGCTCCAGGTCCCCTGAAGGAAGGCTGGTAATCAGCAGGGGCCCCACTTTTGTCACCAA
ACTCTCCACCTGATCTTGGTACTCCACGGTATCCATCTCTGTCACCAAACCTCCTCTCTC
CATCAGAACGAGGTGGGCCACGGGG*ACGGTCACCACCCATGGGACGACCAAGAGGCTTC
TGTTGTTTCTTCAAAGTGGCGGGAACAATCTCAGAAGGTAAATTGAGGTAAGTCCTCAGA
AAGTCAATGCCTTCGTTGGTGAGAAACCAGTAGTAATGCATCCATGCAAACGTCTCGCGA
ACGTAATCCTTAGACTTGAAGCTCTGCATCAATTTTATGACTTGCGGATTCGGTACACCT
TCCACCAAAGGATGCTGCGCTAAATTGAAATCTTTTTTCGCAAACAGAACTCCCTCTTGG
AAGAGGTACTTGGAGATTGCGCGACGGTTCTCCTCTGACATAATCATGGTTACGATAGAG
AAGACGACGGAGAAGGTGTCTGCATGTTGTGTTAGCGTGACGGCGTTCTCTCTTTCTCCT
TTCGCGTCC

QA 1 729 1 729
DS 

RD RS1A288TR 709 0 0
AAAACAATCATGTTGAGTAAAAGACATTCCTTCTCAAATCTGAAGTGCAATTTGGCCAAA
AAGAAACAAGGATTACATTTCCCTTTCAAGGAAGATCTGATCCAGCAGCTGGACCAGCAC
CAAACCC*ACCGGCTCCACGGCCAAACCCAGGCCTAGGTCCAGCTCCAGGTCCCCTGAAG
GAAGGCTGGTAATCAGCAGGAGCCCCACTCTTGTCACCAAACTCTCCACCTGATCTTGGT
ACTCCACGGTATCCATCTCTGTCACCAAACCTCCTCTCTCCATCAGAACGAGGTGGGCCA
CGGGG*ACGGTCACC***CATGGGACGACCAAGAGGCTTCTGTTGTTTCTTCAAAGTGGC
GGGAACAATCTCAGAAGGGAGATTGAGGTAAGTCCTGAGAAAGTCAATGCCTTCGTTGGT
GAGAAACCAGTAGTAATGCATCCATGCAAACGTCTCGCGAACGTACTCCTTAGACTTGAA
GCTCTGCATCAATTTTATTACTTGCAGATTCGGTACACCTTCCACCAAAGGATGCTGCGC
TAAATTGAAATCCTTTTTCGCAAACAGAGCTCCCTCTTGGAAGAGGTACTTGGAGATTGC
GCGACGGTTCTCCTCTGACATAATCATGGTTGCGATAGAGAAGACAACGGAGAAGGTGTC
TACGTGTTGTGTTAGCGTGACGGCGTTCTCTCTTTCTCCTTTCGCGTCC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1A288TV 761 0 0
GT
ACTGAAACGTCCTTTTATAAAATTCTAACGTACGTAAAAACAATCATGTTGAGTAAAAGA
CATTCCTTCTCAAATCTGAAGTGCAATTTGGCCAAAAAGAAACAAGGATTACATTTCCCT
TTCAAGGAAGATCTGATCCAGCAGCTGGACCAGCACCAAACCC*ACCGGCTCCACGGCCA
AACCCAGGCCTAGGTCCAGCTCCAGGTCCCCTGAAGGAAGGCTGGTAATCAGCAGGAGCC
CCACTCTTGTCACCAAACTCTCCACCTGATCTTGGTACTCCACGGTATCCATCTCTGTCA
CCAAACCTCCTCTCTCCATCAGAACGAGGTGGGCCACGGGG*ACGGTCACC***CATGGG
ACGACCAAGAGGCTTCTGTTGTTTCTTCAAAGTGGCGGGAACAATCTCAGAAGGGAGATT
GAGGTAAGTCCTGAGAAAGTCAATGCCTTCGTTGGTGAGAAACCAGTAGTAATGCATCCA
TGCAAACGTCTCGCGAACGTACTCCTTAGACTTGAAGCTCTGCATCAATTTTATTACTTG
CAGATTCGGTACACCTTCCACCAAAGGATGCTGCGCTAAATTGAAATCCTTTTTCGCAAA
CAGAGCTCCCTCTTGGAAGAGGTACTTGGAGATTGCGCGACGGTTCTCCTCTGACATAAT
CATGGTTGCGATAGAGAAGACAACGGAGAAGGTGTCTACGTGTTGTGTTAGCGTGACGGC
GTTCTCTCTTTCTCCTTTCGCGT
CCCCCGGCCGTAATGG

QA 3 745 3 745
DS 



AS 2 10

CO CL358Contig1 751 8 13 U
GGACTATATATTTTAGCAACTAGGGTTTTGTTACTCTTTACCCCAGTCGCCGCCGGAAGA
AGAACGATCTTCAGAGAAAGAACACTCCGTTCACCGCCGTCGTCATGGGCCGACTCCACT
CTAAAGGTAAGGGAATCTCAGCTTCTGCTTTGCCGTACAAGCGATCACCTCCAAGTTGGC
TCAAGACAACCTCCCAGGATGTTGATGAGTCCATTTGCAAGTTTGCGAAGAAGGGTTTGA
CTCCATCACAGATTGGTGTCATCCTTCGTGACTCTCACGGAATCCCACAAGTGAAGAGTG
TTACTGGAAACAAGATCTTGAGAATCTTGAAAGCTCATGGTCTTGCTCCTGAGATTCCTG
AGGATTTGTATCACCTGATCAAGAAAGCAGTTGCAATCAGGAAGCACCTTGAGAGAAACA
GGAAAGACAAGGATTCCAAGTTCAGGTTGATTCTTGTGGAGAGCAGAATCCACCGTCTTG
CTCGCTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTCCCACCCGTCTGGAAGTATGAGTCTACCACCG
CAAGCACTCTTGTGGCTTAAGGAAACCATAGAGTAGGTCAAAGTCCTTCATGAGCGACCA
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GTTTTTTTGATCTGTTACAACTTACAATTCGATTTTTAATTTAATGAAAACTCTTGTTCT
TGTTATCATTTAGTTTGGCTTAACTTCATTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 5 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 0 40 40 25 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 35 35 35 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1GW11TF U 20
AF RS1AP41JQ C 1
AF RS1AP41TFB U 1
AF RS1B445TF U 38
AF RS1B679TF U 38
AF RS1C521TF U 38
AF RS1GW11JQ C 351
AF RS1C521JQ C 155
BS 1 91 RS1AP41TFB
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BS 95 285 RS1AP41TFB
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BS 287 620 RS1AP41TFB
BS 621 621 RS1B445TF
BS 622 667 RS1AP41TFB
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BS 673 724 RS1AP41TFB
BS 725 725 RS1B445TF
BS 726 751 RS1C521TF

RD RS1GW11TF 468 0 0
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GTTCAGGTTGATTCTTGTGGAGAGCAGAATCCACCGTCTTGCTCGCTA

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DS 

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CTCCATCACAGATTGGTGTCATCCTTCGTGACTCTCACGGAATCC*ACAAGTGAAGAGTG
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TTTCGTTGCAACAT

QA 1 614 1 614
DS 

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AGAACGATCTTCAGAGAAAGAACACTCCGTT***CGCCGTCGTCATGGGCCGACTCCACT
CTAAAGGTAAGGGAATCTCAGCTTCTGCTTTGCCGTACAAGCGATCACCTCCAAGTTGGC
TCAAGACAACCTCCCAGGATGTTGATGAGTCCATTTGCAAGTTTGCGAAGAAGGGTTTGA
CTCCATCACAGATTGGTGTCATCCTTCGTGACTCTCACGGAATCC*ACAAGTGAAGAGTG
TTACTGGAAACAAGATCTTGAGAATCTTGAAAGCTCATGGTCTTGCTCCTGAGATTCCTG
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TTTCGTTGCAACATTGCAACTCTAGTTCTATGACTATGGACTTTGTATCTGTTTTCTCTA
GTTTTTT*GATTTGTTACAACTTACAATTCGATTTTTAATTTAATGAAAACTCTTGTTCT
TGTT

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DS 

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GG
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DS 

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GG
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TCGTCATGGGCCGACTCCACTCTAAAGGTAAGGGAATCTCAGCTTCTGCTTTGCCGTACA
AGCGATCACCTCCAAGTTGGCTCAAGACAACCTCACAGGATGTTGATGAGTCCATTTGCA
AGTTTGCGAAGAAGGGTTTGACTCCATCACAGATTGGTGTCATCCTTCGTGACTCTCACG
GAATCCCACAAGTGAAGAGTGTTACTGGAAACAAGATCTTGAGAATCTTGAAAGCTCATG
GTCTTGCTCCTGAGATTCCTGAGGATTTGTATCACCTGATCAAGAAAGCAGTTGCAATCA
GGAAGCACCTTGAGAGAAACAGGAAAGACAAGGATTCCAAGTTCAGGTTGATTCTTGTGG
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GGAAATATGAGTCTACCACCGCAAGCACTCTTGTGGCTTAAGGAAACCATAGAGTAGGTC
AAAGTCCTTCATGAGCGACCATTTCGTTGCAACATTGCAACACT**TTCTATGACTATGG
ACTTTGTATCTGTTTTCTCTAGTTTTTTTGATCTGTTACAACTTACAATTCGATTTTTAA
TTTAATGAAAACTCTTGTTCTT

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DS 

RD RS1C521TF 714 0 0
GG
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TCGTCATGGGCCGACTCCACTCTAAAGGTAAGGGAATCTCAGCTTCTGCTTTGCCGTACA
AGCGATCACCTCCAAGTTGGCTCAAGACAACCTCCCAGGATGTTGATGAGTCCATTTGCA
AGTTTGCGAAGAAGGGTTTGACTCCATCACAGATTGGTGTCATCCTTCGTGACTCTCACG
GAATCCCACAAGTGAAGAGTGTTACTGGAAACAAGATCTTGAGAATCTTGAAAGCTCATG
GTCTTGCTCCTGAGATTCCTGAGGATTTGTATCACCTGATCAAGAAAGCAGTTGCAATCA
GGAAGCACCTTGAGAGAAACAGGAAAGACAAGGATTCCAAGTTCAGGTTGATTCTTGTGG
AGAGCAGAATCCACCGTCTTGCTCGCTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTCCCACCCGTCT
GGAAGTATGAGTCTACCACCGCAAGCACTCTTGTGGCTTAAGGAAACCATAGAGTAGGTC
AAAGTCCTTCATGAGCGACCATTTCGTTGCAACATTGCAACTCTAGTTCTATGACTATGG
ACTTTGTATCTGTTTTCTCTAGTTTTTT*GATTTGTTACAACTTACAATTCGATTTTTAA
TTTAATGAAAACTCTTGTTCTTGTTATCATTTAGTTTGGCTTAACTTCATTC

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DS 

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GAGAGAAACAGGAAAGACAAGGATTCCAAGTTCAGGTTGATTCTTGTGGAGAGCAGAATC
CACCGTCTTGCTCGCTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTCCCTCCCGTCTGGAAATATGAG
TCTACCACCGCAAGCACTCTTGTGGCTTAAGGAAACCATAGAGTAGGTCAAAGTCCTTCA
TGAGCGACCATTTCGTTGCAACATTGCAACACTAGTTCTATGACTATGGACTTTGTATCT
GTTTTCTCTAGTTTTTTTGATCTGTTACAACTTACAATTCGATTTTTAATTTAATGAAAA
CTCTTGTTCTTGTTA
CC

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DS 

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TTGCAAGTTTGCGAAGAAGGGTTTGACTCCATCACAGATTGGTGTCATCCTTCGTGACTC
TCACGGAATCCCACAAGTGAAGAGTGTTACTGGAAACAAGATCTTGAGAATCTTGAAAGC
TCATGGTCTTGCTCCTGAGATTCCTGAGGATTTGTATCACCTGATCAAGAAAGCAGTTGC
AATCAGGAAGCACCTTGAGAGAAACAGGAAAGACAAGGATTCCAAGTTCAGGTTGATTTT
TGTGGAGAGCAGAATCCACCGTCTTGCTCGCTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTCCCACC
CGTCTGGAAGTATGAGTCTACCACCGCAAGCACTCTTGTGGCTTAAGGAAACCATAGAGT
AGGTCAAAGTCCTTCATGAGCGACCATTTCGTTGCAACATTGCAACTCTAGTTTTATGAC
TATGGACTTTGTATCTGTTTTCTCTAGTTTTTT*GATTTGTTACAACTTACAATTCGATT
TTTAATTTAATGAAAACTCTTGTTCTTGTTATCATTTAGTTTGGCTTAACTTCATTC

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DS 



CO CL358Contig2 787 2 2 U
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CTTGTATTTAACTCAGCATTGTTTGGAAACTGGTTCTTTTACATTCCTCGTATCTGTTTT
GTGTTCTTTAGAAAGGGAATCTCAGCTTCTGCTCTGCCGTATAAGCGATCACCACCAAGC
TGGCTCAAGATAACCTCCCAGGATGTTGATGAGTCCATCTGCAAGTTTGCGAAGAAAGGT
TTGACTCCATCTCAGATTGGTGTCATTCTTCGTGACTCTCACGGAATCCCACAAGTGAAG
AGTGTTACCGGAAACAAGATCTTGAGAATCTTGAAAGCTCATGGTCTTGCTCCCGAGATC
CCTGAGGATCTCTATCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACCTTGAGAGG
AACAGGAAAGACAAGGATTCCAAGTTCAGGTTGATTCTTGTAGAGAGCAGAATCCACCGT
CTTGCTCGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTCCCTCCCGTCTGGAAGTATGAGTCTACC
ACCGCAAGCACTCTTGTGGCTTAAGGAAAGCATAGAGTAGGTCAAAGTCTTTCATGAGCG
ACCATTTCGTTGCAACATTGCAACTCAAGCTCTATGACTATAGACTTTGTATCTGTTTTC
TCTAGTTTTTTGATGTGTTACAACTTACAATTCGATTTTTAATTTAATGAAAACTCTTGT
TCTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AT96TF U 1
AF RS1AT96JQ C 127
BS 1 274 RS1AT96TF
BS 275 787 RS1AT96JQ

RD RS1AT96TF 274 0 0
GGGACTGCAGTCGCCGCCGGAAAAAACCGAGGAAGAACGATCTTCAGAGAAAGTAAACTC
ATTGCGCAGCCGTCGACATGGGCCGACTCCACTCCAAAGGGTTCGTCTGCTTGTTTCTTC
CTTGTATTTAACTCAGCATTGTTTGGAAACTGGTTCTTTTACATTCCTCGTATCTGTTTT
GTGTTCTTTAGAAAGGGAATCTCAGCTTCTGCTCTGCCGTATAAGCGATCACCACCAAGC
TGGCTCAAGATAACCTCCCAGGATGTTGATGAGT

QA 1 274 1 274
DS 

RD RS1AT96JQ 661 0 0
TTTAACTCAGCATTGTTTGGAAACTGGTTCTTTTACATTCCTCGTATCTGTTTTGTGTTC
TTTAGAAAGGGAATCTCAGCTTCTGCTCTGCCGTATAAGCGATCACCACCAAGCTGGCTC
AAGATAACCTCCCAGGATGTTGATGAGTCCATCTGCAAGTTTGCGAAGAAAGGTTTGACT
CCATCTCAGATTGGTGTCATTCTTCGTGACTCTCACGGAATCCCACAAGTGAAGAGTGTT
ACCGGAAACAAGATCTTGAGAATCTTGAAAGCTCATGGTCTTGCTCCCGAGATCCCTGAG
GATCTCTATCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACCTTGAGAGGAACAGG
AAAGACAAGGATTCCAAGTTCAGGTTGATTCTTGTAGAGAGCAGAATCCACCGTCTTGCT
CGTTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTCCCTCCCGTCTGGAAGTATGAGTCTACCACCGCA
AGCACTCTTGTGGCTTAAGGAAAGCATAGAGTAGGTCAAAGTCTTTCATGAGCGACCATT
TCGTTGCAACATTGCAACTCAAGCTCTATGACTATAGACTTTGTATCTGTTTTCTCTAGT
TTTTTGATGTGTTACAACTTACAATTCGATTTTTAATTTAATGAAAACTCTTGTTCTTGT
T

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 10

CO CL359Contig1 1050 10 15 U
GGAGCTGATCGGCTTTTAATCATTTGCTAGGGTTCCAATCATATATCTGCAACAACAACA
AAAATGGCTTTGGCTGGTCGTATCAGATCCGGGATCTCCTTCTTCAAGACCATCGCCGTC
TCAGATTCCATCTCCTCTGCCAGATCTTATCCCAGTGGACGGCCTCTTATCCCTGCGTTG
AGAGACTATGCAACAGCTTCAGCTCAGAAAACTGGCAATGTTAAGGTGCCAGTGGCTTTA
GTTGGTGAATCTGGCAACTTTGCTTCGTGGCTGTACATTGCAGCTGTGAAGATGAATTCC
TTGGAAAAGATTGAGTCTGATCTTTCTGAGCTGGTTGAGGCGATGAAGACCAGCCCTACT
TTCTCACAGTTTACTAAGGATCCCTCTGTTCCTAGAGAGACAAGACTTGCTGCTATTGTC
GATGTTTGTGACAAAGCAAAGTTTGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTCTCTTTGTTAGCT
GAGAATGGAAAGCTGAAGAACCTAGACGTGATTGTGAAAAAATTCATGCAGCTGACAACA
GCACATAGGGGAGACGTCAAAGTCTTGGTTACCACTGTCATGCCACTTCCTCCTGCCGAG
GAAAAGGAACTTAAGGAGACACTTCAGGAGATCATTGGAGAAGGGAAGAAAGTAACTGTG
GAACAGAAGATTGATCCGAGTATCTATGGAGGGCTAATAGTAGAGTTCCAACAAAAGGTG
TTGGACATGTCAATCAGGACAAGAGCACAGCAGATGGAGAGGCTCCTCCGTGAACCTGTT
GACCTCAGCAACCTCTGAAAATCTATCCCTCCTCGAGAGAGTTTTCCCTTAAGAAACATG
TTTGTGTGATGCTGCAAACCCAGTTGACAAAATAAAACATTATGACCCCCTCCACCTGGG
AAACAATTAAATTGTCGTTTTTTTTTGAAATTTGTCATTGCATTTTGTTTCCAATTGTTG
TTTGCTTCCAAATAAGCTTTTGGAGATTATTTACTTACATACGAGAGAATAAATAGTCAA
TTTGGTCAAACATGAGGGTGAGAGCCACGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 
45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 20 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GG42TF U 1
AF RS1F443TF U 16
AF RS1F044TF U 24
AF RS1DU81TF U 38
AF RS1CF66TF U 10
AF RS1CF66JQ C 683
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BS 1 614 RS1GG42TF
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BS 616 624 RS1GG42TF
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BS 709 709 RS1F443JQ
BS 710 717 RS1CF66TF
BS 718 718 RS1F443JQ
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BS 738 968 RS1F443JQ
BS 969 1027 RS1F044JQ
BS 1028 1050 RS1DU81JQ

RD RS1GG42TF 624 0 0
GGAGCTGATCGGCTTTTAATCATTTGCTAGGGTTCCAATCATATATCTGCAACAACAACA
AAAATGGCTTTGGCTGGTCGTATCAGATCCGGGATCTCCTTCTTCAAGACCATCGCCGTC
TCAGATTCCATCTCCTCTGCCAGATCTTATCCCAGTGGACGGCCTCTTATCCCTGCGTTG
AGAGACTATGCAACAGCTTCAGCTCAGAAAACTGGCAATGTTAAGGTGCCAGTGGCTTTA
GTTGGTGAATCTGGCAACTTTGCTTCGTGGCTGTACATTGCAGCTGTGAAGATGAATTCC
TTGGAAAAGATTGAGTCTGATCTTTCTGAGCTGGTTGAGGCGATGAAGACCAGCCCTACT
TTCTCACAGTTTACTAAGGATCCCTCTGTTCCTAGAGAGACAAGACTTGCTGCTATTGTC
GATGTTTGTGACAAAGCAAAGTTTGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTCTCTTTGTTAGCT
GAGAATGGAAAGCTGAAGAACCTAGACGTGATTGTGAAAAAATTCATGCAGCTGACAACA
GCACATAGGGGAGACGTCAAAGTCTTGGTTACCACTGTCATGCCACTTCCTCCTGCCGAG
GAAAAGGAACTTAAAGAGACACTT

QA 1 624 1 624
DS 

RD RS1F443TF 595 0 0
GG
AATCATTTGCTAGGGTTCCAATCATATATCTGCAACAACAACAAAAATGGCTTTGGCTGG
TCGTATCAGATCCGGGATCTCCTTCTTCAAGACCATCGCCGTCTCAGATTCCATCTCCTC
TGCCAGATCTTATCCCAGTGGACGGCCTCTTATCCCTGCGTTGAGAGACTATGCAACAGC
TTCAGCTCAGAAAACTGGCAATGTTAAGGTGCCAGTGGCTTTAGTTGGTGAATCTGGCAA
CTTTGCTTCGTGGCTGTACATTGCAGCTGTGAAGATGAATTCCTTGGAAAAGATTGAGTC
TGATCTTTCTGAGCTGGTTGAGGCGATGAAGACCAGCCCTACTTTCTCACAGTTTACTAA
GGATCCCTCTGTTCCTAGAGAGACAAGACTTGCTGCTATTGTCGATGTTTGTGACAAAGC
AAAGTTTGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTCTCTTTGTTAGCTGAGAATGGAAAGCTGAA
GAACCTAGACGTGATTGTGAAAAAATTCATGCAGCTGACAACAGCACATAGGGGAGACGT
CAAAGTCTTGGTTACCACTGTCATGCCACTTCCTCCTGCCGAGGAAAAG
AACT

QA 3 591 3 591
DS 

RD RS1F044TF 600 0 0
GG
GCTAGGGTTCCAATCATATATCTGCAACAACAACAAAAATGGCTTTGGCTGGTCGTATCA
GATCCGGGATCTCCTTCTTCAAGACCATCGCCGTCTCAGATTCCATCTCCTCTGCCAGAT
CTTATCCCAGTGGACGGCCTCTTATCCCTGCGTTGAGAGACTATGCAACAGCTTCAGCTC
AGAAAACTGGCAATGTTAAGGTGCCAGTGGCTTTAGTTGGTGAATCTGGCAACTTTGCTT
CGTGGCTGTACATTGCAGCTGTGAAGATGAATTCCTTGGAAAAGATTGAGTCTGATCTTT
CTGAGCTGGTTGAGGCGATGAAGACCAGCCCTACTTTCTCACAGTTTACTAAGGATCCCT
CTGTTCCTAGAGAGACAAGACTTGCTGCTATTGTCGATGTTTGTGACAAAGCAAAGTTTG
CAGAACCCACCAAGAACTTCCTCTCTTTGTTAGCTGAGAATGGAAAGCTGAAGAACCTAG
ACGTGATTGTGAAAAAATTCATGCAGCTGACAACAGCACATAGGGGAGACGTCAAAGTCT
TGGTTACCACTGTCATGCCACTTCCTCCTGCCGAGGAAAAGGAACTTAAGGAGACACT

QA 3 600 3 600
DS 

RD RS1DU81TF 675 0 0
GGTCTGCAACAA
CAACAACAACAAAAATGGCTTTGGCTGGTCGTATCAGATCCGGGATCTCCTTCTTCAAGA
CCATCGCCGTCTCAGATTCCGTCTCCTCTGCCAGATCTTATCCCAGTGGACGTCCTCTTA
TCCCTGCGTTGAGAGATTATGCAACAGCTTCAGCTCAGAAAACTGGCAATGTTAAGGTGC
CTGTGGCTTTAGTTGGTGAATCTGGCAACTTTGCTTCGTGGCTGTACATTGCAGCTGTGA
AGATGAATTCCTTGGAAAAGATTGAGTCGGATCTTTCTGAGCTGGTTGAGGCGATGAAGA
CCAGCCCTACTTTCTCACAGTTTACTAAGGATCCCTCTGTTCCTAGAGAGACAAGACTTG
CTGCTATTGTCGATGTTTGTGACAAAGCAAAGTTTGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTAT
CTTTGTTAGCTGAGAATGGAAAGCTGAAGAACCTAGACGTGATTGTGAAAAAATTCATGC
AGCTGACAACAGCACATAGGGGAGACGTCAAAGTCTTGGTTACCACTGTCATGCCACTTC
CTCCTGCCGAGGAAAAGGAACTTAAGGAGACACTTCAGGAGATCATTGGAGAAGGGAAGA
AAGTAACTGTGGAACAGAAGATTGATCCGAGTATATATGGAGGGCTAATAGTAGAGTTC
ACAA

QA 13 671 13 671
DS 

RD RS1CF66TF 743 0 0
GGGCTTTT
AATCATTTGCTAGGGTTCCGATCATATATCTGCAACAACAACAAAAATGGCTTTGGCTGG
TCGTATCAGATCCGGGATCTCCTTCTTCAAGACCATCGCCGTCTCAGATTCCATCTCCTC
TGCCAGATCTTATCCCAGTGGGCGGCCTCTTATCCCTGCGTTGAGAGACTATGCAACAGC
TTCAGCTCAGAAAACTGGCAATGTTAAGGTGCCAGTGGCTTTAGTTGGTGAATCTGGCAA
CTTTGCTTCGTGGCTGTACATTGCAGCTGTGAAGATGAATTCCTTGGAAAAGATTGAGTC
TGATCTTTCTGAGCTGGTTGAGGCGATGAAGACCAGCCCTACTTTCTCACAGTTTACTAA
GGATCCCTCTGTTCCTAGAGAGACAAGACTTGCTGCTATTGTCGATGTTTGTGACAAAGC
AAAGTTTGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTCTCTTTTTTAGCTGAGAATGGAAAGCTGAA
GAACCTAGACGTGATTGTGAAAAAATTCATGCAGCTGACAACAGCACATAGGGGAGACGT
CAAAGTCTTGGTTACCACTGTCATGCCACTTCCTCCTGCCGAGGAAAAGGAACTTAAGGA
GACACTTCAGGAGATCATTGGAGAAGGGA*GAAAGTAACTGTGGAACAGAAGATTGATCC
GAGTATCTATGGAGGGCTAATAGTAGAGTCC*AACAAAAG*TGTTGGACATGTCAATCAG
ACAGAGCACAGCAGA

QA 9 728 9 728
DS 

RD RS1CF66JQ 228 0 0
TT
TATGGAGGGCTAATAGTAGAGTTCCAACAAAAGGTGTTGGACATGTCAATCAGGACAAGA
GCACAGCAGATGGAGAGGCTCCTCCGTGAACCTGTTGACCTCAGCAACCTCTGAAAATCT
ATCCCTCCTCGAGAGAGTTTTCCCTTAAGAAACATGTTTGGGGGATGCTGCAAACCCAGT
TGACAAAATAAAACATTATGACCCCCTCCACCTGGGAAACAATTAA

QA 3 228 3 228
DS 

RD RS1F443JQ 694 0 0
CATTGCAGCTGTGAAGATGAATTCCTTGGAAAAGATTGAGTCTGATCTTTCTGAGCTGGT
TGAGGCGATGAAGACCAGCCCTACTTTCTCACAGTTTACTAAGGATCCCTCTGTTCCTAG
AGAGACAAGACTTGCTGCTATTGTCGATGTTTGTGACAAAGCAAAGTTTGCAGAACCCAC
CAAGAACTTCCTCTCTTTGTTAGCTGAGAATGGAAAGCTGAAGAACCTAGACGTGATTGT
GAAAAAATTCATGCAGCTGACAACAGCACATAGGGGAGACGTCAAAGTCTTGGTTACCAC
TGTCATGCCACTTCCTCCTGCCGAGGAAAAGGAACTTAAGGAGACACTTCAGGAGATCAT
TGGAGAAGGGAAGAAAGTAACTGTGGAACAGAAGATTGATCCGAGTATCTATGGAGGGCT
AATAGTAGAGTTCCAACAAAAGGTGTTGGACATGTCAATCAGGACAAGAGCACAGCAGAT
GGAGAGGCTCCTCCGTGAACCTGTTGACCTCAGCAACCTCTGAAAATCTATCCCTCCTCG
AGAGAGTTTTCCCTTAAGAAACATGTTTGTGTGATGCTGCAAACCCAGTTGACAAAATAA
AACATTATGACCCCCTCCACCTGGGAAACAATTAAATTGTCGTTTTTTTTTGAAATTTGT
CATTGCATTTTGTTTCCAATTGTTGTTTGCTTC
C

QA 1 693 1 693
DS 

RD RS1GG42JQ 605 0 0
CACAGTTTACTAAGGATCCCTCTGTTCCTAGAGAGACAAGACTTGCTGCTATTGTCGATG
TTTGTGACAAAGCAAAGTTTGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTCTCTTTGTTAGCTGAGA
ATGGAAAGCTGAAGAACCTAGACGTGATTGTGAAAAAATTCATGCAGCTGACAACAGCAC
ATAGGGGAGACGTCAAAGTCTTGGTTACCACTGTCATGCCACTTCCTCCTGCCGAGGAAA
AGGAACTTAAGGAGACACTTCAGGAGATCATTGGAGAAGGGAAGAAAGTAACTGTGGAAC
AGAAGATTGATCCGAGTATCTATGGAGGGCTAATAGTAGAGTTCCAACAAAAGGTGTTGG
ACATGTCAATCAGGACAAGAGCACAGCAGATGGAGAGGCTCCTCCGTGAACCTGTTGACC
TCAGCAACCTCTGAAAATCTATCCCTCCTCGAGAGAGTTTTCCCTTAAGAAACATGTTTG
TGTGATGCTGCAAACCCAGTTGACAAAATAAAACATTATGACCCCCTCCACCTGGGAAAC
AATTAAATTGTCGTTTTTTTT*GAAATTTGTCATTGCATTTTGTTTCCAATTGTTGTTTG
CTTC
C

QA 1 604 1 604
DS 

RD RS1F044JQ 671 0 0
TACTTTCTCACAGTTTACTAAGGATCCCTCTGTTCCTAGAGAGACAAGACTTGCTGCTAT
TGTCGATGTTTGTGACAAAGCAAAGTTTGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTCTCTTTGTT
AGCTGAGAATGGAAAGCTGAAGAACCTAGACGTGATTGTGAAAAAATTCATGCAGCTGAC
AACAGCACATAGGGGAGACGTCAAAGTCTTGGTTACCACTGTCATGCCACTTCCTCCTGC
CGAGGAAAAGGAACTTAAGGAGACACTTCAGGAGATCATTGGAGAAGGGAAGAAAGTAAC
TGTGGAACAGAAGATTGATCCGAGTATCTATGGAGGGCTAATAGTAGAGTTCCAACAAAA
GGTGTTGGACATGTCAATCAGGACAAGAGCACAGCAGATGGAGAGGCTCCTCCGTGAACC
TGTTGACCTCAGCAACCTCTGAAAATCTATCCCTCCTCGAGAGAGTTTTCCCTTAAGAAT
CATGTTTGTGTGATGCTGCAAACCCAGTTGACAAAATAAAACATTATGACCCCCTCCACC
TGGGAAACAATTAAATTGTCGTTTTTTTTTGAAATCTGTCATTGCATTTTGTTTCCAATT
GTTGTTTGCTTCCAAATAAGCTTTTGGAGATTATTTACTTACATACGAGAGAATAAATAG
TCAATTTGGTC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1DU81JQ 625 0 0
TTGTGACAAAGCAAAGTTTGCAGAACCCACCAAGAACTTCCTATCTTTGTTAGCTGAGAA
TGGAAAGCTGAAGAACCTAGACGTGATTGTGAAAAAATTCATGCAGCTGACAACAGCACA
TAGGGGAGACGTCAAAGTCTTGGTTACCACTGTCATGCCACTTCCTCCTGCCGAGGAAAA
GGAACTTAAGGAGACACTTCAGGAGATCATTGGAGAAGGGAAGAAAGTAACTGTGGAACA
GAAGATTGATCCGAGTATATATGGAGGGCTAATAGTAGAGTTCCAACAAAAGGTGTTGGA
CATGTCAATCAGGACAAGAGCACAGCAGATGGAGAGGCTCCTCCGTGAACCTGTTGACCT
CAGCAACCTTTGAAAATCTATCCCTCCTCGAGAGAGTTTTCCCTTAAGAAACATGTTTGT
GTGATGCTGCAAACCCAGTTGACAAAATAAAACATTATGACCCCCTCCACCTGGGAAACA
ATTACATTGTCGTTTTTTTTTGAAATTTGTCATTGCATTTTGTTTCCAATTGTTGTTTGC
TTCGAAATAAGCTTTTGGAGATTATTTACTTACATACGAGAGAATAAATAGTCAATTTGG
TCAAACATGAGGGTGAGAGCCACGG

QA 1 625 1 625
DS 



AS 2 8

CO CL360Contig1 750 2 4 U
GCACCAAGGATGAGTATGCCTCGTTCTACAAGAGTTTGACCAACGACTGGGAGGATCACC
TCGCTGTGAAGCATTTCTCTGTGGAAGGTCAGCTTGAATTCAAGGCGATTCTCTTTGTTC
CGAAGAGGGCTCCGTTCGATCTCTTTGACACCAGAAAGAAGTTGAACAACATCAAGTTGT
ATGTCAAGAGAGTGTTCATTATGGACAACTGCGAAGAGTTGATCCCTGAGTACCTCAGCT
TCGTCAAAGGTGTTGTTGACTCTGATGACTTGCCACTCAACATCTCTCGCGAGACTCTAC
AGCAGAACAAGATCCTTAAGGTGATCAGGAAGAACCTGGTGAAGAAGTGTATTGAGATGT
TCAACGAGATTGCCGAGAACAAAGAAGACTACAACAAGTTCTACGAGGCTTTCTCCAAGA
ATCTGAAACTGGGTATCCATGAGGACAGTCAGAACAGGTCAAAGATTGCTGATCTTCTTC
GTTACCACTCCACCAAGAGCGGTGATGAGATGACGAGCTTGAAAGACTACGTCACTAGGA
TGAAGGAAGGTCAAAAGGACATCTTCTACATCACTGGCGAAAGCAAGAAGGCGGTGGAGA
ACTCTCCCTTCTTGGAGAAGCTGAAGAAGAGAGGATACGAAGTGCTTTACACGTGGATGC
GATCGATGAATACGCTGTTGGACAGTTGAAGGAGTACGATGGGAAGAAACTCGTCTCTGC
GACCAAAGAAGGGTAAAGCTTGAAGATGAG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1AT63TF U 1
AF RS1C101TF U 1
BS 1 186 RS1AT63TF
BS 187 187 RS1C101TF
BS 188 605 RS1AT63TF
BS 606 750 RS1C101TF

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ACTCT

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DS 

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G
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CGCTGTGAAGCATTTCTCTGTGGAAGGTCAGCTTGAATTCAAGGCGATTCTCTTTGTTCC
GAAGAGGGCTCCGTTCGATCTCTTTGACACCAGAAAGAAGTTGAACAACATCAAGTTGTA
TGTCAAGAGAGTGTTCATTATGGACAACTGCGAAGAGTTGATCCCTGAGTACCTCAGCTT
CGTCAAAGGTGTTGTTGACTCTGATGACTTGCCACTCAACATCTCTCGCGAGACTCTACA
GCAGAACAAGATCCTTAAGGTGATCAGGAAGAACCTGGTGAAGAAGTGTATTGAGATGTT
CAACGAGATTGCCGAGAACAAAGAAGACTACAACAAGTTCTACGAGGCTTTCTCCAAGAA
TCTGAAACTGGGTATCCATGAGGACAGTCAGAACAGGTCAAAGATTGCTGATCTTCTTCG
TTACCACTCCACCAAGAGCGGTGATGAGATGACGAGCTTGAAAGACTACGTCACTAGGAT
GAAGGAAGGTCAAAAGGACATCTTCTACATCACTGGCGAAAGCAAGAAGGCGGTGGAGAA
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ATCGATGAATACGCTGTTGGACAGTTGAAGGAGTACGATGGGAAGAAACTCGTCTCTGCG
ACCAAAGAAGGGTAAAGCTTGAAGATGAG

QA 2 750 2 750
DS 



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TATCTACCTCTGGACTGAGAAAACCACTGAGAAGGAGATCAGTGATGATGAGGATGAGGA
CGAAGCAAAGAAAAACCGAAGGTGAGGTTGAAGAAGTTGATGAGGAGAAGGAGAAGGACG
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GCGAAGAGTTGATCCCTGAGTACCTCAGCTTCGTCAAAGGTGTTGTAGACTCTGATGACT
TGCCGCTCAACATCTCCCGTGAGACTCTCCAGCAGAACAAGATCCTTAAGGTGATCAGGA
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AGAACAGGTCAAAGATTGCTGATCTTCTTCGTTACCACTCCACCAAGAGCGGTGATGAGA
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TCACTGGAGAAAGCAAGAAGGCGGTGGAGAACTCTCCCTTCTTGGAGAAGCTGAAGAAGA
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AGGAGTACGATGGGAAGAAACTCGTCTCTGCGACCAAAGAAGGGTTAAAGCTTGAAGATG
AGACGGAAGAAGAAAAGAAAAAGAAGGAAGAGAAGAAGAAGTCGTTCGAGAACCTCTGCA
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CTATGGAGATCAACCCTGACAACGGTATCATGGAGGAGCTGAGAAAGAGAGCTGAGGTGG
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AGCTGGGTCTGAGTATTGATGAGGACGAGAATGTTGAGGAAGATGGTGATATGCCTGCGC
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GTGAGTTGGTTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1BS86TF U 1
AF RS1BS86JQ C 158
AF RS1EZ41TF U 884
AF RS1AT63JQ C 900
AF RS1C101JQ C 1045
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BS 1 568 RS1BS86TF
BS 569 883 RS1BS86JQ
BS 884 1292 RS1EZ41TF
BS 1293 1293 RS1AT63JQ
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BS 1630 1632 RS1EM42TF
BS 1633 1652 RS1EZ41TF
BS 1653 1675 RS1EM42TF
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BS 1677 1703 RS1EM42TF
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BS 1723 1723 RS1AT63JQ
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AGAGCCTGACCAACGACTGGGAGGATCATCTCGCTGTGAAGCATTTCTCTGTGGAAGGTC
AGCTCGAATTCAAGGCGATTCTCTTTGTTCCGAAGAGAGCTCCGTTTGGTCTCTTCGACA
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GCGAAGAGTTGATCCCTGAGTACCTCAGCTTCGTCAAAGGTGTTGTAGACTCTGATGACT
TGCCGCTCAACATCTCCCGTGAGACTCT
C

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DS 

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GTGGGAACTCATCAACAAGCAGAAACCAATCTGGCTGAGGAAGCCAGAAGAGATCACCAA
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AGCTCCGTTTGGTCTCTTCGACACCAGAAAGAAGTTGAACAACATCAAGTTGTATGTCAG
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ATTGGGTATCCACGAGGACAGTCAGAACAGGTCAAAGATTGCTGATCTTCTTCGTTACCA
CTCCACCAAGAGCGGTGATGAGATGACGAGCTTGAAAGACTACGTCACTAGGATGAAGGA
AGGTCAAAAGGACATCTTCTACATCACTGGAGAAAGCAAGAAGGCGGTGGAGAACTCTCC
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CGAATACGCTGTTGGACAGTTGAAGGAGTACGATGGAAAGAAACTCGTCTCTGCGACCAA
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QA 1 868 1 868
DS 

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GTGTCTTTCTTTTT

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DS 

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GAGA
GATACGAAGTGCTTTACACGGTGGATGCGATCGATGAATACGCTGTTGGACAGT*GAAGG
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CGGAAGAAGAAAAGAAAAAGAAGGAAGAGAAGAAGAAGTCGTTCGAGAACCTCTGCAAGA
CGATTAAGGACATTCTCGGCGACAAGATTGAGAAGGTTGTGGTCTCAGACAGAATCGTTG
ACTCTCCGTGTTGTTTGGTTACCGGTGAATACGGATGGACTGCGAATATGGAGAGGATCA
TGAAGGCTCAGGCTCTGAGAGACAGCAGCATGAGTGGGTACATGTCTAGCAAGAAAACTA
TGGAGATCAACCCTGACAACGGTATCATGGAGGAGCTGAGAAAGAGAGCTGAGGTGGACA
AGAACGACAAGTCCGTCAAAGATCTGGTGATGCTGCTGTTCGAGACAGCTCTGTTGACAT
CTGGATTCAGTCTTGATGAGCCGAACACGTTTGCAGCTAGGATTCACAGGATGTTGAAGC
TGGGTCTGAGTATTGATGAGGACGAGAATGTTGAGGAAGATGGTGATATGCCTGCGCTGG
AGGAGGATGCTGCTGAAGAGAGCAAAATGGAAGAAGTCGATTAAGAGAAGAAGCTTCGCC
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AGTTGGTTTGTC

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DS 

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ACAGCAGCATGAGTGGGTACATGTCTAGCAAGAAAACTATGGAGATCAACCCTGACAACG
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CGAACACGTTTGCAGCTAGGATTCACAGGATGTTGAAGCTGGGTCTGAGTATTGATGAGG
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GCAAAATGGAAGAAGTCGATTAAGAGAAGAAGCTTCGCCGTATGTTTGGTTGTTTTGAGA
GTTGAGAGTTCTAGTAGTGTCTTGGTGTCTTTCATGGTCGTCTGAACTTTTGATGGGCTG
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DS 

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G
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GCTGAAGAGAGCAAAATGGAAGAAGTCGATTAAGAGAAGAAGCTTCGCCGTATGTTTGGT
TGTTTTGAGAGTTGAGAGTTCTAGTAGTGTCTTGGTGTCTTTCATGGTCGTCTGAACTTT
TGATGGGCTGGTTTGTCAAGTGTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTCGTTCGTGTCTGGTGCGT
CTGTTTGTACTTGTCCTTTCCAAGTGAACAGTCGGCTAAAAGCTAAGTGAGTTGGTTTGT
C

QA 2 302 2 302
DS 



AS 2 9

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TCAAAAAAAAA*TTTTGAAGCTATTAGCCGATTATCGATATTGTTCCCCACCGATCTAAC
CTCTTTTGTATTTTATCTTCCTTACGACTTACTTATTTATTTTTCCCTGGACATATATAA
TAATTAACGTTATGTAATTTCAATAACATTCAGGACTTTGGTACTTAGAGCGATCAGTGC
AATAGTCATAGTTCATGTACTTATTTCTGAAATGCACATAGATTTTCTGTTCGTATCCCC
TTAGCCTTTGATATTTGCCTCCATTCCACCAATAGTTGGAAGATCCACAAGTGGCAACGT
TATCACTCCGACCATCTACGTAGCAGCCTGAGAGGCCGGAGAAGTCTTGGAAATGGGCGA
TGAAAGGAGAAAATGCATAGTTAATCTTGGTCTGACCGCCATCAGTCGCCCAAGAGTCAC
CGTTCCAGAGACTGGCTTCTACTTTCATCGGCTTTGATGGATAGTTAACACCTTTCTCGT
TCTTGTACACTCTTATTGGGACGTTGTCAACGTAAAACACAATTTGGTAACGGTTCCAAA
GAATCCCATAAGTGTGGTAATGTTTGATGGGGTTAAACCAAAGCAAGAACCTCTGTTCTC
TGTTTCCTTCTCCATTCGCAAAGATATTTGTCTGTAACGTTATGGGTTTTCCATCGTTGT
TGCCTAAGAACTCGAAGTCAATCTCATCGTGATTACTTCCCAACGAAGTCAAATAAAAAG
CGGTGACGACGCCACCAGAATTTCCTCCGGGCACTTTGATTCTCATTTGAAAGAGACCTG
ATCCGTAAATGTTCTTGGATTCGAACCCGGCACCTGAAGACTGATCCATGTAGAGATCAA
CTTGTTTGCCAGAGTGAAGTGTGGAAATATGACCTTGACCCCATTTAACAACATAGTTCT
GACCGAAAGTAACATATTTCTCGACTCCTCTCCCTCTGATAAACCTAGCATCAACCATTG
TTATACATAATGCTAATGCAAAAACACCAATGATTTTCGTATGCATCATCTTAGTTTGAT
TTTTCTCTAAGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 30 30 30 15 30 30 30 30 10 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

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AF RS1GH89JQ U 32
AF RS1G716JQ U 32
AF RS1FY56TF C 328
AF RS1E415TF C 536
AF RS1GH89TF C 567
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BS 998 1035 RS1FY56TF
BS 1036 1095 RS1E415TF

RD RS1E415JQ 357 0 0
GC
CATAAAATTTTGAAGCTATTAGTTTTATCAAAAAAAAA*TTTTGAAGCTATTAGCCGATT
ATCGATATTGTTCCCCACCGATCTAACCTCTTTTGTATTTTATCTTCCTTACGACTTACT
TATTTATTTTTCCCTGGACATATATAATAATTAACGTTATGTAATTTCAATAACATTCAG
GACTTTGGTACTTAGAGCGATCAGTGCAATAGTCATAGTTCATGTACTTATTTCTGAAAT
GCACATAGATTTTCTGTTCGTATCCCCTTAGCCTTTGATATTTGCCTCCATTCCACCAAT
AGTTGGAAGATCCACAAGTGGCAACGTTATCACTCCGACCATCTACGTAGCAGCC

QA 3 357 3 357
DS 

RD RS1FC27JQ 462 0 0
GTCTGTTGTGGACATGTACATAGAACATTTTGTCATAAAATTTTGAAGCTATTAGTTTTA
TCAAAAAAAAAATTTTGAAGCTATTAGCCGATTATCGATATTGTTCCCCACCGATCTAAC
CTCTTTTGTATTTTATCTTCCTTACGACTTACTTATTTATTTTTCCCTGGACATATATAA
TAATTAACGTTATGTAATTTCAATAACATTCAGGACTTTGGTACTTAGAGCGATCAGTGC
AATAGTCATAGTTCATGTACTTATTTCTGAAATGCTCATAGATTTTCTGTTCGTATCCCC
TTAGCCTTTGATATTTGCCTCCATTCCACCAATAGTTGGAAGATCCACAAGTGGCAACGT
TATCACTCCGACCATCTACGTAGCAGCCTGAGAGGCCGGAAAAGTCTTGGAAATGGGCGA
TGAAAGGAGAAAATGCATAGTTAATCTTGGTCTGACCGCCAT

QA 1 462 1 462
DS 

RD RS1GH89JQ 613 0 0
GT
CATAAAATTTTGAAGCTATTAGTTTTATCAAAAAAAAA*TTTTGAAGCTATTAGCCGATT
ATCGATATTGTTCCCCACCGATCTAACCTCTTTTGTATTTTATCTTCCTTACGACTTACT
TATTTATTTTTCCCTGGACATATATAATAATTAACGTTATGTAATTTCAATAACATTCAG
GACTTTGGTACTTAAAGCGATCAGTGCAATAGTCATAGTTCATGTACTTATTTCTGAAAT
GCTCATAAATTTTCTGTTCGTATCCCCTTAGCCTTTGATATTTGCCTCCATTCCACCAAT
AGTTGGAAAATCCACAAGTGGCAACGTTATCACTCCGACCATCTACGTAGCAGCCTGAAA
GGCCGGAAAAGTCTTGGAAATGGGCGATGAAAGGAGAAAATGCATAGTTAATCTTGGTCT
GACCGCCATCAGTCGCCCAAGAGTCACCGTTCCAAAAACTGGCTTCTACTTTCATCGGCT
TTGATGGATAGTTAACACCTTTCTCGTTCTTGTACACTCTTATTGGGACGTTGTCAACGT
AAAACACAATTTGGTAACGGTTCCAAAGAATCCCATAAGTGTGGTAATGTTTGATGGGGT
TAAACCAAAGC

QA 3 613 3 613
DS 

RD RS1G716JQ 748 0 0
GC
CATAAAATTTTGAAGCTATTAGTTTTATCAAAAAAAAA*TTTTGAAGCTATTAGCCGATT
ATCGATATTGTTCCCCACCGATCTAACCTCTTTTGTATTTTATCTTCCTTACGACTTACT
TATTTATTTTTCCCTGGACATATATAATAATTAACGTTATGTAATTTCAATAACATTCAG
GACTTTGGTACTTAGAGCGATCAGTGCAATAGTCATAGTTCATGTACTTATTTCTGAAAT
GCACATAGATTTTCTGTTCGTATCCCCTTAGCCTTTGATATTTGCCTCCATTCCACCAAT
AGTTGGAAGATCCACAAGTGGCAACGTTATCACTCCGACCATCTACGTAGCAGCCTGAGA
GGCCGGAGAAGTCTTGGAAATGGGCGATGAAAGGAGAAAATGCATAGTTAATCTTGGTCT
GACCGCCATCAATCGCCCAAGAGTCACCGTTCCAGAGACTGGCTTCTACTTTCATCGGCT
TTGATGGATAGTTAACACCTTTCTCGTTCTTGTACACTCTTATTGGGACGTTGTCAACGT
AAAACACAATTTGGTAACGGTTCCAAAGAATCCCATAAGTGTGGTAATGTTTGATGGGGT
TAAACCAAAGCAAGAACCTCTGTTCTCTGTTTCCTTCTCCATTCGCAAAGATATTTGTCT
GTAACGTTATGGGTTTTCCATCGTTGTTGCCTAAGAACTCGAAGTCAATCTCATCGTGAT
TACTTCCCAACGAAGTCAAATAAAAA

QA 3 748 3 748
DS 

RD RS1FY56TF 709 0 0
ATCCACAATAGTGAG
ATCCACAAGTGGCAACGTTATCACTCCGACCATCTACGTAGCAGC*TGAGAGGC*GGAGA
AGTCTTGGAAATGGGCGATGAAAGGAGAAAATGCATAGTTAATCTTGGTCCGACCGCCAT
CAGTCGCCCAAGAGTCACCGTTCTAGAGACTGGCTTCTACTTTCATCGGCTTTGATGGAT
AGTTAACACCTTTCTCGTTCTTGTACACTCTTATTGGGACGTTGTCAACGTAAAACACAA
TTTGGTAAGGGTTCCAAAGAATCCCATAAGTGTGGTAATGTTTGATGGGGTTAAACCAAA
GCAAGAACCTCTGTTCTCTGTTTCCTTCTCCATTCGCAAAGATATTTGTCTGTAACGTTA
TTGGTTTTCCATCGTTGTTGCCTAAGAACTCGAAGTCAATCTCATCGTGATTACTTCCCA
ACGAAGTCAAATAAAAAGCGGTGACGACGCCACCAGAATTTCCTCCGGGCACTTTGATTC
TCATTTGAAAGAGACCTGATCCGTAAATGTTCTTGGATTCGAACCCGGCACCTGAAGACT
GATCCATGTAGAGATCAACTTCTTTGCCAGAGTGAAGTGTGGAAATATGACCTTGACCCC
ATTTAACAACATAGTTCTGACCGAAAGTAACATATTTCTCGACTCCTCTCCCTCCGATAA
ACCTAGCATCAACCATTGTTATACATAATGCTA
C

QA 16 708 16 708
DS 

RD RS1E415TF 560 0 0
CTCGTTCTTGTACACTCTTATTGGGACGTTGTCAACGTAAAACACAATTTGGTAACGGTT
CCAAAGAATCCCATAAGTGTGGTAATGTTTGATGGGGTTAAACCAAAGCAAGAACCTCTG
TTCTCTGTTTCCTTCTCCATTCGCAAAGATATTTGTCTGTAACGTTATGGGTTTTCCATC
GTTGTTGCCTAAGAACTCGAAGTCAATCTCATCGTGATTACTTCCCAACGAAGTCAAATA
AAAAGCGGTGACGACGCCACCAGAATTTCCTCCGGGCACTTTGATTCTCATTTGAAAGAG
ACCTGATCCGTAAATGTTCTTGGATTCGAACCCGGCACCTGAAGACTGATCCATGTAGAG
ATCAACTTGTTTGCCAGAGTGAAGTGTGGAAATATGACCTTGACCCCATTTAACAACATA
GTTCTGACCGAAAGTAACATATTTCTCGACTCCTCTCCCTCTGATAAACCTAGCATCAAC
CATTGTTATACATAATGCTAATGCAAAAACACCAATGATTTTCGTATGCATCATCTTAGT
TTGATTTTTCTCTAAGGTCC

QA 1 560 1 560
DS 

RD RS1GH89TF 529 0 0
TCAACGTAAAACACAATTTGGTAACGGTTCCAAAGAATCCCATAAGTGTGGTAATGTTTG
ATGGGGTTAAACCAAAGCAAGAACCTCTGTTCTCTGTTTCCTTCTCCATTCGCAAAGATA
TTTGTCTGTAACGTTATGGGTTTTCTATCGTTGTTGCCTAAGAACTGGAAGTCAATCTCA
TCGTGATTACTTCCCAACGAAGTCAAATAAAAAGCGGTGACGACGCCACCAGAATTTCCT
CCGGGCACTTTGATTCTCATTTGAAAGAGACCTGATCCGTAAATGTTCTTGGATTCGAAC
CCGGCACCTGAAGACTGATCCATGTAGAGATCAACTTGTTTGCCAGAGTGAAGTGTGGAA
ATATGACCTTGACCCCATTTAACAACATAGTTCTGACCGAAAGTAACATATTTCTCGACT
CCTCTCCCTCTGATAAACCTAGCATCAACCATTGTTATACATAATGCTAATGCAGAAACA
CCAATGATTTTCGTATGCATCATCTTAGTTTGATTTTTCTCTAAGGTCC

QA 1 529 1 529
DS 



CO CL361Contig2 511 2 7 U
GGCGGTCGGACCAAGATTAACTATGCATTTTCTCCTTTCATCGCCCATTTCCAAGACTTT
TCCGGCCTCTCAGGCTGCTACGTAGATGGTCGGAGTGATAACGTTGCCACTTGTGGATTT
TCCAACTATTGGTGGAATGGAGGCAAATATCAAAGGCTAAGGGGATACGAACAGAAAATC
TATGAGCATTTCAGAAATAAGTACATGAACTATGACTATTGCACTGATCGCTCTAAGTAC
CAAAGTCCTGAATGTTATTGAAATTACATAACGTTAATTATTATATATGTCCAGGGAAAA
ATAAATAAGTAAGTCGTAAGGAAGATAAAATACAAAAAAAAAAAAAAATACAAAAGAGGT
TAGATCGGTGGGGAACAATATCGATAATCGGCTAATAGCTTCAAAAAAATTTTTTTGATA
AAACTAATAGCTTCAAAATTTTATGACAAAATGTTTTATGTACATGTCCACAACAGACAA
TAAAATTTATATAAAGATTATTACGTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AN06TF U 122
AF RS1FY56JQ C 1
BS 1 121 RS1FY56JQ
BS 122 328 RS1AN06TF
BS 329 329 RS1FY56JQ
BS 330 408 RS1AN06TF
BS 409 409 RS1FY56JQ
BS 410 425 RS1AN06TF
BS 426 511 RS1FY56JQ

RD RS1AN06TF 304 0 0
CCAACTATTGGTGGAATGGAGGCAAATATCAAAGGCTAAGGGGATACGAACAGAAAATCT
ATGAGCATTTCAGAAATAAGTACATGAACTATGACTATTGCACTGATCGCTCTAAGTACC
AAAGTCCTGAATGTTATTGAAATTACATAACGTTAATTATTATATATGTCCAGGGAAAAA
TAAATAAGTAAGTCGTAAGGAAGATAAGATACAAAAAAAAAAAAAAATACAAAAGAGGTT
AGATCGGTGGGGAACAATATCGATAATCGGCTAATAGCTTCAAAAAA*TTTTTTTGATAA
AACT

QA 1 304 1 304
DS 

RD RS1FY56JQ 511 0 0
GGCGGTCGGACCAAGATTAACTATGCATTTTCTCCTTTCATCGCCCATTTCCAAGACTTT
TCCGGCCTCTCAGGCTGCTACGTAGATGGTCGGAGTGATAACGTTGCCACTTGTGGATTT
TCCAACTATTGGTGGAATGGAGGCAAATATCAAAGGCTAAGGGGATACGAACAGAAAATT
TATGAGCATTTCAGAAATAAGTACATGAACTATGACTATTGCACTGATCGCTTTAAGTAC
CAAAGTCCTGAATGTTATTGAAATTACATAACGTTAATTATTATATATGTCCAGGGAAAA
ATAAATAAGTAAGTCGTAAGGAAGATAAAATACAAAAAAAAAAAAA**TACAAAAGAGGT
TAGATCGGTGGGGAACAATATCGATAATCGGCTAATAGCTTCAAAAAAATTTTTTTGATA
AAACTAATAGCTTCAAAATTTTATGACAAAATGTTTTATGTACATGTCCACAACAGACAA
TAAAATTTATATAAAGATTATTACGTTTTTT

QA 1 511 1 511
DS 



AS 2 10

CO CL362Contig1 748 2 6 U
GGGAGCTCCTCCACTGAATCTCTCCGTCTCTCGTCTCTTCGAATCCTAAAGGGTAGGTAG
GAATCATGGATCCAGCTGAGATGAGGTACTTGGAAGAAGAGGACGGCCCAATGACGAAGA
CAATCAAAGGCAGCGTCACCGGCTTCGCAGCCGGGACTATCTACGGAACCATTTTGGCCA
CGTGGAAAGACGTTCCCAGAGCGGAGAGAAACGTGGCTCTCCCGGGACTCATCAGAACGC
TGAAGATGATGGGAACCCACGGGCTTACCTTTGCTGCCATTGGAGGCGTTTACATCGGTG
TTGAACAGGTGGTTCAGAGTTACAGAGGCAAGAGAGATTTTTTCAATGGTGCTGTTGGTG
GGTTTGTTGCTGGAGCTTCTGTGCTTGGCTATAGAGCAAGGAGCATCCCAACAGCGATAG
CTGCAGGTGCAACTCTAGCTGTTACCTCTGCTTTGATTGACTCTGGAGGTCAGACCACAA
GAGTAGACAACGGCAGAGAGTATTATCCTTACACCCCCGTCGAGAAAACAGCTCAAGCCG
ATGCCTGATCTCTCTCTTTTTGGTGAAACTGAAGTTAATAAAAGCTCTTGAGATCATCCC
TCTTCCATGTCATCTCTGTTTTGTTTGCTGTATCTGAGAGGTGAAATCATAAAAACTCGT
TTGTTCTTTGTTTCCTCCTGTTTTTATGGAGGGTGACTTGCATCTTTTTGCTTGAAATGT
TAAATGTAAGAAACGTAACAGTTCTAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AW19TF U 1
AF RS1AW19JQ C 50
BS 1 640 RS1AW19TF
BS 641 641 RS1AW19JQ
BS 642 692 RS1AW19TF
BS 693 693 RS1AW19JQ
BS 694 703 RS1AW19TF
BS 704 748 RS1AW19JQ

RD RS1AW19TF 703 0 0
GGGAGCTCCTCCACTGAATCTCTCCGTCTCTCGTCTCTTCGAATCCTAAAGGGTAGGTAG
GAATCATGGATCCAGCTGAGATGAGGTACTTGGAAGAAGAGGACGGCCCAATGACGAAGA
CAATCAAAGGCAGCGTCACCGGCTTCGCAGCCGGGACTATCTACGGAACCATTTTGGCCA
CGTGGAAAGACGTTCCCAGAGCGGAGAGAAACGTGGCTCTCCCGGGACTCATCAGAACGC
TGAAGATGATGGGAACCCACGGGCTTACCTTTGCTGCCATTGGAGGCGTTTACATCGGTG
TTGAACAGGTGGTTCAGAGTTACAGAGGCAAGAGAGATTTTTTCAATGGTGCTGTTGGTG
GGTTTGTTGCTGGAGCTTCTGTGCTTGGCTATAGAGCAAGGAGCATCCCAACAGCGATAG
CTGCAGGTGCAACTCTAGCTGTTACCTCTGCTTTGATTGACTCTGGAGGTCAGACCACAA
GAGTAGACAACGGCAGAGAGTATTATCCTTACACCCCCGTCGAGAAAACAGCTCAAGCCG
ATGCCTGATCTCTCTCTTTTTGGTGAAACTGAAGTTAATAAAAGCTCTTGAGATCATCCC
TCTTCCATGTCATCTCTGTTTTGTTTGCTGTATCTGAGAG*TGAAATCATAAAAACTCGT
TTGTTCTTTGTTTCCTCCTGTTTTTATGGAGG*TGACTTGCAT

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1AW19JQ 699 0 0
AGGGTAGGTAGGAATCATGGATCCAGCTGAGATGAGGTACTTGGAAGAAGAGGACGGCCC
AATGACGAAGACAATCAAAGGCAGCGTCACCGGCTTCGCAGCCGGGACTATCTACGGAAC
CATTTTGGCCACGTGGAAAGACGTTCCCAGAGCGGAGAGAAACGTGGCTCTCCCGGGACT
CATCAGAACGCTGAAGATGATGGGAACCCACGGGCTTACCTTTGCTGCCATTGGAGGCGT
TTACATCGGTGTTGAACAGGTGGTTCAGAGTTACAGAGGCAAGAGAGATTTTTTCAATGG
TGCTGTTGGTGGGTTTGTTGCTGGAGCTTCTGTGCTTGGCTATAGAGCAAGGAGCATCCC
AACAGCGATAGCTGCAGGTGCAACTCTAGCTGTTACCTCTGCTTTGATTGACTCTGGAGG
TCAGACCACAAGAGTAGACAACGGCAGAGAGTATTATCCTTACACCCCCGTCGAGAAAAC
AGCTCAAGCCGATGCCTGATCTCTCTCTTTTTGGTGAAACTGAAGTTAATAAAAGCTCTT
GAGATCATCCCTCTTCCATGTCATCTCTGTTTTGTTTGCTGTATCTGAGAGGTGAAATCA
TAAAAACTCGTTTGTTCTTTGTTTCCTCCTGTTTTTATGGAGGGTGACTTGCATCTTTTT
GCTTGAAATGTTAAATGTAAGAAACGTAACAGTTCTAAG

QA 1 699 1 699
DS 



CO CL362Contig2 843 8 31 U
GCTCAAATCCATTAAACATTCAGATAAAGTATCCAAGTTGAGAATAACAGAAGTAAACAC
ATATCAGATACTTAGAACTGTAACGTTTCTTACATTCAACATTTCAAGCAAAAAGATGCA
AGTCACCCTCCATAAAAACAGGAGGAAACAAAGAACAAAAGAGCTTTTATGATTTCACAC
CTCTCAGATACAGCAAACAAAACAGACATGACATGGAAGAGAGATGATCTCAGG*AGCTT
TTATTAACTTCAGTCTCACCATAAAGAGAAATCAGGCGTCAGCTGGAGCTGTTTTCTCGA
CAGGGGTGTAAGGATAATACTCTCTGCCGTTGTCTACTCTTGTGGTCTGACCTCCAGAGT
CAATCAAAGCAGAGGTAACAGCTAGAGTTGCACCTGCAGCTATCGCTGTTGGGATGCTCC
TTGCTCTATAGCCAAGCACAGAAGCTCCAGCAACAAACCCACCAACAGCACCATTGAAAA
AA*TCTCTCTTGCCTCTATAACTCTGAACCACCTGTTCAACACCGATGTAAACGCCTCCA
ATGGCAGCAAAAGTGAGCCCGTGGGTTCCCATCATCTTCAGCGTTCTGATGAGTCCCGGA
AGAGCCACGTTCCTCTCCACTCTCGGAACGTCTTTCCACGTGGCCAAAATGGTTCCGTAG
ATAGTCCCGGCTGCGAAGCCAGTGACGCTGCCTTTGATTGTCTTCATCATAGGGCCGTCC
TCTTCTTCCAAGTACCTCATCTCAGCTGGATCCATGATTACTACCTACCCTTTAGGATTC
GAAGAGACGAGAGACGGAGAGATTCAGTGGAGGAGCTCAACGAAATAGTGTTTCGATCTT
CCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1AK66TF C 51
AF RS1CF80JQ U 45
AF RS1CD66JQ U 51
AF RS1E725JQ U 1
AF RS1BV04JQ U 53
AF RS1E725TF C 185
AF RS1CZ66TF C 132
AF RS1CD66TF C 112
BS 1 53 RS1E725JQ
BS 54 54 RS1CF80JQ
BS 55 168 RS1E725JQ
BS 169 169 RS1CF80JQ
BS 170 262 RS1E725JQ
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BS 264 277 RS1E725JQ
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BS 350 497 RS1E725JQ
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BS 681 681 RS1CD66JQ
BS 682 705 RS1E725JQ
BS 706 706 RS1BV04JQ
BS 707 710 RS1E725JQ
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BS 712 755 RS1E725JQ
BS 756 819 RS1BV04JQ
BS 820 843 RS1CD66TF

RD RS1AK66TF 224 0 0
AA
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AAGATGCAAGTCACCCTCCATAAAAACAGGAGGAAACAAAGAACAAAAGAGCTTTTATGA
TTTCACACCTCTCAGATACAGCAAACAAAACAGACATGACATGGAAGAGAGATGATCTCA
GGGAGCTTTTATTAACTTCAGTCTCACCATAAA
AGAGAAATC

QA 3 215 3 215
DS 

RD RS1CF80JQ 613 0 0
AGCAAG
AAGTAAACACATATCAGATACTTAGAACTGTAACGTTTCTTACATTCAACATTTCAAGCA
AAAAGATGCAAGTCACCCTCCATAAAAACAGGAGGAAACAAAGAACAAAAGAGCTTTTAT
GATTTCACACCTCTCAGATACAGCAAACAAAACAGACATGACATGGAAGAGAGATGATCT
CAGG*AGCTTTTATTAACTTCAGTCTCACCATAAAGAGAAATCAGGCGTCAGCTGGAGCT
GTTTTCTCGACAGGGGTGTAAGGATAATACTCTCTGCCGTTGTCTACTCTTGTGGTCTGA
CCTCCAGAGTCAATCAAAGCAGAGGTAACAGCTAGAGTTGCACCTGCAGCTATCGCTGTT
GGGATGCTCCTTGCTCTATAGCCAAGCACAGAAGCTCCAGCAACAAACCCGCCAACAGCA
CCATTGAAAAAAATCTCTCTTGCCTCTATAACTCTGAACCACCTGTTCAACACCGATGTA
AACGCCTCCAATGGCAGCAAAAGTGAGCCCGTGGGTTCCCATCATCTTCAGCGTTCTGAT
GAGTCCCGGAAGAGCCACGTTCCTATCCACTCTCGGAACGTCTTTCCACGTGGCCAAAAT
GGTTCCG

QA 7 613 7 613
DS 

RD RS1CD66JQ 638 0 0
AA
GTAAACACATATCAGATACTTAGAACTGTAACGTTTCTTACATTCAACATTTCAAGCAAA
AAGATGCAAGTCACCCTCCATAAAAACAGGAGGAAACAAAGAACAAAAGAGCTTTTATGA
TTTCACACCTCTCAGATACAGCAAACAAAACAGACATGACATGGAAGAGAGATGATCTCA
GG*AGCTTTTATTAACTTCAGTCTCACCATAAAGAGAAATCAGGCGTCAGCTGGAGCTGT
TTTCTCGACAGGGGTGTAAGGATAATACTCTCTGCCGTTGTCTACTCTTGTGGTCTGACC
TCCAGAGTCAATCAAAGCAGAGGTAACAGCTAGAGTTGCACCTGCAGCTATCGCTGTTGG
GATGCTCCTTGCTCTATAGCCAAGCACAGAAGCTCCAGCAACAAACCCACCAACAGCACC
ATTGAAAAAA*TCTCTCTTGCCTCTATAACTCTGAACCACCTGTTCAACACCGATGTAAA
CGCCTCCAATGGCAGCAAAAGTGAGCCCGTGGGTTCCCATCATCTTCAGCGTTCTGATGA
GTCCCGGAAGAGCCACGTTCCTCTCCACTCTCGGAACGTCTTTCCACGTGGCCAAAATGG
TTCCGTAGATAGTCCCGGCTGCGAAGCCAGTGACGC

QA 3 638 3 638
DS 

RD RS1E725JQ 755 0 0
GCTCAAATCCATTAAACATTCAGATAAAGTATCCAAGTTGAGAATAACAGAAGCAAACAC
ATATCAGATACTTAGAACTGTAACGTTTCTTACATTCAACATTTCAAGCAAAAAGATGCA
AGTCACCCTCCATAAAAACAGGAGGAAACAAAGAACAAAAGAGCTTTTGTGATTTCACAC
CTCTCAGATACAGCAAACAAAACAGACATGACATGGAAGAGAGATGATCTCAGG*AGCTT
TTATTAACTTCAGTCTCACCATCAAGAGAAATCAGGCATCAGCTGGAGCTGTTTTCTCGA
CAGGGGTGTAAGGATAATACTCTCTGCCGTTGTCTACTCTTGTGGTCTAACCTCCAGAGT
CAATCAAAGCAGAGGTAACAGCTAGAGTTGCACCTGCAGCTATCGCTGTTGGGATGCTCC
TTGCTCTATAGCCAAGCACAGAAGCTCCAGCAACAAACCCACCAACAGCACCATTGAAAA
AA*TCTCTCTTGCCTCTGTAACTCTGAACCACCTGTTCAACACCGATGTAAACGCCTCCA
ATGGCAGCAAAGGTAAGCCCGTGGGTTCCCATCATCTTCAGCGTTCTGATGAGTCCCGGG
AGAGCCACGTTTCTCTCCACTCTGGGAACGTCTTTCCACGTGGCCAAAATGGTTCCGTAG
ATAGTCCCGGCTGCGAAGCCGGTGACGCTGCCTTTGATTGTCTTCGTCATTGGGCCGTCC
TCTTCTTCCAAGTACCTCATCTCAGCTGGATCCAT

QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1BV04JQ 767 0 0
GTAAACACATATCAGATACTTAGAACTGTAACGTTTCTTACATTCAACATTTCAAGCAAA
AAGATGCAAGTCACCCTCCATAAAAACAGGAGGAAACAAAGAACAAAAGAGCTTTTATGA
TTTCACACCTCTCAGATACAGCAAACAAAACAGACATGACATGGAAGAGAGATGATCTCA
GG*AGCTTTTATTAACTTCAGTCTCACCATAAAGAGAAATCAGGCGTCAGCTGGAGCTGT
TTTCTCGACAGGGGTGTAAGGATAATACTCTCTGCCGTTGTCTACTCTTGTGGTCTGACC
TCCAGAGTCAATCAAAGCAGAGGTAACAGCTAGAGTTGCACCTGCAGCTATCGCTGTTGG
GATGCTCCTTGCTCTATAGCCAAGCACAGAAGCTCCAGCAACAAACCCACCAACAGCACC
ATTGAAAAAA*TCTCTCTTGCCTCTATAACTCTGAACCACCTGTTCAACACCGATGTAAA
CGCCTCCAATGGCAGCAAAAGTGAGCCCGTGGGTTCCCATCATCTTCAGCGTTCTGATGA
GTCCCGGAAGAGCCACGTTCCTCTCCACTCTCGGAACGTCTTTCCACGTGGCCAAAATGG
TTCCGTAGATAGTCCCGGCTGCGAAGCCAGTGACGCTGCCTTTGATTGTCTTCATCATAG
GGCCGTCCTCTTCTTCCAAGTACCTCATCTCAGCTAGATCCATGATTACTACCTACCCTT
TAGGATTCGAAGAGACGAGAGACGGAGAGATTCAGTGGAGGAGCTCA

QA 1 767 1 767
DS 

RD RS1E725TF 644 0 0
CAGATACAGCAAACAAAACAGACATGACATGGAAGAGAGATGATCTCAGG*AGCTTTTAT
TAACTTCAGTCTCACCATCAAGAGAAATCAGGCATCAGCTGGAGCTGTTTTCTCGACAGG
GGTGTAAGGATAATACTCTCTGCCGTTGTCTACTCTTGTGGTCTAACCTCCAGAGTCAAT
CAAAGCAGAGGTAACAGCTAGAGTTGCACCTGCAGCTATCGCTGTTGGGATGCTCCTTGC
TCTATAGCCAAGCACAGAAGCTCCAGCAACAAACCCACCAACAGCACCATTGAAAAAA*T
CTCTCTTGCCTCTGTAACTCTGAACCACCTGTTCAACACCGATGTAAACGCCTCCAATGG
CAGCAAAGGTAAGCCCGTGGGTTCCCATCATCTTCAGCGTTCTGATGAGTCCCGGGAGAG
CCACGTTTCTCTCCACTCTGGGAACGTCTTTCCACGTGGCCAAAATGGTTCCGTAGATAG
TCCCGGCTGCGAAGCCGGTGACGCTGCCTTTGATTGTCTTCGTCATTGGGCCGTCCTCTT
CTTCCAAGTACCTCATCTCAGCTGGATCCATGATTCCTACCTACCCTTTAGGATTCGAAG
AGACGAGAGACGGAGAGATTCAGTGGAGGAGCTCAACGAAA
AAA

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1CZ66TF 705 0 0
ATAAAAACAGGAGGAAACAAAGAACAAAAGAGCTTTTATGATTTCACAC*TCTCAGATAC
AGCAAACAAAAAAGACATGACATGGAAGGGAGATGATCTCAGG*AGCTTTTATTAACTTC
AGTCTCACCATAAAGAGAAATCAGGCGTCAGCTGGAGCTGTTTTCTCGACAGGGGTGTAA
GGATAATACTCTCTGCCGTTGTCTACTCTTGTGGTCTGACCTCCAGAGTCAATCAAAGCA
GAGGTAACAGCTAGAGTTGCACCTGCAGCTATCGCTGTTGGGATGCTCCTTGCTCTATAG
CCAAGCACAGAAGCTCCAGCAACAAACCCACCAACAGCACCATTGAAAAAA*TCTCTCTT
GCCTCTATAACTCTGAACCATCTGTTCAACACCGATGTAAACGCCTCCAATGGCAGCAAA
AGTGAGCCCGTGGGTTCCCATCATCTTCAGCGTTCTGATGAGTCCCGGAAGAGCCACGTT
CCTCTCCACTCTCGGAACGTCTTTCCACGTGGCCAAAATGGTTCCGTAGATAGTCCCGGC
TGCGAAGCCAGTGACGCTGCCTTTGATTGTCTTCATCATAGGGCCGTCCTCTTCTTCCAA
GTACCTCATCTCAGCTGGATCCATGATTACTACCTACCCTTTAGGATTCGAAGAGACGAG
AGACGGAGAGATTCAGTGGAGGAGCTCAACGAAATTGTGTTTC
CC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1CD66TF 732 0 0
AAAGATGCAAGTCACC*TCCATAAAAACAGGAGGAAACAAAGAACAAAAGAGCTTTTATG
ATTTCACACCTCTCAGATACAGCAAACAAAACAGACATGACATGGAAGAGAGATGATCTC
AGG*AGCTTTTATTAACTTCAGTCTCACCATAAAGAGAAATCAGGCGTCAGCTGGAGCTG
TTTTCTCGACAGGGGTGTAAGGATAATACTCTCTGCCGTTGTCTACTCTTGTGGTCTGAC
CTCCAGAGTCAATCAAAGCAGAGGTAACAGCTAGAGTTGCACCTGCAGCTATCGCTGTTG
GGATGCTCCTTGCTCTATAGCCAAGCACAGAAGCTCCAGCAACAAACCCACCAACAGCAC
CATTGAAAAAA*TCTCTCTTGCCTCTATAACTCTGAACCACCTGTTCAACACCGATGTAA
ACGCCTCCAATGGCAGCAAAAGTGAGCCCGTGGGTTCCCATCATCTTCAGCGTTCTGATG
AGTCCCGGAAGAGCCACGTTCCTCTCCACTCTCGGAACGTCTTTCCACGTGGCCAAAATG
GTTCCGTAGATAGTCCCGGCTGCGAAGCCAGTGACGCTGCCTTTGATTGTCTTCATCATA
GGGCCGTCCTCTTCTTCCAAGTACCTCATCTCAGCTGGATCCATGATTACTACCTACCCT
TTAGGATTCGAAGAGACGAGAGACGGAGAGATTCAGTGGAGGAGCTCAACGAAATAGTGT
TTCGATCTTCCC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 9

CO CL363Contig1 1403 9 5 U
ATTACGGCCGGGGGACAAAACATAGTGAGTAAAACAACAAAAAAAAGTGGTAAATCAAAA
AAAAAAAAATTGTATAAGTGATACAAATTTCTTCAGTGGAGAAAGCTCATCATAAGAATA
AAGCTGAAAAGAAATCAACACAACTTACGCAAGCGGTGAGCCGTGGAAGAAGATGTTTGG
TCCTGTCTTTGTTTATCTCAACTCTGCCCCCTCTCCCGATCTCATGTGGACCGATGCTAA
ACGACAGTTGGCTGCCGAGGTTAAAAGCTGGCCTTATGAGTTCGTGAAGTCAGAAGATTA
CCCTCTTCGCCAACAAAGAGGAACAGTCCAGGGTCAACTATCTGTCAAGGACAGTTTCAA
AAGCAAGTCGAAGTTAAACGAGGAAATTGCTTTTGTGGGTTTAGCATTACCTGGTGAAGT
TGGTTCATGGCAAGCCGAAACCAAGGGATATCAATTTTGGACACAAGCAGACAAAACGGG
GACGTTCACCATAGCGAATGTGAGACCTGGCACTTATAACCTCTTCGCATGGGTTGCCGG
ACATATTGGCGACTATAAATACGAGCGTGAAATTACAATTACACCAGGTAAGGAAATAAG
CGTAGGACCCTT*AGTGTATGAGCCGCCAAGAAGTGGTCCAACGTTGTGGGAGATCGGTG
TACCGGATCGGAGCGCCGCAGAATTCAATATCCCGGATCCGGACCCAGCCCTTATAACCA
AACTATATGCTAATCACCCAAATGCTCCTGAAGACAGATTTAGACAATATGGTCTATGGG
ATCGTTACAGTGCAGTGTATCCTAAAGAAGATGTTACTTTTACTGTTGG*AGTGAGTGAC
TATAAAAAAGATTGGTTCTTTGCACATCTCAACAGAAAAACTGGAGGAAAGAAACTTCAA
GCAACGACATGGAAAATTGTTTTTAACTTAAAAGAAGTGTCCCAAAATGGAAATTATACT
CTTCGAATGGCTTTGGCTGCAGCCAACACTGCCGATATATTAGTTGAGGTTAACAAACCA
CCTAGCACCAAACCTATGTTCAGGACTGGGATGGTAGGTCGGGATAACGCGATCGCTAGA
CATGGAATTCACGGGTTATACAGATTGTTCAATATAGGCGTTCAGACGAATTTGCTCAAG
GTTGGTGACAATACGATTTATCTCACTCAAAACCGGGTCACTAGTATTTTTGCAGGTGTT
ATGTATGATTATCTTCGATTGGAAGGTCCTTCAGGAGCCAAACAATAATCTCTTAAATAT
AGATAAGTGAGTGATATGAGAGTTTATTTTTTT*ATTTTTTTAAATAAGAAGATTTGTTA
TTAATAATCAATAATTTTTGTAACCAGTGAAATAAATATTTTGACTATTACATGCTTCCA
AAGTTAACGAAAATGTTATTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 
45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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ATCGTTACAGTGCAGTGTATCCTAAAGAAGATGTTACTTTTACTGTTGG*AGTGAGTGAC
TAT

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CCCTCTCCCGATCTCATGTGGACCGATGCTAAACGACAGTTGGCTGCCGAGGTTAAAAGC
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GCTTTTGTGGGTTTAGCATTACCTGGTGAAGTTGGTTCATGGCAAGCCGAAACCAAGGGA
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AGATGTTACTTTTACTGTTGGGAGTGAGTGACT

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TTACCTGGTGAAGTTGGTTCATGGCAAGCCGAAACCAAGGGATATCAATTTTGGACACAA
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TGG*AGTGAGTGACTATAAAAAAGATTGGTTCTTTGCACATCTCAACAGAAAAACTGGAG
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G
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G
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AAATATTTTGACTATTACATGCTTCCAAAGTTAACGAAAATGTTATT
CTT

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G
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QA 2 627 2 627
DS 



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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 35 30 
30 30 30 30 15 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C430TF U 1
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CCAAGGATGTTTAGTGGTATCGATGGAATCTACCGTGTGTTTCTTGGAGCATTGAACAAC
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TCCATGAGCTTCGGCGACTCCGCTGTCCTCGCTTTCGCCCGCCCAGAAAACTCTCACCGT
CCAAGGATGTTTAGTGGTATCGATGGAATCTACTGTGTGTTTCTTGGAGCATTGAACAAC
CTATGCGACTTGAACAAGCAGTACGGTTTATCTGGAAAATCGTCAAACGAAGCCATGTTT
GTGATCGAAGCTTACCGAACACTTCGTGACCGTGGTCCTTACCCAGCTGATCAAGTTCTC
AGAGGTCTCGACGGAAGTTTTGCTTTTGTCGTCTACGATACTCAGACCTCCTCTGTTTTC
GCAGCTCTTGGATCTGATGGAGCTGAGAGTTTGTACTGGGGAATAGCTGCAGATGGATCT
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AAGGATGTTTAGTGGTATCGATGGAATCTACTGTGTGTTTCTTGGAGCATTGAACAACCT
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GATCGAAGCTTACCGAACACTTCGTGACCGTGGTCCTTACCCAGCTGATCAAGTTCTCAG
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AGCTCTTGGATCTGATGGAGCTGAGAGTTTGTACTGGGGAATAGCTGCAGATGGATCTGT
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TCCGACAGGGTGTATGTTTCACAGTGAGAGTGGTTTGATGAGTTTTGAGCATCCGAGGAA
TAAGATGAAAGCGATGCAGAGGATTGATAGTGAAGGGGCTATATGTGGAGCTAACTTTAA
AGTCGATGCTTGCTCCAAGATCAATAGCATTCCGAGGAGAGGAAGTGAAGCTAATTGGTC
TCTGGCAAATTCTAATTAGTGAAACAAAAA*GTAGA*TGAAATCCAAGAGTTGGTTTGGT
TCTTTGATGTGATTTCTGTTTTATGTAAAT
ACAAACATATA

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DS 

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GGAGCTGAGAGTTTGTACTGGGGAATAGCTGCAGATGGATCTGTTGTTATGTCTGATGAT
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CAGAGGATTGATAGTGAAGGGGTTATATGTGGAGCTAACTTTAAAGTCGATGCTTGCTCC
AAGATCAATAGCATTCCGAGGAGAGGAAGTGAAGCTAATTGGTCTCTGGCAAATTCTAAT
TAGTGAAACAAAAAAGTAGAATGAAATCCAAGAGTTGGTTTGGTTCTTTGATGTGATTTC
TGTTTTATGTAAATTAACAAACAATAATAA
TTAAAAA

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TGGAGCTGAGAGTCTGTACTGGGGAATAGCTGCAGATGGGTCCGTTGTTATGTCTGATGA
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GTTTCACAGTGAGAGTGGTTTGATGAGTTTTGAGCATCCGAAGAATAAGATGAAGGCGAT
GCGGAGGATCGATAGTGAAGGGGTTATATGTGGAGCTAACTTTAAAGTCGATGCTTGCTC
CAAGATCAATAGCATTCCGCGGAGAGGAAGTGAAGCTAATTGGTCTCTAGCAAACTCTAG
TTAATGAAACAAAAAAGTAGAATGAAATCCAAGAGTTGGTTTGGTTCTTTCATGTGATTT
CTGTTTTATGTAAATTAACAAACAATAATAAGGATCCCAATAATAATAAAAAAGGCCCTT
GCCTGATTTATCT

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DS 



AS 2 10

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TAAGCGAGATTGTGGACACAGACAGTGGAGTCCATATCATAAAAAGAACAGCTTGATCTG
TTTATCTCCTTCAAAGCCTCCTATCATGTACCAAAAGATACCAGCTTTTTGATTTACCTT
CTCTTCTTAACCAAAGATAGAAGATGGATAATAAGATGAAAAAGCTTTGGTTCTGCATCT
TTATATGGATTTGATACAAACCAAACATATGATAAAGAC*AAGAAACTGTATCTTAGTTA
CTTCTCATAATTTCATAATAACGAATTTCTGTTGTGACAGTGACTTTGTATTATCATCTT
TCAGTTTCTGTGTTA


BQ
30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

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AF RS1F890TF U 1
AF RS1BM48TF U 1
AF RS1H687TF U 1
AF RS1CT07TF U 3
AF RS1CT07JQ C 3
AF RS1F890JQ C 30
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GTCGAGGTCAAATGCAGAAGCCGTTTGAGGAAGCAACATATGCACTGAAGGTGGGAGATA
TAAGCGAGATTGTGGACACAGACAGTGGAGTCCATATCATAAAAAGAACAGCTTGATCTG
TTTATCTCCTTCAAAGCCTCCTATCATGTACCAAAAGATACCAGCTTTTTGATTTACCTT
CTCTTCTTAACCAAAGATAGAAGATGGATAATAAGATGAAAAAGCTTTGGTTCTGCATCT
TTATATGGATTTGATACAAACCAAACATATGATAAAGAC*AAGAAACTGTATCTTAGTTA
CTTCTCATAATTTCATAATAACGAATTTCTGTTGTGAC

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1F890TF 735 0 0
GGGCACACTTTTAACTTTCTCCGTTTTCGTCGTCAGAGACATCTCTCTCAATCCCCAAAT
CTTCGAAGATAGATTCAGATCGGAAACGGAAGAAAGACTCTGTCTCTTCGACAGATCAAC
CAAAGGACAAGAGAGCCGATCACAACCACCAAAGCAAGCACCGTAAGAAGAGCAAGATGG
CGTCGAGAGACCAAGTCAAGGCCTCGCACATTCTGATCAAGCATCAAGGATCTCGCAGGA
AGGCGTCGTGGAAGGATCCGGGAGGTAAGATCATCATGACCACCACCAGAGAAGCAGCCG
TCGAACAGCTTAAATCGATCCGTGAAGACATCCTCTCTGGCAAAACCAACTTCGAGGATG
TGGCCACTCGTGTTTCCGACTGTAGCTCTGCTAAACGCGGTGGCGATCTAGGTCCATTTG
GTCGAGGTCAAATGCAGAAGCCGTTTGAGGAAGCAACATATGCACTGAAGGTGGGAGATA
TAAGCGAGATTGTGGACACAGACAATGGAGTCCATATCATAAAAAGAACAGCTTGATCTG
TTTATCTCCTTCAAAGCCTCCTATCATGTACCAAAAGATACCAGCTTTTTGATTTACCTT
CTCTTCTTAACCAAAGATAGAAGATGGATAATAAGATGAAAAAGCTTTGGTTCTGCATCT
TTATATGGATTTGATACAAACCAAACATATGATAAAGAC*A*GAAACTGTATCTTAGTTA
CT*CTCATAATTTCA

QA 1 735 1 735
DS 

RD RS1BM48TF 758 0 0
GGGCACACTTTTAACTTTCTCCGTTTTCGTCGTCAGAGACATCTCTCTCAATCCCCAAAT
CTTCGAAGATAGATTCAGATCGGAAACGGAAGAAAGACTCTGTCTCTTCGACAGATCAAC
CAAAGGACAAGAGAGCCGATCACAACCACCAAAGCAAGCACCGTAAGAAGAGCAAGATGG
CGTCGAGAGACCAAGTCAAGGCCTCGCACATTCTGATCAAGCATCAAGGATCTCGCAGGA
AGGCGTCGTGGAAGGATCCGGAAGGTAAGATCATCATGACCACCACCAGAGAAGCAGCCG
TCGAACAGCTTAAATCGATCCGTGAAGACATCCTCTCTGGCAAAACCAACTTCGAGGATG
TGGCCACTCGTGTTCCCGACTGTAGCTCTGCTAAACGCGGTGGCGATCTAGGTCCATTTG
GTCGAGGTCAAATGCAGAAGCCGTTTGAGGAAGCAACATATGCACTGAAGGTGGGAGATA
TAAGCGAGATTGTGGACACAGACAGTGGAGTCCATATCATAAAAAGAACAGCTTGATCTG
TTTATCTCCTTCAAAGCCTCCTATCATGTACCAAAAGATACCAGCTTTTTGATTTACCTT
CTCTTCTTAACCAAAGATAGAAGATGGATAATAAGATGAAAAAGCTTTGGTTCTGCATCT
TTATATGGATTTGATACAAACCAAACATATGATAAAGAC*AAGAAACTGTATCTTAGTTA
CTTCTCATAATTTCATAATAACGAATTTCTGTTGTGAC

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1H687TF 763 0 0
GGGCACACTTTTAACTTTCTCCGTTTTCGTCGTCAGAGACATCTCTCTCAATCCCCAAAT
CTTCGAAGATAGATTCAGATCGGAAACGGAAGAAAGACTCTGTCTCTTCGACAGATCAAC
CAAAGGACAAGAGAGCCGATCACAACCACCAAAGCAAGCACCGTAAGAAGAGCAAGATGG
CGTCGAGAGACCAAGTCAAGGCCTCGCACATTCTGATCAAGCATCAAGGATCTCGCAGGA
AGGCGTCGTGGAAGGATCCGGAAGGTAAGATCATCATGACCACCACCAGAGAAGCAGCCG
TCGAACAGCTTAAATCGATCCGTGAAGACATCCTCTCTGGCAAAACCAACTTCGAGGATG
TGGCCACTCGTGTTTCCGACTGTAGCTCTGCTAAACGCGGTGGCGATCTAGGTCCATTTG
GTCGAGGTCAAATGCAGAAGCCGTTTGAGGAAGCAACATATGCACTGAAGGTGGGAGATA
TAAGCGAGATTGTGGACACAGACAGTGGAGTCCATATCATAAAAAGAACAGCTTGATCTG
TTTATCTCCTTCAAAGCCTCCTATCATGTACCAAAAGATACCAGCTTTTTGATTTACCTT
CTCTTCTTAACCAAAGATAGAAGATGGATAATAAGATGAAAAAGCTTTGGTTCTGCATCT
TTATATGGATTTGATACAAACCAAACATATGATAAAGAC*A*GAAACTGTATCTTAGTTA
CTTCTCATAATTTCATAATAACGAATTTCTGTTGTGACA
CAAA

QA 1 759 1 759
DS 

RD RS1CT07TF 773 0 0
GG
ACACTTTTAACTTTCTCCGTTTTCGTCGTCAGAGACATCTCTCTCAATCCCCAAATCTTC
GAAGATAGATTCAGATCGGAAACGGAAGAAAGACTCTGTCTCTTCGACAGATCAACCAAA
GGACAAGAGAGCCGATCACAACCACCAAAGCAAGCACCGTAAGAAGAGCAAGATGGCGTC
GAGAGACCAAGTCAAGGCCTCGCACATTCTGATCAAGCATCAAGGATCTCGCAGGAAGGC
GTCGTGGAAGGATCCGGAAGGTAAGATCATCATGACCACCACCAGAGAAGCAGCCGTCGA
ACAGCTTAAATCGATCTGTGAAGACATCCTCTCTGGCAAAACCAACTTCGAGGATGTGGC
CACTCGTGTTTCCGACTGTAGCTCTGCTAAACGCGGTGGCGATCTAGGTCCATTTGGTCG
AGGTCAAATGCAGAAGCCGTTTGAGGAAGCAACATATGCACTGAAGGTGGGAGATATAAG
CGAGATTGTGGACACAGACAGTGGAGTCCATATCATAAAAAGAACAGCTTGATCTGTTTA
TCTCCTTCAAAGCCTCCTATCATGTACCAAAAGACACCAGCTTTTTGATTTACCTTCTCT
TCTTAACCAAAGATAGAAGATGGATAATAAGATGAAAAAGCTTTGGTTCTGCATCTTTAT
ATGGATTTGATACAAACCAAACATATGATAAAGAC*AAGAAACTGTATCTTAGTTACTTC
TCATAATTTCATAATAACGAATTTCTGT*GTGACAGTGACTTTGTATTATC

QA 3 773 3 773
DS 

RD RS1CT07JQ 793 0 0
GG
ACACTTTTAACTTTCTCG**TTTCGTCGTCAGAGACATCTCTCTCAATCCCCAAATCTTC
GAAGATAGATTCAGATCGGAAACGGAAGAAAGACTCTGTCTCTTCGACAGATCAACCAAA
GGACAAGAGAGCCGATCACAACCACCAAAGCAAGCACCGTAAGAAGAGCAAGATGGCGTC
GAGAGACCAAGTCAAGGCCTCGCACATTCTGATCAAGCATCAAGGATCTCGCAGGAAGGC
GTCGTGGAAGGATCCGGAAGGTAAGATCATCATGACCACCACCAGAGAAGCAGCCGTCGA
ACAGCTTAAATCGATCTGTGAAGACATCCTCTCTGGCAAAACCAACTTCGAGGATGTGGC
CACTCGTGTTTCCGACTGTAGCTCTGCTAAACGCGGTGGCGATCTAGGTCCATTTGGTCG
AGGTCAAATGCAGAAGCCGTTTGAGGAAGCAACATATGCACTGAAGGTGGGAGATATAAG
CGAGATTGTGGACACAGACAGTGGAGTCCATATCATAAAAAGAACAGCTTGATCTGTTTA
TCTCCTTCAAAGCCTCCTATCATGTACCAAAAGACACCAGCTTTTTGATTTACCTTCTCT
TCTTAACCAAAGATAGAAGATGGATAATAAGATGAAAAAGCTTTGGTTCTGCATCTTTAT
ATGGATTTGATACAAACCAAACATATGATAAAGAC*AAGAAACTGTATCTTAGTTACTTC
TCATAATTTCATAATAACGAATTTCTGTTGTGACAGTGACTTTGTATTATCATCTTTCAG
TTTCTGTGTTA

QA 3 793 3 793
DS 

RD RS1F890JQ 764 0 0
TCGTCAGAGACATCTCTCTCAATCCCCAAATCTTCGAAGATAGATTCAGATCGGAAACGG
AAGAAAGACTCTGTCTCTTCGACAGATCAACCAAAGGACAAGAGAGCCGATCACAACCAC
CAAAGCAAGCACCGTAAGAAGAGCAAGATGGCGTCGAGAGACCAAGTCAAGGCCTCGCAC
ATTCTGATCAAGCATCAAGGATCTCGCAGGAAGGCGTCGTGGAAGGATCCGGGAGGTAAG
ATCATCATGACCACCACCAGAGAAGCAGCCGTCGAACAGCTTAAATCGATCCGTGAAGAC
ATCCTCTCTGGCAAAACCAACTTCGAGGATGTGGCCACTCGTGTTTCCGACTGTAGCTTT
GCTAAACGCGGTGGCGATCTAGGTCCATTTGGTCGAGGTCAAATGCAGAAGCCGTTTGAG
GAAGCAACATATGCACTGAAGGTGGGAGATATAAGCGAGATTGTGGACACAGACAATGGA
GTCCATATCATAAAAAGAACAGCTTGATCTGTTTATCTCCTTCAAAGCCTCCTATCATGT
ACCAAAAGATACCAGCTTTTTGATTTACCTTCTCTTCTTAACCAAAGATAGAAGATGGAT
AATAAGATGAAAAAGCTTTGGTTCTGCATCTTTATATGGATTTGATACAAACCAAACATA
TGATAAAGACTAAGAAACTGTATCTTAGTTACTTCTCATAATTTCATAATAACGAATTTC
TGTTGTGACAGTGACTTTGTATTATCATCTTTCAGTTTCTGTGT

QA 1 764 1 764
DS 



CO CL365Contig2 808 3 8 U
TTTTTAACTTTCTCCGTTTTCGTCGTCAGAGACATCTCTCTCAATACCCAAATCTTCGAA
GATAGATTCAGATCGGAAACGGAAGAAAGACTCTGTCTCTTCGACAGATCAACCAAAGGA
CAAGAGAGCCGATCACAACCACCACCACCACCAAAGCAAGCACCGTAAGAAGAGCAAGAT
GGCGTCGAGAGACCAAGTCAAGGCGTCGCACATTCTGATCAAGCATCAAGGATCTCGCAG
GAAGGCGTCGTGGAAGGATCCGGAAGGTAAGATCATCATGACCACCACCAGAGAAGCAGC
CGTCGAACAGCTTAAATCGATCCGTGAAGACATCCTCTCTGGCAAAGCCAACTTCGAGGA
TGTGGCCACTCGTGTTTCCGACTGTAGCTCTGCTAAACGCGGCGGCGATCTAGGTCCATT
TGGGCGAGGTCAAATGCAGAAACCGTTTGAGGAAGCAACATACGCATTGAAGGTGGGGGA
TATAAGCGAGATTGTGGACACAGACAGTGGAGTCCATATCATAAAGAGAACAGCTTGATG
TTCTGTTTATCTCCTTCAAAGCCTCCTCCTATCATGTACCAAAAGTTACCAGCTTTTTTG
ATTTACCGTCTCTTCTTTGACCAAAGATAGAAGATGGATAATAAGATAAAAGGCTTTGTT
TCTGCATCTTTATATGGATTTGATACAAACCAAACATATGATAAAGACAAGAAACTGTAT
CTTAGTTACTTCTCATAATTTCATAATAACGAATTTCTGTTGTGACAGTGACTTTGTATT
ATCATCTTTCAGTTTCTGTGTTATCAGC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FV93TF U 1
AF RS1E008TF U 1
AF RS1FV93JQ C 409
BS 1 477 RS1E008TF
BS 478 478 RS1FV93TF
BS 479 652 RS1E008TF
BS 653 653 RS1FV93JQ
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BS 705 705 RS1FV93JQ
BS 706 735 RS1E008TF
BS 736 808 RS1FV93JQ

RD RS1FV93TF 648 0 0
T
TTTTAACTTTCTCCGTTTTCGTCGTCAGAGATATCTCTCTCAATACCCAAATCTTCGAAG
ATAGATTCAGATCGGAAACGGAAGAAAGACTCTGTCTCTTCGACAGATCAACCAAAGGAC
AAGAGAGCCGATCACAACCACCACCACCACCAAAGCAAGCACCGTAAGAAGAGCAAGATG
GCGTCGAGAGACCAAGTCAAGGCGTCGCACATTCTGATCAAGCATCAAGGATCTCGCAGG
AAGGCGTCGTGGAAGGATCCGGAAGGTAAGATCATCATGACCACCACCAGAGAAGCAGCC
GTCGAACAGCTTAAATCGATCCGTGAAGACATCCTCTCTGGCAAAGCCAACTTCGAGGAT
GTGGCCACTCGTGTTTCCGACTGTAGCTCTGCTAAACGCGGCGGCGATCTAGGTCCATTT
GGGCGAGGTCAAATGCAGAAACCGTTTGAGGAAGCAACATACGCATTGAAGGTGGGGGAT
ATAAGCGAGATTGTGGACACAGACAGTGGAGTCCATATCATAAAGAGAACAGCTTGATGT
TCTGTTTATCTCCTTCAAAGCCTCCTCCTATCATGTACCAAAAGTTACCAGCTTTTTTGA
TTTACCGTCTCTTCTTTGACCAAAGATAGAAGATGGATAATAAGAT
A

QA 2 647 2 647
DS 

RD RS1E008TF 735 0 0
TTTTTAACTTTCTCCGTTTTCGTCGTCAGAGACATCTCTCTCAATACCCAAATCTTCGAA
GATAGATTCAGATCGGAAACGGAAGAAAGACTCTGTCTCTTCGACAGATCAACCAAAGGA
CAAGAGAGCCGATCACAACCACCACCACCACCAAAGCAAGCACCGTAAGAAGAGCAAGAT
GGCGTCGAGAGACCAAGTCAAGGCGTCGCACATTCTGATCAAGCATCAAGGATCTCGCAG
GAAGGCGTCGTGGAAGGATCCGGAAGGTAAGATCATCATGACCACCACCAGAGAAGCAGC
CGTCGAACAGCTTAAATCGATCCGTGAAGACATCCTCTCTGGCAAAGCCAACTTCGAGGA
TGTGGCCACTCGTGTTTCCGACTGTAGCTCTGCTAAACGCGGCGGCGATCTAGGTCCATT
TGGGCGAGGTCAAATGCAGAAACCGTTTGAGGAAGCAACATACGCATTGAAGGTGGGAGA
TATAAGCGAGATTGTGGACACAGACAGTGGAGTCCATATCATAAAGAGAACAGCTTGATG
TTCTGTTTATCTCCTTCAAAGCCTCCTCCTATCATGTACCAAAAGTTACCAGCTTTTTTG
ATTTACCGTCTCTTCTTTGACCAAAGATAGAAGATGGATAATAAGATAAAAG*CTTTGTT
TCTGCATCTTTATATGGATTTGATACAAACCAAACATATGATAA*GACAAGAAACTGTAT
CTTAGTTACTTCTCA

QA 1 735 1 735
DS 

RD RS1FV93JQ 400 0 0
TCTAGGTCCATTTGGGGGAGGTCAAATGCAGAAACCGTTTGAGGAAGCAACATACGCATT
GAAGGTGGGGGATATAAGCGAGATTGTGGACACAGACAGTGGAGTCCATATCATAAAGAG
AACAGCTTGATGTTCTGTTTATCTCCTTCAAAGCCTCCTCCTATCATGTACCAAAAGTTA
CCAGCTTTTTTGATTTACCGTTTCTTCTTTGACCAAAGATAGAAGATGGATAATAAGATA
AAAGGCTTTGTTTCTGCATCTTTATATGGATTTGATACAAACCAAACATATGATAAAGAC
AAGGAACTGTATCTTAGTTACTTCTCATAATTTCATAATAACGAATTTCTGTTGTGACAG
TGACTTTGTATTATCATCTTTCAGTTTCTGTGTTATCAGC

QA 1 400 1 400
DS 



AS 1 8

CO CL366Contig1 1269 8 10 U
GAGATCTATAGACGGTGGAGCTGCTGCTGGGTTTCCCGAGTCGCCTGAAGTAGCTGCTGA
AGCTGGTCTTGTTAGTGGGAAGGATAATGTGATTGACAGGAGTATCCAAGATGCTTACAT
ACACGCCATAAGACGTGCTAAAGACTTCATCTACATTGAGAACCAGTACTTCCTTGGAAG
CTCTTTTGCATGGGCTGCTGATGGTATCACCCCTGAGGAGATCAATGCGCTGCATCTGAT
CCCAAAAGAGCTGTCTCTCAAGATCGTTGACAAGATCGAGAAAGGAGAGAAGTTTAGGGT
TTATGTTGTGGTTCCTATGTGGCCTGAAGGTATCCCGGAGAGTGCATCAGTGCAAGCTAT
ATTGGATTGGCAGAGGAGGACCTTGGAGATGATGTACAAGGATGTTACTCAGGCTCTCAG
GGCACAGGGGTTGGAGGAAGATCCTAGAAACTATCTGACGTTATTCTGCCTTGGAAACCG
TGAGGTCAAGAAAGAAGGAGAGTATGAGCCTGCAGAGAGACCAGACTGTGACACGGACTA
TATGAGGGCCCAAGAAGCACGTCGCTTCATGATCTACGTCCATAGCAAAATGATGATCGT
TGACGATGAATACATTATCGTTGGGTCTGCTAACATCAACCAGAGGTCAATGGATGGTGC
AAGGGACTCTGAGATAGCAATGGGAGGGTATCAACCACATCACTTGTCACATAGACAACC
AGCTCGTGGCCAAGTCCATGGCTTCCGTATGTCACTCTGGTACGAACACTTGGGAATGCT
TGATGAGACGTTCCTAGATCCCTCAAGCTTGGAATGCATTGAGAAAGTTAACCGTATTGC
TGAGAAGTACTGGGACTTCTACTCAAGCGAGTCACTGGAACATGACCTTCCTGGCCACTT
GCTGCGCTACCCAATTAGTGTGGACAATGAAGGTAACATCAGTGAGCTTCCTGGATTTGA
GTTCTTCCCGGACACAAAGGCTCGTATCCTCGGAAACAAAGTAGACTACCTGCCTCCAAT
CCTTACAACCTAAGTTCACTGTCTCTACATTGCTGCTGCAGTAGCTTTGAATAAATTGAG
TGTCTCTCTCTCTATCTATCTACCTTGAGAACTAATAAGTTGGTGTGATGATATGCACTT
TTGTACTCCTTTGGTTTTATATTCGTACAATGACATGGTGATGATGTAACTTTGTGGTCT
TTATGTACCTTATTTATGTCTTATGTATCGTTCAACTTGTGAAACTTGTATTTGATCTTA
GTTACACTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1G839TF U 1
AF RS1G535TF U 1
AF RS1FR83TF U 435
AF RS1BT44JQ C 671
AF RS1FR83JQ C 478
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AGCTGGTCTTGTTAGTGGGAAGGATAATGTGATTGACAGGAGTATCCAAGATGCTTACAT
ACACGCCATAAGACGTGCTAAAGACTTCATCTACATTGAGAACCAGTACTTCCTTGGAAG
CTCTTTTGCATGGGCTGCTGATGGTATCACCCCTGAGGAGATCAATGCGCTGCATCTGAT
CCCAAAAGAGCTGTCTCTCAAGATCGTTGACAAGATCGAGAAAGGAGAGAAGTTTAGGGT
TTATGTTGTGGTTCCTATGTGGCCTGAAGGTATCCCGGAGAGTGCATCAGTGCAAGCTAT
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GGCACAGGGGTTGGAGGAAGATCCTAGAAACTATCTGACGTTATTCTGCCTTGGAAACCG
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TATGAGGGCCCAAGA

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DS 

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AGCTGGTCTTGTTAGTGGGAAGGATAATGTGATTGACAGGAGTATCCAAGATGCTTACAT
ACACGCCATAAGACGTGCTAAAGACTTCATCTACATTGAGAACCAGTACTTCCTTGGAAG
CTCTTTTGCATGGGCTGCTGATGGTATCACCCCTGAGGAGATCAATGCGCTGCATCTGAT
CCCAAAAGAGCTGTCTCTCAAGATCGTTGACAAGATCGAGAAAGGAGAGAAGTTTAGGGT
TTATGTTGTGGTTCCTATGTGGCCTGAAGGTATCCCGGAGAGTGCATCAGTGCAAGCTAT
ATTGGATTGGCAGAGGAGGACCTTGGAGATGATGTACAAGGATGTTACTCAGGCTCTCAG
GGCACAGGGGTTGGAGGAAGATCCTAGAAACTATCTGACGTTATTCTGCCTTGGAAACCG
TGAGGTCAAGAAAGAAGGAGAGTATGAGCCTGCAGAGAGACCAGACTGTGACACGGACTA
TATGAGGGCCCAAGAAGCGCGTCGCTTCATGCTCTACGTCCATAGCAAAATGATGATCGT
TGACGATGAATACATTATCGTTGGGTCTGCTAACATCAACCAGAG*TCAATGGATGGTG

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DS 

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G
GGAAGATCCTAGAAACTATCTGACGTTATTCTGCCTTGGAAACCGTGAGGTCAAGAAAGA
AGGAGAGTATGAGCCTGCAGAGAGACCAGACCGTGACACGGACTATATGAGGGCCCAAGA
AGCACGTCGCTTCATGATCTACGTCCATAGCAAAATGATGATCGTTGACGATGAATACAT
TATCGTTGGGTCTGCTAACATCAACCAGAGGTCAATGGATGGTGCAAGGGACTCTGAGAT
AGCAATGGGAGGGTATCAACCACATCACTTGTCACATAGACAACCAGCTCGTGGCCAAGT
CCATGGCTTCCGTATGTCACTCTGGTACGAACACTTGGGAATGCTTGATGAGACGTTCCT
AGATCCCTCAAGCTTGGAATGCATTGAGAAAGTTAACCGTATTGCTGAGAAGTACTGGGA
CTTCTACTCAAGCGAGTCACTGGAACATGACCTTCCTGGCCACTTGCTGCGCTACCCAAT
TAGTGTGGACAATGAAGGTAACATCAGTGAGCTTCCTGGATTTGAGTTCTTCCCGGACAC
AAAGGCTCGTATCCTCGGAAACAAAGTAGACTACCTGCCTCCAATCCTTACAACCTAAGT
TCACTGTCTCTACATTGCTGCTGCAGTAGCTTTGAATAAATTGAGTGTCTCTCTCTCTAT
CTATCTACCTTGAGAACTAATAAGTTGGTGTGATGATATGCACTTTTGTACTCCTTTGGT
TT

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DS 

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TTCCTAGATCCCTCAAGCTTGGAATGCATTGAGAAAGTTAACCGCATTGCTGAGAAGTAC
TGGGACTTTTACTCAAGCGAGTCGCTGGAACATGACCTTCCTGGCCACTTGCTGCGCTAC
CCGATTACTGTGGACAATGAAGGTAATATCAGTGAGCTTCCAGGGTTTGAGTTCTTCCCC
GACACAAAGGCTCGTATCCTCGGAAACAAAGTAGACTACCTGCCTCCAATCCTTACAACC
TAAGTTCACTGTCTCTACATTGCTGCTGCAGTAGCTTTGAATAAATTGAGTATATCTCTC
TCTATCTATCTACCTTTAGAACTAATAAGTTGGTGTGATGATATGCACTTTTGTACTTCT
TTGGTTTTATATTCG

QA 1 495 1 495
DS 

RD RS1FR83JQ 745 0 0
CCGTGAGGTCAAGAAAGAAGGAGAGTATGAGCCTGCAGAGAGACCAGACCGTGACACGGA
CTATATGAGGGCCCAAGAAGCACGTCGCTTCATGATCTACGTCCATAGCAAAATGATGAT
CGTTGACGATGAATACATTATCGTTGGGTCTGCTAACATCAACCAGAGGTCAATGGATGG
TGCAAGGGACTTTGAGATAGCAATGGGAGGGTATCAACCACATCACTTGTCACATAGACA
ACCAGCTCGTGGCCAAGTCCATGGCTTCCGTATGTCACTTTGGTACGAACACTTGGGAAT
GCTTGATGAGACGTTCCTAGATCCCTCAAGCTTGGAATGCATTGAGAAAGTTAACCGTAT
TGCTGAGAAGTACTGGGACTTTTACTCAAGCGAGTCACTGGAACATGACCTTCCTGGCCA
CTTGCTGCGCTACCCAATTAGTGTGGACAATGAAGGTAACATCAGTGAGCTTCCTGGATT
TGAGTTTTTCCCGGACACAAAGGCTCGTATCCTCGGAAACAAAGTAGACTACCTGCCTCC
AATCCTTACAACCTAAGTTCACTGTCTTTACATTGCTGCTGCAGTAGCTTTGAATAAATT
GAGTGTCTCTCTCTCTATCTATCTACCTTGAGAACTAATAAGTTGGTGTGATGATATGCA
CTTTTGTACTCCTTTGGTTTTATATTCGTACAATGACATGGTGATGATGTAACTTTGTGG
TCTTTATGTACCTTATTTATGTC
CG

QA 1 743 1 743
DS 

RD RS1F245TF 345 0 0
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CATCAGTGAGCTTCCTGGATTTGAGTTCTTCCCGGACACAAAGGCTCGTATCCTCGGAAA
CAAAGTAGACTACCTGCCTCCAATCCTTACAACCTAAGTTCACTGTCTCTACATTGCTGC
TGCAGTAGCTTTGAATAAATTGAGTGTCTCTCTCTCTATCTATCTACCTTGAGGACTAAT
AAGTTGGTGTGATGATATGCACTTTTGTACTCCTTTGGTTTTATATTCGTACAATGACAT
GGTGATGATGTAACTTTGTGGTCTTTATGTACCTTATTTATGTC
T

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DS 

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TGAGGGCCCAAGAAGCGCGTCGCTTCATGCTCTACGTCCATAGCAAAATGATGATCGTTG
ACGATGAATACATTATCGTTGGGTCTGCTAACATCAACCAGAGGTCAATGGATGGTGCAA
GGGACTCTGAGATAACAATGGGAGGGTATCAACCACATCACTTGTCACATAGACAACCAG
CTCGTGGCCAAGTCCATGGCTTCCGTATGTCACTCTGGTACGAACACTTGGGAATGCTTG
ATGAGACGTTCCTAGATCCCTCAAGCTTGGAATGCATTGAGAAAGTTAACCGTATTGCTG
AGAAGTACTGGGACTTCTACTCAAGCGAGTCACTGGAACATGACCTTCCTGGCCACTTGC
TGCGCTACCCAATTAGTGTGGACAATGAAGGTAACATCAGTGAGCTTCCTGGATTTGAGT
TCTTCCCGGACACAAAGGCTCGTATCCTCGGAAACAAAGTAGACTACCTGCCTCCAATCC
TTACAACCTAAGTTCACTGTCTCTACATTGCTGCTGCAGTAGCTTTGAATAAATTGAGTG
TCTCTCTCTCTATCTATCTACCTTGAGAACTAATAAGTTGGTGTGATGATATGCACTTTT
GTACTCCTTTGGTTTTATATTCGTACAATGACATGGTGATGATGTAACTTTGTGGTCTTT
ATGTACCTTATTTATGTCTTATGTATCGTTCAACTTGTGAAACTTGTATTTGATCTTAGT
TACACTT

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DS 

RD RS1G535JQ 637 0 0
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AACCACATCACTTGTCACATAGACAACCAGCTCGTGGCCAAGTCCATGGCTTCCGTATGT
CACTCTGGTACGAACACTTGGGAATGCTTGATGAGACGTTCCTAGATCCCTCAAGCTTGG
AATGCATTGAGAAAGTTAACCGTATTGCTGAGAAGTACTGGGACTTCTACTCAAGCGAGT
CACTGGAACATGACCTTCCTGGCCACTTGCTGCGCTACCCAATTAGTGTGGACAATGAAG
GTAACATCAGTGAGCTTCCTGGATTTGAGTTCTTCCCGGACACAAAGGCTCGTATCCTCG
GAAACAAAGTAGACTACCTGCCTCCAATCCTTACAACCTAAGTTCACTGTCTCTACATTG
CTGCTGCAGTAGCTTTGAATAAATTGAGTGTCTCTCTCTCTATCTATCTACCTTGAGAAC
TAATAAGTTGGTGTGATGATATGCACTTTTGTACTCCTTTGGTTTTATATTCGTACAATG
ACATGGTGATGATGTAACTTTGTGGTCTTTATGTACCTTATTTATGTCTTATGTATCGTT
CAACTTGTGAAACTTGTATTTGATCTTAGTTACACTT

QA 1 637 1 637
DS 



AS 2 10

CO CL367Contig1 670 8 26 U
GGCTAGCTCTCACACCTTTACGCAGTTGCAGTCAGTCTCTCTTCTCACTCTCTCGCCGTC
GCAAACATGGGTAAGACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAAGAGGCTTAGGATT
AACCAGAGGTGGGCTGACAAGCAGTACAAGAAGAGTCACCAAGGAAACGAGTGGAAGAAG
CCTTTTGCTGGTTCTTCCCACGCCAAAGGAATCGTCCTTGAGAAGATTGGTATTGAGGCT
AAGCAGCCTAACTCTGCCATTCGTAAATGTGCTAGAGTTCAGTTGATCAAGAACGGCAAA
AAGATTGCTGCTTTCGTTCCTAATGATGGTTGCTTGAACTACATTGAAGAAAACGATGAG
GTGCTGATTGCTGGATTCGGACGTAAAGGTCATGCCGTCGGAGATATTCCCGGAGTCAGG
TTCAAGGTGGTGAAGGTGTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTTTTCAAGGAGAAGAAGGAG
AAGCCTAGGTCTTAGACTCTCTACTGTTTTTTTTAAGCTTATTTTGTTAATGTATTTTTG
AT*ACTTGAAGGCTTTGAAGCCATTTGCCTCTGTTCTGCTTCAAGATT*TCGAACATGTG
TACCAGTGGTTGAGTTTTAAACTTGGTTTTGTTTCATCTGTTTTGGATTCACTTTGCCTA
AAGCATCATA


BQ
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B193JQ C 1
AF RS1B193TF U 1
AF RS1GO08TF U 1
AF RS1GT60JQ C 1
AF RS1CN61TF U 10
AF RS1BC38JQ C 10
AF RS1BC38TF U 10
AF RS1GT60TF U 1
BS 1 13 RS1B193TF
BS 14 14 RS1GO08TF
BS 15 62 RS1B193TF
BS 63 63 RS1GO08TF
BS 64 107 RS1B193TF
BS 108 108 RS1GO08TF
BS 109 125 RS1B193TF
BS 126 126 RS1GO08TF
BS 127 161 RS1B193TF
BS 162 162 RS1GO08TF
BS 163 363 RS1B193TF
BS 364 364 RS1GO08TF
BS 365 419 RS1B193TF
BS 420 420 RS1GO08TF
BS 421 532 RS1B193TF
BS 533 533 RS1GO08TF
BS 534 542 RS1B193TF
BS 543 543 RS1GO08TF
BS 544 588 RS1B193TF
BS 589 589 RS1GO08TF
BS 590 604 RS1B193TF
BS 605 605 RS1GT60TF
BS 606 622 RS1B193TF
BS 623 633 RS1GO08TF
BS 634 634 RS1CN61TF
BS 635 670 RS1GT60TF

RD RS1B193JQ 622 0 0
GGCTAGCTCTCACGCCTTTACGCAGTTGCAGTCAGTCTCTCTTCTCACTCTCTCGCCGTC
GCGAACATGGGTAAGACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAAAAGGCTTAGGATT
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CCTTTTGCTGGTTCTTCCCACGCCAAAGGAATCGTCCTTGAGAAGATTGGTATTGAGGCT
AAGCAGCCTAACTCTGCCATTCGTAAATGTGCTAGAGTTCAGTTGATCAAGAACGGCAAA
AAGATTGCTGCTTTCGTTCCTAATGATGGTTGCTTGAACTACATTGAAGAAAACGATGAG
GTGTTGATTGCTGGATTCGGACGTAAAGGTCATGCCGTCGGAGATATTCCCGGAGTCAGA
TTCAAGGTGGTGAAGGTGTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTTTTCAAGGAGAAGAAGGAG
AAGCCTAGGTCTTAGACTCTCTACTGTTTTTTTTAAGCTTATTTTGTTAATGGATTTTTG
ATTACTTGAAGGCTTTGAAGCCATTTGCCTCTGTTCTGCTTCAAGATTCTCGAACATGTG
TACCTGTGGTTGAGTTTTAAAC

QA 1 622 1 622
DS 

RD RS1B193TF 622 0 0
GGCTAGCTCTCACGCCTTTACGCAGTTGCAGTCAGTCTCTCTTCTCACTCTCTCGCCGTC
GCGAACATGGGTAAGACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAAAAGGCTTAGGATT
AACCAAAGGTGGGCTGACAAGCAGTACAAGAAGAGTCACCAGGGAAACGAGTGGAAGAAG
CCTTTTGCTGGTTCTTCCCACGCCAAAGGAATCGTCCTTGAGAAGATTGGTATTGAGGCT
AAGCAGCCTAACTCTGCCATTCGTAAATGTGCTAGAGTTCAGTTGATCAAGAACGGCAAA
AAGATTGCTGCTTTCGTTCCTAATGATGGTTGCTTGAACTACATTGAAGAAAACGATGAG
GTGTTGATTGCTGGATTCGGACGTAAAGGTCATGCCGTCGGAGATATTCCCGGAGTCAGA
TTCAAGGTGGTGAAGGTGTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTTTTCAAGGAGAAGAAGGAG
AAGCCTAGGTCTTAGACTCTCTACTGTTTTTTTTAAGCTTATTTTGTTAATGGATTTTTG
ATTACTTGAAGGCTTTGAAGCCATTTGCCTCTGTTCTGCTTCAAGATTCTCGAACATGTG
TACCTGTGGTTGAGTTTTAAAC

QA 1 622 1 622
DS 

RD RS1GO08TF 633 0 0
GGCTAGCTCTCACACCTTTACGCAGTTGCAGTCAGTCTCTCTTCTCACTCTCTCGCCGTC
GCAAACATGGGTAAGACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAAGAGGCTTAGGATT
AACCAGAGGTGGGCTGACAAGCAGTACAAGAAGAGTCACCAAGGAAACGAGTGGAAGAAG
CCTTTTGCTGGTTCTTCCCACGCCAAAGGAATCGTCCTTGAGAAGATTGGTATTGAGGCT
AAGCAGCCTAACTCTGCCATTCGTAAATGTGCTAGAGTTCAGTTGATCAAGAACGGCAAA
AAGATTGCTGCTTTCGTTCCTAATGATGGTTGCTTGAACTACATTGAAGAAAACGATGAG
GTGCTGATTGCTGGATTCGGACGTAAAGGTCATGCCGTCGGAGATATTCCCGGAGTCAGG
TTCAAGGTGGTGAAGGTGTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTTTTCAAGGAGAAGAAGGAG
AAGCCTAGGTCTTAGACTCTCTACTGTTTTTTTTAAGCTTATTTTGTTAATGTATTTTTG
AT*ACTTGAAGGCTTTGAAGCCATTTGCCTCTGTTCTGCTTCAAGATT*TCGAACATGTG
TACCGGTGGTTGAGTTTTAAACTTGGTTTTGTT

QA 1 633 1 633
DS 

RD RS1GT60JQ 665 0 0
GGCTAGCTCTCACACCTTTACGCAGTTGCAGTCAGTCTCTCTTCTCACTCTCTCGCCGTC
GCAAACATGGGTAAGACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAAGAGGCTTAGGATT
AACCAGAGGTGGGCTGACAAGCAGTACAAGAAGAGTCACCAAGGAAACGAGTGGAAGAAG
CCTTTTGCTGGTTCTTCCCACGCCAAAGGAATCGTCCTTGAGAAGATTGGTATTGAGGCT
AAGCAGCCTAACTCTGCCATTCGTAAATGTGCTAGAGTTCAGTTGATCAAGAACGGCAAA
AAGATTGCTGCTTTCGTTCCTAATGGTGGTTGCTTGAACTACATTGAAGAAAACGATGAG
GTGCTGATTGCTGGATTCGGACGTAAAGGTCATGCCGTCGGAGATATTCCCGGAGTCAGG
TTCAAGGTGGTGAAGGTGTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTTTTCAAGGAGAAGAAGGAG
AAGCCTAGGTCTTAGACTCTCTACTGTTTTTTTTAAGCTTATTTTGTTAATGTATTTTTG
AT*ACTTGAAGGCTTTGAAGCCATTTGCCTCTGTTTTGCTTCAAGATT*TCGAACATGTG
TACCAGTGGTTGAGTTTTAAACTTGGTTTTGTTTCATCTGTTTTGGATTCACTTTGCC
TAAAGCA

QA 1 658 1 658
DS 

RD RS1CN61TF 625 0 0
GG
ACGCCTTTACGCAGTTGCAGTCAGTCTCTCTTCTCACTCTCTCGCCGTCGCAAACATGGG
TAAGACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAAAAGGCTTAGGATTAACCAAAGGTG
GGCTGACAAGCAGTACAAGAAGAGTCACCAGGGAAACGAGTGGAAGAAGCCTTTTGCTGG
TTCTTCCCACGCCAAAGGAATCGTCCTTGAGAAGATTGGTATTGAGGCTAAGCAGCCTAA
CTCTGCCATTCGTAAATGTGCTAGAGTTCAGTTGATCAAGAACGGCAAAAAGATTGCTGC
TTTCGTTCCTAATGATGGTTGCTTGAACTACATTGAAGAAAACGATGAGGTGTTGATTGC
TGGATTCGGACGTAAAGGTCATGCCGTCGGAGATATTCCCGGAGTCAGATTCAAGGTGGT
GAAGGCGTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTTTTCAAGGAGAAGAAGGAGAAGCCTAGGTC
TTAGACTCTCTACTGTTTTTTTTAAGCTTATTTTGTTAATGGATTTTTGATTACTTGAAG
GCTTTGAAGCCATTTGCCTCTGTTCTGCTTCAAGATTCTCGAACATGTGTACCTGTGGTT
GAGTTTTAAACTTTGTTTTGTTT

QA 3 625 3 625
DS 

RD RS1BC38JQ 649 0 0
GG
ACACCTTTACGCAGTTGCAGTCAGTCTCTCTTCTCACTCTCTCGCCGTCGCAAACATGGG
TAAGACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAAGAGGCTTAGGATTAACCAGAGGTG
GGCTGACAAGCAGTACAAGAAGAGTCACCAAGGAAACGAGTGGAAGAAGCCTTTTGCTGG
TTCTTCCCACGCCAAAGGAATCGTCCTTGAGAAGATTGGTATTGAGGCTAAGCAGCCTAA
TTCTGCCATTCGTAAATGTGCTAGAGTTCAGTTGATCAAGAACGGCAAAAAGATTGCTGC
TTTCGTTCCTAATGATGGTTGCTTGGACTACATTGAAGAAAACGATGAGGTGCTGATTAC
TGGATTCGGACGTAAAGGTCATGCCGTCGGAGATATTCCCGGAGTCAGGTTCAAGGTGGT
GAAGGTGTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTTTTCAAGGAGAGGAAGGAGAAGCCTAGGTC
TTAGACTCTCTACTGTTTTTTTTAAGCTTATTTTGTTAATGTATTTTTGAT*ACTTGAAG
GCTTTGAAGCCATTTGCCTCTGTTCTGCTTCAAGATT*TCGAACATGTGTACCAGTGGTT
GAGTTTTAAACTTGGTTTTGTTTCATCTGTTTTGGATTCACTTTGCC

QA 3 649 3 649
DS 

RD RS1BC38TF 649 0 0
GG
ACACCTTTACGCAGTTGCAGTCAGTCTCTCTTCTCACTCTCTCGCCGTCGCAAACATGGG
TAAGACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAAGAGGCTTAGGATTAACCAGAGGTG
GGCTGACAAGCAGTACAAGAAGAGTCACCAAGGAAACGAGTGGAAGAAGCCTTTTGCTGG
TTCTTCCCACGCCAAAGGAATCGTCCTTGAGAAGATTGGTATTGAGGCTAAGCAGCCTAA
CTCTGCCATTCGTAAATGTGCTAGAGTTCAGTTGATCAAGAACGGCAAAAAGATTGCTGC
TTTCGTTCCTAATGATGGTTGCTTGGACTACATTGAAGAAAACGATGAGGTGCTGATTAC
TGGATTCGGACGTAAAGGTCATGCCGTCGGAGATATTCCCGGAGTCAGGTTCAAGGTGGT
GAAGGTGTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTTTTCAAGGAGAGGAAGGAGAAGCCTAGGTC
TTAGACTCTCTACTGTTTTTTTTAAGCTTATTTTGTTAATGTATTTTTGAT*ACTTGAAG
GCTTTGAAGCCATTTGCCTCTGTTCTGCTTCAAGATT*TCGAACATGTGTACCAGTGGTT
GAGTTTTAAACTTGGTTTTGTTTCATCTGTTTTGGATTCACTTTGCC

QA 3 649 3 649
DS 

RD RS1GT60TF 670 0 0
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AACCAGAGGTGGGCTGACAAGCAGTACAAGAAGAGTCACCAAGGAAACGAGTGGAAGAAG
CCTTTTGCTGGTTCTTCCCACGCCAAAGGAATCGTCCTTGAGAAGATTGGTATTGAGGCT
AAGCAGCCTAACTCTGCCATTCGTAAATGTGCTAGAGTTCAGTTGATCAAGAACGGCAAA
AAGATTGCTGCTTTCGTTCCTAATGGTGGTTGCTTGAACTACATTGAAGAAAACGATGAG
GTGCTGATTGCTGGATTCGGACGTAAAGGTCATGCCGTCGGAGATATTCCCGGAGTCAGG
TTCAAGGTGGTGAAGGTGTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTTTTCAAGGAGAAGAAGGAG
AAGCCTAGGTCTTAGACTCTCTACTGTTTTTTTTAAGCTTATTTTGTTAATGTATTTTTG
AT*ACTTGAAGGCTTTGAAGCCATTTGCCTCTGTTCTGCTTCAAGATT*TCGAACATGTG
TACCAGTGGTTGAGTTTTAAACTTGGTTTTGTTTCATCTGTTTTGGATTCACTTTGCCTA
AAGCATCATA

QA 1 670 1 670
DS 



CO CL367Contig2 632 2 2 U
GGCTAGCTCTCACGCCTTTACGCAGTTGCAGTCAGTCTCTCTTCTCACTCTCTCGCCTTC
GCAAACATGGGTAAGACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAAGAGGCTTAGGATT
AACCAGAGGTGGGCTGACAAGCAGTACAAGAAGAGTCACCAAGGAAACGAGTGGAAGAAG
CCTTTTGCTGGTTCTTCCCACGCCAAAGGAATCGTCCTTGAGAAGATTGGTATTGAGGCT
AAGCAGCCTAACTCTGCCATTCGTAAATGTGCTAGAGTTCAGTTGATCAAGAACGGCAAA
AGATTGCTGCTTTCGTTCCTAATGATGGTTGCTTGAACTACATTGAAGAAAATGATGAAG
TGTTGATTGCTGGATTCGGACGTAAAGGTCATGCCGTCGGAGATATTCCGGAGTCAGATT
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ACTTGAAGGCTTTGAAGCCATTTACCTCTGTTCTGCTTCAAGATTCTCTAACATGTGTAC
CTGTGGTTGAGTTTTAAACTTTGTTTTGTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1FO21JQ C 1
AF RS1FO21TF U 1
BS 1 630 RS1FO21TF
BS 631 632 RS1FO21JQ

RD RS1FO21JQ 632 0 0
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AACCAGAGGTGGGCTGACAAGCAGTACAAGAAGAGTCACCAAGGAAACGAGTGGAAGAAG
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AAGCAGCCTAACTCTGCCATTCGTAAATGTGCTAGAGTTCAGTTGATCAAGAACGGCAAA
AGATTGCTGCTTTCGTTCCTAATGATGGTTGCTTGAACTACATTGAAGAAAATGATGAAG
TGTTGATTGCTGGATTCGGACGTAAAGGTCATGCCGTCGGAGATATTCCGGAGTCAGATT
CAAGGTGGTGAAGGTGTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTTTTCAAGGAGAAGAAGGAGAA
GCCTAGGTCTTAGACTTCTACTGTTTTTTTTAAGCTTATTTTGTTAATGGATTTTTGATT
ACTTGAAGGCTTTGAAGCCATTTACCTCTGTTCTGCTTCAAGATTCTCTAACATGTGTAC
CTGTGGTTGAGTTTTAAACTTTGTTTTGTTCC

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1FO21TF 632 0 0
GGCTAGCTCTCACGCCTTTACGCAGTTGCAGTCAGTCTCTCTTCTCACTCTCTCGCCTTC
GCAAACATGGGTAAGACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTGAAGAGGCTTAGGATT
AACCAGAGGTGGGCTGACAAGCAGTACAAGAAGAGTCACCAAGGAAACGAGTGGAAGAAG
CCTTTTGCTGGTTCTTCCCACGCCAAAGGAATCGTCCTTGAGAAGATTGGTATTGAGGCT
AAGCAGCCTAACTCTGCCATTCGTAAATGTGCTAGAGTTCAGTTGATCAAGAACGGCAAA
AGATTGCTGCTTTCGTTCCTAATGATGGTTGCTTGAACTACATTGAAGAAAATGATGAAG
TGTTGATTGCTGGATTCGGACGTAAAGGTCATGCCGTCGGAGATATTCCGGAGTCAGATT
CAAGGTGGTGAAGGTGTCTGGTGTCTCACTCTTGGCCCTTTTCAAGGAGAAGAAGGAGAA
GCCTAGGTCTTAGACTTCTACTGTTTTTTTTAAGCTTATTTTGTTAATGGATTTTTGATT
ACTTGAAGGCTTTGAAGCCATTTACCTCTGTTCTGCTTCAAGATTCTCTAACATGTGTAC
CTGTGGTTGAGTTTTAAACTTTGTTTTGTT
CC

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 10

CO CL368Contig1 957 10 29 U
AAAAAAAGTACGTACGAAGTACGTACGAAGTACTCATTTATTTATTTAGTTGCGATAGAA
TACATTGACTCATATTTAGGTGGATGCATGAACAACAAATACATGAAAAAGATGCTTTAT
TAGTTCTTGTAGTAGAGTGGATTAGGGAGCTTGAAAGTCCTTCTCCCAGGGCTGTCTTTA
GCCAAATCAGCCCATTGGTCTCCAATATTCCCAATGATAGTGTGACCACTCCTCACC*AG
CTTCTTCCTCTCCTTTGACTTGAAATTTGATATCTTCGTGTTTGAACCCGTTGGCTTAAA
TAAGATTTGTCTCCAATAGGTGAAGCCAGCAGCTTCGAGATTCTTTAGAGTGACTTCCGC
CAACTCTTGGTAACGCTCAGTGAGTAAGACAGGCTCAATCCCGAGTTCTTGGATGTTTTG
GTAAAGATGCAAAGTCTCTGGGAGCACGGGAGCTTCTCCGGCCTCCAGCCACTTATTGAA
CGCATTTGGGTCTTGCTTCTCTGTCCCGTATCCATATTGAGCGTAAAAGGGAACATTAGA
GAGGAGGGTCTCGTCAAGGTCAAAGATCCAAACATTGACGGTGTCATTCTTCAAAGCAAG
TCCTTTGGCGTAGAAATAAGCTTCTTTGCACACCGTTTTGGAGTCAGCACGGTACTGTTC
GGAAGTGAGGTAGTCTTCAACATAGTCTTTGCAATTTGCGGGCACTGTCTGGAAGTTTAT
GATGTTAGAGGTCTCAACACCAAGGTGCCAGCTTCTGCAGTTGGGGTAGCTGATGGAGAG
TCGTTGTTCCTCAGAGAGTTCGGCTTCGTTGGCTGATGTGAGGAGTTCAATGAGCCTAGG
CAAAGGTAGCGAAGGTCGGCCTTGGGAGACCGTAGCGGCCAAGAGCAAGATAAGTGAAAG
TGAGAGGATCTTCATTATTGTTTTTGGTATGTTATTGTTTTAGTTGTGATGTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 15 15 30 15 15 15 30 15 30 15 15 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 20 20 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 20 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 30 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 5 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GI12JQ U 11
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ATTGAACGCATTTGGGTCTTGCTTCTCTGTCCCGTATCCATATTGAGCGTAAAAGGGAAC
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G
C

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ACAC

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GACTTGAAATTTGATATCTTCGTGTTTGAACCCGTTGGCTTAAATAAGATTTGTCTCCAA
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TCAGTGAGTAAGACAGGCTCAATCCCGAGTTCTTGGATGTTTTGGTAAAGATGCAAAGTC
TCTGGGAGCACGGGAGCTTCTCCGGCCTCCAGCCACTTATTGAACGCATTTGGGTCTTGC
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AGGTCAAAGATCCAAACATTGACGGTGTCATTCTTCAAAGCAAGTCCTTTGGCGTAGAAA
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TCAACATAGTCTTTGCAATTTGCGGGCACTGTCTGGAAGTTTATGATGTTAGAGGTCTCA
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AGTTCGGCTTCGTTGGCTGATGTGAGGAGTTCAATGAGCCT

QA 6 826 6 826
DS 

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AAGATTTGTCTCCAATAGGTGAAGCCAGCAGCTTCGAGATTCTTTAGAGTGACTTCCGCC
AACTCTTGGTAACGCTCAGTGAGTAAGACAGGCTCAACCCCGAGTTCTTGGATGTTTTGG
TAAAGATGCAAAGTCTCTGGGAGCACGGGAGCTTCTCCGGCCTCCAGCCACTTATTGAAC
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AGTCTCTGGGAGCACGGGAGCTTCTCCGGCCTCCAGCCACTTATTGAACGCATTTGGGTC
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CTCAACACCAAGGTGCCAGCTTCTGCAGTTGGGGTAGCTGATGGAGAGTCGTTGTTCCTC
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AGGTCGGCCTTGGGAGACCGTAGCGGCCAAGAGCAAGATAAGTGAAAGTGAGAGGATCTT
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GTTTTCC

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GTGAT
GTTTCC

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DS 

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GGCTCAATCCCGAGTTCTTGGATGTTTTGGTAAAAATGCAAAGTCTCTGGGAGCACGGGA
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CCATATTGAGCGTAAAAGGGAACATTAGAGAGGAGGGTCTCGTCAAGGTCAAAGATCCAA
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GTAGCGGCCAAGAGCAAGATAAGTGAAAGTGAGAGGATCTTCATTATTGTTTTTGGTATG
TTATTGTTTTAGTTGTGAT
CC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 8

CO CL369Contig1 816 8 17 U
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TCCTTTCTGCACATTTATATTTTCCAACAATGGCCGAGTTTGCGGAAGGAGAATTGGTCG
AAGTATGCCTCAAAGAAGATGGTTACTTCGGGTCATTCTTTGAGGCCAAGGTATTGTCCA
AGCTTCACGATGGAACTTTCTACGAGGTTGAATACAAGAACCTTATCACTGAAGGCGAAA
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TACCCCAGCCGTCCACGTTTAGCCTCCATGAGAAGGTTGATGCTTTTGACCTAGACGCGT
GGTGGTACGGAGAGATCTACGGTTATGACGGCGAGACGTACTACGTTCACTTTCCAACGA
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GTTTCTTGGTCGCTAGTTATTGTTCTTAATAATCCGCAACGTTTATCGTTGTAATACTTT
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ACTCTGTTTTGGATTTATGAAACAAAATCCTTGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 5 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GZ86TF U 4
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AF RS1D432TF U 2
AF RS1C071TF U 1
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AF RS1FZ92JQ C 389
AF RS1FZ92TF U 389
AF RS1GZ86JQ C 379
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GGGTCGAG
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AAAAAAAAAAGAGGTTTGCAGATTCTATCTCTCGATCTCTCGTCCAAGTCTCCTTTCTGC
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GGGGTCGAGA
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GTTGGTTGGAACCATCTCCGCCGACGACATCCGTCCGATGCCACCTACATTACCCCAGCC
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GTGCGAGTACCCACTTCAAAGCCTCAGAAAGCATCTCGAATTTGTTGACGGTGAATGGGT
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G
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ATT

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G
GGCGAGACGTACTACGTCCACTTTCCAACGACCAAACATTTGTGCGAGTACCCACTTCAA
AGCCTCAGAAAGCATCTCGAATTTGTTGACGGTGAATGGGTTCCTTCAGCAATGTCAACA
AGGAGGCGTTGAGCTTCTTAGATTCTCCGATGTTTCTTGGTCGCTAGTTATTGTTCTTAA
TAATCCGCAACGTTTATCGTTGTAATACTTTTTATATCGGTTTCCAGAAAACCGTTGCTC
TGTTTTTAAGACGTCCAAATAAAATAGGGAAACGACTTCTAGAACAAATCGTTAGCCCTA
GAAAGTTTGATCATTTTGTAATCAATGCACAGCCACTTGTTTTGCTGTTGCTTTCACAAT
GAATGTTGTATTCAAACTATGTTATTTG
ATT

QA 2 389 2 389
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AACCGTTGCTCTGTTTTTAAGACGCCCAAATAAAATAGGGAAACGACTTCTAGAACAAAT
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GCTTTCACAATGAATGTTGTATTCAAACTATGTTATTTGATTACTCTGTTTTGGATTTAT
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DS 



AS 2 10

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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BX36JQ C 3
AF RS1BX36TF U 173
AF RS1C644JQ C 1
AF RS1C644TF U 1
BS 1 4 RS1C644JQ
BS 5 648 RS1C644TF

RD RS1BX36JQ 498 0 0
GG
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DS 

RD RS1BX36TF 328 0 0
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DS 

RD RS1C644JQ 648 0 0
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DS 

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GGCT
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GCCTTGCCTGCCCGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTGCAAAGCT
GAAGGACCAACAACCATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAATCCTGCATTTGCTCAGTACAT
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ATCAAGCTGTCTTATGAAATAAAATTACCGCTAGTATGTAATGGTTTATATGGTTAAATA
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CCAAAGGATCAATCTATCTTATTAAAACAGAAACATTACAACTTCTTCTAGGTGAATTTT
AAAGTTGGACCTTATGTAATTAATGTTATATTAATCTATTTACT

QA 5 648 5 648
DS 



CO CL370Contig2 503 6 9 U
GGGAGCAAATATATTAAACACTGTAAAACTCAAACAGCTTAACATATACAAATAATTTAG
TAGACATGAAGATCATGGTCTTGAAACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGTTTC
CCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGCTAC
AGCCTTGCCTGCCCGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTGCAAAGC
TGAAGGAGCAACAATCATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAACCCTGCTTTTGCTCAGTACA
TTAGCTCTCCCAACTCTCGTAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAGTTGTT
AAAACTCTTAAGAGTTCTTACCAGAAAAAAAAAATTACGAGTAAGGAAGATGAATAACAT
TATATCAAGCTGTTTTATGAAATAAATAACCGTTAGTATGTAATGGTTTATGTGGTTAAA
TAAAGTTTACTTTCTCATATTAC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 30 30 

AF RS1FP70JQ C 1
AF RS1FP70TF U 1
AF RS1EJ55JQ C 58
AF RS1GJ18JQ C 58
AF RS1EJ55TF U 58
AF RS1GJ18TF U 58
BS 1 2 RS1FP70JQ
BS 3 338 RS1FP70TF
BS 339 339 RS1EJ55TF
BS 340 392 RS1FP70TF
BS 393 394 RS1EJ55TF
BS 395 471 RS1FP70TF
BS 472 472 RS1EJ55TF
BS 473 501 RS1FP70TF
BS 502 503 RS1EJ55TF

RD RS1FP70JQ 501 0 0
GGGAGCAAATATATTAAACACTGTAAAACTCAAACAGCTTAACATATACAAATAATTTAG
TAGACATGAAGATCATGGTCTTGAAACTCATGGTTTTTGTCATACTTTTGACATCGTTTC
CCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGCTAC
AGCCTTGCCTGCCCGGGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTGCAAAGC
TGAAGGAGCAACAATCATGCTTGTGCGGGTTTGTTAAGAACCCTGCTTTTGCTCAGTACA
TTAGCTCTCCCAACTTTTGTAAAGTCCTAACCGCCTGTTGCATTCCTTACCCAAGTTGTT
AAAACTTTTAAGAGTTTTTACCAGAAAAAAAA**TTACGAGTAAGGAAGATGAATAACAT
TATATCAAGCTGTTTTATGAAATAAATAACCGTTAGTATGTAATGGTTTATATGGTTAAA
TAAAGTTTACTTTTTCATATT

QA 1 501 1 501
DS 

RD RS1FP70TF 501 0 0
GG
GAGCAAATATATTAAACACTGTAAAACTCAAACAGCTTAACATATACAAATAATTTAGTA
GACATGAAGATCATGGTCTTGAAACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGTTTCCC
GCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGCTACAG
CCTTGCCTGCCCGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTGCAAAGCTG
AAGGAGCAACAATCATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAACCCTGCTTTTGCTCAGTACATT
AGCTCTCCCAACTCTCGTAAAGTCCTAACCGCCTGTTGCATTCCTTACCCAAGTTGTTAA
AACTCTTAAGAGTTCTTACCAGAAAAAAAA**TTACGAGTAAGGAAGATGAATAACATTA
TATCAAGCTGTTTTATGAAATAAATAACCGTTAGTATGTAATGGTTTATATGGTTAAATA
AAGTTTACTTTCTCATATT

QA 3 501 3 501
DS 

RD RS1EJ55JQ 446 0 0
TAGTAGACATGAAGATCATGGTCTTGAAACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGT
TTCCCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGC
TACAGCCTTGCCTGCCCGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTGCAA
AGCTGAAGGAGCAACAATCATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAACCCTGCTTTTGCTCAGT
ACATTAGCTCTCCCAACTCTCGTAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAGTT
GTTAAAACTCTTAAGAGTTCTTACCAGAAAAAAAAAATTACGAGTAAGGAAGATGAATAA
CATTATATCAAGCTGTTTTATGAAATAAATAACCGTTAGTATGTAATGGTTTATGTGGTT
AAATAAAGTTTACTTTCTCATATTAC

QA 1 446 1 446
DS 

RD RS1GJ18JQ 446 0 0
TAGTAGACATGAAGATCATGGTCTTGAAACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGT
TTCCCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGC
TACAGCCTTGCCTGCCCGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTGCAA
AGCTGAAGGAGCAACAATCATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAACCCTGCTTTTGCTCAGT
ACATTAGCTCTCCCAACTCTCGTAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAGTT
GTTAAAACTCTTAAGAGTTCTTACCAGAAAAAAAAAATTACGAGTAAGGAAGATGAATAA
CATTATATCAAGCTGTTTTATGAAATAAATAACCGTTAGTATGTAATGGTTTATGTGGTT
AAATAAAGTTTACTTTCTCATATTAC

QA 1 446 1 446
DS 

RD RS1EJ55TF 446 0 0
TAGTAGACATGAAGATCATGGTCTTGAAACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGT
TTCCCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGC
TACAGCCTTGCCTGCCCGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTGCAA
AGCTGAAGGAGCAACAATCATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAACCCTGCTTTTGCTCAGT
ACATTAGCTCTCCCAACTCTCGTAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAGTT
GTTAAAACTCTTAAGAGTTCTTACCAGAAAAAAAAAATTACGAGTAAGGAAGATGAATAA
CATTATATCAAGCTGTTTTATGAAATAAATAACCGTTAGTATGTAATGGTTTATGTGGTT
AAATAAAGTTTACTTTCTCATATTAC

QA 1 446 1 446
DS 

RD RS1GJ18TF 446 0 0
TAGTAGACATGAAGATCATGGTCTTGAAACTCATGGTTTTCGTCATACTTCTGACATCGT
TTCCCGCTCCAAACAAAGCGGCAGACACAAATTTGGGAGCAGCATGTGATCCAAAGCAGC
TACAGCCTTGCCTGCCCGCGATTACTGGAGGAGGACAACCCTCGGGTGACTGTTGTGCAA
AGCTGAAGGAGCAACAATCATGCTTGTGCGGGTTTGCTAAGAACCCTGCTTTTGCTCAGT
ACATTAGCTCTCCCAACTCTCGTAAAGTCCTAACCGCCTGTGGCATTCCTTACCCAAGTT
GTTAAAACTCTTAAGAGTTCTTACCAGAAAAAAAAAATTACGAGTAAGGAAGATGAATAA
CATTATATCAAGCTGTTTTATGAAATAAATAACCGTTAGTATGTAATGGTTTATGTGGTT
AAATAAAGTTTACTTTCTCATATTAC

QA 1 446 1 446
DS 



AS 2 9

CO CL371Contig1 769 3 2 U
GAAGAGCAAAGGGCAATGGTGGTGCTCTTGATGAACATGGGCAAGATTCTTAAAATTGTT
ACACACACACACACAACTTAGAAGCAAGCAAGATTGTCTTATCAGGAAAATGTAATACAT
TACATAAGTCAATTACATTACATATACTGAACTGGAGGCATGTAACAAACAAACTGTTTT
TAACCAATTTGACAGGCCTCCACTTCAAATATTACAAACTGGGGTGTGACAAATTAGTCA
GCGGTCCAGCTCTGTTCGACAATCTCCTTAACACGTCTGTTGTACTCTCGCTTGCTCTCG
CTGAATAAGCGAGCAGCTTCTGAGTTCGCAGGCGAGTTTGGGTTGGGATCACAGAGGAGT
GACTGGATAGATGTGAGAATGGCAGCGACATCATAGATAGGACTCCACTGGTTCTGTAAG
ATATCAAGACAGATACTCCCATCTGCATAGATGTTTGGGTGAAACATGCGAGAAACAAAA
CGAACAGTTGGTGGTTTGTTTGGATAATCCTCTGTGAATTGAAGAGTCAACTTAAAAGTA
CCTCCATCCCAAGGCGTATCATCTGGACCGAAGATAACAGCGTTCCAGAGCAAGATGTTG
TTGTCATGAGGAGCACCACTGATACCGGCAGGAGGATCTTGCTGCAACCTCCTGAAATCC
CTCATAAGCCTCTTCCTCGCTGGTGTTGACATCGTCAATCTCAGAAGAGAGGGGAGACAA
AGATTGTCGGAAAGATTAAAGCTTTTAAATAAAAGAGAGTTAGGATTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F267JQ U 80
AF RS1D987JQ U 1
AF RS1FE56TF C 87
BS 1 718 RS1D987JQ
BS 719 769 RS1FE56TF

RD RS1F267JQ 176 0 0
G
GAAGCAAGCAAGATTGTCTTATCAGGAAAATGTAATACATTACATAAGTCAATTACATTA
CATATACTGAACTGGAGGCATGTAACAAACAAACTGTTTTTAACCAATTTGACAGGCCCC
CACTTCAAATATTACAAACTGGGGTGTGACAAATTAATCAGCGGTCCAGCTCTGT

QA 2 176 2 176
DS 

RD RS1D987JQ 718 0 0
GAAGAGCAAAGGGCAATGGTGGTGCTCTTGATGAACATGGGCAAGATTCTTAAAATTGTT
ACACACACACACACAACTTAGAAGCAAGCAAGATTGTCTTATCAGGAAAATGTAATACAT
TACATAAGTCAATTACATTACATATACTGAACTGGAGGCATGTAACAAACAAACTGTTTT
TAACCAATTTGACAGGCCTCCACTTCAAATATTACAAACTGGGGTGTGACAAATTAGTCA
GCGGTCCAGCTCTGTTCGACAATCTCCTTAACACGTCTGTTGTACTCTCGCTTGCTCTCG
CTGAATAAGCGAGCAGCTTCTGAGTTCGCAGGCGAGTTTGGGTTGGGATCACAGAGGAGT
GACTGGATAGATGTGAGAATGGCAGCGACATCATAGATAGGACTCCACTGGTTCTGTAAG
ATATCAAGACAGATACTCCCATCTGCATAGATGTTTGGGTGAAACATGCGAGAAACAAAA
CGAACAGTTGGTGGTTTGTTTGGATAATCCTCTGTGAATTGAAGAGTCAACTTAAAAGTA
CCTCCATCCCAAGGCGTATCATCTGGACCGAAGATAACAGCGTTCCAGAGCAAGATGTTG
TTGTCATGAGGAGCACCACTGATACCGGCAGGAGGATCTTGCTGCAACCTCCTGAAATCC
CTCATAAGCCTCTTCCTCGCTGGTGTTGACATCGTCAATCTCAGAAGAGAGGGGAGAC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1FE56TF 683 0 0
GAAAGCAAGATGTCTATCA
GAAAATGTAATACATTACATAAGTCAATTACATTACATATACTGAACTGGAGGCATGTAA
CAAACAAACTGTTTTTAACCAATTTGACAGGC*TCCACTTCAAATATTACAAACTGGGGT
GTGACAAATTAGTCAGCGGTCCAGCTCTGTTCGACAATCTCCTTAACACGTCTGTTGTAC
TCTCGCTTGCTCTCGCTGAATAAGCGAGCAGCTTCTGAGTTCGCAGGCGAGTTTGGGTTG
GGATCACAGAGGAGTGACTGGATAGATGTGAGAATGGCAGCGACATCATAGATAGGACTC
CACTGGTTCTGTAAGATATCAAGACAGATACTCCCATCTGCATAGATGTTTGGGTGAAAC
ATGCGAGAAACAAAACGAACAGTTGGTGGTTTGTTTGGATAATCCTCTGTGAATTGAAGA
GTCAACTTAAAAGTACCTCCATCCCAAGGCGTATCATCTGGACCGAAGATAACAGCGTTC
CAGAGCAAGATGTTGTTGTCATGAGGAGCACCACTGATACCGGCAGGAGGATCTTGCTGC
AACCTCCTGAAATCCCTCATAAGCCTCTTCCTCGCTGGTGTTGACATCGTCAATC**AGA
AGAGAGGGGAGACAAAGATTGTCGGAAAGATTAAAGCTTTTAAATAAAAGAGAGTTAGGA
TTGA

QA 20 683 20 683
DS 



CO CL371Contig2 809 6 6 U
GGGCAATGGTGATGCACTTGATGAACATGGACAAGATTCTTTAAAAAGTTTACATACACA
CACAACTTAGAAGCAAGCAAGATTGTCTTATCAGGAAAATGCAATATATAGGTTCATCCA
GTAATTACATTACATATACTGAACTGGAGGCATGAAACAAACAAACTGTTTTTCACCAAT
TTGATAGGCCTCTCCACTTCAAATATTACAAACTGGGGTGTGAGTTATTAATCAGCGGTC
CAGCTCTGTTCGACAATCTCCTTAACACGTCTGTTGTACTCACGCTTGCTCTCGCTGAAT
AAGCGAGCAGCTTCTGAGTTCGCAGGCGAGTTTGGGTTGGGATCACAGAGCAGCGACTGG
ATAGATGTAAGAATCGCTGCGACATCATAGATAGGACTCCACTGGTTCTGTAAGATATCA
AGACAGATACTCCCATCTGCATAGATGTTTGGGTGAAACATGCGAGAAACAAAACGAACA
GTTGGTGGTTTGTTTGGATAATCCTCTGTGAATTGAAGAGTCAACTTAAAAGTACCTCCA
TCCCAAGGTGTATCATCTGGACCGAAGATAACAGCGTTCCAGAGCAAGATGTTGTTGTCA
TGAGGAGCACCACTGATTCCGGCAGGAGGATCTTGCTGCAACCTCCTGAAATCCCTCATA
AGCCTCTTCCTCGCTGGTGTTGACATCGTCAATCTCAGAAGAGAGGGGAGACAAAGATTG
TCGGAAAGATTATAGTAGCTTTTAAATAAAAGAGAGTTAGGATTGATTGGGTCGCCGCGG
CACCTTCAAAGGTGTCAACCTAACTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1GZ91JQ U 90
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AF RS1DQ61TF C 22
AF RS1GZ91TF C 85
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DS 

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TTGATAGGCCTCTCCACTTCAAATATTACAAACTGGGGTGTGAGTTATTAATCAGCGGTC
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GTTGGTGGTTTGTTTGGATAATCCTCTGTGAATTGAAGAGTCAACTTAAAAGTACCTCCA
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TGAGGAGCACCACTGATTCCGGCAGGAGGATCTTGATGCAACCTCCTGAAATCCCTCATA
AGCCTCTTCCTCGCTGGTGTTGACATCGTCAA

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DS 

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ATTGTCTTATCAGGAAAATGCAATATATAGGTTCATCCAGTAATTACATTACATATACTG
AACTGGAGGCATGAAACAAACAAACTGTTTTTCACCAATTTGATAGGCCTCTCCACTTCA
AATATTACAAACTGGGGTGTGAGTTATTAATCAGCGGTCCAGCTCTGTTCGACAATCTCC
TTAACACGTCTGTTGTACTCACGCTTGCTCTCGCTGAATAAGCGAGCAGCTTCTGAGTTC
GCAGGCGAGTTTGGGTTGGGATCACAGAGCAGCGACTGGATAGATGTAAGAATCGCTGCG
ACATCATAGATAGGACTCCACTGGTTCTGTAAGATATCAAGACAGATACTCCCATCTGCA
TAGATGTTTGGGTGAAACATGCGAGAAACAAAACGAACAGTTGGTGGTTTGTTTGGATAA
TCCTCTGTGAATTGAAGAGTCAACTTAAAAGTACCTCCATCCCAAGGTGTATCATCTGGA
CCGAAGATAACAGCGTTCCAGAGCAAGATGTTGTTGTCATGAGGAGCACCACTGATTCCG
GCAGGAGGATCTTGATGCAACCTCCTGAAATCCCTCATAAGCCTCTTCCTCGCTGGTGTT
GACATCGTCAATCTCAGAAGAGAGGGGAGACAAAGATTGTCGGAAAGATTATAGTAGCTT
TTAAATAAAAGAGAGTTAGGATTGATTGGGTCGCCGCGGC
CC

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TTTTT
ATCAGGAAAATGCAATATATAGGTTCATCCAGTAATTACATTACATATACTGAACTGGAG
GCATGAAACAAACAAACTGTTTTTCACCAATTTGATAGGCCTCTCCACTTCAAATATTAC
AAACTGGGGTGTGAGTTATTAATCAGCGGTCCAGCTCTGTTCGACAATCTCCTTAACACG
TCTGTTGTACTCACGCTTGCTCTCGCTGAATAAGCGAGCAGCTTCTGAGTTCGCAGGCGA
GTTTGGGTTGGGATCACAGAGCAGCGACTGGATAGATGTAAGAATCGCTGCGACATCATA
GATAGGACTCCACTGGTTCTGTAAGATATCAAGACAGATACTCCCATCTGCATAGATGTT
TGGGTGAAACATGCGAGAAACAAAACGAACAGTTGGTGGTTTGTTTGGATAATCCTCTGT
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AACAGCGTTCCAGAGCAAGATGTTGTTGTCATGAGGAGCACCACTGATTCCGGCAGGAGG
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AAGAGAGTTAGGATTGATTGGGTCGCCGCGGCACCTTCAAAGGTGTCAACCT
CC

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DS 

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AAACAAACAAACCGTTTTTCACCAATTTGATAGGCCTCTCCACTTCAAATATTACAAACT
GGGGTGTGAGTTATTAATCAGCGGTCCAGCTCTGTTCGACAATCTCCTTAACACGTCTGT
TGTACTCACGCTTGCTCTCGCTGAATAAGCGAGCAGCTTCTGAGTTCGCAGGCGAGTTTG
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GACTCCACTGGTTCTGTAAGATATCGAGACAGATACTCCCATCTGCATAGATGTTTGGGT
GAAACATGCGAGAAACAAAACGAACAGTTGGTGGTTTGTTTGGATAATCCTCTGTGAATT
GAAGAGTCAACTTAAAAGTACCTCCATCCCAAGGTGTATCATCTGGACCGAAGATAACAG
CGTTCCAGAGCAAGATGTTGTTGTCATGAGGAGCACCACTGATTCCGGCAGGAGGATCTT
GCTGCAACCTCCTGAAATCCCTCATAAGCCTCTTCCTCGCTGGTGTTGACATCGTCAATC
TCAGAAGAGAGGGGAGACAAAGATTGTCGGAAAGATTATAGTAGCTTTTAAATAAAAGAG
AGTTAGGATTGATTGGGTCGCCGCGGCACCTTCA

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DS 

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ACGTCTGTTGTACTCACGCTTGCTCTCGCTGAATAAGCGAGCAGCTTCTGAGTTCGCAGG
CGAGTTTGGGTTGGGATCACAGAGCAGCGACTGGATAGATGTAAGAATCGCTGCGACATC
ATAGATAGGACTCCACTGGTTCTGTAAGATATCGAGACAGATACTCCCATCTGCATAGAT
GTTTGGGTGAAACATGCGAGAAACAAAACGAACAGTTGGTGGTTTGTTTGGATAATCCTC
TGTGAATTGAAGAGTCAACTTAAAAGTACCTCCATCCCAAGGTGTATCATCTGGACCGAA
GATAACAGCGTTCCAGAGCAAGATGTTGTTGTCATGAGGAGCACCACTGATTCCGGCAGG
AGGATCTTGCTGCAACCTCCTGAAATCCCTCATAAGCCTCTTCCTCGCTGGTGTTGACAT
CGTCAATCTCAGAAGAGAGGGGAGACAAAGATTGTCGGAAAGATTATAGTAGCTTTTAAA
TAAAAGAGAGTTAGGATTGATTGGGTCGCCGCGGCACCTTCAAAGGTGTCAACCTAACTA
TCC

QA 20 622 20 622
DS 



AS 1 9

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TCCCGGTACACAAACAAATGGCTCCAAGAATTGCTCTTGCACTCTTCCTTTCTCTGAACT
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GTCTTTGCGCTAATGCTCTCAATGTAGTTAACATAATATTGGGATACTCACCTGTAAAGC
CATGCTGCTCATTAATTGATGGCTTGGTTGACCTTGAGGCTGCAGCCTGTCTCTGTACCG
CACTCAAGGTTAACATTCTTGGCATCAAGCTTAACCTTCCTATCTATGTCAACGCACTCC
TCAATAATTGTGGCCATATAACTCCGACATTATACCCATGCGTCTAAGTTGTATACTTAT
GACATATATATTAAGAGATGCCTAAACCACAAACAGATCGTATGGTTTCAAATGCTTGAA
CTTATTGTCTTGTTTTCATGTTTCTTTTAATCAGTGATTGCTTTTGTGTTTGTAATTTTC
TTGGATTTAAAATAAATGATGAACCTCACGTTCTCATGCAACAAGGGATTATGGGTTTGT
GTGTGTAATCGGCAAGTTCGTCCCTTTTT*GCTTCACTGTTCCTTCTTATCTTCGTTGTA
ACGTTTCTTTGGAATTTGATTAATAAAACTATCAATCGGTGTTGTTAAAA


BQ
10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 5 45 45 50 50 50 50 35 10 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 25 55 55 0 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 10 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 
45 45 45 15 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 35 35 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 

AF RS1BT90JQ C 146
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AF RS1G001JQ C 27
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DS 

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TCTTTGCGCTAATGCTCTCAATGTAGTTAACATAATATTGGGATACTCACCTGTAAAGCC
ATGCTGCTCATTAATTGATGGCTTGGTTGACCTTGAGGCTGCAGCCTGTCTCTGTACCGC
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CAATAATTGTGGCCATATAACTCCGACATTATACCCATGCGTCTAAGTTGTATACTTATG
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TGTGTAATCGGCAAGTTCGTCCCTTTTT*GCTTCACTGTTCCTTCTTATCTTCGTTG

QA 1 657 1 657
DS 

RD RS1BT90TF 692 0 0
GGGACCCTTCTCAACAAATATAAACACACTCCTACTTCCTCAGCTTTTGATTTAAAGATT
TCCCGGTACACAAACAAATGGCTCCAAGAATCGCTCTTGCACTCTTCCTTTCTCTGAACT
TCCTCTTCTTCACTCACACTTCTGCTCTGGGCACTTGTCCAAGAGATACCCTGCAGATTG
GTCTTTGCGCTAATGCTCTCAATGTAGTTAACATAATATTGGGATACTCACCTGTAAAGC
CATGCTGCTCATTAATTGATGGCTTGGTTGACCTTGAGGCTGCAGCCTGTCTCTGTACCG
CACTCAAGGTTAACATTCTTGGCATCAAGCTTAACCTTCCCATCTATGTCAACGCACTCC
TCAATAATTGTGGCCATATAACTCCGACATTATACCCATGCGTCTAAGTTGTATACTTAT
GACATATATATTAAGAGATGCCTAAACCACAAACAGATCGTATGGTTTCAAATGCTTGAA
CTTATTGTCTTGTTTTCTTGTTTCTTTTAATAAGTAATTGCTTTTGTGTTTGTAATTTTC
TTGGATTTAAAATAAATGATGAACGTCACGTTCTCATGCAACAAGGGATTATGGATTTGT
GTGTGTAATCGGCAAGTTCGTCCCCTTTT*GCTTCACTGTTCCTTCTTATCTTCGTTGTA
ACGTTTCTTTTGAATTTGATTAATAAAACTAT

QA 1 692 1 692
DS 

RD RS1G001TF 707 0 0
G
GGACCCTTCTCAACAAATATAAACACACTACTACTTCCTCAGCTTTTGTTTTAAAGATTT
CCCGGTACACAAACAAATGGCTCCAAGAATTGCTCTTGCACTCTTCCTTTCTCTGAACTT
CCTCTTCTTCACTCACACTTCTGCTCTGGGCACTTGTCCAAGAGATACCCCGCAGATTGG
TCTTTGCGCTAATGCTCTCAATGTAGTTAACATAATATTGGGATACTCACCTGTAAAGCC
ATGCTGCTCATTAATTGATGGCTTGGTTGACCTTGAGGCTGCAGCCTGTCTCTGTACCGC
ACTCAAGGTTAACATTCTTGGCATCAAGCTTAACCTTCCTATCTATGTCAACGCACTCCT
CAATAATTGTGGCCATATAACTCCGACATTATACCCATGCGTCTAAGTTGTATACTTATG
ACATATATATTAAGAGATGCCTAAACCACAAACAGATCGTATGGTTTCAAATGCTTGAAC
TTATTGTCTTGTTCTCATGTTTCTTTTAATCAGTGATTGCTTTTGTGTTTGTAATTTTCT
TGGATTTAAAATAAATGATGAACCTCACGTTCTCATGCAACAAGGGATTATGGGTTTGTG
TGTGTAATCGGCAAGTTCGTCCCTTTTT*GCTTCACTGTTCCTTCTTATCTTCGTTGTAA
CGTTTCTTTGGAATTTGATTAATAAAACTATCAATCGGTGTTGT
CT

QA 2 705 2 705
DS 

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CCCGGTACACAAACAAATGGCTCCAAGAATTGCTCTTGCACTCTTCCTTTCTCTGAACTT
CCTCTTCTTCACTCACACTTCTGCTCTGGGCACTTGTCCAAGAGATACCCTGCAGATTGG
TCTTTGCGCTAATGCTCTCAATGTAGTTAACATAATATTGGGATACTCACCTGTAAAGCC
ATGCTGCTCATTAATTGATGGCTTGGTTGACCTTGAGGCTGCAGCCTGTCTCTGTACCGC
ACTCAAGGTTAACATTCTTGGCATCAAGCTTAACCTTCCCATCTATGTCAACGCACTCCT
CAATAATTGTGGCCATATAACTCCGACATTATACCCATGCGTCTAAGTTGTATACTTATC
ACATATATATTAAGAGATGCCTAAACCACAAACAGATCGTATGATTTCAAATGCTTGAAC
TTATTGTCTTGCTTTCCTATTTCTTTTAATCAGTGATTGCTTTTGTGTTTGTAATTTTCT
TGGATTTAAAATAAATGATGAACGTCACGTTCTCATGCAACAAGGGATTATGGATTTGTG
TGTGTAATCGGCAAGTTCGTCCCCTTTT*GCTTCACTGTTCCTTCTTATCTTCGTTGTAA
CGTGTCTTTTGAATTTGATTAATAAAACTATCAATCGGTGTTGT
T

QA 1 704 1 704
DS 

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GGACCCTTCTCAACAAATATA**CACACTATTACTTCCTGAGCTTTTGTTTTAAAGATTT
CCCGGTACACAAACAAATGGCTCCAAGAATTGCTCTTGCACTCTTCCTTTCTCTGAACTT
CCTCTTCTTCACTCACACTTCTGCTCTGGGCACTTGTCCAAGAGATACCCTGCAGATTGG
TCTTTGCGCTAATGCTCTCAATGTAGTTAACATAATATTGGGATACTCACCTGTAAAGCC
ATGCTGCTCATTAATTGATGGCTTGGTTGACCTTGAGGCTGCAGCCTGTCTCTGTACCGC
ACTCAAGGTTAACATTCTTGGCATCAAGCTTAACCTTCCTATCTATGTCAACGCACTCCT
CAATAATTGTGGCCATATAACTCCGACATTATACCCATGCGTCTAAGTTGTATACTTATG
ACATATATATTAAGAGATGCCTAAACCACAAACAGATCGTATGGTTTCAAATGCTTGAAC
TTATTGTCTTGTTTTCATGTTTCTTTTAATCAGTGATTGCTTTTGTGTTTGTAATTTTCT
TGGATTTAAAATAAATGATGAACCTCACGTTCTCATGCAACAAGGGATTATGGGTTTGTG
TGTGTAATCGGCAAGTTCGTCCCTTTTTTGCTTCACTGTTCCTTCTTATCTTCGTTGTAA
CGTTTCTTTGGAATTTGATTAATAAAACTATCAATCGGT

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DS 

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GGACCCTTCTCAACAAATATA**CACACTATTACTTCCTGAGCTTTTGTTTTAAAGATTT
CCCGGTACACAAACAAATGGCTCCAAGAATTGCTCTTGCACTCTTCCTTTCTCTGAACTT
CCTCTTCTTCACTCACACTTCTGCTCTGGGCACTTGTCCAAGAGATACCCTGCAGATTGG
TCTTTGCGCTAATGCTCTCAATGTAGTTAACATAATATTGGGATACTCACCTGTAAAGCC
ATGCTGCTCATTAATTGATGGCTTGGTTGACCTTGAGGCTGCAGCCTGTCTCTGTACCGC
ACTCAAGGTTAACATTCTTGGCATCAAGCTTAACCTTCCTATCTATGTCAACGCACTCCT
CAATAATTGTGGCCATATAACTCCGACATTATACCCATGCGTCTAAGTTGTATACTTATG
ACATATATATTAAGAGATGCCTAAACCACAAACAGATCGTATGGTTTCAAATGCTTGAAC
TTATTGTCTTGTTTTCATGTTTCTTTTAATTAGTGATTGCTTTTGTGTTTGTAATTTTCT
TGGATTTAAAATAAATGATGAACCTCACGTTCTCATGCAACAAGGGATTATGGGTTTGTG
TGTGTAATCGGCAAGTTCGTCCCTTTTT*GCTTCACTGTTCCTTCTTATCTTCGTTGTAA
CGTTTCTTTGGAATTTGATTAATAAAACTATCAATCG

QA 1 697 1 697
DS 

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GGACCCTTCTCAACAAATATAAACACACTACTACTTCCTCAGCTTTTGTTTTAAAGATTT
CCCGGTACACAAACAAATGGCTCCAAGAATTGCTCTTGCACTCTTCCTTTCTCTGAACTT
CCTCTTCTTCACTCACACTTCTGCTCTGGGCACTTGTCCAAGAGATACCCTGCAGATTGG
TCTTTGCGCTAATGCTCTCAATGTAGTTAACATAATATTGGGATACTCACCTGTAAAGCC
ATGCTGCTCATTAATTGATGGCTTGGTTGACCTTGAGGCTGCAGCCTGTCTCTGTACCGC
ACTCAAGGTTAACATTCTTGGCATCAAGCTTAACCTTCCCATCTATGTCAACGCACTCCT
CAATAATTGTGGCCATATAACTCCGACATTATACCCATGCGTCTAAGTTGTATACTTATC
ACATATATATTAAGAGATGCCTAAACCACAAACAGATCGTATGATTTCAAATGCTTGAAC
TTATTGTCTTGCTTTCCTATTTCTTTTAATCAGTGATTGCTTTTGTGTTTGTAATTTTCT
TGGATTTAAAATAAATGATGAACGTCACGTTCTCATGCAACAAGGGATTATGGATTTGTG
TGTGTAATCGGCAAGTTCGTCCCCTTTT*GCTTCACTGTTCCTTCTTATCTTCGTTGTAA
CGTGTCTTTTGAATTTGATTAATAAA*CTATCAATCGGTGTTGTTAAAA

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1G001JQ 681 0 0
CACTACTACTTCCTCAGCTTTTGTTTTAAAGATTTCCCGGTACACAAACAAATGGCTCCA
AGAATTGCTCTTGCACTCTTCCTTTCTCTGAACTTCCTCTTCTTCACTCACACTTCTGCT
CTGGGCACTTGTCCAAGAGATACCCCGCAGATTGGTCTTTGCGCTAATGCTCTCAATGTA
GTTAACATAATATTGGGATACTCACCTGTAAAGCCATGCTGCTCATTAATTGATGGCTTG
GTTGACCTTGAGGCTGCAGCCTGTCTCTGTACCGCACTCAAGGTTAACATTCTTGGCATC
AAGCTTAACCTTCCTATCTATGTCAACGCACTCCTCAATAATTGTGGCCATATAACTCCG
ACATTATACCCATGCGTCTAAGTTGTATACTTATGACATATATATTAAGAGATGCCTAAA
CCACAAACAGATCGTATGGTTTCAAATGCTTGAACTTATTGTCTTGTTCTCATGTTTCTT
TTAATCAGTGATTGCTTTTGTGTTTGTAATTTTCTTGGATTTAAAATAAATGATGAACCT
CACGTTCTCATGCAACAAGGGATTATGGGTTTGTGTGTGTAATCGGCAAGTTCGTCCCTT
TTT*GCTTCACTGTTCCTTCTTATCTTCGTTGTAACGTTTCTTTGGAATTTGATTAATAA
AACTATCAATCGGTGTTGT
CT

QA 1 679 1 679
DS 



AS 2 9

CO CL373Contig1 1017 7 7 U
GGTTCAACAGCAGTTTCTGTTATAAATTTGTAATTTTTATTTAATAGAAGTGAATTTATC
CAGCAAAAAA*AAAGAAACCTTATGATTGAATTAATTTTACATAAATTGATTTTTTAATA
CTTTTAGTTCTTTTAAATATTACGGACCGACTTGGTAATAAAAGGGTAAAATTCAAGCCT
AAAAGTACAGCTCCTACCTACAACCCTCGCTCCTCGAAAATTATCCACGCAATGGTGAAA
ATGAAAGGTTTTATACCACACACACTCCTTACAAGCTTTTTGCGATAAGTCTCTCGCACA
CTGCACCATTCCGTATACCATCTCACCCTT*GTACCGCTTCTCCCCCACAGAGTACAATG
TAGAATTATCTCCAGTGGTGGCTAATTCCGTCAGATCGTCAACGAGAATATTCCAAACTT
TCATAAATCCGAGGGAGACTCCATTGTCTACCACCTTCTTCGCGTTGGAAATACAAAAGT
TGTTGTCGTAATCGATCTGCCCAATAGAATATTTGGAATCCATCGAGAGAAGACATAGGT
CATACCATATTATTCTCCCCTTGTACCACGGACATCTCCTGCGAAGCGCAGCGAGGGCGG
TGACAAAGCAGTCGTGGCACTTGGGCCCGTAAGAGTCGCCGCGGCACTGGAGGACAGCGG
TAAAAGTAGAATCGCCAAAAAAGTCGTAACCTTTAATACTGTTTTTATCGAACATTTTCA
TGATATTTTTTAAACGTTTCTCGTACTCACTTCCCGTCTTGTATTTTCCCTGACTAACCA
AACATGTGTGGCTGAGATACTCATTGGTCGTGTTTACGGAGAATTCGCTGTTTATAAGGA
GTAGTTGTATGGCAAAGATATAGATCAAAATGAGGTGTTTTGATACAGACGATGAAGAGT
ACATTACTTGAATTATTTTTGTCAAAGGTTCTTTTCTATAGATGGTTAGTTGAGATTGAT
GTTCATCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 5 5 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AI50JQ U 69
AF RS1G429JQ U 21
AF RS1A059JQ U 1
AF RS1A059TR U 39
AF RS1A059TV C 183
AF RS1AI50TF C 202
AF RS1A059TF C 222
BS 1 90 RS1A059JQ
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BS 965 1017 RS1A059TF

RD RS1AI50JQ 566 0 0
AAA
AAAGAAACCTTATGATTGAATTAATTTTACATAAATTGATTTTTTA*TACTTTTAGTTCT
TTTAAATATTACGGACCGACTTGGTAATAAAAGGGTAAAATTCAAGCCTAAAAGTACAGC
TCCTACCTACAACCCTCGCTCCTCGAAAATTATCCACGCAATGGTGAAAATGAAAGGTTT
TATACCACACACACTCCTTACAAGCTTTTTGCGATAAGTCTCTCGCACACTGCACCATTC
CGTATACCATCTCACCCTT*GTACCGCTTCTCCCCCACAGAGTACAATGTAAAATTATCT
CCAGTGGTGGCTAATTCCGTCAGATCGTCAACGAAAATATTCCAAACTTTTATAAATCCG
AGGGGGACTCCATTGTCTACCACCTTCTTCGCGTTGGAAATACAAAAGTTATTGTCGTAA
TCGATCTGCCCAATAAAATATTTGGAATCCATTGAGAGAAGGCACTGGTCATACCATATT
ATTCTCCCCTTGTACCACGGACATCTCCTACGAAGCGCAGCGAGGGCGGTGACAAAGCAG
TCGTGGCACTTGGGCCCGTAAGA

QA 4 566 4 566
DS 

RD RS1G429JQ 641 0 0
GTAATAAATTTAAC
TTTTATTTAATAAAAGTGAGTTTATCCAGCAAAAAAGAAAGAAACCTTATGATTGAATTA
ATTTTACATAAATTGATTTTTTA*TACTTTTAGTTCTTTTAAATATTACGGACCGACTTG
GTAATAAAAGGGTAAAATTCAAGCCTAAAAGTACAGCTCCTACCTACAACCCTCGCTCCT
CGAAAATTATCCACGCAATGGTGAAAATGAAAGGTTTTATACCACACACACTCCTTACAA
GCTTTTTGCGATAAGTCTCTCGCACACTGCACCATTCCGTATACCATCTCACCCTT*GTA
CCGCTTCTCCCCCACAGAGTACAATGTAGAATTATCTCCAGTGGTGGCTAATTCCGTCAG
ATCGTCAACGAGAATATTCCAAACTTTTATAAATCCGAGGGAGACTCCATTGTCTACCAC
CTTCTTCGCGTTGGAAATACAAAAGTTATTGTCGTAATCGATCTGCCCAATAGAATATTT
GGAATCCATCGAGAGAAGGCACTGGTCATACCATATTATTCTCCCCTTGTACCACGGACA
TCTCCTACGAAGCGCAGCGAGGGCGGTGACAAAGCAGTCGTGGCACTTGGGCCCGTAAGA
GTCGCCGCGGCACTGGAGGACAGCGGT

QA 15 641 15 641
DS 

RD RS1A059JQ 787 0 0
GGTTCAACAGCAGTTTCTGTTATAAATTTGTAATTTTTATTTAATAGAAGTGAATTTATC
CAGCAAAAAA*AAAGAAACCTTATGATTGACTTAATTTTACATAAATTGATTTTTTAATA
CTTTTAGTTCTTTTAAATATTACGGACCGACTTGGTAATAAAAGGGTAAAATTCAAGCCT
AAAAGTACAGCTCCTACCTACAACCCTCGCTCCTCGAAAATTATCCACGCAATGGTGAAA
ATGAAAGGTTTTATACCACACACACTCCTTACAAGCTTTTTGCGATAAGTCTCTCGCACA
CTGCACCATTCCGTATACCATCTCACCCTT*GTACCGCTTCTCCCCCACAGAGTACAATG
TAGAATTATCTCCAGTGGTGGCTAATTCCGTCAGATCGTCAACGAGAATATTCCAAACTT
TCATAAATCCGAGGGAGACTCCATTGTCTACCACCTTCTTCGCGTTGGAAATACAAAAGT
TGTTGTCGTAATCGATCTGCCCAATAGAATATTTGGAATCCATCGAGAGAAGACATAGGT
CATACCATATTATTCTCCCCTTGTACCACGGACATCTCCTGCGAAGCGCAGCGAGGGCGG
TGACAAAGCAGTCGTGGCACTTGGGCCCGTAAGAGTCGCCGCGGCACTGGAGGACAGCGG
TAAAAGTAGAATCGCCAAAAAAGTCGTAACCTTTAATACTGTTTTTATCGAACATTTTCA
TGATATTTTTTAAACGTTTCTCGTACTCACTTCCCGTCTTGTATTTTCCCTGACTAACCA
AACATGT

QA 1 787 1 787
DS 

RD RS1A059TR 776 0 0
ATTTAATAGAAGTGAATTTATCCAGCAAAAAA*AAAGAAACCTTATGATTGACTTAATTT
TACATAAATTGATTTTTTAATACTTTTAGTTCTTTTAAATATTACGGACCGACTTGGTAA
TAAAAGGGTAAAATTCAAGCCTAAAAGTACAGCTCCTACCTACAACCCTCGCTCCTCGAA
AATTATCCACGCAATGGTGAAAATGAAAGGTTTTATACCACACACACTCCTTACAAGCTT
TTTGCGATAAGTCTCTCGCACACTGCACCATTCCGTATACCATCTCACCCTT*GTACCGC
TTCTCCCCCACAGAGTACAATGTAGAATTATCTCCAGTGGTGGCTAATTCCGTCAGATCG
TCAACGAGAATATTCCAAACTTTCATAAATCCGAGGGAGACTCCATTGTCTACCACCTTC
TTCGCGTTGGAAATACAAAAGTTGTTGTCGTAATCGATCTGCCCAATAGAATATTTGGAA
TCCATCGAGAGAAGACATAGGTCATACCATATTATTCTCCCCTTGTACCACGGACATCTC
CTGCGAAGCGCAGCGAGGGCGGTGACAAAGCAGTCGTGGCACTTGGGCCCGTAAGAGTCG
CCGCGGCACTGGAGGACAGCGGTAAAAGTAGAATCGCCAAAAAAGTCGTAACCTTTAATA
CTGTTTTTATCGAACATTTTCATGATATTTTTTAAACGTTTCTCGTACTCACTTCCCGTC
TTGTATTTTCCCTGACTAACCAAACATGTGTGGCTGAGATACTCATTGGTCGTGTT

QA 1 776 1 776
DS 

RD RS1A059TV 780 0 0
AAGTACAGCTCCTAC*TACAACCCTCGCTCCTCGAAAATTATCCACGCAATGGTGAAAAT
GAAAGGTTTTATACCACACACACTCTTTACAAGCTTTTTGCGATAAGTCTCTCGCACACT
GCACCATTCCGTATACCATCTCACCCTT*GTACCGCTTCTCCCCCACAGAGTACAATGTA
GAATTATCTCCAGTGGTGGCTAATTCCGTCAGATCGTCAACGAGAATATTCCAAACTTTC
ATAAATCCGAGGGAGACTCCATTGTCTACCACCTTCTTCGCGTTGGAAATACAAAAGTTG
TTGTCGTAATCGATCTGCCCAATAGAATATTTGGAATCCATCGAGAGAAGACATAGGTCA
TACCATATTATTCTCCCCTTGTACCACGGACATCTCCTGCGAAGCGCAGCGAGGGCGGTG
ACAAAGCAGTCGTGGCACTTGGGCCCGTAAGAGTCGCCGCGGCACTGGAGGACAGCGGTA
AAAGTAGAATCGCCAAAAAAGTCGTAACCTTTAATACTGTTTTTATCGAACATTTTCATG
ATATTTTTTAAACGTTTCTCGTACTCACTTCCCGTCTTGTATTTTCCCTGACTAACCAAA
CATGTGTGGCTGAGATACTCATTGGTCGTGTTTACGGAGAATTCGCTGTTTATAAGGAGT
AGTTGTATGGCAAAGATATAGATCAAAATGAGGTGTTTTGATACAGACGATGAAGAGTAC
ATTACTTGAATTATTTTTGTCAAAGGTTCTTTTCTATAGATGGTTAGTTGAGATTGATGT

QA 1 780 1 780
DS 

RD RS1AI50TF 767 0 0
AACCCTCGCTCCTCGAAAATTATCCACGCAATGGTGAAAATGAAAGGTTTTATACCACAC
ACACTCCTTACAAGCTTTT*GCGATAAGTCTCTCGCACACTGCACCATTCCGTATACCAT
CTCACCCTT*GTACCGCTTCTCCCCCACAGAGTACAATGTAGAATTATCTCCAGTGGTGG
CTAATTCCGTCAGATCGTCAACGAGAATATTCCAAACTTTTATAAATCCGAGGGGGACTC
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DS 

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CGGCACTGGAGGACAGCGGTAAAAGTAGAATCGCCAAAAAAGTCGTAACCTTTAATACTG
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TCCGGTACCGTCGACT

QA 1 796 1 796
DS 



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TAATGTACTCTTCATCGTCTGTATCAAAACACCTCATTTTGATCTATATCTTTGCCATAC
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CTTTTACCGCTGTCCTCCAGTGCCGCGGCGACTCTTACGGGCCCAAGTGCCACGACTGCT
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TGTATAAAGGATAAAGCTGCGCACGTACAGCTTTTGATTACGTTTTAGCATATGACAAAA
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AAAAAATACATTTTTTACTTTTTCAATGTATTATTTAATGAAAATCTGTTAACTTCAAGA
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GGTATAAAACCTTTCATTTTCACCATTGCGTGGATAATTTTCGAGGAGCGAGGGTTGTAG
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BQ
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AF RS1BW04JQ C 569
BS 1 642 RS1BW04TF
BS 643 1281 RS1BW04JQ

RD RS1BW04TF 642 0 0
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AAAAAATACATTTTTTACTTTTTCAATGTATTATTTAATGAA

QA 1 642 1 642
DS 

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TCTCTCGATGGATTCCAAATATTCTATTGGGCAGATCGATTACGACAACAACTTTTGTAT
TTCCAACGCGAAGAAGGTGGTAGACAATGGAGTCTCCCTCGGATTTATGAAAGTTTGGAA
TATTCTCGTTGACGATCTGACGGAATTAGCCACCACTGGAGATAATTCTACATTGTACTC
TGTGGGGGAGAAGCGGTACAAGGGTGAGATGGTATACGGAATGGTGCAGTGTGCGAGAGA
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CGTGGATAATTTTCGAGGAGCGAGGGTTGTAGGTAGGAGCTGTACTTTTAGGCTTGAATT
TTACCCTTTTATTACCAAGTCGGTCCGTAATATTTAAAAGAACTAAAAGTATT

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 9

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AGGTCGATTGTGATGAACATAAGACTGTCTGCACTAAGTATGATGTTAGTGGATATCCCA
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TTCCACAAAATGTAGTTGTGTTAACACCTGATAACTTCGATGCGATTGTGCTGGATCAGA
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CTACATACGAAAAGGTAGCAACGGTGTTTAAGCAGGAAGAAGGTGTAGTCATTGCCAACT
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TTGAAATTCTTCCCAAAGGACAACAAAGCCGGTCAAGATTATAACGGTGGAAGAGACTTA
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TAAAAAAAGAACTTGTTTTTGCTTG


BQ
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30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 0 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 20 5 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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CTACATACGAAAAGGTAGCAACGGTGTTTAA

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G
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GATGTTAGTGGATATCCCACCATTAAATGGTTTCCTAAAGGCTCTCTTGAACCTCAAAAG
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DS 

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GGG
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TCTTGAACCTCAAAAGTACGAGGGTGCACGCAATGCCGAAGCTTTGGCTGAATTTGTCAA
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ACCTGATAACTTCGATGCGATTGTGCTGGATCAGAACAAAGATGTCTTGGTCGAGTTTTA
TGCCCCATGGTGCGGCCACTGCAAGTCCCTCGCTCCTACATACGAAAAGGTAGCAACGGT
GTTTAAGCAGGAAGAAGGTGTAGTCATTGCCAACTTGGATGCTGATGCACACAAAAGCCT
TGGCGAGAAGTATGG*AGTAAGTGGATTCCCAACATTGAAATTCTTCCCAAAGGACAACA
AAGCCG*TCA*GAT*ATAACGGTGGA*GAGACTTAGATGACTTTGTA**GTTCATCAATG
AGAAAGT*GGTAC*AGCAGAGACAGTAAAGG
CAGCTACTTC

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GA
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TTATGCTCCCTGGTGTGGGCACTGCAAGAAACTAGCTCCAGAGTGTGAAAAGCTTGCTGC
CAGCTTCAAGAAGGCCAAGTCTGTCTTGATTGCTAAGGTCGATTGTGGTGAACATAAGAC
TGTCTGCACTAAGTATGATGTTAGTGGATATCCCACCATTAAATGGTTTCCTAAAGGCTC
TCTTGAACCTCAAAAGTACGAGGGTGCACGCAATGCTGAAGCTTTGGCTGAATTTGTCAA
CAAGGAAGGAGGTACCAACGTCAAATTAGCTGCAGTTCCACAAAATGTAGTTGTGTTAAC
ACCTGATAACTTCGATGCGATTGTGCTGGATCAGAACAAAGATGTCTTGGTCGAGTTTTA
TGCCCCATGGTGCGGCCACTGCAAGTCCCTCGCTCCTACATACGAAAAGGTAGCAACGGT
GTTTAAGCAGGAAGAAGGTGTAGTCATTGCCAACTTGGATGCTGATGCACACAAAAGCCT
TGGCGAGAAGTATGGGAGTAAGTGGATTCCCAACATTGAAATTCTTCCCAAAGGACAACA
AAGCCGGTCAAGATTATAACGGTGGAAGAGACTTAGATGACTTTGTAAGTTTCATCAATG
AGAAAGTTGGTACCAGCAGAGACAGTAAAGGGCAGCTTACTTCAAAGGCTGGTATAGTTG
AAA

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AACTTCGATGCGATTGTGCTGGATCAGAACAAAGATGTCTTGGTCGAGTTTTATGCCCCA
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CAGGAAGAAGGTGTAGTCATTGCCAACTTGGATGCTGATGCACACAAAAGCCTTGGCGAG
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TTAAGCAGGAAGAAGGTGTAGTCATTGCCAACTTGGATGCTGATGCACACAAAAGCCTTG
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AAAGTTGGTACCAGCAGAGACAGTAAAGGGCAGCTTACTTCAAAGGCTGGTATAGTTGAA
AGCTTAGGTGCGTTGGTAAAGGAGCTAGTTGCAGCGAGTGAAGATGAGAAGAAGGCAATC
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CTTTACGCGTCACTCGCAAAGAAGTACATAGAAAAAGGTTCAGGCTATGCTACCAAAGAA
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ACCAAAGTTTCTTTGACTTTCGTACGATAATC
GT

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DS 

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AGGAAGAAGGTGTAGTCATTGCCAACTTGGATGCTGATGCACACAAAAGCCTTGGCGAGA
AGTATGG*AGTAAGTGGATTCCCAACATTGAAATTCTTCCCAAAGGACAACAAAGCCGGT
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AGGAGTCGTCGATAGACTTTATATATAACTGGTATGAACCTGGTGTTTTGGAGGTTTTAT
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GTTTCTTTGTCTTTCCTACGATAATCATAAAA
GAAAAAAA

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DS 

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TCAAGATTATAACGGTGGAAGAGACTTAGATGACTTTGTAAGTTTCATCAATGAGAAAGT
TGGTACCAGCAGAGACAGTAAAGGGCAGCTTACTTCAAAGGCTGGTATAGTTGAAAGCTT
AGGTGCGTTGGTAAAGGAGCTAGTTGCAGCGAGTGAAGATGAGAAGAAGGCAATCTTGTC
TCGCATCGAAGAGGAAGCTAGTAACCTTAAGGGCTCCACAGCAAGGTATGGAAAGCTTTA
CGCGTCACTCGCAAAGAAGTACATAGAAAAAGGTTCAGGCTATGCTACCAAAGAAGCTGA
GCGGCTTGGACGCGTCCTTATCAAGTCGATAAGTCCGGTGAAAGCTGACGAATTCACTCT
CAAGAGAAATATTTTAAACACGTTCGTTGCTTCTTCTTAGAAGCCAAAAGATTTGAAGAA
TAGGAGTCGTCGATAGACTTTATATATAACTGGTATGAACCTGGTGTTTTGGAGGTTTTA
TGTTTGCCTGTCTGAGATTTGTGGTTGTTTCTGGTTAGTTTTGAAACTCTCTTGAACCAA
AGTTTCTTTGACTTTCGTACGATAATCATAAAAAAAGAACTTGTTTTTGCTTG

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DS 



AS 1 10

CO CL375Contig1 643 10 33 U
CTAGAAACCCGATTTATAAATAATTGTTCTTGTTCAAGACTAGATTTGCACCAACACAAA
CATGAAATAAAAAACATTACACAACTTCAAAAACAGATACGGCTAAAACTCACGCAAACA
CACTTTAGTAGTCAAAGCCTTTTCCATTAAATGGAGAAAGACCCATCATTCATAACTTCA
CCAACACATCCTTAGATGAGGAGCTTCTCAATAGCATCCTTTAGCTGCTGAATCTGAGAT
TTCAACTGGCTAGCATCGTTTGATGTAACAGAGCAAGCAATCACGGGTCTTGTCACACCA
CATGCTCTTCCAAGGGCTTGCTTCGATGGCACAAACACATACGGCACATTCTTGTCTTCA
GCTAGTAAAGGAAGATGAAGAAGGATCTCGAGAGGCTCAGCATCAGCAGCCATAACCACG
AACTCAGAGATACCACGGTTCAAAGTCTTGGTAGCTTCATTAGCTCCTTTCTTGAGCTGT
TTGTAGTTGGTAGCTTGTTGAACAAGATCGAGGATTGTTATGGCTAGCTGAGAATCGGCC
AACGGGTACGCCTTTGGGTTCACTCCTTCAACCGTCATCTTTCGCCGCAGAGTTCTAAGA
GAAGAGGTGAGAGGAGGAAGTAGCTAGGGTTTTAGTTTTGTTC


BQ
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60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 30 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 35 60 60 60 45 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 60 
60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 25 60 35 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 
60 10 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 60 55 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 20 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 20 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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AF RS1DO22TF C 3
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AF RS1G702TF C 3
AF RS1GT44TF C 3
AF RS1CY01TF C 31
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AA
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CTCTTCCAAGGGCTTGCTTCGATGGCACAAACACATACGGCACATTCTTGTCTT

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ATTCATAACTTCACCAACACATCCTTAGATGAGGAGCTTCTCAATAGCATCCTTTAGCTG
CTGAATCTGAGATTTCAACTGGCTAGCATCGTTTGATGTAACAGAGCAAGCAATCACGGG
TCTTGTCACACCACATGCTCTTCCAAGGGCTTGCTTCGATGGCACAAACACATACGGCAC
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DS 

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CACTTTAGTAGTCAAAGCCTTTTCCATTAAATGGAGAAAGACCCATCATTCATAACTTCA
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TTCAACTGGCTAGCATCGTTTGATGTAACAGAGCAAGCAATCACGGGTCTTGTCACACCA
CATGCTCTTCCAAGGGCTTGCTTCGATGGCACAAACACATACGGCACATTCTTGTCTTCA
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AACTCAGAGATACCACGGTTCAAAGTCTTGGTAGCTTT*TTAGCTCCTTTCTTGAGCTGT
TTGTAGTTGGTAGCTTGTTGAACAAGATCGAGGATTGTTATGGCTAGCTGAGAATCGGCC
C

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DS 

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TTAGTAGTCAAAGCCTTTTCCATTAAATGGAGAAAGACCCATCATTCATAACTTCACCAA
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CTCTTCCAAGGGCTTGCTTCGATGGCACAAACACATACGGCACATTCTTGTCTTCAGCTA
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CAAAAATACCACGGTTCAAAGTCTTGGTAGCTTT*TTAGCTCCTTTCTTGAGCTGTTTGT
AGTTGGTAGCTTGTTGAACAAGATCGAGGATTGTTATGGCTAGCT

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DS 

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AA
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TTAGTAGTCAAAGCCTTTTCCATTAAATGGAAAAAAACCCATCATTCATAACTTCACCAA
CACATCCTTAAATGAGGAGCTTCTCAATAGCATCCTTTAGCTGCTGAATCTGAAATTTCA
ACTGGCTAGCATCGTTTGATGTAACAAAACAAGCAATCACGGGTCTTGTCACACCACGTG
CTCTTCCAAGGGCTTGCTTCGATGGCACAAACACATACGGCACATTCTTGTCTTCAGCTA
GTAAAGGAAAATGAAAAAGGATCTCGAGAGGCTCAGCATCAGCAGCCATAACCACGAACT
CAAAAATACCACGGTTCAAAGTCTTGGTAGCTTCATTAGCTCCTTTCTTGAGCTGTTTGT
AGTTGGTAGCTTGTTGAA

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A
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CAACTGGCTAGCATCGTTTGATGTAACAGAGCAAGCAATCACGGGTCTTGTCACACCACG
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CC

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DS 

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AACACATCCTTAGATGAGGAGCTTCTCAATAGCATCCTTTAGCTGCTGAATCTGAGATTT
CAACTGGCTAGCATCGTTTGATGTAACAGAGCAAGCAATCACGGGTCTTGTCACACCACG
TGCTCTTCCAAGGGCTTGCTTCGATGGCACAAACACATACGGCACATTCTTGTCTTCAGC
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CTCAGAGATACCACGGTTCAAAGTCTTGGTAGCTTCATTAGCTCCTTTCTTGAGCTGTTT
GTAGTTGGTAGCTTGTTGAACAAGATCGAGGATTGTTATGGCTAGCTGAGAATCGGCCAA
CGGGTACGCCTTTGGGTTCACTCCTTCAACCGTCATCTTTCGCCGCAGAGTTCTAAGAGA
AGAGGT
CC

QA 1 606 1 606
DS 

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AGGATTGTTATGGCTAGCTGAGAATCGGCCAACGGGTACGCCTTTGGGTTCACTCCTTCA
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TTTAGTTTTGTTC

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 7

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TAAAACCAAAGTTGCCAATTTTGTACATACATAATAACAATCATTTTGTCATTGCTATTT
TGTTTTGTGTGGCTAAATTCAAGCTGCACTTCGGAAGGAGCCGAGGGACTTGGAACCAGA
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TTTGGGATCTGTAGCGGAGAAAACAGTGTAGACCAGGACGAATGTTCCGATGATCTCTGC
AGCAAGTCCAGTCCCTGTGCTGTATCCGTCAGCTAGAGAGTTTGCTCCTCCACCGTAACG
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CTGAGCCACCATGTATAGCACTGCTCTAACCAACGATACCTTCCTTGCCGAGAACAAGCC
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GAATATCATGCCACCGAAAGCCCC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FW79JQ U 98
AF RS1FW79TF C 98
AF RS1CH38JQ U 1
AF RS1CH38TF C 1
AF RS1GG55JQ U 98
AF RS1BJ03JQ U 1
AF RS1BJ03TF C 69
BS 1 24 RS1BJ03JQ
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RD RS1FW79JQ 443 0 0
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QA 1 443 1 443
DS 

RD RS1FW79TF 443 0 0
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CAATCATTTTGTCATTGCTATTTTGTTTTGTGTGGCTAAATTCAAGCTGCACTTCGGAAG
GAGCCGAGGGACTTGGAACCAGAGGCCCTTAGGACGAATTGGTGATAAAATGCAGCTATC
GCAGCTCCGATGAATGGTCCCACCCAGAAAATCCAGTGGTCATCCCACGGCTTGGACTCG
TTGTAGATAACCGCGGCTCCAAAACTCCTGGCCGGGTTAATCCCGGTTCCGGTGATTGGA
ATAGTGGCCAAGTGAACCATGAACACGGCAAATCCAATTGGAAGTGGCGCCAACACGGGG
ACGTGGGAGTCTCGTGCGTTTCTTTTGGGATCTGTAGCGGAGAAAACAGTGTAGACCAGG
ACGAATGTTCCGATGATCTCTGC

QA 1 443 1 443
DS 

RD RS1CH38JQ 556 0 0
GCGAAGGCAAAAACAATTTGATTTAATTGATTGTTTTCCCCGAGTACACAAACATTCACA
TATCCCACAATGAAGTCAGAAATTAGGAAAGACAAAAGGAATAAAACAGAGCATATATTT
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TGTTTTGTGTGGCTAAATTCAAGCTGCACTTCGGAAGGAGCCGAGGGACTTGGAACCAGA
GGCCCTTAGGACGAATTGGTGATAAAATGCAGCTATCGCAGCTCCGATGAATGGTCCCAC
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ACTCCTGGCCGGGTTAATCCCGGTTACGGTGATTGGAATAGTGGCCAAGCGAACCATGAA
CACGGCAAATCCAATTGGAAGTGGCGCCAACACGGGGACGTGGGAGTCTCGTGCGTTTCT
TTTGGGATCTGTAGCGGAGAAAACAGTGTAGACCAGGACGAATGTTCCGATGATCTCTGC
AGCAAGTCCAGTCCC
C

QA 1 555 1 555
DS 

RD RS1CH38TF 556 0 0
GCGAAGGCAAAAACAATTTGATTTAATTGATTGTTTTCCCCGAGTACACAAACATTCACA
TATCCCACAATGAAGTCAGAAATTAGGAAAGACAAAAGGAATAAAACAGAGCATATATTT
TAAAACCAAAGTTGCAAATTTTGTACATACATAATAACAATCATTTTGTCATTGCTATTT
TGTTTTGTGTGGCTAAATTCAAGCTGCACTTCGGAAGGAGCCGAGGGACTTGGAACCAGA
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CCAGAAAATCCAGTGGTCATCCCACGGCTTGGACTCGTTGTAGATAACCGCGGCTCCAAA
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CACGGCAAATCCAATTGGAAGTGGCGCCAACACGGGGACGTGGGAGTCTCGTGCGTTTCT
TTTGGGATCTGTAGCGGAGAAAACAGTGTAGACCAGGACGAATGTTCCGATGATCTCTGC
AGCAAGTCCAGTCCC
C

QA 1 555 1 555
DS 

RD RS1GG55JQ 613 0 0
GGAATAAAACAGAGCATATATTTTAAAACCAAAGTTGCCAATTTTGTACATACATAATAA
CAATCATTTTGTCATTGCTATTTTGTTTTGTGTGGCTAAATTCAAGTTGCACTTCGGAAG
GAGCCGAGGGACTTGGAACCAGAGGCCCTTAGGACGAATTGGTGATAAAATGCAGCTATC
GCAGCTCCGATGAATGGTCCCACCCAGAAAATCCAGTGGTCATCCCACGGCTTGGACTCG
TTGTAGATAACCGCGACTCCAAAACTCCTGGCCGGGTTAATCCCGGTTCCGGTGATTGGA
ATAGTGGCCAAGTGAACCATGAACACGGCAAATCCAATTGGAAGTGGCGCCAACACGGGG
ACGTGGGAGTCTCGTGCGTTTCTTTTGGGATCTGTAGCGGAGAAAACAGTGTAGACCAGG
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GAGTTTGCTCCTCCACCGTAACGTACGTAGTAAGAGCTTTGGAAGGCTTTGACGAAACCA
ACTCCACAAATAGCACCCAAACACTGAGCCACCATGTATAGCACTGCTCTAACCAACGAT
ACCTTCCTTGCCA

QA 1 613 1 613
DS 

RD RS1BJ03JQ 730 0 0
GCGAAGGCAAAAACAATTTGATTTCATTGATTGTTTTCCCCGAGTACACAAACATTCACA
TATCCCACAATGAAGCCAGAAATTAGGAAAGACAAAAGGAATAAAACAGAGCATATATTT
TAAAACCAAAGTTGCCAATTTTGTACATACATAATAACAATCATTTTGTCATTGCTATTT
TGTTTTGTGTGGCTAAATTCAAGCTGCACTTCGGAAGGAGCCGAGGGACTTGGAACCAGA
GGCCCTTAGGACGAATTGGGGATAAAATGCAGCTATCGCAGCTCCGATGAATGGTCCCAC
CCAGAAAATCCAGTGGTCATCCCACGGCTTGGACTCGTTGTAGATAACCGCGGCTCCAAA
ACTCCTGGCCGGGTTAATCCCGGTTCCGGTGATTGGAATAGTGGCCAAGTGAACCATGAA
CACGGCAAATCCAATTGGAAGTGGCGCCAACACGGGGACGTGGGAGTCTCGTGCGTTTCT
TTTGGGATCTGTAGCGGAAAAAACAGTGTAGACCAGGACGAATGTTCCGATGATCTCTGC
AGCAAGTCCAGTCCCTGTGCTGTATCCGTCAGCTAGAGAGTTTGCTCCTCCACCGTAACG
TACGTAGTAAGAGCTTTGGAAGGCTTTGACGAAACCAACTCCACAAATAGCACCCAAACA
CTGAGCCACCATGTATAGCACTGCTCTAACCAACGATACCTTCCTTGCCGAGAACAAGCC
GAACGTCACG

QA 1 730 1 730
DS 

RD RS1BJ03TF 736 0 0
AATGAAGCCAGAAATTAGGAAAGACAAAAGGAATAAA*CAGAGCATATATTTTAAAACCA
AAGTTGCCAATTTTGTACATACATAATAACAATCATTTTGTCATTGCTATTTTGTTTTGT
GTGGCTAAATTCAAGCTGCACTTCGGAAGGAGCCGAGGGACTTGGAACCAGAGGCCCTTA
GGACGAATTGGGGATAAAATGCAGCTATCGCAGCTCCGATGAATGGTCCCACCCAGAAAA
TCCAGTGGTCATCCCACGGCTTGGACTCGTTGTAGATAACCGCGGCTCCAAAACTCCTGG
CCGGGTTAATCCCGGTTCCGGTGATTGGAATAGTGGCCAAGTGAACCATGAACACGGCAA
ATCCAATTGGAAGTGGCGCCAACACGGGGACGTGGGAGTCTCGTGCGTTTCTTTTGGGAT
CTGTAGCGGAGAAAACAGTGTAGACCAGGACGAATGTTCCGATGATCTCTGCAGCAAGTC
CAGTCCCTGTGCTGTATCCGTCAGCTAGAGAGTTTGCTCCTCCACCGTAACGTACGTAGT
AAGAGCTTTGGAAGGCTTTGACGAAACCAACTCCACAAATAGCACCCAAACACTGAGCCA
CCATGTATAGCACTGCTCTAACCAACGATACCTTCCTTGCCGAGAACAAGCCGAACGTCA
CGGCAGGGTTTATGCGACCACCTGAGATACCGGCGGTGCAGTAGACAAGGATGAATATCA
TGCCACCGAAAGCCCC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 8

CO CL377Contig1 1086 8 15 U
GGATTCCGATCCTACGACCAACCAGCAGCCGAAGACGACCGCCGGTTTGCTCCGAGTTTG
ATGGAAGCATTAACTACTTCCAGAGTTGTGCCACTTCAGGTTACCTGTAGAAAGCTCTCA
TCATCACTTTCTGCTGATTTCTCTTGCCTTGAGTTTAAAAGGTATCCTTGTACAAGTGGG
CGTGTCTCCATCATGAACCATCCCAATTTGCTCCTCCGTCCAGTGTCTGCTTCTTTGCAG
CCACAGGAGTTGTCGGCTTTGGGGCACGAAGGAAACGTTGCTCCTTCTAAAGAAATACTC
GAACTTTGGAGAGATGTTGAAGCTGTGTGCTTCGATGTGGATAGCACGGTTTGTGTGGAT
GAAGGTATTGATGAACTTGCTGAGTTTTGTGGAGCTGGAAAGGCTGTTGCTGAATGGACT
GCCAGAGCAATGGGTGGATCTGTTCCATTTGAAGAAGCTCTAGCCGCAAGACTCTCTTTG
TTCAAGCCTTCTCTTTCCAAAGTTGAGGAATATCTCGCAAAGAGACCCCCGAGACTGTCC
CCTGGCATTGAAGAGTTAGTCAAGAAGCTCAGAGCCAATAAAATTGATGTCTATTTGATA
TCTGGAGGTTTTCGACAAATGATCAATCCTGTAGCGTCGATTCTTGGCATTCCTCGAGAG
AATATCTTCGCCAACAATATTCTATTTGGAAATTCTGGCGAGTTTGCGGGCTTTGATGAG
AACGAACCTACATCAAGAAGTGGAGGCAAAGCCAAAGCAGTGCAACAGATACGAAAGGGT
CGTCTTTACAAGACTATGGCCATGATTGG*AGATGGTGCTACTGATCTCGAAGCACGTAA
ACCTGGTGGCGCAGATTTGTTCATATGCTACGCTGGAGTTCAGCTTCGTGAAGCTGTTGC
AGCGCAAGCAGACTGGCTTATTTTCAGTTTTGAACCTCTCATAAAGTCGTTGAACTAAGT
GGAATCTATATAATGATTAGTTTCATTGAGCTAAACTCATTATTGATGATATCTCAACAT
TTGTACTTCTTTTTTCCTTCAAATGTGTGAAACTCCATTGAATGAATAAATGTTTTTGCC
AATTTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 

AF RS1E782TF U 184
AF RS1BB20TF U 1
AF RS1DC21TF U 1
AF RS1AL03TF U 124
AF RS1EU20TF U 322
AF RS1DC21JQ C 334
AF RS1AL03JQ C 290
AF RS1BB20JQ C 662
BS 1 691 RS1BB20TF
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BS 693 764 RS1BB20TF
BS 765 765 RS1AL03TF
BS 766 796 RS1DC21TF
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BS 1036 1082 RS1AL03JQ
BS 1083 1086 RS1BB20JQ

RD RS1E782TF 261 0 0
GG
CTCCATCATGAACCATCCCAATTTGCTCCTCCGTCCAGTGTCTGCTTCTTTGCAGCCACA
GGAGTTGTCGGCTTTGGGGCACGAAGGAAACGTTGCTCCTTCTAAAGAAATACTCGAACT
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TATTGATGAACTTGCTGAGTTTTGTGGAGTTGGAAAGGCTGTTGCTGAATGGACTGCCAG
AGCAATGGGTGGATCTGT
C

QA 3 260 3 260
DS 

RD RS1BB20TF 769 0 0
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TCATCACTTTCTGCTGATTTCTCTTGCCTTGAGTTTAAAAGGTATCCTTGTACAAGTGGG
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CCACAGGAGTTGTCGGCTTTGGGGCACGAAGGAAACGTTGCTCCTTCTAAAGAAATACTC
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GAAGGTATTGATGAACTTGCTGAGTTTTGTGGAGCTGGAAAGGCTGTTGCTGAATGGACT
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AACGAACCTACATCAAGAAGTGGAGGCAAAGCCAAAGCAGTGCA
CAGAT

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1DC21TF 796 0 0
GGATTCCGATCCTACGACCAACCAGCAGCCGAAGACGACCGCCGGTTTGCTCCGAGTTTG
ATGGAAGCATTAACTACTTCCAGAGTTGTGCCACTTCAGGTTACCTGTAGAAAGCTCTCA
TCATCACTTTCTGCTGATTTCTCTTGCCTTGAGTTTAAAAGGTATCCTTGTACAAGTGGG
CGTGTCTCCATCATGAACCATCCCAATCTGCTCCTCCGTCCAGTGTCTGCTTCTTTGCAG
CCACAGGAGTTGTCGGCTTTGGGGCACGAAGGAAACGTTGCTCCTTCTAAAGAAATACTC
GAACTTTGGAGAGATGTTGAAGCTGTGTGCTTCGATGTGGATAGCACGGTTTGTGTGGAT
GAAGGTATTGATGAACTTGCTGAGTTTTGTGGAGCTGGAAAGGCTGTTGCTGAATGGACT
GCCAGAGCAATGGGTGGATCTGTTCCATTTGAAGAAGCTCTAGCCGCAAGACTCTCTTTG
TTCAAGCCTTCTCTTTCCAAAGTTGAGGAATATCTCGCAAAGAGACCCCCGAGACTGTCC
CCTGGCATTGAAGAGTTAGTCAAGAAGCTCAGAGCCAATAAAATTGATGTCTATTTGATA
TCTGGAGGTTTTCGACAAATGATCAATCCTGTAGCGTCGATTCTTGGCATTCCTCGAGAG
AATATCTTCGCCAACAATATTCTATTTGGAA*TTCTGGCGAGTTTGCGGGCTTTGATGAG
AACGAACCTACATCAAGAAGTGGAGGCAAAGCCAAAGCAGTGCA*CAGATACGAAAGGGT
CGTCTTTACAAGACTA

QA 1 796 1 796
DS 

RD RS1AL03TF 830 0 0
G
CACTTTCTGCTGATCTCTCTTGCCTTGAGTTTAAAAGGTATCCTTGTACAAGTGGGCGTG
TCTCCATCATGAACCATCCCAATTTGCTCCTCCGTCCAGTGTCTGCTTCTTTGCAGCCAC
AGGAGTTGTCGGCTTTGGGGCACGAAGGAAACGTTGCTCCTTCTAAAGAAATACTCGAAC
TTTGGAGAGATGTTGAAGCTGTGTGCTTCGATGTGGATAGCACGGTTTGTGTGGATGAAG
GTATTGATGAACTTGCTGAGTTTTGTGGAGCTGGAAAGGCTGTTGCTGAATGGACTGCCA
GAGCAATGGGTGGATCTGTTCCATTTGAAGAAGCTCTAGCCGCAAGACTCTCTTTGTTCA
AGCCTTCTCTTTCCAAAGTTGAGGAATATCTCGCAAAGAGACCCCCGAGACTGTCCCCTG
GCATTGAAGAGTTAGTCAAGAAGCTCAGAGCCAATAAAATTGATGTCTATTTGATATCTG
GAGGTTTTCGACAAATGATCAATCCTGTAGCGTCGATTCTTGGCATTCCTCGAGAGAATA
TCTTCGCCAACAATATTCTATTTGGAAATTCTGGCGAGTTTGCGGGCTTTGATGAGAACG
AACCTACATCAAGAAGTGGAGGCAAAGCCAAAGCAGTGCAACAGATACGAAAGGGTCGTC
TTTACAAGACTATGGCCATGATTGGGAGATGGTGCTACTGATCTCGAAGCACGTAAACCT
GGTGGCGCAGATTTGTTCATATGCTACGCTGGAGTTCAGCTCCGTGAAGCTGTTGCAGCG
CAAGCAGACTGGCTTATTTTCAGTTTTGAAC*TCTCATAAAGTCGTTGA

QA 2 830 2 830
DS 

RD RS1EU20TF 714 0 0
GCTGTGTGCTTCGATGTGGATAGCACGGTTTGTGTGGATGAAGGTATTGATGAACTTGCT
GAGTTTTGTGGAGCTGGAAAGGCTGTTGCTGAATGGACTGCCAGAGCAATGGGTGGATCT
GTTCCATTTGAAGAAGCTCTAGCCGCAAGACTCTCTTTGTTCAAGCCTTCTCTTTCCAAA
GTTGAGGAATATCTCGCAAAGAGACCCCCGAGACTGTCCCCTGGCATTGAAGAGTTAGTC
AAGAAGCTCAGAGCCAATAAAATTGATGTCTATTTGATATCTGGAGGTTTTCGACAAATG
ATCAATCCTGTAGCGTCGATTCTTGGCATTCCTCGAGAGAATATCTTCGCCAACAATATT
CTATTTGGAAATTCTGGCGAGTTTGCGGGCTTTGATGAGAACGAACCTACATCAAGAAGT
GGAGGCAAAGCCAAAGCAGTGCAACAGATACGAAAGGGTCGTCTTTACAAGACTATGGCC
ATGATTGG*AGATGGTGCTACTGATCTCGAAGCACGTAAACCTGGTGGCGCAGATTTGTT
CATATGCTACGCTGGAGTTCAGCTTCGTGAAGCTGTTGCAGCGCAAGCAGACTGGCTTAT
TTTCAGTTTTGAACCTCTCATAAAGTCGTTGAACTAAGTGGAATCTATATAATGATTAGT
TTCATTGAGCTAAACTCATTATTGATGATATCTCAACATTTGTACTTCTTTTTT

QA 1 714 1 714
DS 

RD RS1DC21JQ 729 0 0
GATGTGGATAGCACGGTTTGTGTGGATGAAGGTATTGATGAACTTGCTGAGTTTTGTGGA
GCTGGAAAGGCTGTTGCTGAATGGACTGCCAGAGCAATGGGTGGATCTGTTCCATTTGAA
GAAGCTCTAGCCGCAAGACTCTCTTTGTTCAAGCCTTCTCTTTCCAAAGTTGAGGAATAT
CTCGCAAAGAGACCCCCGAGACTGTCCCCTGGCATTGAAGAGTTAGTCAAGAAGCTCAGA
GCCAATAAAATTGATGTCTATTTGATATCTGGAGGTTTTCGACAAATGATCAATCCTGTA
GCGTCGATTCTTGGCATTCCTCGAGAGAATATCTTCGCCAACAATATTCTATTTGGAAAT
TCTGGCGAGTTTGCGGGCTTTGATGAGAACGAACCTACATCAAGAAGTGGAGGCAAAGCC
AAAGCAGTGCAACAGATACGAAAGGGTCGTCTTTACAAGACTATGGCCATGATTGG*AGA
TGGTGCTACTGATCTCGAAGCACGTAAACCTGGTGGCGCAGATTTGTTCATATGCTACGC
TGGAGTTCAGCTTCGTGAAGCTGTTGCAGCGCAAGCAGACTGGCTTATTTTCAGTTTTGA
ACCTCTCATAAAGTCGTTGAACTAAGTGGAATCTATATAATGATTAGTTTCATTGAGCTA
AACTCATTATTGATGATATCTCAACATTTGTACTTCTTTTTTCCTTCAAATGTGTGATAC
TCCATTGAA

QA 1 729 1 729
DS 

RD RS1AL03JQ 796 0 0
AAGAAATACTCGAACTTTGGAGAGATGTTGAAGCTGTGTGCTTCGATGTGGATAGCACGG
TTTGTGTGGATGAAGGTATTGATGAACTTGCTGAGTTTTGTGGAGCTGGAAAGGCTGTTG
CTGAATGGACTGCCAGAGCAATGGGTGGATCTGTTCCATTTGAAGAAGCTCTAGCCGCAA
GACTCTCTTTGTTCAAGCCTTCTCTTTCCAAAGTTGAGGAATATCTCGCAAAGAGACCCC
CGAGACTGTCCCCTGGCATTGAAGAGTTAGTCAAGAAGCTCAGAGCCAATAAAATTGATG
TCTATTTGATATCTGGAGGTTTTCGACAAATGATCAATCCTGTAGCGTCGATTCTTGGCA
TTCCTCGAGAGAATATCTTCGCCAACAATATTCTATTTGGAAATTCTGGCGAGTTTGCGG
GCTTTGATGAGAACGAACCTACATCAAGAAGTGGAGGCAAAGCCAAAGCAGTGCAACAGA
TACGAAAGGGTCGTCTTTACAAGACTATGGCCATGATTGG*AGATGGTGCTACTGATCTC
GAAGCACGTAAACCTGGTGGCGCAGATTTGTTCATATGCTACGCTGGAGTTCAGCTTCGT
GAAGCTGTTGCAGCGCAAGCAGACTGGCTTATTTTCAGTTTTGAACCTCTCATAAAGTCG
TTGAACTAAGTGGAATCTATATAATGATTAGTTTCATTGAGCTAAACTCATTATTGATGA
TATCTCT*CATTTGTACTTCTTTTTTCCTTCAAATGTGTGAAACTCCATTGAATGAATAA
ATGTTTTTGCCAA
CTG

QA 1 793 1 793
DS 

RD RS1BB20JQ 425 0 0
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ACGAACCTACATCAAGAAGTGGAGGCAAAGCCAAAGCAGTGCAACAGATACGAAAGGGTC
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CCTGGTGGCGCAGATTTGTTCATATGCTACGCTGGAGTTCAGCTTCGTGGAGCTGTTGCA
GCGCAAGCAGACTGGCTTATTTTCAGTTTTGAACCTTTCATAAAGTCGTTGAACTAAGTG
GAATCTATATAATGATTAGTTTCATTGAGTTAAACTCATTATTGATGATATCTCAACATT
TGTACTTCTTTTTTCCTTCAAATGTGTGAAACTCCATTGAATGAATAAATGTTTTTGCCA
ATTTG

QA 1 425 1 425
DS 



AS 1 7

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CGTTGTGTACGTGATAGTGAGGATGCTAATTTTTCATTCGAGCTTTACATGGAAGCATTG
GATTGGTCTTGTGGTGACGTCGATAGGTTACGGTGTTCCTTATAAGTTTCTCGATGGGAT
GGCGAAGCCTAGTGTTAGCGACGATGGTGAGCTTATTGATGGTGGGTTTGACATGAGCAC
TGGTGGTATTTGTGGATACTTGCACGATGTGCTCTACATCACTTGCTTTGTGCAGCTTGC
ATCTATCATCTCTGGAAAGTTTTGGTACACCTATCTAGTGATTCCTGCATTTGGAGCGTA
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CAGGACAAGATCACGATGAATTGTGTTTTCATCATCTTTTAGCAACAACTTAACTGTGGG
AAAATCTGTCCTCAAAACATACAAAATGCAAATCAACGGGCAACAACACTCACTCTTGTC
TTTGCAAAATCATTTTGTTGTACCGATGTAGCCTGTCTTTACACTGTTTGAATTTAATGG
ATGTTGTTGATGTTAAGATTGAAGGTTTTTAGTTATCCTGGGTAAACTCCCTAAGATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1CA59TF U 1
AF RS1CA59JQ C 2
AF RS1DD85TF U 7
AF RS1A807JQ C 5
AF RS1B544JQ C 120
AF RS1B544TF U 5
AF RS1A807TF U 5
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RD RS1CA59TF 662 0 0
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CAGGACAAGATCACGATGAATTGTGTTTTCATCATCTTTTAGCAACAACTTAACTGTGGG
AAAATCTGTCCTCAAAACATACAAAATGCAAATCAACGGGCAACAACACTCACTCTTGTC
TT

QA 1 662 1 662
DS 

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QA 6 778 6 778
DS 

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GG
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CTGGGTTTATTAAAGGATTCATGTCACAAGGTTCAGAGGGAGGTGTGGAGGATGAGAAAA
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GATG

QA 3 726 3 726
DS 

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GG
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AAGATCACGATGAATTGTGTTTTCATCATCTTTTAGCAACAACTTAACTGTGGGAAAATC
TGTCCTCAAAACATACAAAATGCAAATCAACGGGCAACAACACTCACTCTTGTCTTTGCA
AAATCATTTTGTTGTACCGATGTAGCCTGTCTTTACACTGTTTGAATTTAATGGATGTTG
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C

QA 3 773 3 773
DS 

RD RS1B544JQ 659 0 0
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GGATTGGTCTTGTGGTGACGTCGATAGGTTACGGTGTTCCTTATAAGTTTCTCGATGGGA
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CTGGTGGTATTTGTGGATACTTGCACGATGTGCTCTACATCACTTGCTTTGTGCAGCTTG
CATCTATCATCTCTGGAAAGTTTTGGTACACCTATCTAGTGATTCCTGCATTTGGAGCGT
ACAAAGCTTCTGGGTTTATTAAAGGATTCATGTCACAAGGTTCAGAGGGAGGTGTAGAGG
ATGAGAAAACTCGCAAAAAGAGGGAGAAGATGGAGAGAAAAGCTTCTAGAGGGCAAGCCG
TCAGGACAAGATCACGATGAATTGTGTTTTCATCATCTTTTAGCAACAACTTAACTGTGG
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CTTTGCAAAATCATTTTGTTGTACCGATGTAGCCTGTCTTTACACTGTTTGAATTTAATG
GATGTTGTTGATGTTAAGATTGAAGGTTTTTAGTTATCCTGGGTAAACTCCCTAAGAT
C

QA 1 658 1 658
DS 

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GG
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TATTTGTGGATACTTGCACGATGTGCTCTACATCACTTGCTTTGTGCAGCTTGCATCTAT
CATCTCTGGAAAGTTTTGGTACACCTATCTAGTGATTCCTGCATTTGGAGCGTACAAAGC
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AACTCGCAAAAAGAGGGAGAAGATGGAGAGAAAAGCTTCTAGAGGGCAAGCCGTCAGGAC
AAGATCACGATGAATTGTGTTTTCATCATCTTTTAGCAACAACTTAACTGTGGGAAAATC
TGTCCTCAAAACATACAAAATGCAAATCAACGGGCAACAACACTCACTCTTGTCTTTGCA
AA*TCATTTTGTTGTACCGATGTAGCCTGTCTTTACACTGTTG**ATTTAATGGATGTTG
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QA 3 736 3 736
DS 

RD RS1A807TF 736 0 0
GG
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GGATGAGAACGCTCGGCACATGGCCAAGCTCCGTCGTATCATCATCGCTTGCAACGTTGT
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TCTTGTGGTGACGTCGATAGGTTACGGTGTTCCTTATAAGTTTCTCGATGGGATGGCGAA
GCCTAGTGTTAGCGACGATGGTGAGCTTATTGATGGTGGGTTTGACATGAGCACTGGTGG
TATTTGTGGATACTTGCACGATGTGCTCTACATCACTTGCTTTGTGCAGCTTGCATCTAT
CATCTCTGGAAAGTTTTGGTACACCTATCTAGTGATTCCTGCATTTGGAGCGTACAAAGC
TTCTGGGTTTATTAAAGGATTCATGTCACAAGGTTCAGAGGGAGGTGTAGAGGATGAGAA
AACTCGCAAAAAGAGGGAGAAGATGGAGAGAAAAGCTTCTAGAGGGCAAGCCGTCAGGAC
AAGATCACGATGAATTGTGTTTTCATCATCTTTTAGCAACAACTTAACTGTGGGAAAATC
TGTCCTCAAAACATACAAAATGCAAATCAACGGGCAACAACACTCACTCTTGTCTTTGCA
AAATCATTTTGTTGTACCGATGTAGCCTGTCTTTACACTGTTTGAATTTAATGGATGTTG
TTGATGTTAAGATT

QA 3 736 3 736
DS 



AS 1 7

CO CL379Contig1 1149 7 11 U
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GGTAAAATTCTACAAGACATGTCTATATAGATTGGTGGTTGGGTCAGAAAAAGATAAGAT
AAAATCATCACCACCTGACAAAAGTTACCAACACAAAGATGCATGTGAAGATCCCACTTG
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AAACAAGAGAACTTTCCATGCCTTTTGGCATTGCTAGAGTTTGGACTTGTGAGTTGGAGC
TTTACACTCGTGTATCAAGAGAGCGTCGTAGTGACCAAAACCATGGTATAGGACCCGTAT
CGGATCTTCTTTACTGTATTCTTGACCGTATTCCGCTATGGTTATCAATCCTCCAGCCTT
TTCGTCCTTCATATACACTGTGATTGGCATCTGGAGGACGTGTGAAGCCATGAAGAGTTC
AGGTTCACCTCCCCACACATGTGACTTCCGAATTTGACTCACGTATGTGTCAAAATCTCC
TTCTATAAACCATTCTGTTTCTTGTCTTCTATTGATAAATTCGTCAGCAACTCTTGCACG
TAACTCATCAGCGAGCTCTCTCTGTACCTTCTCACTTGGAGAAGGTTTACCAGAGCGTAA
GCAAAACCCATGAGCCACTGAACGAAACAAACATCTACCATCTCCAGGTATACCAATGAC
AGAGTAATCTTTATAAACTCTCTTCCCATTGTTGCTGTGATCACCATCTTTACCCCTCGA
AGCATCTGCACACGTTGATTGAGGAGACGAAGAACAACAAACAAGCAAGCTGACAATCAC
ACCTGTATAAGCAAATCTCGAACACCAATAAAGGTTTCTTCCAGACATTTTCGAGTCAGG
GCTCAAGAAAGAAGCTTCGAGCTTTCCTTTAGGACCAGTTGATCGATTAATCAATACCGA
CCAGCTACAAGGTTGTCTATTAGAGACAGATACACGTGAAGAAAGACTGTGAGTTCGGAA
CTTGTATGATCCTTGAGAGAGGTGAGTGCCTAATTGCCTCTTGATGTAGATAACATTCCT
AGAACATGTTGTGATTGGAGAATAACAACTCATCATCACTTAATTGGCAAAATCCACTTC
AGGAATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 35 35 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GZ24JQ U 59
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AF RS1ES83JQ U 21
AF RS1EA15JQ U 1
AF RS1GZ24TF C 650
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AAATCATCACCACCTGACAAAAGTTACCAACACAAAGATGCATGTGAAGATCCCACTTGC
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GTCTATATAGATTGGTGGTTGGGTCAGAAAAAGATAAGATAAAATCATCACCACCTGACA
AAAGTTACCAACACAAAGATGCATGTGAAGATCCCACTTGCTGTCTACAACAACAACTAA
CTGAGGGTACTTCCGCCAATTCATACGATTCAAGATTCAAAAACAAGAGAACTTTCCATG
CCTTTTGGCATTGCTAGAGTTTGGACTTGTGAGTTGGAGCTTTACACTCGTGTATCAAGA
GAGCGTCGTAGTGACCAAAACCATGGTATAGGACCCGTATCGGATCTTCTTTACTGTATT
CTTGACCGTATTCCGCTATGGTTATCAATCCTCCAGCCTTTTCGTCCTTCATATACACTG
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GTGACTTCCGAATTTGACTCACGTATGTGTCAAAATCTCCTTCTATAAACCATTCTGTTT
CTTGTCTTCTATTGATAAATTCGTCAGCAACTCTTGCACGTAACTCATCAGCGAGCTCTC
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GTCTATATAGATTGGTGGTTGGGTCAGAAAAAGATAAGATAAAATCATCACCACCTGACA
AAAGTTACCAACACAAAGATGCATGTGAAGATCCCACTTGCTGTCTACAACAACAACTAA
CTGAGGGTACTTCCGCCAATTCATACGATTCAAGATTCAAAAACAAGAGAACTTTCCATG
CCTTTTGGCATTGCTAGAGTTTGGAGTTGTGAGTTGGAGCTTTACACTCGTGTATCAAGA
GAGCGTCGTAGTGACCAAAACCATGGTATAGGACCCGTATCGGATCTTCTTTACTGTATT
CTTGACCGTATTCCGCTATGGTTATCAATCCTCCAGCCTTTTCGTCCTTCATATACACTG
TGATTGGCATCTGGAGGACGTGTGAAGTCGTGAAGAGTTCAGGTTCACCTCCCCACACAT
GTGACTTCCGAATTTGACTCACGTATGTGTCAAAATCTCCTTCTATAAACCATTCTGTTT
CTTGTCTTCTATTGATAAATTCGTCAGCAACTCTTGCACGTAACCCATCAGCGAGCTCTC
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AGTAAAATTCTACAAGACATGTCTATATAGATTGGTGGTTGGGTCAGAAAAAGATAAGAT
AAAATCATCACCACCTGACAAAAGTTACCAACACAAAGATGCATGTGAAGATCCCACTTG
CTGTCTACAACAACAACTAACTGAGGGTACTTCCGCCAATTCATACGATTCAAGATTCAA
AAACAAGAGAACTTTCCATGCCTTTTGGCATTGCTAGAGTTTGGACTTGTGAGTTGGAGC
TTTACACTCGTGTATCAAGAGAGCGTCGTAGTGACCAAAACCATGGTATAGGACCCGTAT
CGGATCTTCTTTACTGTATTCTTGACCGTATTCCGCTACGGTTATCAATCCTCCAGCCTT
TTCGTCCTTCATATACACTGTGATTGGCATCTGGAGGACGTGTGAAGCCATGAAGAGTTC
AGGTTCACCTCCCCACACATGTGACTTCCGAATTTGACTCACGTATGTGTCAAAATCTCC
TTCTATAAACCATTCTGTTTCTTGTCTTCTATTGATAAATTCGTCAGCAACTCTTGCACG
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AGAGTAATCTTTATAAACTCTCTTCCCATTGTTGCTGTGATCACCATCTTTACCCCTCGA
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TTACCCCTCGAAGCATCTGCACACGTTGATTGAGGAGACGAAGAACAACAAACAAGCAAG
CTGACAATCACACCGGTATAAGCAAATCTCGAACACCAATAAAGGTTTCTTCCAGACATT
TTCGAGTCAGGGCTCAAGAAAGAAGCTTCGAGCTTTCCTTTAGGACCAGTTGATCGATTA
ATCAATGCCGACCAGCTACAAGGTTGTCTATTAGAGACAGATACACGTGAAGAAAGACTG
TGAGTTCGGAACTTGTATGATCCTTGAGAGAGGTGAGTGCCTAATTGCCTCTTGATGTAG
ATAACATTCCTAGAACATGTTGTGATTGGAGAATAACAACTCATCATCAC
CTATACAGAGGAAGGCCC

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AAACCATTCTGTTTCTTGTCTTCTATTGATAAATTCGTCAGCAACTCTTGCACGTAACTC
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CCCATGAGCCACTGAACGAAACAAACATCTACCATCTCCAGGTATACCAATGACAGAGTA
ATCTTTATAAACTCTCTTCCCATTGTTGCTGTGATCACCATCTTTACCCCTCGAAGCATC
TGCACACGTTGATTGAGGAGACGAAGAACAACAAACAAGCAAGCTGACAATCACACCTGT
ATAAGCAAATCTCGAACACCAATAAAGGTTTCTTCCAGACATTTTCGAGTCAGGGCTCAA
GAAAGAAGCTTCGAGCTTTCCTTTAGGACCAGTTGATCGATTAATCAATACCGACCAGCT
ACAAGGTTGTCTATTAGAGACAGATACACGTGAAGAAAGACTGTGAGTTCGGAACTTGTA
TGATCCTTGAGAGAGGTGAGTGCCTAATTGCCTCTTGATGTAGATAACATTCCTAGAACA
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CC

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DS 

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TCCCCACACATGTGACTTCCGAATTTGACTCACGTATGTGTCAAAATCTCCTTCTATAAA
CCATTCTGTTTCTTGTCTTCTATTGATAAATTCGTCAGCAACTCTTGCACGTAACCCATC
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ATGAGCCACTGAACGAAACAAACATCTACCATCTCCAGGTATACCAATGACAGAGTAATC
TTTATAAACTCTCTTCCCATTGTTGCTGTGATCACCATCTTTACCCCTCGAAGCATCTGC
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AGCAAATCTCGAACACCAATAAAGGTTTCTTCCAGACATTTTCGAGTCAGGGCTCGAGAA
AGAAGCTTCGAGCTTTCCTTTAGGACCAGTTGATCGATTAATCAATACCGACCAGCTACA
AGGTTGTCTATTAGAGACAGATACACGTGAAGAAAGACTGTGAGTTCGGAACTTGTATGA
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TGTGATTGGAGAATAACAACTCATCATCACTTAATTGGCAAAATCCACTTCAGGAATTCC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 8

CO CL380Contig1 1594 8 20 U
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AACACCGCCATGTGTGGAGGAGCTATAATCTCCGATTTCATCCCTCCGCCGAGGTCCCGC
CGCGTCACGAGCGAGTTCATCTGGCCGGATCTGAAAAAGAAAGGGAAAGCTTCGAAGAAG
AAGCGATCCGATTTCCTCGATCTGGAGGATGAGTTGAGGCTGACTTTCAAGGGTTTAAGG
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TCTTCGCCGATGTTAAGCCCTTTGTTTTCACCGCAGGTACCAAGCCGGCACCTTCCCCTC
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CTGAGATCCGTGATCCTAGAAAAGGCGCTAGAGAATGGCTTGGAACATTCGACACAGCCG
AGGAAGCAGCAAGAGCTTATGATGCAGCTGCACGCAGGATCCGTGGTAATAAAGCTAAGG
TGAATTTCCCTGAGGAGATGGTCCC*TAGCAAACGCCC*TGCTGCTAAGACCAGTAATCT
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GAGTCAGTTCTGCAACAACTCCTTTAGTGATGTGAGTTTCACGGAAGCGAAGCCTCAGAT
GTTCAACAATCAGTTCTTTGATGTTGGAGGTAACAATGGATACCAGTATTTCAGTTCTGA
TCAGGGAAGTAACTCCTTGGACTGCTCTGAGTTTGGG*TGGAGTGAACACGGCCCCAAGA
CACCTGAGATCTCTTCAATGCTAGTCAATAACAACCAAGCTCCTTTCATTGAAGAAACCA
ACGCAGCCAAGAAGCTCAAAACCAACTCTGGGGACGGGATAAGCAACAATGATGGTTCTG
ATGATCTGATGGCATACCTGAACAACGCCTTGTGGGAGTCTCCGTTGGAAGTGGAAGCTA
TGCTTGGCGCAGATGCTGCTACTATGACTCAGGAAGAGGCAAACCCAATGGACCTGTGGA
GCTTAGATGATATCAACTCCATGCTGGATGGTGGTGTCTTCTGAAGTGAGTGATGGGTTG
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ACACCTGGAGCTTTATCGTTGTCTTATGAGTCTCTTTCCCATAGAGAGTGTCTCTTTTAA
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ACTTTTTTTTTT*TTTTATAGCGTATCACCCTCGAAAGTGTTTGTTTTAAACCCCCAAAA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

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CGCCGATGTTAAGCCCTTTGTTTTCACCGCAGGTACCAAGCCGGCACCTTCCCCTCCCAC
CACCACTGGTCCAGTTTCTGGCATAGAGTCTGGTGGGCAAGCTGAGAAATGTGCTAAGAG
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G
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AAAGCTAAGGTGAATTTCCCTGAGGAGATGGTCCC*TAGCAAACGCCC*TGCTGCTAAGA
CCAGTAATCTTAAGAAGCCAGTGGCTAAACAAAACCAAAACCCAACTTTGGTTCAGCAGC
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AGCCTCAGATGTTCAACAATCAGTTCCTTGATGTTGGAGGTAACAATGGATACCAGTATT
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CGCCTTGTGGGAGTCTCCGTTGGAAGTGGAAGCTATGCTTGGCGCAGATGCTGCTACTAT
GACTCAGGAAGAGGCAAACCCAATGGACCTGTGGAGCTTAGATGATATCAACTCCATGCT
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AAGTATGTAGAGTATTATTATAATTTCTATTTAATGATTCTCTTCCTTGAGTTTTTGTTT
TTGTATTTCTATGACAATTTATTAATGTTTTAAAAACTTTTTTTTT
CTTTAG

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TCTGATGATCTGATGGCATACCTGAACAACGCCTTGTGGGAGTCTCCGTTGGAAGTGGAA
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TTAAATTCCTGAAATAAAAGGGGGTGATGAAGTATGTAGAGTATTATTATAATTTCTATT
TAATGATTCTCTTCCTTGAGTTTTTGTTTTTGTATTTCTATGACAATTTATTAATGTTTT
AAAAACTTTTTTTTTC*TTTTATAGCGTATCACCCTCGAAAGTGTTTGTTTTAAACCCCC
AAAAAAACATATATAAAAACTGTTTGGAACCTCTGTGC

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TATAGGGTATCACCCTCGAAAGTGTTTGTTTTAAACCCCCAAAAAAACATATATAAAAAC
TGTTTGGAACC
TCTGTTT

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GCCAAGAAGTTCAAAACCAACTCTGGGGACGGGATAAGCAACAATGATGGTTCTGATGAT
CTGATGGCATACCTGAACAACGCCTTGTGGGAGTCTCCGTTGGAAGTGGAAGCTATGCTT
GGCGCAGATGCTGCTACTATGACTCAGGAGGAGGCAAACCCAATGGACCTGTGGAGCTTA
GATGATATCAACTCCATGCTGGATGGTGGTGTCTTCTGAAGTGAGTGATGGGTTGCCTAG
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TGGAGCTTTATCGTTGTCTTATGAGTCTCTTTCCCATAGAGAGTGTCTCTTTTAAATTCC
TGAAATAAAAGGGGGTGATGAAGTATGTAGAGTATTATTATAATTTCTATTTAATGATTC
TCTTCCTTGAGTTTTTGTTTTTGTATTTCTATGACAATTTATTAATGTTTTAAAAACTTT
TTTTTTTCTTTTATAGCGTATCACCCTCGAAAGTGTTTGTTTTAAACCCCCAAAAAAACA
TATATAAAAACTGTTTGGAACC

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DS 



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AAAGATCAATTCTTTGGGAGATGGGTCTATGGGATTCGCTTCTAAACTGGCTCAGGAGCT
TGTTCTTCAAACAAGAGATGGAGCTCTCACTCGTTGGCCTTCAGAATGCTGGAAAGACTT
CTCTTGTCAATGCCATCGCTACTGGAGGTTACAGTGAAGATATGATACCAACTGTGGGGT
TCAACATGAGGAAAGTCACTAAAGGAAACGTTACCATCAAGATTTGGGATCTTGGAGGCC
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TAACGAAACCGTCCTTGAACGGTATTCCTCTTTTGATCCTAGGCAACAAGATTGATAAGT
CTGAAGCTCTCTCCAAGCAAGCTTTGGTTGATCAACTAGGGCTTGATTCCGTAGCTGACA
GAGAGGTTTGTTGTTACATGATCTCGTGTAAGGACTCGGTTAACATCGATGCAGTCATTG
ATTGGCTCATTAAGCACTCGAGAACCGCTAAATAAACAGCAGACGCAGTCATCGGTGCAG
TGGAGGAGGAGACAGGCTTTGTGTGCTTGGTTTCTTGATGTTGTTTATTTGTCGAGAATC
AATCAGATGTAAATCACCCAGCTTTTGGTTTCTTCTTCATCTTTATTATATCTTAAACCT
TGTTTTACAATTCTTCAGAGTTCGAACACTTTCTTTAATACATTCTGTTAAGCATATCCT
TGTTGTACTTGTCAATTGGTTTACTCCGGTTATAGCCAAAGCTTTCTGAT


BQ
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 
45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1ED65TF U 1
AF RS1AY54TF U 6
AF RS1ED65JQ C 73
AF RS1BG74TF U 29
AF RS1EI44TF U 28
AF RS1BG74JQ C 127
AF RS1AY54JQ C 164
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BS 791 852 RS1EI44TF
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RD RS1ED65TF 671 0 0
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TAACGAAACCGTCCTTGAACGGTATTCCTCTTTTGATCCTAGGCAACAAGATTGATAAGT
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TGGAGGAGGAG

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DS 

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GTTTGTTGTTACATGATCTCGTGTAAGGACTCGGTTAACATCGATGCAGTCATTGATTGG
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DS 

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GCACCATGTGGGAGCGTTACTGTCGTGGAGTTTCCGCCATTGTTTATGTGATTGATGCTG
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CCTTGAACGGTATTCCTCTTTTGATCCTAGGCAACAAGATTGATAAGTCCGAAGCTCTCT
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CAGGCTTTGTGTGTTTGGTTTCTTGATGTTGTTTATTTGTCGAGAATCAATCAGATGTAA
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DS 

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GG
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TCTTCTTCATCTTTATTATATCTTAAACCTTGTTTTACAATTCTTCAGAGTTCGAACACT
TTCTT

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DS 

RD RS1EI44TF 825 0 0
GGG
AGGTCTAAGAATCCAAGTGTTTAATCGTCGAAAGATCAATTCTTTGGGAGATGGGTCTAT
GGGATTCGCTTCTAAACTGGCTCAGGAGCTTGTTCTTCAAACAAGAGATGGAGCTCTCAC
TCGTTGGCCTTCAGAATGCTGGAAAGACTTCTCTTGTCAATGCCATCGCTACTGGAGGTT
ACAGTGAAGATATGATACCAACTGTGGGGTTCAACATGAGGAAAGTCACTAAAGGAAACG
TTACCATCAAGATTTGGGATCTTGGAGGTCAACGTAGTTTCCGCACCATGTGGGAGCGTT
ACTGTCGTGGAGTTTCCGCCATTGTATATGTGATTGATGCTGCAGACCGAGACAGTGTAC
CCATATCAAGAAGTGAGTTGCATGATCTGTTAACGAAACCGTCCTTGAACGGTATTCCTC
TTTTGATCCTAGGCAACAAGATTGATAAGTCTGAAGCTCTCTCCAAGCAAGCTTTGGTTG
ATCAACTAGGGCTTGATTCCGTAGCTGACAGAGAGGTTTGTTGTTACATGATCTCGTGTA
AGGACTCGATTAACATCGATGCAGTCATTGATTGGCTCATTAAGCACTCGAGAACCGCTA
AATAAACAGCAGACGCAGTCATCGGTGCAGTGGAGGAGGAGACAGGCTTTGTGTGCTTGG
TTTCTTGATGTTGTTTATTTGTCGAGAATCAATCAGATGTAA*TCACCCAGCTTTTGGTT
TCTTCTTCATCTTTAT*ATATCTTAAACCTTGTTT*ACA*TTCTTCAGAGTTCGAACACT
TTCTTTAATACATTCTGTTAAGCATATCCTTGTTGTACTTGT

QA 4 825 4 825
DS 

RD RS1BG74JQ 764 0 0
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TCAATGCCATCGCTACTGGAGGTTACAGTGAAGATATGATACCAATTGTGGGGTTCAACA
TGAGGAAAGTCACTAAAGGAAACGTTACCATCAAGATTTGGGATCTTGGAGGTCAACGTA
GGTTCCGCACCATGTGGGAGCGTTACTGTCGTGGAGTTTCCGCCATTGTATATGTGATTG
ATGCTGCAGACCGAGACAGTGTACCCATATCAAGAAGTGAGTTGCATGATCTGTTAACGA
AACCGTCCTTGAACGGTATTCCTCTTTTGATCCTAGGCAACAAGATTGATAAGTCTGAAG
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AGGAGACAGGCTTTGTGTGCTTGGTTTCTTGATGTTGTTTATTTGTCGAGAATCAATCAG
ATGTAAATCACCCAGCTTTTGGTTTCTTCTTCATCTTTATTATATCTTAAACCTTGTTTT
ACAATTCTTCAGAGTTCGAACACTTTCTTTAATACATTCTGTTAAGCATATCCTTGTTGT
ACTTGTCAATTGGTTTACTCCGGTTATAGCCAAAGCTTTCTGAT

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DS 

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CATCGATGCAGTCATTGATTGGCTCATTAAGCACTCGAGAACCGCTAAATAAACAGCAGA
CGCAGTCATCGGTGCAGTGGAGGAGGAGACAGGCTTTGTGTGTTTGGTTTCTTGATGTTG
TTTATTTGTCGAGAATCAATCAGATGTAAATCACCCAGCTTTTGGTTTCTTCTTCATCTT
TATTATATCTTAAACCTTGTTTTACAATTCTTCAGAGTTCGAACACTTTCTTTAATACAT
TCTGTTAAGCATATCCTTGTTGTACTTGTCAATTGGTTTACTCCGGTTATAGCCAAAGCT
TTCTGAT

QA 1 727 1 727
DS 



AS 2 9

CO CL382Contig1 758 5 5 U
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TTCTCGAGCTCTTAATGGCTACCAAGTTACTCAAGAGAATCATATTCGTTGGTCTCAGAC
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AGCTGCTTAAACAAAGCTACTCTTGTTTCTTTATTGATCCTTCTGATGTTACTGAAAGTC
TTCCTTCTTGCAAGAGCTGCTTAATAAGTAGCTTTTGTTTCTTCCTATTTTTTAATAGGA
GTTTGATCTTTGCTTCACAAGTCTGGTTTCTAATCTTTTTTCCTGGTACTTAACCGGTCT
ATTAGTCCAAATCCTAGGTTTATGCCTTCAAGAGGAAAGGGAAAGAAAAATGGTTACTAT
AAGTATTGTTTGATCTCCTTGTTACTTGGTTTAAATTGGTAATGTAAACCTAAACCCAAA
ATTGCTAGATTTCTATAACAGAGTCAAACAGAAAAAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D589TF U 1
AF RS1GE82TF U 1
AF RS1GE82JQ C 22
AF RS1BS54TF U 1
AF RS1BS54JQ C 34
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DS 

RD RS1GE82JQ 697 0 0
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TTACTTGGTTTAAATTGGTAATGTAAACCTAAACCC
G

QA 1 696 1 696
DS 

RD RS1BS54TF 758 0 0
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GATATCAGCTGGTTATGAAGACGGTGTGTTGACTGTGACTGTACCAAAGGTGGTTTTGAG
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TTCCTTCTTGCAAGAGCTGCTTAATAAGTAGCTTTTGTTTCTTCCTATTTTTTAATAGGA
GTTTGATCTTTGCTTCACAAGTCTGGTTTCTAATCTTTTTTCCTGGTACTTAACCGGTCT
ATTAGTCCAAATCCTAGGTTTATGCCTTCAAGAGGAAAGGGAAAGAAAAATGGTTACTAT
AAGTATTGTTTGATCTCCTTGTTACTTGGTTTAAATTGGTA*TGTAAACCTAAACCCAAA
*TTGCTAGATTTCTATAACAGAGTCAAACAGAAAAAAA

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1BS54JQ 714 0 0
AATGACACCATGGGAGTATCTTCTATCTTCTCGAGCTCTTAATGGCTACCAAGTTACTCA
AGAGAATCATATTCGTTGGTCTCAGACTCCAGATTCTCACATTTTCTCTGTTGATCTTCC
TGGTTTGAGGAAAGAAGAAACAAAAGTGGAAATCGAAGATTCCATCTACTTAATCATACG
CACGGAGACTACGGAAAGATCCCCGGAACCACCGGTCAGGAGTTTCAAAAGGAAATTCCG
GTTACCGGAATCGATAGATATAACCGGGATATCAGCTGGTTATGAAGACGGTGTGTTGAC
TGTGACTGTACCAAAGGTGGTTTTGAGAAGGAGGAGTTTCTTTATTGATCCTTCTGATGT
TCCTGAAAGTCTTCAAGTTCTTGCAAGAGCTGCTTAAACAAAGCTACTCTTGTTTCTTTA
TTGATCCTTCTGATGTTACTGAAAGTCTTCCTTCTTGCAAGAGCTGCTTAATAAGTAGCT
TTTGTTTCTTCCTATTTTTTAATAGGAGTTTGATCTTTGCTTCACAAGTCTGGTTTCTAA
TCTTTTTTCCTGGTACTTAACCGGTCTATTAGTCCAAATCCTAGGTTTATGCCTTCAAGA
GGAAAGGGAAAGAAAAATGGTTACTATAAGTATTGTTTGATCTCCTTGTTACTTGGTTTA
AATTGGTAATGTAAACCTAAACCCAAAATTGCTAGATTTCTATAA
ACAGAGTTC

QA 1 705 1 705
DS 



CO CL382Contig2 673 4 2 U
ATAGTAACCATTTTTCTTTCCCTTTCCTTTTGAAGGCATAAACTTAGGATTTGGTTTCTA
TAAAGGTTAAGTACCAGGAAAAAAAAATTAGAAACCAGACTTGTGAAGAAAATATCAAAC
TCCTATTAAAAATAGGAAGAAACAAAAGCTACTTATTAAGCAGCTCTTGCAAGAAGGAAG
ACTTTCAGTAACATCAGAAGGATCAATAAAGAAACAAGAGTAGCTTTGTTTAAGCAGCTC
TTGCAAGAACTTGAAGACTTTCAGGAACATCAGAAGGATCAATAAAGAAACTCCTCCTTC
TCAAAACCACCTTTGGTACAGTCACAGTCAACACACCGTCTTCATAACCAGCTGATATCC
CGGTTATATCTATCGATTCCGGTAACCGGAATTTCCTTTTGAAACTCCTGACCGGTGGTT
CCGGGGATCTTTCCGTAGTCTCCGTGCGTATGATTAAGTAGATGGAATCTTCGATTTCCA
CTTTTATTTCTTCTTTCCTCAAACCAGGAAGATCAACAGAGAAAATGTGAGAATCTGGAG
TCTGAGACCAACGAATATGATTCTCTTGAGTTACTTGGTAGCCATTAAGAGCTCGAGAAG
ATAGAAGATACTCCCATGGTGTCATTTGAATCCTCTGAAAGTCCATTTTTTTCTCTCTAT
TCTTTTTTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1BQ41JQ U 275
AF RS1GK92JQ U 1
AF RS1GK92TF C 34
AF RS1BQ41TF C 90
BS 1 656 RS1GK92JQ
BS 657 673 RS1GK92TF

RD RS1BQ41JQ 324 0 0
AGGATCAATAAAGAAACTCCTCCTTCTCAAAACCACCTTTGGTACAGTCACAGTCAACAC
ACCGTCTTCATAACCAGCTGATATCCCGGTTATATCTATCGATTCCGGTAACCGGAATTT
CCTTTTGAAACTCCTGACCGGGGGTTCCGGGGATCTTTCCGTAGTCTCCGTGCGTATGAT
TAAGTAGATGGAATCTTCGATTTCCACTTTTATTTCTTCTTTCCTCAAACCAGGAAGATC
AACAGAAAAAATGTGAGAATCTGGAGTCTGAAACCAACGAATATGATTCTCTTGAGTTAC
TTGGTAGCCATTAAGAGCTCGAGA

QA 1 324 1 324
DS 

RD RS1GK92JQ 656 0 0
ATAGTAACCATTTTTCTTTCCCTTTCCTTTTGAAGGCATAAACTTAGGATTTGGTTTCTA
TAAAGGTTAAGTACCAGGAAAAAAAAATTAGAAACCAGACTTGTGAAGAAAATATCAAAC
TCCTATTAAAAATAGGAAGAAACAAAAGCTACTTATTAAGCAGCTCTTGCAAGAAGGAAG
ACTTTCAGTAACATCAGAAGGATCAATAAAGAAACAAGAGTAGCTTTGTTTAAGCAGCTC
TTGCAAGAACTTGAAGACTTTCAGGAACATCAGAAGGATCAATAAAGAAACTCCTCCTTC
TCAAAACCACCTTTGGTACAGTCACAGTCAACACACCGTCTTCATAACCAGCTGATATCC
CGGTTATATCTATCGATTCCGGTAACCGGAATTTCCTTTTGAAACTCCTGACCGGTGGTT
CCGGGGATCTTTCCGTAGTCTCCGTGCGTATGATTAAGTAGATGGAATCTTCGATTTCCA
CTTTTATTTCTTCTTTCCTCAAACCAGGAAGATCAACAGAGAAAATGTGAGAATCTGGAG
TCTGAGACCAACGAATATGATTCTCTTGAGTTACTTGGTAGCCATTAAGAGCTCGAGAAG
ATAGAAGATACTCCCATGGTGTCATTTGAATCCTCTGAAAGTCCATTTTTTTCTCT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RS1GK92TF 640 0 0
AGGCATAAACTTAGGATTTGGTTTCTATAAAGGTTAAGTACCAGGAAAAAAAAATTAGAA
ACCAGACTTGTGAAGAAAATATCAAACTCCTATTAAAAATAGGAAGAAACAAAAGCTACT
TATTAAGCAGCTCTTGCAAGAAGGAAGACTTTCAGTAACATCAGAAGGATCAATAAAGAA
ACAAGAGTAGCTTTGTTTAAGCAGCTCTTGCAAGAACTTGAAGACTTTCAGGAACATCAG
AAGGATCAATAAAGAAACTCCTCCTTCTCAAAACCACCTTTGGTACAGTCACAGTCAACA
CACCGTCTTCATAACCAGCTGATATCCCGGTTATATCTATCGATTCCGGTAACCGGAATT
TCCTTTTGAAACTCCTGACCGGTGGTTCCGGGGATCTTTCCGTAGTCTCCGTGCGTATGA
TTAAGTAGATGGAATCTTCGATTTCCACTTTTATTTCTTCTTTCCTCAAACCAGGAAGAT
CAACAGAGAAAATGTGAGAATCTGGAGTCTGAGACCAACGAATATGATTCTCTTGAGTTA
CTTGGTAGCCATTAAGAGCTCGAGAAGATAGAAGATACTCCCATGGTGTCATTTGAATCC
TCTGAAAGTCCATTTTTTTCTCTCTATTCTTTTTTCTTCC

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1BQ41TF 584 0 0
G
GAAACCAGACTTGTGAAGAAAATATCAAACTCCTATTAAAAATAGGAAGAAACAAAAGCT
ACTTATTAAGCAGCTCTTGCAAGAAGGAAGACTTTCAGTAACATCAGAAGGATCAATAAA
GAAACAAGAGTAGCTTTGTTTAAGCAGCTCTTGCAAGAACTTGAAGACTTTCAGGAACAT
CAGAAGGATCAATAAAGAAACTCCTCCTTCTCAAAACCACCTTTGGTACAGTCACAGTCA
ACACACCGTCTTCATAACCAGCTGATATCCCGGTTATATCTATCGATTCCGGTAACCGGA
ATTTCCTTTTGAAACTCCTGACCGGTGGTTCCGGGGATCTTTCCGTAGTCTCCGTGCGTA
TGATTAAGTAGATGGAATCTTCGATTTCCACTTTTATTTCTTCTTTCCTCAAACCAGGAA
GATCAACAGAGAAAATGTGAGAATCTGGAGTCTGAGACCAACGAATATGATTCTCTTGAG
TTACTTGGTAGCCATTAAGAGCTCGAGAAGATAGAAGATACTCCCATGGTGTCATTTGAA
TCCTCTGAAAGTCCATTTTTTTCTCTCTATTCTTTTTTCTTCC

QA 2 584 2 584
DS 



AS 1 9

CO CL383Contig1 683 9 6 U
GAAAGAATTCACTTCTCAACACAACGAGATCTAAAAGAAACCATATTGTTATTTTGTTTT
TGTTTTGTCTCTCTCGAATTAATAGAAATGGAGCCGAAGCAGATCAAAGCTATGTTCTTT
ATCTTAACAATGATTATGGCTTTGGTTTGTCATCATCAATCAGAAGCTATGCCATATATT
GGTCGACTGAAATGCATTGTATCACTAAGGAGCGTTGAGGGTTGTATGGAGGCCATAGAG
AAAGCTACAAAGGGAGACAATCATGGTTTGGATAAGGAATGCTGCGACGCCATTCGTGGC
CTCGCCAATGACTGTTTGCCGATTATCTTCTCCGGAGGACCCGCCATTGGCTTAGTCGTT
CAAGCTGCTTGTTCCCGTATATTAGATGACGTTAATTAATTATAGAACATAATTATAATT
AAAAAAAGAGCTGGGTCACTATACAATTGTATCATGCATGGTTTTTTTTT*AAAAGGGGA
AAAGGGAGACAGATATACAAACGTCAATAAACTGCTATATAATTTTCTAGAACTGTATGT
ATTATATAATTATTTTTCTTTCCTGACCGAAGAGATATGAATAAAAAAGTAGTAATAATA
TCTAAAATTGTATTCAACTAAAAAAAATTGTATTGTCAGCTAGAATTTTATACGAAATAA
CCATAAAAATCAAAAAGTTATTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 30 45 45 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 35 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 15 15 30 45 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EG43TF U 25
AF RS1EG43JQ C 128
AF RS1B954JQ C 1
AF RS1DG39TF U 370
AF RS1FC22JQ C 57
AF RS1FC22TF U 57
AF RS1B954TF U 1
AF RS1EQ42TF U 26
AF RS1EQ42JQ C 326
BS 1 27 RS1B954TF
BS 28 370 RS1EG43TF
BS 371 593 RS1DG39TF
BS 594 595 RS1B954TF
BS 596 668 RS1EQ42TF
BS 669 683 RS1EQ42JQ

RD RS1EG43TF 506 0 0
GGA
GATCTAAAAGAAACCATATTGTTATTTTGTTTTTGTTTTGTCTCTCTCGAATTAATAGAA
ATGGAGCCGAAGCAGATCAAAGCTATGTTCTTTATCTTAACAATGATTATGGCTTTGGTT
TGTCATCATCAATCAGAAGCTATGCCATATATTGGTCGACTGAAATGCATTGTATCACTA
AGGAGCGTTGAGGGTTGTATGGAGGCCATAGAGAAAGCTACAAAGGGAGACAATCATGGT
TTGGATAAGGAATGCTGCGACGCCATTCGTGGCCTCGCCAATGACTGTTTGCCGATTATC
TTCTCCGGAGGACCCGCCATTGGCTTAGTCGTTCAAGCTGCTTGTTCCCGTATATTAGAT
GACGTTAATTAATTATAGAACATAATTATAATTAAAAAA*GAGCTGGGTCACTATACAAT
TGTATCATGCATGGTTTTTTTTTTAAAAGGGGAAAAGGGAGACAGATATACAAATGTCAA
TAAACTGCTATATAATTTTCT
GG

QA 4 504 4 504
DS 

RD RS1EG43JQ 403 0 0
CAATGATTATGGCTTTGGTTTGTCATCATCAATCAGAAGCTATGCCATATATTGGTCGAC
TGAAATGCATTGTATCACTAAGGAGCGTTGAGGGTTGTATGGAGGCCATAGAGAAAGCTA
CAAAGGGAGACAATCATGGTTTGGATAAGGAATGCTGGGACGCCATTCGTGGCCTCGCCA
ATGACTGTTTGCCGATTATTTTTTCCGGAGGACCCGCCATTGGCTTAGTCGTTCAAGCTG
CTTGTTCCCGTATATTAGATGACGTTAATTAATTATAGAACATAATTATAATTAAAAAA*
GAGCTGGGTCACTATACAATTGTATCATGCATGGTTTTTTTTTTAAAAGGGGAAAAGGGA
GACAGATATACAAATGTCAATAAACTGCTATATAATTTT
TTGG

QA 1 399 1 399
DS 

RD RS1B954JQ 596 0 0
GAAAGAATTCACTTCTCAACACAACGAGATCTAAAAGAAACCATATTGTTATTTTGTTTT
TGTTTTGTCTCTCTCGAATTAATAGAAATGGAGCCGAAGCAGATCAAAGCTATGTTCTTT
ATCTTAACAATGATTATGGCTTTGGTTTGTCATCATCAATCAGAAGCTATGCCATATATT
GGTCGACTGAAATGCATTGTATCACTAAGGAGCGTTGAGGGTTGTATGGAGGCCATAGAG
AAAGCTACAAAGGGAGACAATCATGGTTTGGATAAGGAATGCTGCGACGCCATTCGTGGC
CTCGCCAATGACTGTTTGCCGATTATCTTCTCCGGAGGACCCGCCATTGGCTTAGTCGTT
CAAGCTGCTTGTTCCCGTATATTAGATGACGTTAATTAATTATAGAACATAATTATAATT
AAAAAAAGAGCTGGGTCACTATACAATTGTATCATGCATGGTTTTTTTTT*AAAAGGGGA
AAAGGGAGACAGATATACAAACGTCAATAAACTGCTGTATAATTTTCTAGAACTGTATGT
ATTATATAATTATTTTTCTTTCCTGACCGAAGAGATATGAATAAAAAAGTAGTAA
G

QA 1 595 1 595
DS 

RD RS1DG39TF 224 0 0
G
GTTCCCGTATATTAGATGACGTTAATTAATTATAGAACATAATTATAATTAAAAAAAGAG
CTGGGTCACTATACAATTGTATCATGCATGGTTTTTTTTT*AAAAGGGGAAAAGGGAGAC
AGATATACAAACGTCAATAAACTGCTATATAATTTTCTAGAACTGTATGTATTATATAAT
TATTTTTCTTTCCTGACCGAAGAGATATGAATAAAAAAGTAGT

QA 2 224 2 224
DS 

RD RS1FC22JQ 513 0 0
TTTTTGTTTTGTCTCTCTCGAATTAATAGAAATGGAGCCGAAACAGATCAAAGCTATGTT
CTTTATTTTAACAATGATTATGGCTTTGGTTTGTCATCATCAATCAGAAGCTATGCCATA
TATTGGTCGACTGAAATGCATTGTATCACTAAGGAGCGTTGAGGGTTGTATGGAGGCCAT
AGAGAAAGCTACAAAGGGAGACAATCATGGTTTGGATAAGGAATGCTGCGACGCCATTCG
TGGCCTCGCCAATGACTGTTTGCCGATCATCTTCTCCGGAGGACCCGCCATTGGCTTAGT
CGTTCAAGCTGCTTGTTCCCGTATATTAGATGACGTTAATTAATTATAGAACATAATTAT
AATTAAAAAAAGAGCTGGGTCACTATACAATTGTATCATGCATGGTTTTTTTTTTAAAAG
GGGAAAAGGGAGACAGATATACAAACGTCAATAAACTGCTATATAATTTTCTAGAACTGT
ATGTATTATATAATTATTTTTCTTTCCTGACCG

QA 1 513 1 513
DS 

RD RS1FC22TF 513 0 0
TTTTTGTTTTGTCTCTCTCGAATTAATAGAAATGGAGCCGAAACAGATCAAAGCTATGTT
CTTTATCTTAACAATGATTATGGCTTTGGTTTGTCATCATCAATCAGAAGCTATGCCATA
TATTGGTCGACTGAAATGCATTGTATCACTAAGGAGCGTTGAGGGTTGTATGGAGGCCAT
AGAGAAAGCTACAAAGGGAGACAATCATGGTTTGGATAAGGAATGCTGCGACGCCATTCG
TGGCCTCGCCAATGACTGTTTGCCGATCATCTTCTCCGGAGGACCCGCCATTGGCTTAGT
CGTTCAAGCTGCTTGTTCCCGTATATTAGATGACGTTAATTAATTATAGAACATAATTAT
AATTAAAAAAAGAGCTGGGTCACTATACAATTGTATCATGCATGGTTTTTTTTTTAAAAG
GGGAAAAGGGAGACAGATATACAAACGTCAATAAACTGCTATATAATTTTCTAGAACTGT
ATGTATTATATAATTATTTTTCTTTCCTGACCG

QA 1 513 1 513
DS 

RD RS1B954TF 596 0 0
GAAAGAATTCACTTCTCAACACAACGAGATCTAAAAGAAACCATATTGTTATTTTGTTTT
TGTTTTGTCTCTCTCGAATTAATAGAAATGGAGCCGAAGCAGATCAAAGCTATGTTCTTT
ATCTTAACAATGATTATGGCTTTGGTTTGTCATCATCAATCAGAAGCTATGCCATATATT
GGTCGACTGAAATGCATTGTATCACTAAGGAGCGTTGAGGGTTGTATGGAGGCCATAGAG
AAAGCTACAAAGGGAGACAATCATGGTTTGGATAAGGAATGCTGCGACGCCATTCGTGGC
CTCGCCAATGACTGTTTGCCGATTATCTTCTCCGGAGGACCCGCCATTGGCTTAGTCGTT
CAAGCTGCTTGTTCCCGTATATTAGATGACGTTAATTAATTATAGAACATAATTATAATT
AAAAAAAGAGCTGGGTCACTATACAATTGTATCATGCATGGTTTTTTTTT*AAAAGGGGA
AAAGGGAGACAGATATACAAACGTCAATAAACTGCTGTATAATTTTCTAGAACTGTATGT
ATTATATAATTATTTTTCTTTCCTGACCGAAGAGATATGAATAAAAAAGTAGTAA
G

QA 1 595 1 595
DS 

RD RS1EQ42TF 654 0 0
GG
GATCTAAAAGAAACCATATTGTTATTTTGTTTTTGTTTTGTCTCTCTCGAATTAATAGAA
ATGGAGCCGAAGCAGATCAAAGCTATGTTCTTTATCTTAACAATGATTATGGCTTTGGTT
TGTCATCATCAATCAGAAGCTATGCCATATATTGGTCGACTGAAATGCATTGTATCACTA
AGGAGCGTTGAGGGTTGTATGGAGGCCATAGAGAAAGCTACAAAGGGAGACAATCATGGT
TTGGATAAGGAATGCTGCGACGCCATTCGTGGCCTCGCCAATGACTGTTTGCCGATTATC
TTCTCCGGAGGACCCGCCATTGGCTTAGTCGTTCAAGCTGCTTGTTCCCGTATATTAGAT
GACGTTAATTAATTATAGAACATAATTATAATTAAAAAAAGAGCTGGGTCACTATACAAT
TGTATCATGCATGGTTTTTTTTT*AAAAGGGGAAAAGGGAGACAGATATACAAACGTCAA
TAAACTGCTATATAATTTTCTAGAACTGTATGTATTATATAATTATTTTTCTTTCCTG**
CGAAGAGATATGAATAAAAAAGTAGTAATAATATCTAAAATTGTATTCAACTAAAAAAAA
TTGTATTGTCAGCTAGAATTTTATACGAAATAACCATAAAA
TCAAAAGTTAT

QA 3 643 3 643
DS 

RD RS1EQ42JQ 358 0 0
TTTTT
TCCGGAGGACCCCCCATTGGCTTAGTCGTTCAAGCTGCTTGTTCCCGTATATTAGATGAC
GTTAATTAATTTTAGAACATAATTATAATTAAAAAAAGAGGGGGGTCACTATACAATTGT
ATCATGCATGGTTTTTTTTT*AAAAGGGGAAAAGGGGGACAGATATACAAACGTCAATAA
ACTGCTATATAATTTTTTAGAACTGTATGTATTATATAATTATTTTTTTTTCCTG**GGA
AGGGATATGAATAAAAAAGTAGTAATAATATTTAAAATTGTATTCAACTAAAAAAAATTG
TATTGTCAGCTAGAATTTTATACGAAATAACCATAAAAATCAAAAAGTTATTT

QA 6 358 6 358
DS 



AS 1 8

CO CL384Contig1 1010 8 18 U
CAGATTCTCTAAAATGTCAACTATTAAGAAAAGGGATGAAGTGATATATAAAGGATTACA
TAGAGAAACAGAGGATTTTCTAAAACACGAAATTTATTTCTTTTCTTCTTCGACAGAGAT
TTTCCAGTTTAGACAACGGAGGGTGACTTATGGTGCTGAACCGCTGTTTTGACTTCCGTT
TTTATGATTTGAAGAACCAGTTTCGGTGCTTACACCAATTTGAATGTTTGATCCTGTTTT
AGTATTGCTTTCTGATCTGGTGGTTGTGACTCTTCCGGAAGTGGAAACGTCGCTTTCGCC
TCCGGTCTTGGTGTTTGAAGAACCAGTTTGGGTTCTTTCACTTCCATTTCCAACAATGGA
GTTAACATCAACGTCAAGCCCTAGCTTCGATATATCCATCGACTTTCCTACTCTCAACTC
CACAGCCGTTTTCACCAATATAGCGATCGTTTTAGTCCAATGCACCATAGCCACGACCAA
CCCTTTCCTTTGCTGAAATGTCATACTCTGTGAACCACTTTTCTTCTGCTCAATCAAAGT
CTTTCCCATTGACAGCATTGCGTCTCTAAAATCCGTATTTGATGGTGCTCTGCCTTTAAC
AGCAGTTAATTCAGACATAGCACTGGCTAGGCCATCAACTTGTGATGTGATCTGTGTATC
TGTGCTTTTCGATGTGGCCGAGGCATTGCTGATGAATTTCACGTAAGACGTGAAGAGTGA
AAAGAATTTCTTGAACTCTCTAGTCGCGGGACACCCACGACGAAGTGTACTCGTCAAAAG
TAACATACCTTTGCATGCGAATGGTGTAAAGTCCGTGGCCCTTCGTACGAATTTCCTCCT
CAAGTACATCTTTAGCAAGAACGTTCCTTGCGCCTCGTACACCACACTTGATGCTACTAG
AAACATCAGACATATTGCTAGTACATTTTTATTAACCATTTTCTTATTCTTTTTTT**TC
TTTAAATGTTTTTTTGTTTTTTTT**GTAATTTTTAGAAATTTCTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 10 10 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 25 0 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1GX57JQ U 139
AF RS1BY84JQ U 26
AF RS1AN94JQ U 121
AF RS1BY84TF C 24
AF RS1AT90JQ U 1
AF RS1AN94TF C 205
AF RS1GX57TF C 533
AF RS1AZ05TF C 351
BS 1 90 RS1AT90JQ
BS 91 91 RS1BY84JQ
BS 92 112 RS1AT90JQ
BS 113 113 RS1BY84JQ
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BS 308 349 RS1AT90JQ
BS 350 350 RS1AN94JQ
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BS 985 986 RS1GX57TF
BS 987 1010 RS1AN94TF

RD RS1GX57JQ 336 0 0
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AATTTCGGTGCTTACACCAATTTGAATGTTTGATCCTGTTTTAGTATTGCTTTCTGATCC
GGTGGTTGTGACTCTTCCGGAAGTGGAAACGTCCCTTTCGCCTCCGGTCTTGTTGTTTGA
AGAACCAGTTTGGGTTCTTTCACTTCCATTTCCAACAATGGAGTTAACATCAACGTCAAG
CCCTAACTTCGATATATCCATCGACTTCCCTACTCTCAACTCCACAGCAGTTCTCACCAA
TATAGCGATCGTTTTAGTCCAATGCACCATAGCCAC

QA 1 336 1 336
DS 

RD RS1BY84JQ 587 0 0
AAA
AAAAGGGATGAAGTGATATATAAAGGATTACATAGAGAAACAGAGGATTTTCTAAAACAC
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TATGGTGCTGAGCCGCTGTTTTGACTTCCGTTTTTATGATTTGAAAAACCAGTTTCGGTG
CTTAAACCAATTTGAATGTTTGATCCTGTTTTAGTATTGCTTTCTGATCTGGGGGTTGTG
ACTCTTCCGGAAGTGGAAACGTCCCTTTCCCCTCCGGGGTTGGTGTTTGAAAAACCAGTT
TGGGTTCTTTCACTTCCATTTTCAACAATGGAGTTAACATCAACGTCAAGCCCTAGCTTC
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GTTTTAGTCCAATGCACCATAGCCACGACCAACCCTTTCCTTTGCTGAAATGTCATACTC
TGTGAACCACTTTTCTTCTGCTCAATCAAAGTCTTTCCCATTGACAGCATTGCATCTCTA
AAATCCGTATTTGATGGTGCTCTGCCTTTAACAGCAGTTAATTC

QA 4 587 4 587
DS 

RD RS1AN94JQ 551 0 0
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TTTAATATTTGAAGAACCAATTTCGGTGCTTACACCAATTTGAATGTTTGATCCTGTTTT
AGTATTGCTTTCTGATCTGGTGGTTGTGACTCTTCCGGAAGTGGAAACGTCGCTTTCGCC
TCCGGTCTTGTTGTTTGAAGAACCAGTTTGGGTTCTTTCACTTCCATTTCCAACAATGGA
GTTAACATCAACGTCAAGCCCTAGCTTCGATATATCCATCGACTTCCCTACTCTCAACTC
CACAGCAGTTTTCACCAATATAGCGATCGTTTTAGTCCAATGCACCATAGCCACGACCAA
CCCTTTCCTTTGCTGAAATGTCATACTCTGTGAACCACTTTT*TTCTGCTCAATCAAAGT
CTTTCCCATTGACAGCATTGCGTCTCTAAAATCCGTATTTGATGGTGCTCTGCCTTTAAC
AGCAGTTAATTCAGACATAGCACTGGCTAGGCCATCAACTTGTGATGTGATCTGTGTATC
TGTGCTTTTCG

QA 1 551 1 551
DS 

RD RS1BY84TF 648 0 0
CTAAG
AAAAGGGATGAAGTGATATATAAAGGATTACATAGAGAAACAGAGGATTTTCTAAAACAC
GAAATTTATTTCTTTTCTTCTTCGACAGAGATTTTCCAGTTTAGACAACGGAGGGTGACT
TATGGTGCTGAGCCGCTGTTTTGACTTCCGTTTTTATGATTTGAAGAACCAGTTTCGGTG
CTTAAACCAATTTGAATGTTTGATCCTGTTTTAGTATTGCTTTCTGATCTGGTGGTTGTG
ACTCTTCCGGAAGTGGAAACGTCGCTTTCGCCTCCGGTGTTGGTGTTTGAAGAACCAGTT
TGGGTTCTTTCACTTCCATTTTCAACAATGGAGTTAACATCAACGTCAAGCCCTAGCTTC
GATATATCCATCGACTTTCCTACTCTCAACTCCACAGCCGTTTTCACCAATATAGCGATC
GTTTTAGTCCAATGCACCATAGCCACGACCAACCCTTTCCTTTGCTGAAATGTCATACTC
TGTGAACCACTTTTCTTCTGCTCAATCAAAGTCTTTCCCATTGACAGCATTGCATCTCTA
AAATCCGTATTTGATGGTGCTCTGCCTTTAACAGCAGTTAATTCCGACATAGCACTGGCT
AGGCCATCAACTTGTGATGTGATCTGTGTATCTGTGCTTTTC
C

QA 6 647 6 647
DS 

RD RS1AT90JQ 773 0 0
CAGATTCTCTAAAATGTCAACTATTAAGAAAAGGGATGAAGTGATATATAAAGGATTACA
TAGAGAAACAGAGGATTTTCTAAAACACGACATTTATTTCTTTTCTTCTTCGCCAGAGAT
TTTCCAGTTTAGACAACGGAGGGTGACTTATGGTGCTGAACCGCTGTTTTGACTTCCGTT
TTTATGATTTGAAGAACCAGTTTCGGTGCTTACACCAATTTGAATGTTTGATCCTGTTTT
AGTATTGCTTTCTGATCTGGTGGTTGTGACTCTTCCGGAAGTGGAAACGTCGCTTTCGCC
TCCGGTGTTGGTGTTTGAAGAACCAGTTTGGGTTCTTTCACTTCCATTTTCAACAATGGA
GTTAACATCAACGTCAAGCCCTAGCTTCGATGTATCCATCGACTTTCCTACTCTCAACTC
CACAGCCGTTTTCACCAATATAGCGATCGTTTTAGTCCAATGCACCATAGCCACGACCAA
CCCTTTCCTTTGCTGAAATGTCATACTCTGTGAACCACTTTTCTTCTGCTCAATCAAAGT
CTTTCCCATTGACAGCATTGCGTCTCTAAAATCCGTATTTGATGGTGCTCTGCCTTTAAC
AGCAGTTAATTCCGACATAGCACTGGCTAGGCCATCAACTTGTGATGTGATCTGTGTATC
TGTGCTTTTCGATGTGGCCGAGGCATTGCTGATGAATTTCACGTAAGACGTGAAGAGTGA
AAAGA*TTTCTTGAACTCTCTAGTCGCGGGACACCCACGACGAAGTGTACTCG

QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1AN94TF 806 0 0
GGTGCTTACACCAATTTGAATGTTTGATCCTGTTTTAGTATTGCTTTCTGATCTGGTGGT
TGTGACTCTTCCGGAAGTGGAAACGTCGCTTTCGCCTCCGGTCTTGTTGTTTGAAGAACC
AGTTTGGGTTCTTTCACTTCCATTTCCAACAATGGAGTTAACATCAACGTCAAGCCCTAG
CTTCGATATATCCATCGACTTCCCTACTCTCAACTCCACAGCAGTTTTCACCAATATAGC
GATCGTTTTAGTCCAATGCACCATAGCCACGACCAACCCTTTCCTTTGCTGAAATGTCAT
ACTCTGTGAACCACTTTT*TTCTGCTCAATCAAAGTCTTTCCCATTGACAGCATTGCGTC
TCTAAAATCCGTATTTGATGGTGCTCTGCCTTTAACAGCAGTTAATTCAGACATAGCACT
GGCTAGGCCATCAACTTGTGATGTGATCTGTGTATCTGTGCTTTTCGATGTGGCCGAGGC
ATTGCTGATGAATTCCACGTAAGCAATGAAGAGTGAAAAGAATTTCTTGAACTCTCTAGT
CGCGGGACACCCCCGACGAAGTGTACTCGTCAAAAGTAACATACCTTTGCATGCGAATGG
TGTAAAGTCCGTGGCCCTTCGTACGAATTTCCTCCTCAAGTACATCTTTAGCAAGAACGT
TCCTTGCGCCTCGTACACCACACTTGATGCTACTAGAAACATCAGACATATTGCTAGTAC
ATTTTTATTAACCATTTTCTTATTCTTTTTTT**TCTTTAAATGTTTTTTTGTTTTTTTT
TTGTAATTTTTAGAAATTTCTGATCC

QA 1 806 1 806
DS 

RD RS1GX57TF 469 0 0
ATCAAAGTCTTTCCCATTGACAGCATTGCGTCTCTAAAATCCGTATTTGATGGTGCTCTG
CCTTTAACAGCAGTTAATTCAGACATAGCACTGGCTAGGCCATCAACTTGTGATGTGATC
TGTGTATCTGTGCTTTTCGATGTGGCCGAGGCATTGCTGATGAATTCCACGTAAGCAATG
AAGAGTGAAAAGAATTTCTTGAACTCTCTAGTCGCGGGACACCCCCGACGAAGTGTACTC
GTCAAAAGTAACATACCTTTGCATGCGAATGGTGTAAAGTCCGTGGCCCTTCGTACGAAT
TTCCTCCTCAAGTACATCTTTAGCAAGAACGTTCCTCGCGCCTCGTACACCACACTTGAT
GCTACAAGAAACATCAGACATATTGCTAGTACATTTTTATTAACCATTTTCTTATTCTTT
TTTT**TCTTTAAATGTTTTTTTGTTTTTTTT**GTAATTTTTAGAAAT

QA 1 469 1 469
DS 

RD RS1AZ05TF 660 0 0
TC
ACAATGGAGTTA*CATCAACGTCAAGCCCTAGCTTCGATATATCCATCGACTTTC*TACT
CTCAACTCCACAGCCGTTTTCACCAATATAGCGATCGTTTTAGTCCAATGCACCATAGCC
ACGACCAACCCTTTCCTTTGCTGAAATGTCATACTCTGTGAACCACTTTTCTTCTGCTCA
ATCAAAGTTTTTACCATTGACAGCATTGCATCTCTAAAATCCGTATTTGATGGTGCTCTG
CCTTTAACAGCAGTTAATTCCGACATAGCACTGGCTAGGCCATCAACTTGTGATGTGATC
TGTGTATCTGTGCTTTTCGATGTGGCCGAGGCATTGCTGATGAATTTCACGTAAGACGTG
AAGAGTGAAAAGAATTTCTTGAACTCTCTAGTCGCGGGACACCCACGACGAAGTGTACTC
GTCAAAAGTAACATACCGTTGCATGCGAATGGTGTAAAGTCCGTGGCCCTTCGTACGAAT
TTCCTCCTCAAGTACATCTTTAGCAAGAACGTTCCTTGCGCCTCGTACACCACACTTGAT
GCTACTAGAAACATCAGACATATTGCTAGTACATTTTTATTAACCATTTTCTTATTCTTT
TTTTTTTCTTTAAATGTTTTTTTGTCTTTTTT**GTAATTTTTAGAAATTTCTGATCC

QA 3 660 3 660
DS 



AS 2 8

CO CL385Contig1 269 2 3 U
CAAAGCAAATGTTTTAGTATATTATTAAACCAAACACCAATTTGAACCAAAACCATACAA
CGATACTTGAAAAAACCTTTATTTCTAGCGACTATTTCTTAAACATTGCTTCTTCTTTAA
AAAAAAAATCCACCCCCACAAGCTAAAACGGTAAACAAACCCTTTTGAAAAACATAAATT
GAGCCGGGGTCAAAGGGGTTTGCAGTACCATTCTTATTGGTGTTCACAGCTTTGAAGGCT
TGGGGAAAATGTCAGGGGTGAACTTCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RS1A588JQ U 1
AF RS1H703JQB U 7
BS 1 16 RS1A588JQ
BS 17 17 RS1H703JQB
BS 18 269 RS1A588JQ

RD RS1A588JQ 269 0 0
CAAAGCAAATGTTTTATTATATTATTAAACCAAACACCAATTTGAACCAAAACCATACAA
CGATACTTGAAAAAACCTTTATTTCTAGCGACTATTTCTTAAACATTGCTTCTTCTTTAA
AAAAAAAATCCACCCCCACAAGCTAAAACGGTAAACAAACCCTTTTGAAAAACATAAATT
GAGCCGGGGTCAAAGGGGTTTGCAGTACCATTCTTATTGGTGTTCACAGCTTTGAAGGCT
TGGGGAAAATGTCAGGGGTGAACTTCTGC

QA 1 269 1 269
DS 

RD RS1H703JQB 259 0 0
AAATGTTTTAGTATATTATTAAACCAAACACCAATTTGAACCAAAACCATACAACGATAC
TTGAAAAAACCTTTTTTTCTAGCGACTATTTCTTAAACATTGCTTCTTCTTTAAAAAAAA
A*TCCCCCCCCCCAAGCTAAAACGGTAAACAAACCCTTTTGAAAAACATAAATTGAGCCT
GGGTCAAAGGGGTTTGCAGTACCATTCTTATTGGTGTTCACAGCTTTGAAGGCTTGGGGA
AAATGTCAGGGGTGAACTT

QA 1 259 1 259
DS 



CO CL385Contig2 631 6 8 U
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TGGATATGATGAAGCAGCATCTCTCCACCGACGCCGGTAAAGAGCTCACAGAGAAGATCG
GCCTCGTTTATCAGATCAACGTCGCTCCCAAGAAATTGGGGTTTGAAGAGGTTACCTACA
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CTACTTTCTCCTTCAAAGATGATGACTTTGTCAAAGTTGCTACTGGCAAGATGAATCCTC
AGATTGCTTTCATTAGGGGTGCGATGAAGATCAAGGGTAGTCTCAGTGCTGCGCAGAAGT
TCACCCCTGACATTTTCCCCAAGCCTTCAAAGCTGTGAACACCAATAAGAATGGTACTGC
AAACCCCTTTGACCCAGGCTCAATTTATGTCTTTCAAAAGGGTTTGTTTACCGTTTTAGC
TTGTGGGGGTGGATTTTTTTTTT*AAAGAAGAAGCAATGTTTAAGAACTAGTCGCTAGAA
ATAAAGGTCTCTTCAAGTATCGTTGTATGGTTCTGGTTCAAATTGGTGTTTGGTTTAATA
ATATACTAAAACATTTGCTTTGAATAGAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 10 10 10 10 

AF RS1AE05TF U 1
AF RS1B566JQ C 5
AF RS1A588TF U 9
AF RS1B566TF U 5
AF RS1H703TF U 85
AF RS1BK16TF U 434
BS 1 282 RS1AE05TF
BS 283 283 RS1A588TF
BS 284 502 RS1AE05TF
BS 503 503 RS1A588TF
BS 504 533 RS1AE05TF
BS 534 534 RS1A588TF
BS 535 627 RS1AE05TF
BS 628 631 RS1H703TF

RD RS1AE05TF 627 0 0
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TGGATATGATGAAGCAGCATCTCTCCACCGACGCCGGTAAAGAGCTCACAGAGAAGATCG
GCCTCGTTTATCAGATCAACGTCGCTCCCAAGAAATTGGGGTTTGAAGAGGTTACCTACA
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CTACTTTCTCCTTCAAAGATGATGACTTTGTCAAAGTTGCTATTGGCAAGATGAATCCTC
AGATTGCTTTCATTAGGGGTGCGATGAAGATCAAGGGTAGTCTCAGTGCTGCGCAGAAGT
TCACCCCTGACATTTTCCCCAAGCCTTCAAAGCTGTGAACACCAATAAGAATGGTACTGC
AAACCCCTTTGACCCAGGCTCAATTTATGTCTTTCAAAAGGGTTTGTTTACCGTTTTAGC
TTGTGGGGGTGGATTTTTTTTT**AAAGAAGAAGCAATGTTTAAGAACTAGTCACTAGAA
ATAAAGGTCTCTTCAAGTATCGTTGTATGGTTCTGGTTCAAATTGGTGTTTGGTTTAATA
ATATACTAAAACATTTGCTTTGAATAG

QA 1 627 1 627
DS 

RD RS1B566JQ 623 0 0
GGACTC
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GGATTTTTTTTTT*AAAGAAGAAGCAATGTTTAAGAACTAGTCGCTAGAAATAAAGGTCT
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ACATTTGCTTTGAATAG

QA 7 623 7 623
DS 

RD RS1A588TF 614 0 0
GG
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GAAGCAGCATCTCTCCACCGACGCCGGTAAAGAGCTCACAGAGAAGATCGGCCTCGTTTA
TCAGATCAACGTCGCTCCCAAGAAATTGGGGTTTGAAGAGGTTACCTACATCGTTGATCT
GAAGAAAGGAGAAGTCACCAAAGGAAAATACGAAGGAGGGAAAGTGGATGCTACTTTCTC
CTTCAAAGATGATGACTTTGTCAAAGTTGCTACTGGCAAGATGAATCCTCAGATTGCTTT
CATTAGGGGTGCGATGAAGATCAAGGGTAGTCTCAGTGCTGCGCAGAAGTTCACCCCTGA
CATTTTCCCCAAGCCTTCAAAGCTGTGAACACCAATAAGAATGGTACTGCAAACCCCTTT
GACCCAGGCTCAATTTATGTCTTTCAAAAGGGTTTGTTTACCGTTTTAGCTTGTGGGGGT
GGATTTTTTTTTT*AAAGAAGAAGCAATGTTTAAGAACTAGTCGCTAGAAATAAAGGTCT
CTTCAAGTATCGTTGTATGGTTCTGGTTCAAATTGGTGTTTGGTTTAATAATATACTAAA
ACATTTGCTTTG

QA 3 614 3 614
DS 

RD RS1B566TF 623 0 0
GGACTC
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TCAGATCAACGTCGCTCCCAAGAAATTGGGGTTTGAAGAGGTTACCTACATCGTTGATCT
GAAGAAAGGAGAAGTCACCAAAGGAAAATACTAAGGAGGGAAAGTGGATGCTACTTTCTC
CTTCAAAGATGATGACTTTGTCAAAGTTGCTACTGGCAAGATGAATCCTCAGATTGCTTT
CATTAGGGGTGCGATGAAGATCAAGGGTAGTCTCAGTGCTGCGCAGAAGTTCACCCCTGA
CATTTTCCCCAAGCCTTCAAAGCTGTGAACACCAATAAGAATGGTACTGCAAACCCCTTT
GACCCAGGCTCAATTTATGTCTTTCAAAAGGGTTTGTTTACCGTTTTAGCTTGTGGGGGT
GGATTTTTTTTTT*AAAGAAGAAGCAATGTTTAAGAACTAGTCGCTAGAAATAAAGGTCT
CTTCAAGTATCGTTGTATGGTTCTGGTTCAAATTGGTGTTTGGTTTAATAATATACTAAA
ACATTTGCTTTGAATAG

QA 7 623 7 623
DS 

RD RS1H703TF 547 0 0
G
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CACCAAAGGAAAATACGAAGGAGGGAAAGTGGATGCTACTTTCTCCTTCAAAGATGATGA
CTTTGTCAAAGTTGCTACTGGCAAGATGAATCCTCAGATTGCTTTCATTAGGGGTGCGAT
GAAGATCAAGGGTAGTCTCAGTGCTGCGCAGAAGTTCACCCCTGACATTTTCCCCAAGCC
TTCAAAGCTGTGAACACCAATAAGAATGGTACTGCAAACCCCTTTGACCCAGGCTCAATT
TATGTCTTTCAAAAGGGTTTGTTTACCGTTTTAGCTTGTGGGGGTGGATTTTTTTTT**A
AAGAAGAAGCAATGTTTAAGAACTAGTCGCTAGAAATAAAGGTCTCTTCAAGTATCGTTG
TATGGTTCTGGTTCAAATTGGTGTTTGGTTTAATAATATACTAAAACATTTGCTTTGAAT
AGAAAA

QA 2 547 2 547
DS 

RD RS1BK16TF 197 0 0
G
CAGGCTCAATTTATGTCTTTCAAAAGGGTTTGTTTACCGTTTTAGCTTGTGGGGGTGGAT
TTTTTTTTTTAAAGAAGAAGCAATGTTTAAGAACTAGTCGCTAGAAATAAAGGTCTCTTC
AAGTATCGTTGTATGGTTCTGGTTCAAATTGGTGTTTGGTTTAATAATATACTAAAACAT
TTGCTTTGAATAG
AAA

QA 2 194 2 194
DS 



AS 2 9

CO CL386Contig1 718 2 5 U
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AACTGCAATACAATAAACAGTTCAAGATAACCGAGGGGGCCTGGTGTTTAGATGCGAATA
AAAAAAACGAGAAGTACACAAAGGTGTGTTCCCAACATTCATATGCTGCTTAGTCTTTCC
TCAAGTCCATGACTTCGGTCCTGATGCCATCGGCCTTAAAAATCATGATCTCAAGCTTGT
CTCCAGTGTAGATATCCCTCTCAGTGGCAGATGCGAAAACAGTCTTGACCAAGTCAACTG
CTTCAGGTTCGGAAAGGGGCGTGATAGCATCCTGTGCAGGGAGCAGAAGTGGGCTGGGAC
TCTTGAGTTGATTGTCAAGGAAAGGCATGATTAGAGTGGAACCAGAACCTTGAGCACTGT
ATCCAACCTTCTCATACGAACCAACAGCATCGTAAGTAAAGACGCATCCTTTACCGTCCT
CGTCAAGCCCTCCAAGAACATTAAATGCATAGTAAGGAAAAAAGCGCTTAAAGTAAAGCG
TGTTGGAGAGAAGATGAGCCATCGCAGGACAGCTCATCTGCTTGTTATGCTGATGCTGAT
AAACCAAGTGCCTTGATTTCAAAACTTTCTGCAACGCTTTCACATCAGCCTGAAAGCCAG
AGGAAGAGAGCACAGCTTTGTCTGCTAGTTTATGGATTTTGGAGTAATCGCGAGTGAG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F617JQ U 6
AF RS1BD74JQ U 1
BS 1 121 RS1BD74JQ
BS 122 122 RS1F617JQ
BS 123 219 RS1BD74JQ
BS 220 220 RS1F617JQ
BS 221 718 RS1BD74JQ

RD RS1F617JQ 653 0 0
ATAACAACACTCCAAAATAACTTTGTCATAAAGGAAACTTCAAGCAAAAGTTGATAACTG
CAATACAATAAACAGTTCAAGATAACCGAGGGGGCCTGGTGTTTAGATGCGAATAAAAAA
AACGAGAAGTACACAAAGGTGTGTTCCCAACATTCATATGCTGCTTAGTCTTTCCTCAAG
TCCATGACTTCGGTCCTGATGCCATCGGCCTTAAAAATCATGATCTCAAGCTTGTCTCCA
GTGTAGATATCCCTCTCAGTGGCAGATGCGAAAACAGTCTTGACCAAGTCAACTGCTTCA
GGTTCGGAAAGGGGTGTGATAGCATCCTGTGCAGGGAGCAGAAGTGGGCTGGGACTCTTG
AGTTGATTGTCAAGGAAAGGCATGATTAGAGTGGAACCAGAACCTTGAGCACTGTATCCA
ACCTTCTCATACGAACCAACAGCATCGTAAGTAAAGACGCATCCTTTACCGTCCTCGTCA
AGCCCTCCAAGAACATTAAATGCATAGTAAGGAAAAAAGCGCTTAAAGTAAAGCGTGTTG
GAGAGAAGCTGAGCCATCGCAGGACAGCTCATCTGCTTGTTATGCTGATGCTGATAAACC
AAGTGCCTTGATTTCAAAACTTTCTGCAACGCTTTCACATCAGCCTGAAAGCC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RS1BD74JQ 718 0 0
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AACTGCAATACAATAAACAGTTCAAGATAACCGAGGGGGCCTGGTGTTTAGATGCGAATA
AGAAAAACGAGAAGTACACAAAGGTGTGTTCCCAACATTCATATGCTGCTTAGTCTTTCC
TCAAGTCCATGACTTCGGTCCTGATGCCATCGGCCTTAAGAATCATGATCTCAAGCTTGT
CTCCAGTGTAGATATCCCTCTCAGTGGCAGATGCGAAAACAGTCTTGACCAAGTCAACTG
CTTCAGGTTCGGAAAGGGGCGTGATAGCATCCTGTGCAGGGAGCAGAAGTGGGCTGGGAC
TCTTGAGTTGATTGTCAAGGAAAGGCATGATTAGAGTGGAACCAGAACCTTGAGCACTGT
ATCCAACCTTCTCATACGAACCAACAGCATCGTAAGTAAAGACGCATCCTTTACCGTCCT
CGTCAAGCCCTCCAAGAACATTAAATGCATAGTAAGGAAAAAAGCGCTTAAAGTAAAGCG
TGTTGGAGAGAAGATGAGCCATCGCAGGACAGCTCATCTGCTTGTTATGCTGATGCTGAT
AAACCAAGTGCCTTGATTTCAAAACTTTCTGCAACGCTTTCACATCAGCCTGAAAGCCAG
AGGAAGAGAGCACAGCTTTGTCTGCTAGTTTATGGATTTTGGAGTAATCGCGAGTGAG

QA 1 718 1 718
DS 



CO CL386Contig2 947 7 41 U
GGATGCTCCAATCTCTCTCGACCCTCTTCTTCCTCTTTGCTAACAAAGCATCCCT**TTT
TTGCTGAAGACGGAGAAGCTCCATGACGAAGCAGCACGCGAACTGGTCTCCTTACGATAA
CAACGGAGGAACATGTGTGGCCATAGCTGGATCGGATTACTGCGTTATCGCCGCCGATAC
TCGGATGTCTACCGGTTACAGTATTCTCACTCGCGATTACTCCAAAATCCATAAACTAGC
AGACAAAGCTGTGCTCTCTTCCTCTGGCTTTCAGGCTGATGTGAAAGCGTTGCAGAAAGT
TTTGAAATCAAGGCACTTGGTTTATCAGCATCAGCATAACAAGCAGATGAGCTGTCCTGC
GATGGCTCAGCTTCTCTCCAACACGCTTTACTTTAAACGCTTTTTTCCTTACTATGCCTT
TAATGTTCTTGGAGGGCTTGACGAGGAAGGTAAAGGATGCGTCTTCACCTACGATGCTGT
TGGTTCCTATGAGAAGGTTGGATACAGTGCTCAGGGTTCTGGTTCCACTCTAATCATGCC
TTTCCTTGACAATCAACTCAAGAGTCCCAGCCCACTTCTGCTACCCGCACAGGATGCCAT
CACACCCCTTTCCGAACTTGAAGCAGTTGACTTGGTCAAGACTGTGTTCGCATCTGCCAC
TGAGAGGGATATCTACACTGGAGACAAGCTTGAGATCATGATTCTCAAAGCCGATGGCAT
CAGGACCGAAGTCATGGACTTGAGGAAAGACTAAGAAAAAGCATAAGAGTGTTCGAGGAC
ACAACTTTGTTCGTTTTTCTTATTCGCATCTCAACATTAGGCTCCCTTGGTTATCTTGAA
CTGTGTTATTGGCTTGATGTATTGCAGTTATCAACTCATGCTTGAAGTTTCCTTTATGAC
AAAAGTTCTTTTGGAGAGTTTTAATAACAATATTCGATTTCTTAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1BD74TF U 1
AF RS1F617TF U 10
AF RS1FW17TF U 18
AF RS1DP20TF U 81
AF RS1AI78TF U 27
AF RS1DP20JQ C 176
AF RS1AI78JQ C 407
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RD RS1BD74TF 705 0 0
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AGACAAAGCTGTGCTCTCTTCCTCTGGCTTTCAGGCTGATGTGAAAGCGTTGCAGAAAGT
TTTGAAATCAAGGCACTTGGTTTATCAGCATCAGCATAACAAGCAGATGAGCTGTCCTGC
GATGGCTCATCTTCTCTCCAACACGCTTTACTTTAAGCGCTTTTTTCCTTACTATGCATT
TAATGTTCTTGGAGGGCTTGACGAGGACGGTAAAGGATGCGTCTTTACTTACGATGCTGT
TGGTTCGTATGAGAAGGTTGGATACAGTGCTCAAGGTTCTGGTTCCACTCTAATCATGCC
TTTCCTTGACAATCAACTCAAGAGTCCCAGCCCACTTCTGCTCCCTGCACAGGATGCTAT
CACGCCCCTTTCCGAACCTGAAGCAGTTGACTTGGTCAAGACTGTTTTCGCATCTGCCAC
TGAGAGGGATATCTACACTGGAGACAAGCTTGAGATCATGATTCT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RS1F617TF 710 0 0
GG
TCTCTCTCGACCCTCTTCTTCCTCTTTGCTAACAAAGCATCCCT**TTTTTGCTGAAGAC
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CCGGTTACAGTATTCTCACTCGCGATTACTCCAAAATCCATAAACTAGCAGACAAAGCTG
TGCTCTCTTCCTCTGGCTTTCAGGCTGATGTGAAAGCGTTGCAGAAAGTTTTGAAATCAA
GGCACTTGGTTTATCAGCATCAGCATAACAAGCAGATGAGCTGTCCTGCGATGGCTCAGC
TTCTCTCCAACACGCTTTACTTTAAGCGCTTTTTTCCTTACTATGCATTTAATGTTCTTG
GAGGGCTTGACGAGGACGGTAAAGGATGCGTCTTTACTTACGATGCTGTTGGTTCGTATG
AGAAGGTTGGATACAGTGCTCAAGGTTCTGGTTCCACTCTAATCATGCCTTTCCTTGACA
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CCGAACCTGAAGCAGTTGACTTGGTCAAGACTGTTTTCGCATCTGCCACTGAGAGGGATA
TCTACACTGGAGACAAGCTTGAGATCATGATTCTTAA*GCCGATGGCA

QA 3 710 3 710
DS 

RD RS1FW17TF 645 0 0
GGGACT
CTCTTCTTCCTCTTTGCTAACAAAGCATCCCT**TTTTTGCTGAAGACGGAGAAGCTCCA
TGACGAAGCAGCACGCGAACTGGTCTCCTCACGATAACAACGGAGGAACATGTGTGGCCA
TAGCTGGATCGGATTACTGCGTTATCGCCGCCGATACTCGGATGTCTACCGGTTACGGTA
TTCTCACTCGCGATTACTCCAAAATCCATAAACTAGCAGACAAAGCTGTGCTCTCTTCCT
CTGGCTTTCAGGCTGATGTGAAAGCGTTGCAGAAAGTTTTGAAATCAAGGCACTTGGTTT
ATCAGCATCAGCATAACAAGCAGATGAGCTGTCCTGCGATGGCTCAGCTTCTCTCCAACA
CGCTTTACTTTAAGCGCTTTTTTCCTTACTATGCATTTAATGTTCTTGGAGGGCTTGACG
AGGACGGTAAAGGATGCGTCTTTACTTACGATGCTGTTGGTTCGTATGAGAAGGTTGGAT
ACAGTGCTCAAGGTTCTGGTTCCACTCTAATCATGCCTTTCCTTGACAATCAACTCAAGA
GTCCCAGCCCACTTCTGCTCCCTGCACAGGATGCTATCACACCCCTTTCCGAACCTGAAG
CAGTTGACTTGGTCAAGACTGTTTTCGCATCTGCCACTG

QA 7 645 7 645
DS 

RD RS1DP20TF 639 0 0
GA
ATGACGAAGCAGCACGCGAACTGGTCTCCTTACGATAACAACGGAGGAACATGTGTGGCC
ATAGCTGGATCCGATTACTGCGTTATCGCCGCCGATACTCGGATGTCTACCGGTTACAGT
ATTCTCACTCGCGATTACTCCAAAATCCATAAACTAGCAGACAAAGCTGTGCTCTCTTCC
TCTGGCTTTCAGGCTGATGTGAAAGCGTTGCAGAAAGTTTTGAAATCAAGGCACTTGGTT
TATCAGCATCAGCATAACAAGCAGATGAGCTGTCCTGCGATGGCTCAGCTTCTCTCCAAC
ACGCTTTACTTTAAACGCTTTTTTCCTTACTATGCCTTTAATGTTCTTGGAGGGCTTGAC
GAGAAAGGTAAAGGATGCGTCTTCACCTACGATGCTGTTGGTTCCTATGAGAAGGTTGGA
TACAGTGCTCAGGGTTCTGGTTCCACTCTAATCATGCCTTTCCTTGACAATCAACTCAAG
AGTCCCAGCCCACTTCTGCTACCCGCACAGGATGCCATCACACCCCTTTCCGAACTTGAA
GCAGTTGACTTGGTCAAGACTGTGTTCGCATCTGCCACTGAGAGGGATATCTACACTGGA
GACAAGCTTGAGATCATGATTCTCAAAGCCGATGGCA

QA 3 639 3 639
DS 

RD RS1AI78TF 861 0 0
GG
CTTCCTCTTTGCTAACAAAGCATCCCTCCTTTTTGCTGAAGACGGAGAAGCTCAATGACG
AAGCAGCACGCGAACTGGTCTCCTTACGATAACAACGGAGGAACATGTGTGGCCATAGCT
GGATCCGATTACTGCGTTATCG**GCCGATACTCGGATGTCTACCGGTTACAGTATTCTC
ACTCGCGATTACTCCAAAATCCATAAACTAGCAGACAAAGCTGTGCTCTCTTCCTCTGGC
TTTCAGGCTGATGTGAAAGCGTTGCAGAAAGTTTTGAAATCAAGGCACTTGGTTTATCAG
CATCAGCATAACAAGCAGATGAGCTGTCCTGCGATGGCTCAGCTTCTCTCCAACACGCTT
TACTTTAAACGCTTTTTTCCTTACTATGCCTTTAATGTTCTTGGAGGGCTTGACGAGGAA
GGTAAAGGATGCGTCTTCACCTACGATGCTGTTGGTTCCTATGAGAAGGTTGGATACAGT
GCTCAGGGTTCTGGTTCCACTCTAATCATGCCTTTCCTTGACAATCAACTCAAGAGTCCC
AGCCCACTTCTGCTACCCGCACAGGATGCCATCACACCCCTTTCCGAACTTGAAGCAGTT
GACTTGGTCAAGACTGTGTTCGCATCTGCCACTGAGAGGGATATCTACACTGGAGACAAG
CTTGAGATCATGATTCTCAAAGCCGATGGCATCAGGACCGAAGTCATGGACTTGAGGAAA
GACTAAGAAAA*GCATAAGAGTGTTCGAGGACACAACTTTGTTCGTTTTTCTTATTCGCA
TCTCAACATTAG*CTCCCTTGGTTATCTTGAACTGTGTTATTGGCTTGATGTATTGCAGT
TATCAACTCATGCTTGA
GT

QA 3 859 3 859
DS 

RD RS1DP20JQ 772 0 0
GATACTCGGATGTCTACCGGTTACAGTATTCTCACTCGCGATTACTCCAAAATCCATAAA
CTAGCAGACAAAGCTGTGCTCTCTTCCTCTGGCTTTCAGGCTGATGTGAAAGCGTTGCAG
AAAGTTTTGAAATCAAGGCACTTGGTTTATCAGCATCAGCATAACAAGCAGATGAGCTGT
CCTGCGATGGCTCAGCTTCTCTCCAACACGCTTTACTTTAAACGCTTTTTTCCTTACTAT
GCCTTTAATGTTCTTGGAGGGCTTGACGAGAAAGGTAAAGGATGCGTCTTCACCTACGAT
GCTGTTGGTTCCTATGAGAAGGTTGGATACAGTGCTCAGGGTTCTGGTTCCACTCTAATC
ATGCCTTTCCTTGACAATCAACTCAAGAGTCCCAGCCCACTTCTGCTACCCGCACAGGAT
GCCATCACACCCCTTTCCGAACTTGAAGCAGTTGACTTGGTCAAGACTGTGTTCGCATCT
GCCACTGAGAGGGATATCTACACTGGAGACAAGCTTGAGATCATGATTCTCAAAGCCGAT
GGCATCAGGACCGAAGTCATGGACTTGAGGAAAGACTAAGAAAAAGCATAAGAGTGTTCG
AGGACACAACTTTGTTCGTTTTTCTTATTCGCATCTCAACATTAGGCTCCCTTGGTTATC
TTGAACTGTGTTATTGGCTGGATGTATTGCAGTTATCAACTCATGCTTGAAGTTTCCTTT
ATGACAAAAGTTCTTTTGGAGAGTTTTAATAACAATATTCGATTTCTTAGCT

QA 1 772 1 772
DS 

RD RS1AI78JQ 541 0 0
CCTTACTATGCCTTTAATGTTCTTGGAGGGCTTGACGAGGAAGGTAAAGGATGCGTCTTC
ACCTACGATGCTGTTGGTTCCTATGAGAAGGTTGGATACAGTGCTCAGGGTTCTGGTTCC
ACTCTAATCATGCCTTTCCTTGACAATCAACTCAAGAGTCCCAGCCCACTTCTGCTACCC
GCACAGGATGCCATCACACCCCTTTCCGAACTTGAAGCAGTTGACTTGGTCAAGACTGTG
TTCGCATCTGCCACTGAGAGGGATATCTACACTGGAGACAAGCTTGAGATCATGATTCTC
AAAGCCGATGGCATCAGGACCGAAGTCATGGACTTGAGGAAAGACTAAGAAAAAGCATAA
GAGTGTTCGAGGACACAACTTTGTTCGTTTTTCTTATTCGCATCTCAACATTAGGCTCCC
TTGGTTATCTTGAACTGTGTTATTGGCTTGATGTATTGCAGTTATCAACTCATGCTTGAA
GTTTCCTTTATGACAAAAGTTCTTTTGGAGAGTTTTAATAACAATATTCGATTTCTTAGC
T

QA 1 541 1 541
DS 



AS 1 9

CO CL387Contig1 1320 9 10 U
GGATCAAAAAGTTTTCATTCTCCCTCCCAACCCAAAATTTCGAGATTCACTCTCAATTTT
TTTTCCTTGTTTCAGATCTATCCATATTCTTTCTCTCTCCCTCCTCTTCCATTCACTTCT
CTCTCTCTCTCCTTTTCTATTCACTTCTCTCTCTCCCTCCTCTTCTATTCTTCATGGCCA
TTATCAAGCTTCCTAACCTCCCATCAGATCTGCTCGTTGTGCTCTGTCTCTCTGAAAGTG
AGCCTCCTCGACTGTTCCCTTCATCGATCGCCTAGGATGAAAAATCTCTTGCCGCCCTAA
TTGATACTCTAAAGGACTCTTCCGCTCCACCCTCTTCAGCTCCTCTGACAAAATCGAACA
GGCAGACTGTTCAATATGCAAAAGCTCCAAACAACGCTCCACAGGCTTTGCTTGTTTTGT
GGTCAAATCGACCAAGATCCTCTCTCCCTAATTGTTTCTTCATGTTCTTGATTTTATTCC
TTAACTTTCTAAACCTTTTCTGGTGCTCTTGCTAGTGTGATTGTTGAGGCTATGAAAGTT
GTCAGCTTGCAGAGGCTCTGCTCCTCTCTGAAACCTATTCACCGTCGAGTTCTAGAGAGC
GAGAAACTTTGAAATTATTAGCCGTCTACGACGAAGAAGATGACCGGAGGAGGCAGATAC
GGCGGCGCATCAGGTAAACTCGTACGCTCATCAATGAAGAGAGAAGAGCATCAAGGCTCA
GATCTGGGATACCACCGGTTAATAAAGTTCTATGCGAGGTGCAGAGGCTAAAGCTGCTTG
CCCTGAGATGCAGTTGGTTCAAGTTCCTGTGTCTCGT***GGGAAGCTACGCAAAGAATG
GATGTCATGGTGGCTGCTTTGGAAGCTACCGGGTTTTGGACGCTGGCTGATATTGGTTGC
TTGGCTGCTTCTCTTCTACCGGGAACAATCAAAGTAGAAGAGCAAATTGTTAAAAGGTCC
TTCTCAGATACAGAGCAACACATTGGCTGCTTTGGAAGCCATTGATGTTCCCGTTGCTGA
AGAAGTTATGGACGCTGGCTGTATCACCGGTGATCGGATTAACGGTCTCGTCGATGGTGT
CTCTGGTGCTTGGTTTATCAAGTTTGATACTTTCACTCCTGCGGTGTCACGAGGACTTCC
TGTGACTCGGGTGATATTGTTTTTGGTGTATAGGTTAGGACTAACTTGTTTGGTAGAAGT
GAAGCTACTTACTCAGGCTACACTTGTTATACTGGCATTGCAGATTTTGTACCGGTTGTT
ATTGAGTCTGTTGGGTATGTTGTATTCAAAGCAAAATATCAAAAATGACGTTTTTTTCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RS1GV37TF U 72
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GG
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GGACTCTTCCGCTCCACCCTCTTCAGCTCCTCTGACAAAATCGAACAGGCAGACTGTTCA
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AAGATCCTCTCTCCCTAATTGTTTCTTCATGTTCTTGATTTTATTCCTTAACTTTCTAAA
CCTTTTCTGGTGCTCTTGCTAGTGTGATTGTTGAGGCTATGAAAGTTGTCAGCTTGCAGA
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QA 3 598 3 598
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CTCTCTCTCTCCTTTTCTATTCACTTCTCTCTCTCCCTCCTCTTCTATTCTTCATGGCCA
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GGTCAAATCGACCAAGATCCTCTCTCCCTAATTGTTTCTTCATGTTCTTGATTTTATTCC
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GATCTGGGATACCACCGGTTAATAAAGTTCTATGCGAGGTGCAGAG*CTAAAGCTG

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CCTTGTTTC
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TAACCTCCCATCAGATCTGCTCGTTGTGCTCTGTCTCTCTGAAAGTGAGCCTCCTCGACT
GTTCCCTTCATCGATCGCCTAGGATGAAAAATCTCTTGCCGCCCTAATTGATACTCTAAA
GGACTCTTCCGCTCCACCCTCTTCAGCTCCTCTGACAAAATCGAACAGGCAGACTGTTCA
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AAGATCCTCTCTCCCTAATTGTTTCTTCATGTTCTTGATTTTATTCCTTAACTTTCTAAA
CCTTTTCTGGTGCTCTTGCTAGTGTGATTGTTGAGGCTATGAAAGTTGTCAGCTTGCAGA
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TGC

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GAGCCTCCTCGACTGTTCCCTTCATCGATCGCCTAGGGTGAAAAATCTCTTGCCGCCCTA
ATTGATACTCTAAAGGACTCTTCCGCTC*ACCCTCTTCAGCTCCTCTGACAAAATCGAAC
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CTTAACTTTCTAAACCTTTTCTGGTGCTCTTGCTAGTGTGATTGTTGAGGCTATGAAAGT
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CGAGAAACTTTGAAATTATTAGCCGTCTACGACGAAGAAGATGACCGTAGGAGGCAGATA
CGGCGGCGCATCAGGTAAACTCGTACGCTCATCAATGAAGAGAGAAGAGCATCAAGGCTC
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GCCCTGAGATGCAGTTGGTTCAAGTTCCTGTGTCTCGT***GGGAAGCTACGCAAAGAAT
GGATGTCATGGTGGCTGCTTTGG

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G
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TTAATAAAGTTCTATGCGAGGTGCAGAGGCTAAAGCTGCTTGCCCTGAGATGCAGTTGGT
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DS 

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*GGGAAGCTACGCAAAGAATGGATGTCATGGTGGCTGCTTTGGAAGCTACCGGGTTTTGG
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GAGCAAATTGTTAAAAGGTCCTTCTCAGATACAGAGCAACACATTGGCTGCTTTGGAAGC
CATTGATGTTCCCGTTGCTGAAGAAGTTATGGACGCTGGCTGTATCACCGGTGATCGGAT
TAACGGTCTCGTCGATGGTGTCTCTGGTGCTTGGTTTATCAAGTTTGATACTTTCACTCC
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GCAGATTTTGTACCGGTTGTTATTGAGTCTGTTGGGTATGTTGTATTCAAAGCAAAATAT
CAAAAATGACGTTTTTTTC
AT

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DS 

RD RS1GV56JQ 665 0 0
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AGGCTCAGATCTGGGATACCACCGGTTAATAAAGTTCTATGCGAGGTGCAGAGGCTAAAG
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TGGTTGCTTGGCTGCTTCTCTTCTACCGGGAACAATCAAAGTAGAAGAGCAAATTGTTAA
AAGGTCCTTCTCAGATACAGAGCAACACATTGGCTGCTTTGGAAGTCATTGATGTTCCCG
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ATGGTGTCTCTGGTGCTTGGTTTATCAAGTTTGATACTTTCACTCCTGCGGTGTCACGAG
GACTTCCTGTGACTCGGGTGATATTGTTTTTGGTGTATAGGTTAGGACTAACTTGTTTGG
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GGTTGTTATTGAGTCTGTTGGGTATGTTGTATTCAAAGCAAAATATCAAAAATGACGTTT
TTTTC

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1GV37JQ 725 0 0
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GATACGGCGGCGCATCAGGTAAACTCGTACGCTCATCAATGAAGAGAGAAGAGCATCAAG
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GCTTGCCCTGAGATGCAGTTGGTTCAAGTTCCTGTGTCTCGTGCAGGGAAGATACGCAAA
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GGTCCTTCTCAGATACAGAGCAACACATTGGCTGCTTTGGAAGCCATTGATGTTCCCGTT
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GGTGTCTCTGGTGCTTGGTTTATCAAGTTTGATACTTTCACTCCTGCGGTGTCACGAGGA
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TTGTTATTGAGTCTGTTGGGTATGTTGTATTCAAAGCAAAATATCAAAAATGACGTTTTT
TTC
AC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 8

CO CL388Contig1 1293 8 18 U
GGAACTTAAAACATAGAAAGATGTTGAATGTACTAAGAAATGCTAACCTGACCCTTGTTG
TTTTGATTTGCTTTGTGCTGATAGCTTCAAGGCTGTGTTCCGCCAATTCTTCTGTGTACA
ACCCACACAACACCCTGATGAAGAAGCAGTTCGGAGAATGGCTTCAATACCACGGAAAAT
CATATGTAGAAAAGGATGAGTGGATGTATAGGTTTGGGATATACCAGTCTAATCTCCAGT
GGATTGACTATGTCAACTCCCTCCACTTGTCCTTTAACTTAGCGGAAAACAGATTTGCTG
ACATGACCAACTCTGAGTTTAAGGCCAATTTTCTCGGGTTGAACACGTCTTCCTTGAGGT
TAAACAGCGACTATGTGCGGGCTTGTGAACCATCAGGCAATGTGCCGGCCGCTGTGGACT
GGAGGAAAGAAGGTGCTGTGACTCCTATTAGAGATCAAGGAAAATGCGGAGGCTGCTGGG
CTTTCGCCACAGTTTCAGCTATTGAAGGAATCAATAAGATAAACACAGGGAATTTAGTAA
CTCTCTCAGAACAACAACTCATAGATTGTGATACCGGCAGTTACAACAAAGGGTGTAGTG
GTGGATTAGTGGAAACAGCCTATGAATACCTCATAGCTAATGGTGGACTCGTCGCCTTGG
ACGACTACCCATACACAGCCACAGATGGTACCGGCTGCGACCAAGAAAAATCCAAAAATA
AGATCGTTACAATTACAGGATACCAAAAGGTAGCACCGAATGAGGCGAGCCTAGAAGTCG
CTGCTGCTCAGCAACCAGTGTCAGTTGGAATCGACGCTGACGGGTTTATCTTTCAGTTCT
ACTCTTCTGGTATTTTCACAGGTTACTGTGGGTCAAGTTTCAACCATGCTGTGACTGTTG
TTGGATATGGAGAAGAAGACGGTCAAAAGTACTGGATCGTGAAGAATACATGGGGAACTG
GTTGGGGTGAAGAAGGCTACATACGGATGGAACGTGGTTATCGTAAAGACAGGGGTAAAT
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AACCAGGGTGCTGTTTACAGGATTCCAAAGATAAGATGTGTCTAGTCTGGATATAATACC
TGCCCAGTTAAGCACACGAGATTCGCTTGAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 25 10 25 25 10 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1AW96TF U 54
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GGATTGACTATGTCAACTCCCTCCACTTGTCCTTTAACTTAGCGGAAAACAGATTTGCTG
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GTGGATTAATGGAAACAGCCTATGAATACCTTATAGCTAATGGTGGACTCGTCGCCTTGG
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AAAAT

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G
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AG

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GA
C

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DS 

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TC
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ATATGGAGAAGAAGACGGTCAAAAGTACTGGATCGTGAAGAATACATGGGGAACTGGTTG
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TATTACTATGCTGGCGAGCTATCCCTTGCAGTGAGTCCACGAACTCCAGAAGATTAAGAG
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AGGGTGCTGTTTACAGGATTCCAAAGATAAGATGTGTCTAGTCTGGATATAATACCTGCC
CAGTTAAGCACACGAGATTCGCTTGAACC

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DS 



AS 1 9

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GTTTGTATGCAAACATTCATCTGCACTACATCGGAAGTGAAGTGCAGGGAGCACGCTGAG
GCCAAGCATCCTAAAGCTGATGTTGTCGCTTGCTTCCCACATCTCAAGAAGTGATGAAAC
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TTTTGCTTAAGACTTTTTCAACAATAAGTCTCTTGCTATTATAATTATATATGCAATGGA
ACTTTCAATATTGTTTTCTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 25 55 55 55 
55 55 55 50 40 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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G

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GG
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TGTTTTCTTTTT

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DS 



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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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AACAGATGGTGAGGTTTATCCGCCAGGAAGCCGAAGAAAAGGCCAATGAGATCTCCGTCT
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TTAGACAGGAGTATGAGAAGAAGGAGAAGCAGGTCGATGTCCGAAGGAAGATTGATTACT
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CAATGAAAGAAGAAGCTGCAAAGCAACTCCTCAAAGTCAGCGAACATGGCTTCTTCAACC
ATCATCACCATCAGTACAAACATCTCTTGAAGCATCTCATTGTTCAGTGTTTGCCTAGAC
TGAAAGAGCCTTCAGTGTTACTGCGTTGTCGCCAAGAAGACCTTCACATAGTGGAGTCGA
TGCTTGACGATGCAACTGAAGAATACTGCGAGAAGGCAAAGGTTCATGCTCCTGAGATTA
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TCTGTGCTGGAGGAGTGGTGCTGGCTTCTCGTGACGGGAAAATCGTGTGTGAAAACACTC
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GG
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GGTGAGGTTTATCCGCCAGGAAGCCGAAGAAAAGGCCAAAGAGATCTCCGTCTCCGCTGA
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ATTGAACGCATCGAGGATCAAAGTTCTGCAGGCTCAAGATGACATTGTCAATGCAATGAA
AGAAGAGGCTGCAAAGCAACTCCTCAAAGTCAGCGAACATGGCTTCTTCAACCATCATCA
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GCCTTCGGTGTTACTGCGTTGTCGCCAAGAAGACCTTCACATAGTGGAGTCGATGCTTGA
CGATGCAACTGAAGAATACTGCGAGAAAGCAAAGGTTCATGCTCCTGAGATTATAGTTGA
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DS 

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AACATGGCTTCTTCAACCATCATCACCATCAGTACAAACATCTCTTGAAGCATCTCATTG
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TTCATGCTCCTGAGATTATAGTTGACAAGGACATTTTCCTACCTCCTGCTCCTTCCGAAG
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TCGTGTGTGAAAACACTCTTGATGCGAGGTTGGAGGTCGCTTTCCGCAAGAAACTCCCTG
AGATTCGAAAGGCGCTCTTTGGCCAGGTTGGGGCAGCTTGATTG***ATGAGTGACTCCC
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CCTACCTTGGCCTTTGTGTGGTGATGTTATAAATAAATACTTTGTTGAATG
T

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DS 

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G
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GCTCTTTGGCCAGGTTGGGGCAGCTTGATTG***ATGAGTGACTCCCAACTTTGAACCAT
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G
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AAATAAATACTTTGTTGAATGAGAAATTGCCAAAAATACCATTTTCATAGTACC

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DS 



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GAAGACATCATCCGTGAACAAGTCAAACTCCTCTACAAACGCCACAAGAACACCGCTTTC
TCTTGGCTCCGTAACATCTTCCACGACTGCGCTGTCGAGTCATGCGATGCGTCGCTTCTG
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TCATGTTCCGATATCCTCGTCTTGTCCGCAAGAGAAGGCATCGAAGCAGTGGGAGGACCA
CATATTCCGTTGAAAACAGGAAGGAGAGATGGACGTAAAAGCAGGACTGATATGCTTGAG
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GACAACAAGGGTTTGCTCCTTGTGGACCACCAGCTCGCACACGACAAACGAACCAGACCA
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CAGATCTTGTCTGAGAACAACCCTTTGACTGGTTCCAAGGGTGAGATCAGGAAGCAGTGC
AATCTCGCAAACAAGATTCACTGAGATTGCAAAGAGTGACAAGGGAGAGAGAGAG**CCT
CTATGTGTTTTGGGTTCTCTCTGCACTTTCTTGGCATCGAACCAAGATGAATAATATTAT
ATTTTAAGAAGTTAAAAATGAAATGAAGGGTGATGATGATGATGTATGCATCATAGTGGT
GACCACATATGCACTCTTCTTTTTGTGTGTTGTTTTAGCCTTAATGCTTTAATTATGGTG
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GTGGGGTTGATGATGGAATGGATGTATGATATGATGAACTGTGTGTTATGTAATAATAAG
TGGTGAAATCGTACTTTAATCTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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BS 1331 1331 RS1A409JQ
BS 1332 1356 RS1BM09TF
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BS 1358 1383 RS1BM09TF
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BS 1385 1397 RS1BM09TF
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GGTGCGATGATAGTGGCGATGCTCTGCCTTTGGGCACTCTCCGCAACAACAGAAGCAGTT
GTAATGGAGGAGGAGCCAGGCTTGATGATGAACTTCTACAAGGACACGTGTCCTCAGGCT
GAAGGCATCATCCGTGAACAAGTCAAACTCCTCTACAAACGCCACAAGAACACCGCTTTC
TCTTGGCTCCGTAACATCTTCCACGACTGTGCTGTCGAGTCATGCGATGCGTCGCTTTTG
CTGGATTCGACAAGAAGAGAGCTAGGAGAGAAAGAACATGACAGGAGCTTCGGTCTGAGA
AACTTCAGATACATTGAGGAGATCAAAGAAGCTCTCGAGAGGGAGTGCCCTGGTGTTGTC
TCATGTTCCGATATCCTTGTCTTGTCCGCAAGAGAAGGCATCGAAGCAGTGGGAGGACCA
CATATTCCGTTGAAAACAGGAAGGAGAGATGGACGTAAAAGCAGGACTGATATGCTTGAG
TCTTACCTTCCCGACCACAACGAGAGTATCTCCGTCGTTCTTGAGAAGTTCAAGTCCATC
GGAATCGACACTCCCGGCCTTGTTGCCCTCCTCGGATCACACAGCGTGGGAAGAACTCAC
TGTGTGAAGCTGGTTCACCGTTTGTACCCTGAG*TGGACCCATCCTTGAACCCGGAC*AC
GTCCCTCACATGCTACACAAGTGTCCCGACTCCATCCCTGACCCAAAG*CGGTCCAGTAT
GTGCGTAATTACCGCGGTACACCCATGGTATTAGACA
CACTACTACCGTA

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DS 

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GGAAAAGGTGCGATGATGGTGGCGATGCTCTGCCTTTGGGCACTCTCCGCAACAACAGAA
GCAGTTGTAATGGAGGAGGAGCCAGGCTTGATGATGAACTTCTACAAGGACACGTGTCCT
CAGGCTGAAGACATCATCCGTGAACAAGTCAAACTCCTCTACAAACGCCACAAGAACACC
GCTTTCTCTTGGCTCCGTAACATCTTCCACGACTGCGCTGTCGAGTCATGCGATGCGTCG
CTTCTGCTGGATTCGACAAGAAGAGAGCTAGGAGAGAAAGAACATGACAGGAGCTTCGGT
CTGAGAAACTTCAGATACATTGAGGAGATCAAAGAAGCTCTCGAGAGGGAGTGCCCTGGT
GTTGTCTCATGTTCCGATATCCTCGTCTTGTCCGCAAGAGAAGGCATCGAAGCAGTGGGA
GGACCACATATTCCGTTGAAAACAGGAAGGAGAGATGGACGTAAAAGCAGGACTGATATG
CTTGAGTCTTACCTTCCCGACCACAACGAGAGTATCTCCGTCGTTCTTGAGAAGTTCAAG
TCCATCGGCATCGACACTCCCGGCCTTGTTGCCCTCCTCGGATCACACAGCGTGGGAAGA
ACTCACTGCGTGAAGCTGGTTCACCGTTTGTACCCTGAG*TGGACCCATCCTTGAACCCG
GAC*ACGTCCCTCACATGCTACACAAGTGTCCCGACTCCATCCCTGACCCAAAG*CGGTC
CAGTATGTGCGTAATGAC
GTGGT

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DS 

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G
GGAGAGAAAGAGCATGACAGGAGCTTCGGTCTGAGAAACTTCAGATACATTGAGGAGATC
AAAGAAGCTCTCGAGAGGGAGTGCCCTGGTGTTGTCTCATGTTCCGATATCCTCGTCTTG
TCCGCAAGAGAAGGCATCGAAGCAGTGGGAGGACCACATATTCCGTTGAAAACAGGAAGG
AGAGATGGACGTAAAAGCAGGACTGATATGCTTGAGTCTTACCTCCCCGACCACAACGAG
AGTATCTCCGTCGTTCTTGAGAAGTTCAAGTCCATCGGCATCGACACTCCCGGCCTTGTT
GCCCTCCTCGGATCACACAGCGTGGGAAGAACTCACTGCGTGAAGCTGGTTCACCGTTTG
TACCCTGAGGTGGACCCATCCTTGAACCCGGACCACGTCCCTCACATGCTACACAAGTGT
CCCGACTCCATCCCTGACCCAAAGGCGGTCCAGTATGTGCGTAATGACCGTGGTACACCC
ATGGTATTAGACAACAACTACTACCGTAACATCCTAGACAACAAGGGTTTGCTCCTTGTG
GACCACCAGCTCGCACACGACAAACGAACCAGACCAATTGTTAAGAAGATGGCTAAGGAC
CAGGCTTACTTCTTCAAGGAGTTTACTAGAGCCATCCAGATCTTGTCTGAGAACAACCCT
TTGACTGGTTCCAAGGGTGAGATCAGGAAGCAGTGCAATCTCGCAAACAAGATTCACTGA
GATTGCAAAGAGTGACAAGGGAGAGAGAGAG**CCTCTATGTGTTTTGGGTTCTCTCTGC
ACTTTCTTG

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DS 

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CCCTGAGGTGGACCCATCCTTGAACCCGGACCACGTCCCTCACATGCTACACAAGTGTCC
CGACTCCATCCCTGACCCAAAGGCGGTCCAGTATGTGCGTAATGACCGTGGTACACCCAT
GGTATTAGACAACAACTACTACCGTAACATCCTAGACAACAAGGGTTTGCTCCTTGTGGA
CCACCAGCTCGCACACGACAAACGAACCAGACCAATTGTTAAGAAGATGGCTAAGGACCA
GGCTTACTTCTTCAAGGAGTTTACTAGAGCCATCCAGATCTTGTCTGAGAACAACCCTTT
GACTGGTTCCAAGGGTGAGATCAGGAAGCAGTGCAATCTCGCAAACAAGATTCACTGAGA
TTGCAAAGAGTGACAAGGGAGAGAGAGAG**CCTTTATGTGTTTTGGGTTCTCTCTGCAC
TTTCTTGGCATCGAACCAAGATGAATAATATTATATTTTAAGAAGTTAAAAATGAAATGA
AGGGTGATGATGATGATGTATGCATCATAGTGGTGACCACATATGCACTCTTCTTTTTGT
GTGTTGTTTTAGCCTTAATGCTTTAATTATGGTGGTAGTCGCCTTTTGAGTTAATTAATC
TGTATGTTGTTTCTTTGTTGATTTT

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DS 

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TGTACCCTGAGGTGGACCCATCCTTGAACCCGGACCACGTCCCTCACATGCTACACAAGT
GTCCCGACTCCATCCCTGACCCAAAGGCGGTCCAGTATGTGCGTAATGACCGTGGTACAC
CCATGGTATTAGACAACAACTACTACCGTAACATCCTAGACAACAAGGGTTTGCTCCTTG
TGGACCACCAGCTCGCACACGACAAACGAACCAGACCAATTGTTAAGAAGATGGCTAAGG
ACCAGGCTTACTTCTTCAAGGAGTTTACTAGAGCCATCCAGATCTTGTCTGAGAACAACC
CTTTGACTGGTTCCAAGGGTGAGATCAGGAAGCAGTGCAATCTCGCAAACAAGATTCACT
GAGATTGCAAAGAGTGACAAGGGAGAGAGAGAG**CCTTTATGTGTTTTGGGTTCTCTCT
GCACTTTCTTGGCATCGAACCAAGATGAATAATATTATATTTTAAGAAGTTAAAAATGAA
ATGAAGGGTGATGATGATGATGTATGCATCATAGTGGTGACCACATATGCACTCTTCTTT
TTGTGTGTTGTTTTAGCCTTAATGCTTTAATTATGGTGGTAGTCGCCTTTTGAGTTAATT
AATCTGTATGTTGTTTCTTTGTTGATTTTGGGTTTGTGGTGGGGTTGATGATGGAATGGA
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DS 

RD RS1EQ64JQ 773 0 0
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GGTGGACCCATCCTTGAACCCGGACCACGTCCCTCACATGCTACACAAGTGTCCCGACTC
CATCCCTGACCCAAAGGCGGTCCAGTATGTGCGTAATTACCGCGGTACACCCATGGTATT
AGACAACAACTACTACCGTAACATCCTAGACAACAAGGGTTTGCTCCTTGTGGACCACCA
GCTCGCACACGACAAACGAACCAGACCAATTGCTAAGAAGATGGCTAAGGACCAGGCTTA
CTTCTTCAAGGAGTTTACTAGAGCCATCCAGATCTTGTTTGAGAACAACCCTTTGACGGG
TTCCAAGGGTGAGATCAGGAAGCAGTGCAATCTCGCAAACAAGATTCACTGAGATTGCAA
AGATTGACAAGAGAGAGAGAGAGAGCCTCTTTGTGTTTTGGGTTCTCTTTGCACTTTCTT
GGCATCGAACCAAGATGAATAATATTATACTTTAAGAAGTTAAAAATGAAATGAAGGGTG
ATGATGATG***TATGCATCATAGTGGTGACCACATATGCACTTTTCTTTTTGTGTGTTG
TTTTAGCCTTAATGCTTTAATTATGGTGGTAGTCGCCTTTTGAGTTTATTAATCTGTATG
TTGTTTCTTTGTTGATTTTGGGTTTGTGGTGGGGTTGATGATGGAATGGATGTATGATAT
GATGGACTGTGTGTTATGTAATAATAAGTGGTGAAATCGTACTTTAATCTTTG

QA 1 773 1 773
DS 

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TGATGATG***TATGCATCATAGTGGTGACCACATATGCACTCTTCTTTTTGTGTGTTGT
TTTAGCCTTAATGCTTTAATTATGGTGGTAGTCGCCTTTTGAGTTTATTAATCTGTATGT
TGTTTCTTTGTTGATTTTGGGTTTGTGGTGGGGTTGACGATGGAATGGATGTATGATATG
ATGGACTGTGTGTTATGTAATAATAAGTGGCGAAATCGTACTTT
AATCT

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DS 

RD RS1D514JQ 709 0 0
GGTGGACCCATCCTTGAACCCGGACCACGTCCCTCACATGCTACACAAGTGTCCCGACTC
CATCCCTGACCCAAAGGCGGTCCAGTATGTGCGTAATGACCGTGGTACACCCATGGTATT
AGACAACAACTACTACCGTAACATCCTAGACAACAAGGGTTTGCTCCTTGTGGACCACCA
GCTCGCACACGACAAACGAACCAGACCAATTGTTAAGAAGATGGCTAAGGACCAGGCTTA
CTTCTTCAAGGAGTTTACTAGAGCCATCCAGATCTTGTCTGAGAACAACCCTTTGACTGG
TTCCAAGGGTGAGATCAGGAAGCAGTGCAATCTCGCAAACAAGATTCACTGAGATTGCAA
AGAGTGACAAGGGAGAGAGAGAG**CCTCTATGTGTTTTGGGTTCTCTCTGCACTTTCTT
GGCATCGAACCAAGATGAATAATATTATATTTTAAGAAGTTAAAAATGAAATGAAGGGTG
ATGATGATGATGTATGCATCATAGTGGTGACCACATATGCACTCTTCTTTTTGTGTGTTG
TTTTAGCCTTAATGCTTTAATTATGGTGGTAGTCGCCTTTTGAGTTAATTAATCTGTATG
TTGTTTCTTTGTTGATTTTGGGTTTGTGGTGGGGTTGATGATGGAATGGATGTATGATAT
GATGAACTGTGTGTTATGTAATAATAAGTGGTGAAATCGTACTTT
AATC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RS1BM13JQ 703 0 0
TGGACCCATCCTTGAACCCGGACCACGTCCCTCACATGCTACACAAGTGTCCCGACTCCA
TCCCTGACCCAAAGGCGGTCCAGTATGTGCGTAATGACCGTGGTACACCCATGGTATTAG
ACAACAACTACTACCGTAACATCCTAGACAACAAGGGTTTGCTCCTTGTGGACCACCAGC
TCGCACACGACAAACGAACCAGACCAATTGTTAAGAAGATGGCTAAGGACCAGGCTTACT
TCTTCAAGGAGTTTACTAGAGCCATCCAGATCTTGTCTGAGAACAACCCTTTGACTGGTT
CCAAGGGTGAGATCAGGAAGCAGTGCAATCTCGCAAACAAGATTCACTGAGATTGCAAAG
AGTGACAAGGGAGAGAGAGAG**CCTCTATGTGTTTTGGGTTCTCTCTGCACTTTCTTGG
CGTCGAACCAAGATGAATAATATTATATTTTAAGAAGTTAAAAATGAAATGAAGGGTGAT
GATGATGATGTATGCATCATAGTGGTGACCACATATGCACTCTTCTTTTTGTGTGTTGTT
TTAGCCTTAATGCTTTAATTATGGTGGTAGTCGCCTTTTGAGTTAATTAATCTGTATGTT
GTTTCTTTGTTGATTTTGGGTTTGTGGTGGGGTTGATGATGGAATGGATGTATGATATGA
TGAACTGTGTGTTATGTAATAATAAGTGGTGAAATCGTACTTT

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 7

CO CL392Contig1 901 7 14 U
TTTTTTGTTCTCTTGTAATCTTTAGTTGTTATACCTTACGTCATATACGACATGGCCGAA
GAGGAACAGAAGAAGGTGACGGAGAACGTTCCTACCGTGTCTGAACCAACTCCATCAGCG
CCACCTCCGGAGGAGAAACCTCTTGCTGCGGTCGATGTTGCTCCACAGGAGAAGCCTGTG
GCTCCACCACCAGTTCTTCCATCTCCGGCGCCTGCAGAGGAGAAGCTAGAGGACTCCAAG
GCTATTGTTCCCATCGTCGCAAAGGAAGCAGGGGAAGAAAAGAAAGAAGGCTCGGTTAAT
CGAGATGCGGTCCTGGCTAGAGTTGAGACAGAGAAGAGGATGTCACTTATCAAAGCTTGG
GAAGAGGCTGAGAAGTGCAAAGTGGAGAACAAAGCTGAGAAGAAACTTTCTTCAATTGAG
TCATGGGAGAACAACAAGAAAGCAGCAGTGGAAGCTGAGCTCAAGAAAATGGAGGAACAA
TTGGAGAAGAAGAAGGCAGAGTATGTGGAGCAAATGAAGAACAAAATAGCTCAAATCCAC
AAACAGGCAGAAGAGAAGAGAGCCATGATCGAAGCTAGACGTGG*AGAAGATGTTCTCAA
AGCCGAGGAATTAGCTGCCAAGTACCGTGCCACTGGAACGGCACCTAAAAAGCTATTTGG
ATGCATGTGATTTATATATCATACATCAATGGGAAGACATAAACTGAATCTGGTGTTGCT
GTAATGGTTTTTTTTT**CAATTTTAATTTTCATTGTGTTATTTAATGTGGAAAATAAAC
CAAAGAAAAAGGGTTCCATTTATACGTTTGTAGTTTGCTTAATCTGTGGGTTTTAATATT
TGCAACATAGAAACTCATGTATGGAAACGTTACTTATATATTTGATTTGGAGTGCATTTG
T


BQ
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 15 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 10 30 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1D972TF U 1
AF RS1E938TF U 1
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AF RS1EO42TF U 1
AF RS1DI13JQ C 129
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RD RS1D972TF 728 0 0
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AGCCGAGGAATTAGCTGCCAAGTACCGTGCCACTGGAACGGCACCTAAAAAGCTATTTGG
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GTAAT
TGT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1E938TF 722 0 0
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GAGGAACAGAAGAAGGTGACGGAGAACGTTCCTACCGTGTCTGAACCAACTCCATCAGCG
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GCTATTGTTCCCATCGTCGCAAAGGAAGCAGGGGAAGAAAAGAAAGAAGGCTCGGTTAAT
CGAGATGCGGTCCTGGCTAGAGTTGAGACAGAGAAGAGGATGTCACTTATCAAAGCTTGG
GAAGAGGCTGAGGAGTGCAAAGTGGAGAACAAAGCTGAGAAGAAACTTTCTTCAATTGAG
TCATGGGAGAACAACAAGAAAGCAGCAGTGGAAGCTGAGCTCAAGAAAATGGAGGAACAA
TTGGAGAAGAAGAAGGCAGAGTATGTGGAGCAAATGAAGAACAAAATAGCTCAAATCCAC
AAACAGGCAGAAGAGAAGAGAGCCATGATCGAAGCTAGACGTGGGAGAAGATGTTCTCAA
AGCCGAGGAATTAGCTGCCAAGTACCGTGCCACTGGAACGGCACCTAAAAAGCTATTTGG
ATGCATGTGATTTATATATCATACATCAATGGGAAGACATAA*CTGAATCTG*TGTTGCT
GT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RS1DI13TF 770 0 0
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GAGGAACAGAAGAAGGTGACGGAGAACGTTCCTACCGTGTCTGAACCAACTCCATCAGCG
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CGAGATGCGGTCCTGGCTAGAGTTGAGACAGAGAAGAGGATGTCACTTATCAAAGCTTGG
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TCATGGGAGAACAACAAGAAAGCAGCAGTGGAAGCTGAGCTCAAGAAAATGGAGGAACAA
TTGGAGAAGAAGAAGGCAGAGTATGTGGAGCAAATGAAGAACAAAATAGCTCAAATCCAC
AAACAGGCAGAAGAGAAGAGAGCCATGACCGAAGCTAGACGTGG*AGAAGATGTTCTCAA
AGCCGAGGAATTAGCTGCCAAGTACCGTGCCACTGGAACGGCACCTAAAAAGCTATTTGG
ATGCATGTGATTTATATATCATACATCAATGGGAAGACATAAACTGAATCTGGTGTTGCT
GTAATGGTTTTTTTTC**AA**TTTAATTTTCATTGTGTTATTTAATGTG

QA 1 770 1 770
DS 

RD RS1EO42TF 739 0 0
TTTTTTGTTCTCTTGTAATCTTTAGTTGTTATACCTTACGTCATATACGACATGGCCGAA
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CCACCTCCGGAGGAGAAACCTCTTGCTGCGGTCGATGTTGCTCCACAGGAGAAGCCTGTG
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ATGTATGTGGTTTATACATCATACATCAATGGGAAGACATAAACTGAATCTGGTGTTGCT
GTAATGGTTTTTTTTT
CAA

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DS 

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ACCAGTTCTTCCATCTCCGGCGCCTGCAGAGGAGAAGCTAGAGGACTCCAAGGCTATTGT
TCCCATCGTCGCAAAGGAAGCAGGGGAAGAAAAGAAAGAAGGCTCGGTTAATCGAGATGC
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AAGGGTTCCATTTATACGTTTGTAGTTTGCTTAATCTGTGGGTTTTAATATTTGCAACAT

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AATCGAGATGCGGTCCTGGCTAGAGTTGAGACAGAGAAGAGGATGTCACTTATCAAAGCT
TGGGAAGAGGCTGAGAAGTGCAAAGTGGAGAACAAAGCTGAGAAGAAACTTTCTTCAATT
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CAAAGCCGAGGAATTAGCTGCCAAGTACCGTGCCACTGGAACGGCACCTAAAAAGCTATT
TGGATGCATGTGATTTATATATCATACATCAATGGGAAGACATAAACTGAATCTGGTGTT
GCTGTAATTGTTTTTTTTTTTCAATTTTAATTTTCATTGTGTTATTTAATGTGGAAAATA
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ATTTGCAACATAGAAACTCATGTATGGAAACGTTACTTATATATTTGATTTGGAGTGCAT
T

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DS 

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AAGGCTCGGTTAATCGAGATGCGGTCCTGGCTAGAGTTGAGACAGAGAAGAGGATGTCAC
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AAAAAGCTATTTGGATGTATGTGGTTTATACATCATACATCAATGGGAAGACATAAACTG
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TGGGTTTTAATATTTGCAACATAGGAACTCATGTATGGAAACGTTACTTATATATTTGAT
TTGGAGTGCATTTGT

QA 1 675 1 675
DS 



AS 2 9

CO CL393Contig1 1053 7 24 U
GGGGGAACGCGTATAGTTTACAGCTACATTCTCCTCTAGCTTTCCTTTACTCTCTTTTTC
TCAGTTCTTCTTGAGTTCTTCTTCTCGAGATCTGTGCCTGTGTTTTCTTCTTTGCTCGGG
AGATTCGTTACTACGCTCAGATATGGCGCCACCGATTGAGATTGCTGCTACCAAGAACTA
TGCGGAGAAACAGGCTTCAGTGCCTCCTCTTAATGAGAGGATACTTTCGTCTTTGACCCA
TAGATCAGTTGCTGCACACCCATGGCATGATCTTGAGATAGGACCTGAAGCTCCAGTAAT
CTTCAACTGTGTTGTTGAGATAGGAAAGGGGAGCAAAGTGAAGTATGAACTCGACAAAAC
TACGGGTCTCATCAAGGTGGACCGTATTCTTTACTCATCTGTTGTGTACCCACACAACTA
TGGGTTCATTCCGCGTACCCTCTGTGAGGACAATGACCCTATTGATGTTCTTGTCATCAT
GCAGGAACCGGTGATCCCAGGATGCTTTCTTCGGGCCAAAGCTATTGGTCTTATGCCAAT
GATCGATCAGGGTGAGAAAGACGACAAGATCATTGCTGTCTGCGCTGACGATCCAGAGTA
CCGTCATTACAATGACATCAAGGAGCTTCCACCTCATCGTCTGGCTGAGATTCGTCGTTT
CTTTGAAGACTATAAGAAAAATGAGAACAAGGAAGTAGCCGTTAACGACTTCCTTCCCGC
TACAGCAGCCTATGAAGCAGTTCAGCATTCCATGGATCTCTATGCGGATTACGTCATGGA
GACCTTGAGACGGTGATCTCTTTCACCATCATCCAAGCAATAAAGAAAGTTTCCAACTGC
ATTTTCACATTTGTTTTCTTAACAGATGGGAAGTGTATGCTAAAGTACAAATACTTACTT
ATTATATGTTAGGGTTCTCAAAAGAATGTATTTGTGTATGTCCTTTTGCTGAATCCGGTA
GATGATGCCGAAAAAA*TTGTCAAAGAAACTAAGAACGTTGGTATTGTACCCATTTTGTT
TGTTCTTCACTTTTATTCTTGAGTAATTTTCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 5 35 5 35 5 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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QA 1 618 1 618
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TCAGTTCTTCTTGAGTTCTTCTTCTCGAGATCTGTGCCTGTGTTTTCTTCTTTGCTCGGG
AGATTCGTTACTACGCTCAGATATGGCGCCACCGATTGAGATTGCTGCTACCAAGAACTA
TGCGGAGAAACAGGCTTCAGCGCCTCCTCTTAATGAGAGGATACTTTCGTCTTTGACCCA
TAGATCAATTGCTGCACACCCATGGCATGATCTTGAGATAGGACCTGAAGCTCCAGTAAT
CTTCAACTGTGTTGTTGAGATAGGAAAGGGGAGCAAAGTGAAGTATGAACTCGACAAAAC
TACGGGTCTCATCAAGGTGGACCGTATTCTTTACTCATCTGTTGTGTACCCACACAACTA
TGGGTTCATTCCGCGTACCCTCTGTGAGGACAATGACCCTATTGATGTTCTTGTCATCAT
GCAGGAACCGGTGATCCCAGGATGCTTTCTTCGGGCCAAAGCTATTGGTCTTATGCCAAT
GATCGATCAGGGTGAGAAAGACGACAAGATCATTGCTGTCTGCGCTGACGATCCAGAGTA
CCGTCATTACAATGACATCAAGGAGCTTCCACCTCATCGTCTGGCTGAGATTCGTCGTTT
CTTTGAAGACTATAAGAAAA*TGAGAACAAGGAAGTAGCCGTTAACGACTTCCTTCCCGC
TACAGCAGCCTATGAAGCAGTTCAGCATTCCATGGATCTCTATGCGGAT*ACGTCATGGA
GACTTGGAGACGGTGATCTCTTTCACCATCA

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ATGCGGAGAAACAGGCTTCAGTGCCTCCTCTTAATGAGAGGATACTTTCGTCTTTGACCC
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TCTTCAACTGTGTTGTTGAGATAGGAAAGGGGAGCAAAGTGAAGTATGAACTCGACAAAA
CTACGGGTCTCATCAAGGTGGACCGTATTCTTTACTCATCTGTTGTGTACCCACACAACT
ATGGGTTCATTCCGCGTACCCTCTGTGAGGACAATGACCCTATTGATGTTCTTGTCATCA
TGCAGGAACCGGTGATCCCAGGATGCTTTCTTCGGGCCAAAGCTATTGGTCTTATGCCAA
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AC*GTCATTACAATGACATCAAGGAGCTTCCACCTCATCGTCTGGCTGAGATTCGTCGTT
TCTTTGAAGACTATAAGAAAAATGAGAACAAGGAAGTAGCCGTTAACGACTTCCTTCCCG
CTACAGCAGCCTATGAAGCAGTTCAGCATTCCATGGATCTCTATGCGGATTACGTCATGG
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CATTTTCACATTTGTTTTCTTA*CAGATGGGA*GTGTATGCTA

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TCTTGAGATAGGACCTGAAGCTCCAGTAATCTTCAACTGTGTTGTTGAGATAGGAAAGGG
GAGCAAAGTGAAGTATGAACTCGACAAAACTACGGGTCTCATCAAGGTGGACCGTATTCT
TTACTCATCTGTTGTGTACCCACACAACTATGGGTTCATTCCGCGTACCCTCTGTGAGGA
CAATGACCCTATTGATGTTCTTGTCATCATGCAGGAACCGGTGATCCCAGGATGCTTTCT
TCGGGCCAAAGCTATTGGTCTTATGCCAATGATCGATCAGGGTGAGAAAGACGACAAGAT
CATTGCTGTCTGCGCTGACGATCCAGAGTACCGTCATTACAATGACATCAAGGAGCTTCC
ACCTCATCGTCTGGCTGAGATTCGTCGTTTCTTTGAAGACTATAAGAAAAATGAGAACAA
GGAAGTAGCCGTTAACGACTTCCTTCCCGCTACAGCAGCCTATGAAGCAGTTCAGCATTC
CATGGATCTCTATGCGGATTACGTCATGGAGACCTTGAGACGGTGATCTCTTTCACCATC
ATCCAAGCAATAAAGAAAGTTTCCAACTGCATTTTCACATTTGTTTTCTTAACAGATGGG
AAGTGTATGCTAAAGTACAAATACTTACTTATTATATGTTAGGGTTCTCAAAAGAATGTA
TTTGTGTATGTCCTTTTGCTGAATCCGGTAGATGATGCCGAAAAAA*TTGTCAAAGAAAC
TAAGAACGTTGGTATTGTACCCATTTTGTTTGT
TCTTC

QA 1 813 1 813
DS 

RD RS1C957JQ 812 0 0
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CTTGAGATAGGACCTGAAGCTCCAGTAATCTTCAACTGTGTTGTTGAGATAGGAAAGGGG
AGCAAAGTGAAGTATGAACTCGACAAAACTACGGGTCTCATCAAGGTGGACCGTATTCTT
TACTCATCTGTTGTGTACCCACACAACTATGGGTTCATTCCGCGTACCCTCTGTGAGGAC
AATGACCCTATTGATGTTCTTGTCATCATGCAGGAACCGGTGATCCCAGGATGCTTTCTT
CGGGCCAAAGCTATTGGTCTTATGCCAATGATCGATCAGGGTGAGAAAGACGACAAGATC
ATTGCTGTCTGCGCTGACGATCCAGAGTACCGTCATTACAATGACATCAAGGAGCTTCCA
CCTCATCGTCTGGCTGAGATTCGTCGTTTCTTTGAAGACTATAAGAAAAATGAGAACAAG
GAAGTAGCCGTTAACGACTTCCTTCCCGCTACAGCAGCCTATGAAGCAGTTCAGCATTCC
ATGGATCTCTATGCGGATTACGTCATGGAGACCTTGAGACGGTGATCTCTTTCACCATCA
TCCAAGCAATAAAGAAAGTTTCCAACTGCATTTTCACATTTGTTTTCTTAACAGATGGGA
AGTGTATGCTAAAGTACAAATACTTACTTATTATATGTTAGGGTTCTCAAAAGAATGTAT
TTGTGTATGTCCTTTTGCTGAATCCGGTAGATGATGCCGAAAAAAATTGTCAAAGAAACT
AAGAACGTTGGTATTGTACCCATTTTGTTTGT

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DS 

RD RS1BL20JQ 745 0 0
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TCATCAAGGTGGACCGTATTCTTTACTCATCTGTTGTGTACCCACACAACTATGGGTTCA
TTCCGCGTACCCTCTGTGAGGACAATGACCCTATTGATGTTCTTGTCATCATGCAGGAAC
CGGTGATCCCAGGATGCTTTCTTCGGGCCAAAGCTATTGGTCTTATGCCAATGATCGATC
AGGGTGAGAAAGACGACAAGATCATTGCTGTCTGCGCTGGCGATCCAGAGTAC*GTCATT
ACAATGACATCAAGGAGCTTCCACCTCATCGTCTGGCTGAGATTCGTCGTTTCTTTGAAG
ACTATAAGAAAAATGAGAACAAGGAAGTAGCCGTTAACGACTTCCTTCCCGCTACAGCAG
CCTATGAAGCAGTTCAGCATTCCATGGATCTCTATGCGGATTACGTCATGGAGGCCTTGA
GACGGTGATCTCTTTCACCATCATCCAAGCAATAAAGAAAGTTTCCAACTGCATTTTCAC
ATTTGTTTTCTTAACAGATGGGAAGTGTATGCTAAAGTACAAATACTTACTTATTATATG
TTAGGGTTCTCAAAAGAATGTATTTGTGTATGTCCTTTTGCTGAATCCGGTAGATGATGC
CGAAAAAA*TTGTCAAAGAAACTAAGAACGTTGGTATTGTACCCATTTTGTTTGTTCTTC
ACTTTTATTCTTGAGTAATTTTCCC

QA 1 745 1 745
DS 



CO CL393Contig2 845 2 10 U
CGGAGAAACAGGCTTCAGTTCCTCCTCTTAATGAGAGGATACTTTCGTCCTTGACCCATA
GATCAGTTGCTGCACACCCATGGCATGATCTTGAGATAGGACCTGAAGCTCCGGTAATCT
TCAACTGTGTGGTTGAGATAGGAAAAGGGAGCAAGGTGAAGTATGAACTTGACAAAACTA
CTGGGCTCATCAAGGTCGATCGTATTCTTTACTCATCTGTTGTGTACCCACACAACTACG
GCTTCATTCCGCGTACACTTTGTGAGGACAATGACCCTATTGATGTTCTTGTCATCATGC
AGGAACCGGTGATCCCAGGATGCTTTCTTCGGGCCAAAGCTATTGGTCTTATGCCAATGA
TTGATCAGGGTGAGAAAGACGACAAGATCATTGCTGTCTGCGCAGACGATCCAGAGTACC
GTCATTACAATGACATCAAGGAGCTTCCACCTCATCGTCTGGCTGAGATTCGTCGTTTCT
TTGAAGACTATAAGAAAAATGAGAACAAGGAAGTAGCCGTTAACGACTTCCTTCCCGCTA
CAGCAGCCTATGAAGCAGTTCAGCATTCCATGGATCTGTATGCGGATTATGTCATGGAGA
CCTTGAGACGGTGATCTCTTTCACCACCATCCAAGCAATAAAGAAAGCTTACAAGTGCAT
TTTCACATTTGTTTTCTTGACAGATGTGAAGTGCATACAAAGTATAAATACTTACATATA
TATGTTAGGGTTCTCAAAAGAATGTATTTGTGTATGTCCTTTTGCTGAATCCGGTAGATG
ATGCCGAAAAAATTGTCAAAGAAACTAAGAAATTGGTATTGTACCCATTTTGTTTGTGTT
TCATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1CC80TF U 1
AF RS1CC80JQ C 216
BS 1 674 RS1CC80TF
BS 675 675 RS1CC80JQ
BS 676 707 RS1CC80TF
BS 708 708 RS1CC80JQ
BS 709 731 RS1CC80TF
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BS 733 738 RS1CC80TF
BS 739 739 RS1CC80JQ
BS 740 755 RS1CC80TF
BS 756 845 RS1CC80JQ

RD RS1CC80TF 755 0 0
CGGAGAAACAGGCTTCAGTTCCTCCTCTTAATGAGAGGATACTTTCGTCCTTGACCCATA
GATCAGTTGCTGCACACCCATGGCATGATCTTGAGATAGGACCTGAAGCTCCGGTAATCT
TCAACTGTGTGGTTGAGATAGGAAAAGGGAGCAAGGTGAAGTATGAACTTGACAAAACTA
CTGGGCTCATCAAGGTCGATCGTATTCTTTACTCATCTGTTGTGTACCCACACAACTACG
GCTTCATTCCGCGTACACTTTGTGAGGACAATGACCCTATTGATGTTCTTGTCATCATGC
AGGAACCGGTGATCCCAGGATGCTTTCTTCGGGCCAAAGCTATTGGTCTTATGCCAATGA
TTGATCAGGGTGAGAAAGACGACAAGATCATTGCTGTCTGCGCAGACGATCCAGAGTACC
GTCATTACAATGACATCAAGGAGCTTCCACCTCATCGTCTGGCTGAGATTCGTCGTTTCT
TTGAAGACTATAAGAAAAATGAGAACAAGGAAGTAGCCGTTAACGACTTCCTTCCCGCTA
CAGCAGCCTATGAAGCAGTTCAGCATTCCATGGATCTGTATGCGGATTATGTCATGGAGA
CCTTGAGACGGTGATCTCTTTCACCACCATCCAAGCAATAAAGAAAGCTTACAAGTGCAT
TTTCACATTTGTTT*CTTGACAGATGTGAAGTGCATACAAAGTATAA*TACTTACATATA
TATGTTAGGGT*CTCAAA*GAATGTATTTGTGTAT

QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1CC80JQ 630 0 0
TCTGTTGTGTACCCACACAACTACGGCTTCATTCCGCGTACACTTTGTGAGGACAATGAC
CCTATTGATGTTCTTGTCATCATGCAGGAACCGGTGATCCCAGGATGCTTTCTTCGGGCC
AAAGCTATTGGTCTTATGCCAATGATTGATCAGGGTGAGAAAGACGACAAGATCATTGCT
GTTTGCGCAGACGATCCAGAGTACCGTCATTACAATGACATCAAGGAGCTTCCACCTCAT
CGTCTGGCTGAGATTTGTCGTTTCTTTGAAGACTATAAGAAAAATGAGAACAAGGAAGTA
GCCGTTAACGACTTCCTTCCCGCTACAGCAGCCTATGAAGCAGTTCAGCATTCCATGGAT
CTGTATGCGGATTATGTCATGGAGACCTTGAGACGGTGATCTCTTTCACCACCATCCAAG
CAATAAAGAAAGCTTACAAGTGCATTTTCACATTTGTTTTCTTGACAGATGTGAAGTGCA
TACAAAGTATAAATACTTACATATATATGTTAGGGTTCTCAAAAGAATGTATTTGTGTAT
GTCCTTTTGCTGAATCCGGTAGATGATGCCGAAAAAATTGTCAAAGAAACTAAGAAATTG
GTATTGTACCCATTTTGTTTGTGTTTCATG

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 9

CO CL394Contig1 1513 9 24 U
GGGGACTAAGAGAGAGAGGAGGGTGAATGATGTTGCGCAGGATATCTGCAAGCTCTTTAA
CGTGGACCCTGAGGCGAATATTAAGTTTGTGGAGAACAGGCCTTTTAATGACCAGAGGTA
CTTTCTTGATGATGAGAAGCTTAAGATCTTGGGATGGTCGGAGAGGACTAGTTGGGAAGA
AGGGTTGAAGAAGACGATGGAGTGGTACACTCAGAACCCGGATTGGTGGGGTGATGTCTC
TGGAGCGTTGCTTCCCCACCCGAGGATGCTGGTGATGCCTGGTGGGAGGCATTTTGATGG
GTCTGAAGAGAACTCTGGAGCAGTGGCTTTATCCGGGAACTCGAGCCAGAGCAGCCAGAT
GGTGGTTCCTACACCTAGGAGCAGTGGCTCCGCTCAGAGCCCTTCGCTGAAGTTCTTGAT
ATATGGTAAGACGGGATGGATTGGGGGTTTGCTTGGGAAGATTTGTGAGAAGCAGGGGAT
TGCTTTTGAGTATGGGAAAGGGCGGCTTGAGGATCGGTCATCCCTCTTGCAAGATATTGT
GAATGTTAAGCCTACCCATGTCTTCAATGCTGCTGGCGTGACAGGGAGACCTAATGTTGA
CTGGTGCGAGTCTCACAAAACGGAGACAATCCGTGCCCAATGTTGCAGGCACTTTGACTC
TGGCTGATGTCTGCAGAGAGCACAGTCTCCGTGTTGATGAACTTTGCTACTGGTTGTATA
TTCGAGGTATGATGAAAACCATCCGCTTGGTTCAGGCATTGGCTTCAAAGAAGAAGACAC
ACCTAACTTCACTGGTTCTTTCTACTCAAAAACCAAAGCCATGGTTGAGGAGCTGCTTAA
GGAGTTTGATAACGTATGCACTCTAAGGGTTAGGATGCCGATTTCCTCTGATCTGAACAA
CCCGAGAAACTTCATCACCAAGATTTCCCGGTACAGCAAAGTAGTGAACATCCCAAACAG
CATGACCGTGCTGGACGAGCTACTTCCAATCTCGATAGAGATGGCGAAAAGAAACCTTAA
AGGGATTTGGAACTTCACCAACCCTGGTGTTGTGAGTCACAATGAGGTCCTGGAGATGTA
CAGAGACTACATCGACTCAGACTTCAAATGGACGAACTTCACACTGGAGGAGCAAGCTAA
GGTCATCGTGGCTCCAAGAAGCAACAACGAGATGGACGCATCTAAGCTCAAGAAAGAGTT
CCCTGAATTACTCTCAATCAAGGAGTCTCTGATCAAATATGCATTTGAGCCCAACAAAAG
AACTTGAGGTAATATATAACTTATCTCAGTTTTGTTTAAGCTGGTTTGTTATTAGTTTCT
CCCCTGGAGTCGTAAACCAAAAGCAACTAGCTTTGCCTTTTAGGTTTAATTATTAAGAGG
GGTACATCTAGTTTGGATTCTTATATGTTATTGTTTTGTTGGTATTGTGTTTCTTGTTCC
ACATTTATAGATAAAAAGTTGATTTATGTATCATTAATACAAACGGTTAAATCCAGGAAC
TAGATTTATGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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5 5 30 30 5 30 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 35 50 50 50 50 20 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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TGCTTTTGAGTATGGGAAAGGGCGGCTTGAGG

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DS 

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TGGGAAGATTTGTGAGAAGCAGGGGATTGCTTTTGAGTATGGGAAAGGGCGGCTTGAGGA
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GATAGAGATGGCGAAGAGAAACCTTAAAGGGATTTGGAACTTCACCAACCCTGGTGTTGT
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GGACGCATCTA
GCTCA

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DS 

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CTTGGTTCAGGCATTGGCTTCAAAGAAGAAGACACACCTAACTTCACTGGTTCTTTCTAC
TCAAAAACCAAAGCCATGGTTGAGGAGCTGCTTAAGGAGTTTGATAACGTATGCACTCTA
AGGGTTAGGATGCCGATTTCCTCTGATCTGAACAACCCGAGAAACTTCATCACCAAGATT
TCCCGGTACAGCAAAGTAGTGAACATCCCAAACAGCATGACCGTGCTGGACGAGCTACTT
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ATGTATCATTAATACAAACGGTTAAATCC

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ATTCTTATATGTTATTGTTTTGTTGGTATTGTGTTTCTTGTTCCACATTTATAGAT

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AACATCCCAAACAGCATGACCGTGCTGGACGAGCTACTTCCAATCTCGATAGAGATGGCG
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GTCCTGGAGATGTACAGAGACTACATCGACTCAGACTTCAAATGGACGAACTTCACACTG
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CTCAAGAAAGAGTTCCCTGAATTACTCTCAATCAAGGAGTCTCTGATCAAATATGCATTT
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TGTTATTAGTTTCTCCCCTGGAGTCGTAAACCAAAAGCAACTAGCTTTGCCTTTTAGGTT
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GTGTTTCTTGTTCCACAT

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TGCACTCTAAGGGTTAGGATGCCGATTTCCTCTGATCTGAACAACCCGAGAAACTTCATC
ACCAAGATTTCCCGGTACAGCAAAGTAGTGAACATCCCAAACAGCATGACCGTGCTGGAC
GAGCTACTTCCAATCTCGATAGAGATGGCGAAAAGAAACCTTAAAGGGATTTGGAACTTC
ACCAACCCTGGTGTTGTGAGTCACAATGAGGTCCTGGAGATGTACAGAGACTACATCGAC
TCAGACTTCAAATGGACGAACTTCACACTGGAGGAGCAAGCTAAGGTCATCGTGGCTCCA
AGAAGCAACAACGAGATGGACGCATCTAAGCTCAAGAAAGAGTTCCCTGAATTACTCTCA
ATCAAGGAGTCTCTGATCAAATATGCATTTGAGCCCAACAAAAGAACTTGAGGTAATATA
TAACTTATCTCAGTTTTGTTTAAGCTGGTTTGTTATTAGTTTCTCCCCTGGAGTCGTAAA
CCAAAAGCAACTAGCTTTGCCTTTTAGGTTTAATTATTAAGAGGGGTACATCTAGTTTGG
ATTCTTATATGTTATTGTTTTGTTGGTATTGTGTTTCTTGTTCCACATTTATAGAT

QA 1 776 1 776
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TGATAACGTATGCACTCTAAGGGTTAGGATGCCGATTTCCTCTGATCTGAACAACCCGAG
AAACTTCATCACCAAGATTTCCCGGTACAGCAAAGTAGTGAACATCCCAAACAGCATGAC
CGTGCTGGACGAGCTACTTCCAATCTCGATAGAGATGGCGAAAAGAAACCTTAAAGGGAT
TTGGAACTTCACCAACCCTGGTGTTGTGAGTCACAATGAGGTCCTGGAGATGTACAGAGA
CTACATCGACTCAGACTTCAAATGGACGAACTTCACACTGGAGGAGCAAGCTAAGGTCAT
CGTGGCTCCAAGAAGCAACAACGAGATGGACGCATCTAAGCTCAAGAAAGAGTTCCCTGA
ATTACTCTCAATCAAGGAGTCTCTGATCAAATATGCATTTGAGCCCAACAAAAGAACTTG
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GAGTCGTAAACCAAAAGCAACTAGCTTTGCCTTTTAGGTTTAATTATTAAGAGGGGTACA
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ATAGATAAAAAGTTGATTT

QA 1 739 1 739
DS 

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G
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AGGTTTAATTATTAAGAGGGGTACATCTAGTTTGGATTCTTATATGTTATTGTTTTGTTG
GTATTGTGTTTCTTGTTCCACATTTATAGATAAAAAGTTGATTTATGTATCATTAATACA
AACGGTTAAATCCAGGAACTAGATTTATGGTC

QA 2 453 2 453
DS 



AS 2 9

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ATCCCAACAAATCCTTTGAGGTTACTCCGTCACCAGCAGATTCAATCAGCAGCTTGACCT
TTAGCCCCAGAGCCGATATCCTTGTCGCCACTTCTTGGGACAATCAGGTGAGGTGTTGGG
AGATATCCCGTAGTGGGAACAATCTAGCAAGTGCTCCTAAAGCATCCATATCCCATGATC
AGCCCGTCTTGTGCTCTGCTTGGAAAGATGATGGAACCGCTGTCTTTAGTGGTGGTTGTG
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ACGATGCTCCTATTGTTGACATGGGCTGGATCCCTGGGATGAATCTCCTCGTTACTGGAA
GCTGGGATAAGACTTTGAGGTATTGGGATACAAGGCAGCAAACACCTGTGCATACCCAAC
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CTGATAGGAATCTCATTGTCTACAACATGCAAAATCCTCAGACTGAGTTCAAGAGAGTGG
TGTCCCCACTCAAGTACCAGACGAGGTGTGTTACTGCC*TTCCCTGATCAGCAAGGATTT
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AACTTCCACCCGGTACAAGGAACTTTTGCTACTGCTGGCTCAGATGGGGCTTTCAATTTC
TGGGACAAGGATAGCAAACAAAGACTCAAGGCAATGTCAAGGTGCAGTCACCCAATTACT
TGCAGTTCGTTTAACCACGATGGGTCGATATTTGCATATGCGTCGTGCTATGACTGGAGC
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CAGGAAAGTGAGGTCAAGGCGAAGCCAAGAGTAGCAACCGGCAGAAAATGAGATTAGCCT
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TTTCTTTCATATCAAGTAAAGTATCTGTCTTTCTATCTTGGATGTTCTCCTTTTGGCTGG
CTCAGTTTGGAATTGCTTTGTCTCAAGTACTAGTCTCTAAAACATAATG


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 20 5 5 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 30 30 30 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AO74TFB U 1
AF RS1H092TF U 2
AF RS1ET44TF U 64
AF RS1AO74JQ C 487
AF RS1FS50TF U 520
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BS 43 44 RS1H092TF
BS 45 58 RS1AO74TFB
BS 59 59 RS1H092TF
BS 60 286 RS1AO74TFB
BS 287 287 RS1H092TF
BS 288 315 RS1AO74TFB
BS 316 316 RS1H092TF
BS 317 683 RS1AO74TFB
BS 684 684 RS1H092TF
BS 685 772 RS1AO74TFB
BS 773 773 RS1ET44TF
BS 774 774 RS1FS50TF
BS 775 781 RS1ET44TF
BS 782 782 RS1FS50TF
BS 783 797 RS1ET44TF
BS 798 1106 RS1FS50TF
BS 1107 1107 RS1AO74JQ
BS 1108 1285 RS1FS50TF
BS 1286 1286 RS1AO74JQ
BS 1287 1301 RS1FS50TF
BS 1302 1309 RS1AO74JQ

RD RS1AO74TFB 772 0 0
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TCTCTCTCTCGGGCTCTTGAATCGTGAAAATGGCTACCTTCGGTGCGACGGCTAATACTA
ATCCCAACAAATCCTTTGAGGTTACTCCGTCACCAGCAGATTCAATCAGCAGCTTGACCT
TTAGCCCCAGAGCCGATATCCTTGTCGCCACTTCTTGGGACAATCAGGTGAGGTGTTGGG
AGATATCCCGTAGTGGGAACAATCTAGCAAGTGCTCCTAAAGCATCTATATCCCATGATC
AGCCCGTCTTGTGCTTTGCTTGGAAAGATGATGGAACCGCTGTCTTTAGTGGTGGTTGTG
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GCTGGGATAAGACTTTGAGGTATTGGGATACAAGGCAGCAAACACCTGTGCATACCCAAC
AGCTTCCAGATAAATGCTATGCTTTGTCTGTGAAACACCCTCTCATGGTTGTCGCAACTG
CTGATAGGAATCTCATTGTCTACAACATGCAAAATCCTCAGACTGAGTTCAAGAGAGTGG
TGTCCCCACTCAAGTACCAGACGGGGTGTGTTACTGCC*TTCCCTGATCAGCAAGGATTT
TTGGTTGGTTCAATTGAGGGGCGGGTTGGTGTGCATCATCTGGATGATTCTC

QA 1 772 1 772
DS 

RD RS1H092TF 768 0 0
GG
ACTCACTTCATCTTCCTCTTGTTGGAAAATTCTAGTCTCTCCAGACGAACGTTCCACTCT
CTCTC**GGGCTCGCGAATCGTGAAAATGGCTACCTTCGGTGCGACGGCTAATACTAATC
CCAACAAATCCTTTGAGGTGACTCCGTCACCAGCAGATTCAATCAGCAGCTTGACCTTTA
GCCCCAGAGCCGATATCCTTGTGGCCACTTCTTGGGACAATCAGGTGAGGTGTTGGGAGA
TATCCCGTAGTGGGAACAATCTAGCAAGTGCTCCTAAAGCATCCATATCCCATGATCAGC
CCGTCTTGTGCTCTGCTTGGAAAGATGATGGGACCGCTGTCTTTAGTGGTGGTTGTGATA
AGCAAGCCAAAATGTGGCCCCTGTTGTCTGGTGGTCAACCTGTTACTGTTGCTATGCACG
ATGCTCCTATTGTTGACATGGGCTGGATCCCCGGGATGAATCTCCTCGTTACTGGAAGCT
GGGATAAGACTTTGAGGTATTGGGATACAAGGCAGCAAACACCTGTGCATACCCAACAGC
TTCCAGATAAATGCTATGCTTTGTCTGTGAAACACCCTCTCATGGTTGTCGCAACTGCTG
ATAGGAATCTCATTGTCTACAACTTGCAAAATCCTCAGACTGAGTTCAAGAGAGTGGTGT
CCCCACTCAAGTACCAGACGAGGTGTGTTACTGCCCTTCCCTGATCAGCAAGGATTTTTG
GTTGGTTCA*TTGAGGG*CGGGTTGGTGTGCATCATCTGGATGATT

QA 3 768 3 768
DS 

RD RS1ET44TF 738 0 0
AGGG
CTCGGGCTCTTGAATCGTGAAAATGGCTACCTTCGGTGCGACGGCTAATACTAATCCCAA
CAAATCCTTTGAGGTTACTCCGTCACCAGCAGATTCAATCAGCAGCTTGACCTTTAGCCC
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CCGTAGTGGGAACAATCTAGCAAGTGCTCCTAAAGCATCCATATCCTATGATCAGCCCGT
CTTGTGTTCCGCTTGGAAAGATGATGGAACCGCTGTGTTTAGTGGTGGTTGTGATAAGCG
AGCCAAAATGTGGCCCTTGTTGTCTGGTGGTCAACCTGTTACTGTTGCTATGCACGATGC
TCCTATTGTTGACATGGGCTGGATCCCTGGGATGAATCTCCTCGTTACTGGTAGCTGGGA
TAAGACTTTGAGGTATTGGGATACAATGCAGCAAACACCTGTGCATACCCAACAGCTTCC
AGATAAATGCTATTCTTTGTCTGTGAAACACCCTCTCATGGTTGTCGCAACTGCTGATAG
GAATCTCATTGTCTACAACTTGCAAAATCCTC*GACTGAGTTCAAGAGAGTGGTGTCCCC
ACTCAAGTACCAGACGAGGTGTGTTACTGCC*TTCCCTGATCAGCAAGGATTTTTGGTTG
GTTCAATTGAGGG*CGGGTTGGTGTGCATCATCTGGATGAT*CTCA*CAGAACA*GAACT
TCACATTCAA
TGCC

QA 5 734 5 734
DS 

RD RS1AO74JQ 823 0 0
ATAAGACTTTGAGGTATTGGGATACAAGGCAGCAAACACCTGTGCATACCCAACAGCTTC
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GGAATCTCATTGTCTACAACATGCAAAATCCTCAGACTGAGTTCAAGAGAGTGGTGTCCC
CACTCAAGTACCAGACGGGGTGTGTTACTGCC*TTCCCTGATCAGCAAGGATTTTTGGTT
GGTTCAATTGAGGGGCGGGTTGGTGTGCATCATCTGGATGATTCTCAACAGAACAAGAAC
TTCACATTCAAATGCCACAGAGATGGGAATGAGATTTATTCTGTCAACTCTCTCAACTTC
CCCCCGGTACAAGGAACTTTTGCTACTGCTGGCTCAGATGGGGCTTTCAATTTTTGGGAC
AAGGATAGCAAACAAAGACTCAAGGCAATGTCAAGGTGCAGTCAGCCAATTACTTGCAGT
TCGTTTAACCACGATGGGTCGATATTTGCATATGCGTCGTGCTATGACTGGAGCAAAGGT
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AGTGAGGTCAAGGCGAAGCCAAGAGTAGCAACCGGCAGAAAATGAGATTAGCCTTTCAGT
GAGAGTGGATAATGCTTTTAGCTGTCTTAATAATGTTTAA***TGTTA*GAGTCTTTCTT
TCATATCAAGTAAAGTATCTGTCTTTCTATCTTGGATGTTCTCCTTTTGGCT****CAGT
TTGGAATTGCTTTGTCTCAAGTACTAGTCTTTAAAACATAATG

QA 1 823 1 823
DS 

RD RS1FS50TF 783 0 0
G
AACACCTGTGCATACCCAACAGCTTCCAGATAAATGCTGTGCTTTGTCTGTGAAACACCC
TCTCATGGTTGTCGCAACTGCTGATAGGAATCTCATTGTCTATAACTTGCAAAATCCTCA
GACTGAGTTCAAGAGAGTGGTGTCCCCACTCAAGTACCAGACGAGGTGTGTTACTGCC*T
TCCCTGATCAGCAAGGATTTTTGGTTGGTTCAATTGAGGGGCGGGTTGGTGTGCATCATC
TGGATGATTCTCAACAGAACAAGAACTTCACATTCAAATGCCACAGAGATGGGAATGAGA
TCTATTCTGTCAACTCTCTCAACTTCCACCCGGTACAAGGAACTTTTGCTACTGCTGGCT
CAGATGGGGCTTTCAATTTCTGGGACAAGGATAGCAAACAAAGACTCAAGGCAATGTCAA
GGTGCAGTCACCCAATTACTTGCAGTTCGTTTAACCACGATGGGTCGATATTTGCATATG
CGTCGTGCTATGACTGGAGCAAAGGTGCAGAGAATCACAACCCGGCAACTGCTAAAAGCA
GCATCTTCTTGCACATGCCTCAGGAAAGTGAGGTCAAGGCGAAGCCTAGAGTAGCAACCG
GCAGAAAATGAGATTAGCCTTTCAGTGAGAGTGGATAATGCTTTTAGCTGTCTTAATAAT
GTTTAATAATGTTAAGAGTCTTTCTTTCATATCAAGTAAAGTATCTGTCTTTCTATCTTG
GATGTTCTCCTTTTGGCTGGCTCAGTTTGGAATTGCTTTGTCTCA*GTACTAGTCTCTAA
A
C

QA 2 782 2 782
DS 



CO CL395Contig2 719 4 3 U
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AGAAAGACTCTTAACATTATTAAACATTATTAAGACAGCTAAAAGCATTATCCACTCTCA
CTGAAAGGCTAATCTCATTTTCTGCCGGTTGCTACTCTAGGCTTCGCCTTGACCTCACTT
TCCTGAGGCATGTGCAAGAAGATGCTGCTTTTAGCAGTTGCCGGGTTGTGATTCTCTGCA
CCTTTGCTCCAGTCATAGCACGACGCATATGCAAATATCGACCCATCGTGGTTAAACGAA
CTGCAAGTAATTGGGTGACTGCACCTTGACATTGCCTTGAGTCTTTGTTTGCTATCCTTG
TCCCAGAAATTGAAAGCCCCATCTGAGCCAGCAGTAGCAAAAGTTCCTTGTACCGGGTGG
AAGTTGAGAGAGTTGACAGAATAGATCTCATTCCCATCTCTGTGGCATTTGAATGTGAAG
TTCTTGTTCTGTTGAGAATCATCCAGATGATGCACACCAACCCGCCCCTCAATTGAACCA
ACCAAAAATCCTTGCTGATCAGGGAAGGCAGTAACACACCTCGTCTGGTACTTGAGTGGG
GACACCACTCTCTTGAACTCAGTCTGAGGATTTTGCAAGTTATAGACAATGAGATTCCT


BQ
10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DU11JQ U 1
AF RS1DU11TF C 1
AF RS1ET44JQ U 1
AF RS1FS50JQ U 1
BS 1 495 RS1DU11JQ
BS 496 501 RS1ET44JQ
BS 502 719 RS1FS50JQ

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C

QA 1 495 1 495
DS 

RD RS1DU11TF 496 0 0
AT
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GTTGAGAGAGTTG
C

QA 3 495 3 495
DS 

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GC
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DS 

RD RS1FS50JQ 719 0 0
GT
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CTGAGGCATGTGCAAGAAGATGCTGCTTTTAGCAGTTGCCGGGTTGTGATTCTCTGCACC
TTTGCTCCAGTCATAGCACGACGCATATGCAAATATCGACCCATCGTGGTTAAACGAACT
GCAAGTAATTGGGTGACTGCACCTTGACATTGCCTTGAGTCTTTGTTTGCTATCCTTGTC
CCAGAAATTGAAAGCCCCATCTGAGCCAGCAGTAGCAAAAGTTCCTTGTACCGGGTGGAA
GTTGAGAGAGTTGACAGAATAGATCTCATTCCCATCTCTGTGGCATTTGAATGTGAAGTT
CTTGTTCTGTTGAGAATCATCCAGATGATGCACACCAACCCGCCCCTCAATTGAACCAAC
CAAAAATCCTTGCTGATCAGGGAAGGCAGTAACACACCTCGTCTGGTACTTGAGTGGGGA
CACCACTCTCTTGAACTCAGTCTGAGGATTTTGCAAGTTATAGACAATGAGATTCCT

QA 3 719 3 719
DS 



AS 3 8

CO CL396Contig1 816 3 10 U
GGGAAGAAGCCTTACCCATTGTCCTGCTGATTTCATTCGTCTGCGCCGCGTGCTTGATTT
GATTCCTCGCAAGCAAACCTTCTTCCATCACACCTTTTTGGCACCACATCTCTTTTACTT
CCACATCGTAGTAGCAAATCATGGCTGATGAAAATAATGAGATAAAGGAAGTGAAGGACG
AGCAAGATCTCGCACCCTTTGATCCAACCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGTTGTCATTC
AAGATCCTATCGAGGACTGTACAGAGTCATCACAGCCCGAGAAGTCTGATTCACTGCCTG
CTAATGATGGCCTTGAGAGTTCCTCTGCTGGTCTGAAGAAAAAGAAGAAGAAGCCTGTTG
AAATTTCAAGCTCATTGAATGAAGAAAGTCTCGATACTGCAGAAGATTTGGATGAGCATG
CTAATGATGACGAGGAAGATGCAGAGGGGATAGATTTACAGCAGCAGCAGCAACGTTACC
CCTGGGAGGGAAGTGATAGGGATTACATATACGACGAGCTTCTTGGCAGAGTCTTTAACA
TTCTCCGTGAAAACAATCCGGAACTTGCTGGAGATAGACGTCGTACGGTTATGAGGCCTC
CTCAAGTTCTTCGTGAGGGAACGAAGAAGACTGTGTTTGTCAACTTCATGGACCTTTGCA
AGACGATGCATCGTCAGCCGGATCATGTAATGAATTTCCTTCTGGCGGAGTTGGGTACGA
GTGGTTCGCTTGACGGGCAGCAACGATTGGTTGTCAAGGGGAGATCGCACCCAAGAATTT
CGAGGATACTGCGTCGTACGTCACTGAGTACGTCAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AX49TF U 472
AF RS1BJ49TF U 1
AF RS1ER67TF U 1
BS 1 130 RS1BJ49TF
BS 131 135 RS1ER67TF
BS 136 225 RS1BJ49TF
BS 226 226 RS1ER67TF
BS 227 324 RS1BJ49TF
BS 325 325 RS1ER67TF
BS 326 510 RS1BJ49TF
BS 511 511 RS1ER67TF
BS 512 783 RS1BJ49TF
BS 784 816 RS1ER67TF

RD RS1AX49TF 147 0 0
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TCTTTAACATTCTCCGTGAAAACAATCCGGAACTTGCTGGAGATAGACGTCGTACGGTTA
TGAGGCCTCCTCAAGTTCTTCGTGAGG

QA 1 147 1 147
DS 

RD RS1BJ49TF 783 0 0
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CCACATCGTA*****AAATCATGGCTGATGAAAATAATGAGATAAAGGAAGTGAAGGACG
AGCAAGATCTCGCACCCTTTGATCCAACCAAGAAGAAGAAGAAGACGAAAGTTGTCATTC
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AAATTTCAAGCTCATTGAATGAAGAAAGTCTCGATACTGCAGAAGATTTGGATGAGCATG
CTAATGATGACGAGGAAGATGCAGAGGGGATAGATTTACAGCAGCAGCAGCAACGTTACC
CCTGGGAGGGAAGTGATAGGGATTACATATGCGACGAGCTTCTTGGCAGAGTCTTTAACA
TTCTCCGTGAAAACAATCCGGAACTTGCTGGAGATAGACGTCGTACGGTTATGAGGCCTC
CTCAAGTTCTTCGTGAGGGAACGAAGAAGACTGTGTTTGTCAACTTCATGGACCTTTGCA
AGACGATGCATCGTCAGCCGGATCATGTAATGAATTTCCTTCTGGCGGAGTTGGGTACGA
GTGGTTCGCTTGACGGGCAGCAACGATTGGTTGTCAAGGGGAGATCGCACCCAAGAATTT
CGA

QA 1 783 1 783
DS 

RD RS1ER67TF 816 0 0
GGGAAGAAGCCTTACCCATTGTCCTGCTGATTTCATTCGTCTGCGCCGCGTGCTTGATTT
GATTCCTCGCAAGCAAACCTTCTTCCATCACACCTTTTTGGCACCACATCTCTTTTACTT
CCACATCGTCGTAGCAAATCATGGCTGATGAAAATAATGAGATAAAGGAAGTGAAGGACG
AGCAAGATCTCGCACCCTTTGATCCAACCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGTTGTCATTC
AAGATCCTATCGAGGACTGTACAGAGTCATCACAGCCCGAGAAGTCTGATTCACTGCCTG
CTAATGATGGCCTTGAGAGTTCCTCTGCTGGTCTGAAGAAAAAGAAGAAGAAGCCTGTTG
AAATTTCAAGCTCATTGAATGGAGAAAGTCTCGATACTGCAGAAGATTTGGATGAGCATG
CTAATGATGACGAGGAAGATGCAGAGGGGATAGATTTACAGCAGCAGCAGCAACGTTACC
CCTGGGAGGGAAGTGATAGGGATTACATATACGACGAGCTTCTTGGCAGAGTCTTTAACA
TTCTCCGTGAAAACAATCCGGAACTTGCTGGAGATAGACGTCGTACGGTTATGAGGCCTC
CTCAAGTTCTTCGTGAGGGAACGAAGAAGACTGTGTTTGTCAACTTCATGGACCTTTGCA
AGACGATGCATCGTCAGCCGGATCATGTAATGAATTTCCTTCTGGCGGAGTTGGGTACGA
GTGGTTCGCTTGACGGGCAGCAACGATTGGTTGTCAAGGGGAGATCGCACCCAG**ATTT
CGAGGATACTGCGTCGTACGTCACTGAGTACGTCAT

QA 1 816 1 816
DS 



CO CL396Contig2 871 2 6 U
GGGACTGAAGAAAAAGAAGAAGAAGCCTGTTGAAATTTCAAGCTCATTGAATGAAGAAAG
TCTCGATGCTGCAGAAGATTTGGATGAGCATTCTAATGATGACGAGGAAGATGCAGAGGG
GATAGATTTACAGCAGCAGCAGCAGCAACGTTACCCCTGGGAGGGAAGTGATAGGGATTA
CATATACGACGAGCTTCTTGGCAGAGTCTTTAACATTCTCCGTGAAAACAATCCGGAGCT
TGCTGGAGATAGACGTCGTACGGTTATGAGGCCTCCTCAAGTTCTTCGTGAGGGAACGAA
GAAGACTGTGTTTGTCAACTTCATGGACCTTTGCAAGACGATGCATCGTCAGCCGGATCA
TGTAATGAATTTCTTGCTTGCTGAGTTGGGTACCAGTGGTTCGCTTGACGGGCAGCAAAG
ATTGGTTGTGAAGGGGAGATTTGCACCCAAGAATTTCGAAGGGATACTGCGGCGTTACGT
CACTGAGTACGTCATTTGCCTTGGTTGCAAGAGTCCGGACACAATTCTCTCAAAGGAGAA
TCGTCTCTTCTTTCTCAGATGCGAAAAGTGTGGATCTGGACGATCGGTGGCGCAGATCAA
AGCTGGTTTTGTTGCTCGTGTTGGTCGCAGGAAGACTTGAGAAATTGGTGGGTGCAGTGA
ACACTAAAGAGCTTGTTATGGAGTTGAGAAACTTGTTTTTTTTTCGTTTTTTTTTTAAGA
ATACGAGGTGTAATCTACTTTGTTCTCCATACTATGTTTTGAAAAAAAATCAAATATGGA
ATAGGTTTTGAACATTCAACTTTGTTAGATCCATGTGGCTCACTTAAAGTCGAATCCATG
GAGTTTTTTAGTCAAGGTTCTTGTTCATGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DQ42TF U 1
AF RS1DQ42JQ C 41
BS 1 630 RS1DQ42TF
BS 631 631 RS1DQ42JQ
BS 632 684 RS1DQ42TF
BS 685 685 RS1DQ42JQ
BS 686 703 RS1DQ42TF
BS 704 871 RS1DQ42JQ

RD RS1DQ42TF 711 0 0
GGGACTGAAGAAAAAGAAGAAGAAGCCTGTTGAAATTTCAAGCTCATTGAATGAAGAAAG
TCTCGATGCTGCAGAAGATTTGGATGAGCATTCTAATGATGACGAGGAAGATGCAGAGGG
GATAGATTTACAGCAGCAGCAGCAGCAACGTTACCCCTGGGAGGGAAGTGATAGGGATTA
CATATACGACGAGCTTCTTGGCAGAGTCTTTAACATTCTCCGTGAAAACAATCCGGAGCT
TGCTGGAGATAGACGTCGTACGGTTATGAGGCCTCCTCAAGTTCTTCGTGAGGGAACGAA
GAAGACTGTGTTTGTCAACTTCATGGACCTTTGCAAGACGATGCATCGTCAGCCGGATCA
TGTAATGAATTTCTTGCTTGCTGAGTTGGGTACCAGTGGTTCGCTTGACGGGCAGCAAAG
ATTGGTTGTGAAGGGGAGATTTGCACCCAAGAATTTCGAAGGGATACTGCGGCGTTACGT
CACTGAGTACGTCATTTGCCTTGGTTGCAAGAGTCCGGACACAATTCTCTCAAAGGAGAA
TCGTCTCTTCTTTCTCAGATGCGAAAAGTGTGGATCTGGACGATCGGTGGCGCAGATCAA
AGCTGGTTTTGTTGCTCGTGTTGGTCGCAG*AAGACTTGAGAAATTGGTGGGTGCAGTGA
ACACTAAAGAGCTTGTTATGGAGT*GAGAAACTTGTTTTTTTT
CGTTTTTT

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1DQ42JQ 831 0 0
AAGCTCA
TGAATGAAGAAAGTCTCGATGCTGCAGAAGATTTGGATGAGCATTCTAATGATGACGAGG
AAGATGCAGAGGGGATAGATTTACAGCAGCAGCAGCAGCAACGTTACCCCTGGGAGGGAA
GTGATAGGGATTACATATACGACGAGCTTCTTGGCAGAGTCTTTAACATTCTCCGTGAAA
ACAATCCGGAGCTTGCTGGAGATAGACGTCGTACGGTTATGAGGCCTCCTCAAGTTCTTC
GTGAGGGAACGAAGAAGACTGTGTTTGTCAACTTCATGGACCTTTGCAAGACGATGCATC
GTCAGCCGGATCATGTAATGAATTTCTTGCTTGCTGAGTTGGGTACCAGTGGTTCGCTTG
ACGGGCAGCAAAGATTGGTTGTGAAGGGGAGATTTGCACCCAAGAATTTCGAAGGGATAC
TGCGGCGTTACGTCACTGAGTACGTCATTTGCCTTGGTTGCAAGAGTCCGGACACAATTC
TCTCAAAGGAGAATCGTCTCTTCTTTTTCAGATGCGAAAAGTGTGGATCTGGACGATCGG
TGGCGCAGATCAAAGCTGGTTTTGTTGCTCGTGTTGGTCGCAGGAAGACTTGAGAAATTG
GTGGGTGCAGTGAACACTAAAGAGCTTGTTATGGAGTTGAGAAACTTGTTTTTTTTTCGT
TTTTTTTTTAAGAATACGAGGTGTAATCTACTTTGTTCTCCATACTATGTTTTGAAAAAA
AATCAAATATGGAATAGGTTTTGAACATTCAACTTTGTTAGATCCATGTGGCTCACTTAA
AGTCGAATCCATGGAGTTTTTTAGTCAAGGTTCTTGTTCATGTG

QA 8 831 8 831
DS 



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CACAAGGATGAAACAGGCACGGGCTTCCTTTCACATGAACAAGAACCTTGACTGAAACAC
TCCATGGATCCGACCTTAAGTGAGCCACATGGATCTAACAAAGTTGAATGTTCAAAACCT
ATCCCATATTTGATTTTTTTTTCAAGACATAGTATGGAGACCAGAGTAGATTATGCCTCA
TATTCAAAAAAAAA*CTAAAAACAAAACAAGTCTCAACTCAATAACAAGCTCTTTAGTGT
TCACTTCACCCACCAATTTCTCAAGTCTTCCTGCGACCAACACGAGCAACAAAACCAGCT
TTGATCTGCGCCACCGATCGTCCAGATCCACACTTTTCGCATCTGAAAAAGAAGAAACGA
TTCTCCTTTGAGAGAATCGTGTCCGGACTCTTGCAACCAAGGCAAATGACGTACTCAGTG
ACGTAACGACGCAGTATCCCTTCGAAATTCTTGGGTGCGAATCTCCCCTTGACAACCAAT
CGTTGCTGCCCGTCAAGCGAACCACTCGTACCCAACTCCGCCAGAAGGAAATTCATTACA
TGATCCGGCTGACGATGCATCGTCTTGCAAAGGTCCATGAAGTTGACAAACACAGTCTTC
TTCGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1ER67JQ U 1
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GG
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DS 

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QA 1 655 1 655
DS 

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AGGAAATTCATTACATGATCCGGCTGACGATGCATCGTCTTGCAAAGGTCCATGAAGTTG
ACAAACACAGTCTTCTTCGTTCC

QA 1 503 1 503
DS 



AS 1 9

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ATGGGCTCACTGTTGGGCTCTCCAACTATGCTGCAGCTTACTGTACTGGCCTTCTCTTGG
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TGGACGGAGGTCTTGATATCCC*TCACAGTGACAAGAGATTTGCCGGTTTCAACAAAGAA
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TATATGAAGATGTTGAACGAAGATGAGCCAGAGAAGTTTCAGACTCATTTCAGCCAGTAC
TTGAAGAAAGGAGTTGATGCCGAGAGCATGGAGGAGTTGTACAAGAAGGTTCATGCAGCC
ATCCGCGCTGATCCTAACCCAAAGAAGACTGAGAAACCTGCTCCCAAGGCACACAAGAGG
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GTTATCTGAGGATTTACTTCTTTTTTCCTTTTAAGAAGTTATTATCGTCTTATAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
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45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

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CCCCCAAGTACCGTTTCGTTGTCCGTTTCACCAACAAAGACATCGTCGCGCAAATCGTGT
CCGCGAGCATAGCTGGTGACATTGTCAAGGCCTCTGCTTATGCTCATGAGCTTCCTCAAT
ATGGGCTCACTGTTGGGCTCTCCAACTATGCTGCAGCTTACTGTACTGGCCTTCTCTTGG
CTCGCCGTGTGTTGAAGATGTTGGAAATGGATGAAGAGTATGAAGGCAACGTGGAGGCCA
CTGGAGAAGACTTTTCCGTGGAACCCACCGAGTCAAGGAGACCTTTCCGTGCTCTTCTTG
ACGTCGGTCTTATCAGGACCACAACAGGAAACCGTGTCTTCGGTGCACTCAAGGGTGCAT
TGGACGGAGGTCTTGATATCCC*TCACAGTGACAAGAGATTCGCCGGTTTCAACAAAGAA
AACAAACAGCTTGATGCTGAGATCCACAGGAACTACATCTA

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1E593TF 621 0 0
GG
ACTCATATCTCACATAGCTAAACAATGGTGTTTGTGAAGCCATCCAAGTCGAATGCTTAC
TTCAAGAGGTACCAAGTCAAGTTCAGGAGAAGGAGAGCTGGAAAGACTGATTACAGAGCA
AGAATCCGTCTCATCAACCAAGACAAGAACAAGTACAACACCCCCAAGTACCGTTCCGTT
GTCCGTTTCACCAACAAAGACATCGTCGCGCAAATCGTGTCCGCGAGCATAGCTGGTGAC
ATTGTCAAGGCCTCTGCTTATGCTCATGAGCTTCCTCACTATGGGCTCCCTGTTGGGCTC
TCCAACTATGCTGCAGCTTACTGTACTGGCCTTCTCTTGGCTCGCCGTGTGTTGAAGATG
TTGGAAATGGATGAAGAGTATGAAGGCAACGTGGAGGCCACTGGTGAAGACTTTTCCGTG
GAACCCACCGAGTCAAGGAGACCTTTCCGTGCTCTTCTTGACGTCGGTCTCATCAGGACC
ACAACAGGAAACCGTGTCTTCGGTGCACTCAGGGGTGCATTGGACGGAGGTCTTGATATC
CC*TCACAGTGACAAGAGATTTGCCGGTTTCAACAAAGAAAACAAACAGCTTGATGCTGA
GATCCACAGGAACTACATC

QA 3 621 3 621
DS 

RD RS1DP66TF 678 0 0
GG
GCCTCCTCGTCACTCATATCTCACATAGCTAAACAATGGTGTTTGTGAAGCCATCCAAGT
CGAATGCTTACTTCAAGAGGTACCAAGTCAAGTTCAGGAGAAGGAGAGCTGGAAAGACTG
ATTACAGAGCAAGAATCCGTCTCATCAACCAAGACAAGAACAAGTACAACACCCCCAAGT
ACCGTTTCGTTGTCCGTTTCACCAACAAAGACATCGTCGCGCAAATCGTGTCCGCGAGCA
TAGCTGGTGACATTGTCAAGGCCTCTGCTTATGCTCATGAGCTTCCTCACTATGGGCTCA
CTGTTGGGCTCTCCAACTATGCTGCAGCTTACTGTACTGGCCTTCTCTTGGCTCGCCGTG
TGTTGAAGATGTTGGAAATGGATGAAGAGTATGAAGGCAACGTGGAGGCCACTGGTGAAG
ACTTTTCCGTGGAACCCACCGAGTCAAGGAGACCTTTCCGTGCTCTTCTTGACGTCGGTC
TCATCAGGACCACGACAGGAAACCGTGTCTTCGGTGCACTCAAGGGTGCATTGGACGGAG
GTCTTGATATCCC*TCACAGTGACAAGAGATTTGCCGGTTTCAACAAAGAAAACAAACAG
CTTGATGCTGAGATCCACAGGAACTACATCTACG*TGGCCATGTGTCGA*CTATATGA*G
ATGTTGAACGA
GATGA

QA 3 673 3 673
DS 

RD RS1AI08TF 730 0 0
GTC
ACTCATATCTCACATAGCTAAACAATGGTGTTTGTGAAGCCATCCAAGTCGAATGCTTAC
TTCAAGAGGTACCAAGTCAAGTTCAGGAGAAGGAGAGCTGGAAAGACTGATTACAGAGCA
AGAATCCGTCTCATCAACCAAGACAAGAACAAGTACAACACCCCCAAGTACCGTTTCGTT
GTCCGTTTCACCAACAAAGACATCGTCGCGCAAATCGTGTCCGCGAGCATAGCTGGTGAC
ATTGTCAAGGCCTCTGCTTATGCTCATGAGCTTCCTCACTATGGGCTCACTGTTGGGCTC
TCCAACTATGCTGCAGCTTACTGTACTGGCCTTCTCTTGGCTCGCCGTGTGTTGAAGATG
TTGGAAATGGATGAAGAGTATGAAGGCAACGTGGAGGCCACTGGTGAAGACTTTTCCGTG
GAACCCACCGAGTCAAGGAGACCTTTCCGTGCTCTTCTTGACGTCGGTCTCATCAGGACC
ACAACAGGAAACCGTGTCTTCGGTGCACTCAAGGGTGCATTGGACGGAGGTCTTGATATC
CCCTCACAGTGACAAGAGATTTGCCGGTTTCAACAAAGAAAACAAACAGCTTGATGCTGA
GATCCACAGGAACTACATCTACGGTGGCCATGTGTCGAACTATATGAAGATGTTGAACGA
AGATGAGCCAGAGAAGTTTCAGACTCATTTCAGCCAGTACTTGAAGAAAGGAGTTGATGC
CGAGAGC

QA 4 730 4 730
DS 

RD RS1DP66JQ 878 0 0
ATCGTCGCGCAA*TCGTGTCCGCGAGCATAGCTGGTGACAT*GTCAAG*CCTCTGCTTAT
GCTCATGAGCTTCCTCACTATGGGCTCACTGTTGGGCTCCCCAACTATGCTGCAGCTTAC
TGTACTGGCCT*CTCTTGGCTCGCCGTGTGTTGAAGATGTTGGAAATGGATGAAGAGTAT
GAAGGCAACGTGGAGGCCACTGGTGAAGACTTTTCCGTGGAACCCACCGAGTCAAGGAGA
CCTTTCCGTGCTCTTCTTGACGTCGGTCTCATCAGGACCACGACAGGAAACCGTGTCTTC
GGTGCACTCAAGGGTGCATTGGACGGAGGTCTTGATATCCC*TCACAGTGACAAGAGATT
TGCCGGTTTCAACAAAGAAAACAAACAGCTTGATGCTGAGATCCACAGGAACTACATCTA
CGGTGGCCATGTGTCGAACTATATGAAGATGTTGAACGAAGATGAGCCAGACAAGTTTCA
GACTCATTTCAGCCAGTACTTGAAGAAAGGAGTTGATGCCGAGAGCATGGAGGAGTTGTA
CAAGAAGGTTCATGCAGCCATCCGCGCTGATCCTAACCCAAAGAAGACTGAGAAACCTGC
TCCCAAGGCACACAAGAGGTACAATTTGAAGAAGTTGACCTATGAAGAAAGGAAGAACAA
GTTGATTGAGAGAGTTAAGGCATTGAATGGAGCAGCTGGTGGTGAGGACGATGATGAGGA
GGACGAAGAGTAAATCAGTGCAACTCTTTTCGTCTCATGATGTTGTCTCTTGTAGCTTTT
TACTGTTTTGAGCTTAAAGCCTCTTTTATTCTATTTTCAAGACTAAAACACTCAGTTTTT
GTTTTCACATTTGAATTGGGTTATCTGAGGATTTACT
C

QA 1 877 1 877
DS 

RD RS1BE45TF 649 0 0
CAAGGAGACCTTTCCGTGCTCTTCTTGACGTCGGTCTCATCAGGACCACAACAGGAAACC
ATGTCTTCGGTGCACTCAAGGGTGCATTGGACGGAGGTCTTGATATCCC*TCACAGTGAC
AAGAGATTTGCCGGTTTCAACAAAGAAAACAAACAGCTTGATGCTGAGATCCACAGGAAC
TACATCTACGGTGGCCATTTGTCGAACTATATGAAGATGTTGAACGAAGATGAGCCAGAG
AAGTTTCAGACTCATTTCAGCCAGTACTTGAAGAAAGGAGTTGATGCCGAGAGCATGGAG
GAGTTGTACAAGAAGCTTCATGCAGCCATCCGCGCTGATCCTAACCCAAAGAAGACTGAG
AAACCTGCTCCCAAGGCACACAAGAGGTACAACTTGAAGAAGTTGACCTATGAAGAAAGG
AAGAACAAGTTGATTGAGAGAGTTAAGGCATTGAATGGAGCAGCTGGTGGTGAGGACGAT
GATGAGGAGGACGAAGAGTAAATCAGTGCAACTCTTTTCGTCTCATGATGTTGTCTCTTG
TAGCTTTTTACTGTTTTGAGCTTAAAGCCTCTTTTATTCTATTTTCAAGACTAAAACACT
CAGTTTTTGTTTTCACATTTGAATTGGGTTATCTGAGGATTTACTTCTT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1E593JQ 685 0 0
CAAGGAGACCTTTCCGTGCTCTTCTTGACGTCGGTCTCATCAGGACCACAACAGGAAACC
GTGTCTTCGGTGCACTCAGGGGTGCATTGGACGGAGGTCTTGATATCCC*TCACAGTGAC
AAGAGATTTGCCGGTTTCAACAAAGAAAACAAACAGCTTGATGCTGAGATCCACAGGAAC
TACATCTACGGTGGCCATGTGTCGAACTATATGAAGATGTTGAACGAAGATGAGCCAGAG
AAGTTTCAGACTCATTTCAGCCAGTACTTGAAGAAAGGAGTTGATGCCGAGAGCATGGAG
GAGTTGTACAAGAAGGTTCATGCAGCCATCCGCGCTGATCCTAACCCAAAGAAGACTGAG
AAACCTGCTCCCAAGGCACACAAGAGGTACAATTTGAAGAATTTGACCTATGAAGAAAGG
AAGAACAAGTTGATTGAGAGAGTTAAGGCATTGAATGGAGCAGCTGGTGGTGAGGACGAT
GATGAGGAGGACGAAGAGTAAATCAGTGCAACTCCTTTCGTCTCATGATGTTGTCTCTTG
TAGCTTTTTACTGTTTTGAGCTTAAAGCCTCTTTTATTCTATTTTCAAGACTAAAACACT
CAGTTTTTGTTTTCACATTTGAATTGGGTTATCTGAGGATTTACTTCTTTTTTCCTTTTA
AGAAGTTATTATCGTCTTATAAT
TC

QA 1 683 1 683
DS 

RD RS1GA63JQ 624 0 0
TCGGTCTTATCAGGACCACAACAGGAAACCGTGTCTTCGGTGCACTCAAGGGTGCATTGG
ACGGAGGTCTTGATATCCC*TCACAGTGACAAGAGATTCGCCGGTTTCAACAAAGAAAAC
AAACAGCTTGATGCTGAGATCCACAGGAACTACATCTACGGTGGCCATGTTTCGAATTAT
ATGAAGATGTTGAATGAAGATGAGCCGGAAAAGTTTCAGACTCACTTCAGTCAGTACTTG
AAGAAAGGAGTTGATGCCGAGAGCATGGAGGAGTTGTACAAGAAGGTTCATGCAGCCATC
CGCGCTGATCCTAACCCAAAGAAGACTGAGAAACCTGCTCCCAAGGCACACAAGAGGTAC
AATTTGAAGAAGTTGACCTATGAAGAAAGGAAGAACAAGTTGATTGAGAGAGTTAAGGCA
TTCAATGGAGCAGCTGGTGGTGATGACGATGATGAGGAGGATGAAGAATAAATCAGTGCA
ACTCTTATTGTCTCATGATGTTGTCTCTTGTAGCTTTTTACTGTTTTGAGCTTAAAGCCT
CTTTTATTCTATTTTCAAGACTAAAACACTCAGTTTTTGTTTTCACATTTGAATTGGGTT
ATCTGAGGATTTACTTCTT
TTTTC

QA 1 619 1 619
DS 

RD RS1AI08JQ 619 0 0
TCGGTGCACTCAAGGGTGCATTGGACGGAGGTCTTGATATCCC*TCACAGTGACAAGAGA
TTTGCCGGTTTCAACAAAGAAAACAAACAGCTTGATGCTGAGATCCACAGGAACTACATT
TACGGTGGCCATGTGTCGAACTATATGAAGATGTTGAACGAAGATGAGCCAGAGAAGTTT
CAGACTCATTTCAGCCAGTACTTGAAGAAAGGAGTTGATGCCGAGAGCATGGAGGAGTTG
TACAAGAAGGTTCATGCAGCCATCCGCGCTGATCCTAACCCAAAGAAGACTGAGAAACCT
GCTCCCAAGGCACACAAGAGGTACAATTTGAAGAAGTTGACCTATGAAGAAAGGAAGAAC
AAGTTGATTGAGAGAGTTAAGGCATTGAATGGAGCAGCTGGTGGTGAGGACGATGATGAG
GAGGACGAAGAGTAAATCAGTGCAACTCTTTTCGTCTCATGATGTTGTCTCTTGCAGCTT
TTTACTGTTTTGAGCTTAAAGCCTCTTTTATTCTATTTTCAAGACTAAAACACTCAGTTT
TTGTTTTCACATTTGAATTGGGTTATCTGAGGATTTACTTCTTTTTTCCTTTTAAGAAGT
TATTATCGTCTTATAATCC

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 8

CO CL398Contig1 605 8 2 U
GGACGTCCTGTCGCTTTGCCTAGCTTTTCGTTCAATTTCTCTTTTTCTTCATTTTCTTTT
CTTTCTTGTTCTTCCCTCTCTAAATCATCAGCTAAAACTGAGGGAGGGAAGAACGTACGA
ATCTTTTTAAAACTGAATATATAATTGGTTATATATCAAACTAAGCAGTTAAAGAGAAGA
GTGAAAGGGAGAAAATCTCAGCACTGAAAATGTCGGCGTCTAAACTTTTCTTCGGAGCTC
TTACAATCGTATGGATAGTTTTCTCCATTTTCTTCCCAATGGCACAGGCTCAGTCCGCAG
CTCCGGCTCCCGCTCCGTCAAGCGATGGAACAACAATAGATCAAGGCATAGCATATGTCC
TTATGTTGGTGGCTTTGGTCCTCACTTATTACATCCATTAATACTTTTGTCATTTTAATT
CTGGTCTCTATTTAGTTTAATTATATTTTCTCATTTTGATTATAATTAAATAGAGACCAG
AAAAGTTTATGTCGTAGAGAAATTAACGAGATTTTCTAATATTTGGAGTGATATAATTTT
GAAGTTCATTTGTATAACGTCGATATGCGTCAACTGTTGGAAATATATTTCATCACTTTA
CATCT


BQ
10 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
35 10 10 10 10 

AF RS1GM19TF U -2
AF RS1BA16JQ C 2
AF RS1BA16TF U 2
AF RS1BG13TF U 1
AF RS1CG03JQ C 139
AF RS1CG03TF U 139
AF RS1DF66TF U 1
AF RS1CU90JQ C -2
BS 1 601 RS1BG13TF
BS 602 605 RS1CU90JQ

RD RS1GM19TF 554 0 0
GGATT
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TTCTTGTTCTTCCCTCTCTAAATCATCAGCTAAAACTGAGGGAGGGAAGAACGTACGAAT
CTTTTTAAAACTGAATATATAATTGGTTATATATCAAACTAAGCAGTTAAAGAGAAGAGT
GAAAGGGAGAAAATCTCAGCACTGAAAATGTCGGCGTCTAAACTTTTCTTCGGAGCTCTT
ACAATCGTATGGATAGTTTTCTCCATTTTCTTCCCAATGGCACAGGCTCAGTCCGCAGCT
CCGGCTCCCGCTCCGTCAAGCGATGGAACAACAATAGATCAAGGCATAGCATATGTCCTT
ATGTTGGTGGCTTTGGTCCTCACTTATTACATCCATTAATACTTTTGTCATTTTAATTCT
GGTCTCTATTTAGTTTAATTATATTTTCTCATTTTGATTATAATTAAATAGAGACCAGAA
AAGTTTATGTCGTAGAGAAATTAACGAGATTTTCTAATATTTGGAGTGATATAATTTTGA
AGTTCATTT

QA 6 554 6 554
DS 

RD RS1BA16JQ 601 0 0
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TTTCTTGTTCTTCCCTCTCTAAATCATCAGCTAAAACTGAGGGAGGGAAGAACGTACGAA
TCTTTTTAAAACTGAATATATAATTGGTTATATATCAAACTAAGCAGTTAAAGAGAAGAG
TGAAAGGGAGAAAATCTCAGCACTGAAAATGTCGGCGTCTAAACTTTTCTTCGGAGCTCT
TACAATCGTATGGATAGTTTTCTCCATTTTCTTCCCAATGGCACAGGCTCAGTCCGCAGC
TCCGGCTCCCGCTCCGTCAAGCGATGGAACAACAATAGATCAAGGCATAGCATATGTCCT
TATGTTGGTGGCTTTGGTCCTCACTTATTACATCCATTAATACTTTTGTCATTTTAATTC
TGGTCTCTATTTAGTTTAATTATATTTTCTCATTTTGATTATAATTAAATAGAGACCAGA
AAAGTTTATGTCGTAGAGAAATTAACGAGATTTTCTAATATTTGGAGTGATATAATTTTG
AAGTTCATTTGTATAACGTCGATATGCGTCAACTGTTGGAAATATATTTCATCACTTTA
AG

QA 1 599 1 599
DS 

RD RS1BA16TF 601 0 0
GACGTCCTGTCGCTTTGC*TAGCTTTTCGTTCAATTTCTCTTTTTCTTCATTTTCTTTTC
TTTCTTGTTCTTCCCTCTCTAAATCATCAGCTAAAACTGAGGGAGGGAAGAACGTACGAA
TCTTTTTAAAACTGAATATATAATTGGTTATATATCAAACTAAGCAGTTAAAGAGAAGAG
TGAAAGGGAGAAAATCTCAGCACTGAAAATGTCGGCGTCTAAACTTTTCTTCGGAGCTCT
TACAATCGTATGGATAGTTTTCTCCATTTTCTTCCCAATGGCACAGGCTCAGTCCGCAGC
TCCGGCTCCCGCTCCGTCAAGCGATGGAACAACAATAGATCAAGGCATAGCATATGTCCT
TATGTTGGTGGCTTTGGTCCTCACTTATTACATCCATTAATACTTTTGTCATTTTAATTC
TGGTCTCTATTTAGTTTAATTATATTTTCTCATTTTGATTATAATTAAATAGAGACCAGA
AAAGTTTATGTCGTAGAGAAATTAACGAGATTTTCTAATATTTGGAGTGATATAATTTTG
AAGTTCATTTGTATAACGTCGATATGCGTCAACTGTTGGAAATATATTTCATCACTTTA
AG

QA 1 599 1 599
DS 

RD RS1BG13TF 604 0 0
GGACGTCCTGTCGCTTTGCCTAGCTTTTCGTTCAATTTCTCTTTTTCTTCATTTTCTTTT
CTTTCTTGTTCTTCCCTCTCTAAATCATCAGCTAAAACTGAGGGAGGGAAGAACGTACGA
ATCTTTTTAAAACTGAATATATAATTGGTTATATATCAAACTAAGCAGTTAAAGAGAAGA
GTGAAAGGGAGAAAATCTCAGCACTGAAAATGTCGGCGTCTAAACTTTTCTTCGGAGCTC
TTACAATCGTATGGATAGTTTTCTCCATTTTCTTCCCAATGGCACAGGCTCAGTCCGCAG
CTCCGGCTCCCGCTCCGTCAAGCGATGGAACAACAATAGATCAAGGCATAGCATATGTCC
TTATGTTGGTGGCTTTGGTCCTCACTTATTACATCCATTAATACTTTTGTCATTTTAATT
CTGGTCTCTATTTAGTTTAATTATATTTTCTCATTTTGATTATAATTAAATAGAGACCAG
AAAAGTTTATGTCGTAGAGAAATTAACGAGATTTTCTAATATTTGGAGTGATATAATTTT
GAAGTTCATTTGTATAACGTCGATATGCGTCAACTGTTGGAAATATATTTCATCACTTTA
C
ATC

QA 1 601 1 601
DS 

RD RS1CG03JQ 463 0 0
GGG
TAATTGGTTATATATCAAACTAAGCAGTTAAAGAGAAGAGTGAAAGGGAGAAAATCTCAG
CACTGAAAATGTCGGCGTCTAAACTTTTCTTCGGAGCTCTTACAATCGTATGGATAGTTT
TCTCCATTTTCTTCCCAATGGCACAGGCTCAGTCCGCAGCTCCGGCTCCCGCTCCGTCAA
GCGATGGAACAACAATAGATCAAGGCATAGCATATGTCCTTATGTTGGTGGCTTTGGTCC
TCACTTATTACATCCATTAATACTTTTGTCATTTTAATTCTGGTCTCTATTTAGTTTAAT
TATATTTTCTCATTTTGATTATAATTAAATAGAGACCAGAAAAGTTTATGTCGTAGAGAA
ATTAACGAGATTTTCTAATATTTGGAGTGATATAATTTTGAAGTTCATTTGTATAACGTC
GATATGCGTCAACTGTTGGAAATATATTTCATCACTTTAC

QA 4 463 4 463
DS 

RD RS1CG03TF 463 0 0
GGG
TAATTGGTTATATATCAAACTAAGCAGTTAAAGAGAAGAGTGAAAGGGAGAAAATCTCAG
CACTGAAAATGTCGGCGTCTAAACTTTTCTTCGGAGCTCTTACAATCGTATGGATAGTTT
TCTCCATTTTCTTCCCAATGGCACAGGCTCAGTCCGCAGCTCCGGCTCCCGCTCCGTCAA
GCGATGGAACAACAATAGATCAAGGCATAGCATATGTCCTTATGTTGGTGGCTTTGGTCC
TCACTTATTACATCCATTAATACTTTTGTCATTTTAATTCTGGTCTCTATTTAGTTTAAT
TATATTTTCTCATTTTGATTATAATTAAATAGAGACCAGAAAAGTTTATGTCGTAGAGAA
ATTAACGAGATTTTCTAATATTTGGAGTGATATAATTTTGAAGTTCATTTGTATAACGTC
GATATGCGTCAACTGTTGGAAATATATTTCATCACTTTAC

QA 4 463 4 463
DS 

RD RS1DF66TF 602 0 0
G
GACGTCCTGTCGCTTTGCCTAGCTTTTCGTTCAATTTCTCTTTTTCTTCATTTTCTTTTC
TTTCTTGTTCTTCCCTCTCTAAATCATCAGCTAAAACTGAGGGAGGGAAGAACGTACGAA
TCTTTTTAAAACTGAATATATAATTGGTTATATATCAAACTAAGCAGTTAAAGAGAAGAG
TGAAAGGGAGAAAATCTCAGCACTGAAAATGTCGGCGTCTAAACTTTTCTTCGGAGCTCT
TACAATCGTATGGATAGTTTTCTCCATTTTCTTCCCAATGGCGCAGGCTCAGTCCGCAGC
TCCGGCTCCCGCTCCGTCAAGCGATGGAACAACAATAGATCAAGGCATAGCATATGTCCT
TATGTTGGTGGCTTTGGTCCTCACTTATTACATCCATTAATACTTTTGTCATTTTAATTC
TGGTCTCTATTTAGTTTAATTATATTTTCTCATTTTGATTATAATTAAATAGAGACCAGA
AAAGTTTATGTCGTAGAGAAATTAACGAGATTTTCTAATATTTGGAGTGATATAATTTTG
AAGTTCATTTGTATAACGTCGATATGCGTCAACTGTTGGAAATATATTTCATCACTTTAC
A

QA 2 601 2 601
DS 

RD RS1CU90JQ 608 0 0
GGATT
ACGTCCTGTCGCTTTGCCTAGCTTTTCGTTCAATTTCTCTTTTTCTTCATTTTCTTTTCT
TTCTTGTTCTTCCCTCTCTAAATCATCAGCTAAAGCTGAGGGAGGGAAGAACGTACGAAT
CTTTTTAAAACTGAATATATAATTGGTTATATATCAAACTAAGCAGTTAAAGAGAAGAGT
GAAAGGGAGAAAATCTCAGCACTGAAAATGTCGGCGTCTAAACTTTTCTTCGGAGCTCTT
ACAATCGTATGGATAGTTTTCTCCATTTTCTTCCCAATGGCACAGGCTCAGTCCGCAGCT
CCGGCTCCCGCTCCGTCAAGCGATGGAACAACAATAGATCAAGGCATAGCATATGTCCTT
ATGTTGGTGGCTTTGGTCCTCACTTATTACATCCATTAATACTTTTGTCATTTTAATTCT
GGTCTCTATTTAGTTTAATTATATTTTCTCATTTTGATTATAATTAAATAGAGACCAGAA
AAGTTTATGTCGTAGAGAAATTAACGAGATTTTCTAATATTTGGAGTGATATAATTTTGA
AGTTCATTTGTATAACGTCGATATGCGTCAACTGTTGGAAATATATTTCATCACTTTACA
TCT

QA 6 608 6 608
DS 



AS 1 9

CO CL399Contig1 1372 9 15 U
GCTTCGGTTAAAGGAGGACATTAATAACTAAGAATCACAAATGTATTATTACAAAACCCT
TTATTTCTCTTACTGTCTTTTGAGTACAACAACAACAAACAGAGATACATAAGCTTCAAA
CAAAACATAAACCAAGTTTGAGAGTTTTATTCAGTTTTTTT*GAGGGTTTAAGAAGAGAT
TAGTGGCGCTTGTTCCCGGTTGCTTGCTCCCATGAGTTCATGACATGGTTCACTATTTCC
TCAACCCCAAGCCCATGCTTCACCTGAGCAAAGACGAATGGACCACCATCACGCATGCGT
AGTGCATCACGCTCCATGACAGATAAGTCAGCCCCAACAGCTGCTGCAAGGTCCGTCTTG
TTTATAACCAGAAGATCAGCTTGAGTGATGCCAGGACCGCCTTTACGTGGTATCTTATCA
CCAGCCGATACATCGATGATGTAGATGATATAGTCAGCTAGCTCTCTGCTGAAATTAGCA
GCTAGATTATCTCCACCAGATTCACAAAGAAGCAAATCAGTCTTGAACAAGTTTGATAAC
TCCTCGAGAGGACCTAAATTGATACTAATGTCTTCACGGATGGCAGCGTGTGGACATCCA
CCGGTTTCAACGGCCCTGATCCTTTCCTCAGGAAGAGCCCCATGCTTCACCAGAAACTCA
CCGTCCTCTTTGGTGAATATATCATTGGTCACAGCAGCAAGACTGTATTTGTCCCTCAAG
ACTCTACAAAGAGCAAGCATCAATGCTGTTTTCCCTGTGCCAACAGGACCGCCAATACCG
ACGGTGAAAGCTCTCTCGGAGAAGTTACGGTCGTTAAGAGGAGGAGCTCGGCGGCTGAAG
TAGCCAGGAGAGTAAATGGGTTCGTGTGAGTGCGGTGCGAGTCCATCGTGGCTATGGTAC
ACCCTCCCGTCCGGTCCTACCCAAGACGTGTCCCCACCGCCGCAGCCGTCCTGTTTC***
TTGTGGCCTCGCTCGTGATGGTGATGATCATGGTCATGTGAAGCCATTTTTAAGAGACTT
GGTTGCTGCGTTGACTTTCACTTGAGCTACTCCGCGAGAGAGCGAGTCTTGAACACACAA
AAGCAAATTCAAGAACCCCCCGGCCGTAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTCCTGTGTTTT
TAATAAACAGTCGCTACCCCCTGGTATGTGCCGCTTTCCTAATCAAAAGATAGGAGAGCA
CCCCTTCTCCCGAAGTTACGGGGTCATTTTGCCGAGTTCCTTCGACATGGTTCTCTCAAG
CGCCCTAGTATACTCTACTTGTTCACCTGTGTCGGTTTGGGGTACGGTCAGTTCACCGGG
AGGATCGCCCTCCCAATTCGAAGTTTTTTCCTGGAAGTTTCAACCTTCTTGC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 15 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DA01JQ U 6
AF RS1F439JQ U 26
AF RS1DP40JQ U 1
AF RS1DJ06JQ U 26
AF RS1CL01JQ U 48
AF RS1DP40TF C 261
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AF RS1DJ06TF C 620
AF RS1F439TF C 718
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BS 445 445 RS1DA01JQ
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BS 455 762 RS1DP40JQ
BS 763 884 RS1DP40TF
BS 885 988 RS1CL01TF
BS 989 989 RS1DJ06TF
BS 990 1084 RS1CL01TF
BS 1085 1091 RS1DJ06TF
BS 1092 1372 RS1F439TF

RD RS1DA01JQ 622 0 0
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TCTCTTACTGTCTTTTGAGTACAACAACAACAAACAGAGATACATAAGCTTCAAACAAAA
CATAAACCAAGTTTGAGAGTTTTATTCAGTTTTTTT*GAGGGTTTAAGAAGAGATTAGTG
GCGCTTGTTCCCGGTTGCTTGCTCCCATGAGTTCATGACATGGTTCACTATTTCCTCAAC
CCCAAGCCCATGCTTCACCTGAGCAAAGACGAATGGACCACCATCACGCATGCGTAGTGC
ATCACGCTCCATGACAGATAAGTCAGCCCCAACAGCTGCTGCAAGGTCCGTCTTGTTTAT
AACCAGAAGATCAGCTTGAGTGATGCCAGGACCGCCTTTACGTGGTATCTTATCACCAGC
CGATACATCGATGATGTAGATGATATAGTCAGCTAGCTCTCTGCTGAAATTAGTAGCTAG
ATTATCTCCACCAGATTCACAAAGAAGCAAATCAGTCTTGAACAAGTTTGATAACTCCTC
GAGAGGACCTAAATTGATACTAATGTCTTCACGGATGGCAGAGTGTGGACATCCACCGGT
TTCAACGGCCCTGATCCTTTCC

QA 1 622 1 622
DS 

RD RS1F439JQ 677 0 0
AA
CTAAGAATCACAAATGTATTATTACAAAACCCTTTATTTCTCTTACTGTCTTTTGAGTAC
AACAACAACAAACAGAGATACATAAGCTTCAAACAAAACATAAACCAAGTTTGAGAGTTT
TATTCAGTTTTTTT*GAGGGTTTAAAAAAAGATTAGTGGCGCTTGTTCCCGGTTGCTTGC
TCCCATGAGTTCATGACATGGTTCACTATTTCCTCAACCCCAAGCCCATGCTTCACCTGA
GCAAAGACGAATGGACCACCATCACGCATGCGTAGTGCATCACGCTCCATGACAGATAAG
TCAGCCCCAACAGCTGCTGCAAGGTCCGTCTTGTTTATAACCAGAAAATCAGCTTGAGTG
ATGCCAGGACCGCCTTTACGTGGTATCTTATCACCAGCCGATACATCGATGATGTAAATG
ATATAGTCAGCTAGCTCTCTGCTGAAATTAGCAGCTAGATTATCTCCACCAGATTCACAA
AGAAGCAAATCAGTCTTGAACAAGTTTGATAACTCCTCGAGAGGACCTAAATTGATACTA
ATGTCTTCACGGATGGCAGCGTGTGGACATCCACCGGTTTCAACGGCCCTGATCCTTTCC
TCAGGAAGAGCCCCATGCTTCACCAGAAACTCACCGTCCTCTTTGGTGAATATATCATTG
GTCACAGCAGCAAGA

QA 3 677 3 677
DS 

RD RS1DP40JQ 762 0 0
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TTATTTCTCTTACTGTCTTTTGAGTACAACAACAACAAACAGAGATACATAAGCTTCAAA
CAAAACATAAACCAAGTTTGAGAGTTTTATTCAGTTTTTT**GAGGGTTTAAGAAGAGAT
TAGTGGCGCTTGTTCCCGGTTGTTTGCTCCCATGAGTTCATGACATGGTTCACTATTTCC
TCAACCCCAAGCCCATGCTTCACCTGAGCAAAGACGAATGGACCACCATCACGCATGCGT
AGTGCATCACGCTCCATGACAGATAAGTCAGCCCCAACAGCTGCTGCAAGGTCCGTCTTG
TTTATAACCAGAAGATCAGCTTGAGTGATGCCAGGACCGCCTTTACGTGGTATCTTATCA
CCAGCCGATACATCGATGATGTAGGTGATATAGCCAGCTAGCTCTCTGCTGAAATTAGCA
GCTAGATTATCTCCACCAGATTCACAAAGAAGCAAATCAGTCTTGAACAAGTTTGATAAC
TCCTCGAGAGGACCTAAATTGATACTAATGTCTTCACGGATGGCAGCGTGTGGACATCCA
CCGGTTTCAACGGCCCTGATCCTTTCCTCAGGAAGAGCCCCATGCTTCACCAGAAACTCA
CCGTCCTCTTTGGTGAATATATCATTGGTCACAGCAGCAAGACTGTATTTGTCCCTCAAG
ACTCTACAAAGAGCAAGCATCAATGCTGTTTTCCCTGTGCCA

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1DJ06JQ 722 0 0
AG
CTAAGAATCACAAATGTATTATTACAAAACCCTTTATTTCTCTTACTGTCTTTTGAGTAC
AACAACAACAAACAGAGATACATAAGCTTCAAACAAAACATAAACCAAGTTTGAGAGTTT
TATTCAGTTTTTTTTGAGGGTTTAAGAAGAGATTAGTGGCGCTTGTTCCCGGTTGCTTGC
TCCCATGAGTTCATGACATGGTTCACTATTTCCTCAACCCCAAGCCCATGCTTCACCTGA
GCAAAGACGAATGGACCACCATCACGCATGCGTAGTGCATCACGCTCCATGACAGATAAG
TCAGCCCCAACAGCTGCTGCAAGGTCCGTCTTGTTTATAACCAGAAGATCAGCTTGAGTG
ATGCCAGGACCGCCTTTACGTGGTATCTTATCACCAGCCGATACATCGATGATGTAGATG
ATATAGTCAGCTAGCTCTCTGCTGAAATTAGCAGCTAGATTATCTCCACCAGATTCACAA
AGAAGCAAATCAGTCTTGAACAAGTTTGATAACTCCTCGAGAGGACCTAAATTGATACTA
ATGTCTTCACGGATGGCAGCGTGTGGACATCCACCGGTTTCAACGGCCCTGATCCTTTCC
TCAGGAAGAGCCCCATGCTTCACCAGAAACTCACCGTCCTCTTTGGTGAATATATCATTG
GTCACAGCAGCAAGACTGTATTTGTCCCTCAAGACTCTACAAAGAGCAAGCATCAATGCT

QA 3 722 3 722
DS 

RD RS1CL01JQ 694 0 0
AC
TACAAAACCCTTTATTTCTCTTACTGTCTTTTGAGTACAACAACAACAAACAGAGATACA
TAAGCTTCAAACAAAACATAAACCAAGTTTGAGAGTTTTATTCAGTTTTTTT*GAGGGTT
TAAGAAGAGATTAGTGGCGCTTGTTCCCGGTTGCTTGCTCCCATGAGTTCATGACATAGT
TCACTATTTCCTCAACCCCAAGCCCATGCTTCACCTGAGCAAAGACGAATGGACCATCAT
CACGCATGCGTAGTGCATCACGCTCCATGACAGATAAGTCAGCCCCAACAGCTGCTGCAA
GGTCCGTCTTGTTTATAACCAGAAGATCAGCTTGAGTGATGCCAGGACCGCCTTTACGTG
GTATCTTATCACCAGCCGATACATCGATGATGTAGATGATATAGTCAGCTAGCTCTCTGC
TGAAATTAGCAGCTAGATTATCTCCACCAGATTCACAAAGAAGCAAATCAGTCTTGAACA
AGTTTGATAACTCCTCGAGAGGACCTAAATTGATACTAATGTCTTCACGGATGGCAGCGT
GTGGACATCCACCGGTTTCAACGGCCCTGATCCTTTCCTCAGGAAGAGCCCCATGCTTCA
CCAGAAACTCACCGTCCTCTTTGGTGAATATATCATTGGTCACAGCAGCAAGACTGTATT
TGTCCCTCAAGACTCTACAAAGAGCAAGCATC

QA 3 694 3 694
DS 

RD RS1DP40TF 625 0 0
TCA
CTGAGCAAAGACGAATGGACCACCATCACGCATGCGTAGTGCATCACGCTCCATGACAGA
TAAGTCAGCCCCAACAGCTGCTGCAAGGTCCGTCTTGTTTATAACCAGAAGATCAGCTTG
AGTGATGCCAGGACCGCCTTTACGTGGTATCTTATCACCAGCCGATACATCGATGATGTA
GGTGATATAGCCAGCTAGCTCTCTGCTGAAATTAGCAGCTAGATTATCTCCACCAGATTC
ACAAAGAAGCAAATCAGTCTTGAACAAGTTTGATAACTCCTCGAGAGGACCTAAATTGAT
ACTAATGTCTTCACGGATGGCAGCGTGTGGACATCCACCGGTTTCAACGGCCCTGATCCT
TTCCTCAGGAAGAGCCCCATGCTTCACCAGAAACTCACCGTCCTCTTTGGTGAATATATC
ATTGGTCACAGCAGCAAGACTGTATTTGTCCCTCAAGACTCTACAAAGAGCAAGCATCAA
TGCTGTTTTCCCTGTGCCAACAGGACCGCCAATACCGACGGTGAAAGCTCTCTCGGAGAA
GTTACGGTCGTTAAGAGGAGGAGCTCGGCGGCTGAAGTAGCCAGGAGAGTAAATGGGTTC
GTGTGAGTGCGGTGCGAGTCC
C

QA 4 624 4 624
DS 

RD RS1CL01TF 671 0 0
TATCACCAGCCGATACATCGATGATGTAGATGATATAGTCAGCTAGCTCTCTGCTGAAAT
TAGCAGCTAGATTATCTCCACCAGATTCACAAAGAAGCAAATCAGTCTTGAACAAGTTTG
ATAACTCCTCGAGAGGACCTAAATTGATACTAATGTCTTCACGGATGGCAGCGTGTGGAC
ATCCACCGGTTTCAACGGCCCTGATCCTTTCCTCAGGAAGAGCCCCATGCTTCACCAGAA
ACTCACCGTCCTCTTTGGTGAATATATCATTGGTCACAGCAGCAAGACTGTATTTGTCCC
TCAAGACTCTACAAAGAGCAAGCATCAATGCTGTTTTCCCTGTGCCAACAGGACCGCCAA
TACCGACGGTGAAAGCTCTCTCGGAGAAGTTACGGTCGTTAAGAGGAGGAGCTCGGCGGC
TGAAGTAGCCAGGAGAGTAAATGGGTTCGTGTGAGTGCGGTGCGAGTCCATCGTGGCTAT
GGTACACCCTCCCGTCCGGTCCTACCCAAGACGTGTCCCCACCGCCGCAGCCGTCCTGTT
TC***TTGTGGCCTCGCTCGTGATGGTGATGATAATGGTCATGTGAAGCCATTTTTAAGA
GACTTGGTTGCTGCGTTGACTTTCACTTGAGCTACTCCGCGAGAGAGCGAGTCTTGAACA
CACAAAAGC
CC

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DS 

RD RS1DJ06TF 476 0 0
TCCTTTCCTCAGGAAGAGCCCCATGCTTCACCAGAAACTCACCGTCCTCTTTGGTGAATA
TATCATTGGTCACAGCAGCAAGACTGTATTTGTCCCTCAAGACTCTACAAAGAGCAAGCA
TCAATGCTGTTTTCCCTGTGCCAACAGGACCGCCAATACCGACGGTGAAAGCTCTCTCGG
AGAAGTTACGGTCGTTAAGAGGAGGAGCTCGGCGGCTGAAGTAGCCAGGAGAGTAAATGG
GTTCGTGTGAGTGCGGTGCGAGTCCATCGTGGCTATGGTACACCCTCCCGTCCGGTCCTA
CCCAAGACGTGTCCCCACCGCCGCAGCCGTCCTGTTTCCTATTGTGGCCTCGCTCGTGAT
GGTGATGACCATGGTCATGTGAAGCCATTTTTAAGAGACTTGGTTGCTGCGTTGACTTTC
ACTTGAGCTACTCCGCGAGAGAGCGAGTCTTGAACACACAAAAGCAAATTCA
GGCC

QA 1 472 1 472
DS 

RD RS1F439TF 655 0 0
AAGACTCTACAAAGAGCAAGCATCAATGCTGTTTTCC*TGTGCCAACAGGACCGCCAATA
CCCACGGTGAAAGCTCTCTCGGAGAAGTTACGGTCGTTAAGAGGAGGAGCTCGGCGGCTG
AAGTAGCCAGGAGAGTAAATGGGTTCGTGTGAGTGCGGTGCGAGTCCATCGTGGCTATGG
TACACCCTCCCGTCCGGTCCTACCCAAGACGTGTCCCCACCGCCGCAGCCGTCCTGTTTC
***TTGTGGCCTCGCTCGTGATGGTGATGATCATGGTCATGTGAAGCCATTTTTAAGAGA
CTTGGTTGCTGCGTTGACTTTCACTTGAGCTACTCCGCGAGAGAGCGAGTCTTGAACACA
CAAAAGCAAATTCAAGAACCCCCCGGCCGTAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTCCTGTGT
TTTTAATAAACAGTCGCTACCCCCTGGTATGTGCCGCTTTCCTAATCAAAAGATAGGAGA
GCACCCCTTCTCCCGAAGTTACGGGGTCATTTTGCCGAGTTCCTTCGACATGGTTCTCTC
AAGCGCCCTAGTATACTCTACTTGTTCACCTGTGTCGGTTTGGGGTACGGTCAGTTCACC
GGGAGGATCGCCCTCCCAATTCGAAGTTTTTTCCTGGAAGTTTCAACCTTCTTGC

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 9

CO CL400Contig1 1257 9 21 U
GGGACTTCTAACCTTCTCTTCTTCCACACACATAAATACACACACGCTTCAGATAATATA
GAAGAAGAACAAGAACAAGAAAATAATGGATCAAGAAAAGTCTCCCTCTTGCTGCTGCGT
TCTTGATGCTTCTACTTATGTAGGTTTCTGGATTCTCAAGAAGTTGCTTAGCAGAGGATA
CTCTGTTCACGCAGCTATTCGTAGAAACGGGGAGAGTGAAATTGAAGAGACAATCAGAGA
GATGGAAGCAACGGAGGAGAGATTAGTGGTGTACGATGTTGATGTGTTGGACTATCAAAG
CATACTTGTCTCTCTCAAGACATGTAACGCTGTCTTCTGCTGCTTAGATAGCCCTGAAGG
ATACGATGAGAAGGAGGTTGATTTGGAGGTGAGAGGAGCTATCAATGTGGTGGAGGCATG
TGGAAGAACAGAGAGCATAGAGAAGATTGTCTTCTCTTCTTCTTTAACAGCTTCTATTTG
GAGAGACAACATTGGAACTCAGAAGGATGTTGATGAGAAGTGTTGGAGTGATCAAGACTT
CTGTCGCAGCAAGAAGCTGTGGCACGCATTGGCAAAGATGTTGTCCGAGAAAGCAGCTTG
GGCACTAGCCATGGACCGTAGGCTCAACATGGTTTCTATCAATCCTGGTCTTATCGTCGG
ACCGTCGGTTGCACAACATAACCCTAGGCCCACCATGTCCTACCTCAAAGGAGCTGCACA
AATGTATGAGAATGGAGTGTTGGCATATGTAGATGTGAAATTCTTAGCGGATGTTCATAT
TAGAGCATTCGAGGATGTTTCAGCATGTGGTCGATATTTCTGCTTCAACCAAATCGTCAA
CACAGAAGAAGAAGCTCTCAAGCTTGTCCAGAGTTTGTCTCCTTTGATACCTATGCCACC
GAGGTATGAGAGTGTAATGCAAGGAAGCGAAGTTTACGAAGAAAGATTGAGGAACAATAA
ATTGAGCAAGCTGGTGGAAGCTGGCTCTGCTTGTTAAACAAATATTAAAATTATTAAAAT
TGAAAATGAGGAGCTTATACAAGAAAGGGTTATAGTTTGTTTATTAAGCTTCTCTCAATT
CATACTTCATGGTAGCATGTGTTCTCGTGAACTATTTATTTATAAAATATCATATTGTCA
TGTGATATATATATTAGTATACGAGTGGTGGGTAGAGGTTTTATATATTTTCCGGGAGCA
CACAATGTCAATGCTTTCTACAATTTATTTATTTATTTTACAGCAACGTTCCCTACG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 20 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 25 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 25 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CO59TF U 2
AF RS1EX66TF U 1
AF RS1BV74TF U 64
AF RS1D783TF U 58
AF RS1H353TF U 202
AF RS1EX66JQ C 268
AF RS1D783JQ C 358
AF RS1H353JQB C 676
AF RS1CO59JQ C 469
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RD RS1CO59TF 682 0 0
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AAGAAGAACAAGAACAAGAAAATAATGGATCAAGAGAAGTCTCCCTCTTGCTGCTGCGTT
CTTGATGCTTCTACTTATGTAGGTTTCTGGATTCTCAAGAAGTTGCTTGGCAGAGGATAC
TCTGTTCACGCAGCTATTCGTAGAAACGGGGAGAGTGAAATTGAAGAGACAATCAGAGAG
ATGGAAGCAACGGAGGAGAGATTAGTGGTGTACGATGTTGATGTGTTGGACTATCAAAGC
ATACTTGTCTCTCTCAAGACATGTAACGCTGTCTTCTGCTGCTTAGATAGCCCTGAAGGA
TACGATGAGAAGGAGGTTGATTTGGAGGTGAGAGGAGCTATCAATGTGGTGGAGGCATGT
GGAAGAACAGAGAGCATAGAGAAGATTGTCTTCTCTTCTTCTTTAACAGCTTCTATTTGG
AGAGACAACATTGGAACTCAGAAGGATGTTGATGAGAAGTGTTGGAGTGATCAAGACTTC
TGTCGCAGCAAGAAGCTGTGGCACGCATTGGCAAAGATGTTGTCCGAGAAAGCAGCTTGG
GCACTAGCCATGGACCGTAGGCTCAACATGGTTTCTATCAATCCTGGTCTTATCGTCGGA
CTGTCGGTTGCACAACATAACC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1EX66TF 758 0 0
GGGACTTCTAACCTTCTCTTCTTCCACACACATAAATACACACACGCTTCAGATAATATA
GAAGAAGAACAAGAACAAGAAAATAATGGATCAAGAAAAGTCTCCCTCTTGCTGCTGCGT
TCTTGATGCTTCTACTTATGTAGGTTTCTGGATTCTCAAGAAGTTGCTTAGCAGAGGATA
CTCTGTTCACGCAGCTATTCGTAGAAACGGGGAGAGTGAAATTGAAGAGACAATCAGAGA
GATGGAAGCAACGGAGGAGAGATTAGTGGTGTACGATGTTGATGTGTTGGACTATCAAAG
CATACTTGTCTCTCTCAAGACATGTAACGCTGTCTTCTGCTGCTTAGATAGCCCTGAAGG
ATACGATGAGAAGGAGGTTGATTTGGAGGTGAGAGGAGCTATCAATGTGGTGGAGGCATG
TGGAAGAACAGAGAGCATAGAGAAGATTGTCTTCTCTTCTTCTTTAACAGCTTCTATTTG
GAGAGACAACATTGGAACTCAGAAGGATGTTGATGAGAAGTGTTGGAGTGATCAAGACTT
CTGTCGCAGCAAGAAGCTGTGGCACGCATTGGCAAAGATGTTGTCCGAGAAAGCAGCTTG
GGCACTAGCCATGGACCGTAG*CTCAACATGGTTTCTATCAATCCTGGTCTTATCGTCGG
ACCGTCG*TTGCACAACATAACCCTAG*CCCAC*ATGTCCTACCTCAAAG*AGCTGCACA
AATGTATGAGAATGGAGTGTTGGCATATGTAGATGTGA

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1BV74TF 684 0 0
GG
AGAACAAGAACAAGAAAATAATGGATCAAGAAAAGTCTCCCTCTTGCTGCTGCGTTCTTG
ATGCTTCTACTTATGTAGGTTTCTGGATTCTCAAGAAGTTGCTTAGCAGAGGATACTCTG
TTCACGCAGCTATTCGTAGAAACGGGGAGAGTGAAATTGAAGAGACAATCAGAGAGATGG
AAGCAACGGAGGAGAGATTAGTGGTGTACGATGTTGATGTGTTGGACTATCAAAGCATAC
TTGTCTCTCTCAAGACATGTAACGCTGTCTTCTGCTGCTTAGATAGCCCTGAAGGATACG
ATGAGAAGGAGGTTGATTTGGAGGTGAGAGGAGCTATCAATGTGGTGGAGGCATGTGGAA
GAACAGAGAGCATAGAGAAGATTGTCTTCTCTTCTTCTTTAACAGCTCCTATTTGGAGAG
ACAACATTGGAACTCAGAAGGATGTTGATGAGAAGTGTTGGAGTGATCAAGACTTCTGTC
GCAGCAAGAAGCTGTGGCACGCATTGGCAAAGATGTTGTCCGAGAAAGCGGCTTGGGCAC
TAGCCATGGACCGTAGGCTCAACATGGTTTCTATCAATCCTGGTCTTATCGTCGGACCGT
CGGTTGCACAACATAACCCTAG*CCCACCATGTCCTACCTCAAAGGAGCTGCACAAATGT
ATGAGAATGGAGTGTTGGCATA

QA 3 684 3 684
DS 

RD RS1D783TF 746 0 0
GGTGAAGA
AGAACAAGAACAAGAAAATAATGGATCAAGAAAAGTCTCCCTCTTGCTGCTGCGTTCTTG
ATGCTTCTACTTATGTAGGTTTCTGGATTCTCAAGAAGTTGCTTAGCAGAGGATACTCTG
TTCACACAGCTATTCGTAGAAACGGGGAGAGTGAAATTGAAGAGACAATCAGAGAGATGG
AAGCAACGGAGGAGAGATTAGTGGTGTACGATGTTGATGTGTTGGACTATCAAAGCATAC
TTGTCTCTCTCAAGACATGTAACGCTGTCTTCTGCTGCTTAGATAGCCCTGAAGGATACG
ATGAGAAGGAGGTTGATTTGGAGGTGAGAGGAGCTATCAATGTGGTGGAGGCATGTGGAA
GAACAGAGAGCATAGAGAAGATTGTCTTCTCTTCTTCTTTAACAGCTTCTATTTGGAGAG
ACAACATTGGAACTCAGAAGGATGTTGATGAGAAGTGTTGGAGTGATCAAGACTTCTGTC
GCAGCAAGAAGCTGTGGCACGCATTGGCAAAGATGTTGTCCGAGAAAGCAGCTTGGGCAC
TAGCCATGGACCGTAGGCTCAACATGGTTTCTATCAATCCTGGTCTTATCGTCGGACCGT
CGGTTGCACAGCATAACCCTAGGCCCACCATGTCCTACCTCAAAG*AGCTGCACAA*TGT
ATGAGAATGGAGTGTTGGCATATGTAGATGTGAA*TTCTTAGCGGATGTTCATATTAGAG
CATTCGAGGATGTTTCAG

QA 9 746 9 746
DS 

RD RS1H353TF 733 0 0
G
AGAAACGGGGAGAGTGAAATTGAAGAGACAATCAGAGAGATGGAAGCAACGGAGGAGAGA
TTAGTGGTGTACGATGTTGATGTGTTGGACTATCAAAGCATACTTGTCTCTCTCAAGACA
TGTAACGCTGTCTTCTGCTGCTTAGATAGCCCTGAAGGATACGATGAGAAGGAGGTTGAT
TTGGAGGTGAGAGGAGCTATCAATGTGGTGGAGGCATGTGGAAGAACAGAGAGCATAGAG
AAGATTGTCTTCTCTTCTTCTTTAACAGCTTCTATTTGGAGAGACAACATTGGAACTCAG
AAGGATGTTGATGAGAAGTGTTGGAGTGATCAAGACTTCTGTCGCAGCAAGAAGCTGTGG
CACGCATTGGCAAAGATGTTGTCCGAGAAAGCAGCTTGGGCACTAGCCATGGACCGTAGG
CTCAACATGGTTTCTATCAATCCTGGTCTTATCGTCGGACCGTCGGTTGCACAACATAAC
CCTAGGCCCACCATGTCCTACCTCAAAGGAGCTGCACAAATGTATGAGAATGGAGTGTTG
GCATATGTAGATGTGAAATTCTTAGCGGATGTTCATATTAGAGCATTCGAGGATGTTTCA
GCATGTGGTCGATATTTCTGCTTCAACCAAATCGTCAACACAGAAGAAGAAGCTCTCAAG
CTTGTCCAGAGTTTGTCTCCTTTGATAC*TATGCCACCGAGGTATGAGAGTGTAATGCAA
GGAAGCGAAGTT

QA 2 733 2 733
DS 

RD RS1EX66JQ 880 0 0
GGTGTACGATGT*GATGTGT*GGACTATCAAAGCATACT*GTCTCTCTCAAGACATGTAA
CGCTGTCTTCTGCTGCTTAGATAGCC*TGAAGGATACGATGAGAAGGAGGTTGATTTGGA
GGTGAGAGGAGCTATCAATGTGGTGGAGGCATGTGGAAGAACAGAGAGCATAGAGAAGAT
TGTCTTCTCTTCTTCTTTAACAGCTTCTATTTGGAGAGACAACATTGGAACTCAGAAGGA
TGTTGATGAGAAGTGTTGGAGTGATCAAGACTTCTGTCGCAGCAAGAAGCTGTGGCACGC
ATTGGCAAAGATGTTGTCCGAGAAAGCAGCTTGGGCACTAGCCATGGACCGTAGGCTCAA
CATGGTTTCTATCAATCCTGGTCTTATCGTCGGACCGTCGGTTGCACAACATAACCCTAG
GCCCACCATGTCCTACCTCAAAGGAGCTGCACAAATGTATGAGAATGGAGTGTTGGCATA
TGTAGATGTGAAATTCTTAGCGGATGTTCATATTAGAGCATTCGAGGATGTTTCAGCATG
TGGTCGATATTTCTGCTTCAACCAAATCGTCAACACAGAAGAAGAAGCTCTCAAGCTTGT
CCAGAGTTTGTCTCCTTTGATACCTATGCCACCGAGGTATGAGAGTGTAATGCAAGGAAG
CGAAGTTTACGAAGAAAGATTGAGGAACAATAAATTGAGCAAGCTGGTGGAAGCTGACTC
TGCTTGTTAAACAAATATTAAAATTATTAAAATTGAAAATGAGGAGCTTATACAAGAAAG
GGTTATAGTTTGTTTATTAAGCTTCTCTCAATTCATACTTCATGGTAGCATGTGTTCTCG
TGAACTATTTATTTATAAAATATCATATT
TCAAAAAAAAA

QA 1 869 1 869
DS 

RD RS1D783JQ 782 0 0
AGGATACGATGAGAAGGAGGTTGATTTGGAGGTGAGAGGAGCTATCAATGTGGTGGAGGC
ATGTGGAAGAACAGAGAGCATAGAGAAGATTGTCTTCTCTTCTTCTTTAACAGCTTCTAT
TTGGAGAGACAACATTGGAACTCAGAAGGATGTTGATGAGAAGTGTTGGAGTGATCAAGA
CTTCTGTCGCAGCAAGAAGCTGTGGCACGCATTGGCAAAGATGTTGTCCGAGAAAGCAGC
TTGGGCACTAGCCATGGACCGTAGGCTCAACATGGTTTCTATCAATCCTGGTCTTATCGT
CGGACCGTCGGTTGCACAGCATAACCCTAGGCCCACCATGTCCTACCTCAAAGGAGCTGC
ACAAATGTATGAGAATGGAGTGTTGGCATATGTAGATGTGAAATTCTTAGCGGATGTTCA
TATTAGAGCATTCGAGGATGTTTCAGCATGTGGTCGATATTTCTGCTTCAACCAAATCGT
CAACACAGAAGAAGAAGCTCTCAAGCTTGTCCAGAGTTTGTCTCCTTTGATACCTATGCC
ACCGAGGTATGAGAGTGTAATGCAAGGAAGCGAAGTTTACGAAGAAAGATTGAGGAACAA
TAAATTGAGCAAGCTGGTGGAAGCTGGCTCTGCTTGTTAAACAAATATTAAAATTATTAA
AATTGAAAATGAGGAGCTTATACAAGAAAGGGTTATAGTTTGTTTATTAAGCTTCTCTCA
ATTCATACTTCATGGTAGCATGTGTTCTCGTGAACTATTTATTTATAAAATATCATATT
GTC

QA 1 779 1 779
DS 

RD RS1H353JQB 464 0 0
ACATAACCCTAGGCCCCCCATGTCCTCCCTCAAAGGAGCTGCACAAATGTATGAGAATGG
AGTGTTGGCATATGTAGATGTGAAATTTTTAGCGGATGTTCATATTAGAGCATTCGAGGA
TGTTTCAGCATGTGGTCGATATTTTTGCTTCAACCAAATCGTCAACACAGAAGAAGAAGC
TCTCAAGCTTGTCCAGAGTTTGTCTCCTTTGATAC*TATGCCCCCGAGGTATGAGAGTGT
AATGCAAGGAAGCGAAGTTTACGAAGAAAGATTGAGGAACAATAAATTGAGCAAGCTGGT
GGAAGCTGGCTTTGCTTGTTAAACAAATATTAAAATTATTAAAATTGAAAATGAGGAGCT
TATACAAGAAAGGGTTATAGTTTGTTTATTAAGCTTCTCTCAATTCATACTTCATGGTAG
CATGTGTTTTCGTGAACTATTTATTTATAAAATATCATATT
GCC

QA 1 461 1 461
DS 

RD RS1CO59JQ 789 0 0
AGCTTCTATTTGGAGAGACAACATTGGAACTCAGAAGGATGTTGATGAGAAGTGTTGGAG
TGATCAAGACTTCTGTCGCAGCAAGAAGCTGTGGCACGCATTGGCAAAGATGTTGTCCGA
GAAAGCAGCTTGGGCACTAGCCATGGACCGTAGGCTCAACATGGTTTCTATCAATCCTGG
TCTTATCGTCGGACTGTCGGTTGCACAACATAACCCTAGGCCCACCATGTCCTACCTCAA
AGGAGCTGCACAAATGTATGAGAATGGAGTGTTGGCATATGTAGATGTGAAATTCTTAGC
GGATGTTCATATTAGAGCATTCGAGGATGTTTCAGCATGTGGTCGATATTTCTGCTTCAA
CCAAATCGTCAACACAGAAGAAGAAGCTCTCAAGCTTGTCCAGAGTTTGTCTCCTTTGAT
ACCTATGCCACCGAGGTATGAGAGTGTAATGCAAGGAAGCGAAGTTTACGAAGAAAGATT
GAGGAACAATAAATTGAGCAAGCTGGTGGAAGCTGGCTCTGCTTGTTAAACAAATATTAA
AATTATTAAAATTGAAAATGAGGAGCTTATACAAGAAAGGGTTATAGTTTGTTTATTAAG
CTTCTCTCAATTCATACTTCATGGTAGCATGTGTTCTCGTGAACTATTTATTTATAAAAT
ATCATATTGTCATGTGATATATATATTAGTATACGAGTGGTGGGTAGAGGTTTTATATAT
TTTCCGGGAGCACACAATGTCAATGCTTTCTACAATTTATTTATTTATTTTACAGCAACG
TTCCCTACG

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 9

CO CL401Contig1 666 9 5 U
GGACACTCCGCCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTC**AATCTCCCTCTCGAGCAGATCTCTC
TCGTGAATATCGACAATGTCGACCACTTTCAGCTCTTCTGTCTCCTCCATGCAAGCTACT
TCTCTGGCAACATTCCAGAAGCCAGCTGCTTTGGTGTCAAGGACTAATCTCTCCTTCAAC
CTGCGCCGTTCGATCCCCACTCGCTTCTCAATCTCTTGCGCGGCCAAACCAGAGACAGTA
GAGAAAGTGTCTAAGATCGTGAAGAAGCAACTCTCACTCAAAGACGATCAAAAGGTCGTT
GCAGAAACCAAATTTGCTGATCTCGGAGCTGATTCTCTCGACACTGTTGAGATAGTGATG
GGTTTGGAGGAAGAGTTTGGCATCGAAATGGCTGAAGAGAAAGCACAGAAGATTGCAACT
GTGGAGCAAGCTGCTGAGCTCATTGAAGAGCTCGTGGAAGCCAATAAGTAATTTTAGTAT
TAAGAGAGAACCAAAGGCTTTGTTGGGTTTGTTGTTTTCATAATGTTTCTCTCATTTTTC
TTTTTTTTTTTT**AATGTGTCATGCGACTCTGTTGGTTTAAGTAGTATCTGTATGCCAT
GGATATCATCTCTATTTGTCGACTGAAAACTTTTGGTTACACATGATGAAGAAAAGCTTG
TTTCTT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 25 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1BI77TF U 1
AF RS1EW92JQ C 173
AF RS1EW92TF U 1
AF RS1F759TF U 1
AF RS1FZ22TF U 1
AF RS1F759JQ C 99
AF RS1GH23JQ C 324
AF RS1GH23TF U 324
AF RS1AY76TF U 301
BS 1 33 RS1BI77TF
BS 34 35 RS1EW92TF
BS 36 625 RS1BI77TF
BS 626 640 RS1F759TF
BS 641 666 RS1AY76TF

RD RS1BI77TF 625 0 0
GGACACTCCGCCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAATCTCCCTCTCGAGCAGATCTCTC
TCGTGAATATCGACAATGTCGACCACTTTCAGCTCTTCTGTCTCCTCCATGCAAGCTACT
TCTCTGGCAACATTCCAGAAGCCAGCTGCTTTGGTGTCAAGGACTAATCTCTCCTTCAAC
CTGCGCCGTTCGATCCCCACTCGCTTCTCAATCTCTTGCGCGGCCAAACCAGAGACAGTA
GAGAAAGTGTCTAAGATCGTGAAGAAGCAACTCTCACTCAAAGACGATCAAAAGGTCGTT
GCAGAAACCAAATTTGCTGATCTCGGAGCTGATTCTCTCGACACTGTTGAGATAGTGATG
GGTTTGGAGGAAGAGTTTGGCATCGAAATGGCTGAAGAGAAAGCACAGAAGATTGCAACT
GTGGAGCAAGCTGCTGAGCTCATTGAAGAGCTCGTGGAAGCCAATAAGTAATTTTAGTAT
TAAGAGAGAACCAAAGGCTTTGTTGGGTTTGTTGTTTTCATAATGTTTCTCTCATTTTTC
TTTTTTTTTTTT**AATGTGTCATGCGACTCTGTTGGTTTAAGTAGTATCTGTATGCCAT
GGATATCATCTCTATTTGTCGACTG

QA 1 625 1 625
DS 

RD RS1EW92JQ 441 0 0
CCTTCAACCTGCGCCGTTCGATCCCCACTCGCTTTTCAATTTCTTGGGCGGCCAAACCAG
AGACAGTAGAGAAAGTGTTTAAGATCGTGAAGAAGCAACTCTCACTCAAAGACGATCAAA
AGGTCGTTGCAGAAACCAAATTTGCTGATTTCGGAGCTGATTCTCTCGACACTGTTGAGA
TAGTGATGGGTTTGGAGGAAGAGTTTGGCATCGAAATGGCTGAAGAGAAAGCACAGAAGA
TTGCAACTGTGGAGCAAGCTGCTGAGCTCATTGAAGAGCTCGTGGAAGCCAATAAGTAAT
TTTAGTATTAAGAGAGAACCAAAGGCTTTGTTGGGTTTGTTGTTTTCATAATGTTTCTCT
CATTTTTCTTTTTTTTTTTT**AATGTGTCATGCGACTCTGTTGGTTTAAGTAGTATCTG
TATGCCATGGATATCATCTC
C

QA 1 440 1 440
DS 

RD RS1EW92TF 613 0 0
GGACACTCCGCCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTC**AATCTCCCTCTCGAGCAGATCTCTC
TCGTGAATATCGACAATGTCGACCACTTTCAGCTCTTCTGTCTCCTCCATGCAAGCTACT
TCTCTGGCAACATTCCAGAAGCCAGCTGCTTTGGTGTCAAGGACTAATCTCTCCTTCAAC
CTGCGCCGTTCGATCCCCACTCGCTTCTCAATCTCTTGCGCGGCCAAACCAGAGACAGTA
GAGAAAGTGTCTAAGATCGTGAAGAAGCAACTCTCACTCAAAGACGATCAAAAGGTCGTT
GCAGAAACCAAATTTGCTGATCTCGGAGCTGATTCTCTCGACACTGTTGAGATAGTGATG
GGTTTGGAGGAAGAGTTTGGCATCGAAATGGCTGAAGAGAAAGCACAGAAGATTGCAACT
GTGGAGCAAGCTGCTGAGCTCATTGAAGAGCTCGTGGAAGCCAATAAGTAATTTTAGTAT
TAAGAGAGAACCAAAGGCTTTGTTGGGTTTGTTGTTTTCATAATGTTTCTCTCATTTTTC
TTTTTTTTTTTT**AATGTGTCATGCGACTCTGTTGGTTTAAGTAGTATCTGTATGCCAT
GGATATCATCTC
C

QA 1 612 1 612
DS 

RD RS1F759TF 640 0 0
GGACACTCCGCCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTC**AATCTCCCTCTCGAGCAGATCTCTC
TCGTGAATATCGACAATGTCGACCACTTTCAGCTCTTCTGTCTCC***ATGCAAGCTACT
TCTCTGGCAACATTCCAGAAGCCAGCTGCTTTGGTGTCAAGGACTAATCTCTCCTTCAAC
CTGCGCCGTTCGATCCCCACTCGCTTCTCAATCTCTTGCGCGGCCAAACCAGAGACAGTA
GAGAAAGTGTCTAAGATCGTGAAGAAGCAACTCTCACTCAAAGACGATCAAAGGGTCGTT
GCAGAAACCAAATTTGCTGATCTCGGAGCTGATTCTCTCGACACTGTTGAGATAGTGATG
GGTTTGGAGGAAGAGTTTGGCATCGAAATGGCTGAAGAGAAAGCACAGAAGATTGCAACT
GTGGAGCAAGCTGCTGAGCTCATTGAAGAGCTCGTGGAAGCCAATAAGTAATTTTAGTAT
TAAGAGAGAACCAAAGGCTTTGTTGGGTTTGTTGTTTTCATAATGTTTCTCTCATTTTTC
TTTTTTTTTTTTTTAATGTGTCATGCGACTCTGTTGGTTTAAGTAGTATCTGTATGCCAT
GGATACCATCTCTATTTGTCGACTGAAAACTTTTGGTTAC

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1FZ22TF 636 0 0
GGACACTCCGCCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTC**AATCTCCCTCTCGAGCAGATCTCTC
TCGTGAATATCGACAATGTCGACCACTTTCAGCTCTTCTGTCTCCTCCATGCAAGCTACT
TCTCTGGCAACATTCCAGAAGCCAGCTGCTTTGGTGTCAAGGACTAATCTCTCCTTCAAC
CTGCGCCGTTCGATCCCCACTCGCTTCTCAATCTCTTGCGCGGCCAAACCAGAGACAGTA
GAGAAAGTGTCTAAGATCGTGAAGAAGCAACTCTCACTCAAAGACGATCAAAAGGTCGTT
GCAGAAACCAAATTTGCTGATCTCGGAGCTGATTCTCTCGACACTGTTGAGATAGTGATG
GGTTTGGAGGAAGAGTTTGGCATCGAAATGGCTGAAGAGAAAGCACAGAAGATTGCAACT
GTGGAGCAAGCTGCTGAGCTCATTGAAGAGCTCGTGGAAGCCAATAAGTAATTTTAGTAT
TAAGAGAGAACCAAAGGCTTTGTTGGGTTTGTTGTTTTCATAATGTTTCTCTCATTTTTC
TTTTTTTTTTTT**AATGTGTCATGCGACTCTGTTGGTTTAAGTAGTATCTGTATGCCAT
GGATATCATCTCTATTTGTCGACTGAAAACTTTTGG

QA 1 636 1 636
DS 

RD RS1F759JQ 542 0 0
TTCTGT
CTCCATGCAAGCTACTTTTCTGGCAACATTCCAGAAGCCAGCTGCTTTGGTGTCAAGGAC
TAATCTTTCCTTCAACCTGCGCCGTTCGATCCCCACTCGCTTCTCAATTTCTTGCGCGGC
CAAACCAGAGACAGTAGAGAAAGTGTTTAAGATCGTGAAGAAGCAACTCTCACTCAAAGA
CGATCAAAGGGTCGTTGCAGAAACCAAATTTGCTGATTTCGGAGCTGATTCTCTCGACAC
TGTTGAGATAGTGATGGGTTTGGAGGAAGAGTTTGGCATCGAAATGGCTGAAGAGAAAGC
ACAGAAGATTGCAACTGTGGAGCAAGCTGCTGAGCTCATTGAAGAGCTCGTGGAAGCCAA
TAAGTAATTTTAGTATTAAGAGAGAACCAAAGGCTTTGTTGGGTTTGTTGTTTTCATAAT
GTTTCTCTCATTTTTCTTTTTTTTTTTTTTAATGTGTCATGCGACTCTGTTGGTTTAAGT
AGTATCTGTATGCCATGGATACCATCTCTATTTGTCGACTGAAAACTTTTGGTTAC

QA 7 542 7 542
DS 

RD RS1GH23JQ 319 0 0
G
GGAGCTGATTCTCTCCACACTGTTGAGATAGTGATGGGTTTGGAGGAAGAGTTTGGCATC
GAAATGGCTGAAGAGAAAGCGCAGAAGATTGCAACTGTGGAGCAGGCTGCTGAGCTCATT
GAAGAGCTCGTGTAAGCCAATAAGTAATTTTAGTATTAAGAGAGAACCAAAGGCTTTGTT
GGGTTTGTTGTTTTCATAATGTTTCTCTCATTTTTCTTTTTTTTTTTT**AATGTGTCAT
GCGACTCTGTTGGTTTAAGTAGTATCTGTATGCCATGGATATCATCTCTATTTGTCGACT
GAAAACTTTTGGTTAC
GC

QA 2 317 2 317
DS 

RD RS1GH23TF 319 0 0
G
GGAGCTGATTCTCTCCACACTGTTGAGATAGTGATGGGTTTGGAGGAAGAGTTTGGCATC
GAAATGGCTGAAGAGAAAGCGCAGAAGATTGCAACTGTGGAGCAGGCTGCTGAGCTCATT
GAAGAGCTCGTGTAAGCCAATAAGTAATTTTAGTATTAAGAGAGAACCAAAGGCTTTGTT
GGGTTTGTTGTTTTCATAATGTTTCTCTCATTTTTCTTTTTTTTTTTT**AATGTGTCAT
GCGACTCTGTTGGTTTAAGTAGTATCTGTATGCCATGGATATCATCTCTATTTGTCGACT
GAAAACTTTTGGTTAC
GC

QA 2 317 2 317
DS 

RD RS1AY76TF 366 0 0
GCAGAAACCAAATTTGCTGATCTCGGAGCTGATTCTCTCGACACTGTTGAGATAGTGATG
GGTTTGGAGGAAGAGTTTGGCATCGAAATGGCTGAAGAGAAAGCACAGAAGATTGCAACT
GTGGAGCAAGCTGCTGAGCTCATTTAAGAGCTCGTGGAAGCCAATAAGTAATTTTAGTAT
TAAGAGAGAACCAAAGGCTTTGTTGGGTTTGTTGTTTTCATAATGTTTCTCTCATTTTTC
TTTTTTTTTTTTT*AATGTGTCATGCGACTCTGTTGGTTTAAGTAGTATCTGTATGCCAT
GGATATCATCTCTATTTGTCGACTGAAAACTTTTGGTTACACATGATGAAGAAAAGCTTG
TTTCTT

QA 1 366 1 366
DS 



AS 1 8

CO CL402Contig1 813 8 21 U
AGAAGAAGAAACATGACAATATCTTTCTCAAAAAAAAGAAACATGACAATATAAATATCT
TTTTTGGGCAAAACAAAATTATATAATAACAAGAAGGAGATGCTTAGGGTTCGTTCTTTC
AAAGCAAAACAGATATGCTTTTATTCATTAAAGACAGACGCACTAATTCCCCTTGTTAGC
AAGATCTAGGCTGGGATAGATAAAAACTAAATTCTTCAGAGAGGATTTATCTTCAATATC
AATGAGCCTTTCCACGAGCTTCATGTGGGCAGGCCAATTCTTGGGATTAGGTTCCCACTC
TTTGAATGTTGGATCCACTTTGCGAAAGTAGGCATGAGCAGCTGGATATCCTTTAACCTC
GGCTATGAGATCAACATACACGGCGAGTTCCGAGGGAGAAAATTCCATCTTCTTTTTATC
CATCCACCTAAAGATCTCTAGTGCGTTTTCAGATTTGTTTTTGTTCTTTGCAAGACGTTT
GGCCCAACTGACAAGATCCGTTTGAGTGACGTAAACGCCCTTCTTCTCTTCTTCCCTTAA
GATGAGATCTATTGTCTCAACCGTAAGTGACTTCAGCTTCTGAAATACTTTCCTCTTCTC
CACCTTCCCCTTCTCTGCCTTGCTAGGAGCTGAGCTCTCCTTCTCAACCTTGATCGGAGC
TGACCTCTCCACACCAGATGAAAACGGCGCAGTCAACGTCCTACAATCCATCTTCCACAT
ACGACCATTCGAAGCCATCGGAGCAGCAACTCTCCTCCAGAGATTAAGAGAAGCCATGAT
TAATGCGGCAGAGATCTTTCTCGCTAAGTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 10 10 25 
25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 20 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BL78TF C 1
AF RS1GH91JQ U 31
AF RS1FZ55JQ U 66
AF RS1B552JQ U 66
AF RS1BL78JQ U 14
AF RS1BF15TF C 70
AF RS1GH91TF C 134
AF RS1FZ55TF C 492
BS 1 13 RS1BL78TF
BS 14 149 RS1BL78JQ
BS 150 150 RS1GH91JQ
BS 151 220 RS1BL78JQ
BS 221 221 RS1GH91JQ
BS 222 323 RS1BL78JQ
BS 324 324 RS1GH91JQ
BS 325 368 RS1BL78JQ
BS 369 369 RS1GH91JQ
BS 370 410 RS1BL78JQ
BS 411 411 RS1GH91JQ
BS 412 438 RS1BL78JQ
BS 439 439 RS1GH91JQ
BS 440 468 RS1BL78JQ
BS 469 469 RS1GH91JQ
BS 470 524 RS1BL78JQ
BS 525 525 RS1GH91JQ
BS 526 528 RS1BL78JQ
BS 529 529 RS1GH91JQ
BS 530 676 RS1BL78JQ
BS 677 813 RS1BF15TF

RD RS1BL78TF 567 0 0
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TTTTTGGGCAAAACAAAATTATATAATAACAAGAAGGAGATGCTTAGGGTTCGTTCTTTC
AAAGCAAAACAGATATGCTTTTATTCATTGAAGACAGACGCACTAATTCCCCTTGTTAGC
AAGATCTAGGCTGGGATAGATAAGAACTAAATTCTTCAGAGAGGATTTATCTTCAATATC
AATGAGCCTTTCCACGAGCTTCATGTGGGCAGGCCAATTCTTGGGATTAGGTTCCCACTC
TTTGAATGTTGGATCCACTTTGCAAAAGTAGGCATGAGCAGCTGGATATCCTTTAACCTC
GGCTATGAGATCAACATACACGGCGAGTTCCGAGGGAGAAAATTCCATCTCCTTTTTATC
CATCCACCTAAAGATCTCGAGTGCGTTTTCAGATTTGTTTTTGTTCTTCGCAAGACGTTT
GGCCCAACTGACAAGATCCGTTTGAGTGACGTAAACGCCCTTCTCCTCATCTTCCCTTAA
GATGAGATCTATTGTCTCAACCGTAAG

QA 1 567 1 567
DS 

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AGAAGAAA
AAACATGACAATAGAAATTCTTTTTTTGGGCAAAACAAAATTATATAATAACAAGAAGGA
GATGCTTAGGGTTCGTTCTTTCAAAGCAAAACAGATATGCTTTTATTCATTAAAGACAGA
CGCACTAATTCCCCTTGTTAGCAAGATCTAGGCTGGGATAGATAAAAACTAAATTCTTCA
GAGAGGATTTATCTTCAATATCAATGAGCCTTTCCACGAGCTTCATGTGGGCAGGCCAAT
TCTTGGGATTAGGTTCCCACTCTTTGAATGTTGGATCCACTTTGCGAAAGTAGGCATGAG
CAGCTGGATATCCTTTAACCTCGGCTATGAGATCAACATACACGGCGAGTTCCGAGGGAG
AAAATTCCATCTTCTTTTTATCCATCCACCTAAAGATCTCTAGTGCGTTTTCAGATTTGT
TTTTGTTCTTTGCAAGACGTTTGGCCCAACTGACAAGATCCGTTTGAGTGACGTAAACGC
CCTTCTTCTCTTCTTCCCTTAAGATGAGATCTATTGTCTCAACCGTAAGTGACTTCAGCT
TCTGAAATACTTTCCTCTTCTCCACCTTCCCCTTCTCTGCCTTGCTAGGAGCTGAGCTCT
CCTTCTCAACCTTGATCGGAGC

QA 9 630 9 630
DS 

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GGGCAAAACAAAATTATATAATAACAAGAAGGAGATGCTTAGGGTTCGTTCTTTCAAAGC
AAAACAGATATGCTTTTATTCATTAAAGACAGACGCACTAATTCCCCTTGTTAGCAAGAT
CTAGGCTGGGATAGATAAAAACTAAATTCTTCAGAAAGGATTTATCTTCAATATCAATGA
GCCTTTCCACGAGCTTCATGTGGGCAGGCCAATTCTTGGGATTAGGTTCCCACTCTTTGA
ATGTTGGATCCACTTTGCGAAAGTAGGCATGAGCAGCTGGATATCCTTTAACCTCGGCTA
TGAGATCAACATACACGGCGAGTTCCGAGGGAGAAAATTCCATCTTCTTTTTATCCATCC
ACCTAAAGATCTCTAGTGCGTTTTCAGATTTGTTTTTGTTCTTTGCAAGACGTTTGGCCC
AACTGACAAGATCCGTTTGAGTGACGTAAACGCCCTTCTTCTCTTCTTCCCTTAAGATGA
GATCTATTGTCTCAACCGTAAGTGACTTCAGCTTCTGAAATACTTTCCTCTTCTCCACCT
TCCCCTTCTCTGCCT

QA 1 555 1 555
DS 

RD RS1B552JQ 565 0 0
GGGCAAAACAAAATTATATAATAACAAGAAGGAGATGCTTAGGGTTCGTTCTTTCAAAGC
AAAACAGATATGCTTTTATTCATTAAAGACAGACGCACTAATTCCCCTTGTTAGCAAGAT
CTAGGCTGGGATAGATAAAAACTAAATTCTTCAGAGAGGATTTATCTTCAATATCAATGA
GCCTTTCCACGAGCTTCATGTGGGCAGGCCAATTCTTGGGATTAGGTTCCCACTCTTTGA
ATGTTGGATCCACTTTGCGAAAGTAGGCATGAGCAGCTGGATATCCTTTAACCTCGGCTA
TGAGATCAACATACACGGCGAGTTCCGAGGGAGAAAATTCCATCTTCTTTTTATCCATCC
CCCTAAAGATCTCTAGTGCGTTTTCAGATTTGTTTTTGTTCTTTGCAAGACGTTTGGCCC
AACTGACAAGATCCGTTTGAGTGACGTAAACGCCCTTCTTCTCTTCTTCCCTTAAGATGA
GATCTATTGTCTCAACCGTAAGTGACTTCAGCTTCTGAAATACTTTCCTCTTCTCCACCT
TCCCCTTCTCTGCCTTGCTAGGAGC

QA 1 565 1 565
DS 

RD RS1BL78JQ 663 0 0
TGACAATATCTTTCTCAAAAAAAAGAAACATGACAATATAAATATCTTTTTTGGGCAAAA
CAAAATTATATAATAACAAGAAGGAGATGCTTAGGGTTCGTTCTTTCAAAGCAAAACAGA
TATGCTTTTATTCATTGAAGACAGACGCACTAATTCCCCTTGTTAGCAAGATCTAGGCTG
GGATAGATAAAAACTAAATTCTTCAGAAAGGATTTATCTTCAATATCAATGAGCCTTTCC
ACGAGCTTCATGTGGGCAGGCCAATTCTTGGGATTAGGTTCCCACTCTTTGAATGTTGGA
TCCACTTTGCAAAAGTAGGCATGAGCAGCTGGATATCCTTTAACCTCGGCTATGAAATCA
ACATACACGGCGAGTTCCGAGGGAGAAAATTCCATCTCCTTTTTATCCATCCACCTAAAG
ATCTCGAGTGCGTTTTCAGATTTGTTTTTGTTCTTCGCAAGACGTTTGGCCCAACTGACA
AGATCCGTTTGAGTGACGTAAACGCCCTTCTCCTCATCTTCCCTTAAGATGAGATCTATT
GTCTCAACCGTAAGTGACTTCAGCTTCTGAAATACTTTCCTCTTCTCCACCTTCCCCTTC
TCTGCCTTGCTAGGAGCTGAGCTCTCCTTCTCAACCTTGATCGGAGCTGACCTCTCCACA
CCA

QA 1 663 1 663
DS 

RD RS1BF15TF 744 0 0
GGCAAACAAAATTATATAT
ACAAGAAGGAGATGCT*AGGGTTCGTTCTT*CAAAGCAAAACAGATATGCTTTTATTCAT
TAAAGACAGACGCACTAATTCCC*TTGTTAGCAAGATCTAGGCTGGGATAGATAAAAACT
AAATTCTTCAGAGAGGATTTATCTTCAATATCAATGAGCCTTTCCACGAGCTTCATGTGG
GCAGGCCAATTCTTGGGATTAGGTTCCCACTCTTTGAATGTTGGATCCACTTTGCGAAAG
TAGGCATGAGCAGCTGGATATCCTTTAACCTCGGCTATGAGATCAACATACACGGCGAGT
TCCGAGGGAGAAAATTCCATCTTCTTTTTATCCATCCACCTAAAGATCTCTAGTGCGTTT
TCAGATTTGTTTTTGTTCTTTGCAAGACGTTTGGCCCAACTGACAAGATCCGTTTGAGTG
ACGTAAACGCCCTTCTTCTCTTCTTCCCTTAAGATGAGATCTATTGTCTCAACCGTAAGT
GACTTCAGCTTCTGAAATACTTTCCTCTTCTCCACCTTCCCCTTCTCTGCCTTGCTAGGA
GCTGAGCTCCCCTTCTCAACCTTGATCGGAGCTGACCTCTCCACACCAGATGAAAACGGC
GCAGTCAACGTCCTACAATCCATCTTCCACATACGACCATTCGAAGCCATCGGAGCAGCA
ACTCTCCTCCAGAGATTAAGAGAAGCCATGATTAATGCGGCAGAGATCTTTCTCGCTAAG
TCTCC

QA 20 744 20 744
DS 

RD RS1GH91TF 667 0 0
ATATGC
TTTATTCATTAAAGACAGACGCACTAATTCCC*TTGTTAGCAAGATCTAGGCTGGGATAG
ATAAAAACTAAATTCTTCAGAGAGGATTTATCTTCAATATCAATGAGCCTTTCCACGAGC
TTCATGTGGGCAGGCCAATTCTTGGGATTAGGTTCCCACTCTTTGAATGTTGGATCCACT
TTGCGAAAGTAGGCATGAGCAGCTGGATATCCTTTAACCTCGGCTATGAGATCAACATAC
ACGGCGAGTTCCGAGGGAGAAAATTCCATCTTCTTTTTATCCATCCACCTAAAGATCTCT
AGTGCGTTTTCAGATTTGTTTTTGTTCTTTGCAAGACGTTTGGCCCAACTGACAAGATCC
GTTTGAGTGACGTAAACGCCCTTCTTCTCTTCTTCCCTTAAGATGAGATCTATTGTCTCA
ACCGTAAGTGACTTCAGCTTCTGAAATACTTTCCTCTTCTCCACCTTCCCCTTCTCTGCC
TTGCTAGGAGCTGAGCTCTCCTTCTCAACCTTGATCGGAGCTGACCTCTCCACACCAGAT
GAAAACGGCGCAGTCAACGTCCTACAATCCATCTTCCACATACGACCATTCGAAGCCATC
GGAGCAGCAACTCTCCTCCAGAGATTAAGAGAAGCCATGATTAATGCGGCAGAGATCT
CCC

QA 7 664 7 664
DS 

RD RS1FZ55TF 300 0 0
CAAGATCCGTT*GAGTGA*GTAAACGCCCTT*TTCTCTTCTTCCCTTAAGATGAGATCTA
TTGTCTCAACCGTAAGTGACTTCAGCTT*TGAAATACTTTCCTCTTCTCCACCTTCCCCT
TCTCTGCCTTG*TAGGAG*TGAGCTCTCCTTCTCAACCTTGATCGGAGCTGACCTCTCCA
CACCAGA*GAAAACGGCGCAGTCAACGTCCTACAATCCATCTTCCACATACGACCATT*G
AAGCCATCGGAGCAGCAACTCTCCTCCAGAGATTAAGAGAAGCCATGATTAATGCGGC
CC

QA 1 298 1 298
DS 



AS 1 9

CO CL403Contig1 1027 9 13 U
GGCACCTCAGCTGCTAATAAACCCTAACTCACTCAACCTTTTCTTCCTCGATTGTCAGCT
ATGGAGTTCTGGGGAGTCGAAGTTCAAGCAGGGAGGCCACTTAAAGTGACGCCCGAAGAT
GGCACTCTTGTCCACATCTCTCATGCATCGCTTGGGGATTGTAAAGGAAAGAAAGGAGAA
GTTGTGACTTTGAATGTGAAGGTTGGGGACAAGAAGTTCGTCATGGGAACTCTTTTGTCT
GAGAGCATTCCTCAGACTTGCTTTGATATGTTATTCGATCAGGAGTTTGAGCTTTCTCAC
AACTGGGGAAAAGGAAGTGTCCACTTTGTTGGATTCCAATGTCCCAACAACAAAGATGAT
GAGGGAGGAGAAGACTTTTCTGATTCAGAGGAAGAGGAAGTTGCTGCCACTGTTGCAGCT
AATGGGAATGCTGCAAAGGGCGTAACAAAACCAAAGCCTGAAGTAGATGATTCTGATTCT
GAAGGAATGGATGATGAAGATGATTCAGAGGAAGAAGAGGAGGCTCCTAAGGCTGAAACA
AGAAGAAAGAGAGCACATGAAGTCGCACCCGGACCTAAGACACCTGTGTCTGCGAAGAAG
GCCAAAGCAGAAGCTACTCCCAAGAAAACAGAGGAGAAGAAGAAAGGTGGACCTGCAACC
CCCCACCCGGCAAAGAAAGGTGGAAACACTCCCGCAACTGCAACGCAGAGCCCAAAGTCT
GCAAGTCAAGTCTCATGTGGTTCATGCAAGAAGACATTCAACTCATCGAACGCACTTGAG
TCTCACACCAAGGCCAAGCACTCTGCTACCGCTAAGTGAGTTGGTTTCCTAAGAGTAACA
ACTTCCGCTGTTTTGGATCTTTGAGACTTATCTTTTTTAACTTTGGCTGTAGTCTTTTTG
AAACCTTTCGGATTTGTATTTACCAGTTACCAATATCTTGCAGTATTCTTTCTTAGTTCC
AAAGTTTTGCCCGTTCGACATTTCAATGAATTAATATGCGAATATTGAAATCCGAGATTT
CGTTACC


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 25 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 
50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 55 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 15 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 15 20 35 35 35 35 15 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E215TF U 7
AF RS1FZ61TF U 2
AF RS1F711TF U 2
AF RS1CD14TF U 1
AF RS1G202TF U 2
AF RS1E215JQ C 254
AF RS1CD14JQ C 383
AF RS1F711JQ C 337
AF RS1FZ61JQ C 595
BS 1 653 RS1CD14TF
BS 654 654 RS1F711TF
BS 655 751 RS1CD14TF
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BS 815 954 RS1E215JQ
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RD RS1E215TF 589 0 0
GG
AGCTGCTAATAAACCCTAACTCACTCAACCTTTTCTTCCTCGATTGTCAGCTATGGAGTT
CTGGGGAGTCGAAGTTCAAGCAGGGAGGCCACTTAAAGTGACGCCCGAAGATGGCACTCT
TGTCCACATCTCTCATGCATCGCTTGGGGATTGTAAAGGAAAGAAAGGAGAAGTTGTGAC
TTTGAATGTGAAGGTTGGGGACAAGAAGTTCGTCATGGGAACTCTTTTGTCTGAGAGCAT
TCCTCAGACTTGCTTTGATATGTTATTCGATCAGGAGTTTGAGCTTTCTCACAACTGGGG
AAAAGGAAGTGTCCACTTTGTTGGATTCCAATGTCCCAACAACAAAGATGATGAGGGAGG
AGAAGACTTTTCTGATTCGGAGGAAGAGGAAGTTGCTGCCACTGTTGCAGCTAATGGGAA
TGCTGCAAAGGGCGTAACAAAACCAAAGCCTGAAGTAGATGATTCTGATTCTGAAGGAAT
GGATGATGAAGATGATTCAGAGGAAGAAGAGGAGGCTCCTAAGGCTGAAACAAGAAGAAA
GAGAGCACATGAAGTCGCACCCGGACTTAAGACACCTGTGTCTGCGA

QA 3 589 3 589
DS 

RD RS1FZ61TF 628 0 0
GG
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GAGTTCTGGGGAGTCGAAGTTCAAGCAGGGAGGCCACTTAAAGTGACGCCCGAAGATGGC
ACTCTTGTCCACATCTCTCATGCATCGCTTGGGGATTGTAA*GGAAAGAAAGGAGAAGTT
GTGACTTTGAATGTGAAGGTTGGGGACAAGAAGTTCGTCATGGGAACTCTTTTGTCTGAG
AGCATTCCTCAGACTTGCTTTGATATGTTATTCGATCAGGAGTTTGAGCTTTCTCACAAC
TGGGGAAAAGGAAGTGTCCACTTTGTTGGATTCCAATGTCCCAACAACAAAGATGATGAG
GGAGGAGAAGACTTTTCTGATTCAGAGGAAGAGGAAGTTGCTGCCACTGTTGCAGCTAAT
GGGAATGCTGCAAAGGGCGTAACAAAACCAAAGCCTGAAGTAGATGATTCTGATTCTGAA
GGAATGGATGATCAAGATGATTCAGAGGAAGAAGAGGAGGCTCCTAAGGCTGAAACAACA
AGAAAGAGAGCACATGAAGTCGCACCCGGACCTAAGACACCTGTGTCTGCGAAGAAGGCC
AAAGCAGAAGCTACTCCCAAGAAAAC

QA 3 628 3 628
DS 

RD RS1F711TF 740 0 0
GG
ACCTCAGCTGCTAATAAACCCTAACTCACTCAACCTTTTCTTCCTCGATTGTCAGCTATG
GAGTTCTGGGGAGTCGAAGTTCAAGCAGGGAGGCCACTTAAAGTGACGCCCGAAGATGGC
ACTCTTGTCCACATCTCTCATGCATCGCTTGGGGATTGTAAAGGAAAGAAAGGAGAAGTT
GTGACTTTGAATGTGAAGGTTGGGGACAAGAAGTTCGTCATGGGAACTCTTTTGTCTGAG
AGCATTCCTCAGACTTGCTTTGATATGTTATTCGATCAGGAGTTTGAGCTTTCTCACAAC
TGGGGAAAAGGAAGTGTCCACTTTGTTGGATTCCAATGTCCCAACAACAAAGATGATGAG
GGAGGAGAAGACTTTTCTGATTCAGAGGAAGAGGAAGTTGCTGCCACTGTTGCAGCTAAT
GGGAATGCTGCAAAGGGCGTAACAAAACCAAAGCCTGAAGTAGATGATTCTGATTCTGAA
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AGAAAGAGAGCACATGAAGTCGCACCCGGACCTAAGACACCTGTGTCTGCGAAGAAGGCC
AAAGCAGAAGCTACTCCCAAGAAAACAGAGGAGAAGAAGAAAGGTGGACCTGCAACTCCC
CACCCGGCAAAGAAAGGTGGAAACACTCCCGCAACTGCAACGCAGAGCCCAAAGTCTGCA
AGTCAAGTCTCATGTGGT

QA 3 740 3 740
DS 

RD RS1CD14TF 787 0 0
GGCACCTCAGCTGCTAATAAACCCTAACTCACTCAACCTTTTCTTCCTCGATTGTCAGCT
ATGGAGTTCTGGGGAGTCGAAGTTCAAGCAGGGAGGCCACTTAAAGTGACGCCCGAAGAT
GGCACTCTTGTCCACATCTCTCATGCATCGCTTGGGGATTGTAAAGGAAAGAAAGGAGAA
GTTGTGACTTTGAATGTGAAGGTTGGGGACAAGAAGTTCGTCATGGGAACTCTTTTGTCT
GAGAGCATTCCTCAGACTTGCTTTGATATGTTATTCGATCAGGAGTTTGAGCTTTCTCAC
AACTGGGGAAAAGGAAGTGTCCACTTTGTTGGATTCCAATGTCCCAACAACAAAGATGAT
GAGGGAGGAGAAGACTTTTCTGATTCAGAGGAAGAGGAAGTTGCTGCCACTGTTGCAGCT
AATGGGAATGCTGCAAAGGGCGTAACAAAACCAAAGCCTGAAGTAGATGATTCTGATTCT
GAAGGAATGGATGATGAAGATGATTCAGAGGAAGAAGAGGAGGCTCCTAAGGCTGAAACA
AGAAGAAAGAGAGCACATGAAGTCGCACCCGGACCTAAGACACCTGTGTCTGCGAAGAAG
GCCAAAGCAGAAGCTACTCCCAAGAAAACAGAGGAGAAGAAGAAAGGTGGACCCGCAACC
CCCCACCCGGCAAAGAAAGGTGGAAACACTCCCGCAACTGCAACGCAGAGCCCAAAGTCT
GCAAGTCAAGTCTCATGTGGTTCATGCAAGA*GACATTCAACTCATCGAACGCACTTGAG
TCTCACA

QA 1 787 1 787
DS 

RD RS1G202TF 828 0 0
GG
ACCTCAGCTGCTAATAAACCCTAACTCACTCAACCTTTTCTTCCTCGATTGTCAGCTATG
GAGTTCTGGGGAGTCGAAGTTCAAGCAGGGAGGCCACTTAAAGTGACGCCCGAAGATGGC
ACTCTTGTCCACATCTCTCATGCATCGCTTGGGGATTGTAAAGGAAAGAAAGGAGAAGTT
GTGACTTTGAATGTGAAGGTTGGGGACAAGAAGTTCGTCATGGGAACTCTTTTGTCTGAG
AGCATTCCTCAGACTTGCTTTGATATGTTATTCGATCAGGAGTTTGAGCTTTCTCACAAC
TGGGGAAAAGGAAGTGTCCACTTTGTTGGATTCCAATGTCCCAACAACAAAGATGATGAG
GGAGGAGAAGACTTTTCTGATTCAGAGGAAGAGGAAGTTGCTGCCACTGTTGCAGCTAAT
GGGAATGCTGCAAAGGGCGTAACAAAACCAAAGCCTGAAGTAGATGATTCTGATTCTGAA
GGAATGGATGATGAAGATGATTCAGAGGAAGAAGAGGAGGCTCCTAAGGCTGAA*CAAGA
AGAAAGAGAGCACATGAAGTCGCACCCGGACCTAAGACACCTGTGTCTGCGAAGAAGGCC
AAAGCAGAAGCTACTCCCAAGAAAGCAGAGGAGAAGAAGAAAGGTGGACCTGCAACCCCC
CACCCGGCAAAGAAAGGTGGAAACACTCCCGCAACTGCAACGCAGAGCCCAAAGTCTGCA
AGTCAAGTCTCATGTGGTTCATGCAAGA*GACATTCAACCCATCGAACGCACTTGAGTCT
CACAC*AAGGC*AAGCACTCTGCTACCGCTA
GTGAGTGGTTCCTAG

QA 3 813 3 813
DS 

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GAAGTGTCCACTTTGTTGGATTCCAATGTCCCAACAACAAAGATGATGAGGGAGGAGAAG
ACTTTTTTGATTCGGAGGAAGAGGAAGTTGCTGCCACTGTTGCAGCTAATGGGAATGCTG
CAAAGGGCGTAACAAAACCAAAGCCTGAAGTAGATGATTTTGATTTTGAAGGAATGGATG
ATGAAGATGATTCAGAGGAAGAAGAGGAGGCTCCTAAGGCTGAAACAAGAAGAAAGAGAG
CACATGAAGTCGCACCCGGACTTAAGACACCTGTGTTTGCGAAGAAGGCCAAAGCAGAAG
CTACTCCCAAGAAAACAGAGGAGAAGAAGAAAGGTGGACCTGCAACCCCCCCCCCGGCAA
AGAAAGGTGGAAACACTCCCGCAACTGCAACGCAGAGCCCAAAGTCTGCAAGTCAAGTCT
CATGTGGTTCATGCAAGAAGACATTCAACTCATCGAACGCACTTGAGTCTCACACCAAGG
CCAAGCACTCTGCTACCGCTAAGTGAGTTGGTTTCCTAAGAGTAACAACTTCCGCTGTTT
TGGATCTTTGAGACTTATCTTTTTTAACTTTGGCTGTAGTCTTTTTGAAACCTTTCGGAT
TTGTATTTACCAGTTACCAATATCTTGCAGTATTCTTTCTT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RS1CD14JQ 575 0 0
ATTCAGAGGAAGAGGAAGTTGCTGCCACTGTTGCAGCTAATGGGAATGCTGCAAAGGGCG
TAACAAAACCAAAGCCTGAAGTAGATGATTCTGATTCTGAAGGAATGGATGATGAAGATG
ATTCAGAGGAAGAAGAGGAGGCTCCTAAGGCTGAAACAAGAAGAAAGAGAGCACATGAAG
TCGCACCCGGACCTAAGACACCTGTGTCTGCGAAGAAGGCCAAAGCAGAAGCTACTCCCA
AGAAAACAGAGGAGAAGAAGAAAGGTGGACCCGCAACCCCCCACCCGGCAAAGAAAGGTG
GAAACACTCCCGCAACTGCAACGCAGAGCCCAAAGTCTGCAAGTCAAGTCTCATGTGGTT
CATGCAAGAAGACATTCAACTCATCGAACGCACTTGAGTCTCACACCAAGGCCAAGCACT
CTGCTACCGCTAAGTGAGTTGGTTTCCTAAGAGTAACAACTTCCGCTGTTTTGGATCTTT
GAGACTTATCTTTTTTAACTTTGGCTGTAGTCTTTTTGAAACCTTTCGGATTTGTGTTTA
CCAGTTACCAATATCTTGCAGTATTCTTTCTT
AGG

QA 1 572 1 572
DS 

RD RS1F711JQ 643 0 0
CAATGTCCCAACAACAAAGATGATGAGGGAGGAGAAGACTTTTTTGATTCAGAGGAAGAG
GAAGTTGCTGCCACTGTTGCAGCTAATGGGAATGCTGCAAAGGGCGTAACAAAACCAAAG
CCTGAAGTAGATGATTCTGATTTTGAAGGAATGGATGATGAAGATGATTCAGAGGAAGAA
GAGGAGGCTCCTAAGGCTGAAACAAGAAGAAAGAGAGCACATGAAGTCGCACCCGGACCT
AAGACACCTGTGTTTGCGAAGAAGGCCAAAGCAGAAGCTACTCCCAAGAAAACAGAGGAG
AAGAAGAAAGGTGGACCTGCAACTCCCCACCCGGCAAAGAAAGGTGGAAACACTCCCGCA
ACTGCAACGCAGAGCCCAAAGTCTGCAAGTCAAGTCTCATGTGGTTCATGCAAGAAGACA
TTCAACTCATCGAACGCACTTGAGTCTCACACCTAGGCCAAGTACTCTGCTACCGCTAAG
TGAGTTGGTTTCCTAAGAGTAACAACTTCCGCTGTTTTGGATCTTTGAGACTTATCTTTT
TTAACTTTGGCTGTAGTCTTTTTGAAACCTTTCGGATTTGTATTTACCAGTTACCAATAT
CTTGCAGTATTCTTTCTTAGTTCCAAAGTTTTGCCCGTTCGAC

QA 1 643 1 643
DS 

RD RS1FZ61JQ 433 0 0
AAGAAGGCCAAAGCAGAAGCTACTCCCAAGAAAACAGAGGAGAAGAAGAAAGGTGGACCT
GCAACCCCCCACCCGGCAAAGAAAGGTGGAAACACTCCCGCAACTGCAACGCAGAGCCCA
AAGTCTGCGAGTCAAGTCTCATGTGGTTCATGCAAGAAGACATTCAACTCATCGAACGCA
CTTGAGTCTCACACCAAGGCCAAGCACTCTGCTACCGCTAAGTGAGTTGGTTTCCTAAGA
GTAACAACTTCCGCTGTTTTGGATCTTTGAGACTTATCTTTTTTAACTTTGGCTGTAGTC
TTTTTGAAACCTTTCGGATTTGTATTTACCAGTTACCAATATCTTGCAGTATTCTTTCTT
AGTTCCAAAGTTTTGCCCGTTCGACATTTCAATGAATTAATATGCGAATATTGAAATCCG
AGATTTCGTTACC

QA 1 433 1 433
DS 



AS 2 8

CO CL404Contig1 679 5 14 U
CGATCAAAAGCTGGATCCATCATTATTCATAACATTACACAGTCCAATATATGACTCAAT
GCTAAGTCATCATTAAAGAAAAACACTCAAAGATTTTGTTTAAGAGTACAGAGTTCTCTA
TCTCTCTTTTTTTTTT*GGGTAATGATTATTCAGGTGCTAATGCTTTTTGAGAGCATTCA
TCTTGTCCCTGAGGTAGTAGAGTTTCGCTCTTCTTACCCTCTTCTTGTCCAACACCTTAA
TCTCCCTCAGGTTTGGAGAATACAAAGGGAACATGGATTCGACTCCCACTCCAGCCACAA
GCCTTCTAATCCTAAACGTAGAGTTAAGACCAGCATTACGCCTTGCTATCACAATTCCTT
TTACGATTGAAACACGCCTCTTGTTCTCAGGCACTTCCACTTTAAGCTGCACAATGTAAC
CGGGCCTTATCTCCGGTATCTCTCTACTAGTTCTCACTTCCTCCACAGCCTCCTTGTCTA
CAATCTGCATGATATGCTTGGCGGTTTTATCAAGCCTCTTGAACTTAATTCTTGGAGGCG
CATCAGGAGCTGACACAGGAAACCCTTGAGGAACAGACTCCCCAACGGTGGAAAAGCACC
TCGATGAATACGCAAAGTTTTGTCTAGGTAGTGCGGAAGAGAAAGAAGCCGCCTTTGTCA
ACGAGCTAATGAGATACGA


BQ
10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RS1EC26JQ U 1
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AF RS1FM82JQ U 2
AF RS1CY33JQ U 2
AF RS1FV17JQ U 2
BS 1 103 RS1EC26JQ
BS 104 104 RS1CY33JQ
BS 105 136 RS1EC26JQ
BS 137 137 RS1CY33JQ
BS 138 199 RS1EC26JQ
BS 200 200 RS1CY33JQ
BS 201 257 RS1EC26JQ
BS 258 258 RS1CY33JQ
BS 259 320 RS1EC26JQ
BS 321 321 RS1CY33JQ
BS 322 327 RS1EC26JQ
BS 328 328 RS1CY33JQ
BS 329 593 RS1EC26JQ
BS 594 679 RS1CY33JQ

RD RS1EC26JQ 593 0 0
CGATCAAAAGCTGGATCCATCATTATTCATAACATTACACAGTCCAATATATGACTCAAT
GCTAAGTCATCATTAAAGAAAAACACTCAAAGATTTTGTTTAAAAGTACAGAGTTCTCTA
TCTCTCTTTTTTTTTTTGGGTAATGATTATTCAGGTGCTAATGCTTTTTGAGAGCATTCA
TCTTGTCCCTGAGGTAGTAAAGTTTCGCTCTTCTTACCCTCTTCTTGTCCAACACCTTAA
TCTCCCTCAGGTTTGGAAAATACAAAGGGAACATGGATTCGACTCCCACTCCAGCCACAA
GCCTTCTAATCCTAAACGTAAAGTTAAAACCAGCATTACGCCTTGCTATCACAATTCCTT
TTACGATTGAAACACGCCTCTTGTTCTCAGGCACTTCCACTTTAAGCTGCACAATGTAAC
CGGGCCTTATCTCCGGTATCTCTCTACTAGTTCTCACTTCCTCCACAGCCTCCTTGTCTA
CAATCTGCATGATATGCTTGGCGGTTTTATCAAGCCTCTTGAACTTAATTCTTGGAGGCG
CATCAGGAGCTGACACAGGAAACCCTTGAGGAACAGACTCCCCAACGGTGGAA

QA 1 593 1 593
DS 

RD RS1F742JQ 607 0 0
GA
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CTCTTTTTTTTTT*GGGTAATGATTATTCAGGTGCTAATGCTTTTTGAGAGCATTCATCT
TGTCCCTGAGGTAGTAAAGTTTCCCTCTTCTTACCCTCTTCTTGTCCAACACCTTAATCT
CCCTCAGGTTTGGAGAATACAAAGGGAACATGGATTCGACTCCCACTCCAGCCACAAGCC
TTCTAATCCTAAACGTAAAGTTAAAACCAGCATTACGCCTTGCTATCACAATTCCTTTTA
CGATTGAAACACGCCTCTTGTTCTCAGGCACTTCCACTTTAAGCTGCACAATGTAACCGG
GCCTTATCTCCGGTATCTCTCTACTAGCTCTCACTTCCTCCACAGCCTCCTTGTCTACAA
TCTGCATGATATGCTTGGCGGTTTTATCAAGCCTCTTGAACTTAATTCTTGGAGGCGCAT
CAGGAGCTGACACAGGAAACCCTTGAGGAACAGACTCCCCAACGGTGGAAAAGCACCTCG
ATGAA

QA 3 607 3 607
DS 

RD RS1FM82JQ 606 0 0
GG
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AAGTCATCATTAAAGAAAAACACTCAAAGATTTTGTTTAAGAGTACAGAGTTCTCTATCT
CTCTTTTTTTTTT*GGGTAATGATTATTCAGGTGCTAATGCTTTTTGAGAGCATTCATCT
TGTCCCTGAGGTAGTAGAGTTTCGCTCTTCTTACCCTCTTCTTGTCCAACACCTTAATCT
CCCTCAGGTTTGGAGAATACAAAGGGAACATGGATTCGACTCCCACTCCAGCCACAAGCC
TTCTAATCCTAAACGTAGAGTTAAGACCAGCATCACGCCTTGCTATCACAATTCCTTTTA
CGATTGGAACACGCCTCTTGTTCTCAGGCACTTCCACTTTAAGCTGCACAATGTAACCGG
GCCTTATCTCCGGTATCTCTCTACTAGTTCTCACTTCCTCCACAGCCTCCTTGTCTACAA
TCTGCATGATATGCTTGGCGGTTTTATCAAGCCTCTTGAACTTAATTCTTGGAGGCGCAT
CAGGAGCTGACACAGGAAACCCTTGAGGAACAGACTCCCCAACGGTGGAAAAGCACCTCG
ATGA

QA 3 606 3 606
DS 

RD RS1CY33JQ 678 0 0
GA
TCAAAAGCTGGATCCATCATTATTCATAACATTACACAGTCCAATATATGACTCAATGCT
AAGTCATCATTAAAGAAAAACACTCAAAGATTTTGTTTAAGAGTACAGAGTTCTCTATCT
CTCTTTTTTTTT**GGGTAATGATTATTCAGGTGCTAATGCTTTTTGAGAGCATTCATCT
TGTCCCTGAGGTAGTAGAGTTTCGCTCTTCTTATCCTCTTCTGGTCCAACACCTTAATCT
CCCTCAGGTTTG*AGAATACAAAGGGAACATGGATTCGACTCCCACTCCAGCCACAAGCC
TTCTAATCCTAAACGTAGAGTTAAGACCAGCATTACGCCTTGCTATCACAATTCCTTTTA
CGATTGAAATACGCCTCTTGTTCTCAGGCACTTCCACTTTAAGCTGCACAATGTAACCGG
GCCTTATCTCCGATATCTCTCTACTAGTTCTCACATCCTCCACAGCCTCCTTGTCTACAA
TCTGCATGATATGCTTGGCGGTTTTATCAAGCCTCTTGAACTTAATTCTTGGAGGCGCAT
CAGGAGCTGACACAGGAAACCCTTGAGGAACAGACTCCCCAACGGTGGAAAAGCACCTCG
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AGCTAATGAGATACGA

QA 3 678 3 678
DS 

RD RS1FV17JQ 674 0 0
GG
TCAAAAGCTGGATCCATCATTATTCATAACATTACACAGTCCAATATATGACTCAATGCT
AAGTCATCATTAAAGAAAAACACTCAAAGATTTTGTTTAAGAGTACAGAGTTCTCTATCT
CTCTTTTTTTTTTTGGGTAATGATTATTCAGGTGCTAATGCTTTTTGAGAGCATTCATCT
TGTCCCTGAGGTAGTAGAGTTTCGCTCTTCTTACCCTCTTCTTGTCCAACACCTTAATCT
CCCTCAGGTTTGGAGAATACAAAGGGAACATGGATTCGACTCCCACTCCAGCCACAAGCC
TTCTAATCCTAAACGTAGAGTTAAGACCAGCATTACGCCTTGCTATCACAATTCCTTTTA
CGATTGAAACACGCCTCTTGTTCTCAGGCACTTCCACTTTAAGCTGCACAATGTAACCGG
GCCTTATCTCCGGTATCTCTCTACTAGTTCTCACTTCCTCCACAGCCTCCTTGTCTACAA
TCTGCATGATATGCTTGGCGGTTTTATCAAGCCTCTTGAACTTAATTCTTGGAGGCGCAT
CAGGAGCTGACACAGGAAACCCTTGAGGAACAGACTCCCCAACGGTGGAAAAGCACCTCG
ATGAATACGCAAAGTTTTGTCTAGGTA************AAGAAGCGGCCTTTGTCAACG
AGCTAATGAGAT

QA 3 674 3 674
DS 



CO CL404Contig2 755 3 12 U
GGGTAGGTTTCTGAAACTCCGCTGTAAACCTTCAGGGCATTCAGATCGAATCCTCTCTTT
GCGGGAGAAAAATGCAATCGATTCGTAGCAGTACAAGGTTGCTCCAGAGGAACCGCTTCT
CCATCTCCAACACTCTCCCTCGTTTCACTTCTTCTTCGTCTTCTTCTTCTCCAAGCTGGT
CTGATGATAATGAGTCGAGGAGGCTAGGAGGAGGGTTTGATTCATTCCGTTCCACAAGAG
CCTTCGATTCGCCAGCAGCGTCGTATCTCATTAGCTCGTTGACAAAGGCCGCTTCTTTAC
CTAGACAAAACTTTGCGTATTCATCGAGGTGCTTTTCCACCGTTGGGGAGTCTGTTCCTC
AAGGGTTTCCTGTGTCAGCTCCTGATGCGCCTCCAAGAATTAAGTTCAAGAGGCTTGATA
AAACCGCCAAGCATATCATGCAGATTGTAGACAAGGAGGCTGTGGAGGAAGTGAGAACTA
GTAGAGAGATACCGGAGATAAGGCCCGGTTACATTGTGCAGCTTAAAGTGGAAGTGCCTG
AGAACAAGAGGCGTGTTTCAATCGTAAAAGGAATTGTGATAGCAAGGCGTAATGCTGGTC
TTAACTCTACGTTTAGGATTAGAAGGCTTGTGGCTGGAGTGGGAGTCGAATCCATGTTCC
CTTTGTATTCTCCAAACCTGAGGGAGATTAAGTGTTGGACAAGAAGAGGGTAAGAAGAGC
GAAACTCTACTACCTCAGGACAAGATGAATGCTCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FM82TF U 1
AF RS1FV17TF U 1
AF RS1F742TF U 19
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CTAGACAAAACTTTGCGTATTCATCGAGGTGCTTTTCCACCGTTGGGGAGTCTGTTCCTC
AAGGGTTTCCTGTGTCAGCTCCTGATGCGCCTCCAAGAATTAAGTTCAAGAGGCTTGATA
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CTTTGTATTCTCCAAACCTGAGGGAGATT

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GG
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BQ
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35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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CT

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AAA

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DS 



AS 2 9

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GTTATTGATGTGTGTGTGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

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AGGAGACTTGTACATTTGTGATGGTTACTTTGGGGTCATGAAGGTCGGAC

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AGGTGAAGGCCCTTATGTCGGTGTCACCGACGGTCGCATCCTCAAATGGCGCGGCGAAGA
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TTTATTCTGGTCAGCTATCATCGAACCGGACCGTTTAAAGGGTACGAAACACGTTCTTCG
AGTGGCTAAGACCATTCCTCTCCCCGGCGTTGGACCAGAGAGCTTAGAGTTTGATTCACA
AGGTGAAGGCCCTTATGTCGGTGTCACCGACGGTCGCATCCTCAAATGGCGCGGCGAAGA
ACTTGGCTGGGTCGACTTCGCCTACACTTCTCCTCACAGAGATAACTGTTCGAGGAATCA
AGTAGTACCAAGTTGTGGAAGACCCTTAGCACTTAGCTTCCACAGGAAAACAGGAGACTT
GTACATTTGTGATGGTTACTTTGGGGTCATGAAGGTTGGACCAGAAGGAGGCTTGGCCGA
GTTAGTCGTTGATGAAGCCGAAGGCCGCAAAGTTATGTTTGCGAACCAAATGGACATAGA
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GTTCTACGTCTCTATATCCGGGGACAAAGTGGGAAGAGTAATTAGATACGATATGAAGAA
GAA

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GG
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TGATTCACAAGGTGAAGGCCCTTATGTCGGTGTCACCGACGGTCGCATCCTCAAATGGCG
TGGCGAAGAACATGGCTGGGTCGACTTCGCCTACACTTCTCCTCACAGAGATAACTGTTC
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TGG

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GATAGCAGCGACAAATACCATTTCGGGGAAGTGTTCTACGTGTCTATATCCGGGGACAAA
GTGGGAAGAGTAATTAGATACGATATGAAGAAGAAAGAGGCCAAAGTTATAATGGACAAA
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GGTGGTACGGGTATTCTCCACAGAATATGGGTCAAAGGTCCTAAGGCCGGGACCACCGAG
GTTTTCGCCAAGGTCCCTGGCCCTCCGGAC*AATATCCGACGTACCCCTACTGGTGATTT
TTGGGTCGCGTTGCACTGCAAGAGCAATTTGTTCACTAGGTTGTTTTTGATTCACTCTTG
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TTATGAGGGCAACAAATGAGTGACCAAACGCAAAATGAATAAAATGTTCGTGGCGTGGTT
TGTTTACTAGCGGAATGCATTTTGTTTCGTATCTTTTGTTTTTGTTTGTTTCTGTTGTTA
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GGATTCTCCACAGAATATGGGTCAAAGGTCCTAAGGCCGGGACCAACGAGATTTTCGCGA
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TTGCACTGCAAGAACAATTTGTTCACTCGGTTGTTTTTTATTCACTCTTGGGTTGGAAAG
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CATGGAATAATCTTGAAACTCTCTGGAGAGACCGGAGAGATTATTGAGATGCTTGAGGAT
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TGGATCGGGTCTGTGTATTGGCCAGCCGTTTGGGTTCTTGATAAATCTGTTTATGAGGGC
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CGGAATGCATTTTGTTTTGTATCTTTT****TTGTTTGTTTCTGTTGTTATTGTTGTGTG
AGTGGACTTTGTTGGTATTGTTGTTATTGTTGTGTGTGTGG

QA 1 821 1 821
DS 



CO CL406Contig2 878 2 2 U
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TTCCACACACACAACAATAACAACAATACCAACAAAGTCCACTCACACAACAATAACAAC
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CCACGAACATTTTATTCATTTTGCGTTTGGTCACTCATTTGTTGCCCTCATAAACAGATT
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CCATAGGGGTACGTCGGATATTGTCCGGAAGGCCAGGCCTCTTTCTTCTTCATATCGTAT
CTAATTACTCTTCCCACTTTGTCCCCGGATATAGAGACGTAGAACACTTCCCCGAAATGG
TATTTGTCGCTGCTATCATTGAAATAGAAGACGTCTTCCTCTTCGTCTATGTCCATTTGG
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TCTGGTCCAACCTTCATGACCCCAAAGTACCATCACAAATGTACAAGTCTCCTGTTTTCC
TGTGGAAGCTAAGTGCTAAGGTCTTCCACACTTGGTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FF40JQ U 1
AF RS1CT01JQ U 42
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BS 537 878 RS1CT01JQ

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QA 1 536 1 536
DS 

RD RS1CT01JQ 837 0 0
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AACTTTCCAACCCAAGAGTGAATAAGAAACAACCGAGTGAACAAATTGTTCTTGCAGTGC
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TAACTCGGCCAAGCCTCCTTCTGGTCCAACCTTCATGACCCCAAAGTACCATCACAAATG
TACAAGTCTCCTGTTTTCCTGTGGAAGCTAAGTGCTAAGGTCTTCCACACTTGGTAC

QA 1 837 1 837
DS 



AS 2 9

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BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1BT05JQ U 23
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AF RS1GA30JQ U 1
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DS 

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CG
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TCTTGGAAAACTGAAGCCCTTCACGAAGATCCTTCTCCCGTTGAGCTTTCAGTTCTTTAT
TCCTCAGATAGTTTTGCATCTGAATTTCCCTCAACCTACTGCTAATGAATCCGGCATTTC
TCTCAGCTCTGATGATCTCTTTCTCTGTTAGCTCACCAGAATCATCCACCTTACCATATC
GTTTCTCCATTTGCATAAGCAAAGGACCAATCCTCTGACGGATGGTGTACATGGTCCTAC
CGTACTCAGCTGCGGCCAAATCTCTGTCCCAAACACTGCACTTGTGGCAATAACTCTGTC
GCCGACAGTGAATTTGCCGGTTTTATCGGCGAAACCACCAGGCAAAATAGCATCAATGTA
AGTCCCACCATCTCTTCCTTTCCTGAATTTCAGACCATAAGGCTGCTCCACTTCTATCTC
ATACGTTTCGTACTTCTCTTCTTCCTCATTTCCTTCTCCACCATCTTTCTCTTTTCCTGC
TTCAGGTTTGGCTGTTGAATCTGTCTCCGACGCTTTCC

QA 7 704 7 704
DS 



CO CL407Contig2 742 4 4 U
GGACACACAAGGTCTCCTCCATATGGCTAAATCCAACTAATCCTCTTGTTTCTTTGGCTT
GTGTCTGAGCTCGAACCTAAAGATAAGAATCCAACATGTCTTTAGCTCCGACCAGTTATC
CATCTCTCTATTCACTGCCAAGAACCCAGCAGACTAAGCAAAACCCTGCCTTGATCACTC
AACCTAGTTTCATTTCGGTGAAGAGTCTCTACCTTTCGAGCAATACCCATGTGGCAAAAC
GGGGGAGTTTCGCTTTGAAAGCGTCGGAGACAGATTCAACAGCCAAACCTGAAGCAGGAA
AAGAGAAAGATGGTGGAGAAGGAAATGAGGAAGAAGAAGAGAAGTACGAAACGTATGAGA
TAGAAGTGGAGCAGCCTTATGGTCTGAAATTCAGGAAAGGAAGAGATGGTGGGACTTACA
TTGATGCTATTTTGCCTGGTGGTTTCGCCGATAAAACCGGCAAATTCACTGTCGGCGACA
GAGTTATTGCCACAAGTGCAGTGTTTGGGACAGAGATTTGGCCTGCAGCTGAGTACGGTA
GGACCATGTACACCATCCGTCAGAGGATTGGTCCTTTGCTTATGCAAATGGAGAAACGAT
ATGGTAAGGTGGATGATTCTGGTGAGCTAACAGAGAAAGAGATCATCAGAGCTGAGAGAA
ATGCCGG*ATTCATTAGCAGTAGGTTGAGGGAAATTCAGATGCAAAACTATCTGAGGAAG
AAAGAACTGAAAGCTCAACGGG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GM75TF U 1
AF RS1H706TF U 4
AF RS1GA30TF U 54
AF RS1BT05TF U 90
BS 1 643 RS1GM75TF
BS 644 679 RS1H706TF
BS 680 713 RS1GA30TF
BS 714 742 RS1BT05TF

RD RS1GM75TF 643 0 0
GGACACACAAGGTCTCCTCCATATGGCTAAATCCAACTAATCCTCTTGTTTCTTTGGCTT
GTGTCTGAGCTCGAACCTAAAGATAAGAATCCAACATGTCTTTAGCTCCGACCAGTTATC
CATCTCTCTATTCACTGCCAAGAACCCAGCAGACTAAGCAAAACCCTGCCTTGATCACTC
AACCTAGTTTCATTTCGGTGAAGAGTCTCTACCTTTCGAGCAATACCCATGTGGCAAAAC
GGGGGAGTTTCGCTTTGAAAGCGTCGGAGACAGATTCAACAGCCAAACCTGAAGCAGGAA
AAGAGAAAGATGGTGGAGAAGGAAATGAGGAAGAAGAAGAGAAGTACGAAACGTATGAGA
TAGAAGTGGAGCAGCCTTATGGTCTGAAATTCAGGAAAGGAAGAGATGGTGGGACTTACA
TTGATGCTATTTTGCCTGGTGGTTTCGCCGATAAAACCGGCAAATTCACTGTCGGCGACA
GAGTTATTGCCACAAGTGCAGTGTTTGGGACAGAGATTTGGCCTGCAGCTGAGTACGGTA
GGACCATGTACACCATCCGTCAGAGGATTGGTCCTTTGCTTATGCAAATGGAGAAACGAT
ATGGTAAGGTGGATGATTCTGGTGAGCTAACAGAGAAAGAGAT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RS1H706TF 676 0 0
G
ACACAAGGTCTCCTCCATATGGCTAAATCCAACTAATCCTCTTGTTTCTTTGGCTTGTGT
CTGAGCTCGGACCTAAAGATAAGAATCCAACATGTCTTTAGCTCCGACCAGTTATCCATC
TCTCTATTCACTGCCAAGAACCCAGCAGACTAAGCAAAACCCTGCCTTGATCACTCAACC
TAGTTTCATTTCGGTGAAGAGTCTCTACCTTTCGAGCAATACCCATGTGGCAAAACGGGG
GAGTTTCGCTTTGAAAGCGTCGGAGACAGATTCAACAGCCAAACCTGAAGCAGGAAAAGA
GAAAGATGGTGGAGAAGGAAATGAGGAAGAAGAAGAGAAGTACGAAACGTATGAGATAGA
AGTGGAGCAGCCTTATGGTCTGAAATTCAGGAAAGGAAGAGATGGTGGGACTTACATTGA
TGCTATTTTGCCTGGTGGTTTCGCCGATAAAACCGGCAAATTCACTGTCGGCGACAGAGT
TATTGCCACAAGTGCAGTGTTTGGGACAGAGATTTGGCCTGCAGCTGAGTACGGTAGGAC
CATGTACACCATCCGTCAGAGGATTGGTCCTTTGCTTATGCAAATGGAGGAACGATATGG
TAAGGTGGATGATTCTGGTGATCTAACAGAGAAAGAGATCATCAGAGCTGAGAGAAATGC
CGG*ATTCATTAGCA

QA 2 676 2 676
DS 

RD RS1GA30TF 660 0 0
GG
GGCTTGTGTCTGAGCTCGAACCTAAAGATAAGAATCCAACATGTCTTTAGCTCCGACCAG
TTATCCATCTCTCTATTCACTGCCAAGAACCCAGCAGACTAAGCAAAACCCTGCCTTGAT
CACTCAACCTAGTTTCATTTCGGTGAAGAGTCTCTACCTTTCGAGCAATACCCATGTGGC
AAAACGGGGGAGTTTCGCTTTGAAAGCGTCGGAGACAGATTCAACAGCCAAACCTGAAGC
AGGAAAAGAGAAAGATGGTGGAGAAGGAAATGAGGAAGAAGAAGAGAAGTACGAAACGTA
TGAGATAGAAGTGGAGCAGCCTTATGGTCTGAAATTCAGGAAAGGAAGAGATGGTGGGAC
TTACATTGATGCTATTTTGCCTGGTGGTTTCGCCGATAAAACCGGCAAATTCACTGTCGG
CGACAGAGTTATTGCCACAAGTGCAGTGTTTGGGACAGAGATTTGGCCTGCAGCTGAGTA
CGGTAGGACCATGTACACCATCCGTCAGAGGATTGGTCCTTTGCTTATGCAAATGGAGAA
ACGATATGGTAAGGTGGATGATTCTGGTGAGCTAACAGAGGAAGAGATCATCAGAGCTGA
GAGAAATGCCGGGATTCATTAGCAGTAGGTTGAGGGAAATTCAGATGCAAAACTATCT

QA 3 660 3 660
DS 

RD RS1BT05TF 653 0 0
TCCAGCATGTCTTTAGCTCCGACCAGTTATCCATCTCTCTATTCACTGCCAAGAACCCAG
CAGACTAAGCAAAACCCTGCCTTGATCACTCAACCTAGTTTCATTTCGGTGAAGAGTCTC
TACCTTTCGAGCAATACCCATGTGGCAAAACGGGGGAGTTTCGCTTTGAAAGCGTCGGAG
ACATATTCAACAGCCAA*CCTGAAGTAGGAAAAGAGAAAGATGGTGGAGAAGGAAATGAG
GAAGAAGAAGAGAAGTACGAAACGTATGAGATAGAAGTGGAGCAGCCTTATGGTCTGAAA
TTCAGGAAAGGAAGAGATGGTGGGACTTACATTGATGCTATTTTGCCTGGTGGTTTCGCC
GATAAAACCGGCAAATTCACTGTCGGCGACAGAGTTATTGCCACAAGTGCAGTGTTTGGG
ACAGAGATTTGGCCTGCAGCTGAGTACGGTAGGACCATGTACACCATCCGTCAGAGGATT
GGTCCTTTGCTTATGCAAATGGAGAAACGATATGGTAAGGTGGATGATTCTGGTGAGCTA
ACAGAGAAAGAGATCATCAGAGCTGAGAGAAATGCCGG*ATTCATTAGCAGTAGGTTGAG
GGAAATTCAGATGCAAAACTATCTGAGGAAGAAAGAACTGAAAGCTCAACGGG

QA 1 653 1 653
DS 



AS 2 9

CO CL408Contig1 758 2 3 U
GGAGGAATCTTGAGTTTATCAAGAAGTAACTTAGAAGAAGAGAAAAATGGAGATATCAAC
AGCATCCCAGTTGTGCTCACGGGTTAAGTTCTCAATCTCTTCATCATCACTCTCCTGTTT
AAATGGTAAGAGGAACCAAAACGGAGCTGTTTCAGTCAATTGCTTGAAAGAGATCAGTAA
TATTAGCTTCACTGCCAAGAAGAAACACAGAAGCCATGCGCCAGTGGTGAGGACAACAAC
AACACGCGCCTCCGCCTCCGTGGATGGGAGTCAACCCCCAGCTTCTGCCACCAAAAGAGA
ACGGTGGCTTCTCCAACCAGTTGGAGATGGAGACACAAGACACATTGGTTACAAAGTGGA
AATGCCTGCTCCTTTCGAGATCTCTTCCGGTCAAGTTACCATCGGACGGCTACCTGAAAA
GGCTGACGTTGTGATTCCTGTGGCCACCGTCTCGGGAGTACATGCGACAATTGATACACA
AAGAGACAACCTTCTTGTAACGGATATGAACAGTACAAATGGTACATTCATCGAAGACAA
ACGTCTGATCCCTGGTGTTGCTGCTCCTGCCTTTCCCGGAACCCGAATCACCTTTGGAGA
TACGAATCTAGCAATTTTCCGTGTTTTCAAGCTCCAAGATAGTCAAGAAGAAGAAGAACC
CACCGAGAAACCAGCCACAGAGTAACCAACCAAACCCCAAACCTGTTCGGTTGTTCTACA
ACCATTGTTGAGCTTATATAACTCTATGTAAACAATAT


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C972TF U 1
AF RS1C972JQ C 1
BS 1 2 RS1C972JQ
BS 3 634 RS1C972TF
BS 635 758 RS1C972JQ

RD RS1C972TF 634 0 0
GG
AGGAATCTTGAGTTTATCAAGAAGTAACTTAGAAGAAGAGAAAAATGGAGATATCAACAG
CATCCCAGTTGTGCTCACGGGTTAAGTTCTCAATCTCTTCATCATCACTCTCCTGTTTAA
ATGGTAAGAGGAACCAAAACGGAGCTGTTTCAGTCAATTGCTTGAAAGAGATCAGTAATA
TTAGCTTCACTGCCAAGAAGAAACACAGAAGCCATGCGCCAGTGGTGAGGACAACAACAA
CACGCGCCTCCGCCTCCGTGGATGGGAGTCAACCCCCAGCTTCTGCCACCAAAAGAGAAC
GGTGGCTTCTCCAACCAGTTGGAGATGGAGACACAAGACACATTGGTTACAAAGTGGAAA
TGCCTGCTCCTTTCGAGATCTCTTCCGGTCAAGTTACCATCGGACGGCTACCTGAAAAGG
CTGACGTTGTGATTCCTGTGGCCACCGTCTCGGGAGTACATGCGACAATTGATACACAAA
GAGACAACCTTCTTGTAACGGATATGAACAGTACAAATGGTACATTCATCGAAGACAAAC
GTCTGATCCCTGGTGTTGCTGCTCCTGCCTTTCCCGGAACCCGAATCACCTTTGGAGATA
CGAATCTAGCAATTTTCCGTGTTTTCAAGCTC

QA 3 634 3 634
DS 

RD RS1C972JQ 758 0 0
GGAGGAATCTTGAGTTTATCAAGAAGTAACTTAGAAGAAGAGAAAAATGGAGATATCAAC
AGCATCCCAGTTGTGCTCACGGGTTAAGTTCTCAATCTCTTCATCATCACTCTCCTGTTT
AAATGGTAAGAGGAACCAAAACGGAGCTGTTTCAGTCAATTGCTTGAAAGAGATCAGTAA
TATTAGCTTCACTGCCAAGAAGAAACACAGAAGCCATGCGCCAGTGGTGAGGACAACAAC
AACACGCGCCTCCGCCTCCGTGGATGGGAGTCAACCCCCAGCTTCTGCCACCAAAAGAGA
ACGGTGGCTTCTCCAACCAGTTGGAGATGGAGACACAAGACACATTGGTTACAAAGTGGA
AATGCCTGCTCCTTTCGAGATCTCTTCCGGTCAAGTTACCATCGGACGGCTACCTGAAAA
GGCTGACGTTGTGATTCCTGTGGCCACCGTCTCGGGAGTACATGCGACAATTGATACACA
AAGAGACAACCTTCTTGTAACGGATATGAACAGTACAAATGGTACATTCATCGAAGACAA
ACGTCTGATCCCTGGTGTTGCTGCTCCTGCCTTTCCCGGAACCCGAATCACCTTTGGAGA
TACGAATCTAGCAATTTTCCGTGTTTTCAAGCTCCAAGATAGTCAAGAAGAAGAAGAACC
CACCGAGAAACCAGCCACAGAGTAACCAACCAAACCCCAAACCTGTTCGGTTGTTCTACA
ACCATTGTTGAGCTTATATAACTCTATGTAAACAATAT

QA 1 758 1 758
DS 



CO CL408Contig2 781 7 24 U
GGGATCAATCAAAAGCAGGAATCTTGAGTTTATCAAGAAGTAACTTAGAAGAAGAGAAAA
ATGGAGATATCAACAACATCCCAGTTGTGCTCACGGGTTAAGTTCTCAATCTCTTCATCA
TCACTCTCCTGCTTAAATGGTAAGAGGAACCAAGACGGAGCTGTTTCAGTCAATTGCTTG
AAAGAGATCAAACAGTTCAGTAACATTAGCTTCATTGCCAAGAAGAAACACAGAAGCCAT
GCACCGGTGGTGAGGACAACAACAACACGCGCCTCCGCCTCCGTGGATGGGAATCAACCC
CCAGCTTCTGCCACCAAAAGAGAACGGTGGCTTCTCCAACCAGTTGGAGATGGAGACACA
AGACACATTGGTTACAAAGTGGAAATGCCTGCTCCTTTCGAGATCTCTTCCGGTCAAGTT
ACCATCGGACGACTACCTGAAAAGGCTGACGTTGTGATTCCTGTGGCCACCGTCTCGGGA
GTACATGCGACAATTGATACACAAAGAGACAACCTTCTTGTAACGGATATGAACAGTACA
AACGGTACATTCATCGAAGACAAACGTCTGATCCCTGGTGTTGCTGCTCCTGCCTTTCCC
GGAACCCGAATCACCTTTGGAGATACGAATCTCGCAATTTTCCGTGTTTTCAAGCTCCAA
GATAGTCAAGAAGAAGAAGAACCCACCGAGAAACCAGCCACAGAGTAACCAACCAAACCC
CAAACCTGTTCGGTGGTTCTACAACCATTGTTGAGCTTATATAACTCTATGTAAACAATA
T


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1EW49TF U 279
AF RS1GZ47TF U 4
AF RS1EW62TF U 106
AF RS1GY31TF U 1
AF RS1EK66TF U 4
AF RS1GZ47JQ C 134
AF RS1EK66JQ C 135
BS 1 176 RS1GY31TF
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BS 753 757 RS1GY31TF
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ACCAGTTGGAGATGGAGACACAAGACACATTGGTTACAAAGTGGAAATGCCTGCTCCTTT
CGAGATCTCTTCCGGTCAAGTTACC

QA 1 145 1 145
DS 

RD RS1GZ47TF 606 0 0
GGG
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ATATCAACAACATCCCAGTTGTGCTCACGGGTTAAGTTCTCAATCTCTTCATCATCACTC
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ATCAAACAGTTCAGTAACATTAGCTTCATTGCCAAGAAGAAACACAGAAGCCATGCACCG
GTGGTGAGGACAACAACAACACGCGCCTCCGCCTCCGTGGATGGGAATCAACCCCCAGCT
TCTGCCACCAAAAGAGAACGGTGGCTTCTCCAACCAGTTGGAGATGGAGACACAAGACAC
ATTGGTTACAAAGTGGAAATGCCTGCTCCTTTCGAGATCTCTTCCGGTCAAGTTACCATC
GGACGACTACCTGAAAAGGCTGACGTTGTGATTCCTGTGGCCACCGTCTCGGGAGTACAT
GCGACAATTGATACACAAAGAGACAACCTTCTTGTAACGGATATGAACAGTACAAACGGT
ACATTCATCGAAGACAAACGTCTGATCCCTGGTGTTGCTGCTCCTGCCTTTCCCGGAACC
CGA

QA 4 606 4 606
DS 

RD RS1EW62TF 593 0 0
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TCAGTCAATTGTTTGAAAGAGATCAAACAGTTCAGTAACATTAGCTTCATTGCCAAGAAG
AAACACAGAAGCCATGCACCGGTGGTGAGGACAACAACAACACGCGCCTCCGCCTCCGTG
GATGGGAATCAACCCCCAGCTTCTGCCACCAAAAGAGAACGGTGGCTTCTCCAACCAGTT
GGAGATGGAGACACAAGACACATTGGTTACAAAGTGGAAATGCCTGCTCCTTTCGAGAAC
TCTTCCGGTCAAGTTACCATCGGACGACTACCTGAAAAGGCTGACGTTGTGATTCCTGTG
GCCACCGTCTCGGGAGTACATGCGACAATTGATACACAAAGAGACAACCTTCTTGTAACG
GATATGAACAGTACAAATGGTACATTCATCGAAGACAAACGTCTGATCCCTGGTGTTGCT
GCTCCTGCCTTTCCCGGAACCCGAATCACCTTTGGAGATACGAATCTAGCAATTTTCCGT
GTTTTCAAGCTCCAAGATAGTCA*GAAGAAGAAGAACCCACCGAGAAAC
AGCC

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1GY31TF 783 0 0
GGGATCAATCAAAAGCAGGAATCTTGAGTTTATCAAGAAGTAACTTAGAAGAAGAGAAAA
ATGGAGATATCAACAACATCCCAGTTGTGCTCACGGGTTAAGTTCTCAATCTCTTCATCA
TCACTCTCCTGCTTAAATGGTAAGAGGAACCAAGACGGAGCTGTTTCAGTCAATTGTTTG
AAAGAGATCAAACAGTTCAGTAACATTAGCTTCATTGCCAAGAAGAAACACAGAAGCCAT
GCACCGGTGGTGAGGACAACAACAACACGCGCCTCCGCCTCCGTGGATGGGAATCAACCC
CCAGCTTCTGCCACCAAAAGAGAACGGTGGCTTCTCCAACCAGTTGGAGATGGAGACACA
AGACACATTGGTTACAAAGTGGAAATGCCTGCTCCTTTCGAGATCTCTTCCGGTCAAGTT
ACCATCGGACGACTACCTGAAAAGGCTGACGTTGTGATTCCTGTGGCCACCGTCTCGGGA
GTACATGCGACAATTGATACACAAAGAGACAACCTTCTTGTAACGGATATGAACAGTACA
AATGGTACATTCATCGAAGACAAACGTCTGATCCCTGGTGTTGCTGCTCCTGCCTTTCCC
GGAACCCGAATCACCTTTGGAGATACGAATCTAGCAATTTTCCGTGTTTTCAAGCTCCAA
GATAGTCAAGAAGAAGAAGAACCCACCGAGAAACCAGCCACAG*GTAACCAACCAA*CCC
CAAACCTGTTCG*TG**TCTACA*CCATTGT*GAGCT*ATATA*CTCTATGTAA
GTGTAAAAA

QA 1 774 1 774
DS 

RD RS1EK66TF 773 0 0
GGG
AATCAAAAGCAGGAATCTTGAGTTTATCAAGAAGTAACTTAGAAGAAGAGAAAAATGGAG
ATATCAACAACATCCCAGTTGTGCTCACGGGTTAAGTTCTCAATCTCTTCATCATCACTC
TCCTGCTTAAATGGTAAGAGGAACCAAGACGGAGCTGTTTCAGTCAATTGCTTGAAAGAG
ATCAAACAGTTCAGTAACATTAGCTTCATTGCCAAGAAGAAACACAGAAGCCATGCACCG
GTGGTGAGGACAACAACAACACGCGCCTCCGCCTCCGTGGATGGGAATCAACCCCCAGCT
TCTGCCACCAAAAGAGAACGGTGGCTTCTCCAACCAGTTGGAGATGGAGACACAAGACAC
ATTGGTTACAAAGTGGAAATGCCTGCTCCTTTCGAGATCTCTTCCGGTCAAGTTACCATC
GGACGACTACCTGAAAAGGCTGACGTTGTGATTCCTGTGGCCACCGTCTCGGGAGTACAT
GCGACAATTGATACACAAAGAGACAACCTTCTTGTAACGGATATGAACAGTACAAACGGT
ACATTCATCGAAGACAAACGTCTGATCCCTGGTGTTGCTGCTCCTGCCTTTCCCGGAACC
CGAATCACCTTTGGAGATACGAATCTCGCAATTTTCCGTGTTTTCAAGCTCCAAGATAGT
CAAGAAGAAGAAGAACCCACCGAGAAAC*AGCCACAGAGTAACCAACCAAACCCCAAACC
TGTTCGGTG**TCTACAACCATTGTTGAGCT*ATATAACTCTATGTAA
CA

QA 4 771 4 771
DS 

RD RS1GZ47JQ 648 0 0
TAAATGGTAAGAGGAACCAAGACGGAGCTGTTTCAGTCAATTGCTTGAAAGAGATCAAAC
AGTTCAGTAACATTAGCTTCATTGCCAAGAAGAAACACAGAAGCCATGCACCGGTGGTGA
GGACAACAACAACACGCGCCTCCGCCTCCGTGGATGGGAATCAACCCCCAGCTTCTGCCA
CCAAAAGAGAACGGTGGCTTCTCCAACCAGTTGGAGATGGAGACACAAGACACATTGGTT
ACAAAGTGGAAATGCCTGCTCCTTTCGAGATCTCTTCCGGTCAAGTTACCATCGGACGAC
TACCTGAAAAGGCTGACGTTGTGATTCCTGTGGCCACCGTCTCGGGAGTACATGCGACAA
TTGATACACAAAGAGACAACCTTCTTGTAACGGATATGAACAGTACAAACGGTACATTCA
TCGAAGACAAACGTCTGATCCCTGGTGTTGCTGCTCCTGCCTTTCCCGGAACCCGAATCA
CCTTTGGAGATACGAATCTCGCAATTTTCCGTGTTTTCAAGCTCCAAGATAGTCAAGAAG
AAGAAGAACCCACCGAGAAACCAGCCACAGAGTAACCAACCAAACCCCAAACCTGTTCGG
TTGTTCTACAACCATTGTTGAGCTTATATAACTCTATGTAA
ACAATAT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1EK66JQ 647 0 0
AAATGGTAAGAGGAACCAAGACGGAGCTGTTTCAGTCAATTGCTTGAAAGAGATCAAACA
GTTCAGTAACATTAGCTTCATTGCCAAGAAGAAACACAGAAGCCATGCACCGGTGGTGAG
GACAACAACAACACGCGCCTCCGCCTCCGTGGATGGGAATCAACCCCCAGCTTCTGCCAC
CAAAAGAGAACGGTGGCTTCTCCAACCAGTTGGAGATGGAGACACAAGACACATTGGTTA
CAAAGTGGAAATGCCTGCTCCTTTCGAGATCTCTTCCGGTCAAGTTACCATCGGACGACT
ACCTGAAAAGGCTGACGTTGTGATTCCTGTGGCCACCGTCTCGGGAGTACATGCGACAAT
TGATACACAAAGAGACAACCTTCTTGTAACGGATATGAACAGTACAAACGGTACATTCAT
CGAAGACAAACGTCTGATCCCTGGTGTTGCTGCTCCTGCCTTTCCCGGAACCCGAATCAC
CTTTGGAGATACGAATCTCGCAATTTTCCGTGTTTTCAAGCTCCAAGATAGTCAAGAAGA
AGAAGAACCCACCGAGAAACCAGCCACAGAGTAACCAACCAAACCCCAAACCTGTTCGGT
TGTTCTACAACCATTGTTGAGCTTATATAACTCTATGTAAACAATAT

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 9

CO CL409Contig1 941 9 10 U
GGGTTCTATACCTCTCTCTATCCCAAAAAAAAAA***GAGATGGAGGAAGCAGCGGCGCA
TCCTTACGTTCCGAGAGATCTGAAACTGCCTGGGTACGTTCCCATCTCCATGTCCATGTC
AAGTATCCTCGCAGTCTACCTCGGTGCTTCTCTCTTTGTCGTCACCTTCGTCTGGTTTCT
ACTCGGGAGGAAGAAGGCGCATCTTGACAGATTGCTAATGTGCTGGTGGGCTTTCACC*G
GCCTCACTCACATGGTTCTTGAGGGCTATTTCGTTTTCTCCCCTGAGTTTTTCAAGGACA
ACACTTCTTGTTACCTCGCTGAAGTTTGGAAAGAATACAGCAAAGGCGATTCCAGATACG
CGGGGAGAGATTCTGCAGTTATAGCTGTTGAAGGCATCACTGCTGTTATTGAAGGCCCTG
CTTCTCTTCTTGCTGTGTATGCTATTGCTAAGGGGAAGTCTTACAGCTACGTGCTTCAGC
TTGCGATTTCGCTAGGCCAGCTCTACGGATGTCTTGTCTATTTCATTACTGCTTTCTTGG
AAGGAGATAACTTTGCTACTAACTCCTTCTACTACTACTCCTACTACATTTGCGCTAATG
GATGGTGGGTTTTGATTCCTTTCCTCATTTCTTACCGTTGCTGGAACAAGATTTGTGCAA
GTCCCAACGGTGTGGAAACTAAGATTAAGAAGAAAACCCGGTAGAATGCAAAAAAAAAAA
**ACTCTTTTACAAGATTCTAGTTTTTTCATCTCTTCTTTCTGGCTTTGATGCTTTGCTT
GTTTTTCTGTTTCCTCATTACCTACCTGAGAACATCATTAGACTGTTTCTCCTTTGGCAA
TTGAATTTGGTTTCATTTTTATTGATGTTATAGCAATGAACAAGTGGTTGGAAACATGAG
CTTGAAGACAACTCTATATCAATATACCATTTTATATTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 
25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AA49TF U 362
AF RS1C014TF U 1
AF RS1GC03TF U 1
AF RS1G208JQ C 8
AF RS1G208TF U 8
AF RS1CA39TF U 6
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AF RS1GC03JQ C 302
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ATGGTGGGTTTTGATTCCTTTCCTCATTTCTTACCGTTGCTG

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DS 

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ACTCGGGAGGAAGAAGGCGCATCTTGACAGATTGCTAATGTGCTGGTGGGCTTTCACC*G
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TTGCGATTTCGCTAGGCCAGCTCTACGGATGTCTTGTCTATTTCATTACTGCTTTCTTGG
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DS 

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GGGTTCTAT
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CGCAGTCTACCTCGGTGCTTCTCTCTTTGTCGTCACCTTCGTCTGGTTTCTACTCGGGAG
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GG
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GTTACCTCGCTGAAGTTTGGAAAGAATACAGCAAAGGCGATTCCAGATACGCGGGGAGAG
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TTGCTGTGTATGCTATTGCTAAGGGGAAGTCTTACAGCTACGTGCTTCAGCTTGCGATTT
CGCTAGGCCAGCTCTACGGATGTCTTGTCTATTTCATTACTGCTTTCTTGGAAGGAGATA
ACTTTGCTACTAACTCCTTCTACTACTACTCCTACTACATTTGCGCTAATGGATGGTGGG
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DS 

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GG
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GTTACCTCGCTGAAGTTTGGAAAGAATACAGCAAAGGCGATTCCAGATACGCGGGGAGAG
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GTGTGGAAACTAAGATTAAGAAGAAAACCCGGTAGAATGC

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DS 

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GGAT
ACCTCTCTCTATCCCAAAAAAAAAA***GAGATGGAGGAAGCAGCGGCGCATCCTTACGT
TCCGAGAGATCTGAAACTGCCTGGGTACGTTCCCATCTCCATGTCCATGTCAAGTATCCT
CGCAGTCTACCTCGGTGCTTCTCTCTTTGTCGTCACCTTCGTCTGGTTTCTACTCGGGAG
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ACATGGTTCTTGAGGGCTATTTCGTTTTCTCCCCTGAGTTTTTCAAGGACAACACTTCTT
GTTACCTCGCTGAAGTTTGGAAAGAATACAGCAAAGGCGATTCCAGATACGCGGGGAGAG
ATTCTGCAGTTATAGCTGTTGAAGGCATCACTGCTGTTATTGAAGGCCCTGCTTCTCTTC
TTGCTGTGTATGCTATTGCTAAGGGGAAGTCTTACAGCTACGTGCTTCAGCTTGCGATTT
CGCTAGGCCAGCTCTACGGATGTCTTGTCTATTTCATTACTGCTTTCTTGGAAGGAGATA
ACTTTGCTACTAACTCCTTCTACTACTACTCCTACTACATTTGCGCTAATGGATGGGGGG
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GTGTGGAAACTAAGATTAAGAAG

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DS 

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TTATGCAAGTCCCAACGGTGTGGAAACTAAGATTAAGAAGAAAACCCGGTAGAATGCAAA
AAAAAAAAAAACTCTTTTACAAGATTCTAGTTTTTTCATCTCTTCTTTCTGGCTTTGATG
CTTTGCTTGTTTTTCTGTTTCCTCATTACCTACCTGAGAACATCATTAGACTGTTTCTCC
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AAAC

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DS 

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GGGGAGAGATTCTGCAGTTATAGCTGTTGAAGGCATCACTGCTGTTATTGAAGGCCCTGC
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TGCGATTTCGCTAGGCCAGCTCTACGGATGTCTTGTCTATTTCATTACTGCTTTCTTGGA
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ATGGTGGGTTTTGATTCCTTTCCTCATTTCTTACCGTTGCTGGAACAAGATTTGTGCAAG
TCCCAACGGTGTGGAAACTAAGATTAAGAAGAAAACCCGGTAGAATGCAAAAAAAAAAA*
*ACTCTTTTACAAGATTCTAGTTTTTTCATCTCTTCTTTCTGGCTTTGATGCTTTGCTTG
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TGAATTTGGTTTCATTTTTATTGATGTTATAGCAATGAACAAGTGGTTGG

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DS 

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ATTTCGTTTTCTCCCCTGAGTTTTTCAAGGACAACACTTCTTGTTACCTCGCTGAAGTTT
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TTGAAGGCATCACTGCTGTTATTGAAGGCCCTGCTTCTCTTCTTGCTGTGTATGCTATTG
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TCTACTACTACTCCTACTACATTTGCGCTAATGGATGGTGGGTTTTGATTCCTTTCCTCA
TTTCTTACCGTTGCTGGAACAAGATTTGTGCAAGTCCCAACGGTGTGGAAACTAAGATTA
AGAAGAAAACCCGGTAGAATGCAAAAAAAAAA***ACTCTTTTACAAGATTCTAGTTTTT
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CATTTTATATTTAG

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DS 



AS 1 9

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TAATAATGTACTGCAACATACTATAATTTTCATTTTAAGGGAATGAAACAAATTAAAA


BQ
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55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 30 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F919JQ C 11
AF RS1E303TF U 1
AF RS1DT43TF U 1
AF RS1F919TF U 1
AF RS1AA38TF U 1
AF RS1F916JQ C 1
AF RS1F916TF U 1
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TCATCCCACTAGAGAATCCGCCCAACATGGCCAGGAACAAACCGCTGGTTTTTTTGGCCA
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G

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G

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GAC

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DS 

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GAC

QA 1 586 1 586
DS 

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QA 1 586 1 586
DS 

RD RS1C747TF 595 0 0
TAGAACTAACTCTCTCACAGACTTTGAATCTTCTTTAAAAAAA*TTGCTTCTTTGGATCA
TCAATCATGTCACAGCAAGCATTCAATGCTGGCCAAACCAAGGGCCAAGCTCGTGAGAAG
GCTGAGCAGTGGACTGAGTCTGCAAAGCAGACTGCACAATCAGCACGTGACAAGACTGCA
GAGGTGGCACAATCAGCACATGACAAGGCTATTGATGTTACACATTCAGCACAAAACAAG
TCTGCTGATAAATCTCATCCCACTAGAGAATCCGCCCAACATGGCCAGGAACAAACCGCT
GGTTTTCTTGGCCAGACGGGAGAATCTGTGAAGAACATGGCTCAAGGTGCTTTGGATGGT
GTTAAGAACAGTCTTGGCATGAATGAGAAGAAATGAGGAAATGAATATTCATACGTCTCA
ACTGTTTATTTACATATTTAAATATTATTTCTGATGTTTGGCAGTT**TGTTTTCTCTAA
ATTATCTATGTAATAACTATTTTCTTTTTGAAAGATTTTGTGATAATAAAAACTGAGATG
TAATAATGTACTGCAACATACTATAATTTTCATTTTAAGGGAATGA
AACAAATTA

QA 1 586 1 586
DS 



AS 2 7

CO CL411Contig1 775 4 28 U
GGAGACTCGAGACAACAAGTACCATCCATTCACACGCAAACAGAAAGAGAAGCTCCAAGA
ATCTGTCGGCTTTTTGAGAAATCCAAAGGGTCAGAAGTAAATAACAGTCGCCATGGCAGT
CTCGGCAGCATTCAACCCTTTGAAACTTGCATCTTCGACTTCTCTAGATTCGATTCCTTC
AATCTCTCCTTCTTCTTCTTATTCATTGTTTCCGGCAAGCATCGGCATCAGAAACTCCGT
CGGATCTCCTTTCAAGAGATGTCTAAAGAAGTCGTGTTCTTCTGTTCGAGCCATGTCTTC
TTCTTCTTCTTCTTCTTCGGCTGCTTCTTCTTCTTCTTTCGGTTCGAGAATGGAGGAGAG
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CTGTACTGAAGTGAAGACATTATTCAAGAGACTTGGAGTTCAGCCATTGGTGATTGAATT
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ACACACTGTTCCTAATGTTTTCGTTGGAGGAAAGCACATTGGTGGCTGCACAGATACAGT
GAAGCTGAACAGGAAAGGAGATCTTGAACTAATGTTAGCTGAAGCCAACGCTAAAACCGA
TTCAACTTGAAGAAATGATGGAAACTGGTATGGAGATTTTGCATAAGGAGCTTGGAACTT
GGAAGAGTTTTAACTACTTTCTTATTTTTGTATAAACTCATTTTCTTTTGTCAAT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 15 0 0 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GI80TF U 1
AF RS1BW61JQ C 1
AF RS1BW61TF U 1
AF RS1AU18JQ C 77
BS 1 40 RS1GI80TF
BS 41 41 RS1BW61TF
BS 42 147 RS1GI80TF
BS 148 148 RS1BW61TF
BS 149 157 RS1GI80TF
BS 158 158 RS1BW61TF
BS 159 195 RS1GI80TF
BS 196 196 RS1BW61TF
BS 197 204 RS1GI80TF
BS 205 205 RS1BW61TF
BS 206 268 RS1GI80TF
BS 269 269 RS1BW61TF
BS 270 312 RS1GI80TF
BS 313 314 RS1BW61TF
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BS 343 343 RS1BW61TF
BS 344 466 RS1GI80TF
BS 467 467 RS1BW61TF
BS 468 497 RS1GI80TF
BS 498 706 RS1BW61TF
BS 707 707 RS1BW61JQ
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RD RS1GI80TF 497 0 0
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GGATGAACTTGGTCCAC

QA 1 497 1 497
DS 

RD RS1BW61JQ 775 0 0
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CGGATCTCCTTTCAAGAGATGTCTAAAGAAGTCGTGTTCTTCTGTTCGAGCCATGTCTTC
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TGTCAAT

QA 1 768 1 768
DS 

RD RS1BW61TF 776 0 0
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CTCGGCAGCATTCAACCCTTTGAAACTTGCATCTTCGACTTCTCTAGATTCGATTCCTTC
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CGGATCTCCTTTCAAGAGATGTCTAAAGAAGTCGTGTTCTTCTGTTCGAGCCATGTCTTC
TTCTTCTTCTTCTTCTTCGGCTGCTTCTTCTTCTTCTTTCGGTTCGAGAATGGAGGAGAG
CGTGAGGAAGACGGTTACTGAGAACATTGTCGTTGTTTACTCCAAAACTTGGTGCTCATA
CTGTACTGAAGTGAAGACATTATTCAAGAGACTTGGAGTTCAGCCATTGGTGATTGAATT
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GAAGCTGAACAGGAAAGGAGATCTTGAACTAATGTTAGCTGAAGCCAACGCTAAAACCGA
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GGAAGAGTTTTAACTACTTTCTTATTTTTGTATAAACTCATTTT
TCTTTTGTCAAT

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1AU18JQ 699 0 0
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CCTTTGAAACTTGCATCTTCGACTTCTCTAGATTCGATTCCTTCAATCTCTCCTTCT*CT
TCTTATTCATTGTTTCCGGCAAGTATCGGCATCAGAAACTCCGTCGGATCTCCTTTCAAG
AGATGTCTAAAGAAGTCGTGTTCTTCTGTTCGAGCCATGTCTTCTTCTTCTTCTTCTTC*
**GGCTGCTTCTTCTTCTTCTTTCGGTTCGAGAATGGAGGAGAGCGTGAGGAAGACGGTT
ACTGAGAACATTGTCGTTGTTTACTCCAAAACTTGGTGCTCATACTGTACTGAAGTGAAG
ACATTATTCAAGAGACTTGGAGTTCAGCCATTGGTGATTGAATTGGATGAACTTGGTCCA
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GTTTTCGTTGGAGGAAAGCACATTGGTGGCTGCACAGATACAGTGAAGCTGAACAGGAAA
GGAGATCTTGAACTAATGTTAGCTGAAGCCAACGCTAAAACCGATTCAACTTGAAGAAAT
GATGGAAACTGGTATGGAGATTTTGCATAAGGAGCTTGGAACTTGGAAGAGTTTTAACTA
CTTTCTTATTTTTGTATAAACTCATTTTCTTTTGTCAAT

QA 1 699 1 699
DS 



CO CL411Contig2 720 3 2 U
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TTAGTTATATAATGTATTTATTTGAATGGTGTTCAATGCATTGACAAAAGAAAATGAGTT
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AGATCTCCTTTCCTGTTCAGCTTCACTGTATCTGTGCAGCCACCAATGTGCTTTCCTCCA
ACGAAAACATTAGGAACAGTGTGTTGGCCAGTAAGTCTTTCAGGTACCTTCTGCAATTGT
GGCCCTTGTGGACCAAGTTCATCCAATTCAATCACCAGTGGCTGAACTCCAAGTCTCTTG
AATAATGTCTTCACTTCAGTACAGTATGAGCACCAAGTTTTGGAGTAAACAACGACAATG
TTCTCAGTAACCGTCTTCCTCACGCTCTCCTCCATTCTCGATCCGAAAGAAGAAGAAGAA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EE78TF C 16
AF RS1EE78JQ U 1
AF RS1GI80JQ U 11
BS 1 711 RS1EE78JQ
BS 712 720 RS1GI80JQ

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TCTTTATATTGTAATGTATAATACATGATAGTGTATATGTGTTATTTAGTTATATAATGT
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DS 



AS 1 8

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 15 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AG90TF U 278
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AAAATCCCGACGGGAAGATTCGGAAATGGAAGAGTTTTCTCCGATATAGTTGCCGAGGGT
TTGGGGATTAAAAAAAATTTACCTGCTGCTCGTAAGCTTTTCATTGCTCCAAGCGACCTT
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GG
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DS 

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TTTTTATGACTCGATCTGCATTCATGCGAGGATATGTGACGAGTGGTGCTTACACCACTA
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TC

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AAAACTTGGCCAAGCGAAGCCGGTTTTCGTGGTGCAAAATTTGTCTATGTCGACATGTTC
AACACTCTTATGGATGTTATAAAAAATTATAGAAGATACGGATTTAGTAATGCCAATAAT
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TATGACTTTGTTCATCCCTCGGAGAAAGCCTACAAAACCATTTCCAAAAGGCTGGTCCAG
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T
CC

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DS 

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CTAGTTGGAACAAAAATTTTATGAAACAAATGTATGATCAAGGAGCCAGAAAATTCGCAG
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GTTGTATGCCTACAGCGATAGTACCTTGCGTAAATCCTCATAGTCACGTCTTCTATGACT
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AGAGAGGCCTTGCCTAGTTTCAGTCTTACGATCCTATATTGTTGTAATCTAAATAACCAA
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AAAAAA*CATCGTCAACTAGTTACACCCAAACAAAAAAACATTGTTAGTTAATTATATAT
TTATGAGCATACACGATCACTTATTTTTAATCTTTTTTTTT
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G
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TTCAAAAAAAAAAACATCGTCAACTAGTTACACCCAAACAAAAAAACATTGTTAGTTAAT
TATATATTTATGAGCATACACGATCACTTATTTTTAATCTTTTTTTTTTGAAACCT

QA 2 297 2 297
DS 



AS 2 6

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GGATGGGGGACACGAAGGTGGAGACAATCTCGAGATTAGCTCAATGGCGGATTGAAAATT
TTGGACCTTGCTCTTTCAAAAAGTCTGATCCTTTCAAAGCTGGAATCTGGAATTGGCATC
TGTCTATAGAGAGGAATCGTTTCCTATCTGTTAGGCTCTTCCCAGAACTCTCTCGTGTAT
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GTAAACTATACATCTCTCCTGTGTATGAGAAACTGCTGCGTACAACTGATGATTGTGTGT
GGCATGTGGATTCAAGCTTCCACGGTCGTTTCACCATTGATGTTGAGTTTCTTGATCTCA
AAATCTGCCCTTTGAATGGTGGTGAAGCTTCACCTGTTTGGCCAACGGATACAACAATGC
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TCTCCGACGTAACCATCCACACATCCGGAGGGACGCTCTCCGCTCACAAAGCCATCCTCT
CCGCCAGCTCAAACGTCTTCAGAAGCATGTTCCACCACGACCTCAAG*AGAAAGAGTCAT
CCACCATCCACATCGACGACATGTCCAGA*AGTCCTGCATGGCGCTCCTTAGCTACCTCT
ACGGAAGCATAACGCAGGAAGACTTGGAACCACAGGCTCGCGCTTCTAGGGGCCGCGAAC
AAGTACGATATCACGGATCTGAAGGCGGCATGCGAGGAGAGCCTGATGGAAGATATAAAC
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AAAGGGTGTTTGATGTATTTGTTTGATTTCGGAAAGATTTATGATGTCAGGGAGGAGATC
AGCGGTTTCTTCAGGCAGGCTGATCGTGAGCTGATGCTGGAGATGTTCCAGGAGGTTTTG
TCGGTGTGGAAACCGGTTTGAGAAATAATATTATACTTTTGAAACATTGGTTTTCAAAAT
GTTTCAGTTTGATTGTGTTCTGTGTCTATAATCATATGATATCTTGCTTTCTTGTGTTGT
GTGTCTGTAAACATTTCTCTATTGTTCTCTCTATTTACGGTGGGTTTAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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DS 

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G
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TTCAAGCTTCCACGGTCGTTTCACCATTGATGTTGAGTTTCTTGATCTCAAAATTGGCCC
TTTGAATGGTGGTGAAGCTTCACCTGTTTGGCCAACGGATACAACAATGCAATCAATCTC
AACGCAAACCACTCTCAAATGCTTATCCCGTATGCTAGAAGAAAACATCCTCTCCGACGT
AATCATCCACACATCCGGCGGGACGCTCTCCGCTCACAAGGCCATCCTCTCCGCCAGCTC
AAACGTCTTCAGAAGCATGTTCCATCACGACCTCAGG*AGAAAGAGTCCTCCACCATCCA
CATCGACGACATGTCTAGAGAATCCTGCATGGCGCTC

QA 2 698 2 698
DS 

RD RS1BG33TF 687 0 0
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GATTGAAAATTTTGGACCTTGCTCTTTCAAAAAGTCTGATCCTTTCAAAGTTGGAATCTG
GAATTGGCATCTGTCTATAGAGAGGAATCGTTTCCTATCTGTTAGGCTCTTCCCAGAACT
CTCTCGAGTATCCAAGGAACAACCTCCTATTGCTAAATTTGTTCTTCGTGTCTCCAACGT
TGGCCCTAACCGTAAACTATACATCTCTCCTGCGTACGGGAAACTGCTGCGTACGACTGA
TGATTGTGTGTGGCATGTGGATTCAAGCTTCCACGGTCGTTTCACCATTGATGTTGAGTT
TCTTGATCTCAAAATCTGCCCTTTGAATGGTGGTGAAGCTTCACCTGTTTGGCCAACGGA
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AGCCATCCTCTCCGCCAGCTCAAACGTCTTCAGAAGCATGTTCCACCACGACCTCAAG*A
GAAAGAGTCATCCACCATCCACATCGACGACATGTCCAGA*AGTCCTGCATGGCGCTCCT
TAGCTAC
TC

QA 19 685 19 685
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CGACATGTCCAGA*AGTCCTGCATGGCGCTCCTTAGCTACCTCTACGGAAGCATAACGCA
GGAAGACTTGGAACCACAGGCTCGCGCTTCTAGGGGCCGCGAACAAGTACGATATCACGG
ATCTGAAGGCGGCATGCGAGGAGAGCCTGATGGAAGATATAAACTCCGGGAACGTGCTGG
AGAGGCTGCAGGAGGCTTGGCTTTATCAGCTAGAGAAACTGAAGAAAGGGTGTTTGATGT
ATTTGTTTGATTTCGGAAAGATTTATGATGTCAGGGAGGAGATCAGCGGTTTCTTCAGGC
AGGCTGATCGTGAGCTGATGCTGGAGATGTTCCAGGAGGTTTTGTCGGTGTGGAAACCGG
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GTTCTGTGTCTATAATCATATGATATCTTGCTTTCTTGTGTTGTGTGTCTGTAAACATTT
CTCTATTGTTCTCTCTATTTACGGTGGGTTTAGCT

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DS 



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GGAGACAATCTCGAGATTAGCTCAATGGCGGATTGAAAATTTTGGACCTTGCTCTTTCAA
AAAGTCTGATCCTTTCAAAGCTGGAATCTGGAATTGGCATCTGTCTATAGAGAGGAATCG
TTTCCTATCTGTTAGGCTCTTCCCAGAACTCTCTCGTGTATCCAAGGAACAACCTCCTAT
TGCTAAATTTGTTCTTCGTGTCTCCAACGTTGGCCCTAACCGTAAACTATACATCTCTCC
CGTGTATGAGAAACTGCTGCGTACAACTGATGATTGTGTGTGGCATGTGGATTCAAGCTT
CCACGGTCGTTTCACCATTGATGTTGAGTTTCTTGATCTCAAAATCTGCCCTTTGAATGT
AAGTTTTCAGATTTTTTTTTTTTTAATTAAAAGTATTTTCGATTTGAGTGTATCTTTTAT
TTTCCCATGGTTTCGATCATTATCCACAGGGTGGTGAAGCTTCACCTGTTTGGCCAACGG
ATACAACAATGCAATCAATCTCAACGCAAACCATCCACACATCCGGCGGGACGCTCTCCG
CTCACAAGGCCATCCTCTCCGCCAGCTCAAACGTGCTGGAGAGGCTGCAGGAGGCTTGGC
TTTATCAGCTGGAGAAACTGAAGAAAGGGTGTTTGATGTATTTGTTTGATTTCGGAAAGA
TTTATGATGTCAGGGAGGAGATCAGCGGTTTCTTCAGGCAGGCTGATCGTGAGCTGATGC
TGGAGATGTTCCAGGAGGTTTTGTCGGTGTGGAAACCGGTTTGAGAAATAATATTATACT
TTTGAAACATTGGTTTTCAAAATGTTTCAGTTTGATTGTGTTCTGTGTCTATAATCATAT
GATATCTTGCTTTCTTGTGTTGTGTGTCTGTAAACATTTCTCTATTGTTCTCTCTATTTA
CGGTGGGTTTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GX72TF U 1
AF RS1GX72JQ C 445
BS 1 631 RS1GX72TF
BS 632 973 RS1GX72JQ

RD RS1GX72TF 631 0 0
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GGAGACAATCTCGAGATTAGCTCAATGGCGGATTGAAAATTTTGGACCTTGCTCTTTCAA
AAAGTCTGATCCTTTCAAAGCTGGAATCTGGAATTGGCATCTGTCTATAGAGAGGAATCG
TTTCCTATCTGTTAGGCTCTTCCCAGAACTCTCTCGTGTATCCAAGGAACAACCTCCTAT
TGCTAAATTTGTTCTTCGTGTCTCCAACGTTGGCCCTAACCGTAAACTATACATCTCTCC
CGTGTATGAGAAACTGCTGCGTACAACTGATGATTGTGTGTGGCATGTGGATTCAAGCTT
CCACGGTCGTTTCACCATTGATGTTGAGTTTCTTGATCTCAAAATCTGCCCTTTGAATGT
AAGTTTTCAGATTTTTTTTTTTTTAATTAAAAGTATTTTCGATTTGAGTGTATCTTTTAT
TTTCCCATGGTTTCGATCATTATCCACAGGGTGGTGAAGCTTCACCTGTTTGGCCAACGG
ATACAACAATGCAATCAATCTCAACGCAAACCATCCACACATCCGGCGGGACGCTCTCCG
CTCACAAGGCCATCCTCTCCGCCAGCTCAAA

QA 1 631 1 631
DS 

RD RS1GX72JQ 529 0 0
AATTAAAAGTATTTTCGATTTGAGTGTATCTTTTATTTTCCCATGGTTTCGATCATTATC
CACAGGGTGGTGAAGCTTCACCTGTTTGGCCAACGGATACAACAATGCAATCAATCTCAA
CGCAAACCATCCACACATCCGGCGGGACGCTCTCCGCTCACAAGGCCATCCTCTCCGCCA
GCTCAAACGTGCTGGAGAGGCTGCAGGAGGCTTGGCTTTATCAGCTGGAGAAACTGAAGA
AAGGGTGTTTGATGTATTTGTTTGATTTCGGAAAGATTTATGATGTCAGGGAGGAGATCA
GCGGTTTCTTCAGGCAGGCTGATCGTGAGCTGATGCTGGAGATGTTCCAGGAGGTTTTGT
CGGTGTGGAAACCGGTTTGAGAAATAATATTATACTTTTGAAACATTGGTTTTCAAAATG
TTTCAGTTTGATTGTGTTCTGTGTCTATAATCATATGATATCTTGCTTTCTTGTGTTGTG
TGTCTGTAAACATTTCTCTATTGTTCTCTCTATTTACGGTGGGTTTAGC

QA 1 529 1 529
DS 



AS 1 9

CO CL414Contig1 710 9 19 U
GGGGACTCCAAA*GCACAAGCGCCGACGCCGAGTCACAAGGAGGAGAAG***********
*CAACAATGACAGGCAAGACGGTGAAGGATGTCTCTCCACACGAGTTCGTCAAGGCTTAC
GCTGCCCATCTCAAGCGCTCCGGCAAGATTGAGTTGCCAGCGTGGACAGACATAGTGAAG
ACTGGAAAACTTAAGGAGCTTGCTCCATATGACCCTGACTGGTACTACATCAGAGCTGCA
TCCATGGCGAGGAAAGTGTACCTGAGAGGTGGACTTGGAGTCGGTGCATTCCGTAGGATC
TACGGAGGAAGCAAGAGGAACGGAAGCCGTCCACCTCATTTCTGCAAGAGCAGTGGTGGT
GTTGCTCGTCACATTCTTCAGCAGCTTCAGACCATGAACATTGTCGACCTTGACACCAAG
GGGGGAAGGAAGATCACATCAAGTGGTCAGAGAGATCTTGACCAAGTCGCTGGAAGGATC
GCAGCAGAAGCCATCTAAATCAAGAGCATCACAATTGCTCCAGAGTTTTTGTGTGTTTTG
AGTTTAGTTATATGTATTGAAATATTTTGCATTTGAAAACATTACTGGATGGAATTCCTC
TCATTTTGGTTTTGATAAGATTTTTTTTTTCCCACTTTTCTGCTTCTTTTTTTTTCTTTA
ATTCTCAGCGACTTCTGGCTTTTATGTTTGATATTATCCACTAATTTTCG


BQ
20 20 10 10 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 25 55 55 
55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 
50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 40 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RS1GI57TF U 29
AF RS1GK46JQ C 1
AF RS1GK46TF U 1
AF RS1GI57JQ C 104
AF RS1FN51JQ C 3
AF RS1FN51TF U 3
AF RS1EO61TF U 3
AF RS1F517TF U 3
AF RS1F517JQ C 131
BS 1 2 RS1GK46TF
BS 3 4 RS1EO61TF
BS 5 5 RS1GK46TF
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BS 7 12 RS1GK46TF
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BS 14 32 RS1GK46TF
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BS 34 49 RS1GK46TF
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BS 709 710 RS1F517JQ

RD RS1GI57TF 465 0 0
GGG
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TCTCTCCACACGAGTTCGTCAAGGCTTACGCTGCCCATCTCAAGCGCTCCGGCAAGATTG
AGTTGCCAGCGTGGACAGACATAGTGAAGACTGGAAAACTTAAGGAGCTTGCTCCATATG
ACCCTGACTGGTACTACATCAGAGCTGCATCCATGGCGAGGAAAGTGTACCTGAGAGGTG
GACTTGGAGTCGGTGCATTCCGTAGGATCTACGGAGGAAGCAAGAGGAACGGAAGCCTTC
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CCATGAACATTGTCGACCTTGACACCAAGGGGGGAAGGAAGATCACATCAAGTGGTCAGA
GAGATCTTGACCAAGTCGCTGGAAGGATCGCAGCAGAAGCCA

QA 4 465 4 465
DS 

RD RS1GK46JQ 633 0 0
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GCTGCCCAACTCAAGCGTTCCGGCAAGATTGAGTTGCCAGCGTGGACAGACATAGTGAAG
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TCCATGGCGAGGAAAGTGTACCTGAGAGGTGGACTTGGAGTCGGTGCATTCCGTAGGATT
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AGTTTAGTTATATGTATTGAAATATTTTGCATTTGAAAACATTACTGGATGGAATTCCTC
TCATTTTGGTTTTGATAAGATTTTTTTTTTCCC

QA 1 633 1 633
DS 

RD RS1GK46TF 636 0 0
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GCAACAATGACAGGCAAGACGGTGAAGGATGTCTCTCCACACGAGTTCGTCAAGGCTTAC
GCTGCCCAACTCAAGCGCTCCGGCAAGATTGAGTTGCCAGCGTGGACAGACATAGTGAAG
ACTGGAAAACTTAAGGAGCTTGCTCCATATGACCCTGACTGGTACTACATCAGAGCTGCA
TCCATGGCGAGGAAAGTGTACCTGAGAGGTGGACTTGGAGTCGGTGCATTCCGTAGGATC
TACGGAGGAAGCAAGAGGAACGGAAGCCGTCCACCTCATTTCTGCAAGAGCAGTGGTGGT
GTTGCTCGTCACATTCTTCAGCAGCTTCAGACCATGAACATTGTCGACCTTGACACCAAG
GGGGGAAGGAAGATCACATCAAGTGGTCAGAGAGATCTTGACCAAGTCGCTGGAAGGATC
GCAGCAGAAGCCATCTAAATCAAGAGCATCACAATTGCTCCAGAGTTTTTGTGTGTTTTG
AGTTTAGTTATATGTATTGAAATATTTTGCATTTGAAA*CATTACTGGATGGAATTCCTC
TCATTTTGGTTTTGATAAGATTTTTTTTTTCCCA
AA

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1GI57JQ 501 0 0
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GTGCATTCCGTAGGATCTACGGAGGAAGCAAGAGGAACGGAAGCCTTCCACCTCATTTCT
GCAAGAGCAGTGGTGGTGTTGCTCGTCACATTCTTCAGCAACTTCAGACCATGAACATTG
TCGACCTTGACACCAAGGGGGGAAGGAAGATCACATCAAGTGGTCAGAGAGATCTTGACC
AAGTCGCTGGAAGGATCGCAGCAGAAGCCATCTAAATCAAGAGCATCACAATTGCTCCAG
AGTTTTTGTGTGTTTTGAGTTTAGTTATATGTATTGAAATATTTTGCATTTGAAAACATT
ACTGGATGGAATTCCTCTCA
G

QA 1 500 1 500
DS 

RD RS1FN51JQ 637 0 0
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CATGGCGAGGAAAATGTACCTGAGAGGTGGACTTGGAGTCGGTGCATTCCGTAGGATCTA
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GGGAAGGAAGATCACATCAAGTGGTCAGAGAGATCTTGACCAAGTCGCTGGAAGGATCGC
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TTTAGTTATATGTATTGAAATATTTTGCATTTGAAAACATTACTGGATGGAATTCCTCTC
ATTTTGGTTTTGATAAGATTTTTTTTTTCCCA
CTTAC

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1FN51TF 637 0 0
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CATGGCGAGGAAAATGTACCTGAGAGGTGGACTTGGAGTCGGTGCATTCCGTAGGATCTA
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TGCTCGTCACATTCTTCAGCAGCTTCAGACCATGAACATTGTCGACCTTGACACCAAGGG
GGGAAGGAAGATCACATCAAGTGGTCAGAGAGATCTTGACCAAGTCGCTGGAAGGATCGC
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TTTAGTTATATGTATTGAAATATTTTGCATTTGAAAACATTACTGGATGGAATTCCTCTC
ATTTTGGTTTTGATAAGATTTTTTTTTTCCCA
CTTAC

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1EO61TF 706 0 0
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CATGGCGAGGAAAGTGTACCTGAGAGGTGGACTTGGAGTCGGTGCATTCCGTAGGATCTA
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TGCTCGTCACATTCTTCAGCAGCTTCAGACCATGAACATTGTCGACCTTGACACCAAGGG
GGGAAGGAAGATCACATCAAGTGGTCAGAGAGATCTTGACCAAGTCGCTGGAAGGATCGC
AGCAGAAGCCATCTAAATCAAGAGCATCACAATTGCTCCAGAGTTTTTGTGTGTTTTGAG
TTTAGTTATATGTATTGAAATATTTTGCATTTGAAAACATTACTGGATGGAATTCCTCTC
ATTTTGGTTTTGATAAGATTTTTTTTTTCCCACTTTTCTGCTTCTTTTTTTTTCTTTAAT
TCTCAGCGATTTCTGGCTTTTATGTTTGATATTATCCACTAATTTT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RS1F517TF 708 0 0
GGACTCCAAA*GCACAAGCGCCGACGCCGAGTCACAAGGAGGAGAAG************C
AACAATGACAGGCAAGACGGTGAAGGATGTCTCTCCACACGAGTTCGTCAAGGCTTACGC
TGCCCATCTCAAGCGCTCCGGCAAGATTGAGTTGCCAGCGTGGACAGACATAGTGAAGAC
TGGAAAACTTAAGGAGCTTGCTCCATATGACCCCGACTGGTACTACATCAGAGCTGCATC
CATGGCGAGGAAAGTGTACCTGAGAGGTGGACTTGGAGTCGGTGCATTCCGTAGGATCTA
CGGAGGAAGCAAGAGGAACGGAAGCCGTCCACCTCATTTCTGCAAGAGCAGTGGTGGTGT
TGCTCGTCACATTCTTCAGCAGCTTCAGACCATGAACATTGTCGACCTTGACACCAAGGG
GGGAAGGAAGATCACATCAAGTGGTCAGAGAGATCTTGACCAAGTCGCTGGAAGGATCGC
AGCAGAAGCCATCTAAATCAAGAGCATCACAATTGCTCCAGAGTTTTTGTGTGTTTTGAG
TTTAGTTATATGTATTGAAATATTTTGCATTTGAAAACATTACTGGATGGAATTCCTCTC
ATTTTGGTTTTGATAAGATTTTTTTTT*CCCACTTTTCTGCTTCTTTTTTTT*CTTTAAT
TCTCAGCGACTTCTGGCTTTTATGTTTGATATTATCCACTAATTTT
CG

QA 1 706 1 706
DS 

RD RS1F517JQ 580 0 0
TCAAGCGCTCCGGCAAGATTGAGTTGCCAGCGTGGACAGACATAGTGAAGACTGGAAAAC
TTAAGGAGCTTGCTCCATATGACCCCGACTGGTACTACATCAGAGCTGCATCCATGGCGA
GGAAAGTGTACCTGAGAGGTGGAATTGGAGTCGGTGCATTCCGTAGGATTTACGGAGGAA
GCAAGAGGAACGGAAGCCGTCCACCTCATTTTTGCAAGAGCAGTGGTGGTGTTGCTCGTC
ACATTTTTCAGCAGCTTCAGACCATGAACATTGTCGACCTTGACACCAAGGGGGGAAGGA
AGATCACATCAAGTGGTCAGAGAGATCTTGACCAAGTCGCTGGAAGGATCGCAGCAGAAG
CCATTTAAATCAAGAGCATCACAATTGCTCCAGAGTTTTTGTGGGTTTTGAGTTTAGTTA
TATGTATTGAAATATTTTGCATTTGAAAACATTACTGGATGGAATTCCTCTCATTTTGGT
TTTGATAAGATTTTTTTTT*CCCACTTTTTTGCTTCTTTTTTTTTCTTTAATTTTCAGCG
ACTTCTGGCTTTTATGTTTGATATTATCCACTAATTTTCG

QA 1 580 1 580
DS 



AS 1 9

CO CL415Contig1 850 9 11 U
CATGGAGAAAAGTTTCACATTTTCATAAAAAAAGATTTGCACAAATACAAACATAGAAAG
GGTAAAATACACAACAACAAGGAACAAAAGATGATCATTTCTTCTTTCCAGCTTTGCCTT
CTTTCCTCCTCACAATCTCATCTGAATACTTAACTCCCTTACCCTTGTACGGCTCCGGGG
GTCTCCACTTCCTCACCGTCGCAGCAAACTGCCCTATCTCGCTCTTGTCGTATCCACTCA
CCGTGATCCTCGTGTTCTCCTCCACTTTCACTTTCAAACTATCCGGTATCTGCATCTTAA
CCGGGTGAGAGAACCCCAGATTCAGAACCAGCTCTTTCCCTTCTACGGTAGCACGGTAAC
CGACACCCACTAGTATCAGCTTCTTCTCAAATCCCTTCGAGACTCCCACCACCATGTTAT
CCGTAAGCGTCCTGAAAAGGCCGTGCATTTGGTTAGCTCTTCTAGTTTCGACGGTTTTTT
TGACCCTCAATAAACCAGCATCTTCTTTGATGAGCTCAACTTCGCGTGGGTAAGTCAGAG
CGAGCTCTCCTAATGGACCTTTGACTTTCAAGTCCTGACCTTCCAACGCGATGGTTACAT
TGGATGGTACAGCGATCGGTTGCTTCCCTATCCTTGATTCCTTGCACTCTATTATGGTCT
TGCTGGTGAAACCCACTCGAGCAAGCGGCTTGGTTGAGACCTTGAACACGTTTCTATCGC
CCAAAAATGATGACCTGGGTTGAAAAGAAGTGACGACTGAGGAAGCCATTGCTTGCTAGG
ATTGGCGACGGAGCTGAGCTCTGCTCCAGGAGGATGGAGAGAAGAGAGTGTTTTATCCAA
AACGACTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 
30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1EL45JQ U 1
AF RS1EU63JQ U 4
AF RS1AY68JQ U 1
AF RS1FJ86TF C 93
AF RS1EU63TF C 125
AF RS1AY68TF C 162
AF RS1EL45TF C 344
AF RS1EN56TF U 323
AF RS1FM24TF U 323
BS 1 117 RS1AY68JQ
BS 118 118 RS1EL45JQ
BS 119 236 RS1AY68JQ
BS 237 237 RS1EL45JQ
BS 238 355 RS1AY68JQ
BS 356 356 RS1EL45JQ
BS 357 761 RS1AY68JQ
BS 762 762 RS1EN56TF
BS 763 782 RS1AY68JQ
BS 783 843 RS1EN56TF
BS 844 850 RS1FJ86TF

RD RS1EL45JQ 522 0 0
CATGGAG
AAAAGTTTCACATTTTCATAAAAAAAGATTTGCACAAATACAAACATAGAAAGGGTAAAA
TACACAACAACAAGGAACAAAAGATGATCATTTCTTCTTTCCAGCTTTGCCCTCTTTCCT
CCTCACAATCTCATCTGAATACTTAACTCCCTTACCCTTGTACGGCTCCGGGGGTCTCCA
CTTCCTCACCGTCGCAGCAAACTGCCCTATCTCGCTCTTGTCGTATCCACTCACCGTGAT
CCTCGTGTTCTCCTCCACTTTCACTTTCAAACTATCCGGTATCTGCATCTTAACCGGGTG
AGAGAACCCCAAATTCAAAACCAGCTCTTTCCCTTCTACGGTAGCACGGTAACCGACACC
CACTAGTATCAGCTTCTTCTCAAATCCCTTCGAGACTCCCACCACCATGTTATCCGTAAG
CGTCCTGAAAGGGCCGTGCATTTGGTTAGCTCTTCTAGTTTCGACGGTTTTTTTGACCCT
CAATAAACCAGCATCTTCTTTGATGAGCTCAACTT

QA 8 522 8 522
DS 

RD RS1EU63JQ 532 0 0
GGAA
AAAAGTTTCACATTTTCATAAAAAAAGATTTGCACAAATACAAACATAGAAAGGGTAAAA
TACACAACAACAAGGAACAAAAGATGATCATTTCTTCTTTCCAGCTTTGCCTTCTTTCCT
CCTCACAATCTCATCTGAATACTTAACTCCCTTACCCTTGTACGGCTCCGGGGGTCTCCA
CTTCCTCACCGTCGCAGCAAACTGCCCTATCTCGCTCTTGTCGTATCCACTCACCGTGAT
CCTCGTGGTCTCCTCCACTTTCACTTTCAAACTATCCGGTATCTGCATCTTAACCGGGTG
AGAAAACCCCAAATTCAAAACCAGCTCTTTCCCTTCTACGGTAGCACGGTAACCGACACC
CACTAGTATCAGCTTCTTCTCAAATCCCTTCGAGACTCCCACCACCATGTTATCCGTAAG
CGTCCTGAAAAGGCCGTGCATTTGGTTAGCTCTTCTAGTTTCGACGGTTTTTT*GACCCT
CAATAAACCAGCATCTTCTTTGATGAGCTCAACTTCGCGTGGGTAAGT

QA 5 532 5 532
DS 

RD RS1AY68JQ 784 0 0
CATGGAGAAAAGTTTCACATTTTCATAAAAAAAGATTTGCACAAATACAAACATAGAAAG
GGTAAAATACACAACAACAAGGAACAAAAGATGATCATTTCTTCTTTCCAGCTTTGCTTT
CTTTCCTCCTCACAATCTCATCTGAATACTTAACTCCCTTACCCTTGTACGGCTCCGGGG
GTCTCCACTTCCTCACCGTCGCAGCAAACTGCCCTATCTCGCTCTTGTCGTATCCAATCA
CCGTGATCCTCGTGTTCTCCTCCACTTTCACTTTCAAACTATCCGGTATCTGCATCTTAA
CCGGGTGAGAGAACCCCAGATTCAGAACCAGCTCTTTCCCTTCTACGGTAGCACGATAAC
CGACACCCACTAGTATCAGCTTCTTCTCAAATCCCTTCGAGACTCCCACCACCATGTTAT
CCGTAAGCGTCCTGAAAAGGCCGTGCATTTGGTTAGCTCTTCTAGTTTCGACGGTTTTTT
TGACCCTCAATAAACCAGCATCTTCTTTGATGAGCTCAACTTCGCGTGGGTAAGTCAGAG
CGAGCTCTCCTAATGGACCTTTGACTTTCAAGTCCTGACCTTCCAACGCGATGGTTACAT
TGGATGGTACAGCGATCGGTTGCTTCCCTATCCTTGATTCCTTGCACTCTATTATGGTCT
TGCTGGTGAAACCCACTCGAGCAAGCGGCTTGGTTGAGACCTTGAACACGTTTCTATCGC
CCAAAAATGATGACCTGGGTTGAAAAGAAGTGACGACTGAG*AAGCCATTGCTTGCTAGG
AT
GG

QA 1 782 1 782
DS 

RD RS1FJ86TF 758 0 0
GATCATTTCTTCTTTCCAGCTTTGCCTTCTTTCCTCCTCACAATCTCATCTGAATACTTA
ACTCCCTTACCCTTGTACGGCTCCGGGGGTCTCCACTTCCTCACCGTCGCAGCAAACTGC
CCTATCTCGCTCTTGTCGTATCCACTCACCGTGATCCTCGTGTTCTCCTCCACTTTCACT
TTCAAACTATCCGGTATCTGCATCTTAACCGGGTGAGAGAACCCCAGATTCAGAACCAGC
TCTTTCCCTTCTACGGTAGCACGGTAACCGACACCCACTAGTATCAGCTTCTTCTCAAAT
CCCTTCGAGACTCCCACCACCATGTTATCCGTAAGCGTCCTGAAAAGGCCGTGCATTTGG
TTAGCTCTTCTAGTTTCGACGGTTTTTTTGACCCTCAATAAACCAGCATCTTCTTTGATG
AGCTCAACTTCGCGTGGGTAAGTCAGAGCGAGCTCTCCTAATGGACCTTTGACTTTCAAG
TCCTGACCTTCCAACGCGATGGTTACATTGGATGGTACAGCGATCGGTTGCTTCCCTATC
CTTGATTCCTTGCACTCTATTATGGTCTTGCTGGTGAAACCCGCTCGAGCAAGCGGCTTG
GTTGAGACCTTGAACACGTTTCTATCGCCCAAAAATGATGACCTGGGTTGAAAAGAAGTG
ACGACTGAGGAAGCCATTGCTTGCTAGGATTGGCGACGGAGCTGAGCTCTGCTCTAGGAG
GATGGGGAGAAGAGAGTGTTTTATCCAAAACGACTTCC

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1EU63TF 726 0 0
CCTCCTCACAATCTCATCTGAATACTTAACTCC*TTACCCTTGTACGGCTCCGGGGGTCT
CCACTTCCTCACCGTCGCAGCAAACTGCCCTATCTCGCTCTTGTCGTATCCACTCACCGT
GATCCTCGTGGTCTCCTCCACTTTCACTTTCAAACTATCCGGTATCTGCATCTTAACCGG
GTGAGAGAACCCCAGATTCAGAACCAGCTCTTTCCCTTCTACGGTAGCACGGTAACCGAC
ACCCACTAGTATCAGCTTCTTCTCAAATCCCTTCGAGACTCCCACCACCATGTTATCCGT
AAGCGTCCTGAAAAGGCCGTGCATTTGGTTAGCTCTTCTAGTTTCGACGGTTTTTT*GAC
CCTCAATAAACCAGCATCTTCTTTGATGAGCTCAACTTCGCGTGGGTAAGTCAGAGCGAG
CTCTCCTAATGGACCTTTGACTTTCAAGTCCTGACCTTCCAACGCGATGGTTACATTGGA
TGGTACAGCGATCGGTTGCTTCCCTATCCTTGATTCCTTGCACTCTATTATGGTCTTGCT
GGTGAAACCCACTCGAGCAAGCGGCTTGGTTGAGACCTTGAACACGTTTCTATCGCCCAA
AAATGATGACCTGGGTTGAAAAGAAGTGACGACTGAGGAAGCCATTGCTTGCTAGGATTG
GCGACGGAGCTGAGCTCTGCTCCAGGAGGATGGAGAGAAGAGAGTGTTTTATCCAAAACG
ACTTCC

QA 1 726 1 726
DS 

RD RS1AY68TF 689 0 0
CCCTTGTACGGCTCCGGGGGTCTCCACTTCCTCACCGTCGCAGCAAACTGCCCTATCTCG
CTCTTGTCGTATCCAATCACCGTGATCCTCGTGTTCTCCTCCACTTTCACTTTCAAACTA
TCCGGTATCTGCATCTTAACCGGGTGAGAGAACCCCAGATTCAGAACCAGCTCTTTCCCT
TCTACGGTAGCACGATAACCGACACCCACTAGTATCAGCTTCTTCTCAAATCCCTTCGAG
ACTCCCACCACCATGTTATCCGTAAGCGTCCTGAAAAGGCCGTGCATTTGGTTAGCTCTT
CTAGTTTCGACGGTTTTTTTGACCCTCAATAAACCAGCATCTTCTTTGATGAGCTCAACT
TCGCGTGGGTAAGTCAGAGCGAGCTCTCCTAATGGACCTTTGACTTTCAAGTCCTGACCT
TCCAACGCGATGGTTACATTGGATGGTACAGCGATCGGTTGCTTCCCTATCCTTGATTCC
TTGCACTCTATTATGGTCTTGCTGGTGAAACCCACTCGAGCAAGCGGCTTGGTTGAGACC
TTGAACACGTTTCTATCGCCCAAAAATGATGACCTGGGTTGAAAAGAAGTGACGACTGAG
GAAGCCATTGCTTGCTAGGATTGGCGACGGAGCTGAGCTCTACTCCAGGAGGATGGAGAG
AAGAGAGTGTTTTATCCAAAACGACTTCC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1EL45TF 507 0 0
TACGGTAGCACGGTAACCGACACCCACTAGTATCAGCTTCTTCTCAAATCCCTTCGAGAC
TCCCACCACCATGTTATCCGTAAGCGTCCTGAAAGGGCCGTGCATTTGGTTAGCTCTTCT
AGTTTCGACGGTTTTTTTGACCCTCAATAAACCAGCATCTTCTTTGATGAGCTCAACTTC
GCGTGGGTAAGTCAGAGCGAGCTCTCCTAATGGACCTTTGACTTTCAAGTCCTGACCTTC
CAACGCGATGGTTACATTGGATGGTACAGCGATCGGTTGCTTCCCTATCCTTGATTCCTT
GCACTCTATTATGGTCTTGCTGGTGAAACCCACTCGAGCAAGCGGCTTGGTTGAGACCTT
GAACACGTTTCTATCGCCCAAAAATGATGACCTGGGTTGAAAAGAAGTGACGACTGAGGA
AGCCATTGCTTGCTAGGATTGGCGACGGAGCTGAGCTCTGCTCCAGGAGGATGGAGAGAA
GAGAGTGTTTTATCCAAAACGACTTCC

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DS 

RD RS1EN56TF 523 0 0
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CTTCTCAAATCCCTTCGAGACTCCCACCACCATGTTATCCGTAAGCGTCCTGAAAAGACC
GTGCATTTGGTTAGCTCTTCTAGTTTCGACGGTTTTTTTGACCCTCAATAAACCAGCATC
TTCTTTGATGAGCTCAACTTCGCGTGGGTAAGTCAGAGCGAGCTCTCCTAATGGACCTTT
GACTTTCAAGTCCTGACCTTCCAACGCGATGGTTACATTGGATGGTACAGCGATCGGTTG
CTTCCCCATCCTTGATTCCTTGCACTCTATTATGGTCTTGCTGGTGAAACCCACTCGAGC
AAGCGGCTTGGTTGAGACCTTGAACACGTTTCTATCGCCCAAAAATGATGACCTGGGTTG
AAAAGAAGTGACGACTGAGGAAGCCATTGCTTGCTAGGATTGGCGACGGAGCTGAGCTCT
GCTCCAGGAGGATGGAGAGAAGAGAGTGTTTTATCCAAAAC
CC

QA 1 521 1 521
DS 

RD RS1FM24TF 523 0 0
CAGAACCAGCTCTTTCCCTTCTACGGTAGCACGGTAACCGACACCCACTAGTATCAGCTT
CTTCTCAAATCCCTTCGAGACTCCCACCACCATGTTATCCGTAAGCGTCCTGAAAAGACC
GTGCATTTGGTTAGCTCTTCTAGTTTCGACGGTTTTTTTGACCCTCAATAAACCAGCATC
TTCTTTGATGAGCTCAACTTCGCGTGGGTAAGTCAGAGCGAGCTCTCCTAATGGACCTTT
GACTTTCAAGTCCTGACCTTCCAACGCGATGGTTACATTGGATGGTACAGCGATCGGTTG
CTTCCCCATCCTTGATTCCTTGCACTCTATTATGGTCTTGCTGGTGAAACCCACTCGAGC
AAGCGGCTTGGTTGAGACCTTGAACACGTTTCTATCGCCCAAAAATGATGACCTGGGTTG
AAAAGAAGTGACGACTGAGGAAGCCATTGCTTGCTAGGATTGGCGACGGAGCTGAGCTCT
GCTCCAGGAGGATGGAGAGAAGAGAGTGTTTTATCCAAAAC
CC

QA 1 521 1 521
DS 



AS 2 9

CO CL416Contig1 775 4 6 U
GGAGACAGAGAGAGGAAAATAATGGAGGAGGAGAAGAAGAAAGAGGGATCGTCGTATAGG
TACTGGGTGAGAGAAGCCACAGCGGACGCAGCTCCTCCTCCTCAGCCACAGAAGCTCACC
AACAACAACAACGACGTCGCTTCCAATGCTCCTCCTGCCCTCGGCTCCCTCTGGAATCAG
GCTGGCACTTGGGAGGAAAAAAATCTCACTAAATGGGCCACTGATCGATTAAAGGAGCTG
CTGGTGTCAGTGGGTTCACTTCAATTCTCTTCTGGAAAAGCTGAGATTACAGATGTTAGC
AGATGTGTTGGAGATGCTTTCTTGGTCACTGTTCGGAACAAAAAAAGAGTTGGCTATACT
TACGAGCTTTCCCTCAAAGTCCAAGGAGAGTGGTCTGTTGACGAGGACGCCAAAAAGGTG
AAGGGGAGTCTCGACATTCCTGAGTTCTCATTCGGCGAGCTTGATGATCTTGAGGTGAAT
GTGAAGCTCAGTGAAGACAAAGAGCTTTCCCAGCAGCTGAAGCAGCAAGCTCGGTTGGAT
ATGAAGCAGTTCTTGGAGCCTATACGCCAGAAACTTGATCAGTTCGAGCAGGAACTCAAA
GATCGATAATTATTGTTTCTTTTCATTTCATGTCAGCAATTTTCTGTTAGCATCGAGAAC
TCTGTTAAAACATAACACTCCCATCTTACAGCTTTTCTTGTATCCATGCTTCATCTGTTC
ACCAACATTTCCACATTTATTGTCTAAGTTCAGTTCATCAATAAGCCTTTTAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1BA70TF U 1
AF RS1CQ14JQ C 139
AF RS1CQ14TF U 9
AF RS1BA70JQ C 268
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BS 291 577 RS1BA70TF
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C

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DS 

RD RS1CQ14JQ 618 0 0
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TTCTTGGTCACTGTTCGGAACAAAAAAAGAGTTGGCTATACTTACGAGCTTTCCCTCAAA
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CTTTTCATTTCATGTCAGCAATTTTCTGTTAGCATCGAGAACTCTGTTAAAACATAACAC
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ATTGTCTGAGTTCAGT
CC

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GATGCTTTCTTGGTCACTGTTCGGAACAAAAAAAGAGTTGGCTATACTTACGAGCTTTCC
CTCAAAGTCCAAGGAGAGTGGTCT*TTGACGAGGACGCCAAAAAGGTGAAGGGGAGTCTC
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GAAGACAAAGAGCTTTCCCAGCAGCTGAAGCAGCAAGCTCGGTTGGATATGAAGCAGTTC
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TTGTTTCTTTTCATTTCATGTCAGCAATTTTCTGTTAGCATCGAGAACTCTGTTAAAACA
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DS 

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TCCCAGCAGCTGAAGCAGCAAGCTCGGTTGGATATGAAGCAGTTCTTGGAGCCTATACGC
CAGAAACTTGGTCAGTTCGAGCAGGAACTCAAAGATCGATAATTATTGTTTCTTTTCATT
TCATGTCAGCAATTTTCTGTTAGCATCGAGAACTCTGTTAAAACATAACACTCCCATCTT
ACAGCTTTTCTGGTATCCATGCTTCATCTGTTCACCAACATTTCCACATTTATTGTTTAA
GTTCAGTTCATCAATAAGCCTTTTAGGC

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CTACCAACATTTCCACATTTATTGTCTAAGTTCAGTTCATGTTCAGC


BQ
10 10 10 10 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C636TF U 1
AF RS1DI05JQ C 1
AF RS1DI05TF U 1
AF RS1DC53JQ C 6
AF RS1DC53TF U 6
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QA 1 679 1 679
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QA 5 737 5 737
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G
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DS 

RD RS1DC53TF 762 0 0
G
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GTTGGAGATGCTTTCTTGGTCACTGTTCGGAACAAGAAAAGAGTAGGCTATACTTACGAG
CTTTCCCTCAAAGTCCAAGGAGAGTGGTCTGTTGACGAGGACGCCAAAAAGGTGAAGGGG
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CAGTTCTTGGAGCCTATACGCCTTAAACTTGCTCAGTTCGAGCAGGAACTCAAAGATCGA
TAGTTATTGTTTCTTTTCATTTGATATCAGCAATTTTCTGTTAGCATCGAGAACTTTGTT
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ACATTTCCACATTTATTGTCTAAGTTCAGTTCAT
GTTCAGC

QA 2 755 2 755
DS 



AS 2 8

CO CL417Contig1 502 3 20 U
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AAAGTGATGAAAAACATTTTCTTAGCCGGAGAGGCACCACCAGAAAAAAAATGCAGAAGA
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CAAGGAGACAACAACAA******AAAGTTATGGGTCTTATAACTT*ATGGTAATGGCAAA
AACCGGCAAGTCATATATCGGCATCAGGCTCGTGTGTTTCGAGTTGTATTTGGTTGTAAT
ATAGATCTTTTGAGTTGTTTAAGATTTAATCTCTACCGTATGTAATCTCATCTTTGATAC
TTTTGTACCAGTAAAAAA**ATATTGTAATATTGATCGTCTTGTGTGTGTTTGTGTGTTT
CTTTCCTGTTTTTTTTTCTGGAATAAAAAGTGGACAATGTTTGGCTGCTCTTGAGTCTTT
ATATTATGTCCATAAGAAATCT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FF13TF U 1
AF RS1CZ55JQ C 21
AF RS1CZ55TF U 21
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RD RS1CZ55TF 482 0 0
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QA 6 482 6 482
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BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1BU95TF U 3
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AF RS1FY32JQ C 1
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GG
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C

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DS 



AS 1 7

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 15 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 35 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CZ18TF U 1
AF RS1AR49TFB U 7
AF RS1EW94TF U 23
AF RS1DR68TF U 7
AF RS1CC17TF U 7
AF RS1DR68JQ C 206
AF RS1CC17JQ C 208
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BS 641 644 RS1CC17TF
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BS 646 721 RS1CC17TF
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BS 779 785 RS1CC17TF
BS 786 788 RS1DR68JQ
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BS 791 792 RS1DR68JQ
BS 793 806 RS1CC17TF
BS 807 924 RS1DR68JQ
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CATCCAGATCCGCCGCTCCCAGTCAGCTGTTGCGCCATCGTTTCCTCTCAACGCGAGGAT
TCTTCGCTGTTTCTTCATTTCCTTCGAATCGAACTCCTCACGATTCTCGGTATCCTCGAG
CGATGGATATTGGACAAGTGCGCAGCTTTAGTGAAGATGTTTCCCACATGCCTGAAATCA
AAGACAGTGATGTTCTTAAATCTTTCAGAGATTTGATGGCGGCAGATTGGGCAGCGCTAC
CTTCTGCTGTTGTTAATGACGCCAAAAACGCAGTCTCGAAAAACACGGATGACAAGGAAG
GGCAAGAGGCCTTGATGAATGTGTTCAGAGCAGCTGAGGCTGTTGAGGAATTTGGTGGGA
TTCTCACTTCCTTAAAGATGGAGATCGATGATAGCATTGGAATGAGTGGGGAGAATGTGA
AGACATTACCTGAAGATATAACCAAAGCGCTGCGTCTTGCTTATCAAAGGTATACTACCT
ACCTAGATGCTTTTGGACCTGAAGAAGTTTACTTGAAGAA

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DS 

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GG
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CTGAGATCCCTCTGCCGTACCGCTGCGGCGGCCTCCGTCGCTACGCTCCGATCATCCAGA
TCCGCCGCTCCCAGTCAGCTGTTGCGCCATCGTTTCCTCTCAACGCGAGGATTCTTCGCT
GTTTCTTCGTTTCCTTCTAATCGAACTCCTCACGATTCTCGGTATCCTCGAGCAATGGAT
ATTGGACAAGTGCGCAGCTTTAACGAAGATGTGTCTCACATGCCTGAAATCAAAGACAGT
GATGTTCTGAAATCTTTCAGAGATTTGATGGCGGCAGATTGGGCAGCGCTACCTTCTGCT
GTTGTTAACGACGCCAAAAACGCAGTCTCGAAAAACACAGATGACAAGGAAGGGCAAGAG
GCTTTGATGAATGTGTTCAGAGCAGCTGAGGCTGTTGAGGAATTTGGTGGGATTCTCACT
TCCTTAAAGATGGAGATCGATGATAGCATTGGAATGAGTGGGGAGAATGTGAAGACCTTA
CCAGAAGATATAACCAAGGCGCTGCGTCTTGCTTATCAAAGGTATACTACCTACCTAGAT
GCTTTTGGACCTGAAGAAGTTTACTTGAAGA

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DS 

RD RS1EW94TF 619 0 0
GG
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GTACCGCTGCGGCGGCCTCCGTCGCTACGCTCCGATCATCCAGATCCGCCGCTCCCAGTC
AGCTGTTGCGCCATCGTTTCCTCTCAACGCGAGGATTCTTCGCTGTTTCTTCGTTTCCTT
CTAATCGAACTCCTCACGATTCTCGGTATCCTCGAGCAATGGATATTGGACAAGTGCGCA
GCTTTAGCGAAGATGTGTCTCACATGCCTGAAATCAAAGACAGTGATGTTCTGAAATCTT
TCAGAGATTTGATGGCGGCAGATTGGGCAGCGCTACCTTCTGCTGTTGTTAACGACGCCA
AAAACGCAGTCTCGAAAAACACAGATGACAAGGAAGGGCAAGAGGCTTTGATGAATGTGT
TCAGAGCAGCTGAGGCTGTTGAGGAATTTGGTGGGATTCTCACTTCCTTAAAGATGGAGA
TCGATGATAGCATTGGAATGAGTGGGGAGAATGTGAAGACCTTACCAGAAGATATAACCA
AGGCGCTGCGTCTTGCTTATCAAAGGTATACTACCTACCTAGATGCTTTTGGACCTGAAG
AAGTTTACTTGAAGAAG

QA 3 619 3 619
DS 

RD RS1DR68TF 698 0 0
GG
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CTGAGATCCCTCTGCCGTACCGCTGCGGCGGCCTCCGTCGCTACGCTCCGATCATCCAGA
TCCGCCGCTCCCAGTCAGCTGTTGCGCCATCGTTTCCTCTCAACGCGAGGATTCTTCGCT
GTTTCTTCATTTCCTTCGAATCGAACTCCTCACGATTCTCGGTATCCTCGAGCGATTGAT
ATTGGACAAGTGCGCAGCTTTAGTGAAGATGTTTCCCACATGCCTGAAATCAAAGACAGT
GATGTTCTGAAATCTTTCAGAGATTTGATGGCGGCAGATTGGGCAGCGCTACCTTCTGCT
GTTGTTAATGACGCCAAAAACGCAGTCTCGAAAAACACGGATGACAAGGAAGGGCAAGAG
GCCTTGATGAATGTGTTCAGAGCAGCTGAGGCTGTTGAGGAATTTGGTGGGATTCTCACT
TCCTTAAAGATGGAGATCGATGATAGCATTGGAATGAGTGGGGAGAATGTGAAGACATTA
CCTGAAGATATAACCAAAGCGCTGCGTCTTGCTTATCAAAG*TATACTACCTACCTAGAT
GCTTTTGGACCTGAAGAAGTTTACTTGAAGAAGAAG*TTGAGATGGAGTTGGGAACAAAG
ATGATCCACTTGA*GATGAGATGCAGCGGGCT
GGTC

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DS 

RD RS1CC17TF 819 0 0
GG
GAGAGAGAGCTTTCGCATTACAGCAGATTTGAGAAGAGCGAAAAATCTAAGATGGCATTT
CTGAGATCCCTCTGCCGTACCGCTGCGGCGGCCTCCGTCGCTACGCTCCGATCATCCAGA
TCCGCCGCTCCCAGTCAGCTGTTGCGCCATCGTTTCCTCTCAACGCGAGGATTCTTCGCT
GTTTCTTCATTTCCTTCGAATCGAACTCCTCACGATTCTCGGTATCCTCGAGCGATGGAT
ATTGGATAAGTGCGCAGCTTTAGTGAAGATGTTTCCCACATGCCTGAAATCAAAGACAGT
GATGTTCTGAAATCTTTCAGAGATTTGATGGCGGCAGATTGGGCAGCGCTACCTTCTGCT
GTTGTTAATGACGCCAAAAACACAGTCTCGAAAAACACGGATGACAAGGAAGGGCAAGAG
GCCTTGATGAATGTGTTCAGAGCAGCTGAGGCTGTTGAGGAATTTGGTGGGATTCTCACT
TCCTTAAAGATGGAGATCGATGATAGCATTGGAATGAGTGGGGAGAATGTGAAGACATTA
CCTGAAGATATAACCAAAGCGCTGCGTCTTGCTTATCAAAGGTATACTACCTACCTAGAT
GCTTTTGGACCAGAAGAAGTTTACTTGAAGAAGAAG*TTGAGATGGAGTTGGGAACAAAG
ATGATCCACTTGAAGATGAGATGCAGCGGGCTTGGTTCAGAATGGGGAAAGGT*ACCGTT
CTTGGA*CCTCAG*ACTCTCGGGGTCTTACGTGGAGCAAAGG*CATAAA*CAAATTT***
ATTGTTTTTTTTCTGCGT
ATGTGTCTTGAGACAAAAA

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DS 

RD RS1DR68JQ 719 0 0
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CTTTAGTGAAGATGTTTCCCACATGCCTGAAATCAAAGACAGTGATGTTCTGAAATCTTT
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AAACGCAGTCTCGAAAAACACGGATGACAAGGAAGGGCAAGAGGCCTTGATGAATGTGTT
CAGAGCAGCTGAGGCTGTTGAGGAATTTGGTGGGATTCTCACTTCCTTAAAGATGGAGAT
CGATGATAGCATTGGAATGAGTGGGGAGAATGTGAAGACATTACCTGAAGATATAACCAA
AGCGCTGCGTCTTGCTTATCAAAGGTATACTACCTACCTAGATGCTTTTGGACCTGAAGA
AGTTTACTTGAAGAAGAAGGTTGAGATGGAGTTGGGAACAAAGATGATCCACTTGAAGAT
GAGATGCAGCGGGCTTGGTTCAGAATGGGGAAAGGTTACCGTTCTTGGAACCTCAGGACT
CTCGGGGTCTTACGTGGAGCAAAGGGCATAAAACAAATTTTATATGTTTTTTTTTCTGCG
TTATTGTGTCCTTGAGACAATAAAGGTCAATAACTGACCAAAGACCTATCTAAGGTGAGT
TTGTTGTTTCCTCCAAAACAAAGCTTTTGAAAGTTAGAGCTTAAAAACAGCACCAATTG

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DS 

RD RS1CC17JQ 744 0 0
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TTAGTGAAGATGTTTCCCACATGCCTGAAATCAAAGACAGTGATGTTCTGAAATCTTTCA
GAGATTTGATGGCGGCAGATTGGGCAGCGCTACCTTCTGCTGTTGTTAATGACGCCAAAA
ACACAGTCTCGAAAAACACGGATGACAAGGAAGGGCAAGAGGCCTTGATGAATGTGTTCA
GAGCAGCTGAGGCTGTTGAGGAATTTGGTGGGATTCTCACTTCCTTAAAGATGGAGATCG
ATGATAGCATTGGAATGAGTGGGGAGAATGTGAAGACATTACCTGAAGATATAACCAAAG
CGCTGCGTCTTGCTTATCAAAGGTATACTACCTACCTAGATGCTTTTGGACCAGAAGAAG
TTTACTTGAAGAAGAAGGTTGAGATGGAGTTGGGAACAAAGATGATCCACTTGAAGATGA
GATGCAGCGGGCTTGGTTCAGAATGGGGAAAGGTTACCGTTCTTGGAACCTCAGGACTCT
CGGGGTCTTACGTGGAGCAAAGGGCATAAAACAAATTTTATATGTTTTTTTTTTTGCGTT
ATTGTGTCCTTGAGACAATAAAGGTCAATAACTGACCAAAGACCTATCTAAGGTGAGTTT
GTTGTTTCCTCCAAAACAAAGCTTTTGAAAGTTAGAGCTTAAAAACAGCACCAATTGAAA
AATAAATTCACAGCTCCGACAACT

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 9

CO CL419Contig1 1055 9 13 U
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CAATAGTTACATATAACAATATGAAGAAGTCTCACGTTTTGCTTCT***GCTTGTTCAAG
TCATTGTCCTTTTGCCTCTCCTTTGTTTATCTGATGGCTTTGTTAGCTCCAGAGCTACTT
ACTATGGCAGCCCCGATTGCAAAGGAAATCCTCGGGGAGCATGTGGATATGGAGAATTTG
GAAGAGATATCAATGATGGTGAAGTAAGTGGTGTTTCATCGCGACTATGGAAAAGTGGAG
CTGGCTGTGGTGCTTGTTACCAGGTGAGATGCAAAATACCTCCACACTGCAATGAGGAAG
GAGTATACGTAGTGGCTACGGACTATGGGGAAGGAGATGGTACGGACTTCATTTTTAGCC
CTAAGGCATACGGACGTATGGCGCGACCCGGCACAGAGTTTCAGCTCTATTCTTTTGGTG
TGGTCGACGTTGAGTACCAAAGGGTCCCTTGCCGGTACGGAGGGTCCAACTTGGTGTATA
AGATCCATGAGAAAAGCTATAATCCTCATTATCTTGCCGTCCTTATCTTGTACGTTGGTG
GTGTCAACGACATCCTCGCCGTTGAAGTCTGGCAGGAGGATTGCAAAGAGTGGAAACGCA
TGAGAAGAGTGTTTGGAGCGGTTCATGATTATCAGAATCCACCTAGAGGCTCTCTCTCTT
TGAGGTTTTTAGTCTATGGAAGCGCCGGTCTCAACTGGGTCGAATCTCAGAACGCTCTTC
CTGCGGACTGGACCGCCGGAGCCACCTACAGCTCCAGCATTCTGCTTACTTGATTTCCTT
*AACTTTCCTTCTATTTATCGATAGTGTGTTTATATAAATTACATATGGTTTTCTCTATG
TAATGGCTATATGCAAATTTAAATAATGCTCTCTAAAAAGGATAATCATTGTAGATTCAT
ACAACTTTGTAATGTGTCTAGTTAAGAAGATTGTAAGGAGTTGTAAGGTTTTGGTTGGTG
GAAATCAAATAATGATAAAAGTTAATTAAAAGTTT


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 15 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 35 35 35 
35 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1EY60TF U 3
AF RS1DS73TF U 2
AF RS1C609TF U 1
AF RS1GZ87TF U 4
AF RS1F931TF U 4
AF RS1F931JQ C 210
AF RS1GZ87JQ C 501
AF RS1C609JQ C 245
AF RS1DS73JQ C 296
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BS 558 558 RS1EY60TF
BS 559 720 RS1C609TF
BS 721 724 RS1F931TF
BS 725 726 RS1F931JQ
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BS 754 754 RS1F931JQ
BS 755 763 RS1F931TF
BS 764 764 RS1F931JQ
BS 765 780 RS1F931TF
BS 781 1055 RS1F931JQ

RD RS1EY60TF 592 0 0
GGG
ACATATCTTTTATAACACTGATCTATTTTCCCAAACCAATTTTATAACAGTCTTGCAATA
GTTACATATAACAATATGAAGAAGTCTCGCGTTTTGCTTCTTCTGCTTGTTCAAGTCATT
GTCCTTTTGCCTCTCCTTTGTTTATCTGATGGCTTTGTTAGCTCCAGAGCTACTTACTAT
GGCAGCCCCGATTGCAAAGGAAATCCTCGGGGAGCATGTGGATATGGAGAATTTGGAAGA
GATATCAATGATGGTGAAG*AAGTGGTGTTTCATCGCGACTATGGAAAAGTGGAGCTGGC
TGTGGTGCTTGTTACCAGGTGAGATGCAAAATGCCTCCACACTGCAATGAGGAAGGAGTA
TACGTAGTGGCTACGGACTATGGGGAAGGAGATGGTACGGACTTCATTTTTAGCCCTAAG
GCATACGGACGTATGGCGCGACCCGGCACAGAGTTTCAGCTCTATTCTTTTGGTGTGGTC
GACGTTGAGTACCAAAGGGTCCCTTGCCGGTACGGAGGGTACAACTTGGTGTATAAGATC
CATGAGAAAAGCTATAACCCTCATTATCTTGCCGTCCTTATCTTGTACG

QA 4 592 4 592
DS 

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GGAC
ACATATCTTTTATAACACTGATCTATTTTCCCAAACCAATTTTAAAACAGTCTTGCAATA
GTTACATATAACAATATGAAGAAGTCTCACGTTTTGCTTCCTCTGCTTGTTCAAGTCATT
GTCCTTTTTCCTCTCCTTTGTTTATCTGATGGCTTTGTTAGCTCCAGAGCTACTTACTAT
GGCAGCCCCGATTGCAAAGGAAATCCTCGGGGAGCATGTGGGTATGGAGAATTTGGAAGA
GATATCAATGATGGTGAAGTAAGTGGTGTTTCATCGCGACTATGGAAAAGTGGAGCTGGC
TGTGGTGCTTGTTACCAGGTGAGATGCAAAATACCTCCACACTGCAATGAGGAAGGAGTA
TACGTAGTGGCTACGGACTATGGGGAAGGAGATGGTACGGACTTCATTTTTAGCCCTAAG
GCATACGGACGTATGGCGCGACCCGGCACAGAGTTTCAGCTCTATTCATTTGGTGTGGTC
GACGTTGAGTACCAAAGGGTCCCTTGCCGCTACGGAGGGTACAACCTGGTGTATAAGATC
CATGAGAAAAGCTATAATCCTCATTATCTTGCCGTCCTTATCTTGTACGTTGGTGGTGT

QA 5 603 5 603
DS 

RD RS1C609TF 720 0 0
GGATCACATATCTTTTATAACACTGATCTATTTTCCCAAACCAATTTTAAAACAGTCTTG
CAATAGTTACATATAACAATATGAAGAAGTCTCACGTTTTGCTTCT***GCTTGTTCAAG
TCATTGTCCTTTTGCCTCTCCTTTGTTTATCTGATGGCTTTGTTAGCTCCAGAGCTACTT
ACTATGGCAGCCCCGATTGCAAAGGAAATCCTCGGGGAGCATGTGGATATGGAGAATTTG
GAAGAGATATCAATGATGGTGAAGTAAGTGGTGTTTCATCGCGACTATGGAAAAGTGGAG
CTGGCTGTGGTGCTTGTTACCAGGTGAGATGCAAAATACCTCCACACTGCAATGAGGAAG
GAGTATACGTAGTGGCTACGGACTATGGGGAAGGAGATGGTACGGACTTCATTTTTAGCC
CTAAGGCATACGGACGTATGGCGCGACCCGGCACAGAGTTTCAGCTCTATTCTTTTGGTG
TGGTCGACGTTGAGTACCAAAGGGTCCCTTGCCGGTACGGAGGGTCCAACTTGGTGTATA
AGATCCATGAGAAAAGCAATAATCCTCATTATCTTGCCGTCCTTATCTTGTACGTTGGTG
GTGTCAACGACATCCTCGCCGTTGAAGTCTGGCAGGAGGATTGCAAAGAGTGGAAACGCA
TGAGAAGAGTGTTTGGAGCGGTTCATGATTATCAGAATCCACCTAGAGGCTCTCTCTCTT

QA 1 720 1 720
DS 

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GG
ACATATCTTTTATAACACTGATCTATTTTCCCAAACCAATTTTAAAACAGTCTTGCAATA
GTTACATATAACAATATGAAGAAGTCTCACGTTTTGCTTCT***GCTTGTTCAAGTCATT
GTCCTTTTGCCTCTCCTTTGTTTATCTGATGGCTTTGTTAGCTCCAGAGCTACTTACTAT
GGCAGCCCCGATTGCAAAGGAAATCCTCGGGGAGCATGTGGATATGGAGAATTTGGAAGA
GATATCAATGATGGTGAAGTAAGTGGTGTTTCATCGCGACTATGGAAAAGTGGAGCTGGC
TGTGGTGCTTGTTACCAGGTGAGATGCAAAATACCTCCACACTGCAATGAGGAAGGAGTA
TACGTAGTGGCTACGGACTATGGGGAAGGAGATGGTACGGACTTCATTTTTAGCCCTAAG
GCATACGGACGTATGGCGCGACCCGGCACAGAGTTTCAGCTCTATTCTTTTGGTGTGGTC
GACGTTGAGTACCAAAGGGTCCCTTGCCGGTACGGAGGGTCCAACTTGGTGTATAAGATC
CATGAGAAAAGCTATAATCCTCATTATCTTGCCGTCCTTATCTTGTACGTTGGTGGTGTC
AACGACATCCTCGCCGTTGAAGTCTGGCAG*AGGATTGCAAAGAGTGGAAACGCATGAGA
AGAGTGTTTGGAGCGGTTCATGAT*ATCAGAATCCA

QA 3 698 3 698
DS 

RD RS1F931TF 785 0 0
GG
ACATATCTTTTATAACACTGATCTATTTTCCCAAACCAATTTTAAAACAGTCTTGCAATA
GTTACATATAACAATATGAAGAAGTCTCACGTTTTGCTTCT***GCTTGTTCAAGTCATT
GTCCTTTTGCCTCTCCTTTGTTTATCTGATGGCTTTGTTAGCTCCAGAGCTACTTACTAT
GGCAGCCCCGATTGCAAAGGAAATCCTCGGGGAGCATGTGGATATGGAGAATTTGGAAGA
GATATCAATGATGGTGAAGTAAGTGGTGTTTCATCGCGACTATGGAAAAGTGGAGCTGGC
TGTGGTGCTTGTTACCAGGTGAGATGCAAAATACCTCCACACTGCAATGAGGAAGGAGTA
TACGTAGTGGCTACGGACTATGGGGAAGGAGATGGTACGGACTTCATTTTTAGCCCTAAG
GCATACGGACGTATGGCGCGACCCGGCACAGAGTTTCAGCTCTATTCTTTTGGTGTGGTC
GACGTTGAGTACCAAAGGGTCCCTTGCCGGTACGGAGGGTCCAACTTGGTGTATAAGATC
CATGAGAAAAGCTATAATCCTCATTATCTTGCCGTCCTTATCTTGTACGTTGGTGGTGTC
AACGACATCCTCGCCGTTGAAGTCTGGCAGGAGGATTGCAAAGAGTGGAAACGCATGAGA
AGAGTGTTTGGAGCGGTTCATGATTATCAGAATCCACCTAGAG*CTCTCTTTCTTTGAG*
*TTTTAGTCTATGGAAGCGCCG*TCTCA*CTGGGTCGA*TCTCAGAACGCTCTTC
TGCGGACT

QA 3 777 3 777
DS 

RD RS1F931JQ 846 0 0
CCTCGGGGAGCATGTGGATATGGAGAATTTGGAAGAGATATCAATGATGGTGAAGTAAGT
GGTGTT*CATCGCGACTATGGAAAAGTGGAGCTGGCTGTGGTGCTTGTTACCAGGTGAGA
TGCAAAATACCTCCACACTGCAATGAGGAAGGAGTATACGTAGTGGCTACGGACTATGGG
GAAGGAGATGGTACGGACTTCATTTTTAGCCCTAAGGCATACGGACGTATGGCGCGACCC
GGCACAGAGTTTCAGCTCTATTCTTTTGGTGTGGTCGACGTTGAGTACCAAAGGGTCCCT
TGCCGGTACGGAGGGTCCAACTTGGTGTATAAGATCCATGAGAAAAGCTATAATCCTCAT
TATCTTGCCGTCCTTATCTTGTACGTTGGTGGTGTCAACGACATCCTCGCCGTTGAAGTC
TGGCAGGAGGATTGCAAAGAGTGGAAACGCATGAGAAGAGTGTTTGGAGCGGTTCATGAT
TATCAGAATCCACCTAGAGGCTCTCTTTCTTTGAGGTTTTTAGTCTATGGAAGCGCCGGT
CTCAACTGGGTCGAATCTCAGAACGCTCTTCCTGCGGACTGGACCGCCGGAGCCACCTAC
AGCTCCAGCATTCTGCTTACTTGATTTCCTT*AACTTTCCTTCTATTTATCGATAGTGTG
TTTATATAAATTACATATGGTTTTCTCTATGTAATGGCTATATGCAAATTTAAATAATGC
TCTCTAAAAAGGATAATCATTGTAGATTCATACAACTTTGTAATGTGTCTAGTTAAGAAG
ATTGTAAGGAGTTGTAAGGTTTTGGTTGGTGGAAATCAAATAATGATAAAAGTTAATTAA
AAGTTT

QA 1 846 1 846
DS 

RD RS1GZ87JQ 555 0 0
AGGGTCCCTTGCCGGTACGGAGGGTCCAACTTGGTGTATAAGATCCATGAGAAAAGCTAT
AATCCTCATTATCTTGCCGTCCTTATCTTGTACGTTGGTGGTGTCAACGACATCCTCGCC
GTTGAAGTCTGGCAGGAGGATTGCAAAGAGTGGAAACGCATGAGAAGAGTGTTTGGAGCG
GTTCATGATTATCAGAATCCACCTAGAGGCTCTCTTTCTTTGAGGTTTTTAGTCTATGGA
AGCGCCGGTCTCAACTGGGTCGAATCTCAGAACGCTCTTCCTGCGGACTGGACCGCCGGA
GCCACCTACAGCTCCAGCATTCTGCTTACTTGATTTCCTT*AACTTTCCTTCTATTTATC
GATAGTGTGTTTATATAAATTACATATGGTTTTCTCTATGTAATGGCTATATGCAAATTT
AAATAATGCTCTCTAAAAAGGATAATCATTGTAGATTCATACAACTTTGTAATGTGTCTA
GTTAAGAAGATTGTAAGGAGTTGTAAGGTTTTGGTTGGTGGAAATCAAATAATGATAAAA
GTTAATTAAAAGTTT

QA 1 555 1 555
DS 

RD RS1C609JQ 803 0 0
AGATATCAATGATGGTGAAGTAAGTGGTGTTTCATCGCGACTATGGAAAAGTGGAGCTGG
CTGTGGTGCTTGTTACCAGGTGAGATGCAAAATACCTCCACACTGCAATGAGGAAGGAGT
ATACGTAGTGGCTACGGACTATGGGGAAGGAGATGGTACGGACTTCATTTTTAGCCCTAA
GGCATACGGACGTATGGCGCGACCCGGCACAGAGTTTCAGCTCTATTCTTTTGGTGTGGT
CGACGTTGAGTACCAAAGGGTCCCTTGCCGGTACGGAGGGTCCAACTTGGTGTATAAGAT
CCATGAGAAAAGCAATAATCCTCATTATCTTGCCGTCCTTATCTTGTACGTTGGTGGTGT
CAACGACATCCTCGCCGTTGAAGTCTGGCAGGAGGATTGCAAAGAGTGGAAACGCATGAG
AAGAGTGTTTGGAGCGGTTCATGATTATCAGAATCCACCTAGAGGCTCTCTCTCTTTGAG
GTTTTTAGTCTATGGAAGCGCCGGTCTCAACTGGGTCGAATCTCAGAACGCTCTTCCTGC
GGACTGGACCGCCGGAGCCACCTACAGCTCCAGCATTCTGCTTACTTGATTTCCTT*AAC
TTTCCTTCTATTTATCGATAGTGTGTTTATATAAATTACATATGGTTTTCTCTATGTAAT
GGCTATATGCAAATTTAAATAATGCTCTCTAAAAAGGATAATCATTGTAGATTCATACAA
CTTTGTAATGTGTCTAGTTAAGAAGATTGTAAGGAGTTGTAAGGTTTTGGTTGGTGGAAA
TCAAATAATGATAAAAGTTAATT

QA 1 803 1 803
DS 

RD RS1DS73JQ 752 0 0
TGGAGCTGGCTGTGGTGCTTGTTACCAGGTGAGATGCAAAATACCTCCACACTGCAATGA
GGAAGGAGTATACGTAGTGGCTACGGACTATGGGGAAGGAGATGGTACGGACTTCATTTT
TAGCCCTAAGGCATACGGACGTATGGCGCGACCCGGCACAGAGTTTCAGCTCTATTCATT
TGGTGTGGTCGACGTTGAGTACCAAAGGGTCCCTTGCCGCTACGGAGGGTACAACCTGGT
GTATAAGATCCATGAGAAAAGCTATAATCCTCATTATCTTGCCGTCCTTATCTTGTACGT
TGGTGGTGTCGACGACATCCTCGCCGTTGAAGTCTGGCAGGAGGATTGCAAAGAGTGGAA
ACGCATGAGAAGAGTGTTTGGAGCGGTTCATGATTATCAGACTCCACCTAGAGGCTCTCT
CTCTTTGAGGTTTTTAGTCCATGGAAGCGCCGGTCTCAACTGGGTCGAATCTCAGAACGC
TCTTCCTGCGGACTGGACCGCCGGAGCTACCTACAGCTCCAGCATTCTGCTTACTTGATT
TCCTTTAACTTTCCTTCTATTTATCGATAGTGTGTTTATATAAAATACATATGGTTTTCT
CTGTCTAATGGCTATATGCAAATTTAAATAATGCTCTCTAAAAAGGATAATCATTGTAGA
TTCATAAAACTTTGTAATGTGTCTAGTTAATAAGATTGTAAGGAGTTGTAAGGTTTTGGT
TGGTGGAAATCAAATAATGATAAAAGTTAATT

QA 1 752 1 752
DS 



AS 2 8

CO CL420Contig1 924 4 6 U
TTTTTTTAATTTTAAACCATCAAATCATATCCAAGCATCAAGGACCAACAAATCTAAACA
ATAAAAAACTAAACCCATCTCCAAGAAAAAGGACAAATACTGCCACATAAATTAAAAAAG
TCCCAAGTCTCAAGAGAAACATGCTTGCAGCAGAGGCATTGAACTAATATACAACATCCA
AAGAAAGAAGAGTAGATTGAGAGCGTGTGTGACTGACTTGACTGCCTATAATAAACCTTT
AGATGACTTTCTTCTTCTCGAAAAAAGTCTTCAAGTGTACATACTGCATTGCTGCCACTC
CTATGCAGACGAACAAAGAGAGTAAACTCAACCATGCCATTTTAGTGTTTGTAGACCGGT
TCAAATCTTGCATTTGCTCTTCCCTTTCTCTAAGGTAAAACATCTCTTCATGAATCGAGT
TGACTGTACCAAGTAGGCTCTTCACGTCAAACTCCATGGTTTCGACTTGGCTCTTCTTGG
CAACAGTAGCCCAGCTCTTGGATTGAACACCCGTCCTCCACTCAAAATCAATGCTAAGAG
TCACCTCAGGCTTATGATCAACGGCGGAGAAACACGCCATGTAGTCCCCTGCTTCCACTG
CCGAGAACGCGAACTGCCCAGTCGCCACTTGATCCGCGTGATGGTACGCGTTCCCGTTGC
TTGACGTCACCTTGACGGAGATCTTGTGAGATTGAGGCAAATCGTGGCCTTCGTGAGGGT
TATCGACGCTGTACTTTCCGACAGTCATCGAATTGCTCTTGATGTCTTCCGCGATACACT
TTGTCCGACCCGAGTGCAGATCGAAGTGCAGCGAGTGTGCTACACGCGACGAGATAACTA
GAATCAGAACCACCGTCCATAGCTTCTGCGACGACCGGAGAAACATTTTTTAGAAAGATA
AGAATCAGAACCTCTTTCCTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CY72JQ U 14
AF RS1C481JQ U 1
AF RS1BU20JQ U 15
AF RS1BU20TF C 242
BS 1 424 RS1C481JQ
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BS 703 924 RS1BU20TF

RD RS1CY72JQ 631 0 0
A
AACCATCAAATCATATCCAAGCATCAAGGACCAACAAATCTAAACAATAAAAAACTAAAC
CCATCTCCAAAAAAAAGGACAAATACTGCCACATAAATTAAAAAAGTCCCAAGTCTCAAG
GGAAACATGCTTGCAGCAGAGGCATTGAACTAATATACAACATCCAAAGAAAGAAGAGTA
GATTGAGAGCGTGTGTGACTGACTTGACTGCCTATAATAAACCTTTAGATGACTTTCTTC
TTCTCGAAAAAAGTCTTCAAGTGTACATACTGCATTGCTGCCACTCCTATGCAGACGAAC
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TGCTCTTCCCTTTCTCTAAGGTAAAACATCTCTTCATGAATCGAGTTGACGGTATCAAGT
AGGCTCTTCACGTCAAACTCCATGGTTTCGACTTGGCTCTTCTAGGCAACAGTAGCCCAG
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TGATCAACGGCGGAGAAACACGCCATGTAGCCCCCTGCTTCCACTGCCGAGAACGCGAAC
TGCCCAGTCGCCACTTGATCCGCGCGATGG

QA 2 631 2 631
DS 

RD RS1C481JQ 702 0 0
TTTTTTTAATTTTAAACCATCAAATCATATCCAAGCATCAAGGACCAACAAATCTAAACA
ATAAAAAACTAAACCCATCTCCAAGAAAAAGGACAAATACTGCCACATAAATTAAAAAAG
TCCCAAGTCTCAAGAGAAACATGCTTGCAGCAGAGGCATTGAACTAATATACAACATCCA
AAGAAAGAAGAGTAGATTGAGAGCGTGTGTGACTGACTTGACTGCCTATAATAAACCTTT
AGATGACTTTCTTCTTCTCGAAAAAAGTCTTCAAGTGTACATACTGCATTGCTGCCACTC
CTATGCAGACGAACAAAGAGAGTAAACTCAACCATGCCATTTTAGTGTTTGTAGACCGGT
TCAAATCTTGCATTTGCTCTTCCCTTTCTCTAAGGTAAAACATCTCTTCATGAATCGAGT
TGACAGTATCAAGTAGGCTCTTCACGTCAAACTCCATGGTTTCGACTTGGCTCTTCTTGG
CAACAGTAGCCCAGCTCTTGGATTGAACACCCGTCCTCCACTCAAAATCAATGCTAAGAG
TCACCTCAGGCTTATGATCAACGGCGGAGAAACACGCCATGTAGTCCCCTGCTTCCACTG
CCGAGAACGCGAACTGCCCAGTCGCCACTTGATCCGCGTGATGGTACGCGTTCCCGTTGC
TTGACGTCACCTTGACGGAGATCTTGTGAGATTGAGGCAAAT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RS1BU20JQ 664 0 0
AACCATCAAATCATATCCAAGCATCAAGGACCAACAAATCTAAACAATAAAAAACTAAAC
CCATCTCCAAGAAAAAGGACAAATACTGCCACATAAATAAAAAAAGTCCCAAGTCTCAAG
AGAAACATGCTTGCAGCAGAGGCATTGAACTAATATACAACATCCAAAGAAAGAAGAGTA
GATTGAGAGCGTGTGTGACAGACTTGACTGCCTATAATAAACCTTTAGATGACTTTCTTC
TTCTCGAAAAAAGTCTTCAAGTGTACATACTGCATTGCTGCCACTCCTATGCAGACGAAC
AAAGAGAGTAAACTCAACCATGCCATTTTAGTGTTTGTAGACCGGTTCAAATCTTGCATT
TGCTCTTCCCTTTCTCTAAGGTAAAACATCTCTTCATGAATCGAGTTGACTGTACCAAGT
AGGCTCTTCACGTCAAACTCCATGGTTTCGACTTGGCTCTTCTTGGCAACAGTAGCCCAG
CTCTTGGATTGAACACCCGTCCTCCACTCAAAATCAATGCTAAGAGTCACCTCAGGCTTA
TGATCAACGGCGGAGAAACACGCCATGTAGTCCCCTGCTTCCACTGCCGAGAACGCGAAC
TGCCCAGTCGCCACTTGATCCGCGTGATGGTACGCGTTCCCGTTGCTTGACGTCACCTTG
ACGG

QA 1 664 1 664
DS 

RD RS1BU20TF 683 0 0
TTAGATGACTTCTC
TCTCGAAAAA*GTCT*CAAGTGTACATACTGCATTGCTGCCACTC*TATGCAGACGAACA
AAGAGAGTAAACTCAACCATGCCATTTTAGTGTTTGTAGACCGGTTCAAATCTTGCATTT
GCTCTTCCCTTTCTCTAAGGTAAAACATCTCTTCATGAATCGAGTTGACTGTACCAAGTA
GGCTCTTCACGTCAAACTCCATGGTTTCGACTTGGCTCTTCTTGGCAACAGTAGCCCAGC
TCTTGGATTGAACACCCGTCCTCCACTCAAAATCAATGCTAAGAGTCACCTCAGGCTTAT
GATCAACGGCGGAGAAACACGCCATGTAGTCCCCTGCTTCCACTGCCGAGAACGCGAACT
GCCCAGTCGCCACTTGATCCGCGTGATGGTACGCGTTCCCGTTGCTTGACGTCACCTTGA
CGGAGATCTTGTGAGATTGAGGCAAATCGTGGCCTTCGTGAGGGTTATCGACGCTGTACT
TTCCGACAGTCATCGAATTGCTCTTGATGTCTTCCGCGATACACTTTGTCCGACCCGAGT
GCAGATCGAAGTGCAGCGAGTGTGCTACACGCGACGAGATAACTAGAATCAGAACCACCG
TCCATAGCTTCTGCGACGACCGGAGAAACATTTTTTAGAAAGATAAGAATCAGAACCTCT
TTCCTTCCC

QA 15 683 15 683
DS 



CO CL420Contig2 830 4 20 U
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GCTATGGACGGTGGTTCTGATTCTAGTTATCTCGTCGCGTGTAGCACACTCGCTGCACTT
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AAAGAGCCTACTTGATACTGTCAACTCGATTCATGAAGAGATGTTTTACCTTAGAGAAAG
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CTCTCAATCTACTCTTCTTTCTTTGGATGTTGTATATTAGTTCGATGCCTGCTGCAAGCA
TGTTACTCTTGAGAGTTGGAACTTTTTTAATTTATGTGGCAGTATTCGTG


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 0 25 25 
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25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CY72TF U 8
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GG
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TCCGTCAAGGTGACGTCAAGCAACGGGAATGCGTACCATCACGCGGATCAAGTGGCGACT
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GATCATAAGCCTGAGGTGACTCTCAGCATTGATTTTGAGTGGAGGACGGGTGTTCAATCC
AAGAGCTGGGCTACTGTTGCCAAGAAGAGCCAAGTCGAAACCATGGAATTTGATGTAAAG
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ACTCTTGAGAGTTGGAACTTTTTTAATTTATGTGGCAGTATTCGTG

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 8

CO CL421Contig1 852 8 10 U
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BQ
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1B108TF C 202
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GTAAAAAACTTGAACAAGATTTAAGAACAAACACATGTTGTCTAATCTCACAACATTGTG
ATATGATTCCATTATTAGCACTTCTTTTTTTACACCACAGAGATCCCACATACAACGAGA
AGCAGCAAAACAAACAAACATCAAAGAAATGAACTTGCTTTGCTTCACACACACTCTAAA
GTTAATAGCTTTTGAAGTTCCCTTCATACAGATACTCCTCACCATAAATGGTCTCATGCT
CTTTAAATCTTTTTGATTTATCAGCTCGGCTCAAGATCTTCTCGAAAGCATCAGGACCAT
TCTCAGCAATGTACTTCTCAGCAGCTGTCAACACATCATCTGGCTTTCTGAAGAAATCCA
TCTTCTTAGGCACATACCAAATGTTAATGCTCTAAGGGTTAACATACAGAGGCCTCACAA
AGTGTTCGTATACATAAGCAGCGCCGCTGAAGTAAGGAATCACAAGCCAGCGAGTCAAGA
TCAGCTTGGCGTATGACCATATCGGTACCCATTCGATGAGTTTGGCGAAAGTGAGCTCGA
AGAGTGTGAGTAAGGAGTAAAGAACCCAGTAAGTGAGC

QA 1 578 1 578
DS 

RD RS1CN22TF 730 0 0
T
AATCTCACAACATTGTGATATGATTCCATTATTAGCACTTCTTTTT**ACACCACAGAGA
TCCCACATACAACGAGAAGCAGCAAAACAAACAAACATCAAAGAAATGAACTTGCTTTGC
TTCACACACACTCTAAAGTTAATAGCTTTTGAAGTTCCCTTCATACAGATACTCCTCACC
ATAAATGGTCTCATGCTCTTTAAATCTTTTTGATTTATCAGCTCGGCTCAAGATCTTCTC
GAAAGCATCAGGACCATTCTCAGCAATGTACTTCTCAGCAGCTGTCAACACATCATCTGG
CTTTCTGAAGAAATCCATCTTCTTAGGCACATACCAAATGTTAATGCTCTGAGGGTTAAC
ATACAGAGGCCTCACAAAGTGTTCGTATACATAAGCAGCGCCGCTGAAGTAAGGAATCAC
AAGCCAGCAAGTCAAGATCAGCTTGGCGTATGACCATATCGGTACCCATTCGATGAGTTT
GGCGAAAGTGAGCTCGAAGAGTGTGAGTAAGGAGTAAAGAACCCAGTAAGTGAGCCATTG
TTTGTCATCAGCGTGAGATTGAGTTTCAATTGCCTTCACTGAAGCATGTAGTGGATAAAC
GAGACTAACAACAGGCCCAGCGAGAACATCGAAGTTCCTCAAAAGAACTTTGATGAAACT
TCCAACTCCAGATCCCATTCTCTCTCGAAGTGTTGATTTGGGCTCTGAATCTGATTCTTC
CTCCACT
CC

QA 2 728 2 728
DS 

RD RS1CN22JQ 729 0 0
AATCTCACAACATTGTGATATGATTCCATTATTAGCACTTCTTTTTT*ACACCACAGAGA
TCCCACATACAACGAGAAGCAGCAAAACAAACAAACATCAAAGAAATGAACTTGCTTTGC
TTCACACACACTCTAAAGTTAATAGCTTTTGAAGTTCCCTTCATACAGATACTCCTCACC
ATAAATGGTCTCATGCTCTTTAAATCTTTTTGATTTATCAGCTCGGCTCAAGATCTTCTC
GAAAGCATCAGGACCATTCTCAGCAATGTACTTCTCAGCAGCTGTCAACACATCATCTGG
CTTTCTGAAAAAATCCATCTTCTTAGGCACATACCAAATGTTAATGCTCTGAGGGTTAAC
ATACAGAGGCCTCACAAAGTGTTCGTATACATAAGCAGCGCCGCTGAAGTAAGGAATCAC
AAGCCAGCAAGTCAAGATCAGCTTGGCGTATGACCATATCGGTACCCATTCGATGAGTTT
GGCGAAAGTGAGCTCGAAGAGTGTGAGTAAGGAGTAAAGAACCCAGTAAGTGAGCCATTG
TTTGTCATCAGCGTGAGATTGAGTTTCAATTGCCTTCACTGAAGCATGTAGTGGATAAAC
GAGACTAACAACAGGCCCAGCGAGAACATCGAAGTTCCTCAAAAGAACTTTGATGAAACT
TCCAACTCCAGATCCCATTCTCTCTCGAAGTGTTGATTTGGGCTCTGAATCTGATTCTTC
CTCCACT
CC

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1B108JQ 788 0 0
GG
TCTCACAACATTGTGATATGATTCCATTATTAGCACTTTTTTTTTTACACCACAGAGATC
CCACATACAACGAGAAGCAGCAAAACAAACAAACATCAAAGAAATGAACTTGCTTTGCCT
CACACACACTCTAAAGTTAATAGCTTTTGAAGTTCCCTTCATACAGATACTCCTCACCAT
AAATGGTCTCATGCTCTTTAAATCTTTTTGATTTATCAGCTCGGCTCAAGATCTTCTCGA
AAGCATCAGGACCATTCTCAGCAATGTACTTCTCAGCAGCTGTCAACACATCATCTGGCT
TTCTGAAGAAATCCATCTTCTTAGGCACATACCAAATGTTAATGCTCTGAGGGTTAACAT
ACAGAGGCCTCACAAAGTGTTCGTATACATAAGCAGCGCCGCTGAAGTAAGGAATCACAA
GCCAGCAAGTCAAGATCAGCTTGGCGTATGACCATATCGGTACCCATTCGATGAGTTTGG
CGAAAGTGAGCTCGAAGAGTGTGAGTAAGGAGTAAAGAACCCAGTAAGTGAGCCATTGTT
TGTCATCAGCGTGAGATTGAGTTTCAATTGCTTTCACTGAAGCATGTAGTGGATAAACGA
GACTAACAACAGGCCCAGCGAGAACATCGAAGTTCCTCAAAAGAACTTTGATGAAACTTC
CAACTCCAGATCCCATTCTCTCTCGAAGTGTTGATTTGGGCTCTGAATCTGATTCTTCCT
CCACCGAAAACAATACTAGTTCACTGGAGAGAGATTGATAGAGAGAGAG**GGAGAGAGA
GAGAG
C

QA 3 787 3 787
DS 

RD RS1AD24JQ 809 0 0
AATCTCACAACATTGTGATATGATTCCATTATTAGCACTTCTTTTTTTACACCACAGAGA
TCCCACATACAACGAGAAGCAGCAAAACAAACAGACATCAAAGAAATGAACTTGCTTTGC
TTCACACACACTCTAAAGTTAATAGCTTTTGAAGTTCCCTTCATACAGATACTCCTCACC
ATAAATGGTCTCATGCTCTTTAAATCTTTTTGATTTATCAGCTCGGCTCAAGAGCTTCTC
GAAAGCATCAGGACCATTCTCAGCAATGTACTTCTCAGCAGCTGTCAACACATCATCTGG
CTTTCTGAAAAAATCCATCTTCTTAGGCACATACCAAATGTTAATGCTCTGAGGGTTAGC
ATACAGAGGCCTCACAAAGTGTTCGTATACATAAGCAGCGCCGCTGAAGTAAGGAATCAC
AAGCCAGCAAGTCAAGATCAGCTTGGCGTATGACCATATCGGTACCCATTCGATGAGTTT
GGCGAAAGTGAGCTCGAAAAGTGTGAGTAAGGAGTAAAGAACCCAGTAAGTGAGCCATTG
TTTGTCATCAGCGTGAGATTGAGTTTCAATTGCTTTCACTGAAGCATGTAGTGGATAGAC
GAGACTAACAACAGGCCCAGCGAGAACATCGAAGTTCCTCAAAAGAACTTTGATGAAACT
TCCAACTCCAGATCCCATTCTCTCTCGAAGTGTTGATTTGGGCTCTGAATCTGATTCTTC
CTCCACTGAAAACAATACTAGTTCACTGGAGAGAGATTGATAGAGAGAGAGAGGGAGAGA
GAGAGAGCGAATAATTGTGTGGCCAGTCC

QA 1 809 1 809
DS 

RD RS1B108TF 651 0 0
CTTCATACAGATACTCCTCACCATAAATGGTCTCATGCTCTTTAAATCTTTTTGATTTAT
CAGCTCGGCTCAAGATCTTCTCGAAAGCATCAGGACCATTCTCAGCAATGTACTTCTCAG
CAGCTGTCAACACATCATCTGGCTTTCTGAAGAAATCCATCTTCTTAGGCACATACCAAA
TGTTAATGCTCTGAGGGTTAACATACAGAGGCCTCACAAAGTGTTCGTATACATAAGCAG
CGCCGCTGAAGTAAGGAATCACAAGCCAGCAAGTCAAGATCAGCTTGGCGTATGACCATA
TCGGTACCCATTCGATGAGTTTGGCGAAAGTGAGCTCGAAGAGTGTGAGTAAGGAGTAAA
GAACCCAGTAAGTGAGCCATTGTTTGTCATCAGCGTGAGATTGAGTTTCAATTGCTTTCA
CTGAAGCATGTAGTGGATAAACGAGACTAACAACAGGCCCAGCGAGAACATCGAAGTTCC
TCAAAAGAACTTTGATGAAACTTCCAACTCCAGATCCCATTCTCTCTCGAAGTGTTGATT
TGGGCTCTGAATCTGATTCTTCCTCCACCGAAAACAATACTAGTTCACTGGAGAGAGATT
GATAGAGAGAGAG**GGAGAGAGAGAGAGCGAATAATTGTGTGGCCAGTCC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1DR24TF 603 0 0
TTTTTGATTTATCAGCTCGGCTCAAGATCTTCTCGAAAGCATCAGGACCATTCTCAGCAA
TGTACTTCTCAGCAGCTGTCAACACATCATCTGGCTTTCTGAAGAAATCCATCTTCTTAG
GCACATACCAAATGTTAATGCTCTAAGGGTTAACATACAGAGGCCTCACAAAGTGTTCGT
ATACATAAGCAGCGCCGCTGAAGTAAGGAATCACAAGCCAGCGAGTCAAGATCAGCTTGG
CGTATGACCATATCGGTACCCATTCGATGAGTTTGGCGAAAGTGAGCTCGAAGAGTGTGA
GTAAGGAGTAAAGAACCCAGTAAGTGAGCCATTGTTTGTCATCAGCGTGAGATTGAGTTT
CAATTGCTTTCACTGAAGCATGTAGTGGATAAACGAGACTAACAACAGGCCCAGCGAGAA
CATCGAAGTTCCTCAAAAGAACTTTGATGAAACTTCCAACTCCAGATCCCATTCTCTCTC
GAAGTGTTGATTTGGGCTCTGAATCTGATTCTTCCTCCACTGAAAACAATACTAGTTCAC
CGGAGAGAGATTGATAGAGAGAGGG******AGAGAGAGAGCGAATAATTGTGTGGCCAG
TCC

QA 1 603 1 603
DS 

RD RS1AD24TF 808 0 0
ATCTCACAACATTGTGATATGATTCCATTATTAGCACTTCTTTTTTTACACCACAGAGAT
CCCACATACAACGAGAAGCAGCAAAACAAACAGACATCAAAGAAATGAACTTGCTTTGCT
TCACACACACTCTAAAGTTAATAGCTTTTGAAGTTCCCTTCATACAGATACTCCTCACCA
TAAATGGTCTCATGCTCTTTAAATCTTTTTGATTTATCAGCTCGGCTCAAGAGCTTCTCG
AAAGCATCAGGACCATTCTCAGCAATGTACTTCTCAGCAGCTGTCAACACATCATCTGGC
TTTCTGAAGAAATCCATCTTCTTAGGCACATACCAAATGTTAATGCTCTGAGGGTTAGCA
TACAGAGGCCTCACAAAGTGTTCGTATACATAAGCAGCGCCGCTGAAGTAAGGAATCACA
AGCCAGCAAGTCAAGATCAGCTTGGCGTATGACCATATCGGTACCCATTCGATGAGTTTG
GCGAAAGTGAGCTCGAAGAGTGTGAGTAAGGAGTAAAGAACCCAGTAAGTGAGCCATTGT
TTGTCATCAGCGTGAGATTGAGTTTCAATTGCTTTCACTGAAGCATGTAGTGGATAGACG
AGACTAACAACAGGCCCAGCGAGAACATCGAAGTTCCTCAAAAGAACTTTGATGAAACTT
CCAACTCCAGATCCCATTCTCTCTCGAAGTGTTGATTTGGGCTCTGAATCTGATTCTTCC
TCCACTGAAAACAATACTAGTTCACTGGAGAGAGATTGATAGAGAGAGAGAGGGAGAGAG
AGAGAGCGAATAATTGTGTGGCCAGTCC

QA 1 808 1 808
DS 



AS 1 9

CO CL422Contig1 974 9 13 U
GCTGATTCCTCTCAATGAAATTTGCCATGTTGCACTAAGTTACTTACGGATGTATGCATG
CAGTCCAGGAACACTTTGGGGTAAACACCCATCCGAACGAGTAGAGTCAATAGTTCAGCA
TTTAGGCTGTAACATTTAGCAACAAAAAAAGTCTTTAACCCAACAAGTGCTCTCCGAACC
AAGCTAGATAGTCTCCTATCACTAGGCTCACCAACCTACCTGGACTTTGATTCTTATTAT
TCCTACCGGATATCAAAACCATAAGGATTGTTTCCAGCCATGAGTTCCCATATGACATAA
GCGCTATTGGGTGGGCCATTCCATCAAATCGTTGAGAAGGGACCCCC*AATCTCGTATTT
GATGGTTGGCGTGGCGATAGACTTCGCTTCTACGACTGCCTCCCCAGCCGTTGCAAACAC
TGAGCGAGAACGGTAAAGGGCGCACAAACTATGTCGTTGCGCGGGGATTCACCAAGCTGG
GGCAAACTAAGCCGTTCGTGGTTGGTGGGGCGGATTAGGAATGCGAAGGCCTTTACTTCA
AAAGGAGACCCGCCCACTATTACCACGAAAAAAGCCCTGCCCTTTTCCTTCGCTACTAGG
AAAGTAAGCAACCTCTATTAGCGCCGGACCTTGAGTCGAATTGATCGTGTCATGTGCAAC
GTCCATCAATGATGGTTCATTAATGTCCATAGATTTAGACTCCTTCCCCCTTCCCTACTA
CGAAAAAGATCGAGAGGAGCCCGAACCAAACCAAGAACGAAAACGGAAGCCTTTCGATTT
GCTTCCCATTCTCTCTTAACTAAAGCTCGCCCTCGAGCCCTGGGCAGGTCGGCCGGGTCT
TTCCCTGTTGTTCTGTTCCTGCCACGAGAAAGACGCACGGAAGAGGTATGCCCAGCGCGC
GGAGGATCTGTTAAGAGTTTCTCTTGTCTCGGTAGGGAACTGTACGATCTTTTCCCCTAT
TATATTGAATCAAT


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 
30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FD31JQ U 2
AF RS1FD57JQ U 1
AF RS1A888JQ U 1
AF RS1A888TF C 160
AF RS1FQ94JQ U 1
AF RS1FQ94TF C 100
AF RS1FD31TF C 252
AF RS1AC76JQ U 101
AF RS1AC76TF C 251
BS 1 8 RS1A888JQ
BS 9 9 RS1FD57JQ
BS 10 84 RS1A888JQ
BS 85 85 RS1FD57JQ
BS 86 190 RS1A888JQ
BS 191 192 RS1FD57JQ
BS 193 341 RS1A888JQ
BS 342 342 RS1FQ94JQ
BS 343 539 RS1A888JQ
BS 540 540 RS1FQ94JQ
BS 541 567 RS1A888JQ
BS 568 727 RS1FQ94JQ
BS 728 974 RS1AC76JQ

RD RS1FD31JQ 317 0 0
CTGATTCCTCTCAATGAAATTTGCCATGTTGCACTAAGTTACTTACGGATGTATGCATGC
AGTCCAGGAACACTTTGGGGTAAACACCCATCCGAACGAGTAGAGTCAATAGTTCAGCAT
TTAGGCTGTAACATTTAGCAACAAAAAAAGTCTTTAACCCAACAAGTGCTCTCCGAACCA
AGCTAGATAGTCTCCTATCACTAGGCTCACCAACCTACCTGGACTTTGATTCTTATTATT
CCTACCGGATATCAAAACCATAAGGATTGTTTCCAGCCATGAGTTCCCATATGACATAAG
CGCTATTGGGTGGGCCA

QA 1 317 1 317
DS 

RD RS1FD57JQ 516 0 0
G
CTGATTCCTCTCAATGAAATTTGCCATGTTGCACTAAGTTACTTACGGATGTATGCATGC
AGTCCAGGAACACTTTGGGGTAAACACCCATCCGAACGAGTAGAGTCAATAGTTCAGCAT
TTAGGCTGTAACATTTAGCAACAAAAAAAGTCTTTAACCCAACAAGTGCTCTCCGAACCA
AGCTAGATAGTCTCCTATCACTAGGCTCACCAACCTACCTGGACTTTGATTCTTATTATT
CATACCGGATATCAAAACCATAAGGATTGTTTCCAGCCATGAGTTCCCATATGACATAAG
CGCTATTGGGTGGGCCATTCCATCAAATCGTTGAAAAGGGGCCCCC*AATCTCGTATTTG
ATGGTTGGCGTGGCGATAGACTTCGCTTCTACGACTGCCTCCCCAGCCGTTGCAAACACT
GAGCGAGAACGGTAAAGGGCGCACAAACTATGTCGTTGCGCGGGGATTCACCAAGCTGGG
GCAAACTAAGCCGTTCGTGGTTGGTGGGGCGGATT

QA 2 516 2 516
DS 

RD RS1A888JQ 567 0 0
GCTGATTCATCTCAATGAAATTTGCCATGTTGCACTAAGTTACTTACGGATGTATGCATG
CAGTCCAGGAACACTTTGGGGTAA*CACCCATCCGAACGAGTAGAGTCAATAGTTCAGCA
TTTAGGCTGTAACATTTAGCAACAAAAAAAGTCTTTAACCCAACAAGTGCTCTCCGAACC
AAGCTAGATAA*CTCCTATCACTAGGCTCACCAACCTACCTGGACTTTGATTCTTATTAT
TCCTACCGGATATCAAAACCATAAGGATTGTTTCCAGCCATGAGTTCCCATATGACATAA
GCGCTATTGGGTGGGCCATTCCATCAAATCGTTGAGAAGGGGCCCCC*AATCTCGTATTT
GATGGTTGGCGTGGCGATAGACTTCGCTTCTACGACTGCCTCCCCAGCCGTTGCAAACAC
TGAGCGAGAACGGTAAAGGGCGCACAAACTATGTCGTTGCGCGGGGATTCACCAAGCTGG
GGCAAACTAAGCCGTTCGTGGTTGGTGGGGCGGATTAGGAATGCGAAGGCCTTTACTTCG
AAAGGAGACCCGCCCACTATTACCACG

QA 1 567 1 567
DS 

RD RS1A888TF 557 0 0
CCAACAAGTGCTCTCCGAACCAAGCTAGATAA*CTCCTATCACTAGGCTCACCAACCTAC
CTGGACTTTGATTCTTATTATTCCTACCGGATATCAAAACCATAAGGATTGTTTCCAGCC
ATGAGTTCCCATATGACATAAGCGCTATTGGGTGGGCCATTCCATCAAATCGTTGAGAAG
GGGCCCCC*AATCTCGTATTTGATGGTTGGCGTGGCGATAGACTTCGCTTCTACGACTGC
CTCCCCAGCCGTTGCAAACACTGAGCGAGAACGGTAAAGGGCGCACAAACTATGTCGTTG
CGCGGGGATTCACCAAGCTGGGGCAAACTAAGCCGTTCGTGGTTGGTGGGGCGGATTAGG
AATGCGAAGGCCTTTACTTCGAAAGGAGACCCGCCCACTATTACCACGAAAAAAGCCCTG
CCCTTTTCCTTCGCTACTAGGAAAGTAAGCAACCTCTATTAGCGCCGGACCTTGAGTCGA
ATTGATCGTGTCATGTGCAACGTCCATCAATGATGGTTCATTAATGTCCATAGATTTAGA
CTCCTTCCCCCTTCCC
C

QA 1 556 1 556
DS 

RD RS1FQ94JQ 727 0 0
G
CTGATTCCTCTCAATGAAATTTGCCATGTTGCACTAAGTTACTTACGGATGTATGCATGC
AGTCCGGGAACACTTTGGGGTGAACACCCATCCGAACGAGTAGAGTCAATAGTTCAGCAT
TTAGGCTGTAACATTTAGCAACAAAAAAAGTCTTTAACCCAACAAGTGCTCTCCGAACCA
AGCTAGATAGTCTCCTATCACTAGGCTCACCAACCTACCTGGACTTTGATTCTTATTATT
CCTACCGGATATCAAAACCATAAGGATTGTTTCCAGCCATGAGTTCCCATATGACATAAG
CGCTATTGGGTGGGCCATTCCATCAAATCGTTGAGAAGGGACCCCC*AATCTCGTATTTG
ATGGTTGGCGTGGCGATAGACTTCGCTTCTACGACTGCCTCCCCAGCCGTTGCAAACACT
GAGCGAGAACGGTAAAGGGCGCACAAACTATGTCGTTGCGCGGGGATTCACCAAGCTGGG
GCAAACTAAGCCGTTCGTGGTTGGTGGGGCGGATTAGGAATGCGAAGGCCTTTACTTCAA
AAGGAGACCCGCCCACTATTACCACGAAAAAAGCCCTGCCCTTTTCCTTCGCTACTAGGA
AAGTAAGCAACCTCTATTAGCGCCGGACCTTGAGTCGAATTGATCGTGTCATGTGCAACG
TCCATCAATGATGGTTCATTAATGTCCATAGATTTAGACTCCTTCCCCCTTCCCTACTAC
GAAAAA

QA 2 727 2 727
DS 

RD RS1FQ94TF 747 0 0
AGTAGAGTCAATAGTTCAGCATTTAGGCTGTAACATTTAGCAACAAAAAA*GTCTTTAAC
CCAACAAGTGCTCTCCGAACCAAGCTAGATAGTCTCCTATCACTAGGCTCACCAACCTAC
CTGGACTTTGATTCTTATTATTCCTACCGGATATCAAAACCATAAGGATTGTTTCCAGCC
ATGAGTTCCCATATGACATAAGCGCTATTGGGTGGGCCATTCCATCAAATCGTTGAGAAG
GGACCCCC*AATCTCGTATTTGATGGTTGGCGTGGCGATAGACTTCGCTTCTACGACTGC
CTCCCCAGCCGTTGCAAACACTGAGCGAGAACGGTAAAGGGCGCACAAACTATGTCGTTG
CGCGGGGATTCACCAAGCTGGGGCAAACTAAGCCGTTCGTGGTTGGTGGGGCGGATTAGG
AATGCGAAGGCCTTTACTTCAAAAGGAGACCCGCCCACTATTACCACGAAAAAAGCCCTG
CCCTTTTCCTTCGCTACTAGGAAAGTAAGCAACCTCTATTAGCGCCGGACCTTGAGTCGA
ATTGATCGTGTCATGTGCAACGTCCATCAATGATGGTTCATTAATGTCCATAGATTTAGA
CTCCTTCCCCCTTCCCTACTACGAAAAAGATCGAGAGGAGCCCGAACCAAACCAAGAACG
AAAACGGAAGCCTTTCGATTCGCTCCCCATTCTCTCTTAACTAAAGCTCGCCCTCGAGCC
CTGGGCAGGTCGGCCGGGTCTTTCCC
C

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1FD31TF 680 0 0
TATC
AAACCATAAGGATTGTTTCCAGCCATGAGTTCCCATATGACATAAGCGCTATTGGGTGGG
CCATTCCATCAAATCGTTGAGAAGGGACCCCC*AATCTCGTATTTGATGGTTGGCGTGGC
GATAGACTTCGCTTCTACGACTGCCTCCCCAGCCGTTGCAAACACTGAGCGAGAACGGTA
AAGGGCGCACAAACTATGTCGTTGCGCGGGGATTCACCAAGCTGGGGCAAACTAAGCCGT
TCGTGGTTGGTGGGGCGGATTAGGAATGCGAAGGCCTTTACTTCAAAAGGAGACCCGCCC
ACTATTACCACGAAAAAAGCCCTGCCCTTTTCCTTCGCTACTAGGAAAGTAAGCAACCTC
TATTAGCGCCGGACCTTGAGTCGAATTGATCGTGTCATGTGCAACGTCCATCAATGATGG
TTCATTAATGTCCATAGATTTAGACTCCTTCCCCCTTCCCTACTACGAAAAAGATCAAGA
GGAGCCCGAACCAAACCAAGAACGAAAACGGAAGCCTTTCGATTCGCTCCCCATTCTCTC
TTAACTAAAGCTCGCCCTCGAGCCCTGGGCAGGTCGGCCGGGTCTTTCCCTGTTGTTCTG
TTCCTGCCACGAGAAAGACGCACGGAAGAGGTATGCCCAGCGCGCGGAGGATCTGTTAAG
AGTTTCTCTTGTCTC
C

QA 5 679 5 679
DS 

RD RS1AC76JQ 874 0 0
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CAACAAGTGCCCTCCGAACCAAGCTAGATAGTCTCCTATCACTAGGCTCACCAACCTACC
TGGACTTTGATTCTTATTATTCCTACCGGATATCAAAACCATAAGGATTGTTTCCAGCCA
TGAGTTCCCATATGACATAAGCGCTATTGGGTGGGCCATTCCATCAAATCGTTGAGAAGG
GACCCCC*AATCTCGTATTTGATGGTTGGCGTAGCGATAGACTCCGCTTCTACGACTGCC
TCCCCAGCCGTTGCAAACACTGAGCGAGAACGGTAAAGGGCGCACAAACTATGTCGTTGC
GCGGGGATTCACCAAGCTGGGGCAAACTAAGCCGTTCGTGGTTGGTGGGGCGGATTAGGA
ATGCGAAGGCCTTTACTTCAAAAGGAGACCCGCCCACTATTACCACGAAAAAAGCCCTGC
CCTTTTCCTTCGCTACTAGGAAAGTAAGCAACCTCTATTAGCGCCGGACCTTGAGTCGAA
TTGATCGTGTCATGTGCAACGTACATCAATGATGGTTCATTAATGTCCATAGATTTAGAC
TCCTTCCCCCTTCCCCACTACGAAAAAGATCGAGAGGAGCCCGAACCAAACCAAGAACGA
AAACGGAAGCCTTTCGATTTGCTTCCCATTCTCTCTTAACTAAAGCTCGCCCTCGAGCCC
TGGGCAGGTCGGCCGGGTCTTTCCCTGTTGTTCTGTTCCTGCCACGAGAAAGACGCACGG
AAGAGGTATGCCCAGCGCGCGGAGGATCTGTTAAGAGTTTCTCTTGTCTCGGTAGGGAAC
TGTACGATCTTTTCCCCTATTATATTGAATCAAT

QA 1 874 1 874
DS 

RD RS1AC76TF 724 0 0
TATCAAAACCATAAGGATTGTTTCCAGCCATGAGTTCCCATATGACATAAGCGCTATTGG
GTGGGCCATTCCATCAAATCGTTGAGAAGGGACCCCCCAATCTCGTATTTGATGGTTGGC
GTAGCGATAGACTCCGCTTCTACGACTGCCTCCCCAGCCGTTGCAAACACTGAGCGAGAA
CGGTAAAGGGCGCACAAACTATGTCGTTGCGCGGGGATTCACCAAGCTGGGGCAAACTAA
GCCGTTCGTGGTTGGTGGGGCGGATTAGGAATGCGAAGGCCTTTACTTCAAAAGGAGACC
CGCCCACTATTACCACGAAAAAAGCCCTGCCCTTTTCCTTCGCTACTAGGAAAGTAAGCA
ACCTCTATTAGCGCCGGACCTTGAGTCGAATTGATCGTGTCATGTGCAACGTACATCAAT
GATGGTTCATTAATGTCCATAGATTTAGACTCCTTCCCCCTTCCCCACTACGAAAAAGAT
CGAGAGGAGCCCGAACCAAACCAAGAACGAAAACGGAAGCCTTTCGATTTGCTTCCCATT
CTCTCTTAACTAAAGCTCGCCCTCGAGCCCTGGGCAGGTCGGCCGGGTCTTTCCCTGTTG
TTCTGTTCCTGCCACGAGAAAGACGCACGGAAGAGGTATGCCCAGCGCGCGGAGGATCTG
TTAAGAGTTTCTCTTGTCTCGGTAGGGAACTGTACGATCTTTTCCCCTATTATATTGAAT
CAAT

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 9

CO CL423Contig1 913 9 33 U
ACTCTCCATAACCAAAACACTTTTCACCAAGCTTTCAAAGGACTACATCAATCAATGGCG
TCCTCTCCCATTTCCCCTGCTACTCAGCTTGGTTCGAGCAGAAGTGCTACTATGTTGGCC
ATGTCGCGTGGGATGATGTTTGTGAAGCCAACGAGGACGAGTCACCAGATGGTGAGGAAG
GAGAAGATTGGTCTGAGAATCGCTTGTCAGGCGACGAGTATTCCAGCAGACAACGTTCCA
GACATGGAAAAGAGGAAAACTTTGAATCTTCTTCTTGTCGGGGCTCTTTCTCTCCCTACT
GGCTTCATGCTTGTCCCTTACGCTACCTTCTTTGCTCCTCCTGGATCCGGAGGTGGAGGT
GGTGGTACTCCAGCCAAGGATGCACTTGGAAACGATGTCATTGCCGCAGAATGGCTCAAG
ACTCATGGTGCTGGTGATCGAACCTTGACTCAAGGATTGAAGGGAGATCCAACTTACCTA
GTTGTGGAGAACGACAAGACACTAGCGACTTACGGTATAAACGCAGTGTGCACTCATCTA
GGATGTGTTGTGCCGTGGAACAAAGCTGAGAACAAGTTCCTATGTCCTTGCCATGGATCC
CAATACAATGCTCAAGGCAGAGTCGTTAGAGGTCCAGCTCCATTGTCGCTTGCCTTGGCA
CATGCGGATATTGATGACGGTGGAAAGGTTGTGTTTGTTCCATGGGTTGAAACTGACTTC
AGGACTGGTGATGCCCCTTGGTGGTCTTAAATCTCTCTTACAACAAACTCTTTTTGTGGG
GAGAAGAATGGGGGATGGCTGTCTTTTTGTGTTTGAATGTTATTATAATGTAAAAGCTGT
GTGTAATCTCATACATTTCTTGGCAAATTACTCTGTGAATTCTTGCCTCTTTATATGAAT
TTTATGTTCATCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 10 10 10 10 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 50 50 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 20 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 25 55 55 25 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 20 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1AW22TF U 1
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AF RS1D058TF U 1
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AF RS1AH30TF U 82
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RD RS1AW22TF 610 0 0
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TCCTCTCCCATTTCCCCTGCTACTCAGCTTGGTTCGAGCAGAAGTGCTACTATGTTGGCC
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GGCTTCATGCTTGTCCCTTACGCTACCTTCTTTGCTCCTCCTGGATCCGGAGGTGGAGGT
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CAATACAATG

QA 1 610 1 610
DS 

RD RS1DX45TF 656 0 0
GG
AAGCTTTCAAAGGACTACATCGATCAATGGCGTCCTCTCCCATTTCCCCTGCTACTCAGC
TTGGTTCGAGCAGAAGTGCTACTATGTTGGCCATGTCGCGTGGGATGATGTTTGTGAAGC
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TTCTTCTTGTCGGGGCTCTTTCTCTCCCTACTGGCTTCATGCTTGTCCCTTACGCTACCT
TCTTTGCTCCTCCTGGATCCGGAGGTGGAGGTGGTGGTACTCCAGCCAAGGATGCACTTG
GAAACGATGTCATTGCCGCAGAATGGCTCAAGACTCATGGTGCTGGTGATCGAACCTTGA
CTCAAGGATTGAAGGGAGATCCAACTTACCTAGTTGTGGAGAACGACAAGACACTAGCGA
CTTACGGTATAAACGCAGTGTGCACTCATCTAGGATGTGTTGTGCCGTGGAACAAAGCTG
AGAACAAGTTCCTATGTCCTTGCCATGGATCCCAATACAATGCTCAAG*CAGAGTCGTTA
GAGGTCCAGCTCCATTGTCGCTTGCCTTGGCACATGCGGATATTGATGACG
TGG

QA 3 653 3 653
DS 

RD RS1D058TF 757 0 0
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TCCTCTCCCATTTCCCCCGCTATTCAGCTTGGTTCGAGCAGAAGTGCTACTATGTTGGCC
ATGTCGCGTGGGATGATGTTTGTGAAGCCAACGAGGACGAGTCACCAGATGGTGAGGAAG
GAGAAGATTGGTCTGAGAATCGCTTGTCAGGCGACGAGTATACCAGCAGACAACGTTCCA
GACATGGAAAAGAGGAAAACTTTGAATCTTCTTCTTGTCGGGGCTCTTTCTCTCCCTACT
GGCTTCATGCTTGTCCCTTACGCTACCTTCTTCGCTCCTCCTGGATCCGGAGGTGGAGGT
GGTGTTACTCCAGCCAAGGATGCACTTGGAAACGATGTCATTGCCGCAGAATGGCTTAAG
ACTCATGGTGCTGGTGATCGAACCTTGACTCAAGGATTGAAGGGAGATCCAACTTACCTA
GTTGTGGAGAACGACAAGACACTAGCGACCTACGGTATAAACGCAGTGTGCACTCATCTA
GGATGTGTTGTGCCGTGGAACAAAGCTGAGAACAAGTTCCTATGTCCTTGCCATGGATCC
CAATACAATGCTCAAGGCAGAGTCGTTAGAGGTCCAGCTCCATTGTCGCTTGCCTTGGCA
CATGCGGATATTGATGACG*TGGAAAGGT*GTGTTTGTTCCATGGGTTGAAACTGACTTC
AG*ACTGGTGATGCTCCTTGGTGGTCTAAA*TCTCTC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RS1FV72TF 750 0 0
GG
CTTTTCACCAAGCTTTCAAAGAACTACATCAATCAATGGCGTCCTCTCCCATTTCCCCTG
CTACTCAGCTTGGTTCGAGCAGAAGTGCTACTATGTTGGCCATGTCGCGTGGGATGATGT
TTGTGAAGCCAACGAGGACGAGTCACCAGATGGTGAGGAAGGAGAAGATTGGTCTGAGAA
TCGCTTGTCAGGCGACGAGTATTCCAGCAGACAACGTTCCAGACATGGAAAAGAGGAAAA
CTTTGAATCTTCTTCTTGTCGGGGCTCTTTCTCTCCCTGCTGGCTTCATGCTTGTCCCTT
ACGCTACCTTCTTTGCTCCTCCTGGATCCGGAGGTGGAGGTGGTGGTACTCCAGCCAAGG
ATGCACTTGGAAACGATGTCATTGCCGCAGAATGGCTCAAGACTCATGGTGCTGGTGATC
GAACCTTGACTCAAGGATTGAAGGGAGATCCAACTTACCTAGTTGTGGAGAACGACAAGA
CACTAGCGACTTACGGTATAAACGCAGTGTGCACTCATCTAGGATGTGTTGTGCCGTGGA
ACAAAGCTGAGAACAAGTTCCTATGTCCTTGCC***GATCCCAATACAATGCTCAAGGCA
GAGTCGTTAGAGGTCCAGCTCCATTGTCGCTTGCCTTGGCACATGCGGATATTGATGACG
GTGGAAAGGTTGTGTTTGTTCCATGGGTTGAAACTGACTTCAG*ACTGGTGATGCCCCTT
GGTGGTCTTAA*TCTCTCTTACAACAA
C

QA 3 749 3 749
DS 

RD RS1AH30TF 702 0 0
ACTCAGCTTGGTTCGAGCAGAAGTGCTACTATGTTGGCCATGTCGCGTGGGATGATGTTT
GTGAAGCCAACGAGGACGAGTCACCAGATGGTGAGGAAGGAGAAGATTGGTCTGAGAATC
GCTTGTCAGGCGACGAGTATTCCAGCAGACAACGTTCCAGACATGGAAAAGAGGAAAACT
TTGAATCTTCTTCTTGTCGGGGCTCTTTCTCTCCCTACTGGCTTCATGCTTGTCCCTTAC
GCTACCTTCTTTGCTCCTCCTGGATCCGGAGGTGGAGGTGGTGGTACTCCAGCCAAGGAT
GCACTTGGAAACGATGTCATTGCCGCAGAATGGCTCAAGACTCATGGTGCTGGTGATCGA
ACCTTGACTCAAGGATTGAAGGGAGATCCAACTTACCTAGTTGTGGAGAACGACAAGACA
CTAGCGACTTACGGTATAAACGCAGTGTGCACTCATCTAGGATGTGTTGTGCCGTGGAAC
AAAGCTGAGAACAAGTTCCTATGTCCTTGCCATGGACCCCAATACAATGCTCAAGGCAGA
GTCGTTAGAGGTCCAGCTCCATTGTCGCTTGCCTTGGCACATGCGGATATTGATGACGGT
GGAAAGGTTGTGTTTGTTCCATGGGTTGAAACTGACTTCAG*ACTGGTGATGCCCCTTGG
TGGTCTTAAATCTCTCTTACAACAA*CTCTTTTTGTGGGGAG

QA 1 702 1 702
DS 

RD RS1D058JQ 825 0 0
CTCCCATTTCCCCCGCTATTCAGCTTG*TTCGAGCAGAAGTGCTACTATGTGGGCCATGT
CGCGTGGGATGATGTT*GTGAAGCCAACGAGGACGAGTCACCAGATGGTGAGGAAGGAGA
AGATTGGTCTGAGAATCGCTTGTCAGGCGACGAGTATACCAGCAGACAACGTTCCAGACA
TGGAAAAGAGGAAAACTTTGAATCTTCTTCTTGTCGGGGCTCTTTCTCTCCCTACTGGCT
TCATGCTTGTCCCTTACGCTACCTTCTTCGCTCCTCCTGGATCCGGAGGTGGAGGTGGTG
TTACTCCAGCCAAGGATGCACTTGGAAACGATGTCATTGCCGCAGAATGGCTTAAGACTC
ATGGTGCTGGTGATCGAACCTTGACTCAAGGATTGAAGGGAGATCCAACTTACCTAGTTG
TGGAGAACGACAAGACACTAGCGACCTACGGTATAAACGCAGTGTGCACTCATTTAGGAT
GTGTTGTGCCGTGGAACAAAGCTGAGAACAAGTTCCTATGTCCTTGCCATGGATCCCAAT
ACAATGCTCAAGGCAGAGTCGTTAGAGGTCCAGCTCCATTGTCGCTTGCCTTGGCACATG
CGGATATTGATGACGGTGGAAAGGTTGTGTTTGTTCCATGGGTTGAAACTGACTTCAGGA
CTGGTGATGCTCCTTGGTGGTCTTAAATCTCTCTTACAACAA*CTCTTTTTGTGGGGAGA
AGAATGGGGG*TGGCTGTCTTTTTGTGTTTGAATGTTAATATAATGTAAAAGCTGTGTGT
AATCTCATACATTTCATGGCAAATTACTCTGTGAATTCTTGCCTC

QA 1 825 1 825
DS 

RD RS1AH30JQ 848 0 0
TCCCATTTCCCCTGCTACTCAGCTTGGTTCGAGCAGAAGTGCTACTATGTTGGCCATGTC
GCGTGGGATGATGTTTGTGAAGCCAACGAGGACGAGTCACCAGATGGTGAGGAAGGAGAA
GATTGGTCTGAGAATCGCTTGTCAGGCGACGAGTATTCCAGCAGACAACGTTCCAGACAT
GGAAAAGAGGAAAACTTTGAATCTTCTTCTTGTCGGGGCTCTTTCTCTCCCTACTGGCTT
CATGCTTGTCCCTTACGCTACCTTCTTTGCTCCTCCTGGATCCGGAGGTGGAGGTGGTGG
TACTCCAGCCAAGGATGCACTTGGAAACGATGTCATTGCCGCAGAATGGCTCAAGACTCA
TGGTGCTGGTGATCGAACCTTGACTCAAGGATTGAAGGGAGATCCAACTTACCTAGTTGT
GGAGAACGACAAGACACTAGCGACTTACGGTATAAACGCAGTGTGCACTCATCTAGGATG
TGTTGTGCCGTGGAACAAAGCTGAGAACAAGTTCCTATGTCCTTGCCATGGACCCCAATA
CAATGCTCAAGGCAGAGTCGTTAGAGGTCCAGCTCCATTGTCGCTTGCCTTGGCACATGC
GGATATTGATGACGGTGGAAAGGTTGTGTTTGTTCCATGGGTTGAAACTGACTTCAGGAC
TGGTGATGCCCCTTGGTGGTCTTAAATCTCTCTTACAACAAACTCTTTTTGTGGGGAGAA
GAATGGGGGATGGCTGTCTTTTTGTGTTTGAATGTTATTATAATGTAAAAGCTGTGTGTA
ATCTCATACATTTCTTGGCAAATTACTCTGTGAATTCTTGCCTCTTTATATGAATTTTAT
GTTCATCC

QA 1 848 1 848
DS 

RD RS1DX45JQ 796 0 0
GCCATGTCGCGTGGGATGATGTTTGTGAAGCCAACGAGGACGAGTCACCAGATGGTGAGG
AAGGAGAAGATTGGTCTGAGAATCGCTTGTCAGGCGACGAGTATTCCAGCAGACAACGTT
CCAGACATGGAAAAGAGGAAAACTTTGAATCTTCTTCTTGTCGGGGCTCTTTCTCTCCCT
ACTGGCTTCATGCTTGTCCCTTACGCTACCTTCTTTGCTCCTCCTGGATCCGGAGGTGGA
GGTGGTGGTACTCCAGCCAAGGATGCACTTGGAAACGATGTCATTGCCGCAGAATGGCTC
AAGACTCATGGTGCTGGTGATCGAACCTTGACTCAAGGATTGAAGGGAGATCCAACTTAC
CTAGTTGTGGAGAACGACAAGACACTAGCGACTTACGGTATAAACGCAGTGTGCACTCAT
TTAGGATGTGTTGTGCCGTGGAACAAAGCTGAGAACAAGTTCCTATGTCCTTGCCATGGA
TCCCAATACAATGCTCAAGGCAGAGTCGTTAGAGGTCCAGCTCCATTGTCGCTTGCCTTG
GCACATGCGGATATTGATGACGGTGGAAAGGTTGTGTTTGTTCCATGGGTTGAAACTGAC
TTCAGGACTGGTGATGCCCCTTGGTGGTCTTAAATCTCTCTTACAACAAACTCTTTTTGT
GGGGAGAAGAATGGGGGATGGCTGTCTTTTTGTGTTTGAATGTTATTATAATGTAAAAGC
TGTGTGTAATCTCATACATTTCTTGGCAAATTACTCTGTGAATTCTTGCCTCTTTATATG
AATTTTATGTTCAT
TC

QA 1 794 1 794
DS 

RD RS1FV72JQ 794 0 0
CATGTCGCGTGGGATGATGTTTGTGAAGCCAACGAGGACGAGTCACCAGATGGTGAGGAA
GGAGAAGATTGGTCTGAGAATCGCTTGTCAGGCGACGAGTATTCCAGCAGACAACGTTCC
AGACATGGAAAAGAGGAAAACTTTGAATCTTCTTCTTGTCGGGGCTCTTTCTCTCCCTGC
TGGCTTCATGCTTGTCCCTTACGCTACCTTCTTTGCTCCTCCTGGATCCGGAGGTGGAGG
TGGTGGTACTCCAGCCAAGGATGCACTTGGAAACGATGTCATTGCCGCAGAATGGCTCAA
GACTCATGGTGCTGGTGATCGAACCTTGACTCAAGGATTGAAGGGAGATCCAACTTACCT
AGTTGTGGAGAACGACAAGACACTAGCGACTTACGGTATAAACGCAGTGTGCACTCATTT
AGGATGTGTTGTGCCGTGGAACAAAGCTGAGAACAAGTTCCTATGTCCTTGCC***GATC
CCAATACAATGCTCAAGGCAGAGTCGTTAGAGGTCCAGCTCCATTGTCGCTTGCCTTGGC
ACATGCGGATATTGATGACGGTGGAAAGGTTGTGTTTGTTCCATGGGTTGAAACTGACTT
CAGGACTGGTGATGCCCCTTGGTGGTCTTAAATCTCTCTTACAACAAACTCTTTTTGTGG
GGAGAAGAATGGGGGATGGCTGTCTTTTTGTGTTTGAATGTTATTATAATGTAAAAGCTG
TGTGTAATCTCATACATTTCTTGGCAAATTACTCTGTGAATTCTTGCCTCTTTATATGAA
TTTTATGTTCAT
CC

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 9

CO CL424Contig1 780 9 7 U
GGATGAATCCCTAGAGCACTCATTTAGCAAAAATCGAATCGGAATCTCAGTGATCGACCA
GAGAGTCAAATTCGATCGAGCAAAGATGACGGAGGCGATGATAAGGAAGAAGGCAGGGAT
GGCGAGCGTGAAGGACATGCCTCTGCTTCAAGATGGTCCGCCACCGGGTGGATTCGCGCC
GGTTCGATATGCTCGCCGGATATCCAATACGGGTCCTAGCGCGATGGCTATTTTCCTTAC
TGTTTCTGGTGCATTTGCTTGGGGGATGTACCAGGTCGGCCAGGGTAACAAGATCCGCAG
GGCTTTGAAGGAAGAGAAATATGCTGCTCGTAGAGCTATACTTCCCATTCTTCAAGCTGA
AGAAGATGAAAGGTTTGTGTCTGAGTGGAAAAAGTATCTGGACTACGAGGCAGATGTAAT
GAAGGATGTTCCGGGATGGAAAGTTGGCGAGAACGTTTATAATTCTGGTCGTTGGATGCC
ACCGGCGACTGGGGAACTCCGTCCTGATGTCTGGTGATCCTCTTCTCAGTTTCTCACAAA
TGCATTTGATGATGATGGTGATGAATGAATGAATTGTTTCAGTGAGGGTTAATAACATGT
TCTTGTTTTATCTTTTTCACTGGGTAATAAGAAGAAGAATGATTCAACAGACAGTTGCTC
TTGTACTGGTTTTGCTGGAACTTTAATCGTTGTGTGTGTTTGTTTATGTAATTGTTCCAA
TGGTAAAATGAGACAAAAAAAAAACAGCTTTTGTCAACAATCATTCAAGATTGGTTTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 35 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 35 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BL18JQ C 1
AF RS1BL18TF U 141
AF RS1FZ78JQ C 52
AF RS1AV42TF U 35
AF RS1FZ78TF U 20
AF RS1FO58JQ C 34
AF RS1FO58TF U 34
AF RS1AC64TF U 177
AF RS1GL59TF U 285
BS 1 21 RS1BL18JQ
BS 22 35 RS1FZ78TF
BS 36 140 RS1AV42TF
BS 141 743 RS1BL18TF
BS 744 744 RS1AC64TF
BS 745 755 RS1BL18TF
BS 756 780 RS1AC64TF

RD RS1BL18JQ 756 0 0
GGATGAATCCCTAGAGCACTCATTTAGCAAAAATCGAATCGGAATCTCAGTGATCGACCA
GAGAGTCAAATTCGATCGAGCAAAGATGACGGAGGCGATGATAAGGAAGAAGGCAGGGAT
GGCGAGCGTGAAGGACATGCCTCTGCTTCAAGATGGTCCGCCACCGGGTGGATTCGCGCC
GGTTCGATATGCTCGCCGGATATCCAATACGGGTCCTAGCGCGATGGCTATTTTCCTTAC
TGTTTCTGGTGCATTTGCTTGGGGGATGTACCAGGTCGGCCAGGGTAACAAGATCCGCAG
GGCTTTGAAGGAAGAGAAATATGCTGCTCGTAGAGCTATACTTCCCATTCTTCAAGCTGA
AGAAGATGAAAGGTTTGTGTCTGAGTGGAAAAAGTATCTGGACTACGAGGCAGATGTAAT
GAAGGATGTTCCGGGATGGAAAGTTGGCGAGAACGTTTATAATTCTGGTCGTTGGATGCC
ACCGGCGACTGGGGAACTCCGTCCTGATGTCTGGTGATCCTCTTCTCAGTTTCTCACAAA
TGCATTTGATGATGATGGTGATGAATGAATGAATTGTTTCAGTGAGGGTTAATAACATGT
TCTTGTTTTATCTTTTTCACTGGGTAATAAGAAGAAGAATGATTCAACAGACAGTTGCTC
TTGTACTGGTTTTGCTGGAACTTTAATCGTTGTGTGTGTTTGTTTATGTAATTGTTCCAA
TGGTAAAATGAGACAAAAAAAAA*CAGCTTTTGTC
G

QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1BL18TF 616 0 0
CTCTGCTTCAAGATGGTCCGCCACCGGGTGGATTCGCGCCGGTTCGATATGCTCGCCGGA
TATCCAATACGGGTCCTAGCGCGATGGCTATTTTCCTTACTGTTTCTGGTGCATTTGCTT
GGGGGATGTACCAGGTCGGCCAGGGTAACAAGATCCGCAGGGCTTTGAAGGAAGAGAAAT
ATGCTGCTCGTAGAGCTATACTTCCCATTCTTCAAGCTGAAGAAGATGAAAGGTTTGTGT
CTGAGTGGAAAAAGTATCTGGACTACGAGGCAGATGTAATGAAGGATGTTCCGGGATGGA
AAGTTGGCGAGAACGTTTATAATTCTGGTCGTTGGATGCCACCGGCGACTGGGGAACTCC
GTCCTGATGTCTGGTGATCCTCTTCTCAGTTTCTCACAAATGCATTTGATGATGATGGTG
ATGAATGAATGAATTGTTTCAGTGAGGGTTAATAACATGTTCTTGTTTTATCTTTTTCAC
TGGGTAATAAGAAGAAGAATGATTCAACAGACAGTTGCTCTTGTACTGGTTTTGCTGGAA
CTTTAATCGTTGTGTGTGTTTGTTTATGTAATTGTTCCAATGGTAAAATGAGACAAAAAA
AAA*CAGCTTTTGTC
G

QA 1 615 1 615
DS 

RD RS1FZ78JQ 683 0 0
A
ATCGACCAGAGAGTCAAATTCGATCGAGCAAAGATGACGGAGGCGATGATAAGGAAGAAG
GCAGGGATGGCGAGCGTGAAGGACATGCCTCTGCTTCAAGATGGTCCGCCACCGGGTGGA
TTCGCGCCGGTTCGATATGCTCGCCGGATATCCAATACGGGTCCTAGCGCGATGGCTATT
TTCCTTACTGTTTCTGGTGCATTTGCTTGGGGGATGTACCAGGTCGGCCAGGGTAACAAG
ATCCGCAGGGCTTTGAAGGAAGAGAAATATGTTGCTCGTAGAGCTATACTTCCCATTCTT
CAAGCTGAAGAAGATGAAAGGTTTGTGTCTGAGTGGAAAAAGTATCTGGACTACGAGGCA
GATGTAATGAAGGATGTTCCGGGATGGAAAGTTGGCGAGAACGTTTATAATTCTGGTCGT
TGGATGCCACCGGCGACTGGGGAACTCCGTCCTGATGTCTGGTGATCCTCTTCTCAGTTT
CTCACAAATGCATTTGATGATGATGGTGATGAATGAATGAATTGTTTCAGTGAGGGTTAA
TAACATGTTCTTGTTTTATCTTTTTCACTGGGTAATAAGAAGAAGAATGATTCAACAGAC
AGTTGCTCTTGTACTGGTTTTGCTGGAACTTTAATCGTTGTGTGTGTTTGTTTATGTAAT
TGTTCCAATGGTAAAATGAGAC

QA 2 683 2 683
DS 

RD RS1AV42TF 717 0 0
C
GAATCGGAATCTCAGTGATCGACCAGAGAGTCAAATTCGATCGAGCAAAGATGACGGAGG
CGATGATAAGGAAGAAGGCAGGGATGGCGAGCGTGAAGGACATGCCTCTGCTTCAAGATG
GTCCGCCACCGGGTGGATTCGCGCCGGTTCGATATGCCCGCCGGATATCCAATACGGGTC
CTAGCGCGATGGCTATTTTCCTTACTGTTTCTGGTGCATTTGCTTGGGGGATGTACCAGG
TCGGCCAGGGTAACAAGATCCGCAGGGCTTTGAAGGAAGAGAAATATGCTGCTCGTAGAG
CTATACTTCCCATTCTTCAAGCTGAAGAAGATGAAAGGTTTGTGTCTGAGTGGAAAAAGT
ATCTGGACTACGAGGCAGATGTAATGAAGGATGTTCCGGGATGGAAAGTTGGCGAGAACG
TTTATAATTCTGGTCGTTGGATGCCACCGGCGACTGGGGAACTCCGTCCTGATGTCTGGT
GATCCTCTTCTCAGTTTCTCACAAATGCATTTGATGATGATGGTGATGAATGAATGAATT
GTTTCAGTGAGGGTTAATAACATGTTCTTGTTTTATCTTTTTCACTGGGTAATAAGAAGA
AGAATGATTCAACAGACAGTTGCTCTTGTACTGGTCTTGCTGGAACTTTAATCGTTGTGT
GTGTTTGTTTATGTAATTGTTCCAATGGTAAA*TGAGACAAAAAAA
CAGCTTTTGC

QA 2 707 2 707
DS 

RD RS1FZ78TF 714 0 0
GG
ATTTAGCAAAAATCGAATCGGAATCTCAGTAATCGACCAGAGAGTCAAATTCGATCGAGC
AAAGATGACGGAGGCGATGATAAGGAAGAAGGCAGGGATGGCGAGCGTGAAGGACATGCC
TCTGCTTCAAGATGGTCCGCCACCGGGTGGATTCGCGCCGGTTCGATATGCTCGCCGGAT
ATCCAATACGGGTCCTAGCGCGATGGCTATTTTCCTTACTGTTTCTGGTGCATTTGCTTG
GGGGATGTACCAGGTCGGCCAGGGTAACAAGATCCGCAGGGCTTTGAAGGAAGAGAAATA
TGTTGCTCGTAGAGCTATACTTCCCATTCTTCAAGCTGAAGAAGATGAAAGGTTTGTGTC
TGAGTGGAAAAAGTATCTGGACTACGAGGCAGATGTAATGAAGGATGTTCCGGGATGGAA
AGTTGGCGAGAACGTTTATAATTCTGGTCGTTGGATGCCACCGGCGACTGGGGAACTCCG
TCCTGATGTCTGGTGATCCTCTTCTCAGTTTCTCACAAATGCATTTGATGATGATGGTGA
TGAATGAATGAATTGTTTCAGTGAGGGTTAATAACATGTTCTTGTTTTATCTTTTTCACT
GGGTAATAAGAAGAAGAATGATTCAACAGACAGTTGCTCTTGTACTGGTTTTGCTGGAAC
TTTAATCGTTGTGTGTGTTTGTTTATGTAATTGTTCCAATGGTAAA
TGAGAC

QA 3 708 3 708
DS 

RD RS1FO58JQ 722 0 0
GG
GAATCGGAATCTCAGTGATCGACCAGAGAGTCAAATTCGATCGAGCAAAGATGACGGAGG
CGATGATAAGGAAGAAGGCAGGGATGGCGAGCGTGAAGGACATGCCTCTGCTTCAAGATG
GTCCGCCACCGGGTGGATTCGCGCCGGTTCGATATGCTCGCCGGATATCCAATACGGGTC
CTAGCGCGATGGCTATTTTCCTTACTGTTTCTGGTGCATTTGCTTGAGGGATGTACCAGG
TCGGCCAGGGTAACAAGATCCGCAGGGCTTTGAAGGAAGAGAAATATGCTGCTCGTAGAG
CTATACTTCCCATTCTTCAAGCTGAAGAAGATGAAAGGTTTGTGTCTGAGTGGAAAAAGT
ATCTGGACTACGAGGCAGATGTAATGAAGGATGTTCCGGGATGGAAAGTTGGCGAGAACG
TTTATAATTCTGGTCGTTGGATGCCACCAGCGACTGGGGAACTCCGTCCTGATGTCTGGT
GATCCTCTTCTCAGTTTCTCACAAATGCATTTGATGATGATGGTGATGAATGAATGAATT
GTTTCAGTGAGGGTTAATAACATGTTCTTGTTTTATCTTTTTCACTGGGTAATAAGAAGA
AGAATGATTCAACAGACAGTTGCTCTTGTACTGGTTTTGCTGGAACTTTAATCGTTGTGT
GTGTTTGTTTATGTAATTGTTCCAATGGTAAAATGAGACAAAAAAAAAACAGCTTTTGTC

QA 3 722 3 722
DS 

RD RS1FO58TF 707 0 0
GG
GAATCGGAATCTCAGTGATCGACCAGAGAGTCAAATTCGATCGAGCAAAGATGACGGAGG
CGATGATAAGGAAGAAGGCAGGGATGGCGAGCGTGAAGGACATGCCTCTGCTTCAAGATG
GTCCGCCACCGGGTGGATTCGCGCCGGTTCGATATGCTCGCCGGATATCCAATACGGGTC
CTAGCGCGATGGCTATTTTCCTTACTGTTTCTGGTGCATTTGCTTGAGGGATGTACCAGG
TCGGCCAGGGTAACAAGATCCGCAGGGCTTTGAAGGAAGAGAAATATGCTGCTCGTAGAG
CTATACTTCCCATTCTTCAAGCTGAAGAAGATGAAAGGTTTGTGTCTGAGTGGAAAAAGT
ATCTGGACTACGAGGCAGATGTAATGAAGGATGTTCCGGGATGGAAAGTTGGCGAGAACG
TTTATAATTCTGGTCGTTGGATGCCACCAGCGACTGGGGAACTCCGTCCTGATGTCTGGT
GATCCTCTTCTCAGTTTCTCACAAATGCATTTGATGATGATGGTGATGAATGAATGAATT
GTTTCAGTGAGGGTTAATAACATGTTCTTGTTTTATCTTTTTCACTGGGTAATAAGAAGA
AGAATGATTCAACAGACAGTTGCTCTTGTACTGGTTTTGCTGGAACTTTAATCGTTGTGT
GTGTTTGTTTATGTAATTGTTCCAATGGTAAAATGAGACAAAAAA

QA 3 707 3 707
DS 

RD RS1AC64TF 604 0 0
CGCCGGTTCGATATGCTCGCCGGATATCCAATACGGGTCCTAGCGCGATGGCTATTTTCC
TTACTGTTTCTGGTGCATTTGCTTGGGGGATGTACCAGGTCGGCCAGGGTAACAAGATCC
GCAGGGCTTTGAAGGAAGAGAAATATGCTGCTCGTAGAGCTATACTTCCCATTCTTCAAG
CTGAAGAAGATGAAAGGTTTGTGTCTGAGTGGAAAAAGTATCTGGACTACGAGGCAGATG
TAATGAAGGATGTTCCGGGATGGAAAGTTGGCGAGAACGTTTATAATTCTGGTCGTTGGA
TGCCACCGGCGACTGGGGAACTCCGTCCTGATGTCTGGTGATCCTCTTCTCAGTTTCTCA
CAAATGCATTTGATGATGATGGTGATGAATGAATGAATTGTTTCAGTGAGGGTTAATAAC
ATGTTCTTGTTTTATCTTTTTCACTGGGTAATAAGAAGAAGAATGATTCAACAGACAGTT
GCTCTTGTACTGGTTTTGCTGGAACTTTAATCGTTGTGTGTGTTTGTTTATGTAATTGTT
CCAATGGTAAAATGAGACAAAAAAAAAACAGCTTTTGTCAACAATCATTCAAGATTGGTT
TACT

QA 1 604 1 604
DS 

RD RS1GL59TF 450 0 0
GTAACAAGATCCGCAGGGCTTTGAAGGAAGAGAAATATGCTGCTCGTAGAGCTATACTTC
CCATTCTTCAAGCTGAAGAAGATGAAAGGTTTGTGTCTGAGTGGAAAAAGTATCTGGACT
ACGAGGCAGATGTAATGAAGGATGTTCCGGGATGGAAAGTTGGCGAGAACGTTTATAATT
CTGGTCGTTGGATGCCACCGGCGACTGGGGAACTCCGTCCTGATGTCTGGTGATCCTCTT
CTCAGTTTCTCACAAATGCATTTGATGATGATGGTGATGAATGAATGAATTGTTTCAGTG
AGGGTTAATATCATGTTCTTGTTTTATCTTTTTCACTGGGTAATAAGAAGAAGAATGATT
CAACAGACAGTTGCTCTTGTACTGGTTTTGCTGGAACTTTAATCGTTGTGTGTGTTTGTT
TGTGTAATTGTTCCAATGGTAAAATGAGAC

QA 1 450 1 450
DS 



AS 1 8

CO CL425Contig1 743 8 2 U
CTAAGAAATCACTGAGCGGCTATGAGATTTTTGTTCCAAATGAAACTTATATCATTTGGT
AGTGCCATTGACATACACAAACACTTGTGTTGAAACATATACAATTATTTATTTGCAAAT
TTACAAACGGATAGGTCCATGTTTTTTTTT*GTTTTCACTCTTCTACTGGTAGTTCATTC
TCTGTCCAGGCAACGTATCCTCCAGCAATGTCTGTAACCCCGGTGAAGCCAGCAGTGAGA
AGTTCAGTGGAAGCCATGAGAGATCTTTCTCCGCTCTCACAACCGATGATGATCTCGTCG
TGTTTCCTGAAATGAGACGATACCTGCCTTAGAAAACTCGGGTTCTTAACCATTCCTGAC
CCGACTCTGTACATGTAAGGCACGTTAATAGCTCTAGACGGATGTCCGATACTGAACTCG
TCCGGTGTCCTGACGTCAAGATGTTTGTATCCTGCTTGAGCTAGCTCACGCGCAACTCTC
ACCGGTACTGATGTCGGAACTCTAGCTGCTGCTTCCGCCGCAACATTTGCTCTGCCTGTT
GTTACTTTCCTCCATCGGAAGTTTGAGTTCTGACGATCTGCAACACTGACGACTCTTCTT
GTTGCCTTTGGTAGCTTCCACTTGAAAGATTCACACACTTGTAGAGGTGGAGATATAAAC
GATGACCAGCTCCCGATTCGTGCGGTTGTGTTTAAAGTAGATTCCATTTTTTTTCTTCTT
GTGTTCGTAGATACTTTGAGTTC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GW34JQ U 36
AF RS1GJ19JQ U 157
AF RS1D640TF C 1
AF RS1D640JQ U 3
AF RS1C579JQ U 37
AF RS1C579TF C 36
AF RS1GJ19TF C 157
AF RS1GW34TF C 157
BS 1 2 RS1D640TF
BS 3 743 RS1D640JQ

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GTTT

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DS 

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TTACAAACGGATAGGTCCATGTTTTTTTTT*GTTTTCACTCTTCTACTGGTAGTTCATTC
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AGTTCAGTGGAAGCCATGAGAGATCTTTCTCCGCTCTCACAACCGATGATGATCTCGTCG
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CCGACTCTGTACATGTAAGGCACGTTAATAGCTCTAGACGGATGTCCGATACTGAACTCG
TCCGGTGTCCTGACGTCAAGATGTTTGTATCCTGCTTGAGCTAGCTCACGCGCAACTCTC
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GTTACTTTCCTCCATCGGAAGTTTGAGTTCTGACGATCTGCAACACTGACGACTCTTCTT
GTTGCCTTTGGTAGCTTCCACTTGAAAGATTCACACACTTGTAGAGGTGGAGATATAAAC
GATGACCAGCTCCCGATTCGTGCGGTTGTGTTTAAAGTAGATTCCATTTTTTTTCTTCTT
GTGTTCGTAGATACTTT
GAGTTC

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DS 

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TGCCATTGACATACACAAACACTTGTGTTGAAACATATACAATTATTTATTTGCAAATTT
ACAAACGGATAGGTCCATGTTTTTTTTT*GTTTTCACTCTTCTACTGGTAGTTCATTCTC
TGTCCAGGCAACGTATCCTCCAGCAATGTCTGTAACCCCGGTGAAGCCAGCAGTGAGAAG
TTCAGTGGAAGCCATGAGAGATCTTTCTCCGCTCTCACAACCGATGATGATCTCGTCGTG
TTTCCTGAAATGAGACGATACCTGCCTTAGAAAACTCGGGTTCTTAACCATTCCTGACCC
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DS 

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CACTCTTCTACTGGTAGTTCATTCTCTGTCCAGGCAACGTATCCTCCAGCAATGTCTGTA
ACCCCGGTGAAGCCAGCAGTGAGAAGTTCAGTGGAAGCCATGAGAGATCTTTCTCCGCTC
TCACAACCGATGATGATCTCGTCGTGTTTCCTGAAATGAGACGATACCTGCCTTAAAAAA
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GACGGATGTCCGATACTGAACTCGTCCGGTGTCCTGACGTCAAGATGTTTGTATCCTGCT
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CCC

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DS 

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TCACTCTTCTACTGGTAGTTCATTCTCTGTCCAGGCAACGTATCCTCCAGCAATGTCTGT
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CTCACAACCGATGATGATCTCGTCGTGTTTCCTGAAATGAGACGATACCTGCCTTAGAAA
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TTGAGCTAGCTCACGCGCAACTCTCACCGGTACTGATGTCGGAACTCTAGCTGCTGCTTC
CGCCGCAACATTTGCTCTGCCTGTTGTTACTTTCCTCCATCGGAAGTTTGAGTTCTGACG
ATCTGCAACACTGACGACTCTTCTTGTTGCCTTTGGTAGCTTCCACTTGAAAGATTCACA
CACTTGTAGAGGTGGAGATATAAACGATGACCAGCTCCCGATTCGTGCGGTTGTGTTTAA
AGTAGATTCCATTTTTTTTCTTCTTGTGTTCGTAGATACTTT
CCC

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CCC

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DS 

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CACTCTTCTACTGGTAGTTCATTCTCTGTCCAGGCAACGTATCCTCCAGCAATGTCTGTA
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TCACAACCGATGATGATCTCGTCGTGTTTCCTGAAATGAGACGATACCTGCCTTAGAAAA
CTCGGGTTCTTAACCATTCCTGACCCGACTCTGTACATGTAAGGCACGTTAATAGCTCTA
GACGGATGTCCGATACTGAACTCGTCCGGCGTCCTGACGTCAAGATGTTTGTATCCTGCT
TGAGCTAGCTCACGCGCAACTCTCACCGGTACTGATGTCGGAACTCTAGCTGCTGCTTCC
GCCGCAACATTTGCTCTGCCTGTTGTTACTTTCCTCCATCGGAAGTTTGAGTTCTGACGA
TCTGCAACACTGACGACTCTTCTTGTTGCCTTTGGTAGCTTCCACTTGAAAGATTCACAC
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GTAGATTCCATTTTTTTTCTTCTTGTGTTCGTAGATACTTT
TCC

QA 1 581 1 581
DS 



AS 2 8

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GACTCCAAGAATAGAAGCTTGAAGCGAGACGGTATGACTCTCATCTCCAATATGAATCCC
ATGATCACCGATCGGTATCCTTCGGATCCCGGCCCGGTCCACTACACTTAAATACTTACA
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AGCAACCAGCTGTTTTCTCGGGGCCCATTCTCCACTTGGCGGAGCAGAGAACACAAGCAT
TGTATGAGTCCCATCTCTCGACCCAACGTTCTTTATATCGACGTGGACGCCTAGAGAGAG
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ACTCAAGCCATGGCCGAAAGGGTAAACAACCGGACCGTCGTAAAAACGGTAGGTACGGCC
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ATAGTCTTGAGGGTACCACGTCATCGGAAGCTTCCCTCCGGGGTTAGCAGCGCCAAATAA
TATATCAGCGATTGCGGTTCCACCTTCCTGACCCGGATACCCGGCCCAAACAATTGCTGA
GATCTTCGGGTCCTTCTCTGCGAAGATACATCAAT


BQ
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 20 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 5 20 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FG78JQ U 1
AF RS1FG78TF C -6
AF RS1FV18TF C -6
AF RS1D751JQ U 1
AF RS1EX30JQ U 1
BS 1 362 RS1D751JQ
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BS 742 742 RS1EX30JQ
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RD RS1FG78JQ 586 0 0
CCTTAAAAGGTTATCCTCACATCAATCGATATGATACAACAATCCATTTGTTTCTTTAAA
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QA 1 586 1 586
DS 

RD RS1FG78TF 673 0 0
TTTTTTTT
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ACATTTTAATTTCTTGACAGTTATTCAATAACAAGAAAAAAGCAGAATCAAGACCTGATG
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GCAACCAGCTGTTTTCTCGGGGCCCATTCTCCACTTGGCGGAGCAGAGAACACAAGCATT
GTATGAGTCCCATCTCTCGACCCAACGTTCTTTATATCGACGTGGACGCCTAGAGAGAGA
CGATTACACCTAGCGTGCGTCACACGTACCGACTTCCCTGATACGGTGCTGTTTCTACCA
CGTACAGCTATTGGAATCACCTTAGGCGCGTCGGCTATGCTGTGCGTGAAGCGAGTGTAA
CTCAAGCCATGGCCGAAAGGGTAAACAACCGGACCGTCGTAAAAACGGTAGGTACGGCCC
GGTATACGCTTCGACCGGATAGCTCTCATCGACATTTCAGTCATAGGTAAGTTCGTTAGA
TAGTC

QA 9 673 9 673
DS 

RD RS1FV18TF 706 0 0
TTTTTTTT
CTTAAAAGGTTATCCTCACATCAATCGACATGATACAACAATCCATTTGTTTCTTCAGAA
ACAATTTAATTTCTTGACAGTTATTCAATAACAAGAAAAAAGCAGAATCAAGACTTGATG
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TGATCACCGATCGGTATCCTTCGGATACCCGCCCAGTCCACTACACTTAAATACTTACAC
ACGTGTATATTCACCTGCACACGCTTGTTCTCCCCTGCCGCCACGTGTACTCTCGTGAAA
GCAACCAGCTGTTTTCTCGGGGCCCATTCTCCACTTGGCGGAGCCGAGAACACAAGCATC
GTATGAGTCCCATCTCTCGACCCAACGTTCTTTATATCAACGTGGACTCCTAGAGAGAGA
CGGTTACACCTAGCATGCGTCACACGCACCGACTTCCCTGATACGGTGCTGTTTCTACCA
CGTACAGCTATTGGAATCACCTTAGGCGCGTCGGCTATGCTGTGCGTGAAGCGAGTGTAA
CTCAAGCCATGACCGAAAGGGTAAACAACCGGACCGTCGTAAAAACGGTAGGTACGGCCC
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GACTCCAAGAATAGAAGCTTGAAGCGAGACGGTATGACTCTCATCTCCAATATGAATCCC
ATGATCACCGATCGGTATCCTTCGGATCCCGGCCCGGTCCACTACACTTAAATACTTACA
CACGTGTATATTCACCTGCACACGCTTGTTCTCCCCTGCCGCCACGTGTACTCTCGTGAA
AGCAACCAGCTGTTTTCTCGGGGCCCATTCTCCACTTGGCGGAGCAGAGAACACAAGCAT
TGCATGAGTCCCATCTCTCGACCCAACGTTCTTTATATCGACGTGGACGCCTAGAGAGAG
ACGATTACACCTAGCGTGCGTCACACGTACCGACTTCCCTGATACGGTGCTGTTTCTACC
ACGTACAGCTATTGGAATCACCTTAGGCGCGTCGGCTATGCTGTGCGTGAAGCGAGTGTA
ACTCAAGCCATGGCCGAAAGGGTAAACAACCGGACCGTCGTAAAAACGGTAGGTACGGCC
CGGTATACGCTTCGACCGGATAGCTCTCATCGACATTTCAGTCATAGGTAAGTTCGTTAG
ATAGTCTTGAGGGTACCACGTCATCGGAAGCTTCCCTCCGGGGTTAGCAGCGCCAAATAA
TATATCAGCGATTGCGGTTCCGCCTTCCTGACCCGGATACCCGGCCCAAACAATTGCTGA
GATCTTCGGGTCCTTCTCTGCGAAGATACATCAAT

QA 1 815 1 815
DS 

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GACTCCAAGAATAGAAGCTTGAAGCGAGACGGTATGACTCCCATCTCCAATATGAATCCC
ATGATCACCGATCGGTATCCTTCGGATACCCGCCCGGTCCACTACACTTAAATACTTACA
CACGTGTATATTCACCTGCACACGCTTGTTCTCCCCTGCCGCCACGTGTACTCTCGTGAA
AGCAACCAGCTGTTTTCTCGGGGCCCATTCTCCACTTGGCGGAGCCGAAAACACAAGCAT
CGTATGAGTCCCATCTCTCGACCCAACGTTCTTTATATCAACGTGGACTCCTAGAGAGAG
ACGGTTACACCTAGCATGCGTCACACGCACCGACTTCCCTGATACGGTGCTGTTTCTACC
ACGTACAGCTATTGGAATCACCTTAGGCGCGTCGGCTATGCTGTGCGTGAAGCGAGTGTA
ACTCAAGCCATGACCGAAAGGGTAAACAACCGGACCGTCGTAAAAACGGTAGGTACGGCC
CGGTATACGCTTCGACCGGATTGCTCTCATAGACATTTCCGTCATAGGTAAGTTCGTTAG
ATAGTCTTGAGGGTACCACGTCATCGGAAGCTTCCCTCCGGGGTTAGCAGCGCCAAATAA
TATATCAGCGATTGCGGTTCCACCTTCCTGACCCGGATACCCGGCCCAAACAATTGCTGA
GATCTT

QA 1 786 1 786
DS 



CO CL426Contig2 1697 3 7 U
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TGTTCTATACGACACACAACATTACACTGGTACTCCTGAAGAAGCAGCTGCTAAATCCAT
CAAAGCTGGCTTGGATTTGGATTGTGGACCGTTTCTAGGAGCTCATACCATCGATGCGGT
GAACAAAAACCTGTTGCGTGAGTCAGACATCGACAATGCCGTAATCAACACGCTAACAGT
ACAAATGAGACTAGGAATGTTCGACGGCGACATAGCGACTCAGCCTTATGGGCACCTTGG
ATCAGCACGCGTTTGTACGCCAGTTCACAAGGGACTAGCTCTAGAAGCAGCTCATCAAGG
AATCGTCCTACTCAAGAACCTCGGCCCGTCTCCACCTCTCTCTCGTCACAGCCACCGTAC
GGTAGCGGTTATCGGACCAAATGCGGACGCAACAGTCACGATGATTGGTAACTACGCAGG
GATTGCCTGTGGATATACCAGTCCGGTTCAGGGTATAGCCGGTTATGCACGAACGATTCA
CAACAAAGGTTGCGCGGACGTACACTGCATGGACGATAGATTGTTCGATAGGGCGGCTGA
GGCGGCTCGTAAAGCTGATGCGACGGTTCTTGTGATGGGTTTGGACCAGTCTATTGAAGC
TGAGTTCAAAGACAGAAACAATTTGCTCTTGCCTGGAAAACAACAAGAGCTTATCTCTAG
AGTTGCTCGGGCCTCTAAAGGCCCAGTTGTTTTAGTTTTAATGTCTGGTGGGCCTATTGA
TGTATCTTTCGCAGAGAAGGATCCGAAGATCTCAGCAATTGTTTGGGCCGGGTATCCGGG
TCAGGAAGGTGGAACCGCAATCGCTGATATATTATTTGGCGCTGCTAACCCCGGAGGGAA
GCTTCCGATGACGTGGTACCCTCAAGACTATCTAACGAACTTACCCATGACGGAAATGTC
TATGAGAGCAATCCGGTCGAAGCGTATACCGGGCCGTACCTACCGTTTTTACGACGGTCC
GGTTGTTTACCCTTTCGGTCATGGCTTGAGTTACACTCGCTTCACGCACAGCATAGCCGA
CGCGCCTAAGGTGATTCCAATAGCTGTACGTGGTAGAAACAGCACCGTATCAGGGAAGTC
GGTGCGTGTGACGCATGCTAGGTGTAACCGTCTCTCTCTAGGAGTCCACGTTGATATAAA
GAACGTTGGGTCGAGAGATGGGACTCATACGATGCTTGTGTTCTCGGCTCCGCCAAGTGG
AGAATGGGCCCCGAGAAAACAGCTGGTTGCTTTCACGAGAGTACACGTGGCGGCAGGGGA
GAACAAGCGTGTGCAGGTGAATATACACGTGTGTAAGTATTTAAGTGTAGTGGACCGGGC
GGGTATCCGAAGGATACCGATCGGTGATCATGGGATTCATATTGGAGATGAGAGTCATAC
CGTCTCGCTTCAAGCTTCTATTCTTGGAGTCATCAGGTCTTGATTTTGCTTTTTTCTTGT
TATTGAATAACTGTCAAGAAATTAAATTGTTTTTGAAGAAACAAATGGATTGTTGTATCA
TATCGATTGATGTGATGATAACCTTTTAAGGAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGTGATTCTTA
AGATTCAATCAAATATTTGAAATTGAGTTGTATGGCCTATGATTCGTTGAAAATAAATCT
TATAGCTCGTTATTATG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EX30TF U 1
AF RS1ET78TF U 310
AF RS1ET78JQ C 903
BS 1 401 RS1EX30TF
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BS 744 975 RS1ET78TF
BS 976 1697 RS1ET78JQ

RD RS1EX30TF 753 0 0
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TGTTCTATACGACACACAACATTACACTGGTACTCCTGAAGAAGCAGCTGCTAAATCCAT
CAAAGCTGGCTTGGATTTGGATTGTGGACCGTTTCTAGGAGCTCATACCATCGATGCGGT
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ACAAATGAGACTAGGAATGTTCGACGGCGACATAGCGACTCAGCCTTATGGGCACCTTGG
ATCAGCACGCGTTTGTACGCCAGTTCACAAGGGACTAGCTCTAGAAGCAGCTCATCAAGG
AATCGTCCTACTCAAGAACCTCGGCCCGTCTCCACCTCTCT**CGTCACAGCCACCGTAC
GGTAGCGGTTATCGGACCAAATGCGGACGCAACAGTCACGATGATTGGTAACTACGCAGG
GATTGCCTGTGGATATACCAGTCCGGTTCAGGGTATAGCCGGTTATGCACGAACGATTCA
CAACAAAGGTTGCGCGGACGTACACTGCATGGACGATAGATTGTTCGATAGGGCGGCTGA
GGCGGCTCGTAAAGCTGATGCGACGGTTCTTGTGATGGGTTTGGACCAGTCTATTGAAGC
TGAGTTCAAAGACAGAAACAATTTGCTCTTGCCTGGAAAACA*CAAGAGCTTATCTCTAG
AGTTGCTCGGGCCTCTAAAGGCC
AGTTGTTTAG

QA 1 743 1 743
DS 

RD RS1ET78TF 666 0 0
GGTTTGTACGCCA
GTTCACAAGGGACTAGCTCTAGAAGCAGCTCATCAAGGAATCGTCCTACTCAAGAACCTC
GGCCCGTCTCTACCTCTCTCTCGTCACAGCCACCGTACGGTAGCGGTTATCGGACCAAAT
GCGGACGCAACAGTCACGATGATTGGTAACTACGCAGGGATTGCCTGTGGATATACCAGT
CCGGTTCAGGGTATAGCCGGTTATGCACGAACGATTCACAACAAAGGTTGCGCGGACGTA
CACTGCATGGACGATAGATTGTTCGATAGGGCGGCTGAGGCGGCTCGTAAAGCTGATGCG
ACGGTTCTTGTGATGGGTTTGGACCAGTCTATTGAAGCTGAGTTCAAAGACAGAAACAGT
TTGCTCTTGCCTGGAAAACAACAAGAGCTTATCTCTAGAGTTGCTCGGGCCTCTAAAGGC
CCAGTTGTTTTAGTTTTAATGTCTGGTGGGCCTATTGATGTATCTTTCGCAGAGAAGGAT
CCGAAGATCTCAGCAATTGTTTGGGCCGGGTATCCGGGTCAGGAAGGTGGAACCGCAATC
GCTGATATATTATTTGGCGCTGCTAACCCCGGAGGGAAGCTTCCGATGACGTGGTACCCT
CAAGACTATCTAACGAACTTACCCATGACGGAAATGTCTATGAGAGCAATCCG

QA 14 666 14 666
DS 

RD RS1ET78JQ 795 0 0
TTCCGATGACGTGGTACCCTCAAGACTATCTAACGAACTTACCCATGACGGAAATGTCTA
TGAGAGCAATCCGGTCGAAGCGTATACCGGGCCGTACCTACCGTTTTTACGACGGTCCGG
TTGTTTACCCTTTCGGTCATGGCTTGAGTTACACTCGCTTCACGCACAGCATAGCCGACG
CGCCTAAGGTGATTCCAATAGCTGTACGTGGTAGAAACAGCACCGTATCAGGGAAGTCGG
TGCGTGTGACGCATGCTAGGTGTAACCGTCTCTCTCTAGGAGTCCACGTTGATATAAAGA
ACGTTGGGTCGAGAGATGGGACTCATACGATGCTTGTGTTCTCGGCTCCGCCAAGTGGAG
AATGGGCCCCGAGAAAACAGCTGGTTGCTTTCACGAGAGTACACGTGGCGGCAGGGGAGA
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TAGCTCGTTATTATG

QA 1 795 1 795
DS 



AS 1 9

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ATTGGCAATTAGTGTTTTTGGAAATCTCAGCTTCATTATCTACACTGTTGTCGGATCTTA
ATTCCAAGTTTAAAACCTTCGAAATATTTAGTTTGTTATTTCATATTTAGCCCCC


BQ
45 45 45 45 45 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 5 55 55 5 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 25 40 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 30 30 30 10 10 10 10 

AF RS1B082JQ C 6
AF RS1B082TF U 6
AF RS1BZ77JQ C 1
AF RS1FA73JQ C 1
AF RS1FA73TF U 1
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DS 

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QA 1 515 1 515
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DS 



AS 2 8

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GCCTCTTCTGCTTTGATTCTTGCTTGCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 0 40 40 25 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 15 5 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D794JQ U 1
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AF RS1C535JQ U 18
AF RS1C535TF C 208
AF RS1FR54TF C 277
AF RS1D794TF C 296
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BS 393 396 RS1D794JQ
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BS 627 728 RS1C535JQ
BS 729 991 RS1C535TF

RD RS1D794JQ 511 0 0
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TCGCCATAAAGTCTAAATGTAAAACAGAGAACTAACAAGATAGATAAAAGGAGACACATC
ACCAAAAGCAGAGATCAAGACTCTGGCGATTAGTTTTGCGCTCAGGATGATTCAGCAGCG
GGTTGAGTCACACCATGCTTCACCAACAGCTTAGTAAGCGAGTCAGGAGAGTGGACATGG
TACTTAACACTCCCGGAAGGAGTCAGAAACACCTCAGCAAGCTCAAGCTTCTCAGACGTC
AAGCTAGTGCTGTCCATCGTCTTGCTCAAAACCTTCAAGGCAAGCTCCACCGCCTCTTCT
CTAGTCGCATCATCCTTGTAGTCTTGCTTCAAAATAAACTGAGCCGCCTGGTTGTTAGCT
CCCACAGCAGCAGCTTTCCAACCACCATAGTTCCCACTCGGGTCACTCATATACAGCTGA
AACCCATGGTTCTTGTCCCACCCTGCAAAAA

QA 1 511 1 511
DS 

RD RS1D457JQ 610 0 0
AC
CTTCAAATAAAATTCTCATAACATTGTGAAATTCAAGTTTCATCGCCATAAAGTCTAA*T
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GACTCTGGCGATTACTTTTGCGCTCAGGACGATTCAGCAGCGGGCTGAGTCACACCATGC
TTCACCAACAGCTTAGTAAGCGAGTCAGGAGAGTGAACATGGTACTTAACACTCCCCGAA
GGAGTCAGAAACACCTCAGCAAGCTCAAGCTTCTCAGACGTCAAGCTAGTGCTGTCCATC
GTCTTGCTCAGAACCTTCAAGGCAAGCTCAACCGCCTCTTCCCTCGTCGCATCATCCTTG
TAGTCTTGCTTCAGAATAGACTGAGCCGCCTGGTTGTTAGCTCCCACAGCAGCAGCTTTC
CAACCACCATAGTTCCCACTCGGGTCACTCATATACAGCTGAAACCCATGGTTCTTGTCC
CACCCTGCAAAAAGAAACGACACAC*AAAGGGACGAAGACCACCGAACTGCGTGTACCCT
TGCTTAGTATCACAGAGAGACTGAACAAGCTGCTCAACAGGCATGGGCTCCTGGTACATG
AAGGTGTA

QA 3 610 3 610
DS 

RD RS1C535JQ 711 0 0
A
CTTCAAATAAAATTCTCATAACATTGTGAAATTCAAGTTTCATCGCCATAAAGTCTAAAT
GTAAAACAGAGAACTAACAAGATAGATAAAAGGAGACACATCACCAAAAGCAGAGATCAA
GACTCTGGCGATTAGTTTTGCGCTCAGGATGATTCAGCAGCGGGTTGAGTCACACCATGC
TTCACCAACAGCTTAGTAAGCGAGTCAGGAGAGTGGACATGGTACTTAACACTCCCGGAA
GGAGTCAGAAACACCTCAGCAAGCTCAAGCTTCTCAGACGTCAAGCTAGTGCTGTCCATC
GTCTTGCTCAAAACCTTCAAGGCAAGCTCCACCGCCTCTTCTCTAGTCGCATCATCCTTG
TAGTCTTGCTTCAAAATAGACTGAGCCGCCTGGTTGTTAGCTCCCACAGCAGCAGCTTTC
CAACCACCATAGTTCCCACTCGGGTCACTCATATACAGCTGAAACCCATGGTTCTTGTCC
CACCCTGCAAAAAGAAAAGACACACCAAAGGGACGAAGACCACCGAACTGCGTGTACCCT
TGTTTAGTATCGCAAAAAGACTGAACAAGCTGCTCAACAGGCATGGGCTCCTGGTACATG
AAGGTGTAGCGCTGGACTTGGACTCTAGCAGTGTCGATGAGGATGTTGGCGTCGGACATG
ATGCCAGCGACGGCACAGGCGACGTGGTCGTCGATCTTGTACATTTTCTC

QA 2 711 2 711
DS 

RD RS1C535TF 784 0 0
AGCTTAGTAAGCGAGTCAGGAGAGTGGACATGGTACTTAACACTCC*GGAAGGAGTCAGA
AACAC*TCAGCAAGCTCAAGCTTCTCAGACGTCAAGCTAGTGCTGTCCATCGTCTTGCTC
AAAACTTTCAAGGCAAGCTCCACCGCCTCTTCTCTAGTCGCATCATCCTTGTAGTCTTGC
TTCAGAATAGACTGAGCCGCCTGGTTGTTAGCTCCCACAGCAGCAGCTTTCCAACCACCA
TAGTTCCCACTCGGGTCACTCATATACAGCTGAAACCCATGGTTCTTGTCCCACCCTGCA
AAAAGAAAAGACACACCAAAGGGACGAAGACCACCGAACTGCGTGTACCCTTGTTTAGTA
TCGCAGAGAGACTGAACAAGCTGCTCAACAGGCATGGGCTCCTGGTACATGAAGGTGTAG
CGCTGGACTTGGACTCTAGCAGTGTCGATGAGGATGTTGGCGTCGGACATGATGCCAGCG
ACGGCACAGGCGACGTGGTCGTCGATCTTGTACATTTTCTCGGAGGAGGTGGAGGTTTGG
AGAAGCTTGGAGGTGACTTTCTTCTCGCCGATCAAGACAACACCGTCTTTGGATAAGATG
CCGATGGCGGAACCTGCGTTGCCTATGGCCTCCATTGCGTACTCGACTTGGTAGAGACGG
CCTTCTGGGGAGAAGATTGTGGTGCGGCTATCATATCTTCGAGACATCTTCTAACCAAAC
CTGAGAGGAAGGAATTGCTTTCGATCTCTGATCGCCTCTTCTGCTTTGATTCTTGCTTGC
TTCC

QA 1 784 1 784
DS 

RD RS1FR54TF 711 0 0
GCAAGCTCAAGCTTCTCAGACGTCAAGCTAGTGCTGTCCATCGTCTTGCTCAGAAC*TTA
AGCGCAAGCTCAACCGCCTCTTCTCTAGTCGCATCATCCTTGTAATCTTGCTTCAGAATA
GACTGAGCCGCCTGGTTGTTAGCTCCCACAGCAGCAGCTTTCCAGCCACCGTAGTTCCCA
CTCGGGTCACTAATATACAGCTGAAACCCATGGTTCTTGTCCCACCCTGCAAAAAGAAAC
GACACACCAAAGGGACGAAGACCACCGAACTGCGTGTACCCTTGTTTAGTATCACAGAGA
GACTGAACAAGCTGCTCAACAGGCATGGGCTCCTGGTACATGAAGGTGTAGCGCTGTGCT
TGGACTCTAGCCGTGTTGATGAGGATGTTGGCGTCGGACATGATGCCAACGACGGCGCAG
GCGACGTGGTCGTCGATCTTGTACATTTTCTCGGAGGAGGTTGAGGTCTGGAGAAGCTTT
GAGGTGACTTTCTTCTCGCCGATCAAGACGACGCCGTCTTTGGATAAGATCCCGATGGCG
GAACCGGCGTTGCCAATGGCCTCCATTGCGTACTCGACTTGGTAGAGACGGCCTTCTGGG
GAGAAGATTGTGGTACGGCTATCATATCTTCGAGACATCTTCTAACCAAACCTGAGAGGA
AGGAATTGCTTTCGATCTCTGATCGCCTCTTCT
TCGATTCTTGCTTGGTCC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RS1D794TF 692 0 0
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CTTCTCTAGTCGCATCATCTTTGTAGTCTTGCTTCAGAATAGACTGAGCCGCCTGGTTGT
TAGCTCCCACAGCAGCAGCTTTCCAACCACCATAGTTCCCACTCGGGTCACTCATATACA
GCTGAAACCCATGGTTCTTGTCCCACCCTGCAAAAAGAAAAGACACACCAAAGGGACGAA
GACCACCAAACTGCGTGTACCCTTGTTTAGTATCACAGAGAGACTGAACAAGCTGCTCAA
CAGGCATGGGCTCCTGGTACATGAAGGTGTAGCGCTGGGCTCGGACTCTAGCAGTGTTGA
TGAGGATGTTGGCGTCGGACATGATGCCAGCGACGGCACAGGCGACGTGGTCGTCGATCT
TGTACATTTTCTCGGAGGAGGTGGAGGTTTGGAGAAGCTTGGAGGTGACTTTCTTCTCGC
CGATCAAGACAACACCGTCTTTGGATAAGATGCCGATGGCGGAACCTGAGTTGCCTATGG
CCTCCATTGCGTACTCGACTTGGTAGAGACGGCCTTCTGGGGAGAAGATTGTGGTGCGGC
TATCATATCTTCGAGACATCTTCTAACCAAACCTGAGAGGAAGGAATTGCTTTCGATCTC
TGATCGCCTCTTCT
GCTTTGATTCTTGCTTCC

QA 1 674 1 674
DS 



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TGTAAAACAGGGAACTAACAAGATAGATAAAAGGAGACACATCACCAAGCAGAGATCAAG
ACTCTCTGGCGATTACTGTTGCGCTCAGGACGATTCAGCAGCGGGCTGAGTCACACCATG
CTTCACCAACAGCTTAGTAAGCGAGTCAGGAGAGTGAACATGGTACTTAACACTCCCCGA
AGGAGTCAGAAACACCTCAGCAAGCTCAAGCTTCTCAGACGTCAAGCTAGTGCTGTCCAT
CGTCTTGCTCAAAACCTTAAACGCAAGCTCAACCGCCTCTTCCCTAGTCGCATCATCCTT
GTAATCTTGCTTCAAAATAAACTGAGCCGCCTGGTTGTTAGCTCCCACAGCAGCAGCTTT
CCAACCACCATAGTTCCCACTCGGGTCACTAATATACAGCTGAAACCCATGGTTCTTGTC
CCACCCTGCAAAAAGAAACGACACACCAAAGGGACGAAGACCACCGAACTGCGTGTACCC
TTGCTTAGTATCACAGAGAGACTGAACAAGCTGCTCAACAGGCATGGGCTCCTGGTACAT
GAAGGTGTAGCGCTGGGCTTGGACTCTAGCCGTGTTGATGAGGATGTTGGCGTCGGACAT
GATGCCAACGACGGCGCAGGCGACGTGGTCGTCGATCTTGTACATTTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FR54JQ U 1
AF RS1D457TF C 97
BS 1 135 RS1FR54JQ
BS 136 136 RS1D457TF
BS 137 165 RS1FR54JQ
BS 166 166 RS1D457TF
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BS 617 711 RS1FR54JQ

RD RS1FR54JQ 711 0 0
GCCTTCAAATAAAATTCTCATAACATTGTGAAATTCAAGTTTCATCGCCATAAAGTCTAA
TGTAAAACAGGGAACTAACAAGATAGATAAAAGGAGACACATCACCAAGCAGAGATCAAG
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CGTCTTGCTCAAAACCTTAAGCGCAAGCTCAACCGCCTCTTCTCTAGTCGCATCATCCTT
GTAATCTTGCTTCAAAATAAACTGAGCCGCCTGGTTGTTAGCTCCCACAGCAGCAGCTTT
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CCACCCTGCAAAAAGAAACGACACACCAAAGGGACGAAGACCACCGAACTGCGTGTACCC
TTGTTTAGTATCACAGAGAGACTGAACAAGCTGCTCAACAGGCATGGGCTCCTGGTACAT
GAAGGTGTAGCGCTGTGCTTGGACTCTAGCCGTGTTGATGAGGATGTTGGCGTCGGACAT
GATGCCAACGACGGCGCAGGCGACGTGGTCGTCGATCTTGTACATTTTCTC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RS1D457TF 615 0 0
ACACATCACC
AAGCAGAGATCAAGACTCT**GGCGATTACTTTTGCGCTCAGGACGATTCAGCAGCGGGC
TGAGTCACACCATGCTTCACCAACAGCTTAGTAAGCGAGTCAGGAGAGTGAACATGGTAC
TTAACACTCCCCGAAGGAGTCAGAAACACCTCAGCAAGCTCAAGCTTCTCAGACGTCAAG
CTAGTGCTGTCCATCGTCTTGCTCAGAACCTTCAAGGCAAGCTCAACCGCCTCTTCCCTC
GTCGCATCATCCTTGTAGTCTTGCTTCAGAATAGACTGAGCCGCCTGGTTGTTAGCTCCC
ACAGCAGCAGCTTTCCAACCACCATAGTTCCCACTCGGGTCACTCATATACAGCTGAAAC
CCATGGTTCTTGTCCCACCCTGCAAAAAGAAACGACACAC*AAAGGGACGAAGACCACCG
AACTGCGTGTACCCTTGCTTAGTATCACAGAGAGACTGAACAAGCTGCTCAACAGGCATG
GGCTCCTGGTACATGAAGGTGTAGCGCTGGGCTTGGACTCTAGCCGTGTTGATGAGGATG
TTGGCGTCGGACATGATGC*AGCGACGGCGCAGGCGACGTGGTCGTCGATCTTGTACATT
TTCTC

QA 11 615 11 615
DS 



AS 3 7

CO CL429Contig1 556 2 7 U
AAGATGTTTGGTTTTAAACAAGACCCAATTCATTTGGTCTTGTTTTACAGAATTTTTAAA
AGAACACAAAGAGATTGTCTATTGAATCATACATAGAAATAACGGCATACTTTGTTTTCA
TTAAAAAAGAGATAGTTTTGAGGTCTTCCTTTTCATCCCATGGCATACTTCTGAGTCCAG
CTCCGTGCAGTGGACTCATACTTGTTCTTGTCAGTCTTGTACATATGAGCAATCTCAGGT
ACCAAAGGATCATCCGGGTTTGGATCGGTTAACAAAGAACAGATCGATAGCAGCACCTTG
GAAATGGTGAGGGCAGGACTCCATTGCTCCTTCAAGATGTCGAGGCAAATGCTTCCGTTG
CTGTTAATGTTGGGATGGAACACCTTGGTCCTAAAGGCCACCTTAGGAGGTTTGAAAGGG
TGATCTGGAGGGAAATGAATGGTAACAAGGAAAACACCTCCAGCGTAAGGACTGTCTGAA
GGACCCATTATCGTTGCCTGCCAATGAAACATGTCTTCAGCAACAGGTCCTGCGCTACAA
GAGGTGGGTGGATCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BY02JQ U 7
AF RS1BY02TF C 1
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QA 1 170 1 170
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QA 1 556 1 556
DS 



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CGCGTAATTAGGAGAGGCCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AB09JQ U 411
AF RS1CN69TF C 1
BS 1 414 RS1CN69TF
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QA 5 181 5 181
DS 

RD RS1CN69TF 740 0 0
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CGCGTAATTAGGAGAGGCCC

QA 1 740 1 740
DS 



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BQ
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AF RS1A604JQ U 40
AF RS1A604TF C 40
AF RS1GN07JQ U 1
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C

QA 1 594 1 594
DS 

RD RS1A604TF 595 0 0
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GCAACCTTAGGAGGCTTGAAAGGGTAATCCGGAGGGAAATGAATGGTAACAAGGAAAACA
CCTCCAGCGTAGGGACTGTCTGAAGGACCCATTATCGTTGCCTGCCAATGAAAC
C

QA 1 594 1 594
DS 

RD RS1GN07JQ 698 0 0
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AAGACAAGACCAAACAACACCAGGAAGATTTCCAGTTTCTAGTTTCACAAAGATGTTTTT
TTTTTCCAAACAAACAAGACCTACTTCATTGGTCCTGTCTTCAGAAATTTCAAACGAGTA
CAGAAAGAGATCGTCTATTGAATCATGCATAGAAATCACGGTAGATTTTCGCATAAAAAG
AGATCGTTTAGTGGATTGGGGATCCCTTATCCTTTTCAGCCCATGGCATACTTCTGAGTC
CAGCTCCGTGCAGTGGACTCATACTTGTTCTTGTCAGTCTTGTACATATGAGCTATCTCA
GGCACCAAAGGATCATCCGGGTTTGGATCGGTTAACAAAGAACAGATCGACAAGAGCACC
TTGGAAATGGTGAGGGCAGGACTCCATTGCTCCTTCAAGATGTCGAGGCAGATGCTTCCA
TTGCTGTTAATGTTGGGATGGAACACCTTCGTCCTAAAGGCAACCTTAGGAGGCTTGAAA
GGGTAATCCGGAGGGAAATGAATGGTAACAAGGAAAACACCCCCAGCGTAGGGACTGTCT
GAAGGACCCATTATCGTTGCCTGCCAATGAAACATGTCTTCAGCAACAGGTCCTGCGCTA
CATGAAGTGGGTGGATCCTTCTGCAGATCCTTCAACTC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 2 9

CO CL430Contig1 579 3 1 U
GGTAGATTAATCTTTTTAGTTTTATTAAATCATAATGCACTCACACATCTATATGTGTTG
GCATCGAATATACACATTTTTTTTTTGTTACAGTTTTCTAAAACTCACCCATATGCGACT
TGAAAAAGGGTTAGAGAAAAGGAAAAACAAAATTGGATGTGAAAGCCCTAGTGTGTTGAT
CTGAGCTTCAACACTTTACGCTTGCCCAGGTGCCTTGACGACAGGTCCAACGCAAGCCTT
TGGGTTCTGGGTTCCCACAAGCTTAGGTGTGACGTTTGTGCATTCGAAAGTGGGTGGACC
ATCAGGTCCTTTGTACTCAATGTTAATGTCTCCAATCTCAACATTCTCACATGGATGTCC
CTTGCTGCACAATAGCTTCACTGCGTCCTTGTTCCCTGATGTTCCTCTAATATTCCTGAA
GGCAATGTCCACCAGCTTAATTGTTGATGGTTTGTTCTTGTTGCATTGGTTCCAAGGGCA
GTACTCCTGGTCAATGAGGATTGGGTTGCTAACTTTGTCAAGGATGATATTCTCAAAATG
AATACCGGCAGCGGTTGTGGCGCAAGCCGCAGAGGGCCC


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1BH88JQ U 1
AF RS1FE26JQ U 4
AF RS1BH88TF C 1
BS 1 579 RS1BH88JQ

RD RS1BH88JQ 579 0 0
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GCATCGAATATACACATTTTTTTTTTGTTACAGTTTTCTAAAACTCACCCATATGCGACT
TGAAAAAGGGTTAGAGAAAAGGAAAAACAAAATTGGATGTGAAAGCCCTAGTGTGTTGAT
CTGAGCTTCAACACTTTACGCTTGCCCAGGTGCCTTGACGACAGGTCCAACGCAAGCCTT
TGGGTTCTGGGTTCCCACAAGCTTAGGTGTGACGTTTGTGCATTCGAAAGTGGGTGGACC
ATCAGGTCCTTTGTACTCAATGTTAATGTCTCCAATCTCAACATTCTCACATGGATGTCC
CTTGCTGCACAATAGCTTCACTGCGTCCTTGTTCCCTGATGTTCCTCTAATATTCCTGAA
GGCAATGTCCACCAGCTTAATTGTTGATGGTTTGTTCTTGTTGCATTGGTTCCAAGGGCA
GTACTCCTGGTCAATGAGGATTGGGTTGCTAACTTTGTCAAGGATGATATTCTCAAAATG
AATACCGGCAGCGGTTGTGGCGCAAGCCGCAGAGGGCCC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RS1FE26JQ 573 0 0
G
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CGAATATACA**TTTTTTTTTTGTTACAGTTTTCTAAAACTCACCCATATGCGACTTGAA
AAAGGGTTAAAAAAAAGGAAAAACAAAATTGGATGTGAAAGCCCTAGTGTGTTGATCTGA
GCTTCAACACTTTACGCTTGCCCAGGTGCCTTGACGACAGGTCCAACGCAAGCCTTTGGG
TTCTGGGTTCCCACAAGCTTAGGTGTGACGTTTGTGCATTCGAAAGTGGGTGGACCATCA
GGTCCTTTGTACTCAATGTTAATGTCTCCAATCTCAACATTCTCACATGGATGTCCCTTG
CTGCACAATAACTTCACTGCGTCCTTGTTCCCTGATGTTCCTCTAATATTCCTGAAGGCA
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TCCTGGTCAATGAGGATTGGGTTGCTAACTTTGTCAAGGATGATATTCTCAAAATGAATA
CCGGCAGCGGTTGTGGCGCAAGCCGCA
AAAGG

QA 2 568 2 568
DS 

RD RS1BH88TF 579 0 0
GGTA
GATTAATCTTTTTAGTTTTATTAAATCATAATGCACTCACACATCTATATGTGTTGGCAT
CGAATATACACATTTTTTTTTTGTTACAGTTTTCTAAAACTCACCCATATGCGACTTGAA
AAAGGGTTAGAGAAAAGGAAAAACAAAATTGGATGTGAAAGCCCTAGTGTGTTGATCTGA
GCTTCAACACTTTACGCTTGCCCAGGTGCCTTGACGACAGGTCCAACGCAAGCCTTTGGG
TTCTGGGTTCCCACAAGCTTAGGTGTGACGTTTGTGCATTCGAAAGTGGGTGGACCATCA
GGTCCTTTGTACTCAATGTTAATGTCTCCAATCTCAACATTCTCACATGGATGTCCCTTG
CTGCACAATAGCTTCACTGCGTCCTTGTTCCCTGATGTTCCTCTAATATTCCTGAAGGCA
ATGTCCACCAGCTTAATTGTTGATGGTTTGTTCTTGTTGCATTGGTTCCAAGGGCAGTAC
TCCTGGTCAATGAGGATTGGGTTGCTAACTTTGTCAAGGATGATATTCTCAAAATGAATA
CCGGCAGCGGTTGTGGCGCAAGCCGCAGAGGGCC
C

QA 5 578 5 578
DS 



CO CL430Contig2 1425 6 11 U
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TCGGATAGAAACATTTTTTTTGTTACAGCTTTGTAAAAGTCTCCCTTACGTGACTTGAAA
AAGGGTACGAAAAAAGGAAAAACAAAATTGGATGTGAAAGCCCTAGTGTGTTGATCTGAG
CTTCAACACTTTACGCTTGCCCAGGTGCCTTGACAACAGGTCCAACGCAAGCCTTTGGGT
TCTGGGTTCCCACAAGCTTAGGTGTGACGTTTGTGCACTCGAAAGTGGGTGGACCATCAG
GTCCTTTGTATTCAATGTTAATGTCTCCAATCTCAACATTCTCACATGGATGTCCCTTGC
TGCACAATAGCTTCACTGCGTCCTTGTTCCCTGATGTTCCTCTAATCTTCCTGAAGGTAA
TGTCCACCAGCTTAATTGTTGATGGTTTGTTCTTGTTGCATTGGTTCCAAGGGCAGTACT
CCTGGTCGATGAGGATTGGGTTGCTAACGTTGTTAAGGATGATATCCTCAAAATGAATAC
CGGAAGCCGTTGTGGCGCAAGCCGCAAAGGGCCATGTCTTGATCCTCAGACCGTTATCGG
TTCCCTGGAGGGTGCAGTTCATAACCTTAATGTCATTTACATCTTGCTCCCATCCGTACC
TTCCAAGGCTTCCAACACTGATTCCATGTCCTGGACCGCACACAACTTTCTCGATGAGGA
GATTCTTCATCCCATCTCCCACGGAGATGCAGTCATCTCCTGTGGCGATCTTAGTGTTGA
GGATCTTGACTCCCTCACATCTTCCCAAATGAATACCGTCAGTGTTGGGGCTTTCAGCTG
GAGCAATGATCTTGATGTTATCAAATGTCATGTTCTTGCCGCTGATAACGTTGAAGTGGA
AGTTTTTGGCATCTAATGAGGTTACGTCTCTTATATCAGCGTTATCCACAAAATCAAACC
TCACACTGATGGGAAGCTTCTTGCACTCAAAAGTCTTGTGGCAGTTATTGGCTTTCCAAG
CTGCATTGCCTTCACCGTCAAATGTTCCACCTCCGTTCAACTTAAAACCATTAATTTTTT
CGAACACAACCCATCTATCCTTTCCCTGGGTAGAGCCACCGTCAGCTTTGACGTTGCCTT
GCAAGGTGAACTCGATTGGAGATTTGCATGGACCAGTCATAGCGATCTCACCAAGCTTGA
AGTCACCTTTTGGGATCAGCACCTGGCTTGGTGCCGGAGCTTGGCATGCCGATGTGAATG
CTTTAAGAACTGCCGCGGTAATATCAGAATTTGGAGGACCACCAGCGTTAAACACCTCGG
CATTGGCTGAATATCCTAGCAAACATAGAACCAAAATTGTATATATTCCTAAATATGAAC
CCATTTTTATTTATTTATTTATTTTATTTTATTTTTGTTTTCTCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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C

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DS 

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GG
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CTTTGTATTCAATGTTAATGTCTCCAATCTCAACATTCTCACATGGATGTCCCTTGCTGC
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CCACCAGCTTAATTGTTGATGGTTTGTTCTTGTTGCATTGGTTCCAAGGGCAGTACTCCT
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C

QA 3 534 3 534
DS 

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TCTTGTGGCAGTTATTGGCTTTCCAAGCTGCATTGCCTTCACCGTCAAATGTTCCACCTC
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C

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DS 

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CA
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DS 



AS 3 9

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1BJ33TF U 1
AF RS1BI85TF U 1
AF RS1EZ67TF U 555
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BS 929 1154 RS1EZ67TF
BS 1155 1155 RS1BJ33JQ
BS 1156 1187 RS1EZ67TF
BS 1188 1433 RS1BJ33JQ

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GGACACC
ATTTCACCACCAAATCATTCCTCCTCCTTTTACATTGTCTTAAACCCTAAAACACATCAT
CGTCTGCGAATCTTCCAGGGATGAGTTCGGACGATGAGAGAGACGAGAAGGAGCTGGATC
TCACCTCTCCCGAAGTCGTCACAAAGTACAAGAGCGCCGCTGAGATCATCAACAAGGCGT
TGCAGGTTGTTTTGGCTGAATGCAAGCCAGGAGCTAAGATTGTCGATCTCTGCGAGGAAG
GAGACTCCTTTATCAAAGAGCAAACAGGTAACATGTACAAGAGTGCCAAAAAGAAGATCG
ACAGAGGCGTCGCTTTTCCGTCATGCGTTTCTGTGAACAACGTCGTTGGTCATTTCTCAC
CTCTTGCTGGTGATGAGTCTGTGTTGGCAGAGGGTGACATGGTCAAAATTGATATGGGAT
GCCATATTGATGGGTTCATTGCCCTTGTTGGCCACACGCATGTTCTTCAGGAAGGACCCA
TTACCGGACGCAAAGCTGATGTTATTGCTGCTGCCAATACTGCCGCTGAAGTTGCTTTGA
GGCTCGTTCGTCCTGGGAAGAAGAACCATCCTGTCACTGAAGCTATTCAGAAGGTGGCTG
AAGCGTACGACTGCAAAATTGTGGAAGGGGTTCTTTTCCACCAGATGAAACAGAATGTGA
TTGATGGAAGCAAG*TTGTCTTAAGTGTAACCAGTCCC

QA 8 705 8 705
DS 

RD RS1BI85TF 763 0 0
GGACACCATTTCACCACCAAATCATTCCTCCTCCTTTTACATTGTCTTAAACCCTAAAAC
ACATCATCGTCTGCGAATCTTCCAGGGATGAGTTCGGACGATGAGAGAGACGAGAAGGAG
CTGGATCTCACCTCTCCCGAAGTCGTCACAAAGTACAAGAGCGCCGCTGAGATCATCAAC
AAGGCGTTGCAGGTTGTTTTGGCTGAATGCAAGCCAGGAGCTAAGATTGTCGATCTCTGC
GAGAAAGGAGACTCCTTTATCAAAGAGCAAACAGGTAACATGTACAAGAGTGCCAAAAAG
AAGATCGACAGAGGCGTCGCTTTTCCGTCATGCGTTTCTGTGAACAACGTCGTTGGTCAT
TTCTCACCTCTTGCTGGTGATGAGTCTGTGTTGGCAGAGGGTGACATGGTCAAAATTGAT
ATGGGATGCCATATTGATGGGTTCATTGCCCTTGTTGGCCACACGCATGTTCTTCAGGAA
GGACCCATTACCGGACGCAAAGCTGATGTTATTGCTGCTGCCAATACTGCCGCTGAAGTT
GCTTTGAGGCTCGTTCGTCCTGGGAAGAAGAACCATCCTGTCACTGAAGCTATTCAGAAG
GTGGCTGAAGCGTACGACTGCAAAATTGTGGAAAGGGTTCTTTCCCACCAGATGAAACAG
AATGTGATTGATGGAAGCAAG*TTGTCTTAAGTGTAACCAGTCCCGAAACTAGGGTTGAT
GATGTTGAGTTTGAAGAGAATGAAGTGTATGCTATAGATATTG

QA 1 763 1 763
DS 

RD RS1EZ67TF 641 0 0
A
CGTCCTGGCAAGAAGAACCATCCTGTCACTGAAGCTATTCAGAAGGTGGCTGAAGCGTAC
GACTGCAAAATTGTGGAAGGGGTTTTTTCCCACCAGATGAAACAGAATGTGATTGATGGA
AGCAAGGTTGTCTTGAGTGTAACCAGTCCCGAAACTAGGGTTGATGATGTTGAGTTTGAA
GAGAATGAAGTGTATGCTATAGATATTGTGGCTAGCACTGGTGATGGCAAGCCTAAGCTG
TTAGACGAGAAGCAAACAACTATTTACAGGAAAGATGAGAGTATTAACTATCAGTTGAAG
ACGAAGGCCTCCAGATCCTTGATAAGCGAGGTTAAAGAGAACTTCCCCCACATGCCATTC
ACTTCAAGGTCATTGGAAGAGAAAAGGGCACGACTTGGACTTGTGGAGTGTGTGAACCAT
GGTCATTTGCAACCATATCCTGTTCTTTACGAGAAGCCTGGTGATTTTGTTGCCCAGATT
AAATTCACAGTTCTGCTGATGCCAAATGGATCGGATAGGATCACTTCACACACACTTCAG
GAGATTCAACCTACGAAGACCATTGACGACCCTGAGATCAAAGGGTGGTTAGCCTTGGGT
ATCAAAAAGAAGAAGGGTGGTGGAAAGAAGAA
AGCCAAGA

QA 2 633 2 633
DS 

RD RS1BJ33JQ 791 0 0
TT
CCACCAGATGAAACAGAATGTGATTGATGGAAGCAAGGTTGTCTTAAGTGTAACCAGTCC
CGAAACTAGGGTTGATGATGTTGAGTTTGAAGAGAATGAAGTGTATGCTATAGATATTGT
GGCTAGCACTGGTGATGGCAAGCCTAAGCTGTTAGACGAGAAGCAAACAACTATTTACAG
GAAAGATGAGAGTATTAACTATCAGTTGAAGATGAAGGCCTCCAGATCCTTAACAAGCGA
GGTTAAAGATAACTTCCCCCACATGCCATTCACTTCAAGGTCACTGGAGGAGAAAAGGGC
ACGACTTGGACTTGTGGAGTGTGTGAACCATGGTCATTTGCAACCATATCCTGTTCTTTA
CGAGAAGCCTGGTGATTTTGTTGCCCAGATTAAATTCACAGTTCTGCTGATGCCAAATGG
ATCGGATAGGATCACTTCACACACACTTCAGGAGATTCAACCTACGAAGACCATTGATGA
CCCTGAGATCAAAGGTTGGTTAGCCTTGGGCATCAAAAAGAAGAAGGGTGGTGGAAAGAA
GAAGAAAGCCAAGAAGGCAGGAGAGAAAGGAGAGGCCTCAACGGAGGCTGAGCCAATGGA
AGCAAGTACCAATGCTGAAGCATGAGTTCTTTCTTTTGTTTTCTTTTAAAAGAATTTTTG
GAACTTCAGGTCTTTTGTAGGTTTGAGTTTCAGAGAGTCTCTTAGATAAAAAAAAAGAAC
AAAGAAAAACAATTTAAATGTGTCTTTTTGCACGAGTCCTTTTACTGAATGTTCATCATC
ATTGTTCCG

QA 3 791 3 791
DS 



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GGACACCATTTCACCACCAAATCAGTCCTCCTCCTTTAACATTGTCTTAAACCCTAAAAC
ACATCATCACCTGCGAATCTTCCAGCGAGAGATGAGTTCGGACGATGAGAGAGACGAGAA
GGAGCTGGATCTCACCTCTCCCGAAGTCGTCACAAAGTACAAGAGCGCCGCTGAGATCGT
CAACAAGGCGTTGCAGGTTGTTTTGGCTGAATGCAAGCCAGGAGCTAAGATTGTCGATCT
CTGCGAGAAAGGAGACGCCTTTATCAAAGAGCAAACAGGGAACATGTACAAGAGTGCCAA
AAAGAAGATAGACAGAGGCGTCGCTTTTCCGACATGCGTTTCTGTTAACAACGTCGTTGG
TCATTTCTCACCTCTTGCTGGCGATGAGTCTGTGTTGGCAGAGGGTGACATGGTCAAAAT
TGATATGGGATGCCATATTGATGGGTTCATTGCCCTTGTTGGCCACACGCATGTTCTTCA
AGAAGGACCAGTTACTGGACGCAAAGCTGATGTTATTGCTGCTGCCAATACTGCCACTGA
AGTTGCTTTGAGGCTCGTTCGTCCTGGCAAGAAGAACCATCCTGTCACTGAAGCTATTCA
GAAGGTGGCTGAAGCGTACGACTGCAAAATTGTGGAAGGGGTTCTTTCCCACCAGATGAA
ACAGAATGTGATTGATGGAAGCAAGTTGTCTTGAGTGTACCAGTCCGAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GF29TF U 1
AF RS1GP14TF U 6
BS 1 514 RS1GF29TF
BS 515 515 RS1GP14TF
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RD RS1GF29TF 635 0 0
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ACATCATCACCTGCGAATCTTCCAGCGAGAGATGAGTTCGGACGATGAGAGAGACGAGAA
GGAGCTGGATCTCACCTCTCCCGAAGTCGTCACAAAGTACAAGAGCGCCGCTGAGATCGT
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CTGCGAGAAAGGAGACGCCTTTATCAAAGAGCAAACAGGGAACATGTACAAGAGTGCCAA
AAAGAAGATAGACAGAGGCGTCGCTTTTCCGACATGCGTTTCTGTTAACAACGTCGTTGG
TCATTTCTCACCTCTTGCTGGCGATGAGTCTGTGTTGGCAGAGGGTGACATGGTCAAAAT
TGATATGGGATGCCATATTGATGGGTTCATTGCCCTTGTTGGCCACACGCATGTTCTTCA
AGAAGGACCAGTTACTGGACGCAAAGCTGATGTTGTTGCTGCTGCCAATACTGCCACTGA
AGTTGCTTTGAGGCTCGTTCGTCCTGGCAAGAAGAACCATCCTGTCACTGAAGCTATTCA
GAAG*TGGCTGAAGCGTACGACTGCAAAATTGTGG

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1GP14TF 705 0 0
GG
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GATCTCACCTCTCCCGAAGTCGTCACAAAGTACAAGAGCGCCGCTGAGATCGTCAACAAG
GCGTTGCAGGTTGTTTTGGCTGAATGCAAGCCAGGAGCTAAGATTGTCGATCTCTGCGAG
AAAGGAGACGCCTTTATCAAAGAGCAAACAGGGAGCATGTACAAGAGTGCCAAAAAGAAG
ATAGACAGAGGCGTCGCTTTTCCGACATGCGTTTCTGTTAACAACGTCGTTGGTCATTTC
TCACCTCTTGCTGGCGATGAGTCTGTGTTGGCAGAGGGTGACATGGTCAAAATTGATATG
GGATTCCATATTGATGGGTTCATTGCCCTTGTTGGCCACACGCATGTTCTTCAAGAAGGA
CCAGTTACTGGACGCAAAGCTGATGTTATTGCTGCTGCCAATACTGCCGCTGAAGTTGCT
TTGAGGCTCGTTCGTCCTGGCAAGAAGAACCATCCTGTCACTGAAGCTATTCAGAAGGTG
GCTGAAGCGTACGACTGCAAAATTGTGGAAGGGGTTCTTTCCCACCAGATGAAACAGAAT
GTGATTGATGGAAGCAAGTTGTCTTGAGTGTACCAGTCCGAAA

QA 3 705 3 705
DS 



CO CL431Contig3 726 3 10 U
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AATTTGTTTTTCTTTGTTCTTTTTTATCTAAGAGACTCTCTGAAACTCAAACCTACAAAA
GACCTGAAGTTCCGAAAATTCTTTTAAAAGAAAACAAAAGAAAGATCTCATGCTTCAGCA
TTGCTACTTGCTTCCATTGGCTCAGCCTCCGTTGAGGCCTCTCCTTTCTCTCCTGCCTTC
TTGGCTTTCTTCTTCTTTCCACCACCCTTCTTCTTTTTGATGCCCAAGGCTAACCACCCT
TTGATCTCAGGGTCGTCAATGGTCTTCGTAGGTTGAATCTCCTGAAGTGTGTGTGAAGTG
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CCAGGCTTCTCGTAAAGAACAGGATATGGTTGCAAATGACCATGGTTCACACACTCCACA
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CCAGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1GP14JQ U 1
AF RS1GF29JQ U 71
AF RS1EZ67JQ U 36
BS 1 64 RS1GP14JQ
BS 65 65 RS1EZ67JQ
BS 66 288 RS1GP14JQ
BS 289 289 RS1GF29JQ
BS 290 339 RS1GP14JQ
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BS 664 702 RS1GP14JQ
BS 703 726 RS1EZ67JQ

RD RS1GP14JQ 702 0 0
GAAAACAAAAACCTATATATTTGAAAGCCATTGATAACTTGATAACGTTCAGCAAGTCAA
ATCAGAACAATGATGATGAACATTCAGTAAAAGGACTTGTGCAAAAGAAAAGACACATTT
AATTTGTTTTTCTTTGTTCTTTTTTATCTAAGAGACTCTCTGAAACTCAAACCTACAAAA
GACCTGAAGTTCCGAAAATTCTTTTAAAAGAAAACAAAAGAAAGATCTCATGCTTCAGCA
TTGCTACTTGCTTCCATTGGCTCAGCCTCCGTTGAGGCCTCTCCTTTCCCTCCTGCCTTC
TTGGCTTTCTTCTTCTTTCCACCACCCTTCTTCTTTTTG**GCCCAAGGCTAACCACCCT
TTGATCTCAGGGTCGTCAATGGTCTTCGTAGGTTGAATCTCCTGAAGTGTGTGTGAAGTG
ATCCTATCCGATCCATTTGGCATCAGCAGAACTGTGAATTTAATCTGGGCAACAAAATCA
CCAGGCTTCTCGTAAAGAACAGGATATGGTTGCAAATGACCATGGTTCACACACTCCACA
AGTCCAAGTCGTGCCCTTTTCTCTTCCAATGACCTTGAAGTGAATGGCATGTGGGGGAAG
TTCTCTTTAACCTCGCTTATCAAGGATCTGGAGGCCTTCATCTTCAACTGATAGTTAATA
CTATCATCTTTCCTGTAAATAGTTGTTTGCTTCTCGTCTAAC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RS1GF29JQ 627 0 0
TGATGATGAACATTCAGTAAAAGGACTTGTGCAAAAGAAAAGACACATTTAATTTGTTTT
TCTTTGTTCTTTTTTATCTAAGAGACTCTCTGAAACTCAAACCTACAAAAGACCTGAAGT
TCCGAAAATTCTTTTAAAAGAAAACAAAAGAAAGATCTCATGCTTCAGCATTGCTACTTG
CTTCCATTGGCTCAGCCTCCGTTGAGGTCTCTCCTTTCTCTCCTGCCTTCTTGGCTTTCT
TCTTCTTTCCACCACCCTTCTTCTTTTTGATGCCCAAGGCTAACCACCCTTTGATCTCAG
GGTCGTCAATGGTCTTCGTAGGTTGAATCTCCTGAAGTGTGTGTGAAGTGATCCTATCCG
ATCCATTTGGCATCAGCAGAACTGTGAATTTAATCTGGGCAACAAAATCACCAGGCTTCT
CGTAAAGAACAGGATATGGTTGCAAATGACCATGGTTCACACACTCCACAAGTCCAAGTC
GTGCCCTTTTCTCTTCCAATGACCTTGAAGTGAATGGCATGTGGGGGAAGTTCTCTTTAA
CCTCGCTTATCAAGGATCTGGAGGCCTTCATCTTCAACTGATAGTTAATACTCTCATCTT
TCCTGTAAATAGTTGTTTGCTTCTCGT

QA 1 627 1 627
DS 

RD RS1EZ67JQ 691 0 0
AACTTGATAACGTTCAGCAAGTCAAATCAAAACAATGATGATGAACATTCAGTAAAAGGA
CTTGTGCAAAAAAAAAGACACATTTAATTTGTTTTTCTTTGTTCTTTTTTATCTAAAAAA
CTCTCTGAAACTCAAACCTACAAAAGACCTGAAGTTCCGAAAATTCTTTTAAAAAAAAAC
AAAAAAAAGATCTCATGCTTCAGCATTGCTACTTGCTTCCATTGGCTCAGCCTCCGTTGA
GGCCTCTCCTTTCTCTCCTGCCTTCTTGGCTTTCTTCTT***TCCACCACCCTTCTTCTT
TTTGATACCCAAGGCTAACCACCCTTTGATCTCAGGGTCGTCAATGGTCTTCGTAGGTTG
AATCTCCTGAAGTGTGTGTGAAGTGATCCTATCCGATCCATTTGGCATCAGCAAAACTGT
GAATTTAATCTGGGCAACAAAATCACCAGGCTTCTCGTAAAGAACAGGATATGGTTGCAA
ATGACCATGGTTCACACACTCCACAAGTCCAAGTCGTGCCCTTTTCTCTTCCAATGACCT
TGAAGTGAATGGCATGTGGGGGAAGTTCTCTTTAACCTCGCTTATCAAGGATCTGGAGGC
CTTCGTCTTCAACTGATAGTTAATACTCTCATCTTTCCTGTAAATAGTTGTTTGCTTCTC
GTCTAACAGCTTAGGCTTGCCATCACCAGTG

QA 1 691 1 691
DS 



AS 4 8

CO CL432Contig1 734 2 3 U
GTTATCAACTTTTAAATTTTTTATTATGGATAAAACCAAACAAGACACATGAAACAGAGT
AAACGATATCCTGGTTTAAAAACAGACCAGGGACAATGCTCAATAGGAAGACAAACCAAC
AAAGAGGTTATAAAACAGTGTTTGGAGATCTTATTCAGACACAGCCGTAAAAGCTATGAT
GATCTCACACCTGATAGCTGAAAAATGGCTACAGAAGAAGAGCATTGGTTGTTTAAGAGA
GGCATGAGTAGGCCAAGTCCTTCTCTTCCTTCAGCTCCTCTGCTGTCAAATCCATCTTCT
TCCTTGACATTTCATCGATCGGAAGCCCTTGGACAATACTCCACTCTCCATTGCGGCAAG
TGACAGGGAAGGAGTAAATAAGTCCAGCTGGAACGTTGTAAGAGCCATCGGAGTATACTC
CCATTGAAACAAATGTACCCTCTGGAGTTCCAAGGACCCAGTCACGGATGTGATCACAAG
CAGAGCTAGCAGCAGAAAGTGCACTTGACAACTTCCTCGCCTTGATGATTGCAGCTCCAC
GTTGTTGAACGGTGGTGATGAATTCTCCATTCAAGTATTCATCGTTCTTCACGAGCTCAC
GGACTGACTTCTCTCCAGCCGATGTCTGCACCTTAACATGGTTGACGTCTGGGTACTGTG
ATGACGAGTGGTTTCCCCAGATGATCACGTTCTTAACATCAGACACGGGTACGTTCAACC
TCTCGGAGATCTGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A186TR U 1
AF RS1A186JQ U 1
BS 1 376 RS1A186JQ
BS 377 377 RS1A186TR
BS 378 734 RS1A186JQ

RD RS1A186TR 699 0 0
GTTATCAACTTTTAAATTTTTTATTATGGATAAAACCAAACAAGACACATGAAACAGAGT
AAACGATATCCTGGTTTAAAAACAGACCAGGGACAATGCTCAATAGGAAGACAAACCAAC
AAAGAGGTTATAAAACAGTGTTTGGAGATCTTATTCAGACACAGCCGTAAAAGCTATGAT
GATCTCACACCTGATAGCTGAAAAATGGCTACAGAAGAAGAGCATTGGTTGTTTAAGAGA
GGCATGAGTAGGCCAAGTCCTTCTCTTCCTTCAGCTCCTCTGCTGTCAAATCCATCTTCT
TCCTTGACATTTCATCGATCGGAAGCCCTTGGACAATACTCCACTCTCCATTGCGGCAAG
TGACAGGGAAGGAGTAAATAAGTCCAGCTGGAACGTTGTAAGAGCCATCGGAGTATACTC
CCATTGAAACAAATGTACCCTCTGGAGTTCCAAGGACCCAGTCACGGATGTGATCACAAG
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GGACTGACTTCTCTCCAGCCGATGTCTGCACCTTAACATGGTTGACGTCTGGGTACTGTG
ATGACGAGTGGTTTCCCCAGATGATCACGTTCTTAACAT

QA 1 699 1 699
DS 

RD RS1A186JQ 734 0 0
GTTATCAACTTTTAAATTTTTTATTATGGATAAAACCAAACAAGACACATGAAACAGAGT
AAACGATATCCTGGTTTAAAAACAGACCAGGGACAATGCTCAATAGGAAGACAAACCAAC
AAAGAGGTTATAAAACAGTGTTTGGAGATCTTATTCAGACACAGCCGTAAAAGCTATGAT
GATCTCACACCTGATAGCTGAAAAATGGCTACAGAAGAAGAGCATTGGTTGTTTAAGAGA
GGCATGAGTAGGCCAAGTCCTTCTCTTCCTTCAGCTCCTCTGCTGTCAAATCCATCTTCT
TCCTTGACATTTCATCGATCGGAAGCCCTTGGACAATACTCCACTCTCCATTGCGGCAAG
TGACAGGGAAGGAGTAGATAAGTCCAGCTGGAACGTTGTAAGAGCCATCGGAGTATACTC
CCATTGAAACAAATGTACCCTCTGGAGTTCCAAGGACCCAGTCACGGATGTGATCACAAG
CAGAGCTAGCAGCAGAAAGTGCACTTGACAACTTCCTCGCCTTGATGATTGCAGCTCCAC
GTTGTTGAACGGTGGTGATGAATTCTCCATTCAAGTATTCATCGTTCTTCACGAGCTCAC
GGACTGACTTCTCTCCAGCCGATGTCTGCACCTTAACATGGTTGACGTCTGGGTACTGTG
ATGACGAGTGGTTTCCCCAGATGATCACGTTCTTAACATCAGACACGGGTACGTTCAACC
TCTCGGAGATCTGA

QA 1 734 1 734
DS 



CO CL432Contig2 893 2 2 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGACAAGCCTC
TCGGAAATCTCAAATACTAATCCATTTCCCCGGCGATAATCGACGATCTAGATCCGATGG
CGAAGGAACCAGTTCGTGTTCTCGTTACCGGTGCTGCAGGACAAATTGGATACGCTCTTG
TCCCAATGATTGCGAGGGGAATCATGCTTGGTGCTGACCAGCCTGTGATCCTCCACATGT
TGGATATTCCTCCAGCTGCTGAAGCACTCAACGGTGTCAAGATGGAGTTGATCGATGCTG
CTTTCCCTCTTCTCAAAGGTGTTGTTGCTACAACTGATGCCGTTGAGGGATGCACGGGAG
TCAACGTTGCTGTTATGGTTGGTGGTTTCCCGAGGAAAGAAGGTATGGAGAGGAAGGATG
TGATGACCAAGAATGTCTCCATTTACAAGTCTCAAGCTACTGCCTTGGAGAAGCATGCCG
CTCCTAACTGCAAGGTTCTTGTTGTTGCAAACCCTGCAAACACCAATGCATTGATCCTGA
AGGAATTTGCACCATCCATCCCTGAAAAGAACATCAGTTGTTTGACAAGGCTTGACCACA
ACAGGGCCTTGGGTCAGATCTCCGAGAGGTTGAACGTACCCGTGTCTGATGTTAAGAACG
TGATCATCTGGGGAAACCACTCGTCATCACAGTACCCAGACGTCAACCATGCTAAGGTGC
AGACATCGGCTGGAGAGAAGTCAGTCCGTGAGCTCGTGAAGAACGATGAATACTTGAATG
GAGAATTCATCACCACCGTTCAACAACGTGGAGCTGCAATCATCAAGGCGAGGAAGTGTC
AGTGCACTTTCTGCTGCTAGCTCTGCTGTGATCACATCCGTGACTGGGTCCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A186TV U 1
AF RS1A186TF U 232
BS 1 834 RS1A186TV
BS 835 893 RS1A186TF

RD RS1A186TV 834 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGACAAGCCTC
TCGGAAATCTCAAATACTAATCCATTTCCCCGGCGATAATCGACGATCTAGATCCGATGG
CGAAGGAACCAGTTCGTGTTCTCGTTACCGGTGCTGCAGGACAAATTGGATACGCTCTTG
TCCCAATGATTGCGAGGGGAATCATGCTTGGTGCTGACCAGCCTGTGATCCTCCACATGT
TGGATATTCCTCCAGCTGCTGAAGCACTCAACGGTGTCAAGATGGAGTTGATCGATGCTG
CTTTCCCTCTTCTCAAAGGTGTTGTTGCTACAACTGATGCCGTTGAGGGATGCACGGGAG
TCAACGTTGCTGTTATGGTTGGTGGTTTCCCGAGGAAAGAAGGTATGGAGAGGAAGGATG
TGATGACCAAGAATGTCTCCATTTACAAGTCTCAAGCTACTGCCTTGGAGAAGCATGCCG
CTCCTAACTGCAAGGTTCTTGTTGTTGCAAACCCTGCAAACACCAATGCATTGATCCTGA
AGGAATTTGCACCATCCATCCCTGAAAAGAACATCAGTTGTTTGACAAGGCTTGACCACA
ACAGGGCCTTGGGTCAGATCTCCGAGAGGTTGAACGTACCCGTGTCTGATGTTAAGAACG
TGATCATCTGGGGAAACCACTCGTCATCACAGTACCCAGACGTCAACCATGCTAAGGTGC
AGACATCGGCTGGAGAGAAGTCAGTCCGTGAGCTCGTGAAGAACGATGAATACTTGAATG
GAGAATTCATCACCACCGTTCAACAACGTGGAGCTGCAATCATCAAGGCGAGGA

QA 1 834 1 834
DS 

RD RS1A186TF 662 0 0
TCCACATG
TTGGATATTCCTCCAGCTGCTGAAGCACTCAACGGTGTCAAGATGGAGTTGATCGATGCT
GCTTTCCCTCTTCTCAAAGGTGTTGTTGCTACAACTGATGCCGTTGAGGGATGCACGGGA
GTCAACGTTGCTGTTATGGTTGGTGGTTTCCCGAGGAAAGAAGGTATGGAGAGGAAGGAT
GTGATGACCAAGAATGTCTCCATTTACAAGTCTCAAGCTACTGCCTTGGAGAAGCATGCC
GCTCCTAACTGCAAGGTTCTTGTTGTTGCAAACCCTGCAAACACCAATGCATTGATCCTG
AAGGAATTTGCACCATCCATCCCTGAAAAGAACATCAGTTGTTTGACAAGGCTTGACCAC
AACAGGGCCTTGGGTCAGATCTCCGAGAGGTTGAACGTACCCGTGTCTGATGTTAAGAAC
GTGATCATCTGGGGAAACCACTCGTCATCACAGTACCCAGACGTCAACCATGCTAAG*TG
CAGACATCGGCTGGAGAGAAGTCAGTCCGTGAGCTCGTGAAGAACGATGAATACTTGAAT
GGAGAATTCATCACCACCGTTCAACAACGTGGAGCTGCA*TCATCA*GGCGAGGAAGTGT
CAGTGCACTTTCTGCTGCTAGCTCTGCTGTGATCACATCCGTGACTGGGTCCTG

QA 9 662 9 662
DS 



CO CL432Contig3 925 2 6 U
GAGAATGTCTCCATTTACAAGTCTCAAGCTACTGCCTTGGAGAAGCATGCCGCTCCTAAC
TGCAAGGTTCTTGTTGTTGCAAACCCTGCAAACACCAATGCATTGATCCTGAAGGAATTT
GCACCATCCATCCCTGAAAAGAACATCAGTTGTTTGACAAGGCTTGACCACAACAGGGCC
TTGGGTCAGATCTCCGAGAGGTTGAGCGTGCCCGTGTCTGATGTTAAGAACGTGATCATC
TGGGGAAACCACTCGTCATCACAGTACCCAGACGTCAACCATGCTAAGGTGCAGACATCG
GCTGGAGAGAAGTCAGTCCGTGAGCTCGTGAAGAACGATGAATACTTGAATGGAGAATTC
ATCACCACCGTTCAACAGCGTGGAGCTGCAATCATCAAGGCGAGGAAGTTGTCAAGTGCA
CTTTCTGCTGCTAGCTCTGCTTGTGACCACATCCGTGATTGGGTCCTTGGAACTCCAGAG
GGTACATTTGTTTCAATGGGAGTATACTCCGATGGCTCTTACGACGTTCCAGCTGGACTT
ATCTACTCCTTCCCTGTCACTTGCCGCAATGGAGAGTGGAGTATTGTCCAAGGGCTTCCG
ATCGATGAAATGTCAAGGAAGAAGATGGATTTGACAGCAGAGGAGCTGAGGAAGAGGAGG
ACTTGGCGTACTCATGCCTCTCTTAAACAACCAATGCTCTTCTTCTGAAGCCATTTTCAG
CTGTCAGGTGTGACGTGTGAGATCAATCATAGCTTTTACGGCTGTGTCTGAATAAGATCT
CCAAACACTGTTTTATAACCTCTTTGTTGGTTTGTCTTCCTATTGAGCATTGTCCCTGGT
CTGTTTCTAAACCAGGATATCGTTTACTCTGTTTCATGTGTCTTGTTTGGTTTTATCCAT
AATAAAATTTTTAAAAATTGATAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BF79TF U 1
AF RS1BF79JQ C 184
BS 1 711 RS1BF79TF
BS 712 712 RS1BF79JQ
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BS 729 760 RS1BF79TF
BS 761 925 RS1BF79JQ

RD RS1BF79TF 760 0 0
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CTTTCTGCTGCTAGCTCTGCTTGTGACCACATCCGTGATTGGGTCCTTGGAACTCCAGAG
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QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1BF79JQ 742 0 0
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GGAAACCACTCGTCATCACAGTACCCAGACGTCAACCATGCTAAGGTGCAGACATCGGCT
GGAGAGAAGTCAGTCCGTGAGCTCGTGAAGAACGATGAATACTTGAATGGAGAATTCATC
ACCACCGTTCAACAGCGTGGAGCTGCAATCATCAAGGCGAGGAAGTTGTCAAGTGCACTT
TCTGCTGCTAGCTCTGCTTGTGACCACATCCGTGATTGGGTCCTTGGAACTCCAGAGGGT
ACATTTGTTTCAATGGGAGTATACTCCGATGGCTCTTACGACGTTCCAGCTGGACTTATC
TACTCCTTCCCTGTCACTTGCCGCAATGGAGAGTGGAGTATTGTCCAAGGGCTTCCGATC
GATGAAATGTCAAGGAAGAAGATGGATTTGACAGCAGAGGAGCTGAGGAAGAGGAGGACT
TGGCGTACTCATGCCTCTCTTAAACAACCAATGCTCTTCTTCTGAAGCCATTTTCAGCTG
TCAGGTGTGACGTGTGAGATCAATCATAGCTTTTACGGCTGTGTCTGAATAAGATCTCCA
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TTTCTAAACCAGGATATCGTTTACTCTGTTTCATGTGTCTTGTTTGGTTTTATCCATAAT
AAAATTTTTAAAAATTGATAAC

QA 1 742 1 742
DS 



CO CL432Contig4 714 2 5 U
GATGTTATCAATTTTTAAAAATTTTATTATGGATAAAACCAAACAAGACACATGAAACAG
AGTAAACGATATCCTGGTTTAAAAACAGACCAGGGACAATGCTCAATAGGAAGACAAACC
AACAAAGAGGTTATAAAACAGTGTTTGGAGATCTTATTCAGACACAGCCGTAAAAGCTAT
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TTCTCTTCCTTCAGCTCCTCTGCTGTCAAATCCATCTTCTTCCTTGACATTTCATCGATC
GGAAGCCCTTGGACAATACTCCACTCTCCATTGCGACAAGTGACAGGGAAGGAGTAAATA
AGTCCAGCTGGAACGTTGTAAGAACCGTCGGAATATACTCCCATTGAAACAAATGTACCC
TCTGGAGTTCCAAGGACCCAGTCACGGATGTGACCACAAGCAGAGCTAGCAGCAGAAAGT
GCACTTGACAACTTCCTCGCCTTGATGATTGCAGCTCCACGCTGTTGAACGGTGGTGATG
AATTCTCCATTCAAGTATTCATCGTTCTTCACGAGCTCACGGACTGACTTTTCTCCAGCC
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ATGATCACGTTCTTAACATCAGAAACGGGCACGTTCAACCTCTCGGAGATCTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ED40JQ U 155
AF RS1ED57JQ U 1
BS 1 239 RS1ED57JQ
BS 240 240 RS1ED40JQ
BS 241 453 RS1ED57JQ
BS 454 454 RS1ED40JQ
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RD RS1ED40JQ 447 0 0
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AAGAGAGGCATGAGTACGCCAAGTCCTTCTCTTCCTTCAGCTCCTCTGCTGTCAAATCCA
TCTTCTTCCTTGACATTTCATCGATCGGAAGCCCTTGGACAATACTCCACTCTCCATTGC
GACAAGTGACAGGGAAGGAGTAGATAAGTCCAGCTGGAACGTTGTAAGAACCGTCGGAGT
ATACTCCCATTGAAACAAATGTACCCTCTGGAGTTCCAAGGACCCAGTCACGGATGTGAC
CACAAGCAGAGCTAGCAGCAGAAAGTGCACTTGACAACTTCCTCGCCTTGATGATTGTAG
CTCCACGCTGTTGAACGGTGGTGATGAATTCTCCATTCAAGTATTCATCGTTCTTCACGA
GCTCACGGACTGACTTTTCTCCAGCC
C

QA 1 446 1 446
DS 

RD RS1ED57JQ 714 0 0
GATGTTATCAATTTTTAAAAATTTTATTATGGATAAAACCAAACAAGACACATGAAACAG
AGTAAACGATATCCTGGTTTAAAAACAGACCAGGGACAATGCTCAATAGGAAGACAAACC
AACAAAGAGGTTATAAAACAGTGTTTGGAGATCTTATTCAGACACAGCCGTAAAAGCTAT
GATTGATCTCACACCTGAAGAGCATTGGTTGTTTAAGAGAGGCATGAGTACGCCAAGTCT
TTCTCTTCCTTCAGCTCCTCTGCTGTCAAATCCATCTTCTTCCTTGACATTTCATCGATC
GGAAGCCCTTGGACAATACTCCACTCTCCATTGCGACAAGTGACAGGGAAGGAGTAAATA
AGTCCAGCTGGAACGTTGTAAGAACCGTCGGAATATACTCCCATTGAAACAAATGTACCC
TCTGGAGTTCCAAGGACCCAGTCACGGATGTGATCACAAGCAGAGCTAGCAGCAGAAAGT
GCACTTGACAACTTCCTCGCCTTGATGATTGCAGCTCCACGCTGTTGAACGGTGGTGATG
AATTCTCCATTCAAGTATTCATCGTTCTTCACGAGCTCACGGACTGACTTTTCTCCAGCC
GATGTCTGCACCTTAACACGGTTGACGTCTGGGTACTGTGATGACGAGTGGTTTCCCCAG
ATGATCACGTTCTTAACATCAGAAACGGGCACGTTCAACCTCTCGGAGATCTGA

QA 1 714 1 714
DS 



AS 2 9

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GATATCAAAATCTGTCAGTTCTTCGCAGAGTTCTTATTATTTGAAGGGGTAAGGTAGAAG
AAGGATGAAGAGAATACTCGGTGCGAAGAACAACAAAGAGCCTCCTCCCTCCATCCAGGA
TGCTTCCGATCGGATCAATAAAAGAGGAGAATCAGTGGAAGATAAGGTGAAGAGGCTGGA
CGCTGAGCTCTGCAAATACAAAGACCAGACCAAGAGGACAAGACCTGGTCCTGCTCAGGA
AGCTATCAAAGCTCGTGCTATGCGAGTTCTCAAGCAAAAGAAAATGTATGAAGGACAACG
TGATATGCTCTATAATCAGACTTTCAACCTTGATCAAGTTTCTTTTGCTGCTGAAGGCCT
CAAAGATGCTCAACAAACTATGACAGCCTTGAAGTCTGCTAACAAGGAGTTGAAAGGAAT
GATGAAAACCGTCAAGATTCAAGATATTGATAATTTACAAGATGAGATGATGGACTTGAT
GGATGTGAGCTCTGAAATTCAAGATTCACTTGGTAGGAGCTACAATGTTCCTGATGACAT
TGACGAAGATGACCTCATGGGCGAGCTTGATGCTCTTGAAGCTGACATGGGAAACGAGAC
TGAAGCAGACGGTGTGCCTTCCTATCTCCAACCCGATACTGAACCTGATCTCGATGAGGG
ACTTGACTTGCCTCCACCACCAACGGGGAGGACACAAACAGCAGGAGCTCAACCTGGACG
AGCTCAGGCTGAGGATGAATGGGGATTACCTGCTGTACCACGTGCATCACTCCGGGGATA
AACCCACCGTTTCCACACACTTCTGTTCCGTGTGCATTTAAAAGTTCATCTCCAAGCGGT
TTCACTTGTCAAAGCTACTAAGATTTTTATAATTCCCTTTCTCATGTAATCATACATTTT
GTGCATAAACATTGGATCCTAATTCATCAGATTGATAGCTTCTAGAACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RS1D342TF U 1
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AF RS1D342JQ C 322
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ACTTGACTTGCCT

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GG
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AGCTCGTGCTATGCGAGTTCTCAAGCAAAAGAAAATGTATGAAGGACAACGTGATATGCT
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TT

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GACAGCCTTGAAGTCTGCTAACAAGGAGTTGAAAGGAATGATGAAAACCGTCAAGATTCA
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CGAGCTTGATGCTCTTGAAGCTGACATGGGAAACGAGACTGAAGCAGACGGTGTGCCTTC
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DS 

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G
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CCTAATTCATCAGATTGATAGCTTCTAGAA
TC

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DS 



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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1H427JQB U 5
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AF RS1F579JQ U 5
AF RS1H427TF C 18
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GGTTGAGCACCTGTTGTTTGTGTCCTCCCCGTCGGTGGTGGAGGCAAGTCAAGTCCCTCA
TCGAGATCAGGTTCTGTATCGGGTTGGAGATAGGACGGCACACCGTCTGCTTCAGTCTCG
TTTCCCATGTCAGCTTCAAGAGCATCAAGCTCGCCCATGAGGTCATCTTCGTCGATGTCA
GCAGGAACATTGTAGCTCCTACCAAGCGTCTCTTGAATTTCAGAACTCACATCCATCAAG
TCCATCATCTCATCTTGTAAGTTATCAATATCTTGACGGTTTTCATCATTCCTTTCAACT
CCTTGTTAGCAGACTTCAACGCTGTCATACTTTGTTGAGCATCTTTGAGGCCTTCAGCAG
CAAAAGAAACTTGATCAAGGTTGACAGTCTAATTGTAGAGCATGTCACGTTGTCCTTCAT
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GGCAAGAGGAGACGACGGACGGCACGAGGAGGAGACCC

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TAACTTACATATATATTATATTTAGGATAGCAAGTAATATATTTAGGAAGAGTATCCAGA
AAATAAATCTTTGAACGTAGACAAACAGAAATGTGTGGAAACGGTGGGTTTATCCCCGGA
GTGATGCACGTGGTACCGCAGGTAATCCCCATTCATCCTCAGCCTGAGCTCGTCCAGGTT
GAGCACCTGTTGTTTGTGTCCTCCCCGTCGGTGGTGGAGGCAAGTCAAGTCCCTCATCGA
GATCAGGTTCTGTATCGGGTTGGAGATAGGACGGCACACCGTCTGCTTCAGTCTCGTTTC
CCATGTCAGCTTCAAGAGCATCAAGCTCGCCCATGAGGTCATCTTCGTCGATGTCAGCAG
GAACATTGTAGCTCCTACCAAGCGTCTCTTGAATTTCAGAACTCACATCCATCAAGTCCA
TCATCTCATCTTGTAAGTTATCAATATCTTGACGGTTTTCATCATTCCTTTCAACTCCTT
GTTAGCAGACTTCAACGCTGTCATACTTTGTTGAGCATCTTTGAGGCCTTCAGCAGCAAA
AGAAACTTGATCAAGGTTGACAGTCTAATTGTAGAGCATGTCACGTTGTCCTTCATACAC
ATAGACGACGACAGATGCAGGACGATGCAGAGGCACAGATGACGACGGACGACGGAGGCA
AGAGGAGACGACGGACGGCACGAGGAGGAGACCC

QA 1 754 1 754
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AAAATTTAAAAGTAAGAGACTAGTGTCAGTTACATATATATTATATTTAACTTACATATA
TATTATATTTAGGATAGCAAGTAATATATT*AGGAAGAGTATCCAGAAAATAAATCTTTG
AACGTAGACAAACAGAAATGTGTGGAAACGGTGGGTTTATCCCCGGAGTGATGCACGTGG
TACCGCAGGTAATCCCCATTCATCCTCAGCCTGAGCTCGTCCAGGTTGAGCACCTGTTGT
TTGTGTCCTCCCCGTCGGTGGTGGAGGCAAGTCAAGTCCCTCATCGAGATCAGGTTCTGT
ATCGGGTTGGAGATAGGACGGCACACCGTCTGCTTCAGTCTCGTTTCCCATGTCAGCTTC
AAGAGCATCAAGCTCGCCCATGAGGTCATCTTCGTCGATGTCAGCAGGAACATTGTAGCT
CCTACCAAGCGTCTCTTGAATTTCAGAACTCACATCCATCAAGTCCATCATCTCATCTTG
TAAGTTATCAATATCTTGACGGTTTTCATCATTCCTTTCAACTCCTTGTTAGCAGACTTC
AACGCTGTCATACTTTGTTGAGCATCTTTGAGGCCTTCAGCAGCAAAAGAAACTTGATCA
AGGTTGACAGTCTAATTGTAGAGCATGTCACGTTGTCCTTCATACACATAGACGACGACA
GATGCAGGACGATGCAGAGGCACAGATGACGACGGACGACGGAGGCAAGAGGAGACGACG
GACGGCACGAGGAGGAGACCC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 2 9

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TTTCAAAAACAGAAATTTATCCACACAAAGACAAACCAAATAAAATAAAAAGAATGAAAA
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TCAGGTTTCTTCTCCTCAACGACGGCGGTTGCAACGGTCTCTTCTTTCTTCTCTTCAACA
ATCTCCTTCTCGCCACTTGTTTCTTCGGTTTTGACTGGCTCCTCGGTTTTGGCTGGCTCC
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CG51JQ U 1
AF RS1DT69JQ U 1
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BS 587 647 RS1DT69JQ

RD RS1CG51JQ 586 0 0
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QA 1 586 1 586
DS 

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TCAGGTTTCTTCTCCTCAACGACGGCGGTTGCAACGGTCTCTTCTTTCTTCTCTTCAACA
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TCCTCGGGAAGGAACACACATACCTTCTCGAATATGAACCCGACTGGTCCGGAGACATAG
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QA 1 647 1 647
DS 



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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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45 45 45 45 45 45 45 45 20 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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BS 1039 1053 RS1DM16JQ

RD RS1DM16TF 588 0 0
GGAGAGAGAGACAATTAATCAGTTTTGTGTGTTCCAGAGAAGAAGAAGAAGATCTTCAAA
GAGATTTAACATCTCAA**GCGCGTTGAGACGGTGAATTTAAATTAAATTACAAAATGGG
TTACTGGAATTCGAAGGTTGTTCCGAGGTTCAAGAAGATATTCGAGAAGAATAGTGCTAA
GAAGGCTGCTGCTGCTGAAGCTTGCAAGACCTTTGATGAGTCTAAGGAAACAATCAACAA
GGAAATTGAGGAGAAAAAGACAGAACTCCAACCAAAGGTCGTGGAGACCTATGAGGCCAC
GTCGGCTGAAGTCAAGGCTTTGGTGAGAGACCCTAAGGAGGCTGGTTTGAAGAAAAACTC
TGCGGCTGTGCTGAAATATCTCGAGGCTCTTGTCGGTATAGAATTCCCCGGATCAACGGC
TGTGAAAGAAGCTGCCTCTAGCTTCGGAGCTGGCTATGTCTCCGGACCAGTCGGGTTCAT
ATTCGAGAAGGTATGTGTGTTCCTTCCCGAGGAGGTTAAGACACGGGAAGTACCTGTGGA
GGAAGTGAAAACCGAAGAACCAGCCAAGACCGAG*AGCCAGCCAAA
CC

QA 1 586 1 586
DS 

RD RS1CG51TF 695 0 0
GGAGAGAC
AATTAATCAGTTTTCTGTGTTTCAGAGAAGAATAAGAAGATCTTCAAAGAGATTTATCAT
CTCGAACGCGCGTCGAGACGGTGAATTTAAATTAAATTACAAAATGGGTTACTGGAATTC
GAAGGTTGTTCCCAGGTTCAAGAAGATATTCGAGAAGAATAGTGCTAAGAAGGCTGCTGC
TGCTGAAGCTTGCAAGACCTTTGATGAGTCTAAGGAAACAATCAACAAGGAAATTGAGGA
GAAAAAGACAGAACTCCAACCAAAGGTCGTGGAGACCTATGAGGCCACGTCTGCTGAAGT
CAAGGCTTTGGTGAGAGACCCTAAGGAGGCTGGTTTGAAGAAAAACTCTGCGGCTGTGCT
GAAATATCTCGAGGCTCTTGTCGGTATAGAATTCCCCGGATCAACGGCTGTGAAAGAAGC
TGCCTCTAGCTTCGGAGCTGGCTATGTCTCCGGACCAGTCGGGTTCATATTCGAGAAGGT
ATGTGTGTTCCTTCCCGAGGAGGTTAAGACACGGGAAGTACCTGTGGAGGAAGTGAAAGC
CGAAGAACCAGCCAAGACCGAGGAGCCAGCCAAAACCGAGGAGCCAGTCAAAACCGAAGA
AACAAGTGGCGAGAAGGAGATTGTTGAAGAGAAGAAAGAAGAGACCGTTGCA*CCGCCGT
CGTTGAG*AGAAGAAACCTGAAGTAGA

QA 9 695 9 695
DS 

RD RS1DT69TF 662 0 0
GG
AATTAATCAGTTTTCTGTGTTTCAGAGAAGAATAAGAAGATCTTCAAAGAGATTTATCAT
CTCGAACGCGCGTTGAGACGGTGAATTTAAATTAAATTACAAAATGGGTTACTGGAATTC
GAAGGTTGTTCCCAGGTTCAAGAAGATATTCGAGAAGAATAGTGCTAAGAAGGCTGCTGC
TGCTGAAGCTTGCAAGACCTTTGATGAGTCTAAGGAAACAATCAACAAGGAAATTGAGGA
GAAAAAGACAGAACTCCAACCAAAGGTCGTGGAGACCTATGAGGCCACGTCTGCTGAAGT
CAAGGCTTTGGTGAGAGACCCTAAGGAGGCTGGTTTGAAGAAAAACTCTGCGGCTGTGCT
GAAATATCTCGAGGCTCTTGTCGGTATAGAATTCCCCGGATCAACGGCTGTGAAAGAAGC
TGCCTCTAGCTTCGGAGCTGGCTATGTCTCCGGACCAGTCGGGTTCATATTCGAGAAGGT
ATGTGTGTTCCTTCCCGAGGAGGTTAAGACACGGGAAGTACCTGTGGAGGAAGTGAAAGC
CGAAGAACCAGCCAAGACCGAGGAGCCAGCCAAAACCGAGGAGCCAGTCAAAACCGAAGA
AACAAGTGGCGAGAAGAAGATTGTTGAAGAGAAGAAAGA*GAGACCGTTGCA
CCGCCGTC

QA 3 654 3 654
DS 

RD RS1D725TF 695 0 0
GG
AATTAATCAGTTTTGTGTGTTCCAGAGAAGAAGAAGAAGATCTTCAAAGAGATTTAACAT
CTCAA**GCGCGTTGAGACGGTGAATTTAAATTAAATTACAAAATGGGTTACTGGAATTC
GAAGGTTGTTCCGAGGTTCAAGAAGATATTCGAGAAGAATAGTGCTAAGAAGGCTGCTGC
TGCTGAAGCTTGCAAGACCTTTGATGAGTCTAAGGAAACAATCAACAAGGAAATTGAGGA
GAAAAAGACAGAACTCCAACCAAAGGTCGTGGAGACCTATGAGGCCACGTCGGCTGAAGT
CAAGGCTTTGGTGAGAGACCCTAAGGAGGCTGGTTTGAAGAAAAACTCTGCGGCTGTGCT
GAAATATCTCGAGGCTCTTGTCGGTATAGAATTCCCCGGATCAACGGCTGTGAAAGAAGC
TGCCTCTAGCTTCGGAGCTGGCTATGTCTCCGGACCAGTCGGGTTCATATTCGAGAAGGT
ATGTGTGTTCCTTCCCGAGGAGGTTAAGACACGGGAAGTACCTGTGGAGGAAGTGAAAAT
CGAAGAACCAGCCAATACCGAGGAGCCAGCCAAAACCGAGGAGCCAGTCAAAACCGAAGA
AACAAGTGGCGAGAAAGAGATTGTTGAAGAGAAGAAAGAAGAGACCGTCGCAACCGCGGT
CGTTGAGGAGAAGAA*CCTGAAGTAGAAAAGGA

QA 3 695 3 695
DS 

RD RS1G528TF 619 0 0
G
AAAGAGATTTAACATCTCAA**GCGCGTTGAGACGGTGAATTTAAATTAAATTACAAAAT
GGGTTACTGGAATTCGAAGGTTGTTCCGAGGTTCAAGAAGATATTCGAGAAGAATAGTGC
TAAGAAGGCTGCTGCTGCTGAAGCTTGCAAGACCTTTGATGAGTCTAAGGAAACAATCAA
CAAGGAAATTGAGGAGAAAAAGACAGAACTCCAACCAAAGGTCGTGGAGACCTATGAGGC
CACGTCGGCTGAAGTCAAGGCTTTGGTGAGAGACCCTAAGGAGGCTGGTTTGAAGAAAAA
CTCTGCGGCTGTGCTGAAATATCTCGAGGCTCTTGTCGGTATAGAATTCCCCGGATCAAC
GGCTGTGAAAGAAGCTGCCTCTAGCTTCGGAGCTGGCTATGTCTCCGGACCAGTCGGGTT
CATATTCGAGAAGGTATGTGTGTTCCTTCCCGAGGAGGTTAAGACACGGGAAGTACCTGT
GGAGGAAGTGAAAACCGAAGAACCAGCCAAGACCGAGGAGCCAGCCAAAACCGAGGAGCC
AGTCAAAACCGAAGAAACAAGTGGCGAGAAAGAGATTGTTGAAGAGAAGAAAGAAGAGAC
CGTCGCAACCGCGGTCGT

QA 2 619 2 619
DS 

RD RS1DM16JQ 708 0 0
TTTGAAGAAAAACTCTGCGGCTGTGCTGAAATATCTCGAGGCTCTTGTCGGTATAGAATT
CCCCGGATCAACGGCTGTGAAAGAAGCTGCCTCTAGCTTCGGAGCTGGCTATGTCTCCGG
ACCAGTCGGGTTCATATTCGAGAAGGTATGTGTGTTCCTTCCCGAGGAGGTTAAGACACG
GGAAGTACCTGTGGAGGAAGTGAAAACCGAAGAACCAGCCAAGACCGAGGAGCCAGCCAA
AACCGAGGAGCCAGTCAAAACCGAAGAAACAAGTGGCGAGAAGGAGATTGTTGAAGAGAA
GAAAGAAGAGACCGTCGCAACCGCGGTCGTTGAGGAGAAGGAACCTGAAGTAGAAAAGGA
GGAGGAGAAGAAGCCTGTCGTCGAAGAAGTGAAAAAGGAAGAAGCTGCTCCAACTCCAGC
GGTGGTTGAAACTCCGGTTACGGCACCAGCTGAAACGACAACGCCGGCGCCAGTGGCTGA
GCCACCGAAGCCTTGATTCGTTTCAAGATGGTACGGTTTGCTTTATCTTGTATGAAAACA
TCTTTGTACGTGACAAAAATTGAAAGGAACAAAAAAAAAAAAACTATTTTCATTCTTTTT
ATTTTATTTGGTTTGTCTTTGTGTGGATAAATCTCTGTTTCTGGAAGTCGTTGATGTGTT
GTTTATTTGTATTCATTTGAATTTGTAAAAAA*GTATCGGTGGATGCG

QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1CO28JQ 596 0 0
ATGTCTCCGGACCAGTCGGGTTCATATTCGAGAAGGTATGTGTGTTCCTTCCCGAGGAGG
TTAAGACACGGGAAGTACCTGTGGAGGAAGTGAAAACCGAAGAACCAGCCAAGACCGAGG
AGCCAGCCAAAACCGAGGAGCCAGTCAAAACCGAAGAAACAAGTGGCGAGAAGGAGATTG
TT*AAGAGAAGAAAGAAGAGACCGTCGCAACCGCGGTCGTTGAGGAGAAGGAACCTGAAG
TAGAAAAGGAGGAGGAGAAGAAGCCTGTCGTCGAAGAAGTGAAAAAGGAAGAAGCTGCTC
CAGCTCCAGCGGTGGTTGAAACTCCGGTTACGGCACCAGCTGAAACGACAACGCCGGCGC
CAGTGGCTGAGCCACCGAAGCCTTGATTCGTTTCAAGATGGTACGGTTTGCTTTATCTTG
TATGAAAACATCTTTGTACGTGACAAAAATTGAAAGGAACAAAAAAAAAAAAACTATTTT
CATTCTTTTTATTTTATTTGGTTTGTCTCTGTGTGGATAAATCTCTGTTTCTGGAAGTCG
TTGATGTGTTGTTTATTTGTATTCATTTGAATTTGTAAAAAAAGTATCGGTGGATG

QA 1 596 1 596
DS 



AS 2 9

CO CL435Contig1 555 5 5 U
GGGAGTGTCCAACGCTTTGGTTTTCGAGATCGTGATGACCTTCGGGCTTGTTTACACAGT
CTGCGCCACCGCCGTCGACCCCAAGAACGGAAGTCTTGGAACAATCGCTCCCATCGCAAT
CGGTTTCATCGTCGGTGCCAACATCTTAGCAGGAGGAGCATTCAGCGGAGCCTCCATGAA
CCCCGCCGTGGCCTTCGGACCAGCTGTGGTAAGCTGGTCGTGGAACAACCACTGGGTCTA
CTGGGCCGGACCTCTTATTGGCGGTGGAATCGCTGGACTCATCTACGAGGTTTTCTTCAT
CAACACCACCCACGAACAGCTCCCCACCACCGACTACTGAATCAATTTCCCTGTTTCTCT
CATGTGTAATTTGATTTGTCGTCTTTGAGTTTTAATGCTTTTTCCGTTTGTGTACTTTCG
CATCAGCATGGCTTTATGACCGTTGGATCTTTTCAGATTAATCATTTTTCTGTTGATTTC
CAGAGTTGTAATTGCAGATATTGTGAATTATGTATCTATCTCATCTTAAGCTTTGTGCCA
TTTCGTCCAAAAAAA


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G215TF U 360
AF RS1FP94JQ C 1
AF RS1FP94TF U 1
AF RS1GS35JQ C 50
AF RS1GS35TF U 1
BS 1 1 RS1FP94JQ
BS 2 360 RS1FP94TF
BS 361 533 RS1G215TF
BS 534 548 RS1FP94TF
BS 549 555 RS1GS35TF

RD RS1G215TF 174 0 0
G
CATGTGTAATTTGATTTGTCGTCTTTGAGTTTTAATGCTTTTTCCGTTTGTGTACTTTCG
CATCAGCATGGCTTTATGACCGTTGGATCTTTTCAGATTAATCATTTTTCTGTTGATTTC
CAGAGTTGTAATTGCAGATATTGTGAATTATGTATCTATCTCATCTTAAGCTT

QA 2 174 2 174
DS 

RD RS1FP94JQ 548 0 0
GGGAGTGTCCAACGCTTTGGTTTTCGAGATCGTGATGACCTTCGGGCTTGTTTACACAGT
CTGCGCCACCGCCGTCGACCCCAAGAACGGAAGTCTTGGAACAATCGCTCCCATCGCAAT
CGGTTTCATCGTCGGTGCCAACATCTTAGCAGGAGGAGCATTCAGCGGAGCCTCCATGAA
CCCCGCCGTGGCCTTCGGACCAGCTGTGGTAAGCTGGTCGTGGAACAACCACTGGGTCTA
CTGGGCCGGACCTCTTATTGGCGGTGGAATCGCTGGACTCATTTACGAGGTTTTCTTCAT
CAACACCACCCACGAACAGCTCCCCACCACCGACTACTGAATCAATTTCCCTGTTTCTTT
CATGTGTAATTTGATTTGTCGTCTTTGAGTTTTAATGCTTTTTCCGTTTGTGTACTTTCG
CATCAGCATGGCTTTATGACCGTTGGATCTTTTCAGATTAATCATTTTTCTGTTGATTTC
CAGAGTTGTAATTGCAGATATTGTGAATTATGTATCTATCTCATCTTAAGCTTTGTGCCA
TTTCGTCC

QA 1 548 1 548
DS 

RD RS1FP94TF 548 0 0
G
GGAGTGTCCAACGCTTTGGTTTTCGAGATCGTGATGACCTTCGGGCTTGTTTACACAGTC
TGCGCCACCGCCGTCGACCCCAAGAACGGAAGTCTTGGAACAATCGCTCCCATCGCAATC
GGTTTCATCGTCGGTGCCAACATCTTAGCAGGAGGAGCATTCAGCGGAGCCTCCATGAAC
CCCGCCGTGGCCTTCGGACCAGCTGTGGTAAGCTGGTCGTGGAACAACCACTGGGTCTAC
TGGGCCGGACCTCTTATTGGCGGTGGAATCGCTGGACTCATCTACGAGGTTTTCTTCATC
AACACCACCCACGAACAGCTCCCCACCACCGACTACTGAATCAATTTCCCTGTTTCTCTC
ATGTGTAATTTGATTTGTCGTCTTTGAGTTTTAATGCTTTTTCCGTTTGTGTACTTTCGC
ATCAGCATGGCTTTATGACCGTTGGATCTTTTCAGATTAATCATTTTTCTGTTGATTTCC
AGAGTTGTAATTGCAGATATTGTGAATTATGTATCTATCTCATCTTAAGCTTTGTGCCAT
TTCGTCC

QA 2 548 2 548
DS 

RD RS1GS35JQ 499 0 0
GTTTACACAGTCTGCGCCACCGCCGTCGACCCCAAGAACGGAAGTCTTGGAACAATCGCT
CCCATCGCAATCGGTTTCATCGTCGGTGCCAACATCTTAGCAGGAGGAGCATTCAGCGGA
GCCTCCATGAACCCCGCCGTGGCCTTCGGACCAGCTGTGGTAAGCTGGTCGTGGAACAAC
CACTGGGTCTACTGGGCCGGACCTCTTATTGGCGGTGGAATCGCTGGACTCATCTACGAG
GTTTTCTTCATCAACACCACCCACGAACAGCTCCCCACCACCGACTACTGAATCAATTTC
CCTGTTTCTCTCATGTGTAATTTGATTTGTCGTCTTTGAGTTTTAATGCTTTTTCCGTTT
GTGTACTTTCGCATCAGCATGGCTTTATGACCGTTGGATCTTTTCAGATTAATCATTTTT
CTGTTGATTTCCAGAGTTGTAATTGCAGATATTGTGAATTATGTATCTATCTCATCTTAA
GCTTTGTGCCATTTCGTCC

QA 1 499 1 499
DS 

RD RS1GS35TF 555 0 0
G
GGAGTGTCCAACGCTTTGGTTTTCGAGATCGTGATGACCTTCGGGCTTGTTTACACAGTC
TGCGCCACCGCCGTCGACCCCAAGAACGGAAGTCTTGGAACAATCGCTCCCATCGCAATC
GGTTTCATCGTCGGTGCCAACATCTTAGCAGGAGGAGCATTCAGCGGAGCCTCCATGAAC
CCCGCCGTGGCCTTCGGACCAGCTGTGGTAAGCTGGTCGTGGAACAACCACTGGGTCTAC
TGGGCCGGACCTCTTATTGGCGGTGGAATCGCTGGACTCATCTACGAGGTTTTCTTCATC
AACACCACCCACGAACAGCTCCCCACCACCGACTACTGAATCAATTTCCCTGTTTCTCTC
ATGTGTAATTTGATTTGTCGTCTTTGAGTTTTAATGCTTTTTCCGTTTGTGTACTTTCGC
ATCAGCATGGCTTTATGACCGTTGGATCTTTTCAGATTAATCATTTTTCTGTTGATTTCC
AGAGTTGTAATTGCAGATATTGTGAATTATGTATCTATCTCATCTTAAGCTTTGTGCCAT
TTCGTCCAAAAAAA

QA 2 555 2 555
DS 



CO CL435Contig2 960 4 13 U
GGAAATCAACAGAAAATGATTAATCTGAAAAGATCCAACGGTCATAAAGCCATGCTGATG
CGAAATTACACAAACGGAAAAAACACATTAAAATTCAAAGACGACAAATCAAATTACACA
TGAGAGAAACAGAGAGATTGATTCAGTAGTCGGTGGTGGGGAGCTGTTCGTGGGTGGTGT
TGATGAAGAAAACCTCGTAAATGAGTCCAGCGATTCCACCGCCAATAAGAGGTCCGGCCC
AGTAGACCCAGTGGTTGTTCCACGACCAGCTTACAACAGCTGGTCCGAAAGCCACGGCGG
GGTTCATGGAGGCTCCGCTGAATGCTCCTCCTGCTAAGATGTTGGCACCGACAATGAAAC
CGATTGCGATGGGAGCGATGGTTCCAAGACTTCCGTTCTTGGGGTCTACGGCGGTGGCGT
AGACTGTGTAAACAAGCCCGAAGGTCATCACGATCTCGAAAACCAAAGCGTTGGACACTC
CTACTCCGGCAGAGAGGCCAAAAGCAGGCACAGCCAAACCGCCGGTGGCGAACTTGAGGA
GGAGACAAGCAACGACTGAGCCAAGTAGCTGAGCAATCCAGTAGGGTATACCACGGAGGA
GAGTGATGTTGCCACCAACGAAAGCGCCGAAAGTGACGGCGGGGTTAACGTGTCCACCGG
AGATGTTGGCGCCGACGGAGACGGCGACAAAGAGTCCAAAGGCGTGAGCCAGTGAGGCGG
CTACGAGGCCGGCGGGAGTGGTGGCACCGTTTTCAGTGAGCTTGTTGAAAGCCATTCCTG
AGCCTGAGCCGGCGAAGACAAAGATCATAGTTGATATGAACTCAGCCAACGCCGCCTTTA
AGGCGTCGGGGCGGGTGGCTTCATCGGGACGGCCAACGGCGATGTTTCTGATCGGCATGA
TGGGAGGAAGATGGAACGGCTGAGATTAAATGTTGTGTGTGTTAGAAGAGAGTGAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1H374JQB U 1
AF RS1AT56JQ U 27
AF RS1H374TF C 290
AF RS1AT56TF C 333
BS 1 457 RS1H374JQB
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BS 817 960 RS1H374TF

RD RS1H374JQB 488 0 0
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TGATGAAGAAAACCTCGTAAATGAGTCCAGCGATTCCACCGCCAATAAGAGGTCCGGCCC
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CGATTGCGATGGGAGCGATGGTTCCAAGACTTCCGTTCTTGGGGTCTACGGCGGTGGCGT
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CTACTCCG

QA 1 488 1 488
DS 

RD RS1AT56JQ 646 0 0
GG
AAAGATCCAACGGTCATAAAGCCATGCTGATGCGAAATTACACAAACGGAAAAAACACAT
TAAAATTCAAAGACGACAAATCAAATTACACATGAGAGAAACAGAGAGATTGATTCAGTA
GTCGGTGGTGGGGAGCTGTTCGTGGGTGGTGTTGATGAAGAAAACCTCGTAAATGAGTCC
AGCGATTCCACCGCCAATAAGGGGTCCGGCCCAGTAGACCCAGTGGTTGTTCCACGACCA
GCTTACAACAGCTGGTCCGAAAGCCACGGCGGGGTTCATGGAGGCTCCGCTGAATGCTCC
TCCTGCTAAGATGTTGGCACCGACAATGAAACCGATTGCGATGGGAGCGATGGTTCCAAG
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CACGATCTCGAAAACCAAAGCGTTGGACACTCCTACTCCGGCAGAAAGGCCAAAAGCAGG
CACAGCCAAACCGCCGGTGGCGAACTTGAGGAGGAGACAAGCAACGACTGAGCCAAGTAG
CTGAACAATCCAGTAGGGTATACCACGGAGGAGAGTGATGTTGCCACCAACGAAAGCGCC
GAAAGTGACGGCGGGGTTAACGTGTCCACCGGAGATGTTGGCGC

QA 3 646 3 646
DS 

RD RS1H374TF 671 0 0
A
GCCACGGCGGGGTTCATGGAGGCTCCGCTGAATGCTCCTCCTGCTAAGATGTTGGCACCG
ACAATGAAACCGATTGCGATGGGAGCGATGGTTCCAAGACTTCCGTTCTTGGGGTCTACG
GCGGTGGCGTAGACTGTGTAAACAAGCCCGAAGGTCATCACGATCTCGAAAACCAAAGCG
TTGGACACTCCTACTCCGGCAGAGAGGCCAAAAGCAGGCACAGCCAAACCGCCGGTGGCG
AACTTGAGGAGGAGACAAGCAACGACTGAGCCAAGTAGCTGAGCAATCCAGTAGAGTATA
CCACGGAGGAGAGTGATGTTGCCACCAACGAAAGCGCCGAAAGTGACGGCGGGGTTAACG
TGTCCACCGGAGATGTTGGCGCCGACGGAGACGGCGACAAAGAGTCCAAAGGCGTGAGCC
AGTGAGGCGGCTACGAGGCCGGCGGGAGTGGTGGCACCGTTTTCAGTGAGCTTGTTGAAA
GCCATTCCTGAGCCTGGGCCGGCGAAGACAAAGATCATAGTTGATGTGAACTCAGCCAAC
GCCGCCTTTAAGGCGTCGGGGCGGGTGGCTTCATCGGGACGGCCAACGGCGATGTTTCTG
ATCGGCATGATGGGAGGAAGATGGAACGGCTGAGATTAAATGTTGTGTGTGTTAGAAGAG
AGTGAGATCC

QA 2 671 2 671
DS 

RD RS1AT56TF 628 0 0
GCTAAGATGTTGGCACCGACAATGAAACCGATTGCGATGGGAGCGATGGTTCCAAGACTT
CCGTTCTTGGGGTCTACGGCGGTGGCGTAGACTGTGTAAACAAGCCCGAAGGTCATCACG
ATCTCGAAAACCAAAGCGTTGGACACTCCTACTCCGGCAGAGAGGCCAAAAGCAGGCACA
GCCAAACCGCCGGTGGCGAACTTGAGGAGGAGACAAGCAACGACTGAGCCAAGTAGCTGA
GCAATCCAGTAGGGTATACCACGGAGGAGAGTGATGTTGCCACCAACGAAAGCGCCGAAA
GTGACGGCGGGGTTAACGTGTCCACCGGAGATGTTGGCGCCGACGGAGACGGCGACAAAG
AGTCCAAAGGCGTGAGCCAGTGAGGCGGCTACGAGGCCGGCGGGAGTGGTGGCACCGTTT
TCAGTGAGCTTGTTGAAAGCCATTCCTGAGCCTGAGCCGGCGAAGACAAGGATCATAGTT
GATATGAACTCAGCCAACGCCGCCTTTAAGGCGTCGGGGCGGGTGGCTTCATCGGGACGG
CCAACGGCGATGTTTCTGATCGGCATGATGGGAGGAAGATGGAACGGCTGAGATTAAATG
TTGTGTGTGTTAGAAGAGAGTGAGATCC

QA 1 628 1 628
DS 



AS 2 8

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GGCAAGTAAACTAGTAATATATCTTATAAATGTTTCATGGATTGACGAAAAATGCGCATA
ACACCGAAAAAGGTTATGGCCCGTAGGCGTGTACATGCAATAAAAAAATACAAGAGTATC
TCCATTGAGCGTTTTCAAAATGAGTCTTTCATATTATAAAAAACCGTACTTCAAAGCCAT
AAGTCTCTATTACAGAGGCTGATTACTGATCCACCTTTGAAACATAATAGATGTCTCGTT
TGGTTTATACTCTGCCGTGTGTCCACTTCCCTTGATAGTAGAAAATGTCATCTTATTGGA
ATAAGTTCTCGTGTATCCAGCAATTTGAGCTTTTATCATCCAAGGCCTCCAGTCATCAAT
GATGGAGTAATTGAGGGATTTGATCCAGGCTTGAGTTGCTAGGGAAGGCATCGTCATGTC
ATGATCACCACTATAAATAAAAAATCGGTATCCGCTGATGCTGTTATTCGCATGATAAGG
TAAGCTGCTTATAATGTCGGAACTGTACGAAATAGTCCTGTTACATCGCTTCCAATGTCC
TTTAGTCCCCTTTCGAATATGGAGAGCTTCGCGGACTCTCTCGTTGTTGGCCCAACTTTC
AATGAGATAATATAGATAATAATAGCAATCAGAAGATATATTTTTCGAATTTTCGTCATC
ATCGCAATCTGGCAATAGTATATTATGTGGATTTATTTTGTCAGTGCACTTATGGTATTC
TGCAACAAGTTCCAAACACTTTGTATTACGTGGATCCACATTTACATAAACTCCTTTGCA
ATTTGTGTTCAGTGACTCGTATAGTTCATCAGAGATTAATGACATTCCATGAGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H392JQB U 44
AF RS1GM80JQ U 54
AF RS1E748JQ U 1
AF RS1FA68JQ U 54
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RD RS1H392JQB 205 0 0
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ATAATAGATGTCTCGTTTGGTTTAT

QA 1 205 1 205
DS 

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TCATGTCATGATCACCACTATAAATA

QA 1 386 1 386
DS 

RD RS1E748JQ 641 0 0
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TGGTTTATACTCTGCCGTGTGTCCACTTCCCTTGATAGTAGAAAATGTCATCTTATTGGA
ATAAGTTCTCGTGTATCCAGCAATTTGAGCTTTTATCATCCAAGGCCTCCAGTCATCAAT
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TTTAGTCCCCTTTCGAATATGGAGAGCTTCGCGGACTCTCTCGTTGTTGGCCCAACTTTC
AATGAGATAATATAGATAATAATAGCAATCGGAAGATATAT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1FA68JQ 782 0 0
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TCTCGTTTGGTTTATACTCTGCCGTGTGTCCACTTCCCTTGATAGTAAAAAATGTCATCT
TATTGGAATAAGTTCTCGTGTATCCAGCAATTTGAGCTTTTATCATCCAAGGCCTCCAGT
CATCAATGATGGAGTAATTGAGGGATTTGATCCAGGCTTGAGTTGCTAGGGAAGGCATCG
TCATGTCATGATCACCACTATAAATAAAAAATCGGTATCCGCTGATGCTGTTATTCGCAT
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AATGTCCTTTAGTCCCCTTTCGAATATGGAGAGCTTCGCGGACTCTCTCGTTGTTGGCCC
AACTTTCAATGAGATAATATAGATAATAATAGCAATCAGGAGATATATTTTTCGAATTTT
CGTCATCATCGCAATCTGGCAATAGTATATTATGTGGATTTATTTTGTCAGTGCACTTAT
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CTTTGCAATTTGTGTTCAGTGACTCGTATAGTTCATCAGAGATTAATGACATTCCATGAG
AA

QA 1 782 1 782
DS 



CO CL436Contig2 1488 4 6 U
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AAGAGGATATACAGTTGTTCTACTACTTCATCAAATCTGAGAAGAATCCAAAGGAAGATC
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AGAATGGACCTCTGGCTTTTAAGTTCGAGGTTTACAATGGAGATCTCGCTTCTTTGGTCT
CTACTACATATTCATGGACACAGGTGGCTAACATAATATTCTTGGATCAACCTGTTGGAT
CTGGTTTCTCATACTCAAGAACTCCACTTGATAAAACTAGTGACACAAATGAAGTTAAGA
TGATCCATGAGTTTCTTCAAAAGTGGCTAAGCAAGCATCCACAGTTTTTCTCTAACCCGT
TTTACGTTATCGGAGATTCGTATTCCGGTAAAATTGTTCCGGCACTCGTTCAGAAAATCT
CAAAAGGAAACTATATATGTTGCAAACCTCTCATCAATCTACAGGGGTATGTGCTCGGAA
ACCCAGTAACATATCCTGAATTTGACATAAACTATCGTATTCCATTTTCTCATGGAATGT
CATTAATCTCTGATGAACTATACGAGTCACTGAACACAAATTGCAAAGGAATTGATGGAA
ATGTGGATCCACGTAATACAAAGTGTTTGGAACTTGTTGCAGAATACCATAAGTGCACTG
ACAAAATAAATCCATATAGTATACTATTGCCAAATTGCGATGACGATGAAAATTCGGAAA
ATATATCTCCTGATTGCTATTATTATCTATATTATCTCATTGAAAGTTGGGCCAATAACG
AGAGAGTCCGTGAAGCTCTCCATGTTCAAAAGGGGACTAAAGGACATTGGAAGCGATGTA
ACAAGACTATTAGTATTACGTACAGTTACGACATTATAAGCAGCGTACCTTATCATCTGA
ATAACAGCATCAGCGGATACCGGTCTCTTATTTATAGTGGTGATCATGACATGACAGTGC
CTTCCCTATCAACTCAAGCCTGGATCAAATCCCTCAATTACTCCATCATCGATGACTGGA
GGCCTTGGATGATAAAAGCTCAAATTGCTGGATACGAGAACTTATTCCAATAAGATGACA
TTTTCTACTATCAAGGGAAGTGGACACACGGCAGAGTATAAACCAAACGAGACATTTATT
ATGTTTCAAAGGTGGATCAGTAGTCAGCCTTTGTAATAGAGACTCATGGCTTTGAAGCGC
GGTTTTTTATATTATGAAAGACTCATTTTGAAAACGCTCAATGCAGATACTCTTGTTTGT
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BQ
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TCACTGAAACAATTGCAA

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DS 



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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DD14TF U 1
AF RS1DD14JQ C 323
BS 1 707 RS1DD14TF
BS 708 708 RS1DD14JQ
BS 709 751 RS1DD14TF
BS 752 752 RS1DD14JQ
BS 753 809 RS1DD14TF
BS 810 944 RS1DD14JQ

RD RS1DD14TF 809 0 0
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GACGACAACAACAGAAGCAACGAAGACATCTCCTACTAATGGAGAAGACAAGCAATCTCA
GAATCTCCGACACCAAGAAGTCGGTCACAAGAGTCTCTTACAGAGCGACGATCTCTACCA
GTATATTCTGGAGACGAGTGTGTATCCAAGAGAACCAGAACCAATGAAAGAACTCAGGGA
AGTCACGGCAAAACACCCTTGGAACATAATGACAACATCGGCAGACGAAGGACAGTTTCT
CAACATGCTCATCAAGCTCGTTAACGCCAAGAACACCATGGAGATCGGTGTTTACACTGG
CTACTCTCTCCTCGCCACCGCTCTTGCTCTCCCTGAAGACGGCAAAATTCTTGCTATGGA
CGTTAACAGAGAGAACTACGAGTTGGGTTTGCCGATCATCGAGAAAGCTGGCGTTGCTCA
CAAGATCGACTTCAGGGAAGGCCCTGCTCTTCCTGTTCTTGATCAACTCGTTGCTGACGA
GAAGAACCATGGAACGTATGACTTTATATTCGTTGATGCTGACAAAGACAACTACATCAA
CTACCATAAACGTTTGATCGATCTTGTGAAAGTTGGAGGAGTGATCGGCTACGACAACAC
TCTGTGGAACGGTTCGGTCGTGGCTCCTCCTGATGCGCCAATGAGGA*GTACGTTCGTTA
CTACAGAGACTTTGTTCTTGAGCTTAACAAG*CTCTTGCTGCTGACCCTAGGATCGAGAT
CTGCATGCTCCCTGTTGGTGATGGGATCA

QA 1 809 1 809
DS 

RD RS1DD14JQ 622 0 0
AACGCCAAGAACACCATGGAGATCGGTGTTTACACTGGCTACTCTCTCCTCGCCACCGCT
CTTGCTCTCCCTGAAGACGGCAAAATTCTTGCTATGGACGTTAACAGAGAGAACTACGAG
TTGGGTTTGCCGATCATCGAGAAAGCTGGCGTTGCTCACAAGATCGACTTCAGGGAAGGC
CCTGCTCTTCCTGTTCTTGATCAACTCGTTGCTGACGAGAAGAACCATGGAACGTATGAC
TTTATATTCGTTGATGCTGACAAAGACAACTACATCAACTACCATAAACGTTTGATCGAT
CTTGTGAAAGTTGGAGGAGTGATCGGCTACGACAACACTCTGTGGAACGGTTCGGTCGTG
GCTCCTCCTGATGCGCCAATGAGGAAGTACGTTCGTTACTACAGAGACTTTGTTCTTGAG
CTTAACAAGGCTCTTGCTGCTGACCCTAGGATCGAGATCTGCATGCTCCCTGTTGGTGAT
GGGATCACTATCTGCCGTCGGATCAATTGATTGATACCCACTTTTGAGTGTGGGTTTTGA
TTGCTTTCAATTTCTCTGTACCTTTCATTCACCAACCATTTTATGTATTATGTTGAGTAT
TATCTCTATTATTCTTCCTTTG

QA 1 622 1 622
DS 



CO CL437Contig2 1023 4 13 U
CAAAAACCACAATCGTCAATCGTAGCAAAAGGAAAACATATACAGAGAGAGAGATGGCGA
CGACAACAGCAGAGGCAACGAAGACATCTACTAATAATGGAGAAGACAAGCAATCTCAGA
ATCTCCGACATCAAGAAGTTGGTCACAAGAGTCTCTTACAGAGCGACGATCTCTACCAGT
ATATTCTGGAGACAAGTGTGTATCCAAGAGAACCAGAATCAATGAAAGAACTCAGGGAAG
TGACAGCAAAACACCCTCGGAACATAATGACAACATCAGCAGATGAAGGACAGTTTCTGA
ACATGCTCATCAAGCTCGTTAACGCCAAGAACACAATGGAGATTGGTGTTTGCACTGGCT
ACTCTCTCCTCGCCACTGCTCTTGCTCTCCCCGAAGACGGCAAAATTCTTGCTATGGATG
TTAACAGAGAGAATTACGCATTGGGTTTGCCGATCATCGAGAAAGCCGGCGTTGCTCACA
AGATCGATTTCAGGGAAGGCCCTGCTCTTCCCGTTCTTGATCAACTCGTTGCTGACGAGA
AGAACCATGGAACATATGACTTTATATTCGTTGATGCTGACAAGGACAACTATATCAACT
ACCATAAGCGTTTGATTGATCTTGTGAAAGTTGGTGG*AGTGATTGGCTATGGCAACACT
TTGTGGAACGGTTCTGTCGTTGCTCCTCCTGATGCACCAATGAGGAAGTATGTTCGTTAT
TACAGAGACTTTGTTCTTGAGCTTAACAAGGCTCTTGCTGCTGACCCTAGGATTGAGATC
TGCATGCTTCCTGTTGGTGATGGAATCACTATCTGCCGTCGGATCAGTTGATTTGATACC
TCCAACACTCTGAGTTTGTCTGCAGTGGATCAATTCTCCTCTCTCTACTACCTACCAAAT
TGGACCACTCATATGTATTTTGTTAAGGCATTGTCTTTTGTTTTTGCTTTTCTTTTGAAC
AAAGAAATAATGTACCCTACCTTTCTTGTTTTGTTTGTTTCTCCCTTATGATACAACTTC
TAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 

AF RS1ER46TF U 1
AF RS1BN21TF U 91
AF RS1ER46JQ C 196
AF RS1BN21JQ C 654
BS 1 697 RS1ER46TF
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RD RS1ER46TF 766 0 0
CAAAAACCACAATCGTCAATCGTAGCAAAAGGAAAACATATACAGAGAGAGAGATGGCGA
CGACAACAGCAGAGGCAACGAAGACATCTACTAATAATGGAGAAGACAAGCAATCTCAGA
ATCTCCGACATCAAGAAGTTGGTCACAAGAGTCTCTTACAGAGCGACGATCTCTACCAGT
ATATTCTGGAGACAAGTGTGTATCCAAGAGAACCAGAATCAATGAAAGAACTCAGGGAAG
TGACAGCAAAACACCCTCGGAACATAATGACAACATCAGCAGATGAAGGACAGTTTCTGA
ACATGCTCATCAAGCTCGTTAACGCCAAGAACACAATGGAGATTGGTGTTTGCACTGGCT
ACTCTCTCCTCGCCACTGCTCTTGCTCTCCCCGAAGACGGCAAAATTCTTGCTATGGATG
TTAACAGAGAGAATTACGCATTGGGTTTGCCGATCATCGAGAAAGCCGGCGTTGCTCACA
AGATCGATTTCAGGGAAGGCCCTGCTCTTCCCGTTCTTGATCAACTCGTTGCTGACGAGA
AGAACCATGGAACATATGACTTTATATTCGTTGATGCTGACAAGGACAACTATATCAACT
ACCATAAGCGTTTGATTGATCTTGTGAAAGTTGGTGG*AGTGATTGGCTATGGCAACACT
TTGTGGAACGGTTCTGTCGTTGCTCCTCCTGATGCAC*AATGAGGAAGTATGTTCGTTAT
TACAGAGACTTTGTTCTTGAGCTTAACAAG*CTCTTGCTGCTGACC

QA 1 766 1 766
DS 

RD RS1BN21TF 775 0 0
CTAA
TAATGGAGAAGACAAGCAATCTCAGAATCTCCGACATCAAGAAGTTGGTCACAAGAGTCT
CTTACAGAGCGACGATCTCTACCAGTATATTCTGGAGACAAGTGTGTATCCAAGAGAACC
AGAATCAATGAAAGAACTCAGGGAAGTGACAGCAAAACACCCTTGGAACATAATGACAAC
ATCAGCAGATGAAGGACAGTTTCTGAACATGCTCATCAAGCTCGTTAACGCCAAGAACAC
AATGGAGATTGGTGTTTACACTGGCTACTCTCTCCTCGCCACTGCTCTTGCTCTCCCCGA
AGACGGCAAAATTCTTGCTATGGATGTTAACAGAGAGAATTACGCATTGGGTTTGCCGAT
CATCGAGAAAGCCGGCGTTGCTCACAAGATCGATTTCAGGGAAGGCCCTGCTCTTCCCGT
TCTTGATCAACTCGTTGCTGACGAGAAGAACCATGGAACATATGACTTTATATTCGTTGA
TGCTGACAAGGACAACTATATCAACTACCATAAGCGTTTGATTGATCTTGTGAAAGTTGG
TGGGAGTGGTTGGCTATGACAACACTTTGTGGAACGGTTCTGTCGTTGCTCCTCCTGATG
CACCAATGAGGAAGTATGTTCGTTATTACAGAGACTTTGTTCTTGAGCTTAACAAGGCTC
TTGCTGCTGACCCTAGGATTGAGATCTGCATGCTTCCTGTTGGTGATGGAATCACTATCT
GCCGTCGGATCAGTTGATTTGATACCTCCA*CACTCTGAGTTTGTCTG
CAG

QA 5 772 5 772
DS 

RD RS1ER46JQ 827 0 0
GTGTGTATCCAAGAGAACCAGAATCAATGAAAGAACTCAGGGAAGTGACAGCAAAACACC
CTCGGAACATAATGACAACATCAGCAGATGAAGGACAGTTTCTGAACATGCTCATCAAGC
TCGTTAACGCCAAGAACACAATGGAGATTGGTGTTTGCACTGGCTACTCTCTCCTCGCCA
CTGCTCTTGCTCTCCCCGAAGACGGCAAAATTCTTGCTATGGATGTTAACAGAGAGAATT
ACGCATTGGGTTTGCCGATCATCGAGAAAGCCGGCGTTGCTCACAAGATCGATTTCAGGG
AAGGCCCTGCTCTTCCCGTTCTTGATCAACTCGTTGCTGACGAGAAGACCCATGGAACAT
ATGACTTTATATTCGTTGATGCTGACAAGGACAACTATATCAACTACCATAAGCGTTTGA
TTGATCTTGTGAAAGTTGGTGG*AGTGATTGGCTATGGCAACACTTTGTGGAACGGTTCT
GTCGTTGCTCCTCCTGATGCACCAATGAGGAAGTATGTTCGTTATTACAGAGACTTTGTT
CTTGAGCTTAACAAGGCTCTTGCTGCTGACCCTAGGATTGAGATCTGCATGCTTCCTGTT
GGTGATGGAATCACTATCTGCCGTCGGATCAGTTGATTTGATACCTCCAACACTCTGAGT
TTGTCTGTAGTGGATCAATTCTCCTCTCTTTACTACCTACCAAATTGGACCACTCATATG
TATTTTGTTAAGGCATTGTCTTTTGTTTTTGCTTTTCTTTTGAACAAAGAAATAATGTAC
CCTACCTTTCTTGTTTTGTTTGTTTCTCCCTTATGATACAACTTCTA

QA 1 827 1 827
DS 

RD RS1BN21JQ 370 0 0
CAACACTTTGTGGAACGGTTCTGTCGTTGCTCCTCCTGATGCACCAATGAGGAAGTATGT
TCGTTATTACAGAGACTTTGTTCTTGAGCTTAACAAGGCTCTTGCTGCTGACCCTAGGAT
TGAGATCTGCATGCTTCCTGTTGGTGATGGAATCACTATCTGCCGTCGGATCAGTTGATT
TGATACCTCCAACACTCTGAGTTTGTCTGCAGTGGATCAATTCTCCTCTCTCTACTACCT
ACCAAATTGGACCACTCATATGTATTTTGTTAAGGCATTGTCTTTTGTTTTTGCTTTTCT
TTTGAACAAAGAAATAATGTACCCTACCTTTCTTGTTTTGTTTGTTTCTCCCTTATGATA
CAACTTCTAC

QA 1 370 1 370
DS 



AS 2 8

CO CL438Contig1 641 2 6 U
GAAGCAAACGTTGTCCATGTGATATTATATCAAGAAAGATACATTTCAACCAATAGTGAT
TGTCATGAACCAAAACATTTGGAAAATTAGCCAGTTTCAGAAAATAACTGAATTAAAAAT
TCTATTAAGAGAGTTTGGCTTCCGACCAAAGTCTCAAATAGTTGTAGTAGAGGAGGGAGC
AGGCTTCATGTTTCAGAACCTGTGCTCGAGTTTCTCCTGTTCCTGGAAGTGATGAGCATA
CGAGTAGGTTCCGAGGACAGGAGTGAGGAGAAGAGTGGCGCTGATCCAATTCTCGGAGAC
CTTGTGGTGAATCTTCTCGGGGAGATCCTTCCAGAGTCCGGTCATTATCTTCTGCTGAAA
CGGCGAAAGCGCGTATACCACCGCCTTCAACTTCACCGGCTGCTTCCCCATCTCTCTTTT
TTCTTCTTCTTCTTCCGACAACCATCTTCGCCTTCTTCCTCGCTCGAGGAGCTTGAAGAG
CTGTCGCTGCGGTGAAGCTTCTCGAGGAGACTATGCTTCTTCTCTTCTTCTTCTTCCACG
TGTTTAACCTCAGGCGCCGGCTCCGAGACGTGAACCTTTTGCTCAAACTCAGACGCTATG
GCGGTCTCCTCTGGTTTTGTTTCATCTTTCTTCTTCCCCAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CD12JQ U 1
AF RS1EY12JQ U 1
BS 1 15 RS1CD12JQ
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RD RS1CD12JQ 441 0 0
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TTCTTCTTCTTCTTCCGAC
CC

QA 1 439 1 439
DS 

RD RS1EY12JQ 641 0 0
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TGTCATGAACCAAAACATTTGGAAAATTAGCCAGTTTCAGAAAATAACTGAATTAAAAAT
TCTATTAAGAGAGTTTGGCTTCCGACCAAAGTCTCAAATAGTTGTAGTAGAGGAGGGAGC
AGGCTTCATGTTTCAGAACCTGTGCTCGAGTTTCTCCTGTTCCTGGAAGTGATGAGCATA
CGAGTAGGTTCCGAGGACAGGAGTGAGGAGAAGAGTGGCGCTGATCCAATTCTCGGAGAC
CTTGTGGTGAATCTTCTCGGGGAGATCCTTCCAGAGTCCGGTCATTATCTTCTGCTGAAA
CGGCGAAAGCGCGTATACCACCGCCTTCAACTTCACCGGCTGCTTCCCCATCTCTCTTTT
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GCGGTCTCCTCTGGTTTTGTTTCATCTTTCTTCTTCCCCAA

QA 1 641 1 641
DS 



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AGCAGAGCAAAC*AAAACTTTTCCCGATAACTATGGCAGAGGAAACCAAGAACGTTGAGG
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TGGATAAGCTGAAGGAGAAGCTTCCTGGACACGGAAAGAAGCCTGAAGATGCTCCACCAG
CACCGGTTGTTGCTCCTCCAGTGGAGGAAGCGCATCCGGCGGAGAAGAAAGGGATCTTGG
AGAAGATTAAGGAGAAGCTTCCAGGCTACCATCCCAAGACTGTAGAGGAGGAAAAGAAGG
ATAAGGATGATCATTAAAGATATGAATCATGATGATGATGATGATGATGTGTTATTGTGT
TGAATGATGATCATCTTTTGCTTTTGTGTTGTTGGAAGTTTGTTGGCTTTTTTATTATTT
CCTTTGTTGATTTCAGCTTTCCTTGTTATGTGTTGTATATTATGATTTCAAAGGTATTTT
TATGGTATGATTATTTTCATTT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EY12TF U 126
AF RS1D763TF U 4
AF RS1EY30TF U 1
AF RS1BF38TF U 162
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GG
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A

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ATGATT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RS1EY30JQ 798 0 0
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TATTATTTCCTTTGTTGATTTCAGCTTTCCTTGTTATGTGTTGTATATTATGATTTCAAA
GGTATTTTTATGGTATGA

QA 1 798 1 798
DS 

RD RS1D763JQ 522 0 0
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GGAGGAGAAAAAAGGGTTTATGGATAAGCTGAAGGAGAAGCTTCCTGGACACGGAAAGAA
GCCTGAAGATGCTCCACCAGCACCGGTTGTTGCTCCTCCGGTAGAGGAAGCGCATCCGGC
GGAGAAGAAAGGGATCTTGGAGAAGATTAAGGAGAAGCTTCCAGGCTACCATCCCAAGAC
TGTAGAGGAGGAAAAGAAGGATAAGGATGATCATTAAAGATATGAATCATGATGATGATG
ATGATGATGTGTTATTGTGTTGAATGATGATCATCTTTTGCTTTTGTGTTGTTGGAAGTT
TGTTGGCTTTTTTATTATTTCCTTTGTTGATTTCAGCTTTCCTTGTTATGTGTTGTATAT
TATGATTTCAAAGGTATTTTTATGGTATGATTATTTTCATTT

QA 1 522 1 522
DS 



AS 1 8

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GAGAAAGATGTATTACAAATGGGACTAGAGAAATGGTTTATCTCTCGAAGTAATCCTCGG
TCCTACCCTTGAATCCGATTTGTCCGAAGGTGAGACAGATGAAGAGACCTAAGTGCCACG
TAACCAACCACAACCAGAACTGTGAAGTGAGTGCTGGAGGAGTTGGGAAGTGAGCGAGCT
CATTTCCTATGCTCTCGAAGAAGAGACCCGTCAAGCTCTTCCCATTTATCGCCGGAATAC
TCGACGGAGCTAGCCATCCGATCAGTACAAACCCCACCACGTTTAGGTCTCTCCTCAACC
AGTTCCTCTCAAAGCAAGTGAATCTTCCTCCTGATGCTCCGTTGACTCTCAGAGGGTTCT
TTGCTCTTAATGTTGGTTTTAGAAAGGATGAAGAGAAGGCTTTGGTGTTGATGCGTGAAA
TAGATGATCCTCCGAGACCTATCACCGTCGATGGGGTTGCAAATGCTGTTGCCATTCTTC
TTCTTTTGCTTCTTTCTCCCAAACCCCCGTTTTTGTAACCACCGTTTCCTCCACTCGAGC
CACCGCCGTTTCTTTAACCGGACCAGCTACTTCTTGTGGTTCTTGTTCAGATTTCGAGGC
GGTTTGTCCCTCTAACAAGCCACATCCATGACGGCCGTCGTCTCCAATGGTGGTGACTCT
CATCCTCCAGAAGCTGACGGCTGCCGTCACGACAGCGATCCATGTCCAGACATTGTTGAC
GATGGCAAGAACACCGAAGCTAACGTATTCGAAAGCCAACGCTTCTAATGGAGAATCCAA
AGTGGCCATGTTTTTCTTGTTGTCTCGATGATCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGG
GCATATGTCCGGTACCGTCGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 15 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
15 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A396TR U 27
AF RS1EL24JQ U 1
AF RS1G532JQ U 7
AF RS1G532TF C 7
AF RS1EL24TF C 1
AF RS1A396JQ U 8
AF RS1A396TV C 171
AF RS1A396TF C 186
BS 1 88 RS1EL24JQ
BS 89 89 RS1G532JQ
BS 90 262 RS1EL24JQ
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BS 532 645 RS1A396JQ
BS 646 923 RS1A396TV

RD RS1A396TR 414 0 0
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AGAGAAATGGTTTATCTCTCGAAGTAATCCTCGGTCCTACCCTTGAATCCGATTTGTCCG
AAGGTGAGACAGATGAAGAGACCTAAGTGCCACGTAACCAACCACAACCAGAACTGTGAA
GTGAGTGCTGGAGGAGTTGGGAAGTGAGCGAGCTCATTTCCTATGCTCTCGAAGAAAAAA
CCCGTCAAGCTCTTCCCATTTATCGCCGGAATACTCGACGGAGCTAGCCATCCGATCAGT
ACAAACCCCACCACGTTTAGGTCTCTCCTCAACCAGTTCCTCTCAAAGCAAGTGAATCTT
CCTCCTGATGCTCCGTTGACTCTCAGAGGGTTCTTTGCTCTTAATGTTGGTTTT

QA 1 414 1 414
DS 

RD RS1EL24JQ 530 0 0
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GAGAAAGATGTATTACAAATGGGACTAGGGAAATGGTTTATCTCTCGAAGTAATCCTCGG
TCCTACCCTTGAATCCGATTTGTCCGAAGGTGAGACAGATGAAGAGACCTAAGTGCCACG
TAACCAACCACAACCAGAACTGTGAAGTGAGTGCTGGAGGAGTTGGGAAGTGAGCGAGCT
CATTTCCTATGCTCTCGAAGAAAAGACCCGTCAAGCTCTTCCCATTTATCGCCGGAATAC
TCGACGGAGCTAGCCATCCGATCAGTCCAAACCCCACCACGTTTAGGTCTCTCCTCAACC
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TTGCTCTTAATGTTGGTTTTAGAAAGGATGAAAAGAAGGCTTTGGTGTTGATGCGTGAAA
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QA 1 530 1 530
DS 

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CCTTGAATCCGATTTGTCCGAAGGTGAGACAGATGAAGAGACCTAAGTGCCACGTAACCA
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CTATGCTCTCAAAGAAAAAACCCGTCAAGCTCTTCCCATTTATCGCCGGAATACTCGACG
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DS 

RD RS1G532TF 525 0 0
GGAATAAAGCTTAGTTTTGAGTAATAATTAATATTACACAAGAGAGGGGACAACGAGAAA
GATGTATTACAAATGGGACTAGAGAAATGGTTTATCTCTCGAAGTAATCCTCGGTCCTAC
CCTTGAATCCGATTTGTCCGAAGGTGAGACAGATGAAGAGACCTAAGTGCCACGTAACCA
ACCACAACCAGAACTGTGAAGTGAGTGCTGGAGGAGTTGGGAAGTGAGCGAGCTCATTTC
CTATGCTCTCAAAGAAGAGACCCGTCAAGCTCTTCCCATTTATCGCCGGAATACTCGACG
GAGCTAGCCATCCGATCAGTCCAAACCCCACCACGTTTAGGTCTCTCCTCAACCAGTTCC
TCTCAAAGCAAGTGAATCTTCCTCCTGATGCTCCGTTGACTCTCAGAGGGTTCTTTGCTC
TTAATGTTGGTTTTAGAAAGGATGAAGAGAAGGCTTTGGTGTTGATGCGTGAAACAGATG
ATCCTCCGAGACCTATCACCGTCGATGGGGTTGCAAATGCTGTTG

QA 1 525 1 525
DS 

RD RS1EL24TF 562 0 0
CGCAAA
GGAATAAAGCTTATTTTTGAGTAATAATTAATATTACACAAGAGAGGGGACAACGAGAAA
GATGTATTACAAATGGGACTAGAGAAATGGTTTATCTCTCGAAGTAATCCTCGGTCCTAC
CCTTGAATCCGATTTGTCCGAAGGTGAGACAGATGAAGAGACCTAAGTGCCACGTAACCA
ACCACAACCAGAACTGTGAAGTGAGTGCTGGAGGAGTTGGGAAGTGAGCGAGCTCATTTC
CTATGCTCTCGAAGAAGAGACCCGTCAAGCTCTTCCCATTTATCGCCGGAATACTCGACG
GAGCTAGCCATCCGATCAGTCCAAACCCCACCACGTTTAGGTCTCTCCTCAACCAGTTCC
TCTCAAAGCAAGTGAATCTTCCTCCTGATGCTCCGTTGACTCTCAGAGGGTTCTTTGCTC
TTAATGTTGGTTTTAGAAAGGATGAAGAGAAGGCTTTGGTGTTGATGCGTGAAATAGATG
ATCCTCCGAGACCTATCACCGTCGATGGGGTTGCAAATGCTGTTGCCATTCTTCTTCTTT
TGCTTCTTTCTCCC
CC

QA 7 560 7 560
DS 

RD RS1A396JQ 638 0 0
GG
ATAAAGCTTATTTTTGAGTAATAATTAATATTACACAAGAGAGGGGACAACGAGAAAGAT
GTATTACAAATGGGACTAGAGAAATGGTTTATCTCTCGAAGTAATCCTCGGTCCTACCCT
TGAATCCGATTTGTCCGAAGGTGAGACAGATGAAGAGACCTAAGTGCCACGTAACCAACC
ACAACCAGAACTGTGAAGTGAGTGCTGGAGGAGTTGGGAAGTGAGCGAGCTCATTTCCTA
TGCTCTCGAAGAAGAGACCCGTCAAGCTCTTCCCATTTATCGCCGGAATACTCGACGGAG
CTAGCCATCCGATCAGTACAAACCCCACCACGTTTAGGTCTCTCCTCAACCAGTTCCTCT
CAAAGCAAGTGAATCTTCCTCCTGATGCTCCGTTGACTCTCAGAGGGTTCTTTGCTCTTA
ATGTTGGTTTTAGAAAGGATGAAGAGAAGGCTTTGGTGTTGATGCGTGAAATAGATGATC
CTCCGAGACCTATCACCGTCGATGGGGTTGCAAATGCTGTTGCCATTCTTCTTCTTTTGC
TTCTTTCTCCCAAACCCCCGTTTTTGTAACCACCGTTTCCTCCACTCGAGCCACCGCCGT
TTCTTTAACCGGACCAGCTACTTCTTGTGGTTCTTG

QA 3 638 3 638
DS 

RD RS1A396TV 753 0 0
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TGAGCGAGCTCATTTCCTATGCTCTCGAAGAAGAGACCCGTCAAGCTCTTCCCATTTATC
GCCGGAATACTCGACGGAGCTAGCCATCCGATCAGTACAAACCCCACCACGTTTAGGTCT
CTCCTCAACCAGTTCCTCTCAAAGCAAGTGAATCTTCCTCCTGATGCTCCGTTGACTCTC
AGAGGGTTCTTTGCTCTTAATGTTGGTTTTAGAAAGGATGAAGAGAAGGCTTTGGTGTTG
ATGCGTGAAATAGATGATCCTCCGAGACCTATCACCGTCGATGGGGTTGCAAATGCTGTT
GCCATTCTTCTTCTTTTGCTTCTTTCTCCCAAACCCCCGTTTTTGTAACCACCGTTTCCT
CCACTCGAGCCACCGCCGTTTCTTTAACCGGACCAGCTACTTCTTGTGGTTCTTGTTCAG
ATTTCGAGGCGGTTTGTCCCTCTAACAAGCCACATCCATGACGGCCGTCGTCTCCAATGG
TGGTGACTCTCATCCTCCAGAAGCTGACGGCTGCCGTCACGACAGCGATCCATGTCCAGA
CATTGTTGACGATGGCAAGAACACCGAAGCTAACGTATTCGAAAGCCAACGCTTCTAATG
GAGAATCCAAAGTGGCCATGTTTTTCTTGTTGTCTCGATGATCCCCCGGCCGTAATGGCC
GAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

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DS 

RD RS1A396TF 738 0 0
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CCTATGCTCTCGAAGAAGAGACCCGTCAAGCTCTTCCCATTTATCGCCGGAATACTCGAC
GGAGCTAGCCATCCGATCAGTACAAACCCCACCACGTTTAGGTCTCTCCTCAACCAGTTC
CTCTCAAAGCAAGTGAATCTTCCTCCTGATGCTCCGTTGACTCTCAGAGGGTTCTTTGCT
CTTAATGTTGGTTTTAGAAAGGATGAAGAGAAGGCTTTGGTGTTGATGCGTGAAATAGAT
GATCCTCCGAGACCTATCACCGTCGATGGGGTTGCAAATGCTGTTGCCATTCTTCTTCTT
TTGCTTCTTTCTCCCAAACCCCCGTTTTTGTAACCACCGTTTCCTCCACTCGAGCCACCG
CCGTTTCTTTAACCGGACCAGCTACTTCTTGTGGTTCTTGTTCAGATTTCGAGGCGGTTT
GTCCCTCTAACAAGCCACATCCATGACGGCCGTCGTCTCCAATGGTGGTGACTCTCATCC
TCCAGAAGCTGACGGCTGCCGTCACGACAGCGATCCATGTCCAGACATTGTTGACGATGG
CAAGAACACCGAAGCTAACGTATTCGAAAGCCAACGCTTCTAATGGAGAATCCAAAGTGG
CCATGTTTTTCTTGTTGTCTCGATGATCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATA
TGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 738 1 738
DS 



AS 2 6

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CAGTCGGCTAAGGCCCACAAGAACGGGATCAATAAGCCAAGGAGGCACCGTCACACTCCC
ACCAGAGGGATAGATCCTAAGTTCTTGAGGAACCAGAGGTACGCGAGGAAGCACAACGTC
AAGAACGGCGAGAATGCCACCGCCGAAGACTAAGCTTTTTGTTTCTCTCTGAGAGGTTTT
TAATGAAATTAAGTTTGTTTTTAGACGAGAGAACCAATTTACATTTGGCGTTATGTTTGG
TTTGATTATGTTTAAGCATTCGGTTTGTGTACTCCTTAATTTTAATATCATGGATTTCAT
TTCTTAT


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AJ16JQ C 1
AF RS1AJ16TF U 1
BS 1 2 RS1AJ16JQ
BS 3 367 RS1AJ16TF

RD RS1AJ16JQ 367 0 0
GGACCGTGTCGCTTCCTTTACTCAGAGATGGCCAAGTCGAAGAATCACACGGCGCATAAC
CAGTCGGCTAAGGCCCACAAGAACGGGATCAATAAGCCAAGGAGGCACCGTCACACTCCC
ACCAGAGGGATAGATCCTAAGTTCTTGAGGAACCAGAGGTACGCGAGGAAGCACAACGTC
AAGAACGGCGAGAATGCCACCGCCGAAGACTAAGCTTTTTGTTTCTCTCTGAGAGGTTTT
TAATGAAATTAAGTTTGTTTTTAGACGAGAGAACCAATTTACATTTGGCGTTATGTTTGG
TTTGATTATGTTTAAGCATTCGGTTTGTGTACTCCTTAATTTTAATATCATGGATTTCAT
TTCTTAT

QA 1 367 1 367
DS 

RD RS1AJ16TF 367 0 0
GG
ACCGTGTCGCTTCCTTTACTCAGAGATGGCCAAGTCGAAGAATCACACGGCGCATAACCA
GTCGGCTAAGGCCCACAAGAACGGGATCAATAAGCCAAGGAGGCACCGTCACACTCCCAC
CAGAGGGATAGATCCTAAGTTCTTGAGGAACCAGAGGTACGCGAGGAAGCACAACGTCAA
GAACGGCGAGAATGCCACCGCCGAAGACTAAGCTTTTTGTTTCTCTCTGAGAGGTTTTTA
ATGAAATTAAGTTTGTTTTTAGACGAGAGAACCAATTTACATTTGGCGTTATGTTTGGTT
TGATTATGTTTAAGCATTCGGTTTGTGTACTCCTTAATTTTAATATCATGGATTTCATTT
CTTAT

QA 3 367 3 367
DS 



CO CL440Contig2 389 4 3 U
GGAGATCTACCGTGTCGCTTCCCTTTACTCAGAGATGGCCAAGTCGAAGAATCACACGGC
GCATAACCAGTCGGCTAAGGCCCACAAGAACGGAATCAAGAAGCCAAGGAGGCACCGTCA
CACTCCCACCAGAGGGATGGATCCTAAGTTCTTGAGGAACCAGAGGTACGCAAGGAAGCA
CAACGTCAAGAACGGCGAGAATGCCACCGCTGAAGACTAAGCTTTTTTAATTCTCTCTGA
GAGGTTTTTATGAAATTAAGTTTGTTTTAGACAAGAGAACCAATTTAATACATTTCGCGT
TATGTTTGGTTTGGTTATGTTTAAGCATGCGGTTTGTGTACTCTTTTATTATGGCCTTAA
TTTTAATATCATGGATTTTCATTTCTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F104TF U 1
AF RS1AJ01JQ C 239
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AF RS1GI03TF U 12
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CACTCCCACCAGAGGGATGGATCCTAAGTTCTTGAGGAACCAGAGGTACGCAAGGAAGCA
CAACGTCAAGAACGGCGAGAATGCCACCGCTGAAGACTAAGCTTTTTTAATTCTCTCTG*
GAGGTTTTTATGAAATTAAGTTTGTTTTAGACAAGAGAACCAATTTAATACATTTCGCGT
TATGTTTGGTTTGGTTATGTTTAAGCATGCGGTTTGTGTACTCTTTTATTATGGCCTTAA
TTTTAATATCATGGATTTTCATTTCTTAT

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DS 

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GG
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TATGTTTGGTTTGGTTATGTTTAAGCATGCGGTTTGTGTACTTTTTTATTATGGCCTTAA
TTTTAATATCATGGATTTT
CATT

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DS 

RD RS1AJ01TF 378 0 0
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AGTCGGCTAAGGCCCACAAGAACGGAATCAAGAAGCCAAGGAGGCACCGTCACACTCCCA
CCAGAGGGATGGATCCTAAGTTCTTGAGGAACCAGAGGTACGCAAGGAAGCACAACGTCA
*GAACGGCGAGAATGCCACCGCTGAAGACTAAGCTTTTTTAATTCTCTCTGAGAGGTTTT
TATGAAATTAAGTTTGTTTTAGACAAGAGAACCAATTTAATACATTTCGCGTTATGTTTG
GTTTGGTTATGTTTAAGCATGCGGTTTGTGTACTCTTTTATTATGGCCTTAATTTTAATA
TCATGGATTTT
CATT

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DS 

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GG
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GCTAAGGCCCACAAGAACAGAATCAAGAAGCCAAGGAGGCACCGTCACACTCCCACCAGA
GGGATGGATCCTAAGTTCTTGAGGAACCAGAGGTACGCAAGGAAGCACAACGTCAAGAAC
GGCGAGAATGCCACCGCTGAAGACTAAGCTTTTTTAATTCTCTCTGAGAGGTTTTTATGA
AATTAAGTTTGTTTTAGACAAGAGAACCAATTTAATACATTTCGCGTTATGTTTGGTTTG
GTTATGTTTAAGCATGCGGTTTGTGTACTCTTTTATCGTGGCCTTAATTTTAATATC

QA 3 359 3 359
DS 



AS 1 9

CO CL441Contig1 1305 9 10 U
GGGAGTCGCAACCCTAAACGAAGCGGAGAGAGCAATGGTGTGGTAGAATAATAGATAGAG
AGATCTAAATCCGAAGAGACCAAGACGCGCTAAAATCAATGGATTTAGATCAATGGATAT
CCAAGGTCAAAGACGCCCAACATCTCTCCGAAGACGAGCTTCACCTTCTCTGCGAATACG
TGAAAGAGATTCTGATTGAGGAGTCTAATGTGCAACCTGTCAACAGTCCTGTCACCGTCT
GTGGTGATATCCATGGCCAGTTTCATGACCTCATGAAGCTTTTCCAGACCGGAGGCCATG
TTCCAGACACTAATTACATTTTTATGGGAGATTTCGTTGACAGAGGTTACAACAGTCTTG
AAGTTTTCACTATTCTTTTGCTTCTCAAAGCAAGATATCCAGCCCATATCACACTTTTGC
GTGGAAATCATGAAAGCAGACAGCTTACTCAGGTGTACGGTTTCTATGACGAATGCCAAA
GGAAGTATGGTAATGCTAATGCTTGGAGATACTGCACGGATGTGTTTGACTATCTCACTC
TCTCAGCTATTATCGATGGCACCGTTCTATGTGTTCATGGTGGCCTTTCACCTGATGTGC
GGACAATCGACCAGATAAGATTGATTGATCGAAATTGCGAAATCCCGCATGAAGGACCAT
TCTGTGATCTTATGTGGAGTGATCCTGAAGACATTGAAACATGGGCTGTAAGTCCACGTG
GGG*CTGGTTGGCTTTTCGGGTCCAGGGTTACCACTGAGTTTAACCATATAAACAATCTT
GAACTAGTGTGTCGCGCACATCAGCTTGTACAAGAAGGTCTCAAGTACATGTTCCAAGAC
AAAGGCCTTGTAACCGTGTGGTCTGCTCCTAACTACTGCTACCGCTGTGGGAATGTGGCT
TCTATGTTGAGCTTCAATGACAACATGGAAAGGGATGTGAAGTTCTTCACGGAGACAGAA
GAGAACAATCAAATGAGAGGGCCAAGAACAGGTGTTCCTTACTTCCTGTAATGGATAGTG
ATGGTCCTACGTTATTAGTCTCATATTGTTCTGACGAAGTTAGCGCCATTACCGTTGGCT
TATGTTCTTGCAAGGTATATCTTCTGATGTTGTGCTTACACTTCCATTGTTTTTACGCCT
TCTTTTGGAAACAGACACATTTTCTTGTGGGATTGATCGTCACTTTAGCAATTCTAGTGG
TTTTTATGCAGTTTTTTTTAAACTTTGATCTCTGACTCTAGACGTTGTTATACATGTGTT
CTGTATGTAAGACCATTCTTTTCATCTCTTCTTTGTTTTGTTCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 15 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 35 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BS13TF U 1
AF RS1CR79TF U 85
AF RS1FD06TF U 32
AF RS1BW38TF U 18
AF RS1FD06JQ C 665
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RD RS1BS13TF 742 0 0
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GTGGTGATATCCATGGCCAGTTTCATGACCTCATGAAGCTTTTCCAGACCGGAGGCCATG
TTCCAGACACTAATTACATTTTTATGGGAGATTTCGTTGACAGAGGTTACAACAGTCTTG
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GTGGAAATCATGAAAGCAGACAGCTTACTCAGGTGTACGGTTTCTATGACGAATGCCAAA
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TCTCAGCTATTATCGATGGCACCGTTCTATGTGTTCGTGGTGGCCTTTCACCTGATGTGC
GGACAATCGACCAGATAAGATTGATTGATCGAAATTGCGAAATCCCGCATGAAGGACCAT
TCTGTGATCTTATTTGGAGTGATCCTGAAGACATTGAAACATGGGCTGTAAGTCCACGTG
GGG*CTGGTTGGCTTTTCGG
TC

QA 1 740 1 740
DS 

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GG
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GACCTCATGAAGCTTTTCCAGACCGGAGGCCATGTTCCAGACACTAATTACATTTTTATG
GGAGATTTCGTTGACAGAGGTTACAACAGTCTTGAAGTTTTCACTATTCTTTTGCTTCTC
AAAGCAAGATATCCAGCCCATATCACACTTTTGCGTGGAAATCATGAAAGCAGACAGCTT
ACTCAGGTGTACGGTTTCTATGACGAATGCCAAAGGAAGTATGGTAATGCTAATGCTTGG
AGATACTGCACGGATGTGTTTGACTATCTCACTCTCTCAGCTATCATCGATGGCACCGTT
CTATGTGTTCATGGTGGTCTTTCACCTGATGTGCGGACAATCGACCAGATAAGATTGATT
GATCGAAATTGCGAAATCCCGCATGAAGGACCATTCTGTGATCTTATGTGGAGTGATCCT
GAAGACATTGAAACATGGGCTGTAAGTCCACGTGGGGGCTGGTTGGCTTTTCGGGTCCAG
GGTTACCACTGAGTTTAACCATATAAACAATCTTGAACTAGTGTGTCGCGCACATCAGCT
TGTACAA

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DS 

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GG
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AATCAATGGGTTTAGATCAATGGATATCCAAGGTCAAAGACGCCCAACATCTCTCCGAAG
ACGAGCTTCACCTTCTCTGCGAATACGTGAAAGAGATTCTGATTGAGGAGTCTAATGTGC
AACCTGTCAACAGTCCTGTCACCGTCTGTGGTGATATCCATGGCCAGTTTCATGACCTCA
TGAAGCTTTTCCAGACCGGAGGCCATGTTCCAGACACTAATTACATTTTTATGGGAGATT
TCGTTGACAGAGGTTACAACAGTCTTGAAGTTTTCACTATTCTTTTGCTTCTCAAAGCAA
GATATCCAGCCCGTATCACACTTTTGCGTGGAAATCATGAAAGCAGACAGCTTACTCAGG
TGTACGGTTTCTATGACGAATGCCAAAGGAAGTATGGTAATGCTAATGCTTGGAGATACT
GCACGGATGTGTTTGACTATCTCACTCTCTCAGCTATTATCGATGGCACCGTTCTATGTG
TTCATGGTGGCCTTTCACCTGATGTGCGGACAATCGACCAGATAAGATTGATTGATCGAA
ATTGCGAAATCCCGCATGAAGGACCATTCTGCGATCTTATGTGGAGTGATCCTGAAGACA
TTGAAACATGGGCTGTAAGTCCACGTGGGG*CTGGTTGGCTTTTCGGGTCCAGGGTTACC
ACTGAGTTTAACCATATAAACA*TCTTGAACTAGTGTGTCGCGCGCATCAGCTTGTACA*
GAAG*TCTCAAGTACATGTTC
AAG

QA 3 803 3 803
DS 

RD RS1BW38TF 909 0 0
GG
GAAGCGGAGAGAGCAATGGTGTGGTAGAATAATAGATAGAGAGATCTAAATCCGAAGAGA
CCAAGACGCGCTAAAATCAATGGATTTAGATCAATGGATATCCAAGGTCAAAGACGCCCA
ACATCTCTCCGAAGACGAGCTTCACCTTCTCTGCGAATACGTGAAAGAGATTCTGATTGA
GGAGTCTAATGTGCAACCTGTCAACAGTCCTGTCACCGTCTGTGGTGATATCCATGGCCA
GTTTCATGACCTCATGAAGCTTTTCCAGACCGGAGGCCATGTTCCAGACATTAATTACAT
TTTTATGGGAGATTTCGTTGACAGAGGTTACAACAGTCTTGAAGTTTTCACTATTCTTTT
GCTTCTCAAAGCAAGATATCCAGCCCATATCACACTTTTGCGTGGAAATCGTGAAAGCAG
ACAGCTTACTCAGGTGTACGGTTTCTATGACGAATGCCAAAGGAAGTATGGTAATGCTAA
TGCTTGGAGATACTGCACGGATGTGTTTGACTATCTCACTCTCTCAGCTATTATCGATGG
CACCGTTCTATGTGTTCATGGTGGCCTTTCACCTGATGTGCGGACAATCGACCAGATAAG
ATTGATTGATCGAAATTGCGAAATCCCGCATGAAGGACCATTCTGTGATCTTATGTGGAG
TGATCCTGAAGACATTGAAACATGGGCTGTAAGTCCACGTGGGG*CTGGTTGGCTTTTCG
GGTCCAGGGTTACCACTGAGTTTAACCATATAAACAATCTTGAACTAGTGTGTCGCGCAC
ATCAGCTTGTACAAGAAGGTCTCAAGTACATGTTCCAAGACAAAGGTCTTGTAACCGTGT
GGTCTGCTCCTAACTACTGCTACCGCTGTGGGAATGTGGCTTCTATGTTGAGCTTCA
TGACACATGG

QA 3 899 3 899
DS 

RD RS1FD06JQ 580 0 0
C
GATCTTATGTGGAGTGATCCTGAAGACATTGAAACATGGGCTGTAAGTCCACGTGGGG*C
TGGTTGGCTTTTCGGGTCCAGGGTTACCACTGAGTTTAACCATATAAACAATCTTGAACT
AGTGTGTCGCGCGCATCAGCTTGTACAAGAAGGTCTCAAGTACATGTTCCAAGACAAAGG
CCTTGTAACCGTGTGGTCTGCTCCTAACTACTGCTACCGCTGTGGGAATGTGGCTTCTAT
GTTGAGCTTCAATGACAACATGGAAAGGGATGTGAAGTTCTTCACGGAGACAGAAGAGAA
CAATCAAATGAGAGGGCCAAGAACAGGTGTTCCTTACTTCCTGTAATGGATAGTGATGGT
CCTATGTTATTAGTCTCATATTGTTCTGACGAAGTTAGCGCCATTACCGTTGGCTTATGT
TCTTGCAAGGTATATCTTCTGATGTTGTGCTTACACTTCCATTGTTTTTACGCCTTCTTT
TGGAAACAGACACATTTTCTTGTGGGATTGATCGTCACTTTAGCAATTCTAGTGGTTTTT
ATGCAGTTTTTTTTAAACTTTGATCTCTGACTCTAGACG

QA 2 580 2 580
DS 

RD RS1CR79JQ 875 0 0
TCACAC
TTTGCGTGGAA*TCATGAAAGCAGACAGCTTACTCAGGTGTACGGTTTCTATGACGA*TG
CCAAAGGAAGTATGGTAATGCTAATGCTTGGAGATACTGCACGGATGTGTTTGACTATCT
CACTCTCTCAGCTATCATCGATGGCACCGTTCTATGTGTTCATGGTGGTCTTTCACCTGA
TGTGCGGACAATCGACCAGATAAGATTGATTGATCGAAATTGCGAAATCCCGCATGAAGG
ACCATTCTGTGATCTTATGTGGAGTGATCCTGAAGACATTGAAACATGGGCTGTAAGTCC
ACGTGGGG*CTGGTTGGCTTTTCGGGTCCAGGGTTACCACTGAGTTTAACCATATAAACA
ATCTTGAACTAGTGTGTCGCGCACATCAGCTTGTACAAGAAGGTCTCAAGTACATGTTCC
AAGACAAAGGCCTTGTAACCGTGTGGTCTGCTCCTAACTACTGCTACCGCTGTGGGAATG
TGGCTTCTATGTTGAGCTTCAATGACAACATGGAAAGGGATGTGAAGTTCTTCACGGAGA
CAGAAGAGAACAATCAAATGAGAGGGCCAAGAACAGGTGTTCCTTACTTCCTGTAATGGA
TAGTGATGGTCCTACGTTATTAGTCTCATATTGTTCTGACGAAGTTAGCGCCATTACCGT
TGGCTTATGTTCTTGCAAGGTATATCTTCTGATGTTGTGCTTACACTTCCATTGTTTTTA
CGCCTTCTTTTGGAAACAGACACATTTTCTTGTGGGATTGATCGTCACTTTAGCAATTCT
AGTGGTTTTTATGCAGTTTTTTTTAAACTTTGATCTCTGACTCTAGACGTTGTTATACAT
GTGTTCTGTATGTAAGACCATTCT
CTTCT

QA 7 870 7 870
DS 

RD RS1CF37TF 726 0 0
G
GGCACCGTTCTATGTGTTCATGGTGGCCTTTCACCTGATGTGCGGACAATCGACCAGATA
AGATTGATTGATCGAAATTGCGAAATCCCGCATGAAGGACCATTCTGTGATCTTATGTGG
AGTGATCCTGAAGACATTGAAACATGGGCTGTAAGTCCACGTGGGG*CTGGTTGGCTTTT
CGGGTCCAGGGTTACCACTGAGTTTAACCATATAAACAATCTTGAACTAGTGTGTCGCGC
ACATCAGCTTGTACAAGAAGGTCTCAAGTACATGTTCCAAGACAAAGGCCTTGTAACCGT
GTGGTCTGCTCCTAACTACTGCTACCGCTGTGGGAATGTGGCTTCTATGTTGAGCTTCAA
TGACAACATGGAAAGGGATGTGAAGTTCTTCACGGAGACAGAAGAGAACAATCAAATGAG
AGGGCCAAGAACAGGTGTTCCTTACTTCCTGTAATGGATAGTGATGGTCCTACGTTATTA
GTCTCATATTGTTCTGACGAAGTTAGCGCCATTACCGTTGGCTTATGTTCTTGCAAGGTA
TATCTTCTGATGTTGTGCTTACACTTCCATTGTTTTTACGCCTTCTTTTGGAAACAGACA
CATTTTCTTGTGGGATTGATCGTCACTTTAGCAATTCTAGTGGTTTTTATGCAGTTTTTT
TTAAACTTTGATCTCTGACTCTAGACGTTGTTATACATGTGTTCTGTATGTAAGACCATT
CT
TTT

QA 2 723 2 723
DS 

RD RS1BS13JQ 795 0 0
GGTAATGCTAATGCTTGGAGATACTGCACGGATGTGTTTGACTATCTCACTCTCTCAGCT
ATTATCGATGGCACCGTTCTATGTGTTCGTGGTGGCCTTTCACCTGATGTGCGGACAATC
GACCAGATAAGATTGATTGATCGAAATTGCGAAATCCCGCATGAAGGACCATTCTGTGAT
CTTATTTGGAGTGATCCTGAAGACATTGAAACATGGGCTGTAAGTCCACGTGGGG*CTGG
TTGGCTTTTCGGGTCCAGGGTTACCACTGAGTTTAACCATATAAACAATCTTGAACTAGT
GTGTCGCGCACATCAGCTTGTACAAGAAGGTCTCAAGTACATGTTCCAAGACAAAGGCCT
TGTAACCGTGTGGTCTGCTCCTAACTACTGCTACCGCTGTGGGAATGTGGCTTCTATGTT
GAGCTTCAATGACAACATGGAAAGGGATGTGAAGTTCTTCACGGAGACAGAAGAGAACAA
TCAAATGAGAGGGCCAAGAACAGGTGTTCCTTACTTCCTGTAATGGATAGTGATGGTCCT
ACGTTATTAGTCTCATATTGTTCTGACGAAGTTAGCGCCATTACCGTTGGCTTATGTTCT
TGCAAGGTATATCTTCTGATGTTGTGCTTACACTTCCATTGTTTTTACGCCTTCTTTTGG
AAACAGACACATTTTCTTGTGGGATTGATCGTCACTTTAGCAATTCTAGTGGTTTTTATG
CAGTTTTTTTTAAACTTTGATCTCTGACTCTAGACGTTGTTATACATGTGTTCTGTATGT
AAGACCATTCT
TTTC

QA 1 791 1 791
DS 

RD RS1BW38JQ 797 0 0
ATACTGCACGGATGTGTTTGACTATCTCACTCTCTCAGCTATTATCGATGGCACCGTTCT
ATGTGTTCATGGTGGCCTTTCACCTGATGTGCGGACAATCGACCAGATAAGATTGATTGA
TCGAAATTGCGAAATCCCGCATGAAGGACCATTCTGTGATCTTATGTGGAGTGATCCTGA
AGACATTGAAACATGGGCTGTAAGTCCACGTGGGG*CTGGTTGGCTTTTCGGGTCCAGGG
TTACCACTGAGTTTAACCATATAAACAATCTTGAACTAGTGTGTCGCGCACATCAGCTTG
TACAAGAAGGTCTCAAGTACATGTTCCAAGACAAAGGTCTTGTAACCGTGTGGTCTGCTC
CTAACTACTGCTACCGCTGTGGGAATGTGGCTTCTATGTTGAGCTTCAATGACAACATGG
AAAGGGATGTGAAGTTCTTCACGGAGACAGAAGAGAACAATCAAATGAGAGGGCCAAGAA
CAGGTGTTCCTTACTTCCTGTAATGGATAGTGATGGTCCTACGTTATTAGTCTCATATTG
TTCTGACGAATTTAGCGCCATTACCGTTGGCTTATGTTCTTGCAAGGTATATCTTCTGAT
GTTGTGCTTACACTTCCATTGTTTTTACGCCTTCTTTTGGAAACAGACACATTTTCTTGT
GGGATTGATCGTCACTTTAGCAATTCTAGTGGTTTTTATGCAGTTTTTTTTAAACTTTGA
TCTCTGACTCTAGACGTTGTTATACATGTGTTCTGTATGTAAGACCATTCTTTTCATCTC
TTCTTTGTTTTGTTCGG

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 9

CO CL442Contig1 830 9 6 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGATAAAAGAA
GAGGACAAGAACAAAAAAGAAAGATAGCACAAACAGAGAAACTTATCAAAGCTAAAATCA
CTTGATAC**TGAAGCTAATTAGAGTCTCCTGCTTGCTTTGTGTATTGGCCTTTTTATTG
TTTATAACTCCAACATCTTCTCTGCAACTCCACACTAGCTACTCATCTCCGAGCCAAGCA
GGTATAAGCGAAAAGATTGTTATTAAGATGGCGCCACGGAAGCTCATGATCATCTCTAGT
GAACATGAAAATGTGATGAAGTCAGGAACTCATGAAGGTTCAAGCCAACAACCTCGAGTT
ACTTCTTCTTCTGGAAAATCTATGGACGAAAAGAAGAGGTTAGGTGACGAAGAAGAGGAG
AAAGCTCTATCGAAATATCTATCGATGGATTATCCAAGGTTTAGAAGAAGACGGCCAGTT
CACAACAAGTCTCTACGTCCATGATATTTTTTTTTTTATTTCAATACAACTATTAATTTA
AGCTATAGATTTATCAATTAACTGGCTAAGTGGTTGGTATAAGAAGTTTTGGCGATATTA
TTGTAATTAAGGGACTATGTTCATGTTAATTCTTTTTATTTGATGATAGTGGCCGACAAG
ATTTAAGCAAAACCCTAAGTCTCTGGTTTGGGGTTTGAGCTTATCTGATCTTCGTTTCAT
GCACTAACATGTTGGCTGGTTTGGTTGTATTTTTTAATTTTATATTGCGAGAGGAAATCG
ATGTTTGAGTTCCATTATTAACCGAGATAATTACATGTATGATTTGATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 10 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 10 45 45 10 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A850TF U 43
AF RS1BB86TF U 44
AF RS1BB86JQ C 226
AF RS1A087JQ C 230
AF RS1A087TV U 1
AF RS1A850JQ C 43
AF RS1A087TF U 518
AF RS1A087TR C 226
AF RS1CJ47TF U 522
BS 1 67 RS1A087TV
BS 68 68 RS1BB86TF
BS 69 128 RS1A087TV
BS 129 130 RS1A850TF
BS 131 812 RS1A087TV
BS 813 830 RS1CJ47TF

RD RS1A850TF 418 0 0
GGGGTTGGT
ATAAAAGAAGAGGACAAGAACAAAAAAGAAAGATAGCACAAACAGAGAAACTTATCAAAG
CTAAAATCACTTGATAC**TGAAGCTAATTAGAGTCTCCTGCTTGCTTTGTGTATTGGCC
TTTTTATTGTTTATAACTCCAACATCTTCTCTGCAACTCCACACTAGCTACTCATCTCCG
AGCCAAGCAGGTATAAGCGAAAAGATTGTTATTAAGATGGCGCCACGGAAGCTCATGATC
ATCTCTAGTGAACATGAAAATGTGATGAAGTCAGGAACTCATGAAGGTTCAAGCCAACAA
CCTCGAGTTACTTCTTCTTCTGGAAAATCTATGGACGAAAAGAAGAGGTTAGGTGACGAA
GAAGAGGAGAAAGCTCTATCGAAATATCTATCGATGGATTATCCAAGGT

QA 10 418 10 418
DS 

RD RS1BB86TF 625 0 0
GGGTTGGT
ATAAAAGAAGAGGACAAGAACAAAAAAGAAAGATAGCACAAACAGAGAAACTTATCAAAG
CTAAAATCACTTGATACAATGAAGCTAATTAGAGTCTCCTGCTTGCTTTGTGTATTGGCC
TTTTTATTGTTTATAACTCCAACATCTTCTCTGCAACTCCACACTAGCTACTCATCTCCG
AGCCAAGCAGGTATAAGCGAAAAGATTGTTATTAAGATGGCGCCACGGAAGCTCATGATC
ATCTCTAGTGAACATGAAAATGTGATGAAGTCAGGAACTCATGAAGGTTCAAGCCAACAA
CCTCGAGTTACTTCTTCTTCTGGAAAATCTATGGACGAAAAGAAGAGGTTAGGTGACGAA
GAAGAGGAGAAAGCTCTATCGAAATATCTATCGATGGATTATCCAAGGTTTAGAAGAAGA
CGGCCAGTTCACAACAAGTCTCTACGTCCATGATATTTTTTTTTTTATTTCAATACAACT
ATTAATTTAAGCTATAGATTTATCAATTAACTGGCTAAGTAGTTGGTATAAGAAGTTTTG
GCGATATTATTGTAATTAAGGGACTATGTTCATGTTAATTCTTTTTATTTGATGATAGTG
GCCGACAAGATTTAAGC

QA 9 625 9 625
DS 

RD RS1BB86JQ 443 0 0
TT
TCCGAGCCAAGCAGGTATAAGCGAAAAGATTGTTATTAAGATGGCGCCACGGAAGCTCAT
GATCATTTTTAGTGAACATGAAAATGTGATGAAGTCAGGAACTCATGAAGGTTCAAGCCA
ACAACCTCGAGTTACTTTTTTTTCTGGAAAATCTATGGACGAAAAGAAGAGGTTAGGTGA
CGAAGAAGAGGAGAAAGCTCTATCGAAATATCTATCGATGGATTATCCAAGGTTTAGAAG
AAGACGGCCAGTTCACAACAAGTCTTTACGTCCATGATATTTTTTTTTTTATTTCAATAC
AACTATTAATTTAAGCTATAGATTTATCAATTAACTGGCTAAGTAGTTGGTATAAGAAGT
TTTGGCGATATTATTGTAATTAAGGGACTATGTTCATGTTAATTCTTTTTATTTGATGAT
AGTGGCCGACAAGATTTAAGC

QA 3 443 3 443
DS 

RD RS1A087JQ 455 0 0
CGAGCCAAGCAGGTATAAGCGAAAAGATTGTTATTAAGATGGCGCCACGGAAGCTCATGA
TCATTTTTAGTGAACATGAAAATGTGATGAAGTCAGGAACTCATGAAGGTTCAAGCCAAC
AACCTCGAGTTACTTTTTTTTTTGGAAAATCTATGGACGAAAAGAAGAGGTTAGGTGACG
AAGAAGAGGAGAAAGCTCTATCGAAATATCTATCGATGGATTATCCAAGGTTTAGAAGAA
GACGGCCAGTTCACAACAAGTCTTTACGTCCATGATATTTTTTTTTTTATTTCAATACAA
CTATTAATTTAAGCTATAGATTTATCAATTAACTGGCTAAGTGGTTGGTATAAGAAGTTT
TGGGGATATTATTGTAATTAAGGGACTATGTTCATGTTAATTCTTTTTATTTGATGATAG
TGGCCGACAAGATTTAAGCAAAACCCTAAGTCTCT

QA 1 455 1 455
DS 

RD RS1A087TV 818 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGATAAAAGAA
GAGGACA*GAACAAAAAAGAAAGATAGCACAAACAGAGAAACTTATCAAAGCTAAAATCA
CTTGATACAATGAAGCTAATTAGAGTCTCCTGCTTGCTTTGTGTATTGGCCTTTTTATTG
TTTATAACTCCAACATCTTCTCTGCAACTCCACACTAGCTACTCATCTCCGAGCCAAGCA
GGTATAAGCGAAAAGATTGTTATTAAGATGGCGCCACGGAAGCTCATGATCATCTCTAGT
GAACATGAAAATGTGATGAAGTCAGGAACTCATGAAGGTTCAAGCCAACAACCTCGAGTT
ACTTCTTCTTCTGGAAAATCTATGGACGAAAAGAAGAGGTTAGGTGACGAAGAAGAGGAG
AAAGCTCTATCGAAATATCTATCGATGGATTATCCAAGGTTTAGAAGAAGACGGCCAGTT
CACAACAAGTCTCTACGTCCATGATATTTTTTTTTTTATTTCAATACAACTATTAATTTA
AGCTATAGATTTATCAATTAACTGGCTAAGTGGTTGGTATAAGAAGTTTTGGCGATATTA
TTGTAATTAAGGGACTATGTTCATGTTAATTCTTTTTATTTGATGATAGTGGCCGACAAG
ATTTAAGCAAAACCCTAAGTCTCTGGTTTGGGGTTTGAGCTTATCTGATCTTCGTTTCAT
GCACTAACATGTTGGCTGGTTTGGTTGTATTTTTTAATTTTATATTGCGAGAGGAAATCG
ATGTTTGAGTTCCATTATTAACCGAGATAATT
ACATGT

QA 1 812 1 812
DS 

RD RS1A850JQ 770 0 0
GGGGTTGGT
ATAAAAGAAGAGGACAAGAACAAAAAAGAAAGATAGCACAAACAGAGAAACTTATCAAAG
CTAAAATCACTTGATAC**TGAAGCTAATTAGAGTCTCCTGCTTGCTTTGTGTATTGGCC
TTTTTATTGTTTATAACTCCAACATCTTTTCTGCAACTCCACACTAGCTACTCATCTCCG
AGCCAAGCAGGTATAAGCGAAAAGATTGTTATTAAGATGGCGCCACGGAAGCTCATGATC
ATCTCTAGTGAACATGAAAATGTGATGAAGTCAGGAACTCATGAAGGTTCAAGCCAACAA
CCTCGAGTTACTTCTTCTTCTGGAAAATCTATGGACGAAAAGAAGAGGTTAGGTGACGAA
GAAGAGGAGAAAGCTCTATCGAAATATCTATCGATGGATTATCCAAGGTTTAGAAGAAGA
CGGCCAGTTCACAACAAGTCTCTACGTCCATGATATTTTTTTTTTTATTTCAATACAACT
ATTAATTTAAGCTATAGATTTATCAATTAACTGGCTAAGTGGTTGGTATAAGAAGTTTTG
GCGATATTATTGTAATTAAGGGACTATGTTCATGTTAATTCTTTTTATTTGATGATAGTG
GCCGACAAGATTTAAGCAAAACCCTAAGTCTCTGGTTTGGGGTTTGAGCTTATCTGATCT
TCGTTTCATGCACTAACATGTTGGCTGGTTTGGTTGTATTTTTTAATTTTATATTGCGAG
AGGAAATCGATGTTTGAGTTCCATTATTAACCTAGATAATT

QA 10 770 10 770
DS 

RD RS1A087TF 274 0 0
ATTTCAATACAACTATTAATTTAAGCTATAGATTTATCAATTAACTGGCTAAGTGGTTGG
TATAAGAAGTTTTGGCGATATTATTGTAATTAAGGGACTATGTTCATGTTAATTCTTTTT
ATTTGATGATAGTGGCCGACAAGATTTAAGCAAAACCCTAAGTCTCTGGTTTGGGGTTTG
AGCTTATCTGATCTTCGTTTCATGCACTAACATGTTGGCTGGTTTGGTTGTATTTTTTAA
TTTTATATTGCGAGAGGAAATCGATGTTTGAGTT

QA 1 274 1 274
DS 

RD RS1A087TR 593 0 0
TT
TCCGAGCCAAGCAGGTATAAGCGAAAAGATTGTTATTAAGATGGCGCCACGGAAGCTCAT
GATCATTTTTAGTGAACATGAAAATGTGATGAAGTCAGGAACTCATGAAGGTTCAAGCCA
ACAACCTCGAGTTACTTTTTTTTTTGGAAAATTTATGGACGAAAAGAAGAGGTTAGGTGA
CGAAGAAGAGGAGAAAGCTCTATCGAAATATCTATCGATGGATTATCCAAGGTTTAGAAG
AAGACGGCCAGTTCACAACAAGTCTTTACGTCCATGATATTTTTTTTTTTATTTCAATAC
AACTATTAATTTAAGCTATAGATTTATCAATTAACTGGCTAAGTGGTTGGTATAAGAAGT
TTTGGCGATATTATTGTAATTAAGGGACTATGTTCATGTTAATTCTTTTTATTTGATGAT
AGTGGCCGACAAGATTTAAGCAAAACCCTAAGTTTTTGGTTTGGGGTTTGAGCTTATTTG
ATTTTCGTTTCATGCACTAACATGTTGGCTGGTTTGGTTGTATTTTTTAATTTTATATTG
CGAGAGGAAATCGATGTTTGAGTTCCATTATTAACCGAGATAATT
ACATGT

QA 3 587 3 587
DS 

RD RS1CJ47TF 309 0 0
CAATACAACTATTAATTTAAGCTATAGATTTATCAATTAACTGGCTAAGTGGTTGGTATA
AGAAGTTTTGGCGATATTATTGTAATTAAGGGACTATGTTCATGTTAATTCTTTTTATTT
GATGATAGTGGCCGACAAGATTTAAGCAAAACCCTAAGTCTCTGGTTTGGGGTTTGAGCT
TATCTGATCTTCGTTTCATGCACTAACATGTTGGCTGGTTTGGTTGTATTTTTTAATTTT
ATATTGCGAGAGGAAATCGATGTTTGAGTTCCATTATTAACCGAGATAATTACATGTATG
ATTTGATCT

QA 1 309 1 309
DS 



AS 2 7

CO CL443Contig1 999 5 34 U
AAGTGAGAACACTGCTACTTTATTCATATAGATAGATAGATAGATATTCGGTTACAAGTA
GACATAGACAGTAAATTATTATTCTCCTTTGATACGGATAAAAAGGTTGACACAAGACAT
AAGCGGGTGTAATGCGGGCAGTTGTGCCCGTAAGAAAAACTCAAAACTTATGTTACAACA
TGTAATAAGGCTTCGTTTTGAGCTTT*ATCTAAAGACATACTATCAGTTTACTTTCCGTT
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AAAAAGCCATTGCTCCAACGTTCCAGCATATCTCCAAGATTCACAATATATGCTCCTTTA
ATCGCCGGCACATATTCCCACTTCTGAGGCTTGGCGTTCTTATCTTTGCATATCTGGAGG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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A
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CGCCAC

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C
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GGTTTATCATAATCAGGATCATCTTTTGGA
C

QA 2 751 2 751
DS 

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AGAATATCGTTCCTGACCGTTCCCAAGAACCCGATGTAGCGTGGATTTGAAAAAGCCATT
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AAGCATCTCCGGGGTATCAAAGTAATTCGCATCCAGATCAAGTGCTAACGCCAATAATCT
TCCAATATCCTTGGAAACCCTCAATGCTTCTTGGTGATATTTCTCCATGGTCTCTCGCCA
CTGAGGCAATACATCGGAATCAGGCCAAGGGTTAGGACCATAGAATGGTTTATCATAATC
AGGATCATCTTTTGGAACTTCAATTCCAATGTAATAACCCTCTTTATGATCTCCGTTAAC
TTGATTCTCAGGATCTAAGATTTCATCC

QA 1 688 1 688
DS 



CO CL443Contig2 772 2 5 U
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GN02TF U 5
AF RS1EL82TF U 1
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BS 244 618 RS1EL82TF
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GG
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GGGGCTGCAAGACCCAACCATGCAAGTTCCATCTCTTAATTGTATCGATCTCGCCGACCA
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TGTGATCAATCACGGTATAAACGAGGAGTTCATGGAGGATGTTTTCGAGCAGAGCAAGAA
GTTTTTCGCTCTTCCTCTGGAGGAGAAGATGAAAGTTCTGAGAAACGAAAAGCACAGAGG
CTATACACCTGTTCTTGATGAAATCTTAGATCCTGAGAATCAAGTTAACGGAGATCATAA
AGAGGGCTATTACATTGGAATTGAAGTTCCAAAAGATGATCCTGATTATGATAAACCATT
CTATGGTCCTAACCCTTGGCCTGCTTCTGATGTATTGCCTCAGTGGCGAGAGACCATGGA
GAAATATCACCAAGAAGCATTGAGGGTTTCTAAGGATATTGGAAGATTATTGGCGTTAGC
ACTTGATCTGGATGCGAATTACTTTGATACCCCGGAGATGCTTGGAAAGCCTATTGCAAC
TATGCGATTGCTGCATTAT

QA 3 621 3 621
DS 

RD RS1EL82TF 772 0 0
GGGGACAACGCCATTTCTCCTTCGTCTTCTGAATAGAGAGATAGAGATGGAGAATCACAC
GAAAGAGGGGCTGCAAGACCCAACCATGCAAGTTCCATCTCTTAATTGTATCGATCTCGC
CGACCATGATCTTCATCGTTCTGTTGCTTCCCTCAAACAGGCATGTTTGGATAGTGGATT
TTTCTATGTGATCAATCACGGTATAAACGAGGAGTTCATGGAGGATGTTTTCGAGCAGAG
CATGAAGTTTTTCGCTCTTCCTCTGGAGGAGAAGATGAAAGTTCTGAGAAACGAAAAGCA
CAGAGGCTATACACCTGTTCTTGATGAAATCTTAGATCCTGAGAATCAAGTTAACGGAGA
TCATAAAGAGGGCTATTACATTGGAATTGAAGTTCCAAAAGATGATCCTGATTATGATAA
ACCATTCTATGGTCCTAACCCTTGGCCTGCTTCTGATGTATTGCCTCAGTGGCGAGAGAC
CATGGAGAAATATCACCAAGAAGCATTGAGGGTTTCTAAGGATATTGGAAGATTATTGGC
GTTAGCACTTGATCCGGATGCGAATTACTTTGATACCCCGGAGATGCTTGGAAAGCCTAT
TGCAACTATGCGATTGCTTCATTATCAAGGGGTTTCTGACCCTTCGCAAGGAATATATGC
TTGTGGAGCACATTCTGATTACGAATGATGACTCTGTTAGCTACTGATGGTGTCATGGGT
CTCCAGATATGCAAAGATAAGAACGCCAAGCCTCAGAAGTGGGAATATGTGC

QA 1 772 1 772
DS 



AS 2 8

CO CL444Contig1 1491 5 4 U
GCGAAATAAAAACCCAAAAAAACTCATTTGTCCTGAGAATTATTCACTTGCCTAGCCATA
AAATGTTATGACATTCGGTGATACAAAGCAATTGTGTTATTCCAAAACAACAAAAGATGT
CCATAAAATAACACTACAGGAACCAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGTGAAGCAATGTCTAA
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AAAACCGGTTTGTTCTGGTTAAGATCCTCCCCCTCCCACTTTTAAATTTTAGCAAACGCC
CAGAAAGATGAAATGAAATGAAGCCTGAAACAGATTCCCAACAGATTCCCAAACGTGCAA
TGATCAATCCTCATGTTCATCATCGCTTTCAGAATCGGATCTGACATCTTCGCTAAGCTT
GCCTCGATCCTGTACTTGTTTCACAAGCATCCGGTAAATCAAAACCCACCAGAATATATG
AAGCACAAGCAGGCAAAACAAGAGAGTGTTGAACATGTAGTAATAGATCGGTCCTTCAAT
AGGATGCTTCTCCTTGTCCACAGTCATAATAATCTGATAGCTCGTGCTCCAAAGGATCCA
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GGCTGCTATACTCTCAAACCCGCTATACTTAGACATCTTCCCAACTTCAAGAAACACATC
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ATATAAAAACTTCAACTTTATCTTCATCTGTTGGTTAGGCCAGATCTGATCTCCAGGACC
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CGATTCGAACAAACCCATCTCGGTAAAGTTTCGAACTTTGCTTCAATCAGATTCTTAAAT
CAGCGAAGCCCACATCGGAATCTCGTCGGATTGAGAGAGAAAAGTTTGATCAAATGCGAT
CGATCTCGAATTCGATTTGATCTGATGATGAGATTGTTGATCGGATCAGAGTTATTAGTC
GAGAGATTTGTCGCTGTGAGAGATAAAAGTGAAGAGGTTTGTTTGTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ER04JQ U 8
AF RS1B596JQ U 1
AF RS1B723JQ U 1
AF RS1DI76TF C 152
AF RS1BY26TF C 706
BS 1 711 RS1B596JQ
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RD RS1ER04JQ 613 0 0
AAAAACCCAAAAAAACTCATTTGTCCTGAGAATTATTCACTTGCCTAGCCATAAAATGTT
ATGACATTCGGTGATACCAAGCAATTGTGTTATTCCAAAACAACAAAAGATGTCCATAAA
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GTTTGTTCTGGTTAAGATCCTCCCCCTCCCACTTTTAAATTTTAGCAAACGCCCAAAAAG
ATGAAATGAAATGAAGCCTGAAACAGATTCCCAACAGATTCCCAAACGTGCAATGATCAA
TCCTCATGTTCATCATCGCTTTCAAAATCGGATCTGACATCTTCGCTAAGCTTGCCTCGA
TCCTGTACTTGTTTCACAAGCATCCGGTAAATCAAAACCCACCAAAATATATGAAGCACA
AGCAGGCAAAACAAGAGAGTGTTGAACATGTAGTAATAGATCGGTCCTTCAATAGGATGC
TTCTCCTTGTCCACAGTCATAATAATCTGATAGCTCGTGCTCCAAAGGATCCAGAAAGGA
TAGTAAATGAGAC

QA 1 613 1 613
DS 

RD RS1B596JQ 711 0 0
GCGAAATAAAAACCCAAAAAAACTCATTTGTCCTGAGAATTATTCACTTGCCTAGCCATA
AAATGTTATGACATTCGGTGATACAAAGCAATTGTGTTATTCCAAAACAACAAAAGATGT
CCATAAAATAACACTACAGGAACCAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGTGAAGCAATGTCTAA
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AAAACCGGTTTGTTCTGGTTAAGATCCTCCCCCTCCCACTTTTAAATTTTAGCAAACGCC
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TGATCAATCCTCATGTTCATCATCGCTTTCAGAATCGGATCTGACATCTTCGCTAAGCTT
GCCTCGATCCTGTACTTGTTTCACAAGCATCCGGTAAATCAAAACCCACCAGAATATATG
AAGCACAAGCAGGCAAAACAAGAGAGTGTTGAACATGTAGTAATAGATCGGTCCTTCAAT
AGGATGCTTCTCCTTGTCCACAGTCATAATAATCTGATAGCTCGTGCTCCAAAGGATCCA
GAAAGGATAGTAAATGAGACGTAGAACCACCCAAGACAAAGCAAAAAGCACAAACGAAAA
GGCTGCTATACTCTCAAACCCGCTATACTTAGACATCTTCCCAACTTCAAG

QA 1 711 1 711
DS 

RD RS1B723JQ 707 0 0
GCGAAAT
AAAAACCCAAAAAAACTCATTTGTCCTGAGAATTATTCACTTGCCTAGCCATAAAATGTT
ATGACATTCGGTGATACAAAGCAATTGTGTTATTCCAAAACAACAAAAGATGTCCATAAA
ATAACACTACAGGAACCAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGTGAAGCAATGTCTAAACAAAAT
CTTGAGAAAACCGATCCCAAAAATGCAATTCCCAAAGTTATCCGATCAATTCAAAAACCG
GTTTGTTCTGGTTAAAATCCTCCCCCTCCCACTTTTAAATTTTAGCAAACGCCCAGAAAG
ATGAAATGAAATGAAGCCTGAAACAGATTCCCAACAGATTCCCAAACGTGCAATGATCAA
TCCTCATGTTCATCATCGCTTTCAAAATCGGATCTGACATCTTCGCTAAGCTTGCCTCGA
TCCTGTACTTGTTTCACAAGCATCCGGTAAATCAAAACCCACCAGAATATATGAAGCACA
AGCAGGCAAAACAAGAGAGTGTTGAACATGTAGTAATAGATCGGTCCTTCAATAGGATGC
TTCTCCTTGTCCACAGTCATAATAATCTGATAGCTCGTGCTCCAAAGGATCCAGAAAGGA
TAGTAAATGAGACGTAGAACCACCCAAGACAAAGCAAAAAGCACAAACGAAAAGGCTGCT
ATACTCTCAAACCCGCTATACTTAGACATCTTCCCAACTT

QA 8 707 8 707
DS 

RD RS1DI76TF 758 0 0
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GCAATTCCCAAAGTTATCCGATCAATTCAAAA*CCGGTTTGTTCTGGTTAAGATCCTCCC
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DS 

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TTTTCC

QA 1 786 1 786
DS 



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AAGTTTTTATATATGTATACAGCTGGGTTCTACACTTACTCTATATTCGCGTTGATCTTT
TGGGAAACAAGACGTTCTGACTTTGGTGTTTCCATGGGTCATCATATCACTACTGTTATC
CTCATCGTCCTCTCCTACATCTGCAGATTCTCTCGTGCTGGCTCTGTTGTTCTTGCGCTC
CATGACGCGAGCGATGTGTTCCTTGAAGTTGGGAAGATGTCTAAGTATAGCGGGTTTGAG
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TACTATCCTTTCTGGATCCTTTGGAGCACGAGCTATCAGATTATTATGACTGTGGACAAG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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QA 1 855 1 855
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GG
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DS 

RD RS1DS70TF 772 0 0
G
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QA 2 772 2 772
DS 



AS 1 8

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AAACAAGATGATTAGAAATCCTTTATTTTTTGAACCTAATCGCTCTTTTGATTTTGGAAA
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AGAAAAAAATTCCTTCCTATACCCGTATTAGGTAATAATCTATTTTTAACATTTAATTAG
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AAAAAAAAAAAAGTACAGCAAATATGTAAATACAACCAAAATAAAAAAAAATCCAGTCAT
GTGTGCGTCAGGGATAAATAGATCTATTTCTCTATC


BQ
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AF RS1F162JQ U 10
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AF RS1GT03JQ U 1
AF RS1GT03TF C 406
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AF RS1CA24TF C 1814
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C

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DS 

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TCCATCTCCAACCTAACCCAAACGAACTAGGGAAAAAATAATTAGGACTCACGAAAAAAT
TGATAATAACACGCAAGAAAAAAATTCCTTCCTATACCCGTATTAGGTAATAATCTATTT
TTAACATTTAATTAGATCGGGTAATTTTTCAAATTACGAATGGAAGCTCGTTTCTTTTTT
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C

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DS 

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QA 1 323 1 323
DS 

RD RS1CA24TF 323 0 0
CGACAAGGTTGTACCGATCAGAAAAGCAAAAAAAAAAAA*TGGTACCTGAATTCTCCCTT
GATACGACATGCTATTTTTTCCGTTCATTCCTTTCAGGATCAGTCGTGGTCTTACAAACT
CTACCGCAGATCTGGACGAATCCTTTTCTTCATACAAATGTGTAAAAGATGCTAGTCGCA
CTTAAAAGCCGAGTACTCTACCGTTGAGTTAGCAACCCCCCCCCAAAAAAAAAAAGAAAG
TACAGCAAATATGTAGATACAACCAGAATAAAGAAAAATCCAGTCATGTGTGCGTCAGGG
ATAAATAGATCTATTTCTCTATC

QA 1 323 1 323
DS 



AS 1 9

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BQ
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55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 20 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 45 45 45 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AD28TF U 1
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AF RS1H359JQB C 1
AF RS1H359TF U 1
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CC

QA 1 554 1 554
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QA 1 557 1 557
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QA 1 557 1 557
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QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 8

CO CL447Contig1 835 8 21 U
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 0 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 5 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 0 10 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 10 10 10 

AF RS1FM62TF U 47
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AF RS1GS17TF U 33
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GAGCTCCAAGATTGCGAGAAAGACAGAGACTCCTCGGGCATCCGGGTCTGCCCGAAATCC
GACAACCTTACCCGACTCACCGGAACCATCCCCGGTCCAATCGGTACTCCTTACGAAGGC
GGAACCTTCCAGATCGATATCACCATTCCAGAAGGGTATCCCTTTGAGCCTCCAAAGATG
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GA

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DS 

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CTTTTGTGGGGATTATTGTTCAATTCGGATCGCGAGGATGATAGATATCAGCCGAGTCCA
GAAAGAGCTCCAAGATTGCGAGAAAGACAGAGACTCCTCGGGCATCCGGGTCTGCCCGAA
ATCCGACAACCTTACCCGACTCACCGGAACCATCCCCGGTCCAATCGGTACTCCTTACGA
AGGCGGAACCTTCCAGATCGATATCACCATTCCAGAAGGGTATCCCTTTGAGCCTCCAAA
GATGCAATTTTCAACCAAAGTTTGGCACCCGAATATCAGTAGCCAAAGCGGGGCAATATG
CTTGGATGTCTTGAAAGACCAGTGGAGTCCAGCTCTTACTTTGAAGACAGCTCTTGTTTC
TGTCCAGGCATTACTCTCTGCACCAGAGCCTAAAGACCCTCAAGATGCTGTTGTTGCTGA
GCAGTACATGAAGAACTATCAAGTGTTCGTATCAACAGCCCGTTACTGGACCCAAACATT
CGCCAAGAACTCTTCTCTTGAGGACAAAGTGAAGAGACTTGTGGAGATGGGTTTTGGAGA
TGC

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DS 

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CGAGGATGATAGATATCAGCCGAGTCCAGAAAGAGCTCCAAGATTGCGAGAAAGACAGAG
ACTCCTCGGGCATCCGGGTCTGCCCGAAATCCGACAACCTTACCCGACTCACCGGAACCA
TCCCCGGTCCAATCGTTACTCCTTACGAAGGCGGAACCTTCCAGATCGATATCACCATTC
CAGAAGGGTATCCCTTTGAGCCTCCAAAGATGCAATTTTCAACCAAAGTTTGGCACCCGA
ATATCAGTAGCCAAAGCGGGGCAATATGCTTGGATGTCTTGAAAGACCAGTGGAGTCCAG
CTCTTACTTTGAAGACAGCTCTTGTTTCTGTCCAGGCATTACTCTCTGCACCAGAGCCTA
AAGACCCTCAAGATGCTGTTGTTGCTGAGCAGTACATGAAGAACTATCAAGTGTTCGTAT
CAACAGCCCGTTACTGGACCCAAACATTCGCCAAGAACTCTTCTCTTGAGGACAAAGTGA
AGAGACTTGTGGAGATGGGTTTTGGAGATGCT

QA 1 572 1 572
DS 

RD RS1FM18TF 512 0 0
GGGAA
GATGATAGATATCAGCCGAGTCCAGAAAGAGCTCCAAGATTGCGAGAAAGACAGAGACTC
CTCGGGCATCCGGGTCTGCCCGAAATCCGATAACCTTACCCGACTCACCGGAACCATCCC
GGGTCCAATCGGTACTCCTTACGAAGGCGGAACCTTTCAGATCGATATCACCATTCCAGA
AGGGTATCCCTTTGAGCCTCCAAAGATGCAATTTTCAACCAAAGTTTGGCATCCGAATAT
CAGTAGCCAAAGCGGGGCAATATGCTTAGATGTCTTGAAAGACCAGTGGAGTCCAGCTCT
TACTTTGAAGACAGCTCTTGTTTCTGTCCAGGCATTACTCTCTGCACCAGAGCCTAAAGA
CCCTCAAGATGCTGTTGTTGCTGAGCAGTACATGAAGAACTATCAAGTGTTTGTATCAAC
GGCTCGTTACTGGACCCAAGCATTCGCCAAGAACTCTTCTCTTGAGGACAAAGTGAAGAG
ACTTGTGGAAATGGGTTTTGGAGATGC

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DS 

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GGAATTCTCTC
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GAGCTCCAAGATTGCGAGAAAGACAGAGACTCCTCGGGCATCCGGGTCTGCCCGAAATCC
GACAACCTTACCCGACTCACCGGAACCATCCCCGGTCCAATCGGTACTCCTTACGAAGGC
GGAACCTTTCAGATCGATATCACCATTCCAGAAGGGTATCCCTTTGAGCCTCCAAAGATG
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GATGTCTTGAAAGACCAGTGGAGTCCAGCTCTTACTTTGAAGACAGCTCTTGTTTCTGTC
CAGGCATTACTCTCTGCACCAGAGCCTAAAGACCCTCAAGATGCTGTTGTTGCTGAGCAG
TACGTGAAGAACTATCAAGTGTTTGTATCAACGGCTCGTTACTGGACCCAAACATTCGCC
AAGAACTCTTCTCTTGAGGACAAAGTGAAGAGACTTGTGGAAATGGGTTTTGGAGATGCT
CAGGTCAGGAGTGCAATTGAATCA**TGGTGGAGATGAGAATCTGGCGCTTGAAAAGCTC
TGCTCTGGTTAGAATCTATCAAAGCAGAGGCCTCTTTTGGCGCTAGATATGATATTAATT
GGGTTTATTATAACTTTATGTGTTGCGTTTCTGTTCTTGTCTGATGATAAGAGTGAACTA
CTTTTTAAAAAAAGAGAATACTAAATGCAATGCTATATATCCATAAAA
CGAGTTTTCATCTTGCTG

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DS 

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GTGAAGAGACTTGTGGAAATGGGTTTTGGAGATGCTCAGGTCAGGAGTGCAATTGAATCA
AGTGGTGGAGATGAGAATCTGGCGCTTGAAAAGCTCTGCTCTGGTTAGAATCTATCAAAG
CAGAGGCCTCTTTTGGCGCTAGATATGATATTAATTGGGTTTATTATAACTTTATGTGTT
GCGTTTCTGTTCTTGTCTGATGATAAGAGTGAACTACTTTTTAAAAAAAGAGAATACTAA
ATGCAATGCTATATATCCATAAAA
CGAGTTTTCATCTTGC

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DS 

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CCGAATATCAGTAGCCAAAGCGGGGCAATATGCTTGGATGTCTTGAAAGACCAGTGGAGT
CCAGCTCTTACTTTGAAGACAGCTCTTGTTTCTGCCCAGGCATTACTCTCTGCACCAGAG
CCTAAAGACCCTCAAGATGCTGTTGTTGCTGAGCAGTACATGAAGAACTATCAAGTGTTC
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AGTGGTGGAGATGAGAATCTGGCGCTTGAAAAGCTCTGCTCTGGTTAGAATCTATCAAAG
CAGAGGCCTCTTTTGGCGCTAGATATGATATTAATTGGGTTTATTATAACTTTATGTGTT
GCGTTTCTGTTCTTGTCTGATGATAAGAGTGAACTACTTTAAAAAAAAA*AGAATACTAA
ATGCAATGCTATATATCCATAAAA
GGAGATTTTATCTAGC

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DS 

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GGAATTCTCTC
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GAGCTCCAAGATTGCGAGAAAGACAGAGACTCCTCGGGCATCCGGGTCTGCCCGAAATCC
GACAACCTTACCCGACTCACCGGAACCATCCCCGGTCCAATCGGTACTCCTTACGAAGGC
GGAACCTTTCAGATCGATATCACCATTCCAGAAGGGTATCCCTTTGAGCCTCCAAAGATG
CAATTTTCAACCAAAGTTTGGCATCCGAATATCAGTAGCCAAAGCGGGGCAATATGCTTA
GATGTCTTGAAAGACCAGTGGAGTCCAGCTCTTACTTTGAAGACAGCTCTTGTTTCTGTC
CAGGCATTACTCTCTGCACCAGAGCCTAAAGACCCTCAAGATGCTGTTGTTGCTGAGCAG
TACGTGAAGAACTATCAAGTGTTTGTATCAACGGCTCGTTACTGGACCCAAACATTCGCC
AAGAACTCTTCTCTTGAGGACAAAGTGAAGAGACTTGTGGAAATGGGTTTTGGAGATGCT
CAGGTCAGGAGTGCAATTGAATCA**TGGTGGAGATGAGAATCTGGCGCTTGAAAAGCTC
TGCTCTGGTTAGAATCTATCAAAGCAGAGGCCTCTTTTGGCGCTAGATATGATATTAATT
GGGTTTAT*ATAACTTTATGTGTTGCGTTTCTGTTCTTGTCTGATGATAAGAGTGAACTA
CTTTT**AAAAAAGAGA*TACTAAATGCA*TGCTATATATC*ATAAAACGA

QA 12 782 12 782
DS 



AS 1 8

CO CL448Contig1 1249 8 21 U
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TTCCTTTCTCGTTATCCAATCCGTTCACGGGTTCGATTACCACGACAGTGAACTAGAGAG
CGAAGAGAGCTTATCAAATCTCTACGACAGATGGAGGAGCCACCACTCTGTTCCTAGGAG
CCTACATGAAAGGGAGAAGAGATTCAACGTATTCAGACACAATGTGATGCATGTTCACAA
CACCAACAAGAAGAACAACCCCTTCACGCTTAAGCTCAACAAGTTTGCAGACTTAACGGT
TGAAGAATTCAAGAGTGCCTACACCGGATCAAACATCAAACATCACAGAATGTTTCAAGG
ACCGAAACGTGGCTCGAAAGGGTTCATGTATGAGAATTCAACCGAACTTCCTACCTCGGT
TGACTGGAGAGAGAAAGGTGCTGTCACTGAAGTCAAGAATTAAGGGAAGT*GTGGAAGTT
GCTGGGCATTTTCTACAGTTGCAGCCGTTGAAGGAATCAACCAGATCAAGACGAACAAGC
TAGTCTCACTGTCTGAACAGGAACTAGTGGATTGTGATACTAAACAGAACCAAGGTTGTA
ACGGAGGCCTCATGGACATTGCATTTGAATTCATCAAGAAGAACGGTGGAATTACCACCG
AGGATAACTATCCCTACGAA*GGTATTGATGGAAAATGCGATGCTTCAAAGGATAATGGC
GAGATTGTGACGATTGACGGGTACGAGGATGTACCCGAAAACGATGAAGATTTTCTTCTG
AAAGCTGTTGCAAACCAACCTGTATCTGTTGCAATTGATGCTGGAAGTTCAAATTTCCAG
TTTTATTCTAAGGGAGTGTTTACAGGATATTGTGGAACAGAGCTGAACCACGGTGTGGCA
GCGGTTGGGTACGGATCAAACTCAAAAGGGAGAAAGTATTGGATAGTGAGAAACTCATGG
GGACCTGAATGGGGAGAGGGAGGCTATATAAAACTCGAGAGAGGGATTGATGATCCCGAA
GGAAAATGTGGTATTGCGATGGAGGCCTCGTACCCGGTCAAGCTTTCGTCTTCTAACCCA
GATGAAGATGCTGACGTCAAAGATGAGCTTTAGATATGTGTACACATTGTGTAAAACCAT
ATAAATGGTCATCCAACTCCTTACCAGTTCATGTTTTTAAGCTTTGTCTGCATGGTTTGA
TATTGACGTTTGGTTTTAAATTTAAATAAAACGAGTCTCGTATTTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 
35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 15 35 35 20 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1C561TF U 1
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AF RS1A002TF U 70
AF RS1EG94TF U 329
AF RS1CS92JQ C 401
AF RS1C561JQ C 494
AF RS1A002JQ C 496
AF RS1A002TR C 774
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TTCCTTTCTCGTTATCCAATCCGTTCACGGGTTCGATTACCACGACAGTGAACTAGAGAG
CGAAGAGAGCTTATCAAATCTCTACGACAGATGGAGGAGCCACCACTCTGTTCCTAGGAG
CCTACATGAAAGGGAAAAGAGATTCAACGTATTCAGACACAATGTGATGCATGTTCACAA
CACCAACAAGAAGAACAACCCCTTCACGCTTAAGCTCAACAAGTTTGCAGACTTAACGGT
TGAAGAATTCAAGAGTGCCTACACCGTATCAAACATCAAACATCACAGAATGTTTCAAGG
ACCGAAACGTGGCTCGAAAGGGTTCATGTATGAGAATTCAACCGAACTTCCTACCTCGGT
TGACTGGAGAGAGAAAGGTGCTGTCACTGAAGTCAAGAATCAAGGGAAGT*GTGGAAGTT
GCTGGGCATTTTCTACAGTTGCAGCCGTTGAAGGAATCAACCAGATCAAGACGAACAAGC
TAGTCTCACTGTCTGAACAGGA**TAGTGGATTGTGATACTAAACAGAACCAAGGTTGTA
ACGGAGGCCTCATGGACATTGCATTTGAATTCATCAAGAAGAACGGTGGA

QA 1 650 1 650
DS 

RD RS1A002TV 650 0 0
CTCTTCCTTTCTCGTTATCCAATCCGTTCACGGGTTCGATTACCACGACAGTGAACTAGA
GAGCGAAGAGAGCTTATCAAATCTCTACGACAGATGGAGGAGCCACCACTCTGTTCCTAG
GAGCCTACATGAAAGGGAGAAGAGATTCAACGTATTCAGACACAATGTGATGCATGTTCA
CAACACCAACAAGAAGAACAACCCCTTCACGCTTAAGCTCAACAAGTTTGCAGACTTAAC
GGTTGAAGAATTCAAGAGTGCCTACACCGGATCAAACATCAAACATCACAGAATGTTTCA
AGGACCGAAACGTGGCTCGAAAGGGTTCATGTATGAGAATTCAACCGAACTTCCTACCTC
GGTTGACTGGAGAGAGAAAGGTGCTGTCACTGAAGTCAAGAATTAAGGGAAGT*GTGGAA
GTTGCTGGGCATTTTCTACAGTTGCAGCCGTTGAAGGAATCAACCAGATCAAGACGAACA
AGCTAGTCTCACTGTCTGAACAGGAACTAGTGGATTGTGATACTAAACAGAACCAAGGTT
GTAACGGAGGCCTCATGGACATTGCATTTGAATTCATCAAGAAGAACGGTGGAATTACCA
CCGAGGATAACTATCCCTACGAA*GGTATTGATGGAAAATGCGATGCTTC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RS1A002TF 638 0 0
CGTTATCCAATCCGTTCACGGGTTCGATTACCACGACAGTGAACTAGAGAGCGAAGAGAG
CTTATCAAATCTCTACGACAGATGGAGGAGCCACCACTCTGTTCCTAGGAGCCTACATGA
AAGGGAGAAGAGATTCAACGTATTCAGACACAATGTGATGCATGTTCACAACACCAACAA
GAAGAACAACCCCTTCACGCTTAAGCTCAACAAGTTTGCAGACTTAACGGTTGAAGAATT
CAAGAGTGCCTACACCGGATCAAACATCAAACATCACAGAATGTTTCAAGGACCGAAACG
TGGCTCGAAAGGGTTCATGTATGAGAATTCAACCGAACTTCCTACCTCGGTTGACTGGAG
AGAGAAAGGTGCTGTCACTGAAGTCAAGAATTAAGGGAAGTTGTGGAAGTTGCTGGGCAT
TTTCTACAGTTGCAGCCGTTGAAGGAATCAACCAGATCAAGACGAACAAGCTAGTCTCAC
TGTCTGAACAGGAACTAGTGGATTGTGATACTAAACAGAACCAAGGTTGTAACGGAGGCC
TCATGGACATTGCATTTGAATTCATCAAGAAGAACGGTGGAATTACCACCGAGGATAACT
ATCCCTACGAAAGGTATTGATGGAAAATGCGATGCTTC

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DS 

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G
CAAACATCAAACATCACAGAATGTTTCAAGGACCGAAACGTGGCTCGAAAGGGTTCATGT
ATGAGAATTCAACCGAACTTCCTACCTCGGTTGACTGGAGAGAGAAAGGTGCTGTCACTG
AAGTCAAGAGTCAAGGGAAGT*GTGGAAGTTGCTGGGCATTTTCTACAGTTGCAGCCGTT
GAAGGAATCAACCAGATCAAGACGAACAAGCTAGTCTCACTGTCTGAACAGGAACTAGTG
GATTGTGATACTAAACAGAACCAAGGTTGTAACGGAGGCCTCATGGACATTGCATTTGAA
TTCATCAAGAAGAACGGTGGAATTACCACCGAGGATAACTATCCCTACGAA*GGTATTGA
TGGAAAATGCGATGCTTCAAAGGATAATGGCGAGATTGTGACGATTGACGGGTACGAGGA
TGTACCCGAAAACGATGAAGATTCTCTTCTGAAAGCTGTTGCAAACCAACCTGTATCTGT
TGCAATTGATGCTGGAAGTTCAAATTTCCAGTTTTATTCTAAGGGAGTGTTTACAGGATA
TTGTGGAACAGAGCTGAACCACGGTGTGGCAGCGGTTGGGTACGGATCAAACTCAAAAGG
GAGAAAGTATTGAATAGTGAGAAACTCATGGGGACCTGAATGGGGAGAGGGAGGCTATAT
AAAACTCGAGAGAGGGATTGATGATCCCGAAG*AAAATGTGGTATTGCGATGG

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DS 

RD RS1CS92JQ 849 0 0
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TAAGGGAAGT*GTGGAAGTTGCTGGGCATTTTCTACAGTTGCAGCCGTTGAAGGAATCAA
CCAGATCAAGACGAACAAGCTAGTCTCACTGTCTGAACAGGAACTAGTGGATTGTGATAC
TAAACAGAACCAAGGTTGTAACGGAGGCCTCATGGACATTGCATTTGAATTCATCAAGAA
GAACGGTGGAATTACCACCGAGGATAACTATCCCTACGAA*GGTATTGATGGAAAATGCG
ATGCTTCAAAGGATAATGGCGAGATTGTGACGATTGACGGGTACGAGGATGTACCCGAAA
ACGATGAAGATTTTCTTCTGAAAGCTGTTGTAAACCAACCTGTATCTGTTGCAATTGATG
CTGGAAGTTCAAATTTCCAGTTTTATTCTAAGGGAGTGTTTACAGGATATTGTGGAACAG
AGCTGAACCACGGTGTGGTAGCGGTTGGGTACGGATCAAACTCAAAAGGGAGAAAGTATT
GGATAGTGAGAAACTCATGGGGACCTGAATGGGGAGAGGGAGGCTATATAAAACTCGAGA
GAGGGATTGATGATCCCGAAGGAAAATGTGGTATTGCGATGGAGGCCTCGTACCCGGTCA
AGCTTTCGTCTTCTAACCCAGATGAAGATGCTGACGTCAAAGATGAGCTTTAGATATGTG
TACACATTGTGTAAAACCATATAAATGGTCATCCAACTCCTTACCAGTTCATGTTTCTAA
GCTTTGTCTGCATGGTTTGATATTGACGTTTGGTTTTAAATTTAAATAAAACGAGTCTCG
TATTTTCC
C

QA 1 848 1 848
DS 

RD RS1C561JQ 730 0 0
TACAGTTGCAGCCGTTGAAGGAATCAACCAGATCAAGACGAACAAGCTAGTCTCACTGTC
TGAACAGGA**TAGTGGATTGTGATACTAAACAGAACCAAGGTTGTAACGGAGGCCTCAT
GGACATTGCATTTGAATTCATCAAGAAGAACGGTGGAATTACCACCGAGGATAACTATCC
CTACGAA*GGTATTGATGGAAAATGCGATGCTTCAAAGGATAATGGCGAGATTGTGACGA
TTGACGGGTACGAGGATGTACCCGAAAACGATGAAGATTTTTTTTTGAAAGCTGTTGCAA
ACCAACCTGTATCTGTTGCAATTGATGCTGGAAGTTCAAATTTCCAGTTTTATTTTAAGG
GAGTGTTTACAGGATATTGTGGAACAGAGCTGAACCACGGTGTGGCAGCGGTTGGGTACG
GATCAAACTCAAAAGGGAGAAAGTATTGGATAGTGAGAAACTCATGGGGACCTGAATGGG
GAGAGGGAGGCTATATAAAACTCGAGAGAGGGATTGATGATCCCGAAGGAAAATGTGGTA
TTGCGATGGAGGCCTCGTACCCGGTCAAGCTTTCGTCTTCTAACCCAGATGAAGATGCTG
ACGTCAAAGATGAGCTTTAGATATGTGTACACATTGTGTAAAACCATATAAATGGTCATC
CAACTCCTTACCAGTTCATGTTTTTAAGCTTTGTCTGCATGGTTTGATATTGACGTTTGG
TTTTAAATTT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RS1A002JQ 754 0 0
CAGTTGCAGCCGTTGAAGGAATCAACCAGATCAAGACGAACAAGCTAGTCTCACTGTCTG
AACAGGAACTAGTGGATTGTGATACTAAACAGAACCAAGGTTGTAACGGAGGCCTCATGG
ACATTGCATTTGAATTCATCAAGAAGAACGGTGGAATTACCACCGAGGATAACTATCCCT
ACGAA*GGTATTGATGGAAAATGCGATGCTTCAAAGGATAATGGCGAGATTGTGACGATT
GACGGGTACGAGGATGTACCCGAAAACGATGAAGATTTTCTTCTGAAAGCTGTTGTAAAC
CAACCTGTATCTGTTGCAATTGATGCTGGAAGTTCAAATTTCCAGTTTTATTTTAAGGGA
GTGTTTACAGGATATTGTGGAACAGAGCTGAACCACGGTGTGGTAGCGGTTGGGTACGGA
TCAAACTCAAAAGGGAGAAAGTATTGGATAGTGAGAAACTCATGGGGACCTGAATGGGGA
GAGGGAGGCTATATAAAACTCGAGAGAGGGATTGATGATCCCGAAGGAAAATGTGGTATT
GCGATGGAGGCCTCGTACCCGGTCAAGCTTTCGTCTTCTAACCCAGATGAAGATGCTGAC
GTCAAAGATGAGCTTTAGATATGTGTACACATTGTGTAAAACCATATAAATGGTCATCCA
ACTCCTTACCAGTTCATGTTTTTAAGCTTTGTCTGCATGGTTTGATATTGACGTTTGGTT
TTAAATTTAAATAAAACGAGTCTCGTATTTTCCC

QA 1 754 1 754
DS 

RD RS1A002TR 475 0 0
TT
TTCTGAAAGCTGTTGTAAACCAACCTGTATCTGTTGCAATTGATGCTGGAAGTTCAAATT
TCCAGTTTTATTTTAAGGGAGTGTTTACAGGATATTGTGGAACAGAGCTGAACCACGGTG
TGGTAGCGGTTGGGTACGGATCAAACTCAAAAGGGAGAAAGTATTGGATAGTGAGAAACT
CATGGGGACCTGAATGGGGAGAGGGAGGCTATATAAAACTCGAGAGAGGGATTGATGATC
CCGAAGGAAAATGTGGTATTGCGATGGAGGCCTCGTACCCGGTCAAGCTTTCGTCTTCTA
ACCCAGATGAAGATGCTGACGTCAAAGATGAGCTTTAGATATGTGTACACATTGTGTAAA
ACCATATAAATGGTCATCCAACTCCTTACCAGTTCATGTTTTTAAGCTTTGTCTGCATGG
TTTGATATTGACGTTTGGTTTTAAATTTAAATAAAACGAGTCTCGTATTTTCC

QA 3 475 3 475
DS 



AS 1 8

CO CL449Contig1 846 8 27 U
GTAATAAAAATTTGTTCAAAATCCATTAATACATTGTTGTTTTGGTACACTGTTTCATTC
AATATCTGTTCCATCAGAAAACTACAAGACAATATTAAAAATCAAAATCCATAAAATACA
TTCTTTCGTGTAATATAAAAACAACTTAAAGAGTGTGCCTCTAAGAAGCCTGGACACTGC
TTTTGGATTTAACAGATGACTTGGTGGCTCCTTCTTTCCACCCTTTTTGACGAGCTCTGA
GTTCCCACATAGAAGTCAGCTTCTTCTGCTCCACAAGTGCCTTCTCCGACTTCTCTCTTG
CTTCTTCACAAGTCTCCATACCGGAGTTGCACTTATCCGCCTCCTTCTGGAAAGAGGATG
TGATCTTCTTGGCCTCTAACAGACCTGTGTCTACTCGTTTGTGTTTCTCCATGGATGCTG
CTTCGCGTTGCTTCAGTTCCTCTGTTAATAGCTCAGCGTAGTTCTTCTCTGTGTCTTCGT
TCACCTCTGAGTCATGCTTTGCACAATCTCCAAAAGATCCATTGCTGAGTCCTTTGGGGA
TGGTGAGAAGAGGCACGGAAGAGCAGTCGCAGACGCAAGGAGAGCAAGAAGAGGCGGAAG
CGACAAGTGCCTCGGTGAGGTGCCAGTAGAGAGGAGGACCGAGTATGTAACCGATCATGC
TCAGAGCAAGCAAAGTAAGTCCAACTTTCAACGCCGCCGTGTGCTTCGCCAT*ACCGAGT
TAGATCTTGCAAAAAGATTTTGTGTTTCGAGATGGATTCAGCTCTTTTTCAGTGGAGACA
GAACTGGATTGGAGACTCTGATTGTCTATATCGCCCACTCGGGTTCTGTCGGTGGTGTTT
ATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 35 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 10 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 
50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 20 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1G803JQ U 71
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AF RS1A536TF C 11
AF RS1G803TF C 117
AF RS1B232JQ U 14
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AF RS1D551TF C 15
AF RS1B232TF C 125
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AACAAATGACTTGGTGGCTCCTTCTTTCCACCCTTTTTGACAAGCTCTGAGTTCCCACAT
AGAAGTCAGCTTCTTCTGCTCCACAAGTGCCTTCTCCGACTTATCTCTTGCTTCTTCACA
AGTCTCCATACCGGAGTTGCACTTATCCGCCTCCTTCTGGAAAGAGGATGTGATCTTCTT
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CTTCACTTCCTCTGTTA

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DS 

RD RS1F214JQ 549 0 0
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TTCTTTCGTGTAATATAAAAACAACTTAA*GAGTGTGCCTCTAAAAAGCCTGGACACTGC
TTTTGGATTTAACAGATGACTTGGTGGCTCCTTCTTTCCACCCTTTTTGACGAGCTCTCA
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TGATATTCTTGGCCTCTAACAAACCTGTGTCTACTCGTTTGTGTTTCTCCATGGATGCTG
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TGGTGAGAA

QA 1 549 1 549
DS 

RD RS1A536TF 765 0 0
TTTGT
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AGAAAACTACAAGACAATATTAAAAATCAAAATCCATAAAATACATTCTTTCGTGTAATA
TAAAAACAACTTAAAGAGTGTGCCTCTAAGAAGCCTGGACACTGCTTTTGGATTTAACAG
ATGACTTGGTGGCTCCTTCTTTCCACCCTTTTTGACGAGCTCTGAGTTCCCACATAGAAG
TCAGCTTCTTCTGCTCCACAAGTGCCTTCTCCGACTTCTCTCTTGCTTCTTCACAAGTCT
CCATACCGGAGTTGCACTTATCCGCCTCCTTCTGGAAAGAGGATGTGATCTTCTTGGCCT
CTAACAGACCTGTGTCTACTCGTCTGTGTTTCTCCATGGATGCTGCTTCGCGTTGCTTCA
GTTCCTCTGTTAATAGCTCAGCGTAGTTCTTCTCTGTGTCTTCGTTCACCTCTGAGTCAT
GCTTTGCACAATCTCCAAAAGATCCATTGCTGAGTCCTTTGGGGATGGTGAGAAGAGGCA
CGGAAGAGCAGTCGCAGACGCAAGGAGAGCAAGAAGAGGCGGAAGCGACAAGTGCCTCGG
TGAGGTGCCAGTAGAGAGGGGGACCGAGTATGTAACCGATCATGCTCAGAGCAAGCAAAG
TAAGTCCAACTTTCAACGCCGCCGTGTGCTTCGCCAT*ACCGAGTTAGATCTTGCAAAAA
GATTTTGTGTTTCGAGATGGATTCAGCTCTTTTTCAGT
CC

QA 6 763 6 763
DS 

RD RS1G803TF 659 0 0
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CTGCTTTTGGATTTAACAGATGACTTGGTGGCTCCTTCTTTCCACCCTTTTTGACGAGCT
CTGAGTTCCCACATAGAAGTCAGCTTCTTCTGCTCCACAAGTGCCTTCTCCGACTTATCT
CTTGCTTCTTCACAAGTCTCCATACCGGAGTTGCACTTATCCGCCTCCTTCTGGAAAGAG
GATGTGATCTTCTTGGCCTCTAACAGACCTGTGTCTACTCGTTTGTGTTTCTCCATGGAT
GCTGCTTCGCGTTGCTTCAGTTCCTCTGTTAATAGCTCAGCGTAGTTCTTCTCTGTGTCT
TCGTTCACCTCTGAGTCATGCTTTGCACAATCTCCAAAAGATCCATTGCTGAGTCCTTTG
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ATGCTCAGAGCAAGCAAAGTAAGTCCAACTTTCAACGCCGCCGTGTGCTTCGCCAT*ACC
GAGTTAGATCTTGCAAAAAGATTTTGTGTTTCGAGATGGATTCAGCTCTTTTTCAGT
CC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RS1B232JQ 801 0 0
GC
TCAACATCCATTAATACATTGTTGTTTTGGTACACTGTTTCATTCAATATCTGTTCCATC
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TAAAAACAACTTAAAGAGTGTGCCTCTAAGAAGCCTGGACACTGCTTTTGGATTTAACAG
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CAAA
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CC

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G
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AGAAAACTACAAGACAATATTATAAATCAAAAACCATAAAATACATTCTTTCGTGTAATA
TAAAAACAACTTAA*GAGTGTGCCTCTAAGAAGCCTGGACACTGCTTCTGGATTTAACAG
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TCAGCTTCTTCTGCTCCACAAGTGCCTTCTCCGACTTCTCTCTTGCTTCTTCACAAGTCT
CCATACCGGAGTTGCACTTATCCGCCTCCTTCTGGTAAGAGGATGTGATTTTCTTGGCTT
CTAGCAGACCTGTGTCTACTCGTTTGAGTTTCTCCGTGGATGCTGCTTCACGTTGCTTCA
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CC

QA 2 767 2 767
DS 

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CTTTCGTGTATAT
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CTGATTGTCTATATCGCCCACTCGGGTTCTGTCGGTGGTGTTTATTTCC

QA 14 722 14 722
DS 



AS 1 8

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BQ
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15 15 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 15 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 
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10 50 50 10 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 35 30 30 30 5 30 30 30 30 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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TCGT

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G
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CCGT

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GGAGCTATTGCTGCAACTACTGGAACTACTTCTGCTTAAAGGGCACAATCAGTTTGTGAT
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TAAACTTGTGGTTATGTCGAAGTCGGTTTTGAACTTTTGATACATTTATGTTATAATTAT
CAGCATTTTGCTAGTAATTTCGTTTCTCGTAATATCTCGACGTGAAGAGAAACTCGAATT
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AAGATGGCGATGCAGAAGGCTAAAGAGACCGTCTCCAGCAACCCCGTCGTTGTTTTCAGC
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TCGCTTCTATCAGGAATAAACAAGTTTGAGCAATAAATGTGAACTTTGTCTGAAATGTTT
TAAACTTGTGGTTATGTCGAAGTCGGTTTTGAACTTCTGATACATTTATGTTATAATTAT
CAGCATTTTGCTAGTAATTTCGTTTCTCGTAATATCTCGACGTGAAGAGAAACTCGAATT
TTAGTTTTGAAAGATTTAATCAAACTTTGACTATAAACTCTTGATTTTTT

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 6

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AGTCATCGCTCGCTTTCAATTGTAAAACCCCAGCATTCAGAAAGCTGTTCCCAGAGTACG
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TTTCTATGTAACAAAACATAGAAATGGATGTTGACTCTTCGGATAAAATCTCTCTCCTCT
CTCTTTCTCTCTGCCCTTCAGTATCAAGAGTAGTCTTCTTTTGTCTAGTGCTCTTCTTAT
GTCCGAATTTACTCAATTTAGCCCCCTTGTCGTGGTTTGTGTTTTTT*AAAGGCCATATA
TTACATAAGTTTGGAACTAATTTGTATAGTATATGG*TTTGTTTGCATTTGATAAATAGA
ACCTTATGGTTTTCATGTGTGCGTACTTATCCAACATTTTTGTTCCAAAGAGCTCATATG
TGTCTTGATTCATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 5 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1FI90TF U 72
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CCTCCGGAGTATCCT

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GGCATTATGTGCTGGAAGGAAGTGATGGAACACCTTTTGCTGGTGGATTTTACTATGGAA
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ATGGTCGATTCATTACACAAAAGAAGATCTGTTTGTCTATGAGTGATTTTCATCCAGAAA
GCTGGAATCCAATGTGGTCTGTTTCAAGCATACTTACAGGGCTCCTCTCATTTATGATGG
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AGTCATCGCTCGCTTTCAATTGTAAAACCCCAGCATTCAGAAAGCTATTCCCAGAGTACG
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GGA
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TCTCTCTCCTCTCTCTTTCTCTCTGCCCTTCAGTATCAAGAGTAGTCTTCTTTTGTCTAG
TGCTCTTCTTATGTCCGAATTTACTCAATTTAGCCCCCTTGTCGTGGTTTGTGTTTTTT*
AAAGGCCATATATTACATAAGTTTGGAACTAATTTGTATAGTATATGG*TTTGTTTGCAT
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G

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G
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AAACCCCAGCATTCAGAAAGCTGTTCCCAGAGTACGTAGAGAAGTACAACCAGCAGCAAC
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GGAAGAACAAGAAGCAGGGATTGCCAGCGTGGATTATACTGTTGCTAGTGTCGGTTTTCG
GGGTTGTAATGGCGCTGCCTTTGCTTCAACTGTGATTTTCTATGTAACAAAACATAGAAA
TGGATGTTGACTCTTCGGATAAAATCTCTCTCCTCTCTCTTTCTCTCTGCCCTTCAGTAT
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CCTTGTCGTGGTTTGTGTTTTTT*AAAGGCCATATATTACATAAGTTTGGAACTAATTTG
TATAGTATATGG*TTTGTTTGCATTTGATAAATAGAACCTTATGGTTTTCATGTGTGCGT
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AGGGCTTCTCTCATTTATGATGGATACTAGTCCGACAACTGGAAGTGTTAACACAACTGT
AGCTGAGAAACAGCGGTTGGCTAAGTCATCGCTCGCTTTCAATTGTAAAACCCCAGCATT
CAGAAAGCTGTTCCCAGAGTACGTAGAGAAGTACAACCAGCAGCAACTAGCCGAGCAAAC
GCAGCAGGCGGCACCAGAGTCTCCTCAAGAGAGCAATGCCAAAGCGGAGTCAGAGAAAAT
AGTCGACACAACAAAGGAGGACTCAGATGGTGGATTGAAGGAGAGGAGGAAGAACAAGAA
GCAGGGATTGCCAGCGTGGATTATACTGTTGCTAGTGTCGGTTTTCGGGGTTGTAATGGC
GCTGCCTCTGCTTCAACTGTGATTTTCTATGTAACAAAACATAGAAATGGATGTTGACTC
TTCGGATAAAATCTCTCTCCTCTCTCTTTCTCTCTGCCCTTCAGTATCAAGAGTAGTCTT
CTTTTGTCTAGTGCTCTTCTTATGTCCGAATTTACTCAATTTAGCCCCCTTGTCGTGGTT
TGTGTTTTTTTAAAGGCCATATATTACATAAGTTTGGAACTAATTTGTATAGTATATGGG
TTTGTTTGCATTTGATAAATAGAACCTTATGGTTTTCATGTGTGCGTACTTATCCAACAT
TTTTGTTCCAAAGAGCTCATATGTGTCTTGATTCATCG

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DS 



AS 2 6

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ATGAAACATAAAATCCCAACAAACAAAAAAGAAAGAAATGTAACCCTCTTATAAAACATC
AAAGAAACCTGTTTTCACCAAGCTACCTCTCTCACTCGTTCATGCTGAGGAATCTCTCTA
ACAAGTCTTTTCCGTTTTGTCTGACAAATCAATCAAATCCATATTATCTTTTTCTTTCCT
AGTCATTTGATGATTTATTTTATCCATTCTAAGCAGAAACAAATCCTCCTCCCACACTGT
TCTTGGGTTGCATCCGCAGGCCGGTACCTTTTGGTTGAGGAATCTGATCGACAAAGAAAC
ATGCGGCGATGATGACATAGCACATCACTAGGACAAGTCCCTTCATGTAATGAGATGTTC
CACCCTGTAAAGTGAATGCTGTGATGATAATTGCCAGGGCTAGACAGCTTGTTTCAAGGA
TGTTGAAGTTGAGATCCATTTTGATTCCCATGATCCACGCAACAATAACACTCAAAGGGA
CCACAAACAAAGAAATCTGAGTTGCAGAGCCCAAGGCCACCCCTAGAGATATATCAAGCT
TGTTCTTGAATGCGAAGATGATGGCTCCAGCATGCTCAGCCGCATTTCCAACAATGGGAA
GCAATATGATGCTTATGAAACTCACTGATAGTCCCCATGAGTCCGATGCGTCCTCGATCG
TGGCCACAACATACTCT


BQ
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AF RS1FI12JQ U 105
AF RS1DQ93JQ U 1
BS 1 343 RS1DQ93JQ
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CCTCTTATA
AAACATCAAAGAAACCTGTTTTCACCAAGCTACCTCTCTCACTCGTTCATGCTGAGGAAT
CTCTCTAACAAGTCTTTTCCGTTTTGTCTGACAAATCAATCAAATCCATATTATCTTTTT
CTTTCCTAGTCATTTGATGATTTATTTTATCCATTCTAAGCAGAAACAAATCCTCCTCCC
ACACTGTTCTTGGGTTGCATCCGCAGGCCGGTACCTTTTGGTTGAGGAATCTGATCGACA
AAGAAACATGCGGCGATGATGACATAGCACATCACTAGGACAAGTCCCTTCATGTAATGA
GATGTTCCACCCTGTAAAGTGAATGCTGTGATGATAATTGCCAGGGCTAGACAGCTTGTT
TCAAGGATGTTGAAGTTGAGATCCATTTTGATTCCCATGATCCACGCAACAATAACACTC
AAAGGGACCACAAACAAAGAAATCTGAGTTGCAGAGCCCAAGGCCACCCCTAGAGATATA
TCAAGCTTGTTCTTGAATGCGAAGATGATGGCTCCAGCATGCTCAGCCGCATTTCCAACA
ATGGGAAGCAATATGATGCTTATGAAACTCACTGATAGTCCCCATGA
GTCC

QA 10 596 10 596
DS 

RD RS1DQ93JQ 737 0 0
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ATGAAACATAAAATCCCAACAAACAAAAAAGAAAGAAATGTAACCCTCTTATAAAACATC
AAAGAAACCTGTTTTCACCAAGCTACCTCTCTCACTCGTTCATGCTGAGGAATCTCTCTA
ACAAGTCTTTTCCGTTTTGTCTGACAAATCAATCAAATCCATATTATCTTTTTCTTTCCT
AGTCATTTGATGATTTATTTTATCCATTCTAAGCAGAAACAAATCCTCCTCCCACACTGT
TCTTGGGTTGCATCCGCAGGCCGGTACCTTTTGGTTGAGGAATTTGATCGACAAAGAAAC
ATGCGGCGATGATGACATAGCACATCACTAGGACAAGTCCCTTCATGTAATGAGATGTTC
CATCCTGTAAAGTGAATGCTGTGATGATAATTGCCAGGGCTAGACAGCTTGTTTCAAGGA
TGTTGAGGTTGAGATCCATTTTGATTCCCATGATCCACGCAACAATAACACTCAAAGGGA
CCACAAACAAAGAAATCTGAGTTGCAGAGCCCAAGGCCACCCCTAGAGATATATCAAGCT
TGTTCTTGAATGCGAAGATGATGGCTCCAGCATGCTCAGCCGCATTTCCAACAATGGGAA
GCAATATGATGCTTATGAAACTCACTGATAGTCCCCATGAGTCCGATGCGTCCTCGATCG
TGGCCACAACATACTCT

QA 1 737 1 737
DS 



CO CL452Contig2 1025 4 20 U
GGAGATGTCATGAGATTCAAAAACGTATTAAGCCATGGGTAGTATCGCTGAGCCATGGGG
AATCTCCACGGAGAGCGAAAACGCAAACGCGACACCAAAGGGTTTGAGCAGGGAGCTGCG
ACATGGGAAAACGGCACACAACATGTCGTCATCGTCGCTAAGGAAGAAGTCAGACCTGCG
ATTGATTCAGAAGGTTCCATGCAAAACTCTCAAGAACGTTCTCTCTAATCTCCAAGAAGT
CATTCTTGGTACAAAACTCACTGTCTTGTTTCTCGCGATCCCTCTCGCCGTTATCGCCGA
TTATTACCACTACGGTCGCCCGTTGATATTTGGACTGAGCTTGATAGGACTGACACCTCT
TGCTGAGCGAGTTAGCTTTTTGACAGAACAACTAGCTTTCTACACCGGCCCAACAGTGGG
CGGTTTGTTGAACGCCACTTGTGGAAACGCGACGGAGCTAATAATAGCGATACTAGCGTT
GGCCCATAACAAAGTGGCCGTGGTGAAATACTCTCTGTTGGGTTCAATTCTCTCAAACCT
TCTCCTGGTTCTCGGCTCTTCCCTCTTCTGTGGTGGAATTGCCAATATCCGCCGCGACCA
GCGGTTTGACCGGAAACAAGCGGATGTGAACTTCTTCTTGCTGCTCATGGGTCTGCTATG
TCATTTGCTCCCATTGCTGCTAAAATATGCAGCGACCGGAGAAGCATCCACCTCTCTGAT
CAACAAAATGTCGCTTAGCCTGTCCAGGACAAGCAGCATCGTTATGCTTATTGCTTACAT
TGCTTATCTCATCTTCCAGCTCTGGACTCACCGCCAATTGTTTGAAGCACAAGAGGATGA
TGAGGATGATGCGTATAATGATGAAGTGACTGTTGAAGAAACTCCGGTGATAGGATTTTG
GAGCGGATTTGCTTGGCTCGCTGGAATGACACTCGTCATCGCATTGCTATCAGAGTATGT
TGTGGCCACGATCGAGATGCATCTGATCATGGGGACTATCAGTGAGTTCATAAGCATCAT
ATTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 0 25 25 0 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1FI12TF U 10
AF RS1DQ93TF U 1
AF RS1C660TF U 8
AF RS1FQ04TF U 224
BS 1 252 RS1DQ93TF
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BS 773 1025 RS1FQ04TF

RD RS1FI12TF 691 0 0
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TCCATGCAAAACTCTCAAGAACGTTCTCTCTAATCTCCAAGAAGTCATTCTTGGTACTAA
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TCGCCCGTTGATATTTGGACTGAGCTTGATAGGACTGACACCTCTTGCTGAGCGAGTTAG
CTTTTTGACAGAACAACTAGCTTTCTACACCGGCCCAACAGTGGGCGGTTTGTTGAACGC
CACTTGTGGAAACGCGACTGAGCTGATAATAGCGATTCTAGCGTTGGCCCATAACAAAGT
GGCCGTGGTGAAATACTCTCTGTTGGGTTCAATTCTCTCAAACCTTCTCCTGGTTCTCGG
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GCTGCTAAGATAT*CAGCGACCGGA

QA 7 691 7 691
DS 

RD RS1DQ93TF 772 0 0
GGAGATGTCATGAGATTCAAAAACGTATTAAGCCATGGGTAGTATCGCTGAGCCATGGGG
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ACATGGGAAAACGGCACACAACATGTCGTCATCGTCGCTAAGGAAGAAGTCAGACCTGCG
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CATTCTTGGTACTAAACTCACTGTCTTGTTTCTCGCGATCCCTCTCGCCGTTATCGCCGA
TTATTACCACTACGGTCGCCCGTTGATATTTGGACTGAGCTTGATAGGACTGACACCTCT
TGCTGAGCGAGTTAGCTTTTTGACAGAACAACTAGCTTTCTACACCGGCCCAACAGTGGG
CGGTTTGTTGAACGCCACTTGTGGAAACGCGACTGAGCTGATAATAGCGATTCTAGCGTT
GGCCCATAACAAAGTGGCCGTGGTGAAATACTCTCTGTTGGGTTCAATTCTCTCAAACCT
TCTCCTGGTTCTCGGCTCTTCCCT*TTCTGTGGTGGAATTGCCAATATCCGCCGCGACCA
GCGGTTTGACCGGAAACAAGCGGATGTGAACTTCTTCTTGCTGCTCATGGGTCTGTTATG
TCATTTGCTCCCATTGCTGCTAAGATATGCAGCGACCGGAGAAGCATCCACCTCTCTGAT
*AACAAA*TGTCGCTTAGCCTGTCCAGGACAAGCAGCATCGTTATGCTTATT

QA 1 772 1 772
DS 

RD RS1C660TF 737 0 0
GGAT
GAGATTCAAAAACGTATTAAGCCATGGGTAGTATCGCTGAGCCATGGGGTATCTCCACGG
AGAGCGAAAACGCAAACGCGACACCAAAGGGTTTGAGCAGGGAACTGCGACATGGGAAAA
CGGCACACAACATGTCGTCATCGTCGCTAAGGAAGAAGTCAGACCTGCGATTGATTCAGA
AGGTTCCATGCAAAACTCTCAAGAACGTTCTCTCTAATCTCCAAGAAGTCATTCTTGGTA
CAAAACTCACTGTCTTGTTTCTCGCGATCCCTCTCGCCGTTATCGCCGATTATTACCACT
ACGGTCGCCCGTTGATATTTGGACTGAGCTTGATAGGACTGACACCTCTTGCTGAGCGAG
TTAGCTTTTTGACAGAACAACTAGCTTTCTACACCGGCCCAACAGTGGGCGGTTTGTTGA
ACGCCACTTGTGGAAACGCGACGGAGCTAATAATAGCGATACTAGCGTTGGCCCATAACA
AAGTGGCCGTGGTGAAATACTCTCTGTTGGGTTCAATTCTCTCAAACCTTCTCCTGGTTC
TCGGCTCTTCCCTCTTCTGTGGTGGAATTGCTAATATCCGCCGCGACCAGCGGTTCGACC
GGAAACAAGCGGATGTGAACTTCTTCTTGCTGCTTATGGGTTTGCTATGTCATTTGCTCC
CATTGCTGCTAAAATATGCAGCGACCGGAGAAGCATCCACCTCTCTGATCAACAAAATGT
CGCTTAGCCTGTC

QA 5 737 5 737
DS 

RD RS1FQ04TF 802 0 0
TCTAATCTCCAAGAAGTCATTCTTGGTACAAAACTCACTGTCTTGTTTCTCGCGATCCCT
CTCGCCGTTATCGCCGATTATTACCACTACGGTCGCCCGTTGATATTTGGACTGAGCTTG
ATAGGACTGACACCTCTTGCTGAGCGAGTTAGCTTTTTGACAGAACAACTAGCTTTCTAC
ACCGGCCCAACAGTGGGCGGTTTGTTGAACGCCACTTGTGGAAACGCGACGGAGCTAATA
ATAGCGATACTAGCGTTGGCCCATAACAAAGTGGCCGTGGTGAAATACTCTCTGTTGGGT
TCAATTCTCTCAAACCTTCTCCTGGTTCTCGGCTCTTCCCTCTTCTGTGGTGGAATTGCT
AATATCCGCCGCGACCAGCGGTTTGACCGGAAACAAGCGGATGTGAACTTCTTCTTGCTG
CTTATGGGTTTGCTATGTCATTTGCTCCCATTGCTGCTAAAATATGCAGCGACCGGAGAA
GCATCCACCTCTCTGATCAACAAAATGTCGCTTAGCCTGTCCAGGACAAGCAGCATCGTT
ATGCTTATTGCTTACATTGCTTATCTCATCTTCCAGCTCTGGACTCACCGCCAATTGTTT
GAAGCACAAGAGGATGATGAGGATGATGCGTATAATGATGAAGTGACTGTTGAAGAAACT
CCGGTGATAGGATTTTGGAGCGGATTTGCTTGGCTCGCTGGAATGACACTCGTCATCGCA
TTGCTATCAGAGTATGTTGTGGCCACGATCGAGATGCATCTGATCATGGGGACTATCAGT
GAGTTCATAAGCATCATATTGC

QA 1 802 1 802
DS 



AS 2 9

CO CL453Contig1 1021 2 6 U
GGACATCATCCATTAACCTCCGCTCAACAGATATAAGCCATCATGTCTGAGTGGTTCACC
CAACTCGAAGAGGTCGCGTACTCCGTAGTGGAATATATCCCACTAGTCGGCACCGTGTAC
CCTCTAAAACGAGCCACTATCGCATACAACGCGAGGGATTGGACGCGACATTGGCAGTCC
CTCGGCAACTTCCTCGAGAGCTCCGTTCGCGATGTCATTCTCTTGAAAGACATTGCCGAA
CCCACCACCAGTCGCCCTTATACACACCATGGCCGAGTCGTTGACCGACAAAATGATTGA
GATCTACCATCACGAGCCCAAAAGGCCTGAGGTCAAAATCACCCAGAAGCTGGATAAACA
ACTCGGACATGTACTCATCGCCGAGTCCTCAAAGGGCAGGTCCAAGCGTGAAGTCTTCGG
CGGCAAAGCCAAGGGTGTGCACCACTTTCACGGCGCTGTCTTCACTGGTACGCTCACTCA
CCCCCAATATGCTCCAAGGGGCGAGAAGATCCGGCTTGATATTCCGCACGGATTGCGCGA
CGGGGCACGAGTCACCTTCACGTGGAAATGGACTACAAACTACTATGGAAAAAAGAATGT
ACCTGAAGCCTCGTATGGTCGTATTAAACTGATCTCCGGCACACCCACAAAGTTCGAATT
GTACAACCTCAAGGGTGCCGGAGTGGCAGGTTATGACTTTTCGGGTGAGGTAATCTCCAA
GGACAAAATCAAAGCTACAACCACAGTCGGTGGTACAAAAACTCCGATTGACTTCACAAG
GTTGGCCGGAACTTGAAGTATACAAGCACCTGAACCTGGCCCTTTCAACAGCAGCGAGAA
CCTCTACTACTAAATAATTTCTCGTTGTTTTTTTCATTTTCAGTACTTGAATAATGCTAA
TAGATAGACAACGGATTTTTCCTTTGTTTATTTGGATTATAAGCTTATTATCTTTAATAT
TTGTAATATTTTTATATTAATAAAAGTCTGGATCCTTTTGTGGGGTCTGACCCAACCCTC
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1AN51TF U 1
AF RS1AN51JQ C 119
BS 1 248 RS1AN51TF
BS 249 249 RS1AN51JQ
BS 250 689 RS1AN51TF
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BS 691 714 RS1AN51TF
BS 715 1021 RS1AN51JQ

RD RS1AN51TF 714 0 0
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CAACTCGAAGAGGTCGCGTACTCCGTAGTGGAATATATCCCACTAGTCGGCACCGTGTAC
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CTCGGCAACTTCCTCGAGAGCTCCGTTCGCGATGTCATTCTCTTGAAAGACATTGCCGAA
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CGGCAAAGCCAAGGGTGTGCACCACTTTCACGGCGCTGTCTTCACTGGTACGCTCACTCA
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CGGGGCACGAGTCACCTTCACGTGGAAATGGACTACAAACTACTATGGAAAAAAGAATGT
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GTACAACCTCAAGGGTGCCGGAGTGGCAG*TTATGACTTTTCGGGTGAGGTAAT

QA 1 714 1 714
DS 

RD RS1AN51JQ 903 0 0
TACCCTCTAAACGAGCCAC
TATCGCATACAACGCGAGGGATTGGACGCGACATTGGCAGTCCCTCGGCAACTTCCTCGA
GAGCTCCGTTCGCGATGTCATTCTCTTGAAAGACATTGCCGAACCCACCCCCAGTCGCCC
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TCGCCGAGTCCTCAAAGGGCAGGTCCAAGCGTGAAGTCTTCGGCGGCAAAGCCAAGGGTG
TGCACCACTTTCACGGCGCTGTCTTCACTGGTACGCTCACTCACCCCCAATATGCTCCAA
GGGGCGAGAAGATCCGGCTTGATATTCCGCACGGATTGCGCGACGGGGCACGAGTCACCT
TCACGTGGAAATGGACTACAAACTACTATGGAAAAAAGAATGTACCTGAAGCCTCGTATG
GTCGTATTAAACTGATCTCCGGCACACCCACAAAGTTCGAATTGTACAACCTCAAGGGTG
CCGGAGTGGCAGGTTATGACTTTTCGGGTGAGGTAATCTCCAAGGACAAAATCAAAGCTA
CAACCACAGTCGGTGGTACAAAAACTCCGATTGACTTCACAAGGTTGGCCGGAACTTGAA
GTATACAAGCACCTGAACCTGGCCCTTTCAACAGCAGCGAGAACCTCTACTACTAAATAA
TTTCTCGTTGTTTTTTTCATTTTCAGTACTTGAATAATGCTAATAGATAGACAACGGATT
TTTCCTTTGTTTATTTGGATTATAAGCTTATTATCTTTAATATTTGTAATATTTTTATAT
TAATAAAAGTCTGGATCCTTTTGTGGGGTCTGACCCAACCCTCG

QA 20 903 20 903
DS 



CO CL453Contig2 1013 7 13 U
GACACATCATCCATTTACCGCCTATCAACAGATATAAGCCATCATGTCTCAGTGGTTCAC
CCAACTCGAAGATGTCGCCTACTCCGTAGTGGAATATATCCCACTAGTCGGAACCGTGTA
CTCTCTAGAACGAGCGGGTATCGCATACAACGAGAGGGATTGGACGAGACATTGGCAGTC
CCTCGGCAACTTCCTCGAGAGCTCCGTTCGCGATATCATTCTCTTCAAAGACATTGCCGA
ACCCACCACAGTCGCCCTTATACACACCATGGCCGAGTCGTTGACGGACAAATTGATTGA
GATCTACCATCACGAGCCCAAAAGGCCTGAGGTCAAAATCACCCAGAAGCTGGATAAACA
AAGAGGACATGTACTCATCGCCGAGTCCTCAAAGGGCAGGTCCAAGGGAGAAGTCTTCGG
AGGCAAAGCCAAGGGTGTGCACCACTTTCACGGCGCTGTCTTCACTGGTACGCTCACTCA
CCCCGTATATGCTCCGAAGGGCGAGACGGTCCGGCTTGATATTCCGGACGGATTGCGCGA
CGGGGCAGCAGTCACCTTCACGTGGTATTGGACTACAAACTACTATGGAAAAAAGAATGT
ACCTGAAGCCTCGTATGGTCGTATTAAACTGATCTCCGGCACACCCACAAAGTTCGAATT
GTACAACCTCAAGGGTGCCGGAGTGGCAGGTTATGACTTTTCGGGTGAGGTAATCTCCAA
GGACAAAATCAAAGCTACAACCACAGTCGGTGGTACAAAAACTCCGATTGACTTCACTAG
GTTGGCCACAACTTGAAGTATACAAGCACCTGAACCTGGCCCTTTCAACAGCAGCGAGAA
CCTCTACTACTAAATAATTTCTCGTTGTTTTCTTCATTTTCAGTACTTGAATAATGCTAA
TAGATAGACAACGGATTTTTCCTTTGTTTATTTGGATTATAAGCTTATTATCTTTAATAT
TTGTAATATTTTTATATTAATAAAAGTCTGGATCCTTTTGTAGGGTCTGACCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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45 45 45 45 45 40 40 40 40 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1GE75TF U 1
AF RS1DJ74TF U 2
AF RS1E012TF U 4
AF RS1E012JQ C 331
AF RS1DU16TF U 403
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AF RS1GE75JQ C 642
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RD RS1GE75TF 669 0 0
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CCAACTCGAAGATGTCGCCTACTCCGTAGTGGAATATATCCCACTAGTCGGAACCGTGTA
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CCTCGGCAACTTCCTCGAGAGCTCCGTTCGCGATATCATTCTCTTCAAAGACATTGCCGA
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AAGAGGACATGTACTCATCGCCGAGTCCTCAAAGGGCAGGTCCAAGGGAGAAGTCTTCGG
AGGCAAAGCCAAGGGTGTGCACCACTTTCACGGCGCTGTCTTCACTGGTACGCTCACTCA
CCCCGTATATGCTCCGAAGGGCGAGACGGTCCGGCTTGATATTCCGGACGGATTGCGCGA
CGGGGCAGCAGTCACCTTCACGTGGTATTGGACTACAAACTACTATGGAAAAAAGAATGT
ACCTGAAGCCCCGTATGGTCGTATTAAACTGATCTCCCGCACACCCACAAAGTTCGAATT
GTACAACCT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RS1DJ74TF 667 0 0
GGAC
ATCATCCATTTACCGCCTATCAACAGATATAAGCCATCATGTCTCAGTGGTTCACCCAAC
TCGAAGATGTCGCCTACTCCGTAGTGGAATATATCCCACTAGTCGGAACCGTGTACTCTC
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GCAACTTCCTCGAGAGCTCCGTTCGCGATATCATTCTCTTCAAAGACATTGCCGAACCCA
CCACAGTCGCCCTTATACACACCATGGC*GAGTCGTTGACGGACAAATTGATTGAGATCT
ACCATCACGAGCCCAAAAGGCCTGAGGTCAAAATCACCCAGAAGCTGGATAAACAAAGAG
GACATGTACTCATCGCCGAGTCCTCAAAGGGCAGGTCCAAGGGAGAAGTCTTCGGAGGCA
AAGCCAAGGGTGTGCACCACTTTCACGGCGCTGTCTTCACTGGTACGCTCACTCACCCCG
TATATGCTCCGAAGGGCGAGACGGTCCGGCTTGATATTCCGGACGGATTGCGCGACGGGG
CAGCAGTCACCTTCACGTGGTATTGGACTACAAACTACTATGGAAAAAAGAATGTACCTG
AAGCCTCGTATGGTCGTATTAAACTGATCTCCGGCACACCCACAAAGTTCGAATTGTACA
CCT

QA 5 664 5 664
DS 

RD RS1E012TF 696 0 0
GG
ATCATCCATTTACCGCCTATCAACAGATATAAGCCATCATGTCTCAGTGGTTCACCCAAC
TCGAAGATGTCGCCTACTCCGTAGTGGAATATATCCCACTAGTCGGAACCGTGTACTCTC
TAGAACGAGCGGGTATCGCATACAACGAGAGGGATTGGACGAGACATTGGCAGTCCCTCG
GCAGCTTCCTCGAGAGCTCCGTTCGCGATATCATTCTCTTCAAAGACATTGCCGAACCCA
CCACAGTCGCCCTTATACACACCATGGCCGAGTCGTTGACGGACAAATTGATTGAGATCT
ACCATCACGAGCCCAAAAGGCCTGAGGTCAAAATCACCCAGAAGCTGGATAAACAAAGAG
GACATGTACTCATCACCGAGTCCTCAAAGGGCAGGTCCAAGGGAGAAGTCTTCGGAGGCA
AAGCCAAGGGTGTGCACCACTTTCACGGCGCTGTCTTCACTGGTACGCTCACTCACCCCG
TATATGCTCCGAAGGGCGAGACGGTCCGGCTTGATATTCCGGACGGATTGCGCGACGGGG
CAGCAGTCACCTTCACGTGGTATTGGACTACAAACTACTATGGAAAAAAGAATGTACCTG
AAGCCTCGTATGGTCGTATTAAACTGATCTCCGGCACACCCACAAAGTTCGAATTGTACA
ACCTCAAGG*TGCCGGAGTGGCAG*TTATGACTT

QA 3 696 3 696
DS 

RD RS1E012JQ 683 0 0
GGTCAAAATCACCCAGAAGCTGGATAAACAAAGAGGACATGTACTCATCACCGAGTCCTC
AAAGGGCAGGTCCAAGGGAGAAGTCTTCGGAGGCAAAGCCAAGGGTGTGCACCACTTTCA
CGGCGCTGTCTTCACTGGTACGCTCACTCACCCCGTATATGCTCCGAAGGGCGAGACGGT
CCGGCTTGATATTCCGGACGGATTGCGCGACGGGGCAGCAGTCACCTTCACGTGGTATTG
GACTACAAACTACTATGGAAAAAAGAATGTACCTGAAGCCTCGTATGGTCGTATTAAACT
GATCTCCGGCACACCCACAAAGTTCGAATTGTACAACCTCAAGGGTGCCGGAGTGGCAGG
TTATGACTTTTCGGGTGAGGTAATCTCCAAGGACAAAATCAAAGCTACAACCACAGTCGG
TGGTACAAAAACTCCGATTGACTTCACTAGGTTGGCCACAACTTGAAGTATACAAGCACC
TGAACCTGGCCCTTTCAACAGCAGCGAGAACCTCTACTACTAAATAATTTCTCGTTGTTT
TCTTCATTTTCAGTACTTGAATAATGCTAATAGATAGACAACGGATTTTTCCTTTGTTTA
TTTGGATTATAAGCTTATTATCTTTAATATTTGTAATATTTTTATATTAATAAAAGTCTG
GATCCTTTTGTAGGGTCTGACC
T

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1DU16TF 599 0 0
G
AAGGGAGAAGTCTTCGGAGGCAAAGCCAAGGGTGTGCACCACTTTCACGGCGCTGTCTTC
ACTGGTACGCTCACTCACCCCGTATATGCTCCGAAGGGCGAGACGGTCCGGCTTGATATT
CCGGACGGATTGCGCGACGGGGCAGCAGTCACCTTCACGTGGTATTGGACTACAAACT**
TATGGAAAAAAGAATGTACCTGAAGCCTCGTATGGTCGTATTAAACTGATCTCCGGCACA
CCCACAAAGTTCGAATTGTACAACCTCAAGGGTGCCGGAGTGGCAGGTTATGACTTTTCG
GGTGAGGTAATCTCCAAGGACAAAATCAAAGCTACAACCACAGTCGGTGGTACAAAAACT
CCGATTGACTTCACTAGGTTGGCCACAACTTGAAGTATACAAGCACCTGAACCTGGCCCT
TTCAACAGCAGCGAGAACCTCTACTACTAAATAATTTCTCGTTGTTTTCTTCATTTTCAG
TACTTGAATAATGCTAATAGATAGACAACGGATTTTTCCTTTGTTTATTTGGATTATAAG
CTTATTATCTTTAATATTTGTAATATTTTTATATTAATAAAAGTCTGGATCCTTTTGT

QA 2 599 2 599
DS 

RD RS1DJ74JQ 682 0 0
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AAGGGCAGGTCCAAGGGAGAAGTCTTCGGAGGCAAAGCCAAGGGTGTGCACCACTTTCAC
GGCGCTGTCTTCACTGGTACGCTCACTCACCCCGTATATGCTCCGAAGGGCGAGACGGTC
CGGCTTGATATTCCGGACGGATTGCGCGACGGGGCAGCAGTCACCTTCACGTGGTATTGG
ACTACAAACTACTATGGAAAAAAGAATGTACCTGAAGCCTCGTATGGTCGTATTAAACTG
ATTTCCGGCACACCCACAAAGTTCGAATTGTACAACCTCAAGGGTGCCGGAGTGGCAGGT
TATGACTTTTCGGGTGAGGTAATCTCCAAGGACAAAATCAAAGCTACAACCACAGTCGGT
GGTACAAAAACTCCGATTGACTTCACTAGGTTGGCCACAACTTGAAGTATACAAGCACCT
GAACCTGGCCCTTTCAACAGCAGCGAGAACCTCTACTACTAAATAATTTCTCGTTGTTTT
CTTCATTTTCAGTACTTGAATAATGCTAATAGATAGACAACGGATTTTTCCTTTGTTTAT
TTGGATTATAAGCTTATTATCTTTAATATTTGTAATATTTTTATATTAATAAAAGTCTGG
ATCCTTTTGTAGGGTCTGACCC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1GE75JQ 372 0 0
CACCCACAAAGTTCGAATTGTACAACCTCAAGGGTGCCGGAGTGGCAGGTTATGACTTTT
CGGGTGAGGTAATCTCCAAGGACAAAATCAAAGCTACAACCACAGTCGGTGGTACAAAAA
CTCCGATTGACTTCACTAGGTTGGCCACAACTTGAAGTATACAAGCACCTGAACCTGGCC
CTTTCAACAGCAGCGAGAACCTCTACTACTAAATAATTTCTCGTTGTTTTCTTCATTTTC
AGTACTTGAATAATGCTAATAGATAGACAACGGATTTTTCCTTTGTTTATTTGGATTATA
AGCTTATTATCTTTAATATTTGTAATATTTTTATATTAATAAAAGTCTGGATCCTTTTGT
AGGGTCTGACC
C

QA 1 371 1 371
DS 



AS 2 9

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GCGCCTTTCAAATTCACTCTCGGTCAAGGTCAGGTTATTAAGGGATGGGATATTGGTATT
AAGACTATGAAGAAGGGGAAGGATATGAGCGTCCCAACGACGGAGCGGTCGTGAAAGTGA
AACTGATAGGGAAACTTGGAGACGGTACTGTATTCCTAAAGAAAGGTCACGGTGAAGGTG
AAGAGCTCTTTGAGTTCAAGACTGATGAAGAGCAAGTGATCGATGGACTTGATAAAGCCG
TGATGAAGATGAAGAAGGGTGAAGTGGCATTGGTGACCATAGACCCAGAGTATGCTTTTG
GTTCAACTGAGTCAAAGCAGGAATTAGCTGTGGTGCCGCCAAACTCAACCGTCTATTATG
AGGTTGACCTTGTGTCTTTCGACAAGGAAAGGGAATCGTGGGACATGAACACTGAGGAGA
AGATTGAAGCTGCTGGTAAGAAGAAGGAAGAAGGAAATGCCAAGTTCAAGGCAGGCAAAT
ATGCGCTCGCTTCTAAGAGATATGAGAAGGCTGTCAAATTCATTGAATACGACTCATCCT
TCAGTGAGGAGGAGAAGAAGCAAGCAAAAGCATTGAAAGTGGCGTGCAATCTGAACGACG
CAGCTTGCAAACTGAAGCTGAAAGAATACAGGCAGGCTGAAAAGCTATGCACAAAGGTGC
TAGAGCTGGAAAGCACCAATGTGAAAGCCCTTTACAGGAGAGCGCAGGCCTACATGGAGT
TGGCTGATTTGGACTTGGCCGAGTTTGATGTCAAGAAGGCCCTTGAAATTGATCCCGATA
ACAGGGAAGTGAAGGTGGAGCAGAGAAGGTTGAAGGAGAAAATGAAGGAATTTAACAAAA
AGGGGGCCAAGTTTTACGGAAACATGTTTGCAAAACTATCCAAGTGAAGCAGCAGCGTCA
TGGAGAATGGCTTACTGGCTTTGGATGTTTTTCTCGTTTATGTATCTTTGCCTAATTTCC
ATTTTAAGTTGTGCTTTAGATGAGACCTTCAAGACATTGTTGTTCTTTATTAAATGTTAG
CTTTGATAATTTATAATCGAGATACTTATCGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FQ24TF U 1
AF RS1F144TF U 75
AF RS1C113JQ C 725
AF RS1F144JQ C 184
AF RS1FQ24JQ C 337
AF RS1C113TF U 725
BS 1 199 RS1FQ24TF
BS 200 200 RS1F144TF
BS 201 627 RS1FQ24TF
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BS 709 724 RS1F144TF
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BS 726 1043 RS1C113TF
BS 1044 1054 RS1FQ24JQ

RD RS1FQ24TF 627 0 0
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AACTGATAGGGAAACTTGGAGACGGTACTGTATTCCTAAAGAAAGGTCACGGTGAAGGTG
AAGAGCTCTTTGAGTTCAAAACTGATGAAGAGCAAGTGATCGATGGACTTGATAAAGCCG
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CAGCTTGCAAACTGAAGCTGAAAGAAT

QA 1 627 1 627
DS 

RD RS1F144TF 650 0 0
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AAGCAGGAATTAGCTGTGGTGCCGCCAAACTCAACCGTCTATTATGAGGTTGACCTTGTG
TCTTTCGACAAGGAAAGGGAATCGTGGGACATGAACACTGAGGAGAAGATTGAAGCTGCT
GGTAAGAAGAAGGAAGAAGGAAATGCCAAGTTCAAGGCAGGCAAATATGCGCTCGCTTCT
AAGAGATATGAGAAGGCTGTCAAATTCATTGAATACGACTCATCCTTCAGTGAGGAGGAG
AAGAAGCAAGCAAAAGCATTGAAAGTGGCGTGCAATCTGAACGACGCAGCTTGCAAACTG
AAGCTGAAAGAATACAGGCAGGCTGAAAAGCTATGCACAAAG*TGCTAGAGCTGGAAAGC
ACCAATGTGAAAGCCCTTTACAGGAGAGCGCAG*CCTACATGGAGTTGGC

QA 1 650 1 650
DS 

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G
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GCCAAGTTTTACGGAAACATGTTTGCAAAACTATCCAAGTGAAGCAGCAG
GGTC

QA 2 171 2 171
DS 

RD RS1F144JQ 825 0 0
AGCTCTTTGAGTTCAAGACTGATGAAGAGCAAGTGATCGATGGACTTGATAAAGCCGTGA
TGAAGATGAAGAAGGGTGAAGTGGCATTGGTGACCATAGACCCAGAGTATGCTTTTGGTT
CAACTGAGTCAAAGCAGGAATTAGCTGTGGTGCCGCCAAACTCAACCGTCTATTATGAGG
TTGACCTTGTGTCTTTCGACAAGGAAAGGGAATCGTGGGACATGAACACTGAGGAGAAGA
TTGAAGCTGCTGGTAAGAAGAAGGAAGAAGGAAATGCCAAGTTCAAGGCAGGCAAATATG
CGCTCGCTTTTAAGAGATATGAGAAGGCTGTCAAATTCATTGAATACGACTCATCCTTCA
GTGAGGAGGAGAAGAAGCAAGCAAAAGCATTGAAAGTGGCGTGCAATTTGAACGACGCAG
CTTGCAAACTGAAGCTGAAAGAATACAGGCAGGCTGAAAAGCTATGCACAAAGGTGCTAG
AGCTGGAAAGCACCAATGTGAAAGCCCTTTACAGGAGAGCGCAGGCCTACATGGAGTTGG
CTGATTTGGACTTGGCCGAGTTTGATGTCAAGAAGGCCCTTGAAATTGATCCCGATAACA
GGGAAGTGAAGGTGGAGCAGAGAAGGTTGAAGGAGAAAATGAAGGAATTTAACAAAAAGG
AGGCCAAGTTTTACGGAAACATGTTTGCAAAACTATCCAAGTGAAGCAGCAGCGTCATGG
AGAATGGCTTACTGGCTTTGGATGTTTTTCTCGTTTATGTATCTTTGCCTAATTTCCATT
TTAAGTTGTGCTTTAGATGAGACCTTCAAGACATTGTTGTTCTT
G

QA 1 824 1 824
DS 

RD RS1FQ24JQ 718 0 0
CGCCAAACTCAACCGTCTATTATGAGGTTGACCTTGTGTCTTTCGACAAGGAAAGGGAAT
CGTGGGACATGAACACTGAGGAGAAGATTGAAGCTGCTGGTAAGAAGAAGGAAGAAGGAA
ATGCCAAGTTCAAGGCAGGCAAATATGCGCTCGCTTCTAAGAGATATGAGAAGGCTGTCA
AATTCATTGAATACGACTCATCCTTCAGTGAGGAGGAGAAGAAGCAAGCAAAAGCATTGA
AAGTGGCGTGCAATTTGAACGACGCAGCTTGCAAACTGAAGCTGAAAGAATACAGGCAGG
CTGAAAAGCTATGCACAAAGGTGCTAGAGCTGGAAAGCACCAATGTGAAAGCCCTTTACA
GGAGAGCGCAGGCCTTCATGGAGTTGGCTGATTTGGACTTGGCCGAGTTTGATGTCAAGA
AGGCCCTTGAAATTGATCCCGATAACAGGGAAGTGAAGGTGGAGCAGAGAAGGTTGAAGG
AGAAAATGAAGGAATTTAACAAAAAGGAGGCCAAGTTTTACGGAAACATGTTTGCAAAAC
TATCCAAGTGAAGCAGCAGCGTCACGGAGAATGGCTTACTGGCTTTGGATGTTTTTTTCG
TTTATGTATCTTTGCCTAATTTCCATTTTAAGTTGTGCTTTAGATGAGACCTTCAAGACA
TTGTTGTTCTTTATTAAATGTTAGCTTTGATAATTTATAATCGAGATACTTATCGTCC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1C113TF 319 0 0
G
GATTTGGACTTGGCCGAGTTTGATGTCAAGAAGGCCCTTGAAATTGATCCCGATAACAGG
GAAGTGAAGGTGGAGCAGAGAAGGTTGAAGGAGAAAATGAAGGAATTTAACAAAAAGGGG
GCCAAGTTTTACGGAAACATGTTTGCAAAACTATCCAAGTGAAGCAGCAGCGTCATGGAG
AATGGCTTACTGGCTTTGGATGTTTTTCTCGTTTATGTATCTTTGCCTAATTTCCATTTT
AAGTTGTGCTTTAGATGAGACCTTCAAGACATTGTTGTTCTTTATTAAATGTTAGCTTTG
ATAATTTATAATCGAGAT

QA 2 319 2 319
DS 



CO CL454Contig2 818 3 5 U
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TTGGTGACCATAGACCCAGAGTATGCTTTTGGTTCAACTGAGTCAAAGCAGGAATTAGCT
GTGGTGCCGCCAAACTCAACCGTCTATTATGAGGTTGACCTTGTGTCTTTCGACAAGGAA
AGGGAATCGTGGGACATGAACACTGAGGAGAAGATTGAAGCTGCCGGTAAGAAGAAGGAA
GAAGGAAATGCCAAGTTCAAAGCAGGCAAATATGCACTCGCTTCCAAGAGATACGAGAAG
GCTGTCAAATTCATTGAATACGACTCATCCTTCAGTGAGGAGGAGAAGAAGCAAGCAAAA
GCATTGAAAGTGGCGTGCAACCTGAACGACGCAGCATGCAAACTGAAGCTGAAAGAATAC
AGGCAGGCTGAAAAGCTATGCACAAAGGTGCTAGAGCTGGAAAGCACCAATGTGAAAGCT
CTTTACAGGAGAGCGCAGGCCTACATGGAGTTGGCTGATTTGGACTTGGCCGAGTTTGAT
GTCAAGAAGGCCCTTGAAATTGATCCCGATAACAGGGAAGTGAAGGTGGAGCAGAGAAGG
TTGAAGGAGAAAATGAAGGAGTTCAACAAAAAGGAGGCCAAGTTTTACGGAAACATGTTT
GCAAAACTATTTAAGTGAAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCGTCATGGGGAATAGCTTTGGA
TGTTTTTCTCGTTTATGTATCTTTGCTTAATTTCCATTTAAGTTGTGTTTTTAGATGAGA
CCTTCAAGACATTGTTGTTCTTTATTAAATGTTAGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 10 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FT81TF U 1
AF RS1E705TF U 351
AF RS1FT81JQ C 21
BS 1 598 RS1FT81TF
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BS 600 603 RS1FT81TF
BS 604 620 RS1E705TF
BS 621 818 RS1FT81JQ

RD RS1FT81TF 603 0 0
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TTGGTGACCATAGACCCAGAGTATGCTTTTGGTTCAACTGAGTCAAAGCAGGAATTAGCT
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GCTGTCAAATTCATTGAATACGACTCATCCTTCAGTGAGGAGGAGAAGAAGCAAGCAAAA
GCATTGAAAGTGGCGTGCAACCTGAACGACGCAGCATGCAAACTGAAGCTGAAAGAATAC
AGGCAGGCTGAAAAGCTATGCACAAAGGTGCTAGAGCTGGAAAGCACCAATGTGAAAGCT
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GTCAAGAAGGCCCTTGAAATTGATCCCGATAACAGGGAAGTGAAGGTGGAGCAGAGAAAG
TTG

QA 1 603 1 603
DS 

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AGG
AGCAAAAGCATTGAAAGTGGCGTGCAACCTGAACGACGCAGCATGCAAACTGAAGCTGAA
AGAATACAGGCAGGCTGAAAAGCTATGCACAAAGGTGCTAGAGCTGGAAAGCACCAATGT
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GTTCGATGTCAAGAAGGCCCTTGAAATTGATCCCGATAACAGGGAAGTGAAGGTGGAGCA
GAGAAGGT*GAAGGAGAAAATGAAGGA
GTCAACAAAAA

QA 4 270 4 270
DS 

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GTATGCTTTTGGTTCAACTGAGTCAAAGCAGGAATTAGCTGTGGTGCCGCCAAACTCAAC
CGTCTATTATGAGGTTGACCTTGTGTCTTTCGACAAGGAAAGGGAATCGTGGGACATGAA
CACTGAGGAGAAGATTGAAGCTGCCGGTAAGAAGAAGGAAGAAGGAAATGCCAAGTTCAA
AGCAGGCAAATATGCACTCGCTTCCAAGAGATACGAGAAGGCTGTCAAATTCATTGAATA
CGACTCATCCTTCAGTGAGGAGGAGAAGAAGCAAGCAAAAGCATTGAAAGTGGCGTGCAA
CCTGAACGACGCAGCATGCAAACTGAAGCTGAAAGAATACAGGCAGGCTGAAAAGCTATG
CACAAAGGTGCTAGAGCTGGAAAGCACCAATGTGAAAGCTCTTTACAGGAGAGCGCAGGC
CTACATGGAGTTGGCTGATTTGGACTTGGCCGAGTTTGATGTCAAGAAGGCCCTTGAAAT
TGATCCCGATAACAGGGAAGTGAAGGTGGAGCAGAGAAGGTTGAAGGAGAAAATGAAGGA
GTTCAACAAAAAGGAGGCCAAGTTTTACGGAAACATGTTTGCAAAACTATTTAAGTGAAG
CAGCAGCAGCAGCAGCAGCGTCATGGGGAATAGCTTTGGATGTTTTTCTCGTTTATGTAT
CTTTGCTTAATTTCCATTTAAGTTGTGTTTTTAGATGAGACCTTCAAGACATTGTTGTTC
TTTATTAAATGTTAGCTT

QA 1 798 1 798
DS 



AS 2 7

CO CL455Contig1 950 5 2 U
AATACGAAGCGAGGTTACCTTGTATGTAAATTAATTTTGGGATAAAATGTAAAAGGATAA
AAATATAAGAGTGGTAAAATGATTTTCAACAAACACAGCAAGGTAGAGTAAACCATGATC
GCAACAAATCAATGGCATCACCTGAGTAAATGCTCTCTGTTTTTTTTTCCTCACAACTCA
AAGACTCAATCCTCTGAAACATTTCAATGGGACGAAAGAGTCTTTAAGAACCAAATCAGA
GTTTTACATGAAATCGTCTTCGAGTTCTTGAAGCGATTTGTTGCTCGAAGCAATGTCTTT
GTTGGATGTCATTTTATCAGTTACCATCAGTCCCTTGTAGCTCCTCATCTCTGCTTGCCG
CTCCTTCTCCAGCCTCTCTATCTCTTCACGCTTCTTCTTCTCCCTGAGATGCTGCTTCCT
CTCAGCTCTTTCTGCAGCGTTCACTGCTTCTCTCTCGGCTCTCAGATCAGGGGTTCTCTC
AACCTTTGTTTTGTTCAACCTGTTAACAATATCATTGACTCGTTTCTCCACTCTGATAGT
CCGGACCATCTTCGAATTGTGGAAACCAACTTGACCAACATCCATGGAGGCGGTTTTCTT
CAAGTTGGACCACGGAGTGTACACAACATCAACGTTGTTCACCTTGTTGCCTTGAATGGA
GTTAGCTTTCACAAGCTGAGCACAGTCCTCCAGCACACCTTCGTTAATGTTATCAAAACC
TTGGCCTTTGTGAAGCCTTAAGTAAACATGAGCTGAAGACATTTTGTCAACGTGAAACCA
GACGTCTCGAACTTGTCAAGCCCCATGAAGATGGTGTAGTCTCCAGCATCTGGTCGTGCC
TTGAAGTAGAACACCATCGCCTTCGATTCAGAGAGAGACGGAGCACACGGAATCTAGGGT
TTTCCCCTCTCTCTCCCCTCCTCTCTTCCCTGACAAGTTGCAAACAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 0 
0 0 0 0 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F367JQ U 44
AF RS1B779JQ U 169
AF RS1FD87JQ U 26
AF RS1AV14JQ U 1
AF RS1B779TF C 169
BS 1 786 RS1AV14JQ
BS 787 950 RS1B779TF

RD RS1F367JQ 379 0 0
AAAATGTAAAAGGATAAAAATATAAGAGTGGTAAAATGATTTTCAACAAACACAGCAAGG
TAGAGTAAACCATGATCGCAACAA*TCAATGGCATCACCTGAGTAAATGCTCTCTGTTTT
TTTT*CCTCACAACTCAAAGACTCAATCCTCTGAAACATTTCAATGGGACGAAAGAGTCT
TTAAAAACCAAATCAGAGTTTTACATGAAATCGCCTTCGAGTTCTTGAAGCGATTTGTTG
CTCGAAGCAATGTCTTTGTTGGATGTCATTTTATCAGTTACCATCAGTCCCTTGTAGCTC
CTCATCTGTGCTTGCCGCTCCTTCTCCAGCCTCTCTATCTCTTCACGCTTCTTCTTCTCC
CTGAGATGCTGCTTCCTCT

QA 1 379 1 379
DS 

RD RS1B779JQ 545 0 0
CCTCACAACTCAAAGACTCAATCCTCTGAAACATTTCAATGGGACGAAAGAGTCTTTAAA
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AGCAATGTCTTTGTTGGATGTCATTTTATCAGTTACCATCAGTCCCTTGTAGCTCCTCAT
CTCTGCTTGCCGCTCCTTCTCCAGCCTCTCTATCTCTTCACGCTTCTTCTTCTCCCTGAG
ATGCTGCTTCCTCTCAGCTCTTTCTGCAGCGTTCACTGCTTCTCTCTCGGCTCTCAGATC
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CACTCTGATAGTCCGGACCATCTTCGAATTGTGGAAACCAACTTGACCAACATCCATGGA
GGCGGTTTTCTTCAAGTTGGACCACGGAGTGTACACAACATCAACGTTGTTCACCTTGTT
GCCTTGAATGGAGTTAGCTTTCACAAGCTGAGCACAGTCCTCCAGCACACCTTCGTTAAT
GTTAT

QA 1 545 1 545
DS 

RD RS1FD87JQ 676 0 0
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GTAAATGCTCTCTGTTTTTTTTTCCTCACAACTCAAAGACTCAATCCTCTGAAACATTTC
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TCTTGAAGCGATTTGTTGCTCGAAGCAATGTCTTTGTTGGATGTCATTTTATCAGTTACC
ATCAGTCCCTTGTAGCTCCTCATCTCTGCTTGCCGCTCCTTCTCCAGCCTCTCTATCTCT
TCACGCTTCTTCTTCTCCCTGAAATGCTGCTTCCTCTCAGCTCTTTCTGCAGCGTTCACT
GCTTCTCTCTCGGCTCTCAAATCAGGGGTTCTCTCAACCTTTGTTTTGTTCAACCTGTTA
ACAATATCATTGACTCGTTTCTCCACTCTGATAGTCCGGACCATCTTCGAATTGTGGAAA
CCAACTTGACCAACATCCATGGAGGCGGTTTT*TTCAAGTTGGACCACGGAGTGTACACA
ACATCAACGTTGTTCACCTTGTTGCCTTGAATGGGGTTAGCTTTCACAAGCTGAGCACAG
TCCTCCAGCACACCTT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1AV14JQ 786 0 0
AATACGAAGCGAGGTTACCTTGTATGTAAATTAATTTTGGGATAAAATGTAAAAGGATAA
AAATATAAGAGTGGTAAAATGATTTTCAACAAACACAGCAAGGTAGAGTAAACCATGATC
GCAACAAATCAATGGCATCACCTGAGTAAATGCTCTCTGTTTTTTTTTCCTCACAACTCA
AAGACTCAATCCTCTGAAACATTTCAATGGGACGAAAGAGTCTTTAAGAACCAAATCAGA
GTTTTACATGAAATCGTCTTCGAGTTCTTGAAGCGATTTGTTGCTCGAAGCAATGTCTTT
GTTGGATGTCATTTTATCAGTTACCATCAGTCCCTTGTAGCTCCTCATCTCTGCTTGCCG
CTCCTTCTCCAGCCTCTCTATCTCTTCACGCTTCTTCTTCTCCCTGAGATGCTGCTTCCT
CTCAGCTCTTTCTGCAGCGTTCACTGCTTCTCTCTCGGCTCTCAGATCAGGGGTTCTCTC
AACCTTTGTTTTGTTCAACCTGTTAACAATATCATTGACTCGTTTCTCCACTCTGATAGT
CCGGACCATCTTCGAATTGTGGAAACCAACTTGACCAACATCCATGGAGGCGGTTTTCTT
CAAGTTGGACCACGGAGTGTACACAACATCAACGTTGTTCACCTTGTTGCCTTGAATGGA
GTTAGCTTTCACAAGCTGAGCACAGTCCTCCAGCACACCTTCGTTAATGTTATCAAAACC
TTGGCCTTTGTGAAGCCTTAAGTAAACATGAGCTGAAGACATTTTGTCAACGTGAAACCA
GACGTC

QA 1 786 1 786
DS 

RD RS1B779TF 782 0 0
CCTCACAACTCAAAGACTCA*TCCTCTGAAACATT*CAATGG*ACGAAAGAGTCTTTAAG
AACCAAATCAGAGTTT*ACATGAAATCGTCTTCGAGT*CTTGAAGCGATTTGTTGCTCGA
AGCAATGTCTTTGTTGGATGTCATTTTATCAGTTACCATCAGTCCCTTGTAGCTCCTCAT
CTCTGCTTGCCGCTCCTTCTCCAGCCTCTCTATCTCTTCACGCTTCTTCTTCTCCCTGAG
ATGCTGCTTCCTCTCAGCTCTTTCTGCAGCGTTCACTGCTTCTCTCTCGGCTCTCAGATC
AGGGGTTCTCTCAACCTTTGTTTTGTTCAACCTGTTAACAATATCATTGACTCGTTTCTC
CACTCTGATAGTCCGGACCATCTTCGAATTGTGGAAACCAACTTGACCAACATCCATGGA
GGCGGTTTTCTTCAAGTTGGACCACGGAGTGTACACAACATCAACGTTGTTCACCTTGTT
GCCTTGAATGGAGTTAGCTTTCACAAGCTGAGCACAGTCCTCCAGCACACCTTCGTTAAT
GTTATCAAAACCTTGGCCTTTGTGAAGCCTTAAGTAAACATGAGCTGAAGACATTTTGTC
AACGTGAGCTCCTCGTTCTCGAACTTGTCAAGCCCCATGAAGATGGTGTAGTCTCCAGCA
TCTGGTCGTGCCTTGAAGTAGAACACCATCGCCTTCGATTCAGAGAGAGACGGAGCACAC
GGAATCTAGGGTTTTCCCCTCTCTCTCCCCTCCTCTCTTCCCTGACAAGTTGCAAACAAT
CC

QA 1 782 1 782
DS 



CO CL455Contig2 614 2 4 U
GGATTGTTTGCAACTTGTCAGGGAAGAGAGGAGGGGAGAGAGAGGGGGAAACCCTAGATT
CCGTGTGCTCCGTCTCTCTCTGAATCGAAGGCGATGGTGTTCTACTTCAAGGCACGACCA
GATGCTGGAGACTACACCATCTTCATGGGGCTTGACAAGTTCGAGAACGAGGAGCTCATC
AAGTACGGCTTCCCCGAAGACGTCTGGTTTCACGTTGACAAAATGTCTTCAGCTCATGTT
TACTTAAGGCTTCACAAAGGCCAAGGTTTTGATAACATTAACGAAGGTGTGCTGGAGGAC
TGTGCTCAGCTTGTGAAAGCTAACTCCATTCAAGGCAACAAGGTGAACAACGTTGATGTT
GTGTACACTCCGTGGTCCAACTTGAAGAAAACCGCCTCCATGGATGTTGGTCAAGTTGGT
TTCCACAATTCGAAGATGGTCCGGACTATCAGAGTGGAGAAACGAGTCAATGATATTGTT
AACAGGTTGAACAAAACAAGGTTGAGAGAACCCCTGATCTGAGAGCCGAGAGAGAAGCAG
TGAACGCTGCAGAAAGAGCTGAGAGGAAGCAGCATCTCAGGGAGAAGAAGAAGCGTGAAG
AGATAGAGAGGCTG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F367TF U 1
AF RS1AV14TF U 4
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BS 356 357 RS1AV14TF
BS 358 448 RS1F367TF
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RD RS1F367TF 448 0 0
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TTCCACAATTCGAAGATGGTCCGGACTA

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DS 

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GG
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TGGAGACTACACCATCTTCATGGGGCTTGACAAGTTCGAGAACGAGGAGCTCATCAAGTA
CGGCTTCCCCGAAGACGTCTGGTTTCACGTTGACAAAATGTCTTCAGCTCATGTTTACTT
AAGGCTTCACAAAGGCCAAGGTTTTGATAACATTAACGAAGGTGTGCTGGAGGACTGTGC
TCAGCTTGTGAAAGCTAACTCCATTCAAGGCAACAAGGTGAACAACGTTGATGTTGTGTA
CACTCCGTGGTCCAACTTGAAGAAAACCGCCTCCATGGATGTTGGTCAAGTTGGTTTCCA
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GAGAGGCTG

QA 3 611 3 611
DS 



AS 1 7

CO CL456Contig1 865 7 28 U
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TTGAAATACATTTGTCTTTTGTAATCCTAAAAACATGGCAATTCTCAGGAACAAAAACAT
AACTTTCTCATTGATCTTGATGTGTCTCATTGTGGTGTCTCCAATTGCTAATGCTCAGCT
TGGTGGTCTTGGTGGTCTTGGCGGGCTTCTTGGCGGGCTTCTTGGCAGTATTACTAGTAT
CTTTAATATACAAGGTCTTCTTAGGTGCTCTGTCACTGGCACCGTCTCTACCAATAACGT
CACTTCCATTCCTCCTCCTTTCCCTAATGCGGGAATTGTGCTCCAGTGCGCTGGGCAAAA
TGTTTCAAGTACGACTACGAACGCTAATGGAGTATTCTCGCTTCCTACTATGGGCACTAT
CTTTTCTCCTTCAACACTCCTCAACTCCGGTTGTAGGATCATCGTCACGACCCCTCTCAC
CAGCTGCAACGCCAGCCTTCCTGCCGGTGGATTACTCACGGCACCTTTAGCTCTACTCGG
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TTCCCTTCTGTTTGTTTTACGTTTTGTGTCATGACCAATAATGTTTGCTTGCCTATGCGC
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GTAACTTCCTTTTACCCACGTTTAATTTGCATTTGTAATGCTGTAACGAAATGTGATAAA
ATAATATGAAAAAAACTTCCTTGCC


BQ
20 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

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AF RS1BX22TF U 1
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CTTTTCTCCTTCAACACTCCTCAACTCCGGTT

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DS 

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TTGAAATACATTTGTCTTTTGTAATCCTAAAAACATGGCAATCCTCAGGAACAAAAACAT
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TGGTGGTCTTGGTGGTCTTGGCGGGCTTCTTGGCGGGCTTCTTGGCAGTATTACTAGTAT
CTTTAATATCCAAGGTCTTCTTAGGTGCTCTGTCACTGGCACCGTCTCTACCAATAACGT
CACTTCCGTTCCTCCTCCTTTCCCTAATGCGGGAATTGTGCTCCAGTGCGCTGGGCAAAA
TGTTTCAAGTACGACTACGAACGCTAATGGAGTATTCTCGCTTCCTACTATGGGCACTAT
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CCCAA

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DS 

RD RS1G973TF 661 0 0
GGATC
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CTTTCTCATTGATCTTGATGTGTCTCATTGTGGTGTCTCCAATTGCTAATGCTCAGCTTG
GTGGTCTTGGTGGTCTTGGCGGGCTTCTTGGCGGGCTTCTTGGCAGTATTACTAGTATCT
TTAATATACAAGGTCTTCTTAGGTGCTCTGTCACTGGCACCGTCTCTACCAATAACGTCA
CTTCCATTCCTCCTCCTTTCCCTAATGCGGGAATTGTGCTCCAGTGCGCTGGGCAAAATG
TTTCAAGTACGACTACGAACGCTAATGGAGTATTCTCGCTTCCTACTATGGGCACTATCT
TTTCTCCTTCAACACTCCTCAACTCCGGTTGTAGGATCATCGTCACGACCCCTCTCACCA
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CCACTTCCAGCAACGGTCTCAGCATCCTCGACCTCGTCCCAGGTCTCTTTAGCATCGTCC
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QA 6 661 6 661
DS 

RD RS1BX22TF 723 0 0
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AACTTTCTCATTGATCTTGATGTGTCTCATTGTGGTGTCTCCAATTGCTAATGCTCAGCT
TGGTGGTCTTGGTGGTCTTGGCGGGCTTCTTGGCGGGCTTCTTGGCAGTATTACTAGTAT
CTTTAATATACAAGGTCTTCTTAGGTGCTCTGTCACTGGCACCGTCTCTACCAATAACGT
CACTTCCATTCCTCCTCCTTTCCCTAATGCGGGAATTGTGCTCCAGTGCGCTGGGCAAAA
TGTTTCAAGTACGACTACGAACGCTAATGGAGTATTCTCGCTTCCTACTATGGGCACTAT
CTTTTCTCCTTCAACACTCCTCAACTCCGGTTGTAGGATCATCGTCACGACCCCTCTCAC
CAGCTGCAACGCCAGCCTTCCTGCCGGTGGATTACTCACGGCACCTTTAGCTCTACTCGG
AGCCACTTCCAGCAACGGTCTCAGCATCCTCGACCTCGTCCCAGGTCTCTTTAGCATCGT
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TTCCCTTCTGTTTGTTTTACGTTTTGCGTCATGACCAATAATGTTTGCTTGCCTATGCGC
ATG

QA 1 723 1 723
DS 

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GT
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TGAAATACATTTGTCTTTTGTAATCCTAAAAACATGGCAATCCTCAGGAACAAAAACATA
ACTTTCTCATTGATCTTGATGTGTCTCATTGTGGTGTCTCCAATTGCTAATGCTCAGCTT
GGTGGTCTTGGTGGTCTTGGCGGGCTTCTTGGCGGACTTCTTGGCAGTATTACTAGTATC
TTTAATATCCAAGGTCTTCTTAGGTGCTCTGTCACTGGCACCGTCTCTACCAATAACGTC
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GTTTCAAGTACGACTACGAACGCTAATGGAGTATTCTCGCTTCCTACTATGGGCACTATC
TTTTCTCCTTCAACACTCCTCAACTCCGGTTGTAGGATCATCGTCACGACCCCTCTCACC
AGCTGCAACGCCAGCCTTCCTGCCGGTGGATTACTCACGGCACCTTTAGCTCTACTCGGA
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TCCCTTCTGTTTGTTTTACGTTTTGTGTCATGACCAATAATGTTTGCTTGCCTATGCGCA
TGA*TAAG*TCTACATAATAATTAAG*CGTATGTCTTTATCTTTCAA*GTATTGTTGTTG
TA*CTTCCTTT*ACCCACGTTTA*TTTGCATTTGTA

QA 3 818 3 818
DS 

RD RS1G973JQ 763 0 0
TCTCAGGAACAAAAACATAACTTTCTCATTGATCTTGATGTGTCTCATTGTGGTGTCTCC
AATTGCTAATGCTCAGCTTGGTGGTCTTGGTGGTCTTGGCGGGCTTCTTGGCGGGCTTCT
TGGCAGTATTACTAGTATCTTTAATATACAAGGTCTTCTTAGGTGCTCTGTCACTGGCAC
CGTCTCTACCAATAACGTCACTTCCATTCCTCCTCCTTTCCCTAATGCGGGAATTGTGCT
CCAGTGCGCTGGGCAAAATGTTTCAAGTACGACTACGAACGCTAATGGAGTATTCTCGCT
TCCTACTATGGGCACTATCTTTTCTCCTTCAACACTCCTCAACTCCGGTTGTAGGATCAT
CGTCACGACCCCTCTCACCAGCTGCAACGCCAGCCTTCCTGCCGGTGGATTACTCACGGC
ACCTTTAGCTCTACTCGGAGCCACTTCCAGCAACGGTCTCAGCATCCTCGACCTCGTCCC
AGGTCTCTTTAGCATCGTCCCAAATCCCTTTGGCCTCCTCGGTTAAGTATGCTTTATGTT
TGATCACGTACGGTGTGTTTCCCTTCTGTTTGTTTTACGTTTTGTGTCATGACCAATAAT
GTTTGCTTGCCTATGCGCATGAATAAGGTCTACATAATAATTAAGGCGTATGTCTTTATC
CTTCAAAGTATTGTTGTTGTAACTTCCTTTTACCCACGTTTAATTTGCATTTGTAATGCT
GTAACGAAATGTGATAAAATAATATGAAAAAAACTTCCTTGC
G

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1FU03JQ 495 0 0
ACGACTACGAACGCTAATGGAGTATTCTCGCTTCCTACTATGGGCACTATCTTTTCTCCT
TCAACACTCCTCAACTCCGGTTGTAGGATCATCGTCACGACCCCTCTCACCAGCTGCAAC
GCCAGCCTTCCTGCCGGTGGATTACTCACGGCACCTTTAGCTTTACTCGGAGCCACTTCC
AGCAACGGTCTCAGCATCCTCGACCTCGTCCCAGGTCTCTTTAGCGTCGTCCCAAATCCC
TTTGGCCTCGTCGGCTAAGTATGCTTTATGTTTGATCACGTACGGTGTGTTTCCCTTCTG
TTTGTTTTACGTTTTGTGTCATGACCAATAATGTTTGCTTGCCTATGCGCATGAATAAGG
TCTACATAATAATTAAGGCGTATGTCTTTATCTTTCAAAGTATTGTTGTTGTAACTTCCT
TTTACCCACGTTTAATTTGCATTTGTAATGCTGTAACGACATGTGATAAAATAATATGAA
AAAA*CTTCCTTGCC

QA 1 495 1 495
DS 



AS 1 7

CO CL457Contig1 943 7 14 U
AACGCGATACAAACTTACCTTAATTATTACATTTGATATTTTGTAAGAAATCAGTGGTTT
TCTAATAAACACTGTTAAGCAAAACGACAGTATCGATATAAATACACTGAAGGCAGCCAT
AAAAATGTGTTGGTACGAAAATGTTGATACGCAAAGAGAAAAACCACCACCAAAGGACAA
GTGAGCTTAATTACAGACCAGATATTACATACAAAGTACAAGTGAACTGAAGAGAAAACA
ATTTTGGACTCGAAGAAGAGGGCATTGCTAGGCAATCAAGTTGAGCAACAGCCATTCTTT
TGGACAACAGGCTGTCCTCTGATCTGCACCGTCGGCAGTCTGGCATTGTTCCCAGCTGGT
TGGCTTGCCATACTCTCTTTGATGGATGCGGACATCGCCATGAAAGCCTGTTCCACGTTT
GTAGCATCTTTTGCACTAGTCTCCATGAAAGGAATTCCAATTTCATCGGCAAAAGCCTTT
GCCGTTTCATATGGAACGGCTCTGTTTTCAGTAAGATCACACTTGTTTCCAACCAGGAGT
TTGTTCACATTGTCACTGGCATAACGATCAATTTCACTCAACCATTGCTTCACGTTGTTA
AAGCTTTCTTGATCTGTGACGTCGTAGACAATAATGATTCCATGTGCGCCGCGGTAATAA
CTGCTAGTAATTGTCCTGAACCGCTCTTGACCAGCAGTGTCCCAAATTTGGAGCTTAATC
GTCTTCCCGTCTTGCTCCACTGTCCGAATTTTAAAATCGACTCCAATAGTGCTTATGTAA
CTTTCTACATACGAATCATCAGAGAATCTCAGCAGTAGACAAGACTTCCCCACGCCAGAA
TCCCCGATGAGCAGGAGCTTGAAGAGGTAGTCGTACTCGGGATTCATGGTTGTTTCGACT
TTCGATGAATGCGTACAAGAGGAAAATCTGAGGGTGGGAGCCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 20 35 35 10 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E608JQ U 1
AF RS1FQ76JQ U 1
AF RS1EY24JQ U 77
AF RS1E778JQ U 254
AF RS1FQ76TF C 173
AF RS1E608TF C 265
AF RS1E778TF C 270
BS 1 102 RS1E608JQ
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BS 104 150 RS1E608JQ
BS 151 151 RS1FQ76JQ
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BS 851 935 RS1FQ76TF
BS 936 943 RS1E608TF

RD RS1E608JQ 524 0 0
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TCTAATAAACACTGTTAAGCAAAACGACAGTATCGATATAAAAACACTGAAGGCAGCCAT
AAAAATGTGTTGGTACGAAAATGTTGATACCCAAAGAGAAAAACCACCACCAAAGGACAA
GTGAGCTTAATTACAGACCAGATATTACATACAAAGTACAAGTGAACTGAAGAGAAAACA
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TGGACAACAGGCTGTCCTCTGATCTGCACCGTCGGCAGTCTGGCATTGTTCCCAGCTGGT
TGGCTTGCCATACTCTCTTTGATGGATGCGGACATCGCCATGAAAGCCTGTTCCACGTTT
GTAGCATCTTTTGCACTAGTCTCCATGAAAGGAATTCCAATTTCATCGGCAAAAGCCTTT
GCCGTTTCATATGGAACGGCTCTGTTTTCAGTAAGATCACACTT

QA 1 524 1 524
DS 

RD RS1FQ76JQ 750 0 0
G
ACGCGATACAAACTTACCTTAATTATTACATTTGATATTTTGTAAGAAATCAGTGGTTTT
CTAATAAACACTGTTAAGCAAAACGACAGTATCGATATAAATACACTGAAGGCAGCCATA
AAAATGTGTTGGTACGAAAATGTTGATACGCAAAGAGAAAAACCACCACCAAAGGACAAG
TGAGCTTAATTACAGACCAGATATTACATACAAAGTACAAGTGAACTGAAGAGAAAACAA
TTTTGGACTCGAAGAAGAGGGCATTGCTAGGCAATCAAGTTGAGCAACAGCCATTCTTTT
GGACAACAGGCTGTCCTCTGATCTGCACCGTCGGCAGTCTGGCATTGTTCCCAGCTGGTT
GGCTTGCCATACTCTCTTTGATGGATGCGGACATCGCCATGAAAGCCTGTTCCACGTTTG
TAGCATCTTTTGCACTAGTCTCCATGAAAGGAATTCCAATTTCATCGGCAAAAGCCTTTG
CCGTTTCATATGGAACGGCTCTGTTTTCAGTAAGATCACACTTGTTTCCAACCAGGAGTT
TGTTCACATTGTCACTGGCATAACGATCAATTTCACTCAACCATTGCTTCACGTTGTTAA
AGCTTTCTTGATCTGTGACGTCGTAGACAATAATGATTCCATGTGCGCCGCGGTAATAAC
TGCTAGTAATTGTCCTGAACCGCTCTTGACCAGCAGTGTCCCAAATTTGGAGCTTAATCG
TCTTCCCGTCTTGCTCCACTGTCCGAATT

QA 2 750 2 750
DS 

RD RS1EY24JQ 676 0 0
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GAAAATGTTGATACGCAAAGAGAAAAACCACCACCAAAGGACAAGTGAGCTTAATTACAG
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AGAGGGCATTGCTAGGCAATCAAGTTGAGCAACAGCCATTCTTTTGGACAACAGGCTGTC
CTCCGATCTGCACCGTCGGCAGTCTGGCATTGTTCCCAGCTGGTTGGCTTGCCATACTCT
CTTTGATGGATGCGGACATCGCCATGAAAGCCTGTTCCACGTTTGTAGCATCTTTTGCAC
TAGTCTCCATGAAAGGAATTCCAATTTCATCGGCAAAAGCCTTTGCCGTTTCATATGGAA
CGGCTCTGTTTTCAGTAAGATCACACTTGTTTCCAACCAGGAGTTTGTTCACATTGTCAC
TGGCATAACGATCAATTTCACTCAACCATTGCTTCACGTTGTTAAAGCTTTCTTGATCTG
TGACGTCGTAGACAATAATGATTCCATGTGCGCCGCGGTAATAACTGCTAGTAATTGTCC
TGAACCGCTCTTGACCAGCAGTGTCCCAAATTTGGAGCTTAATCGTCTTCCCGTCTTGCT
CCACTGTCCGAATTTT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1E778JQ 597 0 0
AGAAAAGGGCATTGCTAGGCAATCAAGTTGAGCAACAGCCATTCTTTTGGACAACAGGCT
GTCCTCTGATCTGCACCGTCGGCAGTCTGGCATTGTTCCCAGCTGGTTGGCTTGCCATAC
TCTCTTTGATGGATGCGGACATCGCCATGAAAGCCTGTTCCACGTTTGTAGCATCTTTTG
CACTAGTCTCCATGAAAGGAATTCCAATTTCATCGGCAAAAGCCTTTGCCGTTTCATATG
GAACGGCTCTGTTTTCAGTAAGATCACACTTGTTTCCAACCAGGAGTTTGTTCACATTGT
CACTGGCATAACGATCAATTTCACTCAACCATTGCTTCACGTTGTTAAAGCTTTCTTGAT
CTGTGACGTCGTAAACAATAATGATTCCATGTGCGCCGCGGTAATAACTGCTAGTAATTG
TCCTGAACCGCTCTTGACCAGCAGTGTCCCAAATTTGGAGCTTAATCGTATTCCCGTCTT
GCTCCACTGTCCGAATTTTAAAATCGACTCCAATAGTGCTTATGTAACTTTCTACATACG
AATCATCAGAGAATCTCAGCAGTAGACAAGACTTCCCCACGCCAGAATCCCCGATGA

QA 1 597 1 597
DS 

RD RS1FQ76TF 765 0 0
AAGGACAAGTGAGCTTAATTACAGACCAGATATTACATACAAAGTACAAGTGAACTGAAG
AGAAAACAATTTTGGACTCGAAGAAGAGGGCATTGCTAGGCAATCAAGTTGAGCAACAGC
CATTCTTTTGGACAACAGGCTGTCCTCTGATCTGCACCGTCGGCAGTCTGGCATTGTTCC
CAGCTGGTTGGCTTGCCATACTCTCTTTGATGGATGCGGACATCGCCATGAAAGCCTGTT
CCACGTTTGTAGCATCTTTTGCACTAGTCTCCATGAAAGGAATTCCAATTTCATCGGCAA
AAGCCTTTGCCGTTTCATATGGAACGGCTCTGTTTTCAGTAAGATCACACTTGTTTCCAA
CCAGGAGTTTGTTCACATTGTCACTGGCATAACGATCAATTTCACTCAACCATTGCTTCA
CGTTGTTAAAGCTTTCTTGATCTGTGACGTCGTAGACAATAATGATTCCATGTGCGCCGC
GGTAATAACTGCTAGTAATTGTCCTGAACCGCTCTTGACCAGCAGTGTCCCAAATTTGGA
GCTTAATCGTCTTCCCGTCTTGCTCCACTGTCCGAATTTTAAAATCGACTCCAATAGTGC
TTATGTAACTTTCTACATACGAATCATCAGAGAATCTCAGCAGTAGACAAGACTTCCCCA
CGCCAGAATCCCCTATGAGCAGGAGCTTGAAGAGGTAGTCGTACTCGGGATTCATGGTTG
TTTCGACTTTCGATGAATGCGTACAAGAGGAAAATCTGAGGGT
CC

QA 1 763 1 763
DS 

RD RS1E608TF 679 0 0
TTGCTAGGCAATCAAGTTGAGCAACAGCCATTCTTTTGGACAACAGGCTGTCCTCTGATC
TGCAC*GTCGGCAGTCTGGCATTGTTCCCAGCTGGTTGGCTTGCCATACTCTCTTTGATG
GATGCGGACATCGCCATGAAAGCCTGTTCCACGTTTGTAGCATCTTTTGCACTAGTCTCC
ATGAAAGGAATTCCAATTTCATCGGCAAAAGCCTTTGCCGTTTCATATGGAACGGCTCTG
TTTTCAGTAAGATCACACTTGTTTCCAACCAGGAGTTTGTTCACATTGTCACTGGCATAA
CGATCAATTTCACTCAACCATTGCTTCACGTTGTTAAAGCTTTCTTGATCTGTGACGTCG
TAGACAATAATGATTCCATGTGCGCCGCGGTAATAACTGCTAGTAATTGTCATGAACCGC
TCTTGACCAGCAGTGTCCCAAATTTGGAGCTTAATCGTCTTCCCGTCTTGCTCCACTGTC
CGAATTTTAAAATCGACTCCAATAGTGCTTATGTAACTTTCTACATACGAATCATCAGAG
AATCTCAGCAGTAGACAAGACTCCCCCACGCCAGAATCCCCGATGAGCAGGAGCTTGAAG
AGGTAGTCGTACTCGGGATTCATGGTTGTTTCGACTTTCGATGAATGCGTACAAGAGGAA
AATCTGAGGGTGGGAGCCC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1E778TF 649 0 0
AGGCAATCAAGTTGAGCAACAGCCATTCTTT*GGACAACAGGCTGTCCTCTGATCTGCAC
*GTCGGCAGTCTGGCATTGTTCCCAGCTGGTTGGCTTGCCATACTCTCTTTGATGGATGC
GGACATCGCCATGAAAGCCTGTTCCACGTTTGTAGCATCTTTTGCACTAGTCTCCATGAA
AGGAATTCCAATTTCATCGGCAAAAGCCTTTGCCGTTTCATATGGAACGGCTCTGTTTTC
AGTAAGATCACACTTGTTTCCAACCAGGAGTTTGTTCACATTGTCACTGGCATAACGATC
AATTTCACTCAACCATTGCTTCACGTTGTTAAAGCTTTCTTGATCTGTGACGTCGTAGAC
AATAATGATTCCATGTGCGCCGCGGTAATAACTGCTAGTAATTGTCCTGAACCGCTCTTG
ACCAGCAGTGTCCCAAATTTGGAGCTTAATCGTATTCCCGTCTTGCTCCACTGTCCGAAT
TTTAAAATCGACTCCAATAGTGCTTATGTAACTTTCTACATACGAATCATCAGAGAATCT
CAGCAGTAGACAAGACTTCCCCACGCCAGAATCCCCGATGAGCAGGAGCTTGAAGAGGTA
GTCGTACTCGGGATTCATGGTTGTTTCGACTTTCGATGAATGCG
TACCC

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 9

CO CL458Contig1 1045 9 4 U
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CCCTAGTTCTAGTCATCGCCACCTCCGTCTCTGCACACCCACCTAAGCCCAAGAAAACAC
AAAAGAACATATGTCCACCTACTTTGGGGGGAGTCCTAACCTTCCCTTCCCTCGAAATCT
CCAAGTTCATCGAGCAAAAGGCTAAATCCGCACCAAACACCGTTCAGTTCAACACTTTGT
TCTCCATATGCCAAACCTTCAGCAACCAGCTCGCAGCCTTCAAGGTCGCAGGGGCCAGGA
ATGTGTTTCGCGTGGTTTACACCAAATACGCCATGATAACCAAGGCCGTGTTTGCGGCTG
AAGCAGCTATTGGTATTCAAGGTGAGCTCGCGGCTAAGCTAGAGAAGAGCTACAACGGTA
TGGCTGGATGTTTTTTTAAGCTTGAGGAGAAAATGGCCGAGATCTCGGCCAAGTACAAGT
ACAATGCTAACGCTAAGATAAGCCAAGGGGACAGGGACAAGATGGACGAATGTTTGATTA
AGTTGAAGGGTGCCATTAATGGTTTCGTCAAGGTGATCACTGAGTGCAGCATGAAGTTCT
CTTCCGTGAAGCAAATCGGTATCCCTGTCAGAGGCGGTTTGATCGGTAGTTTCGCCAAGA
ACGGTGTCGGTTTTGGCTCTGGTTTGATCGGTTTAAGCGGCCACAGCCAAGCTGAAGCCG
AAGCTAAGGTTGGAATTCAAGGTCATCCCGGAGGCAGAAGATTGTTCGGTGGGTTCTTTG
ACTTCGGAGGATTCGTTAAATACGATGCGGCGGGTAAGGGAAAGTTCAGAGGAGATGGTG
AGTTCAAATCACGGGTCCACCCTAGCAAGATACACTTAAACTGAGCAAAGGCGCAATTTA
TGCTTATGAACAACAACATATGAAGGAGAGCCATGAGTTTATCTTTACTACATTTATTTT
GTGTACTACTAATATGAAGGAGGGAAACGCCATGTGATATTTTATCTCTATTTGTAAACC
ATTAATAAAAATATCAGATATTTCT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 40 40 40 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1FX13TF U 1
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AGTTGAA

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AAAAGAACATATGTCCACCTACTTTGGGGGGAGTCCTAACCTTCCCTTCCCTCGAAATCT
CCAAGTTCATCGAGCAAAAGGCTAAATCCGCACCAAACACCGTTCAGTTCAACACTTTGT
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ACGGT

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AAAAGAACATATGTCCACCTACTTTGGGGGGAGTCCTAACCTTCCCTTCCCTCGAAATCT
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GCCGAAGC

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AAAAGAACATATGTCCACCTACTTTGGGGGGAGTCCTAACCTTCCCTTCCCTCGAAATCT
CCAAGTTCATCGAGCAAAAGGCTAAATCCGCACCGAACACCGTTCAGTTCAACACTTTGT
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AAGCAGCTATTGGTATTCAAGGTGAGCTCGCGGCTAAGCTAGAGAAGAGCTACAACGGTA
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ACAATGCTAACGCTAAGATAAGCCAAGGGGACAGGGACAAGATGGACGAATGTTTGATTA
AGTTGAAGGGTGCCATTAATGGTTTCGTCAAGGTGATCACTGAGTGCAGCATGAAGTTCT
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ACGGTGTCG*TTTTGGCTC

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AAAAGAACATATGTCCACCTACTTTGGGGGGAGTCCTAACCTTCCCTTCCCTCGAAATCT
CCAAGTTCATCGAGCAAAAGGCTAAATCCGCACCAAACACCGTTCAGTTCAACACTTTGT
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ACAATGCTAACGCTAAGATAAGCCAAGGGGACAGGGACAAGATGGACGAATGTTTGATTA
AGTTGAAGGGTGCCATTAATGGTTTCGTCAAGGTGATCACTGAGTGCAGCATGAAGTTCT
CTTCCGTGAAGCAAATCGGTATCCCTGTCAGAGGCGGTTTGATCGGTAGTTTCGCCAAGA
ACGGTGTC

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TTT
TTTGACTTCGGAGGATTCGTTAAATACGATGCGGCGGGTAAGGGAAAGTTCAGAGGAGAT
GGTGAGTTCAAATCACGGGTCCACCCTAGCAAGATACACTTAAACTGAGCAAAGGCGCAA
TTTATGTTTATGAACAACAACATATGAAGGAG

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AGGCCGTGTTTGCGGCTGAAGCAGCTATTGGTATTCAAGGTGAGCTCGCGGCTAAGCTAG
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CTTTACTACATTTATTTTGTGTACTACTAATATGAAGGAGGGAAACGCCATGTGATATTT
TATCTCTATTTGTAAACCATTAATAAAAATATCAGATATTTC
G

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TAATGGTTTCGTCAAGGTGATCACTGAGTGCAGCATGAAGTTCT**TCCGTGAAGCAAAT
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T

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TACAACGGTATGGCTGGATGTTTTTTTAAGCTTGAGGAGAAAATGGCCGAGATCTCGGCC
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GGGTTCTTTGACTTCGGAGGATTCGTTAAATACGATGCGGCGGGTAAGGGAAAGTTCAGA
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CATTTATTTTGTGTACTACTAATATGAAGGAGGGAAACGCCATGTGATATTTTATCTCTA
TTTGTAAACCATTAATAAAAATATCAGATATTTCT

QA 1 695 1 695
DS 



AS 2 9

CO CL459Contig1 744 2 6 U
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TTTTGAATAGAAGCCTATATATATGTTCAAAGTTTGGAGAAATCAAAAACAAATAACATT
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1E392JQ U 1
AF RS1AB12JQ U 141
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TTTTGAATAGAAGCCTATATATATGTTCAAAGTTTGGAGAAATCAAAAACAAATAACATT
CTTTGCTCAAATAGAAGATAGATATCCTTTACGGAGAGGTTGCAACAGCAATGAGGTCTC
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GACCATCAACTGGAGCACTTAGAGGATCATCATGAACCTCCATAAAAA

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DS 

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G
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ATATGTCCGAGGAGGAGACCTAGAGATTACTACACCTTCAATCCTAGTCGAGGTAAGGTG
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CTAGGAGTTCTTCTAGATGACGCAAAGGCCATTGGGTTGGACCATCAACTGGAGCACTTA
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TGACAGAAGGAGCACAGAACTGTCCTTTCTTAATATTGATAATTTTTCCAGTTTGGGCTG
CCG

QA 2 604 2 604
DS 



CO CL459Contig2 2180 7 20 U
GGGGACTCGCACTCACTCTGCAACTTCGAGATCAAAGCTAAAACCTTATACAGCTTTTCT
TGCTTTCCCGAGAAGAATGGCGGCAACATCACCACTCTACAATCAGCTTAAGGATGCTGA
ACCATTCTTCTTGTTGGCTGGTCCAAATGTGATCGAATCCGAGGAACATATTCTTCGAAT
GGCAAAACACATCAAACACATTGCCACAAAAGTTGGGTTGCCACTGGTTTTCAAGTCGAG
TTTTGATAAAGCTAACAGAACTTCTTCTAAGTCCTTCCGAGGTCCTGGCATGGCTGAGGG
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CTTATGTCGCCAGACAGATCTTCTGGTTGCGGCAGCCCAAACTGGAAAAATTATCAATAT
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TAGTAATCTCGAGGTCTCCTCCTCGGACATATGGGTCCACGCCAAATCCTGGAGACCTTC
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TTGTTTTTGATTGCTCCAAACTTTGAACATATATATAAGCTTTTATTCAAAATTTCTTCT
GTTTAAGAGTGTTCAAACATATAATAACTATAATGAAGTCTGTTTACATTCGATAGGCAA
AATGTACAAGCTCATGGGTTAAACAGGTTTGCTTCCATAAGTCAACCACATTTACATATG
CCTGCACATTATATGTATATTATCTTCGATGCAACAGTATATACACAGCTGAGACTGAGA
GTGACCTATTCAATGGTTCTACGAACATATAACAAAACGGTCTTGCACAAGGATTTGCTC
TTGTTGCTTGTCTAGTGTCCTCCTCACAGCTTGATAGAACTCAATCCAAGAAGACGAGTA
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CTCGTAGATCTTCCCATTGCGGTCTAGTTTATAGCGAGAAGTGCCCTGAAACTCTCCTTT
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AAACCTGAGTGCCCAGAAGATGAGTTTGTAGTTCTCAATACCAGAGAAAGTGTTCACTGG
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AGGCAAATCTTCGCGAAGGGTACGTATAGCTAGACCGAGATTGATGTAGAACTCATCTTT
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CATAGCTAGCTGAGCTTCTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E392TF U 3
AF RS1AB12TF U 4
AF RS1G441TF U 1
AF RS1A523TF U 7
AF RS1A523JQ C 295
AF RS1H161JQB U 1116
AF RS1H161TF C 1533
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BS 49 65 RS1G441TF
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BS 432 689 RS1G441TF
BS 690 1118 RS1A523JQ
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BS 1130 1873 RS1H161JQB
BS 1874 2180 RS1H161TF

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GGACTC
GCACTCACTCTGCAACTTCGAGATCAAAGCTAAAACCTTATACAGCTTTTCTTGCTTTCC
CGAGAAGAATGGCGGCAACATCACCACTCTACAATCAGCTTAAGGATGCTGAACCATTCT
TCTTGTTGGCTGGTCCAAATGTGATCGAATCCGAGGAGCATATTCTTCGAATGGCGAAGC
ACATCAAACACATTGCCACAAAAGTTGGGTTGCCACTGGTTTTCAAGTCGAGTTTTGATA
AGGCTAACAGAACTTCTTCTAAGTCCTTCCGAGGTCCTGGCATGGCTGAGGGTCTCAAGA
TTCTTGAGAAGGTGAAAGTAGCATATGACTTACCAATTGTAACTGATGTTCATGAGGCGT
ATCAGTGTGAAGAAGTTGGCAAGGTTGCTGATATAATTCAGATACCAGCATTCTTATGTC
GCCAGACAGATCTTCTGGTTGCGGCAGCCCAAACTGGAAAAATTATCAATATTAAGAAAG
GACAGTTCTGTGCTCCTTCTGTCATGGAAAATTCAGCTGAGAAGA

QA 7 531 7 531
DS 

RD RS1AB12TF 527 0 0
GGCTC
GCACTCACTCTGCAACTTCGAGA**AAAGCTAAAACCTTATACAGCTTTTCTTGCTTTCC
CGAGAAGAATGGCTGCAACATCACCACTCTACAATCAGCTTAAGGATGCTGAACCATTCT
TCTTGTTGGCTGGTCCAAATGTGATCGAATCCGAGGAGCATATTCTTCGAATGGCGAAGC
ACATCAAACACATTGCCACAAAAGTTGGGTTGCCACTGGTTTTCAAGTCGAGTTTTGATA
AGGCTAACAGAACTTCTTCTAAGTCCTTCCGAGGTCCTGGCATGGCTGAGGGTCTCAAGA
TTCTTGAGAAGGTGAAAGTAGCATATGACTTACCAATTGTAACTGATGTTCATGAGGCGT
ATCAGTGTGAAGAAGTTGGCAAGGTTGCTGATATAATTCAGATACCAGCATTCTTATGTC
GCCAGACAGATCTTCTGGTTGCGGCAGCCCAAACTGGAAAAATTATCAATATTAAGAAAG
GACAGTTCTGTGCTCCTTCTGTCATGGAAAATTCAGCTGAGA

QA 6 527 6 527
DS 

RD RS1G441TF 696 0 0
GGGGACTCGCACTCACTCTGCAACTTCGAGATCAAAGCTAAAACT***TACAGCTTTTCT
TGCTT*CCCGGGAAGAATGGCTGCAACATCACCACTCTACAATCAGCTTAAGGATGCTGA
ACCATTCTTCTTGTTGGCTGGTCCAAATGTGATCGAATCCGAGGAACATATTCTTCGATT
GGCAAAACACATCAAACACATTGCCACAAAAGTTGGGTTACCACTGGTTTTCAAGTCGAG
TTTTGATAAAGCTAACAGAACTTCTTCTAAGTCCTTCCGAGGTCCTGGCATGGCTGAGGG
TCTCAAGATTCTTGAGAAGGTGAAAGTAGCATATGACTTACCCATTGTAACTGATGTCCA
CGAGGCGTATCAGTGTGAAGAAGTTGGCAAGGTTGCTGATATAATTCAGATACCAGCATT
CTTATGTCGCTAGACAGATCTTCTGGTTGCGGCAGCCCAAACTGGAAAAATTATCAATAT
TAAGAAAGGACAGTTTTGTGCTCCTTCTGTCATGGAAAATTCAGCTGAGAAGATCAGGCT
AGCTGGGAATCCGAATGTGATGGTTTGTGAAAGAGGAACCATGTTTGGATACAATGATTT
GATAGTAGATCCACGAAACTTTGAATGGATGAGGGAAGCTAATTGTCCTGTTGTTGCTGA
TATAACCCATGCACTCCAACAACCTGCAG
CAAAAGT

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1A523TF 679 0 0
GG
GCACTCACTCTGCAACTTCGAGATCAAAGCTAAAACT***TACAGCTTTTCTTGCTT*CC
CGGGAAGAATGGCGGCAACATCACCACTCTACAATCAGCTTAAGGATGCTGAACCATTCT
TCTTGTTGGCTGGTCCAAATGTGATCGAATCCGAGGAACATATTCTTCGATTGGCAAAAC
ACATCAAACACATTGCCACAAAAGTTGGGTTGCCACTGGTTTTCAAGTCGAGTTTTGATA
AAGCTAACAGAACTTCTTCTAAGTCCTTCCGAGGTCCTGGCATGGCTGAGGGTCTCAAGA
TTCTTGAGAAGGTGAAAGTAGCATATGACTTACCCATTGTAACTGATGTCCACGAGGCGT
ATCAGTGTGAAGAAGTTGGCAAGGTTGCTGATATAATTCAGATACCAGCATTCTTATGTC
GCCAGACAGATCTTCTGGTTGCGGCAGCCCAAACTGGAAAAATTATCAATATTAAGAAAG
GACAGTTTTGTGCTCCTTCTGTCATGGAAAATTCAGCTGAGAAGATCAGGCTAGCTGGGA
ATCCGAATGTGATGGTTTGTGAAAGAGGAACCATGTTTGGATACAATGATTTGATAGTAG
ATCCACGAAACTTTGAATGGATGAGGGAAGCTAATTGTCCTGTTGTTGCTGATATAACCC
ATGCACTCCAACAACCT

QA 3 679 3 679
DS 

RD RS1A523JQ 897 0 0
TGAGGGTCTCAAGATTCTTGAGAAGGTGAAAGTAGCATATGACTTACCCATTGTAACTGA
TGTCCACGAGGCGTATCAGTGTGAAGAAGTTGGCAAGGTTGCTGATATAATTCAGATACC
AGCATTCTTATGTCGCCAGACAGATCTTCTGGTTGCGGCAGCCCAAACTGGAAAAATTAT
CAATATTAAGAAAGGACAGTTTTGTGCTCCTTCTGTCATGGAAAATTCAGCTGAGAAGAT
CAGGCTAGCTGGGAATCCGAATGTGATGGTTTGTGAAAGAGGAACCATGTTTGGATACAA
TGATTTGATAGTAGATCCACGAAACTTTGAATGGATGAGGGAAGCTAATTGTCCTGTTGT
TGCTGATATAACCCATGCACTCCAACAACCTGCAGGCAAAAAGTTGGAAGGTGGTGGTGT
TGCTAGTGGAGGCCTTCGGGAGTTAATTCCCTGCATTGCGAGAACAGCTGTAGCCGTTGG
CGTCGATGGAATTTTCATGGAGGTTCATGATGATCCTCTAAGTGCTCCAGTTGATGGTCC
AACTCACTGGCCTTTGCGTCATCTAGAAGAACTCCTAGAGGAGCTCATCACGATTGCTAG
GGTCACAAAAGGAAAGCAGCGATTCCAGATCGATCTCACACCTTACCGCGACTAGGGTTG
AAGGTGTAGTAATCTCGAGGTCTCCTCCTCGGACATATGGGTCCACGCCAAATCCTGGAG
ACCTTCATTGCGGTTGCAACCACTCCGTAAAGGATATTTATCATCTACTTGAGCAAAGAA
TGTTATTTGTTTTTGATTGCTCCAAACTTTGAACATATATATAAGCTTTTATTCAAAATT
TCTTCTGTTTAAGAGTGTTCAAACATATAATAACTATAATGAAGTCTGTTTACATTC

QA 1 897 1 897
DS 

RD RS1H161JQB 758 0 0
CGA
GCTTTTATTCGAAATTTCTTCTGTTTAAGAGTGTTCAAACATATAATAACTATAATGAAG
TCTGTTTACATTCGATAGGCAAAATGTACAAGCTCATGGGTTAAACAGGTTTGCTTCCAT
AAGTCAACCACATTTACATATGCCTGCACATTATATGTATATTATCTTCGATGCAACAGT
ATATACACAGCTGAGACTGAGAGTGACCTATTCAATGGTTCTACGAACATATAACAAAAC
GGTCTTGCACAAGGATTTGCTCTTGTTGCTTGTCTAGTGTCCTCCTCACAGCTTGATAGA
ACTCAATCCAAGAAGACGAGTATGAAGAGCCAAACATGAAAGTCGGATTGGGACTGGCAG
GGCAAGCAGTGACCAAATCCAACACAGAAGTTGCAGGTTTGAGCTGGTGAGGGAAGTTGA
AAGCCAAGTTATCAACTTTATGCTCGTAGATCTTCCCATTGCGGTCTAGTTTATAGCGAG
AAGTGCCCTGAAACTCTCCTTTGGCCTCCCATGGAACTCTAGGCACACCTTTGAGATTCC
ACCTGATGAGGATCATGTTCTCTGATGGTTGCCAAACCCTGAAGATCTCAAGCGAGATGT
CTCTGAAGAGAATCTTGCCATGAAACCTGAGTGCCCAGAAGATGAGTTTGTAGTTCTCAA
TACCAGAGAAAGTGTTCACTGGATCCACCAATGTTATATCATCCCTGTAAATGTCGTAAT
TAAGATCTTTGGTGAAGAGCAAAGGCAAATCTTCG

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DS 

RD RS1H161TF 648 0 0
AGTTGAAAGCCAAGTTATCAACTTTATGCTCGTAGATCTTCCCATTGCGGTCTAGTTTAT
AGCGAGAAGTGCCCTGAAACTCTCCTTTGGCCTCCCATGGAACTCTAGGCACACCTTTGA
GATTCCACCTGATGAGGATCATGTTCTCTGATGGTTGCCAAACCCTGAAGATCTCAAGCG
AGATGTCTCTGAAGAGAATCTTGCCATGAAACCTGAGTGCCCAGAAGATGAGTTTGTAGT
TCTCAATACCAGAGAAAGTGTTCACTGGATCCACCAATGTTATATCATCCCTGTAAATGT
CGTAATTAAGATCTTTGGTGAAGAGCAAAGGCAAATCTTCGCGAAGGGTACGTATAGCTA
GACCGAGATTGATGTAGAACTCATCTTTGCCATGCTGCTGGTGCTTATCCTGTCCACTCG
GCATGGTCTTAACCTGCGCTCCTGGAGCAGGAGGAGTCTGGACGGGAAGAGTTAGCAGAG
AGAGGCTGTCTTCTTCGAAATTGTAGCTACTGGAAGAAGAAGAAGAAGATGATGAGATGG
ATAGAGAATGGGTGGAAATGGGTTTCTCTTTGATGGATTTTCCAGTTTGAAGAAGGAATG
AAGGAGAGAGATTCGGGAGAAGAAACGCCATAGCTAGCTGAGCTTCTC

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 5

CO CL460Contig1 1188 5 6 U
GAAAGGATTAACAATTAAACTTAGTAATTTAACAGATAAAGTCAGATTTGAAAAGAAGAC
AGTATGTAGCAAGCTCTGATCTGATGCTATGAAATATTGTTACACAAATGATAGAAGAGA
CTACTGAGAGACGCAAAGAAAAAACAAAAGAGACCGGATATTTGAGGAGGGATTTACTTT
CTGGAAGCTAAGCTCTCATTGGTTGTCTTGTACATTTCATCGATCACACTCTGGAAGTGT
TTCAGCAATTGAGGCCTCTTCTTTTTGTAGGTCGGAGTGAGAAGGTCGCGTTCCATGTCA
AATGGCACTGGGTCTAGATGAACCGCCTTGATGATCTCGAACCCCTTCATCTTTTTCTCT
TTGCCCATTTTCACAAGTTCTCCGAGGATGAACTCCTTTGCCTTGGCGTTTTGACAGAGA
GCGTTGTAGTCACCGCTCACACCGTTTTCTGCAGCCCATTTTTCAAGGATATGCTGGTTT
GGATTGGCGACTGCCACTAGGAATGATTCAAAGCTGTTCCCGTACACCCACACGGAATCA
ACAGCTTGAACTTCACCATAGATGTTTTCCAAGTTCTCTACCGCAACATACTCTCCTTGT
GAGAGTTTAAAGATATTCTTCTTCCTGTCAATTATCTTCATGCTTCCATTTGGTTGCCAT
TCACCAACATCACCTGTGTGCAGCCATCCATCAATAAGAACCTCTTTTGTGAGGTCTTCA
CGTTTGTAGTATCCAGAGAAAAAGGGTCTTTCCCCTAATGCAGATTTCACCACGTGGAGT
ACTTGCAAGAGCATCATATTCCATCTCGGGTACGGATTCAAGGCGGATATCAACGTTTGG
CACTGGTGGTCCAACTGTCCCGAGCATGTCCAGTCGGTCCGGCAGCGAGACAAAAGTTCC
AGCACAGACCGTATCCTTGAAGAACATGACAGCAAGCCACCACTCTTAGAAATGACTCTA
CGTGACTAGCGAGAGGAGCAGCTCCCGATAGAATGATCCTCACATTGCCTCCGAGCCCTT
GTTTAACCTTGCTGAATACAAGTTTGTCACAAAATGGAGAGGCCTCCACATGAGACTGCC
CTTTCTTCATATGTCCATATTTAAAGGAAAATGCAGAATCAAACATAAACTTTTTGAAGA
ATCCGCCAGCAGCAAGCTTCTGCTGAAGACCTGAGTAAACTCTATCTC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BN17TF C 393
AF RS1BT39JQ U 123
AF RS1D413JQ U 7
AF RS1AO17JQ U 1
AF RS1B251TF C 525
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BS 748 748 RS1B251TF
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BS 771 811 RS1AO17JQ
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GCTGTTCCCGTACACTCACACGGAATCAACAGCTTGAACTTCACCATAGATGTTTTCCAA
GTTCTCTACCGCAACATACTCTCCTTGTGAGAGTTTAAAGAT

QA 1 222 1 222
DS 

RD RS1BT39JQ 586 0 0
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CAGCAATTGAGGCCTCTTCTTTTTGTAGGTCGGAGTGAGAAGGTCGCGTTCCATGTCAAA
TGGCACTGGGTCTAGATGAACCGCCTTGATGATCTCGAACCCCTTCATCTTTTTCTCTTT
GCCCATTTTCACAAGTTCTCCGAGGATGAACTCCTTTGCCTTGGCGTTTTGACAGAAAGC
GTTGTAGTCACCGCTCACACCGTTTTCTGCAGCCCATTTTTCAAGGATATGCTGGTTTGG
ATTGGCGACTGCCACTAGGAATGATTCAAAGCTGTTCCCGTACACCCACACGGAATCAAC
AGCTTGAACTTCACCATAGATATTTTCCCAGTTCTCTACCGCAACATACTCTCCTTGTGA
GAGTTTAAAGATATTCTTCTTCCTGTCAATTATCTTCATGCTTCCATTTGGTTGCCATTC
ACCAACATCACCTGTGTGCAGCCATCCATCAATAAGAACCTCTTTT

QA 1 586 1 586
DS 

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G
TTAACAATTAAACTTAGTAATTTAACAGATAAAGTCAGATTTGAAAAGAAGACAGTATGT
AGCAAGCTCTGATCTGATGCTATGAAATATTGTTACACAAATGATAGAAGAGCCTACTGA
GAGACGCAAAGGAAAAACAAAAGAGACCGGATATTTGAGGAGGGATTTACTTTCTGGAAG
CTAAGCTCTCATTGGTTGTCTTGTACATTTCATCGATCACACTCTGGAAGTGTTTCAGCA
ATTGAGGCCTCTTCTTTTTGTAGGTCGGAGTGAGAAGGTCGCGTTCCATGTCAAATGGCA
CTGGGTCTAGATGAACCGCCTTGATGATCTCGAACCCCTTCATCTTTTTCTCTTTGCCCA
TTTTCACAAGTTCTCCGAGGATGAACTCCTTTGCCTTGGCGTTTTGACAGAGAGCGTTGT
AGTCACCGCTCACACCGTTTTCTGCAGCCCATTTTTCAAGGATATGCTGGTTTGGATTGG
CGACTGCCACTAGGAATGATTCAAAGCTGTTCCCGTACACCCACACGGAATCAACAGCTT
GAACTTCACCATAGATGTTTTCCAAGTTCTCTACCGCAACATACTCTCCTTGTGAGAGTT
TAAAGATATTCTTCTTCCTGTCAATTATCTTCATGCTTCCATTTGGTTGCCATTCACCAA
CATCACCTGTGTGCAGCCATCCATCAATAAGAACCTCTTTTGTGAGGTCTTCAAGTTTGT
AGTATCCAGAGAA

QA 2 734 2 734
DS 

RD RS1AO17JQ 811 0 0
GAAAGGATTAACAATTAAACTTAGTAATTTAACAGATAAAGTCAGATTTGAAAAGAAGAC
AGTATGTAGCAAGCTCTGATCTGATGCTATGAAATATTGTTACACAAATGATAGAAGAGA
CTACTGAGAGACGCAAAGAAAAAACAAAAGAGACCGGATATTTGAGGAGGGATTTACTTT
CTGGAAGCTAAGCTCTCATTGGTTGTCTTGTACATTTCATCGATCACACTCTGGAAGTGT
TTCAGCAATTGAGGCCTCTTCTTTTTGTAGGTCGGAGTGAGAAGGTCGCGTTCCATGTCA
AATGGCACTGGGTCTAGATGAACCGCCTTGATGATCTCGAACCCCTTCATCTTTTTCTCT
TTGCCCATTTTCACAAGTTCTCCGAGGATGAACTCCTTTGCCTTGGCGTTTTGACAGAGA
GCGTTGTAGTCACCGCTCACACCGTTTTCTGCAGCCCATTTTTCAAGGATATGCTGGTTT
GGATTGGCGACTGCCACTAGGAATGATTCAAAGCTGTTCCCGTACACCCACACGGAATCA
ACAGCTTGAACTTCACCATAGATGTTTTCCAAGTTCTCTACCGCAACATACTCTCCTTGT
GAGAGTTTAAAGATATTCTTCTTCCTGTCAATTATCTTCATGCTTCCATTTGGTTGCCAT
TCACCAACATCACCTGTGTGCAGCCATCCATCAATAAGAACCTCTTTTGTGAGGTCTTCA
CGTTTGTAGTATCCAGAGAAAAAGGGTTTTTCCCCTAATGCAGATTTCATCACGTGGAGT
ACTTGCAAGAGCATCATATTCCATCTCGGGT

QA 1 811 1 811
DS 

RD RS1B251TF 664 0 0
CACCCACACGGAATCAACAGCTTGAACTTCACCATAGATGTTTTCCAAGTTCTCTACCGC
AACATACTCCCCTTGTGAGAGTTTAAAGATATTCTTCTTCCTGTCAATTATCTTCATGCT
TCCATTTGGTTGCCATTCACCAACATCACCTGTGTGCAGCCATCCATCGATAAGAACCTC
TTTTGTGAGGTCTTCACGTTTGTAGTATCCAGAGAAAA*GGGTCTTTCCCCTAATGCAGA
TTTCACCACGTGGAGTACTTGCAAGAGCATCATATTCCATCTCGGGTACGGATTCAAGGC
GGATATCAACGTTTGGCACTGGTGGTCCAACTGTCCCGAGCATGTCCAGTCGGTCCGGCA
GCGAGACAAAAGTTCCAGCACAGACCGTATCCTTGAAGAACATGACAGCAAGCCACCACT
CTTAGAAATGACTCTACGTGACTAGCGAGAGGAGCAGCTCCCGATAGAATGATCCTCACA
TTGCCTCCGAGCCCTTGTTTAACCTTGCTGAATACAAGTTTGTCACAAAATGGAGAGGCC
TCCACATGAGACTGCCCTTTCTTCATATGTCCATATTTAAAGGAAAATGCAGAATCAAAC
ATAAACTTTTTGAAGAATCCGCCAGCAGCAAGCTTCTGCTGAAGACCTGAGTAAACTCTA
TCTC

QA 1 664 1 664
DS 



AS 2 9

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GGGCTAAAACGCAGAAGCTGATAAGGCTTCGTTTCCTGTGCAACCATGGCGACTAGCTCT
CATCTTCTTCTTCCTCAGGCACTGCATATGATAACGAGAATCCCTAGTAAGAATCTAGGA
GTTTCTTCACTTATACCATCAGTGAACTCTCGGATATCATTGTCTAGGGTTTCCCTAAAC
CATTCCAGCTCGAACGTTGGATTCGCAATCGGTTCCAGGAAGAGAAGGGAGTTTATAGCT
AAAGCCGAAGAGAGCAGTACTGTAGGTGAAGACACTGAAGCAGTTCCGGAGGATGTTGCT
GAAACAGTAGAAGACAATGAGGTTGAGGAAGCAAAAACTCCGTGGAAGCCAAGGACCAAG
CTCGGAGATGTCATGGGGATACTGAACCAGAAAGCAATTGAGGTTTCAGAGAAAGTAAGA
CCGGTTCCAGAGATTAGGACAGGGGACATTGTAGAGATCAAACTGGAAGTACCTGAGAAC
AGGCGTAGGCTATCAATCTACAAAGGGATAGTGATGTCTAGGCAAAACGCAGGCATCCAC
ACTACTATTCGTATCCGGAGAATCATTGCTGGCATTGGCGTTGAAATCGTCTTTCCTTTA
TACTCACCCAACATAAAGGAGATAAAAGTGGTAAGCCACAGGAAAGTGAGAAGAGCAAGA
CTTTACTATCTGAGGGACAAACTTCCTCGTCTCTCTACTTTTAAATGAGGCCCCAGACCC
AAAATCAGTCTTTTGCTGTCTTCAATCTCCAGAGGTAGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DX11TF U 39
AF RS1EN77TF U 1
AF RS1EZ58JQ C 340
BS 1 92 RS1EN77TF
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BS 708 761 RS1EZ58JQ

RD RS1DX11TF 576 0 0
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TGAGGTTTCAGAGAAAGTAAGACCGGTTCCAGAGATTAGGACAGGGGACATTGTAGAGAT
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CGTTGAAATCGTCTTTCCTTTATACTCACCCAACAT

QA 1 576 1 576
DS 

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GGGCTAAAACGCAGAAGCTGATAAGGCTTCGTTTCCTGTGCAACCATGGCGACTAGCTCT
CATCTTCTTCTTCCTCAGGCACTGCATATGATGACGAGAATCCCTAGTAAGAATCTAGGA
GTTTCTTCACTTATACCATCAGTGAACTCTCGGATATCATTGTCTAGGGTTTCCCTAAAC
CATTCCAGCTCGAACGTTGGATTCGCAATCGGTTCCAGGAAGAGAAGGGAGTTTATAGCT
AAAGCCGAAGAGAGCAGTACTGTAGGTGAAGACACTGAAGCAGTTCCGGAGGATGTTGCT
GAAACAGTAGAAGACAATGAGGTTGAGGAAGCAAAAACTCCGTGGAAGCCAAGGACCAAG
CTCGGAGATGTCATGGGGATACTGAACCAGAAAGCAATTGAGGTTTCAGAGAAAGTAAGA
CCGGTTCCAGAGATTAGGACAGGGGACATTGTAGAGATCAAACTGGAAGTACCTGAGAAC
AGGCGTAGGCTATCAATCTACAAAGGGATAGTGATGTCTAGGCAAAACGCAGGCATCCAC
ACTACTATTCGTATCCGGAGAATCATTGCTGGCATTGGCGTTGAAATCGTCTTTCCTTTA
TACTCACCCAACATAAAGGAGATAAAAGTGGTAAGCCACAGGAAAGTGAGAAGAGCAAGA
CTTTACTATCTGAGGGACAAACTTCCTCGTCTCTCTACTTTTAAATG

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1EZ58JQ 422 0 0
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GAGGTTTCAGAGAAAGTAAGACCGGTTCCAGAGATTAGGACAGGGGACATTGTAGAGATC
AAACTGGAAGTGCCTGAGAACAGGCGTAGGCTATCAATCTACAAAGGGATAGTGATGTTT
AGGCAAAACGCAGGCATCCACACTACTATTCGTATCCGGAGAATCATTGCTGGCATTGGC
GTTGAAATTGTCTTTCCTTTATACTCACCCAACATAAAGGAGATAAAAGTGGTAAGCCAC
AGGAAAGTGAGAAGAGCAAGGCTTTACTATTTGAGGGACAAACTTCCTCGTCTCTTTACT
TTTAAATGAGGCCCCAGACCCAAAATCAGTCTTTTGCTGTCTTCAATCTCCAGAGGTAGC
TT

QA 1 422 1 422
DS 



CO CL461Contig2 863 6 17 U
GGAAGGTTTCGTTACTCTGCAAACATGGCGACTAGCTCTCATCTTCTTCTTCCTCAGGCA
CTGCATATGATAACGAGAATCCCTAGTAAGAATCATCTAGGAGTTTCTTCACTTATACCA
TCAGTGAACTCTCGGGTATCATTGTCTAGGGTTTCCCTAAACCATTCCAGCTCGAACGTT
GGATTCGCGATCGATTCCAGGAAGCGAAGGGAGTTTATAGCTAAAGCCGAAGAGAGCAGT
ACTGAAGGTGAAGACACTGAAGCAGTTCCGGAGGATGTTGCTGAAACAGTAGAAGCCGCT
CAGGTCGAGGAAGCAAAACCTCCGTGGAAGCCAAGGACCAAGCTCGGAGATGTCATGGGG
ATACTGAACCAGAAAGCAATTGAGGTTTCAGAGAAAGTAAGACCGGTTCCAGAGATTAGG
ACAGGGGACATTGTAGAGATCAAACTGGAAGTGCCTGAGAACAGGCGTAGGCTATCAATC
TACAAAGGGATAGTGATGTCTAGGCAAAACGCAGGCATCCACACTACTATTCGTATCCGG
AGAATCATTGCTGGCATTGGCGTTGAAATCGTCTTTCCTTTATACTCACCCAACATAAAG
GAGATAAAAGTGGTAAGCCACAGGAAAGTGAGAAGAGCAAGGCTTTACTATCTGAGGGAC
AAACTTCCTCGTCTCTCTACTTTTAAATGAGGCACCAAACCCAAAATCAGTCTTTTGCTG
TCTTAAATCTCCAGAGGTAGCCTGCTACTCCTCTTCTCGTAAGAATTGTTTGTTTGTTTG
CTTTGTCTTATGGGATTTTGTTACTCGTCATGTAATATTACAGTGACAATTGAGAAAAGT
AAATCAAAATGTTTTGTGAGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 30 30 15 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1F415TF U 1
AF RS1EZ58TF U 47
AF RS1FF02TF U 14
AF RS1F415JQ C 352
AF RS1AC37TF U 288
AF RS1EN77JQ C 672
BS 1 217 RS1F415TF
BS 218 218 RS1EZ58TF
BS 219 625 RS1F415TF
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BS 627 689 RS1F415TF
BS 690 691 RS1FF02TF
BS 692 692 RS1AC37TF
BS 693 697 RS1FF02TF
BS 698 698 RS1AC37TF
BS 699 724 RS1FF02TF
BS 725 725 RS1AC37TF
BS 726 741 RS1FF02TF
BS 742 742 RS1AC37TF
BS 743 750 RS1FF02TF
BS 751 780 RS1AC37TF
BS 781 781 RS1EN77JQ
BS 782 863 RS1AC37TF

RD RS1F415TF 689 0 0
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CTGCATATGATAACGAGAATCCCTAGTAAGAATCATCTAGGAGTTTCTTCACTTATACCA
TCAGTGAACTCTCGGGTATCATTGTCTAGGGTTTCCCTAAACCATTCCAGCTCGAACGTT
GGATTCGCGATCGATTCCAGGAAGCGAAGGGAGTTTACAGCTAAAGCCGAAGAGAGCAGT
ACTGAAGGTGAAGACACTGAAGCAGTTCCGGAGGATGTTGCTGAAACAGTAGAAGCCGCT
CAGGTCGAGGAAGCAAAACCTCCGTGGAAGCCAAGGACCAAGCTCGGAGATGTCATGGGG
ATACTGAACCAGAAAGCAATTGAGGTTTCAGAGAAAGTAAGACCGGTTCCAGAGATTAGG
ACAGGGGACATTGTAGAGATCAAACTGGAAGTGCCTGAGAACAGGCGTAGGCTATCAATC
TACAAAGGGATAGTGATGTCTAGGCAAAACGCAGGCATCCACACTACTATTCGTATCCGG
AGAATCATTGCTGGCATTGGCGTTGAAATCGTCTTTCCTTTATACTCACCCAACATAAAG
GAGATAAAAGTGGTAAGCCACAGGACAGTGAGAAGAGCAAGGCTTTACTATCTGAGGGAC
AAACTTCCTCGTCTCTCTACTTTTAAATG

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1EZ58TF 651 0 0
TTCTTCCTCAGGCACTGCATATGATAACGAGAATCCCTAGTAAGAATCATCTAGGAGTTT
CTTCACTTATACCATCAGTGAACTCTCGGGTATCATTGTCTAGGGTTTCCCTAAACCATT
CCAGCTCGAACGTTGGATTCGCGATCGATTCCAGGAAGCGAAGGGAGTTTATAGCTAAAG
CCGAAGAGAGCAGTACTGAAGGTGAAGACACTGAAGCAGTTCCGGAGGATGTTGCTGAAA
CAGTAGAAGCCGCTCAGGTCGAGGAAGCAAAACCTCCGTGGAAGCCAAGGACCAAGCTCG
GAGATGTCATGGGGATACTGAACCAGAA*GCAATTGAGGTTTCAGAGAAAGTAAGACCGG
TTCCAGAGATTAGGACAGGGGACATTGTAGAGATCAAACTGGAAGTGCCTGAGAACAGGC
GTAGGCTATCAATCTACAAAGGGATAGTGATGTCTAGGCAAAACGCAGGCATCCACACTA
CTATTCGTATCCGGAGAATCATTGCTGGCATTGGCGTTGAAATTGTCTTTCCTTTATACT
CACCCAACATAAAGGAGATAAAAGTGGTAAGCCACAGGAAAGTGAGAAGAGCAAG*CTTT
ACTATCTGAGGGACAAACTTCCTCGTCTCTCTACTTTTAA
TGAGCACAGAC

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DS 

RD RS1FF02TF 750 0 0
ACTC
TGCAAACATGGCGACTAGCTCTCATCTTCTTCTTCCTCAGGCACTGCATATGATAACGAG
AATCCCTAGTAAGAATCATCTAGGAGTTTCTTCACTTATACCATCAGTGAACTCTCGGGT
ATCATTGTCTAGGGTTTCCCTAAACCATTCCAGCTCGAACGTTGGATTCGCGATCGATTC
CAGGAAGCGAAGGGAGTTTATAGCTAAAGCCGAAGAGAGCAGTACTGAAGGTTAAGACAC
TGAAGCAGTTCCGGAGGATGTTGCTGAAACAGTAGAAGCCGCTCAGGTCGAGGAAGCAAA
ACCTCCGTGGAAGCCAAGGACCAAGCTCGGAGATGTCATGGGGATACTGAACCAGAAAGC
AATTGAGGTTTCAGAGAAAGTAAGACCGGTTCCAGAGATTAGGACAGGGGACATTGTAGA
GATCAAACTGGAAGTGCCTGAGAACAGGCGTAGGCTATCAATCTACAAAGGGATAGTGAT
GTCTAGGCAAAACGCAGGCATCCACACTACTATTCGTATCCGGAGAATCATTGCTGGCAT
TGGCGTTGAAATCGTCTTTCCTTTATACTCACCCAACATAAAGGAGATAAAAGTGGTAAG
CCACAGGAAAGTGGGAAGTGCAAGGCTTTACTATCTGAGGGACAAACTTCCTCGTCTCTC
TACTTTTAAATGAG*CACCAGACCCAAAATCAGTCTTTTGCTGTCTTCAATCTCCAGAGG
TAGCTTGCTACTC
TTGTCTCTTCCCT

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DS 

RD RS1F415JQ 392 0 0
GTCATGGGGATACTGAACCAGAAAGCAATTGAGGTTTCAGAGAAAGTAAGACCGGTTCCA
GAGATTAGGACAGGGGACATTGTAGAGATCAAACTGGAAGTGCCTGAGAACAGGGGTAGG
CTATCAATCTACAAAGGGATAGTGATGTCTAGGCAAAACGCAGGCATCCACACTACTATT
CGTATCCGGAGAATCATTGCTGGCATTGGCGTTGAAATCGTCTTTCCTTTATACTCACCC
AACATAAAGGAGATAAAAGTGGTAAGCCACAGGACAGTGAGAAGAGCAAGGCTTTACTAT
TTGAGGGACAAACTTCCTCGTCTCTCTACTTTTAAATGAGGCACCAGACCCAAAATCAGT
CTTTTGCTGTCTTCAATCTCCAGAGG
AAGCTT

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DS 

RD RS1AC37TF 576 0 0
GGTAGAAGACAATGGGGTT
GAGGAAGCAAAAACTCCGTGGAAGCCAAGGACCAAGCTCGGAGATGTCATGGGGATACTG
AACCAGAAAGCAATTGAGGTTTCAGAGAAAGTAAGACCGGTTCCAGAGATTAGGACAGGG
GACATTGTAGAGATCAAACTGGAAGTACCTGAGAACAGGCGTAGGCTATCAATCTACAAA
GGGATAGTGATGTCTAGGCAAAACGCAGGCATCCACACTACTATTCGTATCCGGAGAATC
ATTGCTGGCATTGGCGTTGAAATCGTCTTTCCTTTATACTCACCCAACATAAAGGAGATA
AAAGTGGTAAGCCACAGGAAAGTGAGAAGAGCAAGACTTTACTATCTGAGGGACAAACTT
CCTCGTCTCTCTACTTTTAAATGAGGCACCAAACCCAACATCAGTCTTTTGCTGTCTTAA
GTCTCCAGAGGTAGCCTGCTACTCCTCTTCTCGTAAGAATTGTTTGTTTGTTTGTTTTGT
CTTATGGGATTTTGTTACTCGTCATGTAATATTACAGTGACAATTGAGAAAAGTAAATCA
AAATGTTTTGTGAGGCT

QA 20 576 20 576
DS 

RD RS1EN77JQ 191 0 0
TCTCTCTACTTTTAAATGAGGCACCAAACCCAACATCAGTCTTTTGCTGTCTTAAGTCTC
CAGAGGTAGCCTGCTACTCCTCTTCTTGTAAGAATTGTTTGTTTGTTTGCTTTGTCTTAT
GGGATTTTGTTACTCGTCATGTAATATTACAGTGACAATTGAGAAAAGTAAATCAAGATG
TTTTGTGAGGC

QA 1 191 1 191
DS 



AS 1 9

CO CL462Contig1 695 9 10 U
TATAGATAACAAAATAATCAGATTCCAAGAAGAAGAAAAAGTTACTTTCGCGTTTGATCT
TGAAAGACTCAAATGAATCCCCAAGCTGTTTCGTGTAGTAGCTTCGGCTTCGTTTCTGCT
CCACTTGTCTCTCCCAGAAGAACATCCCGATTTGTTATCCATGCCAAATCGGAACCATCG
GAGAAATCAGTGGAGATAATGAGGAAGTTCTCGGAGCAGTACGCTCGTCGCTCTGGGACT
TACTTCTGTGTTGACAAAGGCGTTACTTCTGTCGTCATCAAGGGTTTGGCTGAGCATAAA
GATTCGTATGGTGCACCGCTTTGTCCTTGCAGACATTATGATGATAAAGCTGCTGAGGTT
GGACAGGGCTTTTGGAACTGTCCTTGTGTTCCAATGAGAGAGAGGAAGGAGTGCCATTGT
ATGCTTTTCTTAACTCCTGACAATGATTTCGCTGGGAAAGATCAGACTATTACCTCAGAG
GAAATCAAAGAAACAACAGCTCACATGTGAGAAGAACTGATTCAGAGAGAAAATGTATCA
CCAATGCATCCCTGTACATTGATACCTCCATCATCTTCTTCTTCGTTCTTCTGTACAACT
ATCTATTTCCTTTGTCAGATAAATACTTTAGTATGATCTTGTTTTTGCAAATGATTACAA
TACAATGATATAAGAAAGGATCTGACTTTGTGCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 20 55 55 40 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 25 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 10 

AF RS1DD66TF U 9
AF RS1BQ56TF U 1
AF RS1DD66JQ C 9
AF RS1H103JQB C 208
AF RS1CU17TF U 21
AF RS1C530JQ C 37
AF RS1C530TF U 31
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AF RS1H103TF U 14
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BS 695 695 RS1DD66JQ

RD RS1DD66TF 638 0 0
GGAAAAT
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AATCCCCAAGCTGTTTCGTGTAGTAGCTTCGGCTTCGTTTCTGCTCCACTTGTCTCTCCC
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ATAATGAGGAAGTTCTCGGAGCAGTACGCTCGTCGCTCTGGGACTTACTTCTGTGTTGAC
AAAGGCGTTACTTCTGTCGTCATCAAGGGTTTGGCTGAGCATAAAGATTCGTATGGTGCA
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ACATTGATACCTCCATCATCTTCTTCTTCGTTCTTCTGTACAACTATCTATTTCCTTTGT
CAGATAAATACTTTAGTATGATCTTGTTTTT

QA 8 638 8 638
DS 

RD RS1BQ56TF 669 0 0
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CCACTTGTCTCTCCCAGAAGAACATCCCGATTTGTTATCCATGCCAAATCGGAACCATCG
GAGAAATCAGTGGAGATAATGAGGAAGTTCTCGGAGCAGTACGCTCGTCGCTCTGGGACT
TACTTCTGTGTTGACAAAGGCGTTACTTCTGTCGTCATCAAGGGTTTGGCTGAGCATAAA
GATTCGTATGGTGCACCGCTTTGTCCTTGCAGACATTATGATGATAAAGCTGCTGAGGTT
GGACAGGGCTTTTGGAACTGTCCTTGTGTTCCAATGAGAGAGAGGAAGGAGTGCCATTGT
ATGCTTTTCTTAACTCCTGACAATGATTTCGCTGGGAAAGATCAGACTATTACCTCAGAG
GAAATCAAAGAAACAACAGCTCACATGTGAGAAGAACTGATTCAGAGAGAAAATGTATCA
CCAATGCATCCCTGCACATTGATACCTCCATCATCTTCTTCTTCGTTCTTCTGTACAACT
ATCTATTTCCTTTGTCAGATAAATACTTTAGTATGATCTTGTTTTTGCAA*TGATTACA*
TACAATGAT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RS1DD66JQ 687 0 0
GGAAAAT
AATCAGATTCCAAGAAGAAGAAAAAGTTACTTTCGCGTTTGATCTTGAAAGACTCAAATG
AATCCCCAAGCTGTTTCGTGTAGTAGCTTCGGCTTCGTTTCTGCTCCACTTGTCTCTCCC
AGAAGAACATCCCGATTTGTTATCCATGCCAAATCGGAACCATCGGAGAAATCAGTGGAG
ATAATGAGGAAGTTCTCGGAGCAGTACGCTCGTCGCTCTGGGACTTACTTCTGTGTTGAC
AAAGGCGTTACTTCTGTCGTCATCAAGGGTTTGGCTGAGCATAAAGATTCGTATGGTGCA
CCGCTTTGTCCTTGCAGACATTATGATGATAAAGCTGCTGAGGTTGGACAGGGCTTTTGG
AACTGTCCTTGTGTTCCAATGAGAGAGAGGAAGGAGTGCCATTGTATGCTTTTCTTAACT
CCTGACAATGATTTCGCTGGGAAAGATCAGACTATTACCTCAGAGGAAATCAAAGAAACA
ACAGCTCACATGTGAGAAGTACTGATTCTGAGAGAAAATGTATCACCAATGCATCCCTGT
ACATTGATACCTCCATCATCTTTTTCTTCGTTCTTCTGTACAACTATCTATTTCCTTTGT
CAGATAAATACTTTAGTATGATCTTGTTTTTGCAAATGATTACAATACAATGATATAAGA
AAGGATCTGACTTTGTGCCT

QA 8 687 8 687
DS 

RD RS1H103JQB 487 0 0
TTCTCGGAGCATTACGCTCGTCGCTCTGGGACTTACTTCTGTGTTGACAAAGGCGTTACT
TCTGTCGTCATCAAGGGTTTGGCTGAGCATAAAGATTCGTATGGTGCACCGCTTTGTCCT
TGCAGACATTATGATGATAAAGCTGCTGAGGTTGGACAGGGCTTTTGGAACTGTCCTTGT
GTTCCAATGAGAGAGAGGAAGGAGTGCCATTGTATGCTTTTCTTAACTCCTGACAATGAT
TTCGCTGGGAAAGATCAGACTATTACCTCAGAGGAAATCAAAGAAACAACAGCTCACATG
TGAGAAGAACTGATTCAGAGAGAAAATGTATCACCAATGCATCCCTGTACATTGATACCT
CCATCATCTTTTTCTTCGTTCTTCTGTACAACTATCTATTTCCTTTGTCAGATAAATACT
TTAGTATGATCTTGTTTTTGCAAATGATTACAATACAATGATATAAGAAAGGATCTGACT
TTGTGCC

QA 1 487 1 487
DS 

RD RS1CU17TF 653 0 0
GATTCCAAGAAGAAGAAAAAGTTACTTTCGCGTTTGATCTTGAAAGACTCAAATGAATCC
CCAAGCTGTTTCGTGTAGTAGCTTCGGCTTCGTTTCTGCTCCACTTGTCTCTCCCAGAAG
AACATCCCGATTTGTTATCCATGCCAAATCGGAACCATCGGAGAAATCAGTGGAGATAAT
GAGGAAGTTCTCGGAGCAGTACGCTCGTCGCTCTGGGACTTACTTCTGTGTTGACAAAGG
CGTTACTTCTGTCGTCATCAAGGGTTTGGCTGAGCATAAAGATTCGTATGGTGCACCGCT
TTGTCCTTGCAGACATTATGATGATAAAGCTGCTGAGGTTGGACAGGGCTTTTGGAACTG
TCCTTGTGTTCCAATGAGAGAGAGGAAGGAGTGCCATTGTATGCTTTTCTTAACTCCTGA
CAATGATTTCGCTGGGAAAGATCAGACTATTACCTCAGAGGAAATCAAAGAAACAACAGC
TCACATGTGAGAAGAACTGATTCAGAGAGAAAATGTATCACCAATGCATCCCTGTACATT
GATACCTCCATCATCTTCTTCTTCGTTCTTCTGTACAACTATCTATTTCCTTTGTCAGAT
AAATACTTTAGTATGATCTTGTTTTTGCAGATGATTACA*TACAATGATATA
G

QA 1 652 1 652
DS 

RD RS1C530JQ 658 0 0
AAAAGTTACTTTCGCGTTTGATCTTGAAAGACTCAAATGAATCCCCAAGCTGTTTCGTGT
AGTAGCTTCGGCTTCGTTTCTGCTCCACTTGTCTCTCCCAGAAGAACATCCCGATTTGTT
ATCCATGCCAAATCGGAACCATCGGAGAAATCAGTGGAGATAATGAGGAAGTTCTCGGAG
CAGTACGCTCGTCGCTCTGGGACTTACTTCTGTGTTGACAAAGGCGTTACTTCTGTCGTC
ATCAAGGGTTTGGCTGAGCATAAAGATTCGTATGGTGCACCGCTTTGTCCTTGCAGACAT
TATGATGATAAAGCTGCTGAGGTTGGACAGGGCTTTTGGAACTGTCCTTGTGTTCCAATG
AGAGAGAGGAAGGAGTGCCATTGTATGCTTTTCTTAACTCCTGACAATGATTTCGCTGGG
AAAGATCAGACTATTACCTCAGAGGAAATCAAAGAAACAACAGCTCACATGTGAGAAGAA
CTGATTCAGAGAGAAAATGTATCACCAATGCATCCCTGTACATTGATACCTCCATCATCT
TCTTCTTCGTTCTTCTGTACAACTATCTATTTCCTTTGTCAGATAAATACTTTAGTATGA
TCTTGTTTTTGCAAATGATTACAATACAATGATATAAGAAAGGATCTGACTTTGTGCC

QA 1 658 1 658
DS 

RD RS1C530TF 664 0 0
G
GAAGAAAAAGTTACTTTCGCGTTTGATCTTGAAAGACTCAAATGAATCCCCAAGCTGTTT
CGTGTAGTAGCTTCGGCTTCGTTTCTGCTCCACTTGTCTCTCCCAGAAGAACATCCCGAT
TTGTTATCCATGCCAAATCGGAACCATCGGAGAAATCAGTGGAGATAATGAGGAAGTTCT
CGGAGCAGTACGCTCGTCGCTCTGGGACTTACTTCTGTGTTGACAAAGGCGTTACTTCTG
TCGTCATCAAGGGTTTGGCTGAGCATAAAGATTCGTATGGTGCACCGCTTTGTCCTTGCA
GACATTATGATGATAAAGCTGCTGAGGTTGGACAGGGCTTTTGGAACTGTCCTTGTGTTC
CAATGAGAGAGAGGAAGGAGTGCCATTGTATGCTTTTCTTAACTCCTGACAATGATTTCG
CTGGGAAAGATCAGACTATTACCTCAGAGGAAATCAAAGAAACAACAGCTCACATGTGAG
AAGAACTGATTCAGAGAGAAAATGTATCACCAATGCATCCCTGTACATTGATACCTCCAT
CATCTTCTTCTTCGTTCTTCTGTACAACTATCTATTTCCTTTGTCAGATAAATACTTTAG
TATGATCTTGTTTTTGCAAATGATTACAATACAATGATATAAGAAAGGATCTGACTTTGT
GCC

QA 2 664 2 664
DS 

RD RS1BQ56JQ 512 0 0
AAATCAGTGGAGATAATGAGGAAGTTCTCGGAGCAGTACGCTCGTCGCTTTGGGACTTAC
TTTTGTGTTGACAAAGGCGTTACTTCTGTCGTCATCAAGGGTTTGGCTGAGCATAAAGAT
TCGTATGGTGCACCGCTTTGTCCTTGCAGACATTATGATGATAAAGCTGCTGAGGTTGGA
CAGGGCTTTTGGAACTGTCCTTGTGTTCCAATGAGAGAGAGGAAGGAGTGCCATTGTATG
CTTTTTTTAACTCCTGACAATGATTTCGCTGGGAAAGATCAGACTATTACCTCAGAGGAA
ATCAAAGAAACAACAGCTCACATGTGAGAAGAACTGATTCAGAGAGAAAATGTATCACCA
ATGCATCCCTGCACATTGATACCTCCATCATTTTTTTTTTCGTTTTTCTGTACAACTATT
TATTTCCTTTGTCAGATAAATACTTTAGTATGATCTTGTTTTTGCAAATGATTACAATAC
AATGATATAAGAAAGGATTTGACTTTGTGC
TG

QA 1 510 1 510
DS 

RD RS1H103TF 681 0 0
GG
AATCAGATTCCAAGAAGAAGAAAA*GTTACTTTCGCGTTTGATCTTGAAAGACTCAAATG
AATCCCCAAGCTGTTTCGTGTAGTAGCTTCGGCTTCGTTTCTGCTCCACTTGTCTCTCCC
AGAAGAACATCCCGATTTGTTATCCATGCCAAATCGGAACCATCGGAGAAATCAGTGGAG
ATAATGAGGAAGTTCTCGGAGCATTACGCTCGTCGCTCTGGGACTTACTTCTGTGTTGAC
AAAGGCGTTACTTCTGTCGTCATCAAGGGTTTGGCTGAGCATAAAGATTCGTATGGTGCA
CCGCTTTGTCCTTGCAGACATTATGATGATAAAGCTGCTGAGGTTGGACAGGGCTTTTGG
AACTGTCCTTGTGTTCCAATGAGAGAGAGGAAGGAGTGCCATTGTATGCTTTTCTTAACT
CCTGACAATGATTTCGCTGGGAAAGATCAGACTATTACCTCAGAGGAAATCAAAGAAACA
ACAGCTCACATGTGAGAAGAACTGATTCAGAGAGAAAATGTATCACCAATGCATCCCTGT
ACATTGATACCTCCATCATCTTCTTCTTCGTTCTTCTGTACAACTATCTATTTCCTTTGT
CAGATAAATACTTTAGTATGATCTTGTTTTTGCAAATGATTACAATACAATGATATAAGA
AAGGATCTGACTTTGTGCC

QA 3 681 3 681
DS 



AS 2 9

CO CL463Contig1 811 6 17 U
GGAAACCAGATCACAGCAAAAATGGATAGTCACAAAAGGAGTTTGGGTTTCATATCTCTC
GCTTTTCTCTTCTTCACTTGCTCTTCTGCTGAGCTCCTCATTCAACAGGTCACAGAAGGC
AGAGGAACAGAGAACAACAGTACTTATAATGTCGAGGCGCATCTTGGAGAGACAAGAGCG
TTTAGAGAGGAGCGACCATCAAGTAAGATAGTCACAATAGCAGGGTACTCCGTGATTAAA
GGGAGATTCGAACCCTACGAATCCTCTGTTTTTGAAGCTGCTGGTTACAAATGGAGATTA
GTTTTGTACGTGATTGGTAATAAGAACGACGGTGGAGCTGGCCATATATCACTTTACGCG
AGAATCGAAGGCGCTGAATCTCTTCCTTATGGTTGGGAAGTCAATGTTGATCTCAAACTC
TTTGTCCACAATCCCAAGACCCATAAGTACTTGACTGTCACAGATGGAACCGTGAAGCGA
TACAATGCTGCAAAAAAGGAGTGGGGATTTGGAAAATTGATCCCTCTTTCAACATTCGAG
AATACTAACAATGGGTACATTGTGCAAGACACTTGTTCTTTTGGTGCTGAGATCCTCATT
GTTAAACCTGCCGAGATACAAGAGAAAGTCACATTCATATCAAACCCTCCAAACAATATT
TTCACTTGGAAGATACTTCGTTTCTCCAGCTTGGAAGATAAATTTTACTATTCTGCCGAT
TTTCTCGTTGGAGACCGATACTGGAGATAGCTTTAACCCGAAAGGGGATGGAGATGGACG
ACCACATGCACTTCACTCTTCTATTTGCTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B265TF U 1
AF RS1DK91TF U 6
AF RS1BC39TF U 1
AF RS1BG81TF U 6
AF RS1GS06TF U 3
AF RS1EP07TF U 6
BS 1 113 RS1B265TF
BS 114 114 RS1BG81TF
BS 115 281 RS1B265TF
BS 282 282 RS1BC39TF
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BS 652 691 RS1BC39TF
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BS 706 706 RS1BG81TF
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BS 737 755 RS1BC39TF
BS 756 756 RS1BG81TF
BS 757 782 RS1BC39TF
BS 783 783 RS1BG81TF
BS 784 794 RS1BC39TF
BS 795 811 RS1EP07TF

RD RS1B265TF 651 0 0
GGAAACCAGATCACAGCAAAAATGGATAGTCACAAAAGGAGTTTGGGTTTCATATCTCTC
GCTTTTCTCTTCTTCACTTGCTCTTCTGCTGAGCTCCTCATTCAACAGGTCACGGAAGGC
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TTTAGAGAGGAGCGACCATCAAGTAAGATAGTCACAATAGCAGGGTACTCCGTGATTAAA
GGGAGATTCGAACCCTACGAATCCTCTGTTTTTGAAGCTGCGGGTTACAAATGGAGATTA
GTTTTGTACGTGATTGGTAATAAGAACGACGGTGGAGCTGGCCATATATCACTTTACGCG
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TTTGTCCACAATCCCAAGACCCATAAGTACTTGACTGTCACAGATGGAACCGTGAAGCGA
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GTTAAACCTGCCGAGATACAAGAGAAAGTCACATTCATATCAAACCCTCCA

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1DK91TF 685 0 0
GG
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DS 

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TCGAACCCTACGAATCCTCTGTTTTTGAAGCTGCTGGTTACAAATGGAGATTAGTTTTGT
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CTGCAAAAAAGGAGTGGGGATTTGGAAAATTGATCCCTCTTTCAACATTCGAGAATACTA
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DS 

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DS 

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TCTTCTTCACTTGCTCTTCTGCTGAGCTCCTCATTCAACAGGTCACAGAAGGCAGAGGAA
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AGGAGCGACCATCAAGTAAGATAGTCACAATAGCAGGGTACTCCGTGATTAAAGGGAGAT
TCGAACCCTACGAATCCTCTGTTTTTGAAGCTGCTGGTTACAAATGGAGATTAGTTTTGT
ACGTGATTGGTAATAAGAACGACGGTGGAGCTGGCCATATATCACTTTACGCGAGAATCG
AAGGCGCTGAATCTCTTCCTTATGGTTGGGAAGTCAATGTTGATCTCAAACTCTTTGTCC
ACAATCCCAAGACCCATAAGTACTTGACTGTCACAGATGGAACCGTGAAGCGATACAATG
CTGCAAAAAAGGAGTGGGGATTTGGAAAATTGATCCCTCTTTCAACATTCGAGAATACTA
ACAATGGGTACATTGTGCAAGACACTTGTTCTTTTGGTGTTGAGATCCTCATTGTTAAAC
CTGCCGAGATACAAGAGAAAGTCACATTCATATCAAACCCTCCAAACAATATTTTCACTT
GGAAGATACTTCGTTTCTCCAGCTTGGAAGATAAATTTTACTATTCTGCCGATTTTCTCG
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GCACTT

QA 6 791 6 791
DS 

RD RS1EP07TF 806 0 0
GG
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TCTTCTTCACTTGCTCTTCTGCTGAGCTCCTCATTCAACAGGTCACAGAAGGCAGAGGAA
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AGGAGCGACCATCAAGTAAGATAGTCACAATAGCAGGGTACTCCGTGATTAAAGGGAGAT
TCGAACCCTACGAATCCTCTGTTTTTGAAGCTGCTGGTTACAAATGGAGATTAGTTTTGT
ACGTGATTGGTAATAAGAACGACGGTGGAGCTGGCCATATGTCACTTTACGCGAGAATCG
AAGGCGCTGAATCTCTTCCTTATGGTTGGGAAGTCAATGTTGATCTCAAACTCTTTGTCC
ACAATCCCAAGACCCATAAGTACTTGACTGTCACAGATGGAACCGTGAAGCGATACAATG
CTGCAAAAAAGGAGTGGGGATTTGGAAAATTGATCCCTCTTTCAACATTCGAGAATACTA
ACAATGGGTACATTGTGCAAGACACTTGTTCTTTTGGTGCTGAGATCCTCATTGTTAAAC
CTGCCGAGATACAAGAGAAAGTCACATTCATATCAAACCCTCCAAACAATATTTTCACTT
GGAAGATACTTCGTTTCTCCAGCTTGGAAGATAAATTTTACTATTCTGCCGATTTTCTCG
TTGGAGACCGATACTGGAGATAGCTTTAACCCGAAAGGGGATGGAGATGGACGAC*ACAT
GCACTTCACTCTTCTATTTGCTCA

QA 3 806 3 806
DS 



CO CL463Contig2 811 3 5 U
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ACACTCCAAGGACAGAAATGACGACTACATCACACAAGCATCGATAATTTCATCTTATTA
CAATCTCATTAAGCGTCTCTTTATTTATAAGGTTGTTTGACCCATATATATGAAAAAGAT
GTAGAGATTACTAAGCTGAGACGATATTGGTCACAGAGACCTTAACCATTTCAGCTTCAA
AGATAATGGCATCATTCACCAAATACCCTTTCGATGGATCCTTTAAATCTGCTAACAATA
TGATATTGTTCACTCCCACACCATAATCACTTCGAATCGGGTACCAAGCTGCAGAATATA
ATTGTCTGTGGTTGGAGTTTCGCTGATTCTTCAACCGCAAGTTAACTGCTCCCCAAGTGT
TTGTAGCAACTGCGTTTTCCTTAAAGCCTTGAGCAAATAGGAAGAGTGGAAGTGCATGTG
GTCGTCCATCTCCATCCCCTTTCGGGTTAAAGCCTAATCTCCAGTATCGGTCTCCAACGA
GAAAATCGGCAGAATAGTAAAATTTATCTTCCAAGCTGGAGAAACGAAGTATCTTCCAAG
TGAAAATATTGTTTGGAGGGTTTGATATGAATGTGACTTTCTCTTGTATCTCGGCAGGTT
TAACAATGAGGATCTCAGCACCAAAAGAACAAGTGTCTTGCACAATGTACCCATTGTTAG
TATTCTCGAATGTTGAAAGAGGGATCAATTTTCCAAATCCCCACTCCTTTTTTGCAGCAT
TGTATCGCTTCACGGTTCCATCTGTGACAGT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BG81JQ U 33
AF RS1DK91JQ U 3
AF RS1GS06JQ U 1
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RD RS1BG81JQ 734 0 0
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CCAAATCCCCACTC

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DS 

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ATAATGGCATCATTCACCAAATACCCTTTCGATGGATCCTTTAAATCTGCTAACAATATG
ATATTGTTCACTCCCACACCATAATCACTTCGAATCGGGTACCAAGCTGCAGAATATAAT
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GTAGCAACTGCGTTTTCCTTAAAGCCTTGAGCAAATAGGAAGAGTGGAAGTGCATGTGGT
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AAATCGGCAGAATAGTAAAATTTATCTTCCAAGCTGGAGAAACGAAGTATCTTCCAAGTG
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ACAATGAGGATTTCAGCACCAAAAGAACAAGTGTCTTGCACAATGTACCCATTGTTAGTA
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QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1GS06JQ 811 0 0
ATCTGCCCGGCTGGGCGGGTCAAGGTCTAGTTTCATTGATAACAAAGCAGAAAATAAAAC
ACACTCCAAGGACAGAAATGACGACTACATCACACAAGCATCGATAATTTCATCTTATTA
CAATCTCATTAAGCGTCTCTTTATTTATAAGGTTGTTTGACCCATATATATGAAAAAGAT
GTAGAGATTACTAAGCTGAGACGATATTGGTCACAGAGACCTTAACCATTTCAGCTTCAA
AGATAATGGCATCATTCACCAAATACCCTTTCGATGGATCCTTTAAATCTGCTAACAACA
TGATATTGTTCACTCCCACACCATAATCACTTCGAATCGGGTACCAAGCTGCAGAATATA
ATTGTCTGTGGTTGGAGTTTCGCTGATTCTTCAACCGCAAGTTAACTGCTCCCCAAGTGT
TTGTAGCAACTGCGTTTTCCTTAAAGCCTTGAGCAAATAGGAAGAGTGGAAGTGCATGTG
GTCGTCCATCTCCATCCCCTTTCGGGTTAAAGCCTAATCTCCAGTATCGGTCTCCAACGA
GAAAATCGGCAGAATAGTAAAATTTATCTTCCAAGCTGGAGAAACGAAGTATCTTCCAAG
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TAACAATGAGGATCTCAACACCAAAAGAACAAGTGTCTTGCACAATGTACCCATTGTTAG
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TGTATCGCTTCACGGTTCCATCTGTGACAGT

QA 1 811 1 811
DS 



AS 3 9

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CGTTCTGATTATTTCGATTTGAATCTGT****CTCTACTAATCTTTGGTTATTGGTAGAT
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ACAACAAAACCAAGGATTGTTGGCTTATTATCTCTGGCAAGGTCTATGATGTGACCCCTT
TCATGGATGATCATCCTGGTGGCGATGAAGTCTTGTTGTCCTCAACAGGGAAAGATGCTA
CGAATGACTTTGAAGACGTTGGACACAGCGACACCGCAAGGGACATGATGGAGAAGTACT
ACATTGGCGAGATCGATTCGTCTACTGTTCCAGCGACAAGGACATACGTTGCACCCGTGC
AACCGGCGTATAACCAAGACAAGACACCAGAATTCATCATCAAGATTCTCCAGTTCCTTG
TTCCGATCGTGATCTTGGGTCTTGCTCTCCTCGTCCGTCAGTATACCAAGAAAGAGTAAG
AAGCAGAGAGAGGCTTCAACTTTTGCTTCCCCATTGGATAACTCTTTCTGATCTCTCTGT
ATTTGCAAAAAAAAATACATTTACGGTTGTTTGGTCCTAGTCTAGACTGCATCGTTGTCC
TTAAAATTATTCTTGTTGAAACTACTACGAACCAATAATCAATGTGTTGTTAGTCTCTTC
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GATCGAATAAAAGAAGGCTTCTTTGTTGGTGCTAAAATGTAGAAACGAGAAATTGAATAG
ATACAACAATTGAACTTATATTATCCATAATACAGTTGTGAAAAAAAGACGGT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BP86JQ C 74
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AF RS1D214TF U 29
AF RS1BP86TF U 74
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CCCCATTGGATAACTCTTTCTGATCTCTCTGTATTTGCAA

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GG
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ACGTTGGCCACAGCGACACCGCAAGGGACATGATGGAGAAGTACTACATTGGCGAGATCG
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AAGACAAGACACCAGAATTCATCATCAAGATTCTCCAGTTCCTTGTTCCGATCGTGATCT
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TCAACTTTTGCTTCCCCATTGGATAACTCTTTCTGATCTCTCTGTATTTGC

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RD RS1D417JQ 816 0 0
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AGCGACAAGGACATACGTTGCACCGGTGCAACCGGCGTATAACCAAGACAAGACACCAGA
ATTCATCATCAAGATTCTCCAGTTCCTTGTTCCGATCATGATCTTGGGTCTTGCTCTCCT
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CATTGGATAACTCTTTCTGATCTCTCTGTATTTGCAAAAAAAAATACATTTACGGTTGTT
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ACAGTTGTGAAAAAAAGACGGT

QA 15 816 15 816
DS 



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TCTTTTCCATCATCATCGTTCTGATTATTTCGATTTGAATCTGTCTCTACTAATCTTTGG
TTATTGGTAGATTTGAGAAGAGAGAGATGGCTTCAGAGAAGAAGGTTCTAGCTTTCGAAG
AAGTTTCACAGCACAACAAAACCAAGGATTGTTGGCTTATTATCTCTGGCAAGGTTAGTT
AGATCTCGTGTCTTTGTCTGATAATTCTCTAGTCTACACGACATAATTTTTTTGTAAGCT
ATTGATTTGTCTAAAAAAGCTTCGATGATGTGACACTGGAGAATCATAGTTTGATGTTTA
CTGTTGATAGTTAGTTACTGATTATGTTTGGTTCTTTTACTTTTGAGTTTAGGTCTATGA
TGTGACCCCTTTCATGGATGATCATCCTGGTGGCGATGAAGTCTTGTTGTCCTCAACAGG
TTTTGAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

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TTTTGAT

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DS 

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TGTGACCCCTTTCATGGATGATCATCCTGGTGGCGATGAAGTCTTGTTGTCCTCAACAGG
TTTTGAT

QA 1 487 1 487
DS 



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BQ
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AF RS1E582TF U 1
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G

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DS 

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CCAATAATCAATGTGTTGTTAGTCG

QA 1 505 1 505
DS 



AS 1 7

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BQ
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AF RS1GH45JQ U 75
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ACATCTAAACACAACCCTTACAGCTATTTTCATAACACTTATCTTATTTTTAGAAGCTTT
TTTCTTAAGTATTATCTTCCTTCAAGTTTGTAAACTGAAGTACACATTGTATGTTTCATC
TCTTAAGCTGAACAATGGCGATAACACAAAGTTCCTCTGTGCTCCGTTCATCACGAAGCT
CATCGGATTGTATTCACTCATTCCTTTCCTTAAGCTAAAGCTTGCTGCCTCTTTAAACTT
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CACATAACAACCCTTCTTGCTCTCTAGCATCAAAGAAACACTCCCCTGCTTCCCATCAAC
TCCAGCTACTAAACGAAACCTCGAGGTTTCTTTGTCAGTAGAAGAAGAACCTTGAACCGC
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ACCGCAAGGGAGCTATCGGTTGCTTCCGTCACAAGCATTCCAGGGAAATCAAACGGTTCG
ATCATGACTAGGCTTCCAATTAGCTCCTCTGGACCTAATGATGATATCCTTGCTTTAGAA
TCAGCAGCCACGAGCCTGAAAGTTGATGCAACGGCGGCTTGCGTCCCTGGCGCTGGCGAT
ACTTCCATGGTGATGGTTTGGTTGTTATTT

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DS 

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TTTTTCTTAAGTATTATCTTCCTTCAAGTTTGTAAACTGAAGTACACATTGTATGTTTCA
TCTCTTAAGCTGAACAATGGCGATAACACAAAGTTCCTCTGTGCTCCGTTCATCACGAAG
CTCATCGGATTGTATTCACTCATTCCTTTCCTTAAGCTAAAGCTTGCTGCCTCTTTAAAC
TTCTCATCAGAATCACATGTGAGCTTCAGTTTCATCCCCGGCTTTACTGTTTGATCGCTG
CACACATAACAACCCTTCTTGCTCTCTAGCATCAAAGAAACACTCCCCTGCTTCCCATCA
ACTCCAGCTACTAAACGAAACCTCGAGGTTTCTTTGTCAGTAGAAGAAGAACCTTGAACC
GCAAGGGAGCTATCGGTTGCTTCCGTCACAAGCATTCCAGGGAAATCAAACGGTTCGATC
ATGACTAGGCTTCCAATTAGCTCCTCTGGACCTAATGATGATATCCTTGCTTTAGAATCA
GCAGCCACGAGCCTGAAAGTTGATGCAACGGCGGCTTGCGTCCCTGGCGCTGGCGATAAT
TCCATGGTGATGGTTTGGTTGTTATTTGACAACACGTAAGAT
C

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DS 

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AAATTGCATAAGACAAAACACCTAACAGACTAAACATCTAAACACAACCCTTACAGCTAT
TTTCATAACACTTATCTTATTTTTAGAAGCTTTTTTCTTAAGTATTATCTTCCTTCAAGT
TTGTAAACTGAAGTACACATTGTATGTTTCATCTCTTAAGCTGAACAATGGCGATAACAC
AAAGTTCCTCTGTGCTCCGTTCATCACGAAGCTCATCGGATTGTATTCACTCATTCCTTT
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TTCTTTGTCAGTAGAAGAAGAACCTTGAACCGCAAGGGAGCTATCGGTTGCTTCCGTCAC
AAGCATTCCAGGGAAATCAAACGGTTCGATCATGACTAGGCTTCCAATTAGCTCCTCTGG
ACCTAATGATGATATCCTTGCTTTAGAATCAGCAGCCACGAGCCTGAAAGTTGATGCAAC
GGCGGCTTGCGTCCCTGGCGCTGGCGATAATTCCATGGTGATGGTTTGGTTGTTATTTGA
CAACA

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DS 

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TATATATATTTATTGTAACTTGCAACATACATTTGTAGATTAAATTGCATAAGACAAACC
ACCTAACAGACTAAACATCTAAACACAACCCTTACAGCTATTTTCATAACACTTATCTTA
TTTTTAGAAGCTTTTTTCTTAAGTATTATCTTCCTTCAAGTTTGTAAACTGAAGTACACA
TTGTATGTTTCATCTCTTAAGCTGAACAATGGCGATAACACAAAGTTCCTCTGTGCTCCG
TTCATCACGAAGCTCATCGGATTGTATTCACTCATTCCTTTCCTTAAGCTAAAGCTTGCT
GACTCTTTAAACTTCTCATCAGAATCACATGTGAGCTTCAGTTTCATCCCCGGCTTTACT
GTTTGATCGCTGCACACATAACAACCCTTCTTGCTCTCTAGCATCAAAGAAACACTCCCC
TGCTTCCCATCAACTCCAGCTACTAAACGAAACCTCGAGGTTTCTTTGTCAGTAGAAGAA
GAACCTTGAACCGCAAGGGAGCTATCGGTTGCTTCCGTCACAAGCATTCCAGGGAAATCA
AACGGTTCGATCATGACTAGGCTTCCAATTAGCTCCTCTGGACCTAATGATGATATCCTT
GCTTTAGAATCAGCAGCCACGAGCCTGAAAGTTGATGCAACGGCGGCTTGCGTCCCTGGC
GCTGGCGATACTTCCATGGTGATGGTTTGGTTGTTATTTGACAACACGTAAGATGTGTT*
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*ATATCCCATCTTTAGCTTGAGT*GTGGTGCTCCAGTCCTGCTCGTGAGTCAGC

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TTTAAACTTCTCATCAGAATCACATGTGAGCTTCAGTTTCATCCCCGGCTTTACTGTTTG
ATCGCTGCACACA***CAACCCTTCTTGCTCTCTAGCATCAAAGAAACACTCCCCTGCTT
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CGATACTTCCATGGTGATGGTTTGGTTGTTATTTGACAACACGTAAGATGTGTTTCCAGA
CTGTTGTGAGAGTGTGACGAGGTGAGTGTTGTGTGTTTCAGGGATAGAGCTTATCCATAT
CCCATCTTTAGCTTGAGTTGTGGTGCTCCA
C

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DS 

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AAATTGCATAAGACAAACCACCTAACAGACTAAACATCTAAACACAACCCTTACAGCTAT
TTTCATAACACTTATCTTATTTTTAGAAGCTTTTTTCTTAAGTATTATCTTCCTTCAAGT
TTGTAAACTGAAGTACACATTGTATGTTTCATCTCTTAAGCTGAACAATGGCGATAACAC
AAAGTTCCTCTGTGCTCCGTTCATCACGAAGCTCATCGGATTGTATTCACTCATTCCTTT
CCTTAAGCTAAAGCTTGCTGCCTCTTTAAACTTCTCATCAGAATCACATGTGAGCTTCAG
TTTCATCCCCGGCTTTACTGTTTGATCGCTGCACACA***CAACCCTTCTTGCTCTCTAG
CATCAAAGAAACACTCCCCTGCTTCCCATCAACTCCAGCTACTAAACGAAACCTCGAGGT
TTCTTTGTCAGTAGAAGAAGAACCTTGAACCGCAAGGGAGCTATCGGTTGCTTCCGTCAC
AAGCATTCCAGGGAAATCAAACGGTTCGATCATGACTAGGCTTCCAGTTAGCTCCTCTGG
ACCTAATG**GATATCCTTGCTTTAGAATCAGCAGCCACGAGCCTGAAAGTTGATGCAAC
GGCGGCTAGCGTCCCTGGCGCTGGCGATACTTCCATGGTGATGGTTTGGTTGTTATTTGA
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TTCAGGGATAGAGCTTATCCATATCCCATCTTTAGCTTGAGTTG

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DS 



AS 1 8

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CTTTCTTCCTTTCCGAAATCTTTGACAAAATTTAGGGTTTTTTTCTAATCTATGATGTAA
TGATTTCATATATTGAGTTCTTTTGGCTGAACTCATGATGTTTCCTTAGTTTGGAGTGTA
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GGAATCTTGGTTACTTTTCTTGAATTAGCATTTGCTTATTGTCTATTATGTGTATCAGCT
TTGGTCTTTATTGCGTCCAAGTTCTTACTCTATTTACCTTGTCCCTCTTCTGGAATGCTT
GGGTACCAAAACGTCCATAAACTTCTCTTTGACTTGCCATTCGAGATCATACTCCGAATC
CAGAAGATGGCCGTTGCCAGTAGAACAAGCGTTTGGCATCATCAAGACCAAGAAGAAGAG
AGAAAGAGTTCGGTTGGTAAAGATAAGAACTTGGAATTAATGAATAAGGTGAGATTGCTT
GAAGAAGCTGTTGAGGAAGAGAGGTTGGCTCGATCTGCTCTAATCGTGGAATTGGAGGAA
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TTTGCATATGATGAGGTAGAGATGAATATTCTCAAGGAGATTTTATTCAAAAGGGAGAGG
GAAAAGCATTTTCTTGAGAAGGAACTTGAGACTTACAAGCACATTGATGATGATGATGAT
GAT***CAAGAAGCGATTGTGTATGATGTTCATGTCATTGAAAATGATAATAATGCTAAG
AAGAAAGATGTTGACGCAGCAGAACATAAAGTAAGGGACTGTGATGATCAAGTGAAGCAA
ATGGATGACTTATTGAAGGATAGTGATTCATCAACATAACCTTCTTAATAAAGTTTTTCT
GTTGGTTGTAATATCTTTGCTATCTTGCTTACTCTGTTTTCTGTAATGTGGTTTGGGTAG
ACTTTGTATAAATTTGTGAAAATATTAGTGTACAACTTTGTGACATCTGTAAACGCATCA
AATGATATTAAGATCGCTTTTATTTGTATT


BQ
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 
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20 20 20 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

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RD RS1FX67TF 654 0 0
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CAGTTTGAGGTGGTTCGCTCTGACCTCAGCTTCATCTCTTTTCTTTT*****ATTACAAC
GAGATCAATTATTTTCTTGACTGGTATAGGTTTTGATTGAGCTTTTGTCTAATAACTTTT
CTTTCTTCCTTTCCGAAATCTTTGACAAAATTTAGGGTTTTTTTCTAATCTATGATGTAA
TGATTTCATATATTGAGTTCTTTTGGCTGAACTCATGATGTTTCCTTAGTTTGGAGTGTA
TTAAAAGCTAATCTTTCTCTGTTTTTTTTTT*GTATGGTTTAAGTTTTTTTTTACAGATC
ATCAGATTTGGTTTCACATTCAGACGCTGAGATTTCAGATTCCTGAAAGATCTGGCTATT
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TCGGTCTTTATTGCGTCCAAGTTCTTACTCTATTTACCTTGTCCCTCTTCTGGAATGCTT
GGGTACCAAAACGTCCATAAACTTCTCTTTGACTTGCCATTCGAGATCATACTC

QA 1 654 1 654
DS 

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CAGTTTGAGGTGGTTCGCTCTGACCTCAGCTTCATCTCTTTTCTTTTCTTTTATTACAAC
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GGGTACCAAAACGTCCATAAACTTCTCTTTGACTTGCCATTCGAGATCATACTCCGAATC
CAGAAGATGGCCGTTGCCAGTAGAACAAGCGTTTGGCA

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DS 

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GGACGCAAGCCATAGCTCCTGCTATTTCTTCCCGTCTCTCTCTTCTTTGACTTTTTTTCC
CAGTTTGAGGTGGTTCGCTCTGACCTCAGCTTCATCTCTTTTCTTTTCTTTTATTACAAC
GAGATCAATTATTTTCTTGACTGGTATAGGTTTTGATTGAGCTTTTGTCTAATAACTTTT
CTTTCTTCCTTTCCGAAATCTTTGACAAAATTTAGGGTTTTTTTCTAATCTATGATGTAA
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GGAATCTTGGTTACTTTTCTTGAATTAGCATTTGCTTATTGTCTATTATGTGTATCAGCT
TTGGTCTTTATTGCGTCCAAGTTCTTACTCTATTTACCTTGTCCCTCTTCTGGAATGCTT
GGGTACCAAAACGTCCATAAACTTCTCTTTGACTTGCCATTCGAGATCATACTCCGAATC
CAGAAGATGGCCGTTGCCAGTAGAACAAGCGTTTGGCATCATCAAGACCAAGAAGAAGAG
AGAAAGAGTTCGGTTGGTAAAGATAAGAACTTG

QA 1 753 1 753
DS 

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ATCTTGGTTGCTTTTCTTGAATTAGCATTTGCTTATTGTCTATTATGTGTATCAGCTTTG
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AAGCATTTTCTTGAGAAG*AACTTGAGACTTACA*GCACATTGATGATGATGATGATGAT
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DS 

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CCTC
TCTGGAATGCTTGGGTACCAAAACGTCCATAAACTTCTCTTTGACTTGCCATTCGAGATC
ATACTCCGAATCCAGAAGATGGCCGTTGCCAGTAGAACAAGCGTTTGGCATCATCAAGAC
CAAGAAGAAGAGAGAAAGAGTTCGGTTGGTAAAGATAAGAACTTGGAATTAATGAATAAG
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TAAAGTTTTTCTGTTGGTTGTAATATCTTTGCTATCTTTCTTACTCTGTTTTCTGTAATG
TGGTTTGGGTAGACTTTGTATAAATTTGTGAAAATATTA
AT

QA 5 763 5 763
DS 

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TTGAAGAAGCTGTTGAGGAAGAGAGGTTGGCTCGATCTGCTCTAATCGTGGAATTGGAGG
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CTGTTGGTTGTAATATCTTTGCTCTCTTGCT*ACTCTGTTTTCCGTAATGTGGTTTGGGT
AGACTTTGTATAAATTTGTGAAAATATTAATGTAGAACTTTGTGACATC

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1FJ72JQ 771 0 0
TTCGAGATCATACTCCGAATCCAGAAGATGGCCGTTGCCAGTAGAACAAGCGTTTGGCAT
CATCAAGACCAAGAAGAAGAGAGAAAGAGTTCGGTTGGTAAAGATAAGAACTTGGAATTA
ATGAATAAGGTGAGATTGCTTGAAGAAGCTGTTGAGGAAGAGAGGTTGGCTCGATCTGCC
CTAATCGTGGAATTGGAGGAAGAAAGAGCGGCTTCAGCGTCAGCAGCTGATGAAGCCATG
GCTATGATTCTGAGGTTACAAGCTGATAAAGCTTCACTTGAAATGGAAGGGAAGCAGTAT
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ATTTTATTCAAAAGGGAGAGGGAAGGGCATTTTCTTGAGAAGGAACTTGAGACTTACAAG
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TCTGTAATGTGGTTTGGGTAGACTTTGTATAAATTTGTGAAAATATTAGTGTACAACTTT
GTGACATCTGTAAACGCATCAAATGATATTAAGATCGCTTTTATTTGTATT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RS1F595JQ 730 0 0
TAGAACAAGCGTTTGGCATCATCAAGACCAAGAAGAAGAGAGAAAGAGTTCGGTTGGTAA
AGATAAGAACTTGGAATTAATGAATAAGGTGAGATTGCTTGAAGAAGCTGTTGAGGAAGA
GAGGTTGGCTCGATCTGCCCTAATCGTGGAATTGGAGGAAGAAAGAGCGGCTTCAGCGTC
AGCAGCTGATGAAGCCATGGCTATGATTCTGAGGTTACAAGCTGATAAAGCTTCACTTGA
AATGGAAGGGAAGCAGTATGAGAGAATGATTGAGGAGAAATTTGCATATGATGAGGTAGA
GATGAATATTCTCAAGGAGATTTTATTCAAAAGGGAGAGGGAAGGGCATTTTCTTGAGAA
GGAACTTGAGACTTACAAGCACATTGATGATGATGATGATGAT***CAAGAAGCGATTGT
GTATGATGTTCATGTCATTGAAAATGATAATAATGCTAAGAAGAAAGATGTTGACGCAGC
AGAACATAAAGTAAGGGACTGTGATGATCAAGTGAAGCAAATGGATGACTTATTGAAGGA
TAGTGATTCATCAACATAACCTTCTTAATAAAGTTTTTCTGTTGGTTGTAATATCTTTGC
TATCTTGCTTACTCTGTTTTCTGTAATGTGGTTTGGGTAGACTTTGTATAAATTTGTGAA
AATATTAGTGTACAACTTTGTGACATCTGTAAACGCATCAAATGATATTAAGATCGCTTT
TATTTGTATT

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 9

CO CL467Contig1 1080 9 5 U
GGACACACACACACACATAGAGGGTTAGAGATTCATCAATGGCGGTTTCTTGCAGCTACT
CATCGATTCTCTTCCCCCGATCCACCGCGGGTACCTCCTCCATTGGCTTCAACCGCTTCC
CTTGTCTCCAAACGCTGCGTTTCAAATCAAGAAACGTTTATCCAAAATCTCGTGCTTCTT
CAGTCTCGGCATCATCAGCTTCACGGTCTCTCGAAGCTCTGATCTTCGACTGCGACGGTG
TGATACTCGAATCGGAGAACTTACACCGTCAAGCTTACAACGACGCATTCTCGCATTTCG
ATGTTCGATGTCCTCCTTCCTCATCCGAGTCTCTCAACTGGAGCCTCGAGTTCTACGACA
AGTTTCAGAATCTTGTCGGAGGTGGGAAACCTAAAATGAGATGGTACTTTAGAGAGAATG
GATGGCCAACTTCGACCCTTTTCGACACACCTCCAGAGAGTGACGATGATCGAGCCAAGT
TGATCGATACTCTTCAGGATTGGAAGACAGAGAGGTACAAAGAGATCATTAAATCAGGAG
GTGTAGAAGCAAGACCTGGTGTAATAAGACTAATGGATGAAGCAAGAGCTGCTGGGAAGA
AACTATCTGTGTGTTCTGCAGCTACAAAGAGTTCAGTTGTCTTATGTCTTGAGAATCTAA
TCCAAATCGAGCGATTCCAAGGACTTGATTGCTTTCTTGCAGGAGATGATGTTAAGGAGA
AGAAACCTGATCCTTCTATATATATAACAGCTGCCGAGAAGCTAGGTGTTTCAGTGAAAG
ACTGTTTGGTCATAGAGGACAGTGTGATTGGCCTGCAGGCTGCTACAAAAGCAGGCATGT
CATGTGTGATCACATACACTTCTTCAACCTCTGATCAGGACTTCAAAGAGGCGATTGCTG
TATACCCTGATCTCAGTAATGTGAGCTTGAAAGAGCTGGAAACTTTGCTTCAAACCGTTG
TCACTGCAGCTTAATACGCACATTTGCCTCCTTTTCATTTTTGTTTCTTCGTCTGCATTT
GTACATCTGTTTTTGCTTATTAATTTTTTTTCATTAATCATATAAATAGCGGCACAATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FF06TF U 81
AF RS1DY34TF U 1
AF RS1BH72TF U 4
AF RS1C921TF U 3
AF RS1FI20TF U 7
AF RS1BH72JQ C 783
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AF RS1DY34JQ C 421
BS 1 622 RS1DY34TF
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BS 760 761 RS1FI20TF
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RD RS1FF06TF 307 0 0
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TTCAAATCAAGAAACGTTTATCCAAAATCTCGTGCTTCTTCAGTCTCGGCATCATCAGCT
TCACGGTCTCTCGAAGCTCTGATCTTCGACTGCGACGGTGTGATACTCGAATCGGAGAAC
TTACACCGTCAAGCTTACAACGACGCATTCT*GCATTTCGATGTTCGATGTCCTCCTTCC
TCATCCGAGTCTCTCAACTGGAGCCTCGAGTTCTACGACAAGTTTCAGAATCTTGTCGGA
GGTGGG
G

QA 1 306 1 306
DS 

RD RS1DY34TF 622 0 0
GGACACACACACACACATAGAGGGTTAGAGATTCATCAATGGCGGTTTCTTGCAGCTACT
CATCGATTCTCTTCCCCCGATCCACCGCGGGTACCTCCTCCATTGGCTTCAACCGCTTCC
CTTGTCTCCAAACGCTGCGTTTCAAATCAAGAAACGTTTATCCAAAATCTCGTGCTTCTT
CAGTCTCGGCATCATCAGCTTCACGGTCTCTCGAAGCTCTGATCTTCGACTGCGACGGTG
TGATACTCGAATCGGAGAACTTACACCGTCAAGCTTACAACGACGCATTCTCGCATTTCG
ATGTTCGATGTCCTCCTTCCTCATCCGAGTCTCTCAACTGGAGCCTCGAGTTCTACGACA
AGTTTCAGAATCTTGTCGGAGGTGGGAAACCTAAAATGAGATGGTACTTTAGAGAGAATG
GATGGCCAACTTCGACCCTTTTCGACACACCTCCAGAGAGTGACGATGATCGAGCCAAGT
TGATCGATACTCTTCAGGATTGGAAGACAGAGAGGTACAAAGAGATCATTAAATCAGGAG
GTGTAGAAGCAAGACCTGGTGTAATAAGACTAATGGATGAAGCAAGAGCTGCTGGGAAGA
AACTATCTGTGTGTTCTGCAGC

QA 1 622 1 622
DS 

RD RS1BH72TF 695 0 0
GAC
ACACACACACATAGAGGGTTAGAGATTCATCAATGGCGGTTTCTTGCAGCTACTCATCGA
TTCTCTTCCCCCGATCCACCGCGGGTACCTCCTCCATTGGCTTCAACCGCTTCCCTTGTC
TCCAAACGCTGCGTTTCAAATCAAGAAACGTTTATCCAAAATCTCGTGCTTCTTCAGTCT
CGGCATCATCAGCTTCACGGTCTCTCGAAGCTCTGATCTTCGACTGCGACGGTGTGATAC
TCGAATCGGAGAACTTACACCGTCAAGCTTACAACGACGCATTCTCGCATTTCGATGTTC
GATGTCCTCCTTCCTCATCCGAGTCTCTCAACTGGAGCCTCGAGTTCTACGACAAGTTTC
AGAATCTTGTCGGAGGTGGGAAACCTAAAATGAGATGGTACTTTAGAGAGAATGGATGGC
CAACTTCGACCCTTTTCGACACACCTCCAGAGAGTGACGATGATCGAGCCAAGTTGATCG
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AAGCAAGACCTGGTGTAATAAGACTAATGGATGAAGCAAGAGCTGCTGGGAAGAAACTAT
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TCGAGCGATTCCAAG*ACTTGATTGCTTTCTT

QA 4 695 4 695
DS 

RD RS1C921TF 757 0 0
GGAC
ACACACACACATAGAGGGTTAGAGATTCATCAATGGCGGTTTCTTGCAGCTACTCATCGA
TTCTCTTCCCCCGATCCACCGCGGGTACCTCCTCCATTGGCTTCAACCGCTTCCCTTGTC
TCCAAACGCTGCGTTTCAAATCAAGAAACGTTTATCCAAAATCTCGTGCTTCTTCAGTCT
CGGCATCATCAGCTTCACGGTCTCTCGAAGCTCTGATCTTCGACTGCGACGGTGTGATAC
TCGAATCGGAGAACTTACACCGTCAAGCCTACAACGACGCATTCTCGCATTTCGATGTTC
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AGAATCTTGTCGGAGGTGGGAAACCTAAAATGAGATGGTACTTTAGAGAGAATGGATGGC
CAACTTCGACCCTTTTCGACACACCTCCAGAGAGTGACGATGATCGAGCCAAGTTGATCG
ATACCCTTCAGGATTGGAAGACAGAGAGGTACAAAGAGATCATTAAATCAGGAGGTGTAG
AAGCAAGACCTGGTGTAATAAGACTAATGGATGAAGCAAGAGCTGCTGGGAAGAAACTAT
CTGTGTGTTCTGCAGCTACAAAGAGTTCAGTTGTCTTATGTCTTGAGAATCTAATCCAAA
TCGAGCGATTCCAAGGACTTGATTGCTTTCTTGCAGGAGATGATGTTAAGGAGAAGAAAC
CTGATCCTTCTATATATATAACAGCTGCCGAGA

QA 5 757 5 757
DS 

RD RS1FI20TF 755 0 0
ACACACACACATAGAGGGTTAGAGATTCATCAATGGCGGTTTCTTGCAGCTACTCATCGA
TTCTCTTCCCCCGATCCACCGCGGGTACCTCCTCCATTGGCTTCAACCGCTTCCCTTGTC
TCCAAACGCTGCGTTTCAAATCAAGAAACGTTTATCCAAAATCTCGTGCTTCTTCAGTCT
CGGCATCATCAGCTTCACGGTCTCTCGAAGCTCTGATCTTCGACTGCGACGGTGTGATAC
TCGAATCGGAGAACTTACACCGTCAAGCTTACAACGACGCATTCT*GCATTTCGATGTTC
GATGTCCTCCTTCCTCATCCGAGTCTCTCAACTGGAGCCTCGAGTTCTACGACAAGTTTC
AGAATCTTGTCGGAGGTGGGAAACCTAAAATGAGATGGTACTTTAGAGAGAATGGATGGC
CAACTTCGACCCTTTTCGACACACCTCCAGAGAGTGACGATGATCGAGCCAAGTTGATCG
ATACTCTTCAGGATTGGAAGACAGAGAGGTACAAAGAGATCATTAAATCAGGAGGTGTAG
AAGCAAGACCTGGTGTAATAAGACTAATGGATGAAGCAAGAGCTGCTGGGAAGAAACTAT
CTTTGTGTTCTGCAGCTACAAAGAGTTCAGTTGTCTTATGTCTTGAGAATCTAATCCAAA
TCGAGCGATTCCAAGGACTTGATTGCTTTCTTGCAG*AGATGATGTTAAG*AGAAGAAAC
CTGATCCTTCTATATATATAACAGCTGCCGAGAAG

QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1BH72JQ 159 0 0
TGTTTGGTCATAGAGGACAGTGTGATTGGCCTGCAGGCTGCTACAAAAGCAGGCATGTCA
TGTGGGATCACATACACTTTTTCAACCTCTGATCAGGACTTCAAAGAGGCGATTGCTGTA
TACCCTGATCTCAGTAATGTGAGCTTGAAAGAGCTGGAA

QA 1 159 1 159
DS 

RD RS1FF06JQ 707 0 0
CTACGACAAGTTTCAGAATCTTGTCGGAGGTGGGAAACCTAAAATGAGATGGTACTTTAG
AGAGAATGGATGGCCAACTTCGACCCTTTTCGACACACCTCCAGAGAGTGACGATGATCG
AGCCAAGTTGATCGATACTCTTCAGGATTGGAAGACAGAGAGGTACAAAGAGATCATTAA
ATCAGGAGGTGTAGAAGCAAGACCTGGTGTAATAAGACTAATGGATGAAGCAAGAGCTGC
TGGGAAGAAACTATCTTTGTGTTCTGCAGCTACAAAGAGTTCAGTTGTCTTATGTCTTGA
GAATCTAATCCAAATCGAGCGATTCCAAGGACTTGATTGCTTTCTTGCAGGAGATGATGT
TAAGGAGAAGAAACCTGATCCTTCTATATATATAACAGCTGCCGAGAAGCTAGGTGTTTC
AGTGAAAGACTGTTTGGTCATAGAGGACAGTGTGATTGGCCTGCAGGCTGCTACAAAAGC
AGGCATGTCATGTGTGATCACATACACTTCTTCAACCTCTGATCAGGACTTCAAAGAGGC
GATTGCTGTATACCCTGATCTCAGTAATGTGAGCTTGAAAGAGCTGGAAACTTTGCTTCA
AACCGTTGTCACTGCAGCTTAATACGCACATTTGCCTCCTTTTCATTTTTGTTTCTTCGT
CTGCATTTGTACATCTGTTTTTGCTTATTAATTTTTTTTCATTAATC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1FI20JQ 572 0 0
TACTCTTCAGGATTGGAAGACAGAGAGGTACAAAGAGATCATTAAATCAGGAGGTGTAGA
AGCAAGACCTGGTGTAATAAGACTAATGGATGAAGCAAGAGCTGCTGGGAAGAAACTATC
TTTGTGTTCTGCAGCTACAAAGAGTTCAGTTGTCTTATGTCTTGAGAATTTAATCCAAAT
CGAGCGATTCCAAGGACTTGATTGCTTTCTTGCAGGAGATGATGTTAAGGAGAAGAAACC
TGATCCTTCTATATATATAACAGCTGCCGAGAAGCTAGGTGTTTCAGTGAAAGACTGTTT
GGTCATAGAGGACAGTGTGATTGGCCTGCAGGCTGCTACAAAAGCAGGCATGTCATGTGT
GATCACATACACTTTTTCAACCTCTGATCAGGACTTCAAAGAGGCGATTGCTGTATACCC
TGATCTCAGTAATGTGAGCTTGAAAGAGCTGGAAACTTTGCTTCAAACCGTTGTCACTGC
AGCTTAATACGCACATTTGCCTCCTTTTCATTTTTGTTTCTTCGTCTGCATTTGTACATC
TGTTTTTGCTTATTAATTTTTTTTCATTAATC

QA 1 572 1 572
DS 

RD RS1DY34JQ 660 0 0
GATGGCCAACTTCGACCCTTTTCGACACACCTCCAGAGAGTGACGATGATCGAGCCAAGT
TGATCGATACTCTTCAGGATTGGAAGACAGAGAGGTACAAAGAGATCATTAAATCAGGAG
GTGTAGAAGCAAGACCTGGTGTAATAAGACTAATGGATGAAGCAAGAGCTGCTGGGAAGA
AACTATCTGTGTGTTCTGCAGCTACAAAGAGTTCAGTTGTCTTATGTCTTGAGAATCTAA
TCCAAATCGAGCGATTCCAAGGACTTGATTGCTTTCTTGCAGGAGATGATGTTAAGGAGA
AGAAACCTGATCCTTCTATATATATAACAGCTTCCGAGAAGCTAGGTGTTTCAGTGAAAG
ACTGTTTGGCCATAGAGGACAGTGTGATTGGCCTGCAGGCTGCTACAAAAGCAGGCATGT
CATGTGTGATCACATACACTTCTTCAACCTCTGATCAGGACTTCAAAGAGGCGATTGCTG
TATACCCTGATCTCAGTAATGTGAGCTTGAAAGAGCTGGAAACTCTGCTTCAAACCATTG
TCACTGCAGCTTAATACACACATTTGCCTCCTTTTCATTTTTGTTTCTTCGTCTGCATTT
GTACATCTGTTTTTGCTTATTAATTTTTTTTCATTAATCATATAAATAGCGGCACAATTC

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 9

CO CL468Contig1 774 9 21 U
GGCATTACGGCCGGGGGGCAGCCGATTCTTTTGATAGCCGCAGCCATGGTGAAGTACTCG
CAAGAACCAGACAACC*AGACCAAGTCTTGCAAGGCTAGAGGTTCCGATCTTAGGGTTCA
CTTCAAGAACACTAGGGAAACAGCGCACGCTATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCCAA
GAGGTACCTTGAGGATGTGATAGCTCACAAGCAGGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAG
AGGTGTTGGAAGGACTGCTCAAGCTAAGAACAGGCACTCCAACGGTCAAGGACGTTGGCC
TGCTAAATCTGCTCAGTTCGTTCTCGATTTGCTCAAGAACGCTGAGAGCAATGCTGAGGT
GAAAGGTTTGGATGTTGATGCGCTCTTCATTTCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCGAA
ACAGAGGAGAAGGACTTACCGTGCTCATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATG
CCACATTGAGTTGATTTTGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACCCA
GTTGGCAGCCAAGTCGAAGAAATCAAGTGCTTAAGCTTTCGTTTATTTTCAGTTTTTTCT
TTTTGCGTTTCTGAACGAGATTTTGTTCCCTTTTCTCCATATTCCCTGTCAAGACAATGG
ATAGAGTTCAATGTTGGTCTTATGAATCATTAATCATTGTTACTAGAATCTTTCTTCTGC
CTTCATTGGTTATGTCAGAAACTATCTTTATTTAACTCTGCTTATATTTGCCTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 5 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DW20JQ C 1
AF RS1DW20TF U 1
AF RS1DC35JQ C 14
AF RS1DC35TF U 14
AF RS1FL41TF U 16
AF RS1CU74TF U 16
AF RS1AD09JQ C 17
AF RS1CU74JQ C 27
AF RS1AD09TF U 17
BS 1 133 RS1DW20TF
BS 134 134 RS1DC35TF
BS 135 222 RS1DW20TF
BS 223 223 RS1DC35TF
BS 224 282 RS1DW20TF
BS 283 283 RS1DC35TF
BS 284 318 RS1DW20TF
BS 319 319 RS1DC35TF
BS 320 324 RS1DW20TF
BS 325 325 RS1DC35TF
BS 326 367 RS1DW20TF
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BS 369 405 RS1DW20TF
BS 406 406 RS1DC35TF
BS 407 574 RS1DW20TF
BS 575 575 RS1CU74TF
BS 576 625 RS1DW20TF
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BS 627 695 RS1DW20TF
BS 696 753 RS1CU74TF
BS 754 774 RS1AD09JQ

RD RS1DW20JQ 695 0 0
GGCATTACGGCCGGGGGGCAGCCGATTCTTTTGATAGCCGCAGCCATGGTGAAGTACTCG
CAAGAACCAGACAACC*AGACCAAGTCTTGCAAGGCTAGAGGTTCCGATCTTAGGGTTCA
CTTCAAGAACACTCGGGAAACAGCGCACGCTATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCCAA
GAGGTACCTTGAGGATGTGATAGCTCACAAGCAGGCTATTCCTTTCACCCGTTTCTGCAG
AGGTGTTGGAAGGACTGCTCAAGCTAAGAACAGGCACTCCAATGGTCAAGGACGTTGGCC
TGCTAAATCTGCTCAGTTTGTTCTTGATTTGCTCAAGAACGCTGAGAGCAATGCTGAGGT
GAAAGGTCTGGATGTTGATGCGCTCTTCATTTCGCACATCCAAGTCAACCAGGCTGCGAA
ACAGAGGAGAAGGACTTACCGTGCTCATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATG
CCACATTGAGTTGATTTTGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACCCA
GTTGGCAGCCAAGTCGAAGAAATCAAGTGCTTAATCTTTCGTTTATTTTCAGTTTTTTCT
TTTTGCGTTTCTGAACGAGATTTTGCTCCCTTTTCTCCATATTCCCTGTCAAGACAATGG
ATAGAGTTCAATGTTGGTCTTATGAATCATTAATC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1DW20TF 695 0 0
GGCATTACGGCCGGGGGGCAGCCGATTCTTTTGATAGCCGCAGCCATGGTGAAGTACTCG
CAAGAACCAGACAACC*AGACCAAGTCTTGCAAGGCTAGAGGTTCCGATCTTAGGGTTCA
CTTCAAGAACACTCGGGAAACAGCGCACGCTATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCCAA
GAGGTACCTTGAGGATGTGATAGCTCACAAGCAGGCTATTCCTTTCACCCGTTTCTGCAG
AGGTGTTGGAAGGACTGCTCAAGCTAAGAACAGGCACTCCAATGGTCAAGGACGTTGGCC
TGCTAAATCTGCTCAGTTTGTTCTTGATTTGCTCAAGAACGCTGAGAGCAATGCTGAGGT
GAAAGGTCTGGATGTTGATGCGCTCTTCATTTCGCACATCCAAGTCAACCAGGCTGCGAA
ACAGAGGAGAAGGACTTACCGTGCTCATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATG
CCACATTGAGTTGATTTTGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACCCA
GTTGGCAGCCAAGTCGAAGAAATCAAGTGCTTAATCTTTCGTTTATTTTCAGTTTTTTCT
TTTTGCGTTTCTGAACGAGATTTTGCTCCCTTTTCTCCATATTCCCTGTCAAGACAATGG
ATAGAGTTCAATGTTGGTCTTATGAATCATTAATC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1DC35JQ 682 0 0
GGCT
GCAGCCGATTCTTTTGATAGCCGCAGCCATGGTGAAGTACTCGCAAGAACCAGACAACC*
AGACCAAGTCTTGCAAGGCTAGAGGTTCCGATCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACTAGGG
AAACAGCGCACGCTATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCCAAGAGGTACCTTGAGGATG
TGATAGCTCACAAGCAGGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGCTGGAAGGACTG
CTCAAGCTAAGAACAGGCACTCCAACGGTCAAGGACGTTGGCCTGCTAAATCTGCTCAGT
TCGTTCTCGATTTGCTCAAGAACGCTGAGAGCAATGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTTG
ATGCGCTCTTCATTTCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCGAAACAGAGGAGAAGGACTT
ACCGTGCTCATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTTGATTT
TGTTTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACCCAGTTGGCAGCCAAGTCGA
AGAAATCAAGTGCTTAAGCTTTCGTTTATTTTCAGTTTTTTCTTTTTGCGTTTCTGAACG
AGATTTTGTTCCCTTTTCTCCATATTCCCTGTCAAGACAATGGATAGAGTTCAATGTTGG
TCTTATGAATCATTAATC

QA 5 682 5 682
DS 

RD RS1DC35TF 682 0 0
GGCT
GCAGCCGATTCTTTTGATAGCCGCAGCCATGGTGAAGTACTCGCAAGAACCAGACAACC*
AGACCAAGTCTTGCAAGGCTAGAGGTTCCGATCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACTAGGG
AAACAGCGCACGCTATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCCAAGAGGTACCTTGAGGATG
TGATAGCTCACAAGCAGGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGCTGGAAGGACTG
CTCAAGCTAAGAACAGGCACTCCAACGGTCAAGGACGTTGGCCTGCTAAATCTGCTCAGT
TCGTTCTCGATTTGCTCAAGAACGCTGAGAGCAATGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTTG
ATGCGCTCTTCATTTCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCGAAACAGAGGAGAAGGACTT
ACCGTGCTCATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTTGATTT
TGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACCCAGTTGGCAGCCAAGTCGA
AGAAATCAAGTGCTTAAGCTTTCGTTTATTTTCAGTTTTTTCTTTTTGCGTTTCTGAACG
AGATTTTGTTCCCTTTTCTCCATATTCCCTGTCAAGACAATGGATAGAGTTCAATGTTGG
TCTTATGAATCATTAATC

QA 5 682 5 682
DS 

RD RS1FL41TF 686 0 0
GGGCAGCCGATTCTTTTGATAGCCGCAGCCATGGTGAAGTACTCGCAAGAACCAGACAAC
C*AGACCAAGTCTTGCAAGGCTAGAGGTTCCGATCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACTAG
GGAAACAGCGCACGCTATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCCAAGAGGTACCTTGAGGA
TGTGATAGCTCACAAGCAGGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGAC
TGCTCAAGCTAAGAACAGGCACTCCAACGGTCAAGGACGTTGGCCTGCTAAATCTGCTCA
GTTCGTTCTCGATTTGCTCAAGAACGCTGAGAGCAATGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGT
TGATGCGCTCTTCATTTCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCGAAACAGAGGAGAAGGAC
TTACCGTGCTCATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTTGAT
TTTGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACCCAGTTGGCAGCCAAGTC
GAAGAAATCAAGTGCTTAAGCTTTCGTTTATTTTCAGTTTTTTCTTTTTGCGTTTCTGAA
CGAGATTTTGTTCCCTTTTCTCCATATTCCCTGTCAAGACAATGGATAGAGTTCAATGTT
GGTCTTATGAATCATTAATCATTGTT

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1CU74TF 738 0 0
GGGCAGCCGATTCTTTTGATAGCCGCAGCCATGGTGAAGTACTCGCAAGAACCAGACAAC
C*AGACCAAGTCTTGCAAGGCTAGAGGTTCCGATCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACTCG
GGAAACAGCGCACGCTATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCCAAGAGGTACCTTGAGGA
TGTGATAGCTCACAAGCAGGCTATTCCTTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGAC
TGCTCAAGCTAAGAACAGGCACTCCAATGGTCAAGGACGTTGGCCTGCTAAATCTGCTCA
GTTTGTTCTTGATTTGCTCAAGAACGCTGAGAGCAATGCTGAGGTGAAAGGTCTGGATGT
TGATGCGCTCTTCATTTCGCACATCCAAGTCAACCAGGCTGCGAAACAGAGGAGAAGGAC
TTACCGTGCTCATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTTGAT
TTTGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCTGGAGACCCAGTTGGCAGCCAAGTC
GAAGAAATCAAGTGCTTAAGCTTTCGTTTATTTTCAGTTTTTTCTTTTTGCGTTTCTGAA
CGAGATTTTTTTCCCTTTTCTCCATATTCCCTGTCAAGACAATGGATAGAGTTCAATGTT
GGTCTTATGAATCATTAATCATTGTTACTAGAATCTTTCTTCTGCCTTCATTGGTTATGT
CAGAAACTATCTTTATTT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1AD09JQ 758 0 0
GGCAGCCGATTCTTTTGATAACCGCAGCCATGGTGAAGTACTCGCAAGAACCAGACAACC
CAGACCAAGTCTTGCAAGGCTAGAGGTTCCGATCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACTAGG
GAAACAGCGCACGCTATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCCAAGAGGTACCTTGAGGAT
GTGATAGCTCACAAGCAGGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACT
GCTCAAGCTAAGAACAGGCACTCCAACGGTCAAGGACGTTGGCCTGCTAAATCTGCTCAG
TTCGTTCTCGATTTGCTCAAGAACGCTGAGAGCAATGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTT
GATGCGCTCTTCATTTCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCGAAACAGAGGAGAAGGACT
TACCGTGCTCATTGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTTGATT
TTGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACCCAGTTGGCAGCCAAGTCG
AAGAAATCAAGTGCTTAAGCTTTCGTTTATTTTCAGTTTTTTCTTTTTGCGTTTCTGAAC
GAGATTTTGTTCCCTTTTCTCCATATTCCCTGTCAAGACAATGGATAGAGTTCAATGTTG
GTCTTATGAATCATTAATCATTGTTACTAGAATCTTTCTTCTGCCTTCATTGGTTATGTC
AGAAACTATCTTTATTTAACTCTGCTTATATTTGCCTT

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1CU74JQ 727 0 0
TCTTTTGATAGCCGCAGCCATGGTGAAGTACTCGCAAGAACCAGACAACC*AGACCAAGT
CTTGCAAGGCTAGAGGTTCCGATCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACTCGGGAAACAGCGC
ACGCTATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCCAAGAGGTACCTTGAGGATGTGATAGCTC
ACAAGCAGGCTATTCCTTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACTGCTCAAGCTA
AGAACAGGCACTCCAATGGTCAAGGACGTTGGCCTGCTAAATCTGCTCAGTTTGTTCTTG
ATTTGCTCAAGAACGCTGAGAGCAATGCTGAGGTGAAAGGTCTGGATGTTGATGCGCTCT
TCATTTCGCACATCCAAGTCAACCAGGCTGCGAAACAGAGGAGAAGGACTTACCGTGCTC
ATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTTGATTTTGTCTGAGA
AGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCTGGAGACCCAGTTGGCAGCCAAGTCGAAGAAATCAA
GTGCTTAAGCTTTCGTTTATTTTCAGTTTTTTCTTTTTGCGTTTCTGAACGAGATTTTTT
TCCCTTTTCTCCATATTCCCTGTCAAGACAATGGATAGAGTTCAATGTTGGTCTTATGAA
TCATTAATCATTGTTACTAGAATCTTTCTTCTGCCTTCATTGGTTATGTCAGAAACTATC
TTTATTT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1AD09TF 722 0 0
GGCAGCCGATTCTTTTGATAACCGCAGCCATGGTGAAGTACTCGCAAGAACCAGACAACC
*AGACCAAGTCTTGCAAGGCTAGAGGTTCCGATCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACTAGG
GAAACAGCGCACGCTATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCCAAGAGGTACCTTGAGGAT
GTGATAGCTCACAAGCAGGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACT
GCTCAAGCTAAGAACAGGCACTCCAACGGTCAAGGACGTTGGCCTGCTAAATCTGCTCAG
TTCGTTCTCGATTTGCTCAAGAACGCTGAGAGCAATGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTT
GATGCGCTCTTCATTTCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCGAAACAGAGGAGAAGGACT
TACCGTGCTCATTGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTTGATT
TTGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACCCAGTTGGCAGCCAAGTCG
AAGAAATCAAGTGCTTAAGCTTTCGTTTATTTTCAGTTTTTTCTTTTTGCGTTTCTGAAC
GAGATTTTGTTCCCTTTTCTCCATATTCCCTGTCAAGACAATGGATAGAGTTCAATGTTG
GTCTTATGAATCATTAATCATTGTTACTAGAATCTTTCTTCTGCCTTCATTGGTTATGTC
AG

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 9

CO CL469Contig1 1298 9 12 U
GCATGGCATTTCCACGATTAAATAATATTTCATTCTGGTTGTTGCCACCAAGTCCCTTGC
TCCTATTAAGCTCAGCCTTAGTAGAAGTAGGTAGCGGCACTGGGTGGACGGTCTATCCGC
CCTTAAGTGGTATTACCAGTCATTCTGGAGGAGCAGTTGATTTAGCAATTTTTAGTCTTC
ATCTATCTGGTGTTTCATCCATTTTAGGTTCTATCAATTTTATAACAACTATCTTCAACA
TGCGTGGACCTGGAATGACTATGCATAGATTACCCCTATTTGTGTGGTCCGTTCTAGTGA
CAGCATTCCTACTTTTATTATCACTCCCGGTACTGGCAGGGGCAATTACCATGTTATTAA
CCGATCGAAACTTTAATACAACCTTTTTTGATCCCGCTGGAGGGGGAGACCCAATTTTAT
ACCAGCATCTCTTTTGGTTCTTCGGTCATCCAGAGGTGTATATTCTCATTCTGCCTGGAT
TCGGTATCATAAGTCATATCGTTTCGACTTTTTCGGGAAAACCGGTCTTCGGGTATCTAG
GCATGGTTTATGCCATGATCAGTATTGGTGTCTTAGGATTTCTTGTTTGGGCTCATCATA
TGTTTACTGTGGGCTTAGACGTAGATACCCGTGCCTACTTCACCGCAGCTACCATGATCA
TAGCTGTCCCCACTGGAATCAAAATCTTTAGTTGGATCGCTACCATGTGGGGGGGTTCGA
TACAATACAAAACACCCATGTTATTTGCTGTAGGATTTATCTTTTTGTTCACCATAGGAG
GACTCACTGGAATAGTCCTGGCAAATTCAGGGCTAGACATTGCTCTACATGATACTTATT
ATGTGGTTGCACATTTCCATTATGTACTTTCTATGGGAGCCGTTTTTGCTTTATTTGCAG
GATTTTACTATTGGGTGGGTAAAATCTTTGGTCGGACATACCCTGAAACTTTAGGTCAAA
TCCATTTTTGGATCACTTTTTTCGGGGTTAATTTGACCTTCTTTCCTATGCATTTCTTAG
GGCTTTCAGGTATGCCACGTCGTATTCCAGATTATCCAGATGCTTACGCTGGATGGAATG
CCCTTTCCAGTTTTGGCTCTTATATATCCGTAGTTGGGATTTGTTGTTTCTTCGTGGTCG
TAACAATCACTTTAAGCAGTGGAAATAACAAAAGATGTGCTCCAAGTCCTTGGGCTCTTG
AACTTAATTCAACTACACTGGAATGGATGGTACAAAGTCCTCCTGCTTTTCATACTTTTG
GAGAACTTCCAGCTATCAAGGAGACGAAAAGCTATGGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RS1AN75TF U 1
AF RS1AN47TF U 1
AF RS1BS20TF U 169
AF RS1AN75JQ C 511
AF RS1FJ85TF U 1020
AF RS1AA61JQ C 888
AF RS1AA61TF U 888
AF RS1AN47JQ C 532
AF RS1A610TF U 831
BS 1 95 RS1AN47TF
BS 96 97 RS1AN75TF
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BS 753 753 RS1AN75JQ
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BS 778 778 RS1AN75JQ
BS 779 881 RS1BS20TF
BS 882 887 RS1A610TF
BS 888 1019 RS1AA61TF
BS 1020 1296 RS1FJ85TF
BS 1297 1298 RS1A610TF

RD RS1AN75TF 572 0 0
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TCCTATTAAGCTCAGCCTTAGTAGAAGTAGGTAGCGGCACTGGGTGGACGGTCTATCCGC
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CAGCATTCCTACTTTTATTATCACTCCCGGTACTGGCAGGGGCAATTACCATGTTATTAA
CCGATCGAAACTTTAATACAACCTTTTTTGATCCCGCTGGAGGGGGAGACCCAATTTTAT
ACCAGCATCTCTTTTGGTTCTTCGGTCATCCAGAGGTGTATATTCTCATTCTGCCTGGAT
TCGGTATCATAAGTCATATCGTTTCGACTTTTTCGGGAAAACCGGTCTTCGGGTATCTAG
GCATGGTTTATGCCATGATCAGTATTGGTGTC

QA 1 572 1 572
DS 

RD RS1AN47TF 773 0 0
GCATGGCATTTCCACGATTAAATAATATTTCATTCTGGTTGTTGCCACCAAGTCCCTTGC
TCCTATTAAGCTCAGCCTTAGTAGAAGTAGGTAGC**CACTGGGTGGACGGTCTATCCGC
CCTTAAGTGGTATTACCAGTCATTCTGGAGGAGCAGTTGATTTAGCAATTTTTAGTCTTC
ATCTATCTGGTGTTTCATCCATTTTAGGTTCTATCAATTTTATAACAACTATCTTCAACA
TGCGTGGACCTGGAATGACTATGCATAGATTACCCCTATTTGTGTGGTCCGTTCTAGTGA
CAGCATTCCTACTTTTATTATCACTCCCGGTACTGGCAGGGGCAATTACCATGTTATTAA
CCGATCGAAACTTTAATACAACCTTTTTTGATCCCGCTGGAGGGGGAGACCCAATTTTAT
ACCAGCATCTCTTTTGGTTCTTCGGTCATCCAGAGGTGTATATTCTCATTCTGCCTGGAT
TCGGTATCATAAGTCATATCGTTTCGACTTTTTCGGGAAAACCGGTCTTCGGGTATCTAG
GCATGGTTTATGCCATGATCAGTATTGGTGTCTTAGGATTTCTTGTTTGGGCTCATCATA
TGTTTACTGTGGGCTTAGACGTAGATACCCGTGCCTACTTCACCGCAGCTACCATGATCA
TAGCTGTCCCCACTGGAATCAAAATCTTTAGTTGGATCGCTACCATGTGGGGGGGTTCGA
TACAATACAAAACACCCATGTTATTTGCTGTACGATTTATCTTTTTGTTCACC

QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1BS20TF 713 0 0
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CTATCTTCAACATGCGTGGACCTGGAATGACTATGCATAGATTACCCCTATTTGTGTGGT
CCGTTCTAGTGACAGCATTCCTACTTTTATTATCACTCCCGGTACTGGTAGGGGCAATTA
CCATGTTATTAACCGATCGAAACTTTAATACAACCTTTTTTGATCCCGCTGGAGGGGGAG
ACCCAATTTTATACCAGCATCTCTTTTGGTTCTTCGGTCATCCAGAGGTGTATATTCTCA
TTCTGCCTGGATTCGGTATCATAAGTCATATCGTTTCGACTTTTTCGGGAAAACCGGTCT
TCGGGTATCTAGGCATGGTTTACGCCATGATCAGTATTGGTGTCTTAGGATTTCTTGTTT
GGGCTCATCATATGTTTACTGTGGGCTTAGACGTAGATACCCGTGCCTACTTCACCGCAG
CTACCATGATCATAGCTGTCCCCACTGGAATCAAAATCTTTAGTTGGATCGCTACCATGT
GGGGGGGTTCGATACAATACAAAACACCCATGTTATTTGCTGTATGATTTATCTTTTTGT
TCACCATAG*AGGACTCACTGGAATAGTCCTGGCAAATTCAGGGCTAGACATTGCTCTAC
ATGATACTTATTATGTGGTTGCACATTTCCATTATGTACTTTCTATGGGAGCC

QA 1 713 1 713
DS 

RD RS1AN75JQ 787 0 0
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TCTTAGGATTTCTTGTTTGGGCTCGTCATATGTTTACTGTGGGCTTAGACGTAGATACCC
GTGCCTACTTCACCGCAGCTACCATGATCATAGCTGTCCCCACTGGAATCAAAATCTTTA
GTTGGATCGCTACCATGTGGGGGGGTTCGATACAATACAAAACACCCATGTTATTTGCTG
TAGGATTTATCTTTTTGTTCACCATAGGAGGACTCACTGGAATAGTCCTGGCAAATTCAG
GGCTAGACATTGCTCTACATGATACTTATTATGTGGTTGCACATTTCCATTATGTACTTT
CTATGGGAGCCGTTTTTGCTTTATTTGCAGGATTTTACTATTGGGTGGGTAAAATCTTTG
GTCGGACATACCCTGAAACTTTAGGTCAAATCCATTTTTGGATCACTTTTTTCGGGGTTA
ATTTGACCTTCTTTCCTATGCATTTCTTAGGGCTTTCAGGTATGCCACGTCGTATTCCAG
ATTATCCAGATGCTTACGCTGGATGGAATGCCCTTTCCAGTTTTGGCTCTTATATATCCG
TAGTTGGGATTTGTTGTTTCTTCGTGGTCGTAACAATCACTTTAAGCAGTGGAAATAACA
AAAGATGTGCTCCAAGTCCTTGGGCTCTTGAACTTAATTCAACTACACTGGAATGGATGG
TACAAAGTCCTCCTGCTTTTCATACTTTTGGAGAACTTCCAGCTATCAAGGAGACGAAAA
GCTATG
C

QA 1 786 1 786
DS 

RD RS1FJ85TF 278 0 0
GGGCTTTCAGGTATGCCACGTCGTATTCCAGATTATCCAGATGCTTACGCTGGATGGAAT
GCCCTTTCCAGTTTTGGCTCTTATATATCCGTAGTTGGGATTTGTTGTTTCTTCGTGGTC
GTAACAATCACTTTAAGCAGTGGAAATAACAAAAGATGTGCTCCAAGTCCTTGGGCTCTT
GAACTTAATTCAACTACACTGGAATGGATGGTACAAAGTCCTCCTGCTTTTCATACTTTT
GGAGAACTTCCAGCTATCAAGGAGACGAAAAGCTATG
C

QA 1 277 1 277
DS 

RD RS1AA61JQ 374 0 0
GCTTTATTTGCAGGATTTTACTATTGGGTGGGTAAAATCTTTGGTCGGACATACCCTGAA
ACTTTAGGTCAAATCCATTTTTGGATCACTTTTTTCGGGGTTAATTTGACCTTCTTTCCT
ATGCATTTCTTAGGGCTTTCAGGTATGCCACGTCGTATTCCAGATTATCCAGATGCTTAC
GCTGGATGGAATGCCCTTTCCAGTTTTGGCTCTTATATATCCGTAGTTGGGATTTGTTGT
TTCTTCGTGGTCGTAACAATCACTTTAAGCAGTGGAAATAACAAAAGATGTGCTCCAAGT
CCTTGGGCTCTTGAACTTAATTCAACTACACTGGAATGGATGGTACAAAGTCCTCCTGCT
TTTCATACTTTTGG

QA 1 374 1 374
DS 

RD RS1AA61TF 374 0 0
GCTTTATTTGCAGGATTTTACTATTGGGTGGGTAAAATCTTTGGTCGGACATACCCTGAA
ACTTTAGGTCAAATCCATTTTTGGATCACTTTTTTCGGGGTTAATTTGACCTTCTTTCCT
ATGCATTTCTTAGGGCTTTCAGGTATGCCACGTCGTATTCCAGATTATCCAGATGCTTAC
GCTGGATGGAATGCCCTTTCCAGTTTTGGCTCTTATATATCCGTAGTTGGGATTTGTTGT
TTCTTCGTGGTCGTAACAATCACTTTAAGCAGTGGAAATAACAAAAGATGTGCTCCAAGT
CCTTGGGCTCTTGAACTTAATTCAACTACACTGGAATGGATGGTACAAAGTCCTCCTGCT
TTTCATACTTTTGG

QA 1 374 1 374
DS 

RD RS1AN47JQ 755 0 0
GGTATCTAGGCATGGTTTATGCCATGATCAGTATTGGTGTCTTAGGATTTCTTGTTTGGG
CTCATCATATGTTTACTGTGGGCTTAGACGTAGATACCCGTGCCTACTTCACCGCAGCTA
CCATGATCATAGCTGTCCCCACTGGAATCAAAATCTTTAGTTGGATCGCTACCATGTGGG
GGGGTTCGATACAATACAAAACACCCATGTTATTTGCTGTAGGATTTATCTTTTTGTTCA
CCATAGGAGGACTCACTGGAATAGTCCTGGCAAATTCAGGGCTAGACATTGCTTTACATG
ATACTTATTATGTGGTTGCACATTTCCATTATGTACTTTTTATGGGAGCCGTTTTTGCTT
TATTTGCAGGATTTTACTATTGGGTGGGTAAAATCTTTGGTCGGACATACCCTGAAACTT
TAGGTCAAATCCATTTTTGGATCACTTTTTTCGGGGTTAATTTGACCTTCTTTCCTATGC
ATTTTTTAGGGCTTTCAGGTATGCCACGTCGTATTCCAGATTATCCAGATGCTTACGCTG
GATGGAATGCCCTTTCCAGTTTTGGCTTTTATATATCCGTAGTTGGGATTTGTTGTTTCT
TCGTGGTCGTAACAATCACTTTAAGCAGTGGAAATAACAAAAGATGTGCTTTAAGTCCTT
GGGCTCTTGAACTTAATTCAACTACACTGGAATGGATGGTACAAAGTCCTCCTGCTTTTC
ATACTTTTGGAGAACTTCCAGCTATCAAGGAGACG

QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1A610TF 468 0 0
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TTATTTGCAGGATTTTACTATTGGGTGGGTAAAATCTTTGGTCGGACATACCCTGAAACT
TTAGGTCAAATCCATTTTTGGATCACTTTTTTCGGGGTTAATTTGACCTTCTTTCCTATG
CATTTCTTAGGGCTTTCAGGTATGCCACGTCGTATTCCAGATTATCCAGATGCTTACGCT
GGATGGAATGCCCTTTCCAGTTTTGGCTCTTATATATCCGTAGTTGGGATTTGTTGTTTC
TTCGTGGTCGTAACAATCACTTTAAGCAATGGAAATAACAAAAGATGTGCTCCAAGTCCT
TGGGCTCTTGAACTTAATTCAACTACACTGGAATGGATGGTACAAAGTCCTCCTGCTTTT
CATACTTTTGGAGAACTTCCAGCTATCAAGGAGACGAAAAGCTATGGC

QA 1 468 1 468
DS 



AS 2 8

CO CL470Contig1 896 3 9 U
AAAAAAGAGAATCCGGTGGGTGAGAGAGAGAGAGAATTGGCGACCCTTAGATTCAGTCGT
AATATCTCTTCCGATCATCTGTGTGTTCTTATCGAATTGATAAACTTTTTCTTGAAGAAG
CAATGATTGGACTGTTTAAAGTAAAGGAGAAGCAAAGGGAACAAGCTCAGAACGCTAGCA
GAGGAGGAGGAGCTTCTGTCAAGAAGCAATCTGCCGGTGAACTTCGTCTCCACAAAGATA
TATCAGAGTTGAATCTTCCGAACTCTTGCACGATATCATTTCCCAATGGCAAAGATGATT
TGATGAACTTTGAAGTCTCCATTAAACCCGATGATGGTTACTACCATAATGGTAAGTTTG
CTTTCACCTTCCAAGTCTCTCCTGTGTATCCTCATGAAGCTCCTAAAGTTAAATGCAAAA
CCAAGGTTTATCATCCCAATATCGATTTGGAAGGAAACGTTTGCCTCAACATCTTGCGTG
AAGACTGGAAACCTGTTCTCAACATTAACACTGTTATCTATGGTCTCTTCCATCTTTTCA
CGGAACCCAACTCTGAAGATCCCTTGAACCATGAAGCTGCACAGGTTTTAAGGGATAACC
CAAAGCTCTTTGAGACCAATGTGCGGAGAGCTATGACCGGTGGATATGTTGGTCAAACCT
TTTTCCCGCGCTGTATCTAATAAAAAAGCTCTGGTTGGTCTTCTTCGAGCATAAAGCTAA
GAACCTAAACCCACTTTATCCTCCAATGTAATTCCTGTCTCAAAGGACCCTTGTTTGTTT
GCTTGCCTTTGAAAAATTACGTTCTCCCTTTCCCTTAGAGACTGAAAGGAAATGATAACT
CAAAAATGTGGATTTGGTTTGTTCGGTTTCAGTTTATAAGTGTGTGGTAATTAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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TTTTCC*GCGCTGTATCTAAT

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G
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AGTGTGTGGTAATTAATG

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DS 



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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AG***CTTCTGTCAAGAAGCAATCTGCCGGTGAACTTCGTCTCCACAAAGATATATCAGA
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GAAACCTGTTCTCAACATT

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GGACTCGAGAGCGTCGACAAAAAAGAGAATCCGGTGGGTGAGAGAGAGAGAGAATTGGCG
ACCCTTAGATTCAGTCGTAATATCTCTTCCGATCATCTGTGTGTTCTTATCGAATTGATA
AACTTCTGTTGTGTGAGTTAGTTTCTTGAAGAAGCAATGATTGGACTGTTTAAAGTAAAG
GAGAAGCAAAGGGAACAAGCTCAGAACGCTAGCAGAGGAGGAGGAGCTTCTGTCAAGAAG
CAATCTGCCGGTGAACTTCGTCTCCACAAAGATATATCAGAGTTGAATCTTCCGAGCTCT
TGCACGATATCATTTCCCAATGGCAAAGATGATTTGATGAACTTTGAAGTCTCCATTAAA
CCCGATGATGGTTACTACCATAATGGTAAGTTTGCTTTCATCTTCCAAGTCTCTCCTGTG
TATCCTCATGAAGCTCCTAAAGTTAAATGCAAAACCAAGGTTTATCATCCCAATATCGAT
TTGGAAGGAAACGTTTGCCTCAACATCTTGCGTGAAGACTGGAAACCTGTTCTCAACATT
AACACTGTTATCTATGGTCTCTTCCATCTTTTCACGGAACCCAACTCTGAAGATCCCTTG
AACCATGAAGCTGCACAGGTTTTAAGGGATAACCCAAAGCTCTTTGAGACCAATGTGCGG
AGAGCTATGACCGGTGGATATGTTGGTCAAACCTTTTTCCCGCGCTGTATCTAAAAAAAA
*GCTCTGGTTGGTCTTCTTC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RS1BE84TF 768 0 0
GGCCGGTGGGT
GAGAGAGAGAGAATTGGCGACCCTTAGATTCAGTCGTAATATCTCTTCCGATCATCTGTG
TGTTCTTATCGAATTGATAAACTTCTGTTGTGTGAGTTAGTTTCTTGAAGAAGCAATGAT
TGGACTGTTTAAAGTAAAGGAGAAGCAAAGGGAACAAGCTCAGAACGCTAGCAGAGGAGG
AG***CTTCTGTCAAGAAGCAATCTGCCGGTGAACTTCGTCTCCACAAAGATATATCAGA
GTTGAATCTTCCAAGCTCTTGCACGATATCATTTCCCAGTGGCAAAGATGATTTGATGAA
CTTTGAAGTCTCCATTAAACCCGATGATGGTTACTACCATAATGGTAAGTTTGCTTTCAC
CTTCCAAGTCTCTCCTGTCCATCCTCATGAAGCTCCTAAAGTTAAATGCAAAACCAAGGT
TTATCATCCCAATAT****TTTGAAGGAAACGTTTGCCTCAACATCTTGCGTGAAGACTG
GAAACCTGTTCTCAACATTAACACTGTCATCTATGGTCTCTTCCATCTCTTCACGGAACC
CAACTCTGAAGATCCCTTGAACCATGAAGCT**ACAGGTCTTAAGGGATAACCCAAAGCT
CTTTGAGACCAATGTCCGGAGGGCTATGACCGGTGGATATGTTGGTCAAACCTTTTTCCC
GCGCTGTATCTAATAAAAA*GCTCTGGTTGGTCTTCTTCGAGCAAGAAAGATAAGAACCA
GAAA*CCACTTTATCCTCCAATGTAATTCCTGTCTCA

QA 12 768 12 768
DS 

RD RS1BE84JQ 751 0 0
CAAAGGGAACAAGCTCAGAACGCTAGCAGAGGAGGAG***CTTCTGTCAAGAAGCAATCT
GCCGGTGAACTTCGTCTCCACAAAGATATATCAGAGTTGAATCTTCCAAGCTCTTGCACG
ATATCATTTCCCAGTGGCAAAGATGATTTGATGAACTTTGAAGTCTCCATTAAACCCGAT
GATGGTTACTACCATAATGGTAAGTTTGCTTTCACCTTCCAAGTCTCTCCTGTCCATCCT
CATGAAGCTCCTAAAGTTAAATGCAAAACCAAGGTTTATCATCCCAATAT****TTTGAA
GGAAACGTTTGCCTCAACATCTTGCGTGAAGACTGGAAACCTGTTCTCAACATTAACACT
GTCATCTATGGTTTCTTCCATCTCTTCACGGAACCCAACTCTGAAGATCCCTTGAACCAT
GAAGCT**ACAGGTCTTAAGGGATAACCCAAAGCTCTTTGAGACCAATGTCCGGAGGGCT
ATGACCGGTGGATATGTTGGTCAAACCTTTTTCCCGCGCTGTATCTAATAAAAAAGCTCT
GGTTGGTCTTCTTCGAGCAAGAAAGATAAGAACCAGAAAACCACTTTATCCTCCAATGTA
ATTCCTGTCTCAAAGGACACTTGTTTGTTTGCTTGCCTTTGAAAAATTACGTTCTCCCTT
TCCCTTAGAGACTGAAAGGAAATGAAAACTCAAAAATGTGGATTTGGTTTGTGTTCGGTT
TCAGTTTATAAGTGTGTGGTAATTAATG
AAC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RS1G791JQ 404 0 0
ATGGTCTCTTCCATCTCTTCACGGAACCCAACTCTGAAGATCCCTTGAACCATGAAGCTG
CACAGGTCTTAAGGGATAACCCAAAGCTCTTTGAGACCAATGTCCGGAGGGCTATGACCG
GTGGATATGTTTGTCAAACCTTTTTCCCGCGCTGTATTTAATAAAAAAGCTCTGGTTGGT
TTTTTTCGAGCAAGAAAGATAAGAACCTGAAAACCACTTTATCCTCCAATGTAATTCCTG
TCTCAAAGGACACTTGTTTGTTTGCTTGCCTTTGAAAAATTACGTTCTCCCTTTCCCTTA
GAGACTGAAAGGAAATGAAAACTCAAAAATGTGGATTTGGTTTGTGTTCGGTTTCAGTTT
ATAAGTGTGTGGTAATTAATGAACAACTGAAAACTCTCAAGATC

QA 1 404 1 404
DS 



AS 1 8

CO CL471Contig1 1039 8 23 U
ATCTAACATTTCCACCAATCCCTCACTTCCTTGGCGATCCAAACAAACACAAGAAAATGC
TAGATAATCTCCTTTTCTGAGCATCCTTTCTCTAGAAAATGGAGACCCTTCTCTCTCCTC
GTTCTCTATCTCCTCCTCTCATTCCCAAAGTATCATCTTCTCATCAATCCAAACTCGCTA
CTTCTTCTTCTTTGGCTCTCTCGAATCCCACCGTCTCTGGCCCGAAACACCTTTCCACCC
GGTTTAGTGCTAAACCAGAAACGTGGTTAACAGATGCAAAGCAAGGACTAGCTGCTCTAT
CTCTATCTCTGGCCCTTACTTTCTCACCTGTTGGCACTGCCTTAGCCTCTGAGTTCAATA
TTCTCAACGATGGTCCACCCAAAGAAA*CTTACGTTGTAGACGACGCTGGTGTTCTTAGT
CGAGTTACGAGATCAGATCTGAAGAAACTCTTGTCTGATCTTGAATACAGAAAGAAACTC
CGACTCAATTTCATCACTGTCCGGAAGCTCACCAGTAAAGCAGATGCGTTCGAGTATGCA
GACCAGGTTTTGGAGAAATGGTATCCTTCAATTGAAGAAGGCAACAATAAGGGTATTGTT
GTTTTGATTACTAGCCAGAAGGAAGGGGCCATTACTGGTGGTCCTGCTTTCATTGAAGCT
GTTGGTGAAAAGATTCTTGATGCTACTGTCTCGGAAAATCTTCCCGTATTAGCCACAGAC
GAAAAATACAATGAGGCAATATACAGCAGTGCAAAACGGTTGGTTGCAGCAATTGACGGT
CTCCCAGATCCCGGGGGTCCAGAAGTGAAGGATAACAAGAGAGAATCAAATTTCAAAACC
AAAGAAGAAACAGAAGAGAAGAGAGGACAGTTCAGTCTTGTCGTTGGAGGTTTGCTTGTA
ATTGCCTTTGTTGTTCCCATGGCTCAGTACTATGCTTATATATCCAAAAAGTAGTGTATT
GGTTCACTCTCGTATATACCAAACTGAGCCAGGTCATAACATTGCTATCAAACCGGTTTA
ATAATGATTTGTTTTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 15 40 25 40 40 40 40 40 25 
40 20 20 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CD35TF U 1
AF RS1EA20TF U 76
AF RS1FY83TF U 140
AF RS1CA01TF U 154
AF RS1FY83JQ C 751
AF RS1CA01JQ C 333
AF RS1EA20JQ C 457
AF RS1GE22TF U 356
BS 1 260 RS1CD35TF
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BS 262 289 RS1CD35TF
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BS 291 512 RS1CD35TF
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BS 621 716 RS1EA20TF
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BS 950 1033 RS1GE22TF
BS 1034 1039 RS1CA01JQ

RD RS1CD35TF 620 0 0
ATCTAACATTTCCACCAATCCCTCACTTCCTTGGCGATCCAAACAAACACAAGAAAATGC
TAGATAATCTCCTTTTCTGAGCATCCTTTCTCTAGAAAATGGAGACCCTTCTCTCTCCTC
GTTCTCTATCTCCTCCTCTCATTCCCAAAGTATCATCTTCTCATCAATCCAAACTCGCTA
CTTCTTCTTCTTTGGCTCTCTCGAATCCCACCGTCTCTGGCCCGAAACACCTTTCCACCC
GGTTTAGTGCTAAACCAGAATCGTGGTTAACAGATGCAAAGCAAGGACTTGCTGCTCTAT
CTCTATCTCTGGCCCTTACTTTCTCACCTGTTGGCACTGCCTTAGCCTCTGAGTTCAATA
TTCTCAACGATGGTCCACCCAAAGAAA*CTTACGTTGTAGACGACGCTGGTGTTCTTAGT
CGAGTTACGAGATCAGATCTGAAGAAACTCTTGTCTGATCTTGAATACAGAAAGAAACTC
CGACTCAATTTCATCACTGTCCGGAAGCTCACTAGTAAAGCAGATGCGTTCGAGTATGCA
GACCAGGTTTTGGAGAAATGGTATCCTTCAATTGAAGAAGGCAACAATAAGGGTATTGTT
GTTTTGATTACTAGCCAGAA

QA 1 620 1 620
DS 

RD RS1EA20TF 641 0 0
GGG
GAGCATTCTTTCTCTAGAAAATGGAGACCCTTCTCTCTCCTCGTTCTCTATCTCCTCCTC
TCATTCCCAAAGTATCATCTTCTCATCAATCCAAACTCGCTACTTCTTCTTCTTTGGCTC
TCTCGAATCCCACCGTCTCTGGCCCGAAACACCTTTCCACCCGGTTTAGT*CTAAACCAG
AAACGTGGTTAACAGATGCAAAGCAAGGACTAGCTGCTCTATCTCTATCTCTGGCCCTTA
CTTTCTCACCTGTTGGCACTGCCTTAGCCTCTGAGTTCAATATTCTCAACGATGGTCCAC
CCAAAGAAA*CTTACGTTGTAGACGACGCTGGTGTTCTTAGTCGAGTTACGAGATCAGAT
CTGAAGAAACTCTTGTCTGATCTTGAATACAGAAAGAAACTCCGACTCAATTTCATCACT
GTCCGGAAGCTCGCCAGTAAAGCAGATGCGTTCGAGTATGCAGACCAGGTTTTGGAGAAA
TGGTATCCTTCAATTGAAGAAGGCAACAATAAGGGTATTGTTGTTTTGATTACTAGCCAG
AAGGAAGGGGCCATTACTGGTGGTCCTGCTTTCATTGAAGCTGTTGGTGAAAAGATTCTT
GATGCTACTGTCTCGGAAAATCTTCCCGTATTAGCCAC

QA 4 641 4 641
DS 

RD RS1FY83TF 812 0 0
G
ATTCCCAAAGTATCATCTTCTCATCAATCCAAACTCGCTACTTCTTCTTCTTTGGCTCTC
TCGAATCCCACCGTCTCTGGCCCGAAACACCTT*CCACCCGGTTTAGTGCTAAACCAGAA
ACGTGGTTAACAGATGCAAAGCAAGGACTAGCTGCTCTATCTCTATCTCTGGCCCTTACT
TTCTCACCTGTTGGCACTGCCTTAGCCTCTGAGTTCAATATTCTCAACGATGGTCCACCC
AAAGAAA*CTTACGTTGTAGACGACGCTGGTGTTCTTAGTCGAGTTACGAGATCAGATCT
GAAGAAACTCTTGTCTGATCTTGAATACAGAAAGAAACTCCGACTCAATTTCATCACTGT
CCGGAAGCTCACCAGTAAAGCAGATGCGTTCGAGTATGCAGACCAGGTTTTGGAGAAATG
GTATCCTTCAATTGAAGAAGGCAACAATAAGGGTATTGTTGTTTTGATTACTAGCCAGAA
GGAAGGGGCCATTACTGGTGGTCCTGCTTTCATTGAAGCTGTTGGTGAAAAGATTCTTGA
TGCTACTGTCTCGGAAAATCTTCCCGTATTAGCCACAGACGAAAAATACAATGAGGCAAT
ATACAGCAGTGCAAAACGGTTGGTTGCAGCAATTGACGGTCTCCCAGATCCCGGGGGTCC
AGAAGTGAAGGATAACAAGAGAGAATCAAATTTCAAAACCAAAGAAGAAACAGAAGAGAA
GAGAGGACAGTTCAGTCTTGTCGTTGGAGTTT*GCTTGTATT*GCCTTTGTG**TCCCAT
GGCTCAGTACTATGCT*ATATATCCAAAA
GT

QA 2 810 2 810
DS 

RD RS1CA01TF 749 0 0
G
ATCTTCTCATCAATCCAAACTCGCTACTTCTTCTTCTTTGGCTCTCTCGAATCCCACCGT
CTCTGGCCCGAAACACCTTTCCACCCGGTTTAGTGCTAAACCAGAAACGTGGTTAACAGA
TGCAAAGCAAGGACTAGCTGCTCTATCTCTATCTCTGGCCCTTACTTTCTCACCTGTTGG
CACTGCCTTAGCCTCTGAGTTCAATATTCTCAACGATGGTCCACCCAAAGAAA*CTTACG
TTGTAGACGACGCTGGTGTTCTTAGTCGAGTTACGAGATCAGATCTGAAGAAACTCTTGT
CTGATCTTGAATACAGAAAGAAACTCCGACTCAATTTCATCACTGTCCGGAAGCTCACCA
GTAAAGCAGATGCGTTCGAGTATGCAGACCAGGTTTTGGAGAAATGGTATCCTTCAATTG
AAGAAGGCAACAATAAGGGTATTGTTGTTTTGATTACTAGCCAGAAGGAAGGGGCCATTA
CTGGTTGTCCTGCTTTCATTGAAGCTGTTGGTGAAAAGATTCTTGATGCTACTGTCTCGG
AAAATCTTCCCGTATTAGCCACAGACGAAAAATACAATGAGGCAATATACAGCAGTGCAA
AACGGTTGGTTGCAGCAATTGACGGTCTCCCAGATCCCGGGGGTCCAGAAGTGAAG*ATA
ACAAGAGAGAATCAAATTTCAAAACCAAAGAAGAAACAGAAGAGAAGAGAGGACAGTTCA
GTCTTGTCGTTGGAGGTT*GCTTGTAAT

QA 2 749 2 749
DS 

RD RS1FY83JQ 167 0 0
GCAAAAGGGTTGGTTGCAGCAATTGACGGTTTCCCAGATCCCGGGGGTCCAGAAGTGAAG
GATAACAAGAGAGAATCAAATTTCAAAACCAAAGAAGAAACAGAAGAGAAGAGAGGACAG
TTCAGTCTTGTCGTTGGAGGTTTGTTTGTAATTGCCTTTGTTGTTCC

QA 1 167 1 167
DS 

RD RS1CA01JQ 707 0 0
GGCACTGCCTTAGCCTCTGAGTTCAATATTCTCAACGATGGTCCACCCAAAGAAA*CTTA
CGTTGTAGACGACGCTGGTGTTCTTAGTCGAGTTACGAGATCAGATCTGAAGAAACTCTT
GTCTGATCTTGAATACAGAAAGAAACTCCGACTCAATTTCATCACTGTCCGGAAGCTCAC
CAGTAAAGCAGATGCGTTCGAGTATGCAGACCAGGTTTTGGAGAAATGGTATCCTTCAAT
TGAAGAAGGCAACAATAAGGGTATTGTTGTTTTGATTACTAGCCAGAAGGAAGGGGCCAT
TACTGGTTGTCCTGCTTTCATTGAAGCTGTTGGTGAAAAGATTCTTGATGCTACTGTCTC
GGAAAATCTTCCCGTATTAGCCACAGACGAAAAATACAATGAGGCAATATACAGCAGTGC
AAAACGGTTGGTTGCAGCAATTGACGGTCTCCCAGATCCCGGGGGTCCAGAAGTGAAGGA
TAACAAGAGAGAATCAAATTTCAAAACCAAAGAAGAAACAGAAGAGAAGAGAGGACAGTT
CAGTCTTGTCGTTGGAGGTTTGCTTGTAATTGCCTTTGTTGTTCCCATGGCTCAGTACTA
TGCTTATATATCCAAAAAGTAGTGTATTGGTTCACTCTCGTATATACCAAACTGAGCCAG
GTCATAACATTGCTATCAAACCGGTTTAATAATGATTTGTTTTTGTT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1EA20JQ 583 0 0
GATCTTGAATACAGAAAGAAACTCCGACTCAATTTCATCACTGTCCGGAAGCTCGCCAGT
AAAGCAGATGCGTTCGAGTATGCAGACCAGGTTTTGGAGAAATGGTATCCTTCAATTGAA
GAAGGCAACAATAAGGGTATTGTTGTTTTGATTACTAGCCAGAAGGAAGGGGCCATTACT
GGTGGTCCTGCTTTCATTGAAGCTGTTGGTGAAAAGATTCTTGATGCTACTGTCTCGGAA
AATCTTCCCGTATTAGCCACAGACGAAAAATACAATGAGGCAATATACAGCAGTGCAAAA
CGGTTGGTTGCAGCAATTGACGGTCTCCCAGATCCCGGGGGTCCAGAAGTGAAGGATAAC
AAGAGAGAATCAAATTTCAAAACCAAAGAAGAAACAGAAGAGAAGAGAGGACAGTTCAGT
CTTGTCGTTGGAGGTTTGCTTGTAATTACCTTTGTTGTTCCCATGGCTCAGTACTATGCT
TATATATCCAAAAAGTAGTGTATTGGTTCACTCTCTTATATACCAAACTGAGCCAGGTCA
TAACATTGCTATCAAACCGGTTTAATAATGATTTGTT
TTTGTT

QA 1 577 1 577
DS 

RD RS1GE22TF 678 0 0
G
AATATTCTCAACGATGGTCCACCCAAAAAAAACTTACGTTGTAGACGACGCTGGTGTTCT
TAGTCGAGTTACGAGATCAGATCTGAAGAAACTCTTGTCTGATCTTGAATACAGAAAGAA
ACTCCGACTCAATTTCATCACTGTCCGGAAGCTCACCAGTAAAGCAGATGCGTTCGAGTA
TGCAGACCAGGTTTTGGAGAAATGGTATCCTTCAATTGAAGAAGGCAACAATAAGGGTAT
TGTTGTTTTGATTACTAGCCAGAAGGAAGGGGCCATTACTGGTGGTCCTGCTTTCATTGA
AGCTGTTGGTGAAAAGATTCTTGATGCTACTGTCTCGGAAAATCTTCCCGTATTAGCCAC
AGACGAAAAATACAATGAGGCAATATACAGCAGTGCAAAACGGTTGGTTGCAGCAATTGA
CGGTCTCCCAGATCCCGGGGGTCCAGAAGTGAAGGATAACAAGAGAGAATCAAATTTCAA
AACCAAAGAAGAAACAGAAGAGAAGAGAGGACAGTTCAGTCTTGTCGTTGGAGGTTTGCT
TGTAATTGCCTTTGTTGTTCCCATGGCTCAGTACTATGCTTATATATCCAAAAAGTAGTG
TATTGGTTCACTCTCGTATATACCAAACTGAGCCAGGTCATAACATTGCTATCAAACCGG
TTTAATAATGATTTGTT

QA 2 678 2 678
DS 



AS 2 7

CO CL472Contig1 723 2 6 U
GGACCATAAGATTAAGATCATCTTCTTCTTCTTTTGATTGAAAAAGGAGGATTCTTTACT
ACTACTCTCTACAGACTTGATCATATGGAAGATCCAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGG
CTATCAGTACCACAGTTTGGAGATTGGGATCAGAAAGGAGGAACCATTCCTGATTACTCT
ATGGATTTCTCTAAGATCAGAGAGATGAGGAAACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGCGCC
AGTCTTGGCAACGAGGAAGAACTCGTTAATCCTTTTCATAATCAACCTACTTCGGTTGAT
AATGCTAAGCCTAAGCTCACCACCGTTCACAGTGACAACAACAAAACCCATAATGAGTTC
TCTCATCACCAGCCACTTTCTCCATCTGCGAGGAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGC
TGCGTTAGAGCTTGAAGGTGCATCTTATCATAGAGACCGATGAGAGGAGATGAATCTTCT
TCAGCTGTTTCAGTTATTTTACAATAATAATAGTAGTGATGATGATTTCAAGACAGAAAT
GAAAAAATGGCAGTGTGGCAACTTATTACTACGGAAGCAGCAGTAAATCAAGTTTGTCTG
CTGTTTACTGTTATCTTAAACTGTCTAACAATATGATGTTTTTGGTAAATGTGAAGTGTA
GTTAGTTTTCTTTCTATTTCTTTGTAATTTTTTAGTTTGGTTTAGAAATTGGTGAAGTTT
CAA


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1CX29TF U 1
AF RS1G185TF U 3
BS 1 428 RS1CX29TF
BS 429 429 RS1G185TF
BS 430 440 RS1CX29TF
BS 441 441 RS1G185TF
BS 442 668 RS1CX29TF
BS 669 723 RS1G185TF

RD RS1CX29TF 672 0 0
GGACCATAAGATTAAGATCATCTTCTTCTTCTTTTGATTGAAAAAGGAGGATTCTTTACT
ACTACTCTCTACAGACTTGATCATATGGAAGATCCAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGG
CTATCAGTACCACAGTTTGGAGATTGGGATCAGAAAGGAGGAACCATTCCTGATTACTCT
ATGGATTTCTCTAAGATCAGAGAGATGAGGAAACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGCGCC
AGTCTTGGCAACGAGGAAGAACTCGTTAATCCTTTTCATAATCAACCTACTTCGGTTGAT
AATGCTAAGCCTAAGCTCACCACCGTTCACAGTGACAACAACAAAACCCATAATGAGTTC
TCTCATCACCAGCCACTTTCTCCATCTGCGAGGAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGC
TGCGTTAGGGCTTGAAGGTGTATCTTATCATAGAGACCGATGAGAGGAGATGAATCTTCT
TCAGCTGTTTCAGTTATTTTACAATAATAATAGTAGTGATGATGATTTCAAGACAGAAAT
GAAAAAATGGCAGTGTGGCAACTTATTACTACGGAAGCAGCAGTAAATCAAGTTTGTCTG
CTGTTTACTGTTATCTTAAACTGTCTAACAATATGATGTTTTTGGTAAATGTGAAGTGTA
GTTAGTTT
TCTT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1G185TF 721 0 0
GG
CATAAGATTAAGATCATCTTCTTCTTCTTTTGATTGAAAAAGGAGGATTCTTTACTACTA
CTCTCTACAGACTTGATCATATGGAAGATCCAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGTTAT
CAGTACCACAGTTTGGAGATTGGGATCAGAAAGGAGGAACCATTCCTGATTACTCTATGG
ATTTCTCTAAGATCAGAGAGATGAGGAAACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGCGCCAGTC
TTGGCAACGAGGAAGAACTCGTTAATCCTTTTCATAATCAACCTACTTCGGTTGATAATG
CTAAGCCTAAGCTCACCACCGTTCACAGTGACAACAACAAAACCCATAATGAGTTCTCTC
ATCACCAGCCACTTTCTCCATCTGCGAGGAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCG
TTAGAGCTTGAAGGTGCATCTTATCATAGAGACCGATGAGAGGAGATGAATCTTCTTCAG
CTGTTTCAGTTATTTTACAATAATAATAGTAGTGATGATGATTTCAAGACAGAAATGAAA
AAATGGCAGTGTGGCAACTTATTACTACGGAAGCAGCAGTAAATCAAGTTTGTCTGCTGT
TTACTGTTATCTTAAACTGTCTAACAATATGATGTTTTTGGTAAATGTGAAGTGTAGTTA
GTTTTCTTTCTATTTCTTTGTAATTTTTTAGTTTGGTTTAGAAATTGGTGAAGTTTCAA

QA 3 721 3 721
DS 



CO CL472Contig2 750 5 8 U
GGACCATAAGATCATCATCTTCTTCTTCTTTTGATTGAAAAAGTTAATTCAAAAAGGAGG
ATTCTATACTACTACTCTCTACAGATTTGATCATATGGAAGATCCAAAGGAGAACAAGAA
CTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGATTGGGATCAGAAAGGAGGAACCATTCC
TGATTACTCTATGGATTTCTCTAAGATCAGAGAGATGCGGAAACAGAACAAGAGAGATCC
TTCTCGTGCTAGTCTTGGCAACGAGGAAGAACTCGTTAATCCTTTTCATAATCAACCTAC
TTCGGCTGATAATGCTAAGCCTAAGCTCACCACCGTTCACAGTGACAACAACAAAACCCA
TAATGAGTTCTCTCATCACCAGCCACTTTCTTCATCTGCGAGGAGAGGAATCTTCAGCTG
CTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAAGGTGTATCTTATCATAGAGACCGATGAGAGGAGA
TGAATCTTCTTCAGCTGTTTCAGTTATTTTACAATAATAATAGTAGTGATGATGATTTCA
AGACAGAAATGAAAAAAATGGCAGTGTGGCAACTTATTACTACGGAAGCAGCAGTAAATC
AAGTTTGTCTGCTGTTTACCGTTATCTTAAACTGTCTTAACAATATGATGTTTTTGGTAA
ATGTGAAGTGTAGTTAGTTTCTTTCTATTTCTTTGTAATTTTTTAGTTTGGTTTAGAAAT
TGGTGCATTTAGATTATAAAGTAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G440TF U 35
AF RS1E148TF U 1
AF RS1GG30TF U 35
AF RS1GC14JQ C 74
AF RS1GG30JQ C 401
BS 1 482 RS1E148TF
BS 483 483 RS1G440TF
BS 484 562 RS1E148TF
BS 563 563 RS1GG30TF
BS 564 669 RS1E148TF
BS 670 703 RS1GG30TF
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RD RS1G440TF 524 0 0
GG
GAAAAAGTTAATTCAAAAAGGAGGATTCTATACTACTACTCTCTACAGATTTGATCATAT
GGAAGATCCAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGATTG
GGATCAGAAAGGAGGAACCATTCCTGATTACTCTATGGATTTCTCTAAGATCAGAGAGAT
GCGGAAACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGTGCTAGTCTTGGCAACGAGGAAGAACTCGT
TAATCCTTTTCATAATCAACCTACTTCGGCTGATAACGCTAAGCCTAAGCTCACCACCGT
TCACAGTGACAACAACAAAGCCCATAATGAGTTCTCTCATCACCAGCCACTTTCTTCATC
TGCGAGGAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAAGGTGTATCTT
ATCATAGAGACCGATGAGAGGAGATGAATCTTCTTCAGCTGTTTCAGTTATTTTACAATA
ATAATAGTAGTGATGATGATTTCAAGACAGAAATGAAAAAAA

QA 3 524 3 524
DS 

RD RS1E148TF 669 0 0
GGACCATAAGATCATCATCTTCTTCTTCTTTTGATTGAAAAAGTTAATTCAAAAAGGAGG
ATTCTATACTACTACTCTCTACAGATTTGATCATATGGAAGATCCAAAGGAGAACAAGAA
CTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGATTGGGATCAGAAAGGAGGAACCATTCC
TGATTACTCTATGGATTTCTCTAAGATCAGAGAGATGCGGAAACAGAACAAGAGAGATCC
TTCTCGTGCTAGTCTTGGCAACGAGGAAGAACTCGTTAATCCTTTTCATAATCAACCTAC
TTCGGCTGATAATGCTAAGCCTAAGCTCACCACCGTTCACAGTGACAACAACAAAACCCA
TAATGAGTTCTCTCATCACCAGCCACTTTCTTCATCTGCGAGGAGAGGAATCTTCAGCTG
CTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAAGGTGTATCTTATCATAGAGACCGATGAGAGGAGA
TGGATCTTCTTCAGCTGTTTCAGTTATTTTACAATAATAATAGTAGTGATGATGATTTCA
AGACAGAAATGAAAAAAATGGCTGTGTGGCAACTTATTACTACGGAAGCAGCAGTAAATC
AAGTTTGTCTGCTGTTTACCGTTATCTTAAACTGTCTTAACAATATGATGTTTTTGGTAA
ATGTGAAGT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RS1GG30TF 716 0 0
GG
GAAAAAGTTAATTCAAAAAGGAGGATTCTATACTACTACTCTCTACAGATTTGATCATAT
GGAAGATCCAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTTGGAGATTG
GGATCAGAAAGGAGGAACCATTCCTGATTACTCTATGGATTTCTCTAAGATCAGAGAGAT
GCGGAAACAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGTGCTAGTCTTGGCAACGAGGAAGAACTCGT
TAATCCTTTTCATAATCAACCTACTTCGGCTGATAATGCTAAGCCTAAGCTCACCACCGT
TCACAGTGACAACAACAAAGCCCATAATGAGTTCTCTCATCACCAGCCACTTTCTTCATC
TGCGAGGAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAAGGTGTATCTT
ATCATAGAGACCGATGAGAGGAGATGAATCTTCTTCAGCTGTTTCAGTTATTTTACAATA
ATAATAGTAGTGATGATGATTTCAAGACAGAAATGAAAAAAATGGCAGTGTGGCAACTTA
TTACTACGGAAGCAGCAGTAAATCAAGTTTGTCTGCTGTTTACCGTTATCTTAAACTGTC
TTAACAATATGATGTTTTTGGTAAATGTGAAGTGTAGTTAGTTTCTTTCTATTTCTTTGT
AATTTTT*AGTTTGGTTTAGAAATTGGTGCATTTAGATTATAAAGTAAAAAAAA

QA 3 716 3 716
DS 

RD RS1GC14JQ 674 0 0
ACTCTCTACAGATTTGATCATATGGAAGATCCAAAGGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTA
TCAGTACCACAGTTTGGAGATTGGGATCAGAAAGGAGGAACCATTCCTGATTACTCTATG
GATTTCTCTAAGATCAGAGAGATGCGGAAGCAGAACAAGAGAGATCCTTCTCGTGCTAGT
CTTGGCAACGAGGAAGAACTCGTTAATCCTTTTCATAATCAACCTACTTCGGCTGATAAT
GCTAAGCCTAAGCTCACCACCGTTCACAGTGACAACAACAAAACCCATAATGAGTTCTCT
CATCACCAGCCACTTTCTTCATCTGCGAGGAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGC
GTTAAAGCTTGAAGGTGTATCTTATCATAGAGACCGATGAGAGGAGATGAATCTTCTTCA
GCTGTTTCAGTTATTTTACAATAATAATAGTAGTGATGATGATTTCAAGACAGAAATGAA
AAAAATGGCAGTGTGGCAACTTATTACTACGGAAGCAGCAGTAAATCAAGTTTGTCTGCT
GTTTACCGTTATCTTAAACTGTCTTAACAATATGATGTTTTTGGTAAATGTGAAGTGTAG
TTAGTTTCTTTCTATTTCTTTGTAATTTTTTAGTTTGGTTTAGAAATTGGTGCATTTAGA
TTATAAA
AGTAAAA

QA 1 667 1 667
DS 

RD RS1GG30JQ 337 0 0
AGGAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTGCGTTAAAGCTTGAAGGTGTATCTTATCA
TAGAGACCGATGAGAGGAGATGAATCTTCTTCAGCTGTTTCAGTTATTTTACAATAATAA
TAGTAGTGATGATGATTTCAAGACAGAAATGAAAAAAATGGCAGTGTGGCAACTTATTAC
TACGGAAGCAGCAGTAAATCAAGTTTGTCTGCTGTTTACCGTTATCTTAAACTGTCTTAA
CAATATGATGTTTTTGGTAAATGTGAAGTGTAGTTAGTTTCTTTCTATTTCTTTGTAATT
TTTTAGTTTGGTTTAGAAATTGGTGCATTTAGATTAT

QA 1 337 1 337
DS 



AS 1 9

CO CL473Contig1 1588 9 15 U
GAGAATGATGTCAATTTAGCACTTGCTAATACTATAACGGTTCAGATGAGACTTGGCATG
TTTGATGGTAATCTTGGGCCGTATGCTAATCTTGGGCCTAGAGATGTTTGTACTCTAGCC
CATAGACATTTAGCCCTTCAAGCGGCCCATCAAGGAATTGTGCTTCTCAAAAACTCTGGT
CGTTCTCTTCCACTCTCCCCTAGGCGTCACCGCACCATTGCCGTGATTGGACCCAACTCC
GACGTCACTGAGACCATGATCGGAAACTATGCAGGGAAAGCTTGCACCTATACGACACCG
TTACAAGGAATCGCAAGATATGCCAGAACACTTCACCAAGCTGGTTGTGCAGGCGTGGCT
TGCCGAGGGAACCAAGGATTTGGTGCGGCAGAGGCAGCTGCACGGGAAGCAGATGCTACG
GTTCTTGTGATGGGATTGGACCAGTCGATAGAGGCCGAGACACGAGGTCGAACCGGGTTG
CTGTTACCAGGTTACCAACAAGAGCTTGTTACACGAGTAGCTCAAGCTTCTAAAGGTCCA
GTCATTCTTGTGCTTATGAGTGGTGGCCCCATCGATGTTACCTTTGCTAAGAACAATCCA
CGTGTTGCTGCCATCATCTGGGCCGGGTATCCGGGTCAAGCTGGTGGAGCTGCTATCGCC
AATATAATCTTTGGTGCTGTTAACCCTGGAGGAAAACTACCTATGACATGGTATCCACAA
GATTACGTAGCAAAAGTGCCAATGACGATAATGGCTATGAGAGCATATGGAAATTACCCA
GGAAGGACCTACAGATTCTACAAAGGTCCAGTGGTGTTTCCATTTGGGTTCGGTTTAAGT
TACACTACCTTCACTCACAGTTTGGCCCAAAGTCCATTAGCCCAACTATCAGTTTCATCC
AAAAAATTCAACTCTGCCATTTTCAACTCGTCATCTGATTCCATCAAAGTGTCTCATGCC
AACTGTGGAACGTTTCCAAAAATGTCTCTCCATGTTGAAGTATCAAACACAGGTGAATTC
GACGGAACCCACACGGTGTTCGTCTTTGCCGAGCCGCCGAAAAACGGGATAAAAGGATTG
GGTGTGAACAAACAATTGATAGCGTTTGAGAAGGTTCATGTCACGGCAGGGGCAAAACGA
ACTGTTCAAGTTGATGTTGATGCTTGCAAGCATCTTGGTGTAGTAGATGAGTATGGAAGG
*AGGAGGATCCCAATGGGTGAACATAAACTGCATATCGGTGATCTTAAACATACTATTTT
GGTTCAACCGCAACTTTAAAAGAGGCATACAAAAAGAAGCAACAAATAAGGAAACCTTTT
AACGGACTGGAGTGTTTCCTCTTATTTACATGTTACATTATATATAGAGAGATAGGTTAT
TTTCTTGAGAAATTACTCAAGAAATGGTTCAATCCAACATGAGAAGCACCAAAGGGTCGC
TTCTTGGATTTGTATGTTTTATTTCTTCTACTTTTTTCGTCATCAATGTTACTGTAACTT
GTGGCTCCCAAAATAAGAAAGATATGGGGCCCTTGTAAAAAGTTGAAACTAAGAAAAAAA
TGAAGATAAATGATAATTTGATATATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RS1AU76TF U 1
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AF RS1EU39TF U 72
AF RS1H588TF U 514
AF RS1H177TF U 676
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AF RS1EU39JQ C 853
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AF RS1H177JQB C 934
BS 1 264 RS1AU76TF
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RD RS1AU76TF 264 0 0
GAGAATGATGTCAATTTAGCACTTGCTAATACTATAACGGTTCAGATGAGACTTGGCATG
TTTGATGGTAATCTTGGGCCGTATGCTAATCTTGGGCCTAGAGATGTTTGTACTCTAGCC
CATAGACATTTAGCCCTTCAAGCGGCCCATCAAGGAATTGTGCTTCTCAAAAACTCTGGT
CGTTCTCTTCCACTCTCCCCTAGGCGTCACCGCACCATTGCCGTGATTGGACCCAACTCC
GACGTCACTGAGACCATGATCGGA

QA 1 264 1 264
DS 

RD RS1GN45TF 221 0 0
GCACCATTGCCGTGATTGGACCCAACTCCGACGTCACTGAGACCATGATCGGAAACTATG
CAGGGAAAGCTTGCACCTATACGACACCGTTACAAGGAATCGCAAGATATGCTAGAACAC
TTCACCAAGCTGGTTGTGCAGGCGTGGCTTGCCGAGGGAACCAAGGATTTGGTGCGGCAG
AGGCAGCTGCACGGGAAGCAGATGCTACGGTTCTTGTG
TGG

QA 1 218 1 218
DS 

RD RS1EU39TF 646 0 0
G
CTTGGGCCGTATGCTAATCTTGGGCCTAGAGATGTTTGTACTCTAGCCCATAGACATTTA
GCCCTTCAAGCGGCCCATCAAGGAATTGTGCTTCTCAAAAACTCTGGTCGTTCTCTTCCA
CTCTCCCCTAGGCGTCACCGCACCATTGCCGTGATTGGACCCAACTCCGACGTCACTGAG
ACCATGATCGGAAACTATGCAGGGAAAGCTTGCACCTATACGACACCGTTACAAGGAATC
GCAAGATATGCCAGAACACTTCACCAAGCTGGTTGTGCAGGCGTGGCTTGCCGAGGGAAC
CAAGGATTTGGTGCGGCAGAGGCAGCTGCACGGGAAGCAGATGCTACGGTTCTTGTGATG
GGATTGGACCAGTCGATAGAGGCCGAGACACGAGGTCGAACCGGGTTGCTGTTACCAGGT
TACCAACAAGAGCTTGTTACACGAGTAGCTCAAGCTTCTAAAGGTCCAGTCATTCTTGTG
CTTATGAGTGGTGGCCCCATCGATGTTACCTTTGCTAAGAACAATCCACGTGTTGCTGCC
ATCATCTGGGCCGGGTATCCGGGTCAAGCTGGTGGA**TGCTATCGCCAATATAATCTTT
GGTGCTGTTAACCCTGGAGGAAAACTACCTATGACATGGTATCCA

QA 2 646 2 646
DS 

RD RS1H588TF 762 0 0
G
GAGTAGCTCAAGCTTCTAAAGGTCCAGTCATTCTTGTGCTTATGAGTGGTGGCCCCATCG
ATGTTACCTTTGCTAAGAACAATCCACGTGTTGCTGCCATCATCTGGGCCGGGTGTCCGG
GTCAAGCTGGTGGAGCTGCTATCGCCAATATAATCTTTGGTGCTGTTAACCCTGGAGGAA
AACTACCTATGACATGGTATCCACAAGATTACGTAGCAAAAGTGCCAATGACGATAATGG
CTATGAGAGCATATGGAAATTACCCAGGAAGGACCTACAGATTCTACAAAGGTCCAGTGG
TGTTTCCATTTGGGTTCGGTTTAAGTTACACTACCTTCACTCACAGTTTGGCCCAAAGTC
CATTAGCCCAACTATCAGTTTCATCCAAAAAATTCAACTCTGCCATTTTCAACTCGTCAT
CTGATTCCATCAAAGTGTCTCATGCCAACTGTGGAACGTTTCCAAAAATGTCTCTCCATG
TTGAAGTATCAAACACAGGTGAATTCGACGGAACCCACACGGTGTTCGTCTTTGCCGAGC
CGCCGAAAAACGGGATAAAAGGATTGGGTGTGAACAAACAATTGATAGCGTTTGAGAAGG
TTCATGTCACGGCAGGGGCAAAACGAACTGTTCAAGTTGATGTTGATGCTTGCAAGCATC
TTGGTGTAGTAGATGAGTATGGAAGGGAGGAGGATCCCAATGGGTGAACATAAACTGCAT
ATCGGTGATCTTAAACATACTATTTTGGT
CACCGCACTTTA

QA 2 750 2 750
DS 

RD RS1H177TF 698 0 0
GCTGTTAACCCTGGAGGAAAACTACCTATGACATGGTATCCACAAGATTACGTAGCAAAA
GTGCCAATGACGATAATGGCTATGAGAGCATATGGAAATTACCCAGGAAGGACCTACAGA
TTCTACAAAGGTCCAGTGGTGTTTCCATTTGGGTTCGGTTTAAGTTACACTACCTTCACT
CACAGTTTGGCCCAAAGTCCATTAGCCCAACTATCAGTTTCATCCAAAAAATTCAACTCT
GCCATTTTCAACTCGTCATCTGATTCCATCAAAGTGTCTCATGCCAACTGTGGAACGTTT
CCAAAAATGTCTCTCCATGTTGAAGTATCAAACACAGGTGAATTCGACGGAACCCACACG
GTGTTCGTCTTTGCCGAGCCGCCGAAAAACGGGATAAAAGGATTGGGTGTGAACAAACAA
TTGATAGCGTTTGAGAAGGTTCATGTCACGGCAGGGGCAAAACGAACTGTTCAAGTTGAT
GTTGATGCTTGCAAGCATCTTGGTGTAGTAGATGAGTATGGAAGG*AGGAGGATCCCAAT
GGGTGAACATAAACTGCATATCGGTGATCTTAAACATACTATTTTGGTTCAACCGCAACT
TTAAAAGAGGCATACAAAAAGAAGCAACAAATAAAGAAACCTTTTAACGGACTGGAGTGT
TTCCTCTTATTTACATGTTACATTATATATAGAGAGAT

QA 1 698 1 698
DS 

RD RS1GY41TF 672 0 0
G
GACATGGTATCCACAAGATTACGTAGCAAAAGTGCCAATGACGATAATGGCTATGAGAGC
ATATGGAAATTACCCAGGAAGGACCTACATATTCTACAAGGGTCCAGTGGTGTTTCCATT
TGGGTTCGGTTTAAGTTACACTACCTTCACTCACAGTTTGGCCCAAAGTCCATTAGCCCA
ACTATCAGTTTCATCCAAAAAATTCAACTCTGCCATTTTCAACTCGTCATCTGATTCCAT
CAAAGTGTCTCATGCCAACTGTGGAACGTTTCCAAAAATGTCTCTCCATGTTGAAGTATC
AAACACAGGTGAATTCGACGGAACCCACACGGTGTTCGTCTTTGCCGAGCCGCCGAAAAA
CGGGATAAAAGGATTGGGTGTGAACAAACAATTGATAGCGTTTGAGAAGGTTCATGTCAC
GGCAGGGGCAAAACGAACTGTTCAAGTTGATGTTGATGCTTGCAAGCATCTTGGTGTAGT
AGATGAGTATGTAAGG*AGGAGGATCCCAATGGGTGAACATAAACTGCATATCGGTGATC
TTAAACATACTATTTTGGTTCAACCGCAACTTTAAAAGAGGCATACAAAAAGAAGCAACA
AATAAGGAAACCTTTTAACGGACTGGAGTGTTTCCTCTTATTTACATGTTACATTATATA
TAGAGAGATAG

QA 2 672 2 672
DS 

RD RS1EU39JQ 733 0 0
ACTCACAGTTTGGCCCAAAGTCCATTAGCCCAACTATCAGTTTCATCCAAAAAATTCAAC
TCTGCCATTTTCAACTCGTCATCTGATTCCATCAAAGTGTCTCATGCCAACTGTGGAACG
TTTCCAAAAATGTCTCTCCATGTTGAAGTATCAAACACAGGTGAATTCGACGTAACCCAC
ACGGTGTTCGTCTTTGCCGAGCCGCCGAAAAACGGGATAAAAGGATTGGGTGTGAACAAA
CAATTGATAGCGTTTGAGAAGGTTCATGTCACGGCAGGGGCAAAACGAACTGTTCAAGTT
GATGTTGATGCTTGCAAGCATCTTGGTGTAGTAGATGAGTATGGAAGG*AGGAGGATCCC
AATGGGTGAACATAAACTGCATATCGGTGATTTTAAACATACTATTTTGGTTCAACCGCA
ACTTTAAAAGAGGCATACAAAAAGAAGCAACAAGTAAGGAAACCTTTTAACGGACTGGAG
TGTTTCCTCTTATTTACATGTTACATTATATATAGAGAGATAGGTTATTTTCTTGAGAAA
TTACTCAAGAAATGGTTCAATCCAACATGAGAAGCACCAAAGGGTCGCTTCTTGGATTTG
TATGTTTTATTTTTTCTACTTTTTTCGTCATCAATGTTACTGTAACTTGTGGCTCCCAAA
ATAAGAAAGATATGGGGCCCTTGTAAAAAGTTGAAACTAAGAAAAAAATGAAGATAAATG
ATAATTTGATA
TT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RS1GN45JQ 651 0 0
TCTGATTCCATCAAAGTGTCTCATGCCAACTGTGGAACGTTTCCAAAAATGTCTCTCCAT
GTTGAAGTATCAAACACAGGTGAATTCGACGGAACCCACACGGTGTTCGTCTTTGCCGAG
CCGCCGAAAAACGGGATAAAAGGATTGGGTGTGAACAAACAATTGATAGCGTTTGAGAAG
GTTCATGTCACGGCAGGGGCAAAACGAACTGTTCAAGTTGATATTGATGCTTGCAAGCAT
CTTGGTGTAGTAGATGAGTATGGAAGG*AGGAGGATCCCAATGGGTGAACATAAACTGCA
TATCGGTGATCTTAAACATACTATTTTGGTTCAACCGCAACTTTAAAAGAGGCATACAAA
AAGAAGCAACAAATAAGGAAACCTTTTAACGGACTGGAGTGTTTCCTCTTATTTACATGT
TACATTATATATAGAGAGATAGGTTATTTTCTTGAGAAATTACTCAAGAAATGGTGCAAT
CCAACATGAGAAGCACCAAAGGGTCGCTTCTTGGATTTGTATGTTTTATTTCTTCTACTT
TTTTCGTCATCAATGTTACTGTAACTTGTGGCTCCCAAAATAAGAAAGATATGGGGCCCT
TGTAAAAAGTTGAAACTAAGAAAAAAATGAAGATAAATGATAATTTGATA
C

QA 1 650 1 650
DS 

RD RS1H177JQB 655 0 0
TCTGATTCCATCAAAGTGTCTCATGCCAACTGTGGAACGTTTCCAAAAATGTCTCTCCAT
GTTGAAGTATCAAACACAGGTGAATTCGACGGAACCCACACGGTGTTCGTCTTTGCCGAG
CCGCCGAAAAACGGGATAAAAGGATTGGGTGTGAACAAACAATTGATAGCGTTTGAGAAG
GTTCATGTCACGGCAGGGGCAAAACGAACTGTTCAAGTTGATGTTGATGCTTGCAAGCAT
CTTGGTGTAGTAGATGAGTATGGAAGG*AGGAGGATCCCAATGGGTGAACATAAACTGCA
TATCGGTGATCTTAAACATACTATTTTGGTTCAACCGCAACTTTAAAAGAGGCATACAAA
AAGAAGCAACAAATAAGGAAACCTTTTAACGGACTGGAGTGTTTCCTCTTATTTACATGT
TACATTATATATAGAGAGATAGGTTATTTTCTTGAGAAATTACTCAAGAAATGGTTCAAT
CCAACATGAGAAGCACCAAAGGGTCGCTTCTTGGATTTGTATGTTTTATTTCTTCTACTT
TTTTCGTCATCAATGTTACTGTAACTTGTGGCTCCCAAAATAAGAAAGATATGGGGCCCT
TGTAAAAAGTTGAAACTAAGAAAAAAATGAAGATAAATGATAATTTGATATATAC

QA 1 655 1 655
DS 



AS 2 9

CO CL474Contig1 783 4 9 U
GGGAAAAAGAAACTACAACTGAAATATGGCAAGTTCTAAATTTAGCTTGATGATCACCAT
CTTATTCATCTGCACGTTAAGCTTATCGATCGGCTCGATTTCTTGCAAGAACGATTTCGT
TACGAACCAAGCCGCTTTGTTCGTGTTCGGAGATTCTCTGTTCGAAGCTGGAAACAACAA
CTACTTCGATTCTCTCCCTGGCTTCCGGTCAAATTACTGGCCGTATGGTAAAACAACGTT
TCAGTTTCCGACGGGACGGGTTTCCGATGGACGAACAATGATAGATTTTATCGCTGAAGA
TGCTTGGTTACCATTGCTCCCACCAAATCTACAGCCTGGTTACAGCAGCAGTCAACTAAC
CTACGGTCTTAATTTCGCCACCACAGCCGCCGGAGTATTTGCTGCAACTTTTCCCGGAGT
GTCAAAAGACTTGGGAACGCAGCTAAGCAGCTTCAAGAACGCAACGCGAGTGTTGGGATC
CAAACTAGGAGATGCAGAGGCGAGAAGAGTCATCTCAAAAGCTGTTTATCTCTTTCACAT
CGGAGCAAATGACTATCAATACCCTTTCTTTGCAAATACCACAACTATTACTACCACTAC
CAAAGAGAGATTCGTTGATTTCGTTATTGGTAACACAACCAACGTCATCGAGGAATTGTA
TAAAATGGGAGCAAGGAAGTTCGGGTTCTTGACCTTAGTCCATACGTTGTACACCAAGCA
TGTCGATAACTGACCCGACAAAGATAGGATCATGTTTGAGCGGTCTCGGAGCTGATCACT
CAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1EM11TF U 13
AF RS1CQ83TF U 20
AF RS1DR70TF U 20
AF RS1DK78TF U 1
BS 1 118 RS1DK78TF
BS 119 119 RS1EM11TF
BS 120 448 RS1DK78TF
BS 449 449 RS1EM11TF
BS 450 714 RS1DK78TF
BS 715 715 RS1DR70TF
BS 716 728 RS1DK78TF
BS 729 729 RS1DR70TF
BS 730 783 RS1DK78TF

RD RS1EM11TF 472 0 0
GGACAAC
TGAAATATGGCAAGTTCTAAATTTAGCTTGATGATCACCATCTTATCCATCTGCACGTTA
AGCTTATCGATCGGCTCGATTTCTTGCAAGAACGATTTCGTTACGAACCAAGCCGCTTTG
TTCGTGTTCGGAGATTCTCTGTTCGAAGCTGGAAACAACGACTACTTCGATTCTCTCCCT
GGCTTCCGGTCAAATTACTGGCCGTATGGTAAAACAACGTTTCAGTTTCCGACGGGACGG
GTTTCCGATGGACGAACAATGATAGATTTTATCGCTGAAGATGCTTGGTTACCATTGCTC
CCACCAAATCTACAGCCTGGTTACAGCAGCAGTCAACTAACCTACGGTCTTAATTTCGCC
ACCACAGCCGCCGGAGTATTTGCTGCAACTTTTCCCGGAGTGTCAAAAGACTTGGGAACG
CAGCTAAGCAGCTTCAAGAACGCAACGCGAGTGTTGGGATCCAAA

QA 8 472 8 472
DS 

RD RS1CQ83TF 675 0 0
TGAAATATGGCAAGTTCTAAATTTAGCTTGATGATCACCATCTTATTCATCTGCACGTTA
AGCTTATCGATCGGCTCGATTTCTTGCAAGAACGATTTCGTTACGAACCAAGCCGCTTTG
TTCGTGTTCGGAGATTCTCTGTTCGAAGCTGGAAACAACAACTACTTCGATTCTCTCCCT
GGCTTCCGGTCAAATTACTGGCCGTATGGTAAAACAACGTTTCAGTTTCCGACGGGACGG
GTTTCCGATGGACGAACAATGATAGATTTTATCGCTGAAGATGCTTGGTTACCATTGCTC
CCACCAAATCTACAGCCTGGTTACAGCAGCAGTCAACTAACCTACGGTCTTAATTTCGCC
ACCACAGCCGCCGGAGTATTTGCTGCAACTTTTCCCGGAGTGTCAAAAGACTTGGGAACG
CAGCTAAGCAGCTTCAAGAACGCAACGCGAGTGTTGGGATCCAAACTAGGAGATGCAGAG
GCGAGAAGAGTCATCTCGAAAGCTGTTTATCTCTTTCACATCGGAGCAAATGACTATCAA
TACCCTTTCTTTGCAAATACCACAACTATTACTACCTCTACCAAAGAGAGATTCGTTGAT
TTCGTTATTGGTAACACAACCAACGTCATCGAGGAATTGTATAAAATGGGAGCAAGGAAG
TTCGGGTTCTTGACC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1DR70TF 725 0 0
TGAAATATGGCAAGTTCTAAATTTAGCTTAATGATCACCATCTTATTCATCTGCACGTTA
AGCTTATCGATCGGCTCGATTTCTTGCAAGAACGATTTCGTTACGAACCAAGCCGCTTTG
TTCGTGTTCGGAGATTCTCTGTTCGAAGCTGGAAACAACAACTACTTCGATTCTCTCCCT
GGCTTCCGGTCAAATTACTGGCCGTATGGTAAAACAACGTTTCAGTTTCCGACGGGACGG
GTTTCCGATGGACGAACAATGATAGATTTTATCGCTGAAGATGCTTGGTTACCATTGCTC
CCACCAAATCTACAGCCTGGTTACAGCAGCGGTCAACTAACCTACGGTCTTAATTTCGCC
ACCACAGCCGCCGGAGTATTTGCTGCAACTTTTCCCGGAGTGTCAAAAGACTTGGGAACG
CAGCTAAGCAGCTTCAAGAACGCAACGCGAGTGTTGGGATCCAAACTAGGAGATGCAGAG
GCGAGAAGAGTCATCTCAAAAGCTGTTTATCTCTTTCACATCGGAGCAAATTACTATCAA
TACCCTTTCTTTGCAAATACCACAACTATTACTACCACTACCAAAGAGAGATTCGTTGAT
TTCGTTATTGGTAACACAACCAACGTCATCGAGGA*TTGTATAAAATGGGAGCAAGGAAG
TTCGGGTTCTTGACCTTAGTCCATACGTTGTACACCAAGCATGTCGATAACTGACCCGAC
AA
GAT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RS1DK78TF 783 0 0
GGGAAAAAGAAACTACAACTGAAATATGGCAAGTTCTAAATTTAGCTTGATGATCACCAT
CTTATTCATCTGCACGTTAAGCTTATCGATCGGCTCGATTTCTTGCAAGAACGATTTCTT
TACGAACCAAGCCGCTTTGTTCGTGTTCGGAGATTCTCTGTTCGAAGCTGGAAACAACAA
CTACTTCGATTCTCTCCCTGGCTTCCGGTCAAATTACTGGCCGTATGGTAAAACAACGTT
TCAGTTTCCGACGGGACGGGTTTCCGATGGACGAACAATGATAGATTTTATCGCTGAAGA
TGCTTGGTTACCATTGCTCCCACCAAATCTACAGCCTGGTTACAGCAGCAGTCAACTAAC
CTACGGTCTTAATTTCGCCACCACAGCCGCCGGAGTATTTGCTGCAACTTTTCCCGGAGT
GTCAAAAGACTTGGGAACGCAGCTAAGCGGCTTCAAGAACGCAACGCGAGTGTTGGGATC
CAAACTAGGAGATGCAGAGGCGAGAAGAGTCATCTCAAAAGCTGTTTATCTCTTTCACAT
CGGAGCAAATGACTATCAATACCCTTTCTTTGCAAATACCACAACTATTACTACCACTAC
CAAAGAGAGATTCGTTGATTTCGTTATTGGTAACACAACCAACGTCATCGAGGAATTGTA
TAAAATGGGAGCAAGGAAGTTCGGGTTCTTGACCTTAGTCCATACGTTGTACAC*AAGCA
TGTCGATA*CTGACCCGACAAAGATAGGATCATGTTTGAGCGGTCTCGGAGCTGATCACT
CAT

QA 1 783 1 783
DS 



CO CL474Contig2 833 5 8 U
GCGTGTAAAACTCATATTATTTTTCATGCACAAGTACAAAATAAAATAAAATAAAACAGT
TTACAGTATAAAAAAAGCCTAGAGTCCAAATAATGTTCTGAGATTGTAAGGTGCAGTGAC
ATTAGGCGATCCGTTCCAAATCAGCTCAGCGATCTGTCCATGAGCCTTCTCCGTCAAATG
AGAAGGATCAAAGAAGATGTAATCATCAGCGTTTTCGCATAGCTGGTAACCTTGCGACGG
TCCATTTCGGTATCCACATGTATTGACTCCCCTTAACGGTCCACTTCCGCAACATGCCAT
CTTCCCTTGCTTGAAACCGTATCTTAAAGGACTGTTGATTCTTTGGAGCAGGGAAGTGTG
AAAGTCGTGAAGAGAGTATTTAAATCCTGATAGTTGGCGCTCTAGACGCCTCAAAACTTT
AGGGAATTCTTGGTTATGGAGGTTGATCAGCTCCGAGACCGGCTCAAAACATGATCCTAT
CTTTGTCGGGTCAGTTATCGACATGCTTGGTGTACAACCGTATGGACCTAAGGTCAAGAA
CCCGAACTTCCTTGCTCCCATTTTATACAATTCCTCGATGACGTTGGTTGTGTTACCAAT
AACGAAATCAACGAATCTCTCTTTGGTAGTGGTAGTAATAGTTGTGGTATTTGCAAAGAA
AGGGTATTGATAGTCATTTGCTCCGATGTGAAAGAGATAAACAGCTTTTGAGATGACTCT
TCTCGCCTCTGCATCTCCTAGTTTGGATCCCAACACTCGCGTTGCGTTCTTGAAGCCGCT
TAGCTGCGTTCCCAAGTCTTTTGACACTCCGGGAAAGTTGCAGCAATACTCCG


BQ
10 10 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FC67JQ U 3
AF RS1CQ83JQ U 3
AF RS1EM11JQ U 1
AF RS1DR70JQ U 3
AF RS1DK78JQ U 3
BS 1 443 RS1EM11JQ
BS 444 444 RS1CQ83JQ
BS 445 445 RS1EM11JQ
BS 446 446 RS1CQ83JQ
BS 447 596 RS1EM11JQ
BS 597 597 RS1CQ83JQ
BS 598 742 RS1EM11JQ
BS 743 833 RS1DK78JQ

RD RS1FC67JQ 487 0 0
GC
GTAAAACTCATATTATTTTTCATGCACAAGTACAAAATAAAATAAAATAAAACAGTTTAC
AGTATAAAAAAAGCCTAAAGTCCAAATAATGTTCTGAGATTGTAAGGTGCAGTGACATTA
GGCGATCCGTTCCAAATCAGCTCAGCGATATGTCCATGAGCCTTCTCCGTCAAATGAGAA
GGATCAAAGAAGATGTAATCATCAGCGTTTTCGCATAGCTGGTAACCTTGCGACGGTCCA
TTTCGGTATCCACATGTATTGACTCCCCTTAACGGTCCACTTCCGCAACATGCCATCTTC
CCTTGCTTGAAACCGTATCTTAAAGGACTGTTGATTCTTTGGAGCAGGGAAGTGTGAAAG
TCGTGAAGAGAGTATTTAAATCCTGATAGTTGGCGCTCTAGACGCCTCAAAACTTTAGGG
AATTCTTGGTTATGGAGGTTGATCAGCTCCGAGACCGACTCAAAACATGATCCTATCTTT
GTCGG

QA 3 487 3 487
DS 

RD RS1CQ83JQ 717 0 0
GTGTAAAACTCATATTATTTTTCATGCACAAGTACAAAATAAAATAAAATAAAACAGTTT
ACAGTATAAAAAAAGCCTAAAGTCCAAATAATGTTCTGAGATTGTAAGGGGCAGTGACAT
TAGGCGATCCGTTCCAAATCAGCTCAGCGATCTGTCCATGAGCCTTCTCCGTCAAATGAG
AAGGATCAAAGAAGATGTAATCATCAGCGTTTTCCCATAGCTGGTAACCTTGCGACGGTC
CATTTCGGTATCCACATGTATTGACTCCCCTTAACGGTCCACTTCCGCAACATGCCATCT
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DS 



AS 2 8

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AACCACTATTGGCACCGTGAGTGTACTCCTCTTCGTTCCTTATAGAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 0 25 25 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

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AF RS1FO28JQ U 38
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QA 1 776 1 776
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RD RS1FO28JQ 787 0 0
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CCTTATA

QA 1 787 1 787
DS 



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TGACTTTATGCCAAGGATGAAGATGCATTCTTCAGAGACTACGCAGATCTCACGAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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G
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GAGTACACGAAAGAGATCAACAAGGCTCGCCGTGATCTCCGCTCAATCATCTCGAGCAAG
AACTGTGCTCCGATCATGCTTAGATTAGCATGGCACGATGCTGGAACCTATGATGCACAG
TCGAAGACAGGGGGACCTAATGGGTCTATAAGGAACGAAGAGGAGTACACTCACGGTGCC
AATAGTGGTTTAAAGATCGCTCTTGAAATCTGTGAGGGAGTGAAAGCTAAACATCCTAAA
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CCTGACATCAGCTTCCAACCGGGAAGAAAAGATTCAAATGTTTGCCCTAGGGAAGGAAGA
CTTCCTGATGCTACAAAAAA*TTTCCAACATCTTAGAGATGTTTTCTACCGCATGGGATT
ATCTGATAAGGATATTGTAGCACT

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DS 

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TCTTAACCGCCCCACCTTGACCATATCATTCTCCTCTCAATTCACCATTGACGATTAGGG
AGAGAGCTATGGCGGCACCGATTGTTAACGCTGAGTACACGAAAGAGATCAACAAGGCTC
GCCGTGATCTCCGCTCAATCATCTCGAGCAAGAACTGTGCTCCGATCATGCTTAGATTAG
CATGGCACGATGCTGGAACCTATGATGCACAGTCGAAGACAGGGGGACCTAATGGGTCTA
TAAGGAACGAAGAGGAGTACACTCACGGTGCCAATAGTGGTTTAAAGATCGCTCTTGAAA
TCTGTGAGGGAGTGAAAGCTAAACATCCTAAAATCACCTATGCGGATCTATACCAGCTTG
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AAGATTCGAATGTTTGCCCTAGGGAAGGAAGACTTCCTGATGCTACAAAAAA*TTTCCAA
CATCTTAGAGATGTCTTCTACCGCATGGGATTATCTGATAAGGATATTGTAGCACTCTCA
GGGGCTCACACTCTGGGAAGGGCTCATCCAGAGAGGTCCGGCTTCGATGGTCCCTGGACT
CAAGAGCCTCTGAAGTTTGATAACTCATACTTCGTGGAACTACTGAAAG*AGATCAGAGG
*CTTGTTGAAACTTCCAT
C

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DS 

RD RS1FO28TF 775 0 0
GG
AACCGCCCCACCTTGACCATATCATTCTCCTCTCAATTCACCATTGACGATTAGGGAGAG
AGCTATGGCGGCACCGATTGTTAACGCTGAGTACACGAAAGAGATCAACAAGGCTCGCCG
TGATCTCCGCTCAATCATCTCGAGCAAGAACTGTGCTCCGATCATGCTTAGATTAGCATG
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GAACGAAGAGGAGTACACTCACGGTGCCAATAGTGGTTTAAAGATCGCTCTTGAAATCTG
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TGTGGTAGCAGTGGAGGTTACTGGTGGACCTGACATCAGCTTCCAACCTGGGAGAAAAGA
TTCAAATGTTTGCCCTAGGGAAGGAAGACTTCCTGATGCTACAAAAAAATTTCCAACATC
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CTCACACTCTGGGAAGGGCTCATCCAGAGAGGTCCGGCTTCGATGGTCCCTGGACTCAAG
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GTTGAAACTTCCATCTGACAAGACTTTGTTGGAGACCCAGAGTTCCGTCGTTATGTTGAC
TTTATGCCAAGGATGAAGATGCATTCTTCAGAGACTACGCAGATCTCACGAGA

QA 3 775 3 775
DS 



AS 1 8

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GTCCTCCCGTCGCGATGGAAACGCCAAAGACTTCTCTGATCCCTAGCTTCCTCTATTCCT
CTTCCTCATCTCCGAGATCTCTTCTGAGCTCCAATCTCGAGAAGTCTCCTTCTCCGACGA
TGCTGTCTCGGAAGAGTTTTCTCATTGCGTCTCCCACGGAGCCAGGGAAGGGGATCGAGA
TGTACTCGCCTGCCTTCTACGCCGCGTGTACCTTCGGTGGAGTTCTCAGCTGTGGTCTCA
CTCATACGACCGTCACCCCTCTTGATCTCGTCAAGTGTAATATGCAGATTGATCCGGCTA
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TCTTCCGTGGATGGGTTCCTACTCTGTTGGGTTACAGTGCTCAGGGTGCCTGCAAGTTTG
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AATACAAGACCCTCATCTACCTTGCTGGTTCCGCCTCTGCTGAGGTTATCGCCGATATTG
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AGACCATTGTTGAGATGATCTACAAGTACGCAATCCCGAACCCAAAACACGAGTGCAGCA
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AAGCCAAAGCCTAAGACTAAATGATGATGATAAAAAAACTTAGGATTTTTGTTTGAAAGA
ATAAAGAGAAACGTATGGCAGTGAGGAAGAGTAAGCTCATCCTCAGGATTCCAACTTGAT
T*TTTTTTTTTTGGAAATTTGTGTTCTTGAATTAACTATAGTGCTCTCTCTTTTCACAAT
ATTATCTCTCTATTTTGGTTTGTGTCATGTAATCTTAAAAGATGAGAGGGACACACGAAG
ATAGAGAGTGTGGGCACACCCACTTACTACTTTTTGTTATTTTTCATTTGGAAAAATCTC
TTTTGGTTGCTATCAAAAAAAAA


BQ
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AF RS1ED67TF U 801
AF RS1DO65JQ C 747
BS 1 232 RS1DO65TF
BS 233 233 RS1F589TF
BS 234 306 RS1DO65TF
BS 307 307 RS1F589TF
BS 308 313 RS1DO65TF
BS 314 314 RS1F589TF
BS 315 316 RS1DO65TF
BS 317 317 RS1F589TF
BS 318 358 RS1DO65TF
BS 359 359 RS1F589TF
BS 360 397 RS1DO65TF
BS 398 398 RS1F589TF
BS 399 412 RS1DO65TF
BS 413 413 RS1F589TF
BS 414 481 RS1DO65TF
BS 482 482 RS1F589TF
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BS 700 800 RS1FJ43JQ
BS 801 868 RS1ED67TF
BS 869 869 RS1FJ43JQ
BS 870 1182 RS1ED67TF
BS 1183 1183 RS1FJ43JQ
BS 1184 1261 RS1ED67TF
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BS 1263 1417 RS1ED67TF
BS 1418 1463 RS1DO65JQ

RD RS1DO65TF 694 0 0
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GTCCTCCCGTCGCGATGGAAACGCCAAAGACTTCTCTGATCCCTAGCTTCCTCTATTCCT
CTTCCTCATCTCCGAGATCTCTTCTGAGCTCCAATCTCGAGAAGTCTCCTTCTCCGACGA
TGCTGTCTCGGAAGAGTTTTCTCATTGCGTCTCCCACGGAGCCAGGGAAGGGAATCGAGA
TGTACTCGCCTGCCTTCTACGCCGCGTGTACCTTCGGTGGAGTTCTCAGCTGTGGTCTCA
CTCATATGACCGTTACACCTCTTGATCTCGTCAAGTGTAATATGCAGATTGATCCGGCCA
AGTACAAGAGCATCTCGTCTGGTTTTGGGATTTTGCTTAAAGAGCAAGGAGTCAAAGGCT
TCTTCCGTGGATGGGTTCCTACTCTGTTGGGTTACAGTGCTCAGGGTGCCTGCAAGTTTG
GGTTTTACGAGTTCTTTAAGAAGTACTACTCTGATCTCGCTGGACCTGAGTTCGCCGCCA
AATACAAGACCCTCATCTACCTTGCTGGTTCTGCCTCTGCTGAGGTTATCGCCGATATTG
CGCTCTGCCCGTTTGAAGCTGTTAAGGTCCGTGTTCAGACACAGCCTG*ATTCGCCAGGG
GGATGTCTGATGGGTTTCCTAAGTTTGTCAAGTC

QA 1 694 1 694
DS 

RD RS1F589TF 678 0 0
GGATCGACA
AAAAAACACATTTGCGAATCTTATCTCCGTCCGTCCTCCCGTCGCGATGGAAACGCCAAA
GACTTCTCTGATCCCTAGCTTCCTCTATTCCTCTTCCTCATCTCCGAGATCTCTTCTGAG
CTCCAATCTCGAGAAGTCTCCTTCTCCGACGATGCTGTCTCGGAAGAGTTTTCTCATTGC
GTCTCCCACGGAGCCAGGGAAGGGGATCGAGATGTACTCGCCTGCCTTCTACGCCGCGTG
TACCTTCGGTGGAGTTCTCAGCTGTGGTCTCACTCATACGACCGTCACCCCTCTTGATCT
CGTCAAGTGTAATATGCAGATTGATCCGGCTAAGTACAAGAGCATCTCGTCTGGTTTTGG
GATTTTGCTGAAAGAGCAAGGAGTGAAAGGCTTCTTCCGTGGATGGGTTCCTACTCTGTT
GGGTTACAGTGCTCAGGGTGCCTGCAAGTTTGGATTCTACGAGTTCTTTAAGAAGTACTA
CTCTGATCTCGCTGGACCTGAGTTCGCCGCCAAATACAAGACCCTCATCTACCTTGCTGG
TTCCGCCTCTGCTGAGGTTATCGCCGATATTGCGCTCTGCCCGTTTGAGGCTGTTAAGGT
CCGTGTTCAGACACAGCCTGGATTCGCCAGGGGGATGTCTGATGGGTTCCCTAAGTTTGT
CAAGTCCGA

QA 10 678 10 678
DS 

RD RS1FJ43TF 686 0 0
GGATCGACA
AAAAAACACATTTGCGAATCTTATCTCCGTCCGTCCTCCCGTCGCGATGGAAACGCCAAA
GACTTCTCTGATCCCTAGCTTCCTCTATTCCTCTTCCTCATCTCCGAGATCTCTTCTGAG
CTCCAATCTCGAGAAGTCTCCTTCTCCGACGATGCTGTCTCGGAAGAGTTTTCTCATTGC
GTCTCCCACGGAGCCAGGGAAGGGGATCGAGATGTACTCGCCTGCCTTCTACGCCGCGTG
TACCTTCGGTGGAGTTCTCAGCTGTGGTCTCACTCATACGACCGTCACCCCTCTTGATCT
CGTCAAGTGTAATATGCAGATTGATCCGGCTAAGTACAAGAGCATCTCGTCTGGTTTTGG
GATTTTGCTGAAAGAGCAAGGAGTGAAAGGCTTCTTCCGTGGATGGGTTCCTACTCTGTT
GGGTTACAGTGCTCAGGGTGCCTGCAAGTTTGGATTCTACGAGTTCTTTAAGAAGTACTA
CTCTGATCTCGCTGGACCTGAGTTCGCCGCCAAATACAAGACCCTCATCTACCTTGCTGG
TTCCGCCTCTGCTGAGGTTATCGCCGATATTGCGCTCTGCCCGTTTGAGGCTGTTAAGGT
CCGTGTTCAGACACAGCCTGGATTCGCCAGGGGGATGTCTGATGGGTTCCCTAAGTTTGT
CAAGTCCGAAG
ATACGG

QA 10 680 10 680
DS 

RD RS1ED67JQ 161 0 0
TTCAAAGTGTTTGTTGGCCTGCCAACCACCGGGGGTGTTGCTCCAGTCCCTGCCATAGCA
GCAGCTGAAGCCAAAGCCTAAGATTAAATGATGATGATAAAAAAACTTATGATTTTTGTT
TGAAAGAATAAAGAGAAACGTATGGCAGTGAGGAAGAGTAA

QA 1 161 1 161
DS 

RD RS1FJ43JQ 783 0 0
TGCTGGTTCCGCCTCTGCTGAGGTTATCGCCGATATTGCGCTCTGCCCGTTTGAGGCTGT
TAAGGTCCGTGTTCAGACACAGCCTGGATTCGCCAGGGGGATGTCTGATGGGTTCCCTAA
GTTTGTCAAGTCCGAAGGATACGGAGGCTTGTACAAGGGTCTTGCTCCACTTTGGGGACG
TCAGATACCTTACACGATGATGAAGTTTGCTTCGTTTGAGACCATTGTTGAGATGATCTA
CAAGTACGCAATCCCGAACCCAAAACACGAGTGCAGCAAAGGTCTGCAACTTGGTGTGAG
TTTTGCAGGAGGTTATGTTGCTGGAGTGTTTTGTGCAATTGTCTCCCATCCTGCAGATAA
TCTAGTGTCGTTCCTCAACAACGCTAAGGGAGCAACCGTTGGAGATGCGGTGAAGAAGAT
AGGAATGGTGGGACTGTTCACAAGAGGACTTCCTTTAAGGATTGTGATGATAGGAACATT
GACTGGAACACAGTGGGGTTTATACGATGCCTTCGAAGTGTTTGTTGGCCTGCCAACCAC
CGGTGGTGTTGCTCCAGTCCCTGCCATAGCAGCAGCTGAAGCCTAAGCCTAAGACTAAAT
GATGATGATGAAAAAACTTAGGATTTTTGTTTGAAAGAATAAAGAGAAACGTATGGTAGT
GAGGAAGAGTAAGCTCATCCTCAGGATTCCAACTTGATT*TTTTTTTT**GGAAATTTGT
GTTCTTGAATTAACTATAGTGCTCTCTCTTTTCACAATATTATCTCTCTATTTTGGTTTG
TGT

QA 1 783 1 783
DS 

RD RS1F589JQ 742 0 0
TCTGCCCGTTTGAGGCTGTTAAGGTCCGTGTTCAGACACAGCCTGGATTCGCCAGGGGGA
TGTCTGATGGGTTCCCTAAGTTTGTCAAGTCCGAAGGATACGGAGGCTTGTACAAGGGTC
TTGCTCCACTTTGGGGACGTCAGATACCTTACACGATGATGAAGTTTGCTTCGTTTGAGA
CCATTGTTGAGATGATCTACAAGTACGCAATCCCGAACCCAAAACACGAGTGCAGCAAAG
GTCTGCAACTTGGTGTGAGTTTTGCAGGAGGTTATGTTGCTGGAGTGTTTTGTGCAATTG
TCTCCCATCCTGCAGATAATCTAGTGTCGTTCCTCAACAACGCTAAGGGAGCAACCGTTG
GAGATGCGGTGAAGAAGATAGGAATGGTGGGACTGTTCACAAGAGGACTTCCTTTAAGGA
TTGTGATGATAGGAACATTGACTGGAACACAGTGGGGTTTATACGATGCCTTCGAAGTGT
TTGTTGGCCTGCCAACCACCGGTGGTGTTGCTCCAGTCCCTGCCATAGCAGCAGCTGAAG
CCTAAGCCTAAGACTAAATGATGATGATGAAAAAACTTAGGATTTTTGTTTGAAAGAATA
AAGAGAAACGTATGGTAGTGAGGAAGAGTAAGCTCATCCTCAGGATTCCAACTTGATT*T
TTTTTTT**GGAAATTTGTGTTCTTGAATTAACTATAGTGCTCTCTCTTTTCACAATATT
ATCTCTCTATTTTGGTTTGTGT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RS1ED67TF 617 0 0
TACAAGTACGCAATCCCGAACCCAAAACACGAGTGCAGCAAAGGTCTGCAACTTGGTGTG
AGTTTTGCTGGAGGTTATGTTGCTGGAGTGTTTTGTGCAATTGTCTCCCATCCTGCAGAT
AATCTAGTGTCGTTCCTCAACAACGCTAAGGGAGCAACCGTTGGAGATGCGGTGAAGAAG
ATAGGAATGGTGGGACTGTTCACAAGAGGACTTCCTCTAAGAATTGTGATGATAGGAACA
TTGACTGGAGCACAGTGGGGTTTATACGATGCCTTCAAAGTGTTTGTTGGCCTGCCAACC
ACCGGTGGTGTTGCTCCAGTCCCTGCCATAGCAGCAGCTGAAGCCAAAGCCTAAGACTAA
ATGATGATGATAAAAAAACTTATGATTTTTGTTTGAAAGAATAAAGAGAAACGTATGGCA
GTGAGGAAGAGTAAGCTCATCCTCAGGATTCCAACTTGATTCTTTTTTTTTTGGAAATTT
GTGTTCTTGAATTAACTATAGTGCTCTCTCTTTTCACAATATTATCTCTCTATTTTGGTT
TGTGTCATGTAATCTTAAAAGATGAGAGGGACACACGAAGATAGAGAGTGTGGGCACACC
CACTTACTACTTTTTGT

QA 1 617 1 617
DS 

RD RS1DO65JQ 717 0 0
ATT
CCTTACACGATGATGAAGTTTGCTTCGTTTGAGACCATTGTTGAGATGATCTACAAGTAC
GCAATCCCGAACCCAAAACACGAGTGCAGCAAAGGTCTGCAACTTGGTGTGAGTTTTGCA
GGAGGTTATGTTGCTGGAGTGTTTTGTGCAATTGTCTCCCATCCTGCAGATAATCTAGTG
TCGTTCCTCAACAACGCTAAGGGAGCAACCGTTGGAGATGCGGTGAAGAAGATAGGAATG
GTGGGACTGTTCACAAGAGGACTTCCTCTAAGAATTGTGATGATAGGAACATTGACTGGA
GCACAGTGGGGTTTATACGATGCCTTCAAAGTGTTTGTTGGCCTGCCAACCACCGGTGGT
GTTGCTCCAGTCCCTGCCATAGCAGCAGCTGAAGCCAAAGCCTAAGACTAAATGATGATG
ATAAAAAAACTTAGGATTTTTGTTTGAAAGAATAAAGAGAAACGTATGGCAGTGAGGAAG
AGTAAGCTCATCCTCAGGATTCCAACTTGATT*TTTTTTTTTTGGAAATTTGTGTTCTTG
AATTAACTATAGTGCTCTCTCTTTTCACAATATTATCTCTCTATTTTGGTTTGTGTCATG
TAATCTTAAAAGATGAGAGGGACACACGAAGATAGAGAGTGTGGGCACACCCACTTACTA
CTTTTTGTTATTTTTCATTTGGAAAAATCTCTTTTGGTTGCTATCAAAAAAAAA

QA 4 717 4 717
DS 



AS 2 8

CO CL477Contig1 643 2 3 U
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CGACGTTCTTCGAGCTAAAGGTAAGAGTTTGAAGAAGTGCATCACAGACCAAATAGAGAA
GATGTCTGAGAAGAAGGGAAGGAAAGAGGAAGTGGTGACCAGAGAGTACACCATCAACCT
CCACAGACGCCTCCACAGCTGTACCCTTAAGAAGAAGGCACCAAAGGCCATAAAGGAGAT
AAGGAAGTTTGCAGAGAAAGCCATGGGAACAAAGGACGTAAGGGTAGACGTGAAGTTGAA
CAAGCAGATATGGAGCAAAGGAATCAGAGGTCCTCCAAGGAGGATTAGGGTGCGTGTTGC
GCGTAAGAGAAACGACGATGAGGACGCAAAGGAAGAGTTTTTCTCACTTGTCACCGTTGC
TGAAATCCCTGCCGAAGGTCTCAGTGGACTTGGCACTAAGGTCATTGACGAGGAGGATTG
AAGATCCTTGTAGTCACTGAGACTAGTTTTGTGGTTTTTTTGTCATTTCTTGTTGTTTTC
ATTTCGAAAGGAGTTTTTTTGTCTTTCTTTGTAGTGTGTTACGATGCAGTTTATTGGAAA
GACTCATTTTCTTACAAGACCTAAAGATGAATCTGTTTTATGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A255TF U 1
AF RS1A255TV U 1
BS 1 624 RS1A255TF
BS 625 625 RS1A255TV
BS 626 643 RS1A255TF

RD RS1A255TF 643 0 0
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CGACGTTCTTCGAGCTAAAGGTAAGAGTTTGAAGAAGTGCATCACAGACCAAATAGAGAA
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AAGGAAGTTTGCAGAGAAAGCCATGGGAACAAAGGACGTAAGGGTAGACGTGAAGTTGAA
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GCGTAAGAGAAACGACGATGAGGACGCAAAGGAAGAGTTTTTCTCACTTGTCACCGTTGC
TGAAATCCCTGCCGAAGGTCTCAGTGGACTTGGCACTAAGGTCATTGACGAGGAGGATTG
AAGATCCTTGTAGTCACTGAGACTAGTTTTGTGGTTTTTTTGTCATTTCTTGTTGTTTTC
ATTTCGAAAGGAGTTTTTTTGTCTTTCTTTGTAGTGTGTTACGATGCAGTTTATTGGAAA
GACTCATTTTCTTACAAGACCTAA*GATGAATCTGTTTTATGT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RS1A255TV 643 0 0
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CGACGTTCTTCGAGCTAAAGGTAAGAGTTTGAAGAAGTGCATCACAGACCAAATAGAGAA
GATGTCTGAGAAGAAGGGAAGGAAAGAGGAAGTGGTGACCAGAGAGTACACCATCAACCT
CCACAGACGCCTCCACAGCTGTACCCTTAAGAAGAAGGCACCAAAGGCCATAAAGGAGAT
AAGGAAGTTTGCAGAGAAAGCCATGGGAACAAAGGACGTAAGGGTAGACGTGAAGTTGAA
CAAGCAGATATGGAGCAAAGGAATCAGAGGTCCTCCAAGGAGGATTAGGGTGCGTGTTGC
GCGTAAGAGAAACGACGATGAGGACGCAAAGGAAGAGTTTTTCTCACTTGTCACCGTTGC
TGAAATCCCTGCCGAAGGTCTCAGTGGACTTGGCACTAAGGTCATTGACGAGGAGGATTG
AAGATCCTTGTAGTCACTGAGACTAGTTTTGTGGTTTTTTTGTCATTTCTTGTTGTTTTC
ATTTCGAAAGGAGTTTTTTTGTCTTTCTTTGTAGTGTGTTACGATGCAGTTTATTGGAAA
GACTCATTTTCTTACAAGACCTAAAGATGAATCTGTTTTATGT

QA 1 643 1 643
DS 



CO CL477Contig2 696 6 16 U
AGAACATAAAACAGATTCATCTTTAGGTCTTGTAGAAGAAAATGAGTCTTTCCAATAAAC
TGCATCGTAACACACTACAAAGAAAGACAAAAAAACTCCTTTCGAAATGAAAACAACAAG
AAATGACAAAAAAACCACAAAACTAGTCTCAGTGACTACAAGGATCTTCAATCCTCCTCG
TCAATGACCTTAGTGCCAAGTCCACTGAGACCTTCGGCAGGGATTTCAGCAACGGTGACA
AGTGAGAAAAACTCTTCCTTTGCGTCCTCATCGTCGTTTCTCTTACGCGCAACACGCACC
CTAATCCTCCTTGGAGGACCTCTGATTCCTTTGCTCCATATCTGCTTGTTCAACTTCACG
TCTACCCTTACGTCCTTTGTTCCCATGGCTTTCTCTGCAAACTTCCTTATCTCCTTTATG
GCCTTTGGTGCCTTCTTCTTAAAGGTACAGCTGTGGAGGCGTCTGTGGAGGTTGATGGTG
TACTCTCTGGTCACCACTTCCTCTTTCCTTCCCTTCTTCTCAGACATCTTCTCTATTTGG
TCTGTGATGCACTTCTTCAAACTCTTACCTTTAGTTCGAAGAACGTCGAGAGACAGGAAG
GCGACGAGAGAGGATAAGTTAGCTTATATATGTGACACTGAATTAACCCTAGATCTTTTA
TTTGGGCTTTATTGGGCTGATAGCTTGTGCCATTCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 5 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H520JQB U 1
AF RS1H520TF C 1
AF RS1CB27JQ U 25
AF RS1AO94JQ U 47
AF RS1CB27TF C 25
AF RS1AO94TFB C 8
BS 1 38 RS1H520JQB
BS 39 39 RS1CB27JQ
BS 40 56 RS1H520JQB
BS 57 57 RS1CB27JQ
BS 58 327 RS1H520JQB
BS 328 328 RS1CB27JQ
BS 329 406 RS1H520JQB
BS 407 407 RS1CB27JQ
BS 408 468 RS1H520JQB
BS 469 522 RS1CB27JQ
BS 523 523 RS1AO94JQ
BS 524 537 RS1CB27JQ
BS 538 538 RS1AO94JQ
BS 539 580 RS1CB27JQ
BS 581 597 RS1AO94JQ
BS 598 696 RS1AO94TFB

RD RS1H520JQB 468 0 0
AGAACATAAAACAGATTCATCTTTAGGTCTTGTAGAAGGAAATGAGTCTTTCCAATTAAC
TGCATCGTAACACACTACAAAGAAAGACAAAAAAACTCCTTTCGAAATGAAAACAACAAG
AAATGACAAAAAAACCACAAAACTAGTCTCAGTGACTACAAGGATCTTCAATCCTCCTCG
TCAATGACCTTAGTGCCAAGTCCACTGAGACCTTCGGCAGGGATTTCAGCAACGGTGACA
AGTGAGAAAAACTCTTCCTTTGCGTCCTCATCGTCGTTTCTCTTACGCGCAACACGCACC
CTAATCCTCCTTGGAGGACCTCTGATTACTTTGCTCCATATCTGCTTGTTCAACTTCACG
TCTACCCTTACGTCCTTTGTTCCCATGGCTTTCTCTGCAAACTTCCCTATCTCCTTTATG
GCCTTTGGTGCCTTCTTCTTAAAGGTACAGCTGTGGAGGCGTCTGTGG

QA 1 468 1 468
DS 

RD RS1H520TF 597 0 0
AGA
ACATAAAACAGATTCATCTTTAGGTCTTGTAGAAGGAAATGAGTCTTTCCAATTAACTGC
ATCGTAACACACTACAAAGAAAGACAAAAAAACTCCTTTCGAAATGAAAACAACAAGAAA
TGACAAAAAAACCACAAAACTAGTCTCAGTGACTACAAGGATCTTCAATCCTCCTCGTCA
ATGACCTTAGTGCCAAGTCCACTGAGACCTTCGGCAGGGATTTCAGCAACGGTGACAAGT
GAGAAAAACTCTTCCTTTGCGTCCTCATCGTCGTTTCTCTTACGCGCAACACGCACCCTA
ATCCTCCTTGGAGGACCTCTGATTACTTTGCTCCATATCTGCTTGTTCAACTTCACGTCT
ACCCTTACGTCCTTTGTTCCCATGGCTTTCTCTGCAAACTTCCCTATCTCCTTTATGGCC
TTTGGTGCCTTCTTCTTAAAGGTACAGCTGTGGAGGCGTCTGTGGAGGTTGATGGTGTAC
TCTCTGGTCACCACTTCCTCCTTCCTTCCCTTCTTCTCAGACATCTTCTCTATTTGGTCT
GTGATGCACTTCTTCAAACTCTTACCTTTAGTTCGAAGAACGTCGAGAGACAG
C

QA 4 596 4 596
DS 

RD RS1CB27JQ 559 0 0
AGGTCTTGTAAAAAAAAATGAGTCTTTCCAATAAACTGCATCGTAACACACTACAAAGAA
AGACAAAAAAACTCCTTTCGAAATGAAAACAACAAGAAATGACAAAAAAACCACAAAACT
AGTCTCAGTGACTACAAGGATCTTCAATCCTCCTCGTCAATGACCTTAGTGCCAAGTCCA
CTGAGACCTTCGGCAGGGATTTCAGCAACGGTGACAAGTGAAAAAAACTCTTCCTTTGCG
TCCTCATCGTCGTTTCTCTTACGCGCAACACGCACCCTAATCCTCCTTGGAGGACCTCTG
ATTCCTTTGCTCCATATCTGCTTGTTCAACTTCACGTCTACCCTTACGTCCTTTGTTCCC
ATGGCTTTCTCTGCAAACTTCCTTATCTCCCTTATGGCCTTTGGTGCCTTCTTCTTAAAG
GTACAGCTGTGGAGGCGTCTGTGGAGGTTGATGGTGTACTCTCTGGTCACCACTTCCTCT
TTCCTTCCCTTCTTCTCAAACATCTTCTCTATTCGGTCTGTGATGCACTTCTTCAAACTC
TTACCTTTAGTTCGAA
AAA

QA 1 556 1 556
DS 

RD RS1AO94JQ 552 0 0
TCTTTCCAATAAACTGCATCGTAACACACTACAAAGAAAGACAAAAAAACTCCTTTCGAA
ATGAAAACAACAAGAAATGACAAAAAAACCACAAAACTAGTCTCAGTGACTACAAGGATC
TTCAATCCTCCTCGTCAATGACCTTAGTGCCAAGTCCACTGAGACCTTCGGCAGGGATTT
CAGCAACGGTGACAAGTGAGAAAAACTCTTCCTTTGCGTCCTCATCGTCGTTTCTCTTAC
GCGCAACACGCACCCTAATCCTCCTTGGAGGACCTCTGATTCCTTTGCTCCATATCTGCT
TGTTCAACTTCACGTCTACCCTTACGTCCTTTGTTCCCATGGCTTTCTCTGCAAACTTCC
TTATCTCCTTTATGGCCTTTGGTGCCTTCTTCTTAAAGGTACAGCTGTGGAGGCGTCTGT
GGAGGTTGATGGTGTACTCTCTGGTCACCACTTCCTCTTTCCTTCCCTTCTTCTCAGACA
TCTTCTCTATTTGGTCTGTGATGCACTTCTTCAAACTCTTACCTTTAGTTCGAAGAACGT
CGAGAGACAGG
A

QA 1 551 1 551
DS 

RD RS1CB27TF 571 0 0
AGGTCTTGTAGAAGAAAATGAGTCTTTCCAATAAACTGCATCGTAACACACTACAAAGAA
AGACAAAAAAACTCCTTTCGAAATGAAAACAACAAGAAATGACAAAAAAACCACAAAACT
AGTCTCAGTGACTACAAGGATCTTCAATCCTCCTCGTCAATGACCTTAGTGCCAAGTCCA
CTGAGACCTTCGGCAGGGATTTCAGCAACGGTGACAAGTGAGAAAAACTCTTCCTTTGCG
TCCTCATCGTCGTTTCTCTTACGCGCAACACGCACCCTAATCCTCCTTGGAGGACCTCTG
ATTCCTTTGCTCCATATCTGCTTGTTCAACTTCACGTCTACCCTTACGTCCTTTGTTCCC
ATGGCTTTCTCTGCAAACTTCCTTATCTCCCTTATGGCCTTTGGTGCCTTCTTCTTAAAG
GTACAGCTGTGGAGGCGTCTGTGGAGGTTGATGGTGTACTCTCTGGTCACCACTTCCTCT
TTCCTTCCCTTCTTCTCAGACATCTTCTCTATTCGGTCTGTGATGCACTTCTTCAAACTC
TTACCTTTAGTTCGAAGAACGTCGAGAGAC
C

QA 1 570 1 570
DS 

RD RS1AO94TFB 689 0 0
G
AAACAGATTCATCTTTAGGTCTTGTAGAAGAAAATGAGTCTTTCCAATAAACTGCATCGT
AACACACTACAAAGAAAGACAAAAAAACTCCTTTCGAAATGAAAACAACAAGAAATGACA
AAAAAACCACAAAACTAGTCTCAGTGACTACAAGGATCTTCAATCCTCCTCGTCAATGAC
CTTAGTGCCAAGTCCACTGAGACCTTCGGCAGGGATTTCAGCAACGGTGACAAGTGAGAA
AAACTCTTCCTTTGCGTCCTCATCGTCGTTTCTCTTACGCGCAACACGCACCCTAATCCT
CCTTGGAGGACCTCTGATTCCTTTGCTCCATATCTGCTTGTTCAACTTCACGTCTACCCT
TACGTCCTTTGTTCCCATGGCTTTCTCTGCAAACTTCCTTATCTCCTTTATGGCCTTTGG
TGCCTTCTTCTTAAAGGTACAGCTGTGGAGGCGTCTGTGGAGGTTGATGGTGTACTCTCT
GGTCACCACTTCCTCTTTCCTTCCCTTCTTCTCAGACATCTTCTCTATTTGGTCTGTGAT
GCACTTCTTCAAACTCTTACCTTTAGTTCGAAGAACGTCGAGAGACAGGAAGGCGACGAG
AGAGGATAAGTTAGCTTATATATGTGACACTGAATTAACCCTAGATCTTTTATTTGGGCT
TTATTGGGCTGATAGCTTGTGCCATTCC

QA 2 689 2 689
DS 



AS 2 7

CO CL478Contig1 865 4 10 U
GGAAGAGCGAAATGGGAGATGCGTCAGAAGCTTTTGCCACGACAGCGCCGTTAGCTCCGG
TGACCAGTGAGCGAAAAGTACGGAGCGACTTGGAGGAAAAACTACCAAAGCCATATTTGG
CAAGAGCACTAGTAGCTCCAGATACAGAGCATCCGAATGGAACAGAAGGCCACGACAGCA
AAGGCATGAGTGTTATGCAACAACATGTTGCTTTCTTCGACCAGAACGGCGACGGTATTG
TCTACCCTTGGGGAGACTTATGCAGGATTCCGTGACCTCGGTTTCAACCCAATCTCCTCT
GTCTTCTGGAGCTTAATCATAAACTTAGCGTTTAGCTACGTTACACTTCCGAGTTGGTTG
CCATCACCACTACTGCCTGTCTATATCGACAACATACACAAAGCCAAACATGGGAGTGAT
TCAAGCACCTATGATACTGAAGGAAGGTATGTCCCATTTAATCTGGAGAACATATTTAGC
AAGTATGCGCTAACGGTTCCAAACAAGTTAACATTCAAAGAGATGTGGAACTTAACCGAG
GGAAACCGAATGACAATCGATCCTTTTGGATGGCTTTCTAACAAAGTTGAATGGATACTA
CTCTATATCCTTGCAAAAGATGAGGAAGGGTTCGTGTCCAAAGAAGCTGTGAGAGGTTGC
TTTGATGGCAGTTTATTTGAATATTGTGCTAAGAAGAATAAAGAGAAGGCCAATTCTCGC
AAGCAAGACTAAGAGTTTGTTTATCTTTTGTATGAATAAGTATTACTGTATTTGCAGCCT
ATTATTGTTAAGCTCACGTTTGAAGAAACCGTTTGTGTATGTTGATGTGTAAAATCTGTT
CAACAAATAAAATGAGATTTTCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AD45TF U 32
AF RS1AD45JQ C 16
AF RS1E631TF U 1
AF RS1E631JQ C 302
BS 1 82 RS1E631TF
BS 83 83 RS1AD45TF
BS 84 169 RS1E631TF
BS 170 170 RS1AD45TF
BS 171 172 RS1E631TF
BS 173 173 RS1AD45TF
BS 174 252 RS1E631TF
BS 253 253 RS1AD45JQ
BS 254 617 RS1E631TF
BS 618 865 RS1E631JQ

RD RS1AD45TF 174 0 0
TTTTGCCACGACAGCGCCGTTAGCTCCGGTGACCAGTGAGCGAAAAGTACGGAGCGACTT
GGAGGAAAAACTACCAAAGCCATATTTGGCAAGAGCACTAGTAGCTCCAGATACAGAGCA
TCCGAATGGAACAGAAGGCCACGACAGCAAAGGCATGAGTGTTATGCAACAACA

QA 1 174 1 174
DS 

RD RS1AD45JQ 267 0 0
GAGATGCGTCAGAAGCTTTTGCCACGACAGCGCCGTTAGCTCCGGTGACCAGTGAGCGAA
AAGTACGGAGCGACTTGGAGGAAAAACTACCAAAGCCATATTTGGCAAGAGCACTAGTAG
CTCCAGATACAGAGCATCCGAATGGAACAGAAGGCCACGACAGCAAAGGCATGAGTGTTA
TGCAACAACATGTTGCTTTCTTCGACCAGAACGGCGACGGTATTGTCTACCCTTGGGGAG
ACTTATGCAGGATTCCGTGACCTCGGT

QA 1 267 1 267
DS 

RD RS1E631TF 619 0 0
GGAAGAGCGAAATGGGAGATGCGTCAGAAGCTTTTGCCACGACAGCGCCGTTAGCTCCGG
TGACCAGTGAGCGAAAAGTACGAAGCGACTTGGAGGAAAAACTACCAAAGCCATATTTGG
CAAGAGCACTAGTAGCTCCAGATACAGAGCATCCGAATGGAACAGAAGGTCATGACAGCA
AAGGCATGAGTGTTATGCAACAACATGTTGCTTTCTTCGACCAGAACGGCGACGGTATTG
TCTACCCTTGGG*AGACTTATGCAGGATTCCGTGACCTCGGTTTCAACCCAATCTCCTCT
GTCTTCTGGAGCTTAATCATAAACTTAGCGTTTAGCTACGTTACACTTCCGAGTTGGTTG
CCATCACCACTACTGCCTGTCTATATCGACAACATACACAAAGCCAAACATGGGAGTGAT
TCAAGCACCTATGATACTGAAGGAAGGTATGTCCCATTTAATCTGGAGAACATATTTAGC
AAGTATGCGCTAACGGTTCCAAACAAGTTAACATTCAAAGAGATGTGGAACTTAACCGAG
GGAAACCGAATGACAATCGATCCTTTTGGATGGCTTTCTAACAAAGTTGAATGGATACTA
CTCTATATCCTTGCAAA
GA

QA 1 617 1 617
DS 

RD RS1E631JQ 564 0 0
TCTTCTGGAGCTTAATCATAAACTTAGCGTTTAGCTACGTTACACTTCCGAGTTGGTTGC
CATCACCACTACTGCCTGTCTATATCGACAACATACACAAAGCCAAACATGGGAGTGATT
CAAGCACCTATGATACTGAAGGAAGGTATGTCCCATTTAATCTGGAGAACATATTTAGCA
AGTATGCGCTAACGGTTCCAAACAAGTTAACATTCAAAGAGATGTGGAACTTAACCGAGG
GAAACCGAATGACAATCGATCCTTTTGGATGGCTTTCTAACAAAGTTGAATGGATACTAC
TCTATATCCTTGCAAAAGATGAGGAAGGGTTCGTGTCCAAAGAAGCTGTGAGAGGTTGCT
TTGATGGCAGTTTATTTGAATATTGTGCTAAGAAGAATAAAGAGAAGGCCAATTCTCGCA
AGCAAGACTAAGAGTTTGTTTATCTTTTGTATGAATAAGTATTACTGTATTTGCAGCCTA
TTATTGTTAAGCTCACGTTTGAAGAAACCGTTTGTGTATGTTGATGTGTAAAATCTGTTC
AACAAATAAAATGAGATTTTCATC

QA 1 564 1 564
DS 



CO CL478Contig2 850 3 4 U
CCAAAATGATTGATGAAAGTCTCATTTTATTTGTTCAACCGATTTTACACAACAA*CATA
CACAAACGG*TTTCTTCAAACGTGAGCTTAACAATAATAGG*CTGCAAA*TACAGTAATA
CATACTTATTCATACAAAAGATAAACAAACTCTTAGTCTTGCTTGCGAGAATTGGCCTTC
TCTTTATTCTTTTTAGCACAATATTCAAATAAGCTGCCATCAAAGCAACCTCTCACAGCT
TCTTTGGACACGAACCCTTCCTCATCTTTTGCAAGGATATAGAGTAGTATCCATTCAACT
TTGTTCGAAAGCCATCCAAAAGGATCGATTGCCATTCGGTTTCCCTCGGTTAAGTTCCAC
ATCTCTTTGAATGTTAACTTATTCGGAGCCGTTAGAGCGTACTTGCTAAATATATTCTCC
AGATTAAATGGGACATACCTTCCTTCGGTGTCATAGGTGCTTGAATCACTCCCATGTTTG
GCTTTGTGTATGTTGTCGATATAGACAGGCAGTAATGGTGATGGCAACCAACTCGGAAGT
GTAACATAGCTAAACGCTAAGTTTATGATTAAGCTCCAGAAGACAGAGGAGACTGGGTTG
AAACCGAGGTCACGGAATCCTGCATAAGTCTCCCAAGGGTAGACAATACCGTCGCCGTTC
TGGTCGAAGAAAGCAACATGTTGTTGCATAACACTCATGCCTTTGCTGTCGTGGCCTTCT
GTTCCATTCGGATGCTCTGTATCTGGAGCTACTAGTGCTCTTGCCAAATATGGCTTTGGT
AGTTTTTCCTCCAAGTCGCTCCGTACTTTTCGCTCACTGGTCACCGGAGCTAACGGCGCT
GTCGTGGCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1EF18TF C 1
AF RS1GS40JQ U 12
AF RS1EI72JQ U 12
BS 1 11 RS1EF18TF
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GTTGTCGATATAGACAGGCAGTAATGGTGATGGCAACCAACTCGGAAGTGTAACATAGCT
AAACGCTAAGTTTATGATTAAGCT

QA 1 564 1 564
DS 

RD RS1EI72JQ 839 0 0
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TTCTTCAAACGTGAGCTTAACAATAATAGG*CTGCAAA*TACAGTAATACATACTTATTC
ATACAAAAGATAAACAAACTCTTAGTCTTGCTTGCGAGAATTGGCCTTCTCTTTATTCTT
TTTAGCACAATATTCAAATAAGCTGCCATCAAAGCAACCTCTCACAGCTTCTTTGGACAC
GAACCCTTCCTCATCTTTTGCAAGGATATAGAGTAGTATCCATTCAACTTTGTTCGAAAG
CCATCCAAAAGGATCGATTGCCATTCGGTTTCCCTCGGTTAAGTTCCACATCTCTTTGAA
TGTTAACTTATTCGGAGCCGTTAGAGCGTACTTGCTAAATATATTCTCCAGATTAAATGG
GACATACCTTCCTTCGGTGTCATAGGTGCTTGAATCACTCCCATGTTTGGCTTTGTGTAT
GTTGTCGATATAGACAGGCGGTAATGGTGATGGCAACCAACTCGGAAGTGTAACATAGCT
AAACGCTAAGTTTATGATTAAGCTCCAGAAGACAGAGGAGACTGGGTTGAAACCGAGGTC
ACGGAATCCTGCATAAGTCTCCCAAGGGTAGACAATACCGTCGCCGTTCTGGTCGAAGAA
AGCAACATGTTGTTGCATAACACTCATGCCTTTGCTGTCGTGGCCTTCTGTTCCATTCGG
ATGCTCTGTATCTGGAGCTACTAGTGCTCTTGCCAAATATGGCTTTGGTAGTTTTTCCTC
CAAGTCGCTCCGTACTTTTCGCTCACTGGTCACCGGAGCTAACGGCGCTGTCGTGGCAA

QA 1 839 1 839
DS 



AS 3 9

CO CL479Contig1 991 2 2 U
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ACATGGAAACGGTCGTGGGTTTTATGATAGTGATGTACGTTTTTGAGACATACTTGGATA
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AAAACTTACCTAACAACAACACTCCACTCTTGAGCCCCTTCTCGTGCAGTCTTCACCGTA
GCTGTCCACAAGATTCCCAAACTGAAGAAACCTACAGCGTTATCTCCTGCGAGAGCGCGG
CTGTTGCAGAAACCAGAGATGAGAGTCTCATCAACAAGGTCCAACATAAAAAGAAACCGA
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AAAAGATGAAAGATTTCAACATGGTGGATCTTAGAGACGTGGAGCATGCTTCGGATGTAC
AGGAAGCGCTTAGATGCTACTCAAGCATTAGAAGCCCTGTGTACCTGGACATTGTTGACA
ATTTCTTCACTGACATGTACTACGAGTTCTCTGATCCGCTCACTACTTCTAGTATGAAGG
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TTCAGGCTCTAAGGTGAAGCCATTACGTTTAGAGTATGCAATTCCTAAGACGTGTTGTTA
TCCATTTACCCAGCTCAAAAATTTCACTTGC


BQ
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AF RS1FI25TF U 1
AF RS1FI25JQ C 174
BS 1 718 RS1FI25TF
BS 719 991 RS1FI25JQ

RD RS1FI25TF 718 0 0
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GATGAGAGACAAAAAAAACAAAGATGATGAAACCCACAACGAAATCAATCGAGAGAGTTG
GTCGTTTCTTAAGGAAGAGCCTTGGGAGCATCAAGTCCACTATCTGCTTTGGCAAATACC
AAAACTTACCTAACAACAACACTCCACTCTTGAGCCCCTTCTCGTGCAGTCTTCACCGTA
GCTGTCCACAAGATTCCCAAACTGAAGAAACCTACAGCGTTATCTCCTGCGAGAGCGCGG
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AAAAGATGAAAGATTTCAACATGGTGGATCTTAGAGACGTGGAGCATGCTTCGGATGT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1FI25JQ 818 0 0
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CACTTTGTTCATGAGTTTGTGACTATCCTTATGGACTCTGCGTTGATACCGCTGCTTACG
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AGAGTTGGTCGTTTCTTAAGGAAGAGCCTTGGGAGCATCAAGTCCACTATCTGCTTTGGC
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AAACCGAAGAAGAAGAAGGTTGCAGAGCCATTGGAGGAGGCTAAGAGGAGAGGTGACATG
ATGGCGCAAAAGATGAAAGATTTCAACATGGTGGATCTTAGAGACGTGGAGCATGCTTCG
GATGTACAGGAAGCGCTTAGATGCTACTCAAGCATTAGAAGCCCTGTGTACCTGGACATT
GTTGACAATTTCTTCACTGACATGTACTACGAGTTCTCTGATCCGCTCACTACTTCTAGT
ATGAAGGGATCAAGAAGAAAAGCAGTCTCTTTCAGGCTCTAAGACCCTCTCGATCAGCTT
ATTAGCTTTCAGGCTCTAAGGTGAAGCCATTACGTTTAGAGTATGCAATTCCTAAGACGT
GTTGTTATCCATTTACCCAGCTCAAAAATTTCACTTGC

QA 1 818 1 818
DS 



CO CL479Contig2 789 3 7 U
GGATTCTTCGATTCGTTTCTCTCTTCAGGTCTTCGTTTTGGGCAGAGATGGCGATTCCTT
ACATGGAAACGGTCGTGGGTTTTATGATAGTGATGTACGTTTTTGAGACATACTTGGATA
TGAGGCAGCACACGGCTCTCAAGCTTCCAACTCTCCCAAAAACCTTGGTTGGAGTCATTA
GCCAAGAGAAGTTTGAGAAATCTCGAGCTTACAGTCTTGACAAAAGCCATTTTCACTTTG
TTCATGAGTTTGTGACTATCCTTATGGACTCTGCGATGTTGTTCTTTCGGATCCTGCCTT
GGTTTTGGAAGTCATCTGGAGGTTTTCTACCGATGGTGAGACTCGATCCAGAGAATGAAA
TACTGCACACTCTTTCATTCTTGGCTGGTGTTATGATATGGTCACAGATCACTGATTTGC
CCTTTTCTCTGTACTCAACTTTCGTGATTGAGTCTCGACATGGGTTCAACAAACAAACAA
TATGGATGTTCTTTAGGGACATGGTCAAAGGAATACTTCTCTCTGTCATACTAGCCCCTC
CCATTGTTGCCGCAATTATTGTTATAGTTCAGAAAGGAGGTCCTTACCTTGCCATCTATC
TGTGGGCATTCATGTTTGTCCTGTCTCTTGTAATGATGACTATATACCCAGTTTTGATTG
CACCTCTTTTCAACAAGTTCACTCCTCTTCCAGATGGAGACCTCCGGGAGAAATTGAGAA
CTTGCTTCTTCACTAAAGTTCCTCTGACGAGCTGTTTGTCGTCGATGGATCTACAGTCAG
CATAGCATG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GV57TF U 1
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TT

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ACATGGAAACGGTCGTGGGTTTTATGATAGTGATGTACGTTTTTGAGACATACTTGGATA
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TTCATGAGTTTGTGACTATCCTTATGGACTCTGCGATGTTGTTCTTTCGGATCCTGCCTT
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TACT*CACACTCTTTCATTCTTGGCTGGTGTTATGATATGGTCACAGATCACTGATTTGC
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TATGGATGTTCTTTAGGGACATGGTCAAAGGAATACTTCTCTCTGTCATACTAGCCCCTC
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CATAGCATG

QA 1 789 1 789
DS 



CO CL479Contig3 1041 4 10 U
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ATACCATTATGTAGATTTGTTTTACAGCAAACAAGTGTAACAAACCTTAAATCACTTTGC
AAAATTGTATGATTAAACTATCTCTTGCTCCGTAATCCAATATGCTCAAAAGATACCGAC
CGTAAAACTGTAAACAATCCGGACAACCGGTAATCTTATAAGGTCTTAGTCTGTCTTCTT
GTCCTGTCCATCAATGGCTCGAAGCCTCTCAACAAGAGGAGGATGCGAGTAGTGATAAGC
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CCGGAGGTCTCCATCTGGAAGAGGAGTGAAATTGTTGAAAAGAGGTGCAATCAAAACTGG
GTATATAGTCATCATTACAAGAGACAGGACAAACATGAATGCCCACAGATAGATGGCAAG
GTAAGGACCTCCTTTCTGAACTATAACAATAATTGCGGCAACAATAGGAGGGGCTAGTAT
GACAGAGAGAAGTATTCCTTC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1H054JQB U 41
AF RS1FZ40JQ U 3
AF RS1G688JQ U 1
AF RS1G688TF C 247
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CAAACCTTAAATCACTTTGCAAAATTGTATGATTAGACTATCTCTTGCTCCGTAATCCAA
TATGCTCAAAAGATACCGACTGTAAAACTGTAAACAATCCGGACAACCGGTAATCTTATA
AGGTCTTAGTCTGTCTTCTTGTCCTGTCCATCAATGGCTCGAAGCCTCTCAACAAGAGGA
GGATGCGAGTAGTGATAAGCTGAGTACAATGGATCAGTGTTCATTGCTGATAAGTTCTCT
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GCATCAGCCTGAAACTCAAATGCTCGACTAACAAGGTTGAGGCCAAAGCTTACTAGGTGT
TGAAGTGGTATTACAGTGTGCTGAAATATGATCAAACCAATTAGAACTGGTTGGGTATCA
AATCCAAAACTC

QA 1 492 1 492
DS 

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C
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CCATTATGTAGATTTGTTTTACAGCAAACAAGTGTAACAAACCTTAAATCACTTTGCAAA
ATTGTATGATTAAACTATCTCTTGCTCCGTAATCCAATATGCTCAAAAGATACCGACCGT
AAAACTGTAAACAATCCGGACAACCGGTAATCTTATAAGGTCTTAGTCTGTCTTCTTGTC
CTGTCCATCAATGGCTCGAAGCCTCTCAACAAGAGGAGGATGCGAGTAGTGATAAGCTGA
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AATGAACGAGTATGTAGTGTGATTTAGCTTCCAGTGTCCAAGCTCGTGTGCAATAACCGC
CACAATTTCATCTTCATTCTTGCACTGCTGAATCAATGTGTCATAAAGAACAATCCTTTT
GTTCTTGAAGAAACCATACATGTAAGCATTGCTATGGCTTGACCTTGTAGAT

QA 2 773 2 773
DS 

RD RS1G688JQ 849 0 0
AAAAGTAAAATATTAAATTTGGTTTTTCTTTTCTTTTTTTACTGAATGTCTTGCTCGATG
ATACCATTATGTAGATTTGTTTTACAGCAAATAAGTGTAACAAACCTCAAATCACTTTGC
AAAATTGTATGATTAAACTATCTCTTGCTCCGTAATCCAATATGCTCAAAAGATACCGAC
CGTAAAACTGTAAACAATCCGGACAACCGGTAATCTTATAAGGTCTTAGTCTGTCTTCTT
GTCCTGTCCATCAATGGCTCGAAGCCTCTCAACAAGAGGAGGATGCGAGTAGTGATAAGC
TGAGTACAATGGATCAGTGTTCGTTGCTGATAAGTTCTCTTCCTGTAGCTTCACTAGAGC
AGGACGGAGATCTTTAGCATAACCAAGCTTCACAGCAAAAGCATCAGCCTGAAACTCAAA
TGCTCGACTAACAAGGTTGAGGCCAAAGCTTACTAGGTGTTGAAGTGGTATTACAGTGTG
CTGAAATATGATCAAACCAATTAGAACTGGTTGGGTATCAAATCCAAAACTCCTGAAGAG
ATCAGTGGAGTTTCTGACAAGAGTGTATCCTCCAAACTGTAAGAGGGTAAGGATTTGAAC
TGCAATGAACGAGTATGTAGTGTGATTTAGCTTCCAGTGTCCAAGCTCGTGTGCAATAAC
CGCCACAATTTCATCTTCATTCTTGCACTGCTGAATCAATGTGTCATAAAGAACAATCCT
TTTGTTCTTGAAGAAACCATACATGTAAGCATTGCTATGGCTTGACCTTGTAGATCCATC
GACGACAAACAGCTTCGTCAGAGGAAACTTTAGTGAA*AAGCAAGTTTCTCAATTTTCTC
CCGGAGGTC

QA 1 849 1 849
DS 

RD RS1G688TF 795 0 0
TCCATCAATGGCTCGAAGCCTCTCAACAAGAGGAGGATGCGAGTAGTGATAAGCTGAGTA
CAATGGATCAGTGTTCGTTGCTGATAAGTTCTCTTCCTGTAGCTTCACTAGAGCAGGACG
GAGATCTTTAGCATAACCAAGCTTCACAGCAAAAGCATCAGCCTGAAACTCAAATGCTCG
ACTAACAAGGTTGAGGCCAAAGCTTACTAGGTGTTGAAGTGGTATTACAGTGTGCTGAAA
TATGATCAAACCAATTAGAACTGGTTGGGTATCAAATCCAAAACTCCTGAAGAGATCAGT
GGAGTTTCTGACAAGAGTGTATCCTCCAAACTGTAAGAGGGTAAGGATTTGAACTGCAAT
GAACGAGTATGTAGTGTGATTTAGCTTCCAGTGTCCAAGCTCGTGTGCAATAACCGCCAC
AATTTCATCTTCATTCTTGCACTGCTGAATCAATGTGTCATAAAGAACAATCCTTTTGTT
CTTGAAGAAACCATACATGTAAGCATTGCTATGGCTTGACCTTGTAGATCCATCGACGAC
AAACAGCTTCGTCAGAGGAAACTTTAGTGAAGAAGCAAGTTTCTCAATTTTCTCCCGGAG
GTCTCCATCTGGAAGAGGAGTGAAATTGTTGAAAAGAGGTGCAATCAAAACTGGGTATAT
AGTCATCATTACAAGAGACAGGACAAACATGAATGCCCACAGATAGATGGCAAGGTAAGG
ACCTCCTTTCTGAACTATAACAATAATTGCGGCAACAATAGGAGGGGCTAGTATGACAGA
GAGAAGTATTCCTTC

QA 1 795 1 795
DS 



AS 2 7

CO CL480Contig1 789 2 10 U
GGACGTATTCACATCTTCAGAACGAATCTCTCTCATCGTCACGTAGGACAGACAGACAGT
CTCCATTCCATCTCTTCGACTCCTGCCGTGCTTCTCATCAGTGACTGAGCGAAAAATGGA
GAAGAACTTGGAGGATTTGAGAATTGTGGGGGAGCAATGGTTGAATCAAGGAACTGAATT
TGTTCAACAGATACCACAGGATCAGCTTTATGCTGCTGTTGGCGTTCTGTTATTAACTAC
CATCTTCTTGCTCTTTTTCTTCTCTATTCGCTTGTTCAGACGTACGAAGGCCAATACTGT
ACTCCTCTCTGGCCTAAGCGGAAGTGGCAAAACCGTTCTCTTCTATCAACTCCGAGATGG
ATCTTCTCATCAGGGCTCTGTGACGTCAATGGAACCTAACGAAGGCACCTTTGTGCTCCA
CACTGAAAACACTAATAAAACGAAGCCCGTTCATCTTGTTGATGTTCCTGGGCACTCTCG
GCTTAGATCTAAGCTAGAAGAGTACTTGCCACGAGCAGCCGCTATTGTGTTTGTAGTAGA
TGCACTTGAGTTCCTCCCTAATTGTCGTGCAGCTTCAGAGTACCTCTACGACATTCTTAC
CAATGCAAGCGTGGTTAAGAATAAGATCCCAGTCCTGCTTTGCTGTAACAAGACTGATAA
AATAACTGCACACACAAAGGAGTTCATCCGCAAGCAGATGGAGAAGAATAGAGAAACTTA
GGTTTCGAGGAGTGCGGTTTCACTGCTGACATAGCCATGACTTACTCTTGGGATTGAAGA
GAGTGTTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AV25TF U 1
AF RS1CF28TF U 1
BS 1 77 RS1AV25TF
BS 78 78 RS1CF28TF
BS 79 222 RS1AV25TF
BS 223 223 RS1CF28TF
BS 224 458 RS1AV25TF
BS 459 461 RS1CF28TF
BS 462 721 RS1AV25TF
BS 722 722 RS1CF28TF
BS 723 734 RS1AV25TF
BS 735 789 RS1CF28TF

RD RS1AV25TF 734 0 0
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CTCCATTCCATCTCTTC*ACTCCTGCCGTGCTTCTCATCAGTGACTGAGCGAAAAATGGA
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CATCTTCTTGCTCTTTTTCTTCTCTATTCGCTTGTTCAGACGTACGAAGGCCAATACTGT
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AATAACTGCACACACAAAGGAGTTCATCCGCAAGCAGATGGAGAAGAATAGAGAAACTTA
GTTTTCGAGGAGTG

QA 1 734 1 734
DS 

RD RS1CF28TF 789 0 0
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CTCCATTCCATCTCTTCGACTCCTGCCGTGCTTCTCATCAGTGACTGAGCGAAAAATGGA
GAAGAACTTGGAGGATTTGAGAATTGTGGGGGAGCAATGGTTGAATCAAGGAACTGAATT
TGTTCAACAGATACCACAGGATCAGCTTTATGCTGCTGTTGGCGTTCTGTTATTAACTAC
CATCTTCTTGCTCTTTTTCTTCTCTATTCGCTTGTTCAGACGTACGAAGGCCAATACTGT
ACTCCTCTCTGGCCTAAGCGGAAGTGGCAAAACCGTTCTCTTCTATCAACTCCGAGATGG
ATCTTCTCATCAGGGCTCTGTGACGTCAATGGAACCTAACGAAGGCACCTTTGTGCTCCA
CACTGAAAACACTAATAAAACGAAGCCCGTTCATCTTGTTGATGTTCCTGGGCACTCTCG
GCTTAGATCTAAGCTAGAAGAGTACTTGCCACGAGCAGCCGCTATTGTGTTTGTAGTAGA
TGCACTTGAGTTCCTCCCTAATTGTCGTGCAGCTTCAGAGTACCTCTACGACATTCTTAC
CAATGCAAGCGTGGTTAAGAATAAGATCCCAGTCCTGCTTTGCTGTAACAAGACTGATAA
AATAACTGCACACACAAAGGAGTTCATCCGCAAGCGGATGGAGAAGAATAGAGAAACTTA
GGTTTCGAGGAGTGCGGTTTCACTGCTGACATAGCCATGACTTACTCTTGGGATTGAAGA
GAGTGTTTT

QA 1 789 1 789
DS 



CO CL480Contig2 1082 5 5 U
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GGACTAACACGATTTCAATATCCAAAATCCTCCGACAATATTATCACAAATCATAAATTC
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AACATATTCTCTGATGAACTCTTGCACTTGCTCTGTTTCTCCTGTTAGTCCAGATGCTTC
AGCGACAGTGACTTTGTTTAAGCAATGCGAAAAGGAAAACACTTCTCCTTCAATCCCAAG
AGTAAAGTCATTGGCTATGTCAGCAGTTGAAACCGCACTCCTCGAAACCCTAAGTTTCTC
TATTTCTTTCTCCATCTGCTTGCGGATGAACTCCTTTGTGTGTGCAGTTATTTTATCAGT
CTTGTTACAGCAAAGCAGGACTGGGATCTTATTCTTAACCACGCTTGCATTGGTAAGAAT
GTCGTAGAGGTACTCTGAAGCTGCACGACAATTAGGGAGGAACTCAAGTGCATCTACTAC
AAACACAATAGCGGCTGCTCGTGGCAAGTACTCTTCTAGCTTAGATCTAAGCCGAGAGTG
CCCAGGAACATCAACAAGATGAACGGGCTTCGTTTTATTAGTGTTTTCAGTGTGGAGCAC
AAAGGTGCCTTCGTTAGGTTCCATTGACGTCACAGAGCCCTGATGAGAAGATCCATCTCG
GAGTTGATAGAAGAGAACGGTTTTGCCACTTCCGCTTAGGCCAGAGAGGAGTACAGTATT
GGCCTTAGTACGTCTGAACAAGCGAATAGAGAAGAAGAAGAGCAAGAAGATGGTAGTTAA
TAAGAGAACACCAATAGCAGCATAAAGCTGATCCTTTGGTATCTGTTGAACAAATTCAGT
TCCTTGATTCAACCATTGCTCCCCCACAATTCTCAAATCCTCCAAGTTCTTCTCCATTTT
TCGTTCAGTCACTGATGAGAAGCACGGCAGGAGTCGAAGAGATGGAATGGAGATTCGTTC
TGAAGATGTGAATACGTAAGAGATAGGTTTAGTTGGTCTTTTTTGAAGTTGGTCAAGGGT
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1AR30JQ U 18
AF RS1CF12JQ U 60
AF RS1CF28JQ U 1
AF RS1AV25JQ U 60
AF RS1AR30TFB C 353
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BS 378 671 RS1CF28JQ
BS 672 755 RS1AV25JQ
BS 756 1082 RS1AR30TFB

RD RS1AR30JQ 201 0 0
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ATATCCAAAATCCTCCGACAATATTATCACAAATCTTAAATTCATGTACATAAAAGACTT
AAGTGTATGCTTAATGCTCACACATTTCAGCCCTTTATGGCTTAACATATTCTCTGATGA
ACTCTTGCACTTGCTCTGTTT

QA 1 201 1 201
DS 

RD RS1CF12JQ 536 0 0
GGGACTAACACGATTTCAATATCCAAAATCCTCCGACAATATTATCACAAATCTTAAATT
CATGTACATAAAAGACTTAAGTGTATGCTTAATGCTCACACATTTCAGCTCTTCATGGCT
TAACTTATTCTCTGATGAACTCTTGCACTTGCTCTGTTTCTCCTGTTAGTCCAGATGCTT
CAGCGACAGTGACTTTGTTTAAGCAATGCGAAAAGGAAAACACTTCTCCTTCAATCCCAA
GAGTAAAGTCATTGGCTATGTCAGCAGTTGAAACCGCACTCCTCGAAACCCTAAGTTTCT
CTATTTCTTTCTCCATCTGCTTGCGGATGAACTCCTTTGTGTGTGTAGTTATTTTATCAG
TCTTGTTACAGCAAAGCAGGACTGGGATCTTATTCTTAACCACGCTTGCATTGGTAAGAA
TGTAGTAAAGGTACTCTGAAGCTGCACGACAAT*AGGGAGGAACTCAAGTGCATCTACTA
CAAACACAATAGCGGCTGCTCGTGGCAAGTACTCTTCTAGCTTAAATCTAAGCCGA

QA 1 536 1 536
DS 

RD RS1CF28JQ 671 0 0
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GGACTAACACGATTTCAATATCCAAAATCCTCCGACAATATTATCACAAATCATAAATTC
ATGTACATAAAAGACTTAAGTGTATGCTTAATGCTCACACATTTCAGCTCTTCATGGCTT
AACATATTCTCTGATGAACTCTTGCACTTGCTCTGTTTCTCCTGTTAGTCCAGATGCTTC
AGCGACAGTGACTTTGTTTAAGCAATGCGAAAAGGAAAACACTTCTCCTTCAATCCCAAG
AGTAAAGTCATTGGCTATGTCAGCAGTTGAAACCGCACTCCTCGAAACCCTAAGTTTCTC
TATTTCTTTCTCCATCCGCTTGCGGATGAACTCCTTTGTGTGTGCAGTTATTTTATCAGT
CTTGTTACAGCAAAGCAGGACTGGGATCTTATTCTTAACCACGCTTGCATTGGTAAGAAT
GTCGTAGAGGTACTCTGAAGCTGCACGACAATTAGGGAGGAACTCAAGTGCATCTACTAC
AAACACAATAGCGGCTGCTCGTGGCAAGTACTCTTCTAGCTTAGATCTAAGCCGAGAGTG
CCCAGGAACATCAACAAGATGAACGGGCTTCGTTTTATTAGTGTTTTCAGTGTGGAGCAC
AAAGGTGCCTT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1AV25JQ 696 0 0
GGGACTAACACGATTTCAATATCCAAAATCCTCCGACAATATTATCACAAATCATAAATT
CATGTACATAAAAGACTTAAGTGTATGCTTAATGCTCACACATTTCAGCTCTTCATGGCT
TAACATATTCTCTGATGAACTCTTGCACTTGCTCTGTTTCTCCTGTTAGTCCAGATGCTT
CAGCGACAGTGACTTTGTTTAAGCAATGCGAAAAGGAAAACACTTCTCCTTCAATCCCAA
GAGTAAAGTCATTGGCTATGTCAGCAGTTGAAACCGCACTCCTCGAAAACCTAAGTTTCT
CTATTTCTTTCTCCATCTGCTTGCGGATGAACTCCTTTGTGTGTGCAGTTATTTTATCAG
TCTTGTTACAGCAAAGCAGGACTGGGATCTTATTCTTAACCACGCTTGCATTGGTAAGAA
TGTCGTAAAGGTACTCTGAAGCTGCACGACAATTAGGGAGGAACTCAAGTGCATCTACTA
CAAACACAATAGCGGCTGCTCGTGGCAAGTACTCTTCTAGCTTAGATCTAAGCCGAGAGT
GCCCAGGAACATCAA***GATGAACGGGCTTCGTTTTATTAGTGTTTTCAGTGTGGAGCA
CAAAGGTGCCTTCGTTAGGTTCCATTGACGTCACAGAGCCCTGATGAGAAGATCCATCTC
GGAGTTGATAGAAGAGAACGGTTTTGCCACTTCCGC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RS1AR30TFB 730 0 0
AGTTTCTCTATTTCTTTCTCCATCTGCTTGCGGATGAACTCCTTTGTGTGTGCAGTTATT
TTATCAGTCTTGTTACAGCAAAGCAGGACTGGGATCTTATTCTTAACCACGCTTGCATTG
GTAAGAATGTCGTAGAGGTACTCTGAAGCTGCACGACAATTAGGGAGGAACTCAAGTGCA
TCTACTACAAACACAATAGCGGCTGCTCGTGGCAAGTACTCTTCTAGCTTAGATCTAAGC
CGAGAGTGCCCAGGAACATCGACAAGATGAACGGGCTTCGTTTTATTAGTGTTTTCAGTG
TGGAGCACAAAGGTGCCTTCGTTAGGTTCCATTGACGTCACAGAGCCCTGATGAGAAGAT
CCATCTCGGAGTTGATAGAAGAGAACGGTTTTGCCACTTCCGCTTAGGCCAGAGAGGAGT
ACAGTATTGGCCTTAGTACGTCTGAACAAGCGAATAGAGAAGAAGAAGAGCAAGAAGATG
GTAGTTAATAAGAGAACACCAATAGCAGCATAAAGCTGATCCTTTGGTATCTGTTGAACA
AATTCAGTTCCTTGATTCAACCATTGCTCCCCCACAATTCTCAAATCCTCCAAGTTCTTC
TCCATTTTTCGTTCAGTCACTGATGAGAAGCACGGCAGGAGTCGAAGAGATGGAATGGAG
ATTCGTTCTGAAGATGTGAATACGTAAGAGATAGGTTTAGTTGGTCTTTTTTGAAGTTGG
TCAAGGGTCC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 2 9

CO CL481Contig1 1213 4 8 U
GGGAGCTAGCGTTTCCCCTTTCTTCAATCCCTGATTTCATAGATCGACCATGAAACTTTT
TTTTTTTTTGTAACTTGACCATGAAACCTTTGCTCTTCCTCTTCTCTGTTCCGTTTCACG
ATCTGATCGACGAGCATTCAAGACAACCTCCACTTCGTTTCACCCTTTATTCTCATTTAT
GGACTCTCTTAGGATTTCTCCTTCTGATTTTTCATATAAAACATATGATCACAGTTTTTT
TCCGATCCAACTTCGCTCTATATTCTCTCTACCACAGTGGATGATTTTGGTTACGTTTGT
TGATTTGGTTTTTGTTTGTTGATGTAAGATGATTTGGATATATTTTATTAATTTAGAAAT
CTTGAATTTAGATGATTTTGATTTAGTTTTGGTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTATGTTA
GATGATTTTGGTTGTATACTGATATAGAAAGCTTTGGATGATACTGGTTTTGTTTATTGA
TTCTGTTTTCGTTTGTTACTGCTTTTGTTTATTCAGAACTTAATTTATATTCGTGTCAAA
ATCTTTGGGTCTCTCTTTTGCAGAATGAACTTTCATGGAGAGAGATGAGAAAATAATCGT
TGCCCAAAAAAAAAAGAGAAAATAATCTTCCGGTTTGAATCCAACTACCGAACCGATGAA
CTCTTCAGATCGACGGCGACCGTATGAAGGAAGAGCTTGCAAGCAGATTCAAGCAAAACG
ATATTGGAGAATGATGATGCTCAACCGCCATGCTTTCCGGTGAACAAATCACGGTCTCTG
TTTCACAATGATTTTGGTTTTGTTTATTGTTTTTGTTTTTGTTTGTTACTCTTTTTATTT
ATTCAGAACTTAATTTATCGTTTCGTATCAAAATATTTGCGTCTCCCTTCTGCAGAATGG
AACTAACCTTTTTAATCAGCTTCTGATGATGAAATGTGGAAGCCAAGTTCAACGTGGTAG
AAGCCTAGGACATCACTCCCAAAAACTTGAATACTTTGAGGCTGTTGAAGGGGTTCTAAA
GATCAAGGACAGATACAATCCTGCAACGTGAATGCTTGGAGATGGACATTCACATTGAAG
TACCTTATTGCAAAAAAATATTAATTTTATAATTATTGCACGATGTCAACTAAATAAAAT
TTATAAAATCAGTGTATTTGCAAAAATAACTAAAACACATAATATAATTCACAATATTAT
GAAGTTAGAGAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BM69JQ C 208
AF RS1B319TF U 1
AF RS1BM69TF U 131
AF RS1B319JQ C 416
BS 1 255 RS1B319TF
BS 256 256 RS1BM69TF
BS 257 275 RS1B319TF
BS 276 276 RS1BM69TF
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BS 465 601 RS1B319TF
BS 602 1213 RS1B319JQ

RD RS1BM69JQ 393 0 0
TTTTTCATATAAAACATATGATCACAGTTTTTTTCCGTTCCAACTTCGCTCTATATTCTC
TCTACCACAGTGGATGATTTTGGTTACGTTTGTTGATTTGGTTTTTGTTTGTTGATGTAA
GATGATTTGGATATATTTTATTAATTTAGAAATCTTGAATTTAGATGATTTTGATTTAGT
TTTGGTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTATGTTAGATGATTTTGGTTGTATACTGATATAG
AAAGCTTTGGATGATACTGGTTTTGTTTATTGATTCTGTTTTCGTTTGTTACTGCTTTTG
TTTATTCAGAACTTAATTTATATTCGTGTCAAAATCTTTGGGTCTCTCTTTTGCAGAATG
AACTTTCATGGAGAGAGATGAGAAAATAATCGT

QA 1 393 1 393
DS 

RD RS1B319TF 605 0 0
GGGAGCTAGCGTTTCCCCTTTCTTCAATCCCTGATTTCATAGATCGACCATGAAACTTTT
TTTTTTTTTGTAACTTGACCATGAAACCTTTGCTCTTCCTCTTCTCTGTTCCGTTTCACG
ATCTGATCGACGAGCATTCAAGACAACCTCCACTTCGTTTCACCCTTTATTCTCATTTAT
GGACTCTCTTAGGATTTCTCCTTCTGATTTTTCATATAAAACATATGATCACAGTTTTTT
TCCGATCCAACTTCGTTCTATATTCTCTCTACCACGGTGGATGATTTTGGTTACGTTTGT
TGATTTGGTTTTTGTTTGTTGATGTAAGATGATTTGGATATATTTTATTAATTTAGAAAT
CTTGAATTTAGATGATTTTGATTTAGTTTTGGTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTATGTTA
GATGATTTTGGTTGTATACTGATATAGAAAGCTTTGGATGATATTGGTTTTGTTTATTGA
TTCTGTTTTCGTTTGTTACTGCTTTTGTTTATTCAGAACTTAATTTATATTCGTGTCAAA
ATCTTTGGGTCTCTCTTTTGCAGAATGAACTTTCATGGAGAGAGATGAGAAAATAATCGT
T
GCCC

QA 1 601 1 601
DS 

RD RS1BM69TF 475 0 0
CGAGCATTCAAGACAACCTCCACTTCGTTTCACCCTTTATTCTCATTTATGGATTCTCTT
AGGATTTCTCCTTCTGATTTTTCATATAAAACATATGAACACAGTTTTTTTCCGAACCAA
CTTCGCTCTATATTCTCTCTACCACAGTGGATGATTTTGGTTACGTTTGTTGATTTGGTT
TTTGTTTGTTGATGTAAGATGATTTGGATATATTTTATTAATTTAGAAATCTTGAATTTA
GATGATTTTGATTTAGTTTTGGTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTATGTTAGATGATTTTG
GTTGTATACTGATATAGAAAGCTTTGGATGATACTGGTTTTGTTTATTGATTCTGTTTTC
GTTTGTTACTGCTTTTGTTTATTCAGAACTTAATTTATATTCGTGTCAAAATCTTTGGGT
CTCTCTTTTGCAGAATGAACTTTCATGGAGAGAGATGAGAAAATAATCGTT
GCCC

QA 1 471 1 471
DS 

RD RS1B319JQ 798 0 0
TGTTAGATGATTTTGGTTGTATACTGATATAGAAAGCTTTGGATGATATTGGTTTTGTTT
ATTGATTCTGTTTTCGTTTGTTACTGCTTTTGTTTATTCAGAACTTAATTTATATTCGTG
TCAAAATCTTTGGGTCTCTCTTTTGCAGAATGAACTTTCATGGAGAGAGATGAGAAAATA
ATCGTTGCCCAAAAAAAAAAGAGAAAATAATCTTCCGGTTTGAATCCAACTACCGAACCG
ATGAACTCTTCAGATCGACGGCGACCGTATGAAGGAAGAGCTTGCAAGCAGATTCAAGCA
AAACGATATTGGAGAATGATGATGCTCAACCGCCATGCTTTCCGGTGAACAAATCACGGT
CTCTGTTTCACAATGATTTTGGTTTTGTTTATTGTTTTTGTTTTTGTTTGTTACTCTTTT
TATTTATTCAGAACTTAATTTATCGTTTCGTATCAAAATATTTGCGTCTCCCTTCTGCAG
AATGGAACTAACCTTTTTAATCAGCTTCTGATGATGAAATGTGGAAGCCAAGTTCAACGT
GGTAGAAGCCTAGGACATCACTCCCAAAAACTTGAATACTTTGAGGCTGTTGAAGGGGTT
CTAAAGATCAAGGACAGATACAATCCTGCAACGTGAATGCTTGGAGATGGACATTCACAT
TGAAGTACCTTATTGCAAAAAAATATTAATTTTATAATTATTGCACGATGTCAACTAAAT
AAAATTTATAAAATCAGTGTATTTGCAAAAATAACTAAAACACATAATATAATTCACAAT
ATTATGAAGTTAGAGAAG

QA 1 798 1 798
DS 



CO CL481Contig2 1346 5 18 U
GGACCATGGCCGTTTTGAGCTAGCGTTTCCCCTTTCTTCAATCCCTGATTTCATAGATCG
AGCATGAAACTTTTCTTTTTTTTTTTGTAACTTGACCATGAAACCTTTGCTCTTCCTCTT
CTCTGTTCCGTTTCACGATCTGATCGACGAGCATTCAAGACAACTTCCACTTCGTTTCAC
CCTTTATTCTCATTTATGGATTCTCTTTGGATTTCTCCTTCTGATTTTTCATATAAAACA
TATAATCACAGTTTTTTTCCGATCCAACTTCGTTCTATATTCTCTCTACCACAGTGGATG
ATTTTGGTTACGTTTGTTGATTTGGTTTTTGTTTGTTGATGTAAGATGATTTGGATATAT
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TTTTTGTTTTTATGTTAGATGATTTTGGTTGTATACTGATTTAGAAAGCTTTGGATGATA
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TTTATAGTTTCGTGTCAAAATCTTTGGTTCTCTTTTTGCAGAATGAACTTTCATGGAGAG
AGATGAGAAAATAATCGTTCCCCCAAAAAAATATATGAGAAAATAATCTTCCAGTTTGAA
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TTCAGCTTTCTTCCGTTGCGGATAGTAGGTTTATCTTTACTTTTCCTTTAGAGGATCAAT
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AAGTGTCTGTGTTTTTTGGATTTTACTTTAGTGAAGATAAACAGAATCAGATAAGTTGAA
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TCAACTAAATAAAATTTATAAAATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1FH47JQ C 688
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TTTTTGTTTTTATGTTAGATGATTTTGGTTGTATACTGATTTAGAAAGCTTTGGATGATA
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TTTATAGTTTCGTGTCAAAATCTTTGGTTCTCTTTTTGCAGAATGAACTTTCATGGAGAG
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TCCAAGTGAGAA*CACTTTTTTTTT**GGTGTATGATTGTTCCGTTTCTCAGATT
GTTTTC

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GT
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GAGCATTCAAGACAACTTCCACTTCGTTTCACCCTTTATTCTCATTTATGGATTCTCTTT
GGATTTCTCCTTCTGATTTTTCATATAAAACATATAATCACAGTTTTTTTCCGATCCAAC
TTCGTTCTATATTCTCTCTACCACAGTGGATGATTTTGGTTACGTTTGTCGATTTGGTTT
TTGTTTGTTGATGTAAGATGATTTGGATATATTTTATTAATTTAGAAATCTTGAATTTAG
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QA 3 646 3 646
DS 

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GG
AACTTGACCATGAAACCTTTGCTCTTCCTCTTCTCTGTTCCGTTTCACGATCTGATCGAC
GAGCATTCAAGACAACTTCCACTTCGTTTCACCCTTTATTCTCATTTATGGATTCTCTTT
GGATTTCTCCTTCTGATTTTTCATATAAAACATATAATCACAGTTTTTTTCCGATCCAAC
TTCGTTCTATATTCTCTCTACCACAGTGGATGATTTTGGTTACGTTTGTTGATTTGGTTT
TTGTTTGTTGATGTAAGATGATTTGGATATATTTTATTAATTTAGAAATCTTGAATTTAG
ATGATTTTGATTTAGTTTTGGTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTATGTTAGATGATTTTGG
TTGTACACTGATTTAGAAAGCTTTGGATGATATTGGTTTTGTTTATTGATTCTGTTTTCG
TTTGTTACTGCTTTTGTTTATTCAGAACTTAATTTATAGTTTCGTGTCAAAATCTTTGGT
TCTCTTTTTGCAGAATGAACTTTCATGGAGAGAGATGAGAAAATAATCGTTCCCCCAAAA
AAATATATGAGAAAATAATCTTCCAGTTTGAATCCAAGTGAGAAACACTTTTTTTTTT*G
GTGTATGATTGTTCCGTTTCTCGGATTTGTTTTTCAGCTTTCTTCCGTTGCGGATAGTAG
*TTTATCTTTACTTTTCCTTTAGAGGATCAATCTAATTTCTTT
GATT

QA 3 705 3 705
DS 

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TCTC
TTTTGCAGAATGAACTTTCATGGAGAGAGATGAGAAAATAATCGTTCCCCCAAAAAAATA
TATGAGAAAATAATCTTCCAGTTTGAATCCAAGTGAGAAACACTTTTTTTTTT*GGTGTA
TGATTGTTCCGTTTCTCGGATTTGTTTTTCAGCTTTCTTCCGTTGCGGATAGTAGGTTTA
TCTTTACTTTTCCTTTAGAGGATCAATCTAATTTCTTTTGATTTGAGGGGTTTTTCTCTG
TAAGTTAGTTATGCTTAGATCCTTGATTTAGAACCGAAACAATTTCTGTTTGATTAAAAT
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CGACCGTATGAAGGAAGAGCTTGCAAGCAGATTCAAGCAAAACGAGATTGGAGAATGATG
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GCTTCTGATGATGAAATGTGGAAGCCAAGTTCAACGTGATAGAAGCCTAGGACATCACTC
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TCCTGCAACGTGAATGCTTGGAGATGGACATTCACATTGAAGTACCTTATTGCACAAAAA
TATTAATTTTATAATTATTGCACGATGTCAACTAAATAAAATTTAT

QA 5 770 5 770
DS 

RD RS1FH47JQ 659 0 0
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GGTTTATCTTTACTTTTCCTTTAGAGGATCAATCTAATTTCTTTTGATTTGAGGGGTTTT
TCTCTGTAAGTTAGTTATGCTTAGATCCTTGATTTAGAACCGAAACAATTTCTGTTTGAT
TAAAATCTTTTAGACAGAGTCTCCTTGCAAGTCAAGTGTCTGTGTTTTTTGGATTTTACT
TTAGTGAAGATAAACAGAATCAGATAAGTTGAAGCTTTCTAGAAGGTGTTTCAACAAGAT
CGACGGCGACCGTATGAAGGAAGAGCTTGCAAGCAGATTCAAGCAAAACGAGATTGGAGA
ATGATGATGCTCAACCGCCATGCTTTCCGGTGAACAAATCACGAATGGAACTAACCTTTT
TAATCAGCTTCTGATGATGAAATGTGGAAGCCAAGTTCAACGTGATAGAAGCCTAGGACA
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ATACAATCCTGCAACGTGAATGCTTGGAGATGGACATTCACATTGAAGTACCTTATTGCA
CAAAAATATTAATTTTATAATTATTGCACGATGTCAACTAAATAAAATTTATAAAATCG

QA 1 659 1 659
DS 



AS 2 9

CO CL482Contig1 454 4 8 U
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TGAAGTTCTTGTTCCAGTGTCCATGCTGCTCTTGCTTCTGCTTCATGAAACCAAAGCAGG
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CTGAGAAGAAAGAAGAAAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAACCAAAGCAG
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AATTTCGATGCTATGTGATGCTTGAGTAACTTGTAACTTTTCTTGATTAATAAATTGTCT
TTTTTTTGCCAATATGGTTTCTCTCTATTTTATCAATGATGCTCGTTTGATATGTGTACT
CTTATGAATTCGTGAAAGCTATGATTATTGTTCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1C062TF U 1
AF RS1D621TF U 1
AF RS1DZ24JQ C 49
AF RS1DZ24TF U 49
BS 1 121 RS1C062TF
BS 122 122 RS1DZ24TF
BS 123 252 RS1C062TF
BS 253 253 RS1D621TF
BS 254 286 RS1C062TF
BS 287 370 RS1D621TF
BS 371 452 RS1DZ24TF
BS 453 454 RS1DZ24JQ

RD RS1C062TF 286 0 0
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TGAAGTTCTTGTTCCAGTGTCCATGCTGCTCTTGCTTCTGCTTCATGAAACCAAAGCAGG
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CTGAGAAGAAAGAAGAAAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAACCAAAGCAG
AGAAGGCCGAGTAAAAGCTCTACTCTCAAGAAAACGTAATTGATTA

QA 1 286 1 286
DS 

RD RS1D621TF 370 0 0
GG
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AAGTTCTTGTTCCAGTGTCCATGCTGCTCTTGCTTCTGCTTCATGAAACCAAAGCAGGGT
AAACCGAAAGCTGTAGATTCAAAACCAAAGGAAGAGAAGAAAAAAGAGGAGAAGAAGCCT
GAGAAGAAAGAAGAAAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAACCAAAGCAGAG
AAGGCCGAGTGAAAGCTCTACTCTCAAGAAAACGTAATTGATTATCCAGTTTTATTTTAA
TTTCGATGCTATGTGATGCTTGAGTAACTTGTAACTTTTCTTGATTAATAAATTGTCTTT
TTTTTGCC

QA 3 370 3 370
DS 

RD RS1DZ24JQ 406 0 0
GG
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CCAAAGCAGGGCAAACCGAAAGCTGTAGATTCAAAACCAAAGGAAGAGAAGAAAAAAGAG
GAGAAGAAGCCTGAGAAGAAAGAAGAAAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAA
ACCAAAGCAGAGAAGGCCGAGTGAAAGCTCTACTCTCAAGAAAACGTAATTGATTATCCA
GTTTTATTTTAATTTCGATGCTATGTGATGCTTGAGTAACTTGTAACTTTTCTTGATTAA
TAAATTGTCTTTTTTTTGCCAATATGGTTTCTCTCTATTTTATCAATGATGCTCGTTTGA
TATGTGTACTCTTATGAATTCGTGAAAGCTATGATTATTGTTCC

QA 3 406 3 406
DS 

RD RS1DZ24TF 406 0 0
GG
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CCAAAGCAGGGCAAACCGAAAGCTGTAGATTCAAAACCAAAGGAAGAGAAGAAAAAAGAG
GAGAAGAAGCCTGAGAAGAAAGAAGAAAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAA
ACCAAAGCAGAGAAGGCCGAGTGAAAGCTCTACTCTCAAGAAAACGTAATTGATTATCCA
GTTTTATTTTAATTTCGATGCTATGTGATGCTTGAGTAACTTGTAACTTTTCTTGATTAA
TAAATTGTCTTTTTTTTGCCAATATGGTTTCTCTCTATTTTATCAATGATGCTCGTTTGA
TATGTGTACTCTTATGAATTCGTGAAAGCTATGATTATTGTT
CC

QA 3 404 3 404
DS 



CO CL482Contig2 488 5 2 U
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AATGAAGTTCTTGTTCCAGTGTCCATGCTGCTCTTGCTTCTGCTTCATGAAACCAAAGCA
GGGTAAACCAAAAGCTGTAGATTCAAAACCAAAGGAAGAGAAGAAAAAAGAGGAGAAGAA
GCCTGAGAAGAAAGAAGAAAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAGAGAAGAA
AGAAACCAAAGCAGAGAAGGCCGAGTGAAAGCTCTACTCTCAAGAAAACGTAATTGATTA
TCCAGTTTTATTTTAATTTCGATGCTATGTGATGCTTGAGTAACTTGTAATTTTTCTTGA
TTAATAAATTGTCTTTTTTTTGCCAATATGGTTTATCTCTATTTTATCAATGATGCTCGT
TTGATATGTGTACTCTTATGAATTCGTGAAAGCTATGATTATTGTTTCAACGTGATTATG
CTTTAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DC05TF U 1
AF RS1DC05JQ C 94
AF RS1CC41JQ C 22
AF RS1CC41TF U 22
AF RS1CP78TF U 17
BS 1 475 RS1DC05TF
BS 476 488 RS1CP78TF

RD RS1DC05TF 477 0 0
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GCCTGAGAAGAAAGAAGAAAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAGAGAAGAA
AGAAACCAAAGCAGAGAAGGCCGAGTGAAAGCTCTACTCTCAAGAAAACGTAATTGATTA
TCCAGTTTTATTTTAATTTCGATGCTATGTGATGCTTGAGTAACTTGTAATTTTTCTTGA
TTAATAAATTGTCTTTTTTTTGCCAATATGGTTTATCTCTATTTTATCAATGATGCTCGT
TTGATATGTGTACTCTTATGAATTCGTGAAAGCTATGATTATTGTTTCAACGTGA
CT

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DS 

RD RS1DC05JQ 341 0 0
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GCTTGAGTAACTTGTAATTTTTCTTGATTAATAAATTGTCTTTTTTTTGCCAATATGGTT
TATCTCTATTTTATCAATGATGCTCGTTTGATATGTGTACT

QA 1 341 1 341
DS 

RD RS1CC41JQ 447 0 0
GG
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CAAAACCAAAGGAAGAGAAGAAAAAAGAGGAGAAGAAGCCTGAGAAGAAAGAAGAAAAGA
AAGAGGAGAAGAAGGAAGAGAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAACCAAAGCAGAGAAGGCCG
AGTGAAAGCTCTACTCTCAAGAAAACGTAATTGATTATCCAGTTCTATTTTAATTTCGAT
GCTATGTGATGCTTGAGTAACTTGTAATTTTTCTTGATTAATAAATTGTCTTTTTTTTGT
CAATATGGTTTATCTCTATTTTATCAATGATGCTCGTTTGATATGTGTACTCTTATGAAT
TCGTGAAAGCTATGATTATTGTT
GC

QA 3 445 3 445
DS 

RD RS1CC41TF 447 0 0
GG
AAGATAGAGAGAAGGTGATAAGTGAGAGAGAGAGAAAAATGAAGTTCTTGTTCCAGTGTC
CATGCTGCTCTTGCTTCTGCTTCATGAAACCAAAGCAGGGTAAACCAAAAGCTGTAGATT
CAAAACCAAAGGAAGAGAAGAAAAAAGAGGAGAAGAAGCCTGAGAAGAAAGAAGAAAAGA
AAGAGGAGAAGAAGGAAGAGAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAACCAAAGCAGAGAAGGCCG
AGTGAAAGCTCTACTCTCAAGAAAACGTAATTGATTATCCAGTTCTATTTTAATTTCGAT
GCTATGTGATGCTTGAGTAACTTGTAATTTTTCTTGATTAATAAATTGTCTTTTTTTTGT
CAATATGGTTTATCTCTATTTTATCAATGATGCTCGTTTGATATGTGTACTCTTATGAAT
TCGTGAAAGCTATGATTATTGTT
GC

QA 3 445 3 445
DS 

RD RS1CP78TF 472 0 0
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GAAAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAGAGAAGAAAGAAACCAAAGCAGAG
AAGGCCGAGTGAAAGCTCTACTCTCAAGAAAACGTAATTGATTATCCAGTTTTATTTTAA
TTCCGATGCTATGTGATGCTTGAGTAACTTGTAATTTTTCTTGATTAATAAATTGTCTTT
TTTTTGCCAATATGGTTTATCTCTATTTTATCAATGATGCTCGTTTGATATGTGTACTCT
TATGAATTCGTGAAAGCTATGATTATTGTTTCAACGTGATTATGCTTTAATT

QA 1 472 1 472
DS 



AS 1 7

CO CL483Contig1 1044 7 12 U
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GACAAGGACGCTAGCGTGAGATCAGGGTTCGAGAGTGAGGCTGCTGGAGAGGAAATTGTC
GAGAATAACAGATGCAAGCCCCATACTGTGATTTCTGTGGAGGGATACGACACTAGTCTG
CCTGAGGACGATATCAAGAGTGAATTGATTAATCACTTCAAATCATGTGGCGAAGTCTTT
AATGTTATTCTTCGCGAAGACCCAGATAGCCCTAATCTCGACAGACGTGCTTTGGTTATT
CTTCTCGGAGAAGGCGCGGAAGAGAAGGCCTTGCAACTCAATGGAACTGACATTGGTGGA
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TCTTCTTGTGGAGATATCACCCATGTTTTTGTCTCTACTCTCGAAAAGATTACTAATATC
TATTTTCACCAAGAAGAAGGAGAAGCTAAGGCGCTGGATCTTTCTGGAAGTGAAGTGGGA
GGATTCAAAATAGATGTTGAGCGCGTAGCTACAATCTTTACTAACTGTCCCCCTCCCTTT
CCCTCTTCCTCTCCCTCCGATGAAATTTATTACGGCTACTGTATCCCAGCTCATATGATT
GAGTTTTCCGGCGTGATCGAGGACAAGGTCGCTGCTTTTAAGAAGCAGAGGATTTCTATC
TAGAAATCTCTCTCTCTCTCTCTCAAGAAGCTCAATCTTTGGTGCTTAATAATTAATAAA
TCTTGTCAGATTATACAATGCAATGCAACCTTGGGGCTTTCTTATTTATGTTTAATGTCA
GAGCTCATTATGTATGTATGATGAGCCGTTTTAGTGTGTCTGGATGATAAACGTACTCTT
AATAATTTCCTTTTATTATTAGCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FL19TF U 1
AF RS1BR01TF U 24
AF RS1G518TF U 1
AF RS1G518JQ C 279
AF RS1BR01JQ C 336
AF RS1AH29TF U 364
AF RS1AH29JQ C 342
BS 1 136 RS1FL19TF
BS 137 137 RS1G518TF
BS 138 469 RS1FL19TF
BS 470 470 RS1G518TF
BS 471 611 RS1FL19TF
BS 612 618 RS1G518TF
BS 619 619 RS1AH29TF
BS 620 712 RS1G518TF
BS 713 713 RS1AH29TF
BS 714 728 RS1G518TF
BS 729 1037 RS1AH29TF
BS 1038 1044 RS1BR01JQ

RD RS1FL19TF 611 0 0
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GAGAATAACAGATGCATGCCCCATACTGTGATTTCTGTGGAGGGATACGACACTAGTCTG
CCTGAGGACGATATCAAGAGTGAATTGATTAATCACTTCAAATCATGTGGCGAAGTCTTT
AATGTTATTCTTCGCGAAGACCCAGATAGCCCTAATCTCGACAGACGTGCTTTGGTTATT
CTTCTCGGAGAAGGCGCGGAAGAGAAGGCCTTGCAACTCAATGGAACTGACATTGGTGGA
TGGAAGGCTCTTGTTAAAGTTGAACCAGAGGAGGAAGAAGACGAGGAGACACAACGTTAT
AAATCCTTTCTGATTGACGAACTAACGAATGACCGCAGATTTTGGTATGACGTTACCGTA
AGGGGATATAACACTTCCCTTCCTGCAGATGAAGTAAAGACTTGTTTGAAACACCACTTC
TCTTCTTGTGGAGATATCACCCATGTTTTTGTCTCTACTCTCGAAAAGATTACTAATATC
TATTTTCACCA

QA 1 611 1 611
DS 

RD RS1BR01TF 589 0 0
GGG
GGCAGCTTAGGGTTATTTGCACCTCTTCACCATGGACAAGGACGCTAGCGTGAGATCAGG
GTTCGAGAGTGAGGCTGCTGGAGAGGAAATTGTCGAGAATAACAGATGCAAGCCCCATAC
TGTGGTTTCTGTGGAGGGATACGACACTAGTCTGCCTGAGGACGATATCAAGAGTGAATT
GATTAATCACTTCAAATCATGTGGCGAAGTCTTTAATGTTATTCTTCGCGAAGACCCAGA
TAGCCCTAATCTCGACAGACGTGCTTTGGTTATTCTTCTCGGAGAAGGCGCGGAAGAGAA
GGCCTTGCAACTCAATGGAACTGACATTGGTGGATGGAAGGCTCTTGTTAAAGTTGAACC
AGAGGAGGAAGAAGACGAGGAGACACAACGTTATAAATCCTTTCTGATTGACGAACTAAC
GAATGACCGCAGATTTTGGTATGGCGTTACCGTAAGGGGATATAACACTTCCCTTCCTGC
AGATGAAGTAAAGACTTGTTTGAGACACCACTTCTCTTCTTGTGGAGATATCACCCATGT
TTTTGTCTCTACTCTCGAAAAGATTACTAATATCTATTTTCACCAA

QA 4 589 4 589
DS 

RD RS1G518TF 747 0 0
GGAAAACCGGAAAAATATCGTAAAGCGGCAGCTTAGGGTTATTTGCACCTCTTCACCATG
GACAAGGACGCTAGCGTGAGATCAGGGTTCGAGAGTGAGGCTGCTGGAGAGGAAATTGTC
GAGAATAACAGATGCAAGCCCCATACTGTGATTTCTGTGGAGGGATACGACACTAGTCTG
CCTGAGGACGATATCAAGAGTGAGTTGATTAATCACTTCAAATCATGTGGCGAAGTCTTT
AATGTTATTCTTCGCGAAGACCCAGATAGCCCTAATCTCGACAGACGTGCTTTGGTTATT
CTTCTCGGAGAAGGCGCGGAAGAGAAGGCCTTGCAACTCAATGGAACTGACATTGGTGGA
TGGAAGGCTCTTGTTAAAGTTGAACCAGAGGAGGAAGAAGACGAGGAGACACAACGTTAT
AAATCCTTTCTGATTGACGAACTAACGAATGACCGCAGATTTTGGTATGGCGTTACCGTA
AGGGGATATAACACTTCCCTTCCTGCAGATGAAGTAAAGACTTGTTTGAAACACCACTTC
TCTTCTTGTGGAGATATCACCCATGTTTTTGTCTCTACTCTCGAAAAGATTACTAATATC
TATTTTCACCAAGAAGAAAGAGAAGCTAAGGCGCTGGATCTTTCTGGAAGTGAAGTGGGA
GGATTCAAAATAGATGTTGAGCGCGTAGCTACAATCTTTACTAACTGTCCCC*TCCCTTT
CCCTCTTC
TCTCCTCCGATGAATTTAT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1G518JQ 759 0 0
CGACAGACGTGCTTTGGTTATTCTTCTCGGAGAAGGCGCGGAAGAGAAGGCCTTGCAACT
CAATGGAACTGACATTGGTGGATGGAAGGCTCTTGTTAAAGTTGAACCAGAGGAGGAAGA
AGACGAGGAGACACAACGTTATAAATCCTTTCTGATTGACGAACTAACGAATGACCGCAG
ATTTTGGTATGGCGTTACCGTAAGGGGATATAACACTTCCCTTCCTGCAGATGAAGTAAA
GACTTGTTTGAAACACCACTTCTCTTCTTGTGGAGATATCACCCATGTTTTTGTCTCTAC
TCTCGAAAAGATTACTAATATCTATTTTCACCAAGAAGAAGGAGAAGCTAAGGCGCTGGA
TCTTTCTGGAAGTGAAGTGGGAGGATTCAAAATAGATGTTGAGCGCGTAGCTACAATCTT
TACTAACTGTCCCCCTCCCTTTCCCTCTTCCTCTCCCTCCGATGAAATTTATTACGGCTA
CTGTATCCCAGCTCATATGATTGAGTTTTCCGGCGTGATCGAGGACAAGGTCGCTGCTTT
TAAGAAGCAGAGGATTTCTATCTAGAAATCTCTCTCTCTCTCTCTCAAGAAGCTCAATCT
TTGGTGCTTAATAATTAATAAATCTTGTCAGATTATACAATGCAATGCAACCTTGGGGCT
TTCTTATTTATGTTTAATGTCAGAGCTCATTATGTATGTATGATGAGCCGTTTTAGTGTG
TCTGGATGATAAACGTACTCTTAATAATTTCCTTTTA
CC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RS1BR01JQ 709 0 0
ACTCAATGGAACTGACATTGGTGGATGGAAGGCTCTTGTTAAAGTTGAACCAGAGGAGGA
AGAAGACGAGGAGACACAACGTTATAAATCCTTTCTGATTGACGAACTAACGAATGACCG
CAGATTTTGGTATGGCGTTACCGTAAGGGGATATAACACTTCCCTTCCTGCAGATGAAGT
AAAGACTTGTTTGAAACACCACTTCTCTTCTTGTGGAGATATCACCCATGTTTTTGTCTC
TACTCTCGAAAAGATTACTAATATCTATTTTCACCAAGAAGAAGGAGAAGCTAAGGCGCT
GGATCTTTCTGGAAGTGAAGTGGGAGGATTCAAAATAGATGTTGAGCGCGTAGCTACAAT
CTTTACTAACTGTCCCCCTCCCTTTCCCTCTTCCTC*CCCTCCGATGAAATTTATTACGG
CTACTGTATCCCAGCTCATATGATTGAGTTTTCCGGCGTGATCGAGGACAAGGTCGCTGC
TTTTAAGAAGCAGAGGATTTCTATCTAGAAATCTCTCTCTCTCTCTCTCAAGAAGCTCAA
TCTTTGGTGCTTAATAATTAATAAATCTTGTCAGATTATACAATGCAATGCGACCTTGGG
GCTTTCTTATTTATGTTTAATGTCAGAGCTCATTATGTATGTATGATGAGCCGTTTTAGT
GTGTCTGGATGATAAACGTACTCTTAATAATCTCCTTTTATTATTAGCC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1AH29TF 678 0 0
AAGGCTCTTGTTAAAGTTGAACCAGAGGAGGAAGAAGACGAGGAGACACAACGTTATAAA
TCCTTTCTGATTGACGAACTAACGAATGACCGCAGATTTTGGTATGGCGTTACCGTAAGG
GGATATAACACTTCCCTTCCTGCAGATGAAGTAGAGACTTGTTTGAAACACCACTTCT**
TCTTGTGGAGATATCACCCATGTTTTTGTCTCTACTCTCGAAAAGATTACTAATATCTAT
TTTCACCAAGAAGAAGGAGAAGCTAAGGCGCTGGATCTTTCTGGAAGTGAAGTGGGAGGA
TTCAAAATAGATGTTGAGCGCGTAGCTACAATCTTTACTAACTGTCCCCCTCCCTTTCCC
TCTTCCTCTCCCTCCGATGAAATTTATTACGGCTACTGTATCCCAGCTCATATGATTGAG
TTTTCCGGCGTGATCGAGGACAAGGTCGCTGCTTTTAAGAAGCAGAGGATTTCTATCTAG
AAATCTCTCTCTCTCTCTCTCAAGAAGCTCAATCTTTGGTGCTTAATAATTAATAAATCT
TGTCAGATTATACAATGCAATGCAACCTTGGGGCTTTCTTATTTATGTTTAATGTCAGAG
CTCATTATGTATGTATGATGAGCCGTTTTAGTGTGTCTGGATGATAAACGTACTCTTAAT
AATTTCCTTTTATT
AAAA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1AH29JQ 696 0 0
G
GGAACTGACATTGGTGGATGGAAGGCTCTTGTTAAAGTTGAACCAGAGGAGGAAGAAGAC
GAGGAGACACAACGTTATAAATCCTTTCTGATTGACGAACTAACGAATGACCGCAGATTT
TGGTATGGCGTTACCGTAAGGGGATATAACACTTCCCTTCCTGCAGATGAAGTAGAGACT
TGTTTGAAACACCACTTCT**TCTTGTGGAGATATCACCCATGTTTTTGTCTCTACTCTC
GAAAAGATTACTAATATCTATTTTCACCAAGAAGAAGGAGAAGCTAAGGCGCTGGATCTT
TCTGGAAGTGAAGTGGGAGGATTCAAAATAGATGTTGAGCGCGTAGCTACAATCTTTACT
AACTGTCCCCCTCCCTTTCCCTCTTCCTCTCCCTCCGATGAAATTTATTACGGCTACTGT
ATCCCAGCTCATATGATTGAGTTTTCCGGCGTGATCGAGGACAAGGTCGCTGCTTTTAAG
AAGCAGAGGATTTCTATCTAGAAATCTCTCTCTCTCTCTCTCAAGAAGCTCAATCTTTGG
TGCTTAATAATTAATAAATCTTGTCAGATTATACAATGCAATGCAACCTTGGGGCTTTCT
TATTTATGTTTAATGTCAGAGCTCATTATGTATGTATGATGAGCCGTTTTAGTGTGTCTG
GATGATAAACGTACTCTTAATAATTTCCTTTTATT

QA 2 696 2 696
DS 



AS 1 8

CO CL484Contig1 881 8 7 U
GGAGCTTACAAATAACGCGGAGAGGAAACAGTGAAGAAACAAAAAAGAACACAAGTCATA
TCGTTTTTTTCCCGACTGGAGAAAAAAATATCTTTCTTCGGCTTCTTGATTTTCAACTAG
AGTTATCGTTTGAAATCGGTTTGATTCAGCAGCCATGGCAAACGCGGCATCAGGAATGGC
TGTGCATGATGATTGCAAGCTCAAATTTTTGGAACTGAAAGCGAAAAGAACTTTCCGTAC
CATTGTCTACAAGATTGCGGACAAGCAAGTGGTCGTGGACAAACTCGGTGAGCCTGAGCA
ATCATACGATGACTTTGCAGCGAGTCTTCCCGACAACGAATGCCGATATGCCATTTATGA
CTTCGACTTTGTCACCGAAGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATCGCATGGTC
TCCTGACACTGCCAAAGTGAGAGACAAGATGATATACGCGAGCTCTAAGGATAGGTTCAA
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TGATGTTTTCAAGAGCCGCACCAACTAAAAACCTAAAACCCCTCCTCCTTGTGAATGGTG
GAGGGGCCCTTGAATAAATTTGTTTCTGGAGTGAATTTATGTGTATGCTGTTAACTGTTG
TTCCCTCTGACGGTTATGAAACTATTAACATCTTCCGTTTATTTGGGTATTGTTAATCGT
CTTTCGTGTTCTCTTGATGATCATGTGTTTCATCATCTATGAACTTGTGAGATTGTAGCT
GCCTTGCCTTGTGGTGGTTTGCAATCTTTTGTGTCAGTTTATGTACAATACTTTGAAAAA
TCAGATTGGAGTTTATTGGTTGATGATTGCGACTATAACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GD39TF U 1
AF RS1DY02TF U 18
AF RS1GS45TF U 113
AF RS1EM72TF U 21
AF RS1E156TF U 14
AF RS1AQ38TFB U 71
AF RS1DY02JQ C 141
AF RS1EM72JQ C 368
BS 1 87 RS1GD39TF
BS 88 88 RS1E156TF
BS 89 668 RS1GD39TF
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BS 788 813 RS1AQ38TFB
BS 814 862 RS1DY02JQ
BS 863 881 RS1EM72JQ

RD RS1GD39TF 668 0 0
GGAGCTTACAAATAACGCGGAGAGGAAACAGTGAAGAAACAAAAAAGAACACAAGTCATA
TCGTTTTTTTCCCGACTGGAGAAAAAA*TATCTTTCTTCGGCTTCTTGATTTTCAACTAG
AGTTATCGTTTGAAATCGGTTTGATTCAGCAGCCATGGCAAACGCGGCATCAGGAATGGC
TGTGCATGATGATTGCAAGCTCAAATTTTTGGAACTGAAAGCGAAAAGAACTTTCCGTAC
CATTGTCTACAAGATTGCGGACAAGCAAGTGGTCGTGGACAAACTCGGTGAGCCTGAGCA
ATCATACGATGACTTTGCAGCGAGTCTTCCCGACAACGAATGCCGATATGCCATTTATGA
CTTCGACTTTGTCACCGAAGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATCGCATGGTC
TCCTGACACTGCCAAAGTGAGAGACAAGATGATATACGCGAGCTCTAAGGATAGGTTCAA
GAGAGAACTGGATGGGATTCAAGTGGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACCGAGATGGGTCT
TGATGTTTTCAAGAGCCGCACCAACTAAAAACCTAAAACCCCTCCTCCTTGTGAATGGTG
GAGGGGCCCTTGAATAAATTTGTTTCTGGAGTGAATTTATGTGTATGCTGTTAACTGTTG
TTCCCTCT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1DY02TF 693 0 0
GGGA
GAGGAAACAGTGAAGAAACAAAAAAGAACACAAGTCATATCGTTTTTTTCCCGACTGGAG
AAAAAAATATCTTTCTTCGGCTTCTTGATTTTCAACTAGAGTTATCGTTTGAAATCGGTT
TGATTCAGCAGCCATGGCAAACGCGGCATCAGGAATGGCTGTGCATGATGATTGCAAGCT
CAAATTTTTGGAACTGAAAGCGAAAAGAACTTTCCGTACCATTGTCTACAAGATTGCGGA
CAAGCAAGTGGTCGTGGACAAACTCGGTGAGCCTGAGCAATCATACGATGACTTTGCAGC
GAGTCTTCCCGACAACGAATGCCGATATGCCATTTATGACTTCGACTTTGTCACCGAAGA
GAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATCGCATGGTCTCCTGACACTGCCAAAGTGAG
AGACAAGATGATATACGCGAGCTCTAAGGATAGGTTCAAGAGAGAACTGGATGGGATTCA
AGTGGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACCGAGATGGGTCTTGATGTTTTCAAGAGCCGCAC
CAACTAAAAACCTAAAACCCCTCCTCCTTGTGAATGGTGGAGGGGCCCTTGAATAAATTT
GTTTCTGGAGTGAATTTATGTGTATGCTGTTAACTGTTGTTCCCTCTGACGGTTATGAAA
CTATTAACATCTTCCGTTTATTTGGGTAT

QA 5 693 5 693
DS 

RD RS1GS45TF 594 0 0
G
CAACTAGAGTTATCGTTTGAAATCGGTTTGATTCAGCAGCCATGGCAAACGCGGCATCAG
GAATGGCTGTGCATGATGATTGCAAGCTCAAATTTTTGGAACTGAAAGCGAAAAGAACTT
TCCGTACCATTGTCTACAAGATTGCGGACAAGCAAGTGGTCGTGGACAAACTCGGTGAGC
CTGAGCAATCATACGATGACTTTGCAGCGAGTCTTCCCGACAACGAATGCCGATATGCCA
TTTATGACTTCGACTTTGTCACCGAAGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATCG
CATGGTCTCCTGACACTGCCAAAGTGAGAGACAAGATGATATACGCGAGCTCTAAGGATA
GGTTCAAGAGAGAACTGGATGGGATTCAAGTGGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACCGAGA
TGGGTCTTGATTTTTTCAAGAGCCGCACCAACTAAAAACCTAAAACCCCTCCTCCTTGTG
AATGGTGGAGGGGCCCTTGAATAAATTTGTTTCTGGAGTGAATTTATGTGTATGCTGTTA
ACTGTTGTTCCCTCTGACGGTTATGAAACTATTAACATCTTCCGTTTATTTGG

QA 2 594 2 594
DS 

RD RS1EM72TF 760 0 0
G
GAGGAAACAGTGAAGAAACAAAAAAGAACTCAAGTCATATCGTTTTTTTCCCGACTGGAG
AAAAAA*TATCTTTCTTCGGCTTCTTGATTTTCAACTAGAGTTATCGTTTGAAATCGGTT
TGATTCAGCAGCCATGGCAAACGCGGCATCAGGAATGGCTGTGCATGATGATTGCAAGCT
TAAATTTTTGGAACTGAAAGCGAAAAGAACTTTCCGTACCATTGTCTACAAGATTGCGGA
CAAGCAAGTGGTCGTGGACAAACTCGGTGAGCCTGAGCAATCATACGATGACTTTGCAGC
GAGTCTTCCCGACAACGAATGCCGATATGCCATTTATGACTTCGACTTCGTCACCGAAGA
GAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATCGCATGGTCTCCTGACACTGCCAAAGTGAG
AGACAAGATGATATACGCTAGCTCTAAGGATAGGTTCAAGAGAGAACTGGATGGGATTCA
AGTGGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACCGAGATGGGTCTTGATGTTTTCAAGAGCCGCAC
CAACTAAAAACCTAAAACCCCTCCTCCTTGTGAATGGTGGAGGGGCCCTTGAATAAATTT
GTTTCTGGAGTGAATTTATGTGTATGCTGTTAACTGTTGTTCCCTCTGACGGTTATGAAA
CTATTAACATCTTCCGTTTATTTGGGTATTGTTAATCGTCTTTCGTGTTCTCT**ATGAT
CATGTGTTTCATCATCTATGAACTTGTGAGATTGTAGCT

QA 2 760 2 760
DS 

RD RS1E156TF 774 0 0
GGGGGGGA
GAGGAAACAGTGAAGAAACAAAAAAGAACACAAGTCATATCGTTTTTTTCCCGACTGGAG
AAAAAAATATCTTTCTTCGGCTTCTTGATTTTCAACTAGAGTTATCGTTTGAAATCGGTT
TGATTCAGCAGCCATGGCAAACGCGGCATCAGGAATGGCTGTGCATGATGATTGCAAGCT
CAAATTTTTGGAACTGAAAGCGAAAAGAACTTTCCGTACCATTGTCTACAAGATTGCGGA
CAAGCAAGTGGTCGTGGACAAACTCGGTGAGCCTGAGCAATCATACGATGACTTTGCAGC
GAGTCTTCCCGACAACGAATGCCGATATGCCATTTATGACTTCGACTTTGTCACCGAAGA
GAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATCGCATGGTCTCCTGACACTGCCAAAGTGAG
AGACAAGATGATATACGCGAGCTCTAAGGATAGGTTCAAGAGAGAACTGGATGGGATTCA
AGTGGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACCGAGATGGGTCTTGATGTTTTCAAGAGCCGCAC
CAACTAAAAACCTAAAACCCCTCCTCCTTGTGAATGGTGGAGGGGCCCTTGAATAAATTT
GTTTCTGGAGTGAATTTATGTGTATGCTGTTAACTGTTGTTCCCTCTGACGGTTATGAAA
CTATTAACATCTTCCGTTTATTTGGGTATTGTTAATCGTCTTTCGTGTTCTCTTGATGAT
CATGTGTTTCATCATCTATGAACTTGTGAGATTGTAGCTGCCTTGC

QA 9 774 9 774
DS 

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CCCGACTGGAGAAAAAAATATCTTTCTTCGGCTTCTTGATTTTCAACTAGAGTTATCGTT
TGAAATCGGTTTGATTCAGCAGCCATGGCAAACGCGGCATCAGGAATGGCTGTGCATGAT
GATTGCAAGCTCAAATTTTTGGAACTGAAAGCGAAAAGAACTTTCCGTACCATTGTCTAC
AAGATTGCGGACAAGCAAGTGGTCGTGGACAAACTCGGTGAGCCTGAGCAATCATACGAT
GACTTTGCAGCGAGTCTTCCCGACAACGAATGCCGATATGCCATTTATGACTTCGACCTT
GTCACCGAAGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATCGCATGGTCTCCTGACACT
GCCAAAGTGAGAGACAAGATGATATACGCGAGCTCTAAGGATAGGTTCAAGAGAGAACTG
GATGGGATTCAAGTGGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACCGAGATGGGTCTTGATGTTTTC
AAGAGCCGCACCAACTAAAAACCTAAAACCCCTCCTCCTTGTGAATGGTGGAGGGGCCCT
TGAATAAATTTGTTTCTGGAGTGAATTTATGTGTATGCTGTTAACTGTTGTTCCCTCTGA
CGGTTATGAAACTATTAACATCTTCCGTTTATTTGGGTATTGTTAATCGTCTTTCGTGTT
CTCTTGATGATCATGTGTTTCATCATCTATGAACTTGTGAGATTGTAGCTGCCTTGCCTT
GTGGTGGTTTGCAATCTTTTGTG

QA 1 743 1 743
DS 

RD RS1DY02JQ 722 0 0
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TCAAATTTTTGGAACTGAAAGCGAAAAGAACTTTCCGTACCATTGTCTACAAGATTGCGG
ACAAGCAAGTGGTCGTGGACAAACTCGGTGAGCCTGAGCAATCATACGATGACTTTGCAG
CGAGTCTTCCCGACAACGAATGCCGATATGCCATTTATGACTTCGACTTTGTCACCGAAG
AGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTTTTCATCGCATGGTCTCCTGACACTGCCAAAGTGA
GAGACAAGATGATATACGCGAGCTTTAAGGATAGGTTCAAGAGAGAACTGGATGGGATTC
AAGTGGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACCGAGATGGGTCTTGATGTTTTCAAGAGCCGCA
CCAACTAAAAACCTAAAACCCCTCCTCCTTGTGAATGGTGGAGGGGCCCTTGAATAAATT
TGTTTTTGGAGTGAATTTATGTGTATGCTGTTAACTGTTGTTCCCTCTGACGGTTATGAA
ACTATTAACATCTTCCGTTTATTTGGGTATTGTTAATCGTCTTTCGTGTTCTCTTGATGA
TCATGTGTTTCATCATCTATGAACTTGTGAGATTGTAGCTGCCTTGCCTTGTGGTGGTTT
GCAATCTTTTGTGTCAGTTTATGTACAATACTTTGAAAAATCAGATTGGAGTTTATTGGT
TG

QA 1 722 1 722
DS 

RD RS1EM72JQ 514 0 0
TTC
GTCACCGAAGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATCGCATGGTCTCCTGACACT
GCCAAAGTGAGAGACAAGATGATATACGCTAGCTCTAAGGATAGGTTCAAGAGAGAACTG
GATGGGATTCAAGTGGAGCTTCAAGCAACCGATCCAACCGAGATGGGTCTTGATGTTTTC
AAGAGCCGCACCAACTAAAAACCTAAAACCCCTCCTCCTTGTGAATGGTGGAGGGGCCCT
TGAATAAATTTGTTTCTGGAGTGAATTTATGTGTATGCTGTTAACTGTTGTTCCCTCTGA
CGGTTATGAAACTATTAACATCTTCCGTTTATTTGGGTATTGTTAATCGTCTTTCGTGTT
CTCT**ATGATCATGTGTTTCATCATCTATGAACTTGTGAGATTGTAGCTGCCTTGCCTT
GTGGTGGTTTGCAATCTTTTGTGTCAGTTTATGTACAATACTTTGAAAAATCAGATTGGA
GTTTATTGGTTGATGATTGCGACTATAACAC

QA 4 514 4 514
DS 



AS 2 8

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TTCCATACAAATGAAATTCGAGAATTCTGACCACACAAATCCACACAGAAGATATACCAC
TCGAGCAAAAAAACAAAACATAAAAGCTGATCACCGGTAACGACGGAGAGAGAGGGAATT
GTTCTTCTTCCAGGTAGCCCTGCGGGAAGGTCTGTTCTTGTGATTGTTGTGACCCTTTCC
ACGAAGACCACGATTCTTCTTTCCCTCTGAGGTGAGCCCTCTGAGTTCTCTGTGCTTGTG
CACTGGGTTGCAGATCCAGTTGATCCGGGGATCATTTCGAACGGCATTGTGTGCAGGGTC
AACAAGTATAATCTCGTAATACTTGTAGGTAGAGTCCTCATTGAGCCAGTAGGAGTTGAC
GACCCTGAGACCACCAAGTTTGCGACCAGCACGTTCCTCAGCAACAGATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1D269TF C 1
AF RS1D269JQ U 43
BS 1 42 RS1D269TF
BS 43 473 RS1D269JQ

RD RS1D269TF 473 0 0
AAAGGTTTCAAAGTTTGAAGAAACACAAAACTTGAACAAACTCTTGAATGTAAAATATTC
TTCCATACAAATGAAATTCGAGAATTCTGACCACACAAATCCACACAGAAGATATACCAC
TCGAGCAAAAAAACAAAACATAAAAGCTGATCACCGGTAACGACGGAGAGAGAGGGAATT
GTTCTTCTTCCAGGTAGCCCTGCGGGAAGGTCTGTTCTTGTGATTGTTGTGACCCTTTCC
ACGAAGACCACGATTCTTCTTTCCCTCTGAGGTGAGCCCTCTGAGTTCTCTGTGCTTGTG
CACTGGGTTGCAGATCCAGTTGATCCGGGGATCATTTCGAACGGCATTGTGTGCAGGGTC
AACAAGTATAATCTCGTAATACTTGTAGGTAGAGTCCTCATTGAGCCAGTAGGAGTTGAC
GACCCTGAGACCACCAAGTTTGCGACCAGCACGTTCCTCAGCAACAGATCTC
C

QA 1 472 1 472
DS 

RD RS1D269JQ 431 0 0
CTTGAATGTAAAATATTCTTCCATACAAATGAAATTCGAGAATTCTGACCACACAAATCC
ACACAGAAGATATACCACTCGAGCAAAAAAACAAAACATAAAAGCTGATCACCGGTAACG
ACGGAGAGAGAGGGAATTGTTCTTCTTCCAGGTAGCCCTGCGGGAAGGTCTGTTCTTGTG
ATTGTTGTGACCCTTTCCACGAAGACCACGATTCTTCTTTCCCTCTGAGGTGAGCCCTCT
GAGTTCTCTGTGCTTGTGCACTGGGTTGCAGATCCAGTTGATCCGGGGATCATTTCGAAC
GGCATTGTGTGCAGGGTCAACAAGTATAATCTCGTAATACTTGTAGGTAGAGTCCTCATT
GAGCCAGTAGGAGTTGACGACCCTGAGACCACCAAGTTTGCGACCAGCACGTTCCTCAGC
AACAGATCTCC

QA 1 431 1 431
DS 



CO CL485Contig2 778 6 15 U
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ATGTAAAATATTCTGACACAAATCCACACAGAAGATACACCACTCGACAAGAAAAAAAA*
CAAAACACGAAAAGCAGATCACCGGTAACGACGGAGAGAGAGGGAATTGTTCTTCTTCCA
GGTAGCCCTGCGAGAAGGTCTGTTCTTGTGGTTGTTGTGACCCTTTCCACGAAGACCACG
ATTCTTCTTTCCCTCTGAGGTGAGCCCCCTGAGTTCTCTGTGCTTGTGCACTGGGTTGCA
GATCCAGTTGATCCTTGGGTCATTACGGACGGCATTGTGTGCAGGGTCCACAAGTATGAT
CTCGTAATACTTGTAGGTAGAGTCCTCATTGAGCCAGTAGGAGTTAACGACCCTGAGGCC
ACCAAGTTTGCGGCCAGCACGTTCCTCAGCAACAGATCTCTTACTGCGCTGGAATTTGAG
CTGTGTCACTCCCTGGTTAGTGGGTTTACCATACACAATACCCTTGGGAACTGGCCTCTT
GCGACCTCCACGTCTCACACGAACACGGTAGACAACAAACCCCTGCTTGGCCTTGTAGCC
GAGACGACGGGCCTTGTCGGGACGAGTAGGCCTGACGAGACGGACAATGGAAGGTTGCTG
TCTGTACTCCCAGCACCCGACCCTCTGCACAAACCTCATCACATCCGACTGCTTCTTCCT
ACATAGCTCAGACACATACTTGTACGCCCCCATTGCTGATCTCCGGTGTCGCAGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G990JQ U 1
AF RS1G990TF C 1
AF RS1BR33JQ U 10
AF RS1AE66TF C 7
AF RS1BR33TF C 38
AF RS1AE66JQ U 142
BS 1 152 RS1G990JQ
BS 153 153 RS1BR33JQ
BS 154 249 RS1G990JQ
BS 250 250 RS1BR33JQ
BS 251 277 RS1G990JQ
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BS 279 296 RS1G990JQ
BS 297 297 RS1BR33JQ
BS 298 315 RS1G990JQ
BS 316 316 RS1BR33JQ
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BS 603 720 RS1AE66JQ
BS 721 721 RS1BR33TF
BS 722 778 RS1AE66JQ

RD RS1G990JQ 386 0 0
GATCTTATTGTGTAAGATTTGAAGTTTTAATTAGCTCAAAACTTGAAAACAAACTCTTGA
ATGTAAAATATTCTGACACAAATCCACACAGAAGATACACCACTCGACAAGAAAAAAAA*
CAAAACACGAAAAGCAGATCACCGGTAACGACAGAGAGAGAGGGAATTGTTCTTCTTCCA
GGTAGCCCTGCGAGAAGGTCTGTTCTTGTGGTTGTTGTGACCCTTTCCACGAAGACCACG
ATTCTTCTTCCCCTCTGAGGTGAGCCCCCTGAGTTCTGTGTGCTTGTGCACTGGGTCGCA
GATCCAGTTGATCCTCGGGTCATTACGGACGGCATTGTGTGCAGGGTCCACAAGTATGAT
CTCGTAATACTTGTAGGTAGAGTCC
C

QA 1 385 1 385
DS 

RD RS1G990TF 386 0 0
GATCTT
ATTGTGTAAGATTTGAAGTTTTAATTAGCTCAAAACTTGAAAACAAACTCTTGAATGTAA
AATATTCTGACACAAATCCACACAGAAGATACACCACTCGACAAGAAAAAAAA*CAAAAC
ACGAAAAGCAGATCACCGGTAACGACAGAGAGAGAGGGAATTGTTCTTCTTCCAGGTAGC
CCTGCGAGAAGGTCTGTTCTTGTGGTTGTTGTGACCCTTTCCACGAAGACCACGATTCTT
CTTCCCCTCTGAGGTGAGCCCCCTGAGTTCTGTGTGCTTGTGCACTGGGTCGCAGATCCA
GTTGATCCTCGGGTCATTACGGACGGCATTGTGTGCAGGGTCCACAAGTATGATCTCGTA
ATACTTGTAGGTAGAGTCC
C

QA 7 385 7 385
DS 

RD RS1BR33JQ 593 0 0
GTGTAAGATTTGAAGTTTTAATTAGCTCAAAACTTGAAAACAAACTCTTGAATGTAAAAT
ATTATGACACAAATCCACACAGAAGATACACCACTCGACAAGAAAAAAAAACAAAACACG
AAAAGCAGATCACCGGTAACGACGGAGAGAGAGGGAATTGTTCTTCTTCCAGGTAGCCCT
GCGAGAAGGTCTGTTCTTGTGGTTGTTGTGACCCTTTCCACGAAGACCACGATTCTTCTT
TCCCTCTGAGGTGAGCCCCCTGAGTTCTCTGTGCTTGTGCACTGGGTTGCAGATCCAGTT
GATCCTTGGGTCATTACGGACGGCATTGTGTGCAGGGTCCACAAGTATGATCTAGTAATA
CTTGTAGGTAGAGTCCTCATTGAGCCAGTAGGAGTTAACGACCCTGAGGCCACCAAGTTT
GCGGCCAGCACGTTCCTCAGCAACAGATCTCTTACTGCGCTGGAATTTGAGCTGTGTCAC
TCCCTGGTTAGTGGGTTTACCATACACAATACCCTTGGGAACTGGCCTCTTGCGACCTCC
ACGTCTCACACGAACACGGTAGACAACAAACCCCTGCTTGGCCTTGTAGCCGA

QA 1 593 1 593
DS 

RD RS1AE66TF 678 0 0
ATT
GTGTAAGATTTGAAGTTTTAATTAGCTCAAAACTTGAAAACAAACTCTTGAATGTAAAAT
ATTCTGACACAAATCCACACAGAAGATACACCACTCGACAAGAAAAAAAA*CAAAACACG
AAAAGCAGATCACCGGTAACGACGGAGAGAGAGGGAATTGTTCTTCTTCCAGGTAGCCCT
GCGAGAAGGTCTGTTCTTGTGGTTGTTGTGACCCTTTCCACGAAGACCACGATTCTTCTT
TCCCTCTGAGGTGAGCCCCCTGAGTTCTCTGTGCTTGTGCACTGGGTTGCAGATCCAGTT
GATCCTTGGGTCATTACGGACGGCATTGTGTGCAGGGTCCACAAGTATGATCTCGTAATA
CTTGTAGGTAGAGTCCTCATTGAGCCAGTAGGAGTTAACGACCCTGAGGCCACCAAGTTT
GCGGCCAGCACGTTCCTCAGCAACAGATCTCTTACTGCGCTGGAATTTGAGCTGTGTCAC
TCCCTGGTTAGTGGGTTTACCATACACAATACCCTTGGGAACTGGCCTCTTGCGACCTCC
ACGTCTCACACGAACACGGTAGACAACAAACCCCTGCTTGGCCTTGTAGCCGAGACGACG
GGCCTTGTCGGGACGAGTAGGCCTGACGAGACGGACAATGGAAGGTTGCTGTCTGTACTC
CCAGCACC
CGACCCT

QA 4 671 4 671
DS 

RD RS1BR33TF 724 0 0
AAAACTTGAAAACAAACTCTTGAATGTAAAATATTATGACACAAATCCACACAGAAGATA
CACCACTCGACAAGAAAAAAAA*CAAAACACGAAAAGCAGATCACCGGTAACGACGGAGA
GAGAGGGAATTGTTCTTCTTCCAGGTAGCCCTGCGAGAAGGTCTGTTCTTGTGGTTGTTG
TGACCCTTTCCACGAAGACCACGATTCTTCTTTCCCTCTGAGGTGAGCCCCCTGAGTTCT
CTGTGCTTGTGCACTGGGTTGCAGATCCAGTTGATCCTTGGGTCATTACGGACGGCATTG
TGTGCAGGGTCCACAAGTATGATCTAGTAATACTTGTAGGTAGAGTCCTCATTGAGCCAG
TAGGAGTTAACGACCCTGAGGCCACCAAGTTTGCGGCCAGCACGTTCCTCAGCAACAGAT
CTCTTACTGCGCTGGAATTTGAGCTGTGTCACTCCCTGGTTAGTGGGTTTACCATACACA
ATACCCTTGGGAACTGGCCTCTTGCGACCTCCACGTCTCACACGAACACGGTAGACAACA
AACCCCTGCTTGGCCTTGTAGCCGAGACGACGGGCCTTGTCGGGACGAGTAGGCCTGACG
AGACGGACAATGGAAGGTTGCTGTCTGTACTCCCAGCACCTGACCCTCTGCACAAACCTC
ATCACATCCGACTGCTTCTTCCTACATAGCTCAGACACATACTTGTACGCCCCCATTGCT
GATC

QA 1 724 1 724
DS 

RD RS1AE66JQ 637 0 0
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QA 1 637 1 637
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AS 1 7

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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 15 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 
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35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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A

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TCACACGGTTGTCTTTTTCAGGAACGTTGCTGCTTTCCCTCTTCC
C

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1EA23TF 750 0 0
AGAAGAGACAGCGTTCTTGCTGTGTCATGATGCGTTTCACACGGTTGTCTTTT*CAGGAA
CGTTGCTGCTTTCCCGCTTCCGGGACTTTTTGCTTGGAGCGTCTCTGTAGTCATTCTCAT
CATCAGCAGCTTGGTTAGATGTTTTGTACAGTTTGTTATGCATTATGCTTTTGGCTAGAT
GCATATCCGTGTCATCTTCTTCGTTCTTCCTCTTACCTGACATGTCTTTGATAGGATACC
TCGCTGCTCTGACGTAGTGTTGTTCTTTGGATGAATCGTCTCCAACGGCTTGCTTTGCTT
TCAGCCTCTCTGCTTCTTCCGTAAGTTTCTGGGCTTCTTCAAGTTTCCCTTTCAGACGGA
GCTGTAAGGCCTTAGCAGCTAGTTGGTTCACACTTAAAGATTCTATATTGGGAATAGTCC
CTTCACCACCATCTTTTTTGGTCTCCGAGTCGCTTCTGTGATCTTCACGAGGCTCTACTG
GTTCATTCTTCTGCTTAGAAAGCATTTGCTTCATGGAGCTTCCATCATTGGTGAACTTAT
TCAAGTGAGATGCAGCTTCAGATATCAGCTTCGAGTCTTCATGTCTATGAGTCTGACCCT
TTCTTTTCCCCCAGGATAACGAAGGATCAGTTTTAGGGGCTCTCAATGTACGATGACGAA
TTGAGTCATCCTTCAAGTAGTCCCGACCATTTCCCTTCTCAGACACTCTTTCTGACTTTT
TCTCTTTATCATTGTCTCCATTGTTCTCTC

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 8

CO CL487Contig1 1280 8 10 U
AAGAAGAACAAGTGATATCTCAATTGATAGAAGTTTAGATAAATGAAAAGCAAAAGAAAG
TAAACATAACATCGCAAGTCGCAACAGAAGAAACAGAAGAGCATAGATATGCATTTTTGG
TAACATCTCTCAGAAGAATGCAAAAGCTAATTAATCGGAGGAATTTAACAAGAAAAACAA
AGCTGAGATGAGATGAGTTTTCACTTGGTGTACAACACATCTTCCCATGGGTGACGGTAC
AATGGCTGCTTCAACCTCTTCTGATCAAATGTGTGCCCAATCAAACCGATGGAACGAGCA
AGAACAAAGAGACCGTTGAGGTAACCGATCTGAACAATCTCATCGATCTCTTGCTTAGTG
AACATCCCACTTCCAGCTAGAAGGTCCAAGAAGAGAGACCCAATGGCTCCGTCAACGTTG
AGTACAAGGTTGTTGGCCTTTGAGAGCGTGTAGCTCTCCACTGTTACTGAGTACTCCATG
TACTTCACTGATGGGAAGTTAGACCTAGCAAATTTCTGGAGCAGCTCCACTCTCTTGTCT
CTGTTGTCTCTGCTCTTGATCCTGTGTCCAATCCCAGGGACTCTGATTCCCTTCTTCTTC
ATTCCCTCAACGAACTCATAAGGTGTGAGGTTCCTGTCACAAGCGTCCTTGAAGTACCTA
GCAGCGTCATCAATGGCCACCGAATCTAGGGCCAATGGTTAATAAACCAGAGACAAGACT
TGAGACAAGGTCTTTGCCTGCTCTTGCTGTCACAATGGTGTTGTGAGCTCCCGAGACGCA
TGGACCATGATCAGCACACAGCATTATGCACATCTCAATGAATTTTGTACAGTAACGAGG
AAGGCTACGTTTGAACCATAGAAGGGAAATGACATCACCAACTCCTAAGCCTTGTTCGAT
GATGGAAGACATCGGAACACCAGCATAGCATGGTTCCTCCCCCCTATCATCAGAAATGGT
GGAGATGATGTGAGTAGGAGCTCGGACTTTCCCACTCTTGATTGCAGAACTGAGATCCTC
GGGGATCTGTGGAGGAGTGACTTCCTTTATTGGAGAGACCTTTCCTTCTTCAACTAGTTT
CTCAAAAGTCTCTTTGATTGCAGATTCGAGAGCTTCGAATGAAGTGGGAACAATGGCTCC
AGCATCCATAAGAGCTTGATTCTTGGCTTGTGCAGACTCCATCTCGCCACCACTTTTAGC
ACCCGCGTGACCAAACTGCACTTCAGACTTGAAGAGACGTGCACAAGTCCCACTGACCCA
AGCAACAACAGGTTTATTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CG49JQ U 242
AF RS1D303JQ U 1
AF RS1D303TF C 1
AF RS1FW30JQ U 17
AF RS1EQ19JQ U 17
AF RS1FW30TF C 154
AF RS1EQ19TF C 178
AF RS1CG49TF C 673
BS 1 132 RS1D303JQ
BS 133 133 RS1FW30JQ
BS 134 469 RS1D303JQ
BS 470 470 RS1EQ19JQ
BS 471 606 RS1D303JQ
BS 607 821 RS1EQ19JQ
BS 822 822 RS1FW30TF
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BS 872 1280 RS1CG49TF

RD RS1CG49JQ 157 0 0
ATGGCTGCTTCAACCTCTTCTGATCAAATGTGTGCCCAATCAAACCGATGGAACGAGCAA
GAACAAAAAAACCGTTGAGGTAACCCATCTGAACAATCTCATCGATCTCCTGCTTAGTGA
ACATCCCACTTCCAGCTAGAAGGTCCAAGAAGAGAGA

QA 1 157 1 157
DS 

RD RS1D303JQ 607 0 0
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AATGGCTGCTTCAACCTCTTCTGATCAAATGTGTGCCCAATCAAACCGATGGAACGAGCA
AGAACAAAGAGACCGTTGAGGTAACCGATCTGAACAATCTCATCGATCTCTTGCTTAGTG
AACATCCCACTTCCAGCTAGAAGGTCCAAGAAGAGAGACCCAATGGCTCCGTCAACGTTG
AGTACAAGGTTGTTGGCCTTTGAGAGCGTGTAGCTCTCCACTGTTACTGCGTACTCCATG
TACTTCACTGATGGGAAGTTAGACCTAGCAAATTTCTGGAGCAGCTCCACTCTCTTGTCT
CTGTTGTCTCTGCTCTTGATCCTGTGTCCAATCCCAGGGACTCTGATTCCCTTCTTCTTC
ATTCCC
C

QA 1 606 1 606
DS 

RD RS1D303TF 607 0 0
AAGAAGAACAAGTGATATCTCAATTGATAGAAGTTTAGATAAATGAAAAGCAAAAGAAAG
TAAACATAACATCGCAAGTCGCAACAGAAGAAACAGAAGAGCATAGATATGCATTTTTGG
TAACATCTCTCAGAAGAATGCAAAAGCTAATTAATCGGAGGAATTTAACAAGAAAAACAA
AGCTGAGATGAGATGAGTTTTCACTTGGTGTACAACACATCTTCCCATGGGTGACGGTAC
AATGGCTGCTTCAACCTCTTCTGATCAAATGTGTGCCCAATCAAACCGATGGAACGAGCA
AGAACAAAGAGACCGTTGAGGTAACCGATCTGAACAATCTCATCGATCTCTTGCTTAGTG
AACATCCCACTTCCAGCTAGAAGGTCCAAGAAGAGAGACCCAATGGCTCCGTCAACGTTG
AGTACAAGGTTGTTGGCCTTTGAGAGCGTGTAGCTCTCCACTGTTACTGCGTACTCCATG
TACTTCACTGATGGGAAGTTAGACCTAGCAAATTTCTGGAGCAGCTCCACTCTCTTGTCT
CTGTTGTCTCTGCTCTTGATCCTGTGTCCAATCCCAGGGACTCTGATTCCCTTCTTCTTC
ATTCCC
C

QA 1 606 1 606
DS 

RD RS1FW30JQ 709 0 0
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AGTCGCAACAAAAGAAACAGAAGAGCATAGATATGCATTTTTGGTAACATCTCTCAGAAG
AATGCAAAAGCTAATTAATCGGAGGAATTTAACAAGAAAAACAAAGCTGAGATGAGATGA
GTTTTCACTTGGTGTACAACACATCTTCCCATGGGTGACGGTACAATGGCTGCTTCAACC
TCTTCTGATCAAATGTGTGCCCAATCAAACCGATGGAACGAGCAAGAACAAAGAGACCGT
TGAGGTAACCGATCTGAACAATCTCATCGATCTCTTGCTTAGTGAACATCCCACTTCCAG
CTAGAAGGTCCAAGAAGAGAGACCCAATGGCTCCGTCAACGTTGAGTACAAGGTTGTTGG
CCTTTGAGAGCGTGTAGCTCTCCACTGTTACTGAGTACTCCATGTACTTCACTGATGGGA
AGTTAGACCTAGCAAATTTCTGGAGCAGCTCCACTCTCTTGTCTCTGTTGTCTCTGCTCT
TGATCCTGTGTCCAATCCCAGGGACTCTGATTCCCTTCTTCTTCATTCCCTCAACGAACT
CATAAGGTGTGAGGTTCCTGTCACAAGCGTCCTTGAAGTACCTAGCAGCGTCATCAATGG
CCACCGAATCTAGGGCCAATGGTTAATAAACCAGAGACAAGACTTGAGA

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1EQ19JQ 820 0 0
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AGTCGCAACAAAAGAAACAGAAGAGCATAGATATGCATTTTTGGTAACATCTCTCAAAAG
AATGCAAAAGCTAATTAATCGGAGGAATTTAACAAGAAAAACAAAGCTGAGATGAGATGA
GTTTTCACTTGGTGTACAACACATCTTCCCATGGGTGACGGTACAATGGCTGCTTCAACC
TCTTCTGATCAAATGTGTGCCCAATCAAACCGATGGAACGAGCAAGAACAAAGAGACCGT
TGAGGTAACCGATCTGAACAATCTCATCGATCTCTTGCTTAGTGAACATCCCACTTCCAG
CTAGAAGGTCCAAGAAGAAAGACCCAATGGCTCCGTCAACGTTGAGTACAAGGTTGTTGG
CCTTTGAGAGCGTGTAGCTCTCCACTGTTACTGAGTACTCCATGTACTTCACTGATGGGA
AGTTAGACCTAGCAAATTTCTGGAGCAGCTCCACTCTCTTGTCTCTGTTGTCTCTGCTCT
TGATCCTGTGTCCAATCCCAGGGACTCTGATTCCCTTCTTCTTCATTCCCTCAACGAACT
CATAAGGTGTGAGGTTCCTGTCACAAGCGTCCTTGAAGTACCTAGCAGCGTCATCAATGG
CCACCGAATCTAGGGCCAATGGTTAATAAACCAGAGACAAGACTTGAGACAAGGTCTTTG
CCTGCTCTTGCTGTCACAATGGTGTTGTGAGCTCCCGAGACGCATGGACCATGATCAGCA
CACAGCATTATGCACATCTCAATGA*TTTTGTACAGTA
CG

QA 1 818 1 818
DS 

RD RS1FW30TF 719 0 0
ATCGGAGGAATTTAACAAGAAAAACAAAGCTGAGATGAGATGAGTTTTCACTTGGTGTAC
AACACATCTTCCCATGGGTGACGGTACAATGGCTGCTTCAAC*TCTTCTGATCAAATGTG
TGCCCAATCAAACCGATGGAACGAGCAAGAACAAAGAGACCGTTGAGGTAACCGATCTGA
ACAATCTCATCGATCTCTTGCTTAGTGAACATCCCACTTCCAGCTAGAAGGTCCAAGAAG
AGAGACCCAATGGCTCCGTCAACGTTGAGTACAAGGTTGTTGGCCTTTGAGAGCGTGTAG
CTCTCCACTGTTACTGAGTACTCCATGTACTTCACTGATGGGAAGTTAGACCTAGCAAAT
TTCTGGAGCAGCTCCACTCTCTTGTCTCTGTTGTCTCTGCTCTTGATCCTGTGTCCAATC
CCAGGGACTCTGATTCCCTTCTTCTTCATTCCCTCAACGAACTCATAAGGTGTGAGGTTC
CTGTCACAAGCGTCCTTGAAGTACCTAGCAGCGTCATCAATGGCCACCGAATCTAGGGCC
AATGGTTAATAAACCAGAGACAAGACTTGAGACAAGGTCTTTGCCTGCTCTTGCTGTCAC
AATGGTGTTGTGAGCTCCCGAGACGCATGGACCATGATCAGCACACAGCATTATGCACAT
CTCAATGAATTTTGTACAGTAACGAGGAAGGCTACGTTTGAACCATAGAAGGGAAATG
C

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1EQ19TF 695 0 0
AC
AAGCTGAGATGAGATGAGTTT*CACTTGGTGTACAACACATCTTCCCATGGGTGACGGTA
CAATGGCTGCTTCAAC*TCTTCTGATCAAATGTGTGCCCAATCAAACCGATGGAACGAGC
AAGAACAAAGAGACCGTTGAGGTAACCGATCTGAACAATCTCATCGATCTCTTGCTTAGT
GAACATCCCACTTCCAGCTAGAAGGTCCAAGAAGAGAGACCCAATGGCTCCGTCAACGTT
GAGTACAAGGTTGTTGGCCTTTGAGAGCGTGTAGCTCTCCACTGTTACTGAGTACTCCAT
GTACTTCACTGATGGGAAGTTAGACCTAGCAAATTTCTGGAGCAGCTCCACTCTCTTGTC
TCTGTTGTCTCTGCTCTTGATCCTGTGTCCAATCCCAGGGACTCTGATTCCCTTCTTCTT
CATTCCCTCAACGAACTCATAAGGTGTGAGGTTCCTGTCACAAGCGTCCTTGAAGTACCT
AGCAGCGTCATCAATGGCCACCGAATCTAGGGCCAATGGTTAATAAACCAGAGACAAGAC
TTGAGACAAGGTCTTTGCCTGCTCTTGCTGTCACAATGGTGTTGTGAGCTCCCGAGACGC
ATGGACCATGATCAGCACACAGCATTATGCACATCTCAATGAATTTTGTACAGTAACGAG
GAAGGCTACGTTTGAACCATAGAAGGGAAATG
C

QA 3 694 3 694
DS 

RD RS1CG49TF 608 0 0
GGCA
CCACCGAATCTAGGGCCAATGGTTAATAAACCAGAGACAAGACTTGAGACAAGGTCTTTG
CCTACTCTTGCTGTCACAATGGTGTTGTGAGCTCCCGAGACGCATGGACCATGATCAGCA
CACAGCATTATGCACATCTCAATGAATTTTGTACAGTAACGAGGAAGGCTACGTTTGAAC
CATAGAAGGGAAATGACATCACCAACTCCTAAGCCTTGTTCGATGATGGAAGACATCGGA
ACACCAGCATAGCATGGTTCCTCCCCCCTATCATCAGAAATGGTGGAGATGATGTGAGTA
GGAGCTCGGACTTTCCCACTCTTGATTGCAGAACTGAGATCCTCGGGGATCTGTGGAGGA
GTGACTTCCTTTATTGGAGAGACCTTTCCTTCTTCAACTAGTTTCTCAAAAGTCTCTTTG
ATTGCAGATTCGAGAGCTTCGAATGAAGTGGGAACAATGGCTCCAGCATCCATAAGAGCT
TGATTCTTGGCTTGTGCAGACTCCATCTCGCCACCACTTTTAGCACCCGCGTGACCAAAC
TGCACTTCAGACTTGAAGAGACGTGCACAAGTCCCACTGACCCAAGCAACAACAGGTTTA
TTCC

QA 5 608 5 608
DS 



AS 1 9

CO CL488Contig1 894 9 13 U
TTTCGTTTGAAGGTTTATTTTATATGGGAAGACATCACATGTTCTTGTACCAAATATCAT
CAATATTAAGCTATTTTCAGTTCTAGTCTAATAATTGAACCATATAGACAACATCACATA
AACATAGCACAACACAAGCTCAAGCTTTGCAGGAACCAAGAACCTTCTTGGTATCTGTTG
ACTTAAGCGACCCTTTCCTTTGACTTGAAGTCTGAGTGAATACTAGTGGGTGACTTTGCG
GTCGGAGAAACAGAGCTGAATTTACGGACAAGGATTTTGAAACATGGTAGAAACAGGATG
TACAGTCCAACGACCACAAATGGGGTCGCTATGAGCCACCCTAGTAGCGCATTACCAATG
CTTAAAAAGACTTCTCTGGAAGCTTGGCCTGTGAAAACCTTCTTTAGAGCATCGGTCGTT
AGAGGAAAATGAGGTCCACCGGTTAGTTTTTCGCCAAGACGTAAGAAAGGCACCATAAGA
CTTAGTTCAATAGGAGTGGCAAGGAAGTTAAACAACATGACAGTTGGAGCATGACAAAGA
GATCCAAGCGAGGCAATAGCTACTCCACACAGCAACACCGTAACACCACAGATTGGAAAT
ACTCCCATGGTAACGCCCAATGCAGCAGAGAAAGCCAGCTGCTTTGGCTCAGCACCTCTG
CGCAGGATCTGGACAAGAGGTTCGGTGATTTTCTTTTCGAACCAAACTTTCAATCTAACT
TT*GGAGATCGCCATCACGATTACTCTTCGGATAAAGATTTGATAATGTTCTCTCAGTTA
AGTAAAACCTGAACAAACTCTAATGTCCCAAATCCGCTTTCCTTGTATAACCTGTGTGCC
TCCACCGCTTACACGCAACCACCAGTCTTTGGTTTCTTATTTGCCTTCGTTCAC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
20 50 50 50 25 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1G562JQ U 69
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AF RS1AR15TFB C 6
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AF RS1BB22TF C 65
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GCCCAATGC

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CC

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TTCG
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TTAAGCTATTTTCAGTTCTAGTCTAATAATTGAACCATATAGACAACATCACATAAACAT
AGCACAACACAAGCTCAAGCTTTGCAGGAACCAAGAACCTTCTTGGTATCTGTTGACTTA
AGCGACCCTTTCCTTTGACTTGAAGTCTGAGTGAATACTAGTGGGTGACTTTGCGGTCGG
AGAAACAGAGCTGAATTTACGGACAAGGATTTTGAACCATGGTAGAAACAGGATGTACAG
TCCAACGACCACAAATGGGGTCGCTATGAGCCACCCTAGTAGCGCATTACCAATGCTTAA
AAAGACTTCTCTGGAAGCTTGGCCTGTGAAAACCTTCTTTAGAGCATCGGTCGTTAGAGG
AAAATGAGGTCCACCGGTTAGTTTTTCGCCAAGACGTAAGAAAGGCACCATAAGACTTAG
TTCAATAGGAGTGGCAAGGAAGTTAAACAACATGACAGTTGGAGCATGACAAAGAGATCC
AAGCGAGGCAATAGCTACTCCACACAGCAACACCGTAACACCACAGATTGGAAATACTCC
CATGGTAACGCCCAATGCAGCAGAGAAAGCCAGCTGCTTTGGCTCAGCACCT**GCGCAG
GATCTGGACAAGAGGTTCGGTGATTTTCTTATCGAACCAAACTTTCAATCTAACTTT*GG
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AACCTGAACAA
CTCTTAATGTCTCAAATCC

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AAGCGACCCTTTCCTTTGACTTGAAGTCTGAGTGAATACTAGTGGGTGACTTTGCGGTCG
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GTCCAACGACCACAAATGGGGTCGCTATGAGCCACCCTAGTAGCGCATTACCAATGCTTA
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AAACCTGAACAACTCTTAATGTCTCAAATCCGCTTTCCTT
CC

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DS 

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CTTAGTTCAATAGGAGTAGCAAGGAAGTTAAACAACATGACAGTTGGAGCATGACAAAGA
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TCCACC
CC

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DS 

RD RS1BD11TF 789 0 0
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TTTCAGTTCTAGTCTAATAATTGAACCATATAGACAACATCACATAAACATAGCACAACA
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GCTGAATTTACGGACAAGGATTTTGAAACATGGTAGAAACAGGATGTACAGTCCAACGAC
CACAAATGGGGTCGCTATGGGCCACCCTAGTAGCGCATTACCAATGCTTAAAAAGACTTC
TCTGGAAGCTTGGCCTGTGAAAACCTTCTTTAGAGCATCGGTCGTTAGAGGAAAATGAGG
TCCACCGGTTAGTTTTTCGCCAAGACGTAAGAAAGGCACCATAAGACTTAGTTCAATAGG
AGTGGCAAGGAAGTTAAACAACATGACAGTTGGAGCATGACAAAGAGATCCAAGCGAGGC
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CC

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CTTGGTATCTGTTGACTTCAGCGACCCTTTCCTTTGACTTGAAGTCTGAGTGAATACTAG
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GTAGAAACAGGATGTACAGTCCAACGACCACAAATGGGGTCGCTATGAGCCACCCTAGTA
GCGCATTACCAATGCTTAAAAAGACTTCTCTGGAAGCTTGGCCTGTGAAAACCTTCTTTA
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TCGTTCAC

QA 1 848 1 848
DS 



AS 1 7

CO CL489Contig1 997 7 17 U
GGGCTGTGTAGTCTTATAGATCTGTAGTAGTTCTAACGCGACATCCCGTAAAATCCTCCG
TTCGATCGGATCGAGTCGAATCGAGGATCTAGAAGGGGTTCGAAAAGATGTCGCAACAGT
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AAGGCAACTTCACAACCATCGCCGCACAGTGCCTCCAGAAACTCCCCTCTTCCAACAACA
AGTTCACCTACAACTGCGACGGTCACACCTTCAACTACCTCGTCGAAGATGGCTTCACCT
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GCTTGAATAAAGAGTTCGGCTCTAAGCTGAAAGAGCACATGCAGTATTGTATGGATCATC
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TAAGAGATCTAAAACTATTAAATGATTTTGTCGACTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
15 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BU60TF U 6
AF RS1BR25TF U 1
AF RS1DF62TF U 14
AF RS1GV09TF U 16
AF RS1GV09JQ C 116
AF RS1DH63TF U 369
AF RS1DF62JQ C 633
BS 1 537 RS1BR25TF
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BS 539 623 RS1BR25TF
BS 624 624 RS1DF62TF
BS 625 645 RS1BR25TF
BS 646 646 RS1DF62TF
BS 647 660 RS1BR25TF
BS 661 661 RS1GV09TF
BS 662 688 RS1BR25TF
BS 689 689 RS1DF62TF
BS 690 695 RS1BR25TF
BS 696 696 RS1DF62TF
BS 697 763 RS1BR25TF
BS 764 772 RS1DF62TF
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BS 774 782 RS1GV09TF
BS 783 997 RS1DH63TF

RD RS1BU60TF 615 0 0
GG
GTAGTCTTATAGATCTGTAGTAGTTCTAACGCGACATCCCGTAAAATCCTCCGTTCGATC
GGATCGAGTCGAATCGAGGATCTAGAAGGGGTTCGAAAAGATGTCGCAACAGTCGCTGAT
CTACAGCTTCGTGGCACGCGGGACGGTGATCCTCGTGGAGTTCACAGATTTCAAAGGCAA
CTTCACAACCATCGCCGCACAGTGCCTCCAGAAACTCCCCTCTTCCAACAACAAGTTCAC
CTACAACTGCGACGGTCACACCTTCAACTACCTCGTCGAAGATGGCTTCACCTACTGTGT
TGTTGCTGTTGAATCTGCTGGGAGGCAGATCCCGATGGCCTTTTTGGAAAGAGTAAAGTA
GGATTTTAACAAGAGATATGGTGGTGGAAAGGCTGCAACTGCTCAAGCTAACAGCTTGAA
TAAAGAGTTCGGCTCTAAGCTGAAAGAGCACATGCAGTATTGTATGGATCATCCTGATGA
GATTAGCAAGCTTGCTAAGGTTAAGGCGCAAGTGTCTGAGGTTAAGGGTGTTATGATGGA
GAACATCGAGAAGGTTCTTGACCGTGGTGAGAAAATTGAGCTTCTTGTGGACAAAACTGA
GAACCTTCGCTCA

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DS 

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TTCGATCGGATCGAGTCGAATCGAGGATCTAGAAGGGGTTCGAAAAGATGTCGCAACAGT
CGCTGATCTACAGCTTCGTGGCACGCGGGACGGTGATCCTCGTGGAGTTCACAGATTTCA
AAGGCAACTTCACAACCATCGCCGCACAGTGCCTCCAGAAACTCCCCTCTTCCAACAACA
AGTTCACCTACAACTGCGACGGTCACACCTTCAACTACCTCGTCGAAGATGGCTTCACCT
ACTGTGTTGTTGCTGTTGAATCTGCTGGGAGGCAGATCCCGATGGCCTTTTTGGAAAGAG
TAAAGGAGGATTTTAACAAGAGATATGGTGGTGGAAAGGCTGCAACTGCTCAAGCTAACA
GCTTGAATAAAGAGTTCGGCTCTAAGCTGAAAGAGCACATGCAGTATTGTATGGATCATC
CTGATGAGATTAGCAAGCTTGCTAAGGTTAAGGCGCAAGTGTCTGAGGTTAAGGGTGCTA
TGATGGAGAACATCGAGAAGGTTCTTGACCGTGGTGAGAAAATTGAGCTTCTTGTGGACA
AAACTGAGAACCTTCGCTCACAG*CACAAGACTTCAGAACAACAG*AACTCAGATGAGAA
AGAAGATGTGGCTTCAGAACATGAAGAT*AAACTCGTAGTTCTCGCCATCATCATCGCAC
TGATTCTCATAATCGTGCTCTCAGTCTGCCATGGCTTCAAGTG

QA 1 763 1 763
DS 

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GGAT
AGATCTGTAGTAGTTCTAACGCGACATCCCGTAAAATCCTCCGTTCGATCGGATCGAGTC
GAATCGAGGATCTAGAAGGGGTTCGAAAAGATGTCGCAACAGTCGCTGATCTACAGCTTC
GTGGCACGCGGGACGGTGATCCTCGTGGAGTTCACAGATTTCAAAGGCAACTTCACAACC
ATCGCCGCACAGTGCCTCCAGAAACTCCCCTCTTCCAACAACAAGTTCACCTACAACTGC
GGCGGTCACACCTTCAACTACCTCGTCGAAGATGGCTTCACCTACTGTGTTGTTGCTGTT
GAATCCGCTGGGAGGCAGATCCCGATGGCCTTTTTGGAAAGAGTAAAGGAGGATTTTAAC
AAGAGATATGGTGGTGGAAAGGCTGCAACTGCTCAAGCTAACAGCTTGAATAAAGAGTTC
GGCTCTAAGCTGAAAGAGCACATGCAGTATTGTATGGATCATCCTGATGAGATTAGCAAG
CTTGCTAAGGTTAAGGCGCAAGTGTCTGAGGTTAAGGGTGTTATGATGGAGAACATCGAG
AAGGTTCTTGACCGTGGTGAGAAAATTGAGCTTCTTGTGGACAAAACTGAGAACCTTCGC
TCACAGGCACAAGACTTCAGAACAACAGGAACTCAGATGAGAAAGAAGATGTGGCTTCAG
AGCATGAAGATTAAACTCATAGTTCTCGCCATCATCATCGCACTGATTCTCATAATCGTG
CTCTCAGTCTGC*ATGGCTTCAAGTGCTAAAAGCC
AGGA

QA 5 759 5 759
DS 

RD RS1GV09TF 767 0 0
GG
AGATCTGTAGTAGTTCTAACGCGACATCCCGTAAAATCCTCCGTTCGATCGGATCGAGTC
GAATCGAGGATCTAGAAGGGGTTCGAAAAGATGTCGCAACAGTCGCTGATCTACAGCTTC
GTGGCACGCGGGACGGTGATCCTCGTGGAGTTCACAGATTTCAAAGGCAACTTCACAACC
ATCGCCGCACAGTGCCTCCAGAAACTCCCCTCTTCCAACAACAAGTTCACCTACAACTGC
GACGGTCACACCTTCAACTACCTCGTCGAAGATGGTTTCACCTACTGTGTTGTTGCTGTT
GAATCTGCTGGGAGGCAGATCCCGATGGCCTTTTTGGAAAGAGTAAAGGAGGATTTTAAC
AAGAGATATGGTGGTGGAAAGGCTGCAACTGCTCAAGCTAACAGCTTGAATAAAGAGTTC
GGCTCTAAGCTGAAAGAGCACATGCAGTATTGTATGGATCATCCTGATGAGATTAGCAAG
CTTGCTAAGGTTAAGGCGCAAGTGTCTGAGGTTAAGGGTGTTATGATGGAGAACATCGAG
AAGGTTCTTGACCGTGGTGAGAAAATTGAGCTTCTTGTGGACAAAACTGAGAACCTTCGC
TCACAGGCACAAGACTTCAGAACAACAGGAACTCAGATGAGAAGGA*GATGTGGCTTCAG
AACATGAAGATTAAACTCATAGTTCTCGCCATCATCATCGCACTGATTCTCATAATCGTG
CTCTCAGTCTGC*ATGGCTTCA*GTGCTAAAAGCC*AGGAAAAAA

QA 3 767 3 767
DS 

RD RS1GV09JQ 831 0 0
ACAGTCGCTGATCTACAGCTTCGTGGCACGCGGGACGGTGATCCTCGTGGAGTTCACAGA
TTTCAAAGGCAACTTCACAACCATCGCCGCACAGTGCCTCCAGAAACTCCCCTCTTCCAA
CAACAAGTTCACCTACAACTGCGACGGTCACACCTTCAACTACCTCGTCGAAGATGGTTT
CACCTACTGTGTTGTTGCTGTTGAATCTGCTGGGAGGCAGATCCCGATGGCCTTTTTGGA
AAGAGTAAAGGAGGATTTTAACAAGAGATATGGTGGTGGAAAGGCTGCAACTGCTCAAGC
TAACAGCTTGAATAAAGAGTTCGGCTCTAAGCTGAAAGAGCACATGCAGTATTGTATGGA
TCATCCTGATGAGATTAGCAAGCTTGCTAAGGTTAAGGCGCAAGTGTCTGAGGTTAAGGG
TGTTATGATGGAGAACATCGAGAAGGTTCTTGACCGTGGTGAGAAAATTGAGCTTCTTGT
GGACAAAACTGAGAACCTTCGCTCACAGGCACAAGACTTCAGAACAACAGGAACTCAGAT
GAGAAGGAAGATGTGGCTTCAGAACATGAAGATTAAACTCATAGTTCTCGCCATCATCAT
CGCACTGATTCTCATAATCGTGCTCTCAGTCTGCCATGGCTTCAAGTGCTAAAAGCCCAG
GAAAAAAATTCAAAACTCTCTTGAGATCTTTCTCACTCGGTACATCGTGTACTTGCCCTT
TTTCCCTTTATTGTCCTATCATCAGCATTCTAATGTTTCTGCTTGAATTGGTTTTTGTAT
AGATAGACATATATGTAAGCTTCACGTTTGCTATATTACTTGTTGCACC
CG

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DS 

RD RS1DH63TF 629 0 0
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AAAGAGTTCGGCTCTAAGCTGAAAGAGCACATGCAGTATTGTATGGATCATCCTGATGAG
ATTAGCAAGCTTGCTAAGGTTAAGGCGCAAGTGTCTGAGGTTAAGGGTGTTATGATGGAG
AACATCGAGAAGGTTCTTGACCGTGGTGAGAAAATTGAGCTTCTTGTGGACAAAACTGAG
AACCTTTGCTCACAGGCACAATACTTCAGAACAACAGGAACTCAGATGAGAAGGAAGATG
TGGCTTCAGAACATGAAGATTAAACTCATAGTTCTCGCCATCATCATCGCACTGATTCTC
ATAATCGTGCTCTCAGTCTGCCATGGCTTCAAGTGCTAAAAGCCCAGGAAAAAAATTCAA
AACTCTCTTGAGATCTTTCTCACTCGGTACATCGTGTACTTGCCCTTTTTCCCTTTATTG
TCCTATCATCAGCATTCTAATGTTTCTGCTTGAATTGGTTTTTGTATAGATAGACATATA
TGTAAGCTTCACGTTTGCTATATTACTTGTTGCACCTGATGACGTTGATCCCTAAGAGAT
CTAAAACTATTAAATGATTTTGTCGACTA

QA 1 629 1 629
DS 

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TTCAGAACAACAGGAACTCAGATGAGAAGGAAGATGTGGCTTCAGAGCATGAAGATTAAA
CTCATAGTTCTCGCCATCATCATCGCACTGATTCTCATAATCGTGCTCTCAGTCTGCCAT
GGCTTCAAGTGCTAAAAGCCCAGGAAAAAAATTCAAAACTCTCTTGAGATCTTTCTCACT
CGGTACATCGTGTACTTGCCCTTTTTCCCTTTATTGTCCTATCATCAGCATTCTAATGTT
TCTGCTTGAATTGGTTTTTGTATAGATAGACATATATGTAAGCTTCACGTTTGCTATATT
ACTTGTTGCACCTGATGACGTTGATCCCTA

QA 1 330 1 330
DS 



AS 2 8

CO CL490Contig1 699 4 3 U
TTTTTCTCTATCCGAATCGTTGATCTCTTTGACAACAACATCAACAGAGAAACGTCGCAA
CCAGCACAGAGATAGGAGCCAATCGCAAATCCTTCCTCCCGATTTTGGTGGGCGTTGAGG
AGACATCATCAGAAATGTCAAGCGTAGAGGATGTGAAAGAGCAAGGGAACCTCACCAATG
ACGCAGATAATTCAATGCCATCATCACAGCAAGAGGAGGCTGCTGTAAAGAACAAGTATG
GAGGACTCATGCCAAAGAAACCACCTCTCATTTCCAAGGATCATGAACGAGCATACTTTG
ACTCAGCTGATTGGGCTCTTGGAAAGCAAGGTGTTGCTAAGCCAAAGGGACCCTTAGAAG
CTCTTCGTCCCAAGTTACAGCCAACGCAGCAGCAGACGCGTTACAGGAAGTCTCCATGTG
CTCCATCCGGTGAAGATGGAGGAGCTGCTCAGGGCGAATGAGTTTAGAGACCAGAGAGAG
AGAGAGAGAGAGAGAGAG**GGGGGGAGAGATGTGAAAACTCTGGTGTAATAACTTTGTT
ATAATCGGATATTGTCTGTCCATTTGAAACAACAGATACGTTTTTCAATAAATCTTAACT
CTGATCGCATAGAGTCTCCAAGGTGAAAACATTGTTATAGTTTAGCCTCTGTATGGAATC
TCCGAGTATAACTTTTTAAGTTTATGAGAACCTTCCGTC


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B485TF U 6
AF RS1DT91TF U 1
AF RS1B485JQ C 6
AF RS1DT91JQ C 1
BS 1 5 RS1DT91JQ
BS 6 619 RS1DT91TF
BS 620 699 RS1DT91JQ

RD RS1B485TF 443 0 0
CTCTATCCGAATCGTTGATCTCTTTGACAACAACATCAACAGAGAAACGTCGCAACCAGC
ACAGAGATAGGAGCCAATCGCAAATCCTTCCTCCTGATTTTGGTGGGCGTTGAGGAGACA
TCATCAGAAATGTCAAGCGTAGAGGATGTGAAAGAGCAAGGTAACCTCACCAATGACGCA
GATAATTCAATGCCATCATCACAGCAAGAGGAGGCTGCTGTAAAGAACAAGTATGGAGGA
CTCATGCCAAAGAAACCACCTCTCATTTCCAAGGATCATGAACGAGCATACTTTGACTCA
GCTGATTGGGCTCTTGGAAAGCAAGGTGTTGCTAAGCCAAAGGGACCCTTAGAAGCTCTT
CGTCCCAAGTTACAGCCAACGCAGCAGCAGACGCGTTACAGGAAGTCTCCATGTGCTCCA
TCCGGTGAAGATGGAGGAGCTGC

QA 1 443 1 443
DS 

RD RS1DT91TF 619 0 0
TTTTT
CTCTATCCGAATCGTTGATCTCTTTGACAACAACATCAACAGAGAAACGTCGCAACCAGC
ACAGAGATAGGAGCCAATCGCAAATCCTTCCTCCCGATTTTGGTGGGCGTTGAGGAGACA
TCATCAGAAATGTCAAGCGTAGAGGATGTGAAAGAGCAAGGGAACCTCACCAATGACGCA
GATAATTCAATGCCATCATCACAGCAAGAGGAGGCTGCTGTAAAGAACAAGTATGGAGGA
CTCATGCCAAAGAAACCACCTCTCATTTCCAAGGATCATGAACGAGCATACTTTGACTCA
GCTGATTGGGCTCTTGGAAAGCAAGGTGTTGCTAAGCCAAAGGGACCCTTAGAAGCTCTT
CGTCCCAAGTTACAGCCAACGCAGCAGCAGACGCGTTACAGGAAGTCTCCATGTGCTCCA
TCCGGTGAAGATGGAGGAGCTGCTCAGGGCGAATGAGTTTAGAGACCAGAGAGAGAGAGA
GAGAGAGAGAGAG**GGGGGGAGAGATGTGAAAACTCTGGTGTAATAACTTTGTTATAAT
CGGATATTGTCTGTCCATTTGAAACAACAGATACGTTTTTCAATAAATCTTAACTCTGAT
CGCATAGAGTCTCC

QA 6 619 6 619
DS 

RD RS1B485JQ 603 0 0
CTCTATCCGAATCGTTGATCTCTTTGACAACAACATCAACAGAGAAACGTCGCAACCAGC
ACAGAGATAGGAGCCAATCGCAAATCCTTCCTCCTGATTTTGGTGGGCGTTGAGGAGACA
TCATCAGAAATGTCAAGCGTAGAGGATGTGAAAGAGCAAGGTAACCTCACCAATGACGCA
GATAATTCAATGCCATCATCACAGCAAGAGGAGGCTGCTGTAAAGAACAAGTATGGAGGA
CTCATGCCAAAGAAACCACCTCTCATTTCCAAGGATCATGAACGAGCATACTTTGACTCA
GCTGATTGGGCTCTTGGAAAGCAAGGTGTTGCTAAGCCAAAGGGACCCTTAGAAGCTCTT
CGTCCCAAGTTACAGCCAACGCAGCAGCAGACGCGTTACAGGAAGTCTCCATGTGCTCCA
TCCGGTGAAGATGGAGGAGCTGCTCAGGGCGAATGAGTTTAGAGACCAGAGAGAGAGAGA
GAGAGAGAGAGAGAGGGGGGGAGAGATGTGAAAACTCTGGTGTAATAACTTTGTTATAAT
CGGATATTGTCTGTCCATTTGAAACAACAGATACGTTTTTCAATAAATCTTAACTCTGAT
CGC

QA 1 603 1 603
DS 

RD RS1DT91JQ 699 0 0
TTTTTCTCTATCCGAATCGTTGATCTCTTTGACAACAACATCAACAGAGAAACGTCGCAA
CCAGCACAGAGATAGGAGCCAATCGCAAATCCTTCCTCCCGATTTTGGTGGGCGTTGAGG
AGACATCATCAGAAATGTCAAGCGTAGAGGATGTGAAAGAGCAAGGGAACCTCACCAATG
ACGCAGATAATTCAATGCCATCATCACAGCAAGAGGAGGCTGCTGTAAAGAACAAGTATG
GAGGACTCATGCCAAAGAAACCACCTCTCATTTCCAAGGATCATGAACGAGCATACTTTG
ACTCAGCTGATTGGGCTCTTGGAAAGCAAGGTGTTGCTAAGCCAAAGGGACCCTTAGAAG
CTTTTCGTCCCAAGTTACAGCCAACGCAGCAGCAGACGCGTTACAGGAAGTCTCCATGTG
CTCCATCCGGTGAAGATGGAGGAGCTGCTCAGGGCGAATGAGTTTAGAGACCAGAGAGAG
AGAGAGAGAGAGAGAGAG**GGGGGGAGAGATGTGAAAACTCTGGTGTAATAACTTTGTT
ATAATCGGATATTGTCTGTCCATTTGAAACAACAGATACGTTTTTCAATAAATCTTAACT
CTGATCGCATAGAGTCTCCAAGGTGAAAACATTGTTATAGTTTAGCCTCTGTATGGAATC
TCCGAGTATAACTTTTTAAGTTTATGAGAACCTTCCGTC

QA 1 699 1 699
DS 



CO CL490Contig2 586 4 5 U
GAACAACATCAACAGAGAAACGTCGCAACCAGCACAGAGATAGGAGCCAATCGCAAATCC
TTCCTCCTGATTTTGGTGGGCGTTGAGGAGACATCATCAGAAATGTCAAGCGTAGAGGAT
GTGAAAGAGCAAGGGAACCTCACCAATGACGCAGATAATTCAATGCCATCATCACAGCAA
GAGGAGGCTGCTGTAAAGAACAAGTATGGAGGACTCATGCCAAAGAAACCACCTCTCATT
TCCAAGGATCATGAACGAGCATACTTTGACTCAGCTGATTGGGCTCTTGGAAAGCAAGGT
GTTGCTAAGCCAAAGGGACCCTTAGAAGCTCTTCGTCCCAAGTTACAGCCAACGCAGCAG
CAGACGCGTTACAGGAAGTCTCCATGTGCTCCATCCGGTGAAGATGGAGGAGCTGCTCAG
GGCGAATGAGTTCAGAGACCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGG
GGGGAGAGATGTGAAAACTCTGGTGTAATAACTTTGTTATAATCGGATATTGTCTGTCCA
TTTGAAACAACAGATACGTTTTTCAATAAATCTTAACTCTGATCGC


BQ
10 10 10 10 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 

AF RS1DW83TF U 1
AF RS1GJ37TF U 3
AF RS1F666TF U 6
AF RS1DW83JQ C 88
BS 1 6 RS1DW83TF
BS 7 7 RS1GJ37TF
BS 8 534 RS1DW83TF
BS 535 585 RS1GJ37TF
BS 586 586 RS1F666TF

RD RS1DW83TF 534 0 0
GAACAATATCAACAGAGAAACGTCGCAACCAGCACAGAGATAGGAGCCAATCGCAAATCC
TTCCTCCTGATTTTGGTGGGCGTTGAGGAGACATCATCAGAAATGTCAAGCGTAGAGGAT
GTGAAAGAGCAAGGGAACCTCACCAATGACGCAGATAATTCAATGCCATCATCACAGCAA
GAGGAGGCTGCTGTAAAGAACAAGTATGGAGGACTCATGCCAAAGAAACCACCTCTCATT
TCCAAGGATCATGAACGAGCATACTTTGACTCAGCTGATTGGGCTCTTGGAAAGCAAGGT
GTTGCTAAGCCAAAGGGACCCTTAGAAGCTCTTCGTCCCAAGTTACAGCCAACGCAGCAG
CAGACGCGTTACAGGAAGTCTCCATGTGCTCCATCCGGTGAAGATGGAGGAGCTGCTCAG
GGCGAATGAGTTCAGAGACCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGG
GGGGAGAGATGTGAAAACTCTGGTGTAATAACTTTGTTATAATCGGATATTGTC

QA 1 534 1 534
DS 

RD RS1GJ37TF 584 0 0
GG
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TCCTGATTTTGGTGGGCGTTGAGGAGACATCATCAGAAATGTCAAGCGTAGAGGATGTGA
AAGAGCAAGGGAACCTCACCAATGACGCAGATAATTCAATGCCATCATCACAGCAAGAGG
AGGCTGCTGTAAAGAACAAGTATGGAGGACTCATGCCAAAGAAACCACCTCTCATTTCCA
AGGATCATGAACGAGCATACTTTGACTCAGCTGATTGGGCTCTTGGAAAGCAAGGTGTTG
CTAAGCCAAAGGGACCCTTAGAAGCTCTTCGTCCCAAGTTACAGCCAACGCAGCAGCAGA
CGCGTTACAGGAAGTCTCCATGTGCTCCATCCGGTGAAGATGGAGGAGCTGCTCAGGGCG
AATGAGTTTAGAGACCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGGGGG
AGAGATGTGAAAACTCTGGTGTAATAACTTTGTTATAATCGGATATTGTCTGTCCATTTG
AAACAACAGATACGTTTTTCAATAAATCTTAACTCTGATCG
G

QA 3 583 3 583
DS 

RD RS1F666TF 581 0 0
GG
ATCAACAGAGAAACGTCGCAACCAGCACAGAGATAGGAGCCAATCGCAAATCCTTCCTCC
TGATTTTGGTGGGCGTTGAGGAGACATCATCAGAAATGTCAAGCGTAGAGGATGTGAAAG
AGCAAGGGAACCTCACCAATGACGCAGATAATTCAATGCCATCATCACAGCAAGAGGAGG
CTGCTGTAAAGAACAAGTATGGAGGACTCATGCCAAAGAAACCACCTCTCATTTCCAAGG
ATCATGAACGAGCATACTTTGACTCAGCTGATTGGGCTCTTGGAAAGCAAGGTGTTGCTA
AGCCAAAGGGACCCTTAGAAGCTCTTCGTCCCAAGTTACAGCCAACGCAGCAGCAGACGC
GTTACAGGAAGTCTCCATGTGCTCCATCCGGTGAAGATGGAGGAGCTGCTCAGGGCGAAT
GAGTTTAGAGACCAGAGAGAGAGAGAGATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG**GGGGGGAGA
GATGTGAAAACTCTGGTGTAATAACTTTGTTATAATCGGATATTGTCTGTCCATTTGAAA
CAACAGATACGTTTTTCAATAAATCTTAACTCTGATCGC

QA 3 581 3 581
DS 

RD RS1DW83JQ 499 0 0
GAGACATCATCAGAAATGTCAAGCGTAGAGGATGTGAAAGAGCAAGGGAACCTCACCAAT
GACGCAGATAATTCAATGCCATCATCACAGCAAGAGGAGGCTGCTGTAAAGAACAAGTAT
GGAGGACTCATGCCAAAGAAACCACCTCTCATTTCCAAGGATCATGAACGAGCATACTTT
GACTCAGCTGATTGGGCTCTTGGAAAGCAAGGTGTTGCTAAGCCAAAGGGACCCTTAGAA
GCTTTTCGTCCCAAGTTACAGCCAACGCAGCAGCAGACGCGTTACAGGAAGTCTCCATGT
GCTCCATCCGGTGAAGATGGAGGAGCTGCTCAGGGCGAATGAGTTCAGAGACCAGAGAGA
GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGGGGGAGAGATGTGAAAACTCTGGTGTA
ATAACTTTGTTATAATCGGATATTGTCTGTCCATTTGAAACAACAGATACGTTTTTCAAT
AAATCTTAACTCTGATCGC

QA 1 499 1 499
DS 



AS 3 9

CO CL491Contig1 828 4 15 U
GGACCCATTTCTTGGCTCACAACAGCAACTAATAAACGTTTTTACTTTTACGCAAACCGC
AATGGCCGCCTCAACAATGGCTCTCTCATCCCCTGCTTTTGCCGGAAAGGCCGTCAAGAT
TTCTCCGGCGGCGTCAGAAGTCCTCGGAAGCGGCCGTGTGACAATGAGGAAGACCGTAGC
CAAGCCAAAGGGCCCATCAGGCAGCCCATGGTACGGGTCCGAAAGAGTCAAGTACTTGGG
TCCATTCTCTGGCGAGCCACCAAGCTACCTTACCGGAGAGTTCCCAGGTGACTACGGATG
GGACACCGCTGGTCTCTCCGCTGATCCCGAGACATTTGCAAGGAACCGTGAGCTAGAAGT
TATCCACTGCAGGTGGGCCATGCTCGGAGCCCTAGGCTGCGTCTTCCCGGAGTTGTTGGC
CAGGAACGGAGTCAAGTTCGGAGAGGCGGTTTGGTTCAAGGCCGGTTCACAGATCTTCAG
CGAAGGAGGACTTGATTACTTGGGAAACCCAAGCTTGGTTCACGCTCAGAGCATTTTGGC
GATATGGGCTACTCAAGTGATCTTGATGGGAGCCGTTGAAGGTTACAGAGTTGCAGGAGA
TGGGCCGCTGGGAGAGGCTGAGGACTTGCTTTACCCAGGAGGTAGTTTCGACCCATTGGG
CCTAGCTACAGACCCAGAGGCCTTCGCTGAGTTGAAGGTGAAGAAGATCAAAAACGGAAG
ATTGGCTATGTTCTCTATGTCTGGATTCTTCGTTCAAGCCATTGTCACTGGTAAGGGACC
GTTGGAAAACCTTGCTGACCATTTGGCCGATCCAGTCAACAACAACGC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E432TF U 1
AF RS1GG78TF U 1
AF RS1H518TF U 1
AF RS1AH73TF U 1
BS 1 99 RS1AH73TF
BS 100 100 RS1E432TF
BS 101 285 RS1AH73TF
BS 286 286 RS1E432TF
BS 287 321 RS1AH73TF
BS 322 322 RS1E432TF
BS 323 481 RS1AH73TF
BS 482 482 RS1E432TF
BS 483 594 RS1AH73TF
BS 595 595 RS1GG78TF
BS 596 711 RS1AH73TF
BS 712 712 RS1H518TF
BS 713 740 RS1AH73TF
BS 741 741 RS1H518TF
BS 742 828 RS1AH73TF

RD RS1E432TF 501 0 0
GGACCCATTTCTTGGCTCACAACAGCAACTAATAAACGTTTTTACTTTTACGCAAACCGC
AATGGCCGCCTCAACAATGGCTCTCTCATCCCCTGCTTTTGCCGGAAAGGCCGTCAAGAT
TTCTCCGGCGGCGTCAGAAGTCCTCGGAAGCGGCCGTGTGACAATGAGGAAGACCGTAGC
CAAGCCAAAGGGCCCATCAGGCAGCCCATGGTACGGGTCCGAAAGAGTCAAGTACTTGGG
TCCATTCTCTGGCGAGCCACCAAGCTACCTTACCGGAGAGTTCCCAGGTGACTACGGATG
GGACACTGCTGGTCTCTCCGCTGATCCCGAGACATTTGCAAGGAACCGTGAGCTAGAAGT
TATCCACTGCAGGTGGGCCATGCTCGGAGCCCTAGGCTGCGTCTTCCCGGAGTTGTTGGC
CAGGAACGGAGTCAAGTTCGGAGAGGCGGTTTGGTTCAAGGCCGGTTCACAGATCTTCAG
CGAAGGAGGACTTGATTACTT

QA 1 501 1 501
DS 

RD RS1GG78TF 682 0 0
GGACCCATTTCTTGGCTCACAACAGCAACTAATAAACGTTTTTACTTTTACGCAAACCGC
AATGGCCGCCTCAACAATGGCTCTCTCATCCCCTGCTTTTGCCGGAAAGGCCGTCAAGAT
TTCTCCGGCGGCGTCAGAAGTCCTCGGAAGCGGCCGTGTGACAATGAGGAAGACCGTAGC
CAAGCCAAAGGGCCCATCAGGCAGCCCATGGTACGGGTCCGAAAGAGTCAAGTACTTGGG
TCCATTCTCTGGCGAGCCACCAAGCTACCTTACCGGAGAGTTCCCAGGTGACTACGGATG
GGACACTGCTGGTCTCTCCGCTGATCCCGAGACATTTGCAAGGAACCGTGAGCTAGAAGT
TATCCACTGCAGGTGGGCCATGCTCGGAGCCCTAGGCTGCGTCTTCCCGGAGTTGTTGGC
CAGGAACGGAGTCAAGTTCGGAGAGGCGGTTTGGTTCAAGGCCGGTTCACAGATCTTCAG
CGAAGGAGGACTTGATTACTTGGGAAACCCAAGCTTGGTTCACGCTCAGAGCATTTTG*C
GATATGGGCTACTCAAGTGATCTTGATGGGAGCCGTTGAAGGTTACAGAGTTGCAG*AGA
TGGGCCGCTGGGAGAGGCTGAGGACTTGCTTTACCCAGGAGGTAGTTTCGACCCATTGGG
CCTAGCTACAGACCCAGAGGC
T

QA 1 681 1 681
DS 

RD RS1H518TF 752 0 0
GGACCCATTTCTTGGCTCACAACAGCAACTAATAAACGTTTTTACTTTTACGCAAACCGC
AATGGCCGCCTCAACAATGGCTCTCTCATCCCCTGCTTTTGCCGGAAAGGCCGTCAAGAT
TTCTCCGGCGGCGTCAGAAGTCCTCGGAAGCGGCCGTGTGACAATGAGGAAGACCGTAGC
CAAGCCAAAGGGCCCATCAGGCAGCCCATGGTACGGGTCCGAAAGAGTCAAGTACTTGGG
TCCATCCTCTGGCGAGCCACCAAGCTACCTTACCGGAGAGTTCCCAGGTGACTACGGATG
GGACACCGCTGGTCTCTCCGCTGATCCCGAGACATTTGCAAGGAACCGTGAGCTAGAAGT
TATCCACTGCAGGTGGGCCATGCTCGGAGCCCTAGGCTGCGTCTTCCCGGAGTTGTTGGC
CAGGAACGGAGTCAAGTTCGGAGAGGCGGTTTGGTTCAAGGCCGGTTCACAGATCTTCAG
CGAAGGAGGACTTGATTACTTGGGAAACCCAAGCTTGGTTCACGCTCAGAGCATTTTGGC
GATATGGGCTACTCAAGTGATCTTGATGGGAGCCGTTGAAGGTTACAGAGTTGCAGGAGA
TGGGCCGCTGGGAGAGGCTGAGGACTTGCTTTACCCAGGAGGTAGTTTCGACCCATTGGG
CCTAGCTACAGACCCAGAGGCCTTCGCTGAGTTGAAG*TGAAGA*GATCAAAAACGGA*G
ATTGGCTATGTTCTCTATGTCTGGAT
CTTCGT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1AH73TF 828 0 0
GGACCCATTTCTTGGCTCACAACAGCAACTAATAAACGTTTTTACTTTTACGCAAACCGC
AATGGCCGCCTCAACAATGGCTCTCTCATCCCCTGCTTTCGCCGGAAAGGCCGTCAAGAT
TTCTCCGGCGGCGTCAGAAGTCCTCGGAAGCGGCCGTGTGACAATGAGGAAGACCGTAGC
CAAGCCAAAGGGCCCATCAGGCAGCCCATGGTACGGGTCCGAAAGAGTCAAGTACTTGGG
TCCATTCTCTGGCGAGCCACCAAGCTACCTTACCGGAGAGTTCCCGGGTGACTACGGATG
GGACACCGCTGGTCTCTCCGCCGATCCCGAGACATTTGCAAGGAACCGTGAGCTAGAAGT
TATCCACTGCAGGTGGGCCATGCTCGGAGCCCTAGGCTGCGTCTTCCCGGAGTTGTTGGC
CAGGAACGGAGTCAAGTTCGGAGAGGCGGTTTGGTTCAAGGCCGGTTCACAGATCTTCAG
C*AAGGAGGACTTGATTACTTGGGAAACCCAAGCTTGGTTCACGCTCAGAGCATTTTGGC
GATATGGGCTACTCAAGTGATCTTGATGGGAGCCGTTGAAGGTTACAGAGTTGCCGGAGA
TGGGCCGCTGGGAGAGGCTGAGGACTTGCTTTACCCAGGAGGTAGTTTCGACCCATTGGG
CCTAGCTACAGACCCAGAGGCCTTCGCTGAGTTGAAGGTGAAGAAGATCAAGAACGGAAG
ATTGGCTATGTTCTCTATGTTTGGATTCTTCGTTCAAGCCATTGTCACTGGTAAGGGACC
GTTGGAAAACCTTGCTGACCATTTGGCCGATCCAGTCAACAACAACGC

QA 1 828 1 828
DS 



CO CL491Contig2 568 2 1 U
GGCCAGGAACGGAGTCAAGTTCGGAGAGGCGGTTTGGTTCAAGGCCGGTTCACAGATCTT
CAGCGACGGAGGCCTTGACTACTTGGGAAACCCAAGCTTGGTTCATGCTCAGAGCATTTT
GGCTATTTGGGCCACTCAGGTGATCTTGATGGGAGCCGTTGAAGGTTACAGAGTCGCTGG
AGATGGGCCGTTGGGAGAGGCCGAAGACTTGCTCTACCCAGGTGGCAGCTTCGACCCATT
GGGCTTAGCTACCGACCCAGAAGCCTTCGCGGAATTGAAGGTGAAGGAGATCAAGAACGG
AAGATTGGCTATGTTCTCTATGTTTGGATTCTTTGTTCAAGCCATTGTCACTGGTAAGGG
ACCTTTGGAGAATCTTGCTGACCATTTGGCTGATCCAGTTAACAACAACGCATGGGCCTT
CGCCACCAACTTCGTCCCTGGAAAATGAGCCAAGTTCTTCTATCTGTTTGTTATTTGATT
CAGTACTTTGAGTTCGACTGAGAGTGAGTAAGAGGAGAACGAGTTAAGGTTTGTGTTTGT
GATGGATGGTTAAGACTTAAAATTTGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1B659JQ C 1
AF RS1B659TF U 1
BS 1 568 RS1B659TF

RD RS1B659JQ 568 0 0
GGCCAGGAACGGAGTCAAGTTCGGAGAGGCGGTTTGGTTCAAGGCCGGTTCACAGATCTT
CAGCGACGGAGGCCTTGACTACTTGGGAAACCCAAGCTTGGTTCATGCTCAGAGCATTTT
GGCTATTTGGGCCACTCAGGTGATCTTGATGGGAGCCGTTGAAGGTTACAGAGTCGCTGG
AGATGGGCCGTTGGGAGAGGCCGAAGACTTGCTCTACCCAGGTGGCAGCTTCGACCCATT
GGGCTTAGCTACCGACCCAGAAGCCTTCGCGGAATTGAAGGTGAAGGAGATCAAGAACGG
AAGATTGGCTATGTTCTCTATGTTTGGATTCTTTGTTCAAGCCATTGTCACTGGTAAGGG
ACCTTTGGAGAATCTTGCTGACCATTTGGCTGATCCAGTTAACAACAACGCATGGGCCTT
CGCCACCAACTTCGTCCCTGGAAAATGAGCCAAGTTCTTCTATCTGTTTGTTATTTGATT
CAGTACTTTGAGTTCGACTGAGAGTGAGTAAGAGGAGAACGAGTTAAGGTTTGTGTTTGT
GATGGATGGTTAAGACTTAAAATTTGTT

QA 1 568 1 568
DS 

RD RS1B659TF 568 0 0
GGCCAGGAACGGAGTCAAGTTCGGAGAGGCGGTTTGGTTCAAGGCCGGTTCACAGATCTT
CAGCGACGGAGGCCTTGACTACTTGGGAAACCCAAGCTTGGTTCATGCTCAGAGCATTTT
GGCTATTTGGGCCACTCAGGTGATCTTGATGGGAGCCGTTGAAGGTTACAGAGTCGCTGG
AGATGGGCCGTTGGGAGAGGCCGAAGACTTGCTCTACCCAGGTGGCAGCTTCGACCCATT
GGGCTTAGCTACCGACCCAGAAGCCTTCGCGGAATTGAAGGTGAAGGAGATCAAGAACGG
AAGATTGGCTATGTTCTCTATGTTTGGATTCTTTGTTCAAGCCATTGTCACTGGTAAGGG
ACCTTTGGAGAATCTTGCTGACCATTTGGCTGATCCAGTTAACAACAACGCATGGGCCTT
CGCCACCAACTTCGTCCCTGGAAAATGAGCCAAGTTCTTCTATCTGTTTGTTATTTGATT
CAGTACTTTGAGTTCGACTGAGAGTGAGTAAGAGGAGAACGAGTTAAGGTTTGTGTTTGT
GATGGATGGTTAAGACTTAAAATTTGTT

QA 1 568 1 568
DS 



CO CL491Contig3 760 3 2 U
GACATAAATCCATTTTCATTAGTTTTTACAGCACTGAGTTGAGAGAAAAAAGAGTTATTT
GATAAACGGTAAATTATACAAAAGACTTGCAAGTTTTACATCTAGACAACCTCTCTTTCT
CTTACACTCACACGAAGCAAAGACTGAAGCAAATTACAGATAAAACTTCGCTCACTTTCC
AGGAACAAAGTTGGTGGCGAAGGCCCATGCGTTGTTGTTGACTGGATCGGCCAA*TGGTC
AGCAAGGTTCTCCAAGGGTCCCTTACCAGTGACAATGGCTTGAACGAAGAATCCAGACAT
AGAGAACATAGCCAATCTTCCGTTCTTGATCTCCTTCACCTTCAACTCAGCGAAGGCCTC
TGGGTCTGTAGCTAGGCCCAATGGGTCGAAACTACCTCCTGGGTAAAGCAAGTCCTCAGC
CTCTCCCAGCGGCCCATCTCCTGCAACTCTGTAACCTTCAACGGCTCCCATCAAGATCAC
TTGAGTAGCCCATATCGC*AAAATGCTCTGAGCGTGAACCAAGCTTGGGTTTCCCAAGTA
ATCAAGTCCTCCTTCGCTGAAGATCTGTGAACCGGCCTTGAACCAAACCGCCTCTCCGAA
CTTGACTCCGTTCCTGGCCAACAACTCCGGGAAGACGCAGCCTAGGGCTCCGAGCATGGC
CCACCTGCAGTGGATAACTTCTAGCTCACGGTTCCTTGCAAATGTCTCGGGATCAGCGGA
GAGACCAGCAGTGTCCCATCCGTAGTCACCTGGGAACTCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E432JQ U 1
AF RS1H518JQB U 41
AF RS1GG78JQ U 1
BS 1 634 RS1E432JQ
BS 635 760 RS1GG78JQ

RD RS1E432JQ 634 0 0
GACATAAATCCATTTTCATTAGTTTTTACAGCACTGAGTTGAGAGAAAAAAGAGTTATTT
GATAAACGGTAAATTATACAAAAGACTTGCAAGTTTTACATCTAGACAACCTCTCTTTCT
CTTACACTCACACGAAGCAAAGACTGAAGCAAATTACAGATAAAACTTCGCTCACTTTCC
AGGAACAAAGTTGGTGGCGAAGGCCCATGCGTTGTTGTTGACTGGATCGGCCAA*TGGTC
AGCAAGGTTCTCCAAGGGTCCCTTACCAGTGACAATGGCTTGAACGAAGAATCCAGACAT
AGAGAACATAGCCAATCTTCCGTTCTTGATCTCCTTCACCTTCAACTCAGCGAAGGCCTC
TGGGTCTGTAGCTAGGCCCAATGGGTCGAAACTACCTCCTGGGTAAAGCAAGTCCTCAGC
CTCTCCCAGCGGCCCATCTCCTGCAACTCTGTAACCTTCAACGGCTCCCATCAAGATCAC
TTGAGTAGCCCATATCGC*AAAATGCTCTGAGCGTGAACCAAGCTTGGGTTTCCCAAGTA
ATCAAGTCCTCCTTCGCTGAAGATCTGTGAACCGGCCTTGAACCAAACCGCCTCTCCGAA
CTTGACTCCGTTCCTGGCCAACAACTCCGGGAAG

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1H518JQB 568 0 0
GAGAGAAAAAAGAGTTATTTGATAAACGGTAAATTATACAAAAGACTTGCAAGTTTTACA
TCTAGACAACCTCTCTTTCTCTTACACTCACACGAAGCAAAGACTGAAGCAAATTACAGA
TAAAACTTCGCTCACTTTCCAGGAACAAAGTTGGTGGCGAAGGCCCATGCGTTGTTGTTG
ACTGGATCGGCCAAATGGTCAGCAAGGTTCTCCAAGGGTCCCTTACCAGTGACAATGGCT
TGAACGAAGAATCCAGACATAGAGAACATAGCCAATCTTCCGTTTTTGATCTCCTTCACC
TTCAACTCAGCGAAGGCCTCTGGGTCTGTAGCTAGGCCCAATGGGTCGAAACTACCTCCT
GGGTAAAGCAAGTCCTCAGCCTCTCCCAGCGGCCCATCTCCTGCAACTCTGTAACCTTCA
ACGGCTCCCATCAAGATCACTTGAGTAGCCCATATCGCCAAAATGCTCTGAGCGTGAACC
AAGCTTGGGTTTCCCAAGTAATCAAGTCCTCCTTCGCTGAAGATCTGTGAACCGGCCTTG
AACCAAACCGCCTCTCCGAACTTGACTC

QA 1 568 1 568
DS 

RD RS1GG78JQ 760 0 0
GACATAAATCCATTTTCATTAGTTTTTACAGCACTGAGTTGAGAGAAAAAAGAGTTATTT
GATAAACGGTAAATTATACAAAAGACTTGCAAGTTTTACATCTAGACAACCTCTCTTTCT
CTTACACTCACACGAAGCAAAGACTGAAGCAAATTACAGATAAAACTTCGCTCACTTTCC
AGGAACAAAGTTGGTGGCGAAGGCCCATGCGTTGTTGTTGACTGGATCGGCCAA*TGGTC
AGCAAGGTTCTCCAAGGGTCCCTTACCAGTGACAATGGCTTGAACGAAGAATCCAGACAT
AGAGAACATAGCCAATCTTCCGTTCTTGATCTCCTTCACCTTCAACTCAGCGAAGGCCTC
TGGGTCTGTAGCTAGGCCCAATGGGTCGAAACTACCTCCTGGGTAAAGCAAGTCCTCAGC
CTCTCCCAGCGGCCCATCTCCTGCAACTCTGTAACCTTCAACGGCTCCCATCAAGATCAC
TTGAGTAGCCCATATCGC*AAAATGCTCTGAGCGTGAACCAAGCTTGGGTTTCCCAAGTA
ATCAAGTCCTCCTTCGCTGAAGATCTGTGAACCGGCCTTGAACCAAACCGCCTCTCCGAA
CTTGACTCCGTTCCTGGCCAACAACTCCGGGAAGACGCAGCCTAGGGCTCCGAGCATGGC
CCACCTGCAGTGGATAACTTCTAGCTCACGGTTCCTTGCAAATGTCTCGGGATCAGCGGA
GAGACCAGCAGTGTCCCATCCGTAGTCACCTGGGAACTCT

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 9

CO CL492Contig1 1541 9 20 U
CATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATCAGTCGACGGTACCGGACATATGCC
CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGATCTAGGGTTGGGTCGAGGGGGTAACTCACCG
GCGATTTTGCGAGATGGGAAGAGACCGCGACGACTCTCCGCCGGAGAAGGCGAGATGCGA
CGTCGAGGATAAAGACTACAGAAGAGAATCATCCCGGGAGAAATCGAGCCGTATCGAAAA
GAAGCCGGTCGAAGAAGAAGTGAGTCGGCGCGAATCGAAGAGAAAATCAAAAGACGGCAG
AGACTCCGATTCAGGTTCGGGACTGGAGAGTGGTAGCGAGTCCGAGTCGGAGAAGGAAGA
GAGACGTAGAAGTAGAAAGTCGAGAGGGAAAAGGAAATCAGATCGGAGGTCTCGTAGTAG
ACGAAGCAGGAGGAGACGCTACGATGATTCCAGTAGTAGCTCGGAATCGGAATCTGAGTC
GGAGTCAGAGTATTCTGATTCTGAGGAGAGTGAGAGTGAGAGTGGGAGTGAGAGTGAGAG
TGAGGATGAGCGGAGGAGAAGGAAGAGGAAGAGAAGGGAGAGGGAGGAGAGAGATAAGAA
GAGAAGGAGGAGAGAGAAAGAGAAGAAGAAGAGAAGGAAGGTGAAAGGAGTTGATGGAGA
TGATAGCAGCAAGAAGAAGAAGCGAAAGAAGGAGAAGAAGTCTGAGAAGGCCAAGAAAGG
AGCTGTCACTGAATCTTGGGGGAAATATGGAGTCATCAGAGAGACTGATATGTGGAATAA
ACGACCAGAGTTCACAGCATGGCTGCTTGAAGTAAAAGAGGTCAACTTGGAAAGCTTGCC
ACCATGGGAAGAGAAGAAAATGTTTAAAGATTTCATGGAAGATCACAATACTGGTACATT
TACCTCCAAGAAGTACTATGACATTGATGGTTACTATAGACGTAAGTTGGAGAAAGAGAT
GAAGAAGGGTTTGAAGAAAGCTGGGCAGAGTGAACGGACTGTGTTCAATGACGAGGAGCA
ACGCCGGCTAGAGATGCAGGAAGCACGCGAGAAGCAGAAGGAAGAAGAAGTTTTAGCTCT
AAAGCGATCAATGGAAGGCGGAATGGCTCAAGCTATGAAGGAACAAGCTCGGCTTAAGGA
AGAAATGGTCTACTTGTACAAGATTGGGGACATGGAGGGTGCAGCTGCTATTCAGAAAAG
GTTGGATCCAGATGTTCCCATGTAATGTGGAGGTTTTGGTTTAAGCTACAACATCTTCTA
GTTCTCGTTTCTAAGCTGTGTTCCAAGTATCGAGCTTGTGTAACACGGCATAAGAAGAAA
AAAAAGCCAAAACGTTCATCTCTAGAGCTTTAAAGCATGATCTTGCCTTTTTTGGATATT
ATACACCATCGGCTAGTCAAGTATTGAAAACCGTTATGCTTTTTAATCGGCTAGTCAAGT
ATTGAAAACCGTTATGTTTTTTAATCGGCTAGTCAAGTATTGAAAACCGTTATGCTTTTT
AGACTGTGTGTGACAGAGAAGAAAAATTGGACCCTTCCTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 25 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A282TF U 1
AF RS1A282TV U 76
AF RS1A282JQ C 86
AF RS1A282TR C 86
AF RS1E314TF U 86
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AF RS1E314JQ C 735
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CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGATCTAGGGTTGGGTCGAGGGGGTAACTCACCG
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CGTCGAGGATAAAGACTACAGAAGAGAATCATCCCGGGAGAAATCGAGCCGTATCGAAAA
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AGACTCCGATTCAGGTTCGGGACTGGAGAGTGGTAGCGAGTCCGAGTCGGAGAAGGAAGA
GAGACGTAGAAGTAGAAAGTCGAGAGGGAAAAGGAAATCAGATCGGAGGTCTCGTAGTAG
ACGAAGCAGGAGGAGACGCTACGATGATTCCAGTAGTAGCTCGGAATCGGAATCTGAGTC
GGAGTCAGAGTATTCTGATTCTGAGGAGAGTGAGAGTGAGAGTGGGAGTGAGAGTGAGAG
TGAGGATGAGCGGAGGAGAAGGAAGAGGAAGAGAAGGGAGAGGGAGGAGAGAGATAAGAA
GAGAAGGAGGAGAGAGAAAGAGAAGAAGAAGAGA
GAAAGAGAG

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DS 

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GGGAAGAGACCGCGACGACTCTCCGCCGGAGAAGGCGAGATGCGACGTCGAGGATAAAGA
CTACAGAAGAGAATCATCCCGGGAGAAATCGAGCCGTATCGAAAAGAAGCCGGTCGAAGA
AGAAGTGAGTCGGCGCGAATCGAAGAGAAAATCAAAAGACGGCAGAGACTCCGATTCAGG
TTCGGGACTGGAGAGTGGTAGCGAGTCCGAGTCGGAGAAGGAAGAGAGACGTAGAAGTAG
AAAGTCGAGAGGGAAAAGGAAATCAGATCGGAGGTCTCGTAGTAGACGAAGCAGGAGGAG
ACGCTACGATGATTCCAGTAGTAGCTCGGAATCGGAATCTGAGTCGGAGTCAGAGTATTC
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GAGAAGGAAGAGGAAGAGAAGGGAGAGGGAGGAGAGAGATAAGAAGAGAAGGAGGAGAG

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GATTCCAGTAGTAGCTCGGAATCGGAATTTGAGTCGGAGTCAGAGTATTCTGATTCTGAG
GAGAGTGAGAGTGAGAGTGGGAGTGAGAGTGAGAGTGAGGATGAGCGGAGGAGAAGGAAG
AGGAAGAGAAGGGAGAGGGAGGAGAGAGATAAGAAGAGAAGGAGGAGAGAGAAAGAGAAG
AAGAAGAGA
GAAAGAGAG

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DS 

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CGCGACGACTTTCCGCCGGAGAAGGCGAGATGCGACGTCGAGGATAAAGACTACAGAAGA
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GGGAAAAGGAAATCAGATCGGAGGTCTCGTAGTAGACGAAGCAGGAGGAGACGCTACGAT
GATTCCAGTAGTAGCTCGGAATCGGAATTTGAGTCGGAGTCAGAGTATTCTGATTCTGAG
GAGAGTGAGAGTGAGAGTGGGAGTGAGAGTGAGAGTGAGGATGAGCGGAGGAGAAGGAAG
AGGAAGAGAAGGGAGAGGGAGGAGAGAGATAAGAAGAGAAGGAGGAGAGAGAAAGAGAAG
AAGAAGAGA
GAAAGAGAG

QA 1 549 1 549
DS 

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CGCGACGACTCTCCGCCGGAGAAGGCGAGATGCGACGTCGAGGATAAAGACTACAGAAGA
GAATCATCCCGGGAGAAATCGAGCCGTATCGAAAAGAAGCCGGTCGAAGAAGAAGTGAGT
CGGCGCGAATCGAAGAGAAAATCAAAAGACGGCAGAGACTCCGATTCAGGTTCGGGACTG
GAGAGTGGTAGCGAGTCCGAGTCGGAGAAGGAAGAGAGACGTAGAAGTAGAAAGTCGAGA
GGGAAAAGGAAATCAGATCGGAGGTCTCGTAGTAGACGAAGCAGGAGGAGACGCTACGAT
GATTCCAGTAGTAGCTCGGAATCGGAATCTGAGTCGGAGTCAGAGTATTCTGATTCTGAG
GAGAGTGAGAGTGAGAGTGAGAGTGAGAGTGAGAGTGAGGATGAGCGGAGGAGAAGGAAG
AGGAAGAGAAGGGAGAGGGAGGAGAGAGATAAGAAGAGAAGGAGGAGAGAGAAAGAGAAG
AAGAGAAGGA***AGGTGAAAGGAGTTGATGGAGATGATAGCAGCAAGAAGA

QA 1 592 1 592
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GGTG
GGGTCGGGGGGGTAACTCACCGGCGATTTTGCGAGATGGGAAGAGACCGCGACGACTCTC
CGCCGGAGAAGGCGAGATGCGACGTCGAGGATAAAGACTACAGAAGAGAATCATCCCGGG
AGAAATCGAGCCGTATCGAAAAGAAGCCGGTCGAAGAAGAAGTGAGTCGGCGCGAATCGA
AGAGAAAATCAAAAGACGGCAGAGACTCCGATTCAGGTTCGGGACTTGAGAGTGGTAGCG
AGTCCGAGTCGGAGAAGGAAGAGAGACGTAGAAGTAGAAAGTCGAGAGGGAAAAGGAAAT
CAGATCGGAGGTCTCGTAGTAGACGAAGCAGGAGGAGACGCTACGATGATTCCAGTAGTA
GCTCGGAATCGGAATCTGAGTCGGAGTCAGAGTATTCTGATTCTGAGGAGAGTGAGAGTG
AGAGTGAGAGTGAGAGTGAGAGTGAGGATGAGCGGAGGAGAAGGAAGAGGAAGAGAAGGG
AGAGGGAGGAGAGAGATAAGAAGAGAAGGAGGAGAGAGAAAGAGAAGAAGAAGAGAAGGA
AGGTGAAAGGAGTTGATGGAGATGATAGCAGCAAGAAGAAGAAGCGAAAGAAGGAGAAGA
AGTCTGAGAAGGCCAAGAAAGGAGCTGTCACTGAATCTTGGGG*AAATATGGAGTCATCA
GAGAGACTGATATGTGGAATAAACGACCAGAGTTCACAGCATGGCTGCTTGAAGTAAAAG
AGGTCAACTTGGAAAGCTTGCC

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DS 

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TGGAGAGTGGTAGCGAGTCCGAGTCGGAGAAGGAAGAGGGACGTAGAAGTAGAAAGTCGA
GAGGGAAAAGGAAATCAGATCGGAGGTCTCGTAGTAGACGAAGCAGGAGGAGACGCTACG
ATGATTCCAGTAGTAGCTCGGAATCGGAATCTGAGTCGGAGTCAGAGTATTCTGATTCTG
AGGAGAGTGAGAGTGAGAGTGAGAGTGAGAGTGAGAGTGAGGATGAGCGGAGGAGAAGGA
AGAGGAAGAGAAGGGAGAGGGAGGAGAGAGATAAGAAGAGAAGGAGGAGAGAGAAAGAGA
AGAAGAAGAGAAGGAAGGTGAAAGGAGTTGATGGAGATGATAGCAGCAAGAAGAAGAAGC
GAAAGAAGGAGAAGAAGTCTGAGAAGGCCAAGAAAGGAGCTGTCACTGAATCTTGGGGGA
AATATGGAGTCATCAGAGAGACTGATATGTGGAATAAACGACCAGAGTTCACAGCATGGC
TGCTTGAAGTAAAAGAGGTCAACTTGGAAAGCTTGCCACCATGGTAAGAGAAGAAAATGT
TTAAAGATTTCATGGAAGATCACAATACTGGTACATTTACCTCCAAGAAGTACTATGACA
TTGATGGTTACTATAGACGTAAGTTGGAGAAAGAGATGA*GAAGG*TTTGA*GAAAGCTG
GGCAGAGTGAACG*ACTGTGTTCA
TGACGAGAGCA

QA 1 744 1 744
DS 

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CTTG
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ATGGCTGCTTGAAGTAAAAGAGGTCAACTTGGAAAGCTTGCCACCATGGGAAGAGAAGAA
AATGTTTAAAGATTTCATGGAAGATCACAATACTGGTACATTTACCTCCAAGAAGTACTA
TGACATTGATGGTTACTATAGACGTAAGTTGGAGAAAGAGATGAAGAAGGGTTTGAAGAA
AGCTGGGCAGAGTGAACGGACTGTGTTCAATGACGAGGAGCAACGCCGGCTAGAGATGCA
GGAAGCACGCGAGAAGCAGAAGGAAGAAGAAGTTTTAGCTCTAAAGCGATCAATGGAAGG
CGGAATGGCTCAAGCTATGAAGGAACAAGCTCGGCTTAAGGAAGAAATGGTCTACTTGTA
CAAGATTGGGGACATGGAGGGTGCAGCTGCTATTCAGAAAAGGTTGGATCCAGATGTTCC
CATGTAATGTGGAGGTTTTGGTTTAAGCTACAACATCTTCTAGTTCTCGTTTCTAAGCTG
TGTTCCAAGTATCGAGCTTGTGTAACACGGCATAAGAAGAAAAAAAAGCCAAAACGTTCA
TCTCTAGAGCTTTAAAGCATGATCTTGCCTTTTTTGGAT

QA 5 643 5 643
DS 

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GATATGTGGAATAAACGACCAGAGTTCACAGCATGGCTGCTTGAAGTAAAAGAGGTCAAC
TTGGAAAGCTTGCCACCATGGGAAGAGAAGAAAATGTTTAAAGATTTCATGGAAGATCAC
AATACTGGTACATTTACCTCCAAGAAGTACTATGACATTGATGGTTACTATAGACGTAAG
TTGGAGAAAGAGATGAAGAAGGGTTTGAAGAAAGCTGGGCAGAGTGAACGGACTGTGTTC
AATGACGAGGAGCAACGCCGGCTAGAGATGCAGGAAGCACGCGAGAAGCAGAAGGAAGAA
GAAGTTTTAGCTTTAAAGCGATCAATGGAAGGCGGAATGGCTCAAGCTATGAAGGAACAA
GCTCGGCTTAAGGAAGAAATGGTTTACTTGTACAAGATTGGGGACATGGAGGGTGCAGCT
GCTATTCAGAAAAGGTTGGATCCAGATGTTCCCATGTAATGTGGAGGTTTTGGTTTAAGC
TACAACATTTTTTAGTTTTCGTTTTTAAGCTGTGTTCCAAGTATCGAGCTTGTGTAACAC
GGCATAAGAAGAAAAAAAAGCCAAAACGTTCATCTCTAGAGCTTTAAAGCATGATCTTGC
CTTTTTTGGATATTATACACCATCGGCTAGTCAAGTATTGAAAACCGTTATGCTTTTTAA
TCGGCTAGTCAAGTATTGAAAACCGTTATGTTTTTTAATCGGCTAGTCAAGTATTGAAAA
CCGTTATGCTTTTTAGACTGTGTGTGACAGAGAAGAAAAATTGGACCCTTCCTAG

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 9

CO CL493Contig1 1903 9 36 U
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BQ
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GTGGCCGCGACGGGCGTTTCTACGTAGTCACTGACCCAAATGACGACAACCCCGTTAACC
CTAGACCGGGAACACTACGTCACGCCGTGATCCAAGACCGACCGCTATGGATCGTTTTCA
ACCGCGACATGGTGATTCAGCTAAAACAAGAGCTGATCGTTAACAGCTTCAAAACGATCG
ACGGACGCGGCGCAAACGTTCACATCGCTAACGGCGGTTGTATCACGATACAGTACGTGA
CGAACGTCATCGTGCATGGGTTGCA

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DS 

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GGACATTCACT
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CACTCTGCTCAGCTTCTGCTCCAATGACGGTTCTTCCGACATGGATTTTAGCTATGATGT
GTCTACTCTTCTTCGTCGGAGCAATGGAGAACAGTACACACGAGAAGATCTCATCTCTCT
CCAGATCCGACGAAAATGAATGGAACACGCATGCAGTGACAAATCCAGATGAAGTAGCGG
ACGAAGTTATCG*****GCTGAAATGAGTGTGAGAAACCATACCGAGAGGAGGAAGCTAG
GTTACTTTACTTGCGGAACAGGCAACCCTATCGACGATTGTTGGCGTTGCGATCCCAACT
GGCACAAGAACCGCAAACGCCTAGCGGACTGTGGAATCGGATTCGGGAGAAACGCGATCG
GTGGCCGCGACGGGCGTTTCTACGTAGTCACTGACCCAAATGACGACAACCCCGTTAACC
CTAGACCGGGAACACTACGTCACGCCGTGATCCAAGACCGACCGCTATGGATCGTTTTCA
ACCGCGACATGGTGATTCAGCTAAAACAAGAGCTGATCGTTAACAGCTTCAAAACGATCG
ACGGACGCGGCGCAAACGTTCACATCGCTAACGGCGGTTGCATCACGATACAGTACGTGA
CGAACGTCATCGTGCATGGGTTGCATATTCATGACTGTAGACCGACGGGTAACGCTATGG
TGAGA*GCTCGGAGACGCACTTTGGGTGGAGGACGATGGCGGACG*TGACGCTATT*CCA
TCTTTGGATCGAGTCACGTTTGGAT
GATCA

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G
CAACCGCGACATGGTGATTCAGCTAAAACAAGAGCTGATCGTTAACAGCTTCAAAACGAT
CGA*GGACGCGGCGCAAACGTTCACATCGCTAACGGCGGTTGCATCACGATACAGTACGT
GACGAACGTCATCGTGCATGGGTTGCATATTCATGACTGTAGACCGACGGGTAACGCTAT
GGTGAGAAGCTCGGAGACGCACTTTGGGTGGAGGACGATGGCGGACGGTGACGCTATTTC
CATCTTTGGATCGAGTCACGTTTGGATTGATCACAACTCGTTGTCTCATTGCGCTGATGG
GCTTGTGGATGCGGTTATGGGCTCGACCGCGATTACAATCTCAAACAACCACATGACTCA
CCACAACGAGGTTATGTTGCTCGGACATAGTGATTCTTACACGAGGGATAAAGCCATGCA
AATTACTATTGCTTATAACCATTTTGGAGTCGGACTTATTCAAAGAATGCCTAGGTGCCG
ACACGGGTACTTCCATGTCGTGAACAATGACTACACTCACTGGGAAATGTACGCCATCGG
TGGAAGCGCTAACCCGACAATCAACAGTCAAGGAAACCGTTATGCCGCTCCCCAAAACCC
CTTTGCTAAAGAGGTGACTAAGAGAGTGGACACACCGGCGAGTCACTGG

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DS 

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TAAAGCCATGCAAATTACTATTGCTTATAACCATTTTGGAGTCGGACTTATTCAAAGAAT
GCCTAGGTGCCGACACGGGTACTTCCATGTCGTGAACAATGACTACACTCACTGGGAAAT
GTACGCCATCGGTGGAAGCGCTAACCCGACAATCAACAGTCAAGGAAACCGTTATGCCGC
TCCCCAAAACCCCTTTGCTAAAGAGGTGACTAAGAGAGTGGACACACCGGCGAGTCACTG
GAAAGGATGGAACTGGAGAACAGGAGGAGATTTGCTTCAGAACGGAGCTTACTTCACTGC
TTCTGGAGCCGCTGCATCTGGTAGCTACGCACGTGCCTCTAGCCTGGCAGCTAAATTTTT
TTCACTAGTTGCAACCATTACTAACGACGCCCGAGCTCTACCTTGTCGCAGAGGACGTCA
GTGTACCTCATAGTTGTTTTTAAACCTCCTCCC*AACACTATCACCACCAAAAATTCAAA
ACCATCTTCAATTATATTTAGACAAAAGTGTACATTTTCACACATTTGTCATTTAAAAGC
CAATTATCTTT
TT

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DS 

RD RS1GP43JQ 600 0 0
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CTTCCATGTCGTGAACAATGACTACACTCACTGGGAAATGTACGCCATCGGTGGAAGCGC
TAACCCGACAATCAACAGTCAAGGAAACCGTTATGCCGCTCCCCAAAACCCCTTTGCTAA
AGAGGTGACTAAGAGAGTGGACACACCGGCGAGTCACTGGAAAGGATGGAACTGGAGAAC
AGAAGGAGATTTGCTTCAGAACGGAGCTTACTTCACTGCTTCTGGAGCCGCTGCATCTGG
TAGCTACGCACGTGCCTCTAGCCTGGCAGCTAAATCTTCTTCACTAGTTGCAACCATTAC
TAACGACGCTGGAGCTCTACCTTGTCGCAGAGGACGTCAGTGTACCTCATAGTTGTTTTT
AAACCTCCTCCC*AACACTATCACCACCAAAAATTCAAAACCATCTTCAATTATATTTAG
ACAAAAGTGTACATTTTCACACATTTGTCATTTAAAAGCCAATTATCTTTCTTTTTGTGT
GTGTTTTTGTGTCGATTTTTCTCAACCTCGGGTTTGCTTGCTTCAACCGCAAGGTAACAC

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DS 

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CTGGAAAGGATGGAACTGGAGAACAGAAGGAGATTTGCTTCAGAACGGAGCTTACTTCAC
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TTCTTCACTAGTTGCAACCATTACTAACGACGCTGGAGCTCTACCTTGTCGCAGAGGACG
TCAGTGTACCTCATAGTTGTTTTTAAACCTCCTCCC*AACACTATCACCACCAAAAATTC
AAAACCATCTTCAATTATATTTAGACAAAAGTGTACATTTTCACACATTTGTCATTTAAA
AGCCAATTATCTTTCTTTTTGTGTGTGTTTTTGTGTCGATTTTTCTCAACCTCGGGTTTG
CTTGCTTCAACCGCAAGGTAACACAAGTAAAGGCGAAAAAAGCAACCTTTCATGTAAAAG
ATATACTCCCGAAGTGTTGTTGGTTCTGTCTGATAAACTCAGGTCGTTCTTCCTTTGTCT
CTGTCATTTACC

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DS 

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TTGGTGGAAGCGCTAACCCGACAATCAACAGTCAAGGAAACCGCTATGCCGCTCCCCAAA
ACCCCTTTGCTAAAGAGGTGACTAAGAGAGTGGACACACCGGCGAGTCATTGGAAAGGAT
GGAACTGGAGAACAGAAGGAGATTTGCTTCAGTACGGAGCTTACTTCACTGCTTCTGGAG
CCGCTGCATCTGGTAGCTACGCACGTGCCTCTAGCCTGGCAGCTAAATCTTCTTCACTGG
TTGCAACAATTACTAACGACGCTGGAGCTCTACCTTGTCGCAGAGGACGTCAGTGTACCT
CATAGTTGTTTTTAAACCTCCTCCCCAACACTATCACCACCAAAAATTCAAAACCATCTT
CAATTATAATTAGACAAAAGTGTACATTTTCACACATTTGTCATTTAAAAGCCAATTATC
TTTCTTTTTGTGTGTGTTTTTGTGTCGATTTTTCTCAACCTCGGGTTTGCTTGCTTCAAC
CGCAAGGTAACACAAGTAAAGGCGAAAAAA*CAACCTTTCATGTAAAAGATATACTCCCG
AAGTGTTGTTGGTTCTGTCTGATGAACTCAGGTTGTTCTTCCTTTGTCTCTGTCATTTAC
CAAGAAAAAAAACAAGAATATAATGTCTTGTTTTTTTTGTATCTTTCTTGTATTTCTTGA
AGTTTATAATTTAATATAGGGTCTAAATGATTTGG

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DS 



AS 1 9

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TATTGGTTGTGGCAGCCACACCCACCTTATCCGCAATCTCCTCTTTCTCTCCTAAAATAA
AGCTATTAACCTTCTTTTTGCTTCTCTCATCTCTGAGTCCATTAACTTCTGTTGCATCCT
TCAACCTTACTCATAGCAAAAAGGAAATGGCTACAGCAGCGGCACCGGCGGTGGTTGCAT
GGACAAGAGCGGGAGTCGCGTTCAAATCCGGACAGTCACAGAGGAAAACGGAGATGAAAA
TTTCGTACGTGAGAGGACTAAATTCTTACGGTGGTCTCAAGGCACAGAACAACAAGGTTG
TCTCCATGGGATTACCGCTCTGCACCGAACAGTGCTTTGCCAATGTCGTGATGTCTCTCA
AAGGGCGAACAAGTGGAAGTGGAGGAGCCTTAACCTCAACTTGTAACGCAGTCGGAGAGA
TCTTCAAGATTGCAGCAATCATGAACGCTCTTACTCTTGTTGGCGTTGCGGTTGGATTCG
TTCTCCTTCGAATCGAAGCTTCTGTTGAGGAAGCTGAGTAAATAGATTGAACAATCCTTT
TCTTTATATTAATATATATTTGTTATTGTTGTTGTCAAGCTTCTGGATGCATATGAGACA
TTTGTTTTATGAAGCTCTTTTGTTCTTACTGATCAAACGGTACTTTTTTTTGTTTGCATT
GTCAAACAAATGCAAAATCTGCTTTTAGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 40 40 45 45 45 45 50 50 50 50 35 5 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 40 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 
55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 40 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 30 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

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AF RS1GL45JQ C 135
AF RS1GX80TF U 157
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GG
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ACAGCAGCGGCACCGGCGGTGGTTGCATGGACAAGAGCGGGAGTCGCGTTCAAATCCGGA
CAGTCACAGAGGAAAACGGAGATGAAAATTTCGTACGTGAGAGGACTAAATTCTTACGGT
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TGCTTTGCCAATGTCGTGATGTCTCTCAAAGGGCGAACAAGTGGAAGTGGAGGAGCCTTA
ACCTCAACTTGTAACGCAGTCGGAGAGATCTTCAAGATTGCAGCAATCATGAACGCTCTT
ACTCTTGTTGGCGTTGCGGTTGGATTCGTTCTCCTTCGAATCGAAGCTTCTGTTGAGGAA
GCTGAGTAAATAGATTGAACAATCCTTTTCTTTATATTAATATATATTTGTTATTGTTGT
TGTCAAGCTTCTGGATGCATATGA

QA 3 506 3 506
DS 

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TCTTTATATTAATATATATTTGTTATTGTTGTTGTCAAGCTTCTGGATGCATATGAGACA
TTTGTTTTATGAAGCTCTTTT

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GG
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TCTCAAGGCACAGAACAACAAGGTTGTCTCCATGGGATTACCGCTCTGCACCGAACAGTG
CTTTGCCAATGTCGTGATGTCTCTCAAAGGGCGAACAAGTGGAAGTGGAGGAGCCTTAAC
CTCAACTTGTAACGCAGTCGGAGAGATCTTCAAGATTGCAGCAATCATGAACGCTCTTAC
TCTTGTTGGCGTTGCGGTTGGATTCGTTCTCCTTCGAATCGAAGCTTCTGTTGAGGAAGC
TGAGTAAATAGATTGAACAATCCTTTTCTTTATATTAATATATATTTGTTATTGTTGTTG
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QA 3 533 3 533
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CCGCTCTGCACCGAACAGTGCTTTGCCAATGTCGTGATGTCTCTCAAAGGGCGAACAAGT
GGAAGTGGAGGAGCCTTAACCTCAACTTGTAACGCAGTCGGAGAGATCTTCAAGATTGCA
GCAATCATGAACGCTCTTACTCTTGTTGGCGTTGCGGTTGGATTCGTTCTCCTTCGAATC
GAAGCTTCTGTTGAGGAAGCTGAGTAAATAGATTGAACAATCCTTTTCTTTATATTAATA
TATATTTGTTATTGTTGTTGTCAAGCTTCTGGATGCATATGAGACATTTGTTTTATGAAG
CTCTTTTGTTCTTACTGAT

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DS 

RD RS1FF47JQ 534 0 0
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GTGGTTGCATGGACAAGAGCGGGAGTCGCGTTCAAATCCGGACAGTCACAGAGGAAAACG
GAGATGAAAATTTCGTACGTGAGAGGACTAAATTCTTACGGTGGTCTCAAGGCACAGAAC
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ATGTCTCTCAAAGGGCGAACAAGTGGAAGTGGAGGAGCCTTAACCTCAACTTGTAACGCA
GTCGGAGAGATTTTCAAGATTGCAGCAATCATGAACGCTCTTACTCTTGTTGGCGTTGCG
GTTGGATTCGTTCTCCTTCGAATCGAAGCTTCTGTTGAGGAAGCTGAGTAAATAGATTGA
ACAATCCTTTTCTTTATATTAATATATATTTGTTATTGTTGTTGTCAAGCTTCTGGATGC
ATATGAGACATTTGTTTTATGAAGCTCTTTTGTTCTTACTGATCAAACGGTACT

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DS 

RD RS1GL45JQ 617 0 0
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AGCAAAAAGGAAATGGCTACAGCAGCGGCACCGGCGGTGGTTGCATGGACAAGAGCGGGA
GTCGCGTTCAAATCCGGATAGTCACAGAGGAAAACGGAGATGAAAATTTCGTACGTGAGA
GGACTAAATTCTTACGGTGGTCTCAAGGTACAGAACAACAAGGTTGTCTCCATGGGATTA
CCGCTCTGCACCGAACAGTGCTTTGCCAATGTCGTGATGTCTCTCAAAGGGCGAACAAGT
GGAAGTGGAGGAGCCTTAACCTCAACTTGTAACGCAGTCGGAGAGATCTTCAAGATTGCA
GCAATCATGAACGCTCTTACTCTTGTTGGCGTTGCGGTTGGATTCGTTCTCCTTCGAATC
GAAGCTTCTGTTGAGGAAGCTGAGTAAATAGATTGAACAATCCTTTTCTTTATATTAATA
TATATTTGTTATTGTTGTTGTCAAGCTTCTGGATGCATATGAGACATTTGTTTTATGAAG
CTCTTTTGTTCTTACTGATCAAACGGTACTTTTTTTTGTTTGCATTGTCAAACAAATGCA
AAATCTGCTTTTAGATC

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DS 

RD RS1GX80TF 594 0 0
GG
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GCGGCACCGGCGGTGGTTGCATGGACAAGAGCGGGAGTCGCGTTCAAATCCGGACAGTCA
CAGAGGAAAACGGAGATGAAAATTTCGTACGTGAGAGGACTAAATTCTTACGGTGGTCTC
AAGGCACAGAACAACAAGGTTGTCTCCATGGGATTACCGCTCTGCACCGAACAGTGCTTT
GCCAATGTCGTGATGTCTCTCAAATGGCGAACAAGTGGAAGTGGAGGAGCCTTAACCTCA
ACTTGTAACGCAGTCGGAGAGATCTTCAAGATTGCAGCAATCATGAACGCTCTTACTCTT
GTTGGCGTTGCGGTTGGATTCGTTCTCCTTCGAATCGAAGCTTCTGTTGAGGAAGCTGAG
TAAATAGATTGAACAATCCTTTTCTTTATATTAATATATATTTGTTATTGTTGTTGTCAA
GCTTCTGGATGCATATGAGACATTTGTTTTATGAAGCTCTTTTGTTCTTACTGATCAAAC
GGTACTTTTTTTTGTTTGCATTGTCAAACAAATGCAAAATCTGCTTTTAGAT

QA 3 594 3 594
DS 



AS 1 9

CO CL495Contig1 594 9 9 U
GGAAAGCACAAACTCACATTCACAAATTAACGCGAAAAAGATCGAAGAAGAGAGACTCAG
AAATGGCTTCTACCTCCGCTGTAGCATCGGTCATGCCACTCACCCAAAACCGATCATCTT
CGGCGAAAACCATTGCTTTTCTCAAGCCACTGCCTTTGAAACCATCTAAGGCGTCCTCCT
TCTCCGTAGCCATGCCTTCACGGAAGTTTCAAGTGAATGCGTCTAACCTGAAGATGGAGA
AGGCTGTGAGCGGCTTAGCCGCGGCAGCTCTCACTGTTTCCATGGTGATCCCTGAGGTGG
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CAGGAGGCGTGGTGCTCACGGTCATCATCGGTGTTGTTGTTGGTGTCTCCAACTTTGATC
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BQ
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1FA84TF U 32
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CC

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C

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C

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AS 1 8

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BQ
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TTTTT

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CTTCTCT
TCCT

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TGCACCTGGACCCGCCGCAAGCGGAGCCTCCGTAGCCGTACCAGCTCTTGGCTCTTTGGT
TGGAGCTTCCCTTGTGTCTCTCTTCACCTACTACTTGAACTAAATTTACTTTTATACAAA
AAAAAA*TTGATGCCCATGTCTGATTTTGTACGTGTTTAGACAGGCAAAGTGAATAAGAC
GGAAGACATATGCTTTTGATTATGGTCAGATAAAACTTTATGTAATGCTGATTAATAAAA
TTATTTGTTCTTCTCTTCCT

QA 1 320 1 320
DS 



AS 3 9

CO CL497Contig1 506 2 6 U
CGCAGAAGATGATATAGACTGGGGAGTTATAGTTCCACAAACGGGTGTTGTGACATTATT
TAGTACAAAGTTCGGTTTTGGTTTAAAAACATCATATCATTGTTCTCATTCATCTTACGC
TTACAACCCAAAGAAAGCATTGATCTTTCCTTTTATTCTGGACGAGACTTGACGATGAAA
TTTTGACGGCTGATGGGATTCATGACGACAGGAGGACCAGCGGTTCTTGGCCAAGCTTGG
AACTTCTCGTCTGTCGCCTTCCACCATTCCTTGTTGAAGACTGTTCCTGGAGTACTCCCT
CCAAATATCTTATTATCAGAGATAAGTTTGTCAAAGAGGTACGAGATTCCGAAAGAGCCG
ATGAAAGCACCGATTATGTACTTGGCTTTACCTCCTGTTGATGCTGCCATTTTCTTCTTT
AACAAAAAAACACTTTTTGCCGATTCAAAAAAAGTGAAGCTTACACAGTTGACTAGCTGG
TGTTCGAACTAAACGGTGGAGAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EF04TF C 1
AF RS1EF04JQ U 12
BS 1 11 RS1EF04TF
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BS 46 46 RS1EF04TF
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BS 69 69 RS1EF04TF
BS 70 506 RS1EF04JQ

RD RS1EF04TF 430 0 0
CGCAGAAGATGATATAGACTGTGGAGTTATAGTTCCACAAACGGGTGTTGTGACATTATT
TAGTACAAAGTTCGGTTTTGGTTTAGAAACATCATATCATTGTTCTCATTCATCTTACGC
TTACAACCCAAAGAAAGCATTGATCTTTCCTTTTATTCTGGACGAGACTTGACGATGAAA
TTTTGACGGCTGATGGGATTCATGACGACAGGAGGACCAGCGGTTCTTGGCCAAGCTTGG
AACTTCTCGTCTGTCGCCTTCCACCATTCCTTGTTGAAGACTGTTCCTGGAGTACTCCCT
CCAAATATCTTATTATCAGAGATAAGTTTGTCAAAGAGGTACGAGATTCCGAAAGAGCCG
ATGAGAGCACCGATTATGTACTTGGCTTTACCTCCTGTTGATGCTGCCATTTTCTTCTTT
AACAAAAAAA

QA 1 430 1 430
DS 

RD RS1EF04JQ 495 0 0
ATATAGACTGGGGAGTTATAGTTCCACAAACGGG*GTTGTGACATTATTTAGTACAA*GT
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AGAAAGCATTGATCTTTCCTTTTATTCTGGACGAGACTTGACGATGAAATTTTGACGGCT
GATGGGATTCATGACGACAGGAGGACCAGCGGTTCTTGGCCAAGCTTGGAACTTCTCGTC
TGTCGCCTTCCACCATTCCTTGTTGAAGACTGTTCCTGGAGTACTCCCTCCAAATATCTT
ATTATCAGAGATAAGTTTGTCAAAGAGGTACGAGATTCCGAAAGAGCCGATGAAAGCACC
GATTATGTACTTGGCTTTACCTCCTGTTGATGCTGCCATTTTCTTCTTTAACAAAAAAAC
ACTTTTTGCCGATTCAAAAAAAGTGAAGCTTACACAGTTGACTAGCTGGTGTTCGAACTA
AACGGTGGAGAATCC

QA 1 495 1 495
DS 



CO CL497Contig2 1354 5 9 U
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GTAAGCTTCACCGTCTCTAAATCGGCAAAAGTGTTTTTCTGTTAAAGAAGAAAATGGCAG
CATCAACAGGAGGTAAAGCCAAGTACATAATCGGTGCTCTCATCGGCTCTTTCGGAATCT
CATACCTCTTTGACAAACTTATCTCTGATAATAAGATCTTTGGAGGGAGTACTCCAGGAA
CAGTCTCCAACAAGGAATGGTGGAAGGCGACAGATGAGAAGTTCCAAGCTTGGCCAAGAA
CCGCTGGCCCTCCCGTCGTCATGAATCCCATCAGCCGTCAGAATTTCATCGTCAAGTCTC
GTCCAGAATAAAAGGAAAGATCAATGCTTTCTTTGGGTTGTAAGCGTAAGATGAATGAGA
ATAATGATATGATGTTTCTAAACCAAACCGAACTTGTACTAAATAATGTCACAACACCGT
TTGTGGAACCAAACTCCACTGTCTATATCATCTTCTGCTATAGAAAATAGATGCAAAAGC
CGAAAGCACAAGTCCTAAAATATATATAAACGAAACAAACTTCTTTGGATCCTCCTTTTC
ATTTGCCATCATCTTTCCCTTTGTCCATCTCCTCCATCTTGCTTGCCACCTCTAAGCCCC
ACGTTTGCAGCACTTCCTCCGAGAGAGGTTTCTGGCAGTTGTTGTTGCATCTGATGCTGC
ATCCCAATGTTGTTGTTGATACCCATTGGAATGGGTCTAATCCCACCCATGTGTCCTTGC
ATAGCTTGTTGATGTAGCTGAAGCTGCTGTTGTTGTTGCGGATCATGAAGCTGGTGAGGG
CTACCAAACTGCAAAGGACCTCTTGGAGGGAAAATACCGCCGGCGGGAGATGCTTGTTGT
TGAGCCACCATCCCTGAAGCTTGTGGGTGTTGTTGCATAAAGTAGCTCGGCGGTTGCATC
GAAGGATGTGGTGCTGCCGTCATCTGAAAAGCCATAGCTGGTGCTGGTGCAGGTCCTGTT
GTAGGTGGAGGAGGCTGAGCATCAGCAATAGCAGCGAGGTACATTAAGTTCTTCTGGAGA
AGAGCTTGGTACTGTGCACATTCTGCAAGTTTCCCCAGATTCTGGTTCTCCATGATTGCC
ATTATCAGCTTTTTGTTCTCATCAAGGTAGTTTTGGATCTGCTCTGTGGTGATGTTAGCT
GACGCAATCGAAGGAACCATCGTCGGAAACATTTGCGGTGACTGCTGCATCTTCTTTTAC
TCGCCGAACAAACCCTTAACCCTACCTTTTCTTCGAGATTCTTACCAAACACAGAGCCTT
GAGAGAGATTTCGATAGACCCCTCGCACGCGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GL30TF U 1
AF RS1E779JQ C 213
AF RS1E779TF U 213
AF RS1A410JQ U 437
AF RS1A410TF C 573
BS 1 406 RS1GL30TF
BS 407 407 RS1E779TF
BS 408 502 RS1GL30TF
BS 503 598 RS1A410JQ
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BS 623 1208 RS1A410JQ
BS 1209 1354 RS1A410TF

RD RS1GL30TF 502 0 0
GGGAGTTGAAAGATTTGATCATTCTCCACCGTTTAGTTCGAACACCAGCTAGTCAACTGT
GTAAGCTTCACCGTCTCTAAATCGGCAAAAGTGTTTTTCTGTTAAAGAAGAAAATGGCAG
CATCAACAGGAGGTAAAGCCAAGTACATAATCGGTGCTCTCATCGGCTCTTTCGGAATCT
CATACCTCTTTGACAAACTTATCTCTGATAATAAGATCTTTGGAGGGAGTACTCCAGGAA
CAGTCTCCAACAAGGAATGGTGGAAGGCGACAGATGAGAAGTTCCAAGCTTGGCCAAGAA
CCGCTGGCCCTCCCGTCGTCATGAATCCCATCAGCCGTCAGAATTTCATCGTCAAGTCTC
GTCCAGAATAAAAGGAAAGATCAATGCTTTCTTTGGGTTGTAAGCGCAAGATGAATGAGA
ATAATGATATGATGTTTCTAAACCAAACCGAACTTGTACTAAATAATGTCACAACACCGT
TTGTGGAACCAAACTCCACTGT

QA 1 502 1 502
DS 

RD RS1E779JQ 292 0 0
G
AGATCTTTGGAGGGAGTACTCCAGGAACAGTCTCCAACAAGGAATGGTGGAAGGCGACAG
ATGAGAAGTTCCAAGCTTGGCCAAGAACCGCTGGCCCTCCCGTCGTCATGAATCCCATCA
GCCGTCAGAATTTCATCGTCAAGTCTCGTCCAGAATAAAAGGAAAGATCAATGCTTTCTT
TGGGTTGTAAGCGTAAGATGAATGAGAATAATGATATGATGTTTCTAAACCAAACCGAAC
TTGTACTAAATAATGTCACAACACCGTTTGTGGAACCAAACTCCACTGT
CT

QA 2 290 2 290
DS 

RD RS1E779TF 292 0 0
G
AGATCTTTGGAGGGAGTACTCCAGGAACAGTCTCCAACAAGGAATGGTGGAAGGCGACAG
ATGAGAAGTTCCAAGCTTGGCCAAGAACCGCTGGCCCTCCCGTCGTCATGAATCCCATCA
GCCGTCAGAATTTCATCGTCAAGTCTCGTCCAGAATAAAAGGAAAGATCAATGCTTTCTT
TGGGTTGTAAGCGTAAGATGAATGAGAATAATGATATGATGTTTCTAAACCAAACCGAAC
TTGTACTAAATAATGTCACAACACCGTTTGTGGAACCAAACTCCACTGT
CT

QA 2 290 2 290
DS 

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C
CTAAACCAAACCGAACTTGTACTAAATAATGTCACAACACCGTTTGTGGAACCAAACTCC
ACTGTCTATATCATCTTCTGCTATAGAAAATAGATGCAAAAGCCGAAAGCACAAGTCCTA
AAATATATATAAACGAAACAAACTTCTTTGGATCCTCCTTT*CATTTGCCATCATCTTTC
CCTT*GTCCATCTCCTCCATCTTGCTTGCCACCTCTAAGCCCCACGTTTGCAGCACTTCC
TCCGAGAGAGGTTTCTGGCAGTTGTTGTTGCATCTGATGCTGCATCCCAATGTTGTTGTT
GATACCCATTGGAATGGGTCTAATCCCACCCATGTGTCCTTGCATAGCTTGTTGATGTAG
CTGAAGCTGCTGTTGTTGTTGCGGATCATGAAGCTGGTGAGGGCTACCAAACTGCAAAGG
ACCTCTTGGAGGGAAAATACCGCCGGCGGGAGATGCTTGTTGTTGAGCCACCATCCCTGA
AGCTTGTGGGTGTTGTTGCATAAAGTAGCTCGGCGGTTGCATCGAAGGATGTGGTGCTGC
CGTCATCTGAAAAGCCATAGCTGGTGCTGGTGCAGGTCCTGTTGTAGGTGGAGGAGGCTG
AGCATCAGCAATAGCAGCGAGGTACATTAAGTTCTTCTGGAGAAGAGCTTGGTACTGTGC
ACATTCTGCAAGTTTCCCCAGATTCTGGTTCTCCATGATTGCCATTATCAGCTTTTTGTT
CTCATCAAGGTAGTTTTGGATCTGCTCTGTGGTGATGTTAGCTGACGCAAT

QA 2 772 2 772
DS 

RD RS1A410TF 782 0 0
AAACAAA
CTTCTTTGGATCCTCCTTTTCATTTGCCATCATCTTTCCCTTTGTCCATCTCCTCCATCT
TGCTTGCCACCTCTAAGCCCCACGTTTGCAGCACTTCCTCCGAGAGAGGTTTCTGGCAGT
TGTTGTTGCATCTGATGCTGCATCCCAATGTTGTTGTTGATACCCATTGGAATGGGTCTA
ATCCCACCCATGTGTCCTTGCATAGCTTGTTGATGTAGCTGAAGCTGCTGTTGTTGTTGC
GGATCATGAAGCTGGTGAGGGCTACCAAACTGCAAAGGACCTCTTGGAGGGAAAATACCG
CCGGCGGGAGATGCTTGTTGTTGAGCCACCATCCCTGAAGCTTGTGGGTGTTGTTGCATA
AAGTAGCTCGGCGGTTGCATCGAAGGATGTGGTGCTGCCGTCATCTGAGAAGCCATAGCT
GGTGCTGGTGCAGGTCCTGTTGTAGGTGGAGGAGGCTGAGCATCAGCAATAGCAGCGAGG
TACATTAAGTTCTTCTGGAGAAGAGCTTGGTACTGTGCACATTCTGCAAGTTTCCCCAGA
TTCTGGTTCTCCATGATTGCCATTATCAGCTTTTTGTTCTCATCAAGGTAGTTTTGGATC
TGCTCTGTGGTGATGTTAGCTGACGCAATCGAAGGAACCATCGTCGGAAACATTTGCGGT
GACTGCTGCATCTTCTTTTACTCGCCGAACAAACCCTTAACCCTACCTTTTCTTCGAGAT
TCTTACCAAACACAGAGCCTTGAGAGAGATTTCGATAGACCCCTCGCACGCGCCC

QA 8 782 8 782
DS 



CO CL497Contig3 943 2 4 U
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TTTCGTTTGCGCGTGCGAGGGGGTCTATCAAAATCTATCTCTCGGCTCTGTGTTTGGTTA
GAATCTCTGAAGAAAAGCTAGGGTTAAGGGTTTTTTCGGCGAGTAAAAGAAGATGCAGCA
GTCACCGCAAATGTTTCCGACGATGGTTCCTTCGATTGCGTCATCTAACATCACCACAGA
GCAGATCCAAAACTACCTTGATGAGAACAAAAAGCTGATAATGGCAATCATGGAGAACCA
GAATCTGGGGAAACTTGCAGATTGTGCACAGTACCAAGCTCTTCTCCAGAAGAACCTAAT
GTACCTCGCTGCTATTGCTGATGCTCAACCTCCTCCACCTACAACAGGACCTGCACCCGC
ACCAGCTATGGCTTCTCAGATGACGGCAGCACCACATCCTTCGATGCAACCGCCGAGCTA
CTTTATGCAACAACACCCACAAGCTTCAGGGATGGTGGCTCAACAACAAGCATCTCCCGC
CGGCGGTATTTTCCCTCCAAGAGGTCCTTTGCAGTTTGGTAGCCCTCACCAGCTTCATGA
TCCGCAACAGCAACAGCAACAGCAGCTTCAGCTACATCAACAAGCTATGCAAGGACACAT
GGGTGGGATTAGACCCATTCCAATGGGTATCAACAACAACATTGGGATGCAACAACTGCC
AGAAACCTTTCTTGGAGGAAGTGCTGCAAACGTGGGGCTTAGAGGTGGCAAGCAAGATGG
AGCAGATGGACAAGGGAAAGATGATGGCAAATGAAAGGAGGATCCAAAGAAGCTTTGTTT
CGTTTATATGTATTTTAGGACTTGTGCTTTCGGCTTTTGCATCAATTTTCTTTGGCAGAA
GATGATATAGACTGTGGAGTTATAGTTCCACAAACGGTGTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GQ87TF U 1
AF RS1GQ87JQ C 601
BS 1 653 RS1GQ87TF
BS 654 654 RS1GQ87JQ
BS 655 701 RS1GQ87TF
BS 702 943 RS1GQ87JQ

RD RS1GQ87TF 701 0 0
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TTTCGTTTGCGCGTGCGAGGGGGTCTATCAAAATCTATCTCTCGGCTCTGTGTTTGGTTA
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GTCACCGCAAATGTTTCCGACGATGGTTCCTTCGATTGCGTCATCTAACATCACCACAGA
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GAATCTGGGGAAACTTGCAGATTGTGCACAGTACCAAGCTCTTCTCCAGAAGAACCTAAT
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CGGCGGTATTTTCCCTCCAAGAGGTCCTTTGCAGTTTGGTAGCCCTCACCAGCTTCATGA
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GGGTGGGATTAGACCCATTCCAATGGGTATCAACAACAACA

QA 1 701 1 701
DS 

RD RS1GQ87JQ 343 0 0
TCCGCAACA
GCAACAGCAACAGCAGCTTCAGCTACATCAACAAGCTATGCAAGGACACATGGGTGGGAT
TAGACCCATTCCAATGGGTATCAACAACAACATTGGGATGCAACAACTGCCAGAAACCTT
TCTTGGAGGAAGTGCTGCAAACGTGGGGCTTAGAGGTGGCAAGCAAGATGGAGCAGATGG
ACAAGGGAAAGATGATGGCAAATGAAAGGAGGATCCAAAGAAGCTTTGTTTCGTTTATAT
GTATTTTAGGACTTGTGCTTTCGGCTTTTGCATCAATTTTCTTTGGCAGAAGATGATATA
GACTGTGGAGTTATAGTTCCACAAACGGTGTTGT

QA 10 343 10 343
DS 



AS 2 6

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GAAACGAGGTCGTCAACAATGGTGCACATGATCTGCAACTTCTTGATACCGTAACCAACC
GGTACAAGCTTGGATGCTCCCCAAAATAAACCTTCCATCTGGACGGATCTCACAGCTTCC
TCTAGTTTCTTCATGTCGGTCTCATCATCCCACGGCTCGATATCAATCAAAACTGATGAC
TTTCCAGATTCCTTCCTCTTTGTGGATGCCTTTACAGAAGCAGCTCTCTCTTCAGCAGCC
TTCTTCTCCTCCTCGGTCTCCTCTCCGAAAAGGTCAACATCATCATCATCCTCTTCATCC
GCAGCATCCTTGGAATCAGCTGCAGGGGGAGTAGCAATAGTCTCTTCCGCAACTGGGGCT
GATCCCTCAACAATGACACCACTTCCCTCAGCAGAGACACCTGAGATCCTCAAGAGGGCA
TCGATGTGGTTGTACCAACGAGAAGCGTTCACAAACTGCGAGGTTGGTGGCTTTGTAAGA
GCAGCAAAGACAGTGATATCATCCTTGGAAGCCTGGTACCAGTGATGTAACTGCGAGTGA
GAAGATGCTCATCGAGCTTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FD69JQ U 1
AF RS1CE53JQ U 6
BS 1 293 RS1FD69JQ
BS 294 294 RS1CE53JQ
BS 295 397 RS1FD69JQ
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BS 399 458 RS1FD69JQ
BS 459 803 RS1CE53JQ

RD RS1FD69JQ 458 0 0
GGTAACGAAACTGTCTTCTTCATAAATATCAAAATTAAACAGGAGATAAGGCAAACCAAA
GCAAAATCAAAAACACGAGTCCACAAGAAACTTGGAAACAATAATCAGATTGCATGAGCG
CTTCCTTAAAGCAAAAAAAAAAGCCATCCTCAGATTTTGTTGAAAGCAACAATGTCACAG
CTCTGGACAAACTCATTGATTGGCTCGACGGTGAGCGTCTCTTCAATCATGGTGTCAACA
GAAACGAGGTCGTCAACAATGGTGCACATGATCTGCAACTTCTTGATACCGTA*CCAACC
GGTACAAGCTTGGATGCTCCCCAAAATAAACCTTCCATCTGGACGGATCTCACAGCTTCC
TCTAGTTTCTTCATGTCGGTCTCATCATCCCACGGCTTGATATCAATCAAAACTGATGAC
TTTCCAGATTCCTTCCTCTTTGTGGATGCCTTTACAGA

QA 1 458 1 458
DS 

RD RS1CE53JQ 798 0 0
CGAAACTGTCTTCTTCATAAATATCAAAATTAAACAGGAGATAAGGCAAACCAAAGCAAA
ATCAAAAACACGAGTCCACAAGAAACTTGGAAACAATAATCAGATTGCATGAGCGCTTCC
TTAAAGCAGAAAAAAAA*CCATCCTCAGATTTTGTTGAAAGCAACAATGTCACAGCTCTG
GACAAACTCATTGATTGGCTCGACGGTGAGCGTCTCTTCAATCATGGTGTCAACAGAGAC
GAGGTCGTCAACAATGGTGCACATGATCTGCAACTTCTTGATACCGTAACCAACCGGTAC
AAGCTTGGATGCTCCCCAAAATAAACCTTCCATCTGGACGGATCTCACAGCTTCCTCTAG
TTTCTTCATGTCGGTCTCATCATCCCACGGCTCGATATCAATCAAAACTGATGACTTTCC
AGATTCCTTCTTCTTTGTGGATGCCTTTACAGAAGCAGCTCTCTCTTCAGCAGCCTTCTT
CTCCTCCTCGGTCTCCTCTCCGAAAAGGTCAACATCATCATCATCCTCTTCATCCGCAGC
ATCCTTGGAATCAGCTGCAGGGGGAGTAGCAATAGTCTCTTCCGCAACTGGGGCTGATCC
CTCAACAATGACACCACTTCCCTCAGCAGAGACACCTGAGATCCTCAAGAGGGCATCGAT
GTGGTTGTACCAACGAGAAGCGTTCACAAACTGCGAGGTTGGTGGCTTTGTAAGAGCAGC
AAAGACAGTGATATCATCCTTGGAAGCCTGGTACCAGTGATGTAACTGCGAGTGAGAAGA
TGCTCATCGAGCTTCTTC

QA 1 798 1 798
DS 



CO CL498Contig2 760 4 7 U
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CTTCTCGTTGGTACAACCACATCGATGCCCTCTTGAGGATCTCAGGTGTCTCTGCTGAGG
GAAGTGGTGTCATTGTTGAGGGATCAGCCCCAGTTTCGGAAGAGGCTATTGCTACTCCTC
CTGCAGTTGATTCTAAGGATGCTGCTGATGAAGAGGATGATGATGATGTTGACCTTTTTG
GTGAGGAGACCGAGGAGGAGAAGAAGGCTGCTGAAGAGAGAGCTGCTTCTGTAAAGGCAT
CCACAAAGAAGAAGGAATCTGGAAAGCCGTCTGTTTTGATTGATATCAAGCCATGGGATA
ATGAGACTGACATGAAGAAGCTAGAGGAAGCTGTGAGATCCGTCCAGATGGAAGGTTTAT
TCTGGGGAGCATCCAAGCTTGTACCGGTTGGTTACAGTATCAAGAAGTTGCAGATCATGT
GCACCATTGTTGACGACCTCGTCTCTGTTGACACCATGATTGAAGAGACGCTCACCGTCG
AGCCAATCAATGAGTTTGTCCAGAGCTGTGACATTGTTGCTTTCAACAAAATCTAAGGAT
GTCATCTTTGCTATAAGGAAGCGCTATTGCAGTCTGATTATTGTTTCCAAGTTTCTTGTG
GACTCATGTTTTTGATTTTGCTATGGTTTGCCTTATCTCCTGTTTAATTTTGATATTTAT
GAAGAAGACAGTTTCGTTATTTGCTTGAAGTTTACTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GJ15TF U 1
AF RS1GJ15JQ C 48
AF RS1DN80JQ C 194
AF RS1DN80TF U 194
BS 1 359 RS1GJ15TF
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RD RS1GJ15TF 602 0 0
GGGATGATATCACTGTCTTTGCTGCTCTTGCAAAGCCACCAACCTCGCAGTTTGTGAACG
CTTCTCGTTGGTACAACCACATCGATGCCCTCTTGAGGATCTCAGGTGTCTCTGCTGAGG
GAAGTGGTGTCATTGTTGAGGGATCAGCCCCAGTTTCGGAAGAGGCTATTGCTACTCCTC
CTGCAGTTGATTCTAAGGATGCTGCTGATGAAGAGGATGATGATGATGTTGACCTTTTTG
GTGAGGAGACCGAGGAGGAGAAGAAGGCTGCTGAAGAGAGAGCTGCTTCTGTAAAGGCAT
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TCTGGGGAGCATCCAAGCTTGTACCGGTTGGTTACAGTATCAAGAAGTTGCAGATCATGT
GCACCATTGTTGACGACCTCGTCTCTGTTGACACCATGATTGAAGAGACGCTCACCGTCG
AGCCAATCAATGAGTTTGTCCAGAGCTGTGACATTGTTGCTTTCAACAAAATCTAAAGAT
GT

QA 1 602 1 602
DS 

RD RS1GJ15JQ 713 0 0
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GTCTCTGCTGAGGGAAGTGGTGTCATTGTTGAGGGATCAGCCCCAGTTTCGGAAGAGGCT
ATTGCTACTCCTCCTGCAGTTGATTCTAAGGATGCTGCTGATGAAGAGGATGATGATGAT
GTTGACCTTTTTGGTGAGGAGACCGAGGAGGAGAAGAAGGCTGCTGAAGAGAGAGCTGCT
TCTGTAAAGGCATCCACAAAGAAGAAGGAATCTGGAAAGCCGTCTGTTTTGATTGATATC
AAGCCATGGGATGATGAGACTGACATGAAGAAGCTAGAGGAAGCTGTGAGATCCGTCCAG
ATGGAAGGTTTATTCTGGGGAGCATCCAAGCTTGTACCGGTTGGTTACAGTATCAAGAAG
TTGCAGATCATGTGCACCATTGTTGACGACCTCGTCTCTGTTGACACCATGATTGAAGAG
ACGCTCACCGTCGAGCCAATCAATGAGTTTGTCCAGAGCTGTGACATTGTTGCTTTCAAC
AAAATCTAAGGATGTCATCTTTGCTATAAGGAAGCGCTATTGCAGTCTGATTATTGTTTC
CAAGTTTCTTGTGGACTCATGTTTTTGATTTTGCTATGGTTTGCCTTATCTCCTGTTTAA
TTTTGATATTTATGAAGAAGACAGTTTCGTTATTTGCTTGAAGTTTACTTTCC

QA 1 713 1 713
DS 

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GGG
GGATGCTGCTGATGAAGAGGATGATGATGATGTTGACCTTTTTGGTGAGGAGACCGAGGA
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GCTTGTACCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAGTTGCAGATCATGTGCACCATTGTTGACGA
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GGAAGCGCTATTGCAGTCTGATTATTGTTTCCAAGTTTCTTGTGGACTCATGTTTTTGAT
TTTGCTATGGTTTGCCTTATCTCCTGTTTAATTTTGATATTTATGAAGAAGACAGTTTCG
TTA
TTTGCT

QA 4 546 4 546
DS 

RD RS1DN80TF 552 0 0
GGG
GGATGCTGCTGATGAAGAGGATGATGATGATGTTGACCTTTTTGGTGAGGAGACCGAGGA
GGAGAAGAAGGCTGCTGAAGAGAGAGCTGCTTCTGTAAAGGCATCCACAAAGAAGAAGGA
ATCTGGAAAGTCGTCTGTTTTGATTGATATCAAGCCATGGGATAATGAGACTGACATGAA
GAAGCTAGAGGAAGCTGTGAGATCCGTCCAGATGGAAGGTTTATTCTGGGGAGCATCCAA
GCTTGTACCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAGTTGCAGATCATGTGCACCATTGTTGACGA
CCTCGTCTCTGTTGACACCATGATTGAAGAGACGCTCACCGTCGAGCCAATCAATGAGTT
TGTCCAGAGCTGTGACATTGTTGCTTTCAACAAAATCTAAGGATGTCATCTTTGCTATAA
GGAAGCGCTATTGCAGTCTGATTATTGTTTCCAAGTTTCTTGTGGACTCATGTTTTTGAT
TTTGCTATGGTTTGCCTTATCTCCTGTTTAATTTTGATATTTATGAAGAAGACAGTTTCG
TTA
TTTGCT

QA 4 546 4 546
DS 



AS 1 9

CO CL499Contig1 965 9 9 U
GGCTCGTTTTCCTCCGAATCACGGTGGTTCTGCGACTACCAAAAAAGGCGATCTCTTTGT
TCATAACCGTCTTCAAAATTGATTCGTGTACTCAGGTGAAATGGCGTCTTCGTCGGATTC
ATGGATGAGAGAATACAACGAAGCTTTAAAACTCGCTGAAGACATAAACGGAATGATCTC
AGAAAGGAGCAAATCTTCCTTAACAGGGCCCGACGCTCAGCGCCGCGCTTCAGCTATACG
AAGAAAGATCACAATTTTCGGAACCCGTTTAGAGAGTCTCCAGTCTCTTCTTGCCAAAAT
CCATGGAAAGCCCATCTCAGAGAAGGAGATGAACCGACGCAAGGATATGATTGGGAACTT
GAGGTCGCAGGCGAATCAGATGGCGAATGCTTTGAACATGTCCAACTTTGCTAATAGAGA
CAGCTTGCTTGGGTCATCAGAGATTAAGGCGGATGATACTATGAGTAGAGTTGCTAGCAT
GGATAACCAAGGGATTGTTGGGTTTCAACGACAGGTTATGAGAGAACAAGATGAAGGACT
TGAGAAGTTGGAGGAAACAGTCATGAGTACTAAACATATTGCTTTAGCTGTCAATGAGGA
GCTTGGTTTGCAGACAAGGCTTATCGATGACTTAGACTACCATGTGGATGTCACTGACTC
TCGCTTACGGAGAGTGCAAAAGAACCTTGCTGTCATGAACAAGAATATGAGGAGTGGCTG
TTCTTGCATGTCAATGCTCTTGTCAGTGCTTGGAATCGTTGGTCTTGCTGTTGTAATATG
GCTGCTCGTTAAGTATTTGTAATCCCCAACGACGTCAGATAAACTTATAAGTTTCTTTAT
CTAGTTAACTTTGCCGGCTCTGGTGTGAATGGTCTCGGTATATCTACTGATTCCACGTTT
GTGCTTTTCGTTTTTCTCTTCTGTTGTGAGAACCTTAAATAAAGTATATATATTATGTGT
TCAGC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 

AF RS1H192TF U 4
AF RS1F967TF U 1
AF RS1BK02TF U 507
AF RS1GS70TF U 4
AF RS1AC16TF U 1
AF RS1BK02JQ C 172
AF RS1H192JQB C 375
AF RS1GS70JQ C 200
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RD RS1H192TF 393 0 0
GG
GTTTTCCTCCGAATCACGGTGGTTCTGCGACTACCAAAAAAGGCGATCTCTTTGTTCATA
ACCGTCTTCAAAATTGATTCGTGTACTCAGGTGAAATGGCGTCTTCGTCGGATTCATGGA
TGAGAGAATACAACGAAGCTTTAAAACTCGCTGAAGACATAAACGGAATGATCTCAGAAA
GGAGCAAATCTTCCTTAACAGGGCCCGACGCTCAGCGCCGCGCTTCAGCTATACGAAGAA
AGATCACAATTTTCGGAACCCGTTTAGAGAGTCTCCAGTCTCTTCTTGCCAAAATCCATG
GAAAGCCCATCTCAGAGAAGGAGATGAACCGACGCAAGTATATGATTGGGAACTTGAGGT
CGCAGGCGAATCAGATGGCGAATGCTTTGAA

QA 3 393 3 393
DS 

RD RS1F967TF 700 0 0
GGCTC
GTTTTCCTCCGAATCACGGTGGTTCTGCGACTACCAAAAAAGGCGATCTCTTTGTTCATA
ACCGTCTTCAAAATTGATTCGTGTACTCAGGTGAAATGGCGTCTTCGTCGGATTCATGGA
TGAGAGAATACAACGAAGCTTTAAAACTCGCTGAAGACATAAACGGAATGATCTCAGAAA
GGAGCAAATCTTCCTTAACAGGGCCCGACGCTCAGCGCCGCGCTTCAGCTATACGAAGAA
AGATCACAATTTTCGGAACCCGCTTAGAGAGTCTCCAGTCTCTTCTTGCCAAAATCCATG
GAAAGCCCATCTCAGAGAAGGAGATTAACCGACGCAAGGATATGATTGGGAACTTGAGGT
CGCAGGCGAATCAGATGGCGAATGCTTTGAACATGTCCAACTTTGCTAATAGAGACAGCT
TGCTTGGGTCATCAGAGATTAAGGCGGATGATACTATGAGTAGAGTTGCTAGCATGGATA
ACCAAGGGATTGTTGGGTTTCAACGACAGGTTATGAGAGAACAAGATGAAGGACTTGAGA
AGTTGGAGGAAACAGTCATGAGTACTAAACATATTGCTTTAGCTGTCAATGAGGAGCTTG
GTTTGCAGACAAG*CTTATCGATGACTTAGACTACCATGTGGATGTCACTGACTCTCGCT
TACG*AGAGTGCAAA*GAACCTTGCTGTCATGA
CA

QA 6 698 6 698
DS 

RD RS1BK02TF 195 0 0
AACGACAGGTTATGAGAGAACAAGATGAAGGACTTGAGAAGCTGGAGGAAACAGTCATGA
GTACTAAACATATTGCTTTAGCTGTCAATGAGGAGCTTGGTTTGCAGACAAGGCTTATCG
ATGACTTAGACTACCATGTGGATGTCACTGACTCTCGCTTACGGAGAGTGCAAAAGAACC
TTGCTGTCATGAACA

QA 1 195 1 195
DS 

RD RS1GS70TF 755 0 0
GG
GTTTTCCTCCGAATCACGGTGGTTCTGCGACTACCAAAAAAGGCGATCTCTTTGTTCATA
ACCGTCTTCAAAATTGATTCGTGTACTCAGGTGAAATGGCGTCTTCGTCGGATTCATGGA
TGAGAGAATACAACGAAGCTTTAAAACTCGCTGAAGACATAAACGGAATGATCTCAGAAA
GGAGCAAATCTTCCTTAACAGGGCCCGACGCTCAGCGCCGCGCTTCAGCTATACGAAGAA
AGATCACAATTTTCGGAACCCGTTTAGAGAGTCTCCAGTCTCTTCTTGCCAAAATCCATG
GAAAGCCCATCTCAGAGAAGGAGATGAACCGACGCAAGGATATGATTGGGAACTTGAGGT
CGCAGGCGAATCAGATGGCGAATGCTTTGAACATGTCCAACTTTGCTAATAGAGACAGCT
TGCTTGGGTCATCAGAGATTAAGGCGGATGATACTATGAGTAGAGTTGCTAGCATGGATA
ACCAAGGGATTGTTGGGTTTCAACGACAGGTTATGAGAGAACAAGATGAAGGACTTGAGA
AGTTGGAGGAAACAGTCATGAGTACTAAACATATTGCTTTAGCTGTCAATGAGGAGCTTG
GTTTGCAGACAAAGCTTATCGATGACTTAGACTACCATGTGGATGTCACTGACTCTCGCT
TACGGAGAGTGCAAAAGAACCTTGCTGTCATGAACAAGAATATGAGGAGTGGCTGTTCTT
GCATGTCA*TGCTCTTGTCAGTGCTTGGAATCG

QA 3 755 3 755
DS 

RD RS1AC16TF 854 0 0
GGCTCGTTTTCCTCCGAATCACGGTGGTTCTGCGACTACCAAAAAAGGCGATCTCTTTGT
TCATAACCGTCTTCAAAATTGATTCGTGTACTCAGGTGAAATGGCGTCTTCGTCGGATTC
ATGGATGAGAGAATACAACGAAGCTTTAAAACTCGCTGAAGACATAAACGGAATGATCTC
AGAAAGGAGCAAATCTTCCTTAACAGGGCCCGACGCTCAGCGCCGCGCTTCAGCTATACG
AAGAAAGATCACAATTTTCGGAACCCGTTTAGAGAGTCTCCAGTCTCTTCTTGCCAAAAT
CCATGGAAAGCCCATCTCAGAGAAGGAGATGAACCGACGCAAGGATATGATTGGGAACTT
GAGGTCGCAGTCGAATCAGATGGCGAATGCTTTGAACATGTCCAACTTTGCTAATAGAGA
CAGCTTGCTTGGGTCATCAGAGATTAAGGCGGATGATACTATGAGTAGAGTTGCTAGCAT
GGATAACCAAGGGATTGTTGGGTTTCAACGACAGGTTATGAGAGAACAAGATGAAGGACT
TGAGAAGTTGGAGGAAACAGTCATGAGTACTAAACATATTGCTTTAGCTGTCAATGAGGA
GCTTGGTTTGCTGACAAGGCTTATCGATGACTTAGACTACCATGTGGATGTCACTGACTC
TCGCTTACGGAGAGTGCAAAAGAACCTTGCTGTCATGAACAAGAATATGAGGAGTGGCTG
TTCTTGCATGTCAATGCTCTTGTCAGTGCTTGGAATCGTTGGTCTTGCTGTTGTAATATG
GCTGCTCGTTAAGTATTTGTAATCCCCAACGACGTCAGATAAACTTATA*GTTTCTTTAT
CTAGTTAACTTTGC

QA 1 854 1 854
DS 

RD RS1BK02JQ 791 0 0
AATGATCTCAGAAAGGAGCAAATCTTCCTTAACAGGGCCCGACGCTCAGCGCCGCGCTTC
AGCTATACGAAGAAAGATCACAATTTTCGGAACCCGTTTAGAGAGTCTCCAGTCTCTTCT
TGCCAAAATCCATGGAAAGCCCATCTCAGAGAAGGAGATGGACCGACGCAAGGATATGAT
TGGGTACTTGAGGTCGCAGGCGAATCAGATGGCGAATGCTTTGAACATGTCCAACTTTGC
TAATAGAGACAGCTTGCTTGGGTCATCAGAGATTAAGGCGGATGATACTATGAGTAGAGT
TGCTAGCATGGATAACCAAGGGATTGTTGGGTTTCAACGACAGGTTATGAGAGAACAAGA
TGAAGGACTTGAGAAGTTGGAGGAAACAGTCATGAGTACTAAACATATTGCTTTAGCTGT
CAATGAGGAGCTTGGTTTGCAGACAAGGCTTATCGATGACTTAGACTACCATGTGGATGT
CACTGACTCTCGCTTACGGAGAGTGCAAAAGAACCTTGCTGTCATGAACAAGAATATGAG
GAGTGGCTGTTCTTGCATGTCAATGCTCTTGTCAGTGCTTGGAATCGTTGGTCTTGCTGT
TGTAATATGGCTGCTCGTTAAGTATTTGTAATCCCCAACGACGTCAGATAAACTTATAAG
TTTCTTTATCTAGTTAACTTTGCCGGCTCTGGTGTGAATGGTCTCGGTATATCTACTGAT
TCCACGTTTGTGCTTTTCGTTTTTCTCTTCTGTTGTGAGAACCTTAAATAAAGTATATAT
ATTATGTGT
AC

QA 1 789 1 789
DS 

RD RS1H192JQB 551 0 0
ATCAGATGGCGAATGCTTTGAACATGTCCAACTTTGCTAATAGAGACAGCTTGCTTGGGT
CATCAGAGATTAAGGCGGATGATACTATGAGTAGAGTTGCTAGCATGGATAACCAAGGGA
TTGTTGGGTTTCAACGACAGGTTATGAGAGAACAAGATGAAGGACTTGAGAAGTTGGAGG
AAACAGTCATGAGTACTAAACATATTGCTTTAGCTGTCAATGAGGAGCTTGGTTTGCAGA
CAAGGCTTATCGATGACTTAGACTACCATGTGGATGTCACTTACTCTCGCTTACGGAGAG
TGCAAAAGAACCTTGCTGTCATGAACAAGAATATGAGGAGTGGCTGTTCTTGCATGTCAA
TGCTCTTGTCAGTGCTTGGAATCGTTGGTCTTGCTGTTGTAATATGGCTGCTCGTTAAGT
ATTTGTAATCCCCAACGACGTCAGATAAACTTATAAGTTTCTTTATCTAGTTAACTTTGC
CGGCTCTGGTGTGAATGGTCTCGGTATATCTACTGATTCCACGTTTGTGCTTTTCGTTTT
TCTCTTCTGTT

QA 1 551 1 551
DS 

RD RS1GS70JQ 762 0 0
C
TAACAGGGCCCGACGCTCAGCGCCGCGCTTCAGCTATACGAAGAAAGATCACAATTTTCG
GAACCCGTTTAGAGAGTCTCCAGTCTCTTCTTGCCAAAATCCATGGAAAGCCCATCTCAG
AGAAGGAGATGAACCGACGCAAGGATATGATTGGGAACTTGAGGTCGCAGGCGAATCAGA
TGGCGAATGCTTTGAACATGTCCAACTTTGCTAATAGAGACAGCTTGCTTGGGTCATCAG
AGATTAAGGCGGATGATACTATGAGTAGAGTTGCTAGCATGGATAACCAAGGGATTGTTG
GGTTTCAACGACAGGTTATGAGAGAACAAGATGAAGGACTTGAGAAGTTGGAGGAAACAG
TCATGAGTACTAAACATATTGCTTTAGCTGTCAATGAGGAGCTTGGTTTGCAGACAAGGC
TTATCGATGACTTAGACTACCATGTGGATGTCACTGACTCTCGCTTACGGAGAGTGCAAA
AGAACCTTGCTGTCATGAACAAGAATATGAGGAGTGGCTGTTCTTGCATGTCAATGCTCT
TGTCAGTGCTTGGAATCGTTGGTCTTGCTGTTGTAATATGGCTGCTCGTTAAGTATTTGT
AATCCCCAACGACGTCAGATAAACTTATAAGTTTCTTTATCTAGTTAACTTTGCCGGCTC
TGGTGTGAATGGTCTCGGTATATCTACTGATTCCACGTTTGTGCTTTTCGTTTTTCTCTT
CTGTTGTGAGAACCTTAAATAAAGTATATATATTATGTGT
T

QA 2 761 2 761
DS 

RD RS1F967JQ 749 0 0
TCAGCGCCGCGCTTCAGCTATACGAAGAAAGATCACAATTTTCGGAACCCGCTTAGAGAG
TCTCCAGTCTCTTCTTGCCAAAATCCATGGAAAGCCCATCTCAGAGAAGGAGATTAACCG
ACGCAAGGATATGATTGGGAACTTGAGGTCGCAGGCGAATCAGATGGCGAATGCTTTGAA
CATGTCCAACTTTGCTAATAGAGACAGCTTGCTTGGGTCATCAGAGATTAAGGCGGATGA
TACTATGAGTAGAGTTGCTAGCATGGATAACCAAGGGATTGTTGGGTTTCAACGACAGGT
TATGAGAGAACAAGATGAAGGACTTGAGAAGTTGGAGGAAACAGTCATGAGTACTAAACA
TATTGCTTTAGCTGTCAATGAGGAGCTTGGTTTGCAGACAAGGCTTATCGATGACTTAGA
CTACCATGTGGATGTCACTGACTCTCGCTTACGGAGAGTGCAAAAGAACCTTGCTGTCAT
GAACAAGAATATGAGGAGTGGCTGTTCTTGCATGTCAATGCTCTTGTCAGTGCTTGGAAT
CGTTGGTCTTGCTGTTGTAATATGGCTGCTCGTTAAGTATTTGTAATCCCCAACGACGTC
AGATAAACTTATAAGTTTCTTTATCTAGTTAACTTTGCCGGCTCTGGTGTGAATGGTCTC
GGTATATCTACTGATTCCACGTTTGTGCTTTTCGTTTTTCTCTTCTGTTGTGAGAACCTT
AAATAAAGTATATATATTATGTGTTCAGC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 9

CO CL500Contig1 666 9 6 U
GGAACATCAAGTTGTTTCACATTTCTCAACAGAAAATATTTTATTCTGAGGCTAATTATC
TCGAGCGCTACTAATTAATCCCTAAAATGAAGTTAATTCTGTTGATGTGCATCGTCTTTG
TCATGATGTTAACATCATTCCCTGCTACGATCAACGGTGATGATTGCCCTGACACTATTC
GGACCTGCTTGCGCCTAGCTAGAGCCAAAGATAACCAGTGGAAGACAATATGTTGTCCAA
TTTGGAAAGGGCCTATACCACCAAAATTTTTAGCATGTATATGTCGTATAAGGAAAAACC
CATTTGACAATAATGTTCTGGTCCGAGTTTTAAGAGCTTGTGAATTAGGAGATAAAGACA
TCAAGTGTTAACGATGCGATCATAAAATAGTCAAACCACCAATGATCGTCAAACCAAACT
TGAGATAATAAGGTGTAGTAATTATCTGGCTATTTCTTAATTTCGTTTAATAATTTTAGT
TAAGTTCTTGTTCAATAACAAGATAAAATTTATATTATTTATGTTCATGCTCTTATGAAT
TACGATTCCGTGTTCTTTTTTTTGTTTCTGTGTATTTTATTATATGTAGAAATAAAAAAT
CCAAAAAGTTATAGTCTACTCTAAAATAACCAAGATTTGTAATAAGAATCTTCATTTTAT
TTACTT


BQ
45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 40 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1BP23TF U 1
AF RS1B050JQ C 1
AF RS1B050TF U 1
AF RS1BK93TF U 4
AF RS1GR40JQ C 117
AF RS1FA46TF U 1
AF RS1GR40TF U 1
AF RS1F980TF U 1
AF RS1F980JQ C 1
BS 1 270 RS1BP23TF
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BS 594 660 RS1FA46TF
BS 661 666 RS1F980JQ

RD RS1BP23TF 528 0 0
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TGAGATAATAAGGTGTAGTAATTATCTGGCTATTTCTTAATTTCGTTTAATAATTTTAGT
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QA 1 528 1 528
DS 

RD RS1B050JQ 593 0 0
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TCATGATGTTAACATCATTCCCTGCTACGATCAACGGTGATGATTGCCCTGACACTATTC
GGACCTGCTTGCGCCTAGCTAGAGCCAAAGATAACCAGTGGAAGACAATATGTTGTCCAA
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CATTTGACAATAATGTTCTGGTCCGAGTTTTAAGAGCTTGTGAATTAGGAGATAAAGACA
TCAAGTGTTAACGATGCGATCATAAAACAGTCAAACCACCAATGATCGTCAAACCAAACT
TGAGATAATAAGGTGTAGTAATTATCTGGCTATTTCTTAATTTCGTTTAATAATTTTAGT
TAAGTTCTTGTTCAATAACAAGATAAAATTTATATTATTTATGTTCATGCTCTTATGAAT
TACGATTCCGTGTTCTTTTTTTTGTTTCTGTGTATTTTATTATATGTAGAAAT

QA 1 593 1 593
DS 

RD RS1B050TF 593 0 0
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TCGAGCGCTACTAATTAATCCCTAAAATGAAGTTAATTCTGTTGATGTGCATCGTCTTTG
TCATGATGTTAACATCATTCCCTGCTACGATCAACGGTGATGATTGCCCTGACACTATTC
GGACCTGCTTGCGCCTAGCTAGAGCCAAAGATAACCAGTGGAAGACAATATGTTGTCCAA
TTTGGAAAGGGCCTATACCACCAAAATTTTTAGCATGTATATGTCGTATAAGGAAAAACC
CATTTGACAATAATGTTCTGGTCCGAGTTTTAAGAGCTTGTGAATTAGGAGATAAAGACA
TCAAGTGTTAACGATGCGATCATAAAACAGTCAAACCACCAATGATCGTCAAACCAAACT
TGAGATAATAAGGTGTAGTAATTATCTGGCTATTTCTTAATTTCGTTTAATAATTTTAGT
TAAGTTCTTGTTCAATAACAAGATAAAATTTATATTATTTATGTTCATGCTCTTATGAAT
TACGATTCCGTGTTCTTTTTTTTGTTTCTGTGTATTTTATTATATGTAGAAAT

QA 1 593 1 593
DS 

RD RS1BK93TF 596 0 0
GG
ATCAAGTTGTTTCACATTTCTCAACAGAAAATATTTTATTCTGAGGCTAATTATCTCGAG
CGCTACTAATTAATCCCTAAAATGAAGTTAATTCTGTTGATGCGCATCGTCTTTGTCATG
ATGTTAACATCATTCCCTGCTACGATCAACGGTGATGATTGCCCTGACACTATTCGGACC
TGCTTGCGCCTAGCTAGAGCCAAAGATAACCAGTGGAAGACAATATGTTGTCCAATTTAG
AAAGGGCCTATACCACCAAAATTTTTAGCATGTATATGTCGTATAAGGAAAAACCCATTT
GACAATAATGTTCTGGTCCGAGTTTTAAGAGCTTGTGAATTAGGAGATAAAGACATCAAG
TGTTAACGATGCGATCATAAAATAGTCAAACCACCAATGATCGTCAAACCAAACTTGAGA
TAATAAGGTGTAGTAATTATCTGGCTATTTCTTAATTTCGTTTAATAATTTTAGTTAAGT
TCCTGTTCAATAACAAGATAAAATTTATATTATTTATGTTCATGCTCTTATGAATTACGA
TTCCGTGTTCTTTTTTTTGTTTCTGTGTATTTTATTATATGTAGAAATAAAAAA

QA 3 596 3 596
DS 

RD RS1GR40JQ 501 0 0
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ATTCGGACCTGCTTGCGCCTAGCTAGAGCCAAAGATAACCAGTGGAAGACAATATGTTGT
CCAATTTGGAAAGGCCCTATACCACCAAAATTTTTAGCATGTATATGTCGTATAAGGAAA
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AACTTGAGATAATAAGGTGTAGTAATTATCTGGCTATTTCTTAATTTCGTTTAATAATTT
TAGTTAAGTTCTTGTTCAATAACAAGATAAAATTTATATTATTTATGTTCATGCTCTTAT
GAATTACGATTCCGTGTTCTTTTTTTTGTTTCTGTGTATTTTATTATATGTAGAAATAAA
AAATCCAAAAAGTTATAGTC
C

QA 1 500 1 500
DS 

RD RS1FA46TF 660 0 0
GGAACATCAAGTTGTTTCACATTTCTCAACAGAAAATATTTTATTCTGAGGCTAATTATC
TCGAGCGCTACTAATTAATCCCTAAAATGAAGTTAATTCTGTTGATGTGCATCGTCTTTG
TCATGATGTTAACATCATTCCCTGCTACGATCAACGGTGATGATTGCCCTGACACTATTC
GGACCTGCTTGCGCCTAGCTAGAGCCAAAGATAACCAGTGGAAGACAATATGTTGTCCAA
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TCAAGTGTTAACGATGCGATCATAAAATAGTCAAACCACCAATGATCGTCAAACCAAACT
TGAGATAATAAGGTGTAGTAATTATCTGGCTATTTCTTAATTTCGTTTAATAATTTTAGT
TAAGTTCTTGTTCAATAACAAGATAAAATTTATATTATTTATGTTCATGCTCTTATGAAT
TACGATTCCGTGTTCTTTTTTT*GTTTCTGTGTATTTTATTATATGTAGAAATAAAAAAT
CCAAAAAGTTATAGTCTACTCTAAAATAACCAAGATTTGTAATAAGAATCTTCATTTTAT

QA 1 660 1 660
DS 

RD RS1GR40TF 617 0 0
GGAACATCAAGTTGTTTCACATTTCTCAACAGAAAATATTTTATTCTGAGGCTAATTATC
TCGAGCGCTACTAATTAATCCCTAAAATGAAGTTAATTCTGTTGATGTGCATCGTCTTTG
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GGACCTGCTTGCGCCTAGCTAGAGCCAAAGATAACCAGTGGAAGACAATATGTTGTCCAA
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TCAAGTGTTAACGATGCGATCATAAAATAGTCAAACCACCAATGATCGTCAAACCAAACT
TGAGATAATAAGGTGTAGTAATTATCTGGCTATTTCTTAATTTCGTTTAATAATTTTAGT
TAAGTTCTTGTTCAATAACAAGATAAAATTTATATTATTTATGTTCATGCTCTTATGAAT
TACGATTCCGTGTTCTTTTTTTTGTTTCTGTGTATTTTATTATATGTAGAAATAAAAAAT
CCAAAAAGTTATAGTC
C

QA 1 616 1 616
DS 

RD RS1F980TF 664 0 0
GGAACATCAAGTTGTTTCACATTTCTCAACAGAAAATATTTTATTCTGAGGCTAATTATC
TCGAGCGCTACTAATTAATCCCTAAAATGAAGTTAATTCTGTTGATGTGCATCGTCTTTG
TCATGATGTTAACATCATTCCCTGCTACGATCAACGGTGATGATTGCCCTGACACTGTTC
GGACCTGCTTGCGCCTAGCTAGAGCCAAAGATAACCAGTGGAAGACAATATGTTGTCCAA
TTTGGAAAGGGCCTATACTACCAAAATTTTTAGCATGTATATGTCGTATAAGGAAAAACC
CATTTGACAATAATGTTCTGGTCCGAGTTTTAAGAGCTTGTGAATTAGGAGATAAAGACA
TCAAGTGTTAACGATGCGATCATAAAATAGTCAAACCACCAATGATCGTCAAACCAAACT
TGAGATAATAAGGTGTAGTAATTATCTGGCTATTTCTTAATTTCGTTTAATAATTTTAGT
TAAGTTCTTGTTCAATAACAAGATAAAATTTATATTATTTATGTTCATGCTCTTATGAAT
TACGATTCCGTGTTCTTTTTTT*GTTTCTGTGTATTTTATTATATGTAGAAATAAAAAAT
CCAAAAAGTTATAGTCTACTCTAAAATAACCAAGATTTGTAATAAGAATCTTCATTTTAT
TTAC

QA 1 660 1 660
DS 

RD RS1F980JQ 666 0 0
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GGACCTGCTTGCGCCTAGCTAGAGCCAAAGATAACCAGTGGAAGACAATATGTTGTCCAA
TTTGGAAAGGGCCTATACTACCAAAATTTTTAGCATGTATATGTCGTATAAGGAAAAACC
CATTTGACAATAATGTTCTGGTCCGAGTTTTAAGAGCTTGTGAATTAGGAGATAAAGACA
TCAAGTGTTAACGATGCGATCATAAAATAGTCAAACCACCAATGATCGTCAAACCAAACT
TGAGATAATAAGGTGTAGTAATTATCTGGCTATTTCTTAATTTCGTTTAATAATTTTAGT
TAAGTTCTTGTTCAATAACAAGATAAAATTTATATTATTTATGTTCATGCTCTTATGAAT
TACGATTCCGTGTTCTTTTTTT*GTTTCTGTGTATTTTATTATATGTAGAAATAAAAAAT
CCAAAAAGTTATAGTCTACTCTAAAATAACCAAGATTTGTAATAAGAATCTTCATTTTAT
TTACTT

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 8

CO CL501Contig1 1110 8 8 U
GGAGAATCAAATCCTATAATCCAGAATTCGAGAACGAGGCTGAGAAGAAAATCATCAATC
AAACCAACACAGGATGGCGGGTCACCACGCGATCGAGGTTACAAAGACGGTGCTGGAGGT
TGCGGACGTAGCGTGGACCGCCGTGGAAGTCTACCACCAACACCACCACCACGACCATCA
CAGCGACGAAGGCGAGAATCACGACGAGTCAACAGATCCGATCACGGATCCACGAGATCG
AGAATTAGAAGCTCTTCGCCAAGAGAATATCCGTCTCAGGACCTTGCTTGAAGCGAATCT
TAAGCTCTTTGAGACTCTCGCTGAATCCGCTGCGTTATCTCACGATTGCCCTAAAGACAT
CTATGCGAGGCTTGTATCGATGGTTACATCGAGAGATTTCTTGGCTCGATTAGAAAGTCT
GAGGCAAGCGTTATCTAACGGAACTCAAAATCAGTTTCCCTTCAAAGAGCCTACAGAAGA
TGATGTGCAGACTGTTGAAGTACTTATAGAGATTGATCACCAAGAACCAAGCTGGTGGGT
TTTGGTGACAGACGACATGATCCCTAGCAATGTCGAGGAAAAAAGCGCTATCGATAACGA
CCATTACATTGTTGTGAATGAGGAACATGTGGTTGATGCTGTTGCACACTTCTTAGCAAA
ATGCATCATGTCAAACCCCAAAGCTAAGATTCTCAAACCTGAAGAGCTTCAGAAGATTCT
GGCACAAGAAGTTAGTGCTCTGAGCAAGGTAGGGAGGGTAGTGGATATATGGCACGCTGG
GAAAATGTTCTACACGTTTTCCACATGGGGACTTGCTTTCGGAGGGTTATATCAAGCTCG
TGGTGCGTTGAAGATAGCTGCTAAGGGCGTTCATGCAACAAGCAAAGTTGTTCTGAGGGC
TCTCTGAAAGTTGTAAAAGGGGTCTACTGCGATGAAAGCAGAGATGATTCTCCTCTTTCT
CATGGTTTGTGTTTCTGTGTTGTGTTGGAATGACTTTTATTTTAGTTACTACTATCATTG
GGTCATTGCTTGTGTAAATAGTGTAAAATGTGTGTGATCAGAATTGTACTTTACTTTACT
TGAATTCTTCATTTGTTCTTTGATTCTCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FZ60TF U 11
AF RS1ET57TF U 14
AF RS1DF28TF U 17
AF RS1DV20TF U 28
AF RS1EK68TF U 1
AF RS1DV20JQ C 291
AF RS1ET57JQ C 355
AF RS1DF28JQ C 465
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BS 786 800 RS1EK68TF
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BS 1023 1095 RS1ET57JQ
BS 1096 1110 RS1DF28JQ

RD RS1FZ60TF 482 0 0
GGGGGAT
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CGGGTCACCACGCGATCGAGGTTACAAAGACGGTGCTGGAGGTTGCGGACGTAGCGTGGA
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CGATGGTTACATCGAGAGATTTCTTGGCTCGATTAGAAAGTCTGAGGCAAGCGTTATCTA
ACGGAACTCAAAATCAGTTTCCCTTCAAAGAGCCTACAGGAGATGATGTGCAGAC

QA 8 482 8 482
DS 

RD RS1ET57TF 605 0 0
GGAT
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CGGGTCACCACGCGATCGAGGTTACAAAGACGGTGCTGGAGGTTGCGGACGTAGCGTGGA
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CGATGGTTACATCGAGAGATTTCTTGGCTCGATTAGAAAGTCTGAGGCAAGCGTTATCTA
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A

QA 5 605 5 605
DS 

RD RS1DF28TF 727 0 0
G
AATCCAGAATTCGAGAACGAGGCTGAGAAGAAAATCATCAATCAAACCAACACAGGATGG
CGGGTCACCACGCGATCGAGGTTACAAAGACGGTGCTGGAGGTTGCGGACGTAGCGTGGA
CCGCCGTGGAAGTCTACCACCAACACCACCACCACGACCATCACAGCGACGAAGGCGAGA
ATCACGACGAGTCAACAGATCCGATCACGGATCCACGAGATCGAGAATTAGAAGCTCTTC
GCCAAGAGAATATCCGTCTCAGGACCTTGCTTGAAGCGAATCTTAAGCTCTTTGAGACTC
TCGCTGAATCCGCTGCGTTATCTCACGATTGCCCTAAAGACATCTATGCGAGGCTTGTAT
CGATGGTTACATCGAGAGATTTCTTGGCTCGATTAGAAAGTCTGAGGCAAGCGTTATCTA
ACGGAACTCAAAATCAGTTTCCCTTCAAAGAGCCTACAGAAGATGATGTGCAGACTGTTG
AAGTACTTATAGAGATTGATCACCAAGAACCAAGCTGGTGGGTTTTGGTGACAGACGACA
TGATCCCTAGCAATGTCGAGGAAAAAAGCGCTATCGATAACGACCATTACATTGTTGTGA
ATGAGGAACATGTGGTTGATGCTGTTGCACACTTCTTAGCAAAATGCATCATGTCAAACC
CCAAAGCTAAGATTCTCAAACCTGAAGAGCTTCAGA*GAT*CTGGCACAAGAAGTTAGTG
CTCTGA

QA 2 727 2 727
DS 

RD RS1DV20TF 717 0 0
GG
GAGAACGAGGCTGAGAAGAAAATCATCAATCAAACCAACACAGGATGGCGGGTCATCACG
CGATCGAGGTTACAAAGACGGTGCTGGAGGTTGCGGACGTAGCGTGGACCGCCGTGGAAG
TCTACCACCAACACCACCACCACGACCATCACAGCGACGAAGGCGAGAATCACGACGAGT
CAACAGATCCGATCACGGATCCACGAGATCGAGAATTAGAAGCTCTTCGCCAAGAGAATA
TCCGTCTCAGGACCTTGCTTGAAGCGAATCTTAAGCTCTTTGAGACTCTCGCTGAATCCG
CTGCGTTATCTCACGATTGCCCTAAAGACATCTATGCGAGGCTTGTATCGATGGTTACAT
CGAGAGATTTCTTGGCTCGATTAGAAAGTCTGAGGCAAGCGTTATCTAACGGAACTCAAA
ATCAGTTTCCCTTCAAAGAGCCTACAGAAGATGATGTGCAGACTGTTGAAGTACTTATAG
AGATTGATCACCAAGAACCAAGCTGGTGGGTTTTGGTGACAGACGACATGATCCCTAGCA
ATGTCGAGGAAAAAAGCGCTATCGATAACGACCATTACATTGTTGTGAATGAGGAACATG
TGGTTGATGCTGTTGCACACTTCTTAGCAAAATGCATCATGTCAAACCCCAAAGCTAAGA
TTCTCAAACCTGAAGAGCTTCAGAAGATTCTGGCACAAGAAGTTAGTGCTCTGAG

QA 3 717 3 717
DS 

RD RS1EK68TF 800 0 0
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AAACCAACACAGGATGGCGGGTCACCACGCGATCGAGGTTACAAAGACGGTGCTGGAGGT
TGCGGACGTAGCGTGGACCGCCGTGGAAGTCTACCACCAACACCACCACCACGACCATCA
CAGCGACGAAGGCGAGAATCACGACGAGTCAACAGATCCGATCACGGATCCACGAGATCG
AGAATTAGAAGCTCTTCGCCAAGAGAATATCCGTCTCAGGACCTTGCTTGAAGCGAATCT
TAAGCTCTTTGAGACTCTCGCTGAATCCGCTGCGTTATCTCACGATTGCCCTAAAGACGT
CTATGCGAGGCTTGTATCGATGGTTACATCGAGAGATTTCTTGGCTCGATTAGAAAGTCT
GAGGCAAGCGTTATCTAACGGAACTCAAAATCAGTTTCCCTTCAAAGAGCCTACAGAAGA
TGATGTGCAGACTGTTGAAGTACTTATAGAGATTGATCACCAAGAACCAAGCTGGTGGGT
TTTGGTGACAGACGACATGATCCCTAGCAATGTCGAGGAAAAAAGCGCTATCGATAACGA
CCATTACATTGTTGTGAATGAGGAACATGTGGTTGATGCTGTTGCACACTTCTTAGCAAA
ATGCATCATGTCAAACCCCAAAGCTAAGATTCTCAAACCTGAAGAGCTTCAGAAGATTCT
GGCACAAGAAGTTAGTGCTCTGAGCAAGGTAGGGAGGGTAGTGGATATATGGCACGCTGG
GAAA*TGTTCTACACGTTTT

QA 1 800 1 800
DS 

RD RS1DV20JQ 734 0 0
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CTAAAGACATCTATGCGAGGCTTGTATCGATGGTTACATCGAGAGATTTCTTGGCTCGAT
TAGAAAGTCTGAGGCAAGCGTTATCTAACGGAACTCAAAATCAGTTTCCCTTCAAAGAGC
CTACAGAAGATGATGTGCAGACTGTTGAAGTACTTATAGAGATTGATCACCAAGAACCAA
GCTGGTGGGTTTTGGTGACAGACGACATGATCCCTAGCAATGTCGAGGAAAAAAGCGCTA
TCGATAACGACCATTACATTGTTGTGAATGAGGAACATGTGGTTGATGCTGTTGCACACT
TCTTAGCAAAATGCATCATGTCAAACCCCAAAGCTAAGATTCTCAAACCTGAAGAGCTTC
AGAAGATTCTGGCACAAGAAGTTAGTGCTCTGAGCAAGGTAGGGAGGGTAGTGGATATAT
GGCACGCTGGGAAAATGTTCTACACGTTTTCCACATGGGGACTTGCTTTCGGAGGGTTAT
ATCAAGCTCGTGGTGCGTTGAAGATAGCTGCTAAGGGCGTTCATGCAACAAGCAAAGTTG
TTCTGAGGGCTCTCTGAAAGTTGTAAAAGGGGTCTACTGCGATGAAAGCAGAGATGATTC
TCCTCTTTCTCATGGTTTGTGTTTCTGTGTTGTGTTGGAATGACTTTTATTTTAGTTACT
ACTATCATTGGG
GC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1ET57JQ 742 0 0
AGACATCTATGCGAGGCTTGTATCGATGGTTACATCGAGAGATTTCTTGGCTCGATTAGA
AAGTCTGAGGCAAGCGTTATCTAACGGAACTCAAAATCAGTTTCCCTTCAAAGAGCCTAC
AGAAGATGATGTGCAGACTGTTGAAGTACTTATAGAGATTGATCACCAAGAACCAAGCTG
GTGGGTTTTGGTGACAGACGACATGATCCCTAGCAATGTCGAGGAAAAAAGCGCTATCGA
TAACGACCATTACATTGTTGTGAATGAGGAACATGTGGTTGATGCTGTTGCACACTTCTT
AGCAAAATGCATCATGTCAAACCCCAAAGCTAAGATTCTCAAACCTGAAGAGCTTCAGAA
GATTTTGGCACAAGAAGTTAGTGCTTTGAGCAAGGTAGGGAGGGTAGTGGATATATGGCA
CGCTGGGAAAATGTTTTACACGTTTTCCACATGGGGACTTGCTTTCGGAGGGTTATATCA
AGCTCGTGGTGCGTTGAAGATAGCTGCTAAGGGCGTTCATGCAACAAGCAAAGTTGTTTT
GAGGGCTCTTTGAAAGTTGTAAAAGGGGTTTACTGCGATGAAAGCAGAGATGATTCTCCT
CTTTCTCATGGTTTGTGTTTCTGTGTTGTGTTGGAATGACTTTTATTTTAGTTACTACTA
TCATTGGGTCATTGCTTGTGTAAATAGTGTAAAATGTGTGTGATCAGAATTGTACTTTAC
TTTACTTGAATTCTTCATTTG
G

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1DF28JQ 646 0 0
AAAGAG
CTACAGAAGATGATGTGCAGACTGTTGAAGTACTTATAGAGATTGATCACCAAGAACCAA
GCTGGTGGGTTTTGGTGACAGACGACATGATCCCTAGCAATGTCGAGGAAAAAAGCGCTA
TCGATAACGACCATTACATTGTTGTGAATGAGGAACATGTGGTTGATGCTGTTGCACACT
TCTTAGCAAAATGCATCATGTCAAACCCCAAAGCTAAGATTCTCAAACCTGAAGAGCTTC
AGAAGATTCTGGCACAAGAAGTTAGTGCTCTGAGCAAGGTAGGGAGGGTAGTGGATATAT
GGCACGCTGGGAAAATGTTCTACACGTTTTCCACATAGGGACTTGCTTTCGGAGGGTTAT
ATCAAGCTCGTGGTGCGTTGAAGATAGCTGCTAAGGGCGTTCATGCAACAAGCAAAGTTG
TTCTGAGGGCTCTCTGAAAGTTGTAAAAGGGGTCTACTGCGATGAAAGCAGAGATGATTC
TCCTCTTTCTCATGGTTTGTGTTTCTGTGTTGTGTTGGAATGACTTTTATTTTAGTTACT
ACTATCATTGGGTCATTGCTTGTGTAAATAGTGTAAAATGTGTGTGATCAGAATTGTACT
TTACTTTACTTGAATTCTTCATTTGTTCTTTGATTCTCGG

QA 7 646 7 646
DS 



AS 1 9

CO CL502Contig1 1105 9 24 U
GGATAGTATCATTCACCAATCTCTAGCCAATAGTCACACACACACACACACACACACACA
CACTCACAATGGCCACCGTCGCTAACTTCTCAGCCAAACCAATCACCACCGTGATTCCAC
GGCTGTCATCCGCCGTTGCCTCCACCTCATCCTTCGTATTCTTCGACCCCAAACCCAACT
CACTGATCCTAAAACAGAGCTGGGTTAAAACTCCCTCGAAAAGAAGATTCTCAGCCGTGA
AGGTCAAGGCCAGTGCGGCGTCACCAGGGAAGGTTGGTACACCGGCGGCGAAGGACGAGA
AAGTGCAAAAGATTCACAGCGGAGAGGAGTTTGACGAAGCGCTTAAGAAGGCCAAGAACA
AGCTTGTGGTTGTGGAGTTTGCCACGAGTAAGAGTGATCAGAGTAGTAAGATATATCCGT
TTATGGTGGAGCTGAGCAGGACATGTAACGACGTCGACTTCTTGCTCGTCATGGGTGATG
AGTCCGAAAAGACTAGAGAGCTTTGTCGGAGAGAAAAGATCGAGAAAGTTCCTCACTTTA
GCTTCTATAAGAGCATGGAGAAAATACACGAGGAAGAAGGTATCGGACCGGACCAGCTAA
TGGGGG*ACGTGCTATATTACGGGGACAGCCACTCGGCGGTTGTGCAGCTGCATGGACGA
GCTGACGTGGAGAAGCTGATTGACGAGAACCGTACTGGAGGCAAGCTGATTGTGCTGGAT
GTCGGTCTGAAACACTGTGGACCATGCGTGAAGGTTTATCCGACGGTGCTGAAACTGTCG
CGGTCGATGTCCGAGTCTGTCGTGTTCGCTAGAATGAATGGGGACGAGAACGATAGCTGT
ATGGAGTTTCTAAAGGACATGAATGTTATCGAAGTACCAACTTTCTTGTTCATCAGACAA
GGCGATATTTGTGGGCGGTATGTTGGTTCCGGTAAAGGAGAACTCATTGGAGAGATTCTC
CGGTACTCAGGCGTTCGTGTCACTTACTAATTTGTATCAAAACTCGATTGATTCAAAGAA
TTATGTTTTTGTGGGTTTTGTTTGTACCATCCGATCGAGACCGGTTGAATATGAAAAAAA
CGCAAAGTGTGTGATTATTGGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 5 5 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 25 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 
55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 55 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 45 45 45 15 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 15 35 
35 35 35 35 15 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

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AF RS1AK33TF U 400
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AAAGATTCACAGCGGAGAGGAGTTTGACGAAGCGCTTAAGAAGGCCAAGAACAAGCTTGT
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GGAGCTGAGCAGGACATGTAACGACGTCGACTTCTTGCTCGTCATGGGTGATGAGTCCGA
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TAATAGCATGGAGAAAATACACGAGGAAGAAGGTATCGGACCGGACCAGCTAATGGGGG*
ACGTGCTATAT

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CACTCACAATGGCCACCGTCGCTAACTTCTCAGCCAAACCAATCACCACCGTGATTCCAC
GGCTGTCATCCGCCGTTGCCTCCACCTCATCCTTCGTATTCTTCGACCCCAAACCCAACT
CACTGATCCTAAAACAGAGCTGGGTTAAAACTCCCTCGAAAAGAAGATTCTCAGCCGTGA
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AAGTGCAAAAGATTCACAGCGGAGAGGAGTTTGACGAAGCGCTTAAGAAGGCCAAGAACA
AGCTTGTGGTTGTGGAGTTTGCCACGAGTAAGAGTGATCAGAGTAGTAAGATATATCCGT
TTATGGTGGAGCTGAGCAGGACATGTAACGACGTCGACTTCTTGCTCGTCATGGGTGATG
AGTCCGAAAAGACTAGAGAGCTTTGTCGGAGAGAAAAGATCGAGAAAGTTCCTCACTTTA
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GCTGACGTGGAGAAGCTGATTGACGAGAACCGTA

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CCTAAAACAGAGCTGGGTTAAAACTCCCTCGAAAATAAGATTCTCAGCCGTGAAGGTCAG
GGCCAGTGCGGCGTCACCAGGGAAGGTTGGTACACCGGCGGCGAAGGACGAGAAAGTGCA
AAAGATTCACAGCGGAGAGGAGTTTGACGAAGCGCTTAAGAAGGCCAAGAACAAGCTTGT
GGTTGTGGAGTTTGCCATGAGTAAGAGTGATCAGAGTAGTAAGATATATCCGTTTATGGT
GGAGCTGAGCAGGACATGTAACGACGTCGACTTCTTGCTCGTCATGGGTGATGAGTCCGA
AAAGACTAGAGAGCTTTGTCGGAGAGAAAAGATCGAGAAAGTTCCTCACTTTAGCTTCTA
TAAGAGCATGGAGAAAATACACGAGGAAGAAGGTATCGGACCGGACCAGCTAATGGGGGG
ACGTGCTATATTACGGGGACAGCCACTCGGCGGTTGTGCAGCTGCATGGACGAGCTGACG
TGGAGAAGCTGATTGACGAGAACCGTACTGGAG
CAA

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GCTTCTATAAGAGCATGGAGAAAATACACGAGGAAGAAGGTATCGGACCGGACCAGCTAA
TGGGGG*ACGTGCTATATTACGGGGACAGCCACTCGGCGGTTGTGCAGCTGCATGGACGA
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GTCGGTCTGAAACACTGTGGACCATGCGTGAAGGTTTATCCGACGGTGCTGAAACTGTCG
CGGTCGATGTCCGAGTCTGTCGTGTTCGCTAGAATGAATGGGGACGAGAACGATAGCTGT
ATGGAGTTTCTAAAGGACATGAATGTTATCGAAGTACCAACTTTCTTGTTCATCAGACAA
GGCGATATTTGTGGGCGGTATGTTGGTTCCGGTAAAGGGGAACTCATTGGAGAGATTCTC
CGGTACTCAGGCGTTCGTGTCACTTACTAATTTGTATCAAAACTCGATTGATTCAAAGAA
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TGGAGAAAATACACGAGGAAGAAGGTATTGGACCGGACCAGCTAATGGGGG*ACGTGCTA
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CTGATTGACGAGAACCGTACTGGGGGCAAGCTGATTGTGCTGGATGTCGGTCTGAAACAC
TGTGGACCATGCGTGAAGGTTTATCCGACGGTGCTGAAACTGTCCCGGTCGATGTCCGCG
AGTGTCGTGTTCGCTAGAATGAATGGGGACGAAAACGATAGCTGTATGGAGTTTCTAAAG
GACATGAATGTTATCGAAGTACCAACTTTCTTGTTCATCAGAAACGGCGATATTTGTGGG
CGGTATGTTGGTTCCGGTAAAGGAGAACTCATTGGAGAGATTCTCCGGTACTCAGGCGTT
CGTGTCACTTACTAATTTGTATCAAAACTCGATTGATTCAAAGAATTATGTTTTTGTGGG
TTTTGTTTGTACCATCCGATCGAGACCGGTTGAATATGAAAAAAACGCAAAGTGTGTGAT
TATTGGTTCC

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DS 

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CTCACTTTAGCTTCTATAAGAGCATGGAGAAAATACACGAGGAAGAAGGTATCGGACCGG
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GTGCTGGATGTCGGTTTGAAACACTGTGGACCATGCGTGAAGGTTTATCCGACGGTGCTG
AAACTGTCGCGGTCGATGTCCGAGTCTGTCGTGTTCGCTAGAATGAATGGGGACGAGAAC
GATAGCTGTATGGAGTTTTTAAAGGACATGAATGTTATCGAAGTACCAACTTTCTTGTTC
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GAGATTTTCCGGTACTCAGGCGTTCGTGTCACTTACTAATTTGTATCAAAACTCGATTGA
TTCAAAGAATTATGTTTTTGTGGGTTTTGTTTGTACCATCCGATCGAGACCGGTTGAATA
TGAAAAAAACGCAAAGTTTGTGATTATTGGTT
TG

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GTATTGGACCGGACCAGCTAATGGGGG*ACGTGCTATATTACGGGGACAGCCACTCGGCG
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GGCAAGCTGATTGTGCTGGATGTCGGTCTGAAACACTGTGGACCATGCGTGAAGGTTTAT
CCGACGGTGCTGAAACTGTCCCGGTCGATGTCCGCGAGTGTCGTGTTCGCTAGAATGAAT
GGGGACGAAAACGATAGCTGTATGGAGTTTCTAAAGGACATGAATGTTATCGAAGTACCA
ACTTTCTTGTTCATCAGAAACGGCGATATTTGTGGGCGGTATGTTGGTTCCGGTAAAGGA
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AAACTCGATTGATTCAAAGAATTATGTTTTTGTGGGTTTTGTTTGTACCATCCGATCGAG
ACCGGTTGAATATGAAAAAA*CGCAA*GTGTGTGATTATTGGTT
C

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DS 

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GTAAGAGTGATCAGAGTAGTAAGATATATCCGTTTATGGTGGAGCTGAGCAGGACATGTA
ACGACGTCGACTTCTTGCTCGTCATGGGTGATGAGTCCGAAAAGACTAGAGAGCTTTGTC
GGAGAGAAAAGATCGAGAAAGTTCCTCACTTTAGCTTCTATAATAGCATGGAGAAAATAC
ACGAGGAAGAAGGTATCGGACCGGACCAGCTAATGGGGG*ACGTGCTATATTACGGGGAC
AGCCACTCGGCGGTTGTGCAGCTGCATGGACGAGCTGACGTGGAGAAGCTGATTGACGAG
AACCGTACTGGAGGCAAGCTGATTGTGCTGGATGTCGGTCTGAAACACTGTGGACCATGC
GTGAAGGTTTATCCGACGGTGTTGAAACTGTCGCGGTCGATGTCCGAGTCTGTCGTGTTC
GCTAGAATGAATGGGGACGAGAACGATAGCTGTATGGAGTTTCTAAAGGACATGAATGTT
ATCGAAGTACCAACTTTCTTGTTCATCAGACAAGGCGATATTTGTGGGCGGTATGTTGGT
TCCGGTAAAGGAGAACTCATTGGAGAGATTCTCCGGTACTCAGGCGTTCGTGTCACTTAC
TAATTTGTATCAAAACTCGATTGATTCAAAGAATTATGTTTTTGTGGGTTTTGTTTGTAC
CATCCGATCGAGACCGGTTGAATATGAAAAAAACGCAAAGTTTGTGATT

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DS 

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AAGATATATCCGTTTATGGTGGAGCTGAGCAGGACATGTAACGACGTCGACTTCTTGCTC
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GTTCCTCACTTTAGCTTCTATAAGAGCATGGAGAAAATACACGAGGAAGAAGGTATCGGA
CCGGACCAGCTAATGGGGG*ACGTGCTATATTACGGGGACAGCCACTCGGCGGTTGTGCA
GCTGCATGGACGAGCTGACGTGGAGAAGCTGATTGACGAGAACCGTAGTGGAGGCAAGCT
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GCTGAAACTGTCGCGGTCGATGTCCGAGTCTGTCGTGTTCGCTAGAATGAATGGGGACGA
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TTGATTCAAAGAATTATGTTTTTGTGGGTTTTGTTCGTACCATCCGATCGAGACCGGTTG
AATATGAAAAAAACGCAAAGTTTGTGATT

QA 11 759 11 759
DS 



AS 2 7

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AAGATCAGATCATGGTGGGGTTTTTTATTTTCTCCTTATCAAGAAACCTCTGATCAGTCA
AATACCCATCAATCAATCAAATCCCCAAACACTCCAAAAAAAGAGAGGAGAGCTTCCAAC
TTCAAAGCCTTTTTCATCTTCTTAAAAAATGTCTATGTCGTCTATGTCTTCCCCTTCCTC
AGCTGTTTTTTCACCAGAGAACCTCTCACCAGATCCTCTCTCTCCTTCCGAACAGCTCTG
CTATGTCCAGTGCAACTATTGCGAAACCATTCTTGCGGTTAGTGTTCCTTACACAAGCAT
GTTCAAGACCGTAACCGTCAGATGTGGTTGCTGTACTAATCTTATTTCCGTGAACATGAG
ATCGCTTGTCCTTCCAGCTTCTAACCAGCTCCAGCTCCAGCTTGGACCTCACTCTTACTT
CACTCCCCAAAACATTCTGGGGGAGCTGAAAGATGCACCATCAAACATGAATATGATGAT
GATGAATCAACACCCTAATATGAATGACATCCCATCTTTCATGGATCTTCATCAGCAACA
TGAGATTCCTAAGGCACCACCCGTTAACCGCCCTCCAGAGAAAAGACAGAGAGTCCCATC
CGCATATAACCGATTCATCAAGGAGGAGATCCAACGTATCAAAGCTGGTAATCCTGATAT
AAGCCACCGAGAAGCTTTTAGTGCTGCAGCCAAGAATTGGGCCCACTTCCCCCACATACA
CTTCGGGCTCTCGCCAGACAATCAACCCGTGAAGAAAACCAACATGCCTCAACAGGAGGG
TGAAGACAACATGGGGATGAGAGAAGGGTTTTACGCTCCTGCGGCGAATGTTGGTGCGAT
TCCTTACTAAAGATAAATTTAATCAAGAAGTATTTAAGACTTTGAAATCCAGTTTGTAGG
GTTTATGTTGCCCAAAAGTAGGGTTTCTTTTTCTTTCTTGAACTTATATATGTTATATAT
GCTTGCGTTTTCTTCTGTTGTTGTAATCAAAATCCTGCTAATTAATGAGGTTTGCTATGT
TAGTTTCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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AAAAAAAGAGAGGAGAGCTTCCAACTTCAAAGCCTTTTTCATCTTCTTAAAAAATGTCTA
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ATAACCGATTCATCAAGGAGGAGATCCAACGTATCAAAGCTGGTAATCCTGATATAAGCC
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DS 



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TAAAAAATGTCTATGTCGTCTATGTCTTCCCCTTCCTCAGCTGTTTTTTCACCAGAGAAC
CTCTCACCAGATCCTCTCTCCTTCCGAACAGCTCTGCTATGTCCAGTGCAACTATTGCGA
AACCATTCTTGCGGTTAGTGTTCCTTACACAAGCATGTTCAAGACCGTAACCGTCAGATG
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BQ
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AF RS1BI05TF U 1
AF RS1BI05JQ C 52
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BS 650 752 RS1BI05JQ

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TAAAAAATGTCTATGTCGTCTATGTCTTCCCCTTCCTCAGCTGTTTTTTCACCAGAGAAC
CTCTCACCAGATCCTCTCTCCTTCCGAACAGCTCTGCTATGTCCAGTGCAACTATTGCGA
AACCATTCTTGCGGTTAGTGTTCCTTACACAAGCATGTTCAAGACCGTAACCGTCAGATG
TGGTTGCTGTACTAATCTTATTTCCGTGAACATGAGATTCCTAAGGCACCACCCGTTAAC
CGCCCTCCAGAGAAAAGACAGAGGGTCCCATCCGCATATAACCGATTCATCAAGGAGGAG
ATCCAACGTATCAAAGCTGGTAATCCTGATATAAGCCACCGAGAAGCTTTTAGTGCTGCA
GCCAAGAATTGGGCCCACTTCCCCCACATACACTTCGGGCTCTCGCCAGACAATCAACCC
GTGAAGAAAACCAACATGCCTCAACAGGAGGGTGAAGACAACATGGGGATGAGAGAAGGG
TTCTACGCTCCTGCGGCGAATGTTGGTGCGATTCCTTACTAAAGATAAATTTAATCAAGA
AGTATTTAAGACTTTGAAATCCAGTTTGTAGGGTTTATGTTGCCCAAAA

QA 1 649 1 649
DS 

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CCAGAGAACCTCTCACCAGATCCTCTCTCCTTCCGAACAGCTCTGCTATGTCCAGTGCAA
CTATTGCGAAACCATTCTTGCGGTTAGTGTTCCTTACACAAGCATGTTCAAGACCGTAAC
CGTCAGATGTGGTTGCTGTACTAATCTTATTTCCGTGAACATGAGATTCCTAAGGCACCA
CCCGTTAACCGCCCTCCAGAGAAAAGACAGAGGGTCCCATCCGCATATAACCGATTCATC
AAGGAGGAGATCCAACGTATCAAAGCTGGTAATCCTGATATAAGCCACCGAGAAGCTTTT
AGTGCTGCAGCCAAGAATTGGGCCCACTTCCCCCACATACACTTCGGGCTCTCGCCAGAC
AATCAACCCGTGAAGAAAACCAACATGCCTCAACAGGAGGGTGAAGACAACATGGGGATG
AGAGAAGGGTTCTACGCTCCTGCGGCGAATGTTGGTGCGATTCCTTACTAAAGATAAATT
TAATCAAGAAGTATTTAAGACTTTGAAATCCAGTTTGTAGGGTTTATGTTGCCCAAAAGT
AGGGTTTCTTTTTCTTTCTTGAACTTATATATGTTATATATGCTTGCGTTTTCTTCTGTT
TTGTAATCAAAATCCTGCTAATTAATGAGGTTTGCTATGTT

QA 1 701 1 701
DS 



AS 2 7

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AAAAATGCCAGTCGACGAATCCTCGTCTGTCGGAAAAACCGTTTGCGTCACCGGAGCTGG
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AACCGTACGGAATCCAGATGATCCAAAGAATACGCATTTGAGACAGCTCGAAGGAGCCAA
GGAAAGACTGATTCTGTGCAAAGCTGATCTTCAGGACTACGAGGCTCTTAAAGCGGCGAT
TGATGGCTGCGACGGCGTCTTTCACACGGCTTCTCCGGTCACTGACGACCCCGAGCAAAT
GGTGGAGCCAGCGGTGAACGGAGCCAAGTTCGTAATTAATGCGGCTGCTGAAGCAAAGGT
CAAGCGCGTGGTCATCACCTCCTCAATTGGTGCCGTCTACATGGACCCGAACCGTGACCC
TGAAGCCATCGTTGACGAAAGTTGTTGGAGTGATCTTGAGTTCTGCAAAAACACCAAGAA
TTGGTATTGTTACGGCAAGATGGTGGCGGAGCAAGCCGCGTGGGAGACGGCGAAGGAGAA
AGGTGTTGACCTGGTGGTTTTGAATCCCGTGCTGGTCCTTGGACCACCGTTACAGCCAAC
GATCAACGCCAGTCTCTTCCATGTCCTCAAGTATCTAACCGGCTCGGCTAAGACTTATGC
TAATCTGACTCAGGCTTACGTGGATGTTCGCGATGTCGCCCTGGCTCATGTACTGGTCTA
CGAGGCACCCTCGGCCTCTGGACGTTATCTCCTCGCCGAGAGCGCTCTTCACCGCTGCGA
AGTTTTTGAGATTCTGGCTAAGTTATTCCCGGAGTACCCACTTCCGACCAAGTGCAAGGA
CGAGAAGAACCCAAGAGCCAAGCCGTACAAGTTCACTAACCAAAAGATTAAGGACTTAGG
CTTAGAGTTCACATCCACCAAGCAAAGCCTTTATGATACAGTCAAGAGCTTGCAAGAGAA
AGGTCATCTTCCTCCTCCTCCTCCTTCTACATCACAAGAATCCAACCACAACGGCATCAA
GATCGATTCTTGAATAGCTTATTCCCTGAAGTATCATCCTTAGCCATTGATATATGCTTT
TTTTTT*CAAAAAAAACAAACAAACAAACAGATGTTTTTTGTTACTGTCTTTGTTTATGT
GAAATATTTATTTCAAAATGTCTTTGTCTGGATTTTGATTCTGTCTTAAAGCCTTC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EQ45TF U 1
AF RS1F490TF U 7
AF RS1F490JQ C 677
AF RS1B178JQ C 736
AF RS1B178TF U 736
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RD RS1EQ45TF 585 0 0
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AAAAATGCCAGTCGACGAATCCTCGTCTGTCGGAAAAACCGTTTGCGTCACCGGAGCTGG
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GGAAAGACTGATTCTGTGCAAAGCTGATCTTCAGGACTACGAGGCTCTTAAAGCGGCGAT
TGATGGCTGCGACGGCGTCTTTCACACGGCTTCTCCGGTCACTGACGATCCTGAGCAAAT
GGTGGAGCCAGCGGTGAATGGAGCCAAGTTCGTAATTAATGCGGCTGCTGAAGCCAAGGT
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TGAAGCCATCGTTGACGAA*GTTGTTGGAGTGATCTTGAGTTCTGCAAAAACACCAAGAA
TTGGTATTGTTACGGCAAGATGGTGGCGGAGCAAGCCGCGTGGGA

QA 1 585 1 585
DS 

RD RS1F490TF 776 0 0
GG
ACAATAATCACTTTGCTTCAAAAGCTAAAGCTTATACTTTCAACCGCCGAGAAAAAATGC
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TAGCTTCTTGGATTGTGAAGTCACTCCTCGAGAG**GCTACACCGTCAAAGGAACCGTAC
GGAATCCAGATGATCCAAAGAATACGCATTTGAGAGAGCTCGAAGGAGCCAAGGAAAGAC
TGATTCTGTGCAAAGCTGATCTTCAGGACTACGAGGCTCTTAAAGCGGCGATTGATGGCT
GCGACGGCGTCTTTCACACGGCTTCTCCGGTCACTGACGACCCCGAGCAAATGGTGGAGC
CGGCGGTGAACGGAGCCAAGTTCGTAATTAATGCGGCTGCTGAAGCAAAGGTCAAGCGCG
TGGTCATCACCTCCTCAATTGGTGCCGTCTACATGGACCCGAACCGTGACCCTGAAGCCA
TTGTTGACGAAAGTTGTTGGAGTGATCTTGAGTTCTGCAAAAACACCAAGAATTGGTATT
GTTACGGCAAGATGGTGGCGGAGCAAGCCGCGTGGGAGACGGCGAAGGAGAAAGGTGTTG
ACCTGGTGGTTTTGAATCCCGTGCTGGTCCTTGGACCACCGTTACAGCCAACGATCAACG
CCAGTCTCTTCCATGTCCTCAAGTATCTAACCGGCTCGGCTAAGACTTATGCTAATCTGA
CTCAG*CTTACGTGGATGTTCGCGATGTCGCCCTGGCTCATGTACTGGTCTACG

QA 3 776 3 776
DS 

RD RS1F490JQ 541 0 0
TTCCATGTCCTC
AAGTATCTAACCGGCTCGGCTAAGACTTATGCTAATCTGACTCAGGCTTACGTGGATGTT
CGCGATGTCGCCCTGGCTCATGTACTGGTTTACGAGGCACCCTCGGCCTCTGGACGTTAT
CTCCTCGCCGAGAGCGCTCTTCACCGCGGCGAAGTTGTTGAGATTCTGGCTAAGTTATTC
CCGGAGTACCCACTTCCGACCAAGTGCAAGGACGAGAAGAACCCAAGAGCCAAGCCATAC
AAGTTCACTAACCAAAAGATTAAGGACTTAGGCTTAGAGTTCACATCCACCAAGCAAAGC
CTTTATGATACAGTCAAGAGCTTGCAAGAGAAAGGTCATCTTCCTCCTCCTCCTCCTTCT
ACATCACAAGAATCCAACCACAACGGCATCAAGATCGATTCTTGAATAGCTTATTCCCTG
AAGTATCATCCTTAGCCATTGATATATGCTTTTTTTTTTCAAAAAAAACAAACAAACAAA
CAGATGTTTTTTGTTACTGTCTTTGTTTATGTGAAATATTTATTTCAAA

QA 13 541 13 541
DS 

RD RS1B178JQ 521 0 0
G
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TCTGGACGTTATCTCCTCGCCGAGAGCGCTCTTCACCGCTGCGAAGTTTTTGAGATTCTG
GCTAAGTTATTCCCGGAGTACCCACTTCCGACCAAGTGCAAGGACGAGAAGAACCCAAGA
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CCTCCTCCTTCTACATCACAAGAATCCAACCACAACGGCATCAAGATCGATTCTTGAATA
GCTTATTCCCTGAAGTATCATCCTTAGCCATTGATATATGCTTTTTTTTT*CAAAAAAAA
CAAACAAACAAACAGATGTTTTTTGTTACTGTCTTTGTTTATGTGAAATATTTATTTCAA
AATGTCTTTGTCTGGATTTTGATTCTGTCTTAAAGCCTTC

QA 2 521 2 521
DS 

RD RS1B178TF 521 0 0
G
TACGTGGATGTTCGCGATGTCGCCCTGGCTCATGTACTGGTCTACGAGGCACCCTCGGCC
TCTGGACGTTATCTCCTCGCCGAGAGCGCTCTTCACCGCTGCGAAGTTTTTGAGATTCTG
GCTAAGTTATTCCCGGAGTACCCACTTCCGACCAAGTGCAAGGACGAGAAGAACCCAAGA
GCCAAGCCGTACAAGTTCACTAACCAAAAGATTAAGGACTTAGGCTTAGAGTTCACATCC
ACCAAGCAAAGCCTTTATGATACAGTCAAGAGCTTGCAAGAGAAAGGTCATCTTCCTCCT
CCTCCTCCTTCTACATCACAAGAATCCAACCACAACGGCATCAAGATCGATTCTTGAATA
GCTTATTCCCTGAAGTATCATCCTTAGCCATTGATATATGCTTTTTTTTT*CAAAAAAAA
CAAACAAACAAACAGATGTTTTTTGTTACTGTCTTTGTTTATGTGAAATATTTATTTCAA
AATGTCTTTGTCTGGATTTTGATTCTGTCTTAAAGCCTTC

QA 2 521 2 521
DS 



CO CL504Contig2 1344 2 10 U
AGGGGATACAAAACGTAATTCACTTTGTAACAACGCATTCATCATTTTGTTTCTGTCTCT
TCGAAGACCGTAGCTTTTGTTTTCTACTGCCGGAAACGATGCCAGTCGACGAATCTTTAA
CGCCAGGGAAAACAGTCTGTGTCACTGGAGCTGGTGGATACATCGCTTCTTGGATTGTTA
AGTTACTACTTGAGAGAGGCTACACGGTCAAGGGAACCGTACGGAATCCAGATGATCCGA
AGAACACACATTTGAGAGAACTAGAAGGGGCCAAGGAGAGACTGATTCTGTGCAAAGCAG
ATCTTCAGGACTATGATGCTCTTAAGGAGGCTATCGATGGTTGCGATGGCGTCTTTCACA
CGGCTTCTCCGGTCACTGACGATCTCGAACAAATGGTGGAGCCGGCCGTGAACGGAGCCA
AGTTCGTAATTAATGCTGCAGCTGAAACCAAGGTGAAGCGCGTGGTAATCACCTCCTCAA
TTGGTGCGGTCTACATGGACCCGAACCGTGACCCTGAAGCCGTTGTTGACGAAAGTTGTT
GGAGTGATCTTGAGTTCTGCAAAAACACTAAGAATGGGTATTGTTACGGCAAGATGGTGG
CGGAGCAAGCGGCGTGGGAGACGGCAGAGGAGAAAGGTGTTGACCTGGTGGTTTTGAATC
CGGTGCTGGTTCTTGGTCCGCCGTTACAGCCGACGATCAACGCCAGTCTCTTCCACGTAC
TAAAGTATCTAACCGGCTCGGCTAAGACTTACGCTAATTTGACTCAGGCTTATGTGGATG
TTCGTGATGTCGCACTAGCTCATGTTCTTGTCTACGAGGCACCCTCGGCCTCTGGACGTT
ATCTCCTTGCGGAGAGCGCACTTCACCGCGGCGAAGTTGTTGAGATTTTGGCTAAGTTAT
TCCCTGAGTACCCACTTCCAACCAAGTGCAAGGACGAGAAGAACCCAAGAGCCAAGCCGT
ACAAGTTCACTAACCAAAAGATAAAGGACTTAGGCTTAGAGTTCACGTCCACCAAGCAAA
GCCTTTACGACACTGTCAAGAGCCTGCAAGAGAAAGGTCATCTTCCTCCTCCTCCTTCTC
CTTCGACATCACAGGAATCAAGCCAAAACGGCATCAGATCGAGCCTTGAATAACTTATTC
CCTGATGTATTATCCTTAGCCATTGGCGTTTCCTTTGATTTAGAGAAATAAACCAGATGT
TTAGTTATCGTCTCTGGTTATGTGAAACCTTTGTTTCAAAATATTTTGCTCGGTTATGAA
TCTGTTTATTCAGATCTTTAGCCAAATCCTTTGATAGATTTTGTTCTGTATAAACTACAA
AGGCTTAAATGCTTCATGTTTATT


BQ
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AF RS1FQ26TF U 1
AF RS1FQ26JQ C 567
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RD RS1FQ26TF 816 0 0
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ACT
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AAGGACGAGAAGAACCCAAGAGCCAAGCCGTACAAGTTCACTAACCAAAAGATAAAGGAC
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TTTGTTTCAAAATATTTTGCTCGGTTATGAATCTGTTTATTCAGATCTTTAGCCAAATCC
TTTGATAGATTTTGTTCTGTATAAACTACAAAGGCTTAAATGCTTCATGTTTATT

QA 4 778 4 778
DS 



AS 1 8

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BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1GF06JQ U 1
AF RS1EW87JQ U 113
AF RS1G836JQ U 111
AF RS1EW87TF C 114
AF RS1G547JQ U 185
AF RS1GF06TF C 71
AF RS1G547TF C 246
AF RS1G836TF C 391
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BS 856 906 RS1GF06TF
BS 907 907 RS1G547TF

RD RS1GF06JQ 655 0 0
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GTTAAGAAAAAAACTATTCTGGACTTGATAGGAACCAACTAGAACAAAATGTATGTAAGC
ATTATTGCATTAATTATTAGTTATACCTACCATATAGTAAGAAGAGCAAGGAGAATGATC
ATTTCCTCGAGTGGAATCACATCCACTGATTCACGTCGGTCTCTTATTCATTACACGCAC
AAACAATACGTACAAACACACAAAACACAATGACAACAAAGACAGAGATCATTGTTAAGG
GTGGACCACTCGGTGGATCTGAGTCTGCGGTTGTGGCTGCACCATCGGATGGAGTTTGGC
TCTGGAGCAGGAGCGAGCCATTCCTCCTATGAGGGGGACAACGGGGAGACACTCACAGTT
GCATATCTCGATCATGAAGCCATCTGGATCGTGGAAGAAAAGCTGATCCACTTGGATCCC
TCCTTCTTCAACTATCGCCCTCACATACTCTATCTCCATCTCCTCAAGCTTCTTCTCCAC
TGCCTCCATACTCTCGCACTGGAAAGAGATATGGTTGTCTTTGGGATTGATTTCGGTCTT
CTTGGGAAGTTTCTCTGGTTCTGAAGAACGCAAGAGATGTATTCCAATTCCATGC

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DS 

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G
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CACGCACAAACAATACATACAAACACACAAAACACAATGACAACAAAGACAGAGGTCATT
GTTAAGGGTGGACCACTCGGTGGATCTGAGTCTGCGGTTGTGGCTGCACCATCGGATGGA
GTTTGGCTCTGGAGCAGGAGCGAGCCATTCCTCCTATGAGGGGGACAACGGGGAGACACT
CACAGTTGCATATCTCGATCATGAAGCCATCTGGATCGTGGAAGAAAAGCTGATCCACTT
GGATCCCTCCTTCTTCAACTATCGCCCTCACATACTCTATCTCCATCTCCTCAAGCTTCT
TCTCCACTGCCTCCATACTCTCGCACTGGAAAGAAATATGGTTGTCTTTGGGATTGATTT
CGGTCTTCTTGGGAAGTTTCTCTGGTTCTGAAGAACGCAAGAGATGTATTCCAATTCCAT
GCCCAAACAACCAAGCGCCATCAAAATTTAAAGATTCAGG

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DS 

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GTA
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AATGATCATTTCCTCGAGTGGAATCACATCCACTGATTCACGTCGGTCTCTTATTCATTA
CACGCACAAACAATACATACAAACACACAAAACACAATGACAACAAAGACGGAGATCATT
GTTAAGGGTGGACCACTCGGTGGATCTGAGTCTGCGGTTGTGACTGCACCATCGGATGGA
GTTTGGCTCTGGAGCAGGAGCGAGCCATTCCTCCTATGAGGGGGACAACGGGGAGACACT
CACAGTTGCATATCTCGATCATGAAGCCATCTGGATCGTGGAAGAAAAGCTGATCCACTT
GGATCCCTCCTTCTTCAACTATCGCCCTCACATACTCTATCTCCATCTCCTCAAGCTTCT
TCTCCACTGCCTCCATACTCTCGCACTGGAAAGAGATATGGTTGTCTTTGGGATTGATTT
CGGTCTTCTTGGGAAGTTTCTCTGGTTCTGAAGAACGCAAGAGATGTATTCCAATTCCAT
GCCCAAACAACCAAGCGCCATCAAAATTTAAAGATTCAGGTCTTCGAATGGGAAAGAACC
CTAACACCATTTGATAAAAA

QA 4 623 4 623
DS 

RD RS1EW87TF 750 0 0
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CACGCACAAACAATACATACAAACACACAAAACACAATGACAACAAAGACAGAGGTCATT
GTTAAGGGTGGACCACTCGGTGGATCTGAGTCTGCGGTTGTGGCTGCACCATCGGATGGA
GTTTGGCTCTGGAGCAGGAGCGAGCCATTCCTCCTATGAGGGGGACAACGGGGAGACACT
CACAGTTGCATATCTCGATCATGAAGCCATCTGGATCGTGGAAGAAAAGCTGATCCACTT
GGATCCCTCCTTCTTCAACTATCGCCCTCACATACTCTATCTCCATCTCCTCAAGCTTCT
TCTCCACTGCCTCCATACTCTCGCACTGGAAAGAGATATGGTTGTCTTTGGGATTGATTT
CGGTCTTCTTGGGAAGTTTCTCTGGTTCTGAAGAACGCAAGAGATGTATTCCAATTCCAT
GCCCAAACAACCAAGCGCCATCAAAATTTAAAGATTCAGGTCTTCGAATGGGAAAGAATC
CTAACACCATTTGATAAAAATTCATGGATTCTTCGATGGATCGGCACAAGAGAGACACAT
GGTTCAGTGACGTGAGATGGAGAGGGTTTCCTGCGTTCTCCTTCATTTTCTTTTCTCGAG
AAAACTCCTAAATAACAACGGCGTCGAC
CC

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DS 

RD RS1G547JQ 671 0 0
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AATACATACAAACACACAAAACACAATGACAACAAAGACAGAGATCATTGTTAAGGGTGG
ACCACTCGGTGGATCTGAGTCTGCGGTTGTGGCTGCACCATCGGATGGAGTTTGGCTCTG
GAGCAGGAGCGAGCCATTCCTCCTATGAGGGGGACAACGGGGAGACACTCACAGTTGCAT
ATCTCGATCATGAAGCCATCTGGATCGTGGAAGAAAAGCTGATCCACTTGGATCCCTCCT
TCTTCAACTATCGCCCTCACATAA*CTATCTCCATCTCCTCAAGCTTCTTCTCCACTGCC
TCCATACTCTCGCACTGGAAAGAGATATGGTTGTCTTTGGGATTGATTTCGGTCTTCTTG
GGAAGTTTCTCTGGTTCTGAAGAACGCAAGAGATGTATTCCAATTCCATGCCCAAACAAC
CAAGCGCCATCAAAATTTAAAGATTCAGGTCTTCGAATGGGAAAGAATCCTAACACCATT
TGATAAAAATTCATGGATTCTTCGATGGATCGGCACAAGAGAGACACATGGTTCAGTGAC
GTGAGATGGAGAGGGTTTCCTGCGTTCTCCTTCATTTTCTTTTCTCGAGAAAACTCCTAA
ATAACAACGGC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1GF06TF 836 0 0
AAACTATTCTGGACTTGATAGGA*CCAACTAGAACAAAATGTATGTAAGCATTAT*GCAT
TAATTATTAGTTATAC*TACCATATAGTAAGAAGAGCAAGGAGAATGATCATT*CCTCGA
GTGGAATCACATCCACTGATTCACGTCGGTCTCTTATTCATTACACGCACAAACAATACG
TACAAACACACAAAACACAATGACAACAAAGACAGAGATCATTGTTAAGGGTGGACCACT
CGGTGGATCTGAGTCTGCGGTTGTGGCTGCACCATCGGATGGAGTTTGGCTCTGGAGCAG
GAGCGAGCCATTCCTCCTATGAGGGGGACAACGGGGAGACACTCACAGTTGCATATCTCG
ATCATGAAGCCATCTGGATCGTGGAAGAAAAGCTGATCCACTTGGATCCCTCCTTCTTCA
ACTATCGCCCTCACATACTCTATCTCCATCTCCTCAAGCTTCTTCTCCACTGCCTCCATA
CTCTCGCACTGGAAAGAGATATGGTTGTCTTTGGGATTGATTTCGGTCTTCTTGGGAAGT
TTCTCTGGTTCTGAAGAACGCAAGAGATGTATTCCAATTCCATGCCCAAACAACCAAGCG
CCATCAAAATTTAAAGATTCAGGTCTTCGAATGGGAAAGAATCCTAACACCATTTGATAA
AAATTCATGGATTCTTCGATGGATCGGCACAAGAGAGACACATGGTTCAGTGACGTGAGA
TGGAGAGGGTTTCCTGCGTTCTCCTTCATTTTCTTTTCTCGAGAAAACTCCTAAATAACA
ACGGCGTCGACGCCGTACGTTGGTATAGTCGAGGTTGATTAGATGAGACGATTGCC

QA 1 836 1 836
DS 

RD RS1G547TF 662 0 0
ATACATACAAACACACAAAACACAATGACAACAAAGACAGAGATCATTGTTAAGGGTGGA
CCACTCGGTGGATCTGAGTCTGCGGTTGTGGCTGCACCATCGGATGGAGTTTGGCTCTGG
AGCAGGAGCGAGCCATTCCTCCTATGAGGGGGACAACGGGGAGACACTCACAGTTGCATA
TCTCGATCATGAAGCCATCTGGATCGTGGAAGAAAAGCTGATCCACTTGGATCCCTCCTT
CTTCAACTATCGCCCTCACATAA*CTATCTCCATCTCCTCAAGCTTCTTCTCCACTGCCT
CCATACTCTCGCACTGGAAAGAGATATGGTTGTCTTTGGGATTGATTTCGGTCTTCTTGG
GAAGTTTCTCTGGTTCTGAAGAACGCAAGAGATGTATTCCAATTCCATGCCCAAACAACC
AAGCGCCATCAAAATTTAAAGATTCAGGTCTTCGAATGGGAAAGAATCCTAACACCATTT
GATAAAAATTCATGGATTCTTCGATGGATCGGCACAAGAGAGACACATGGTTCAGTGACG
TGAGATGGAGAGGGTTTCCTGCGTTCTCCTTCATTTTCTTTTCTCGAGAAAACTCCTAAA
TAACAACGGCGTCGACGCCGTACGTTGGTATAGTCGAGGTTGATTAGATGAGACGATTGC
CC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RS1G836TF 517 0 0
GAGGGGGACAACGGGGAGACACTCACAGTTGCATATCTCGATCATGAAGCCATCTGGATC
GTGGAAGAAAAGCTGATCCACTTGGATCCCTCCTTCTTCAACTATCGCCCTCACATACTC
TATCTCCATCTCCTCAAGCTTCTTCTCCACTGCCTCCATACTCTCGCACTGGAAAGAGAT
ATGGTTGTCTTTGGGATTGATTTCGGTCTTCTTGGGAAGTTTCTCTGGTTCTGAAGAACG
CAAGAGATGTATTCCAATTCCATGCCCAAACAACCAAGCGCCATCAAAATTTAAAGATTC
AGGTCTTCGAATGGGAAAGAACCCTAACACCATTTGATAAAAATTCATGGATTCTTCGAT
GGATCGGCACAAGAGAGACACATGGTTCAGTGACGTGAGATGGAGAGGGTTTCCTGCGTT
CTCCTTCATTTTCTTTTCTCGAGAAAACTCCTAAATAACAACGGCGTCGACGCCGTACGT
TGGTATAGTCGAGGTCGATTAGATGATACGATTGCC
C

QA 1 516 1 516
DS 



AS 1 8

CO CL506Contig1 792 8 12 U
GGGAAAGCATCAGTGGGGAATTTTGCGGGAGCCGTTAAACCCTAGAAAGCAAAGCAGCAC
CGGTGAAGAAGAAGAAGATATGAAAGAACACAATTCCGATTCCGACTCCGATGGTCCACC
TGAAGAGTTCACCCAGGAGCAGGCCAAGGTGGAAGATGCAGCGTTGAGGAAAATACAGAG
AGACAACAAAGCTAGAGTTGCCCGCGAAAAGAAAGAGAGTCGCAGGCATTTGGCTGAGAA
AATAACGCCAAGGAAATCACGAAAAATTGAATCTTTCGAAGAAGAAGAACCTGAGGAAGA
AGAAGACCCTGAAGCTCTTGCAAACAAGGGGCTCCTTTCCAAAGACGTCATTGACTTCCT
TGCAGAACGGGAGAAGCCGAAAAACAGTTCTGAGTTTGAAGAAGAAGAAGAGGAGACCAA
CAAAGAACACCCGAGAAAGAAAAAGCATAAGAGCTCTGGTATTGAAACGGTTATTTACAA
GGAGATTCCACCACCAGAATGCTTGAAAACCGGGTTAGATTTCTTGAAGAAGCGGAAAGC
ACAAGTCCCGAGATCTTCTTCAATCCTCAAGAACTCAACCCAAGCTCTCCGACTTATCAC
CGGTGCTGCTTCATCCAAGAAACAGCGACAGAAAAAATGAGAACTCTTAAATGATTCAAA
ATCCTTGTAGGCTTCTTCAATGCCATTGCATTTTTTGTTTTTGTTTAACATTAAAACCAG
CTTCATTTGATACTTCACTTCTACTGCATGATGTGTTGGAGGTTTACTAAAATATATCAA
GGCATCAAATCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 40 40 40 25 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G388TF U 1
AF RS1DL04TF U 63
AF RS1G388JQ C 296
AF RS1EP90TF U 32
AF RS1DL04JQ C 63
AF RS1GV06TF U 10
AF RS1A648JQ C 116
AF RS1A648TF U 23
BS 1 75 RS1G388TF
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RD RS1G388TF 765 0 0
GGGAAAGCATCAGTGGGGAATTTTGCGGGAGCCGTTAAACCCTAGAAAGCAAAGCAGCAC
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TGCAGAACGGGAGAAGCCGAAAAACAGTTCTGAGTTTGAAGAAGAAGAAGAGGAGACCAA
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GGAGATTCCACCACCAGAATGCTTGAAAACCGGGTTAGATTTCTTGAAGAAGCGGAA*GC
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CGGTGCTGCTTCATCCAAGAAACAGCGACAGAAAAAATGAGAACTCTTAAATGATTCAAA
ATCCTTGTAG*CTTCTTCAATGCCATTGCATTTTTTGTTTT*GTTTAACATTAAAACCAG
CTTCATTTGATACTTCACTTCTACTGCATGATGTGTTGGAGGTT
A

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1DL04TF 670 0 0
GG
GAAGAAGAAGAAGATATGAAAGAACACAATTCCGATTCCGACTCCGATGGTCCACCTGAA
GAGTTCACCCAGGAGCAGGCCAAGGTGGAAGATGCAGCGTTGAGGAAAATACAGAGAGAC
AACAAAGCTAGAGTTGCCCGCGAAAAGAAAGAGAGTCGCAGGCATTTGGCTGAGAAAATA
ACGCCAAGGAAATCACGAAAAATTGAATCTTTCGAAGAAGAAGAACCTGAGGAAGAAGAA
GACCCTGAAGCTCTTGCAAACAAGGGGCTCCTTTCCAAAGACGTCATTGACTTCCTTGCA
GAACGGGAGAAGCCGAAAAACAGCTCTGAGTTTGAAGAAGAAGAAGAGGAGACCAACAAA
GAACACCCGAGAAAGAAAAAGCATAAGAGCTCTGGTATTGAAACGGTTATTTACAAGGAG
ATTCCACCACCAGAATGCTTGAAAACCGGGTTAGATTTCTTGAAGAAGCGGAAAGCACAA
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GCTGCTTCATCCAAGAAACAGCGACAGAAAAAATGAGAACTCTTAAATGATTCAAAATCC
TTGTAG*CTTCTTCAATGCCATTGCATTTTTTGTTTTTGTTTAACATTAAAACCAGCTTC
ATTTGA
CG

QA 3 668 3 668
DS 

RD RS1G388JQ 473 0 0
GAAGAAGAAGACCCTGAAGCTCTTGCAAACAAGGGGCTCCTTTCCAAAGACGTCATTGAC
TTCCTTGCAGAACGGGAGAAGCCGAAAAACAGTTCTGAGTTTGAAGAAGAAGAAGAGGAG
ACCAACAAAGAACACCCGAGAAAGAAAAAGCATAAGAGCTCTGGTATTGAAACGGTTATT
TACAAGGAGATTCCACCACCAGAATGCTTGAAAACCGGGTTAGATTTCTTGAAGAAGCGG
AAAGCACAAGTCCCGAGATCTTCTTCAATCCTCAAGAACTCAACCCAAGCTTTCCGACTT
ATCACCGGTGCTGCTTCATCCAAGAAACAGCGACAGAAAAAATGAGAACTCTTAAATGAT
TCAAAATCCTTGTAGGCTTCTTCAATGCCATTGCATTTTTTGTTTTTGTTTAACATTAAA
ACCAGCTTCATTTGATACTTCACTTCTACTGCATGATGTGTTGGAGGTTTACT

QA 1 473 1 473
DS 

RD RS1EP90TF 704 0 0
GG
GTTAAACCCTAGAAAGCAAAGCAGCACCGGTGAAGAAGAAGAAGATATGAAAGAACACAA
TTCCGATTCCGACTCCGATGGTCCACCTGAAGAGTTCACCCAGGAGCAGGCCAAGGTGGA
AGATGCAGCGTTGAGGAAAATACAGAGAGACAACAAAGCTAGAGTTGCCCGCGAAAAGAA
AGAGAGTCGCAGGCATTTGGCTGAGAAAATAACGCCAAGGAAATCACGAAAAATTGAATC
TTTCGAAGAAGAAGAACCTGAGGAAGAAGAAGACCCTGAAGCTCTTGCAAACAAGGGGCT
CCTTTCCAAAGACGTCATTGACTTCCTTGCAGAACGGGAGAAGCCGAAAAACAGTTCTGA
GTTTGAAGAAGAAGAAGAGGAGACCAACAAAGAACACCCGAGAAAGAAAAAGCATAAGAG
CTCTGGTATTGAAACGGTTATTTACAAGGAGATTCCACCGCCAGAATGCTTGAAAACCGG
GTTAGATTTCTTGAAGAAGCGGAAAGCACAAGTCCCGAGATCTTCTTCAATCCTCAAGAA
CTCAACCCAAGCTCTCCGACTTATCACCGGTGCTGCTTCATCCAAGAAACAGCGACAGAA
AAA*TGAGAACTCTTAAATGATTCAAGATCCTTGTAG*CTTCTTCA*TGCCATTGCATTT
TTTGTTCTTGTTTAACATTAAA*CCAGCTTCATTTGATACTT

QA 3 704 3 704
DS 

RD RS1DL04JQ 667 0 0
GG
GAAGAAGAAGAAGATATGAAAGAACACAATTCCGATTCCGACTCCGATGGTCCACCTGAA
GAGTTCACCCAGGAGCAGGCCAAGGTGGAAGATGCAGCGTTGAGGAAAATACAGAGAGAC
AACAAAGCTAGAGTTGCCCGCGAAAAGAAAGAGAGTCGCAGGCATTTGGCTGAGAAAATA
ACGCCAAGGAAATCACGAAAAATTGAATCTTTCGAAGAAGAAGAACCTGAGGAAGAAGAA
GACCCTGAAGCTCTTGCAAACAAGGGGCTCCTTTCCAAAGACGTCATTGACTTCCTTGCA
GAACGGGAGAAGCCGAAAAACAGCTCTGAGTTTGAAGAAGAAGAAGAGGAGACCAACAAA
GAACACCCGAGAAAGAAAAAGCATAAGAGCTCTGGTATTGAAACGGTTATTTACAAGGAG
ATTCCACCACCAGAATGCTTGAAAACCGGGTTAGATTTCTTGAAGAAGCGGAAAGCACAA
GTCCCGAGATCTTCTTCAATCCTCAAGAACTCAACCCAAGCTCTCCGACTTATCACCGGT
GCTGCTTCATCCAAGAAACAGCGACAGAAAAAATGAGAACTCTTAAATGATTCAAAATCC
TTGTAGGCTTCTTCAATGCCATTGCATTTTTTGTTTTTGTTTAACATTAAAACCAGCTTC
ATTTG

QA 3 667 3 667
DS 

RD RS1GV06TF 783 0 0
GG
AGTGGGGAATTTTGCGGGAGCCGTTAAACCCTAGAAAGCAAAGCAGCACCGGTGAAGAAG
AAGAAGATATGAAAGAACACAATTCCGATTCCGACTCCGATGGTCCACCTGAAGAGTTCA
CCCAGGAGCAGGCCAAGGTGGAAGATGCAGCGTTGAGGAAAATACAGAGAGACAACAAAG
CTAGAGTTGCCCGCGAAAAGAAAGAGAGTCGCAGGCATTTGGCTGAGAAAATAACGCCAA
GGAAATCACGAAAAATTGAATCTTTCGAAGAAGAAGAACCTGAGGAAGAAGAAGACCCTG
AAGCTCTTGCAAACAAGGGGCTCCTTTCCAAAGACGTCATTTACTTCCTTGCAGAACGGG
AGAAGCCGAAAAACAGTTCTGAGTTTGAAGAAGAAGAAGAGGAGACCAACAAAGAACACC
CGAGAAAGAAAAAGCATAAGAGCTCTGGTATTGAAACGGTTATTTACAAGGAGATTCCAC
CACCAGAATGCTTGAAAACCGGGTTAGATTTCTTGAATAAGCGGAAAGCACAAGTCCCGA
GATCTTCTTCAATCCTCAAGAACTCAACCCAAGCTCTCCGACTTATCACCGGTGCTGCTT
CATCCAAGAAACAGCGACAGAAAAAATGAGAACTCTTAAATGATTCAAAATCCTTGTAG*
CTTCTTCAATGCCATTGCATTTTTTGTTTTTGTTTAACATTAAA*CCAGCTTCATTTGAT
ACCTCACTTCTACTGCATGATGTGTTGGAGGTTTACTAAAATATATCAAGGCATCAAATC
A

QA 3 783 3 783
DS 

RD RS1A648JQ 668 0 0
CCACCTGAAGAGTTCACCCAGGAGCAGGCCAAGGTGGAAGATGCAGCGTTGAGGAAAATA
CAGAGAGACAACAAAGCTAGAGTTGCCCGCGAAAAGAAAGAGAGTCGCAGGCATTTGGCT
GAGAAAATAACGCCAAGGAAATCACGAAAAATTGAATCTTTCGAAGAAGAAGAACCTGAG
GAAGAAGAAGACCCTGAAGTTCTTGCAAACAAGGGGCTCCTTTCCAAAGACGTCATTGAC
TTCCTTGCAGAACGGGAGAAGCCGAAAAACAGTTCTGAGTTTGAAGAAGAAGAAGAGGAG
ACCAACAAAGAACACCCGAGAAAGAAAAAGCATAAGAGCTCTGGTATTGAAACGGTTATT
TACAAGTAGATTCCACCACCAGAATGCTTGAAAACCGGGTTAGATTTCTTGAAGAAGCGG
AAAGCACAAGTCCCGAGATCTTCTTCAATCCTCAAGAACTCAACCCAAGCTTTCCGACTT
ATCACCGGTGCTGCTTCATCCAAGAAACAGCGACAGAAAAAATGAGAACTCTTAAATGAT
TCAAAATCCTTGTAGGCTTCTTCAATGCCATTGCATTTTTTGTTTTTGTTTAACATTAAA
ACCAGCTTCATTTGATACTTCACTTCTACTGTATGATGTGTTGGAGGTTTACTAAAATAT
ATCAAGGC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1A648TF 761 0 0
GG
GCGGGAGCCGTTAAACCCTAGAAAGCAAAGCAGCACCGGTGAAGAAGAAGAAGATATGAA
AGAACACAATTCCGATTCCGACTCCGATGGTCCACCTGAAGAGTTCACCCAGGAGCAGGC
CAAGGTGGAAGATGCAGCGTTGAGGAAAATACAGAGAGACAACAAAGCTAGAGTTGCCCG
CGAAAAGAAAGAGAGTCGCAGGCATTTGGCTGAGAAAATAACGCCAAGGAAATCACGAAA
AATTGAATCTTTCGAAGAAGAAGAACCTGAGGAAGAAGAAGACCCTGAAGCTCTTGCAAA
CAAGGGGCTCCTTTCCAAAGACGTCATTGACTTCCTTGCAGAACGGGAGAAGCCGAAAAA
CAGTTCTGAGTTTGAAGAAGAAGAAGAGGAGACCAACAAAGAACACCCGAGAAAGAAAAA
GCATAAGAGCTCTGGTATTGAAACGGTTATTTACAAGTAGATTCCACCACCAGAATGCTT
GAAAACCGGGTTAGATTTCTTGAAGAAGCGGAAAGCACAAGTCCCGAGATCTTCTTCAAT
CCTCAAGAACTCAACCCAAGCTCTCCGACTTATCACCGGTGCTGCTTCATCCAAGAAACA
GCGACAGAAAAAATGAGAACTCTTAAATGATTCAAAATCCTTGTAGGCTTCTTCAATGCC
ATTGCATTTTTTGTTTTTGTTTAACATTAAAACCAGCTTCATTTGATACTTCACTTCTAC
TGTATGATGTGTTGGAGGTTTACTAAAATATATCAAGGC

QA 3 761 3 761
DS 



AS 2 8

CO CL507Contig1 434 2 3 U
GTAAATGCAAACCGACCATTTCAATTTCCAACTTGACCACATCTGAATCAATGCTTACTG
TCGGTATAGCAAAACCCTTAACCGGACGGTTCAGTTACGTATATGTATATAATTAATTAC
ATTTATATATCCGGGAGCAACATCCATCATAACTCCCAACTATGTAGTAAAGTACATAAC
AGTTACAACACTTGAAACACAGACTTATGGTTCTATATATGTTACTGTACGGATGTGATG
AGCGAGTAAAGATGACTTAAGGGTTTAAAAAAGAGCTTCCCTCTCTGATGAGCACAAAGA
CGCTTCCACCATCGCCTCTAGAGATCCGAAGGTCTTTGTCGAGATAAGTGGCGAGCAGCC
ATGACTGTGCACTGTCTCCAGGCAAAGAGAATTTCAACGGTGGCTGGCTTGAAATAGTTC
TTGCCACTGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EM01JQ U 45
AF RS1G186JQ U 1
BS 1 268 RS1G186JQ
BS 269 269 RS1EM01JQ
BS 270 434 RS1G186JQ

RD RS1EM01JQ 272 0 0
GAATCAATGCTTACTGTCGGTATAGCAAAACCCTTAACCGGACGGTTCAGTTACGTATAT
GTATATAATTAATTACATTTATATATCCGGGAGCAACATCCATCATAACTCCCAACTATG
TAGTAAAGTACATAACAGTTACAACACTTGAAACACAGACTTATGGTTCTATATATGTTA
CTGTACGGATGTGATGAGTGAGTAAAGATGACTTAAGGGTTTAAAAAAGAGCTTCCCTCT
CTGATGAGCACAAAGACGCTTCCACCATC
CCC

QA 1 269 1 269
DS 

RD RS1G186JQ 434 0 0
GTAAATGCAAACCGACCATTTCAATTTCCAACTTGACCACATCTGAATCAATGCTTACTG
TCGGTATAGCAAAACCCTTAACCGGACGGTTCAGTTACGTATATGTATATAATTAATTAC
ATTTATATATCCGGGAGCAACATCCATCATAACTCCCAACTATGTAGTAAAGTACATAAC
AGTTACAACACTTGAAACACAGACTTATGGTTCTATATATGTTACTGTACGGATGTGATG
AGCGAGTAAAGATGACTTAAGGGTTTAAGAAAGAGCTTCCCTCTCTGATGAGCACAAAGA
CGCTTCCACCATCGCCTCTAGAGATCCGAAGGTCTTTGTCGAGATAAGTGGCGAGCAGCC
ATGACTGTGCACTGTCTCCAGGCAAAGAGAATTTCAACGGTGGCTGGCTTGAAATAGTTC
TTGCCACTGAAAAA

QA 1 434 1 434
DS 



CO CL507Contig2 1050 6 49 U
GGGAGTTTGTTTCTCTGGATAGATCAAACATGGCAACGGTACCTTTGTTCACCCAATTTC
CCTGCAAAACCCTAGTTTCAAGCCCTTCAAACTCCAAACATCAATCTAAATCTCCTCTTC
TATTGCCCATTAGTTTGTTCAATCGGCGACCTCAGGCTGGAATCGCTGTTCATCGGTCAG
ATTTCAAGGTCCGAGCCAGTGACGTCAATGACGAGTGGGGTCCGGATTCCAAGGGCCGAG
GCGGTGACGTTGAAGACGAGTGGGGTCCCGAGAGAGGAACGAACTCATCGGTTGGGGAGA
AAGAAGCAGAAGAAGCCATCGAATCTGCGGAGGAGACGGAGCGGCTTAAGAGAGTGCTAG
CGGATTCTCTGTACGGAACAGATCGAGGTTTAAACGCGTCGAGTGAGACGAGAGCGGAGA
TCAGTGAGCTGATAACGCAGCTGGAGGGGAAGAACCCTAACCCAGCTCCTAACGAAGCTC
TGTTTCTCCTCAACGGCAAATGGATTCTCGCCTATACATCGTTTGTTGGTCTGTTCCCGT
TGCTCTCACGCAGAATCTCACCGTTGGTTAAAGTGGATGAGATCTCACAAACCATTGATT
CCGACAGCTTCACCGTACACAACTCTGTCCGG*TTCGCTGGTCCACTTGCCACAACATCG
CTTAGCACCAACGCTAAATTCGAAGTCCGAAGTCCTAAACGCGTCCAGGTCAAGTTTGAG
CAAGGCATTATCGGGACTCCACAACTAACGGATTCGATTGAAATCCCGGAGTTCGTCGAG
GTTCTTGGTCAAAAAATCGACCTCAACCCCATCAGAGGGTTACTTACATCTGTCCAAGAC
ACGGCTTCTTCAGTGGCAAGAACTATTTCAAGCCAGCCACCGTTGAAATTCTCTTTGCCT
GGAGACAGTGCACAGTCATGGCTGCTCACCACTTATCTCGACAAGACCTCGGATCTCTAG
AGCGATGGTGGAAGCGTCTTTGTGCTCATCAGAGAGGGAAGCTCTCTCTAAACCCTTAGT
CATCTTACTCACTCATCACATCCGTACAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G186TF U 1
AF RS1A508TF U 2
AF RS1AM07TF U 9
AF RS1EM01TF U 19
AF RS1AJ92TF U 25
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BS 75 75 RS1A508TF
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BS 136 156 RS1G186TF
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BS 224 224 RS1A508TF
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RD RS1G186TF 678 0 0
GGGAGTTTGTTTCTCTGGATAGATCAAACATGGCAACGGTACCTTCCTTCACCCAATTTC
CCTGCAAAACCCTAATCTCAAGCCCTTCAAACTCTAAACATCAATCTAAATCTCCTCTTC
TATTGCCCATTAGTCTGTTCAATCGGCGACCTCAGGTTGGAATCGCTGTTCATCGGTCAG
ATTTCAAGGTCCGAGCCAGTGACGTCAATGACGAGTGGGGTCCAGATTCCAAGGGACGAG
GCGGTGACGTTGAAGACGAGTGGGGTCCCGAGAGAGGATCGAACTCATCGGTGGGGGAGA
AAGAAGCAGAGGAAGCCATCGAATCTGCGGAGGAGACGGAGCGGCTTAAGAGAGTGCTAG
CCGGTTCTTTGTATGGAATAGATCGAGGTTTAAACGCGTCGAGTGAGACGAGAGCGGAGA
TCAGTGAGCTGATAACGCAGCTGGAGGGGAATAACCCTAACCCAGCTCCTAACGAAGCTC
TGTTTCTCCTCAACGGCAAATGGATTCTCGCCTATACATCGTTTGTTGGTCTGTTCCCGT
TGCTCTCACGCAGAATCTCACCGTTGGTTAAAGTGGATGAGATCTCACAAACCATTGATT
CCGACAGCTTCACCGTACACAACTCTGTCCGG*TTCGCTGGTCCACTTGCCACAACATCG
CTTAGCACCAACGCTAAA

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1A508TF 717 0 0
GGGGTTT
GTTTCTCTGGATAGATCAAACATGGCAACGGTACCTTTGTTCACCCAATTTCCCTGCAAA
ACCCTAGTTTCAAGCCCTTCAAACTCCAAACATCAATCTAAATCTCCTCTTCTATTGCCC
ATTAGTTTGTTCAATCGGCGACCTCAGGCTGGAATCGCTGTTCATCGGTCAGATTTCAAG
GTCCGAGCCAGTGACGTCAATGACGAGTGGGGTCCGGATTCCAAGGGCCGAGGCGGTGAC
GTTGAAGACGAGTGGGGTCCCGAGAGAGGAACGAACTCATCGGTTGGGGAGAAAGAAGCA
GAAGAAGCCATCGAATCTGCGGAGGAGACGGAGCGGCTTAAGAGAGTGCTAGCGGATTCT
CTGTACGGAGCAGATCGAGGTTTAAACGCGTCGAGTGAGACGAGAGCGGAGATCAGTGAG
CTGATAACGCAGCTGGAGGGGAAGAACCCTAACCCAGCTCCTAACGAAGCTCTGTTTCTC
CTCAACGGCAAATGGATTCTCGCCTATACATCGTTTGTTGGTCTGTTCCCGTTGCTCTCA
CGCAGAATCTCACCGTTGGTTAAAGTGGATGAGATCTCACAAACCATTGATTCCGACAGC
TTCACCGTACACAACTCTGTCCGG*TTCGCTGGTCCACTTGCCACAACATCGCTTAGCAC
CAACGCTAAATTCGAAGTCCGAAGTCCTAAACGCATCCAGGTCAAGTTTG

QA 8 717 8 717
DS 

RD RS1AM07TF 766 0 0
GTTTCTCTGGATAGATCAAACATGGCAACGGTACCTTTGTTCACCCAATTTCCCTGCAAA
ACCCTAGTTTCAAGCCCTTCAAACTCCAAACATCAATCTAAATCTCCTCTTCTATTGCCC
ATTAGTTTGTTCAATCGGCGACCTCAGGCTGGAATCGCTGTTCATCGGTCAGATTTCAAG
GTCCGAGCCAGTGACGTCAATGACGAGTGGGGTCCGGATTCCAAGGGCCGAGGCGGTGAC
GTTGAAGACGAGTGGGGTCCCGAGAGAGGAACGAACTCATCGGTTGGGGAGAAAGAAGCA
GAAGAAGCCATCGAATCTGCGGAGGAGACGGAGCGGCTTAAGAGAGTGCTAGCGGATTCT
CTGTACGGAACAGATCGAGGTTTAAACGCGTCGAGTGAGACGAGAGCGGAGATCAGTGAG
CTGATAACGCAGCTGGAGGGGAAGAACCCTAATCCAGCTCCTAACGAAGCTCTGTTTCTC
CTCAACGGCAAATGGATTCTCGCCTATACATCGTTTGTTGGTCTGTTCCCGTTGCTCTCA
CGCAGAATCTCACCGTTGGTTAAAGTGGATGAGATCTCACAAACCATTGATTCCGACAGC
TTCACCGTACACAACTCTGTCCGG*TTCGCTGGTCCACTTGCCACAACATCGCTTAGCAC
CAACGCTAAATTCGAAGTCCGAAGTCCTAAACGCGTCCAGGTCAAGTTTGAGCAAG*CAT
TATCGGGACTCCACAACTAACGGATTCGATTGAA
TCCCGGAGTTCG

QA 1 754 1 754
DS 

RD RS1EM01TF 745 0 0
GG
AGATCAAACATGGCAACGGTACCTTTGTTCACCCAATTTCCCTGCAAAACCCTAGTTTCA
AGCCCTTCAAACTCCAAACATCAATCTAAATCTCCTCTTCTATTGCCCATTAGTTTGTTC
AATCGGCGACCTCAGGCTGGAATCGCTGTTCATCGGTCAGATTTCAAGGTCCGAGCCAGT
GACGTCAATGACGAGTGGGGTCCGGATTCCAAGGGCCGAGGCGGTGACGTTGAAGACGAG
TGGGGTCCCGAGAGAGGAACGAACTCATCGGTTGGGGAGAAAGAAGCAGAAGAAGCCATC
GAATCTGCGGAGGAGACGGAGCGGCTTAAGAGAGTGCTAGCGGATTCTCTGTACGGAACA
GATCGAGGTTTAAACGCGTCGAGTGAGACGAGAGCGGAGATCAGTGAGCTGATAACGCAG
CTGGAGGGGAAGAACCCTAACCCAGCTCCTAACGAAGCTCTGTTTCTCCTCAACGGCAAA
TGGATTCTCGCCTATACATCGTTTGTTGGTCTGTTCCCGTTGCTCTCACGCAGAATCTCA
CCTTTGGTTAAAGTGGATGAGATCTCACAAACCATTGATTCCGACAGCTTCACCGTACAC
AACTCTGTCCGG*TTCGCTGGTCCACTTGCCACAACATCGCTTAGCACCAACGCTAAATT
CGAAGTCCGAAGTCCTAAACGCGTCCAGGTCAAGTTTGAGCAAGGCATTATCGGGACTCC
ACAACTAACGGATTCGATTGAA
T

QA 3 744 3 744
DS 

RD RS1AJ92TF 809 0 0
G
AAACATGGCAACGGTACCTTTGTTCACCCAATTTCCCTGCAAAACCCTAGTTTCAAGCCC
TTCAAACTCCAAACATCAATCTAAATCTCCTCTTCTATTGCCCATTAGTTTGTTCAATCG
GCGACCTCAGGCTGGAATCGCTGTTCATCGGTCAGATTTCAAGGTCCGAGCCAGTGACGT
CAATGACGAGTGGGGTCCGGATTCCAAGGGCCGAGGCGGTGACGTTGAAGACGAGTGGGG
TCCCGAGAGAGGAACGAACTCATCGGTTGGGGAGAAAGAAGCAGAAGAAGCCATCGAATC
TGCGGAGGAGACGGAGCGGCTTAAGAGAGTGCTAGCGGATTCTCTGTACGGAACAGATCG
AGGTTTAAACGCGTCGAGTGAGACGAGAGCGGAGATCAGTGAGCTGATAACGCAGCTGGA
GGGGAAGAACCCTAACCCAGCTCCTAACGAAGCTCTGTTTCTCCTCAACGGCAAATGGAT
TCTCGCCTATACATCGTTTGTTGGTCTGTTCCCGTTGCTCTCACGCAGAATCTCACCGTT
GGTTAAAGTGGATGAGATCTCACAAACCATTGATTCCGACAGCTTCACCGTACACAACTC
TGTCCGGGTTCGCTGGTCCACTTGCCACAACATCGCTTAGCACCAACGCTAAATTCGAAG
TCCGAAGTCCTAAACGCGTCCAGGTCAAGTTTGAGCAAAGCATTATCGGGACTCCACAAC
TAACGGATTCGATTGAAATCCCGGATTTCGTCGAGGTTCTTGGTCAAAAA*TCGACCTCA
ACCCCATCAGAGGGT*ACTTACATCTGT

QA 2 809 2 809
DS 

RD RS1AT25TF 804 0 0
G
CGTTGAAGACGAGTGGGGTCCCGAGAGAGGAACGAACTCATCGGTTGGGGAGAAAGAAGC
AGAAGAAGCTATCGAATCTGCGGAGGAGACGGAGCGGCTTAAGAGAGTGCTAGCGGATTC
TCTGTACGGAACAGATCGAGGTTTAAACGCGTCGAGTGAGACGAGAGCGGAGATCAGTGA
GCTGATAACGCAGCTGGAGGGGAAGAACCCTAACCCAGCTCCTAATGAAGCTCTGTTTCT
CCTCAACGGCAAATGGATTCTCGCCTATACATCGTTTGTTGGTCTGTTCCCGTTGCTCTC
ACGCAGAATCTCACCGTTGGTTAAAGTGGATGAGATCTCACAAACCATTGATTCCGACAG
CTTCACCGTACACAACTCTGTCCGG*TTCGCTGGTCCACTTGCCACAACATCGCTTAGCA
CCAACGCTAAATTCGAAGTCCGAAGTCCTAAACGCGTCCAGGTCAAGTTTGAGCAAGGCA
TTATCGGGACTCCACAACTAACGGATTCGATTGAAATTCCGGAGTTCGTCGAGGTTCTTG
GTCAAAAAATCGACCTCAACCCCATCAGAGGGTTACTTACATCTGTCCAAGACACGGCTT
CTTCAGTGGCAAGAACTATTTCAAGCCAGCCACCGTTGAAATTCTCTTTGCCTGGAGACA
GTGCACAGTCATGGCTGCTCACCACTTATCTCGACAAGACCTCGGATCTCTAGAGCGATG
GTGGAAGCGTCTTTGTGCTCATCAGAGAGGGAAGCTCTCTCTAAACCCTTAGTCATCTTA
CTCACTCATCACATCCGTACAGT

QA 2 804 2 804
DS 



AS 2 5

CO CL508Contig1 418 2 2 U
TTCACGGATTAAGCTGTTCCCTGGAAAGCTTAAGTCCATATGGTCCGGACCTTTCACCAT
CAAGGAGGTTCGCCCTTACGGAGCTGTTGTGTTGCTGGACATAAGAGGTGGAGAATTTGT
TGTTAATGGTCAGCGTCTTAAGCCATATCTTGCTGACACAACAATCGCTGAAGGTGTAGA
GATACCCTTAAGCGATCCCCCTCAAGCCTAATCGGCTCATTGAAGTCAAGCTAGTGACAG
AAAACAAGCGCTTGGTGGGAGGCAACCCACTGGTGAGTGTAAATATTGTTTTCTTTTTGT
CTTTGTTGTTCTTTCTAGGAACTAACTTGCAGGTTGAAAAATCAAGAAAATTCGAGATCA
CTCCAGGAGAACACTCCAGCGGTTGTTCCGCCGATTGTTCCAGGTAAGTGCTCGAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RS1BB36JQ C 1
AF RS1BB36TF U 1
BS 1 414 RS1BB36TF
BS 415 418 RS1BB36JQ

RD RS1BB36JQ 418 0 0
TTCACGGATTAAGCTGTTCCCTGGAAAGCTTAAGTCCATATGGTCCGGACCTTTCACCAT
CAAGGAGGTTCGCCCTTACGGAGCTGTTGTGTTGCTGGACATAAGAGGTGGAGAATTTGT
TGTTAATGGTCAGCGTCTTAAGCCATATCTTGCTGACACAACAATCGCTGAAGGTGTAGA
GATACCCTTAAGCGATCCCCCTCAAGCCTAATCGGCTCATTGAAGTCAAGCTAGTGACAG
AAAACAAGCGCTTGGTGGGAGGCAACCCACTGGTGAGTGTAAATATTGTTTTCTTTTTGT
CTTTGTTGTTCTTTCTAGGAACTAACTTGCAGGTTGAAAAATCAAGAAAATTCGAGATCA
CTCCAGGAGAACACTCCAGCGGTTGTTCCGCCGATTGTTCCAGGTAAGTGCTCGAACC

QA 1 418 1 418
DS 

RD RS1BB36TF 418 0 0
TTCACGGATTAAGCTGTTCCCTGGAAAGCTTAAGTCCATATGGTCCGGACCTTTCACCAT
CAAGGAGGTTCGCCCTTACGGAGCTGTTGTGTTGCTGGACATAAGAGGTGGAGAATTTGT
TGTTAATGGTCAGCGTCTTAAGCCATATCTTGCTGACACAACAATCGCTGAAGGTGTAGA
GATACCCTTAAGCGATCCCCCTCAAGCCTAATCGGCTCATTGAAGTCAAGCTAGTGACAG
AAAACAAGCGCTTGGTGGGAGGCAACCCACTGGTGAGTGTAAATATTGTTTTCTTTTTGT
CTTTGTTGTTCTTTCTAGGAACTAACTTGCAGGTTGAAAAATCAAGAAAATTCGAGATCA
CTCCAGGAGAACACTCCAGCGGTTGTTCCGCCGATTGTTCCAGGTAAGTGCTCG
AACC

QA 1 414 1 414
DS 



CO CL508Contig2 700 3 13 U
GCGTTCGAGAACTTACCTGGGAACAATCGGCGGAACAACCGCTGGAGTGCTCTCCTGGAG
TGATCTCGAATTTTCTTGATTTTTCAACCTGCAAGTTAGTTCCTAGAAAGATAAAGACAA
AAAGAAAACAATATTTACACTCACCAGTGGGTTGCCTCCCACCAAGCGCTTGTTTTCTGT
CACTAGCTTGACTTCAATGAGCCGATTAGGCTTGAGGGGGATCGCTTAAGGGTATCTCTA
CACCTTCAGCGATTGTTGTGTCAGCAAGATATGGCTTGAGACGCTGACCATTGACAACAA
ATTCTCCTCCTCTTGTGTCCAGCAACACAACAGCTCCATAAGGGCGAACCTCCTTAATGG
TGAAAGGTCCAGACCATCTAGATTTAAGCTTTCCAGGGAAAAGCTTAACCCGTGAATTGA
AGAGTAGGACCTGATCGTTCGGAGCAAAGCTTCTGCTGATGATCCGCTTGTCGTGGAACA
CCTTGGTCTTTTCCTTGTATATCTTAGAACTCTCATAGGCCAGATGCCTGATCTCCTCCA
GCTCGTGGATCTGAATGGTTCGCCTCTCCTTGGCAGGTTTGATGTCGAAGTTGAGTAGTT
TGACAGCCCAAGCCGCCTTGTACTCTAGCTCAACAGGTAGGTGGCACGCCTTGCCGTAGA
CCAGATGATATGGAGTGGTCCCTAAAGGGGTCTTGTAGGC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DF19JQ U 1
AF RS1EG56JQ U 7
AF RS1EE73TF C 6
BS 1 28 RS1DF19JQ
BS 29 29 RS1EG56JQ
BS 30 61 RS1DF19JQ
BS 62 62 RS1EG56JQ
BS 63 355 RS1DF19JQ
BS 356 356 RS1EG56JQ
BS 357 357 RS1DF19JQ
BS 358 358 RS1EG56JQ
BS 359 399 RS1DF19JQ
BS 400 400 RS1EG56JQ
BS 401 401 RS1EE73TF
BS 402 426 RS1EG56JQ
BS 427 700 RS1EE73TF

RD RS1DF19JQ 399 0 0
GCGTTCGAGAACTTACCTGGGAACAATCAGCGGAACAACCGCTGGAGTGCTCTCCTGGAG
TAATCTCGAATTTTCTTGATTTTTCAACCTGCAAGTTAGTTCCTAGAAAGATAAAGACAA
AAAGAAAACAATATTTACACTCACCAGTGGGTTGCCTCCCACCAAGCGCTTGTTTTCTGT
CACTAGCTTGACTTCAATGAGCCGATTAGGCTTGAGGGGGATCGCTTAAGGGTATCTCTA
CACCTTCAGCGATTGTTGTGTCAGCAAGATATGGCTTGAGACGCTGACCATTGACAACAA
ATTCTCCTCCTCTTGTGTCCAGCAACACAACAGCTCCATAAGGGCGAACCTCCTTGACGG
TGAAAGGTCCAGACCATCTAGATTTAAGCTTTCCAGGGA

QA 1 399 1 399
DS 

RD RS1EG56JQ 420 0 0
GGGAACTTACCTG
GGAACAATCGGCGGAACAACCGCTGGAGTGCTCTCCTGGAGTGATCTCGAATTTTCTTGA
TTTTTCAACCTGCAAGTTAGTTCCTAGAAAAATAAAGACAAAAAGAAAACAATATTTACA
CTCACCAGTGGATTGCCTCCCACCAAGCGCTTGTTTTCTGTCACTAGCTTGACTTCAATG
AGCCGATTAGGCTTGAGGGGGATCGCTTAAGGGTATCTCTACACCTTCAGCGATTGTTGT
GTCAGCAAGATATGGCTTGAGACGCTGACCATTGACAACAAATTCTCCTCCTCTTGTGTC
CAGCAACACAACAGCTCCGTAAGGGCGAACCTCCTTAATGGTGAAAGGTCCAGACCATCT
AGATTTAAGCTTCCCAGGGAACAGCTTAACCCGTGAATTGAAGAGTA

QA 14 420 14 420
DS 

RD RS1EE73TF 695 0 0
CGAGAACTTACCTGGGAACAATCGGCGGAACAACCGCTGGAGTGCTCTCCTGGAGTGATC
TCGAATTTTCTTGATTTTTCAACCTGCAAGTTAGTTCCTAGAAAGATAAAGACAAAAAGA
AAACAATATTTACACTCACCAGTGGGTTGCCTCCCACCAAGCGCTTGTTTTCTGTCACTA
GCTTGACTTCAATGAGCCGATTAGGCTTGAGGGGGATCGGTTAAGGGTATCTCTACTCCT
TCAGCGATTGTTGTGTCAGCAAGATATGGCTTGAGACGCTGACCATTGACAACAAATTCT
CCTCCTCTTGTGTCCAGCAACACAACAGCTCCATAAGGGCGAACCTCCTTAATGGTGAAA
GGTCCAGACCATCTAGATTTAAGCTTTCCAGGGAAAAGCTTAACCCGTGAATTGAAGAGT
AGGACCTGATCGTTCGGAGCAAAGCTTCTGCTGATGATCCGCTTGTCGTGGAACACCTTG
GTCTTTTCCTTGTATATCTTAGAACTCTCATAGGCCAGATGCCTGATCTCCTCCAGCTCG
TGGATCTGAATGGTTCGCCTCTCCTTGGCAGGTTTGATGTCGAAGTTGAGTAGTTTGACA
GCCCAAGCCGCCTTGTACTCTAGCTCAACAGGTAGGTGGCACGCCTTGCCGTAGACCAGA
TGATATGGAGTGGTCCCTAAAGGGGTCTTGTAGGC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 8

CO CL509Contig1 793 8 10 U
GGTCCTCTCTTCCACTCAGGGTTTAAGCGCCTCAACCTCACCGCCTTCTTGAGCTACCTC
ATCCCGTCGAGCTAATCTTCTCTCTCAGAAGCGTGAGTAATGAGGAAGCTCAAGTACCAC
GAGAAGAAGGTTCTGAAGAAAGTTAATTTCCTGGAATGGAAAAGAGAACGTGGTCATCTC
GAAAACCTCATCACGGGTCGTTACCACATGGGTGGTCGTGACGACTACAAAAAATATTCA
GGATTGAGTAGGATGGTTCAGAAGCTGACGAATGTATTGAAACAGATGGATGCAACTGAT
CCTTTTCGTATTCAGATGACTGATAACCTTCTCGAGAAGCTATACAACATGGGAGTTATA
CCGACTAGGAAAAGCTTGGCTTTAACTGATCGGTTATCAGTCTCCTCCTTCTGTAGGCGT
AGGCTATCAACTGTGCTGGTTCACCTCAAGTACGCAGAGCACTTGAAAGAAGCTGTGACA
TACATAGAGCAAGGACACATTCGTGTAGGACCAGACACTATCACTGATCCAGCCTTCTTA
GTAACTCGGAACATGGAAGATTTCATCACTTGGGTTGATTCTTCCAAGATCAAACGCAAG
GTGCTTCAATACAATGACAAGTTGGATGACTACGACATGATGCTTGCTTAACTCAACTCT
CTCTTAAGATAATATTTGTCTTGCTTCTCAAAAGTGTAAACCTTTTTCTATTGCCAAACT
ATGTTTTCATTACTTATCAAAACCTTTTGCAACAGATTAAGACCAAAGCAAGAACATAAC
GAAAGTTTCAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1AA21JQ C 94
AF RS1DI30TF U 1
AF RS1DI30JQ C 1
AF RS1EE59JQ C 23
AF RS1EE59TF U 23
AF RS1AA21TF U 23
AF RS1B852JQ C 171
AF RS1B852TF U 171
BS 1 52 RS1DI30TF
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BS 60 60 RS1AA21TF
BS 61 594 RS1DI30TF
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DS 

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DS 

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ATCCCGTCGAGCTAATCTTCTCTCTCAGAAGCGTGAGTAATGAGGAAGCTCAAGTACCAC
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GAAAACCTCATCACGGGTCGTTACCACATGGGTGGTCGTGACGACTACAAAAAATATTCA
GGATTGAGTAGGATGGTTCAGAAGCTGACGAATGTATTGAAACAGATGGATGCAACTGAT
CCTTTTCGTATTCAGATGACTGATAACCTTCTCGAGAAGCTATACAACATGGGAGTTATA
CCGACTAGGAAAAGCTTGGCTTTAACTGATCGGTTATCAGTCTCCTCCTTCTGTAGGCGT
AGGCTATCAACTGTGCTGGTTCACCTCAAGTACGCAGAGCACTTGAAAGAAGCTGTGACA
TACATAGAGCAAGGACACATTCGTGTAGGACCAGACACTATCACTGATCCAGCCTTCTTA
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CTGACGAATGTATTGAAACAGATGGATGCAACTGATCCTTTTCGTATTCAGATGACTGAT
AACCTTCTCGAGAAGCTATACAACATGGGAGTTATACCGACTAGGAAAAGCTTGGCTTTA
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QA 3 728 3 728
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GG
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CACATGGGTGGTCGTGACGACTACAAAAAATATTCAGGATTGAGTAGGATGGTTCAGAAG
CTGACGAATGTATTGAAACAGATGGATGCAACTGATCCTTTTCGTATTCAGATGACTGAT
AACCTTCTCGAGAAGCTATACAACATGGGAGTTATACCGACTAGGAAAAGCTTGGCTTTA
ACTGATCGGTTATCAGTCTCCTCCTTCTGTAGGCGTAGGCTATCAACTGTGCTGGTTCAC
CTCAAGTACGCAGAGCACTTGAAAGAAGCTGTGACATACATAGAGCAAGGACACATTCGT
GTAGGACCAGACACTATCACTGATCCAGCCTTCTTAGTAACTCGGAACATGGAAGATTTC
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G
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G
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GCTGTGACATACATAGAGCAAGGACACATTCGTGTAGGACCAGACACTATCACTGATCCA
GCCTTCTTAGTAACTCGGAACATGGAAGATTTCATCACTTGGGTTGATTCTTCCAAGATC
AAACGCAAGGTGCTTCAATACAATGACAAGTTGGATGACTACGACATGATGCTTGCTTAA
CTCAACTCTCTCTTAAGATAATATTTGTCTTGCTTCTCAAAAGTGTAAACCTTTTTCTAT
TGCCAAACTATGTTTTCATTACTTATCAAAACCTTTTGCAACAGATTAAGACCAAAGCAA
GAACATAACGAAAGTTTCAACC

QA 2 623 2 623
DS 



AS 1 8

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GTCATTTAAGAAAATCTTGATCCTACCAAGCAAGGATTCTGGAAGTAAACCAAAAAGAAG
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AAACTTTGAGATAATAATAATCTTAGAACACACGGTTAGGTGGACCCATTGTGCTCTTCA
AGTACAAACACCTCACGTTTTGCCAGTTCTTCTTCAATAGTGAGACGAGGAAGTTGACGC
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GCTTCCAAAGACTCTTGGTGGCTAACAAGAGTTGGGAACTTTCCTGCCTTGTTGAGACCA
GGACCAAGAAGACGAGGAATCTGTTTGATAACGGATTCAGAAGCAAGGAAAGCATGGAAC
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TCCATAGACTCTAATCCAATCTTCTCAGCCTCTTCAACGTGCTGGGCATCACCGAGCATG
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CTCTGGAGTTTACTCATTTTGGCTTACTTCCTGAGATGCTCCCCCGGCCGTAAGCAGTGG
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TGGCAACCAAAGGGCAACGAGAGAAGAACCCAAGTGGTGCGACGGAGAAGTGGAGCTTTG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 25 
40 40 25 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BG36JQ U 1
AF RS1C952JQ U 163
AF RS1BR14JQ U 46
AF RS1BG36TF C 115
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AF RS1BR14TF C 147
AF RS1C952TF C 377
AF RS1AB34TF C 315
BS 1 72 RS1BG36JQ
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BS 120 120 RS1BR14JQ
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BS 825 880 RS1AB34JQ
BS 881 1073 RS1AB34TF

RD RS1BG36JQ 492 0 0
GGAAACTTAAATGAAAAAAAAAAAAACACTAACAAAAATAGCAATAATAGAAACAAAATT
GTCATTTAAGAAGATCTTGATCCTACCAAGCAAGGATTCTGGAAGTAAACCAAAAAGAAA
AAAGCTCACGACAGAAATGAAAATCAAATCTAATCTCAGCCTTTGATGATACATTAAGAG
AAACTTTGAGATAATAATAATCTTAAAACACACGGTTAGGTGGACCCATTGTGCTCTTCA
AGTACAAACACCTCACGTTTTGCCAGTTCTTCTTCAATAGTGAGACGAGGAAGTTGACGC
TCATCTGAACATTCTGAAAGATCTGCTTCTCCTCCATGTCAAGGTTCCC*AACGGCGACA
CCCATGCAAAGAACCTTCTTGAGCTGGAACTTCACTGTTGCCTTTGTCTCGTTCACTTTG
GCTTCCAAAGACTCTTGGTGGCTAACAAGAGTTGGGAACTTTCCTGCCTTGTTGAGACCA
GGACCAAGAAGA

QA 1 492 1 492
DS 

RD RS1C952JQ 324 0 0
TTGATGATACATTAAAAAAAACTTTGAAATAATAATAATCTTAAAACACACGGTTAGGGG
GACCCATTGGGCTCTTCAAGTACAAACACCTCACGTTTTGCCAGTTCTTCTTCAATAGTG
AGACGAGGAAGTTGACCCTCATCTGAACATTCTGAAAGATCTGCTTCTCCTCCATGTCAA
GGTTCCC*AACGGCGACCCCCATGCAAAGAACCTTCTTGAGCTGGAACTTCACTGTTGCC
TTTGTCTCGTTCACTTTGGCTTCCAAAGACTCTTGGTGGCTAACAAGAGTTGGGAACTTT
CCTGCCTTGTTGAGACCAGGACCA

QA 1 324 1 324
DS 

RD RS1BR14JQ 784 0 0
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TAAACCAAAAAGAAGAAAGCTCACGACAGAAATGAAAATCAAATCTAATCTCAGCCTTTG
ATGATACATTAAGAGAAACTTTGAGATAATAATAATCTTAGAACACACGGTTAGGTGGAC
CCATTGTGCTCTTCAAGTACAAACACCTCACGTTTTGCCAGTTCTTCTTCAATAGTGAGA
CGAGGAAGTTGACGCTCATCTGAACATTCTGAAAGATCTGCTTCTCCTCCATGTCAAGGT
TCCC*AACGGCGACACCCATGCAA*GAACCTTCTTGAGCTGGAACTTCACTGTTGCCTTT
GTCTCGTTCACTTTGGCTTCCAAAGACTCTTGGTGGCTAACAAGAGTTGGGAACTTTCCT
GCCTTGTTGAGACCAGGACCAAGAAGACGAGGAATCTGTTTGATAACGGATTCAGAAGCA
AGGAAAGCATGGAACTTCTTTGCTAGCTTCTTAACAAGCTTCTTGTTCTTGTTCAGCTTC
TTAAGTGCTTCCACATCCATAGACTCTAATCCAATCTTCTCAGCCTCTTCAACGTGCTGG
GCATCACCGAGCATGCAAATCTTCATCTTAGGCCTTGGGATGTGAGGCAACTTGACGGAA
CCGCTGAAACGCTTGTCCTTTTGAGGGTCGTAGTTCTTAAGACCAATCTGGAGTTCGATG
GTCTCGGTGAACTTGCGAGGCTTCGTCTCCTTGCAGTGAGTGATCATGGCGGATATCGC
TCTCT

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DS 

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TAAGAGAA*CTTTGAGATAATAATAATCTTAGAACACACGGTTAGGTGGACCCATTGTGC
TCTTCAAGTACAAACACCTCACGTTTTGCCAGTTCTTCTTCAATAGTGAGACGAGGAAGT
TGACGCTCATCTGAACATTCTGAAAGATCTGCTTCTCCTCCATGTCAAGGTTCCC*AACG
GCGACACCCATGCAAAGAACCTTCTTGAGCTGGAACTTCACTGTTGCCTTTGTCTCGTTC
ACTTTGGCTTCCAAAGACTCTTGGTGGCTAACAAGAGTTGGGAACTTTCCTGCCTTGTTG
AGACCAGGACCAAGAAGACGAGGAATCTGTTTGATAACGGATTCAGAAGCAAGGAAAGCA
TGGAACTTCTTTGCTAGCTTCTTAACAAGCTTCTTGTTCTTGTTCAGCTTCTTAAGTGCT
TCCACATCCATAGACTCTAATCCAATCTTCTCAGCCTCTTCAACGTGCTGGGCATCACCG
AGCATGCAAATCTTCATCTTAGGCCTTGGGATGTGAGGCAACTTGACGGAACCGCTGAAA
CGCTTGTCCTTTTGAGGGTCGTAGTTCTTAAGACCAATCTGGAGTTCGATGGTCTCGGTG
AACTTGCGAGGCTTCGTCTCCTTGCAGTGAGTGATCATGGCGGATATCGCCTCTC

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DS 

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TACCAAGCAAGGATTCTGGAAGTAAACCAAAAAGAAGAAAGCTCACGACAGAAATGAAAA
TCAAATCTAATCTCAGCCTTTGATGATACATTAAGAGAAACTTTGAGATAATAATAATCT
TAAAACACACGGTTAGGTGGACCCATTGTGCTCTTCAAGTACAAACACCTCACGTTTTGC
CAGTTCTTCTTCAATAGTGAGACGAGGAAGTTGACGCTCATCTGAACATTCTGAAAGATC
TGCTTCTCCTCCATGTCAAGGTTCCC*AACGGCGACACCCATGCAAAGAACCTTCTTGAG
CTGGAACTTCACTGTTGCCTTTGTCTCGTTCACTTTGGCTTCCAAAGACTCTTGGTGGCT
AACAAGAGTTGGGAACTTTCCTGCCTTGTTGAGACCAGGACCAAGAAGACGAGGAATCTG
TTTGATAACGGATTCAGAAGCAAGGAAAGCATGGAACTTCTTTGCTAGCTTCTTAACAAG
CTTCTTGTTCTTGTTCAGCTTCTTAAGTGCTTCCACATCCATAGACTCTAATCCAATCTT
CTCAGCCTCTTCAACGTGCTGGGCATCACCGAGCATGCAAATCTTCATCTTAGGCCTTGG
GATGTGAGGCAACTTGACGGAACCGCTGAAACGCTTGTCCTTTTGAGGGTCGTAGTTCTT
AAGACCAATCTGGAGTTCGATGGTCTCGGTGAACTTGCGAGGCTTCGTCTCCTTGCAGTG
*GTGATCATGGCGGATATCGCCTCTCTCACGGCTTCACTCTGGAGTTTACTCATTTTGGC
TTACTTCCTGAGATGCT
CCCCCGG

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DS 

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AATCTAATCTCAGC*TTTGATGATACAT*AAGAGAAACTT*GAGATAATAATA*TCTTAG
AACACACGGTTAGGTGGACCCATTGTGCTCTTCAAGTACAAACACCTCACGTTTTGCCAG
TTCTTCTTCAATAGTGAGACGAGGAAGTTGACGCTCATCTGAACATTCTGAAAGATCTGC
TTCTCCTCCATGTCAAGGTTCCC*AACGGCGACACCCATGCAA*GAACCTTCTTGAGCTG
GAACTTCACTGTTGCCTTTGTCTCGTTCACTTTGGCTTCCAAAGACTCTTGGTGGCTAAC
AAGAGTTGGGAACTTTCCTGCCTTGTTGAGACCAGGACCAAGAAGACGAGGAATCTGTTT
GATAACGGATTCAGAAGCAAGGAAAGCATGGAACTTCTTTGCTAGCTTCTTAACAAGCTT
CTTGTTCTTGTTCAGCTTCTTAAGTGCTTCCACATCCATAGACTCTAATCCAATCTTCTC
AGCCTCTTCAACGTGCTGGGCATCACCGAGCATGCAAATCTTCATCTTAGGCCTTGGGAT
GTGAGGCAACTTGACGGAACCGCTGAAACGCTTGTCCTTTTGAGGGTCGTAGTTCTTAAG
ACCAATCTGGAGTTCGATGGTCTCGGTGAACTTGCGAGGCTTCGTCTCCTTGCAGTGAGT
GATCATGGCGGATATCGCCTCTCTCACGGCTTCACTCTGGAGTTTACTCATTTTGGCTTA
CTTCCTGAGATGCT
AAGAGCC

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DS 

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GGTGGCTAACAAGAGTTGGGAACTTTCCTGCCTTGTTGAGACCAGGACCAAGAAGACGAG
GAATCTGTTTGATAACGGATTCAGAAGCAAGGAAAGCATGGAACTTCTTTGCTAGCTTCT
TAACAAGCTTCTTGTTCTTGTTCAGCTTCTTAAGTGCTTCCACATCCATAGACTCTAATC
CAATCTTCTCAGCCTCTTCAACGTGCTGGGTATCACCGAGCATGCAAATCTTCATCTTAG
GCCTTGGGATGTGAGGCAACTTGACGGAACCGCTGAAACGCTTGTCCTTTTGAGGGTCGT
AGTTCTTAAGACCAATCTGGAGTTCGATGGTCTCGGTGAACTTGCGAGGCTTCGTCTCCT
TGCAGTGAGTGATCATGGCGGATATCGCCTCTCTCACGGCTTCACTCTGGAGTTTACTCA
TTTTGACTTACTTCCTGAGAT
CC

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DS 

RD RS1AB34TF 759 0 0
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CTTCTTGAGCTGGAACTTCACTGTTGCCTTTGTCTCGTTCACTTTGGCTTCCAAAGACTC
TTGGTGGCTAACAAGAGTTGGGAACTTTCCTGCCTTGTTGAGACCAGGACCAAGAAGACG
AGGAATCTGTTTGATAACGGATTCAGAAGCAAGGAAAGCATGGAACTTCTTTGCTAGCTT
CTTAACAAGCTTCTTGTTCTTGTTCAGCTTCTTAAGTGCTTCCACATCCATAGACTCTAA
TCCAATCTTCTCAGCCTCTTCAACGTGCTGGGCATCACCGAGCATGCAAATCTTCATCTT
AGGCCTTGGGATGTGAGGCAACTTGACGGAACCGCTGAAACGCTTGTCCTTTTGAGGGTC
GTAGTTCTTAAGACCAATCTGGAGTTCGATGGTCTCGGTGAACTTGCGAGGCTTCGTCTC
CTTGCAGTG*GTGATCATGGCGGATATCGCCTCTCTCACGGCTTCACTCTGGAGTTTACT
CATTTTGGCTTACTTCCTGAGATGCTCCCCCGGCCGTAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGT
GAAGCGAAAGGAATAGATTTAGAAGACATTGTTGACACACCAGCGTTGGCAACCAAAGGG
CAACGAGAGAAGAACCCAAGTGGTGCGACGGAGAAGTGGAGCTTTGGAGAGGTTATGGAA
TTTATAGGAGTAAATTGCTCATATATTATATATATAATC

QA 1 759 1 759
DS 



AS 2 5

CO CL511Contig1 1203 3 6 U
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CGACCATATCACCTGAATATCTCAACATTATTGTATCTTTTTCCCATATCAAAAGTTTCA
AGTCTCCCAAACACTATATGCTAAAGAGGAATAGCATAGCAGTACACAAAATGGACTCAA
GTCGATTTGCACTCTAAACCGGACCAAGATCATTCGGTCTTTTTATCGAGCTTCTTCTTT
GTCTCCCCGCTATAAGGACCAACATGGTAAGCATGCTTCTGAACAGCAGCGAAGATAACC
ATCTCAACACACACCAACACATTCTGAATAGCTTCCTGGATTTGTTCCACCTCCAACCAG
AAATGGTGTGATTTGATCACTCCCATCGCCACCAGTATGTCTAGTGCTATTCCCTGCCAG
AAGCAAAAGAAGACGATCCCTTTGATGCAGAGGAACTTTGCGAGTGGATTATGAGGAGCA
AGCTCCTTGGCAAACACATGGTAGAAGATCACAAGAGAATACAAGGCCAGAGAAACCGAG
ATATTGAGAACGATAGTGAATGTCCAGCTCAACCAAGACGGATAAAACCCGATGATTTGT
AAAGCAATCATCAAGATAGAGCACACTGGTCTGATCACCACAAACTGCCATGTCCAGTAC
TTCAAGAGCCTCAGAGTGCGATGATCCAGACGGACTACATGAGGCTGGAAGAGAGTCATA
GGGAAAGAATGGTGAATCTCTCTTCCTTTGATTCCATCAGGGACAATGTTTTTGCTGATA
GATATGTTCAAGTAACTATACATCAAAGCCAAGAACTTTGCAATGACGAGTGCTTCGTAG
CATTCTTTGATGGATTCAAGAAACAAGAAGAAGGTTTCACTTCCTTTGACATCTAACAAA
CCAACAAAGGAAACAACGGCGTAGATAGGAGCCATGAGAACAATGACGAGTATAGCCTTC
TGTTCCTTGGGGTTCTTCCAGTGAAAGAGATGCTGAGACACAAGCTGAATCGTCAGATGA
AGTGTGATCAATACGGAAAACGCCGAGCAGTAAAAAGTGATCTGCGGAGGCTTCATCTTC
GTTAGGTCCATCATTGCGGAGAAGAAGAGGGATGAGAGTGTGGGAGACGCGAGTAGAATC
AGATCTCTCTGTCTTCTTCTTCTTTAGATCATGAAGAATTGAAGACCGCCACCATTGATG
GGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1G971JQ U 37
AF RS1DA41JQ U 1
AF RS1BR34TF C 468
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BS 682 689 RS1DA41JQ
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RD RS1G971JQ 394 0 0
G
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TTTTTCCCATATCAAAAGTTTCAAGTCTCCCAAACACTATATGCTAAAGAGGAATAGCAT
AGCAGTACACAAAATGGACTCAAGTCGATTTGCACTCTAAACCGGACCAAGATCATTCGG
TCTTTTTATCGAGCTTCTTCTTTGTCTCCCCGCTATAAGGACCAACATGGTAAGCATGCT
TCTGAACAGCAGCGAAGATAACCATCTCAACACACACCAACACATTCTGAATAGCTTCCT
GGATTTGTTCCACCTCCAACCAGAAATGGTGTGATTTGATCACTCCCATCGCCACCAGTA
TGTCTAGTGCTATTCCCTGCCAGAAGCAAAA
GA

QA 2 392 2 392
DS 

RD RS1DA41JQ 689 0 0
GGCAGTGAAATGATATCATATTGGCTCAAATTGTATAGTACAAGTGGTTTAACATTATTT
CGACCATATCACCTGAATATCTCAACATTATTGTATCTTTTTCCCATATCAAAAGTTTCA
AGTCTCCCAAACACTATATGCTAAAGAGGAATAGCATAGCAGTACACAAAATGGACTCAA
GTCGATTTGCACTCTAAACCGGACCAAGATCATTCGGTCTTTTTATCGAGCTTCTTCTTT
GTCTCCCCGCTATAAGGACCAACATGGTAAGCATGCTTCTGAACAGCAGCGAAGATAACC
ATCTCAACACACACCAACACATTCTGAATAGCTTCCTGGATTTGTTCCACCTCCAACCAG
AAATGGTGTGATTTGATCACTCCCATCGCCACCAGTATGTCTAGTGCTATTCCCTGCCAG
AAGCAAAAGAAGACGATCCCTTTGATGCAGAGGAACTTTGCGAGTGGATTATGAGGAGCA
AGCTCCTTGGCAAACACATGGTAGAAGATCACAAGAGAATACAAGGCCAGAGAAACCGAG
ATATTGAGAACGATAGTGAATGTCCAGCTCAACCAAGACGGATAAAACCCGATGATTTGT
AAAGCAATCATCAAGATAGAGCACACTGGTCTGATCACCACAAACTGCCATGTCCAGTAC
TTCAAGAGCCTGAGAGTGCGGTGATCCAG

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1BR34TF 736 0 0
G
TTATGAGGAGCAAGCTCCTTGGCAAACACATGGTAGAAGATCACAAGAGAATACAAGGCC
AGGGAA*CCGAGATATTGAGAACGATAGTGAATGTCCAGCTCAACCAAGACGGATAAAAC
CCGATGATTTGTAAAGCAATCATCAAGATAGAGCACACTGGTCTGATCACCACAAACTGC
CATGTCCAGTACTTCAAGAGCCTCAGAGTGCGATGATCCAGACGGACTACATGAGGCTGG
AAGAGAGTCATAGGGAAAGAATGGTGAATCTCTCTTCCTTTGATTCCATCAGGGACAATG
TTTTTGCTGATAGATATGTTCAAGTAACTATACATCAAAGCCAAGAACTTTGCAATGACG
AGTGCTTCGTAGCATTCTTTGATGGATTCAAGAAACAAGAAGAAGGTTTCACTTCCTTTG
ACATCTAACAAACCAACAAAGGAAACAACGGCGTAGATAGGAGCCATGAGAACAATGACG
AGTATAGCCTTCTGTTCCTTGGGGTTCTTCCAGTGAAAGAGATGCTGAGACACAAGCTGA
ATCGTCAGATGAAGTGTGATCAATACGGAAAACGCCGAGCAGTAAAAAGTGATCTGCGGA
GGCTTCATCTTCGTTAGGTCCATCATTGCGGAGAAGAAGAGGGATGAGAGTGTGGGAGAC
GCGAGTAGAATCAGATCTCTCTGTCTTCTTCTTCTTTAGATCATGAAGAATTGAAGACCG
CCACCATTGATGGGC

QA 2 736 2 736
DS 



CO CL511Contig2 723 2 4 U
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AAATCGTGGCGTCTCACGTGGTAATAATAATATAATACATCATCAGTGGGACCCAACTTG
CAAACTCCCATCAATGGCGGTCTTCAATTCTTCATGATCTAAAGAAGAAGAAGACAGAGA
GATCTGATTCTACTCGCGTCTCTCACACTCTCATCGCTCTTCTTCTTCTCCTCAATGATG
GACCTAACGAAGATGAAGCCTCCGCAGATCACTTTCTACTGCTCGGCGTTTTCTGTATTG
ATCACACTTCATCTGACGATACAGCTTGTGTCTCAGCATCTCTTTCACTGGAAGAACCCC
AAGGAACAGAAGGCTATACTCGTCATTGTTCTCATGGCTCCTATCTATGCCGTTGTTTCC
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AAAGAATGCTACGAAGCACTCGTCATTGCAAAGTCCTTGGCGTTGATGTATAGTTACTTG
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TCTTTTCCAATGACTCTTTTCCAGCCTCATGTAGTCCGTCTGGATCACCGCACTCTCGGC
TCTTGAAGTACTGGACATGGCAGTTTGTGGTGATCAGACCAGTGTGCTCTATCTTGATGA
TTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1G971TF U 1
AF RS1DA41TF U 87
BS 1 514 RS1G971TF
BS 515 515 RS1DA41TF
BS 516 615 RS1G971TF
BS 616 723 RS1DA41TF

RD RS1G971TF 615 0 0
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AAATCGTGGCGTCTCACGTGGTAATAATAATATAATACATCATCAGTGGGACCCAACTTG
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GATCTGATTCTACTCGCGTCTCTCACACTCTCATCGCTCTTCTTCTTCTCCTCAATGATG
GACCTAACGAAGATGAAGCCTCCGCAGATCACTTTCTACTGCTCGGCGTTTTCTGTATTG
ATCACACTTCATCTGACGATACAGCTTGTGTCTCAGCATCTCTTTCACTGGAAGAACCCC
AAGGAACAGAAGGCTATACTCGTCATTGTTCTCATGGCTCCTATCTATGCCGTTGTTTCC
TTTGTTGGTTTGTTAGATGTCAAAGGAAGTGAAACCTCCTTCTTGATTCTTGAGTCCATC
AAAGAATGCTACGAAGCACTCGTCATTGCAAAGTTCTTGGCGTTGATGTATAGTTACTTG
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TCTTTTCCAATGACT

QA 1 615 1 615
DS 

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GG
AATATAATACATCATCAGTGGGACCCAACTTGCAAACTCCCATCAATGGCGGTCTTCAAT
TCTTCATGATCTAAAGAAGAAGAAGACAGAGAGATCTGATTCTACTCGCGTCTCTCACAC
TCTCATCGCTCTTCTTCTTCTCCTCAATGATGGACCTAACGAAGATGAAGCCTCCGCAGA
TCACTTTCTACTGCTCGGCGTTTTCTGTATTGATCACACTTCATCTGACGATACAGCTTG
TGTCTCAGCATCTCTTTCACTGGAAGAACCCCAAGGAACAGAAGGCTATACTCGTCATTG
TTCTCATGGCTCCTATCTATGCCGTTGTTTCCTTTGTTGGTTTGTTAGATGTCAAAGGAA
GTGAAACCTTCTTCTTGTTTCTTGAGTCCATCAAAGAATGCTACGAAGCACTCGTCATTG
CAAAGTCCTTGGCGTTGATGTATAGTTACTTGAACATATCTATCAGCAAAAACATTGTGC
CTGATGGAATCAAAGGAAGGGAGATTCACCATTCTTTTCCAATGACTCTTTTCCAGCCTC
ATGTAGTCCGTCTGGATCACCGCACTCTCGGCTCTTGAAGTACTGGACATGGCAGTTTGT
GGTGATCAGACCAGTGTGCTCTATCTTGATGATTG

QA 3 637 3 637
DS 



AS 1 8

CO CL512Contig1 1728 8 36 U
GGGCTCTCACCAAACATCTCTCTAAAACTATTTCTCTCTCTCTCT**ACACTGAGTCAAA
CGGAGGAGGACGATGATGAAGGCTTCCGTCAAAGGCAAGTACGATGGCGGTAAGAGCACT
GGAGTAGGCTCAGTGGCCTTCAACGCCGGCGACATAAAGCTACGCGCCACCATGACCGAT
GCAACCTTCGTCGCTGGTCCTACCTTGAACGGCCTCTCTCTGGCCGTGGAGAAGCCTGGT
TTCTTCATGGTCGAGTATAACGTCCCTAAGAAAGATGTTAGGTTTCAGTTCATGAACACG
GTGAGGGTTGCTGAGAAGCCATTGAATCTGACTTACATTCATAGCAGAGCTGATAACAGA
ACAATCGTGGACGGGAGCCTTGTGGTTGATTCTGCGAACAAAGTCTCTGCTAATTACATG
GTGGGAACAAACAACTGTAAGCTTAAGTACACTTATGCGCACGGAAGGGTTGCTACATTC
GAGCCTTGCTACGACTTTGCCAAGAATGCTTGGGATTTTGCGGTTTCTAGGAGAGTTTAT
GGAGATGATGTTGTCAAGGCCACTTATCAAACGTCTACTAAGTTGCTTGGTGTGGAATGG
TCAAGGAACTCCAAATCCACTGGATCTTTCAAGGTATGTGCGTCTGTGAATTTGGCGGAG
GAAGTGAAAACGCCGAAATTGATAGCAGAAACAACTTGGAACCTTGAAATCTAATGCCCT
TTACGATTATTCAAGTTTCCACCTGAATTGTTCGCTTGTTACCAACGATTTTAATTGCAC
CTTTTAGCCAACCTTTTTTGGTCAACATGACAACGCCCTCATGTGTCTGGTAATTTTGTC
TCTCTCATGAAAAATAATTTGTTGCAAGGGAAAAATGTACCCCTAAACCTCTTTTGAATG
CGTAATAAAAATCTGCAAATGGTTCTTAAAAATCCTCATTCCATGCCCAATCTTTTTTCT
CAATATCAAATTAACCTAAAGGGATGGACATGAATTTGTAAAAAACACTTAAGACATCAA
AATATGAAACGAATGTAAATCGTTTTCAAAACACAGCATAGGGCAAAAGCTTAGGATATG
AGACTCTTCGGCTTTATATTCAAGTCCACCTCACAGCTCGTAATGAATCAAACAGGAACA
GGTAGGCCTTTCTTCGCCATCCCATCCAGAATGTCGTTGAAAGCTTGGCATAATCCTGAT
ATCTGATGGTCCCATTGCTGTAGTTCCTCAATGTCATCTTCAAAATGTATCACAGCCTCT
TCCTGATCGATGGAACCTCTCATTCTGTCTTGGCCAATCATATTAGATGCTATCTTCTCC
GCCTTAGTTGGGTCAATTCCCAGTAAAGTTCCCAACTCATCAAACCTTATGTTAGTGTAA
AGTTTGCTTGAACTCAGAAGGTTATGCTAAATCATGGCACGGTCAAGAACAGTGGATTTG
TCAGGCAAAGTTGCTTTCTGATGTGGCCTTAATTCTTCCGCAAAAGCATCAATCTCTGGT
TTCCTTAAAATCCTTTCCAGATAAACCTTCTGCAGGATGGGATAGATCTTAAGCTTGGAG
CAGCGTTCATCTTTATATAAAGTTGCAAGAACACGAGAACGCTGAGGACCAGCTCCAGCT
AATATGGTACATGTCACAGCAGCAGATAGGCTTGCTCTAGTGCATCTCATCATCTCTCAT
CCCTATTTGGCGTTTTCATCTGAGATATGCTGTATACGAGTGCAGCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GG
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AAACAACTGTAAGCTTAAGTACACTTATGCGCACGGAAGGGTTGCTACATTCGAGCCTTG
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CAACCTTTTT*GGTCA*CATGACA*CGCCCTCATGTGTCTGGTA
TTT

QA 9 832 9 832
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AAGAAAGATGTTAGGTTTCATTTCATGAACACGGTGAGGGTTGCTGAGAAGCCATTGAAT
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TTCAAGGTATGTGCGTCTGTGAATTTGGCGGAGGAAGTGAAAACGCCGAAATTGATAGCA
GAAACAACTTGGAACCTTGAAATCTAATGCCCTTTACGATTATTCAAGTTTCCACCTGAA
TTGTTCGCTTGTTACCAACGATTTTAATTGCACCTTTTAGCCAACCTTTTTTGGTCAACA
TGACAACGCCCTCATGTGTCTGGTAATTTTGTCTCTCTCATGAAAAATAATTTGTTGCAA
GGGAAAAATGTACCCCTAAACCTCTTTTGAATGCGTAATAAAAATCTGCAAATGGTTC
CT

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TTTAATTGCACCTTTTAGCCAACCTTTTTTGGTCAACATGACAACGCCCTCATGTGTCTG
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TT

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DS 

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GATTCTGCGAACAAAGTCTCTGCTAATTACATGGTGGGAACAAACAACTGTAAGCTTAAG
TACACTTATGCGCACGGAAGGGTTGCTACATTCGAGCCTTGCTACGACTTTGCCAAGAAT
GCTTGGGATTTTGCGGTTTCTAGGAGAGTTTATGGGGATGATGTTGTCAAGGCCACTTAT
CAAACGTCTACTAAGTTGCTTGGTGTGGAATGGTCAAGGAACTCCAAATCCACTGGATCT
TTCAAGGTATGTGCGTCTGTGAATTTGGCGGAGGAAGTGAAAACGCCGAAATTGATAGCA
GAAACAACTTGGAACCTTGAAATCTAATGCCCTTTACGATTATTCAAGTTTCCACCTGAA
TTGTTCGCTTGTTACCAACGATTTTAATTGCACCTTTTAGCCAACCTTTTTTGGTCAACA
TGACAACGCCCTCATGTGTCTGGTAATTTTGTCTCTCTCATGAAAAATAATTTGTTGCAA
GGGAAAAATGTACCCCTAAACCTCTTTTGAATGCGTAATAAAAATCTGCAAATGGTTC
TT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1FT92JQ 661 0 0
GG
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ACTTAAGACATCAAAATATGAAACGAATGTAAATCGTTTTCAAAACACAGCATAGGGCAA
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ATCAAACAGGAACAGGTAGGCCTTTCTTCGCCATCCCATCCAGAATGTCGTTGAAAGCTT
GGCATAATCCTGATATCTGATGGTCCCATTGCTGTAGTTCCTCAATGTCATCTTCAAAAT
GTATCACAGCCTCTTCCTGATCGATGGAACCTCTCATTCTGTCTTGGCCAATCATATTAG
ATGCTATCTTCTCCGCCTTAGTTGGGTCAATTCCCAGTAAAGTTCCCAACTCATCAAACC
TTATGTTAGTGTAAAGTTTGCTTGCACTCAGAAGGTTATGCTCAATCATGGCACGGTCAA
GAACAGTGGATTTGTCAGGCAAAGTTGCTTTCTGATGTGGCCTTAATTCTTCCGCAAAAG
CATCAATCTCTGGTTTCCTTAAAATCCTTTCCAGATAAACCTTCTGCAGGATGGGATAGA
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CAAATGGTTCTTAAAAATCCTCATTCCATGCCCAATCTTTTTTCTCAATATCAAATTAAC
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TAAATCGTTTTCAAAACACAGCATAGGGCAAAAGCTTAGGATATGAGACTCTTCGGCTTT
ATATTCAAGTCCACCTCACAGCTCGTAATGAATCAGACAGGAACAGGTAGGCCTTTCTTC
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TGCTGTAGTTCCTCAATGTCATCTTCAAAATGTATCACAGCCTCTTCCTGATCGATGGAA
CCTCTCATTCTGTCTTGGCCAATCATATTAGATGCTATCTTCTCCGCCTTAGTTGGGTCA
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AGAAGGTTATGCTAAATCATGGCACGGTCAAGAACAGTGGATTTGTCAGGCAAAGTTGCT
TTCTGATGTGGCCTTAATTCTTCCGCAAAAGCATCAATCTCTGGTTTCCTTAAAATCCTT
TCCAGATAAACCTTCTGCAGGATGGGATAGATCTTAAGCTTGGAGCAGCGTTCATCTTTA
TATAAAGTTGCAAGAACACGAGAACGCTGAGGACCAGCTCCAGCTAATATGGTACATGTC
ACAGCAGCAGATAGGCTTGCTCTAGTGCATCTCATCATCTCTCATCCCTATTTGGCGTTT
TCATCTGAGATATGCTGTATACGAGTGCAGCGT

QA 1 873 1 873
DS 



AS 2 8

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GATCCTTTGAAAATCGGTCCAATACATCTGAATCGAGAGACCAGAACCCTAACATCAATA
TTAACATCGATCATCCCTCTGTTCACTGGGAAATCATGACTTCTTTTGCTGCGATTTCGA
ACTTTGTTATACAATGTCACGAGAGGGCAGGGGCAGAAGAACACCTTGAGAGTTACTTTC
AAGGTCTGAGTCAGGACGTTTGCAACAAATGGAACTTCCATAACGCCAGCTTGACAGAAT
TTCTTTCTACTTGGAGAGAAAGGAGGCAAGACATAGTTCCGACACCTGTTGACCAGCCAG
AAGATTTGGAATCTTCTTGGGCTATAAGCTTATCTACAGGCCAATCTGCCTTGGTTAAAT
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ATCAAAACAAGTTTGAGAGTCTAATTGAATATCTGTTAGTCAGAGGACCGGTGGTAGCAT
CTTTTGACGTCTTTCCGAGCTATGACGAAGAGTTCACGTTAAACATGGGACAAGGAATAT
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TTGAAAGCTTGGGGAGGAGTTTGGAGACGAGGCTTCGTTCGATGGCTCGGCATCACTGTG
TATCAGAGAAGTTGTGGAGTGAAGTTGATCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BJ61TF U 1
AF RS1CW41TF U 6
AF RS1BI37TF U 93
AF RS1FO02TF U 173
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BS 169 169 RS1CW41TF
BS 170 335 RS1BJ61TF
BS 336 336 RS1CW41TF
BS 337 344 RS1BJ61TF
BS 345 345 RS1CW41TF
BS 346 361 RS1BJ61TF
BS 362 362 RS1CW41TF
BS 363 587 RS1BJ61TF
BS 588 616 RS1CW41TF
BS 617 617 RS1BI37TF
BS 618 637 RS1CW41TF
BS 638 771 RS1BI37TF
BS 772 991 RS1FO02TF

RD RS1BJ61TF 587 0 0
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GTTAGCTCAAAGAGATACTCCGCACCATCCTCTCACGCTGAAGCAGCTGATGAGGCTACA
GATCCTTTGAAAATCGGTCCAATACATCTGAATCGAGAGACCAGAACCTTAACATCAATA
TTAACATCGATCATCCCTCTGTTCACTGGGAAATCATGACTTCTTTTGCTGCGATTTCGA
ACTTTGTTATACAATGTCACGAGAGGGCAGGGGCAGAAGAACACCTTGAGAGTTACTTTC
AAGGTCTGAGTCAGGACGTTTGCAACAAATGGAACCTCCATAACTCCAGCTTGACAGAAT
T*CTTTCTACTTGGAGAGAAAGGAGGCAAGACATAGTTCCGACACCTGTTGACCAGCCAG
AAGATTTGGAATCTTCTTGGGCTATAAGCTTATCTACAGGCCAATCTGCCTTGGTTAAAT
TAGAGAACTCTGATAGAGCACTTTTAACTACCAAGATGCTCCTGGAAGGTGTCCCTATTC
ATTATCAATCCGAAACTTGCGCGGTAGATCGTCTAGAAGATGTAAGA

QA 1 587 1 587
DS 

RD RS1CW41TF 636 0 0
GG
GAAACTGCCGTCGTAGTCTTTCTCGTCTCTTTTGACCTAAATCATGGACTAGAGTTAGCT
CAAAGAGATACTCCGCACCATCCTCTCACGCTGAAGCAGCTGATGAGGCTACAGATCCTT
TGAAAATCGGTCCAATACATCTGAATCGAGAGACCAGAACCCTAACATCAATATTAACAT
CGATCATCCCTCTGTTCACTGGGAAATCATGACTTCTTTTGCTGCGATTTCGAACTTTGT
TATACAATGTCACGAGAGGGCAGGGGCGGAAGAACACCTTGAGAGTTACTTTCAAGGTCT
GAGTCAGGACGTTTGCAACAAATGGAACTTCCATAACGCCAGCTTGACAGAATTTCTTTC
TACTTGGAGAGAAAGGAGGCAAGACATAGTTCCGACACCTGTTGACCAGCCAGAAGATTT
GGAATCTTCTTGGGCTATAAGCTTATCTACAGGCCAATCTGCCTTGGTTAAATTAGAGAA
CTCTGATAGAGCACTTTTAACTACCAAGATGCTCCTGGAAAGTGTCCCTATTCATTATCA
ATCCGAAACTTGCGCGGTAGATCGTCTAGAAGATGTAAGATCTTTCATGGTTGGAGGAAA
TTATGTGAG*CAGATGGTCGTTCACCACAG
CCAA

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DS 

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GGAG
GCTGAAGCAGCTGATGAGGCTACAGATCCTTTGAAAATCGGTCCAATACATCTGAATCGA
GAGACCAGAACCCTAACATCAATATTAACATCGATCATCCCTCTGTTCACTGGGAAATCA
TGACTTCTTTTGCTGCGATTTCGAACTTTGTTATACAATGTCACGAGAGGGCAGGGGCAG
AAGAACACCTTGAGAGTTACTTTCAAGGTCTGAGTCAGGACGTTTGCAACAAATGGAACT
TCCATAACGCCAGCTTGACAGAATTTCTTTCTACTTGGAGAGAAAGGAGGCAAGACATAG
TTCCGACACCTGTTGACCAGCCAGAAGATTTGGAATCTTCTTGGGCTATAAGCTTATCTA
CAGGCCAATCTGCCTTGGTTAAATTAGAGAACTCTGATAGAGCACTTTTAACTACCAAGA
TGCTCCTGGAAGGTGTCCCTATTCATTATCAATCCGAAACTTGCGCGGTAGATCGTCTAG
AAGATGTAAGATCTTTCATGGTTGGAGGAAATTATGTGAGGCAGATGGTCGCTCACCACA
GGCCAAGAGGAAATGATGAAGATGATCAAAACAAGTTTGAGAGTCTAATTGAATATCTGT
TAGTCAGAGGACCGGTGGTAGCATCTTTTGACGTCTTTCCGAGCTATGACGAAGAGTTCA
CGTTAAACATGGGAC

QA 5 679 5 679
DS 

RD RS1FO02TF 819 0 0
G
ATCAATATTAACATCGATCATCCCTCTGTTCACTGGGAAATCATGACTTCTTTTGCTGCG
ATTTCGAACTTTGTTATACAATGTCACGAGAGGGCAGGGGCAGAAGAACACCTTGAGAGT
TACTTTCAAGGTCTGAGTCAGGACGTTTGCAACAAATGGAACTTCCATAACGCCAGCTTG
ACAGAATTTCTTTCTACTTGGAGAGAAAGGAGGCAAGACATAGTTCCGACACCTGTTGAC
CAGCCAGAAGATTTGGAATCTTCTTGGGCTATAAGCTTATCTACAGGCCAATCTGCCTTG
GTTAAATTAGAGAACTCTGATAGAGCACTTTTAACTACCAAGATGCTCCTGGAAGGTGTC
CCTATTCATTATCAATCCGAAACTTGCGCGGTAGATCGTCTAGAAGATGTAAGATCTTTC
ATGGTTGGAGGAAATTATGTGGGGCAGATGGTCGTTCACCACAGGCCAAGAGGAAATGAT
GAAGATGATCAAAACAAGTTTGAGAGTCTAATTGAATATCTGTTAGTCAGAGGACCGGTG
GTAGCATCTTTTGACGTCTTTCCGAGCTATGACGAAGAGTTCACGTTAAACATGGGACAA
GGAATATTCAAGCCAACACCTGACGAGCATCATATGCGTGCATATCGAACATTTCCGAGG
CAATGTATCGTTTTGTTTGGGAAAGGAGTACAAGTGCAGGCTCAGATATCTAAGATTTTG
GGAAGGCTTGAAAGCTTGGGGAGGAGTTTGGAGACGAGGCTTCGTTCGATGGCTCGGCAT
CACTGTGTATCAGAGAAGTTGTGGAGTGAAGTTGATCA

QA 2 819 2 819
DS 



CO CL513Contig2 795 4 3 U
GATAAAAAGAAAAGCCTTGCAAATTGTTGTCACCAAATATTACATAATAAGGGAACAATT
GTCTGCTTAACAGTCGATTCAAATTAACTAGCGTGACAGATACATTAAGAAAGTTCACAT
ACAGAAGAAGTAACAGATACGTTAAGATAGTCAACTTAAAGAAACGATAGATAATGAAGT
TTTGGATAGATAATGATGCCACTGATGAGATCTTCTTGATCAAACCTTCAACTCCACAAC
TTCTCTGATTACACAGTGATGCCGAGCCAATCGAACGAAGCCCTCGTCTCCAAACTCCTC
CCCAAGGCTTTCAAGCCCTTCCCAAAATTCTTGGATATCTGAGCCCTGCACTTGTACTCC
TTTCCCAAACAAAACGATACAATGCCTCGGAAATGTTTGATATGCACGCATATGATGCTC
GTCAGGTGTTGGCTTGAATATTCCTTGTCCCATGTTTAACGTGAACTCTTCGTCATAGCT
CGGAAAGACGTCAAAAGATGCTACCACCGGTCCTCTGACTAACAGATATTCAATTAGACT
CTCAAACTTGTTTTGATCATCTTCATCATTTCCTCTTGGCCTGTGGTGAACGACCATCTG
CCTCACATAATTTCCTCCAACCATGAAAGATCTTACATCTTCTAGACGATCTACCGCGCA
AGTTTCGGATTGATAATGAATAGGGACACCTTCCAGGAGCATCTTGGTAGTTAAAAGTGC
TCTATCAGAGTTCTCTAATTTAACCAAGGCAGATTGGCCTGTAGATAAGCTTATAGCCCA
AGAAGATTCCAAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BJ61JQ U 60
AF RS1BI37JQ U 29
AF RS1C569JQ U 29
AF RS1CW41JQ U 1
BS 1 250 RS1CW41JQ
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BS 252 795 RS1CW41JQ

RD RS1BJ61JQ 305 0 0
TGTCTGCTTAACAGTCGATTCAAATTAACTAGCGTGACAGATACATTAAGAAAGTTCACA
TACAGAAGAAGTAACAGATACGTTAAGATAGTCAACTTAAAGAAACGATAGATAATGAAG
TTTTGGATAGATAATGATGCCACTGATGAGATCTTCTTGATCAAACCTTCAACTCCACAA
CTTCTCTGATTACACAGTGATGCCGAGCCAATCTAACGAAGCCCTCGTCTCCAAGCTCCT
CCCCAAGGCTTTCAAGCCCTTCCCAAAATTCTTGGATATCTGAGCCCTGCACTTGTACTC
CTTTC

QA 1 305 1 305
DS 

RD RS1BI37JQ 602 0 0
GTCACCAAATATTACATAATAAGGGAACAATTGTCTGCTTAACAGTCGATTCAAATTAAC
TAGCGTGACAGATACATTAAGAAAGTTCACATACAGAAGAAGTAACGGATACGTTAAGAT
AGTCAACTTAAAGAAACGATAGATAATGAAGTTTTGGATAGATAATGATGCCACTGATGA
GATCTTCTTGATCAAACCTTCAACTCCACAACTTCTCTGATTACACAGTGATGCCGAGCC
AATCGAACGAAGCCCTCGTCTCCAAACTCCTCCCCAAGGCTTTCAAGCCCTTCCCAAAAT
TCTTGGATATCTGAGCCCTGCACTTGTACTCCTTTCCCAAACAAAACGATACAATGCCTC
GGAAATGTTTGATATGCACGCATATGATGCTCGTCAGGTGTTGGCTTGAATATTCCTTGT
CCCATGTTTAACGTGAACTCTTCGTCATAGCTCGGAAAGACGTCAAAAGATGCTACCACC
GGTCCTCTGACTAACAGATATTCAATTAGACTCTCAAACTTGTTTTGATCATCTTCATCA
TTTCCTCTTGGCCTGTGGTGAGCGACCATCTGCCTCACATAATTTCCTCCAACCATGAAA
GA

QA 1 602 1 602
DS 

RD RS1C569JQ 707 0 0
GTCACCAAATATTACATAATAAGGGAACAATTGTCTGCTTAACAGTCGATTCAAATTAAC
TAGCGTGACAGATACATTAAGAAAGTTCACATACAGAAGAAGTAACAGATACGTTAAGAT
AGTCAACTTAAAGAAACGATAGATAATGAAGTTTTGGATAGATAATGATGCCACTGATGA
GATCTTCTTGATCAAACCTTCAACTCCACAACTTCTCTGATTACACAGTGATGCCGAGCC
AATCGAACGAAGCCCTCGTCTCCAAACTCCTCCCCAAGGCTTTCAAGCCCTTCCCAAAAT
TCTTGGATATCTGAGCCCTGCACTTGTACTCCTTTCCCAAACAAAACGATACAATGCCTC
GGAAATGTTTGATATGCACGCATATGATGCTCGTCAGGTGTTGGCTTGAATATTCCTTGT
CCCATGTTTAACGTGAACTCTTCGTCATAGCTCGGAAAGACGTCAAAAGATGCTACCACC
GGTCCTCTGACTAACAGATATTCAATTAGACTCTCAAACTTGTTTTGATCATCTTCATCA
TTTCCTCTTGGCCTGTGGTGAACGACCATCTGCCTCACATAATTTCCTCCAACCATGAAA
GATCTTACATCTTCTAGACGATCTACCGCGCAAGTTTCGGATTGATAATGAATAGGGACA
CCTTCCAGGAGCATCTTGGTAGTTAAAAGTGCTCTATCAGAGTTCTC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1CW41JQ 795 0 0
GATAAAAAGAAAAGCCTTGCAAATTGTTGTCACCAAATATTACATAATAAGGGAACAATT
GTCTGCTTAACAGTCGATTCAAATTAACTAGCGTGACAGATACATTAAGAAAGTTCACAT
ACAGAAGAAGTAACAGATACGTTAAGATAGTCAACTTAAAGAAACGATAGATAATGAAGT
TTTGGATAGATAATGATGCCACTGATGAGATCTTCTTGATCAAACCTTCAACTCCACAAC
TTCTCTGATTGCACAGTGATGCCGAGCCAATCGAACGAAGCCCTCGTCTCCAAACTCCTC
CCCAAGGCTTTCAAGCCCTTCCCAAAATTCTTGGATATCTGAGCCCTGCACTTGTACTCC
TTTCCCAAACAAAACGATACAATGCCTCGGAAATGTTTGATATGCACGCATATGATGCTC
GTCAGGTGTTGGCTTGAATATTCCTTGTCCCATGTTTAACGTGAACTCTTCGTCATAGCT
CGGAAAGACGTCAAAAGATGCTACCACCGGTCCTCTGACTAACAGATATTCAATTAGACT
CTCAAACTTGTTTTGATCATCTTCATCATTTCCTCTTGGCCTGTGGTGAACGACCATCTG
CCTCACATAATTTCCTCCAACCATGAAAGATCTTACATCTTCTAGACGATCTACCGCGCA
AGTTTCGGATTGATAATGAATAGGGACACCTTCCAGGAGCATCTTGGTAGTTAAAAGTGC
TCTATCAGAGTTCTCTAATTTAACCAAGGCAGATTGGCCTGTAGATAAGCTTATAGCCCA
AGAAGATTCCAAATC

QA 1 795 1 795
DS 



AS 1 8

CO CL514Contig1 701 8 4 U
AGAAACACAAAGCAAACATAATTTTTCATCCATAAGTGGAAAATGAGGAACATTACTAAA
AACCAGACCATGTTACTGCTTGTTGTTACACTTTTAGTGGTGATTGCGTACCAAGAGGGA
GAAGCCATACAATGCTCACAGATAACCATGTACTTAGCACCATGTTTGTCTTATGTAAAA
GGTGGAGGAAACCCGCCTCCTCCGTGTTGCGCCGGGCTTAATAATCTAAAAGCCTCAGCG
CCGGGGAAACCCGATAAACAAGCAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTAGCTAATGCTATA
TCCGGATTCAACGATGACAATGCCAAACAACTCCCTGGTAAATGCGGTGTTAGTGTGGGG
GTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAAGGACTACCAACG
GCCATGCAGCAATAATATAAAGTGTGGAATTCAACGGCCATATCCTGAAAGAGCAAAAAG
CATTATAACAAAACTGTTTGGATACTTTATACATGTAATCATATAAATAAACTGTGGAAT
TCATACATCTAGACAATTTTCTCTAGTCTAAATGTTTTAAATTTTTTAAGTAGGAGTAAT
TAGCCAAGTTAATTATCTTTGATTAGTACTATTAACAGAAAACAGTATAGTAGTGTATCT
ACTTTATAGCATGTGAACAAAAGTAAGACGCTTTCCGTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AL71TF U 26
AF RS1G868TF U 1
AF RS1AY62JQ C 246
AF RS1AY62TF U 246
AF RS1G868JQ C 246
AF RS1E885TF U 132
AF RS1GT63TF U 26
AF RS1GT63JQ C 228
BS 1 200 RS1G868TF
BS 201 201 RS1AL71TF
BS 202 552 RS1G868TF
BS 553 701 RS1GT63TF

RD RS1AL71TF 503 0 0
GG
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TGCGCCGGGCTTAATAATCTAAAAGCCTCAGCGCCGGGGAAACCCGATAAACAAGCAGCT
TGTCAATGCTTGAAGAGTGTAGCTAATGCTATATCCGGATTCAACGATGACAATGCCAAA
CAACTCCCTGGTAAATGCGGTGTTAGTGTGGGGGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGT
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AATTCCACGGCCATATCCTGAAAGAGCAAAAAGCATTATAACAAAACTGTTTGGATACTT
TATACATGTAATCATATAAAT

QA 3 503 3 503
DS 

RD RS1G868TF 562 0 0
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AACCAGACCATGTTACTGCTTGTTGTTACACTTTTAGTGGTGATTGCGTACCAAGAGGGA
GAAGCCATACAATGCTCACAGATAACCATGTACTTAGCACCATGTTTGTCTTATGTAAAA
GGTGGAGGAAACCCGCCTCCCCCGTGTTGCGCCGGGCTTAATAATCTAAAAGCCTCAGCG
CCGGGGAAACCCGATAAACAAGCAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTAGCTAATGCTATA
TCCGGATTCAACGATGACAATGCCAAACAACTCCCTGGTAAATGCGGTGTTAGTGTGGGG
GTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAAGGACTACCAACG
GCCATGCAGCAATAATATAAAGTGTGGAATTCAACGGCCATATCCTGAAAGAGCAAAAAG
CATTATAACAAAACTGTTTGGATACTTTATACATGTAATCATATAAATAAACTGTGGAAT
TCATACATCTAG
GCAAAAAAAA

QA 1 552 1 552
DS 

RD RS1AY62JQ 301 0 0
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GCAGCAATAATATAAAGTGTGGAATTCAACGGCCATATCCTGAAAGAGCAAAAAGCATTA
TAACAAAACTGTTTGGATACTTTATACATGTAATCATATAAATAAACTGTGGAATTCATA
C

QA 1 301 1 301
DS 

RD RS1AY62TF 301 0 0
GAAACCCGATAAACAAGCAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTAGCTAATGCTATATCTGG
ATTCAACGATGACAATGCCAAACAACTCCCTGGTAAATGCGGTGTTAGTGTGGGGGTCCC
TTTCTCTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAAGGACTACCAACGGCCAT
GCAGCAATAATATAAAGTGTGGAATTCAACGGCCATATCCTGAAAGAGCAAAAAGCATTA
TAACAAAACTGTTTGGATACTTTATACATGTAATCATATAAATAAACTGTGGAATTCATA
C

QA 1 301 1 301
DS 

RD RS1G868JQ 309 0 0
GAAACCCGATAAACAAGCAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTAGCTAATGCTATATCCGG
ATTCAACGATGACAATGCCAAACAACTCCCTGGTAAATGCGGTGTTAGTGTGGGGGTCCC
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GCAGCAATAATATAAAGTGTGGAATTCAACGGCCATATCCTGAAAGAGCAAAAAGCATTA
TAACAAAACTGTTTGGATACTTTATACATGTAATCATATAAATAAACTGTGGAATTCATA
CATCTAG
GC

QA 1 307 1 307
DS 

RD RS1E885TF 415 0 0
G
TGCTCACAGATAACCATGTACTTAGCACCATGTTTGTCTTATGTAAAAGGTGGAGGAAAC
CCGCCTCCTCCGTGTTGCGCCGGGCTTAATAATCTAAAAGCCTCAGCGCCGGGGAAACCC
GATAAACAAGCAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGTAGCTAATGCTATATCCGGATTCAAC
GATGACAATGCCAAACAACTCCCTGGTAAATGCGGTGTTAGTGTGGGGGTCCCTTTCTCT
AAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAAGGACTACCAACGGCCATGCAGCAA
TAATATAAAGCGTGGAATTCAACGGCCATATCCTGAAAGAGCAAAAAGCATTATAACAAA
ACTGTTTGGATACTTTATACATGTAATCATATAAATAAACTGTGGAATTCATAC

QA 2 415 2 415
DS 

RD RS1GT63TF 676 0 0
GG
ATCCATAAGTGGAAAATGAGGAACATTACTAAAAACCAGACCATGTTACTGCTTGTTGTT
ACACTTTTAGTGGTGATTGCGTACCAAGAGGGAGAAGCCATACAATGCTCACAGATAACC
ATGTACTTAGCACCATGTTTGTCTTATGTAAAAGGTGGAGGAAACCCGCCTCCTCCGTGT
TGCGCCGGGCTTAATAATCTAAAAGCCTCAGCGCCGGGGAAACCCGATAAACAAGCAGCT
TGTCAATGCTTGAAGAGTGTAGCTAATGCTATATCCGGATTCAACGATGACAATGCCAAA
CAACTCCCTGGTAAATGCGGTGTTAGTGTGGGGGTCCCTTTCTCTAAGAGCGTGGACTGT
AACAGCATAAACTGAAAAGAAGGACTACCAACGGCCATGCAGCAATAATATAAAGTGTGG
AATTCAACGGCCATATCCTGAAAGAGCAAAAAGCATTATAACAAAACTGTTTGGATACTT
TATACATGTAATCATATAAATAAACTGTGGAATTCATACATCTAGACAATTTTCTCTAGT
CTAAATGTTTTAAATTTTTTAAGTAGGAGTAATTAGCCAAGTTAATTATCTTTGATTAGT
ACTATTAACAGAAAACAGTATAGTAGTGTATCTACTTTATAGCATGTGAACAAAAGTAAG
ACGCTTTCCGTGAC

QA 3 676 3 676
DS 

RD RS1GT63JQ 474 0 0
AAAAGCTTCAGCGCCGGGGAAACCCGATAAACAAGCAGCTTGTCAATGCTTGAAGAGTGT
AGTTAATGCTATATCCGGATTCAACGATGACAATGCCAAACAACTCCCTGGTAAATGCGG
TGTTAGTGTGGGGGTCCCTTTTTTTAAGAGCGTGGACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGA
AGGACTACCAACGGCCATGCAGCAATAATATAAAGTGTGGAATTCAACGGCCATATCCTG
AAAGAGCAAAAAGCATTATAACAAAACTGTTTGGATACTTTATACATGTAATCATATAAA
TAAACTGTGGAATTCATACATCTAGACAATTTTTTTTAGTCTAAATGTTTTAAATTTTTT
AAGTAGGAGTAATTAGCCAAGTTAATTATCTTTGATTAGTACTATTAACAGAAAACAGTA
TAGTAGTGTATTTACTTTATAGCATGTGAACAAAAGTAAGACGCTTTCCGTGAC

QA 1 474 1 474
DS 



AS 2 6

CO CL515Contig1 969 2 4 U
GGGTGCCATCAGCTTTTATATTAAGAGAAACCACTTACAAATCTAAGTGCGAACTCTCTT
CTTGTTCCTCCTTCTATAAACCTAAACAGTTTATTTAAACAAAACAAGAAAAGCATGCCT
CTCTTCGACACTCACAACACATGGGCCTTTGTCTTTGGTTTGATGGGGAATGTCATCTCC
TTCGCTGTGTTCCTCTCTCCTGTGCCAACGTTCTATAGGGTTTGGAAGAAGAAGACAACA
GAAGGGTTTCAGTCTCTTCCTTACGTTGTGGCTCTCTTCAGCGCGACACTTTGGCTTTAC
TACGCAACGCAAAAGAAAGATGTTTTCCTCCTCGTCACCATCAACTCTTTTGGATGCTTC
ATAGAAACTATTTACATATCTATCTTCCTTGCATACGCACCCAAGAAAGCCCGGATGTTG
ACAGTGAAGTTGCTTCTTCTGATGAACTTTGGAGGATTCTGTCTGATTCTCCTTCTATGC
CAATTCTTAGCAAAAGGAACCACACGTGCCAAGATCATCGGAGGAATCTGTGTCGGATTT
TCCGTCTGTGTTTTCGCTGCTCCTCTAAGCATAATCAGGACAGTAATAAAGACAAGAAGT
GTAGAGTACATGCCCTTTAGCTTATCCTTAACCCTCACAATCAGTGCTGTGGTATGGCTC
CTTTATGGTCTTGCTCTCAAGGACATCTATGTTGCTTTCCCTAATGTGCTTGGTTTTGCT
CTCGGTGCACTCCAAATGATACTCTACGTGGTCTACAAATACTGTAAAACGCCGCCGCAT
CTAGGAGATAAAGAAGTGGAAGCCGCTAAGTTGCCTGAGGTGAGCCTCGATATCCTAAAG
CTAGGCACAGTGTCGTCCCCTGAGGTTCGTCAAGCGAACAAGTGTACTTGCGGAAATGAT
CAGAGGCCTGAGGTTGAAGATGGATAAAACACTAAAAACGGCGAACAGTTCTCTTCCGCA
TCAGCTACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GG37TF U 1
AF RS1BZ36TF U 278
BS 1 332 RS1GG37TF
BS 333 333 RS1BZ36TF
BS 334 700 RS1GG37TF
BS 701 969 RS1BZ36TF

RD RS1GG37TF 700 0 0
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CTTGTTCCTCCTTCTATAAACCTAAACAGTTTATTTAAACAAAACAAGAAAAGCATGCCT
CTCTTCGACACTCACAACACATGGGCCTTTGTCTTTGGTTTGATGGGGAATGTCATCTCC
TTCGCTGTGTTCCTCTCTCCTGTGCCAACGTTCTATAGGGTTTGGAAGAAGAAGACAACA
GAAGGGTTTCAGTCTCTTCCTTACGTTGTGGCTCTCTTCAGCGCGACACTTTGGCTTTAC
TACGCAACGCAAAAGAAAGATGTTTTCCTCCTTGTCACCATCAACTCTTTTGGATGCTTC
ATAGAAACTATTTACATATCTATCTTCCTTGCATACGCACCCAAGAAAGCCCGGATGTTG
ACAGTGAAGTTGCTTCTTCTGATGAACTTTGGAGGATTCTGTCTGATTCTCCTTCTATGC
CAATTCTTAGCAAAAGGAACCACACGTGCCAAGATCATCGGAGGAATCTGTGTCGGATTT
TCCGTCTGTGTTTTCGCTGCTCCTCTAAGCATAATCAGGACAGTAATAAAGACAAGAAGT
GTAGAGTACATGCCCTTTAGCTTATCCTTAACCCTCACAATCAGTGCTGTGGTATGGCTC
CTTTATGGTCTTGCTCTCAAGGACATCTATGTTGCTTTCC

QA 1 700 1 700
DS 

RD RS1BZ36TF 692 0 0
GCAGCGCG
ACACTTTGGCTTTACTACGCAACGCAAAAGAAAGATGTTTTCCTCCTCGTCACCATCAAC
TCTTTTGGATGCTTCATAGAAACTATTTACATATCTATCTTCCTTGCATACGCACCCAAG
AAAGCCCGGATGTTGACAGTGAAGTTGCTTCTTCTGATGAACTTTGGAGGATTCTGTCTG
ATTCTCCTTCTATGCCAATTCTTAGCAAAAGGAACCACACGTGCCAAGATCATCGGAGGA
ATCTGTGTCGGATTTTCCGTCTGTGTTTTCGCTGCTCCTCTAAGCATAATCAGGACAGTA
ATAAAGACAAGAAGTGTAGAGTACATGCCCTTTAGCTTATCCTTAACCCTCACAATCAGT
GCTGTGGTATGGCTCCTTTATGGTCTTGCTCTCAAGGACATCTATGTTGCTTTCCCTAAT
GTGCTTGGTTTTGCTCTCGGTGCACTCCAAATGATACTCTACGTGGTCTACAAATACTGT
AAAACGCCGCCGCATCTAGGAGATAAAGAAGTGGAAGCCGCTAAGTTGCCTGAGGTGAGC
CTCGATATCCTAAAGCTAGGCACAGTGTCGTCCCCTGAGGTTCGTCAAGCGAACAAGTGT
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CAGTTCTCTTCCGCATCAGCTACA

QA 9 692 9 692
DS 



CO CL515Contig2 1280 4 8 U
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ATAGGAAATATACATATCCCCAATAGGTAATTACATAAAAGTTTAAAAAAGAAGTGGAAA
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TTTCTCTACTTCGCACACTTGATTAACTCAAAAAAATACGACAGCATAACGGGAATACGT
GGTGGTTGGTATATCAAGTTGGGGGTAAAGTCAACATTGCATAGTCGTCAACGAAATTGT
TCATGTGGCTGTTGCGGAAAAGGACTGCTTGCCGTTTTTAGCATTTTGTCCATCTTCAAC
CTCAGCCCTCCGATCATTTCCGCAGGTACACTTGTTCGTTTGACGAACGGCTGCGATTGG
ATCAGGGGATGACACGGTGCCTAGCTTCAGCATATCGAGGGTCACCTCCGGTATCTTAGC
AGCTTCCACTTCTTTCTCTCCCAAATGTGGCGGCGTTTTACAGTATTTGTAAACCACGTA
GAGTATCATTTGAAGTGCACCGAGGGCAAAACCAATCACATTAGGGAAAGCAACATAGAT
GTCCTTGAGAGCAAGACCATAAAGGAGCCATACGACAGCACTGATTGTAAGGGTTAAGGA
TAAGCTAAAGGGCATGTACTCCACACTTCTGGTCTTTATTACTGTCCTGATTATGCTTAG
AGGAGCAGCAAAAACACAAACAGAGAATCCGACACATATTCCTCCGATGATCTTAGCACG
TGTTGTTCCTTTTGCCAAGAATTGACATAGAAGGAGAATCAAGCAAAATCCTCCAAAGTT
CATAAGAAGTAGCAACTTCACTGTCAGCATCCTGGCTTTCTTGGGTGCGAAGGCAAGGAA
GATAGAGATGTAGATGGTTTCTATGAAGCATCCAAAGGAGTTGATGGTAACAAGAAGGAA
GACATCTTTCTTCTGTGTTGCGTAGTAAAGCCAAAGTGTTGCACTGAAGAGCGCCACGAC
GTAAGGAAGAGACTGAAACCCTTCCGTTGTCTTCTTCTTCCACACCCTATAGAACGTTGG
CACAGGAGAGAGGAACACGGCGAAGGAGATTACATTCCCCATCAAACCAAAGACAAAGGC
CCATGTGTTGTGAGTGTCAAAGAGAGGCATGGTTTTCTTTTGGTTTAAATAAACTGTTTA
GGGTTTTTTGGAGGAAGAAGGAGAGATATCTCACTTAGATTTGTAAGTGTTTTCTCGTAA
TGTAAAAGCTGATGGCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H276JQB U 1
AF RS1AB43JQ U 161
AF RS1H276TF C 367
AF RS1AB43TF C 608
BS 1 597 RS1H276JQB
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BS 599 729 RS1H276JQB
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BS 1111 1280 RS1AB43TF

RD RS1H276JQB 729 0 0
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ATAGGAAATATACATATCCCCAATAGGTAATTACATAAAAGTTTAAAAAAGAAGTGGAAA
ATTTAATTCCAGAAACATATATATAACATCGAAAATGCATATATTTATCCTGGGAAATTA
TTTCTCTACTTCGCACACTTGATTAACTCAAAAAAATACGACAGCATAACGGGAATACGT
GGTGGTTGGTATATCAAGTTGGGGGTAAAGTCAACATTGCATAGTCGTCAACGAAATTGT
TCATGTGGCTGTTGCGGAAAAGGACTGCTTGCCGTTTTTAGCATTTTGTCCATCTTCAAC
CTCAGCCCTCCGATCATTTCCGCAGGTACACTTGTTCGTTTGACGAACGGCTGCGATTGG
ATCAGGGGATGACACGGTGCCTAGCTTCAGCATATCGAGGGTCACCTCCGGTATCTTAGC
AGCTTCCACTTCTTTCTCTCCCAAATGTGGCGGCGTTTTACAGTATTTGTAAACCACGTA
GAGTATCATTTGAAGTGCACCGAGGGCAAAACCAATCACATTAGGGAAAGCAACATAAAT
GTCCTTGAGAGCAAGACCATAAAGGAGCCATACGACAGCACTGATTGTAAGGGTTAAGGA
TAAGCTAAAGGGCATGTACTCCACACTTCTGGTCTTTATTACTGTCCTGATTATGCTTAG
AGGAGCAGC

QA 1 729 1 729
DS 

RD RS1AB43JQ 612 0 0
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ACAGCATAACGGGAATACGTGGTGGTTGGTATATCAAGTTGGGGGTAAAGTCAACATTGC
ATAGTCGTCAACGAGATTGTTCATGTGGCTGTTGCGGAAGAGGACTGCTTGCCGTTTTTA
GCATTTTGTCCATCTTCAACCTCAGCCCTCCGATCATTTCCGCAGGTACACTTGTTCGTT
TGACGAACGGCTGCGATTGGATCAGGGGATGACACGGTGCCTAGCTTCAGCATATCGAGG
GTCACCTCCGGTATCTTAGCAGCTTCCACTTCTTTCTCTCCCAAATGTGGCGGCGTTTTA
CAGTATTTGTAAACCACGTAGAGTATCATTTGAAGTGCACCGAGGGCAAAACCAATCACA
TTAGGGAAAGCAACATAGATGTCCTTGAGAGCAAGACCATAAAGGAGCCATACGACAGCG
CTGATTGTAAGGGTTAAGGATAAGCTAAAGGGCATGTACTCCACACTTCTGGTCTTTATT
ACTGTCCTGATTATGCT*AGAGGAGCAGCAAAAACACAAACAGAGAATCCGACACATATT
CCTCCGATGATC

QA 1 612 1 612
DS 

RD RS1H276TF 747 0 0
CCTCCGATCATTTCCGCAGGTACACTTGTTCGTTTGACGAACGGCTGCGATTGGATCAGG
GGATGACACGGTGCCTAGCTTCAGCATATCGAGGGTCAC*TCCGGTATCTTAGCAGCTTC
CACTTCTTTCTCTCCCAAATGTGGCGGCGTTTTACAGTATTTGTAAACCACGTAGAGTAT
CATTTGAAGTGCACCGAGGGCAAAACCAATCACATTAGGGAAAGCAACATAGATGTCCTT
GAGAGCAAGACCATAAAGGAGCCATACGACAGCACTGATTGTAAGGGTTAAGGATAAGCT
AAAGGGCATGTACTCCACACTTCTGGTCTTTATTACTGTCCTGATTATGCTTAGAGGAGC
AGCAAAAACACAAACAGAGAATCCGACACATATTCCTCCGATGATCTTAGCACGTGTTGT
TCCTTTTGCCAAGAATTGACATAGAAGGAGAATCAAGCAAAATCCTCCAAAGTTCATAAG
AAGTAGCAACTTCACTGTCAGCATCCTGGCTTTCTTGGGTGCGAAGGCAAGGAAGATAGA
GATGTAGATGGTTTCTATGAAGCATCCAAAGGAGTTGATGGTAACAAGAAGGAAGACATC
TTTCTTCTGTGTTGCGTAGTAAAGCCAAAGTGTTGCACTGAAGAGCGCCACGACGTAAGG
AAGAGACTGAAACCCTTCCGTTGTCTTCTTCTTCCGCACCCTATAGAACGTTGGCACAGG
AGAGAGGAACACGGCGAAGGAGAT
TAC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1AB43TF 673 0 0
AGAGCAAGACCATAAAGGAGCCATACGACAGCGCTGATTGTAAGGGTTAAGGATAAGCTA
AAGGGCATGTACTCCACACTTCTGGTCTTTATTACTGTCCTGATTATGCT*AGAGGAGCA
GCAAAAACACAAACAGAGAATCCGACACATATTCCTCCGATGATCTTAGCACGTGTTGTT
CCTTTTGCCAAGAATTGACATAGAAGGAGAATCAAGCAAAATCCTCCAAAGTTCATAAGA
AGTAGCAACTTCACTGTCAGCATCCTGGCTTTCTTGGGTGCGAAGGCAAGGAAGATAGAG
ATGTAGATGGTTTCTATGAAGCATCCAAAGGAGTTGATGGTAACAAGAAGGAAGACATCT
TTCTTCTGTGTTGCGTAGTAAAGCCAAAGTGTTGCACTGAAGAGCGCCACGACGTAAGGA
AGAGACTGAAACCCTTCCGTTGTCTTCTTCTTCCACACCCTATAGAACGTTGGCACAGGA
GAGAGGAACGCGGCGAAGGAGATTACATTCCCCATCAAACCAAAGACAAAGGCCCATGTG
TTGTGAGTGTCAAAGAGAGGCATGGTTTTCTTTTGGTTTAAATAAACTGTTTAGGGTTTT
TTGGAGGAAGAAGGAGAGATATCTCACTTAGATTTGTAAGTGTTTTCTCGTAATGTAAAA
GCTGATGGCACCC

QA 1 673 1 673
DS 



AS 2 6

CO CL516Contig1 966 2 12 U
ACTTTATTTCACGAATAGGGGATAGAGGTACATCGACCCATCTTTTCGGATGGTTGACGT
TACAAAATAAAATAAAAAGTACAATGGGCTATAAACCCAAATTATTAAAAACCAAAGATT
AAAACATATAACATAGCGTGGGTGTCTTGATTCTTGAACAATAAACATCAATAAAGCATA
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TTCTGTTTCTTCACAGTGTCCTCCAGTTTCTGCATTGCAATCTTAGTCCCTGCCCATCCC
ACGGCAACGACTGGTAAAGCAAAACCCGCAGCTATTGCACCTTCCACCAGAAATTCGCCC
CCGAATGCAAATGTAGCCACCCCTATGAGAGCAACAACACCAAACAACGTGCCGAAAATT
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CTGTTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 

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DS 

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DS 



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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AATTTCTTCTTGATTAGTTTCAGTTCATTTTTCGTGTCTCTCTCGCTAGCCCCGTCAGGA
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CTTAGCTATTAACTTGTCGCCATCAAAATCGTGTTTCATGTTTTCAAACTTCTTCAGGTC
CTCCAATGCTTTTTCATACTTGTTCTTAGTATTCCCACCATTTTCCGCCGACTCTTTGTC
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CTT
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CTTTAGATCTTCATTGTCCCACACGCCTCCTTCGATAGCAGTAATGAACTTTGCCACAGC
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TGCTGAGTGAACTTCGTGTAGTGCCATTGATATTACTGAACTTGGATCGGAATTTTGCTC
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DS 



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AAGTTCAGTATTATATGGTTTTGTTTTGCAG


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1FB84TF U 1
AF RS1EJ75TF U 2
AF RS1D021JQ C 776
AF RS1EJ75JQ C 635
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AF RS1D021TF U 776
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CATATTTGCGGAGATGATAACCCAAAAGCCCTTGTTTCCTGGAGACTCCGAGATTGATCA
ACTCTTCAAGATATTCAGAATCATGGGAACTCCAACTGAGGATACATG

QA 1 768 1 768
DS 

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GG
GGATCCGTCGGCTGTCTCACTCGCTATCACTACATCCGATCGTCCCCGGTGATTCGTGTT
GCTTTCAGCCTAGTTTAAAGGGATGGATCAGTACGAGAAAGTTGAGAAGATCGGTGAAGG
AACTTACGGTGTTGTGTACAAGGCACGAGACAAAGTCACCAACGAGACTATCGCTTTGAA
GAAGATCCGCCTCGAGCAGGAGGATGAAGGTGTCTCCAGCACCGCCATTAGAGAAATCTC
TCTTTTGAAAGAAATGCAGCACAGCAACATTGTCAAGTTGCAGGATGTAGTGCACAGCGA
GAAGCGTTTGTATCTGGTTTTCGAGTATCTTGACCTGGATCTCAAAAAGCACATGGACTC
TTCTCCTGATTTCTCCAAGGATCTTCATATGATCAAAAGGTATGTTTATCAGATTCTCCG
TGGAATAGCGTATTGCCACTCTCACAGGGTTCTCCACCGTGACCTGAAGCCACAGAATCT
GTTGATTGATCGCCGCACCAACTCACTTAAGCTTGCAGATTTTGGACTGGCCAGAGCATT
CGGTATCCCTGTCAGGACATTTACTCATGAGGTGGTTACTCTCTGGTACCGAGCACCAGA
GATACTCCTAGGGTCTCATCACTACTCTACACCGGTTGATATTTGGTCTGTGGGATGCAT
ATTTGCGGAGATGATAACCCAAAAGCCCTTGTTTCCTGGAGACTCCGAGATTGATCAACT
CTTCA*GATATTCAGAATCATGGGAACTCCAACTGAGGATA

QA 3 763 3 763
DS 

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TCTTTTGTCCCAAACCTTGATCCTAATGGCATAGATCTCCTTTCTAAAATGCTGTTGATG
GATCCAAGCAAAAGAATCAACGCAAGAGCTGCCCTGGAGCATGATTACTTCAAGGATCTA
GGCGTCATGCCGTAGAGAATGCTTCAAAACCAGTAATCTCCTACATTCTCTCTATATATA
AGTATCTCGATATCTTTCATCCTTGAGAAAACGAGGTAAAAAA*TACATCATGGCTTTTG
TTTATTCTTTTTTCTTTTCTTCTTAGTTTGTTATTCTCTGATACGAAAACAGGAATGATT
TTAGAGTGTGGTTTGTTTATTTCTTCTAAGCTTTTGAGATC
ATATTT

QA 1 401 1 401
DS 

RD RS1EJ75JQ 542 0 0
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TTTCCTGGAGACTCCGAGATTGATCAACTCTTCAAGATATTCAGAATCATGGGAACTCCA
ACTGAGGATACATGGCCAGGGGTAACTTCGCTTCCGGATTATAAATTTGCTTTCCCAAAA
TGGAAACCAACGGACTTGGAATTTTTTGTCCCAAACCTTGATCCTAATGGCATAGATCTC
CTTTTTAAAATGCTGTTGATGGATCCAAGCAAAAGAATCAACGCAAGAGCTGCCCTGGAG
CATGATTACTTCAAGGATTTAGGCGTCATGCCGTAGAGAATGCTTCAAAACCAGTAATCT
CCTACATTCTCTCTATATATAAGTATCTCGATATCTTTCATCCTTGAGAAAACGAGGTAA
AAAAATACATCATGGCTTTTGTTTATTCTTTTTTCTTTTCTTCTGAGTTTGTTATTTTCT
GATACGAAAACAGGAATGATTTTAGAGTGTGGTTTGTTTATTTCTTTTAAGCTTTTGAGA
TC

QA 1 542 1 542
DS 

RD RS1FC62JQ 759 0 0
AGCCACAGAATCTGTTGATTGATCGCCGCACCAACTCACTTAAGCTTGCAGATTTTGGAC
TGGCCAGAGCATTCGGTATCCCTGTCAGGACATTTACTCATGAGGTGGTTACTCTCTGGT
ACCGAGCACCAGAGATACTCCTAGGGTCTCATCACTACTCTACACCGGTTGATATTTGGT
CTGTGGGATGCATATTTGCGGAGATGATAACCCAAAAGCCCTTGTTTCCTGGAGACTCCG
AGATTGATCAACTCTTCAAGATATTCAGAATCATGGGAACTCCAACTGAGGATACATGGC
CAGGGGTAACTTCGCTTCCGGATTATAAATCTGCTTTCCCAAAATGGAAACCAACGGACT
TGGAATCTTTTGTCCCAAACCTTGATCCTAATGGCATAGATCTCCTTTCTAAAATGCTGT
TGATGGATCCAAGCAAAAGAATCAACGCAAGAGCTGCCCTGGAGCATGATTACTTCAAGG
ATCTAGGCGTCATGCCGTAGAGAATGCTTCAAAACCAGTAATCTCCTACATTCTCTCTAT
ATATAAGTATCTCGATATCTTTCATCCTTGAGAAAACGAGGTAAAAAA*TACATCATGGC
TCTTGTTTATTCTTTTTTCTTTTCTTCTGAGTTTGTTATTCTCTGATACGAAAACAGGAA
TGATTTTAGAGTGTGGTTTGTTTATTTCTTCTAAGCTTTTGAGATCATATTTCTTGTGTA
TCTTTCTACCAAGTTCAGTATTATATGGTTTTGTTTTGC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RS1D021TF 456 0 0
GTAACTTCGCTTCCGGATTATAAATCTGCTTTCCCAAAACGGAAACCAACGGACTTGGAA
TCTTTTGTCCCAAACCTTGATCCTAATGGCATAGATCTCCTTTCTAAAATGCTGTTGATG
GATCCAAGCAAAAGAATCAACGCAAGAGCTGCCCTGGAGCATGATTACTTCAAGGATCTA
GGCGTCATGCCGTAGAGAATGCTTCAAAACCAGTAATCTCCTACATTCTCTCTATATATA
AGTATCTCGATATCTTTCATCCTTGAGAAAACGAGGTAAAAAA*TACATCATGGCTTTTG
TTTATTCTTTTTTCTTTTCTTCTTAGTTTGTTATTCTCTGATACGAAAACAGGAATGATT
TTAGAGTGTGGTTTGTTTATTTCTTCTAAGCTTTTGAGATCATATTTCTTGTGTATCTTT
CTACCAAGTTCAGTATTATATGGTTTTGTTTTGCAG

QA 1 456 1 456
DS 



AS 1 8

CO CL518Contig1 766 8 11 U
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AAGCTCCATAACCCTTTTCTTGGCTCTCAATCTCATCTTCTTCACAACAATCTCTGCATG
CGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCAAAGCCAACTCCTAA
ACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCATGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGG
TGTCTGCGCCAATGTGCTCAACGGCCTCCTCGACTTGACCCTTGGCAAGCCACCGGTCGA
ACCATGCTGTACCCTCATTCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGTAC
CGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTTCCGATCTCTCTCAGTCTTCT
CCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAACTATATCATA
TATAATTTAAACACACTTATATATATATTTATCTTCTTGTTTTGAAAAGACGAGGTGAAT
CTATATACTTTTAATATTGTGTGCCTTTATCTTTGTGTGTTCTTATTCTAGTCTTACCTG
TTATGGAGTTCATTGGCTCAATTTATGTTTCTCTCTGGGTGATCCGTAAAGATTCTTGAA
ATGTACCGTTTCATTGTTTCCCATTAATACTCTTATATCGGGGCTATTATTGTTGCTTTG
GTTGTATTGTGATTTATGAATTAATAAAGGATTTATATTTAAGTAA


BQ
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 30 45 45 45 15 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 20 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EG81TF U 1
AF RS1AM22JQ C 1
AF RS1BU63JQ C 417
AF RS1EG81JQ C 317
AF RS1AP40JQ C 1
AF RS1AP40TFB U 1
AF RS1BU63TF U 1
AF RS1AM22TF U 1
BS 1 52 RS1EG81TF
BS 53 53 RS1BU63TF
BS 54 183 RS1EG81TF
BS 184 184 RS1AP40TFB
BS 185 328 RS1EG81TF
BS 329 329 RS1AP40TFB
BS 330 645 RS1EG81TF
BS 646 676 RS1AP40TFB
BS 677 677 RS1BU63TF
BS 678 745 RS1AP40TFB
BS 746 766 RS1AM22JQ

RD RS1EG81TF 645 0 0
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CCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAACTATATCATA
TATAATTTAAACACACTTATATATATATTTATCTTCTTGTTTTGAAAAGACGAGGTGAAT
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TTATGGAGTTCATTGGCTCAATTTATGTTTCTCTCTGGGTGATCC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1AM22JQ 766 0 0
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AAGCTCCATAACCCTTTTCTTGGCTCTCAATCTCATCTTCTTCGCAACAATCTCTGCATG
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TGTCTGCGCCAATGTGCTCAACGGCCTCCTCGACTTGACCCTTGGCAAGCCACCGGTCGA
ACCATGCTGTACCCTCATTCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGTAC
CGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTTCCGATCTCTCTCAGTCTTCT
CCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAACTATATCATA
TATAATTTAAACACACTTATATATATATTTATCTTCTTGTTTTGAAAAGACGAGGTGAAT
CTATATACTTTTAATATTGTGTGCCTTTATCTTTGTGTGTTCTTATTCTAGTCTTACCTG
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GTTGTATTGTGATTTATGAATTAATAAAGGATTTATATTTAAGTAA

QA 1 766 1 766
DS 

RD RS1BU63JQ 349 0 0
TTT
TCCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAACTATATCAT
ATATAATTTAAACACACTTATATATATATTTATCTTCTTGTTTTGAAAAGACGAGGTGAA
TCTATATACTTTTAATATTGTGTGCCTTTATCTTTGTGTGTTCTTATTCTAGTCTTACCT
GTTATGGAGTTCATTGGCTCAATTTATGTTTCTCTCTGGGTGATCCGTAAAGATTCTTGA
AATGTACCGTTTCATTGTTTCCCATTAATACTCTTATATCGGGGCTATTATTGTTGCTTT
GGTTGTATTGTGATTTATGAATTAATAAAGGATTTAT
ATTTAAGCT

QA 4 340 4 340
DS 

RD RS1EG81JQ 444 0 0
ATTCAAGGACTCACTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGTACCGCTCTTAAGGCTAAC
GTTCTTGGAATCAACTTGAACCTTCCGATCTCTCTCAGTCTTCTCCTCAATGTTTGCAGC
AAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAACTATATCATATATAATTTAAACACAC
TTATATATATATTTATCTTCTTGTTTTGAAAAGACGAGGTGAATCTATATACTTTTAATA
TTGTGTGCCTTTATCTTTGTGTGTTCTTATTCTAGTCTTACCTGTTATGGAGTTCATTGG
CTCAATTTATGTTTCTCTCTGGGTGATCCGTAAAGATTCTTGAAATGTACCGTTTCATTG
TTTCCCATTAATACTCTTATATCGGGGCTATTATTGTTGCTTTGGTTGTATTGTGATTTA
TGAATTAATAAAGGATTTAT
ATTT

QA 1 440 1 440
DS 

RD RS1AP40JQ 760 0 0
GGACACTCCATTCACCCACAACATAGCTAGTGAACAGTGTCTTCTAAAAAAA*TGGCTTC
AAGCTCCATAACCCTTTTCTTGGCTCTCAATCTCATCTTCTTCACAACAATCTCTGCATG
CGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCAAAGCCAACTCCTAA
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TGTCTGCGCCAATGTGCTCAACGGCCTCCTCGACTTGACCCTTGGCAAGCCACCGGTCGA
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CGCTCTTAAGGCTAACATTCTTGGAATCAACTTGAACCTTCCGATCTCTCTCAGTCTTCT
CCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAACTATATCATA
TATAATTTAAACACACTTATATATATATATATCTTCTTGTTTTGAAAAGACAAGGTGATT
CTATATACTTTTAATATTGTGTGCTTTTATCTTTGTGTGTTCTTATTCTAGTCTTACCTG
TTATGGAGTTCACTGGCTCAATTTATGTTTCTCTCTGGGTGATCCGTAAAGATTCTTGAA
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GTTGTATTGTGATTTATGAATTAATAAAGGATTTAT
TTTC

QA 1 756 1 756
DS 

RD RS1AP40TFB 745 0 0
GGACACTCCATTCACCCACAACATAGCTAGTGAACAGTGTCTTCTAAAAAAA*TGGCTTC
AAGCTCCATAACCCTTTTCTTGGCTCTCAATCTCATCTTCTTCACAACAATCTCTGCATG
CGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCAAAGCCAACTCCTAA
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TGTCTGCGCCAATGTGCTCAACGGCCTCCTCGACTTGACCCTTGGCAAGCCACCGGTCGA
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CGCTCTTAAGGCTAACATTCTTGGAATCAACTTGAACCTTCCGATCTCTCTCAGTCTTCT
CCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAACTATATCATA
TATAATTTAAACACACTTATATATATATATATCTTCTTGTTTTGAAAAGACAAGGTGATT
CTATATACTTTTAATATTGTGTGCTTTTATCTTTGTGTGTTCTTATTCTAGTCTTACCTG
TTATGGAGTTCACTGGCTCAATTTATGTTTCTCTCTGGGTGATCCGTAAAGATTCTTGAA
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GTTGTATTGTGATTTATGAATTAAT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1BU63TF 744 0 0
GGACACTCCATTCACCCACAACATAGCTAGTGAACAGTGTCTCCTAAAAAAAATGGCTTC
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TGTCTGCGCCAATGTGCTCAACGGCCTCCTCGACTTGACCCTTGGCAAGCCACCGGTCGA
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CGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTTCCGATCTCTCTCAGTCTTCT
CCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAACTATATCATA
TATAATTTAAACACACTTATATATATATTTATCTTCTTGTTTTGAAAAGACGAGGTGAAT
CTATATACTTTTAATATTGTGTGCCTTTATCTTTGTGTGTTCTTATTCTAGTCTTACCTG
TTATGGAGTTCATTGGCTCAATTTATGTTTCTCTCTGGGTGATCCGTAAAGATTCTTGAA
ATGTACCGTTTCATTGTTTCC*ATTAATACTCTTATATCGGGGCTATTATTGTTGCTTTG
GTTGTATTGTGATTTATGA
TTAAT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1AM22TF 745 0 0
GGACACTCCATTCACCCACAACATAGCTAGTGAACAGTGTCTTCTAAAAAAAATGGCTTC
AAGCTCCATAACCCTTTTCTTGGCTCTCAATCTCATCTTCTTCGCAACAATCTCTGCATG
CGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCAAAGCCAACTCCTAA
ACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCATGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGG
TGTCTGCGCCAATGTGCTCAACGGCCTCCTCGACTTGACCCTTGGCAAGCCACCGGTCGA
ACCATGCTGTACCCTCATTCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGTAC
CGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTTCCGATCTCTCTCAGTCTTCT
CCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAACTATATCATA
TATAATTTAAACACACTTATATATATATTTATCTTCTTGTTTTGAAAAGACGAGGTGAAT
CTATATACTTTTAATATTGTGTGCCTTTATCTTTGTGTGTTCTTATTCTAGTCTTACCTG
TTATGGAGTTCATTGGCTCAATTTATGTTTCTCTCTGGGTGATCCGTAAAGATTCTTGAA
ATGTACCGTTTCATTGTTTCCCATTAATACTCTTATATCGGGGCTATTATTGTTGCTTTG
GTTGTATTGTGATTTATGAATTAAT

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 7

CO CL519Contig1 1014 7 16 U
GCAAAGAACGAAAGCTTATATAAGTCGATATTTCGAGACATGGTACATGTTAAAGTGCGG
ATTTTTTTTAGAAAATATGACCTTAAAGATATAAAACATTCGTTCGGGAAAAAGAAATAC
ATTTTACTCAACAAAATAAATATAAATACATTTTACCCGAACATAGTAAACATTCCAGAG
ATTGAGAAATCTTTGTAGACTCATCACTCATATGTTACACCGTCAAGTACTTTAGAACCG
AAGCACGTACCTTCTCCATGTAATCTCCTGCTTCTTTCTGGTTCCCTCTGTATGCATTAG
CTATGTTTTCATCAAGAAGAGTCAACAAAGATCTGTTGATCTCGTTTTTCTCCACCATAT
CCAACAATGTTGCTTTGATATCGGTTGAGGTTAAGATCTTGGTTAAGCTATTTGTAGCCG
TCATAAGCTCCTTTTGCATTTTGTCATAAGCCTCAATTCCTTCTTCTAAGGCCTTCTGAA
GTGATTCAAGCTCAATCAATCTGTCTTCATCTTCCGCGGTTTTTGTAACAGCAAACCGGA
TTTGCCCGATTTCAAGTCGAATTTGCGCAAAAAACTCGTCGTTTAACCTTCCACGAAGCC
TAGCGATTTCGAATTCAATCTCCTGAGCTTCCGTGTCAAGAAAGAACTCAATCAGCTCAG
CGGAAGTATCTGGTACAACTCTAGACTCTCTAAGAGCTTGACGACGCTCTCTCTCTTCAC
GGAGTTGTTTCTGGAAAGCTTCTTTAGCCTCGGAGTCTCTCTCTATCCTGCGTTTGAACT
CAAGACGAGCGATATGGCCAGTTTGTGCTGGTCCTAATATACCTTTCGGATCCCATTCGC
AGGAGATTTTGCTCCTTCGTGTATTGATTCTTGGGATTGTGCGGACAGTATTCGAGAAGG
CGATTCCTATTGAGAGCGAAGCCATTTTTTTTTTCCGGAAGGCTCTGCTGTCACTAGCTA
TGTTACGTTATCTCCTTAACTATCTCTTATCTGTTTTTTTTCTAATGGCGGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 30 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GC
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TCCACCATATCCAACAATGTTGCTTTGATATCGGTTGAGGTTAAGATCTTGGTTAAGCTA
TTTGTAGCCGTCATAAGCTCCTTTTGCATTTTGTCATAAGCCTCAATTCCTTCTTCTAAG
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ATCAGCTCAGCGGAAGTATCTGGTACAACTCTAGACTCTCTAAGAGCTTGACGACGCTCT
C

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TCATAAGCTCCTTTTGCATTTTGTCATAAGCCTCAATTCCTTCTTCTAAGGCCTTCTGAA
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T*ACTCAACAAAATAAATATAAATACATTT*ACCCGAACATAGTAAACATTCCAGAGATT
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TAAGCTCCTTTTGCATTTTGTCATAAGCCTCAATTCCTTCTTCTAAGGCCTTCTGAAGTG
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CCTTCTCCATGTAATCTCCTGCTTCTTTCTGGTTCCCTCTGTATGCATTAGCTATGTTTT
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GCTCAATCAATCTGTCTTCATCTTCCGCGGTTTTTGTAACAGCAAACCGGATTTGCCCGA
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CGAATTCAATCTCCTGAGCTTCCGTGTCAAGAAAGAACTCAATCAGCTCAGCGGAAGTAT
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CT
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AAGCCTCAATTCCTTCTTCTAAGGCCTTCTGAAGTGATTCAAGCTCAATCAATCTGTCTT
CATCTTCCGCGGTTTTTGTAACAGCAAACCGGATTTGCCCGATTTCAAGTCGAATCTGCG
CAAAAAACTCGTCGTTTAACCTTCCACGAAGCCTAGCGATTTCGAATTCAATCTCCTGAG
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TTCTTGGGATTGTGCGGACAGTATTCGAGAAGGCGATTCCTATTGAGAGCGAAGCCATT
TTTTTTTCCGGCC

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TTTTTCT
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GGTTAAGCTATTTGTAGCCGTCATAAGCTCCTTTTGCATTTTGTCATAAGCCTCAATTCC
TTCTTCTAAGGCCTTCTGAAGTGATTCAAGCTCAATCAATCTGTCTTCATCTTCCGCGGT
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GGCTCTGCTGTCACTAGCTATGTTACGTTATCTCCTTAACTATCTCTTATCTGTTTTTTT
TCTAATGGCGGGCC

QA 8 741 8 741
DS 



AS 2 8

CO CL520Contig1 821 5 4 U
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CCGACCATGATGGCCGAAACTCCTTTTCTTTGCATTGTCACCCTTTGTACGCTAATGTTC
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GTGCAGACAAACATATTTGCTCATGGCAAAGGAGATAGAGAGCAAAGGGTTAATCTTTGG
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AACTGGTGGGAAGGTACGCTTATCAGTCACTTACGCCGTGG


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 10 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GG77TF U 2
AF RS1D583TF U 44
AF RS1CZ50TF U 1
AF RS1AP84TFB U 1
AF RS1C129TF U 1
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BS 738 784 RS1AP84TFB
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TCGATCCGTCTTTGGATTTCCACACTTACAGTATCCTTTGGTCACACAAACACATTGTCT
TT

QA 1 542 1 542
DS 

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TGAGCATGAAGATCAAACTCGTTCCTGGCGACTCTGCCGGTACGGTCACCGCCTTCTACA
TGAACTCGGATACCGACACCGTGAGGGATGAACTAGATTTTGAGTTCTTGGGAAACCGAA
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AAAGGGTTAATCTTTGGTTCGATCCGTCTTTGGATTTCCACACTTACAGTATCCTTTGGT
CACACAAACACATTGTCTTTTACGTGGACGATGTACCAATAAGAGAATACAAAAACAACC
AAGCCAAGAACATAGCCTACCCAACATCACAACCCATGGGAGTTTACTCAACCCTATGGG
AAGCCGATGATTGGGCGACACGTGGAGGATTAGAGAAAATTGATTGGAGCAAAGCTCCTT
TTTATGCTTATTACAAAGATTTCGATATCGAAG*CTGTCCTGTTCCTGGACCCGC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1CZ50TF 768 0 0
G
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TCCAGATTTCAGCACGGCCTACGACATTCGCCGAGGATTTCAAAGCCGCATGGTCGGAGT
CTCACATCCATCAAGTCGACGGTGGGAAAGCTATCCAACTCGTCCTTGACCAGAGCACAG
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TCGTTCCTGGCGACTCTGCCGGTACGGTCACCGCCTTCTACATGAACTCGGATACCGACA
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TGCAGACAAACATATTTGCTCATGGCAAAGGAGATAGAGAGCAAAGGGTTAATCTTTGGT
TCGATCCGTCTTTGGATTTCCACACTTACAGTATCCTTTGGTCACACAAACACATTGTCT
TTTACGTGGACGATGTACCAATAAGAGAATACAAAAACAACCAAGCCAAGAACATAGCCT
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TTGTCATC

QA 2 760 2 760
DS 

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GGAATTTAAAACCAAACTCACAAGTAGTCACTCAAAACATCTTTTTCATTGTTATAAAGG
CCGACCATGATGGCCGAAACTCCTTTTCTTTGCATTGTCACCCTTTGTACGCTAATGTTC
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CTCGTTCCTGGCGACTCTGCCGGTACGGTCACCGCCTTCTACATGAACTCGGATACCGAC
ACCGTGAGGGATGAACTAGATTTTGAGTTCTTGGGAAACCGAAGTGGCCAACCTTACTCG
GTGCAGACAAACATATTTGCTCATGGCAAAGGAGATAGAGAGCAAAGGGTTAATCTTTGG
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TTTTACGTGGACGATGTACCAATAAGAGAATACAAAAACAACCAAGCCAAGAACATAGCC
TACCCAACATCACAACCCATGGGAGTTTACTCAACCCTATGGGAAGCCGATGATTGGGCG
ACACGTGGAGGATTAGAGAAAATTGATTGGAGCAAAGCTCCTTTTTATGCTTATTACAAA
GATTTCGATATCGAAGGCCGTCCTGTTCCTGGACCCGCCAATTGTCCATCTAACCCTCAT
AACT

QA 1 784 1 784
DS 

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G
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TCCAGATTTCAGCACGGCCTACGACATTCGCCGAGGATTTCAAAGCCGCATGGTCGGAGT
CTCACATCCATCAAGTCGACGGTGGGAAAGCTATCCAACTCGTCCTTGACCAGAGCACAG
GATGTGGATTCTCTTCGAAAAGAAAGTATTTATTCGGGAAAGTGAGCATGAAGATCAAAC
TCGTTCCTGGCGACTCTGCCGGTACGGTCACCGCCTTCTACATGAACTCGGATACCGACA
CCGTGAGGGATGAACTAGATTTTGAGTTCTTGGGAAACCGAAGTGGCCAACCTTACTCGG
TGCAGACAAACATATTTGCTCATGGCAAAGGAGATAGAGAGCAAAGGGTTAATCTTTGGT
TCGATCCGTCTTTGGATTTCCACACTTACAGTATCCTTTGGTCACACAAACACATTGTCT
TTTACGTGGACGATGTACCAATAAGAGAATACAAAAACAACCAAGCCAAGAACATAGCCT
ACCCAACATCACAACCCATGGGAGTTTACTCAACCCTATGGGAAGCCGATGATTGGGCGA
CACGTGGAGGATTAGAGAAAATTGATTGGAGCAAAGCTCCTTTT*ATGCTTATTACAAAG
ATT*CGATATCGAAG*CTGTCTT**TCCTGGACCCGCCAAT*GTC*ATCTA*CCCTCATA
*CTGGTGGGAAGGTACGCTTATCAGTCACTTACGCCGTGG

QA 2 821 2 821
DS 



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CACGTACTTGCGTATAAAAAAAGACATTGCAATCCACAATTCCCCACAATTATATAAAGA
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ATATGGTTTACTCTAACCCAACGGTAACGTCGAGCTTCCACGGCGTTAAGTGACTGATAA
GCGTAACCTTCCCACCAGTTATGAGGGTTAGATGGACAATTGGCGGGTCCAGGAACAGGA
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TTCTCTAATCCTCCACGTGTCGCCCAATCATCGGCTTCCCATAGGGTTGAGTAAACTCCC
ATGGGTTGTGATGTTGGGTAGGCTATGTTCTTGGCTTGGTTGTTTTTGTATTCTCTTATT
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GCAAATATGTTTGTCTGCACCGAGTAAGGTTGGCCACTTCGGTTTCCCAAGAACTCAAAA
TCTAGTTCATCCCTCACGGTGTCGGTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EF56JQ U 153
AF RS1D583JQ U 1
AF RS1C129JQ U 22
BS 1 560 RS1D583JQ
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BS 562 734 RS1D583JQ
BS 735 749 RS1C129JQ

RD RS1EF56JQ 248 0 0
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ATAAAAA
A

QA 1 247 1 247
DS 

RD RS1D583JQ 734 0 0
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GCATGACACTCGATTGGTGGGACAGGATACCTTGACTTGTCGGTACAGTAATCATATACC
ATATGGTTTACTCTAACCCAACGGTAACGTCGAGCTTCCACGGCGTTAAGTGACTGATAA
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ATGGGTTGTGATGTTGGGTAGGCTATGTTCTTGGCTTGGTTGTTTTTGTATTCTCTTATT
GGTACATCGTCCACGTAAAAGACAATGTGTTTGTGTGACCAAAGGATACTGTAAGTGTGG
AAATCCAAAGACGGATCGAACCAAAGATTAACCCTTTGCTCTCTATCTCCTTTGCCATGA
GCAAATATGTTTGTCTGCACCGAGTAAGGTTGGCCACTTCGGTTTCCCAAGAACTCAAAA
TCTAGTTCATCCCT

QA 1 734 1 734
DS 

RD RS1C129JQ 728 0 0
CAAATAACCACATACATTAACCATTATATTTATACACACCACGTACTTGCGTATAAAAAA
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TGATCATTGTACGTAAGTTTGTACATGGTCTTATTTCAAGCATGACACTCGATTGGTGGG
ACAGGATACCTTGACTTGTCGGTACAGTAATCATATACCATATGGTTTACTCTAACCCAA
CGGTAACGTCGAGCTTCCACGGCGTTAAGTGACTGATAAGCGTAACCTTCCCACCAGTTA
TGAGGGTTAGATGGACAATTGGCGGGTCCAGGAA*AGGACAGCCTTCGATATCGAAATCT
TTGTAATAAGCATAAAAAGGAGCTTTGCTCCAATCAATTTTCTCTAATCCTCCACGTGTC
GCCCAATCATCGGCTTCCCATAGGGTTGAGTAAACTCCCATGGGTTGTGATGTTGGGTAG
GCTATGTTCTTGGCTTGGTTGTTTTTGTATTCTCTTATTGGTACATCGTCCACGTAAAAA
ACAATGTGTTTGTGTGACCAAAGGATACTGTAAGTGTGGAAATCCAAAGACGGATCGAAC
CAAAGATTAACCCTTTGCTCTCTATCTCCTTTGCCATGAGCAAATATGTTTGTCTGCACC
GAGTAAGGTTGGCCACTTCGGTTTCCCAAGAACTCAAAATCTAGTTCATCCCTCACGGTG
TCGGTATC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 7

CO CL521Contig1 833 7 11 U
GGCTCCTTTAATCCAAAAGATAATAATAATAACACTTAAGAGTAAGATTGAGCTTCTGAT
TTGTTTCTCAAACAATACAAAACATTGCTGGGTCTCTGTGATCGAAGTGCCAGAGCCATG
GCTTCCCTTTCAATCACTTCCTCTTCGACAATCATCAATTCTAGAGCTTCTCCTCTTCCT
AGACAAGCCTCCACCTCTTCTCCGTCATGTATTTCCCTTCCCATGCTTCCTCCTCAGCCG
CTTCAGTCCACTGCTTACTGTCGGAAGATTGCGAGGAACGTTCTGACAAGAGCTACCGAA
GTTGAAGCTTCGGTCACTGCCGACGCTGACACTACAGAGTTGCCAGAAATCGTCAAGACC
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GCTTTGTTGGCTCTTTGGGGTTCTACTGGCCTCATCTCGGCAATCGACAGGCTTCCATTG
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AACACATGTCTATGTCTCTCTGTGCTCCTTGTAGCTTAATATACCATGCGTCTTATATCA
GTGTTGTAGATTCCATCATCTCTCTCTCTC**TGCTCTCCTTGTAGCTCAAATATCATCC
ATTTTATGTTGTAAATTCCTCAAGACTATGCAATGATGAGATATTTCATTCTC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RS1CO74TF U 2
AF RS1D310TF U 7
AF RS1CV26TF U 1
AF RS1DR09TF U 2
AF RS1FB54JQ C 46
AF RS1CO74JQ C 164
AF RS1D310JQ C 102
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GG
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TTTCTCAAACAATACAAAACATTGTTGGGTCTCTGTGATCGAAGTGCCAGAGCCATGGCT
TCCCTTTCAATCACTTCCTCTTCGACAATCATCAATTCTAGAGCTTCTCCTCTTCCTAGA
CAAGCCTCCACCTCTTCTCCGTCATGTATTTCCCTTCCCATGCTTCCTCCTCAGCCGCTT
CAGTCCACTGCTTACTGTCGGAAGATTGCGAGGAACGT

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DS 

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GGG
AATCCAAAAGATAATAATAATAACACTTAAGAGT************CTGATTTGTTTCTC
AACCAATACAAAACATTGCTGGGTCTCTGTGATCGAAGTGCCAGAGCCGTGGCTTCCCTT
TCAATCACTTCCTCTTCGACAATCATCAATTCTAGAGCTTCTCCTCTTCCTAGACAAGCT
TCCACCTCTTCTCCGTCGTGTATTTCCCTTCCCATGCTTCCTCCTCAGCCGGTTCAGTCC
ACTGCTTACTGTCGGAAGATTGCGAGGAACGTTCTGACAAGGGCTACCGAAGTTGAAGCT
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GCTTGGGAGAAAGTGGAGGACAAGTATGCAATTGGTTCTCTCGCATTTGCTGCTTTGTTG
GCTCTTTGGGGTTCTACTGGCCTCATCTCGGCAATCGACAGGCTTCCATTGTTTCCAGGT
GTTTTTGAACT

QA 4 494 4 494
DS 

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TTGTTTCTCAAACAATACAAAACATTGCTGGGTCTCTGTGATCGAAGTGCCAGAGCCATG
GCTTCCCTTTCAATCACTTCCTCTTCGACAATCATCAATTCTAGAGCTTCTCCTCTTCCT
AGACAAGCCTCCACCTCTTCTCCGTCATGTATTTCCCTTCCCATGCTTCCTCCTCAGCCG
CTTCAGTCCACTGCTTACTGTCGGAAGATTGCGAGGAACGTTCTGACAAGAGCTACCGAA
GTTGAAGCTACGGTCGCTGCCGACGCTGACACTACAGAGTTGCCAGAAATCGTCAAGACC
GCTCAAGAAGCTTGGGAGAAAGTGGAGGACAAGTATGCAATTGGTTCTCTCGCATTTGCT
GCTTTGTTGGCTCTTTGGGGTTCTACTGGCCTCATCTCGGCAATCGACAGGCTTCCATTG
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DS 

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GG
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TTTCTCAAACAATACAAAACATTGCTGGGTCTCTGTGATCGAAGTGCCAGAGCCATGGCT
TCCCTTTCAATCACTTCCTCTTCGACAATCATCAATTCTAGAGCTTCTCCTCTTCCTAGA
CAAGCCTCCACCTCTTCTCCGTCATGTATTTCCCTTCCCACGCTTCCTCCTCAGCCGCTT
CAGTCCACTGCTTACTGTCGGAAGATTGCGAGGAACGTTCTGACAAGAGCTACCGAAGTT
GAAGCTTCGGTCGCTGCCGACGCTGACACTACAGAGTTGCCAGAAATCGTCAAGACCGCT
CAAGAAGCTTGGGAGAAATTGGAGGACAAGTATGCAGTTGGTTCTCTCGCATTTGCTGCT
TTGTTGGCTCTTTGGGGTTCTACTGGCCTCATCTCGGCAATCGACAGGCTTCCATTGTTT
CCAGGTGTTTTTGAACTTGTAGGCATTGGTTACACTGGG*TGGTTTGCTTACAAGAATCT
GATCTTCAAACCAGACAGGGAGGTGCTGTTTCAGAAGATCAAAGACACATACAGAGACAT
ACTAGGGAGCAGCAGCTGAATCAGAGGAAGAATGAGAGCAGCTGAATCGAAGA

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DS 

RD RS1FB54JQ 788 0 0
ACTTAAGAG
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GCCATGGCTTCCCTTTCAATCACTTCCTCTTCGACAATCATCAATTCTAGAGCTTCTCCT
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TTTGCTGCTTTGTTGGCTCTTTGGGGTTTTACTGGCCTCATCTCGGCAATCGACAGGCTT
CCATTGTTTCCAGGTGTTTTTGAACTTGTAGGCATTGGTTACACTGGG*TGGTTTGCTTA
CAAGAATCTGATCTTCAAACCAGACAGGGAGGTGCTGTTTCAGAAGATCAAAGACACATA
CAGAGACATACTAGGGAGCAGCAGCTGAATCAGAGGAAGAATGAGATCAGCTGAATCGAA
GAATCTAACACATGTCTATGTCTCTCTGTGCTCCTTGTAGCTTAATATACCATGCGTCTT
ATATCAGTGTTGTAGATTCCATCATCTCTCTCTTTC**TGCTCTCCTTGTAGCTCAAATA
TCATCCATTTTATGTTGTAAATTCCTCAAGACTATGCAATGATGAGATATTTCATTCTC

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DS 

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TGACAAGAGCTACCGAAGTTGAAGCTTCGGTCGCTGCCGACGCTGACACTACAGAGTTGC
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TCGACAGGCTTCCATTGTTTCCAGGTGTTTTTGAACTTGTAGGCATTGGTTACACTGGG*
TGGTTTGCTTACAAGAATCTGATCTTCAAACCAGACAGGGAGGTGCTGTTTCAGAAGATC
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GCTGAATCGAAGAATCTAACACATGTCTATGTCTCTCTGTGCTCCTTGTAGCTTAATATA
CCATGCGTCTTATATCAGTGTTGTAGATTCCATCATCTCTCTCTCTCTCTGCTCTCCTTG
TAGCTCAAATATCATCCATTTTATGTTGTAAATTCCTCAAGACTATGCAATGATGAGATA
TTTCAT
CC

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DS 

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TCGAAGTGCCAGAGCCGTGGCTTCCCTTTCAATCACTTCCTCTTCGACAATCATCAATTC
TAGAGCTTCTCCTCTTCCTAGACAAGCTTCCACCTCTTCTCCGTCGTGTATTTCCCTTCC
CATGCTTCCTCCTCAGCCGGTTCAGTCCACTGCTTACTGTCGGAAGATTGCGAGGAACGT
TCTGACAAGGGCTACCGAAGTTGAAGCTTCGGTCACTGCCGACGCTGACACTACAGAGTT
GCCAGAAATCGTCAAGACCGCTCAAGAAGCTTGGGAGAAAGTGGAGGACAAGTATGCAAT
TGGTTCTCTCGCATTTGCTGCTTTGTTGGCTCTTTGGGGTTCTACTGGCCTCATCTCGGC
AATCGACAGGCTTCCATTGTTTCCAGGTGTTTTTGAACTTGTAGGCATTGGTTACACTGG
G*TGGTTTGCTTACAAGAATCTGATCTTCAAACCAGACAGGGAGGTGCTGTTTCAGAAGA
TCAAAGACACATACAGAGACATACTAGGGAGCAGCAGCTGAATCAGAGGAAGAATGAGAT
CAGCTGAATCGAAGAATCTAACACATGTCTATGTCTCTCTTTGCTCCTTGTAGCTTAATA
TACCATGCGTCTTATATCAGTGTTGTAGATTCCATCATCTCTCTCTCTC**TGCTCTCCT
TGTAGCTCAAATATCATCCATTTTATGTTGTAAATTCCTCAAGAC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 5

CO CL522Contig1 813 5 34 U
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ATATTTGATACAAACACCAAAATTGAACTAAACCGGAAAGTGTAGGTAGAGAGGTAAACC
AAAACAATCTCTTTTCAAGAGAGATCAGCGATAACACGCTCACATTTATCTTCCAATATC
TTCACAGCTTCAGTAAAGAGAACATCCGGAGGCAGTGATCCTGTGGACTCGATTTTAAAT
ATAAAATGGTCCTTGACACTGCGCAGATCCACCAGGTCAACCAAGTCATGGTCTCTTATG
CACTCCTTACACAAGGTGCAATTGCGAGGCTGTGCTACCGTTGCCCTTTTCCTACCATTG
CCCATGTCTTCAATGTCAAAAACATTCATTGGGCAGGTTTTTACCAGTCGTTCAGCTTTC
TCATCCTCAACTTCCCCTAGTAAAACCACCTCAGGAAGCATTCGATACCAAGCTGTCCCT
ACTGGAGACCATTTTGCATGTGTTTTACCAATGCCCTTAATCGAATGAGCTTCAAGTTCA
ATTTCCTGACCAGGGCTGAGTTTTGATATCAAGATATCCAGGTGGCTCGGAGTGATAGGG
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TTGAAAACGATGGTGTTCTTCTCGTTTGGCTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 0 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 0 0 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FC24JQ U 32
AF RS1FC24TF C 32
AF RS1FM22JQ U 27
AF RS1E517JQ U 1
AF RS1DW08JQ U 27
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BS 775 788 RS1E517JQ
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RD RS1FC24JQ 651 0 0
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GCAGTGATCCTGTGGACTCGATTTTAAATATAAAATGGTCCTTGACACTGCGCAAATCCA
CCAGGTCAACCAAGTCATGGTCTCTTATGCACTCCTTACACAAGGTGCAATTGCGAGGCT
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CAGGAAGCATTCGATACCAAGCTGTCCCTACTGGAGACCATTTTGCATGTGTTTTACCAA
TGCCCTTAATCGAGTGAGCTTCAAGTTCAATTTCCTGACCAGGGCTGAGTTTTGATATCA
AGATATCCAGG***CTCGGAGTGATAGGGTTATCAGCAAATTCAGGGAGAGAATCTTGGC
TACAGCTGAATGAAGTGTAAGTTTTTGGCTTTGAGGTTGAAGTTGAATCTC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1FC24TF 651 0 0
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GTGCTACCGTTGCCCTTTTCCTACCATTGCCCATGTCTTCAATGTCAAAAACATTCATTG
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TGCCCTTAATCGAGTGAGCTTCAAGTTCAATTTCCTGACCAGGGCTGAGTTTTGATATCA
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QA 1 651 1 651
DS 

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CCAGGTCAACCAAGTCATGGTCTCTTATGCACTCCTTACACAAGGTGCAATTGCGAGGCT
GTGCTACCGTTGCCCTTTTCCTACCATTGCCCATGTCTTCAATGTCAAAAACATTCATTG
GGCAGGTTTTTACCAGTCGTTCAGCTTTCTCATCCTCAACTTCCCCTAGTAAAACCACCT
CAGGAAGCATTCGATACCAAGCTGTCCCTACTGGAGACCATTTTGCATGTGTTTTACCAA
TGCCCTTAATCGCATGAGCTTCAAGTTCAATTTCCTGACCAGGGCTGAGTTTTGATATCA
AGATATCCAGGTGGCTCGGAGTGATAGGGTTATCAGCAAATTCAGGGAGAGAATCTTGGC
TACAGCTGAATGAAGTGTAAGTTTTTGGCTTTGAGGTTGAAGTTGAATCTCCTGATTCTT
TGATAAACTCACTTCCATTTGGTAACCATTGCAGCTCGTTCGTTAAAACATGAAGACGTG
ATTGACCTTTCGGACATTTCACATGGA

QA 6 752 6 752
DS 

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ATATTTGATACCAACACCAAAACTGAACTAAACCGGAAAGTGT************AAACC
AAAACAATCTCTTTTCAGGAGAGATCAGCGATAACACGCTCACATTTATCTTCCAATATC
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ATTTCCTGACCAGGGCTGAGTTTTGATATCAAGATATCAAGGTGGCTCGGAGTGATAGGG
TTATCAGCAAATTCAGG*AGAGAATCTTGACTACAGCTGAATGAAGTGTAAGTTTTTGGC
TTTGAGGTTGAAGTTGAATCTCCTGATTCTTTGAGAAACTCACTTCCATTTGGTAACCAT
TGCAACTCGTTCGTTAAAACATGAAGACGTGATTGACCTTTCGGACATTTCACGTGGAGT
TTGAAAAC

QA 1 788 1 788
DS 

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AATTT
CAAGGTTCTTCGTATTAATAATAAGGAGAATATTTGATACAAACATCAAAATTGAACTAA
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TAACACGCTCACATTTATCTTCCAATATCTTCACAGCTTCAGTAAAGAGAACATCCGGAG
GCAGTGATCCTGTGGACTCGATTTTAAATATAAAATGGTCCTTGACACTGCGCAGATCCA
CCAGGTCAACCAAGTCATGGTCTCTTATGCACTCCTTACACAAGGTGCAATTGCGAGGCT
GTGCTACCGTTGCCCTTTTCCTACCATTGCCCATGTCTTCAATGTCAAAAACATTCATTG
GGCAGGTTTTTACCAGTCGTTCAGCTTTCTCATCCTCAACTTCCCCTAGTAAAACCACCT
CAGGAAGCATTCGATACCAAGCTGTCCCTACTGGAGACCATTTTGCATGTGTTTTACCAA
TGCCCTTAATCGCATGAGCTTCAAGTTCAATTTCCTGACCAGGGCTGAGTTTTGATATCA
AGATATCCAGGTGGCTCGGAGTGATAGGGTTATCAGCAAATTCAGGGAGAGAATCTTGGC
TACAGCTGAATGAAGTGTAAGTTTTTGGCTTTGAGGTTGAAGTTGAATCTCCTGATTCTT
TGATAAACTCACTTCCATTTGGTAACCATTGCAGCTCGTTCGTTAAAACATGAAGACGTG
ATTGACCTTTCGGACATTTCACATGGAGTTTGAAAACGATGGTGTTCTTCTCGTTTGGCT
GG

QA 6 787 6 787
DS 



AS 1 5

CO CL523Contig1 792 5 14 U
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TATTTTTTTGAAGAGATTGAGAGAACCACATACATAGTTCTAGTTATCCCATAGGCCATA
TCAATCCCAAAATAGACACTTGGAGTTCTCTATCGCCAATAAACAGTTACCGACATTAGG
CAAAGTTAAATCGTGCCAATAAACCTCGCCGACGTGGTTTCAGATTACACATGGCACCAC
AAAGTTGTCTCCATTTTGGTCTATAAATACAAACAACAATCCCACATCTCTCATCAAAAC
AAAACACACCCAAATTCATAAAAACAAAAATATATTCTTAAGAAAAATGGCAGACAACAA
GCAAAGCTTCCAAGCCGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCTGAGGAGAAGTCTAATGTGCTGAT
GGACAAGGTCAAGGATGCTGCTACCGCTGCTGGAGCGACTGCTCAAACCGCAGGACAGAA
GATATCGGAGACCGCAGGAGGAGCTGTTAATCTTGTGAAGGAGAAGACTGGCATGAACAA
GTAGTGGACTCAAAATCAAATTGGCAGCTATTTAATATCCCTTCCTAATTAATTGTTATG
GTTTTAAATAAAATTGGGAGTTCATATTGATTCTCATCTACATCATAGTTGTTGTTTGTT
GTTGTTGTTGTTGTTGTTGTGTTTATTGTTTTAAATACTTGAATTGATTCTCCCCTTAGG
TTTGTACGTTTGGATGTTTGTGTATTTAGTTTTCCCAGTAATAAAAACAAATGTATAATT
TTAAGTTCCAAC


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RS1F374TF U 1
AF RS1B405TF U 3
AF RS1F374JQ C 487
AF RS1B405JQ C 3
AF RS1FZ82TF U 499
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BS 37 114 RS1F374TF
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RD RS1F374TF 470 0 0
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DS 

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GG
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QA 3 712 3 712
DS 

RD RS1F374JQ 290 0 0
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QA 1 290 1 290
DS 

RD RS1B405JQ 790 0 0
GG
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TTTT*GAAGAGATTGAGAGAACCACATACATAGTTCTAGTTATCCCATAGGCCATATCAA
TCCCAAAATAGACACTTGGAGTTCTCTATCGCCAATAAACAGTTACCGACATTAGGCAAA
GTTAAATCGTGCCAATAAACCTCGCCGACGTGGTTTCAGATTACACATGGCACCACAAAG
TTGTCTCCATTTTGGTCTATAAATACAAACAACAATCCCACATCTCTCATCAAAACAAAA
CACACCCAAATTCATAAAAACAAAAATATATTCTTAAGAAAAATGGCAGACAACAAGCAA
AGCTTCCAAGCCGGTCAAGCCGCTGGTCGTGCTGAGGAGAAGTCTAATGTGCTGATGGAC
AAGGTCAAGGATGCTGCTACCGCTGCTGGAGCGACTGCTCAAACCGCAGGACAGAAGATA
TCGGAGACCGCAGGAGGAGCTGTTAATCTTGTGAAGGAGAAGACTGGCGTGAACAAGTAG
TGGACTCAAAATCAAATTGGCAGCTATTTAATATCCCTTCCTAATTAATTGTTATGGTTT
TAAATAAAATTGGGAGTTCATATTGATTCTCATCTACATCATAGTTGTTGTTTGTTGTTG
TTGTTGTTGTTGTTGTGTTTATTGTTTTAAATACTTGAATTGATTCTCCCCTTAGGTTTG
TACGTTTGGATGTTTGTGTATTTAGTTTTCCCAGTAATAAAAACAAATGTATAATTTTAA
GTTCCAAC

QA 3 790 3 790
DS 

RD RS1FZ82TF 291 0 0
G
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ATTGGCAGCTATTTAATATCCCTTCCTAATTAATTGTTATGGTTTTAAATAAAATTGGGA
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TGTTTATTGTTTTAAATACTTGAATTGATTCTCCCCTTAGGTTTGTACGTTTGGATGTTT
GTGTATTTAGTTTTCCCAGTAATAAAAACAAATGTATAATTTTAAGTTCC

QA 2 291 2 291
DS 



AS 1 8

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TCTTTAGCTTGTCGTTTGGAAATGGCCACCGTTGAGGTTGAACAAGTGATTGCTCCAGCA
GCAGAGAACGTTGAGGTGGCAGCAAAGGCAGTGGTGGATCCAGATGTGGAGACCAAACAG
CCGGAAGAAGTCGTGGCCGCCACGACAGAATCTGCTGCTGCTCCAGCCACCGTAACTGAA
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GAGGAGAAGACTGAGTCAGAGGAAGTTGTCGCTGCTGGGGAAGTCGCCGCCGAGAAGGCC
GAGGAGTAAAGATGAAGAAACAATATGTGGCCTTCTTTGGTCTCATTTCGTTGTTTTAAA
AAGATTACTTCGCAAAATTTCATAAGTATTGTCTATCGTGTGTTATGATGAAATGATATT
TGGTTATGATGAAATGATATATTTGACAAAAAAAA


BQ
10 30 30 30 30 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 
50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ES81TF U 2
AF RS1BY78TF U 2
AF RS1C149TF U 6
AF RS1AX54TF U 1
AF RS1BY78JQ C 2
AF RS1G162TF U 2
AF RS1ES81JQ C 38
AF RS1G162JQ C 80
BS 1 107 RS1AX54TF
BS 108 108 RS1C149TF
BS 109 125 RS1AX54TF
BS 126 126 RS1C149TF
BS 127 228 RS1AX54TF
BS 229 229 RS1BY78TF
BS 230 418 RS1AX54TF
BS 419 419 RS1C149TF
BS 420 481 RS1AX54TF
BS 482 635 RS1G162TF

RD RS1ES81TF 129 0 0
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CTTTAGCTTGTCGTTTGGAAATGGCCACCGTTGAGGTTGAACAAGTGATTGCTCCACCAG
CAGAGAACG

QA 1 129 1 129
DS 

RD RS1BY78TF 402 0 0
GGAG
TCACCAAAGCATCAAATACATTTTACTTCTCTTCTATTTCTCTTTATATCTATCATCTTT
AGCTTGTCGTTTGGAAATGGCCACCGTTGAGGTTGAACAAGTGATTGCTCCAGCAGCAGA
GAACGTTGAGGTGGCAGCAAAGACAGTGGTGGATCCAGATGTGGAGACCAAACAGCCGGA
AGAAGTCGTGGCCGCCACGACAGAATCTGCTGCTGCTCCAGCCACCGTAACTGAACAAGA
ATCTGAATCACCAGTCGTAGAAACGAGCAAAGAAGTGGTTGTTGAAGAGGCAGATAAAAA
AGATGAAGAAATAAAAGAGCCACAGTAAGAAGAGAAGACGGAAGCTCCGGTGGCTGAGGA
GGAGGCGAAGATAGAAAAGAAGGAGGAGGTGACTGAAA

QA 5 402 5 402
DS 

RD RS1C149TF 431 0 0
GG
ACCAAAGCATCAAATACATTTTACTTCTCTTCTATTTCTCTTTATATCTATCATCTTTAG
CTTGTCGTTTGGAAATGGCCACCGTTGAGGTTGAACAAGTGATTGCTCCAGCAGCAGAGA
ACGTTGAGGTGGCAGCAAAGGCAGTGGTGGATCCAGATGTGGAGACCAAACAGCCGGAAG
AAGTCGTGGCCGCCACGACAGAATCTGCTGCTGCTCCAGCCGCCGTAACTGAACAAGAAT
CTGAATCACCAGTCGTAGAAACGAGCAAAGAAGTGGTTGTTGAAGAGGCAGATAAAAAAG
ATGAAGAAATAAAAGAGCCACAGGAAGAAGAGAAGACGGAAGCTCCGGTGGCTGAGGAGG
AGGCGAAGATAGAAAAGAAGGAGGAGGTGACTGAAACTCCGGCTGTTGTGGAGGAGGAGA
AGACTGAGT

QA 3 431 3 431
DS 

RD RS1AX54TF 481 0 0
GGGACTCACCAAAGCATCAAATACATTTTACTTCTCTTCTATTTCTCTTTATATCTATCA
TCTTTAGCTTGTCGTTTGGAAATGGCCACCGTTGAGGTTGAACAAGTTATTGCTCCAGCA
GCAGATAACGTTGAGGTGGCAGCAAAGGCAGTGGTGGATCCAGATGTGGAGACCAAACAG
CCGGAAGAAGTCGTGGCCGCCACGACAGAATCTGCTGCTGCTCCAGCCGCCGTAACTGAA
CAAGAATCTGAATCACCAGTCGTAGAAACGAGCAAAGAAGTGGTTGTTGAAGAGGCAGAT
AAAAAAGATGAAGAAATAAAAGAGCCACAGGAAGAAGAGAAGACGGAAGCTCCGGTGGCT
GAGGAGGAGGCGAAGATAGAAAAGAAGGAGGAGGTGACTGAAACTCCGGCTGTTGTGGGG
GAGGAGAAGACTGAGTCAGAGGAAGTTGTCGCTGCTGGGGAAGTCGCCGCCGAGAAGGCC
G

QA 1 481 1 481
DS 

RD RS1BY78JQ 607 0 0
GGACTCACCAAAGCATCAAATACATTTTACTTCTCTTCTATTTCTCTTTATATCTATCAT
CTTTAGCTTGTCGTTTGGAAATGGCCACCGTTGAGGTTGAACAAGTGATTGCTCCAGCAG
CAGAGAACGTTGAGGTGGCAGCAAAGACAGTGGTGGATCCAGATGTGGAGACCAAACAGC
CGGAAGAAGTCGTGGCCGCCACGACAGAATTTGCTGCTGCTCCAGCCACCGTAACTGAAC
AAGAATTTGAATCACCAGTCGTAGAAACGAGCAAAGAAGTGGTTGTTGAAGAGGCAGATA
AAAAAGATGAAGAAATAAAAGAGCCACAGTAAGAAGAGAAGACGGAAGCTCCGGTGGCTG
AGGAGGAGGCGAAGATAGAAAAGAAGGAGGAGGTGACTGAAACTCCGGCTGTTGTGGAGG
AGGAGAAGACTGAGTCAGAGGAAGTTGTCGCTGCTGGGGAAGTCGCCGCCGAGAAGGCCG
AGGAGTAAAGATGAAGAAACAATATGTGACCTTCTTTGGTCTCATTTCGTTGTTTTAAAA
AGATTACTTCGCAAAATTTCATAAGTATTGTCTATCGTGTGTTATGATGAAATGATATTT
GGTTATG

QA 1 607 1 607
DS 

RD RS1G162TF 634 0 0
GGACTCACCAAAGCATCAAATACATTTTACTTCTCTTCTATTTCTCTTTATATCTATCAT
CTTTAGCTTGTCGTTTGGAAATGGCCACCGTTGAGGTTGAACAAGTGATTGCTCCAGCAG
CAGAGAACGTTGAGGTGGCAGCAAAGGCAGTGGTGGATCCAGATGTGGAGACCAAACAGC
CGGAAGAAGTCGTGGCCGCCACGACAGAATCTGCTGCTGCTCCAGCCACCGTAACTGAAC
AAGAATCCGAATCACCAGTCGTAGAAACGAGCAAAGAAGTGGTTGTTGAAGAGGC*GATA
AAAAAGATGAAGAAATAAAAGAGCCACAGGAAGAAGAGAAGACGGAAGCTCCGGTGGCTG
AGGAGGAGGCGAAGATAGAAAAGAAGGAGGAGGTGACTGAAACTCCGGCTGTTGTGGAGG
AGGAGATGACTGAGTCAGAGGAAGTTGTCGCTGCTGGGGAAGTCGCCGCCGAGAAGGCCG
AGGAGTAAAGATGAAGAAACAATATGTGGCCTTCTTTGGTCTCATTTCGTTGTTTTAAAA
AGATTACTTCGCAAAATTTCATAAGTATTGTCTATCGTGTGTTATGATGAAATGATATTT
GGTTATGATGAAATGATATATTTGACAAAAAAAA

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1ES81JQ 590 0 0
TCTATTTCTCTTTATATCTATCATCTTTAGCTTGTCGTTTGGAAATGGCCACCGTTGAGG
TTGAACAAGTGATTGCTCCAGCAGCAGAGAACGTTGAGGTGGCAGCAAAGGCAGTGGTGG
ATCCAGATGTGGAGACCAAACAGCCGGAAGAAGTCGTGGCCGCCACGACAGAATCTGCTG
CTGCTCCAGCCACCGTAACTGAACAAGAATCCGAATCACCAGTCGTAGAAACGAGCAAAG
AAGTGGTTGTTGAAGAGGC*GATAAAAAAGATGAAGAAATAAAAGAGCCACAGGAAGAAG
AGAAGACGGAAGCTCCGGTGGCTGAGGAGGAGGCGAAGATAGAAAAGAAGGAGGAGGTGA
CTGAAACTCCGGCTGTTGTGGAGGAGGAGATGACTGAGTCAGAGGAAGTTGTCGCTGCTG
GGGAAGTCGCCGCCGAGAAGGCCGAGGAGTAAAGATGAAGAAACAATATGTGGCCTTCTT
TGGTCTCATTTCGTTGTTTTAAAAAGATTACTTCGCAAAATTTCATAAGTATTGTCTATC
GTGTGTTATGATGAAATGATATTTGGTTATGATGAAATGATATATTTGAC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RS1G162JQ 548 0 0
AAATGGCCACCGTTGAGGTTGAACAAGTGATTGCTCCAGCAGCAGAGAACGTTGAGGTGG
CAGCAAAGGCAGTGGTGGATCCAGATGTGGAGACCAAACAGCCGGAAGAAGTCGTGGCCG
CCACGACAGAATCTGCTGCTGCTCCAGCCACCGTAACTGAACAAGAATCCGAATCACCAG
TCGTAGAAACGAGCAAAGAAGTGGTTGTTGAAGAGGC*GATAAAAAAGATGAAGAAATAA
AAGAGCCACAGGAAGAAGAGAAGACGGAAGCTCCGGTGGCTGAGGAGGAGGCGAAGATAG
AAAAGAAGGAGGAGGTGACTGAAACTCCGGCTGTTGTGGAGGAGGAGATGACTGAGTCAG
AGGAAGTTGTCGCTGCTGGGGAAGTCGCCGCCGAGAAGGCCGAGGAGTAAAGATGAAGAA
ACAATATGTGGCCTTCTTTGGTCTCATTTCGTTGTTTTAAAAAGATTACTTCGCAAAATT
TCATAAGTATTGTCTATCGTGTGTTATGATGAAATGATATTTGGTTATGATGAAATGATA
TATTTGAC

QA 1 548 1 548
DS 



AS 1 8

CO CL525Contig1 570 8 24 U
GGGGCTTCTGGGTCTTCCTCATTT*GCAGTAGCAGTCTTGTGCGTGTTTATCAGCCGACT
GAGAAAATGGTCAAGGGACGCCAAGGAGAACGTGTCAGACTCTACGTTAGGGGAACCATC
TTGGGATACAAAAGGTCCAAGTCCAACCAGTACCCAAACACATCCCTTATTCAGATTGAA
GGAGTCAACACTACAGAGGAGGTGACATGGTACAAAGGAAAGAGGATGGCTTACATCTAC
AAGGCTAAGACCAAGAAGAACGGTAGCCACTACCGCTGCATCTGGGGCAAAGTTACCAGG
CCTCACGGTAACAGCGGTGTTGTCCGTGCCAAATTCACATCCAACTTGCCTCCTAAGTCC
ATGGGAATGAGGGTCAGAGTCTTCATGTATCCTAGCAACATATGAAGCAAAAGTACAAGA
GCAAGAACTTTGATTTAGCTGTGGTTTTGTCCACTAGTTCGTTATTTTGTATTTTGATAC
TGAGACCGTTTTCCTTTCTTTGTTTGAAGTGTTTTGGTGATTATCTGAACGACTTTAAAA
TATCATGGATCTGGTTTTTAATCTCAAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 45 15 30 45 45 45 45 45 45 45 15 15 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 20 20 
20 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 10 10 10 10 10 

AF RS1GS55TF U 1
AF RS1BI04JQ C 10
AF RS1GS55JQ C 13
AF RS1GR39JQ C 48
AF RS1BI04TF U 10
AF RS1GR39TF U 8
AF RS1F718TF U 10
AF RS1CN03TF U 10
BS 1 9 RS1GS55TF
BS 10 11 RS1BI04TF
BS 12 28 RS1GS55TF
BS 29 29 RS1BI04TF
BS 30 45 RS1GS55TF
BS 46 47 RS1BI04TF
BS 48 59 RS1GS55TF
BS 60 63 RS1BI04TF
BS 64 104 RS1GS55TF
BS 105 105 RS1BI04TF
BS 106 161 RS1GS55TF
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BS 538 565 RS1GS55TF
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RD RS1GS55TF 565 0 0
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AGAAAAATGGTCAAGGGACGCCAAGGAGAACGTGTCAGACTCTATGTTAGGGGAACCATC
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GGAGTCAACACTACAGAGGAGGTGACATGGTACAAGGGAAAGAGGATGGCTTACATCTAC
AAGGCTAAGACCAAGAAGAACGGTAGCCACTACCGCTGCATCTGGGGCAAAGTTACCAGG
CCTCACGGTAACAGCGGTGTTGTCCGTGCCAAATTCACATCGAACTCGCCTCCTAAGTCC
ATGGGAATGAGGGTCAGAGTCTTCATGTATCCTAGCAACATATGAAGCAAAAGTACAAGA
TCAAGAACTTTGATTTAGCTGTGGTTTTGTCCACTAGTTCGTTATTTTGTATTTTGATAC
TGAGACCGTTTTCCTTTCTTTGTTTGAAGTGTTTTGGTGATTATCTGAACGACTTTGAAA
TATCATGGATCTGGTTTTTAATCTC

QA 1 565 1 565
DS 

RD RS1BI04JQ 561 0 0
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GTCAAGGGACGCCAAGGAGAACGTGTCAGACTTTACGTTAGGGGAACCATCTTGGGATAC
AAAAGGTCCAAGTCCAACCAGTACCCAAACACATCCCTTATTCAGATTGAAGGTGTCAAC
ACTACAGAGGAGGTGACATGGTACAAAGGAAAGAGGATGGCTTACATCTACAAGGCTAAG
ACCAAGAAGAACGGTAGCCACTACCGCTGCATCTGGGGGAAAGTTACCAGGCCTCACGGT
AACAGCGGTGTTGTCCGTGCCAAATTCACATCCAACTTGCCTCCTAAGTCCATGGGAATG
AGGGTCAGAGTCTTCATGTATCCTAGCAACATATGAAGCAAAAGTACAAGAGCAAGAACT
TTGATTTAGCTGTGGTTTTGTCCACTAGTTCGTTATTTTGTATTTTGATACTGAGACCGT
TTTCCTTTCTTTGTTTGAAGTGTTTTGGTGATTATCTGAACGACTTTAAAATATCATGGA
TCTGGTTTTTAATCTCAAACT

QA 1 561 1 561
DS 

RD RS1GS55JQ 553 0 0
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AAGGGACGCCAAGGAGAACGTGTCAGACTCTATGTTAGGGGAACCATCTTGGGATACAAA
AGGTCCAAGTCCAACCAGTACCCAAACACGTCCCTTATTCAGATTGAAGGAGTCAACACT
ACAGAGGAGGTGACATGGTACAAGGGAAAGAGGATGGCTTACATCTACAAGGCTAAGACC
AAGAAGAACGGTAGCCACTACCGCTGCATTTGGGGCAAAGTTACCAGGCCTCACGGTAAC
AGCGGTGTTGTCCGTGCCAAATTCACATCGAACTCGCCTCCTAAGTCCATGGGAATGAGG
GTCAGAGTCTTCATGTATCCTAGCAACATATGAAGCAAAAGTACAAGATCAAGAACTTTG
ATTTAGCTGTGGTTTTGTCCACTAGTTCGTTATTTTGTATTTTGATACTGAGACCGTTTT
CCTTTCTTTGTTTGAAGTGTTTTGGTGATTATCTGAACGACTTTGAAATATCATGGATCT
GGTTTTTAATCTC

QA 1 553 1 553
DS 

RD RS1GR39JQ 518 0 0
TTATCATCCGACTGAGAAAATGGTCAAGGGACGCCAAGGAGAACGTGTCAGACTCTACGT
TAGGGGAACCATCTTGGGATACAAAAGGTCCAAGTCCAACCAGTACCCAAACACGTCCCT
TATTCAGATTGAAGGAGTCAACACTACAGAGGAGGTGACATGGTACAAGGGAAAGAGGAT
GGCTTACATCTACAAGGCTAAGACCAAGAAGAACGGTAGCCACTACCGCTGCATCTGGGG
CAAAGTTACCAGGCCTCACGGTAACAGCGGTGTTGTCCGTGCCAAATTCACATCCAACTT
GCCTCCTAAGTCCATGGGAATGAGGGTCAGAGTCTTCATGTATCCTAGCAACATATGAAG
CAAAAGTACAAGAGCAAGAACTTTGATTTAGCTGTGGTTTTGTCCACTAGCTCGTTATTT
TGTATTTTGATACTGAGACCGTTTTCCTTTCTTTGTTTGAAGTGTTTTGGTGATTATCTG
AACGACTTTAAAATATCATGGATCTGGTTTTTAATCTC

QA 1 518 1 518
DS 

RD RS1BI04TF 561 0 0
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GTCAAGGGACGCCAAGGAGAACGTGTCAGACTCTACGTTAGGGGAACCATCTTGGGATAC
AAAAGGTCCAAGTCCAACCAGTACCCAAACACATCCCTTATTCAGATTGAAGGTGTCAAC
ACTACAGAGGAGGTGACATGGTACAAAGGAAAGAGGATGGCTTACATCTACAAGGCTAAG
ACCAAGAAGAACGGTAGCCACTACCGCTGCATCTGGGGGAAAGTTACCAGGCCTCACGGT
AACAGCGGTGTTGTCCGTGCCAAATTCACATCCAACTTGCCTCCTAAGTCCATGGGAATG
AGGGTCAGAGTCTTCATGTATCCTAGCAACATATGAAGCAAAAGTACAAGAGCAAGAACT
TTGATTTAGCTGTGGTTTTGTCCACTAGTTCGTTATTTTGTATTTTGATACTGAGACCGT
TTTCCTTTCTTTGTTTGAAGTGTTTTGGTGATTATCTGAACGACTTTAAAATATCATGGA
TCTGGTTTTTAATCTC
AAACT

QA 1 556 1 556
DS 

RD RS1GR39TF 558 0 0
GGCC
GTCTTCCTCATTTTGCAGTAGCAGTCTTGTGCGTGTTTATCATCCGACTGAGAAAATGGT
CAAGGGACGCCAAGGAGAACGTGTCAGACTCTACGTTAGGGGAACCATCTTGGGATACAA
AAGGTCCAAGTCCAACCAGTACCCAAACACGTCCCTTATTCAGATTGAAGGAGTCAACAC
TACAGAGGAGGTGACATGGTACAAGGGAAAGAGGATGGCTTACATCTACAAGGCTAAGAC
CAAGAAGAACGGTAGCCACTACCGCTGCATCTGGGGCAAAGTTACCAGGCCTCACGGTAA
CAGCGGTGTTGTCCGTGCCAAATTCACATCCAACTTGCCTCCTAAGTCCATGGGAATGAG
GGTCAGAGTCTTCATGTATCCTAGCAACATATGAAGCAAAAGTACAAGAGCAAGAACTTT
GATTTAGCTGTGGTTTTGTCCACTAGCTCGTTATTTTGTATTTTGATACTGAGACCGTTT
TCCTTTCTTTGTTTGAAGTGTTTTGGTGATTATCTGAACGACTTTAAAATATCATGGATC
TGGTTTTTAATCTC

QA 5 558 5 558
DS 

RD RS1F718TF 556 0 0
GGGTCTTCCTCATTT*GCAGTAGCAGT**TGTGCGTGTTTATCAGCCGACTGAGAAAATG
GTCAAGGGACGCCAAGGAGAACGTGTCAGACTCTACGTTAGGGGAACCATCTTGGGATAC
AAAAGGTCCAAGTCCAACCAGTACCCAAACACATCCCTTATTCGGATTGAAGGTGTCAAC
ACTACAGAGGAGGTGACATGGTACAAAGGAAAGAGGATGGCTTACATCTACAAGGCTAAG
ACCAAGAGGAACGGTAGCCACTACCGCTGCATCTGGGGGAAAGCTACCAGGCCTCACGGT
AACAGCGGTGTTGTCCGTGCCAAATTCACATCCAACTTGCCTCCTAAGTCCATGTGAATG
AGGGTCAGAGTCTTCATGTATCCTAGCAACATATGAAGCAAAAGTACAAGAGCAAGAACT
TTGATTTAGCTGTGGTTTTGTCCACTAGTTCGTTATTTTGTATTTTGATACTGAGACCGT
TTTCCTTTCTTTGTTTGAAGTGTTTTGGTGATTATCTGAACGACTTTAAAATATCATGGA
TCTGGTTTTTAATCTC

QA 1 556 1 556
DS 

RD RS1CN03TF 555 0 0
GGGTCTTCCTCATTT*GCATTAGCAGTCTTGTGCGTGTTTATCAGCCGACTGAAAAAATG
GTCAAGGGACGCCAAGGAGAACGTGTCAGACTCTACGTTAGGGGAACCATCTTGGGATAC
AAAAGGTCCAAGTCCAACCAGTACCCAAACACATCCCTTATTCAGATTGAAGGTGTCAAC
ACTACAGAGGAGGTGACATGGTACAAAGGAAAGAGGATGGCTTACATCTACAAGGCTAAG
ACCAAGAAGAACGGTAGCCACTACCGCTGCATCTGGGGGAAAGTTACCAGGCCTCACGGT
AACAGCGGTGTTGTCCGTGCCAAATTCACATCCAACTTGCCTCCTAAGTCCATGGGAATG
AGGGTCAGAGTCTTCATGTATCCTAGCAACATATGAAGCAAAAGTACAAGAGCAAGAACT
TTGATTTAGCTGTGGTTTTGTCCACTAGTTCGTTATTTTGTATTTTGATACTGAGACCGT
TTTCCTTTCTTTGTTTTAAGTGTTTTGGTGATTATCTGAACGACTTTAAAATATCATGGA
TCTGGTTTTTAATCT

QA 1 555 1 555
DS 



AS 1 6

CO CL526Contig1 852 6 10 U
GGAACTTTCGCCTCTAAGAAACAAAAATAAAAATAAAATGGCTTCGATGGGTGTTGGCTT
ACGTGTCACATCTCCCGCCGTTCTCGAAGGAAGCGTGAAGATCAACGGCTCTAGCCGTTT
AACCGGAAGAGTAACGGTGGCTCAAAGGTCAGGACTTGTCGTCAGAGCTCAGCAGAGCGA
GGCGGCACCAGAGACTACTCGAAGGTCTGTGATTGGGCTCGTGGCTGCTGGTTTAGCCGG
TGGCTCGTTTGTTCAGGCCGTTCTCGCCGATGCTGTTCCTATCAAAATTGGCCCTCCTCC
ACCTCCCTCCGGCGGTCTTCCTGGGACAGATAACTCAGACCAAGCGAGAGATCTGAAACT
GGCGTTGAAGGAAAGGTTTTATTTACAGCCATTGCCACCGACGGAAGCTGTGGCTAGAGC
CAAAGAATCTGCCAAGGAGATCGTGAATGTGAAGTCATTGATCGACAAGAAAGCTTGGCC
ATATGTTCAGAACGATCTCCGTCTCAGGGCGTCTTACCTCCGTTATGACCTTAACACAAT
CATCTCTTCCAAATCCAAGGATGAGAAGAAGTCTCTCAAGGAGCTCACTGGAAAGCTCTT
TGATACCATCAACAACCTGGACTATGCGGCGAAGAAGAAGAGTACTCCGGATGCTGAGAA
GTACTATTCAGAGACTGTCTCTACTTTGAACGATGTTCTCGCCAAGCTTGGTTAACCATT
TCGAGTCCGCATTTTTCTTTGTAAATTTATTGTGTCTTGATCTTTGTTTCCTGAGTACTT
AATACTCAAATCCCTGAATCTGAATGTGTTTCAAGTTTTTACCCCCAAAACAATGGTAAT
TTCTTGTGTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1E472TF U 10
AF RS1D471JQ C 130
AF RS1D471TF U 127
AF RS1GX65TF U 1
AF RS1DM74JQ C 43
AF RS1CI23JQ C 250
BS 1 193 RS1GX65TF
BS 194 194 RS1E472TF
BS 195 435 RS1GX65TF
BS 436 436 RS1E472TF
BS 437 727 RS1GX65TF
BS 728 728 RS1CI23JQ
BS 729 761 RS1DM74JQ
BS 762 762 RS1CI23JQ
BS 763 849 RS1DM74JQ
BS 850 852 RS1CI23JQ

RD RS1E472TF 594 0 0
GGCTCT
AAGAAACAAAAATAAAAATAAAATGGCTTCGATGGGTGTTGGCTTACGTGTCACATCTCC
CGCCGTTCTCGAAGGAAGCGTGAAGATCAACGGCTCTAGCCGTTTAACCGGAAGAGTAAC
GGTGGCTCAAAGGTCAGGACTTGTCGTCAGAGCTCAGCAGAGCGAGGCGGCACCAGAGAC
TACTCGAAGGTCTGTGATTGGGCTCGTGGCTGCTGGTTTAGCCGGTGGCTCGTTTGTTCA
GGCCGTTCTCGCCGATGCTGTTCCTATCAAAATTGGCCCTCCTCCACCTCCCTCCGGCGG
TCTTCCTGGGACAGATAACTCAGACCAAGCGAGAGATCTGAAACTGGCGTTGAAGGAAAG
GTTTTATTTACAGCCATTGCCACCGACGGAAGCTGTGGCTAGAGCCAAAGAATCTGCCAA
GGAGATCGTGAATGTGAAGTCATTGATCGACAAGAAAGCTTGGCCATATGTTCAGAACGA
TCTCCGTCTCAGGGCGTCTTACCTCCGTTATGACCTTAACACAATCATCTCTTCCAAACC
CAAAGATGAGAAGAAGTCTCTCAAGGAGCTCACTGGAAAGCTCTTTGA

QA 7 594 7 594
DS 

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AGAGACTACTCGAAGGTCTGTGATTGGGCTCGTGGCTGCTGGTTTAGCCGGTGGCTCGTT
TGTTCAGGCCGTCCTCGCCGATGCTGTTCCTATCAAAATTGGCCCTCCTCCACCTCCCTC
CGGCGGTCTTCCTGGGACAGATAACTCAGACCAAGCGAGAGATCTGAAACTGGCGTTGAA
GGAAAGGTTTTATTTACAGCCATTGCCACCGACGGAAGCTGTGGCTAGAGCCAAAGAATC
TGCCAAGGAGATCGTGAATGTGAAGTCATTGATCGACAAGAAAGCTTGGCCATATGTTCA
GAACGATCTCCGTCTCAGGGCGTCTTACCTCCGTTATGACCTTAACACAATCATCTCTTC
CAAATCCAAGGATGAGAAGAAGTCTCTCAAGGAGCTCACTGGAAAGCTCTTTGATACCAT
CAACAACCTGGACTATGCGGCGAAGAA

QA 1 507 1 507
DS 

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AAGAGTAACGGTGGCTCAAAGGTCAGGACTTGTCGTCAGAGCTCAGCAGAGCGAGGCGGC
ACCAGAGACTACTCGAAGGTCTGTGATTGGGCTCGTGGCTGCTGGTTTAGCCGGTGGCTC
GTTTGTTCAGGCCGTCCTCGCCGATGCTGTTCCTATCAAAATTGGCCCTCCTCCACCTCC
CTCCGGCGGTCTTCCTGGGACAGATAACTCAGACCAAGCGAGAGATCTGAAACTGGCGTT
GAAGGAAAGGTTTTATTTACAGCCATTGCCACCGACGGAAGCTGTGGCTAGAGCCAAAGA
ATCTGCCAAGGAGATCGTGAATGTGAAGTCATTGATCGACAAGAAAGCTTGGCCATATGT
TCAGAACGATCTCCGTCTCAGGGCGTCTTACCTCCGTTATGACCTTAACACAATCATCTC
TTCCAAATCCAAGGATGAGAAGAAGTCTCTCAAGGAGCTCACTGGAAAGCTCTTTGATAC
CATCAACAACCTGGACTATGCGGCGAAGAAGAAGAGTACTCCGGATGCTGAGAAGTACTA
TTCAGAGACTGTCTCTACTTTGAACGATGTTCTC

QA 1 574 1 574
DS 

RD RS1GX65TF 731 0 0
GGAACTTTCGCCTCTAAGAAACAAAAATAAAAATAAAATGGCTTCGATGGGTGTTGGCTT
ACGTGTCACATCTCCCGCCGTTCTCGAAGGAAGCGTGAAGATCAACGGCTCTAGCCGTTT
AACCGGAAGAGTAACGGTGGCTCAAAGGTCAGGACTTGTCGTCAGAGCTCAGCAGAGCGA
GGCGGCACCAGAGTCTACTCGAAGGTCTGTGATTGGGCTCGTGGCTGCTGGTTTAGCCGG
TGGCTCGTTTGTTCAGGCCGTTCTCGCCGATGCTGTTCCTATCAAAATTGGCCCTCCTCC
ACCTCCCTCCGGCGGTCTTCCTGGGACAGATAACTCAGACCAAGCGAGAGATCTGAAACT
GGCGTTGAAGGAAAGGTTTTATTTACAGCCATTGCCACCGACGGAAGCTGTGGCTAGAGC
CAAAGAATCTGCCAATGAGATCGTGAATGTGAAGTCATTGATCGACAAGAAAGCTTGGCC
ATATGTTCAGAACGATCTCCGTCTCAGGGCGTCTTACCTCCGTTATGACCTTAACACAAT
CATCTCTTCCAAATCCAAGGATGAGAAGAAGTCTCTCAAGGAGCTCACTGGAAAGCTCTT
TGATACCATCAACAACCTGGACTATGCGGCGAAGAAGAAGAGTACTCCGGATGCTGAGAA
GTACTATTCAGAGACTGTCTCTACTTTGAACGATGTTCTCGCCAAGCTTGGTTAACCATT
TCGAGTC
TGCA

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1DM74JQ 807 0 0
TTCGATGGGTGTTGGCTTACGTGTCACATCTCCCGCCGTTCTCGAAGGAAGCGTGAAGAT
CAACGGCTCTAGCCGTTTAACCGGAAGAGTAACGGTGGCTCAAAGGTCAAGACTTGTCGT
CAGAGCTCAGCAGAGCGAGGCGGCACCAGAGACTACTCGAAGGTCTGTGATTGGGCTCGT
GGCTGCTGGTTTAGCCGGTGGCTCGTTTGTTCAGGCCGTTCTCGCCGATGCTGTTCCTAT
CAAAATTGGCCCTCCTCCACCTCCCTCCGGCGGTCTTCCTGGGACAGATAACTCAGACCA
AGCGAGAGTTCTGAAACTGGCGTTGAAGGAAAGGTTTTATTTACAGCCATTGCCACCGAC
GGAAGCTGTGGCTAGAGCCAAAGAATCTGCCAAGGAGATCGTGAATGTGAAGTCATTGAT
CGACAAGAAAGCTTGGCCATATGTTCAGAACGATCTCCGTCTCAGGGCGTCTTACCTCCG
TTATGACCTTAACACAATCATCTCTTCCAAATCCAAGGATGAGAAGAAGTCTCTCAAGGA
GCTCACTGGAAAGCTCTTTGATACCATCAACAACCTGGACTATGCGGCGAAGAAGAAGAG
TACTCCGGATGCTGAGAAGTACTATTCAGAGACTGTCTCTACTTTGAACGATGTTCTCGC
CAAGCTTGGTTAACCATTTCGAGTCTGCATTTTTCTTTGTAAATTTATTGTGTCTTGATT
TTTGTTTCCTGAGTACTTAATACTCAAATCCCTGAATCTGAATGTGTTTCAAGTTTTTAC
CCCCAAAACAATGGTAATTTCTTGTGT

QA 1 807 1 807
DS 

RD RS1CI23JQ 603 0 0
TGTTCAGGCTGTACTCGCCGATGCTGTCCCGATCAAAATTGGCCCTCCTCCACCTCCCTC
CGGTGGTCTTCCTGGGACAGATAACTCAGACCAAGCGAGAGATCTGAAACTGGCGTTGAA
GGAAAGGTTTTATTTACAGCCATTGCCACCGACGGAAGCTGTGGCTAGAGCCAAAGAATC
TGCCAAGGAGATCGTGAATGTGAAGTCATTGATCGACAAGAAAGTTTGGCCATATGTTCA
GAACGATCTCCGTCTCAGGGCGTCTTACCTCCGTTATGACCTTAACACAATCATCTTTTC
CAAATCCAAGGATGAGAAGAAGTCTCTCAAGGAGCTCACTGGAAAGCTCTTTGATACCAT
CAACAACCTGGACTATGCGGCGAAGAAGAAGAGTACTCCGGATGCTGAGAAGTACTATTC
AGAGACTGTCTCTACTTTGAACGATGTTCTCGCCAAGCTTGGTTAACCATTTCGAGTCCG
CATTTTTCTTTGTAAATTTATTGTGTCTTGATCTTTGTTTCCTGAGTACTTAATACTCAA
ATCCCTGAATCTGAATGTGTTTCAAGTTTTTACCCCCAAAACAATGGTAATTTTTTGTGT
GTG

QA 1 603 1 603
DS 



AS 2 8

CO CL527Contig1 1079 4 8 U
CACTTGAACCCAGTTCCGGGTTAATTAGATCCGAATAGTCTTACATTTTGAGATAAGCAA
GGCAAAAGAAAGAGATGGTGATAATAATTTAAAAAGAGAAACAAAGATAAAGACAAGTGT
ATTGCTTATCAATTGATCATCATTCATCGTCTGAGTACTCAAACTTAACCGAATGTGACT
GAAGATCGATCTCTCCTCCTCTGTAGCTACCACGTTTCTTCTTCGTCTTATCATGTCGGA
AACCCCTTCCTCTGACTTGACCTAAAACCTCTTGAGCTTTAGCACCATAACCCGAATCAG
CACCATCCTTTGCCCAGTAAGAGTTATCTTTAAGCCTCTCGTCAGTGAAGACAACCTCTT
CAACGTCCACTCTCTGAAACGGTTTCTTCGGTTCTTTAGAGTTAGTAAGGGCTTTTCCTG
ATTTCTTTTCGCTTTTCTCAACGTTACCGTTTTCCTGAACATCATCAGCCTGCTGCTTGA
CAGGCGTTTCTTCCACTTCCTTCTTCCTCCGTTTTGATCCCTCATCATCATCATCATCCT
CCTCGGTCTCTTCTTTAGTCTCTTCAGGCTCTGATCTTTTCCTTTTCTTGGAGGATTTCT
CCTTATCCTCCTCATCTTCAACCAAAGACTCAGAATTGGTTTTCTTCTTCTTCTTCTTTT
TCTCTTTCAGTTCGTCTTCA*TCTCAGCATCAGTCTCCTTGACATTCTCCTCCTCCAATT
TTGGTTCCTTCTTTTTCTTCTTCTTCTTATCTTTCTTCTCGTCCTTTTCGTGATCAACAG
ATGCATTCTCATCTACACTTGCTGCTTTCTTCTTCCCATCCTCATTATCATCACCAGATT
TTTCAACATGGCTCTTGTTAAAAAAATCGCAGAAAACTTCCTCTATATCCGGTAAGCTAC
TGTTCAATTCCTTCTTCTCGATTTCAGCTTCCGAGAGATGCTTCTTGAAGCATTTAGAAA
ACCCACATCGATCCAAGTACTGAGCGACCGAACGGAGAACAATCACTTTCTGCTCTGCTT
TCAAGCTCGAGGCTTTGCTGCTCTCTTTCCCCATAACTCGTCTAAAGATCAACACTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RS1EL22JQ U 1
AF RS1AA30JQ U 430
AF RS1AA30TF C 430
AF RS1EL22TF C 671
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ATCTCAGCA

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CC

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ATCCAAGTACTGAGCGACCGAACGGAGAACAATCACTTTCTGCTCTGCTTTCAAGCTCGA
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DS 



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AAGTGTATTGCTTATCAATTGATCATCATTCATCGTCTGAGTACTCAAACTTAACCGAAT
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CATCATCCTCCTCGGTCTCTTCTTTTGTCTCTTCAGGCTCTGATCTTTTACTTTTCTTGG
AGGATTTCTCCTTATCCTCATCTTCAACCAAAGACTCAGCCTCGCTAGACTTCGACTTGG
TTTTCTTCTTCTTCTTTTTCTCTTTCAGTCTGTCTTCAATCTCACCATCAGTCTCTTTGA
CCTTCTCCTCCTCCTTAGTTACCTCCAGTTCTGGTTCCTTCTTTTTCTTCTTCTTCTTAT
CTTTCTTCTCGTCCTTTTGGTGATCAACAGATGCATTCTCATCTATACTTGCTGCTTTCT
TCTTCTTCCCATCCTCATTATCATCAACATGGCTCTTGTTAAAAAAATCGCAGAAAACTT
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TCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1GO66JQ U 1
AF RS1A628JQ U 66
AF RS1GO66TF C 581
AF RS1A628TF C 518
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RD RS1GO66JQ 665 0 0
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GGCAAAACTTGAACCCAGTTCCGGGTTAATTAGATCCGAATAGTCTTACATTTTTGAGAT
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AAGTGTATTGCTTATCAATTGATCATCATTCATCGTCTGAGTACTCAAACTTAACCGAAT
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AATCAGCACCATCCTTTGCCCAGTAAGAGTTATCTTTAAGCCTCTCGTCAGTGAAGACAA
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TTCCTGATTTCTTTTCGCTTTTCTCAACGTTACCGTTTTCCTGAACATCATCAGCCTGCT
GCTTAACAGGCGTTTCTTCCACTACACTCTCTTCCTTCTTCCTCCGTTTTGATCCCTCAT
CATCATCCTCCTCGGTCTCTTCTTTTGTCTCTTCAGGCTCTGATCTTTTCCTTTTCTTGG
GAGGA

QA 1 660 1 660
DS 

RD RS1A628JQ 875 0 0
GC
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GCAAAAGAAAGAGATGGTGATAATAATTTAAAAGGAGAAACAAAGATAAAGACAAGTGTA
TTGCTTATCAATTGATCATCATTCATCGTCTGAGTACTCAAACTTAACCGAATGTGACTG
AAGATCGATCTCTCCTCCTCTGTAGCTACCACGTTTCTTCTTCGTCTTCTCATGTCGGAA
ACCCCTTCCTCTGACTTGACCTAGAACCTCTTGAGCTTTAGCACCATAACCCGAATCAGC
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AGGCGTTTCTTCCACTACACTCTCTTCCTTCTTCCTCCGTTTTGATCCCTCATCATCATC
CTCCTCGGTCTCTTCTTTTGTCTCTTCAGGCTCTGATCTTTTACTTTTCTTGGAGGATTT
CTCCTTATCCTCATCTTCAACCAAAGACTCAGCCTCGCTAGACTTCGACTTGGTTTTCTT
CTTCTTCTTTTTCTCTTTCAGTCTGTCTTCAATCTCACCATCAGTCTCTTTGACCTTCTC
CTCCTCCTTAGTTACCTCCAGTTCTGGTTCCTTCTTTTTCTTCTTCTTCTTATCTTTCTT
CTCGTCCTTTTGGTGATCAACAGATGCATTCTCATCTATACTTGCTGCTTTCT*CTTCTT
CCCATCCTCATTATCATCA
ACATGGCTCTTGTT

QA 3 861 3 861
DS 

RD RS1GO66TF 679 0 0
T
CTCCGTTTTGATCCCTCATCATCATCCTCCTCGGTCTCTTCTTTTGTCTCTTCAGGCTCT
GATCTTTTCCTTTTCTTGGAGGATTTCTCCTTATCCTCATCTTCAACCAAAGACTCAGCC
TCGCTAGACTTCGACTTGGTTTTCTTCTTCTTCTTTTTCTCTTTCAGTCTGTCTTCAATC
TCACCATCAGTCTCTTTGACCTTCTCCTCCTCCTTAGTTACCTCCAGTTCTGGTTCCTTC
TTTTTCTTCTTCTTCTTATCTTTCTTCTCGTCCTTTTGGTGATCAACAGATGCATTCTCA
TCTATACTTGCTGCTTTCTTCTTCTTCCCATCCTCATTATCATCAACATGGCTCTTGTTA
AAAAAATCGCAGAAAACTTCCTCTAAATCCGGTAAGCTACTGTTCAATTCCTTCTTCTCG
ATTTCAGCTTCGGAGAGAAGCTTCTTGAAGCATTTAGAAAACCCACATCGCTCCAAGTAC
TGTGCGACCGAACGGAGAACAATAACTTTCTGCTCTGCTTTCAAGCTCGAGGCTTTGCTG
CTCTCTTTCCCCATTACTGGTCTAAAGATCAACACTTGACGAGGAGAGAGAGAGCTAAGA
GGGGCGTTTAAGGTGGTGGTGCTCTGGTCTCAATTTTGAGAGCTTAGGGCAAATTCCTTG
GAACCGAGGAGGAGGC
CC

QA 2 677 2 677
DS 

RD RS1A628TF 746 0 0
TTT
CTGAACATCATCAGC*TGCTGCTTAACAGGCGTTTCTTCCACTACACTCTCTTC*TTCTT
C*TCCGTTTTGATCCCTCATCATCATCCTCCTCGGTCTCTTCTTTTGTCTCTTCAGGCTC
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GGAACCGAGGAGGAGGCGGATCC

QA 4 746 4 746
DS 



AS 1 8

CO CL528Contig1 1345 8 11 U
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TTTT*AGCTCAAGTAAACATGCCAATTCCACAGTTTATGGACCAATGAAAGAGCTTGTGT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 30 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 35 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BE37TF U 1
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AF RS1FX52TF U 6
AF RS1AL77JQ C 535
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AF RS1BE37JQ C 654
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RD RS1BE37TF 733 0 0
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CCTAACTTTGGGG

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DS 

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GCTTGCAGGGATGCTGTGTTCGAATACTCAAAACATGTGATGAGTT*AGGTGGTTTACTC
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DS 

RD RS1FX52TF 764 0 0
GG
ATTCTGTGAAACACAAACAAGAACAAAAAAATGGCCTCTACCGAATTCGATCCTTATATG
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ACTGAAGTCCCTCCTATCTTCCACATCCCTAGAGATGCCTTGACCGACAAGAAAGCCTCT
GTCTCTGTTTCAGACCTGGAGATCCCTACCATCGACTTTGCAAGCGTCCACGTGGACACA
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TTGGGGATA*GTCA*CACTCAGACA*CTCCTTCCTCACG
TTC

QA 3 761 3 761
DS 

RD RS1AL77JQ 760 0 0
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AGGTGGTTTACTCTTTGAGCTTCTCTCAGAAGCACTAGGTTTGGAATCTGAGACCCTTAA
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TGGATATGTCTACTTCAGTCATATTAATCAGACTATAT
AG

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1EW83JQ 715 0 0
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CTTATAACGAACGATAAGTTCGTTAGCGTGGAGCATAGGGTGCTTGCGAATAGACAAGGA
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TGGACCAATGAAAGAGCTTGTGTCTGAAGAAGACCCTCCAAAATACAGAGACATTACCAT
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GTATCAGACTCTATGTGTGGATATGTCTACTTCAGTCATATTAATCAGACTATAT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1FX52JQ 766 0 0
TCCCAGTGGCTTGCAGGGATGCTGTGTTCGAATACTCAAAACATGTGATGAGTTTAGGTG
GTTTACTCTTTGAGCTTCTCTCAGAAGCACTAGGTTTGGAATCTGAGACCCTTAAGAGCA
AGGAGTGCTTGAAGACTTTGCTTATGGTCTGCCATTATTACCCACCTTGTCCACAACCTG
ACCTAACTTTGGGGATAAGTCAACACTCAGACAACTCCTTCCTCACGGTTCTTCTTCAAG
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CTGGAGCTCTTGTCATCAACATGGGAGATTTCTTGCAGCTTATAACGAACGATAAGTTCG
TTAGCGTGGAGCATAGGGTGCTTGCGAATAGACAAGGACCAAGGATTTCAGTTGCAAGCT
TTTTTTAGCTCAAGTAAACATGCCAATTCCACAGTTTATGGACCAATGAAAGAGCTTGTG
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TTTGAGAAAGGTCTGGATGGAACATCACATCTCTTGAATTTCAGGATATGAAAACAAAAC
TTCAGAAAAAGAAAATTACGTTGTTTCTTAGCATCAATTACTCTTTCTTGGATCTGCAAT
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ATGTCTACTTCAGTCATATTAATCAGACTATATAGAAGTTGTATGC

QA 1 766 1 766
DS 

RD RS1BE37JQ 692 0 0
AGAGCAAGGAGTGCTTGAAGACTTTGCTTATGGTCTGCCATTATTACCCACCTTGTCCAC
AACCTGACCTAACTTTGGGGATAAGTCAACACTCAGACAACTCCTTCCTCACGGTTCTTC
TTCAAGACAACATCGGTGGTCTACAAATTCTTCATCAAGATTCTTGGGTTGATGTGGCTC
CTCTTCCTGGAGCTCTTGTCATCAACATGGGAGATTTCTTGCAGCTTATAACGAACGATA
AGTTCGTTAGCGTGGAGCATAGGGTGCTTGCGAATAGACAAGGACCAAGGATTTCAGTTG
CAAGCTTTTTT*AGCTCAAGTAAACATGCCAATTCCACAGTTTATGGACCAATGAAAGAG
CTTGTGTCTGAAGAAGACCCTCCAAAATACAGAGACATTACCATAAAAGAATACACTGAT
GGATATTTTGAGAAAGGTCTGGATGGAACATCACATCTCTTGAATTTCAGGATATGAAAA
CAAAACTTCAGTAAAAGAAAATTACGTTGTTTCTTAGCATCAATTACTCTTTCTTGGATC
TGCAATAATTAATCTAGTATACCAAGTAGTGTGTGCGCGCGTATGTATCAGACTCTATGT
GTGGATATGTCTACTTCAGTCATATTAATCAGACTATATAGAAGTTGTATGCATTGAACG
ATTTGATCATAATAACATCCACATTGTGCATT

QA 1 692 1 692
DS 



AS 2 6

CO CL529Contig1 1040 3 4 U
GCAAGCTAAACTTATTAAATAGTAAAATTATGAATCAAATTGTTGAGACTGTTACAAACT
CTGTGGAACTTTCTGTTTCTTTCTATAAGAGGGGAAGAAGGCATATAACATAAGAGGAAG
AGACATATCTGGTCTTCTGATGCTTTTCAAGACCCAGTAATAACAATAATGTTTCTAATG
TAATGGCTTGAGGTGGAAGATTTGACAAGCTGGTGTGTATGAAACCTTGGAAGCTGCTTT
TTCGAATTTCTTGCTCGCTGCCTAGTTTTCCTCTAGATTCGTCTGTGAGAAGAAACGGTT
CCACCACGACGAGCTTCGCATTTTAGCAGGTCTTCCAAACTTCGATAGTTCTGCAACTTT
GGCCTTTTGCTTACCAGGATTACCTGCAAAGAGAAGGAGACCATCTGAAGCAACACGTGC
AAGTTCAGGAACGGTCTTGTTGAGATACTTAGGTGAGAGGTAATCAAGAGCATCTGAGAC
GATGACGAGAGAAAACGACTTTGCAGCTAGAGTCCGCATTCTCTACATCGTACGGTTCAA
CACCCCATGCTTCGGTCTCATCTTCCTTCAACAGAGTAGAGACAACCGCACATGTGTCAG
GACCCACGTGCAAAACCTTTCGCATGCTGTCTCCGTAAGCGGTCTTGAGAAGAGGAACGG
CTCTTTGAACTTCTGATGTGCAAGAATAGCCACCTGTGGTCTTGCTGACCTCTCTGATAC
TCTTAAACATACCTGGACCACTGAAAGCATAACCAATGAGAAGGCATGCTCCAAGGAGAA
AAAGGCAAACAGATAAGAGAGGAGAGGAACGTGATTTAGAGTGCAAAGCTCCTACGAAAG
GGAAGCTTCCACTATCCCCTACACGCCTCGTCGAACCTACTTGCCTTCTTGCCATCACTC
TAAATAGATTTTTCTGTTTAACCTCGAGAATTAACGATGCTCGGATCCAAAGATCTCAGA
TCCGAGAATGTTCCGTTCGTTCGTGTGTGAAAGAAAATTTTACTAAGCGGAGGAGAGCTT
CCTATAGCACAGTGTTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G960JQ U 155
AF RS1EV91JQ U 1
AF RS1EV91TF C 388
BS 1 263 RS1EV91JQ
BS 264 264 RS1G960JQ
BS 265 736 RS1EV91JQ
BS 737 1040 RS1EV91TF

RD RS1G960JQ 344 0 0
CAGTAATAACAATAATGTTTCTAATGTAATGGCTTGAGGTGGAAGATTTGACAAGCTGGT
GTGTATGAAACCTTGGAAGCTGCTTTTTCGAATTTCTTGCTCGCTGCCTAGTTTTCCTCT
AGATTCGTCTGTGAGAAGAAACGGTTCCACCACGACGAGCTTCGCATTTTAGCAGGTCTT
CCAAACTTCGATAGTTCTGCAACTTTGGCCTTTTGCTTACCAGGATTACCTGCAAAGAGA
AGGAGACCATCTGAAGCAACACGTGCAAGTTCAGGAACGGTCTTGTTGAGATACTTAGGT
GAGAGGTAATCAAGAGCATCTGAGACGATGACGAGAGAAAACGA

QA 1 344 1 344
DS 

RD RS1EV91JQ 736 0 0
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CTGTGGAACTTTCTGTTTCTTTCTATAAGAGGGGAAGAAGGCATATAACATAAGAGGAAG
AGACATATCTGGTCTTCTGATGCTTTTCAAGACCCAGTAATAACAATAATGTTTCTAATG
TAATGGCTTGAGGTGGAAGATTTGACAAGCTGGTGTGTATGAAACCTTGGAAGCTGCTTT
TTCGAATTTCTTGCTCGCTGCCTCGTTTTCCTCTAGATTCGTCTGTGAGAAGAAACGGTT
CCACCACGACGAGCTTCGCATTTTAGCAGGTCTTCCAAACTTCGATAGTTCTGCAACTTT
GGCCTTTTGCTTACCAGGATTACCTGCAAAGAGAAGGAGACCATCTGAAGCAACACGTGC
AAGTTCAGGAACGGTCTTGTTGAGATACTTAGGTGAGAGGTAATCAAGAGCATCTGAGAC
GATGACGAGAGAAAACGACTTTGCAGCTAGAGTCCGCATTCTCTACATCGTACGGTTCAA
CACCCCATGCTTCGGTCTCATCTTCCTTCAACAGAGTAGAGACAACCGCACATGTGTCAG
GACCCACGTGCAAAACCTTTCGCATGCTGTCTCCGTAAGCGGTCTTGAGAAGAGGAACGG
CTCTTTGAACTTCTGATGTGCAAGAATAGCCACCTGTGGTCTTGCTGACCTCTCTGATAC
TCTTAAACATACCTGG

QA 1 736 1 736
DS 

RD RS1EV91TF 653 0 0
AAAGAGAAGGAGACCATCTGAAGCAACACGTGCAAGTTCAGGAACGGTCTTGTTGAGATA
CTTAGGTGAGAGGTAATCAAGAGCATCTGAGACGATGACGAGAGAAAACGACTTTGCAGC
TAGAGTCCGCATTCTCTACATCGTACGGTTCAACACCCCATGCTTCGGTCTCATCTTCCT
TCAACAGAGTAGAGACAACCGCACATGTGTCAGGACCCACGTGCAAAACCTTTCGCATGC
TGTCTCCGTAAGCGGTCTTGAGAAGAGGAACGGCTCTTTGAACTTCTGATGTGCAAGAAT
AGCCACCTGTGGTCTTGCTGACCTCTCTGATACTCTTAAACATACCTGGACCACTGAAAG
CATAACCAATGAGAAGGCATGCTCCAAGGAGAAAAAGGCAAACAGATAAGAGAGGAGAGG
AACGTGATTTAGAGTGCAAAGCTCCTACGAAAGGGAAGCTTCCACTATCCCCTACACGCC
TCGTCGAACCTACTTGCCTTCTTGCCATCACTCTAAATAGATTTTTCTGTTTAACCTCGA
GAATTAACGATGCTCGGATCCAAAGATCTCAGATCCGAGAATGTTCCGTTCGTTCGTGTG
TGAAAGAAAATTTTACTAAGCGGAGGAGAGCTTCCTATAGCACAGTGTTATCC

QA 1 653 1 653
DS 



CO CL529Contig2 1087 3 11 U
GGAACACTGTGCTATAGGAAGCTCTCCTCCGCTTAGTAAAATTTTTTTCACACACGAACG
AACGGAACATTCTCGGATCTGAGATCTTTGGATCCGAGCATCGTTAATTCTCGAGGTCAA
ACAGAAAATCTATTTTAGAGAGATGGCAAGAAGGCAAGTAGGTTCGGCGAGGCGTGTAGG
GGATAGTGGAAGCTTCCCTTTCGTAGGAGCTTTGCACTCTAAATCACGTTCCTCTCCTCT
CTTATCTGTTTGCCTTGTTCTCCTTGGAGCATGCCTTCTCATTGGTTATGCTTTCAGCGG
TCCAGGTATGTTTAAGAGTATCAGAGAGGTCAGCAAGATCACAGGTGACTATTCATGCAC
ATCAGAAGTTCAAAGAGCCATTCCTCTTCTCAAGACCGCTTACGGAGACAGCATGCGAAA
GGTCTTGCACGTGGGTCCTGACACATGCGCGGTGGTCTCTACTCTGTTGAAGGAAGATGA
GACCGAAGCGTGGGGTGTTGAACCGTACGATGTTGAGGATGCAGACTCCAGCTGCAAAAG
TCTTTTGCGTAAAGGCCTTGTACGTGTGGCTGACATCAAGTTCCCTCTCCCTTACCGGGC
GAAGTCGTTTTCTCTCGTCATCGTCTCGGATGCTCTGGATTACCTCTCACCCAAGTATCT
CAACAAGACCGTTCCTGAACTTGCACGTGTTGCTTCAGATGGTCTCCTTCTCTTTGCAGG
TAATCCTGGTAAGCAAAAGGCCAAAGCTGCGGAACTATCCAAGTTTGGAAGACCTGCTAA
AATGCGTAGCTCGTCGTGGTGGAACCGTTTCTTCTCATAGACGAATCTAGAGGAAAACGA
AGCAGCGAGCAAGAAGTTCGAAAAAGCAGCTACCAAGGTTTCATACACACCAGCTTGTCA
AATCTTCCACCTCAAGCCATTACATTAGAAACATTATTGTTATTACTGGGTCTTGAAAAG
CATCAGAATACCAGATATGTCTCTTCCTCTTATGTTATATGCCTTCTTCCCCTCTTATAG
AAAGAAACAGAAAGTTCCACAGAGTTGTAACACAGTCTCAACAATTTGATTCATAATTTT
ACTATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EW72TF U 1
AF RS1DP96TF U 139
AF RS1C889JQ C 295
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CTTATCTGTTTGCCTTGTTCTCCTTGGAGCATGCCTTCTCATTGGTTATGCTTTCAGCGG
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GAAGTCGTTTTCTCTCGTCATCGTCTCGGATGCTCTGGATTACCTCTCACCCAAGTATCT
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CCTTGGAGCATGCCTTCTCATTGGTTATGCTTTCAGCGGTCCAGGTATGTTTAAGAGTAT
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CAAAG
TTGCAGA

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GCGGAAAGTCTTGCACGTAGGTCCTGACACATGCGCGGTGGTCTCTACTCTGTTGAAGGA
AGATGAGACCGAAGCGTGGGGTGTTGAACCGTACGATGTTGAGGATGCAGACTCCAGCTG
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TGCAGGTAATCCTGGTAAGCAAAAGGCCAAAGCTGCGGAACTATCCAAGTTTGGAAGACC
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GAAAAGCATCAGAATACCAGATATGTCTCTTCCTCTTATGTTATATGCCTTCTTCCCCTC
TTATAGAAAGAAACAGAAAGTTCCACAGAGTTGTAACACAGTCTCAACAATTTGATTCAT
AATTTTACTATTT

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DS 



AS 1 8

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CAAAATATGACGATGAAGATTCGGACAAGAACACACAAAAGTCTATTAATAAATAATGAG
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AACGCTCTTGTCATACAGGTACTCAACGAACTCATCGATGAGGTAAGGCCATGCTCCTTC
TGCATCGTAATTCGACAGCGCTGGGTCCACAGTCCTTGCAAACTCCAGGAGCTGTGCCCA
TGTGTCTTTAGATATGGCCTTGTTGTGACGATCCTGCAAGAAATCACACCAGTGATTCAC
CAATGGCCACTCTCTTTCTGCAAAGAGCAACTGCCACATCCCAATCGCTGTATCTAAAGC
AAGAGACTTCTGCCCCTTCTCTTTCGCCCACCCAAAAGCAAAGTTGTATATGTCATGGAA
CTTTTGTTCATCTTTAAGCTCTGAACGCATAAAGGACAGCTTTTCCTGCAACTTTCCAAT
GGAATCTACTCCTAATGCCTGTAATCCACCAAAAAATTCTTCCTTGGAAAATTCACACGC
TGTGGCAGCATTCATATGCCACGAAAGAACCAACGTGACAATGTCTTGGGGTTCCACCTG
AAGATCACTACACAGAACCGAGATACCTTCGGCCAGAATCATATCAGAATAGGGGTCTTT
ATATCTATTGTAGAGCTCCTCCAAGCGTCTCATATCGCCATTGCTTCTTGGCTGAGGCTG
GCTGTAAAAGACATCAAAAGCTGCTTCGAGCTGCCAATCGCAGGCTTTGAGAGCCTGAAG
AGCATTCTTCTCACTAGCTCCAGTGATAGCCACGAACTGCTGAAGTTTATCGCGGTTGCT
TCTACTCAACTTATGCATCGTGTGTTGTGCAGGCGAAGCGAAAACCCTAACAAGGTAAAT
CGAAGGAGAGCGCCGCGAGAGAAGAGAGGGGAGTGACTCAGGGAAGACTCGAGAGGTCTC
TCACGATTTGCTTTTAAAGCTTTCTCACTTTCCTCTTCTCCGCCTCTCTCTCCC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 
50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 
35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RS1DW18JQ U 449
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AF RS1BL84JQ U 4
AF RS1BT20JQ U 84
AF RS1BT20TF C 339
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AF RS1DA82TF C 479
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DS 

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CTTTTGTTCATCTTTAAGCTCTGAACGCATAAAGGACAGCTTTTCCTGCAACTTCCCAAT
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TGTGGCAGCATTCATATGCCACGAAAGAACCAACGTGACAATGTCT

QA 1 646 1 646
DS 

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AATATGACGATGAAGATTCGGACAAGAACACACAAAAGTCTATTAATAAATAATGAGCAA
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GTCGTAATTCGACAGCGCTGGGTCCACAGTCCTTGCAAACTCCAGGAGCTGTGCCCATGT
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ACTG

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DS 

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DS 

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TCCCAATCGCTGTATCTAAAGCAAGAGACTTCTGCCCCTTCTCTTTCGCCCACCCAAAAG
CAAAGTTGTATATGTCATGGAACTTTTGTTCATCTTTAAGCTCTGAACGCATAAAGGACA
GCTTTTCCTGCAACTTTCCAATGGAATCTACTCCTAATGCCTGTAATCCACCAAAAAATT
CTTCCTTGGAAAATTCACACGCTGTGGCAGCATTCATATGCCACGAAAGAACCAACGTGA
CAATGTCTTGGGGTTCCACCTGAAGATCACTACACAGAACCGAGATACCTTCGGCCAGAA
TCATATCAGAATAGGGGTCTTTATATCTATTGTAGAGCTCCTCCAAGCGTCTCATATCGC
CAATGCTTCTTGGCTGAGGCTGGCTGTAAAAGACATCAAAAGCTGCTTCGAGCTGCCAAT
CGCAGGCTTTGAGAGCCTGAAGAGCATTCTTCTCACTAGCTCAAGTGATAGCCACGAACT
GCTGAAGTTTATCGCGGTTGCTTCTACTCAACTTATGCATC
C

QA 1 581 1 581
DS 

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AATTCACACGCTGTGGCAGCATTCATATGCCACGAAAGAACCAGCGTGACAATGTCTTGG
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TATGGGTCTTTATATCTATTGTAGAGCTCCTCCAAGCGTCTCATATCGCCATTGCTTCTT
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TCGCGGTTGCTTCTACTCAACTTATGCATCGTGTGTTGTGCAGGCGAAGCGAAAAGCCTA
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CC

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CCATTGCTTCTTGGCTGAGACTGGCTGTAAAAGACATCAAAAGCTGCTTCGAGCTGCCAA
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CTCCGCCTCTCTCTCCC

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ATGGAATCTACTCCTAATGCCTGTAATCCACCAAAAAATTCTTCCTTGGAAAATTCACAC
GCTGTGGCAGCATTCATATGCCACGAAAGAACCAACGTGACAATGTCTTGGGGTTCCACC
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TTATATCTATTGTAGAGCTCCTCCAAGCGTCTCATATCGCCATTGCTTCTTGGCTGAGGC
TGGCTGTAAAAGACATCAAAAGCTGCTTCGAGCTGCCAATCGCAGGCTTTGAGAGCCTGA
AGAGCATTCTTCTCACTAGCTCCAGTGATAGCCACGAACTGCTGAAGTTTATCGCGGTTG
CTTCTACTCAACTTATGCATCGTGTGTTGTGCAGGCGAAGCGAAAACCCTAACAAGGTAA
ATCGAAGGAGAGCGCCGCGAGAGAAGAGAGGGGAGTGACTCAGGGAAGACTCGAGAGGTC
TCTCACGATTTGCTTTTAAAGCTTTCTCACTTTCCTCTTCTCCGCCTCTCTC
CC

QA 1 592 1 592
DS 



AS 1 8

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AAAAAATTAAAATATAGCATGGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCCTTGTT
CTTATTATCTTTTCTGCTTTTGAAGCACCAACAATTGTGGAAGGGCAGAAGTCATGCAAG
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TGCCACTTTCCATGTTAATCAACAGAGCCTTTCCAAGACATTTTCATGCCCTATGCCAAA
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AAATCAATGAATCTTTTTGATAGTTTAATAATGTAAGAATAACATTAAATTTTATTACAA
TATATTAACCATTTTAACAC


BQ
10 10 10 10 30 30 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 15 45 45 
45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 15 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 10 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1B072TF U 3
AF RS1CF03JQ C 3
AF RS1CF03TF U 3
AF RS1FP27TF U 295
AF RS1BE44JQ C 6
AF RS1BE44TF U 6
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AF RS1GF39JQ C 9
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QA 3 476 3 476
DS 

RD RS1CF03TF 476 0 0
GG
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QA 3 476 3 476
DS 

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GAT

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CT

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G
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ATCTTTTCTGCTTTTGAAGCACCAACAATTGTGGAAGGGCAGAAGTCATGCAAGAGGCAG
CCTAATTCTGGGAGCAAAAATTGTATGAAGGATAATGATTGCCGGAAGATTTGCGAAAAC
GAGAAATCATTACGTGCTACTTGCGATTATGCATTCCCAAGGCGCCGGTGTTTCTGCCAC
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TTACTAGATAACTTTCGGAGATATCGCGGAATAAAGTTCATTTCAATATTATTATAATAA
GTTTTCTATATAATTGAAATTTATAACAATTTCGATAAATTAATTTTTTGATAAAAATCA
ATGAATCTTTTTGATAGTTTAATAATGTAAGAATAACATTAAATT
CT

QA 2 526 2 526
DS 

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ATTTTCTGCTTTTGAAGCACCAACAATTGTGGAAGGGCAGAAGTCATGCAAGAGGCAGCC
TAATTCTGGGAGCAAAAATTGTATGAAGGATAATGAATGCCGGAAGATTTGCGAAACCGA
GAAAGCATTACGTGCTACTTGCGATTATACATTCCCAAGGCGCCGGTGTTTCTGCCACTT
TCCATGTTAATCAACAGAGCCTTTCCAAGACATTTTTATGCCCTATGCCAAATAAATATT
ACTAGATAACTTTCGGAGATATCACGGAATAAAGTTCATTTCAATATTATTATAATAAGT
TTTCTATATAATTGAAATTTATAACAATTTCGATAAATTAATTTTTTGATAAAAATCAAT
GAATCTTTTTGATAGTTTAATAATGTAAGAATAACATTAAATTTTATTACAATATATTAA
CCATTTTAACAC

QA 1 552 1 552
DS 



AS 1 5

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TCGCCGTGTTGACCGCTTTTACGATTTCTTCCGCCGTGACACAATCTCATATCCTCCGTG
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CTGGAGATGTGTGGTTCTTGGATTCCACTAAAGAATCATTAGGCTTCGTTCTTGCTGATT
ATGGATTCGATGTTTGGATAGGAAACGTTCGTGGTACGCGTTACAGTTATGGGCATGTAA
CTTTGTCTGAAACTGACAAGGAATTTTGGGATTGGAGTTGGCAAGATTTGGCTATGTACG
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TGGATTGCACTGATTTCCTCTCATCCATAACAGGGAAGAATTGTTGTTTCAATGCCTCGA
GGATAGAATACTACCTAGATTACGAGCCTCACCCATCATCTGTGAAGAACTTGCGACATC
TTTTCCAAATGATTCGGAAGGGGAGCTTTGCAAAATTTGACTACGGCTTTCTAAAAAACA
TATTGACTTATGGGACATCAAAACCTCCGGAATTCGAACTTGGCCTCATTCCGGCATCAT
TACCTGTGTGGATGGGGTACGGTGGAAGTGATCTCTTAGCAGACGTGACGGATGTGGAAC
GTACTCTCGCCGAGCTACCTTCCAGACCAGAGTTGCTATACCTTGAGAATTATGGTCACA
TTGATTTTGTACTAAGCACAAGTGCCAAAGAAGATGTGTATCTGCACATGATTCAATTCT
TCAGGGCAAGGAAAAATTTTAGTAGTTGGTAAACTACTAACTGCAAGGCTGGACACATTT
TTATCTGTTATCTGTCTCCTCCTTGATGTCGTGTGTACATATGTATATCTATATTTCAAA
CTCAGTTTTCCATAAAATCGAACTAGATAGACTAATCAG


BQ
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20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 15 15 30 0 30 15 30 30 15 15 15 15 15 30 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CA29TF U 1
AF RS1BS80TF U 4
AF RS1EP45TF U 26
AF RS1CA29JQ C 572
AF RS1BS80JQ C 626
BS 1 289 RS1CA29TF
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BS 291 667 RS1CA29TF
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RD RS1CA29TF 667 0 0
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TCGCCGTGTTGACCGCTTTTACGATTTCTTCCGCCGTGACACAATCTCATATCCTCCGTG
GATCTCCGGTCAATTCTCTCTGCGCTGACCTCGTTCATCCGGCGGGTTACTCCTGCACCG
AACACACTATTCAAACGAAAGATGGGTACATACTAGCTCTTCAACGCGTGGCTTCTCCTG
CTCAGAATCTAACTTTTCAATATGGTCCACCTGTTCTGCTTCAGCACGGCCTCTTTATGG
CTGGAGATGTGTGGTTCTTGGATTCCACTAAAGAATCATTAGGCTTCGTTCTTGCTGATT
ATGGATTCGATGTTTGGATAGGAAACGTTCGTGGTACGCGTTACAGTTATGGGCATGTAA
CTTTGTCTGAAACTGACAAGGAATTTTGGGATTGGAGTTGGCAAGATTTGGCTATGTACG
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GACATTCTCAGGGGACTATCATGTCTTTTGCTGCTCTTACTCAGCCACGTGTTGCTGAAA
TGGTTGAAGCAGCTGCGTTGCTTTGTCCAATATCGTATTTGGATCATGTCACAGCTCCAC
TTGTAGA

QA 1 667 1 667
DS 

RD RS1BS80TF 767 0 0
GG
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GTGTTGACCGCTTTTACGATTTCTTCCGCCGTGACACAATCTCATATCCTCCGTGGATCT
CCGGTCAATTCTCTCTGCGCTGACCTCGTTCATCCGGCGGGTTACTCCTGCACCGAACAC
ACTATTCAAACGAAAGATGGGTACATACTAGCTCTTCAACGCGTGGCTTCTCCTGCTCAG
AATCTAACTTTTCAATATGGTCCACCTGTTCTGCTTCAGCACGGTCTCTTTATGGCTGGA
GATGTGTGGTTCTTGGATTCCACTAAAGAATCATTAGGCTTCGTTCTTGCTGATTATGGA
TTCGATGTTTGGATAGGAAACGTTCGTGGTACGCGTTACAGTTATGGGCATGTAACTTTG
TCTGAAACTGACAAGGAATTTTGGGATTGGAGTTGGCAAGATTTGGCTATGTACGACTTG
GCAGAAATGGTTCAGTATATGTATTCAGTTGCAAACTCCAAAATCTTCCTTGTTGGACAT
TCTCAGGGGACTATCATGTCTTTTGCTGCTCTTACTCAGCCACGTGTTGCTGAAATGGTT
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GAAAGAATGGTTTTTATGCATCTCGATCAGATGGTCGTTGCTCTTGGCCTGCATCAAATA
AACTTTCGAAGTGATACATTAGCTAA*CTTGTTGACTCATTATGC

QA 3 767 3 767
DS 

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GGG
GTCGTTTCCGGGGAGGATGAAGTGGTTACTTGTCGCCGCGTTGACCGCTTGTACGATTTC
TTCCGCCGTGACACAATCTCATATCCTCCGTGGATCTCCGGTCAATTCTCTCTGCGCTGA
CCTCGTTCATCCGGCCGGTTACTCCTGCACCGAACACACTATTCAAACGAAAGATGGGTA
CATACTAGCTCTTCAACGCGTGGCTTCTCCTGCTCAGAATCTAACTTTTCAATATGGTCC
ACCTGTTCTGCTTCAGCACGGTCTCTTTATGGCTGGAGATGTGTGGTTCTTGGATTCCAC
TAAAGAATCATTAGGCTTCGTTCTTGCTGATTATGGATTCGATGTTTGGATAGGAAACGT
TCGTGGTACGCGTTACAGTTATGGGCATGTAACTTTGTCTGAAACTGACAAGGAATTTTG
GGATTGGAGTTGGCAAGATTTGGCTATGTACGACTTGGCAGAAATGGTTCAGTATATGTA
TTCAGTTGCAAACTCCAAAATCTTCCTTGTTGGACATTCTCAGGGGACTATCATGTCTTT
TGCTGCTCTTACTCAGCCACGTGTTGCTGAAATGGTTGAAGCAGCTGCGTTGCTTTGTCC
AATATCGTATTTGGATCATGTCACAGCTCCACTTGTAGAAAGAATGGTTTTTATGCATCT
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AGA*CGTGACAGAT

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DS 

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ATCGTATTTGGATCATGTCACAGCTCCACTTGTAGAAAGAATGGTTTTTATGCATCTCGA
TCAGATGGTCGTTGCTCTTGGCCTGCATCAAATAAACTTTCGAAGTGATACATTAGCTAA
ACTTGTTGACTCATTATGCGACGGGCATATGGATTGCACTGATTTCCTCTCATCCATAAC
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CCCATCATCTGTGAAGAACTTGCGACATCTTTTCCAAATGATTCGGAAGGGGAGCTTTGC
AAAATTTGACTACGGCTTTCTAAAAAACATATTGACTTATGGGACATCAAAACCTCCGGA
ATTCGAACTTGGCCTCATTCCGGCATCATTACCTGTGTGGATGGGGTACGGTGGAAGTGA
TCTCTTAGCAGACGTGACGGATGTGGAACGTACTCTCGCCGAGCTACCTTCCAGACCAGA
GTTGCTATACCTTGAGAATTATGGTCACATTGATTTTGTACTAAGCACAAGTGCCAAAGA
AGATGTGTATCTGCACATGATTCAATTCTTCAGGGCAAGGAAAAATTTTAGTAGTTGGTA
AACTACTAACTGCAAGGCTGGACACATTTTTATCTGTTATCTGTCTCCTCCTTGATGTCG
TGTGTACATATGTATATCTATATTTCAAA
CTTAGTTTTCCAT

QA 1 749 1 749
DS 

RD RS1BS80JQ 734 0 0
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TCTCGATCAGATGGTCGTTGCTCTTGGCCTGCATCAAATAAACTTTCGAAGTGATACATT
AGCTAAACTTGTTGACTCATTATGCGACGGGCATATGGATTGCACTGATTTCCTCTCATC
CATAACAGGGAAGAATTGTTGTTTCAATGCCTCGAGGATAGAATACTACCTAGATTACGA
GCCTCACCCATCATCTGTGAAGAACTTGCGACATCTTTTCCAAATGATTCGGAAGGGGAG
CTTTGCAAAATTTGACTACGGCTTTCTAAAAAACATATTGACTTATGGGACATCAAAACC
TCCGGAATTCGAACTTGGCCTCATTCCGGCATCATTACCTGTGTGGATGGGGTACGGTGG
AAGTGATCTCTTAGCAGACGTGACGGATGTGGAACGTACTCTCGCCGAGCTACCTTCCAG
ACCAGAGTTGCTATACCTTGAGAATTATGGTCACATTGATTTTGTACTAAGCACAAGTGC
CAAAGAAGATGTGTATCTGCACATGATTCAATTCTTCAGGGCAAGGAAAAATTTTAGTAG
TTGGTAAACTACTAACTGCAAGGCTGGACACATTTTTATCTGTTATCTGTCTCCTCCTTG
ATGTCGTGTGTACATATGTATATCTATATTTCAAACTCAGTTTTCCATAAAATCGAACTA
GATAGACTAATCAG

QA 1 734 1 734
DS 



AS 2 8

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CCATTAAGGAGTTTAGAAACCAAAAACAACCTAACAATCTTTGAAGAAGACATAAGAGTT
TTCATAAAGCAGAGAGAGATAGGATAACAAAAAACATAACAGCTCGATCAAAATCAACAA
TCACTGGTCTCCGGGAAGCGACTTGATGATGTCGGAATCACCTGGATCAACAATGCTGAG
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GTGATGAACGCCAACTTTAGCAAGCATAGCGTAGTACTCAATCTCTGATCCCCTCAACGG
AGGGCAGTTGCTAGAGATAAAAATCAACTTACCTTTGGAGCTGCGAAGGGACTTGAGAAC
AGATTTGTAGCCGAAAGTGTACTTTCCACTCTTCATGACCAGAGCTAATCTGCTGTTGAT
TCCCTCATGGGACTCCTTCGTCTTCTTCGCCGCAACCATTTTTCTCAACGCCGGGAGTAG
TCCGCTGATCGCCGAGTTAACAAGAAGAGAGGCCTTTTCGGAAGGGGTGAGGTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RS1EE53JQ U 1
AF RS1B524TF C 43
BS 1 593 RS1EE53JQ
BS 594 596 RS1B524TF

RD RS1EE53JQ 595 0 0
TTTTTTTTTAGCAGAAATTGAGTTTTTCATTTCAAAATTGAGAAACGATAATATCATTAA
CCATTAAGGAGTTTAGAAACCAAAAACAACCTAACAATCTTTGAAGAAGACATAAGAGTT
TTCATAAAGCAGAGAGAGATAGGATAACAAAAAACATAACAGCTCGATCAAAATCAACAA
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ACAGGAAACACGGAAGTACTTCCCGCAAGCAGTTCCCAAATCGACATTGTTCCCGTTGTA
GTGATGAACGCCAACTTTAGCAAGCATAGCGTAGTACTCAATCTCTGATCCCCTCAACGG
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AGATTTGTAGCCGAAAGTGTACTTTCCACTCTTCATGACCAGAGCTAATCTGCTGTTGAT
TCCCTCATGGGACTCCTTCGTCTTCTTCGCCGCAACCATTTTTCTCAACGCCGGGAGTAG
TCCGCTGATCGCCGAGTTAACAAGAAGAGAGGCCTTTTCGGAAGGGGTGAGGT
CC

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DS 

RD RS1B524TF 554 0 0
AAACGATAATATCATTAACCATTAAGGAGTTTAGAAACCAAAAACAACCTAACAATCTTT
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CTCGATCAAAATCAACAATCACTGGTCTCCGGGAAGCGACTTGATGATGTCGGAATCACC
TGGATCAACAATGCTGAGACAGGAAACACGGAAGTACTTCCCGCAAGCAGTTCCCAAATC
GACATTGTTCCCGTTGTAGTGATGAACGCCAACTTTAGCAAGCATAGCGTAGTACTCAAT
CTCTGATCTCCTCAACGGAGGGCAGTTGCTAGAGATAAGAATCAACTTACCTTTGGAGCT
GCGAAGGGACTTGAGAACAGATTTGTAGCCGAGAGTGTACTTTCCACTCTTCATGACCAG
AGCTAATCTGCTGTTGATTCCCTCATGGGACTTCTTCGTCTTCTTCGCCGCAACCATTTT
TCTCAACGCCGGGAGTAGTCCGCTGATCGCCGAGTTAACAAGAAGAGAGGCCTTTTCGGA
AGGGGTGAGGTGCC

QA 1 554 1 554
DS 



CO CL533Contig2 550 6 15 U
CGAGAAACGATAATATCATTAACCATAAGGAGTTTAGAAACCAAAAACAACCTAACAATC
TTTGAAAAAGATTTAAGAGTTTTCATAAAGCAGAGAGAGATAGGACAACAAAAAACATAA
CAGCTCGATCAAAATCAACAATCACTGGTCTCCGGGAAGCGACTTGATGATGTCGGAATC
ACCTGGATCAACAATGCTGAGACAGGAAACGCGGAAGTACTTCCCGCAAGCAGTTCCCAA
ATCGACATTGTTCCCGTTGTAGTGATGAACGCCAACTTTAGCAAGCATAGCGTAGTACTC
AATCTCTGATCTCCTCAACGGAGGGCAGTTGCTAGAGATAAGAATCAACTTACCTTTGGA
GCTGCGAAGGGACTTGAGAACAGATTTGTAGCCGAGTGTGTACTTTCCACTCTTCATGAC
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TTTCTCAAGAGTCGCTGATCGCCGAGTTAACAAGAAGAGGGAGAGGCCTTTTCGTGGGGG
TGACGCAGCC


BQ
10 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 35 35 20 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RS1FM28JQ U 1
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AF RS1EI27JQ U 2
AF RS1FM28TF C 1
AF RS1DB92TF C 2
AF RS1EI27TF C 2
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CT

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C
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CC

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DS 

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GACGC
CCC

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DS 

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GG
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GAAAAAGATTTAAGAGTTTTCATAAAGCAGAGAGAGATAGGACAACAAAAAACATAACAG
CTCGATCAAAATCAACAATCACTGGTCTCCGGGAAGCGACTTGATGATGTCGGAATCACC
TGGATCAACAATGCTGAGACAGGAAACGCGGAAGTACTTCCCGCAAGCAGTTCCCAAATC
GACATTGTTCCCGTTGTAGTGATGAACGCCAACTTTAGCAAGCATAGCGTAGTACTCAAT
CTCTGATCTCCTCAACGGAGGGCAGTTGCTAGAGATAAGAATCAACTTACCTTTGGAGCT
GCGAAGGGAATTGAGAACAGATTTGTAGCCGAGTGTGTACTTTCCACTCTTCATGACCAA
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CTCAGGAGTCGCTGATCGCCGAGTTAACAAGAAGAGGGAGAGGCCTTTTCGTGGGGGTGA
CGCAGCC

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DS 



AS 1 8

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TTTTATCCTCGTTAGGTCGAACTCGCGCATGCATAATGGATCTAGAGTACTCTTCTTTCT
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AACCGGTGAGGATCATGAGAGGCACGGCGGATATAGCTGCAGCATTAGCTAGCGGTTTAT
CATTTGTGCCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 15 15 15 15 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1AH56JQ U 127
AF RS1AH56TF C 24
AF RS1EF94JQ U 1
AF RS1CZ70JQ U 169
AF RS1AL63JQ U 269
AF RS1EF94TF C 275
AF RS1AL63TF C 276
AF RS1CZ70TF C 394
BS 1 326 RS1EF94JQ
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BS 328 529 RS1EF94JQ
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BS 531 726 RS1EF94JQ
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BS 805 810 RS1AL63JQ
BS 811 1016 RS1EF94TF
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RD RS1AH56JQ 268 0 0
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DS 

RD RS1AH56TF 597 0 0
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AAAAAAATAAGAAAAAAAAATCCTGGCAACTAAAGTAGATGCATTCGTATAGTTGATATA
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GCCGGATTATGATCTATCTCCGACAATTTTTCTATTTCTGACT
CTGGACTAAGAACT

QA 1 583 1 583
DS 

RD RS1EF94JQ 726 0 0
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CTTAGAATTCCTAGCGACGTAATAAAAAAATAAGAAAAAAAAATCCTGGCAACTAAAGTA
GATGCATTCGTATAGTTGATATAAATACCAAAAAATGCAAGTAATTTTGGCTATGTAGAA
CAAGTTGTATTCTCATCTGACTTAGCATCATTGTGGGTATTATAATGTTACTACTCGTAA
AGATGCTGCATAATTATGTAGTTGTTTTGGATAGATGTCAATGTCATATATGAAAATGGT
TTGTGTATTTCTTGTCGCGCGATGTAAAATATTTATATGCAAAAGCTCCGACACGAGGGA
CTTTTTGGTACTCTTTCATGAAAATAGATTGTACCTTTCCAGGATCCATGGCAAATCGAA
GTTGATGAGATCTTTGCAAAGTACCTGGACCGCTAGGCTTGGAGCCAATTGAATTTTGCT
CCACCAGTAAAACCTTTGATATCTCAGGGATTATAAGTGGCCCTTCCTCAGCATGCTTGA
CTCCTCGTAGCGATTTTTCCTCCGCCGGATTATGATCTATCTCCGACAATTTTTCTATTT
CTGACTGATTGTATTCCTCCGCCTTGTCTCTTCCCGTCGAGCTAATTTCCTCCGCCGTCT
TATTTATTTCAGGCGGCCTTTCTTCCTCTGGAGGTTTATCTCCTCTGGACAGCTTCGCAA
TTTTAT

QA 1 726 1 726
DS 

RD RS1CZ70JQ 636 0 0
GGCTATGTAGAACAAGTTGTATTCTCATCTGACTTAGCATCATTGTGGGTATTATAATGT
TACTACTCGTAAAGATGCTGCATAATTATGTAGTTGTTTTGGATAGATGTCAATGTCATA
TATGAAAATGGTTTGTGTATTTCTTGTCGCGCGATGTAAAATATTTATATGCAAAAGCTC
CGACACGAGGGACTTTTTGGTACTCTTTCATGAAAATAGATTGTACCTTTCCAGGATACA
TGGCAAATCGAAGTTGATGAGATCTTTGCAAAGTACCTGGACCGCTAGGCTTGGAGCCAA
TTGAATTTTGCTCCACCAGTAAAACCTTTGATATCTCAGGGATTATAAGTGGCCCTTCCT
CCGCATG****ACTCCTCGTAGCGATTTTTCCTCCGCCGGATTATGATCTATCTCCGACA
ATTTTTCTATTTCTGACTGATTGTATTCCTCCGCCTTGTCTCTTCCCGTCGAGCTAATTT
CCTCCGCCGTCTTATTTATTTCAGGCGGCCTTTCTTCCTCTGGAGGTTTATCTCCTCTGG
ACAGCTTCGCAATTTTATCCTCGTTAGGTCGAACTCGCGCATGCATAATGGATCTAGAGT
ACTCTTCTTTCTTAATTAACTCCTTGTAGAGCCAGA

QA 1 636 1 636
DS 

RD RS1AL63JQ 542 0 0
GGT
TAGATGTCAATGTCATATATGAAAATGGTTTGTGTATTTCTTGTCGCGCGATGTAGAATA
TTTATATGCAAAAGCTCCGACACGAGGGACTTTTTGGTACTCTTTCATGAAAATAGATTG
TACCTTTCCAGGATCCATGGCAAATCGAAGTTGATGAGATCTTTGCAAAGTACCTGGACC
GCTAGGCTTGGAGCCAATTGAATTTTGCTCCACCAGTAAAACCTTTGATATCTCAGGGAT
TATAAGTGGCCCTTCCTCCGCATGCTTGACTCCTCGTAGCGATTTTTCCTCCGCCGGATT
ATGATCTATCTCCGACAATTTTTCTATTTCTGACTGATTGTATTCCTCCGCCTTGTCTCT
TCCCGTCGAGCTAATTTCCTCCGCCGTCTTATTTATTTCGGGCGGCCTTTCTTCCTCTGG
AGGTTTATCTCCTCTGGACAGCTTCCCAATTTTATCCTCGTTAGGTCGAACTCGCGCATG
CATAATGGATCTAGAGTACTCTTCTTTCTTAATTAACTCCTTGTAGAGCCAGACGAAGA

QA 4 542 4 542
DS 

RD RS1EF94TF 742 0 0
ATGTCAATGTCATATATGAAAATGGTTTGTGTATTTCT*GTCGCGCGATGTAGAATATTT
ATATGCAAAAGCTCCGACACGAGGGACTTTTTGGTACTCTTTCATGAAAATAGATTGTAC
CTTTCCAGGATCCATGGCAAATCGAAGTTGATGAGATCTTTGCAAAGTACCTGGACCGCT
AGGCTTGGAGCCAATTGAATTTTGCTCCACCAGTAAAACCTTTGATATCTCAGGGATTAT
AAGTGGCCCTTCCTCAGCATGCTTGACTCCTCGTAGCGATTTTTCCTCCGCCGGATTATG
ATCTATCTCCGACAATTTTTCTATTTCTGACTGATTGTATTCCTCCGCCTTGTCTCTTCC
CGTCGAGCTAATTTCCTCCGCCGTCTTATTTATTTCAGGCGGCCTTTCTTCCTCTGGAGG
TTTATCTCCTCTGGACAGCTTCGCAATTTTATCCTCGTTAGGTCGAACTCGCGCACGCAT
AATGGATCTAGAGTACTCTTCTTTCTTAATTAACTCCTTGTAGAGCCAGACGAAGAGGGC
GATCGCCGATGCTCCAAGCCTACCAGAAGCTAAGAACCCCGTGACCAAGAAACTCGAAGT
GATAACCGCCGTTACGAGAATCGGACTAAGAACTAAAAAAACCGGCGTCATAACCATTAA
CACCACGGCCGTACCGGCAAGTGCTAAACCGGTGAGGATCATGAGAGGCACGGCGGATAT
AGCTGCAGCATTAGCTAGCGGT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RS1AL63TF 757 0 0
TGTCAATGTCATATATGAAAATGGTTTGTGTATTTCTTGTCGCGCGATGTAGAATATTTA
TATGCAAAAGCTCCGACACGAGGGACTTTTTGGTACTCTTTCATGAAAATAGATTGTACC
TTTCCAGGATCCATGGCAAATCGAAGTTGATGAGATCTTTGCAAAGTACCTGGACCGCTA
GGCTTGGAGCCAATTGAATTTTGCTCCACCAGTAAAACCTTTGATATCTCAGGGATTATA
AGTGGCCCTTCCTCCGCATGCTTGACTCCTCGTAGCGATTTTTCCTCCGCCGGATTATGA
TCTATCTCCGACAATTTTTCTATTTCTGACTGATTGTATTCCTCCGCCTTGTCTCTTCCC
GTCGAGCTAATTTCCTCCGCCGTCTTATTTATTTCGGGCGGCCTTTCTTCCTCTGGAGGT
TTATCTCCTCTGGACAGCTTCGCAATTTTATCCTCGTTAGGTCGAACTCGCGCATGCATA
ATGGATCTAGAGTACTCTTCTTTCTTAATTAACTCCTTGTAGAGCCAGACGAAGAGGGCG
ATCGCCGATGCTCCAAGCCTACCAGAAGCTAAGAACCCCGTGACCAAGAAACTCGAAGTG
ATAACCGCCGTTACGAGAATCGGACTAAGAACTAAAAAAACCGGCGTCATAACCATTAAC
ACCACGGCCGTACCGGCAAGTGCTAAACCGGTGAGGATCATGAGAGGCACGGCGGATATA
GCTGCAGCATTAGCTAGCGGTTTATCATTTGTGCCCC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RS1CZ70TF 640 0 0
CCTTTCCAGGATACATGGCAAATCGAAGTTGATGAGATCTTTGCAAAGTACCTGGACCGC
TAGGCTTGGAGCCAATTGAATTTTGCTCCACCAGTAAAACCTTTGATATCTCAGGGATTA
TAAGTGGCCCTTCCTCCGCATG****ACTCCTCGTAGCGATTTTTCCTCCGCCGGATTAT
GATCTATCTCCGACAATTTTTCTATTTCTGACTGATTGTATTCCTCCGCCTTGTCTCTTC
CCGTCGAGCTAATTTCCTCCGCCGTCTTATTTATTTCAGGCGGCCTTTCTTCCTCTGGAG
GTTTATCTCCTCTGGACAGCTTCGCAATTTTATCCTCGTTAGGTCGAACTCGCGCATGCA
TAATGGATCTAGAGTACTCTTCTTTCTTAATTAACTCCTTGTAGAGCCAGACGAAGAGGG
CGATCGCCGATGCTCCAAGCCTACCAGAAGCTAAGAACCCCGTGACCAAGAAACTCGAAG
TGATAACCGCCGTTACGAGAATCGGACTAAGAACTAAAAAAACCGGCGTCATAACCATTA
ACACCACGGCCGTACCGGCAAGTGCTAAACCGGTGAGGATCATGAGAGGCACGGCGGATA
TAGCTGCAGCATTAGCTAGCGGTTTATCATTTGTGCCCCC

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 8

CO CL535Contig1 1113 8 21 U
GGGTCGTCTTCGCAGCTTCTCTCTTTCAAGATATAACGAGACCGAACCAGATCTTGTTCT
AGATCCGTTCCCATTCATCATCATGTCTCTGTTTCTTAAGGACGATTCGATCCAAATCCG
CGAGGTATGGAGCGAAAATCTCGAAGAAGAAATGGCTCTGATTCGCGAAATCGTCGACGA
CTTCCCTTACGTCGCGATGGACACCGAGTTCCCGGGAGTCGTCTTTAGACCGATCAAAGA
TATCAAATCCGCCGCCCATTATCATTACGAAACACTGAGGAGGAACGTCAACCTGCTCAA
GTTGATTCAGCTCGGCCTCACGTTCTCCGACGAGAAAGGGAACCTCCCGGCTTGCGGTCC
CGACGGCAAGTACTGCATCTGGCAGTTCAACTTCCGCGAGTTCGATCTCACCTGCTCCAT
CTACGCTCCCGACTCCATCAAGCTTCTCCGTGAAGCAGGTATCGATTTCCATAAAAACCA
CAAAGACGGCGTCGATTCGAAACGCTTTGCAGAGCTTTTTCGGTCTTCGGGGGTCGTGTT
GAACGAGCAGGTTCACTGGGTTACGTTTCACGGCCTGTACGATTTTGCTTACTTGCTGAA
GGTATTGATGGAGACGGATCTGCCGGAGACGCCGAA*GGGATTCGATGAGATGATTAAGG
TGTATTTCCCGACGGTTTACGACATTAAGCACTTGATGAAGTTCTTCGATTACCGTGGTG
GTTTGAGCAAGTTGGGGGAACTGCTTGAAGTTGAGCGTTTGGGGATTTCTCACCAGGCCG
GATCGGATAGCTTGTTAACTTCCCGTGCATGTATGAGTATGCAGGAGAATCTCTTTAATG
GTTCTGTGGCGGAGAAATACTCTGGTGTTTTGCATGGATTTGGTGTTGAAAATGGTAACT
GAAACACTAGAAATATATTCTTCTATGTTATAAATAAATTTATTTAGATTCATGTTTATA
TGTTTGTGTTGTGTGAATGCTATAATCTCCCTCTTCGTTCTGCTTTGTCTCCATGGATTG
TATTTGGGTTTGTACTGTGTGCTCTGGCTTTGAATAAGTCCCCTTTGTATAATGTGTTAT
TTGTAATATAATCATCAAGTGTTTGTGTTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 30 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DE70TF U 96
AF RS1GQ67TF U 1
AF RS1BJ40TF U 4
AF RS1A728TF U 1
AF RS1DE70JQ C 441
AF RS1BJ40JQ C 212
AF RS1A728JQ C 416
AF RS1GQ67JQ C 537
BS 1 87 RS1A728TF
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BS 89 636 RS1A728TF
BS 637 637 RS1DE70TF
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BS 660 824 RS1A728TF
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BS 830 851 RS1A728TF
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BS 871 871 RS1BJ40JQ
BS 872 886 RS1A728TF
BS 887 887 RS1BJ40JQ
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BS 911 970 RS1BJ40JQ
BS 971 1113 RS1A728JQ

RD RS1DE70TF 555 0 0
G
TAAGGACGATTCGATCCAAATCCGCGAGGTATGGAGCGAAAATCTCGAAGAAGAAATGGC
TCTGATTCGCGAAATCGTCGACGACTTCCCTTACGTCGCGATGGACACCGAGTTCCCGGG
AGTCGTCTTTAGACCGATCAAAGATATCAAATCCGCCGCCCATTATCATTACGAAACACT
GAGGAGGAACGTCAACCTGCTCAAGTTGATTCAGCTCGGCCTCACGTTCTCCGACGAGAA
AGGGAACCTCCCGGCTTGCGGTCCCGACGGCAAGTACTGCATCTGGCAGCTCAACTTCCG
CGAGTTCGATCTCACCTGCTCCATCTACGCTCCCGACTCCATCAAGCTTCTCCGTGAAGC
AGGTATCGATTTCCATAAAAACCACAAAGACGGCGTCGATTCGAAACGCTTTGCATAGCT
TTTTCGGTCTTCGGGGGTCGTGTTGAACGAGCAGGTTCACTGGGTTACGTTTCACGGCCT
GTACGATTTTGCTTACTTGCTGAAGGTATTGATGGAGACGGATCTGCCGGAGACGCCGAA
*GGGATTCGATGAG

QA 2 555 2 555
DS 

RD RS1GQ67TF 772 0 0
GGGTC
GTCTTCGCAGCTTCTCTCTTTCAAGATATAACGAGACCGAACCAGATCTTGTTCTAGATC
CGTTCCCATTCATCATCATGTCTCTGTTTCTTAAGGACGATTCGATCCAAATCCGCGAGG
TATGGAGCGAAAATCTCGAAGAAGAAATGGCTCTGATTCGCGAAATCGTCGACGACTTCC
CTTACGTCGCGATGGACACCGAGTTCCCGGGAGTCGTCTTTAGACCGATCAAAGATATCA
AATCCGCCGCCCATTATCATTACGAAACACTGAGGAGGAACGTCAACCTGCTCAAGTTGA
TTCAGCTCGGCCTCACGTTCTCCGACGAGAAAGGGAACCTCCCGGCTTGCGGTCCCGACG
GCAAGTACTGCATCTGGCAGTTCAACTTCCGCGAGTTCGATCTCACCTGCTCCATCTACG
CTCCCGACTCCATCAAGCTTCTCCGTGAAGCGGGTATCGATTTCCATAAAAACCACAAAG
ACGGCGTCGATTCGAAACGCTTTGCAGAGCTTTTTCAGTCTTCGGGGGTCGTGTTGAACG
AGCAGGTTCACTGGGTTACGTTTCACGGCCTGTACGATTTTGCTTACTTGCTGAAGGTAT
TGATGGAGACGGATCTGCCGGAGACGCCGAA*GGGATTCGATGAGATGATTAA*GTGTAT
TTCCCGACG*TTTACGACATTAAGCACTTGATGAG**TCTTCGATTACCGTGGTGGTTTG
AGCAAGTTGGGG**ACTGCTTGAAGT*GAGCGTTTGGGGATTTCTCA

QA 6 772 6 772
DS 

RD RS1BJ40TF 744 0 0
GG
GTCTTCGCAGCTTCTCTCTTTCAAGATATAACGAGACCGAACCAGATCTTGTTCTAGATC
CGTTCCCATTCATCATCATGTCTCTGTTTCTTAAGGACGATTCGATCCAAATCCGCGAGG
TATGGAGCGAAAATCTCGAAGAAGAAATGGCTCTGATTCGCGAAATCGCCGACGACTTCC
CTTACGTCGCGATGGACACCGAGTTCCCGGGAGTCGTCTTTAGACCGATCAAAGATATCA
AATCCGCCGCCCATTATCATTACGAAACGCTGAGGAGGAACGTCAACCTGCTCAAGTTGA
TTCAGCTCGGCCTCACGTTCTCCGACGAGAAAGGGAACCTCCCGGCTTGCGGTCCCGACG
GCAAGTACTGCATCTGGCAGTTCAACTTCCGCGAGTTCGATCTCACCTGCTCCATCTACG
CTCCCGACTCCATCAAGCTTCTCCGTGAAGCAGGTATCGATTTCCATAAAAACCACAAAG
ACGGCGTCGATTCGAAACGCTTTGCAGAGCTTTTTCGGTCTTCGGGGGTCATGTTGAACG
AGCAGGTTCACTGGGTTACGTTTCACGGCCTGTACGATTTTGCTTACTTGCTGAAGGTAT
TGATGGAGACGGATCTGCCGGAGACGCCGAA*GGGATTCGATGAGATGATTAAGGTGTAT
TTCCCGACGGTTTACGACATTAAGCACTTGATGAAG*TCTTCGATTACCGTGGTGGTTTG
AGCAAGTTGGGG*AACTGCTTG

QA 3 744 3 744
DS 

RD RS1A728TF 910 0 0
GGGTCGTCTTCGCAGCTTCTCTCTTTCAAGATATAACGAGACCGAACCAGATCTTGTTCT
AGATCCGTTCCCATTCATCATCATGTCCCTGTTTCTTAAGGACGATTCGATCCAAATCCG
CGAGGTATGGAGCGAAAATCTCGAAGAAGAAATGGCTCTGATTCGCGAAATCGTCGACGA
CTTCCCTTACGTCGCGATGGACACCGAGTTCCCGGGAGTCGTCTTTAGACCGATCAAAGA
TATCAAATCCGCCGCCCATTATCATTACGAAACACTGAGGAGGAACGTCAACCTGCTCAA
GTTGATTCAGCTCGGCCTCACGTTCTCCGACGAGAAAGGGAACCTCCCGGCTTGCGGTCC
CGACGGCAAGTACTGCATCTGGCAGTTCAACTTCCGCGAGTTCGATCTCACCTGCTCCAT
CTACGCTCCCGACTCCATCAAGCTTCTCCGTGAAGCAGGTATCGATTTCCATAAAAACCA
CAAAGACGGCGTCGATTCGAAACGCTTTGCAGAGCTTTTTCGGTCTTCGGGGGTCGTGTT
GAACGAGCAGGTTCACTGGGTTACGTTTCACGGCCTGTACGATTTTGCTTACTTGCTGAA
GGTATTGATGGAGACGGATCTGCCGGAGACGCCGAAAGGGATTCGATGAGATGATTAAAG
TGTATTTCCCGACGGTTTACGACATTAAGCACTTGATGAAGTTCTTCGATTACCGTGGTG
GTTTGAGCAAGTTGGGGGAACTGCTTGAAGTTGAGCGTTTGGGGATTTCTCACCAGGCCG
GATCGGATAGCTTGTTAACTTCCCGTGCATGTATGAGTATGCAG*AGA*TCTCTTTAATG
GTTCTGTGGCG*AGAA*TACTCTGGTGTTT*GCATGGATTTGGTGT*GAAAATGGTAACT
GAAACACTAG

QA 1 910 1 910
DS 

RD RS1DE70JQ 517 0 0
AGCTTCTCCGTGAAGCAGGTATCGATTTCCATAAAAACCACAAAGACGGCGTCGATTCGA
AACGCTTTGCATAGCTTTTTCGGTCTTCGGGGGTCGTGTTGAACGAGCAGGTTCACTGGG
TTACGTTTCACGGCCTGTACGATTTTGCTTACTTGCTGAAGGTATTGATGGAGACGGATC
TGCCGGAGACGCCGAA*GGGATTCGATGAGATGATTAAGGTGTATTTCCCGACGGTTTAC
GACATTAAGCACTTGATGAAGTTCTTCGATTACCGTGGTGGTTTGAGCAAGTTGGGGGAA
CTGCTTGAAGTTGAGCGTTTGGGGATTTCTCACCAGGCCGGATCGGATAGCTTGTTAACT
TCCCGTGCATTTATGAGTATGCAGGAGAATCTCTTTAATGGTTCTGTGGCGGAGAAATAC
TCTGGTGTTTTGCATGGATTTGGTGTTGAAAATGGTAACTGAAACACTAGAAATATATTC
TTCTATGTTATAAATAAATTTATTTAGATTCATGTTT

QA 1 517 1 517
DS 

RD RS1BJ40JQ 759 0 0
CCGGGAGTCGTCTTTAGACCGATCAAAGATATCAAATCCGCCGCCCATTATCATTACGAA
ACGCTGAGGAGGAACGTCAACCTGCTCAAGTTGATTCAGCTCGGCCTCACGTTCTCCGAC
GAGAAAGGGAACCTCCCGGCTTGCGGTCCCGACGGCAAGTACTGCATCTGGCAGTTCAAC
TTCCGCGAGTTCGATCTCACCTGCTCCATCTACGCTCCCGACTCCATCAAGCTTCTCCGT
GAAGCAGGTATCGATTTCCATAAAAACCACAAAGACGGCGTCGATTCGAAACGCTTTGCA
GAGCTTTTTCGGTCTTCGGGGGTCATGTTGAACGAGCAGGTTCACTGGGTTACGTTTCAC
GGCCTGTACGATTTTGCTTACTTGCTGAAGGTATTGATGGAGACGGATCTGCCGGAGACG
CCGAA*GGGATTCGATGAGATGATTAAGGTGTATTTCCCGACGGTTTACGACATTAAGCA
CTTGATGAAGTTCTTCGATTACCGTGGTGGTTTGAGCAAGTTGGGG*AACTGCTTGAAGT
TGAGCGTTTGGGGATTTCTCACCAGGCCGGATCGGATAGCTTGTTAACTTCCCGTGCATT
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GCATGGATTTGGTGTTGAAAATGGTAACTGAAACACTAGAAATATATTCTTCTATGTTAT
AAATAAATTTATTTAGATTCATGTTTATATGTTTGTGTT

QA 1 759 1 759
DS 

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AACCACAAAGACGGCGTCGATTCGAAACGCTTTGCAGAGCTTTTTCGGTCTTCGGGGGTC
GTGTTGAACGAGCAGGTTCACTGGGTTACGTTTCACGGCCTGTACGATTTTGCTTACTTG
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TGGTGGTTTGAGCAAGTTGGGGGAACTGCTTGAAGTTGAGCGTTTGGGGATTTCTCACCA
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TAATGGTTCTGTGGCGGAGAAATACTCTGGTGTTTTGCATGGATTTGGTGTTGAAAATGG
TAACTGAAACACTAGAAATATATTCTTCTATGTTATAAATAAATTTATTTAGATTCATGT
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GATTGTATTTGGGTTTGTACTGTGTGCTCTGGCTTTGAATAAGTCCCCTTTGTATAATGT
GTTATTTGTAATATAATCATCAAGTGTTTGTGTTCTTC

QA 1 698 1 698
DS 

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TGAAGGTATTGATGGAGACGGATCTGCCGGAGACGCCGAA*GGGATTCGATGAGATGATT
AAGGTGTATTTCCCGACGGTTTACGACATTAAGCACTTGATGAAGTTCTTCGATTACCGT
GGTGGTTTGAGCAAGTTGGGGGAACTGCTTGAAGTTGAGCGTTTGGGGATTTCTCACCAG
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AATGGTTCTGTGGCGGAGAAATACTCTGGTGTTTTGCATGGATTTGGTGTTGAAAATGGT
AACTGAAACACTAGAAATATATTCTTCTATGTTATAAATAAATTTATTTAGATTCATGTT
TATATGTTTGTGTTGTGTGAATGCTATAATCTCCCTCTTCGTTCTGCTTTGTCTCCATGG
ATTGTATTTGGGTTTGTACTGTGTGCTCTGGCTTTGAATAAGTCCCCTTTGTATAATGTT
TTATTTGTAATATAATCATCAAGTGTTTGTG
CT

QA 1 571 1 571
DS 



AS 1 4

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CTACAAGAAATCAAAAACCATCCATAAACTCATAAGACTTGACAATGCAGCTACTAATAG
ACAAGATTAGGCTCAAACTCGGCGAAATCAACAGATCCAGACTCAACAGGAGGCATGAGA
TACGCAGCCAAGATCTCAGAGACTAAACCAGCAATGAGAGGAATCCTCTTGAGGTTCTTG
ACAAAGGAAGGATCATCGGTTTGTCCTACAGCCATCAGCTTCTCATTGATCACAACCATT
CTATCTAGCTTCCTCTTGAACTCAGGGTTCTCAACATCCAACACAGCTGGGAATATCCTT
GCCGTGGTCCGGTTTGTCTCAATGATGACGTGCATGTCAAACTCCTTGGTGTTTAACCCA
ATACCCTCGTAAAAATCAGTTCTTTGACAATCGTTGAGGTACATGGTCACATAAACCGAG
AGGCAGAAGAAACGAGACCAGAGCTTGGCTTGCCAGTCATTGAGGAACTGAGGCTGAGCT
TTCATCAAAGCAGAGAAGAAATCTCCATGACGGTTCTCGTCTTGGCACCAGTTCTCAAAG
TACTTGAAGATAGGGTAACATTGGAACTCAGGGTTTTGCTTGAGGTGTCTGTAGATTGTG
ATGTATCTCCAGTACCCGATTTTCTCGGACAAGTAAGTGGCGTAGAAGATGAACTTGGGT
TTGAAGAAAGTGTATTTCCTTGCCTTTGTCAAGAAACCCAAGTCAAGAGCCAAGTTGAAA
TCAGACAAACCCTTGTTCAAGAACCCGGCATGTCTTGCTTCATCTCTGGACATAAGAGAG
AAGATCTCAGCCACAACAGGGTTTGTTTTCTTGAGCCTTCTACCAAGCTCCTTGTAGAGA
AGGAAACCAGAGAACTCAGCAGTACAAGACCGCTCAAGAAACTCAACGAAGATCTGTCTT
AGAGGACCCTGCAACTTGTCCGCTGCTTCTTTGAACTCCTTGTTCCTCACGAAATGTGCC
TGATTGTAATCAGTCTTAAACTCTTGAAGCAGAGCAATGAACTCTTCATCGTTAAGGTTC
TTGTTGATCTCCGTGTTGAAAAGCTGCTCCATCTCCTCGAAGTCCGTAGTGTAGAACCTC
GGTGTCAGAAGCGACTCGTTAATCTCCTTCTTCGTGCCCTTCTTGGACTTAGAGGTTGCG
GTGGCCGGAGGCGGCGGCGTGGAGGTGGCTGACATTCTGATCACGGTGGAGAAACGTCGG
CTGGTGAGGCATGTCCTTGAGTTAGAGAGCTTTGGAGATGCGAATTGGGAGATTGGCTTC
ACTAACATCATTTCAGCTGCCATTGTTAGAGTTGCAGAAGCAATAGAGAGAGAGAGAGCG
AGGAGCTAGAGGAAGAAGATCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H318JQB U 1
AF RS1B063JQ U 2
AF RS1H318TF C 104
AF RS1DH01TF C 606
BS 1 554 RS1H318JQB
BS 555 888 RS1H318TF
BS 889 1402 RS1DH01TF

RD RS1H318JQB 556 0 0
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ACAAAGGAAGGATCATCGGTTTGTCCTACAGCCATCAGCTTCTCATTGATCACAACCATT
CTATCTAGCTTCCTCTTGAACTCAGGGTTCTCAACATCCAACACAGCTGGGAATATCCTT
GCCGTGGTCCGGTTTGTCTCAATGATGACGTGCATGTCAAACTCCTTGGTGTTTAACCCA
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AGGCAGAAGAAACGAGACCAGAGCTTGGCTTGCCAGTCATTGAGGAACTGAGGCTGAGCT
TTCATCAAAGCAGA
AA

QA 1 554 1 554
DS 

RD RS1B063JQ 556 0 0
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TACAAGAAATCAAAAACCATCCATAAACTCATAAGACTTGACAATGCAGCTACTAATAGA
CAAGATTAGGCTCAAACTCGGCGAAATCAACAGATCCAGACTCAACAGGAGGCATGAGAT
ACGCAGCCAAGATCTCAGAGGCTAAACCAGCAATGAGAGGAATCCTCTTGAGGTTCTTGA
CAAAGGAAGGATCATCGGTTTGTCCTACAGCCATCAGCTTCTCATTGATCACAACCATTC
TATCTAGCTTCCTCTTGAACTCAGGGTTCTCAACATCCAACACAGCTGGGAATATCCTTG
CCGTGGTCCGGTTTGTCTCAATGATGACGTGCATGTCAAACTCCTTGGTGTTTAACCCAA
TACCCTCGTAAAAATCAGTTCTTTGACAATCGTTGAGGTACATGGTCACATAAACCGAGA
GGCAAAAAAAACGAGACCAGAGCTTGGCTTGCCAGTCATTGAGGAACTGAGGCTGAGCTT
TCATCAAAGCA
AAGAA

QA 1 551 1 551
DS 

RD RS1H318TF 785 0 0
AAT
GCAGCTACTAATAGACA*GATTAGGCTCAAACTCGGCGAAATCAACAGATCCAGACTCAA
CAGGAGGCATGAGATACGCAGCCAAGATCTCAGAGACTAAACCAGCAATGAGAGGAATCC
TCTTGAGGTTCTTGACAAAGGAAGGATCATCGGTTTGTCCTACAGCCATCAGCTTCTCAT
TGATCACAACCATTCTATCTAGCTTCCTCTTGAACTCAGGGTTCTCAACATCCAACACAG
CTGGGAATATCCTTGCCGTGGTCCGGTTTGTCTCAATGATGACGTGCATGTCAAACTCCT
TGGTGTTTAACCCAATACCCTCGTAGAAATCAGTTCTTTGACAATCGTTGAGGTACATGG
TCACATAAACCGAGAGGCAGAAGAAACGAGACCAGAGCTTGGCTTGCCAGTCATTGAGGA
ACTGAGGCTGAGCTTTCATCAAAGCAGAGAAGAAATCTCCATGACGGTTCTCGTCTTGGC
ACCAGTTCTCAAAGTACTTGAAGATAGGGTAACATTGGAACTCAGGGTTTTGCTTGAGGT
GTCTGTAGATTGTGATGTATCTCCAGTACCCGATTTTCTCGGACAAGTAAGTGGCGTAGA
AGATGAACTTGGGTTTGAAGAAAGTGTATTTCCTTGCCTTTGTCAAGAAACCCAAGTCAA
GAGCCAAGTTGAAATCAGACAAACCCTTGTTCAAGAACCCGGCATGTCTTGCTTCATCTC
TGGACATAAGAGAGAAGATCTCAGCCACAACAGGGTTTGTTTTCTTGAGCCTTCTACCAA
GC

QA 4 785 4 785
DS 

RD RS1DH01TF 797 0 0
GAAGATAGGGTAACATTGGAACTCAGGGTTT*GCTTGAGGTGTCTGTAGATTGTGATGTA
TCTCCAGTACCCGATTT*CTCGGACAAGTAAGTGGCGTAGAAGATGAACTTGGGTTTGAA
GAAAGTGTATTTCCTTGCCTTTGTCAAGAAACCCAAGTCAAGAGCCAAGTTGAAATCAGA
CAAACC*TTGTTCAAGAACCCGGCATGTCTTGCTTCATCTCTGGACATAAGAGAGAAGAT
CTCAGCCACAACAGGGTTTGTTTTCTTGAGCCTTCTACCAAGCTCCTTGTAGAGAAGGAA
ACCAGAGAACTCAGCAGTACAAGACCGCTCAAGAAACTCAACGAAGATCTGTCTTAGAGG
ACCCTGCAACTTGTCCGCTGCTTCTTTGAACTCCTTGTTCCTCACGAAATGTGCCTGATT
GTAATCAGTCTTAAACTCTTGAAGCAGAGCAATGAACTCTTCATCGTTAAGGTTCTTGTT
GATCTCCGTGTTGAAAAGCTGCTCCATCTCCTCGAAGTCCGTAGTGTAGAACCTCGGTGT
CAGAAGCGACTCGTTAATCTCCTTCTTCGTGCCCTTCTTGGACTTAGAGGTTGCGGTGGC
CGGAGGCGGCGGCGTGGAGGTGGCTGACATTCTGATCACGGTGGAGAAACGTCGGCTGGT
GAGGCATGTCCTTGAGTTAGAGAGCTTTGGAGATGCGAATTGGGAGATTGGCTTCACTAA
CATCATTTCAGCTGCCATTGTTAGAGTTGCAGAAGCAATAGAGAGAGAGAGAGCGAGGAG
CTAGAGGAAGAAGATCC

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 6

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GGTTAAGATTTTTACATCCAAGATGCTGCAGTATTTTTGGGAAAAAGAGAAACCGAGAAC
AAGAAGACAAACAAGAGTGTACTTTGCGTAATAAACCGTAAAGCCATGTCTAAAAAGAGC
AGCAGTAGCTCGATGAAGCACTGCTTGTTTGTGCTGGGTTCTGTTTGAAGATGTTCTTCT
TCCCTCCAGACGAACCTTCAGCAGTAAGACTAGGCGTTTCCAAAATCTTAAGAACAAGCT
CTTCGAAACATTGCTCAACGTTGACACGAGTCTTTGCACTACACTCGAGAAACAAACATC
CGTACTGCCGAGCAAAGTCTATGCCTTCTTTTTTAGAGACAGCTCTTTCACTCTCCTTGT
CGACTTTATTGCCAACAAGCATCTTGATGCAATCCTGATTAGTCGAGTAAAGGTCGATTT
CCTTGGCCCATATATCTGATAGATTTGTGAATGTGTCTCGTCGTGTCACATCATACACCA
TTATAATGCCCTGAGCTCCTCTGTAATATGAACTTGTTAGCGTCCTAAACCTCTCTTGCC
CAGCTGTATCCCAAATGGCAAGCTTGAGTTTCTTGTCTCCAATGGTAAGATACTTAACCT
TAAAATCCACACCTATAGTGGGAGACAGATCATCAAAGGTATTAGATGTGAAACTCAACA
AGAGAGAGCTTTTCCCAACACCAGAATCTCCGATCAACAACACTTTGAACAAGTAATCAA
ATTCTGCTTGCCCCGACGACGTACCCATCGCAAAAAAAACAATCAATCAAACAAACACAA
ACTTTGAATCGATTGCGTAAACTTTCCTCGAGATCTGCGATAAGAATGACAAAGATACAG
ACGGACAGACAGGGGAAAAAAAAGCCGAAGAAAATCTCAGAAACAGGGAAAGAGAGAGAT
GCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1G720JQ U 1
AF RS1A707JQ U 44
AF RS1CU26JQ U 172
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TCCCTCCAGACGAACCTTCAGCAGTAAGACTAGGCGTTTCCAAAATCTTAAGAACAAGCT
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CCTTGGCCCATATATCTGATAGATTTGTGAATGTGTCTCGTCGTGTCACATCATACACCA
TTATAATGCCCTGAGCTCCTCTGTAATATGAACTTGTTAGCGTCCTAAACCTCTCTTGCC
CAGCTGTATCCCAAATGGCAAGCTTGAGTTTCTTGTCTCCAATGGTAAGATACTTAACCT
TAAAATCCACACCTATAG

QA 1 678 1 678
DS 

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CGAGTAAAGGTCGATTTCCTTGGCCCATATATCTGATAGATTTGTGAATGTGTCTCGTCG
TGTCACATCATACACCATTATAATGCCCTGAGCTCCTCTGTAATATGAACTTGTTAGCGT
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TTTGAACAAGTAATCAAATTCTGCTTGCCCCGACGACGTACCCATCGCA

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DS 

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AAG
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TCTTCTTCCCTCCAGACGAACCTTCAGCAGTAAGACTAGGCGTTTCCAAAATCTTAAGAA
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CGATTTCCTTGGCCCATATATCTGATAGATTTGTGAATGTGTCTCGTCGTGTCACATCAT
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CTTGCCCAGCTGTATCCCAAATGGCAAGCTTGAGTTTCTTGTCTCCAATGGTAAGATACT
TAACCTTAAAATCCACACCTATAGTGGGAGACAGATCATCAAAGGTATTAGATGTGAAAC
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TTTGGGAAAAGAGA
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CTCTCTTGCCCAGCTGTATCCCAAATGGCAAGCTTGAGTTTCTTGTCTCCAATGGTAAGA
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AAACTCAACAAGAGAGAGCTTTTCCCAACACCAGAATCTCCGATCAACAACACTTTGAAC
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ACAAACACAAACTTTGAATCGATTGCGTAAACTTTCCTCGAGATTTGCGATAAGAATGAC
AAAGATACAGAC
GGCC

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CAGACGAA
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CAACGTTGACACGAGTCTTTGCACTACACTCGAGAAACAAACATCCGTACTGCCGAGCAA
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ACGACGTACCCATCGCAAAAAAAACAATCAATCAAACAAACACAAACTTTGAATCGATTG
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GGACAGACAGGGCC

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AGACG
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CTCAACGTTGACACGAGTCTTTGCACTACACTCGAGGAACAAACATCCGTACTGCCGAGC
AAAGTCTATGCCTTCTTTTTTAGAGACAGCTCTTTCACTCTCCTTGTCGACTTTATTGCC
AACAAGCATCTTGATGCAATCCTGATTAGTCGAGTAAAGGTCGATTTCCTTGGCCCATAT
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AGCTCCTCTGTAATATGAACTTGTTAGCGTCCTAAACCTCTCTTGCCCAGCTGTATCCCA
AATGGCAAGCTTGAGTTTCTTGTCTCCAATGGTAAGATACTTAACCTTAAAATCCACACC
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CCCAACACCAGAATCTCCGATCAACAACACTTTGAACAAGTAATCAAATTCTGCTTGCCC
CGACGACGTACCCATCGCAAAAAAAACAATCAATCAAACAAACACAAACTTTGAATCGAT
TGCGTAAACTTTCCTCGAGATCTGCGATAAGAATGACAAAGATACAGACGGACAGACAGG
GGAAAAAAAAGCCGAAGAAAATCTCAGAAACAGGGAAAGAGAGAGATGCCC

QA 6 716 6 716
DS 



AS 2 8

CO CL538Contig1 710 4 8 U
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CGTGACTCAATCCACAAGAGGCGTGCCACTGGAGGCAAGCAGAAGGGATGGAGGAAGAAG
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AACTACTCTTGGGGAAGTGAGGCAGTTACCCGCAAGACCAGAGTTCTTGATGTTGTCTAC
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TGGATACATTCTGGAAGGTAAAGAGCTGGAATTCTACCAGAAGAAGATCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E323TF U 1
AF RS1DA20TF U 1
AF RS1CX88TF U 7
AF RS1CF23TF U 114
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GGATCTCC
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AATCCACAAGAGGCGTGCCACTGGAGGCAAGCATAAGGGATGGAGGAAGAAGCGAAAGTA
CGAGATGGGAAGGCAGCCAGCCAACACCAAGTTGTCCAGCAACAAGACGGTCAGAAGAAT
CCGTGTTCGTGGAGGCAACGTCAAGTGGCGTGCGTTGAGGCTCGATACTGGTAACTACTC
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DS 

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AACTACTCTTGGGGAAGTGAGGCAGTTACCCGCAAGACCAGAGTTCTTGATGTTGTCTAC
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GG
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CCGTGTTCGTGGAGGCAACGTCAAGTGGCGTGCGTTGAGGCTCGATACTGGTAACTACTC
TTGGGGAAGTGAGGCAGTTACCCGCAAGACCAGAGTTCTTGATGTTGTCTACAACGCCTC
CAACAACGAGCTTGTCCGTACAAAGACGCTAGTCAAGAGTGCTATTGTTCAGGTGGATGC
CGCTCCCTTCAAGCAGTGGTATCTCCAGCACTATGGTGTCGAGGTTGGTCGCAAGAAGAA
GAATGCTGCGTCCGCTGCCAAGAAGGAAGCAGAGGATGGTGGAGAAGCAGCTCCAGCTGC
TGCTGCTGCTGCTGCTGCTCCTGAGGAGGTGAAGAAGAGCAACCACGTGCTGAGAAAGAT
TGAGAGCCGTCAAGAGGG*ACGAAGTCTTGATTCCCACATTGAGGACCAGTTTGCGAGCG
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TTCTGGAAG
TAA

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DS 

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GACGGTCAGAAGAATCCGTGTTCGTGGAGGCAACGTCAAGTGGCGTGCGTTGAGGCTCGA
TACTGGTAACTACTCTTGGGGAAGTGAGGCAGTTACCCGCAAGACCAGAGTTCTTGATGT
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TGGTCGCAAGAAGAAGAATGCTGCGTCCGCTGCCAAGAAGGAAGCAGAGGATGGTGAAGA
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DS 



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ACACAGTATTACAAACTGAAACCTCAAAACAGCATGTATAAAGAAAACAAAAAGGTTTCA
GGCAAAAGAACAAGCTTTTAAGCAGCACCCTTTCCCTTCTTCTTCTGGATCTTCTTCTGG
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CTTGATGAGATGCAAGCCAACAAACGAACGCTCGCAAACTGGTCCTCAATGTGGGAATCA
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CTGGAGATACCACTGCTTGAAGGGAGCATGTTCTTGTTATTGTAAGCGAGCATCCTATGA
GGTTTGCAGAAACCTTAACAGTCGCAGGCTGTCCCAGCTGAATTGTATGCTGGTGAAGGA
AGTAGCGGACGTAGTCAGAGACAACCTGAGAATCAGCAGCCGATCCAGAACGGCAGACGT
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TGATGGATTGGCTACTGATTAGAAGGGTGAAGAAGAAGAAGAACTGACTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E323JQ U 1
AF RS1GT61TF C 71
AF RS1BM76JQ U 23
AF RS1BM76TF C 241
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CTCC
CC

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DS 

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DS 

RD RS1BM76TF 772 0 0
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TGATGGATTGGCTACTGATTAGAAGGGTGAAGAAGAAGAAGAACTGACTTCC

QA 1 772 1 772
DS 



AS 2 8

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CAATGGGACAAGATAAAATTAAAATAACCTTTAAAAACAAATCTCAAATCATGGAGGATT
GGACGCTCAACTGCTTCACTCTACTTTTCCAGGGGGGACCCGTCTCAATACCCTCGTATT
TAACTTAATGTATAATTGATAATGCACATAACAAATGTTTTAAAATCTTTTTGTTTGTAT
GTTTCGCTTAACATTCTGGTGTTTGGGTATGGTCTCTTTTAGGGTCATGGCAATAGTTAT
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TCCTTCCATTTTCCGTGGCCCAGTCCGATGCATCCCATATCGATCCGTACAACCACATCG
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CGTAGAATACAATTTGATTAGTGTTCCACAAAATTGCGTAATGGTGGAAATCTTGAGTAG
GGTCGAACCACAAATTGAATTTCATTTCTCTCCCAATAACATTTCGGTCACCACTTCCTC
TGACGAATACGTTCGTCTGAAGGCTATATGGTTTCCCGGGCGTTGTTCCTAGAAATTCGA
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TGTTAGGAATGTTAATAACGCCATTAGTTCATGTATTTTGATTAAAAATTAGTTTATCTC
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TGGAGCTTAATGGAAGCACCAAAGTAGCCCGACTCGTAAGAACGAAGAGACTTGAATCCA
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TAGTATCCCGGCGAAGGAGAACGTTGGCTGTAGCCACTAGCACACAACACTAAGAAAGTT
GAAAGAATAAGAGGAAAAGCCATTTGGAGAGAGTGAAGTAAAGTCTTTTGAGTGGTTACT
AGAAAAGGGGTAATAGATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 15 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1AK47JQ U 1
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AF RS1B683JQ U 204
AF RS1B121JQ U 204
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BS 1 152 RS1AK47JQ
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RD RS1AK47JQ 552 0 0
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CAATGGGACAAGATAAAATTAAAATAACCTTTAAAAACAAATCTCAAATCATGGAGGATT
GGACGCTCAACTGCTTCACTCTACTTTTCCAGTGTGGACCCGTCTCAATACCCTCGTATT
TAACTTAATGTATAATTGATAATGCACATAACAAATGTTTTAAAATCTTTTTGTTTGTAT
GTTTCGCTTAACATTCTGGTGTTTGGGTATGGTCTCTTTTAGGGTCATGGCAATAGTTAT
AGACCAAGAAGTTCCTCTGTGCCCATGCCATAGCCCCCCTTTGTTGATTGCTTAACCCTC
GACTCCCCATAGGTGAAGCCGATGGCGGTGTACATGAGCTAAACCCGTCTGCTGTGCATC
CCGCTAACTTAAAGTTTGTGTACTTAGCAATAAATGGTTGGTATCGATAGTCGGCTTTGA
TTCTTCCATTTTCCGTGGCCCAGTCCGATGCATCCCATATCGATCCGTACAACCACATCG
GTCTTGTAGGGA

QA 1 552 1 552
DS 

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AAATTAAAATAACCTTTAAAAACAAATCTCAAATCATGGAGGATTGGACGCTCAACTGCT
TCACTCTACTTTTCCAGGGGGGACCCGTCTCAATACGCTCGTATTTAACTTAATGTATAA
TTGATAATGCACATAACAAATGTTTTAAAATCTTTTTGTTTGTATGTTTCGCTTAACATT
CTGGGGTTTGGGTATGGTCTCTTTTAGGGTCATGGCAATAGTTATAGACCAAGAAGTTCC
TCTGTGCCCATGCCATAGCCCCCCTTTGTTGATTGCTTAACCCTCGACTCCCCATAGGTG
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TTGTGTACTTAGCAATAAATGGTTGGTATCGATAGTCGGCTTTGATCCTTCCATTTTCCG
TGGCCCAGTCCGATGCATCCCATATCGATCCGTACAACCACATCGGTCTTGTAGGGA

QA 1 537 1 537
DS 

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TGGGTATGGTCTCTTTTAGGGTCATGGCAATAGTTATAGACCAAGAAGTTCCTCTGTGCC
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GGCGGTGTACATGAGCTAGACCCGTCTGCTGTGCATCCCGCTAACTTAAAGTTTGTGTAC
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GTAGCCCGACTCGTA
GAACGA

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TGGGTATGGTCTCTTTTAGGGTCATGGCAATAGTTATAGACCAAGAAGTTCCTCTGTGCC
CATGCCATAGCCCCCCTTTGTTGATTGCTTAACCCTCGACTCCCCATAGGTGAAGCCGAT
GGCGGTGTACATGAGCTAGACCCGTCTGCTGTGCATCCCGCTAACTTAAAGTTTGTGTAC
TTAGCAATAAATGGTTGGTATCGATAGTCGGCTTTGATCCTTCCATTTTCCGTGGCCCAG
TCCGATGCATCCCATATCGATCCGTACAACCACATCGGTCTTGTAGGGAAGATAGCTTCG
TTCTTTCTGTCGTACGTACGTATCGGTACATCATCTACGTAGAATACAATTTGATTAGTG
TTCCACAAAATTGCGTAATGGTGGAAATCTTGAGTAGGGTCGAACCACAAATTGAATTTC
ATTTCTCTCCCAATAACATTTCGGTCACCACTTCCTCTGACGAATACGTTCGTCTGAAGG
CTATATGGTTTCCCGGGCGTTGTTCCTAGAAATTCGATATCAACCTCGTCGTGGTCTCCG
GGATGTTCTTGATTGTTTGAGAGCTTGAATACAAAGGTGTTAGGAATGTTAATAACGCCA
TTAGTTCATGTATTTTGATTAAAAATTAGTTTATCTCTAAAAGTTTAAAGTAATTTTTAC
GTAGAGAGATGTATCAACTCCAGCTGTGTAGCCTGATTGGAGCTTAATGGAAGCACCAAA
GTAGCCCGACTCGTAAGA*CGAAGAGACTTGAATCCACTCCCAGATGATT

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CACCACTTCCTCTGACGAATACGTTCGTCTGAAGGCTATATGGTTTCCCGGGCGTTGTTC
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TTAGTTTATCTCTAAAAGTTTAAAGTAATTTTTACGTAGAGAGATGTATCAACTCCAGCT
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TGAGTGGTTACTAGAAAAGGGGTAATAGATA

QA 1 751 1 751
DS 

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TCTTTCTGTCGTACGTACGTATCGGTACATCATCTACGTAGAATACAATTTGATTAGTGT
*CCACAAAATTGCGTAATGGTGGAAATCTTGAGTAGGGTCGAACCACAAATTGAATTTCA
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GATGTTCTTGATTGTTTGAGAGCTTGAATACAAAGGTGTTAGGAATGTTAATAACGCCAT
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TAGAGAGATGTATCAACTCCAGCTGTGTAGCCTGATTGGAGCTTAATGGAAGCACCAAAG
TAGCCCGACTCGTAAGAACGAAGAGACTTGAATCCACTCCCAGATGATTTGTCCAGCAAA
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TGGCTGTAGCCACTAGCACACAACACTAAGAAAGTTGAAAGAATAAGAGGAAAAGCCATT
TGGAGAGAGTGAAGTAAAGTCTTTTGAGTGGTTACTAGAAAAGGGGTAATAGATA

QA 19 733 19 733
DS 



CO CL539Contig2 773 2 2 U
TATCTATTACCCCTTTTCTAGTAACCACTCAAAAGACTTTACTTCACTCTCTCCAAATGG
CTTTTCCTCTTATTCTTTCAACTTTCTTAGTGTTGTGTGCTAGTGGCTACAGCCAACGTT
CTCCTTCGCCGGGATACTACCCGAGTTCTCGAGTACCAACTTCACCTTTTGATCGTGAAT
TTCGGACCCTATGGGACTCTCAACACCAGCGGAAAGAGCAAGACGTTATCACTCTTTTGC
TGGACAAATCATCTGGGAGTGGATTCAAGTCTCTTCGTTCTTACGAGTCGGGCTACTTTG
GTGCTTCCATTAAGCTCCAATCAGGCTACACAGCTGGAGTTGATACATCTCTCTACTTCT
CAAACAATCAAGAACATCTCGGAGACCACGACGAGGTTGATATCGAATTTCTAGGAACAA
CGCCCGGGAAACCATATAGCCTTCAGACGAACGTATTCGTCAGAGGAAGTGGTGACCTAA
ATGTTATTGGGAGAGAAATGAAATTCAATTTGTGGTTCGACCCTACTCAAGATTTCCACC
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GTACGTACGACAGAAAGAACGAAGCTATCTTCCCTACAAGACCGATGTGGTTGTACGGAT
CGATATGGGATGCATCGGACTGGGCCACGGAAAATGGAAAGATCAAAGCCGACTATCGAT
ACCAACCATTTATTGCTAAGTACACAAACTTTAAGTTAGCGGGATGCACAGCA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RS1AK47TF U 1
AF RS1AK59TF U 1
BS 1 769 RS1AK47TF
BS 770 773 RS1AK59TF

RD RS1AK47TF 769 0 0
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CTTTTCCTCTTATTCTTTCAACTTTCTTAGTGTTGTGTGCTAGTGGCTACAGCCAACGTT
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ACCAACCATTTATTGCTAAGTACACAAACTTTAAGTTAGCGGGATGCAC

QA 1 769 1 769
DS 

RD RS1AK59TF 773 0 0
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CTTTTCCTCTTATTCTTTCAACTTTCTTAGTGTTGTGTGCTAGTGGCTACAGCCAACGTT
CTCCTTCGCCGGGATACTACCCGAGTTCTCGAGTACCAACTTCACCTTTTGATCGTGAAT
TTCGGACCCTATGGGACTCTCAACACCAGCGGAAAGAGCAAGACGTTATCACTCTTTTGC
TGGACAAATCATCTGGGAGTGGATTCAAGTCTCTTCGTTCTTACGAGTCGGGCTACTTTG
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CAAACAATCAAGAACATCTCGGAGACCACGACGAGGTTGATATCGAATTTCTAGGAACAA
CGCCCGGGAAACCATATAGCCTTCAGACGAACGTATTCGTCAGAGGAAGTGGTGACCTAA
ATGTTATTGGGAGAGAAATGAAATTCAATTTGTGGTTCGACCCTACTCAAGATTTCCACC
ATTACGCAATTTTGTGGAACACTAATCAAATTGTATTCTACGTAGATGATGTACCGATAC
GTACGTACGACAGAAAGAACGAAGCTATCTTCCCTACAAGACCGATGTGGTTGTACGGAT
CGATATGGGATGCATCGGACTGGGCCACGGAAAATGGAAGGATCAAAGCCGACTATCGAT
ACCAACCATTTATTGCTAAGTACACAAACTTTAAGTTAGCGGGATGCACAGCA

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 7

CO CL540Contig1 1208 7 9 U
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TGTATGTTCCTTTTTTTCGTGTTTACAGAACACTGATGTCTCTCTCA*****TTACTCTT
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TGTATATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 25 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EI31JQ U 43
AF RS1GD56JQ U 1
AF RS1GD56TF C 76
AF RS1H501JQB U 17
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AF RS1H501TF C 497
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RD RS1EI31JQ 439 0 0
C
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CTCA*****TTACTCTTGAAAAGATAGATAAGAAACTAAACAAAGGCAGCTAAAACACAG
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AAAAATCCTTTCCACCATCTCCTCACACGGTTCGACACCATCTTCATCTTTCCCCTCAAA
AACTCTCCTTTCTTCTTGAGTACCTTAGTGATTGTCTTCTTCCACTCTTCCTTTTTATT*
**CTCTTTCTCTCTCAAAACTTTTCCCAAGTTCTTGGGGAACTTGTCATCCTCTTCCTCA
TCTTCATCATCATCGTCACCGTCCTCATCTTCAGCACCGAATTTTTCCGGGTTTGCCTTG
TACTTCTCTAAATCTTCC

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DS 

RD RS1GD56JQ 756 0 0
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TGTATGTTCCTTTTTT*CGTGTTTACAGAACACTGATGTCTCTCTCA*****TTACTCTT
GAAAAGATAGATAAGAAACTAAACAAAGACAGCTAAAACACAGAGCAAGTTTGAATTATC
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TCTCCTCACCCGGTTCGACACCATCTTCATCTTTCCCCTCAGAGACTCTCCTTTCTTCTT
GAGTACCTTAGTGATTGTCTTCTTCCACTCTTCCTTTTTATT***CTCTTTCTCTCTCAG
AACTTTTCCCAAGTTCTTGGGGAACTTGTCATCCTCTTCCTCATCTTCATCATCATCGTC
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GGGAAGAGGAGGAGGGGTCTTGGTACAAGCATCGGTAAGGTCTTTGCAAAGATGGTTAAC
TAGTGAAACAAGATCAGGCTTAGACTTGTATATACACTCCGCAACATCAGTGTCTGAGTA
ACCAATGACCTTTTGACAAGCGGCCTCGATCGTC
CC

QA 1 754 1 754
DS 

RD RS1GD56TF 681 0 0
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TTTCCCGGATTTAGGTT*CTTCGAAGAAGAAGATCCTTTCCACCATCTCCTCACCCGGTT
CGACACCATCTTCATCTTTCCCCTCAGAGACTCTCCTTTCTTCTTGAGTACCTTAGTGAT
TGTCTTCTTCCACTCTTCCTTTTTATT***CTCTTTCTCTCTCAGAACTTTTCCCAAGTT
CTTGGGGAACTTGTCATCCTCTTCCTCATCTTCATCATCATCGTCACCGTCCTCATCTTC
AGCACCGAATTTTTCCGGGTTTGCCTTGTACTTCTCTAAATCTTCCCTAGAGTATACTTT
CATGCCAGGTGCTCCTGGCATACCCTACATAGATCTCATGATCTTGTCCATTTCAGCATC
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AGGCTTAGACTTGTATATACACTCCGCAACATCAGTGTCTGAGTAACCAATGACCTTTTG
ACAAGCGGCCTCGATCGTC
CC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1H501JQB 730 0 0
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TTCCCGGATTTAGGTTTCTTCGAAGAAGAAGATCCTTTCCACCATCTCCTCACCCGGTTC
GACACCATCTTCATCTTTCCCCTAAGAGACTCTCCTTTCTTCTTGAGTAACTTAGTGACT
GTCTTCTTCCACTCTTCCTTTTTATTAGTCTCTTTCTCTCTCAGAACTTTTCCCAAGTTC
TTGGGGAACTTGTCATCCTCTTCCTCATCTTCATCATCGTCGTCACCATCTTCATCTTCA
GTACCGAATTTTTCAGGGTTCGCTTTGTACTTCTCTAAATCTTCCCTAGAGTATACCTTC
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GGCTTAGACTTGTATATATACTCCGCAACATCAGTGTCTGAGTAACCAATGACCTTTTGA
CAAGCGGCCT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RS1C245JQ 806 0 0
GCTTCAAACTTGAATTCATGATTTTGATCTAAAACCATTACATTTGTATGTTCCTTTTTT
TCGTGTTTACAGAACACTGATGTCTCTCTCA*****TTACTCTTGAAAAGATAGATAAGA
AACTAAACAAAGACAGCTAAAACACAGAGCAAGTTTGAATTATCCTCCTATAGTTCAGAT
TTCCCGGATTTAGGTTTCTTCGAAGAAGAAGATCCTTTCCACCATCTCCTCACCCGGTTC
GACACCATCTTCATCTTCCCCCTCAGAGACTCTCCTTTCTTCTTGAGTACCTTAGTGATT
GTCTTCTTCCACTCTTCCTTTTTATT***CTCTTTCTCTCTCAGAACTTTTCCCAAGTTC
TTGGGGAACTTGTCATCCTCTTCCTCATCTTCATCATCATCGTCACCGTCCTCATCTTCA
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ATGCCAGGTGCTCCTGGCATACCCTGCATAGATCTCATGATCTTGTCCATTTCAGCATCT
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GGCTTAGACTTGTATATATACTCCGCAACATCAGTGTCTGAGTAACCAATGACCTTTTGA
CAAGCGGCCTCGATCGTCTTGCACTCTGAATTGCACATCCCTTCTTCTTCTTGTTCAACC
AGCTGAAGCTTATCACCTTTCTCAAC

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DS 

RD RS1C245TF 567 0 0
GACACCATCTTCATCTTCCCCCTCAGAGACTCTCCTTTCTTCTTGAGTACCTTAGTGATT
GTCTTCTTCCACTCTTCCTTTTTATT***CTCTTTCTCTCTCAGAACTTTTCCCAAGTTC
TTGGGGAACTTGTCATCCTCTTCCTCATCTTCATCATCATCGTCACCGTCCTCATCTTCA
GCACCGAATTTTTCCGGGTTTGCCTTGTACTTCTCTAAATCTTCCCTAGAGTATACTTTC
ATGCCAGGTGCTCCTGGCATACCCTGCATAGATCTCATGATCTTGTCCATTTCAGCATCT
TTCGATGGTTTTGCCACAAATGGTTCTCCAGGAACTCGATCCTTGGGAAGAGGAGGAGGG
ATCTTGGTACAAGCATCGGTAAGGTCTTTGCAAAGATGGTTAACAAGTGAAGCAAGATCA
GGCTTAGACTTGTATATATACTCCGCAACATCAGTGTCTGAGTAACCAATGACCTTTTGA
CAAGCGGCCTCGATCGTCTTGCACTCTGAATTGCACATCCCTTCTTCTTCTTGTTCAACC
AGCTGAAGCTTATCACCTTTCTCAAC
C

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DS 

RD RS1H501TF 712 0 0
ATGCCAGGTGCTCCTGGCATACCCTGCATAGATCTCATGATCTTGTCCATTTCAGCATCT
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GTCTTGGTACAAGCATCGGTAAGGTCTTTGCATAGATGGTTAACTAGTGAAACAAGATCA
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QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 7

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GCGGCGAGATGCCAACCGGCCACCGGAGACAATATCTCTTTTGAGGAACTAGAGAGAAGT
TAAAGTGTTTAGAGAGAGAGAGATTCTAAATATTGAACAAATTTATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 
35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1D781JQ U 12
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AF RS1FU19TF C 197
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QA 5 759 5 759
DS 

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AAAAA

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CCAACCGGCCACCGGAGACA*TATCTCTTTTGAGGA*CTAGAGAGA
GTAAA

QA 1 826 1 826
DS 

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AGAGA
TTCTAAATCC

QA 1 785 1 785
DS 

RD RS1GN01TF 735 0 0
TTC
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AGCAGTAAACAAATCTTTAACTGCAGCAAGGATTCGCCGGTTTAGTCCACTTGTTTGACC
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AAGCTTCAACTCTACTGAGTCCTCTAAAACTTCGAAGATTAATCAAATAACTCACAGACA
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AAAGACAACAAAATATCGCCTTGCGAAACATAGATCCGCTACCGGAAACTTTAAATCGAT
CTAAGAGATCAAAAATATTATACATAAACAGAACATAAACAAAAAGGAGGTGGCGACCGG
CGGCGAGATGCCAACCGGCCACCGGAAACAATATCTCTTTTGAGGAACTAGAGAGAAGTT
AAAGTGTTTAG
C

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DS 

RD RS1FU19TF 693 0 0
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TCGTTGATATTAAAAGCTTTCATGCCTCCTCCAGATGTTAATTTCAGTGAACAGCTTCAT
AAAAGTTTGAGAAAGAGACTTTGTTGAAACACTTCTCTGTATGAGAAGCTTCAACTCTAC
TGAGTCCTCTAAAACTTCGAAGATTAATCAAATAACTCACAGACATAGTTTGATCGGATA
CTCTGCCCAAAGGTCTTATGGCCAATACTTTTCAAAAGGCAAAGATTGACTCCTTCCAAA
CTCTAGCCTTGAGAATGACCGGGAGAAAACATTGATTCTCTAAATAACCAACAAGATTTA
AGAAAATTGAAGATCAAAGGAAAAGGGAAGGATTAACTTTACTAAAAAGACAACAAAATA
TCGCCTTGCGAAACATAGATCCGCTACCGGAAACTTTAAATCGATCTAAGAGATCAAAAA
TATTATACATAAACAGAACATAAACAAAAAGGAGGTGGCGACCGGCGGCGAGATGCCAAC
CGGCCACCGGAAACAATATCTCTTTTGAGGAACTAGAGAGAAGTTAAAGTGTTTAGAGAG
AGAGAGATTCTAAATATTGAACAAATTTATCCC

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DS 



AS 1 6

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TCTTATTTCGTGAAAACCGAAAATAAAATGACTTTCATTATAAATTTATAATTAGTTTTT
TCTTAGACTATTACTTGGTTTAGAGTCTTGAGGGCATTCCTCCAGCGACGACCAAAGTTT
CTCCGGTGATGTAAGAAGAATCATCAGATGCTAAGAAAGCCGTAGCAGCAGCCATGTCTC
CTGTTGTTCCCAACCTATTAAGCAGAGTCTTCTCTTCGATGCTTTCCCTCACTTGGGAGT
TTCCGGTGATGAAAGAAGCAAAGTGTGTGGGCACAAAACCGGGAGCAACCGCGTTGACAC
GTGTGTCCGGACCCATCTCAGCAGCAAGAGCCTTGGTTAGTCCGAGAAGAGCAGTCTTAG
TGACACCATACATAGCCATGGATCCTTGTGGTTGAAATCCAGCGATAGAAGTTATGAAAA
TAACAGAAGAGCCCTTCTCTAAGTGAGGAGCCATATCCTGAAGGAGAAGTATAGATGATT
TGACATTGATTTCCCAAAGCTTGTCGAGGACAGCTTCTTTGGTGGACAAGATTGGGTCTG
TAGATGGATTAGCAGCGGCGTTACAGACAAGGATATCTATCTTTCCATATTTCTGAACAG
TCTTTTCGACAAGATTACGGCGATGTTGAGCATTGGAAACGTGACAGACAATTCCATAAG
CATCAATCCCTTTGGATTTGAGTTTTTCTACTGCTTCCTCAACATTTGCCTGCTTGCGGG
AAGAAACGACGACGGAAGCGCCTTCGAGACCGAAACGCTCGATGATACCGAAGCCGATCC
CTTGCGTCGAAGCCGTTACTATCGCCACCTTTCCTTCCAATCTCCTCCCTATCTTCTTCC
CCTCCATTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTTTTCTTTTTTACCTTCTTTCTCTCTCTTA
GCCGATGATGATTGATGAGTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 10 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 10 

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TCTTAGACTATTACTTGGTTTAGAGTCTTGAGGGCATTCCTCCAGCGACGACCAAAGTTT
CTCCGGTGATGTAAGAAGAATCATCAGATGCTAAGAAAGCCGTAGCAGCAGCCATGTCTC
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G
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GTGAAAACCGAAAATAAAATGACTTTCATTATAAATTTATAATTAGTTTTTTCTTAAACT
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ATTACTTGGTTTAGAGTCTTGAGGGCATTCCTCCAGCGACGACCAAAGTTTCTCCGGTGA
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CCAACCTATTAAGCAGAGTCTTCTCTTCGATGCTTTCCCTCACTTGGGAGTTTCCGGTGA
TGAAAGAAGCAAAGTGTGTGGGCACAAAACCGGGAGCAACCGCGTTGACACGTGTGTCCG
GACCCATCTCAGCAGCAAGAGCCTTGGTTAGTCCGAGAAGAGCAGTCTTAGTGACACCAT
ACATAGCCATGGATCCTTGTGGTTGAAATCCAGCGATAGAAGTTATGAAAATAACAGAAG
AGCCCTTCTCTAAGTGAGGAGCCATATCCTGAAGGAGAAGTATAGATGATTTGACATTGA
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TAGCAGCGGCGTTACAGACAAGGATATCTATCTTTCCATATTTCTGAACAGTCTTTTCGA
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GCGCCT

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CGTTACAGACAAGGATATCTATCTTTCCATATTTCTGAACAGTCTTTTCGACAAGATTAC
GGCGATGTTGAGCATTGGAAACGTGACAGACAATTCCATAAGCATCAATCCCTTTGGATT
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CGCCTTCGAGACCGAAACGCTCGATGATACCGAAGCCGATCCCTTGCGTCGAAGCCGTTA
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TCTC**TTTCTTTTTTCTTTTTTACCTTCTTTCTCTCTCTTAGCCGATGATGATTGACGA
GTGTC
C

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DS 

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AAAACCGGGAGCAACCGCGTTGACACGTGT**CCGGACCCATCTCAGCAGCAAGAGC*TT
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AAATCCAGCGATAGAAGTTATGAAAATAACAGAAGAGCCCTTCTCTAAGTGAGGAGCCAT
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ATCTATCTTTCCATATTTCTGAACAGTCTTTTCGACAAGATTACGGCGATGTTGAGCATT
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CTTTTTTACCTTCTTTCTCTCTCTTAGCCGATGATGATTGATGAGTGTC
C

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TCCATATTTCTGAACAGTCTTTTCGACAAGATTACGGCGATGTTGAGCATTGGAAACGTG
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ATTTGCCTGCTTGCGGGAAGAAACGACGACGGAAGCGCCTTCGAGACCGAAACGCTCGAT
GATACCGAAGCCGATCCCTTGCGTCGAAGCCGTTACTATCGCCACCTTTCCTTCCAATCT
CCTCCCTATCTTCTTCCCCTCCATTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTTTTCTTTTTTAC
CTTCTTTCTCTCTCTTAGCCGATGATGATTGATGAGTGTCC

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DS 



AS 3 6

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F031TF U 80
AF RS1AP31TFB U 1
BS 1 837 RS1AP31TFB

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GG
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GCAGTGGTGGTTCATCGAGAACGGACCTCCTCAGCGGAGGAGCTATTGATCGGAAACGGA
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ACCCTCCTTCAACCTCCACAACAGCTAAATCTCACCTTCCAGATCAATCTGAAACCGATA
ACAGCGAAGAAGGATCCGACGTGAGTGGCTCGGAAGGTGGTGGTGATGATGACGACACGT
CGTGGATCTCGTGGTTCTGTAACTTGAGAGGGAACGAGTTTTTCTGTCAAGTGGATGAAG
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ATGC
AC

QA 3 486 3 486
DS 

RD RS1AP31TFB 837 0 0
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CTACTTCTTCTCTTTCCTCTTACTCTAGATTTCTCCGCCTCTCTCCTCTCTTTAAACGGT
AACAAAGTCCAAGACTTTGAATCGAAATCAAACCTTCTAGTATCAAAATTATGTACAAAG
ATCGAAGCGGAGGCATAATGGGCAGTGGTGGTTCATCGAGAACGGACCTCCTCAGCGGAG
GAGCTATTGATCGGAAACGGATCAACGAAGCCTTAGACAAACATCTCAAGAAAACTTCCA
CTTCTAAAGGCGAAGACTCAAACCCTCCTTCAACCTCCACAACAGCTAAATCTCACCTTC
CAGATCAATCTGAAACCGATAACAGCGAAGAAGGATCCGACGTGAGTGGCTCGGAAGGTG
GTGGTGATGATGACGACACGTCGTGGATCTCGTGGTTCTGTAACTTGAGAGGGAACGAGT
TTTTCTGTCAAGTGGATGAAGATTATGTGGAGGATGATTTTAATCTCTGTGGCTTGAGTG
CTCAAGTTCCTTACTATGACTATGCACTTGATCTTATCTTAGATGTTGAATCATCAAACA
GTGATATGTTTACTGAAGAACAGAATGAGCTGGTGGAATCAGCTGCTGAGATGTTGTATG
GTCTTATTCATGTTCGTTACATTCTCACTACTAAAGGAATGGCTGCTATGTTGGAGAAGT
ACAAGAACTGTGATTTTGGAAGTGTCCGAGAGTGTTCTGCAGCGGGCAGTCTTGTCTTCC
GGTTGGGCAATCTGATACACCGAGGTCGCGTACGTGAAGATATACTGCCCAAATGCG

QA 1 837 1 837
DS 



CO CL543Contig2 1148 2 2 U
GGGTGACGAAAATTATTTAAAGTAAAACCCTATTTGTCTCCGTCTTTATCCCAATCTTCA
GAAAGTCGTGAGCTTCTCAGTCCTTTTGTTCTTGGGAGAATCGAATTATGTACAAGGAAC
GGAGTGGTGGCGGGTCGTCGAGATCGGAGATCGTGGGTGGAGCAATTGATCGGAAACGAA
TCAACGACGCACTCAACAAGAGACTAGAGAAGTCTTCGACATCCACTTCTAAAGACAAAC
ATCAGCTTCCAGATGTGGAATCTGAAACGGATAGTGATGGTTCGGATGTGAGTGGATCGG
AAGGTGATGATGATGATGATGATACCTCGTGGATCTCGTGGTTTTGTAATTTGAGAGGGA
ATGATTTCTTCTGTGAAGTCGATGAAGATTATATACAAGATGATTTCAATCTCTGTGGGT
TGAGTGGTCAAGTTCCTTACTATGAGTATGCGCTTGATCTCATCCTAGATGTCGAGTCTT
CAAACAGTGAGATGTTTACAGAAGAACAGAATGAACTTGTGGAATCAGCTGCTGAAATGT
TGTATGGTCTTATTCATGCTCGTTACATTTTGACTACTAAAGGACTGGCTGCAATGGCTG
AGAAGTTCAAGAAGTGTGATTTCGGGAGATGTCCGAGAGTTTTCTGTTGCGGACAATCTT
GTCTACCAGTTGGACAATCTGACATACCGAGATCGAGTACTGTGAAGATATACTGCCCAA
AATGCCAAGACATATCTTACCCTCGATCTAAATTCCAAGATATTGATGGAGCATACTTTG
GAACCACGTTCCCTCATTTGTTCTTGATGACTAACGGGAATTTGAAGCCTCAGAAACCGA
CTCAGAACTATGTCCCAAGAATCTTTGGCTTCAAGGTACACAAACCATGATACTAGTGCC
TCTGCGTTCTCTCAATGGTGAAACATCTAGTGGCATGAGCAACTGAAGATAGCCTTCGGT
TTGGATGGAGCATACCAATCAAATCATTGTATCGTAGACAGACTCGGAAATGTAATGTTC
CTTCGGTTGGATTTTTGTTTTTCTTTTATTTCTCTGTTATTTAACTAGATATTGCTATGT
TCTTCTCAGCATATTTTCTACTAATTTCATGTATAACCTCAGGAATTGTTCAATTCAAAG
GTTAACAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CQ04TF U 1
AF RS1CQ04JQ C 305
BS 1 817 RS1CQ04TF
BS 818 1148 RS1CQ04JQ

RD RS1CQ04TF 817 0 0
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GAAAGTCGTGAGCTTCTCAGTCCTTTTGTTCTTGGGAGAATCGAATTATGTACAAGGAAC
GGAGTGGTGGCGGGTCGTCGAGATCGGAGATCGTGGGTGGAGCAATTGATCGGAAACGAA
TCAACGACGCACTCAACAAGAGACTAGAGAAGTCTTCGACATCCACTTCTAAAGACAAAC
ATCAGCTTCCAGATGTGGAATCTGAAACGGATAGTGATGGTTCGGATGTGAGTGGATCGG
AAGGTGATGATGATGATGATGATACCTCGTGGATCTCGTGGTTTTGTAATTTGAGAGGGA
ATGATTTCTTCTGTGAAGTCGATGAAGATTATATACAAGATGATTTCAATCTCTGTGGGT
TGAGTGGTCAAGTTCCTTACTATGAGTATGCGCTTGATCTCATCCTAGATGTCGAGTCTT
CAAACAGTGAGATGTTTACAGAAGAACAGAATGAACTTGTGGAATCAGCTGCTGAAATGT
TGTATGGTCTTATTCATGCTCGTTACATTTTGACTACTAAAGGACTGGCTGCAATGGCTG
AGAAGTTCAAGAAGTGTGATTTCGGGAGATGTCCGAGAGTTTTCTGTTGCGGACAATCTT
GTCTACCAGTTGGACAATCTGACATACCGAGATCGAGTACTGTGAAGATATACTGCCCAA
AATGCCAAGACATATCTTACCCTCGATCTAAATTCCAAGATATTGATGGAGCATACTTTG
GAACCACGTTCCCTCATTTGTTCTTGATGACTAACGG

QA 1 817 1 817
DS 

RD RS1CQ04JQ 844 0 0
TGATGA
TGATGATGATGATACCTCGTGGATCTCGTGGTTTTGTAATTTGAGAGGGAATGATTTCTT
CTGTGAAGTCGATGAAGATTATATACAAGATGATTTCAATCTCTGTGGGTTGAGTGGTCA
AGTTCCTTACTATGAGTATGCGCTTGATCTCATCCTAGATGTCGAGTCTTCAAACAGTGA
GATGTTTACAGAAGAACAGAATGAACTTGTGGAATCAGCTGCTGAAATGTTGTATGGTCT
TATTCATGCTCGTTACATTTTGACTACTAAAGGACTGGCTGCAATGGCTGAGAAGTTCAA
GAAGTGTGATTTCGGGAGATGTCCGAGAGTTTTCTGTTGCGGACAATCTTGTTTACCAGT
TGGACAATCTGACATACCGAGATCGAGTACTGTGAAGATATACTGCCCAAAATGCCAAGA
CATATCTTACCCTCGATCTAAATTCCAAGATATTGATGGAGCATACTTTGGAACCACGTT
CCCTCATTTGTTCTTGATGACTAACGGGAATTTGAAGCCTCAGAAACCGACTCAGAACTA
TGTCCCAAGAATCTTTGGCTTCAAGGTACACAAACCATGATACTAGTGCCTCTGCGTTCT
CTCAATGGTGAAACATCTAGTGGCATGAGCAACTGAAGATAGCCTTCGGTTTGGATGGAG
CATACCAATCAAATCATTGTATCGTAGACAGACTCGGAAATGTAATGTTCCTTCGGTTGG
ATTTTTGTTTTTCTTTTATTTCTCTGTTATTTAACTAGATATTGCTATGTTCTTCTCAGC
ATATTTTCTACTAATTTCATGTATAACCTCAGGAATTGTTCAATTCAAAGGTTAACAG

QA 7 844 7 844
DS 



CO CL543Contig3 624 2 11 U
TATATCATAAATAAAGTATATCCCGCCCGTTGGGCGGGCCGAACCTAGTTCTATATAAAG
CTCAGTTTCTTCCAAAATTACATACATTTGACCTTTTGTCATAAAGCTCTTCTCATTCTC
CCCAACCACAATCTTAGTATTGAACCCTTTTAAAATCGGCGACCATCAAGAGGAAGTGTT
GAGCCACCGAGATTGCGTTAGAACTCATTGGACTGGCGAGACGAGAAAGCCTCTCATTGC
TTGTTGTGCACCTTAAATCCAAAGATTTTAGGAACATAGCTTTGAGTGGGCTTCTGAGGT
TTCAGGTTCCCATAAGCCATGAAAAACAAATGTGGGAAAGTTTGTCCCAAAGTAAGCGCC
ATCAATGTTGCCTTGGTATTTAGAACGCGGGTAGTAAACATCCTCGCATTTTGGGCAGTA
TATCTTCACCGTACGCGACCTCGGTGTATCAAATTGCCCAACCGGAAAACAAGACTGCCC
GCTGCAGAACACTCTCGGACACCTTCCAAAATCACAGTTCTTGTACTTCTCCAACATAGC
AGCCATTCCTTTAGTAGTGAGAATGTAACGAACATGAATAAGACCATACAACATCTCAGC
AGCTGATTCCACCAGCTCATTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AP31JQ U 35
AF RS1F031JQ U 1
BS 1 42 RS1F031JQ
BS 43 43 RS1AP31JQ
BS 44 143 RS1F031JQ
BS 144 144 RS1AP31JQ
BS 145 216 RS1F031JQ
BS 217 217 RS1AP31JQ
BS 218 342 RS1F031JQ
BS 343 343 RS1AP31JQ
BS 344 384 RS1F031JQ
BS 385 385 RS1AP31JQ
BS 386 624 RS1F031JQ

RD RS1AP31JQ 416 0 0
CGGGCCGAACCTAGTTCTATATAAAGCTCAGTTTCTTCCAAAATTACATACATTTGACCT
TTTGTCATAAAGCTCTTCTCATTCTCCCCAACCACAATCTTAGTATTGAACCCTTTTAAA
ATCGGCGACCATCAAGAGGAAGTGTTGAGCCACCGAGATTGCGTTAGAACTCATTGGACT
GGCGAGACGAGAAAGCCTCTCATTGCTTGTTGTGCACCTTAAATCCAAAGATTTTAGGAA
CATAGCTTTGAGTGGGCTTCTGAGGTTTCAGGTTCCCGTAAGCCATGAGAAACAAATGTG
GGAAAGTTTGTCCCAAAGTAAGCTCCATCAATGTTGCCTTGGTATTTAGAACGCGGGTAG
TAAACATCCTCGCATTTTGGGCAGTATATCTTCACCGTACGCGACCTCGGTGTATC

QA 1 416 1 416
DS 

RD RS1F031JQ 624 0 0
TATATCATAAATAAAGTATATCCCGCCCGTTGGGCGGGCCGATCCTAGTTCTATATAAAG
CTCAGTTTCTTCCAAAATTACATACATTTGACCTTTTGTCATAAAGCTCTTCTCATTCTC
CCCAACCACAATCTTAGTATTGATCCCTTTTAAAATCGGCGACCATCAAGAGGAAGTGTT
GAGCCACCGAGATTGCGTTAGAACTCATTGGACTGGTGAGACGAGAAAGCCTCTCATTGC
TTGTTGTGCACCTTAAATCCAAAGATTTTAGGAACATAGCTTTGAGTGGGCTTCTGAGGT
TTCAGGTTCCCATAAGCCATGAAAAACAAATGTGGGAAAGTT*GTCCCAAAGTAAGCGCC
ATCAATGTTGCCTTGGTATTTAGATCGCGGGTAGTAAACATCCTCGCATTTTGGGCAGTA
TATCTTCACCGTACGCGACCTCGGTGTATCAAATTGCCCAACCGGAAAACAAGACTGCCC
GCTGCAGAACACTCTCGGACACCTTCCAAAATCACAGTTCTTGTACTTCTCCAACATAGC
AGCCATTCCTTTAGTAGTGAGAATGTAACGAACATGAATAAGACCATACAACATCTCAGC
AGCTGATTCCACCAGCTCATTCTG

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 8

CO CL544Contig1 518 8 7 U
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TATGATGCTAAATCATGATATCTTTGAAGTTTTTTTCACATTTTTGCTATATTGTTTTTT
CTTTAATAGAAAAAACTATAATATTTTTTTATTGGGAGCCTTGTAATAAAGTATTGAAGT
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BQ
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 

AF RS1CQ03JQ C 1
AF RS1CQ03TF U 1
AF RS1DR01JQ C 1
AF RS1DR01TF U 1
AF RS1E030TF U 1
AF RS1ED01JQ C 1
AF RS1ED01TF U 1
AF RS1C259TF U 11
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BS 61 271 RS1CQ03TF
BS 272 294 RS1DR01TF
BS 295 295 RS1E030TF
BS 296 516 RS1DR01TF
BS 517 518 RS1E030TF

RD RS1CQ03JQ 271 0 0
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QA 1 271 1 271
DS 

RD RS1CQ03TF 271 0 0
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ATGCGTTGAGAGACACGGAACTAATGGGAAG

QA 1 271 1 271
DS 

RD RS1DR01JQ 518 0 0
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AG

QA 1 516 1 516
DS 

RD RS1DR01TF 518 0 0
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AG

QA 1 516 1 516
DS 

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QA 1 518 1 518
DS 

RD RS1ED01JQ 518 0 0
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CTTTAATAGAAAAAACTATAATATTTTTTTATTGGGAGCCTTGTAATAAAGTATTGAAGT
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QA 1 518 1 518
DS 

RD RS1ED01TF 518 0 0
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TTCATCATTCTTGTGCTAGGAACGATGGCAAATGCACAAGAAAGAAAAAAAGATATGTAA
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ATGCGTTGAGAGACACGGAACTAATGGGAAGGGTACATGTTATGGGACAAAGGAAAAAAA
CGATGTGACTTGCTTTTGCGGAACTCCTTGTTAACGTTCTGGTTAAGTAAGGTGAATAAA
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QA 1 518 1 518
DS 

RD RS1C259TF 508 0 0
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ATCCCTTTAGCCAAAAATGGGCTGTGTGTTGAATCTGAATGCCGAGCTAAATGCGTTGAG
AGACACGGGACTAATGGGAAGGGTACATGTTATGGGACAAAGGAAAAAAACGATGTGACT
TGCTTTTGCGGAACTCCTTGTTAACGTTCTGGTTAAGTAAGGTGAATAAATATGATGCTA
AATCATGATATCTTTGAAGTTTTTTTCACATTTTTGCTATATTGTTTTTTCTTTAATAGA
AAAAACTATAATATTTTTTTATTGGGAGCCTTGTAATAAAGTATTGAAGTTGACATATAA
TTATAAATAAAGTAAATGTTTGTTTTGG

QA 1 508 1 508
DS 



AS 1 8

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TCTTTAGTGCCCTTTTCTCATTTTCTTTCCGATGTCATTTCTTGTGACAGAAGAATCAAA
CTGGAACTATGAACATTTGGTTTCTCCTTTAACCGGAGGAGCTCTGTAGTACGCAGGCAC
AGTCGCTGGGAAAAACATCTGCCTTACTCCTTCCGCCTTTATTATCGGAAATATTATCCC
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AAGATAATCGAAGCAAGCTTCCCTCATCTCGTTTCTCGCTTCATCTTTCGACGAACAGAA
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GTAAAAAGATTCGAGGTATTTGCAGAGACTGGAGCCGTCGCTAAGGTCACGGAGCGGTCT
AAGGAGATTACGCAGGACAACGATGTCGGATAACGCGACCGTCATGCCTCCACCTGTTAA
CGGATGACGCATGTTGAACGCATCTCCCATCAACAAAGCTCCTGGAGTTGGGTAAGGAGA
AGCCGGCATGCTTCTGTTCGGCATGGACTTGATGTTTCCTTTGTTAACCGCAGCGATGAA
AGAGTCAAAGACCTCATGAGGCATCTGAGGAGCCACGACAGTTTTCAAATAGTTTGCCAT
TTCACCATTTGCGATAGAAGGCACTTTCTGACCAGGAACGTCGACTAGACACCGGACCTC
TGTGCTACTGATTGGATACATCAAGATTGGTGATGGATCTGCTAAGACGACATGTCCATG
GTTTGCGAATGGAAGGTTGCAGTTCTCTAGGACCAAACCGACAAAGCAAGAAGGTACATC
GACCTGAGGATTGCATAGAGAGCGACGCAGGTTTGAGAAACAACCGTCACAGACTATAGT
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AAGTGCATAGCCATACACTCTCTGAGCATCAATTTCCTCCACGCAATCTTCAATACCCAA
CTCGAGTAACTTGAGATAGCCACCAGGTTGTAAAAGCTCTCCAACAATACGATCCGGCTC
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GACGGAGATCATAAGAGCGAAGGAGGAGATCACGAGAGGCGAGAGCCAACCGAGTAATTG
AGCCTCCATCACCGTCGTCGTCGTCGTCTTTAACAGAAAAAGTTTCGATTTCTCAGCGGA
GAGAACGAGAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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CTGGAACTATGAACATTTGGTTTCTCCTTTAACCGGAGGTGCTCTGTAGTACGCAGGCAC
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CACTTTGTAAAGCGCATTCGCAAGTGTGTTGATCGTCGACGCCACTGGCTTCCGTAGAGT
GTAGAAAGATTCGAGGTATTTGCAGAGACTGGAGCCGTC
AA

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DS 

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C
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AAACTGACCACAAAGTTC*ATCTCTTTAGTGCCCTTTTCTCATTTTCTTTCCGATGTCAT
TTCTTGTGACAGAATAATCAAACTGGAACTATGAACATTTGGTTTCTCCTTTAACCGGAG
GAGCTCTGTAGTACGCAGGCACAGTTGCTGGGAAAAACATCTGCCTTACTCCTTCCGCCT
TTATTATCGGAAATATTATCCCCGATGCTCCCGAGATTAATTTGGCTCCAAGCCACATGC
GTTTTGGAGAAGGGAAAGGGATCAACAACCGTATAACTCCATAAACCGCAACCGCAAAGA
AATGGCAGACAAGAGTCAACGGCCGAGGGTTCAAACCCGAAAGCAAAGACACTGGTCCGC
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CTTCATCTTTCGACGAACAGAACACTTTGTAAAGCGCATTCGCAAGTGTGTTGATCGTCG
ACGCCACTGGCTTCCGTAGAGTGTAGAAAGATTCGAGGTATTTGCAGAGACTGGAGCCGT
CACTAAGGTCACGGAGCGGTCTAAGGAGATTACGGAGGACAACAATGTCGGATAACGCAA
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CTCCTGGAGTTGGG

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GCG
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TAGTGCCCTTTT*TCATTTTCTTTCCGATGTCATTTCTTGTGACAGAAGAATCAAACTGG
AACTATGAACATTTGGTTTCTCCTTTAACCGGAGGAGCTCTGTAGTACGCAGGCACAGTC
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GCTCCCGAGATTAATTTGGCTCCAAGCCACATGCGTTTTGGGGAAGGGAACGGGATCAAC
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AAAGATTCGAGGTATTTGCAGAGACTGGAGCCGTCGCTAAGGTCACGGAGCGGTCTAAGG
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DS 

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GCTACG
AAAAAGAATGATATTCCATTAGTAAAGTACAACCGTCACCAACCTATAAAACAGAAATAA
TCATTCATACGTATAAAAAACACAGACACAAAAAAAATTAACCACAAAGTTCCATCTCTT
TAGTGCCCTTTT*TCATTTTCTTTCCGATGTCATTTCTTGTGACAGAAGAATCAAACTGG
AACTATGAACATTTGGTTTCTCCTTTAACCGGAGGAGCTCTGTAGTACGCAGGCACAGTC
GCTGGGAAAAACATCTGCCTTACTCCTTCCGCCTTTATTATCGGAAATATTATCCCCGAT
GCTCCCGAGATTAATTTGGCTCCAAGCCACATGCGTTTTGGGGAAGGGAACGGGATCAAC
AACCGTATAACTCCATAAACCGCAACGGCAAAGAAATGGCAGACAAGAGTCAACGGTCGA
GGGTTCAAACCCGAAAGCAAGGACACTGGTCCGCTCGTGCACATACCACCAAGGCCAAGA
TAATCGAAGCAAGCTTCCCTCATCTCGTTTCTCGCTTCATCTTTCGACGAACAGAACACT
TTGTAAAGCGCATTCGCGAGGGTGTTGATCGTTGACGCCACTGGCTTCCGTAGAGTGTAA
AAAGATTCGAGGTATTTGCAGAGACTGGAGCCGTCGCTAAGGTCACGGAGCGGTCTAAGG
AGATTACGCAGGACAACGATGTCGGATAACGCGACCGTCATGCCTCCACCTGTTAACGGA
TGACGCATGTTGAACGCATCTCCCATCAACAAAGCTCCTGGAGTTGGGTAAGGAGAAGCC
GGCATGCTTCTGTTCGGCATGGACTTGATGTTTCCTTTGTTAACCGCAGCGATGAAAGAG
TCAAAGACCTCATGAGGCATCTGAG

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GAGCCACGACAGTTTTCAAATAGTTTGCCATTTCACCATTTGCGATAGAAGGCACTTTCT
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C

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DS 

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AGAGCAGAACCAGCGACTCCGGCTCCAACAACGATGACGTCAGCGACGTTATC
C

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DS 

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TCTTTAACAGAAAAA

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DS 

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TCCAACAATACGATCCGGCTCCGATAAATCTCTTTCAATCACATGAACTCGACGATTATC
CTTTCCAAGAGTGTACGCCAGAGCAGAACCAGCGACTCCGGCTCCAACAACGATGACGTC
AGCGACGTTATCTCCGCCTCTAACGTTCAGGGATACAACGGTGGAGGTGACGGTCCGATC
GTGATGGATCTTCGAAGTTGTAGGGTCTAGTACTCTGTTACTGTTCCGTCTCGTCTTCAC
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AAGTTTCGATTTCTCAGCGGAGAGAACGAGAAAAAAAA

QA 1 638 1 638
DS 



AS 2 8

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TACCAAGGATGAAAAAA*TCACTTATATTTTCATTCAATGTTTTAACTCTCCTCGTCATT
CTTGTACTAGTGGCCGGAGCGATGGGGCAAGGGAATAAAAATAAAAAAGATTTATGTCCC
ATATATCTAGATAACCAACAGCCTGGAAGTTGTAAGAACAAAGCAGCTTGCCAATCTGCG
TGCAACAAGAGGATACAAGGGTCAGGAATAAAGGAAGTAACCACTGGTTGTGTCCCGGGA
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TGTCAAAATTTTATTTTCAAATTACGATAACAATAAATATGTTCATTTGCATATGTAATA
AATGACAAAATAAGCTGTAAAAGTTAATTATAATTATCAACTTCTAAATTTTAAGCGCC


BQ
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RS1BW02JQ C 1
AF RS1BW02TF U 1
AF RS1EK23TF U 12
AF RS1DR60TF U 1
AF RS1GF07JQ C 1
AF RS1GF07TF U 1
BS 1 262 RS1BW02TF
BS 263 263 RS1DR60TF
BS 264 464 RS1BW02TF
BS 465 537 RS1DR60TF
BS 538 539 RS1GF07JQ

RD RS1BW02JQ 464 0 0
GGGTTCTTTACACACACCAAAATTTTCTGATAAAAAAAA*CATAATCAATTCATTCATAT
TACCAAGGATGAAAAAA*TCACTTATATTTTCATTCAATGTTTTAACTCTCCTCGTCATT
CTTGTACTAGTGGCCGGAGCGATGGGGCAAGGGAATAAAAATAAAAAAGATTTATGTCCC
ATATATCTAGATAACCAACAGCCTGGAAGTTGTAAGAACAAAGCAGCTTGCCAATCTGCG
TGCAACAAGAGGATACAAGGGTTAGGAATAAAGGAAGTAACCACTGGTTGTGTCCCGGGA
GACAAATGCGCCTGCTATACCCCATGTCCAAAATAATCTTTATGTTTAGTTTATTGACAA
CAGCATTCAGATATATTTATAATAAATTATGATGTTATTTATAGTAATAACTAAATAAGT
TGTCAAAATTTTATTTTCAAATTACGATAACAATAAATATGTTC

QA 1 464 1 464
DS 

RD RS1BW02TF 464 0 0
GGGTTCTTTACACACACCAAAATTTTCTGATAAAAAAAA*CATAATCAATTCATTCATAT
TACCAAGGATGAAAAAA*TCACTTATATTTTCATTCAATGTTTTAACTCTCCTCGTCATT
CTTGTACTAGTGGCCGGAGCGATGGGGCAAGGGAATAAAAATAAAAAAGATTTATGTCCC
ATATATCTAGATAACCAACAGCCTGGAAGTTGTAAGAACAAAGCAGCTTGCCAATCTGCG
TGCAACAAGAGGATACAAGGGTTAGGAATAAAGGAAGTAACCACTGGTTGTGTCCCGGGA
GACAAATGCGCCTGCTATACCCCATGTCCAAAATAATCTTTATGTTTAGTTTATTGACAA
CAGCATTCAGATATATTTATAATAAATTATGATGTTATTTATAGTAATAACTAAATAAGT
TGTCAAAATTTTATTTTCAAATTACGATAACAATAAATATGTTC

QA 1 464 1 464
DS 

RD RS1EK23TF 459 0 0
GG
ACACCAAAATTTTCTGATAAAAAAAA*CATAATCAATTCATTCATATTACCAAGGATGAA
AAAA*TCACTTATATTTTCATTCAATGTTTTAACTCTCCTCGTCATTCTTGTACTAGTGG
CCGGAGCGATGGGGCAAGGGAATAAAAATAAAAAAGATTTATGTCCCATATATCTAGATA
ACCAACAGCCTGGAAGTTGTAAGAACAAAGCAGCTTGCCAATCTGCGTGCAACAAGAGGA
TACAAGGGTCAGGAATAAAGGAAGTAACCACTGGTTGTGTCCCGGGAGACAAATGCGCCT
GCTATACCCCATGTCCAAAATAATCTTTATGTTTAGTTTATTGACAACAGCATTCAGATA
TATTTATAATAAATTATGATGTTATTTATAGTAATAACTAAATAAGTTGTCAAAATTTTA
TTTTCAAATTACGATAACAATAAATATGTTCATTTGC

QA 3 459 3 459
DS 

RD RS1DR60TF 537 0 0
GGGTTCTTTACACACACCAAAATTTTCTGATAAAAAAAA*CATAATCAATTCATTCATAT
TACCAAGGATGAAAAAA*TCACTTATATTTTCATTCAATGTTTTAACTCTCCTCGTCATT
CTTGTACTAGTGGCCGGAGCGATGGGGCAAGGGAATAAAAATAAAAAAGATTTATGTCCC
ATATATCTAGATAACCAACAGCCTGGAAGTTGTAAGAACAAAGCAGCTTGCCAATCTGCG
TGCAACAAGAGGATACAAGGGTCAGGAATAAAGGAAGTAACCACTGGTTGTGTCCCGGGA
GACAAATGCGCCTGCTATACCCCATGTCCAAAATAATCTTTATGTTTAGTTTATTGACAA
CAGCATTCAGATATATTTATAATAAATTATGATGTTATTTATAGTAATAACTAAATAAGT
TGTCAAAATTTTATTTTCAAATTACGATAACAATAAATATGTTCATTTGCATATGTAATA
AATGACAAAATAAGCTGTAAAAGTTAATTATAATTATCAACTTCTAAATTTTAAGCG

QA 1 537 1 537
DS 

RD RS1GF07JQ 539 0 0
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TACCAAGGATGAAAAAAATCACTTATATTTTCATTCAATGTTCTAACTCTCCTCGTCATT
CTTGTACTAGTGGCCGGAGCGATGGGGCAAGGGAATAAAAATAAAAAAGATTTATGTCCC
ATATATCTAGATAACCAACAGCCTGGAAGTTGTAAGAACAAGGCAGCTTGCCAATCTGCG
TGCAACAAGAGGATACAAGGGTCAGGAATAAAGGAAGTAACCACTGGTTGTGTCCCGGGA
GACAAATGCGCCTGCTATACCCCATGTCCAAAATAATCTTTATGTTTAGTTTATTGACAA
CAGCATTCAGATATATTTATAATAAATTATGATGTTATTTATAGTAATAACTAAATAAGT
TGTCAAAATTTTATTTTCAAATTACGATAACAATAAATATGTTCATTTGCATATGTAATA
AATGACAAAATAAGCTGTAAAAGTTAATTATAATTATCAACTTCTAAATTTTAAGCGCC

QA 1 539 1 539
DS 

RD RS1GF07TF 539 0 0
GGGTTCTTTACACACACCAAAATTTTCTGATAAAAAAAAACATAATCAATTCATTCATAT
TACCAAGGATGAAAAAAATCACTTATATTTTCATTCAATGTTCTAACTCTCCTCGTCATT
CTTGTACTAGTGGCCGGAGCGATGGGGCAAGGGAATAAAAATAAAAAAGATTTATGTCCC
ATATATCTAGATAACCAACAGCCTGGAAGTTGTAAGAACAAGGCAGCTTGCCAATCTGCG
TGCAACAAGAGGATACAAGGGTCAGGAATAAAGGAAGTAACCACTGGTTGTGTCCCGGGA
GACAAATGCGCCTGCTATACCCCATGTCCAAAATAATCTTTATGTTTAGTTTATTGACAA
CAGCATTCAGATATATTTATAATAAATTATGATGTTATTTATAGTAATAACTAAATAAGT
TGTCAAAATTTTATTTTCAAATTACGATAACAATAAATATGTTCATTTGCATATGTAATA
AATGACAAAATAAGCTGTAAAAGTTAATTATAATTATCAACTTCTAAATTTTAAGCG
CC

QA 1 537 1 537
DS 



CO CL546Contig2 509 2 3 U
GGTTGTTCTTTACACACAACAAAATTTTCTGATAAAAACATAATCAATTCATTCATATTA
CCAAGGATGAAAAAAATCACTTATATTTTCATTTAATGTGTTAACTATCCTCGTCATTCT
TGTACTAGTGGCCGGAGCGATGGGGCAAGGGAATAAAAATAAAAAAGATTTATGTCCCAT
ATATCTAGATAACCAACAGCCTGAAAGTTGTAAGAATAAGGCAGCTTGCCAATCTGCGTG
CAACAAGAGGATACAAGGGTCAGGAATAAAGGAAGTAACCACTGGTTGTGTCCCGGGAAA
CAAATGCGCCTGCTATACCCCATGTCCAAAATAATCTTAATGTTTAGTTTATTGACAACA
GAATTCAGATATATTTATAATAAATTATGATGTTATTTATAGTAATAATTAAATAAGTTG
TCAAATTTTTATTTTCAAATTACGATAACAATAAATATGTTCATTTGCATATGTAATAAA
TGACAAAATAAGCTGTAAAAGTTAATTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1GR89TF U 1
AF RS1GR48TF U 10
BS 1 75 RS1GR89TF
BS 76 76 RS1GR48TF
BS 77 509 RS1GR89TF

RD RS1GR89TF 509 0 0
GGTTGTTCTTTACACACAACAAAATTTTCTGATAAAAACATAATCAATTCATTCATATTA
CCAAGGATGAAAAAA*TCACTTATATTTTCATTTAATGTGTTAACTATCCTCGTCATTCT
TGTACTAGTGGCCGGAGCGATGGGGCAAGGGAATAAAAATAAAAAAGATTTATGTCCCAT
ATATCTAGATAACCAACAGCCTGAAAGTTGTAAGAATAAGGCAGCTTGCCAATCTGCGTG
CAACAAGAGGATACAAGGGTCAGGAATAAAGGAAGTAACCACTGGTTGTGTCCCGGGAAA
CAAATGCGCCTGCTATACCCCATGTCCAAAATAATCTTAATGTTTAGTTTATTGACAACA
GAATTCAGATATATTTATAATAAATTATGATGTTATTTATAGTAATAATTAAATAAGTTG
TCAAATTTTTATTTTCAAATTACGATAACAATAAATATGTTCATTTGCATATGTAATAAA
TGACAAAATAAGCTGTAAAAGTTAATTAT

QA 1 509 1 509
DS 

RD RS1GR48TF 500 0 0
GG
ACACACAACAAAATTTTCTGATAAAAACATAATCAATTCATTCATATTACCAAGGATGAA
AAAAATCACTTATATTTTCATTTAATGTGTTAACTATCCTCGTCATTCTTGTACTAGTGG
CCGGAGCGATGGGGCAAGGGAATAAAAATAAAAAAGATTTATGTCCCATATATCTAGATA
ACCAACAGCCTGAAAGTTGTAAGAATAAGGCAGCTTGCCAATCTGCGTGCAACAAGAGGA
TACAAGGGTCAGGAATAAAGGAAGTAACCACTGGTTGTGTCCCGGGAAACAAGTGCGCCT
GCTATACCCCATGTCCAAAATAATCTTAATGTTTAGTTTATTGACAACAGAATTCAGATA
TATTTATAATAAATTATGATGTTATTTATAGTAATAATTAAATAAGTTGTCAAATTTTTA
TTTTCAAATTACGATAACAATAAATATGTTCATTTGCATATGTAATAAATGACAAAATAA
GCTGTAAAAGTTAATTAT

QA 3 500 3 500
DS 



AS 1 6

CO CL547Contig1 1323 6 14 U
GGACGTCAGACAATGGCTTCTCTTTTGACTTCCCCATTAACAAAGTCCAAGCCTTTTTGC
CTCTCTTCACCTCCACGAACTCTAACCACAACACCGTCGTTAAACCTCACCAGAATCTCT
CTCACCCGCAGCCAAAAGCTCGCTCCTTTCAAGCTCCCGAGCCTCGTCTCCGCATTCTCT
GGAAAGGGTCCGAAGCGAGATGTCACCGCATCAGCTGCGGAGCCGGGAGATTACAGAAGG
ATAATGCTATCTGATGTGATGGTGAAGAAGAAGAAGGATAAGGTGCCGTGGTGGGAAAGA
GAATGGTTGCCGATGGACTTTGGAGCTGTTGCTGTGGTTCTGTCAATGCATGTGCTTAGT
CTTTTGGCTCCGTTTCAGTTTAACTGGAGAGCCGTGTTGGTTGCTTTTGGGCTTTATATC
GTTACTGGGCTTTTTGGTGTTACTCTGTCTTTCCATAGGAATCTCTCTCATAAGAGCTTC
AAGCTTCCTAAATGGCTTGAGTACTTGTTTGCTTATTGTGGAACTCAAGCTCTTCAGGGG
AACCCTATTGATTGGGTGAGTACACATAGGTACCATCATCAGTTCTGTGATTCAGACAGA
GATCCTCATAGTCCACTTGATGGGTTTTGGTTCAGTCATATGAATTGGATGTTTGATGCC
AATGCTATCACCCAAAGGGTTGGTGAGCGTAATAATGTTGGAGATCTAGAGAAGCAGCGG
TTCTATCAGTTCCTTAGATCTACTTACATTTGGCATCCGCTGGCTCTAGCAGTTGCTCTA
TACGCAATGGGAGGCTTCCCCTTCGTTGTTTGGGGGATGGGTGTAAGAATAGTATGGGTG
TATCATATAACTTGGTTAGTAAACTCAGCTTGTCATGTATGGGGGGAACAAGCATGGAAC
ACTGGAGATCTGTCTAAGAACAACTGGTTGGTAGCAGCTCTTGCGTTTGGAGAAGGATGG
CACAATAATCACCATGCTTTTGAGTTTTCAGCTAGACATGGCCTAGAGTGGTGGCAACTT
GATATGACTTGGTATGTCGTTAGATTCCTCCAAGCCCTTGGATTAGCAACCGATGTTAAG
CTGCCATCAGAAGCTCAGAAACAACAAATGGCATTGACTAGTGACTGATTTTAAAACTAC
GTGGTTACAACCAGTATATAATCAATACTGTACCATTGGCGCTATGAAAGTTCTAAAAGG
GGTTTGTGTTTACATAAAAAGGTATATATGTATGTGCAAGAGACTGTATGTGACAAACTG
ATTATGAATTTAATCTATTAAAACTGAAGTACAAAAATAAAATAGCCTTTAGTTTTCCTC
AAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
5 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1D196TF U 1
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AF RS1D255TF U 54
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AF RS1BD90TF U 1
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BS 777 786 RS1BD90TF
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TAAATGGCTCGAGTACTTGTTTGCTTATTGTGGAA

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ACCTCCACGAACTCTAACCACAACACCGTCGTTAAACCTCACCAGAATCTCTCTCACCCG
CAGCCAAAAGCTCGCTCCTTTCAAGCTCCCGAGCCTCGTCTCCGCATTCTCTGGAAAGGG
TCCGAAGCGAGATGTCACCGCATCAGCTGCGGAGCCGGGAGATTACAGAAGGATAATGCT
ATCTGATGTGATGGTGAAGAAGAAGAAGGATAGGGTGCCGTGGTGGGAAAGAGAATGGTT
GCCGATGGACTTTGGAGCTGTTGCTGTGGTTCTGTCAATGCATGTGCTTAGTCTTTTGGC
TCCGTTTCAGTTTAACTGGAGAGCCGTGTTGGTTGCTTTTGGGCTTTATATCGTTACTGG
GCTTTTTGGTGTTACTCTGTCTTTCCATAGGAATCTCTCTCATAAGAGCTTCAAGCTTCC
TAAATGGCTTGAGTACTTGTTTGCTTATTGTGGAACTCAAGCTCTTCAGGGGAACCCTAT
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TGATGCCAATACTATCACCCAAAGGGTT

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CAGCCAAAAGCTCGCTCCTTTCAAGCTCCCGAGCCTCGTCTCCGCATTCTCTGAAAAGGG
TCCGAAGCGAGATGTCACCGCATCAGCTGCGGAGCCGGGAGATTACAGAAGGATAATGCT
ATCTGATGTGATGGTGAAGAAGAAGAAGGATAAGGTGCCGTGGTGGGAAAGAGAATGGTT
GCCGATGGACTTTGGAGCTGTTGCTGTGGTTCTGTCAATGCATGTGCTTAGCCTTTTGGC
TCCGTTTCAGTTTAACTGGAGAGCTGTGTTGGTTGCTTTTGGGCTTTATATCGTTACTGG
GCTTCTTGGTGTTACTCTGTCTTTCCATAGGAATCTCTCTCATAAAAGCTTCAAGCTTCC
TAAATGGCTTGAGTACTTGTTTGCTTATTGTGGAACTCAAGCTCTTCAGGGGAACCCTAT
TGATTGGGTGAGTACACATAGGTACCATCATCAGTTCTGTGATTCAGACAGAGATCCTCA
TAGTCCACTTGATGGGTTTTGGTTCAGTCATATGAATTGGATGTTTGATGCCAATGCTAT
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CTCACCCGCAGCCAAAAGCTCGCTCCTTTCAAGCTCCCGAGCCTCGTCTCCGCATTCTCT
GGAAAGGGTCCGAAGCGAGATGTTACCGCATCAGCTGCGGAGCCGGGAGATTACAGAAGG
ATAATGCTATCTGATGTGATGGTGAAGAAGAAGAAGGATAAGGTGCCGTGGTGGGAAAGA
GAATGGTTGCCGATGGACTTTGGAGCTGTTGCTGTGGTTCTGTCAATGCATGTGCTTAGT
CTTTTGGCTCCGTTTCAGTTTAACTGGAGAGCCGTGTTGGTTGCTTTTGGGCTTTATATC
GTTACTGGGCTTTTTGGTGTTACTCTGTCTTTCCATAGGAATCTCTCTCATAAGAGCTTC
AAGCTTCCTAAATGGCTTGAGTACTTGTTTGCTTATTGTGGAACTCAAGCTCTTCAGGGG
AACCCTATTGATTGGGTGAGTACACATAGGTACCATCATCAGTTCTGTGATTCAGACAGA
GATCCTCATAGTCCACTTGATGGGTTTTGGTTCAGTCATATGAATTGGATGTTTGATGCC
AATACTATCACCCAAAGGGTTGGTGAGCGTA*TAATGTTGGAGATCTAGAGAAGCAGCCG
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TACGCA
TGGG

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DS 

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GCACAATAATCACCATGCTTTTGAGTTTTCAGCTAGACATGGCCTAGAGTGGTGGCAACT
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GCTGCCATCAGAAGCTCAGAAACAACAAATGGCATTGACTAGTGACTGATTTTAAAACTA
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GATTATGAATTTAATCTATTAAAACTGAAGTACAAAAATAAAATAGCCTTTAGTTTTCCT
CAAG

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DS 



AS 1 7

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ATCTCTTTCTTTGTCTCTTTATCACATATGTGTCTTCACAATCCTTGATACGACAAATCC
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AACGCAAACTCAGTAACCGCGAATCGGAACTAAGGAATTGGTACGGAAGAACCTATTCTT
GGGGTATCGTGAACCTTATCTCTTTCGATGATCTCAGAGATTCGTCAAAGGGTTTCCTTG
TGAATGACGCGTTGATCGTTGAAGTCCAATTGGAGGCTATTTCTACTACCACGTACTTCC
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ATTATTTTCGGCTATTATCAACCACTCAATTATAATAAGAATCCATGTCAAACTAAGAAA
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ATCGAGAAGTATTTT


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G168TF U 3
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AF RS1DC30TF U 10
AF RS1GB90TF U 280
AF RS1GE40TF U 280
AF RS1DC30JQ C 491
AF RS1GQ60JQ C 744
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BS 848 848 RS1DC30JQ
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BS 857 857 RS1DC30JQ
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BS 935 1275 RS1DC30JQ

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ACTATAATGTCTCTCATTCGAAGACGGTAACAGGTATGAGAAATCTTCGTCCATCAACCT
ATTCTTACAAGATTGAGACAAACGTTATAGACAAATTTGAAACTCGTCCTTTCACGGTTG
GTGGATACAATTGGATTCTCCATGTGTACCTTAATGGGAACACAAAGGATGGTGGTGCAG
GTTACGTTTCTCTTTACGTAGAAATAGACAAGTCAGGTTTCGATTCTGCACATCAAGAGG
TTTACGCGGATCTCAGGTTTTACATCTTCAACAGGAAGGAGAGGAAATATTTTACCATCC
AAGATACGGATGTGTGGCGATTCAATGCCTTCAACACGATGTGGGGATTCTCTCAGGTCC
TCCCCGTTGATACCTTCAAAGACCCGAAAAATGGTTACCTTTACGATGGAGAACACTGTG
AGTTTGGTGTTGATGTGACCGTTCCTACTCCCTTTGA

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CATCAACCTATTCTTACAAGATTGAGACAAACGTTATAGACAAATTTGAAACTCGTCCTT
TCACGGTTGGTGGATACAATTGGATTCTCCATGTGTACCTTAATGGGAACACAAAGGATG
GTGGTGCAGGTTACGTTTCTCTTTACGTAGAAATAGACAAGTCAGGTTTCGATTCTGCAC
ATCAAGAGGTTTACGCGGATCTCAGGTTTTACATCTTCAACAGGAAGGAGAGGAAATATT
TTACCATCCAAGATACGGATGTGTGGCGATTCAATGCCTTCAACACGATGTGGGGATTCT
CTCAGGTCCTCCCCGTTGATACCTTCAAAGACCCGAAAAATGGTTACCTTTACGATGGAG
AACACTGTGAGTTTGGTGTTGATGTGACCGTTCCTACTCCCTTTGAAGAATCAGAAACTT
TCTCAATCAGCAGTAGTTCTGATAAATTC

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DS 

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TTTGTCTCTTTATCACATATGTGTCTTCACAATCCTTGATACGACAAATCCCCGATGACT
TCAATACAGATCTAAAAGAAGTGCCTTACGTACAAAAACATCATGAGTTCTCATCGCGTC
ACTATAATGTCTCTCATTCGAAGACGGTAACAGGTATGAGAAATCTTCGTCCATCAACCT
ATTCTTACAAGATTGAGACAAACGTTATAGACAAATTTGAAACTCGTCCTTTCACGGTTG
GTGGATACAATTGGATTCTCCATGTGTACCTTAATGGGAACACAAAGGATGGTGGTGCAG
GTTACGTTTCTCTTTACGTAGAAATAGACAAGTCAGGTTTCGATTCTGCACATCAAGAGG
TTTACGCGGATCTCAGGTTTTACATCTTCAACAGGAAGGAGAGGAAGTATTTTACCATCC
AAGATACGGATGTGTGGCGATTCAATGCCTTCAACACGATGTGGGGATTCTCTCAGGTCC
TCCCCGTTGATACCTTCAAAGACCCGAAAAATGGTTACCTTTACGATGGAGAACACTGTG
AGTTTGGTGTTGATGTGACCGTTCCTACTCCCTTTGAAGAATCAGAAACTTTCTCAATCA
GCAGTAGTTCTGATAAATTCACCTGGAGAATTGAGA*CTTCTCCACGTTGGTCAAAGATG
CTTACACATCTGTGTTCTCTCTTG

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DS 

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G
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CAACACGATGTGGGGATTCTCTCAGGTCCTCCCCGTTGATACCTTCAAAGACCCGAAAAA
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CTTTGAAGAATCAGAAACTTTCTCAATCAGCAGTAGTTCTGATAAATTCACCTGGAGAAT
TGAGAACTTCTCCACGTTGGTCAAAGATGCTTACTCATCTGTGTTCTCTCTTGGAGGAAA
AAAATGGAACTTAAGAATGGTTCTAACTGGTTCTGGCTCCGGAAGCG*AAAATACGTTTC
ATTGTTTCTTCAACTTTCTACAAATCAGAGAAGAGCTTATGAGTACATTTATGTT

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G
CAAATTTGAAACTCGTCCTTTCACGGTTGGTGGATACAATTGGATTCTCCATGTGTACCT
TAATGGGAACACAAAGGATGGTGGTGCAGGTTACGTTTCTCTTTACGTAGAAATAGACAA
GTCAGGTTTCGATTCTGCACATCAAGAGGTTTACGCGGATCTCAGGTTTTACATCTTCAA
CAGGAAGGAGAGGAAATATTTTACCATCCAAGATACGGATGTGTGGCGATTCAATGCCTT
CAACACGATGTGGGGATTCTCTCAGGTCCTCCCCGTTGATACCTTCAAAGACCCGAAAAA
TGGTTACCTTTACGATGGAGAACACTGTGAGTTTGGTGTTGATGTGACCGTTCCTACTCC
CTTTGAAGAATCAGAAACTTTCTCAATCAGCAGTAGTTCTGATAAATTCACCTGGAGAAT
TGAGAACTTCTCCACGTTGGTCAAAGATGCTTACTCATCTGTGTTCTCTCTTGGAGGAAA
AAAATGGAACTTAAGAATGGTTCTAACTGGTTCTGGCTCCGGAAGCG*AAAATACGTTTC
ATTGTTTCTTCAACTTTCTACAAATCAGAGAAGAGCTTATGAGTACATTTATGTTCGAGT
CAAGTTTCGAGTTCTTAACCAACGCAAACTCAGTAACCGCGAATCCGAACTAAG
AATTGG

QA 2 655 2 655
DS 

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CCCCGTTGATAC*TTCAAAGACCCGAAAAATGGTTACCTTTACGATGGAGAACACTGTGA
GTTTGGTGTTGATGTGACCGTTCCTACTCCCTTTGAAGAATCAGAAACTTTCTCAATCAG
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TTACACATCTGTGTTCTCTCTTGGAGGAAAAAAATGGAACTTAAGAATGGTTCCAACTGG
TTCTGGCTCCGGAAGCGGAAAATACGTTTCATTGTTTCTTCAACTTTCTACAAATCAAAG
AAGAGCATATGAGTACATTTATGTTCGAGTCAAGTTTCGAGTTCTTAACCAACGCAAACT
CAGTAACCGCGAATCGGAACTAAGGAATTGGTACGGAAGAACCTATTCTTGGGGTATCGT
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TAAAGGAACATTCAGCTCTATCTTTGTGTTATTACCAACCCTTTTGTGTTATTATTTTCG
GCTATTATCAACCACTCAATTATAATAAGAATCCATGTCAAACTAAGAAAAAAGATTCGT
AAATATATGTAATGTTTTGTTGAATGAACTTTGTAATCCCCTTCTTATTAATCGAGAAGT
ATTTT

QA 1 785 1 785
DS 

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AGCGGAAAATACGTTTCATTTTTTCTTCAACTTTCTACAAATCAAAGAAGAGCATATGAG
TACATTTATGTTCGAGTCAAGTTTCGAGTTCTTAACCAACGCAAACTCAGTAACCGCGAA
TCGGAACTAAGGAATTGGTACGGAAGAACCTATTCTTGGGGTATCGTGAACCTTATCTCT
TTCGATGATTTCAGAGATTCGTCAAAGGGTTTCCTTGTGAATGACGCGTTGATCGTTGAA
GTCCAATTGGAGGCTATTTCTACTACCACGTACTTCCCTTAGTTAACTAAAGGAACATTC
AGCTCTATCTTTGTGTTATTACCAACCCTTTTGTGTTATTATTTTCGGCTATTATCAACC
ACTCAATTATAATAAGAATCCATGTCAAACTAAGAAAAAAGATTCGTAAATATATGTAAT
GTTTTGTTGAATGAACTTTGTAATCCCCTTCTTATTAATCGAGAA

QA 1 525 1 525
DS 



AS 2 8

CO CL549Contig1 760 6 19 U
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ATTTTTTTTTATGATAACAAGTTTTGAGAATGAACATCATAAAAGTACAAAGAAGTTACA
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ACAACCAACTCTGACTAGTTAA*CAACAACTCCTCCTCCTCCCTCTCTTGTTCAACGAGG
CTGGTGGATGTTTCTTGGAACAGCAACCCTCTGGTTTGCCCATTTAGCTGGCTTCTCCGA
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TTCACTGTCGTAGAAACCATCTACCCCTTGGTGCTGGCTGATCCAGTAGTCATGGTACCA
CGTCGATATCGTCACCAACTGCCACCACTCCGGCGAAAAATCCTCCACTTGCCGTACGGC
CGCCGGAACAAACAGTGGCGCGTCGGGGTTTAGAGTAGAACGTCTTCCTGAAACCATCGC
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GATAAAAAGCGAAACGGATTAGGACAGAACACGAATGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1BL26JQ U 164
AF RS1BL26TF C 44
AF RS1ES08JQ U 71
AF RS1BC57TF C 1
AF RS1ES08TF C 494
AF RS1BC57JQ U 71
BS 1 70 RS1BC57TF
BS 71 163 RS1BC57JQ
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RD RS1BL26JQ 251 0 0
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CTCGATCTCCTAACCATCTCACCGTCCTTCCCTAAACCACCTGCGTGGTAAATCTCTACA
TCAAACTCATC

QA 1 251 1 251
DS 

RD RS1BL26TF 420 0 0
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AGTACAAAGAAGTTACATGTTCTCTTATGGGAAAGCAAATAATAAAAAAAAATTACA*AA
GGTACAGTGGCTAACATACAACCAACTCTGACTAGTTAA*CAACAACTCCTCCTCCTCCC
TCTCTTGTTCAACGAGGCTGGTGGATGTTTCTTGGAACAGCAACCCTCTGGTTTGCCCAT
TTAGCTGGCTTCTCCGCATACCTAGCCGGTTCAACAATCAACTTAGGACTCCTGTTCCCT
CTCGATCTCCTAACCATCTCACCGTCCTTCCCTAAACCACCTGCGTGGTAGATCTTTACA
TCAAACTCATCAGCCACGAAGAGATCTTCCATGTCATCGAAATCAAACGACTCTGGTAGA

QA 1 420 1 420
DS 

RD RS1ES08JQ 645 0 0
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TGGGAAAGCAAATACTAAAAAAAA*TTACATAAGGTACAGTGGCTAACATACAACCAACT
CTGACTAGTTAAACAACTCCTCCTCCTCCTCCCTCTCTTGTTCAACGAGGCTGGTGGATG
TTTCTTGGAACAGCAACCCTCTGGTTTGCCCATTTAGCTGGCTTCTCCGAATACTTAGCC
GGTTCAACAATCAACTTAGGACTCCTGTTCCCTCTCGATCTCCTCACCATCTCACCGTTC
TTCCCTAAACCACCTGCGTGGTAGATCTCTACATCAAACTCATCAGCCACGAAGAGATCT
TCCATGTCATCGAAATCAAACGACTCTGGTAGAAGATCAGCTACATCGACTTCACTGTCG
TAAAAACCATCTGCCCCTTGGTGCTGGCTGATCCAGTAGTCATGGTACCACGTCGATATC
GTCACCAACTGCCACCACTCCGGCGAAAAATCCTCCACTTGCCGTACGGCCGCCGGAACA
AACAGTGGCGCGTCGGGGTTTAGAGTAGAACGTCTTCCTGAAACCATCGCCATGTTCTTC
TTTAAGATCTCTTTGTGTTAAGAAAATATCTGGAATTCTTT
CTTG

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1BC57TF 760 0 0
GGAATAACTCTAGCTAGTCTCATTCTCATTCAAAGTTTACAACTTTTTTTTATGTTTTAC
ATTTTTTTTTATGATAACAAGTTTTGAGAATGAACATCATAAAAGTACAAAGAAGTTACA
TGTTCTCTTATGGGAAAGCAAATACTAAAAAAAA*TTACATAAGGTACAGTGGCTAACAT
ACAACCAACTCTGACTAGTTAA***ACAACTCCTCCTCCTCCCTCTCTTGTTCAACGAGG
CTGGTGGATGTTTCTTGGAACAGCAACCCTCTGGTTTGCCCATTTAGCTGGCTTCTCCGA
ATACTTAGCCGGTTCAACAATCAACTTAGGACTCCTGTTCCCTCTCGATCTCCTCACCAT
CTCACCGTTCTTCCCTAAACCACCTGCGTGGTAGATCTCTACATCAAACTCATCAGCCAC
GAAGAGATCTTCCATGTCATCGAAATCAAACGACTCTGGTAGAAGATCAGCTACATCGAC
TTCACTGTCGTAGAAACCATCTACCCCTTGGTGCTGGCTGATCCAGTAGTCATGGTACCA
CGTCGATGTCGTCACCAACTGCCACCACTCCGGCGAAAAATCCTCCACTTGCCGTACGGC
CGCCGGAACAAACAGTGGCGCGTCGGGGTTTAGAGTAGAACGTCTTCCTGAAACCATCGC
CATGTTCTTCTTTAAGATCTCTTTGTGTTAAGAAAATATCTGGAATTCTTT*CTTGTCTT
GATAAAAAGCGAAACGGATTAGGACAGAACACGAATGTCC

QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1ES08TF 267 0 0
AAACCATCTGCCCCTTGGTGCTGGCTGATCCAGTAGTCATGGTACCACGTCGATATCGTC
ACCAACTGCCACCACTCCGGCGAAAAATCCTCCACTTGCCGTACGGCCGCCGGAACAAAC
AGTGGCGCGTCGGGGTTTAGAGTAGAACGTCTTCCTGAAACCATCGCCATGTTCTTCTTT
AAGATCTCTTTGTGTTAAGAAAATATCTGGAATTCTTT*CTTGTCTTGATAAAAAGCGAA
ACGGATTAGGACAGAACACGAATGTCC

QA 1 267 1 267
DS 

RD RS1BC57JQ 653 0 0
ATGATAACAAGTTTTGAGAATGAACATCATAAAAGTACAAAGAAGTTACATGTTCTCTTA
TGGGAAAGCAAATACTAAAAAAAA*TTACATAAGGTACAGTGGCTAACATACAACCAACT
CTGACTAGTTAA***ACAACTCCTCCTCCTCCCTCTCTTGTTCAACGAGGCTGGTGGATG
TTTCTTGGAACAGCAACCCTCTGGTTTGCCCATTTAGCTGGCTTCTCCGAATACTTAGCC
GGTTCAACAATCAACTTAGGACTCCTGTTCCCTCTCGATCTCCTCACCATCTCACCGTTC
TTCCCTAAACCACCTGCGTGGTAGATCTCTACATCAAACTCATCAGCCACGAAGAGATCT
TCCATGTCATCGAAATCAAACGACTCTGGTAGAAGATCAGCTACATCGACTTCACTGTCG
TAGAAACCATCTACCCCTTGGTGCTGGCTGATCCAGTAGTCATGGTACCACGTCGATGTC
GTCACCAACTGCCACCACTCCGGCGAAAAATCCTCCACTTGCCGTACGGCCGCCGGAACA
AACAGTGGCGCGTCGGGGTTTAGAGTAGAACGTCTTCCTGAAACCATCGCCATGTTCTTC
TTTAAGATCTCTTTGTGTTAAGAAAATATCTGGAATTCTTTTCTTGTCTTGAT

QA 1 653 1 653
DS 



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TGACAAAAGATGGATCGGTCAAGACGGACTGAGGGAGACTATTCAGAGGGGATGGGATGA
CACTTCAAGGAATAATGCAGGAGAAAGGGCGAGCAATTTTGTTTCAAGACTTATAAATTG
TAGGCATGAGATCTCAACATGGCGCAAGAATAATCCTCCTTACGGGAAGGAAAAAATCGG
TGAGCTTCAGAAGGCTCTTGAAGAAGTACAAACGGATAATAATAGTACTCAAGAAGATAT
CTTAAATATATCTAGGAAGCTACAGGAGGCGTATAAGGATGAAGAGGAATATTGGCATCA
AAAAAGTCGGAATACGTGGAACACAAAGAGATCTTAAAGAAGAACATGGCGATGGTTTCA
GGAGGACGTTCTACTCTAAACCCCGACGCGCCACTGTTTGTTCCGGCGGCCGTACGGCAA
GTGGAGGATTTTTCGCCGGAGTGGTGGCAGTTGGTGACGACATCGACGTGGTACCATGAC
TACTGGATCAGCCAGCACCAAGGGGCAGATGGTTTCTACGACAGTGAAGTCGATGTAGCT
GATCTTCTACCAGAGTCGTTTGATTTCGATGACATGGAAGATCTCTTCGTGGCTGATGAG
TTTGATGTAGAGATCTACCACGCAGGTGGTTTAGGGAAGAACGGTGAGATGGTGAGGAGA
TCGAGAGGGAACAGGAGTCCTAAGTTGATTGTTGAACCGGCTAAGTATTCGGAGAAGCCA
GCTAAATGGGCAAACCAGAGGGTTGCTGTTCCAAGAAACATCCACCAGCCTCGTTGAACA
AGAGAGGGAGGAGGAGGAGGAGTTGTTTAACTAGTCGGAGTTGGTTGTATGTTAGCCACT
GTACCTTATGTAATTTTTTTTAGTATTTGCTTTCCCATAAGAGAACATGTAACTTCTTTG
TACTTTTATGATGTTCATTCTCAAAACTTGTTATCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BS93TF U 1
AF RS1BS93JQ C 298
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BS 661 997 RS1BS93JQ

RD RS1BS93TF 660 0 0
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CTTAAATATATCTAGGAAGCTACAGGAGGCGTATAAGGATGAAGAGGAATATTGGCATCA
AAAAAGTCGGAATACGTGGAACACAAAGAGATCTTAAAGAAGAACATGGCGATGGTTTCA
GGAGGACGTTCTACTCTAAACCCCGACGCGCCACTGTTTGTTCCGGCGGCCGTACGGCAA
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TACTGGATCAGCCAGCACCAAGGGGCAGATGGTTTCTACGACAGTGAAGTCGATGTAGCT
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QA 1 660 1 660
DS 

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TTGTACTTTTATGATGTTCATTCTCAAAACTTGTTATCAT

QA 1 700 1 700
DS 



AS 2 7

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GACAATAGTTTCCACATCCTGCAACCCAACTCCTACACAAACGGTCTTGGAAGGGGTTCT
AACTGAATCAGTCATCACAGCATCGGTCTCGTTCACCACTCTAACGTTTGGACCATCTCT
ACACTTCCCCATGCACTTGCAAGCCACAGCAAATCCTTCCATCCCCGTCATCGCCTTCTG
AAACTCATCCAACAACACAGCTCCTCCTGATTTCTTGCGCTTTCCTCCCATACAGACTTC
TATTCTCTTCGACGGCAATCCAACAACCGGAACTGCTTCCACCGTCTTCAATGGCAATCC
AGGATTAACAACTGAGGGAAAAGCTGTAGACGCAGCAGCTGATTGCAGCAGAGCGAGCTT
CAATGCTTCACCGGTGTTCTTGCAAGAATCTTCTTGGATTCTAGGAAGGGTTGCTACTCC
AGACTCTGGTTGTAACGGCTCGAGAATCGCCTTGTTTCTGAAAGAGCTCATGTCAACAAC
TTTCCCTTTCCCACAATCACTGTCACTTGATTCAGACGAAGAAGAAGAAGATTCAGCTGC
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GCTTCCGGATCAAGACCAAACCCTATGCTTGAAAACATATTCAAGTTCTTAGAAAGAGCT
TTAAGAACCTTAGCCTTCTTCTTCATCTCCTTCTTCTCCTTCTCCATAACCTTCACCTTA
TCCTTCCCCTCACCGCCGCATCTCGTCGTCGTCGTCCCAGAATTACACATGTGCCCTTTA
TCGGCAAACTCGTTATTACACGTGATCCCTCTGAATCTCCTCGTCCTAAACCCGACCGTC
GTCGTCCTCGTGTTGCCGGAAAATCGGAGACCGGAGTAACGGCCGTCGGTGACGGAGCTT
GAGACGCACGGAATCTGTCGGAGAACGACGCCGGAAACTTCCATCTCTAGCTTCTGTCTG
AAAACCTTCGATGAACTCGACTTTGAGCCTTAAAGCGATCGTGTTCTGTTTTACACGATG
TCCTTTGAGGCTCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCTTATGTCCGGT


BQ
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5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E474JQ U 1
AF RS1A206TR U 3
AF RS1A206JQ U 1
AF RS1A206TV C 360
AF RS1A206TF C 455
BS 1 331 RS1A206JQ
BS 332 332 RS1E474JQ
BS 333 794 RS1A206JQ
BS 795 1253 RS1A206TV

RD RS1E474JQ 516 0 0
ACAA
AAAAAAGGTTTATATTATCAATGTTCCACTCGAAAATGCACACGAAAACATTTATGTACA
ATGAGAAAAAAAACACCATACTATGCATATATCAATTTGATCATATGTTTAAACACTTTC
CATACGAGGCATGATCCAAAACCTTCTCTCCTGCATTATTCACCAAAAAAACTTGTGACA
ATAGTTTCCACATCCTGCAACCCAACTCCTACACAAACGGTCTTGGAAGGGGTTCTGACT
GAATCAGTCATCACAGCATCGGTCTCGTTCACCACTCTAACGTTTGGACCATCTCTACAC
TTCCCCATGCACTTGCAAGCCACAGCAAATCCTTCCATCCCCGTCATCCCCTTCTGAAAC
TCATCCAACAACACAGCTCCTCCTGATTTCTTGCACTTTCCTCCCATACAAACTTCTATT
CTCTTCGACGGCAATCCAACAACCGGAACTGCTTCCACCGTCTTCAATGGCAATCCAGGA
TTAACAACTGAGGGAAAAGC
CGTGGATGCAGC

QA 5 504 5 504
DS 

RD RS1A206TR 690 0 0
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CAATGAGAAAAAGAACACCATACTATGCATATATCAATTTGATCATATGTTTAAACACTT
TCCATACGAGGCATGATCCAAAACCTTCTCTCCTGCATTATTCACCAAAAAAACTTGTGA
CAATAGTTTCCACATCCTGCAACCCAACTCCTACACAAACGGTCTTGGAAGGTGTTCTAA
CTGAATCAGTCATCACAGCATCGGTCTCGTTCACCACTCTAACGTTTGGACCATCTCTAC
ACTTCCCCATGCACTTGCAAGCCACAGCAAATCCTTCCATCCCCGTCATCGCCTTCTGAA
ACTCATCCAACAACACAGCTCCTCCTGATTTCTTGCGCTTTCCTCCCATACAGACTTCTA
TTCTCTTCGACGGCAATCCAACAACCGGAACTGCTTCCACCGTCTTCAATGGCAATCCAG
GATTAACAACTGAGGGAAAAGCTGTAAACGCAGCAGCTGATTGCAGCAAAGCGAGCTTCA
ATGCTTCACCGGTGTTCTTGCAAGAATCTTCTTGGATTCTAGGAAGGGTTGCTACTCCAG
ACTCTGGTTGTAACGGCTCGAGAATCGCCTTGTTTCTGAAAGAGCTCATGTCAACAACTT
TCCCTTTCCCACAATCACTGTCACTTGATT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1A206JQ 794 0 0
ACAGAAAAGAGGTTTATATTATCAATGTTCCACTCGAAAATGCACACGAAGACATTTATG
TACAATGAGAAAAAGAACACCATACTATGCATATATCAATTTGATCATATGTTTAAACAC
TTTCCATACGAGGCATGATCCAAAACCTTCTCTCCTGCATTATTCACCAAAAAAACTTGT
GACAATAGTTTCCACATCCTGCAACCCAACTCCTACACAAACGGTCTTGGAAGGGGTTCT
AACTGAATCAGTCATCACAGCATCGGTCTCGTTCACCACTCTAACGTTTGGACCATCTCT
ACACTTCCCCATGCACTTGCAAGCCACAGCAGATCCTTCCATCCCCGTCATCGCCTTCTG
AAACTCATCCAACAACACAGCTCCTCCTGATTTCTTGCGCTTTCCTCCCATACAGACTTC
TATTCTCTTCGACGGCAATCCAACAACCGGAACTGCTTCCACCGTCTTCAATGGCAATCC
AGGATTAACAACTGAGGGAAAAGCTGTAGACGCAGCAGCTGATTGCAGCAGAGCGAGCTT
CAATGCTTCACCGGTGTTCTTGCAAGAATCTTCTTGGATTCTAGGAAGGGTTGCTACTCC
AGACTCTGGTTGTAACGGCTCGAGAATCGCCTTGTTTCTGAAAGAGCTCATGTCAACAAC
TTTCCCTTTCCCACAATCACTGTCACTTGATTCAGACGAAGAAGAAGAAGATTCAGCTGC
TTAACCAGAATCTCTGTCGCTTCCGAGATCGTCTTGTTCTGAATCTCAGAGACCAAACCG
GCTTCCGGATCAAG

QA 1 794 1 794
DS 

RD RS1A206TV 894 0 0
GAAACTCATCCAACAACACAGCTCT**CTGATTTCTTGCGCTTTCCTCCCATACAGACTT
CTATTCTCTTCGACGGCAATCCAACAACGGGAACTGCTTCCAC*GTCTTCAATGGCAATC
CAGGATTAACAACTGAGGGAAAAGCTGTAGACGCAGCAGCTGATTGCAGCAGAGCGAGCT
TCAATGCTTCACCGGTGTTCTTGCAAGAATCTTCTTGGATTCTAGGAAGGGTTGCTACTC
CAGACTCTGGTTGTAACGGCTCGAGAATCGCCTTGTTTCTGAAAGAGCTCATGTCAACAA
CTTTCCCTTTCCCACAATCACTGTCACTTGATTCAGACGAAGAAGAAGAAGATTCAGCTG
CTTAACCAGAATCTCTGTCGCTTCCGAGATCGTCTTGTTCTGAATCTCAGAGACCAAACC
GGCTTCCGGATCAAGACCAAACCCTATGCTTGAAAACATATTCAAGTTCTTAGAAAGAGC
TTTAAGAACCTTAGCCTTCTTCTTCATCTCCTTCTTCTCCTTCTCCATAACCTTCACCTT
ATCCTTCCCCTCACCGCCGCATCTCGTCGTCGTCGTCCCAGAATTACACATGTGCCCTTT
ATCGGCAAACTCGTTATTACACGTGATCCCTCTGAATCTCCTCGTCCTAAACCCGACCGT
CGTCGTCCTCGTGTTGCCGGAAAATCGGAGACCGGAGTAACGGCCGTCGGTGACGGAGCT
TGAGACGCACGGAATCTGTCGGAGAACGACGCCGGAAACTTCCATCTCTAGCTTCTGTCT
GAAAACCTTCGATGAACTCGACTTTGAGCCTTAAAGCGATCGTGTTCTGTTTTACACGAT
GTCCTTTGAGGCTCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCTTATGTCCGGT

QA 1 894 1 894
DS 

RD RS1A206TF 754 0 0
TGCTTCCA
CGTCTTCAATGGCAATCCAGGATTAACAACTGAGGGAAAAGCTGTAGACGCAGCAGCTGA
TTGCAGCAGAGCGAGCTTCAATGCTTCACCGGTGTTCTTGCAAGAATCTTCTTGGATTCT
AGGAAGGGTTGCTACTCCAGACTCTGGTTGTAACGGCTCGAGAATCGCCTTGTTTCTGAA
AGAGCTCATGTCAACAACTTTCCCTTTCCCACAATCACTGTCACTTGATTCAGACGAAGA
AGAAGAAGATTCAGCTGCTTAACCAGAATCTCTGTCGCTTCCGAGATCGTCTTGTTCTGA
ATCTCAGAGACCAAACCGGCTTCCGGATCAAGACCAAACCCTATGCTTGAAAACATATTC
AAGTTCTTAGAAAGAGCTTTAAGAACCTTAGCCTTCTTCTTCATCTCCTTCTTCTCCTTC
TCCATAACCTTCACCTTATCCTTCCCCTCACCGCCGCATCTCGTCGTCGTCGTCCCAGAA
TTACACATGTGCCCTTTATCGGCAAACTCGTTATTACACGTGATCCCTCTGAATCTCCTC
GTCCTAAACCCGACCGTCGTCGTCCTCGTGTTGCCGGAAAATCGGAGACCGGAGTAACGG
CCGTCGGTGACGGAGCTTGAGACGCACGGAATCTGTCGGAGAACGACGCCGGAAACTTCC
ATCTCTAGCTTCTGTCTGAAAACCTTCGATGAACTCGACTTTGAGCCTTAAAGCGATCGT
GTTCTGTTTTACACGATGTCCTTT
GA

QA 9 752 9 752
DS 



CO CL550Contig2 761 2 3 U
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TAAGAACTTGAATATGTTTTCAAGCATAGGGTTTGGTCTTGATCCGGAAGCCGGTTTGGT
CGCTGAGATTCAAAACAAGACGATCTCGGAAGCAACGGAGATTCTGGTTAAGCAGCTGGA
TCAGTTGAAAGCAGAGGAGAAGCTATTGAAGAAACAGAGGAAAGAAGAAAAGGCAAAGGC
TAAAGCTTTGAAGATGATGACTGAGATGGACTCTGAATCTTCTTCTTCTTCGTCTGAATC
AAGTGACAGTGACTGTGGCAAAGGGAAAGTTGTTGACATGAGCTCTTTCAGAAACAAGGC
GATTCTTGAGCCGTTACAACCAGAATCTGGAGTAGCAACCCTTCCTAGAATCCAAGTGCA
TGGGGAAGTGTAGAGATGGTCCAAACGTTAGAGTGGTGAACGAGACCGATGCTGTGACGA
CTGATTCAGTCAGAACACCTTCCAAGACCGTTTGTGTAGGAGTTGGGTTACAGGATGTGG
AAACTATTGTCACAAGTTTTTTTGGTGAATAATGCAGGAGAGAAGGTTTTGGATCATGCC
TCGTATGGAAAGTGTTTAAACATATGATCAAATTGATATATGCATAGTGTGGTGTTCTTT
TTCTCATTGTACATACATGTCTTCGTGTGCATTTTCGAGTGGAACATTGGTAATATAAAC
CTCTTTTCTGTACTTTGGTCTTGACAAAGAAACCTATGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DC38JQ C 1
AF RS1DC38TF U 1
BS 1 14 RS1DC38JQ
BS 15 744 RS1DC38TF
BS 745 761 RS1DC38JQ

RD RS1DC38JQ 761 0 0
GATGGAGAAGGAGAAGAAGAAGGAGATGAAGAAGAAGGCTAAGGTTCTTAAAGCTCTTTC
TAAGAACTTGAATATGTTTTCAAGCATAGGGTTTGGTCTTGATCCGGAAGCCGGTTTGGT
CGCTGAGATTCAAAACAAGACGATCTCGGAAGCAACGGAGATTCTGGTTAAGCAGCTGGA
TCAGTTGAAAGCAGAGGAGAAGCTATTGAAGAAACAGAGGAAAGAAGAAAAGGCAAAGGC
TAAAGCTTTGAAGATGATGACTGAGATGGACTCTGAATCTTCTTTTTCTTCGTTTGAATC
AAGTGACAGTGACTGTGGCAAAGGGAAAGTTGTTGACATGAGCTCTTTCAGAAACAAGGC
GATTCTTGAGCCGTTACAACCAGAATCTGGAGTAGCAACCCTTCCTAGAATCCAAGTGCA
TGGGGAAGTGTAGAGATGGTCCAAACGTTAGAGTGGTGAACGAGACCGATGCTGTGACGA
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AAACTATTGTCACAAGTTTTTTTGGTGAATAATGCAGGAGAGAAGGTTTTGGATCATGCC
TCGTATGGAAAGTGTTTAAACATATGATCAAATTGATATATGCATAGTGTGGTGTTCTTT
TTCTCATTGTACATACATGTCTTCGTGTGCATTTTCGAGTGGAACATTGGTAATATAAAC
CTCTTTTCTGTACTTTGGTCTTGACAAAGAAACCTATGTTG

QA 1 761 1 761
DS 

RD RS1DC38TF 744 0 0
GATGGAGAAGGAGA
AGAAGAAGGAGATGAAGAAGAAGGCTAAGGTTCTTAAAGCTCTTTCTAAGAACTTGAATA
TGTTTTCAAGCATAGGGTTTGGTCTTGATCCGGAAGCCGGTTTGGTCGCTGAGATTCAAA
ACAAGACGATCTCGGAAGCAACGGAGATTCTGGTTAAGCAGCTGGATCAGTTGAAAGCAG
AGGAGAAGCTATTGAAGAAACAGAGGAAAGAAGAAAAGGCAAAGGCTAAAGCTTTGAAGA
TGATGACTGAGATGGACTCTGAATCTTCTTCTTCTTCGTCTGAATCAAGTGACAGTGACT
GTGGCAAAGGGAAAGTTGTTGACATGAGCTCTTTCAGAAACAAGGCGATTCTTGAGCCGT
TACAACCAGAATCTGGAGTAGCAACCCTTCCTAGAATCCAAGTGCATGGGGAAGTGTAGA
GATGGTCCAAACGTTAGAGTGGTGAACGAGACCGATGCTGTGACGACTGATTCAGTCAGA
ACACCTTCCAAGACCGTTTGTGTAGGAGTTGGGTTACAGGATGTGGAAACTATTGTCACA
AGTTTTTTTGGTGAATAATGCAGGAGAGAAGGTTTTGGATCATGCCTCGTATGGAAAGTG
TTTAAACATATGATCAAATTGATATATGCATAGTGTGGTGTTCTTTTTCTCATTGTACAT
ACATGTCTTCGTGTGCATTTTCGAGTGGAACATTGGTAATATAAACCTCTTTTCTGTACT
TTGGTCTTGA

QA 15 744 15 744
DS 



AS 1 7

CO CL551Contig1 1072 7 14 U
GGGACCCAACACTCGTATCGCAACTATTGCTACCTACCTCCTCCCTCTTCTCTTACATCA
TTACTAGGCCATCAAACATTCAAACCTAACCCCAAACTCAAACCATGTCTTCTTCCCATT
GTCCGTCACCGTTACCCTCCGTCACCAAACTTCAAGTAGACTGCGTTACTTTTCCACCCT
CAGTCATCTCACCGGCTTCCTCCACTCCCCTCTTCCTCGGTGGCGCAGGCGTGCGAGGTT
TGGACATACACGGAAAATTCGTGATCTTCACCGTCATTGGAGTTTATCTAGCTCCTGTCG
CCGTCCCGTCACTTTCCGTTAAGTGGAAAGGCAAAACGACAGAGGAGTTAACGGAATCCG
TCCCCTTCTTCCGTGAAATCGTCACAGGTTCGTTTGAAAAGTTTATTAAGGTGACGATGA
AACTGCCGTTAACGGGACATCAATATTCCGAGAAAGTTACGGAGAACTGTGTGGCGATTT
GGAAATCGCTAGGTATCTACACAGACGCTGAAGCTAAAGCTGTGGAGAGGTTCTTGGAAG
TCTTCAAGGACCAAACGTTCCCTCCTGGTGCTTCGATCCTCTTTGCTCTCTCCCCTAACG
GGTCTCTCACGATTGCCTTTTCCAAGGACGATCATATTCCTAAAACCGGAAAAGCCGTGA
TCGAGAATAAATTGCTGGCAGAGGCAGTTCTTGAATCGATCATAGGAAAGAAGGGTGTGT
CTCCTGGGGCTAGGTTGAGTCTTGCCGAGAGATTATCTCAGCTGATGAAGGAGAACAAGG
TCGAAGAAGATGCAACAAAGACTGATAATCAAGATGAAGCTAACGATCTCTCCCTTGGAG
ATAAGTTGGCCAAAGAGAACTAATCGTGTGGGAGGTTTTTCTTGGTCGTCTTTGAGGGCT
TTATGTTTCTATTTCTAATCATGTTGTTTATTTCACATCTCACATGTGTTTATTTGCTTC
TACTCGTAAGAATAATTAAATAATCTCATAAAATTAGAACAAATCTACCAAAACTGTATT
ATCAGTGATGTTGATTCTATAAATTATGAACAAAACCGATTATCTGATGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TGGACATACACGGAAAATTCGTGATCTTCACCGTCATCGGAGTTTATCTAGCTCCTGTCG
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GG
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GCCATCAAACATTCAAACCTAACCCCAAACTCAAACCATGTCTTCTTCCCATTGTCCGTC
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CTCACCGGCTTCCTCCACTCCCCTCTTCCTCGGTGGCGCAGGCGTGCGAGGTTTGGACAT
ACACGGAAAATTCGTGATCTTCACCGTCATTGGAGTTTATCTAGCTCCTGTCGCCGTCCC
GTCACTTTCCGTTAAGTGGAAAGGCAAAACGACAGAGGAGTTAACGGAATCCGTCCCCTT
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TAAATTGCTGGC

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GG
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CCCTCAGTCATCTCACCGGCTTCCTCCACTCCCCTCTCCCTCGGTGGCGCAGGCGTGCGA
GGTTTGGACATACACGGAAAATTCGTGATCTTCACCGTCATTGGAGTTTATCTAGCTCCT
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ATTTGGAAATCGCTAGGTATCTACACAGACGCTGAAGCTAAAGCTGTGGAGAGGTTCTTG
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AACGGGTCTCTCACGATTGCCTTTTCCAAGGACGATCATATTCCTAAAACCGGAAAAGCC
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G
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ATCTTCACCGTCATTGGAGTTTATCTAGCTCCTGTCGCCG*CCCGTCACTTTCCGTTAAG
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TATTCCGAGAAAGTTATGGAGAACTGTGTGGCGATTTGGAAATCGCTAGGTATCTACACA
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CTAA

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CTTCTTCCGTGAAATCGTCACAGGTTCGTTTGAAAAGTTTATTAAGGTGACGATGAAACT
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C

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GGACCAAACGTTCCCTCCTGGTGCTTCGATCCTCTTTGCTCTCTCCCCTAACGGGTCTCT
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GGCCAAAGAGAACTAATCGTGTGGGAGGTTTTTCTTGGTCGTCTTTGAGGGCTTTATGTT
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ATGTTGATTCTATAAATTATGAACAAAACCGATTATCTGATGATG

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DS 



AS 2 7

CO CL552Contig1 1041 2 8 U
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CACTCTCGACGGTAGAGAGAGGAGCTGCTGCTCTCCGGCGAATCTGCGCAAGCCCTAACT
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TGCAATGCATCAATACAACGACCCAACTGTGGATTTATCTGAACGACCAATCGTGTACTA
TGGAGGGAGTGTTTGGGGCAAACTACCTCACCAGATCCTGGCTGCAGCAAACAATACATT
ACCTCCAAAGATATCGCCAGCTGATTACAGAGCTGAAGTTCGCCGAGGATTGCTGACTCC
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CTCATTCGTATCAATAGCCTCTTCGACGCTACTGGCTATTCTTGGCAAGTGCGAGTTTTT
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AW78TF U 1
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BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C812TF U 4
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AF RS1CX27JQ C 7
AF RS1CX27TF U 7
AF RS1C812JQ C 4
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AGTGTTTGGGGCAAACTACCTCACCAGATCCTGGCTGCAACAAACAATACATTACCTCCA
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CCAAAGATATCGCCAGCTGATTACAGAGCTGAAGTGCGCCGAGGATTGCTGACTCCAAGA
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AC

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DS 



AS 1 4

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TGTAATCGAATTATTGGCCATTATTATTTCTGCCCTACC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 0 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GB46TF U 4
AF RS1AW65TF U 1
AF RS1CB40TF U 417
AF RS1GB46JQ C 556
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BS 87 705 RS1AW65TF
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GG
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AGAGCGTTTCCAGAGTATCATAAGCCAGCTCTTCCAATATAGGATTATTCGTTGTGGTGG
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TTCGATTCTCAGAAGCTTTCTCTCCCTTTCGAGCCCCTTCGTTCAAGGAAGACGAAGAAG
TTAGTTAGCAGCAGAAAGAATTGGAAGAGCTCGTCAACTCCGAAGGCTGTATACTCCGGC
AATCTCTGGACACCGGAGACTCCTTCGCCGGAAGGAGTTTGGTCCATCAGAGATGATTTA
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GATCCCACTAAGGATATCGTCATGTATGTGAATTCTCCTGGTGGATCAGTTACAGCTGGC
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CTAGCTGCTAGTATGGGTGCATTTCTGCTTAGTGCTGGAACCAAAGGGAAAAGATACAGT
CTGCCAAACTCAAGGATAATGATCCATCAACCTCTTGGTGGAGCTCAAGGTGGCCAAACC
GATATCGACATTCAGGCAAATGAAATGCTGCATCACAAGGCAAACCTAAACGGTTACCTC
GCTTACCAAACTGGTCAAAGCCTTGAGAGGATAAACCAAGACACAGACCGTGATTTCTTC
ATGAGTGCTAAAGAAGCAAAAGATTACGGGCTTATCGATGGTGTCATCATGAACCCTCTT
AAAGCTCTTCAGCCACTTGCCGCAGCTTTGATCGATCGCCTGAAGGTAATGTTTCGGCTT
GGCACTTCTATTTT**TGATGGGCCTTTTCTGAACTTAAGGTTTCCATTAAATGT
GC

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TTCGATACTATGAGGCATATCCGACCTGATGTCTCCACTGTTTGTGTCGGTCTAGCTGCT
AGTATGGGTGCATTTCTGCTTAGTGCTGGAACCAAAGGGAAAAGATACAGTCTGCCAAAC
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AAAGAAGCAAAAGATTACGGGCTTATCGATGGTGTCATCATGAACCCTCTTAAAGCTCTT
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ATTTTGATGGGGGGCCATTTCTGAACTTAAGGTTTCCATTAAATGTTCCTTTTTCTTCTA
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TGTTGTTTGATTGAATAACAATGACTTTGTAATGTTTTTATCCTTTGTAATCGAATTATT
GGCCATTATTATTTCTGCCCTACC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 7

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GAATAATGGAGAGAGCCGACGAGTCTCTACTCCCAGGCGTATACAAAGAGGTCGGTGCAG
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CAGTCACTTGTTGCTGACTCGACGGACGACGCTAACCGTGGAAGTGCCTTTGGGTGGTTA
CAACTAACAGCAAACCTCGGTTCGATCTTAGGCGGGCTCTGCTCTGTTTTGATAGCTCCG
TTGACATTCATGGGTGTACCTGGTTGGAGAGTTGCTTTCCATATCGTAGGTGTGGTTAGT
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TTGCCTGATGATCCATCTACTGGTGTGATCCATGGTGTGGTGTTGGTCCTATTGGGTCTG
TTTGTTTCTTGGAACGCTCCAGCTACAAACAACCCGATCTTTGCAGAGATTGTTCCAGAG
AAGTCAAGAACAAGCGTCTACGCCTTAGACAAATCGTTCGAGTCGATATTATCATCGTTC
GCTCCTCCTGTAGTTGGGATCCTGGCGCAGCATGTGTACGGATACAAACCAATCCCTCAA
GGCTCATCGAGATCAGCAGAGATAGCCACGGATAGAGAGAACGCCGCTTCGCTCGCGAAA
GCTCTTTACACGTCTATAGGCATCCCAATGGCTGCTTGCTGCTTCATCTACTCCTTTCTC
TACCGCACGTATCCTCTAGACAGAGAACGTGCTCGGATGGAGGCTTTTATAGATTCAGAG
ATGCGTGAACTGCTTCCCGAAGATTCTAATTTAGAAAGCTAGCAGATAAGATAAGAACAT
TTACAATGTTATGTTCTTTTACAATGTTAATAACTTTATATACCAAATTTTTCAACAACA
TAAAGATAGTGCGAGGTTTATCTACTCGGTTTTGTGGCGGAAAGCATAATAAATAGACCG
TTTCTAACACGAGTGAAGCCAACGAGTCCACCGGCTTTGCAGAGTTCTTCAAGCTCGCGT
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AAGGGGATAAAGCTGAAAGGGCCATCATAGATGAACGTGGTGGCGACAAAGACTCCTCCA
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GCGGCACCAGCGTGGACGGCGTCAACTGAGCCTGAGAGAAAAGGGAGTCTAGCTATGTCT
GCTCGGACCAGAACAACTTTCTCTTTGTTAGTAAGGTTTTCTTCTTGGTTTAAGAACTCA
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CTTTTAGCGAATAGTCTCGAGAACATCCCACTTCCGCAACTGGCGTCAATGATGTTGCCT
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CCACCCCCATATGAAATTCTGACGCCAACCTCTTTCGTAAAGGAATGAAACTAAAGGAGT
CCTGAATAACTCAGTTGAAAGAGGCATTGGTTCAGTGTACTGATTGCTTCCACTAGCCAC
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CTGAGTGCCAGAGCCAGCAGCAGATCCTACTAATCCATTAGGTTGACTAATCAATGCTAA
TGAGTTATAGCATATAGGGCAAGCTAGAATGTCCTTCTTCTCTTTCTCCACAGCAGAATC
CGCGCTCGAGTTCGTCTCGATGGAGAGGGAAGCAGAAGATGCTCGAGCTGATACGGGAAC
GAAAACAGCGGCTCTTCTTCGAGAGGGGGACTTGAAGGAAGGTAAACGAGAACCAATCGA
GAGAATCGCCGGCGAAAATCGACCGGAAACAGCCATCACCGTCGGCATTATCAAACCTCC
GTG


BQ
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CTCGGTGCTTTCCTCTGGTCCGCTGCCACTTTCCTTGTCGCTTTCTCTTCCACTTTCTTC
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AGTG

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G
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AGTGACAGGTTCGTTCCCTTGGTCGGCTCTATCTTTTGCGCCTATGTGGTTGGAGCTTAT
GGGGTTCTCGCACGGGAAGACTGCGTTCTTGATGGGTCTGTTCGTGGCTGCGTCTTCTCT
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GCTAGTTTTGCCTGATGATCCATCTACTGGTGTGATCCATGGTGTGGTGTTGGTCCTATT
GGGTCTGTTTGTTTCTTGGAACGCTCCAGCTACAAACAACCCGATCTTTGCAGAGATTGT
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CTT*CTCTACCGCACGTAT

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TTCTCTCGGTGGGTTGTTTGGTGGCAAGATGGGGGATTATCTGTCGACGCGTCTTCCTAA
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CCTATTGGGTCTGTTTGTTTCTTGGAACGCTCCAGCTACAAACAACCCGATCTTTGCAGA
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ATTATCATCGTTCGCTCCTCCTGTAGTTGGGATCCTGGCGCAGCATGTGTACGGATACAA
ACCAATCCCTCAAGGCTCATCGAGATCAGCAGAGATAGCCACGGATAGAGAGAACGCCGC
TTCGCTCGCGAAAGCTCTTTACACGTCTATAGGCATCCCAATGGCTGCTTGCTGCTTCAT
CTACTCCTTTCTCTACCGCACGTATCCTCTAGACAGAGAACGTGCTCGGATGGAGGCTTT
TATAGATTCAGAGATGCGTGAACTGCTTCCCGAAGATTCTAATTTAGAAAGCTAGCAGAT
AAGATAAGAACATTTACAATGTTATGTTCTTTTACAATGTTAATAACTTT

QA 1 710 1 710
DS 

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GATTGTTCCAGAGAAGTCAAGAACAAGCGTCTACGCCTTAGACAAATCGTTCGAGTCGAT
ATTATCATCGTTCGCTCCTCCTGTAGTTGGGATCCTGGCGCAGCATGTGTACGGATACAA
ACCAATCCCTCAAGGCTCATCGAGATCAGCAGAGATAGCCACGGATAGAGAGAACGCCGC
TTCGCTCGCGAAAGCTCTTTACACGTCTATAGGCATCCCAATGGCTGCTTGCTGCTTCAT
CTACTCCTTTCTCTACCGCACGTATCCTCTAGACAGAGAACGTGCTCGGATGGAGGCTTT
TATAGATTCAGAGATGCGTGAACTGCTTCCCGAAGATTCTAATTTAGAAAGCTAGCAGAT
AAGATAAGAACATTTACAATGTTATGTTCTTTTACAATGTTAATAACTTTATATACCAAA
TTTTTC

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DS 

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A
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CTTTATATACCAAATTTTTCAACAACATAAAGATAGTGCGAGGTTTATCTACTCGGTTTT
GTGGCGGAAAGCATAATAAATAGACCGTTTCTAACACGAGTGAAGCCAACGAGTCCACCG
GCTTTGCAGAGTTCTTCAAGCTCGCGTTCACTCAGAAAGATGTGAGAGCCTGAGTATCTC
ATTAGTTCCTGGCGAAAATTCTTCAAGAAGGGGATAAAGCTGAAAGGGCCATCATAGATG
AACGTGGTGGCGACAAAGACTCCTCCAGGTCTAAAAACACGGCTTATCTCAGCAACAGCT
GAGGATGGTGAAGGCCAGCAATGCAAAGCGGCACCAGCGTGGACGGCGTCAACTGAGCCT
GAGAGAAAAGGGAGTCTAGCTATGTCTGCTCGGACCAGAACAACTTTCTCTTTGTTAGTA
GGGTTTTCTTCTTGGTTTAAGAACTCATAGCACTGTCTTAGCATATTCTCCGAGTAATCA
AGGGCGAACACCCGAGAAAACAGCTCGCTTTTAGCGAATAGTCTCGAGAACATCCCACTT
CCGCAACTGGCGTCAATGATGTTGCCT

QA 2 628 2 628
DS 

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GAAAGCTAGCAGATAAGATAAGAACATTTACAATGTTATGTTCTTTTACAATGTTAATAA
CTTTATATACCAAATTTTTCAACAACATAAAGATAGTGCGAGGTTTATCTACTCGGTTTT
GTGGCGGAGAGCATAATAAATAGACCGTTTCTAGCACGAGTGAAGCCAACGAGTCCACCG
GCTTTGCAGAGTTCTTCAAGCTCGCGTTCACTCAGAAAGATGTGAGAGCCTGAGTATCTC
ATTAGTTCCTGGCGAAGATTCTTCAAGAAGGGGATAAAGCTGAAAGGGCCATCATAGATG
AACGTGGTGGCGACAAAGACTCCTCCAGGTCTAAGAACACGGCTTATCTCAGCAACAGCT
GAGGATGGTGAAGGCCAGCAATGCAAAGCGGCACCAGCGTGGACGGCGTCAACTGAGCCT
GAGAGAAAAGGGAGTCTAGCTATGTCTGCTCGGACCAGAACAACTTTCTCTTTGTTAGTA
AGGTTTTCTTCTTGGTTTAAGAACTCATAGCACTGTCTTAGCATATTCTCCGAGTAATCA
AGGGCGAACACCCGAGAAAACAGCTCGCTTTTAGCGAATAGTCTCGAGAACATCCCACTT
CCGCAACTGGCGTCAATGATGTTGCCTCCCAATACAGGCTTCAGGTAGTCTTTAGCCATT
TCAAACTCTTTCTCTGGTCCTGGGAAACCACCCC*ATATGAAATTCTGACGCCAACCTCT
TTCGTAAAGGAATGAAACTAAAGGAGTCCTGAATAACTCAGTTGAAAGAGGCATTGGTTC
AGTGTACTGATTGCTTCCACTAGCCACAGCCAAATCAAGATGCGTCTCGTTACC

QA 1 834 1 834
DS 

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TCAGCAACAGCTGAGGATG*TGAAGGCCAGCAATGCAAAGCGGCACCAGCGTGGACGGCG
TCAACTGAGC*TGAGAGAAAAGG*AGTCTAGCTATGTCTGCTCGGACCAGAACAACTTTC
TCTTTGTTAGTAAGGTTTTCTTCTTGGTTTAAGAACTCATAGCACTGTCTTAGCATATTC
TCCGAGTAATCAAGGGCGAACACCCGAGAAAACAGCTCGCTTTTAGCGAATAGTCTCGAG
AACATCCCACTTCCGCAACTGGCGTCAATGATGTTGCCTCCCAATACAGGCTTCAGGTAG
TCTTTAGCCATTTCAAACTCTTTCTCTGGTCCTGGGAAACCACCCCCATATGAAATTCTG
ACGCCAACCTCTTTCGTAAAGGAATGAAACTAAAGGAGTCCTGAATAACTCAGTTGAAAG
AGGCATTGGTTCAGTGTACTGATTGCTTCCACTAGCCACAGCCAAATCAAGATGCGTCTC
GTTACCTGAGTAACTCTTTTTACAGGTACTGCATTGTAACTGAGTGCCAGAGCCAGCAGC
AGATCCTACTAATCCATTAGGTTGACTAATCAATGCTAATGAGTTATAGCATATAGGGCA
AGCTAGAATGTCCTTCTTCTCTTTCTCCACAGCAGAATCCGCGCTCGAGTTCGTCTCGAT
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AGAGGGGGACTTGAAGGAAGGTAAACGAGAACCAATCGAGAGAATCGCCGGCGAAAATCG
ACCGGAAACAGCCATCACCGTCGGCATTATCAAACCTCCGTG

QA 11 832 11 832
DS 



AS 2 8

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GTATACGTTCATACAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AD74JQ C 1
AF RS1AD74TF U 1
BS 1 256 RS1AD74TF

RD RS1AD74JQ 256 0 0
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AAACCGTAAATTAAGACATCTAATCAAATGAGACTCTATTTAGTTTTATATTTTATTAAT
GTTTATTATAAATAATTGATGAAGTTTCTATTGTTAAAATAATATTTATCAGTCATTTTC
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GTATACGTTCATACAC

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DS 

RD RS1AD74TF 256 0 0
GGCTCTCACCAGTTTTGGTGGGCTAAGAGTGTACGGATGGCTGGGCCGCTGAAAGAACCA
AAACCGTAAATTAAGACATCTAATCAAATGAGACTCTATTTAGTTTTATATTTTATTAAT
GTTTATTATAAATAATTGATGAAGTTTCTATTGTTAAAATAATATTTATCAGTCATTTTC
AGTTGTAATACTTTCACGACACGACATTATGTTTGAATTTGAAAATTTCTTTAAATAATA
GTATACGTTCATACAC

QA 1 256 1 256
DS 



CO CL555Contig2 1111 6 10 U
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TAGGCTAAACTTTCGAATACAAAATGGGTATATTCTCTAGATTTGGTAGCTGGATCAGTA
AGAACAGTCAACAGCCTCTTAAGGGCGAGGCCAAGGGATCTGAAAATGACGAATCTAAGT
CGGTGTCAGAGAAAGACACTAATAATAATGATCCTGCTAAGAAGAATAAGAAAGAATATT
ATGATGAAAAAGAGAAGATGAGACAAGATATACTTTGGCATGATGAAGAGAAGAAGCATC
CTTGGCATAATCCCCCTCCCAAGGTCAAGGTGACAACTAATAAAATGGGTGTTTACCATA
TGAACTTAGAAATGACGTTGGGGGCACCGCCTGAACTAATCCACTTATGGTTGACTCATC
CACACGGCAGTTCGTTTTTGGATGAGAAGAATTGGCGCAACCTTATGATAACCAAATCAA
AAAA*GGTTTTGATGGAGGATGGCCCGAGGGGGGTCTACAAGGTGGAGAGATCTGTAGCT
TATGACTTCTTTTCGCTGACGTATATACCTATCCCGTTACATCTAATTGTGGAAGAAAAC
AGAAAAGATCTTACGGGAAAATATAAGAAAGAGAAAGTAATGTTGATGGAAGTGTTCGAG
GGAAACTATAAAGTGGAGCCCGTATATGTAGATCAAGAACGCTTGTGCAAAAAGAGGTTA
CCAAAGAGTCCGGAAGAATATAGAAAATGTAGCGGTGGCCAAGGAAAGATTGGGTCAAAA
TTGACAATAAATCAATACTTTGAGCCATATCCTCCATTCAATCTACCGCCGCTTTCTTGG
TACATCCGTGGGAGCACCATCAAAACCTCCAAAAAACTGCTCAATGCGCTTCAGAACACG
GCTAAGAGTGTACGGATGGCTGGGCCGCTGAAAGAACCAAAACCGTAAATTAAGACATCT
AATCAAATGAGACTCTATTTAGTTTTATATTTTATTAATGTTTATTATAAATAATTGATG
AAGTTTCTATTGTTAAAATAATATTTATCAGTCATTTTCAGTTGTAATACTTTCACGACA
CGACATTATGTTTGAATTTGAAAATTTCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 

AF RS1H413TF U 1
AF RS1E028TF U 42
AF RS1F448TF U 42
AF RS1E028JQ C 395
AF RS1F448JQ C 398
AF RS1H413JQB C 435
BS 1 105 RS1H413TF
BS 106 106 RS1E028TF
BS 107 468 RS1H413TF
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BS 1111 1111 RS1F448JQ

RD RS1H413TF 711 0 0
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CGGTGTCAGAGAAAGACACTAATAATAATGATCCTGCTAAGAAGAATAAGAAAGAATATT
ATGATGAAAAAGAGAAGATGAGACAAGATATACTTTGGCATGATGAAGAGAAGAAGCATC
CTTGGCATAATCCCCCTCCCAAGGTCAAGGTGACAACTAATAAAATGGGTGTTTACCATA
TGAACTTAGAAATGACGTTGGGGGCACCGCCTGAACTAATCCACTTATGGTTGACTCATC
CACACGGCAGTTCGTTTTTGGATGAGAAGAATTGGCGCAACCTTATGACAACCAAATCAA
AAAA*GGTTTTGATGGAGGATGGCCCGAGGGGGGTCTACAAGGTGGAGAGATCTGTAGCT
TATGACTTCTTTTCGCTGACGTATATACCTATCCCGTTACATCTAATTGTGGAAGAAAAC
AGAAAAGATCTTACGGGAAAATATAAGAAAGAGAAAGTAATGTTGATGGAAGTGTTCGAG
GGAAACTATAAAGTGGAGCCCGTATATGTAGATCAAGAACGCTTGTGCAAA

QA 1 711 1 711
DS 

RD RS1E028TF 672 0 0
GG
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TGGTAGCTGGATCAGTAAGAACAGTCAACAGCCTCTTAAGGGCGAGGCCAAGGGATCTGA
AAATGACGAATCTAAGTCGGTGTCAGAGAAAGACACTAATAATAATGATCCTGCTAAGAA
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TGAAGAGAAGAAGCATCCTTGGCATAATCCCCCTCCCAAGGTCAAGGTGACAACTAATAA
AAAGGGTGTTTACCATATGAACTTAGAAATGACGTTGGGGGCACCGCCTGAACTAATCCA
CTTATGGTTGACTCATCCACACGGCAGTTCGTTTTTGGATGAGAAGAATTGGCGCAACCT
TATGATAACTAAATCAAAAAAAGGTTTTGATGGAGGATGGCCCGAGGGGGGTCTACAAGG
TGGAGAGATCTGTAGCTTATGACTTCTTTTCGCTGACGTATATACCTATCCCGTTACATC
TAATTGTGGAAGAAAACAGAAAAGATCTTACGGGAAAATATAAGAAAGAGAAAGTAATGT
TGATGGAAGTGTTCGAGGGAAACTATAAAGTGGAGCCCGTATATGTAGATCAAGAACGCT
TGTGCAAAAA

QA 3 672 3 672
DS 

RD RS1F448TF 672 0 0
GG
GCTCTCATCAGTTTTGGTAGGCTAAACTTTCGAATACAAAATGGGTATATTCTCTAGATT
TGGTAGCTGGATCAGTAAGAACAGTCAACAGCCTCTTAAGT*CGAGGCCAAGGGATCTGA
AAATGACGAATCTAAGTCGGTGTCAGA*AAAGACACTAATAATAATGATCCTGCTAAGAA
GAATAAGAAAGAATATTATGATGAAAAAGAGAAGATGAGACAAGATATACTTTGGCATGA
TGAAGAGAAGAAGCATCCTTGGCATAATCCCCCTCCCAAGGTCAAGGTGACAACTAATAA
AATGGGTGTTTACCATATGAACTTAGAAATGACGTTGGGGGCACCGCCTGAACTAATCCA
CTTATGGTTGACTCATCCACACGGCAGTTCGTTTTTGGATGAGAAGAATTGGCGCAACCT
TATGATAACCAAATCAAAAAA*GGTTTTGATGGTGGTTGGCCCGAGGGGGGTCTACAAGG
TGGAGAGATCTGTAGCTTATGACTTCTTTTCGCTGACGTATATACCTATCCCGTTACATC
TAATTGTGGAAGAAAACAGAAAAGATCTTACGGGAAAATATAAGAAAGGGAAAGTAATGT
TGATGGAAGTGTTCGAGGGAAACTATAAAGTGGAGCCCGTATACGTAGATCAAGAACGCT
TGTGCAAAAA

QA 3 672 3 672
DS 

RD RS1E028JQ 716 0 0
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QA 1 716 1 716
DS 

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DS 

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QA 1 677 1 677
DS 



AS 2 6

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CAAGATCCGAGTTCCGTTCCCAAGACGCGCACAAGACAGAAAGTAAGACATTCTGTGTTA
CACTTTTGTAACCGGTTTCTGTACCGAGTTAAAACTACTGGTCCCTTTTACTATCGGAGA
GATCCAAAACTGGTGGACTGACTAACTCTTTGGAATGGTGGTGGTATTTTCAGGGACGTC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 0 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C110TF U 1
AF RS1GU59TF U 166
AF RS1F316TF U 32
AF RS1F316JQ C 531
BS 1 257 RS1C110TF
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BS 750 1360 RS1F316JQ

RD RS1C110TF 388 0 0
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TTCGTGAGGAAGCAGGAAGATGAAGTCGGCAGTTGCACATTTCTCAACGCCTTTAATCAC
GGCTAGATTCTTCCCTACAACATGTCTTATTCATCCACAATCGATCTCCACCGTCGCTCT
CTCCGCCCTCCGCAATCGAAAGTCGTCTTCTCTTACCGTGATGGCCTCAGCAGCTCAGTC
TTCTTCTCAGGCTGTATTACCAGGGAATGTCATTAGTGAGACAGATGTTTTCAAATTGAT
TCAAGCTCATGAGGCGAAGGCTGCTCGTCTTTCTCCTGTTGAGGAAATCCGAACTGTGCT
TAACGGTAGTGTTTGTGGTATGCTTTCC

QA 1 388 1 388
DS 

RD RS1GU59TF 553 0 0
G
TCCACCGTCGCTCTCTCCGCCCTCCGCAATCGAAAGTCGTCTTCTCTTACCGTGATGGCC
TCAGCAGCTCAGTCTTCTTCTCAGGCTGTATCACCAGGGAATGTCAGCAGTGAGACAGAT
GTTTTCAAATTGATTCAAGCTCATGAGGCGAAGGCTGCTCGTCTTTCTCCTGTTGAGGAA
ATCCGAACTGTGCTTAACGGTAGTGTTTGTGGTATGCTTTCCACTTTCTCTCAGAAGTAT
AAGGGTTATCCTTCAGGCTCAATGGTTGATTTTGCATGTGATGCTGATGGATCTCCCATT
CTTGCAGTCAGTAGCCTGGCTGTCCATACAAAGGATCTGTTAGCTAATCCAAAATGCTCG
CTACTGGTTGCTAGAGAGCCAGAAGATAGGACCGGTTTGAGGATCACCCTACATGGTGAT
GCAGTGTTGGTTTCTGACAAAGATCAAGCGGCTGTTCGATCTGCCTATTTAGCCAAGCAT
CCCAATGCTTTCTGGGTTGATTTTGGAGACTTCAGCTTTATGCGAATTGAACCAAAAGTT
GTGAGATTTGTT

QA 2 553 2 553
DS 

RD RS1F316TF 718 0 0
GGGTGT
AAACCAAACGAACCATCGAAGGTTTCGTGAGGAAGCAGTAAGATGAAGTCGGCAGTTGCA
CATTTCTCAACGCCTTTAATCACGGCTAGATTCTTCCCTACAACATGTCTTATTCATCCA
CAATCGATCTCCACCGTCGCTCTCTCCGCCCTCCGCAATCGAAAGTCGTCTTCTCTTACC
GTGATGGCCTCAGCAGCTCAGTCTTCTTCTCAGGCTGTATCACCAGGGAATGTCAGCAGT
GAGACAGATGTTTTCAAATTGATTCAAGCTCATGAGGCGAAGGCTGCTTGTCTTTCTCCT
GTTGAGGAAATCCGAACTGTGCTTAACGGTAGTGTTTGTGGTATGCTTTCCACTTTCTCT
CAGAAGTATAAGGGTTATCCTTCAGGCTCAATGGTTGATTTTGCATGTGATCCTGATGGA
TCTCCCATTCTTGCAGTCAGTAGCCTGGCTGTCCATACAAAGGATCTGTTAGCTAATCCA
AAATGCTCGCTACTGGTTGCTAGAGAGCCAGAAGATAGGACCGGTTTGAGGATCACCCTA
CATGGTGATGCAGTGTTGGTTTCTGACAAAGATCAAGCGGCTGTTCGATCTGCCTATTTA
GCCAAACATCCCAATGCTTTCTGGGTTGATTTTGGAGACTTCAGCTTTATGCGA*TTGAA
CCAAAAGTTGTGAGATTGTTT*CAGGGGT*GCA*CTGCTTTTCTTGGATCTG

QA 7 718 7 718
DS 

RD RS1F316JQ 830 0 0
CT
GTTGCTAGAGAGCCAGAAGATAGGACCGGTTTGAGGATCACC*TACATGGTGATGCAGTG
TTGGTTTCTGACAAAGATCAAGCGGCTGTTCGATCTGCCTATTTAGCCAAACATCCCAAT
GCTTTCTGGGTTGATTTTGGAGACTTCAGCTTTATGCGAATTGAACCAAAAGTTGTGAGA
TTTGTTTCAGGGGTTGCAACTGCTTTTCTTGGATCTGGAGAACTCAGCAAAGAGGAGTAC
CAAGGAGCCAAAGTCGATCCTATCGCTCAGTTTGCAAAGCCTGTAACGTCACACATGAAC
AAAGACCATGAAGAGGATACCAAAGCTATTGTACACCATACAACATCCATACCTGTGGAG
AGCGCGTTGATGCTTGATTTGGACAGCCTTGGTTTCAACGTTAAGGCTACTCTTCAAGGG
AACACCTTCAAGATCCGAGTTCCGTTCCCAAGACGCGCACAAGACAGAAAGTAAGACATT
CTGTGTTACACTTTTGTAACCGGTTTCTGTACCGAGTTAAAACTACTGGTCCCTTTTACT
ATCGGAGAGATCCAAAACTGGTGGACTGACTAACTCTTTGGAATGGTGGTGGTATTTTCA
GGGACGTCAAGACACTGATAGTGGAAATGCTTCAAGCTGCTAAGTCTGTTTCCAATTAGT
TTTGCTAAAATAAAGATGTAAAAAACTTCATGTCTTGTTCTGAACCCGCTCCCAAGATCT
GTGAATATATTAAGACTAGAACAAAACTAGATACATGAAAAAGGGAACTCATGTATGCTT
ATTACACATCCGCCATGGTTATGATATCAAATACGTAATAAAACAGTG

QA 3 830 3 830
DS 



CO CL556Contig2 1107 2 2 U
GGAAACCAAACGAACATTGAAGGTTTCGTGAGGAAGCAGGAAGATGAAGTCGGTAGCTGC
TCATTTCTCAACGCCTTTAATCACAGCTAGATTCTTCCCTCCTACTACATGTCTTATTCA
TCCACAATCGATCTCCACCGTCGCTCTCTCCGGCCTCCGCAGTCGAAAGTCTTCCTCCCC
TCTCACCGTGATGGCCTCAGCAGCTCAGTCTTCTTCTCAGGCTGTATCACCAGGGAATGT
CAGCAGTGATCAAGATGTTTTCAAATTGATTCAAGCTCATGAGGCGAAGGCTGCTCGTCT
TTCTCCTGTTGAGGAAATACGAACTGTGCTTAACGGTAGTGTTTGTGGTATGCTTTCCAC
TTTCTCTCAGAAGTATGAGGGTTATCCTTCCGGCTCAATGGTTGATTTTGCATGTGATGC
TGATGGCTCTCCAATTCTGGCAGTCAGTAGCTTAGCTGTTCATATAAAGGATCTGTTAGC
TAATCCAAAATGCTCACTACTGGTTGCTAGAGAGCCAGAAGATAGGACCGGTTTGAGGAT
CACCCTACACGGTGATGCAGTGTTGGTTTCTGACAAAGATCAAGCGGCTGTTCGATCTGC
CTATTTAGCCAAGCATCCCAATGCTTTCTGGGTTGATTTTGGAGACTTCAGCTTTATGCG
AATTGAACCAAAAGTTGTGAGATTTGTTTCAGGGGTTGCAACTGCTTTTTTAGGATCTGG
AGAATTCAGCAAAGAGGAGTACCAAGGAGCCAAAGTCGATCCTATCGCTCAGTTTGCAAA
GCCTGTAACGTCACACATGAACAAAGACCATGAAGAGGATACCAAAGCTATTGTACACCA
TACAACATCCATACCTGTGGAGAGCGCCTTGATGCTTGATTTGGACAGCCTGGTTTCAAC
GTTAAGGCTACTCTTCAAGGGAACACCTTCAAGATCCGAGTTCCGTTCCCAAGACGCGCA
CAAGACAGAAAGGATGTGAAGACACTGATAGTGGAAATGCTTCAAGCTGCTAAGTCTGTT
TCCAATTAGTTTTGCTAAAATAAAGATGTAAAAAACTTCATGTCTTGTTCTGAACCCGCT
CCCAAGAATCTTTGAATATATTAAGAC


BQ
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AF RS1ED87TF U 1
AF RS1ED87JQ C 604
BS 1 688 RS1ED87TF
BS 689 1107 RS1ED87JQ

RD RS1ED87TF 688 0 0
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TCATTTCTCAACGCCTTTAATCACAGCTAGATTCTTCCCTCCTACTACATGTCTTATTCA
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TCTCACCGTGATGGCCTCAGCAGCTCAGTCTTCTTCTCAGGCTGTATCACCAGGGAATGT
CAGCAGTGATCAAGATGTTTTCAAATTGATTCAAGCTCATGAGGCGAAGGCTGCTCGTCT
TTCTCCTGTTGAGGAAATACGAACTGTGCTTAACGGTAGTGTTTGTGGTATGCTTTCCAC
TTTCTCTCAGAAGTATGAGGGTTATCCTTCCGGCTCAATGGTTGATTTTGCATGTGATGC
TGATGGCTCTCCAATTCTGGCAGTCAGTAGCTTAGCTGTTCATATAAAGGATCTGTTAGC
TAATCCAAAATGCTCACTACTGGTTGCTAGAGAGCCAGAAGATAGGACCGGTTTGAGGAT
CACCCTACACGGTGATGCAGTGTTGGTTTCTGACAAAGATCAAGCGGCTGTTCGATCTGC
CTATTTAGCCAAGCATCCCAATGCTTTCTGGGTTGATTTTGGAGACTTCAGCTTTATGCG
AATTGAACCAAAAGTTGTGAGATTTGTT

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DS 

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TGAACCAAAAGTTGTGAGATTTGTTTCAGGGGTTGCAACTGCTTTTTTAGGATCTGGAGA
ATTCAGCAAAGAGGAGTACCAAGGAGCCAAAGTCGATCCTATCGCTCAGTTTGCAAAGCC
TGTAACGTCACACATGAACAAAGACCATGAAGAGGATACCAAAGCTATTGTACACCATAC
AACATCCATACCTGTGGAGAGCGCCTTGATGCTTGATTTGGACAGCCTGGTTTCAACGTT
AAGGCTACTCTTCAAGGGAACACCTTCAAGATCCGAGTTCCGTTCCCAAGACGCGCACAA
GACAGAAAGGATGTGAAGACACTGATAGTGGAAATGCTTCAAGCTGCTAAGTCTGTTTCC
AATTAGTTTTGCTAAAATAAAGATGTAAAAAACTTCATGTCTTGTTCTGAACCCGCTCCC
AAGAATCTTTGAATATATTAAGAC

QA 1 504 1 504
DS 



AS 2 8

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AGGCTTTATGTCCAAGGAAAAGAAATTAACGGTGCTGGAATCAACGCCAGTTTTGCTGTC
CACCAGGATGTTGACGGTAGAGCCGCTGATGTTGCTCTGGGATGGTCAGTAGCACTTGGT
TCTCCTTTTACTTTTGCTACTACTCTTGAGCAAGAGTACAAGAGTGACATCTTTGGAGAA
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GAAAATGGAATGAGTGAAGACTTGGCTTACAAGAACACAGTAGAGTGCATCACAGGAAAT
ATCTCGAGAACTATCTCTACCCAGGGAATGTTGGCTGTCTACAACTCCTTGTCTGAAGAA
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TACGAATGTTACGAGGATGTAGCAGCTGGCAGCGAAATCAGGAGCGTTGTCTTAGCCGGT
CGTCGCTTCTACGATAAGGAGGGCTTACCTGCATTCCCAATGGGAAAGATTGATCAGCAA
CTTCTTCGCTGATCCAGTCCATGGTGCTATCCAGGTCTGTGCGGAGCTCACGCCCACCGT
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GAAGGGTTTGAAATGTTATCAGTCTCTTTCATGTATCGTGTTTGAGAAGACATGGTCTTT
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BQ
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AF RS1C583TF U 59
AF RS1GD89TF U 1
BS 1 825 RS1GD89TF

RD RS1C583TF 518 0 0
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TCCACCAGGATGTTGACGGTAGAGCCGCTGATGTTGCTCTGGGATGGTCAGTAGCACTTG
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AAAGAGGCATTTTGCTTGGTGCTGTCCACGGAATCGTGGAGTCTCTGTTCAGAAGGTACA
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TCTACGAATGTTACGAGGATGTAGCAGCTGGCAGCGAAATCAGGAGCGTTGTCTTAGCCG
GTCGTCGCTTCTACGATAAGGAGGGCTTACCTGCATTC

QA 1 518 1 518
DS 

RD RS1GD89TF 825 0 0
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AGGCTTTATGTCCAAGGAAAAGAAATTAACGGTGCTGGAATCAACGCCAGTTTTGCTGTC
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AGAGGCATTTTGCTTGGTGCTGTCCACGGAATCGTGGAGTCTCTGTTCAGAAGGTACACC
GAAAATGGAATGAGTGAAGACTTGGCTTACAAGAACACAGTAGAGTGCATCACAGGAAAT
ATCTCGAGAACTATCTCTACCCAGGGAATGTTGGCTGTCTACAACTCCTTGTCTGAAGAA
GGCAAAAAGGACTTCGAGACTGCATACAGTGCATCCTTCTACCCTTGCATGGAGATCCTC
TACGAATGTTACGAGGATGTAGCAGCTGGCAGCGAAATCAGGAGCGTTGTCTTAGCCGGT
CGTCGCTTCTACGATAAGGAGGGCTTACCTGCATTCCCAATGGGAAAGATTGATCAGCAA
CTTCTTCGCTGATCCAGTCCATGGTGCTATCCAGGTCTGTGCGGAGCTCACGCCCACCGT
GGATATCTCAGTGCCTCAAGATGCAGACTTCGTTCGACAGAGCTGCGTCGTCAACTGAGT
GAAGGGTTTGAAATGTTATCAGTCTCTTTCATGTATCGTGTTTGAGAAGACATGGTCTTT
GGAAGTTGTAGCGTGAATGAATGTTTTTTTTGGACTACTTGAATA

QA 1 825 1 825
DS 



CO CL557Contig2 909 6 8 U
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TTATTCAAGTAGTCCAAACAAAAACATTCATTCACGCCTACAACTTCCAAAGACCATTGT
CTTTCTTCAAAACACGATTACATTGAAAGAGACTGATAACATTTCAAACCCTTCACTCAG
TTGGACCGACGCAGCTCTGGTCGAACGAAATCTGCATCTTGAGGCACTGAGATATCCACG
GTGGGCCTGAGCTCCGCACAGACCTGGATAGCACCATGGACTGGATCAGCGAAGAAGTTG
CTGATCAAGTCTTTGTTGATTGGTGCACCATTGTCCACAGCCACCAAAGCTTGTTGTGTC
AGGTTGTAGTCAAAACGTGGTGCCCATTTCCTCGATCCCAATCTTGCTGTGGTCGAGCAG
TTGTCCACCATGAAGGACACTCCTCTAGCGTGCATAAACGGGTTCAGAGAATCAACAGAC
TCAATCACACTCTCGTTGATGACCTCCGAGTAGGAGTGACCCTTCTTCCTCAAGATCTCA
ATCTGAGCCATCATAAGAGCAACGTAAACTCCAGCGGTGAAGGGATACAAGGGACCCAAG
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ATCTTTCCCATTGGGAATGCAGGTAAGCCCTCCTTATCGTAGAAGCGACGACCGGCTAAG
ACAACGCTCCTGATTTCGCTGCCAGCTGCTACATCCTCGTAACATTCGTAGAGGATCTCC
ATACAAGGGTAGAAGGATGCACTGTATGCAGTCTCGAAGTCCTTTTTGCCTTCTTCAGAC
AAGGAGTTGTAGACAGCCAACATTCCCTGGGTAGAGATAGTTCTCGAGATATTTCCTGTG
ATGCACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 10 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 

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AF RS1BV38JQ U 40
AF RS1FL84JQ U 39
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TTATTCAAGTAGTCCAAACAAAAACATTCATTCACGCCTACAACTTCCAAAGACCATTGT
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TTGGAC
CGA

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DS 

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TGTGG

QA 10 374 10 374
DS 

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CGAGACAA
CGAAACATCATTATTACTGAAGTAGTCCAAACAAAA*CATTCATTCACGCCTACAACTTC
CAAAGACCATTGTCTTTCTTCAAAACACGATTACATTGAAAGAGACTGATAACATTTCAA
ACCCTTCACTCAGTTGGACTGACGCAGCTCTGGTCGAACAAAATCTGCATCTTGAGGCAC
TGAGATATCCACGGGGGGCCTGAGCTCCGCACAGACCTGGATAGCACCGTGGACTGGATC
AGCGAAGAAGTTGCTGATCAAGTCTTTGTTGATTGGTGCACCATTGTCCACAGCCACCAA
AGCTTGTTGTGTCAGGTTGTAGTCAAACCGTGGTGCCCATTTCCTCGATCCCAATCTTGC
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ACCCTTCACTCAGTTGGACCGACGCAGCTCTGGTCGAACGAAATCTGCATCTTGAGGCAC
TGAGATATCCACGGTGGGCCTGAGCTCCGCACAGACCTGGATAGCACCATGGACTGGATC
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AGCTTGTTGTGTCAGGTTGTAGTCAAAACGTGGTGCCCATTTCCTCGATCCCAATCTTGC
TGTGGTCGAGCAGTTGTCCACCATGAAGGACACTCCTCTAGCGTGCATAAACGGGTTCAG
AGAATCAACAGACTCAATCACACTCTCGTTGATGACCTCCGAGTAGGAGTGACCCTTCTT
CCTCAAGATCTCAATCTGAGCCATCATAAGAGCAGCGTAAACTCCAGCGGTGAAGGGATA
CAAGGGACCCAAGTCACCAGCTGGTCTGGACTTCCTGACGCGTTCACCGACCTTCCACAT
TCTTGTCTGATCAATCTTTCCCATTGGGAATGCAGGTAAGCCCTCCTTATCGTAGAAGCG
ACGACCGGCTAAGACAACGCTCCTGATTTCGCTGCCAGCTGCTACATCCTCGTAACATTC
GTAGAGGATCTCCATACAAGGGTA

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ATAGCACCATGGACTGGATCAGCGAAGAAGTTGCTGATCAAGTCTTTGTTGATTGGTGCA
CCATTGTCCACAGCCACCAAAGCTTGTTGTGTCAGGTTGTAGTCAAAACGTGGTGCCCAT
TTCCTCGATCCCAATCTTGCTGTGGTCGAGCAGTTGTCCACCATGAAGGACACTCCTCTA
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GAGTAGGAGTGACCCTTCTTCCTCAAGATCTCAATCTGAGCCATCATAAGAGCAGCGTAA
ACTCCAGCGGTGAAGGGATACAAGGGACCCAAGTCACCAGCTGGTCTGGACTTCCTGACG
CGTTCACCGACCTTCCACATTCTTGTCTGATCAATCTTTCCCATTGGGAATGCAGGTAAG
CCCTCCTTATCGTAGAAGCGACGACCGGCTAAGACAACGCTCCTGATTTCGCTGCCAGCT
GCTACATCCTCGTAACATTCGTAGAGGATCTCCATACAAGGGTAGAAGGATGCACTGTAT
GCAGTCTCGAAGTCCTTTTTGCCTTCTTCAGACAAGGAGTTGTAGACAGCCAACATTCCC
TGGGTAGAGATAGTTCTCGAGATATTTCCTGTGATGCACTCC

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DS 

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CAAAACGTGGTGCCCATTTCCTCGATCCCAATCTTGCTGTGGTCGAGCAGTTGTCCACCA
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C

QA 1 656 1 656
DS 



AS 2 7

CO CL558Contig1 1208 4 8 U
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CTTGGCCAGGCACTATCATCAGAAAACAATTTATATTCCTCAGCCAACATGGGGAAACCA
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AACACGTGGGTTGAACTTTCAAGGTTTATTAGAAGACCTTGGTGCTGCCCCACAGGGTTC
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AGCTATGGCTGATCGTATCATCAGCATGAGAAAGCAGCTCTTCGAGGCATTACGTGCTCG
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CGGGAGGATAAGCATGGCTGGTCTGAGCTCCAAGACTGTACCGCACCTTGCAGACGCTAT
CCACGCCGTTGTTACCAAAGCCCTCTGAAACATCTCATCACCACCACTACGGTTACATGG
TGACATAATAAAGGATCTCACTTTCGTTTTTCTCAGCATTTCCGGCAGTGAGAAGTTAAA
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TTGTTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AW37TF U 495
AF RS1AW38TF U 1
AF RS1AW38JQ C 341
AF RS1AL61TF U 723
BS 1 710 RS1AW38TF
BS 711 711 RS1AW38JQ
BS 712 753 RS1AW38TF
BS 754 941 RS1AL61TF
BS 942 942 RS1AW38JQ
BS 943 1083 RS1AL61TF
BS 1084 1084 RS1AW38JQ
BS 1085 1208 RS1AL61TF

RD RS1AW37TF 136 0 0
CTC
TCAGCATTGTATGCAAAGCAGCAGATGTGGCGGGCAGAGTTGAAAGCCAACTGAAACTTG
TAATAAGGCCAATGTACTCGAATCCTCCCATTCACGGTGCATCCATCGTTGCTGTAATCC
TCCGTGACAGGAA

QA 4 136 4 136
DS 

RD RS1AW38TF 758 0 0
GCGTGTTACAACCGTAGAGTGTTTGTCTGGTACTGGTTCCCTCAGAGTTGGAGGGGAGTT
CTTGGCCAGGCACTATCATCAGAAAACAATTTATATTCCTCAGCCAACATGGGGAAACCA
TCCGAAAATTTTCACCTTGGCTGGTTTGTCCGTGAAAACTTACCGCTACTACGATCCGTC
AACACGTGGGTTGAACTTTCAAGGTTTATTAGAAGACCTTGGTGCTGCCCCACAGGGTTC
TATAGTACTTCTCCATGCCTGTGCTCATAACCCAACTGGTGTTGATCCAACCCTTGAACA
ATGGGAGCAAATCAGGAAGTTGATGCGTTCCAAAGGATTGATGCCATTCTTTGATAGTGC
TTATCAGGGCTTTGCGAGTGGAAGTTTGGATACAGATGCGAAACCGATTAGGATGTTTGT
TGCTGATGGAGGAGAATTGCTCGTTGCTCAGAGTTATGCAAAGAACATGGGACTCTATGG
AGAACGTGTTGGAGCTCTCAGCATTGTATGCAAAGCAGCAGATGTGGCGGGCAGAGTTGA
AAGCCAACTGAAACTTGTAATAAGGCCAATGTACTCGAATCCTCCCATTCACGGTGCATC
CATCGTTGCTGTAATCCTCCGTGACAGGAACTTGTTCAACGAATGGACTTTGGAACTGAA
AGCTATGGCTGATCGTATCATCAGCATGAGAAAGCAGCTCTTCGAGGCAT*ACGTGCTCG
GGGGACGCCTGGAGACTGGACTCACATCATCAA
CAGAT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1AW38JQ 850 0 0
TGATGCCATC
TTGATAGTGCT*ATCAGGGCTTTGCGAGTGGAAGTTTGGATACAGATGCGAAACCGATTA
GGATGTTTGTTGCTGATGGAGGAGAATTGCTCGTTGCTCAGAGTTATGCAAAGAACATGG
GACTCTATGGAGAACGTGTTGGAGCTCTCAGCATTGTATGCAAAGCAGCAGATGTGGCGG
GCAGAGTTGAAAGCCAACTGAAACTTGTAATAAGGCCAATGTACTCGAATCCTCCCATTC
ACGGTGCATCCATCGTTGCTGTAATCCTCCGTGACAGGAACTTGTTCAACGAATGGACTT
TGGAACTGAAAGCTATGGCTGATCGTATCATCAGCATGAGAAAGCAGCTCTTCGAGGCAT
TACGTGCTCGGGGGACGCCTGGAGACTGGACTCACATCATCAAACAGATCGGCATGTTTA
CCTTCACAGGGTTGAACCCAGCTCAAGTCTCCTACATGAGTAAAGAGTACCACATCTACA
TGACATCCGACGGGAGGATAAGCATGGCTGGTCTGAGCTCCAAGACTGTACCGCACCTTG
CAGACGCTATCCACGCCGTTGTTACCAAAGCCCTCTGAAACATCTCATCACCACCACTAC
GGTTACATGGTGACGTAATAAAGGGTCTCACTTTCGTTTTTCTCAGCATTTCCGGCAGTG
AGAAGTTAAATGTCATTATTATTATTTGTTATTTCATCTCAGTGGTTAATAAAGTAGGCA
AGAGCGTTTTGTGCCTCTTCTACTATTTACATTCTCAATGTCGTAACTTTGTAGACGGTA
ACCAACTTTAAAGTTTTGGTTCTATCTTTTAAGGGTTCTAGCTTATGGAACCTAACATAG

QA 11 850 11 850
DS 

RD RS1AL61TF 486 0 0
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TGAACCCAGCTCAAGTCTCCTACATGACTAAAGAGTACCACATCTACATGACATCCGACG
GGAGGATAAGCATGGCTGGTCTGAGCTCCAAGACTGTACCGCACCTTGCAGACGCTATCC
ACGCCGTTGTTACCAAAGCCCTCTGAAACATCTCATCACTACCACTACGGTTACATGGTG
ACATAATAAAGGATCTCACTTTCGTTTTTCTCAGCATTTCCGGCAGTGAGAAGTTAAATG
TCATTATTATTATTTGTTATTTCATCTCAGTGGTTAATAAAGTAGGCAAGAGCGTTTTGT
GTCTCTTCTACTATTTACATTCTCAATGTCGTAACTTTGTAGACGGTAACCAACTTTAAA
GTTTTGGTTCTATCTTTTAAGGGTTCTAGCTTATGGAACCTAACATAGAATAAAAATATT
GTTACT

QA 1 486 1 486
DS 



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AATAGTAGAAGAGGCACAAAACTCTCTTGCCTACTTTATTAACCACTGAGATGAAATAAC
AAATAATAATAATGACATTTAACTTGTCACTGCCGGAAATGCTGAGAAAAACGAAAGTGA
GATCCTTTATTATCACCATGTATGCAACCGTAGTGTGGTGGTGAGATGTTTTCAGAGGGC
TTTGGTAACAACGGCGTGGATAGCGTCTGCAAGGTGCGGTACAGTCTTGGAGCTCAGACC
AGCCATGCTTATCCTCCCGTCGGATGTCATGTAGATGTGGTACTCTTTAGTCATGTAGGA
GACTTGAGCTGGGTTCAACCCTGTGAAGGTGAACATGCCGATCTGTTTGATGATGTGAGT
CCAGTCTCCAGGCGTCCCCCGAGAACGTAATGCCTCGAAGAGCTGCTTTCTCATGCTGAT
GATACGATCAGCCATGGCTTTCAGTTCTAAAGTCCATTCGTTGAACAAGTTCCTGTCGCG
GAGGATTACAGCGACGATGGATGCACCATGGATGGGAGGATTTGAGTACATTGGCCTTAT
TACAAGTTTCAGTTGGCTTTCAACTCTTCCCGCTACATCTGCTGCTTTGCATACAATGCT
GA


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RS1FT90JQ U 1
AF RS1FT90TF C 1
AF RS1DJ82JQ U 2
BS 1 165 RS1FT90JQ
BS 166 166 RS1DJ82JQ
BS 167 437 RS1FT90JQ
BS 438 662 RS1DJ82JQ

RD RS1FT90JQ 437 0 0
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AATAGTAGAAGAGGCACAAAACTCTCTTGCCTACTTTATTAACCACTGAGATGAAATAAC
AAATAATAATAATGACATTTAACTTGTCACTGCCGGAAATGCTGAAAAAAACGAAAGTGA
GATCCTTTATTATCACCATGTATGCAACCGTAGTGTGGTGGTGAGATGTTTTCAGAGGGC
TTTGGTAACAACGGCGTGGATAGCGTCTGCAAGGTGCGGTACAGTCTTGGAGCTCAGACC
AGCCATGCTTATCCTCCCGTCGGATGTCATGTAGATGTGGTACTCTTTAGTCATGTAGGA
GACTTGAGCTGGGTTCAACCCTGTGAAGGTGAACATGCCGATCTGTTTGATGATGTGAGT
CCAGTCTCCAGGCGTCC

QA 1 437 1 437
DS 

RD RS1FT90TF 437 0 0
G
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ATAGTAGAAGAGGCACAAAACTCTCTTGCCTACTTTATTAACCACTGAGATGAAATAACA
AATAATAATAATGACATTTAACTTGTCACTGCCGGAAATGCTGAGAAAAACGAAAGTGAG
ATCCTTTATTATCACCATGTATGCAACCGTAGTGTGGTGGTGAGATGTTTTCAGAGGGCT
TTGGTAACAACGGCGTGGATAGCGTCTGCAAGGTGCGGTACAGTCTTGGAGCTCAGACCA
GCCATGCTTATCCTCCCGTCGGATGTCATGTAGATGTGGTACTCTTTAGTCATGTAGGAG
ACTTGAGCTGGGTTCAACCCTGTGAAGGTGAACATGCCGATCTGTTTGATGATGTGAGTC
CAGTCTCCAGGCGTCC

QA 2 437 2 437
DS 

RD RS1DJ82JQ 661 0 0
GATAGAACCAAAACTTTAAAGTTGGTTACTGCCTACAAAGTTACGACACTGAGAATGTGA
ATAGTAGAAGAGGCACAAAACTCTCTTGCCTACTTTATTAACCACTGAGATGAAATAACA
AATAATAATAATGACATTTAACTTGTCACTGCCGGAAATGCTGAGAAAAGCGAAAGTGAG
ATCCTTTATTATCACCATGTATGCAACCGTAGTGTGGTGGTGAGATGTTTTCAGAGGGCT
TTGGTAACAACGGCGTGGATAGCGTCTGCAAGGTGCGGTACAGTCTTGGAGCTCAGACCA
GCCATGCTTATCCTCCCGTCGGATGTCATGTAGATGTGGTACTCTTTAGTCATGTAGGAG
ACTTGAGCTGGGTTCAACCCTGTGAAGGTGAACATGCCGATCTGTTTGATGATGTGAGTC
CAGTCTCCAGGCGTCCCCCGAGAACGTAATGCCTCGAAGAGCTGCTTTCTCATGCTGATG
ATACGATCAGCCATGGCTTTCAGTTCTAAAGTCCATTCGTTGAACAAGTTCCTGTCGCGG
AGGATTACAGCGACGATGGATGCACCATGGATGGGAGGATTTGAGTACATTGGCCTTATT
ACAAGTTTCAGTTGGCTTTCAACTCTTCCCGCTACATCTGCTGCTTTGCATACAATGCTG
A

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 8

CO CL559Contig1 715 8 5 U
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AACATATTTAGGCAGCCTAGAGCGATGCAGGCCGCAAACGCTATGTTACAGGGCAATCTT
TCTTTGACTCCATCCAAACTCTTTGTTGGAGGTCTCTCACCAACTACTGATGTAGATATC
TTGAAACAAGTTTTTGGCAAATTTGGCAAAATCGTTGATGTGGTAGTGGTTTCGGACCGT
GAAACTGGTGTATCGAAGGGGTTTGGTTTCGTAACATATGATTCCATCGATGCTGCTAAT
AAGGCAATGCAACAGATGAATGATCAGGAACTTGATGGGCGAATAATTGGAGTGAACCCG
GCTGATTCAGGAGGCGGTGGAGGTGGTTTTGGAAGAAGGGGAGGCTATGGTGGTGGCCGT
GGTGGATTTGGTCGAGGTGGGTTTGGACGTGGTGGATTCGGACGTGGTGGCTATAACTTT
GTTCGTTAACTTGGTGTCTAGGAATGCAATTCCACCGAGATTGATTAGTCTGCTTGTTTG
AATTTTCTCTTTCACAGAGAAGAGACCAATATTTTTGTTATAACGTTCACTGAAGCTTTG
AATAAACAGATGAAACAGCTATAAACAAATGTATCGGTTCAGTGGAATTTCACGC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 10 50 
50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1FW06JQ C 141
AF RS1FT47TF U 1
AF RS1DB70JQ C 31
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GGTGGATTTGGTCGAGGTGGGTTTGGACGTGGTGGATTCGGACGTGGTGGCTATAACTTT
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AA

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DS 

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TCTTTGACTCCATCCAAACTCTTTGTTGGAGGTCTCTCACCAACTACTGATGTAGATATC
TTGAAACAAGTTTTTGGCAAATTTGGCAAAATCGTTGATGTGGTAGTGGTTTCGGACCGT
GAAACTGGTGTATCGAAGGGGTTTGGTTTCGTAACATATGATTCCATCGATGCTGCTAAT
AAGGCAATGCAACAGATGAATGATCAGGAACTTGATGGGCGAATAATTGGAGTGAACCCG
GCTGATTCAGGAGGCGGTGGAGGTGGTTTTGGAAGAAGGGGAGGCTATGGTGGTGGCCGT
GGTGGATTTGGTCGAGGTGGGTTTGGACGTGGTGGATTCGGACGTGGTGGCTATAACTTT
GTTCGTTAACTTGGTGTCTAGGAATGCAATTCCACCGAGATTGATTAGTCTGCTTGTTCG
AATTTTCTCTTTCACAGAGAAGAGACCAATATTTTTGTTATAACGTTCACTGAAGCTTTG
AATAAACAGATGAAACAGCTATAAACAAATGTATCGGTTCAGT
GG

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DS 

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GTTTGGTTTCGTAACATATGATTCCATCGATGCTGCTAATAAGGCAATGCAACAGATGAA
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AGGTGGTTTTGGAAGAAGGGGAGGCTATGGTGGTGGCCGTGGTGGATTTGGTCGAGGTGG
GTTTGGACGTGGTGGATTCGGACGTGGTGGCTATAACTTTGTTCGTTAACTTGGTGTCTA
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AGAGACCAATATTTTTGTTATAACGTTCACTGAAGCTTTGAATAAACAGATGAAACAGCT
ATAAACAAATGTATCGGTTCAGT
GG

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DS 

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TCTTTGACTCCATCCAAACTCTTTGTTGGAGGTCTCTCACCAACTACTGATGTAGATATC
TTGAAACAAGTTTTTGGCAAATTTGGCAAAATCGTTGATGTGGTAGTGGTTTCGGACCGT
GAAACTGGTGTATCGAAGGGGTTTGGTTTCGTAACATATGATTCCATCGATGCTGCTAAT
AAGGCAATGCAACAGATGAATGATCAGGAACTTGATGGGCGAATAATTGGAGTGAACCCG
GCTGATTCAGGAGGCGGTGGAGGTGGTTTTGGAAGAAGGGGAGGCTATGGTGGTGGCCGT
GGTGGATTTGGTCGAGGTGGGTTTGGACGTGGTGGATTCGGACGTGGTGGCTATAACTTT
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AATTTTCTCTTTCACAGAGAAGAGACCAATATTTTTGTTATAACGTTCACTGAAGCTTTG
AATAA

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DS 

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CTTGATGGGCGAATAATTGGAGTGAACCCGGCTGATTCAGGAGGCGGTGGAGGTGGTTTT
GGAAGAAGGGGAGGCTATGGTGGTGGCCGTGGTGGATTTGGTCGAGGTGGGTTTGGACGT
GGTGGATTCGGACGTGGTGGCTATAACTTTGTTCGTTAACTTGGTGTCTAGGAATGCAAT
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GTATCGGTTCAGTGGAATTTCACGC

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G
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GGTTTTGGAAGAAGGGGAGGCTATGGTGGTGGCCGTGGTGGATTTGGTCGAGGTGGGTTT
GGACGTGGTGGATTCGGACGTGGTGGCTATAACTTTGTTCGTTAACTTGGTGTCTAGGAA
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ACCAATATTTTTGTTATAACGTTCACTGAAGCTTTGAATAAACAGATGAAACAGCTATAA
ACAAATGTATCGGTTCAGT
AG

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AG

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DS 



AS 1 6

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 5 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EJ59TF U 1
AF RS1GF82TF U 344
AF RS1EZ42TF U 486
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ATGGCGAAGAACGTAGGGATATTGGCTATGGATATCTACTTCCCTCCCACATGTGTGCAA
CAGGAAGCTTTGGAAGCTCATGATGGAGCAAGCAAAGGCAAATACACCATTGGACTTGGC
CAAGATTGTTTAGCTTTTTGCACTGAACTTGAAGATGTCATCTCAATGAGTTTCAATGCG
GTGACATCTCTTCTTGAAAAGTACAAGATTGACCCCAAGCAAATTGGGCGTCTTGAAGTA
GGAAGTGAGACTGTCATTGACAAAAGCAAGTCCATCAAAACCTTCTTGATGCAACTCTTT
GAGAAATGTGGAAACACCGACGTTGAAGGTGTTGACTCGACCAATGCGTGTTATGGTGGA
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GGCCTCGTCATTTGTACTGACAGTGCGGTTTATGCAGAAGGACCTGCAAGGCCCACTGGA
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TTGAGAGGAAGCCACATGGCTCATGTCTATGACTTCTACAAGCCAAATCTTGCTAGCGAG
TACCCGGTTGTTGATGGTAAGCTTTCACAGACATGC

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DS 

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GG
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TTGATGCAACTCTTTGAGAAATGTGGAAACACTGACGTTGAAGGTGTTGACTCGACCAAT
GCATGTTATGGTGGAACCGCAGCTTTGCTAAACTGTGTCAACTGGGTTGAGAGTAACTCC
TGGGATGGACGCTATGGCCTCGTCATTTGTACTGACAGTGCGGTTTATGCAGAAGGACCT
GCAAGGCCCACTGGAGGAGCAGCTGCCATTGCTATGTTGATAGGACCAGATGCTCCTATT
GTTTTTGAGAGCAAACTGAGAGGAAGCCACATGGCTCATGTCTATGACTTCTCCAAGCCA
AATCTTGCTAGCGAGTACCCGGTTGTTGATGGTAAGCTTTCACAGACATGCTACCTTATG
GCACTTGACTCTTGCTACAAACATTTATGCAACAAGTTTGAGAAACTTGAGGGCAAAGAG
TTCTCAATCAATGATGCTGATTACTTTGTCTTCCATTCTCCATACAACAAACTTGTGCAG
AAAAGCTTTGCTCGTCTCTTGTACAACGACTTCTTGAGGAACGCAAGCTCCATTGATGAG
GCTGCCAAAGAAAGGTTCACTCCTTATTCCTCTTTGTCCCTCGATGAGAGTTA

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G
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GTCATTTGTACTGACAGTGCGGTTTATGCAGAAGGACCTGCAAGGCCCACTGGAGGAGCA
GCTGCCATTGCTATGTTGATAGGACCAGATGCTCCTATCGTTTTCGAGAGCAAATTGAGA
GGAAGCCACATGGCTCATGTCTATGACTTCTACAAGCCAAATCTTGCTAGCGAGTACCCG
GTTGTTGATGGTAAGCTTTCACAGACATGCTACCTTATAGCACTTGACTCTTGCTACAAA
CATTTATGCAACAAGTTTGAGAAACTTGAGGGCAAAGAGTTCTCAATCAATGATGCTGAT
TACTTTGTCTTCCATTCTCCATACAACAAACTTGTGCAGAAAAGCTTTGCTCGTCTCTTG
TACAACGACTTCTTGAGAAACGCAAGCTACCTCGACGTTGCTGCCAAAGAAAAATTCACT
CCTTATTCCTCTTTGTCCCTCGATGAGAGTTACCAAAGCCGTGATCTTGAAAAGGTGTCA
CAACAACTAGCGAAAACGTATTATGATGCTAAAGTGCAACCAACGACTTTAGTACCAAAA
GAAGTGGGTAACATTACACTGCTTCACTCTACGCAGCATTTGCTTCCCTCATCCACAACA
AACACAGCGATTTGGTGGGAAAACGGGTGGTTATGTCT*CATATGGAAGTGGTTCA*CCG
CA*CGATGTTCTCATTGCGTCTCTGCGAGA
CCA

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DS 

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GGGGTGGTTATGTTTTCATATGGAAGTGGTTCAACCGCAACGATGTTCTCATTGCGTTTT
TGCGAGAACCACTCTCCTTTCAGCTTATCAAACATCGCTTCTGTAATGGACGTTGGTGGT
AAATTGAAGGCTAGACATGAGTATGCCCCTGAGAAGTTTGTGGAGACAATGAAGCTAATG
GAGCATAGGTACGGAGCAAAGGAGTTCGTGACCAGCAAGGAAGGTATCTTAGAGCTTTTG
GCTCCGGGGACTT

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DS 

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AACGCAAGCTACCTCGACGTTGCTGCCAAAGAAAAATTCACTCCTTATTCCTCTTTGTCC
CTCGATGAGAGTTACCAAAGCCGTGATCTTGAAAAGGTGTCACAACAACTAGCGAAAACG
TATTATGATGCTAAAGTGCAACCAACGACTTTAGTACCAAAAGAAGTGGGTAACATTACA
CTGCTTCACTTTACGCAGCATTTGCTTCCCTCATCCACAACAAACACAGCGATTTGGTGG
GAAAACGGGTGGTTATGTTTTCATATGGAAGTGGTTCAACCGCAACGATGTTCTCATTGC
GTCTTTGCGAGAACCACTCTCCTTTCAGCTTATCAAACATCGCTTCTGTAATGGACGTTG
GTGGTAAATTGAAGGCTAGACATGAGTATGCACCTGAGAAGTTTGTGGAGACAATGAAGC
TAATGGAGCATAGGTACGGAGCAAAGGAGTTCGTGACCAGCAAGGAAGGTATCTTAGAGC
TTTTGGCTCCGGGGACTTACTATTTGAAAGAGGTTGATTCATTGTACCGGAGATTTTATG
GCAAGAAAGGGGACGATGGATCCATAGCCAATGGACACTAAATCACTTTAAAGATGGCCT
TCGCTCATCCACTCTTTATCTTCTTCTTTTTTCACTATTGATTTGCTTTCTCAAGCTTAT
TTAGTATGTTGTGTTTTCTTTTAAAAACTAAGTCCGTTAAATTGATGAATTATTAAAATT
TAATAA
GAAAAAAAA

QA 1 786 1 786
DS 

RD RS1EJ59JQ 446 0 0
TGCGAGAACCACTCTCCTTTCAGCTTATCAAACATCGCTTCTGTAATGGACGTTGGTGGT
AAATTGAAGGCTAGACATGAGTATGCACCTGAGAAGTTTGTGGAGACAATGAAGCTAATG
GAGCATAGGTACGGAGCAAAGGAGTTCGTGACCAGCAAGGAAGGTATTTTAGAGCTTTTG
GCTCCGGGGACTTACTATTTGAAAGAGGTTGATTCATTGTACCGGAGATTTTATGGCAAG
AAAGGGGACGATGGATCCATAGCCAATGGACACTAAATCACTTTAAAGATGGCCTTCGCT
CATCCACTCTTTATCTTCTTCTTTTTTCACTATTGATTTGCTTTCTCAAGCTTATTTAGT
ATGTTGTGTTTTCTTTTAAAAACTAAGTCCGTTAAATTGATGAATTATTAAAATTTAATA
AGAAGTTAGAATAAACCTTTAAATCT

QA 1 446 1 446
DS 



AS 1 8

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GAGGATGAAGCAGACGATTTCGACGAGTTCGATCCGACGCCGTACAGCGGCGGTTACGAC
ATCACAGTGATCTACGGCCGTCCGATCCCTCCTAGCGACGACACTTGCTACCCTCTCTCC
TCCGCAGCCGACGAAGACTTCGAGTACGAGAGACCTGAATTCACCTCGTACCACGATCCT
TCCGCCTACGCCGAAGAGGCTCTCCAGACCGAGTACAGCAGAGTTACGGATCTGGTGGAT
ATGGAGGTAGATCGGAGGTTGAATCTGGTGGTTACGGTGGAAGAACGGAGGTTGAGTATG
GCCGGAGGCCTGAATCTGGATACGGTGGGAGATCGGAGGTCGATTCTGGCGGTTATGGTG
GCAGATCGGAGTCTGAGTCTGGTGGTTACGGTGGAAGAACGGAGGTTGAGTATGGTCGGA
GACCTGAATCTGGATATGGTGGGAGATCGGAGAGTGGGACCGGGTATGGAGAAGAGAGGA
GCGAGTATGAGCGTAAGCCTAGCTACGGGAGGTCTGAGGAGGAAGAAGGAGGAGGTTACA
GGAAGCCTAGCTATGGGAGATCTGAGGATCAGGTTGAGAGCTACATAAAGCCCAGCAGCT
ACGGAAGATCTGAGGAAGAGGAAGAGGGAGGCTATAGGAAGCCTAGCTATGGAAGATCTG
AGGAACAAGAGGAAGGGAGTTACAGGAAGCCTAGCTATGGCCGTCGCAATGATGATGATG
ATGATGATGGGGAGCGTAGGAACCGTTCTGGTGATGATGAGGAAGGGAGCTATGGCCGCA
AGAAATATGGTGGCAATAACTCTGATGATGATGATGAAGAGAAGAAACAGCATCGTTACC
AGCATCACCACCACCAGAGGCGTCGTGATGAAGACGATGACTAAAACACTCTCCCATGAC
GGAGAGTCTTGTTCTGCTTAGCTTTATCTTACTAAATAAAAAGCTAAGGCATTTATCTTT
GGATGTTGCTGTTGTGTTTGCTTGATTCTCTTTAGATACAGCTGAGTCTGTGTCTGACTT
TGTTTCTGGTT*ATAATAAGACCTTGAACTGGTATCGGG*TCATCATCATCATGTAAACT
GTTGGTACTCTGTGTTTCATTTTTATGTTATGGAACTTTCCGCTTTTAGAGTTTAATGGT
TTTATGGCTTCTGTTGTTTTGGTTTTGTCGAAATCAAAAGTCATCGCCGAGAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E602TF U 1
AF RS1G512TF U 505
AF RS1A518JQ C 541
AF RS1H775JQB C 1083
AF RS1H775TF U 818
AF RS1E602JQ C 688
AF RS1A518TF U 541
AF RS1H115TF U 757
BS 1 565 RS1E602TF
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BS 568 586 RS1G512TF
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BS 1195 1259 RS1H115TF

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GAGGATGAAGCAGACGATTTCGACGAGTTCGATCCGACGCCGTACAGCGGCGGTTACGAC
ATCACAGTGATCTACGGCCGTCCGATCCCTCCTAGCGACGACACTTGCTACCCTCTCTCC
TCCGCAGCCGACGAAGACTTCGAGTACGAGAGACCTGAATTCACCTCGTACCACGATCCT
TCCGCCTACGCCGAAGAGGCTCTCCAGACCGAGTACAGCAGAGTTACGGATCTGGTGGAT
ATGGAGGTAGATCGGAGGTTGAATCTGGTGGTTACGGTGGAAGAACGGAGGTTGAGTATG
GCCGGAGGCCTGAATCTGGATACGGTGGGAGATCGGAGGTCGATTCTGGCGGTTATGGTG
GCAGATCGGAGTCTGAGTCTGGTGGTTACGGTGGAAGAACGGAGGTTGAGTATGGTCGGA
GACCTGAATCTGGATATGGTGGGAGATCGGAGAGTGGGACCGGGTATGGAGAAGAGAGGA
GCGAGTATGAGCGTAAGCCTAGCTATG

QA 1 567 1 567
DS 

RD RS1G512TF 612 0 0
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ATGGGAGGTCTGAGGAGGAAGAGGAAGGAGGTTACAGGAAGCCTAGCTATGGGAGATCTG
AGGATCAGGTTGAGAGCTACATAAAGCCTAGCAGCTATGTAAGATCTGAGGAAGAGGAAG
AGGGAGGCTATAGGAAGCCTAGCTATGGAAGATCTGAGGAACAGGAGGAAGGGAGTTACA
GGAAGTCTAGCTATGGCCGTCGCAATGATGATGATGATGATGATGGGGAGCGTAGGAACC
GTTCTGGTGATGATGAGGAAGGGAGCTATGGCCGCAAGAAATATGGTGGCAATAACTCTG
ATGATGATGATGAAGAGAAGAAACAGCATCGTTACCAGCATCACCACCACCAGAGGCGTC
GTGATGAAGACGACGACTAAAATACTCTCCCATGATGGAGAGTCTTGTTCTGCTTAGCTT
TATCTTACTAAATAAAAAGCTAAGGCATTTATCTTTGGATGTTGCTGTTGTGTTTGTTTG
ATTCTCTTTAGATACAGCTGAGTCTGTGTCTGACTTTGTTTCTGGTTTATAATAAGACCT
TGAACTGGTATC

QA 1 612 1 612
DS 

RD RS1A518JQ 654 0 0
C
CGAGTATGAGCGTAAGCCTAGCTACGGGAGGTCTGAGGAGGAAGAAGGAGGAGGTTACAG
GAAGCCTAGCTATGGGAGATCTGAGGATCAGGTTGAGAGCTACATAAAGCCCAGCAGCTA
CGGAAGATCTGAGGAAGAGGAAGAGGGAGGCTATAGGAAGCCTAGCTA*GGAAGATCTGA
GGAACAAGAGGAAGGGAGTTACAGGAAGCCTAGCTATGGCCGTCGCAATGATGATGATGA
TGATGATGAGGGGCGCAGGAACCGTTCTGGTGATGATGAGGAAGGGAGCTATGGCCGCAA
GAAATATGGTGGCAATAACTCTGATGATGATGATGAGGAGAAGAAACAGCATCGTTACCA
GCATCACCACCACCAGAGGCGTCGTGATGAAGACGATGACTAAAACACTCTCCCATGACG
GATAGTCTTGTTCTGCTTAGCTTTATCTTACTAAATAAAAAGCTAAGGCATTTATCTTTG
GATGTTGCTGTTGTGTTTGCTTGATTCTCTTTAGATACAGCTGAGTCTGTGTCTGACTTT
GTTTCTGGTT*ATAATAAGACCTTGAACTGGTATCGGG*TCATCATCATCATGTAAACTG
TTGGTACTCTGTGTTTCATTTTTATGTTATGGAACTTTCCGCTTTTAGAGTTT

QA 2 654 2 654
DS 

RD RS1H775JQB 112 0 0
TTTT
TGGTT*ATAATAAGACCTTGAAATGGTATCGGG*TCATCATCATCATGTAAACTGTTGGT
ACTTTGTGTTTCATTTTTATGTTATGGAACTTTCCGCTTTTAGAGTTT

QA 5 112 5 112
DS 

RD RS1H775TF 377 0 0
TGAGGAAGGGAGCTATGGCCGCAAGAAATATGGTGGCAATAACTCTGATGGTGATGATGA
GGAGAAGAAACAGCATCGTTACCAGCATCACCACCACCAGAGGCGTCGTGATGAAGACGA
TGACTAAAACACTCTCCCATGACGGATAGTCTTGTTCTGCTTAGCTTTATCTTACTAAAT
AAAAAGCTAAGGCATTTATCTTTGGATGTTGCTGTTGTGTTTGCTTGATTCTCTTTAGAT
ACAGCTGAGTCTGTGTCTGACTTTGTTTCTGGTT*ATAATAAGACCTTGAACTGGTATCG
GG*TCATCATCATCATGTAAACTGTTGGTACTCTGTGTTTCATTTTTATGTTATGGAACT
TTCCGCTTTTAGAGTTT

QA 1 377 1 377
DS 

RD RS1E602JQ 505 0 0
GAGGCTATAGGAAGCCTAGCTATGGAAGATCTGAGGAACAGGAGGAAGGGAGTTACAGGA
AGCCTAGCTATGGCCGTCGCAATGATGATGATGATGATGATGGGGAGCGTAGGAACCGTT
CTGGTGATGATGAGGAAGGGAGCTATGGCCGCAAGAAATATGGTGGCAATAACTCTGATG
ATGATGATGAAGAGAAGAAACAGCATCGTTACCAGCATCACCACCACCAGAGGCGTCGTG
ATGAAGACGATGACTAAAATACTCTCCCATGATGGAGAGTCTTGTTCTGCTTAGCTTTAT
CTTACTAAATAAAAAGCTAAGGCATTTATCTTTGGATGTTGCTGTTGTGTTTGTTTGATT
CTCTTTAGATACAGCTGAGTCTGTGTCTGACTTTGTTTCTGGTTTATAATAAGACCTTGA
ACTGGTATCGGG*TCATCATCATCATGTAAACTGTTGGTACTCTGTGTTTCGTTTTTATG
TTATGGAACTTTCCGCTTTTAGAG
C

QA 1 504 1 504
DS 

RD RS1A518TF 654 0 0
C
CGAGTATGAGCGTAAGCCTAGCTACGGGAGGTCTGAGGAGGAAGAAGGAGGAGGTTACAG
GAAGCCTAGCTATGGGAGATCTGAGGATCAGGTTGAGAGCTACATAAAGCCCAGCAGCTA
CGGAAGATCTGAGGAAGAGGAAGAGGGAGGCTATAGGAAGCCTAGCTA*GGAAGATCTGA
GGAACAAGAGGAAGGGAGTTACAGGAAGCCTAGCTATGGCCGTCGCAATGATGATGATGA
TGATGATGAGGGGCGCAGGAACCGTTCTGGTGATGATGAGGAAGGGAGCTATGGCCGCAA
GAAATATGGTGGCAATAACTCTGATGATGATGATGAGGAGAAGAAACAGCATCGTTACCA
GCATCACCACCACCAGAGGCGTCGTGATGAAGACGATGACTAAAACACTCTCCCATGACG
GATAGTCTTGTTCTGCTTAGCTTTATCTTACTAAATAAAAAGCTAAGGCATTTATCTTTG
GATGTTGCTGTTGTGTTTGCTTGATTCTCTTTAGATACAGCTGAGTCTGTGTCTGACTTT
GTTTCTGGTT*ATAATAAGACCTTGAACTGGTATCGGGGTCATCATCATCATGTAAACTG
TTGGTACTCTGTGTTTCATTTTTATGTTATGGAACTTTCCGCTTTTAGAGTTT

QA 2 654 2 654
DS 

RD RS1H115TF 503 0 0
GCTAGCTATGG
AATGATGATGATGATGATGATGGGGAGCGTAGGAACCGTTCTGGTGATGATGAGGAAGGG
AGCTATGGCCGCAAGAAATATGGTGGCAATAACTCTGATGATGATGATGAAGAGAAGAAA
CAGCATCGTTACCAGCATCAC*ACCACCGGAGGCGTCGTGATGAAGACGATTACTAAAAT
ACTCTCCCATGATGGAGAGTCTTGTTCTGCTTAGCTTTATCTTACTAAATAAAAAGCTAA
GGCATTTATCTTTGGATGTTGCTGTTGTGTTTGCTTGATTCTCTTTAGATACAGCTGAGT
CTGTGTCTGACTTTGTTTCTGGTTTATAATAAGACCTTGAACTGGTATCGGG*TCATCAT
CATCATGTAAACTGTTGGTACTCTGTGTTTCGTTTTTATGTTATGGAACTTTCCGCTTTT
AGAGTTTAATGGTTTTATGGCTTCTGTTGTTTTGGTTTTGTCGAAATCAAAAGTCATCGC
CGAGAAAAAAAA

QA 12 503 12 503
DS 



AS 1 8

CO CL562Contig1 747 8 2 U
GTACTAATATCACCGCACTGCTGTTTGCATAAAAATCATGAGAACCTTTTTACAACCATC
GTTCTTAATTACATAGTGGGAAACATCAAAAACAATGTAGAAACATGATATCAATGTAGA
GAGACTCTGACTCGGTTCTGTGACTGAAGCGCCAGCTAAACATTAAATTTTACTGTTTAA
AATGTTTAAATCCTTAGTTTGAAAATGTTGACACCATGCAGCTTACTATGATCTTGAACT
GTGACCCTGTAACTTGATCTTCCCAGAGGTGTAGACTCGGAAGCCGTTGGTAGAGGAAAC
AAGCTTGATACGTTTGTGTGCATTGGTTGATCTGTGATTGCATCTATATAGCTTAGGCAC
ATGTACTGGCTTAACGACGCACGTGTTTTCCATGTCGGGGATTGCGTGGAGTTGGGAAGG
GAGATCGATTTCAAACTCTCCCGAATCATCAGTAATAGCTTTAATCCATTTGGATCTCCT
TTTGTATCCAGTTTGGCACTTGATGGCAACCGTTGCACCTGGAATAGCTATAGAGGGAAG
GTGAGGACGTGGAGTGTCGCAGAGAAGAGATCCAGTGATGATTACGGAAGAGAGTTTCTG
TTCACCGTAGCCAGCCATCTCCACCATCTCTGTTATGCTCCATATCTTCCCTGCAGCTGC
AAACGCTCCTTCAAACAAGAACAAGAACAACAAGAAGCAACGTAACATGAAGAAGCTTCC
CATTTTAAATGTTTACTTTCTGTTTCC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1C112JQ U 12
AF RS1D279JQ U 12
AF RS1DB34JQ U 1
AF RS1DB34TF C 52
AF RS1DP95JQ U 1
AF RS1DP95TF C 1
AF RS1D279TF C 62
AF RS1C112TF C 463
BS 1 675 RS1DB34JQ
BS 676 747 RS1D279TF

RD RS1C112JQ 552 0 0
G
CCGCACTGCTGTTTGTATAAAAATCATGAGAACCTTTTTACAACCATCGTTCTTAATTAC
ATAGTGGGAAACATCAAAAACAATGTAGAAACATGATATCAATGTAGAGAGACTCTGACT
CGGTTCTGTGACTGAGGCGCCAGCTAAACATTAAATTTTACTGTTTAAAATGTTTAAATC
TTTAGTTTGAAAATGTTGACACCATGCAGCTTACTATGATCTTGAACTGTGACCCTGTAA
CTTGATCTTCCCAGAGGTGTAGACTCGGAAGCCGTTGGTAGAGGAAACAAGCTTGATACG
TTTGTGTGCATTGGTTGATCTGTGATTGCATCTATATAGCTTAGGCACATGTACTGGCTT
AACGACGCACGTGTTTTCCATGTCGGGGATTGCGTGGAGTTGGGAAGGGAGATCGATTTC
AAACTCTCCCGAATCATCAGTAATAGCTTTAATCCATTTGGATCTCCTTTTGTATCCAGT
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AGTGTCGCAGA

QA 2 552 2 552
DS 

RD RS1D279JQ 546 0 0
G
CCGCACTGCTGTTTGTATAAAAATCATGAGAACCTTTTTACAACCATCGTTCTTAATTAC
ATAGTGGGAAACATCAAAAACAATGTAGAAACATGATATCAATGTAGAGAGACTCTGACT
CGGTTCTGTGACTGAGGCGCCAGCTAAACATTAAATTTTACTGTTTAAAATGTTTAAATC
TTTAGTTTGAAAATGTTGACACCATGCAGCTTACTATGATCTTGAACTGTGACCCTGTAA
CTTGATCTTCCCAGAGGTGTAGACTCGGAAGCCGTTGGTAGAGGAAACAAGCTTGATACG
TTTGTGTGCATTGGTTGATCTGTGATTGCATCTATATAGCTTAGGCACATGTACTGGCTT
AACGACGCACGTGTTTTCCATGTCGGGGATTGCGTGGAGTTGGGAAGGGAGATCGATTTC
AAACTCTCCCGAATCATCAGTAATAGCTTTAATCCATTTGGATCTCCTTTTGTATCCAGT
TTGGCACTTGATGGCAACCGTTGCACCTGGAATAGCTATAGAGGGAAGGTGAGGACGTGG
AGTGT

QA 2 546 2 546
DS 

RD RS1DB34JQ 675 0 0
GTACTAATATCACCGCACTGCTGTTTGCATAAAAATCATGAGAACCTTTTTACAACCATC
GTTCTTAATTACATAGTGGGAAACATCAAAAACAATGTAGAAACATGATATCAATGTAGA
GAGACTCTGACTCGGTTCTGTGACTGAAGCGCCAGCTAAACATTAAATTTTACTGTTTAA
AATGTTTAAATCCTTAGTTTGAAAATGTTGACACCATGCAGCTTACTATGATCTTGAACT
GTGACCCTGTAACTTGATCTTCCCAGAGGTGTAGACTCGGAAGCCGTTGGTAGAGGAAAC
AAGCTTGATACGTTTGTGTGCATTGGTTGATCTGTGATTGCATCTATATAGCTTAGGCAC
ATGTACTGGCTTAACGACGCACGTGTTTTCCATGTCGGGGATTGCGTGGAGTTGGGAAGG
GAGATCGATTTCAAACTCTCCCGAATCATCAGTAATAGCTTTAATCCATTTGGATCTCCT
TTTGTATCCAGTTTGGCACTTGATGGCAACCGTTGCACCTGGAATAGCTATAGAGGGAAG
GTGAGGACGTGGAGTGTCGCAGAGAAGAGATCCAGTGATGATTACGGAAGAGAGTTTCTG
TTCACCGTAGCCAGCCATCTCCACCATCTCTGTTATGCTCCATATCTTCCCTGCAGCTGC
AAACGCTCCTTCAAA

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1DB34TF 624 0 0
ACAACCATCGTTCTTAATTACATAGTGGGAAACATCAAAAACAATGTAGAAACATGATAT
CAATGTAGAGAGACTCTGACTCGGTTCTGTGACTGAAGCGCCAGCTAAACATTAAATTTT
ACTGTTTAAAATGTTTAAATCCTTAGTTTGAAAATGTTGACACCATGCAGCTTACTATGA
TCTTGAACTGTGACCCTGTAACTTGATCTTCCCAGAGGTGTAGACTCGGAAGCCGTTGGT
AGAGGAAACAAGCTTGATACGTTTGTGTGCATTGGTTGATCTGTGATTGCATCTATATAG
CTTAGGCACATGTACTGGCTTAACGACGCACGTGTTTTCCATGTCGGGGATTGCGTGGAG
TTGGGAAGGGAGATCGATTTCAAACTCTCCCGAATCATCAGTAATAGCTTTAATCCATTT
GGATCTCCTTTTGTATCCAGTTTGGCACTTGATGGCAACCGTTGCACCTGGAATAGCTAT
AGAGGGAAGGTGAGGACGTGGAGTGTCGCAGAGAAGAGATCCAGTGATGATTACGGAAGA
GAGTTTCTGTTCACCGTAGCCAGCCATCTCCACCATCTCTGTTATGCTCCATATCTTCCC
TGCAGCTGCAAACGCTCCTTCAAA

QA 1 624 1 624
DS 

RD RS1DP95JQ 675 0 0
GTACTAATATCACCGCACTGCTGTTTGCATAAAAATCATGAGAACCTTTTTACAACCATC
GTTCTTAATTACATAGTGGGAAACATCAAAAACAATGTAGAAACATGATATCAATGTAGA
GAGACTCTGACTCGGTTCTGTGACTGAAGCGCCAGCTAAACATTAAATTTTACTGTTTAA
AATGTTTAAATCCTTAGTTTGAAAATGTTGACACCATGCAGCTTACTATGATCTTGAACT
GTGACCCTGTAACTTGATCTTCCCAGAGGTGTAGACTCGGAAGCCGTTGGTAGAGGAAAC
AAGCTTGATACGTTTGTGTGCATTGGTTGATCTGTGATTGCATCTATATAGCTTAGGCAC
ATGTACTGGCTTAACGACGCACGTGTTTTCCATGTCGGGGATTGCGTGGAGTTGGGAAGG
GAGATCGATTTCAAACTCTCCCGAATCATCAGTAATAGCTTTAATCCATTTGGATCTCCT
TTTGTATCCAGTTTGGCACTTGATGGCAACCGTTGCACCTGGAATAGCTATAGAGGGAAG
GTGAGGACGTGGAGTGTCGCAGAGAAGAGATCCAGTGATGATTACGGAAGAGAGTTTCTG
TTCACCGTAGCCAGCCATCTCCACCATCTCTGTTATGCTCCATATCTTCCCTGCAGCTGC
AAACGCTCCTTCAAA

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1DP95TF 675 0 0
GTACTAATATCACCGCACTGCTGTTTGCATAAAAATCATGAGAACCTTTTTACAACCATC
GTTCTTAATTACATAGTGGGAAACATCAAAAACAATGTAGAAACATGATATCAATGTAGA
GAGACTCTGACTCGGTTCTGTGACTGAAGCGCCAGCTAAACATTAAATTTTACTGTTTAA
AATGTTTAAATCCTTAGTTTGAAAATGTTGACACCATGCAGCTTACTATGATCTTGAACT
GTGACCCTGTAACTTGATCTTCCCAGAGGTGTAGACTCGGAAGCCGTTGGTAGAGGAAAC
AAGCTTGATACGTTTGTGTGCATTGGTTGATCTGTGATTGCATCTATATAGCTTAGGCAC
ATGTACTGGCTTAACGACGCACGTGTTTTCCATGTCGGGGATTGCGTGGAGTTGGGAAGG
GAGATCGATTTCAAACTCTCCCGAATCATCAGTAATAGCTTTAATCCATTTGGATCTCCT
TTTGTATCCAGTTTGGCACTTGATGGCAACCGTTGCACCTGGAATAGCTATAGAGGGAAG
GTGAGGACGTGGAGTGTCGCAGAGAAGAGATCCAGTGATGATTACGGAAGAGAGTTTCTG
TTCACCGTAGCCAGCCATCTCCACCATCTCTGTTATGCTCCATATCTTCCCTGCAGCTGC
AAACGCTCCTTCAAA

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1D279TF 686 0 0
TTCTTAATTACATAGTGGGAAACATCAAAAACAATGTAGAAACATGATATCAATGTAGAG
AGACTCTGACTCGGTTCTGTGACTGAGGCGCCAGCTAAACATTAAATTTTACTGTTTAAA
ATGTTTAAATCTTTAGTTTGAAAATGTTGACACCATGCAGCTTACTATGATCTTGAACTG
TGACCCTGTAACTTGATCTTCCCAGAGGTGTAGACTCGGAAGCCGTTGGTAGAGGAAACA
AGCTTGATACGTTTGTGTGCATTGGTTGATCTGTGATTGCATCTATATAGCTTAGGCACA
TGTACTGGCTTAACGACGCACGTGTTTTCCATGTCGGGGATTGCGTGGAGTTGGGAAGGG
AGATCGATTTCAAACTCTCCCGAATCATCAGTAATAGCTTTAATCCATTTGGATCTCCTT
TTGTATCCAGTTTGGCACTTGATGGCAACCGTTGCACCTGGAATAGCTATAGAGGGAAGG
TGAGGACGTGGAGTGTCGCAGAGAAGAGATCCAGTGATGATTACGGAAGAGAGTTTCTGT
TCACCGTAGCCAGCCATCTCCACCATCTCTGTTCTGCTCCATATCTTCCCTGCAGCTGCA
AACGCTCCTTCAAACAAGAACAAGAACAACAAGAAGCAACGTAACATGAAGAAGCTTCCC
ATTTTAAATGTTTACTTTCTGTTTCC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1C112TF 285 0 0
AATCCATTTGGATCTCCTTTTGTATCCAGTTTGGCACTTGATGGCAACCGTTGCACCTGG
AATAGCTATAGAGGGAAGGTGAGGACGTGGAGTGTCGCAGAGAAGAGATCCAGTGATGAT
TACGGAAGAGAGTTTCTGTTCACCGTAGCCAGCCATCTCCACCATCTCTGTTCTGCTCCA
TATCTTCCCTGCAGCTGCAAACGCTCCTTCAAACAAGAACAAGAACAACAAGAAGCAACG
TAACATGAAGAAGCTTCCCATTTTAAATGTTTACTTTCTGTTTCC

QA 1 285 1 285
DS 



AS 2 8

CO CL563Contig1 220 2 4 U
CCCCGGAAATGAATATCACGACAAGAAAGGCAAACAATCAACTGATGTTTTTAAACTCTT
GTCATGTGAAACTGATCTAGTGCTCTTTGACAGGGGCAAATTTTGGTAAAGGAGGAAGGT
TCTCGACTGTAACAGTGAGCTTCATGCCTTTAAAACAACCCCCCCTTCCGTCAAGTAAAT
AGTACTGTTTGGTGACATTGAAAGGGAAAATGTCTCTCCC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1C423JQ U 1
AF RS1D575JQ U 1
BS 1 76 RS1C423JQ
BS 77 77 RS1D575JQ
BS 78 217 RS1C423JQ
BS 218 220 RS1D575JQ

RD RS1C423JQ 217 0 0
CCCCGGAAATGAATATCACGACAAGAAAGGCAAACAATCAACTGATGTTTTTAAACTCTT
GTCATGTGAAACTGATTTAGTGCTCTTTGACAGGGGCAAATTTTGGTAAAGGAGGAAGGT
TCTCGACTGTAACAGTGAGCTTCATGCCTTTAAAACAACCCCCCCTTCCGTCAAGTAAAT
AGTACTGTTTGGTGACATTGAAAGGGAAAATGTCTCT

QA 1 217 1 217
DS 

RD RS1D575JQ 220 0 0
CCC
CGGAAATGAATATCACGACAAGAGAGGCAAACAATCAACTGATGTTTTTAAACTCTTGTC
ATGTGAAACTGATCTAGTGCTCTTTGACAGGGGCAAATTTTGGTAAAGGAGGAAGGTTCT
CGACTGTAACAGTGAGCTTCATGCCTTTAAAACAACCCCCCCTTCCGTCAAGTAAATAGT
ACTGTTTGGTGACATTGAAAGGGACAATGTCTCTCCC

QA 4 220 4 220
DS 



CO CL563Contig2 889 6 7 U
GAGGGGTGTCGGTGTAAATAGAAGATCTCGAGATTATCTGTACTCACTATGAAAACCCAC
TAGTCTACCTCTAAATCACAAGTCCACTAGAGGAGACAGAGAGAGAGAAAAGATGGCGAG
ATTCACGGTGTTGATTGCGGCAGCAGTACTTGCTTTTCTAGTGGCAGCGCCGGTGCCGGA
AGTGACGGCAAAGAAGTATTTAGTTGGCGACAAAAAGTTTTGGAATCCAAACATCGACTA
TAACACCTGGGTTCAGGGAAAGCATTTCTACCTTGGAGATTGGCTCTATTTTGTGTACTA
CAGAGACCAACACAACATTCTTGAAGTAAACAAGACCGACTACGAGAGATGTATCTCCGA
CCATCCGATCCGAAACTATACACGTGGAGCTGGGAGAGACATCGTCCCTCTCAATGTCAC
CAAACAGTACTATCTACTTGACGGAAGGGGTGGTTGTTTTAAAGGCATGAAGCTCACTGT
TACAGTCGAGAACCTTCCTCCTCCACCAAAATCTGCACCTGTCAAAGAGCACTAGATCAG
TTTCACATGACAAGAGTTTAAAAACATCAGTTGATTGTTTGCCTCTCTTGTCGTGATATT
CATTTCCGTGGATGATCTTGTTTCATGATTTGTTGTGTTTTGTTGCTATGGTTTACTTTC
TTTTTGTTTTAGCATAAGACATGAATTTCAAACGCCTAAAAATATGGATCTACCATATGA
TAATGATATTTCTTGCTGGTTTGTTTATGTTGTGTCAAAGCTAGTTCCCACTATTCAATA
CATATCAGAAGAATTAATATGAAATCTCACCTAGTTGTTTTGGAATAAGTTTTAGGTTTC
TTTGTAATGATATTGTCTTGGCTGGATGTTAATAAAATGCTTTGCCATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 
35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H481TF U 1
AF RS1H481JQB C 281
AF RS1D575TF U 65
AF RS1FW89TF U 43
AF RS1D308TF U 81
AF RS1D308JQ C 158
BS 1 75 RS1H481TF
BS 76 76 RS1D575TF
BS 77 452 RS1H481TF
BS 453 453 RS1D575TF
BS 454 742 RS1H481TF
BS 743 789 RS1D308TF
BS 790 889 RS1D308JQ

RD RS1H481TF 748 0 0
GAGGGGTGTCGGTGTAAATAGAAGATCTCGAGATTATCTGTACTCACTATGAAAACCCAC
TAGTCTACCTCTAAACCACAAGTCCACTAGAGGAGACAGAGAGAGAGAAAAGATGGCGAG
ATTCACGGTGTTGATTGCGGCAGCAGTACTTGCTTTTCTAGTGGCAGCGCCGGTGCCGGA
AGTGACGGCAAAGAAGTATTTAGTTGGCGACAAAAAGTTTTGGAATCCAAACATCGACTA
TAACACCTGGGTTCAGGGAAAGCATTTCTACCTTGGAGATTGGCTCTATTTTGTGTACTA
CAGAGACCAACACAACATTCTTGAAGTAAACAAGACCGACTACGAGAGATGTATCTCCGA
CCATCCGATCCGAAACTATACACGTGGAGCTGGGAGAGACATCGTCCCTCTCAATGTCAC
CAAACAGTACTATCTACTTGACGGAAGGGGTGATTGTTTTAAAGGCATGAAGCTCACTGT
TACAGTCGAGAACCTTCCTCCTCCACCAAAATCTGCACCTGTCAAAGAGCACTAGATCAG
TTTCACATGACAAGAGTTTAAAAACATCAGTTGATTGTTTGCCTCTCTTGTCGTGATATT
CATTTCCGTGGATGATCTTGTTTCATGATTTGTTGTGTTTTGTTGCTATGGTTTACTTTC
TTTTTGTTTTAGCATAAGACATGAATTTCAAACGCCTAAAAATATGGATCTACCATATGA
TAATGATATTTCTTGCTGGTTT
AAAAAA

QA 1 742 1 742
DS 

RD RS1H481JQB 462 0 0
TGGCTCTATTTTGTGTACTACAGAGACCAACACAACATTCTTGAAGTAAACAAGACCGAC
TACGAGAGATGTATCTCCGACCATCCGATCCGAAACTATACACGTGGAGCTGGGAGAGAC
ATCGTCCCTCTCAATGTCACCAAACAGTACTATCTACTTGACGGAAGGGGTGATTGTTTT
AAAGGCATGAAGCTCACTGTTACAGTCGAGAACCTTCCTCCTCCACCAAAATCTGCACCT
GTCAAAGAGCACTAGATCAGTTTCACATGACAAGAGTTTAAAAACATCAGTTGATTGTTT
GCCTCTCTTGTCGTGATATTCATTTCCGTGGATGATCTTGTTTCATGATTTGTTGTGTTT
TGTTGCTATGGTTTACTTTCTTTTTGTTTTAGCATAAGACATGAATTTCAAACGCCTAAA
AATATGGATCTACCATATGATAATGATATTTCTTGCTGGTTT

QA 1 462 1 462
DS 

RD RS1D575TF 678 0 0
GG
ACCTCTAAATCACAAGTCCACTAGAGGAGACAGAGAGAGAGAAAAGATGGCGAGATTCAC
GGTGTTGATTGCGGCAGCAGTACTTGCTTTTCTAGTGGCAGCGCCGGTGCCGGAAGTGAC
GGCAAAGAAGTATTTAGTTGGCGACAAAAAGTTTTGGAATCCAAACATCAACTATAACAC
CTGGGTTCAGGGAAAGCATTTCTACCTTGGAGATTGGCTCTATTTTGTGTACTACAGAGA
CCAACACAACATTCTTGAAGTAAACAAGACCGACTACGAGAGATGTATCTCTGACCATCC
GATCCGAAACTATACACGTGGAGCTGGGAGAGACATCGTCCCTCTCAATGTCACCAAACA
GTACTATCTACTTGACGGAAGGGGTGGTTGTTTTAAAGGCATGAAGCTCACTGTTACAGT
CGAGAACCTTCCTCCTCTACCAAAATCTGCACCTGTCAAAGAGCACTAGATCAGTTTCAC
ATGACAAGAGTTTAAAAACATCAGTTGATTGTTTGCCTCTCTTGTCGTGATATTCATTTC
CGTGGATGATCTTGTTTCATGATTTGTTGTGTTTTGTTGCTATGGTTTACTTTCTTTTTG
TTTTAGCATAAGACATGAATTTCAAACGCCTAAAAATATGGATCTACCATATGATAATGA
TATTTCTTGCTGGTTT

QA 3 678 3 678
DS 

RD RS1FW89TF 697 0 0
GGG
ACTATGAAAACCCACTAGTCTACCTCTAAATCACAAGTCCACTAGAGGAGACAGAGAGAG
AGAAAAGATGGCGAGATTCACGGTGTTGATTGCGGCAGCAGTACTTGCTTTTCTAGTGGC
AGCGCCGGTGCCGGAAGTGACGGCAAAGAAGTATTTAGTTGGCGACAAAAAGTTTTGGAA
TCCAAACATCAACTATAACACCTGGGTTCAGGGAAAGCATTTCTACCTTGGAGATTGGCT
CTATTTTGTGTACTACAGAGACCAACACAACATTCTTGAAGTAAACAAGACCGACTACGA
GAGATGTATCTCCGACCATCCGATCCGAAACTATACACGTGGAGCTGGGAGAGACATCGT
CCCTCTCAATGTCACCAAACAGTACTATCTACTTGACGGAAGGGGTGGTTGTTTTAAAGG
CATGAAGCTCACTGTTACAGTCGAGAACCTTCCTCCTCCACCAAAATCTGCACCTGTCAA
AGAGCACTAGATCAGTTTCACATGACAAGAGTTTAAAAACATCAGTTGATTGTTTGCCTC
TCTTGTCGTGATATTCATTTCCGTGGATGATCTTGTTTCATGATTTGTTGTGTTTTGTTG
CTATGGTTTACTTTCTTTTTGTTTTAGCATAAGACATGAATTTCAAACGCCTAAAAATAT
GGATCTACCATATGATAATGATATTTCTTGCTGG

QA 4 697 4 697
DS 

RD RS1D308TF 711 0 0
GGAGAGGAGACA
GAGAGAGAGAGAGAGAAAAGATGGCGAGATTCACGGTGTTGATTGCGGCAGCAGTACTTG
CTTTTCTAGTGGCAGCGCCGGTGCCGGAAGTGACGGCAAAGAAGTATTTAGTTGGCGACA
AAAAGTTTTGGAATCCAAACATCGACTATACCACCTGGGTTCAGGGAAAGCATTTCTACC
TTGGAGATTGGCTCTATTTCGTGTACTACAGAGACCAACACAACATTCTTGAAGTAAACA
AGACCGACTACGAGAGATGTATCTCCGACCATCCGATCCGAAACTATACACGTGGAGCTG
GGAGAGACATTGTCCCTCTCAATGTCACCAAACAGTACTATCTACTTGACGGAAGGGGTG
GTTGTTTTAAAGGCATGAAGCTCACTGTTACAGTCGAGAACCTTCCTCCTCCACCAAAAT
CTGCACCTGTCAAAGAGCACTAGATCAGTTTCACATGACAAGAGTTTAAAAACATCAGTT
GATTGTTTGCCTCTCTTGTCGTGATATTCATTTCCGTGGATGATCTTGTTTCATGATTTG
TTGTGTTTTGTTGCTATGGTTTACTTTCTTTTTGTTTTAGCATAAGACGTGAATTTCAAA
CGCCTAAAAATATGGATCTACC*TATTATAATGATATTTCTTGCTGGTTTGTTTATGTTG
TGTCAAAGCTAGTTCCCACTATTCAATACATATCAGA
GA

QA 13 709 13 709
DS 

RD RS1D308JQ 732 0 0
CTAGTGGCAGCGCCGGTGCCGGAAGTGACGGCAAAGAAGTATTTAGTTGGCGACAAAAAG
TTTTGGAATCCAAACATCGACTATACCACCTGGGTTCAGGGAAAGCATTTCTACCTTGGA
GATTGGCTCTATTTCGTGTACTACAGAGACCAACACAACATTCTTGAAGTAAACAAGACC
GACTACGAGAGATGTATCTCCGACCATCCGATCCGAAACTATACACGTGGAGCTGGGAGA
GACATTGTCCCTCTCAATGTCACCAAACAGTACTATCTACTTGACGGAAGGGGTGGTTGT
TTTAAAGGCATGAAGCTCACTGTTACAGTCGAGAACCTTCCTCCTCCACCAAAATCTGCA
CCTGTCAAAGAGCACTAGATCAGTTTCACATGACAAGAGTTTAAAAACATCAGTTGATTG
TTTGCCTCTCTTGTCGTGATATTCATTTCCGTGGATGATCTTGTTTCATGATTTGTTGTG
TTTTGTTGCTATGGTTTACTTTCTTTTTGTTTTAGCATAAGACGTGAATTTCAAACGCCT
AAAAATATGGATCTACC*TATTATAATGATATTTCTTGCTGGTTTGTTTATGTTGTGTCA
AAGCTAGTTCCCACTATTCAATACATATCAGAAGAATTAATATGAAATCTCACCTAGTTG
TTTTGGAATAAGTTTTAGGTTTCTTTGTAATGATATTGTCTTGGCTGGATGTTAATAAAA
TGCTTTGCCATG

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 8

CO CL564Contig1 793 8 12 U
CACACTGAAACATTCATTGATTGATATTCAAGGGTGGAATACAAGTTTAGGACACAAAGC
CAGCGTGTAACCATTACACCCGGAGACAAGAGCTAGCAAGAACTAAACAACTTCTTCTAG
AGACAACAGACAACAGAAACAGAGAGTTCTCTGATGCCAACAACATATAAAACAAACAAT
TTGATAATTAGAAACCAAAATCTAAATCAACCCAAAAGATAAGGTGACCCAGCGTAAAAT
GGAGGATTGGAGATAGACACATCAACTGCCAAACATTATTAGGGAAGAACCGGCTCGAAC
CTCTATCTACTGTTTCGGAACCGTACCAGGAACCACGAGGAAGAGCCGTAGAAACAACCC
AGGGATATGAAGAGGCGCACCTTGTAACATTCAAACCCCATGGCAGGATGCAGATAAAAG
AGAGCCGTAGCTCCTTCTCCCTAGAATCAAACCGGAGAGCCCAGCCTGAACCAAAAGAAC
CAAGAACCTAAGGAGTCTGTTCCGTTGCTACGACACCAAGGAAAAGCGTAACCTCCAGAA
ACGACAGGATCACCACAGAAGCACGAAACGAAGCTCAAAAAGCAGATCAAAGAAGAGAGA
GAGCGAAGGACCGAAACCCTTATCGTCACACCTCAGTCAAACTTTAGATCTGTCGATCTA
GATCTAGATCTGGTTTCTAAACATCATCAAATCGAGCCAAATTACAAACCCAACCGACGG
CGGCACCGTAGAGCCAAACCGTCGGCCGGTGAAATGGTATCCTTTATTTTCTAGGTAGAA
GGCGGAAGGAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 
35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EM32JQ U 1
AF RS1DX07JQ U 138
AF RS1EM09JQ U 2
AF RS1DN43JQ U 2
AF RS1EM32TF C 4
AF RS1DX07TF C 172
AF RS1EM09TF C 117
AF RS1DN43TF C 122
BS 1 190 RS1EM32JQ
BS 191 191 RS1DN43JQ
BS 192 286 RS1EM32JQ
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BS 711 785 RS1EM32TF
BS 786 793 RS1DN43TF

RD RS1EM32JQ 410 0 0
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CAGCGTGTAACCATTACACCCGGAGACAAGAGCTAGCAAGAACTAAACAACTTCTTCTAG
AGACAACAGACAACAGAAACAGAGAGTTCTCTGATGCCAACAACATATAAAACAAACAAT
TTGATAATTAAAAACCAAAATCTAAATCAACCCAAAAGATAAGGTGACCCAGCGTAAAAT
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CTCTATCTACTGTTTCGGAACCGTACCAGGAACCACGAGGAAAAGCCGTAAAAACAACCC
AGGGATATGAAGAGGCGCACCTTGTAACATTCAAACCCCATGGCAGGATG

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DS 

RD RS1DX07JQ 273 0 0
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AAATCTAAATCAACCCAAAAGATAAGGGGACCCAGCGTAAAATGGAGGATTGGAGATAGA
CACATCAACTGCCAAACATTATTAGGGAAGAACCGGCTCGAACCTCTATCTACTGTTTCG
GAACCGTACCAGGAACCACGAGGAAGAGCCGTAAAAACAACCCAGGGATATGAAGAGGCG
CACCTTGTAACATTCAAACCCCATGGGAGGATG

QA 1 273 1 273
DS 

RD RS1EM09JQ 427 0 0
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TGATTGATATTCAAGGGTGGAATACAAGTTTAGGACACAAAGCCAGCGTGTAACCATTAC
ACCCGGAGACAAGAGCTAGCAAGAACTAAACAACTTCTTCTAGAGACAACAGACAACAAA
AACAGAAAGTTCTCTGATGCCAACAACATATAAAACAAACAATTTGATAATTAAAAACCA
AAATCTAAATCAACCCAAAAGATAAGGTGACCCAGCGTAAAATGGAGGATTGGAGATAGA
CACATCAACTGCCAAACATTATTAGGGAAAAACCGGCTCGAACCTCTATCTACTGTTTCG
GAACCGTACCAGGAACCACGAGGAAAAGCCGTAAAAACAACCCAGGGATATGAAGAGGCG
CACCTTGTAACATTCAAACCCCATGGCAGGATGCAAATAAAAGAAAGCCGT

QA 17 427 17 427
DS 

RD RS1DN43JQ 709 0 0
ACACTGAAACATTCAT
TGATTGATATTCAAGGGTGGAATACAAGTTTAGGACACAAAGCCAGCGTGTAACCATTAC
ACCCGGAGACAAGAGCTAGCAAGAACTAAACAACTTCTTCTAGAGACAACAGACAACAGA
AACAGAGAGTTCTCTGATGCCAACAACATATAAAACAAACAATTTGATAATTAGAAACCA
AAATCTAAATCAACCCAAAAGATAAGGTGACCCAGCGTAAAATGGAGGATTGGAGATAGA
CACATCAACTGCCAAACATTATTAGGGAAGAACCGGCTCGAACCTCTATCTACTGTTTCG
GAACCGTACCAGGAACCACGAGGAAGAGCCGTAGAAACAACCCAGGGATATGAAGAGGCG
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GAAGCACGAAACGAAGCTCAAAAAGCAGATCAAAGAAGAGAGAGAGCGAAGGACCGAAAC
CCTTATCGTCACACCTCAGTCAAACTTTAGATCTGTCGATCTAGATCTAGATCTGGTTTC
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QA 17 709 17 709
DS 

RD RS1EM32TF 785 0 0
ACACTGAACATTCA
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AACAGAGAGTTCTCTGATGCCAACAACATATAAAACAAACAATTTGATAATTAGAAACCA
AAATCTAAATCAACCCAAAAGATAAGGTGACCCAGCGTAAAATGGAGGATTGGAGATAGA
CACATCAACTGCCAAACATTATTAGGGAAGAACCGGCTCGAACCTCTATCTACTGTTTCG
GAACCGTACCAGGAACCACGAGGAAGAGCCGTAGAAACAACCCAGGGATATGAAGAGGCG
CACCTTGTAACATTCAAACCCCATGGCAGGATGCAGATAAAAGAGAGCCGTAGCTCCTTC
TCCTTAGAATCAAACCGGAGAGCCCAGCCTGAACCAAAAGAACCAAGAACCTAAGGAGTC
TGTTCCGTTGCTACGACACCAAGGAAAAGCGTAACCTCCAGAAACGACAGGATCACCACA
GAAGCACGAAACGAAGCTCAAAAAGCAGATCAAAGAAGAGAGAGAGCGAAGGACCGAAAC
CCTTATCGTCACACCTCAGTCAAACTTTAGATCTGTCGATCTAGATCTAGATCTGGTTTC
TAAACATCATCAAATCGAGCCAAATTACAAACCCAACCGACGGCGGCACCGTAGAGCCAA
ACCGTCGGCCGGTGAAATGGTATCCTTTATTTTCTAGGTAGAAGGCGG
CCC

QA 15 782 15 782
DS 

RD RS1DX07TF 616 0 0
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GGCTCGAACCTCTATCTACTGTTTCGGAACCGTACCAGGAACCACGAGGAAGAGCCGTAG
AAACAACCCAGGGATATGAAGAGGCGCACCTTGTAACATTCAAACCCCATGGCAGGATGC
AGATAAAAGAGAGCCGTAGCTCCTTCTCCTTAGAATCAAACCGGAGAGCCCAGCCTGAAC
CAAAAGAACCAAGAACCTAAGGAGTCTGTTCCGTTGCTACGACACCAAGGAAAAGCGTAA
CCTCCAGAAACGACAGGATCACCACAGAAGCACGAAACGAAGCTCAAAAAGCAGATCAAA
GAAGAGAGAGAGCGAAGGACCGAAACCCTTATCGTCACACCTCAGTCAAACTTTAGATCT
GTCGATCTAGATCTAGATCTGGTTTCTAAACATCATCAAATCGAGCCAAATTACAAACCC
AACCGACGGCGGCACCGTAGAGCCAAACCGTCGGCCGGTGAAATGGTATCCTTTATTTTC
TAGGTAGAAGGCGG
CC

QA 1 614 1 614
DS 

RD RS1EM09TF 671 0 0
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CAATTTGATAATTAGAAACCAAAATCTAAATCAACCCAAAAGATAAGGTGACCCAGCGTA
AAATGGAGGATTGGAGATAGACACATCAACTGCCAAACATTATTAGGGAAGAACCGGCTC
GAACCTCTATCTACTGTTTCGGAACCGTACCAGGAACCACGAGGAAGAGCCGTAGAAACA
ACCCAGGGATATGAAGAGGCGCACCTTGTAACATTCAAACCCCATGGCAGGATGCAGATA
AAAGAGAGCCGTAGCTCCTTCTCCTTAGAATCAAACCGGAGAGCCCAGCCTGAACCAAAA
GAACCAAGAACCTAAGGAGTCTGTTCCGTTGCTACGACACCAAGGAAAAGCGTAACCTCC
AGAAACGACAGGATCACCACAGAAGCACGAAACGAAGCTCAAAAAGCAGATCAAAGAAGA
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TCTAGATCTAGATCTGGTTTCTAAACATCATCAAATCGAGCCAAATTACAAACCCAACCG
ACGGCGGCACCGTAGAGCCAAACCGTCGGCCGGTGAAATGGTATCCTTTATTTTCTAGGT
AGAAGGCGG
CC

QA 1 669 1 669
DS 

RD RS1DN43TF 672 0 0
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TGATAATTAGAAACCAAAATCTAAATCAACCCAAAAGATAAGGTGACCCAGCGTAAAATG
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TCTATCTACTGTTTCGGAACCGTACCAGGAACCACGAGGAAGAGCCGTAGAAACAACCCA
GGGATATGAAGAGGCGCACCTTGTAACATTCAAACCCCATGGCAGGATGCAGATAAAAGA
GAGCCGTAGCTCCTTCTCCCTAGAATCAAACCGGAGAGCCCAGCCTGAACCAAAAGAACC
AAGAACCTAAGGAGTCTGTTCCGTTGCTACGACACCAAGGAAAAGCGTAACCTCCAGAAA
CGACAGGATCACCACAGAAGCACGAAACGAAGCTCAAAAAGCAGATCAAAGAAGAGAGAG
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ATCTAGATCTGGTTTCTAAACATCATCAAATCGAGCCAAATTACAAACCCAACCGACGGC
GGCACCGTAGAGCCAAACCGTCGGCCGGTGAAATGGTATCCTTTATTTTCTAGGTAGAAG
GCGGAAGGAACC

QA 1 672 1 672
DS 



AS 2 8

CO CL565Contig1 732 2 2 U
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AATATCAGAAAGTTTGGTACTAAGGCTGTTATACTATATGCAGTGAACCTTTGCCTTTTT
TTATAGATCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CN55TF U 1
AF RS1CN55JQ C 323
BS 1 563 RS1CN55TF
BS 564 732 RS1CN55JQ

RD RS1CN55TF 563 0 0
GGATGAGTAATTATTATTTCGTGATTACAATTGCTCGGCCCTGATTACATTTGTGCGAGA
GTAGCATCCACTCGAGGGAGAACAGAGCATATGGAGACTGCTATATGTGGGAGATTAGCT
CTCGCACCAAACTCTCTCTTCAATTCTTCTTTATCAGGGGAAAACATTCTCTGTCAAAAG
GACCATGCGTTAATAATCGTGGAGTTCTCATGACCATAGTGAGTAAAGGAGGTGGTGTGT
TGGACAAACCAATTATAGAGAAGACTACTCCTGGTCGTGAATCTGAGCTTGATTTGAGGA
AATCAAAGAAGATGGCTCCACCTTACAGAGTGATACTACACAACGACAACTTCAACAAGA
GGGAATATGTGGTTCAGGTTTTGATGAAGGTCATACCAGGAATGACCGTAGACAACGCAG
TTAACATTATGCAAGAAGCCCACATCAACGGTTTGGCTGTTGTCATCGTCTGTGCTCAGG
CCGATGCAGAGCAACACTGTATGCAGCTTCGCGGTAACGGTCTTCTCAGTTCTGTTGAAC
CTGATGGTGGAGGCTGCTGAAAC

QA 1 563 1 563
DS 

RD RS1CN55JQ 410 0 0
TTACAGAGTGATACTACACAACGACAACTTCAACAAGAGGGAATATGTGGTTCAGGTTTT
GATGAAGGTCATACCAGGAATGACCGTAGACAACGCAGTTAACATTATGCAAGAAGCCCA
CATCAACGGTTTGGCTGTTGTCATCGTCTGTGCTCAGGCCGATGCAGAGCAACACTGTAT
GCAGCTTCGCGGTAACGGTCTTCTCAGTTCTGTTGAACCTGATGGTGGAGGCTGCTGAAA
CAAAAAAACAAAAAACTAGTTTAAATTTCGTATAGGTTTTTCACACCTCTCAGGACACTC
TATTTAGTAAAAAAAGAAAATGTCCTTTGGTGTATATAAATATCAGAAAGTTTGGTACTA
AGGCTGTTATACTATATGCAGTGAACCTTTGCCTTTTTTTATAGATCTTT

QA 1 410 1 410
DS 



CO CL565Contig2 716 6 15 U
GGGCTCTGGCCCTGATTACATTTGTGTGAGAGAAGCATCCACTCGAGGGAGAGCAGAGGA
GGCATATGGAGAGTGCGATATTTGGGAGATTAACTCTCGCACCAAACTCTCTCTTCAATT
CTTCTTTATCAGGAGACAAACATTCTGTCTCAAAAGGACCATGCGTGAATAATCGTGGAG
TTCTCATGACCATAGTGAGTAAAGGAGGTGGTGTGTTGGACAAACCAATTATAGAGAAGA
CTACTCCTGGTCGTGAATCTGAGTTTGATTTGAGGAAATCAAAGAAGATGGCTCCACCTT
ACAGAGTGATACTACACAACGACAACTTCAACAAGAGGGAATATGTGGTTCAGGTTTTGA
TGAAGGTCATACCAGGAATGACCGTAGACAACGCAGTTAACATTATGCAAGAAGCCCATA
TCAACGGTTTGGCAGTTGTCATCGTCTGTGCACAGGCCGATGCAGAGCAACACTGTATGC
AGCTGCGCGGTAACGGTCTTCTCAGTTCTGTTGAACCTGATGGTGGAGGCTGCTGAAACC
CAAAAAAATGCAAAACTAGTTTAAATTTCGTATAGGTTTTTCACACCTCTTAGGACACTC
TATTTAGTAAAAAAGAAATGTCCTTTGGTGTATATAAATATCAGAAAGTTTGGTACTAAG
ACTGTTACTATATGCAGTGAACCTTTGCCTTTTTATAGATCTTTCGTTGGTTTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EK29TF U 1
AF RS1DL07JQ C 10
AF RS1AU21JQ C 114
AF RS1EU47TF U 43
AF RS1DL07TF U 10
AF RS1EK29JQ C 299
BS 1 50 RS1EK29TF
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BS 52 81 RS1EK29TF
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BS 695 716 RS1EK29JQ

RD RS1EK29TF 688 0 0
GGGCTCTGGCCCTGATTACATTTGTGTGAGAGAAGCATCCACTCGAGGGAAAGCAGAGGA
GGCATATGGAGAGTGCGATATGTGGGAGATTAACTTTCGCACCAAACTCTCTCTTCAATT
CTTCTTTATCAGGAGACAAACATTCTGTCTCAAAAGGACCATGCGTGAATAATCGTGGAG
TTCTCATGACCATAGTGAGTAAAGGAGGTGGTGTGTTGGACAAACCAATTATAGAGAAGA
CTACTCCTGGTCGTGAATCTGAGTTTGATTTGAGGAGATCAAAGAAGATGGCTCCACCTT
ACAGAGTGATACTACACAACGACAACTTCAACAAGAGGGAATATGTGGTTCAGGTTTTGA
TGAAGGTCGTACCAGGAATGACCGTAGACAACGCAGTTAACATTATGCAAGAAGCCCATA
TCAACGGTTTGGCAGTTGTCATCGTCTGTGCACAGGCCGATGCAGAGCAACACTGTATGC
AGCTGCGCGGTAACGGTCTTCTCAGTTCTGTTGAACCTGATGGTGGAGGCTGCTGAAACC
CAAAAAAATGCAAAACTAGTTTAAATTTCGTATAGGTTTTTCACACCTCTTAGGACACTC
TATTTAGTAAAAA*GAAATGTCCTTTGGTGTATATAAATATCAGAAAGTTTGGTACTAAG
ACTGTTACTATATGCAGTGAACCTTTGC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RS1DL07JQ 692 0 0
GG
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AGTGCGATATTTGGGAGATTAACTCTCGCACCAAACTCTCTCTTCAATTCTTCTTTATCA
GGAGACAAACATTCTGTCTCAAAAGGACCATGCGTGAATAATCGTGGAGTTCTCATGACC
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CTACACAACGACAACTTCAACAAGAGGGAATATGTGGTTCAGGTTTTGATGAAGGTCATA
CCAGGAATGACCGTAGACAACGCAGTTAACATTATGCAAGAAGCCCATATCAACGGTTTG
GCAGTTGTCATCGTCTGTGCACAGGCCGATGCAGAGCAACACTGTATGCAGCTGCGCGGT
AACGGTCTTCTCAGTTCTGTTGAACCTGATGGTGGAGGCTGCTGAAACCCAAAAAAATGC
AAAACTAGTTTAAATTTCGTATAGGTTTTTCACACCTCTTAGGACACTCTATTTAGTAAA
AAAGAAATGTCCTTTGGTGTATATAAATATCAGAAAGTTTGGTACTAAGACTGTTACTAT
ATGCAGTGAACCTTTGCCTTTTT
ATAGATC

QA 3 685 3 685
DS 

RD RS1AU21JQ 567 0 0
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CGTGGAGTTCTCATGACCATAGTGAGTAAAGGAGGTGGTGTGTTGGACAAACCAATTATA
GAGAAGACTACTCCTGGTCGTGAATTTGAGTTTGATTTGAGGAAATCAAAGAAGATGGCT
CCACCTTACAGAGTGATACTACACAACGACAACTTCAACAAGAGGGAATATGTGGTTCAG
GTTTTGATGAAGGTCATACCAGGAATGACCGTAGACAACGCAGTTAACATTATGCAAGAA
GCCCATATCAACGGTTTGGCAGTTGTCATCGTCTGTGCACAGGCCGATGCAGAGCAACAC
TGTATGCAGCTGCGCGGTAACGGTCTTTTCAGTTCTGTTGAACCTGATGGTGGAGGCTGC
TGAAACCCAAAAAAATGCAAAACTAGTTTAAATTTCGTATAGGTTTTTCACACCTCTTAG
GACACTCTATTTAGTAAAAAAGAAATGTCCTTTGGTGTATATAAATATCAGAAAGTTTGG
TACTAAGACTGTTACTATATGCAGTGA

QA 1 567 1 567
DS 

RD RS1EU47TF 656 0 0
GG
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AACTCTCTCTTCAATTCTTCTTTATCAGGAGACAAACATTCTGTCTCAAAAGGACCATGC
GTGAATAATCGTGGAGTTCTCATGACCATAGTGAGTAAAGGAGGTGGTGTGTTGGACAAA
CCAATTATAGAGAAGACTACTCCTGGTCGTGAATCTGAGTTTGATTTGAGGAAATCAAAG
AAGACGGCTCCACCTTACAGAGTGATACTACACAACGACAACTTCAACAAGAGGGAATAT
GTGGTTCAGGTTTTGATGAAGGTCATACCAGGAATGACCGTAGACAACGCAGTTAACATT
ATGCAAGAAGCCCATATCAACGGTTTGGCAGTTGTCATCGTCTGTGCACAGGCCGATGCA
GAGCAACACTGTATGCAGCTGCGCGGTAACGGTCTTCTCAGTTCTGTTGAACCTGATGGT
GGAGGCTGCTGAAACCCAAAAAAATGCAAAACTAGTTTAAATTTCGTATAGGTTTTTCAC
ACCTCTTAGGACACTCTATTTAGTAAAAAAGAAATGTCCTTTGGTGTATATAAATATCAG
AAAGTTTGGTACTAAGACTGTTACTATATGCAGTGAACCTTTGCCTTTTT
ATAG

QA 3 652 3 652
DS 

RD RS1DL07TF 664 0 0
GG
CTGATTACATTTGTGTGAGAGAAGCATCCACTCGAGGGAGAGCAGAGGAGGCATATGGAG
AGTGCGATATTTGGGAGATTAACTCTCGCACCAAACTCTCTCTTCAATTCTTCTTTATCA
GGAGACAAACATTCTGTCTCAAAAGGACCATGCGTGAATAATCGTGGAGTTCTCATGACC
ATAGTGAGTAAAGGAGGTGGTGTGTTGGACAAACCAATTATAGAGAAGACTACTCCTGGT
CGTGAATCTGAGTTTGATTTGAGGAAATCAAAGAAGATGGCTCCACCTTACAGAGTGATA
CTACACAACGACAACTTCAACAAGAGGGAATATGTGGTTCAGGTTTTGATGAAGGTCATA
CCAGGAATGACCGTAGACAACGCAGTTAACATTATGCAAGAAGCCCATATCAACGGTTTG
GCAGTTGTCATCGTCTGTGCACAGGCCGATGCAGAGCAACACTGTATGCAGCTGCGCGGT
AACGGTCTTCTCAGTTCTGTTGAACCTGATGGTGGAGGCTGCTGAAACCCAAAAAAATGC
AAAACTAGTTTAAATTTCGTATAGGTTTTTCACACCTCTTAGGACACTCTATTTAGTAAA
AAAGAAATGTCCTTTGGTGTATATAAATATCAGAAAGTTTGGTACTAAGACTGTTACTAT
AT

QA 3 664 3 664
DS 

RD RS1EK29JQ 418 0 0
TTACAGAGTGATACTACACAACGACAACTTCAACAAGAGGGAATATGTGGTTCAGGTTTT
GATGAAGGTCGTACCAGGAATGACCGTAGACAACGCAGTTAACATTATGCAAGAAGCCCA
TATCAACGGTTTGGCAGTTGTCATCGTCTGTGCACAGGCCGATGCAGAGCAACACTGTAT
GCAGCTGCGCGGTAACGGTCTTTTCAGTTCTGTTGAACCTGATGGTGGAGGCTGCTGAAA
CCCAAAAAAATGCAAAACTAGTTTAAATTTCGTATAGGTTTTTCACACCTCTTAGGACAC
TCTATTTAGTAAAAAAGAAATGTCCTTTGGTGTATATAAATATCAGAAAGTTTGGTACTA
AGACTGTTACTATATGCAGTGAACCTTTGCCTTTTTATAGATCTTTCGTTGGTTTTAG

QA 1 418 1 418
DS 



AS 1 7

CO CL566Contig1 1250 7 10 U
GGTGACATAAAAGTGTGTTATTTATAAACATGGAAGCAAATACAAAGCAGGAAGATCTGA
TTCCTCGAAGCAGATTGTTTCTTCCTTTTTTATATTCATTAGTATTACAAAAAAAAAGAG
ATTATTTATTGCATCTCCACGTCCTCAGGCTGTGTCGCTACATAAACCATATTCTCCAGC
ATTTTGATTTATTACATAACATAACATTATATTTCTTATTTTATTCTAGTGTTCGATCCT
TCACACATATATAGGAGGATGTTCATACATATTTAGTCACAGAAATGACTTCAAACTCAA
CTCCCACGTAAAGCTTATCCTTGACCAAATAAGGTTCACAAAGTTTCGACAGAGGCATGA
ACTCATCAAAACCCTTATCGGCATCATATTCTTCTCGAACCAAACACGAATCTGTTTTCT
CAACATGATTGCGGTTAACTTGATCCAATACTCTCAGCTTAAATTTCACGAAAGTCTCCG
CCTTTGGTTCATTGTTGATAAACCCTTCTCCCACTAAATACACAGAGAATGATTCGTCTG
TTTCCTCATAACCACTTGGATGAACTTCAATTCTCCATTTGCGGTTTCCAACGACAAATG
GATTGGAGAGATGAGCCTGTTCAGGGTCGAAAGAGGAGAACTTGGTCATCATCCAAGTGA
CTTTGCCATTGAGAGGCTTCTCAATTAGGCTATAACATTCAGCTGTTCCAGGTCTCTCAG
TTTCCTGGTCAGGAAGAGTGGCACCGAACATACAACAATCTTCAATAAGAAACCCTTCGC
TCTTAAGACCACACAGTGACATCAATTTTATTCCTTGTAGAATCGGATTTGGTGATGCAT
CAAATTCCATTATTACATTGTTTTTGGGGTACCATTCTGGCTTTAACTGACTTACGACAT
AGACCTGAAACTTGAGCTCAACGTCTACTGGATCTTGATTCTCTAAGAAAACGGAGACAT
GCTCTGCATTCTTGTCATACTCCACATTGATTTTCCATTTGCGACCACAGATATCAAAAT
CAGAAGATTCGACACGAGCAACCCCATACTTTGTGAGTAAAGAGAAATTGTCTATCTTGA
GCAAGTGAGAATTTGGGTGATTCTTCTTGAACTCTTGCACCATCTTTTCAATGGGTATTG
GTCGTCGTAACATGTTACTTTCAGTGGGTATTAGTCGTCGTCGTGACATGTTAACAAGCT
GCAAATGATATGAACTTAAGTTTTTTCTTCTGTGAGGCTTATATGCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 15 15 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RS1E353JQ U 143
AF RS1E367JQ U 107
AF RS1GF35JQ U 1
AF RS1CH90JQ U 131
AF RS1GF35TF C 557
AF RS1E367TF C 621
AF RS1E353TF C 621
BS 1 370 RS1GF35JQ
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BS 372 651 RS1GF35JQ
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BS 838 838 RS1GF35TF
BS 839 920 RS1CH90JQ
BS 921 921 RS1GF35TF
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BS 936 1246 RS1GF35TF
BS 1247 1250 RS1E353TF

RD RS1E353JQ 313 0 0
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AACATTATATTTCTTATTTTATTCTAGTGTTCGATCCTTCACACATATATAGGAGGATGT
TCATACATATTTAGTCACAAAAATGACTTCAAACTCAACTCCCACGTAAAGCTTATCCTT
GACCAAATAAGGTTCACAAAGTTTCGACAGAGGCATGAACTCATCAAAACCCTTATCGGC
ATCATATTCTTCTCGAACCAAACACGAATCTGTTTTCTCAACATGATTGCGGTTAACTTG
ATCCAATACTCTC

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DS 

RD RS1E367JQ 423 0 0
G
CAAAAAAAAAGAGATTATTTATTGCATCTCCACGTCCTCAGGCTGTGTCGCTACATAAAC
CATATTCTCCAGCATTTTGATTTATTACATAACATAACATTATATTTCTTATTTTATTCT
AGTGTTCGATCCTTCACACATATATAGGAGGATGTTCACACATATTTAGTCACAGAAATG
ACTTCAAACTCAACTCCCACGTAAAGCTTATCCTTGACCAAATAAGGTTCACAAAGTTTC
GACAGAGGCATAAACTCATCAAAACCCTTATCGGCATCATATTCTTCTCGAACCAAACAC
GAATCTGTTTTCTCAACATGATTGCGGTTAACTTGATCCAATACTCTCAGCTTAAATTTC
ACGAAAGTCTCCGCCTTTGGTTCATTGTTGATAAACCCTTCTCCCACTAAATACACAGAG
AA

QA 2 423 2 423
DS 

RD RS1GF35JQ 651 0 0
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ATTATTTATTGCATCTCCACGTCCTCAGGCTGTGTCGCTACATAAACCATATTCTCCAGC
ATTTTGATTTATTACATAACATAACATTATATTTCTTATTTTATTCTAGTGTTCGATCCT
TCACACATATATAGGAGGATGTTCATACATATTTAGTCACAGAAATGACTTCAAACTCAA
CTCCCACGTAAAGCTTATCCTTGACCAAATAAGGTTCACAAAGTTTCGACAGAGGCATGA
ACTCATCAAAGCCCTTATCGGCATCATATTCTTCTCGAACCAAACACGAATCTGTTTTCT
CAACATGATTGCGGTTAACTTGATCCAATACTCTCAGCTTAAATTTCACGAAAGTCTCCG
CCTTTGGTTCATTGTTGATAAACCCTTCTCCCACTAAATACACAGAGAATGATTCGTCTG
TTTCCTCATAACCACTTGGATGAACTTCAATTCTCCATTTGCGGTTTCCAACGACAAATG
GATTGGAGAGATGAGCCTGTTCAGGGTCGAAAGAGGAGAACTTGGTCATCA

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DS 

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ATTACATAACATAACATTATATTTCTTATTTTATGCTAGTGTTCGATCCTTCACACATAT
ATAGGAGGATGTTCATACATATTTAGTCACAGAAATGACTTCAAACTCAACTCCCACGTA
AAGCTTATCCTTGACCAAATAAGGTTCACAAAGTTTCGACAGAGGCATGAACTCATCAAA
ACCCTTATCGGCATCATATTCTTCTCGAACCAAACACGAATCTGTTTTCTCAACATGATT
GCGGTTAACCTGATCCAATACTCTCAGCTTAAATTTCACGAAAGTCTCCGCCTTTGGTTC
ATTGTTGATAAACCCTTCTCCCACTAAATACACAGAGAATGATTCGTCTGTTTCCTCATA
ACCACTTGGATGAACTTCAATTCTCCATTTGCGGTTTCCAACGACAAATGGATTGGAGAG
ATGAGCCTGTTCAGGGTCGAAAGAGGAGAACTTGGTCATCATCCAAGTGACTTTGCCATT
GAGAGGCTTCTCAATTAGGCTATAACATTCAGCTGTTCCAGGTCTCTCAGTTTCCTGGTC
AGGAAGAGTGGCACCGAACATACAACAATCTTCAATAAGAAACCCTTCGCTCTTAAGACC
ACACAGTGACATCAATTTTATTCCTTGTAGAATCGGATTTGGTGATGAATCAAATTCCAT
TATTACATTGTTTTTGGGGTACCATTCTGGCTTTAACTGACTTACGACATAGACCTGAAA
CTTGAGCTCA*CGTCTACTGGATCT

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DS 

RD RS1GF35TF 694 0 0
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CTGTTCAGGGTCGAAAGAGGAGAACTTGGTCATCATCCAAGTGACTTTGCCATTGAGAGG
CTTCTCAATTAGGCTATAACATTCAGCTGTTCCAGGTCTCTCAGTTTCCTGGTCAGGAAG
AGTGGCACCGAACATACAACAATCTTCAATAAGAAACCCTTCGCTCTTAAGACCACACAG
TGACATCAATTTTATTCCTTGTAGAATCGGATTTGGTGATGCATCAAATTCCATTATTAC
ATTGTTTTTGGGGTACCATTCTGGCTTTAACTGACTTACGACATAGACCTGAAACTTGAG
CTCAACGTCTACTGGATCTTGATTCTCTAAGAAAACGGAGACATGCTCTGCATTCTTGTC
ATACTCCACATTGATTTTCCATTTGCGACCACAGATATCAAAATCAGAAGATTCGACACG
AGCAACCCCATACTTTGTGAGTAAAGAGAAATTGTCTATCTTGAGCAAGTGAGAATTTGG
GTGATTCTTCTTGAACTCTTGCACCATCTTTTCAATGGGTATTGGTCGTCGTAACATGTT
ACTTTCAGTGGGTATTAGTCGTCGTCGTGACATGTTAACAAGCTGCAAATGATATGAACT
TAAGTTTTTTCTTCTGTGAGGCTTATATGC
ACCC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1E367TF 622 0 0
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ATCAATTTTATTCCTTGTAGAATCGGATTTGGTGATGCATCAAATTCCATTATTACATTG
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ACGTCTACTGGATCTTGATTCTCTAAGAAAACGGAGACATGCTCTGCATTCTTGTCATAC
TCCACATTGATTTTCCATTTGCGACCACAGATATCAAAATCAGAAGATTCGACACGAGCA
ACCCCATACTTTGTGAGTAAAGAGAAATTGTCTATCTTGAGCAAGTGAGAATTTGGGTGA
TTCTTCTTGAACTCTTGCACCATCTTTTCAATGGGTATTGGTCGTCGTAACATGTTACTT
TCAGTGGGTATTAGTCGTCGTCGTGACATGTTAACAAGCTGCAAATGATATGAACTTAAG
TTTTTTCTTCTGTGAGGCTT
CC

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DS 

RD RS1E353TF 630 0 0
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TCAATTAGGCTATAACATTCAGCTGTTCCAGGTCTCTCAGTTTCCTGGTCAGGAAGAGTG
GCACCGAACATACAACAATCTTCAATAAGAAACCCTTCGCTCTTAAGACCACACAGTGAC
ATCAATTTTATTCCTTGTAGAATCGGATTTGGTGATGCATCAAATTCCATTATTACATTG
TTTTTGGGGTACCATTCTGGCTTTAACTGACTTACGACATAGACCTGAAATTTGAGACTA
ACGTCTACTGGATCTTGATTCTCTAAGTAAATGGAGACATGCTCTGCATTCTTGTCATAC
TCCACATTGATTTTCCATTTGCGACCACAGATATCAAAGTCAGAAGATTCGACACGAGCA
ACCCCATACTTTGTGAGTAAAGAGAAATTGTCTATCTTGAGCAAGTGAGAATTTGGGTGA
TTCTTCTTGAACTCTTGCACCATCTTTTCAATGGGTATTGGTCGTCGTAACATGTTACTT
TCAGTGGGTATTAGTCGTCGTCGTAACATATTAACAAGCTGCAAATGATATGAACTTAAG
TTTTTTCTTCTGTGAGGCTTATATGCACCC

QA 1 630 1 630
DS 



AS 2 7

CO CL567Contig1 869 3 29 U
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CAAAAATGTGGACTGAGACAATGAACAAGTTTGGAAATGCAAGTCACCAAACTTTAAATT
AAAAACAAGAAAACTACAAAAACCAAAAGGGTGAAAAGAGTTTTATGATATCATCATCGA
CAAATCTTTTAACTCAAGAAAAGACAGATGTAGTGAGAGACAGACATGATGATGTCTCTT
TTAGTTGATGTATTGAGAGAGCCATTTGAACCCCTCGCCGTAGCCCATTTTACGGACAAT
GCTGCACATGAAGACTTCAAGAGGGCGAACACCAGAATCTCCTCCAGCTGTTGTCACTTT
GCCCTTACCGGTGGTGAAGTTGGTGAGACCCAAGTGATACCTAAGCTCGTCTTCGGAGGC
TGCATAAGGGATATCAATCTTGTTTCCGAGAATAAGAAACGGCACAGTTGCAAGAGCTTC
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ATCCACGAGGTAGACAACTGCATCAACCTTGGCATAGTAATCTTTCCAAACTCTTCGAGC
AATCTGATGGCCACCCAAATCAAAAGCCTTGAACTTGATATTGCCAATGCTGAGTTCCTC
AGAGGTTGGATGTTGTGTTGGCTGGTGCTGAACCAATCTCTCGTCTTTGAGCATGTGAAG
GAGTGTGGTTTTTCCGGCATTGTCGAGGCCGAGAAACAAGATCTTCGCCTCTTTCTGCCA
TAACCCCAACGACGCCAAGATTCCGTAGAACCAATCGAAAAAAAAACATTGTCTCGTTCG
CTGATCTCACAGAAGTAACCGATAAGCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FS48JQ U 1
AF RS1C076JQ U 16
AF RS1C076TF C 164
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BS 720 778 RS1C076JQ
BS 779 779 RS1C076TF
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BS 827 855 RS1C076JQ
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RD RS1FS48JQ 719 0 0
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TGCATAAGGGATATCAATCTTGTTTCCGAAAATAAAAAACGGCACAGTTGCAAGAGCTTC
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AATCTGATGGCCACCCAAATCAAAAGCCTTGAACTTGATTTTGCCAATGCTAAGTTCCTC
GGAGGTTGGATGTTGTGTTGGCTGGTGCTGAACCAATCTCTCGTCTTTGAGCATGTGAA

QA 1 719 1 719
DS 

RD RS1C076JQ 852 0 0
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AGACAATGAACAAGTTTGGAAATGCAAGTCACCAAACTTTAAATTAAAAACAAGAAAACT
ACAAAAACCAAAAGGGTGAAAAGAGTTTTATGATATCATCATCGACAAATCTTTTAACTC
AAGAAAAGACAGATGTAGTGAGAGACAGACATGATGATGTCTCTTTTAGTTGATGTATTG
AGAGAGCCATTTGAACCCCTCGCCGTAGCCCATTTTACGGACAATGCTGCACATGAAGAC
TTCAAGAGGGCGAACACCAGAATCTCCTCCAGCTGTTGTCACTTTGCCCTTACCGGTGGT
GAAGTTGGTGAGACCCAAGTGATACCTAAGCTCGTCTTCGGAGGCTGCATAAGGGATATC
AATCTTGTTTCCGAGAATAAGAAACGGCACAGTTGCAAGAGCTTCGTCTGAGAGAAGAGC
GTCTAGCTCTCTTTTTGACTCTGAAAATCTCTCCTTGTCATAAGCATCCACGAGGTAGAC
AACTGCATCAACCTTGGCATAGTAATCTTTCCAAACTCTTCGAGCAATCTGATGGCCACC
CAAATCAAAAGCCTTGAACTTGATATTGCCAATGCTGAGTTCCTCAGAGGTTGGATGTTG
TGTTGGCTGGTGCTGAACCAATCTCTCGTCTTTGAGCATGTGAAGGAGTGTGGTTTTTCC
GGCATTGTCGAGGCCGAGAAACAAGATCTTCGCCTCTTTCTGC*ATAACCCCAACGACGC
CA*GATTCCGTAGAACCAATCGAAAAAAAA*CATTGTCTCGTTCGCTGATCTCACAGAAG
TACCGATAGCGC

QA 1 840 1 840
DS 

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ACATGATGATGTCTCTTTTAGTTGATGTATTGAGAGAGCCATTTGAACCCCTCGCCGTAG
CCCATTTTACGGACAATGCTGCACATGAAGACTTCAAGAGGGCGAACACCAGAATCTCCT
CCAGCTGTTGTCACTTTGCCCTTACCGGTGGTGAAGTTGGTGAGACCCAAGTGATACCTA
AGCTCGTCTTCGGAGGCTGCATAAGGGATATCAATCTTGTTTCCGAGAATAAGAAACGGC
ACAGTTGCAAGAGCTTCGTCTGAGAGAAGAGCGTCTAGCTCTCTTTTTGACTCTGAAAAT
CTCTCCTTGTCATAAGCATCCACGAGGTAGACAACTGCATCAACCTTGGCATAGTAATCT
TTCCAAACTCTTCGAGCAATCTGATGGCCACCCAAATCAAAAGCCTTGAACTTGATATTG
CCAATGCTGAGTTCCTCAGAGGTTGGATGTTGTGTTGGCTGGTGCTGAACCAATCTCTCG
TCTTTGAGCATGTGAAGGAGTGTGGTTTTTCCGGCATTGTCGAGGCCGAGAAACAAGATC
TTCGCCTCTTTCTGCCATAACCCCAACGACGCCAAGATTCCGTAGAACCAATCGAAAAAA
AAACATTGTCTCGTTCGCTGATCTCACAGAAGTAACCGATAAGCGC

QA 1 706 1 706
DS 



CO CL567Contig2 878 4 21 U
GGGAATAATGTTTCAATAAAAAGCACAAGTTGTTGACAAAAATGTGGACCGAGACAATGA
ACAAGTTTGGAAATGCAAGTCACCAAACTTAAATTAAAAACAAGAAAAACCAAAAGGGTG
AAAAGAGTGTTATGATATCATCATTGACAAATCTTTTAACTCAAGAAAAGACAGATGTAG
CGAGAGACAGACATGATGATGTCTTTTTAGTTGATGTACTGAGAGAGCCATTTGAATCCC
TCGCCGTAGCCCATTTTACGGACAATGCTGCACATGAAGACTTCAAGAGGGCGAACACCA
GAATCTCCTCCAGCTGTTGTCACTTTGCCCTTACCGGTGGTGAAGTTGGTGAGACCAAAG
TGATACCTAAGCTCGTCTTCGGAGGCTGCATAAGGGATATCAATCTTGTTTCCGAGAATA
AGAAACGGCACAGTTGCAAGAGCTTCATCTGAGAGAAGAGCGTCTAGCTCTCTTTTTGAC
TCTGAAAATCTCTCCTTGTCATAAGCATCCACGAGGTAGACAACTGCATCAACCTTGGCA
TAGTAATCTTTCCAAACTCTTCGAGCAATCTGATGGCCACCCAAATCAAAAGCCTTGAAC
TTGATTTTGCCAATGCTAAGTTCCTCAGAGGTTGGATGTTGTGTTGGCTGGTGCTGAACC
AATCTCTCGTCTTTGAGCATGTGAAGGAGTGTGGTTTTTCCTGCATTGTCGAGGCCGAGA
AACAAGATCTTCGCCTCTTTCTGCCATAACCCCAACGACGCCAAGATTCCGTAGAACCAA
TCGAACAAAAACATTGTCTCCTTCGCTGATCTCACAGAAGAAACTGAAAAGCGCAAATAA
AAAAACAGAGAGGAGATGTTTGTCTCCGGCCGGTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1G104JQ U 1
AF RS1EC73JQ U 69
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AF RS1EC73TF C 122
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QA 1 388 1 388
DS 

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GTCTTTGAGCATGTGAAGGAGTGTGGTTTTTCCTGCATTGTCGAGGCCGAGAAACA

QA 1 656 1 656
DS 

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GGCGAACACCAGAATCTCCTCCAGCTGTTGTCACTTTGCCCTTACCGGTGGTGAAGTTGG
TGAGACCCAAGTGATACCTAAGCTCGTCTTCGGAGGCTGCATAAGGGATATCAATCTTGT
TTCCGAGAATAAGAAACGGCACAGCTGCAAGAGCTTCATCTGAGAGAAGAGCGTCTAGCT
CTCTTTTTGACTCTGAAAATCTCTCCTTGTCATAAGCATCCACGAGGTAGACAACTGCAT
CAACCTTGGCATAGTAATCTTTCCAAACTCTTCGAGCAATCTGATGGCCAACCAAATCAA
AAGCCTTGAACTTGATTTTGCCAATACTAAGTTCCTCAGAGGTTGGATGTTGTGTTGGCT
GGTGCTGAACCAATCTCTCGTCTTTGAGCATGTGGAGGAGTGTGGTTTTTCCTGCATTGT
CGAGGCCGAGAAACAAGATCTTCGCCTCTTTCTGCCATAACCCCA*CGACGCCAAGATTC
CGTAGAACCAATCGAACAAAAACATTGTCTCCTTCGCTGATCTCACAGAAGAAACTGAAA
AGCGCAAATAAAAAA*CAGAGAGGAGATGTTTGTCTCCGGCCGGTTCCC

QA 1 769 1 769
DS 

RD RS1EC73TF 757 0 0
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GAGAGACAGACATGATGATGTCTTTTTAGTTGATGTACTGAGAGAGCCATTTGAATCCCT
CGCCGTAGCCCATTTTACGGACAATGCTGCACATGAAGACTTCAAGAGGGCGAACACCAG
AATCTCCTCCAGCTGTTGTCACTTTGCCCTTACCGGTGGTGAAGTTGGTGAGACCAAAGT
GATACCTAAGCTCGTCTTCGGAGGCTGCATAAGGGATATCAATCTTGTTTCCGAGAATAA
GAAACGGCACAGTTGCAAGAGCTTCATCTGAGAGAAGAGCGTCTAGCTCTCTTTTTGACT
CTGAAAATCTCTCCTTGTCATAAGCATCCACGAGGTAGACAACTGCATCAACCTTGGCAT
AGTAATCTTTCCAAACTCTTCGAGCAATCTGATGGCCACCCAAATCAAAAGCCTTGAACT
TGATTTTGCCAATGCTAAGTTCCTCAGAGGTTGGATGTTGTGTTGGCTGGTGCTGAACCA
ATCTCTCGTCTTTGAGCATGTGAAGGAGTGTGGTTTTTCCTGCATTGTCGAGGCCGAGAA
ACAAGATCTTCGCCTCTTTCTGCCATAACCCCAACGACGCCAAGATTCCGTAGAACCAAT
CGAACAAAAACATTGTCTCCTTCGCTGATCTCACAGAAGAAACTGAAAAGCGCAAATAAA
AAAACAGAGAGGAGATGTTTGTCTCCGGCCGGTTCCC

QA 1 757 1 757
DS 



AS 2 7

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TGGCTTTCTTCAAAAATCAAGGTACAATATCTGAGATTTGAGCAAAATTTGAGAACTGAA
GAAGAATTAACACAAAATGTTAGTTCCGTGGTGCACATAAACGGTCCAAGATAAGAAGAA
AAACAAAGAAGTAATCACTGGTTTTAAATAAAGACAGATTTATTCTTCTTTCCGGGTCTT
TGGTCTCACAGGCTTCACAGGAACCAAGTAGCTGAGTAGAATCACAACAATAGGCACTAC
TGTTCCTATGAAATACACACTCTTGTAGGCAATGAGTGTTTCGTGCAAGCTCAATACCAT
GAAACCAACGGATGAGTAATTGAGAACCAAAACTGTGTAGAGGAAGTTGATGAAAACCAT
AACACTTCTCAGCATTGCCATCTTCGGAGGCATTGCTTGTTGCCAACGGTAAATAGCTTT
TGAACCATCAATCATCAATGCTGATTGAACAAAGAATATAATGTATCCAGGATACAGTCC
ATGCCACACGGCACTGACGGCTTGAGTAGCTAGCAACTGGAAGAAACCAGCTTTCTTCCC
AGGCTTCACAAGTCTCTCATACACATAGTGACGGAGCCAAGTGCTGACTTGTATGTTCCA
CACAAGAGGAATCTGAACAGCACTCTTGGCTAGCTCAACACCTAGGATATCGACGTTCTT
TGCTCGGTCCCATTTCGCCTTTGTTCGAGTGTTTTCGTCGGCCCAGCCCCTGAAGCCCAA
GCCGGAGACGATGATGGAAGCCTCTGAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 5 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
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15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EN44JQ U 41
AF RS1E141JQ U 1
AF RS1BB60JQ U 44
AF RS1BB60TF C 128
AF RS1BK20JQ U 239
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BS 699 742 RS1BB60JQ
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RD RS1EN44JQ 486 0 0
GGT
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TCTTCTTTCCGGGTCTTTGGTCTCACAGGCTTCACAGGAACCAAGTAGCTGAGTAAAATC
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AAGTTGATGAAAACCATAACACTTCTCAGCATTGCCATCTTCGGAGGCATTGCTTGTTGC
CAACGGTAAATAGCTTTTGAACCATCAATCATCAATGCTGATTGAACAAAGAATATAATG
TAT

QA 4 486 4 486
DS 

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TGGCTTTCTTCAAAAATCAAGGTACAATATCTGAGATTTGAGCAAAATTTGAGAACTGAA
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AAACAAAGAAGTAATCACTGGTTTTAAATAAAGACAGATTTATTCTTCTTTCCGGGTCTT
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TGTTCCTATGAAATACACACTCTTGTAGGCAATGAGTGTTTCGTGCAAGCTCAATACCAT
GAAACCAACGGATGAGTAATTGAGAACCAAAACTGTGTAGAGGAAGTTGATGAAAACCAT
AACACTTCTCAGCATTGCCATCTTCGGAGGCATTGCTTGTTGCCAACGGTAAATAGCTTT
TGAACCATCAATCATCAATGCTGATTGAACAAAGAATATAATGTATCCAGGATACAGTCC
ATGCCACACGGCACTGACGGTTTGAGTAGCTAGCAACTGGAAGAAACCAGCTTTCTTCCC
AGGCTTCACAAGTCTCTCATACACATAGTGACGGAGCCAAGTGCTGACTTGTATGTTCCA
CACAAGAGGAATCTGAACAGCACTCTTGGCTAGCTCAA

QA 1 698 1 698
DS 

RD RS1BB60JQ 699 0 0
AGAAACACATCTAAAAGTGGCTTTCTTCAAAAATCAAGGTACAATATCTGAGATTTGAGC
AAAATTTGGGAACTGAAGAAGAATTAACACAAAATGTTAGTTCCGTGGTGCACATAAACG
GTCCAAGATAAGAAGAAAAACAAAGAAGTAATCACTGGTTTTAAATAAAGACAGATTTAT
TCTTCTTTCCGGGTCTTTGGTCTCACAGGCTTCACAGGAACCAAGTAGCTGAGTAGAATC
ACAACAATAGGCACTGCTGTTCCTATGAAATACACACTCTTGTAGGCAATGAGTGTTTCG
TGCAAGCTCAATACCATGAAACCAACGGATGAGTAATTGAGAACCAAAACTGTGTAGAGG
AAGTTGATGAAAACCATAACACTTCTCAGCATTGTCATCTTCGGAGGCATTGCTTGTTGC
CAACGGTAAATAGCTTTTGAACCATCAATCATCAATGCTGATTGAACAAAGAATATAATG
TATCCAGGATACAGTCCATGCCACACGGCACTGACGGCTTGAGTAGCTAGCAACTGGAAG
AAACCAGCTTTCTTCCCAGGCTTCACAAGTCTCTCATACACATAGTGACGGAGCCAAGTG
CTGACTTGTATGTTCCACACAAGAGGAATCTGAACAGCACTCTTGGCTAGCTCAACACCT
AGGATATCGACGTTCTTTGCTCGGTCCCATTTCGCCTTT

QA 1 699 1 699
DS 

RD RS1BB60TF 651 0 0
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GAAGTAATCACTGGTTTTAAATAAAGACAGATTTATTCTTCTTTCCGGGTCTTTGGTCTC
ACAGGCTTCACAGGAACCAAGTAGCTGAGTAGAATCACAACAATAGGCACTGCTGTTCCT
ATGAAATACACACTCTTGTAGGCAATGAGTGTTTCGTGCAAGCTCAATACCATGAAACCA
ACGGATGAGTAATTGAGAACCAAAACTGTGTAGAGGAAGTTGATGAAAACCATAACACTT
CTCAGCATTGTCATCTTCGGAGGCATTGCTTGTTGCCAACGGTAAATAGCTTTTGAACCA
TCAATCATCAATGCTGATTGAACAAAGAATATAATGTATCCAGGATACAGTCCATGCCAC
ACGGCACTGACGGCTTGAGTAGCTAGCAACTGGAAGAAACCAGCTTTCTTCCCAGGCTTC
ACAAGTCTCTCATACACATAGTGACGGAGCCAAGTGCTGACTTGTATGTTCCACACAAGA
GGAATCTGAACAGCACTCTTGGCTAGCTCAACACCTAGGATATCGACGTTCTTTGCTCGG
TCCCATTTCGCCTTTGTTCGAGTGTTTTCGTCGGCCCAGCCCCTGAAGCCC

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DS 

RD RS1BK20JQ 572 0 0
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ACTGTTCCTATGAAATACACACTCTTGTAGGCAATGAGTGTTTCGTGCAAGCTCAATACC
ATGAAACCAACGGATGAGTAATTGAGAACCAAAACTGTGTAGAGGAAGTTGATGAAAACC
ATAACACTTCTCAGCATTGCCATCTTCGGAGGCATTGCTTGTTGCCAACGGTAAATAGCT
TTTGAACCATCAATCATCAATGCTGATTGAACAAAGAATATAATGTATCCAGGATACAGT
CCGTGCCACACGGCACTGACGGTTTGAGTAGCTAGCAACTGGAAGAAACCAGCTTTCTTC
CCAGGCTTCACAAGTCTCTCATACACATAGTGACGGAGCCAAGTGCTGACTTGTATGTTC
CACACAAGAGGAATCTGAACAGCACTCTTGGCTAGCTCAACACCTAGGATATCGACGTTC
TTTGCTCGGTCCCATTTCGCCTTTGTTCGAGTGTTTTCGTCGGCCCAGCCCCTGAAGCCC
AAGCCGGAGACGATGATGGAAGCCTCTGAGAT

QA 1 572 1 572
DS 



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CAGACAAGACAAAACCATGGAATCGTTCGACATGAGTTCCATGGCGGCCTCGATCGGCGT
CTCCGTCGCCGTTCTCCGTTTCCTCCTCTGCTTCGTCGCGACGATCCCAGTCTCCTTCGC
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AAACTACAACGACGGGATGTTGAAGGAAGAGACTCTCCGTGAGGCTCAGAAGAAGAACCG
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CTTCGCTGGCCCTGTCTTCGAAATGAAGATTATCTCGAATGGACCGAAGAGAAAGGATTT
GGGCTGTTTCTGGAAAGGGAGAGACATCACCTTACGAGCACGCTTCGAGCTATATACAAG
CTGGGATCTGTATGGCTCTGTATCTCTACTTAGTACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BK20TF U 16
AF RS1EN44TF U 1
BS 1 344 RS1EN44TF
BS 345 345 RS1BK20TF
BS 346 443 RS1EN44TF
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RD RS1BK20TF 590 0 0
GG
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TGGAATCGTTCGACATGAGTTCCATGGCGGCCTCGATCGGCGTCTCCGTCGCCGTTCTCC
GTTTCCTCCTCTGCTTCGTCGCGACGATCCCAGTCTCCTTCGCGTGGAGATTCGTCCCGA
GTCGACTCGGTAAACACATCTACTCAGCTGCTTCCGGAGCTCTCCTCTCTTACCTCTCCT
TCGGCTTCTCCTCGAATCTCCACTTCCTCGTTCCCATGACCATTGGCTACGCTTCGATGG
CGATCTGTAGACCGATCTCTGGATTCACCACTTTCTTCCTCGGTTTCGCTTATCTCATTG
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TGTTGAGGGAAGAGACTCTCCGTGAGGCTCAGAAGAAGAACCGTTTGGTTCGGATGCCTT
CTCTCATTGAGTATTTTAGTTACTGCCTTTGCTGCGGGAGCCACTTCG

QA 3 590 3 590
DS 

RD RS1EN44TF 758 0 0
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CTTCGCTGGCCCTGTCTTCGAAATGAAGATTATCTCGAATGGACCGAAGAGAAAGGATTT
GGGCTGTTTCTGGAAAGGGAGAGACATCACCTTACGAGCACGCTTCGAGCTATATACAAG
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QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 8

CO CL569Contig1 739 8 25 U
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ACTTGATAGATATTAATGATAACACACTTTCATATCACTCACATCTCTTTAGATCTAGAG
AGAGCATTATTTGATACAGACCACCC*AGATACATAAAGATAGATACATATTATAGAGAT
ATTCGGCGAGTATCTACTCCTCAAGCAGAAGCATTTCGTCAATGTCTTTGAACAATTCAA
TACCAGTTTGGAGCAAAGTCTCTGGGTGAGCCACGTTTTCATCAATCCTCTCATATGTCA
TTTTCAATTTCACCACGCCTCCAGGTCCTTCTTTCTTTGGAGTCACCTGGATCGTTATTA
AAAAGCTCTTGAACTCTTCCGTAACATCTCCCTCTATCACTTTCAGCTTTATCATGTTCT
TCTTCGGATCCACTGCCTCGATCCTCTCCTTGGCCACATTTGGTTTCCCATCAAGAACAT
AGTTCCAAGTGATGAGAGTGCCAACTCTTCCCATCTCTCCCCCTTGCACACGACATCCCT
GGACGGTTTCAGGAGAGGCTTTAGAAACATCTTGTGGTCTCACTGCGAACATGTGAAAGA
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TCATCATCGCCTGTGCCAGTTTTCTCCAGATGATTAAATGCTTATCTAGTTTATTTT*AG
AACGAGAGTAAGTGAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 35 35 35 35 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 35 
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 0 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FK61JQ U 51
AF RS1FO86JQ U 165
AF RS1FK38JQ U 141
AF RS1FK38TF C 50
AF RS1FO86TF C 1
AF RS1BW79JQ U 42
AF RS1FK61TF C 52
AF RS1BW79TF C 42
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BS 42 143 RS1BW79JQ
BS 144 148 RS1FK38JQ
BS 149 149 RS1BW79JQ
BS 150 164 RS1FK38JQ
BS 165 169 RS1FO86JQ
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BS 171 180 RS1FO86JQ
BS 181 181 RS1FK38JQ
BS 182 207 RS1FO86JQ
BS 208 208 RS1BW79JQ
BS 209 225 RS1FO86JQ
BS 226 226 RS1FK38JQ
BS 227 288 RS1FO86JQ
BS 289 289 RS1FK38JQ
BS 290 290 RS1FO86JQ
BS 291 291 RS1FK38JQ
BS 292 316 RS1FO86JQ
BS 317 317 RS1BW79JQ
BS 318 368 RS1FO86JQ
BS 369 369 RS1FK38JQ
BS 370 477 RS1FO86JQ
BS 478 502 RS1BW79JQ
BS 503 504 RS1FO86TF
BS 505 739 RS1BW79JQ

RD RS1FK61JQ 299 0 0
TCGATT
TATAACTTGATAGATATTAATGATAACACACTTTCATATCACTCACATCTCTTTAGATCT
AGAGAGAGCATTATTTGATACAGACCACCC*AGATACATAAAGATAGATACATATTATAG
AGATATTCGGCGAGTATCTACTCCTCAAGCAAAAGCATTTCGTCAATGTCTTTGAACAAT
TCAATACCAGTTTGGAGCAAAGTCTCTGGGGGAGCCACGTTTTCATCAAACCTCTCATAT
GTCATTTTCAATTTCACCACGCCTCCAGGTCCTTCTTTCTTTGGAGTCCCCTG

QA 7 299 7 299
DS 

RD RS1FO86JQ 313 0 0
TACATTTTATAGAGATTTTCGGCGAGTATCTACTCCTCAAGCAAAAGCATTTCGTCAATG
TTTTTGAACAATTCAATACCAGTTTGGAGCAAAGTCTCTGGGTGAGCCACGTTTTCATCA
ATCCCCCCATATGTCATTTTCAATTTCACCACCCCTCCAGGTCCTTCTTTCTTTGGAGTC
ACCTGGATCGTTATTAAAAAGCTCCTGAACTCTTCCGTAACATCTCCCTCTATCACTTTC
AGCTTTATCATGTTCTTCTTCGGATCCACTGCCTCGATCCTCTCCTTGGCCACATTTGGT
TTCCCATCAAGAA

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DS 

RD RS1FK38JQ 337 0 0
CCC
CCC*AAATACATAAAGATAGATACATATTATAAAGATATTCGGCGAGTATCTACTCCTCA
AGCAAAAGCATTTCGTCAATGTCTTTGAACAGTTCAATACCAGTTTGGAGCAAAGTCTCT
GGGTGAGCCACGTTTTCATCAATCCTCTCATATGTCATTTTCAATTTCACCACCCCTCCA
GGTCCTTCTTTCTTTGGAGTCACCTGGATCGTTATTAAAAAGCTCTTGAACTCTTCCGTA
ACATCTCCCTCTATCACTTTCAGCTTTATCATGTTCTTCTTCGGATCCACTGCCTCGATC
CTCTCCTTGGCCACATTTGGTTTCCCATCAAGAA

QA 4 337 4 337
DS 

RD RS1FK38TF 555 0 0
ACTGATATATAACTTGATAGATATTAATGATAACACACTTTCATATCACTCACATCTCTT
TAGATCTAGAGAGAGCATTATTTGATACAGACCACCC*AGATACATAAAGATAGATACAT
ATTATAGAGATATTCGGCGAGTATCTACTCCTCAAGCAGAAGCATTTCGTCAATGTCTTT
GAACAGTTCAATACCAGTTTGGAGCAAAGTCTCTGGGTGAGCCACGTTTTCATCAATCCT
CTCATATGTCATTTTCAATTTCACCACGCCTCCAGGTCCTTCTTTCTTTGGAGTCACCTG
GATCGTTATTAAAAAGCTCTTGAACTCTTCCGTAACATCTCCCTCTATCACTTTCAGCTT
TATCATGTTCTTCTTCGGATCCACTGCCTCGATCCTCTCCTTGGCCACATTTGGTTTCCC
ATCAAGAACATAGTTCCAAGTGATGAGAGTGCCAACTCTTCCCATCTCTCCCCCTTGCAC
ACGACATCCCTGGACGGTTTCAGGAGAGGCTTTAGAAACATCTTGTGGTCTCACTGCGAA
CATGTGAAAGAATT
C

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DS 

RD RS1FO86TF 735 0 0
TTGATATCTAAAGAGAGAGAGCAAATTATCAAACACCCAAAAACATAATACTGATATATA
ACTTGATAGATATTAATGATAACACACTTTCATATCACTCACATCTCTTTAGATCTAGAG
AGAGCATTATTTGATACAGACCACCC*AGATACATAAAGATAGATACATATTATAGAGAT
ATTCGGCGAGTATCTACTCCTCAAGCAGAAGCATTTCGTCAATGTCTTTGAACAATTCAA
TACCAGTTTGGAGCAAAGTCTCTGGGTGAGCCACGTTTTCATCAATCCTCTCATATGTCA
TTTTCAATTTCACCACGCCTCCAGGTCCTTCTTTCTTTGGAGTCACCTGGATCGTTATTA
AAAAGCTCCTGAACTCTTCCGTAACATCTCCCTCTATCACTTTCAGCTTTATCATGTTCT
TCTTCGGATCCACTGCCTCGATCCTCTCCTTGGCCACATTTGGTTTCCCATCAAGAACAT
AGTTCCAAGTGATGAGAGTGCCAACTCCTCCCATCTCTCCCCCTTGCACACGACATCCCT
GGACGGTTTCAGGAGAGGCTTTAGAAACATCTTGTGGTCTCACTGCGAACATGTGAAAGA
ATTTCTTGGCCGGAGCTCTAATCTCCACATCTGCCTCAACCTCTCCGTGTAAAGAAGAAT
TCATCATCGCCTGTGCCAGTTTTCTCCAGATGATTAAATGCTTATCTAGTTTATTTTTAG
AACGAGAGTAAG
TCC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1BW79JQ 698 0 0
AACATAATACTGATATATAACTTGATAGATATTAATGATAACACACTTTCATATCACTCA
CATCTCTTTAGATCTAGAGAGAGCATTATTTGATACAGACCACCC*AGATACATAAAGAT
AGATACATATTATAGAGATATTCGGCGAGTATCTACTCCTCAAGCAGAAGCATTTCGTCA
ATGTCTTTGAACAATTCAATACCAGTTTGGAGCAAAGTCTCTGGGTGAGCCACGTTTTCA
TCAATCCTCTCATATGTCATTTTCAATTTCACCACGCCTCCAGGTCCTTCTTTCTTTGGA
GTCACCTGGATCGTTATTAAAAAGCTCTTGAACTCTTCCGTAACATCTCCCTCTATCACT
TTCAGCTTTATCATGTTCTTCTTCGGATCCACTGCCTCGATCCTCTCCTTGGCCACATTT
GGTTTCCCATCAAGAACATAGTTCCAAGTGATGAGAGTGCC**CTCTTCCCATCTCTCCC
CCTTGCACACGACATCCCTGGACGGTTTCAGGAGAGGCTTTAGAAACATCTTGTGGTCTC
ACTGCGAACATGTGAAAGAATTTCTTGGCCGGAGCTCTAATCTCCACATCTGCCTCAACC
TCTCCGTGTAAAGAAGAATTCATCATCGCCTGTGCCAGTTTTCTCCAGATGATTAAATGC
TTATCTAGTTTATTTT*AGAACGAGAGTAAGTGAGTCC

QA 1 698 1 698
DS 

RD RS1FK61TF 688 0 0
C
GATATATAACTTGATAGATATTAATGATAACACACTTTCATATCACTCACATCTCTTTAG
ATCTAGAGAGAGCATTATTTGATACAGACCACCC*AGATACATAAAGATAGATACATATT
ATAGAGATATTCGGCGAGTATCTACTCCTCAAGCAGAAGCATTTCGTCAATGTCTTTGAA
CAATTCAATACCAGTTTGGAGCAAAGTCTCTGGGTGAGCCACGTTTTCATCAAACCTCTC
ATATGTCATTTTCAATTTCACCACGCCTCCAGGTCCTTCTTTCTTTGGAGTCACCTGGAT
CGTTATTAAAAAGCTCTTGAACTCTTCCGTAACATCTCCCTCTATCACTTTCAGCTTTAT
CATGTTCTTCTTCGGATCCACTGCCTCGATCCTCTCCTTGGCCACATTTGGTTTCCCATC
AAGAACATAGTTCCAAGTGATGAGAGTGCCAACTCTTCCCATCCCTCCCCCTTGCACACG
ACATCCCTGGACGGTTTCAGGAGAGGCTTTAGAAACATCTTGTGGTCTCACTGCGAACAT
GTGAAAGAATTTCTTGGCCGGAGCTCTAATCTCCACATCTGCCTCAACCTCTCCGTGTAA
AGAAGAATTCATCATCGCCTGTGCCAGTTTTCTCCAGATGATTAAATGCTTATCTAGTTT
ATTTTTAGAACGAGAGTAAG
TGAGTCC

QA 2 681 2 681
DS 

RD RS1BW79TF 691 0 0
AACATAATACTGATATATAACTTGATAGATATTAATGATAACACACTTTCATATCACTCA
CATCTCTTTAGATCTAGAGAGAGCATTATTTGATACAGACCACCCCAGATACATAAAGAT
AGATACATATTATAGAGATATTCGGCGAGTATCTACTCCTCAAGCAGAAGCATTTCGTCA
ATGTCTTTGAACAATTCAATACCAGTTTGGAGCAAAGTCTCTGGGTGAGCCACGTTTTCA
TCAATCCTCTCATATGTCATTTTCAATTTCACCACGCCTCCAGGTCCTTCTTTCTTTGGA
GTCACCTGGATCGTTATTAAAAAGCTCTTGAACTCTTCCGTAACATCTCCCTCTATCACT
TTCAGCTTTATCATGTTCTTCTTCGGATCCACTGCCTCGATCCTCTCCTTGGCCACATTT
GGTTTCCCATCAAGAACATAGTTCCAAGTGATGAGAGTGCC**CTCTTCCCATCTCTCCC
CCTTGCACACGACATCCCTGGACGGTTTCAGGAGAGGCTTTAGAAACATCTTGTGGTCTC
ACTGCGAACATGTGAAAGAATTTCTTGGCCGGAGCTCTAATCTCCACATCTGCCTCAACC
TCTCCGTGTAAAGAAGAATTCATCATCGCCTGTGCCAGTTTTCTCCAGATGATTAAATGC
TTATCTAGTTTATTTT*AGAACGAGAGTAAG

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 7

CO CL570Contig1 813 7 12 U
GGGTCTCAGTTCTGAGCTTAAGAGAGCTTTCGGCGAAAAAA*CATGGCTTCTCCCTCAGC
GGCGCTTTCTCTGTGCTCTGCTTTCTCCGCTCATTGCAGTATCGCTCCACCGCGCTCCCT
CTCTAAGCCTTCGTTGAGTCTGGCTAGACCAGCGATTGGGTTTCTTTCTACTTCCGCTGC
TGCGTCTACGTCTCGTCCCGCATTCCCCGCCGCTCCGAAATTCTCCGAATCAGCCGTCGT
GGCTGAACCAGAGACTACCGATATTGAAGCTGTTGTGGTCTCAGAGGAGGATAAGCCTAA
ACGAGAAGAGATCTTCGCCGTTGTTATGGTTGGTGGACGTCAGTACATTGTTTTCCCAGG
GAGATATCTCTACACTCAGCGGCTCAAAGATGCGAATGTTGATGACCAGATTGTTTTGAA
CAAAGTGTTGCTTGTCGGGACAAAGACACATACTTACATCGGCAAACCCGTTGTTACCAA
TGCTACTGTGCATGCTGTAGTGGAAAATCAAGGTCTGAATGATAAAGTGGTGGTCTTCAA
GTACAAGCCAAAGAAGAAGTACCGCAGAAATATCGGTCACCGACAGCCAAATACGAGGAT
TAGGATTACAGGAATCTCAGGGTACGAAGAGTATCCAGCGTCTCCTAACGTTGCTGTTTA
AATGTCTAGAGAAGTATAGGATCTTTGGAAAAAAATTATGCTTCTTGAATGTTCAATTTT
CTGATCTTTTCTATGTACTTCTGAAAGACAAGACCATTTCATTTCTGTTGAGAATCTTAA
GATCCAGTATATTAATATATACTCACTTCTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G708TF U 6
AF RS1C180JQ C 376
AF RS1GA56TF U 1
AF RS1G328TF U 1
AF RS1GA56JQ C 204
AF RS1C180TF U 45
AF RS1G328JQ C 182
BS 1 113 RS1G328TF
BS 114 114 RS1GA56TF
BS 115 603 RS1G328TF
BS 604 604 RS1C180TF
BS 605 694 RS1G328TF
BS 695 695 RS1G328JQ
BS 696 750 RS1C180TF
BS 751 751 RS1G328JQ
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BS 774 774 RS1G328JQ
BS 775 796 RS1C180TF
BS 797 813 RS1G328JQ

RD RS1G708TF 503 0 0
GG
AGTTCTGAGCTTAAGAGAGCTTTCGGCGAAAAAAACATGGCTTCTCCCTCAGCGGCGCTT
TCTCTGTGCTCTGCTTTCTCCGCTCATTGCAGTATCGCTCCACCGCGCTCCCTCTCTAAA
CCTTCGTTGAGTCTGGCAAGACCAACGATTGAGTTTCTTTCTACTTCCGCTGCTGCGTCT
ACGTCTCGTCCCGCATTCCCCGCCGCTCCGAAATTCTCCGAATCAGCCGTCGTGGCTGAA
CCAGAGACTACCGATATTGAAGCTGTGGTGGTCTCAGAGGA***TAAGCCTAAACGAGAA
GAGATCTTCGCCGTTGTTATGGTTGGTGGACGGCAGTACATTGTTTTCCCAGGGAGATAT
CTCTACACTCAGCGGCTCAAAGATGCTAATGTTGATGACCAGATTGTTTTGAACAAAGTG
TTGCTTGTCGGGACAAAGACACACACTTACATCGGCAAACCGGTTGTTACCAATGCCACT
GTGCATGCTGTAGTGGAAAAT

QA 3 503 3 503
DS 

RD RS1C180JQ 144 0 0
TCAGCGGCTCAAAGATGCGAATGTTGATGACCAGATTGTTTTGAACAAAGTGTTGCTTGT
CGGGACAAAGACACATACTTACATCGGCAAACCCGTTGTTACCAATGTTACTGTGCATGC
TGTAGTGGAAAATCAAGGTTTGAA

QA 1 144 1 144
DS 

RD RS1GA56TF 585 0 0
GGGTCTC
AGTTCTGAGCTTAAGAGAGCTTTCGGCGAAAAAA*CATGGCTTCTCCCTCAGCGGCGCTT
TCTCTGTGCTCTGCTTTCTCCGCTCATTGCAGTATCGCTCCACCGCGCTCCCTCTCTAAG
CCTTCGTTGAGTCTGGCTAGACCAGCGATTGGGTTTCTTTCTACTTCCGCTGCTGCGTCT
ACGTCTCGTCCCGCATTCCCCGCCGCTCCGAAATTCTCCGAATCAGCCGTCGTGGCTGAA
CCAGAGACTACCGATATTGAAGCTGTTGTGGTCTCAGAGGAGGATAAGCCTAAACGAGAA
GAGATCTTCGCCGTTGTTATGGTTGGTGGACGTCAGTACATTGTTTTCCCAGGGAGATAT
CTCTACACTCAGCGGCTCAAAGATGCGAATGTTGATGACCAGATTGTTTTGAACAAAGTG
TTGCTTGTCGGGACAAAGACACATACTTACATCGGCAAACCCGTTGTTACCAATGCTACT
GTGCATGCTGTAGTGGAAAATCAAGGTCTGAATGATAAAGTGGTGGTCCTCAAGTACAAG
CCAAAGAAGAAGTACCGCAGAAATATCGGTCACCGACA

QA 8 585 8 585
DS 

RD RS1G328TF 694 0 0
GGGTCTCAGTTCTGAGCTTAAGAGAGCTTTCGGCGAAAAAA*CATGGCTTCTCCCTCAGC
GGCGCTTTCTCTGTGCTCTGCTTTCTCCGCTCATTGCAGTATCGCTCCACCGCTCTCCCT
CTCTAAGCCTTCGTTGAGTCTGGCTAGACCAGCGATTGGGTTTCTTTCTACTTCCGCTGC
TGCGTCTACGTCTCGTCCCGCATTCCCCGCCGCTCCGAAATTCTCCGAATCAGCCGTCGT
GGCTGAACCAGAGACTACCGATATTGAAGCTGTTGTGGTCTCAGAGGAGGATAAGCCTAA
ACGAGAAGAGATCTTCGCCGTTGTTATGGTTGGTGGACGTCAGTACATTGTTTTCCCAGG
GAGATATCTCTACACTCAGCGGCTCAAAGATGCGAATGTTGATGACCAGATTGTTTTGAA
CAAAGTGTTGCTTGTCGGGACAAAGACACATACTTACATCGGCAAACCCGTTGTTACCAA
TGCTACTGTGCATGCTGTAGTGGAAAATCAAGGTCTGAATGATAAAGTGGTGGTCTTCAA
GTACAAGCCAAAGAAGAAGTACCGCAGAAATATCGGTCACCGACAGCCAAATACGAGGAT
TAG*ATTACAGGAATCTCAGGGTACGAAGAGTATCCAGCGTCTCCTAACGTTGCTGTTTA
AATGTCTAGAGAAGTATAGGATCTTTGGAAAAAA

QA 1 694 1 694
DS 

RD RS1GA56JQ 569 0 0
TCCCCGCCGCTCCGAAATTCTCCGAATCAGCCGTCGTGGCTGAACCAGAGACTACCGATA
TTGAAGCTGTTGTGGTCTCAGAGGAGGATAAGCCTAAACGAGAAGAGATCTTCGCCGTTG
TTATGGTTGGTGGACGTCAGTACATTGTTTTCCCAGGGAGATATCTCTACACTCAGCGGC
TCAAAGATGCGAATGTTGATGACCAGATTGTTTTGAACAAAGTGTTGCTTGTCGGGACAA
AGACACATACTTACATCGGCAAACCCGTTGTTACCAATGCTACTGTGCATGCTGTAGTGG
AAAATCAAGGTCTGAATGATAAAGTGGTGGTCCTCAAGTACAAGCCAAAGAAGAAGTACC
GCAGAAATATCGGTCACCGACAGCCAAATACGAGGATTAGGATTACAGGAATCTCAGGGT
ACGAAGAGTATCCAGCGTCTCCTAACGTTGCTGTTTAAATGTCTAGAGAAGTATAGGATC
TTTGGAAAAAAATTATTCTTCTTGAATGTTCAATTTTCTGATCTTTTCTATGTACTTCTG
AAAGACAAGACCATTTCATTTCTGTTGAG

QA 1 569 1 569
DS 

RD RS1C180TF 752 0 0
G
GGCTTCTCCCTCAGCGGCGCTTTCTCTGTGCTCTGCTTTCTCCGCTCATTGCAGTATCGC
TCCACCGCGCTCCCTCTCTAAGCCTTCGTTGAGTCTGGCTAGACCAGCGATTGGGTTTCT
TTCTACTTCCGCTGCTGCGTCTACGTCTCGTCCCGCATTCCCCGCCGCTCCGAAATTCTC
CGAATCAGCCGTCGTGGCTGAACCAGAGACTACCGATATTGAAGCTGTTGTGGTCTCAGA
GGAGGATAAGCCTAAACGAGAAGAGATCTTCGCCGTTGTTATGGTTGGTGGACGTCAGTA
CATTGTTTTCCCAGGGAGATATCTCTACACTCAGCGGCTCAAAGATGCGAATGTTGATGA
CCAGATTGTTTTGAACAAAGTGTTGCTTGTCGGGACAAAGACACATACTTACATCGGCAA
ACCCGTTGTTACCAATGCTACTGTGCATGCTGTAGTGGAAAATCAAGGTCTGAATGATAA
AGTGGTGGTCTTCAAGTACAAGCCAAAGAAGAAGTACCGCAGAAATATCGGTCACCGACA
GCCAAATACGAGGATTAGGATTACAGGAATCTCAGGGTACGAAGAGTATCCAGCGTCTCC
TAACGTTGCTGTTTAAATGTCTAGAGAAGTATAGGATCTTTGGAAAAAA*TTATGCTTCT
TGAATGTTCAATTTTCTGATCTTTTCTATGTACTTCTGAAAGACA*GACCATTTCATTTC
TGTTGAGA*TCTTAAGATCCAGTATATTAAT

QA 2 752 2 752
DS 

RD RS1G328JQ 632 0 0
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GCTGAACCAGAGACTACCGATATTGAAGCTGTTGTGGTCTCAGAGGAGGATAAGCCTAAA
CGAGAAGAGATCTTCGCCGTTGTTATGGTTGGTGGACGTCAGTACATTGTTTTCCCAGGG
AGATATCTCTACACTCAGCGGCTCAAAGATGCGAATGTTGATGACCAGATTGTTTTGAAC
AAAGTGTTGCTTGTCGGGACAAAGACACATACTTACATCGGCAAACCCGTTGTTACCAAT
GCTACTGTGCATGCTGTAGTGGAAAATCAAGGTCTGAATGATAAAGTGGTGGTCTTCAAG
TACAAGCCAAAGAAGAAGTACCGCAGAAATATCGGTCACCGACAGCCAAATACGAGGATT
AGGATTACAGGAATCTCAGGGTACGAAGAGTATCCAGCGTCTCCTAACGTTGCTGTTTAA
ATGTCTAGAGAAGTATAGGATCTTTGGAAAAAAATTATGCTTCTTGAATGTTCAATTTTC
TGATCTTTTCTATGTACTTCTGAAAGACAAGACCATTTCATTTCTGTTGAGAATCTTAAG
ATCCAGTATATTAATATATACTCACTTCTGAC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 6

CO CL571Contig1 915 6 8 U
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TTCAGTTTTTTCTCTCACACATTATTTTCATCATCTTCACTCGAATCCGGAAGAAACAAA
GACGCACCCAGAAGAAAGAGAGATGTCTTCGCCGAGCAAACGCAGAGAAATGGACATGAT
GAAGCTGATGATGAGCGACTATAAAGTGGAGACGATCAACGATGGCATGCAGGAGTTCTT
TGTTGAATTCAATGGCCCCAAAGACAGTCTGTATGAAGGAGGAGTGTGGAAGATAAGGGT
TGAGCTTCCAGATGCTTATCCTTACAAATCTCCTTCCGTTGGTTTCATCACCAAGATTTA
TCACCCTAATGTTGATGAACTGTCCGGTTCTGTTTGCTTAGATGTGATCAACCAGACTTG
GAGTCCTATGTTTGACCTTGTGAATGTGTTTGAGACATTTCTTCCTCAGCTTCTTTTGTA
TCCAAACCCATCAGACCCGTTGAATGGAGAAGCTGCTGCTTTGATGATGCGTGATCGTCC
TACTTATGAACTACGAGTTAAAGAATACTGTGAGAAGTATGCAAAACCAGGGGAAGGTTC
AGAAGATAAGTCTAGCGATGAAGAGCTAAGTGATGAGGAATATGGTTCTGATGACAATGA
AGATGATGATGATGTTGCAATTGCAGGCAACCCAGATCCTTAAACCGGGATTTGCTAGAG
CACTTGGTTTTTATGTATATCATGCATTTCTATTTATGCTTATAAGCTGCCGAACTGTGA
AATCTGTCTGCTGTTTCTCCCTTTGTGCTTGTTCGCCTGTTTAAATGTACCGGTTCCGGA
CGTTTGTGTACATTATTAGACCGAACCGTATTGTTAAATCTTTCCGAGTTCAAAATAAAC
GCGTCATTCCGGTTG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 15 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1C373TF U 4
AF RS1DO89TF U 1
AF RS1CU61TF U 75
AF RS1CU61JQ C 539
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AF RS1C373JQ C 205
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RD RS1C373TF 467 0 0
GG
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TTTTTTCTCTCACACATTATTTTCATCATCTTCACTCGAATCCGGAAGAAACTAAGACGC
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CTATGTTTGACCTTGTGAATGTGTTTGAGACATTTCTTCCTCAGC

QA 3 467 3 467
DS 

RD RS1DO89TF 655 0 0
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GAAGCTGATGATGAGCGACTATAAAGTGGAGACGATCAACGATGGCATGCAGGAGTTCTT
TGTTGAATTCAATGGCCCCAAAGACAGTCTGTATGAAGGAGGAGTGTGGAAGATAAGGGT
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QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1CU61TF 744 0 0
GGACG
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GAGATGTCTTCGCCGAGCAAACGCAGAGAAA*GGACATGATGAAGCTGATGATGAGCGAC
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CCTTTGTGCTTGTTCGC
TG

QA 6 742 6 742
DS 

RD RS1CU61JQ 266 0 0
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GAAATCTGTTTGCTGTTTCTCCCTTT

QA 1 266 1 266
DS 

RD RS1DO89JQ 759 0 0
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CAACGATGGCATGCAGGAGTTCTTTGTTGAATTCAATGGCCCCAAAGACAGTCTGTATGA
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GTATGCAAAACCAGGGGAAGGTTCAGAAGATAAGTCTAGCGATGAAGAGCTAAGTGATGA
GGAATATGGTTCTGATGACAATGAAGATGATGATGATGTTGCAATTGCAGGCAACCCAGA
TCCTTAAACCGGGATTTGCTAG**CACTTGGTTTTTATGTATATCATGCATTTCTATTTA
TGCTTATTAGCTGCCGAACTGTGAAATCTGTCTGCTGTTTCTCCCTTTGTGCTTGTTCGC
CTGTTTAAATGTACCGGTTCCGGACGTTTGTGTACATTATTAGACCGAACCGTATTGTTA
AATCTTTCCGAGTTCAAAATAAACGCGTCATTCCGGTT
C

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1C373JQ 711 0 0
AGTGGAGACGATCAACGACGGCATGCAGGAGTTCTTTGTTGAATTCAATGGCCCCAAAGA
CAGTCTGTATGAAGGAGGAGTGTGGAAGATAAGGGTTGAGCTTCCAGATGCTTATCCTTA
CAAATCTCCTTCCGTTGGTTTCATCACCAAGATTTATCACCCTAATGTTGATGAACTGTC
CGGTTCTGTTTGCTTAGATGTGATCAACCAGACCTGGAGTCCTATGTTTGACCTTGTGAA
TGTGTTTGAGACATTTCTTCCTCAGCTTCTTTTGTATCCAAACCCATCAGACCCTTTGAA
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ATACTGTGAGAAGTATGCAAAACCAGGGGAAGGTTCAGAAGATAAGTCTAGCGATGAAGA
GCTAAGTGATGAGGAATATGGTTCTGATGACAATGAAGATGATGATGATGTTGCAATTGC
AGGCAACCCAGATCCTTAAACCGGGATTTGCTAGAGCATTTGGTTTTTATGTATATCATG
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ACCGTATTGTTAAATCTTTCCGATTTCAAAATAAACGCGTCATTCCGGTTG

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 8

CO CL572Contig1 786 8 19 U
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ATCACTTCCTCACATCTCTTCTCATTACCATTACGATAACCACGCTCAAGTCGGTCCATA
CAGCAACAACAACAAACACGGAGTTCGTAAAATCATCATGCAAATTCACAACATATCAAA
AACTCTGTGTCACTTCACTCTCAACTCAATCCAGTCTCATCCAAACCAGCCACAAACTCA
TGGCTCACGCGGCTCTCAACATCACATTAGCCTCGGTTAAAGCCACATCAGCAATGATGG
TGCGTCTCTCGAGTAGTCAGCTCAAGCCCAGAGAAGTCTCGGCCATGAGAGACTGCGTTG
AGGAGCTAGGTGACACGTTGGCGGAGCTTAGGAAATCGATAGGTGAGATGGGTCTGTTAA
GTGGCTCGAACTACGAAATCTACATGAGTGATATTCAGACTTGGGTTAGCGCGGCTCTGA
CCGATGAGAACACGTGCTCGGATGGTTTTGGAGGAGCTGACATGAATGGGAAAGTCAAGG
ATTTGGTTAGAGGGAGG*ATTTTGGTTATTGCTCATCTAACGAGTAATGCTTTAGCTTTG
ATTAATCACTTTGCTTATATTCATGGTTAGAGAGACTAATATATTTTTTAGTTTCTTTTT
ATCGAAAATTTCATTTGCTTTTGTCAGTTTGTGTATATAACAAATAGTAATAGTACAATG
TATCGCTCGTCTTTAAGATTCCGGAATCAATATGTACCAGAAAATATTCAATATTTTTTT
TTTGCT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 
45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1FY86TF U 1
AF RS1C932TF U 1
AF RS1ES41TF U 1
AF RS1FY73TF U 1
AF RS1CE18TF U 1
AF RS1CE18JQ C 187
AF RS1FY73JQ C 220
AF RS1C932JQ C 150
BS 1 228 RS1C932TF
BS 229 229 RS1CE18TF
BS 230 376 RS1C932TF
BS 377 377 RS1CE18TF
BS 378 396 RS1C932TF
BS 397 397 RS1CE18TF
BS 398 557 RS1C932TF
BS 558 558 RS1CE18TF
BS 559 626 RS1C932TF
BS 627 627 RS1CE18TF
BS 628 641 RS1C932TF
BS 642 717 RS1CE18TF
BS 718 718 RS1CE18JQ
BS 719 739 RS1CE18TF
BS 740 740 RS1CE18JQ
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BS 747 766 RS1CE18TF
BS 767 786 RS1C932JQ

RD RS1FY86TF 106 0 0
CATTCACAATCTCATATAACTCATACTACATAAGAATGGCTGGATCTCTTAGATTTAATC
ATCACTTCCTCACATCTCTTCTCATTACCATTACGATAACCAC
ACT

QA 1 103 1 103
DS 

RD RS1C932TF 641 0 0
CATTCACAATCTCATATAACTCATACTATATAAGAATGGCTGGATCTCTTAGATTTAATC
ATCACTTCCTCACATCTCTTCTCATTACCATTACGATAACCACGCTCAAGTCGGTCCATA
CAGCAACAACAACAAACACGGAGTTCGTAAAATCATCATGCAAATTCACAACATATCAAA
AACTCTGTGTCACTTCACTCTCAACTCAATCCAGTCTCATCCAAACCATCCACAAACTCA
TGGCTCACGCGGCTCTCAACATCACATTAGCCTCGGTTAAAGCCACATCAGCAATGATGG
TGCGTCTCTCGAGTAGTCAGCTCAAGCCCAGAGAAGTCTCGGCCATGAGAGACTGCGTTG
AGGAGCTAGGTGACACTTTGGCGGAGCTTAGGAAATTGATAGGTGAGATGGGTCTGTTAA
GTGGCTCGAACTACGAAATCTACATGAGTGATATTCAGACTTGGGTTAGCGCGGCTCTGA
CCGATGAGAACACGTGCTCGGATGGTTTTGGAGGAGCTGACATGAATGGGAAAGTCAAGG
ATTTGGTTAGAGGGAGGGATTTTGGTTATTGCTCATCTAACGAGTAATGCTTTAGCTTTG
ATTAATCACTTTGCTTATATTCATGGCTAGAGAGACTAATA

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1ES41TF 607 0 0
CATTCACAATCTCATATAACTCATACTATATAAGAATGTCTGGATCTCTTAGATTTAATC
ATCACTTCCTCACATCTCTTCTCATTACCATTACGATAACCACGCTCAAGTCGGTCCATA
CAGCAACAACAACAAACACGGAGTTCGTAAAATCATCATGCAAATTCACAACATATCAAA
AACTCTGTGTCACTTCACTCTCAACTCAATCCAGTCTCATCCAAACCAGCCACAAACTCA
TGGCTCACGCGGCTCTCAACATCACATTAGCCTCGGTTAAAGCCACATCAGCAATGATGG
TGCGTCTCTCGAGTAGTCAGCTCAAGCCCAGAGAAGTCTCGGCCATGAGAGACTGCGTTG
AGGAGCTAGGTGACACGTTGGCGGAGCTTAGGAAATCGATAGGTGAGATGGGTCTGTTAA
GTGGCTCGAACTACGAAATCTACATGAGTGATATTCAGACTTGGGTTAGCGCGGCTCTGA
CCGATGAGAACACGTGCTCGGATGGTTTTGGAGGAGCTGACATGAATGG*AAAGTCAAGG
ATTTGGTTAGAGGGAGG*ATTTTGGTTATTGCTCATCTAACGAGTAATGCTTTAGCTTTG
ATTAATC

QA 1 607 1 607
DS 

RD RS1FY73TF 641 0 0
CATTCACAATCTCATATAACTCATACTACATAAGAATGGCTGGATCTCTTAGATTTAATC
ATCACTTCCTCACATCTCTTCTCATTACCATTACGATAACCACGCTCAAGTCGGTCCATA
CAGCAACAACAACAAACACGGAGTTCGTAAAC*CATCATGCAAATTCACAACATATCAAA
AACTCTGTGTCACTTCACTCTCAACTCAATCCAGTCTCATCCAAACCAGCCACAAACTCA
TGGCTCACGCGGCTCTCAACATCACATTAGCCTCGGTTAAAGCCACATCAGCAATGATGG
TGCGTCTCTCGAGTAGTCAGCTCAAGCCCAGAGAAGTCTCGGCCATGAGAGACTGCGTTG
AGGAGCTAGGTGACACGTTGGCGGAGCTTAGGAAATCGATAGGTGAGATGGGTCTGTTAA
GTGGCTCGAACTACGAAATCTACATGAGTGATATTCAGACTTGGGTTAGCGCGGCTCTGA
CCGATGAGAACACGTGCTCGGATGGTTTTGGAGGAGCTGACATGAATGGGAAAGTCAAGG
ATTTGGTTATAGGGAGG*ATTTTGGTTATTGCTCATCTAACGAGTAATGCTTTAGCTTTG
ATTAATCACTTTGCTTATATTCATGGTTAGAGAGACTAATA

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1CE18TF 773 0 0
CATTCACAATCTCATATAACTCATACTATATAAGAATGGCTGGATCTCTTAGATTTAATC
ATCACTTCCTCACATCTCTTCTCATTACCATTACGATAACCACGCTCAAGTCGGTCCATA
CAGCAACAACAACAAACACGGAGTTCGTAAAATCATCATGCAAATTCACAACATATCAAA
AACTCTGTGTCACTTCACTCTCAACTCAATCCAGTCTCATCCAAACCAGCCACAAACTCA
TGGCTCACGCGGCTCTCAACATCACATTAGCCTCGTTTAAAGCCACATCAGCAATGATGG
TGCGTCTCTCGAGTAGTCAGCTCAAGCCCAGAGAAGTCTCGGCCATGAGAGACTGCGTTG
AGGAGCTAGGTGACACGTTGGCGGAGCTTAGGAAATCGATAGGTGAGATGGGTCTGTTAA
GTGGCTCGAACTACGAAATCTACATGAGTGATATTCAGACTTGGGTTAGCGCGGCTCTGA
CCGATGAGAACACGTGCTCGGATGGTTTTGGAGGAGCTGACATGAATGGGAAAGTCAAGG
ATTTGGTTAGAGGGAGG*ATTTTGGTTATTGCTCATCTAACGAGTAATGCTTTAGCTTTG
GTTAATCACTTTGCTTATATTCATGGTTAGAGAGACTAATATATTTTTTAGTTTCTTTTT
ATCGAAAATTTCATTTGCTTTTGTCAGTTTGTGTATATAACAAATAGTAATAGTACA*TG
TATCGCTCGTCTTTAAGAT*CCGGA*TCAATATGTACCAGAAAATA
TTCAATA

QA 1 766 1 766
DS 

RD RS1CE18JQ 580 0 0
GTGTCACTTCACTCTCAACTCAATCCAGTTTCATCCAAACCAGCCACAAACTCATGGCTC
ACGCGGCTCTCAACATCACATTAGCCTCGTTTAAAGCCACATCAGCAATGATGGTGCGTC
TCTCGAGTAGTCAGCTCAAGCCCAGAGAAGTTTCGGCCATGAGAGACTGCGTTGAGGAGC
TAGGTGACACGTTGGCGGAGCTTAGGAAATCGATAGGTGAGATGGGTCTGTTAAGTGGCT
CGAACTACGAAATCTACATGAGTGATATTCAGACTTGGGTTAGCGCGGCTTTGACCGATG
AGAACACGTGCTCGGATGGTTTTGGAGGAGCTGACATGAATGGGAAAGTCAAGGATTTGG
TTAGAGGGAGG*ATTTTGGTTATTGCTCATCTAACGAGTAATGCTTTAGCTTTGGTTAAT
CACTTTGCTTATATTCATGGTTAGAGAGACTAATATATTTTTTAGTTTCTTTTTATCGAA
AATTTCATTTGCTTTTGTCAGTTTGTGTATATAACAAATAGTAATAGTACAATGTATCGC
TCGTCTTTAAGATTCCGGAATCAATATGTACCAGAAAATA

QA 1 580 1 580
DS 

RD RS1FY73JQ 556 0 0
TCCAAACCAGCCACAAACTCATGGCTCACGCGGCTCTCAACATCACATTAGCCTCGGTTA
AAGCCACATCAGCAATGATGGTGCGTCTCTCGAGTAGTCAGCTCAAGCCCAGAGAAGTTT
CGGCCATGAGAGACTGCGTTGAGGAGCTAGGTGACACGTTGGCGGAGCTTAGGAAATCGA
TAGGTGAGATGGGTCTGTTAAGTGGCTCGAACTACGAAATCTACATGAGTGATATTCAGA
CTTGGGTTAGCGCGGCTTTGACCGATGAGAACACGTGCTCGGATGGTTTTGGAGGAGCTG
ACATGAATGGGAAAGTCAAGGATTTGGTTATAGGGAGG*ATTTTGGTTATTGCTCATCTA
ACGAGTAATGCTTTAGCTTTGATTAATCACTTTGCTTATATTCATGGTTAGAGAGACTAA
TATATTTTTTAGTTTCTTTTTATCGAAAATTTCATTTGCTTTTGTCAGTTTGTGTATATA
ACAAATAGTAATAGTACAATGTATCGCTCGTCTTTAAGATTCCGGAATCAATATGTACCA
GAAAATATTCAATA
TC

QA 1 554 1 554
DS 

RD RS1C932JQ 637 0 0
AAATCATCATGCAAATTCACAACATATCAAAAACTCTGTGTCACTTCACTCTCAACTCAA
TCCAGTTTCATCCAAACCATCCACAAACTCATGGCTCACGCGGCTTTCAACATCACATTA
GCCTCGGTTAAAGCCACATCAGCAATGATGGTGCGTCTCTCGAGTAGTCAGCTCAAGCCC
AGAGAAGTTTCGGCCATGAGAGACTGCGTTGAGGAGCTAGGTGACACTTTGGCGGAGCTT
AGGAAATTGATAGGTGAGATGGGTCTGTTAAGTGGCTCGAACTACGAAATCTACATGAGT
GATATTCAGACTTGGGTTAGCGCGGCTTTGACCGATGAGAACACGTGCTCGGATGGTTTT
GGAGGAGCTGACATGAATGGGAAAGTCAAGGATTTGGTTAGAGGGAGG*ATTTTGGTTAT
TGCTCATCTAACGAGTAATGCTTTAGCTTTGATTAATCACTTTGCTTATATTCATGGCTA
GAGAGACTAATATATTTTTTAGTTTCTTTTTATCGAAAATTTTTGTTGCTTTTGTCAGTT
TGTGTATATAACAAATAGTAATAGTACAATGTATCGCTCGTCTTTAAGATTCCGGAATCA
ATATGTACCAGAAAATATTCAATATTTTTTTTTTGCT

QA 1 637 1 637
DS 



AS 2 7

CO CL573Contig1 732 2 4 U
GGAAGCAAAGAATCTCTCTCTCTCTCTATATCCGTCTTCTTCTTCCTCCGTTGATCATCC
TCTTAGGCTTGTTCGGATAATCTTCGATCCGTTCGAATCTCTCGCTCCGTGACTGTTCCC
GCCATCTGCGATCATCTGATCCACCGATCTCCCGCGCGAAAATTGAAGACGAGGTCGCTT
CAAGCACCAGTCGTTTGCCCCGCGATTCGTCGTCCATGCGCTCTGAACAAACCCACGCTT
CTCCTCAGGAGCCAATTCTTCGGTCACCGGATCAACAAGTCTCAGGTCACTCCTCCTCGT
GGGTGCAGAAACAACAACAACAAGAGGATCAGCATAATAAAGTGTATGTTCAGCTCTCAC
TCTGACGGTAACGGAAGCACCGCCGAGAATTTCAACGAGAACGACGAGGAATACGTCAAC
TCTACCATACTGGAAGCTGTTGAGGTGAAGAGTGGAGCTGATGGTTTCATGGTGAAGATG
AGAGACGGTAGGCAGTTACGGTGCGTGCATAACAATCCTCAAGGAGGGCACTTGCCTGAT
TATGCTCCACACCCTGCTATTGTCTTGAAAATGGAAGATGGAACCGGTCTCCTCCTTCCC
ATTATTGTCTTGGAAATGCCTAGTGTGTTGCTTATGGCAGCAATGACCAATGTCCAGATT
GCAAGACCCACCATGTATCAAGTGGTTAAGAGATGGTAGACAGATGGGTTACGAAGTTAG
ACTTGTTAGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DS11TF U 1
AF RS1GF63TF U 1
BS 1 615 RS1DS11TF
BS 616 616 RS1GF63TF
BS 617 652 RS1DS11TF
BS 653 732 RS1GF63TF

RD RS1DS11TF 652 0 0
GGAAGCAAAGAATCTCTCTCTCTCTCTATATCCGTCTTCTTCTTCCTCCGTTGATCATCC
TCTTAGGCTTGTTCGGATAATCTTCGATCCGTTCGAATCTCTCGCTCCGTGACTGTTCCC
GCCATCTGCGATCATCTGATCCACCGATCTCCCGCGCGAAAATTGAAGACGAGGTCGCTT
CAAGCACCAGTCGTTTGCCCCGCGATTCGTCGTCCATGCGCTCTGAACAAACCCACGCTT
CTCCTCAGGAGCCAATTCTTCGGTCACCGGATCAACAAGTCTCAGGTCACTCCTCCTCGT
GGGTGCAGAAACAACAACAACAAGAGGATCAGCATAATAAAGTGTATGTTCAGCTCTCAC
TCTGACGGTAACGGAAGCACCGCCGAGAATTTCAACGAGAACGACGAGGAATACGTCAAC
TCTACCATACTGGAAGCTGTTGAGGTGAAGAGTGGAGCTGATGGTTTCATGGTGAAGATG
AGAGACGGTAGGCAGTTACGGTGCGTGCATAACAATCCTCAAGGAGGGCACTTGCCTGAT
TATGCTCCACACCCTGCTATTGTCTTGAAAATGGAAGATGGAACCGGTCTCCTCCTTCCC
ATTATTGTCTTGGAAGTGCCTAGTGTGTTGCTTATGGCAGCAATGACCAATG

QA 1 652 1 652
DS 

RD RS1GF63TF 732 0 0
GGAAGCAAAGAA
TCTCTCTCTCTCTCTATATCCGTCTTCTTCTTCCTCCGTTGATCATCCTCTTAGGCTTGT
TCGGATAATCTTCGATCCGTTCGAATCTCTCGCTCCGTGACTGTTCCCGCCATCTGCGAT
CATCTGATCCACCGATCTCCCGCGCGAAAATT****ATGAGGTCGCTTCAAGCACCAGTC
GTTTGCCCCGCGATTCGTCGTCCATGCGCTCTGAACAAACCCACGCTTCTCCTCAGGAGC
CAATTCTTCGGTCACCGGATCAACGAGTCTCAGGTCACTCCTCCTCGTGGGTGCAGAAAC
AACAACAACAAGAGGATCAGTATAATAAAGTGTGTGTTCAGCTCTCACTCTGACGGTAAC
GGAAGCACCGCCGAGAATTTCAACGAGAACGACGAGGAATACGTCAACTCTACCATACTG
GAAGCTGTTGAGGTGAAGAGTGGAGCTGATGGTTTCATGGTGAAGATGAGAGACGGTAGG
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CCTGCTATTGTCTTGAAAATGGAAGATGGAACCGGTCTCCTCCTTCCCATTATTGTCTTG
GAAATGCCTAGTGTGTTGCTTATGGCAGCAATGACCAATGTCCAGATTGCAAGACCCACC
ATGTATCAAGTGGTTAAGAGATGGTAGACAGATGGGTTACGAAGTTAGACTTGTTAGAGT

QA 13 732 13 732
DS 



CO CL573Contig2 849 5 22 U
AAAAACAACTCACATCTGCAATTAACTTAATCAAACAACGCCAAACAAGAGGAGCCTTAA
AACACAATCAGAGTGAACTTAACGTGCATAGGTACGACGACGTAGATTAACAAGTAATAT
GTACACATCACGCTACATACATATTTAACACATTACATTTTTCTTTTTGTTTCTGGGACA
ATGAGTTAAGTGTAGAAGCATTCTTAAATATCCGAAGACTCTGCTTCTTCCTCCACTTTG
ATCCCGACAATGACCACCTCCTTATTATGTACACAGACCAATACTTGTTGATCGAGTTCT
CTTATGTGTATTTCCTCAGGTTACGCTTGGCCCTAAACTGGCCAAGCTTGTCTCTCCATT
CAGCAGCTTCATCATATCGCTCTTCATTAACGGCTTGCATCATGTTGCTCAGAATATTGA
ACTCTTTCGTATCAAGGCAAGCCTGACCATTTGGTTTGTCTTGCTCAGTAAACAATAAAC
CATCCGAAGCAGGTGTCTGTTGTGACAGCTTCCCTGACTCGATGACTCTCATTCCATCAC
TATACGCAAGGTACTTGTTCACTTGGACAGGTACCTTGCATCTAACAGCTATATTAATTG
CATCTGAAGGGCGAAGGTCAAAGCTGATACAGTCAGATGCATTACCCACCTTTGAAAGGT
AGAGTTGGGCAAAATACGCCTCGTGAACTCTTTTGGTGACTCTAACAAGTCTAACTTCGT
AACCCATCTTGTCTACCATCTCCTTAACCACTTGATACATGGTGGGTCTTGCAATCTGGA
CATTGGTCATTGCTGCCATAAGCAACACACTAGCACTTCCAAGACAATAATGGGAAGAGG
AGACCGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 0 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AGTTCTCTTATGTGTATTTCCTCAGGTTACGCTTGGCCCTAAACTGGCCAAGCTTGTCTC
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ATAAACCATCCGAAGCAGGTGTCTGTTGTGACAGCTTCCCTGACTCTATGACTCTCATTC
CATCACTATACGCAAGGTACTTGTTCACTTGGATAGGTACCTTGCATCTAACAGCTATAT
TAATTGCATCTGAAGGGCGAAGGTCAAAGCTGATACAGTCAGATGCATTACCCACCTTTG
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CCACCTTCTTATTATGTACACAGACCAATACTTGTTGATCGAGTTCTCTTATGTGTATTT
CCTCAGGTTACGCTTGGCCCTAAACTGGCCAAGCTTGTCTCTCCATTCAGCGGCTTCATC
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TGTCTGTTGTGACAGCTTCCCTGACTCGATGACTCTCATTCCATCACTATACGCAAGGTA
CTTGTTCACTTGGACAGGTACCTTGCATCTAACAGCTATATTAATTGCATCTGAAGGGCG
AAGGTCAAAGCTGATACAGTCAGATGCATTACCCACCTTTGAAAGGTAGAGTTGGGCAAA
ATACGCCTCGTGAACTCTTTTGGTGACTCTAACAAGTCTAACTTCGTAACCCATCTTGTC
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DS 



AS 1 8

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GACCTGAGCATAATCTGAAATAAAGA


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
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BS 598 701 RS1AN33TF
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CTCAAAGGAGAAATGGCGGCGACACAACTTACAGCATCACCAGTGACTGTGTCAGCCAGG
AGCTTTGCCTCCCTGTATGGTCTCAGAGCTTCGAGTGCCATCAAGTTTGGAACTTTGAAA
CCAGGCACCCTTAAGCAGAGCCAGTTCCGTTCCTTGGTTGTCAGAGCTGCTTCCGTCGTT
GCTCCTAAGTATACTTCGATTAAGCCACTGGGAGATAGAGTTTTGGTGAAGATCAAGGAG
GCAGAGGAAAAGACTATGGGAGGTATCTTACTTCCATCCACAGCTCAATCAAAGCCTCAA
GGAGGTGAAGTCATTGCTGTTGGTGAAGGAAGAACTATTGGGAAGACCAAAGTTGATATC
ACTATCCCTACTGGAGCACAAATCATTTACTCCAAGTACGCAGGAACCGAGGTGGAGTTC
AACGATGTGAAGCATCTCATTCTCAAGGAAGATGACATTGTTGGTCTTCTTGAGACAGAG
GATATCAAAGATCTCAAGCCCTTGAATGACCGTGTCTTCATT

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DS 

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GGACTTCT
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AATGGCGGCGACACAACTTACAGCATCACCAGTGACTGTGTCAGCCAGGAGCTTTGCCTC
CCTGGATGGTCTCAGAGCTTCGAGTGCCATCAAGTTTGGAACTTTGAAACCAGGCACCCT
TAAGCAGAGCCAGTTCCGTTCTTTGGTTGTCAGAGCTGCTTCCGTCGTTGCTCCTAAGTA
TACTTCGATTAAGCCACTGGGAGATAGAGTTTTGGTGAAGATCAAGGAGGCAGAGGAAAA
GACTATGGGAGGTATCTTACTTCCATCCACAGCTCAATCAAAGCCTCAAGGAGGTGAAGT
CATTGCTGTTGGTGAAGGAAGAACTATTGGGAAGACCAAAGTTGATATCACTATCCCTAC
TGGAGCACAAATCATTTACTCCAAGTACGCAGGAACCGAGGTGGAGTTCAACGATGTGAA
GCATCTCATTCTCAAGGAAGATGACATTGTTGGTCTTCTTGAGACAGAGGATATCAAAGA
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TGGAGGGTTGTTGCTTACCGAGACCACCAAAGAGAAGCCTTCTATTGGCACGGTGATAGC
AGTTGGACCAGGTACTCTAGATGAGGAAGG

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DS 

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GG
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TGGTTGTCAGAGCTGCTTCCGTCGTTGCTCCTAAGTATACTTCGATTAAGCCACTGGGAG
ATAGAGTTTTGGTGAAGATCAAGGAGGCAGAGGAAAAGACTATGGGAGGTATCTTACTTC
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CTATTGGGAAGACCAAAGTTGATATCACTATCCCTACTGGAGCACAAATCATTTACTCCA
AGTACGCAGGAACCGAGGTGGAGTTCAACGATGTGAAGCATCTCATTCTCAAGGAAGATG
ACATTGTTGGTCTTCTTGAGACAGAGGATATCAAAGATCTCAAGCCCTTGAATGACCGTG
TCTTCATTAAGGTTGCTGAAGCAGAGGAGAAAACAGCTGGAGGGTTGTTGCTTACCGAGA
CCACCAAAGAGAAGCCTTCTATTGGCACGGTGATAGCAGTTGGACCAGGTACTCTAGATG
AGGAAG

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DS 

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GG
GCAATTCTTAGGGTTTTATCCTCCAAAGTCACAGTCCTCTTCTCTTATCCTCAAAGGAGA
AATGGCGGCGACACAACTTACAGCATCACCAGTGACTGTGTCAGCCAGGAGCTTTGCCTC
CCTGGATGGTCTCAGAGCTTCGAGTGCCATCAAGTTTGGAACTTTGAAACCAGGCACCCT
TAAGCAGAGCCAGTTCCGTTCTTTGGTTGTCAGAGCTGCTTCCGTCGTTGCTCCTAAGTA
TACTTCGATTAAGCCACTGGGAGATAGAGTTTTGGTGAAGATCAAGGAGGCAGAGGAAAA
GACTATGGGAGGTATCTTACTTCCATCCACAGCTCAATCAAAGCCTCAAGGAGGTGAAGT
CATTGCTGTTGGTGAAGGAAGAACTATTGGGAAGACCAAAGTTGATATCACTATCCCTAC
TGGAGCACAAATCATTTACTCCAAGTACGCAGGAACCGAGGTGGAGTTCAACGATGTGAA
GCATCTCATTCTCAAGGAAGATGACATTGTTGGTCTTCTTGAGACAGAGGATATCAAAGA
TCTCAAGCCCTTGAATGACCGTGTCTTCATTAAGGTTGCTGAAGCAGAGGAGAAAACAGC
TGGAGGGTTGTTGCTTACCGAGACCACCAAAGAGAAGCCTTCTATTGGCACGGTGATAGC
AGTTGGACCAGGTACTCTAGAT

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DS 

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AGCAGAGCCAGTTCCGTTCTTTGGTTGTCAGAGCTGCTTCCGTCGTTGCTCCTAAGTATA
CTTCGATTAAGCCACTGGGAGATAGAGTTTTGGTGAAGATCAAGGAGGCAGAGGAAAAGA
CTATGGGAGGTATCTTACTTCCATCCACAGCTCAATCAAAGCCTCAAGGAGGTGAAGTCA
TTGCTGTTGGTGAAGGAAGAACTATTGGGAAGACCAAAGTTGATATCACTATCCCTACTG
GAGCACAAATCATTTACTCCAAGTACGCAGGAACCGAGGTGGAGTTCAACGATGTGAAGC
ATCTCATTCTCAAGGAAGATGACATTGTTGGTCTTCTTGAGACAGAGGATATCAAAGATC
TCAAGCCCTTGAATGACCGTGTCTTCATTAAGGTTGCTGAAGCGGAGGAGAAAACAGCTG
GAGGGTTGTTGCTTACCGAGACCACCAAAGAGAAGCCTTCTATTGGCACGGTGATAGCAG
TTGGACCAGGTACTCTAGATGAGGAAGGTAAGGTTCAGCCACTATCGATATCGACTGGAA
GCACAGTTCTCTACTCCAAGTATGCTGGTAACGACTTCAAGGGCAAGGATGGTTCAAACT
ACATTGCCCTGAGAGCTTCAGATGTGATGGCTATCCTTTCTTAGTTTATTATATCTTTTG
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TCTGAAATAAAG

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DS 

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ATCACTATCCCTACTGGAGCACAAATCATTTACTCCAAGTACGCAGGAACCGAGGTGGAG
TTCAACGATGTGAAGCATCTCATTCTCAAGGAAGATGACATTGTTGGTCTTCTTGAGACA
GAGGATATCAAAGATCTCAAGCCCTTGAATGACCGTGTCTTCATTAAGGTTGCTGAAGCA
GAGGAGAAAACAGCTGGAGGGTTGTTGCTTACCGAGACCACCAAAGAGAAGCCTTCTATT
GGCACGGTGATAGCAGTTGGACCAGGTACTCTAGATGAGGAAGGTAAGGTTCAGCCACTA
TCGATATCGACTGGAAGCACAGTTCTCTACTCCAAGTATGCTGGTAACGACTTCAAGGGC
AAGGATGGTTCAAACTACATTGCCCTGAGAGCTTCAGATGTGATGGCTATCCTTTCTTAG
TTTATTATATCTTTTGTAAACCTGCAAAATTTGTATCCCAATTGTGGAATTTTTTTCGTA
GACGACCTGAGCATAATCTGAAATAAAG

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DS 

RD RS1FY09JQ 671 0 0
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ATGGGAGGTATCTTACTTCCATCCACAGCTCAATCAAAGCCTCAAGGAGGTGAAGTCATT
GCTGTTGGTGAAGGAAGAACTATTGGGAAGACCAAAGTTGATATCACTATCCCTACTGGA
GCACAAATCATTTACTCCAAGTACGCAGGAACCGAGGTGGAGTTCAACGATGTGAAGCAT
CTCATTCTCAAGGAAGATGACATTGTTGGTCTTCTTGAGACAGAGGATATCAAAGATCTC
AAGCCCTTGAATGACCGTGTCTTCATTAAGGTTGCTGAAGCAGAGGAGAAAACAGCTGGA
GGGTTGTTGCTTACCGAGACCACCAAAGAGAAGCCTTCTATTGGCACGGTGATAGCAGTT
GGACCAGGTACTCTAGATGAGGAAGGTAAGGTTCAGCCACTATCGATATCGACTGGAAGC
ACAGTTCTCTACTCCAAGTATGCTGGTAACGACTTCAAGGGCAAGGATGGTTCAAACTAC
ATTGCCCTGAGAGCTTCAGATGTGATGGCTATCCTTTCTTAGTTTATTATATCTTTTGTA
AACCTGCAAAATTTGTATCCCAATTGTGGAATTTTTTTCGTAGACGACCTGAGCATAATC
TGAAATAAAG
A

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DS 

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TGAAGGAAGAACTATTGGGAAGACCAAAGTTGATATCACTATCCCTACTGGAGCACAAAT
CATTTACTCCAAGTACGCAGGAACCGAGGTGGAGTTCAACGATGTGAAGCATCTCATTCT
CAAGGAAGATGACATTGTTGGTCTTCTTGAGACAGAGGATATCAAAGATCTCAAGCCCTT
GAATGACCGTGTCTTCATTAAGGTTGCTGAAGCAGAGGAGAAAACAGCTGGAGGGTTGTT
GCTTACCGAGACCACCAAAGAGAAGCCTTCTATTGGCACGGTGATAGCAGTTGGACCAGG
TACTCTAGATGAGGAAGGTAAGGTTCAGCCACTATCGATATCGACTGGAAGCACAGTTCT
TTACTCCAAGTATGCTGGTAACGACTTCAAGGGCAAGGATGGTTCTAACTACATTGCCCT
GAGAGCTTCAGATGTGATGGCCATCCTTTCGTAGTTTATTATATCTTTTGTAAACCTGCA
AAATTTGTATCCCAATTGTGGAATTTTTTTCGTAGACGACCTGAGCATAATCTGAAATAA
AGA

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DS 



AS 1 8

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CTTTTTTTTTTTTTTTACGGTTGTTTCAAAAATTGAACATAACTTTAATAGCATTGCTTC
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TTATGAGTGGCTTCACATCAATCTTAACACTTGTAAGGAACTCGAGACACAAAGGCCATG
TGTTCTTGTACCTGAACACACCCACCACATCTACCTCCCTTGCGGCTGCGGGAGTGAGAG
GGACAGTCATTATACCATGACCCATTCCGACAAGGCATACTTTCCCGCCGCATCGAGTGG
CTGCTAATGCCGTCGACATTGTTTTGTTGAAACCCGCACAATCGAATGTCACATCGACGT
TTGACCCTATAGCTTTCTTAATTTGTTCAACCTCAAAACCAACATCCTCTAAGCTTGTTG
TCACTTTGACAATCCCATCTGCACCTAGCTGTTTGGCTACAGATAAACGGTTATCATCAA
CATCCACAATCACAATCCTTGGCACACCGAAAGCACGAGCAGCCAACATGGTGACAAGTC
CAATAGGTCCGGCTCCCATTACCAACACGTTTGTCTCAGGACCAACCTCAGCTCGGCGAC
AAGCATGCACGCCAACACTTAGTGGCTCACACATTGCTCCTTCCTCCAAACTCACATTCT
CAGGCAATTTAAAACATAGATCCGCAGGGTGAACCACTTGGTTTGCTAGAGAGCCATGAA
CCGGTGGGGTTGCAAAGAACTTCATCTCAGGACAAAGATTGTATCTTCCTTCCTTGCAGA
GGTTGCATCTCCAGCAACTAATCCCAGGCTCAAGAGCCACTCGGTCACCGACCACTAGAT
GTTTCACTCCTTCACCTACCTCTTCAATGATCCCAGCGCATTCATGTCCAATCACCATCG
GTTCTTTCACAATGAAATCCGCACATCTCATGGTCTTAAGGTAATGAACATCACTTCCAC
AAATTCCAACAGCCTTCATCCTAACTCTCACATCATGAGGACCAAGGGAAGGAAGAGGAA
AAGGTTGGATCTTGAGAGTGTTGAGACCAACCAACCAAGCAGCCATGTTCTCTTCTTCAA
CCTTTGAGCCTTCTCCCTGAGACATTCCTCCTTTTCCCATAACTCTTCTCAGCTCTAAGC
TACTCTAGTGATCTCAACTTTTAGATGAAAGGAAACAGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 0 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

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TTATGAGTGGCTTCACATCAATCTTAACACTTGTAAGGAACTCGAGACACAAAGGCCATG
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GGACAGTCATTATACCATGACCCATTCCGACAAGGCATACTTTCCCGCCCCATCGAGTGG
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TTGACCCTATAGCTTTCTTAATTTGTTCAACCTCAAAACCAACATCCTCTAAGCTTGTTG
TCACTTTGACAATCCCATCTGCACCTAGCTGTTTGGCTACAGATAAACGGTTATCATCAA
CATCCACAATCGCAATCCTTGGCACACCGAAAGCACGAGCAGCCAACATGG

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DS 

RD RS1DC46JQ 690 0 0
AG
TAAAAGATTTATCTATTCAACAAGGACTAACGAGAGTGATGATGATACATTGAACAAAGC
TGCAGACGCATTCTTATTACAGAAACATTGAAATGATCTTAGAAGAGCAAATGCTTTCTT
TTTTT****ACGGTTGTTTCAAAAATTGAACATAACTTTAATAGCATTGCTTCCACGAGC
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TGGCTTCACATCAATCTTACCACTTGTAAGGAACTCGAGACACAAAGGCCATGTGTTCTT
GTACCTGAACACACCCACCACATCTACCTCCCTTGCGGCTGCGGGAGTGAGAGGGACAGT
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TGCCGTCGACATTGTTTTGTTGAAACCCGCACAATCGAATGTCACATCGACGTTTGACCC
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AATCACAATCCTTGGCACACCGAAAGCACGAGCAGCCAACATGGTGACAAGTCCAATAGG
TCCGGCTCCCATTACCAACACGTTTGTC

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DS 

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ACATTGAAATGATCTTAGAAGAGCAAATGCTTTTTTTTTTTTTTTACGGTTGTTTCAAAA
ATTGAACATAACTTTAATAGCATTGCTTCCACGAGCACTGGTTTCAAAGGCATCTTCCAC
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TGTAAGGAACTCGAGACACAAAGGCCATGTGTTCTTGTACCTGAACACACCCACCACATC
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AAGGCATACTTTCCCGCCGCATCGAGTGGCTGCTAATGCCGTCGACATTGTTTTGTTGAA
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AGCACGAGCAGCCAACATGGTGACAAGTCCAATAGGTCCGGCTCCCATTACCAACACGTT
TGTCTCAGGACCAACCTCAGCTCGGCGACAAGCATGCACGCCAACACTTAGTGGCTCACA
CATTGC

QA 1 726 1 726
DS 

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AAGGCATCTTCCACTTCCTTCTGAGAGAAACCAAATCTGTGGGTTATGAGTGGCTTCACA
TCAATCTTACCACTTGTAAGGAACTCGAGACACAAAGGCCATGCGTTCTTGTACCTGAAC
ACACCCACCACATCTACCTCCCTTGCGGCTGCGGGAGTGAGAGGGACAGTCATTATACCA
TGACCCATTCCGACAAGGCATACTTTCCCGCCGCATCGAGTGGCTGCTAATGCCGTCGAC
ATTGTTTTGTTGAAACCCGCACAATCGAATGTCACATCGACGTTTGACCCTATAGCTTTC
TTAATTTGTTCAACCTCAAAACCAACATCCTCTAAGCTTGTTGTCACTTTGACAATCCCA
TCTGCACCTAGCTGTTTGGCTACAGATAAACGGTTATCATCAACGTCCACAATCACAATC
CTTGGCACACCGAAAGCACGAGCAGCCAACATGGTGACAAGTCCAATAGGTCCGGCTCCC
ATTACCAACACGTTTGTCTCAGGACCAACCTCAGCTCGGCGACAAGCATGCACGCCAACA
CTTAGTGGCTCACACATTGCTCCTTCCTCCAAACTCACATTCTCAGGCAATTTAAAACAT
AGATCCGCAGGGTGAACCACTTGGTTTGCTAGAGAGCCATGAACCGGTGGGGTTGCAAAG
AACTTCATC

QA 1 729 1 729
DS 

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CTCCACTT
CTTCTGAGAGAAACCAAATCTGTGGGTTATGAGTGGCTTCACATCAATCTTAACACTTGT
AAGGAACTCGAGACACAAAGGCCATGTGTTCTTGTAC*TGAACACACCCACCACATCTAC
CTCCCTTGCGGCTGCGGGAGTGAGAGGGACAGTCATTATACCATGACCCATTCCGACAAG
GCATACTTTCCCGCCGCATCGAGTGGCTGCTAATGCCGTCGACATTGTTTTGTTGAAACC
CGCACAATCGAATGTCACATCGACGTTTGACCCTATAGCTTTCTTAATTTGTTCAACCTC
AAAACCAACATCCTCTAAGCTTGTTGTCACTTTGACAATCCCATCTGCACCTAGCTGTTT
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ACGAGCAGCCAACATGGTGACAAGTCCAATAGGTCCGGCCCCCATTA**AACACGTTTGT
CTCAGGACCAACCTCAGCTCGGCGACAAGCATGCACGCCAACACTTAGTGGCTCACACAT
TGCTCCTTCCTCCAAACTCACATTCTCAGGCAATTTAAAACATAGATCCGCAGGGTGAAC
CACTTGGTTTGATAGAGAGCCATGAACCGGTGGGGTTGCAAAGAACTTCATCTCAGGACA
AAGATTGTATCTTCCTTCCTTGCAGAGGTTGCATCTCCAGCAACTAATCCCAGGCTCAAG
AGCCACTCGGTCACCGACCACTAGAT
C

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DS 

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CTGCGGGAGTGAGAGGGACAGTCATTATACCATGACCCAT*CCGACAAG*CATACTTTCC
CGCCGCATCGAGTGGCTGCTAATGCCGTCGACATTGTTTTGTTGAAACCCGCACAATCGA
ATGTCACATCGACGTTTGACCCTATAGCTTTCTTAATTTGTTCAACCTCAAAACCAACAT
CCTCTAAGCTTGTTGTCACTTTGACAATCCCATCTGCACCTAGCTGTTTGGCTACAGATA
AACGGTTATCATCAACATCCACAATCACAATCCTTGGCACACCGAAAGCACGAGCAGCCA
ACATGGTGACAAGTCCAATAGGTCCGGCTCCCATTACCAACACGTTTGTCTCAGGACCAA
CCTCAGCTCGGCGACAAGCATGCACGCCAACACTTAGTGGCTCACACATTGCTCCTTCCT
CCAAACTCACATTCTCAGGCAATTTAAAACATAGATCCGCAGGGTGAACCACTTGGTTTG
CTAGAGAGCCATGAACCGGTGGGGTTGCAAAGAACTTCATCTCAGGACAAAGATTGTATC
TTCCTTCCTTGCAGAGGTTGCATCTCCAGCAACTAATCCCAGGCTCAAGAGCCACTCGGT
CACCGACCACTAGATGTTTCACTCCTTCACCTACCTCTTCAATGATCCCAGCGCATTCAT
GTCCAATCACCATCGGTTCTTTCACAATGAAATCCGCACATCTC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1D203TF 730 0 0
TG
TTGGCTACAGATAAACGGT*ATCATCAACGTCCACAATCACAATCCTTGGCACAC*GAAA
GCACGAGCAGCCAACATGGTGACAAGTCCAATAGGTCCGGCTCCCATTACCAACACGTTT
GTCTCAGGACCAACCTCAGCTCGGCGACAAGCATGCACGCCAACACTTAGTGGCTCACAC
ATTGCTCCTTCCTCCAAACTCACATTCTCAGGCAATTTAAAACATAGATCCGCAGGGTGA
ACCACTTGGTTTGCTAGAGAGCCATGAACCGGTGGGGTTGCAAAGAACTTCATCTCAGGA
CAAAGATTGTATCTTCCTTCCTTGCAGAGGTTGCATCTCCAGCAACTAATCCCAGGCTCA
AGAGCCACTCGGTCACCGACCACTAGATGTTTCACTCCTTCACCTACCTCTTCAATGATC
CCAGCGCATTCATGTCCAATCACCATCGGTTCTTTCACAATGAAATCCGCACATCTCATG
GTCTTGAGGTAATGAACATCACTTCCACAAATTCCAACAGCCTTCATCCTAACTCTCACA
TCATGAGGACCAAGGGAAGGAAGAGGAAAAGGTTGGATCTTGAGAGTGTTGAGACCAACC
AACCAAGCAGCCATGTTCTCTTCTTCAACCTTTGAGCCTTCTCCCTGAGACATTCCTCCT
TTTCCCATAACTCTTCTCAGCTCTAAGCTACTCTAGTGATCTCAACTTTTAGATGAAAGG
AAACAGCC

QA 3 730 3 730
DS 

RD RS1DC46TF 666 0 0
CGAGCAGCCAACATGGTGACAAGTCCAATAGGTCCGGCTCCCATTACCAACACGTTTGTC
TCAGGACCAACCTCAGCTCGGCGACAAGCATGCACGCCAACACTTAGTGGCTCACACATT
GCTCCTTCCTCCAAACTCACATTCTCAGGCAATTTAAAACATAGATCCGCAGGGTGAACC
ACTTGGTTTGCTAGAGAGCCATGAACCGGTGGGGTTGCAAAGAACTTCATCTCAGGACAA
AGATTGTATCTTCCTTCCTTGCAGAGGTTGCATCTCCAGCAACTAATCCCAGGCTCAAGA
GCCACTCGGTCACCGACCACTAGATGTTTCACTCCTTCACCCACCTCTTCAATGATCCCA
GCGCATTCATGTCCAATCACCATCGGTTCTTTCACAATGAAATCCGCACATCTCATGGTC
TTAAGGTAATGAACATCACTTCCACAAATTCCAACAGCCTTCATCCTAACTCTCACATCA
TGAGGACCAAGGGAAGGAAGAGGAAAAGGTTGGATCTTGAGAGTGTTGAGACCAACCAAC
CAAGCAGCCATGTTCTCTTCTTCAACCTTTGAGCCTTCTCCCTGAGACATTCCTCCTTTT
CCCATAACTCTTCTCAGCTCTAAGCTACTCTAGTGATCTCAACTTTTAGATGAAGGGAAA
CAGCCC

QA 1 666 1 666
DS 



AS 2 8

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AAAAAGAAAGTCTTAGGTAGGTATATACCGATGATTTGGTTAATTTGGACCAAATCGCAT
TGGTAGATATACTAATGCCAGTTATAATGATAACCACATCATTTTAATAAATTTACAAAG
AAAATTTGTACACTGGTTATCATTTCCTTGTAACATGTCGTATATTCATAAAAATGATTA
TGAAACATGTAGTTTAGGATAAATTAGGAATAATTTATGGAACCCAAACTACTCCATTCA
GCTATACCATGCGGGAGGTTTATTCTCTCCAGCTGGTTTATCCGTTGATGCTCCAACTCA
GTGCCGGCTCTACACATGTGCTGAAGGAGCTTTAGCACAGGGTCCTTTTATTTTTCAATA
ATTTTCTTTAAGGAATCAAGGTCCTATTTTGTCAAATGAATACAGATTTAGGGTCCTAAT
TTTGGATTTTAAAAATGTTAACAATGATTTTGGAAATGAAAAACTTGAGCACAAGGTCCA
CTAACTTAATAAGCCGGCCCTGCTCCAACTGGTTTATTTTTTTGGTTTTTCAGCCGGTTT
ATTTGCTGCCCCGCCAGCAGGTTTATTTGCTGCTCCTCCGGTCGGTTTATCTGCTGGTTT
ATCTGTTGGTCCTCCAGCAGGTTTATCTGCTGGTCCTCCAGCTGGTTTATTTCCTGGTTT
ATCTGTTGGTCCTCCAGCGGGTTTATCTTTTGGTTTATGAGCTGGTTCTCCAGCTGGTTT
ACTTCCTGGTTTATTTGTTGGTCCTCCAGCAGGTTTATCTGGTTTATGTGCTGGTCCTCC
AGCTGGTTTACTTCCTGGTTTATCTGTTGCTTCTCCATCCGGTTTACCTCCTGGCTTATC
TGCTGCTCCTGCAGCCGGTTTACCTCCTGGCTTATCTGCTGCTCCTCCAGCCGGTTTATC
TTCTGGCTTATCGGTTGCTCCTCCAGCTGGTTTATCATTTGGCATACTTGTTGCTTCTCC
AGCTGGTTTATCATTTGGTTTATCTGTTGCTCCACCAGCTGGTTTAGCTGCTTCGGTGGG
TGGAGCTCCTGCTGGAGGTGGATTATTCTTCGGGTGTACTCCCATTCTATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AF82JQ U 86
AF RS1DV78JQ U 1
AF RS1AF82TF C 387
BS 1 170 RS1DV78JQ
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RD RS1AF82JQ 530 0 0
GC
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TTGTAACATGTCGTATATTCATAAAAATGATTATGAAGCATGTAGTTTAGGATAAATTAG
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TCCAGCTGGTTTATCCGTTGATGCTCCAACTCAGTGCCGGCTCTACACATGTGCTGAAGG
AGCTTTAGCACAGGGTCCTTTTATTTTTCAATAATTTTCTTTAAGGAATCAAGGTCCTAT
TTTGTCAAATGAATACAGATTTAGGGTCCTAATTTTGGATTTTAAAAATGTTAACAATGA
TTTTGGAAATGAAAAACTTGAGCACAAGGTCCACTAACTTAATAAGCCGGCCCTGCTCCA
ACTGGTTTATTTTTTTGGTTTTTCAGCCGGTTTATTTGCTGCCCCGCCAGCAGGTTTATT
TGCTGCTCCTCCGGTCGGTTTATCTGCTGGTTTATCTGTTGGTCCTCC

QA 3 530 3 530
DS 

RD RS1DV78JQ 745 0 0
AAAAAGAAAGTCTTAGGTAGGTATATACCGATGATTTGGTTAATTTGGACCAAATCGCAT
TGGTAGATATACTAATGCCAGTTATAATGATAACCACATCATTTTAATAAATTTACAAAG
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TGAAACATGTAGTTTAGGATAAATTAGGAATAATTTATGGAACCCAAACTACTCCATTCA
GCTATACCATGCGGGAGGTTTATTCTCTCCAGCTGGTTTATCCGTTGATGCTCCAACTCA
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ATTTTCTTTAAGGAATCAAGGTCCTATTTTGTCAAATGAATACAGATTTAGGGTCCTAAT
TTTGGATTTTAAAAATGTTAACAATGATTTTGGAAATGAAAAACTTGAGCACAAGGTCCA
CTAACTTAATAAGCCGGCCCTGCTCCAACTGGTTTATTTTTTTGGTTTTTCAGCCGGTTT
ATTTGCTGCCCCGCCAGCAGGTTTATTTGCTGCTCCTCCGGTCGGTTTATCTGCTGGTTT
ATCTGTTGGTCCTCCAGCAGGTTTATCTGCTGGTCCTCCAGCTGGTTTATTTCCTGGTTT
ATCTGTTGGTCCTCCAGCGGGTTTATCTTTTGGTTTATGAGTTGGTTCTCCAGCTGGTTT
ACTTCCTGGTTTATTTGTTG
GTCCT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RS1AF82TF 686 0 0
TTTTGTCAAATGAATACAGATTTAGGGTCCTAATTTTGGATTTTAAAAATGTTAACAATG
ATTTTGGAAATGAAAAACTTGAGCACAAGGTCCACTAACTTAATAAGCCGGCCCTGCTCC
AACTGGTTTATTTTTTTGGTTTTTCAGCCGGTTTATTTGCTGCCCCGCCAGCAGGTTTAT
TTGCTGCTCCTCCGGTCGGTTTATCTGCTGGTTTATCTGTTGGTCCTCCAGCAGGTTTAT
CTGCTGGTCCTCCAGCTGGTTTATTTCCTGGTTTATCTGTTGGTCCTCCAGCGGGTTTAT
CTTTTGGTTTATGAGCTGGTTCTCCAGCTGGTTTACTTCCTGGTTTATTTGTTGGTCCTC
CAGCAGGTTTATCTGGTTTATGTGCTGGTCCTCCAGCTGGTTTACTTCCTGGTTTATCTG
TTGCTTCTCCATCCGGTTTACCTCCTGGCTTATCTGCTGCTCCTGCAGCCGGTTTACCTC
CTGGCTTATCTGCTGCTCCTCCAGCCGGTTTATCTTCTGGCTTATCGGTTGCTCCTCCAG
CTGGTTTATCATTTGGCATACTTGTTGCTTCTCCAGCTGGTTTATCATTTGGTTTATCTG
TTGCTCCACCAGCTGGTTTAGCTGCTTCGGTGGGTGGAGCTCCTGCTGGAGGTGGATTAT
TCTTCGGGTGTACTCCCATTCTATGC

QA 1 686 1 686
DS 



CO CL576Contig2 826 5 29 U
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AAATATAGTACCCATTCAAACCAAATTTCAGCCGTTGTAATCTAAATCTATATCCAAAAG
AATGCTCTCTCGTCTCATCCCAATTTTTCAGGTTTTTCAGGTTGTTAGTGCTGTCATTGT
AACTGCAGTCTTGTTTGCTTTGGCCGGCGTAACCCTCGCCGTCTCAGTCGTGGGATTAAT
CGTAGCCACACCTCTTTTCGTGATATTCAGTCCGGTTCTCGTACCAGCAACTATAGCTAC
CACTCTCTTAGCCACCAATCTCTCGGCCGTTGCCTTATTTGGAGTGACGGCGGGTGCTCT
CATAGTTTGGCTCCTTAAGCATAGAATGGGAGTACACCCGAAGAATAATCCACCTCCAGC
AGGAGCTCCACCCACCGAAGCAGCTAAACCAGCTGGTGGAGCAACAGATAAACCAAATGA
TAAACCAGCTGGAGAAGCAACAAGTATGCCAAATGATAAACCAGCTGGAGGAGCAACCGA
TAAGCCAGAAGATAAACCGGCTGGAGGAGCAGCAGATAAGCCAGGAGGTAAACCGGCTGC
AGGAGCAGCAGATAAGCCAGGAGGTAAACCGGATGGAGAAGCAACAGATAAACCAGGAAG
TAAACCAGCTGGAGGACCAGCACATAAACCAGATAAACCTGCTGGAGGACCAACAAATAA
ACCAGGAAGTAAACCAGCTGGAGA*CCAGCTCATAACCAAAGATAAACCGCTGGAGACCA
CAGATAAAAAGAATAACCAGCTGGAGACAGCAGATAACTGCTGAGA


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 15 5 30 15 30 30 30 5 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RS1B994TF U 2
AF RS1AO63TFB U 44
AF RS1DO57TF U 41
AF RS1DV78TF U 1
AF RS1AF78TF U 154
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BS 444 707 RS1DV78TF
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BS 791 803 RS1DV78TF
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BS 805 826 RS1DV78TF

RD RS1B994TF 732 0 0
GAC
ACAACCATTCGAACAGAGCCAAGTATTCCTTCAAAATTTTTAACCATAATAAAATAAAAT
ATAGTACCCATTCAAACCAAATTTCAGCCGTTGTAATCTAAATCTATATCCAAAAGAATG
CTCTCTCGTCTCATCCCAATTTTTCAGGTTTTTCAGGTTGTTAGTGCTGTCATTGTAACT
GCAGTCTTGTTTGCTTTGGCCGGCGTAACCCTCGCCGTCTCAGTCGTGGGATTAATCGTA
GCCACACCTCTTTTCGTGATATTCAGTCCGGTTCTCGTACCAGCAACTATAGCTACCACT
CTCTTAGCCACCAATCTCTCGGCCGTTGCCTTATTTGGAGTGACGGCGGGTGCTCCCATA
GTTTGGCTCCTTAAGCATAGAATGGGAGTACACCCGAAGAATAATCCACCTCCAGCAGGA
GCTCCACCCACCGAAGCAGCTAAACCAGCTGGTGGAGCAACAGATAAACCAAATGATAAA
CCAGCTGGAGAAGCAACAAGTATGCCAAATGATAAACCAGCTGGAGGAGCAACCGATAAG
CCAGAAGATAAACCGGCTGGAGGAGCAGCAGATAAGCCAGGAGGTAAACCGGCTGCAGGA
GCAGCAGATAAGCCAGGAGGTAAACCGGATGGAGAAGCAACAGATAAACCAGGAAGTAAA
CCAGCTGGAGGAC*AGCACATAAACCAGATAAACCTGCTGGAGGAGCAGCAAATAAACC
GGCTGAAAAC

QA 4 722 4 722
DS 

RD RS1AO63TFB 722 0 0
G
TAACCAAAATAAAATAAAATATAGTACCCATTCAAACCAAATTTCAGCCGTTGTAATCTA
AATCTATATCCAAAAGAATGCTCTCTCGTCTCATCCCAATTTTTCAGGTTTTTCAGTTTG
TTAGTGCTGTCATTGTAACTGCAGTCTTGTTTGCTTTGGCCGGCGTAACCCTCGCCGTCT
CAGTCGTGGGGTTAATCGTAGCCACACCTCTTTTCGTGATATTCAGTCCGGTTCTCGTAC
CAGCAACTATAGCTACCACTCTCTTAGCCACCAATCTCTCGGCCGTTGCCTTATTTGGAG
TGACGGCGGGTGCTCTCATAGTTTGGCTCCTTAAGCATAGAATGGGAGTACACCCGAAGA
ATAATCCACCTCCAGCAGGAGCTCCACCCACCGAAGCAGCTAAACCAGCTGGTGGAGCAA
CAGATAAACCAAATGATAAACCAGCTGGAGAAGCAACAAGTATGCCAAATGATAAGCCAG
CTGGAGGAGCAACCGATAAGCCAGAAGATAAACCGGCTGGAGGAGCAGCAGATAAGCCAG
GAGGTAAACCGGCTGCAGGAGCAGCAGATAAGCCAGGAGGTAAACCGGATGGAGAAGCAA
CAGATAAACCAGGAAGTAAACCAGCTGGAGGACCAGCACATAAACCAGATAAACCTGCTG
GAGGACCAACAAATAAACCAGGAAGTAAACCAGCTGGAGAACCAGCTCATAA
ACCAAAAGA

QA 2 713 2 713
DS 

RD RS1DO57TF 724 0 0
TTTT
TAACCAAAATAAAATAAAATATAGTACCCATTCAAACCAAATTTCAGCCGTTGTAATCTA
AATCTATATCCAAAAGAATGCTCTCTCGTCCCATCCCAATTTTTCAGGTTTTTCAGGTTG
TTAGTGCTGTCATTGTAACTGCAGTCTTGTTTGCTTTGGCCGGCGTAACCCTCGCCGTCT
CAGTCGTGGGATTAATCGTAGCCACACCTCTTTTCGTGATATTCAGTCCGGTTCTCGTAC
CAGCAACTATAGCTACCACTCTCTTAGCCACCAATCTCTCGGCCGTTGCCTTATTTGGAG
TGACGGCGGGTGCTCTCATAGTTTGGCTCCTTAAGCATAGAATGGGAGTACACCCGAAGA
ATAATCCACCTCCAGCAGGAGCTCCACCCACCGAAGCAGCTAAACCAGCTGGTGGAGCAA
CAGATAAACCAAATGATAAACCAGCCGGAGAAGCAACAAGTATGCCAAATGATAAACCAG
CTGGAGGAGCAACCGATAAGCCAGAAGATAAACCGGCTGGAGGAGCAGCAGATAAGCCAG
GAGGTAAACCGGCTGCAGGAGCAGCAGATAAGCCAGGAGGTAAACCGGATGGAGAAGCAA
CAGATAAACCAGGAAGTAAACCAGCTGGAGGACCAGCACATAAACCAGATAAACCTGCTG
GAGGAC*AACAA*TAAACCAGGAAGTAA*CCAGCTGGAGA*CCAGCTCATAA
CCAAAAGA

QA 5 716 5 716
DS 

RD RS1DV78TF 826 0 0
AGGGACAACCATTCGAACAGAGCCAAGTATTCCTTCAAAATTTTTAACCAAAATAAAATA
AAATATAGTACCCATTCAAACCAAATTTCAGCCGTTGTAATCTAAATCTATATCCAAAAG
AATGCTCTCTCGTCTCATCCCAATTTTTCAGGTTTTTCAGGTTGTTAGTGCTGTCATTGT
AACTGCAGTCTTGTTTGCTTTGGCCGGCGTAACCCTCGCCGTCTCAGTCGTGGGATTAAT
CGTAGCCACACCTCTTTTCGTGATATTCAGTCCGGCTCTCGTACCAGCAACTATAGCTAC
CACTCTCTTAGCCACCAATCTCTCGGCCGTTGCCTTATTTGGAGTGACGGCGGGTGCTCT
CATAGTTTGGCTCCTTAAGCATAGAATGGGAGTACACCCGAAGAATAATCCACCTCCAGC
AGGAGCTCCACCCACCGAAGCAACTAAACCAGCTGGTGGAGCAACAGATAAACCAAATGA
TAAACCAGCTGGAGAAGCAACAAGTATGCCAAATGATAAACCAGCTGGAGGAGCAACCGA
TAAGCCAGAAGATAAACCGGCTGGAGGAGCAGCAGATAAGCCAGGAGGTAAACCGGCTGC
AGGAGCAGCAGATAAGCCAGGAGGTAAACCGGATGGAGAAGCAACAGATAAACCAGGAAG
TAAACCAGCTGGAGGACCAGCACATAAACCAGATAAACCTGCTGGAG*AC*AACAA*TAA
ACCAGGA*GTAAAC*AGCTGGAGA*CCA*CTCATAAC*AAAGATAACCCGCTGGAGAC*A
CAGATAACAGGAATAACCAGCTG*AGACAGCAGATAACTGCTGAGA

QA 1 826 1 826
DS 

RD RS1AF78TF 669 0 0
TTTTCAGGTTGTTAGTGCTGTCATTGTAACTGCAGTCTTGTTTGCTTTGGCCGGCGTAAC
CCTCGCCGTCTCAGTCGTGGGATTGATCGTAGCCACACCTCTTTTCGTGATATTCAGTCC
GGTTCTCGTACCAGCAACTATAGCTACCACTCTCTTAGCCACCAATCTCTCGGCCGTTGC
CTTATTTGGAGTGACGGCGGGTGCTCTCATAGTTTGGCTCCTTAAGCATAGAATGGGAGT
ACACCCGAAGAATAATCCACCTCCAGCAGGAGCTCCACCCACCGAAGCAGCTAAACCAGC
TGGTGGAGCAACAGATAAACCAAATGATAAACCAGCTGGAGAAGCAACAAGTATGCCAAA
TGATAAACCAGCTGGAGGAGCAACCGATAAGCCAGAAGATAAACCGGCTGGAGGAGCAGC
AGATAAGCCAGGAGGTAAACCGGCTGCAGGAGCAGCAGATAAGCCAGGAGGTAAACCGGA
TGGAGAAGCAACAGATAAACCAGGAAGTAAACCAGCTGGAGGACCAGCACATAAACCAGA
TAAACCTGCTGGAG*ACCAACAAATAAACCAGGAAGTAAACCAGCTGGAGA*CCAGCTCA
TAACCAAAGATAAACCGCTGGAGACCACAGATAAACAGAATAACCAGCTGGAGACAGCAG
ATAACTGCT

QA 1 669 1 669
DS 



AS 2 8

CO CL577Contig1 730 5 3 U
GGAATCAATTGAGACACTAGACATAAGAAGAGATATAGAGATCTGGTCATTTGGAAGATT
AGCAAAAAATGGCATCATCGGAGCAAAAGTTGGTAGAAGAAAACGGGTCGGTGATTTCAA
GCTTGTTGGATAAAGCCAAAGGTTTCATTGCGGAGAAGCTAGCCAATATTCCAACGCCGG
AAGCCACCGTTGACGACGTTGATTTCAAAGGCGTGTCACGTCAAGGTGTTGATTATCACG
CCAAGGTCTCCGTCAAGAATCCTTACTCTCAATCCATCCCTATTTGCCAGATCTCTTACA
TCCTCAAGAGTGCCACAAGGACGATCGCATCGGGCACGATACCGGACCCGGGTTCGTTGG
TCGGGAAGGGCACCACGGTTCTGGACGTACCGGTTAAGGTGGCTTATGGCATAGCGGTTA
GTCTAATGAAGGACATCGGCTCGGACTGGGACATTGACTATCAACTTGACATTGGTCTAA
CCATCGACATTCCTGTTGTTGGTGACATTACCATTCCTGTGTCTACTCAGGGTGAGATCA
AGCTCCCTTCCCTTCGCGACTTCTTTTAATTTCAACTGTGTTCTTCTTAATTATAATCTA
CTTTTCAATAAAACATAGACGACCACATGAATGTTTCAGTCTGGATTTCTCTTTTGTTGG
TTTTGTTATTGGGTTGTTTAAGTACTTTGATTGGTTATTTATGTTTCCGTGGTATGTGAT
TTACATTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D955TF U 1
AF RS1DO87JQ C 9
AF RS1FA28TF U 47
AF RS1DO87TF U 9
AF RS1D955JQ C 251
BS 1 241 RS1D955TF
BS 242 711 RS1FA28TF
BS 712 730 RS1D955JQ

RD RS1D955TF 241 0 0
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AGCAAAAAATGGCATCATCGGAGCAAAAGTTGGTAGAAGAAAACGGGTCGGTGATTTCAA
GCTTGTTGGATAAAGCCAAAGGTTTCATTGCGGAGAAGCTAGCCAATATTCCAACGCCGG
AAGCCACCGTTGACGACGTTGATTTCAAAGGCGTGTCACGTCAAGGTGTTGATTATCACG
C

QA 1 241 1 241
DS 

RD RS1DO87JQ 704 0 0
GG
GAGACACTAGACATAAGAAGAGATATAGAGATCTGGTCATTTGGAAGATTAGCAAAAAAT
GGCATCATCGGAGCAAAAGTTGGTAGAAGAAAACGGGTCGGTGATTTCAAGCTTGTTGGA
TAAAGCCAAAGGTTTCATTGCGGAGAAGCTAGCCAATATTCCAACGCCGGAAGCCACCGT
TGACGACGTTGATTTCAAAGGCGTGTCACGTCAAGGTGTTGATTATCACGCCAAGGTCTC
CGTCAAGAATCCTTACTCTCAATCCATCCCTATTTGCCAGATCTCTTACATCCTCAAGAG
TGCCACAAGGACGATCGCATCGGGCACGATACCGGACCCGGGTTCGTTGGTCGGGAAGGG
CACCACGGTTCTGGACGTACCGGTTAAGGTGGCTTATGGCATAGCGGTTAGTCTAATGAA
GGACATCGGCTCGGACTGGGACATTGACTATCAACTTGACATTGGTCTAACCATCGACAT
TCCTGTTGTTGGTGACATTACCATTCCTGTGTCTACTCAGGGTGAGATCAAGCTCCCTTC
CCTTCGCGACTTCTTTTAATTTCAACTGTGTTCTTCTTAATTATAATCTACTTTTCAATA
AAACATAGACGACCACATGAATGTTTCAGTCTGGATTTCTCTTTTGTTGGTTTTGTTATT
GGGTTGTTTAAGTACTTTGATTGGTTATTTATGTTTCCGTG
G

QA 3 703 3 703
DS 

RD RS1FA28TF 665 0 0
TCATTTGGAAGATTAGCAAAAA*TGGCATCATCGGAGCAAAAGTTGGTAGAAGAAAACGG
GTCGGTGATTTCAAGCTTGTTGGATAAAGCCAAAGGTTTCATTGCGGAGAAGCTAGCCAA
TATTCCAACGCCGGAAGCCACCGTTGACGACGTTGATTTCAAAGGCGTGTCACGTCAAGG
TGTTGATTATCACGCCAAGGTCTCCGTCAAGAATCCTTACTCTCAATCCATCCCTATTTG
CCAGATCTCTTACATCCTCAAGAGTGCCACAAGGACGATCGCATCGGGCACGATACCGGA
CCCGGGTTCGTTGGTCGGGAAGGGCACCACGGTTCTGGACGTACCGGTTAAGGTGGCTTA
TGGCATAGCGGTTAGTCTAATGAAGGACATCGGCTCGGACTGGGACATTGACTATCAACT
TGACATTGGTCTAACCATCGACATTCCTGTTGTTGGTGACATTACCATTCCTGTGTCTAC
TCAGGGTGAGATCAAGCTCCCTTCCCTTCGCGACTTCTTTTAATTTCAACTGTGTTCTTC
TTAATTATAATCTACTTTTCAATAAAACATAGACGACCACATGAATGTTTCAGTCTGGAT
TTCTCTTTTGTTGGTTTTGTTATTGGGTTGTTTAAGTACTTTGATTGGTTATTTATGTTT
CCGTG

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1DO87TF 706 0 0
GG
GAGACACTAGACATAAGAAGAGATATAGAGATCTGGTCATTTGGAAGATTAGCAAAAAAT
GGCATCATCGGAGCAAAAGTTGGTAGAAGAAAACGGGTCGGTGATTTCAAGCTTGTTGGA
TAAAGCCAAAGGTTTCATTGCGGAGAAGCTAGCCAATATTCCAACGCCGGAAGCCACCGT
TGACGACGTTGATTTCAAAGGCGTGTCACGTCAAGGTGTTGATTATCACGCCAAGGTCTC
CGTCAAGAATCCTTACTCTCAATCCATCCCTATTTGCCAGATCTCTTACATCCTCAAGAG
TGCCACAAGGACGATCGCATCGGGCACGATACCGGACCCGGGTTCGTTGGTCGGGAAGGG
CACCACGGTTCTGGACGTACCGGTTAAGGTGGCTTATGGCATAGCGGTTAGTCTAATGAA
GGACATCGGCTCGGACTGGGACATTGACTATCAACTTGACATTGGTCTAACCATCGACAT
TCCTGTTGTTGGTGACATTACCATTCCTGTGTCTACTCAGGGTGAGATCAAGCTCCCTTC
CCTTCGCGACTTCTTTTAATTTCAACTGTGTTCTTCTTAATTATAATCTACTTTTCAATA
AAACATAGACGACCACATGAATGTTTCAGTCTGGATTTCTCTTTTGTTGGTTTTGTTATT
GGGTTGTTTAAGTACTTTGATTGGTTATTTATGTTTCCGTG
GAA

QA 3 703 3 703
DS 

RD RS1D955JQ 480 0 0
CGTCAAGAATCCTTACTCTCAATCCATCCCTATTTGCCAGATTTCTTACATCCTCAAGAG
TGCCACAAGGACGATCGCATCGGGCACGATACCGGACCCGGGTTCGTTGGTCGGGAAGGG
CACCACGGTTCTGGACGTACCGGTTAAGGTGGCTTATGGCATAGCGGTTAGTCTAATGAA
GGACATCGGCTCGGACTGGGACATTGACTATCAACTTGACATTGGTCTAACCATCGACAT
TCCTGTTGTTGGTGACATTACCATTCCTGTGTCTACTCAGGGTGAGATCAAGCTCCCTTC
CCTTCGCGACTTCTTTTAATTTCAACTGTGTTCTTCTTAATTATAATCTACTTTTCAATA
AAACATAGACGACCACATGAATGTTTCAGTCTGGATTTCTCTTTTGTTGGTTTTGTTATT
GGGTTGTTTAAGTACTTTGATTGGTTATTTATGTTTCCGTGGTATGTGATTTACATTTTT

QA 1 480 1 480
DS 



CO CL577Contig2 707 3 9 U
GGAAACACAAATCTTATACTATAATCAATTGAGACACTAGACATAAGAAGAGATAGAGAT
CTGGTCATTTGGAAGATTAGCAAAAAAA*TGGCATCATCGGAGCAAAAGTTGGTAGAGGA
AAACGGGTCGGTGATTTCAAGCTTGTTGGATAAAGCCAAAGGTTTCATTGCGGAGAAGCT
AGCCAATATTCCCACGCCGGAAGCTACCGTTGACGACGTTGATTTCAAAGGCGTGTCACG
TCAAGGTGTTGATTATCACGCCAAGGTCTCCGTCAAGAATCCTTACTCTCAATCCATCCC
TATTTGCCAGATCTCTTACATCCTCAAGAGTGCCACAAGGACGATCGCATCGGGCACGAT
ACCGGACCCGGGTTCGTTGGTTGGGAAGGGCACCACGGTTCTGGACGTACCGGTTAAGGT
GGCTTATGGCATAGCGATTAGTCTAATGAAGGACATCGGCTCGGACTGGGACATTGACTA
TCAACTTGACATTGGTCTAACCATCGACATTCCAGTTGTTGGTGACATTACCATTCCTGT
GTCTACTCAGGGTGAGATCAAGCTCCCTTCCCTTCGCGACTTCTTTTAATTTCTACTATG
TTCTTCTTAATTATAATCTAATTTTCAATAAAAACATAGACGATCACATGATGTTTCAGT
TCTGGATTTCTCTTTTGTTGGTTTTGTTATTGGGTTGTTTAAGTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1EQ51TF U 1
AF RS1EC72JQ C 25
AF RS1EC72TF U 25
BS 1 88 RS1EQ51TF
BS 89 89 RS1EC72TF
BS 90 179 RS1EQ51TF
BS 180 180 RS1EC72TF
BS 181 659 RS1EQ51TF
BS 660 660 RS1EC72TF
BS 661 684 RS1EQ51TF
BS 685 685 RS1EC72TF
BS 686 707 RS1EQ51TF

RD RS1EQ51TF 707 0 0
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CTGGTCATTTGGAAGATTAGCAAAAAAAATGGCATCATCGGAGCAAAAGTTGGTAGAGGA
AAACGGGTCGGTGATTTCAAGCTTGTTGGATAAAGCCAAAGGTTTCATTGCGGAGAAGCC
AGCCAATATTCCCACGCCGGAAGCTACCGTTGACGACGTTGATTTCAAAGGCGTGTCACG
TCAAGGTGTTGATTATCACGCCAAGGTCTCCGTCAAGAATCCTTACTCTCAATCCATCCC
TATTTGCCAGATCTCTTACATCCTCAAGAGTGCCACAAGGACGATCGCATCGGGCACGAT
ACCGGACCCGGGTTCGTTGGTTGGGAAGGGCACCACGGTTCTGGACGTACCGGTTAAGGT
GGCTTATGGCATAGCGATTAGTCTAATGAAGGACATCGGCTCGGACTGGGACATTGACTA
TCAACTTGACATTGGTCTAACCATCGACATTCCAGTTGTTGGTGACATTACCATTCCTGT
GTCTACTCAGGGTGAGATCAAGCTCCCTTCCCTTCGCGACTTCTTTTAATTTCTACTATG
TTCTTCTTAATTATAATCTAATTTTCAATAAAAACATAGACGATCACATGATGTTTCAGC
TCTGGATTTCTCTTTTGTTGGTTT*GTTATTGGGTTGTTTAAGTACT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1EC72JQ 683 0 0
GG
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AA*TGGCATCATCGGAGCAAAAGTTGGTAGAGGAAAACGGGTCGGTGATTTCAAGCTTGT
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CCGTTGACGACGTTGATTTCAAAGGCGTGTCACGTCAAGGTGTTGATTATCACGCCAAGG
TTTCCGTCAAGAATCCTTACTCTCAATCCATCCCTATTTGCCAGATCTCTTACATCCTCA
AGAGTGCCACAAGGACGATCGCATCGGGCACGATACCGGACCCGGGTTCGTTGGTTGGGA
AGGGCACCACGGTTCTGGACGTACCGGTTAAGGTGGCTTATGGCATAGCGATTAGTCTAA
TGAAGGACATCGGCTCGGACTGGGACATTGACTATCAACTTGACATTGGTCTAACCATCG
ACATTCCAGTTGTTGGTGACATTACCATTCCTGTGTCTACTCAGGGTGAGATCAAGCTCC
CTTCCCTTCGCGACTTCTTTTAATTTCTACTATGTTCTTCTTAATTATAATCTAATTTTC
AATAAAAACATAGACGATCACATGATGTTTCAGTTCTGGATTTCTCTTTTGTTGGTTTTG
TTATTGGGTTGTTTAAGTACT

QA 3 683 3 683
DS 

RD RS1EC72TF 683 0 0
GG
AATTGAGACACTAGACATAAGAAGAGATAGAGATCTGGTCATTTGGAAGATTAGCAAAAA
AA*TGGCATCATCGGAGCAAAAGTTGGTAGAGGAAAACGGGTCGGTGATTTCAAGCTTGT
TGGATAAAGCCAAAGGTTTCATTGCGGAGAAGCTAGCCAATATTCCCACGCCGGAAGCTA
CCGTTGACGACGTTGATTTCAAAGGCGTGTCACGTCAAGGTGTTGATTATCACGCCAAGG
TCTCCGTCAAGAATCCTTACTCTCAATCCATCCCTATTTGCCAGATCTCTTACATCCTCA
AGAGTGCCACAAGGACGATCGCATCGGGCACGATACCGGACCCGGGTTCGTTGGTTGGGA
AGGGCACCACGGTTCTGGACGTACCGGTTAAGGTGGCTTATGGCATAGCGATTAGTCTAA
TGAAGGACATCGGCTCGGACTGGGACATTGACTATCAACTTGACATTGGTCTAACCATCG
ACATTCCAGTTGTTGGTGACATTACCATTCCTGTGTCTACTCAGGGTGAGATCAAGCTCC
CTTCCCTTCGCGACTTCTTTTAATTTCTACTATGTTCTTCTTAATTATAATCTAATTTTC
AATAAAAACATAGACGATCACATGATGTTTCAGTTCTGGATTTCTCTTTTGTTGGTTTTG
TTATTGGGTTGTTTAAGTACT

QA 3 683 3 683
DS 



AS 1 7

CO CL578Contig1 1392 7 34 U
GGACTCAAGCAAACAAATATTCATTACTTTCTTCCTTCTCAGATCCGTCTCAAAGCTTAA
GCTTTTTTTTTCCTAAATCGAGTGCAAGCAACCATGGACGGTGGAGCAGAAGGAACTCAG
CAGCCTCACCTTATACTAGCTCACAAGCTCTTTCTCCTCACCCATCCAGATGTCCAAGAC
ATCGAAAAAGTCCAGCTCAAGTCTGACGTCTTGGATTCCATCAAATCCGATGGGATGGCT
CCATTGTACGAAACCCTAGCGGCGTCTTCTGTTCTGGAGTTGGATCAGAGCTTGTTGGAT
TCCATGCGCGCTAACAACGAGGAGGAGCTTAAAAAGCTCGACGACAAGATTGCAGATGCT
GAAGAAAATTTGGGGGAAAGTGAAGTCCGTGAAGCTCATCTTGCTAAGGCTCTCTATTTC
ATCAGGATTAGTGATAAGGAGAAAGCTTTAGAGCAACTGAAACTCACTGAAGGAAAAACC
GTTGCTGTTGGCCAAAAGATGGATTTGGTCTTCTATACGCTCCAGCTTGCCTTCTTCTAC
ATGGACTTTGATCTGGTATCCAAGAGCATTGACAAAGCTAAAAAGTTGTTTGAAGAGGGC
GGTGACTGGGAGAGAAAGAACAGGCTAAAGGTCTATGAAGGCTTGTATTGCATGTCCACC
AGAAATTTTAAGAAAGCTGCCAGCTTATTTCTAGATTCCATTTCAACCTTCACGACTTAT
GAGATATTTCCCTACGAGACTTTCATCTTCTACACCGTCCTGACGAGCATCATAACTCTC
GACAGAGTTTCCCTTAAGCAGAAGGTTGTTGATGCACCTGAAATCTTGACCGTGCTTGGG
AAGATTCCATTCCTTTCCGAGTTCCTGAACTCCCTGTACGAGTGCCAGTACAAGGCGTTT
TTCTCCGCATTTGCGGGAATGGCGGAGCAGATAAAGTTTGACCGTTACTTGAACCCACAT
TTCCGATTCTACATGAGGGAAGTGAGAACGGTGGTGTACTCTCAGTTTCTGGAATCTTAC
AAGAGCGTTACTGTCGATGCCATGGCAAATGCGTTTGGTGTTTCGGTTGATTTCATTGAT
CAGGAGCTGTCACGTTTCATTGCAGCTGGGATGCTTCACTGCAAGATAGACAAGGTGGCA
GGTGTGTTGGAGACAAACCGTCCAGATGCAAAGAATGCGCTTTACCAGGCAACGATCAAG
CAAGGAGATTTTTTGCTAAACAGGATCCAGAAGCTCTCTCGTGTCATCGATCTGTGAACC
ATGTCACACATGTTTCTTTTTCGTTTTTTTTTCTTCTTCAAAATTGCAACTTGGATACAC
AGACGGCAGAATCTTCTTAAGGTTTGAGAACCGATATTCGAGATCAAAATACTAGTCGGG
TTCCCTTGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

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AF RS1D187TF U 60
AF RS1A650TF U 72
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AF RS1D793JQ C 736
AF RS1A650JQ C 671
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ATCGAGAAAGTCCAGCTCAAGTCTGACGTCTTGGATTCCATCAAATCCGATGGGATGGCT
CCATTGTACGAAACCCTAGCGGCGTCTTCGGTTCTGGAGCTGGATCAGAGTTTGTTGGAT
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GAAGAAAATTTGGGGGAAAGTGAAGTCCGTGAAGCCCATCTTGCTAAGGCTCTCTATTTC
ATCAGGATTAGTGATAAGGAGAAAGCTTTAGAGCAACTGAAACTCACTGAAGGAAAAACC
GTTGCTGTTGGGCAAAAAATGGATTTGGTCTTCTATACGCTCCAGCTTGCCTTCTTCTAC
ATGGACTTCGATCTGGTATCCAAGAGCATTGACAAAGCTAAAAAGTTGTTTGAAGAGGGT
GGTGACTGGGAGAGAAAGAACAGGCTAAAGGTCTAT

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DS 

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TACGAAACCCTAGCGGCGTCTTCTGTTCTGGAGTTGGATCAGAGCTTGTTGGATTCCATG
CGCGCTAACAACGAGGAGGAGCTTAAAAAGCTCGACGACAAGATTGCAGATGCTGAAGAA
AATTTGGGGGAAAGTGAAGTCCGTGAAGCTCATCTTGCTAAGGCTCTCTATTTCATCAGG
ATTAGTGATAAGGAGAAAGCTTTAGAGCAACTGAAACTCACTGAAGGAAAAACCGTTGCT
GTTGGCCAAAAGATGGATTTGGTCTTCTATACGCTCCAGCTTGCCTTCTTCTACATGGAC
TTTGATCTGGTATCCAAGAGCATTGACAAAGCTAAAAAGTTGTTTGAAGAGGGCGGTGAC
TGGGAGAGAAAGA

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DS 

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TTTTTTC
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CACCTTATACTAGCTCACAAGCTCTTTCTCCTCACCCATCCAGATGTCCAAGACATCGAA
AAAGTCCAGCTCAAGTCTGACGTCTTGGATTCCATCAAATCCGATTGGATGGCTCCATTG
TACGAAACCCTAGCGGCGTCTTCTGTTCTGGAGTTGGATCAGAGCTTGTTGGATTCCATG
CGCGCTAACAACGAGGAGGAGCTTAAAAAGCTCGACGACAAGATTGCAGATGCTGAAGAA
AATTTGGGGGAAAGTGAAGTCCGTGAAGCTCATCTTGCTAAGGCTCTCTATTTCATCAGG
ATTAGTGATAAGGAGAAAGCTTTAGAGCAACTGAAACTCACTGAAGGAAAAACCGTTGCT
GTTGGCCAAAAGATGGATTTGGTCTTCTATACGCTCCAGCTTGCCTTCTTCTACATGGAC
TTTGATCTGGTATCCAAGAGCATTGACAAAGCTAAAAAGTTGTTTGAAGAGGGCGGTGAC
TGGGAGAGAAAGAACAGGCTAAAGGTCTATGAAGGCTTGTATTGCATGTCCACCAGAAAT
TTTAAGAAAGCTGCCAGCTTA

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DS 

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CCTG
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CTAGCGGCGTCTTCCGTTCTGGAGTTGGATCAGAGCTTGTTGGATTCCATGCGCGCTAAC
AACGAGGAGGAGCTTAAAAAGCTCGACGACAAGATTGCAGATGCTGAAGAAAATTTGGGG
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AAGATGGATTTGGTCTTCTATACGCTCCAGCTTGCCTTCTTCTACATGGACTTTGATCTG
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AAGAACAGGCTAAAGGTCTATGAAGGCTTGTATTGCATGTCCACCAGAAATTTTAAGAAA
GCTGCCAGCTTATTTCTAGATTCCATTTCAACCTTCACGACTTATGAGATATTTCCCTAC
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A

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TAACTCTCGACAGAGTTTCCCTTAAGCAGAAGGTTGTTGATGCACCTGAAATCTTGACCG
TGCTTGGGAAGATTCCATTCCTTTCCGAGTTCCTGAACTCCCTGTACGAGTGCCAGTACA
AGGCGTTTTTCTCCGCATTTGCGGGAATGGCGGAGCAGATAAAGTTTGACCGTTACTTGA
ACCCACATTTCCGATTCTACATGAGGGAAGTGAGAACGGTGGTGTACTCTCAGTTTCTGG
AATCTTACAAGAGCGTTACTGTCGATGCCATGGCAAATGCGTTTGGTGTTTCGGTTGATT
TCATTGATCAGGAGCTGTCACGTTTCATTGCAGCTGGGATGCTTCACTGCAAGATAGACA
AGGTGGCAGGTGTGTTGGAGACAAACCGTCCAGATGCAAAGAATGCGCTTTACCAGGCAA
CGATCAAGCAAGGAGATTTTTTGCTAAACAGGATCCAGAAGCTCTCTCGTGTCATCGATC
TGTGAACCATGTCACACATGTTTCTTTTTCGTTTTTTTTTCTTCTTCAAAATTGCAACTT
GGATACACAGACGGCAGAATCTTCTTAAGGTTTGAGAACCGATATTCGAGATCAAAATAC
TAGTCGGGTTCCCTTGTTTG

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DS 

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AGGGAAGTGAGAACGGTGGTGTACTCTCAGTTTCTGGAATCTTACAAGAGCGTTACTGTC
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AACCGTCCAGATGCAAAGAATGCGCTTTACCAGGCAACGATCAAGCAAGGAGATTTTCTG
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CTTTTTCGTTTTTTTTTCTTCTTCAAAATTGCAACTTGGATACACAGACGGCAGAATCTT
CTTAAGGTTTGAGAACCGATATTCGAGATCAAAATACTAGTCGGGTTCCCTTGTTT
G

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DS 

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TCCTTTCCGAGTTCCTGAACTCCCTGTACGAGTGCCAGTACAAGGCGTTTTTTTCCGCAT
TTGCGGGAATGGCGGAGCAGATAAAGTTTGACCGTTACTTGAACCCACATTTCCGATTTT
ACATGAGGGAAGTGAGAACGGTGGTGTACTTTCAGTTTTTGGAATTTTACAAGAGCGTTA
CTGTCGATGCCATGGCAAATGCGTTTGGTGTTTCGGTTGATTTCATTGATCAGGAGCTGT
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TGTTTTTTTTTCGTTTTTTTTTTTTTTTCAAAATTGCAACTTGGATACACAGACGGCAGA
ATTTTTTTAAGGTTTGAGAACCGATATTCGAGATCAAAATACTAGTCGGGTTCCCTTGTT
T

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 7

CO CL579Contig1 1210 7 13 U
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TGTTGTATAGACTTCTAATTTGCACTACTACTTGATAAAAGTGCTTGAAAATAAACAAGA
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AAGACAAAACGCAGAAAGATCTTATTGCTGAGAAGGATGCATCTTAGTTTG***AAGAGG
TAGAAGCCAAACTCTCATCACTAAGCAACTCTTCCCAGAAACCATCGTCCAACTCTCTCT
CGACCACCATATCCTCCTCTTCCTTCACATTCCTCTGCCTTCCATAGCCTTGCATCTCCA
GGGCAAGAGCTTCCAGCTCCGATACCGAAGAACCTCTTCCCCTCTCCGCCGCCTCAACCT
CAAGCTCCTTAACCCTCATGTCTCTCTGCTTAAGTAGCTGATGCAGAAACGAAGGGTTCT
GCATCGCTCTAGCCAAGAAAGACATCATCTTCCTCTGTTTCTCCTCTGCTCCTTCGATCC
TCTGTTCCATTGCTTTGATGTAGCTTTTCGTGGTTTGCTGCTGCTGTCTCAGACTCACCA
GCTCCATCAACAGCAGCTGCTTCTCCTTGCGAAGCTCTGTGCAAGGATCTTGAATAGAAG
AAGACGTGGAAGCCAAGGAAGCTCTTCTCTTGATGTTCTTCAGTAAATGTCTCTGTCCTG
ATAGAAACCCTTCGTTTGCAAACTCCCATTTCTCTGCTTCTATTTTTCTAAAACCATAAG
TGTTGAGCTGTCTGATGAAGCTTGAGAAATTGCTGTGTTTGAAGTGACGAGGGAGAAGAA
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CGATGTGGTCCGTGTTTGGATCCTCCACAATCTCAAATGTCTTGATCAGAAACGGAGGCG
GTCCGATTTCATGCAGTCCTTCGACTGGTTTTGGTGGTGGTGGATCATCTTCTTGGTTGA
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TTCGATCCTTTGATCAGTGACCCAATAAAACCATCTCGGAAATTGGGTTTTTTATGGGAT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 10 40 40 40 40 40 25 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1AT14JQ U 94
AF RS1AT14TF C 94
AF RS1C177JQ U 94
AF RS1C177TF C 94
AF RS1BF78JQ U 1
AF RS1AN49JQ U 14
AF RS1AN49TF C 432
BS 1 144 RS1BF78JQ
BS 145 146 RS1AT14JQ
BS 147 247 RS1BF78JQ
BS 248 248 RS1AN49JQ
BS 249 330 RS1BF78JQ
BS 331 331 RS1AN49JQ
BS 332 464 RS1BF78JQ
BS 465 465 RS1AN49JQ
BS 466 595 RS1BF78JQ
BS 596 596 RS1AN49JQ
BS 597 815 RS1BF78JQ
BS 816 853 RS1AN49JQ
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RD RS1AT14JQ 666 0 0
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CTCTTCCCCTCTCCGCCGCCTCATCCTCAAGCTCCTTAACCCTCATGTCTCTCTGCCTAA
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GCTCTGTGCAAGGATCTTGAATCGATGAAGACGTGGAAGCCAAGGAAGCTCTTCTCTTGA
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CTGC
CC

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DS 

RD RS1AT14TF 666 0 0
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AAAAGAAAAGCTTCAAAGTACAACTAAAAGACAAAACGCAGAAAGATCTTATTGCTGAGA
AGGATGCATCTTAGTTTGTTGAAGAGGTAGAAGCCAAACTCTCATTACTAAGCAACTCTT
CCCAGAAACCATCGTCCAACTCTCTCTCGACCACCATATCCTCCTCTTCTTTCACATTCC
TCTGCCTTCCATAGCCTTGCATCTCCAGAGCAAGAGCTTCCAGCTCCGATACCGAAGAAC
CTCTTCCCCTCTCCGCCGCCTCATCCTCAAGCTCCTTAACCCTCATGTCTCTCTGCCTAA
GTAGCTGATGCAGAAACGAAGGGCTCTGCATCGCTCTAGCCAAGAAAGACATCATCTTCC
TCTGTTTCTTCTCTGCTCCTTCGATCCTCTGTTCCATTGCTTTGATGTAGCTTTTCGTGG
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GCTCTGTGCAAGGATCTTGAATCGATGAAGACGTGGAAGCCAAGGAAGCTCTTCTCTTGA
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CTGC
CC

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DS 

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CCCAGAAACCATCGTCCAACTCTCTCTCGACCACCATATCCTCCTCTTCCTTCACATTCC
TCTGCCTTCCATAGCCTTGCATCTCCAGGGCAAGAGCTTCCAGCTCCGATACCGAAGAAC
CTCTTCCCCTCTCCGCCGCCTCAACCTCAAGCTCCTTAACCCTCATGTCTCTCTGCTTAA
GTAGCTGATGCAGAAACGAAGGGTTCTGCATCGCTCTAGCCAAGAAAGACATCATCTTCC
TCTGTTTCTCCTCTGCTCCTTCGATCCTCTGTTCCATTGCTTTGATGTAGCTTTTCGTGG
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GCTCTGTGCAAGGATCTTGAATAGAAGAAGACGTGGAAGCCAAGGAAGCTCTCCTCTTGA
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CT
CC

QA 1 662 1 662
DS 

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AAAAGAAAAGCTTCAAAGTACAACTAAAAGACAAAACGCAGAAAGATCTTATTGCTGAGA
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CCCAGAAACCATCGTCCAACTCTCTCTCGACCACCATATCCTCCTCTTCCTTCACATTCC
TCTGCCTTCCATAGCCTTGCATCTCCAGGGCAAGAGCTTCCAGCTCCGATACCGAAGAAC
CTCTTCCCCTCTCCGCCGCCTCAACCTCAAGCTCCTTAACCCTCATGTCTCTCTGCTTAA
GTAGCTGATGCAGAAACGAAGGGTTCTGCATCGCTCTAGCCAAGAAAGACATCATCTTCC
TCTGTTTCTCCTCTGCTCCTTCGATCCTCTGTTCCATTGCTTTGATGTAGCTTTTCGTGG
TTTGATGCTGCTGTCTCAGACTCACCAGCTCCATCAACAGCAGCTGCTTCTCCTTGCGAA
GCTCTGTGCAAGGATCTTGAATAGAAGAAGACGTGGAAGCCAAGGAAGCTCTCCTCTTGA
TGTTCTTCAGTAAATGTCTCTGTCCTGATAGAAACCCTTCGTTTGCAAACTCCCATTTCT
CT
CC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RS1BF78JQ 815 0 0
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TGTTGTATAGACTTCTAATTTGCACTACTACTTGATAAAAGTGCTTGAAAATAAACAAGA
GAACAAAAAGGTGGTGAAAAAAAAAA*GAGAAGAAAAGAAAAGCTTCAAAGTACAACTAA
AAGACAAAACGCAGAAAGATCTTATTGCTGAGAAGGATGCATCTTAGTTTG***AAGAGG
TAGAAGCAAAACTCTCATCACTAAGCAACTCTTCCCAGAAACCATCGTCCAACTCTCTCT
CGACCACCATATCCTCCTCTTCCTTCACATACCTCTGCCTTCCATAGCCTTGCATCTCCA
GGGCAAGAGCTTCCAGCTCCGATACCGAAGAACCTCTTCCCCTCTCCGCCGCCTCAACCT
CAAGCTCCTTAACCCTCATGTCTCTCTGCTTAAGTAGCTGATGCGGAAACGAAGGGTTCT
GCATCGCTCTAGCCAAGAAAGACATCATCTTCCTCTGTTTCTCCTCTGCTCCTTCGATCC
TCTGTTCCATTGCTTTGATGTAGCTTTTCGTGGTTTGCTGCTGCTGTCTCAGACTTACCA
GCTCCATCAACAGCAGCTGCTTCTCCTTGCGAAGCTCTGTGCAAGGATCTTGAATAGAAG
AAGACGTGGAAGCCAAGGAAGCTCTTCTCTTGATGTTCTTCAGTAAATGTCTCTGTCCTG
ATAGAAACCCTTCGTTTGCAAACTCCCATTTCTCTGCTTCTATTTTTCTAAAACCATAAG
TGTTGAGCTGTCTGATGAAGCTTGAGAAATTGCTG

QA 1 815 1 815
DS 

RD RS1AN49JQ 845 0 0
A
TAGAACATTTCATATAGTTATCTACGTACATGAAAGAATTACAACGTGTTGTATAGACTT
CTAATTTGCACTACTACTTGATAAAAGTGCTTGAAAATAAACAAGAGAACAAAAAGGTGG
TGAAAAAAAAAAAGAGAAGAAAAGAAAAGCTTCAAAGTACAACTAAAAGACAAAACGCAG
AAAGATCTTATTGCTGAGAAGGATGCATCTTAGTTTG***AAGAGGTAGAAGCCAAACTC
TCATCACTAAGCAACTCTTCCCAGAAACCATCGTCCAACTCTCTCTCGACCACCATATCC
TCCTCTTCCTTCACATTCCTCTGCCTTCCATAGCCTTGCATCTCCAGGGCAAGAGCTTCC
AGCTCCGATACCGAAGAACCTCTTCCCCTCTCCGCCGCCTCCACCTCAAGCTCCTTAACC
CTCATGTCTCTCTGCTTAAGTAGCTGATGCAGAAACGAAGGGTTCTGCATCGCTCTAGCC
AAGAAAGACATCATCTTCCTCTGTTTCTCCTCTGCTCCTTCGATCCTCTGTTCCATTGCT
TTGATGTAGCTTTTCGTGGTTTGCTGCTGCTGTCTCAGACTCACCAGCTCCATCAACAGC
AGCTGCTTCTCCTTGCGAAGCTCTGCGCAAGGATCTTGAATAGAAGAAGACGTGGAAGCC
AAGGAAGCTCTTCTCTTGATGTTCTTCAGTAAATGTCTCTGTCCTGATAGAAACCCTTCG
TTTGCAAACTCCCATTTCTCTGCTTCTATTTTTCTAAAACCATAAGTGTTGAGCTGTCTG
ATGAAGCTTGAGAAATTGCTGTGTTTGAAGTGACGAGGGAGAAGAAACTCAGAGAAAGA
TGCAG

QA 2 840 2 840
DS 

RD RS1AN49TF 779 0 0
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GCCAAGAAAGACATCATCTTCCTCTGTTTCTCCTCTGCTCCTTCGATCCTCTGTTCCATT
GCTTTGATGTAGCTTTTCGTGGTTTGCTGCTGCTGTCTCAGACTCACCAGCTCCATCAAC
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GCCAAGGAAGCTCTTCTCTTGATGTTCTTCAGTAAATGTCTCTGTCCTGATAGAAACCCT
TCGTTTGCAAACTCCCATTTCTCTGCTTCTATTTTTCTAAAACCATAAGTGTTGAGCTGT
CTGATGAAGCTTGAGAAATTGCTGTGTTTGAAGTGACGAGGGAGAAGAAACTCAGAGAAA
GAATGCAGATCCCAGACGACAAAACTAGCGCCTCCTCTGTTCCAAGAGACGATGTGGTCC
GTGTTTGGATCCTCCACAATCTCAAATGTCTTGATCAGAAACGGAGGCGGTCCGATTTCA
TGCAGTCCTTCGACTGGTTTTGGTGGTGGTGGATCATCTTCTTGGTTGAGAAACGGATTC
ATCGATTCTGTGAAAAAAACTAATCAAAGAAATGATTTTTTATTGGTGATTCGATCCTTT
GATCAGTGACCCAATAAAACCATCTCGGAAATTGGGTTTTTTATGGGATTTGAAATTGAA
AAAGTGATTTGATGTTATGGTGCTGACATGGTTGAGAAGTTCGTTTATGTCAGTTGGGA

QA 1 779 1 779
DS 



AS 2 8

CO CL580Contig1 710 4 9 U
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AACAGAGTATCGATGACCATAACATGTAAGAAACAGAGTATTTATTTAATGAAAGAGAGA
ACGAACAAACAAACTCTCTCTCAGTATCCATAATCATAAGCGAACTCGTTGACACCAACC
ATGGCTGAAACGACTTGGGAGACGATGTAGAAGCTTCCACCTAAGATGATCACAATGAGA
ACGGCGGAAATTGGGTTCTTGAGGAGTTCGAAGATGGGCTCGAACACGGCGGAAAGAGCT
CCCGTGCTGACGGTGAGTGCGTAAAGACCGTACCTTCTCACGTTATCCCAAAACCCTTCC
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GCCACCATCAAACCTACGGAGACACCGGTCACCAAAGCTCGTCTCAGTTGCTTCTTCTCC
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GTGGATGCTTCGCACTGAACACGGCGCCACGGTGTTCTGGTGCTTATGGTTGAGCTCGGA
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GAAGATAGTTTCATTTTGGGGAGAGACATCATCATAGTCATCATCCTCCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AL39JQ U 17
AF RS1FB63JQ U 1
AF RS1FB63TF C 1
AF RS1AL39TF C 17
BS 1 209 RS1FB63JQ
BS 210 210 RS1AL39JQ
BS 211 272 RS1FB63JQ
BS 273 273 RS1AL39JQ
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BS 649 699 RS1FB63TF
BS 700 710 RS1AL39TF

RD RS1AL39JQ 584 0 0
G
TGTCAAATAAAATGTAACAAAAGATTATAAGACTAATGCATAAAACAGAGTATCGATGAC
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CTTGAGGAGTTCGAAGATGGGCTCGAACACGGCGGAAAGAGCTCCCGTGCTGACGGTGAG
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GGAGACACCGGTCACCAAAGCTCGTCTCAGTTGCTTCTTCTCCAGAGTCAAAGGTTGTGT
CTTTTCAAGCCTGGCTCTGTTGCTTTCCGCCGTTGATCTTCTTGTGGATGCTTCGCACTG
AACACGGCGCCACGGTGTTCTGGTGCTTATGGTTGAGCTCGGA

QA 2 584 2 584
DS 

RD RS1FB63JQ 653 0 0
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ACGGCGGAAATTGGGTTCTTGAGGAGTTCGAAAATGGGCTCGAACACGGCGGAAAGAGCT
CCCGTGCTGACGGTGAGTGCGTAAAGACCGTACCTTCTCACGTTATCCCAAAACCCTTCC
ATCAAAGGACCTTCCGGTCCTAAAGCCATCGCCTTTTCTCCATCTATTCCTAATGCCAAA
GCCACCATCAAACCTACGGAGACACCGGTCACCAAAGCTCGTCTCAGTTGCTTCTTCTCC
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GTGGATGCTTCGCACTGAACACGGCGCCACGGTGTTCTGGTGCTTATGGTTGAGCTCGGA
GACGACGCCTTAGCTGGTGCTAGTAATCTGCTGCTGCTCAAATGGAGA
AGAAG

QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1FB63TF 701 0 0
GG
GTTGATCCCTTTTTATGTCAAATAAAATGTAACAAAAGATTATAAGACTAATGCATAAAA
CAGAGTATCGATGACCATAACATGTAAGAAACAGAGTATTTATTTAATGAAAGAGAGAAC
GAACAAACAAACTCTCTCTCAGTATCCATAATCATAAGCGAACTCGTTGACACCAACCAT
GGCTGAGACGACTTGGGAGACGATGTAGAAGCTTCCACCTAAGATGATCACAATGAGAAC
GGCGGAGATTGGGTTCTTGAGGAGTTCGAAGATGGGCTCGAACACGGCGGAGAGAGCTCC
CGTGCTGACGGTGAGTGCGTAAAGACCGTACCTTCTCACGTTATCCCAAAACCCTTCCAT
CAGAGGACCTTCCGGTCCTAAAGCCATCGCCTTTTCTCCATCTATTCCTAATGCCAAAGC
CACCATCAAACCTACGGAGACACCGGTCACCAAAGCTCGTCTCAGTTGCTTCTTCTCCAG
AGTCAAAGGTTGTGTCTTTTCAAGCCTGGCTCTGTTGCTTTCCGCCGTTGATCTTCTTGT
GGATGCTTCGCACTGAACACGGCGCCACGGTGTTCTGGTGCTTATGGTTGAGCTCGGAGA
CGACGCCTTAGCTGGTGCTAGTAATCTGCTGCTGCTCAAATGGAGAAGAGGTTGCAGAGA
AGATAGTTTCATTTTGGGGAGAGACATCATCATAGTC
CC

QA 3 699 3 699
DS 

RD RS1AL39TF 694 0 0
G
TGTCAAATAAAATGTAACAAAAGATTATAAGACTAATGCATAAAACAGAGTATCGATGAC
CATAACATGTAAGAAACAGAGTATTTATTTAATGAAAGAGAGAACGAACAAACAAACTCT
CTCTCAGTATCCATAATCATAAGCGAACTCGTTGACACCAACCATGGCTGAGACGACTTG
GGAGACGATGTAGAAGCTTCCACCTAAGATGATCACAATGAGAACGGCGGAGATTGGGTT
CTTGAGGAGTTCGAAGATGGGCTCGAACACGGCGGAGAGAGCTCCCGTGCTGACGGTGAG
TGCGTAAAGACCGTACCTTCTCACGTTATCCCAAAACTCTTCCATCAGAGGACCTTCCGG
TCCTAAAGCCATCGCCTTTTCTCCATCTATTCCTAATGCCAAAGCCATCATCAAACCTAC
GGAGACACCGGTCACCAAAGCTCGTCTCAGTTGCTTCTTCTCCAGAGTCAAAGGTTGTGT
CTTTTCAAGCCTGGCTCTGTTGCTTTCCGCCGTTGATCTTCTTGTGGATGCTTCGCACTG
AACACGGCGCCACGGTGTTCTGGTGCTTATGGTTGAGCTCGGAGACGACGCCTTAGCTGG
TGCTAGTAATCTGCTGCTGCTCAAATGGAGAAGAGGTTGCAGAGAAGATAGTTTCATTTT
GGGGAGAGACATCATCATAGTCATCATCCTCCC

QA 2 694 2 694
DS 



CO CL580Contig2 727 4 4 U
GGAGAGAGAGGATGATGACTATGATGATGTCTCTCCCCAAAATGAAACTATCTTCTCTGC
AACCTCATCTCCATTTGAGCAGCAGCAGATTACTAGCACCAGCTAAGGCGTCGTCTCCGA
GCTCAAGCATAAGCACCAGAACACCGTGCCGCCGTGTTCAGTGCGAAGCATCCAGAAGAA
GAAGAAGATCAACGGTGGAAAGCAACAGAACCAGGCTTGAAAAGACACAACCTTTGTGTC
TGGAGAAGAAGCAACTGAGACAAGCTTTGGTGACTGGTGTCTCCGTAGGTTTGATGATGG
CTTTGGCATTAGGAATAGATGGAGAAAAGGCGATGGCTTTGGGACCGGAAGGTCCTCTGA
TGGAAGAGTTCTGGGACAACGTGAGAAGGTACGGTCTTTACGCACTCACCGTCAGCACGG
GAGCTCTCTCCGCTGTCTTCGAGCCCATCTTCGAACTCCTCAAGAACCCGATCTCCGCCG
TTCTCATCGTGATCATCTTAGGTGGAAGCTTCTACATCGCCTCCCAAGTCGTCTCAGCCA
TGGTTGGTGTCAACGAGTTCGCTTATGATTACGGATACTGAGAGAGAGTTTGTTTGTTCG
TTCTCTCTTTCATTAAATAAATACTCTGTTTCTTACATGTTATGGTCATCGATACTCTGT
TTTATGCATTAGTCTTATAATCTTTTGTTACATTTTATTTGACATAAAAAGGGGTCAACT
TTGTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FL47TF U 1
AF RS1BB40JQ C 116
AF RS1BB40TF U 3
AF RS1FL47JQ C 68
BS 1 519 RS1FL47TF
BS 520 520 RS1BB40TF
BS 521 704 RS1FL47TF
BS 705 727 RS1FL47JQ

RD RS1FL47TF 704 0 0
GGAGAGAGAGGATGATGACTATGATGATGTCTCTCCCCAAAATGAAACTATCTTCTCTGC
AACCTCATCTCCATTTGAGCAGCAGCAGATTACTAGCACCAGCTAAGGCGTCGTCTCCGA
GCTCAAGCATAAGCACCAGAACACCGTGCCGCCGTGTTCAGTGCGAAGCATCCAGAAGAA
GAAGAAGATCAACGGTGGAAAGCAACAGAACCAGGCTTGAAAAGACACAACCTTTGTGTC
TGGAGAAGAAGCAACTGAGACAAGCTTTGGTGACTGGTGTCTCCGTAGGTTTGATGATGG
CTTTGGCATTAGGAATAGATGGAGAAAAGGCGATGGCTTTGGGACCGGAAGGTCCTCTGA
TGGAAGAGTTCTGGGACAACGTGAGAAGGTACGGTCTTTACGCACTCACCGTCAGCACGG
GAGCTCTCTCCGCTGTCTTCGAGCCCATCTTCGAACTCCTCAAGAACCCGATCTCCGCCG
TTCTCATCGTGATCATCTTAGGTGGAAGCTTCTACATCGTCTCCCAAGTCGTCTCAGCCA
TGGTTGGTGTCAACGAGTTCGCTTATGATTACGGATACTGAGAGAGAGTTTGTTTGTTCG
TTCTCTCTTTCATTAAATAAATACTCTGTTTCTTACATGTTATGGTCATCGATACTCTGT
TTTATGCATTAGTCTTATAATCTTTTGTTACATTTTATTTGACA

QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1BB40JQ 552 0 0
TCCGAGCTCAAGCATAAGCACCAGAACACCGTGCCGCCGTGTTCAGTGCGAAGCATCCAG
AAGAAGAAGAAGATCAACGGTGGAAAGCAACAGAACCAGGCTTGAAAAGACACAACCTTT
GTGTCTGGAGAAGAAGCAACTGAGACAAGCTTTGGTGACTGGTGTCTCCGTAGGTTTGAT
GATGGCTTTGGCATTAGGAATAGATGGAGAAAAGGCGATGGCTTTGGGACCGGAAGGTCC
TCTGATGGAAGAGTTCTGGGACAACGTGAGAAGGTACGGTCTTTACGCACTCACCGTCAG
CACGGGAGCTCTCTCCGCTGTCTTCGAGCCCATCTTCGAACTCCTCAAGAACCCGATCTC
CGCCGTTCTCATCGTGATCATCTTAGGTGGAAGCTTCTACATCGCCTCCCAAGTCGTTTC
AGCCATGGTTGGTGTCAACGAGTTCGCTTATGATTACGGATACTGAGAGAGAGTTTGTTT
GTTCGTTCTCTCTTTCATTAAATAAATACTCTGTTTCTTACATGTTATGGTCATCGATAC
TCTGTTTTATGC

QA 1 552 1 552
DS 

RD RS1BB40TF 665 0 0
GGAGA
GAGGATGATGACTATGATGATGTCTCTCCCCAAAATGAAACTATCTTCTCTGCAACCTCA
TCTCCATTTGAGCAGCAGCAGATTACTAGCACCAGCTAAGGCGTCGTCTCCGAGCTCAAG
CATAAGCACCAGAACACCGTGCCGCCGTGTTCAGTGCGAAGCATCCAGAAGAAGAAGAAG
ATCAACGGTGGAAAGCAACAGAACCAGGCTTGAAAAGACACAACCTTTGTGTCTGGAGAA
GAAGCAACTGAGACAAGCTTTGGTGACTGGTGTCTCCGTAGGTTTGATGATGGCTTTGGC
ATTAGGAATAGATGGAGAAAAGGCGATGGCTTTGGGACCGGAAGGTCCTCTGATGGAAGA
GTTCTGGGACAACGTGAGAAGGTACGGTCTTTACGCACTCACCGTCAGCACGGGAGCTCT
CTCCGCTGTCTTCGAGCCCATCTTCGAACTCCTCAAGAACCCGATCTCCGCCGTTCTCAT
CGTGATCATCTTAGGTGGAAGCTTCTACATCGCCTCCCAAGTCGTCTCAGCCATGGTTGG
TGTCAACGAGTTCGCTTATGATTACGGATACTGAGAGAGAGTTTGTTTGTTCGTTCTCTC
TTTCATTAAATAAATACTCTGTTTCTTACATGTTATGGTCATCGATACTCTGTTTTATGC

QA 6 665 6 665
DS 

RD RS1FL47JQ 660 0 0
TCTCCATTTGAGCAGCAGCAGATTACTAGCACCAGCTAAGGCGTCGTCTCCGAGCTCAAG
CATAAGCACCAGAACACCGTGCCGCCGTGTTCAGTGCGAAGCATCCAGAAGAAGAAGAAG
ATCAACGGTGGAAAGCAACAGAACCAGGCTTGAAAAGACACAACCTTTGTGTCTGGAGAA
GAAGCAACTGAGACAAGCTTTGGTGACTGGTGTCTCCGTAGGTTTGATGATGGCTTTGGC
ATTAGGAATAGATGGAGAAAAGGCGATGGCTTTGGGACCGGAAGGTCCTCTGATGGAAGA
GTTCTGGGACAACGTGAGAAGGTACGGTCTTTACGCACTCACCGTCAGCACGGGAGCTCT
TTCCGCTGTTTTCGAGCCCATTTTCGAACTCCTCAAGAACCCGATTTCCGCCGTTCTCAT
CGTGATCATCTTAGGTGGAAGCTTTTACATCGTCTCCCAAGTCGTTTCAGCCATGGTTGG
TGTCAACGAGTTCGCTTATGATTACGGATACTGAGAGAGAGTTTGTTTGTTCGTTCTCTC
TTTCATTAAATAAATACTCTGTTTCTTACATGTTATGGTCATCGATACTCTGTTTTATGC
ATTAGTCTTATAATCTTTTGTTACATTTTATTTGACATAAAAAGGGGTCAACTTTGTACG

QA 1 660 1 660
DS 



AS 2 8

CO CL581Contig1 780 3 3 U
GGGAAAGATCAATTATTCAGCTGAGGAAAGAATAAAGTAATGGGGCGTGTGGATTACCTG
GCGATGAAGTCTGACGACGTCGACACGGTTACTTTGGTCAACTCCGACGTGGAGGAGCTC
AAGATCGCTGCCAAGAAGCTCTTCAGCGATGTCTCGAAGCTCGGTGGATCAGCCTTTGGT
GTTTCTTTCGTCAAATGGATGGCTTGCTTCGCTGCCATTTACTTGTTGATATTGGATCGT
ACAAATTGGAGAAGCAAGATGCTTACATCACTCTTGATACCATACATCTTCCTTAGCCTT
CCTGGTGTGATTTTCAACTTCCTCAGTGGAGACGTTGGGAAATGGATTGCGTTCGTTGCA
GTTGTGCTCAGACTTTTCTTCCCTAAGCATTTCCCAGATTGGCTAGAGATGCCTGGTTCT
CTGATCCTTCTGCTAGTAGTGTCTCCACATTTTCTAGCTCACCATATACGCGGAACCTGG
ATTGGCTCTGTCATCGGTCTTTTCATAGGCTGTTACCTTCTTCAAGAACATATCCGAGTC
TCAGGTGGGTTCAGGAATTCGTTCACGCAGCCCCGTGGAGTATCCAACACTCTAGGGATC
ATCCTTATTCTGGTCTACCCTGTTTGGGCTCTAATCGTTCGTGTCACAAAATAGACATTC
CCTGTTCCATTTCCCTCAAGTTGTATATGTCTTGTCTAATAAAATTCCCTAGTGCTCTGC
TTCTCTTACATACCCTTATACTACTGTCTCAGCTCATCATGTTCCATATTAGAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CK20TF U 1
AF RS1CK20JQ C 311
AF RS1F166TF U 69
BS 1 698 RS1CK20TF
BS 699 701 RS1F166TF
BS 702 780 RS1CK20TF

RD RS1CK20TF 780 0 0
GGGAAAGATCAATTATTCAGCTGAGGAAAGAATAAAGTAATGGGGCGTGTGGATTACCTG
GCGATGAAGTCTGACGACGTCGACACGGTTACTTTGGTCAACTCCGACGTGGAGGAGCTC
AAGATCGCTGCCAAGAAGCTCTTCAGCGATGTCTCGAAGCTCGGTGGATCAGCCTTTGGT
GTTTCTTTCGTCAAATGGATGGCTTGCTTCGCTGCCATTTACTTGTTGATATTGGATCGT
ACAAATTGGAGAAGCAAGATGCTTACATCACTCTTGATACCATACATCTTCCTTAGCCTT
CCTGGTGTGATTTTCAACTTCCTCAGTGGAGACGTTGGGAAATGGATTGCGTTCGTTGCA
GTTGTGCTCAGACTTTTCTTCCCTAAGCATTTCCCAGATTGGCTAGAGATGCCTGGTTCT
CTGATCCTTCTGCTAGTAGTGTCTCCACATTTTCTAGCTCACCATATACGCGGAACCTGG
ATTGGCTCTGTCATCGGTCTTTTCATAGGCTGTTACCTTCTTCAAGAACATATCCGAGTC
TCAGGTGGGTTCAGGAATTCGTTCACGCAGCCCCGTGGAGTATCCAACACTCTAGGGATC
ATCCTTATTCTGGTCTACCCTGTTTGGGCTCTAATCGTTCGTGTCACAAAATAGACATTC
CCTGTTCCATTTCCCTCAAGTTGTATATGTCTTGTCTA**TAAATTCCCTAGTGCTCTGC
TTCTCTTACATACCCTTATACTACTGTCTCAGCTCATCATGTTCCATATTAGAAAAAAAA

QA 1 780 1 780
DS 

RD RS1CK20JQ 439 0 0
TTTTCAACTTCCTCAGTGGAGACGTTGGGAAATGGATTGCGTTCGTTGCAGTTGTGCTCA
GACTTTTCTTCCCTAAGCATTTCCCAGATTGGCTAGAGATGCCTGGTTCTCTGATCCTTC
TGCTAGTAGTGTCTCCACATTTTCTAGCTCACCATATACGCGGAACCTGGATTGGCTCTG
TCATCGGTCTTTTCATAGGCTGTTACCTTCTTCAAGAACATATCCGAGTCTCAGGGGGGT
TCAGGAATTCGTTCACGCAGCCCCGTGGAGTATCCAACACTCTAGGGATCATCCTTATTC
TGGTCTACCCTGTTTGGGCTCTAATCGTTCGTGTCACAAAATAGACATTCCCTGTTCCAT
TTCCCTCAAGTTGTATATGTCTTGTCTAATAAAATTCCCTAGTGCTCTGCTTCTCTTACA
TACCCTTATACTACTGTCT

QA 1 439 1 439
DS 

RD RS1F166TF 659 0 0
GTCT
GACGACGTCGACACGGTTACTTTGGTCAACTCCGACGTGGAGGAGCTCAAGATTGCTGCC
AAGAAGCTCTTCAGCGATGTCTCGAAGCTCGGTGGATCAGCCTTTGGTGTTTCTTTCGTC
AAATGGATGGCTTGCTTCGCTGCCATTTACTTGTTGATATTGGATCGTACAAATTGGAGA
AGCAAGATGCTTACATCACTCTTGATACCATACATCTTCCTTAGCCTTCCTGGTGTGATT
TTCAACTTCCTCAGTGGAGACGTTGGGAAATGGATTGCGTTCGTTGCAGTTGTGCTCAGA
CTTTTCTTCCCTAAGCATTTCCCAGATTGGCTAGAGATGCCTGGTTCTCTGATCCTTCTG
CTAGTAGTGTCTCCACATTTTCTAGCTCACCATATACGCGGAACCTGGATTGGCTCTGTC
ATCGGTCTTTTCATAGGCTGTTACCTTCTTCAAGAACATATCCGAGTCTCAGGTGGGTTC
AGGAATTCGTTCACGCAGCCCCGTGGAGTATCCAACACTCTAGGGATCATCCTTATTCTG
GTCTACCCTGTTTGGGCTCTAATCGTTCGTGTCACAAA*TAGACATTCCCTGTTCCATTT
CCCTCAAGTTGTATATGTCT*GTCTAATAAA**TCCCTAGTGCTCTGCT
CTAAAA

QA 5 653 5 653
DS 



CO CL581Contig2 803 5 14 U
GGACGAAAGATCAATTATTCAGCTGAGGAAAGAATAAAGTACTAATGGGGCGTGTGGATT
ACCTAGCGATGAAGTCCGACGACGTCGACACGGTTGCTTTGGTCAACTCCGACGTGGAGG
AGCTCAAGATCGCTGCCAAGAAGCTCTTCAGCGATGTCTCGAAGCTTGGTGGATCAGCCT
TTGGTGTTTCTTTCGTCAAATGGATGGCTTGCTTCGCTGCCATTTATTTGTTGATATTGG
ATCGTACAAATTGGAGAAGCAAGATGCTTACATCACTCTTGATACCATACATCTACCTTA
GCCTTCCTGGTGTGATTTTCAACTTCCTCAGTGGAGACGTTGGGAAATGGATTGCGTTCG
TTGCAGTTGTGCTCAGACTTTTCTTCCCTAAGCATTTCCCAGATTGGCTAGAGATGCCTG
GTTCTCTGATCCTTCTGCTAGTAGTGTCTCCACATTTTCTAGCTCACCATATACGTGGAA
CCTGGATTGGCTCTGTCATCGGTCTTTTCATAGGCTGTTACCTTCTTCAAGAACATATCC
GAGTCTCAGGTGGGTTCAGGAATTCGTTCACGCAGCCCCGTGGAGTATCCAACACTCTAG
GGATCATCCTTATTCTTGTCTACCCTGTTTGGGCTCTAATCGTTCGTGTCACAAAATAGA
CATTGCCTCTTCCATATCCCTCAAGTTGTATATGTCTTGTCTAATAAATTCCCTATTGCT
CTGCTTCTCTTACATACCCTTATACTACTGTCTCAAGCTCAATCAATGTTCCATATTATA
AAAAAAAAGAATCTCATTTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DH41TF U 34
AF RS1GY03TF U 1
AF RS1DH41JQ C 34
AF RS1DE73JQ C 269
AF RS1DE73TF U 269
BS 1 222 RS1GY03TF
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BS 224 225 RS1GY03TF
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BS 227 604 RS1GY03TF
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BS 704 704 RS1DE73TF
BS 705 722 RS1GY03TF
BS 723 803 RS1DE73TF

RD RS1DH41TF 596 0 0
GGAAAGTAC
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GAGTATCCAACACTCTAGGGATCATCCTTATTCTTGTCTACCCTGTT

QA 10 596 10 596
DS 

RD RS1GY03TF 722 0 0
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ACCTAGCGATGAAGTCCGACGACGTCGACACGGTTGCTTTGGTCAACTCCGACGTGGAGG
AGCTCAAGATCGCTGCCAAGAAGCTCTTCAGCGATGTCTCGAAGCTTGGTGGATCAGCCT
TTGGTGTTTCTTTCGTCAAATGGATGGCTTGCTTCGCTGCCAGTTTTTTGTTGATATTGG
ATCGTACAAATTGGAGAAGCAAGATGCTTACATCACTCTTGATACCATACATCTACCTTA
GCCTTCCTGGTGTGATTTTCAACTTCCTCAGTGGAGACGTTGGGAAATGGATTGCGTTCG
TTGCAGTTGTGCTCAGACTTTTCTTCCCTAAGCATTTCCCAGATTGGCTAGAGATGCCTG
GTTCTCTGATCCTTCTGCTAGTAGTGTCTCCACATTTTCTAGCTCACCATATACGTGGAA
CCTGGATTGGCTCTGTCATCGGTCTTTTCATAGGCTGTTACCTTCTTCAAGAACATATCC
GAGTCTCAGGTGGGTTCAGGAATTCGTTCACGCAGCCCCGTGGAGTATCCAACACTCTAG
GGATTA*CCTTATTCTTGTCTACCCTGTTTGGGCTCTAATCGTTCGTGTCACAAAATAGA
CATTGCCTCTTCCATATCCCTCAAGTTGTATATGTCT*GTCTA*TAAATTCCCTATTGCT
CT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RS1DH41JQ 691 0 0
GGAAAGTAC
TAATGGGGCGTGTGGATTACCTAGCGATGAAGTCCGACGACGTCGACACGGTTGCTTTGG
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AGCTTGGTGGATCAGCCTTTGGTGTTTCTTTCGTCAAATGGATGGCTTGCTTCGCTGCCA
TTTATTTGTTGATATTGGATCGTACAAATTGGAGAAGCAAGATGCTTACATCACTCTTGA
TACCATACATCTACCTTAGCCTTCCTGGTGTGATTTTCAACTTCCTCAGTGGAGACGTTG
GGAAATGGATTGCGTTCGTTGCAGTTGTGCTCAGACTTTTCTTCCCTAAGCATTTCCCAG
ATTGGCTAGAGATGCCTGGTTCTCTGATCCTTCTGCTAGTAGTGTCTCCACATTTTCTAG
CTCACCATATACGTGGAACCTGGATTGGCTCTGTCATCGGTCTTTTCATAGGCTGTTACC
TTCTTCAAGAACATATCCGAGTCTCAGGTGGGTTCAGGAATTCGTTCACGCAGCCCCGTG
GAGTATCCAACACTCTAGGGATCATCCTTATTCTTGTCTACCCTGTTTGGGCTCTAATCG
TTCGTGTCACAAAATAGACATTGCCTCTTCCATATCCCTCAAGTTGTATATGTCTTGTCT
AATAAATTCCCTATTGCTCTGC

QA 10 691 10 691
DS 

RD RS1DE73JQ 535 0 0
G
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AGTGGAGACGTTGGGAAATGGATTGCGTTCGTTGCAGTTGTGCTCAGACTTTTCTTCCCT
AAGCATTTCCCAGATTGGCTAGAGATGCCTGGTTCTTTGATCCTTCTGCTAGTAGTGTCT
CCACATTTTCTAGCTCACCATATACGTGGAACCTGGATTGGCTCTGTCATCGGTCTTTTC
ATAGGCTGTTACCTTCTTCAAGAACATATCCGAGTTTCAGGTGGGTTCAGGAATTCGTTC
ACGCAGCCCCGTGGAGTATCCAACACTTTAGGGATCATCCTTATTCTTGTCTACCCGGTT
TGGGCTCTAATCGTTCGTGTCACAAAATAGACATTGCCTCTTCCATATCCCTCAAGTTGT
ATATGTCTTGTCTAATAAATTCCCTATTGCTCTGCTTCTCTTACATACCCTTATACTACT
GTCTCAAGCTCAATCAATGTTCCATATTATAAAAAAAAAGAATCTCATTTTTTC

QA 2 535 2 535
DS 

RD RS1DE73TF 535 0 0
G
ACATCACTCTTGATACCATACATCTACCTTAGCCTTCCTGGTGTGATTTTCAACTTCCTC
AGTGGAGACGTTGGGAAATGGATTGCGTTCGTTGCAGTTGTGCTCAGACTTTTCTTCCCT
AAGCATTTCCCAGATTGGCTAGAGATGCCTGGTTCTCTGATCCTTCTGCTAGTAGTGTCT
CCACATTTTCTAGCTCACCATATACGTGGAACCTGGATTGGCTCTGTCATCGGTCTTTTC
ATAGGCTGTTACCTTCTTCAAGAACATATCCGAGTCTCAGGTGGGTTCAGGAATTCGTTC
ACGCAGCCCCGTGGAGTATCCAACACTCTAGGGATCATCCTTATTCTTGTCTACCCGGTT
TGGGCTCTAATCGTTCGTGTCACAAAATAGACATTGCCTCTTCCATATCCCTCAAGTTGT
ATATGTCTTGTCTAATAAATTCCCTATTGCTCTGCTTCTCTTACATACCCTTATACTACT
GTCTCAAGCTCAATCAATGTTCCATATTATAAAAAAAAAGAATCTCATTTTTTC

QA 2 535 2 535
DS 



AS 1 7

CO CL582Contig1 702 7 9 U
GGAACACAAGCAAAAAAAAGGAAAGGTTGTCTAGTTGTGTAAACAAAAAAAGAGAGATAG
AGAAAAATGGCTAGCTTCACTGCCTCCGCTTCCACCGTCTCCGTCGCTCGTCCTGCTCTC
CTTCTCAAGCCCACCGTCGCCGTCTCTGCTCCTGTTCTTGGTTTGCCTCCAATGAGTAAG
AGGAAGGGAGGAGTGAAGTGCTCGATGGAGACCAAGCAAGGAAACGTGTCAGCCGTGGGA
GCTGGAGTTTCTGCGGCGGCTACAGCAGCTTTGACGGCTGTGATGAGCAGCCCGGCTATG
GCTTTGGTGGATGACAGGATGTCAACGGAGGGAACCGGCTTGCCCTTTGGTCTGAGCAAC
AACCTCTTGGGTTGGATTCTTTTAGGAGTGTTTGGTTTGATCTGGACTTTCTACTTCACC
TACACTTCATCTCTTGACGAGGATGAAGAATCTGGTCTTTCACTCTGAACATGAATTCTA
GATATGTCCTTCATCAGTGTTCATCTCTCTCTCTCCTTTTCCATTTTCATTTGAGGACAT
GAATCATGAACGATCTTCTGGTTTCTTGTAATTTTAAGTACACCCAAAAAAACTATTTTC
ATGTATACATCCTAAGACAAATATAAATTTTCAAGAATAATAGAGTAACTCTAAAATATT
TAGGGCTTATTGCAAAAGTGACTCAAAACTTGAATTCAAACG


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1F312JQ C 20
AF RS1F312TF U 20
AF RS1AS65TF U 4
AF RS1FY49JQ C 20
AF RS1FY49TF U 20
AF RS1A520JQ C 1
AF RS1A520TF U 30
BS 1 5 RS1A520JQ
BS 6 19 RS1AS65TF
BS 20 331 RS1F312TF
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BS 333 585 RS1F312TF
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BS 634 634 RS1A520TF
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BS 652 702 RS1A520TF

RD RS1F312JQ 566 0 0
GGAAAGGTTGTCTAGTTGTGTAAACAAAAAAAGAGAGATAGAGAAAAATGGCTAGCTTCA
CTGCCTCCGCTTCCACCGTCTCCGTCGCTCGTCCTGCTCTCCTTCTCAAGCCCACCGTCG
CCGTTTCTGCTCCTGTTCTTGGTTTGCCTCCAATGAGTAAGAGGAAGGGAGGAGTGAAGT
GCTCGATGGAGACCAAGCAAGGAAACGTGTCAGCCGTGGGAGCTGGAGTTTTTGCGGCGG
CTACAGCAGCTTTGACGGCTGTGATGAGCAGCCCGGCTATGGCTTTGGTGGATGACAGGA
TGTCAACGGAGGTAACCGGCTTGCCCTTTGGTCTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTC
TTTTAGGAGTGTTTGGTTTGATCTGGACTTTCTACTTCACCTACACTTCATCTCTTGACG
AGGATGAAGAATCTGGTCTTTCACTCTGAACATGAATTCTAGATATGTCCTTCATCAGTG
TTCATCTCTCTCTCTCCTTTTCCATTTTCATTTGAGGACATGAATCATGAACGATCTTCT
GGTTTCTTGTAATTTTAAGT
CCCCCC

QA 1 560 1 560
DS 

RD RS1F312TF 566 0 0
GGAAAGGTTGTCTAGTTGTGTAAACAAAAAAAGAGAGATAGAGAAAAATGGCTAGCTTCA
CTGCCTCCGCTTCCACCGTCTCCGTCGCTCGTCCTGCTCTCCTTCTCAAGCCCACCGTCG
CCGTCTCTGCTCCTGTTCTTGGTTTGCCTCCAATGAGTAAGAGGAAGGGAGGAGTGAAGT
GCTCGATGGAGACCAAGCAAGGAAACGTGTCAGCCGTGGGAGCTGGAGTTTCTGCGGCGG
CTACAGCAGCTTTGACGGCTGTGATGAGCAGCCCGGCTATGGCTTTGGTGGATGACAGGA
TGTCAACGGAGGTAACCGGCTTGCCCTTTGGTCTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTC
TTTTAGGAGTGTTTGGTTTGATCTGGACTTTCTACTTCACCTACACTTCATCTCTTGACG
AGGATGAAGAATCTGGTCTTTCACTCTGAACATGAATTCTAGATATGTCCTTCATCAGTG
TTCATCTCTCTCTCTCCTTTTCCATTTTCATTTGAGGACATGAATCATGAACGATCTTCT
GGTTTCTTGTAATTTTAAGTACACCC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RS1AS65TF 648 0 0
GG
ACAAGCAAAAAAAATTAAAGGTTGTCTAGTTGTGTAAACAAAAAAAGAGAGATAGAGAAA
AATGGCTAGCTTCACTGCCTCCGCTTCCACCGTCTCCGTCGCTCGTCCTGCTCTCCTTCT
CAAGCCCACCGTCGCCGTCTCTGCTCCTGTTCTTGGTTTGCCTCCAATGAGTAAGAGGAA
GGGAGGAGTGAAGTGCTCGATGGAGACCAAGCAAGGAAACGTGTCAGCCGTGGGAGCTGG
AGTTTCTGCGGCGGCTACAGCAGCTTTGACGGCTGTGATGAGCAGCCCGTCTATGGCTTT
GGTGGATGACAGGATGTCAACGGAGGGAACCGGCTTGCCCTTTGGTCTGAGCAACAACCT
CTTGGGTTGGATTCTTTTAGGAGTGTTTGGTTTGATCTGGACTTTCTACTTCACCTACAC
TTCATCTCTTGACGAGGATGAAGAATCTGGTCTTTCACTCTGAACATGAATTCTAGATAT
GTCCTTCATCAGTGTTCATCTCTCTCTCTCCTTTTCCATTTTCATTTGAGGACATGAATC
ATGAACGATCTTCTGGTTTCTTGTAATTTTAAGTACACCCAAAAAAACTATTTTCATGTA
TACATCCTAAGACAAATATAAATTTTCATGAATAATAGAGTAACTC

QA 3 648 3 648
DS 

RD RS1FY49JQ 616 0 0
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CTGCCTCCGCTTCCACCGTCTCCGTCGCTCGTCCTGCTCTCCTTCCCAAGCCCACCGTCG
CCGTCTCTGCTCCTGTTCTTGGTTTGCCTCCAATGAGTAAGAGGAAGGGAGGAGTGAAGT
GCTCGATGGAGACCAAGCAAGGAAACGTGTCAGCCGTGGGAGCTGGAGTTTCTGCGGCGG
CTACAGCAGCTTTGACGGCTGTGATGAGCAGCCCGGCTATGGCTTTGGTGGATGACAGGA
TGTCAACGGAGGGAACCGGCTTGCCCTTTGGTCTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTC
TTTTAGGAGTGTTTGGTTTGATCTGGACTTTCTACTTCACCTACACTTCATCTCTTGACG
AGGATGAAGAATCTGGTCTTTCACTCTGAACATGAATTCTAGATATGTCCTTCATCAGTG
TTCATCTCTCTCTCTCCTTTTCCATTTTCATTTGAGGACATGAATCATGAACGATCTTCT
GGTTTCTTGTAATTTTAAGTACACCCAAAAAAACTATTTTCATGTATACATCCTAAGACA
AATATAAATTTTCA
TG

QA 1 614 1 614
DS 

RD RS1FY49TF 613 0 0
GGAAAGGTTGTCTAGTTGTGTAAACAAAAAAAGAGAGATAGAGAAAAATGGCTAGCTTCA
CTGCCTCCGCTTCCACCGTCTCCGTCGCTCGTCCTGCTCTCCTTCCCAAGCCCACCGTCG
CCGTCTCTGCTCCTGTTCTTGGTTTGCCTCCAATGAGTAAGAGGAAGGGAGGAGTGAAGT
GCTCGATGGAGACCAAGCAAGGAAACGTGTCAGCCGTGGGAGCTGGAGTTTCTGCGGCGG
CTACAGCAGCTTTGACGGCTGTGATGAGCAGCCCGGCTATGGCTTTGGTGGATGACAGGA
TGTCAACGGAGGGAACCGGCTTGCCCTTTGGTCTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTC
TTTTAGGAGTGTTTGGTTTGATCTGGACTTTCTACTTCACCTACACTTCATCTCTTGACG
AGGATGAAGAATCTGGTCTTTCACTCTGAACATGAATTCTAGATATGTCCTTCATCAGTG
TTCATCTCTCTCTCTCCTTTTCCATTTTCATTTGAGGACATGAATCATGAACGATCTTCT
GGTTTCTTGTAATTTTAAGTACACCCAAAAAAACTATTTTCATGTATACATCCTAAGACA
AATATAAATTTTC

QA 1 613 1 613
DS 

RD RS1A520JQ 702 0 0
GGAACACAAGCAAAAAAAATTAAAGGTTGTCTAGTTGTGTAAACAAAAAAAGAGAGATAG
AGAAAAATGGCTAGCTTCACTGCCTCCGCTTCCACCGTCTCCGTCGCTCGTCCTGCTCTC
CTTCTCAAGCCCACCGTCGCCGTCTCTGCTCCTGTTCTTGGTTTGCCTCCAATGAGTAAG
AGGAAGGGAGGAGTGAAGTGCTCGATGGAGACCAAGCAAGGAAACGTGTCAGCCGTGGGA
GCTGGAGTTTTTGCGGCGGCTACAGCAGCTTTGACGGCTGTGATGAGCAGCCCGGCTATG
GCTTTGGTGGATGACAGGATGTCAACGGAGGGAACCGGCTTGCCCTTTGGTTTGAGCAAC
AACCTCTTGGGTTGGATTCTTTTAGGAGTGTTTGGTTTGATCTGGACTTTCTACTTCACC
TACACTTCATCTCTTGACGAGGATGAAGAATCTGGTCTTTCACTCTGAACATGAATTCTA
GATATGTCCTTCATCAGTGTTCATCTCTCTCTC**CTTTTCCATTTTCATTTGAGGACAT
GAATCATGAACGATCTTCTGGTTTCTTGTAATTTTAAGTACACCCAAAAAAACTATTTTC
ATGTATACATCCTAAGACAAATATAAATTTTCAAGAATAATAGAGTAACTCTAAAATATT
TAGGGCTTATTGCAAAAGTGACTCAAAACTTGAATTCAAACG

QA 1 702 1 702
DS 

RD RS1A520TF 673 0 0
TCTAGTTGTGTAAACAAAAAAAGAGAGATAGAGAAAAATGGCTAGCTTCACTGCCTCCGC
TTCCACCGTCTCCGTCGCTCGTCCTGCTCTCCTTCTCAAGCCCACCGTCGCCGTCTCTGC
TCCTGTTCTTGGTTTGCCTCCAATGAGTAAGAGGAAGGGAGGAGTGAAGTGCTCGATGGA
GACCAAGCAAGGAAACGTGTCAGCCGTGGGAGCTGGAGTTTCTGCGGCGGCTACAGCAGC
TTTGACGGCTGTGATGAGCAGCCCGGCTATGGCTTTGGTGGATGACAGGATGTCAACGGA
GGGAACCGGCTTGCCCTTTGGTCTGAGCAACAACCTCTTGGGTTGGATTCTTTTAGGAGT
GTTTGGTTTGATCTGGACTTTCTACTTCACCTACACTTCATCTCTTGACGAGGATGAAGA
ATCTGGTCTTTCACTCTGAACATGAATTCTAGATATGTCCTTCATCAGTGTTCATCTCTC
TCTC**CTTTTCCATTTTCATTTGAGGACATGAATCATGAACGATCTTCTGGTTTCTTGT
AATTTTAAGTACACCCAAAAAAACTATTTTCATGTATACATCCTAAGACAAATATAAATT
TTCAAGAATAATAGAGTAACTCTAAAATATTTAGGGCTTATTGCAAAAGTGACTCAAAAC
TTGAATTCAAACG

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 5

CO CL583Contig1 711 5 5 U
GGGCCCGCAGAGGAAGCTAGAGGAAGAAAGAGGAAGAGAAAGATCGAAGGAAGAAAAATA
ATGGAGTCTCCGAAGAAGATAGCTCATGAGATCGGTGGTGTCAAGAGAGACGCTCTTCGA
TTCGGTCTCAACGGCGTTAAGAGCGACATCGTCGGATCTCACCCACTCGAATCCTCTTAC
GAATCTGGAAAGAGATCGGACGAGGCGATGAAGAGAACAATCATTGGGCATACCTACGGG
TCTGCAATTCCATTGAAGATGGATATGGACAGACAAATTCTCTCACGGTTTCAAAGACCT
CCTGGACCAATTCCATCGTCAATGCTCGGGTTAGAAGTCTACACAGGAGCCATTGATAAC
TTTGGTTTTGAGGATTACTTAAATGATCCTCGTGACTCGGAGACATTCAAGCCGGTAGAC
TTCCACCACGGGATGGAAGTTCGTCTTGGCATCTCAAAGGGCCCGGTTGCCCCAAGTTTC
ATGTGAGGAACCCTCATGGGTGGGGGGTTTTGTTGGATGTTACGTCATTTTAGCTTTTGA
ATGATGATTGAATCAAGTGTGTGAACTTATTTCGACGTTAGACTTCTACTATAAAGTTTG
AAATCAGATGAAACTGGGCAATTAATATTGTGGATTAATTATAGTATGGTGGTGATTCCA
ACAAATAGAAGAATCATCCGGACTTCATAATCAATATTATATTATCTGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 10 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FD18TF U 1
AF RS1G317TF U 3
AF RS1E272TF U 5
AF RS1BZ34TF U 12
AF RS1E272JQ C 148
BS 1 410 RS1FD18TF
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RD RS1FD18TF 569 0 0
GGGCCCGCAGAGGAAGCTAGAGGAAGAAAGAGGAAGAGAAAGATCGAAGGAAGAAAAATA
ATGGAGTCTCCGAAGAAGATAGCTCATGAGATCGGTGGTGTCAAGAGAGACGCTCTTCGA
TTCGGTCTCAACGGCGTTAAGAGCGACATCGTCGGATCTCACCCACTCGAATCCTCTTAC
GAATCTGGAAAGAGATCGGACGAGGCGATGAAGAGAACAATCATTGGGCATACCTACGGG
TCTGCAATTCCATTGAAGATGGATATGGACAGACAAATTCTCTCACGGTTTCAAAGACCT
CCTGGACCAATTCCATCGTCAATGCTCGGGTTAGAAGTCTACACAGGAGCCATTGATAAC
TTTGGTTTTGAGGATTACTTAAATGATCCTCGTGACTCGGAGACATTCAATCCGGTAGAC
TTCCACCACGGGATGGAAGTTCGTCTTGGCATCTCAAAGGGCCCGGTTGCCCCAAGTTTC
ATGTGAGGAACCCTCATGGGTGGGGGGTTTTGTTGGATGTTACGTCATTTTAGCTTTTGA
ATGATGATTGAATCAAGTGTGTGAACTTA

QA 1 569 1 569
DS 

RD RS1G317TF 619 0 0
GGGG
GCAGAGGAAGCTAGAGGAAGAAAGAGGAAGAGAAAGATCGAAGGAAGAAAAATAATGGAG
TCTCCGAAGAAGATAGCTCATGAGATCGGTGGTGTCAAGAGAGACGCTCTTCGATTCGGT
CTCAACGGCGTTAAGAGCGACATCGTCGGATCTCACCCACTCGAATCCTCTTACGAATCT
GGAAAGAGATCGGACGAGGCGATGAAGAGAACAATCATTGGGCATACCTACGGGTCTGCA
ATTCCATTGAAGATGGATATGGACAGACAAATTCTCTCACGGTTTCAAAGACCTCCTGGA
CCAATTCCATCGTCAATGCTCGGGTTAGAAGTCTACACAGGAGCCATTGATAACTTTGGT
TTTGAGGATTACTTAAATGATCCTCGTGACTCGGAGACATTCAAGCCGGTAGACTTCCAC
CACGGGATGGAAGTTCGTCTTGGCATCTCAAAGGGCCCGGTTGCCCCAAGTTTCATGTGA
GGAACCCTCATGGGTGGGGGGTTTTGTTGGATGTTACGTCATTTTAGCTTTTGAATGATG
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GATGAAACTGGGCAA

QA 5 619 5 619
DS 

RD RS1E272TF 609 0 0
GGGCAGA
GGAAGCTAGAGGAAGAAAGAGGAAGAGAAAGATCGAAGGAAGAAAAATAATGGAGTCTCC
GAAGAAGATAGCTCATGAGATCGGTGGTGTCAAGAGAGACGCTCTTCGATTCGGTCTCAA
CGGCGTTAAGAGCGACATCGTCGGATCTCACCCACTCGAATCCTCTTACGAATCTGGAAA
GAGATCGGACGAGGCGATGAAGAGAACAATCATTGGGCATACCTACGGGTCTGCAATTCC
ATTGAAGATGGATATGGACAGACAAATTCTCTCACGGTTTCAAAGACCTCCTGGACCAAT
TCCATCGTCAATGCTCGGGTTAGAAGTCTACACAGGAGCCATTGATAACTTTGGTTTTGA
GGATTACTTAAATGATCCTCGTGACTCGGAGACATTCAAGCCGGTAGACTTCTACCACGG
GATGGAAGTTCGTCTTGGCATCTCAAAGGGCCCGGTTGCCCCAAGTTTCATGTGAGGAAC
CCTCATGGGTGGGGGGTTTTGTTGGATGTTACGTCATTTTAGCTTTTGAATGATGATTGA
ATCAATTGTGTGAACTTATTTCGACGTTAGACTTCTACTATAAAGTTTGAAATCAGATGA
AA

QA 8 609 8 609
DS 

RD RS1BZ34TF 610 0 0
GGAAGCTAGAGGAAGAAAGAGGAAGAGAAAGATCGAAGGAAGAAAAATAATGGAGTCTCC
GAAGAAGATAGCTCATGAGATCGGTGGTGTCAAGAGAGACGCTCTTCGATTCGGTCTCAA
CGGCGTTAAGAGCGACATCGTCGGATCTCACCCACTCGAATCCTCTTACGAATCTGGAAA
GAGATCGGACGAGGCGATGAAGAGAACAATCATTGGGCATACCTACGGGTCTGCAATTCC
ATTGAAGATGGATATGGACAGACAAATTCTCTCACGGTTTCAAAGACCTCCTGGACCAAT
TCCATCGTCAATGCTCGGGTTAGAAGTCTACACAGGAGCCATTGATTACTTTGGTTTTGA
GGATTACTTAAATGATCCTCGTGACTCGGAGACATTCAAGCCGGTAGACTTCCACCACGG
GATGGAAGTTCGTCTTGGCATCTCAAAGGGCCCGGTTGCCCCAAGTTTCATGTGAGGAAC
CCTCATGGGTGGGGGGTTTTGTTGGATGTTACGTCATTTTAGCTTTTGAATGATGATTGA
ATCAAGTGTGTGAACTTATTTCGACTTTAGACTTCTACTATAAAGTTTGAAATCAGATGA
AACTGGGCAA

QA 1 610 1 610
DS 

RD RS1E272JQ 564 0 0
ATCGTCGGATCTCACCCACTCGAATCCTCTTACGAATCTGGAAAGAGATCGGACGAGGCG
ATGAAGAGAACAATCATTGGGCATACCTACGGGTCTGCAATTCCATTGAAGATGGATATG
GACAGACAAATTCTCTCACGGTTTCAAAGACCTCCTGGACCAATTCCATCGTCAATGCTC
GGGTTAGAAGTCTACACAGGAGCCATTGATAACTTTGGTTTTGAGGATTACTTAAATGAT
CCTCGTGACTCGGAGACATTCAAGCCGGTAGACTTCTACCACGGGATGGAAGTTCGTCTT
GGCATCTCAAAGGGCCCGGTTGCCCCAAGTTTCATGTGAGGAACCCTCATGGGTGGGGGG
TTTTGTTGGATGTTACGTCATTTTAGCTTTTGAATGATGATTGAATCAATTGTGTGAACT
TATTTTGACGTTAGACTTTTACTATAAAGTTTGAAATCAGATGAAACTGGGCAATTAATA
TTGTGGATTAATTATAGTATGGTGGTGATTCCAACAAATAGAAGAATCATCCGGACTTCA
TAATCAATATTATATTATCTGTTG

QA 1 564 1 564
DS 



AS 1 5

CO CL584Contig1 1172 5 6 U
GCACACTATTCAATGGCAACCATGGCTAGGTCGTTTTTGCAGGCGATATCGAAGGACGAG
GTGGTCGCTCCTCCGCTCAGAGTTGTTCAGATCGAAGGACTGGCTGTGCTAAAGATAATA
AAACACTGCAAGGAGTTTGCACCGACGCTTGTCACAGGGCAGCTTCTTGGACTTGACGTT
GGTAGTGTCCTTGAAGTCACCAATTGTTTTCCGTTCCCCGTGAGAGATGACGATGAAGAA
ATTGAAGCCGATGGTGCTAATTATCAGCTTGAAATGATGAGGTGTCTGAGAGAGGTTAAT
GTCGACAACAACACTGTCGGCTGGTATCAATCCACAGTTCTTGGATCCTATCAGACCGTT
GAATTGATTGAGACCTTCATGAATTACCAGGAAAACATCAAGAGGTGTGTGTGCATCATC
TATGATCCCTCTAAAGCTGACTTAGGCGTCTTAGCTCTGAAGGCTTTGAAGCTTTCTGAT
TCCTTTATGGAGCTATACCGGGCCGGAAACTTTACAGGCGAGAAGTTGAGAGAGAAGAAC
TTCTCCTGGATGGATATTTTTGAGGAAATTCCCATTAAGGTTTCAAACTCTGCGCTTGTC
AGTGCCTTCATGACTGAACTGGAGACTGATGCACCTGTCTCACAGGGTGATTATGATCGT
CTACACTCATCAACCACTCCTTTCCTTGAGAACAATATGGAGTTTCTGATTAAATGCATG
GATGATTTATCTATGGAACAGCAAAAGTTCCAATACTACTACCGGAACCTGTCTCGTCAG
CAAGCGCAGCAGCAAGCCTGGCTCCAGAAGAGGAGGACGGAGAATATGGGTCGTAGATCA
GCTGGAGAAGAGGCTTTGCCCGAAGAGGATCCTTCAAACCCAATCTTTAAGCCGATCCCT
GAACCTTCAAGGCTAGAGAGTTTCCTCATCACAAACCAAGTCTCGAACTTCTGTGGTCAA
ATCAATGGAGTGGCTGGCCAGAACTTCAGCAGGCTCTACCTGACCAAGGCATTGCACGAT
AACTGATTACAACAAGACCACCAAATTTTTGTTTCGAGTCGAGAGAAAGTGAGAAAACGG
ATCCTATGTTTGTTTTAATCTTGAAATTTTTCATTATTGTAGTTAAACCACTTCATAATA
CATAATTTCTGAAAACTTCTTTTTTAGTTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D511TF U 1
AF RS1GP07TF U 371
AF RS1D511JQ C 404
AF RS1B703JQ C 500
AF RS1B703TF U 500
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GGTAGTGTCCTTGAAGTCACCAATTGTTTTCCGTTCCCCGTGAGAGATGACGATGAAGAA
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GTCGACAACAACACTGTCGGCTGGTATCAATCCACAGTTCTTGGATCCTATCAGACCGTT
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TATGATCCCTCTAAAGCTGACTTAGGCGTCTTAGCTCTGAAGGCTTTGAAGCTTTCTGAT
TCCTTTATGGAGCTATACCGGGCCGGAAACTTTACAGGCGAGAAGTTGAGAGAGAAGAAC
TTCTCCTGGATGGATATTTTTGAGGAA*TTCCCATTAAGGTTTCAAACTCTGCGCTTGTC
AGTGCCTTCATGACTGAACTGGAGACTGATGCACCTGTCTCACAGGGTGATTATGATCGT
CTACACTCATCAACCACTCCTTTCCTTGAGAACAATATGGAGTTTCTGATTAAATGCATG
GATGATTTATC

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DS 

RD RS1GP07TF 618 0 0
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GCCGGAAACTTTACAGGCGAGAAGTTGAGAGAGAAGAACTTCTCCTGGATGGATATTTTT
GAGGAAATTCCCATTAAGGTTTCAAACTCTGCGCTTGTCAGTGCCTTCATGACTGAACTG
GAGACTGATGCACCTGTCTCACAGGGTGATTATGATCGTCTACACTCATCAACCACTCCT
TTCCTTGAGAACAATATGGAGTTTCTGATTAAATGCATGGATGATTTATCTATGGAACAG
CAAAAGTTCCAATACTACTACCGGAACCTGTCTCGTCAGCAAGCGCAGCAGCAAGCCTGG
CTCCAGAAGAGGAGGACGGAGAATATGGGTCGTAGATCAGCTGGAGAAGAGGCTTTGCCC
GAAGAGGATCCTTCAAACCCAATCTTTAAGCCGATCCCTGAACCTTCAAGGCTAGAGAGT
TTCCTCATCACAAACCAAGTCTCGAACTTCTGTGGTCAAATCAATGGAGTGGCTGGCCAG
AACTTCA

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DS 

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GG
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TTGAAGCTTTCTGATTCCTTTATGGAGCTATACCGGGCCGGAAACTTTACAGGCGAGAAG
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AACTCTGCGCTTGTCAGTGCCTTCATGACTGAACTGGAGACTGATGCACCTGTCTCACAG
GGTGATTATGATCGTCTACACTCATCAACCACTCCTTTCCTTGAGAACAATATGGAGTTT
CTGATTAAATGCATGGATGATTTATCTATGGAACAGCAAAAGTTCCAATACTACTACCGG
AACCTGTCTCGTCAGCAAGCGCAGCAGCAAGCCTGGCTCCAGAAGAGGAGGACGGAGAAT
ATGGGTCGTAGATCAGCTGGAGAAGAGGCTTTGCCCGAAGAGGATCCTTCAAACCCAATC
TTTAAGCCGATCCCTGAACCTTCAAGGCTAGAGAGTTTCCTCATCACAAACCAAGTCTCG
AACTTCTGTGGTCAAATCAATGGAGTGGCTGGCCAGAACTTCAGCAGGCTCTACCTGACC
AAGGCATTGCACAATAACTGATTACAACAAGACCACCAAATTTTTGTTTCGAGTCGAGAG
AAAGTGAGAAAACGGATCCTATGTTTGTTTTAATCTTGAAATTTTTCATTATTGTACTTA
AACCACTTCATAATACATAATTTCTGAAAACTTCTTTTTTAGTTCCG

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TTGAGGAAATTCCCATTAAGGTTTCAAACTCTGCGCTTGTCAGTGCCTTCATGACTGAAC
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CTTTCCTTGAGAACAATATGGAGTTTCTGATTAAATGCATGGATGATTTATCTATGGAAC
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GGCTCCAGAAGAGGAGGACGGAGAATATGGGTCGTAGATCAGCTGGAGAAGAGGCTTTGC
CCGAAGAGGATCCTTCAAACCCAATCTTTAAGCCGATCCCTGAACCTTCAAGGCTAGAGA
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CTTGAAATTTTTCATTATTGTAGTTAAACCACTTCATAATACATAATTTCTG
C

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TTGAGGAAATTCCCATTAAGGTTTCAAACTCTGCGCTTGTCAGTGCCTTCATGACTGAAC
TGGAGACTGATGCACCTGTCTCACAGGGTGATTATGATCGTCTACACTCATCAACCACTC
CTTTCCTTGAGAACAATATGGAGTTTCTGATTAAATGCATGGATGATTTATCTATGGAAC
AGCAAAAGTTCCAATACTACTACCGGAACCTGTCTCGTCAGCAAGCGCAGCAGCAAGCCT
GGCTCCAGAAGAGGAGGACGGAGAATATGGGTCGTAGATCAGCTGGAGAAGAGGCTTTGC
CCGAAGAGGATCCTTCAAACCCAATCTTTAAGCCGATCCCTGAACCTTCAAGGCTAGAGA
GTTTCCTCATCACAAACCAAGTCTCGAACTTCTGTGGTCAAATCAATGGAGTGGCTGGCC
AGAACTTCAGCAGGCTCTACCTGACCAAGGCATTGCACGATAACTGATTACAACAAGACC
ACCAAATTTTTGTTTCGAGTCGAGAGAAAGTGAGAAAACGGATCCTATGTTTGTTTTAAT
CTTGAAATTTTTCATTATTGTAGTTAAACCACTTCATAATACATAATTTCTG
C

QA 1 652 1 652
DS 



AS 2 8

CO CL585Contig1 761 5 12 U
CTAGGTTCCAACATCGTTATTATTATTAATGTTAAACAAGTCTTGGGGGATACAAAACAA
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TGTTTGTATTCACAATGGGCTTTTGAAACTCACCAACACACACAAAAAAACAGCTTTATT
TACAAACTAGGCAACCAACCCATCATTCAATCACACTTCAAAAGACTCCTCCATCAAGCA
TGGAGTTGATATCATCTAAGCTCCATAGCTCCATTGGGTTTTCCTCTTCCTGAGTCACAC
CAGCAGCATCTACGCCGAGCATATCTTCCACTTCTAAAGGAGTTTCCCACATGGCGTTGT
CAAGGTAGACCATCAAATCATCATTGTTGCTCGTCTCGTCCTCGGAGTTGAGTTTGACCT
TCTTGGCTGCATTGGTTTCTTCAGCAAAGGTGGTAGCTTGGTTGTTATTGACTAGCATCG
AGGAGATCTCTGGTGGTGTCTTGGGACCATGATCACTCCACCCAAACTCAGAGCAGTCGA
AAGAGTCACTGCCCTGATCAGAACTGAAGTACTGTCCAACGTCGAAGAACTGATTGTTGT
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TCAAATGTGCTGTTGGCTGCTGAACCAAAGCTACGGTTTGGTTTGGTTTAGCCACTGGCT
TCTTAAGATTACTGGTCTTACCAGTAGGGACCATCTTCTCC


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RS1G780JQ U 84
AF RS1FG34JQ U 1
AF RS1FG34TF C 1
AF RS1BT18JQ U 1
AF RS1B341JQ U 86
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BS 129 220 RS1BT18JQ
BS 221 221 RS1G780JQ
BS 222 367 RS1BT18JQ
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RD RS1G780JQ 178 0 0
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TGAAACTCACCAACACACACAAAAAAACAGCTTTATTTACAAACTAGGCAACCAACCCAT
CATTCAATCACACTTCAAAAAACTCCTCCATCAAGCATGGAGTTGATATCATCTAAGC

QA 1 178 1 178
DS 

RD RS1FG34JQ 363 0 0
GG
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C

QA 3 362 3 362
DS 

RD RS1FG34TF 363 0 0
GG
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CCCTGTGAGACAACAACAACAAACACAAAAACAAAACTCAAGATTTAAAGTAAACCGCTG
TTTGTATTCACAATGGGCTTTTGAAACTCACCAACACACACAAAAAAACAGCTTTATTTA
CAAACTAGGCAACCAACCCATCATTCAATCACACTTCAGAAGACTCCTCCATCAAGCATG
GAGTTGATATCATCTAAGCTCCATAGCTCCATTGGGTTTTCCTCTTCCTGAGTCACACCA
GCAGCATCTACGCCGAGCATATCTTCCACTTCTAAAGGAGTTTCCCACATGGCGTTGTCA
C

QA 3 362 3 362
DS 

RD RS1BT18JQ 757 0 0
CTAGGTTCCAACATCGTTATTATTATTAATGTTAAACAAGTCTTGGGGGATACAAAACAA
AGCCCTGTGAGACAACAACAACAAACACAAAAACAAAACTCAAGATTTAAAGTAAACCGC
TGTTTGTCTTCACAATGGGCTTTTGAAACTCACCAACACACACAAAAAAACAGCTTTATT
TACAAACTAGGCAACCAACCCATCATTCAATCACACTTCAGAAGACTCCTCCATCAAGCA
TGGAGTTGATATCATCTAAGCTCCATAGCTCCATTGGGTTTTCCTCTTCCTGAGTCACAC
CAGCAGCATCTACGCCGAGCATATCTTCCACTTCTAAAGGAGTTTCCCACATGGCGTTGT
CAAGGTATGCCATCAGATCATCATTGTTGCTCGTCTCGTCCTCGGAGTTGAGTTTGACCT
TCTTGGCTGCATTGGTTTCTTCAGCAAAGGTGGTAGCTTGGTTGTTATTGACTAGCATCG
AGGAGATCTCTGGTGGTGTCTTGGGACCATGATCACTCCACCCAAACTCAGAGCAGTCGA
AAGAGTCACTGCCCTGATCAGAACTGAAGTACTGTCCAACGTCGAAGAACTGATTGTTGT
ACATCTGAGGCTTCTCTTCAATGAAACTCAAATCACCAAAGGAGTTGTTGCAGTACTGAC
TCAGATGTGCTGTTGGCTGCTGAACCAAAGCTACGGTTTGGTTTGGTTTAGCCACTGGCT
TCTTAAGATTACTGGTCTTACCAGTAGGGACCATCTT

QA 1 757 1 757
DS 

RD RS1B341JQ 676 0 0
CG
CAAAAACAAAACTCAAGATTTAAAGTAAACCGCTGTTTGTCTTCACAATGGGCTTTTGAA
ACTCACCAACACACACAAAAAAACAGCTTTATTTACAAACTAGGCAACCAACCCATCATT
CAATCACACTTCAAAAGACTCCTCCATCAAGCATGGAGTTGATATCATCTAAGCTCCATA
GCTCCATTGGGTTTTCCTCTTCCTGAGTCACACCAGCAGCATCTACGCCGAGCATATCTT
CCACTTCTAAAGGAGTTTCCCACATGGCGTTGTCAAGGTAGACCATCAAATCATCATTGT
TGCTCGTCTCGTCCTCGGAGTTGAGTTTGACCTTCTTGGCTGCATTGGTTTCTTCAGCAA
AGGTGGTAGCTTGGTTGTTATTGACTAGCATCGAGGAGATCTCTGGTGGTGTCTTGGGAC
CATGATCACTCCACCCAAACTCAGAGCAGTCGAAAGAGTCACTGCCCTGATCAGAACTGA
AGTACTGTCCAACGTCGAAGAACTGATTGTTGTACATCTGAGGCTTCTCTTCAATGAAAC
TCAAATCACCAAAGGAGTTGTTGCAGTACTGACTCAAATGTGCTGTTGGCTGCTGAACCA
AAGCTACGGTTTGGTTTGGTTTAGCCACTGGCTTCTTAAGATTACTGGTCTTACCAGTAG
GGACCATCTTCTCC

QA 3 676 3 676
DS 



CO CL585Contig2 767 3 16 U
GGGGAGAGCATCAAACCACAGAGAGAGTAAACGATTAAATACAAAGAGAACCCCAAAGAA
GCTAATATTTACCATTTCGCCGCTAAGTTTACATTTCCGGAACATTTAACACCCTCAAAG
AAGTTTAACGCCGCCATGTGTGGAGGAGCAATAATCTCCGATTTCATCCCTCCGCCGAAG
TCCCGCCGCGTCACCAGCGAGTTTATCTGGCCGGATCCGAAGAAGAAGTCGAAGAGGCGA
TCCAGTTTCTTCGATCTGGACGACGAATTCGAGGCTGATTTCAAAGGGTTCAAGGATGAT
GATGATTATTCTTCTTTTGACTGCGAAGATGTGAAGAAGCCCTTTGTCTTCACCGCACCT
ACCAAACTCGTAGCTTCCCGTCCCACCACCCTCGCCACCACTGGTTCAGTTTCTGGCAAG
AAGACCATAGACTCCGATGAGAAATCTGGCAAGAGGAAGAGAAAGAATCAGTACAGGGGG
ATTAGGCTGCGCCCCTGGGGAAAATGGGCTGCTGAGATCCGTGATCCTAAAAAAGGCTCT
CGAGAATGGCTTGGAACGTTCGACACCGCCGAGGAAGCAGCAAGAGCTTATGATGCAGCT
GCACGTAGGATCCGTGGCGATAAAGCTAAAGTGAACTTCCCTGAGGAGAAGATGGTCCCT
ACTGGTAAGACCAGTAATCTTAAGAAGCCAGTGGCTAACCAAACCAAACCGTAGCTTTGG
TTCAGCAGCCAACAGCACATCTGAGTCAGTACTGCACACTCCTTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G780TF U 1
AF RS1BT18TF U 11
AF RS1B341TF U 287
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BS 415 415 RS1BT18TF
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RD RS1G780TF 718 0 0
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GATGATTATTCTTCTTTTGACTGCGAAGATGTGAAGAAGCCCTTTGTCTTCACCGCACCT
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CGAGAATGGCTTGGAACGTTCGACACCGCCGAGGAAGCAGCAAGAGCTTATGATGCAGCT
GCACGTAGGATCCGTGGCGATAAAGCTAAAGTGAACTTCCCTGAGGAGAAGATGGTCCCT
ACTGGTAAGACCAGTAATCTTAAGAAGCCAGTGGCTAACCAAACCAA*CCGTAGCTTT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1BT18TF 757 0 0
GG
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GCCATGTGTGGAGGAGCAATAATCTCCGATTTCATCCCTCCGCCGAAGTCCCGCCGCGTC
ACCAGCGAGTTTATCTGGCCGGATCCGAAGAAGAAGTCGAAGAGGCGATCCAGTTTCTTC
GATCTGGACGACGAATTCGAGGCTGATTTCAAAGGGTTCAAGGATGATGATGATTATTCC
TCTTTTGACTGCGAAGATGTGAAGAAGCCCTTTGTCTTCACCGCACCTACCAAACTCGTA
GCTTCCCGTCCCACCACCCTCGCCACCACTGGTTCAGTTTCTGGCAAGAAGACCATAGAC
TCCGATGAGAAATCTGGCAAGAGGAAGAGAAAGAATCAGTACAGGGGGATTAGGCTGCGC
CCCTGGGGAAAATGGGCTGCTGAGATCCGTGATCCTAAAAAAGGCTCTCGAGAATGGCTT
GGAACGTTCGACACCGCCGAGGAAGCAGCAAGAGCTTATGATGCAGCTGCACGTAGGATC
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CAGCACATCTGAGTCAGTACTGCACACTCCTTTGG

QA 3 757 3 757
DS 

RD RS1B341TF 469 0 0
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TCTTCACCGCACCTACCAAACTCGTAGCTTCCCGTCCCACCACCCTCGCCACCACTGGTT
CAGTTTCTGGCAAGAAGACCATAGACTCCGATGAGAAATCTGGCAAGAGGAAGAGAAAGA
ATCAGTACAGGGGGATTAGGCTGCGCCCCTGGGGAAAATGGGCTGCTGAGATCCGTGATC
CTAAAAAAGGCTCTCGAGAATGGCTTGGAACGTTCGACACCGCCGAGGAAGCAGCAAGAG
CTTATGATGCAGCTGCACGTAG*ATCCGTGGTGATAAAGCTAAAGTGAACTTCCCTGAGG
AGAAGATGGTCCCTACTGGTAAGACCAGTAATCTTAAGAAGCCAGTGGCTAACCAAACCA
AACCGTAGCTTTGGTTCAGCAGCCAACAGCACATCTGAGTCAGTACTGC

QA 1 469 1 469
DS 



AS 2 6

CO CL586Contig1 749 4 6 U
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AATTAAAAAGTGTAAAATATTATACTAACAATAAAAGATGGGTTACATTTCGCCCTCGAT
AGTTGCATTTCTAGTCGCATTTGCCTTGCCCGTGGTTCTAGCCACCGATACAGCACCGAT
TCCAGAAGTCAGATCCCAAATTCCCCAATGGTTCAAGACCAACGTTGCACCCTATTCCCA
AAGAAAGGGAACTCTAGACCCTGCCCTCGATGCTGCTGAAGCTGCACGACAAATTATCAC
CGTTAATCCAAAAGGAGGTGCCAACTTTAAGTCAATAAACGAAGCGATTAAGAGCATTCC
GATAGGAAACAAGAAGCGTATGATCATCAAGTTGGCTCCAGGTATATACTATGAAAAGGT
CACGATCGACATAGGTCGACCATTCGTTACATTGCTTGCTCAACCTGGTTCACAAACGGT
CTTAACTTACCACGGGACGGCCGCTAAGTACGGAACCGTAGAGAGTGCAACTCTTATTGT
CTGGTCTGATTATTTCATGGCAGCTAACCTCATCATTAAAAATACTTCTCCTATGCCGAA
ACCAGGCTCACAAGGACAAGCTCTAGCTATGAGGATCAACGGTGATTATGCAGCTTTCTA
CACCTGTAGTTTCTACGTTTTCAAGATACTCTATGCGACGACAAAGCAACATTTCTTCAG
ACTGTTACATCGAAGACCTATGATTTATC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H338TF U 1
AF RS1CN81TF U 1
AF RS1GS93TF U 1
AF RS1FP45TF U 1
BS 1 146 RS1CN81TF
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BS 675 749 RS1FP45TF

RD RS1H338TF 582 0 0
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AATTAAAAAGTGTAAAATATTATACTAACAATAAAAGATGGGTTACATTTCGCCCTCGAT
AGTTGCATTTCTAGTCGCATTTGCCTTGCCCGTGGTTCTAGCCACCGATACAGCACCGAT
TCCAGAAGTCAGATCCCAAATTCCCCAATGGTTCAAGACCAACGTTGCACCCTATTCCCA
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CGTTAATCCAAAAGGAGGTGCCAACTTTAAGTCAATAAACGAAGCGATTAAGAGCATTCC
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CACGATCGACATAGGTCGACCATTCGTTACATTGCTTGCTCAACCTGGTTCACAAACGGT
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CTGGTCTGATTATTTCATGGCAGCTAACCTCATCATTAAAAA

QA 1 582 1 582
DS 

RD RS1CN81TF 674 0 0
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AATTAAAAAGTGTAAAATATTATACTAACAATAAAAGATGGGTTACATTTCGCCCTCGAT
AGTTGCATTTCTAGTCGCATTTGCCTCGCCCGTGGTTCTAGCCACCGATACAGCACCGAT
TCCAGAAGTCAGATCCCAAATTCCCCAATGGTTCAAGACCAACGTTGCACCCTATTCCCA
AAGAAAGGGAACTCTAGACCCTGCCCTCGATGCTGCTGAAGCTGCACGACAAATTATCAC
CGTTAATCCAAAAGGAGGTGCCAACTTTAAGTCAATAAACGAAGCGATTAAGAGCATTCC
GATAGGAAACAAGAAGCGTATGATCATCAAGTTGGCTCCAGGTATATACTATGAAAAGGT
CACGATCGACATAGGTCGATCATTCGTTACATTGCTTGCTCAACCTGGTTCACAAACGGT
CTTAACTTACCACGGGACGGCCGCTAAGTACGGAACCGTAGAGAGTGCAACTCTTATTGT
CTGGTCTGATTATTTCATGGCAGCTAACCTCATCATTAAAAATACTTCTCCTATGCCGAA
ACCAGGCTCACAAGGACAAGCTCTAGCTATGAGGATCAACGGTGATTATGCAGCTTTCTA
CACCTGTAGTTTCT

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1GS93TF 673 0 0
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AATTAAAAAGTGTAAAATATTATACTAACAATAAAAGATGGGTTACATTTCGCCCTCGAT
AGTTGCATTTCTAGTCGCATTTGCCTTGCCCGTGGTTCTAGCCACCGATACAGCACCGAT
TCCAGAAGTCAGATCCCAAATTCCCCAATGGTTCAAGACCAACGTTGCACCCTATTCCCA
AAGAAAGGGAACTCTAGACCCTGCCCTCGATGCTGCTGAAGCTGCACGACAAATTATCAC
CGTTAATCCAAAAGGAGGTGCCAACTTTAAGGCAATAAACGAAGCGATTAAGAGCATTCC
GATAGGAAACAAGAAGCGTATGATCATCAAGTTGGCTCCAGGTATATACTATGAAAAGGT
CACGATCGACATAGGTCGACCATTCGTTACATTGCTTGCTCAACCTGGTTCACAAACGGT
CTTAACTTACCACGGGACGGCCGCTAAGTACGGAACCGTAGAGAGTGCAACTCTTATTGT
CTGGTCTGATTATTTCATGGCAGCTAACCTCATCATTAAAAATACTTCTCCTATGCCGAA
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CACCTGTAGT
CTC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RS1FP45TF 749 0 0
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AATTAAAAAGTGTAAAATATTATACTAACAATAAAAGATGGGTTACATTTCGCCCTCGAT
AGTTGCATTTCTAGTCGCATTTGCCTTGCCCGTGGTTCTAGCCACCGATACAGCACCGAT
TCCAGAAGTCAGATCCCAAATTCCCCAATGGTTCAAGACCAACGTTGCACCCTATTCCCA
AAGAAAGGGAACTCTAGACCCTGCCCTCGATGCTGCTGAAGCTGCACGACAAATTATCAC
CGTTAATCCAAAAGGAGGTGCCAACTTTAAGTCAATAAACGAAGCGATTAAGAGCATTCC
GATAGGAAACAAGAAGCGTATGATCATCAAGTTGGCTCCAGGTATATACTATGAAAAGGT
CACGATCGACATAGGTCGACCATTCGTTACATTGCTTGCTCAACCTGGTTCACAAACGGT
CTTAACTTACCACGGGACGGCCGCTAAGTACGGAACCGTAGAGAGTGCAACTCTTATTGT
CTGGTCTGATTATTTCATGGCAGCTAACCTCATCATTAAAAATACTTCTCCTATGCCGAA
ACCAGGCTCACAAGGACAAGCTCTAGCTATGAGGATCAACGGTGATTATGCAGCTTTCTA
CACCTGTAGTTTCTACGTTTTCAAGATACTCTATGCGACGACAAAGCAACATTTCTTCAG
ACTGTTACATCGAAGACCTATGATTTATC

QA 1 749 1 749
DS 



CO CL586Contig2 693 2 2 U
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ACACTTATACTCTCCATAGAAGACCGTCTTGTCATACCCGCGGTTGAAGTTTTCCCTCCA
GCCAGCTGGGTTGACCACGCTGGTCATCTCTGTGAAAGCATAAATGACTTTGGGGTGGCT
CATCCAAGATCGGCCCAAATAAATTCCGGTTCCGGTTCCAGTGATTTTGCAGTGCACGAA
TGTGTATCCGTTTTGTTCGGTGTTACTTGTTCTGCTTTGTGCCGTAATCACTCTTAATCC
GTCTCCAACAGCGTGTAATTTCGTGTTCAAGTACAAGGAAGCTCCTCTTCCGAAGATAAA
ATCATAGGTTCCTTCGATGTAACAGTCCTTGAAGAAATGGTTGCCTTTGTCGTCGCATAG
AGTATCTTGAAAACCGTAGAAACTACAGGTGTAGAAAGCTGCATAATCACCGTTGATCCT
CATAGCTAGAGCTTGTCCTTGTGAGCCTGGTTT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1FP45JQ U 1
AF RS1H338JQB U 1
BS 1 691 RS1FP45JQ
BS 692 693 RS1H338JQB

RD RS1FP45JQ 691 0 0
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AGGAGGAAGAAGCCACTTGGAGCCCTTAATGTAACCAAGAGTGAGGAAAGGCCTAACTTC
GTTTTGGTCAACATCTTGTGTGTAAGGCACTCTCTTCTCTTGGTGTGACCCTGGTCCAAA
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GCCAGCTGGGTTGACCACGCTGGTCATCTCTGTGAAAGCATAAATGACTTTGGGGTGGCT
CATCCAAGATCGGCCCAAATAAATTCCGGTTCCGGTTCCAGTGATTTTGCAGTGCACGAA
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CATAGCTAGAGCTTGTCCTTGTGAGCCTGGT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1H338JQB 693 0 0
G
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GCCGAAAGGACTGTTAAAAATCAATATTTTGTCTTTAAAGAAATTTCTCAGTATTTAGGA
GGAGGAAGAAGCCACTTGGAGCCCTTAATGTAACCAAGAGTGAGGAAAGGCCTAACTTCG
TTTTGGTCAACATCTTGTGTGTAAGGCACTCTCTTCTCTTGGTGTGACCCTGGTCCAAAA
CACTTATACTCTCCATAGAAGACCGTCTTGTCATACCCGCGGTTGAAGTTTTCCCTCCAG
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ATCCAAGATCGGCCCAAATAAATTCCGGTTCCGGTTCCAGTGATTTTGCAGTGCACGAAT
GTGTATCCGTTTTGTTCGGTGTTACTTGTTCTGCTTTGTGCCGTAATCACTCTTAATCCG
TCTCCAACAGCGTGTAATTTCGTGTTCAAGTACAAGGAAGCTCCTCTTCCGAAGATAAAA
TCATAGGTTCCTTCGATGTAACAGTCCTTGAAGAAATGGTTGCCTTTGTCGTCGCATAGA
GTATCTTGAAAACCGTAGAAACTACAGGTGTAGAAAGCTGCATAATCACCGTTGATCCTC
ATAGCTAGAGCTTGTCCTTGTGAGCCTGGTTT

QA 2 693 2 693
DS 



AS 1 7

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GAACCAACCACCATATGATATATCATTCGCTTAAAGTGAGTGGCCTATTAAGGGAAATAT
TGTGTAAAAACAAAAATAATGGAAATAGTAGCCGCCAAATGGTTCGAGGTGATGATGACC
TCTAAGATGCGACTGGTTTTGAAGTGGCCTTCTTAACAGCTTCAGCATAGGTCCTGTGCT
GGTATGTTAAGGTCGACTCAAGCAAGTCCCAAAGAGATGTCTTCGGGTTCCATCCAAGTT
GACGGTTGATGATGGTCATGTCTGGGATTCTCTTGTCGCTGTCATCATAACCTTCTCCAT
AGAATTCTTTGGAGCTCACATCTATAGTTGGACTCTCTATAGCCGTCTCTCCACTCACTT
TTGAGTAGACCTTAGTCATCATTTCCGCAAGCTGCCTTACTGTCACTTCATTGTTTGGGT
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CTTCAATGGCATCTTTGATGTAGATGAAAGTTCTCTGTGATTCACCACCATCCACAAGCT
TAAGAGGCTCGCGCCTCAGAAGGTTGTTGCTGAAGCACGCTAGGACACGAGGGACACCCT
CGCTGGGACCATCAATGCCAGGGATGAAATCCATCCTAGGTCCAATCCAGTTAAACGGTC
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GTTGCTTAGCACAAGCATATGACCACCTCTGCTTCTCAATAGAACCAAAAATGCAAGGAG
ACGTATCTTCTTTGAGTACATAAAAATCAGGATCCTGACGCAGAGGATGATCCTTTGGAA
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GGATCCTCTCGGCCCACTCGGAGGTGTCAGGCTCGAGGAGGTGCTTGATCTTGTCGTTGT
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AGCCGATGAATCCGCCGGCGCCGATCATGCAGATCGTGAGCGGCTTGATCGGTTTGCCGT
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GGAAGGAATCGGAGGAGAAGAGTGGTGTATAGAAACGCGTGGATCTGTCACACTCACACG
ATCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1F640JQ U 35
AF RS1BG23JQ U 2
AF RS1GE79JQ U 1
AF RS1BN68JQ U 1
AF RS1BG23TF C 275
AF RS1GE79TF C 278
AF RS1F640TF C 776
BS 1 153 RS1BN68JQ
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BS 820 973 RS1BG23TF
BS 974 974 RS1GE79TF
BS 975 997 RS1BG23TF
BS 998 1072 RS1GE79TF
BS 1073 1504 RS1F640TF

RD RS1F640JQ 585 0 0
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TCTATATAACAATAAAACGTTAACTAAAACCAACCACCATATGATATATCATTCCCTTAA
AGTGAGTGGCCTATTAAGGGAAATATTGTGTAAAAACAAAAATAATGGAAATAGTAGCCG
CCAAATGGTTCGAGGTGATGATGGCCTCTAAGATGCGACTGGTTTTGAAGTGGCCTTCTT
AACAGCTTCAGCATAGGTCCTGTGCTGGTATGTTAAGGTCGACTCAAGCAAGTCCCAAAA
AAATGTCTTCGGGTTCCATCCAAGTTGACGGTTGATGATGGTCATGTCTGGGATTCT**T
GTCGCTGTCATCATAACCTTCTCCATAAAATTCTTTGGAGCTCACATCTATAGTTGGACT
CTCTATAGCCGTCTCTCCACTCACTTTTGAGTAAACCTTAGTCATCATTTCCGCAAGCTG
CCTTACTGTCACTTCATTGTTTGGGTTTCCTACATTGAAAATATGCCCATTGGCTCTCTC
TGGGTTTTCAATCATCAAGAGGACAGCTTCAATGGCATCTTTGAT

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DS 

RD RS1BG23JQ 618 0 0
AACAAACCATTCTCTTTTGTTT*AGTTGTTTTTGGGGACAAATACAAAGATATAAAGCTT
CAACAACGAACTCAAAAACATTAACAGTAATACTCTATATAACAATAAAACGTTAACTAG
AACCAACCACCATATGATATATCATTCGCTTAAAGTG****GCCTATTAAGGGAAATATT
GTGTAAAAACAAAAATAATGGAAATAGTAGCCGCCAAATGGTTCGAGGTGATGATGACCT
CTAAGATGCGACTGGTTTTGAAGTGGCCTTCTTAACAGCTTCAGCATAGGTCCTGTGCTG
GTAAGTTAAGGTCGACTCAAGCAAGTCCCAAAGAGATGTCTTCGGGTTCCATCCAAGTTG
ACGGTTGATGATGGTCATGTCTGGGATTCTCTTGTCGCTGTCATCATAACCTTCTCCATA
GAATTCTTTGGAGCTCACATCTATAGTTGGACTCTCTATAGCTGTCTCTCCACTCACTTT
TGAGTAGACCTTAGTCATCATTTCGGCAAGCTGCCTTACCGTCACTTCATTGTTTGGGTT
TCCTACATTGAAGATATGCCCATTGGCTCTCTCTGGGTTTTCAATCATCAAGAGGACAGC
TTCAATGGCATCTTTGAT

QA 1 618 1 618
DS 

RD RS1GE79JQ 662 0 0
A
AACAAACCATTCTCTTTTTTTTTAGTTGTTTTTGGGGACAAATACAAAGATATAAAGCTT
CAACAACAAACTCAAAAACATTAACAGTAATACTCTATATAACAATAAAACGTTAACTAG
AACCAACCACCATATGATATATCATTCGCTTAAAGTGAGTGGCCTATTAAGGGAAATATT
GTGTAAAAACAAAAATAATGGAAATAGTAGCCGCCAAATGGTTCGAGGTGATGATGACCT
CTAAGATGCGACTGGTTTTGAAGTGGCCTTCTTAACAGCTTCAGCATAGGTCCTGTGCTG
GTATGTTAAGGTCGACTCAAGCAAGTCCCAAAGAGATGTCTTCGGGTTCCATCCAAGTTG
ACGGTTGATGATGGTCATGTCTGGGATTCTCTTGTCGCTGTCATCATAACCTTCTCCATA
GAATTCTTTGGGGCTCACATCTATAGTTGGACTCTCTATAGCCGTCTCTCCACTCACTTT
TGAGTAGACCTTAGTCATCATTTCCGCAAGCTGCCTTACTGTCACTTCATTGTTTGGGTT
TCCTACATTGAAGATATGCCCATTGGCTCTCTCTGGGTTTTCAATCATCAAGAGGACAGC
TTCAATGGCATCTTTGATGTAGATGAAAGTTCTCTGTGATTCACCACCATCCACAAGCTT
A

QA 2 662 2 662
DS 

RD RS1BN68JQ 783 0 0
AAACAAACCATTCTCTTTTTTTT*AGTTGTTTTTGGGGACAAATACAAAGATATAAAGCT
TCAACAACGAACTCAAAAACATTAACAGTAATACTCTATATAACAATAAAACGTTAACTA
GAACCAACCACCATATGATATATCATTCGCTTAGAGTGAGTGGCCTATTAAGGGAAATAT
TGTGTAGAAACAAAAATAATGGAAATAGTAGCCGCCAAATGGTTCGAGGTGATGATGACC
TCTAAGATGCGACTGGTTTTGAAGTGGCCTTCTTAACAGCTTCAGCATAGGTCCTGTGCT
GGTATGTTAAGGTCGACTCAAGCAAGTCCCAAAGAGATGTCTTCGGGTTCCATCCAAGTT
GACGGTTGATGATGGTCATGTCTGGGATTCTCTTGTCGCTGTCATCATAACCTTCTCCAT
AGAATTCTTTGGAGCTCACATCTATAGTTGGACTCTCTATAGCCGTCTCTCCACTCACTT
TTGAGTAGACCTTAGTCATCATTTCCGCAAGCTGCCTTACTGTCACTTCATTGTTTGGGT
TTCCTACATTGAAGATATGCCCATTGGCTCTCTCTGGGTTTTCAATCATCAAGAGGACAG
CTTCAATGGCATCTTTGATGTAGATGAAAGTTCTCTGTGATTCACCACCATCCACAAGCT
TAAGAGGCTCGCGCCTCAGAAGGTTGTTGCTGAAGCACGCTAGGACACGAGGGACACCCT
CGCTGGGACCATCAATGCCAGGGATGAAATCCATCCTAG*TCCA*TCCAGTTAAACGG
CTCAC

QA 1 778 1 778
DS 

RD RS1BG23TF 724 0 0
AACAGCTTCAGCATAGGTCCTGTGCTGGTAAGTTAAGGTCGACTCAAGCAAGTCCCAAAG
AGATGTCTTCGGGTTCCATCCAAGTTGACGGTTGATGATGGTCATGTCTGGGATTCTCTT
GTCGCTGTCATCATAACCTTCTCCATAGAATTCTTTGGAGCTCACATCTATAGTTGGACT
CTCTATAGCTGTCTCTCCACTCACTTTTGAGTAGACCTTAGTCATCATTTCGGCAAGCTG
CCTTACCGTCACTTCATTGTTTGGGTTTCCTACATTGAAGATATGCCCATTGGCTCTCTC
TGGGTTTTCAATCATCAAGAGGACAGCTTCAATGGCATCTTTGATGTAGATGAAGGTTCT
CTGTGATTCTCCGCCATCCACAAGCTTAAGAGGCTCGCGCCTCAGAAGGTTGTTGCTGAA
GCACGCTAGGACGCGAGGGACACCCTCGCTGGGACCATCAATGCCAGGGATGAAATCCAT
CCTAGGTCCAATCCAGTTAAACGGTCTCACAATGGTGAACTCAAGTCCGTTCTCAGCACC
CTCATCATAGACAAGTCTCTCAATCAGTTGCTTAGCACAAGCATATGACCACCTCTGCTT
CTCAATAGAACCAAAAATGCAAGGAGACGTATCTTCTTTGAGTACATAAAAATCAGGATC
CTGACGCAGAGGATGATCCTTTGGAAGAAAGCTACCAATGGTTTTCCCATACACTTCACA
AGT
C

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1GE79TF 796 0 0
ACAGCTTCAGCATAGT
CTGTGCTGGTATGT*AAGGTCGACTCAAGCAAGTCCCAAAGAGATGTCTTCGGGTTCCAT
CCAAGTTGACGGTTGATGATGGTCATGTCTGGGATTCTCTTGTCGCTGTCATCATAACTT
TCTCCATAGAAT*CTTTGGGGCTCACATCTATAGTTGGACTCTCTATAGCCGTCTCTCCA
CTCACTTTTGAGTAGACCTTAGTCATCATTTCCGCAAGCTGCCTTACTGTCACTTCATTG
TTTGGGTTTCCTACATTGAAGATATGCCCATTGGCTCTCTCTGGGTTTTCAATCATCAAG
AGGACAGCTTCAATGGCATCTTTGATGTAGATGAAAGTTCTCTGTGATTCACCACCATCC
ACAAGCTTAAGAGGCTCGCGCCTCAGAAGGTTGTTGCTGAAGCACGCTAGGACACGAGGG
ATACCCTCGCTGGGACCATCAATGCCAGGGATGAAATCCATCCTAGGTCCAATCCAGTTA
AACGGTCTCACAATGGTGAACTCAAGTCCGTTCTCAGCACCCTCAGCATAGACAAGTCTC
TCAATCAGTTGCTTAGCACAAGCATATGACCACCTCTGCTTCTCAATAGAACCAAAAATG
CAAGGAGACGTATCTTCTTTGAGTACATAAAAATCAGGATCCTGACGCAGAGGATGATCC
TTTGGAAGAAAGCTACCAATAGTTTTCCCATACACTTCACAAGTGGAGAAATGAATAAGA
CGCTTGTTGTTCTCAGAGCAGTACTTAACCACAGGGAGAGCATCGATGAAATTGCTGTA
C

QA 17 795 17 795
DS 

RD RS1F640TF 729 0 0
CGGTCTCACAATGGTGAACTCAAGTCCGTCC*CAGCACCCTCAGCATAGACAAGTCTCTC
AATCAGTTGCTTAGCACAAGCATATGACCACCTCTGCTTCTCAATAGAACCAAAAATGCA
AGGAGACGTATCTTCTTTGAGTACATAAAAATCAGGATCCTGACGCAGAGGATGATCCTT
TGGAAGAAAGCTACCAATAGTTTTCCCATACACTTCACAAGTGGAGAAATGAATAAGACG
CTTGTTGTTCTCAGAGCAGTACTTAACCACAGGGAGAGCATCGATGAAATTGCTGTAGAT
AGTGTCAAGAGGACGCGTATTGTAATCCGCTGGTGTACAGATCGCAGCGAGATTAATCGT
CAGATCTGCCATCTTGACGAGCCCCTCGAGCCTCGAATCATGCTTGATGTTGATGCGGTG
GAACTGGATCCTCTCGGCCCACTCGGAGGTGTCAGGCTCGAGGAGGTGCTTGATCTTGTC
GTTGTAGACGTCGAGCGCGAGCACCTTGTGCGGGGTCTCGTTCAGGAGCTTCTCGCAGAG
GTGAGAGCCGATGAATCCGCCGGCGCCGATCATGCAGATCGTGAGCGGCTTGATCGGTTT
GCCGTCCAGATCCAATCTAACGGCCGCCCCGTTCGCCATTGTTTGTTTTTTTGTCGGTGG
ATGGAGGAAGGAATCGGAGGAGAAGAGTGGTGTATAGAAACGCGTGGATCTGTCACACTC
ACACGATCC

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 8

CO CL588Contig1 663 8 1 U
GGATCTCCTACGAGATTCTAATTCTAGGGTTGTCTTTCATTTCATTCTTCTGCAAACACA
TAGCGATGGCGGCGAGAAATGCTCTGCTTCGATACCTTAGAGTCAACGTCAATCCATCAC
TACTAAACCCTACAACAATCGGCGCTAGAGAAGCAGCACTGCCTTTCGCCGTCATTCTTC
GTCGTTTCTCGGAGGAAGTTAGAGGATCGTTTCTAGACAAATCTGATGTCACAGATCGCG
TTATCTCCGTCGTCAAAAACTTCCAGAGAGTCGATCCCTCAAAGGTAACACCGAAAGCCC
ATTTCCATAACGATCTAGGGTTAGACAGTTTGGACAGTGTGGAGGTTGTGATGGCATTGG
AGGAAGAATTCAAATTTGAGATCCCTGATAATGAAGCTGACAAGATCCAGTCCGTCGATC
AAGCCGTTGATTTTATCGCTTCTCATCCTCAGGCCACTTAAAAAGGGAAACAAATTCTTC
AGTGTTATGCCATCATGCCTTCTGTGCCCAATAAGAAGTTCAGAAACAAACATATTTTTT
TTGGCTCTACTTTTGTTTTCATATGGTATTAGATGTGTTCTTTGCTTGAGTTTACGAGGT
CTTTCCTGAAACTTTGTTGTTCTTGACAATCTTTTGATGAATAATGCATCAGACACTCGT
TGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 30 30 

AF RS1AZ76JQ C 50
AF RS1AZ76TF U 43
AF RS1F821JQ C 1
AF RS1B491JQ C 78
AF RS1F821TF U 1
AF RS1B491TF U 42
AF RS1CP37JQ C 22
AF RS1CP37TF U 22
BS 1 663 RS1F821TF

RD RS1AZ76JQ 559 0 0
CTGCAAACACATAGCGATGGCGGCGAGAAATGCTCTGCTTCGATACCTTAGAGTCAACGT
CAATCCATCACTACTAAACCCTACAACAATCGGCGCTAGAGAAGCAGCACTGCCTTTCGC
CGTCATTTTTCGTCGTTTCTCGGAGGAAGTTAGAGGATCGTTTCTAGACAAATCTGATGT
CACAGATCGCGTTATCTCCGTCGTCAAAAACTTCCAGAGAGTCGATCTCTCAAAGGTAAC
ACCGAAAGCCCATTTCCATAACGATCTAGGGTTAGACAGTTTGGACAGTGTGGAGGTTGT
GATGGCATTGGAGGAAGAATTCAAATTTGAGATCCCTGATAATGAAGCTGACAAGATCCA
GTCCGTCGATCAAGCCGTTGATTTTATCGCTTCTCATCCTCAGGCCACTTAAAAAGGGAA
ACAAATTCTTCAGTGTTATGCCATCATGCCTTCTGTGCCCAATAAGAAGTTCAGAAACAA
ACATATTTTTTTTGGCTCTACTTTTGTTTTCATATGGTATTAGATGTGTTCTTTGCTTGA
GTTTACGAGGTCTTTCCTG

QA 1 559 1 559
DS 

RD RS1AZ76TF 566 0 0
CATTCTTCTGCAAACACATAGCGATGGCGGCGAGAAATGCTCTGCTTCGATACCTTAGAG
TCAACGTCAATCCATCACTACTAAACCCTACAACAATCGGCGCTAGAGAAGCAGCACTGC
CTTTCGCCGTCATTCTTCGTCGTTTCTCGGAGGAAGTTAGAGGATCGTTTCTAGACAAAT
CTGATGTCACAGATCGCGTTATCTCCGTCGTCAAAAACTTCCAGAGAGTCGATCTCTCAA
AGGTAACACCGAAAGCCCATTTCCATAACGATCTAGGGTTAGACAGTTTGGACAGTGTGG
AGGTTGTGATGGCATTGGAGGAAGAATTCAAATTTGAGATCCCTGATAATGAAGCTGACA
AGATCCAGTCCGTCGATCAAGCCGTTGATTTTATCGCTTCTCATCCTCAGGCCACTTAAA
AAGGGAAACAAATTCTTCAGTGTTATGCCATCATGCCTTCTGTGCCCAATAAGAAGTTCA
GAAACAAACATATTTTTTTTGGCTCTACTTTTGTTTTCATATGGTATTAGATGTGTTCTT
TGCTTGAGTTTACGAGGTCTTTCCTG

QA 1 566 1 566
DS 

RD RS1F821JQ 663 0 0
GGATCTCCTACGAGATTCTAATTCTAGGGTTGTCTTTCATTTCATTCTTCTGCAAACACA
TAGCGATGGCGGCGAGAAATGCTCTGCTTCGATACCTTAGAGTCAACGTCAATCCATCAC
TACTAAACCCTACAACAATCGGCGCTAGAGAAGCAGCACTGCCTTTCGCCGTCATTTTTC
GTCGTTTCTCGGAGGAAGTTAGAGGATCGTTTCTAGACAAATCTGATGTCACAGATCGCG
TTATTTCCGTCGTCAAAAACTTCCAGAGAGTCGATCCCTCAAAGGTAACACCGAAAGCCC
ATTTCCATAACGATCTAGGGTTAGACAGTTTGGACAGTGTGGAGGTTGTGATGGCATTGG
AGGAAGAATTCAAATTTGAGATCCCTGATAATGAAGCTGACAAGATCCAGTCCGTCGATC
AAGCCGTTGATTTTATCGCTTCTCATCCTCAGGCCACTTAAAAAGGGAAACAAATTCTTC
AGTGTTATGCCATCATGCCTTCTGTGCCCAATAAGAAGTTCAGAAACAAACATATTTTTT
TTGGCTCTACTTTTGTTTTCATATGGTATTAGATGTGTTCTTTGCTTGAGTTTACGAGGT
CTTTCCTGAAACTTTGTTGTTCTTGACAATCTTTTGATGAATAATGCATCAGACACTCGT
TGC

QA 1 663 1 663
DS 

RD RS1B491JQ 586 0 0
AATC
CTCTGCTTCGATACCTTAGAGTCAACGTCAATCCATCACTATTAAACCCTACAACAATCG
GCGCTAGAGAAGCAGCACTGCCTTTCGCCGTCATTCTTCGTCGTTTCTCGGAGGAAGTTA
GAGGATCGTTTCTAGACAAATCTGATGTCACAGATCGCGTTATCTCCGTCGTCAAAAACT
TCCAAAGAGTCGATCCCTCAAAGGTAACACCGAAAGCACATTTCCATAACGATCTCGGGT
TAGACATTTTGGACAGTGTGGAGGTTGTGATGGCATTGGAGGAAGAGTTCAAATTTGAGA
TCCCTGATAATGAAGCTGACAAGATCCAGTCCGTCGATCAAGCTGTTGATTTTATCGCTT
CTCATCCTCAGGCCACTTAAAAAGGGAAACAAATTCTTCAGTGTTATGCCATCATGCCTT
CTGTGCCCAATAAGAAGTTCAGAAACAAACATATTTTTTT*GGCTCTACTTTTGTTTTCA
TATGGTATTAGATGTGTTCTTTGCTTGAGTTTACGAGGTCTTTCCTGAAACTTTGTTGTT
CTTGACAATCTTTTGATGAATAATGCATCAGACACTCGTT
AC

QA 5 584 5 584
DS 

RD RS1F821TF 663 0 0
GGATCTCCTACGAGATTCTAATTCTAGGGTTGTCTTTCATTTCATTCTTCTGCAAACACA
TAGCGATGGCGGCGAGAAATGCTCTGCTTCGATACCTTAGAGTCAACGTCAATCCATCAC
TACTAAACCCTACAACAATCGGCGCTAGAGAAGCAGCACTGCCTTTCGCCGTCATTCTTC
GTCGTTTCTCGGAGGAAGTTAGAGGATCGTTTCTAGACAAATCTGATGTCACAGATCGCG
TTATCTCCGTCGTCAAAAACTTCCAGAGAGTCGATCCCTCAAAGGTAACACCGAAAGCCC
ATTTCCATAACGATCTAGGGTTAGACAGTTTGGACAGTGTGGAGGTTGTGATGGCATTGG
AGGAAGAATTCAAATTTGAGATCCCTGATAATGAAGCTGACAAGATCCAGTCCGTCGATC
AAGCCGTTGATTTTATCGCTTCTCATCCTCAGGCCACTTAAAAAGGGAAACAAATTCTTC
AGTGTTATGCCATCATGCCTTCTGTGCCCAATAAGAAGTTCAGAAACAAACATATTTTTT
TTGGCTCTACTTTTGTTTTCATATGGTATTAGATGTGTTCTTTGCTTGAGTTTACGAGGT
CTTTCCTGAAACTTTGTTGTTCTTGACAATCTTTTGATGAATAATGCATCAGACACTCGT
TGC

QA 1 663 1 663
DS 

RD RS1B491TF 622 0 0
GG
ATTCTTCTGCAAACACATAGCGATGGCGGCGAGAAATCCTCTGCTTCGATACCTTAGAGT
CAACGTCAATCCATCACTATTAAACCCTACAACAATCGGCGCTAGAGAAGCAGCACTGCC
TTTCGCCGTCATTCTTCGTCGTTTCTCGGAGGAAGTTAGAGGATCGTTTCTAGACAAATC
TGATGTCACAGATCGCGTTATCTCCGTCGTCAAAAACTTCCAAAGAGTCGATCCCTCAAA
GGTAACACCGAAAGCACATTTCCATAACGATCTCGGGTTAGACATTTTGGACAGTGTGGA
GGTTGTGATGGCATTGGAGGAAGAGTTCAAATTTGAGATCCCTGATAATGAAGCTGACAA
GATCCAGTCCGTCGATCAAGCTGTTGATTTTATCGCTTCTCATCCTCAGGCCACTTAAAA
AGGGAAACAAATTCTTCAGTGTTATGCCATCATGCCTTCTGTGCCCAATAAGAAGTTCAG
AAACAAACATATTTTTTT*GGCTCTACTTTTGTTTTCATATGGTATTAGATGTGTTCTTT
GCTTGAGTTTACGAGGTCTTTCCTGAAACTTTGTTGTTCTTGACAATCTTTTGATGAATA
ATGCATCAGACACTCGTT
AC

QA 3 620 3 620
DS 

RD RS1CP37JQ 642 0 0
GGTG
AGGGTTGTCTTTCATTTCATTCTTCTGCAAGCACATAGCGATGGCGGCGAGAAATGCTCT
TCTTCGATACCTTAGAGTCAACGTCAATCCATCACTACTAAACCCTACAACAATCGGCGC
TAGAGAAGCAGCACTGCCTTTCGCCGTCATTTTTCGTCGTTTCTCGGAGGAAGTTAGAGG
ATCGTTTCTAGACAAATCTGATGTCACAGATCGCGTTATCTCCGTCGTCAAAAACTTCCA
GAGAGTCGATCCCTCAAAGGTAACACCGAAAGCCCATTTCCATAACGATCTAGGGTTAGA
CAGTTTGGACAGTGTGGAGGTTGTGATGGCATTGGAGGAAGAATTCAAATTTGAGATCCC
TGATAATGAAGCTGACAAGATCCAGTCCGTCGATCAAGCCGTTGATTTTATCGCTTCTCA
TCCTCAGGCCACTTAAAAAGGGAAACAAATTCTTCAGTGTTATGCCATCATGCCTTCTGT
GCCCAATAAGAAGTTCAGAAACAAACATATTTTTTTTGGCTCTACTTTTGTTTTCATATG
GTATTAGATGTGTTCTTTGCTTGAGTTTACGAGGTCTTTCCTGAAACTTTGTTGTTCTTG
ACAATCTTTTGATGAATAATGCATCAGACACTCGTTGC

QA 5 642 5 642
DS 

RD RS1CP37TF 642 0 0
GGTG
AGGGTTGTCTTTCATTTCATTCTTCTGCAAGCACATAGCGATGGCGGCGAGAAATGCTCT
TCTTCGATACCTTAGAGTCAACGTCAATCCATCACTACTAAACCCTACAACAATCGGCGC
TAGAGAAGCAGCACTGCCTTTCGCCGTCATTCTTCGTCGTTTCTCGGAGGAAGTTAGAGG
ATCGTTTCTAGACAAATCTGATGTCACAGATCGCGTTATCTCCGTCGTCAAAAACTTCCA
GAGAGTCGATCCCTCAAAGGTAACACCGAAAGCCCATTTCCATAACGATCTAGGGTTAGA
CAGTTTGGACAGTGTGGAGGTTGTGATGGCATTGGAGGAAGAATTCAAATTTGAGATCCC
TGATAATGAAGCTGACAAGATCCAGTCCGTCGATCAAGCCGTTGATTTTATCGCTTCTCA
TCCTCAGGCCACTTAAAAAGGGAAACAAATTCTTCAGTGTTATGCCATCATGCCTTCTGT
GCCCAATAAGAAGTTCAGAAACAAACATATTTTTTTTGGCTCTACTTTTGTTTTCATATG
GTATTAGATGTGTTCTTTGCTTGAGTTTACGAGGTCTTTCCTGAAACTTTGTTGTTCTTG
ACAATCTTTTGATGAATAATGCATCAGACACTCGTTGC

QA 5 642 5 642
DS 



AS 1 8

CO CL589Contig1 719 8 7 U
GGGCAGCAGGAAATGACAAACTTCAGGAAGCTCGGCCGGCATGCGGGTCACCGTATCTCC
ATGCTCAGGACACTGGTGTCTCAATTGGTCAAGCACGAGCGCATAGAAACCACTGTCACT
AAGGCTAAAGAGGTGCGTCGTCTTGCTGATAACATGATTCAACTCGGTAAAGAGGGCTCA
CTCGATTCGGCAAGGCGAGCAGCTGGTTTTGTAAGAGGAGATGATGTCCTTCACAAGATT
TTCACTGAACTGGCTTACCGTTACAAAGATAGAGATGGTGGATACACAAGATTATTACGT
ACTCGCATTCGAGTTGGTGATGCTGCTCCAATGGCCTATATCGAGTTTATAGACAGAGAG
AACGAGCTTAGGCAATCGAATCCAGCAACACCTCAACCACCACAACGAGTGCCGTTGGAC
CCATGGGATAAATCCCGTCTCATGAAGCAAGTTGCTCCACCTAAGGAGGATAAAATCTCT
GATTCCGAGCTATAATGTGGAAAAAAAATATCCCCTTCCCTTTCAAAGAAATGTACTTTC
TTCATCATCCATTATCTGCCATAATATGTTTTTACAGAGGTAAACAATAAAGTTAGGCTT
TTTGTTGTTGGTTCTGAACATTTACAATGGTGTCTTGAATGCATCAACAGTTCTCATGAG
TCTTTTTTGGTTAACTTAACTGTAAGTTAAAAGTTTCTCTTTTCAGTTTTCACTTCTGC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1EI26TF U 1
AF RS1EX80JQ C 1
AF RS1EX80TF U 1
AF RS1EI26JQ C 43
AF RS1AW53JQ C 172
AF RS1DR17JQ C 172
AF RS1AW53TF U 172
AF RS1DR17TF U 172
BS 1 385 RS1EI26TF
BS 386 386 RS1AW53TF
BS 387 445 RS1EI26TF
BS 446 446 RS1AW53TF
BS 447 655 RS1EI26TF
BS 656 656 RS1EX80TF
BS 657 719 RS1AW53TF

RD RS1EI26TF 655 0 0
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AAGGCTAAAGAGGTGCGTCGTCTTGCTGATAACATGATTCAACTCGGTAAAGAGGGCTCA
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TTCACTGAACTGGCTTACCGTTACAAAGATAGAGATGGTGGATACACAAGATTATTACGT
ACTCGCATTCGAGTTGGTGATGCTGCTCCAATGGCCTATATCGAGTTTATAGACAGAGAG
AACGAGCTTAGGCAATCGAATCCAGTAACACCTCAACCACCACAACGAGTGCCGTTGGAC
CCATGGGATAAATCCCGTCTCATGAGGCAAGTTGCTCCACCTAAGGAGGATAAAATCTCT
GATTCCGAGCTATAATGTGGAAAAAAAATATCCCCTTCCCTTTCAAAGAAATGTACTTTC
TTCATCATCCATTATCTGCCATAATATGTTTTTACAGAGGTAAACAATAAAGTTAGGCTT
TTTGTTGTTGGTTCTGAACATTTACAATGGTGTCTTGAATGCATCAACAGTTCTC

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1EX80JQ 653 0 0
GGGCAGCAGGAAATGACAAACTTCAGGAAGCTCGGCCGGCATGCGGGTCACCGTATCTCC
ATGCTCAGGACACTGGTGTCTCAATTGGTCAAGCACGAGCGCATAGAAACCACTGTCACT
AAGGCTAAAGAGGTGGGTCGTCTTGCTGATAACATGATTCAACTCGGTAAAGAGGGCTCA
CTCGATTCGGCAAGGCGAGCAGCTGGTTTTGTAAGAGGAGATGATGTCCTTCACAAGATT
TTCACTGAACTGGCTTACCGTTACAAAGATAGAGATGGTGGATACACAAGATTATTACGT
ACTCGCATTCGAGTTGGTGATGCTGCTCCAATGGCCTATATCGAGTTTATAGACAGAGAG
AACGAGCTTAGGCAATCGAATCCAGTAACACCTCAACCACCACAACGAGTGCCGTTGGAC
CCATGGGATAAATCCCGTCTCATGAGGCAAGTTGCTCCACCTAAGGAGGATAAAATCTCT
GATTCCGAGCTATAATGTGGAAAAAAAATATCCCCTTCCCTTTCAAAGAAATGTACTTTC
TTCATCATCCATTATCTGCCATAATATGTTTTTACAGAGGTAAACAATAAAGTTAGGCTT
TTTGTTGTTGGTTCTGAACATTTACAATGGTGTCTTGAATGCATCAACAGTTC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RS1EX80TF 662 0 0
GGGCAGCAGGAAATGACAAACTTCAGGAAGCTCGGCCGGCATGCGGGTCACCGTATCTCC
ATGCTCAGGACACTGGTGTCTCAATTGGTCAAGCACGAGCGCATAGAAACCACTGTCACT
AAGGCTAAAGAGGTGCGTCGTCTTGCTGATAACATGATTCAACTCGGTAAAGAGGGCTCA
CTCGATTCGGCAAGGCGAGCAGCTGGTTTTGTAAGAGGAGATGATGTCCTTCACAAGATT
TTCACTGAACTGGCTTACCGTTACAAAGATAGAGATGGTGGATACACAAGATTATTACGT
ACTCGCATTCGAGTTGGTGATGCTGCTCCAATGGCCTATATCGAGTTTATAGACAGAGAG
AACGAGCTTAGGCAATCGAATCCAGTAACACCTCAACCACCACAACGAGTGCCGTTGGAC
CCATGGGATAAATCCCGTCTCATGAGGCAAGTTGCTCCACCTAAGGAGGATAAAATCTCT
GATTCCGAGCTATAATGTGGAAAAAAAATATCCCCTTCCCTTTCAAAGAAATGTACTTTC
TTCATCATCCATTATCTGCCATAATATGTTTTTACAGAGGTAAACAATAAAGTTAGGCTT
TTTGTTGTTGGTTCTGAACATTTACAATGGTGTCTTGAATGCATCAACAGTTCTCA
AAAAAA

QA 1 656 1 656
DS 

RD RS1EI26JQ 613 0 0
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ATAGAAACCACTGTCACTAAGGCTAAAGAGGTGCGTCGTCTTGCTGATAACATGATTCAA
CTCGGTAAAGAGGGCTCACTCGATTCGGCAAGGCGAGCAGCTGGTTTTGTAAGAGGAGAT
GATGTCCTTCACAAGATTTTCACTGAACTGGCTTACCGTTACAAAGATAGAGATGGTGGA
TACACAAGATTATTACGTACTCGCATTCGAGTTGGTGATGCTGCTCCAATGGCCTATATC
GAGTTTATAGACAGAGAGAACGAGCTTAGGCAATCGAATCCAGTAACACCTCAACCACCA
CAACGAGTGCCGTTGGACCCATGGGATAAATCCCGTCTCATGAGGCAAGTTGCTCCACCT
AAGGAGGATAAAATCTCTGATTCCGAGCTATAATGTGGAAAAAAAATATCCCCTTCCCTT
TCAAAGAAATGTACTTTCTTCATCATCCATTATCTGCCATAATATGTTTTTACAGAGGTA
AACAATAAAGTTAGGCTTTTTGTTGTTGGTTCTGAACATTTACAATGGTGTCTTGAATGC
ATCAACAGTTCTC

QA 1 613 1 613
DS 

RD RS1AW53JQ 548 0 0
GAGGGCTCACTCGATTCGGCAAGGCGAGCAGCTGGTTTTGTAAGAGGAGATGATGTCCTT
CACAAGATTTTCACTGAACTGGCTTACCGTTACAAAGATAGAGATGGTGGATACACAAGA
TTATTACGTACTCGCATTCGAGTTGGTGATGCTGCTCCAATGGCCTATATCGAGTTTATA
GACAGAGAGAACGAGCTTAGGCAATCGAATCCAGCAACACCTCAACCACCACAACGAGTG
CCGTTGGACCCATGGGATAAATCCCGTCTCATGAAGCAAGTTGCTCCACCTAAGGAGGAT
AAAATCTCTGATTCCGAGCTATAATGTGGAAAAAAAATATCCCCTTCCCTTTCAAAGAAA
TGTACTTTCTTCATCATCCATTATCTGCCATAATATGTTTTTACAGAGGTAAACAATAAA
GTTAGGCTTTTTGTTGTTGGTTCTGAACATTTACAATGGTGTCTTGAATGCATCAACAGT
TCTCATGAGTCTTTTTTGGTTAACTTAACTGTAAGTTAAAAGTTTCTCTTTTCAGTTTTC
ACTTCTGC

QA 1 548 1 548
DS 

RD RS1DR17JQ 548 0 0
GAGGGCTCACTCGATTCGGCAAGGCGAGCAGCTGGTTTTGTAAGAGGAGATGATGTCCTT
CACAAGATTTTCACTGAACTGGCTTACCGTTACAAAGATAGAGATGGTGGATACACAAGA
TTATTACGTACTCGCATTCGAGTTGGTGATGCTGCTCCAATGGCCTATATCGAGTTTATA
GACAGAGAGAACGAGCTTAGGCAATCGAATCCAGCAACACCTCAACCACCACAACGAGTG
CCGTTGGACCCATGGGATAAATCCCGTCTCATGAAGCAAGTTGCTCCACCTAAGGAGGAT
AAAATCTCTGATTCCGAGCTATAATGTGGAAAAAAAATATCCCCTTCCCTTTCAAAGAAA
TGTACTTTCTTCATCATCCATTATCTGCCATAATATGTTTTTACAGAGGTAAACAATAAA
GTTAGGCTTTTTGTTGTTGGTTCTGAACATTTACAATGGTGTCTTGAATGCATCAACAGT
TCTCATGAGTCTTTTTTGGTTAACTTAACTGTAAGTTAAAAGTTTCTCTTTTCAGTTTTC
ACTTCTGC

QA 1 548 1 548
DS 

RD RS1AW53TF 548 0 0
GAGGGCTCACTCGATTCGGCAAGGCGAGCAGCTGGTTTTGTAAGAGGAGATGATGTCCTT
CACAAGATTTTCACTGAACTGGCTTACCGTTACAAAGATAGAGATGGTGGATACACAAGA
TTATTACGTACTCGCATTCGAGTTGGTGATGCTGCTCCAATGGCCTATATCGAGTTTATA
GACAGAGAGAACGAGCTTAGGCAATCGAATCCAGCAACACCTCAACCACCACAACGAGTG
CCGTTGGACCCATGGGATAAATCCCGTCTCATGAAGCAAGTTGCTCCACCTAAGGAGGAT
AAAATCTCTGATTCCGAGCTATAATGTGGAAAAAAAATATCCCCTTCCCTTTCAAAGAAA
TGTACTTTCTTCATCATCCATTATCTGCCATAATATGTTTTTACAGAGGTAAACAATAAA
GTTAGGCTTTTTGTTGTTGGTTCTGAACATTTACAATGGTGTCTTGAATGCATCAACAGT
TCTCATGAGTCTTTTTTGGTTAACTTAACTGTAAGTTAAAAGTTTCTCTTTTCAGTTTTC
ACTTCTGC

QA 1 548 1 548
DS 

RD RS1DR17TF 548 0 0
GAGGGCTCACTCGATTCGGCAAGGCGAGCAGCTGGTTTTGTAAGAGGAGATGATGTCCTT
CACAAGATTTTCACTGAACTGGCTTACCGTTACAAAGATAGAGATGGTGGATACACAAGA
TTATTACGTACTCGCATTCGAGTTGGTGATGCTGCTCCAATGGCCTATATCGAGTTTATA
GACAGAGAGAACGAGCTTAGGCAATCGAATCCAGCAACACCTCAACCACCACAACGAGTG
CCGTTGGACCCATGGGATAAATCCCGTCTCATGAAGCAAGTTGCTCCACCTAAGGAGGAT
AAAATCTCTGATTCCGAGCTATAATGTGGAAAAAAAATATCCCCTTCCCTTTCAAAGAAA
TGTACTTTCTTCATCATCCATTATCTGCCATAATATGTTTTTACAGAGGTAAACAATAAA
GTTAGGCTTTTTGTTGTTGGTTCTGAACATTTACAATGGTGTCTTGAATGCATCAACAGT
TCTCATGAGTCTTTTTTGGTTAACTTAACTGTAAGTTAAAAGTTTCTCTTTTCAGTTTTC
ACTTCTGC

QA 1 548 1 548
DS 



AS 1 7

CO CL590Contig1 953 7 16 U
GGACCTTCACATTCAACAGCAAACGAATCACATTTCAAAGACTTTCTTTGTGATCAATTC
AATGGCAGGTATCAAAGTTTTCGGACACCCTGCTTCCACTGCCACCAGGAGAGTCCTCCT
CACCCTCCACGAGAAAAACCTCGACTTTGAGCTCGTTCATGTCGAGCTCAAAGACGGTGA
GCACAAGAAAGAGCCCTTCCTCTCCCGCAACCCTTTTGGTAAAGTTCCCGCCTTTGAAGA
TGGAGACCTCAAGCTCTTCGAATCAAGAGCGATTACTCAGTACATAGCTCACCGATATGA
AGAGGAAGGAACCAACCTTCTCCCAGCCGACTCCAAGAACATATCCCACTACGCAATCAT
GGCCATTGGAATGGAAGTAGAAGCTCACCACTTCGACCCAGTGGCTTCAAAGCTTGCCTG
GGAACAAGTGTTCAAGCTCTTCTATGGCATGACCACAGACCAAGCCGTTGTTGAAGAAGA
AGAGGCTAAGTTAGCCGCGGTCCTTGATGTGTACGAGGCTAGGCTCAAGGAGTTCAAGTA
TTTGGCTGGTGAAACTTTTACTTTGACCGATCTTCACCACATTCCCGTTATTCAATACTT
GCTTGGAACTCCCACCAAAAAGCTCTTCGCCGAGCGTCCACATGTCAACGAGTGGGTGG*
AAGAGATCACCAACAGGCCAGCTTCCCAGAAGATCCTTCAGTGAGAAATTTCTGAAGAAG
GGAAAAGAAAATGATTTTGCTTCAGTCACAGTAATAATAATATGCTCAAAGTAAATAAGT
GGCTGCCTCATTGCCCAATTTCTCAGTGCTCTGTTTTGTCTTTCCGTTGTGTCCTCTGTT
TTTATTCTCCCTTTTATATGTATGTGTTTGTGTTCTTGAGAGATTTTTGTTGAATCAAAA
GCTATTTATAATGTTCAAGCTCATCTATGATAAAACAGCTTAGCTAGTTATTT


BQ
20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 
20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D745TF U 1
AF RS1GG67TF U -2
AF RS1G289TF U 1
AF RS1GL29TF U 1
AF RS1A464TF U 56
AF RS1D745JQ C 249
AF RS1GG67JQ C 249
BS 1 22 RS1D745TF
BS 23 23 RS1G289TF
BS 24 156 RS1D745TF
BS 157 157 RS1G289TF
BS 158 227 RS1D745TF
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BS 229 477 RS1D745TF
BS 478 478 RS1G289TF
BS 479 652 RS1D745TF
BS 653 672 RS1G289TF
BS 673 678 RS1GL29TF
BS 679 682 RS1GG67JQ
BS 683 711 RS1D745JQ
BS 712 712 RS1GG67JQ
BS 713 856 RS1D745JQ
BS 857 953 RS1GG67JQ

RD RS1D745TF 652 0 0
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AATGGCAGGTATCAAAGTTTTCGGACACCCTGCTTCCACTGCCACCAGGAGAGTCCTCCT
CACCCTCCACGAGAAAAACCTCGACTTTGAGCTCGT*CATGTCGAGCTCAAAGACGGTGA
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GGCCATTGGAATGGAAGTAGAAGCTCACCACTTCGACCCAGTGGCTTCAAAGCTTGCCTG
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AGAGGCTAAGTTAGCCGCGGTCCTTGATGTGTACGAGGCTAGGCTCAAGGAGTTCAAGTA
TTTGGCTGGTGAAACTTTTACTTTGACCGATCTTCACCACATTCCCGTTATTCAATACTT
GCTTGGAACTCCCACCAAAAAGCTCTTCGCCGAGCGTCCACATGTCAACGAG

QA 1 652 1 652
DS 

RD RS1GG67TF 624 0 0
GGATC
ACCTTCACATTCAACAGCAAACGAATCACATTTCAAAGACTTTCTTTGTGATCAATTCAA
TGGCAGGTATCAAAGTTTTCGGACACCCTGCTTCCACTGCCACCAGGAGAGTCCTCCTCA
CCCTCCACGAGAAAAACCTCGACCTTGAGCTCGTTCATGTCGAGCTCAAAGACGGTGAGC
ACAAGAAAGAGCCCTTCCTCTCCCGCAACCCTTTTGGTAAAGTTCCCGCCTTTGAAGATG
GAGACCTCAAGCTCTTCGAATCAAGAGCGATTACTCAGTACATAGCTCACCGATATGAAG
AGGAAGGAACCAACCTTCTCCCAGCCGACTCCAAGAACATATCCCACTACGCAATCATGG
CCATTGGAATGGAAGTAGAAGCTCACCACTTCGACCCAGTGGCTTCAAAGCTTGCCTGGG
AACAAGTGTTCAAGCTCTTCTATGGCATGACCACAGACCAAGCCGTTGTTGAAGAAGAAG
AGGCTAAGTTAGCCGCGGTCCTTGATGTGTACGAGGCTAGGCTCAAGGAGTTCAAGTATT
TGGCTGGTGAAACTTTTACTTTGACCGATCTTCACCACATTCCCGTTATTCAATACTTGC
TTGGAACTCCCACCAAAAA

QA 6 624 6 624
DS 

RD RS1G289TF 672 0 0
GGACCTTCACATTCAACAGCAAACGAATCACATTTCAAAGACTTTCTTTGTGATCAATTC
AATGGCAGGTATCAAAGTTTTCGGACACCCTGCTTCCACTGCCACCAGGAGAGTCCTCCT
CACCCTCCACGAGAAAAACCTCGACTTTGAGCTCGTTCATGTCGAGCTCAAAGACGGTGA
GCACAAGAAAGAGCCCTTCCTCTCCCGCAACCCTTTTGGTAAAGTTCCCGCCTTTGAAGA
TGGAGACCTCAAGCTCTTCGAATCAAGAGCGATTACTCAGTACATAGCTCACCGACATGA
AGAGGAAGGAACCAACCTTCTCCCAGCCGACTCCAAGAACATATCCCACTACGCAATCAT
GGCCATTGGAATGGAAGTAGAAGCTCACCACTTCGACCCAGTGGCTTCAAAGCTTGCCTG
GGAACAAGTGTTCAAGCTCTTCTATGGCATGACCACAGACCAAGCCGTTGTTGAAGAAGA
AGAGGCTAAGTTAGCCGCGGTCCTTGATGTGTACGAGGCTAGGCTCAAGGAGTTCAAGTA
TTTGGCTGGTGAAACTTTTACTTTGACCGATCTTCACCACATTCCCGTTATTCAATACTT
GCTTGGAACTCCCACCAAAAAGCTCTTCGCCGAGCGTCCACATGTCAACGAGTGGGTGG*
AAGAGATCACCA

QA 1 672 1 672
DS 

RD RS1GL29TF 687 0 0
GGACCTTCACATTCAACATCAAACAAATCACATTTCAAAGAGTTTCTTTGTGATCAATCC
AATGGCAGGTATCAAAGTTTTCGGACACGCTGCTTCCACTGCCACCAGGAGAGTCCTCCT
CACCCTCCACGAGAAAAACCTCGACTTTGAGCTCGTTCATGTCGAGCTCAAAGACGGTGA
GCACAAGAAAGAGCCCTTCCTCTCCCGCAACCCTTTTGGTAAAGTTCCCGCCTTTGAAGA
TGGAGACCTCAAGCTCTTCGAATC**GAGCGATTACTCAGTATATAGCTCACCGATATGA
AGAGGAAGGAACCAACCTTCTCCCAGCCAACTCCAAGAACATATCCCACTACGCAATCAT
GGCCATTGGAATGGAAGTAGAAGCTCACCACTTCGACCCAGTGGCTTCAAAGCTTGCCTG
GGAACAAGTGTTCAAGCTCTTCTATGGCATGACCACAGACCAAGCCGTTGTTGAAGAAGA
GGAGGCTAAGTTAGCCACGGTCCTTGATGTGTACGAGGCTAGGCTCAAGGAGTTCAAGTA
TTTGGCTGGTGAAACTTTTACTTTGACCGATCTTCACCACATTCCCGTTATTCAATACTT
GCTTGGAACTCCCACCAAAAAGCTCTTCGCCGAGCGTCCACATGTCGACGAGTGGGTGG*
AAGAGATCACCAACAGGC
CAGCTTCCC

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1A464TF 617 0 0
AATC
CAATGGCAGGTATCAAAGTTTTCGGACACTCTGCTTCCACTGCCACCAGGAGAGTCCTCC
TCACCCTCCACGAGAAAAACCTCGACTTTGAGCTCGTTCATGTCGAGCTCAAAGACGGTG
AGCACAAGAAAGAGCCCTTCCTCTCCCGCAACCCTTTTGGTAAAGTTCCCGCCTTTGAAG
ATGGAGACCTCAAGCTCTTCGAATCAAGAGCGATTACTCAGTACATAGCTCACCGATATG
AAGAGGAAGGAACCAACCTTCTCCCAGCCGACTCCAAGAACATATCCCACTACGCAATCA
TGGCCATTGGAATGGAAGTAGAAGCTCACCACTTCGACCCAGTGGCTTCAAAGCTTGCCT
GGGAACAAGTGTTCAAGCTCTTCTATGGCATGACCACAGACCAAGCCGTTGTTGAAGAAG
AGGAGGCTAAGTTAGCCACGGTCCTTGATGTGTACGAGGCTAGGCTCAAGGAGTTCAAGT
ATTTGGCTGGTGAAACTTTTACTTTGACCGATCTTCACCACATTCCCGTTATTCAATACT
TGCTTGGAACTCCCACCAAAAAGCTCTTCGCCGAGCGTCCACATGTCAACGAGTGGGTGG
GAAGAGATCACCA

QA 5 617 5 617
DS 

RD RS1D745JQ 608 0 0
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GAACCAACCTTCTCCCAGCCGACTCCAAGAACATATCCCACTACGCAATCATGGCCATTG
GAATGGAAGTAGAAGCTCACCACTTCGACCCAGTGGCTTCAAAGCTTGCCTGGGAACAAG
TGTTCAAGCTTTTTTATGGCATGACCACAGACCAAGCCGTTGTTGAAGAGGAAGAGGCTA
AGTTAGCCGCGGTCCTTGATGTGTACGAGGCTAGGCTCAAGGAGTTCAAGTATTTGGCTG
GTGAAACTTTTACTTTGACCGATCTTCACCACATTCCCGTTATTCAATACTTGCTTGGAA
CTCCCACCAAAAAGCTTTTCGCCGAGCGTCCACATGTCAACGAGTGGGTGG*AAGAGATC
ACCAACAGGC****TTCCCAGAAGATCCTTCAGTGAGAAATTTTTGAAGAAGGGAAAAGA
AAATGATTTTGCTTCAGTCACAGTAATAATAATATGCTCAAAGTAAATAAGTGGCTGCCT
CATTGCCCAATTTCTCAGTGCTCTGTTTTGTCTTTCCGTTGTGTCCTCTGTTTTTATTCT
CCCTTTTA

QA 1 608 1 608
DS 

RD RS1GG67JQ 705 0 0
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GAACCAACCTTCTCCCAGCCGACTCCAAGAACATATCCCACTACGCAATCATGGCCATTG
GAATGGAAGTAGAAGCTCACCACTTCGACCCAGTGGCTTCAAAGCTTGCCTGGGAACAAG
TGTTCAAGCTCTTTTATGGCATGACCACAGACCAAGCCGTTGTTGAAGAAGAAGAGGCTA
AGTTAGCCGCGGTCCTTGATGTGTACGAGGCTAGGCTCAAGGAGTTCAAGTATTTGGCTG
GTGAAACTTTTACTTTGACCGATCTTCACCACATTCCCGTTATTCAATACTTGCTTGGAA
CTCCCACCAAAAAGCTTTTCGCCGAGCGTCCACATGTCAACGAGTGGGTGG*AAGAGATC
ACCAACAGGCCAGCTTCCCAGAAGATCCTTCAGTGAGAAATTTCTGAAGAAGGGAAAAGA
AAATGATTTTGCTTCAGTCACAGTAATAATAATATGCTCAAAGTAAATAAGTGGCTGCCT
CATTGCCCAATTTCTCAGTGCTCTGTTTTGTCTTTCTGTTGTGTCCTCTGTTTTTATTCT
CCCTTTTATATGTATGTGTTTGTGTTCTTGAGAGATTTTTGTTGAATCAAAAGCTATTTA
TAATGTTCAAGCTCATCTATGATAAAACAGCTTAGCTAGTTATTT

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 8

CO CL591Contig1 535 8 2 U
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GAATCGCATGGTTCAGATCATAATTTATCTCATTAAAGGGAGGAAAAAGAAAGATAAAAT
TAAATTATAACAAATACAGAAGAATCAATGCCAGAAAAAAAAAGAAACAAACTTAAGAAA
ATATAATGTATGATTATGAAGCCCTAAAATATAATTAAATGATGAACCATGATCAAGCAT
ATATCCTCAGCTTGTTAATTACTTTAAAAACATCATCCACGTCATTGTCGTCATGTTCTT
TGACCGCCTCCACACACCGCTCATTATCGTCGCCGAGACTGCCATCGCCTCCGCCACATC
CTTTTCTGGTGATGTCAGCAGCACCAGACTCAGTTCTCATGAAGAAAGTGCACAAGAGAA
GTGTTAATAGGCAACATATGATAAATTCTCTAGATGCAGCCATTGATCGATAATACAATA
GGTCAATCGAACTGCTTTTAAAGCTTTGGTTGTTTTCTTTTGTGTTCTTTGTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1ES64JQ U 1
AF RS1G362JQ U 47
AF RS1G362TF C 47
AF RS1ES64TF C 1
AF RS1AR57TFB C 70
AF RS1AR57JQ U 81
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AF RS1EN34TF C 107
BS 1 511 RS1ES64JQ
BS 512 535 RS1AR57JQ

RD RS1ES64JQ 511 0 0
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GAATCGCATGGTTCAGATCATAATTTATCTCATTAAAGGGAGGAAAAAGAAAGATAAAAT
TAAATTATAACAAATACAGAAGAATCAATGCCAGAAAAAAAAAGAAACAAACTTAAGAAA
ATATAATGTATGATTATGAAGCCCTAAAATATAATTAAATGATGAACCATGATCAAGCAT
ATATCCTCAGCTTGTTAATTACTTTAAAAACATCATCCACGTCATTGTCGTCATGTTCTT
TGACCGCCTCCACACACCGCTCATTATCGTCGCCGAGACTGCCATCGCCTCCGCCACATC
CTTTTCTGGTGATGTCAGCAGCACCAGACTCAGTTCTCATGAAGAAAGTGCACAAGAGAA
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GGTCAATCGAACTGCTTTTAAAGCTTTGGTT

QA 1 511 1 511
DS 

RD RS1G362JQ 465 0 0
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ACAAACTTAAGAAAATATAATGTATGATTATGAAGCCCTAAAATATAATTAAATGATGAA
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TCGATAATACAATAGGTCAATCGAACTGCTTTTAAAGCTTTGGTT

QA 1 465 1 465
DS 

RD RS1G362TF 465 0 0
GACAAAAATGACTAGAATCGCATGGTTCAGATCATAATTTATCTCATTAAAGGGAGGAAA
AAGAAAGATAAAATTAAATTATAACAAATACAGAAGAATCAATGCCAGAAAAAAAAAGAA
ACAAACTTAAGAAAATATAATGTATGATTATGAAGCCCTAAAATATAATTAAATGATGAA
CCATGATCAAGCATATATCCTCAGCTTGTTAATTACTTTAAAAACATCATCCACGTCATT
GTCGTCATGTTCTTTGACCGCCTCCACACACCGCTCATTATCGTCGCCGAGACTGCCATC
GCCTCCGCCACATCCTTTTCTGGTGATGTCAGCAGCACCAGACTCAGTTCTCATGAAGAA
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TCGATAATACAATAGGTCAATCGAACTGCTTTTAAAGCTTTGGTT

QA 1 465 1 465
DS 

RD RS1ES64TF 511 0 0
GGAGAATCATGGGATATTGAATGATTTGAAACATGGAAGGTTGAATGACAAAAATGACTA
GAATCGCATGGTTCAGATCATAATTTATCTCATTAAAGGGAGGAAAAAGAAAGATAAAAT
TAAATTATAACAAATACAGAAGAATCAATGCCAGAAAAAAAAAGAAACAAACTTAAGAAA
ATATAATGTATGATTATGAAGCCCTAAAATATAATTAAATGATGAACCATGATCAAGCAT
ATATCCTCAGCTTGTTAATTACTTTAAAAACATCATCCACGTCATTGTCGTCATGTTCTT
TGACCGCCTCCACACACCGCTCATTATCGTCGCCGAGACTGCCATCGCCTCCGCCACATC
CTTTTCTGGTGATGTCAGCAGCACCAGACTCAGTTCTCATGAAGAAAGTGCACAAGAGAA
GTGTTAATAGGCAACATATGATAAATTCTCTAGATGCAGCCATTGATCGATAATACAATA
GGTCAATCGAACTGCTTTTAAAGCTTTGGTT

QA 1 511 1 511
DS 

RD RS1AR57TFB 466 0 0
GGTTCAGATCATAATTTATCTCATTAAAGGGAGGAAAAAGAAAGGTAAAATTAAATTATA
ACAAATACAGAAGAATCAATGCCAGAAAAAAAA*GAAACAAACTTAAGAAAATATAATGT
ATGATTATGAAGCCCTAAAATATAATTAAATGATGAACCATGATCAAGCATATATCCTCA
GCTTGTTAATTACTTTAAAAACATCATCCACGTCATTGTCGTCATGTTCTTTGACCGCCT
CCACACACCGCTCATTATCGTCGCCGAGACTGCCATCGCCTCCGCCACATCCTTTTCTGG
TGATGTCAGTAGCACCAGACTCAGTTCTCATGAAGAAAGTGCACAAGAGAAGTGTTAATA
GGCAACATATGATAAATTCTCTAGATGCAGCCATTGATCGATAATACAATAGGTCAATCG
AACTGCTTTTAAAGCTTTGGTTGTTTTCTTTTGTGTTCTTTGTTCC

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TCATTATCGTCGCCGAGACTGCCATCGCCTCCGCCACATCCTTTTCTGGTGATGTCAGTA
GCACCAGACTCAGTTCTCATGAAGAAAGTGCACAAGAGAAGTGTTAATAGGCAACATATG
ATAAATTCTCTAGATGCAGCCATTGATCGATAATACAATAGGTCAATCGAACTGCTTTTA
AAGCTTTGGTTGTTTTCTTTTGTGTTCTTTGTTCC

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DS 

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AG
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CTCCGCCACATCCTTTTCTGGTGATGTCAGCAGCACCAGACTCAGTTCTCATGAAGAAAG
TGCACAAGAGAAGTGCTAATAGGCAACATATGATAAATTCTCTAGATGCAGCCATTGATC
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TCC

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DS 

RD RS1EN34TF 418 0 0
AG
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AAACTTAAGAAAATATAATGTATGATTATGAAGCCCTAAAATATAATTAAATGACGAACC
ATGATCAAGCATATATCCTCAGCTTGTTAATTACTTTAAAAACATCATCCACGTCATTGT
CGTCATGTTCTTTGACCGCCTCCACACACCGCTCATTATCGTCGCCGAGACTGCCATCGC
CTCCGCCACATCCTTTTCTGGTGATGTCAGCAGCACCAGACTCAGTTCTCATGAAGAAAG
TGCACAAGAGAAGTGCTAATAGGCAACATATGATAAATTCTCTAGATGCAGCCATTGATC
GATAATACAATAGGTCAATCGAACTGCTTTTAAAGCTTTGGTTGTTTTCTTTT
TCC

QA 3 415 3 415
DS 



AS 1 8

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TCAACATTTCTCATGAAAACAATCTTCCTTGTACTCATTTTTCTCTCTTATACAATCTCT
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ATTGGTGTTGGTGCTCCTCTCTTTAGCCGTTCCGTGCCATTCCTTCAACCCGACGGGAAC
ATTTTCACGATCGTTAAATGTTTCGCCTCAGGGATTATCCTCGGAACCGGTTTTATGCAC
GTCTTGCCTGATTCTTTCGAGATGTTGTCTTCACAATGCCTGGAAGAGAACCCGTGGCAC
AAATTTCCTTTCTCCGGGTTTCTTGCTATGTTGTCCGGTCTAATCACTTTAGTCATCGAT
TCCATGGCTACGAGCATTTATACTAGCAAGAACGCAGTTGGAATCTTACCACATGGTCAT
GGTCACGGCCCTGGAAATGATGTTACCTTACCCACTAAAAGTGGAGATTCCCCGAGTGCA
CAACTCTTGAGATATCGAGTCATTGCTATGGTATTGGAACTTGGAATCATAGTTCACTCT
GTAGTCATTGGACTATCTCTAGGAGCAACAAGTGACACTTGCACCATTAAAGGACTCATC
GCAGCTCTTTGCTTCCATCAAATGTTCGAAGGCATGGGTCTTGGTGGTTGCATTCTCCAG
GCTGAGTATACGAACTTGAAAAAGTTTCTTATGGCGTTCTTTTTTGCGGTGACAACGCCT
TTTGGAATAGCCTTAGGGATCGCTCTTTCGACCATCTACAGAGACAATAGTCCCTCTGCA
TTGGTAACTGTTGGATTGCTCAATGCATGCTCCGCAGGATTGCTCATCTACATGGCGCTT
GTGGACCTTCTTGCGGCAGAGTTCATGGGACCAAAGCTTCAAGGTAGCATCAAAATGCAG
ATCAAGTGTTTCATTGCAGCTCTTCTTGGGTGCGGTGGCATGTCGATCATCGCCAAATGG
GCTTAACTAATTCCACTGATAGTACTGCAGAATTGAAGTCATGTGGATTTCGTTGTCGAA
CCTAAAAGACCCTATTAGGTTTAAGTCTCGACTCTTTAATCGTGTTTTTTCCCTTTAC*A
AGATATACTTGGTATCTATCATATTTAATGTCTTTTAATATATATGTATTGTGGTTGGTT
CAACAAGTCTTTCCTTTTGTTTACGGGGTAATAATTAATTCTTGTCGCGCGTATAATGTT
TTCTCATGTCATTTAAATAAATAAGACTCTTTTTC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1GT45TF U 2
AF RS1CI41TF U 1
AF RS1D213TF U 2
AF RS1AD08JQ C 863
AF RS1AD08TF U 571
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BS 1 428 RS1CI41TF
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RD RS1GT45TF 619 0 0
GG
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ACATTTCTCATGAAAACAATCTTCCTTGTACTCATTTTTCTCTCTTATACAATCTCTCCG
GCAATTTCAACAGCCCCCCAAGACTGCGCAAGCGAGTCAGCGAACCCATGCGTCAACAAG
GCTAAAGCTTTGCCTCTCAAAATCATAGCAATCGCAGCAATCCTAGTCGCAAGCATGATT
GGTGTTGGTGCTCCTCTCTTTAGCCGTTCCGTGCCATTCCTTCAACCCGACGGGAACATT
TTCACGATCGTTAAATGTTTCGCCTCAGGGATTATCCTCGGAACCGGTTTTATGCACGTC
TTGCCTGATTCTTTCGAGATGTTGTCTTCACAATGCCTGGAAGAGAACCCGTGGCACAAA
TTTCCTTTCTCCGGGTTTCTTGCTATGTTGTCCGGTCTAATCACTTTAGTCATCGATTCC
ATGGCTACGAGTATTTATACTAGCAAGAACGCAGTTGGAATCTTACCACATGGTCATGGT
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CTCTTGAGATATCGAGT

QA 3 619 3 619
DS 

RD RS1CI41TF 710 0 0
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TCAACATTTCTCATGAAAACAATCTTCCTTGTACTCATTTTTCTCTCTTATACAATCTCT
CCGGCAATTTCAACAGCCCCCCAAGACTGCGCAAGCGAGTCAGCGAACCCATGCGTCAAC
AAGGCTAAAGCTTTGCCTCTCAAAATCATAGCAATCGCAGCAATCCTAGTCGCAAGCATG
ATTGGTGTTGGTGCTCCTCTCTTTAGCCGTTCCGTGCCATTCCTTCAACCCGACGGGAAC
ATTTTCACGATCGTTAAATGTTTCGCCTCAGGGATTATCCTCGGAACCGGTTTTATGCAC
GTCTTGCCTGATTCTTTCGAGATGTTGTCTTCACAATGCCTGGAAGAGAACCCGTGGCAC
AAATTTCCCTTCTCCGGGTTTCTTGCTATGTTGTCCGGTCTAATCACTTTAGTCATCGAT
TCCATGGCTACGAGCATTTATACTAGCAAGAACGCAGTTGGAATCTTACCACATGGTCAT
GGTCACGGCCCTGGAAATGATGTTACCTTACCCACTAAAAGTGGAGATTCCCCGAGTGCA
CAACTCTTGAGATATCGAGTCATTGCTATGGTATTGGAACTTGGAATCATAGTTCACTCT
GTAGTCATTGGACTATCTCTAGGAGCA*CAAGTGACACTTGCACCATTAA

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DS 

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GG
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ACATTTCTCATGAAAACAATCTTCCTCGTACTCATTTTTCTCTCTTATACAATCTCTCCG
GCAACTTCAACAGCGCCCCAAGACTGCGCAAGCGAGTCAGCGAACCCATGCGTCAACAAG
GCTAAAGCTTTGCCTCTCAAAATCATAGCAATCGCAGCAATCCTAGTCGCAAGCATGATT
GGTGTTGGTGCTCCTCTCTTTAGCCATTCCGTGCCATTCCTTCAACCCGACGGGAACATT
TTCACGATCGTTAAATGTTTCGCCTCAGGGATTATCCTCGGAACTGGTTTTATGCACGTC
TTGCCTGATTCTTTCGAGATGTTGTCTTCACAATGCCTCAAAGAGAACCCGTGGCACAAA
TTTCCTTTCTCCGGGTTTCTTGCTATGTTGTCCGGTCTAATCACTTTAGTCATCGATTCC
ATGGCTACGAGCATTTATACTAGCAAGAACGCAGTTGGAATCGTACCACATGGTCATGGT
CACGGCCCTGGAAATGATGTTACCTTACCCACGAAAGATGGAGATTCCGCGAGTGCACAA
CTCTTGAGATATCGAGTCATTGCTATGGTACTGGAACTTGGAATCATAGTTCACTCTGTA
GTCATTGGACTATCTCTAGGAGCA

QA 3 686 3 686
DS 

RD RS1AD08JQ 398 0 0
CTCTTTCGACCATCTACAGAGACAATAGTCCCTCTGCATTGGTAACTGTTGGATTGCTCA
ATGCATGCTCCGCAGGATTGCTCATCTACATGGCGCTTGTGGACCTTCTTGCGGCAGAGT
TCATGGGACCAAAGCTTCAAGGTAGCATCAAAATGCAGTTCAAGTGTTTCATTGCAGCTC
TTCTTGGGTGCGGTGGCATGTCGTTCATCGCCAAATGGGCTTAACTAATTCCACTGATAG
TACTGCAGAATTGAAGTCATGTGGATTTCGTTGTCGAACCTAAAAGACCCTATTAGGTTT
AAGTCTCGACTCTTTAATCGTGTTTTTTCCCTTTACTAAGATATACTTGGTATCTATCAT
ATTTAATGTCTTTTAATATATATGTATTGTGGTTGGTT

QA 1 398 1 398
DS 

RD RS1AD08TF 678 0 0
GCCACGAAAGA
TGGAGATTCCGCGAGTGCACAACTCTTGAGATATCGATTCATTGCTATGGTACTGGAACT
TGGAATCATAGTTCACTCTGTAGTCATTGGACTATCTCTAGGAGCAACAAGTGACACTTG
CACCATTAAAGGACTCATCGCAGCTCTTTGCTTCCATCAAATGTTCGAAGGCATGGGTCT
TGGTGGTTGCATCCTCCAGGCTGAGTATACGAACTTGAAAAAGTTTCTTATGGCGTTCTT
TTTTGCGGTGACAACGCCTTTTGGAATAGCCTTAGGGACCGCTCTTTCGACCATCTACAG
AGACAATAGTCCCTCTGCATTGGTAACTGTTGGATTGCTCAATGCATGCTCCGCAGGATT
GCTCATCTACATGGCGCTTGTGGACCTTCTTGCGGCAGAGTTCATGGGACCAAAGCTTCA
AGGTAGCATCAAAATGCAGATCAAGTGTTTCATTGCAGCTCTTCTTGGGTGCGGTGGCAT
GTCGATCATCGCCAAATGGGCTTAACTAATTCCACTGATAGTACTGCAGAATTGAAGTCA
TGTGGATTTCGTTGTCGAACCTAAAAGACCCTATTAGGTTTAAGTCTCGACTCTTTAATC
GTGTTTTTTCCCTTTAC*AAGATATACTTGGTATCTATCATATTTAATGTCTTTTAATAT
ATATGTA

QA 12 678 12 678
DS 

RD RS1GT45JQ 671 0 0
CACAACTCTTGAGATATCGAGTCATTGCTATGGTATTGGAACTTGGAATCATAGTTCACT
CTGTAGTCATTGGACTATCTCTAGGAGCAACAAGTGACACTTGCACCATTAAAGGACTCA
TCGCAGCTCTTTGCTTCCATCAAATGTTCGAAGGCATGGGTCTTGGTGGTTGCATTCTCC
AGGCTGAGTATACGAACTTGAAAAAGTTTCTTATGGCGTTCTTTTTTGCGGTGACAACGC
CTTTTGGAATAGCCTTAGGGATCGCTCTTTCGACCATCTACAGAGACAATAGTCCCTCTG
CATTGGTAACTGTTGGATTGCTCAATGCATGCTCCGCAGGATTGCTCATCTACATGGCGC
TTGTGGACCTTCTTGCGGCAGAGTTCATGGGACCAAAGCTTCAAGGTAGCATCAAAATGC
AGATCAAGTGTTTCATTGCAGCTCTTCTTGGGTTCGGTGGCATGTCGATCATCGCCAAAT
GGGCTTAACTAATTCCACTGATAGTACTGCAGAATTGAAGTCATATCGATTTCGTTGTCG
AACCTAAAAGGCCTTATTAGGTTTAAGTCTCGACTCTTTAATCGTGTTTTTTCCCTTTAC
*AAGATATACTTGGTATCTATCATATTTAATGTCTTTTAATATATATGTATTGTGGTTGG
TTCAACAAGTC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1CI41JQ 815 0 0
T
GTCACGGCCCTGGAAATGATGTTACCTTACCCACTAAAAGTGGAGATTCCCCGAGTGCAC
AACTCTTGAGATATCGAGTCATTGCTATGGTATTGGAACTTGGAATCATAGTTCACTCTG
TAGTCATTGGACTATCTCTAGGAGCAACAAGTGACACTTGCACCATTAAAGGACTCATCG
CAGCTCTTTGCTTCCATCAAATGTTCGAAGGCATGGGTCTTGGTGGTTGCATTCTCCAGG
CTGAGTATACGAACTTGAAAAAGTTTCTTATGGCGTTCTTTTTTGCGGTGACAACGCCTT
TTGGAATAGCCTTAGGGATCGCTCTTTCGACCATCTACAGAGACAATAGTCCCTCTGCAT
TGGTAACTGTTGGATTGCTCAATGCATGCTCCGCAGGATTGCTCATCTACATGGCGCTTG
TGGACCTTCTTGCGGCAGAGTTCATGGGACCAAAGCTTCAAGGTAGCATCAAAATGCAGA
TCAAGTGGTTCATTGCAGCTCTTCTTGGGTGCGGTGGCATGTCGATCATCGCCAAATGGG
CTTAACTAATTCCACTGATAGTACTGCAGAATTGAAGTCATGTCGATTTCGTTGTCGAAC
CTAAAAGACCTTATTAGGTTTAAGTCTCGACTCTTTAATCGTGTTTTTTCCCTTTAC*AA
GATATACTTGGTATCTATCATATTTAATGTCTTTTAATATATATGTATTGTGGTTGGTTC
AACAAGTCTTTCCTTTTGTTTACGGGGTAATAATTAATTCTTGTCGCGCGTATAATGTTT
TCTCATGTCATTTAAATAAATAAGACTCTTTTTC

QA 2 815 2 815
DS 

RD RS1D213JQ 536 0 0
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AGAGACAATAGTCCCTCTGCATTGGTAACTGTTGGATTGCTCAATGCATGCTCCGCAGGA
TTGCTCATTTACATGGCGCTTGTGGACCTTCTTGCGGCAGAGTTCATGGGACCAAAGCTT
CAAGGTAGCATCAAAATGCAGATCAAGTGTTTCATTGCAGCTCTTCTTGGGTGCGGTGGC
ATGTCGATCATCGCCAAATGGGCTTAACTAATTCCACTGATAGTATTGCAGAATTGAAGT
CATGTGGATTTCGTTGTCGAACCTAAAAGACCTTATTAGGTTTAAGTCTCGACTCTTTAA
TCGTGTTTTTTCCCTTTAC*AAGATATACTTGGTATCTATCATATTTAATGTCTTTTAAT
ATATATGTAT*GTGGTTGGTTCAACAAGTCTTTCCTTTTGTTTACGGGGTAATAATTAAT
TCTTGTCGCGCGTATAATGTTTTCTCATGTCATTTAAATAAATAAGACTCTTTTTC

QA 1 536 1 536
DS 



AS 1 8

CO CL593Contig1 648 8 36 U
AGAAAGAAA*AAAAAAACACAACGTTTTAAGATGTCTACAAGCACACAAGAACAGACCAA
ACTCAAACATTCCCCTCCATCACAATGAATCACACAATGTTTAATTGATGGAGAGGACGA
TAAATAGCCACACATTTTTTTTGATGATTTACAAATCGGAAGGAGCCAACAGACAAAAGC
AAACTTCATTTCTTTGGAGAATCAGCAGAAGCACTTGGTCCACCAAAGAGATAACCAAGA
GAAGATCCTCCACCAGGAGCAGCATGAACCTTTGTAGACGGCCTCTCCGTGAGGAAGTTG
CCACAGTTTTGGCCTTCTGATCTGAAGTAATTATTAGGACTTCCTCTAACACCTGCAGGT
ATCTTCTTATTCTCAGTGACCGTGGTCGTCGTGGTCGTTATCGGTCTCCCTCCAGTTCCA
TCTGTGGTAGTTGTCGTCGTTGTCGTAGTCGTGGTCCCCATTGTCGCCGCAGCGGCCGGA
GGAGTCTCGCCGGAACCAAAGAGGTAATCGAGAGAGCTTTGGTTAACACCGTTGTTCACT
CCTCTTGCCTTACCCATCGACAGAGATCTCTTTCTAGTTCCTAGTGTCTTCTTCTTCTAT
GATTGGCTGCAAATCTTTAGGAAGAGAATCAACAAATGGGAATAATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 30 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 0 0 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 0 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 35 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 0 50 50 0 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 

AF RS1AG31JQ U -2
AF RS1AG31TF C -2
AF RS1F833TF C 1
AF RS1GP52JQ U 1
AF RS1F833JQ U 3
AF RS1CY58JQ U -7
AF RS1GP52TF C 23
AF RS1CY58TF C -7
BS 1 7 RS1GP52JQ
BS 8 28 RS1AG31JQ
BS 29 29 RS1GP52JQ
BS 30 49 RS1AG31JQ
BS 50 50 RS1GP52JQ
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BS 107 107 RS1GP52JQ
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BS 174 174 RS1GP52JQ
BS 175 198 RS1AG31JQ
BS 199 199 RS1GP52JQ
BS 200 207 RS1AG31JQ
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BS 241 276 RS1AG31JQ
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BS 320 446 RS1AG31JQ
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BS 560 643 RS1GP52JQ
BS 644 648 RS1CY58JQ

RD RS1AG31JQ 562 0 0
TTTTAAAAAA
AA*AAAAAAACACAACGTTTTGAGATGTCTACAAGCACACAAAAACAGACCAAACTCAAA
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CCACACATTTTTTTTGATGATTTACAAATCGGAAGGAGCCAACAAAAAAAAGCAAACTTC
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TTTGGCCTTCAAATCTGAAGTAATTATTAGGACTTCCTCTAACACCTGCAGGTATCTTCT
TATTCTCAGTGACCGTGGTCGTCGTGGTCGTTATCGGTCTCCCTCCAGTTCCATCTGTGG
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CTTTACCCATCG

QA 11 562 11 562
DS 

RD RS1AG31TF 563 0 0
TTTTAGAAAG
AA*AAAAAAACACAACGTTTTGAGATGTCTACAAGCACACAAGAACAGACCAAACTCAAA
CATTCCCCTCCATCACAATGAATCACACAATGTTTAATTAATGGAGAGGACGATAAATAG
CCACACATTTTTTTTGATGATTTACAAATCGGAAGGAGCCAACAGAGAAAAGCAAACTTC
ATTTCTTTGGAGAATCAGCAGAAGCACTTGGTCCACCAAAGAGATAACCAAGGGAAGATC
CTCCACCAGGAGCAGCATGAACCTTTGTAGATGGCCTCTCCGTGAGGAAGTTGCCACAGT
TTTGGCCTTCAGATCTGAAGTAATTATTAGGACTTCCTCTAACACCTGCAGGTATCTTCT
TATTCTCAGTGACCGTGGTCGTCGTGGTCGTTATCGGTCTCCCTCCAGTTCCATCTGTGG
TAGTTGTCGTCGTTGTCGTCGTTGTGGTCCCCATTGTTGCCGCAGCGGCCGGAGGAGTCT
CGCCGGAACCAAAGAGGTAATCGAGAGAGCTTTGGTTAACACCGTTGTTCACTCCTCTTG
CTTTACCCATCGA

QA 11 563 11 563
DS 

RD RS1F833TF 645 0 0
AGAAAGAAA*AAAAAAACACAACGTTTTGAGATGTCTACAAGCACACAAGAACAGACCAA
ACTCAAACATTCCCCTCCATCACAATGAATCACACAATGTTTAATTGATGGAGAGGACGA
TAAATAGCCACACATTTTTTTTGATGATTTACAAATCGGAAGGAGCCAACAGAGAAAAGC
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GAAGATCCTCCACCAGGAGCAGCATGAACCTTTGTAGATGGCCTCTCCGTGAGGAAGTTG
CCACAGTTTTGGCCTTCTGATCTGAAGTAATTATTAGGACTTCCTCTAACACCTGCAGGT
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GATTGGCTGCAAATCTTTAGGAAGAGAATCAACAAATGGGAAT
CC

QA 1 643 1 643
DS 

RD RS1GP52JQ 646 0 0
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ACTCAAACATTGCCCTCCATCACAATGAATCACACAATGTTTAATTGATGGAG**GACGA
TAAATAGCCACACATTTTTT**GATGATTTACAAATCTGAAGGAGCCAACAGACAAAAGC
AAACTTCATTTCTTTGGAGAATCAGCAGAAGCACTTGGTCCACCAAAGAGATAACCAAGA
AAAGATCCTCCACCAGGAGCAGAATGAACCTTTGTAGACGGCCTCTCCGTGAGGAAGTTG
CCACAGTTTTGGCCTTCTGATCTGAAGTAATTATTAGGACTTCCTCTAACACCTGCAGGT
ATCTTCTTATTCTCAGTGACCGTGGTCGTCGTGGTCGTTATCGGTCTCCCTCCAGTTCCG
TCTGTGGTAGTTGTGGTCGTTGTTGTAGTCGTGGTTCCCATTGTCGCCGCAGCGGCCGGA
GGAGTCTCGCCGGAACCAAAGAGGTAATCGAGAGAGCTTTGGTTAACACCGTTGTTCACT
CCTCTTGCCTTACCCATCGACAGAGATCTCTTTCTAGTTCCTAGTGTCTTCTTCTTCTAT
GATTGGCTGCAAATCTTTAGGAAGAGAATCAACAAATGGGAAT
CCC

QA 1 643 1 643
DS 

RD RS1F833JQ 643 0 0
AGAAAG
AAAAAAAAACACAACGTTTTGAGATGTCTACAAGCACACAAGAACAGACCAAACTCAAAC
ATTCCCCTCCATCACAATGAATCACACAATGTTTAATTGATGGAGAGGACGATAAATAGC
CACACATTTTTTTTGATGATTTACAAATCGGAAGGAGCCAACAGAAAAAAGCAAACTTCA
TTTCTTTGGAGAATCAGCAGAAGCACTTGGTCCACCAAAGAGATAACCAAGGGAAGATCC
TCCACCAGGAGCAGCATGAACCTTTGTAGATGGCCTCTCCGTGAGGAAGTTGCCACAGTT
TTGGCCTTCTGATCTGAAGTAATTATTAGGACTTCCTCTAACACCTGCAGGTATCTTCTT
ATTCTCAGTGACCGTGGTCGTCGTGGTCGTTATCGGTCTCCCTCCAGTTCCATCTGTGGT
AGTTGTCGTCGTTGTCGTCGTTGTGGTCCCCATTGTTGCCGCAGCGGCCGGAGGAGTCTC
GCCGGAACCAAAGAGGTAATCGAGAGAGCTTTGGTTAACACCGTTGTTCACTCCTCTTGC
TTTACCCATCGACAGAGATCTCTTTCTAGTTCCTAGTGTCTTCTTCTTCTATGATTGGCT
GCAAATCTTTAGGAAGAGAATCAACAAATGGGAAT
CC

QA 7 641 7 641
DS 

RD RS1CY58JQ 656 0 0
GTAATTTTAGAAAGAAAG
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CACCAGGAGCAGCATGAACCTTTGTAGACGGCCTCTCCGTGAGGAAGTTGCCACAGTTTT
GGCCTTCTGATCTGAAGTAATTATTAGGACTTCCTCTAACACCTGCAGGTATCTTCTTAT
TCTCAGTGACCGTGGTCGTCGTGGTCGTTATCGGTCTCCCTCCAGTTCCGTCTGTGGTAG
TTGTGGTCGTTGTTGTAGTCGTGGTTCCCATTGTCGCCGCAGCGGCCGGAGGAGTCTCGC
CGGAACCAAAGAGGTAATCGAGAGAGCTTTGGTTAACACCGTTGTTCACTCCTCTTGCCT
TACCCATCGACAGAGATCTCTTTCTAGTTCCTAGTGTCTTCTTCTTCTATGATTGGCTGC
AAATCTTTAGGAAGAGAATCAACAAATGGGAATAATCC

QA 19 656 19 656
DS 

RD RS1GP52TF 598 0 0
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CAATGAATCACACAATGTTTAATTGATGGAG**GACGATAAATAGCCACACATTTTTT**
GATGATTTACAAATCTGAAGGAGCCAACAGACAAAAGCAAACTTCATTTCTTTGGAGAAT
CAGCAGAAGCACTTGGTCCACCAAAGAGATAACCAAGAGAAGATCCTCCACCAGGAGCAG
AATGAACCTTTGTAGACGGCCTCTCCGTGAGGAAGTTGCCACAGTTTTGGCCTTCTGATC
TGAAGTAATTATTAGGACTTCCTCTAACACCTGCAGGTATCTTCTTATTCTCAGTGACCG
TGGTCGTCGTGGTCGTTATCGGTCTCCCTCCAGTTCCGTCTGTGGTAGTTGTGGTCGTTG
TTGTAGTCGTGGTTCCCATTGTCGCCGCAGCGGCCGGAGGAGTCTCGCCGGAACCAAAGA
GGTAATCGAGAGAGCTTTGGTTAACACCGTTGTTCACTCCTCTTGCCTTACCCATCGACA
GAGATCTCTTTCTAGTTCCTAGTGTCTTCTTCTTCTATGATTGGCTGCAAATCTTTAG

QA 1 598 1 598
DS 

RD RS1CY58TF 656 0 0
GTAATTTTAGAAAGAAAG
AAAAAAACACAACGTTTTAAGATGTCTACAAGCACACAAGAACAGACCAAACTCAAACAT
TGCCCTCCATCACAATGAATCACACAATGTTTAATTGATGGAG**GACGATAAATAGCCA
CACATTTTTT**GATGATTTACAAATCTGAAGGAGCCAACAGACAAAAGCAAACTTCATT
TCTTTGGAGAATCAGCAGAAGCACTTGGTCCACCAAAGAGATAACCAAGAGAAGATCCTC
CACCAGGAGCAGCATGAACCTTTGTAGACGGCCTCTCCGTGAGGAAGTTGCCACAGTTTT
GGCCTTCTGATCTGAAGTAATTATTAGGACTTCCTCTAACACCTGCAGGTATCTTCTTAT
TCTCAGTGACCGTGGTCGTCGTGGTCGTTATCGGTCTCCCTCCAGTTCCGTCTGTGGTAG
TTGTGGTCGTTGTTGTAGTCGTGGTTCCCATTGTCGCCGCAGCGGCCGGAGGAGTCTCGC
CGGAACCAAAGAGGTAATCGAGAGAGCTTTGGTTAACACCGTTGTTCACTCCTCTTGCCT
TACCCATCGACAGAGATCTCTTTCTAGTTCCTAGTGTCTTCTTCTTCTATGATTGGCTGC
AAATCTTTAGGAAGAGAATCAACAAATGGGAAT
AATCC

QA 19 651 19 651
DS 



AS 1 7

CO CL594Contig1 1184 7 9 U
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TCAGAAATCATGTGAA*GGAGATAGAGAGCTAACATGGAAGAT*CTTAAATATACAGGCA
TCAAATCCATTTTTGCTTCTGACAAAAACCCATTCTTTCCTTTTCCATCTTCATCTCACA
GGGTTCAAGCTTAGCTTCCTTCTGGCAATGTGATCAACCTAGAACCAGAGTCATACTCCA
TCGCGGTTCCACAGTTGGTGCATTTGACATTGTTGGTTTTGCCACCGCTGGAGATTGAAA
GAATTGTTCCAAAGAAGGAAACATTCTCTGTTCCACAATTTGGACAAGGACCCTTCAATA
TCAGGAAGTCTTTGATGATGAGTTTTGTGATTGTTGAAGCCAGGTATACGATCAAAGGCA
CGGCAGCGAACCAAGTGAATATGAAACTAAATGGCTCTGAAAGCTCCAAGATGTATGTGA
TCTCAAAACCTGTTATGTCGTCCAAGAAGAAAAACAGTCCAAGAGCAACAACGGATGCTG
GAACATTGAGCAATAGCATTTTGAAGTAATCTACAGCGAGATCACTATACACCTTTTTAC
TACGGAGACTGCATCTTGGACCCTCGCACACAATCTCACTACCATCCATCTTTAGTTTGA
GTTTGAGATTATCAAATTCTTCATCATTGAGGATTGGATTTCCAGAAACATAAGCCATCG
AAGCTTCCAAGAATCTCTGTTCATCAGAACTTAGCATGACAACGCTGCTTCCTTCCCACA
TGAGCTCTTCTTTAAGGTTATCAAACTCCTCATTCGACATGATCGCTTTGCCATCGTAAT
AGGACGATTGCATGGCTTGGAGAAACTCTTGCTCCATTTCACCAATTGATTTCTTCTCAG
CTTTGTTGATGCTACAGTAAGGCATGATGTTGCTATCCACGTCTTCTCCTCCCACTTGAC
CTGATTGCTCTGTGGTGGCTTTTGCAGGCAACAGGAAGAATCTTTTTCTCAAGGGAACCG
ATCTTCCAGGGGTGAGCTGAGACCATTGAGTCCTCGACGAGAAACAAGGAGGGGTGGTGG
GTTTGCGAGAAACAGCGGAGAAGAGTCGAGGGCTTGTTAAACTGAACAGCATCTTGCTAC
CCATTTTCCCTGGGAGGAGAAAGGAGAATCCTTTTTTCCTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AH94JQ U 2
AF RS1GG62JQ U 1
AF RS1DW89JQ U 9
AF RS1H236JQB U 2
AF RS1GG62TF C 202
AF RS1AH94TF C 165
AF RS1DW89TF C 494
BS 1 43 RS1GG62JQ
BS 44 44 RS1AH94JQ
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BS 494 717 RS1GG62JQ
BS 718 784 RS1AH94TF
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AGTTGGTGA
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TGTGAA*GGAGATAGAGAGCTAACATGGAAGAT*CTTAAATATACAGGCATCAAATCCAT
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TTAGCTTCCTTCTGGCAATGTGATCAACCTAGAACCAGAGTCATACTCCATCGCGGTTCC
ACAGTTGGTGCATTTGACATTGTTGGTTTTGCCACCGCTGGAGATTGAAAGAATTGTTCC
AAAGAAGGAAACATTCTCTGTTCCACAATTTGGACAAGGACCCTTCAATATCAGGAAGTC
TTTGATGATGAGTTTTGTGATTGTTGAAGCCAGGTATACGATCAAAGGCACGGCAGCGAA
CCAAGTGAATATGAAACTAAATGGCTCTGAAAGCTCCAAGATGTATGTGATCTCAAAACC
TGTTATGTCGCCCAAGAAGAAAAACAGTCCAAGAGCAAAAACGGATGCTGGAACATTGAG
CAATAGCATTTTGAAGTAATCTACAGCGAGATCACTATACACCTTTTTACTACGGAGGCT
GCATCTTG

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DS 

RD RS1GG62JQ 717 0 0
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TCAAAAATCATGTGAA*GGAGATAGAGAGCTAACATGGAAGAT*CTTAAATATACAGGCA
TCAAATCCATTTTTGCTTCTGACAAAAACCCATTCTTTCCTTTTCCATCTTCATCTCACA
GGGTTCAAGCTTAGCTTCCTTCTGGCAATGTGATCAACCTAGAACCAGAGTCATACTCCA
TCGCGGTTCCACAGTTGGTGCATTTGACATTGTTGGTTTTGCCACCGCTGGAGATTGAAA
GAATTGTTCCAAAGAAGGAAACATTCTCTGTTCCACAATTTGGACAAGGACCCTTCAATA
TCAGGAAGTCTTTGATGATGAGTTTTGTGATTGTTGAAGCCAGGTATACGATCAAAGGCA
CGGCAGCGAACCAAGTGAATATGAAACTAAATGGCTCTGAAAGCTCCAAGATGTATGTGA
TCTCAAAACCTGCTATGTCGTCCAAGAAGAAAAACAGTCCAAGAGCAACAACGGATGCTG
GAACATTGAGCAATAGCATTTTGAAGTAATCTACAGCGAGATCACTATACACCTTTTTAC
TACGGAGACTGCATCTTGGACCCTCGCACACAATCTCACTACCATCCATCTTTAGTTTGA
GTTTGAGATTATCAAATTCTTCATCATTGAGGATTGGATTTCCAGAAACATAAGCCA

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DS 

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GG
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TGTGAAAGGAGATAGAGAGCTAACATGGAAGATACTTAAATATACAGGCATCAAATCCAT
TTTTGCTTCTGACAAAA*CCCATTCTTTCTTTTTCCATCTTTATCTCACAGGGTTCAAGC
TTAGCTTCCTTCTGGCAATGTGATCAACCTAGAACCAGAGTCATACTCCATCGCGGTTCC
ACAGTTGGTGCATTTGACATTGTTGGTTTTGCCACCGCTGGAGATTGAAAGAATTGTTCC
AAAGAAGGAAACATTCTCTGTTCCACAATTTGGACAAGGACCCTTTAATATCAGGAAGTC
TTTGATGATGAGTTTGGTGATTGTTGAAGCCAGGTATACGATCAAAGGCACGGCAGCGAA
CCAAGTGAATATGAAACTAAATGACTCTGAAAGCTCCAAGATGTATGTGATCTCAAAACC
TGTTATGTCGTCCAAGAAGAAAAACAGTCCAAGAGCAACAACGGATGCTGGAACATTGAG
CAATAGCATTTTGAAGTAATCTACAGCGAGATCACTATACACCTTTTTACTACGGAGACT
GCATCTTGGACCCTCACACACAATCTCACTACCATCCATCTTTAGTTTGAGTTTGAGATT
ATCAAATTCTGCATCAT

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DS 

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GGTTGGTGA
AGAAGTATTCATTAAATATTTTCCCTTATTGCTTACACAGTACTTACAAATCAGAAATCA
TGTGAA*GGAGATAGAGAGCTAACATGGAAGAT*CTTAAATATACAGGCATCAAATCCAT
TTTTGCTTCTGACAAAAACCCATTCTTTCCTTTTCCACCTTCATCTCACAGGGTTCAAGC
TTAGCTTCCTTCTGGCAATGTGATCAACCTAGAACCAGAGTCATACTCCATCGCGGTTCC
ACAGTTGGTGCATTTGACATTGTTGGTTTTGCCACCGCTGGAGATTGAAAGAATTGTTCC
AAAGAAGGAAACATTCTCTGTTCCACAATTTGGACAAGGACCCTTCAATATCAGGAAGTC
TTTGATGATGAGTTTTGTGATTGTTGAAGCCAGGTATACGATCAAAGGCAAGGCAGCGAA
CCAAGTGAATATGAAACTAAATGGCTCTGAAAGCTCCAAGATGTATGTGATCTCAAAACC
TGTTATGTCGTCCAAGAAGAAAAACAGTCCAAGAGCAACAACGGATGCTGGAACATTGAG
CAATAGCATTCTGAAGTAATCTACAGCGAGATCACTATACACCTTTTTACTACGGAGACT
GCATCTTGGACCCTCGCACACAATCTCACTACCATCCATCTTTAGTTTGAGTTTGAGATT
ATCAAATTCTTCATCATTGAGGATT

QA 10 694 10 694
DS 

RD RS1GG62TF 560 0 0
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ATTTGACATTGTTGGTTTTGCCACCGCTGGAGATTGAAAGAATTGTTCCAAAGAAGGAAA
CATTCTCTGTTCCACAATTTGGACAAGGACCCTTCAATATCAGGAAGTCTTTGATGATGA
GTTTTGTGATTGTTGAAGCCAGGTATACGATCAAAGGCACGGCAGCGAACCAAGTGAATA
TGAAACTAAATGGCTCTGAAAGCTCCAAGATGTATGTGATCTCAAAACCTGCTATGTCGT
CCAAGAAGAAAAACAGTCCAAGAGCAACAACGGATGCTGGAACATTGAGCAATAGCATTT
TGAAGTAATCTACAGCGAGATCACTATACACCTTTTTACTACGGAGACTGCATCTTGGAC
CCTCGCACACAATCTCACTACCATCCATCTTTAGTTTGAGTTTGAGATTATCAAATTCTT
CATCATTGAGGATTGGATTTCCAGAAACATAAGCCATCGAAGCTTCCAAGAATCTCTGTT
CATCAGAACTTAGCGTGAC
C

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DS 

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TATACGATCAAAGGCACGGCAGCGAACCAAGTGAATATGAAACTAAATGGCTCTGAAAGC
TCCAAGATGTATGTGATCTCAAAACCTGTTATGTCGCCCAAGAAGAAAAACAGTCCAAGA
GCAAAAACGGATGCTGGAACATTGAGCAATAGCATTTTGAAGTAATCTACAGCGAGATCA
CTATACACCTTTTTACTACGGAGGCTGCATCTTGGACCCTCGCACACAATCTCACTACCA
TCCATCTTTAGTTTGAGTTTGAGATTATCAAATTCTTCATCATTGAGGATTGGATTTCCA
GAAACATAAGCCATCGAAGCTTCCAAGAATCTCTGTTCATCAGAACTTAGCATGACAACG
CTGCTTCCTTCCCACATGAG

QA 1 620 1 620
DS 

RD RS1DW89TF 691 0 0
TATGTCGTCCAAGAAGAAAAACAGTCCAAGAGCAACAACGGATGCTGGAACATTGAGCAA
TAGCATTTTGAAGTAATCTACAGCGAGATCACTATACACCTTTTTACTACGGAGACTGCA
TCTTGGACCCTCACACACAATCTCACTACCATCCATCTTTAGTTTGAGTTTGAGATTATC
AAATTCTGCATCATTGAGGATTGGATTTCCAGAAACATAAGCCATCGAAGCTTCCAAGAA
TCTCTGTTCATCAGAACTTAGCATGACAACGCTGCTTCCTTCCCACATGAGCTCTTCTTT
AAGGTTATCAAACTCCTCATTCGACATGATCGCTTTGCCATCGTAATAGGACGATTGCAT
GGCTTGGAGAAACTCTTGCTCCATTTCACCAATTGATTTCTTCTCAGCTTTGTTGATGCT
ACAGTAAGGCATGATGTTGCTATCCACGTCTTCTCCTCCCACTTGACCTGATTGCTCTGT
GGTGGCTTTTGCAGGCAACAGGAAGAATCTTTTTCTCAAGGGAACCGATCTTCCAGGGGT
GAGCTGAGACCATTGAGTCCTCGACGAGAAACAAGGAGGGGTGGTGGGTTTGCGAGAAAC
AGCGGAGAAGAGTCGAGGGCTTGTTAAACTGAACAGCATCTTGCTACCCATTTTCCCTGG
GAGGAGAAAGGAGAATCCTTTTTTCCTCTCC

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 6

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GTTGGAGGACACGTACGCTAGCAGGGTAACCGCCTGCATGGCACCGTTTGATAGTGAGGC
TGCTGCTAAGCAAAAAGCCATCCTCGAGAACTACACCAATCCCTGGGTTAGGATATCTGT
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CTTCAAATCATGTGGCCGTGACAGTAGAGTTGATTTCCCCAGAGAGCCTCTTTTGGACAG
ACGTGCTTTTGTTACTCTTCGTGCACATGGTGATGATGCACATGTCGCAAAAGAGAAAGC
GTTGCAACTTAATGGAAGTAACATGAGAGGTTGGAATGCCCTTGTCAAGATTGCACCCGA
GGAAGAGGATGAGGAATACCTGGCGTTATCAGCTTATAGAGAAGCTCTTGGTGATGATCT
ATTATATGACAAAAGATTTATGTTTGGCATTTCCGTTGAGGGGTATGACACCTCCCTTCG
TGAAGATGAAGTCGAGAAGGCTTTGACTACACATTTCTCTTCTTGTGGAGAGATAACACA
TGTTTACGTTGATCTCCAGTACAAGTTTACTAATATCTATTTTTCCAAAGAAGAAGGAGA
AGCTAGTGCCATGGCTCTTGATGGAAGTCAAGTGGACGGATTCAAAATAACTACTTCGCT
CGTAGCCACAACAGCCAGTAGTTACACTCCCCTTCCCCCTGATGAAACTTATTTTGGCTC
TTGTTACCCAGCTCATATGCTCGAGTTTGGCGAGGAGATGCAGGAGAAGATCGATTTTTA
TATGACTGAGTGGAGGCTCAATGCGATGACAAAGAAGCTCAGGGCTCTTAAGAAGCACAA
GGTCTGGACTCTTAGGGAGCCTAAGCTCAAGGCTCTTAAGAAGCCCAAGGCCGGGGCTCT
TAAGAAGCTTAAGGCCTGGGCTCTTAGGAAGGAGCTTAAGGCCTTGGCCCTTAAGAAGCT
TAAGGCCAGGGCTCTTAAGAAGCTTAAGGCCAAGGCCAGGGCCAGGAGGGAGAAGGGTCA
GAGTCCTCTTGAGAAGGAGAGGATGTTGATGTAATAAATT*CTCCCTAAGAGACTAACAG
AAACTCTTTGGTGTTTATCAATCCTGTGATAATACTATTATGCAACCTTCCGTTTGTTTG
TGTGTGTTTTGTGGATGATAAACTTAAAAACTTATTTATCTTAATTTTTATTTGCCGATG
GTTTATAGGCAGAAGCATAATCTTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 
35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 30 30 10 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FW07TF U 1
AF RS1DN73TF U 6
AF RS1AW27TF U 7
AF RS1BA52JQ C 513
AF RS1DN73JQ C 543
AF RS1AW27JQ C 539
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GTTGGAGGACACGTACGCTAGCAGGGTAACCGCCTGCATGGCACCGTTTGATAGTGAGGC
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CTTCAAATCATGTGGCCGTGACAGTAGAGTTGATTTCCCCAGAGAGCCTCTTTTGGACAG
ACGTGCTTTTGTTACTCTTCGTGCACATGGTGATGATGCACATGTCGCAAAAGAGAAAGC
GTTGCAACTTAATGGAAGTAACATGAGAGGTTGGAATGCCCTTGTCAAGATTGCACCCGT
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ATTATATGACAAAAGATTTATGTTTGGCATTTCCGTTGAGGGGTATGACACCTCCCTTCG
TGAAGATGAAGTCGAGAAGGCTTTGACTACACATTTCTCTTCTTGTGGAGAGATAACACA
TGTTTACGTTGATCTCCAGTACAAGTTTACTAATATCTATTTTTCCAAAGAAGA

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DS 

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TGG
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ACACGTACGCTAGCAGGGTAACCGCCTGCATGGCACCGTTTGATAGTGAGGCTGCTGCTA
AGCAAAAAGCCATCCTCGAGAACTACACCAATCCCTGGGTTAGGATATCTGTTGAAGGAT
TCAGGTGTTGTAAGTACGTTGAGGATGAAATCAGGATTGAATTGATTAATCTCTTCAAAT
CATGTGGCCGTGACAGTAGAGTTGATTTCCCCAGAGAGCCTCTTTTGGACAGACGTGCTT
TTGTTACTCTTCGTGCACATGGTGATGATGCACATGTCGCAAAAGAGAAAGCGTTGCAAC
TTAATGGAAGTAACATGAGAGGTTGGAATGCCCTTGTCAAGATTGCACCCGAGGAAGAGG
ATGAGGAATACCTGGCGTTATCAGCTTATAGAGAAGCTCTTGGTGATGATCTATTATATG
ACAAAAGATTTATGTTTGGCATTTCCGTTGAGGGGTATGACACCTCCCTTCGTGAAGATG
AAGTCGAGAAGGCTTTGACTACACATTTCTCTTCTTGTGGAGAGATAACACATGTTTACG
TTGATCTCCAGTACAAGTTTACTAATATCTATTTTTCCAAAGAA

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GG
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ACACGTACGCTAGCAGGGTAACCGCCTGCATGGCACCGTTTGATAGTGAGGCTGTTGCTA
AGCAAAAAGCCATCCTCGAGAACTACACCAATCCCTGGGTTAGGATATCTGTTGAAGGAT
TCAGGTGTTGTAAGTACGTTGAGGATGAAATCAGGATTGAATTGATTAATCTCTTCAAAT
CATGTGGCCGTGACAGTAGAGTTGATTTCCCCAGAGAGCCTCTTTTGGACAGACGTGCTT
TTGTTACTCTTCGTGCACATGGTGATGATGCCCATGTCGCAAAAGGGAAAGCGTTGCAAC
TTAATGGAAGTAACATGAGAGGTTGGAATGCCCTTGTCAAGATTGCACCCGAGGAAGAGG
ATGAGGAATACCTGGCGTTATCAGCTTATAGAGAAGCTCTTGGTGATGATCTATTATATG
ACAAAAGATTTATGTTTGGCATTTCCGTTGAGGGGTATGACACCTCCCTTCGTGAAGATG
AAGTCGAGAGGGCTTTGACTACACATTTCTCTTCTTGTGGAGAGATAACACATGTTTACG
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CCATGGCTCTTGATGGAAGTCAAGTG

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DS 

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ATTTCTCTTCTTGTGGAGAGATAACACATGTTTACGTTGATCTCCAGTACAAGTTTACTA
ATATCTATTTTTCCAAAGAAGAAGGAGAAGCTAGTGCCATGGCTCTTGATGGAAGTCAAG
TGGACGGATTCAAAATAACTACTTCGCTCGTAGCCACAACAGCCAGTAGTTACACTCCCC
TTCCCCCTGATGAAACTTATTTTGGCTCTTGTTACCCAGCTCATATGCTCGAGTTTGGCG
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AGGCCAGGGCCAGGAGGGAGAAGGGTCAGAGTCCTCTTGAGAAGGAGAGGATGTTGATGT
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TATTTATCTTAATTTTTATTTGCC

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DS 

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AAGATGAAGTCGAGAAGGCTTTGACTACACATTTCTCTTCTTGTGGAGAGATAACACATG
TTTACGTTGATCTCCAGTACAAGTTTACTAATATCTATTTTTCCAAAGAAGAAGGAGAAG
CTAGTGCCATGGCTCTTGATGGAAGTCAAGTGGACGGATTCAAAATAACTACTTCGCTCG
TAGCCACAACAGCCAGTAGTTACACTCCCCTTCCCCCTGATGAAACTTATTTTGGCTCTT
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TCTGGACTCTTAGGGAGCCTAAGCTCAAGGCTCTTAAGAAGCCCAAGGCCGGGGCTCTTA
AGAAGCTTAAGGCCTGGGCTCTTAGGAAGGAGCTTAAGGCCTTGGCCCTTAAGAAGCTTA
AGGCCAGGGCTCTTAAGAAGCTTAAGGCCAAGGCCAGGGCCAGGAGGGAGAAGGGTCAGA
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ACTCTTTGGTGTTTATCAATCCTGTGATAATACTATTATGCAACCTTCCGTTTGTTTGTG
TGTGTTTT

QA 1 668 1 668
DS 

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CATGTTTACGTTGATCTCCGGTACAAGTTTACTAATATCTATTTTTCCAAAGAAGAAGGA
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CTCGTAGCCACAACAGCCAGTAGTTACACTCCCCTTCCCCCTGATGAAACTTATTTTGGC
TCTTGTTACCCAGCTCATATGCTCGAGTTTGGCGAGGAGATGCAGGAGAAGATCGATTTT
TATATGACTGAGTGGAGGCTCAATGCGATGACAAAGAAGCTCAGGGCTCTTAAGAAGCAC
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CTTAAGGCCAGGGCTCTTAAGAAGCTTAAGGCCAAGGCCAGGGCCAGGAGGGAGAAGGGT
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AGAAACTCTTTGGTGTTTATCAATCCTGTGATAATACTATTATGCAACCTTCCGTTTGTT
TGTGTGTGTTTTGTGGATGATAAACTTAAAAACTTATTTATCTTAATTTTTATTTGCCGA
TGGTTTATAGGCAGAAGCATAATCTTATCC

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 8

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CTCTGCGAGGAGATAACATCCGAAGAAACAAATCGAAAATCGTACCATCGGAGTTGATCC
GAAGTCAGAATCAAAGGGGGAGTCATGGGGGATCATGCGGTGAGAGCGGAGGAATTCGAG
AAGAAAGCAGAGAAGAAGCTCAACGGATGGGGAATATTCGGATCTAAGCACGAGGATGCT
GCCGATCTCTTCGAGAAAGCTGCTAATTCCTATAAGCTCGCCAAATCATGGGATCTAGCT
GGAAAGGCTTATCTTAAAGTTGCTGACTGTCACTTGAAGTCGGACAGCAAGCATGATGCT
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TCTTGTCTGGAGCGAGCTGTGAATATTTTCTGCGAGATAGGAAGGCTCAACATGGCTGCC
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CAGTGCAATCTAAAGGTGGCACAGTATGCTTCCCAGTTGGAGCAATATGAGAAGGCAATC
AAGATTTATGAAGATATAGCACGCCATTCACTCGGAAATAACTTGCTTAAGTATGGAGTC
AAGGGCCATCTTCTCAATGCTGGCTTGTGCCACCTTTGCAAAGCTGATGTTGTTTCCATC
ACTAATGCTCTCGAGAAGTATCAGGATCTGGATCCAACTTTTACAGGAACAAGAGAATGC
AAACTCTTATCGGACCTTGCTTTTGCTATCGATGAAGAAGACATCGCAAAATTCACAGAC
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CTCTTTCCATCCGAAGCTTTGGTCTTTATTTGTTACT*GCTGGTGTGTACTCATCATTTG
TGTTCGTGCTACTTC***ATGTTCGACCCTTCATTGTGTCTGGTTTATGAGATTTAAGGT
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TCTCATTACTTCATCTATGTGAACTTCTCAACTACTTGGAGATTTGATTTGTTTACATCA
AATAAAAGATTGTTTACATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

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AF RS1E733TF U 565
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CTCTGCGAGGAGATAACATCCGAAGAAACAAATCGAAAATCGTACCATCGGAGTTGATCC
GAAGTCAGAATCAAAGGGGGAGTCATGGGGGATCATGCGGTGAGAGCGGAGGAATTCGAG
AAGAAAGCAGAGAAGAAGCTCAACGGATGGGGAATATTCGGATCTAAGCACGAGGATGCT
GCCGATCTCTTCGAGAAAGCTGCTAATTCCTATAAGCTCGCCAAATCATGGGATCTAGCT
GGAAAGGCTTATCTTAAAGTTGCTGACTGTCACTTGAAGTCGGACAGCAAGCATGATGCT
GCTAACGCCTATGCTGAAGCTGCTAAATGCTACAAGAAAGTTGACACTAATGAGGCTGCA
TCTTGTCTGGAGCGAGCTGTGAATATTTTCTGCGAGATAGGAAGGCTCAACATGGCTGCC
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CAGTGCAATCTAAAGGTGGCACAGTATGCTTCCCAGTTGGAGCAATATGAGAAGGCAA

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DS 

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G
GCTCCCCGATCGATTTCTCCTCCCTCATTTCAACGAAGCAAACCCTCTGCGAGGAGATAA
CATCCGAAGAAACAAATCGAAAATCGTACCATCGGAGTTGATCCGAAGTCAGAATCAAAG
GGGGAGTCATGGGGGATCATGCGGTGAGAGCGGAGGAATTCGAGAAGAAAGCAGAGAAGA
AGCTCAACGGATGGGGAATATTCGGATCTAAGCACGAGGATGCTGCCGATCTCTTCGAGA
AAGCTGCTAATTCCTATAAGCTCGCCAAATCATGGGATCTAGCTGGAAAGGCTTATCTTA
AAGTTTCTGACTGTCACTTGAAGTCGGACAGCAAGCATGATGCTGCTAACGCCTATGCTG
AAGCTGCTAAATGCTACAAGAAAGTTGACACTAATGAGGCTGCATCTTGTCTGGAGCGAG
CTGTGAATATTTTCTGCGAGATAGGAAGGCTCAACATGGCTGCCCGATACTACAAGGAAA
TTGCTGAGTATTATGAAGCAGACCAGAAGTTAGAGCAGGCTATTGATTACTTTGAAAAGG
CTGCTGAATTTTTCCAAAATGAAGAAGTTACCACTTCTGCAAACCAGTGCAATCTAAAGG
TGGCACAGTATGCTTCCCAGTTGGAGCAATATGAGAAGGCAATCAAGATTTATGAAGATA
TAGCACGCCATTCACTCGGAAATAACTTGCTTAAGTATGGAG
GCA

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DS 

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GG
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TACCATCGGAGTTGATCCGAAGTCAGAATCAAAGGGGGAGTCATGGGGGATCATGCGGTG
AGAGCGGAGGAATTCGAGAAGAAAGCAGAGAAGAAGCTCAACGGATGGGGAATATTCGGA
TCTAAGCACGAGGATGCTGCCGATCTCTTCGAGAAAGCTGCTAATTCCTATAAGCTCGCC
AAATCATGGGATCTAGCTGGAAAGGCTTATCTTAAAGTTGCTGACTGTCACTTGAAGTCG
GACAGCAAGCATGATGCTGCTAACGCCTATGCTGAAGCTGCTAAATGCTACAAGAAAGTT
GACACTAATGAGGCTGCATCTTGTCTGGAGCGAGCTGTGAATATTTTCTGCGAGATAGGA
AGGCTCAACATGGCTGCCAGATACTACAAGGAAATTGCTGAGTATTATGAAGCAGACCAG
AAGTTAGAGCAGGCTATTGATTACTTTGAAAAGGCTGCTGAATTTTTCCAAAATGAAGAA
GTTACCACTTCTGCAAACCAGTGCAATCTAAAGGTGGCACAGTATGCTTCCCAGTTGGAG
CAATATGAGAAG*CAATCAAGATTTATGAAGATATAGCACGCCATTCACTC

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DS 

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G
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CGAGATAGGAAGGCTCAACATGGCTGCCAGATACTACAAGGAAATTGCTGAGTATTATGA
AGCAGACCAGAAGTTAGAGCAGGCTATTGATTACTTTGAAAAGGCTGCTGAATTTTTCCA
AAATGAAGAAGTTACCACTTCTGCAAACCAGTGCAATCTAAAGGTGGCACAGTATGCTTC
CCAGTTGGAGCAATATGAGAAGGCAATCAAGATTTATGAAGATATAGCACGCCATTCACT
CGGAAATAACTTGCTTAAGTATGGAGTCAAGGGCCATCTTCTCAATGCTGGCTTGTGCCA
CCTTTGCAAAGCTGATGTTGTTTCCATCACTAATGCTCTCGAGAAGTATCAGGATCTGGA
TCCAACTTTTACAGGAACAAGAGAATGCAAACTCTTATCGGACCTTGCTTCTGCTATCGA
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GGACTCATGGAAGACAACTATGTTGTTGAGGGTGAAGGAGAAGCTGAAGGCGAAGGAGCT
TGAAGAGGATGATCTCACCTAAACATATCTCTTTCCATCCGAAGCTTTGGTCTTTATTTG
TTACT*GCTGGTGTGTACTCATCATTTGTGTTCGTGCTACTTC***ATGTTCGACCCTTC
ATTGTGT
C

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DS 

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TATGCTTCCCAGTTGGAGCAATATGAGAAGGCAATCAAGATTTATGAAGATATAGCACGC
CATTCACTCGGAAATAACTTGCTTAAGTATGGAGTCAAGGGCCATCTTCTCAATGCTGGC
TTGTGCCACCTTTGCAAAGCTGATGTTGTTTCCATCACTAATGCTCTCGAGAAGTATCAG
GATCTGGATCCAACTTTTACAGGAACAAGAGAATGCAAACTCTTATCGGACCTTGCTTCT
GCTATCGATGAAGAAGACATCGCAAAATTCACAGACGTTGTCAAGGAATTTGATAGCATG
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AAGGAGCTTGAAGAGGATGACCTCACCTAAACATATCTCTTTCCATCCGAAGCTTTGGTC
TTTATTTGTTATTTGCTGGTGTGTACTCATCATTTGTGTTCGTGCTACTTCTTCATGTTC
GACCCTTCATTGTGTCTGGTTTATGAGATTT

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DS 

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AGGTGGCACAGTATGCTTCCCAGTTGGAGCAATATGAGAAGGCAATCAAGATTTATGAAG
ATATAGCACGCCATTCACTCGGAAATAACTTGCTTAAGTATGGAGGCAAGGGCCATCTTC
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ACCTTGCTTTTGCTATCGATGAAGAAGACATCGCAAAATTCACAGACGTTGTCAAGGAAT
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AGCTGAAGGCGAAGGAGCTTGAAGAGGATGATCTCACCTAAACATATCTCTTTCCATCCG
AAGCTTTGGTCCTTATTTGTTACT*GCTGGTGTGTACTCATCATTTGTGTTCGTGCTACT
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TGGTCAAAACTATGTTTGTTTGATATCACGACAATGTTTGTTACATCTCTCATTACTTCA
TCTATGTGAACTTCTCAACTACTTGG

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DS 

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TGGAGCGAGCTGTGAATATTT*CTGCGAGATAGGAAGGCTCAACATGGCTGCCAGATACT
ACAAGGAAATTGCTGAGTATTATGAAGCAGACCAGAAGTTAGAGCAGGCTATTGATTACT
TTGAAAAGGCTGCTGAATTTTTCCAAAATGAAGAAGTTACCACTTCTGCAAACCAGTGCA
ATCTAAAGGTGGCACAGTATGCTTCCCAGTTGGAGCAATATGAGAAGGCAATCAGGATTT
ATGAAGATATAGCACGCCATTCACTCGGAAATAACTTGCTTAAGTATGGAGTCAAGGGCC
ATCTTCTCAATGCTGGCTTGTGCCACCTTTGCAAAGCTGATGTTGTTTCCATCACTAATG
CTCTCGAGAAGTATCAGGATTTGGATCCAACTTTTACAGGAACAAGAGAATGCAAACTTT
TATCGGACCTTGCTTTTGCTATCGATGAAGAAGACATCGCAAAATTCACAGACGTTGTCA
AGGAATTTGATAGCATGACTCCTCTGGACTCATGGAAGACAACTATGTTGTTGAGGGTGA
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CATCCGAAGCTTTGGTCTTTATTTGTTACT*GCTGGTGTGTACTCATCATTTGTGTTCGT
GCTACTTC***ATGTTCGACCCTTCATTGTGTTTGGTTTATGAGATTTAAGGTTTTTTAA
GAGGTTTGGTCAAAACTATGTTTGTTTGATATCACGACAATGTTTGTTACATCTCTCATT
ACTTCATCTATGTGAACTTCTCAACTACTTGGAGATTTGATTTGTTTACATCAAATAAAA
GATTGTTTACATG

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DS 

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TTTTT
TCAATGCTGGCTTGTGCCACCTTTGCAAAGCTGATGTTGTTTCCATCACTAATGCTCTCG
AGAAGTATCAGGATCTGGATCCAACTTTTACAGGAACAAGAGAATGCAAACTTTTATCGG
ACCTTGCTTTTGCTATCGATGAAGAAGACATCGCAAAATTCACAGACGTTGTCAAGGAAT
TTGATAGCATGACTCCTCTGGACTCATGGAAGACAACTATGTTGTTGAGGGTGAAGGAGA
AGCTGAAGGCGAAGGAGCTTGAAGAGGATGATCTCACCTAAACATATCTCTTTCCATCCG
AAGCTTTGGTCTTTATTTGTTACT*GCTGGTGTGTACTCATCATTTGTGTTCGTGCTACT
TC***ATGTTCGACCCTTCATTGTGTTTGGTTTATGAGATTTAAGGTTTCTTAAGAGGTT
TGGTCAAAACTATGTTTGTTTGATATCACGACAATGTTTGTTACATCTCTCATTACTTCA
TCTATGTGAACTTCTCAACTACTTGGAGATTTGATTTGTTTACATCAAATAAAAGATTGT
TTACA
GG

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DS 



AS 2 8

CO CL597Contig1 996 5 11 U
CCCAAAAAAAAAAATAAAATTTCTGGATCTTATATAATCTATCATACACGAACTTATTAT
GTTAAATTTTATTACATGATCAGACATCTCCAAACTATAATGTCTTGTCTTATCTATAGT
ACGTAACTTATTATGTTAAGTTTTATTACATCAGACAACTACTCGTCTTAGTTAAAAACA
AAAGTTCATTAATACGGACGTGTGTTCTCATCACCCATCGGCCTAGGAGCATAGTTACAT
ACGACCCAAAGATATGTATTTGCATGACACCTGACGTGACCACAACCAACTCGGTGCGAT
TGGTTAGCCACCATCTGAGTATAATGCCCGCACACACCACTACATTTGTTGGTTTGATAA
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TTAGATTTGAGCCACCCTGCAGCTATATTCTCGCCGTACATTTCGTCGTTCGAATGCTGT
AGGGCACAGTCTTTGGATCGTACGTTAGCGTAGTTCTGTGCGAAGGCAGCTAGTTTAAAG
TCCCACAGCATTGGAGCCACCCCGACTTCGGCTCGAACCTGATTGTGAACCAATAAAGTT
GCTGCCGGGTTGAGATCAAACATTGGGTCTAAGTTGGTTCGACCTAGGGTGTTAAGCCCT
AAGGTTGCTGCCGGTTGGGGATGAGCCTTAAGCCCTGACCTTGCTGCCGGTTGAGGATGA
GCATTAAGCCCTGACCTTGCTGCCGGTTGAGGATGAGCATTAAGCCCTGACGTTGCTGCC
GGTTGGGGATGAGCATTATGCCCTGACATTGCTGCCGGTTGGGGTTCAGCCTGTGGGTCA
TTACAGGAACCATAGATTTGAGTTAAGACGACGGAAAGTAAAGTTACTACGACGAAGCTA
TATCCAGAAAACGACATTCTTGTTCTTCTTCTTATTGTTTTTTTTGTTTTTTTTCAACAC
TTCTTTTGTTTTTGTTTTTGAACTTCTTTGGTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EW53JQ U 1
AF RS1FL72JQ U 11
AF RS1D151JQ U 64
AF RS1D151TF C 185
AF RS1DH90TF C 274
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RD RS1EW53JQ 694 0 0
CCCAAAAAAAAAAATAAAATTTCTGGATCTTATATAATCTATCATACACGAACTTATTAT
GTTAAATTTTATTACATGATCAGACATCTCCAAACTATAATGTCTTGTCTTATCTATAGT
ACGTAACTTATTATGTTAAGTTTTATTACATCAAACAACTACTCGTCTTAGTTAAAAACA
AAAGTTCATTAATACGGACGTGTGTTCTCATCACCCATCGGCCTAGGAGCATAGTTACAT
ACGACCCAAAGATATGTATTTGCATGACACCTGACGTGACCACAACCAACTCGGTGCGAT
TGGTTAGCCACCATCTGAGTATAATGCCCGCACACACCACTACATTTGTTGGTTTGATAA
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TTAAATTTGAGCCACCCTGCAGCTATATTCTCGCCGTACATTTCGTCGTTCGAATGCTGT
AGGGCACAGTCTTTGGATCGTACGTTAGCGTAGTTCTGTGCGAAGGCAGCTAGTTTAAAG
TCCCACAGCATTGGAGCCACCCCGACTTCGGCTCGAACCTGATTGTGAACCAATAAAGTT
GCTGCCGGGTTGAGATCAAACATTGGGTCTAAGTTGGTTCGACCTAGGGTGTTAAGCCCT
AAGGTTGCTGCCGGTTGGGGATGAGCCTTAAGCC

QA 1 694 1 694
DS 

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ATTACATGATCAGACATCTCCAAACTATAATGTCTTGTCTTATCTATAGTACGTAACTTA
TTATGTTAAGTTTTATTACATCAGACAACTACTCGTCTTAGTTAAAAACAAAAGTTCATT
AATACGGACGTGTGTTCTCATCACCCATCGGCCTAGGAGCATAGTTACATACGACCCAAA
GATATGTATTTGCATGACACCTGACGTGACCACAACCAACTCGGTGCGATTGGTTAGCCA
CCATCTGAGTATAATGCCCGCACACACCACTACATTTGTTGGTTTGATAATTGTAGAATT
TCTTCTCGCCATACCACAACTTAGCCGCGATCGGACCGCTCATTGATTCCTTAGATTTGA
GCCACCCTGCAGCTATATTCTCGCCGTACATTTCGTCGTTCGAATGCTGTAGGGCACAGT
CTTTGGATCGTACGTTAGCGTAGTTCTGTGCGAAGGCAGCTAGTTTAAAGTCCCACAGCA
TTGGAGCCACCCCGACTTCGGCTCGAACCTGATTGTGAACCAATAAAGTTGCTGCCGGGT
TGAGATCAAACATTGGGTCTAAGTTGGTTCGACCTAGGGTGTTAAGCCCTAAGGTTGCTG
CCGGTTGGGGATGAGCCTTAAGCCCTGACCTTGCTGCCGGTTGA

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DS 

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GTTCATTAATACGGACGTGTGTTCTCATCACCCATCGGCCTAGGAGCATAGTTACATACG
ACCCAAAGATATGTATTTGCATGACACCTGACGTGACTACAACCAACTCGGTGCGATTGG
TTAGCCACCATCTGAGTATAATGCCCGCACACACCACTACATTTGTTGGTTTGATAATTG
TAGAATTTCTTCTCGCCATACCACAACTTAGCCGCGATCGGACCGCTCATTGATTCCTTA
GATTTGAGCCACCCTGCAGCTATATTCTCGCCGTACATTTCGTCGTTCGAATGCTGTAGG
GCACAGTCTTTGGATCGTACGTTAGCGTAGTTCTGTGCGAAGGCAGCTAGTTTAAAGTCC
CACAGCATTGGAGCCACCCCGACTTCGGCTCGAACCTGATTGTGAACCAATAAAGTTGCT
GCCGGGTTGAGATCAAACATTGGGTCTAAGTTGGTTCGACCTAGGGTGTTAAGCCCTAAG
GTTACTGCCGGTTGGGGATGAGCCTTAAGCCCTGACCTTGCTGCCGGTTGAGGATGAGCA
TTAAGCCCTGACCTTGCTGCCGGTTGAGGATGAGCATTAAGCCCTGACGTTGCTGCCGGT
TGGGG
ATGA

QA 1 725 1 725
DS 

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TAGCCACCATCTGAGTATAATGCCCGCACACACCACTACATTTGTTGGTTTGATAATTGT
AGAATTTCTTCTCGCCATACCACAACTTAGCCGCGATCGGACCGCTCATTGATTCCTTAG
ATTTGAGCCACCCTGCAGCTATATTCTCGCCGTACATTTCGTCGTTCGAATGCTGTAGGG
CACAGTCTTTGGATCGTACGTTAGCGTAGTTCTGTGCGAAGGCAGCTAGTTTAAAGTCCC
ACAGCATTGGAGCCACCCCGACTTCGGCTCGAACCTGATTGTGAACCAATAAAGTTGCTG
CCGGGTTGAGATCAAACATTGGGTCTAAGTTGGTTCGACCTAGGGTGTTAAGCCCTAAGG
TTACTGCCGGTTGGGGATGAGCCTTAAGCCCTGACCTTGCTGCCGGTTGAGGATGAGCAT
TAAGCCCTGACCTTGCTGCCGGTTGAGGATGAGCATTAAGCCCTGACGTTGCTGCCGGTT
GGGGATGAGCATTATGCCCTGACATTGCTGCCGGTTGGGGTTCAGCC
C

QA 1 647 1 647
DS 

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ACGTGACCACAACCAACTCGGTGCGATTGGT*AGCCACCATCTGAGTATAATGCCCGCAC
ACACCACTACATTTGTTGGTTTGATAATTGTAGAATTTCTTCTCGCCATACCACAACTTA
GCCGCGATCGGACCGCTCATTGATTCCTTAGATTTGAGCCACCCTGCAGCTATATTCTCG
CCGTACATTTCGTCGTTCGAATGCTGTAGGGCACAGTCTTTGGATCGTACGTTAGCGTAG
TTCTGTGCGAAGGCAGCTAGTTTAAAGTCCCACAGCATTGGAGCCACCCCGACTTCGGCT
CGAACCTGATTGTGAACCAATAAAGTTGCTGCCGGGTTGAGATCAAACATTGGGTCTAAG
TTGGTTCGACCTAGGGTGTTAAGCCCTAAGGTTGCTGCCGGTTGGGGATGAGCCTTAAGC
CCTGACCTTGCTGCCGGTTGAGGATGAGCATTAAGCCCTGACCTTGCTGCCGGTTGAGGA
TGAGCATTAAGCCCTGACGTTGCTGCCGGTTGGGGATGAGCATTATGCCCTGACATTGCT
GCCGGTTGGGGTTCAGCCTGTGGGTCATTACAGGAACCATAGATTTGAGTTAAGACGACG
GAAAGTAAAGTTACTACGACGAAGCTATATCCAGAAAACGACATTCTTGTTCTTCTTCTT
ATTGTTTTTTTTGTTTTTTTTCAACACTTCTTTTGTTTTTGTTTTTGAACTTCTTTGGTC
TCC

QA 1 723 1 723
DS 



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TCTCCGTCGTCTTAACTCAAATCTATGGTTCCTGTAATGACCCACAGGCTGAACCCCAAC
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CTCATTTTCAACCGGCAGCAAGGTCAGGGCTTAAGGCTCATCCCCAACCGGCAGCAACCT
TAGGGCTTAACACCCTAGGTCGAACCAACTTAGACCCAATGTTTGATCTCAACCCGGCAG
CAACTTTATTGGTTCACAATCAGGTTCGAGCCGAAGTCGGGGTGGCTCCAATGCTGTGGG
ACTTTAAACTAGCTGCCTTCGCACAGAACTACGCTAACGTACGATCCAAAGACTGTGCCC
TACAGCATTCGAACGACGAAATGTACGGCGAGAATATAGCTGCAGGGTGGCTCAAATCTA
AGGAATCAATGAGCGGTCCGATCGCGGCTAAGTTGTGGTATGGCGAGAAGAAATTCTACA
ATTATCAAACCAACAAATGTAGTGGTGTGTGCGGGCATTATACTCAGATGGTGGCTAACC
AATCGCACCGAGTTGGTTGTGGTCACGTCAGTGTCATGCAAATACATATCTTTGGGTCGT
ATGTAACTATGCTCCTAGGCGATGGGTGATGAGACACACGTCCGTATTAATGAACTTTTG
TTTTACTAAGACGAGTAGTTGTCT


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1EW53TF U 4
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QA 3 706 3 706
DS 

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GTCGTCTTAACTCAAATCTATGGTTCCTGTAATGACCCACAGGCTGAACCCCAACCGGCA
GCAATGTCAGGGCATAATACTCATCCCCAACCGGCAGCAACGTCAGGGCTTAATGCTCAT
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TTATTGGTTCACAATCAGGTTCGAGCCGAAGTCGGGGTGGCTCCAATGCTGTGGGACTTT
AAACTAGCTGCCTTCGCACAGAACTACGCTAACGTACGATCCAAAGACTGTGCCCTACAG
CATTCGAACGACGAAATGTACGGCGAGAATATAGCTGCAGGGTGGCTCAA*TCTAAGGAA
TCAATGAGCGGTCCGATCGCGGCTAAGTTGTGGTATGGCGAGAAGAAATTCTACAATTAT
CAAACCAACAAATGTAGTGGTGTGTGCGGGCATTATACTCAGATGGTGGCTAACCAATCG
CACCGAGTTGGTTGTGGTCACGTCAGTGTCATGCAAATACATATCTTTGGGTCGTATGTA
ACTATGCTCCTAGGCGATGGGTGATGAGACACACGTCCGTATTAATGAACTTTTGTTTTA
CTAAGACGAGTAGTTGTCT

QA 3 801 3 801
DS 



AS 1 7

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AAAAGAGAAATATAACAAGAATATGATTGTCTGATGCAAAGAGACTCAAAGAGACCAGTT
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ATTCTGATGTTGATGGTCAGATAACTCGAACTCACCCATTGTCGTTCCACCGCCCATCTC
TGTCTCGGTGAATCGCCCCAAATTCAAAACAGGAGACATATCATTCTGACAGTTATTGTC
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GTTGGTGTTGT***CATGTGGCTGGTGTGGGTTTGACAGAAGAGAGAGAGCACAGTTTGA
GTCGCTGCCAATCCCCTTGTAGCTCTCTGGTTTAGTGTCCATAACCTCTGGAGATGAGAA
GCTTATCCCTCCTCCTCCTCCTCCACTGACTGATCCTTGACTAAACACGTTCATCGGATT
GATCTGCCACGACGGTCGTCTCATCACTCTTGTATCCAACGTTCTTGTATTTGTCCAACC
CATTTCTTGGGAACCAAGAAAGCTCCCATTCATTGTAGTTTCAGCATTTCCGTAAAGCGA
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CCGTCTCTCATTATGACCAGCGAGTCTCCTACGGCAACTCCTTTTCTCTAGGTCAAATTC
CGGAAGCTGATGAAAGCTGCCGCACTGTTGACAGAACCTTTGTTCGATACCAGCGACAAT
GACTTTGGGTGTTTTAGAGTGCACTCCACACACTCTGTGCCTAGAGTAATAACCCTTTGC
ATTGGTTAGATCCATTCCACAACCTTCCACTTGGCACCTTGGTATCTGACCCGAAGGACC
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TCCAGCGTCCTCGAAGTAGATCCTCTGGCCAAACATGAGCCCTCCGCTTAAAGAGGATGA
CTCAGTCGATGAACCACCCGACTCTGCTTGACCTGGACCACGACCAGGACCCGAGTAGGA
ACCCATATTCATTTTTGTTTCCTCTTACTCAGACAGAAAGAGAGTACTCACACATCATTC
TCTCTCTCTCTCTCTTTATTAAACCTAACTGTCTTGGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FC69JQ U 173
AF RS1BN79JQ U 36
AF RS1GU37JQ U 30
AF RS1AN39JQ U 1
AF RS1BN79TF C 242
AF RS1FC69TF C 572
AF RS1GU37TF C 757
BS 1 71 RS1AN39JQ
BS 72 73 RS1GU37JQ
BS 74 86 RS1AN39JQ
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BS 97 97 RS1GU37JQ
BS 98 102 RS1AN39JQ
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BS 121 123 RS1GU37JQ
BS 124 484 RS1AN39JQ
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BS 921 921 RS1FC69TF
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BS 1026 1133 RS1FC69TF
BS 1134 1362 RS1GU37TF

RD RS1FC69JQ 238 0 0
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TGCCTCCTATTCTGATGTTGATGGTCAGATAACTCGAACTCACCCATTGTCGTTCCACCG
CCCATCTCTGTCTCGGTGAATCGCCCCAAATTCAAAACAGGAGACATATCATTCTGACAG
TTATTGTCATCGTCCTTAAACACCCAAGGGGGGTTCAGATACTGATGCTGGCTAGGTG

QA 1 238 1 238
DS 

RD RS1BN79JQ 486 0 0
CACC
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TAAAGCAAATAACAGAAAAAAAAAAGAGAAATATAACAAGAATATGATTGTCTGATGCAA
AGAGACTCAAAGAGACCAGTTGTGATGGTGTGAAGAAGAGTCATAAGCCCTTGAGTTCTC
ACCTTCCATGTACTGCCTCCTATTCTGATGTTGATGGTCAGATAACTCGAACTCACCCAT
TGTCGTTCCACCGCCCATCTCTGTCTCGGTGAATCGCCCCAAATTCAAAACAGGAGACAT
ATCATTCTGACAGTTATTGTCATCGTCCTTAAACACCCAAGGCGGGTTCAGATACTGATG
CTGGCTAGGTGCAGGTGGTGGCTGAGCCATTGTAACCGTCATCGGACCAAAACCTGAAGA
AGTTCTCCATGTGTTGTTGTCGTTGGTGTTGT***CATGTGGCTGGTGTGGGTTTGACAG
AA

QA 5 486 5 486
DS 

RD RS1GU37JQ 663 0 0
GGAAACA
ACCAACAAGAAGCATAAATAAACAAAAGCCAATGTATGGAAACAATTTTTTT*GGTTCAT
GAGTAAAGCAAATAACAGAAAAAAAAAAGAGAAATATAACAAGAATATGATTGTCTGATG
CAAAGAGACTCAGAAAGACCAGTTGTGATGGTGTGAAGAAGAGTCATAAGCCCTTGAGTT
CTCACCTTCCATGTACTGCCTCCTATTCTGATGTTGATGGTCAGATAACTCGAACTCACC
CATTGTCGTTCCACCGCCCATCTCTGTCTCGGTGAATCGCCCCAAATTCAAAACAGGAGA
CATATCATTCTGACAGTTATTGTCATCGTCCTTAAACACCCAAGGCGGGTTCAGATACTG
ATGCTGGCTAGGTGCAGGTGGTGGCTGAACCATTGTAACCGTCATCGGACCAAAACCTGA
AGAAGTTCTCCATGTGTTGTTGTCGTTGGTGTTGT***CATGTGGCTGGTGTGGGTTTGA
CAGAAGAGAGAGAGCACAGTTTGAGTCGCTGCCAATCCCCTTGTAGCTCTCTGGTTTAGT
GTCCATAACCTCTGGAGATGAGAAGCTTATCCCTCCTCCTCCTCCTCCACTGACTGATCC
TTGACTAAACACGTTCATCGGATTGATCTGCCACGACGGTCGTCTCATCACTCTTG

QA 8 663 8 663
DS 

RD RS1AN39JQ 822 0 0
ATCAAATCTGATCTCTTAGCTTGGAAAGAGAAAACAACAAACAAGAAGCATAAATAAACA
AAAGCCAATGTCAGGAAACAATTTTTG**GGTTTATTAGTAA*GCAAATAACAGAAAAAA
***AGAGAAATATAACAAGAATATGATTGTCTGATGCAAAGAGACTCAAAGAGACCAGTT
GTGATGGTGTGAAGAAGAGTCATAAGCCCTTGAGTTCTCACCTTCCATGTACTGCCTCCT
ATTCTGATGTTGATGGTCAGATAACTCGAACTCACCCATTGTCGTTCCACCGCCCATCTC
TGTCTCGGTGAATCGCCCCAAATTCAAAACAGGAGACATATCATTCTGACAGTTATTGTC
ATCGTCCTTAAACACCCAAGGCGGGTTCAGATACTGATGCTGGCTAGGTGCAGGTGGTGG
CTGAGCCATTGTAACCGTCATCGGACCAAAACCTGAAGAAGTTCTCCATGTGTTGTTGTC
GTTGTTGTTGTTGTCATGTAGCTGATGTGGGTTTGACAGAAGAGAGAGAGCACAGTTTGA
GTCGCTGCCAATTCCCTTGTAGCTCTCTGGTTTAGTGTCCATAACCTCTGGAGATGCGAA
GCTTATCCCTCCTCCTCCTCCTCCACTGACTGATCCTTGACTAAACACGTTCATCGGATT
AATCTGCCACGACGGTCGTCTCATCACTCTTGTATCCAACGTTCTTGTATTTGTCCAACC
CATTTCTTGGGAACCAAGAAAGCTCCCATTCATTGTAGTTTCAGCATTTCCGTAAAGCGA
AAGTGCTATCCTCCCGTAACGAGAAGACAACACAGAGAGAGA

QA 1 822 1 822
DS 

RD RS1BN79TF 785 0 0
TTCTGATGTTGATGGTCAGATAACTCGAACTCACCCATTGTCGTTCCACCGCCCATCTCT
GTCTCGGTGAATCGCCCCAAATTCAAAACAGGAGACATATCATTCTGACAGTTATTGTCA
TCGTCCTTAAACACCCAAGGCGGGTTCAGATACTGATGCTGGCTAGGTGCAGGTGGTGGC
TGAGCCATTGTAACCGTCATCGGACCAAAACCTGAAGAAGTTCTCCATGTGTTGTTGTCG
TTGGTGTTGT***CATGTGGCTGGTGTGGGTTTGACAGAAGAGAGAGAGCACAGTTTGAG
TCGCTGCCAATCCCCTTGTAGCTCTCTGGTTTAGTGTCCATAACCTCTGGAGATGAGAAG
CTTATCCCTCCTCCTCCTCCTCCACTGACTGATCCTTGACTAAACACGTTCATCGGATTG
ATCTGCCACGACGGTCGTCTCATCACTCTTGCATCCAACGTTCTTGTATTTGTCCAACCC
ATTTCTTGGGAACCAAGAAAGCTCCCATTCATTGTAGTTTCAGCATTTCCGTAAAGCGAA
GGTGCTATCCTCCCGTAACGAGAAGACAACACAGAGAGAGACGCAGGCTGTGGCTTCCTC
CGTCTCTCATTATGACCAGCGAGTCTCCTACGGCAACTCCTTTTCTCTAGGTCAAATTCC
GGAAGCTGATGAAACCTGCTGCACTGTTGACAGAACCTTTGTTCGATACCAGCGACAATG
ACTTTGGGTGTTTTAGAGTGCACTCCACACACTCTGTGCCTAGAGTAATAACCCTTTGCA
TTGG
C

QA 1 784 1 784
DS 

RD RS1FC69TF 562 0 0
TTAGTGTCCATA*CCTCTGGAGATGAGAAGCTTATCCCTCCTCCTCCTCCTCCACTGACT
GATCCTTGACTAAACACGTTCATCGGAT*GATCTGCCACGACGGTCGTCTCATCACTCTT
GTATCCAACGTTCTTGTATTTGTCCAACCCATTTCTTGGGAACCAAGAAAGCTCCCATTC
ATTGTAGTTTCAGCATTTCCGTAAAGCGAAGGTGCTATCCTCCCGTAACGAGAAGACAAC
ACAGAGAGAGACGCAGGCTGTGGTTTCCTCCGTCTCTCATTATGACCAGCGAGTCTCCTA
CGGCAACTCCTTTTCTCTAGGTCAAATTCCGGAAGCTGATGAAAGCTGCCGCACTGTTGA
CAGAACCTTTGTTCGATACCAGCGACAATGACTTTGGGTGTTTTAGAGTGCACTCCACAC
ACTCTGTGCCTAGAGTAATAACCCTTTGCATTGGTTAGATCCATTCCACAACCTTCCACT
TGGCACCTTGGTATCTGACCCGAAGGACCCGACCCGCCACCACGTACCCTTCTGTTTGAC
CCGCCGGAGGAAGAAGACCCGG

QA 1 562 1 562
DS 

RD RS1GU37TF 606 0 0
AGTTTCAGCATTTCCGTAAAGCGAAGGTGCTATCCTCCCGTAACGAGAAGACAACACAGA
GAGAGACGCAGGCTGTGGTTTCCTCCGTCTCTCATTATGACCAGCGAGTCTCCTACGGCA
ACTCCTTTTCTCTAGGTCAAATTCCGGAAGCTGATGAAAGCTGCCGCACTGTTGACAGAA
CCTTTGTTCGATACCAGCGACAATGACTTTGGGTGTTTTAGAGTGCACTCCACACACTCT
GTGCCTAGAGTAATAACCCTTTGCATTGGTTAGATCCATTCCACAACCTTCCACTTGGCA
CCTTGGTATCTGACCCGAAGGACCCGACCCGCCACCACGTACCCTTCTGTTTGACCCGCC
GGAGGAAGAAGACCCGGTTCCACCTCCAGCGTCCTCGAAGTAGATCCTCTGGCCAAACAT
GAGCCCTCCGCTTAAAGAGGATGACTCAGTCGATGAACCACCCGACTCTGCTTGACCTGG
ACCACGACCAGGACCCGAGTAGGAACCCATATTCATTTTTGTTTCCTCTTACTCAGACAG
AAAGAGAGTACTCACACATCATTCTCTCTCTCTCTCTCTTTATTAAACCTAACTGTCTTG
GTTTCC

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 7

CO CL599Contig1 690 7 15 U
GGGACTTGAGTAGAAGAAAATGTCGATCATTCCAATCAACGATGATCGCCGGAGAATCTC
TCCCGGCGATAGAATCTGGGAGCCATTTGAACTCATGAACACCTTCCTCGACTTCCCCTC
GCCATCCCTCCTGCTATCTCGCCACTTTCCTTCACTTTCCCGAGACCTCTCCCCTTTCTC
TTCTCCATCCACCGTCGAGACCCAGCTCAACTGGACGGAGACTCCGACGGCTCACGTTTT
CAAAGCGTATCTTCCGGGAACGGCTCAGGACGAAGCGATCGTGTTCGTGGACGACGAAGG
ATACCTCCAGATCTGCACGGGAGACAACAAGTTCATGAGCAGGTTCAAGCTCCCCGACAA
CGCTTTGACGGATCAGGTGACGGCGTGGATGGAGGATTGTTTCCTCGTCGTGTTCGTCGC
GAAAGATGGTGCTGCTTCTTCGCAGTCAACGCCGGGGATCGAGGAGAATCGCAATGTGAG
AGTGGTGGAGATTACCGGCGATGATGATTAAATCAAGTCTTGGGACTTTTAAAGTCTGTG
TAATAAAATAAACAGAGTAATCGCGTATTTAGATTTGTGATTGGAAGTCCTTTGTGATCT
TGTGTGAAGTTCCTTTTGTTATAAAGGAATCTGTGTCGTTTTGCTGAATTGGAAAAAAGT
ATGTATAATAGAGAAAATTTGAAGGTCTGC


BQ
10 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
5 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 
5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ER14TF U 1
AF RS1BZ06TF U 90
AF RS1GS32JQ C 2
AF RS1F222JQ C -4
AF RS1F222TF U -4
AF RS1GS32TF U 2
AF RS1BZ06JQ C 2
BS 1 262 RS1ER14TF
BS 263 263 RS1F222TF
BS 264 300 RS1ER14TF
BS 301 301 RS1F222TF
BS 302 302 RS1ER14TF
BS 303 303 RS1F222TF
BS 304 397 RS1ER14TF
BS 398 398 RS1F222TF
BS 399 475 RS1ER14TF
BS 476 476 RS1BZ06TF
BS 477 600 RS1ER14TF
BS 601 601 RS1F222TF
BS 602 632 RS1ER14TF
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TCCCGGCGATAGAATCTGGGAGCCATTTGAACTCATGAACACCTTCCTCGACTTCCCCTC
GCCATCCCTCCTGCTATCTCGCCACTTTCCTTCACTTTCCCGAGACCTCTCCCCTTTCTC
TTCTCCATCCACCGTCGAGACCCAGCTCAACTGGACGGAGACTCCGACGGCTCACGTTTT
CAAAGCGTATCTTCCGGGAACGACTCAGGACGAAGCGATCGTGTTCGTGGACGACGAAGG
GTTCCTCCAGATCTGCACGGGAGACAACAAGTTCATGAGCAGGTTCAAGCTCCCCGACAA
CGCTTTGACGGATCAGGTGACGGCGTGGATGGAGGATGGTTTCCTCGTCGTGTTCGTCGC
GAAAGATGGTGCTGCTTCTTCGCAGTCAACGCCGGGGATCGAGGAGAATCGCAAT*TGAG
AGTGGTGGAGATTACCGGCGATGATGATTAAATCAAGTCTTGGGACTTTTAAAGTCTGTG
TAATAAAATAAACAGAGTAATCGCGTATTTAGATTTGTGATTGGAAGTCCTTTGTGATCT
CGTGTGAAGTTCCTTTTGTTATAAAGGAATCT

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1BZ06TF 569 0 0
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CTTCACTTTCCCGAGACCTCTCCCCTTTCTCTTCTCCATCCACCGTCGAGACCCAGCTCA
ACTGGACGGAGACTCCGACGGCTCACGTTTTCAAAGCGTATCTTCCGGGAACGACTCAGG
ACGAAGCGATCGTGTTCGTGGACGACGAAGGGTTCCTCCAGATCTGCACGGGAGACAACA
AGTTCATGAGCAGGTTCAAGCTCCCCGACAACGCTTTGACGGATCAGGTGACGGCGTGGA
TGGAGGATGGTTTCCTCGTCGTGTTCGTCGCGAAAGATGGTGCTGCTTCTTCGCAGTCAA
CGCCGGGGATCGAGGAGAATCGCAATGTGAGAGTGGTGGAGATTACCGGCGATGATGATT
AAATCAAGTCTTGGGACTTTTAAAGTCTGTGTAATAAAATAAACAGAGTAATCGCGTATT
TAGATTTGTGATTGGAAGTCCTTTGTGATCTCGTGTGAAGTTCCTTTTGTTATAAAGGAA
TCTGTGTCGTTTTGCTGAA
TTGGAAAAAA

QA 1 559 1 559
DS 

RD RS1GS32JQ 650 0 0
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CCCGGCGATAGAATCTGGGAGCCATTTGAACTCATGAACACCTTCCTCGACTTCCCCTCG
CCATCCCTCCTGCTATCTCGCCACTTTCCTTCACTTTCCCGAGACCTCTCCCCTTTCTCT
TCTCCATCCACCGTCGAGACCCAGCTCAACTGGACGGAGACTCCGACGGCTCACGTTTTC
AAAGCGTATCTTCCGGGAACGGCTCAGGACGAAGCGATCGTGTTCGTGGACGACGAAGGA
TACCTCCAGATCTGCACGGGAGACAACAAGTTCATGAGCAGGTTCAAGCTCCCCGACAAC
GCTTTGACGGATCAGGTGACGGCGTGGATGGAGGATTGTTTCCTCGTCGTGTTCGTCGCG
AAAGATGGTGCTGCTTCTTCGCAGTCAACGCCGGGGATCGAGGAGAATCGCAATGTGAGA
GTGGTGGAGATTACCGGCGATGATGATTAAATCAAGTCTTGGGACTTTTAAAGTCTGTGT
AATAAAATAAACAGAGTAATCGCGTATTTAGATTTGTGATTGGAAGTCCTTTGTGATCTT
GTGTGAAGTTCCTTTTGTTATAAAGGAATCTGTGTCGTTTTGCTGAA
CCC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RS1F222JQ 651 0 0
GGCTCCTC
ACTTGAGTAGAAGAAAATGTCGATCATTCCAATCAACGATGATCGCCGGAGAATCTCTCC
CGGCGATAGAATCTGGGAGCCATTTGAACTCATGGACACCTTCCTCGACTTCCCCTCGCC
ATCCCTCCTGCTATCTCGCCACTTTCCTTCACTTTCCCGAGACCTCTCCCCTTTTTTTTC
TCCATCCACCGTCGAGACCCAGCTCAACTGGACGGAGACTCCGACGGCTCACGTTTTCAA
AGCGTATCTTCCGGGAACGGCTCAGGACGAAGCGATCGTGTTCGTGGACGACGAAGGATA
CCTCCAGATCTGCACGGGAGACAACAAGTTCATGAGCAGGTTCAAGCTCCCCGACAACGC
CTTGACGGATCAGGTGACGGCGTGGATGGAGGATTGTTTCCTCGTCGTGTTCGTCGCGAA
AGATGGTGCTGCTTCTTCGCAGTCAACGCCGGGGATCGAGGAGAATCGCAATGTGAGAGT
GGTGGAGATTACCGGCGATGATGATTAAATCAAGTCTTGGGACTTTTAAAGTCTGTGTAA
TAAAATAAACAGAGTAATCGCGTATTTAGATTTGTGATTGGAAGTCCTTCGTGATCTTGT
GTGAAGTTCCTTTTGTTATAAAGGAATCTGTGTCGTTTTGC
AG

QA 9 649 9 649
DS 

RD RS1F222TF 656 0 0
GGCTCCTC
ACTTGAGTAGAAGAAAATGTCGATCATTCCAATCAACGATGATCGCCGGAGAATCTCTCC
CGGCGATAGAATCTGGGAGCCATTTGAACTCATGGACACCTTCCTCGACTTCCCCTCGCC
ATCCCTCCTGCTATCTCGCCACTTTCCTTCACTTTCCCGAGACCTCTCCCCTTTCTCTTC
TCCATCCACCGTCGAGACCCAGCTCAACTGGACGGAGACTCCGACGGCTCACGTTTTCAA
AGCGTATCTTCCGGGAACGGCTCAGGACGAAGCGATCGTGTTCGTGGACGACGAAGGATA
CCTCCAGATCTGCACGGGAGACAACAAGTTCATGAGCAGGTTCAAGCTCCCCGACAACGC
CTTGACGGATCAGGTGACGGCGTGGATGGAGGATTGTTTCCTCGTCGTGTTCGTCGCGAA
AGATGGTGCTGCTTCTTCGCAGTCAACGCCGGGGATCGAGGAGAATCGCAATGTGAGAGT
GGTGGAGATTACCGGCGATGATGATTAAATCAAGTCTTGGGACTTTTAAAGTCTGTGTAA
TAAAATAAACAGAGTAATCGCGTATTTAGATTTGTGATTGGAAGTCCTTCGTGATCTTGT
GTGAAGTTCCTTTTGTTATAAAGGAATCTGTGTCGTTTTGC
AGAAAAA

QA 9 649 9 649
DS 

RD RS1GS32TF 648 0 0
GGACTTGAGTAGAAGAAAATGTCGATCATTCCAATCAACGATGATCGCCGGAGAATCTCT
CCCGGCGATAGAATCTGGGAGCCATTTGAACTCATGAACACCTTCCTCGACTTCCCCTCG
CCATCCCTCCTGCTATCTCGCCACTTTCCTTCACTTTCCCGAGACCTCTCCCCTTTCTCT
TCTCCATCCACCGTCGAGACCCAGCTCAACTGGACGGAGACTCCGACGGCTCACGTTTTC
AAAGCGTATCTTCCGGGAACGGCTCAGGACGAAGCGATCGTGTTCGTGGACGACGAAGGA
TACCTCCAGATCTGCACGGGAGACAACAAGTTCATGAGCAGGTTCAAGCTCCCCGACAAC
GCTTTGACGGATCAGGTGACGGCGTGGATGGAGGATTGTTTCCTCGTCGTGTTCGTCGCG
AAAGATGGTGCTGCTTCTTCGCAGTCAACGCCGGGGATCGAGGAGAATCGCAATGTGAGA
GTGGTGGAGATTACCGGCGATGATGATTAAATCAAGTCTTGGGACTTTTAAAGTCTGTGT
AATAAAATAAACAGAGTAATCGCGTATTTAGATTTGTGATTGGAAGTCCTTTGTGATCTT
GTGTGAAGTTCCTTTTGTTATAAAGGAATCTGTGTCGTTTTGCTGAA
C

QA 1 647 1 647
DS 

RD RS1BZ06JQ 689 0 0
GGACTTGAGTAGAAGAAAATGTCGATCATTCCAATCAACGATGATCGCCGGAGAATCTCT
CCCGGCGATAGAATCTGGGAGCCATTTGAACTCATGAACACCTTCCTCGACTTCCCCTCG
CCATCCCTCCTGCTATCTCGCCACTTTCCTTCACTTTCCCGAGACCTCTCCCCTTTCTCT
TCTCCATCCACCGTCGAGACCCAGCTCAACTGGACGGAGACTCCGACGGCTCACGTTTTC
AAAGCGTATCTTCCGGGAACGACTCAGGACGAAGCGATCGTGTTCGTGGACGACGAAGGG
TTCCTCCAGATCTGCACGGGAGACAACAAGTTCATGAGCAGGTTCAAGCTCCCCGACAAC
GCTTTGACGGATCAGGTGACGGCGTGGATGGAGGATGGTTTCCTCGTCGTGTTCGTCGCG
AAAGATGGTGCTGCTTCTTCGCAGTCAACGCCGGGGATCGAGGAGAATCGCAATGTGAGA
GTGGTGGAGATTACCGGCGATGATGATTAAATCAAGTCTTGGGACTTTTAAAGTCTGTGT
AATAAAATAAACAGAGTAATCGCGTATTTAGATTTGTGATTGGAAGTCCTTTGTGATCTC
GTGTGAAGTTCCTTTTGTTATAAAGGAATCTGTGTCGTTTTGCTGAATTGGAAAAAAGTA
TGTATAATAGAGAAAATTTGAAGGTCTGC

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 8

CO CL600Contig1 694 8 8 U
GAAGGGATAAAGTCGAGAATGACATTCAAATTGAACAACTGTGTGGTGTGGGCTTCGCCC
CTTTTGTAAGGGTTTACGAGGTGAACTCGGAAGCGTGGGCGTCAAGCATCAAGTGGAGGC
GCCGAATCGTTGCAAGAGGGGGTACTAAGCGGGATCGACCGGTCAGAAGCCAAGCTGGCC
AAAAGGCATAGGGGTTCCTCTGAGCTGGCAGGCTCATCTCACTGATTGTGTGCTTTTATT
GGATAACTCCCATCAAGGGAAAGTGCACTTTAGCTCTATTCCGTTTCCACAACGTGTTGA
TTTCCCGCGTTGACCCCTAAACACTATGGTATGGCATCAAGGTCGGCAACCCAAAAGGGT
CGGGCCTCAACCGATTGACTTATTTATAAGGGGAAAGCCACGAATATATATAACAAGACA
AGCACTTGCATACAGAAAGACCCCTTGCGCCTAGACCGATAGCCCACGTCTTCCACGTAA
GTAGTTGAGTTAACGCCCCTTTCGCAACAAGTGCTCGAGTCACTCCGAGGAACGCCTTTT
CAGTCGAGTTGCTAAAGCACCTCTCCTTGCAGTCGAGTTGCTAAAGCACCTCTCCTTGCA
GTCGAGTTGCTAAAGCACCTCTCCTTTGCTGTTCGAGTAAACAAGAAATGCTCGAGTTAC
TAAACACCCCCTAGGGGGCCCCTCTCTGATAAGG


BQ
10 10 10 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 20 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 10 10 10 10 

AF RS1FI46JQ C 1
AF RS1FI46TF U 1
AF RS1E129JQ C 3
AF RS1E129TF U 3
AF RS1E823JQ C -2
AF RS1E823TF U -2
AF RS1CX39JQ C 23
AF RS1CX39TF U 23
BS 1 3 RS1FI46JQ
BS 4 107 RS1FI46TF
BS 108 108 RS1E129TF
BS 109 587 RS1FI46TF
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BS 589 672 RS1FI46TF
BS 673 690 RS1E823TF
BS 691 694 RS1CX39JQ

RD RS1FI46JQ 694 0 0
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CTTTTGTAAGGGTTTACGAGGTGAACTCGGAAGCGTGGGCGTCAAGCGTCAAGTGGAGGC
GCCGAATCGTTGCAAGAGGGGGTACTAAGCGGGATCGACCGGTCAGAAGCCAAGCTGGCC
AAAAGGCATAGGGGTTCCTTTGAGCTGGCAGGCTCATCTCACTGATTGTGTGCTTTTATT
GGATAACTCCCATCAAGGGAAAGTGCACTTTAGCTTTATTCCGTTTCCACAACGTGTTGA
TTTCCCGCGTTGACCCCTAAACACTATGGTATGGCATCAAGGTCGGCAACCCAAAAGGGT
CGGGCCTCAACCGATTGACTTATTTATAAGGGGAAAGCCACGAATATATATAACAAGACA
AGCACTTGCATACAGAAAGACCCCTTGCGCCTAGACCGATAGCCCACGTTTTCCACGTAA
GTAGTTGAGTTAACGCCCCTTTCGCAACAAGTGCTCGAGTCACTCCGAGGAACGCCTTTT
CAGTCGAGTTGCTAAAGCACCTCTCCTTGCAGTCGAGTTGCTAAAGCGCCTCTCCTTGCA
GTCGAGTTGCTAAAGCACCTTTCCTTTGCTGTTCGAGTAAACAAGAAATGCTCGAGTTAC
TAAACACCCCCTAGGGGGCCCCTCTTTGAT
AAGG

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1FI46TF 672 0 0
GAA
GGGATAAAGTCGAGAATGACATTCAAATTGAACAACTGTGTGGTGTGGGCTTCGCCCCTT
TTGTAAGGGTTTACGAGGTGAACTCGGAAGCGTGGGCGTCAAGCGTCAAGTGGAGGCGCC
GAATCGTTGCAAGAGGGGGTACTAAGCGGGATCGACCGGTCAGAAGCCAAGCTGGCCAAA
AGGCATAGGGGTTCCTCTGAGCTGGCAGGCTCATCTCACTGATTGTGTGCTTTTATTGGA
TAACTCCCATCAAGGGAAAGTGCACTTTAGCTCTATTCCGTTTCCACAACGTGTTGATTT
CCCGCGTTGACCCCTAAACACTATGGTATGGCATCAAGGTCGGCAACCCAAAAGGGTCGG
GCCTCAACCGATTGACTTATTTATAAGGGGAAAGCCACGAATATATATAACAAGACAAGC
ACTTGCATACAGAAAGACCCCTTGCGCCTAGACCGATAGCCCACGTCTTCCACGTAAGTA
GTTGAGTTAACGCCCCTTTCGCAACAAGTGCTCGAGTCACTCCGAGGAACGCCTTTTCAG
TCGAGTTGCTAAAGCACCTCTCCTTGCAGTCGAGTTGCTAAAGCGCCTCTCCTTGCAGTC
GAGTTGCTAAAGCACCTCTCCTTTGCTGTTCGAGTAAACAAGAAATGCTCGAGTTACTAA
ACACCCCCT

QA 4 672 4 672
DS 

RD RS1E129JQ 692 0 0
G
GGGATAAAGTCGAGAATGACATTCAAATTGAACAACTGTGTGGTGTGGGCTTCGCCCCTT
TTGTAAGGGTTTACGAGGTGAACTCGGAAGCGTGGGCGTCAAGCATCAAGTGGAGGCGCC
GAATCGTTGCAAGAGGGGGTACTAAGCGGGATCGACCGGTCAGAAGCCAAGCTGGCCAAA
AGGCATAGGGGTTCCTCTGAGCTGGCAGGCTCATCTCACTGATTGTGTGCTTTTATTGGA
TAACTCCCATCAAGGGAAAGTGCACTTTAGCTCTATTCCGTTTCCACAACGTGTTGATTT
CCCGCGTTGACCCCTAAACACTATGGTATGGCATCAAGGTCGGCAACCCAAAAGGGTCGG
GCCTCAACCGATTGACTTATTTATAAGGGGAAAGCCACGAATATATATAACAAGACAAGC
ACTTGCATACAGAAAGACCCCTTTCGCCTAGACCGATAGCCCACGTCTTCCACGTAAGTA
GTTGAGTTAACGCCCCTTTCGCAACAAGTGCTCGAGTCACTCCGAGGAACGCCTTTTCAG
TCGAGTTGCTAAAGCACCTCTCCTTGCAGTCGAGTTGCTAAAGCACCTCTCCTTGCAGTC
GAGTTGCTAAAGCACCTCTCCTTTGCTGTTCGAGTAAACAAGAAATGCTCGAGTTACTAA
ACACCCCCTAGGGGGCCCCTCTCTGAT
AAGG

QA 2 688 2 688
DS 

RD RS1E129TF 668 0 0
G
GGGATAAAGTCGAGAATGACATTCAAATTGAACAACTGTGTGGTGTGGGCTTCGCCCCTT
TTGTAAGGGTTTACGAGGTGAACTCGGAAGCGTGGGCGTCAAGCATCAAGTGGAGGCGCC
GAATCGTTGCAAGAGGGGGTACTAAGCGGGATCGACCGGTCAGAAGCCAAGCTGGCCAAA
AGGCATAGGGGTTCCTCTGAGCTGGCAGGCTCATCTCACTGATTGTGTGCTTTTATTGGA
TAACTCCCATCAAGGGAAAGTGCACTTTAGCTCTATTCCGTTTCCACAACGTGTTGATTT
CCCGCGTTGACCCCTAAACACTATGGTATGGCATCAAGGTCGGCAACCCAAAAGGGTCGG
GCCTCAACCGATTGACTTATTTATAAGGGGAAAGCCACGAATATATATAACAAGACAAGC
ACTTGCATACAGAAAGACCCCTTTCGCCTAGACCGATAGCCCACGTCTTCCACGTAAGTA
GTTGAGTTAACGCCCCTTTCGCAACAAGTGCTCGAGTCACTCCGAGGAACGCCTTTTCAG
TCGAGTTGCTAAAGCACCTCTCCTTGCAGTCGAGTTGCTAAAGCACCTCTCCTTGCAGTC
GAGTTGCTAAAGCACCTCTCCTTTGCTGTTCGAGTAAACAAGAAATGCTCGAGTTACTAA
ACACCCC

QA 2 668 2 668
DS 

RD RS1E823JQ 693 0 0
GGAGAAT
GGATAAAGTCGAGAATGACATTCAAATTGAACAACTGTGTGGTGTGGGCTTCGCCCCTCT
TGTAAGGGTTTACGAGGTGAACTCGGAAGCGTGGGCGTCAAGCATCAAGTGGAGGCGCCG
AATCGTTGCAAGAGGGGGTACTAAGCGGGATCGACCGGTCAGAAGCCAAGCTGGCCAAAA
GGCATAGGGGTTCCTCTGAGCTGGCAGGCTCATCTCACTGATTGTGTGCTTTTATTGGAT
AACTCCCATCAAGGGAAAGTGCACTTTAGCTCTATTCCGTTTCCACAACGTGTTGATTTC
CCGCGTTGACCCCTAAACACTATGGTATGGCATCAAGGTCGGCAACCCAAAAGGGTCGGG
CCTCAACCGATTGACTTATTTATAAGGGGAAAGCCACGAATATATATAACAAGACAAGCA
CTTGCATACAGAAAGACTCCTTGCTCCTAGACCGATAGCCCACGTCTTCCACGTAAGTAG
TTGAGTTAACGCCCCTTTCGCAACAAGTGCTCGAGTCACTCCGAGGAACGCCTTTTCAGT
CGAGTTGCTAAAGCACCTCTCCTTGCAGTCGAGTTGCTAAAGCACCTCTCCTTGCAGTCG
AGTTGCTAAAGCACCTCTCCTTTGCTGTTCGAGTATACAAGAAATGCTCGAGTTACTAAA
CACCCCCTAGGGGGCCCCTCTCTGAT

QA 8 693 8 693
DS 

RD RS1E823TF 693 0 0
GGAGAAT
GGATAAAGTCGAGAATGACATTCAAATTGAACAACTGTGTGGTGTGGGCTTCGCCCCTCT
TGTAAGGGTTTACGAGGTGAACTCGGAAGCGTGGGCGTCAAGCATCAAGTGGAGGCGCCG
AATCGTTGCAAGAGGGGGTACTAAGCGGGATCGACCGGTCAGAAGCCAAGCTGGCCAAAA
GGCATAGGGGTTCCTCTGAGCTGGCAGGCTCATCTCACTGATTGTGTGCTTTTATTGGAT
AACTCCCATCAAGGGAAAGTGCACTTTAGCTCTATTCCGTTTCCACAACGTGTTGATTTC
CCGCGTTGACCCCTAAACACTATGGTATGGCATCAAGGTCGGCAACCCAAAAGGGTCGGG
CCTCAACCGATTGACTTATTTATAAGGGGAAAGCCACGAATATATATAACAAGACAAGCA
CTTGCATACAGAAAGACTCCTTGCTCCTAGACCGATAGCCCACGTCTTCCACGTAAGTAG
TTGAGTTAACGCCCCTTTCGCAACAAGTGCTCGAGTCACTCCGAGGAACGCCTTTTCAGT
CGAGTTGCTAAAGCACCTCTCCTTGCAGTCGAGTTGCTAAAGCACCTCTCCTTGCAGTCG
AGTTGCTAAAGCACCTCTCCTTTGCTGTTCGAGTATACAAGAAATGCTCGAGTTACTAAA
CACCCCCTAGGGGGCCCCTCTCTGAT

QA 8 693 8 693
DS 

RD RS1CX39JQ 672 0 0
G
ATTCAAATTGAACAACTGTGTGGTGTGGGCTTCGCCCCTTTTGTAAGGGTTTACGAGGTG
AACTCGGAAGCGTGGGCGTCAAGCATCAAGTGGAGGCGCCGAATCGTTGCAAGAGGGGGT
ACTAAGCGGGATCGACCGGTCAGAAGCCAAGCTGGCCAAAAGGCATAGGGGTTCCTCTGA
GCTGGCAGGCTCATCTCACTGATTGTGTGCTTTTATTGGATAACTCCCATCAAGGGAAAG
TGCACTTTAGCTCTATTCCGTTTCCACAACGTGTTGATTTCCCGCGTTGACCCCTAAACA
CTATGGTATGGCATCAAGGTCGGCAACCCAAAAGGGTCGGGCCTCAACCGATTGACTTAT
TTATAAGGGGAAAGCCACGAATATATATAACAAGACAAGCACTTGCATACAGAAAGACCC
CTTGCGCCTAGACCGATAGCCCACGTCTTCCACGTAAGTAGTTGAGTTAACGCCCCTTTC
GCAACAAGTGCTCGAGTCACTCCGAGGAACGCCTTTTCAGTCGAGTTGCTAAAGCACCTC
TCCTTGCAGTCGAGTTGCTAAAGCACCTCTCCTTGCAGTCGAGTTGCTAAAGCACCTCTC
CTTTGCTGTTCGAGTAAACAAGAAATGCTCGAGTTACTAAACACCCCCTAGGGGGCCCCT
CTCTGATAAGG

QA 2 672 2 672
DS 

RD RS1CX39TF 644 0 0
G
ATTCAAATTGAACAACTGTGTGGTGTGGGCTTCGCCCCTTTTGTAAGGGTTTACGAGGTG
AACTCGGAAGCGTGGGCGTCAAGCATCAAGTGGAGGCGCCGAATCGTTGCAAGAGGGGGT
ACTAAGCGGGATCGACCGGTCAGAAGCCAAGCTGGCCAAAAGGCATAGGGGTTCCTCTGA
GCTGGCAGGCTCATCTCACTGATTGTGTGCTTTTATTGGATAACTCCCATCAAGGGAAAG
TGCACTTTAGCTCTATTCCGTTTCCACAACGTGTTGATTTCCCGCGTTGACCCCTAAACA
CTATGGTATGGCATCAAGGTCGGCAACCCAAAAGGGTCGGGCCTCAACCGATTGACTTAT
TTATAAGGGGAAAGCCACGAATATATATAACAAGACAAGCACTTGCATACAGAAAGACCC
CTTGCGCCTAGACCGATAGCCCACGTCTTCCACGTAAGTAGTTGAGTTAACGCCCCTTTC
GCAACAAGTGCTCGAGTCACTCCGAGGAACGCCTTTTCAGTCGAGTTGCTAAAGCACCTC
TCCTTGCAGTCGAGTTGCTAAAGCACCTCTCCTTGCAGTCGAGTTGCTAAAGCACCTCTC
CTTTGCTGTTCGAGTAAACAAGAAATGCTCGAGTTACTAAACA

QA 2 644 2 644
DS 



AS 2 8

CO CL601Contig1 1116 4 3 U
AGGGACCATTTGAGTTTCGAAACTTTACGGCTCACCAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAAA
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AGAAGCCTCTTCTACTCTCAAATCAACCAACCATGGATCTACCGAGGAAGAAGCTGTCAG
AATCGTAAAGGAAACAGGGTTGGATACTGATGAGCAGCGTATAGAGATCACTGATTCAAG
CCATGATCATGACAAGAGCTCTAGCAGCAACAGCAGTAGCGGTAGTGGTAGCAGCAGCTC
TGATGATGATGAATCCCATGAAGTCAAGGAGGAGACTGAAGTGATCATCACTGTGCCAAG
TCAACCTGTTCCTGTTGCTGGAGACGCTCCTTTTATTGGTTCTACTGCTAATGCGATTGT
AGAGAATGCCGGTTTGATGGATTCCACTACACCTAGTGATCCAGAGACTGAGAACATTGT
TGTGACCTCGTCTGCCGCTGAAGCTTCTCTTGCATCTGATGAGAGTAAGCAGGCGTCTTC
AAGCACGACTGGCTCTGATAAAAAAGAACTAAAAAAATGTTTTCCTGAAGGGAGCAAAGA
GTCTCAAGTTGTCATTTCTCATGTGGAAGAGGATCCGGTGCGACCAACACATGGAGTTGC
GCAAAGAACCTCATGGTTAAGTTGTTGTGGCTTGTTTGATGTGATGACAGGATCCAGTAG
ATAAGCTCAGAAACTTGAGTCGCCTATAAAGTCAGAAGCTGCAATAATGCTAAATGTAAT
GAATGTCTCTCTCTCTCTTTCACTTATACCTTTTCTCATATGAAATAGAACTCAGCTTCT
AGTAGTAGTCTCTTCATTAGTAGGCATGTCTGCATAGTCTTCCCTTTCGCTCTGTACCAT
TACTTGTCTATTGTTGTTTTTGTTCTCTCAGGTTCTGAGACTTTGAGACTGTTGTTGTTG
GCCAATTTATGTAATGATTAAATCACTACGCATGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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QA 1 648 1 648
DS 

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GG
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CCTGTTGCTGGAGACGCTCCTTTTATTGGTTCTACTGCTAATGCGATTGTAGAGAATGCC
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QA 1 804 1 804
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RD RS1FZ11JQ 674 0 0
T
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GCTCTGATAAAAAAGAACTAAAAAAATGTTTTCCTGAAGGGAGCAAAGAGTCTCAAGTTG
TCATTTCTCATGTGGAAGAGGATCCGGTGCGACCAACACATGGAGTTGCGCAAAGAACCT
CATGGTTAAGTTGTTGTGGCTTGTTTGATGTGATGACAGGATCCAGTAGATAAGCTCAGA
AACTTGAGTCGCCTATAAAGTCAGAAGCTGCAATAATGCTAAATGTAATGAATGTCTCTC
TCTCTCTTTCACTTATACCTTTTCTCATATGAAATAGAACTCAGCTTCTAGTAGTAGTCT
CTTCATTAGTAGGCATGTCTGCATAGTCTTCCCTTTCGCTCTGTACCATTACTTGTCTAT
TGTTGTTTTTGTTCTCTCAGGTTCTGAGACTTTGAGACTGTTGTTGTTGGCCAATTTATG
TAATGATTAAA
CC

QA 2 672 2 672
DS 



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CCTGCTAATGAAGAGACTACTACTAGAAGCTGAGTTCTATTTCATATGAGAAAAAGTATA
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GGCGACTCAAGTTTCTGAGCTTATCTACTGGATCCTGTCATCACATCAAACAAGCCACAA
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TCCATCAAACCGACATTCTCTACAATCGCATTAGCAGTAGAACCAATAAAAGGAGCGTCT
CCAGCAACAGGAACAGGTTGACTTGGCACAGTGATGATCACTTCAGTCTCCTCCTTGACT
TCATGGGATTCATCATCATCAGAGCTGCTGCTACCACCACTACCACTACCGCTACTGCTG
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GTAGAAGAGGCTTCTTGTTGCTGCTTTTTCTTGGCGGCTTTCCTTTTCTTAGCACCGGAA
GGCATGATTGATTGATTGATTAGCC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H652JQB U 1
AF RS1H652TF C 102
AF RS1FC86JQ U 1
AF RS1BA84TF C 224
BS 1 174 RS1FC86JQ
BS 175 175 RS1H652JQB
BS 176 343 RS1FC86JQ
BS 344 344 RS1H652JQB
BS 345 453 RS1FC86JQ
BS 454 454 RS1H652TF
BS 455 640 RS1FC86JQ
BS 641 641 RS1H652TF
BS 642 842 RS1FC86JQ
BS 843 925 RS1BA84TF

RD RS1H652JQB 429 0 0
GG
TTTAATCATTACATAAATTGGCCAACAACAACAGTCTCAAAGTCTCAGAACCTGAGAGAA
CAAAAACAACAATAGACAAGTAATGGTACAGAGCGAAAGGGAAGACTATGCAGACATGCC
TGCTAATGAAGAGACTACTACTAGAAGCTGAGTTCTATTTCATATGAGAAAAAGTATAAG
TGAAAGAGAGAGAGAGACATTCATTACATTTAGCATTATTGCAGCTTCTGACTTTATAGG
CGACTCAAGTTTCTGAGCTTATCTACTGGATCCTGTCATCACATCAAACAAGCCACAACA
ACTTAACCATGAGGTTCTTTGCGCAACTCCATGTGTTGGTCGCACCGGATCCTCTTCCAC
ATGAGAAATGACAACTTGAGACTCTTTGCTGCTTTCAGGGACACATTTTTTTAGTTCTTT
TTTATCA

QA 3 429 3 429
DS 

RD RS1H652TF 638 0 0
GGAAGACTATGCAGACATGCCTGCTAATGAAGAGACTACTACTAGAAGCTGAGTTCTATT
TCATATGAGAAAAAGTATAAGTGAAAGAGAGAGAGAGACATTCATTACATTTAGCATTAT
TGCAGCTTCTGACTTTATAGGCGACTCAAGTTTCTGAGCTTATCTACTGGATCCTGTCAT
CACATCAAACAAGCCACAACAACTTAACCATGAGGTTCTTTGCGCAACTCCATGTGTTGG
TCGCACCGGATCCTCTTCCACATGAGAAATGACAACTTGAGACTCTTTGCTGCTTTCAGG
AACACATTTTTTTAGTTCTTTTTTATCAGAGCCAGTCGTGCTTGAAGACGCCTGCTTACT
CTCATCAGATGCAAGAGAAGGTTCAACAGAGGAGGTCACAACAATGTTCTCAGTCTCTGG
ATCACTAGGTGTAGTTGAATCCATCAAACCGACATTCTCTACAATCGCATTAGCAGTAGA
ACCAATAAAAGGAGCGTCTCCAGCAACAGGAACAGGTTGACTTGGCACAGTGATGATCAC
TTCAGTCTCCTCCTTGACTTCATGGGATTCATCATCATCAGAGCTGCTGCTACCACCACT
ACCACTACCGCTACTGCTGTTGCTGCTAGAGCTCTTG
C

QA 1 637 1 637
DS 

RD RS1FC86JQ 842 0 0
GATTTAATCATTACATAAATTGGCCAACAACAACAGTCTCAAAGTCTCAGAACCTGAGAG
AACAAAAACAACAATAGACAAGTAATGGTACAGAGCGAAAGGGAAGACTATGCAGACATG
CCTGCTAATGAAGAGACTACTACTAGAAGCTGAGTTCTATTTCATATGAGAAAAGGTATA
AGTGAAAGAGAGAGAGAGACATTCATTACATTTAGCATTATTGCAGCTTCTGACTTTATA
GGCGACTCAAGTTTCTGAGCTTATCTACTGGATCCTGTCATCACATCAAACAAGCCACAA
CAACTTAACCATGAGGTTCTTTGCGCAACTCCATGTGTTGGTCACACCGGATCCTCTTCC
ACATGAGAAATGACAACTTGAGACTCTTTGCTGCTTTCAGGAACACATTTTTTTAGTTCT
TTTTTATCAGAGCCAGTCGTGCTTGAAGACGCC*GCTTACTCTCATCAGATGCAAGAGAA
GGTTCAACAGAGGAGGTCACAACAATGTTCTCAGTCTCTGGATCACTAGGTGTAGTTGAA
TCCATCAAACCGACATTCTCTACAATCGCATTAGCAGTAGAACCAATAAAAGGAGCGTCT
CCAGCAACAGGAACAGGTTGACTTGGCACAGTGATGATCAATTCAGTCTCCTCCTTGACT
TCATGGGATTCATCATCATCAGAGCTGCTGCTACCACCACTACCACTACCGCTACTGCTG
TTGCTGCTAGAGCTCTTGTCATGATCATGGCTTGAATCAGTGATCTCTATACGCTCATCA
GTTTCCTTTAAGATTCTGGGAGCTTCTTCCTCAGTAGATCCATGGTTGGTTGATTTGAGA
GT

QA 1 842 1 842
DS 

RD RS1BA84TF 702 0 0
CAGCTTCTGACTTTATAGGCGACTCAAGTTTCTGAGCTTATCTACTGGATCCTGTCATCA
CATCAAACAAGCCACAACAACTTAACCATGAGGTTCTTTGCGCAACTCCATGTGTTGGTC
GCACCGGATCCTCTTCCACATGAGAAATGACAACTTGAGACTCTTTGCTGCTTTCAGGAA
CACATTTTTTTAGTTCTTTTTTATCAGAGCCAGTCGTGCTTGAAGACGCCTGCTTACTCT
CATCAGATGCAAGAGAAGGTTCAACAGAGGAGGTCACAACAATGTTCTCAGTCTCTGGAT
CACTAGGTGTAGTTGAATCCATCAAACCGACATTCTCTACAATCGCATTAGCAGTAGAAC
CAATAAAAGGAGCGTCTCCAGCAACAGGAACAGGTTGACTTGGCACAGTGATGATCACTT
CAGTCTCCTCCTTGACTTCATGGGATTCATCATCATCAGAGCTGCTGCTACCACCACTAC
CACTACCGCTACTGCTGTTGCTGCTAGAGCTCTTGTCATGATCATGGCTTGAATCAGTGA
TCTCTATACGCTCATCAGTTTCCTTTAAGATTCTGGGAGCTTCTTCCTCAGTAGATCCAT
GGTTGGTTGATTTGAGAGTAGAAGAGGCTTCTTGTTGCTGCTTTTTCTTGGCGGCTTTCC
TTTTCTTAGCACCGGAAGGCATGATTGATTGATTGATTAGCC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 8

CO CL602Contig1 764 8 18 U
GGCCTTTAGCTCCGTCTCTCTCGTCTGTCGGCACGATCAGAGCTCAGATCTCAAAACTCA
AAATCGAAATCAAATCCACAAACCCGATCGAACATGACTCTTGGCTCTGGTGGATCGAGT
GTCGTCGTACCGAGAAACTTCAGGTTGCTGGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGGATT
GGAGATGGAACTGTTAGCTATGGAATGGACGATGGTGATGACATCTACATGCGCTCTTGG
ACTGGCACTATCATCGGTCCTCACAAC***ACTGTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTG
AAGCTCTTTTGCGACAAAGATTACCCGGAGAAACCCCCAACTGTCCGGTTCCATTCACGT
GTCAACATGACTTGTGTCAACCATGAAACAGGAGTGGTGGATCCAAAGAAGTTCGGACTT
CTTGCGAACTGGCAAAGGGAGTACACGATGGAGAATATACTGATACAACTGAAGAAAGAA
ATGGCTGCGTCGCATAACCGTAAGCTTGTTCAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTAG
CTTCTGGAATCTTGGTTCTTGTTTGCTGAAAAAATCTTTGCCCCTTCCTATTACTAACGT
ATGTATCTGGGGGCAGTCCATTGTCGTT*CGTTCTCAAGCTTTTTATTTTCTTCTGAATT
TATGATAAAAAATGGTATGTGGATGGTGATGATGTTGATGTTGTTCGATTAATCATCTCA
AGTTTATCCTTTGTGTGCAAATTATCAAAAACAGCGTCTTCGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 35 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AY03TF U 51
AF RS1A589JQ C 294
AF RS1AY03JQ C 51
AF RS1BR68TF U 10
AF RS1DG34TF U 1
AF RS1DG34JQ C 88
AF RS1A589TF U 294
AF RS1DO30TF U 144
BS 1 59 RS1DG34TF
BS 60 60 RS1AY03TF
BS 61 68 RS1DG34TF
BS 69 69 RS1AY03TF
BS 70 81 RS1DG34TF
BS 82 82 RS1AY03TF
BS 83 146 RS1DG34TF
BS 147 147 RS1AY03TF
BS 148 267 RS1DG34TF
BS 268 270 RS1AY03TF
BS 271 332 RS1DG34TF
BS 333 333 RS1AY03TF
BS 334 338 RS1DG34TF
BS 339 339 RS1AY03TF
BS 340 671 RS1DG34TF
BS 672 672 RS1A589TF
BS 673 736 RS1DG34TF
BS 737 764 RS1DG34JQ

RD RS1AY03TF 490 0 0
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TGGATCGAGTGTCGTCGTACCGAGAAACTTCAGGTTGCTGGAGGAGCTGGAACGTGGGGA
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GCGCTCTTGGACTGGCACTATCATCGGTCCTCACAAC***ACTGTTCATGAAGGTAGGAT
CTATCAGTTGAAGCTCTTTTGCGACAAAGATTACCCGGAGAAACCCCCAACTGTCCGGTT
CCATTCACGTGTCAACATGACTTGTGTCAACCATGAAACAGGAGTGGTGGATCCAAAGAA
GTTCGGACTTCTTGCGAACTGGCAAAGGGAGTACACGATGGAGAATATACTGATACAACT
GAAGAAAGAAATGGCTGCGTCGCATAACCGTAAGCTTGTTCAACCTCCAGAAGGCACTTG
CTTCTAGTAG

QA 1 490 1 490
DS 

RD RS1A589JQ 318 0 0
C
CAGTTGAAGCTCTTTTGCGACAAAGATTACCCGGAGAAACCCCCAACTGTCCGGTTCCAT
TCACGTGTCAACATGACTTGTGTCAACCATGAAACAGGAGTGGTGGTTCCAAAGAAGTTC
GGACTTCTTGCGAACTGGCAAAGGGAGTACACGATGGAGAATATACTGATACAACTGAAG
AAAGAAATGGCTGCGTCGCATAACCGTAAGCTTGTTCAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTC
TAGTAGCTTCTGGAATCTTGGTTCTTGTTTGCTGAAAAAATCTTTGCCCCTTCCTATTAC
TAACGTATGTATCTGGG

QA 2 318 2 318
DS 

RD RS1AY03JQ 664 0 0
TCAAAACTCAAAATCGAAATCAAATCCACAAACCCGATCGAACATGACTCTTGGCTCTGG
TGGATCGAGTGTCGTCGTACCGAGAAACTTCAGGTTGCTGGAGGAGCTGGAACGTGGGGA
GAAAGGGATTGGAGATGGAACTGTTAGCTATGGAATGGACGATGGTGATGACATCTACAT
GCGCTCTTGGACTGGCACTATCATCGGTCCTCACAAC***ACTGTTCATGAAGGTAGGAT
CTATCAGTTGAAGCTCTTTTGCGACAAAGATTACCCGGAGAAACCCCCAACTGTCCGGTT
CCATTCACGTGTCAACATGACTTGTGTCAACCATGAAACAGGAGTGGTGGATCCAAAGAA
GTTCGGACTTCTTGCGAACTGGCAAAGGGAGTACACGATGGAGAATATACTGATACAACT
GAAGAAAGAAATGGCTGCGTCGCATAACCGTAAGCTTGTTCAACCTCCAGAAGGCACTTG
CTTCTAGTAGCTTCTGGAATCTTGGTTCTTGTTTGCTGAAAAAATCTTTGCCCCTTCCTA
TTACTAACGTATGTATCTGGGGGCAGTCCATTGTCGTT*CGTTCTCAAGCTTTTTATTTT
CTTCTGAATTTATGATAAAAAATGGTATGTGGATGGTGATGATGTTGATGTTGTTCGATT
AATC

QA 1 664 1 664
DS 

RD RS1BR68TF 662 0 0
GG
CCGTCTCTCTCGTCTGTCGGCACGATCAGAGCTCAGATCTCAAAACTCCAAATCGAA*TC
AAATCCACAA*CCCGATCGAACATGACTCTTGGCTCTGGTGGATCGAGTGTCGTCGTACC
GAGAAACTTCAGGTTGCTGGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGGATTGGAGATGGAAC
TGTTAGCTATGGAATGGACGATGGTGATGACATCTACATGCGCTCTTGGACTGGCACTAT
CATCGGTCCTCACAAC***ACTGTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTTTTG
CGACAAAGATTACCCGGAGAAGCCCCCTACTGTCCGGTTCCATTCACGTGTCAACATGAC
TTGTGTCAACCATGAAACAGGAGTGGTGGATCCAAAGAAGTTCGGACTTCTTGCGAACTG
GCAAAGGGAGTACACGATGGAGAATATACTGATACAACTGAAGAAAGAAATGGCTGCGTC
GCATAACCGTAAGCTTGTTCAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTAGCTTCTGGAATC
TTGGTTCTTGTTTGCTGAAAAAATCTTTGCCCCTTCCTATTACTAACGTATGTATCTGGG
GGCAGTCCATTGTCGTT*CGTTCCCAAGCTTTTTATTTTCTTCTGAATTTATGATAAAAA

QA 3 662 3 662
DS 

RD RS1DG34TF 736 0 0
GGCCTTTAGCTCCGTCTCTCTCGTCTGTCGGCACGATCAGAGCTCAGATCTCAAAACTCC
AAATCGAA*TCAAATCCACAA*CCCGATCGAACATGACTCTTGGCTCTGGTGGATCGAGT
GTCGTCGTACCGAGAAACTTCAGGTTTCTGGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGGATT
GGAGATGGAACTGTTAGCTATGGAATGGACGATGGTGATGACATCTACATGCGCTCTTGG
ACTGGCACTATCATCGGTCCTCACAACGTAACTGTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTG
AAGCTCTTTTGCGACAAAGATTACCCGGAGAAGCCCCCTACTGTCCGGTTCCATTCACGT
GTCAACATGACTTGTGTCAACCATGAAACAGGAGTGGTGGATCCAAAGAAGTTCGGACTT
CTTGCGAACTGGCAAAGGGAGTACACGATGGAGAATATACTGATACAACTGAAGAAAGAA
ATGGCTGCGTCGCATAACCGTAAGCTTGTTCAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTAG
CTTCTGGAATCTTGGTTCTTGTTTGCTGAAAAAATCTTTGCCCCTTCCTATTACTAACGT
ATGTATCTGGGGGCAGTCCATTGTCGTT*CGTTCTCAAGCTTTTTATTTTCTTCTGAATT
TATGATAAAAA*TGGTATGTGGATGGTGATGATGTTGATGTTGTTCGATTAATCATCTCA
AGTTTATCCTTTGTGT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RS1DG34JQ 677 0 0
TCGAACATGACTCTTGGCTCTGGTGGATCGAGTGTCGTCGTACCGAGAAACTTCAGGTTT
CTGGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGGATTGGAGATGGAACTGTTAGCTATGGAATG
GACGATGGTGATGACATCTACATGCGCTCTTGGACTGGCACTATCATCGGTCCTCACAAC
GTAACTGTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTTTTGCGACAAAGATTACCCG
GAGAAGCCCCCTACTGTCCGGTTCCATTCACGTGTCAACATGACTTGTGTCAACCATGAA
ACAGGAGTGGTGGATCCAAAGAAGTTCGGACTTCTTGCGAACTGGCAAAGGGAGTACACG
ATGGAGAATATACTGATACAACTGAAGAAAGAAATGGCTGCGTCGCATAACCGTAAGCTT
GTTCAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTAGCTTCTGGAATCTTGGTTCTTGTTTGCT
GAAAAAATCTTTGCCCCTTCCTATTACTAACGTATGTATCTGGGGGCAGTCCATTGTCGT
T*CGTTCTCAAGCTTTTTATTTTCTTCTGAATTTATGATAAAAAATGGTATGTGGATGGT
GATGATGTTGATGTTGTTCGATTAATCATCTCAAGTTTATCCTTTGTGTGCAAATTATCA
AAAACAGCGTCTTCGCC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RS1A589TF 445 0 0
G
CAGTTGAAGCTCTTTTGCGACAAAGATTACCCGGAGAAACCCCCAACTGTCCGGTTCCAT
TCACGTGTCAACATGACTTGTGTCAACCATGAAACAGGAGTGGTGGATCCAAAGAAGTTC
GGACTTCTTGCGAACTGGCAAAGGGAGTACACGATGGAGAATATACTGATACAACTGAAG
AAAGAAATGGCTGCGTCGCATAACCGTAAGCTTGTTCAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTC
TAGTAGCTTCTGGAATCTTGGTTCTTGTTTGCTGAAAAAATCTTTGCCCCTTCCTATTAC
TAACGTATGTATCTGGGGGCAGTCCATTGTCGTTTCGTTCTCAAGCTTTTTATTTTCTTC
TGAATTTATGATAAAAAATGGTATGTGGATGGTGATGATGTTGATGTTGTTCGATTAATC
ATCTCAAGTTTATCCTTTGTGT
AC

QA 2 443 2 443
DS 

RD RS1DO30TF 593 0 0
GG
TGCTGGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGGATTGGAGATGGAACTGTTAGCTATGGAA
TGGACGATGGTGATGACATCTACATGCGCTCTTGGACTGGCACTATCATCGGTCCTCACA
AC***ACTGTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTTTTGCGACAAAGATTACC
CGGAGAAGCTCCCTACTGTCCGGTTCCATTCACGTGTCAACATGACTTGTGTCAACCATG
AAACAGGAGTGGTGGATCCAAAGAAGTTCGGACTTCTTGCGAACTGGCAAAGGGAGTACA
CGATGGAGAATATACTGATACAACTGAAGAAAGAAATGGCTGCGTCGCATAACCGTAAGC
TTGTTCAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTAGCTTCTGGAATCTTGGTTCTTGTTTG
CTGAAAAAATCTTTGCCCCTTCCTATTACTAACGTATGTATCTGGGGGCAGTCCATTGTC
GTT*CGTTCTCAAGCTTTTTATTTTCTTCTGAATTTATGATAAAAAATGGTATGTGGATG
GTGATGATGTTGATGTTGTTCGATTAATCATCTCAAGTTTATCCTTTGTGT

QA 3 593 3 593
DS 



AS 1 7

CO CL603Contig1 712 7 7 U
GGGGTCTGCCGCTGCAAAAGTGACCGGAGAGTTTCAGCTGCTTCACCTCACCAGATTTTG
AGCGGGAAGGAATCGTTCAGAGCAATGTCTCCGGCTAAAGTTGATACGACGAAGAAGGCT
GACCCAAAAGCCAAGGCCTTGAAGGCTGCAAAGGCAGTGAAGTCTGGCCAAGCTTTCAAG
AAGAAGGACAAGAAGATCAGGACTAAGGTCACCTTCCACAGGCCCAAGACTTTGACCAAG
GCCAGAGATCCCAAGTACCCGAGGATCAGCGCTACTCCGAGGAACAAGTTGGACCATTAC
GGTATCCTTAAGTACCCACTCACCACTGAGTCGGCAATGAAGAAGATTGAAGACAACAAC
ACTCTTGTCTTCATTGTTGACATTCGTGCTGACAAGAAGAAGATCAAGGATGCTGTTAAG
AAAATGTATGACATCCAGACCAAGAAGGTCAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAG
AAGGCTTACGTTAGGCTTACACCGGACTATGATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATCGGC
ATCATCTAAGTTTTATCTATCTCTGCTATTATAAAAATAGACTTGTGGTTGGTTTTGTTT
CTCTGGTAGTTTCTGGTTTTACAATACATTCTTGTTTCTCTGGTTTTGATTCTATCTTAC
AACAAAACACTCTTGTGAACTTCCAAAATGCAAACTATTCTGTCAATGGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 15 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C971TF U 26
AF RS1C669JQ C 26
AF RS1C669TF U 26
AF RS1AD51TF U 1
AF RS1AD51JQ C 215
AF RS1C971JQ C 26
AF RS1FZ83TF U 26
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BS 26 27 RS1C669TF
BS 28 157 RS1AD51TF
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DS 

RD RS1C669TF 635 0 0
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ACATTCTTGTTTCTCTGGTTTTGATTCTATCTTAC

QA 1 635 1 635
DS 

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GACCCAAAAGCCAAGGCCTTGAAGGCTGCAAAGGCAGCGAAGTCTGGCCAAGCTTTCAAG
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GGTATCCTTAAGTACCCACTCACCACTGAGTCGGCAATGAAGAAGATTGAAGACAACAAC
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AAGGCTTACGTTAGGCTTACACCGGACTATGATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATCGGC
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CTCTGGTAGTTTCTGGTTTTACAATACATTCTTGTTTCTCTGGTTTTGATTCTATCTTAC
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DS 

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AAATAGACTTGTGGTTGGTTTTGTTTCTCTGGTAGTTTCTGGTTTTACAATACATTCTTG
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TAAACTATT

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DS 

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AGGTCACCTTCCACAGGCCCAAGACTTTGACCAAGGCCAGAGATCCCAAGTACCCGAGGA
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CTGAGTCGGCAATGAAGAAGATTGAAGACAACAACACTCTTGTCTTCATTGTTGACATTC
GTGCTGACAAGAAGAAGATCAAGGATGCTGTTAAGAAAATGTATGACATCCAGACCAAGA
AGGTCAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACACCGG
ACTATGATGCTTTGGATGTTGCTAACAAGATCGGCATCATCTAAGTTTTATCTATTTCTG
CTATTATAAAAATAGACTTGTGGTTGGTTTTGTTTCTCTGGTAGTTTCTGGTTTTACAAT
ACATTCTTGTTTCTCTGGTTTTGATTCTATCTTACAACAAAACACTCTTGTGAACTTCC

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DS 

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CTGCAAAGGCAGTGAAGTCTGGCCAAGCTTTCAAGAAGAAGGACAAGAAGATCAGGACTA
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CTGAGTCGGCAATGAAGAAGATTGAAGACAACAACACTCTTGTCTTCATTGTTGACATTC
GTGCTGACAAGAAGAAGATCAAGGATGCTGTTAAGAAAATGTATGACATCCAGACCAAGA
AGGTCAACACCCTCATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCTTACGTTAGGCTTACACCGG
ACTATGATGCTTTGGATGTTGCTAACAATATCGGCATCATCTAAGTTTTATCTATCTCTG
CTATTATAAAAATAGACTTGTGGTTGGTTTTGTTTCTCTGGTAGTTTCTGGTTTTACAAT
ACATTCTTGTTTCTCTGGTTTTGATTCTATCTTACAACAAAACACTCTTGTGAACTTCC
AA

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 6

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AACACACAATGATCCCTTACGCAACGATCGAAGATGCCTCGATGGCCTTAGGCCGAAACC
TAACGACCCTGGAGACGCTCTGGTTCGAATACTCCGCCACGAAGTCAGATTACTACCTCT
ACTGCCACAACATCCTCTTCCTCTTCCTCATCTTCTCCCTCGTCCCTCTCCCTCTCGTCT
TCCTCGAATTGGCTCGATCCGCCTGGTTCGACCGGTACAAGATCCAGCCCAAGGTCAAGA
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TGCCGTTACCGTCTTTTGGGGAGATTGCGGCGCAGTTAGTGGTTTACTTTTTGGTAGAGG
ACTATACGAACTATTGGGTTCATAGATTCTTTCATAGCAAGTGGGGTTATGAGAAGATTC
ATCATATCCATCATGAGTACACTGCTCCTATTGGGTATGCTGCTCCTTATGCCCATTGGG
CTGAGGTTTTGCTTCTTGGTGTTCCCACGTTTCTTGGCCCTGCTATTGCTCCTGGTCACA
TGATTACCTTCTGGCTGTGGATTGCTTTACGCCAGATTGAAGCCATTGAGACTCACAGCG
GATATGATTTTCCATGGACTCTGACGAAATTCATTCCGTTCTACGGTGGAGCTGAGTATC
ATGATTACCATCATTACGTTGGAGGACAAAGCCAAAGCAACTTTGCTTCAGTTTTCACTT
ACTGCGATTACATCTATGGAACTGACAAAGGTTACCGATTCCAAAAGAAGCTTCTTCAGC
AGATAAAGGAGGAGTCCAAGAAGAGCAACAAGCAGAATGGAGGAGATAAATTAGATTAGT
AAAAACCTGAAATTTCTTACGGAGGGTTGAGTTTACTTGTCATAAAGATAAGTTTATAAG
CAGTCTGCTAATCTAATCAAAGTCAAGAGTCGCAAAAGAAAGTGTAGTTTTAGTTTTCTT
CTCTTTTCTGCTATGTGTTGTCACATGGAAATGCTCCTTCGTTTTCCATTGGTGTGCGTC
TTTTTCGTATTGTTTTTCTTTGTTTAAACTCTTTTTACGTAAGGCATTTATTATTTTGTA
TGGTAGAGGAAAGAAGATTGAAAGGAGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1GN12TF U 53
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AF RS1H116TF U 27
AF RS1H116JQB C 435
AF RS1GA17JQ C 786
AF RS1GA17TF U 786
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G
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CGAAACCTAACGACCCTGGAGACGCTCTGGTTCGAATACTCCGCCACGAAGTCAGATTAC
TACCTCTACTGCCACAACATCCTCTTCCTCTTCCTCATCTTCTCCCTCGTCCCTCTCCCT
CTCGTCTTCCTCGAATTGGCTCGATCCGCCTGGTTCGACCGGTACAAGATCCAGCCCAAG
GTCAAGAACTCCTTCTCCGACATGTTCCGTTGCTACCGATACATCATGAAGATGTTCCTC
CTCGTCGTCGGCCCTCTCCAGCTCGTCTCTTATCCTTCCATCCAGATGATTGAGATTCGA
AGTGGGTTGCCGTTACCGTCTTTTGGGGAGATTGCGGCGCAGTTAGTGGTTTACTTTTTG
GTAGAGGACTATACGAACTATTGGGTTCATAGATTCTTTCATAGCAAGTGGGGTTATGAG
AAGATTCATCATATCCATCATGAG
ACTCACAGCGGATATGA

QA 2 505 2 505
DS 

RD RS1D271TF 671 0 0
GGGCTCCACTCTCTCGTCTCTCTCTCTGGATCCCACCACGTCAACGAGATCATCTCGCGG
AACACACAATGATCCCTTACGCAACGATCGAAGATGCCTCGATGGCCTTAGGCCGAAACC
TAACGACCCTGGAGACGCTCTGGTTCGAATACTCCGCCACGAAGTCAGATTACTACCTCT
ACTGCCACAACATCCTCTTCCTCTTCCTCATCTTCTCCCTCGTCCCCCTCCCTCTCGTCT
TCCTCGAATTGGCTCGATCCGCCTGGTTCGATCGGTACAAGATCCAGCCCAAGGTCAAGA
ACTCCTTCTCCGACATGTTCCGTTGCTACCGAGACGTCATGAAGATGTTCCTCCTCGTCG
TCGGCCCTCTCCAGCTCGTCTCTTATCCTTCTATCCAGATGATTGAGATTCGAAGTGGGT
TGCCGTTACCGTCTTTCGGGGAGATTGCGGCGCAGTTAGTGGTTTACTTTTTGGTGGAGG
ACTATACGAACTATTGGGTTCATAGATTCTTTCATAGCAAGTGGGGTTATGAGAAGATTC
ATCATATCCATCATGAGTACACTGCTCCTATTGGGTATGCTGCTCCTTATGCCCATTGGG
CTGAGGTTTTGCTTCTTGGGGTTCCGACTTTTCTTGGACCTGCTATTGCTCCTGGTCACA
TGATTACCTTC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1H116TF 710 0 0
G
GGATCCCACCACGTCAACGAGATCATCTCGCGGAACACACAATGATCCCTTACGCAACGA
TCGAAGATGCCTCGATGGCCTTAGGCCGAAACCTAACGACCCTGGAGACGCTCTGGTTCG
AATACTCCGCCACGAAGTCAGATTACTACATCTACTGCCACAACATCCTCTTCCTCTTCC
TCATCTTCTCCCTCGTCCCTCTCCCTCTCGTCTTCCTCGAATTGGCTCGATCCGCCTGGT
TCGACCGGTACAAGATCCAGCCCAAGGTCAAGAACTCCTTCTCCGACATGTTCCGTTGCT
ACCGAGACGTCATGAAGATGTTCCTCCTCGTCGTCGGCCCTCTCCAGCTCGTCTCTTATC
CTTCCATCCAGATGATTGAGATTCGAAGTGGGTTGCCGTTACCGTCTTTTGGGGAGATTG
CGGCGCAGTTAGTGGTTTACTTTTTGGTAGAGGACTATACGAACTATTGGGTTCATAGAT
TCTTTCATAGCAAGTGGGGTTATGAGAAGATTCATCATATCCATCATGAGTACACTGCTC
CTATTGGGTATGCTGCTCCTTATGCCCATTGGGCTGAGGTTTTGCTTCTTGGTGTTCCCA
CGTTTCTTGGCCCTGCTATTGCTCCTGGTCACATGATTACCTTCTGGCTGTGGATTGCTT
TACGCCAGATTGAAGCCATTGAGACTCACAGCGGATATGATTTTCCATG

QA 2 710 2 710
DS 

RD RS1H116JQB 786 0 0
TTTT
GGGAGATTGCGGCGCAGTTAGTGGTTTACTTTTTGGTAGAGGACTATACGAACTATTGGG
TTCATAGATTCTTTCATAGCAAGTGGGGTTATGAGAAGATTCATCATATCCATCATGAGT
ACACTGCTCCTATTGGGTATGCTGCTCCTTATGCCCATTGGGCTGAGGTTTTGCTTCTTG
GTGTTCCCACGTTTCTTGGCCCTGCTATTGCTCCTGGTCACATGATTACCTTCTGGCTGT
GGATTGCTTTACGCCAGATTGAAGCCATTGAGACTCACAGCGGATATGATTTTCCATGGA
CTCTGACGAAATTCATTCCGTTCTACGGTGGAGCTGAGTATCATGATTACCATCATTACG
TTGGAGGACGAAGCCAAAGCAACTTTGCTTCAGTTTTCACTTACTGCGTTTACATCTATG
GAACTGACAAAGGTTACCGATTCCAAAAGAAGCTTCTTCAGCAGATAAAGGAGGAGTCCA
AGAAGAGCAACAAGCAGAATGGAGGAGATAAATTAGATTAGTAAAAACCTGAAATTTCTT
ACGGAGGGTTGAGTTTACTTGTCATAAAGATAAGTTTATAAGCAGTCTGCTAATCTAATC
AAAGTCAAGAGTCGCAAAAGAAAGTGTAGTTTTAGTTTTCTTCTCTTTTTTGCTATGTGT
TGTCACATGGAAATGCTCCTTCGTTTTCCATTGGTGTGCGTCTTTTTCGTATTGTTTTTC
TTTGTTTAAACTCTTTTTACGTAAGGCATTTATTATTTTGTATGGTAGAGGAAAGAAGAT
TG

QA 5 786 5 786
DS 

RD RS1GA17JQ 445 0 0
G
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ATTACATCTATGGAACTGACAAAGGTTACCGATTCCAAAAGAAGCTTCTTCAGCAGATAA
AGGAGGAGTCCAAGAAGAGCAACAAGCAGAATGGAGGAGATAAATTAGATTAGTAAAAAC
CTGAAATTTCTTACGGAGGGTTGAGTTTACTTGTCATAAAGATAAGTTTATAAGCAGTCT
GCTAATCTAATCAAAGTCAAGAGTCGCAAAAGAAAGTGTAGTTTTAGTTTTCTTCTCTTT
TCTGCTATGTGTTGTCACATGGAAATGCTCCTTCGTTTTCCATTGGTGTGCGTCTTTTTC
GTATTGTTTTTCTTTGTTTAAACTCTTTTTACGTAAGGCATTTATTATTTTGTATGGTAG
AGGAAAGAAGATTGAAAGGAGTGG

QA 2 445 2 445
DS 

RD RS1GA17TF 445 0 0
G
ACCATCATTACGTTGGAGGACAAAGCCAAAGCAACTTTGCTTCAGTTTTCACTTACTGCG
ATTACATCTATGGAACTGACAAAGGTTACCGATTCCAAAAGAAGCTTCTTCAGCAGATAA
AGGAGGAGTCCAAGAAGAGCAACAAGCAGAATGGAGGAGATAAATTAGATTAGTAAAAAC
CTGAAATTTCTTACGGAGGGTTGAGTTTACTTGTCATAAAGATAAGTTTATAAGCAGTCT
GCTAATCTAATCAAAGTCAAGAGTCGCAAAAGAAAGTGTAGTTTTAGTTTTCTTCTCTTT
TCTGCTATGTGTTGTCACATGGAAATGCTCCTTCGTTTTCCATTGGTGTGCGTCTTTTTC
GTATTGTTTTTCTTTGTTTAAACTCTTTTTACGTAAGGCATTTATTATTTTGTATGGTAG
AGGAAAGAAGATTGAAAGGAGTGG

QA 2 445 2 445
DS 



AS 1 8

CO CL605Contig1 752 8 4 U
TTTTTTTTCTACAAACATTTTCATTTGTTCAAATCCATTTGCTCCTTCGTCCACAGATCT
CCTCCATGGCTCCTATTGCTGTTGGTAATACTCTACCAGACGGAAAAATTTTCCTCTTTG
ACGAGAACGATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCACTCTCTCTTGGCTGGTAAGAAGGTCA
TTCTCTTTGGTGTCCCCGGTGCTTTCACTTCCACCTGCAGCTTGCAGCATGTGCCTACTT
TCATTGAGAAAGCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTGTCAATGAGATCATTTGTTATGGCA
TGAATGATCCATATGTGATGAAAGCATGGGGAAATACATTCCCAGAGAACAAGCATGTCA
AGTTTGTCTCAGACGGCTCAGGAGAATACACAAAGCTTCTCGGACTCGAGCTTGACCTTA
AGGACAAGGGTCTTGGTATTAGGACAAAGAGATTTGCTATGTTGCTCGATAACCTCAAGG
TAACCGTCGCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTTCACGGTTTCCAGTGCCGATGATATCC
TCAAGGCTCTCTAAGAAATTACCATCTGAATTGAGAGGATCTCTAGCCTGATTTGCAGAA
TAAGAAGTTGCCATAATAAATTGGTTTAATATTATTTATTTTCCTCTCTTT*ATTATAAT
AATGTACTTAGTTTGGGTTGTTTTCTTTAAGTTTGATTTATGAGCCAAATACACTATTTT
GATGTGGGCTCCAAATGATATGAAAGTTTACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GL35TF U 9
AF RS1CX07JQ C 193
AF RS1EW60TF U 9
AF RS1GK63JQ C 1
AF RS1GK63TF U 1
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AF RS1CX07TF U 9
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BS 156 156 RS1CX07TF
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RD RS1GL35TF 492 0 0
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GCCAACATTGAA

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DS 

RD RS1CX07JQ 387 0 0
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CGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTGTCAATGAGATCATTTGTTATGGCATGAATGATCCAT
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AAGAAATTACCATTTGAATTGAGAGGA

QA 1 387 1 387
DS 

RD RS1EW60TF 582 0 0
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GCTCCTATTGCTGTTGGTAATACTCTACCAGACGGAAAA*TTTTCCTCTTTGACGAGAAC
GATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCACTCTCTCTTGGCTGGTAAGAAGGTCATTCTCTTT
GGTGTCCCCGGTGCTTTCACTTCCACCTGCAGCTTGCAGCATGTGCCTACTTTCATTGAG
AAAGCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTGTCAATGAGATCATTTGTTATGGCATGAATGAT
CCATATGTGATGAAAGCATGGGGAAATACATTCCCAGAGAACAAGCATGTCAAGTTTGTC
TCAGACAGCTCAGGAGAATACACAAAGCTTCTCGGACTCGAGCTTGACCTTAAGGACAAG
GGTCTTGTTATTAGGACAAAGAGATTTGCTATGTTGCTCGATAACCTCAAGGTAACCGTC
GCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTTCACGGTTTCCAGTGCCGATGGTATCCTCAAGGCT
CTCTAAGAAATTACCATCTGAATTGAGAGGATCTCTAGCCTG

QA 1 582 1 582
DS 

RD RS1GK63JQ 633 0 0
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CCTCCATGGCTCCTATTGCTGTTGGTAATACTCTACCAGACGGAAAAATTTTCCTCTTTG
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TTCTCTTTGGTGTCCCCGGTGCTTTCACTTCCACCTGCAGCTTGCAGCATGTGCCTACTT
TCATTGAGAAAGCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTGTCAATGAGATCATTTGTTATGGCA
TGAATGATCCATATGTGATGAAAGCATGGGGAAATACATTCCCAGAGAACAAGCATGTCA
AGTTTGTCTCAGACGGCTCAGGAGAATACACAAAGCTTTTCGGACTCGAGCTTGACCTTA
AGGACAAGGGTCTTGGTATTAGGACAAAGAGATTTGCTATGTTGCTCGATAACCTCAAGG
TAACCGTCGCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTTCACGGTTTCCAGTGCCGATGATATCC
TCAAGGCTCTCTAAGAAATTACCATCTGAATTGAGAGGATCTCTAGCCTGATTTGCAGAA
TAAGAAGTTGCCATAATAAATTGGTTTAATATT

QA 1 633 1 633
DS 

RD RS1GK63TF 633 0 0
TTTTTTTTCTACAAACATTTTCATTTGTTCAAATCCATTTGCTCCTTCGTCCACAGATCT
CCTCCATGGCTCCTATTGCTGTTGGTAATACTCTACCAGACGGAAAAATTTTCCTCTTTG
ACGAGAACGATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCACCCTCTCTTGGCTGGTAAGAAGGTCA
TTCTCTTTGGTGTCCCCGGTGCTTTCACTTCCACCTGCAGCTTGCAGCATGTGCCTACTT
TCATTGAGAAAGCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTGTCAATGAGATCATTTGTTATGGCA
TGAATGATCCATATGTGATGAAAGCATGGGGAAATACATTCCCAGAGAACAAGCATGTCA
AGTTTGTCTCAGACGGCTCAGGAGAATACACAAAGCTTCTCGGACTCGAGCTTGACCTTA
AGGACAAGGGTCTTGGTATTAGGACAAAGAGATTTGCTATGTTGCTCGATAACCTCAAGG
TAACCGTCGCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTTCACGGTTTCCAGTGCCGATGATATCC
TCAAGGCTCTCTAAGAAATTACCATCTGAATTGAGAGGATCTCTAGCCTGATTTGCAGAA
TAAGAAGTTGCCATAATAAATTGGTTTAATATT

QA 1 633 1 633
DS 

RD RS1GL35JQ 611 0 0
AAAATTTTCCTCTTTGACGAGAACGATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCACTCTCTCTTG
GCTGGTAAGAAGGTCATTCTCTTTGGTGTCCCCGGTGCTTTCACTTCCACCTGCAGCTTG
CAGCATGTGCCTACTTTCATTGAGAAAGCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTTTCAATGAG
ATCATTTGTTATGGCATGAATGATCCATATGTGATGAAAGCATGGGGAAATACATTCCCA
GAGAACAAGCATGTCAAGTTTGTCTCAGACGGCTCAGGGGAATACACAAAGCTTCTCGGA
CTCGAGCTTGACCTTAAGGACAAGGGTCTTGGTATTAGGACAAAGAGATTTGCTATGTTG
CTCGATAACCTCAAGGTAACCGTCGCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTTCACGGTTTCC
AGTGCCGATGATATCCTCAAGGCTCTCTAAGAAATTACCATCTGAATTGAGAGGATCTCT
AGCCTGATTTGCAGAATAAGAAGTTGCCATAATAAATTGGTTTAATATTATTTATTTTCC
TCTCTTTTATTATAATAATGTACTTAGTTTGGGTTTTTTTCTTTAAGTTTGATTTATGAG
CCAA
ATACAAC

QA 1 604 1 604
DS 

RD RS1CX07TF 744 0 0
CTACAAACATTTTCATTTGTTCAAATCCATTTGCTCCTTCGTCCACAGATCTCCTCCATG
GCTCCTATTGCTGTTGGTAATACTCTACCAGACGGAAAAATTTTCCTCTTTGACGAGAAC
GATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCACTCTCTCTTGGCTGGTAAGAAGGTCATTCTCTTT
GGTGTCCCCGGTGCTTTCACTTCCACCTGCAGCTTGCAGCATGTGCCTACTTTCATTGAG
AAAGCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTGTCAATGAGATCATTTGTTATGGCATGAATGAT
CCATATGTGATGAAAGCATGGGGAAATACATTCCCAGAGAACAAGCATGTCAAGTTTGTC
TCAGACGGCTCAGGAGAATACACAAAGCTTCTCGGACTCGAGCTTGACCTTAAGGACAAG
GGTCTTGGTATTAGGACAAAGAGATTTGCTATGTTGCTCGATAACCTCAAGGTAACCGTC
GCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTTCACGGTTTCCAGTGCCGATGATATCCTCAAGGCT
CTCTAAGAAATTACCATCTGAATTGAGAGGATCTCTAGCCTGATTTGCAGAATAAGAAGT
TACCATAATAAATTGGTTTAATATTATTTATTTTCCTCTCTTT*ATTATAATAATGTACT
TAGTTTGGGTTGTTTTCTTTAAGTTTGATTTATGAGCCAAATACACTATTTTGATGTGGG
CTCCAAATGATATGAAAGTTTACC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1AD90TF 697 0 0
CGTCCACAGATCTCCTCCATGGCTCCTATTGCTGTTGGTAATACTCTACCAGACGGAAAA
ATTTTCCTCTTTGACGAGAACGATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCACTCTCTCTTGGCT
GGTAAGAAGGTCATTCTCTTTGGTGTCCCCGGTGCTTTCACTTCCACCTGCAGCTTGCAG
CATGTGCCTACTTTCATTGAGAAAGCGGAACAGCTGAAAGCGAAAGGTGTCAATGAGATC
ATTTGTTATGGCATGAATGATCCATATGTGATGAAAGCATGGGGAAATACATTCCCAGAG
AACAAGCATGTCAAGTTTGTCTCAGACGGCTCAGGAGAATACACAAAGCTTCTCGGACTC
GAGCTTGACCTTAAGGACAAGGGTCTTGGTATTAGGACAAAGAGATTTGCTATGCTGCTC
GATAACCTCAAGGTAACCGTCGCCAACATTGAAACAGGTGGCGAGTTCACGGTTTCCAGT
GCCGATGATATCCTCAAGGCTCTCTAAGAAATTACCATCTGAATTGAGAGGATCTCTAGC
CTGATTTGCAGAATAAGAAGTTGCCATAATAAATTGGTTTAATATTATTTATTTTCCTCT
CTTT*ATTATAATA*TGTACTAGTTTTGGGTTGTTTTCTTTAAGTTTGATTTATGAGCCA
A*TACACTATTTTGATGTGGGCTCCAA*TGATATGAA

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 7

CO CL606Contig1 1095 7 24 U
GGAGGCATTGAGATTTCAAGAAAAATAAGGGTGATAAAAATAAACACCCGAAAAATGGGT
CTCAAGGCTTCCTCTTCTCTCCTCTGTCTCACCATCTTATTAGGTGTTTCTTCTATTGTA
TCAGCGGTTAACATAACCCGAGCACTCGAGAAATACCCTGAATTCAGCACCATGATCGAG
CTTTTCGCCAAGACTGAGCTTACACCAATTATCAACAAACGTCAGACAATTACCGTGCTG
GCTCTTAGCAACGATGCTATCGGTTCCATTTCTGGTAGACCCGAGGAGGAGCTCAAGAAC
GTTCTTATGAATCATGTAGTTCTTGACTACTTTGATGAACTCAAGCTCAAGGCACTCAAG
GACAGGAGCACATTGCTCACTACCCTTTACCAATCTACCGGTTTGGGCCAGCAGCAAAAC
GGTTTCCTCAACTGCACCAAAACTAACGGAAAGATTTACTTTGGGTCTGGTGTGAAAGGC
GCTCCTCAAACCGCTGAATACATCACAACCGTGTTCCGCAACCCGTACAATCTCTCTGTG
ATCCAAATCAGCATGCCCATTGTGGCTCCTGGACTCGGATCTCCTGTTAACGTTCCTCCA
CCACCACCCATGTCATCACCACCGACTCCATCTCCCAAGAAGGCTGCAACCACTCCAGCT
CCTGGACCATCTGAGGAGGAGGATTATGCAGATTCTCCTCCTGGTGCAGCTCCAGAAGCC
GCACCTGCATCAGCCCCATCAGAAGATGGTTCTCCTGCTCCGGCTCCTGGGAATGCTGGT
AAGAAGAAAATGGCAGCAGCTGATGAAGTTGAACCACCTACTTCTGCTTCTAACACCGGT
TTGAGTTTTGGTGCTGTTCTGGTTCTCGGGTTTTTGGTTAGTTTTGTTGGGTTCTAAAAT
GATTTAAGACAGAACAGAGTTGAGGACAGTAAACTGAATATGAGACTAGATCATGGTGAT
ATGAAGTGGGTCAATACTTAACAATTTCTACTCACATTACTAAAACTCAAAATGATTTAT
CATTAGTGAATGAAAATATGATGTTCAACAATGTGAAACTTGTACTGAGATATTGTAACT
TATGTGTTTATATTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GE44TF U 1
AF RS1GG22TF U 1
AF RS1CF07TF U 28
AF RS1FN63TF U 1
AF RS1GL28JQ C 274
AF RS1GE44JQ C 351
AF RS1GG22JQ C 774
BS 1 24 RS1FN63TF
BS 25 25 RS1GE44TF
BS 26 212 RS1FN63TF
BS 213 213 RS1CF07TF
BS 214 641 RS1FN63TF
BS 642 642 RS1GL28JQ
BS 643 667 RS1FN63TF
BS 668 668 RS1GL28JQ
BS 669 684 RS1FN63TF
BS 685 685 RS1GL28JQ
BS 686 712 RS1FN63TF
BS 713 713 RS1GL28JQ
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BS 725 725 RS1GL28JQ
BS 726 736 RS1FN63TF
BS 737 901 RS1GL28JQ
BS 902 902 RS1GE44JQ
BS 903 920 RS1GL28JQ
BS 921 921 RS1GE44JQ
BS 922 969 RS1GL28JQ
BS 970 970 RS1GE44JQ
BS 971 993 RS1GL28JQ
BS 994 1046 RS1GE44JQ
BS 1047 1095 RS1GG22JQ

RD RS1GE44TF 625 0 0
GGAGGCATTGAGATTTCAAGAAAAATAAGGGTGATAAAAATAAACACCCGAAAAATGGGT
CTCAAGGCTTCCTCTTCTCTCCTCTGTCTCACCATCTTATTAGGTGTTTCTTCTATTGTA
TCAGCGGTTAACATAACCCGAGCACTCGAGAAATACCCTGAATTCAGCACCATGATCGAG
CTTTTCGCCAAGACTGAGCTTACACCAATTATCAACAAACGTTAGACAATTACCGTGCTG
GCTCTTAGCAACGATGCTATCGGTTCCATTTCTGGTAGACCCGAGGAGGAGCTCAAGAAC
GTTCTTATGAATCATGTAGTTCTTGACTACTTTGATGAACTCAAGCTCAAGGCACTCAAG
GACAGGAGCATATTGCTCACTACCCTTTACCAATCTACCGGTTTGGGCCAGCAGCAAAAC
GGTTTCCTCAACTGCACCAAAACTAACGGAAAGATTTACTTTGGGTCTGGTGTGAAAGGC
GCTCCTCAAACCGCTGAATACATCACAACCGTGTTCCGCAACCCGTACAATCTCTCTGTG
ATCCAAATCAGCATGCCCATTGTGGCTCCTGGACTCGGATCTCCTGTTAACGTTCCTCCA
CCACCACCCATGTCATCACCACCGA

QA 1 625 1 625
DS 

RD RS1GG22TF 638 0 0
GGAGGCATTGAGATTTCAAGAAAAATAAGGGTGATAAAAATAAACACCCGAAAAATGGGT
CTCAAGGCTTCCTCTTCTCTCCTCTGTCTCACCATCTTATTAGGTGTTTCTTCTATTGTA
TCAGCGGTTAACATAACCCGAGCACTCGAGAAATACCCTGAATTCAGCACCATGATCGAG
CTTTTCGCCAAGACTGAGCTTACACCAATTATCAACAAACGTCAGACAATTACCGTGCTG
GCTCTTAGCAACGATGCTATCGGTTCCATTTCTGGTAGACCCGAGGAGGAGCTCAAGAAC
GTTCTTATGAATCATGTAGTTCTTGACTACTTTGATGAACTCAAGCTCAAGGCACTCAAG
GACAGGAGCACATTGCTCACTACCCTTTACCAATCTACCGGTTTGGGCCAGCAGCAAAAC
GGTTTCCTCAACTGCACCAAAACTAACGGAAAGATTTACTTTGGGTCTGGTGTGAAAGGC
GCTCCTCAAACCGCTGAATACATCACAACCGTGTTCCGCAACCCGTACAATCTCTCTGTG
ATCCAAATCAGCATGCCCATTGTGGCTCCTGGACTCGGATCTCCTGTTAACGTTCCTCCA
CCACCACCCATGTCATCACCACCGACTCCATCTCCCAA

QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1CF07TF 642 0 0
AGGGTGATAAAAATAAACACCCGAAAAATGGGTCTCAAGGCTTCCTCTTCTCTCCTCTGT
CTCACCATCTTATTAGGTGTTTCTTCTATTGTATCAGCGGTTAACATAACCCGAGCACTC
GAGAAATACCCTGAATTCAGCACCATGATCGAGCTTTTCGCCAAGACTGAGCTTACACCA
TTTATCAACAAACGTCAGACAATTACCGTGCTGGCTCTTAGCAACGATGCTATCGGTTCC
ATTTCTGGTAGACCCGAGGAGGAGCTCAAGAACGTTCTTATGAATCATGTAGTTCTTGAC
TACTTTGATGAACTCAAGCTCAAGGCACTCAAGGACAGGAGCACATTGCTCACTACCCTT
TACCAATCTACCAGTTTGGGCCAGCAGCAAAACGGTTTCCTCAACTGCACCAAAACTAAC
GGAAGGATTTACTTTGGGTCTGGTGTGAAAGGCGCTCCTCAAACCGCTGAATACATCACA
ACCGTGTTCCGCAACCCGTACAATCTCTCTGTGATCCAAATCAGCATGCCCATTGTGGCT
CCTGGACTCGGATCTCCTGTTAACGTTCCTCCACCACCACCCATGTCATCACCACCGACT
CCATCTCCCAAGAA*GCTGCAACCACTCCAGCTCCTG
ACATC

QA 1 637 1 637
DS 

RD RS1FN63TF 754 0 0
GGAGGCATTGAGATTTCAAGAAAAGTAAGGGTGATAAAAATAAACACCCGAAAAATGGGT
CTCAAGGCTTCCTCTTCTCTCCTCTGTCTCACCATCTTATTAGGTGTTTCTTCTATTGTA
TCAGCGGTTAACATAACCCGAGCACTCGAGAAATACCCTGAATTCAGCACCATGATCGAG
CTTTTCGCCAAGACTGAGCTTACACCAATTAT*AACAAACGTCAGACAATTACCGTGCTG
GCTCTTAGCAACGATGCTATCGGTTCCATTTCTGGTAGACCCGAGGAGGAGCTCAAGAAC
GTTCTTATGAATCATGTAGTTCTTGACTACTTTGATGAACTCAAGCTCAAGGCACTCAAG
GACAGGAGCACATTGCTCACTACCCTTTACCAATCTACCGGTTTGGGCCAGCAGCAAAAC
GGTTTCCTCAACTGCACCAAAACTAACGGAAAGATTTACTTTGGGTCTGGTGTGAAAGGC
GCTCCTCAAACCGCTGAATACATCACAACCGTGTTCCGCAACCCGTACAATCTCTCTGTG
ATCCAAATCAGCATGCCCATTGTGGCTCCTGGACTCGGATCTCCTGTTAACGTTCCTCCA
CCACCACCCATGTCATCACCACCGACTCCATCTCCCAAGAAAGCTGCAACCACTCCAGCT
CCTGGAC*ATCTGAGGAGGAGGAT*ATGCAGATTCTCCTCCTGGTGCAGCTC*AGAAGCC
GCAC*TGCATCAGCCC
ATCAGAGATGGTTCTCTG

QA 1 736 1 736
DS 

RD RS1GL28JQ 720 0 0
GGTAGACCCGAGGAGGAGCTCAAGAACGTTCTTATGAATCATGTAGTTCTTGACTACTTT
GATGAACTCAAGCTCAAGGCACTCAAGGACAGGAGCACATTGCTCACTACTCTTTACCAA
TCTACCGGTTTGGGCCAGCAGCAAAACGGTTTCCTCAACTGCACCAAAACTAACGGAAAG
ATTTACTTCGGGTCTGGTGTGAAAGGCGCTCCTCAAACCGCTGAATACATCACAACCGTG
TTTCGCAACCCGTACAATCTCTCTGTGATCCAAATCAGCATGCCCATTGTGGCTCCTGGA
CTCGGATCTCCTGTTAACGTTCCTCCACCACCACCCATGTCATCACCACCGTCTCCATCT
CCCAAGAAGGCTGCAACCACTCCAGCTCCTGGACCATCTGAGGAGGAGGATTACGCAGAT
TCTCCTCCTGGTGCAGCTCCAGAAGCCGCACCTGCATCAGCCCCATCAGAAGATGGTTCT
CCTGCTCCGGCTCCTGGGAATGCTGGTAAGAAGAAAATGGCAGCAGCTGATGAAGTTGAA
CCACCTACTTCTGCTTCTAACACCGGTTTGAGTTTTGGTGCTGTTCTGGTTCTCGGGTTT
TTGGTTAGTTTTGTTGGGTTCTAAAATGGTTTAAGACAGAACAGAGTCGAGGACAGTAAA
CTGAATATGAGACTAGATCATGGTGATATGAAGTGGATCAATACTTAACAATTTCTACTC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RS1GE44JQ 696 0 0
GGCACTCAAGGACAGGAGCATATTGCTCACTACCCTTTACCAATCTACCGGTTTGGGCCA
GCAGCAAAACGGTTTCCTCAACTGCACCAAAACTAACGGAAAGATTTACTTTGGGTCTGG
TGTGAAAGGCGCTCCTCAAACCGCTGAATACATCACAACCGTGTTCCGCAACCCGTACAA
TCTCTCTGTGATCCAAATCAGCATGCCCATTGTGGCTCCTGGACTCGGATCTCCTGTTAA
CGTTCCTCCACCACCACCCATGTCATCACCACCGACTCCATCTCCCAAGAAGGCTGCAAC
CACTCCAGCTCCTGGACCATCTGAGGAGGAGGATTATGCAGATTCTCCTCCTGGTGCAGC
TCCAGAAGCCGCACCTGCATCAGCCCCATCAGAAGATGGTTCTCCTGCTCCGGCTCCTGG
GAATGCTGGTAAGAAGAAAATGGCAGCAGCTGATGAAGTTGAACCACCTACTTCTGCTTC
TAACACCGGTTTGAGTTTTGGTGCTGTTCTGGTTCTCGGGTTTTTGGTTAGTTTTGTTGG
GTTCTAAAATGATTTAAGACAGAACAGAGTTGAGGACAGTAAACTGAATATGAGACTAGA
TCATGGTGATATGAAGTGGGTCAATACTTAACAATTTCTACTCACATTACTAAAACTCAA
AATGATTTATCATTAGTGAATGAAAATATGATGTTC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RS1GG22JQ 322 0 0
TGCTGGTAAGAAGAAAATGGCAGCAGCTGATGAAGTTGAACCACCTACTTCTGCTTCTAA
CACCGGTTTGAGTTTTGGTGCTGTTCTGGTTCTCGGGTTTTTGGTTAGTTTTGTTGGGTT
CTAAAATGATTTAAGACAGAACAGAGTTGAGGACAGTAAACTGAATATGAGACTAGATCA
TGGTGATATGAAGTGGGTCAATACTTAACAATTTCTACTCACATTACTAAAACTCAAAAT
GATTTATCATTAGTGAATGAAAATATGATGTTCAACAATGTGAAACTTGTACTGAGATAT
TGTAACTTATGTGTTTATATTC

QA 1 322 1 322
DS 



AS 2 7

CO CL607Contig1 1363 5 10 U
TGCAACAATGGTGATTGATTGCTCTACATTAACCAAAACAAGAAATGAAAATCACAAGCT
TCTGAAACTTTCTTAGGTACCAAAGAGATCACCCTCAAACTTT*ATGAGTAGCCAGTCCA
CACTTCTTCATTGTTTTAGGAAGAAAGTGTATGAAGAATCTAAGAGGCACGATAGATAGA
CATCAACTCAGCCACAAGCTCCTTGTCATCATCATGCTTCATCACATACTTGGTTAAGAA
AGCTTCATCAGTAACCGCTAACACAGGGGACAATGGAGGGAGTTCACTTCCAAGCAGACC
TTTAGACATGAGAGCTTTGATCACATAACACCTAGGGACAGTCCTCTTCTCCAAATTGTA
TCCAAATACCGCAGGGTTGGAAACTAGAGCCTTTAGTGACCAGTTCATCTCCTTCACAAG
AAACTCAGTCTTCTTCTTCACCGACTCTGCAGATAACCCAATGCACTGAGGACAGTGCTT
GACCATTGTCACAAACTCATCTCTGCTGAATCCTAGACCGATAAATGTCTCAAAGGAGTT
CACTATATTCTTCTCCGAAAGCGCAAGAAACAACGGATTCTTCTTGAAAATCTCCCATAC
ATCTACTGTACTAAACCCTAACTTTCTATAGAGATTAACCTTCTCTTCAGTTGTTTTGTG
GCTCATTTGGTAAACAACGCACAAAGCTCTGACAAACTTAGAGGTGGTGGGATCGAAACC
CATCCCAACAACTTTCTTGAGGGATTCTTGGAATCTTTCTTTTCCGGATACAACATGGAA
GTTGGAGGTGAGCAAGGAGAACAAGAACCTTTGAGGCACGCCCAATCGTCTCAGAGCCAA
CACGTTTATGATGATGTTCTCCTGGCAGGTACCATGTGGCAAAGACATTTCGTAATTGGA
GCACTTGTCTGCTTCGATGATGTCTTTGACGAAATCATAGTACCTGCCGACTGCTTTGTG
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TCAGAGCTGACTTTCCTCCAGATTGATTCAGCGAGTTTGGTGGTGAAACCCAATGAATCA
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GAAGCAGAGGAGAAGGAGTGGGAAGGAGAAGATAATATAATTGGGGAAGCAGACTCATTT
TGAAGAAGGTTCACTACAGATCTCAAGTGACGCCATTTCTGCAACTCAAGAGACTTTCTT
CCATGGAGTATCTTCAGCGAGTACATGAGAAAAGGCGATACCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AAAA

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CACTTCTTCATTGTTTTAGGAAGAAAGTGTATGAAGAATCTAAGAGGCACGATAGATAGA
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GC

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AGCTTCATCAGTAACCGCTAACACAGGGGACAATGGAGGGAGTTCACTTCCAAGCAGACC
TTTAGACATGAGAGCTTTGATCACATAACACCTAGGGACAGTCCTCTTCTCCAAATTGTA
TCCAAATACCGCAGGGTTGGAAACTAGAGCCTTTAGTGACCAGTTCATCTCCTTCACAAG
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GACCATTGTCACAAACTCATCTCTGCTGAATCCTAGACCGATAAATGTCTCAAAGGAGTT
CACTATATTCTTCTCCGAAAGCGCAAGAAACAACGGATTCTTCTTGAAAATCTCCCATAC
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AGAGATTAACCTTCTCTTCAGTTGTTTTGTGGCTCATTTGGTAAACAACGCACAAAGCTC
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TTTGAGGCACGCCCAATCGTCTCAGAGCCAACACGTTTATGATGATGTTCTCCTG
ACAG

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GATGTTCTCCTGGCAGGTACCATGTGGCAAAGACATTTCGTAATTGGAGCACTTGTCTGC
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CAAGATTCTCGGAACATTGGGTAGTTTGTAATGACGGTGGAGATGTGAGAATCTGTGAAG
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TTCAGCGAGTACATGAGAAAAGGCGATACCC

QA 1 691 1 691
DS 



CO CL607Contig2 784 2 4 U
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GTTGCAGAAATGGCGTCACTTGAGATCTGTAGTGAACCTTCTTCAAAATGAGTCTGCTTC
CCCAATTATATTATCTTCTCCTTCCCACTCCTTCTCCTCTGCTTCTGATGTGAGCTCTCT
TCAAGTTTGTCGAAAAGGTAACAACTTTACAGTCTCTTACCTGGTTGATTCATTGGGTTT
CACCACCAAACTCGCTGAATCAATCTGGAGGAAAGTCAGCTCTGAGGCCAAGGCCAATCC
AGATTCTGTTCTGAATCTTCTCAGGAGTCATGGCTTCACAGATTCTCACATCTCCACCGT
CATTACAAACTACCCACGACTGCTCACATTAGACTCTGAGAAAACCCTTGCTCCTAATCT
CAAGTTCCTGCAGTCCAGAGAAGGAGCTTCAACCTCTGAGCTCACTGAGATTGTTTCCAA
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GTTG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1FG16TF U 1
AF RS1FQ02TF U 1
BS 1 680 RS1FG16TF
BS 681 681 RS1FQ02TF
BS 682 702 RS1FG16TF
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CCCAATTATATTATCTTCTCCTTCCCACTCCTTCTCCTCTGCTTCTGATGTGAGCTCTCT
TCAAGTTTGTCGAAAAGGTAACAACTTTACAGTCTCTTACCTGGTTGATTCATTGGGTTT
CACCACCAAACTCGCTGAATCAATCTGGAGGAAAGTCAGCTCTGAGGCCAAGGCCAATCC
AGATTCTGTTCTGAATCTTCTCAGGAGTCATGGCTTCACAGATTCTCACATCTCCACCGT
CATTACAAACTACCCACGACTGCTCACATTAGACTCTGAGAAAACCCTTGCTCCTAATCT
CAAGTTCCTGCAGTCCAGAGAAGGAGCTTCAACCTCTGAGCTCACTGAGATTGTTTCCAA
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GAAAAAAA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RS1FQ02TF 784 0 0
CTCT
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ATTATATTATCTTCTCCTTCCCACTCCTTCTCCTCTGCTTCTGATGTGAGCTCTCTTCAA
GTTTGTCGAAAAGGTAACAACTTTACAGTCTCTTACCTGGTTGATTCATTGGGTTTCACC
ACCAAACTCGCTGAATCAATCTGGAGGAAAGTCAGCTCTGAGGCCAAGGCCAATCCAGAT
TCTGTTCTGAATCTTCTCAGGAGTCATGGCTTCACAGATTCTCACATCTCCACCGTCATT
ACAAACTACCCACGACTGCTCACATTAGACTCTGAGAAAACCCTTGCTCCTAATCTCAAG
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CCGAGAATCTTGGGAATGAGATGGCACAAAGCAGTCGGCAGGTACTATGATTTCGTCAAA
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TGTTCTCCTTGCTCACCTCCACTTCCATGTTGTATCCGAAAGAAGATCCAAGATCCCTCA
AGAAAGTTGTTGGGATGGGTTCGATCCCCCACCTCTAGTTTGTCAGAGCTTTGTGCGTTG

QA 5 784 5 784
DS 



AS 1 8

CO CL608Contig1 992 8 12 U
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CATCTTTATCTAAGAGATCGGTTGCTGCTCATCCATGGCATGATCTTGAAATCGGACCTG
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AACTTGACAAAAAGACAGGACTAATCAAGGTTGATAGGATCCTTTATTCATCAGTTGTGT
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TATCCTTTTAAAGTTTCGATTTCGTTCCAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RS1EE81TF U 1
AF RS1EL14TF U 68
AF RS1DR06TF U 68
AF RS1AB87TF U 74
AF RS1EE81JQ C 374
AF RS1AB87JQ C 188
AF RS1EL14JQ C 259
AF RS1DR06JQ C 188
BS 1 80 RS1EE81TF
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BS 82 91 RS1EE81TF
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BS 744 747 RS1AB87TF
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RD RS1EE81TF 638 0 0
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AAATCCGGCGATTCTTTGAAGATTACAAGAAGAATGAG

QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1EL14TF 564 0 0
TTTTTT
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GAGATCGGTTGCTGCTCATCCATGGCATGATCTTGAAATCGGACCTGGAGCTCCAGTGAT
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CTTTGAAGATTACAAGAA

QA 7 564 7 564
DS 

RD RS1DR06TF 679 0 0
TTTTTT
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CAATAAGCTTCAGAAGCCAACTCCACGTTTAAACGAGAGGATCCTCTCATCTTTATCTAA
GAGATCGGTTGCTGCTCATCCATGGCATGATCTTGAAATCGGACCTGGAGCTCCAGTGAT
TTTCAATGTGGTTGTTGAGATCTCAAAGGGTAGCAAGGTCAAATATGAACTTGACAAAAA
GACAGGACTAATCAAGGTTGATAGGATCCTTTATTCATCAGTTGTGTATCCTCATAACTA
CGGCTTTATTCCCCGCACATTATGCGAAGACAATGATCCGTTGGATGTGCTAGTCATCAT
GCAGGAGCCTGTACTTCCAGGCTGTTTTCTGCGCGCCCGAGCTATTGGATTAATGCCCAC
GATTGATCAGGGAGAAAAAGATGACAAGATCATTGCCGTATGTGTTGATGATCCGGAGTA
TAAGCATTACACTGACATCAAAGAACTTCCTCCTCATCGTCTCACTGAAATCCGGCGATT
CTTTGAAGATTACAAGAAGAATGAGAACAAAGAAGTTGCTGTAAATGACTTTCTACCGAA
TGGTCCTGCTGTTGAAGCCATTCAGTACTCAATGGACCTTTACGCTGAGTACATTCTTCA
CACCTTGAGA
GAT

QA 7 676 7 676
DS 

RD RS1AB87TF 674 0 0
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GAGATCGGTTGCTGCTCATCCATGGCATGATCTTGAAATCGGACCTGGAGCTCCAGTGAT
TTTCAATGTGGTTGTTGAGATCTCAAAGGGTAGCAAGGTCAAATATGAACTTGACAAAAA
GACAGGACTAATCAAGGTTGATAGGATCCTTTATTCATCAGTTATGTATCCTCATAACTA
CGGCTTTATTCCCCGCACATTATGCGAAGACAATGATCCGTTGGATGTGCTAGTCATCAT
GCAGGAGCCTGTACTTCCAGGCTGTTTTCTGCGCGCCCGAGCTATTGGATTAATGCCCAT
GATTGATCAGGGAGAAAAAGATGGCAAGATCATTGCCGTATGTGTTGATGATCCGGAGTA
TAAGCATTACACTGACATCAAAGAACTTCCTCCTCATCGTCTCACTGAAATCCGGCGATT
CTTTGAAGATTACAAGAAGAATGAGAACAAGGAAGTTGCTGTAAATGACTTTCTACCGAA
TGGTCCTGCTGTTGAAGCCATTCAGTACTCAATGGACCTTTACGCTGAGTACATTCTTCA
CACCTTGAGAAGAT

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DS 

RD RS1EE81JQ 575 0 0
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GCAGGAGCCTGTACTTCCAGGCTGTTTTCTGCGCGCCCGAGCTATTGGATTAATGCCCAT
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TAAGCATTACACTGACATCAAAGAACTTCCTCCTCATCGTCTCACTGAAATCCGGGGATT
CTTTGAAGATTACAAGAAGAATGAGAACAAGGAAGTTGCTGTAAATGACTTTTTACCGAA
TGGTCCTGCTGTTGAAGCCATTCAGTACTCAATGGACCTTTACGCTGAGTACATTTTTCA
CACCTTGAGAAGATAAGGGAAGGGCCATTCCTGCCAAAAGAAAGAGAGAATTTGTTTGAT
TGAATTTTGAATAAAGCACGTGTTCATGAAACTGTTTTGATGTTTTGACTTTAAAGCTTG
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AATCCCCGTTGAGTTTTTTTTTT
TTTTATTTGTAT

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DS 

RD RS1AB87JQ 805 0 0
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TAACTACGGCTTTATTCCCCGCACATTATGCGAAGACAATGATCCGTTGGATGTGCTAGT
CATCATGCAGGAGCCTGTACTTCCAGGCTGTTTTCTGCGCGCCCGAGCTATTGGATTAAT
GCCCATGATTGATCAGGGAGAAAAAGATGGCAAGATCATTGCCGTATGTGTTGATGATCC
GGAGTATAAGCATTACACTGACATCAAAGAACTTCCTCCTCATCGTCTCACTGAAATCCG
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TCTTCACACCTTGAGAAGATAAGGGAAGGGCCATTCCTGCCAAAAGAAAGAGAGAATTTG
TCTGATTGAATTTTGAATAAAGCACGTGTTCATGAAACTGTTTTGATGTTTTGACTTTAA
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AGATTAAATCCCAGTTGAGTTTTTTTTTT*CTCTTATTTGTATTGGATCTTTTTATCCTT
TTAAAGTTTCGATTTCGTTCCAACG

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DS 

RD RS1EL14JQ 730 0 0
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GACTAATCAAGGTTGATAGGATCCTTTATTCATCAGTTGTGTATCCTCATAACTACGGCT
TTATTCCCCGCACATTATGCGAAGACAATGATCCGTTGGATGTGCTAGTCATCATGCAGG
AGCCTGTACTTCCAGGCTGTTTTCTGCGCGCCCGAGCTATTGGATTAATGCCCATGATTG
ATCAGGGAGAAAAAGATGACAAGATCATTGCCGTATGTGTTGATGATCCGGAGTATAAGC
ATTACACTGACATCAAAGAACTTCCTCCTCATCGTCTCACTGAAATCCGGCGATTCTTTG
AAGATTACAAGAAGAATGAGAACAAGGAAGTTGCTGTAAATGACTTTCTACCGAATGGTC
CTGCTGTTGAAGCCATTCAGTACTCAATGGACCTTTACGCTGAGTACATTCTTCACACCT
TGAGAAGATAAGGGAAGGGCCATTCCTGCCAAAAGAAAGAGAGAATTTGTTTGATTGAAT
TTTGAATAAAGCACGTGTTCATGAAACTGTTTTGATGTTTTGACTTTAAAGCTTGTTTTG
ACTTTAAAGCTTTTTTGTTGTTGTTTTCTTCTGGGGATCTTTTGTCTGAAGATTAAATCC
CAGTTGAGTTTTTTTTTTTCTCTTATTTGTATTGGATCTTTTTATCCTTTTAAAGTTTCG
ATTTCGTTCC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RS1DR06JQ 801 0 0
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AGTGATTTTCAATGTGGTTGTTGAGATCTCAAAGGGTAGCAAGGTCAAATATGAACTTGA
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QA 1 801 1 801
DS 



AS 1 7

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TACTTTCTTAGCCATCGTTGGAGCATGCTTATCAAACTTGTCCGAAACTTCACCGACCTT
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ATCGTTTCTACCAACAAGTCTTTTAATAATATCTCTTTGCTTCGGAGTTATCGCCTGTCT
TCGCTAAACAGAAAGTATCTTCCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 15 15 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

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QA 1 766 1 766
DS 

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ACAGGAACTAACGGGAGATAACCAACCACAGGGTAACCCATCTGGATCATGTCCGTCACC
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TGAATCGGTTTATACCGGTTGAGTTTAGCCCATACTTTAACAGAACTGTTCACAAGGAAA
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AGATAACCAACCACAGGGTAACCCATCTGGGTCATGTCCGTCACCAACTCGTTGTAAATA
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TTCCCCACCGCCGGTTTAGGAGGACCAGAGTTTTGTTTTG**TAGTCGTAGAGGCTCGAG
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QA 1 820 1 820
DS 

RD RS1B334TF 764 0 0
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T**CTCCTTTTCATAAGC*TTGACAATGTCATCAACAGGAACTAACGGGAGATAACCAAC
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GTCCGAAACTTCACCGACCTTGTGATCTAGAAAGAGGAGGAGAGTATCTGGAACATCTTT
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AACATGGATCGCCGCGACTCTCACGAACCCTAGGTGTTTCAGACCTATCTCCTTGCTATT
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DS 

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AAACTTCACCGACCTTGTGATCTAGAAAGAGGAGGAGAGTATCTGGAACATCTTTGAATG
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TAAGAGGACCAGAGTTTTGTTTCGCGTAGTCGTAGAGGCTCGAGAGGCTGACGAGAACAT
GGATCGCCGCGACTCTCACGAACCCTAGGTGTTTCAGACCTATCTCCTTGCTATTTTTCT
TCTCCGTCTCCATCTGATCGTTTCTACCAACAAGTCTTTTAATAATATCTCTTTGCTTCG
GAGTTATCGCCTGTCTTCGCTAAACAGAAAGTATCTTCC
C

QA 1 699 1 699
DS 

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ATCTGGGTCATGTCCGTCACCAACTCGTTGTAAATACCAGACAAGTGTGCAGCCACGGGC
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GGACCACCGGTACGAGCCTCTTTCACAAAGGATTGAGCCTTCTGGATCAACACATTAGCT
TGATTCGCTACTTTCTTAGCCATCGTTGGAGCATGCTTATCAAACTTGTCCGAAACTTCA
CCGACCTTGTGATCTAGAAAGAGGAGGAGAGTATCTGGAACATCTTTGAATGTGTTGTAG
ACAGGGTTGACGACGGTGGTGACAGCTCCTTCCACTTTCCCCACCGCCGGTTTAAGAGGA
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GCGACTCTCACGAACCCTAGGTGTTTCAGACCTATCTCCTTGCTATTTTTCTTCTCCGTC
TCCATCTGATCGTTTCTACCAACAAGTCTTTTAATAATATCTCTTTGCTTCGGAGTTATC
GCCTGTCTTCGCTAAACAGAAAGTATCTTCCC

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 7

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CCTTTGTCCAATGATCTGCAACCTTGTGTCTTTCCTCAACACTGGGAGATGTAACAGTCC
CATTGGTGGTTGTATTAGAAGATTCTGGAGAATGGCTGTCCACTCTTCGAGTCAAAGGAT
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CTTGAACTTCTTTCGAAATCTGCTGCATTTGAGGTTGTTTCATGACACCGTCTATGTGGC
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CTGTTCCTCTCGCCGTCTTCGGTGAAGGAGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 20 35 35 35 0 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 0 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AT92JQ U 1
AF RS1EG95JQ U 27
AF RS1EG95TF C 45
AF RS1EK61JQ U 85
AF RS1G227JQ U 132
AF RS1EK61TF C 322
AF RS1AT92TF C 433
BS 1 85 RS1AT92JQ
BS 86 86 RS1EG95JQ
BS 87 89 RS1AT92JQ
BS 90 90 RS1EG95JQ
BS 91 231 RS1AT92JQ
BS 232 232 RS1EG95JQ
BS 233 291 RS1AT92JQ
BS 292 292 RS1EG95JQ
BS 293 386 RS1AT92JQ
BS 387 387 RS1EG95JQ
BS 388 491 RS1AT92JQ
BS 492 494 RS1EG95JQ
BS 495 656 RS1AT92JQ
BS 657 657 RS1EG95JQ
BS 658 715 RS1AT92JQ
BS 716 735 RS1EK61JQ
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BS 937 1087 RS1EK61TF
BS 1088 1114 RS1AT92TF

RD RS1AT92JQ 715 0 0
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TAGAAGTTGATACATAACCGGCTGAAAACAAAATCACACACATTTATTCATATTCCTAAG
AACTTACAAAGCCGCAGAATAAATTATAGGAATCAAGATCGTTTACCAAAATTACAAGAT
CAATTACTGAACTTATCTCTGCCAGGTTTAACTCACTTGTTGCCGGAGCAGTAACAGATT
TCAGGACTCTGGCCCAGTTAGTATTCTCAGGCTACAAGTACAAACAAAGACTATGCCGGT
GTCTTCTTGTGACTTGTTGATCGATGATCCATAAAACTTGACTTCAAGTTTCTCCTTTCT
CTTCAACAACAAACTTCCCTTTTAAATCTGGAGTTTCCTTTTCGGCTTGTGCAAAAAAGT
GTTTGGCTTTGTGTGCTACTTCAGCTTCAAGAACAGCCTCCAGCATTAAATCAGATCCTT
TTGCACTCTCTGCTTTGCGATGAGGGAGCAACTTTGCCATCTCTGCAGAAACTGGAAGAA
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ACGCTGTTGCTTGGGCGTGCAGATTAACTGAAGCTGATGACGAACCACTAAACTCT*GAG
CCTTTGTCCAATGATCTGCAACCTTGTGTCTTTCCTCAACACTGGGAGATGTAAC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1EG95JQ 671 0 0
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TAGGAATGAAGATCGTTTACCAAAATTACAAGATCAATTACTGAACTTATCTCTGCCAGG
TTTAACTCACTTGTTGCCGGAGCAAAAACCGATTTCAGGACTCTGGCCCAGTTAGTATTC
TCAGGCTACAAGTACAAACAAAGACCATGCCGGTGTCTTCTTGTGACTTGTTGATCGATG
ATCCATAAAACTTGACTTCAAGTTTCTCCTTTCTCTTCAACAACAAACTTCCCTTTTAAA
GCTGGAGTTTCCTTTTCGGCTTGTGCAAAAAAGTGTTTGGCTTTGTGTGCTACTTCAGCT
TCAAGAACAGCCTCTAGCATTAAATCAGATCCTTTTGCACTCTCT***TTGCGATGAGGG
AGCAACTTTGCCATCTCAGCAGAAACTGGAAGAACAGGTGAATCACTAGTTATAGTGTGA
GTTCTGCCACTGACAGACTCAGATAAACGTTCAAACGCTGTTGCTTGGGCGTGCAGATTA
ACTGAAGCCGATGACGAACCGCTAAACTCTTGAGCCTTTGTCCAATGATCTGCAACATTG
TGTCTTTCCTC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1EG95TF 699 0 0
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TATTCATATTCCTAAGAACTTACAAAGCCGCAGAATAAATTATAGGAATGAAGATCGTTT
ACCAAAATTACAAGATCAATTACTGAACTTATCTCTGCCAGGTTTAACTCACTTGTTGCC
GGAGCAGAAACCGATTTCAGGACTCTGGCCCAGTTAGTATTCTCAGGCTACAAGTACAAA
CAAAGACCATGCCGGTGTCTTCTTGTGACTTGTTGATCGATGATCCATAAAACTTGACTT
CAAGTTTCTCCTTTCTCTTCAACAACAAACTTCCCTTTTAAAGCTGGAGTTTCCTTTTCG
GCTTGTGCAAAAAAGTGTTTGGCTTTGTGTGCTACTTCAGCTTCAAGAACAGCCTCTAGC
ATTAAATCAGATCCTTTTGCACTCTCT***TTGCGATGAGGGAGCAACTTTGCCATCTCA
GCAGAAACTGGAAGAACAGGTGAATCACTAGTTATAGTGTGAGTTCTGCCACTGACAGAC
TCAGATAAACGTTCAAACGCTGTTGCTTGGGCGTGCAGATTAACTGAAGCCGATGACGAA
CCGCTAAACTCTTGAGCCTTTGTCCAATGATCTGCAACATTGTGTCTTTCCTCAACACTG
GGAGATGTAACAGTCCCGTTGGTGGTTGTATTAGAAGA
C

QA 1 698 1 698
DS 

RD RS1EK61JQ 651 0 0
CG
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TAGGAATCAAGATCGTTTACCAAAATTACAAGATCAATTACTGAACTTATCTCTGCCAGG
TTTAACTCACTTGTTGCCGGAGCAAAAACAGATTTCAGGACTCTGGCCCAGTTAGTATTC
TCAGGCTACAAGTACAAACAAAGACTATGCCGGTGTCTTCTTGTGACTTGTTGATCGATG
ATCCATAAAACTTGACTTCAAGTTTCTCCTTCCTCTTCAACAACAAACTTCCCTTTTAAA
GCTGGAGTTTCCTTTTCGGCTTGTGCAAAAAAGTGTTTGGCTTTGTGTGCTACTTCAGCT
TCAAGAACAGCCTCCAGCATTAAATCAAATCCTTTTGCACTCTCT***TTGCGATGAGGG
AGCAACTTTGCCATCTCTGCAGAAACTGGAAGAACAGGTGAATCACTAGTTATAGTGTGA
GTTTTGGCACTGACAGACTCAAATAAACGTTCAAACGCTGTTGCTTGGGCGTGCAGATTA
ACTGAAGCTGATGACGAACCACTAAACTCTCGAGCCTTTGTCCAATGATCTGCAACCTTG
TGTCTTTCCTCAACACTGGGAGATGTAACAGTCCCATTGGTGGTTGTAT

QA 3 651 3 651
DS 

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CTTATCTCTGCCAGGTTTAACTCACTTGTTGCCGGAGCAGAAACAGATTTCAGGACTCTG
GCCCAGTTAGTATTCTCAGGCTACAAGTACAAACAAAGACTATGCCGGTGTCTTCTTGTG
ACTTGTTGATCGATGATCCATAAAACTTGACTTCAAGTTTCTCCTTTCTCTTCAACAACA
AACTTCCCTTTTAAAGCTGGAGTTTCCTTTTCGGCTTGTGCAAAAAAGTGTTTGGCTTTG
TGTGCTACTTCAGCTTCAAGAACAGCCTCCAGCATTAAATCAAATCCTTTTGCACTCTCT
***TTGCG*TGAGGGAGCAACTTTGCCATCTCTGCAGAAACTGGAAGAACAGGTGAATCA
CTAGTTATAGTGTGAGTTTTGGCACTGACAGACTCAGATAAACGTTCAAACGCTGTTGCT
TGGGCGTGCAGATTAACTGAAGCTGATGACGAACCACTAAACTCTTGAGCCTTTGTCCAA
TGATCTGCAACCTTGTGTCTTTCCTCAACACTGGGAGATGTAACAGTCCCATTGGTGGTT
ATATTAGAAGATTCTGGAGAATGGCTGTCCACTCTTCGAGTCAAAGGATTGGAGTTAAAG
AGAGAGAAACTTGCGCCATGGCTAATAGCATCAACTTGTGCTCGCAAATCTTGAACTTCT
TTCGAAATCTGCTGCATTTGAGGTTGTTTCATGACACCGTCTATGTGGCCACGAGCCATT
TGGATGTAACCAATCGCTCGTCCGA

QA 1 805 1 805
DS 

RD RS1EK61TF 767 0 0
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TTAAAGCTGGAGTTTCCTTTTCGGCTTGTGCAAAAAAGTGTTTGGCTTTGTGTGCTACTT
CAGCTTCAAGAACAGCCTCCAGCATTAAATCAGATCCTTTTGCACTCTCT***TTGCGAT
GAGGGAGCAACTTTGCCATCTCTGCAGAAACTGGAAGAACAGGTGAATCACTAGTTATAG
TGTGAGTTTTGGCACTGACAGACTCAGATAAACGTTCAAACGCTGTTGCTTGGGCGTGCA
GATTAACTGAAGCTGATGACGAACCACTAAACTCTCGAGCCTTTGTCCAATGATCTGCAA
CCTTGTGTCTTTCCTCAACACTGGGAGATGTAACAGTCCCATTGGTGGTTGTATTAGAAG
ATTCTGGAGAATGGCTGTCCACTCTTCGAGTCAAAGGATTGGAGTTAAAGAGAGAGAAAC
TTGCGCCATGGCTAATAGCATCAACTTGTGCTCGCAAATCTTGAACTTCTTTCGAAATCT
GCTGCATTTGAGGTTGTTTCATGACACCGTCTATGTGGCCACGAGCCATTTGGATGTAAC
CAATCGCTCGTCCGAACAATCTTCCTCCTGCTCTTGCGATTATCGGAAGATCCTTTGGCC
CTACAACAGCAGCTGTTGCGCCGATGATGACTAAAATCTCACCGTAAGAGAGTCCCAGCA
TCGTTCCTTTTTTCCGGCGTCTGATCCTCGGTTTCTCCTCTGTTCC
C

QA 1 766 1 766
DS 

RD RS1AT92TF 682 0 0
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CTTTGCGATGAGGGAGCAACTTTGCCATCTCTGCAGAAACTGGAAGAACAGGTGAATCAC
TAGTTATAGTGTGAGTTTTGGCACTGACAGACTCAGATAAACGTTCAAACGCTGTTGCTT
GGGCGTGCAGATTAACTGAAGCTGATGACGAACCACTAAACTCT*GAGCCTTTGTCCAAT
GATCTGCAACCTTGTGTCTTTCCTCAACACTGGGAGATGTAACAGTCCCATTGGTGGTTG
TATTAGAAGATTCTGGAGAATGGCTGTCCACTCTTCGAGTCAAAGGATTGGAGTTAAAGG
GAGAGAAACTTGCGCCATGGCTAATAGCATCAACTTGTGCTCGCAAATCTTGAACTTCTT
TCGAAATCTGCTGCATTTGAGGTTGTTTCATGACACCGTCTATGTGGCCACGAGCCATTT
GGATGTAACCAATCGCTCGTCCGAACAATCTTCCTCCTGCTCTTGCGATTATCGGAAGAT
CCTTTGGCCCTACAACAGCAGCTGTTGCGCCGATGATGACTAAAATCTCACCGTAAGAGA
GTCCCAGCATCGTTCCTTTTTTCCGGCGTCTGATCCTCGGTTTCTCCTCTGTTCCTCTCG
CCGTCTTCGGTGAAGGAGACCC

QA 1 682 1 682
DS 



AS 2 6

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AAAGGATCTTTTGAGCTCTCTGCTCTTTTCTTCTTTGAATTTTTGCTATTTGTTTTTGTT
TCAAATATCTTGTGCTTCTTGAGATATGGTTCGGATTGATATTAGCGGAACTCAGGTGCT
AGTTTACCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1AD23JQ C 1
AF RS1AD23TF U 1
BS 1 1 RS1AD23JQ
BS 2 307 RS1AD23TF
BS 308 309 RS1AD23JQ

RD RS1AD23JQ 309 0 0
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TGGAAGAGAAGCAGCTCTTTCAGAATGTTCAGATGAGCGTTAACTTCCTTGTCTCGCTCT
TGAAGAAGAATTGGCAAAACGTGAGGTGTTTGTACTTGAAGAGCACCATGGGTCCCCCAC
AAAGGATCTTTTGAGCTCTCTGCTCTTTTCTTCTTTGAATTTTTGCTATTTGTTTTTGTT
TCAAATATCTTGTGCTTCTTGAGATATGGTTCGGATTGATATTAGCGGAACTCAGGTGCT
AGTTTACCC

QA 1 309 1 309
DS 

RD RS1AD23TF 309 0 0
G
AGTAAAGTTCCAGTTGAAGAAGGTTCTGTGTATGGGTGTTGCTGTTGGTAACCTTTCCAT
GGAAGAGAAGCAGCTCTTTCAGAATGTTCAGATGAGCGTTAACTTCCTTGTCTCGCTCTT
GAAGAAGAATTGGCAAAACGTGAGGTGTTTGTACTTGAAGAGCACCATGGGTCCACCACA
AAGGATCTTTTGAGCTCTCTGCTCTTTTCTTCTTTGAATTTTTGCTATTTGTTTTTGTTT
CAAATATCTTGTGCTTCTTGAGATATGGTTCGGATTGATATTAGCGGAACTCAGGTGCTA
GTTTAC
CC

QA 2 307 2 307
DS 



CO CL611Contig2 908 4 21 U
GATAGTAAAGCTTTCCTCTGCTTCACCTTTCAGGTTCAGAGATTCGTCAACTGAGAGAAA
CTCAAGATGAGTAAGCTTCAGAGCGAGGCTCTTAGAGAAGCCATCACGACCATCAAGGGC
AAATCTGAGGAGAAGAAGCGTAACTTTACGGAGACGGTTGAGCTTCAGATTGGTCTGAAG
AACTATGACCCGCAAAAGGACAAGCGTTTCAGTGGATCCGTCAAGCTCCCGCACATCCCT
CGCCCTAAGATGAAAGTCTGCATGCTTGGAGATGCTCAGCATGTTGAGGAGGCTGAGAAG
ATGGGACTAGACTCTATGGATGTTGAGGCTTTGAAAAAGCTCAACAAGAACAAGAAGCTT
GTTAAGAAGCTTGCCAAGAAGTACCATGCTTTCTTGGCTTCTGAGTCCGTCATCAAGCAG
ATTCCCCGTCTTCTTGGTCCTGGTCTTAACAAAGCAGGAAAGTTCCCAACACTGGTGAGT
CACCAAGAGTCGTTGGAAGGGAAGGTGAACGAGACCAAAGCGACAGTCAAGTTCCAGTTG
AAGAAGGTTCTGTGTATGGGTGTTGCTGTCGGTAACCTTTCCATGGAAGAGAAGCAGCTC
TTTCAGAATGTTCAGATGAGCATCAACTTCCTTGTCTCGCTCTTGAAGAAGAATTGGCAA
AACGTGAGGTGTTTGTACTTGAAGAGCACCATGGGACCACCACAGAGAATCTTTTGAGTT
CTCGACTCCTGTCATCTTGGAACTTTTGCTTTGTGGTTTTTGTTTGCTTCAGAGATCTTG
AGTTATGGTTTTGTTTGATATTAGCAGAACTGAGGTGTTAGTTTGCTTTTTGTTAAGACA
TTATAATATGCAATGTTGGATTCTACAATATCGACTCTCCGATTCAGTTTTATCTTATCT
ATTCCGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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G

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C

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BQ
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GT***TCCAGTGGAAGATGCCGGAGGAGTTGTGGTAGTTGCCGGCGAGGTCAAAGGTGTA
GTGGTGCCATTGCTGGCTTTGCATAGCGAGATGTCAGCTTTGGCGCCACAAGCTTTAGGG
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ACGGAGCAAAGACACGTCGCGTCTTTCGCCACGATCTCATTCAACGGCAGGCAACACGAC
GCAGGAGGTGGAGGAGTCACCGAGTGGAGATAAGGCTGACATGGCATCAGTTTCTGTATA
CACGGCATTGAGTGAGCATCTCCTTTTCCTCCACCTCCACCTGTTGTCGGTGTAGGTTCA
GCGTTAGACGAAGAAACAGAGAAAA
CCA

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GTTGAATACGGAGCAAAGACACGTCGCGTCGTTCGCCACGATCTCATTCAATGGTAGGCA
ACACGACGCAGGAGGTGGAGGAGTCACCGAGTGAAGATAAGGCTGACATGGCATCAGTTT
CTGTATACACGGCATTGAGTGAGCATCTCCTTTTCCTCCAGCTCCACCTGTTGTCGGTGT
AGGTTCAGCGTTAGACGAA

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TTTGTTGGTTTGGCCGTTGAAAAAGCTCCGGTGCTTCCAGTGGAAGATGCCGGAGGAGTT
GTGGTAGTTGCTGGCGATGCCGAAGGTGTAGTGGTGCCATTGCCGGCTTTGCATAGCGAG
ATGTCAGCTTTGGCGCCACAAGCTTTAGGGAGAACGAGAGCGTTTTCTTTAGTGAGGTTA
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ACGATCTCATTCAATGGTAGGCAACACGACGCAGGAGGTGGAGGAGTCACCGAGTGAAGA
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CCAGCTCCACCTGTTGTCGGTGTAGGTTCAGCGTTAGACGAAGAAATAGCGAAAAACACA
AAAACGACGGCGACGGCGAATCTAACGGCC

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TACAGAACAATGAATAAAAAGACATGATGCAATATAGTAGTAGATCAGAAGAAGATTGTA
GCCAAGGCCACAAAAGCTGATGCGAAGCTAGCTCCGGCGAAGTTGATGGCCGGAGCCGAG
TTTGTTGGTTTGGCCGTTGAAAAAGCTCCGGTGCTTCCAGTGGAAGATGCCGGAGGAGTT
GTGGTAGTTGCTGGCGATGTCGAAGGTGTAGTGGTGCCATTGCCGGCTTTGCATAGCGAG
ATGTCAGCTTTGGCGCCACAAGCTTTAGGGAGAACGAGAGCGTTTTCTCTAGTGAGGTTA
AGCGATCTGAGCATGTCGACATTGTTGAATACGGAGCAAAGACACGTCGCGTCGTTCGCC
ACGATCTCATTCAATGGTAGGCAACACGACGCAGGAGGTGGAGGAGTCACCGAGTGAAGA
TAAGGCTGACATGGCATCAGTTTCTGTATACACGGCATTGAGTGAGCATCTCCTTTTCCT
CCAGCTCCACCTGTTGTCGGTGGAGGTTCAGCGTTAGACGAAGAAACAGCGAAAAACACA
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AAAACAAACGGTTTTGTTGT

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TTTTTCGGA
AAATTATTATTATTAGAAATTTCAAGTGCATATTAATAATAAATAACCAAACAATTTTCA
AG****TGCAAAC*TACAGAACAATGAATAAAAAGACATGATGCAATATAGTAGTAGATC
AGAAGAAGATTGTAGCCAAGGCCACAAAAGCTGATGCGAAGCTAGCTCCGGCGAAGTTGA
TGGCCGGAGCCGAGTTTGTTGGTTTGGCCGTTGAAGAAGCTCCGGTGCTTCCAGTGGAAG
ATGCCGGAGGAGTTGTGGTAGTTGCTGGCGATGTCGAAGGTGTAGTGGTGCCATTGCCGG
CTTTGCATAGCGAGATGTCAGCTTTGGCGCCACAAGCTTTAGGGAGAACGAGAGCGTTTT
CTCTAGTGAGGTTAAGCGATCTGAGCATGTCGACATTGTTGAATACGGAGCAAAGACACG
TCGCGTCGTTCGCCACGATCTCATTCAATGGTAGGCAACACGACGCAGGAGGTGGAGGAG
TCACCGAGTGAAGATAAGGCTGACATGGCATCAGTTTCTGTATACACGGCATTGAGTGAG
CATCTCCTTTTCCTCCAGCTCCACCTGTTGTCGGTGGAGGTTCAGCGTTAGACGAAGAAA
CAGCGAAAAACACAAAAACGACGGCGACGGCGAATCTAACGGCCTCCATTTTCAAAAACA
AAGAGTTAATGTTTAAAACAAACGGTTTTGTTGTCTTCCTTTGAAAGTTGTGTGGATT
CCCCT

QA 10 727 10 727
DS 

RD RS1EI57TF 667 0 0
AAACAATTTTCAAG****TGCAAAC*TACAGAACAATGAATAAAAAGACATGATGCAATA
TAGTAGTAGACCAGAAGAAGATTGTAGCCAAGGCCACAAAAGCTGATGCGAAGCTAGCTC
CGGCGAAGTTGATGGCCGGAGCCGAGTTTGTTGGTTTGGCCGTTGAAGAAGCTCCGGTGC
TTCCAGTGGAAGATGCCGGAGGAGTTGTGGTAGTTGCTGGCGATGCCGAAGGTGTAGTGG
TGCCATTGCCGGCTTTGCATAGCGAGATGTCAGCTTTGGCGCCACAAGCTTTAGGGAGAA
CGAGAGCGTTTTCTTTAGTGAGGTTAAGCGATCTGAGCATGTCGACATTGTTGAATACGG
AGCAAAGACACGTCGCGTCGTTCGCCACGATCTCATTCAATGGTAGGCAACACGACGCAG
GAGGTGGAGGAGTCACCGAGTGAAGATAAGGCTGACATGGCATCAGTTTCTGTATACACG
GCATTGAGTGAGCATCTCCTTTTCCTCCAGCTCCACCTGTTGTCGGTGTAGGTTCAGCGT
TAGACGAAGAAATAGCGAAAAACACAAAAACGACGGCGACGGCGAATCTAACGGCCTCCA
TTTTCAAAAACAAAGAGTTAATGTTTAAAACAAACGGTTTTGTTGTCTTCCTTTGAAAGT
TGTGT
CC

QA 1 665 1 665
DS 

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TATTATT
AGAAATTTCAAGTGCATATTAATAATAAATAACCAAACAATTTTCAAG****TGCAAACC
TACAGAACAATGAATAAAAAGACATGATGCAATATAGTAGTAGATCAGAAGAAGATTGTA
GCCAAGGCCACAAAAGCTGATGCGAAGCTAGCTCCGGCGAAGTTGATGGCCGGAGCCGAG
TTTGTTGGTTTGGCCGTTGAAGAAGCTCCGGTGCTTCCAGTGGAAGATGCCGGAGGAGTT
GTGGTAGTTGCTGGCGATGTCGAAGGTGTAGTGGTGCCATTGCCGGCTTTGCATAGCGAG
ATGTCAGCTTTGGCGCCACAAGCTTTAGGGAGAACGAGAGCGTTTTCTTTAGTGAGGTTA
AGCGATCTGAGCATGTCGACATTGTTGAATACGGAGCAAAGACACGTCGCGTCGTTCGCC
ACGATCTCATTCAATGGTAGGCAACACGACGCAGGAGGTGGAGGAGTCACCGAGTGAAGA
TAAGGCTGACATGGCATCAGTTTCTGTATACACGGCATTGAGTGAGCATCTCCTTTTCCT
CCAGCTCCACCTGTTGTCGGTGTAGGTTCAGCGTTAGACGAAGAAACAGCGAAAAACACA
AAAACGACGGCGACGGCGAATCTAACGGCCTCCATTTTCAAAAACAAAAAGTTAATGTTT
AAAACAAACGGTTTTGTTGTCTTCCTTTGAAAGTTGTGT
CC

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DS 

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GCAAACATACAGAACAATGAATAAAAAGACATAATGCAATATAGTAGTAGATCAGAAGAA
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AGCCGAGTTTGTTGGTTTGGCAGTTGAAGAAGCTCCGGT***TCCAGTGGAAGATGCCGG
AGGAGTTGTGGTAGTTGCCGGCGAGGTCGAAGGTGTAGTGGTGCCATTGCTGGCTTTGCA
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GAGGTTAAGCGATCTGAGCATGTCGACATTGTTGAATACGGAGCAAAGACACGTCGCGTC
TTTCGCCACGATCTCATTCAACGGCAGGCAACACGACGCAGGAGGTGGAGGAGTCACCGA
GTGGAGATAAGGCTGACATGGCATCAGTTTCTGTATACACGGCATTGAGTGAGCATCTCC
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AATGTTTCAAAAAAACGGTTTTGTTGTCTTCCTTTGAAAGTTGTGTGGATTGCTCC

QA 1 656 1 656
DS 



AS 3 8

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ATGATGGGAACACTGCCACGCAAGAACCTGCGAGCTCTACCAGTAATCGCCACAAGAACA
TTTGCCGTCACTGAAGTGATGGAAACGCTTGTTGTCTCTCACGATCAACGTTCTACCAAT
GATTTTGGACATGATCTTGATGAAGTTGTGACAGTCATTACACACGCGGAGATTCTTGAT
GATTGTCAGAGACTTCCTAGGCGGGGTGCATATAATACCATAAGCAATCGCTAGCCTCTC
ACTGTGGTAGAGCAGCGCCTGTTGCTTAGCCTCCTCGTCAATGTCATGCAGAACACATTT
AGTGTCTGGAACATAAACCGCTCCTTTCTTCGCATCCAACTCCTTAGCTTCATCCTTGTA
CAAAGTCAGATTCCGAAACTCGAGAATCCTACTCCTACTAGCAAGCATACTCGTCTCCCT
GTATGACTTAGGTGGAGGGGTAGGAATCTTGTTCGTCACAGCCTTGGAAGGGTCAAGACC
AACCATCAACTCCTCCGCGTAATCCTCTAACTCAATATCTCCATGAATCTTACCATAGTT
CCTCATAGCTTCCCAGAACTCAGCCGTGGCTTCGAAAGAAGCCCGGATGTACTGCTCCGC
CTCGACGAGATGCCCGCATTC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B556JQ U 1
AF RS1B556TF C 1
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BS 1 186 RS1B556JQ
BS 187 801 RS1DQ26JQ

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ATGATG
C

QA 1 186 1 186
DS 

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CA

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ATGATGGGAACACTGCCACGCAAGAACCTGCGAGCTCTACCAGTAATCGCCACAAGAACA
TTTGCCGTCACTGAAGTGATGGAAACGCTTGTTGTCTCTCACGATCAACGTTCTACCAAT
GATTTTGGACATGATCTTGATGAAGTTGTGACAGTCATTACACACGCGGAGATTCTTGAT
GATTGTCAGAGACTTCCTAGGCGGGGTGCATATAATACCATAAGCAATCGCTAGCCTCTC
ACTGTGGTAGAGCAGCGCCTGTTGCTTAGCCTCCTCGTCAATGTCATGCAGAACACATTT
AGTGTCTGGAACATAAACCGCTCCTTTCTTCGCATCCAACTCCTTAGCTTCATCCTTGTA
CAAAGTCAGATTCCGAAACTCGAGAATCCTACTCCTACTAGCAAGCATACTCGTCTCCCT
GTATGACTTAGGTGGAGGGGTAGGAATCTTGTTCGTCACAGCCTTGGAAGGGTCAAGACC
AACCATCAACTCCTCCGCGTAATCCTCTAACTCAATATCTCCATGAATCTTACCATAGTT
CCTCATAGCTTCCCAGAACTCAGCCGTGGCTTCGAAAGAAGCCCGGATGTACTGCTCCGC
CTCGACGAGATGCCCGCATTC

QA 1 801 1 801
DS 



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ACAAAGTCAGATTCCGAAACTCAAAAATCCTGCTCCTACTAGCAAGCATACTCGTCTCCC
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TCCTCATAGCTTCCAGAACTCAGCCGTGGCTTCAAAAGGAAGCCCGCGGC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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ATGATGGGGAACACGCCACGCTAGAGCCAGGGAGCTCTACCAGTAATCGCCACAAGAACA
TTTGCCGTCACTGAAGTGATGGAAACGTTTGTTGTCTCTCACGATCAACGTTCTACCAAT
GATTTTGGACATGATCTTGATGAAGTTGTGACAGTCATTACACACGCGGAGATTCTTGAT
GATTGTCAGAGACTTCCTAGGCGGGGTGCATATAATACCATAAGCAATCGCTAGCCTCTC
GCTGTGGTAGAGCAGCGCCTGTTGCTTAGCCTCCTCATCAATGTCATGCAGAACACATTT
AGTGTCTGGAACATAAACCGCTCCTTTCTTCGCATCCAACTCCTTAGCTTCATCCTTGTA
CAAAGTCAGATTCCGAAACTCAAAAATCCTGCTCCTACTAGCAAGCATACTCGTCTCCCT
GTACGATTTAGGTGGAGGGGTAGGAATCTTGTTGGTCACAGCCTTGGAAGGGTCAAGACC
AACCATCAACTCCTCCGCGTAATCCTCTAACTCAATATCTCCATGAATCTTACCATAGTT
CCTCATAGCTTCCAGAACTCAGCCGTGGCTTC
A

QA 1 752 1 752
DS 



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ATGCCTGACAAAGACTGTTTCTCTCTCCTCTTCGAGTCCTGCGCCAATCTGAAGTCTCTC
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CTGAACAACGTGGTGATTGGTATGTTCGGGGAGTGCAGCAGCGTCACCGACGCCAAGAGA
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AGTGACAACGGGATGGGGGATGACGCGTTGCAGATGTTCGAGGAGATGACGACGAAGGTA
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GCTAGCGATGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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GGGATGAGACCTAACGAGGAGACGTTCGTTGCTGTCTTCTTGGCTTGTGCTGCTGTGGGT
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G
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GGATGACGCGTTGCAGATGTTCGAGGAGATGACGACGAAGGTAGGGATGAGACCTAACGA
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TTTGCATTTCGATTCGATGAAGAACGAGTTTGGGATTAGCCCCGGGACTGAGCATTACTT
GGGTGTTTTGGATGTTCTTGGGAAATGCGGGCATCTCGTCGAGGCGGAGCAGTACATCCG
**GGCTTCTTTTCGAAGCCACGGCTGAGTTCTGGGAAGCTATGAGGAACTATGGTAAGAT
TCATGGAGATATTGAGTTAGAGGATTACGCGGAGGAGTTGATGGTTGGTCTTGACCCTTC
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DS 



AS 1 8

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CCAAATCCGCTCTCGCTCGCCGCTACTAACGGGGTCTCGGTTGATTTCCCTTCCTTTAGC
TACTTAGATGTTTCAGTTCGCTAAGTTTTCAAAGTCCAAAGAGCGCAGACTAGCCACGGA
GCTTGGATACGGTTTCCCGATCGGAGATCCATGGATCACAGACGGTATCTCCCCATGGCC
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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 40 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 

AF RS1D952JQ U 1
AF RS1D952TF C 1
AF RS1CP93JQ U 175
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BS 277 287 RS1D952JQ
BS 288 288 RS1CP93JQ
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CCTGGCGAAAAAGAAGTGAACACTTTGGAACGAAGCTTCGTCTTTCTTTTTCTTCAAATC
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QA 1 402 1 402
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G
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QA 2 228 2 228
DS 

RD RS1GI48TF 228 0 0
G
AAATCCCAAATCCGCTCTCGCTCGCCGCTACTAACGGGGTCTCGGTTGATTTCCCTTCCT
TTAGCTACTTAGATGTTTCAGTTCGCTAAGTTTTCAAAGTCCAAAGAGCGCAGACTAGCC
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QA 2 228 2 228
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QA 1 228 1 228
DS 

RD RS1H548TF 228 0 0
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ATGGCCTTTCGCCTCTGAAAGCGTCCTTCCTTCTCAATGCCCGGGCAT

QA 1 228 1 228
DS 



AS 1 6

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GCTTACTGGAGGTAAACGGACATTAAAGATTCCTCCAGAACTCGCGTATGGTGATCGAGG
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TCTATAATGATAAATTGTTTAAGGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A060TF U 1
AF RS1FS72TF U 256
AF RS1D426TF U 59
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AF RS1A060TR C 79
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RD RS1A060TF 641 0 0
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TATTGGTTTTGGTGTCTGTATTGGTCTTGTTGATAACGTTTCAGCATTTGCCGAAACAAG
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GGCAGGTTGCAAAGGAGGCTCATGTCTCATTCCACCAGCTT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1FS72TF 521 0 0
G
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GTCTCTCCTTCTGGTCTTGCCTTCTGTGATAAGGTAGTTGGATATGGTCCTGCAGCTGTT
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TATACTCTATTTGTAATCAAGTGAATATTTTCTGGCTC
AC

QA 2 519 2 519
DS 

RD RS1D426TF 722 0 0
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TAAAGCTTGAGAGAGAGCTTTTTGCTTTTCTTTGTCTTTGCTGAGCCACCATCTTCTTTA
AAA*TATACTCTATTTGTAATCAAGTGAATATTTTCTGGCTCTTTTTC

QA 15 722 15 722
DS 

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ATGACCTCCTTTATTTTCTGTTGGCACTTGTTCTCCACCAAGTGAGCAAAGAAAAGGCAG
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GGTTTCTGATCACGAATTAAGTTTTGTTCAACCAGCTTCTTGTGGTAGAAGAGAAGCAAT
TATTGGTTTTGGTGTCTGTATTGGTCTTGTTGATAACGTTTCAGCATTTGCCGAAACAAG
TTCTTGTGAATTCTCTGTGTCTCCTTCTGGTCTTGCCTTCTGTGATAAGGTAGTTGGATA
TGGCCCTGCAGCTGTTAAAGGGCAGCTAATCAAGGCACATTATGTGGGGAAGTTGGAGAA
TGGGAAAGTCTTTGATAGTAGCTATAATCGGGGAAAACCTCTAACTTTCCGTATAGGTGT
TGGTGAGGTGATCAAAGGTTGGGACCAGGGAATCATTGGCTCTGATGGAGTTCCTGCTAT
GCTTACTGGAGGTAAACGGACATTAAAGATTCCTCCAGAACTCGCGTATGGTGATCGAGG
GGCAGGTTGCAAAGGAGGCTCATGTCTCATTCCACCAGCTTCGGTTCTTCTCTTTGACAT
TGAGTTCATAGGTAAAGCTTGAGAGAGAGCTTTTTGCTTTCCTTTGTCTTTGCTGAGCCA
CCATCTTCTTTAAAAATATACTCTATTTGTAATCAAGTGAATATTTTCTGGCTCTTTTTC
AAACTTGTTCGTTCATATAAATTTAC

QA 1 806 1 806
DS 

RD RS1A060TR 787 0 0
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CTTAACCAAAGCAGATGCCATTAACTTGAGAAGCAAACAAAAGGTTTCTGATCACGAATT
AAGTTTTGTTCAACCAGCTTCTTGTGGTAGAAGAGAAGCAATTATTGGTTTTGGTGTCTG
TATTGGTCTTGTTGATAACGTTTCAGCATTTGCCGAAACAAGTTCTTGTGAATTCTCTGT
GTCTCCTTCTGGTCTTGCCTTCTGTGATAAGGTAGTTGGATATGGCCCTGCAGCTGTTAA
AGGGCAGCTAATCAAGGCACATTATGTGGGGAAGTTGGAGAATGGGAAAGTCTTTGATAG
TAGCTATAATCGGGGAAAACCTCTAACTTTCCGTATAGGTGTTGGTGAGGTGATCAAAGG
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CTCATGTCTCATTCCACCAGCTTCGGTTCTTCTCTTTGACATTGAGTTCATAGGTAAAGC
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TACTCTATTTGTAATCAAGTGAATATTTTCTGGCTCTTTTTCAAACTTGTTCGTTCATAT
AAATTTACAAACACGTACAATCACAAATTGAGATGTTTAGGATCTATAATGATAAATTGT
TTAAGGG

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DS 

RD RS1A060JQ 582 0 0
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GTGGGGAAGTTGGAGAATGGGAAAGTCTTTGATAGTAGCTATAATCGGGGAAAACCTCTA
ACTTTCCGTATAGGTGTTGGTGAGGTGATCAAAGGTTGGGACCAGGGAATCATTGGCTCT
GATGGAGTTCCTGCTATGCTTACTGGAGGTAAACGGACATTAAAGATTCCTCCAGAACTC
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GTTCTTCTCTTTGACATTGAGTTCATAGGTAAAGCTTGAGAGAGAGCTTTTTGCTTTCCT
TTGTCTTTGCTGAGCCACCATCTTCTTTAAAAATATACTCTATTTGTAATCAAGTGAATA
TTTTCTGGCTCTTTTTCAAACTTGTTCGTTCATATAAATTTACAAACACGTACAATCACA
AATTGAGATGTTTAGGATCTATAATGATAAATTGTTTAAGGG

QA 1 582 1 582
DS 



AS 1 6

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AGGCACCAGCTGCCTGGTCTGTCTGTCTCGTCTTAAAACTTCAATTTTACAACTTTCTTT
TAAGTTCCACAGCATGCAAACTTCTGTGTGGCCTGCCCGGCACCAGCTGCCTGGTCTGTC
TGGCTTATCTTAATCGTCGCAGGCTCAGCCCTGGAGTCAGTGTCAAAAAGCCTCTGCTTG
ATGTCCCTCCCTATCGAGAAGAAAACTTCTTCCACGTTTAGGTTTGTCTTAGCACTTGTT
TCGAAGAACTTAATTCCGTACTCATCAGCAAGAGCCTGACCCTTTGCTGTAGGTACAGCC
CTCTTGCTTTCATCCATGTCAGCCTTGTTACCAACCAAGATCTTGTTAACATTATCAGAA
GCATGTTGTTCGATATTACGAATCCAGTTCCTAATGTTGTTGAAGGAAGACTCGTCTGTG
ACATCATAGACAAGCAAAATCCCCATTGCCCCACGGTAATAAGCAGTGGTGATAGTGCGG
AAGCGTTCTTGACCAGCAGTGTCCCAAATCTGGAGCTTGATACGTTTCCCATCAAGCTCA
ATCGTTATGATCTTAAAGTCAATGCCAATGGTGGTGATGAAGCTAGTGGTGAAGGATCCA
TCAGAGAAACGTAGAAGTAGGCAACTTTTACCCACACCACTGTCTCCAATCAGAAGAAGC
TTAATGAGATAATCATAATCGGCTCTAGCCCTAGCAGGTGGAGCAGCCATCGATTCGATT
CGATTCGATTCGATTCCGACGATGATGAAAGGGAAGAGAAGGAACCGAGATGTAGTCGGA
GAGACAGCGACGGTTATGCGGACGGCTAAAATGCGCCACTCCTCGATTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 0 25 25 10 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

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A
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G
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AG

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ATTCCC

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DS 



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BQ
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30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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GCCTAAAGCTTGTAATGTTGAAACTCCTCCTGCAAGTAGCTGCAATGTTAATTCGCATGC
AGGATTATCAAACATTTCAGGTTCAAGAGTTGGGTCGTCGTCTGATGGGAATTCTATCAA
GCTCTCATTCCCTCTTCTCGCCATCCTATCCACAGCTTCCTACATTATATGCTCAAAATA
CTGACCTTTTTCGTTAGAAACCACAAAGCTTTTGGCCTCTTTGATAGGCATATTCTTTAC
TAGTCTCTATTGAATATGAAGTGTAGTGTGG*****TGTTGCGTTATGTATTTTGTGCTT
TATAAAGCCCTACTTTCTGAGTGATATCGACA
GTGGCGGAGCCACGTTCAA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RS1D393TF 646 0 0
G
CTCAGAACACCACAAGAAAAACATGAAACATGGAATGTGTTCACTGCTGCTGCTTACAGT
TTCAGTGACAGTGATATGGTCCACAACGACGGTTTCTGCTCAATCTGACTGCACAAATGT
TCTTATAAGCATGGCGCTGTGTCTTGGCTACATCACTGGGAACTCTACTACTCCTTCCCA
GCAGTGTTGCAATCAGTTGGCTAATGCTGTCAGGTCGTCTCCTGAGTGTTTGTGTGAGGT
TCCCAAAGGTGGAGGTCCCCAGCTTGGGATCAATGTTAGTCAAACACAAGCTCTTGCTTT
GCCTAAAGCTTGTAATGTTGAAACTCCTCCTGCAAGTAGCTGCAATGTTAATTCGCATGC
AGGATTATCAAACATTTCAGGTTCAAGAGTTGGGTCGTCGTCTGATGGGAATTCTATCAA
GCTCTCATTCCCTCTTCTCGCCATCCTATCCACAGCTTCCTACATTATATGCTCAAAATA
CTGACCTTTTTCGTTAGAAACCACAAAGCTTTTGGCCTCTTTGATAGGCATATTCTTTAC
TAGTCTCTATTGAATATGAAGTGTAGTGTGGTGTGGTGTTGTGTTATGCATTTTGTGCTT
TATAAAGCCCTACTTTCTGAGTGATATCGACAAATAGTGTGTTGT

QA 2 646 2 646
DS 

RD RS1G256TF 647 0 0
GG
AAATTCTTTAAGAGATTCTCAGAACACCACAAGAAAAACATGAAACATGGAATGTGTTCA
CTGCTGCTGCTTACAGTTTCAGTGGCAGTGATATGGTCCACAACGACGGTTTCTGCTCAA
TCTGACTGCACAAATGTTCTTATATGCATGGCGCTGTGTCTTGGCTACATCACTGGGAAC
TCTACTACTCCTTCCCAGCAGTGTTGCAATCAGTTGGCTAATGCTGTCAGGTCGTCTCCT
GAGTGTTTGTGTGAGGTTCCCAAAGGTGGAGGTCCCCAGCTTGGGATCAATGTTAGTCAA
ACACAAGCTCTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTGAAACTCCTCCTGCAAGTAGCTGC
AATGTTAATTCGCATGCAGGATTATCAAACATTTCAGGTTCAAGAGTTGGGTCGTCGTCT
GATGGGAATTCTATCAAGCTCTCATTCCCTCTTCTCGCCATCCTATCCACAGCTTCCTAC
ATTATATGCTCAAAATACTGACCTTTTTCGTTAGAAACCACAAAGCTTTTGGCCTCTTTG
ATAGGCATATTCTTTACTAGTCTCTATTGAATATGAAGTGTAGTGTGGTGTGGTGTTGTG
TTATGTATTTTGTTCTTTATAAAGCCCTACTTTCTGAGTGATATC

QA 3 647 3 647
DS 

RD RS1D109TF 746 0 0
GGACG
AACCATTAAACTCAGCAGCTAATAAACAATTAAACAAATTCTTTAAGAGATTCTCAGAAC
ACCACAAGAAAAACATGAAACATGGAATGTGTTCACTGCTGCTGCTTACAGTTTCAGTGG
CAGTGATATGGTCCACAACGACGGTTTCTGCTCAATCTGACTGCACAAATGTTCTTATAA
GCATGGCGCTGTGTCTTGGCTACATCACTGGGAACTCTACTACTCCTTCCCAGCAGTGTT
GCAATCAGTTGGCTAATGCTGTCAGGTCGTCTCCTGAGTGTTTGTGTGAGGTTCCCAAAG
GTGGAGGTCCCCAGCTTGGGATCAATGTTAGTCAAACACAAGCTCTTGCTTTGCCTAAAG
CTTGTAATGTTGAAACTCCTCCTGCAAGTAGCTGCAATGTTAATTCGCATGCAGGATTAT
CAAACATTTCAGGTTCAAGAGTTGGGTCGTCGTCTGATGGGAATTCTATCAAGCTCTCAT
TCCCTCTTCTCGCCATCCTATCCACAGCTTCCTACATTATATGCTCAAAATACTGACCTT
TTTCGTTAGAAACCACAAAGCTTTTGGCCTCTTTGATAGGCATATTCTTTACTAGTCTCT
ATTGAATATGAAGTGTAGTGTGGTGTGGTGTTGTGTTATGTATTTTGTGCTTTATAAAGC
CCTACTTTCTGAGTGATATCGACAAATAGTGTGTTGTATCTACG*CCTTTAG*CAATAAA
CATTACTTTCTAGAAAAAAAA

QA 6 746 6 746
DS 

RD RS1FQ09JQ 739 0 0
GGACG
AACCATTAAACTCAGCAGCTAATAAACAATTAAACAAATTCTTTAAGAGATTCTCAGAAC
ACCACAAGAAAAACATGAAACATGGAATGTGTTCACTGCTGCTGCTTACAGTTTCAGTGG
CAGTGATATGGTCCACAACGACGGTTTCTGCTCAATCTGACTGCGCAAATGTTCTTATAA
GCATGGCGCTGTGTCTTGGCTACATCACTGGGAACTCTACTACTCCTTCCCAGCAGTGTT
GCAATCAGTTGGCTAATGCTGTCAGGTCGTCTCCTGAGTGTTTGTGTGAGGTTCCCAAAG
GTGGAGGTCCCCAGCTTGGGATCAATGTTAGTCAAACACAAGCTCTTGCTTTGCCTAAAG
CTTGTAATGTTGAAACTCCTCCTGCAAGTAGCTGCAATGTTAATTCGCATGCAGGATTAT
CAAACATTTCAGGTTCAAGAGTTGGGTCGTCGTTTGATGGGAATTCTATCAAGCTCTCAT
TCCCTCTTCTCGCCATCCTATCCACAGCTTCCTACATTATATGCTCAAAATACTGACCTT
TTTCGTTAGAAACCACAAAGCTTTTGGCCTCTTTTATAGGCATATTCTTTACTAGTCTCT
ATTGAATATGAAGTGTAGTGTGGTGTGGTGTTGTGTTATGTATTTTGTGCTTTATAAAGC
CCTACTTTCTGAGTGATATCGACAAATAGTGTGTTGTATCTACGGCCTTTAGGCAATAAA
CATTACTTTCTAG
G

QA 6 738 6 738
DS 

RD RS1D109JQ 708 0 0
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AATGTGTTCACTGCTGCTGCTTACAGTTTCAGTGGCAGTGATATGGTCCACAACGACGGT
TTCTGCTCAATCTGACTGCACAAATGTTCTTATAAGCATGGCGCTGTGTCTTGGCTACAT
CACTGGGAACTCTACTACTCCTTCCCAGCAGTGTTGCAATCAGTTGGCTAATGCTGTCAG
GTCGTCTCCTGAGTGTTTGTGTGAGGTTCCCAAAGGTGGAGGTCCCCAGCTTGGGATCAA
TGTTAGTCAAACACAAGCTCTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTGAAACTCCTCCTGC
AAGTAGCTGCAATGTTAATTCGCATGCAGGATTATCAAACATTTCAGGTTCAAGAGTTGG
GTCGTCGTTTGATGGGAATTCTATCAAGCTCTCATTCCCTCTTCTCGCCATCCTATCCAC
AGCTTCCTACATTATATGCTCAAAATACTGACCTTTTTCGTTAGAAACCACAAAGCTTTT
GGCCTCTTTGATAGGCATATTCTTTACTAGTCTCTATTGAATATGAAGTGTAGTGTGGTG
TGGTGTTGTGTTATGTATTTTGTGCTTTATAAAGCCCTACTTTTTGAGTGATATCGACAA
ATAGTGTGTTGTATCTACGGCCTTTAGGCAATAAACATTACTTTCTAG

QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1FQ09TF 739 0 0
GGACG
AACCATTAAACTCAGCAGCTAATAAACAATTAAACAAATTCTTTAAGAGATTCTCAGAAC
ACCACAAGAAAAACATGAAACATGGAATGTGTTCACTGCTGCTGCTTACAGTTTCAGTGG
CAGTGATATGGTCCACAACGACGGTTTCTGCTCAATCTGACTGCGCAAATGTTCTTATAA
GCATGGCGCTGTGTCTTGGCTACATCACTGGGAACTCTACTACTCCTTCCCAGCAGTGTT
GCAATCAGTTGGCTAATGCTGTCAGGTCGTCTCCTGAGTGTTTGTGTGAGGTTCCCAAAG
GTGGAGGTCCCCAGCTTGGGATCAATGTTAGTCAAACACAAGCTCTTGCTTTGCCTAAAG
CTTGTAATGTTGAAACTCCTCCTGCAAGTAGCTGCAATGTTAATTCGCATGCAGGATTAT
CAAACATTTCAGGTTCAAGAGTTGGGTCGTCGTCTGATGGGAATTCTATCAAGCTCTCAT
TCCCTCTTCTCGCCATCCTATCCACAGCTTCCTACATTATATGCTCAAAATACTGACCTT
TTTCGTTAGAAACCACAAAGCTTTTGGCCTCTTTTATAGGCATATTCTTTACTAGTCTCT
ATTGAATATGAAGTGTAGTGTGGTGTGGTGTTGTGTTATGTATTTTGTGCTTTATAAAGC
CCTACTTTCTGAGTGATATCGACAAATAGTGTGTTGTATCTACG*CCTTTAG**CATAAA
CATTACTTTCTAG
G

QA 6 738 6 738
DS 



AS 2 7

CO CL618Contig1 1003 5 11 U
GGATCGCCTGTTCCTCCTCTTCCGGTTCCTGCATCAGCATATTCACCTCCAACTGGTATC
AAGAAAGACATGGGAAGCCAATCATACGAAGACGCCATCGAAGCTCTCAAGAAGCTTATC
ATTGAGAAGGATGACCTGAAGACGGTGGCTGCGGCCAAGGTGGAGAAGCTCACAGCGGAG
CTTAAGACAATCTCGTCATCGGACGGCAAAGCATTCGATCCTGTGGAACGAATTAAGCAA
GGCTTCGTCACCTTCAAGAAGGAGAAATACGATACGAATCCAGCTTTGTACGGTGAGCTT
GCCAAAGGTCAAAGCCCAAAGTACATGGTGCTTGCTTGTTCGGACTCGCGTGTGTGCCCA
TCACACTTGCTTAACTTCCATCCTGGAGATGCCTTCGTGGTTCGTAACATTGCAAATATG
GTTCCTCCTTATGACCAGGTCAAATATGCAGGAGTTGGAGCCGCCATTGAATATGCTGTC
TTGCACCTTAAGGTCGAGAACATTGTGATAATAGGTCACAGTGCATGTGGTGGCATCAAG
GGACTTATGTCATTTGCTCTTGACGGAAACAACTCCACTGATTTCATAGAGGATTGGGTA
AAAATCTGTTTGCCAGCAAAGTCAAAAGTTTTGGCAGAAGCTGAAAGTTCAGCATTTGAA
GACCAATGTGGCCGATGTGAAAGGGAGGCAGTGAATGTGTCACTAGCAAACCTATTAACA
TACCCATTTGTGAGGGAAGGAGTTGTCAAAGGAACACTTGCTTTGAAGGGAGGCTATTAT
GACTTTGCTAAGGGAGCTTTTGAGCTTTGGGAACTCCAGTTCGGCCTCTCTCCCGCTCAT
CCAGTTTGAGCCAATATATCATAATCATCTTCACCGTCTTCATCACCTTGTTCTCTACTC
TTGATCTCCCATCTAAATTAATGGCTACTCGAATAACTGCTTTTTTATTTGAGTTAAGCT
ACATTTTCTCAACTATCTATCCGACTTATAAAATGAATAAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AY42TF U 169
AF RS1D712TF U 1
AF RS1D932TF U 1
AF RS1D932JQ C 256
AF RS1D712JQ C 380
BS 1 110 RS1D712TF
BS 111 111 RS1D932TF
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BS 349 366 RS1D712TF
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BS 681 970 RS1D932JQ
BS 971 1003 RS1D712JQ

RD RS1AY42TF 326 0 0
CTCACAGCGGAGCTTAAGACAATCTCCTCATCGGACGGCAAAGCATTCGATCCTGTGGAA
CGAATTAAGCAAGGCTTCGTCACCTTCAAGAAGGAGAAATACGATACGAATCCAGCTTTG
TACGGTGAGCTTGCCAAAGGTCAAAGCCCAAAGTACATGGTGTTTGCTTGTTCGGACTCA
CGTGTGTGCCCATCACACGTGCTTAACTTCCATCCTGGAGATGCCTTCGTGGTTCGTAAC
ATTGCAAATATGGTTCCTCCTTATGACCAGGTCAAATATGCAGGAGTTGGAGCCGCCATT
GAATATGCTGTCTTGCACCTTAAGGT

QA 1 326 1 326
DS 

RD RS1D712TF 680 0 0
GGATCGCCTGTTCCTCCTCTTCCGGTTCCTGCATCAGCATATTCACCTCCAACTGGTATC
AAGAAAGACATGGGAAGCCAATCATACGAAGACGCCATCGAAGCTCTCAATAAGCTTATC
ATTGAGAAGGATGACCTGAAGACGGTGGCTGCGGCCAAGGTGGAGAAGCTCACAGCGGAG
CTTAAGACAATCTCGTCATCGGACGGCAAAGCATTCGATCCTGTGGAACGAATTAAGCAA
GGCTTCGTCACCTTCAAGAAGGAGAAATACGATACGAATCCAGCTTTGTACGGTGAGCTT
GCCAAAGGTCAAAGCCCAAAGTACATGGTGTTTGCTTGTTCGGACTCACGTGTGTGCCCA
TCACACGTGCTTAACTTCCATCCTGGAGATGCCTTCGTGGTTCGTAACATTGCAAATATG
GTTCCTCCTTATGACCAGGTCAAATATGCAGGAGTTGGAGCCGCCATTGAATATGCTGTC
TTGCACCTTAAGGTCGAGAACATTGTGATAATAGGTCACAGTGCATGTGGTGGCATCAAG
GGACTTATGTCATTTGCTCTTGACGGAAACAACTCCACTGATTTCATAGAGGATTGGGTA
AAAATCTGTTTGCCAGCAAAGTCAAAAGTTTTGGCAGAAGCTGAAAGTTCAGCATTTGAA
GACCAATGTGGCCGATGTGA

QA 1 680 1 680
DS 

RD RS1D932TF 679 0 0
GGATCGCCTGTTCCTCCTCTTCCGGTTCCTGCATCAGCATATTCACCTCCAACTGGTATC
AAGAAAGACATGGGAAGCCAATCATACGAAGACGCCATCGAAGCTCTCAAGAAGCTTATC
ATTGAGAAGGATGACCTGAAGACGGTGGCTGCGGCCAAGGTGGAGAAGCTCACAGCGGAG
CTTAAGACAATCTCGTCATCGGACGGCAAAGCATTCGATCCTGTGGAACGAATTAAGCAA
GGCTTCGTCACCTTCAAGAAGGAGAAATACGATACGAATCCAGCTTTGTACGGTGAGCTT
GCCAAAGGTCAAAGCCCAAAGTACATGGTGCTTGCTTGTTCGGACTCGCGTGTGTGCCCA
TCACACTTGCTTAACTTCCATCCTGGAGATGCCTTCGTGGTTCGTAACATTGCAAATATG
GTTCCTCCTTATGACCAGGTCAAATATGCAGGAGTTGGAGCCGCCATTGAATATGCTGTC
TTGCACCTTAAGGTCGAGAACATTGTGATAATAGGTCACAGTGCATGTGGTGGCATCGAG
GGACTTATGTCATTTGCTCTTGACGGAAACAACTCCACTGATTTCATTGAGGATTGGGTA
AAAATCTGTTTGCCAGCAAAGTCAAAAGTTTTGGCAGAAGCTGAAAGTTCAGCATTTGAG
GACCAATGTGGCCGATGTG

QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1D932JQ 715 0 0
AAGAAGGAGAAATACGATACGAATCCAGCTTTGTACGGTGAGCTTGCCAAAGGTCAAAGC
CCAAAGTACATGGTGCTTGCTTGTTCGGACTCGCGTGTGTGCCCATCACACTTGCTTAAC
TTCCATCCTGGAGATGCCTTCGTGGTTCGTAACATTGCAAATATGGTTCCTCCTTATGAC
CAGGTCAAATATGCAGGAGTTGGAGCCGCCATTGAATATGCTGTCTTGCACCTTAAGGTC
GAGAACATTGTGATAATAGGTCACAGTGCATGTGGTGGCATCGAGGGACTTATGTCATTT
GCTCTTGACGGAAACAACTCCACTGATTTCATTGAGGATTGGGTAAAAATCTGTTTGCCA
GCAAAGTCAAAAGTTTTGGCAGAAGCTGAAAGTTCAGCATTTGAGGACCAATGTGGCCGA
TGTGAAAGGGAGGCAGTGAATGTGTCACTAGCAAACCTATTAACATACCCATTTGTGAGG
GAAGGAGTTGTCAAAGGAACACTTGCTTTGAAGGGAGGCTATTATGACTTTGCTAAGGGA
GCTTTTGAGCTTTGGGAACTCCAGTTCGGCCTCTCTCCCGCTCATCCAGTTTGAGCCAAT
ATATCATAATCATCTTCACCGTCTTCATCACCTTGTTCTCTACTCTTGATCTCCCATCTA
AATTAATGGCTACTCGAATAACTGCTTTTTTATTTGAGTTAAGCTACATTTTCTC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1D712JQ 624 0 0
ATCCTGGAGATGCCTTCGTGGTTCGTAACATTGCAAATATGGTTCCTCCTTATGACCAGG
TCAAATATGCAGGAGTTGGAGCCGCCATTGAATATGCTGTCTTGCACCTTAAGGTCGAGA
ACATTGTGATAATAGGTCACAGTGCATGTGGTGGCATCAAGGGACTTATGTCATTTGCTC
TTGACGGAAACAACTCCACTGATTTCATAGAGGATTGGGTAAAAATCTGTTTGCCAGCAA
AGTCAAAAGTTTTGGCAGAAGCTGAAAGTTCAGCATTTGAAGACCAATGTGGCCGATGTG
AAAGGGAGGCAGTGAATGTGTCACTAGCAAACCTATTAACATACCCATTTGTGAGGGAAG
GAGTTGTCAAAGGAACACTTGCTTTGAAGGGAGGCTATTATGACTTTGTTAAGGGAGCTT
TTGAGCTTTGGGAACTCCAGTTCGGCCTCTCTCCCGCTCATCCAGTTTGAGCCAATATAT
CATAATCATCTTCACCGTCTTCATCACCTTGTTCTCTACTCTTGATCTCCCATCTAAATT
AATGGCTACTCGAATAACTGCTTTTTTATTTGAGTTAAGCTACATTTTCTCAACTATCTA
TCCGACTTATAAAATGAATAAAAA

QA 1 624 1 624
DS 



CO CL618Contig2 758 2 2 U
GCCCGCTCATCCAGTTTGAGCCAATATATATCATAATCATCTTCACCGTCTTCATCACCT
TGCTCTCTACTCTTGATCTCCCATATCTAAATTAATGGCTACTCGAATAACTGCTTTTTT
ATTTAAGCTAAGCTTCATTTTCTCAACTATCTATCCGACTTATAAAATGAATAAAAATAA
ATTCTGAATTCTATATATAAGAATTTAATTATATGCTTATTTGGGTTTGTTCTTTATTTA
GTTGGTTTCGATTTATAACATGGTGAAATGTCAAAATCATAGAATATTTAAAATGACATA
ATAAAATGTTCATTAAATGAAAAGAATAATTTATTTAGAGGTTTAAAAATGAAATCTGTT
TTTATTTTCATTGAATTTTGCGTATTTTTTTCTACAAAATCACGAATTAAAATCGTCAAA
CTGTTGTCTAGGATGGAGATGTGGCTGCAATATTAATAACATTAACCAAGATCGATCTGG
TCAAATTTGGGAACTTCAGCTTGTGATTTCAATTATACATAACCAACGTGTCCCCTTGTA
GATCATCAAACCCCCTACTTCGAATGACTCCATGCTTCATATACAAAATGTAACAGTATC
ATGCATTATTTAAATGACTGTATAATTTAAAAGCAATGAAGGGTGGGGAGTCCGGGTTCA
AACCCCACCGGCCACACGGATATGAGTTATTGCTTTCGACTCATTTGAATGTCCAGGAGA
GAGTCTATCCGTGGACTGTACCTCCACTCGGGAATTAG


BQ
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AF RS1DV61TF U 1
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TGCTCTCTACTCTTGATCTCCCATATCTAAATTAATGGCTACTCGAATAACTGCTTTTTT
ATTTAAGCTAAGCTTCATTTTCTCAACTATCTATCCGACTTATAAAATGAATAAAAATAA
ATTCTGAATTCTATATATAAGAATTTAATTATATGCTTATTTGGGTTTGTTCTTTATTTA
GTTGGTTTCGATTTATAACATGGTGAAATGTCAAAATCATAGAATATTTAAAATGACATA
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TTTATTTTCATTGAATTTTGCGTATTTTTTTCTACAAAATCACGAATTAAAATCGTCAAA
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TCAAATTTGGGAACTTCAGCTTGTGATTTCAATTATACATAACCAACGTGTCCCCTTGTA
GATCATCAAACCCCCTACT

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DS 

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GAATTCTATATATAAGAATTTAATTATATGCTTATTTGGGTTTGTTCTTTATTTAGTTGG
TTTCGATTTATAACATGGTGAAATGTCAAAATCATAGAATATTTAAAATGACATAATAAA
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TTTCATTGAATTTTGCGTATTTTTTTCTACAAAATCACGAATTAAAATCGTCAAACTGTT
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TCAAACCCCCTACTTCGAATGACTCCATGCTTCATATACAAAATGTAACAGTATCATGCA
TTATTTAAATGACTGTATAATTTAAAAGCAATGAAGGGTGGGGAGTCCGGGTTCAAACCC
CACCGGCCACACGGATATGAGTTATTGCTTTCGACTCATTTGAATGTCCAGGAGAGAGTC
TATCCGTGGACTGTACCTCCACTCGGGAATTAG

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 6

CO CL619Contig1 1122 6 20 U
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TCTCTTCTCTTCTCGTGGGCGCAAACAACGAATCAAGATCGGAAATGGCGATGAGGTG**
TATACAGCGAGATCAAAGGGAAGAAGGTGAAGGAGCTTCCTTCCTACATCAAATCGTCGT
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ACATCCAGACCAGCCCCGTCCAACCTCTCCTCCACATCTGCTTCGGAGGCATGGCTTTCT
CTTACCTCGTCGCTCTCCCTAACGAGCGTCGCCATCTCGACCACCAGCAGCATGCCAAGG
AGCACGGTGGCCATTGATCTCCAGATGTTGGTTTCTGCGATGGTGTGACGGCTGAAGATT
GCATGTCTTTGTTATTTCTTATTTTCCTGAATCTCCTGGATTGATATTATTTATTGATCT
AAAGGAAAACCCTTTCTTTTTTTTTT*CTTTTCAAAACTGAAGCTTGATGATATTGATGA
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CTTGGCTTGTCCTCTGCCCATCTTCTGTTCTAATTGATAGGGAGTTAGTCATCTGAGCTT
GGGCCTAAGGTGGGCTTACTCTATGTAGAATTCATCTATTTGGAGAGCTAGTCTGTTAAA
ATGACTTAAGCCCAAGCCCGAACTTACTCATCTATTCTAAAAGTTACATTTAGTCGACAT
CACTTTTGGGAGTATTATCATAATTCATATATCTTCACGAGAAAGCCAAATCATCTTTTC
ACCTTTCTCATTCTACTATACATCACGATAGTTCCGTCGTTTATCAGCAGAGTCGAGACG
AATTTTCATTGTTGCCTTCTAGCATTAGTCATTTTCAAGCAAATTATACGTGATACCTCA
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GATATAGATAGAAGAAATAAATACTAATTAAATAGCATTTTC


BQ
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AF RS1GP10TF U 1
AF RS1AK74TF U 12
AF RS1H313TF U 43
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AF RS1E734JQ U 556
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AC

QA 1 587 1 587
DS 

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TCTCTTCTCTTCTCTTGGGCGCAAACAACGAATCAAGATCGGAAATGGCGATGAGGAGAG
TATACAGCGAGATCAAAGGGAAGAAGGTGAAGGAGCTTCCTTCCTACATCAAATCGTCGT
TTTCGACGCAGTCCGTGAAGACGTATGTGAAGAAAGGTCTCGATAACTACAACGACAAAT
ACATCCAGACCAGCTCCGTCCAACCTCTCCTCCACATCTGCTTCGGAGGCATGGCTTTCT
CTTACCTCGTCGCTCTCCCTAACGAGCGTCGCCATCTCGAGCACCACCAGCATGCCAAGG
AGCACGGTGGCCATTGATCTCCAGATGTTGGTTTCTGCGATGGTGTGACGGCTGAAGATT
GCATGTCTTTGTTATTTCTTATTTTCCTGAATCTCCTGGATTGATATTATTTATTGATCT
AAAGGAAAACCTTTTCTTTTTTTTT**CTTTTCAAAACTGAAGCTTGATGATATTGATGA
ATAATGAAACTGTTGTTTCTTTTATCGTAATATAAGCTGTGGATTC

QA 1 586 1 586
DS 

RD RS1AK74TF 578 0 0
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CTCGTGGGCGCAAACAACGAATCAAGATCGGAAATGGCGATGAGGTG**TATACAGCGAG
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GCTCTCCCTAACGAGCGTCGCCATCTCGACCACCAGCAGCATGCCAAGGAGCACGGTGGC
CATTGATCTCCAGATGTTGGTTTCTGCGATGGTGTGACGGCTGAAGATTGCATGTCTTTG
TTATTTCTTATTTTCCTGAATCTCCTGGATTGATATTATTTATTGATCTAAAGGAAAACC
CTTTCTTTTTTTTTT*CTTTTCAAAACTGAAGCTTGATGATATTGATGAATAATGAAACT
GTTGTTTCTTTTATCGTAATATAAGCTGTGGATTCA
AC

QA 1 576 1 576
DS 

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GG
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ATGGCGATGAGGAGAGTATACAGCGAGATCAAAGGGAAGAAGGTGAAGGAGCTTCCTTCC
TACATCAAATCGTCGTTTTCGACGCAGTCCGTGAAGACGTATGTGAAGAAAGGTCTCGAT
AACTACAACGACAAATACATCCAGACCAGCTCCGTCCAACCTCTCCTCCACATCTGCTTC
GGAGGCATGGCTTTCTCTTACCTCGTCGCTCTCCCTAACGAGCGTCGCCATCTCGAGCAC
CAGCAGCATGCCAAGGAGCACGGTGGCCATTGATCTCCAGATGTTGGTTTCTGCGATGGT
GTGACGGCTGAAGATTGCATGTCTTTGTTATTTCTTATTTTCCTGAATCTCCTGGATTGA
TATTATTTATTGATCTAAAGGAAAACCTTTTCTTTTTTTTTTTCTTTTCAAAACTGAAGC
TTGATGATATTGATGAATAATGAAACTGTTGTTTCTTTTATCGTAATATAAGCTGTGGAT
TCAGCATTT
G

QA 3 551 3 551
DS 

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C
AAACTGAAGCTTGATGATATTGATGAATAATGAAACTGTTGTTTCTTTTATCGTAATATA
AGCTGTGGATTCAGCATTTCGTTTTGTTCCTGTTTAAGTGTTTCGGTTTGATCTATTTGA
TACTTGGGAACACAAGCATGCATAATCTTGGCTTGTCCTCTGCCCATCTTCTGTTCTAAT
TGATAGGGAGTTAGTCATCTGAGCTTGGGCCTAAGGTGGGCTTACTCTATGTAGAATTCA
TCTATTTGGAGAGCTAGTCTGTTAAAATGACTTAAGCCCAAGCCCGAACTTACTCATCTA
TTCTAAAAGTTACATTTAGTCGACATCACTTTTGGGAGTATTATCATAATTCATATATCT
TCACGAGAAAGCCAAATCATCTTTTCACCTTTCTCATTCTACTATACATCACGATAGTTC
CGTCGTTTATCAGCAGAGTCGAGACGAATTTTCATTGTTGCCTTCTAGCATTAGTCATTT
TCAAGCAAATTATACGTGATACCTCAGTTCGGTTGTATAAGTATAATACATATAAACAAA
TGTGGGTAACTGGGTATAGTCGTATAGATATAGATAGAAGAAATAAATACTAATTAAATA
GCATTTTC

QA 2 609 2 609
DS 

RD RS1E734JQ 567 0 0
TTTCTTTTATCGTAATATAAGCTGTGGATTCAGCATTTCGTTTTGTTCCTGTTTAAGTGT
TTCGGTTTGATCTATTTGATACTTGGGAACACAAGCATGCATAATCTTGGCTTGTCCTCT
GCCCATCTTCTGTTCTAATTGATAGGGAGTTAGTCATCTGAGCTTGGGCCTAAGGTGGGC
TTACTCTATGTAGAATTCATCTATTTGGAGAGCTAGTCTGTTAAAATGACTTAAGCCCAA
GCCCGAACTTACTCATCTATTCTAAAAGTTACATTTAGTCGACATCACTTTTGGGAGTAT
TATCATAATTCATATATCTTCACGAGAAAGCCAAATCATCTTTTCACCTTTCTCATTCTA
CTATACATCACGATAGTTCCGTCGTTTATCAGCAGAGTCGAGACGAATTTTCATTGTTGC
CTTCTAGCATTAGTCATTTTCAAGCAAATTATACGTGATACCTCAGTTCGGTTGTATAAG
TATAATACATATAAACAAATGTGGGTAACTGGGTATAGTCGTATAGATATAGATAGAAGA
AATAAATACTAATTAAATAGCATTTTC

QA 1 567 1 567
DS 



AS 2 7

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GGAAGTGGAGTCGAGAGGATGGAGAAAGTGGTAGATCTCTTCGGAGTGGGAGAAGCCAAT
ACACAGAAGCTACTGGAAGGAGGCAACGATCTCAGCCAAATCCAAAAGGGACTGTTCATA
GGCTCAGTAGCTGAAGCAAACAACAAGGATTTGCTCAAAGCCTCCAACGTCACTCATGTC
TTAACCATAGCTGTCGCCCTCTCTCCTCCTTACCCTGACGACTTCGTCTATAAAGTCATC
GAAGTCGTGGACAGATCCGAGACAGATTTGACTGTGTATTTCGATGAGTGTTATGGATTC
ATCGACCAAGCTATTCAATCTGGAGGTGGTGTTTTGGTTCATTGCTTCATGGGGATCTCA
AGGAGTGTGACAATAGTTGTGGCTTATTTGATGAGAAAGCATGGTATGGGTTTCTCTAAA
GCTATGGAGCTCGTAAAGAGTAGACGTCCTCAAGCATTGCCTAACTTTGGTTTCGTTTCC
CAGCTTCAGCAATTTGAAAATTCCATCAAAGTACATGATGCGGATTCTTCTTCAGCTGAT
AAGAAGATAGTGTCATGAACTCCCAAGAGATTATGAAGAAGTCTCATGAGCCCC**ATAA
TGACCAAATAAAAACTCAATTGTTTCGTGATTTGAATGATTTTTCTTGTGAACGATTGAT
GGTGAGCTATTTGCCATGTCCATTTGCCGAGTGAAATAAATAAAAACGCAGATACTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 5 5 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 20 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RS1EM78JQ C 1
AF RS1EM78TF U 1
AF RS1BG21TF U 6
AF RS1AY69TF U 13
AF RS1AY69JQ C 223
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GCTATGGAGCTCGTAAAGAGTAGACGTCCTCAAGCATTGCCTAACTTTGGTTTT*TTTTT
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AAGAAGATAGTGTCATGAACTCCCAAGAGATTATGAAGAAGTCTCATGAGCCCCCCATGA
TGACCAAATAAAAACTCAATTGTTTCGTGATTTGAATGATTTTTCTTGTGAACGATTGAT
GGTGAGCTATTTGCCATGTCCATTTGCCGAGTGAAATAAATAAAAACGCAGATACTA
T

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1EM78TF 719 0 0
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ATAGTGTCATGAACTCCCAAGAGATTATGAAGAAGTCTCATGAGCCCCCCATGATGACCA
AATAAAAACTCAATTGTTTCGTGATTTGAATGATTTTTCTTGTGAACGATTGATGGTGAG
CTATTTGCCATGTCCATTTGCCGAGTGAAATAAATAAAA*CGCAGATACTA
TA

QA 7 717 7 717
DS 

RD RS1BG21TF 701 0 0
G
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AAGCTACTGGAAGGAGGCAACGATCTCAGCCAAATCCAACAGGGACTGTTCATAGGCTCA
GTAGCTGAAGCAAACAACAAGGATTTGCTCAAAGCCTCCAACGTCACTCATGTCTTAACC
ATAGCTGTCGCCCTCTCTCCTCCCTACCCTGACGACTTCGTCTATAAAGTCATCGAAGTC
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CAAGCTATTCAATCTGGAGGTGGTGTTTTGGTTCATTGCTTCATGGGGATCTCAAGGAGT
GTGACAATAGTTGTGGCTTATTTGATGAGAA*GTATGGTATGGGTTTCTCTAAAGCTATG
GAGCTCGTAAAGAGTAGACGTCCTCAAGCATTGCCTAACTTTGGTTTCGTTTCCCAGCTT
CAGCAATTTGAAAATTCCATCAAAGTACATGATGCGGATTCTTCTTCAGCTGATAAGAAG
ATAGTGTCATGAACTCCCAAGAGATTATGAAGAAGTCTCATGAGCCCC**ATAATGACCA
AATAAAAACTCAATTGTTTCGTGATTTGAATGATTTTTCTTGTGAACGATTGATGGTGAG
CTATTTGCCATGTCCATTTGCCGAGTGAAATAAATAAAAA

QA 2 701 2 701
DS 

RD RS1AY69TF 706 0 0
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CTGGAAGGAGGCAACGATCTCAGCCAAATCCAACAGGGACTGTTCATAGGCTCAGTAGTT
GAAGCAAACAACAAGGATTTGCTCAAAGCCTCCAACGTCACTCATGTCTTAACCATAGCT
GTCGCCCTCTCTCCTCCCTACCCTGACGACTTCGTCTATAAAGTCATCGAAGTCGTGGAC
AGATCCGAGACAGATTTGACTGTGTATTTCGATGAGTGTTATGGATTCATCGACCAAGCT
ATTCAATCTGGAGGTGGTGTTTTGGTTCATTGCTTCATGGGGATCTCAAGGAGTGTGACA
ATAGTTGTGGCTTATTTGATGAGAAAGCATGGTATGGGTTTCTCTAAAGCTATGGAGCTC
GTAAAGAGTAGACGTCCTCAAGCATTGCCTAACTTTGGTTTCGTTTCCCAGCTTCAGCAA
TTTGAAAATTCCATCAAAGTACATGATGCGGATTCTTCTTCAGCTGATAAGAAGATAGTG
TCATGAACTCCCAAGAGATTATGAAGAAGTCTCATGAGCCCC**ATAATGACCAAATAAA
AACTCAATTGTTTCGTGATTTGAATGATTTTTCTTGTGAACGATTGATGGTGAGCTATTT
GCCATGTCCATTTGCCGAGTGAAATAAATAAAA*CGCAGATACTAC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RS1AY69JQ 496 0 0
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TGCTTCATGGGGATCTCAAGGAGTGTGACAATAGTTGTGGCTTATTTGATGAGAAAGCAT
GGTATGGGTTTCTCTAAAGCTATGGAGCTCGTAAAGAGTAGACGTCCTCAAGCATTGCCT
AACTTTGGTTTCGTTTCCCAGCTTCAGCAATTTGAAAATTCCATCAAAGTACATGATGCG
GATTTTTCTTCAGCTGATAAGAAGATAGTGTCATGAACTCCCAAGAGATTATGAAGAAGT
CTCATGAGCCCC**ATAATGACCAAATAAAAACTCAATTGTTTCGTGATTTGAATGATTT
TTTTTGTGAACGATTGATGGTGAGCTATTTGCCATGTCCATTTGCCGAGTGAAATAAATA
AAAACGCAGATACTA
C

QA 1 495 1 495
DS 



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ACACAGAAGCTACTGGAAGGAGGCAACGATCTCAGCCAAATCCAACAGGGACTGTTCATA
GGCTCAGTAGCTGAAGCGAACAACAAGGATTTGCTCAAGGCCTCCAACGTCACTCATGTC
TTAACCATAGGTGTTGCCTTGTCCCCTCCGTACCCTGACGACTTCGTCTATAAAGTCATC
GAAGGTTTGGTGCCTCCTTCTTCATGTTCCCTCTTGTTACTTGAACTGTGTAAAGTTGTA
ACCTTTTTTTGTTTTCTTTGAGGGGGTTAAGTCGTGGACAGATCCGAGACAGATTTGACT
GTGTATTTCGATGAGTGTTATGGATTCATCGACCAAGCTATTCAATCTGGAGGTGGTGTT
TTGGTTCATTGCTTCATGGGGATCTCAAGGAGTGTGACTATAGTTGTGGCTTATTTGATG
AGAAAGCATGGTATGGGTTTCTCTAAAGCTATGGAGCTCGTTAAGAGTAGACGTCCCCAA
GCATTGCCTAACTTTGGTTTCGTTTCTCAGCTTCAGCAATTTGAAAATTCCATCAAAGCA
GTACATGATGCCGATTCTTCTTCAGCTGATAAGAAGATAGTGTCATGAACTCCCAAGAGA
TTATGAAGAAGTCTCACGAGCCCCCCATGATGACCAAATAAAAACTCAATTGTTTCGTGA
TTTGAATGATTTTTCTTGTGAACGATTGATGGTGAGCTATTTGCCATGTCCATTTGCCGA
GTGAAATAAATAAAAACGCAGATACTACATTCTCATCTGTTACTACAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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GAAGGTTTGGTGCCTCCTTCTTCATGTTCCCTCTTGTTACTTGAACTGTGTAAAGTTGTA
ACCTTTTTTTGTTTTCTTTGAGGGGGTTAAGTCGTGGACAGATCCGAGACAGATTTGACT
GTGTATTTCGATGAGTGTTATGGATTCATCGACCAAGCTATTCAATCTGGAGGTGGTGTT
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GCATTG

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DS 

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CTGAAGCGAACAACAAGGATTTGCTCAAGGCCTCCAACGTCACTCATGTCTTAACCATAG
GTGTTGCCTTGTCCCCTCCGTACCCTGACGACTTCGTCTATAAAGTCATCGAAGGTTTGG
TGCCTCCTTCTTCATGTTCCCTCTTGTTACTTGAACTGTGTAAAGTTGTAACCTTTTTTT
GTTTTCTTTGAGGGGGTTAAGTCGTGGACAGATCCGAGACAGATTTGACTGTGTATTTCG
ATGAGTGTTATGGATTCATCGACCAAGCTATTCAATCTGGAGGTGGTGTTTTGGTTCATT
GCTTCATGGGGATCTCAAGGAGTGTGACTATAGTTGTGGCTTATTTGATGAGAAAGCATG
GTATGGGTTTCTCTAAAGCTATGGAGCTCGTTAAGAGTAGACGTCCCCAAGCATTGCCTA
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CCGATTCTTCTTCAGCTGATAAGAAGATAGTGTCATGAACTCCCAAGAGATTATGAAGAA
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TTTTCTTGTGAACGATTGATGGTGAGCTATTTGCCATGTCCATTTGCCGAGTGAAATAAA
TAAAAACGCAGATACTACATTCTCATCTGTTACTACAAGC

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DS 



AS 1 7

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ACAGAGAGACGGTGAAGTAGAAAAGACTTATCGAGATATAGCTTCCAAGAATGTCGATGA
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CGAGATTCCCACAACGTGCCAATCCTCCTCGCGCAGCGAGATCGGTGAATCCGACGGCGA
GGATCCAAACACGCATCCATCGTCTGATCCAAGACCAAGGCATCATCCTCATGCCTGGAT
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CCGGTTACGCTCTCTCCGCTTCTCTTTTGGGTAAACCGGACTTCGGTTTGCTAACACCAC
CGGAGATGGCTGCGACGGCAAGGTCCGTCTGTGCTTCGGCTCCAAACATCCCCATTATTG
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ATATGCGTGGCAAACAGGTTATATCAGCAGAAGAACATGCTGCCAAGATAGCATCAGCAC
GAGACGCTATTGGAGATTCTGACTTCTTCCTTGTCGCGAGAACAGACGCACGTGCCACTT
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CATCGGCTCGAGCACTAGTGGATGCTCTCAAGACTCTTAAAGAAAACGGAACCACGAGAG
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GGTTTGAGCTCGAAGCTCGTTATTCGAACCTTAGGAACGCTCTTGGGACGACAACAAAAT
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TCTGAAGCTCTTCTGTTTTGCTAATTTTACAGACGATTTATTTGAGCAATTGTCTCATCA
ATAAGACAATAATGTAACTTTTGCAGTCGTATAAAAGTTCCTATTTCCTATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 35 5 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1H445TF U 39
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AGAATGTCGATGATGCTCACGGCGGTCAAAACCCCTTCCCTCTGCAACAACACCCTAAAC
CTGACAGCTTCACCGAGATTCCCACAACGTGCCAATCCTCCTCGCGCAGCGAGATCGGTG
AATCCGACGGCGAGGATCCAAACACGCATCCATCGTCTGATCCAAGACCAAGGCATCATC
CTCATGCCTGGATGCTACGACGCTTTATCCGCTGCCATCGTGCAGCAAACCGGATTCTCC
GCCGGTTTCATCTCCGGTTACGCTCTCTCCGCTTCTCTTTTGTGTAAACCGGACTTCGGT
TTGCTAACACCACCGGAGATGGCTGCGACGGCAAGGTCCGTCTGTGCTTCGGCTCCAAAC
ATCCCCATTATTGCAGATGCTGATACTGGTGGAGGTAATGCACTAAACGTTCAAAGAACT
GTGAAGGACTTGATCGCAGCTGGTGCTGCTGGTTGCTTCCTTGAGGATCAAGCATGGCCA
AAGAAATGCGGTCATATGCGTGGCAAACAGGTTATATCAGCAGAAGAACATGCTGCCAAG
ATAGCATCAGCACGAGACGCTATTGGAGATTCTGACTTCTTCCTTGTCGCGAGAACAGAC
GCACGTGCCACTTCTGCT

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DS 

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ACAGAGAGACGGTGAAGTAGAAAAGACTTATCGAGATATAGCTTCCAAGAATGTCGATGA
TGCTCACGGCGGTCAAAACCCCTTCCCTCTGCAACAACACCCTAAACCTGACAGCTTCAC
CGAGATTCCCACAACGTGCCAATCCTCCTCGCGCAGCGAGATCGGTGAATCCGACGGCGA
GGATCCAAACACGCATCCATCGTCTGATCCAAGACCAAGGCATCATCCTCATGCCTGGAT
GCTACGACGCTTTATCCGCTGCCATCGTGCAGCAAACCGGATTCTCCGCCGGTTTCATCT
CCGGTTACGCTCTCTCCGCTTCTCTTTTGGGTAAACCGGACTTCGGTTTGCTAACACCAC
CGGAGATGGCTGCGACGGCAAGGTCCGTCTGTGCTTCGGCTCCAAACATCCCCATTATTG
CAGATGCTGATACTGGTGGAGGTAATGCACTAAACGTTCAAAGAACTGTAAAGGACTTGA
TCGCAGCTGGTGCTGCTGGTTGCTTCCTTGAGGATCAAGCATGGCCAAAGAAATGCGGTC
ATATGCGTGGCAAACAGGTTATATCAGCAGAAGAACATGCTGCCAAGATAGCATCAGCAC
GAGACGCTATTGGAGATTCTGACTTCTTCCTTGTCGCGAGAACAGACGCACGTGCCACTT
CTGCTAAATCAGG*CTTGAAGACGCCATCGCTCGTGTCA*TCTCTACATGGAG*CTGGCG
CTGATGCTTCCTTTGTGG

QA 1 798 1 798
DS 

RD RS1AH81TF 797 0 0
GGA
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AGAATGTCGATGATGCTCACGGCGGTCAAAACCCCTTCCCTCTGCAACAACACCCTAAAC
CTGACAGCTTCACCGAGATTCCCACAACGTGCCAATCCTCCTCGCGCAGCGAGATCGGTG
AATCCGACGGCGAGGATCCAAACACGCATCCATCGTCTGATCCAAGACCAAGGCATCATC
CTCATGCCTGGATGCTACGACGCTTTATCCGCTGCCATCGTGCAACAAACCGGATTCTCC
GCCGGTTTCATCTCCGGTTACGCTCTCTCCGCTTCTCTTTTGGGTAAACCGGACTTCGGT
TTGCTAACACCACCGGAGATGGCTGCGACGGCAAGGTCCGTCTGTGCTTCGGCTCCAAAC
ATCCCCATTATTGCAGATGCTGATACTGGTGGAGGTAATGCACTAAACGTTCAAAGAACT
GTAAAGGACTTGATCGCAGCTGGTGCTGCTGGTTGCTTCCTTGAGGATCAAGCATGGCCA
AAGAAATGCGGTCATATGCGTGGCAAACAGGTTATATCAGCAGAAGAACATGCTGCCAAG
ATAGCATCAGCACTAGACGCTATTGGAGATTCTGACTTCTTCCTTGTCGCGAGAACAGAC
GCACGTGCCACTTCTGCTAGATCAGGGCTTGAAGACGCCATCGCTCGTGTCAATCTCTAC
ATGGAGGCTGGCGCTGATGCTTCCTTTGTGGAGGCGCCGAGAGACGATGATGAGCTCAAG
GAA
TAGCAACGCAC

QA 4 786 4 786
DS 

RD RS1EF47TF 652 0 0
G
AGCTTCACCGAGATTCCCACAACGTGCGAATCCTCCTCGCGCAGCGAGATCGGTGAATCC
GACGGCGAGGATCCAAACACGCATCCATCGTCTGATCCAAGACCAAGGCATCATCCTCAT
GCCTGGATGCTACGACGCTTTATCCGCTGCCATCGTGCAGCAAACCGGATTCTCCGCCGG
TTTCATCTCCGGTTACGCTCTCTCCGCTTCTCTTTTGGGTAAACCGGACTTCGGTTTGCT
AACACCACCGGAGATGGCTGCTACGGCGAGGTCCGTCTGTGCTTCGGCTCCAAACATCCC
CATTATTGCAGATGCCGATACTGGTGGAGGTAATGCACTAAACGTTCAAAGAACTGTAAA
GGACTTGATCGCAGCTGGTGCTGCTGGTTGCTTCCTTGAGGATCAAGCATGGCCAAAGAA
ATGCGGTCATATGCGTGGCAAACAGGTTATATCAGCAGAAGAACATGCTGCCAAGATAGC
ATCAGCACGAGACGCTATTGGAGATTCTGACTTCTTCCTTGTCGCGAGAACAGACGCACG
TGCCACTTCTGCTAAGTCAGGGCTTGAAGACGCCATTGCGCGTGTTAATCTCTACATGGA
GGCTGGAGCTGATGCTTCCTTTGTGGAGGCGCCGAGAGACGA
CTATGAGCT

QA 2 643 2 643
DS 

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GATGCTGATACTGGTGGAGGTAATGCACTAAACGTTCAAAGAACTGTAAAGGACTTGATC
GCAGCTGGTGCTGCTGGTTGCTTCCTTGAGGATCAAGCATGGCCAAAGAAATGCGGTCAT
ATGCGTGGCAAACAGGTTATATCAGCAGAAGAACATGCTGCCAAGATAGCATCAGCACTA
GACGCTATTGGAGATTCTGACTTCTTCCTTGTCGCGAGAACAGACGCACGTGCCACTTCT
GCTAGATCAGGGCTTGAAGACGCCATCGCTCGTGTCAATCTCTACATGGAGGCTGGCGCT
GATGCTTCCTTTGTGGAGGCGCCGAGAGACGATGATGAGCTCAAGGAAATAGGCAAACGC
ACAAAGGGTTTCAGAGTCTGCAACATGATCGAAGGCGGAGTCACGCCGTTGCACACGCCT
GAGGAGCTTAAAGAAATGGGGTTTCACTTGATTGTTCATCCCTTGACCGCACTCTACGCA
TCGGCTCGAGCACTAGTGGATGCTCTCAAGACTCTTAAAGAAAACGGAACCACGAGAGGT
CACTTGGAAAAGATGGCGACTTTTGAGGAGTTCAATAGTTTGGTGGATTTAGAGTCGTGG
TTTGAGCTCGAAGCTCGTTATTCGAACCTTAGTAACGCTCTTGGGACGACAACAAAATCT
TGAAGAGGCTGCTGCTGCGTACTAGAGAGCCATAAGGTTTTATCTTCTTTCAAATGTCTC
TGAAGCTCTTCTGTTTTGCTAATTTTACAGACGATTTATTTGAGCAATTGTCTCATCAAT
AAGACAATAATGTAACTTTTGCAGTCGTATAAAAGTTCCTATTTCCTATTT

QA 1 831 1 831
DS 

RD RS1DS04JQ 747 0 0
CTTGAGGATCAAGCATGGCCAAAGAAATGCGGTCATATGCGTGGCAAACAGGTTATATCA
GCAGAAGAACATGCTGCCAAGATAGCATCAGCACGAGACGCTATTGGAGATTCTGACTTC
TTCCTTGTCGCGAGAACAGACGCACGTGCCACTTCTGCTAAATCAGGGCTTGAAGACGCC
ATCGCTCGTGTCAATCTCTACATGGAGGCTGGCGCTGATGCTTCCTTTGTGGAGGCGCCG
AGAGACGATGATGAGCTCAAGGAAATAGGCAAACGCACAAAGGGTTTCAGAGTCTGCAAC
ATGATCGAAGGCGGAGTCACGCCGTTGCACACGCCTGAGGAGCTTAAAGAAATGGGGTTT
CACTTGATTGTTCATCCCTTGACCGCACTCTACGCATCGGCTCGAGCACTAGTGGATGCT
CTCAAGACTCTTAAAGAAAACGGAACCACGAGAGGTCACTTGGAAAAGATGGCGACTTTT
GAGGAGTTCAATAGTTTGGTGGATTTAGAGTCGTGGTTTGAGCTCGAAGCTCGTTATTCG
AACCTTAGGAACGCTCTTGGGACGACAACAAAATCTTGAAGAGGCTGCTGCTGCGTACTA
GAGAGCCATAAGGTTTTATCTTCTTTCAAATGTCTCTGAAGCTCTTCTGTTTTGCTAATT
TTACAGACGATTTATTTGAGCAATTGTCTCATCAATAAGACAATAATGTAACTTTTGCAG
TCGTATAAAAGTTCCTATTTCCTATT
T

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1H445JQB 413 0 0
CCTGAGGAGCTTAAAGAAATGGGGTTTCACTTGATTGTTCATCCCTTGACCGCACTTTAC
GCATCGGCTCGAGCACTAGTGGATGCTCTCAAGACTCTTAAAGAAAACGGAACCACGAGA
GGTCACTTGGAAAAGATGGCGACTTTTGAGGAGTTCAATAGTTTGGTGGATTTAGAGTCG
TGGTTTGAGCTCGAAGCTCGTTATTCGAACCTTAGGAACGCTCTTGGGACGACAACAAAA
TCTTGAAGAGGCTGCTGCTGCGTACTAGAGAGCCATAAGGTTTTATCTTCTTTCAAATGT
CTCTGAAGCTTTTCTGTTTTGCTAATTTTACAGACGATTTATTTGAGCAATTGTCTCATC
AATAAGACAATAATGTAACTTTTGCAGTCGTATAAAAGTTCCTATTTCCTATT

QA 1 413 1 413
DS 



AS 1 7

CO CL622Contig1 1294 7 17 U
GGAGGCAGTGTGCTCTCTCCCTCCCTCCCTTTGCACAAACAAAACCGGTTCTCGCTAAGA
GCCCCGACAATGGCTGTCTGCGCAACTCACAGCTCCGGTCTCATGATAGCATACGCGGCA
TCCAAGGACCTTACAATCCCGTCTCTTTTCTCATTTGCCAACCCAAGACCCAACAACTTG
AGCGTCGCACTCTGTCCCCCTCTTGTTCTCCTTGGGGGTAGAAGAGGCTCGAACAGATCC
TTGCCGGTAGTGGTCTCAGCCGTCGCAGCAGAGGCTGATGTAGACACGGAGGAAGACGCG
GAGCAGAATGAAGCCACCTCCACCGCCACAGCCGTCCTTGATCCGCCGAAGCCTAAGAAA
GGAAAAGCCGCTTTGCTTCTAAAGAGAGATAGAACAAGGTCTAAGAGGTTTCTGGAAATT
CAAAAGCTAAGGGAAACCAAAAAGGAGTACGACGTCAAGACTGCTGTATCCTTGCTCAAG
CAAACCGCTAACACAAGGTTTGTGGAGTCTGTTGAAGCCCATTTCCGTCTCAACATCGAT
CCAAAGTACAACGATCAGCAGCTCCGAGCAACGGTGAGCCTTCCTAAAGGAACAGGACAA
ACTGTTAAAGTGGCTGTTCTTGCACAAGGTGAGAAGGTCGATGAAGCAAAAAATGCAGGG
GCAGATATTGTGGGCAGTGATGATTTGATTGAACAGATAAAAGGAGGGTTCATGGAGTTC
GATAAGTTAATTGCATCCCCGGATATGATGGTCAAGGTTGCTGGCCTTGGAAAGATTCTT
GGTCCTCGAGGACTCATGCCAAATCCCAAGGCTGGTACCGTCACAGCTAACATTCCACAG
GCTATAGAGGAGTTCAAGAAGGGAAAAGTAGAATTCAGAGCAGACAAAACTGGGATTGTT
CACATTCCCTTTGGGAAAGTTAATTTCACAGAGGAAGACCTGCTCGTAAACTTCCTAGCA
GCAGTGAAATCGGTGGAGACAAACAAGCCAAAGGGAGCAAAAGGAGTGTACTGGAAAAGC
GCACACATATGCTCGTCAATGGGGCCATCCATCAAGTTGAACATAAGGGAGATGATAGAC
TTCAAGCCATAAATAAATAAATAAACCCACATTTGAGTGAATGAGGAGGAGGAAGGTGTA
GTATGTTTTTGGGAGTGTAGGCGAACACCAAAGATGTAGTATGTTAGTTTATCTCTTCTT
TGTATAACCTCCTCACTGGTTGTATCACCTTTAACTCTGATATAGACCATTTGCTGTATT
GGATTATTACTGTTAAAATTTGCATTGCGAGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1GP47TF U 1
AF RS1AW56TF U 14
AF RS1ET50TF U 109
AF RS1G530TF U 284
AF RS1GP47JQ C 703
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AF RS1G530JQ C 500
BS 1 45 RS1GP47TF
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BS 47 447 RS1GP47TF
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BS 836 899 RS1ET50JQ
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BS 901 1294 RS1ET50JQ

RD RS1GP47TF 622 0 0
GGAGGCAGTGTGCTCTCTCCCTCCCTCCCTTTGCACAAACAAAACTGGTTCTCGCTAAGA
GCCCCGACAATGGCTGTCTGCGCAACTCACAGCTCCGGTCTCATGATAGCATACGCGGCA
TCCAAGGACCTTACAATCCCGTCTCTTTTCTCATTTGCCAACCCAAGACCCAACAACTTG
AGCGTCGCACTCTGTCCCCCTCTTGTTCTCCTTGGGGGTAGAAGAGGCTCGAACAGATCC
TTGCCGGTAGTGGTCTCAGCCGTCGCAGCAGAGGCTGATGTAGACACGGAGGAAGACGCG
GAGCAGAATGAAGCCACCTCCACCGCCACAGCCGTCCTTGATCCGCCGAAGCCTAAGAAA
GGAAAAGCCGCTTTGCTTCTAAAGAGAGATAGAACAAGGTCTAAGAGGTTTCTGGAAATT
CAAAAGCTAAGGGAAACCAAAAAGGAGCACGACGTAAAGACTGCTGTATCCTTGCTCAAG
CAAACCGCTAACACAAGGTTTGTGGAGTCTGTTGAAGCCCATTTCCGTCTCAACGTCGAT
CCAAAGTACAACGATCAGCAGCTCCGAGCAACGGTGAGCCTTCCTAAAGGAACAGGACAA
ACTGTTAAAGTGGCTGTTCTTG

QA 1 622 1 622
DS 

RD RS1AW56TF 635 0 0
GGGCTCT
CTCCCTCCCTTTGCACAAACAAAACCGGTTCTCGCTCAGAGCTCCGACAATGGCTGTCTG
CGCAACTCACAGCTCCGGTCTCATGATAGCATACGCGGCATCCAAGGACCTTACAATCCC
GTCTCTTTTCTCATTTGCCAACCCAAGACCCAACAACTTGAGCGTCGCACTCTGTCCCCC
TCTTGTTCTCCTTGGGGCTAGAAGAGGCTCGAACCGATCCTTCCCGGTAGTTGTATCAGC
CGTCGCAGCAGAGGCTGATGTAGACACGGAGGAGGACGCGGAGCAGAATGAAGCAACCTC
AACCGCCACAGCCGTCCTTGATCCGCCGAAGCCTAAGAAAGGAAAAGCCGCTTTGCTTCT
AAAGAGAGATAGAACAAGGTCTAAGAGGTTTCTGGAAATTCAAAAGCTAAGGGAAACCAA
AAAGGAGTACGACGTCAAGACTGCTGTATCCTTGCTCAAGCAAACCGCTAACACAAGGTT
TGTGGAGTCGGTTGAAGCCCATTTCCGTCTCAACATCGGTCCAAAGTACAACGATCAGCA
GCTCCGAGCAACGGTGAGCCTTCCTAAAGGAACAGGACAAACTGTTAAAGTGGCTGTTCT
TGCACAAGGTGAGAAGGTGGATGAAGCA

QA 8 635 8 635
DS 

RD RS1ET50TF 644 0 0
GCATACGCGGCATCCAAGGACCTTACAATCCCGTCTCTTTTCTCATTTGCCAACCCAAGA
CCCAACAACTTGAGCGTCGCACTCTGTCCCCCTCTTGTTCTCCTTGGGGGTAGAAGAGGC
TCGAACAGATCCTTGCCGGTAGTGGTCTCAGCCGTCGCAGCAGAGGCTGATGTAGACACG
GAGGAAGACGCGGATCAGAATGAAGCCACCTCCACCGCCACAGCCGTCCTTGATCCGCCG
AAGCCTAAGAAAGGAAAAGCCGCTTTGCTTCTAAAGAGAGATAGAACAAGGTCTAAGAGG
TTTCTGGAAATTCAAAAGCTAAGGGAAACCAAAAAGGAGTACGACGTCAAGACTGCTGTA
TCCTTGCTCAAGCAAACCGCTAACACAAGGTTTGTGGAGTCTGTTGAAGCCCATTTCCGT
CTCAACATCGATCCAAAGTACAACGATCAGCAGCTCCGAGCAACGGTGAGCCTTCCTAAA
GGAACAGGACAAACTGTTAAAGTGGCTGTTCTTGCACAAGGTGAGAAGGTCGATGAAGCA
AAAAATGCAGGGGCAGATATTGTGGGCAGTGATGATTTGATTGAACAGATAAAAGGAGGG
TTCATGGAGTTCGATAAGTTAATTGCATCCCCGGATATGATGGT

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1G530TF 552 0 0
GG
ACGGAGGAAGACGCGGAGCAGAATGAAGCCACCTCCACCGCCACAGCCGTCCTTGATCCG
CCGAAGCCTAAGAAAGGAAAAGCCGCTTTGCTTCTAAAGAGAGATAGAACAAGGTCTAAG
AGGTTTCTGGAAATTCAAAAGCTAAGGGAAACCAAAAAGGAGTACGACGTCAAGACTGCT
GTATCCTTGCTCAAGCAAACCGCTAACACAAGGTTTGTGGAGTCTGTTGAAGCCCATTTC
CGTCTCAACATCGATCCAAAGTACAACGATCAGCAGCTCCGAGCAACGGTGAGCCTTCCT
AAAGGAACAGGACAAACTGTTAAAGTGGCTGTTCTTGCACAAGTTGAGAAGGTCGATGAA
GCAAAAAATGCAGGGGCAGATATTGTGGGCAGTGATGATTTGATTGAACAGATAAAAGGA
GGGTTCATGGAGTTCGATAAGTTAATTGCATCCCCGGATATGATGGTCAAGGTTGCTGGC
CTTGGAAAGATTCTTGGTCCTCGAGGACTCATGCCAAATCCCAAGGCTGGTACCGTCACA
GCTAACATTC

QA 3 552 3 552
DS 

RD RS1GP47JQ 555 0 0
GGAGGGTTCATGGAGTTCGATAAGTTAATTGCATCCCCGGATATGATGGTCAAGGTTGCT
GGCCTTGGAAAGATTCTTGGTCCTCGAGGACTCATGCCAAATCCCAAGGCTGGTACCGTC
ACAGCTAACATTCCACAGGCTATAGAGGAGTTCAAGAAGGGAAAAGTAGAATTCAGAGCA
GACAAAACTGGGATTGTTCACATTCCCTTTGGGAAAGTTAATTTCACAGAGGAAGACCTG
CTCGTAAACTTCCTAGCAGCAGTGAAATCGGTGGAGACAAACGAGCCAAAGGGAGCAAAA
GGAGTGTACTGGAAAAGCGCACACATATGCTCGTCAATGGGGCCATCCATCAAGTTGAAC
ATAAGGGAGATGATAGACTTCAAGCCATAAATAAATAAATAAACCCACATTTGAGTGAAT
GAGGAGGAGGAAGGTGTAGTATGTTTTTGGGAGTGTAGGCGAACACCAAAGATGTAGTAT
GTTAGTTTATCTCTTCTTTGTATAACCTCCTCACTGGTTGTATCGCCTTTAACTCTGATA
TAGACCATTTGCTGT

QA 1 540 1 540
DS 

RD RS1ET50JQ 827 0 0
TATCC
TGCTCAAGCAA*CCGCTAACACAAGGTTTGTGGAGTCTGTTGAAGCCCATT*CCGTCTCA
ACATCGATCCAAAGTACAACGATCAGCAGCTCCGAGCAACGGTGAGCCTTCCTAAAGGAA
CAGGACAAACTGTTAAAGTGGCTGTTCTTGCACAAGGTGAGAAGGTCGATGAAGCAAAAA
ATGCAGGGGCAGATATTGTGGGCAGTGATGATTTGATTGAACAGATAAAAGGAGGGTTCA
TGGAGTTCGATAAGTTAATTGCATCCCCGGATATGATGGTCAAGGTTGCTGGCCTTGGAA
AGATTCTTGGTCCTCGAGGACTCATGCCAAATCCCAAGGCTGGTACCGTCACTGCTAACA
TTCCACAGGCTATAGAGGAGTTCAAGAAGGGAAAAGTAGAATTCAGAGCAGACAAAACTG
GGATTGTCCACATTCCCTTTGGGAAAGTTAATTTCACAGAGGAAGACCTGCTCGTAAACT
TCCTAGCAGCAGTGAAATCGGTGGAGACAAACAAGCCAAAGGGAGCAAAAGGAGTGTACT
GGAAAAGCGCACACATATGCTCGTCAATGGGGCCATCCATCAAGTTGAACATAAGGGAGA
TGATAGACTTCAAGCCATAAATAAATAAATAAACCCACATTTGAGTGAATGAGGAGGAGG
AAGGTGTAGTATGTTTTTGGGAGTGTAGGCGAACACCAAAGATGTAGTATGTTAGTTTAT
CTCTTCTTTGTATAACCTCCTCACTGGTTGTATCACCTTTAACTCTGATATAGACCATTT
GCTGTATTGGATTATTACTGTTAAAATTTGCATTGCGAGATC

QA 6 827 6 827
DS 

RD RS1G530JQ 792 0 0
TTGTGGAGTCTGT*GAAGCCCATT*CCGTCTCAACATCGATCCAAAGTACAACGATCAGC
AGCTCCGAGCAACGGTGAGCCTTCCTAAAGGAACAGGACAAACTGTTAAAGTGGCTGTTC
TTGCACAAGTTGAGAAGGTCGATGAAGCAAAAAATGCAGGGGCAGATATTGTGGGCAGTG
ATGATTTGATTGAACAGATAAAAGGAGGGTTCATGGAGTTCGATAAGTTAATTGCATCCC
CGGATATGATGGTCAAGGTTGCTGGCCTTGGAAAGATTCTTGGTCCTCGAGGACTCATGC
CAAATCCCAAGGCTGGTACCGTCACAGCTAACATTCCACAGGCTATAGAGGAGTTCAAGA
AGGGAAAAGTATAATTCAGAGCAGACAAAACTGGGATTGTTCACATTCCCTTTGGGAAAG
TTAATTTCACAGAGGAAGACCTGCTCGTAAACTTCCTAGCAGCAGTGAAATCGGTGGAGA
CAAACAAGCCAAAGGGAGCAAAAGGAGTGTACTGGAAAAGCGCACACATATGCTCGTCAA
TGGGGCCATCCATCAAGTTGAACATAAGGGAGATGATAGACTTCAAGCCATAAATAAATA
AATAAACCCACATTTGAGTGAATGAGGAGGAGGAAGGTGTAGTATGTTTTTGGGAGTGTA
GGCGAACACCAAAGATGTAGTATGTTAGTTTATCTCTTCTTTGTATAACCTCCTCACTGG
TTGTATCACCTTTAACTTTGATATAGACCATTTGCTGTATTGGATTATTACTGTTAAAAT
TTGCATTGCGAG

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 8

CO CL623Contig1 840 8 9 U
TGGACTCCTCTCTCACTTACTCATTGAAAGAAAGAAGAACGATCTTTGTACTCTTCTCTT
CGTTCTCTTACTTTCGATCGATCCTTGTGATGGCTGCCGTTAATGGGTACCAAGGGAATA
CTCCTGCCGCAGATCCTCCGGCGTCAAACGGATCAAAGCAATCCGCTCCTCCGAGTAAGA
CTGTCGACAGCCAATCTGTTCTCAAAAGGCTGCAATCTGAACTCATGGGCTTGATGATGG
GAGGTGACCCGGGAATATCTGCTTTCCCGGAGGAAGACAACATCTTCTGTTGGAAAGGGA
CGATAACAGGAAGCAAAGACACTGTGTTTGAAGGAACTGAGTATAGACTCTCCCTCTCTT
TCTCCAATGACTATCCTTTCAAACCTCCCAAGATCAAGTTCCAGACTACTTGCTTCCACC
CCAATGTTGATCTCCACGGCAATATCTGTTTGGACATTCTTCAGGATAAA*TGGTCATCT
GCATATGATGTGAGGACAATACTACTATCGATTCAGAGCCTTCTGGGAGAACCGAACATC
AGCTCACCATTGAACACTCAAGCAGCTCAGCTCTGGAGCAACCAAGAAGAGTATAGGAAG
ATGGTTGAGAAGCTCTACAAGCCTCCCAGTGCATGATTTCTTCTTCAACCTGCTCTGTTT
AATAAATCTCGCTTGCCGTTGATCATATATCACATTATATGTTTTTCCCGAAGAAAGAAT
ATGTCTTATTCATTTGCTTTCTTTGTTTATGATCTCATCATCAACAGATTTATCTGTAAC
CTTTGCCTTTGATTATCACATAACATGATTTTCCATAAGAAAGAGTGTGTGTTTTATTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 15 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BL16JQ C 454
AF RS1FI89TF U 1
AF RS1FU55TF U 2
AF RS1DR71TF U 7
AF RS1BL16TF U 86
AF RS1FU55JQ C 217
AF RS1DR71JQ C 155
AF RS1FI89JQ C 188
BS 1 707 RS1FI89TF
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BS 710 755 RS1FU55TF
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BS 764 766 RS1DR71TF
BS 767 830 RS1BL16TF
BS 831 840 RS1DR71JQ

RD RS1BL16JQ 124 0 0
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CAGAGCCTTCTGGGAGAACCGAACATCAGCTCACCATTGAACACTCAAGCAGCTCAGCTG
TGGA

QA 1 124 1 124
DS 

RD RS1FI89TF 707 0 0
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CGTTCTCTTACTTTCGATCGATCCTTGTGATGGCTGCCGTTAATGGGTACCAAGGGAATA
CTCCTGCCGCAGATCCTCCGGCGTCAAACGGATCAAAGCAATCCGCTCCTCCGAGTAAGA
CTGTCGACAGCCAATCTGTTCTCAAAAGGCTGCAATCTGAACTCATGGGCTTGATGATGG
GAGGTGACCCGGGAATATCTGCTTTCCCGGAGGAAGACAACATCTTCTGTTGGAAAGGGA
CGATAACAGGAAGCAAAGACACTGTGTTTGAAGGAACTGAGTATAGACTCTCCCTCTCTT
TCTCCAATGACTATCCTTTCAAACCTCCCAAGATCAAGTTCCAGACTACTTGCTTCCACC
CCAATGTTGATCTCCACGGCAATATCTGTTTGGACATTCTTCAGGATAAA*TGGTCATCT
GCATATGATGTGAGGACAATACTACTATCGATTCAGAGCCTTCTGGGAGAACCGAACATC
AGCTCACCATTGAACACTCAAGCAGCTCAGCTCTGGAGCAACCAAGAAGAGTATAGGAAG
ATGGTTGAGAAGCTCTACAAGCCTCCCAGTGCATGATTTCTTCTTCAACCTGCTCTGTTT
AATAAATCTCGCTTGCCGTTGATCATATATCACATTATATGTTTTTC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1FU55TF 762 0 0
GGACTC
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TTACTTTCGATCGATCCTTGTGATGGCTGCCGTTAATGGGTACCAAGGGAATACTCCTGC
CGCAGATCCTCCGGCGTCAAACGGATCAAAGCAATCCGCTCCTCCGAGTAAGACTGTCGA
CAGCCAATCTGTTCTCAAAAGGCTGCAATCTGAACTCATGGGCTTGATGATGGGAGGTGA
CCCGGGAATATCTGCTTTCCCGGAGGAAGACAACATCTTCTGTTGGAAAGGGACGATAAC
AGGAAGCAAAGACACTGTGTTTGAAGGAACTGAGTACAGACTCTCCCTCTCTTTCTCCAA
TGACTATCCTTTCAAACCTCCCAAGATCAAGTTCCAGACTACTTGCTTCCACCCCAATGT
TGATCTCCATGGCAATATCTGTTTGGACATTCTTCAGGATAAA*TGGTCATCTGCATATG
ATGTGAGGACAATACTACTATCGATTCAGAGCCTTCTGGGAGAACCGAACATCAGCTCAC
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AGAAGCTCTACAAGCCTCCCAGTGCATGATTTCTTCTTCA*CCTGCTCTGTTTAATAAAT
CTCGTTTGCCGTTGATCATATATCACATTATATGTTTTTCC*GAAGAAAGAATATGTCTT
ATTCATTTGCTTTCTTTGTTTATGATCTGATCATCA

QA 7 762 7 762
DS 

RD RS1DR71TF 764 0 0
G
CTCTCTCACTTACTCATTGAAAGAAAGAAGAACGATCTTTGTACTCTTCTCTTCGTTCTC
TTACTTTCGATCGATCCTTGTGATGGCTGCCGTTAATGGGTACCAAGGGAATACTCCTGC
CGCAGATCCTCCGGCGTCAAACGGATCAAAGCAATCCGCTCCTCCGAGTAAGACTGTCGA
CAGCCAATCTGTTCTCAAAAGGCTGCAATCTGAACTCATGGGCTTGATGATGGGAGGTGA
CCCGGGAATATCTGCTTTCCCGGAGGAAGACAACATCTTCTGTTGGAAAGGGACGATAAC
AGGAAGCAAAGACACTGTGTTTGAAGGAACTGAGTATAGACTCTCCCTCTCTTTCTCCAA
CGACTATCCTTTCAAACCTCCCAAGATCAAGTTCCAGACTACTTGCTTCCACCCCAATGT
TGATCTCCACGGCAATATCTGTTTGGACATTCTTCAGGATAAA*TGGTCATCTGCATATG
ATGTGAGGACAATACTACTATCGATTCAGAGCCTTCTGGGAGAACCGAACATCAGCTCAC
CATTGAACACTCAAGCAGCTCAGCTCTGGAGCAACCAAGAAGAGTATAGGAAGATGGTTG
AGAAGCTCTACAAGCCTCCCAGTGCATGATTTCTTCTTCCACCTGCTCTGTTTAATAAAT
CTCGCTTGCCGTTGATCATATATCACATTATATGTTTTTCCCGAAGAAAGAATATGTCTT
ATTCATTTGCTTTCTTTGTTTATGATCTCATCATCAACA
CTTT

QA 2 760 2 760
DS 

RD RS1BL16TF 747 0 0
TGTGATGGCTGCCGTTAATGGGTACCAAGGGAATACTCCTGCCGCAGATCCTCCGGCGTC
AAACGGATCAAAGCAATCCGCTCCTCCGAGTAAGACTGTCGACAGCCAATCTGTTCTCAA
AAGGCTGCAATCTGAACTCATGGGCTTGATGATGGGAGGTGACCCGGGAATATCTGCTTT
CCCGGAGGAAGACAACATCTTCTGTTGGAAAGGGACGATAACAGGAAGCAAAGACACTGT
GTTTGAAGGAACTGAGTACAGACTCTCCCTCTCTTTCTCCAATGACTATCCTTTCAAACC
TCCCAAGATCAAGTTCCAGACTACTTGCTTCCACCCCAATGTTGATCTCCATGGCAATAT
CTGTTTGTACATTCTTCAGGATAAA*TGGTCATCTGCATATGATGTGAGGACAATACTAC
TATCGATTCAGAGCCTTCTGGGAGAACCGAACATCAGCTCACCATTGAACACTCAAGCAG
CTCAGCTGTGGAGCAACCAAGAAGAGTATAGGAAGATGGTTGAGAAGCTCTACAAGCCTC
CCAGTGCATGATTTCTTCTTCAACCTGCTCTGTTTAATAAATCTCGTTTGCCGTTGATCA
TATATCACATTATATGTTTTTCCCGAAGAAAGAATATGTCTTATTCATTTGCTTTCTTTG
TTTATGATCTGATCATCAACAGATTTATCTGTAACCTTTGCCTTTGATTATCACATAACA
TGATTTTCCATAAGAAAGAGTGTGT
TT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1FU55JQ 598 0 0
CTGAACTCATGGGCTTGATGATGGGAGGTGACCCGGGAATATCTGCTTTCCCGGAGGAAG
ACAACATCTTCTGTTGGAAAGGGACGATAACAGGAAGCAAAGACACTGTGTTTGAAGGAA
CTGAGTACAGACTCTCCCTCTCTTTCTCCAATGACTATCCTTTCAAACCTCCCAAGATCA
AGTTCCAGACTACTTGCTTCCACCCCAATGTTGATCTCCATGGCAATATCTGTTTGGACA
TTCTTCAGGATAAA*TGGTCATCTGCATATGATGTGAGGACAATACTACTATCGATTCAG
AGCCTTCTGGGAGAACCGAACATCAGCTCACCATTGAACACTCAAGCAGCTCAGCTGTGG
AGCAACCAAGAAGAGTATAGGAAGATGGTTGAGAAGCTCTACAAGCCTCCCAGTGCATGA
TTTCTTCTTCAACCTGCTCTGTTTAATAAATCTCGTTTGCCGTTGATCATATATCACATT
ATATGTTTTTCCCGAAGAAAGAATATGTCTTATTCATTTGCTTTCTTTGTTTATGATCTG
ATCATCAACAGATTTATCTGTAACCTTTGCCTTTGATTATCACATAACATGATTTT
GC

QA 1 596 1 596
DS 

RD RS1DR71JQ 686 0 0
AAAGCAATCCGCTCCTCCGAGTAAGACTGTCGACAGCCAATCTGTTCTCAAAAGGCTGCA
ATCTGAACTCATGGGCTTGATGATGGGAGGTGACCCGGGAATATCTGCTTTCCCGGAGGA
AGACAACATCTTCTGTTGGAAAGGGACGATAACAGGAAGCAAAGACACTGTGTTTGAAGG
AACTGAGTATAGACTCTCCCTCTCTTTCTCCAACGACTATCCTTTCAAACCTCCCAAGAT
CAAGTTCCAGACTACTTGCTTCCACCCCAATGTTGATCTCCACGGCAATATCTGTTTGGA
CATTCTTCAGGATAAA*TGGTCATCTGCATATGATGTGAGGACAATACTACTATCGATTC
AGAGCCTTCTGGGAGAACCGAACATCAGCTCACCATTGAACACTCAAGCAGCTCAGCTCT
GGAGCAACCAAGAAGAGTATAGGAAGATGGTTGAGAAGCTCTACAAGCCTCCCAGTGCAT
GATTTCTTCTTCCACCTGCTCTGTTTAATAAATCTCGCTTGCCGTTGATCATATATCACA
TTATATGTTTTTCCCGAAGAAAGAATATGTCTTATTCATTTGCTTTCTTTGTTTATGATC
TCATCATCAACACTTTTATCTGTAACCTTTGCCTTTGATTATCACATAACATGATTTTCC
ATAAGAAAGAGTGTGTGTTTTATTCG

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1FI89JQ 627 0 0
CAGCCAATCTGTTCTCAAAAGGCTGCAATCTGAACTCATGGGCTTGATGATGGGAGGTGA
CCCGGGAATATCTGCTTTCCCGGAGGAAGACAACATCTTCTGTTGGAAAGGGACGATAAC
AGGAAGCAAAGACACTGTGTTTGAAGGAACTGAGTATAGACTCTCCCTCTCTTTCTCCAA
TGACTATCCTTTCAAACCTCCCAAGATCAAGTTCCAGACTACTTGCTTCCACCCCAATGT
TGATCTCCACGGCAATATCTGTTTGGACATTCTTCAGGATAAA*TGGTCATCTGCATATG
ATGTGAGGACAATACTACTATCGATTCAGAGCCTTCTGGGAGAACCGAACATCAGCTCAC
CATTGAACACTCAAGCAGCTCAGCTCTGGAGCAACCAAGAAGAGTATAGGAAGATGGTTG
AGAAGCTCTACAAGCCTCCCAGTGCATGATTTTTTCTTCAACCTGCTCTGTTTAATAAAT
CTCGCTTGCCGTTGATCATATATCACATTATATGTTTTTCCCGAAGAAAGAATATGTCTT
ATTCATTTGCTTTCTTTGTTTATGATCTCATCATCAACACTTTTATCTGCAACCTTTGCC
TTTGATTATCACATAACATGATTTT
CC

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 7

CO CL624Contig1 1498 7 8 U
GCAAGATGCGAGATTTACGGCCTTATATATAATTTAACAAATAAACATAAAACACCAAAC
TTACATAAGATTTTGAAATCATAGTTTTTAAAAAGAAGAGAAATCCAACGAGTAAAGATA
CCAAAGTTTCTAGAGTCGAGTCGACCGCAGTCGTATTAAGTATGACTTAAAATGATAATT
AAAGCACAAAACCTCACACTTAAATACTAGTTATAGTTGTGAAGTGTCCATCAAGTTTCT
AGAGTCGGCCGCAATCGTATTTAGTATGACGAATCTGATGACGCCCAAACAACAGCACCA
ACAACACAATAAACATGAGCCTGACGACCGTTGACTGCGTTTGTAGCGACCGTCCCGTCA
AATACGTCTGCGTCGAAAGCGCGACTAGTCTCATCCTACGTTCATTCACATACTCATCAA
TAGCTTCTCCAATGCTTTTCACAGAACAATCCTTTAACGAGTCTCCATGGTCCGGACCCA
TTTTCCTAGCTAGACATCTAGCAAGAACAACGGAATCCTCTAGCGCAGCCGAGCCGCCTT
GTCCGAGGAATGGACCCATCACGTGCATTGCATCGCCAGCTACAGTCACGGTCCCACGTC
TAAATTTCCCGAACATGATTTCCAACGGCGAACGGTACCTTAAGTGTGTCAAAGTTAATG
CCTCCACATCGCATCTTTTCACCATTTCTTTCCAGTCTTCAGATAACTTATCGACCCATT
TTAGAGTCAACTTTGCGATCGATTCTTGATCCTTAACCTTGTATTGGCTGTCTTGCATAT
GCACTACGAACCAAAAGACTTGGTTCTCGCTCAAAGGAAGTCTTCCGACTAAGACGTTTC
CTGTTTTCATCCTTAGAAGCTCATGTGGAAATCCGTGGCCGTTTGGGCAATTAGTGAACC
CTCTCACCGCACGACAGGCAAACGCCTTTTTAGGGCCTAATCGCAGATAATCACTGACGA
TAGAATTTGCACCATCGCATCCAATCAAGACCTTGGCTTTGATCGTATTTCCATTGGATA
AGTGAACGACTGGAAACGACGTAGTTTCGTCCTCTTGGATCGAAACAATTTGGGAACTGA
ACCGGATGGTTCCATCAGGGAGAGCATCGGCCAAGGCCTCAACAAGATCGTTCCTTCTAA
GACAACGAGCTTCGTCCTTGATGTTTAAAACGAATTCTCGTTTTTTCTTCCCATCCTCAA
TCAACATGGTCCGTGCTTTGTGAATAAGATTAGAAGTGAGACGAAGACGATCAGAGACGC
CAAGCTGATCAAGAGCTCTCCAGCCATTAGTAAGAGTTCCAATTCCAGCTCCTTCCGACC
TCACTTTATCTGCTCTCTCCAACACAACACTCTTTATTCCTTTCCTATGAAGAGCAAGAG
AAGTGGCGAGACCAGCGATTCCGCCGCCAACGATAACTATTCCGACTTCTTCCATTTTTA
TTTCTAATTTAAAGCTGAGATATTCAGATCTGGAGTTTAGTTTGGGTACTTGTTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A936JQ U 1
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AAAGCACAAAACC

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CCTTTAACGAGTCTCCATGGTCCGGACCCATTTTCCTAGCTAGACATCTAGCAAGAACAA
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CACACTTAAATACTAGTTATAGTTGTAAAGTGTCCATCAAGTTTCTAGAGTCGGCCGCAA
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GAAAGCGCGACTAGTCTCATCCTACGTTCATTCACATACTCATCAATAGCTTCTCCAATG
CTTTTCACAGAACAATCCTTTAACGAGTCTCCATGGTCCGGACCCACTTTCCTAGCTAGA
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C
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AGCTAGACATCTAGCAAGAACAACGGAATCCTCTAGCGCAGCCGAGCCGCCTTGTCCGAG
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TTTGATCGTATTTCCATTGGATAAGTGAACGACTGGAAACGACGTAGTTTCGTCCTCTTG
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GAGACGAAGACGATCAGAGACGCCAAGCTGATCAAGAGCTCTCCAGCCATTAGTAAGAGT
TCCAATTCCAGCTCCCTCCGACCTCACTTTATCTGCTCTCTCCAACACAACACTCTTTAT
TCCTTTCCTATGAAGAGCAAGAGAAGTGGCGAGACCAGCGATTCCGCCGCCAACGATAAC
TATTCCGACTTCTTCCATTTTTATTTCTAATTTAAAGCTGAGATATTCAGATCTGGAGTT
TAGTTTGGGTACTTGTTATCC

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DS 



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GCACCCTAAAAGCTTCTCTCTTTCTTGCTCTGTAACTGTTGGGATTCTCTGGCACAACTT
CCCTTGGGTACACACTAATCTTCTTCCTGTCAGGACCAAACTTCTCGAACTTGACTAACC
CATCGATTAAAGAGAAGATGGTATGATCTTTACCAATCCCAACGTTCTTTCCAGCATGGA
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TCTTGTGCGCGGATTCAATCGTCAATGGAATCGGAGCTTGGAGTTTTTCCAAAGGGAGAG
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CCATTGCTAAGAGAAGCTAGGGTTTTTTTTTTGTGAGGATGAAGAAGATCC


BQ
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1EE44JQ U 1
AF RS1EK02JQ U 1
AF RS1EE44TF C 2
AF RS1E838JQ U 34
AF RS1GO26JQ U 34
AF RS1GO26TF C 65
AF RS1EK02TF C 3
AF RS1E838TF C 642
BS 1 506 RS1EE44JQ
BS 507 507 RS1EK02JQ
BS 508 627 RS1EE44JQ
BS 628 743 RS1E838JQ
BS 744 751 RS1EE44TF
BS 752 752 RS1GO26TF
BS 753 771 RS1EE44TF

RD RS1EE44JQ 627 0 0
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AAGGGAAAATGATCATAAACAAAGACTAAACGTAACGAGAGGACAAAGACAGATTCACAT
ATGAATTTCAGCAATCGGGATTGGTTTCCTCCTCATCGATCGCAGCAGATGCAAGCACAA
GCTGAGGGGTAGGAAGTGTGTAAGTGTAATTCTCGCGTCTAGCCTTCTTCTTCTCCCTTT
GCACCCTAAAAGCTTCTCTCTTTCTTGCTCTGTAACTGTTGGGATTCTCTGGCACAACTT
CCCTTGGGTACACACTAATCTTCTTCCTGTCAGGACCAAACTTCTCGAACTTGACTAACC
CATCGATTAAAGAGAAGATGGTATGATCTTTACCAATCCCAACGTTCTTTCCAGCATGGA
ACTTAGTGCCACGTTGACGAACGATGATGGCCCCTGGTTTAGCGACTTGGTCACCGTAAA
TCTTGACGCCGAGTCTTTGTCCCGGAAAATCACGACCGTTCTTAGTACTCCCAGCTCCTT
TCTTGTGCGCGGATTCAATCGTCAATGGAATCGGAGCTTGGAGTTTTTCCAAAGGGAGAG
TCACAGTGAAGGAGGCTTTAGGGTTTA

QA 1 627 1 627
DS 

RD RS1EK02JQ 626 0 0
GTGT
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AGGGGTAGGAAGTGTGTAAGTGTAATTCTCGCGTCTAGCCTTCTTCTTCTCCCTTTGCAC
CCTAAAAGCTTCTCTCTTTCTTGCTCTGTAACTGTTGGGATTCTCTGGCACAACTTCCCT
TGGGTACACACTAATCTTCTTCCTGTCAGGACCAAACTTCTCGAACTTGACTAACCCATC
GATTAAAGAGAAGATGGTATGATCTTTACCAATCCCAACGTTCTTTCCAGCATGGAACTT
AGTGCCACGTTGACGAACGATGATGGCCCCTGGTTTAGCGACTTGGTCACCGTAAATCTT
GACGCCGAGTCTTTGTCCCGGAGAATCACGACCGTTCTTAGTACTCCCAGCTCCTTTCTT
GTGCGCGGATTCAATCGTCAATGGAATCGGAGCTTGGAGTTTTTCCAAAGGGAGAGTCAC
AGTGAAGGAGGCTTTAGGGTTT

QA 5 626 5 626
DS 

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GTG
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GAAAATGATCATAAACAAAGACTAAACGTAACGAGAGGACAAAGACAGATTCACATATGA
ATTTCAGCAATCGGGATTGGTTTCCTCCTCATCGATCGCAGCAGATGCAAGCACAAGCTG
AGGGGTAGGAAGTGTGTAAGTGTAATTCTCGCGTCTAGCCTTCTTCTTCTCCCTTTGCAC
CCTAAAAGCTTCTCTCTTTCTTGCTCTGTAACTGTTGGGATTCTCTGGCACAACTTCCCT
TGGGTACACACTAATCTTCTTCCTGTCAGGACCAAACTTCTCGAACTTGACTAACCCATC
GATTAAAGAGAAGATGGTATGATCTTTACCAATCCCAACGTTCTTTCCAGCATGGAACTT
AGTGCCACGTTGACGAACGATGATGGCCCCTGGTTTAGCGACTTGGTCACCGTAAATCTT
GACGCCGAGTCTTTGTCCCGGAGAATCACGACCGTTCTTAGTACTCCCAGCTCCTTTCTT
GTGCGCGGATTCAATCGTCAATGGAATCGGAGCTTGGAGTTTTTCCAAAGGGAGAGTCAC
AGTGAAGGAGGCTTTAGGGTTTAGAATCAAATCGCCTCTGAGGAACGACGAGGTTGAAGA
GAGGGATAAGCCTTTGAATGCTCCGATTAGATTCAAACTCATCGATGTTGCAATCGCCAT
TGCTAAGAGAAGCTAGGGTTTTTTTTT*GTGAGGATGAAGAAGATCC

QA 4 770 4 770
DS 

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CGCGTCTGGCCTTCTTCTTCTCCCTCTGCACTCTAAAAGCTTCCCTCTTTCTTGCTCTGT
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GACCAAACTTCTCGAACTTGACAAGTCCATCGATTAAAGAGAAGATGGTATGATCTTTAC
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CTGGTTTAGCGACTTGGTCACCGTAAATCTTGACGCCGAGTCTTTGTCCCGGAGAATCAC
GACCGTTCTTAGTACTCCCAGCTCCTTTCTTGTGCGCGGATTCAATCGTCAATGGAATCG
GAGCTTGGAGTTTTTCCAAAGGGAGAGTCACAGTGAAGGAGGTTTTAGGGTTTAGAATCA
AATCGCCTCTGAGGAAGGACGAGGTTGAAGAGAGGGATAAGCCTTTGAATGCTCCGATTA
GATTCAAACTCATCGATGTTGCAATCGCCATTGCTAAGAGAAGCTAGGGT

QA 1 710 1 710
DS 

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AACGAGAGGACAAAGACAGATTCACATATGATTTTCAGCAATCGGGATTGGTTTCCTCAT
CATCAATCGCAGCAGATGCAAGCACAAGCTGAGGGGTAGGAAGTGTGTAAGTGTAGTTCT
CGCGTCTGGCCTTCTTCTTCTCCCTCTGCACTCTAAAAGCTTCCCTCTTTCTTGCTCTGT
AACTGTTGGGATTCTCTGGCACAACTTCCCTTGGGTACACACTAATCTTCTTCCTGTCAG
GACCAAACTTCTCGAACTTGACAAGTCCATCGATTAAAGAGAAGATGGTATGATCTTTAC
CAATCCCAACGTTATTTCCAGCATGGAACTTAGTGCCACGTTGACGAACGATGATGGCCC
CTGGTTTAGCGACTTGGTCACCGTAAATCTTGACGCCGAGTCTTTGTCCCGGAGAATCAC
GACCGTTCTTAGTACTCCCAGCTCCTTTCTTGTGCGCGGATTCAATCGTCAATGGAATCG
GAGCTTGGAGTTTTTCCAAAGGGAGAGTCACAGTGAAGGAGGTTTTAGGGTTTAGAATCA
AATCGCCTCTGAGGAAGGACGAGGTTGAAGAGAGGGATAAGCCTTTGAATGCTCCGATTA
GATTCAAACTCATCGATGTTGCAATCGCC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1GO26TF 707 0 0
GG
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TTCAGCAATCGGGATTGGTTTCCTCATCATCAATCGCAGCAGATGCAAGCACAAGCTGAG
GGGTAGGAAGTGTGTAAGTGTAGTTCTCGCGTCTGGCCTTCTTCTTCTCCCTCTGCACTC
TAAAAGCTTCCCTCTTTCTTGCTCTGTAACTGTTGGGATTCTCTGGCACAACTTCCCTTG
GGTACACACTAATCTTCTTCCTGTCAGGACCAAACTTCTCGAACTTGACAAGTCCATCGA
TTAAAGAGAAGATGGTATGATCTTTACCAATCCCAACGTTATTTCCAGCATGGAACTTAG
TGCCACGTTGACGAACGATGATGGCCCCTGGTTTAGCGACTTGGTCACCGTAAATCTTGA
CGCCGAGTCTTTGTCCCGGAGAATCACGACCGTTCTTAGTACTCCCAGCTCCTTTCTTGT
GCGCGGATTCAATCGTCAATGGAATCGGAGCTTGGAGTTTTTCCAAAGGGAGAGTCACAG
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CTAAGAGAAGCTAGGGTTTTTTTTTTGTGAGGATGAAGAAGATCC

QA 3 707 3 707
DS 

RD RS1EK02TF 769 0 0
TG
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GAAAATGATCATAAACAAAGACTAAACGTAACGAGAGGACAAAGACAGATTCACATATGA
ATTTCAGCAATCGGGATTGGTTTCCTCCTCATCGATCGCAGCAGATGCAAGCACAAGCTG
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CCTAAAAGCTTCTCTCTTTCTTGCTCTGTAACTGTTGGGATTCTCTGGCACAACTTCCCT
TGGGTACACACTAATCTTCTTCCTGTCAGGACCAAACTTCTCGAACTTGACTAACCCATC
GATTAAAGAGAAGATGGTATGATCTTTACCAATCCCAACGTTCTTTCCAGCATGGAACTT
AGTGCCACGTTGACGAACGATGATGGCCCCTGGTTTAGCGACTTGGTCACCGTAAATCTT
GACGCCGAGTCTTTGTCCCGGAGAATCACGACCGTTCTTAGTACTCCCAGCTCCTTTCTT
GTGCGCGGATTCAATCGTCAATGGAATCGGAGCTTGGAGTTTTTCCAAAGGGAGAGTCAC
AGTGAAGGAGGCTTTAGGGTTTAGAATCAAATCGCCTCTGAGGAACGACGAGGTTGAAGA
GAGGGATAAGCCTTTGAATGCTCCGATTAGATTCAAACTCATCGATGTTGCAATCGCCAT
TGCTAAGAGAAGCTAGGGTTTTTTTTT*GTGAGGATGAAGAAGATCC

QA 3 769 3 769
DS 

RD RS1E838TF 130 0 0
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CTCATCGATGTTGCAATCGCCATTGCTAAGAGAAGCTAGGGTTTTTTTTTTGTGAGGATG
AAGAAGATCC

QA 1 130 1 130
DS 



AS 1 7

CO CL626Contig1 968 7 7 U
GGCTTCTTTCTTCTGGAGTGGAGGCGGTGATGGCGACGAACAATGGAGACGTTTTGATGC
TAGAGGCGGCGCCGGAAGCTACGAAGCCCTGGGCTAGCGCGGCGAACGCAGAAGTTATCG
ACGCGCTTCCTTATATCGACGATGACTACGGTAATCCACTCATTAAAGCTGAGGTCGATC
GCCTTGTTGAGGAAGAGATGCGTCGGAGCTCGAGAAAGCCTGCCGACTTTCTCAAGGAGT
TGCCTCCTCTTCCCAAGTTCGATTTCGAGAACTGTCCTGTTCTTGGCAAAGAGTATGAAC
GTGTTCGAGCTGGGAAGCCTCCAGTGCGGATCGATTTTGAGTCCAGGTACAAGCTTGAAC
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GTCCTGAGCTTTGGAGACAGAACAACCATCGGCTAGAAGTATTCTTGACCAGAATGCAAA
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AGCAAACCACTGCGTACGAGCTCAATGCACTATCTCAAGAATGGAGACAGCTGTGCATGA
AGAATATGGAGATTCAGTCTGCTTGTGCTGTGCTAGAGACACAGATCGATTCGTTCAAAA
GGGAAGCTGCTGAAAGAGGATGGAACTTAGAAGAGAAACTAGAGAGTGTCAAGCCGCTTC
AACCGCAGTGAGGCAACCGCTGGGGTTGTTGGCCCCGCTCTTTGCTTGCCTTTACTGATA
TGTTTAGGCATATCGTTTACGATTTTTTAGTGAAAATTATGTTTTTAACCTTTGTAACGA
TTATCATTTCTCTGTTATAAATTGAATGTTGGTTTATCAGATATTATAAAGGATAACATT
ATGATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 45 45 45 15 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1AB83TF U 28
AF RS1G558TF U 1
AF RS1CS39TF U 8
AF RS1EH78TF U 1
AF RS1CS39JQ C 127
AF RS1G558JQ C 410
AF RS1EH78JQ C 412
BS 1 724 RS1EH78TF
BS 725 725 RS1CS39JQ
BS 726 734 RS1EH78TF
BS 735 865 RS1CS39JQ
BS 866 866 RS1G558JQ
BS 867 903 RS1CS39JQ
BS 904 968 RS1G558JQ

RD RS1AB83TF 474 0 0
TGATGGCGACGAACAATGGAGACGTTTTGATGCTAGAGGCGGCGCCGGAAGCTACGATGC
CCTGGGCTAGCGCGGCGAACGCAGAAGTTATCGACGCGCTTCCTTATATCGACGATGACT
ACGGTAATCCACTCATTAAAGCTGAGGTCGATCGCCTTGTTGAGGAAGAGATGCGTCGGA
GCTCGAGAAAGCCTGCCGACTTTCTCAAGGAGTTGCCTCCTCTTCCCAAGTTCGATTTCG
AGAACTGTCCTGTTCTTGGCAAAGAGTATGAACGTGTTCGAGCTGGGAAGCCTCCAGTGC
GGATCGATTTTGAGTCCAGGTACAAGCTTGAACTGCCGCCTGCTAGTAAGAAAAATGATG
ATGCTTCCTGGAAGCAGTATCTTCAGAAGAACCAACGGTCATTGCAACAGAAGATGATCG
AGCTTGAGAATTTGGAAATGATGTCGAAACAGGGCCCTGAGCTTTGGAGACAGA

QA 1 474 1 474
DS 

RD RS1G558TF 548 0 0
GGCTTCTTT
CTTCTGGAGTGGAGGCGGTGATGGCGACGAACAATGGAGACGTTTTGATGCTAGAGGCGG
CGCCGGAAGCTACGAAGCCCTGGGCTAGCGCGGCGAACGCAGAAGTTATCGACGCGCTTC
CTTATATCGACGATGACTACGGTAATCCACTCATTAAAGCTGAGGTCGATCGCCTTGTTG
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TTCCCAAGTTCGATTTCGAGAACTGTCCTGTTCTTGGCAAAGAGTATGAACGTGTTCGAG
CTGGGAAGCCTCCAGTGCGGATCGATTTTGAGTCCAGGTACAAGCTTGAACTGCCGCCTG
CTAGTAAGAAAAATGATGATGCTTCCTGGAAGCAGTATCTTCAGAAGAACCAACGGTCAT
TGCAACAGAAGATGATCAAGCTTGAGAATTTGGAAATGATGTCAAAACAGGGTCCTGAGC
TTTGGAGACAGAACAACCATCGGCTAGAAGTATTCTTGACCAGAATGCAAAAGCTAGCT

QA 10 548 10 548
DS 

RD RS1CS39TF 703 0 0
GGCTTCT
GGAGTGGAGGCGGTGATGGCGACGAACAATGGAGACGTTTTGATGCTAGAGGCGGCGCCG
GAAGCTACGAAGCCCTGGGCTAGCGCGGCGAACGCAGAAGTTATCGACGCGCTTCCTTAT
ATCGACGATGACTACGGTAATCCACTCATTAAAGCTGAGGTCGATCGCCTTGTTGAGGAA
GAGATGCGTCGGAGCTCGAGAAAGCCTGCCGACTTTCTCAAGGAGTTGCCTCCTCTTCCC
AAGTTCGATTTCGAGAACTGTCCTGTTCTTGGCAAAGAGTATGAACGTGTTCGAGCTGGG
AAGCCTCCAGTGCGGATCGATTTTGAGTCCAGGTACAAGCTTGAACTGCCGCCTGCTAGT
AAGAAAAATGATGATGCTTCCTGGAAGCAGTATCTTCAGAGGAACCAACGGTCATTGCAA
CAGAAGATGATCGAGCTTGAGAATTTGGAAATGATGTCAAAACAGGGCCCTGAGCTTTGG
AGACAGAACAACCATCTGCTAGAAGTATTCTTGACCAGAATGCAAAAGCTAGCTCAGGAG
CAGAACGAAGAAATTGAAAAAGTAAATCGTGAAAGGAAGTATCATCAGCAAACCACTGCG
TACGAGCTCAATGCACTATCTCAAGAATGGAGACAGTTGTGCATGAAGAATATGGAGATT
CAGTCTGCTTGTGCTGTGCTAGAGACACAGATCGAT

QA 8 703 8 703
DS 

RD RS1EH78TF 734 0 0
GGCTTCTTTCTTCTGGAGTGGAGGCGGTGATGGCGACGAACAATGGAGACGTTTTGATGC
TAGAGGCGGCGCCGGAAGCTACGAAGCCCTGGGCTAGCGCGGCGAACGCAGAAGTTATCG
ACGCGCTTCCTTATATCGACGATGACTACGGTAATCCACTCATTAAAGCTGAGGTCGATC
GCCTTGTTGAGGAAGAGATGCGTCGGAGCTCGAGAAAGCCTGCCGACTTTCTCAAGGAGT
TGCCTCCTCTTCCCAAGTTCGATTTCGAGAACTGTCCTGTTCTTGGCAAAGAGTATGAAC
GTGTTCGAGCTGGGAAGCCTCCAGTGCGGATCGATTTTGAGTCCAGGTACAAGCTTGAAC
TGCCGCCTGCTAGTAAGAAAAATGATGATGCTTCCTGGAAGCAGTATCTTCAGAAGAACC
AACGGTCATTGCAACAGAAGATGATCAAGCTTGAGAATTTGGAAATGATGTCAAAACAGG
GTCCTGAGCTTTGGAGACAGAACAACCATCGGCTAGAAGTATTCTTGACCAGAATGCAAA
AGCTAGCTCAGGAGCAGAACGAAGAAATTGAAAAAGTAAATCGTGAAAGGAAGTATCATC
AGCAAACCACTGCGTACGAGCTCAATGCACTATCTCAAGAATGGAGACAGCTGTGCATGA
AGAATATGGAGATTCAGTCTGCTTGTGCTGTGCTAGAGACACAGATCGATTCGTTCAAAA
GGGA*GCTGCTGAA

QA 1 734 1 734
DS 

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C
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TGAGGAAGAGATGCGTCGGAGCTCGAGAAAGC*TGCCGACTTTCTCAAGGAGTTGCCTCC
TCTTCCCAAGTTCGATTTCGAGAACTGTCCTGTTCTTGGCAAAGAGTATGAACGTGTTCG
AGCTGGGAAGCCTCCAGTGCGGATCGATTTTGAGTCCAGGTACAAGCTTGAACTGCCGCC
TGCTAGTAAGAAAAATGATGATGCTTCCTGGAAGCAGTATCTTCAGAGGAACCAACGGTC
ATTGCAACAGAAGATGATCGAGCTTGAGAATTTGGAAATGATGTCAAAACAGGGCCCTGA
GCTTTGGAGACAGAACAACCATCTGCTAGAAGTATTCTTGACCAGAATGCAAAAGCTAGC
TCAGGAGCAGAACGAAGAAATTGAAAAAGTAAATCGTGAAAGGAAGTATCATCAGCAAAC
CACTGCGTACGAGCTCAATGCACTATCTCAAGAATGGAGACAGTTGTGCATGAAGAATAT
GGAGATTCAGTCTGCTTGTGCTGTGCTAGAGACACAGATCGATTCGTTCAAAAGGGAAGC
TGCTGAAAGAGGATGGAACTTAGAAGAGAAACTAGAGAGTGTCAAGCCGCTTCAACCGCA
GTGAGGCAACCGCTGGGGTTGTTGGCCCCGCTCTTTGCTTGCCTTTACTGATATGTTTAG
GCATATCGTTTACGATTTCTTAGTGAAAATTATGTTTTTAACCTTTGTAACGATTA

QA 2 777 2 777
DS 

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TCAGAAGAACCAACGGTCATTGCAACAGAAGATGATCAAGCTTGAGAATTTGGAAATGAT
GTCAAAACAGGGTCCTGAGCTTTGGAGACAGAACAACCATCGGCTAGAAGTATTCTTGAC
CAGAATGCAAAAGCTAGCTCAGGAGCAGAACGAAGAAATTGAAAAAGTAAATCGTGAAAG
GAAGTATCATCAGCAAACCACTGCGTACGAGCTCAATGCACTATTTCAAGAATGGAGACA
GCTGTGCATGAAGAATATGGAGATTCAGTCTGCTTGTGCTGTGCTAGAGACACAGATCGA
TTCGTTCAAAAGGGAAGCTGCTGAAAGAGGATGGAACTTAGAAGAGAAACTAGAGAGTGT
CAAGCCGCTTCAACCGCAGTGAGGCAACCGCTGGGGTTGTTGGCCCCGCTCTTTGCTTGC
CTTTACTGATATGTTTAGGCATATCGTTTACGATTTTTTAGTGAAAATTATGTTTTTAAC
CTTTGTAACGATTATCATTTCTCTGTTATAAATTGAATGTTGGTTTATCAGATATTATAA
AGGATAACATTATGATTTG

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DS 

RD RS1EH78JQ 557 0 0
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CAAAACAGGGTCCTGAGCTTTGGAGACAGAACAACCATCGGCTAGAAGTATTTTTGACCA
GAATGCAAAAGCTAGCTCAGGAGCAGAACGAAGAAATTGAAAAAGTAAATCGTGAAAGGA
AGTATCATCAGCAAACCACTGCGTACGAGCTCAATGCACTATTTCAAGAATGGAGACAGC
TGTGCATGAAGAATATGGAGATTCAGTTTGCTTGTGCTGTGCTAGAGACACAGATCGATT
CGTTCAAAAGGGAAGCTGCTGAAAGAGGATGGAACTTAGAAGAGAAACTAGAGAGTGTCA
AGCCGCTTCAACCGCAGTGAGGCAACCGCTGGGGTTGTTGGCCCCGCTCTTTGCTTGCCT
TTACTGATATGTTTAGGCATATCGTTTACGATTTTTTAGTGAAAATTATGTTTTTAACCT
TTGTAACGATTATCATTTTTTTGTTATAAATTGAATGTTGGTTTATCAGATATTATAAAG
GATAACATTATGATTTG

QA 1 557 1 557
DS 



AS 1 6

CO CL627Contig1 1279 6 20 U
GGGGAGCTAGTAATAATAATAATAATAAAGATGGTTTAATTATAGTAATCAAATCATCCT
TGTGCCAAATTCAACACACCAAAAAATCATTTATTCATGGAGTCCTCTCAATGAATGTTA
CCAAATTGTCTGCTCGCTTTATTCTTCACAAGAAGCACAATCTTGTTTCAGTTTTTGTTT
TTTTTTT*CAAAACACTCCTCCCTCTGTAATAAACATAGATGCCAAAACTCTCATGCACA
TGTTTAAATGGTTACATTCATGGAGAGAGAAAAATGAGATACTT*CACACATCGGCAAGT
GCAATAAGCTGATCAACAACACTAGGATCTGCGAGTGTGCTAATATCTCCAAGCTCTTCT
AATTGCCTTGAAGCGATCTTTCTCAGGATTCTCCTCATTATCTTTCCACTTCTTGTCTTT
GGCAACCCTGGTGCCCAATGTATTCTGTCCGGTGCTGCAAATGCCCCAATCTGGTTTCGA
ACCATGATTATAAGGCTTTTCCGAAGCTCTTCGCTGTAAGGAACACCCTCCACAAGAGTG
ACAAACGCATAGATACCCTGACCTTTCACCTCATGTTCTACACCTACAACAGCTGCCTCT
GCACATTGGGGATGTGAAGCCAGAGCAGATTCCACTTCAGCAGTTCCAATGCGGTGGCCA
CTGACATTGATAACATCATCAACCCTTCCTGTAAGCCAGTAGTAACCATCCTTGTCTCTG
CTGCAACCATCACCACTAAAATAGTATCCAGCAAAAGGTTTGAAGTATGTGGTTTCATAT
CTTTCATGATCCCCAAACAAAGTTCGAAACGCCCCGGGCCATGATCCTTTCACACAAAGA
TAACCACTACACTCGCCTTCGATTTCATTGCCTTTTTCATCAACTATGACAGGCTGAACA
CCAAAGAAAGGGAAAGTAGCTGAACCAGGCTTCTGCGGCCAAGCACCTGGCAACGGCGTT
ATCATGAAGCCACCAGTTTCAGTTTGCCACCACGTATCGGAAATGGGACACCTTGAATCA
CCAACTAGATTGAAGAACCATCTACATCAATCAAGAGTGTTGGTAAACCATTAAAATAAA
CTTCTCATTCAATTGATCGCATGATTGAAAGATTTAAAGACATTTAGGGTTCCAAACCTC
CATGCACTCGGATTGATGGGCTCACCCACACTTCCAAGGACTCGTAGCGATTTGCGAGAA
TGATTTGTCACAAACTTATCATCATCGCGCATGAGAGACCTCACCAATGTTGGAGCAGTG
TAAAATATCGATATCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D408JQ U 125
AF RS1CX37JQ U 1
AF RS1EO36JQ U 87
AF RS1DT86JQ U 87
AF RS1EO36TF C 234
AF RS1CX37TF C 500
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RD RS1D408JQ 448 0 0
ATTGTCTGCTCGCTTTATTCTTCACAAGAACCACAATCTTGTTTCAGTTTTTGATTTTTG
TTT*CAAAACACTCCTCCCTCTGTAATAAACATAGATGCCAAAACTCTCATGCACATGTT
TAAATGGTTACATTCATGGAGAGAGAAAAATGAGATAACTTCACACATCGGCAAGTGCAA
TAAGCTGATCAACAACACTAGGATCTGCGAGTGTGCTAATATCTCCAAGCTCTTCTAATT
GCCTTGAAGCGATCTTTCTCAGGATTCTCCTCATTATCTTTCCACTTCTTGTCTTTGGCA
ACCCTGGTGCCCAATGTATTCTGTCCGGTGCTGCAAACGCCCCAATCTGGTTTCGAACCA
TGATTATAAGGCTTTTCCGAAGCTCTTCGCTGTAAGGAACACCCTCCACAAGAGTGACAA
ACGCATAGATACCCTGACCTTTCACCTC

QA 1 448 1 448
DS 

RD RS1CX37JQ 623 0 0
GGGGAGCTAGTAATAATAATAATAATAAAGATGGTTTAATTATAGTAATCAAATCATCCT
TGTGCCAAATTCAACACACCAAAAAATCATTTATTCATGGAGTCCTCTCAATGAATGTTA
CCAAATTGTCTGCTCGCTTTATTCTTCACAAGAAGCACAATCTTGTTTCAGTTTTTGTTT
TTTTTTTTCAAAACACTCCTCCCTCTGTAATAAACATAGATGCCAAAACTCTCATGCACA
TGTTGAAATGGTTACATTCATGGAGAGAGAAAAATGAGATACTTTCACACATCGGCAAGT
GCAATAAGCTGATCAACAACACTAGGATCTGCGAGTGTGCTAATGTCTCCAAGCTCTTCT
AATTGCCTTGAGGCGATCTTTCTCAGGATTCTCCTCATTATCTTTCCACTTCTTGTCTTT
GGCAACCCTGGTGCCCAATGTATTCTGTCCGGTGCTGCAAATGCCCCAATCTGGTTTCGA
ACCATGATTATAAGGCTTTTCCGAAGCTCTTCGCTGTAAGGAACACCCTCCACAAGAGTG
ACAAACGCATAGATACCCTGACCTTTCACCTCATGTTCTACACCTACAACAGCTGCCTCT
GCACATTGGGGATGTGAAGCCAG

QA 1 623 1 623
DS 

RD RS1EO36JQ 612 0 0
TCATTTATTCATGGAGTCCTCTCAATGAATGTTACCAAATTGTCTGCTCGCTTTATTCTT
CACAAGAAGCACAATCTTGTTTCAGTTTTTGTTTTTTTTT**CAAAACACTCCTCCCTCT
GTAATAAACATAGATGCCAAAACTCTCATGCACATGTTTAAATGGTTACATTCATGGAAA
GAGAAAAATGAAATACTT*CACACATCGGCAAGTGCAATAAGCTGATCAACAACACTAGG
ATCTGCGAGTGTGCTAATATCTCCAAGCTCTTCTAATTGCCTTGAAGCGATCTTTCTCAG
GATTCTCCTCATTATCTTTCCACTTCTTGTCTTTGGCAACCCTGGTGCCCAATGTATTCT
GTCCGGTGCTGCAAATGCCCCAATCTGGTTTCGAACCATGATTATAAGGCTTTTCCGAAG
CTCTTCGCTGTAAGGAACACCCTCCACAAGAGTGACAAACGCATAGATACCCTGACCTTT
CACCTCATGTTCTACACCTACAACAGCTGCCTCTGCACATTGGGGATGTGAAGCCAGAGC
AAATTCCACTTCAGCAGTTCCAATGCGGTGGCCACTGACATTGATAACATCATCAACCCT
TCCTGTAAGCCA

QA 1 612 1 612
DS 

RD RS1DT86JQ 769 0 0
TCATTTATTCATGGAGTCCTCTCAATGAATGTTACCAAATTGTCTGCTCGCTTTATTCTT
CACAAGAAGCACAATCTTGTTTCAGTTTTTGTTTTTTTTTT*CAAAACACTCCTCCCTCT
GTAATAAACATAGATGCCAAAACTCTCATGCACATGTTTAAATGGTTACATTCATGGAGA
GAGAAAAATGAGATACTT*CACACATCGGCAAGTGCAATAAGCTGATCAA**ACACTAGG
ATCTGCGAGTGTGCTAATATCTCCAAGCTCTTCTAATTGCCTTGAAGCGATCTTTCTCAG
GATTCTCCTCATTATCTTTCCACTTCTTGTCTTTGGCAACCCTGGTGCCCAATGTATTCT
GTCCGGTGCTGCAAATGCCCCAATCTGGTTTCGAACCATGATTATAAGGCTTTTCCGAAG
CTCTTCGCTGTAAGGAACACCCTCCACAAGAGTGACAAACGCATAGATACCCTGACCTTT
CACCTCATGTTCTACACCTACAACAGCTGCCTCTGCACATTGGGGATGTGATGCCAGAGC
AGATTCCACTTCAGCAGTTCCAATGCGGTGGCCACTGACATTGATAACATCATCAACCCT
TCCTGTAAGCCAGTAGTAACCATCCTTGTCTCTGCTGCAACCATCACCACTAAAATAGTA
TCCAGCAAAAGGTTTGAAGTATGTGGTTTCATATCTTTCATGATCCCCAAACAAAGTTCG
AAACGCCCCGGGCCATGATCCTTTCACACAAAGATAACCACTACACTCG

QA 1 769 1 769
DS 

RD RS1EO36TF 791 0 0
ATGCACATGTTTAAATGGT*ACATTCATGGAGAGAGAAAAATGAGATACTT*CACACATC
GGCAAGTGCAATAAGCTGATCAACAACACTAGGATCTGCGAGTGTGCTAATATCTCCAAG
CTCTTCTAATTGCCTTGAAGCGATCTTTCTCAGGATTCTCCTCATTATCTTTCCACTTCT
TGTCTTTGGCAACCCTGGTGCCCAATGTATTCTGTCCGGTGCTGCAAATGCCCCAATCTG
GTTTCGAACCATGATTATAAGGCTTTTCCGAAGCTCTTCGCTGTAAGGAACACCCTCCAC
AAGAGTGACAAACGCATAGATACCCTGACCTTTCACCTCATGTTCTACACCTACAACAGC
TGCCTCTGCACATTGGGGATGTGAAGCCAGAGCAGATTCCACTTCAGCAGTTCCAATGCG
GTGGCCACTGACATTGATAACATCATCAACCCTTCCTGTAAGCCAGTAGTAACCATCCTT
GTCTCTGCTGCAACCATCACCACTAAAATAGTATCCAGCAAAAGGTTTGAAGTATGTGGT
TTCATATCTTTCATGATCCCCAAACAAAGTTCGAAACGCCCCGGGCCATGATCCTTTCAC
ACAAAGATAACCACTACACTCGCCTTCGATTTCATTGCCTTTTTCATCAACTATGACAGG
CTGAACACCAAAGAAAGGGAAAGTAGCTGGACCAGGCTTCTGCGGCCAAGCACCTGGCAA
CGGGGTTATCATGAAGCCGCCAGTTTCAGTTTGCCACCACGTATCGGAAATGGGACACCT
TGAATCACCA
C

QA 1 790 1 790
DS 

RD RS1CX37TF 780 0 0
TCCGAAGCTCT*CGCTGTAAGGAACACCCTCCACAAGAGTGACAAACGCATAGATACC*T
GAC*TTTCAC*TCATGTTCTACAC*TACAACAGCTGCCTCTGCACATTGGGGATGTGAAG
CCAGAGCAGATTCCACTTCAGCAGTTCCAATGCGGTGGCCACTGACATTGATAACATCAT
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AATAGTATCCAGCAAAAGGTTTGAAGTATGTGGTTTCATATCTTTCATGATCCCCAAACA
AAGTTCGAAACGCCCCGGGCCATGATCCTTTCACACAAAGATAACCACTACACTCGCCTT
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QA 1 780 1 780
DS 



AS 2 6

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TACATCACATCACAGCAGAGACAGAACATAACACACAGACACCAAATGAATCTTGCAGTC
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CACCCTTGCAGCAAACTGTCTTTGAGCTCTTCGGTTTCTTAGGAGTCAAAGTATATCTTA
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CATAGGCCAAGGCTCTTTCCCGCTTGATCGTTGCTTCTTCCCTTTGATGTATCCTCCCTA
ATATTTCATCTTTTGTCTCTGCCCCACCATTCCATTCGACCTCAATATCGTGAAGCTTAG
CCTCAAGCTTCTGCTGATTCTCTAACCTTTTATGCATCAGTCGGCTTTCCATGACCATGC
CAACTCGGCGAGCCTTTATCTGAGACTGTATATTACTCCATGAGTGAAGATACTTCAATG
TAACCGCCGCTTGCTTCTTCACTGGATGCTTTTCAGCTAACATCTTTGCTCTTGCTATCC
CTTTTAGACGCCGTAGCATTTTTCTAGCCTTATAGGCTCTAAAAGCAGACTGAATTCGAG
TTGCAGCCCAATCCTCGCTACGAACAACTAGTGAAGAAGCATGAGTACCCTTCTTCTTGG
AAGCTTTTGATTTCACAGCAGGAGAAAGCCCCTTTGTTTGTTTCCCTTTCTTCGATCCAA
TTATTGCCTTGAAAAAATTCCCAGAACCCATCTCAGACTCTTTAGGGGAAAGAAAGACAA
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AAACAGAGGAGAACAAACAAAAAAACAGAACAGAGATTTGGTGATTGAATGATTAAAGAT
TGGTTTTTTTTTTTCCTCGGTGCCTGTCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1EU25JQ U 1
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AF RS1D950TF C 526
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QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1EH40JQ 799 0 0
CG
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CTTTCCCGCTTGATCGTTGCTTCTTCCCTTTGATGTATCCTCCCTAATATTTCATCTTTT
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QA 3 799 3 799
DS 

RD RS1B205TF 641 0 0
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CCTCGGTGCCTGTCC

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DS 

RD RS1D950TF 644 0 0
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TATCGTGAAGCTTAGCCTCAAGCTTCTGCTGATTCTCTAACCTTTTATGCATCAGTCGGC
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GAAGATACTTCAATGTAACCGCCGCTTGCTTCTTCACTGGATGCTTTTCAGCTAACATCT
TTGCTCTTGCTATCCCTTTTAGACGCCGTAGCATTTTTCTAGCCTTATAGGCTCTAAAAG
CAGACTGAATTCGAGTTGCAGCCCAATCCTCGCTACGAACAACTAGTGAAGAAGCATGAG
TACC*TTCTTCTTGGAAGCTTTTGATTTCACAGCAGGAGAAAGCCCCTTTGTTTGTTTCC
CTTTCTTCGATCCAATTATTGCCTTGAAAAAATTCCCAGAACCTATCTCAGACTCTTTAG
GGGAAAGAAAGACAACTCGAATGCTATAGAAGCTTGTCGTGAAGATACTGAAGACCAGAT
TTAGCCGTGACCTCGAAACAGAGGAGAACAAACAAAAAAACAGAACAGAGATTTTGTGAT
TGAATGATTAAAGATTGGTTTTTTTTTTTCCTCGGTGCCTGTCC

QA 1 644 1 644
DS 



CO CL628Contig2 1419 2 8 U
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CGTTACTGGTTTCAATGGTTTGTAGATTGGATCTGGAGAATAGTCAAAGAGTTAATGGAT
TTAAAGTAGAGAATTCTTCAGTTTTATTGCTATTCTTACTCATTTATAGTGTTGGGTTTA
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CTTTCTTTCCCCTAAAGAGTCTGAGATGGGTTCTGGGAATTTTTTCAAGGCAATAATTGG
ATCGAAGAAAGGGAAACAAACAAAGGGGCTTTCTCCTGCTGTGAAATCAAAAGCTTCCAA
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AATTCAGTCTGCTTTTAGAGCCTATAAGGCTAGAAAAATGCTAAGGCGTCTAAAAGGGAT
AGCAAGAGCAAAGATGTTAGCTGAAAAGCATCCAGTGAAGAAGCAAGCGGCGGTTACATT
GAAGTATCTTCACTCATGGAGTAATATACAGTCGCAGATAAAGGCTCGCCGAGTTGGCAT
GGTCATGGAAAGCCGACTGATGCATAAAAGGTTAGAGAATCAGCAGAAGCTTGAGGCTAA
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CTTGGTTTGATTTTGTAATACATACAATAGTTTTGTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DJ31JQ C 550
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DS 



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BQ
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AF RS1B459JQ C 1
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BS 3 582 RS1B459TF

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AAACGAGATCTCCAATGGAAGGTGGGCTATGTTTGGTTTTGCGGTGGGGATGCTGACAGA
GTATGCAACAGGATCAGACCTTGTGGACCAAGTTAAAATCCTTCTCTCCAATTTCGGCAT
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DS 

RD RS1B459TF 582 0 0
GG
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AGATTCTCAACGAGTAAGCCATGCTCTTCATCATCAGATGTTCTCAGGCCGATGGTCCTT
TGAGAAGGCCCTCGGCTCCTCCTACTCTCCGGGAACCTACACCTCCCCAAAAACCTGCTC
CTCCTACGCCGTCTTCTTCTCCTCCACCACCACCACCGCAGAAAGCTGTGGCTGTTGATG
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QA 3 582 3 582
DS 



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ACCACCGCCTCCACCGCAGAAAGCTGTGGCTGTTGATGGTAAGAGTGTTACCACGGTGGA
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TCATCTGCTTGTTTATTATTCTTCCTCCTGTATATGCTGCATCTCTTAAGATCTTTAAAT
ACAGGGCCCTTTTGTTGTTCAACCACTTTTTATCTTCAAATGTTATAAATATGATCTATG
GATCGATTCTAAAAATGG


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DY14TF U 4
AF RS1GF53TF U 1
AF RS1BP61TF U 26
AF RS1GF53JQ C 313
AF RS1DY14JQ C 174
AF RS1BP61JQ C 26
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G
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TCTTTGACAGCTTCGTCGTCTTTGAGATTCTCAGCGAGTAAGCCATGTGTCTTCATCATC
AGATGTTCTCAGGCTGAAGGTCCCTTGAGAAGGCCCTCGGCTCCTCCTACTCTCAGGGAG
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DS 

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ATCTTCTTTGACAGCTTCGTCGTCTTTGAGATTCTCAGCGAGTAAGCCATGTGTCTTCAT
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GGAGCCTATACCTCCCCAAAAACCTGCTCCTCCTACGCCGTCTACTTCTCCTCCACCACC
ACCACCGCCTCCACCGCAGAAAACTGTGGCTGTTGATGGTAAGAGTGTTACCACGGTGGA
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GG
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AACC

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CGGTGGAGTTTCAAAGGCAGAAAGCTAAAGAGCTTCAGGATTACTTTAAGCAGAAGAAGC
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GGAAGGTGGGCTATGTTTGGTTTTGCGGTGGGGATGCTGACAGAGTATGCAACAGGATCA
GACCTTGTGGACCAAGTTAAAATCCTTCTCTCCAATTTCGGCATTCTAGACTTGGAATAA
TAATGAAAAAGAGTGTTGTTGGTGTTATATAGATATGATATTTCTCTGATTCCCTTATGT
TCAATCTTCATCTGCTTGTTTATTATTCTTCCTCCTGTATATGCTGCATCTCTTAAGATC
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DS 

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GG
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GAGATTCTCAGCGAGTAAGCCATGTGTCTTCATCATCAGATGTTCTCAGGCTGAAGGTCC
CTTGAGAAGGCCCTCGGCTCCTCCTACTTTCAGGGAGCCTATACCTCCCCAAAAACCTGC
TCCTCCTACGCCGTCTACTTTTCCTCCACCACCACCACCGCCTCCACCGCAGAAAGCTGT
GGCTGTTGATGGTAAGAGTGTTACCACGGTGGAGTTTCAAAGGCAGAAAGCTAAAGAGCT
TCAGGATTACTTTAAGCAGAAGAAGCTTGAAGCTGCTGGTCAAGGTCCCTTTTTTTGGTT
TCCAGCCCAAAAACGAGATCTCCAATGGAAGGTGGGCTATGTTTGGTTTTGCGGTGGGGA
TGCTGACAGAGTATGCAACATGATCAGACCTTGTGGACCAAGTTAAAATCCTTCTCTCCA
ATTTCGGCATTCTAGACTTGGAATAATAATGAAAAAGAGTGTTGTTGGTGTTATATAGAT
ATGATATTTCTCTGATTCCCTTATGTTCAATCTTCATCTGCTTGTTTATTATTCTTCCTC
CTGTATATGCTGCATCTCTTAAGATCTTTAAATACAGGGCCCTTTTGTTGTTCAACCACT
TTTTATCTTCAAATGTTATAAATATGATCTATGGATCGATTCTAAAAATGG

QA 3 773 3 773
DS 



AS 1 6

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TTTTTTAACACTCAAAAGCAAATCACACATTCATAAACGATAAGACAATAGATTCATAGT
AGACACCGGGTTCAATTTCTAAGCACAGATCTGCTGTGCCGACATGCGACTATCTGTTTT
CTCGCGGGGCATCCCTGGTTCGGTCGTATTACAAGCCACCATGCCATGATCAGTTAAACC
TGCAGATCCGGTTTTAGTTTCCATATTGTCATCACTACCCGGAACTTTGTCCTCAGATTT
CAATTGGTCCGGTAAAGAGACAGGGAGAAAACCCTTTTGACGACATGTCTCAATTGATTC
CACCAACATATCCTCGAGACTATACTTGAAGTTAAATCCCATATCAATCAGCTTCTTGGA
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TTCTGGGTATTTTTGCCTGATAAATTCTGAGATGCTAAGAATCGTTGCATCGTGAGAGGA
ACAAACATAACGTCCCTTGGCAACAGTTTGTTCGTACAAGAATATATGAGCGTTGCATAA
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TGCTTTCTCCGCTAACGTTTTCGACATGAAATACATCCATCCGGTCATCTTCTTGGACAT
GATAAAGTCAAGATCACTCCAATCGTTTTCATCATAGACATTTTTCTGGTGTTCCTCAAC
ATTGACCGTTCCAGCAGACGAAGTGAACACAATTCTTCGTACGGTCTTTGCCTTATCACA
TGCTTTCACTATCCCCAACGCTCCATTCACTGTCGGTTTTATCACTTCGTTCTCAGGATC
CTTGGATTCAAAATCCATGGGAGTTGCGATGTGGAAAACGCCGTCGCATCCGTTTATGGC
GTCATCGTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CW88JQ U 1
AF RS1GP18JQ U 1
AF RS1DU01JQ U 23
AF RS1BB17JQ U 23
AF RS1CW88TF C 121
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AGACACCGGGTTCAATTTCTAAGCACAGATCTGCTGTGCCGACATGCGACTATCTGTTTT
CTCGCGGGGCATCCCTGGTTCGGTCGTATTACAAGCCACCATGCCATGATCAGTTAAACC
TGCAAATCCGGTTTTAGTTTCCATATTGTCATCACTACCCGGAACTTTGTCCTCAAATTT
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TTCTGGGTATTTTTGCCTGATAAATTCTGAGATGC

QA 1 575 1 575
DS 

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TTTTTTAACACTCAAAAGCAAATCACACATTCATAAACGATAAGACAATAGATTCATAGT
AGACACCGGGTTCAATTTCTAAGCACAGATCTGCTGTGCCGACATGCGACTATCTGTTTT
CTCGCGGGGCATCCCTGGTTCGGTCGTCTTACAAGCCACCATGCCATGATCAGTTAAACC
TGCAGATCCGGTTTTAGTTTCCATATTGTCATCACTACCCGGAACTTTGTCCTCAAATTT
CAATTGGTCCGGTAAAGAGACAGGGAGAAAACCCTTTTGACGACATGTCTCAATTGATTC
CACCAACATATCCTCGAGACTATACTTGAAGTTAAATCCCATATCAATCAGCTTCTTGGA
ACTGAACGCAATGCTCTTCAAATTCTCATCCACTCCTTCAAACGATGAAGGAACGTTATA
TTCTGGGTATTTTTGCCTGATAAATTCTGAGATGCTAAGAATCGTTGCATCGTGAGAGGA
ACAAACATAACGTCCCTTGGCAACAGTTTGTTCGTACAAGAATATATGAGCGTTGCATAA
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GATAGGAGAGAGCGCGGTAA

QA 1 740 1 740
DS 

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GCACAGATCTGCTGTGCCGACATGCGACTATCTGTCTTCTCGCGGGGCATCCCTGGTTCG
GTCGTCTTACAAGCCACCATGCCATGATCAGTTAAACCTGCAGATCCGGTTTTAGTTTCC
ATATTGTCATCACTATCCGGAACTTTGTCCTCAGATTTCAATTGGTCCGGTAAAGAGACA
GGGAGAAAACCCTTTTGACGACATGTCTCAATTGATTCCACCAACATATCCTCGAGACTA
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CCTTGTCTTATGATGGAGTAATGTGCCTCGTTACGAGTG

QA 1 699 1 699
DS 

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TCACACATTCATAAACGATAAGACAATAGATTCATAGTAGACACCGGGTTCAATTTCTAA
GCACAGATCTGCTGTGCCGACATGCGACTATCTGTTTTCTCGCGGGGCATCCCTGGTTCG
GTCGTCTTACAAGCCACCATGCCATGATCAGTTAAACCTGCAGATCCGGTTTTAATTTCC
ATATTGTCATCACTACCCGGAACTTTGTCCTCAGATTTCAATTGGTCCGGTAAAGAGACA
GGGAGAAAACCCTTTTGACGACATGTCTCAATTGATTCCACCAACATATCCTCGAGACTA
TACTTGAAGTTAAATCCCATATCAATCAGCTTCTTGGAACTGAACGCAATGCTCTTCAGA
TTCTCATCCACTCCTTCAAACGATGAAGGAACGTTATATTCTGGGTATTTTTGCCTGATA
AATTCTGAGATGCTAAGAATCGTTGCATCGTGAGAGGAACAAACATAACGTCCCTTGGCA
ACAGTTTGTTCGTACAAGAATATATGAGCGTTGCATAAGTCGTCCAAGTGCACATACTGT
CCTTGTCTTATGATGGAGTAATGTGCCTCGTTACGAGTGATAGGAGAGAGCGCGGTAATA
A

QA 1 721 1 721
DS 

RD RS1CW88TF 677 0 0
TTTTTTAACACTCAAAAGCAAATCACACATTCATAAACGATAAGACAATAGATTCATAGT
AGACACCGGGTTCAATTTCTAAGCACAGATCTGCTGTGCCGACATGCGACTATCTGTTTT
CTCGCGGGGCATCCCTGGTTCGGTCGTATTACAAGCCACCATGCCATGATCAGTTAAACC
TGCAGATCCGGTTTTAGTTTCCATATTGTCATCACTACCCGGAACTTTGTCCTCAGATTT
CAATTGGTCCGGTAAAGAGACAGGGAGAAAACCCTTTTGACGACATGTCTCAATTGATTC
CACCAACATATCCTCGAGACTATACTTGAAGTTAAATCCCATATCAATCAGCTTCTTGGA
ACTGAACGCAATGCTCCTCAGATTCTCATCCACTCCTTCAAACGATGAAGGAACGTTATA
TTCTGGGTATTTTTGCCTGATAAATTCTGAGATGCTAAGAATCGTTGCATCGTGAGAGGA
ACAAACATAACGTCCCTTGGCAACAGTTTGTTCGTACAAGAATATACGAGCGTTGCATAA
GTCGTCCAAGTGCACATACTGTCCTTGTCTTATGATGGAGTAATGTGCCTCGTTACGAGT
GATAGGAGAGAGCGCGGTAATAAGACTAGGCGGCATAGATGTTGTTATAAATGGACCGAT
CACCAATGTCGGGATA
C

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1DU01TF 708 0 0
ATACTTGAAGTTAAATCCCATATCAATCAGCTTCTTGGAACTGAACGCAATGCTCTTCAG
ATTCTCATCCACTCCTTCAAA**ATGAAGGAACGTTATATTCTGGGTATTTTTGCCTGAT
AAATTCTGAGATGCTAAGAATCGTTGCATCGTGAGAGGAACAAACATAACGTCCCTTGGC
AACAGTTTGTTCGTACAAGAATATATGAGCGTTGCATAAGTCGTCCAAGTGCACATACTG
TCCTTGTCTTATGATGGAGTAATGTGCCTCGTTACGAGTGATAGGAGAGAGCGCGGTAAT
AAGACTAGGCGGCATAGATGTTGTTATAAATGGACCGATCACCAATGTCGGGATAATACT
GATGAAATCTATTCCTTTTTCCTTTGCGTAATCCCAAGCTGCTTTCTCCGCTAACGTTTT
CGACATGAAATACATCCATCCGGTCATCTTCTTGGACATGATAAAGTCAAGATCACTCCA
ATCGTTTTCATCATAGACATTTTTCTGGTGTTCCTCAACATTGACCGTTCCAGCAGACGA
AGTGAACACAATTCTTCGTACGGTCTTTGCCTTATCACATGCTTTCACTATCCCCAACGC
TCCATTCACTGTCGGTTTTATCACTTCGTTCTCAGGATCCTTGGATTCAAAATCCATGGG
AGTTGCGATGTGGAAAACGCCGTCGCATCCGTTTATGGCGTCATCGTC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 8

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ACATGGCGTCCGTCGCCGCAAGTCCAGCTTTCTCACTCCTCAAGTTAACCACCGGAGGAG
CCTCTTCTTCCTCCGCCGCAACTCGCACACGCGCCTCCCTTTCCCCCATCCTCTCCAAAT
CCATCTCCACCCGTCCTCTAGGCTTCTCCGCCGTCCTAGACTCACGTTTCGCCGTCCATG
TCGCCTCGAAGGTTCAGTCTTTCCGCGGGAAAGGGACCAGAGGAGTTGTTTCCATGGCGA
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CTGATCTCAATGTACCTCTCGATGACAGTCAGACGATCACTGACGATACTAGGATCCGTG
CCGCTATTCCGACGATCAAGTACTTGATCGACAATGGTGCCAAAGTCATCCTCTCCACTC
ATCTGGGAAGGCCAAAGGGAGTAACACCGAAGTTTAGTTTGGCTCCTCTTGTCCCTAGGC
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ACAAGGAAGAAGAGAAGAACGATCCAGAGTTCGCTAAGAAGCTTGCTTCACTAGCTGACC
TCTACGTCAACGATGCTTTTGGAGCTGCTCACAGAGCTCATGCTTCCACTGAGGGTGTCA
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AGGTTGTGTCTGCATCAGGGATTGAGGATGGATGGATGGGGTTGGACATTGGACCAGACT
CGATTAAAACATTCAACGAAGCTTTGGACACAACACAGACAGTCATTTGGAATGGACCTA
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TCACCGTTTAGAAGAAGCTCACTCTTCTGATGAGGCGAACAAATGTATACTCTCATATGA
GTTTTTTTTT*ACTTTCTTTTGCTGTAAATCTACCTATTCAACAGTTTGACTTTTATTCA
CTACCTCCAAGTCAGAGACTTATTATTATCAATAAAAGTTACTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 35 35 35 
35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RS1AU05TF U 1
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AF RS1BF12TF U 767
AF RS1BQ08TF U 891
AF RS1BQ08JQ C 942
AF RS1D317JQ C 957
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AF RS1AU05JQ C 965
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ACATGGCGTCCGTCGCCGCAAGTCCAGCTTTCTCACTCCTCAAGTTAACCACCGGAGGAG
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CCATCTCCACCCGTCCTCTAGGCTTCTCCGCCGTCCTAGACTCACGTTTCGCCGTCCATG
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CTGATCTCAATGTACCTCTCGATGACAGTCAGACGATCACTGACGATACTAGGATCCGTG
CCGCTATTCCGACGATCAAGTACTTGATCGACAATGGTGCCAAAGTCATCCTCTCCACTC
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TATCTGAGCTTCTTGGTATTGAGGTCAAGAAAGCTGACGACTGTATCGGTCCTGAAGTTG
AGAGCTTGGTGGCTTCTCTACCTGACGGAGGAGTTTTGCTTCTTGAGAACGTCAG*TTCT
ACAAG*AAGAAGAGAAGA*CGATCCAGAGTTCGCTA

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DS 

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G
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GATCACTGACGATACTAGGATCCGTGCCGCTATTCCGACGATCAAGTACTTGATCGACAA
TGGTGCCAAAGTCATCCTCTCCACTCATCTGGGAAGGCCAAAGGGAGTAACACCGAAGTT
TAGTTTGGCTCCTCTTGTCCCTAGGCTATCTGAGCTTCTTGGTATTGAGGTCAAGAAAGC
TGACGACTGTATCGGTCCTGAAGTTGAGAGCTTGGTGGCTTCTCTACCTGACGGAGGAGT
TTTGCTTCTTGAGAACGTCAGGTTCTACAAGGAAGAAGAGAAGAACGATCCAGAGTTCGC
TAAGAAGCTTGCTTCACTAGCTGACCTCTACGTCAACGATGCTTTTGGAGCTGCTCACAG
AGCTCATGCTTCCACTGAGGGTGTCACAAAGTTCTTGAAGCCTTCTGTTGCTGGTTTCCT
TCTCCAAAAG*AGCTTGATTACCTTGTGGGTGCTGTTTCA
GCCC

QA 2 761 2 761
DS 

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G
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CTTGATTACCTTGTGGGTGCTGTTTCAAGCCCAAAGAGACCATTTGCAGCCATAGTTGGT
GGTTCCAAGGTCTCCTCCAAGATTGGAGTGATTGAATCGCTTCTTGAGAAGTGTGATATC
CTTCTTCTTGGTGGTGGAATGATCTTTACGTTCTACAAGGCGCAGGGTCTCTCTGTTGGT
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GCCAAAGGAGTCTCTCTTTTGTTGCCAACCGACGTTGTGGTTGCTGACAAGTTCGCTCCT
GATGCCAACAGTAAGGTTGTGTCTGCATCAGGGATTGAGGATGGATGGATGGGGTTGGAC
ATTGGACCAGACTCGATTAAAACATTCAACGAAGCTTTGGACACAACACAGACAGTCATT
TGGAATGGACCTATGGGAGTTTTCGAGATGGAGAAGTTTGCTGCTGGAACTGAGGCCATT
GCGAATAAACTAGCAGAGCTAAGTGAGAAAGGAGTGACGACGATAATAGGAGGAGGAGAC
TCAGTGGCTGCAGTGGAGAAAGTGGGAGTTGCAGGAGTCATGAGTCACATCTCAACTGGT
GGTGGAGCTAGCTTGGAGCTCTTGGAAG

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DS 

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CTTCTTGGTGGTGGAATGATCTTTACGTTCTACAAGGCGCAGGGTCTCTCTGTTGGTTCG
TCTTTAGTTGAAGAAGACAAGCTTGAGTTGGCTACATCACTCCTCGCCAAAGCTAAGGCC
AAAGGAGTCTCTCTTTTGTTGCCAACCGACGTTGTGGTTGCTGACAAGTTCGCTCCTGAT
GCCAACAGTAAGGTTGTGTCTGCATCAGGGATTGAGGATGGATGGATGGGGTTGGACATT
GGACCAGACTCGATTAAAACATTCAACGAAGCTTTGGACACAACACAGACAGTCATTTGG
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AATAAACTAGCAGAGCTAAGTGAGAAAGGAGTGACGACGATAATAGGAGGAGGAGACTCA
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GGAGCTAGCTTGGAGCTCTTGGAAGGTAAAGTACTTCCCGGTGTGATCGCTCTCGATGAA
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TCTCATATGAGTTTTTTTT**ACTTTCTTTTGCTGTAAATCTACCTATTCAACAGTTTGA
CTTTTATTCACTACCTCCAAG

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DS 

RD RS1BQ08JQ 725 0 0
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GTTGGTTCGTCTTTAGTTGAAGAAGACAAGCTTGAGTTGGCTACATCACTCCTCGCCAAA
GCTAAGGCCAAAGGAGTCTCTCTTTTGTTGCCAACCGACGTTGTGGTTGCTGACAAGTTC
GCTCCTGATGCCAACAGTAAGGTTGTGTCTGCATCAGGGATTGAGGATGGATGGATGGGG
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GTCATTTGGAATGGACCTATGGGAGTTTTCGAGATGGAGAAGTTTGCTGCTGGAACTGAG
GCCATTGCGAATAAACTAGCAGAGCTAAGTGAGAAAGGAGTGACGACGATAATAGGAGGA
GGAGACTCAGTGGCTGC*GTGGAGAAAGTGGGAGTTGCAGGAGTCATGAGTCATATCTCA
ACTGGTGGTGGAGCTAGCTTGGAGCTCTTGGAAGGTAAAGTACTTCCCGGTGTGATCGCT
CTCGATGAAGCAATCGCAGTCACCGTTTAGAAGAAGCTCACTCTTCTGATGAGGCGAACA
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ACAGTTTGACTTTTATTCACTACCTCCAAGTCAGAGACTTATTATTATCGATAAAAGTTA
CTT
GC

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DS 

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GTTGAAGAAGACAAGCTTGAGTTGGCTACATCACTCCTCGCCAAAGCTAAGGCCAAAGGA
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GACTCGATTAAAACATTCAACGAAGCTTTGGACACAACACAGACAGTCATTTGGAATGGA
CCTATGGGAGTTTTCGAGATGGAGAAGTTTGCTGCTGGAACTGAGGCCATTGCGAATAAA
CTAGCAGAGCTAAGTGAGAAAGGAGTGACGACGATAATAGGAGGAGGAGACTCAGTGGCT
GCAGTGGAGAAAGTGGGAGTTGCAGGAGTCATGAGTCATATCTCAACTGGTGGTGGAGCT
AGCTTGGAGCTCTTGGAAGGTAAAGTACTTCCCGGTGTGATCGCTCTCGATGAAGCAATC
GCAGTCACCGTTTAGAAGAAGCTCACTCTTCTGATGAGGCGAACAAATGTATACTCTCAT
ATGAGTTTTTTTTTTACTTTCTTTTGCTGTAAATCTACCTATTCAACAGTTTGACTTTTA
TTCACTACCTCCAAGTCAGAGACTTATTATTATCAATAAAAGTTACTT
GT

QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1BF12JQ 709 0 0
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TTGAAGAAGACAAGCTTGAGTTGGCTACATCACTCCTCGCCAAAGCTAAGGCCAAAGGAG
TCTCTCTTTTGTTGCCAACCGACGTTGTGGTTGCTGACAAGTTCGCTCCTGATGCCAACA
GTAAGGTTGTGTCTGCATCAGGGATTGAGGATGGATGGATGGGGTTGGACATTGGACCAG
ACTCGATTAAAACATTCAACGAAGCTTTGGACACAACACAGACAGTCATTTGGAATGGAC
CTATGGGAGTTTTCGAGATGGAGAAGTTTGCTGCTGGAACTGAGGCCATTGCGAATAAAC
TAGCAGAGCTAAGTGAGAAAGGAGTGACGACGATAATAGGAGGAGGAGACTCAGTGGCTG
CAGTGGAGAAAGTGGGAGTTGCAGGAGTCATGAGTCACATCTCAACTGGTGGTGGAGCTA
GCTTGGAGCTCTTGGAAGGTAAAGTACTTCCCGGTGTGATCGCTCTCGATGAAGCAATCG
CAGTCACCGTTTAGAAGAAGCTCACTCTTTTGATGAGGCGAACAAATGTATACTCTCATA
TGAGTTTTTTTTTTACTTTCTTTTGCTGTAAATCTACCTATTCAACAGTTTGACTTTTAT
TCACTACCTCCAAGTCAGAGACTTATTATTATCAACAAAAGTTACTT
GT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1AU05JQ 702 0 0
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AGACAAGCTTGAGTTGGCTACATCACTCCTCGCCAAAGCTAAGGCCAAAGGAGTCTCTCT
TTTGTTGCCAACCGACGTTGTGGTTGCTGACAAGTTCGCTCCTGATGCCAACAGTAAGGT
TGTGTCTGCATCAGGGATTGAGGATGGATGGATGGGGTTGGACATTGGACCAGACTCGAT
TAAAACATTCAACGAAGCTTTGGACCCAACACAGACAGTCATTTGGAATGGACCTATGGG
AGTTTTCGAGATGGAGAAGTTTGCTGCTGGAACTGAGGCCATTGCGAATAAACTAGCAGA
GCTAAGTGAGAAAGGAGTGACGACGATAATAGGAGGAGGAGACTCAGTGGCTGCAGTGGA
GAAAGTGGGAGTTGCAGGAGTCATGAGTCATATCTCAACTGGTGGTGGAGCTAGCTTGGA
GCTCTTGGAAGGTAAAGTACTTCCCGGTGTGATCGCTCTCGATGAAGCAATCGCAGTCAC
CGTTTAGAAGAAGCTCACTCTTCTGATGAGGCGAACAAATGTATACTCTCATATGAGTTT
TTTTTT*ACTTTCTTTTGCTGTAAATCTACCTATTCAACAGTTTGACTTTTATTCACTAC
CTCCAAGTCAGAGACTTATTATTATCAATAAAAGTTACTTAC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 8

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AAAAGTAAAATATAGCATGGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCGTTGTTCT
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CGAAAACGAGAAAGCAATACGTGCTAGTTGCGATTTTACATTCCCAAGGCGCGTGTGTTT
CTGCCACTTTCCATGTTAATCAACAGAACCGTTCCAAGATATTTTTATGCCGTATGCCAA
ATAAATATTACTAGATAACTTCCTGCAATATCGCGGAATAAAGTTCATTTCAATATTATT
ATAATAAGTTTTACATATAATTGAAATTTATAACAATTTCGATTAATTAATTTTTTGATA
AAATCAATGAATCTTTTTGATAGGTTAATAATGTAAGAATAACATTAATTTTATTACAAT
ATATTAACCATTTTAACA


BQ
35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 35 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 
50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1FI82JQ C 1
AF RS1C959JQ C 17
AF RS1FI82TF U 1
AF RS1C959TF U 17
AF RS1GM16TF U 1
AF RS1FZ75TF U 2
AF RS1A401TF U 1
AF RS1F032TF U 1
BS 1 140 RS1A401TF
BS 141 143 RS1F032TF
BS 144 558 RS1A401TF

RD RS1FI82JQ 434 0 0
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DS 

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GG
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AATTGAAATTTATAACAATTTCGATTAA

QA 3 450 3 450
DS 

RD RS1FI82TF 434 0 0
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CGAAAACGAGAAAGCAATACGTGCTAGTTGCGATTTTACATTCCCAAGGCGCGTGTGTTT
CTGCCACTTTCCATGTTAATCAACAGAACCGTTCCAAGATATTTTTATGCCGTATGCCAA
ATAAATATTACTAGATAACTTCCTGCAATATCGCGGAATAAAGTTCATTTCAATATTATT
ATAATAAGTTTTAC

QA 1 434 1 434
DS 

RD RS1C959TF 463 0 0
GG
ATACCTTCAAATTCAAAAAAAAAAAGAAAGAGAAAAAGTAAAAAAAGTAAAATATAGCAT
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AAAATCTTGTATGAAGGATGGTGATTGCCGGAAGATTTGCATCGAAAACGAGAAAGCAAT
ACGTGCTAGTTGCGATTCTACATTCCCAAGGCGCGTGTGTTTCTGCCACTTTCCATGTTA
ATCAACAGAACCGTTCCAAGATATTTTTATGCCGTATGCCAAATAAATATTACTAGATAA
CTTCCTGCAATATCGCGGAATAAAGTTCATTTCAATATTATTATAATAAGTTTTACATAT
AATTGAAATTTATAACAATTTCGATTAATTAATTTTTTGA
G

QA 3 462 3 462
DS 

RD RS1GM16TF 480 0 0
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TATTATCTTTTCTGCTTTCGAAGCACCAACAATTGTGGAAGGGCAGAAGTCATGCAAGAG
GCAGCCAAATTCAGGGAGAAAATCTTGTATGAAGGATGGTGATTGCCGGAAGATTTGCAT
CGAAAACGAGAAAGCAATACGTGCTAGTTGCGATTTTACATTCCCAAGGCGCGCGTGTTT
CTGCCACTTTCCATGTTAATCAACAGAACCGTTCCAAGATATTTTTATGCCGTATGCCAA
ATAAATATTACTAGATAACTTCCTGCAATATCGCGGAATAAAGTTCATTTCAATATTATT
ATAATAAGTTTTACATATAATTGAAATTTATAACAATTTCGATTAATTAATTTTTT
TGAT

QA 1 476 1 476
DS 

RD RS1FZ75TF 531 0 0
GG
TACAATAAACATAACATACCTTCAAATT***AAAAAAAAAGAAAGAGAAAAAGTAAAAAA
*GTAAAATATAGCATGGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCGTTGTTCTTAT
TATCTTTTCTGCTTTCGAAGCACCAACAATTGTGGAAGGGCAGAAGTCATGCAAGAGGC*
GCCAAATTCAGGGAGAAAATATTGTATGAAGGATGGTGATTGCCGGAAGATTTGCGTCGA
AACCGAGAAAGCATTACGTGCTAGTTGCGATTATACATTCCCAAGGCGCGTGTGTTTCTG
CCACTTTCCATGTTAATCAACAGAGCCGTTCCAAGACATTTTTATGCCCTATGCCAAATA
AATTTTACTAGATAACTTCCTGCAATATCGCGGAATAAAGTTCATTTCAATATTATTATA
ATAAGTTTTACATATAATTGAAATTTATAACAATTTCGATTAATTAATTTTTTGATAAAA
TCAATGAATCTTTTTGATAGGTTAATAATGTAAGAATAACATTAATTTT

QA 3 531 3 531
DS 

RD RS1A401TF 558 0 0
GGATACAATAAAAATAACATACCTTCAAATTCAAAAAAAAAAAGAAAGAGAAAAAGTAAA
AAAAGTAAAATATAGCATGGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCGTTGTTCT
TATTATCTTTTCTGCTTTCG***CACCAACAATTGTGGAAGGGCAGAAGTCATGCAAGAG
GCAGCCAAATTCAGGGAGAAAATCTTGTATGAAGGATGGTGATTGCCGGAAGATTTGCAT
CGAAAACGAGAAAGCAATACGTGCTAGTTGCGATTTTACATTCCCAAGGCGCGTGTGTTT
CTGCCACTTTCCATGTTAATCAACAGAACCGTTCCAAGATATTTTTATGCCGTATGCCAA
ATAAATATTACTAGATAACTTCCTGCAATATCGCGGAATAAAGTTCATTTCAATATTATT
ATAATAAGTTTTACATATAATTGAAATTTATAACAATTTCGATTAATTAATTTTTTGATA
AAATCAATGAATCTTTTTGATAGGTTAATAATGTAAGAATAACATTAATTTTATTACAAT
ATATTAACCATTTTAACA

QA 1 558 1 558
DS 

RD RS1F032TF 556 0 0
GGATACAATAAAAATAACATACCTTCAAATTCAAAAAAAAAAAGAAAGAGAAAAAGTAAA
AAAAGTAAAATATAGCATGGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCGTTGTTCT
TATTATCTTTTCTGCTTTCGAAGCACCAACAATTGTGGAAGGGCAGAAGTCATGCAAGAG
GCAGCCAAATTCAGGGAGAAAATCTTGTATGAAGGATGGTGATTGCCGGAAGATTTGCAT
CGAAAACGAGAAAGCAATACGTGCTAGTTGCGATTTTACATTCCCAAGGCGCGTGTGTTT
CTGCCACTTTCCATGTTAATCAACAGAACCGTTCCAAGATATTTTTATGCCGTATGCCAA
ATAAATATTACTAGATAACTTCCTGCAATATCGCGGAATAAAGTTCATTTCAATATTATT
ATAATAAGTTTTACATATAATTGAAATTTATAACAATTTCGATTAATTAATTTTTTGATA
AAATCAATGAATCTTTTTGATAGGTTAATAATGTAAGAATAACATTAATTTTATTACAAT
ATATTAACCATTTTAA

QA 1 556 1 556
DS 



AS 1 8

CO CL633Contig1 705 8 9 U
AGGGATCCTCAAAACTCGCGAGTGAACTCTCATCTTCTTCTTTCGCCCATAGCTACAATG
CTTAGTCTCTCAATTGCCTCGCCGGGGACGGCGGTGACTTTCCTCCGAGGAAACACTTCG
ACCTCTTCTTCGTTCCACGGCGTCAGAATCTCGCACAAAGCTTCGGCTCGCGTGCCCGCG
GCGGCGATTTCTTCGTACGGGAAACCTTCGGTGGTGATGATGTCGAAAAGAGAGGCGGAG
TTGAAAGATATCAGGGCGAAGACGACGGAGGAGCTGAACGAGGAGGTGATTGACCTTAAA
GGAGAGCTCTTTATGCTCCGTCTCCAGAAGTCGGCGAGGAACGAGTTCAAATCGAGCGAG
TTTCGCCGTATGAAGAAACAAGTAGCTCGGATATTGACGGTGAGAAGAGAGAGGGAGATA
GAAGAAGGGATAGGGAAGAGGTTGTCGAGGAAACTTGACAGGCAATGGAAGAAAAGCATT
GTTGTCAGACCACCTCCTTCTCTCAAGAAGCTTCAAGAGGAAGAAGCTGCTGAAGAGGCT
GCTGAAGCTGCCAAATCTGCTTGATAAACCCTAGCAGCCATTCTATTTCTCTGTTGATGT
TACTCTCTGTTGCTGGAAACCATATGCTATTTTGTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTGTTG
GTGTAAAAACTTTGTTCATTAAGCAGTTTACATAATTTCTAGTGG


BQ
10 10 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 
45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AU94TF U 0
AF RS1AY58TF U 28
AF RS1FJ31JQ C 1
AF RS1FJ31TF U 1
AF RS1A846TF U 2
AF RS1EU40TF U 3
AF RS1AY58JQ C 3
AF RS1EU40JQ C 124
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BS 3 114 RS1FJ31TF
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RD RS1AU94TF 570 0 0
GGGTT
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AAGATATCAGGGCGAAGACGACGGAGGAGCTGAACGAGGAGGTGATTGACCTTAAAGGAG
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TCAGACCACCTCCTTCTCTCAAGAAGCTTCAAGAGGAAGAAGCTGCTGAAGAGGCTGCTG
AAGCTGCCAAATCTGCTTGATAAAC

QA 6 570 6 570
DS 

RD RS1AY58TF 602 0 0
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ACGGCGGTGACTTTCCTCCGAGGAAACACTTCGACCTCTTCTTCGTTCCACGGCGTCAGA
ATCTCGCACAAAGCTTCGGCTCGCGTGCCCGCGGCGGCGATTTCTTCGTACGGGAAACCT
TCGGTGGTGATGATGTCGAAAAGAGAGGCGGAGTTGAAAGATATCAGGGCGAAGACGACG
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AAGTCGGCGAGGAACGAGTTCAAATCGAGCGAGTTTCGCCGTATGAAGAAACAAGTAGCT
CGGATATTGACGGTGAGAAGAGAGAGGGAGATAGAAGAAGGGATAGGGAAGAGGTTGTCG
AGGAAACTTGACAGGCAATGGAAGAAAAGCATTGTTGTCAGACCACCTCCTTCTCTCAAG
AAGCTTCAAGAGGAAGAAGCTGCTGAAGAGGCTGCTGAAGCTGCCAAATCTGCTTGATAA
ACCCTAGCAGCCATTCTATTTCTCTGTTGATGTTACTCTCTGTTGCTGGAA*CCATATGC
TA

QA 1 602 1 602
DS 

RD RS1FJ31JQ 700 0 0
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CTTAGTCTCTCAATTGCCTCGCCGGGGACGGCGGTGACTTTCCTCCGAGGAAAC*CTTCG
ACCTCTTCTTCGTTCCACGGCGTCAGAATCTCGCACAAAGCTTCGGCTCGCGTGCCCGCG
GCGGCGATTTCTTCGTACGGGAAACCTTCGGTGGTGATGATGTCGAAAAGATAGGCGGAG
TTGAAAGATATCAGGGCGAAGACGACGGAGGAGCTGAACGAGGAGGTGATTGACCTTAAA
GGAGAGCTCTTTATGCTCCGTCTCCAGAAGTCGGCGAGGAACGAGTTCAAATCGAGCGAG
TTTCGCCGTATGAAGAAACAAGTAGCTCGGATATTGACGGTGAGAAGAGAGAGGGAGATA
GAAGAAGGGATAGGGAAGAGGTTGTCGAGGAAACTTGACAGGCAATGGAAGAAAAGCATT
GTTGTCAGACCACCTCCTTCTCTCAAGAAGCTTCAAGAGGAAGAAGCTGCTGAAGAGGCT
GCTGAAGCTGCCAAATCTGCTTGATAAACCCTAGCAGCCATTCTATTTCTCTGTTGATGT
TACTCTCTGTTGCTGGAAACCATATGCTATTTTGTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTGTTG
GTGTAAAAACTTTGTTCATTAAGCAGTTTACATAATTTC
C

QA 1 699 1 699
DS 

RD RS1FJ31TF 700 0 0
AG
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CTCTTCTTCGTTCCACGGCGTCAGAATCTCGCACAAAGCTTCGGCTCGCGTGCCCGCGGC
GGCGATTTCTTCGTACGGGAAACCTTCGGTGGTGATGATGTCGAAAAGATAGGCGGAGTT
GAAAGATATCAGGGCGAAGACGACGGAGGAGCTGAACGAGGAGGTGATTGACCTTAAAGG
AGAGCTCTTTATGCTCCGTCTCCAGAAGTCGGCGAGGAACGAGTTCAAATCGAGCGAGTT
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CTCTCTGTTGCTGGAAACCATATGCTATTTTGTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTGTTGGT
GTAAAA*CTTTGTTCATTAAGCAGTTTACATAATTTC
C

QA 3 699 3 699
DS 

RD RS1A846TF 699 0 0
G
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TAGTCTCTCAATTGCCTCGCCGGGGACGGCGGTGACTTTCCTCCGAGGAAACACTTCGAC
CTCTTCTTCGTTCCACGGCGTCAGAATCTCGCACAAAGCTTCGGCTCGCGTGCCCGCGGC
GGCGATTTCTTCGTACGGGAAACCTTCGGTGGTGATGATGTCGAAAAGAGAGGCGGAGTT
GAAAGATATCAGGGCGAAGACGACGGAGGAGCTGAACGAGGAGGTGATTGACCTTAAAGG
AGAGCTCTTTATGCTCCGTCTCCAGAAGTCGGCGAGGAACGAGTTCAAATCGAGCGAGTT
TCGCCGTATGAAGAAACAAGTAGCTCGGATATTGACGGTGAGAAGAGAGAGGGAGATAGA
AGAAGGGATAGGGAAGAGGTTGTCGAGGAAACTTGACAGGCAATGGAAGAAAAGCATTGT
TGTCAGACCACCTCCTTCTCTCAAGAAGCTTCAAGAGGAAGAAGCTGCTGAAGAGGCTGC
TGAAGCTGCCAAATCTGCTTGATAAACCCTAGCAGCCATTCTATTTCTCTGTTGATGTTA
CTCTCTGTTGCTGGAAACCATATGCTATTTTGTTCTTCTCCTTCTTCTTCTTCTGTTGGT
GTAAAAACTTTGTTCATTAAGCAGTTTACATAATTTC
T

QA 2 698 2 698
DS 

RD RS1EU40TF 688 0 0
GGATCCTCAAAACTCGCGAGTGAACTCTCATCTTCTTCTTTCGCCCATAGCTACAATGCT
TAGTCTCTCAATTGCCTCGCCGGGGACGGCGGTGACTTTCCTCCGAGGAAACACTTCGAC
CTCTTCTTCGTTCCACGGCGTCAGAATCTCGCACAAAGCTTCGGCTCGCGTGCCCGCGGC
GGCGATTTCTTCGTACGGGAAACCTTCGGTGGTGATGATGTCGAAAAGAGAGGCGGAGTT
GAAAGATATCAGGGCGAAGACGACGGAGGAGCTGAACGAGGAGGTGATTGACCTTAAAGG
AGAGCTCTTTATGCTCCGTCTCCAGAAGTCGGCGAGGAACGAGTTCAAATCGAGCGAGTT
TCGCCGTATGAAGAAACAAGTAGCTCGGATATTGACGGTGAGAAGAGAGAGGGAGATAGA
AGAAGGGATAGGGAAGAGGTTGTCGAGGAAACTTGACAGGCAATGGAAGAAAAGCATTGT
TGTCAGACCACCTCCTTCTCTCAAGAAGCTTCAAGAGGAAGAAGCTGCTGAAGAGGCTGC
TGAAGCTGCCAAATCTGCTTGATAAACCCTAGCAGCCATTCTATTTCTCTGTTGATGTTA
CTCTCTGTTGCTGGAAACCATATGCTATTTTGTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTGTTGGT
GTAAAA*CTTTGTTCATTAAGCAGTTTA

QA 1 688 1 688
DS 

RD RS1AY58JQ 691 0 0
GGATCCTCAAAACTCGCGAGTGAACTCTCATCTTCTTCTTTCGCCCATAGCTACAATGCT
TAGTCTCTCAATTGCCTCGCCGGGGACGGCGGTGACTTTCCTCCGAGGAAACACTTCGAC
CTCTTCTTCGTTCCACGGCGTCAGAATCTCGCACAAAGCTTCGGCTCGCGTGCCCGCGGC
GGCGATTTCTTCGTACGGGAAACCTTCGGTGGTGATGATGTCGAAAAGAGAGGCGGAGTT
GAAAGATATCAGGGCGAAGACGACGGAGGAGCTGAACGAGGAGGTGATTGACCTTAAAGG
AGAGCTCTTTATACTCCGTCTCCAGAAGTCGGCGAGGAACGAGTTCAAATCGAGCGAGTT
TCGCCGTATGAAGAAACAAGTAGCTCGGATATTGACGGTGAGAAGAGAGAGGGAGATAGA
AGAAGGGATAGGGAAGAGGTTGTCGAGGAAACTTGACAGGCAATGGAAGAAAAGCATTGT
TGTCAGACCACCTCCTTCTCTCAAGAAGCTTCAAGAGGAAGAAGCTGCTGAAGAGGCTGC
TGAAGCTGCCAAATCTGCTTGATAAACCCTAGCAGCCATTCTATTTCTCTGTTGATGTTA
CTCTCTGTTGCTGGAAACCATATGCTATTTTGTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTGTTGGT
GTAAAAACTTTGTTCATTAAGCAGTTTACAT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1EU40JQ 582 0 0
TCTTCTTCGTTCCACGGCGTCAGAATCTCGCACAAAGCTTCGGCTCGCGTGCCCGCGGCG
GCGATTTCTTCGTACGGGAAACCTTCGGTGGTGATGATGTCGAAAAGAGAGGCGGAGTTG
AAAGATATCAGGGCGAAGACGACGGAGGAGCTGAACGAGGAGGTGATTGACCTTAAAGGA
GAGCTCTTTATGCTCCGTCTCCAGAAGTCGGCGAGGAACGAGTTCAAATCGAGCGAGTTT
CGCCGTATGAAGAAACAAGTAGCTCGGATATTGACGGTGAGAAGAGAGAGGGAGATAGAA
GAAGGGATAGGGAAGAGGTTGTCGAGGAAACTTGACAGGCAATGGAAGAAAAGCATTGTT
GTCAGACCACCTCCTTCTCTCAAGAAGCTTCAAGAGGAAGAAGCTGCTGAAGAGGCTGCT
GAAGCTGCCAAATCTGCTTGATAAACCCTAGCAGCCATTCTATTTCTCTGTTGATGTTAC
TCTCTGTTGCTGGAAACCATATGCTATTTTGTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTGTTGGTG
TAAAAACTTTGTTCATTAAGCAGTTTACATAATTTCTAGTGG

QA 1 582 1 582
DS 



AS 1 7

CO CL634Contig1 803 7 2 U
GCATAAAAATTACAATCGATAAAACTATTTTTCAAGATAATATTGTTATTTATAGTCCTC
CACACTCCTCCATCTAGAGGTGAAGGAAAGCTCAAGTAACCAAAATGAGATGAAACATTA
TCAATTACACAATTCCATAAACCCAATTGTTCAACTTTAGATCCAAAAGATTTTGCTTTT
TATTCAAAGAGACAGAAACAAACAACAAATAACTCAAGAGAGATTCTCAAAGAGCATAAA
CCAGAGCTCTCACATTCTTACTTGGTCTTGGTGGGTACCCATGGTTGGTACCTAGTCCAG
TTCTTTTGCCCCGGGTTCAAGGTATGTCCTTTGGAATGGTAAATGTATGCATCACCTTCT
CCAGAGAAGTTCTCCTTATGCTCAATCCCATACCTTTTTGGTTTCTGACTCAACAGCTCA
TCTCCAGTGTGATCAGTGATGAAATGAAGCCATCCGTGCCATTCGGCTGGTACTTGAGAT
GCGTTGTAACGATCCTTGGATGCGTACTCTACCCATCTGTGTCTACCGTATTGAGTATCA
CCCAGCTTCTGGTAGTATTTGTTACCGAACTTGTCGACACCAACAAGTGTTGCTCCTATG
TTGTGTATTTTAGTTTGCAAGAGGTTCCCATCTGGTAGGCATCTCAGGAAGCCTTCTTCA
CGGATCATCCTGAGGAAACCGCCGAGACCTTTCTCTCTAATCGTCTCTAACGCACTCTTC
GCCACCGTCAAAGCCATCGCTTTTTTTCCTCTTCACCTCTCTCACTCGGATTCGCCTGGA
TATTCGATTTCGACGTTCGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 10 

AF RS1BW24JQ U 1
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AF RS1F062JQ U 98
AF RS1AZ29JQ U 127
AF RS1AZ29TF C 182
AF RS1D502JQ U 120
AF RS1D502TF C 120
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BS 758 803 RS1F062JQ

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CGGATCATCCTGAGGAAACCGCCGAGACCTTTCTCTCTAATCGTCTCTAACGCACTCTTC
GCCACCGTCAAAGCCATCGCTTTTTTTCCTCTTCACC

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AGACAGAAACAAACAACAAATAACTCAAGAGAGATTCTCAAAGAGCATAAACCAGAGCTC
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CCCGGGTTCAAGGTATGTCCTTTGGAATGGTAAATGTATGCATCACCTTCTCCAGAGAAG
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TGATCAGTGATGAAATGAAGCCATCCGTGCCATTCGGCTGGTACTTGAGATGCGTTGTAA
CGATCCTTGGATGCGTACTCTACCCATCTGTGTCTACCGTATTGAGTATCACCCAGCTTC
TGGTAGTATTTGTTACCGAACTTGTCGACACCAACAAGTGTTGCTCCTATGTTGTGTATT
TTAGTTTGCAAGAGGTTCCCATCTGGTAGGCATCTCAGGAAGCCTTCTTCACGGATCATC
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AAAGCCATCGCTTTTTTTCCTCTTCACCTCTCTCACTCGGATTCGCCTGGATATTCGATT
TCGAC

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DS 

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CCCATGGTTGGTACCTAGTCCAGTTCTTTTGCCCCGGGTTCAAGGTATGTCCTTTGGAAT
GGTAAATGTATGCATCACCTTCTCCAGAGAAGTCCTCCTTATGCTCAATCCCATACCTTT
TTGGTTTCTGACTCAACAGCTCATCTCCAGTGTGATCAGTGATGAAATGAAGCCATCCGT
GCCATTCGGCTGGTACTTGAGATGCGTTGTAACGATCCTTGGATGCGTACTCTACCCATC
TGTGTCTACCGTATTGAGTATCACCCAGCTTCTGGTAGTATTTGTTACCGAACTTGTCGA
CACCAACAAGTGTTGCTCCTATGTTGTGTATTTTAGTTTGCAAGAGGTTCCCATCTGGTA
GGCATCTCAGGAAGCCTTCTTCACGGATCATCCTGAGGAAACCGCCGAGACCTTTCTCTC
TAATCGTCTCTAACGCACTCTTCGCCACCGTCAAAGCCATCGCTTTTTTTCCTCTTCACC
TCTCTCACTCGGATTCGCCTGGATATTCGATTTCGACGTTCGTCCC

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GT
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GAGACAGAAACAAACAACAAATAACTCAAGAGAGATTCTCAAAGAGCATAAACCAGAGCT
CTCACATTCTTACTTGGTCTTGGTGGGTACCCATGGTTGGTACCTAGTCCAGTTCTTTTG
CCCCGGGTTCAAGGTATGTCCTTTGGAATGGTAAATGTATGCATCACCTTCTCCAGAGAA
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GTGATCAGTGATGAAATGAAGCCATCCGTGCCATTCGGCTGGTACTTGAGATGCGTTGTA
ACGATCCTTGGATGCGTACTCTACCCATCTGTGTCTACCGTATTGAGTATCACCCAGCTT
CTGGTAGTATTTGTTACCGAACTTGTCGACACCAA**AGTGTTGCTCCTATGTTGTGTAT
TTTAGTTTGCAAGAGGTTCCCATCTGGTAGGTATCTCAGGAAGCCTTCTTCACGGATCAT
CCTGAGGAAACCGCCGAGACCTTTCTCTCTAATCGTCTCTAACGCACTCTTCGCCACCGT
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TTCGACGTTCGTCC

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TCTTTTGCCCCGGGTTCAAGGTATGTCCTTTGGAATGGTAAATGTATGCATCACCTTCTC
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ATTCGATTTCGACGTTCGTCC

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TTATTCAAAGAGACAGAAACAAACAACAAATAACTCAAGAGAGATTCTCAAAGAGCATAA
ACCAGAGCTCTCACATTCTTACTTGGTCTTGGTGGGTACCCATGGTTGGTACCTAGTCCA
GTTCTTTTGCCCCGGGTTCAAGGTATGTCCTTTGGAATGGTAAATGTATGCATCACCTTC
TCCAGAGAAGTTCTCCTTATGCTCAATCCCATACCTTTTTGGTTTCTGACTCAACAGCTC
ATCTCCAGTGTGATCAGTGATGAAATGAAACCATCCGTGCCATTCGGCTGGTACTTGAGA
TGCGTTGTAACGATCCTTGGATGCGTACTCTACCCATCTGTGTCTACCGTATTGAGTATC
ACCCAGCTTCTGGTAGTATTTGTTACCGAACTTGTCGACACCAACAAGTGTTGCTCCTAT
GTTGTGTATTTTAGTTTGCAAGAGGTTCCCATCTGGTAGGCATCTCAGGAAGCCTTCTTC
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CGCCACCGTCAAAGCCATCGCTTTTTTTCCTCTTCACCTCTCTCACTCGGATTCGCCTGG
ATATTCGATTTCGACGTTCGTCC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 8

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TGAAGAGCTCCTTTGTTGTGTCATCTTCAGCTGGATGATTTCATTACTTCAACAATTCTG
CTGAGGGAAATAAACTTTGCTAGAGTTTTTACCTAAAGATTATCTATTGAAAGAGTTCGA
TTTCCATTTC


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1BR77JQ C 115
AF RS1AV53JQ C 31
AF RS1AV53TF U 31
AF RS1BR77TF U 31
AF RS1E921JQ C 1
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AF RS1BB54JQ C 2
AF RS1BB54TF U 2
BS 1 1 RS1E921JQ
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RD RS1BR77JQ 471 0 0
TTTTTT
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QA 7 471 7 471
DS 

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ACCTAAAGATTATCT

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DS 

RD RS1AV53TF 555 0 0
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ACCTAAAGATTATCT

QA 1 555 1 555
DS 

RD RS1BR77TF 555 0 0
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ACCTAAAGATTATCT

QA 1 555 1 555
DS 

RD RS1E921JQ 610 0 0
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CAATAAGCTATCTTCGTCATCATCGACGACAGGGAGAACACTCTTCGCTCGTTCTTCTTC
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GCTTATACCGTTACATAGTGTTACTGCTTCAGCTTTACTCACTTCGTTGCTGTCTCTTAG
CAATCAGAGCTGGGGTTGCTTATCTGAAGGATTTGGAACGGCACTATAACATGGACTGCG
AGTTTTTGACTCCTCCAGGGTTTACTTGTCAGATCCCAAGAAACCCTTTTCATCATTTCA
TCATCGGTGGTCTGCAGTTTTTTTTTTGTCCCCCAAAAGGTTTCAGATAACATTTCTCTT
TGAAGAGCTCCTTTGTTGTGTCATCTTCAGTTGGATGATTTCATTACTTCAACAATTCTG
CTGAGGGAAATAAACTTTGCTAGAGTTTT*ACCTAAAGATTATCTATTGAAAGAGTTCGA
TTTCCATTTC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RS1E921TF 610 0 0
G
GGAAGGGCGAAGCAAAGGAGTTGAAGAAACATGGCGGCCAACGGCGTGAGAAGGGCCCTC
AATAAGCTATCTTCGTCATCATCGACGACAGGGAGAACACTCTTCGCTCGTTCTTCTTCT
GGTCCGAGTGTCGGAAAATCAGCTGGATTCGCTTTCTCGAACGGATCATCTTCATCTCGC
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CATCGGTGGTCTGCAGTTTTTTTTTTGTCCCCCAAAAGGTTTCAGATAACATTTCTCTTT
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TTCCATTTC

QA 1 609 1 609
DS 



AS 2 7

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CTGCAGTCAGTACGGTTATTGTGGTACCACTGCTGCTTACTGCGGTGCTGGGTGTCGGTC
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ATATGGTTTCTTTAACAACATTATCAACCAAGCCAGTAATGGCTGCGCCGGGAAAAGCTT
CTACACCCGCGACTCTTTCGTCAACGCTGCTAATACATTCCCAAACTTTGCTAGTTCCGT
TACTAGGCGTGAAATTGCAACCATGTTTGCTCATTTCACTCACGAGACAGGACACTTCTG
CTATATAGAAGAAATAAACGGAGCGTCACGAGACTACTGCGATGAGAACAACAGGCAATA
CCCATGTGCACCGGGTAAAGGCTACTACGGTCGTGGACCGATCCAGCTATCATGGAACTA
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GGGTAGCAACCCAACTGTGGCTTTCAGGACAGGTCTTTGGTTTTGGATGAATAGCGTAAG
ACCGGTACTGAACCAAGGGTTTGGAGCGACCATTAGAGCCATCAACGGAATGGAGTGTAA
CGGTGGGAACCCGGGTGCCGTCAATGCAAGGATTACGTACTATAGAAACTATTGTGGACA
GCTTGGTGTCGACCCTGGTTCTAACCTTGGCTGCTAAGAAACTCTATGCACACACATGTA
AGGTTGCAAATTATATGGGACGTTTGTGTTTAAGGTGAAATAATAAGTGTCTAAGTGAGA
TGGTAAAGTTATACTTCACGTATGTACTTTGCGTTGTGTTTCAAATTTCAATGTTCTTTG
CTCGAAAGCAAATGTTGTTGTAATAATTGTGAAAAGTGATTTTCTTTTGTACCGTCTTGT
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GTTCTTCG


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DK12TF U 1
AF RS1E373TF U 1
AF RS1D980TF U 2
AF RS1D980JQ C 252
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DS 

RD RS1E373TF 623 0 0
G
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QA 2 623 2 623
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GGTCCTTGTAGTGGCAGTGGAACCCCTTCTAGTGGTGGATCGGTCGGTAGCATTGTGACA
TATGGTTTCTTTAACAACATTATCAACCAAGCCAGTAATGGCTGCGCCGGGAAAAGCTTC
TACACCCGCGACTCTTTCGTCAACGCTGCTAATACATTCCCAAACTTTGCTAGTTCCGTT
ACTAGGCGTGAAATTGCAACCATGTTTGCTCATTTCACTCACGAGACAGGACACTTCTGC
TATATAGAAGAAATAAACGGAGCGTCACGAGACTACTGCGATGAGAACAACAGGCAATAC
CCATGTGCACCGGGTAAAGGCTACTACGGTCGTGGACCGATCCAGCTATCATGGAACTAC
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GGTAGCAACCCAACTGTGGCTT

QA 1 622 1 622
DS 

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ACTCTTTCGTCAACGCTGCTAATACATTCCCAAACTTTGCTAGTTCCGTTACTAGGCGTG
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AAATAAACGGAGCGTCACGAGACTACTGCGATGAGAACAACAGGCAATACCCATGTGCAC
CGGGTAAAGGCTACTACGGTCGTGGACCGATCCAGCTATCATGGAACTACAATTACGGAG
CATGCGGCCAGAGTCTCGGCCTTAATCTCCTACGCCAGCCAGAACTAGTGGGTAGCAACC
CAACTGTGGCTTTCAGGACAGGTCTTTGGTTTTGGATGAATAGCGTAAGACCGGTACTGA
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CGGGTGCCGTCAATGCAAGGATTACGTACTATAGAAACTATTGTGGACAGCTTGGTGTCG
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TATATGGGACGTTTGTGTTTAAGGTGAAATAATAAGTGTCTAAGTGAGATGGTAAAGTTA
TACTTCACGTATGTACTTTGCGTTGTGTTTCAAATTTCAATGTTCTTTGCTCGAAAGCAA
ATGTTGTTGTAATAATTGTGAAAAGTGATTTTCTTTTGTACCGTCTTGTGGAAGTGAATT
TAAGATTAAAAAGTGTGTTGAGTGATATTTATTGTCTTATATAATATTTGTTCTTCG

QA 1 837 1 837
DS 



CO CL636Contig2 1004 3 20 U
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TCACTTCCACAAAACGGTACAAAAAAAAATCACTTTTCAAAATTATTACAACAACATTTG
CTTTCAAGCAAAAAACATTGAAATTTGAAACACAACGCAAAGTACATACGTGAAGTATAA
CTTTACCATCTCACTTAAACACTTATTATTTCACCTTAAACACAAACGTCCCATATAATT
TGCAACCTTACATGTGTGTGCATAAAGTTTCTTACCACCCAAGGTTAAAACCAGGGTCGA
CACCAAGCTGTCCACAATAGTTTCTATAGTACGTAATCCTTGCATTGACGGCACCCGGGT
TCCCACCGTTACACTCCATTCCGTTGATGGCTCTAATGGTCGCTCCAAACCCTTGGTTCA
GTACCGGTCTTACGCTATTCATCCAAAACCAAAAACCTGTCCTGAAAGCCACAGTTGGGT
TGCTACCCACTAGTTCTGGCTGGCGTAGGAAATTAAGGCCGAAACTCTGGCCGCATGCTC
CGTAATTGTAGTCTCGTGACGCTCCGTTTATTTCTTCTATATAGCAAAAGTGTCCTGTCT
CGTGAGTGAAATGAGCAAACATGGTCGCAATTTCACGCCTAGTAACGGAACTAGCAAAGT
TTGGGAATGTATTAGCAGCGTTGACGAAAGAGTCGCGGGTGTAGAAGCTTTTCCCGGCGC
AGCCATTACTGGCTTGGTTGATAATGTTGTTAAAGAAACCATATGTCACAATGCTACCGA
CCGATCCACCACTAGAAGGGGTTCCACTGCCACTACAAGGACCCGACCGACACCCAGCAC
CGCAGTAAGCAGCAGTGGTACCACAATAACCGTACTGACTGCAGCATAAGTTTGGGGCGC
AGCCGCAGTTCTGAGAGTTGACTGTTTCGGAGTAGAAACCTAAGAGGCAGAGGAGAAGGA
TTAAAGAGATTTTTGTGAGACCCATATTTTGTATTTGTGGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E373JQ U 34
AF RS1H138JQB U 1
AF RS1H138TF C 365
BS 1 72 RS1H138JQB
BS 73 73 RS1E373JQ
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BS 85 85 RS1E373JQ
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BS 126 126 RS1E373JQ
BS 127 132 RS1H138JQB
BS 133 133 RS1E373JQ
BS 134 197 RS1H138JQB
BS 198 198 RS1E373JQ
BS 199 264 RS1H138JQB
BS 265 265 RS1E373JQ
BS 266 274 RS1H138JQB
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BS 276 277 RS1H138JQB
BS 278 278 RS1E373JQ
BS 279 287 RS1H138JQB
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BS 289 689 RS1H138JQB
BS 690 1004 RS1H138TF

RD RS1E373JQ 492 0 0
CACTCAACACACTTTTTAATCTTAAATTCACTTCCACAAAACGGTACAAAAAAAAATCAC
TTTTCACAATTATTACAACAACATTTGCTTTCAAGCAAAAAACATTGAAATTTGAAACAC
AACGCAAAGTACATACGTGAAGTATAACTTTACCATCTCACTTAAACACTTATTATTTCA
CCTTAAACACAAACGTCCCATATAATTTGCAACCTTACATGTGTGTGCATAAAGTTTCTT
ACCACCCAAGGTTAAAACCAGGGTCGACACCAAGCTGTCCACAATAGTTTCTATAGTACG
TAATCCTTGCATTGACGGCACCCGGGTTCCCACCGTTACACTCCATTCCGTTGATGGCTC
TAATGGTCCCTCCAAACCCTTGGTTCAGTACCGGTCTTACCCTATTCATCCAAAACCAAA
AACCTGTCCTGAAAGCCACAGTTGGGTTGCTACCCACTAGTTCTGGCTGGCGTAGGAAAT
TAAGGCC
AAAAC

QA 1 487 1 487
DS 

RD RS1H138JQB 689 0 0
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TCACTTCCACAAGACGGTACAAAAGAAAATCACTTTTCAAAATTATTACAACAACATTTG
CTTTCGAGCAAAGAACATTGAAATTTGAAACACAACGCAAAGTACATACGTGAAGTATAA
CTTTACCATCTCACTTAGACACTTATTATTTCACCTTAAACACAAACGTCCCATATAATT
TGCAACCTTACATGTGTGTGCATAGAGTTTCTTAGCAGCCAAGGTTAGAACCAGGGTCGA
CACCAAGCTGTCCACAATAGTTTCTATAGTACGTAATCCTTGCATTGACGGCACCCGGGT
TCCCACCGTTACACTCCATTCCGTTGATGGCTCTAATGGTCGCTCCAAACCCTTGGTTCA
GTACCGGTCTTACGCTATTCATCCAAAACCAAAAACCTGTCCTGAAAGCCACAGTTGGGT
TGCTACCCACTAGTTCTGGCTGGCGTAGGAAATTAAGGCCGAAACTCTGGCCGCATGCTC
CGTAATTGTAGTCTCGTGACGCTCCGTTTATTTCTTCTATATAGCAAAAGTGTCCTGTCT
CGTGAGTGAAATGAGCAAACATGGTCGCAATTTCACGCCTAGTAACGGAACTAGCAAAGT
TTGGGAATGTATTAGCAGCGTTGACGAAA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1H138TF 640 0 0
ACCGTTACACTCCATTCCGTTGATGGCTCTAATGGTCGCTCCAAACCCTTGGTTCAGTAC
CGGTCTTACGCTATTCATCCAAAACCAAAGACCTGTC*TGAAAGCCACAGTTGGGTTGCT
ACCCACTAGTTCTGGCTGGCGTAGGAGATTAAGGCCGAGACTCTGGCCGCATGCTCCGTA
ATTGTAGTCTCGTGACGCTCCGTTTATTTCTTCTATATAGCAGAAGTGTCCTGTCTCGTG
AGTGAAATGAGCAAACATGGTCGCAATTTCACGCCTAGTAACGGAACTAGCAAAGTTTGG
GAATGTATTAGCAGCGTTGACGAAAGAGTCGCGGGTGTAGAAGCTTTTCCCGGCGCAGCC
ATTACTGGCTTGGTTGATAATGTTGTTAAAGAAACCATATGTCACAATGCTACCGACCGA
TCCACCACTAGAAGGGGTTCCACTGCCACTACAAGGACCCGACCGACACCCAGCACCGCA
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GCAGTTCTGAGAGTTGACTGTTTCGGAGTAGAAACCTAAGAGGCAGAGGAGAAGGATTAA
AGAGATTTTTGTGAGACCCATATTTTGTATTTGTGGATCC

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 8

CO CL637Contig1 740 8 7 U
CCTTGGTCCTTGAAAGAGAGGACAGGGATATACAAAGGGAAACCAAGACCCACAACACAT
ACAAAGGATAATAAAACTGTTTTCACTCGACCCTT*GCTTGCGTTATTCTATATTTGCGT
GATAAAAGAACAAGTTCTTGTAATAAATAGTAAGACTAAAAAAGGACATGACATTTATTT
TGGTAGCAAAGCTTTTGCAACTCGTCAACTAGTTATTCAGAGGAATTCACCCACACCACA
GCGAGGGTCACAAGAGAAGCATACACTGAAGTAGGCAGCTTATGCACCACTTTCCCAACA
CCTGGGACACCTTCCGTGGCCTTCTTTGTAGCGATAGCCACAGTGGGAGCCACGATCAAC
GATATGATCAAACCCTGACTCACAACCGCCAACGTGTCGGTCGAAAGCAGCTCAATAAAC
TTCACAAACTCCTCCCGGTCAATTTCTCCATCCAAGTTCATATCACACTCCGTCATAATG
CTCCGGACAAGATCCTTAGAAGGCGGATCGAAATGAGGACCAGGCAATCGCTTGTTTATG
TCATTGTAGACCAGAAGCACGGCGATGTATAGCTCTTCAAAACTAAGATTGGCTCTTCCG
GTTTCAAGCTTGAACCGATCGAAAACACGATCACATATCGCCTGTACCTGTTTTTGCCTC
CACTGCTTGCCTCGGAGCTTGTCGAAGACTTGTCCCATGGCGATGAGTTTCTTCTTGTCT
GATGTGCAAATCTGATTTCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1C124JQ U 5
AF RS1E287JQ U 1
AF RS1BR21TF C 14
AF RS1BR21JQ U 5
AF RS1E287TF C 148
AF RS1C124TF C 54
AF RS1DW88JQ U 182
AF RS1DW88TF C 182
BS 1 396 RS1E287JQ
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BS 728 740 RS1DW88JQ

RD RS1C124JQ 499 0 0
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CAAACTCCTCCCGGTCAATTTCTCCATCCAAGTTCATATCACACTCCGTCATAATGCTCC
GGACAAGATCCTTAGAAGG

QA 1 499 1 499
DS 

RD RS1E287JQ 706 0 0
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ACAAAGGATAATAAAACTGTTTTCACTCGACCCTT*GCTTGCGTTATTCTATATTTGCGT
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TGGTAGCAAAGCTTTTGCAACTCGTCAACTAGTTATTCAGAGGAATTCACCCACACCACA
GCGAGGGTCACAAGAGAAGCATACACTGAAGTAGGCAGCTTATGCACCACTTTCCCAACA
CCTGGGACACCTTCCGTGGCCTTCTTTGTAGCGATAGCCACAGTGGGAGCCACGATCAAC
GATATGATCAAACCCTGACTCACAACCGCCAACGTGCCGGTCGAAAGCAGCTCAATAAAC
TTCACAAACTCATCCCGGTCAATTTCTCCATCCAAGTTCATATCACACTCCGTCATAATG
CTCCGGACAAGATCCTTAGAAGGCGGATCGAAATGAGGACCAGGCAATCGCTTGTTTATG
TCATTGTAGACCAGAAGCACGGCGATGTATAGCTCTTCAAAACTAAGATTGGCTCTTCCG
GTTTCAAGCTTGAACCGATCGAAAACACGATCACATATCGCCTGTACCTGTTTTTGCCTC
CACTGCTTGCCTCGGAGCTTGTCGAAGACTTGTCCCATGGCGATGA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RS1BR21TF 685 0 0
AAAGAGA
GACAGGGATATACAAAGGGAAACCAAGACCCACAACACATACAAAGGATAATAAA*CTGT
TTTCACTCGACCCTT*GCTTGCGTTATTCTATATTTGCGTGATAAAAGAACAAGTTCTTG
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CTCGTCAACTAGTTATTCAGAGGAATTCACCCACACCACAGCGAGGGTCACAAGAGAAGC
ATACACTGAAGTAGGCAGCTTATGCACCACTTTCCCAACACCTGGGACACCTTCCGTGGC
CTTCTTTGTAGCGATAGCCACAGTGGGAGCCACGATCAACGATATGATCAAACCCTGACT
CACAACCGCCAACGTGTCGGTCGAAAGCAGCTCAATAAACTTCACAAACTCCTCCCGGTC
AATTTCTCCATCCAAGTTCATATCACACTCCGTCATAATGCTCCGGACAAGATCCTTAGA
AGGCGGATCGAAATGAGGACCAGGCAATCGCTTGTTTATGTCATTGTAGACCAGAAGCAC
GGCGATGTATAGCTCTTCAAAACTAAGATTGGCTCTTCCGGTTTCAAGCTTGAACCGATC
GAAAACACGATCACATATCGCCTGTACCTGTTTTTGCCTCCACTGCTTGCCTCGGAGCTT
GTCGAAGACTTGTCCCAT

QA 8 685 8 685
DS 

RD RS1BR21JQ 726 0 0
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AGGATAATAAAACTGTTTTCACTCGACCCTT*GCTTGCGTTATTCTATATTTGCGTGATA
AAAGAACAAGTTCTTGTAATAAATAGTAAGACTAAAAAAGGACATGACATTTATTTTGGT
AGCAAAGCTTTTGCAACTCGTCAACTAGTTATTCAGAGGAATTCACCCACACCACAGCGA
GGGTCACAAGAGAAGCATACACTGAAGTAGGCAGCTTATGCACCACTTTCCCAACACCTG
GGACACCTTCCGTGGCCTTCTTTGTAGCGATAGCCACAGTGGGAGCCACGATCAACGATA
TGATCAAACCCTGACTCACAACCGCCAACGTGTCGGTCGAAAGCAGCTCAATAAACTTCA
CAAACTCCTCCCGGTCAATTTCTCCATCCAAGTTCATATCACACTCCGTCATAATGCTCC
GGACAAGATCCTTAGAAGGCGGATCGAAATGAGGACCAGGCAATCGCTTGTTTATGTCAT
TGTAGACCAGAAGCACGGCGATGTATAGCTCTTCAAAACTAAGATTGGCTCTTCCGGTTT
CAAGCTTGAACCGATCGAAAACACGATCACATATCGCCTGTACCTGTTTTTGCCTCCACT
GCTTGCCTCGGAGCTTGTCGAAGACTTGTCCCATGGCGATGAGTTTCTTCTTGTCTGATG
TGC
CCC

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RD RS1E287TF 582 0 0
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ACTAGTTATTCAGAGGAATTCACCCACACCACAGCGAGGGTCACAAGAGAAGCATACACT
GAAGTAGGCAGCTTATGCACCACTTTCCCAACACCTGGGACACCTTCCGTGGCCTTCTTT
GTAGCGATAGCCACAGTGGGAGCCACGATCAACGATATGATCAAACCCTGACTCACAACC
GCCAACGTGCCGGTCGAAAGCAGCTCAATAAACTTCACAAACTCATCCCGGTCAATTTCT
CCATCCAAGTTCATATCACACTCCGTCATAATGCTCCGGACAAGATCCTTAGAAGGCGGA
TCGAAATGAGGACCAGGCAATCGCTTGTTTATGTCATTGTAGACCAGAAGCACGGCGATG
TATAGCTCTTCAAAACTAAGATTGGCTCTTCCGGTTTCAAGCTTGAACCGATCGAAAACA
CGATCACATATCGCCTGTACCTGTTTTTGCCTCCACTGCTTGCCTCGGAGCTTGTCGAAG
ACTTGTCCCATGGCGATGAGTTTCTTCTTGTCTGATGTGC
CC

QA 1 580 1 580
DS 

RD RS1C124TF 687 0 0
AACACATACAAAGGATAATAAAACTGTTTTCACTCGACCCTTTGCTTGCGTTATTCTATA
TTTGCGTGATAAAAGAACAAGTTCTTGTAATAAATAGTAAGACTAAAAAAGGACATGACA
TTTATTTTGGTAGCAAAGCTTTTGCAACTCGTCAACTAGTTATTCAGAGGAATTCACCCA
CACCACAGCGAGGGTCACAAGAGAAGCATACACTGAAGTAGGCAGCTTATGCACCACTTT
CCCAACACCTGGGACACCTTCCGTGGCCTTCTTTGTAGCGATAGCCACAGTGGGAGCCAC
GATCAACGATATGATCAAACCCTGACTCACAACCGCCAACGCGTCGGTCGAAAGCAGCTC
AATAAACTTCACAAACTCCTCCCGGTCAATTTCTCCATCCAAGTTCATATCACACTCCGT
CATAATGCTCCGGACAAGATCCTTAGAAGGCGGATCGAAATGAGGACCAGGCAATCGCTT
GTTTATGTCATTGTAGACCAGAAGCACGGCGATGTATAGCTCTTCAAAACTAAGATTGGC
TCTTCCGGTTTCAAGCTTGAACCGATCGAAAACACGATCACATATCGCCTGTACCTGTTT
TTGCC*CCACTGCTTGCCTCGGAGCTTGTCGAAGACTTGTCCCATGGCGATGAGTTTCTT
CTTGTCTGATGTGCAAATCTGATTTCC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1DW88JQ 559 0 0
GGTAGCAAAGCTTTTGCAACTCGTCAACTAGTTATTCAGAGGAATTCACCCACACCACAG
CGAGGGTCACAAGAGAAGCATACACTGAAGTAGGCAGCTTATGCACCACTTTCCCAACAC
CTGGGACACCTTCCGTGGCCTTCTTTGTAGCGATAGCCACAGTGGGGGCCACGATCAACG
ATATGATCAAACCCTGACTCACAACCGCCAACGTGTCGGTCGAAAGCAGCTCAATAAACT
TCACAAACTCCTCCCGGTCAATTTCTCCATCCAAGTTCATATCACACTCCGTCATAATGC
TCCGGACAAGATCCTTAGAAGGCGGATCGAAATGAGGACCAGGCAATCGCTTGTTTATGT
CATTGTAGACCAGAAGCACGGCGATGTATAGCTCTTCAAAACTAAGATTGGCTCTTCCGG
TTTCAAGCTTGAACCGATCGAAAACACGATCACATATCGCCTGTACCTGTTTTTGCCTCC
ACTGCTTGCCTCGGAGCTTGTCGAAGACTTGTCCCATGGCGATGAGTTTCTTCTTGTCTG
ATGTGCAAATCTGATTTCC

QA 1 559 1 559
DS 

RD RS1DW88TF 559 0 0
GGTAGCAAAGCTTTTGCAACTCGTCAACTAGTTATTCAGAGGAATTCACCCACACCACAG
CGAGGGTCACAAGAGAAGCATACACTGAAGTAGGCAGCTTATGCACCACTTTCCCAACAC
CTGGGACACCTTCCGTGGCCTTCTTTGTAGCGATAGCCACAGTGGGGGCCACGATCAACG
ATATGATCAAACCCTGACTCACAACCGCCAACGTGTCGGTCGAAAGCAGCTCAATAAACT
TCACAAACTCCTCCCGGTCAATTTCTCCATCCAAGTTCATATCACACTCCGTCATAATGC
TCCGGACAAGATCCTTAGAAGGCGGATCGAAATGAGGACCAGGCAATCGCTTGTTTATGT
CATTGTAGACCAGAAGCACGGCGATGTATAGCTCTTCAAAACTAAGATTGGCTCTTCCGG
TTTCAAGCTTGAACCGATCGAAAACACGATCACATATCGCCTGTACCTGTTTTTGCCTCC
ACTGCTTGCCTCGGAGCTTGTCGAAGACTTGTCCCATGGCGATGAGTTTCTTCTTGTCTG
ATGTGCAAATCTGATTTCC

QA 1 559 1 559
DS 



AS 2 8

CO CL638Contig1 807 4 7 U
GCGGTTAAATCGAAAATATATATATCAGCCAAACAAGTACTT*GTTAAAAGAACAAAAAT
CACAATCATACAACTTCATCGTTGCATCTTATCTTTACTTAGGATAAAGTCCAATATTTT
GGTATACTATGACGAGGAAAAGAGTCACCACAGATAATATTACTCTTCCTCCGTTATATC
AAACCATCTAATTAACCGGACTGAGAAACTCGAAGAGCACGGGGCATTATTGGCTCATGA
TGAACATTAATCCCGACAGAGATGTTCTGCATCTTGCAGTTATTCTCCGCATTAGTCAAC
ATCTTCTTCTCGTTCTCTTCCTCCAATAGAATCTCCTCGATGGTTCCTATTAAGATCCTC
TCCAAGCTTTCACCATCGGCCCATTCTCTAATAGCTGATTTAACCAGCATCGGGTTTTGA
CTAATCAGATCCCAAACCGGGAAATTCTTACGTGGCATCGCGTAATCTTCAGACTTTAGT
TTTAAAGTTGGACAGTAATCACCAGCTCCATCTCCAAGGTAGACCATCTTCTTCTTTCCT
TCTTTAGCTAGTGATTCTTGAATCCTCTCAATAATCAATCCCTTGCACATGTTAGGAGGG
CACGTGCGATGAGAGCAACCATGAGATGAGTTGGTGAAATCATGGTAAGGAGAAATTCTC
AACGTGTCATGCTCATCGACGAACCCTGGGTTCGAGTTGATCTCAGAGAAGTATTCACTA
ATCCCGAGATGCTCAACGATGGTTTCGATGAAGAACATGTTGGCGTCGCTTACTATCCTA
AGCTCACACCCTAAAGCATGGGCAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AK57JQ U 20
AF RS1G469JQ U 24
AF RS1E463JQ U 25
AF RS1D181JQ U 1
BS 1 64 RS1D181JQ
BS 65 65 RS1AK57JQ
BS 66 379 RS1D181JQ
BS 380 380 RS1E463JQ
BS 381 572 RS1D181JQ
BS 573 573 RS1E463JQ
BS 574 807 RS1D181JQ

RD RS1AK57JQ 230 0 0
CGGTTAAATCG
AAACAAGTACTTCGTTAAAAGAACAAAAATCACAATCATACAACTTCATCGTTGCATCTT
ATCTTTACTTAGGATAAAGTCCAATATTTTGGTATACTATGACGAGGAAAAGAGTCACCA
CAGATAATATTACTCTTCCTCCGTTATATCAAACCGTCTAATTAACCGGACTGAGAAACT
CGAAGAGCACGGGGCATTATTGGCTCATGATGAACATTA

QA 12 230 12 230
DS 

RD RS1G469JQ 269 0 0
ATCAGCC
AAACAAGTACTT*GTTAAAAGAACAAAAATCACAGTCATACAACTTCATCGTTGCATCTT
ATCTTTACTTAGGATAAAGTCCAATATTTTGGTATACTATGACGAGGAAAAGAGTCACCA
CAGATAATATTACTCTTCATCCGTTATATCAAACCATCTAATTAACCGGACTGAGAAACT
CGAAGAGCACGGGGCATTATTGGCTCATGATGAACATTAATCCCGACAGAGATGTTCTGC
ATCTTGCAGT
TATTCTCCGCAT

QA 8 257 8 257
DS 

RD RS1E463JQ 586 0 0
AAATCG
AAACAAGTACTT*GTTAAAAGAACAAAAATCACAATCATACAACTTCGTCGTTGCATCTT
ATCTTTACTTAGGATAAAGTCCAATATTTTGGTATACTATGACGAGGAAAAGAGTCACCA
CAGATAATATTACTCTTCCTCCGTTATATCAAACCATCTAATTAACCGGACTGAGAAACT
CGAAGAGCACGGGGCATTATTGGCTCATGATGAACATTAATCCCGACAGAGATGTTCTGC
ATCTTGCAGT*********CATTAGTCAACATCTTCTTCTCGTTCTCTTCCTCCGATAGA
ATCTCCTCGATGGTTCCTATTAAGATCCTCTCCAAGCTTTCACCATCGGCCCATTCTCTA
ATAGCTGCTTTAACCAGCATCGGGTTTTGACTAATCAGATCCCAAACCGGGAAATTCTTA
CGTGGCATCGCGTAATCTTCAGACTTTAGTTTTAAAGTTGGACAGTAATCACCAGCTCCA
TCTCCAAGGTAGATCATCTTCTTCTTTCCTTCTTTAGCTAGTGATTCTTGAATCCTTTCA
ATAATCAGTCCCTTGCACATGTTAGGAGGGCACGTGCGAT

QA 7 586 7 586
DS 

RD RS1D181JQ 807 0 0
GCGGTTAAATCGAAAATATATATATCAGCCAAACAAGTACTT*GTTAAAAGAACAAAAAT
CACAGTCATACAACTTCATCGTTGCATCTTATCTTTACTTAGGATAAAGTCCAATATTTT
GGTATACTATGACGAGGAAAAGAGTCACCACAGATAATATTACTCTTCCTCCGTTATATC
AAACCATCTAATTAACCGGACTGAGAAACTCGAAGAGCACGGGGCATTATTGGCTCATGA
TGAACATTAATCCCGACAGAGATGTTCTGCATCTTGCAGTTATTCTCCGCATTAGTCAAC
ATCTTCTTCTCGTTCTCTTCCTCCAATAGAATCTCCTCGATGGTTCCTATTAAGATCCTC
TCCAAGCTTTCACCATCGGTCCATTCTCTAATAGCTGATTTAACCAGCATCGGGTTTTGA
CTAATCAGATCCCAAACCGGGAAATTCTTACGTGGCATCGCGTAATCTTCAGACTTTAGT
TTTAAAGTTGGACAGTAATCACCAGCTCCATCTCCAAGGTAGACCATCTTCTTCTTTCCT
TCTTTAGCTAGTGATTCTTGAATCCTCTCAATGATCAATCCCTTGCACATGTTAGGAGGG
CACGTGCGATGAGAGCAACCATGAGATGAGTTGGTGAAATCATGGTAAGGAGAAATTCTC
AACGTGTCATGCTCATCGACGAACCCTGGGTTCGAGTTGATCTCAGAGAAGTATTCACTA
ATCCCGAGATGCTCAACGATGGTTTCGATGAAGAACATGTTGGCGTCGCTTACTATCCTA
AGCTCACACCCTAAAGCATGGGCAGAT

QA 1 807 1 807
DS 



CO CL638Contig2 893 4 20 U
GGGATCCACAAACCAACGAACTCAAAACATCCAATCAAATCTAAAACACAGATTCTCTCG
AAAAAAATCTTAGACATGGCTTACAATAGCAACAACAAGAACAACATTGTCGTTGTGTTC
GACTTCGACAAGACAATCATCGACGTCGATAGCGACAATTGGGTGGTTGATGGACTTGGC
TTCACTGATTTGTTCAATCAACTTCTCCCTACCATGCCTTGGAACACACTCATGGACCGT
ATGATGAAAGAGCTTCATGATCAAGGCAAAACCATTGAAGAGATCAAAGAAGTTCTAAAA
ACAATCCCTATCCATCCACGAGTCGTCCCTGCCATCAAATCTGCCCATGCTTTAGGGTGT
GAGCTTAGGATAGTAAGCGACGCCAACATGTTCTTCATCGAAACCATCGTCGAGCATCTC
GGGATTAGTGAATACTTCTCTGAGATCAACTCGAACCCAGGGTTCGTCGATGAGCATGAC
ACGTTGAGAATTTCTCCTTACCATGATTTCACCAACTCATCTCATGGTTGCTCTCATCGC
ACGTGCCCTCCTAACATGTGCAAGGGACTGATCATTGAAAGGATTCAAGAATCACTAGCT
AAAGAAGGAAAGAAGAAGATGATCTACCTTGGAGATGGAGCTGGTGATTACTGTCCAACT
TTAAAACTAAAGTCTGAAGATTACGCGATGCCACGTAAGAATTTCCCGGTTTGGGATCTG
ATTAGTCAAAACCCGATGCTGGTTAAAGCAGCTATTAGAGAATGGACCGATGGTGAAAGC
TTGGAGAGGATCTTAATAGAACCATCGAGGAGATTCTATTGGAGGAGAGACGAGAAGAAG
ATGTTGACTAATGACTGCAGATGCAGACATCTCTGTCGGGATTAATGTTCATC


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 0 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D181TF U 1
AF RS1E463TF U 2
AF RS1G469TF U 3
AF RS1AK57TF U 2
BS 1 50 RS1D181TF
BS 51 51 RS1AK57TF
BS 52 66 RS1D181TF
BS 67 67 RS1AK57TF
BS 68 173 RS1D181TF
BS 174 174 RS1AK57TF
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BS 568 568 RS1AK57TF
BS 569 578 RS1D181TF
BS 579 579 RS1AK57TF
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BS 622 622 RS1AK57TF
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AAAAAATTCTTAGACATGGCTTACAATAGCAACAACAAGAACAACATTGTCGTTGTGTTC
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ACAATCCCTATCCATCCACGAGTCGTCCCTGCCATCAAATCTGCCCATGCTTTAGGGTGT
GAGCTTAGGATAGTAAGCGACGCCAACATGTTCTTCATCGAAACCATCGTTGAGCATCTC
GGGATTAGTGAATACTTCTCTGAGATCAACTCGAACCCAGGGTTCGTCGATGAGCATGAC
ACGTTGAGAATTTCTCCTTACCATGATTTCACCAACTCATCTCATGGTTGCTCTCATCGC
ACGTGCCCTCCTAACATGTGCAAGGGATTGATCATTGAGAGGATTCAAGAATCACTAGCT
AAAGAAGGAAAGAAGAAGATGGTCTACCTTGGAGATGGAGCTGGTGATTACTGTCCAACT
TTAAAACTAAAGTCTGAAGATTACGCGATGCCACGTAA

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DS 

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G
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CACTGATTTGTTCAATCAACTTCTCCCTACCATGCCTTGGAACACACTCATGGACCGTAT
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AGAAGGAAAGAAGAAGATGATCTACCTTGGAGATGGAGCTGGTGATTACTGTCCAACTTT
AAAACTAAAGTCTGAAGATTACGCGATGCCACGTAAGA
TTTC

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CACTGATTTGTTCAATCAACTTCTGCCTACCATGCCTTGGAACACACTCATGGACCGTAT
GATGAAAGAGCTTCATGATCAAGGCAAAACCATTGAAGAGATCAAAGAAGTTCTAAAAAC
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GGAGAGGATCTTA

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DS 

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G
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CACTGACTTGTTCAATCAACTTCTCCCTACCATGCCTTGGAACACACTCATGGACCGTAT
GATGAAAGAGCTTCATGATCAAGGCAAAACCATTGAAGAGATCAAAGAAGTTCTAAAAAC
AATCCCTATCCATCCACGAGTCGTCCCTGCCATCAAATCTGCCCATGCTTTAGGGTGTGA
GCTTAGGATATTGAGCGACGCCAACATGTTCTTCATCGAAACCATCGTCGAGCATCTCGG
GATTAGTGAATACTTCTCTGAGATCAATTCGAACCCAGGGTTCGTCGATGAGCATGACAC
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AGAAGGAAAGAAGAAGATGATCTACCTTGGAGATGGAGCAGGTGATTACTGTCCAACTTT
AAAACTAAAGTCTGAAGATTACGCGATGCCACGTAAGAATTTCCCGGTTTGGGATCTGAT
TAGTCAAAACCCGATGCTGGTTAAAGCAGCTATTAGAGAATGGGCCGATGGTGAAAGCTT
GGAGAGGATCTTAATAGAACCATCGAGGAGATTCTATTGGAGGAGAGACGAGAAGAAGAT
GTTGACTAATGACTGCAGATGCAGACATCTCTGTCGGGATTAATGTTCATC

QA 2 892 2 892
DS 



AS 1 7

CO CL639Contig1 996 7 31 U
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AGCAAATAAAGCTGGATCGGAGGTGTCGTCTCCAAACCAGACGATTTACATCAATAATCT
CAACGAAAAAGTCAAGCTCGATGAGCTGAAGAAGTCGCTAAATGCGGTGTTCTCGCAGTA
CGGGAAGATAGTGGAGGTGTTGGCGTTTAAGACATTGAAGCACAAAGGGCAAGCTTGGGT
TGTGTTCGACAATCCTGAATCTGCTTCCAATGCTATTTCCAAGATGAATGGATTCCCCTT
CTACGACAAACCCATGAGAATACAATTTGCTAAAACGAAATCAGATGTTATTGCCAAGGC
TGACGGCACCTTTGTTCCTCGCGAGAAACGAAAGCGACACGAGGAGAAAGGTGGTAAGAA
AAAGAAAGAGCAGCACCATGATAATACACGTATGCCCATCCCACCATATCCTGGTGTCTA
TGGATCTGCCCCTCCTCTTTCGCAAGTACCATACCCTGGTGGTGGTGGTG*********G
TGGTGGTGTCAAAAGCAATCTTCCCGAGGCACCCGCACCCCCAAACAACATCCTCTTTGT
CCAACACCTTCCTCACGACACAACTCCTGAGAGGCTTCAGGAACTCTTCGGCAATTACCA
TGGCTTCAAGGAGGTTAGGATGGTTGCTGCCAAGCCAGGTATTGCTTTCGTTGAGTTTGC
TGATGAGATGCAGTCTACCGCTGCTATGCACGGTCTTGAAGGTTTCACCATTCACCAAAC
CCCTATGCACATCACCTATGCTAAGAAATAAACCCCCTCCATTTTGGATTTTGGTGGGGT
GCTACTATTATTATCTCCCTTGTATTCTGTCAATGCTACTTCTTCTTTCTTCTCTTGTGT
TAGAGATTTTTTTTTT**CTTAGAATATATTACAACTTTAATCCAGTGTAAGAAAAGGTT
TTAGTGGGCTTTTATTGACCCATTCATCTTTAGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 
10 10 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 0 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 
30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DV04TF U 1
AF RS1BL09TF U 1
AF RS1GP70TF U 7
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AF RS1CY42JQ C 301
AF RS1DV04JQ C 307
AF RS1GP70JQ C 332
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BS 89 177 RS1BL09TF
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AAGCTGGATCGGAGGTGTCTTCTCCAAACCAGACGATTTACATCAATAATCTCAACGAAA
AAGTCAAGCTCGATGAGCTGAAGAAGTCGCTAAATGCGGTGTTCTCGCAGTACGGGAAGA
TAGTGGAGGTGTTGGCGTTTAAGACATTGAAGCACAAAGGGCAAGCTTGGGTTGTGTTCG
ACAATCCTGAATCTGCTTCCAATGCTATTTCCAGGATGAATGGATTCCCCTTCTACGACA
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CCTTTGTTCCTCGCGAGAAACGAAAGCGACACGAGGAGAAAGGTGGTAAGAAAAAGAAAG
AGCAGCACCATGATAATACACGTATGCCCATCCCACCATATCCTGGTGTCTATGGATCTG
CCCCTCCTCTTTCGCAAGTACCATACC

QA 9 515 9 515
DS 

RD RS1BL09TF 637 0 0
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AGCAAATAAAGCTGGATCGGAGGTGTCTTCTCCAAACCAGACGATTTACATCAATAATCT
CAACGAAAAAGTCAAGCTCGATGAGCTGAAGAAGTCGCTAAATGCGGTGTTCTCGCAATA
CGGGAAGATAGTGGAGGTGTTGGCGTTTAAGACATTGAAGCACAAAGGGCAAGCTTGGGT
TGTGTTCGACAATCCTGAATCTGCTTCCAATGCTATTTCCAAGATGAATGGATTCCCCTT
CTACGACAAACCCATGAGAATACAATTTGCAAAAACAAAATCAGATGTTATTGCCAAGGC
TGACGGAACCTTTGTTCCTCGCGAGAAACGAAAGCGACACGAGGAGAAAGGTGGTAAGAA
AAAGAAAGAGCAGCACCATGATAATACACGTATGCCCATTCCACCATATCCTGGTGTCTA
TGGATCTGCCCCTCCTCTTTCGCAAGTACCATACCCTGGTGGTGGTGG************
TGGTGGTGTCAAAAGCAATCTTCCCGAAGCACCGGCACCCCCGAACAACATCCTCTTTGT
CCAACACCTTCCTCACGACACAACTCCTGAGAGGCTT

QA 1 637 1 637
DS 

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AGGTGTTGGCGTTTAAGACATTGAAGCACAAAGGGCAAGCTTGGGTTGTGTTCGACAATC
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TGAGAATACAATTTGCTAAAACGAAATCAGATGTTATTGCCAAGGCTGACGGCACCTTTG
TTCCTCGCGAGAAACGAAAGCGACACGAGGAGAAAGGTGGTAAGAAAAAGAAAGAGCAGC
ACCATGATAATACACGTATGCCCATCCCACCATATCCTGGTGTCTATGGATCTGCCCCTC
CTCTTTCGCAAGTACCATACCCTGGTGGTGGTGG***********GTGGTGGTGTCAAAA
GCAATCTTCCCGAGGCACCCGCACCCCCAAACAACATCCTCTTTGTCCAACACCTTCCTC
ACGACACAACTCCTGAGAGGCTTCAG*AACTCTTCGGCAATTACCATGGCTT

QA 9 660 9 660
DS 

RD RS1CY42TF 663 0 0
AGG
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GATCGGAGGTTTCGTCTCCAAACCAGACGATTTACATCAATAATCTCAACGAAAAAGTCA
AGCTCGATGAGCTGAAGAAGTCGCTAAATGCGGTGTTCTCGCAGTACGGTAAGATAGTGG
AGGTGTTGGCGTTTAAGACATTGAAGCACAAAGGGCAAGCTTGGGTTGTGTTCGACAATC
CTGAATCTGCTTCTAATGCTATTTCCAAGATGAATGGATTCCCCTTCTACGACAAACCCA
TGAGAATACAATTTGCTAAAACGAAATCAGATGTTATTGCCAAGGCTGACGGCACCTTTG
TTCCTCGCGAGAAACGAAAGCGACACGAGGAGAAAGGTGGTAAGAAAAAGAAAGAGCAGC
ACCATGATAATACACGTATGCCCATCCCACCATATCCTGGTGTCTATGGATCTGCCCCTC
CTCTTTCGCAAGTACCATACCCTGGTGGTGGTGGTGG********GTGGTGGTGTCAAAA
GCAATCTTCCCGAGGCACCCGCACCCCCAAACAACATCCTCTTTGTCCAACACCTTCCTC
ACGACACAACTCCTGAGAGGCTTCAG*AACTCTTCGGCAATTACCATGGCTTCAAGGAGG

QA 4 663 4 663
DS 

RD RS1CY42JQ 688 0 0
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TGACGGCACCTTTGTTCCTCGCGAGAAACGAAAGCGACACGAGGAGAAAGGTGGTAAGAA
AAAGAAAGAGCAGCACCATGATAATACACGTATGCCCATCCCACCATATCCTGGTGTCTA
TGGATCTGCCCCTCCTCTTTCGCAAGTACCATACCCTGGTGGTGGTGGTG*********G
TGGTGGTGTCAAAAGCAATCTTCCCGAGGCACCCGCACCCCCAAACAACATCCTCTTTGT
CCAACACCTTCCTCACGACACAACTCCTGAGAGGCTTCAGGAACTCTTCGGCAATTACCA
TGGCTTCAAGGAGGTTAGGATGGTTGCTGCCAAGCCAGGTATTGCTTTCGTTGAGTTTGC
TGATGAGATGCAGTCTACCGCTGCTATGCACGGTCTTGAAGGTTTCACCATTCACCAAAC
CCCTATGCACATCACCTATGCTAAGAAATAAACCCCCTCCATTTTGGATTTTGGTGGGGT
GCTACTATTATTATCTCCCTTGTATTCTGTCAATGCTACTTCTTCTTTCTTCTCTTGTGT
TAGAGATTTTTTTTT***CTTAGAATATATTACAACTTTAATCCAGTGTAAGAAAAGGTT
TTAGTGGGCTTTTATTGACCCATTCATC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RS1DV04JQ 659 0 0
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CACCTTTGTTCCTCGCGAGAAACGAAAGCGACACGAGGAGAAAGGTGGTAAGAAAAAGAA
AGAGCAGCACCATGATAATACACGTATGCCCATCCCACCATATCCTGGTGTCTATGGATC
TGCCCCTCCTCTTTCGCAAGTACCATACCCTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGG
TGTCAAAAGCAATCTTCCCGAGGCACCCGCACCCCCAAACAACATCCTCTTTGTCCAACA
CCTTCCTCACGACACAACTCCTGAGAGGCTTCAGGAACTCTTCGGCAATCACCATGGCTT
CAAGGAGGTTAGGATGGTTGCTGCCAAGCCAGGTATTGCTTTCGTTGAGTTTGCTGATGA
GATGCAGTCTACCGCTGCTATGCACGGTCTTGAAGGTTTCACCATTCACCAAACCCCTAT
GCACATCACCTATGCTAAGAAATAAACCCCCTCCATTTTGGATTTTGGTGGGGTGCTACT
ATTATTATCTCCCTTGTATTCTGTCAATGCTACTTTTTCTTTCTTCTCTTGTGTTAGAGA
TTTTTTTTTT**CTTAGAATATATTACAACTTTAATCCAGTGTAAGAAAAGGTTTTAGT

QA 1 659 1 659
DS 

RD RS1GP70JQ 665 0 0
AAAACGAAATCAGATGTTATTGCCAAGGCTGACGGCACCTTTGTTCCTCGCGAGAAACGA
AAGCGACACGAGGAGAAAGGTGGTAAGAAAAAGAAAGAGCAGCACCATGATAATACACGT
ATGCCCATCCCACCATATCCTGGTGTCTATGGATCTGCCCCTCCTCTTTCGCAAGTACCA
TACCCTGGTGGTGGTGG************TGGTGGTGTCAAAAGCAATCTTCCCGAGGCA
CCCGCACCCCCAAACAACATCCTCTTTGTCCAACACCTTCCTCACGACACAACTCCTGAG
AGGCTTCAGGAACTCTTCGGCAATTACCATGGCTTCAAGGAGGTTAGGATGGTTGCTGCC
AAGCCAGGTATTGCTTTCGTTGAGTTTGCTGATGAGATGCAGTCTACCGCTGCTATGCAC
GGTCTTGAAGGTTTCACCATTCACCAAACCCCTATGCACATCACCTATGCTAAGAAATAA
ACCCCCTCCATTTTGAATTTTGGTGGGGTGCTACTATTATTATCTCCCTTGTATTCTGTC
AATGCTACTTCTTCTTTCTTCTCTTGTGTTAGAGATTTTTTTTTTTTCTTAGAATATATT
ACAACTTTAATCCAGTGTAAGAAAAGGTTTTAGTGGGCTTTTATTGACCCATTCATCTTT
AGCCC

QA 1 665 1 665
DS 



AS 2 7

CO CL640Contig1 958 5 7 U
TGGGGGGTTCTCCGCCACACTAATCTCTCAGGAAGAGGAGCGAGCAGCCAAAAAAAAAAA
A*AGGAGGAAATGGTAGCGCTGAAGCAACAGAAGCGGCTCGCCGCATCGGTGATGAAGTG
CGGGAAGGGCAAAGTTTGGCTCGATCCAAATGAAACCGCCGATATCTCCATGGCTAACTC
CCGCCAAAACATCAGGAAGTTGGTGAATGATGGTTTCATTATCAAGAAGCCAACCAAGAT
CCACTCTCGCTCCCGGGCCCGCCGCATGAAGATTGCCAAGATGAAGGGTCGTCACTCTGG
ATATGGTAAGAGGAAGGGTACGCGTGAGGCTAGGTTGCCAACAAAGGTACTGTGGATGCG
TAGGATGCGTGTGCTAAGGCGTCTCCTGAAGAAGTACAGAGAGTCGAAGAAGATTGACAA
GCACATGTACCACGACATGTACATGCGTGTCAAGGGTAACGTGTTCAAGAACAAGCGTGT
CTTGATGGAGAGCATCCACAAGTCCAAGGCCGAGAAAGCCAGAGAGAAGACTTTGTCTGA
TCAGTTTGAGGCTAAGAGGGCTAAGAACAAGGCTAGCCGAGAAAGGAAACATGCTAGGAG
AGAAGAGCGTCTTGCTAAGGGTCCTGGTGGAGATGTCGAGCCTGCGACTGCACCACCAGC
TGCTGCTGCTGCTACTACTGCTCAAACCGCAGAGGTACCGAAGAAGAAGTCTAAGAAGTG
AAGAGGATAGTCATCAAGCCTCAGTTCATTTTACTTGACTTGGAAGAAGTTTTTTGAATG
TTTTATGAAGTTGCTTTTGTTGAAATACTTTCTTGGCGCAGAAAAACATAATTGTTATGC
TTTTAAGGATTTTTTAGCTTATCAGTTTACTTTCTTTTTCGAGACATTTTGTTCTCCATT
CCTTTCTGAATGGTTTTTGTTATTCACTTAATCTAATCCACCGACACATGAATTTGAC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 
5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GT79TF U 5
AF RS1CZ10TF U 3
AF RS1A415TF U 1
AF RS1A415JQ C 63
AF RS1CZ10JQ C 247
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TTTGAGGCTAAGAGGGCTAAG

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DS 

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GG
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AAGGGCAAAGTTTGGCTCGATCCAAATGAAACCGCCGATATCTCCATGGCTAACTCCCGC
CAAAACATCAGGAAGTTGGTGAATGATGGTTTCATTATCAAGAAGCCAACCAAGATCCAC
TCTCGCTCCCGGGCCCGCCGCATGAAGATTGCCAAGATGAAGGGTCGTCACTCTGGATAT
GGTAAGAGGAAGGGTACGCGTGAGGCTAGGTTGCCAACAAAGGTACTGTGGATGCGTAGG
ATGCGTGTGCTAAGGCGTCTCCTGAAGAAGTACAGAGAGTCGAAGAAGATTGACAAGCAC
ATGTACCACGACATGTACATGCGTGTCAAGGGTAACGTGTTCAAGAACAAGCGTGTCTTG
ATGGAGAGCATCCACAAGTCCAAGGCCGAGAAAGCCAGAGAGAAGACTTTGTCTGATCAG
TTTGAGGCTAAGAGAGCTAAGAACAAGGCTAGCCGAGAAAGGAAACATGCTAGGAGAGAA
GAGCGTCTTG

QA 3 612 3 612
DS 

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CGGGAAGGGCAAAGTTTGGCTCGATCCAAATGAAACCGCCGATATCTCCATGGCTAACTC
CCGCCAAAACATCAGGAAGTTGGTGAATGATGGTTTCATTATCAAGAAGCCAACCAAGAT
CCACTCTCGCTCCCGGGCCCGCCGCATGAAGATTGCCAAGATGAAGGGTCGTCACTCTGG
ATATGGTAAGAGGAAGGGTACGCGTGAGGCTAGGTTGCCAACAAAGGTACTGTGGATGCG
TAGGATGCGTGTGCTAAGGCGTCTCCTGAAGAAGTACAGAGAGTCGAAGAAGATTGACAA
GCACATGTACCACGACATGTACATGCGTGTCAAGGGTAACGTGTTCAAGAACAAGCGTGT
CTTGATGGAGAGCATCCACAAGTCCAAGGCCGAGAAAGCCAGAGAGAAGACTTTGTCTGA
TCAGTTTGAGGCTAAGAGGGCTAAGAACAAGGCTAGCCGAGAAAGGAAACATGCTAGGAG
AGAAGAGCGTCTTGCTAAGGGTCCTGGTGGAGATGTCGAGCCTGCGACTGCACCACCAGC
TGCTGCTGCTGCTACTACTGCTCAAACCGCAGAGGTACCGAAGAAGAAGTCTAAGAAGTG
AAGAGGATAGTCATCAAGCCTCAGTTCATTTTACTTGACTTGGA

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1A415JQ 812 0 0
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GGAAGGGCAAAGTTTGGCTCGATCCAAATGAAACCGCCGATATCTCCATGGCTAACTCCC
GCCAAAACATCAGGAAGTTGGTGAATGATGGTTTCATTATCAAGAAGCCAACCAAGATCC
ACTCTCGCTCCCGGGCCCGCCGCATGAAGATTGCCAAGATGAAGGGTCGTCACTCTGGAT
ATGGTAAGAGGAAGGGTACGCGTGAGGCTAGGTTGCCAACAAAGGTACTGTGGATGCGTA
GGATGCGTGTGTTAAGGCGTCTCCTGAAGAAGTACAGAGAGTCGAAGAAGATTGACAAGC
ACATGTACCACGACATGTACATGCGTGTCAAGGGTAACGTGTTCAAGAACAAGCGTGTCT
TGATGGAGAGCATCCACAAGTCCAAGGCCGAGAAAGCCAGAGAGAAGACTTTGTCTGATC
AGTTTGAGGCTAAGAGGGCTAAGAACAAGGCTAGCCGAGAAAGGAAACATGCTAGGAGAG
AAGAGCGTCTTGCTAAGGGTCCTGGTGGAGATGTCGAGCCTGCGACTGCACCACCAGCTG
CTGCTGCTGCTACTACTGCTCAAACCGCAGAGGTACCGAAGAAGAAGTTTAAGAAGTGAA
GAGGATAGTCATCAAGCCTCAGTTCATTTTACTTGACTTGGAAGAAGTTTTTTGAATGTT
TTATGAAGTTGCTTTTGTTGAAATACTTTCTTGGCGCAGAAAAACATAATTGTTATGCTT
TTAAGGATTTTTTAGCTTATCAGTTTACTT
CC

QA 1 810 1 810
DS 

RD RS1CZ10JQ 712 0 0
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TAAGAGGAAGGGTACGCGTGAGGCTAGGTTGCCAACAAAGGTACTGTGGATGCGTAGGAT
GCGTGTGCTAAGGCGTCTCCTGAAGAAGTACAGAGAGTCGAAGAAGATTGACAAGCACAT
GTACCACGACATGTACATGCGTGTCAAGGGTAACGTGTTCAAGAACAAGCGTGTCTTGAT
GGAGAGCATCCACAAGTCCAAGGCCGAGAAAGCCAGAGAGAAGACTTTGTCTGATCAGTT
TGAGGCTAAGAGAGCTAAGAACAAGGCTAGCCGAGAAAGGAAACATGCTAGGAGAGAAGA
GCGTCTTGCTAAGGGTCCTGGTGGAGATGTCGAGCCTGCGACTGCACCACCAGCTGCTGC
TGCTGCTACTACTGCTCAAACCGCAGAGGTACCAAAGAAGAAGTCTAAGAAGTGAAGAGG
ATAGTCATCAAGCCTCAGTTCATTTTACTTGACTTGGAAGAAGTTTTTTGAATGTTTTAT
GAAGTTGCTTTTGTTGAAATACTTTCTTGGCGCAGAAAAACATAATTGTTATGCTTTTAA
GGATTTTTTAGCTTATCAGTTTACTTTCTTTTTCGAGACATTTTGTTCTCCATTCCTTTC
TGAATGGTTTTTGTTATTCACTTAATCTAATCCACCGACACATGAATTTGAC

QA 1 712 1 712
DS 



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TGCCGCGTCGGTGATGAAGTGCGGGAAGGGCAAAGTTTGGCTCGATCCGAATGAAACCGC
CGATATCTCCATGGCCAACTCCCGGCAAAACATCAGGAAGCTTGTGAACGATGGTTTCAT
CATCAAGAAACCAACGAAGATCCACTCTCGCTCCAGAGCGCGTCGTATGAAGATCGCCAA
GATGAAGGGACGTCACTCTGGTTACGGTAAGAGGAAGGGTACCCGTGAAGCTAGGCTGCC
GACCAAGGTGCTGTGGATGCGTAGGATGCGTGTTCTAAGGCGTCTTCTGAAGAAGTACAG
AGAGTCTAAGAAGATTGACAAGCACATGTACCATGACATGTACATGCGTGTTAAGGGTAA
CGTGTTCAAGAACAAGCGTGTCTTGATGGAGAGCATCCACAAGTCCAAGGCCGAGAAGGC
TAGAGAGAAGACTTTGTCTGATCAGTTTGAGGCTAAGAGGGCTAAGAACAAGGCTAGCCG
TGAAAGGAAACATGCTAGGAGAGAAGAGCGTTTAGCTAAGGGTCCTGAAGGAGATGTTGC
ACCTACGACTGCACCTCCAGCTGCTGCTGCTACTACTACTGCTCAAACTGCAGAGGTACC
AAAGAAGAAGTCCAAGAAGTGAAGAGGATATAGTGATCAATCTATATAAATCATTTCACT
TGACTTTGAGTTTTTGAATGTTTTATGATGTTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GQ51TF U 1
AF RS1BX73TF U 1
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CATCGAGAAACCAACGAAGATCCACTCTCGCTCCAGAGCGCGTCGTATGAAGATCGCCAA
GATGAAGGGACGTCACTCTGGTTACGGTAAGAGGAAGGGTACCCGTGAAGCTAGGCTGCC
GACCAAGGTGCTGTGGATGCGTAGGATGCGTGTTCTAAGGCGTCTTCTGAAGAAGTACAG
AGAGTCTAAGAAGATTGACAAGCACATGTACCATGACATGTACATGCGTGTTAAGGGTAA
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TAGAGAGAAGACTTTGTCTGATCAGTTTGAGGCTAAGAGGGCTAAGAACAAGGCTAGCCG
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ACCTACGACTGCACCTCCAGCTGCTGCTGCTACTACTACTGCTCAAACTGCAGAGGTAC
AAAGAAG

QA 1 659 1 659
DS 

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GGGCCACACCCAAAACGTAAAAAAGAAAAAAATGGTGTCTCTGAAGCCCCAGAAGCGGCT
TGCCGCGTCGGTGATGAAGTGCGGGAAGGGCAAAGTTTGGCTCGATCCGAATGAAACCGC
CGATATCTCCATGGCCAACTCCCGGCAAAACATCAGGAAGCTTGTGAACGATGGTTTCAT
CATCAAGAAACCAACGAAGATCCACTCTCGCTCCAGAGCGCGTCGTATGAAGATCGCCAA
GATGAAGGGACGTCACTCTGGTTACGGTAAGAGGAAGGGTACCCGTGAAGCTAGGCTGCC
GACCAAGGTGCTGTGGATGCGTAGGATGCGTGTTCTAAGGCGTCTTCTGAAGAAGTACAG
AGAGTCTAAGAAGATTGACAAGCACATGTACCATGACATGTACATGCGTGTTAGGGGTAA
CGTGTTCAAGAACAAGCGTGTCTTGATGGAGAGCATCCACAAGTCCAAGGTCGAGAAGGC
TAGAGAGAAGACTTTGTCTGATCAGTTTGAGGCTAAGAGGGCTAAGAACAAGGCTAGCCG
TGAAAGGAAACATGCTAGGAGAGAAGAGCGTTTAGCTAAGGGTCCTGAAGGAGATGTTGC
ACCTACGACTGCACCTCCAGCTGCTGCTGCTACTACTACTGCTCAAACTGCAGAGGTACC
AAAGAAGAAGTCCAAGAAGTGAAGAGGATATAGTGATCAATCTATATAAATCATTTCACT
TGACTTTGAGTTTTTGAATGTTTTATGATGTTG

QA 1 753 1 753
DS 



AS 2 7

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AAACACAACAAAAGTTCATTAGCCTAATCAATCCGGTTTACTCATACCGGAGATTCCAAC
AAAAGACAAACTAAATAAAAAGCATAGGATAATATTAAAAAAGTTTTTTTCAGAAACCGA
CGAATGAGATCAGATCCGACGGTTGACAGTTAGACCTCTTTGTTATCTTCCTTCTCATCA
CTCTCCTTCGCCGGAGAAACAAAGATCCACGTGAAACCGAACGGATCCGTCACCTTCCCC
TTGACTCCAACCTCCTCCTCCTCCACCTTGACAGCTCCAGCGGCAACGGCCTTCGCAACC
GCAGCTTCCACGTCATCAGTCTCGAGGATCGCAGGCATAGTCCCCGTCTTCACATCAGAA
CCAGAGTTAACGGAGACGTCAGAAACGACGACGGTTGTTCCGGCGAGCTTGAGCTCGGAA
GAGACGAGGTGAGGGAGCTCTTGGTCAGCCTTACGCTTAGGGTAAAGAGAGCGTCCAGTC
TCCACAGCGTCAAACACCGCCTTGTAGAAAGCAACAGAGTCGCCGACCTTCTGTGCTTCC
ACGATCAGCTGAGGCTTGTACGCCGTGAAGGTAACTGACTTCACCTTCTCCACCACCGTA
GTAGCACCGTTAGTAGCAGCAGCAGCAGCAGCGACGTCTTCCTGAGCCATTGTTTTAGAG
AGAGAGATTCGTTGGTTAGTGAGGAGAGAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GK77JQ U 43
AF RS1D532JQ U 1
AF RS1GK77TF C 81
BS 1 126 RS1D532JQ
BS 127 127 RS1GK77JQ
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BS 174 210 RS1D532JQ
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RD RS1GK77JQ 445 0 0
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GGAAGAGACGA

QA 15 445 15 445
DS 

RD RS1D532JQ 752 0 0
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AAACACAACAAAAGTTCATTAGCCTAATCAATCCGGTTTACTCATACCGGAGATTCCAAC
AAAAGAAAAACTAAATAAAAAGCATAGGATAATATTAAAAAAGTTTTTTTCAAAAACCGA
CGAATGAGATCAGATCCGACGGTTGACAGTCAGACCTCTTTGTTATCTTCCTTCTCATCA
CTCTCCTTCGCCGGAAAAACAAAGATCCACGTGAAACCGAACGGATCCGTCACCTTCCCC
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GTAGCACCGTTAGTAGCAGCAGCAGCAG***CGACGTCTTCCTGAGCCATTGTTTTAGAG
AGAGAGATTCGTTGGTTAGTGAGGAGAGAGAG

QA 1 752 1 752
DS 

RD RS1GK77TF 662 0 0
TAG
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ATAGGATAATATTAAAAAAGTTTTTT*CAGAAACCGACGAATGAGATCAGATCCGACGGT
TGACAGTTAGACCTCTTTGTTATCTTCCTTCTCATCACTCTCCTTCGCCGGAGAAACAAA
GATCCACGTGAAACCGAACGGATCCGTCACCTTCCCCTTGACTCCAACCTCCTCCTCCTC
CACCTTGACAGCTCCAGCGGCAACGGCCTTCGCAACCGCAGCTTCCACGTCATCAGTCTC
GAGGATCGCAGGCATAGTCCCCGTCTTCACATCAGAACCAGAGTTAACGGAGACGTCAGA
AACGACGACGGTTGTTCCGGCGAGCTTGAGCTCGGAAGAGACGAGGTGAGGGAGCTCTTG
GTCAGCCTTACGCTTAGGGTAGAGAGAGCGTCCAGTCTCCACAGCGTCAAACACCGCCTT
GTAGAAAGCAACAGCGTCGCCGACCTTCTGTGCTTCCACGATCAGCTGAGGCTTGTACGC
CGTGAAGGTAACTGACTTCACCTTCTCCACCACGGTAGTAGCACCGTTAGTAGCAGCAGC
AGCAGCAGCGACGTCTTCCTGAGCCATTGTTTTAGAGAGAGAGA
GAGATTCGTTGGTTC

QA 4 647 4 647
DS 



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TCTCTCTCTCTCTCTAAAACAATGACTCAGGAAGACGTCGCTGCTGCTAACGGTGCTACT
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GAAGCACAGAAGGTCGGCGACGCCGTTGCTTTCTACAAGGCGGTGTTTGACGCGGTGGAG
ACTGGACGCTCTCTCTACCCTAAGCGTAAGGCTGACCAAGAGCTCCCTCACCTCGTCTCC
TCCGAGCTCGAGCTCGCCGGAACTACCGTCGTCGTTTCTGACGTCTCCGTTAACCCTGGC
TCTGATGCGAAGACGGGGACTATGCCTGCGATCCTCGAGACTGATGACGTGGAAGCTGCG
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GAGAAGGAAGATAACAAAGAGGTGGTCTAACTGTCAACCGTCGGATCTGATATCATTAGT
CGGTTTCTGAAAAAACTTTTTTAATATTATCCTATGCTTTTTATTTAGTTTGTCTTTTGT
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TTCACCCCTTTTGACATAAACTTGGTGAAAGAAATAACGAAAAATCTCGGATGTTAATGT
TTTGTTTATTATGCTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C562TF U 2
AF RS1FE11TF U 1
AF RS1C562JQ C 2
AF RS1FE11JQ C 216
BS 1 155 RS1FE11TF
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BS 615 615 RS1C562JQ
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BS 723 775 RS1C562JQ
BS 776 797 RS1FE11JQ

RD RS1C562TF 666 0 0
GGACTC
TCTCTTCACACGCCATTTGCATTCTTCTCTCTCTCTCTTCACTAACCAACGAATCTCTCT
CTCTCTCTAAAACAATGACTCAGGAAGACGTCGCTGCTGCTAACGGTGCTACTACCGTGG
TGGAGAAGGAGAAGTCCGTTACCTTCACGGCGTACAAGCCTCAGCTGATCGTGGAAGCAC
AGAAGGTCGGCGACGCCGTTGCTTTCTACAAGGCGGTGTTTGACGCGGTGGAGACTGGAC
GCTCTCTCTACCCTAAGCGTAAGGCTGACCAAGAGCTCCCTCACCTCGTCTCTTCCGAGC
TCGAGCTCGCCGGAACTACCGTCGTCGTTTCTGACGTCTCCGTTAACTCTGGCTCTGATG
CGAAGACGGGGACTATGCCTTCGATCCTCGAGACTGATGACGTGGAAGCTGCGGTTGCGA
AGGCCGTTGCCGCCGGAGCTGTCAAGGTCGAGGAGGAGGAGGTTGGAGTCAAGGGTAAGG
TGACGGATCCGTTCGGTTTCACGTGGATCTTTGTTTCTCCGGCGAAGGAGAGTGAGAAGG
AAGATAACAAAGAGGTGGTCTAACTGTCAACCGTCGGATCTGATATCATTAGTCGGTTTC
TGAAAAA*CTTTTTTAATATTATCCTATGCTTTTTATTTAGTTTGTCTTTTGTTGGAATC

QA 7 666 7 666
DS 

RD RS1FE11TF 723 0 0
GACACTCTCTCTTCACACGCCATTTGCATTCTTCTCTCTCTCTCTTCACTAACCAACGAA
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QA 1 722 1 722
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RD RS1C562JQ 774 0 0
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QA 7 774 7 774
DS 

RD RS1FE11JQ 582 0 0
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CCAAGAGCTCCCTCACCTCGTCTCCTCCGAGCTCGAGCTCGCCG*AACTACCGTCGTCGT
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QA 1 582 1 582
DS 



AS 1 8

CO CL642Contig1 1188 8 16 U
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TGAAATAGCAGATGAGCTGATCAAGTCAGATATTTATAGCGACTTCATTCAAGATCATCT
TGCTCCTAGTGGTTATCTCAAAATCCCTACGGAAATGAAAAAGTACCTAGAAAGTTCCAA
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TATAATAAATGTTGTATTCGTAATATTTGGTAAGCGGATATTTATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H730TF U 5
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AF RS1D159TF U 1
AF RS1D061TF U 1
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BS 1 65 RS1D061TF
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RD RS1H730TF 577 0 0
GG
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QA 3 577 3 577
DS 

RD RS1GV86TF 626 0 0
GGAACC
AAAAACATAAACACAAACGTCAATCGAAACTCTCGCGTTTACTATGGAGAAGAAGTGTTT
TGGACTTGCGGTGGCATTTGTATTCTTAGTATTGGTTCATGTCTCTGTATCGGTTCCCTT
TATAGTGCTTCATGGGATTGCAGCTGCATGTTCTGAGGGCAAAGAAGCTAACTTCACACA
GCTTCTCTCTAACTTCTCTGGCTCTCCTGGTTTTTGCCTAGAAGTTGGAAATGGAGAACT
CGATTCATGGTTCATGCCACTTGCTAAACAAGCGGAAATAGCGTGTGAGAAAGTGAAGCA
AATGAAAGAGTTGCGTCAAGGATACAACATTGTTGGAAGATCTCAGGGGAATCTAGTGGC
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ACCTAAGCTTAACAATGAGA

QA 7 626 7 626
DS 

RD RS1D159TF 704 0 0
GGAACC
AAAAACATAAACACAAACGTCAATCGAAACTCTCGCGTTTACTATGGAGAAGAAGTGTTT
TGGACTTGCGGTGGCATTTGTATTCTTAGTATTGGTTCATGTCTCTGTATCGGTTCCCTT
TATAGTGCTTCATGGGATTGCAGCTGCATGTTCTGAGGGCAAAGAAGCTAACTTCACACA
GCTTCTCTCTAACTTCTCTGGCTCTCCTGGTTTTTGCCTAGAAGTTGGAAATGGAGAACT
CGATTCATGGTTCATGCCACTTGCTAAACAAGCGGAAATAGCGTGTGAGAAAGTGAAGCA
AATGAAAGAGTTGCGTCAAGGATACAACATTGTTGGAAGATCTCAGGGGAATCTAGTGGC
TAGAGGCTTGATTGAGTTCTGCGATGGTGGACCTCCGGTTTACAACTATGTATCTTTAGC
AGGTCCCCATGCTGGAATCTCCTCTGTTCCGATGTGTGGTTCGGGATTATGGTGTGAAAT
AGCAGATGAGCTGATCAAGTCAGATATTTATAGCGACTTCATTCAAGATCATCTTGCTCC
TAGTGGTTATCTCAAAATCCCTACGGAAATGAAAAAGTACCTAGAAAGTTCCAAGTATCT
ACCTAAGCTTAACAATGAGATACCAGGCCAAAGAAACTCCACTTACAAAGAACGTTTCGC
CAGCTTACATAACTTGGTTCTTATCATGTTTGAAGACG

QA 7 704 7 704
DS 

RD RS1D061TF 744 0 0
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GTGTTCTGGACTTGCGGTGGCATTTGTATTCTTAGTATTGGTTCATGTCTCTGTATCGGT
TCCCTTTATAGTGCTTCATGGGATTGCAGCTGCATGTTCTGAGGGCAAAGAAGCTAACTT
CACACAGCTTCTCTCTAACTTCTCTGGCTCTCCTGGTTTTTGCCTAGAAGTTGGAAATGG
AGAACTCGATTCATGGTTCATGCCACTTGCTAAACAAGCGGAAATAGCGTGTGAGAAAGT
GAAGCAAATGAAAGAGTTGCGTCAAGGATACAACATTGTTGGAAGATCTCAGGGGAATCT
AGTGGCTAGAGGCTTGATTGAGTTCTGCGATGGTGGACCTCCGGTTTACAACTATGTATC
TTTAGCAGGTCCCCATGCTGGAATCTCCTCTGTTCCGATGTGTGGTTCGGGATTATGGTG
TGAAATAGCAGATGAGCTGATCAAGTCAGATATTTATACTGACTTCATTCAAGATCATCT
TGCTCCTAGTGGTTATCTCAAAATCCCTACGGAAATGAAAAAGTACCTAGAAAGTTCCAA
GTATCTACCTAAGCTTAACAATGAGATACCAGGCCAAAGAAACTCCACTTACAAAGAACG
TTTCGCCAGCTTACATAACTTGGTTCTTATCATGTTTGA*GACGATAAG*TCATTGTTCC
AAA*GATTCATCTTGGTTCGGGTT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1D159JQ 805 0 0
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CGTCAAGGATACAACATTGTTGGAAGATCTCAGGGGAATCTAGTGGCTAGAGGCTTGATT
GAGTTCTGCGATGGTGGACCTCCGGTTTACAACTATGTATCTTTAGCAGGTCCCCATGCT
GGAATCTCCTCTGTTCCGATGTGTGGTTCGGGATTATGGTGTGAAATAGCAGATGAGCTG
ATCAAGTCAGATATTTATAGCGACTTCATTCAAGATCATCTTGCTCCTAGTGGTTATCTC
AAAATCCCTACGGAAATGAAAAAGTACCTAGAAAGTTCCAAGTATCTACCTAAGCTTAAC
AATGAGATACCAGGCCAAAGAAACTCCACTTACAAAGAACGTTTCGCCAGCTTACATAAC
TTGGTTCTTATCATGTTTGAAGACGATAAGGTCATTGTTCCAAAAGATTCATCTTGGTTC
GGGTTTTACCCGGATGGTGATTTCGGACCTCTTCTCACCGTTCGAGAGACAAAACTCTTT
AAAGAGGACTGGATCGGTCTGAAACCATTGATTGATACTGGGAAAGTGGAGTTTGTCAGT
GTAGATGGCGCACACCTAAGAATGTCAAATATGGATATCGTCAAATATGTTGTACCTTAT
CTCCAAAACCAACCTTCTTCCGCGCAAAAAAGATTCAATCGCAAAACGAAAGAGCCTTTG
CGCCCTTGAAAGAGAAAATATTTCATGTTTCATAAGCTTATTTATGAAATAGTGAAAAAA
CCCTTAGTGATGGATGAATGTGTAG

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DS 

RD RS1H730JQB 495 0 0
AAGCTTAACAATGAGATACCAGGCCAAAGAAACTCCACTTACAAAGAACGTTTCGCCAGC
TTACATAACTTGGTTCTTATCATGTTTGAAGACGATAAGGTCATTGTTCCAAAAGATTCA
TCTTGGTTCGGGTTTTACCCGGATGGTGATTTCGGACCTCTTCTCACCGTTCGAGAGACA
AAACTCTTTAAAGAGGACTGGATCGGTCTGAAACCATTGATTGATACCGGGAAAGTGGAG
TTTGTCAGTGTAGATGGCGCACACCTAAGAATGTCAAATATGGATATCGTCAAATATGTT
GTACCTTATCTCCAAAACCAACCTTTTTCCGCGCAAAAAAGATTCAATCGCAAAACGAAA
GAGCCTTTGCGCCCTTGAAAGAGAAA*TATTTCATGTTTCATAAGCTTATTTATGAAATA
GTGAAAAAAACCTTAGTGATGGATGAATGTGTAGAACAAAAATCATTATTCATATAGATA
CAAATAATATACAC
C

QA 1 494 1 494
DS 

RD RS1GV86JQ 774 0 0
GCGATGGTGGACCTCCGGTTTACAACTATGTATCTTTAGCAGGTCCCCATGCTGGAATCT
CCTCTGTTCCGATGTGTGGTTCGGGATTATGGTGTGAAATAGCAGATGAGCTGATCAAGT
CAGATATTTATAGCGACTTCATTCAAGATCATCTTGCTCCTAGTGGTTATCTCAAAATCC
CTACGGAAATGAAAAAGTACCTAGAAAGTTCCAAGTATCTACCTAAGCTTAACAATGAGA
TACCAGGCCAAAGAAACTCCACTTACAAAGAACGTTTCGCCAGCTTACATAACTTGGTTC
TTATCATGTTCGAAGACGATAAGGTCATTGTTCCAAAAGATTCATCTTGGTTCGGGTTTT
ACCCGGATGGTGATTTCGGACCTCTTCTCACCGTTCGAGAGACAAAACTCTTTAAAGAGG
ACTGGATCGGTCTGAAACCATTGATTGATACTGGGAAAGTGGAGTTTGTCAGTGTAGATG
GCGCACACCTAAGAATGTCAAATATGGATATCGTCAAATATGTTGTACCTTATCTCCAAA
ACCAACCTTTTTCCGCGCAAAAAAGATTCAATCGCAAAACGAAAGAGCCTTTGCGCCCTT
GAAAGAGAAAATATTTCATGTTTCATAAGCTTATTTATGAAATAGTGAAAAAAACCTTAG
TGATGGATGAATGTGTAGAACAAAAATCATTATTCATATAGATACAAATAATATACACTA
GACCTTGATCTACGGTTGTTTAGTTTCTTTTGTTTATAATAAATGTTGTATTCG

QA 1 774 1 774
DS 

RD RS1D061JQ 732 0 0
GATGTGTGGTTCGGGATTATGGTGTGAAATAGCAGATGAGCTGATCAAGTCAGATATTTA
TACTGACTTCATTCAAGATCATCTTGCTCCTAGTGGTTATCTCAAAATCCCTACGGAAAT
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QA 1 732 1 732
DS 



AS 2 8

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BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 15 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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QA 1 642 1 642
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TC

QA 1 842 1 842
DS 



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CAAACGCTATTCTACCTCCCAATCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AAGTTATCTGTCCATTGTTCCTCCCAACTCCACAACACCCTGCATTTGTCACTGTAAACC
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TAA

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A
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CATGAAATAGTTGTTGAGGTAATCGTTACTGCCTAAGCCGATAGAGTAAATGCATTTGCT
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CACGTGATTTGCTACCTGACCTGCAAACGCTATTCTACCTCCCAATCC

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DS 



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TGGCGACCTCCTTCTTCCGCCGACTCGCTAGGTCAGCTCCGATCGCACTCCCCGCCGCGT
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RS1D837TF U 3
AF RS1H425TF U 1
AF RS1FW33TF U 4
AF RS1FP78TF U 8
AF RS1H425JQB C 945
AF RS1FW33JQ C 550
AF RS1D837JQ C 596
AF RS1FP78JQ C 556
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BS 1296 1299 RS1FP78JQ

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GGATTGC
GCTTACCTTTGTTACTATTCTCCGAGAGATCTGAACTGAACAAACAAAATATGGCGACCT
CCTTCTTCCGCCGACTCGCTAGGTCAGCTCCGATCGCACTCCCCGCCGCGTTCAGATCCC
AAAGCAAATCTGGTCTCGGCACTTTCCGATTCTCCGCCGGCGCGATCGCTGCACTTTCCG
GTGGACTCTCCTGTTACTACCTCTCTTCTGGCAACAATCTGGCTTATCTGGATCAAGCTA
AGGAAGAGACAGGACCCAAAACAGCTCTAAACCCTGATAAATGGCTCGAGTTCAAGCTCC
AAGACACTGCTACAGTTAGCCACAACACCAAGTTGTTCAGGTTCTCATTTGACCCCTCAG
CCAACTTGGGTCTTCATGTTGCTTCTTGTCTCCTGACAAGGGCTCCTTTGGGCTATAATG
CTGAAGGGAAAACGAAATATGTCGTTAGACCTTACACTCCTATCTCAGACCCAGAGGCTA
AGGGCTATTTCGATTTACTGATTAAGGTATATCCAGATGGAAAAATGAGTCAGCATTTTG
CCAGCTTAAAACCGGGGGATGTGTTGGAAGTGAAAGGACCTATTGAAAAA

QA 8 597 8 597
DS 

RD RS1H425TF 670 0 0
GGCCATTGCGCTTACCTTTGTTACTATTCTCCGAGAGATCTGAACTGAACAAACAAAATA
TGGCGACCTCTTTCTTCCGCCGACTCGCTAGGTCAGCTCCGATCGCACTCCCCGCCGCGT
TCAGATCCCAAAGCAAATCTGGTCTCGGCACTTTCCGATTCTCCGCCGGCGCGATCGCTG
CACTTTCCGGTGGACTCTCCTGTTACTACCTCTCTTCTGGCAACAATCTGGCTTATCTGG
ATCAAGCTAAGGAAGAGACGGGACCCAAAACAGCTCTAAACCCTGATAAATGGCTCGAGT
TCAAGCTCCAAGACACTGCTACAGTTAGCCACAACACCAAGTTGTTCAGGTTCTCATTTG
ACCCCTCAGCCAACTTGGGTCTTCATGTTGCTTCTTGTCTCCTGACAAGGGCTCCTTTGG
GCTATAATGCTGAAGGGAAAACGAAATATGTCGTTAGACCTTACACTCCTATCTCAGACC
CAGAGGCTAAGGGCTATTTCGATTTACTGATTAAGGTATATCCAGATGGAAAAATGAGTC
AGCATTTTGCCAGCTTAAAACCGGGGGATGTGTTGGAAGTGAAAGGACCTATTGAAAAAT
TCAAATATTCGCCTAACATGAAGAAACATATTGGCATGATTGCTGGTGGAAGTGGGATTA
CTCCAATGCT

QA 1 670 1 670
DS 

RD RS1FW33TF 776 0 0
GATTGC
GCTTACCTTTGTTACTATTCTCCGAGAGATCTGAACTGAACAAACAAAATATGGCGACCT
CCTTCTTCCGCCGACTCGCTAGGTCAGCTCCGATCGCACTCCCCGCCGCGTTCAGATCCC
AAAGCAAATCTGGTCTCGGCACTTTCCGATTCTCCGCCGGCGCGATCGCTGCACTTTCCG
GTGGACTCTCCTGTTACTACCTCTCTTCTGGCAACAATCTGGCTTATCTGGATCAAGCTA
AGGAAGAGACGGGACCCAAAACAGCTCTAAACCCTGATAAATGGCTCGAGTTCAAGCTCC
AAGACACTGCTACAGTTAGCCACAACACCAAGTTGTTCAGGTTCTCATTTGACCCCTCAG
CCAACTTGGGTCTTCATGTTGCTTCTTGTCTCCTGACAAGGGCTCCTTTGGGCTATAATG
CTGAAGGGAAAACGAAATATGTCGTTAGACCTTACACTCCTATCTCAGACCCAGAGGCTA
AGGGCTATTTCGATTTACTGATTAAGGTATATCCAGATGGAAAAATGAGTCAGCATTTTG
CCAGCTTAAAACCGGGGGATGTGTTGGAAGTGAAAGGACCTATTGAAAAATTCAAATATT
CGCCTAACATGAAGAAACATATTGGCATGATTGCTGGTGGAAGTGGGATTACTCCAATGC
TTCAG*TGATTGATACCATTGTGAAGAATCCTGAGGACAACACGAAGATA*CATTACTTT
ATGCCAATGTTTCTCCGGATGATATACTTCTCA
GCAAAGCTGGATGCTCT

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DS 

RD RS1FP78TF 730 0 0
GG
GCTTACCTTTGTTACTATTCTCCGAGAGATCTGAACTGAACAAACAAAATATGGCGACCT
CCTTCTTCCGCCGACTCGCTAGGTCAGCTCCGATCGCACTCCCCGCCGCGTTCAGATCCC
AAAGCAAATCTGGTCTCGGCACTTTCCGATTCTCCGCCGGCGCGATCGCTGCACTTTCCG
GTGGACTCTCCTGTTACTACCTCTCTTCTGGCAACAATCTGGCTTATCTGGATCGAGCTA
AGGAAGAGACGGGACCCAAAACAGCTCTAAACCCTGATAAATGGCTCGAGTTCAAGCTCC
AAGACACTGCTACAGTTAGCCACAACACCAAGTTGTTCAGGT*CTCATTTGACCCCTCAG
CCAACTTGGGTCTTCATGTTGCTTCTTGTCTCCTGACAAGGGCTCCTTTGGGCTATAATG
CTGAAGGGAAAACGAAATATGTCGTTAGACCTTACACTCCTATCTCAGACCCAGAGGCTA
AGGGCTATTTCGATTTACTGATTAAGGTATATCCAGATGGAAAAATGAGTCAGCATTTTG
CCAGCTTAAAACCGGGGGATGTGTTGGAAGTGAAAGGACCTATTGAAAAATTCAAATATT
CGCCTAACATGAAGAAACATATTGGCATGATTGCTGGTGGAAGTGGGATTACTCCAATGC
TTCAG*TGATTGATACCATTGTGAAGAATCCTGAGGACA*CACGAAGATA*CATTACTTT
ATGCCA
TG

QA 3 728 3 728
DS 

RD RS1H425JQB 162 0 0
GAACATGTATCCGGAGGCAAAGCTCCAGACTGGTCACAAGGAGAGGTAAAGGGGATACTC
AAAGAACTCGGATTCACAGAGCAAATGGTTTTCAAATTCTGAGAGGGCTTATGAATAGAA
GTTCCTTAGTTTCTACTCTTGACGAGGTTTCATTTCATGTAA

QA 1 162 1 162
DS 

RD RS1FW33JQ 746 0 0
CCAGCTTAAAACCGGGGGATGTGTTGGAAGTGAAAGGACCTATTGAAAAATTCAAATATT
CGCCTAACATGAAGAAACATATTGGCATGATTGCTGGTGGAAGTGGGATTACTCCAATGC
TTCAGGTGATTGATACCATTGTGAAGAATCCTGAGGACAACACGAAGATAACATTACTTT
ATGCCAATGTTTCTCCGGATGATATACTTCTCAAGCAAAAGCTGGATGCTCTTCAGGCAA
ACCACCCAAATCTGAAGGTATTCTACACTGTTGACAATCCTACTAAAAATTGGAAAGGAG
GAGTAGGTTACGTTTCAAAGGACATGGCTCTGAAAGGCTTACCTCTTCCTGCTGACGATA
CACTTGTCCTCGTACGTGGTCCTCCTGGGATGATGGAACATGTATCCGGAGGCAAGGCTC
CAGACTGGTCACAAGGAGAGGTAAAGGGGATACTCAAAGAACTCGGATTCACAGAGCAAA
TGGTTTTCAAATTTTGAGAGGGCTTATGAATCGAAGTTCCTTAGTTTCTACTCTTGACGA
GGTTTCGTTTCATGTAATAAAGTGGCCCAAAGGCAAACATTAATTGATGCATGATGAGCT
TGACACAGGACTTATCAAGCTTTGAAAATAAACAAAGCAAAAAGTTCAGTTAGTCTTTTG
TCTTTGGAGGGTTTTAGCTAGCGGGGACCTTTGCTATACTTGATTTTGATGATAAATTTC
TATGCGATTGAGACTGCAAGATATTG

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1D837JQ 691 0 0
AAAATTCAAATATTCGCCTAACATGAAGAAACATATTGGCATGATTGCTGGTGGAAGTGG
GATTACTCCAATGCTTCAGGTGATTGATACCATTGTGAAGAATCCTGAGGACAACACGAA
GATAACATTACTTTATGCCAATGTTTCTCCGGATGATATACTTCTCAAGCAAAAGCTGGA
TGCTCTTCAGGCAAACCACCCAAATCTGAAGGTATTCTACACTGTTGACAATCCTACTAA
AAATTGGAAAGGAGGAGTAGGTTACGTTTCAAAGGACATGGCTCTGAAAGGCTTACCTCT
TCCTGCTGACGATACACTTGTCCTCGTATGTGGTCCTCCTGGGATGATGGAACATGTATC
CGGAGGCAAAGCTCCAGACTGGTCACAAGGAGAGGTAAAGGGGATACTCAAAGAACTCGG
ATTCACAGAGCAAATGGTTTTCAAATTCTGAGAGGGCTTATGAATCGAAGTTCCTTAGTT
TCTACTCTTGACGAGGTTTCATTTCATGTAATAAAGTGGCCCAAAGGCAAACATTAATTG
ATGCATGATGAGCTTGACACAGGACTTATCAAGCTTTGAAAATAAACAAAGCAAAAAGTT
CAGTTAGTCTTTTGTCTTTGGAGGGTTTTAGCTAGCGGGGACCTTTGCTATACTTGATTT
TGATGATAAATTTCTATGCGATTGAGACTGC

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DS 

RD RS1FP78JQ 744 0 0
TAAAACCGGGGGATGTGTTGGAAGTGAAAGGACCTATTGAAAAATTCAAATATTCGCCTA
ACATGAAGAAACATATTGGCATGATTGCTGGTGGAAGTGGGATTACTCCAATGCTTCAGG
TGATTGATACCATTGTGAAGAATCCTGAGGACAACACGAAGATAACATTACTTTATGCCA
ATGTTTCTCCGGATGATATACTTCTCAAGCAAAAGCTGGATGCTTTTCAGGCAAACCACC
CAAATTTGAAGGTATTTTACACTGTTGACAATCCTACTAAAAATTGGAAAGGAGGAGTAG
GTTACGTTTCAAAGGACATGGCTTTGAAAGGCTTACCTTTTCCTGCTGACGATACACTTG
TCCTCGTATGTGGTCCTCCTGGGATGATGGAACATGTATCCGGAGGCAAAGCTCCAGACT
GGTCACAAGGAGAGGTAAAGGGGATACTCAAAGAACTCGGATTCACAGAGCAAATGGTTT
TCAAATTTTGAGAGGGCTTATGAATCGAAGTTCCTTAGTTTTTACTCTTGACGAGGTTTC
ATTTCATGTAATAAAGTGGCCCAAAGGCAAACATTAATTGATGCATGATGAGCTTGACAC
AGGACTTATCAAGCTTTGAAAATAAACAAAGCAAAAAGTTCAGTTAGTCTTTTGTCTTTG
GAGGGTTTTAGCTAGCGGGGACCTTTGCTATACTTGATTTTGATGATAAATTTTTATGCG
ATTGAGACTGCAAGATATTGAATA

QA 1 744 1 744
DS 



AS 2 8

CO CL645Contig1 768 2 9 U
GGGTGAAGAGAAGAGACCTTAGCCACACACAAACTCTCCAAAAAGCTTTAGGCTTCGATT
CAACCCCAAATCAGTAAAGATAGGGTTACCAGAAGAACCCCACCGGGATTCCACAGAGGA
ACTGCATCACTCGCGTTCCTGCTGCGGCTTGAGGAAGAAGAAGAACAGTAACGGTAACAG
AGACCAACACAAGGAGGAAGAGAAACCAAAGATGCAGCCAACAGAGCCTCCTGCTCAGCC
TCAGAGTCAGCAGATGGTGAGCTTGAGCTTTAGCAGTCAGATGTCGAGAGAAGACGAGGA
GATGGCTCGCTCTGCTCTCTCTGCTTTTAGGGCTAAAGAGGATGAGATTGAGAAGAGAAA
AATGGAGGTTCGTGAACGGGTCAAGGCTCAGCTGGGTCGGGTTGAGGAAGAGACCCGACG
TCTCGCTAACATCCGCGAGGAGCTTGAGAATATGGCAGATCCCATGAGGAAAGAAGTTTC
TTTGGTTCGAAAGAAGATTGATAGCGTCAACAAAGAACTCAAACCATTAGGCGCAACAGT
TCAAAAGAAAGAAAGGGAATACAAAGAAGCTTTGGATACATTCAACGAGAAAAACCGTGA
GAAAGTTCAGCTAATCACCAAGCTAATGGAGTTGGTTGGAGAAAGCGAGAAGCTGAGTTA
AAGAAGCTTGAAGAGCTTAGCAAGAGCATAGAAACCGAGTGAGACTATCTCACAGACAAA
GACAAGACTAATTGGGCTTAGATATGGTCTATCTGATGTATTATTTAT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G653TF U 3
AF RS1D267TF U 1
BS 1 55 RS1D267TF
BS 56 56 RS1G653TF
BS 57 224 RS1D267TF
BS 225 225 RS1G653TF
BS 226 547 RS1D267TF
BS 548 548 RS1G653TF
BS 549 549 RS1D267TF
BS 550 550 RS1G653TF
BS 551 768 RS1D267TF

RD RS1G653TF 675 0 0
GG
GAAGAGAAGAGACCTTAGCCACACACAAACTCTCCAAAAAGCTTTAGGCTTCGATTCAAC
CCCAAATCAGTAAAGATAGGGTTACCAGAAGAACCCCACCGGGATTCCACAGAGGAACTG
CATCACTCGCGTTCCTGCTGCGGCTTGAGGAAGAAGAAGAACAGTAACGGTAACAGAGAC
CAACACAAGGAGGAAGAGAAACCAAAGATGCAGCCAACAGAGCCTCCTGCTCAGCCTCAG
AGTCAGCAGATGGTGAGCTTGAGCTTTAGCAGTCAGATGTCGAGAGAAGACGAGGAGATG
GCTCGCTCTGCTCTCTCTGCTTTTAGGGCTAAAGAGGATGAGATTGAGAAGAGAAAAATG
GAGGTTCGTGAACGGGTCAAGGCTCAGCTGGGTCGGGTTGAGGAAGAGACCCGACGTCTC
GCTAACATCCGCGAGGAGCTTGAGAATATGGCAGATCCCATGAGGAAAGAAGTTTCTTTG
GTTCGAAAGAAGATTGATAGCGTCAACAAAGAACTCAAACCATTAGGCGCAACAGTTCAA
AAGAAAGAAAGGGAATACAAAGAAGCTTTGGATACATTCAACGAGAAAAATCGTGAGAAA
GTTCAGCTAATCACCAAGCTAATGGAGTTGGTTGGAGAAAGCGAGAAGCTGAGTTAAAGA
AGCTTGA
GAGCTT

QA 3 669 3 669
DS 

RD RS1D267TF 768 0 0
GGGTGAAGAGAAGAGACCTTAGCCACACACAAACTCTCCAAAAAGCTTTAGGCTTTGATT
CAACCCCAAATCAGTAAAGATAGGGTTACCAGAAGAACCCCACCGGGATTCCACAGAGGA
ACTGCATCACTCGCGTTCCTGCTGCGGCTTGAGGAAGAAGAAGAACAGTAACGGTAACAG
AGACCAACACAAGGAGGAAGAGAAACCAAAGATGCAGCCAACAGGGCCTCCTGCTCAGCC
TCAGAGTCAGCAGATGGTGAGCTTGAGCTTTAGCAGTCAGATGTCGAGAGAAGACGAGGA
GATGGCTCGCTCTGCTCTCTCTGCTTTTAGGGCTAAAGAGGATGAGATTGAGAAGAGAAA
AATGGAGGTTCGTGAACGGGTCAAGGCTCAGCTGGGTCGGGTTGAGGAAGAGACCCGACG
TCTCGCTAACATCCGCGAGGAGCTTGAGAATATGGCAGATCCCATGAGGAAAGAAGTTTC
TTTGGTTCGAAAGAAGATTGATAGCGTCAACAAAGAACTCAAACCATTAGGCGCAACAGT
TCAAAAGTAGGAAAGGGAATACAAAGAAGCTTTGGATACATTCAACGAGAAAAACCGTGA
GAAAGTTCAGCTAATCACCAAGCTAATGGAGTTGGTTGGAGAAAGCGAGAAGCTGAGTTA
AAGAAGCTTGAAGAGCTTAGCAAGAGCATAGAAACCGAGTGAGACTATCTCACAGACAAA
GACAAGACTAATTGGGCTTAGATATGGTCTATCTGATGTATTATTTAT

QA 1 768 1 768
DS 



CO CL645Contig2 1020 6 10 U
GATCAAAATTAAGCTAAAAATTAAATAAATATTAAAAAAGCAAGGAAAAAATAATTCAAA
CTTTCAAACCCTTTAGCATTCAGTAGCCTAAGCATTATCCCATTAACCTTCCCTAATTTG
GTTAATCAAAAACATAAAACACCCCATCATAAGTCTACAAATCAATCCACTTAGGAAAAG
AAAATGAAAACTAAAACACCCACGAAAAAACACACCAACTTGATGAAAAATAAATAAATA
AATACATCAGATAGAACCATAATCCTAAGCCCAATTAGTTCTTGGTCTTTTGTCTGTGAG
ATAGTCTTCACTCGGTTTCTATGCTCTTGCTAAGCTCTTCAAGCTTCTTTAACCTCAGCT
TCTCGCTTTCTCCAACCAACTGCCCCATCTCCATTAGCTTGGTGATTAGCTGAACTTTCT
CACGGTTTTTCTCGTTGAATGTATCCAAAGCTTCTTTGTATTCCCTTTCCTTCTTTTGAA
CTGTTGCGCCTAATGGTTTGAGTTCTTTGTTGACGCTATCAATCTTCTTTCGAACCAAAG
AAACTTCTTTCCTCATGGGATCTGCCATATTCTCAAGCTCCTCGCGGATGTTAGCGAGAC
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GCTGAGCAGGAGGCTCTGTTGGCTGCATCTTTGGTTTCTCTTCCTCCTTGTGTTGGTCTC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 15 15 15 15 15 15 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1A638JQ U 53
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CCTCAGCTTCTCGCTTTCTCCAACCAACTGCCCCATCTCCATTAGCTTGGTGATTAGCTG
AACTTTCTCACGGTTTTTCTCGTTGAATGTATCCAAAGCTTCTTTGTATTCCCTTTCCTT
CTTTTGAACTGTTGCGCCTAATGGTTTGAGTTCTTTGTTGACGCTATCAATCTTCTTTCG
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AGCGAGACGTCGGGTCTCTTCCTCAACCCGACCCAGCTGAGCCTTGACCCGTTCACGAAC
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AGCCATCTCCTCGTCTTCTCTCGACATCTGACTGCTAAAGCTCAAGCTCACCATCTGCTG
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GAAAAATAAATAAATAAATACATCAGATAGAACCATAATCCTAAGCCCAATTAGTTCTTG
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TCCCGTGGGGT

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CTTTGTATTCCCTTTCCTTCTTTTGAACTGTTGCGCCTAATGGTTTGAGTTCTTTGTTGA
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TTAACCTCAGCTTCTCGCTTTCTCCAACCAACTGCCCCATCTCCATTAGCTTGGTGATTA
GCTGAACTTTCTCACGGTTTTTCTCGTTGAATGTATCCAAAGCTTCTTTGTATTCCCTTT
CCTTCTTTTGAACTGTTGCGCCTAATGGTTTGAGTTCTTTGTTGACGCTATCAATCTTCT
TTCGAACCAAAGAAACTTCTTTCCTCATGGGATCTGCCATATTCTCAAGCTCCTCGCGGA
TGTTAGCGAGACGTCGGGTCTCTTCCTCAACCCGACCCAGCTGAGCCTTGACCCGTTCAC
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AGCGAGCCATCTCCTCGTCTTCTCTCGACATCTGACTGCTAAAGCTCAAGCTCACCATCT
GCTGACTCTGAGGCTGAGCAGGAGGCTCTGTTGGCTGCATCTTTGGTTTCTCTTCCTCCT
TGTGTTGGTCTCTGTTACCGTTACTGTTCTTCTTCTTCCTCAAGCCGCAGCAGGAACGCG
AGTGATGCAGTTCCTCTGTGGAATCCCGGTGGGGTTCTTCTGGTAACCCTATCTTTACTG
ATTTGGGGTTGAATCGAAGCCTAAAGCTTTTTGGAGAGTTTGTGTGTGGCTAAGGTCTCT
TCTCTTCACTCC

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DS 



AS 2 8

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GCTAATGGAAGAGATTCGAAAAGTCGCCATTTTGTTTATGCACCTGTGTCGAGAACAAAG
GAGGAAGGGTGGAGAAGGCGGAGACTACGAGAGGGGTTGGTGGTTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G552JQ U 1
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AF RS1A658JQ U 352
AF RS1A655TF C 57
AF RS1A655JQ U 363
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CTTGTTAGCGATGAGCTGGTTCGTCGGCTGGCTTCTGAGAACGGCCTTGGTGGTGGTCAT
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GCTAAAAAGGCATATCTGAGACGTGTTCATACAAAAAGCATTATCTTTTAAACACACACA
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ACACTACCACCAAACGAGAACGGGTCTTTTAGAAGAGTTCAGTTTCCTTGTGGGTATGGA
TCACACAGTCCGACTGCGGGTAAGCCACACAAGTCAAGACAAAACCTTTCTCAAAGTGAT
CATCCTCGAGAAACGAACCCTCGGACTGATCAGCTTGGCCTTTCACGATCTGACCGGCGC
AGGTGGAACACGTTCCTGCTCTGCAAGAGTAAGGCAAGTCAACTCCCGCCTCTTCGGCTG
CGTCCAATATGAACTGG*TCGTCCTGAACCTCGAACTCGTTCTCTTCCCC**TTCTGGTC
CTATGAGCTTGACCTT*GTATACCGCTGACATCATGGTTGCACCTCC*TGAGTTGGCTGA
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CTTGTTAGCGATGAGCTGGTTCGTCGGCTGGCTTCTGAGAACGGCCTTGGTGGTGGTCAT
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GGTTGGTCC

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DS 

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CTTCGGCTGCGTCCAATATGAACTGGGTCGTCCTGAACCTCGAACTCGTTCTCTTTCCCC
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DS 

RD RS1A655TF 712 0 0
GGAAG
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CACTACCACAAAACGAGAACGGGTCTTTTAGAAGAGTTCAGTTTCCTTGTGGGTATGGAT
CACACAGTCTGACTGCGGGTAAGCCACCCAAGTCAAGACAAAACCTTTCTCAAAGTGATC
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GGTGGAACACGCTCCTGCTCTGCAAGAGTAAGGCAAGTCAACTCCCGCCTCTTCGGCTGC
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TATGAGCTTGACCTT*GTATACCGCTGACATCATGGTTGCACCTCC*TGAGTTGGCTGAG
CATTTCAAGCCAAAGGATCTCGTGACTTTTTTGACCGATCCGACGGAGACTTGCTGGCTC
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CTAATGGAAGAGATTCGAAAAGTCGCCATTTTGTTTATGCACCTGTGTCGAGAACAAAGG
AGGAAGGGTGGAGAAGGCGGAGACTACGAGAGGGGTTGGTGGTTTCC

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DS 

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TCCAATATGAACTGG*TCGTCCTGAACCTCGAACTCGTTCTCTTCCCC**TTCTGGTCCT
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DS 

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GACCGGCGCAGGTGGAACACGCTCCTGATCTGCAAGAGTAAGGCAAGTCAACTCCCGCCT
CTTCGGCTGCGTCCAATATGAACTGG*TCGTCCTGAACCTCGAACTCGTTCTCTTCCCC*
*TTCTGGTCCTATGAGCTTGACCTT*GTATACCGCTGACATCATGGTTGCACCTCC*TGA
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TTGCTGGCTCTTGTTAGCGATGAGCTGGTTCGTCGGCTGGCTTCTGAGAACGGCCTTGGT
GGTGGTCATGCTAATGGAAGAGATTCGAAAAGTCGCCATTTTGTTTATGCACCTGTGTCG
AGAACAAAGGAGGAAGGGTGGAGAAGGCGGAGACTACGAGAGG
GGTTGGTCCC

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DS 



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TACAACTAGTTAATAAAGTGGTTAAATGTCATTCAGTCGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RS1B727TF U 1
AF RS1B727JQ C 45
BS 1 664 RS1B727TF
BS 665 665 RS1B727JQ
BS 666 720 RS1B727TF
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RD RS1B727TF 761 0 0
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CCTTACTCTTGCAGAGCCGGTGCGTGTTCCACCTGCGCCGGTCAGATCGTGAAAGGCCAA
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ACATGTGTGGCTTACCCGCAGTCGGACTGTGTGATCCATACCCACAAGGAAACTGAACTC
TTCTAAAAGACCCGTTCTCGTTTGGTGGTAGTGTGATGCAAATTGTTATTTGAGTTATTG
TTATTATTATTATCAGGTTCCTTTCTACAAATTTGTGTGTGTTTAAAGGTTAATGCTTTT
TTTT*GTATGAACACGTCTCACGATATGTCTTTTTAGTTTTCATCAATCTGTCACCGGAT
*ACA*CTAGTTAATAAAGTGGTTAAATGTCATTCAGTCG
AT

QA 1 759 1 759
DS 

RD RS1B727JQ 718 0 0
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CATACACAAAATGGCGACTTTTCGAGTCTCTTCCACTAGCATGACGACCACCAAGGCCGT
TCTCAGAAGCCAGCCGACGAACCAGCTCATCGCTAACAAGAGCCAGCAAGTCTCCGTCGG
ATCGGTCAAGAAAGTCGCGAGATCCTTTGGCTTGAAATGCTCAGCCAATTCAGGAGGTGC
AACCATGATGTCAGCGGTGTACAAGGTGAAGCTCATAGGACCAGAAGGGGAAGAGAACGA
GTTCGAGGTTCAGGACGACCAGTTCATACTGGACGCAGCCGAGGAGGCGGGAGTTGACTT
GCCTTACTCTTGCAGAGCCGGTGCGTGTTCCACCTGCGCCGGTCAGATCGTGAAAGGCCA
AGTTGATCAGTCCGAGGGTTCGTTTCTTGAGGATGATCACTTTGAGAAAGGTTTCGTCTT
GACATGTGTGGCTTACCCGCAGTCGGACTGTGTGATCCATACCCACAAGGAAACTGAACT
CTTCTAAAAGACCCGTTCTCGTTTGGTGGTAGTGTGATGCAAATTGTTATTTGAGTTATT
GTTATTATTATTATCAGGTTCCTTTCTACAAATTTGTGTGTGTTTAAAGGTTAATGCTTT
TTTTTTGTATGAACACGTCTCAGGATATGTCTTTTTAGTTTTCATCAATCTGTCACCGGA
TTACAACTAGTTAATAAAGTGGTTAAATGTCATTCAGTCGATT

QA 16 718 16 718
DS 



AS 1 7

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AGATGGCGACGGAGAAGAAAGAGATGGAAGTGGTGAAAGGTCTAGACTTGGAGAGGTACA
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AGGAGCTGGTGGAGAAGGCGGTGGAGCAAGGGTATGACGTCAGCAAGCTTCACAAGACAC
CTCAGAGTGACACACCACCCGAGTCCAACGCTGCTCCTGATGACACCAAGGGCATTTGGT
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TTTTACTTCCCTTTGTCTGTGTATTGTCTGTGTAATATACTACTACCCCTTTTGTTTACT
CCAGTGAACATCATCGTTCTGCTTTTGTTCAAA


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DZ65TF U 1
AF RS1DZ65JQ C 2
AF RS1GC05TF U 69
AF RS1BH24TF U 39
AF RS1EP62JQ C 39
AF RS1EP62TF U 39
AF RS1BH24JQ C 143
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ATACTCGCGCCACTTACAGCCTTAACCCTGACGGCACGGTTAAAGTCTTGAACGAGACGT
GGAACGGAGGCAAGAGAGGTTTCATCCAAGGGTCAGCTTTCAAAACTGATCCTAAGAGCG
ATGAGGCAAAGTTCAAAGTCAGGTTCTACCTCCCTCCTTTCCTCCCTATCATTCCCGTTA
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CTTCGAGGAGTTATCTCTGGATCCTGAGCAGGACGGCGCATGTGGAGGAAGAGACATACA
AG
AGCTGGTG

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GATGGCGACGGAGAAGAAAGAGATGGAAGTGGTGAAAGGTCTAGACTTGGAGAGGTACAT
GGGCCGTTGGTACGAGATTGCTTCTTTCCCTTCCAGGTTTCAGCCCAAGGACGGTGTAGA
TACTCGCGCCACTTACAGCCTTAACCCTGACGGCACGGTTAAAGTCTTGAACGAGACGTG
GAACGGAGGCAAGAGAGGTTTCATCCAAGGGTCAGCTTTCAAAACTGATCCTAAGAGCGA
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CGGTGATTACTGGGTGCTGTATATAGATCCTGAGTACCAGCATGCGGTCATTGGGCAGCC
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TTTACTTCCCTTTGTCTGTGTATTGTCTGTGTAATATACTACTACCCCTTTTGTTTACTC
CAGTGAACATCATCGTTCTGCT

QA 1 742 1 742
DS 

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G
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CCACCTACAGCCTTAACCCTGACGGCACGGTTAAAGTCTTGAACGAGACGTGGAACGGAG
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AGTTCAAAGTCAGGTTCTACCTCCCTCCTTTCCTCCCTATCATTCCCGTTACCGGTGATT
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TGGAGAAGGCGGTGGAGCAAGGGTATGACGTCAGCAAGCTTCACAAGACACCTCAGAGTG
ACACACCACCCGAGTCCAACGCTGCTCCTGATGACACCAAGGGCATTTGGTGGCTCAAAT
CTATCTTTGGCAAATAGTTTATAGAAAAACACAAGACTTGTTTTCACCTCCTTTTACTTC
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ATCATCGTTCTG

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TTCCTCCCTATCATTCCCGTTACCGGTGATTACTGGGTGCTGTATATAGATCCTGAGTAC
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TTCCTCCCTATCATTCCCGTTACCGGTGATTACTGGGTGCTGTATATAGATCCTGAGTAC
CAGCATGCGGTCATTGGGCAGCCTTCGAGGAGTTATCTCTGGATCCTGAGCAGGACGGCG
CATGTGGAGGAAGAGACATACAAGGAGCTGGTGGAGAAGGCGGTGGAGCAAGGGTATGAC
GTCAGCAAGCTTCACAAGACACCTCAGAGTGACACACCACCCGAGTCCAACGCTGCTCCT
GATGACACCAAGGGCATTTGGTGGCTCAAATCTATCTTTGGCAAATAGTTTATAGAAAAA
CACAAGACTTGTTTTCACCTCCTTTTACTTCCCTTTGTCTGTGTATTGTCTGTGTAATAT
ACTACTACCCCTTTTGTTTACTCCAGTGAACATCATCGTTCTGCTTTTG
TTC

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DS 

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TTCAAAACTGATCCTAAGAGCGATGAGGCAAAGTTCAAAGTCAGGTTCTACCTCCCTCCT
TTCCTCCCTATCATTCCCGTTACCGGTGATTACTGGGTGCTGTATATAGATCCTGAGTAC
CAGCATGCGGTCATTGGGCAGCCTTCGAGGAGTTATCTCTGGATCCTGAGCAGGACGGCG
CATGTGGAGGAAGAGACATACAAGGAGCTGGTGGAGAAGGCGGTGGAGCAAGGGTATGAC
GTCAGCAAGCTTCACAAGACACCTCAGAGTGACACACCACCCGAGTCCAACGCTGCTCCT
GATGACACCAAGGGCATTTGGTGGCTCAAATCTATCTTTGGCAAATAGTTTATAGAAAAA
CACAAGACTTGTTTTCACCTCCTTTTACTTCCCTTTGTCTGTGTATTGTCTGTGTAATAT
ACTACTACCCCTTTTGTTTACTCCAGTGAACATCATCGTTCTGCTTTTGTTCAAA

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DS 

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CATCCAAGGGTCAGCTTTCAAAACTGATCCTAAGAGCGATGAGGCAAAGTTCAAAGTCAG
GTTCTACCTCCCTCCTTTCCTCCCTATCATTCCCGTTACCGGTGATTACTGGGTGCTGTA
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CCTGAGCAGGACGGCGCATGTGGAGGAAGAGACATACAAGGAGCTGGTGGAGAAGGCGGT
GGAGCAAGGGTATGACGTCAGCAAGCTTCACAAGACACCTCAGAGTGACACACCACCCGA
GTCCAACGCTGCTCCTGATGACACCAAGTGCATTTGGTGGCTCAAATCTATCTTTGGCAG
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ATTGTCTGTGTAATATACTACTACCCCTTTTGTTTACTCCATTGAACATCATCGTTCTGC
TTTTG
TCT

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DS 



AS 1 5

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ACATTTTCAAATATATATGGATTTGATGGTATAGCTCACAAATGGTAGAAGAAGCTTAAT
ATAATCCAAATGTCTCAAACAAACAGCCAGAAGAAGAAGAATCATTTCAAACTAAACACT
TGAAACTCTTATTCATTATTCTCTCTTTCTTCTTCATTCAATAACTGAAACTTTCTGACA
CAGAATCCCACTCATCATGAGTCACTAACGAGTTCAGACATGTCTTTGCTGATGCTGTTC
TCGGGTGTTGACAACTGTGTTCCAGATATAAAAGCTTTGAAGAGCGCAAGAGCCTCCTTC
GGTCTATGCAAAGGAACTTCATGGCCTGCTCCTCTCACCGTCACAAAGTTTAGACCAGCA
TACTGCTGAGTCCACCCTCCCACCTGTCCGTCTATGTACCAAGGACCGTAAGGACTCAGT
GGACGCAGGTTTAGTGCATCTATGCTGTACCGGGTTGATGTAACTGGTACAACAGCATCT
GCGTCTCCACTGAAAACCCAAATGCGTAGCCCTGCAGCTATAAGCTCGTGGTAAATGTTC
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TACACTCTAGAGTGTTTCTCCGTGCAAGGATCATACTGCTCACTCACCCGGCTAGTCATT
GGTCTTTTCTTTAGCAACATTTTTGACTGGGTAGCATTAGCAATACAGGCTGGTGTGAAG
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GCTTTGGAGGAGTGAACAAAAGATTCAAAACCACACTGAAGTTTCAGTAAGCTATATGTC
TGGTCAGAGATAAAACCCAACGACCAAATGTATTGGAAAAGACCAAGCCTGTCATGGAAA
TCATCCATCAGACCATTTCCTACCATGTAACCCTTAAGATTAATAGTGTTGTCGCCAGAA
GCTTGGTTATGTCTTACAATAGCTTGACTCAGCTGAGGAACGTAATGCCCTGCATAGCTC
TCTCCAACTATGTAAAACTCTCTTCCTTTATACTCAGGATAACGCTCAACCCATTTCAGC
AGAAACTTCAGTGAGTCTTGAGCAGTTCTCTTATCACCATTGCTACTCAAATCAGATGAA
GTGTTTGAGTATGAATAGCCAACTCCTACAGGTGCATCCAGGAACAAAATATTCGCAGCT
TGGTTCCAAGAGTAGTGATTAAGGTAAAGAGTCTTCCCATCAGACTTAATGTGAAAAGGT
CCTATCTCTTCTGCTTCACCATATGCAACAGATGAACATCCTGGTCCTCCATTGAGCCAG
AGAACGAGGGGTTTGGAGGAAGCATCATCGGCGGCTTCAAAGAACCAGTAGAAGAGTGCT
CTTCCCAGTTTCTCGTTAGTAGTAATAAAACCAGAGTAGTGAGCGAAGTCAACGTTGAAG
TTCTGACCAGGCAGTTTAGAGACCTTGTCCTCTTCTTTCTGAGACAAGATAGCTTCACAG
GTACACAGATGGGTGATCGCTAAAATAGCGATGATGACAAAACAAGATCCTCTAGTTTTA
GCCATCGTTGTTAAACTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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CACTCACCCGGCTAGTCATTGGTCTTTTCTTTAGCAACATTTTTGACTGGGTAGCATTAG
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A

QA 1 721 1 721
DS 

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TCCTTCCAGTGTTCATTCACTACATCACTGCAAGTATCCCATTTGGATGGTGCAAGTCCT
GCCGGGACATGGAGAGCTTCTTGAACCTCTGGAAGATTGAAATACACTCTAGAGTGTTTC
TCCGTGCAAGGATCATACTGCTCACTCACCCGGCTAGTCATTGGTCTTTTCTTTAGCAAC
ATTTTTGACTGGGTAGCATTAGCAATACAGGCTGGTGTGAAGACGCTGTATTGGTCTATG
TTACCTATTTCCTTGTCAGCTAACTCCAGAACCTTATCACACGCTTTGGAGGAGTGAACA
AAAGATTCAAAACCACACTGAAGTTTCAGTAAGCTATATGTTTGGTCAGAGATAAAACCC
AACGACCAAATGTATTGGAAAAGACCAAGCCTGTCATGGAAATCATCCATCAGTCCATTT
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ATGGCTTGACTCAGCTGAGGAACGTAATGCCCTGCATAGCTCTCTCCAACTAT
C

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DS 

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TTCC
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GCTGAGGAACGTAATGCCCTGCATAGCTCTCTCCAACTATGTAAAACTCTCTTCCTTTAT
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TGATGACAAAACAAGATCCTCTAGTTTTAGCCATCGTTGTTAAACTTCC

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DS 



AS 2 8

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GAAAAAAAAGAGAAACTATGAACAAAGGAAGAAAAAAAAATCATGATTTGCATTATTGTT
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TAACTTGTTGCAGATCTGTAACCTTCTACGCCTATTCAACGGATTCCCTTGCTTTGGTAC
TTCTTTCACACTCCCGATCTCTCCTAAGTTCCCAAACGATTTTGATTTCCCTTTGTAGTG
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AU72JQ U 39
AF RS1DO05JQ U 1
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CGAC
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GACAACTCCTCTTGGTCCTCCTCGCTCTTCATCGCTCAGATCTCCCTCCTCTTCTTCATC
ATCATCATCTTGATCTTCGTTTACAGGCAAAAGAGGCATAGATTTAGGGTTTTG

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DS 

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GAAAAAAAAGAGAAACTATGAACAAAGGAAGAAAAAAAAATCATGATTTGCATTATTGTT
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QA 1 773 1 773
DS 



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AACAAGTTAGCAAGAAGATCGTTCTACTCGTGGCAAAACCCTAAATCTATGCCTCTTTTG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 0 10 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 10 35 35 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 

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QA 9 575 9 575
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GG
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G
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ATGTTTTTCTTTTTA
TT

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T
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CAATAATGCAAATCATGATTTTTTTTCTTCCTTTGTTCATAGTTTCTTTTTTTTT*CCCT
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TC

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GCCTGTAAACGAAGATCAAGATGATGA***AGAGGAGGGAGACGATGGTGATCTGAGCGA
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TTTTTTTTCCCTTATCTAAAAATATAATTTTAATTTTCGTCGAATTAATGTTTTTCTTTT
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TAGTGTTTGTTCC

QA 1 613 1 613
DS 



AS 2 8

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TCTCCAACAAACGTGTTGCACGTACTGCATTTGATCCCCTTTCCTTCTCCTTCTCCCTTT
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TCAGTCTCAAGAGGTAACAACGGCTTGTTTGTCTGCAATGCCATATCGTCATGCTCATCG
TAATGATCCATGCTCGTGTCACCTTCAGCATGAACCGATACAGCGAGTATCTCTAATCTC
CCCTGCATACTCCTCACAAGGGAATCACACTCTCGGTATAGCCCCGGTTCCATCTCGCAG
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BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F351JQ U 2
AF RS1BF03JQ U 20
AF RS1EJ20JQ U 1
AF RS1GU02JQ U 1
BS 1 70 RS1EJ20JQ
BS 71 71 RS1F351JQ
BS 72 690 RS1EJ20JQ
BS 691 830 RS1GU02JQ

RD RS1F351JQ 597 0 0
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TTCGCTTCAGGTTGTGTTTGTGCCAATCAGTCTTGAAATGCTCTCTATATTGCTTAGCTT
CTCCAACAAACGTGTTGCACGTACTGCATTTGATCCCCTTTCCTTCTCCTTCTTCCTTTG
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CAGTCTCAAGAGGTAACAACGGCTTGTTTGTCTGCAATGCCAGATCGTCATGCTCATCGT
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QA 1 597 1 597
DS 

RD RS1BF03JQ 618 0 0
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TAAAATATCAAAAAGAGTAGTCTTTCAAGTCTGATCTGGAGTCATCCATGTCAACCTCAG
CAGAGCATTCTTCAGCAGTAAGAGGAGGGAGTTTACGAGTCTTTCGCTTCAGGTTGTGTT
TGTGCCAATCAGTCTTGAAATGCTCTCTGTATTGCTTAGCTTCCCCAACAAACGTGTTGC
ACGTACTGAATTTGATCCCCTTTCCTTCTCCTTCTCCCTTTGTGTTGTCACTAGTAGTAC
CAATCTCTTGCTTCTGCATTTTCTTGCTCAGTTCGTCGGCCTCAGTCTCAAGAGGTAACA
ACGGCTTGTTTGTCTGCAATGCCATATCGTCATGCTCATCGTAATGATCCATGCTCGTGT
CACCTTCAGCATGAACCGATACAGCGAGTATCTCTAATCTCCCCTGCATACTCCTCACAA
GGGAATCACACTCTCGGTATAGCCCCGGTTCCATCTCGCAGACAGTGGACATGTGAGTTC
CAGATTCGTCTTTGGAGA

QA 1 618 1 618
DS 

RD RS1EJ20JQ 690 0 0
CGGTATTAAGACATTTATAGACTCAAGAAAAGGGTCTGTTAACAGCAACAATAATAAACA
AACAAAAAAA*GATTCATTCCTGATCAGCTCCACAACAAGTTTGCGTGTTCATACTCACC
CACTAAATGGCAAAAGCTGTAAAATATCAAAAAGAGTAGTCTTTCAAGTCTGATCTGGAG
TCATCCATGTCAACCTCAGCAGAGCATTCTTCAGCAGTAAGAGGAGGGAGTTTACGAGTC
TTTCGCTTCAGGTTGTGTTTGTGCCAATCAGTCTTGAAATGCTCTCTGTATTGCTTAGCT
TCTCCAACAAACGTGTTGCACGTACTGCATTTGATCCCCTTTCCTTCTCCTTCTCCCTTT
GTGTTGTCACTAGTAGTACCAATCTCTTGCTTCTGCATTTTCTTGCTCAGTTCGTCGGCC
TCAGTCTCAAGAGGTAACAACGGCTTGTTTGTCTGCAATGCCATATCGTCATGCTCATCG
TAATGATCCATGCTCGTGTCACCTTCAGCATGAACCGATACAGCGAGTATCTCTAATCTC
CCCTGCATACTCCTCACAAGGGAATCACACTCTCGGTATAGCCCCGGTTCCATCTCGCAG
ACAGTGGACATGTGAGTTCCAGATTCGTCTTTGGAGACAAGAGAAGCGTCCCATTCTTTA
AGCTTCTCCAGAAGCGAGGAGAAGTTCTGA

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1GU02JQ 830 0 0
C
GGTATTAAGACATTTATAGACTCAAGAAAAGGGTCTGTTAACAGCAACAATAATAAACAA
ACAAAAAAA*GATTCATTCCTGATCAGCTCCACAACAAGTTTGCGTGTTCATACTCACCC
ACTAAATGGCAAAAGCTGTAAAATATCAGAAAGAGTAGTCTTTCAAGTCTGATCTGGAGT
CATCCATGTCAACCTCAGCAGAGCATTCTTCAGCAGTAAGAGGAGGGAGTTTACGAGTCT
TTCGCTTCAGGTTGTGTTTGTGCCAATCAGTCTTGAAATGCTCTCTGTATTGCTTAGCTT
CTCCAACAAACGTGTTGCACGTACTGCATTTGATCCCCTTTCCTTCTCCTTCTCCCTTTG
TGTTGTCACTAGTAGTACCAATCTCTTGCTTCTGCATTTTCTTGCTCAGTTCGTCGGCCT
CAGTCTCAAGAGGTAACAACGGCTTGTTTGTCTGCAATGCCATATCGTCATGCTCATCGT
AATGATCCATGCTCGTGTCACCTTCAGCATGAACCGATACAGCGAGTATCTCTAATCTCC
CCTGCATACTCCTCACAAGGGAATCACACTCTCGGTATAGCCCCGGTTCCATCTCGCAGA
CAGTGGACATGTGAGTTCCAGATTCGTCTTTGGAGACAAGAGAAGCGTCCCATTCTTTAA
GCTTCTCCAGAAGCGAGGAGAAGTTCTGAGCAGGAACAGTGAGACGCAGTCTCATTGGAG
AACGCTTTATAGGGAAGTGCTTCTGCAGCTCACGGATGACATCAAGAGCCTGCTTCTTGG
AGTTGCTATTAGATCAACAGCGAAATGGATCTCATGCATAAGACGCTCA

QA 2 830 2 830
DS 



CO CL650Contig2 835 4 3 U
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TGGATCCGATGATCACACCAAGATCTGCTTGGAGATTCTGGAGAAAGGTGAGCTTCAAGT
TGCTGGCAAAGAGAGAGAGTCGCAGCTGTCTAGTCAGTTTAGGGATATCGCTACGATTGT
GATGCAGAAAACCATTAACCCTGACACCCAACGCCCTTATACCATTAGCATGGTTGAGCG
TCTTATGCATGAGATCCATTTCGCTGTTGATCCTAATAGCAACTCCAAGAAGCAGGCTCT
TGATGTCATCCGTGAGCTGCAGAAGCACTTCCCTATAAAGCGTTCTCCAATGAGACTGCG
TCTCACTGTTCCTGCTCAGAACTTCTCCTCGCTTCTGGAGAAGCTTAAAGAATGGGACGC
TTCTCTTGTCTCCAAAGACGAATCTGGAACTCACATGTCCACTGTCTGCGAGATGGAACC
GGGGCTATACCGAGAGTGTGATTCCCTTGTGAGAGTATGCAGGGAGATAGAGATACTCGC
TGTATCGTTCATGCTGAGTGACACGAGCATGGATCATACGATGAGCATGACGATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 0 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1F351TF U 1
AF RS1GU02TF U 22
AF RS1EJ20TF U 22
AF RS1BF03TF U 23
BS 1 531 RS1F351TF
BS 532 740 RS1EJ20TF
BS 741 835 RS1BF03TF

RD RS1F351TF 531 0 0
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GGTCCTTTCTTGGCGTTCCGGCGTGGAGAAGGATATAGATGAAGTGTTGCAGTCGCATAC
TGTTTACTCAAACGTGTCCAAAGGAGTTCTTGCTAAATCTAAAGACTTGATAAAGGTCTT
TGGATCCGATGATCACACCAAGATCTGCTTGGAGATTCTGGAGAAAGGTGAGCTTCAAGT
TGCTGGCAAAGAGAGAGAGTCGCAGCTGTCTAGTCAGTTTAGGGATATCGCTACGATTGT
GATGCAGAAAACCATTAACCCTGACACCCAACGCCCTTATACCATTAGCATGGTTGAGCG
TCTTATGCATGAGATCCATTTCGCTGTTGATCCTAATAGCAACTCCAAGAA

QA 1 531 1 531
DS 

RD RS1GU02TF 626 0 0
GGG
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GCTGTCTAGTCAGTTTAGGGATATCGCTACGATTGTGATGCAGAAAACCATTAACCCTGA
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CTCCTCGCTTCTGGAGAAGCTTA

QA 4 626 4 626
DS 

RD RS1EJ20TF 719 0 0
GGG
GCAACCAACCGGCGAGAGCAAAAGAAGGT***TACGAGAGAGAGA**TGTCGAAGACGCT
GGTGCAGCCGGTAGGGCAGAAGAGGTTGACGAACGTCGCAGTGGTTCGATTGAAGAAGCA
AGGCAACCGCTTCGAGATCGCTTGCTACAAGAACAAGGTCCTTTCTTGGCGTTCCGGCGT
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CTGCTTGGAGATTCTGGAGAAAGGTGAGCTTCAAGTTGCTGGCAAAGAGAGAGAGTCGCA
GCTGTCTAGTCAGTTTAGGGATATCGCTACGATTGTGATGCAGAAAACCATTAACCCTGA
CACCCAACGCCCTTATACCATTAGCATGGTTGAGCGTCTTATGCATGAGATCCATTTCGC
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CTCCTCGCTTCTGGAGAAGCTTAAAGAATGGGACGCTTCTCTTGTCTCCAAAGACGAATC
TGGAACTCACATGTCCACTGTCTGCGAGATGGAACCGGGGCTATACCGAGAGTGTG

QA 4 719 4 719
DS 

RD RS1BF03TF 813 0 0
GG
GCAACCAACCGGCGAGAGCAAAAGAAGGTACTTACGAGAGAGAGAGATGTCGAAGACGCT
GGTGCAGCCGGTGGGGCAGAAGAGGTTGACGAGCGTCGCAGTGGTTCGATTGAAGAAGCA
AGGCAACCGCTTCGAGATCGCTTGCTACAAGAACAAGGTCCTTTCTTGGCGTTCCGGCGT
GGAGAAGGATATAGATGAAGTGTTGCAGTCGCATACTGTTTACTCAAACGTGTCCAAAGG
AGTTCTTGCTAAATCTAAAGACTTGATAAAGGTCTTTGGATCCGATGATCACACCAAGAT
CTGCTTGGAGATTCTGGAGAGAGGTGAGCTTCAAGTTGCTGGCAAAGAGAGAGAGTCGCA
GCTGTCTAGTCAGTTTAGGGATATCGCTACGATTGTGATGCAGAAAACCATTAACCCTGA
CACCCAACGCCCTTATACCATTAGCATGGTTGAGCGTCTTATGCATGAGATCCATTTCGC
TGTTGATCCTAATAGCAACTCCAAGAAGCAGGCTCTTGATGTCATCCGTGAGCTGCAGAA
GCACTTCCCTATAAAGCGTTCTCCAATGAGACTGCGTCTCACTGTTCCTGCTCAGAACTT
CTCCTCGCTTCTGGAGAAGCTTAAAGAATGGGACGCTTCTCTTGTCTCCAAAGACGAATC
TGGAACTCACATGTCCACTGTCTGCGAGATGGAACCGGGGCTATACCGAGAGTGTGATTC
CCTTGTGAGAGTATGCAGGGAGATAGAGATACTCGCTGTATCGTTCATGCTGAGTGACAC
GAGCATGGATCATACGATGAGCATGACGATA

QA 3 813 3 813
DS 



AS 1 7

CO CL651Contig1 721 7 8 U
GGGGCAGCCAATTCTTCCGTTTAGCAGCCATGGTGAAGTACTCGCAAGAACCCGACAATC
AGACCAAGTCCTGCAAGGCTAGAGGTTCCGACCTGAGGGTTCACTTCAAGAACACCCGTG
AAACAGCGCACGCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCGAAGAGATACCTTGAAGATG
TGATAGCTCACAAGCAAGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACTG
CCCAAGCCAAGAACAGGCACTCTAACGGTCAGGGACGTTGGCCTGCGAAATCTGCTCAGT
TCGTTCTTGATTTGCTTAAGAACGCTGAGAGCAACGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTTG
ATGCACTCTTCATATCTCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCAAAGCAAAGGAGAAGGACTT
ACCGTGCCCACGGAAGAATCAATCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTTGATTT
TGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTTAAGAAAGAGCCGGAGACGCAGTTGGCAGCCAAGTCAA
AGAAATCAGCAGCTTAAAAGCTTTCTTTGTTTTTTTTTTTAAGTCTCTCCTTTTT*GTGT
TGTTGAAAGAGATTTTGTTACATTTTTCTCTATCTTTGCAAGACAATAGATATATTTTCA
TGGATCAGTTTGGTGATGGTTTGTACTATCACTCCATCTTTACTAGTTTCCGCTTATCTT
T


BQ
10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 
45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1GH59TF U 2
AF RS1F026TF U 1
AF RS1GX22JQ C 2
AF RS1GX22TF U 2
AF RS1GH59JQ C 59
AF RS1DF15TF U 2
AF RS1DF15JQ C 164
BS 1 27 RS1F026TF
BS 28 28 RS1DF15TF
BS 29 94 RS1F026TF
BS 95 95 RS1GX22TF
BS 96 108 RS1F026TF
BS 109 109 RS1DF15TF
BS 110 640 RS1F026TF
BS 641 721 RS1DF15TF

RD RS1GH59TF 521 0 0
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GATAGCTCACAAGCAAGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACTGC
CCAAGCCAAGAACAGGCACTCTAACGGTCAGGGACGTTGGCCTGCGAAATCTGCTCAGTT
CGTTCTCGATTTGCTTAAGAACGCTGAGAGCAACGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTTGA
TGCACTCTTCATATCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCAAAGCAAAGGAGAGGGACTTA
CCGTGCCCACGGAAGAATCAATCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTCGATTTT
GTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTTAAGAAAGAGCCGGAGACGC

QA 1 521 1 521
DS 

RD RS1F026TF 647 0 0
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AGACCAAGTCCTGCAAGGCTAGAGGTTCCGACCTAAGGGTTCACTTCA*GAACACCCGTG
AAACAGCGCACGCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCGAAGAGATACCTTGAAGATG
TGATAGCTCACAAGCAAGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACTG
CCCAAGCCAAGAACAGGCACTCTAACGGTCAGGGACGTTGGCCTGCGAAATCTGCTCAGT
TCGTTCTTGATTTGCTTAAGAACGCTGAGAGCAACGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTTG
ATGCACTCTTCATATCTCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCAAAGCAAAGGAGAAGGACTT
ACCGTGCCCACGGAAGAATCAATCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTTGATTT
TGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTTAAGAAAGAGCCGGAGACGCAGTTGGCAGCCAAGTCAA
AGAAATCAGCAGCTTAAAAGCTTTCTTTGTTTTTTTTTTTAAGTCTCTCCTTTTT*GTGT
TGTTGAAAGAGATTTTGTTACATTTTTCTCTATCTTTGCA
GACATAG

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1GX22JQ 648 0 0
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GACCAAGTCCTGCAAGGCTAGAGGTTCCGACCTGAGGGTTCACTTCAAGAACACCCGTGA
AACAGCGCACGCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCGAAGAGATACCTTGAAGATGT
GATAGCTCACAAGCAAGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACTGC
CCAAGCCAAGAACAGGCACTCTAACGGTCAGGGACGTTGGCCTGCGAAATCTGCTCAGTT
CGTTCTTGATTTGCTTAAGAACGCTGAGAGCAACGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTTGA
TGCACTCTTCATATCTCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCAAAGCAAAGGAGAAGGACTTA
CCGTGCCCACGGAAGAATCAATCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTTGATTTT
GTTTGAGAAGGAAGAGTCTGTTAAGAAAGAGCCGGAGACGCAGTTGGCAGCCAAGTCAAA
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GTTGAAAGAGATTTTGTTACATTTTTCTCTATCTTTGCAAGACAATAG

QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1GX22TF 648 0 0
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GACCAAGTCCTGCAAGGCTAGAGGTTCCGACCTGAGGGTTCACTTCAAGAACACCCGTGA
AACAGCGCACGCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCGAAGAGATACCTTGAAGATGT
GATAGCTCACAAGCAAGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACTGC
CCAAGCCAAGAACAGGCACTCTAACGGTCAGGGACGTTGGCCTGCGAAATCTGCTCAGTT
CGTTCTTGATTTGCTTAAGAACGCTGAGAGCAACGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTTGA
TGCACTCTTCATATCTCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCAAAGCAAAGGAGAAGGACTTA
CCGTGCCCACGGAAGAATCAATCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTTGATTTT
GTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTTAAGAAAGAGCCGGAGACGCAGTTGGCAGCCAAGTCAAA
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GTTGAAAGAGATTTTGTTACATTTTTCTCTATCTTTGCAAGACAATAG

QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1GH59JQ 608 0 0
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TGAAACAGCGCACGCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCGAAGAGATACCTTGAAGA
TGTGATAGCTCACAAGCAAGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGAC
TGCCCAAGCCAAGAACAGGCACTCTAACGGTCAGGGACGTTGGCCTGCGAAATTTGCTCA
GTTCGTTCTCGATTTGCTTAAGAACGCTGAGAGCAACGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGT
TGATGCACTCTTCATATCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCAAAGCAAAGGAGAGGGAC
TTACCGTGCCCACGGAAGAATCAATCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTCGAT
TTTGTTTGAGAAGGAAGAGTCTGTTAAGAAAGAGCCGGAGACGCAGTTGGCAGCCAAGTC
AAAGAAATCAGCAGCTTAAAAGCTTTCTTTGTTTTTTTTTTTAAGTCTCTCCTTTTT*GT
GTTGTTGAAAGAGATTTTGTTACATTTTTCTCTATCTTTGCAAGACAATAGATATATTTT
CATGGATC

QA 1 608 1 608
DS 

RD RS1DF15TF 720 0 0
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GACCAAGTCCTGCAAGGCTAGAGGTTCCGACCTAAGGGTTCACTTCAAGAACACCCGTGA
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GATAGCTCACAAGCAAGCTATTCCCTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGACTGC
CCAAGCCAAGAACAGGCACTCTAACGGTCAGGGACGTTGGCCTGCGTAATCTGCTCAGTT
CGTTCTTGATTTGCTTAAGAACGCTGAGAGCAACGCTGAGGTGAAAGGTTTGGATGTTGA
TGCACTCTTCATATCTCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCAAAGCAAAGGAGAAGGACTTA
CCGTGCCCACGGAAGAATCAATCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGTTGATTTT
GTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTTAAGAAAGAGCCGGAGACGCAGTTGGCAGCCAAGTCAAA
GAAATCGGCAGCTTAAAAGCTTTCTTTGTTTTTTTTTT*AAGTCTCTCCTTTTT*GTGTT
GTTGAAAGAGATTTTGTTACATTTTTCTCCATCTTTGCAAGACAATAGATATATTTTCAT
GGATCAGTTTGGTGATGGTTTGTACTATCACTCCATCTTTACTAGTTTCCGCTTATCTTT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RS1DF15JQ 558 0 0
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TGCGTAATTTGCTCAGTTCGTTCTTGATTTGCTTAAGAACGCTGAGAGCAACGCTGAGGT
GAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTTTTCATATTTCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCAAA
GCAAAGGAGAAGGACTTACCGTGCCCACGGAAGAATCAATCCTTACATGTCCAACCCATG
CCACATTGAGTTGATTTTGTTTGAGAAGGAAGAGTTTGTTAAGAAAGAGCCGGAGACGCA
GTTGGCAGCCAAGTCAAAGAAATCGGCAGCTTAAAAGCTTTCTTTGTTTTTTTTTT*AAG
TCTCTCCTTTTT*GTGTTGTTGAAAGAGATTTTGTTACATTTTTCTCCATCTTTGCAAGA
CAATAGATATATTTTCATGGATCAGTTTGGTGATGGTTTGTACTATCACTCCATCTTTAC
TAGTTTCCGCTTATCTTT

QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 7

CO CL652Contig1 1273 7 41 U
CAGGAAACTCGATGTTGCCGCCGGAAGAAAAGTTTATTTATGATCAGACCAACATTGTCT
**CAACTACTGAGACTGCAAACTGTAACATGATAAACATCAAGCTTTTATTTTCTCAAAC
ATCACTTTAAAATTGAGTCGCAAACTTTATTTGGAAACTTTCTGAAGACAGAACCCAAGT
GCAAAAGACTTTGTTATTTATCATTTGGAGAATCTGTGTCGATCATGAGGTGAAGAGTAA
TCGATGTTTGGTCCGTGAGGGATGATCCCAAAAGGGTTGATCGAAGGGTGGCTTCCATAG
TAATGCTGCTTGATGTGATTCATGTGCACGGTGCTACTCATACCAGGGACTTGAAATACG
TCTTTCGTGTAGTTGAACAGATTCGGATACTCTCTTAAGAGTTTCTTGTTGCACTTGAAG
TGAACCGCATAAACCTCGTCAAATCTTATCAGTGTCACAAACAACCTGATATCCGCTTCA
GTCAAAGTGTTACCGCAGATGTAACGATGCTTTCCAAGAATCTCCTCGCATCTATCTAAT
GCTTCATACACTTGCTGCACTGCCTCCTCGTAAGGTTCTTGTTTCTTTGCAAAACCGCAC
CTATAGACACCATTATTAATCCCACTGTAAATCCATTCATTAGCTTCATCGATTTTAGCT
TGGAGTTGAGAAGGGTAAAGATCAAGAGCAGGGTTTCTAGCAATATGATTGAACTCGGTG
TTGAACATCCTGATAATCTCAACGCTCTCATTGTTCACAACAGTCTTCAGCTTCTTATCC
CACAGAACAGGAACAGTATACTTCCCGGTGTAGTTTGGGCTAGCAATCTCATAGAGTTCT
CTTACACTCTTAGCACCATTAAGATGGTCAGGATCAGCTCCTTGAACCTCAGCGTCTGAA
TCCGGGAAGACCCATCCCATATGCTCATCACTTTCCTTAGTCCTTCCCCAAATGGGTTTA
ACAGACGAGAAGCTTATTGCATCGTCAAGTCCTTTGATCTTCAAGTATGAGATGCATCTA
GAAGCCCATGGACAAGCATAAGATATGTAAAGATGGTATCTACCAGATTCAGCTGGAAAC
TGAGAATTGGAATCTCTTGAGACGAAATTACGGAACGTTGAGGCAGTTCTTTGAAATGCT
CCGGAGTCTGATGTCTCATCAACCGCAGATCTAGCCATTGATAGTGTACAGAGTGGATTG
CGATGATGTTGACGAGATCCACGAGTAGTGAACTTTGTAGCGAGAGAGAGGAAGCTGTTG
TGGCTGAGGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 5 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1B671JQ U 17
AF RS1GQ24JQ U 1
AF RS1B213JQ U 165
AF RS1FX39JQ U 17
AF RS1FF39JQ U 114
AF RS1B213TF C 565
AF RS1B671TF C 572
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BS 1123 1273 RS1B213TF

RD RS1B671JQ 557 0 0
GC
CGCCGGAAGAAAAGTTTATTTATGATCAGACCAACATTGTCT**CAACTA*TGAAACTGC
AAACTGTAACATGATAAACATCAAGCTTTTATTTTCTCAAACATCACTTTAAAATTGAGT
CGCAAACTTTATTTGGAAACTTTCTGAAAACAGAACCCAAGTGCAAAAGACTTTGTTATT
TATCATTTGGAGAATCTGTGTCGATCATGAGGTGAAGAGTAATCGATGTTTGGTCCCTGA
GGGACGATCCCCAAAGGGTTGATCGAAGGGTGGCTTCCATAGTAATGCTGCTTGATGTGA
TTCATGTTCACGGTGCTACTCATACCTGGGACTTGAAATATGTCTTTCGTGTAGTTGAAC
AGATTCGGATACCCTCTTAAAAGTTTCTTGTTGCATTTGAAGTGAACCGCGTAAACCTCG
TCAAATCTTATCAGTGTCACAAACAATCTGATATCTGTTTCAGTCAAAGTGTTACCGCAG
ATGTAACGATGCTTTCCAAGAATCTCCTCGCATCTATCTAATGCTTCATACACTTGCTGC
ACTGCCTCCTCGTAA

QA 3 557 3 557
DS 

RD RS1GQ24JQ 660 0 0
CAGGAAACTCGATGTTGCCGCCGGAAGAAAAGTTTATTTATGATCAGACCAACATTGTCT
**CAACTACTGAGACTGCAAACTGTAACATGGTAAACATCAAGCTTTTATTTTCTCAAAC
ATCACTTTAAAATTGAGTCGCAAACTTTATTTGGAAACTTTCTGAAGACAGAACCCAAGT
GCAAAAGACTTTGTTATTTATCATTTGGAGAATCTGTGTCGATCATGAGGTGAAGAGTAA
TCGATGTTTGGTCCCTGAGGGACGATCCCCAAAGGGTTGATCGAAGGGTGGCTTCCATAG
TAATGCTGCTTGATGTGATTCATGTTCACGGTGCTACTCATACCAGGGACTTGAAATATG
TCTTTCGTGTAGTTGAACAGATTCGGATACTCTCTTAAGAGTTTCTTGTTGCATTTGAAG
TGAACCGCGTAAACCTCGTCAAATCTTATCAGTGTCACAAACAATCTGATATCTGTTTCA
GTCAAAGTGTTACCGCAGATGTAACGATGCTTTCCAAGAATCTCCTCGCATCTATCTAAT
GCTTCATACACTTGCTGCACTGCCTCCTCGTAAGGTTCTTGTTTCTTTGCAAAACCGCAT
CTATAGACACCATTATTAATCCCACTGTAAATCCATTCATTAGCTTCATCGATTTTAGCT

QA 1 660 1 660
DS 

RD RS1B213JQ 518 0 0
AATAT
AGAACCCAAGTGCAAAAGACTTTGTTATTTATCATTTGGAGAATCCGTGTCGATCATGAG
GTGAAGAGTAATCGATGTTTGGTCCGTGAGGGATGATCCCAAAAGGGTTGATCGAAGGGT
GGCTTCCATAGTAATGCTGCTTGATGTGATTCATGTGCACGGTGCTACTCATACCAGGGA
CTTGAAATACGTCTTTCGTGTAGTTGAACAGATTCGGATACTCTCTTAAGAGTTTCTTGT
TGCACTTGAAGTGAACCGCATAAACCTCGTCAAATCTTATCAGTGTCACAAACAACCTGA
TATCCGCTTCAGTCAAAGTGTTACCGCAGATGTAACGATGCTTTCCAAGAATCTCCTCGC
ATCTATCTAATGCTCCATACACTTGCTGCACTGCCTCCTCGTAAGGTTCTTGTTTCTTTG
CAAAACCGCACCTATAGACACCATTATTAATCCCACTGTAAATCCATTCATTAGCTTCAT
CGATTTTAGCTTGGAGTTGAGAAGGGTAAAGAT

QA 6 518 6 518
DS 

RD RS1FX39JQ 758 0 0
GT
CGCCGGAAGAAAAGTTTATTTATGATCAGACCAACATTGTCTCTCAACTACTGAGACTGC
AAACTGTAACATGATAAACATCAAGCTTTTATTTTCTCAAACATCACTTTAAAATTGAGT
CGAAAACTTTATTTGGAAACTTTCTGAAGACAGAACCCAAGTGCAAAAGACTTTGTTATT
TATCATTTGGAGAATCTGTGTCGATCATGAGGTGAAGAGTAATCGATGTTTGGTCCGTGA
GGGATGATCCCAAAAGGGTTGATCGAAGGGTGGCTTCCATAGTAATGCTGCTTGATGTGA
TTCACGTGCACGGTGCTACTCATACCAGGGACTTGAAATACGTCTTTCGTGTAGTTGAAC
AGATTCGGATACTCTCTTAAGAGTTTCTTGTTGCACTTGAAGTGAACCGCATAGACCTCG
TCAAATCTTATCAGTGTCACAAACAACCTGATATCCGCTTCAGTCAAAGTGTTACCGCAG
ATGTAACGATGCTTTCCAAGAATCTCCTCGCATCTATCTAATGCTTCATACACTTGCTGC
ACTGCCTCCTCGTAAGGTTCTTGTTTCTTTGCAAAACCGCACCTATAGACACCATTATTA
ATCCCACTGTAAATCCATTCATTAGCTTCATCGATTTTAGCTTGGAGTTGAGAAGGGTAA
AGATCAAGATCAGGGTTTCTAGCAATATGATTGAACTCGGTGTTGAACATCCTGATAATC
TCAGCGCTCTCATTGTTCACAACAGTCTTCAGCTTC

QA 3 758 3 758
DS 

RD RS1FF39JQ 661 0 0
CTCAAACATCACTTTAAAATTGAGTCGCAAACTTTATTTGGAAACTTTCTGAAGATAGAA
CCCAAGTGCAAAAGACTTTGTTATTTATCATTTGGAGAATCCGTGTCGATCATGAGGTGA
AGAGTAATCGATGTTTGGTCCGTGAGGGATGATCCCAAAAGGGTTGATCGAAGGGTGGCT
TCCATAGTAATGCTGCTTGATGTGATTCATGTGCACGGTGCTACTCATACCAGGGACTTG
AAATACGTCTTTCGTGTAGTTGAACAGATTCGGATACTCTCTTAAGAGTTTCTTGTTGCA
CTTGAAGTGAACCGCATAGACCTCGTCAAATCTTATCAGTGTCACAAACAACCTGATATC
CGCTTCAGTCAAAGTGTTACCGCAGATGTAACGATGCTTTCCAAGAATCTCCTCGCATCT
ATCTAATGCTTCATACACTTGCTGCACTGCCTCCTCGTAAGGTTCTTGTTTCTTTGCAAA
ACCGCACCTATAGACACCATTATTAATCCCACTGTAAATCCATTCATTAGCTTCATCGAT
TTTAGCTTGGAGTTGAGAAGGGTAAAGATCAAGAGCAGGGTTTCTAGCAATATGATTGAA
CTCGGTGTTGAACATCCTGATAATCTCAACGCTCTCATTGTTCACAACAGTCTTCAGCTT
C

QA 1 661 1 661
DS 

RD RS1B213TF 709 0 0
TCCTCGTAAGGTTCTTGTT*CTTTGCAAAACCGCACCTATAGACACCATTATTAATCCCA
CTGTAAATCCATTCATTAGCTTCATCGATTTTAGCTTGGAGTTGAGAAGGGTAAAGATCA
AGAGCAGGGTTTCTAGCAATATGATTGAACTCGGTGTTGAACATCCTGATAATCTCAACG
CTCTCATTGTTCACAACAGTCTTCAGCTTCTTATCCCACAGAACAGGAACAGTATACTTC
CCGGTGTAGTTTGGGCTAGCAATCTCATTGAGTTCTCTTACACTCTTAGCACCATTAAGA
TGGTCAGGATCAGCTCCTTGAACCTCAGCGTCTGAATCCGGGAAGACCCATCCCATGTGC
TCATCACTTTCCTTGGTCCTTCCCCAAATGGGTTTAACAGACGAGAAGCTTATTGCATCG
TCAAGTCCTTTGATCTTCAAGTATGAGATGCATCTAGAAGCCCATGGACAAGCATAAGAT
ATGTAAAGATGGTATCTACCAGATTCAGCTGGAAACTGAGAATTGGAATCTCTTGAGACG
AAGTTACGGAACGTTGATGCAGTTCTTTGAAATGCTCCGGAGTCTGATGTCTCATCAACC
GCAGATCTAGCCATTGATAGTGTACAGAGTGGATTGCGATGATGTTGACGAGATCCACGA
GTAGTGAACTTTGTAGCGAGAGAGAGGAAGCTGTTGTGGCTGAGGATCC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1B671TF 702 0 0
TAAGGTTC
TGTTTCTTTGCAAAACCGCATCTATAGACACCATTATTAATCCCACTGTAAATCCATTCA
TTAGCTTCATCGATTTTAGCTTGGAGT*GAGAAGGGTAAAGATCAAGATCAGGGTTTCTA
GCAATATGATTGAACTCGGTGTTGAACATCCTGATTATCTCAGCGCTCTCATTGTTCACA
ACAGTCTTCAGCTTCTTATCCCACAGAACAGGAACAGTATACTTCCCGGTGTAGTTTGGG
CTAGCAATCTCATAGAGTTCTCTTACACTCTTAGCACCATTAAGATGGTCAGGATCAGCT
CCTTGAACCTCAGCGTCTGAATCCGGGAAGACCCATCCCATATGCTCATCGCTTTCCTTA
GTCCTTCCCCAAATGGGTTTAACAGACGAGAAGCTTATTGCATCGTCAAGTCCTTTGATC
TTCAAGTATGAGATGCATCTAGAAGCCCATGGACATGCATAAGATATGTAAAGATGGTAT
CTACCAGATTCAGCTGGAAACTGAGAATTGGAATCTCTTGAGACGAAATTACGGAACGTT
GAGGCAGTTCTTTGAAATGCTCCGGAGTCTGATGTCTCATCAACCGCAGATCTAGCCATT
GATAGTGTACAGAGTGGATTGCGATGATGTTGACGAGATCCACGAGTAGTGAACTTTGTA
GCGAGAGAGAGGAAGCTGTTGTGGCTGAGGATCC

QA 9 702 9 702
DS 



AS 1 6

CO CL653Contig1 1195 6 52 U
GGAAATCAATCCATAGCCTTGATGAAAAGAACGAAACCACTTGGTACAATACAATCTTAT
CAGATGCTTGCTAGGAGATAAGTCATAAAGAGTTGATTCAACAGAAACAAAAGAGATGCA
GAACAACGAAGCTGAACTTTCCAGCCAAAATGACTGAAGCAGAGTACTCCGAGCTGGTAA
AGTGAACAAGTTCTCTAGAAGACAACAGTGTCGAGCATGGTGCCTAGTGTCTGAACAATG
TTGGACGACATCAAGTTGGAAACATGTTCTTCCAGATGCTTCTTTGCGTCTTGTCTTCCC
ACATTCACAATCGCCAGTTTTTCCGGTGACAACTCGTCCTCCTCTTGTACCGCCTTGTTA
TATTTAGCAGCCAAGCTCAACATTTCCTGAACAGTCTGTTCGTTTGTCTTAGAGTGGGTG
TCAAAGCGTCTTAGCGTCAGACCATCTGTCCATTTCTTCTTGTGGAGGTTTAGTAACATC
TTCTCCTCCAGCTCGTTCTTCCTATAGTTGATGGCTATTGAATAGTAGTGTCTGTTCAAT
CCATGAATCAAGGCCTGGATCGATGGTTTGTTCAGATGCCCAAGGTTCGACGTTGTTTGA
CGAGGTTCCTGCCCAAGCATAATGGTCTGCGGGTTTATCGAGCGGAACGCATCAATGACC
ACTTTCCCCTTCACACTTTGAATGGGATCAACCACCACCGCCACGGCTCGCTGGTTCAAA
GCTTCAAAACTCTGCTGAGTATTAATATCAACACCAGAAAGCCAGCATCCAAATCCAGGA
TGTGAATGATACCAACCCACCACCATCTCAGGTCTTCCAGTCTGTTTAAGCATGTCGAGC
ATATTAGTCTGGAAGACATGATCAACAGCTTCGACGCTAACACCAGTACCACTCTGAGGA
ATAGCGAAAACATCAACAACCCTAACAGTGTACTCATCCACGAACCCTCCAAGCATCAAT
CCCATCACTTCCATAGGAACTCCAGCTCTTCCGTGCTTGAGCATCTTGAGGAGGGCGAGA
GAAGAGATGTAAACTTGCTCCGACGTATCGAGCGTCGGAGAATCAGGCGATGCGTGACCC
AGACCGCCACCGGCGCCGAAGATTCGCTGTAATCTCTCCATAATCTCAGGTAAAATCAGT
CGGCTTCTTCTTCTTCTTCGGAGCTGCTTTTGGATCTTATAAAACCTCGAGAGCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FG53JQ U 1
AF RS1BZ10JQ U 1
AF RS1BL87JQ U 1
AF RS1AM90JQ U 68
AF RS1AM90TF C 271
AF RS1BL87TF C 391
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A
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TGGATGACATCAAGTTGGAAACATGTTCTTCCAGATGCTTCTTTGCGTCCTGTCTTCCCA
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ATTTAGCAGCCAAGTTCAACATTTCCTGAACCGTCTGTTCGTTTGTCTTGGAGTGGGTGT
CAAAGCGTCTTAGCGTCAGACCATCTGTCCATTTCTTCTTGTGGAGGTTTAGTAACATCT
TCTCCTCGAGCTCGTTCTTCCTATAGTTGATGGCTATTGAATAGTAGTGTCTGTTCAGTC
CATGAATCAAGGCCTGGATCGATGGTTTGTTCAGATGCCCAAGGTTCGACGTTGT
CTGT

QA 2 596 2 596
DS 

RD RS1BZ10JQ 716 0 0
A
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AGATGCTTGCTAGGAGATAAGTCATAAAGCGTTGATTCAACAGAAACAAAAGAGATGCAG
AACAACGAAGCTGAACTTTCCAGCCAAAATGACTGAAGCAGAGTACTCCG*GCTGGTAAA
GTGAACAAGTTCTCTAGAAGACAACAGTGTCGAGCATGGTGCCTAGTGTCTGAACAATGT
TGGACGACATCAAGTTGGAAACATGTTCTTCCAGATGCTTCTTTGCGTCTTGTCTTCCCA
CATTCACAATCGCCAGTTTTTCCGGTGACAACTCGTCCTCCTCTTGTACCGCCTTGTTAT
ATTTAGCAGCCAAGCTCAACATTTCCTGAACAGTCTGTTCGTTTGTCTTAAAGTGGGTGT
CAAAGCGTCTTAGCGTCAGACCATCTGTCCATTTCTTCTTGTGGAGGTTTAGTAACATCT
TCTCCTCCAGCTCGTTCTTCCTATAGTTGATGGCTATTGAGTAGTAGTGTCTGTTCAATC
CATGAATCAAGGCCTGGATCGATGGTTTGTTCAGATGCCCAAGGTTCGACGTTGTTTGAC
GAGGTTCCTGCCCAAGCATAATGGTCTGCGGGTTTATCGAGCGGAACGCATCAATGACCA
CTTTCCCCTTCACACTTTGAATGGGATCAACCACCACCGCCACGGCTCGCTGGTT

QA 2 716 2 716
DS 

RD RS1BL87JQ 789 0 0
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CAGATGCTTGCTAGGAGATAAGTCATAAAGAGTTGATTCAACAGAAACAAAAGAGATGCA
GAAGAACGAAGCTTAACTTTCCAGCCAAAATGACTGAAGCAGAGTACTCCTAGCTGGTAA
AGTGAACAAGTTCTCTAGAAGACAACAGTGTCGAGCATGGTGCCTAGTGTCTGAACAATG
TTGGATGACATCAAGTTGGAAACATGTTCTTCCAGATGCTTCTTTGCGTCCTGTCTTCCC
ACATTCACGATCGCCAGTTTTTCCGGTGACAACTCGTCCTCCTCTTGTACCGCCTTGTTA
TATTTAGCAGCCAAGTTCAACATTTCCTGAACCGTCTGTTCGTTTGTCTTGGAGTGGGTG
TCAAAGCGTCTTAGCGTCAGACCATCTGTCCATTTCTTCTTGTGGAGGTTTAGTAACATC
TTCTCCTCGAGCTCGCTCTTCCTATAGTTGATGGCTATTGAATAGTAGTGTCTGTTCAGT
CCATGAATCAAGGCCTGGATCGATGGTTTGTTCAGATGCCCAAGGTTCGACGTTGTCTGT
CGAGGTTCCTGCCCAAGCATAATGGTCTGCGGGTTTATCGAGCGGAACGCATCAATCACC
ACTTTCCCCTTCACACTTTGAATCGGATCAACCACCACTGCCACGGCTCGCTGGTTCAAA
GCTTCAAAACTCTGTTGAGTATTAATATCAACACCAGAAAGCCAGCATCCAAATCCAGGA
TGTGAATGA

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DS 

RD RS1AM90JQ 804 0 0
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GAAGCTGAACTTTCCAGCCAAAATGACTGAAGCAGAGTACTCCG*GCTGGTAAAGTGAAC
AAGTTCTCTAGAAGACAACAGTGTCGAGCATGGTGCCTAGTGTCTGAACAATGTTGGACG
ACATCAAGTCGGAAACATGTTCTTCCAGATGCTTCTTTGCGTCTTGTCTTCCCACATTCA
CAATCGCCAGTTTTTCCGGTGACAACTCGTCCTCCTCTTGTACCGCCTTGTTATGTTTAG
CAGCCAAGCTCAACATTTCCTGAACAGTCTGTTCGTTTGTCTTAGAGTGGGTGTCAAAGC
GTCTTAGCGTCAGACCATCTGTCCATTTCTTCTTGTGGAGGTTTAGTAACATCTTCTCCT
CCAGCTCGTTCTTCCTATAGTTGATGGCTATTGAGTAGTAGTGTCTGTTCAATCCATGAA
TCAAGGCCTGGATCGATGGTTTGTTCAGATGCCCAAGGTTCGACGTTGTTTGACGAGGTT
CCTGCCCAAGCATAATGGTCTGCGGGTTTATCGAGCGGAACGCATCAATGACCACTTTCC
CCTTCACACTTTGAATGGGATCAACCACCACCGCCACGGCTCGCTGGTTCAAAGCTTCAA
AACTCTGCTGAGTATTAATATCAACACCAGAAAGCCAGCATCCAAATCCAGGATGTGAAT
GATACCAACCCACCACCATCTCAG*TCTTCCAGTCTGTTTAAGCATGTCGAGCATATTAG
TCTGGAAGACATGATCAACAGCTT

QA 1 804 1 804
DS 

RD RS1AM90TF 795 0 0
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AACTCGTCCTCCTCTTGTACCGCCTTGTTATGTTTAGCAGCCAAGCTCAACATTTCCTGA
ACAGTCTGTTCGTTTGTCTTAGAGTGGGTGTCAAAGCGTCTTAGCGTCAGACCATCTGTC
CATTTCTTCTTGTGGAGGTTTAGTAACATCTTCTCCTCCAGCTCGTTCTTCCTATAGTTG
ATGGCTATTGAGTAGTAGTGTCTGTTCAATCCATGAATCAAGGCCTGGATCGATGGTTTG
TTCAGATGCCCAAGGTTCGACGTTGTTTGACGAGGTTCCTGCCCAAGCATAATGGTCTGC
GGGTTTATCGAGCGGAACGCATCAATGACCACTTTCCCCTTCACACTTTGAATGGGATCA
ACCACCACCGCCACGGCTCGCTGGTTCAAAGCTTCAAAACTCTGCTGAGTATTAATATCA
ACACCAGAAAGCCAGCATCCAAATCCAGGATGTGAATGATACCAACCCACCACCATCTCA
GGTCTTCCAGTCTGTTTAAGCATGTCGAGCATATTAGTCTGGAAGACATGATCAACAGCT
TCGACGCTAACACCAGTACCACTCTGAGGCATAGCGAAAACATCAACAACCCTAACAGTG
TACTCATCCACGAACTCTCCAAGCATCAATCCCATCACTTCCATAGGAACTCCAGCTCTT
CCGTGCTTGAGCATCTTGAGGAGGGCGAGAGAAGAGATGTAAACTTGCTCTGACGTGTCG
AGTGTCGGAGAATC
C

QA 1 794 1 794
DS 

RD RS1BL87TF 805 0 0
ACC
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TTCTTCTTGTGGAGGTTTAGTAACATCTTCTCCTCGAGCTCGCTCTTCCTATAGTTGATG
GCTATTGAATAGTAGTGTCTGTTCAGTCCATGAATCAAGGCCTGGATCGATGGTTTGTTC
AGATGCCCAAGGTTCGACGTTGTCTGTCGAGGTTCCTGCCCAAGCATAATGGTCTGCGGG
TTTATCGAGCGGAACGCATCAATCACCACTTTCCCCTTCACACTTTGAATCGGATCAACC
ACCACTGCCACGGCTCGCTGGTTCAAAGCTTCAAAACTCTGTTGAGTATTAATATCAACA
CCAGAAAGCCAGCATCCAAATCCAGGATGTGAATGATACCAACCCACCACCATCTCAGGT
CTTCCAGTCTGTTTGAGCATGTCGAGCATACTAGTCTGGAAGACATGATCAACAGCTTCG
ACGCTAACACCAGTACCACTCTGAGGAATAGCGAAAACATCAACAACCCTAACAGTGTAC
TCATCCACGAACCCTCCAAGCATCAATCCCATCACTTCCATAGGAACTCCAGCTCTTCCG
TGCTTGAGCATCTTGAGGAGGGCGAGAGAGGAGATGTAAACTTGCTCCGCCGTATCGAGC
GTGGGAGAATCAGGCGATGCGTGACCCAGACCGCCACCGGCGCCGAAGATTCGCTGTAAT
CTCTCCATAATCTCAGGTAAAATCAGTCGGCTTCTTCTTCTTCTTCGGAGCTGCTTTTGG
ATCTTATAAAACCTCGAGAGCC

QA 4 805 4 805
DS 



AS 1 8

CO CL654Contig1 725 8 15 U
ATGACAAATCTCAATAACGTTTATTATGATCAGATGGCAATTATTGCTTGTCTGTGTGAA
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ACGAGCTTATTTAGAAGAAAAATATTTCATTCAATGGCGGATTCTTCAAGCCTGTCTGTT
CCTCCTCTTGGGGCCAGACTTGGCGACTCTGAGGCCTTTGCTGATCACGCTGAGCCTAGC
AAGCGCTGCCTTTTTCAAATCAGGCCTGTAGTAGTTGTCCACAACCTGGTTGGCAACAGC
TTTGGCCATCCTGGGGAACTCCTTCTTGAGGACAGACTTGTTAACAGAGAGCTTTGGCTT
GTTTTGCTTCTTGGTCTTGGTGGTTCCAAGTACCACACCTTGATCCTTGTCAGCTGGCTG
AATGGTCACCGTCTTCTTGTTTGCCAAACCAGAGTGCTTGTAAGAGTTGAGGTTGCAGAG
GTTGTTGCTCTCTTTGCTGAACTGAACCTTAGCATTGCCTCTACCGAACTGTTTCACCAA
GAAACAGTTGTTTCTCTTCACGATCTCCCACACCAGCTGTCCTGGAACTGTTGTCATTTC
GATCTCCTTGCAAATTGAATAACTAGACAACGGCGGAATAGAGAGAATGAGACTTGTGCC
GGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 15 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
10 10 10 10 10 

AF RS1G843JQ U 1
AF RS1D231JQ U 127
AF RS1CY32JQ U 115
AF RS1D231TF C 127
AF RS1FS80JQ U 127
AF RS1CY32TF C 127
AF RS1G843TF C 157
AF RS1FS80TF C 127
BS 1 196 RS1G843JQ
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BS 721 725 RS1FS80TF

RD RS1G843JQ 508 0 0
ATGACAAATCTCAATAACGTTTATTATGATCAGATGGCAATTATTGCTTGTCTGTGTGAA
GAATAAACCATAAACGCTACAAGTCTGGCACTTGCACGCACTAGGGAGGTGGTTCAAACA
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CCTCCTCTTGGGGCCGGACTTGGCGACTCTGAGGCCTTTGCTGATCACGCTGAGCCTAGC
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GTTTTGCTTCTTGGTCTTGGTGGTTCCAAGTACCACACCTTGATCCTTGTCAGCTGGCTG
AATGGTCACCGTCTTCTTGTTTGCCAAA

QA 1 508 1 508
DS 

RD RS1D231JQ 532 0 0
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TTATTTAGAAGAAAAATATTTCATTCAATGGCGGATTCTTCAAGCCTGTCTGTTCCTCCT
CTTGGGGCCAGACTTGGCGACTCTGAGGCCTTTGCTGATCACGCTGAGCCTAGCAAGCGC
TGCCTTTTTCAAATCAGGCCTGTAGTAGTTGTCCACAACCTGGTTGGCAACAGCTTTGGC
CATCCTGGGGAACTCCTTCTTGAGGACA**CTTGTTAACAGAGAGCTTTGGCTTGTTTTG
CTTCTTGGTCTTGGTGGTTCCAAGTACCACACCTTGATCCTTGTCAGCTGGCTGAATGGT
CACCGTCTTCTTGTTTGCCAAACCAGAGTGCTTGTAAGAGTTGAGGTTGCAGAGGTTGTT
GCTCTCTTTGCTGAACTGAACCTTAGCATTGCCTCTACCGAGCTGTTTCACCAAGAAACA
GTTGTTTCTCTTCACGATCTCCCACACCAGCTGTCCTGGAACTGTTGTCATT

QA 1 532 1 532
DS 

RD RS1CY32JQ 608 0 0
CAAACAAAACTTTTAGCTGTTCAGGAACGATCTTTTAACCTACAAACACTGTCTGAAACA
CTCAAAACGAGCTTATTTAGAAGAAAAATATTTCATTCAATGGCGGATTCTTCAAGCCTG
TCTGTTCCTCCTCTTGGGGCCAGACTTGGCGACTCTGAGGCCTTTGCTGATCACGCTGAG
CCTAGCAAGCGCTGCCTTATTCAAATCAGGCCTGTAGTAGTTGTCCACAACCTGGTTGGC
AACAGCTTTGGCCATCCTGGGGAACTCCTTCTTGAGGACAGACTTGTTAACAGAGAGCTT
TGGCTTGTTTTGCTTCTTGGTCTTGGTGGTTCCAAGTACCACACCTTGATCCTTGCCAGC
TGGCTGAATGGTCACCGTCTTCTTGTTTGCCAAACCAAAGTGCTTGTAAGAGTTGAGGTT
GCAGAGGTTGTTGCTCTCTTTGCTGAACTGAACCTTAGCATTGCCTCTACCGAACTGTTT
CACCAAGAAACAGTCGTTTCTCTTCACGATCTCCCACACCAGCTGTCCTGGAACTGTTGT
CATTTCGATCTCCTTGCAAATTGAATAACTAGACAACGGCGGAATAGAGAGAATGAGACT
TGTGCC
CC

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DS 

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TGCCTTTTTCAAATCAGGCCTGTAGTAGTTGTCCACAACCTGGTTGGCAACAGCTTTGGC
CATCCTGGGGAACTCCTTCTTGAGGACA**CTTGTTAACAGAGAGCTTTGGCTTGTTTTG
CTTCTTGGTCTTGGTGGTTCCAAGTACCACACCTTGATCCTTGTCAGCTGGCTGAATGGT
CACCGTCTTCTTGTTTGCCAAACCAGAGTGCTTGTAAGAGTTGAGGTTGCAGAGGTTGTT
GCTCTCTTTGCTGAACTGAACCTTAGCATTGCCTCTACCGAGCTGTTTCACCAAGAAACA
GTTGTTTCTCTTCACGATCTCCCACACCAGCTGTCCTGGAACTGTTGTCATTTCGATCTC
CTTGCAAATTGAATAACTAGACAACGGCGGAATAGAGAGAATGAGACTTGTGCC
CC

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DS 

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CTTGGGGCCAGACTTGGCGACTCTGAGGCCTTTGCTGATCACGCTGAGCCTAGCAAGCGC
TGCCTTTTTAAAATCAGGCCTGTAGTAGTTGTCTACAACCTGGTTGGCAACAGCTTTGGC
CATCCTGGGGAACTCCTTCTTGAGGACAGACTTGTTAACAGAGAGCTTTGGCTTGTTTTG
CTTCTTGGTCTTGGTGGTTCCAAGTACCACACCTTGATCCTTGTCAGCTGGCTGAATGGT
CACCGTCTTCTTGTTTGCCAAACCAGAGTGCTTGTAAGAATTGAGGTTGCAGAGGTTGTT
GCTCTCTTTGCTGAACTGAACCTTAGCATTGCCTCTACCGAACTGTTTCACCAAGATACA
GTTGTTTCTCTTCACGATCTCCCACACCAGCTGTCCTGGAACTGTTGTCATTTCGATCTC
CTTGCAAATTGAATAACTAGACAACGGCGGAATA
AAGA

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DS 

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CTTGGGGCCAGACTTGGCGACTCTGAGGCCTTTGCTGATCACGCTGAGCCTAGCAAGCGC
TGCCTTATTCAAATCAGGCCTGTAGTAGTTGTCCACAACCTGGTTGGCAACAGCTTTGGC
CATCCTGGGGAACTCCTTCTTGAGGACAGACTTGTTAACAGAGAGCTTTGGCTTGTTTTG
CTTCTTGGTCTTGGTGGTTCCAAGTACCACACCTTGATCCTTGCCAGCTGGCTGAATGGT
CACCGTCTTCTTGTTTGCCAAACCAGAGTGCTTGTAAGAGTTGAGGTTGCAGAGGTTGTT
GCTCTCTTTGCTGAACTGAACCTTAGCATTGCCTCTACCGAACTGTTTCACCAAGAAACA
GTCGTTTCTCTTCACGATCTCCCACACCAGCTGTCCTGGAACTGTTGTCATTTCGATCTC
CTTGCAAATTGAATAACTAGACAACGGCGGAATAGAGAGAATGAGACTTGTGCC
CC

QA 1 594 1 594
DS 

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GCGGATTCTTCAAGCCTGTCTGTTCCTCCTCTTGGGGCCGGACTTGGCGACTCTGAGGCC
TTTGCTGATCACGCTGAGCCTAGCAAGCGCTGCCTTTTTCAAATCAGGCCTGTAGTAGTT
GTCCACAACCTGGTTGGCAACAGCTTTGGCCATCCTGGGGAACTCCTTCTTGAGGACAGA
CTTGTTAACAGAGAGCTTTGGCTTGTTTTGCTTCTTGGTCTTGGTGGTTCCAAGTACCAC
ACCTTGATCCTTGTCAGCTGGCTGAATGGTCACCGTCTTCTTGTTTGCCAAACCAGAGTG
CTTGTAAGAGTTGAGGTTGCAGAGGTTGTTGCTCTCTTTGCTGAACTGAACCTTAGCATT
GCCTCTACCGAACTGTTTCACCAAGAAACAGTTGTTTCTCTTCACGATCTCCCACACCAG
CTGTCCTGGAACTGTTGTCATTTCGATCTCCTTGCAAATTGAATAACTAGACAACGGCGG
AATAGAGAGAATGAGACTTGTGCC
GGCCC

QA 1 564 1 564
DS 

RD RS1FS80TF 599 0 0
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TTATTTAGAAGAAAAATATTTCATTCAATGGCGGATTCTTCAAGCCTGTCTGTTCCTCCT
CTTGGGGCCAGACTTGGCGACTCTGAGGCCTTTGCTGATCACGCTGAGCCTAGCAAGCGC
TGCCTTTTTAAAATCAGGCCTGTAGTAGTTGTCTACAACCTGGTTGGCAACAGCTTTGGC
CATCCTGGGGAACTCCTTCTTGAGGACAGACTTGTTAACAGAGAGCTTTGGCTTGTTTTG
CTTCTTGGTCTTGGTGGTTCCAAGTACCACACCTTGATCCTTGTCAGCTGGCTGAATGGT
CACCGTCTTCTTGTTTGCCAAACCAGAGTGCTTGTAAGAGTTGAGGTTGCAGAGGTTGTT
GCTCTCTTTGCTGAACTGAACCTTAGCATTGCCTCTACCGAACTGTTTCACCAAGATACA
GTTGTTTCTCTTCACGATCTCCCACACCAGCTGTCCTGGAACTGTTGTCATTTCGATCTC
CTTGCAAATTGAATAACTAGACAACGGCGGAATAGAGAGAATGAGACTTGTGCCGGCCC

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 8

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TCAATTTTCTCTTTTCTCGGAAGACATCAGAACACACGAACATCTCTCTGTTGCCTTAAA
AGCCTCTTCTTACCATGGCAACGACAGCAACATTGGCAGCTCCATCAACTGGATCTGTAC
AAAAACCTGATGATGAGTGGCGTGCCGTTCTGTCTCCTGAACAATTTAGAGTTCTCAGGG
AAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTACGACGAAGGAACAT
ATGCCTGTGCTGGCTGTGCAATTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGTTCGACTCTGGCT
GTGGCTGGCCTGCCTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAACTCTGGAGCCAG
ATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAGGTCATGTTTTCA
AAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTTAACAGTGTTTCTCTTA
AGTTTAGTCCTTCCGAATAAATCGATGTATATCGATCCATTTATTGTTTGGACCAATTCA
CCTCTTTGGAGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGTTTCAAGAATAATTGTTTTTTCCTG
CTAAAATTTGGTGTTTTTTTTTTTGAAAGCTGGTTTTCTAAAATTTGGTGTGTTTCATGA
ATAAATTGTACCTTTGCCGAGTACTGATGAAGCTTTTTGGTTAATAATACGGACTTATAT
ATGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 30 45 45 45 50 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 25 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1E521TF U 50
AF RS1EP47TF U 50
AF RS1EP47JQ C 105
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AF RS1EX05JQ C 231
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AGTTCT

QA 1 186 1 186
DS 

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GTTTTTTCCTGCCAAAA

QA 1 617 1 617
DS 

RD RS1EP47JQ 558 0 0
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TGTTTGGACCAATTCACCTCTTTGGAGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGTTTCAAGAA
TAATTGTTTTTTCCTGC
C

QA 1 557 1 557
DS 

RD RS1A131TV 739 0 0
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TCAATTTTCTCTTTTCTCGGAAGACATCAGAACACACGAACATCTCTCTGTTGCCTTAAA
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AAAAACCTGATGATGAGTGGCGTGCCGTTCTGTCTCCTGAACAATTTAGGGTTCTCAGGG
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ATGCCTGTGCTGGCTGTGCAATTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGTTCGACTCTGGCT
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ATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAGGTCATGTTTTCA
AAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTTAACAGTGTTTCTCTTA
AGTTTAGTCCTTCCGAATAAATCGATGTATATCGATCCATTTATTGTTTGGACCAATTCA
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ATAAATTGTACCTTTGCCG

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DS 

RD RS1A131JQ 690 0 0
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CGAAGGAACATATGCCTGTGCTGGCTGTGCAATTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGTT
CGACTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCCTTTTTTGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAAC
TCTGGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAGG
TCATGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTTAACAG
TGTTTCTCTTAAGTTTAGTCCTTCCGAATAAATCGATGTATATCGATCCATTTATTGTTT
GGACCAATTCACCTCTTTGGAGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGTTTCAAGAATAATT
GTTTTTTCCTGCTAAAATTTGGTGTTTTTTTTTTTGAAAGCTGGTTTTTTAAAATTTGGT
GTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTGCCG

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DS 

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CCTTAAAAGCCTCTTCTTACCATGGCAACGACAGCAACATTGGCAGCTCCATCAACTGGA
TCTGTACAAAAACCTGATGATGAGTGGCGTGCCGTTCTGTCTCCTGAACAATTTAGGGTT
CTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTACGACGAA
GGAACATATGCCTGTGCTGGCTGTGCAATTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGTTCGAC
TCTGGCTGTGGCTGGCCTGCCTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAACTCTG
GAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCGCAAAATGTGATGGACATTTAGGTCAT
GTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTTAACAGTGTT
TCTCTTAAGTTTAGTCCTTCCGAATAAATCGATGTATATCGATCCATTTATTGTTTGGAC
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TTCATGAATAAATTGTACCTTTGCCG

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1EX05TF 718 0 0
GGACTCAAATATCAATTTTCTCTTTTCTCGGAAGACATCAGAACACACGAACATCTCTCT
GTTGCCTTAAAAGCCTCTTCTTACCATGGCAACGACAGCAACATTGGCAGCTCCATCAAC
TGGATCTGTACAAAAACCTGATGATGAGTGGCGTGCCGTTCTGTCTCCTGAACAATTTAG
ATTTCTCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTACGA
CGAAGGAACATATGCCTGTGCTGGCTGTGCAATTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGTT
CGACTCTGGCTGTGGCTGGCCTGCCTTTTTCGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAAC
TCTGGAGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCACAAAATGTGATGGACATTTAGG
TCATGTTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTTAACAG
TGTTTCTCTTAAGTTTAGTCCTTCCGAATAAATCGATGTATATCGATCCATTTATTGTTT
GGACCAATTCACCTCTTTGGAGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGTTTCAAGAATAATT
GTTTTTTCCTGCTAAAATTTGGTGTTTTTTTTTTTGAAAGCTGGTTTTCTAAAATTTGGT
GTGTTTCATGAATAAATTGTACCTTTGCCGAGTACTGATGAAGCTTTTTGGTTAATAA

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1EX05JQ 556 0 0
TTTT
TCAGGGAAAAGGGCACAGAAGCCCGATTCAAAGGAGAATATAATAAACTGTACGACGAAG
GAACATATGCCTGTGCTGGCTGTGCAATTCCTCTTTATAAGTCCACCACCAAGTTCGACT
CTGGCTGTGGCTGGCCTGCCTTTTTTGACGCTATTCCCGGTGCCATTAAACAAACTCTGG
AGCCAGATGGGAGAAGAGTTGAGATCACATGCACAAAATGTGATGGACATTTAGGTCATG
TTTTCAAAGGAGAAGGTTTCCCCACGGCTAAAGATGAGCGTCACTGCGTTAACAGTGTTT
TTTTTAAGTTTAGTCCTTCCGAATAAATCGATGTATATCGATCCATTTATTGTTTGGACC
AATTCACCTCTTTGGAGAGAATTCAAAAATCGAGTCTGTTGTTTCAAGAATAATTGTTTT
TTCCTGCTAAAATTTGGTGTTTTTTTTTTTGAAAGCTGGTTTTTTAAAATTTGGTGTGTT
TCATGAATAAATTGTACCTTTGCCGAGTACTGATGAAGCTTTTTGGTTAATAATACGGAC
TTATATATGCTT

QA 5 556 5 556
DS 



AS 1 8

CO CL656Contig1 2073 8 15 U
GGGTAGCAAATAAATAAACTTCATGGATAGAAATATGAAGTGAAGACTAGATATGCCTAA
ATATTTTATTTCTATGGATAAAAAAGATTGAATTGATAGAGGAAGCACCGTAAAGATCAA
CTGGAAAGGTTTTGGACCGATACAACAAGAGCTGTTTATTTATATCATAATATGAGATAA
ATCTTAGGAATCTACTTATGTAATAGAGTGGATCCCCTAAGGTATTGAGCAGCGGTGTAG
CATCAGATCCTAAAGACAGTAAGTCTTTTTCTTTTTTATGAAGTATGAAAAAAAGTCTTT
TTCAACGATTCTATATAAATTTATATATGAAAGCGGGATAGTTACCTTTCAGAAAATTCT
AATATCTAATAACAGTGGACATGCCTTTTTTTTCTGAAGGTAGGAGAAAAGATAAAACTT
ATTAGATTAATTAATATATTAATTAAATCAAAACGAAAGTTTGAAACTCATGTAATTACT
CTCTTTTGTTTAATCCAAGAAAAACCGAATGAATATCTATAAGAAATCTCATTCAATTAG
ACATTCAATTAGATATAAAGTTAAAGTAGGTTAAAGTGAAAAAACTGGTACACCAAAACA
AAAGAGTTGGTTGTCGAGCCGTATGAGGTAGGAAACTCTCAAGTACGGTTCTCAGGGAGG
GAATTGACCCGCCTATTCCGACCGTGGAGAACAGGCCATTCAACAAGGAGATTCTGAAAT
GGCGGAGGCTTGGTTTGCTCAAGCCGCCGAGTATTGGAAACAGGCTATAACGCTTACTCC
TGGTAATTATATTGAAGCACAGAATTGGTTGACGATCACGAGGCGCTTCGAATAAGAAAT
TTTTCTTTGTTTCTTTTTTTTTTATTCTATAATATATCTTTATTTGTTTTTACAATTAAT
TGTTTTTTAGTTTCTTGGCCCTCTCGGTCAAATAAAACAGATTCTTTTTT*CTATCAGAA
GAACCAATCACAGAAAAAAATTTCATTATATCCTTTTCTCAAATCGTTCTATTTCATCTG
GTATTCTCTAAAGATAAGTAGTACATGAATATGAGAATATCTATATATCTATATCTAGTT
TTT*CTATTTTTTTTTT*CGACTATTAAAACGAATAAAAGGGATTTGAAAATGACTAAAT
ATCAATACTAGAGTGTTTCTTAGTAATGACTAATAAGTGGTTATTGAAATAGGATAATAT
CCTCTATTTAAAACATAAAAAATAGGCTATATTTCGGAACTTATAATTGAAATATGAATA
CACTAGGTTAGGTTATAAAAAAAAA*TTCTTTGTGTACCAATACCAATGTAAAGGTGCGA
AAACGTTTTTTAATAAAAAGAAAAAGGGAGGTCCGTTGAGCGCCCTATGGATATGTCATA
ATAGATCCGAACACTTGCCCCAGATCGACTTCCAGATCATAATTGCTCTAGTGAATAACT
AAAGAAAATGGATGAATAGATGGGAGATAGAAGAGAAAGAAAAAAATTCTAAGCATCTAT
CATCGGTTCACTAATTATTTGAGTGACTGTTGGCGGGTTTCTTTGTATGTGTTGTCCGGA
AAGAGGAGGACTCAATGATTATTCGTTCGCCGGAACCAGAAGTCAAAATTTTGGTAGATA
GGGATCCCATAAAAACTTCTTTCGAGGAATGGGCTAAACCCGGTCATTTCTCAAGAACAA
TAGCTAAGGGACCTGATACTACCACTTGGATCTGGAACCTACATGCTGATGCTCACGATT
TTGATAGTCATACCAGTGATTTGGAGGAAATCTCTCGAAAAGTATTTAGTGCCCATTTTG
GCCAACTCTCTATCATCTTTCTTTGGCTGAGTGGCATGTATTTCCACGGTGCTCGTTTTT
CCAATTATGAAGCATGGCTGAGTGATCCTACTCACATTGGACCTAGTGCTCAGGTGGTTT
GGCCAATAGTGGGCCAAGAAATCCTGAATGGAGATGTGGGCGGAGGCTTCCGAGGAATAC
AAATAACCTCCGGCTTTTTTCAGCTTTGGCGAGCATCTGGAATAACTAGTGAATTACAAC
TTTATTGTACCGCAATTGGCGCATTGGTCTTCC


BQ
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ACTAAATATCAATACTAGAGTGTTTCTTAGTAATGACTAATAAGTGGTTATTGAAATAGG
ATAATATCCTCTATTTAAAACATAAAAAATAGGCTATATTTCGGAACTTATAATTGAAAT
ATGAATACACTAGGTTAGGTTATAAAAAAAA

QA 2 632 2 632
DS 

RD RS1GL14JQ 678 0 0
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CTGAAATGGCGGAGGCTTGGTTTGCTCAAGCCGCCGAGTATTGGAAACAGGCTATAACGC
TTACTCCTGGTAATTATATTGAAGCACAGAATTGGTTGACGATCACGAGGCGCTTCGAAT
AAGAAATTTTTCTTTGTTTCTTTTTTTTTTATTCTATAATATATCTTTATTTGTTTTTAC
AATTAATTGTTTTTTAGTTTCTTGGCCCTCTCGGTCAAATAAAACAGATTCTTTTTT*CT
ATCAGAAGAACCAATCACAGAAAAAAATTTCATTATATCCTTTTCTCAAATCGTTCTATT
TCATCTGGTATTCTCTAAAGATAAGTAGTACATGAATATGAGAATATCTATATATCTATA
TCTAGTTTTT*CTATTTTTTTTTT*CGACTATTAAAACGAATAAAAGGGATTTGAAAATG
ACTAAATATCAATACTAGAGTGTTTCTTAGTAATGACTAATAAGTGGTTATTGAAATAGG
ATAATATCCTCTATTTAAAACATAAAAAATAGGCTATATTTCGGAACTTATAATTGAAAT
ATGAATACACTAGGTTAGGTTATAAAAAAAAA*TTCTTTGTGTACCAATACCAATGTAAA
GGTGCGAAAACGTTTTTT

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1EW55JQ 620 0 0
TTCTGAAATGGCGGAGGCTTGGTTTGCTCAAGCCGCCGAGTATTGGAAACAGGCTATAAC
GCTTACTCCTGGTAATTATATTGAAGCACAGAATTGGTTGACGATCACGAGGCGCTTCGA
ATAAGAAATTTTTCTTTGTTTCTTTTTTTTTTATTCTATAATATATCTTTATTTGTTTTT
ACAATTAATTGTTTTTTAGTTTCTTGGCCCTCTCGGTCAAATAAAACAGATTTTTTTTT*
TTATCAGAAGAACCAATCACAGAAAAAAATTTCATTATATCCTTTTCTCAAATCGTTCTA
TTTCATCTGGTATTCTCTAAAGATAAGTAGTACATGAATATGAGAATATCTATATATCTA
TATCTAGTTTTTTCTATTTTTTTTTTTCGACTATTAAAACGAATAAAAGGGATTTGAAAA
TGACTAAATATCAATACTAGAGTGTTTCTTAGTAATGACTAATAAGTGGTTATTGAAATA
GGATAATATCCTCTATTTAAAACATAAAAAATAGGCTATATTTCGGAACTTATAATTGAA
ATATGAATACACTAGGTTAGGTTATAAAAAAAAA*TTCTTTGTGTACCAATACCAATGTA
AAGGTGCGAAAACGTTTTTT

QA 1 620 1 620
DS 

RD RS1CQ08JQ 746 0 0
CGACTATTAAAACGAATAAAAGGGATTTGAAAATGACTAAATATCAATACTAGAGTGTTT
CTTAGTAATGACTAATAAGTGGTTATTGAAATAGGATAATATCCTCTATTTAAAACATAA
AAAATAGGCTATATTTCGGAACTTATAATTGAAATATGAATACACTAGGTTAGGTTATAA
AAAAAAAATTCTTTGTGTACCAATACCAATGTAAAGGTGCGAAAACGTTTTTTAATAAAA
AGAAAAAGGGAGGTCCGTTGAGCGCCCTATGGATATGTCATAATAGATCCGAACACTTGC
CCCAGATCGACTTCCAGATCATAATTGCTCTAGTGAATAACTAAAGAAAATGGATGAATA
GATGGGAGATAGAAGAGAAAGAAAAAAATTCTAAGCATCTATCATCGGTTCACTAATTAT
TTGAGTGACTGTTGGCGGGTTTCTTTGTATGTGTTGTCCGGAAAGAGGAGGACTCAATGA
TTATTCGTTCGCCGGAACCAGAAGTCAAAATTTTGGTAGATAGGGATCCCATAAAAACTT
CTTTCGAGGAATGGGCTAAACCCGGTCATTTCTCAAGAACAATAGCTAAGGGACCTGATA
CTACCACTTGGATCTGGAACCTACATGCTGATGCTCACGATTTTGATAGTCATACCAGTG
ATTTGGAGGAAATCTCTCGAAAAGTATTTAGTGCCCATTTTGGCCAACTCTCTATCATCT
TTCTTTGGCTGAGTGGCATGTATTTC

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1CQ08TF 748 0 0
TTTTTTAATAAAAAGAAAAAGGGAGGTCCGTTGAGCGCCCTATGGATATGTCATAATAGA
TCCGAACACTTGCCCCAGATCGACTTCCAGATCATAATTGCTCTAGTGAATAACTAAAGA
AAATGGATGAATAGATGGGAGATAGAAGAGAAAGAAAAAAATTCTAAGCATCTATCATCG
GTTCACTAATTATTTGAGTGACTGTTGGCGGGTTTCTTTGTATGTGTTGTCCGGAAAGAG
GAGGACTCAATGATTATTCGTTCGCCGGAACCAGAAGTCAAAATTTTGGTAGATAGGGAT
CCCATAAAAACTTCTTTCGAGGAATGGGCTAAACCCGGTCATTTCTCAAGAACAATAGCT
AAGGGACCTGATACTACCACTTGGATCTGGAACCTACATGCTGATGCTCACGATTTTGAT
AGTCATACCAGTGATTTGGAGGAAATCTCTCGAAAAGTATTTAGTGCCCATTTTGGCCAA
CTCTCTATCATCTTTCTTTGGCTGAGTGGCATGTATTTCCACGGTGCTCGTTTTTCCAAT
TATGAAGCATGGCTGAGTGATCCTACTCACATTGGACCTAGTGCTCAGGTGGTTTGGCCA
ATAGTGGGCCAAGAAATCCTGAATGGAGATGTGGGCGGAGGCTTCCGAGGAATACAAATA
ACCTCCGGCTTTTTTCAGCTTTGGCGAGCATCTGGAATAACTAGTGAATTACAACTTTAT
TGTACCGCAATTGGCGCATTGGTCTTCC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 2 8

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TGGATAATTTGCACACAAGGATAAACTTCAGATGATCAATCGAACATCATCATCATCGTC
ATCACCATCCACATAGACCAATTTTTTATCACAAATTTAGAAAAAAAGCTTGAGAACGAC
AATAGAGTACCCCCAGATACATACTTTAGTATTAGAAGGGGCAAAGATTTTCACTACTAG
AAGCAAGTGCCTTCTGGAGGTTGAACAAGCTTACGGTTATGCGACGTAAACATCTCCTTC
TTCAGCTGTGTCAGTATAGTCTCCATTGTGTAGTCCCTTTGCCAGTTCGCAAGAAGCCCA
AATTTCTTAGGTTCCACCACTCCTGTTTCACTGTTGACACAAGCCATGTTGATACGTGAA
TGGAAACGGACAGTGGGAGGTTTTTCCGGGTAATCTTTGTCACAGAAGAGCTTCAACTGA
TAGATCCTACCTTCATGAACAGTGTTATGAGGAGCGATGATAGTGCCAGTCCAAGAGCGC
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GCGAGAGAGACGAGAGATGAGCTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A615JQ U 319
AF RS1FD05JQ U 41
AF RS1A615TF C 1
BS 1 40 RS1A615TF
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BS 464 660 RS1FD05JQ
BS 661 747 RS1A615TF

RD RS1A615JQ 145 0 0
GTCC
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CTGTTTCACTGTTGACACAAGCCATGTTGATACGTGAATGGAAACGGACAGGGGGAGGTT
TTTCCGGGTAATCTTTGTCAC

QA 5 145 5 145
DS 

RD RS1FD05JQ 620 0 0
GGGGAAGACACTGTTTTTTT*GGATAATTTGCACACAAGGATAAACTTCAGATGATCAAT
CGAACATCATCATCATCGTCATCACCATCCACATAGACCAATTTTTTATCACAAATTTAG
AAAAAAAGCTTGAGAACGACAATAGAGTACCCCCAGATACATACTTTAGTATTAGAAGGG
GCAAAGATTTTCACTACTAGAAGCAAGTGCCTTCTGGAGGTTGAACAAGCTTACGGTTAT
GCGACGTAAACATCTCCTTCTTCAGCTGTGTCAGTATAGTCTCCATTGTGTAGTCCCTTT
GCCAGTTCGCAAGAAGCCCAAATTTCTTAGGTTCCACCACTCCTGTTTCACTGTTGACAC
AAGCCATGTTGATACGTGAATGGAAACGGACAATGGGAGGTTTTTCCGGGTAATCTTTGT
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GAACAACAACACTCGATCCT

QA 1 620 1 620
DS 

RD RS1A615TF 747 0 0
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TGGATAATTTGCACACAAGGATAAACTTCAGATGATCAATCGAACATCATCATCATCGTC
ATCACCATCCACATAGACCAATTTTTTATCACAAATTTAGAAAAAAAGCTTGAGAACGAC
AATAGAGTACCCCCAGATACATACTTTAGTATTAGAAGGGGCAAAGATTTTCACTACTAG
AAGCAAGTGCCTTCTGGAGGTTGAACAAGCTTACGGTTATGCGACGTAGACATCTCCTTC
TTCAGCTGTGTCAGTATAGTCTCCATTGTGTAGTCCCTTTGCCAGTTCGCAAGAAGCCCA
AATTTCTTAGGTTCCACCACTCCTGTTTCACTGTTGACACAAGCCATGTTGATACGTGAA
TGGAAACGGACAGTGGGAGGTTTTTCCGGGTAATCTTTGTCACAGAAGAGCTTCAACTGA
TAGATCCTACCTTCATGAACAGTGTTATGAGGAGCGATGATAGTGCCAGTCCAAGAGCGC
ATGTAAATGTCATCTCCATCATCCATTCCATAGCTCACAGTTCCATCTCCTATACCTTTC
TCCCCACGTTCAAGCTCCTCTAGCAACCGGAAATTCCTCGGAACAACAACACTCGATCCT
CCAGAGCCAAGAGTCATGTTGTGGATTAGATCCGATTTTAGTTTATGAGATCTGGTCGTG
GCGAGAGAGACGAGAGATGAGCTGACC

QA 1 747 1 747
DS 



CO CL657Contig2 705 5 15 U
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GCTAGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGGATAGGAGATGGAACTGTGAGCTATGGAAT
GGATGATGGAGATGACATTTACATGCGCTCTTGGACTGGCACTATCATCGCTCCTCATAA
CACTGTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTTCTGTGACAAAGATTACCCGGA
AAAACCTCCCACTGTCCGGTTCCATTCACGTATCAACATGGCTTGCGTCAACAATGAAAC
AGGAGTGGTGGAACCTAAGAAGTTTGGGCTTCTTGCGAACTGGCAAAGGGACTACACAAT
GGAGACTATACTGACACAGCTGAAGAAGGAGATGTCTACGTCGCATAACCGTAAGCTTGT
TCAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTACTGAAAATCTTTGCCCCTTCTAATACTAAA
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AAAAAAATTGGTCTATGTGGATGGTGATGATGATGATGATGTTCGATTGATCATCTGAAG
TTTATCCTTGTGTGCAAATTATCCAAAAAAACATTGCCTTCCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CE09TF U 6
AF RS1E002TF U 1
AF RS1GM13JQ C 40
AF RS1GM13TF U 40
AF RS1CE09JQ C 6
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BS 600 705 RS1CE09JQ

RD RS1CE09TF 500 0 0
GG
ATCTCTCGTCTCTCTCGGCACGATCAGATCTCATAAACTAAATCGGATCGAATCCACAAC
ATGACTCTTGGCTCTGGAGGATCCAGTGTTGTTGTTCCGAGGAATTTCCGGTTGCTAGAG
GAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGTATAGGAGATGGAACTGTGAGCTATGGAATGGATGAT
GGAGATGACATTTACATGCGCTCTTGGACTGGCACTATCATCGCTCCTCATAACACTGTT
CATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTTCTGTGACAAAGATTACCCGGAAAAACCT
CCCACTGTCCGGTTCCATTCACGTATCAACATGGCTTGCGTCAACAATGAAACAGGAGTG
GTGGAACCTAAGAAGTTTGGGCTTCTTGCGAACTGGCAAAGGGACTACACAATGGAGACT
ATACTGACACAGCTGAAGAAGGAGATGTCTACGTCGCATAACCGTAAGCTTGTTCAACCT
CCAGAAGGCACTTGCTTC

QA 3 500 3 500
DS 

RD RS1E002TF 598 0 0
GGAGCTCATCTCTCGTCTCTCTCGGCACGATCAGATCTCATAAACTAAATCGGATCGAAT
CCACAACATGACTCTTGGCTCTGGAGGATCGAGTGTTGTTGTTCCGAGGAATTTCCGGTT
GCTAGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGGATAGGAGATGGAACTGTGAGCTATGGAAT
GGATGATGGAGATGACATTTACATGCGCTCTTGGACTGGCACTATCATCGCTCCTCATAA
CACTGTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTTCTGTGACAAAGATTACCCGGA
AAAACCTCCCACTGTCCGTTTCCATTCACGTATCAACATGGCTTGCGTCAACAATGAAAC
AGGAGTGGTGGAACCTAAGAAGTTTGGGCTTCTTGCGAACTGGCAAAGGGACTACACAAT
GGAGACTATACTGACACAGCTGAAGAAGGAGATGTCTACATCGCATAACCGTAAGCTTGT
TCAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTAGTGAAAATCTTTGCCCCTTCTAATACTAAA
GTATGTATCTGGGGGTACTCCATTGTCGTTCTCAAGCTTTTTTTTTCTAAATTTGTGA

QA 1 598 1 598
DS 

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GG
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TTCCGAGGAATTTCCGGTTGCTAGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGGATAGGAGATG
GAACTGTGAGCTATGGAATGGATGATGGAGATGACATTTACATGCGCTCTTGGACTGGCA
CTATCATCGCTCCTCATAACACTGTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTTCT
GTGACAAATATTACCCGGAAAAACCTCCCACTGTCCGGTTCCATTCACGTATCAACATGG
CTTGCGTCAACAATGAAACAGGAGTGGTGGAACCTAAGAAGTTTGGGCTTCTTGCGAACT
GGCAAAGGGACTACACAATGGAGACTATACTGACACAGCTGAAGAAGGAGATGTCTACGT
CGCATAACCGTAAGCTTGTTCAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTACTGAAAATCTT
TGCCCCTTCTAATACTAAAGTATGTATCTGGGGGTACTCTATTGTCGTTCTCAAG***TT
TTTTTCTAAATTTGTGAT

QA 3 560 3 560
DS 

RD RS1GM13TF 560 0 0
GG
AAACTAAATCGGATCGAATCCACAACATGACTCTTGGCTCTGGAGGATCCAGTGTTGTTG
TTCCGAGGAATTTCCGGTTGCTAGAGGAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGGATAGGAGATG
GAACTGTGAGCTATGGAATGGATGATGGAGATGACATTTACATGCGCTCTTGGACTGGCA
CTATCATCGCTCCTCATAACACTGTTCATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTTCT
GTGACAAATATTACCCGGAAAAACCTCCCACTGTCCGGTTCCATTCACGTATCAACATGG
CTTGCGTCAACAATGAAACAGGAGTGGTGGAACCTAAGAAGTTTGGGCTTCTTGCGAACT
GGCAAAGGGACTACACAATGGAGACTATACTGACACAGCTGAAGAAGGAGATGTCTACGT
CGCATAACCGTAAGCTTGTTCAACCTCCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTACTGAAAATCTT
TGCCCCTTCTAATACTAAAGTATGTATCTGGGGGTACTCTATTGTCGTTCTCAAG***TT
TTTTTCTAAATTTGTGAT

QA 3 560 3 560
DS 

RD RS1CE09JQ 700 0 0
GG
ATCTCTCGTCTCTCTCGGCACGATCAGATCTCATAAACTAAATCGGATCGAATCCACAAC
ATGACTCTTGGCTCTGGAGGATCCAGTGTTGTTGTTCCGAGGAATTTCCGGTTGCTAGAG
GAGCTTGAACGTGGGGAGAAAGGTATAGGAGATGGAACTGTGAGCTATGGAATGGATGAT
GGAGATGACATTTACATGCGCTCTTGGACTGGCACTATCATCGCTCCTCATAACACTGTT
CATGAAGGTAGGATCTATCAGTTGAAGCTCTTCTGTGACAAAGATTACCCGGAAAAACCT
CCCACTGTCCGGTTCCATTCACGTATCAACATGGCTTGCGTCAACAATGAAACAGGAGTG
GTGGAACCTAAGAAGTTTGGGCTTCTTGCGAACTGGCAAAGGGACTACACAATGGAGACT
ATACTGACACAGCTGAAGAAGGAGATGTCTACGTCGCATAACCGTAAGCTTGTTCAACCT
CCAGAAGGCACTTGCTTCTAGTACTGAAAATCTTTGCCCCTTCTAATACTAAAGTATGTA
TCTGGGGGTACTCTATTGTCGTTCTCAAG***TTTTTTTCTAAATTTGTGATAAAAAAAA
TTGGTCTATGTGGATGGTGATGATGATGATGATGTTCGATTGATCATCTGAAGTTTATCC
TTGTGTGCAAATTATCCAAAAAAACATTGCCTTCCCCC

QA 3 700 3 700
DS 



AS 1 8

CO CL658Contig1 1080 8 6 U
GGGAGTATCCAGACCGTATGATGATGACCTTCTCGGTGTTTCCTTCTCCTAAGGTCTCCG
ACACTGTTGTTGAGCCATACAACGCAACGCTCTCTGTCCATCAGCTCGTTGAAAACGCCG
ACGAGTGTATGGTTCTCGACAATGAGGCTCTCTACGACATCTGCTTCCGTACCCTCAAGC
TCTCTAACCCCTCTTTTGGTGATCTTAACCACCTCATCTCGGCTACAATGAGTGGTGTTA
CATGCTGTCTTCGTTTCCCTGGTCAACTCAACTCTGACCTTAGGAAGCTCGCTGTAAACC
TCATCCCTTTCCCAAGGCTCCACTTCTTCATGGTGGGTTTTGCTCCGTTGACATCCAGAG
GTTCTCAGCAATACAGTGCCTTGAGTGTCCCTGAACTGACCCAGCAGATGTGGGATGCAA
AGAACATGATGTGCGCTGCTGACCCTCGTCACGGACGTTACTTGACTGCATCAGCTGTGT
TCCGTGGGAAGCTGAGCACTAAGGAGGTCGATGAGCAGATGATGAACATCCAGAACAAGA
ACTCGTCCTACTTTGTGGAATGGATCCCGAACAATGTTAAGTCCAGCGTCTGTGACATTG
CACCGAAGGGTTTGAAGATGGCATCGACTTTCATCGGGAACTCGACTTCAATCCAGGAGA
TGTTCAGGCGTGTGAGTGAACAGTTCACAGCTATGTTCAGGAGAAAGGCTTTCCTTCATT
GGTACACAGGAGAAGGCATGGACGAGATGGAGTTCACGGAAGCTGAGAGTAACATGAATG
ATCTCGTTGCAGAGTATCAGCAGTACCAGGATGCTACAGCCGGTGAAGAGGAGTACGAGG
ATGAAGAAGAGGAGTACGATGAGGCTTGAGATGTTTGTTCATCAATGGCTTGGTCGGGAT
TCATAAGCTGTGTAAGCCGCAGTTGCTTCCTTCTTCCCTTTAAAAATCTATTTCTTTTGT
TCAGTTTATGTGTGCTTTGTTTCTTGAAACACAAGTTCATTTTGGGATGTTAAAAAAACT
TATGCGTGTATTGCTTTATTGTTTTTGTCACTGCCAAAAAAATATTGCTTTTGTTCTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RS1C827TF U 1
AF RS1A844JQ C 502
AF RS1A844TF U 502
AF RS1C827JQ C 315
AF RS1D780JQ C 624
AF RS1D780TF U 624
AF RS1ER28TF U 387
AF RS1AR12JQ C 784
BS 1 645 RS1C827TF
BS 646 933 RS1D780TF
BS 934 934 RS1A844TF
BS 935 1040 RS1D780TF
BS 1041 1075 RS1C827JQ
BS 1076 1080 RS1AR12JQ

RD RS1C827TF 645 0 0
GGGAGTATCCAGACCGTATGATGATGACCTTCTCGGTGTTTCCTTCTCCTAAGGTCTCCG
ACACTGTTGTTGAGCCATACAACGCAACGCTCTCTGTCCATCAGCTCGTTGAAAACGCCG
ACGAGTGTATGGTTCTCGACAATGAGGCTCTCTACGACATCTGCTTCCGTACCCTCAAGC
TCTCTAACCCCTCTTTTGGTGATCTTAACCACCTCATCTCGGCTACAATGAGTGGTGTTA
CATGCTGTCTTCGTTTCCCTGGTCAACTCAACTCTGACCTTAGGAAGCTCGCTGTAAACC
TCATCCCTTTCCCAAGGCTCCACTTCTTCATGGTGGGTTTTGCTCCGTTGACATCCAGAG
GTTCTCAGCAATACAGTGCCTTGAGTGTCCCTGAACTGACCCAGCAGATGTGGGATGCAA
AGAACATGATGTGCGCTGCTGACCCTCGTCACGGACGTTACTTGACTGCATCAGCTGTGT
TCCGTGGGAAGCTGAGCACTAAGGAGGTCGATGAGCAGATGATGAACATCCAGAACAAGA
ACTCGTCCTACTTTGTGGAATGGATCCCGAACAATGTTAAGTCCAGCGTCTGTGACATTG
CACCGAAGGGTTTGAAGATGGCATCGACTTTCATCGGGAACTCGA

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1A844JQ 486 0 0
G
GGAGGTCGATGAGCAGATGATGAACATCCAGAACAAGAACTCGTCCTACTTTGTGGAATG
GATCCCGAACAATGTTAAGTCCAGCGTCTGTGACATTGCACCGAAGGGTTTGAAGATGGC
ATCGACTTTCATCGGGAACTCGACTTCAATCCAGGAAATGTTCAGGCGTGTGAGTGAACA
GTTCACAGCTATGTTCAGGAGAAAGGCTTTCCTTCATTGGTACACAGGAGAAGGCATGGA
CGAGATGGAGTTCACGGAAGCTGAGAGTAACATGAATGATCTCGTTGCAGAGTACCAGCA
GTACCAGGATGCTACAGCCGGTGAAGAGGAGTACGAGGATGAAGAAGAGGAGTACGATGA
GGCTTGAGATGTTTGTTCATCAATGGCTTGGTCGGGATTCATAAGCTGTGTAAGCCGCAG
TTGCTTCCTTCTTCCCTTTAAAAATCTATTTCTTTTGTTCAGTTTATGCGTGCTTTGTTT
CTTGA

QA 2 486 2 486
DS 

RD RS1A844TF 510 0 0
G
GGAGGTCGATGAGCAGATGATGAACATCCAGAACAAGAACTCGTCCTACTTTGTGGAATG
GATCCCGAACAATGTTAAGTCCAGCGTCTGTGACATTGCACCGAAGGGTTTGAAGATGGC
ATCGACTTTCATCGGGAACTCGACTTCAATCCAGGAAATGTTCAGGCGTGTGAGTGAACA
GTTCACAGCTATGTTCAGGAGAAAGGCTTTCCTTCATTGGTACACAGGAGAAGGCATGGA
CGAGATGGAGTTCACGGAAGCTGAGAGTAACATGAATGATCTCGTTGCAGAGTACCAGCA
GTACCAGGATGCTACAGCCGGTGAAGAGGAGTACGAGGATGAAGAAGAGGAGTACGATGA
GGCTTGAGATGTTTGTTCATCAATGGCTTGGTCGGGATTCATAAGCTGTGTAAGCCGCAG
TTGCTTCCTTCTTCCCTTTAAAAATCTATTTCTTTTGTTCAGTTTATGCGTGCTTTGTTT
CTTGAAACACAAGTTCATTTTGGGATGTT

QA 2 510 2 510
DS 

RD RS1C827JQ 761 0 0
AGGCTCCACTTCTTCATGGTGGGTTTTGCTCCGTTGACATCCAGAGGTTCTCAGCAATAC
AGTGCCTTGAGTGTCCCTGAACTGACCCAGCAGATGTGGGATGCAAAGAACATGATGTGC
GCTGCTGACCCTCGTCACGGACGTTACTTGACTGCATCAGCTGTGTTCCGTGGGAAGCTG
AGCACTAAGGAGGTCGATGAGCAGATGATGAACATCCAGAACAAGAACTCGTCCTACTTT
GTGGAATGGATCCCGAACAATGTTAAGTCCAGCGTCTGTGACATTGCACCGAAGGGTTTG
AAGATGGCATCGACTTTCATCGGGAACTCGACTTCGATCCAGGAGATGTTCAGGCGTGTG
AGTGAACAGTTCACAGCTATGTTCAGGAGAAAGGCTTTCCTTCATTGGTACACAGGAGAA
GGCATGGACGAGATGGAGTTCACGGAAGCTGAGAGTAACATGAATGATCTCGTTGCAGAG
TACCAGCAGTACCAGGATGCTACAGCCGGTGAAGAGGAGTACGAGGATGAAGAAGGGGAG
TACGATGAGGCTTGAGATGTTTGTTCATCAATGGCTTGGTCGGGATTCATAAGCTGTGTA
AGCCGCAGTTGCTTCCTTCTTCCCTTTAAAAATCTATTTCTTTTGTTCAGTTTATGTGTG
CTTTGTTTCTTGAAACACAAGTTCATTTTGGGATGTTAAAAAAACTTATGCGTGTATTGC
TTTATTGTTTTTGTCACTGCCAAAAAAATATTGCTTTTGTT

QA 1 761 1 761
DS 

RD RS1D780JQ 417 0 0
G
CGACTTTCATTGGGAACTCGACTTCAATCCAGGAGATGTTCAGGCGTGTGAGTGAACAGT
TCACAGCTATGTTCAGGAGAAAGGCTTTCCTTCATTGGTACACAGGAGAAGGCATGGACG
AGATGGAGTTCACGGAAGTTGAGAGTAACATGAATGATCTCGTTGCAGAGTATCAGCAGT
ACCAGGATGCTACAGCCGGTGAAGAGGAGTACGAGGATGAAGAAGAGGAGTACGATGAGG
CTTGAGATGTTTGTTCATCAATGGCTTGGTCGGGATTCATAAGCTGTGTAAGCCGCAGTT
GCTTCCTTCCTCCCTTTAAAAATCTATTTCTTTTGTTCAGTTTATGTGTGCTTTGTTTCT
TGAAACACAAGTTCATTTTGGGATGTTAAAAAAACTTATGCGTGTATTGCTTTATT

QA 2 417 2 417
DS 

RD RS1D780TF 417 0 0
G
CGACTTTCATTGGGAACTCGACTTCAATCCAGGAGATGTTCAGGCGTGTGAGTGAACAGT
TCACAGCTATGTTCAGGAGAAAGGCTTTCCTTCATTGGTACACAGGAGAAGGCATGGACG
AGATGGAGTTCACGGAAGCTGAGAGTAACATGAATGATCTCGTTGCAGAGTATCAGCAGT
ACCAGGATGCTACAGCCGGTGAAGAGGAGTACGAGGATGAAGAAGAGGAGTACGATGAGG
CTTGAGATGTTTGTTCATCAATGGCTTGGTCGGGATTCATAAGCTGTGTAAGCCGCAGTT
GCTTCCTTCCTCCCTTTAAAAATCTATTTCTTTTGTTCAGTTTATGTGTGCTTTGTTTCT
TGAAACACAAGTTCATTTTGGGATGTTAAAAAAACTTATGCGTGTATTGCTTTATT

QA 2 417 2 417
DS 

RD RS1ER28TF 654 0 0
GTCCCTGAACTGACCCAGCAGATGTGGGATGCGAAGAACATGATGTGCGCTGCTGACCCT
CGTCACGGACGTTACTTGACTGCATCAGCTGTGTTCCGTGGGAAGCTGAGCACTAAGGAG
GTCGATGAGCAGATGATGAACATCCAGAACAAGAACTCATCCTACTTTGTGGAATGGATC
CCGAACAATGTTAAGTCCAGCGTCTGTGACATTGCACCCAAGGGTTTGAAGATGGCATCG
ACTTTCATTGGGAACTCGACTTCAATCCAGGAGATGTTCAGGCGTGTGAGTGAACAGTTC
ACAGCTATGTTCAGGAGAAAGGCTTTCCTTCATTGGTACACAGGAGAAGGCATGGACGAG
ATGGAGTTCACGGAAGCTGAGAGTAACATGAATGATCTCGTTGCAGAGTATCAGCAGTAC
CAGGATGCTACAGCCGGTGAAGAGGAGTACGAGGATGAAGAAGAGGAGTACGATGAGGCT
TGAGATGTTTGTTCATCAATGGCTTGGTCGGGATTCATAAGCTGTGTAAGCCGCAGTTGC
TTCCTTCTTCCCTTTAAAAATCTATTTCTTTTGTTCAGTTTATGTGTGCTTTGTTTCTTG
AAACACAAGTTCATTTTGGGATGTTAAAAAA*CTTATGCGTGTATTGCTTTATT

QA 1 654 1 654
DS 

RD RS1AR12JQ 297 0 0
TCAAC
GCAGAGTATCAGCAGTACCAGGATGCTACAGCCGGTGAAGAGGAGTACGAGGATGAAGAA
GAGGAGTACGATGAGGCTTGAGATGTTTGTTCATCAATGGCTTGGTCGGGATTCATAAGC
TGTGTAAGCCGCAGTTGCTTCCTTCTTCCCTTTAAAAATCTATTTCTTTTGTTCAGTTTA
TTTGTGCTTTGTTTCTTGAAACACAAGTTCATTTTGGGATGTTAAAAAAACTTATGCGTG
TATTGCTTTATTGTTTTTGTCACTGCCAAAAAAATATTGCTTTTGTTCTTTC

QA 6 297 6 297
DS 



AS 1 7

CO CL659Contig1 878 7 10 U
TTCCCAATTGTAGGATTTATTATCAGACAATTGTAAACCTTGGTTACTTTTAATTTAATG
CATCAAATTTAGTCAAAAAAGTTAAAAAAAGAAACCACAAGTGTTGTGACGGCTATTCCA
GTGAAAACAAGAACCAAAAAACAAAAACGTAAAAAATCAATTTCAAAAATCATGATCTAA
TTAGTGAGAATGATCCACAAGGCCTAGAGACCTGTTGAGCCAAGCCTTCCACCGCCCAGA
GATCTTCCTCATTGTTGTTGTCTCCACAGAGTCTCCAAGGCTTTGAGCTTCTGACTTCTT
CGACAAAACGAAGTTCCTCGATCCGGTTGACCCGATTTTCCCCCACGGATTGAATGCTTC
AGCGGCACAATAAGGACAGTAAAGAATGAAAAAGCTGGAATCTGATCCGAGAAGGGGAAG
CCTGCCTTCACGGGCGTAGCATTTGAGAGCATACTCAATCACATTTGATACTGTTTCATC
TTCTTTGACAACAAAACGAATCGGTCCAGCACTTCCAACGAAACTGATGCTAACGAGGAA
CCTGTTTATCTTCGATTTAGAGTTTTTCAACTGCTTGTTGTACACCATCTTTACAATTAT
ACCAACAAAAGGAATCAGAAACTCTGATGAAGGCCTTTTTTTTATTCAAGGGTGGACGCC
CATGCAACGTAAGTACCAAGATTTCTTGAAAGAGACAAATGTTAAAGAAGATGGGGTGGA
GACAGGGAGGAGAAAGCTCGCCCTAGCGGTTGTGCAATGGGAGAGCATAAAATCTCTGAT
AGTCGGAATTGTTTCTACCATTCAAGACGCTAAGCAATCTGATTTTAAAAAAAAACGAGT
CTGAGTAGTTTCCGATCGATATAGAGTTTTTGAGATCC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 35 35 15 35 15 15 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1C420JQ U 57
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BS 871 878 RS1C028TF

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TTAGTGAGAATGATCCACAAGGC

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CT
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AAACAAGAACCAAAAAACAAAAACGTAAAAAATCAATTTCAAAAATCATGATCTAATTAG
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GGGAGGAGAAAGCTCGCCCTAGCGGTTGTGCAATGGGAGAGCATAAA*TCTCTGATA

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DS 

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TGTTGTGACGGCTATTCCAGTGAAAACAAGAACCAAAAAACAAAAACGTAAAAAATCAAT
TTCAAAAATCATGATCTAATTAGTGAGAATGATCCACAAGGCCTAGAGACCTGTTGAGCC
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CATTTGATACTGTTTCATCTTCTTTGACAACAAAACGAATCGGTCCAGCACTTCCAACGA
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ATTT
A

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DS 

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TCCAGTGAAAACAAGAACCAAAAAACAAAAACGTAAAAAATCA*************TGAT
CTAATTAGTGAGAATGATCCACAAGGCCTAGAGACCTGTTGAGCCAAGCCTTCCACCGCC
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TCTTCGACAAAACGAAGTTCCTCGATCCGGTTGACCCGATTTTCCCCCACGGATTGAATG
CTTCAGCGGCACAATAAGGACAGTAAAGAATGAAAAAGCTGGAATCTGATCCGAGAAGGG
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CATCTTCTTTGACAACAAAACGAATCGGTCCAGCACTTCCAACGAAACTGATGCTAACGA
GGAACCTGTTTATCTTCGATTTAGAGTTTTTCAACTGCTTGTTGTACACCATCTTTACAA
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GAGTCTGAGTAGTTTCCGATCGATATAGAGTTTT
GAGATC

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DS 

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AGAATGATCCACAAGGCCTAGAGAC*TGTTGAGCCAAGCCTTCCACCGCCCAGAGATCTT
CCTCATTGTTGTTGTCTCCACAGAGTCTCCAAGGCTTTGAGCTTCTGACTTCTTCGACAA
AACGAAGTTCCTCGATCCGGTTGACCCGATTTTCCCCCACGGATTGAATGCTTCAGCGGC
ACAATAAGGACAGTAAAGAATGAAAAAGCTGGAATCTGATCCGAGAAGGGGAAGCCTGCC
TTCACGGGCGTAGCATTTGAGAGCATACTCAATCACATTTGATACTGTTTCATCTTCTTT
GACAACAAAACGAATCGGTCCAGCACTTCCAACGAAACTGATGCTAACGAGGAACCTGTT
TATCTTCGATTTAGAGTTTTTCAACTGCTTGTTGTACACCATCTTTACAATTATACCAAC
AAAAGGAATCAGAAACTCTGATGAAGGCCTTTTTTTTATTCAAGGGTGGACGCCCATGCA
ACGTAAGTACCAAGATTTATTGAAAGAGACAAATGTTAAAGAAGATGGGGTGGAGACAGG
GAGGAGAAAGCTCGCCCTAGCGGTTGTGCAATGGGAGAGCATAAAATCTCTGATAGTCGG
AATTGTTTCTACCATTCAAGACGCTAAGCAATCTGATTTTAAAAAAAAACGAGTCTGAGT
AGTTTCCGATCGATATAGAGTTTTTGAGATCC

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GATCCGAGAAGGGGAAGCCTGCCTTCACGGGCGTAGCATTTGAGAGCATACTCAATCACA
TTTGATACTGTTTCATCTTCTTTGACAACAAAACGAATCGGTCCAGCACTTCCAACGAAA
CTGATGCTAACGAGGAACCTGTTTATCTTCGATTTAGAGTTTTTCAACTGCTTGTTGTAC
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AGCATAAAATCTCTGATAGTCGGAATTGTTTCTACCATTCAAGACGCTAAGCAATCTGAT
TTTAAAAAAAAACGAGTCTGAGTAGTTTCCGATCGATATAGAGTTTTTGAGATC
C

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DS 

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TACTCAATCACATTTGATACTGTTTCATCTTCTTTGACAACAAAACGAATCGGTCCAGCA
CTTCCAACGAAACTGATGCTAACGAGGAACCTGTTTATCTTCGATTTAGAGTTTTTCAAC
TGCTTGTTGTACACCATCTTTACAATTATACCAACAAAAGGAATCAGAAACTCTGATGAA
GGCCTTTTTTTTATTCAAGGGTGGACGCCCATGCAACGTAAGTACCAAGATTTCTTGAAA
GAGACAAATGTTAAAGAAGATGGGGTGGAGACAGGGAGGAGAAAGCTCGCCCTAGCGGTT
GTGCAATGGGAGAGCATAAAATCTCTGATAGTCGGAATTGTTTCTACCATTCAAGACGCT
AAGCAATCTGATTTAAAAAAAAAACGAGTCTGAGTAGTTTCCGATCGATATAGAGTTTTT
GAGATC

QA 1 546 1 546
DS 



AS 1 7

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AGACCATATTCTAAGAATCACCACATAAAGAGAAA*GAAAACTTACAATGACAA*TGAAA
CTAAACATTGTATTTTCATTAAAACAAAGACAAAA*TAAAAGTAGATGAAGATGATATTA
AAGAGATCACAAAAGAAAAGACTTATGCCAGCAAACTCCACCACCAGCAACTAGGCAATT
CCTGACCTGCGCAGTTCTGCTTCCCCGTGTGCAAAGTGACATCTATCACCAAACGTACAG
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GCTGCAGAGTTAAGCCTCCCAATCAGCTCCCTAACCATCGCGCTAGCTTCGTTTATCTGC
TCGAACGTCCCTTCGAGCTCAATGTTCTTCAGGTTAGGGTCTCTCTCGTGGTCTTGAATC
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GACGCGTGTCCAGGACCAGACTCTCCTCCTCCTCTCCCTGAGAATCTCCCTCCTCCTCCA
ACACCACCAGATCCTTGCATGTTTCTGGAAGCTTGAGGAAGCATGGGCGCCATGTTTGTC
AGCTGTGCTACAGCATTATATCCTCCGGGAACATAGTGCAAGAAGTGGCAGTTATCTCCA
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GTTGAATATGATTCCATCTCTTGCTTAGACTTCTTGAATCCTCCGCCGCCGCCATTGGAG
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GATCCGAATTAGAAACCCTTTTTGTGTCTGAAGAGCGGATCGGGGAGAAAAAGAACAGAT
CGGAATCGGAGACAAGGGAGAGAGAAATAATAGGATAAATAAACCTAACCCTGATGTGGT
GGTGGTTGTGGTTGTCCC


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 0 25 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BN44TF C 2
AF RS1BN44JQ U 4
AF RS1DT47JQ U 4
AF RS1DT47TF C 4
AF RS1FJ56JQ U 1
AF RS1AY67JQ U 32
AF RS1FJ56TF C 375
BS 1 254 RS1FJ56JQ
BS 255 255 RS1BN44JQ
BS 256 302 RS1FJ56JQ
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BS 309 309 RS1BN44JQ
BS 310 366 RS1FJ56JQ
BS 367 367 RS1BN44JQ
BS 368 398 RS1FJ56JQ
BS 399 400 RS1BN44JQ
BS 401 440 RS1FJ56JQ
BS 441 441 RS1BN44JQ
BS 442 468 RS1FJ56JQ
BS 469 469 RS1BN44JQ
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BS 483 483 RS1BN44JQ
BS 484 752 RS1FJ56JQ
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DS 

RD RS1BN44JQ 623 0 0
G
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CGCCGGCAAGCGAAGCATCC
CC

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DS 

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G
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CATATTCTAAGAATCACCACATAAAGAGAAA*GAAAACTTACAATGACAA*TGAAACTAA
ACATTGTATTTTCATTAAAACAAAGACAAAA*TAAAAGTAGATGAAGATGATATTAAAGA
GATCACAAAAGAAAAGACTTATGCCAGCAAACTCCACCACCAGCAACTAGGCAATTCCTG
ACCTGCGCAGTTCTGCTTCCCCGTGTGCAAAGTGACATCTATCACCAAACGTACAGTTCC
CTTTAGCGAATCTCTCACACATCTTCGTCTTGAAGTTGCTCCCTGGATGCGGTTTCCCTT
CAGAACCAACCCCACCTCCAAGTCCACCACCACCGACACCAGGTGGTCTCCTACTAGCTG
CAGAGTTAAGCCTCCCAATCAGCTCCCTAACCATCGCGCTAGCTTCGTTTATCTGCTCGA
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GCTTCGCACCTGTCTGACGACATATCTGTTTCGAACTGACTCCTCCTTTACCAATGATGG
CGCCGGCAAGCGAAGCATCC
C

QA 2 621 2 621
DS 

RD RS1DT47TF 622 0 0
G
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CATATTCTAAGAATCACCACATAAAGAGAAA*GAAAACTTACAATGACAA*TGAAACTAA
ACATTGTATTTTCATTAAAACAAAGACAAAA*TAAAAGTAGATGAAGATGATATTAAAGA
GATCACAAAAGAAAAGACTTATGCCAGCAAACTCCACCACCAGCAACTAGGCAATTCCTG
ACCTGCGCAGTTCTGCTTCCCCGTGTGCAAAGTGACATCTATCACCAAACGTACAGTTCC
CTTTAGCGAATCTCTCACACATCTTCGTCTTGAAGTTGCTCCCTGGATGCGGTTTCCCTT
CAGAACCAACCCCACCTCCAAGTCCACCACCACCGACACCAGGTGGTCTCCTACTAGCTG
CAGAGTTAAGCCTCCCAATCAGCTCCCTAACCATCGCGCTAGCTTCGTTTATCTGCTCGA
ACGTCCCTTCGAGCTCAATGTTCTTCAGGTTAGGGTCTCTCTCGTGGTCTTGAATCGACA
GCTTCGCACCTGTCTGACGACATATCTGTTTCGAACTGACTCCTCCTTTACCAATGATGG
CGCCGGCAAGCGAAGCATCC
C

QA 2 621 2 621
DS 

RD RS1FJ56JQ 753 0 0
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AGACCATATTCTAAGAATCACCACATAAAGAGAAA*GAAAACTTACAATGACAA*TGAAA
CTAAACATTGTATTTTCATTAAAACAAAGACAAAA*TAAAAGTAGATGAAGATGATATTA
AAGAGATCACAAAAGAAAAGACTTATGCCAGCAAACTCCACCACCAGCAACTAGGCAATT
CCTGACCTGCGCAGCTCTGCTTCCCCGTGTGCAAAGTGACATCTATCACCAAACGTACAG
TTTCCTTTCGCGAATCTCTCACACATCTTCGTCTTGAAGTTGCTCCCTGGATGCGGTTTC
CCTTCAAAACCAACCCCACCTCCAAGTCCACCACCACCACCACCAGGTGGTCTCCTACTA
GCTGCAGAGTTAAGCCTCCCGATCAGCTCCCTAACCATCGCGCTAGCTCCGTTTATCTGC
TCAAACGTCCCTTCGAGCTCAATGTTCTTCAGGTTAGGGTCTCTCTCGTGGTCTTGAATC
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GACGCGTGTCCAGGACCAGACTCTCCTCCTCCTCTCCCTGAGAATCTCCCTCCTCCTCCA
ACACCACCAGATCCTTGCATGTTTCTGGAAGC
T

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DS 

RD RS1AY67JQ 721 0 0
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AAAA*TAAAAGTAGATGAAGATGATATTAAAGAGATCACAAAAGAAAAGACTTATGCCAG
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CAAAGTGACATCTATCACCAAACGTACAGTTCCCTTTAGCGAATCTCTCACACATCTTCG
TCTTGAAGTTGCTCCCTGGATGCGGTTTCCCTTCAAAACCAACCCCACCTCCAAGTCCAC
CACCACC***ACCAGGTGGTCTCCTACTAGCTGCAGAGTTAAGCCTCCCAATCAGCTCCC
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GTTTCGAACTGACTCCTCCTTTACCAATGATGGCGCCGGCAAGCGAAGCATCCACGCTGA
TC**CGCAGTGGCTGAGGCACCAAAGCTAGACACGTGTCCAGGACCAGACTCTCCTCCTC
CTCTCCCTGAGAATCTCCCTCCTCC***AACACCACCAGATCCTTGCATGTTTCTGGAAG
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RS1FJ56TF 784 0 0
CCCC
CCTCCCAGTCCACCACCACCACCACCAGT**GTCTC*TACTAGCTGCAGAGTTAAGC*TC
CCGATCAGCTCCCTAACCATCGCGCTAGCTCCGTTTATCTGCTCAAACGTCCCTTCGAGC
TCAATGTTCTTCAGGTTAGGGTCTCTCTCGTGGTCTTGAATCGACAGCTTCGCACCTGTC
TGACGACATATCTGTTTCGAACTGACTCCTCCTTTACCAATGATGGCGCCGGCAAGCGAA
GCATCCACGCTGATCTTCGCAGTGGCTGAGGCACCAAAGCTAGACGCGTGTCCAGGACCA
GACTCTCCTCCTCCTCTCCCTGAGAATCTCCCTCCTCCTCCAACACCACCAGATCCTTGC
ATGTTTCTGGAAGCTTGAGGAAGCATGGGCGCCATGTTTGTCAGCTGTGCTACAGCATTA
TATCCTCCGGGAACATAGTGCAAGAAGTGGCAGTTATCTCCAAAAGGACAGCCAGAAGTG
CTGAAAAATTTAGTGCAAGGCTTGGATTTGCTTCCTAAACCAGTTGAATATGATTCCATC
TCTTGCTTAGACTTCTTGAATCCTCCGCCGCCGCCATTGGAGTTGAACGAACCAGCAGCT
TCAGGCCGTCCTCTCTTACGAGTATCCATGGACGAAAGTACAGATCCGAATTAGAAACCC
TTTTTGTGTCTGAAGAGCGGATCGGGGAGAAAAAGAACAGATCGGAATCGGAGACAAGGG
AGAGAGAAATAATAGGATAAATAAACCTAACCCTGATGTGGTGGTGGTTGTGGTTGTCCC

QA 5 784 5 784
DS 



AS 2 8

CO CL661Contig1 717 5 12 U
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ATCAAACTTAAGCCAAAGGAGAAGAAGACAAAAGTTATAAGCAATATGTCAAAAGTTTAT
CTTATCAGATTGTCATTGTTAGTGTTCCTGGTGATGGCCGTCGTGACTCCATCGGCGAAG
TCCGCCCTTCTCGGAGGGAAGTCAGATGTTGGGAACGTTGGAATCAACATGGAGATTCAA
GAACTTGGAAGGTACTGCGTGAAACAATTCAATCTACAAGAAATGAGCGAGCAAACAAAC
GCTGCATCCATTGCGAGAAAAGACGCTAACGTGTTGAGTCCGTTGAAATTCAGACGAGTT
GTGTCGGCTCAGAAACAGATCGTGGCTGGTACAAAATACTATCTAAGGATTGAAGTGGCT
CAACCCGATGGAACGAGCAGGATGTTTGACTCAGTTATAGTTATTCAACCATGGCTTTTC
TCTAAGAAGTTGCTCGAATTCACTCCAGTTGCTACTCCTATCTACTAACTTCATTTCTTT
ATTCAACAATATCCACATGCAATCAAAAAGACCAAAAACGTGCTTGATATGAAGCTATTT
TAACAATGGGCTAATAGTTCGTTTGTATTGTAATGATGTTTTACGTTGTTCATAAATAAA
GGCCAAAAGATGTTATAAAGATGTGATGAAATTATTGAAATTTTGCCCAAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GL85TF U 2
AF RS1AI34TF U 3
AF RS1BY08JQ C 1
AF RS1BY08TF U 1
AF RS1AI34JQ C 3
BS 1 4 RS1BY08JQ
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RD RS1GL85TF 577 0 0
GAA
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QA 4 577 4 577
DS 

RD RS1AI34TF 657 0 0
GG
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AGAAGTTGCTCGAATTCACTCCAGTTGCTACTCCTATCTACTAACTTCATTTCTTTATTC
AACAATATCCACATGCAATCAAAAAGACCAAAAACGTGCTTGATATGAAGCTATTTTAAC
AATGGGCTAATAGTTCGTTTGTATTGTAATGATGTTTTACGTTGTTCATAAATAA

QA 3 657 3 657
DS 

RD RS1BY08JQ 708 0 0
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ATCAAACTTAAGCCAAAGGAGAAGAAGACAAAAGTTATAAGCAATATGTCAAAAGTTTAT
CTTATCAGATTGTCATTGTTAGTGTTCCTGGTGATGGCCGTCGTGACTCCATCGGCGAAG
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TCTAAGAAGTTGCTCGAATTCACTCCAGTTGCTACTCCTATCTACTAACTTCATTTCTTT
ATTCAACAATATCCACATGCAATCAAAAAGACCAAAAACGTGCTTGATATGAAGCTATTT
TAACAATGGGCTAATAGTTCGTTTGTATTGTAATGATGTTTTACGTTGTTCATAAATAAA
GGCCAAAAGATGTTATAAAGATGTGATGAAATTATTGAAA
TTTTGCCC

QA 1 700 1 700
DS 

RD RS1BY08TF 717 0 0
GGAA
AGGAAAACAAAATCAAAGCTTTGAAGAAACATCGAGGCAAATAAATAACCCAAAAAATCA
AACTTAAGCCAAAGGAGAAGAAGACAAAAGTTATAAGCAATATGTCAAAAGTTTATCTTA
TCAGATTGTCATTGTTAGTGTTCCTGGTGATGGCCGTCGTGACTCCATCGGCGAAGTCCG
CCCTTCTCGGAGGGAAGTCAGATGTTGGGAACGTTGGAATCAACATGGAGATTCAAGAAC
TTGGAAGGTACTGCGTGAAACAATTCAATCTACAAGAAATGAGCGAGCAAACAAACGCTG
CATCCATTGCGAGAAAAGACGCTAACGTGTTGAGTCCGTTGAAATTCAGACGAGTTGTGT
CGGCTCAGAAACAGATCGTGGCTGGTACAAAATACTATCTAAGGATTGAAGTGGCTCAAC
CCGATGGAACGAGCAGGATGTTTGACTCAGTTATAGTTATTCAACCATGGCTTTTCTCTA
AGAAGTTGCTCGAATTCACTCCAGTTGCTACTCCTATCTACTAACTTCATTTCTTTATTC
AACAATATCCACATGCAATCAAAAAGACCAAAAACGTGCTTGATATGAAGCTATTTTAAC
AATGGGCTAATAGTTCGTTTGTATTGTAATGATGTTTTACGTTGTTCATAAATAAAGGCC
AAAAGATGTTATAAAGATGTGATGAAATTATTGAAATTTTGCCCAAAAAAAAA

QA 5 717 5 717
DS 

RD RS1AI34JQ 686 0 0
GG
AGGAAAACAAAATCAAAGCTTTGAAGAAACATCGAGGCAAATAAATAACCCAAAAAATCA
AACTTAAGCCAAAGGAGAAGAAGACAAAAGTTATAAGCAATATGTCAAAAGTTTATCTTA
TCAGATTGTCATTGTTAGTGTTCCTGGTGATGGCCGTCGTGACTCCATCGGCGAAGTCCG
CCCTTCTCGGAGGGAAGTCAGATGTTGGGAACGTTGGAATCAACATGGAGATTCAAGAAC
TTGGAAGGTACTGCGTGAAACAATTCAATTTACAAGAAATGAGCGAGCAAACAAACGCTG
CATCCATTGCGAGAAAAGACGCTAACGTGTTGAGTCCGTTGAAATTCAGACGAGTTGTGT
CGGCTCAGAAACAGATCGTGGCTGGTACAAAATACTATCTAAGGATTGAAGTGGCTCAAC
CCGATGGAACGAGCAGGATGTTTGACTCAGTTATAGTTATTCAACCATGGCTTTTCTTTA
AGAAGTTGCTCGAATTCACTCCAGTTGCTACTCCTATCTACTAACTTCATTTCTTTATTC
AACAATATCCACATGCAATCAAAAAGACCAAAAACGTGCTTGATATGAAGCTATTTTAAC
AATGGGCTAATAGTTCGTTTGTATTGTAATGATGTTTTACGTTGTTCATAAATAAAGGTC
AAAAGATGTTATAAAGATGTGA
CG

QA 3 684 3 684
DS 



CO CL661Contig2 704 3 10 U
AGGGGAAACAAAATCAAAGCTTTGGAGAAACATCAAGAGGCAAATAAATAACCGCAAAAA
TCAAAGTTAAGCCAAAGGAGAAGAAGACAAAAGTTATAAGCAATATGTCAAAAGTTTCTT
TTATAAGATTTTCATTGTTGGTGTTCCTGGTGATCGCCGTCGTGACTCCATCGGCGAAGT
CCGCCGTTCTCGGAGGGAAGTCAGATGTTGGGAACGTTGGAATCAACATGGAGATTCAAG
AACTTGGAAGGTACTGCGTGAAACAATTCAATCTACAAGAAATGAGCGAGCAAACAAACG
CTGCATCCATTGCGAGAACAGACGCTAACGTGTTGAGTCCGTTGAAATTCAGACGAGTTG
TGTCGGCTCAGAAACAGATTGTGGCTGGTACCAAATACT****AAGGATTGAAGTGACTC
AACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTTGACTCAGTTATAGTTATTCAACCATGGCTTTTTT
CTAAGAAGTTGCTCGAATTCACTCCTGTTGCTACTCCTATCTACTAACTTCATCTCTTTA
TTCAACAATATCCAAATGCAATCAAAAAGACCAAAAATGTGCATGATATGAAGCTACTAT
TAACAATGGGCTAATAGTTCGTTTGTATTGTAATGATGTTTTACGTTGTTCATAAATAAA
GGCCAAAGATGCTATAAAGATGTGATGAAATTACTGAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FN81TF U 31
AF RS1CU04JQ C 1
AF RS1CU04TF U 1
BS 1 5 RS1CU04JQ
BS 6 36 RS1CU04TF
BS 37 399 RS1FN81TF
BS 400 403 RS1CU04TF
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BS 535 656 RS1FN81TF
BS 657 704 RS1CU04TF

RD RS1FN81TF 626 0 0
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QA 7 626 7 626
DS 

RD RS1CU04JQ 682 0 0
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TGTCGGCTCAGAAACAGATTGTGGCTGGTACCAAATACT****AAGGATTGAAGTGACTC
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TAACAATGGGCTAATAGTTCGTTTGTATTGTAATGATGTTTTACGTTGTTCATAAATAAA
GGCCAAAGATGCTATAAAGATG

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1CU04TF 704 0 0
AGGGG
AAACAAAATCAAAGCTTTGGAGAAACATCAAGAGGCAAATAAATAACCGCAAAAATCAAA
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TCCATTGCGAGAACAGACGCTAACGTGTTGAGTCCGTTGAAATTCAGACGAGTTGTGTCG
GCTCAGAAACAGATTGTGGCTGGTACCAAATACT****AAGGATTGAAGTGACTCAACCC
GATGGCACGAGCAGGATGTTTGACTCAGTTATAGTTATTCAACCATGGCTTTTTTCTAAG
AAGTTGCTCGAATTCACTCCTGTTGCTACTCCTATCTACTAACTTCATCTCTTTATTCAA
CAATATCCAAATGCAATCAAAAAGACCAAAAATGTGCATGATATGAAGCTACTATTAACA
ATGGGCTAATAGTTCGTTTGTATTGTAATGATGTTTTACGTTGTTCATAAATAAAGGCCA
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QA 6 704 6 704
DS 



AS 1 8

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AGATGAAAACATCAAAGGAAAGATGGGATATCATCTCCATATTGCTTGTGTTTGAAAATC
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CTATGGGAACTTTGTTTCAGTGAGCTTCTCCTGCGGCTGTGATAAGTACCTTATAAGCTC
TTCTTCCCTTTCTATACAATAACAGTCTTCTCTCT


BQ
10 35 35 50 50 50 0 0 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 0 0 0 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 0 0 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1C109JQ C 1
AF RS1EA42TF U 2
AF RS1EA42JQ C 2
AF RS1C109TF U 1
AF RS1GF77TF U -1
AF RS1D002TF U 0
AF RS1B970JQ C 2
AF RS1B970TF U 2
BS 1 1 RS1C109JQ
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BS 4 6 RS1EA42TF
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RD RS1C109JQ 660 0 0
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ATTTTGCATCTGATGTGGAGCCTGTTGTTGCTAAAGAATGATTACGACGAAAAAACAAGA
AGATGAAAGCATCAAAGGAAAGATGGGATATCATCTCCATATTGCTTGTGTTTGAAAATC
TAGCTTCATGATATTTGATTTTTCCTTTTCATTCTCAGATCTTAA*GGGTCGATTTACTA
TGAAATAAGTTCACCTTTTTAATACCCCATAAACGCTTCTCTCTGTCTTTGATGCGGTAT
CTATGGGAACTTTGTTTCAGTGAGCTTCTCCTGCGGCTGTGATAAGTACCTT
TTACGCTC

QA 1 652 1 652
DS 

RD RS1EA42TF 631 0 0
GG
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AATATCA***AATGGCGACATCGAGGCTTCAAGCTCTGTGGAATCACCCTGCCGGTCCTA
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ACTTTGCTAAACCTACTGACAAAATATCCTACCCTCAACAGATTGCTGTTACATGCACTG
GAGTTATCTGGTCTCGTTACAGCATGGTTATCACTCCCAAAAACTGGAACCTCTTTAGCG
TCAATGTTGCTATGGCTGGGACTGGCATGTACCAGCCTGCTCGTAAAATCAAAAACGATT
TTGCATCTGATGTGGAGCCTGTTGTTGCTAAAGAATGATTACGACGAAAAAACAAGAAGA
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TTTCATGATATTTGATTTTTCCTTTTCATTCTCAGATCTTAA*GGGTCGATTTACTATGA
AATAAGTTCACCTTTTTAATACCCCATAAACGCTTCTCTCTGTCTTTGATGCGGTATCTA
TGGGAACTTTGTTTCAGTGAGC
AAAAAAA

QA 3 624 3 624
DS 

RD RS1EA42JQ 624 0 0
GG
GACG*GAGGAAAGGAAAGGAAAAAGAGAATCTGGTGGGGAGAGAGAAGATTGATTGATCG
AATATCA***AATGGCGACATCGAGGCTTCAAGCTCTGTGGAATCACCCTGCCGGTCCTA
AAACCATTCATTTCTGGGCGCCAACGTTCAAGTGGGGAATAAGCATTGCTAACATTGCAG
ACTTTGCTAAACCTACTGACAAAATATCCTACCCTCAACAGATTGCTGTTACATGCACTG
GAGTTATCTGGTCTCGTTACAGCATGGTTATCACTCCCAAAAACTGGAACCTCTTTAGCG
TCAATGTTGCTATGGCTGGGACTGGCATGTACCAGCCTGCTCGTAAAATCAAAAACGATT
TTGCATCTGATGTGGAGCCTGTTGTTGCTAAAGAATGATTACGACGAAAAAACAAGAAGA
TGAAAGCATCAAAGGAAAGATGGGATATCATCTCCATATTGCTTGT*TTTGAAAATCTAG
TTTCATGATATTTGATTTTTCCTTTTCATTCTCAGATCTTAA*GGGTCGATTTACTATGA
AATAAGTTCACCTTTTTAATACCCCATAAACGCTTCTCTCTGTCTTTGATGCGGTATCTA
TGGGAACTTTGTTTCAGTGAGC

QA 3 624 3 624
DS 

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GGA
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TTACGCTCAAAAAAAA

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GGA
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GG
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DS 

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GATGAAAACATCAAAGGAAAGATGGGATGTCATCTCCATATTGCTTGTGTTTGAAAATCT
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DS 



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TCCCTCCGGTGGTCATGACGAGCTCCCCGTTGCAGTAGACCTTGGCGTCCTCGTGAAACT
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TTTAACGATGGATCC


BQ
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50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 20 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 20 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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AF RS1BP56JQ U 14
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CC

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CC

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CAAGACGATCTCTCCTTTCAGGACAGGAATCTCCATGATCTCCGACAGCCCGGCGAACCT
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GAACGGGTGGTTACCGGACCAAACATCGGCGACGTACTCTTTCTTGGTCCCTCCGGTGGT
CATGACGAGCTCCCCGTTGCAGTAAACCTTGGCGTCCTCGTGAAACTCGGGGTGTAGATC
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CC

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DS 



AS 1 6

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GGAACTTGAGTTCGATTGGGGTGTCTTTTTGGGACGAGACGTTGTTATCGCCATTGTTGG
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TGTTTTCC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1EZ73JQ U 1
AF RS1D704JQ U 20
AF RS1C484JQ U 4
AF RS1AR48TFB C 48
AF RS1EZ73TF C 220
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GGAACCTGTGAGGCAATATCTCTCTGATCTGGTTAATGTCCATGACCGATGGAAATGCTG
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AGCAACGGAGCGC

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DS 

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GCATAAGAAGAAGAAGA***AGAAAAAGAACATAACATATAACGAGGGAAACAATGGTTG
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ACCCACGTAAGCTTTACCTTCCATCTTAGCAAGACCGAAGCGTTTCTGGAACTTGAGAAG
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TCCTCCCACTTGCGCCATCGCCTCAACCATGAGAACACCAGGCATGATGGGACGGTCAGG
GAAATGACCAGGGAAGAAGTTGTCATTGATAGTGACGTTCTTAATAGCTACAGCTGAAAC
ACCAGGTGTATACTCAATCACTCTATCCACCAGCAGAAACGGGAACCTGTGAGGCAATAT
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GGTGGATTGCTTGGTGGGTATGAGAGAAACGGAATGGGATCT

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CGCAGACCAAAGACCCACCCACGTAAGCTTTACCTTCCATCTTAGCAAGACCGAAGCGTT
TCTGGAACTTGAGAAGAGTCATCCTCATCACCAGTGTGTCTCCTGCAATCACTGGTTTGC
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GCTGCAGCATTACTATCCCTCCCACTTGCGCCATCGCCTCAACCATGAGAACACCAGGCA
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TAGCTACAGCTGAAACACCAGGTGTATACTCAATCACTCTATCCACCAGCAGAAACGGGA
ACCTGTGAGGCAATATCTCTCTGATCTGGTTAATGTCCATGACCGTTGGAAATGCTGGGA
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AGCTCGA

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DS 

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AACATAACATATAACGAGGGAAACAATGGTTGAGAAGATCAAGAACTGCCAGCAGAAACC
ATCATGAACTCTCCCTCGCAGACCAAAGACCCACCCACGTAAGCTTTACCTTCCATCTTA
GCAAGACCGAAGCGTTTCTGGAACTTGAGAAGAGTCATCCTCATGACCAGTGTGTCTCCT
GCAATCACTGGTTTGCGGAATCTCACTTTATCAATACCCGCAAAGAAGAAGTTATCCTGA
GATCCTCCTACTTCCGGCTGCAGCACTACTATTCCTCCCACTTGCGCCATCGCCTCAACC
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ATAGTGACGTTCTTAATAGCTACAGCTGAAACACCAGGTGTATACTCAATCACTCTATCC
ACCAGCAGAAACGGGAACCTGTGAGGCAATATCTCTCTGATCTGGTTAATGTCCATGACC
GATGGAAATGCTGGGAACTTGAGTTCGATTGGGGTGTCTTTTTGGGACGAGACGTTGTTA
TCGCCATTGTTGGAGCAACGGAGCGCGAGGGAGGTGGATTGCTTGGTGGGTATGAGAGAA
ACGGAATGGGATCTGGAGGAGGAAAGATGGAGGTGGGTTCTGGGCGGGTTGTGATGATGA
TGACTCGGTGAGTCGGAGCTCGAGAAGAGTACCGAGTTGGATGCAGTAGCCATTGTTATT
GTCCC

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DS 

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CTCTATCCACCAGCAGAAACGGGAACCTGTGAGGCAATATCTCTCTGATCTGGTTAATGT
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CGTTGTTATCGCCATTGTTGGAGCAACGGAGCGCGAGGGAGGTGGATTGCTTGGTGGGTA
TGAGAGAAACGGAATGGGATCTGGAGGAGGAAAGATGGAGGTGGGTTCTGGGCGGGTTGT
GATGATGATGACTCGGTGAGTCGGAGCTCGAGAAGAGTACCGAGTTGGATGCAGTAGCCA
TTGTTATTGTCAAAGTAAAG
CC

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DS 

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TATCCTGAGATCCTCCTACTTCCGGCTGCAGCATTACTATCCCTCCCACTTGCGCCATCG
CCTCAACCATGAGAACACCAGGCATGATGGGTCGGTCGGGGAAATGACCAGGGAAGAAGT
TGTCATTGATAGTAACATTCTTAATAGCTACAGCTGAAACACCAGGTGTATACTCAATCA
CTCTATCCACCAGCAGAAACGGGAACCTGTGAGGCAATATCTCTCTGATCTGGTTAATGT
CCATGACCGTTGGAAATGCTGGGAACTTGAGTTCGATTGGGGTGTCTTTTTGGGACGAGA
CGTTGTTATCGCCATTGTTGGAGCAACGGATCGCGAGGGAGGTGGACTGCTTGGTGGGTA
GGAGAGAAACGGAATGGGATCTGGAGGAGGAAAGATGGAGATGGGTTCTGGGCGGGTTGT
GATGGTGATGACTCTGTGAGTCGGAGCTCGAGAAGAGTACCGAGTTGGATGCAGTAGCCA
TTATTATTATCAAAGTAAAGAGGGAGGAAGAGAGTGAGAAGATGTTTTTGCAGACAAAAT
AAGAAGCGGAGAGTCCAAAGGTGTTTTCC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 8

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AAGCCAGGAGCGCCGGAGGTTCTGCAACTCCGAGAAGTGGAAGACCCACAAGTGAAAGAC
GACGAGGTTCTCATCAGAGTTCACGCCACTGCTCTGAATCGCGCTGATACTCTCCAGAGA
CTCGGCTCCTACTCTCCGCCACCTGGCTCTAGCCCTTACCCTGGTCTCGAGTGTTCCGGT
ACCATCGAATCCCTCGGCAACTCCGTCGTCTCTCGTTGGAAGGTCGGAGACCAGGTGTGT
GCTCTTCTTTCTGGAGGAGGTTATGCAGAGAAGGTTGCTGTACCTGTTGGACAAATCCTT
CCAATCCCTGCTGGTATCTCTCTAAAAGATGCAGCTGCTTTCCCTGAAGTGGCATGCACT
GTTTGGTCAACTGTCTTCATGATGGGCCGTCTCTCCCCTGGTGAATCCTTCTTGGTTCAT
GGAGGTTCAAGTGGGATTGGGACATTTGCGATTCAGATGGCCAAACATCAAGGAGTCAGA
GTATTCGTCACAGCAGGAAATGAGGAAAAGCTAGCTGCTTGCAAAGAACTCGGGGCTGAT
GTTTGTATAAATTACAAAACCGAGGACTTTGTGGCAAGGGTGAAAGCTGAAACCGATGGG
AAAGGTGTGGATGTTATCTTGGACTGCATTGGAGCGCCTTATTTGCAGAAAAACCTCGAC
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ATAAAACTAAGTAGTCTGCTCCCGAAGCGTCTCACTGTCTTAGGAGCTGCGTTAAGACCA
AGAAGCAAGGAGAACAAAGCGGTTGTTGTAGCGGAAGTGGAGAAGATTGTTTGGCCAGCG
ATAGAAGCAGGGAAGGTGAAACCGGTGATTTACAAGTACTTACCGTTGTCGCAAGCAGCA
GAAGCTCATAGCCTGATGGAGAGTAGTAGCCATATTGGTAAGATTCTGCTTGTTACTTGA
TTCTCTTGCAAAGGGAGAAAGAAAATGTTCAAGAGACACGAATCATGGTGCATGGGAAAA
TAATAAAATCTGGTGGATTGTGTTCATAGATGTATAAGAGGTCTGTTTGTTCACTGGCTT
TTATGTATCTCTATGTTTGGGACTATGATGGAACATTATATACTAATAAGCTGTCAACTT
CTTCATATTGGTCTAAATATATTATGTTGTATAATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 0 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 25 40 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GI38TF U 1
AF RS1FW63TF U 16
AF RS1CI86TF U 27
AF RS1FJ92TF U 12
AF RS1FW63JQ C 831
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AF RS1GI38JQ C 476
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CTCGGCTCCTACTCTCCGCCACCTGGCTCTAGCCCTTACCCTGGTCTCGAGTGTTCCGGT
ACCATCGAATCCCTCGGCAACTCCGTCGTCTCTCGTTGGAAGGTCGGAGACCAGGTGTGT
GCTCTTCTTTCTGGAGGAGGTTATGCAGAGAAGGTTGCTGTACCTGTTGGACAAATCCTT
CCAATCCCTGCTGGTATCTCTCTAAAATATGCAGCTGCTTTCCCTGAAGTGGCATGCACT
GTTTGGTCAACTGTCTTCATGATGGGCCGTCTCTCCCCTGGTGAATCCTTCTTGGTTCAT
GGAGGTTCAAGTGGGATTGGGACATTTGCGATTCAGATGGCCAAACATCAAGGAGTCAGA
GTATTCGTCACA

QA 1 552 1 552
DS 

RD RS1FW63TF 735 0 0
GG
ACGGAAGCTAGAGAGAGAGAGAATGAAGGCGATCGTGATCACGAAGCCAGGAGCGCCGGA
GGTTCTGCAACTCCGAGAAGTGGAAGACCCACAAGTGAAAGACGACGAGGTTCTCATCAG
AGTTCACGCCACTGCTCTGAATCGCGCTGATACTCTCCAGAGACTCGGCTCCTACTCTCC
GCCACCTGGCTCTAGCCCTTACCCTGGTCTCGAGTGTTCCGGTACCATCGAATCCCTCGG
CAACTCCGTCGTCTCTCGTTGGAAGGTCGGAGACCAGGTGTGTGCTCTTCTTTCTGGAGG
AGGTTATGCAGAGAAGGTTGCTGTACCTGTTGGACAAATCCTTCCAATCCCTGCTGGTAT
CTCTCTAAAAGATGCAGCTGCTTTCCCTGAAGTGGCATGCACTGTTTGGTCAACTGTCTT
CATGATGGGCCGTCTCTCCCCTGGTGAATCCTTCTTGGTTCATGGAGGTTCAAGTGGGAT
TGGGACATTTGCGATTCAGATGGCCAAACATCAAGGAGTCAGAGTATTCGTCACAGCAGG
AAATGAGGAAAAGCTAGCTGCTTGCAAAGAACTCGGGGCTGATGTTTGTATAAATTACAA
AACCGAGGACTTTGTGGCAAGGGTGAAAGCTGAAACCGATGGGAAGGGTGTGGATGTTAT
CTTGGACTGCATTGGAGCGCCTTATTTGCAGAAAA*CCTCGACAGCTTAAACTTCGATGG
AAG*TTATGTATC

QA 3 735 3 735
DS 

RD RS1CI86TF 724 0 0
G
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CTCCGAGAAGTGGAAGACCCACAAGTGAAAGACGACGAGGTTCTCATCAGAGTTCACGCC
ACTGCTCTGAATCGCGCTGATACTCTCCAGAGACTCGGCTCCTACTCTCCGCCACCTGGC
TCTAGCCCTTACCCTGGTCTCGAGTGTTCCGGTACCATCGAATCCCTCGGCAACTCCGTC
GTCTCTCGTTGGAAGGTCGGAGACCAGGTGTGTGCTCTTCTTTCTGGAGGAGGTTATGCA
GAGAAGGTTGCTGTACCTGTTGGACAAATCCTTCCAATCCCTGCTGGTATCTCTCTAAAA
GATGCAGCTGCTTTCCCTGAAGTGGCATGCACTGTTTGGTCAACTGTCTTCATGATGGGC
CGTCTCTCCCCTGGTGAATCCTTCTTGGTTCATGGAGGTTCAAGTGGGATTGGGACATTT
GCGATTCAGATGGCCAAACATCAAGGAGTCAGAGTATTCGTCACAGCAGGAAATGAGGAA
AAGCTAGCTGCTTGCAAAGAACTCGGGGCTGATGTTTGTATAAATTACAAAACCGAGGAC
TTTGTGGCAAGGGTGAAAGCTGAAACCGATGGGAAGGGTGTGGATGTTATCTTGGACTGC
ATTGGAGCGCCTTATTTGCAGAAAA*CCTCGACAGCTTAAACTTCGATGGAAG*GT
ATGTATC

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DS 

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GGGGAT
ACGGAAGCTAGAGAGAGAGAGAATGAAGGCGATCGTGATCACGAAGCCAGGAGCGCCGGA
GGTTCTGCAACTCCGAGAAGTGGAAGACCCACAAGTGAAAGACGACGAGGTTCTCATCCG
AGTTCACGCCACTGCTCTGAATCGCGCTGATACTCTCCAGAGACTCGGCTCCTACTCTCC
GCCACCTGGCTCTAGCCCTTACCCTGGTCTCGAGTGTTCCGGTACCATCGAATCCCTCGG
CGACTCCGTCGTCTCTCGTTGGAAGGTCGGAGACCCGGTGTGTGCTCTTCTTTCTGGAGG
AGGTTATGCAGAGAAGGTTGCTGTACCTGTTGGACAAATCCTTCCAATCCCTGCTGGTAT
CTCTCTAAAAGATGCAGCTGCTTTCCCTGAAGTGGCATGCACTGTTTGGTCAACTGTCTT
CATGATGGGCCGTCTCTCCCCTGGTGAATCCTTCTTGGTTCATGGAGGTTCAAGTGGGAT
TGGGACATTTGCGATTCAGATGGCCAAACATCAAGGAGTCAGAGTATTCGTCACAGCAGG
AAATGAGGAAAAGCTAGCTGCTTGCAAAGAACTCGGGGCTGATGTTTGTATAAATTACAA
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CTTGGACTGCATTGGAGCGCCTTATTTGCAGAAAA*CCTCGACAGCTTAAACTTCGATGG
AAG*TTATGTATCATCGGTTTAATGAGAGGAGCTAATGCAGAGATAAAACTAAGTAGTCT
GCTCCCGAAGCGTCTCACTG

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DS 

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TTGCCCAGCGATAGAAGCAGGGAAGGTGAAACCGGTGATTTACAAGTACTTACCGTTGTC
GCAAGCAGCAGAAGCTCATACCCTGATGGAGAGTA

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DS 

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TTCAGATGGCCAAACATCAAGGAGTCAGAGTATTCGTCACAGCAGGAAATGAGGAAAAGC
TAGCTGCTTGCAAAGAACTCGGGGCTGATGTTTGTATAAATTACAAAACCGAGGACTTTG
TGGCAAGGGTGAAAGCTGAAACCGATGGGAAAGGTGTGGATGTTATCTTGGACTGCATTG
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TCACTGTCTTAGGAGCTGCGTTAAGACCAAGAAGCAAGGAGAACAAAGCGGTTGTTGTAG
CGGAAGTGGAGAAGATTGTTTGGCCAGCGATAGAAGCAGGGAAGGTGAAACCGGTGATTT
ACGAGTACTTACCGTTGTCGCAAGCAGCAGAAGCTCATAGCCTGATGGAGAGTAGTAGCC
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AGAGACACGAATCATGGTGCATGGGAAAATAATAAAATCTGGTGGATTGTGTTCATAGAT
GTATAAGAGGTCTGTTTGTTCACTGGCTTTTATGTATCTCTATGTTTGGGACTATGATGG
AACATTATATACTAATAAGCTGTCAACTTCT

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DS 

RD RS1FJ92JQ 729 0 0
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TCAGAGTATTCGTCACAGCAGGAAATGAGGAAAAGCTAGCTGCTTGCAAAGAACTCGGGG
CTGATGTTTGTATAAATTACAAAACCGAGGACTTTGTGGCAAGGGTGAAAGCTGAAACCG
ATGGGAAAGGTGTGGATGTTATCTTGGACTGCATTGGAGCGCCTTATTTGCAGAAAAACC
TCGACAGCTTAAACTTCGATGGAAGGTTATGTATCATCGGTTTAATGAGAGGAGCTAATG
CAGAGATAAAACTAAGTAGTCTGCTCCCGAAGCGTCTCACTGTCTTAGGAGCTGCGTTAA
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CAGCGATAGAAGCAGGGAAGGTGAAACCGGTGATTTACAAGTACTTACCGTTGTCGCAAG
CAGCAGAAGCTCATAGCCTGATGGAGAGTAGTAGCCATATTGGTAAGATTCTGCTTGTTA
CTTGATTCTCTTGCAAAGGGAGAAAGAAAATGTTCAAGAGACACGAATCATGGTGCATGG
GAAAATAATAAAATCTGGTGGATTGTGTTCATAGATGTATAAGAGGTCTGTTTGTTCACT
GGCTTTTATGTATCTCTATGTTTGGGACTATGATGGAACATTATATACTAATAAGCTGTC
AACTTCT
TC

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TCAGAGTATTCGTCACAGCAGGAAATGAGGAAAAGCTAGCTGCTTGCAAAGAACTCGGGG
CTGATGTTTGCATAAATTACAAAACCGAGGACTTTGTGGCAAGGGTGAAAGCTGAAACCG
ATGGGAAAGGTGTGGATGTTATCTTGGACTGCATTGGAGCGCCTTATTTGCAGAAAAACC
TCGACAGCTTAAACTTCGATGGAAGGTTATGTATCATCGGTTTAATGAGAGGAGCTAATG
CAGAGATAAAACTAAGTAGTCTGCTCCCGAAGCGTCTCACTGTCTTAGGAGCTGCGTTAA
GACCAAGAAGCAAGGAGAACAAAGCGGTTGTTGTAGCGGAAGTGGAGAAGATTGTTTGGC
CAGCGATAGAAGCAGGGAAGGTGAAACCGGTGATTTACAAGTACTTACCGTTGTCGCAAG
CAGCAGAAGCTCATAGCCTGATGGAGAGTAGTAGCCATATTGGTAAGATTTTGCTTGTTA
CTTGATTCTCTTGTAAAGGGAGAAAGAAAATGTTCAAGAGACACGAATCATGGTGCATGG
GAAAATAATAAAATTTGGTGGATTGTGTTCATAGATGTATAAGAGGTCTGTTTGTTCACT
GGCTTTTATGTATCTCTATGTTTGGGGCTATGATGGAACATTATATACTAATAAGCTGTC
AACTTCTTCATATTGGTCTAAATATATTATGTTGTATAATGT

QA 1 762 1 762
DS 



AS 2 8

CO CL666Contig1 931 6 43 U
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GCTGAAAAATCAAAATCCCAGGACTCAGAGGCCTCTAGCCTCACCACATCACTGAACAAT
CTTGTTCACACCCATAGAAAAGAAACAACCTCAAAGGTAAGCACAGTTCTTGGCTCATCA
TCAGTTACTTCCACCACAAGCGAATCATCCGCTACATCAGAGAGCATAGAGAGCTTAAAG
CTAACCCTAAAGAAGCTACGCGGTCTAACCGCCCGTGACCTAGTACACCATCCAAACTTC
GACGAGATTATAGAAGCCGGTACACGTTACGAGGTACTCAGCTCGGCTTCCACTGGTTAC
ATCTCGTTACTAGCCAAATACAAAACCGTCATCAAAGAAGGACTCGAGGCTTCTCATAGA
GTCCACCTCGCTCGAACTCGAGCCAAACTACTCAAAGAAACCGCCATGGAGAAGCAGAGA
GCCGTGGACGCGGAGTTCGCGTCCGCCAAGAGTCTTGCTCAGGGAGGAGACGCCTTGTCC
ATCAAAATCTTCGCAATCAAGAAACTGTTGGTTAAGCTTGAAGCGGAGAAAGTGAGTGTT
GGTCTGAAGTTTAAGTCGACGGAGAGTAATGTAGCACGGCTTCTTAAGGAGGCTTCTCAG
GCTTACGAAGAGTATCATGTGGCTGTGCGTAAGGCGAAGGACGAGCAAGCTGCTGAGGAG
TTCGCTCTTGAGACGACCAAGAGAGCTGAACACATTTGGGTTGAGTTTCTTAGTTCACTT
AACTGAACTGATGAGATTCTTGCTTGTGCTTAAAGCTTAGTTGTGGTTCTTTTTCTTGTT
CTTATTGGTGCTGTTTTATTGGGTTATACCGGGAAAAAAGAGGTTCAAAACAAATAATGT
ATTATTCCTCTAATAAAACCTTTTTCACTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AT70TF U 1
AF RS1GO89TF U 52
AF RS1CQ90TF U 107
AF RS1CS81JQ C 475
AF RS1CQ90JQ C 162
AF RS1CS81TF U 475
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BS 166 166 RS1GO89TF
BS 167 175 RS1AT70TF
BS 176 176 RS1GO89TF
BS 177 195 RS1AT70TF
BS 196 196 RS1GO89TF
BS 197 209 RS1AT70TF
BS 210 210 RS1GO89TF
BS 211 241 RS1AT70TF
BS 242 242 RS1GO89TF
BS 243 352 RS1AT70TF
BS 353 353 RS1CQ90TF
BS 354 449 RS1AT70TF
BS 450 450 RS1GO89TF
BS 451 501 RS1AT70TF
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BS 504 554 RS1AT70TF
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BS 859 876 RS1CQ90TF
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BS 926 931 RS1CQ90JQ

RD RS1AT70TF 617 0 0
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GCTGAAAAATCAAAATCCCAGGACTCAGAGGCCTCTAGCCTCACCACATCACTGAACAAT
CTTGTTCACACCCATAGAAAAGAAACAACCTCAAAGGTAAGCACATTTCTTGGCTTATCA
TCAGTTACTTCCACCGCAAGCGAATCATCAGCTACATCAGAGAGCATAGAGAGCTTAAAG
CAAACCCTAAAGAAGCTACGCGGTCTAACCGCCCGTGACCTAGTACACCATCCAAACTTC
GACGAGATTATAGAAGCCGGTACACGTTACGAGGTACTCAGCTCGGCTTCCATTGGTTAC
ATCTCGTTACTAGCCAAATACAAAACCGTCATCAAAGAAGGACTCGAGGCTTCTCATAGA
GTCCACCTCGCTCGAACTCGAGCCAAACTTCTCAAAGAAACCGCCATGGAGAAGCAGAGA
GCCGTGGACGCGGAGTTCGCGCTCGCCAAGAGTCTTGCTCAGGGAGGAGACGCCTTGTCC
ATCAAAATCTTCGCCATCAAGAAACTGTTGGTTAAGCTTGAAGCGGAGAAAGTGAGTGTT
GGTCTGAAGTTTAAGTC

QA 1 617 1 617
DS 

RD RS1GO89TF 799 0 0
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CTGAACAATCTTGTTCACACCCATAGAAAAGAAACAACCTCAAAGGTAAGCACAGTTCTT
GGCTCATCATCAGTTACTTCCACCACAAGCGAATCATCCGCTACATCAGAGAGCATAGAG
AGCTTAAAGCTAACCCTAAAGAAGCTACGCGGTCTAACCGCCCGTGACCTAGTACACCAT
CCAAACTTCGACGAGATTATAGAAGCCGGTACACGTTACGAGGTACTCAGCTCGGCTTCC
ATTGGTTACATCTCGTTACTAGCCAAATACAAAACCGTCATCAAAGAAGGACTCGAGGCT
TCTCATAGAGTCCACCTCGCTCGAACTCGAGCCAAACTACTCAAAGAAACCGCCATGGAG
AAGCAGAGAGCCGTGGACGCGGAGTTCGCGTCCGCCAAGAGTCTTGCTCAGGGAGGAGAC
GCCTTGTCCATCAAAATCTTCGCAATCAAGAAACTGTTGGTTAAGCTTGAAGCGGAGAAA
GTGAGTGTTGGTCTGAAGTTTAAGTCGACGGAGAGTAATGTAGCACGGCTTCTTAAGGAG
GCTTCTCAG*CTTACGAAGAGTATCATGTGGCTGTGCGTAAG*CGAAG*ACGAACAAGCT
GCTGAGGAGTTCGCTCTTGAGACGACCAAGAGAGCTGA*CACATTTGGGTTGAGTTTCTT
AGTTCACTTAACTGAACTGATGAGAT*CTTGCTTGTGCT*AAAGCTTAGT*GTGGTTCTT
TT
CTGTCTTTTGGTGCTGT

QA 1 782 1 782
DS 

RD RS1CQ90TF 770 0 0
G
ATCACTGAACAATCTTGTTCACACCCATAGAAAAGAAACAACCTCAAAGGTAAGCACAGT
TCTTGGCTCATCATCAGTTACTTCCACCACAAGCGAATCATCCGCTACATCAGAGAGCAT
AGAGAGCTTAAAGCTAACCCTAAAGAAGCTACGCGGTCTAACCGCCCGTGACCTAGTACA
CCATCCAAACTTCGACGAGATTATAGAAGCCGGTACACGTTACGAGGTACTCAGCTCGGC
TTCCACTGGTTACATCTCGTTACTAGCCAAATACAAAACCGTCATCAAAGAAGGACTCGA
GGCTTCTCATAGAGTCCACCTCGCTCGAACTCGAGCCAAACTACTCAAAGAAACCGCCAT
GGAGAAGCAGAGAGCCGTGGACGCGGAGTTCGCGTCCGCCAAGAGTCTTGCTCAGGGAGG
AGACGCCTTGTCCATCAAAATCTTTGCAATCAAGAAACTGTTGGTTGAGCTTGAAGCGGA
GAAAGTGAGTGTTGGTCTGAAGTTTAAGTCGACGGAGAGTAATGTAGCACGGCTTCTTAA
GGAGGCTTCTCAGGCTTACGAAGAGTATCATGTGGCTGTGCGTAAGGCGAAGGACGAGCA
AGCTGCTGAGGAGTTCGCTCTTGAGACGACCAAGAGAGCTGAACACATTTGGGTTGAGTT
TCTTAGTTCACTTAACTGAACTGATGAGATTCTCGCTTGTGCTTAAAGCTTAGTTGTGGT
TCTTTTTCTTGTTCTTATTGGTGCTGTTTTGTTGGGTTATACCGGGAAA

QA 2 770 2 770
DS 

RD RS1CS81JQ 405 0 0
G
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TGTCCATCAAAATCTTCGCAATCAAGAAACTGTTGGTTAAGCTTGAAGCGGAGAAAGTGA
GTGTTGGTCTGAAGTTTAAGTCGACGGAGAGTAATGTAGCACGGCTTCTTAAGGAGGCTT
CTCAGGCTTACGAAGAGTATCATGTGGCTGTGCGTAAGGCGAAGGACGAGCAAGCTGCTG
AGGAGTTCGCTCTTGAGACGACCAAGAGAACTGAACACATTTGGGTTGAGTTTCTTAGTT
CACTTAACTGAACTGATGAGATTCTTGCTTGTGCTTAAAGCTTAGTTGTGGTTCTTTTTC
TTGTTCTTATTGGTGCTGTTTTATTGGGTTATACCGGGAAA
AAA

QA 2 402 2 402
DS 

RD RS1CQ90JQ 770 0 0
CACAGTTCTTGGCTCATCATCAGTTACTTCCACCACAAGCGAATCATCCGCTACATCAGA
GAGCATAGAGAGCTTAAAGCTAACCCTAAAGAAGCTACGCGGTCTAACCGCCCGTGACCT
AGTACACCATCCAAACTTCGACGAGATTATAGAAGCCGGTACACGTTACGAGGTACTCAG
CTCGGCTTCCACTGGTTACATCTCGTTACTAGCCAAATACAAAACCGTCATCAAAGAAGG
ACTCGAGGCTTCTCATAGAGTCCACCTCGCTCGAACTCGAGCCAAACTACTCAAAGAAAC
CGCCATGGAGAAGCAGAGAGCCGTGGACGCGGAGTTCGCGTCCGCCAAGAGTCTTGCTCA
GGGAGGAGACGCCTTGTCCATCAAAATCTTTGCAATCAAGAAACTGTTGGTTGAGCTTGA
AGCGGAGAAAGTGAGTGTTGGTCTGAAGTTTAAGTCGACGGAGAGTAATGTAGCACGGCT
TCTTAAGGAGGCTTCTCAGGCTTACGAAGAGTATCATGTGGCTGTGCGTAAGGCGAAGGA
CGAGCAAGCTGCTGAGGAGTTCGCTCTTGAGACGACCAAGAGAGCTGAACACATTTGGGT
TGAGTTTCTTAGTTCACTTAACTGAACTGATGAGATTCTCGCTTGTGCTTAAAGCTTAGT
TGTGGTTCTTTTTCTTGTTCTTATTGGTGCTGTTTTGTTGGGTTATACCGGGAAAAAAGA
GGTTCAAAACAAATAATGTATTATTCCTCTAATAAAACCTTTTTCACTCT

QA 1 770 1 770
DS 

RD RS1CS81TF 457 0 0
G
AGAGAGCCGTGGACGCGGAGTTCGCGTCCGCCAAGAGTCTTGCTCCGGGAGGAGACGCCT
TGTCCATCAAAATCTTCGCAATCAAGAAACTGTTGGTTAAGCTTGAAGCGGAGAAAGTGA
GTGTTGGTCTGAAGTTTAAGTCGACGGAGAGTAATGTAGCACGGCTTCTTAAGGAGGCTT
CTCAGGCTTACGAAGAGTATCATGTGGCTGTGCGTAAGGCGAAGGACGAGCAAGCTGCTG
AGGAGTTCGCTCTTGAGACGACCAAGAGAACTGAACACATTTGGGTTGAGTTTCTTAGTT
CACTTAACTGAACTGATGAGATTCTTGCTTGTGCTTAAAGCTTAGTTGTGGTTCTTTTTC
TTGTTCTTATTGGTGCTGTTTTATTGGGTTATACCGGGAAAAAAGAGGTTCACAACAAAT
AATGTATTATTCCTCTAATAAAACCTTTTT
CACTTC

QA 2 451 2 451
DS 



CO CL666Contig2 784 2 1 U
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TATAACCCAACAAAACAACACCAATAAAAACAAGAAAAAGAACCACAACTAAGCTTCAAG
CACAAGCGAGAATCTCATCCGTTCAGTTAAGCGAGCTAAGAAACTCAACCCAAATGTGTT
CAGCTCTCTTGGTCGTCTCAAGAGCGAACTCCTCAGCAGCTTGCTCGTCCTTCGCCTTAC
GCACAGCCACATGATACTCTTCATAAGCCTGAGAAGCCTCCTTAAGAAGCCTTGCTACAT
TACTCTCCGTCGACTTAAACTTCAGACCAACACTCACTTTCTCCGCTTCAAGCTTAACCA
ACAGTTTCTTGATGGCGAAGATTTTGATGGACAAGGCGTCTCCTCCCTGAGCAAGACTCT
TGGCGAGCGCGAACTCCGCGTCCACGGCTCTCTGCTTCTCCATGGCGGTTTCTTTGAGAA
GTTTGGCTCGAGTTCGAGCGAGGTGGACTCTATGAGAAGCCTCGAGTCCTTCTTTGATGA
CGGTTTTGTATTTGGCTAGTAACGAGATGTAACCAATGGAAGCCGAGCTGAGTACCTCGT
AACGTGTACCGGCTTCTATAATCTCGTCGAAGTTTGGATGGTGTACTAGGTCACGGGCGG
TTAGACCGCGTAGCTTCTTTAGGGTTTGCTTTAAGCTCTCTATGCTCTCTGATGTAGCTG
ATGATTCGCTTGCGGTGGAAGTAACTGATGATAAGCCAAGAACTGTGCTTACCTTTGAGG
TTTT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1AT70JQ U 2
AF RS1CV88JQ U 1
BS 1 784 RS1CV88JQ

RD RS1AT70JQ 693 0 0
AAA
AAAAAGGTTTTATTAGAGGAATAATACATTATTTGTGTTCAACCTCTTTCTCCCGGTATA
ACCCAACAAAACAACACCAATAAAAACAAGAAAAAGAACCACAACTAAGCTTCAAGCACA
AGCGAGAATCTCATCCGTTCAGTTAAGCGAGCTAAGAAACTCGACCCAAATGTGTTCAGC
TCTCTTGGTCGTCTCAAGAGCGAACTCCTCAGCAGCTTGCTCGTCCTTCGCCTTACGCAC
AGCCAGATGATACTCTTCATAAGCCTGAGAAGCCTCCTTAAGAAGCCTTGCTACATTACT
CTCCGTCGACTTAAACTTCAGACCAACACTCACTTTCTCCGCTTCAAGCTTAACCAACAG
TTTCTTGATGGCGAAGATTTTGATGGACAAGGCGTCTCCTCCCTGAGCAAGACTCTTGGC
GAGCGCGAACTCCGCGTCCACGGCTCTCTGCTTCTCCATGGCGGTTTCTTTGAGAAGTTT
GGCTCGAGTTCGAGCGAGGTGGACTCTATGAGAAGCCTCGAGTCCTTCTTTGATGACGGT
TTTGTATTTGGCTAGTAACGAGATGTAACCAATGGAAGCCGAGCTGAGTACCTCGTAACG
TGTACCGGCTTCTATAATCTCGTCGAAGTTTGGATGGTGTACTAGGTCACGGGCGGTTAG
ACCGCGTAGCTTCTTTAGGGTTTGCTTTAA

QA 4 693 4 693
DS 

RD RS1CV88JQ 784 0 0
AAAAAAAAAGGGTTTATTAGAGGAATAATACATTATTTGTGTTCAACCTCTTTCTCCCGG
TATAACCCAACAAAACAACACCAATAAAAACAAGAAAAAGAACCACAACTAAGCTTCAAG
CACAAGCGAGAATCTCATCCGTTCAGTTAAGCGAGCTAAGAAACTCAACCCAAATGTGTT
CAGCTCTCTTGGTCGTCTCAAGAGCGAACTCCTCAGCAGCTTGCTCGTCCTTCGCCTTAC
GCACAGCCACATGATACTCTTCATAAGCCTGAGAAGCCTCCTTAAGAAGCCTTGCTACAT
TACTCTCCGTCGACTTAAACTTCAGACCAACACTCACTTTCTCCGCTTCAAGCTTAACCA
ACAGTTTCTTGATGGCGAAGATTTTGATGGACAAGGCGTCTCCTCCCTGAGCAAGACTCT
TGGCGAGCGCGAACTCCGCGTCCACGGCTCTCTGCTTCTCCATGGCGGTTTCTTTGAGAA
GTTTGGCTCGAGTTCGAGCGAGGTGGACTCTATGAGAAGCCTCGAGTCCTTCTTTGATGA
CGGTTTTGTATTTGGCTAGTAACGAGATGTAACCAATGGAAGCCGAGCTGAGTACCTCGT
AACGTGTACCGGCTTCTATAATCTCGTCGAAGTTTGGATGGTGTACTAGGTCACGGGCGG
TTAGACCGCGTAGCTTCTTTAGGGTTTGCTTTAAGCTCTCTATGCTCTCTGATGTAGCTG
ATGATTCGCTTGCGGTGGAAGTAACTGATGATAAGCCAAGAACTGTGCTTACCTTTGAGG
TTTT

QA 1 784 1 784
DS 



AS 2 8

CO CL667Contig1 734 5 3 U
GGGGAATCATCAACAACCCCTTGAGATTTCCGAAGATCACCAATCAAAAACCCTAAGAAA
GAAGCAGCAGAGTGCAGTTCAAGATGGCTTCTTCGAAAAGAATCAACAAGGAGCTTAGGG
ACCTCCAAAGGGATCCTCCTGTCTCATGCAGTGCTGGTCCTGTGGGTGATGATATGTTCC
ACTGGCAAGCGACTATAATGGGTCCAACTGATAGCCCATTCTCTGGTGGTGTGTTTCTTG
TTTCCATTCACTTCCCACCAGATTACCCCTTCAAGCCACCCAAGGTTTCTTTCCGCACCA
AAGTTTACCACCCGAATATCAACAGTAACGGCAGCATCTGTCTTGACATTCTGAAAGAGC
AGTGGAGCCCTGCACTTACCATATCCAAGGTTCTTCTGTCGATATGCTCACTGCTTACAG
ATCCAAACCCTGATGATCCTCTGGTTCCAGAAATAGCTCATACCTACAAGACAGACCGAG
TCAAGTACGAGAGCACTGCCCGATCCTGGACCCAGAAGTATGCAATGGGATGATGATGAT
TGGCAATAATAATCTGCACCACCAATACATTGCGCATTGTCTTAAGAATAAGATTGAGAA
AAAA*CAGAGTGTGGTGTTTGCTTGGTTGCTTTATTAGTTTTATACATCTCAAGCCAGTG
TGTTGGTTGACGTACTGTACATGAGCTTTATATTGAGACATTTTGAGAGCTTGCAATGCT
TTAACCAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CH31TF U 1
AF RS1BV05TF U 2
AF RS1CW11TF U 4
AF RS1BV05JQ C 92
AF RS1CW11JQ C 565
BS 1 720 RS1CH31TF
BS 721 724 RS1BV05TF
BS 725 734 RS1CW11TF

RD RS1CH31TF 720 0 0
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GAAGCAGCAGAGTGCAGTTCAAGATGGCTTCTTCGAAAAGAATCAACAAGGAGCTTAGGG
ACCTCCAAAGGGATCCTCCTGTCTCATGCAGTGCTGGTCCTGTGGGTGATGATATGTTCC
ACTGGCAAGCGACTATAATGGGTCCAACTGATAGCCCATTCTCTGGTGGTGTGTTTCTTG
TTTCCATTCACTTCCCACCAGATTACCCCTTCAAGCCACCCAAGGTTTCTTTCCGCACCA
AAGTTTACCACCCGAATATCAACAGTAACGGCAGCATCTGTCTTGACATTCTGAAAGAGC
AGTGGAGCCCTGCACTTACCATATCCAAGGTTCTTCTGTCGATATGCTCACTGCTTACAG
ATCCAAACCCTGATGATCCTCTGGTTCCAGAAATAGCTCATACCTACAAGACAGACCGAG
TCAAGTACGAGAGCACTGCCCGATCCTGGACCCAGAAGTATGCAATGGGATGATGATGAT
TGGCAATAATAATCTGCACCACCAATACATTGCGCATTGTCTTAAGAATAAGATTGAGAA
AAAA*CAGAGTGTGGTGTTTGCTTGGTTGCTTTATTAGTTTTATACATCTCAAGCCAGTG
TGTTGGTTGACGTACTGTACATGAGCTTTATATTGAGACATTTTGAGAGCTTGCAATGCT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RS1BV05TF 728 0 0
GGGA
ATCATCAACAACCCCTTGAGATTTCCGAAGATCACCAATCAAAAACCCTAAGAAAGAAGC
AGCAGAGCGCAGTTCAAGATGGCTTCTTCGAAAAGAATCAACAAGGAGCTTAGGGACCTC
CAAAGGGATCCTCCTGTCTCATGCAGTGCTGGTCCTGTGGGTGATGATATGTTCCACTGG
CAAGCGACTATAATGGGTCCAACTGATAGCCCATTCTCTGGTGGTGTGTTTCTTGTTTCC
ATTCACTTCCCACCAGATTACCCCTTCAAGCCACCCAAGGTTTCTTTCCGCACCAAAGTT
TACCACCCGAATATCAACAGTAACGGCAGCATCTGTCTTGACATTCTGAAAGAGCAGTGG
AGCCCTGCACTTACCATATCCAAGGTTCTTCTGTCGATATGCTCACTGCTTACAGATCCA
AACCCTGATGATCCTCTGGTTCCAGAAATAGCTCATACCTACAAGACAGACCGAGTCAAG
TACGAGAGCACTGCCCGATCCTGGACCCAGAAGTATGCAATGGGATGATGATGATTGGCA
ATAATAATCTGCACCACCAATACATTGCGCATTGTCTTAAGAATAAGATTGAGAAAAAA*
CAGAGTGTGGTGTTTGCTTGGTTGCTTTATTAGTTTTATACATCTCAAGCCAGTGTGTTG
GCTGACGTACTGTACATGAGCTTTATATTGAGACATTC*GAGAGCTTGCAATGCTTTAA
CAAAA

QA 5 723 5 723
DS 

RD RS1CW11TF 731 0 0
GG
ATCATCAACAACCCCTTGAGATTTCCGAAGATCACCAATCAAAAACCCTAAGAAAGAAGC
AGCAGAGTGCAGTTCAAGATGGCTTCTTCGAAAAGAATCAACAAGGAGCTTAGGGACCTC
CAAAGGGATCCTCCTGTCTCATGCAGTGCTGGTCCTGTGGGTGATGATATGTTCCACTGG
CAAGCGACTATAATGGGTCCAACTGATAGCCCATTCTCTGGTGGTGTGTTTCTTGTTTCC
ATTCACTTCCCACCAGATTACCCCTTCAAGCCACCCAAGGTTTCTTTCCGCACCAAAGTT
TACCACCCGAATATCAACAGTAACGGCAGCATCTGTCTTGACATTCTGAAAGAGCAGTGG
AGCCCTGCACTTACCATATCCAAGGTTCTTCTGTCGATATGCTCACTGCTTACAGATCCA
AACCCTGATGATCCTCTGGTTCCAGAAATAGCTCATACCTACAAGACAGACCGAGTCAAG
TACGAGAGCACTGCCCGATCCTGGACCCAGAAGTATGCAATGGGATGATGATGATTGGCA
ATAATAATCTGCACCACCAATACATTGCGCATTGTCTTAAGAATAAGATTGAGAAAAAA*
CAGAGTGTGGTGTTTGCTTGGTTGCTTTATTAGTTTTATACATCTCAAGCCAGTGTGTTG
GTTGACGTACTGTACATGAGCTTTATATTGAGACATTTTGAGAGCTTGCAATGCTTTAAC
CAAAAAAAA

QA 3 731 3 731
DS 

RD RS1BV05JQ 632 0 0
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TGCTGGTCCTGTGGGTGATGATATGTTCCACTGGCAAGCGACTATAATGGGTCCAACTGA
TAGCCCATTTTCTGGTGGTGTGTTTCTTGTTTCCATTCACTTCCCACCAGATTACCCCTT
CAAGCCACCCAAGGTTTCTTTCCGCACCAAAGTTTACCACCCGAATATCAACAGTAACGG
CAGCATCTGTCTTGACATTTTGAAAGAGCAGTGGAGCCCTGCACTTACCATATCCAAGGT
TCTTCTGTCGATATGCTCACTGCTTACAGATCCAAACCCTGATGATCCTCTGGTTCCAGA
AATAGCTCATACCTACAAGACAGACCGAGTCAAGTACGAGAGCACTGCCCGATCCTGGAC
CCAGAAGTATGCAATGGGATGATGATGATTGGCAATAATAATTTGCACCACCAATACATT
GCGCATTGTTTTAAGAATAAGATTGAGAAAAAAACAGAGTGTGGTGTTTGCTTGGTTGCT
TTATTAGTTTTATACATCTCAAGCCAGTGTGTTGGCTGACGTACTGTACATGAGCTTTAT
ATTGAGACATTTCGAGAGCTTGCAATGCTTTA

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1CW11JQ 159 0 0
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GGTTGCTTTATTAGTTTTATACATCTCAAGCCAGTGTGTTGGTTGACGTACTGTACATGA
GCTTTATATTGAGACATTTTGAGAGCTTGCAATGCTTTA

QA 1 159 1 159
DS 



CO CL667Contig2 753 3 12 U
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CAGCAGAGTGCAGTTCGAGATGGCTTCTTCGAAAAGAATCAACAAGGAGCTTAGGGACCT
CCAAAGGGATCCTCCTGTCTCATGCAGTGCTGGTCCTGTGGGTGATGATATGTTCCACTG
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CATTCACTTCCCACCTGATTACCCCTTCAAGCCACCCAAGGTTTCTTTCCGCACCAAGGT
TTACCACCCTAATATCAACAGTAACGGCAGCATCTGTCTTGACATTCTGAAAGAGCAGTG
GAGCCCTGCACTTACCATATCCAAGGTTCTTCTGTCGATATGCTCACTGCTGACAGATCC
AAACCCTGATGATCCTCTGGTTCCAGAAATAGCTCATACCTACAAGACAGACCGAGTCAA
GTACGAGAGCACTGCCCGATCCTGGACCCAGAAGTATGCAATGGGATGATGATGATTGGC
AATAATAATCTGCACCACCAATCCATTGCGCATTGTCTTAAGAATAAGAAAAAAAAAAAA
AACAGAGTGTGGCGTTTGCTTGGTTGCTTTATTAGTTTTATACATCTCAAGCCAGTGTGT
TGGTTGGCGTACTGTACATGAGGCTTTATATTGAGACATTTTGAGAGCTTGCAATGCTTT
AAAACCCAATAATTGTCTATTACGTTTATGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1E266TF U 1
AF RS1CA94TF U 171
AF RS1CA94JQ C 184
BS 1 402 RS1E266TF
BS 403 403 RS1CA94TF
BS 404 550 RS1E266TF
BS 551 551 RS1CA94TF
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BS 590 592 RS1CA94TF
BS 593 682 RS1E266TF
BS 683 683 RS1CA94TF
BS 684 723 RS1E266TF
BS 724 724 RS1CA94TF
BS 725 742 RS1E266TF
BS 743 753 RS1CA94TF

RD RS1E266TF 742 0 0
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CAGCAGAGTGCAGTTCGAGATGGCTTCTTCGAAAAGAATCAACAAGGAGCTTAGGGACCT
CCAAAGGGATCCTCCTGTCTCATGCAGTGCTGGTCCTGTGGGTGATGATATGTTCCACTG
GCAAGCGACTATAATGGGTCCAACTGATAGCCCATTCTCTGGAGGTGTTTTTCTTGTCTC
CATTCACTTCCCACCTGATTACCCCTTCAAGCCACCCAAGGTTTCTTTCCGCACCAAGGT
TTACCACCCTAATATCAACAGTAACGGCAGCATCTGTCTTGACATTCTGAAAGAGCAGTG
GAGCCCTGCACTTACCATATCCAAGGTTCTTCTGTCGATATGTTCACTGCTGACAGATCC
AAACCCTGATGATCCTCTGGTTCCAGAAATAGCTCATACCTACAAGACAGACCGAGTCAA
GTACGAGAGCACTGCCCGATCCTGGACCCAGAAGTATGCAATGGGATGATGATGATTGGC
AATAATAATCCGCACCACCAATCCATTGCGCATTGTCTTAAGAATAAGATTGAAAAAAAA
AACAGAGTGTGGCGTTTGCTTGGTTGCTTTATTAGTTTTATACATCTCAAGCCAGTGTGT
TGGTTGGCGTACTGTACATGAG*CTTTATATTGAGACATTTTGAGAGCTTGCAATGCTTT
AAA*CCCAATAATTGTCTATTA

QA 1 742 1 742
DS 

RD RS1CA94TF 583 0 0
G
GTTCCACTGGCAAGCGACTATAATGGGTCCAACTGATAGCCCATTCTCTGGAGGTGTTTT
TCTTGTCTCCATTCACTTCCCACCTGATTACCCCTTCAAGCCACCCAAGGTTTCTTTCCG
CACCAAGGTTTACCACCCTAATATCAACAGTAACGGCAGCATCTGTCTTGACATTCTGAA
AGAGCAGTGGAGCCCTGCACTTACCATATCCAAGGTTCTTCTGTCGATATGCTCACTGCT
GACAGATCCAAACCCTGATGATCCTCTGGTTCCAGAAATAGCTCATACCTACAAGACAGA
CCGAGTCAAGTACGAGAGCACTGCCCGATCCTGGACCCAGAAGTATGCAATGGGATGATG
ATGATTGGCAATAATAATCTGCACCACCAATCCATTGCGCATTGTCTTAAGAATAAGAAA
AAAAAAAAAAACAGAGTGTGGCGTTTGCTTGGTTGCTTTATTAGTTTTATACATCTCAAG
CCAGTGTGTTGGTTGGCGTACTGTACATGAGGCTTTATATTGAGACATTTTGAGAGCTTG
CAATGCTTTAAAACCCAATAATTGTCTATTACGTTTATGACG

QA 2 583 2 583
DS 

RD RS1CA94JQ 570 0 0
AGCGACTATAATGGGTCCAACTGATAGCCCATTTTTTGGAGGTGTTTTTTTTGTTTCCAT
TCACTTCCCACCTGATTACCCCTTCAAGCCACCCAAGGTTTTTTTCCGCACCAAGGTTTA
CCACCCTAATATCAACAGTAACGGCAGCATCTGTCTTGACATTTTGAAAGAGCAGTGGAG
CCCTGCACTTACCATATCCAAGGTTTTTCTGTCGATATGCTCACTGCTGACAGATCCAAA
CCCTGATGATCCTTTGGTTCCAGAAATAGCTCATACCTACAAGACAGACCGAGTCAAGTA
CGAGAGCACTGCCCGATCCTGGACCCAGAAGTATGCAATGGGATGATGATGATTGGCAAT
AATAATTTGCACCACCAATCCATTGCGCATTGTTTTAAGAATAAGAAAAAAAAAAAAAAC
AGAGTGTGGCGTTTGCTTGGTTGCTTTATTAGTTTTATACATCTCAAGCCAGTGTGTTGG
TTGGCGTACTGTACATGAGGCTTTATATTGAGACATTTTGAGAGCTTGCAATGCTTTAAA
ACCCAATAATTGTCTATTACGTTTATGACG

QA 1 570 1 570
DS 



AS 2 8

CO CL668Contig1 776 6 9 U
CGTGTCTATGTTTTTTTAAAAAGAGAGAAGAAATTCAAAGCTTCAAAGTTACTTACAAAA
TATCGGACAACTCAAAACCAACTCATATCAACATTTTATACAAATATGTTTTGCTTCATA
TCCACTTTTTCTGTAGCCATAAAAAGAAATGGATCTGAGTATGCTAAAGAAGCCTTACTT
ATCACCGTTGATCCCGAAGATGCGTACCTTGTGCATGTTAGGGAACTTGGCCACAACTAG
AACCATCACAGCGAGTGTGTTGAGGAATAGCCATGGATGTCTGTAATCTGTTGTATGTGA
TGCTATCAAGTACAGGACGACAGGAACAACGGTAAGGAACTTGCGGTTGCGGGTAAGTTG
CTGACCATTGTCCATCTGTTCCCACCAGGTGAGAGCATTGTAGACACCTTGGTCGTCTGC
AAAAGGAGTTCCTTTCATCCAGTGAAAGGAGTGATACGTTACAACGAAGTGAGCGAGATT
AACAACAGTCCAAGCCATTCCAGGGGAACAGCCAGAGAGGGAGAGAACAACGAGCCACCC
GAAGAAGAGGATTAGTATATAAGTCGTCCACACCCCTGGATACATGAACCACTCCGTGTT
CCTGTTCATGTCCGGCGGTGGTGCCGCTTTCACATACAGATTCGCCATCCTTCCGTTCCG
ATCTTATTCTCTTCTCCCTTTCTTTATCTTCTTCTTCTTCTACTTTCGCCTGATTCGCAA
AACTCTCTCTTTTGGGGGGAAGAAGGAAGGGAGGATTCTCCAGATTTCTGGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EZ69JQ U 1
AF RS1GF48JQ U 18
AF RS1EZ69TF C 12
AF RS1C382JQ U 51
AF RS1C382TF C 51
AF RS1GF48TF C 211
BS 1 29 RS1EZ69JQ
BS 30 30 RS1GF48JQ
BS 31 243 RS1EZ69JQ
BS 244 370 RS1GF48JQ
BS 371 371 RS1C382JQ
BS 372 695 RS1GF48JQ
BS 696 745 RS1C382JQ
BS 746 746 RS1C382TF
BS 747 776 RS1C382JQ

RD RS1EZ69JQ 243 0 0
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TCCACTTTTTCTGTAGCCATAAAAAGAAATGGATCTGAGTATGCTAAAGAAGCCTTACTT
ATCACCGTTGATCCCGAAGATGCGTACCTTGTGCATGTTAGGGAACTTGGCCACAACTAG
AAC

QA 1 243 1 243
DS 

RD RS1GF48JQ 678 0 0
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CCAACTCATATCAACATTTTATACAAATATGTTTTGCTTCATATCCACTTTTTCTGTAGC
CATAAAAAGAAATGGATCTGAGTATGCTAAAGAAGCCTTACTTATCACCGTTGATCCCGA
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TCCAGTGAAAGGAGTGATACGTTACAACGAAGTGAGCGAGATTAACAACAGTCCAAGCCA
TTCCAGGGGAACAGCCAGAGAGGGAGAGAACAACGAGCCACCCGAAGAAGAGGATTAGTA
TATAAGTCGTCCACACCCCTGGATACATGAACCACTCCGTGTTCCTGTTCATGTCCGGCG
GTGGTGCCGCTTTCACATACAGATTCGCCATCCTTCCGTTCCGATCTTATTCTCTTCTCC
CTTTCTTTATCTTCTTCT

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1EZ69TF 738 0 0
TTTTTT
AAAAAGAGAGAAGAAATTCAAAGCTTCAAAGTTACTTACAAAATATCGGACAACTCAAAA
CCAACTCATATCAACATTTTATACAAATATGTTTTGCTTCATATCCACTTTTTCTGTAGC
CATAAAAAGAAATGGATCTGAGTATGCTAAAGAAGCCTTACTTATCACCGTTGATCCCGA
AGATGCGTACCTTGTGCATGTTAGGGAACTTGGCCACAACTAGAACCATCACAGCGAGTG
TGTTGAGGAATAGCCATGGATGTCTGTAATCTGTTGTATGTGA*GCTATCAAGTACAGGA
CGACAGGAACAACGGTAAGGAACTTGCGGTTGCGGGTAAGTTGCTGACCATTGTCCATCT
GTTCCCACCAGGTGAGAGCATTGTAGACACCTTGGTCGTCTGCAAAAGGAGTTCCTTTCA
TCCAGTGAAAGGAGTGATACGTTACAACGAAGTGAGCGAGATTAACAACAGTCCAAGCCA
TTCCAGGGGAACAGCCAGAGAGGGAGAGAACAACGAGCCACCCGAAGAAGAGGATTAGTA
TATAAGTCGTCCACACCCCTGGATACATGAACCACTCCGTGTTCCTGTTCATGTCCGGCG
GTGGTGCCGCTTTCACATACAGATTCGCCATCCTTCCGTTCCGATCTTATTCTCTTCTCC
CTTTCTTTATCTTCTTCTTCTTCTACTTTCGCCTGATTCGCAAAACTCTCTCTTTTGGGG
GGAAGAAG
GACC

QA 7 734 7 734
DS 

RD RS1C382JQ 726 0 0
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TTGCTTCATATCCACTTTTTCTGTAGCCATAAAAAGAAATGGATCTGAGTATGCTAAAGA
AGCCTTACTTATCACCGTTGATCCCGAAGATGCGTACCTTGTGCATGTTAGGGAACTTGG
CCACAACTAGAACCATCACAGCGAGTGTGTTGAGGAATAGCCATGGATGTCTGTAATCTG
TTGTATGTGATGCTATCAAGTACAGGACGACAGGAACAACGGTAAGGAACTTGCGGTTGC
GGGTAAGTTGCTGACCATTGTCCATCTGTTCCCACCAGGTGAGAGCATTGTAGACACCTT
GGTCGTCTGCAAAAGGAGTTCCTTTCATCCAGTGAAAGGAGTGATACGTTACAACGAAGT
GAGCGAGATTAACAACAGTCCAAGCCATTCCAGGGGAACAGCCAGAGAGGGAGAGAACAA
CGAACCACCCGAAGAAGAGGATTAGTATATAAGTCGTCCACACCCCTGGATACATGAACC
ACTCCGTGTTCCTGTTCATGTCCGGCGGTGGTGCCGCTTTCGCATACAGATTCGCCATCC
TTCCGTTCCGATCTTATTCTCTTCTCCCTTTCTTTATCTTCTTCTTCTTCTACTTTCGCC
TGATTCGCAAAACTCTCTCTTTTGGGGGGAAGAAG*AAGGGAGGATTCTCCAGATTTCTG
GTTTCC

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DS 

RD RS1C382TF 726 0 0
ACTTACAAAATATCGGACAACTCAAAACCAACTCATATCAACATTTTATACAAATATGTT
TTGCTTCATATCCACTTTT*CTGTAGCCATAAAAAGAAATGGATCTGAGTATGCTAAAGA
AGCCTTACTTATCACCGTTGATCCCGAAGATGCGTACCTTGTGCATGTTAGGGAACTTGG
CCACAACTAGAACCATCACAGCGAGTGTGTTGAGGAATAGCCATGGATGTCTGTAATCTG
TTGTATGTGATGCTATCAAGTACAGGACGACAGGAACAACGGTAAGGAACTTGCGGTTGC
GGGTAAGTTGCTGACCATTGTCCATCTGTTCCCACCAGGTGAGAGCATTGTAGACACCTT
GGTCGTCTGCAAAAGGAGTTCCTTTCATCCAGTGAAAGGAGTGATACGTTACAACGAAGT
GAGCGAGATTAACAACAGTCCAAGCCATTCCAGGGGAACAGCCAGAGAGGGAGAGAACAA
CGAACCACCCGAAGAAGAGGATTAGTATATAAGTCGTCCACACCCCTGGATACATGAACC
ACTCCGTGTTCCTGTTCATGTCCGGCGGTGGTGCCGCTTTCGCATACAGATTCGCCATCC
TTCCGTTCCGATCTTATTCTCTTCTCCCTTTCTTTATCTTCTTCTTCTTCTACTTTCGCC
TGATTCGCAAAACTCTCTCTTTTGGGGGGAAGAAGGAAGGGAGGATTCTCCAGATTTCTG
GTTTCC

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GCCAGAGAGGGAGAGAACAACGAGCCACCCGAAGAAGAGGATTAGTATATAAGTCGTCCA
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CACATACAGATTCGCCATCCTTCCGTTCCGATCTTATTCTCTTCTCCCTTTCTTTATCTT
CTTCTTCTTCTACTTTCGCCTGATTCGCAAAACTCTCTCTTTTGGGGGGAAGAAGGAAGG
GAGGATTCTCCAGATTTC

QA 1 558 1 558
DS 



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ATCGGATCGGGATAGATGGCGAATCTGTATGTGAAAGCGGCACCACCGCCGGACATGAAC
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GTTCTAGTTGTGGCCAAGTTCCCTAACATGCACAAAGTACGCATCTTCGGGATCAACGGT
GATAAGTAAAGCTTCTTTACCAAACCTCAGATCCATATCCATTTCTTTTATGGCAACAGA
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ATAGACACGAAATTGATAATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GL65TF U 1
AF RS1GL65JQ C 176
BS 1 620 RS1GL65TF
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BS 700 709 RS1GL65TF
BS 710 743 RS1GL65JQ

RD RS1GL65TF 709 0 0
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ATCGGATCGGGATAGATGGCGAATCTGTATGTGAAAGCGGCACCACCGCCGGACATGAAC
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GTTCTAGTTGTGGCCAAGTTCCCTAACATGCACAAAGTACGCATCTTCGGGATCAACGGT
GATAAGTAAAGCTTCTTTACCAAACCTCAGATCCATATCCATTTCTTTTATGGCAACAGA
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TGTCG*ATATTT*GTAAGTAACTTTGAAGCTTTGAATT*CTTCTCTCTT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1GL65JQ 568 0 0
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CTGTTGTTAATCTCGCTCACTTCGTTGTAACGTATCACTCCTTTCACTGGATGAAAGGAA
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TGATGGTTCTAGTTGTGGCCAAGTTCCCTAACATGCACAAGGTACGCATCTTCGGGATCA
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TGAGTTGTCGGATATTTTGTAAGTAACTTTGAAGCTTTGAATTTCTTCTCTCTTTTTAAA
AAAACATAGACACGAAATTGATAATTTC

QA 1 568 1 568
DS 



AS 2 7

CO CL669Contig1 1027 3 4 U
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TTTTAAGAACAAATTTTCAGAAAACCTTTATGAATCAAATCATATTTGTTCTGAAAACCT
TTATGAATCAAAAATCATACGGGGACAGTAAATAGATATAGCTTCAGCACAACCGCAAGC
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ATGACCCATCTGAAGATCTCCACTGGCACCACCGACAGGCACAATGCAGGGATGAAGATG
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TTGAGAACAACATACAACGCGAGAGGAACAAGCGTGACATATCCATAGAACACTCCTACG
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TACGTGACAAACGTGCCGATAGATGCCGCCACGAATATCAAAGTCGTGCATATCCAAAAA
GGACCATACAAGTCAGGCTTATCAGCAGTCTTCTCAGTAAACGTTCCACGAAACGGGAAG
AGAGACTCTTTGAGTCTGTCCACAACATCCGAAGTGTCGACATCGAAGAACGGCTTGTAA
GCACCAACAGTGAATTTATGGAGCCAGCCACCAGTCTGAGGTTCATCTCTACTACTACTA
CTACCGTTACCAGGTCCAGAAAATGTATCGTCAGCATCACGAGGGGGATTACTACCACCA
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ACGGTGGTGTGGCCTGGATCTGGAACAGAAGGTACAGATCCAGAGACTTTCTGGCTGTCG
ATAGTCGTGTAGTTCCCGCCGGTCATCATCTTGCTCTCCTCCTCCTTCCTTCTCGATCTC
ACGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AL70JQ U 79
AF RS1DW94JQ U 1
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T
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DS 

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CCCAGCTGCAAAAGAAATATACTTGCGATTATCAGGATTGATCTCTCTCCAGCTGAATTG
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ATGACCCATCTGAAGATCTCCACTGGCACCACCGACAGGCACAATGCAGGGATGAAGATG
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TTGAGAACAACATACAACGCGAGAGGAACAAGCGTGACATATCCATAGAACACTCCTACG
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TACGTGACAAACGTGCCGATAGATGCCGCCACGAATATCAAAGTCGTGCATATCCAAAAA
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DS 

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GAACAGGGAATAGC*GTAGAGGCAGAAGAGCTGGACAAGCCCTGAAGGCGCAGAAAAGTA
CTTGAGAACAACATACAACGCGAGAGGAACAAGCGTGACATATCCATAGAACACTCCTAC
GGACCAAGTCACAAGATTGATATCGTAGTTCCATTCCTGTTTCTTCCATTTGTGTGCCAC
GTACGTGACAAACGTGCCGATAGATGCCGCCACGAATATCAAAGTCGTGCATATCCAAAA
AGGACCATACAAGTCAGGCTTATCAGCAGTCTTCTCAGTAAACGTTCCACGAAACGGGAA
GAGAGACTCTTTGAGTCTGTCCACAACATCCGAAGTGTCGACATCGAAGAACGGCTTGTA
AGCACCAACAGTGAATTTATGGAGCCAGCCACCAGTCTGAGGTTCATCTCTACTACTACT
ACTACCGTTACCAGGTCCAGAAAATGTATCGTCAGCATCACGAGGGGGATTACTACCACC
AGAGATCTTGCCCTGAGCAGCAGAAGGAGGAAAGGTTTGAAGATTTGATTCTGTGAATTT
GACGGTGGTGTGGCCTGGATCTGGAACAGAAGGTACAGATCCAGAGACTTTCTGGCTGTC
GATAGTCGTGTAGTTCCCGCCGGTCATCATCTTGCTCTCCTCCTCCTTCCTTCTCGATCT
CACGTTCC

QA 1 728 1 728
DS 



CO CL669Contig2 1016 4 30 U
GGGACGAACGTGAGATCGAGAAGGAAGGAGGAGGAGAGCAAGATGATGACCGGCGGGAAC
TACACGACTATCGACAGCCAGAAAGTCTCTGGATCTGTACCTTCTGTTCCAGATCCAGGC
CACACCACCGTCAAATTCGCAGAATCAAATCTTCAAACCTTTCCTCCTTCTGCTGCTCAG
GGGAAGATCTCTGGTGGTAGTAATCCCCCTCGTGACGCCGACGATACGTTTTCTGGACCT
GGTAACGGTAGTAGCAGTAG***AGATGAACCTCAGTCTGGTGGCTGGCTTCATAAATTC
ACTGTTGGTGCTTACAAGCCGTTCTTCGATGTGGACACTTCGGATGTTGTAGACAGACTC
AAAGAGTCTCTCTTCCCGTTCCGTGGAACGTTTACTGAGAAGACTGCTGATAAGCCTGAC
TTGTATGGTCCGTTTTGGATATGCACTACTTTGATATTCGTGGCGGCGTCTATCGGCACG
TTTGTCACGTACGTAGCGCACAAGTGGAAGAAACAAGAGTGGAACTACGATATCAATCTG
GTGACTTGGTCCGCAGGAGTGTTCTATGGCTATGTCACGCTTGTTCCTCTAGCGTTGTAT
GTCGTTCTCAAGTACTTCTCTGCGCCTTCAGGGCTTGTCCAGCTCTTCTGCCTCTACGGC
TATTCCCTGTTCATCTTCATCCCTGCATTGTGCCTCTCGGTGGTGCCAGTGG*AGATCTT
TAGATGGGTCATCGCGGGTGTGGCAGGGTTCATGTCTGCGACATTTGTAGCTCTGAACCT
CAAAGCGCATATCAATTCAGCTGGAGAGAGATCAATCCTGATAATCGCAAGTATATTTCT
TTTGCAGCTGGGGCTTGCGGTTGTGCTGAAGCTATATCTATTTACTGTCACCGTATGATT
TTTGATTCATAAAGGTTTTCAGAACAAATATGATTTGATTCATAAAGGTTTTCAGAAAAT
TTGTTCTTAAAACAAAAAGGTGATGTGTTTTATGATAATATACCTACAGATTCATC


BQ
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AF RS1AL70TF U 12
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AS 1 8

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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

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ACCCCTTCTTCTTCCTCCTCATCATCTCTCCGCCGTCTCTCCTCCCTTCCCGTCTCTACC
TTCCCTCGCCACTCTAACCGGAGGCTACAGATACTTTGCCAGGCCACAGCCGGAACTCAG
CCTCAGAGTCAGAGCAACCTCTCTGACTCTAACTCCAAACTAGCCGCCCGTTCTGGCCAA
GACCGTCTTTTGAAGGTACCGATATCGAAGATAAGGAACTTTAGTATAATAGCACATATT
GATCATGGGAAGTCGACGTTGGCGGATAAGTTGCTTCAGGTGACTGGTACTGTTCAGAAC
AGAGATATGAAGGAGCAGTTTCTTGATAACATGGATTTGGAACGTGAACGAGGCATCACC
ATCAAGCTCCAGGCAGCTCGAATGCGCTATGTTTATGAGGATACACCGTATTGCCTCAAC
TTGATTGATACTCCAGGCCATGTTGATTTCTCTTACGAGGTTTCTCGATCTCTTGCCGCA
TGTGAGGGTGCTCTTCTTGTTGTGGATGCATCCCAGGGTGTGGAAGCGCAAACACTGGCC
AACGTTTATTTGGCTCTAGAAAACAACCTCGAAATCATTCCTGTTGTGAATAAGATTGAC
CTTCCAGGCGCTGAGCCAGAGCAAGT
CTCAGGAGAT

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DS 

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ACCCCTTCTTCTTCCTCTTCATCATCTCTCCGCCGTCTCTCCTCCCTTCCCGTCTCTACC
TTCCCTCGCCACTCTAACCGGAGGCTACAGATACTTTGCCAGGCCACAGCCGGAACTCAG
CCTCAGAGTCAGAGCAACCTCTCTGACTCTAACTCCAAACTAGCCGCCCGTTCTGGCCAA
GACCGTCTTTTGAAGGTACCGATATCGAAGATAAGGAACTTTAGTATAATAGCACATATT
GATCATGGGAAGTCGACGTTGGCGGATAAGTTGCTTCAGGTGACTGGTACTGTTCAGAAC
AGAGATATGAAGGAGCAGTTTCTTGATAACATGGATTTGGAACGTGAACGAGGCATCACC
ATCAAGCTCCAGGCAGCTCGAATGCGCTATGTTTATGAGGATACACCGTATTGCCTCAAC
TTGATTGATACTCCAGGCCATGTTGATTTCTCTTACGAGGTTTCTCGATCTCTTGCCGCA
TGTGAGGGTGCTCTTCTTGTTGTGGATGCATCCCAGGGTGTGGAAGCGCAAACACTGGCC
AACGTTTATTTGGCTCTAGAAAACAACCTCGAAATCATTCCTGTTGTGAATAAGATTGAC
CTTCCAGGCGCTGAGCCAGAGCAAGTTCTCAGG
AGATTGAGAGGT

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DS 

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G
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GCTCTTCTTGTTGTGGATGCATCCCAGGGTGTGGAAGCGCAAACACTGGCCAACGTTTAT
TTGGCTCTAGAAAACAACCTCGAAATCATTCCTGTTGTGAATAAGATTGACCTTCCAGGC
GCTGAGCCAGAGCAAGTTCTCAGGGAGATTGAGGAGGTTATTGGGTTAGACTGTAGCAAA
GCAATACTCTGCTCGGCAAAGGAGGGAATTGGTATAACGGAGATATTGAATGCAATTGTT
GAAAGGATACCTCCACCTCCCGAAACTGCAGAAAAACCCTTCAGAGCCTTAATTTTTGAC
AGTTATTATGATCCATATCGTGGTGTCATTGTATACTTTCGAGTTATCGACGGGAAAGTG
AAGAAAGGCGACAGGAT*CTATTCATGGCAAGCGGAAAGGACTATTTCGCAGATGAAATA
GGCGTTCTATCTCCAAATCAAATTCAAGTGGATGAGTTATATGCTGGTGAGGTGGGATAC
ATTTCTGCTTCTATAAGATCAGTTGCAGATGCCAGGGTAGGAGATACAATAACAAATTTT
AGCAGAAAGGCAGAAAGCTCCTTACCCGGTTACGAGGAAGCTACCCCTATGGTGTTCTGT
GGCCTGTTCCCAGTTGACGCTGAC*AGTTTCCTGATCTTCGAGATGCGTTGGAAAA*CTG
CA*CTCA*TGATGCCGCTTTGAAGTT
GAGCTGAGAC

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DS 

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G
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ATTTTTGACAGTTATTATGATCCATATCGTGGTGTCATTGTATACTTTCGAGTTATCGAC
GGGAAAGTGAAGAAAGGCGACAGGATTCTATTCATGGCAAGCGGAAAGGACTATTTCGCA
GATGAAATAGGCGTTCTATCTCCAAATCAAATTCAAGTGGATGAGTTATATGCTGGTGAG
GTGGGATACATTTCTGCTTCTATAAGATCAGTTGCAGATGCCAGGGTAGGAGATACAATA
ACAAATTTAAGCAGAAAGGCAGAAAGCTCCTTACCCGGTTACGAGGAAGCTACCCCTATG
GTGTTCTGTGGCCTGTTCCCAGTTGACGCTGACCAGTTTCCTGATCTTCGAGATGCGTTG
GAAAAACTGCAACTCAATGATGCCGCTTTGAAGTTTGAGCCTGAGACTTCAAGTGCCATG
GGTTTTGGCTTTAGATGTGGTTTCTTGGGTCTTCTCCACATGGAAATTGTGCAGGAAAGG
CTAGAGAGAGAATACAACTTGAATCTCATTACCACTGCTCCAAGTGTTGTATATAAAGTG
CACACTGTAA*TGGTGATACTACTATGTGCTCAAACCCATCTCTCCTTCCACAACCTGG*
CTAAG*AAAGCAGTCGAAGAACCATACGTGAAGATTGAGTTGCTTACACCGAAAGACTAC
AT

QA 2 723 2 723
DS 

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TGTGGTTTCTTGGGTCT*CTCCACATGGAAATTGTGCAGGAAAGGCTAGAGAGAGAATAC
AACTTGAATCTCATTACCACTGCTCCAAGTGTTGTATATAAAGTGCACACTGTAAATGGT
GATACTACTATGTGCTCAAACCCATCTCTCCTTCCACAACCTGGGCTAAGGAAAGCAGTC
GAAGAACCATACGTGAAGATTGAGTTGCTTACACCGAAAGACTACATCGGTGCACTTATG
GAGCTCGCTCAAGATAGGAGAGGGGAGTTCAAAGAAATGAAGTATATAGCTGAGAACAGA
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AAGTCCAGGACCAAGGGATATGCTAGCATGGAATACTCAGTTATTGGGTACAGGGAGAGC
GATCTGATAAAACTAGATATTCTGATTAATGCTGAATTGGTGGAGCCTTTATCAACCATT
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ATTCCGAGACAAATGTTTAAAGTGCCCATCCAGGCTTGTATAGGATCAAAAGTGATTGCT
AGTGAAGCGCTCTCAGCAATCAGAAAGGATGTTTTGGCCAAATGTTACGGTGGAGATATT
TCTCGGAAGAAGAAGCTTCTTAAGAAACAGGCGGCAGGTAAGAATAGAATGAAAGCCATA
GGTAGAGTTGATGTACCTCAAGAAGCTTTCATGGCCGTCCTCAAACTTGAAAAGGAGGTT
TTGTAACACCACTCGATAAAAAGACCCATTACATTATATATTTCATTTGATCCCTTTTGT
AATAAACTATTTTCACACCTAATGCAATCTTTCTTGCTTTCCG

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DS 

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G
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AGACAAATGTTTAAAGTGCCCATCCAGGCTTGTATAGGATCAAAAGTGATTGCTAGTGAA
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GTTGATGCACCTCAAGAAGCTTTCATGGCCGTCCTCAAACTTGAAAAGGAGGCTTTGTAA
CACCACTCGATAAAAAGCCCCATTACATTATATATTTCATTTGATCCCTTTTGTAATAAA
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GGGATATGCTAGCATGGAATACTCAGTTATTGGGTACAGGGAGAGCGATCTGATAAAACT
AGATATTCTGATTAATGCTGAATTGGTGGAGCCTTTATCAACCATTGTACACAGAGACAA
GGCATATTCTGTTGGAAGAGCTTTGACTCAAAAACTCAAAGAGCTTATTCCGAGACAAAT
GTTTAAAGTGCCCATCCAGGCTTGTATAGGATCAAAAGTGATTGCTAGTGAAGCGCTCTC
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GCTTCTTAAGAAACAGGCGGCAGGTAAGAAGAGAATGAAAGCCATAGGTAGAGTTGATGT
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GATAAAAAGACCCATTACATTATATATTTCATTTGATCCCTTTTGTAATAAACTATTTTC
ACACCTAATGCAATCTTTCTTGCTTTCC

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DS 

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AGAGACAAGGCATATTCTGTTGGAAGAGCTTTGACTCAAAAACTCAAAGAGCTTATTCCG
AGACAAATGTTTAAAGTGCCCATCCAGGCTTGTATAGGATCAAAAGTGATTGCTAGTGAA
GCGCTCTCAGCAATCAGAAAGGATGTTTTGGCCAAATGTTACGGTGGAGATATTTCTCGG
AAGAAGAAGCTTCTTAAGAAACAGGCGGCAGGTAAGAAGAGAATGAAAGCCATATGTAGA
GTTGATGTACCTCAAGAAGCTTTCATGGCCGTCCTCAAACTTGAAAAGGAGGTTTTGTAA
CACCACTCGATAAAAAGACCCATTACATTATATATTTCATTTGATCCCTTTTGTAATAAA
CTATTTTCACACCTAA

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DS 



AS 1 7

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GAGAGAGAGAGAACGGAGAATACAATGGCGTCGAACTCGCTCATGAGCTGCGGCATCGCC
GCCGTCTACCCTTCCCTTCTTTCTTCTTCAAAGTCTAAATTCGCCTCCTCCGGATTTGCC
CTTCCCAACGCCGGGAACGTTGGCCGTATCAGAATGGCTGCTCACTGGATGCCCGGCGAG
CCGCGTCCTGCTTACCTCGACGGTTCTGCTCCTGGTGACTTTGGGTTTGACCCTCTTGGA
CTTGGAGAGGTTCCAGAGAATCTTGAGAGATACAAAGAATCAGAGCTCATCCACTGTAGA
TGGGCTATGCTTGCTGTTCCAGGGATTTTGGTACCAGAGGCTTTGGGATACGGAAACTGG
GTCAAGGCTCAAGAGTGGGCAGCAGTACCTGGAGGACAAGCCACTTACTTGGGCAACCCG
GTCCCATGGGGTACTCTGCCCACAATCTTGGCTATAGAGTTCTTAGCTATTGCCTTTGTT
GAGCACCAGAGGAGCATGGAGAAAGACCCTGAGAAAAAGAAATACCCTGGAGGTGCATTT
GACCCTCTTGGATACTCCAAAGACCCCAAGAAGTTTGAGGAGTTGAAAGTTAAGGAGATC
AAGAACGGGAGGCTTGCGTTGTTGGCCTTTGTAGGCTTCTGTGTGCAGCAATCGGCTTAC
CCAGGGACAGGACCATTGGAGAACTTGGCTACTCACTTGGCGGATCCATGGCACAAAAAC
ATTGGCGATATTGTTATCCCTCTGAACTAGTGACTTGTAAAAAAAATGGTAGTAATGTGT
CCTATGAGCTGCATGTGTATCAAAACTCCCTGTAATGAAAAGACAGATTGTGAAACCTAT
GATGTTTTGTCTTGGTGATCGACTGCTTCGTGTGAGCTTGAATTCTATGTGGTTTTACTA
TTTGTAATACCATATTCCTGATGTTTCATTGAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RS1DX88TF U 22
AF RS1G964TF U 23
AF RS1EV10TF U 1
AF RS1EV10JQ C 280
AF RS1DU51TF U 83
AF RS1DX88JQ C 297
AF RS1G964JQ C 510
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BS 71 72 RS1G964TF
BS 73 201 RS1EV10TF
BS 202 202 RS1G964TF
BS 203 489 RS1EV10TF
BS 490 490 RS1G964TF
BS 491 553 RS1EV10TF
BS 554 554 RS1G964TF
BS 555 721 RS1EV10TF
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BS 793 868 RS1DX88JQ
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BS 971 991 RS1DX88JQ
BS 992 995 RS1G964JQ

RD RS1DX88TF 625 0 0
GG
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AATGGCGTCGAACTCGCTCATGAGCTGCGGCATCGCCGCCGTCTACCCTTCCCTTCTTTC
TTCTTCAAAGTCTAAATTCGCCTCCTCCGGATTTGCCCTTCCCAACGCCGGGAACGTTGG
CCGTATCAGAATGGCTGCTCACTGGATGCCCGGCGAGCCGCGTCCTGCTTACCTCGACGG
TTCTGCTCCTGGTGACTTTGGGTTTGACCCTCTTGGACTTGGAGAGGTTCCAGAGAATCT
TGAGAGATACAAAGAATCAGAGCTCATCCACTGTAGATGGGCTATGCTTGCTGTTCCAGG
GATTTTGGTACCAGAGGCTTTGGGATACGGAAACTGGGTCAAGGCTCAAGAGTGGGCAGC
AGTACCTGGAGGACAAGCCACTTACTTGGGCAACCCGGTCCCATGGGGTACTCTGCCCAC
AATCTTGGCTATAGAGTTCTTAGCTATTGCCTTTGTTGAGCACCAGAGGAGCATGGAGAA
AGACCCTGAGAAAAAGAAATACCCTGGAGGTGCATTTGACCCTCTTGGATACTCCAAAGA
CCCCAAGAAGTTTGAGGAGTTGA

QA 3 625 3 625
DS 

RD RS1G964TF 640 0 0
G
ATTCACATCTTTCTTCTTTGTAGTAAACAGAAAGGGAGAGAGAGAGAGAACGGAGAATAC
AATGGCGTCGAACTCGCTCATGAGCTGCGGCATCGCCGCCGTCTACCCTTCCCTTCTTTC
TTCTTCAAAGTCTAAATTCGCCTCCTCCGGATTTGCCCTTCCCAACGCCGGGAACGTTGG
CCGTATCAGAATGGCTGCTCACTGGATGCCCGGCGAGCCGCGTCCTGCTTACCTCGACGG
TTCTGCTCCTGGTGACTTTGGGTTTGACCCTCTTGGACTTGGAGAGGTTCCAGAGAATCT
TGAGAGATACAAAGAATCAGAGCTCATCCACTGTAGATGGGCTATGCTTGCTGTTCCAGG
GATTTTGGTACCAGAGGCTTTGGGATACGGAAACTGGGTCAAGGCTCAAGAGTGGGCAGC
AGTACCTGGAGGACAAGCCACTTACTTGGGCAACCCGGTCCCATGGGGTACTCTGCCCAC
AATCTTGGCTATAGAGTTCTTAGCTATTGCCTTTGTTGAGCACCAGAGGAGCATGGAGAA
AGACCCTGAGAAAAAGAAATACCCTGGAGGTGCATTTGACCCTCTTGGATACTCCAAAGA
CCCCAAGAAGTTTGAGGAGTTGAAAGTTAAGGAGATCAA

QA 2 640 2 640
DS 

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GAGAGAGAGA**ACGGAGAATACAATGGCGTCGAACTCGCTCATGAGCTGCGGCATCGCC
GCCGTCTACCCTTCCCTTCTTTCTTCTTCAAAGTCTAAATTCGCCTCCTCCGGATTTGCC
CTTCCCAACGCCGGGAACGTTTGCCGTATCAGAATGGCTGCTCACTGGATGCCCGGCGAG
CCGCGTCCTGCTTACCTCGACGGTTCTGCTCCTGGTGACTTTGGGTTTGACCCTCTTGGA
CTTGGAGAGGTTCCAGAGAATCTTGAGAGATACAAAGAATCAGAGCTCATCCACTGTAGA
TGGGCTATGCTTGCTGTTCCAGGGATTTTGGTACCAGAGGCTTTGGGATACGGAAACTGG
GTCAAGGCTCAAGAGTGGGCAGCAGTACCTGGAGGACAAGCCACTTACTTGGGCAACCCG
GTCCCATGGTGTACTCTGCCCACAATCTTGGCTATAGAGTTCTTAGCTATTGCCTTTGTT
GAGCACCAGAGGAACATGGAGAAAGACCCTGAGAAAAAGAAATACCCTGGAGGTGCATTT
GACCCTCTTGGATACTCCAAAGACCCCAAGAAGTTTGAGGAGTTGAAAGTTAAGGAGATC
AAGAACGGGAGGCTTGCGTTGTTGGCCTTTGTAGGCTTCTGTGTGCAGCAATCGGCTTAC
C*AGGGACAGGAC*ATTGGAGAACTTGGCTACTCACTTGGCG

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DS 

RD RS1EV10JQ 500 0 0
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TCAGAGCTCATCCACTGTAGATGGGCTATGCTTGCTGTTCCAGGGATTTTGGTACCAGAG
GCTTTGGGATACGGAAACTGGGTCAAGGCTCAAGAGTGGGCAGCAGTACCTGGAGGACAA
GCCACTTACTTGGGCAACCCGGTCCCATGGTGTACTCTGCCCACAATTTTGGCTATAGAG
TTTTTAGCTATTGCCTTTGTTGAGCACCAGAGGAACATGGAGAAAGACCCTGAGAAAAAG
AAATACCCTGGAGGTGCATTTGACCCTCTTGGATACTCCAAAGACCCCAAGAAGTTTGAG
GAGTTGAAAGTTAAGGAGATCAAGAACGGGAGGCTTGCGTTGTTGGCCTTTGTAGGCTTC
TGTGTGCAGCAATCGGCTTACCCAGGGACAGGACCATTGGAGAACTTGGCTACTCACTTG
GCGGATCCATGGCACAAAAA

QA 1 500 1 500
DS 

RD RS1DU51TF 710 0 0
G
AATGGCGTCGAACTCGCTCATGAGCTGCGGCATCGCCGCCGTATACCCTTCCCTTCTTTC
TTCTTCGAAGTCTAAATTCGTCTCCTCCGGATTTGCCCTCCCCAACGCCGGGAACGTTGG
CCGCATCAGAATGGCTGCTCACTGGATGCCCGGCGAGCCGCGTCCCGCTTACCTCGACGG
TTCTGCTCCAGGTGACTTTGGGTTTGACCCGCTTGGACTTGGAGAGGTTCCAGAGAATCT
TGAGAGATACAAAGAATCAGAGCTCATCCACTGTAGATGGGCTATGCTTGCTGTTCCAGG
GATTTTGGTACCAGAGGCTTTGGGATACGGAAACTGGGTCAAGGCTCAAGAATGGGCAGC
AGTGCCTGGAGGATAAGCCACTTACTTGGGAAACCCAGTCCCATGGGGTACTCTGCCCAC
AATCTTGGCTATAGAGTTCTTAGCTATTGCCTTTGTTGAGCACCAGAGGAGCATGGAGAA
AGACCCTGAGAAAAAGAAGTACCCTGGAGGTGCATTTGACCCTCTTGGATACTCCAG*GA
CCCTAAGAAGTTTGAGGAGTTGAAAGTTAAGGAGATCAAGAACGGGAGGCTTGCGTTGTT
GGCCTTTGTAGGCTTCTGTGTGCAGCAATCGGCTTACCCAGGGACAGGACCATTGGAGAA
CTTGGCTACTCACTTGGCTGATCCATGGCACAAAAC*ATTGGCGATATT

QA 2 710 2 710
DS 

RD RS1DX88JQ 695 0 0
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CTGGGTCAAGGCTCAAGAGTGGGCAGCAGTACCTGGAGGACAAGCCACTTACTTGGGCAA
CCCGGTCCCATGGGGTACTCTGCCCACAATCTTGGCTATAGAGTTCTTAGCTATTGCCTT
TGTTGAGCACCAGAGGAGCATGGAGAAAGACCCTGAGAAAAAGAAATACCCTGGAGGTGC
ATTTGACCCTCTTGGATACTCCAAAGACCCCAAGAAGTTTGAGGAGTTGAAAGTTAAGGA
GATCAAGAACGGGAGGCTTGCGTTGTTGGCCTTTGTAGGCTTCTGTGTGCAGCAATCGGC
TTACCCAGGGACAGGACCATTGGAGAACTTGGCTACTCACTTGGCGGATCCATGGCACAA
AAACATTGGCGATATTGTTATCCCTCTGAACTAGTGACTTGTAAAAAAAATGGTAGTAAT
GTGTCCTATGAGCTGCATGTGTATCAAAACTCTCTGTAATGAAAAGACAGATTGTGAAAC
CTATGATGTTTTGTCTTGGTGATCGACTGCTTCGTGTGAGCTTGAATTCTATGTGGTTTT
ACTATTTGTAATATCATATTCCTGATGTTTCATTG

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DS 

RD RS1G964JQ 486 0 0
GGCTATAGAGTTCTTAGCTATTGCCTTTGTTGAGCACCAGAGGAGCATGGAGAAAGACCC
TGAGAAAAAGAAATACCCTGGAGGTGCATTTGACCCTCTTGGATACTCCAAAGACCCCAA
GAAGTTTGAGGAGTTGAAAGTTAAGGAGATCAAGAACGGGAGGCTTGCGTTGTTGGCCTT
TGTAGGCTTCTGTGTGCAGCAATCGGCTTACCCAGGGACAGGACCATTGGAGAACTTGGC
TACTCACTTGGCGGATCCATGGCACAAAAACATTGGCGATATTGTTATCCCTTTGAACTA
GTGACTTGTAAAAAAAATGGTAGTAATGTGTCCTATGAGCTGCATGTGTATCAAAACTCC
CTGTAATGAAAAGACAGATTGTGAAACCTATGATGTTTTGTCTTGGTGATCGACTGCTTC
GTGTGAGCTTGAATTCTATGTGGTTTTACTATTTGTAATACCATATTCCTGATGTTTCAT
TGAAAC

QA 1 486 1 486
DS 



AS 1 8

CO CL672Contig1 858 8 13 U
GGACTTCAGACACACAACAATAAAGCAAGAACATTTAAACACATCATGGAGCCTAAAAAT
ACGATCTTTCTAGTTCTATTCCTGTCAACAACCATTCTCCAATCTTCATCCGCAATTCCA
AATCGTTCCGAACTAGACCGGTTCATCGTGACATCATGCCAAACCACCC*GATATCCACT
ACTATGCGTGCATACTCTCTCTGCTTACGCCACCATGATTCGACACAAAAACGACCAGGA
TCTTGCCCAAACCGCTCTCGCCATCAGCATGTCTCGAGCCAGATCCGTTGCTATATTCGT
CGCTAAACTAACCAAACAAACGCCAAGTTTCAAACGTAGAGAATATTTAGCAATCAAAGA
TTGCATTGAAGTGTTAGACAACAGCGTGGACCGGTTAGGCCAGTCGGTTAAAGAACTAGG
TCGAGCTGGTCATGCTGTGGCTAGTGAGGACTTCATGTGGAAAATGAGTAACGTTCAGAC
GTGGGTTAGTGCTGCATTGACGGACGAAACCACGTGTCTAGATGGATTCTCCGGTCGAGC
CATGGAAGGCAAAGTAAAGAGGCTGATTCGTTTAAAAGTGGTGCACGTGGCTCAAGTCAC
TAGCAATGCTCTTGCGTTGGTTAATCATTTTGCTGAGAAACGAAGTGTGAAGTTTCCCTA
AATGGAGTTGAGTTTTTCTTTTCCTTTAGTAATGACTAATGTGAAATTTTGGCTTGTATG
TAAAATAAAATCTCTGATCTTTAAAGACTGTAAAAAATGTTTTCTTTTTGTCGTTCGGAA
AGAAAACTAAATCTTTGGTTCTGTATAAATATTGTATCATAATCAAATCTACATATAAGT
TTTTTTTTATTTAGATAT


BQ
10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EZ19TF U 2
AF RS1B024TF U 1
AF RS1AI27TF U 1
AF RS1B024JQ C 99
AF RS1EG82JQ C 57
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AF RS1EG82TF U 2
AF RS1AI27JQ C 1
BS 1 1 RS1AI27JQ
BS 2 484 RS1EG82TF
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BS 758 785 RS1EG82TF
BS 786 858 RS1AI27JQ

RD RS1EZ19TF 782 0 0
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TGCATTGAAGTGTTAGACAACAGCGTGGACCGGTTAGGCCAGTCGGTTAAAGAACTAGGT
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TGGTTTAGTGCTGCATTGACGGACGAAACCACGTGTCTAGATGGATTCTCCGGTCGAGCC
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AAA*TAAAATCTCTGGTCTTTAA*GACTGTAAAAA*TGTTTTCTTTTTGTCGT
CGGAAGAAA

QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1B024TF 751 0 0
G
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CGATCTTTCTAGTTCTATTCCTGTCAACAACCATTCTCCAATCTTCATCCGCAATTCCAA
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CTATGCGTGCATACTCTCTCTGCTTACGCCACCATGATTCGACACAAAAACGACCAGGAT
CTTGCCCAAACCGCTCTCGCCATCAGCATGTCTCGAGCCAGATCCGTTGCTATATTCGTC
GCTAAACTAACCAAACAAACGCCAAGTTTCAAACGTAGAGAATATTTAGCAATCAAAGAT
TGCATTGAAGTGTTAGGCAACAGCGTGGACCGGTTAGGCCAGTCGGTTAAAGAACTAGGT
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TGGGTTAGTGCTGCATTGACGGACGAAACCACGTGTCTAGATGGATTCTCCGGTCGAGCC
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AAA*TAAAATCTCTGATCTTTAAAGACTGT

QA 2 751 2 751
DS 

RD RS1AI27TF 751 0 0
G
GACTTCAGACACACAACAATAAAGCAAGAACATTTAAACACATCATGGAGCCTAAAAATA
CGATCTTTCTAGTTCTATTCCTGTCAACAACCATTCTCCAATCTTCATCCGCAATTCCAA
ATCGTTCCGAACTAGACCGGTTCATCGTGACATCATGCCAAACCACCC*GATATCCACCA
CTATGCGTGCATACTCTCTCTGCTTACGCCACCATGATTCGACACAAAAACGACCAGGAT
CTTGCCCAAACCGCTCTCGCCATCAGCATGTCTCGAGCCAGATCCGTTGCTATATTCGTC
GCTAAACTAACCAAACAAACGCCAAGTTTCAAACGTAGAGAATATTTAGCAATCAAAGAT
TGCATTGAAGTATTAGGCAACAGCGTGGACCGGTTAGGCCAGTCGGTTAAAGAACTAGGT
CGAGCTGGTCATGCTGTGGCTAGTGAGGACTTCATGTGGAAAATGAGTAACGTTCAGACG
TGGGTTAGTGCTGCATTGACGGACGAAACCACGTGTCTAGATGGATTCTCCGGTCGAGCC
ATGGAAGGCAAAGTAAAGAGACTGATTCGTTTAAAAGTAGTTCACGTGGCTCAAGTCACT
AGCAATGCTCTTGCGTTGGTTAATCATTTTGCTGAGAAACGAAGTGTGAAGTTTCCCTAA
ATGGAGTTGAGTTTTTCTTTTCCTTTAGTAATGACTAATGTGAAATTTTGGCTTGTATGT
AAAATAAAATCTCTGATCTTTAAAGACTGT

QA 2 751 2 751
DS 

RD RS1B024JQ 722 0 0
CCAATCTTCATCCGCAATTCCAAATCGTTCCGAACTAGACCGGTTCATCGTGACATCATG
CCAAACCACCC*GATATCCACTACTATGCGTGCATACTCTCTCTGCTTACGCCACCATGA
TTCGACACAAAAACGACCAGGATCTTGCCCAAACCGCTCTCGCCATCAGCATGTCTCGAG
CCAGATCCGTTGCTATATTCGTCGCTAAACTAACCAAACAAACGCCAAGTTTCAAACGTA
GAGAATATTTAGCAATCAAAGATTGCATTGAAGTGTTAGGCAACAGCGTGGACCGGTTAG
GCCAGTCGGTTAAAGAACTAGGTCGAGCTGGTCATGCTGTGGCTAGTGAGGACTTCATGT
GGAAAATGAGTAACGTTCAGACGTGGGTTAGTGCTGCATTGACGGACGAAACCACGTGTC
TAGATGGATTCTCCGGTCGAGCCATGGAAGGCAAAGTAAAGAGGCTGATTCGTTTAAAAG
TGGTGCACGTGGCTCAAGTCACTAGCAATGCTCTTGCGTTGGTTAATCATTTTGCTGAGA
AACGAAGTGTGAAGTTTCCCTAAATGGAGTTGAGTTTTTCTTTTCCTTTAGTAATGACTA
ATGTGAAATTTTGGCTTGTATGTAAAATAAAATCTCTGATCTTTAAAGACTGTAAAAAAT
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A
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BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1EM85JQ U 158
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RD RS1EM85JQ 591 0 0
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ATAATTGAGACAGTAAAGCTTGTGATCCTTGTATATCATGCTAAAACAATC

QA 1 591 1 591
DS 

RD RS1CV74JQ 728 0 0
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CTTTCTATGCATCTACGTACGCTGATTTTGAAAACTTGCAAGGGAACATGTCCAGAAAA*
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CTAAAA
AA

QA 1 726 1 726
DS 

RD RS1GM39JQ 830 0 0
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TATGTGGTTGTTCAACCTTCTTTGTGTCGAGATTGAATATGAAGATATCATTTTCATCAT
ATGGATTTACTGAATCAGAACCATTAAAGTAGATCGAGTTTCTCTTGATTCCTTCAATGT
CCTTGGCAAGCACTGTGATGCCCAACTCCAGAAGAATCACCTCATCTCCCAAAGAAACAA
CTTCCACCCACTTGCTCCCCTTCGATGAACCCATCTTGTAGATTTTAAAGTTCCATATGT
AGGACATCTCCTTCCGCATGCTATTAACAATTAAGACATCCCCATCTACAGTGACTACCA
CATTATTCTTATAACAAGCCCAATAATAGCGTTTGCATGGGATGTTCCCAGGAATTCTAG
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GTTTCCACGAGTTATCTTCTTTCTTGATAGAAACCATATTTTCTTCATCT

QA 1 830 1 830
DS 

RD RS1GM20JQ 803 0 0
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TTGGCAAGCACTGTGATACCCAACTCCAGAAGAATCACCTCATCTCCCAAAGAAACAACT
TCCACCCACTTGCTCCCCTTCGATGAACCCATCTTGTAGATTTTAAAGCTCCATATGTAG
GACATCTCCTTCCGCATGCTATTAACAATTAAGACATCCCCATCTACAGTGACTACCACA
TTATTCTTATAACAAGCCCAATAATAGCGTTTGCATGGGATGTTCCCAGGAATTCTAGTG
GTTCCACCTACTACTCTTTCTATGCATCTACGTACGCTGATTTTGAAAACTTGCAAGGGA
ACATGTCCAGAAAAATCAAAAATGGTGAGTTTATAATAATTGAGACAGTAAAGCTTGTGA
TCCTTGTATATCATGCTAAAACAATCCTCGATAGATGACAATGACAGCTGGGTGATTGGT
TTCCGCGAGTTATCTTCTTTCTT

QA 1 803 1 803
DS 

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GACCTATCGCATGAGAT*TAGAGGAAGCTCGGACCAGCAATGGAGATTTCTTTTTGGTCC
TGATGGAGTGACTACAATAACAGAGACAACGTGAGAGGCCATCAGGCGGAATATGGGAGA
AAATAGTTTTTTTCGTTT
TCTATCTTTCTTCC

QA 1 138 1 138
DS 

RD RS1EM85TF 482 0 0
TGAGCCCATAACATGATTCAAAACTCGGTAGATTGATCCTCTCTCGTGTTAAAAGATCTA
AGATATAGGGATTATACAGACAAACCTCCTCAGTATAAGTTACCATCAAAAGCCAGCTTT
TATATGTCGCCACACAAGAACTCTCTCCAAAGTCGTTGCCGAGATCTTGAGTTTTGTAAA
ACTTGTCTTTTTCTTCAGGATTGAACAAGAGACCATAGTTCTCGTCCTTCGGGATTAGAA
ACAACCAAGGGACTTGATTGTTTGGCTTAGATAGTCTCGAAGCGGATCGCCATGACGGAC
AAACGGATTTAGCTCGCTGGAAATCAGCAAATCCAAGGCGCTCGAAGACCAATCGCATGA
GATCTAGAGGAAGCTCGGACCAGCAATGGAGATTTCTTTTTGGTCCTGATGGAGTGACTA
CAATAACAGAGACAACGTGAGAGGCCATCAGGCGGAATATGGGAGAAAATAGTTTTTTTC
CC

QA 1 480 1 480
DS 

RD RS1GM39TF 363 0 0
TTATATGTCGCCACACAAGA*CTCTCTCCAAAGTCGTTGCCGAGATCTTGAGTTTTGTAA
AATTTGTCTTTTTCTTCAGAATTGAACAAGAGACCATAGCTCTCGTCCTTCGGGATTAGA
AACAACCAAGGGACTTGATTGTTTGGCTTAGATAGTCTCGAAGCGGATCGCCATGACGGA
AAAACGGATTTAGCTCGCTGGAAATCAGCAAATCCAAGGCGCTCGAAGACCAATCGCATG
AGATCTAGAGGAAGCTCGGACCAGCAATGGAGATTTCTTTTTGGTCCTGATGGAGTGACT
ACAATAACAGAGACAACGTGAGAGGCCATCAGGCGGAATATGGGAGAAAATAGTTTTTTT
C
CC

QA 1 361 1 361
DS 

RD RS1CV74TF 705 0 0
AAATGGTGAGTTTATAATAATTGAGACAGTAAAGCTTGTGATC*TTGTATATCATGCTAA
AACAATCCTCGATAGATGACAATGACAGCTGGGTGATTGGTTTCCACGAGTTATCTTCTT
TCTTGATAGAAACCATATTTTCTTCATCTAACATCCCTATAACAAGGTAATCTTTGGTTT
TCTCGTCTATCCACAACACCGGAGAGATGAGCCCATAACATGATTCAAAACTCGGTAGAT
TGATCCTCTCTCGTGTTAAAAGATCTAAGATATAGGGATTATACAGACAAACCTCCTCAG
TATAAGTTACCATCAAAAGCCAGCTTTTATATGTCGCCACACAAGAACTCTCTCCAAAGT
CGTTGCCGAGATCTTGAGTTTTGTAAAACTTGTCTTTTTCTTCAGGATTGAACAAGAGAC
CATAGTTCTCGTCCTTCGGGATTAGAAACAACCAAGGGACTTGATTGTATGGCTTAGATA
GTCTCGAAGCGGATCGCCATGACGGACAAACGGATTTAGCTCGCTGGAAATCAGCAAATC
CAAGGCGCTCGAAGACCAATCGCATGAGATCTAGAGGAAGCTCGGACCAGCAATGGAGAT
TTCTTTTTGGTCCTGATGGAGTGACTACAATAACAGAGACAACGTGAGAGGCCATCAGGC
GGAATATGGGGGAAAATAGTTTTTTTCGTTTCCCCCGGCCGTACC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 2 5

CO CL674Contig1 860 3 2 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGAGTGAAAC
ACCAATGCGTGCACGGTGAATTCGAGGATCGAGGAGCTTGAAATCGGTCGGACACTTTGT
CTGTCATCACCTGTCGTCATCATCGTCGCTTAAAGTTCCGACCTTCCGTTGCCGGAAGGG
AAGATGCTCGCTTGAAGTCGACCTCCACCGTTCTCGCCTCTATCTTTTACCTTTTTT*GA
GCTCAACAAGTAAGAAGGAAGGA*GGGGATGTCGACACCAACGAGGAAGAGATTGATGAG
GGATTTCAAGAGGTTGCAGCAAGACCCACCTGCTGGAATCAGCGGTGCTCCTCAAGACAA
CAACATCATGCTCTGGAATGCTGTTATCTTCGGGCCTGATGATACCCCATGGGATGGAGG
TACTTTCAAACTCTCACTGCAGTTTTCAGAAGATTATCCGAACAAACCACCAACGGTTCG
GTTTGTTTCAAGGATGTTCCATCCTAATATATATGCTGATGGGAGTATATGCTTGGACAT
TCTCCAAAACCAGTGGAGTCCAATATATGATGTCGCTGCTATCCTTACCTCCATCCAGTC
ATTACTCTGTGATCCTAATCCGAATTCTCCTGCCAACTCGGAAGCTGCACGAATGTTCAG
CGAAAGCAAACGAGAGTACAACAGAAGAGTCCGCGAGGTTGTGGAACAAAGCTGGACTGC
AGACTAGTAATAATAATAGCATTTGTCTTTTATTGTCATTGAACCTTCCTCTCTTGTTTT
TCATTCCGCAACACTTCTTTCTCGTTTCCTTTCTTGTCTTTGTATGTTTTTCTTCTTTCA
AACTATGTGATTTGTTGCTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FV06TF U 67
AF RS1A256TF U 1
AF RS1A256TV U 1
BS 1 824 RS1A256TF
BS 825 860 RS1A256TV

RD RS1FV06TF 600 0 0
GG
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CGCTTGAAGTCGACCTCCACCGTTCTCGCCTCTATCTTTTACCTTTTTTTGAGCTCAACA
AGTAAGAAGGAAGGAAGGAGATGTCGACACCAGCGAGGAAGAGATTGATGAGGGATTTCA
AGAGGTTGCAGCAAGACCCACCTGCTGGAATCAGCGGTGCTCCTCAAGACAACAACATCA
TGCTCTGGAATGCTGTTATCTTCGGGCCTGATGATACCCCATGGGATGGAGGTACTTTCA
AACTCTCACTGCAGTTTTCAGAAGATTATCCAAACAAACCACCAACGGTTCGGTTTGTTT
CAAGGATGTTCCATCCTAATATATATGCTGATGGGAGTATATGCTTGGACATTCTCCAAA
ACCAGTGGAGTCCAATATATGATGTCGCTGCTATCCTTACCTCCATCCAGTCATTACTCT
GTGATCCTAATCCGAATTCTCCTGCCAACTCGGAAGCTGCACGAATGTTCAGCGAAAG

QA 3 600 3 600
DS 

RD RS1A256TF 824 0 0
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CTGTCATCACCTGTCGTCATCATCGTCGCTTAAAGTTCCGACCTTCCGTTGCCGGAAGGG
AAGATGCTCGCTTGAAGTCGACCTCCACCGTTCTCGCCTCTATCTTTTACCTTTTTT*GA
GCTCAACAAGTAAGAAGGAAGGA*GGGGATGTCGACACCAACGAGGAAGAGATTGATGAG
GGATTTCAAGAGGTTGCAGCAAGACCCACCTGCTGGAATCAGCGGTGCTCCTCAAGACAA
CAACATCATGCTCTGGAATGCTGTTATCTTCGGGCCTGATGATACCCCATGGGATGGAGG
TACTTTCAAACTCTCACTGCAGTTTTCAGAAGATTATCCGAACAAACCACCAACGGTTCG
GTTTGTTTCAAGGATGTTCCATCCTAATATATATGCTGATGGGAGTATATGCTTGGACAT
TCTCCAAAACCAGTGGAGTCCAATATATGATGTCGCTGCTATCCTTACCTCCATCCAGTC
ATTACTCTGTGATCCTAATCCGAATTCTCCTGCCAACTCGGAAGCTGCACGAATGTTCAG
CGAAAGCAAACGAGAGTACAACAGAAGAGTCCGCGAGGTTGTGGAACAAAGCTGGACTGC
AGACTAGTAATAATAATAGCATTTGTCTTTTATTGTCATTGAACCTTCCTCTCTTGTTTT
TCATTCCGCAACACTTCTTTCTCGTTTCCTTTCTTGTCTTTGTA

QA 1 824 1 824
DS 

RD RS1A256TV 860 0 0
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ACCAATGCGTGCACGGTGAATTCGAGGATCGAGGAGCTTGAAATCGGTCGGACACTTTGT
CTGTCATCACCTGTCGTCATCATCGTCGCTTAAAGTTCCGACCTTCCGTTGCCGGAAGGG
AAGATGCTCGCTTGAAGTCGACCTCCACCGTTCTCGCCTCTATCTTTTACCTTTTTT*GA
GCTCAACAAGTAAGAAGGAAGGA*GGGGATGTCGACACCAACGAGGAAGAGATTGATGAG
GGATTTCAAGAGGTTGCAGCAAGACCCACCTGCTGGAATCAGCGGTGCTCCTCAAGACAA
CAACATCATGCTCTGGAATGCTGTTATCTTCGGGCCTGATGATACCCCATGGGATGGAGG
TACTTTCAAACTCTCACTGCAGTTTTCAGAAGATTATCCGAACAAACCACCAACGGTTCG
GTTTGTTTCAAGGATGTTCCATCCTAATATATATGCTGATGGGAGTATATGCTTGGACAT
TCTCCAAAACCAGTGGAGTCCAATATATGATGTCGCTGCTATCCTTACCTCCATCCAGTC
ATTACTCTGTGATCCTAATCCGAATTCTCCTGCCAACTCGGAAGCTGCACGAATGTTCAG
CGAAAGCAAACGAGAGTACAACAGAAGAGTCCGCGAGGTTGTGGAACAAAGCTGGACTGC
AGACTAGTAATAATAATAGCATTTGTCTTTTATTGTCATTGAACCTTCCTCTCTTGTTTT
TCATTCCGCAACACTTCTTTCTCGTTTCCTTTCTTGTCTTTGTATGTTTTTCTTCTTTCA
AACTATGTGATTTGTTGCTT

QA 1 860 1 860
DS 



CO CL674Contig2 855 2 2 U
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ACAAATCACAGAGTCTGAAACACACACACACACAAAGACATAAACATAAAAAGGGGAGAG
GGAGACGGTGTTGGTGGAATCAAACACAAGAAAAAAGGTTCAATTGTTTTTTTTTGAAGA
CAAAAATGCTACAAAGAAAAGACTATTTAGTTAGTCAGCAGTCCAGCTTTGTTCCACAAC
CTCGCGGACTCTTCTGTTGTACTCTCGTTTGCTTTCGCTGAACATTCGCGCAGCTTCCGA
GTTGGCAGGAGAATTCGGATTAGGATCACAGAGCAATGACTGGATGGAGGTAAGTATAGC
AGCGACATCATATATAGGACTCCACTGGTTTTGGAGAATGTCCAAGCATATACTCCCATC
AGCATATATGTTAGGATGGAACATCCGTGAAACAAACCGAACAGTAGGTGGTTTGTTTGG
ATAATCTTCTGAAAACTGCAGTGAGAGTTTGAAAGTACCTCCATCCCAGGGGGTATCATC
AGGCCCGAAAATAACAGCATTCCAGAGCATGATGCTGTTGTCTTGAGGAGCACCGCTGAT
TCCAGCAGGTGGGTCTTGCTGCAACCTCTTGAAGTCCCTCATCAACCTCTTCCTCGCTGG
TGTCGACATTCTTTCTCTTTCACTCTATATCTATAGATGTTGAGCGAAAAAAGGGTAAAG
ATCGGTGGAGGTTCGTCGTCAAGCGAGCAGCATCTTTCCTTGCGGCGAGGTAAAAGGTCT
GAACTTTAAGCGACGATGATAACCACCTGATAGATGAGAGGAGAGTCTCCGATCGGTAAT
CTTTGGATTCACCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EU12JQ U 1
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BS 561 855 RS1EC13TF

RD RS1EU12JQ 563 0 0
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CAAAAATGCTACAAAGAAAAGACTATTTAGTTAGTCAGCAGTCCAGCTTTGTTCCACAAC
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AGCGACATCATATATAGGACTCCACTGGTTTTGGAGAATGTCCAAGCATATACTCCCATC
AGCATATATGTTAGGATGGAACATCCGTGAAACAAACCGAACAGTAGGTGGTTTGTTTGG
ATAATCTTCTGAAAACTGCAGTGAGAGTTTGAAAGTACCTCCATCCCAGGGGGTATCATC
AGGCCCGAAAATAACAGCAT
CCC

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DS 

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TCCCATCAGCATATATGTTAGGATGGAACATCCGTGAAACAAACCGAACAGTAGGTGGTT
TGTTTGGATAATCTTCTGAAAACTGCAGTGAGAGTTTGAAAGTACCTCCGTCCCAGGGGG
TATCATCAGGCCCGAAAATAACAGCATTCCAGAGCATGATGCTGTTGTCTTGAGGAGCAC
CGCTGATTCCAGCAGGTGGGTCTTGCTGCAACCTCTTGAAGTCCCTCATCAACCTCTTCC
TCGCTGGTGTCGACATTCTTTCTCTTTCACTCTATATCTATAGATGTTGAGCGAAAAAAG
GGTAAAGATCGGTGGAGGTTCGTCGTCAAGCGAGCAGCATCTTTCCTTGCGGCGAGGTAA
AAGGTCTGAACTTTAAGCGACGATGATAACCACCTGATAGATGAGAGGAGAGTCTCCGAT
CGGTAATCTTTGGATTCACCCC

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 8

CO CL675Contig1 984 8 14 U
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TCCACATGAAAACCGATGGAACATCATTGTCTGATTTTATAGAAGGTAAATTTTATGAAG
AACATACTAAAATATTAAAAATACTGGTGATCAAGTCATGTTTTGGTAATATAAATAGAG
ATCTCTCACATACAAAACTGAATTTGAAACGGTGTAGAGATTTGAGAGAGTTGTTGAGGT
TTCAAGCGGTGTAAGCGCTCCTCGCGCCTCTGTCCAGCTTCTTGGCATCCTCATGGATGA
TGAAACCAATGCTGTTGTTGTAATCAATAATCTCCTTCCATTGTCTCCCAATGCTCACCT
GAGCAGCTTCATTGGTAGCGTTTTTGGTCCAAATGGATATCCTCTCTTGCTTTACTCTAA
CATTGACAACAACTCCGCATATCTCATCTCCATGGTCAAACTGTTCTCCAATCAACGCAA
GCAAAGTGTAAAGCCAGGGCTTATCAGACTTCTCCTTGGAGAAGTTCATAGTCCATTTGC
CACCATTAGCACAAATAGGATCCTCCCACTTAGGTTCGATATTGTGTTTGAAACAGTAGA
AGTCAGCTCCGGTAACTAACTTGCTCGGAACCCGCATGTTATTGTACAGACCCCAGAACT
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CTTGTTCATGGTATCGATCGATCGGTTGGTCTGTAGGGTTAGGGTTCGCTTCTTCCGCAA
CAACAACAACAGGCTTGGATGTGTCTTCTACCGCCATTGTTAAAACTTCTGCCTCTTTCT
CTTTTCTCTCCAGACGATGGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 
50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GQ93JQ U 1
AF RS1AZ03JQ U 78
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AF RS1GQ93TF C 135
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GCAAAGTGTAAAGCCAGGGCTTA

QA 1 503 1 503
DS 

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GGAG
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ATTTGAAACGGTGTAAAGATTTGAGAGAGTTGTTGAGGTTTCAAGCGGTGTAAGCGCTCC
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TTTTGGTCCAAATGGATATCCTCTCTTGCTTTACTCTAACATTGACAACAACTCCGCATA
TCTCATCTCCATGGTCAAACTGTTCTCCAATCAACGCAAGCAAAGTGTAAAGCCAGGGCT
TATCAGACTTCTCCTTGGAGAAGTTCATAGTCCATTTGCCACCATTAGCACAAATAGGAT
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DS 

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CCCAATGCTCACCTGAGCAGCTTCATTGGTAGCGTTTTTGGTCCAAATGGATATCCTCTC
TTGCTTTACTCTAACATTGACAACAACTCCGCATATCTCATCTCCATGGTCAAACTGTTC
TCCAATCAACGCAAGCAAAGTGTAAAGCCAGGGCTTATCAAACTTCTCCTTGGAGAAGTT
CATAGTCCATTTGCCACCATTAGCACAAATAGGATCCTCCCACTTAGGTTCGATATTGTG
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AGCCGTCTGCTTTAATTTAACAGAAGGGTTATCGAACCAGAAAGTCCACGAATGCTCCAA
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CTCAGCATCGTCGCCTTGTTCATGGTATCGACCGATCGGTTGGTCT

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DS 

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ATAATCTCCTTCCATTGTCTCCCAATGCTCACCTGAGCAGCTTCATTGGTAGCGTTTTTG
GTCCAAATGGATATCCTCTCTTGCTTTACTCTAACATTGACAACAACTCCGCATATCTCA
TCTCCATGGTCAAACTGTTCTCCAATCAACGCAAGCAAAGTGTAAAGCCAGGGCTTATCA
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CACTTAGGTTCGATATTGTGTTTGAAACAGTAGAAGTCAGCTCCGGTAACTAACTTGCTC
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TCGGTTGGTCTGTC

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DS 

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ATGATGAAACCAATGCTGTTGTTGTGATCAATAATCTCCTTCCATTGTCTCCCAATGCTC
ACCTGAGCAGCTTCGTTGGAAGCGTTTTTGGTCCAAATGGATATCCTCTCTTGCTTTACT
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TGAGGAACGGCGGATTTACTCGATTCGTCTCCGTCTCCGATCTCTCCTTCCTCAGCATCG
TCGCCTTGTTCATGGTATCGATCGATCGGTTGGTCT

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DS 

RD RS1BY86TF 842 0 0
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AGAGATCTCTCACATACAAAACTGAATTTGAAACGGTGTAGAGATTTGAGAGAGTTGTTG
AGGTTTCAAGCGGTGTAAGCGCTCCTCGCGCCTCTGTCCAGCTTCTTGGCATC*TCATGG
ATGATGAAACCAATGCTGTTGTTGTGATCAATAATCTCCTTCCATTGTCTCCCAATGCTC
ACCTGAGCAGCTTCGTTGGAAGCGTTTTTGGTCCAAATGGATATCCTCTCTTGCTTTACT
CTAACGTTGACAACAACTCCGCATATCTCATCTCCATGGTCAAACTGTTCTCCAGTCAAC
GCAAGCAAAGTGTAAAGCCAGGGCTTATCAGACTTCTCCTTGGAGAAGTTCATAGTCCAT
TTGCCACCATTAGCACAAATAGGATCCTCCCACTTAGGTTCGATATTGTGTTTGAAACAG
TAGAAGTCAGCTCCCGTAACTAACTTGCTCGGAACCCGCATGTTATTGTACAGACCCCAG
AACTCCTCGACGGTGGAGAAAGTGAAGACGGATCGCAGAGAGCTTCCCCAAGTCGTCTGC
TTTAATTTAACAGAAGGGTTATCGAACCAGAAAGTCCACGAATGCTCCAACGGATGCGAC
TGAGGAACGGCGGATTTACTCGATTCGTCTCCGTCTCCGATCTCTCCTTCCTCAGCATCG
TCGCCTTGTTCATGGTATCGATCGATCGGTTGGTCTGTAGGGTTAGGGTTCGCTTCTTCC
GCAACAACAACAAGTGGCTTGGATGTGTCTTCTACCGCCATTGTTAAAACTT
TTTGCCTCCC

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DS 

RD RS1DJ38TF 508 0 0
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ACGCAAGCAAAGTGTAAAGCCAGGGCTTATCAGACTTCTCCTTGGAGAAGTTCATAGTCC
ATTTGCCACCATTAGCACAAATAGGATCCTCCCACTTAGGTTCGATATTGTGTTTGAAAC
AGTAGAAGTCAGCTCCGGTAACTAACTTGCTCGGAACCCGCATGTTATTGTACAGACCCC
AGAACTCCTCGACGGTGGAGAAAGTGAAGACGGATCGCAGAGAGCTTCCCCAAGCCGTCT
GCTTTAATTTAACAGAAGGGTTATCGAACCAGAAAGTCCACGAATGCTCCAACGGATGCG
ACTGAGGAACGGCGGATTTGCTCGATTCGTCTCCGTCTCCGATCTCTCCTTCCTCAGCAT
CGTCGCCTTGTTCATGGTATCGACCGATCGGTTGGTCTGTAGGGTTAGGGTTCGCTTCTT
CCGCAACAACAACAACAGGCTTGGATG
C

QA 1 507 1 507
DS 

RD RS1AZ03TF 599 0 0
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ATCTCCATGGTCAAACTGTTCTCCAATCAACGCAAGCAAAGTGTAAAGCCAGGGCTTATC
AGACTTCTCCTTGGAGAAGTTCATAGTCCATTTGCCACCATTAGCACAAATAGGATCCTC
CCACTTAGGTTCGATATTGTGTTTGAAACAGTAGAAGTCAGCTCCGGTAACTAACTTGCT
CGGAACCCGCATGTTATTGTACAGACCCCAGAACTCCTCGACGGTGGAGAAAGTGAAGAC
GGATCGCAGAGAGCTTCCCCAAGCCGTCTGCTTTAATTTAACAGAAGGGTTATCGAACCA
GAAAGTCCACGAATGCTCCAACGGATGCGACTGAGGAACGGCGGATTTGCTCGATTCGTC
TCCGTCTCCGATCTCTCCTTCCTCAGCATCGTCGCCTTGTTCATGGTATCGATCGATCGG
TTGGTCTGTAGGGTTAGGGTTCGCTTCTTCCGCAACAACAACAACAGGCTTGGATGTGTC
TTCTACCGCCATTGTTAAAACTTCTGCCTCTTTCTCTTTTCTCTCCAGACGATGGATCC

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 8

CO CL676Contig1 1434 8 24 U
GGGAGAGAAAGCAGAAAGGATATGTGGCGGGAGAAGAGAGAGAGGTTACACTTCAATGGC
GTCTCTCCAACTCTGCGACGGTTATCTTCTCTCTAAGCCCTCTGTATCTCCACGCTTCCG
TCTCCCCCAACGAATCTCTCACCGCCTCATCCCCACCAAAGCATCCGCTTCTCCTCCTCC
ACCATCACCATCTTCATCTTCTTCACTGTCTCTCACTCGGCGGGACCTTCTCTACCAATC
GGCGGCAGTATCACTCTCCCTTTCCTCCATCGTCGGACCAGCTAAAGCTGATGAACAGTT
ATCCGAATGGGAAAGAGTCTTCCTCCCAATCGATCCCGGCGTCGTTCTTCTCGACATTGC
TTTCGTCCCCGACGAGCCTAGCCGCGGGTTTCTACTGGGGACGAGGCAGACTCTGTTAGA
GACCAAAGACGGTGGAAACACATGGGCCCCACGATCAATCCCTTCAGCCGAAGAAGAGGA
TTTCAACTACAGGTTCAATTCGATCTGCTTCAAAGGCAAAGAAGGGTGGATCATTGGCAA
GCCTGCTATCTTGTTGTACACTGCCGATGCCGGAGAGAATTGGGATCGAATCCCCCTTAG
CTCTCAGCTTCCTGGTGATATGGTGTTTATAGAGGCGACTGGAGAAAAGAGCGCGGAGAT
GGTTACGGATGAAGGTGCTATCTATGTTACTTCTAACAAGGGATATAACTGGAAAGCTGC
TATTCAGGAAACAGTGTCAGCTACTTTGAATAGGACAGTCTCCAGTGGAATCAGTGGTGC
TAGTTACTACACGGGAACCTTCAGTGCTGTTAATCGTTCACCAGATGGAAGATATGTTGC
TGTTTCCAGCCGTGGTAACTTCTTTTTGACGTGGGAGCCTGGGCAGCCTTACTGGCAACC
ACACAATAGAGCAGTTGCCAGAAGAATTCAGAACATGGGATGGAGAGCTGATGGTGGTCT
TTGGCTTCTTGTTCGAGGAGGAGGACTTTATCTTAGCAAAGGCACTGGTATTTCAGAGGA
CTTTGACGAAGTTCCAGTACAAAGCCGTGGGTTTGGCATTCTAGATGTTGGTTATCGCTC
AGAGGAAGAAGCATGGGCAGCAGGAGGCAGTGGGATTCTACTGAGAACAAGAAACGGAGG
CAAGTCATGGAACCGTGACAAAGCTGCTGACAATATCGCAGCTAATCTGTACGCGGTCAA
ATTTGTGGATGACAAGAAAGGGTTTGTGCTTGGAAACGATGGAGTGTTGCTTCGATATGT
GGGATGAAGAGAAGGTGAATTGAGAGATTCGTTTTTT*GTTTTGTTTCAGTCTTTCTTTG
TAAAGCGTTTACAGCGTCTTGATACTGCATTACAAAGTATTGTATACATTCCCACCATGC
ATGAGATGTGTATATTTAAAGTTCTTATAAAATCTACTAGCCCGTTTATGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 10 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1C941TF U 5
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AF RS1DC41TF U 24
AF RS1C206TF U 48
AF RS1FD94TF U 491
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AF RS1DC41JQ C 657
AF RS1EG92JQ C 627
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RD RS1C941TF 639 0 0
GG
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CCAACTCTGCGACGGTTATCTTCTCTCTAAGCCCTCTGTATCTCCACGCTTCCGTCTCCC
CCAACGAATCTCTCACCGCCTCATCCCCACCAAAGCATCCGCTTCTCCTCCTCCACCATC
ACCATCTTCATCTTCTTCACTGCCTCTCACTCGGCGGGACCTTCTCTACCAATCGGCGGC
AGTATCACTCTCCCTTTCCTCCATCGTCGGACCAGCTAAAGCTGATGAACAGTTATCCGA
ATGGGAAAGAGTCTTCCTCCCAATCGATCCCGGCGTCGTTCTTCTCGACATTGCTTTCGT
CCCCGACGAGCCTAGCCGCGGGTTTCTACTGGGGACGAGGCAGACTCTGTTAGAGACCAA
AGACGGTGGAAACACATGGGCCCCACGATCAATCCCTTCAGCCGAAGAAGAGGATTTCAA
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TATCTTGTTGTACACTGCCGATGCCGGAGAGAATTGGGATCGAATCCCCCTTAGCTCTCA
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QA 3 639 3 639
DS 

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GTCTCTCCAACTCTGCGACGGTTATCTTCTCTCTAAGCCCTCTGTATCTCCACGCTTCCG
TCTCCCCCAACGAATCTCTCACCGCCTCATCCCCACCAAAGCATCCGCTTCTCCTCCTCC
ACCATCACCATCTTCATCTTCTTCACTGTCTCTCACTCGGCGGGACCTTCTCTACCAATC
GGCGGCAGTATCACTCTCCCTTTCCTCCATCGTCGGACCAGCTAAAGCTGATGAACAGTT
ATCCGAATGGGAAAGAGTCTTCCTCCCAATCGATCCCGGCGTCGTTCTTCTCGACATTGC
TTTCGTCCCCGACGAGCCTAGCCGCGGGTTTCTACTGGGGACGAGGCAGACTCTGTTAGA
GACCAAAGACGGTGGAAACACATGGGCCCCACGATCAATCCCTTCAGCCGAAGAAGAGGA
TTTCAACTACAGGTTCAATTCGATCTGCTTCAAAGGCAA*GAAGGGTGGATCATTGGCAA
GCCTGCTATCTTGTTGTACACTGCCGATGCCGGAGAGAATTGGGATCGAATCCCCCTTAG
CTCTCAGCTTCCTGGTGATATGGTGTTTATAGAGGCGACTGGAGAAAAGAGCGCGGAGAT
GGTTACGGATGAAGGTGCTATCTATGTTACTTCTAACAAGGGATATAACTGGAA*GCTGC
TATTCAG*GAACAGTGTCAGCTACTTTGAATAGGACAGTCTCCAGTGGAA

QA 1 770 1 770
DS 

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GG
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CTTCTCTCTAAGCCCTCTGTATCTCCACGCTTCCGTCTCCCCCAACGAATCTCTCACCGC
CTCATCCCCACCAAAGCATCCGCTTCTCCTCCTCCACCATCACCATCTTCATCTTCTTCA
CTGTCTCTCACTCGGCGGGACCTTCTCTACCAATCGGCGGCAGTATCACTCTCCCTTTCC
TCCATCGTCGGACCAGCTAAAGCTGATGAACAGTTATCCGAATGGGAAAGAGTCTTCCTC
CCAATCGATCCCGGCGTCGTTCTTCTCGACATTGCTTTCGTCCCCGACGAGCCTAGCCGC
GGGTTTCTACTGGGGACGAGGCAGACTCTGTTAGAGACCAAAGACGGTGGAAACACATGG
GCCCCACGATCAATCCCTTCAGCCGAAGAAGAGGATTTCAACTACAGGTTCAATTCGATC
TGCTTCAAAGGCAAAGAAGGGTGGATCATTGGCAAGCCTGCTATCTTGTTGTACACTGCC
GATGCCGGAGAGAATTGGGATCGAATCCCCCTTAGCTCTCAGCTTCCTGGTGATATGGTG
TTTATAGAGGCGACTGGAGAAAAGAGCGCGGAGATGGTTACGGATGAAGGTGCTATCTAT
GTTACTTCTAACAAGGGATATAACTGGAAAGCTGCTATTCAG*AAACAGTGTCAGCTACT
TTGA

QA 3 726 3 726
DS 

RD RS1C206TF 792 0 0
GG
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CCACGCTTCCGTCTCCCCCAACGAATCTCTCACCGCCTCATCCCCACCAAAGCATCCGCT
TCTCCTCCTCCACCATCACCATCTTCATCTTCTTCACTGTCTCTCACTCGGCGGGACCTT
CTCTACCAATCGGCGGCAGTATCACTCTCCCTTTCCTCCATCGTCGAACCAGCTAAAGCT
GATGAACAGTTATCCGAATGGGAAGGAGTCTTCCTCCCAATCGATCCCGGCGTCGTTCTT
CTCGACATTGCTTTCGTCCCCGACGAGCCTAGCCGCGGGTTTCTACTGGGGACGAGGCAG
ACTCTGTTAGAGACCAAAGACGGTGGAAACACATGGGCCCCACGATCAATCCCTTCAGCC
GAAGAAGAGGATTTCAACTACAGGTTCAATTCGATCTGCTTCAAAGGCAAAGAAGGGTGG
ATCATTGGCAAGCCTGCTATCTTGTTGTACACTGCCGATGCCGGAGAGAATTGGGATCGA
ATCCCCCTTAGCTCTCAGCTTCCTGGTGATATGGTGTTTATAGAGGCGACTGGAGAAAAG
AGCGCGGAGATGGTTACGGATGAAGGTGCTATCTATGTTACTTCTAACAAGGGATATAAC
TGGAAAGCTGCTATTCAG*AAACAGTGTCAGCTACTTTGAATAGGACAGTCTCCAGTGGA
ATCAGTGGTGCTAGTTACTACACGGGAAC*TTCAGTGCTGTTAATCGT*CACCAGATGGA
*GATATGTTG

QA 3 792 3 792
DS 

RD RS1FD94TF 744 0 0
G
GGTTCAATTCGATCTGCTTCAAAGGCAAAGAAGGGTGGATCATTGGCAAGCCTGCTATCT
TGTTGTACACTGCCGATGCCGGAGAGAATTGGGATCGAATCCCCCTTAGCTCTCAGCTTC
CTGGTGATATGGTGTTTATAGAGGCGACTGGAGAAAAGAGCGCGGAGATGGTTACGGATG
AAGGTGCTATCTATGTTACTTCTAACAAGGGATATAACTGGAAAGCTGCTATTCAGGAAA
CAGTGTCAGCTACTTTGAATAGGACAGTCTCCAGTGGAATCAGTGGTGCTAGTTACTACA
CGGGAACCTTCAGTGCTGTTAATCGTTCACCAGATGGAAGATATGTTGCTGTTTCCAGCC
GTGGTAACTTCTTTTTGACGTGGGAGCTTGGGCAGCCTTACTGGCAACCACACAATAGAG
CAGTTGCCAGAAGAATTCAGAACATGGGATGGAGAGCTGATGGTGGTCTTTGGCTTCTTG
TTCGAGGAGGAGGACTTTATCTTAGCAAAGGCACTGGTATTTCAGAGGACTTTGACGAAG
TTCCAGTACAAAGCCGTGGGTTTGGCATTCTAGATGTTGGTTATCGCTCAGAGGAAGAAG
CATGGGCAGCAGGAGGCAGTGGGATTCTACTGAGAACAAGAAACGGAGGCAAGTCATGGA
ACCGTGACAAAGCTGCTGACTATATCGCAGCTAATCTGTACGCGGTCAAATTTGTGGATG
ACAAGAAAGGGTTTGTGCTTGGA

QA 2 744 2 744
DS 

RD RS1C941JQ 839 0 0
CCTTAGCTCTCAGCTTCCTGGTGATATGGTGTTTATAGAGGCGACTGGAGAAAAGAGCGC
GGAGATGGTTACGGATGAAGGTGCTATCTATGTTACTTCTAACAAGGGATATAACTGGAA
AGCTGCTATTCAGGAAACAGTGTCAGCTACTTTGAATAGGACAGTCTCCAGTGGAATCAG
TGGTGCTAGTTACTACACGGGAACCTTCAGTGCTGTTAATCGTTCACCAGATGGAAGATA
TGTTGCTGTTTCCAGCCGTGGTAACTTCTTTTTGACGTGGGAGCCTGGGCAGCCTTACTG
GCAACCACACAATAGAGCAGTTGCCAGAAGAATTCAGAACATGGGATGGAGAGCTGATGG
TGGTCTTTGGCTTCTTGTTCGAGGAGGAGGACTTTATCTTAGCAAAGGCACTGGTATTTC
AGAGGACTTTGACGAAGTTCCAGTACAAAGCCGTGGGTTTGGCATTCTAGATGTTGGTTA
TCGCTCAGAGGAAGAAGCATGGGCAGCAGGAGGCAGTGGGATTCTACTGAGAACAAGAAA
CGGAGGCAAGTCATGGAACCGTGACAAAGCTGCTGACAATATCGCAGCTAATCTGTACGC
GGTCAAATTTGTGGATGACAAGAAAGGGTTTGTGCTTGGAAACGATGGAGTGTTGCTTCG
ATATGTGGGATGAAGAGAAGGTGAATTGAGAGATTCGTTTTTT*GTTTTGTTTCAGTCTT
TCTTTGTAAAGCGTTCACAGCGTCTTGATACTGCATTACAAAGTATTGTATACATTCCCA
CCATGCATGAGATGTGTATATTTAAAGTTCTTATAAAATCTACTAGCCCGTTTATGTTC

QA 1 839 1 839
DS 

RD RS1DC41JQ 752 0 0
AGATGGTTACGGATGAAGGTGCTATCTATGTTACTTCTAACAAGGGATATAACTGGAAAG
CTGCTATTCAGGAAACAGTGTCAGCTACTTTGAATAGGACAGTCTCCAGTGGAATCAGTG
GTGCTAGTTACTACACGGGAACCTTCAGTGCTGTTAATCGTTCACCAGATGGAAGATATG
TTGCTGTTTCCAGCCGTGGTAACTTCTTTTTGACGTGGGAGCCTGGGCATCCTTACTGGC
AACCACACAATAGAGCAGTTGCCAGAAGAATTCAGAACATGGGATGGAGAGCTGATGGTG
GTCTTTGGCTTCTTGTTCGAGGAGGAGGACTTTATCTTAGCAAAGGCACTGGTATTTCAG
AGGACTTTGACGAAGTTCCAGTACAAAGCCGTGGGTTTGGCATTCTAGATGTTGGTTATC
GCTCAGAGGAAGAAGCATGGGCAGCAGGAGGCAGTGGGATTTTACTGAGAACAAGAAACG
GAGGCAAGTCATGGAACCGTGACAAAGCTGCTGACAATATCGCAGCTAATCTGTACGCGG
TCAAATTTGTGGATGACAAGAAAGGGTTTGTGCTTGGAAACGATGGAGTGTTGCTTCGAT
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TTTGTAAAGCGTTTACAGCGTCTTGATACTGCATTACAAAGTATTGTATACATTCCCACC
ATGCATGAGATGTGTATATTTAAAGTTCTTAT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RS1EG92JQ 808 0 0
TTATAGAGGCGACTGGAGAAAAGAGCGCGGAGATGGTTACGGATGAAGGTGCTATCTATG
TTACTTCTAACAAGGGATATAACTGGAAAGCTGCTATTCAGGAAACAGTGTCAGCTACTT
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TGACGTGGGAGCCTGGGCAGCCTTACTGGCAACCACACAATAGAGCAGTTGCCAGAAGAA
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TTTATCTTAGCAAAGGCACTGGTATTTCAGAGGACTTTGACGAAGTTCCAGTACAAAGCC
GTGGGTTTGGCATTCTAGATGTTGGTTATCGCTCAGAGGAAGAAGCATGGGCAGCAGGAG
GCAGTGGGATTCTACTGAGAACAAGAAACGGAGGCAAGTCATGGAACCGTGACAAAGCTG
CTGACAATATCGCAGCTAATCTGTACGCGGTCAGATTTGTGGATGACAAGAAAGGGTTTG
TGCTTGGAAACGATGGAGTGTTGCTTCGATATGTGGGATGAAGAGAGGGTGAATTGAGAG
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GCATTACAAAGTATTGTATACATTCCCACCATGCATGAGATGTGTATATTTAAAGTTCTT
ATAAAATCTACTAGCCCGTTTATGTTCC

QA 1 808 1 808
DS 



AS 1 7

CO CL677Contig1 1520 7 20 U
CGAAAGAGAAATACCACAAATATAAATATTACACACCCATTAAAATCACAACACACAAAT
AAAACATCAAACATTCCACAAATAATAATATTACACACCCATTAAAGTCACAACACATAA
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CTCCTCCAACCTGGATGATGTACTCGTTCGGCCTAAGAGTGTAAACTATATCACTACCGG
AGAAGACGAACGACACGTTAGGCATGTTGTGTGTCGTTAACATTTCATCATGTGTGAACA
CGTGACTATCCTCGTCTTCAACCTCCTCTCCCATGATAATTTGTTGATGTCTACGTCTAC
GACAACGTCCACCTAAAATCTGTGTATTGATAGCTCGAATTATATGAGAAGGGCCAAATA
TGTATGGCGAGGCTGTGTGAATTAAAGCTTTGCCGCCTTGTATTTCTCGGTTTTGTCCAA
CAGCAACATAAGACATTTGAATCATCCATTCACTACAACCGTCAACAAGGTCGTAATGTT
CATGTCCTTGTTCTTCGTCGAAATGATCGCTATTTGCGGCACCAAAAACTATTGCCCCTC
CGTTAGGTCCAGAAACATTATAGTTTCTCATCCAAACAGTGAATATGTTACCAAATAACA
TGTTTTCAGTCATCATAGTGCTCCAAATCGGGGGAGCATAGCAACATGGTGCTGGAGGAG
AGAGTGAAAGCCCAACAATTCCCGTCCAAGTTGTATAGTCAGAATAATAAACCGGATTCA
CGTCATACACAGCACAGAATACACTCCTCATAGTTTGATTACCAACCCAAAACAAATCAG
TACACCTAGTTGCAGCCATATTAAGATCATAAAACGGCCGTACTCGCAAATTTGCTTGGG
TACCTGGAAGACGATCACAAGTACTTGACTGAAATGCAACATATGGATTATTCATTTCTT
GAATGTTATCTGGA*TCCATATTTCATGAGCAGCGGTATTAAAAGACACTCTTTGAACAA
CTGTTGGATATCCAATTTTTATATTACCAAAATATGAAATATTGTCTACATTTGTAAGAG
GGATCTCAATTACTAAGTCCATTATGACTTAGTGAGAAAAATTAACACTAGTTTTGAAGG
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AAAAAGTGTGAAGGGAGAGGAGAGAAGAGTGAGGAGAGGAGAGCGAGCAAAGAGTGTGAA
GCTACTTGAATTGTGTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 5 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 25 25 
25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1FH87JQ U 31
AF RS1FL08JQ U 31
AF RS1GJ42JQ U 1
AF RS1AA40JQ U 16
AF RS1AA40TF C 428
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AF RS1FH87TF C 784
BS 1 232 RS1GJ42JQ
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BS 234 285 RS1GJ42JQ
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BS 315 315 RS1FH87JQ
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BS 544 544 RS1AA40JQ
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BS 904 1154 RS1AA40TF
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BS 1156 1290 RS1AA40TF
BS 1291 1520 RS1FL08TF

RD RS1FH87JQ 383 0 0
ACACACCCATTAAAATCACAACACACAAATAAAACATCAAACATTCCACAAATAATAATA
TTACACACCCATTAAAGTCACAACACATAAATAAAACATCACACAAATAATAATATTACA
AATCCATAAAAATCCAACATAAGTTAAAGCGTGATAATAGATAGAAATTGTGAGCAAGAG
TCGCTCTTTAGGGATTGGAAGGGGCGAAACCGATTTTACGTTCCTCGAAGTTAAATAGAG
AGTGATAACGCCTCAAAAAAGGCATTCCAAGAGTATAATGCTCAAAGTTCGGGCTCGAGA
AATGCATGGGTCTAAATGCACTAACGTATTCTCCTCCAACCTGGATGATGTACTCGTTCG
GCCTAAGAGTGTAAACTATATCA

QA 1 383 1 383
DS 

RD RS1FL08JQ 507 0 0
ACACACCCATTAAAATCACAACACACAAATAAAACATCAAACATTCCACAAATAATAATA
TTACACACCCATTAAAGTCACAACACATAAATAAAACATCACACAAATAATAATATTACA
AATCCATAAAAATCCAACATAAGTTAAAGCGTGATAATAGATAGAAATTGTGAGCAAGAG
TCGCTCTTTAGGGATTGGAAGGGGCGAAACCGATTTTACGTTCCTCGAAGTTAAATAGAG
AGTGATAACGCCTCAAAAAAGGCATTCCAAGAGTATAATGCTCAAAGTTCGGGCTCGAGA
AATGCATGGGTCTAAATGCACTAACGTATTCTCCTCCAACCTGGATGATGTACTCGTTCG
GCCTAAGAGTGTAAACTATATCACTACCGGAAAAAACGAACGACACGTTAGGCATGTTGT
GTGTCGTTAACATTTCATCATGTGTGGACACGTGACTATCCTCGTCTTCAACCTCCTCTC
CCATGATAATTTGTTGATGTCTACGTC

QA 1 507 1 507
DS 

RD RS1GJ42JQ 781 0 0
CGAAAGAGAAATACCACAAATATAAATATTACACACCCATTAAAATCACAACACACAAAT
AAAACATCAAACATTCCACAAATAATAATATTACACACCCATTAAAGTCACAACACATAA
ATAAAACATCACACAAATAATAATATTACAAATCCATAAAAATCCAACATAAGTTAAAGC
GTGATAATAGATAGAAATTGTGAGCAAGAGTCGCTCTTTAGGGATTGGAAGGTGCGAAAC
CGATTTTACGTTCCTCGAAGTTAAATAGAGAGTGATAACGCCTCAGAAAAGGCATTCCAA
GAGTATAATGCTCAGAGTTCGGGCTCGAGAAATGCATGGGTCTAAATGCACTAACGTATT
CTCCTCCAACCTGGATGATGTACTCGTTCGGCCTAAGAGTGTAAACTATATCACTACCGG
AGAAGACGAACGACACGTTAGGCATGTTGTGTGTCGTTAACATTTCATCATGTGTGAACA
CGTGACTATCCTCGTCTTCAACCTCCTCTCCCATGATAATTTGTTGATGTCTACGTCTGC
GACGACGTCCACCTAAAATCTGTGTATTGATAGCTCGAATTATATGAGAAGGGCCAAATA
TGTATGGCGAGGCTGTGTGAATTAAAGCTTTGCCGCCTTGTATTTCTCGGTTTTGTCCAA
CAGCAACATAAGACATTTGAATCATCCATTCACTACAACCGTCAACAAGGTCGTAATGTT
CATGTCCTTGTTCTTCGTCGAAATGATCGCTATTTGCGGCACCAAAA*CTATTGCCCC
CCG

QA 1 778 1 778
DS 

RD RS1AA40JQ 888 0 0
ACAAATATAAATATTACACACCCATTAAAATCACAACACACAAATAAAACATCAAACATT
CCACAAATAATAATATTACACACCCATTAAAGTCACAACACATAAATAAAACATCACACA
AATAATA***TTACAAATCCATAAAAATCCAACATAAGTTAAAGCGTGATAATAGATAGA
AATTGTGAGCAAGAGTCGCTCTTTAGGGATTGGAAGGTGCGAAACCGATTTTACGTTCCT
CGAAGTTAAATAGAGAGTGATAACGCCTCAGAAAAGGCATTCCAAGAGTATAATGCTCAG
AGTTCGGGCTCGAGAAATGCATGGGTCTAAATGCACTAACGTATTCTCCTCCAACCTGGA
TGATGTACTCGTTCGGCCTAAGAGTGTAAACTATATCACTACCGGAGAAGACGAACGACA
CGTTAGGCATGTTGTGTGTCGTTAACATTTCATCATGTGTGAACACGTGACTATCCTCGT
CTTCAACCTCCTCTCCCATGATAATTTGTTGATGTCTACGTCTACGACAACGTCCACCTA
AAATCTGTGTATTGATAGCTCGAATTATATGAGAAGGGCCAAATATGTATGGCGAGGCTG
TGTGAATTAAAGCTTTGCCGCCTTGTATTTCTCGGTTTTGTCCAACAGCAACATAAGACA
TTTGAATCATCCATTCACTACAACCGTCAACAAGGTCGTAATGTTCATGTCCTTGTTCTT
CGTCGAAATGATCGCTATTTGCGGCACCAAAAACTATTGCCCCTCCGTTAGGTCCAGAAA
CATTATAGTTTCTCATCCAAACAGTGAATATGTTACCAAATAACATGTTTTCAGTCATCA
TAGTGCTCCAAATCGGGGGAGCATAGCA*CATGGTGCTGGAGGAGAGA

QA 1 888 1 888
DS 

RD RS1AA40TF 865 0 0
GAACGACACGTTAGGCATGT*GTGTGTCGT*AACATTTCATCATGTGTGAACACGTGACT
ATC*TCGTCT*CAACCTCCTCTCCCATGATAATTTGTTGATGTCTACGTCTACGACAACG
TCCAC*TAAAATCTGTGTATTGATAGCTCGAATTATATGAGAAGGGCCAAATATGTATGG
CGAGGCTGTGTGAATTAAAGCTTTGCCGCCTTGTATTTCTCGGTTTTGTCCAACAGCAAC
ATAAGACATTTGAATCATCCATTCACTACAACCGTCAACAAGGTCGTAATGTTCATGTCC
TTGTTCTTCGTCGAAATGATCGCTATTTGCGGCACCAAAAACTATTGCCCCTCCGTTAGG
TCCAGAAACATTATAGTTTCTCATCCAAACAGTGAATATGTTACCAAATAACATGTTTTC
AGTCATCATAGTGCTCCAAATCGGGGGAGCATAGCAACATGGTGCTGGAGGAGAGAGTGA
AAGCCCAACAATTCCCGTCCAAGTTGTATAGTCAGAATAATAAACCGGATTCACGTCATA
CACAGCACAGAATACACTCCTCATAGTTTGATTACCAACCCAAAACAAATCAGTACACCT
AGTTGCAGCCATATTAAGATCATAAAACGGCCGTACTCGCAAATTTGCTTGGGTACCTGG
AAGACGATCACAAGTACTTGACTGAAATGCAACATATGGATTATTCATTTCTTGAATGTT
ATCTGGAATCCATATTTCATGAGCAGCGGTATTAAAAGACACTCTTTGAACAACTGTTGG
ATATCCAATTTTTATATTACCAAAATATGAAATATTGTCTACATTTGTAAGAGGGATCTC
AATTACTAAGTCCATTATGACTT
CC

QA 1 863 1 863
DS 

RD RS1FL08TF 751 0 0
CTATTG
CCCTCCGTTAGGTCCAGAAACATTATAGTTTCTCATCCAAACAGTGAATATGTTACCAAA
TAACATGTTTTCAGTCATCATAGTGCTCCAAATCGGGGGAGCATAGCAACATGGTGCTGG
AGGAGAGAGTGAAAGCCCAACAATTCCCGTCCAAGTTGTATAGTCAGAATAATAAACCGG
ATTCACGTCATACACAGCACAGAATACACTCCTCATAGTTTGATTACCAACCCAAAACAA
ATCAGTACACCTAGTTGCAGCCATATTAAGATCATAAAACGGCCGTACTCGCAAATTTGC
TTGGGTACCTGGAAGACGATCACAAGTACTTGACTGAAATGCAACATATGGATTATTCAT
TTCTTGAATGTTATCTGGA*TCCATATTTCATGAGCAGCGGTATTAAAAGACACTCTTTG
AACAACTGTTGGATATCCAATTTTTATATTACCAAAATATGAAATATTGTCTACATTTGT
AAGAGGGATCTCAATTACTAAGTCCATTATGACTTAGTGAGAAAAATTAACACTAGTTTT
GAAGGGAGAATTAAGAAAAGAAAAAGAAGAGAAAGAAGAAAGAGAGATGAACGAAAGATT
GAAGAAAGATAGAGAAGAGAGCAAAGAGAGTGAAGCTACGAGAGAGCAGAGAATGAGAAG
AAAAAAAAAAGTGTGAAGGGAGAGGAGAGAAGAGTGAGGAGAGGAGAGCGAGCAAAGAGT
GTGAAGCTACTTGAATTGTGTATCC

QA 7 751 7 751
DS 

RD RS1FH87TF 737 0 0
TAGGTCCAGAAACATTATAGTTTCTCATCCAAACAGTGAATATGTTACCAAATAACATGT
TTTCAGTCATCATAGTGCTCCAAATCGGGGGAGCATAGCAACATGGTGCTGGAGGAGAGA
GTGAAAGCCCAACAATTCCCGTCCAAGTTGTATAGTCAGAATAATAAACCGGATTCACGT
CATACACAGCACAGAATACACTCCTCATAGTTTGATTACCAACCCAAAACAAATCAGTAC
ACCTAGTTGCAGCCATATTAAGATCATAAAACGGCCGTACTCGCAAATTTGCTTGGGTAC
CTGGAAGACGATCACAAGTACTTGACTGAAATGCAACATATGGATTATTCATTTCTTGAA
TGTTATCTGGA*TCCATATTTCATGAGCAGCGGTATTAAAAGACACTCTTTGAACAACTG
TTGGATATCCAATTTTTATATTACCAAAATATGAAATATTGTCTACATTTGTAAGAGGGA
TCTCAATTACTAAGTCCATTATGACTTAGTGAGAAAAATTAACACTAGTTTTGAAGGGAG
AATTAAGAAAAGAAAAAGAAGAGAAAGAAGAAAGAGAGATGAACGAAAGATTGAAGAAAG
ATAGAGAAGAGAGCAAAGAGAGTGAAGCTACGAGAGAGCAGAGAATGAGAAGAAAAAAAA
AAGTGTGAAGGGAGAGGAGAGAAGAGTGAGGAGAGGAGAGCGAGCAAAGAGTGTGAAGCT
ACTTGAATTGTGTATCC

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 8

CO CL678Contig1 1040 8 8 U
ATTACGGCCGGGGGGTGGCTGAGTCAGAATAACGTATAGAGAAACACAACCATTGGTGTG
ATTAGGTTCTGTAATAGATTTAAGGAATCTACGTAACGTGAAGCAATCTCCAAATCGACC
TCATCATCGTCGAGTCTCTGTCTCTCTGCATTACTGTGTTGTCTGTGTAAGTGGAGATGG
CGAGTATTCGTTGCGGCGGAGGAAGAGGAGGAAGCGCATGTGCCGTTCGTTGTGATCGGC
GAACGGTGACAGTTCGATCATCGTGCGTGGTTCCGGTGATTAATCGACGGACTTGGGTAG
AGACCGGGAAGATTTCGATGACGAAGATAATGGCGGAGTTGACGCCGGTGAAGAACGGTG
AAAGGAAACGTGGTGGAGCGGTCGTGTCGCGAGAGAAGCTCGAGCAGTGGTTGAGGGATT
CGGTTGTTGAGATCGTGAAGAATCTGAGAGAGTCGCCGTTGTTGTTGCACCTGTACGCGG
AGGCGAACGGAGGTTTGAGTACGACGGCGACGACGAATCCAGTGGAGGGAGATTGGGAGG
CGATGGAAGGAAGGTGGGATAGAGGAGAGGAGGAGACGCCAGAGGGAGTGATCTTCGTTG
AGAAGCTAGCGGACGATGAGGAGGATGATCACGATGCTGATGGTGGATACAACGGTGGAG
AAAGAAGTGGAACAAGCGCTTGGGGGATAGTGGCGCAGGGAAGAGGAACTGACTGTGGAC
CGGTTTGCTACCTGTTGAAAACGACCCGGGTCGGATCGGGTATGGGGACGGTTTGCACGC
ATTTCTGTTTGGTGAAGGTGAAGAGTTTTAGGGAGACGGCTATGTCACAGTTCAATAACT
CGTGGTTGGTGCAGACTGGTCAATGAATCAGAGAATAGGTTTTTATTTAGCAAAAAAAGA
ATCAGAGAATAGGTTTCATGGTTCCTTATTTATACAGTGGTTGATTGTGTAGTTATTCTC
TTTGGGTTGAATTATAAAACCCTTATCGATGATCAATGTACCTTTATTGTTGTTACAGTA
TATACATTCATCTTTCAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RS1A146TF U 1
AF RS1D283TF U 15
AF RS1CR28TF U 24
AF RS1A146TV U 73
AF RS1A146TR C 117
AF RS1A146JQ C 210
AF RS1CR28JQ C 245
AF RS1D283JQ C 469
BS 1 578 RS1A146TF
BS 579 579 RS1D283TF
BS 580 694 RS1A146TF
BS 695 699 RS1D283TF
BS 700 766 RS1CR28TF
BS 767 797 RS1A146TV
BS 798 990 RS1A146TR
BS 991 1040 RS1A146JQ

RD RS1A146TF 694 0 0
ATTACGGCCGGGGGGTGGCTGAGTCAGAATAACGTATAGAGAAACACAACCATTGGTGTG
ATTAGGTTCTGTAATAGATTTAAGGAATCTACGTAACGTGAAGCAATCTCCAAATCGACC
TCATCATCGTCGAGTCTCTGTCTCTCTGCATTACTGTGTTGTCTGTGTAAGTGGAGATGG
CGAGTATTCGTTGCGGCGGAGGAAGAGGAGGAAGCGCATGTGCCGTTCGTTGTGATCGGC
GAACGGTGACAGTTCGATCATCGTGCGTGGTTCCGGTGATTAATCGACGGACTTGGGTAG
AGACCGGGAAGATTTCGATGACGAAGATAATGGCGGAGTTGACGCCGGTGAAGAACGGTG
AAAGGAAACGTGGTGGAGCGGTCGTGTCGCGAGAGAAGCTCGAGCAGTGGTTGAGGGATT
CGGTTGTTGAGATCGTGAAGAATCTGAGAGAGTCGCCGTTGTTGTTGCACCTGTACGCGG
AGGCGAACGGAGGTTTGAGTACGACGGCGACGACGAATCCAGTGGAGGGAGATTGGGAGG
CGATGGAAGGAAGGTGGGATAGAGGAGAGGAGGAGACGTCAGAGGGAGTGATCTTCGTTG
AGAAGCTAGCGGACGATGAGGAGGATGATCACGATGCTGATGGTGGATACAACGGTGGAG
AAAGAAGTGGAACAAGCGCTTGGGGGATAGTGGC

QA 1 694 1 694
DS 

RD RS1D283TF 688 0 0
GG
GGCTGAGTCAGAATAACGTATAGAGAAACACAACCATTGGTGTGATTAGGTTCTGTAATA
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TCTGTCTCTCTGCATTACTGTGTTGTCTGTGTAAGTGGAGATGGCGAGTATTCGTTGCGG
CGGAGGAAGAGGAGGAAGCGCATGTGCCGTTCGTTGTGATCGGCGAACGGTGACAGTTCG
ATCATCGTGCGTGGTTCCGGTGATTAATCGACGGACTTGGGTAGAGACCGGGAAGATTTC
GATGACGAAGATAATGGCGGAGTTGACGCCGGTGAAGAACGGTGAAAGGAAACGTGGTGG
AGCGGTCGTGTCGCGAGAGAAGCTCGAGCAGTGGTTGAGGGATTCGGTTGTTGAGATCGT
GAAGAATCTGAGAGAGTCGCCGTTGTTGTTGCACCTGTACGCGGAGGCGAACGGAGGTTT
GAGTACGACGGCGACGACGAATCCAGTGGAGGGAGATTGGGAGGCGATGGAAGGAAGGTG
GGATAGAGGAGAGGAGGAGACGCCAGAGGGAGTGATCTTCGTTGAGAAGCTAGCGGACGA
TGAGGAGGATGATCACGATGCTGATGGTGGATACAACGGTGGAGAAAGAAGTGGAACAAG
CGCTTGGGGGATAGTGGCGCAGG
AAG

QA 3 685 3 685
DS 

RD RS1CR28TF 743 0 0
GG
AGAATAACGTATAGAGAAACACAACCATTGGTGTGATTAGGTTCTGTAATAGATTTAAGG
AATCTACGTAACGTGAAGCAATCTCCAAATCGACCTCATCATCGTCGAGTCTCTGTCTCT
CTGCATTACTGTGTTGTCTGTGTAAGTGGAGATGGCGAGTATTCGTTGCGGCGGAGGAAG
AGGAGGAAGCGCATGTGCCGTTCGTTGTGATCGGCGAACGGTGACAGTTCGATCATCGTG
CGTGGTTCCGGTGATTAATCGACGGACTTGGGTAGAGACCGGGAAGATTTCGATGACGAA
GATAATGGCGGAGTTGACGCCGGTGAAGAACGGTGAAAGGAAACGTGGTGGAGCGGTCGT
GTCGCGAGAGAAGCTCGAGCAGTGGTTGAGGGATTCGGTTGTTGAGATCGTGAAGAATCT
GAGAGAGTCGCCGTTGTTGTTGCACCTGTACGCGGAGGCGAACGGAGGTTTGAGTACGAC
GGCGACGACGAATCCAGTGGAGGGAGATTGGGAGGCGATGGAAGGAAGGTGGGATAGAGG
AGAGGAGGAGACGCCAGAGGGAGTGATCTTCGTTGAGAAGCTAGCGGACGATGAGGAGGA
TGATCACGATGCTGATGGTGGATACAACGGTGGAGAAAGAAGTGGAACAAGCGCTTGGGG
GATAGTGGCGCAGGGAAGAGGAACTGACTGTGGACCGGTTTGCTACCTGTTGAAAACGAC
CCGGGTCGGATCGGGTATGGG

QA 3 743 3 743
DS 

RD RS1A146TV 733 0 0
AATAGATTTAAGGAATCTACGTAACGTGAAGCAATCTCCAAATCGACCTCATCATCGTCG
AGTCTCTGTCTCTCTGCATTACTGTGTTGTCTGTGTAAGTGGAGATGGCGAGTATTCGTT
GCGGCGGAGGAAGAGGAGGAAGCGCATGTGCCGTTCGTTGTGATCGGCGAACGGTGACAG
TTCGATCATCGTGCGTGGTTCCGGTGATTAATCGACGGACTTGGGTAGAGACCGGGAAGA
TTTCGATGACGAAGATAATGGCGGAGTTGACGCCGGTGAAGAACGGTGAAAGGAAACGTG
GTGGAGCGGTCGTGTCGCGAGAGAAGCTCGAGCAGTGGTTGAGGGATTCGGTTGTTGAGA
TCGTGAAGAATCTGAGAGAGTCGCCGTTGTTGTTGCACCTGTACGCGGAGGCGAACGGAG
GTTTGAGTACGACGGCGACGACGAATCCAGTGGAGGGAGATTGGGAGGCGATGGAAGGAA
GGTGGGATAGAGGAGAGGAGGAGACGTCAGAGGGAGTGATCTTCGTTGAGAAGCTAGCGG
ACGATGAGGAGGATGATCACGATGCTGATGGTGGATACAACGGTGGAGAAAGAAGTGGAA
CAAGCGCTTGGGGGATAGTGGCGCAGGGAAGAGGAACTGACTGTGGACCGGTTTGCTACC
TGTTGAAAACGACCCGGGTCGGATCGGGTATGGGGACGGTTTGCACGCATTTCTGTTTGG
TGAAG
TGAAGAGT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1A146TR 874 0 0
GACCTCATCATCGTCGAGTCTCTGTCTCTCTGCATTACTGTGTTGTCTGTGTAAGTGGAG
ATGGCGAGTATTCGTTGCGGCGGAGGAAGAGGAGGAAGCGCATGTGCCGTTCGTTGTGAT
CGGCGAACGGTGACAGTTCGATCATCGTGCGTGGTTCCGGTGATTAATCGACGGACTTGG
GTAGAGACCGGGAAGATTTCGATGACGAAGATAATGGCGGAGTTGACGCCGGTGAAGAAC
GGTGAAAGGAAACGTGGTGGAGCGGTCGTGTCGCGAGAGAAGCTCGAGCAGTGGTTGAGG
GATTCGGTTGTTGAGATCGTGAAGAATCTGAGAGAGTCGCCGTTGTTGTTGCACCTGTAC
GCGGAGGCGAACGGAGGTTTGAGTACGACGGCGACGACGAATCCAGTGGAGGGAGATTGG
GAGGCGATGGAAGGAAGGTGGGATAGAGGAGAGGAGGAGACGTCAGAGGGAGTGATTTTC
GTTGAGAAGCTAGCGGACGATGAGGAGGATGATCACGATGCTGATGGTGGATACAACGGT
GGAGAAAGAAGTGGAACAAGCGCTTGGGGGATAGTGGCGCAGGGAAGAGGAACTGACTGT
GGACCGGTTTGCTACCTGTTGAAAACGACCCGGGTCGGATCGGGTATGGGGACGGTTTGC
ACGCATTTCTGTTTGGTGAAGGTGAAGAGTTTTAGGGAGACGGCTATGTCACAGTTCAAT
AACTCGTGGTTGGTGCAGACTGGTCAATGAATCAGAGAATAGGTTTTTATTTAGCAAAAA
AAGAATCAGAGAATAGGTTTCATGGTTCCTTATTTATACAGTGGTTGATTGTGTAGTTAT
TCTCTTTGGGTTGAATTATAAAACCCTTATCGAT

QA 1 874 1 874
DS 

RD RS1A146JQ 831 0 0
GGAAGCGCATGTGCCGTTCGTTGTGATCGGCGAACGGTGACAGTTCGATCATCGTGCGTG
GTTCCGGTGATTAATCGACGGACTTGGGTAGAGACCGGGAAGATTTCGATGACGAAGATA
ATGGCGGAGTTGACGCCGGTGAAGAACGGTGAAAGGAAACGTGGTGGAGCGGTCGTGTCG
CGAGAGAAGCTCGAGCAGTGGTTGAGGGATTCGGTTGTTGAGATCGTGAAGAATCTGAGA
GAGTCGCCGTTGTTGTTGCACCTGTACGCGGAGGCGAACGGAGGTTTGAGTACGACGGCG
ACGACGAATCCAGTGGAGGGAGATTGGGAGGCGATGGAAGGAAGGTGGGATAGAGGAGAG
GAGGAGACGTCAGAGGGAGTGATCTTCGTTGAGAAGCTAGCGGACGATGAGGAGGATGAT
CACGATGCTGATGGTGGATACAACGGTGGAGAAAGAAGTGGAACAAGCGCTTGGGGGATA
GTGGCGCAGGGAAGAGGAACTGACTGTGGACCGGTTTGCTACCTGTTGAAAACGACCCGG
GTCGGATCGGGTATGGGGACGGTTTGCACGCATTTCTGTTTGGTGAAGGTGAAGAGTTTT
AGGGAGACGGCTATGTCACAGTTCAATAACTCGTGGTTGGTGCAGACTGGTCAATGAATC
AGAGAATAGGTTTTTATTTAGCAAAAAAAGAATCAGAGAATAGGTTTCATGGTTCCTTAT
TTATACAGTGGTTGATTGTGTAGTTATTCTCTTTGGGTTGAATTATAAAACCCTTATCGA
TGATCAATGTACCTTTATTGTTGTTACAGTATATACATTCATCTTTCAACG

QA 1 831 1 831
DS 

RD RS1CR28JQ 792 0 0
GGTGACAGTTCGATCATCGTGCGTG*TTCCGGTGATTAATCGACGGACTTGGGTAGAGAC
CGGGAAGATTTCGATGACGAAGATAATGGCGGAGTTGACGCCGGTGAAGAACGGTGAAAG
GAAACGTGGTGGAGCGGTCGTGTCGCGAGAGAAGCTCGAGCAGTGGTTGAGGGATTCGGT
TGTTGAGATCGTGAAGAATCTGAGAGAGTCGCCGTTGTTGTTGCACCTGTACGCGGAGGC
GAACGGAGGTTTGAGTACGACGGCGACGACGAATCCAGTGGAGGGAGATTGGGAGGCGAT
GGAAGGAAGGTGGGATAGAGGAGAGGAGGAGACGCCAGAGGGAGTGATCTTCGTTGAGAA
GCTAGCGGACGATGAGGAGGATGATCACGATGCTGATGGTGGATACAACGGTGGAGAAAG
AAGTGGAACAAGCGCTTGGGGGATAGTGGCGCAGGGAAGAGGAACTGACTGTGGACCGGT
TTGCTACCTGTTGAAAACGACCCGGGTCGGATCGGGTATGGGGACGGTTTGCACGCATTT
CTGTTTGGTGAAGGTGAAGAGTTTTAGGGAGACGGCTATGTCACAGTTCAATAACTCGTG
GTTGGTGCAGACTGGTCAATGAATCAGAGAATAGGTTTTTATTTAGCAAAAAAAGAATCA
GAGAATAGGTTTCATGGTTCCTTATTTATACAGTGGTTGATTGTGTAGTTATTCTCTTTG
GGTTGAATTATAAAACCCTTATCGATGATCAATGTACCTTTATTGTTGTTACAGTATATA
CATTCATCTTTC

QA 1 792 1 792
DS 

RD RS1D283JQ 568 0 0
ACCTGTACGCGGAGGCGAACGGAGGTTTGAGTACGACGGCGACGACGAATCCAGTGGAGG
GAGATTGGGAGGCGATGGAAGGAAGGTGGGATAGAGGAGAGGAGGAGACGCCAGAGGGAG
TGATCTTCGTTGAGAAGCTAGCGGACGATGAGGAGGATGATCACGATGCTGATGGTGGAT
ACAACGGTGGAGAAAGAAGTGGAACAAGCGCTTGGGGGATAGTGGCGCAGGGAAGAGGAA
CTGACTGTGGACCGGTTTGCTACCTGTTGAAAACGACCCGGGTCGGATCGGGTATGGGGA
CGGTTTGCACGCATTTCTGTTTGGTGAAGGTGAAGAGTTTTAGGGAGACGGCTATGTCAC
AGTTCAATAACTCGTGGTTGGTGCAGACTGGTCAATGAATCAGAGAATAGGTTTTTATTT
AGCAAAAAAAGAATCAGAGAATAGGTTTCATGGTTCCTTATTTATACAGTGGTTGATTGT
GTAGTTATTCTCTTTGGGTTGAATTATAAAACCCTTATCGATGATCAATGTACCTTTATT
GTTGTTACAGTATATACATTCATCTTTC

QA 1 568 1 568
DS 



AS 2 6

CO CL679Contig1 836 4 5 U
CTAAGAACAAAGTGATTGCAGTTTATTAAATCTTCAAAATCAGACTCTACTCGCAGGAGC
TTTCATTGCGAGGCATTGTTCTTATTCCAAACAAACACTATTCGAAAGACAAAACTAAAA
GTGTTTTTATCAATTCTCTTTACTACTTCTTGACAAAGGTAACACCTTTCGCAATACTCC
CTCCAAGCTCTTTCTTCGCCTTCTCTAATCCCATCCTCTCGTATTCGTTCAATGGTCCGA
GACCGTACACTTCATCGACCCCACATCTTCCTAGACGCACCTTTGATGCGAAGAAGGGAA
GCTCAGTCACATGAGATGCCACAAATGCGCACTCGACAATGTTTGCATCGCCTCGTAGAC
CCCTGAGACAAGCATCTGCAAACTTCACTGCTGCGTAAGCCATTGATAGTGTTGCAGAAC
CTGCACCAGCTTTTGCCTCGACAACTTCAGTGCCACCATTTTGGATGCGGTCTGTGAGAT
ATTCAATCTCTTTCTGAGTGAAAGAGCAAGGAGGTTTCACCTGAGAAAGCAGAGGCAAGA
TTGTAACTCCTGCGTGTCCTCCAACGACCGGAACATCAACTTCTCGAGGATCAAGACTCA
TTACTTCCGCCACAAAAGTATTAGCTCTAACAACATCAAGCATGGTGACTCCCATGAGTT
TCTTCGGATCAAAAGTACCAGCTTTCTTGAAAACCTCGGCCGCGATCGGCACCGTGGAGT
TCACCGGATTACTGATGATATTCACAATCGCTTTGGGACAGCATTTGGCTATAGCTTCGG
AGAGCGTCCTGACGATGCCGGCGTTGATGTTGAAAAGATCATCCCTCGTCATCCCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FG68JQ U 1
AF RS1CW85JQ U 1
AF RS1BE58JQ U 3
AF RS1EG33TF C 143
BS 1 796 RS1CW85JQ
BS 797 800 RS1BE58JQ
BS 801 801 RS1EG33TF
BS 802 812 RS1BE58JQ
BS 813 836 RS1EG33TF

RD RS1FG68JQ 530 0 0
CT
AAGAACAAAGTGATTGCAGTTTATTAAATCTACAAAATCAGACTCTACTCGCAGGAGCTT
TCATTGCGAGGCATTGTTCTTATTCCAAACAAACACTATTCGAAAGACAAAACTAAAAGT
GTTTTTATCAATTCTCTTTACTACTTCTTGACAAAGGTAACACCTTTCGCAATACTCCCT
CCAAGCTCTTTCTTCGCCTTCTCTAATCCCATCCTCTCGTATTCGTTCAATGGTCCGAGA
CCGTACACTTCATCGACCCCACATCTTCCTAGACGCACCTTTGATGCGAAGAAGGGAAGC
TCAGTCACATGAGATGCCACAAATGCGCACTCGACAATGTTTGCATCGCCTCGTAAACCC
CTGAGACAAGCATCTGCAAACTTCACTGCTGCGTAAGCCATTGATAGTGTTGCAGAACCT
GCACCAGCTTTTGCCTCGACAACTTCAGTGCCACCATTTTGGATGCGGTCTGTGAGATAT
TCAATCTCTTTCTGAGTGAAAGAGCAAGGAGGTTTCACCTGAGAAAGC

QA 3 530 3 530
DS 

RD RS1CW85JQ 796 0 0
CTAAGAACAAAGTGATTGCAGTTTATTAAATCTTCAAAATCAGACTCTACTCGCAGGAGC
TTTCATTGCGAGGCATTGTTCTTATTCCAAACAAACACTATTCGAAAGACAAAACTAAAA
GTGTTTTTATCAATTCTCTTTACTACTTCTTGACAAAGGTAACACCTTTCGCAATACTCC
CTCCAAGCTCTTTCTTCGCCTTCTCTAATCCCATCCTCTCGTATTCGTTCAATGGTCCGA
GACCGTACACTTCATCGACCCCACATCTTCCTAGACGCACCTTTGATGCGAAGAAGGGAA
GCTCAGTCACATGAGATGCCACAAATGCGCACTCGACAATGTTTGCATCGCCTCGTAGAC
CCCTGAGACAAGCATCTGCAAACTTCACTGCTGCGTAAGCCATTGATAGTGTTGCAGAAC
CTGCACCAGCTTTTGCCTCGACAACTTCAGTGCCACCATTTTGGATGCGGTCTGTGAGAT
ATTCAATCTCTTTCTGAGTGAAAGAGCAAGGAGGTTTCACCTGAGAAAGCAGAGGCAAGA
TTGTAACTCCTGCGTGTCCTCCAACGACCGGAACATCAACTTCTCGAGGATCAAGACTCA
TTACTTCCGCCACAAAAGTATTAGCTCTAACAACATCAAGCATGGTGACTCCCATGAGTT
TCTTCGGATCAAAAGTACCAGCTTTCTTGAAAACCTCGGCCGCGATCGGCACCGTGGAGT
TCACCGGATTACTGATGATATTCACAATCGCTTTGGGACAGCATTTGGCTATAGCTTCGG
AGAGCGTCCTGACGAT

QA 1 796 1 796
DS 

RD RS1BE58JQ 810 0 0
AAGAACAAAGTGATTGCAGTTTATTAAATCTTCAAAATCAGACTCTACTCGCAGGAGCTT
TCATTGCGAGGCATTGTTCTTATTCCAAACAAACACTATTCGAAAGACAAAACTAAAAGT
GTTTTTATCAATTCTCTTTACTACTTCTTGACAAAGGTAACACCTTTCGCAATACTCCCT
CCAAGCTCTTTCTTCGCCTTCTCTAATCCCATCCTCTCGTATTCGTTCAATGGTCCGAGA
CCGTACACTTCATCGACCCCACATCTTCCTAGACGCACCTTTGATGCGAAGAAGGGAAGC
TCAGTCACATGAGATGCCACAAATGCGCACTCGACAATGTTTGCATCGCCTCGTAGACCC
CTGAGACAAGCATCTGCAAACTTCACTGCTGCGTAAGCCATTGATAGTGTTGCAGAACCT
GCACCAGCTTTTGCCTCGACAACTTCAGTGCCACCATTTTGGATGCGGTCTGTGAGATAT
TCAATCTCTTTCTGAGTGAAAGAGCAAGGAGGTTTCACCTGAGAAAGCAGAGGCAAGATT
GTAACTCCTGCGTGTCCTCCAACGACCGGAACATCAACTTCTCGAGGATCAAGACTCATT
ACTTCCGCCACAAAAGTATTAGCTCTAACAACATCAAGCATGGTGAATCCCATGAGTTTC
TTCGGATCAAAAGTACCAGCTTTCTTGAAAACCTCGGCCGCGATCGGCACCGTGGAGTTC
ACCGGATTACTGATGATATTCACAATCGCTTTGGGACAGCATTTGGCTATAGCTTCG*AG
AGCGTCCTGACGATGCCG*CGTTGATGTTG

QA 1 810 1 810
DS 

RD RS1EG33TF 694 0 0
CTACTTCTTGACAAAGGTAACAC*TTTCGCAATACTCC*TCCAAGCTCTTTCTTTGC*TT
CTCTAATCCCATCCTCTCGTATTCGTTCAATGGTCCGAGACCATACACTTCGTCGACCCC
ACATCTTCCTAGACGCACCTTTGATGCGAAGAAGGGAAGCTCAGTCACATGAGAGGCCAC
AAATGCACACTCGACAATGTTTGCATCGCCTCGTAGACCCCTGAGACAAGCATCTGCAAA
CTTCACTACTGCGTAAGCCATTGATAATGTTGCAGAACCTGCACCAGCTTTTGCCTCGAC
AACTTCAGTGCCACCATTTTGGATGCGGTCTGTGAGATATTCAATCTCTTTCTGAGTGAA
AGAGCAAGGAGGTTTCACCTGAGAAAGCAGAGGCAAGATTGTAACTCCTGCGTGTCCTCC
AACAACTGGAACATCAACTTCTCGAGGATCAAGACTCATTACTTCCGCCACAAAAGTATT
AGCTCTAACAACATCAAGCATGGTGACTCCCATGAGTTTCTTCGGATCAAAAGTACCAGC
TTTCTTGAAAACCTCCGCTGCGATCGGCACCGTGGAGTTCACCGGATTACTGATGATATT
CACAATCGCTTTGGGACAGCACTTGGCTATAGCTTCGGAGAGCGTCCTGACGATGCCGGC
GTTGATGTTGAAAAGATCATCCCTCGTCATCCCC

QA 1 694 1 694
DS 



CO CL679Contig2 744 2 7 U
GGAAAGTAATCAAACCTTTAATCAAACCTTTAATCGGAGCAGAAAAAAAAAAAAGAAGAA
GCAGAGCTATGGATGCAAACCAAAGAATCGCAAGAATCTCCGCTCATCTTAACCCTCCTA
ATCTCGATCAGAATGGTTCCGGGTCGGATCTGAGACGGGTGGGTTGTCGGGCGAAAGGCG
GATCTCCCGGATTCAAAGTGGCGATACATGGAGCAGCGGGAGGGATAGGACAGCCACTAG
CGATGTTGATGAAGATGAATCCTCTGGTCTCGCTTCTCCATCTCTACGACGTTGCTAACG
CTCCTGGTGTCACCGCTGATATTAGTCACATGGACACTAGTGCCATCGTTCGTGGATTTC
TCGGGCAACCGCAATTAGAGGAGGCACTTACGGGTATGGATCTAGTGATTATACCAGCTG
GAGTTCCGAGGAAGCCAGGGATGACGAGGGATGATCTTTTCAACATCAACGCTGGCATCG
TCAGGACGCTCTCCGAAGCTATAGCCAAATGCTGTCCCAAAGCGATTGTGAATATCATCA
GTAATCCGGTGAACTCCACGGTGCCGATCGCGGCCGAGGTTTTCAAGAAAGCTGGTACTT
TTGATCCGAAGAAACTCATGGGAGTCACCATGCTTGATGTTGTTAGAGCTAATACTTTTG
TGGCGGAAGTAATGAGCCTTGATCCTCGAGAAGTTGATGTTCCCGGTCGTTGGAGGACAC
GCAGAGTTACAATCTTGCCTCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FG68TF U 1
AF RS1CW85TF U 1
BS 1 51 RS1CW85TF
BS 52 54 RS1FG68TF
BS 55 467 RS1CW85TF
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RD RS1FG68TF 712 0 0
AGGAAGT
AATCAAACCTTTAATCAAACCTTTAATCGGAGCAGAAAAAAAAAAAAGAAGAAGCAGAGC
TATGGATGCAAACCAAAGAATCGCAAGAATCTCCGCTCATCTTAACCCTCCTAATCTCGA
TCAGAATGGTTCCGGGTCGGAT*TGAGACGGGTGGGTTGTCGGGCGAAAGGCGGATCTCC
CGGATTCAAAGTGGCGATACTTGGAGCAGCGGGAGGGATAGGACAGCCACTAGCGATGTT
GATGAAGATGAATCCTCTGGTCTCGCTTCTCCATCTCTACGACGTTGCTAACGCTCCTGG
TGTCACCGCTGATATTAGTCACATGGACACTAGTGCCATCGTTCGTGGATTTCTCGGGCA
ACCGCAATTAGAGGAGGCACTTACGGGTATGGATCTAGTGATTATACCAGCTGGAGTTCC
GAGGAAGCCAGGGATGACGAGGGATGATCTTTTCAACATCAACGCTGGCATCGTCAGGAC
GCTCTCCGAAGCTATAGCCAAATGCTGTCCCAAAGCGATTGTGAATATCATCAGTAATCC
GGTGAACTCCACGGTGCCGATCGCGGCCGAGGTTTTCAAGAAAGCTGGTACTTTTGATCC
GAAGAAACTCATGGGAGTCACCATGCTTGATGTTGTTAGAGCTAATACTTTTGTGGCGGA
AGTAATGAGCCTTGATCCTCGAGAAGTTGATGTTCC*GGTCGTTG

QA 8 712 8 712
DS 

RD RS1CW85TF 744 0 0
GGAAAGTAATCAAACCTTTAATCAAACCTTTAATCGGAGCAGAAAAAAAAA***GAAGAA
GCAGAGCTATGGATGCAAACCAAAGAATCGCAAGAATCTCCGCTCATCTTAACCCTCCTA
ATCTCGATCAGAATGGTTCCGGGTCGGATCTGAGACGGGTGGGTTGTCGGGCGAAAGGCG
GATCTCCCGGATTCAAAGTGGCGATACATGGAGCAGCGGGAGGGATAGGACAGCCACTAG
CGATGTTGATGAAGATGAATCCTCTGGTCTCGCTTCTCCATCTCTACGACGTTGCTAACG
CTCCTGGTGTCACCGCTGATATTAGTCACATGGACACTAGTGCCATCGTTCGTGGATTTC
TCGGGCAACCGCAATTAGAGGAGGCACTTACGGGTATGGATCTAGTGATTATACCAGCTG
GAGTTCCGAGGAAGCCAGGGATGACGAGGGATGATCTTTTCAACATCGACGCTGGCATCG
TCAGGACGCTCTCCGAAGCTATAGCCAAATGCTGTCCCAAAGCGATTGTGAATATCATCA
GTAATCCGGTGAACTCCACGGTGCCGATCGCGGCCGAGGTTTTCAAGAAAGCTGGTACTT
TTGATCCGAAGAAACTCATGGGAGTCACCATGCTTGATGTTGTTAGAGCTAATACTTTTG
TGGCGGAAGTAATGAGTCTTGATCCTCGAGAAGTTGATGTTCCCGGTCGTTGGAGGACAC
GCAGAGTTACAATCTTGCCTCTGC

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 8

CO CL680Contig1 759 8 17 U
GGTCGGAAATGGTACCAACGGAATAGTTCTTTATCATTAAACTTTTTCTTTAATTTAATT
CTGGTGAACATTATTTGAGAAAACATAAAGCAAAACGTAACCAAAGTAACACATCTCAAT
CAAAATACGGGAAACTAGGAAATAAAAATCGATTAAGGTGTTAACTAATGTAGGGAACTC
CTTTTTTACCCAAAAAACTAATAAAACCCTTTCACCACTTTCCTTGAAGTTTGTATCCTC
CGATGACGCTCATTAACGTCGCGTTTTAGCTTCGACTTGTATGAACCTCCCACTTCTGCG
GCAGTGCCTAAGAATCCGGTCTGAGTTCCGTCGCTGTCGTTGTCAATGTCTCCTTCAATC
GTCAATCCTTTGATCCTAGCCGCAATGGATTCCTCTTTTACCCCAACATCCACATTTGGA
TTAGAGAAAAACCAAAGGACTAGAGCACAAGCGAGAAGAACAAATGGGATTATGTGAACA
GCATTTTCAGCAAACTTGGCACGTGACTTCTCTTTCTTTGTTACCTCCTGGCTCGTAGGA
TCGTATGTAGTCGGCTCGTCTTCATCTAGGCCTTTCCATAATCCCTTTGGCGCGGACCAA
GGTACTGAGTAATCCTCAGTCACACGGCTCCAGCTTGCGGATCGGTACATATTCTGTGTT
TGCTTCAGTCTTATTGTGGGTAGTAAGGATTGAATCACTTTATTTGCCCAAGAAACTTAA
AAGGTAAAAGACTACCTTTGTGGCCCCCGGCCGTAATGG


BQ
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40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AS 2 8

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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A122TF U 1
AF RS1A122TV U 1
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QA 1 790 1 790
DS 



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TAAAAAGAAGAAGATGGAATTTTCTCCTTGGGAGCTTGCTGTTTACGTTGGTCTCATTTG
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GTTAATTTTTATAAACCGTTTGCTTTCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DC10TF U 53
AF RS1GO04TF U 1
AF RS1DC10JQ C 53
AF RS1GO04JQ C 92
AF RS1FE58JQ C 53
AF RS1FE58TF U 377
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TAAAAAGAAGAAGATGGAATTTTCTCCTTGGGAGCTTGCTGTTTACGTTGGTCTCATTTG
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TCTTT

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QA 3 699 3 699
DS 

RD RS1GO04JQ 659 0 0
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TCTTT

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DS 

RD RS1FE58JQ 695 0 0
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ATGGGCTAAACAGCTTAAAAAGGATGGCAAATTTGAACATGCCTACGAGATCTTTGAGTG
GATGGATAAAAAGAAGAAGATGGAATTTTCTCCTTGGGAGCTTGCTGTTTACGTTGGTCT
CATTTGTCAGACTAAAGGCATAGATGTGGCTCAAGAATACTTCAATAAAGTAGAACCAGT
CTTTGATAGAAGCAACAACCTTGCCAAGAATGCGCCTGCTTATGTTACTATTGTGGTGAG
GATCCTTGAATATGATAGGAAAAACTCTTTGTGTCAAGAAAGGCCAAGGCGTGTTCGTCG
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TCTCTACTTTTCTGTTCTCCTTGTTTTAATCTCTCGCCCAAAACAATAGTTATGTAGTTC
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CC

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GCCAAGAATGCGCCTGCTTATGTTACTATTGTGGTGAGGATCCTTGAATATGATAGGAAA
AACTCTTTGTGTCAAGAAAGGCCAAGGCGTGTTCGTCGCATTCGCAAGAACGTTTAATTC
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GTTTTAATCTCTCGCCCAAAACAATAGTTATGTAGTTCCTCTTTGTTAATTTTTATAAAC
CGTTTGCTT
CC

QA 1 369 1 369
DS 



AS 2 8

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TGAAGCTATTGAAACCGCAAAGCAACTAGCTCTCCAAGAAGGCTTGTTGGTTGGTATATC
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CTTGACCTACAAGGAACCTCTTCTTTGATTTCTTTCTTGTTTCTCTCTCACTCTACTTCA
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AGGCGTAATTGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 
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AGCTTGTGTTGACTGAACCTGCAAAAGGCATGACCGGTGCAATTCA

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AAGAGGG

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G
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ACAGGGATAGGTCTTGCTTTTATTGCTGCTTCGAAAGGATATAAACTTATCTTGACGATG
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TACGAGACAACTGGTCCTGAGATTTGGGAAGATACAAGAGGGAAGGTGGATATATTGGTT
GCGGGAATTGGAACTGGTGGAACCATTACGGGTGTTGGTCGATACATTAAAGAAAGAAAA
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TTTGCGTTT

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ATCTTCTGGAGCGACTGCTGCTGCTGCAATCCAGGTCGCAAAGAGACCTGAAAATGCCGG
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TCAACTGTATTTTTGCGTTTTACAATGTGCACAACGCAATTGGTGTTTATT

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AGGCTGAAGAGATCTTGAAGAACACTCCCAACTCCTACATGCTCCAACAGTTTGACAACC
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CCATACTTGCTGGAGGAAAACCAGGACCCCACAAGATTCAAGGGATTGGAGCTGGATT*A
TTCCTAAGAATTTGGATCAGACTATTGTAGATGAGTACATAGCGATTTCCAGTGATGAAG
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GAGCGGCTGCTGCTGCTGCAATCCAGGTCGCAAAGAGACCTGAAAATGCCGGGAAACTCA
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CCTACAAGGAACCTCTTCTTTGATTTCTTTCTTGTTTCTCTCTCACTCTACTTCAACTGT
ATTTTTGCGTTTTACAATGTGCACAACGCAATTGGTGTTTATTAATAAATGCACAAGGCG
TAATTGTCCC

QA 1 850 1 850
DS 



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GGATCTTTTGTGTGATACAATTTTGGGAAAGCAAGGACGAAAGATCCAAACCATGGCTGC
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E355TF U 1
AF RS1GR12TF U 7
BS 1 167 RS1E355TF
BS 168 168 RS1GR12TF
BS 169 239 RS1E355TF
BS 240 240 RS1GR12TF
BS 241 590 RS1E355TF
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RD RS1E355TF 590 0 0
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GTGCAAGGCTGTGTCTGCAAAGGTCGAAGCTGGTGTTGAAGGGCTCAATATCGCTGAGAA
TGCCGCTCAGCTTATTGGGAAAACTCCAATGGTGTACTTGAACAATATAGTCAAGGGTTC
TGTTGCAAGTGTTGCTGCTAAGCTTGAGATCATGGAGCCATGTTGCAGTGTCAAGGATAG
GATTGGGTATAGTATGATTACTGATGCTGAGGAAAAAGGACTTATCACACCTGGAAAGAG
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DS 

RD RS1GR12TF 639 0 0
GGG
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TTCTGCCTCTGCTTTCCTCCTTAATCCGTTGACTTCTCGCCACCGTCCTTTCAACCACTC
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TGTGTCTGCAAAGGTCGAAGCTGGTGTTGAAGGGCTCAATATCGCTGAGAGTGCCGCTCA
GCTTATTGGGAAAACTCCAATGGTGTACTTGAACAATATAGTCAAGGGTTCTGTTGCAAG
TGTTGCTGCTAAGCTTGAGATCATGGAGTCATGTTGCAGTGTCAAGGATAGGATTGGGTA
TAGTATGATTACTGATGCTGAGGAAAAAGGACTTATCACACCTGGAAAGAGTGTTCTTGT
GGAATCAACAAGTGGAAACACAGGGATAGGTTTTGCTTTTATTGCTGCTTCGAAAGGGTA
TAAACTTATCTTGACGATGCCAGCGTCCATGAGTTTGGAAAGAAGGGTTCTTTTGAGGGC
GTTTGGGGCTGAGCTTGTGTTGACTGAACCTGCAAA

QA 4 639 4 639
DS 



AS 1 7

CO CL683Contig1 1401 7 9 U
GGACCCATCACACACTCCTCTCAAAACAGAGAAACGAAAAAAAAAGAAACATTCCAAGAA
TATCTTAGAGATTTCAAGAAAAATGGGATCAACGGCAGAGACACAGATAACTCCGGTCCA
AGTCACCGACGACGAAGCCGCTCTCTTTGCCATGCAGCTAGCCAGCGCCTCCGTTCTTCC
GATGGTTTTAAAGTCCGCGCTAGACCTTGATCTTCTCGAGATCATGGCCAAGAACTCTTC
TCCGATGTCTCCTTCTGAGATTGCTTCTAAACTTCAGACCAAAAACCCCGAAGCTCCGGT
CATGCTCGACCGAATCCTCCGGCTTCTCACGTCTTACTCCATCCTCACCTGCTCCAACCG
TACTACTCCCGGCGGAGACGGCGTCGAGAGGATTTACGGGCTTGGTCCAGTTTGCAAGTA
CTTGACCAAGAACGAAGATGGTGTCTCGATAGCTGCTCTTTGTCTTATGAACCAAGACAA
GGTTCTGATGGAAAGCTGGTACCATTTGAAAGATGCAATTCTTGATGGTGGGATTCCATT
CAACAAGGCTTATGGAATGACCGCTTTTGAGTACCACGGTAAGGACCTAAGGTTCAACAC
GGTCTTTAACAACGGAATGTCTAACCATTCAACCATCACAATGAAGAAGATTCTTGAGAC
CTATAAGGGTTTTGAGGAATTGACTTCTTTGGTTGATGTTGGTGGT**GGTATTGGTGCC
ACTCTCAAAATGATTGTCTCTAAGTACCCTAACCTTAAAGGCATCAACTTTGATCTCCCC
CATGTCATTGAAGAAGCTACTTCTCATCCCGGTATTGAACATGTTGGAGGAGATATGTTT
GTAAGTGTCCCTAAAGGTGATGCCATTTTCATGAAGTGGATATGCCACGACTGGAGTGAT
GAACACTGTGTGAAATTCCTGAAGAACTGCTACAAGGCGCTTCCAGAGGATGGAAAAGTG
ATACTAGCAGAGTGTATACTTCCAGAGACACCAGACTCCAGCCTCTCGACCAAACAAGTG
GTCCATGTTGATTGCATTATGTTGGCTCACAACCCTGGAGGCAAAGAACGGACTGAGAAA
GAGTTTGAAGCATTAGCTAAAGAATCAGGCTTCAAAGGCATCAAAGTTGCCTGCAATGCT
TTTGGTGTTTACGTTATTGAGCTGCTCAAAAAGATGTAAAAACTCACACAGGCACAAATC
CATGTAATGATGATTTTATATGTAAGCATTTCTCCCATGTCTACGTGTACTTCACCACCT
TTGTTTTAAAACCATGATGTTTAATAAAGGTTTGTTAAGAGATTGATTCTAGAGTTTTCA
ATTATCTGGTTATTGATATCTTATTTGTTTGGAACAAATTATGTAATCAAAGAAAAAATA
ATAATGAGATACTATTACCCT


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AD53TF U 4
AF RS1F350TF U 1
AF RS1D616TF U 1
AF RS1F350JQ C 491
AF RS1D616JQ C 508
AF RS1E975JQ C 1069
AF RS1E975TF U 1069
BS 1 267 RS1D616TF
BS 268 268 RS1F350TF
BS 269 668 RS1D616TF
BS 669 669 RS1F350JQ
BS 670 705 RS1D616TF
BS 706 708 RS1F350JQ
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BS 726 1069 RS1F350JQ
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RD RS1AD53TF 386 0 0
GG
CATCACACACTCCTCTCAAAACAGAGAAACGAAAAAAAAAGAAACATTCCAAGAATATCT
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TGTCTCCTTCTGAGATTGCTTCTAAACTTCAGACCAAAAACCCCGAAGCTCCGGTCATGC
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CTCCCGGCGGAGACGGCGTCGAGA

QA 3 386 3 386
DS 

RD RS1F350TF 476 0 0
GGACC
CATCACACACTCCTCTCAAAACAGAGAAACGAAAAAAAAAGAAACATTCCAAGAATATCT
TAGAGATTTCAAGAAAAATGGGATCAACGGCAGAGACACAGATAACTCCGGTCCAAGTCA
CCGACGACGAAGCCGCTCTCTTTGCCATGCAGCTAGCCAGCGCCTCCGTTCTTCCGATGG
TTTTAAAGTCCGCGCTAGACCTTGATCTTCTCGAGATCATGGCCAAGAACTCTTCTCCGA
TGTCTCCTTCTGAGATTGCTTCTAAACTTCAGACCAAAAACCCCGAAGCTCCGGTCATGC
TCGACCGAATCCTCCGGCTTCTCACGTCTTACTCCATCCTCACCTGCTCCAACCGTACTA
CTCCCGGCGGAGACGGCGTCGAGAGGATTTACGGGCTTGGTCCAGTTTGCAAGTACTTGA
CCAAGAACGAAGATGGTGTCTCGATAGCTGCTCTTTGTCTTATGAACCAAG

QA 6 476 6 476
DS 

RD RS1D616TF 725 0 0
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TATCTTAGAGATTTCAAGAAAAATGGGATCAACGGCAGAGACACAGATAACTCCGGTCCA
AGTCACCGACGACGAAGCCGCTCTCTTTGCCATGCAGCTAGCCAGCGCCTCCGTTCTTCC
GATGGTTTTAAAGTCCGCGCTAGACCTTGATCTTCTCGAGATCATGGCCAAGAACTCTTC
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CATGCTCGACCGAATCCTCCGGCTTCTCACGTCTTACTCCATCCTCACCTGCTCCAACCG
TACTACTCCCGGCGGAGACGGCGTCGAGAGGATTTACGGGCTTGGTCCAGTTTGCAAGTA
CTTGACCAAGAACGAAGATGGTGTCTCGATAGCTGCTCTTTGTCTTATGAACCAAGACAA
GGTTCTGATGGAAAGCTGGTACCATTTGAAAGATGCAATTCTTGATGGTGGGATTCCATT
CAACAAGGCTTATGGAATGACCGCTTTTGAGTACCACGGTAAGGACCTAAGGTTCAACAC
GGTCTTTAACAACGGAATGTCTAACCATTCAACCATCACAATGAAGAAGATTCTTGAGAC
CTATAAGG*TTTTGAGGAATTGACTTCTTTGGTTGATGTTGGTGGGTGGGTATTGGTGCC
ACTCT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1F350JQ 811 0 0
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AAGAAGCTACTTCTCATCCCGGTATTGAACATGTTGGAGGAGATATGTTTGTAAGTGTCC
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ACGTTATTGAGCTGCTCAAAAAGATGTAAAAACTCACACAGGCACAAATCCATGTAATGA
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ACCATGATGTTTAATAAAGGTTTGTTAAGAG

QA 1 811 1 811
DS 

RD RS1D616JQ 794 0 0
GAAAGATGCAATTCTTGATGGTGGGATTCCATTCAACAAGGCTTATGGAATGACCGCTTT
TGAGTACCACGGTAAGGACCTAAGGTTCAACACGGTCTTTAACAACGGAATGTCTAACCA
TTCAACCATCACAATGAAGAAGATTCTTGAGACCTATAAGGGTTTTGAGGAATTGACTTC
TTTGGTTGATGTTGGTGGT**GGTATTGGTGCCACTCTCAAAATGATTGTCTCTAAGTAC
CCTAACCTTAAAGGCATCAACTTTGATCTCCCCCATGTCATTGAAGAAGCTACTTCTCAT
CCCGGTATTGAACATGTTGGAGGAGATATGTTTGTAAGTGTCCCTAAAGGTGATGCCATT
TTCATGAAGTGGATATGCCACGACTGGAGTGATGAACACTGTGTGAAGTTCCTGAAGAAC
TGCTACAAGGCGCTTCCAGAGGATGGAAAAGTGATACTAGCAGAGTGTATACTTCCAGAG
ACACCAGACTCCAGCCTCTCGACCAAACAAGTGGTCCATGTTGATTGCATTATGTTGGCT
CACAACCCTGGAGGCAAAGAACGGACTGAGAAAGAGTTTGAAGCATTAGCTAAAGAATCA
GGCTTCAAAGGCATCAAAGTTGCCTGCAATGCTTTTGGTGTTTACGTTATTGAGCTGCTC
AAAAAGATGTAAAAACTCACACAGGCACAAATCCATGTAATGATGATTTTATATGTAAGC
ATTTCTCCCATGTCTACGTGTACTTCACCACCTTTGTTTTAAAACCATGATGTTTAATAA
AGGTTTGTTAAGAG

QA 1 794 1 794
DS 

RD RS1E975JQ 333 0 0
G
GGACTGAGAAAGAGTTTGAAGCATTAGCTAAAGAATCAGGCTTCAAAGGCATCAAAGTTG
CCTGCAATGCTTTTGGTGTTTACGTTATTGAGCTGCTCAAAAAGATGTAAAAACTCACAC
AGGCACAAATCCATGTAATGATGATTTTATATGTAAGCATTTCTCCCATGTCTACGTGTA
CTTCACCACCTTTGTTTTAAAACCATGATGTTTAATAAAGGTTTGTTAAGAGATTGATTC
TAGAGTTTTCAATTATCTGGTTATTGATATCTTATTTGTTTGGAACAAATTATGTAATCA
AAGAAAAAATAATAATGAGATACTATTACCCT

QA 2 333 2 333
DS 

RD RS1E975TF 333 0 0
G
GGACTGAGAAAGAGTTTGAAGCATTAGCTAAAGAATCAGGCTTCAAAGGCATCAAAGTTG
CCTGCAATGCTTTTGGTGTTTACGTTATTGAGCTGCTCAAAAAGATGTAAAAACTCACAC
AGGCACAAATCCATGTAATGATGATTTTATATGTAAGCATTTCTCCCATGTCTACGTGTA
CTTCACCACCTTTGTTTTAAAACCATGATGTTTAATAAAGGTTTGTTAAGAGATTGATTC
TAGAGTTTTCAATTATCTGGTTATTGATATCTTATTTGTTTGGAACAAATTATGTAATCA
AAGAAAAAATAATAATGAGATACTATTACCCT

QA 2 333 2 333
DS 



AS 2 8

CO CL684Contig1 1012 6 9 U
CTGGGTACATTTTATTTATTTATTTTAAATTCTGGTCCCTCTTGCAACTTGCACATCTAC
TCAATTCTTTGATTCATACTCTCTGGACATCTCTACCAATTAAATACTTTAGACTCATCC
TGAGCCTCTTTGAGCCATGAAAGAACACAGTAGCTCCATTGTCACAGGAACTCTTTATTA
CACATTAACTACACTAATCCAACATTTTTCTTCGCTCTCTATACATGATACTTCACATAC
TTAGATATTTACCTATACTAATTAAAACTTAAGCATCACCAATCCCATTAGTTCGATGAT
GAATTACTGGAAGTTGTTCCTTGAGGCTCCGGTACATCGGTTCTTCTCCTCTTCCGGCAA
GAATTGACCGGAGCATCATACTTTCCTGCATCCAAAGGAAAGTTGAGCACAGCTTTTCTT
CCCCTGAGCTTAAAAGCTTCATAGTCATAAGCTCTCGCAGCATCAATGTCACTCTCAAAA
GTGCCTAGCCAAATCCTTGATCCTTTCTTAGCCGGATCTCGAATCTCTGCTGCGAATTTT
CCCCACGGCCTCCTTCTCACGCCTCTGTAATGCCTTGTCTCTTCAGCTCTCTTTGATCTT
TTCCGGTTTGAGACAGTTTCAACCTCAGTTGATGCTGTGGTTGTAGTTGTTGTTGTTGTT
GTTGATGATGATGATTCTGCTTCCATTTGCAGAAACTCTTGGACATAGGAATCTGGATCA
AGAACCGGTGAACCAGGTTCCTGTTTAGGAACTTGGTTCAAGGGTTCTAGAGACCAGAGT
CCTGAGAAAAAATCAGCATCATCAAAGACAAAATCTTCCATGAAACCATCAGGCATCATC
AGGTCCTCAAATAGATGCTTATGTATATCATCCAAATCAGAGCTTTCCTCAATGGTTGCC
ATATTTTATTTTCTTATATGCAGACAAGACAGAAGAAGAAAAGTCTTGCAAGTGATGTTT
TCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1DO77JQ U 1
AF RS1DO77TF C 1
AF RS1A385JQ U 144
AF RS1A385TR U 141
AF RS1A385TF C 162
AF RS1A385TV C 221
BS 1 181 RS1DO77JQ
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BS 923 1012 RS1A385TF

RD RS1DO77JQ 587 0 0
CTGGGTACATTTTATTTATTTATTTTAAATTCTGGTCCCTCTTGCAACTTGCACATCTAC
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TGAGCCTCTTTGAGCCATGAAAGAACACAGTAGCTCCATTGTCACAGGAACTCTTTATTA
CGCATTAACTACACTAATCCAACATTTTTCTTCGCTCTCTATACATGATACTTCACATAC
TTAGATATTTACCTATACTAATTAAAACTTAAGCATCACCAATCCCATTAGCTCGATGAT
GAATTACTGGAAGTTGTTCCTTGAGGCTCCGGTACATCGGTTCTTCTCCTCTTCCGGCAA
GAATTGACCGAAGCATCATACTTTCCTGCATCCAAAGGAAAGTTGAGCACAGCTTTTCTT
CCCCTGAGCTTAAAAGCTTCATAGTCATAAGCTCTCGCAGCATCAATGTCACTCTCAAAA
GTGCCTAGCCAAATCCTTGATCCTTTCTTAGCCGGATCTCGAATCTCTGCTGCGAATTTT
CCCCACGGCCTCCTTCTCACGCCTCTGTAATGCCTTGTCTCTTCAGC

QA 1 587 1 587
DS 

RD RS1DO77TF 587 0 0
CTGGGTACATTTTATTTATTTATTTTAAATTCTGGTCCCTCTTGCAACTTGCACATCTAC
TCAATTCTTTGATTCATACTCTCTGGACATCTCTACCAATTAAATACTTTAGACTCATCC
TGAGCCTCTTTGAGCCATGAAAGAACACAGTAGCTCCATTGTCACAGGAACTCTTTATTA
CGCATTAACTACACTAATCCAACATTTTTCTTCGCTCTCTATACATGATACTTCACATAC
TTAGATATTTACCTATACTAATTAAAACTTAAGCATCACCAATCCCATTAGCTCGATGAT
GAATTACTGGAAGTTGTTCCTTGAGGCTCCGGTACATCGGTTCTTCTCCTCTTCCGGCAA
GAATTGACCGAAGCATCATACTTTCCTGCATCCAAAGGAAAGTTGAGCACAGCTTTTCTT
CCCCTGAGCTTAAAAGCTTCATAGTCATAAGCTCTCGCAGCATCAATGTCACTCTCAAAA
GTGCCTAGCCAAATCCTTGATCCTTTCTTAGCCGGATCTCGAATCTCTGCTGCGAATTTT
CCCCACGGCCTCCTTCTCACGCCTCTGTAATGCCTTGTCTCTTCAGC

QA 1 587 1 587
DS 

RD RS1A385JQ 620 0 0
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ATTTTTCTTCGCTCTCTATACATGATACTTCACATACTTAGATATTTACCTATACTAATT
AAAACTTAAGCATCACCAATCCCATTAGTTCGATGATGAATTACTGGAAGTTGTTCCTTG
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TCCTGCATCCAAAGGAAAGTTGAGCACAGCTTTTCTTCCCCTGAGCTTAAAAGCTTCATA
GTCATAAGCTCTCGCAGCATCAATGTCACTCTCAAAAGTGCCTAGCCAAATCCTTGATCC
TTTCTTAGCCGGATCTCGAATCTCTGCTGCGAATTTTCCCCACGGCCTCCTTCTCACGCC
TCTGTAATGCCTTGTCTCTTCAGCTCTCTTTGATCTTTTCCGGTTTGAGACAGTTTCAAC
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CATTTGCAGAAACTCTTGGACATAGGAATCTGGATCAAGAACCGGTGAACCAGGTTCCTG
TTTAGGAACTTGGTTCAAGG

QA 1 620 1 620
DS 

RD RS1A385TR 782 0 0
TTT
AACACAGTAGTTCCATTGTCACAGGAACTCTTTATTACACATTAACTACACTAATCCAAC
ATTTTTCTTCGCTCTCTATACATGATACTTCACATACTTAGATATTTACCTATACTAATT
AAAACTTAAGCATCACCAATCCCATTAGTTCGATGATGAATTACTGGAAGTTGTTCCTTG
AGGCTCCGGTACATCGGTTCTTCTCCTCTTCCGGCAAGAATTGACCGGAGCATCATACTT
TCCTGCATCCAAAGGAAAGTTGAGCACAGCTTTTCTTCCCCTGAGCTTAAAAGCTTCATA
GTCATAAGCTCTCGCAGCATCAATGTCACTCTCAAAAGTGCCTAGCCAAATCCTTGATCC
TTTCTTAGCCGGATCTCGAATCTCTGCTGCGAATTTTCCCCACGGCCTCCTTCTCACGCC
TCTGTAATGCCTTGTCTCTTCAGCTCTCTTTGATCTTTTCCGGTTTGAGACAGTTTCAAC
CTCAGTTGATGCTGTGGTTGTAGTTGTTGTTGTTGTTGTTGATGATGATGATTCTGCTTC
CATTTGCAGAAACTCTTGGACATAGGAATCTGGATCAAGAACCGGTGAACCAGGTTCCTG
TTTAGGAACTTGGTTCAAGGGTTCTAGAGACCAGAGTCCTGAGAAAAAATCAGCATCATC
AAAGACAAAATCTTCCATGAAACCATCAGGCATCATCAGGTCCTCAAATAGATGCTTATG
TATATCATCCAAATCAGAGCTTTCCTCAATGGTTGCCATATTTTATTTTCTTATATGCA

QA 4 782 4 782
DS 

RD RS1A385TF 851 0 0
TCACAGGAACTCTTTATTACACATTAACTACACTAATCCAACATTTT*CTTCGCTCTCTA
TACATGATACTTCACATACTTAGATATTTACCTATACTAATTAAAACTTAAGCATCACCA
ATCCCATTAGTTCGATGATGAATTACTGGAAGTTGTTCCTTGAGGCTCCGGTACATCGGT
TCTTCTCCTCTTCCGGCAAGAATTGACCGGAGCATCATACTTTCCTGCATCCAAAGGAAA
GTTGAGCACAGCTTTTCTTCCCCTGAGCTTAAAAGCTTCATAGTCATAAGCTCTCGCAGC
ATCAATGTCACTCTCAAAAGTGCCTAGCCAAATCCTTGATCCTTTCTTAGCCGGATCTCG
AATCTCTGCTGCGAATTTTCCCCACGGCCTCCTTCTCACGCCTCTGTAATGCCTTGTCTC
TTCAGCTCTCTTTGATCTTTTCCGGTTTGAGACAGTTTCAACCTCAGTTGATGCTGTGGT
TGTAGTTGTTGTTGTTGTTGTTGATGATGATGATTCTGCTTCCATTTGCAGAAACTCTTG
GACATAGGAATCTGGATCAAGAACCGGTGAACCAGGTTCCTGTTTAGGAACTTGGTTCAA
GGGTTCTAGAGACCAGAGTCCTGAGAAAAAATCAGCATCATCAAAGACAAAATCTTCCAT
GAAACCATCAGGCATCATCAGGTCCTCAAATAGATGCTTATGTATATCATCCAAATCAGA
GCTTTCCTCAATGGTTGCCATATTTTATTTTCTTATATGCAGACAAGACAGAAGAAGAAA
AGTCTTGCAAGTGATGTTTTCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGG
TACCGTCGACT

QA 1 851 1 851
DS 

RD RS1A385TV 792 0 0
ATACATGATACTTCACATACTTAGATATTTACCTATACTAATTAAAACTTAAGCATCACC
AATCCCATTAGTTCGATGATGAATTACTGGAAGTTGTTCCTTGAGGCTCCGGTACATCGG
TTCTTCTCCTCTTCCGGCAAGAATTGACCGGAGCATCATACTTTCCTGCATCCAAAGGAA
AGTTGAGCACAGCTTTTCTTCCCCTGAGCTTAAAAGCTTCATAGTCATAAGCTCTCGCAG
CATCAATGTCACTCTCAAAAGTGCCTAGCCAAATCCTTGATCCTTTCTTAGCCGGATCTC
GAATCTCTGCTGCGAATTTTCCCCACGGCCTCCTTCTCACGCCTCTGTAATGCCTTGTCT
CTTCAGCTCTCTTTGATCTTTTCCGGTTTGAGACAGTTTCAACCTCAGTTGATGCTGTGG
TTGTAGTTGTTGTTGTTGTTGTTGATGATGATGATTCTGCTTCCATTTGCAGAAACTCTT
GGACATAGGAATCTGGATCAAGAACCGGTGAACCAGGTTCCTGTTTAGGAACTTGGTTCA
AGGGTTCTAGAGACCAGAGTCCTGAGAAAAAATCAGCATCATCAAAGACAAAATCTTCCA
TGAAACCATCAGGCATCATCAGGTCCTCAAATAGATGCTTATGTATATCATCCAAATCAG
AGCTTTCCTCAATGGTTGCCATATTTTATTTTCTTATATGCAGACAAGACAGAAGAAGAA
AAGTCTTGCAAGTGATGTTTTCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCG
GTACCGTCGACT

QA 1 792 1 792
DS 



CO CL684Contig2 760 2 2 U
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CCTGATGATCCCTGATGGTTTCATGGAAGATTTTGTCTTTGATGATGCTGATTTTTTCTC
AGGACTCTGGTCTCTAGAACCCTTGAACCAAGTTCCTAAACAGGAACCTGGTTCACCGGT
TCTTGATCCAGATTCCTATGTCCAAGAGTTTCTGCAAATGGAAGCAGAATCATCATCAAC
AACTACAACTACAACAACAACTACAACTACAACCACAGCATCAACTGAGGTTGAAACTGT
CTCAAACCGGAAAAGATCAAAGAGAGCTGAAGAGTCAAGGCATTACAGAGGCGTGAGAAG
GAGGCCGTGGGGAAAATTCGCAGCAGAGATTCGAGATCCGGCTAAGAAAGGATCAAGGAT
TTGGCTAGGCACTTTTGAGAGTGACATTGATGCTGCAAGAGCTTATGACTATGAAGCTTT
TAAGCTCAGGGGAAGAAAAGCTGTGCTCAACTTTCCTTTGGATGCAGGAAAGTATGATGC
TCCGGTCAATTCTTGCCGGAAGAGGAGAAGAACCGATGTACCGGAGCCTCAAGGAACAAC
TTCCAGTAATTCATCATCGAACTAATGGGATTGGTGATGCTTAAGTTTTAATTAGTATAG
GTAAATATGTGAAGTATCATGTATGGAGAGCCAAGAAAATGTTGGATTAGTGTAGTTAAT
GTGTAATAAAGAGTTCCTGTGACAATGGAACTACTGTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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BS 585 760 RS1DY27JQ

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AGGACTCTGGTCTCTAGAACCCTTGAACCAAGTTCCTAAACAGGAACCTGGTTCACCGGT
TCTTGATCCAGATTCCTATGTCCAAGAGTTTCTGCAAATGGAAGCAGAATCATCATCAAC
AACTACAACTACAACAACAACTACAACTACAACCACAGCATCAACTGAGGTTGAAACTGT
CTCAAACCGGAAAAGATCAAAGAGAGCTGAAGAGTCAAGGCATTACAGAGGCGTGAGAAG
GAGGCCGTGGGGAAAATTCGCAGCAGAGATTCGAGATCCGGCTAAGAAAGGATCAAGGAT
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TAAGCTCAGGGGAAGAAAAGCTGTGCTCAACTTTCCTTTGGATGCAGGAAAGTATGATGC
TCCGGTCAATTCTTGCCGGAAGAGGAGAAGAACCGATGTACCGG

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DS 

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CGGTTCTTGATCCAGATTCCTATGTCCAAGAGTTTCTGCAAATGGAAGCAGAATCATCAT
CAACAACTACAACTACAACAACAACTACAACTACAACCACAGCATCAACTGAGGTTGAAA
CTGTCTCAAACCGGAAAAGATCAAAGAGAGCTGAAGAGTCAAGGCATTACAGAGGCGTGA
GAAGGAGGCCGTGGGGAAAATTCGCAGCAGAGATTCGAGATCCGGCTAAGAAAGGATCAA
GGATTTGGCTAGGCACTTTTGAGAGTGACATTGATGCTGCAAGAGCTTATGACTATGAAG
CTTTTAAGCTCAGGGGAAGAAAAGCTGTGCTCAACTTTCCTTTGGATGCAGGAAAGTATG
ATGCTCCGGTCAATTCTTGCCGGAAGAGGAGAAGAACCGATGTACCGGAGCCTCAAGGAA
CAACTTCCAGTAATTCATCATCGAACTAATGGGATTGGTGATGCTTAAGTTTTAATTAGT
ATAGGTAAATATGTGAAGTATCATGTATGGAGAGCCAAGAAAATGTTGGATTAGTGTAGT
TAATGTGTAATAAAGAGTTCCTGTGACAATGGAACTACTGTGCC

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 7

CO CL685Contig1 1392 7 28 U
CGTCGTAGTAACCCTTCTCCCTAAGTCGCCCAGGTCCATTTGAGGATCGGAGGATATGAA
TCTATCTGTCCTTTAGTTGGATTCGAAAACTTGTTTGATCCATCCATCAATTTTCTCAGG
ACCGATCTCGATTCCACAGGTAGGATTTGTTTCGCCGAGGAAGATGATGATGAAGATTCG
AATTGGTGTGATGGCGTTGTTGGTGGCTCTCTCTGTGATTGAATTTGGATTGGCTTCTCC
TAACACCGTCCCTGCTTTCCTCTGGTCTCCTCATCTCCAGGCTGGTAATGGTGAATTAGA
TCAGGCTGTGAATTATCAGGTCATGTCTGCGAAAGATCTTGTAAATTCTGTCTTCACTCA
TGGAAGATGGTCAAACCTTCTGTGCTCTGAGAAGAAAGTTGAGCAACCTGTTGATGTCGC
ACTTGTGTTCATTGGCAGAGAGTTACTGTCTTCTGATGTTTCTTCGATAAGGAATTCAGA
CCCTTCCCTTGTTAACACATTGAATGGTCTCTTTACATCTTCCAACTTCTCGTTGGCATT
CCCATATATCGCTGCGCCAGAGGAAGAGAGGATGGAGAATTTGTTGCTTTCAGGGCTTAA
ACAAGCTTGCCCTCACAGTGTAGGAGTCAGCAATATTGTGTTTTCAGATTCTTGCTCTGT
TGAGGATGGTACAATTCAAAAACTATCAGACTTGCAATCTCTCAAAGATCATTTGCTTGC
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TGAATCACCTGGCCAGTCACATTCAGAGCGTGAAAGCATCTCTGAACTTGTTAGTTCTGT
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TTACAAAACCCTCCAAAGGTTTCTAGCTGAAAGTGGTACCGGAAACAGCAGCTCTGTTGG
TGTTTCCGCAACCTGTGATGAACTCTGCAAATTCAAGTCGTCACTTTTGGAAGGCATACT
AGTGGGAATAGTTTTTCTTCTCATCTTGATCAGTGGACTTTGTTGTATGGCGGGTATTGA
TACACCAACTAGATTCGAGACTCCTCAAGATTCTTGAGCAGTTGACTTCTTAAAGAGTCA
TCCCCACCTTTTTGCTTTGCTTTTTTGCTTGTCTTTTCTCTGCATAGTGCGTGTGGTGGT
GAAAAGGTACTTCAATGTCGATGGTCACATTACTATATGCGATGTAAAGTCCCCTTGTAT
CATTTATTCATCTTGTTTGTGAGTCTTTCCTATACACTAAAAATTAATAATGGAGAGCAA
GTAAGAACAACCCAGAGAGACACTGGAAGGACTACATTCTTTTATAAACATGTTATATTT
CTTTTTCTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AW51TF U 1
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AF RS1EU95TF U 68
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ACCGATCTCGATTCCACAGGTAGGATTTGTTTCGCCGAGGAAGATGATGATGAAGATTCG
AATTGGTGTGATGGCGTTGTTGGTGGCTCTCTCTGTGATTGAATTTGGATTGGCTTCTCC
TAACACCGTCCCTGCTTTCCTCTGGTCTCCTCATCTCCAGGCTGGTAATGGTGAATTAGA
TCAGGCTGTGAATTATCAGGTCATGTCTGCGAAAGATCTTGTAAATTCTGTCTTCACTCA
TGGAAGATGGTCAAGCCTTCTGTGCTCTGAGAAGAAAGTTGAGCAACCTGTTGATGTCGC
ACTTGTGTTCATTGGCAGAGAGTTACTGTCTTCTGATGTTTCTTCGATAAGGAATTCAGA
CCCTTCCCTTGTTAACACATTGAATGGTCTCTTTACATCTTCCAACTTCTCGTTGGCATT
CCCATATATCGCTGCGCCAGAGGAAGAGAGGATGGAGAATTTGTTGCTTTCAGGGCTTAA
ACAAGCTTGCCCTCACAGTGTAG*AGTCAGCAATATTGTGTTTTCAGATTCT

QA 1 652 1 652
DS 

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GG
GTCGCCCAGGTCCATTTGAGGATCGGAGGATATGAATCTATCTGTCCTTTAGTTGGATTC
GAAAACTTGTTTGATCCATCCATCAATTTTCTCAGGACCGATCTCGATTCCACAGGTAGG
ATTTGTTTCGCCGAGGAAGATGATGATGAAGATTCGAATTGGTGTGATGGCGTTGTTGGT
GGCTCTCTCTGTGATTGAATTTGGATTGGCTTCTCCTAACACCGTCCCTGCTTTCCTCTG
GTCTCCTCATCTCCAGGCTGGTAATGGTGAATTAGATCAGGCTGTGAATTATCAGGTCAT
GTCTGCGAAAGATCTTGTAAATTCTGTCTTCACTCATGGAAGATGGTCAAACCTTCTGTG
CTCTGAGAAGAAAGTTGAGCAACCTGTTGATGTCGCACTTGTGTTCATTGGCAGAGAGTT
ACTGTCTTCTGATGTTTCTTCGATAAGGAATTCAGACCCTTCCCTTGTTAACACATTGAA
TGGTCTCTTTACATCTTCCAACTTCTCGTTGGCATTCCCATATATCGCTGCGCCAGAGGA
AGAGAGGATGGAGAATTTGTTGCTTTCAGGGCTTAAACAAGCTTGCCCTCACAGTGTAGG
AGTCAGCAATATTGTGTTTTCAGATTCTTGCTCTGTTGAGGATGGTACAATTCAA

QA 3 657 3 657
DS 

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GG
CCTTTAGTTGGATTCGAAAACTTGTTTGATCCATCCATCAATTTTCTCAGGACCGTTCTC
GATTCCACAGGTAGGATTTGTTTCGCCGAGGAAGATGATGATGAAGATTCGAATTGGTGT
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CCCTCACAGTGTAGGAGTCAGCAATATTGTGTTTTCAGATTCTTGCTCTGTTGAGGATGG
TACAATTCAAAAACTATCAGACTTGCAATCTTTCAAAGATCATTTGCTTGCTATAAGAG

QA 3 661 3 661
DS 

RD RS1AF52TF 889 0 0
G
CAGGTCATGTCTGCGAAAGATCTTGTAAATTCTGTCTTCACTCATGGAAGATGGTCAAAC
CTTCTGTGCTCTGAGAAGAAAGTTGAGCAACCTGTTGATGTCGCACTTGTGTTCATTGGC
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GAGACTCCTCAAGATTCTTGAGCAGT*GACTTCT*AAAGAGTCATCCCCAC**TTTTGCT
TTGCTTTTT*GCT*GTCTTT*CTCTGCATAGTGCGTGTGGTGGTGAAA

QA 2 889 2 889
DS 

RD RS1AF52JQ 890 0 0
TT
ACACATTGAATGGTCTCTTTACATCTTCCAACTTCTCGTTGGCATTCCCATATATCGCTG
CGCCAGAGGAAGAGAGGATGGAGAATTTGTTGCTTTCAGGGCTTAAACAAGCTTGCCCTC
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GTTTGTGAGTCTTTCCTATACACTAAAAATTAATAATGGAGAGCAAGTAAGAACAACCCA
GAGAGACACTGGAAGGACTACATTCTTTTATAAACATGTTATATT
TCG

QA 3 887 3 887
DS 

RD RS1BA60JQ 766 0 0
CAGTGTAGGAGTCAGCAATATTGTGTTTTCAGATTCTTGCTCTGTTGAGGATGGTACAAT
TCAAAAACTATCAGACTTGCAATCTTTCAAAGATCATTTGCTTGCTAGAAGAGAAACAAG
GAAAGAAGGAGAAACTGACTTGTTTGTGCTCTGTTATGAGGGTTCTGAATCACCTGGCCA
GTCACATTCAGAGCGTGAAAGCATCTCTGAACTTGTTAGTTCTGTGGAACAATCTGGCAG
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TGATGAACTCTGCAAATTCAAGTCATCACTTTTGGAAGGCATACTAGTGGGAATAGTTTT
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TGTCGATGGTCACATTACTATATGCGATGTAAAGTCCCCTTGTATCATTTATTCATCTTG
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AGAGACACTGGAAGGACTACATTCTTTTATAAACATGTTATATT
TC

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1EU95JQ 677 0 0
CTTGCTATAAGAGAAACAAGGAAAGAAGGAGAAACTGACTTGTTTGTGCTCTGTTATGAG
GGTTCTGAATCACCTGGCCAGTCACATTCAGAGCGTGAAAGCATCTCTGAACTTGTTAGT
TCTGTGGAACAATCTGGCAGTAAATATACAGCTCTTTATGTTTCTGATCCTTACTGGTAC
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GTTGGTGTTTCCGCAACCTGTGATGAACTCTGCAAATTCAAGTCATCACTTTTGGAAGGC
ATACTAGTGGGAATAGTTTTTCTTCTCATCTTGATCAGTTGACTTTGTTGTATGGCGGGT
ATTGATACACCAACTAGATTCGAGACTCCTCAAGATTCTTGAGCAGTTGACTTCTTAAAG
AGTCATCCCCACCTTTTTGCTTTGCTTTTTTGCTTGTCTTTTCTCTGCATAGTGCGTGTG
GTGGTGAAAAGGTACTTCAATGTCGATGGTCACATTACTATATGCGATGTAAAGTCCCCT
TGTATCATTTATTCATCTTGTTTGTGAGTCTTTCCTATACACTAAAAATTAATAATGGAG
AGCAAGTAAGAACAACCCAGAGAGACACTGGAAGGACTACATTCTTTTATAAACATGTTA
TATTTCTTTTTCTGTCC

QA 1 677 1 677
DS 



AS 2 8

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GGACACTATCAAAAGAATCTGATCCCACCTTTCTTTGATTCTGAGGCCAAAAGTTAAGTC
AAAGAGTTGAAAAATGGAAGGGACTGTGTTCACGCCGTGTTTGGAAGGAATGAAGAATGT
CAAGTCTGAACAAGGGGAGATGCTTACTAAGCCTTTTCTAGACCTCTGCAAGACCATCTT
GCCTGTTATAGATAAGTTTGGAGCCGCTATGACTCTCGTGAAAGCTGACATTGGTGGCAA
CATATCGAGGTTGGAGAAGAACTACTTGTCCGATCCGGACAAGTACAAGTACTTGTACAC
CTTTGTTCAAGGTGAAATTGAGTCTAAGACAGCAAAAGGATCGTCTAGTTGTACCAACGG
TCTTCTCTGGTTAACCAGAGCAATGGATTTCTTAGTGGAGCTGTTCCGCAACTTGGTAGC
ACATCAAGACTGGCCAATGTCACAGGCTTGTGGTGAATCTTACCAAAAAACACTCAAGAA
ATGGCACGGATGGCTCGCCAGCTCTACCTTCTCTATGGCGTTAAAGCTTGCTCCAGACAG
GAAGAAGTTCATGGATGTCATATCTGGTTCTGGTGACATATACGCTGACATGGAAAGGTT
TTGCACTGAGTTTGGTCCATTCCTTCAAGAAAATCATAAGTTTCTGGCTAGCGTTGGTTT
GGATGACCTGAAAGCTTCTTGAGGCATCATATGATTATCACCTGTATCCAATCTACTTTT
TTTCAGAAAAAAAAA*TTGTCTGTTTCAAAGTTTCTCCTTTGGATTCTAAAACTTTTTAG
ACTATATCCAAAGAAACAGAATAATGTTCACTTTATATTATAAAGTTTATATA


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 0 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D377TF U 3
AF RS1FX17TF U 1
AF RS1AL09TF U 17
AF RS1BW26TF U 17
AF RS1AL09JQ C 319
AF RS1BW26JQ C 62
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RD RS1D377TF 648 0 0
GG
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AAGTTCATGGATGTCATATCTGGTTCTGGTGACATATACGCTGACATGGAAAGGTTTTGC
ACTGAGTTTGGTCCATTCCTTCAAGAAAATCATAAGTTTCTG
TCTA

QA 3 644 3 644
DS 

RD RS1FX17TF 722 0 0
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GCCTGTTATAGATAAGTTTGGAGCCGCTATGACTCTCGTGAAAGCTGACATTGGTGGCAA
CATATCGAGGTTGGAGAAGAACTACTTGTCTGATCCCGACAAGTACAAGTACTTGTACAC
CTTTGTTCAAGGTGAAATTGAGTCTAAGACAGCAAAAGGATCGTCTAGTTGTACCAACGG
TCTTCTCTGGTTAACCAGAGCAATGGATTTCTTAGTGGAGCTGTTCCGCAACTTGGTAGC
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TTGCACTGAGTTTGGTCCATTCCTTCAAGAAAATCATAAGTTTCTGGCTAGCGTTGGTTT
GGATGACCTGAAAGCTTCTTGAGTCATCATATGATTATCACCTGTATCCAATCTGCTTTT
TT

QA 1 722 1 722
DS 

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AGAGCAATGGATTTCTTAGTGGAGCTGTTCCGCAACTTGGTAGCACATCAAGACTGGCCA
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CCATTCCTTCAAGAAAATCATAAGTTTCTGGCTAGCGTTGGTTTGGATGACCTGAAAGCT
TCTTGAGGCATCATATGATTATCACCTGTATCCAATCTACTTTTTTTCAG

QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1BW26TF 817 0 0
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GAAGGGACTGTGTTCACGCCGTGTTTGGAAGGAATGAAGAATGTCAAGTCTGAACAAGGG
GAGATGCTTACTAAGCCTTTTCTAGACCTCTGCAAGACCATCTTGCCTGTTATAGATAAG
TTTGGAGCCGCTATGACTCTCGTGAAAGCTGACATTGGTGGCAACATATCGAGGTTGGAG
AAGAACTACTTGTCCGATCCGGACAAGTACAAGTACTTGTACACCTTTGTTCAAGGTGAA
ATTGAGTCTAAGACAGCAAAAGGATCGTCTAGTTGTACCAACGGTCTTCTCTGGTTAACC
AGAGCAATGGATTTCTTAGTGGAGCTGTTCCGCAACTTGGTAGCACATCAAGACTGGCCA
ATGTCACAGGCTTGTGGTGAATCTTACCAAAAAACACTCAAGAAATGGCACGGATGGCTC
GCCAGCTCTACCTTCTCTATGGCGTTAAAGCTTGCTCCAGACAGGAAGAAGTTCATGGAT
GTCATATCTGGTTCTGGTGACATATACGCTGACATGGAAAGGTTTTGCACTGAGTTTGGT
CCATTCCTTCAAGAAAATCATAAGTTTCTGGCTAGCGTTGGTTTGGATGACCTGAAAGCT
TCTTGAGGCATCATATGATTATCACCTGTATCCAATCTACTTTTTTTCAGAAAAAAAAA*
TTGTCTGTTTCAAAGTTTCTCCTTTGGATTCTAAAACTTTTTAGACTATATCCAAAGAAA
CAGAATAATGTTCACTTTATATTATAAAGTTTATATA

QA 1 817 1 817
DS 

RD RS1AL09JQ 476 0 0
TGAGTCTAAGACAGCAAAAGGATCGTCTAGTTGTACCAACGGTCCTCTCTGGTTAACCAG
AGCAATGGATTTCTTAGTGGAGCTGTTCCGCAACTTGGTAGCACATCAAGACTGGCCAAT
GTCACAGGCTTGTGGTGAATCTTACCAAAAAACACTCAAGAAATGGCACGGATGGCTCGC
CAGCTCTACCTTCTCTATGGCGTTAAAGCTTGCTCCAGACAGGAAGAAGTTCATGGATGT
CATATCTGGTTCTGGTGACATATACGCTGACATGGAAAGGTTTTGCACTGAGTTTGGTCC
ATTCCTTCAAGAAAATCATAAGTTTCTGGCTAGCGTTGGTTTGGATGACCTGAAAGCTTC
TTGAGGCATCATATGATTATCACCTGTATCCAATCTACTTTTTTTCAGAAAAAAAAAATT
GTCTGTTTCAAAGTTTCTCCTTTGGATTCTAAAACTTTTTAGACTATATCCAAAGA

QA 1 476 1 476
DS 

RD RS1BW26JQ 762 0 0
AAAGAG
TGAAAAATGGAAGGGACTGTGTTCACGCCGTGTTTGGAAGGAATGAAGAATGTCAAGTCT
GAACAAGGGGAGATGCTTACTAAGCCTTTTCTAGACCTCTGCAAGACCATCTTGCCTGTT
ATAGATAAGTTTGGAGCCGCTATGACTCTCGTGAAAGCTGACATTGGTGGCAACATATCG
AGGTTGGAGAAGAACTACTTGTCCGATCCGGACAAGTACAAGTACTTGTACACCTTTGTT
CAAGGTGAAATTGAGTTTAAGACAGCAAAAGGATCGTCTAGTTGTACCAACGGTCTTCTC
TGGTTAACCAGAGCAATGGATTTCTTAGTGGAGCTGTTCCGCAACTTGGTAGCACATCAA
GACTGGCCAATGTCACAGGCTTGTGGTGAATCTTACCAAAAAACACTCAAGAAATGGCAC
GGATGGCTCGCCAGCTCTACCTTCTCTATGGCGTTAAAGCTTGCTCCAGACAGGAAGAAG
TTCATGGATGTCATATCTGGTTCTGGTGACATATACGCTGACATGGAAAGGTTTTGCACT
GAGTTTGGTCCATTCCTTCAAGAAAATCATAAGTTTCTGGCTAGCGTTGGTTTGGATGAC
CTGAAAGCTTCTTGAGGCATCATATGATTATCACCTGTATCCAATCTACTTTTTTTCAGA
AAAAAAAA*TTGTCTGTTTCAAAGTTTCTCCTTTGGATTCTAAAACTTTTTAGACTATAT
CCAAAGAAACAGAATAATGTTCACTTTATATTATAA

QA 7 762 7 762
DS 



CO CL686Contig2 1130 2 8 U
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AAATCTCAGGGTTATCATCAGAAATATTCGTAACACTGGGGGTACAACAGAATCATTTGA
AATTTATAACTCCTATAGAGCAAAGAAGAAGAAACCTCTCTCTCACACTATCAGAAGAAT
CTGATCCCACCTTTCTTTGATTCTGAGGCCAAAAGATAAATGATAGTCACTGGAGGATCA
GCCATTCTTCAATGTGTGTTTTAATCAGCCATAAATATCTGAGATTTCCTCTTTTGTCTT
GTTGTTGTCAATTAAGTCAAAGAGTTGAAAATGGAAGGGACTGTGTTCACCCCGTGTTTG
GAAGGAATGGAGAATGCCAAGTCTGAACAAGGGGAGATGCTTACTAAGCCTTTTCTAGAC
CTCTGCAAGACCATCTTGCCTGTTATAGATAAGTTTGGAGCCGCTATGACTCTCGTGAAA
GCTGACATTGGTGGCAACATATCGAGGTTGGAGAAGAACTACTTGTCTGACCCCGACAAG
TACAAGTACTTGTACACCTTTGTTCAAGGTGAAATTGAGTCGAAGACAGCAAAAGGATCG
TCTAGTTGTACCAACGGTCTTCTCTGGTTAACCAGAGCAATGGATTTCTTAGTGGAGCTG
TTCCGCAACTTGGTAGCACATCAAGACTGGCCAATGTCACAGGCTTGTGGTGAATCTTAC
CAAAAAACACTCAAGAAATGGCACGGATGGCTCGCCAGCTCTACCTTCTCTATGGCCTTA
AAGCTTGCTCCAGACAGGAAGAAGTTCATGGATGTCATATCTGGTTCTGGTGACATATAC
GCTGACATGGAAAGGTTTTGCACTGAGTTTGGTCCATTCCTTCAAGAAAATCATAAGTTT
CTGGCTAGCGTTGGTTTGGATGACCTGAAAGCTTCTTGAGTCATCATATGATTATCACCT
GTATCCAATCTGCTTTTTTTCAGAAAAAAATTTGTCTGTTTTAACGTTTCTCCTTTGGAT
TCTAAAAAACTTTTATAGTCTATCCAAAGAAACAGAATAATGTTCACTTTATATTATAAA
GTTTATATAAAAAAGGACCAAATACATGTTTAGACATGCATGTGTTTATT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A394JQ U 27
AF RS1EC92JQ U 1
AF RS1EH24JQ U 6
AF RS1A394TR U 27
AF RS1EC92TF C 671
AF RS1A394TV C 537
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ACTGGGTCTGCTAAATCACCCACTATGATATCAAACTTCTCTTCCCTTTTCT

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CCGGAGTAACTTGAGGAACAAGCAAACGAAATCCCAAGCAATGTAGAAAATAAAGAGACT
GGTTCTTGAGTGTGGACATGGGTATGGTATTAATCTTGAAGCTGACATCGGTTCTTCTTC
AAGTATGCCGGTACGCCACACCATGTCCATGAATGAATCTCGCGTTCTCTTCGCTATAAA
CTTCCGTCTCCTTCTCCAGCGCGAGAGAGATGGTCTTGTTGAGAGTAGCAGCTGAAAGGA
AAGAAGGAGCATTCAGATACATCAACTCTCCTTTCACTCTCTCTTCGATTCGTTTATCTA
TTTCATTCACTTCAACTTCAAACTCTTGGTCCGATGCCATCACCCATCCCCACGTGTCCG
CAAACGACGGCACATGTGCTGTGTAAGCCTTCACGTGCTTGAAGACTTGTTTCATGGTGT
TGTAGATTGATGTAAAGACCTCTTTATGAGTGAATATTCCTGCTGGTCCAGCCTGAGTCA
CAAAAATGCCATTAGGGGTAAGCTTGGGTTTGAGGATGTTTTGGTAGAAGGATTTGGTGT
AGAGCTGATAACATGGTCCACCTTCTACTGGGTCTGCTAAATCACCCACTATGATATCAA
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TGTTGCAAAAA

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DS 

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TTGAGTGTGGACATGGGTATGGTATTAATCTTGAAGCTGACATCGGTTCTTCTTCAAGTA
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GTCTCCTTCTCCAGCGCGAGAGAGATGGTCTTGTTGAGAGTAGCAGCTGAAAGGAAAGAA
GGAGCATTCAGATACATCAACTCTCCTTTCACTCTCTCTTCGATTCGTTTATCTATTTCA
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GACGGCACATGTGCTGTGTAAGCCTTCACGTGCTTGAAGACTTGTTTCATGGTGTTGTAG
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ATGCCATTAGGGGTAAGCTTGGGTTTGAGGATGTTTTGGTAGAAGGATTTGGTGTAGAGC
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TCTTCCCTTTTCTCCAGTT*AGCCTTTGCATCTTTGATCACAAGTTCAAGCTTCTTGTTG
CAAAAA*GCCTCGCTGTTAACGGTCAGAAATCTCTTGCAAAAATCAACGACTTCCTGATC
AATATCACACATGACTACTTTCTCGATTGTCTT

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DS 

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CGAAATCCCAAGCAATGTAGAAAATAAAGAGACTGGTTCTTGAGTGTGGACATGGGTATG
GTATTAATCTTGAAGCTGACATCGGTTCTTCTTCAAGTATGCCGGTACGCCACACCATGT
CCATGAATGAATCTCGCGTTCTCTTCGCTATAAACTTCCGTCTCCTTCTCCAGCGCGAGA
GAGATGGTCTTGTTGAGAGTAGCAGCTGAGAGGAAAGAAGGAGCATTCAGATACATCAAC
TCTCCTTTCACTCTCTCTTCGATTCGTTTATCTATCTCATTCACTTCAACTTCAAACTCT
TGGTCCGATGCCATCACCCATCCCCACGTGTCAGCAAACGACGGCACATGTGCTGTGTAA
GCCTTCACGTGCTTGAAGACTTGTTTCATGGTGTTGTAGATTGATGTAAAGACCTCTTTA
TGAGTGAATATTCCTGTTGGTCCAGCCTGGGTCACAAAAATGCCATTAGGGGTAAGCTTG
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CTCGATTGTCTTGTGTTTTAGTATTTCTCTTGCAGCA

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*AATCTCCGGGAACCCATT

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TCAAACTTCTCTTCCCTTTTCTCCAGTTCAGCCTTTGCATCTTTGATCACAAGTTCAAGC
TTCTTGTTACAAAAA*GCCTCGCTGTTAACGGTCAGGAATCTCTTGCAAAAATCAACGAC
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TGCAGCAGAGCCTTCACCTCCTCCCATTATTAACACAGTCTTTGGGTTGGGGTGGAAAAG
GGGGGCAGGGTGGATCAAACATTCATGGTAGATAAACTCATCTCTCTCTGCACTTTGCAT
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ATCAATGGTTTCTTCATACCAATGGCAGTCCTGCTGGTTGGAGAGGAGGGTTTGAATGGG
TGAAGTATCTTTGTGAATCTCCGGGAAGCCATTTCCGAACATGATCTCTACGGCTTCTCC
CATATC

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DS 

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GCCTTTGCATCTTTGATCACAAGTTCAAGCTTCTTGTTGCAAAAA*GCCTCGCTGTTAAC
GGTCAGAAATCTCTTGCAAAAATCAACGACTTCCTGATCAATATCACACATGACTACTTT
CTCGATTGTCTTGTGTTTTAGTATTTCTCTTGCAGCAGAGCCTTCACCTCCTCCCATTAT
GAACACAGTCTTTGGGTTGGGGTGGAAG*GGAGGGCAGGGTGGATCAAACATTCATGGTA
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ATGTTTGGTGTCCAGAAGTGCAATTTCTTGGTACTCACTAGTTCCTGTATGGAGCACACT
GTTGAGGGCAAAAGACCATTTGAGATCACCATCAATGGTTTCTTCATACCAATGGCAGTC
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ATTTCCGAACATGATCTCTACGGCTTCTCCCATATCCAACAAGTCAAGAAAACAGATAGA
GAAATATAGAG*AGATAGATAATAGAGAGGAGTGATATAATGCTTCGTGTT
CC

QA 1 651 1 651
DS 

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GATATCAAACTTCTCTTCCCTTTTCTCCAGTTCAGCCTTTGCATCTTTGATCACAAGTTC
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CGACTTCCTGATCAATATCACACATGACCACTTTCTCGATTGTCTTGTGTTTTAGTATTT
CTCTTGCAGCAGAGCCTTCACCTCCTCCCATTATTAACACAGTCTTTGGGTTGGGGTGGA
AAAGGGGGGCAGGGTGGATCAAACATTCATGGTAGATAAACTCATCTCTCTCTGCACTTT
GCATTTTCCCGTCAATCACAAGTACCTTGCCGAAATGTTTGGTGTCCAGAAGTGCAATTT
CTTGGTACTCACTAGTTCCTGTATGGAGCACACTGTTGAGGGCAAAAGACCATTTGAGAT
CATCATCAATGGTTTCTTCATACCAATGGCAGTCCTGCTGGTTGGAGAGGAGGGTTTGAA
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CTCCCATATCCAACAAGTCAAGAAAACAGAGAGAGAAATATAGAGGAGATAGATAATAGA
GAGGAGTGATATAATGCTTCGTGTTGAGATATCCCCTGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGG
GCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 8

CO CL688Contig1 904 8 12 U
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TTCAACTGGTTGAAGATAATCTCAAATCCTCTTTCTTTCTTCGTCTTCCTCTGCTTTGGG
ACAACATACTTCTTGCTAATTGTTTATTTCTTTGAAGTCAATATCAAAGGGAGAGTTTGT
GTTTGAAGATCACGAGAAGACTTCAGATTCAATAAAACCATGGTTGGTATTTTTTCAAGA
TTTACTGTTGGTAGAAGCAGCCATCGACGGACTCAAAGTGCAATCGATGATAAGGAAGTA
TTAGCTCCAAATCCTGATGTTACTACCACAACTGCTACTCATGGAATTGAGGTAGCAACA
GAGTTTAAACCAGTGGAACATCCGGTCGAGCCTTTGGACAATGATCAACCAATTCAGTGT
CCACTACCTGAACCATCCATTCTAAATGATGGAAGAATCTGGAAGGAGAGGGTATCGGCA
TCTATGAGGATAAAAGGTGATTTGCAGATTGCTGAATCTGATGGATCTGCACCAAAACCG
CCTCGCCCTAGCCAGCCAAACCGTTCTATATTGCCATCACTCAGTGCCCCAGAACACAAC
TTGCTAAATCTACTTGAAGAATGTAATGCTATGCAGACGGTAGCATCCAAGAATGGATGA
AACAAAGTTCAGTAGTTTATAAGAATATCATCACACGGATACAACCTTGTTCCTTCAACC
CCC*TTGTGAATCTATGTGTTTTTGTTGTTCTTTACACTTTTACTTCTGTCTATGCAAGA
ACAAATCCAAATCATAGTGTAATGTTATATATATTATATATACTCAACTAAGGTTCACTG
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CACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1D233TF U 1
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AF RS1AU67TF U 76
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TTCAACTGGTTGAAGATAATCTCAAATCCTCTTTCTTTCTCCGTCTTCCTCTGCTTTGGG
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GTTTGAAGATCACGAGAAGACTTCAGATTCAATAAAACCATGGTTGGTATTTTTTCAAGA
TTTACTGTTGGTAGAAGCAGCCATCGACGGACTCAAAGTGCAATCGATGATAAGGAAGTA
TTAGCTCCAAATCCTGATGTTACTACCACAACTGCTACTCATGGAATTGAGGTAGCAACA
GAGTTTAAACCAGTGGAACATCCGGTCGAGCCTTTGGACAATGATCAACCAATTCAGTGT
CCACTACCTGAACCATCCATTCTAAATGATGGAAGAATCTGGAAGGAGAGGGTATCGGCA
TCTATGGGGATAAAAGGTGATTTGCTGATTGCTGAATCTGATGGATCTGCACCAAAACCG
CCTCGCCCTAGCCAGCCAAACCGTTCTATATTGCCATCACTCAGTGCCCCAGAACACAAC
TTGCTAAATCTACTTGAAGAATGTAATGCTATGCAGAC
AGT

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DS 

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G
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ACATACTTCTTGCTAATTGTTTATTTCTTTGAAGTCAATATCAAAGGGAGAGTTTGTGTT
TGAAGATCACGAGAAGACTTCAGATTCAATAAAACCATGGTTGGTATTTTTTCAAGATTT
ACTGTTGGTAGAAGCAGCCATCGACGTACTCAAAGTGCAATCGATGATAAGGAAGTATTA
GCTCCAAATCCTGATGTTACTACCACAACTGCTACTCATGGAATTGAGGTAGCAACAGAG
TTTAAACCAGTGGAACATCCGGTCGAGCCTTTGGACAATGATCAACCAATTCAGTGTCCA
CTACCTGAACCATCCATTCTAAATGATGGAAGAATCTGGAAGGAGAGGGTATCGGCATCT
ATGAGGATAAAAGGTGATTTGCAGATTGCTGAATCTGATGGATCTGCACCAAA*CCGCCT
CGCCCTAGCCAGCCAAACCGTTCTATATTGCCATCACTCAGTGCCCCAGAACACAACTTG
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AAAGTTCAGTAGTTTATAAGAATATCATCACACGGATACAACCTTGTTCCTTCAACCCCC
CTTGTGAATCTATGTGTTTTTGTTGTTGTTTACACTTTTACTTCTGTCTATG

QA 2 713 2 713
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GG
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ACATCCGGTCGAGCCTTTGGACAATGATCAACCAATTCAGTGTCCACTACCTGAACCATC
CATTCTAAATGATGGAAGAATCTGGAAGGAGAGGGTATCGGCATCTATGAGGATAAAAGG
TGATTTGCAGATTGCTGAATCTGATGGATCTGCACCAAAACCGCCTCGCCCTAGCCAGCC
AAACCGTTCTATATTGCCATCACTCAGTGCCCCAGAACACAACTTGCTAAATCTACTTGA
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TATAAGAATATCATCACACGGATACAACCTTGTTCCTTCAACCCCC*TTGTGAATCTATG
TGTTTT*GTTGTTCTTTACACTTTTACTTCTGTCTATGCA
GACA

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DS 

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ACATCCGGTCGAGCCTTTGGACAATGATCAACCAATTCAGTGTCCACTACCTGAACCATC
CATTTTAAATGATGGAAGAATTTGGAAGGAGAGGGTATCGGCATCTATGAGGATAAAAGG
TGATTTGCAGATTGCTGAATTTGATGGATTTGCACCAAAACCGCCTCGCCCTAGCCAGCC
AAACCGTTCTATATTGCCATCACTCAGTGCCCCAGAACACAACTTGCTAAATTTACTTGA
AGAATGTAATGCTATGCAGACGGTAGCATCCAAGAATGGATGAAACAAAGTTCAGTAGTT
TATAAGAATATCATCACACGGATACAACCTTGTTCCTTCAACCCCC*TTGTGAATCTATG
TGTTTTTGTTGTTCTTTACACTTTTACTTCTGTCTATGCAAGAACAAATCCAAATCATAG
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GTTCACTG

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G
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AGCTCCAAATCCTGATGTTACTACCACAACTGCTACTCATGGAATTGAGGTAGCAACAGA
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C*TTGTGAATCTATGTGTTTTTGTTGTTCTTTACACTTTTACTTCTGTCTATGCAAGAAC
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GG
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ACATACTTCTTGCTAATTGTTTATTTCTTTGAAGTCAATATCAAAGGGAGAGTTTGTGTT
TGAAGATCACGAGAAGACTTCAGATTCAATAAAACCATGGTTAGTATTTTTTCAAGATTT
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GCTCCAAATCCTGATGTTACTACCACAACTGCTACTCGTGGAATTGAGGTAGCAACAGAG
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CGCCCTAGCCAGCCAAACCGTTCTATATTGCCATCACTCAGTGCCCCAGAACACAACTTG
CTAAATCTACTTGAAGAATGTAATGCTATGCAGACGGTAGCATCCAAGAATGGATGAAAC
AAAGTTCAGTAGTTTATAAGAATATCATCACACGGATACAACCTTGTTCCTTCAACCCCC
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AATCCAAATCATAGTGTAATGTTATATATATTATATATACTCAACTAAG*TTCACTGAGA
GCTCATGCTCT

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DS 

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AAGTGCAATCGATGATAAGGAAGTATTAGCTCCAAATCCTGATGTTACTACCACAACTGC
TACTCGTGGAATTGAGGTAGCAACAGAGTTTAAACCAGTGGAACATCCGGTCGAGCCTTT
GGACAATGATCAACCAATTCAGTGTCTACTACCTGAACCATCCATTCTAAATGATGGAAG
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ATCTGATGGATCTGCACCAAAACCGCCTCGCCCTAGCCAGCCAAACCGTTCTATATTGCC
ATCACTCAGTGCCCCAGAACACAACTTGCTAAATCTACTTGAAGAATGTAATGCTATGCA
GACGGTAGCATCCAAGAATGGATGAAACAAAGTTCAGTAGTTTATAAGAATATCATCACA
CGGATACAACCTTGTTCCTTCAACCCCC*TTGTGAATCTATGTGTTTTTGTTGTTCTTTA
CACTTTTACTTCTGTCTATGCAAGAACAAATCCAAATCATAGTGTAATGTTATATATATT
ATATATACTCAACTAAGGTTCACTGAGAGCTCATGCTCTTTATATATCACTGTACTAATA
TTCTACACTG
G

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DS 

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GAACACAACTTGCTAAATCTACTTGAAGAATGTAATGCTATGCAGACGGTAGCATCCAAG
AATGGATGAAACAAAGTTCAGTAGTTTATAAGAATATCATCACACGGATACAACCTTGTT
CCTTCAACCCCC*TTGTGAATCTATGTGTTTTTGTTGTTCTTTACACTTTTACTTCTGTC
TATGCAAGAACAAATCCAAATCATAGTGTAATGTTATATATATTATATATACTCAACTAA
GGTTCACTGAGAGCTCATGCTCTTTATATATCACTGTACTAATATTCTACACTGAAAGGT
CCTTTCTTTCACT

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DS 



AS 1 8

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ACATTCATCCAACTCTCCAGGTATGTCTACATCCGAGAACAAAGTCGAAATAGTTGACAG
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CCTGATCGACAGTGACGGGAGGAAACTCGTCTCGGGACTGATCCCCGACGCTGGAACCAT
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GAGCACTTACAACGACATCAACCCCGGGATGATCATACCTTACAGGATCAAAGTCGATCT
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GGTTAATGACTTGGACTGTGAGGTGTGGTTGGCTGATGTGAGTATTGGGAAAGCAGAGAT
ATCTGACTCTGTAAAGCTTGATAAAAACGGGAGTGGGTTGATTAATGTGCCGATGACGTT
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CACTATTAAAGGTAATGTGGATGTTGATACACCGTTTGGAGGTATGAAGCTTCCTATTAT
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GTTAAATGAAAGACTTGTTTGTTGTGCTTTATGGTGGTGGATCAGACTTTTGAATAGAGC
TGTGTCTGGACTTGTTATATCATCGTGGTCCGGTTTTATTGGTTATGTTTTGTTTAAACC
GGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 10 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

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CGTAGACGTGCTCGTCAAGAACCCCAACCCAGTCCCCATCCCTCTCATCGACATCGACTA
CCTGATCGACAGTGACGGGAGGAAACTCGTCTCGGGACTGATCCCCGACGCTGGAACCAT
CAAGGCGCATGGAGAAGAAACCGTCAAGATACCGCTGACTCTGATCTACGACGACATCAA
GAGCACTTACAACGACATCAACCCCGGGATGATCATACCTTACAGGATCAAAGTCGATCT
CATCGTCGACGTGCCTGTCTTGGGGGGGCTCACGTTACCGTTGGAGAAACGTGGAGAGAT
CCCGATCCCGAAGAAACCTGATGTCGACATCGAGAAGATCCAGTTCCAGAAGTTTTCTCT
GGAAGA

QA 1 666 1 666
DS 

RD RS1AU62TF 650 0 0
GGACAC
ACAACTCTTGAAAGCACTCTCTTGTCTCTCTCTTGCTCACATTCATCCAACTCTCCAGGT
ATGTCTACATCCGAGAACAAAGTCGAAATAGTTGACAGAGCTCACAAGGAGGATGAAAAA
GAAGAAG******GTAAAGGTGGATTCCTAGACAATGTCAAAGGTTTCATTCACGGCATC
GGCGAGAAGATACAGGGAACCGTTGGTTTCGGGAAGCCAACGGCTGACGTCTCAGCCATC
CACATCCCCAAGATCAATCTCGAGAGAGCAGACATTGTCGTAGACGTGCTCGTCAAGAAC
CCCAACCCAGTCCCCATCCCTCTCATCGACATCGACTACCTGATCGACAGTGACGGGAGG
AAACTCGTCTCGGGACTGATCCCCGACGCTGGAACCATCAAGGCGCATGGAGAAGAAACC
GTCAAGATACCGCTGACTCTGATCTACGACGACATCAAGAGCACTTACAACGACATCAAC
CCCGGGATGATCATACCTTACAGGATCAAAGTCGATCTCATCGTCGACGTGCCTGTCTTG
GGGAGGCTCACGTTACCGTTGGAGAAACGTGGAGAGATCCCGATCCCGAAGAAACCTGAT
GTCGACATCGAGAAGATCCAGTTCCAGAAGTTTTCTCTGGAAGA

QA 7 650 7 650
DS 

RD RS1H580TF 779 0 0
GG
ACAACTCTTGAAAGCACTCTCTTGTCTCTCTCTTGCTCACATTCATCCAACTCTCCAGGT
ATGTCTACATCCGAGAACAAAGTCGAAATAGTTGACAGAGCTCACAAGGAGGATGAAAAA
GAAGAAGAAGAAGGTAAAGGTGGATTCCTAGACAATGTCAAAGGTTTCATTCACGGCATC
GGCGAGAAGATACAGGGAACCGTTGGTTTCGGGAAGCCAACGGCTGACGTCTCAGCCATC
CACATCCCCAAGATCAATCTCGAGAGAGCAGACATTGTCGTAGACGTGCTCGTCAAGAAC
CCCAACCCAGTCCCCATCCCTCTCATCGACATCGACTACCTGATCGACAGTGACGGGAGG
AAACTCGTCTCGGGACTGATCCCCGACGCTGGA*CCATCAAGGCGCATGGAGAAGAAACC
GTCAAGATACCGCTGACTCTGATCTACGACGACATCAAGAGCACTTACAACGACATCAAC
CCCGGGATAATCATACCTTACAGGATCAAAGTCGATCTCATCGTCGACGTGCCTGTCTTG
GGGAGGCTCACGTTACCGTTGGAGAAACGTGGAGAGATCCCGATCCCGAAGAAACCTGAT
GTCGACATCGAGAAGATCCAGTTCCAGAAGTTTTCTCTGGAAGAGACG*TGGCGATACTC
CACGTGAGGCTTGAGAACTTGAATGATTTTGATTTGGGGGTTA*TGACCTG*ACTGTGAA
GTGTGGTTGGCTGATGTGAGTATTGGGAAAGCAGAGATATCTGACTCTGTAA
GCTGA

QA 3 774 3 774
DS 

RD RS1AH70TF 843 0 0
ATTCATCCAACTCTCCAGGTATGTCTACATCCGAGAACAAAGTCGAAATAGTTGACAGAG
CTCACAAGGAGGATGAAAAAGAAGAAGAAGAAGGTAAAGGTGGATTCCTAGACAATGTCA
AAGGTTTCATTCACGGCATCGGCGAGAAGATACAGGGAACCGTTGGTTTCGGGAAGCCAA
CGGCTGACGTCTCAGCCATCCACATCCCCAAGATCAATCTCGAGAGAGCAGACATTGTCG
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TGATCGACAGTGACGGGAGTAAACTCGTCTCGGGACTGATCCCCGACGCTGGAACCATCA
AGGCGCATGGAGAAGAAACCGTCAAGATACCGCTGACTCTGATCTACGACGACATCAAGA
GCACTTACAACGACATCAACCCCGGGATGATCATACCTTACAGGATCAAAGTCGATCTCA
TCGTCGACGTGCCTGTCTTGGGGAGGCTCACGTTACCGTTGGAGAAACGTGGAGAGATCC
CGATCCCGAAGAAACCCGATGTCGACATCGAGAAGATCCAGTTCCAGAAGTTTTCTCTGG
AAGAGACGGTGGCGATACTCCACGTGAGGCTTGAGAACTTGAATGATTTTGATTTGGGGG
TTAATGACTTGGACTGTGAGGTGTGGTTGTCTGATGTGAGTATTGGGAAAGCAGAGATAT
CTGACTCTGTAAAGCTTGATAAAAACGGGAGTGGGTTGATTAATGTGCCGATGACGTTTA
*GCCAAAG*ACTTTGGGTCTGCGCTTTGG*ATATGATACGTG*TAAAGGA*CTGGGTACA
CTA

QA 1 843 1 843
DS 

RD RS1H580JQB 722 0 0
GCTGG
ACCATCAAGGCGCATGGAGAAGAAACCGTCAAGATACCGCTGACTCTGATCTACGACGAC
ATCAAGAGCACTTACAACGACATCAACCCCGGGATAATCATACCTTACAGGATCAAAGTC
GATCTCATCGTCGACGTGCCTGTCTTGGGGAGGCTCACGTTACCGTTGGAGAAACGTGGA
GAGATCCCGATCCCGAAGAAACCTGATGTCGACATCGAGAAGATCCAGTTCCAGAAGTTT
TCTCTGGAAGAGACGGTGGCGATACTCCACGTGAGGCTTGAGAACTTGAATGATTTTGAT
TTGGGGGTTAATGACCTGGACTGTGAGGTGTGGTTGGCTGATGTGAGTATTGGGAAAGCA
GAGATATCTGACTCTGTAAAGCTTGATAAAAACGGGAGTGGGTTGATTAATGTGCCGATG
ACGTTTAGGCCAAAGGACTTTGGGTTTGCGCTTTGGGATATGATACGTGGTAAAGGAACT
GGGTACACTATTAAAGGTAATGTGGATGTTGATACACCGTTTGGAGGTATGAAGCTTCCT
ATTATCAAGGAAGGTGGTGAGACTCGTCTGAAGAAGGAAGATGATGATGATGACGATGAG
GAATAAGGAAAAGAGGTTAAGAGAATGAGGGCTGAATCTCTGATGTTTAAAAATAATGTG
TAAAAGTTAAATGAAAGACTTGTTTGTTGTGCTTTATGGTGGTGGATCAGACTTT
CG

QA 6 720 6 720
DS 

RD RS1AU62JQ 917 0 0
TCCCCAAGATCA*TCTCGAGAGAGCAGACATTGTCGTAGACGTGCTCGTCAAGA*CCCCA
ACCCAGTCCCCATCC*TCTCATCGACATCGACTAC*TGATCGACAGTGACGGGAGGAAAC
TCGTCTCGGGACTGATCCCCGACGCTGGAACCATCAAGGCGCATGGAGAAGAAACCGTCA
AGATACCGCTGACTCTGATCTACGACGACATCAAGAGCACTTACAACGACATCAACCCCG
GGATGATCATACCTTACAGGATCAAAGTCGATCTCATCGTCGACGTGCCTGTCTTGGGGA
GGCTCACGTTACCGTTGGAGAAACGTGGAGAGATCCCGATCCCGAAGAAACCTGATGTCG
ACATCGAGAAGATCCAGTTCCAGAAGTTTTCTCTGGAAGAGACGGTGGCGATACTCCACG
TG**GCTTGAGAACTTGAATGATTTTGATTTGGGGGTTAATGACTTGGACTGTGAGGTGT
GGTTGGCTGATGTGAGTATTGGGAAAGCAGAGATATCTGACTCTGTAAAGCTTGATAAAA
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ATACACCGTTTGGAGGTATGAAGCTTCCTATTATCAAGGAAGGTGGTGAGACTCGTCTGA
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CTGAATCTCTGATGTTTAAAAATAATGTGTAAAAGTTAAATGAAAGACTTGTTTGTTGTG
CTTTATGGTGGTGGATCAGACTTTTGAATAGAGCTGTGTCTGGACTTGTTATATCATCGT
GGTCCGGTTTTATTGG
T

QA 1 916 1 916
DS 

RD RS1AH70JQ 849 0 0
CCCCATCCCTCTCATCGACATCGACTAC*TGATCGACAGTGACGGGAGTAAACTCGTCTC
GGGACTGATCCCCGACGCTGGAACCATCAAGGCGCATGGAGAAGAAACCGTCAAGATACC
GCTGACTCTGATCTACGACGACATCAAGAGCACTTACAACGACATCAACCCCGGGATGAT
CATACCTTACAGGATCAAAGTCGATCTCATCGTCGACGTGCCTGTCTTGGGGAGGCTCAC
GTTACCGTTGGAGAAACGTGGAGAGATCCCGATCCCGAAGAAACCCGATGTCGACATCGA
GAAGATCCAGTTCCAGAAGTTTTCTCTGGAAGAGACGGTGGCGATACTCCACGTGAGGCT
TGAGAACTTGAATGATTTTGATTTGGGGGTTAATGACTTGGACTGTGAGGTGTGGTTGTT
TGATGTGAGTATTGGGAAAGCAGAGATATCTGACTCTGTAAAGCTTGATAAAAACGGGAG
TGGGTTGATTAATGTGCCGATGACGTTTAGGCCAAAGGACTTTGGGTTTGCGCTTTGGGA
TATGATACGTGGTAAAGGAACTGGGTACACTATTAAAGGTAATGTGGATGTTGATACACC
GTTTGGAGGTATGAAGCTTCCTATTATCAAGGAAGGTGGTGAGACTCGTCTGAAGAAGGA
AGATGATGATGATGACGATGAGGAATAAGGAAAAGAGGTTAAGAGAATGAGGGCTGAATC
TCTGATGTTTAAAAATAATGTGTAAAAGTTAAATGAAAGACTTGTTTGTTGTGCTTTATG
GTGGTGGATCAGACTTTTGAATAGAGCTGTGTCTGGACTTGTTATATCATCGTGGTCCGG
TTTTATTGG

QA 1 849 1 849
DS 

RD RS1DC17JQ 633 0 0
CACGTTACCGTTGGAGAAACGTGGAGAGATCCCGATCCCGAAGAAACCTGATGTCGACAT
CGAGAAGATCCAGTTCCAGAAGTTTTCTCTGGAAGAGACGGTGGCGATACTCCACGTGAG
GCTTGAGAACTTGAATGATTTTGATTTGGGGGTTAATGACTTGGACTGTGAGGTGTGGTT
GGCTGATGTGAGTATTGGGAAAGCAGAGATATCTGACTCTGTAAAGCTTGATAAAAACGG
GAGTGGGTTGATTAATGTGCCGATGACGTTCAGGCCAAAGGACTTTGGGTCTGCGCTTTG
GGATATGATACGTGGTAAAGGAACTGGGTACACTATTAAAGGTAATGTGGATGTTGATAC
ACCGTTTGGAGGTATGAAGCTTCCTATTATCAAGGAAGGTGGTGAGACTCGTCTGAAGAA
GGAAGATGATGATGATGACGATGAGGAATAAGGAAAAGAGGTTAAGAGAATGAGGGCTGA
ATCTCTGATGTTTAAAAATAATGTGTAAAAGTTAAATGAAAGACTTGTTTGTTGTGCTTT
ATGGTGGTGGATCAGACTTTTGAATAGAGCTGTGTCTGGACTTGTTATATCATCGTGGTC
CGGTTTTATTGGTTATGTTTTGTTTAAACCGGG

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 8

CO CL690Contig1 942 8 5 U
TGGTCTCCGGTACTAATAATTCAAGCATAGAATAACTCAGAATAACATATCAGAATCAGA
AGATCCTCAAAACTTGAATTGAGCATATAGATAAAAGAAAAGAAAATTTGAGATTATAGT
TGTTAAATTCTCACATCTTATGATGAAGAACCAGAAGTGCTGGTTCAGTAAAATCTTATT
GAACTCTGCAGTGTAATTGGAGCGACATTATCAAGGTAACATCAAAAGAGGATTCTTCTT
GAGGCAGGAGTATCTTTAGAGAGGACCAGGGAAAGTTCCATTCTCTCTTTGCTCGTTCCA
CTTATCAACCCATTCGCCGGGGCAAAGGGATCGATAAAACTTTGAAAACTTATCACATTC
TGGAGCGTCGTCACCCTTAGCAGCTACACATCTGGGATATTCAATGTAACGAGTGAAACA
ATGCCTTGTTTGGTTTGTTGTCGGGAAACGGAAATCAGCAGGAGCTGTCTCAAGCTTGAT
CTCATCAGGAGTCTCCTCAGCAACTTCTTCACTAGCGTCATTACTTTCCTCAACCGCAGC
AGGAGCCTCATCAGCATTGTCTTCCGCTGTCACAGCAGGAGCCTCTTCAGAAGCAGGAGG
AGACTCAGACTTGTCCTCAACAGCAGGAGGAGACTCTGACTTGTCCTCAACCTCAACAGC
AGGAGATTCTTCACCGGCTTTGTCGGTGCTGACCTCTTCAGCTTGAGTAGTAACCTCTAG
AGCAACCTCGACAGGCTTAGCACTTGTGTCTTGCTTCACTTCTTTCTCCAAATGATATTG
CTCAGAGAGCGATTGAGTTTGAGCAGCTGCAGATTCCGCCATTGGAGTTAGTGGTCTCAG
AGATTCTTCTTCAGAGCGACGAGGATCGGAGAGACAGAGAATCTTATTGATCCCCCGGCC
GTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1E620JQ U 55
AF RS1A183TR U 1
AF RS1A183JQ U 2
AF RS1GD33JQ U 76
AF RS1GD33TF C 201
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AF RS1A183TV C 165
BS 1 809 RS1A183TR
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BS 936 942 RS1A183TF

RD RS1E620JQ 400 0 0
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TATAGTTGTTAAATTCTCACATCTTATGATGAAGAACCAGAAGTGTTGGTTCAGTAAAAT
CTTATTGAACTATGCAGTGTAATTGGAGCGACATTATCAAGGTAACATCAAAAGAGGATT
CTTCTTGAGGCAGGAGTATCTTTAGAGAGGACCAGGGAAAGTTCCATTCTCTCTTTGCTC
GTTCCACTTATCAACCCATTCGCCGGGGCAAAGGGATCGATAAAACTTTGAAAACTTATC
ACATTCTGGAGCGTCGTCACCCTTAGCAGCTACACATCTGTGATATTCAATGTAACGAGT
GAAACAATGCCTTGTTTGGTTTGTTGTCGGGAAACGGAAA

QA 1 400 1 400
DS 

RD RS1A183TR 809 0 0
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AGATCCTCAAAACTTGAATTGAGCATATAGATAAAAGAAAAGAAAATTTGAGATTATAGT
TGTTAAATTCTCACATCTTATGATGAAGAACCAGAAGTGCTGGTTCAGTAAAATCTTATT
GAACTCTGCAGTGTAATTGGAGCGACATTATCAAGGTAACATCAAAAGAGGATTCTTCTT
GAGGCAGGAGTATCTTTAGAGAGGACCAGGGAAAGTTCCATTCTCTCTTTGCTCGTTCCA
CTTATCAACCCATTCGCCGGGGCAAAGGGATCGATAAAACTTTGAAAACTTATCACATTC
TGGAGCGTCGTCACCCTTAGCAGCTACACATCTGGGATATTCAATGTAACGAGTGAAACA
ATGCCTTGTTTGGTTTGTTGTCGGGAAACGGAAATCAGCAGGAGCTGTCTCAAGCTTGAT
CTCATCAGGAGTCTCCTCAGCAACTTCTTCACTAGCGTCATTACTTTCCTCAACCGCAGC
AGGAGCCTCATCAGCATTGTCTTCCGCTGTCACAGCAGGAGCCTCTTCAGAAGCAGGAGG
AGACTCAGACTTGTCCTCAACAGCAGGAGGAGACTCTGACTTGTCCTCAACCTCAACAGC
AGGAGATTCTTCACCGGCTTTGTCGGTGCTGACCTCTTCAGCTTGAGTAGTAACCTCTAG
AGCAACCTCGACAGGCTTAGCACTTGTGTCTTGCTTCACTTCTTTCTCCAAATGATATTG
CTCAGAGAGCGATTGAGTTTGAGCAGCTG

QA 1 809 1 809
DS 

RD RS1A183JQ 838 0 0
GGTCTCCGGTACTAATAATTCAAGCATAGAATAACTCAGAATAACATATCAGAATCAGAA
GATCCTCAAAACTTGAATTGAGCATATAGATAAAAGAAAAGAAAATTTGAGATTATAGTT
GTTAAATTCTCACATCTTATGATGAAGAACCAGAAGTGCTGGTTCAGTAAAATCTTATTG
AACTCTGCAGTGTAATTGGAGCGACATTATCAAGGTAACATCAAAAGAGGATTCTTCTTG
AGGCAGGAGTATCTTTAGAGAGGACCAGGGAAAGTTCCATTCTCTCTTTGCTCGTTCCAC
TTATCAACCCATTCGCCGGGGCAAAGGGATCGATAAAACTTTGAAAACTTATCACATTCT
GGAGCGTCGTCACCCTTAGCAGCTACACATCTGGGATATTCAATGTAACGAGTGAAACAA
TGCCTTGTTTGGTTTGTTGTCGGGAAACGGAAATCAGCAGGAGCTGTCTCAAGCTTGATC
TCATCAGGAGTCTCCTCAGCAACTTCTTCACTAGCGTCATTACTTTCCTCAACCGCAGCA
GGAGCCTCATCAGCATTGTCTTCCGCTGTCACAGCAGGAGCCTCTTCAGAAGCAGGAGGA
GACTCAGACTTGTCCTCAACAGCAGGAGGAGACTCTGACTTGTCCTCAACCTCAACAGCA
GGAGATTCTTCACCGGCTTTGTCGGTGCTGACCTCTTCAGCTTGAGTAGTAACCTCTAGA
GCAACCTCGACAGGCTTAGCACTTGTGTCTTGCTTCACTTCTTTCTCCAAATGATATTGC
TCAGAGAGCGATTGAGTTTGAGCAGCTGCAGATTCCGCCATTGGAGTTAGTGGTCTCA

QA 1 838 1 838
DS 

RD RS1GD33JQ 708 0 0
GAATTGAGCATATAGATAAAAGAAAAGAAAATTTGAGATTATAGTTGTTAAATTCTCACA
TCTTATGATGAAGAACCAGAAGTGCTGGTTCAGTAAAATCTTATTGAACTCTGCAGTGTA
ATTGGAGCGACATTATCAAGGTAACATCAAAAGAGGATTCTTCTTGAGGCAGGAGTATCT
TTAGAGAGGACCAGGGAAAGTTCCATTCTCTCTTTGCTCGTTCCACTTATCAACCCATTC
GCCGGGGCAA*GGGATCGATAAAACTTTGAAAACTTATCACATTCTGGAGCGTCGTCACC
CTTAGCAGCTACACATCTGTGATATTCAATGTAACGAGTGAAACAATGCCTTGTTTGGTT
TGTTGTCGGGAAACGGAAATCAGCAGGAGCTGTCTCAAGCTTGATCTCATCAGGAGTCTC
CTCAGCAACTTCTTCACTAGCGTCATTACTTTCCTCAACCGCAGCAGGAGCCTCATCAGC
ATTGTCCTCCGCTGTCACAGCAGGAGCCTCTTCAGAAGCAGGAGGAGACTCAGACTTGTC
CTCAACAGCAGGAGGAGACTCTGACTTGTCCTCAACCTCAACAACAGGAGATTCTTCACC
GGCTTTGTCGGTGCTGACCTCTTCAGCTTGAGTAGTAACCTCTAGAGCAACCTCGACAGG
CTTAGCACTTGTGTCTTGCTTCACTTCTTTCTCCAAATGATATTGCTC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1GD33TF 693 0 0
AGCGACATTATCAAGGTAACATCAAAAGAGGATTCTTCTTGAGGCAGGAGTATCTTTAGA
GAGGACCAGGGAAAGTTCCATTCTCTCTTTGCTCGTTCCACTTATCAACCCATTCGCCGG
GGCAA*GGGATCGATAAAACTTTGAAAACTTATCACATTCTGGAGCGTCGTCACCCTTAG
CAGCTACACATCTGTGATATTCAATGTAACGAGTGAAACAATGCCTTGTTTGGTTTGTTG
TCGGGAAACGGAAATCAGCAGGAGCTGTCTCAAGCTTGATCTCATCAGGAGTCTCCTCAG
CAACTTCTTCACTAGCGTCATTACTTTCCTCAACCGCAGCAGGAGCCTCATCAGCATTGT
CCTCCGCTGTCACAGCAGGAGCCTCTTCAGAAGCAGGAGGAGACTCAGACTTGTCCTCAA
CAGCAGGAGGAGACTCTGACTTGTCCTCAACCTCAACAACAGGAGATTCTTCACCGGCTT
TGTCGGTGCTGACCTCTTCAGCTTGAGTAGTAACCTCTAGAGCAACCTCGACAGGCTTAG
CACTTGTGTCTTGCTTCACTTCTTTCTCCAAATGATATTGCTCAGAGAGCGATTGAGTTT
GAGCAGCTGCAGATTCCGCCATTGGAGTTAGTGGTCTCAGAGATTCTTCTTCAGAGCGAC
GAGGATCGGAGAGACAGAGAATCTTATTGATC
C

QA 1 692 1 692
DS 

RD RS1E620TF 727 0 0
TCAGT
AAATCTTATTGAACTATGCAGTGTAATTGGAGCGACAT*ATCAAGGTAACATCAAAAGAG
GATTCTTCTTGAGGCAGGAGTATCTTTAGAGAGGACCAGGGAAAGTTCCATTCTCTCTTT
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TATCACATTCTGGAGCGTCGTCACCCTTAGCAGCTACACATCTGTGATATTCAATGTAAC
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CAAGCTTGATCTCATCAGGAGTCTCCTCAGCAACTTCTTCACTAGCGTCATTACTTTCCT
CAACCGCAGCAGGAGCCTCATCAGCATTGTCTTCCGCTGTCACAGCAGGAACCTCTTCAG
AAGCAGGAGGAGACTCAGACTTGTCCTCAACAGCAGGAGGAGACTTTGACTTGTCCTCAA
CCTCAACAGCAGGAGATTCTTCACCGGCTTTGTCGGTGCTGACCTCTTCAGCTTGAGTAG
TAACCTCTAGAGCAACCTCGACAGGCTTAGCACTTGTGTCTTGCTTCACTTCT**CTCCA
AATGATATTGCTCAGAGAGCGATTGAGTTTGAGCAGCTGCAGATTCCGCCATTGGAGTTA
GTGGTCTCAGAGATTCTTCTTCAGAGCGACGAGGATCGGAGAGACAGAGAATCTTATTGA
TC

QA 6 727 6 727
DS 

RD RS1A183TF 819 0 0
TAAATTCTCACATCTTATGATGAAGAACCAGAAGTGCTGGTTCAGTAAAATCTTATTGAA
CTCTGCAGTGTAATTGGAGCGACATTATCAAGGTAACATCAAAAGAGGATTCTTCTTGAG
GCAGGAGTATCTTTAGAGAGGACCAGGGAAAGTTCCATTCTCTCTTTGCTCGTTCCACTT
ATCAACCCATTCGCCGGGGCAAAGGGATCGATAAAACTTTGAAAACTTATCACATTCTGG
AGCGTCGTCACCCTTAGCAGCTACACATCTGGGATATTCAATGTAACGAGTGAAACAATG
CCTTGTTTGGTTTGTTGTCGGGAAACGGAAATCAGCAGGAGCTGTCTCAAGCTTGATCTC
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AGCCTCATCAGCATTGTCTTCCGCTGTCACAGCAGGAGCCTCTTCAGAAGCAGGAGGAGA
CTCAGACTTGTCCTCAACAGCAGGAGGAGACTCTGACTTGTCCTCAACCTCAACAGCAGG
AGATTCTTCACCGGCTTTGTCGGTGCTGACCTCTTCAGCTTGAGTAGTAACCTCTAGAGC
AACCTCGACAGGCTTAGCACTTGTGTCTTGCTTCACTTCTTTCTCCAAATGATATTGCTC
AGAGAGCGATTGAGTTTGAGCAGCTGCAGATTCCGCCATTGGAGTTAGTGGTCTCAGAGA
TTCTTCTTCAGAGCGACGAGGATCGGAGAGACAGAGAATCTTATTGATCCCCCGGCCGTA
ATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACTGTCGACT

QA 1 819 1 819
DS 

RD RS1A183TV 778 0 0
TCAGTAAAATCTTATTGAACTCTGCAGTGTAATTGGAGCGACATTATCAAGGTAACATCA
AAAGAGGATTCTTCTTGAGGCAGGAGTATCTTTAGAGAGGACCAGGGAAAGTTCCATTCT
CTCTTTGCTCGTTCCACTTATCAACCCATTCGCCGGGGCAAAGGGATCGATAAAACTTTG
AAAACTTATCACATTCTGGAGCGTCGTCACCCTTAGCAGCTACACATCTGGGATATTCAA
TGTAACGAGTGAAACAATGCCTTGTTTGGTTTGTTGTCGGGAAACGGAAATCAGCAGGAG
CTGTCTCAAGCTTGATCTCATCAGGAGTCTCCTCAGCAACTTCTTCACTAGCGTCATTAC
TTTCCTCAACCGCAGCAGGAGCCTCATCAGCATTGTCTTCCGCTGTCACAGCAGGAGCCT
CTTCAGAAGCAGGAGGAGACTCAGACTTGTCCTCAACAGCAGGAGGAGACTCTGACTTGT
CCTCAACCTCAACAGCAGGAGATTCTTCACCGGCTTTGTCGGTGCTGACCTCTTCAGCTT
GAGTAGTAACCTCTAGAGCAACCTCGACAGGCTTAGCACTTGTGTCTTGCTTCACTTCTT
TCTCCAAATGATATTGCTCAGAGAGCGATTGAGTTTGAGCAGCTGCAGATTCCGCCATTG
GAGTTAGTGGTCTCAGAGATTCTTCTTCAGAGCGACGAGGATCGGAGAGACAGAGAATCT
TATTGATCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 7

CO CL691Contig1 1280 7 38 U
AGCGATCTTAAATTAATCTTGACATTGAACGCATATTTTACGAAGACTAGTATATTTAGA
CATGCCATCTTGTGGTTAGAAACTAGCTATATGATAGTCAGAAAAGTATACATGAGAGAC
GACAAAGTAAACATGCTTACTTGTATACAAAGTAAAAAACCATATAATAGCCAGAAAAGT
ATATAAATATCCTCCCTTTTTGAGGTTTACCCAGCAGATATTCGAAGACCCTGATCCAAA
GTCCTCCGAGTTCTTCCCCCGTCCCGGGTCGGAAGGATCGCCGGAAGCCGCTAATATTCG
CCTTTATACTCCGGAATACCTCGAAGGTCGGAAGCCCGAATTTGAAGATCTTCAGCCACT
TTCTTAGTGGTCTCGACAGTGAACCGGCGCATGTACGACGACAGCAGTGGCAGATCCCAA
GGAGAAGCAGGCCTAAAAGTCTGCTCCACTTTAACCTTGGACGCAATCCGTCCTTTTCCA
CCACTACATTTTCTGTATTCTTCTGTACTCTTTGGCTTAATGCGCTTGCACAAGCGTTCT
GCATCAACATATAATGGCTCCACTGTATAGCTACCCTCGAACGTTTCCATGGTCCTTATT
CCTTTTGCATCTTTCAAGTAGAGTACATTGAGTTTTTTTGGATCTTCGAGGACAATTAGA
CGTATTGGGAGAGTTCCTGACAAGAAAAGGAATTTCCATGCCAACTCTTTCTCAACCTTC
ACGATCGGCCTATGCCCTGGACCTTCATCCCTCTCTGGTGTAACTATTCTTGATACGGCT
GTCAGAAGTGCGCGGTCGTTCTTTTCTCTGGACTGTGATATGTTGTCTTCATTAGTTAAA
ACGTCGTAAGCTGTTTGAGGTGGAATTCCTAATATAAATTCCATTTCCATACGGGAAAGG
CCATCAAATTTATGGTCTACGCGCATCTTCACAGCAGGAGGAGGTTCTTGATATTGTTTC
TTCTTGTTTGCATCTCTCCATAGTTTCAATTGCTCCATCTCATCTCTCTCATGGTGAGTT
TTTGTCTCTCTCACTGGCTTGGATTTAACATTTTCAGATTTTTTAGGCTGTTGTATGTTC
TGACTGATCCAGCCACCAAACCCAGGAAATATACCCATTCACACTCTGAAAATTTAGGCC
TCAAAGAGATATGACGATCAAAAGAGTATCTGAGATATAGGTACCGGGACAAAGAGATAA
TTGACTTACAGGGGAATAAGGTCAACGGGACAAATCATGCATAGTATATGCTATAGGGTT
TCAGGAACTTTAGAAAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 5 
5 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CJ30JQ U 1
AF RS1BD44JQ U 65
AF RS1EG66JQ U 65
AF RS1EH59JQ U 65
AF RS1EH59TF C 323
AF RS1BD44TF C 579
AF RS1EG66TF C 634
BS 1 96 RS1CJ30JQ
BS 97 97 RS1BD44JQ
BS 98 177 RS1CJ30JQ
BS 178 178 RS1BD44JQ
BS 179 197 RS1CJ30JQ
BS 198 198 RS1BD44JQ
BS 199 201 RS1CJ30JQ
BS 202 202 RS1BD44JQ
BS 203 259 RS1CJ30JQ
BS 260 260 RS1BD44JQ
BS 261 263 RS1CJ30JQ
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BS 265 338 RS1CJ30JQ
BS 339 339 RS1BD44JQ
BS 340 505 RS1CJ30JQ
BS 506 506 RS1BD44JQ
BS 507 593 RS1CJ30JQ
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BS 1265 1280 RS1EG66TF

RD RS1CJ30JQ 737 0 0
AGCGATCTTAAATTAATCTTGACATTGAACGCATATTTTACGAAGACTAGTATATTTAGA
CATGCCATCTTGTGGTTAGAAACTAGCTATATGATACTCAGAAAAGTATACATGAGAGAC
GACAAAGTAAACATGCTTACTTGTATACAAAGTAAAAAACCATATAATAGCCAGAAAGGT
ATATAAATATCCTCCCTCTTTTAGGTTTACCCAGCAGATATTCGAAGACCCTGATCCAAA
GTCCTCCGAGTTCTTCCCC*GTCTCGGGTCGGAAGGATCGCCGGAAGCCGCTAATATTCG
CCTTTATACTCCGGAATACCTCGAAGGTCGGAAGCCCGCATTTGAAGATCTTCAGCCACT
TTCTTAGTGGTCTCGACAGTGAACCGGCGCATGTACGACGACAGCAGTGGCAGATCCCAA
GGAGAAGCAGGCCTAAAAGTCTGCTCCACTTTAACCTTGGACGCAATCCGTCCTTTTCCA
CCACTACATTTTCTGTATTCTTCTGGACTCTTTGGCTTAATGCGCTTGCACAAGCGTTCT
GCATCAACATATAATGGCTCCACTGTATAGCTACCCTCGAACGTTTCCATGGTTCTTATT
CCTTTTGCATCTTTCAAGTAGAGTACACGGAGTTTTTTTGGATTTTCGAGGACAATTAGA
CGTATTGGGAGAGTTCCTGACAAGAAAAGGAATTTCCATGCCGACTCTTTCTCA*CCTTC
ACGATCGGCCTATGCCC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RS1BD44JQ 709 0 0
GATCAAA
GTGGTTAGAAACTAGCTATATGATAGTCAGAAAAGTATACATGAGAGACGACAAAGTAAA
CATGCTTACTTGTATACAAAGTAAAAAACCATATAATAGCCAGAAAAGTATATAAATATC
CTCCCTTTTTGAGGTTTACCCAGCAGATATTCGAAGACCCTGATCCAAAGTCCTCCGAGT
TCTTCCCCCGTCCCGGGTCGGAAGGATCGCCGGAAGCCGCTAATATTCGCCTTTATACTC
CGGAATACCTCGAAGGTCGGAAGCCCGAATTTGAAGATCTTCAGCCACTTTCTTAGTAGT
CTCGACAGTGAACCGGCGCATGTACGACGACAGCAGTGGCAGATCCCAAGGAGAAGCAGG
CCTAAAAGTCTGCTCCACTTTAACCTTGGACGCAATCCGTCCTTTTCCACCACTACATTT
TCTGTATTCTTCTGTACTCTTTGGCTTAATGCGCTTGCACAAGCGTTCTGCATCAACATA
TAATGGCTCCACTGTATAACTACCCTCGAACGTTTCCATGGTCCTTATTCCTTTTGCATC
TTTCAAGTAGAGTACATTGAGTTTTTTTGGATCTTCGAGGACAATTAGACGTATTGGGAG
AGTTCCTGACAAGAAAAGGAATTTCCATGCCAACTCTTTCTCAACCTTCACGATCGGCCT
ATGCCATGGACCTTCATCCCTCTCTGGTGTAACTATTCTTGA

QA 8 709 8 709
DS 

RD RS1EG66JQ 825 0 0
GATCAAA
GTGGTTAGAAACTAGCTATATGATAGTCAGAAAAGTATACATGAGAGACGACAAGGTAAA
CATGCTTACTTGTATACAAAGTAAAAAACCATATAATAGCCAGAAAAGTATATAAATATC
CTCCCTTTTTGAGGTTTACCCAGCAGATATTCGAAGACCCTGATCCAAAGTCCTCCGAGT
TCTTCCCCCGTCCCGGGTCGGAAGGATCGCCGGAAGCCGCTAATATTCGCCTTTATACTC
CGGAATACCTCGAAGGTCGGAAGCCCGAATTTGAAGATCTTCAGCCACTTTCTTAGTGGT
CTCGACAGTGAACCGGCGCATGTACGACGACAGCAGTGGCAGATCCCAAGGAGAAGCAGG
CCTAAAAGTCTGCTCCACTTTAACCTTGGACGCAATCCGTCCTTTTCCACCACTACATTT
TCTGTATTCTTCTGTACTCTTTGGCTTAATGCGCTTGCACAAGCGTTCTGCATCAACATA
TAATGGCTCCACTGTATAGCTACCCTCGAACGTTTCCATGGTCCTTATTCCTTTTGAATC
TTTCAAGTAGAGTACATTGAGTTTTTTTGGATCTTCGAGGACAATTAGACGTATTGGGAG
AGTTCCTGACAAGAAAAGGAATTTCCATGCCAACTCTTTCTCAACCTTCACGATCGGCCT
ATGCCCTGGACCTTCATCCCTCTCTGGTGTAACTATTCTTGATACGGCTGTCAGAAGTGC
GCGGTCGTTCTTTTCTCTGGACTGTGATATGTTGTCTTCATTAGTTAAAACGTCGTAAGC
TGTTTGAGGTGGAATTCCTAATATAA*TTCCATTTCCA

QA 8 825 8 825
DS 

RD RS1EH59JQ 797 0 0
GCTCAAA
GTGGTTAGAAACTAGCTATATGATAGTCAGAAAAGTATACATGAGAGACGACAAAGTAAA
CATGCTTACTTGTATACAAAGTAAAAAACCATATAATAGCCAGAAAAGTATATAAATATC
CTCCCTTTTTGAGGTTTACCCAGCAGATATTCGAAGACCCTGATCCAAAGTCCTCCGAGT
TCTTCCCCCGTCCCGGGTCGGAAGGATCGCCGGAAGCCGCTAATATTCGCCTTTATACTC
CGGAATACCTCGAAGGTCGGAAGCCCGAATTTGAAGATCTTCAGCCACTTTCTTAGTGGT
CTCGACAGTGAACCGGCGCATGTACGACGACAGCAGTGGCAGATCCCAAGGAGAAGCAGG
CCTAAAAGTCTGCTCCACTTTAACCTTGGACGGAATCCGTCCTTTTCCACCACTACATTT
TCTGTATTCTTCTGTACTCTTTGGCTTAATGCGCTTGCACAAGCGTTCTGCATCAACATA
TAATGGCTCCACTGTATAGCTACCCTCGAACGTTTCCATGGTCCTTATTCCTTTTGCATC
TTTCAAGTAGAGTACATTGAGTTTTTTTGGATCTTCGAGGACAATTAGACGTATTGGGAG
AGTTCCTGACAAGAAAAGGAATTTCCATGCCAACTCTTTCTCAACCTTCACGATCGGCCT
ATGCCCTGGACCTTCATCCCTCTCTGGTGTAACTATTCTTGATACGGC****AGAAGTGC
GCGGTCGTTCTTTTCTCTGGACTGTGATATGTTGTCTTCATTAGTTAAAACGTCGTAAGC
TGTTTGAGGT

QA 8 797 8 797
DS 

RD RS1EH59TF 642 0 0
GAAGGTCGGAAGCCCGAATTTGAAGATCTTCAGCCACTTTCTTAGTGGTCTCGACAGTGA
ACCGGCGCATGTACGACGACAGCAGTGGCAGATCCCAAGGAGAAGCAGGCCTAAAAGTCT
GCTCCACTTTAACCTTGGACGGAATCCGTCCTTTTCCACCACTACATTTTCTGTATTCTT
CTGTACTCTTTGGCTTAATGCGCTTGCACAAGCGTTCTGCATCAACATATAATGGCTCCA
CTGTATAGCTACCCTCGAACGTTTCCATGGTCCTTATTCCTTTTGCATCTTTCAAGTAGA
GTACATTGAGTTTTTTTGGATCTTCGAGGACAATTAGACGTATTGGGAGAGTTCCTGACA
AGAAAAGGAATTTCCATGCCAACTCTTTCTCAACCTTCACGATCGGCCTATGCCCTGGAC
CTTCATCCCTCTCTGGTGTAACTATTCTTGATACGGC****AGAAGTGCGCGGTCGTTCT
TTTCTCTGGACTGTGATATGTTGTCTTCATTAGTTAAAACGTCGTAAGCTGTTTGAGGTG
GAATTCCTAATATAAATTCCATTTCCATACGGGAAAGGCCATCAAATTTATGGTCTACGC
GCATCCTCACAGCAGGAGGAGGTTCTTGATATTGTTTCTTC
C

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1BD44TF 686 0 0
GAACGTTTCCATGGTCCT*ATTCCTTTTGCATCTTTCAAGTAGAGTACATTGAGTTTTTT
*GGATCTTCGAGGACAATTAGACGTATTGGGAGAGTTCCTGACAAGAAAAGGAATTTCCA
TGCCAACTCTTTCTCAACCTTCACGATCGGCCTATGCCATGGACCTTCATCCCTCTCTGG
TGTAACTATTCTTGATACGGCTGTCAGAAGTGCGCGGTCGTTCTTTTCTCTGGACTGTGA
TATGTTGTCTTCATTAGTTAAAACGTCGTAAGCTGTTTGAGGTGGAATTCCTAATATAAA
TTCCATTTCCATACGGGAAAGGCTATCAAATTTATGGTCTACGCGCATCTTCACAGCAGG
AGGAGGTTCTTGATATTGTTTCTTCTTGTTTGCATCTCTCCATAGTTTCAATTGCTCCAT
CTCATCTCTCTCATGGTGAGTTTTTGTCTCTCTCACTGGCTTGGATTTAACATTTTCAGA
TTTTTTAGGCTGTTGTATGTTCTGACTGATCCAGCCACCAAACCCAGGAAATATACCCAT
TCACACTCTGAAAATTTAGGCCTCAAAGAGATATGACGATCAAAAGAGTATCTGAGATAT
AGGTACCGGGACAAAGAGATAATTGACTTACAGGGGAATAAGGTCAACGGGACAAATCAT
GTATAGTATATGCTATAGGGTTTCAG

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1EG66TF 647 0 0
TTTTTTGGATCTTCGAGGACAATTAGACGTATTGGGAGAGTTCCTGACAAGAAAAGGAAT
TTCCATGCCAACTCTTTCTCAACCTTCACGATCGGCCTATGCCCTGGACCTTCATCCCTC
TCTGGTGTAACTATTCTTGATACGGCTGTCAGAAGTGCGCGGTCGTTCTTTTCTCTGGAC
TGTGATATGTTGTCTTCATTAGTTAAAACGTCGTAAGCTGTTTGAGGTGGAATTCCTAAT
ATAAATTCCATTTCCATACGGGAAAGGCCATCAAATTTATGGTCTACGCGCATCTTCACA
GCAGGAGGAGGTTCTTGATATTGTTTCTTCTTGTTTGCATCTCTCCATAGTTTCAATTGC
TCCATCTCATCTCTCTCATGGTGAGTTTTTGTCTCTCTCACTGGCTTGGATTTAACATTT
TCAGATTTTTTAGGCTGTTGTGTGTTCTGACTGATCCAGCCACCAAACCCAGGAAATATA
CCCATTCACACTCTGAAAATTTAG*CCTCAAAGAGATATGACGATCAAAAGAGTATCTGA
GATATAGGTACCGGGACAAAGAGATAATTGACTTACAGGGGAATAAGGTCAACGGGACAA
ATCATGCATAGTATATGCTATAGGGTTTCAGGAACTTTAGAAAATCC

QA 1 647 1 647
DS 



AS 3 8

CO CL692Contig1 729 2 1 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGGAAGCCTG
ACCTTATCATTGGGAACTACAGTGATGGAAACCTCGTTGCCTCTTTATTGGCACACAAAC
TTGGTGTCACACAGTGTACCATTGCTCACGCTCTGGAGAAGACAAAGTACCCTGATTCAG
ACATCTACTGGAAGAAGCTTGACGACAAGTACCATTTCTCATGCCAGTTCACTGCGGATC
TATTTGCAATGAACCACACTGATTTCATCATCACTAGTACTCTCCAAGAAATTGCTGGAA
GCAAGGACACTGTTGGGCAGTACGAGAGCCACACAGCCTTCACTCTTCCTGGACTGTACC
GTGTTGTTCACGGAATTGATGTGTTTGATCCTAAATTTAACATTGTCTCCCCTGGTGCTG
ATATGAGCATCTACTTCCCTTACACAGAGGAGAAGCGTAGATTGACTAAGTTCCACCCTG
AGATCGAGGAGCTACTCTACAGCGATGTTGAGAACCAAGAGCACTTATGTGTGCTCAAGG
ACAAGAAGAAGCCAATACTCTTCACCATGGCTAGACTAGACCGTGTCAAGAACCTGTCAG
GTCTTGTCGAGTGGTACGGGAAGAACAAGCGCCTGCGTGAGCTTGTTAACTTGGTGGTTG
TTGGAGGAGACAGGAGGAAAGAGTCGAAGGACAACGAAGAGAAGGCTGAGATGAAGAGAA
TGTATGACC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A273TF U 1
AF RS1A273TV U 1
BS 1 729 RS1A273TF

RD RS1A273TF 729 0 0
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TATTTGCAATGAACCACACTGATTTCATCATCACTAGTACTCTCCAAGAAATTGCTGGAA
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ATATGAGCATCTACTTCCCTTACACAGAGGAGAAGCGTAGATTGACTAAGTTCCACCCTG
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GTCTTGTCGAGTGGTACGGGAAGAACAAGCGCCTGCGTGAGCTTGTTAACTTGGTGGTTG
TTGGAGGAGACAGGAGGAAAGAGTCGAAGGACAACGAAGAGAAGGCTGAGATGAAGAGAA
TGTATGACC

QA 1 729 1 729
DS 

RD RS1A273TV 729 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGGAAGCCTG
ACCTTATCATTGGGAACTACAGTGATGGAAACCTCGTTGCCTCTTTATTGGCACACAAAC
TTGGTGTCACACAGTGTACCATTGCTCACGCTCTGGAGAAGACAAAGTACCCTGATTCAG
ACATCTACTGGAAGAAGCTTGACGACAAGTACCATTTCTCATGCCAGTTCACTGCGGATC
TATTTGCAATGAACCACACTGATTTCATCATCACTAGTACTCTCCAAGAAATTGCTGGAA
GCAAGGACACTGTTGGGCAGTACGAGAGCCACACAGCCTTCACTCTTCCTGGACTGTACC
GTGTTGTTCACGGAATTGATGTGTTTGATCCTAAATTTAACATTGTCTCCCCTGGTGCTG
ATATGAGCATCTACTTCCCTTACACAGAGGAGAAGCGTAGATTGACTAAGTTCCACCCTG
AGATCGAGGAGCTACTCTACAGCGATGTTGAGAACCAAGAGCACTTATGTGTGCTCAAGG
ACAAGAAGAAGCCAATACTCTTCACCATGGCTAGACTAGACCGTGTCAAGAACCTGTCAG
GTCTTGTCGAGTGGTACGGGAAGAACAAGCGCCTGCGTGAGCTTGTTAACTTGGTGGTTG
TTGGAGGAGACAGGAGGAAAGAGTCGAAGGACAACGAAGAGAAGGCTGAGATGAAGAGAA
TGTATGACC

QA 1 729 1 729
DS 



CO CL692Contig2 835 2 4 U
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CTGAGAGGCAAATGATAAAATAAAAAAAAAAGACGAATGGATTGAAATAACAAAGAAGCA
AAAGCGCTCCTAAAATCAAAATGACAGTAAGAATCAAAAGAGATTTTTGTTATTCTTCTT
CACACACTGCAACCTCTTTCTCTCTTCAAGCTCTTTATAATGGTTCCGCATCTCCTTCAT
TCCTCCTCGGCAAGAGGAACAGCCTTAGCCAGTGGGCGATACTTCAATGCATAGAACATC
TCAAGGTAACGACGGCTCTCAAGACGGTCAAGGTTCGATACATGCTTCCAGAATCCATAC
ACACCAGTCAATGTCAAGAGCCTCTGTGAGTATATCTGCCATGTGTATTTCTCCTCAATC
CTCTGAAGCCCTCCCTTCGAGATCTCATCCCAATGAGATGGATCTTCCTTACACTTAGTG
AAGAAGTCAGCAAGAGTATCAGCAGCCTGATCACCATGGTAAGGGTCAATATGGAAGCCA
GATTTGCCATGCACGATGATCTCAGCCGGACCACCTTTGCAAGTGGCGAAAGTCGGTAAC
CCACAGGTCATGGCCTCCACAACAGTCAGACCAAAGGCTTCATACAACGCAGGCTGCACG
AAGGCGCCCTTTGTGTCACAGATGTAACGGTAGAGCTCACCGTTCCTAACCCTGTTCATC
TGAGAAGAGATCCACCTGAACTGACCGTTCAGCTTGTACTCACCGATGAGGTCATACATT
TTCTTCATCTCAGCCTTCTCTTCGTTGTCCTTCGACTCTTTCCTCCTGTCTCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CV57JQ U 1
AF RS1CS26JQ U 6
BS 1 762 RS1CV57JQ
BS 763 763 RS1CS26JQ
BS 764 823 RS1CV57JQ
BS 824 835 RS1CS26JQ

RD RS1CV57JQ 823 0 0
AGGATAGAGAAATAGAAATTTCATTCTCTCAACAATCAGAATACAACGCATTAGCCTTGC
CTGAGAGGCAAATGATAAAATAAAAAAAAAAGACGAATGGATTGAAATAACAAAGAAGCA
AAAGCGCTCCTAAAATCAAAATGACAGTAAGAATCAAAAGAGATTTTTGTTATTCTTCTT
CACACACTGCAACCTCTTTCTCTCTTCAAGCTCTTTATAATGGTTCCGCATCTCCTTCAT
TCCTCCTCGGCAAGAGGAACAGCCTTAGCCAGTGGGCGATACTTCAATGCATAGAACATC
TCAAGGTAACGACGGCTCTCAAGACGGTCAAGGTTCGATACATGCTTCCAGAATCCATAC
ACACCAGTCAATGTCAAGAGCCTCTGTGAGTATATCTGCCATGTGTATTTCTCCTCAATC
CTCTGAAGCCCTCCCTTCGAGATCTCATCCCAATGAGATGGATCTTCCTTACACTTAGTG
AAGAAGTCAGCAAGAGTATCAGCAGCCTGATCACCATGGTAAGGGTCAATATGGAAGCCA
GATTTGCCATGCACGATGATCTCAGCCGGACCACCTTTGCAAGTGGCGAAAGTCGGTAAC
CCACAGGTCATGGCCTCCACAACAGTCAGACCAAAGGCTTCATACAACGCAGGCTGCACG
AAGGCGCCCTTTGTGTCACAGATGTAACGGTAGAGCTCACCGTTCCTAACCCTGTTCATC
TGAGAAGAGATCCACCTGAACTGACCGTTCAGCTTGTACTCATCGATGAGGTCATACATT
TTCTTCATCTCAGCCTTCTCTTCGTTGTCCTTCGACTCTTTCC

QA 1 823 1 823
DS 

RD RS1CS26JQ 830 0 0
AGAA
AAATAGAAATTTCATTCTCTCAACAATCAGAATACAACGCATTAGCCTTGCCTGAGAGGC
AAATGATAAAATAAAAAAAAAAGACGAATGGATTGAAATAACAAAGAAGCAAAAGCGCTC
CTAAAATCAAAATGACAGTAAGAATCAAAAGAGATTTTTGTTATTCTTCTTCACACACTG
CAGCCTCTTTCTCTCTTCAAGCTCTTTATAATGGTTCCGCATCTCCTTCATTCCTCCTCG
GCAAGAGGAACAGCCTTAGCCAGTGGGCGATACTTCAATGCATAGAACATCTCAAGGTAA
CGACGGCTCTCAAGACGGTCAAGGTTCGATACATGCTTCCAGAATCCATACACACCAGTC
AATGTCAAGAGCCTCTGTGAGTATATCTGCCATGTGTATTTCTCCTCAATCCTCTGAAGC
CCTCCCTTCGAGATCTCATCCCAATGAGATGGATCTTCCTTACACTTAGTGAAGAAGTCA
GCAAGAGTATCAGCAGCCTGATCACCATGGTAAGGGTCAATATGGAAGCCAGATTTGCCA
TGCACGATGATCTCAGCCGGACCACCTTTGCAAGTGGCGAAAGTCGGTAACCCACAGGTC
ATGGCCTCCACAACAGTCAGACCAAAGGCTTCATACAACGCAGGCTGCACGAAGGCGCCC
TTTGTGTCACAGATGTAACGGTAGAGCTCACCGTTCCTAACCCTGTTCATCTGAGAAGAG
ATCCACCTGAACTGACCGTTCAGCTTGTACTCACCGATGAGGTCATACATTTTCTTCATC
TCAGCCTTCTCTTCGTTGTCCTTCGACTCTTTCCTCCTGTCTCCTC

QA 5 830 5 830
DS 



CO CL692Contig3 1026 4 23 U
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AAGAAGAAGCCCACCCTCTTCACCATGGCTAGACTAGACCGTGTCAAGAACTTATCAGGT
CTCGTCGAGTGGTACGGGAAGAACAAACGCCTTCGTGAGCTTGTTAACTTGGTGGTTGTT
GGAGGAGACAGGAGGAAAGAGTCGAAGGACAACGAAGA*GAAGGCTGAGATGAAGAAAAT
GTATGACCTCATCGATGAGTACAAGCTGAACGGTCAGTTCAGGTGGATCTCCTCTCAGAT
GAACAGGGTTAGGAACGGTGAGCTCTACCGTTACATCTGTGACACAAAAGGAGCCTTCGT
GCAGCCTGCGTTGTACGAAGCATTTGGTCTCACTGTTGTGGAGGCCATGACCTGTGGGTT
ACCGACTTTCGCCACTTGCAAAGGTGGTCCGGCTGAGATCATCGTGCACGGCAAATCTGG
CTTCCATATTGACCCTTACCATGGTGATCAGGCTGCTGATACTCTTGCTGACTTCTTCAC
TAAGTGTAAGGAAGATCCATCTCATTGGGATGAGATCTCGAAGGGAGGGCTTCAGAGGAT
TGAGGAGAAATACACATGGCAGATATACTCACAGAGGCTTCTGACATTGACTGGTGTGTA
TGGATTCTGGAAGCATGTATCGAACCTTGACCGTCTTGAGAGCCGTCGTTACCTTGAGAT
GTTCTATGCATTGAAGTATCGCCCACTGGCTAAGGCTGTCCCTCTTGCCGAGGAGGAATG
AAGGAGATGCGGAACCATTATAAAGAGCTTGAAGAGAGAAAGAGCTTGCAGTGTGTGAAG
AAGAATAAAAAAAAAATCTCTTTTGATTCTTACTGTCATTTTGATTTTAGGAGCGCTTTT
GCTTCTTTGTTATTTCAATCCATTCGTCTTTGTTTTTATTTTATCCTTTGCCTCTCAGGC
AGGCAGGCGGGCTAATGCGTTTGTATTCTGATTGTTGAGAGAATGAAATTTCTATTTTTC
TATCTT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1CS26TF U 2
AF RS1CV57TF U 1
AF RS1A273TR C 72
AF RS1A273JQ C 268
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BS 551 639 RS1CV57TF
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BS 716 957 RS1A273TR
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RD RS1CS26TF 631 0 0
G
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GAAGAAGCCCACCCTCTTCACCATGGCTAGACTAGACCGTGTCAAGAACTTATCAGGTCT
CGTCGAGTGGTACGGGAAGAACAAACGCCTTCGTGAGCTTGTTAACTTGGTGGTTGTTGG
AGGAGACAGGAGGAAAGAGTCGAAGGACAACGAAGA*GAAGGCTGAGATGAAGAAAATGT
ATGACCTCATCGGTGAGTACAAGCTGAACGGTCAGTTCAGGTGGATCTCTTCTCAGATGA
ACAGGGTTAGGAACGGTGAGCTCTACCGTTACATCTGTGACACAAAGGGCGCCTTCGTGC
AGCCTGCGTTGTATGAAGCCTTTGGTCTGACTGTTGTGGAGGCCATGACCTGTGGGTTAC
CGACTTTCGCCACTTGCAAAGGTGGTCCGGCTGAGATCATCGTGCATGGCAAATCTGGCT
TCCATATTGACCCTTACCATGGTGATCAGGCTGCTGATACTCTTGCTGACTTCTTCACTA
AGTGTAAGGAAGATCCATCTCATTGGGATGAGATCTCGAAGGGAGGGCTTCAGAGGATTG
AGGAGAAATACACATGGCAGATATACTCAC

QA 2 631 2 631
DS 

RD RS1CV57TF 715 0 0
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CTCGTCGAGTGGTACGGGAAGAACAAACGCCTTCGTGAGCTTGTTAACTTGGTGGTTGTT
GGAGGAGACAGGAGGAAAGAGTCGAAGGACAACGAAGA*GAAGGCTGAGATGAAGAAAAT
GTATGACCTCATCGATGAGTACAAGCTGAACGGTCAGTTCAGGTGGATCTCTTCTCAGAT
GAACAGGGTTAGGAACGGTGAGCTCTACCGTTACATCTGTGACACAAAGGGCGCCTTCGT
GCAGCCTGCGTTGTATGAAGCCTTTGGTCTGACTGTTGTGGAGGCCATGACCTGTGGGTT
ACCGACTTTCGCCACTTGCAAAGGTGGTCCGGCTGAGATCATCGTGCATGGCAAATCTGG
CTTCCATATTGACCCTTACCATGGTGATCAGGCTGCTGATACTCTTGCTGACTTCTTCAC
TAAGTGTAAAGAAGATCCATCTCATTGGGATGAGATCTCGAAGGGAGGGCTTCAGAGGAT
TGAGGAGAAATACACATGGCAGATATACTCACAGAGGCTCTTGACATTGACTGGTGTGTA
TGGATTCTGGAAGCATGTATCGAACCTTGACCGTCTTGAGAGCCGTCGTTACCTT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1A273TR 886 0 0
AATA
CTCTTCACCATGGCTAGACTAGAC*GTGTCAAGAACTG*TCAGGTCT*GTCGAGTGGTAC
GGGAAGAACAAGCGCCTGCGTGAGCTTGTTAACTTGGTGGTTGTTGGAGGAGACAGGAGG
AAAGAGTCGAAGGACAACGAAGAAGAAGGCTGAGATGAAGAGAATGTATGACCTCATCGA
TGAATACAAGCTGAACGGTCAGTTCAGGTGGATCTCCTCTCAGATGAACAGGGTTAGGAA
CGGTGAGCTCTACCGTTACATCTGTGACACCAAAGGAGCCTTCGTGCAGCCTGCGTTGTA
CGAAGCATTTGGTCTCACTGTTGTGGAGGCCATGACCTGTGGTTTGCCGACTTTCGCCAC
TTGCAAAGGTGGTCCGGCTGAGATCATCGTGCACGGCAAATCTGGCTTCCATATTGACCC
TTACCATGGTGATCAGGCTGCTGATACTCTTGCTGACTTCTTCACTAAGTGTAAGGAAGA
TCCATCTCATTGGGATGAGATCTCGAAGGGAGGGCTTCAGAGGATTGAGGAGAAATACAC
GTGGCAGATATACTCACAGAGGCTTCTGACATTGACTGGTGTGTATGGATTCTGGAAGCA
TGTATCGAACCTTGACCGTCTTGAGAGCCGTCGTTACCTTGAGATGTTCTATGCATTGAA
GTATCGCCCACTGGCTAAGGCTGTCCCTCTTGCCGAGGAGGAATGAAGGAGATGCGGAAC
CATTATAAAGAGCTTGAAGAGAGAAAGAGCTTGCAGTGTGTGAAGAAGAATAAAAAAAAA
ATCTCTTTTGATTCTTACTGTCATTTTGATTTTAGGAGCGCTTTTGCTTCTTTGTTATTT
CAATCCATTCGTCTTTGTTTTTATTTTATCCTTTGCCTCTCA

QA 5 886 5 886
DS 

RD RS1A273JQ 759 0 0
GAACGGTCAGTTCAGGTGGATCTCCTCTCAGATGAACAGGGTTAGGAACGGTGAGCTCTA
CCGTTACATCTGTGACACCAAAGGAGCCTTCGTGCAGCCTGCGTTGTACGAAGCATTTGG
TCTCACTGTTGTGGAGGCCATGACCTGTGGTTTGCCGACTTTCGCCACTTGCAAAGGTGG
TCCGGCTGAGATCATCGTGCACGGCAAATCTGGCTTCCATATTGACCCTTACCATGGTGA
TCAGGCTGCTGATACTCTTGCTGACTTCTTCACTAAGTGTAAGGAAGATCCATCTCATTG
GGATGAGATCTCGAAGGGAGGGCTTCAGAGGATTGAGGAGAAATACACGTGGCAGATATA
CTCACAGAGGCTTCTGACATTGACTGGTGTGTATGGATTCTGGAAGCATGTATCGAACCT
TGACCGTCTTGAGAGCCGTCGTTACCTTGAGATGTTCTATGCATTGAAGTATCGCCCACT
GGCTAAGGCTGTCCCTCTTGCCGAGGAGGAATGAAGGAGATGCGGAACCATTATAAAGAG
CTTGAAGAGAGAAAGAGCTTGCAGTGTGTGAAGAAGAATAAAAAAAAAATCTCTTTTGAT
TCTTACTGTCATTTTGATTTTAGGAGCGCTTTTGCTTCTTTGTTATTTCAATCCATTCGT
CTTTGTTTTTATTTTATCCTTTGCCTCTCAGGCAGGCAGGCGGGCTAATGCGTTTGTATT
CTGATTGTTGAGAGAATGAAATTTCTATTTTTCTATCTT

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 8

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AGTCGACGGTACCGGACATATGCACCCCAAT*CTGTAAACACACACTCGACGACGACCAT
GGCGGTCTCGTTTAATACGACCCTTCACCAGTGTTCTCTGAGTCCGAGCTGTAGCATCAA
ACTTTATTCTGGGTTGAAGCCTCAATCTGCAAGCTTTTTGACAAATGGGTATCAGAATCT
GAATAAGGAGTTCTATGGCAGGATCCACAAGAGTTTGGAATCCGGGACTGGGAAAGCGAG
TAGGTCACGGGTGAAGATGATGCCAATAGGCACACCTAGAGTGCCTTACAGAAACCGAGA
AGAAGGCACTTGGCAATGGGTCGACATTTGGAATGCCCTTTATCGAGAGCGTGTAATCTT
CATTGGACAAAACATAGATGAAGAGTTTAGCAACCAGATATTAGCAACTATGTTGTATCT
TGATACACTTGATGACTCGAGGAGGATTTATATGTACCTTAATGGACCAGGCGGGGATCT
TACTCCAAGTCTGGCTATCTATGATACGATGAAGAGCTTGAAGAGTCCTGTAGGGACACA
TTGTGTCGGGCTTGCTTATAACCTTGCAGGTTTTCTTCTTGCTGCTGGTGAGAAGGGTCA
ACGGTTTGCGATGCCATTGTCAAGAATAGCCCTCACGTCACCAGCTGGTGCAGCCCGTGG
GCAGGCTGATGATATACAAAACGAAGCAAAAGAGCTTTCAAGGATAAGAGATTACCTCTT
CAATGAGCTAGCCAAGAATACAGGGCAGCCTGCGGAAAGGATATTCAAAGACTTGAGCAG
AGTGAAAAGGTTCAACGCAGAAGAAGCTATGGAGTATGGGCTTATCGATAAGATTGTTAG
ACCACCTCGTATCAAAGCGGACGCTCCTCGCCAAGAAGAAACTGCAGGTCTCGGTTAATC
TGTTTTTCTTTTCTTTTGTAATGTAATAAGGTTTGAAGTTCATACAATCTTGAAGTCATT
GGTTCTTGTTATGAAATCTCACAGTTTTCAGGTTATTTTGATTCCCATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 10 10 10 25 25 25 25 10 25 10 10 25 10 10 25 25 10 10 10 25 10 10 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 20 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 35 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G721TF U 17
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AF RS1A161TV U 1
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AF RS1B346TF U 22
AF RS1A161TR C 161
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GGAAAAT
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TTCACCAGTGTTCTCTGAGTCCGAGCTGTAGCATCAAACTTTATTCTGGGTTGAAGCCTC
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TCCACAAGAGTTTGGAATCCGGGACTGGGAAAGCGAGTAGGTCACGGGTGAAGATGATGC
CAATAGGCACACCTAGAGTGCCTTACAGAAACCGAGAAGAAGGCACTTGGCAATGGGTCG
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AGTTTAGCAACCAGATATTAGCAACTATGTTGTATCTTGATACACTTGATGACTCGAGGA
GGATTTATATGTACCTTAATGGACCAGGCGGGGATCTTACTCCAAGTCTGGCTATCTATG
ATACGATGAAGAGCTTGAAGAGTCCTGTAGGGACACATTGTGTCGGGCTTGCTTATAACC
TTGCACGTTTTCTTCTTGCTGCTGGTGAGAAGGGTCAACGGTTTGCGATGCCATTGTCAA
GAATAGCCCTCACGTCACCAGCTGGTGCAGCCCGTGG

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DS 

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GGAAAAT
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TTCACCAGTGTTCTCTGAGTCCGAGCTGTAGCATCAAACTTTATTCTGGGTTGAAGCCTC
AATCTGCAAGCTTTTTGACAAATGGGTATCAGAATCTGAATAAGGAGTTCTATGGCAGGA
TCCACAAGAGTTTGGAATCCGGGACTGGGAAAGCGAGTAGGTCGCGGGTGAAGATGATGC
CAATAGGCACACCTAGAGTGCCTTACAGAAACCGAGAAGAAGGCACTTGGCAATGGGTCG
ACATTTGGAATGCCCTTTATCGAGAGCGTGTAATCTTCATTGGACAAAACATAGATGAAG
AGTTTAGCAACCAGATATTAGCAACTATGTTGTATCTTGATACACTTGATGACTCGAGGA
GGATTTATATGCACCTTAATGGACCAGGCGGGGATCTTACTCCAAGTCCGGCTATCTATG
ATACGATGAAGAGCTTGAAGAGTCCTGTAGGGACACATTGTGTCGGGCTTGCTTATAACC
TTGCAGGTTTTCTTCTTGCTGCTGGTGAGAAGGGTCAACGGTTCGCGATGCCATTGTCAA
GAATAGCCCTCACGTCACCAGCTGGTGCAGCCCGTGGACAGGCTGATGATATACAAAACG
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GGCAGCCTGCGGAAAGGATATTCAAAGA

QA 8 755 8 755
DS 

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GGCGGTCTCGTTTAATACGACCCTTCACCAGTGTTCTCTGAGTCCGAGCTGTAGCATCAA
ACTTTATTCTGGGTTGAAGCCTCAATCTGCAAGCTTTTTGACAAATGGGTATCAGAATCT
GAATAAGGAGTTCTATGGCAGGATCCACAAGAGTTTGGAATCCGGGACTGGGAAAGCGAG
TAGGTCACGGGTGAAGATGATGCCAATAGGCACACCTAGAGTGCCTTACAGAAACCGAGA
AGAAGGCACTTGGCAATGGGTCGACATTTGGAATGCCCTTTATCGAGAGCGTGTAATCTT
CATTGTACAAAACATAGATGAAGAGTTTAGCAACCAGATATTAGCAACTATGTTGTATCT
TGATACACTTGATGACTCGAGGAGGATTTATATGTACCTTAATGGACCAGGCGGGGATCT
TACTCCAAGTCTGGCTATCTATGATACGATGAAGAGCTTGAAGAGTCCTGTAGGGACACA
TTGTGTCGGGCTTGCTTATAACCTTGCAGGTTTTCTTCTTGCTGCTGGTGAGAAGGGTCA
ACGGTTTGCGATGCCATTGTCAAGAATAGCCCTCACGTCACCAGCTGGTGCAGCCCGTGG
GCAGGCTGATGATATACAAAACGAAGCAAAAGAGCTTTCAAGGATAAGAGATTACCTCTT
CAATGAGCTAGCCAAGAATACAGGGCAGCCTGCGGAAAGGATATTCAAAGACTTGAGCAG
AGTGA

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DS 

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TAGGCACACCTAGAGTGCCTTACAGAAACCGAGAAGAAGGCACTTGGCAATGGGTCGACA
TTTGGAATGCCCTTTATCGAGAGCGTGTAATCTTCATTGTACAAAACATAGATGAAGAGT
TTAGCAACCAGATATTAGCAACTATGTTGTATCTTGATACACTTGATGACTCGAGGAGGA
TTTATATGTACCTTAATGGACCAGGCGGGGATCTTACTCCAAGTCTGGCTATCTATGATA
CGATGAAGAGCTTGAAGAGTCCTGTAGGGACACATTGTGTCGGGCTTGCTTATAACCTTG
CAGGTTTTCTTCTTGCTGCTGGTGAGAAGGGTCAACGGTTTGCGATGCCATTGTCAAGAA
TAGCCCTCACGTCACCAGCTGGTGCAGCCCGTGGGCAGGCTGATGATATACAAAACGAAG
CAAAAGAGCTTTCAAGGATAAGAGATTACCTCTTCAATGAGCTAGCCAAGAATACAGGGC
AGCCTGCGGAAAGGATATTCAAAGACTTGAGCAGAGTG

QA 1 578 1 578
DS 

RD RS1B346TF 785 0 0
GG
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TTCACCAGTGTTCTCTGAGTCCGAGCTGTAGCATCAAACT**ATTCTGGGTTGAAGCCTC
AATCTGCAAGCTTTTTGACAAATGGGTATCAGAATCTGAATAAGGAGTTCTATGGCAGGA
TCCACAAGAGTTTGGAATCCGGGACTGGGAAAGCGAGTAGGTCACGGGTGAAGATGATGC
CAATAGGCACACCTAGAGTGCCTTACAGAAACCGAGAAGAAGGCACTTGGCAATGGGTCG
ACATTTGGAATGCCCTTTATCGAGAGCGTGTAATCTTCATTGGACAAAACATAGATGAAG
AGTTTAGCAACCAGATATTAGCAACTATGTTGTATCTTGATACACTTGATGACTCGAGGA
GGATTTATATGTACCTTAATGGACCAGGCGGGGATCTTACTCCAAGTCTGGCTATCTATG
ATACGATGAAGAGCTTGAAGAGTCCTGTAGGGACACATTGTGTCGGGCTTGCTTATAACC
TTGCAGGTTTTCTTCTTGCTGCTGGTGAGAAGGGTCAACGGTTTGCGATGCCATTGTCAA
GAATAGCCCTCACGTCACCAGCTGGTGCAGCCCGTGGACAGGCTGATGATATACAAAACG
AAGCAAA*GAGCTTTCAAGGATAAGAGAT*ACCTCTTCA*TGAGCTAGCCAG**ATACAG
G*CAGCCTGCGGAAAGG*TATTCAA*GACTTGAGCAGAGTGAAA
GTCACGCAGAGAGCTATGG

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TCCGGGACTGGGAAAGCGAGTAGGTCACGGGTGAAGATGATGCCAATAGGCACACCTAGA
GTGCCTTACAGAAACCGAGAAGAAGGCACTTGGCAATGGGTCGACATTTGGAATGCCCTT
TATCGAGAGCGTGTAATCTTCATTGTACAAAACATAGATGAAGAGTTTAGCAACCAGATA
TTAGCAACTATGTTGTATCTTGATACACTTGATGACTCGAGGAGGATTTATATGTACCTT
AATGGACCAGGCGGGGATCTTACTCCAAGTCTGGCTATTTATGATACGATGAAGAGCTTG
AAGAGTCCTGTAGGGACACATTGTGTCGGGCTTGCTTATAACCTTGCAGGTTTTTTTCTT
GCTGCTGGTGAGAAGGGTCAACGGTTTGCGATGCCATTGTCAAGAATAGCCCTCACGTCA
CCAGCTGGTGCAGCCCGTGGGCAGGCTGATGATATACAAAACGAAGCAAAAGAGCTTTCA
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ATATTCAAAGACTTGAGCAGAGTGAAAAGGTTCAACGCAGAAGAAGCTATGGAGTATGGG
CTTATCGATAAGATTGTTAGACCACCTCGTATCAAAGCGGACGCTCCTCGCCAAGAAGAA
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CATACAATCTTGAAGTCATTGGTTCTTGTTATGAAATCTCACAGTTTTCAGG

QA 1 832 1 832
DS 

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TCGACATTTGGAATGCCCTTTATCGAGAGCGTGTAATCTTCATTGTACAAAACATAGATG
AAGAGTTTAGCAACCAGATATTAGCAACTATGTTGTATCTTGATACACTTGATGACTCGA
GGAGGATTTATATGTACCTTAATGGACCAGGCGGGGATCTTACTCCAAGTCTGGCTATTT
ATGATACGATGAAGAGCTTGAAGAGTCCTGTAGGGACACATTGTGTCGGGCTTGCTTATA
ACCTTGCAGGTTTTTTTCTTGCTGCTGGTGAGAAGGGTCAACGGTTTGCGATGCCATTGT
CAAGAATAGCCCTCACGTCACCAGCTGGTGCAGCCCGTGGGCAGGCTGATGATATACAAA
ACGAAGCAAAAGAGCTTTCAAGGATAAGAGATTACCTTTTCAATGAGCTAGCCAAGAATA
CAGGGCAGCCTGCGGAAAGGATATTCAAAGACTTGAGCAGAGTGAAAAGGTTCAACGCAG
AAGAAGCTATGGAGTATGGGCTTATCGATAAGATTGTTAGACCACCTCGTATCAAAGCGG
ACGCTCCTCGCCAAGAAGAAACTGCAGGTCTCGGTTAATCTGTTTTTCTTTTCTTTTGTA
ATGTAATAAGGTTTGAAGTTCATACAATCTTGAAGTCATTGGTTCTTGTTATGAAATCTC
ACAGTTTTCAGG

QA 1 732 1 732
DS 

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CAACTATGTTGTATCTTGATACACTTGATGACTCGAGGAGGATTTATATGCACCTTAATG
GACCAGGCGGGGATCTTACTCCAAGTCCGGCTATCTATGATACGATGAAGAGCTTGAAGA
GTCCTGTAGGGACACATTGTGTCGGGCTTGCTTATAACCTTGCAGGTTTTCTTCTTGCTG
CTGGTGAGAAGGGTCAACGGTTCGCGATGCCATTGTCAAGAATAGCCCTCACGTCACCAG
CTGGTGCAGCCCGTGGACAGGCTGATGATATACAAAACGAAGCAAAAGAGCTTTCAAGGA
TAAGAGATTACCTCTTCAATGAGCTAGCCAAGAATACAGGGCAGCCTGCGGAAAGGATAT
TCAAAGACTTGATCAGAGTGAAAAGGTTCAACGCAGAAGAAGCTATGGAGTATGGGCTTA
TCTATAAGATTGTTAGACCACCTCGTATCGAAGCGGACGCTCCTCGCCAAGAAGAAACTG
CAGGTCTCGGTTAATCTGTTTTTCTTTTCTTTTGTAATGTAATAAGGTCTGAAGTTCATA
CAATCTTGAAGTCATTGGTTCTTGTTATGAAATCTCATAGTTTTCAGGTTATTTTGATTC
CCATTT

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 8

CO CL694Contig1 846 8 13 U
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AGATAAAAGTCTTCCTCAAGGAAATATCTATGCCCAATGGCTTACTACCTTTGAAGGACA
TAGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGTGTCGTGTGGCTGAAGCAGAAACAGAGCA
TCACCCACAAGTTCGAAGCGATCGATAAGCTTGTCTCCTATGGAACCGAAGTCACTGCCG
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GGGTCACTATCAGTGAGATCTATACAGAGGAGAAAGAGAAGATCACCTTTATGTCACCAA
CCACACTCTCCAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTCATAGTCCCAGAGGAAGTGGAACCAG
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AACCTGCCAAGGAGGCTGCCAAGGAAGAACCTGCCAAAGAGGCTGTTGCCGTCAAGGAGG
CCTAATCAAGCTTCTTGCTGCTTCTACAGTTAAGAGATACCGAAATCTTTTGATATGTAC
ACCATTGAGAGTTAAGAGTTTCGCACTGCTCTTACTGTCATCTATTACCTACCACTCGTT
GCTGCTTGTTTTTACCTGTAATAAGATGTCAACATCATCCTGTTCTACAAATATTACCGT
ATAATTATTTATAAACTACATTGAAGATGGTTTTGTATGTCACTTCAAGAACACTGAGTT
CGAGAC


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 20 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 25 25 50 50 50 50 50 35 25 35 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 45 45 45 45 45 
45 45 45 25 40 15 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1EK41TF U 1
AF RS1EI89TF U 1
AF RS1FR31TF U 2
AF RS1E780TF U 3
AF RS1EI89JQ C 61
AF RS1EK41JQ C 353
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BS 803 803 RS1EI89JQ
BS 804 846 RS1E780JQ

RD RS1EK41TF 775 0 0
GGAC
ACAACACACAACTAAACCCCCCCCACAACAGAGCTAAGAAACAGAGATGGGTCTGGTCAC
AGAGGAGGTGAGAGCTAAGGCAGAGATGTACACCGGAGATGAGATGTGCCGAGAGAAGAT
AAAAGTCTTCCTCAAGGAAATATCTATGCCCAATGGCTTACTACCTTTGAAGGACATAGA
AGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGTGTCGTGTGGCTGAAGCAGAAACAGAGCATCAC
CCACAAGTTCGAAGCGATCGATAAGCTTGTCTCCTATGGAACCGAAGTCACTGCCGTGGT
TCAAACCGGTAAGATCAAGAAGCTCACTGGAGTCAAGTCCAAGGAGCTTCTTATCTGGGT
CACTATCAGTGAGATCTATACAGAGGAGAAAGAGAAGATCACCTTTATGTCACCAACCAC
ACTCTCCAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTCATAGTCCCAGAGGAAGTGGAACCAGCCAA
GGAAGAACCTGCCAAGGAGAAGAGTGGTGAAGCCACCGAGGAAGCTGCCAAGGAAGAACC
TGCCAAGGAGGCTGCCAAGGAAGAACCTGCCAAAGAGGCTGTTGCCGTCAAGGAGGCCTA
ATCAAGCTTCTTGCTGCTTCTACAGTTAAGAGATACCGAAATCTTTTGATATGTACACCA
TTGAGAGTTAAGAGTTTCGCACTGCTCTTACTGTCATCTATTACCTACCACTCGTTGCTG
CTTGTTTTTACCTGTAATAAGATGTCA*CATCATCCTGTTCTACAAATATT

QA 5 775 5 775
DS 

RD RS1EI89TF 785 0 0
GGACACAACACACAACTAAACCCCCCCCACAACAGAGCTAAGAAACAGAGATGGGTCTGG
TCACAGAGGAGGTGAGAGCTAAGGCAGAGATGTACACCGGAGATGAGATGTGCCGAGAGA
AGATAAAAGTCTTCCTCAAGGAAATATCTATGCCCAATGGCTTACTACCTTTGAAGGACA
TAGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGTGTCGTGTGGCTGAAGCAGAAACAGAGCA
TCACCCACAAGTTCGAAGCGATCGATAAGCTTGTTTCCTATGGAACCGAAGTCACTGCCG
TGGTCCAAACCGGTAAGATCAAGAAGCTCACTGGAGTCAAGTCCAAGGAGCTTCTTATCT
GGGTCACTATCAGTGAGATCTATACAGAGGAGAAAGAGAAGATCACCTTTATGTCACCAA
CCACACTCTCCAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTCATAGTCCCAGAGGAAGTGGAACCAG
CCAAGGAAGAACCTGCCAAGGAGAAGAGTAGTGAAGCCACCGAGGAAGCTGCCAAGGAAG
AACCTGCCAAGGAGGCTGCCAAGGAAGAACCTGCCAAAGAGGCTGTTGCCGTCAAGGAGG
CCTAATCAAGCTTCTTGCTGCTTCTACAGTTAAGAGATACCGAAATCTTTTGATATGTAC
GCCATTGAGAGTTAAGAGTTTCGCACTGCTCTTACTGTCATCTATTACCTACCACTCGTT
GCTGCTTGTTTT*ACCTGTAA*AAGATGTCAACATCATCCTGTTCTACAAATATTACCGT
ATAAT

QA 1 785 1 785
DS 

RD RS1FR31TF 786 0 0
GAC
ACAACACACAACTAAACCCCCCCCACAACAGAGCTAAGAAACAGAGATGGGTCTGGTCAC
AGAGGAGGTGAGAGCTAAGGCAGAGATGTACACCGGAGATGAGATGTGCCGAGAGAAGAT
AAAAGTCTTCCTCAAGGAAATATCTATGCCCAATGGCTTACTACCTTTGAAGGACATAGA
AGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGTGTCGTGTGGCTGAAGCAGAAACAGAGCATCAC
CCACAAGTTCGAAGCGATCGATAAGCTTGTCTCCTATGGAACCGAAGTCACTGCCGTGGT
CCAAACCGGTAAGATCAAGAAGCTCACTGGAGTCAAGTCCAAGGAGCTTCTTATCTGGGT
CACTATCAGTGAGATCTATACAGAGGAGAAAGAGAAGATCACCTTTATGTCACCAACCAC
ACTCTCCAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTCATAGTCCCAGAGGAAGTGGAACCAGCCAA
GGAAGAACCTGCCAAGGAGAAGAGTAGTGAAGCCACCGAGGAAGCTGCCAAGGAAGAACC
TGCCAAGGAGGCTGCCAAGGGAGAACCTGCCAAAGAGGCTGTTGCCGTCAAGGAGGCCTA
ATCAAGCTTCTTGCTGCTTCTACAGTTAAGAGATACCGAAATCTTTTGATATGTACACCA
TTGAGAGTTAAGAGTTTCGCACTGCTCTTACTGTCATCTATTACCTACCACTCGTTGCCG
CTTGTTTT**ACTGTAATAAGATGTCAACATCATCCTGTTCTACAA*TATTACCGTATA
TTAT

QA 4 782 4 782
DS 

RD RS1E780TF 800 0 0
GG
ACAACACACAACTAAACCCCCCCCGCAACAGAGCTAAGAAACAGAGATGGGTCTGGTCAC
AGAGGAGGTGAGAGCTAAGGCAGAGATGTACACCGGAGATGAGATGTGCCGAGAGAAGAT
AAAAGTCTTCCTCAAGGAAATATCTATGCCCAATGGCTTACTACCTTTGAAGGACATAGA
ATAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGTGTCGTGTGGCTGAAGCAGAAACAGAGCATCAC
CCACAAGTTCGAAGCGATCGATAAGCTTGTCTCCTATGGAACCGAAGTCACTGCCGTGGT
CCAAACCGGTAAGATCAAGAAGCTCACTGGAGTCAAGTCCAAGGAGCTTCTTATCTGGGT
CACTATCAGTGAGATCTATACAGAGGAGAAAGAGAAGATCACCTTTATGTCACCAACCAC
ACTCTCCAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTCATAGTCCCAGAGGAAATGGAACCAGCCAA
GGAAGAACCTGCCAAGGAGAAGAGTAGTGAAGCCACCGAGGAAGCTGCCAAGGAAGAACC
TGCCAAGGAGGCTGCCAAGGAAGAACCTGCCAAAGAGGCTGTTGCCGTCAAGGAGGCCTA
ATCAAGCTTCTTGCTGCTTCTACAGTTAAGAGATACCGAAATCTTTTGATATGTACACCA
TTGAGAGTTAAGAGTTTCGCACTGCTCTTACTGTCATCTATTACCTACCACTCGTTGCTG
CTTGTTTT**ACTGTAT**AGATGTCAACATCATCCTGTTCTACAAATATTACCGTATAT
TA**TTATAAACTACATT

QA 3 800 3 800
DS 

RD RS1EI89JQ 743 0 0
TCACAGAGGAGGTGAGAGCTAAGGCAGAGATGTACACCGGAGATGAGATGTGCCGAGAGA
AGATAAAAGTCTTCCTCAAGGAAATATCTATGCCCAATGGCTTACTACCTTTGAAGGACA
TAGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGTGTCGTGTGGCTGAAGCAGAAACAGAGCA
TCACCCACAAGTTCGAAGCGATCGATAAGCTTGTTTCCTATGGAACCGAAGTCACTGCCG
TGGTCCAAACCGGTAAGATCAAGAAGCTCACTGGAGTCAAGTCCAAGGAGCTTCTTATTT
GGGTCACTATCAGTGAGATCTATACAGAGGAGAAAGAGAAGATCACCTTTATGTCACCAA
CCACACTCTCCAGGACTTTCCCTGTTTCAGCTTTCATAGTCCCAGAGGAAGTGGAACCAG
CCAAGGAAGAACCTGCCAAGGAGAAGAGTAGTGAAGCCACCGAGGAAGCTGCCAAGGAAG
AACCTGCCAAGGAGGCTGCCAAGGAAGAACCTGCCAAAGAGGCTGTTGCCGTCAAGGAGG
CCTAATCAAGCTTCTTGCTGCTTCTACAGTTAAGAGATACCGAAATCTTTTGATATGTAC
GCCATTGAGAGTTAAGAGTTTCGCACTGCTCTTACTGTCATCTATTACCTACCACTCGTT
GCTGCTTGTTTTTACCTGTAATAAGATGTCAACATCATCCTGTTCTACAAATATTACCGT
ATAATTATTTATAAACTACATTG

QA 1 743 1 743
DS 

RD RS1EK41JQ 451 0 0
TT
TTATTTGGGTCACTATCAGTGAGATCTATACAGAGGAGAAAGAGAAGATCACCTTTATGT
CACCAACCACACTTTCCAGGACTTTCCCTGTTTCAGCTTTCATAGTCCCAGAGGAAGTGG
AACCAGCCAAGGAAGAACCTGCCAAGGAGAAGAGTGGTGAAGCCACCGAGGAAGCTGCCA
AGGAAGAACCTGCCAAGGAGGCTGCCAAGGAAGAACCTGCCAAAGAGGCTGTTGCCGTCA
AGGAGGCCTAATCAAGCTTCTTGCTGCTTTTACAGTTAAGAGATACCGAAATCTTTTGAT
ATGTACACCATTGAGAGTTAAGAGTTTCGCACTGCTTTTACTGTCATTTATTACCTACCA
CTCGTTGCTGCTTGTTTTTACCTGTAATAAGATGTCAACATCATCCTGTTTTACAAATAT
TACCGTATAATTATTTATAAACTACATTG

QA 3 451 3 451
DS 

RD RS1FR31JQ 447 0 0
GAGATCTATACAGAGGAGAAAGAGAAGATCACCTTTATGTCACCAACCACACTTTCCAGG
ACTTTCCCTGTTTCAGCTTTCATAGTCCCAGAGGAAGTGGAACCAGCCAAGGAAGAACCT
GCCAAGGAGAAGAGTAGTGAAGCCACCGAGGAAGCTGCCAAGGAAGAACCTGCCAAGGAG
GCTGCCAAGGGAGAACCTGCCAAAGAGGCTGTTGCCGTCAAGGAGGCCTAATCAAGCTTC
TTGCTGCTTTTACAGTTAAGAGATACCGAAATCTTTTGATATGTACACCATTGAGAGTTA
AGAGTTTCGCACTGCTCTTACTGTCATCTATTACCTACCACTCGTTGCCGCTTGTTTTTA
CCTGTAATAAGATGTCAACATCATCCTGTTCTACAAATATTACCGTATAATTATTTATAA
ACTACATTGAAGATGGTTTTGTATG
CC

QA 1 445 1 445
DS 

RD RS1E780JQ 785 0 0
CACAGAGGAGGTGAGAGCTAAGGCAGAGATGTACACCGGAGATGAGATGTGCCGAGAGAA
GATAAAAGTCTTCCTCAAGGAAATATCTATGCCCAATGGCTTACTACCTTTGAAGGACAT
AGAATAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGTGTCGTGTGGCTGAAGCAGAAACAGAGCAT
CACCCACAAGTTCGAAGCGATCGATAAGCTTGTCTCCTATGGAACCGAAGTCACTGCCGT
GGTCCAAACCGGTAAGATCAAGAAGCTCACTGGAGTCAAGTCCAAGGAGCTTCTTATCTG
GGTCACTATCAGTGAGATCTATACAGAGGAGAAAGAGAAGATCACCTTTATGTCACCAAC
CACACTCTCCAGGACTTTCCCTGTTTCAGCTTTCATAGTCCCAGAGGAAATGGAACCAGC
CAAGGAAGAACCTGCCAAGGAGAAGAGTAGTGAAGCCACCGAGGAAGCTGCCAAGGAAGA
ACCTGCCAAGGAGGCTGCCAAGGAAGAACCTGCCAAAGAGGCTGTTGCCGTCAAGGAGGC
CTAATCAAGCTTCTTGCTGCTTCTACAGTTAAGAGATACCGAAATCTTTTGATATGTACA
CCATTGAGAGTTAAGAGTTTCGCACTGCTCTTACTGTCATCTATTACCTACCACTCGTTG
CTGCTTGTTTTTACCTGTAATAAGATGTCAACATCATCCTGTTCTACAAATATTACCGTA
TAATTATTTATAAACTACATTGAAGATGGTTTTGTATGTCACTTCAAGAACACTGAGTTC
GAGAC

QA 1 785 1 785
DS 



AS 2 8

CO CL695Contig1 782 6 38 U
GGGCCGCTTGGATCTATCGCTCTCTCCCTCTCTCTCACTTTCTTATCGTCTTCCTATACC
CTTCGTCGGAGGAAGAATCCTAGGAATCGAGTTAACAAGATGAATAGGGAGAAGTTAATG
AAGATGGCTAACACTGTCCGCACTGGCGGAAAGGGAACTGTAAGAAGAAAGAAGAAGGCT
GTTCACAAGACGAACACGACCGATGACAAGAAGCTACAGAGCACTCTTAAGAGAGTTGGA
GTCAACTCCATTCCCGGTATTGAGGAAGTTAACATCTTCAAGGATGATGTTGTCATTCAG
TTCATTAACCCTAAGGTTCAAGCCTCTGTTGCTGCTAACACATGGGCTGTGAGCGGTACA
CCACAGACCAAAAAACTGCAAGACATACTTCCTCAGATTATCAGCCAACTCGGGACTGAT
AACTTGGAAAACCTGAAGAAGCTAGCTGAGCAATTCCAGAAACAATCACCAGGTGGAGCT
GATATTCAAGCAACTATCCAAGAAGAGGACGACGATGATGATGTCCCTGATCTTGTCGTG
GGAGAGACGTTCGAGACTCCAGCTGCTGAAGAAGCTGCTCAGCCCAAAGCTGCTGCTTCT
TAAGAGGAAGAATAAGAAGAGAAGAGCTCACCCCTCCACCTTTTTTTGAGCACCTTTCAG
ATTCTTGTTTTCTCTTAAATCTTTTTTTGCGAACAGAAAGACTGATGTTTTTGTTTATTA
TCACTTGTCCAGACACCAATGATCCTTTTATTAAGGTTAGATCGGTTTCTATGTTCTGTC
TT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 15 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 5 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 5 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1DB60TF U 1
AF RS1EG29JQ C 228
AF RS1DB60JQ C 91
AF RS1EG29TF U 14
AF RS1A671TF U 1
AF RS1A671JQ C 1
BS 1 18 RS1DB60TF
BS 19 19 RS1A671TF
BS 20 20 RS1EG29TF
BS 21 29 RS1DB60TF
BS 30 30 RS1EG29TF
BS 31 36 RS1DB60TF
BS 37 38 RS1EG29TF
BS 39 39 RS1DB60TF
BS 40 40 RS1EG29TF
BS 41 45 RS1DB60TF
BS 46 46 RS1EG29TF
BS 47 53 RS1DB60TF
BS 54 54 RS1EG29TF
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BS 78 78 RS1A671TF
BS 79 83 RS1DB60TF
BS 84 84 RS1EG29TF
BS 85 90 RS1DB60TF
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BS 140 140 RS1EG29TF
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BS 646 646 RS1EG29TF
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BS 694 751 RS1EG29TF
BS 752 782 RS1A671JQ

RD RS1DB60TF 645 0 0
GGGCCGCTTGGATCTATC**TCTCTCCCTATCTCTC**TGTCTTAGCGTCTTCTTATACC
CTTCGTCGGAGGAAGAACCCTAGAAATCGAATTAACAAGATGAATAGGGAGAAGTTAATG
AAGATGGCTAACACTGTCCACACTGGCGGAAAGGGAACAGTAAGAAGAAAGAAGAAGGCT
GTTCACAAGACGAACACGACCGATGACAAGAAGCTACAGAGCACTCTTAAGAGAGTTGGA
GTCAACTCCATTCCCGGTATTGAGGAAGTTAACATCTTCAAGGATGATGTTGTCATTCAG
TTCATTAACCCTAAGGTTCAAGCCTCTGTTGCGGCTAACACATGGGCTGTGAGCGGTACA
CCACAGACCAAAAAACTGCAAGACATACTTCCTCAGATTATCAGCCAACTCGGGACTGAT
AACTTGGAAAACCTGAAGAAGCTAGCTGAGCAATTCCAGAAACAATCACCAGGTGGAGCT
GATATTCCAGCAACTATCCAAGAAGAGGACGACGATGATGATGTCCCTGATCTTGTCGTG
GGAGAGACGTTCGAGACTCCAGCTGCTGAAGAAGCTGCTCAGCCCAAAGCTCCTGCTTCT
TAAGAGGAAGAATAAGAAGAGAAGAGCTCACCCCTCCACCTTTTT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1EG29JQ 544 0 0
TAAGAGAGTTGGAGTCAACTCCATTCCCGGTATTGAGGAAGTTAACATCTTCAAGGATGA
TGTTGTCATTCAGTTCATTAACCCTAAGGTTCAAGCCTCTGTTGCTGCTAGCACATGGGC
TGTGAGCGGTACACCACAGACCAAAAAACTGCAAGACATACTTCCTCAGATTATCAGCCA
ACTCGGGACTGATAACTTGGAAAACCTGAAGAAGCTGGGTGAGCAATTCCAGAAACAATC
ACCAGGTGGAGCTGATATTCAAGCAACTATCCAAGAAGAGGACGACGATGATGATGCCCC
TGATCTTGTCGTGGGAGAGACGTTCGAGACTCCAGCTGCTGAAGAAGCTGCTCAGCCCAA
AGCTGCTGCTTCTTAAGAGGAAGGATAAGAAGAGAAGAGCTCACCCCTCCACCTTTTTT*
GAGCACCTTTCAGATTCTTGTTTTCTCTTAAATCTTTTTTTGCGAACAGAAAGACTGATG
TTTTTGTTTATTATCACTTGTCCAGACACCAATGATCCTTTTATTAAGGTTAGATCGGTT
TC
CG

QA 1 542 1 542
DS 

RD RS1DB60JQ 680 0 0
ATTAACAAGATGAATAGGGAGAAGTTAATGAAGATGGCTAACACTGTCCACACTGGCGGA
AAGGGAACAGTAAGAAGAAAGAAGAAGGCTGTTCACAAGACGAACACGACCGATGACAAG
AAGCTACAGAGCACTCTTAAGAGAGTTGGAGTCAACTCCATTCCCGGTATTGAGGAAGTT
AACATCTTCAAGGATGATGTTGTCATTCAGTTCATTAACCCTAAGGTTCAAGCCTCTGTT
GCGGCTAACACATGGGCTGTGAGCGGTACACCACAGACCAAAAAACTGCAAGACATACTT
CCTCAGATTATCAGCCAACTCGGGACTGATAACTTGGAAAACCTGAAGAAGCTAGCTGAG
CAATTCCAGAAACAATCACCAGGTGGAGCTGATATTCCAGCAACTATCCAAGAAGAGGAC
GACGATGATGATGTCCCTGATCTTGTCGTGGGAGAGACGTTCGAGACTCCAGCTGCTGAA
GAAGCTGCTCAGCCCAAAGCTCCTGCTTCTTAAGAGGAAGAATAAGAAGAGAAGAGCTCA
CCCCTCCACCTTTTTTTTAGCACTTTTCAGATTCTTGTTTTCTCTTAAATCTTTTTTTGC
GAACAGAAAGACTGATGTTTTTGTTTATTATCACTTGTCCAGACACCAATGATCCTTTTA
TTAAGGTTAGATCGGTTTC
G

QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1EG29TF 738 0 0
GGATCG
CTCTCTCCCTCTCTCTCACTTTCTTATCGTCTTCCTATACCCTTCGTCGGAGGAAGAACC
CTAGGAATCGAGTTAACAAGATGAATAGGGAGAAGTTAATGAAGATGGCTAACACTGTCC
GCACTGGCGGAAAGGGAACTGTAAGAATAAAGAAGAAGGCTGTTCACAAGACGAACACGA
CCGATGACAAGAAGCTACAGAGCACTCTTAAGAGAGTTGGAGTCAACTCCATTCCCGGTA
TTGAGGAAGTTAACATCTTCAAGGATGATGTTGTCATTCAGTTCATTAACCCTAAGGTTC
AAGCCTCTGTTGCTGCTAGCACATGGGCTGTGAGCGGTACACCACAGACCAAAAAACTGC
AAGACATACTTCCTCAGATTATCAGCCAACTCGGGACTGATAACTTGGAAAACCTGAAGA
AGCTGGCTGAGCAATTCCAGAAACAATCACCAGGTGGAGCTGATATTCAAGCAACTATCC
AAGAAGAGGACGACGATGATGATGCCCCTGATCTTGTCGTGGGAGAGACGTTCGAGACTC
CAGCTGCTGAAGAAGCTGCTCAGCCCAAAGCTGCTGCTTCTTAAGAGGAAGGATAAGAAG
AGAAGAGCTCACCCCTCCACCTTTTTT*GAGCACCTTTCAGATTCTTGTTTTCTCTTAAA
TCTTTTTT*GCGA*CAGAAAGACTGATGTTTTTGTTTATTATCACTTGTCCAGACACCAA
TGATCCTTTTAT

QA 7 738 7 738
DS 

RD RS1A671TF 751 0 0
GGGCCGCTTGGATCTATCGCTCTCTCCCTCTCTCTCACTTTCTTATCGTCTTCCTATACC
CTTCGTCGGAGGAAGAATCCTAGGAATCGAGTTAATAAGATGAATAGGGAGAAGTTAATG
AAGATGGCTAACACTGTCCGCACTGGCGGAAAGGGAACTGTAAGAAGAAAGAAGAAGGCT
GTTCACAAGACGAACACGACCGATGACAAGAAGCTACAGAGCACTCTTAAGAGAGTTGGA
GTCAACTCCATTCCCGGCATTGAGGAAGTTAACATCTTCAAGGATGATGTTGTCATTCAG
TTCATTAACCCTAAGGTTCAAGCCTCTGTTGCTGCTAACACATGGGCTGTGAGCGGTACA
CCACAGACCAAAAAACTGCAAGACATACTTCCTCAGATTATCAGCCAACTCGGGACTGAT
AACTTGGAAAACCTGAAGAAGCTAGCTGAGCAATTCCAGAAACAATCACCAGGTGGAGCT
GATATTCAAGCAACTATCCAAGAAGAGGGCGACGATGATGATGTCCCTGATCTTGTCGTG
GGAGAGACGTTCGAGACTCCAGCTGCTGAAGAAGCTGCTCAGCCCAAAGCTGCTGCTTCT
TAAGAGGAAGAATAAGAAGAGAAGAGCTCACCCCTCCACCTTTTTTTGAGCACCTTTCAG
ATTCTTGTTTTCTCTTAAATCTTTTTTTGCGAACAGAAAGACTGATGTTTTTGTTTATTA
TTACTTGTCCAGACACCAATGATCCTTTTAT

QA 1 751 1 751
DS 

RD RS1A671JQ 782 0 0
GGGCCGCTTGGATCTATCGCTCTCTCCCTCTCTCTCACTTTCTTATCGTCTTCCTATACC
CTTCGTCGGAGGAAGAATCCTAGGAATCGAGTTAATAAGATGAATAGGGAGAAGTTAATG
AAGATGGCTAACACTGTCCGCACTGGCGGAAAGGGAACTGTAAGAAGAAAGAAGAAGGCT
GTTCACAAGACGAACACGACCGATGACAAGAAGCTACAGAGCACTCTTAAGAGAGTTGGA
GTCAACTCCATTCCCGGCATTGAGGAAGTTAACATCTTCAAGGATGATGTTGTCATTCAG
TTCATTAACCCTAAGGTTCAAGCCTCTGTTGCTGCTAACACATGGGCTGTGAGCGGTACA
CCACAGACCAAAAAACTGCAAGACATACTTCCTCAGATTATCAGCCAACTCGGGACTGAT
AACTTGGAAAACCTGAAGAAGCTAGCTGAGCAATTCCAGAAACAATCACCAGGTGGAGCT
GATATTCAAGCAACTATCCAAGAAGAGGGCGACGATGATGATGTCCCTGATCTTGTCGTG
GGAGAGACGTTCGAGACTCCAGCTGCTGAAGAAGCTGCTCAGCCCAAAGCTGCTGCTTCT
TAAGAGGAAGAATAAGAAGAGAAGAGCTCACCCCTCCACCTTTTTTTGAGCACCTTTCAG
ATTCTTGTTTTCTCTTAAATCTTTTTTTGCGAACAGAAAGACTGATGTTTTTGTTTATTA
TTACTTGTCCAGACACCAATGATCCTTTTATTAAGGTTAGATCGGTTTCTATGTTCTGTC
TT

QA 1 782 1 782
DS 



CO CL695Contig2 763 2 2 U
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AACCCTAGAAATCGAATTAACAAGATGAATAGGGAGAAGTTAATGAAGATGGCTAACACT
GTCCGCACTGGCGGAAAGGGAACAGTAAGAAGGAAGAAGAAGGCAGTTCACAAGACGAAC
ACGACCGATGACAAGAAGCTACAGAGCACTCTTAAGAGAGTTGGAGTCAACTCCATTCCC
GTATTGAGGAAGTTAACATCTTTAAGGATGATGTTGTCATTCAGTTCATTAACCCTAAGG
TTCAAGCCTCTGTTGCTGCTAACACATGGGCTGTGAGCGGTACACCACAGACCAAAAAAC
TGCAAGACATACTTCCTCAGATTATCAGCCAACTCGGGACTGATAACTTGGAAAACCTGA
AGAAGCTAGCTGAGCAATTCCAGAAACAGCCACCAGGTGGAGCTGATATTCCGGCAACTA
TCCAAGAAGAGGACGACGATGATGATGTCCCAGATCTTGTCGTGGGAGAGACTTTCGAGA
CTCCAGCTGCTGAAGAAGCTGCTCAACCCAAAGCTGCTGCTACTTAAGAAGAAGAATAAG
AAGAGCTCACCACTCCACCTTTTTTGAGCACCTTTCAGATTCTTGTTTTCTCTTAAATCT
TTATTTTGCGAACAGAAAGACTGATGTTTTTGTTTATTATCACTTGTCCAGACACCAATG
ATCCTTTTATTAAGGTTAGATCGGTTTCTATGTTCTGTCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F556TF U 1
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BS 1 723 RS1F556TF
BS 724 763 RS1F556JQ

RD RS1F556TF 723 0 0
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TTATTTTGCGAACAGAAAGACTGATGTTTTTGTTTATTATCACTTGTCCAGACACCAATG
ATC

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1F556JQ 762 0 0
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TCTCTCTCTCTTTCTTATCGTCTTCCTATACCCTTCGTCGGAGGAAGAACCCTAGAAATC
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AGAAGCTACAGAGCACTCTTAAGAGAGTTGGAGTCAACTCCATTCCCGTATTGAGGAAGT
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TGCTGCTAACACATGGGCTGTGAGCGGTACACCACAGACCAAAAAACTGCAAGACATACT
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AGAAGCTGCTCAACCCAAAGCTGCTGCTACTTAAGAAGAAGAATAAGAAGAGCTCACCAC
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GGTTAGATCGGTTTCTATGTTCTGTCTTTT

QA 13 762 13 762
DS 



AS 1 8

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TCTTTGAGTTCTATGTAGACTTGGGGGAGATACTGAAAGGTGGTGAGTTCGTGGTGGGTT
TAAGCTCTGCAAACGGGAACTCTTCCAATGCACATCTTCTCCATTCATGGAACTTTGACA
TAAGGCATCCAACGCCGGTGTGTGTGCCTCCATTGCCACCTCGGGGTCCAGATGGAAGTG
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TTGTGAAGTTGATGTTTTCCTTGAATCCATTTGGTTTTAT


BQ
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GG
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TTTGACGAGGAAGTTGAACTGTTTGGAGATTCGAAGCTGATCAACGAAGGTTCTTCGATT
CAGCTGACGAACTCGGTGAGTGGAAGCGAGGGAAGAGTCGTTTACAAGGAACCCATCAAT
CTTTTCCGAGGTGAAGAGAGTCGTAGTAACTCGTTATCTT*CTCGACTCACTTCTCGTTT
TCCATGCCTAACGAGACCGATGGTGTCATGGCTTTTGTAATCGTTCCAACTAGTTTGGAT
CTTAGTATGTTCGGTAAAGAAAACAAAAGTTCCTCTGCCTTAGGGTTTTTGTTTGAGCAT
GCAAAGAACGAGACAGTTGTGGCTTTTGAGTTTGATATTTCCAGTAGAGGAAACCGTGCA
AGGATCTTGATAGGTAAACCTGAATCTTCCGAAACTAGAAACATTTCTTTTGAGGGTGAC
TTGTTGATGGGCGATGGAGG*ACGTTGAGCTGTATGGTTGAGTATGAGGCAAGTTTGAAG
AGAATGATGGT

QA 3 553 3 553
DS 

RD RS1DV26TF 693 0 0
G
AGAAAAAAAACAAGAAGACAACGATGTTCAGACCTATGAGTTTTGACGAGGAAGTTGAAC
TGTTTGGAGATTCGAAGCTGATCAACGAAGGTTCTTCGATTCAGCTGACAAACTCGGTGA
GTGGAAGCGAGGGAAGAGTCGTTTACAAGGAACCCATCAATCTTTTCCGAGGTGAAGAGA
GTCGTAGTAACTCGTTATCTTTCTCGACTCACTTCTCGTTTTCCATGCCTAACGAGACCG
ATGGTGTCATGGCTTTTGTAATCATTCCAACTAGTTTGGATCTTAGTATGTTCGGTAAAG
AAAACAAAAGTTCCTCTGCCTTAGGGTTTTTGTTTGAGCATGCAAAGAACGAGACAGTTG
TGGCTTTTGAGTTTGATATTTCCAGTAGAGGAAACCGTGCAAGGATCTTGATAGGTAAAC
CTGAATCTTCCGAAACTAGAAACATTTCTTTTGAGGGTGACTTGTTGATGGGCGATGGAG
GGACGTTGAGCTGTATGGTTGAGTATGAGGCAAGTTTGAAGAGAATGATGGTTCGGTTCA
GAAAACTAGGCACGAGAAAGATGTTGGATCCGTTCTTTGAGTTCTATGTAGACTTGGGGG
AGATACTGAAAGGTGGTGAGTTCGTGGTGGGTTTAAGCTCTGCAAACGGGAACTCTTCCA
ATGCACATCTTCTCCATTCATGGAACTTTGAC

QA 2 693 2 693
DS 

RD RS1C355TF 721 0 0
GGATTCACAAGAACCACCACACCAAAAAGAAAAAAAACAAGAAGACAACGATGTTCAGAC
CTATGAGTTTTGACGAGGAAGTTGAACTGTTTGGAGATTCGAAGCTGATCAACGAAGGTT
CTTCGATTCAGCTGACAAACTCGGTGAGTGGAAGCGAGGGAAGAGTCGTTTACAAGGAAC
CCATCAATCTTTTCCGAGGTGAAGAGAGTCGTAGTAACTCGTTATCTTTCTCGACTCACT
TCTCGTTTTCCATGCCTAACGAGACTGATGGTGTCATGGCTTTTGTAATCGTTCCAACTA
GTTTGGATCTTAGTATGTTCGGTAAAGAAAACAAAAGTTCCTCTGCCTTAGGGTTTTTGT
TTGAGCATGCAAAGAACGAGACAGTTGTGGCTTTTGAGTTTGATATTTCCAGTAGAGGAA
ACCGTGCAAGGATCTTGATAGGTAAACCTGAATCTTCCGAAACTAGAAACATTTCTTTTG
AGTGTGACTTGTTGATGGGCGATGGAGGGACGTTGAGCTGTATGGTTGAGTATGAGGCAA
GTTTGAAGAGAATGATGGTTCGGTTCAGAAAACTAGGCACGAGAAAGATGTTGGATCCGT
TCTTTGAGTTCTATGTAGACTTGGGGGAGATACTGAAAGGTGGTGAGTTCGTGGTGGGTT
TAAGCTCTGCAAACGGGAACTCTTCCAATGCACATCTTCTC*ATTCATGGAACTTTGACA
T

QA 1 721 1 721
DS 

RD RS1AP61TFB 774 0 0
GG
GTTCAGACCTATGAGTTTTGACGAGGAAGTTGAACTGTTTGGAGATTCGAAGCTGATCAA
CGAAGGTTCTTCGATTCAGCTGACAAACTCGGTGAGTGGAAGCGAGGGAAGAGTCGTTTA
CAAGGAACCCATCAATCTTTTCCGAGGTGAAGAGAGTCGTAGTAACTCGTTATCTTCCTC
GACTCACTTCTCGTTTTCCATGCCTAACGAGACCGATGGTGTCATGGCTTTTGTAATCGT
TCCAACTAGTTTGGATCTTAGTATGTTCGGTAAAGAAAACAAAAGTTCCTCTGCCTTAGG
GTTTTTGTTCGAGCATGCAAAGAACGAGACAGTTGTGGCTTTTGAGTTTGATATTTCCAG
TAGAGGAAACCGTGCAAGGATCTTGATAGGTAAACCTGAATCTTCCGAAACTAGAAACAT
TTCTTTTGAGGGTGACTTGTTGATGGGCGATGGAGGGACGTTGAGCTGTATGGTTGAGTA
TGAGGCAAGTTTGAAGAGAATGATGGTTCGGTTCAGAAAACTAGGCACGAGAAAGATGTT
GGATCCGTTCTTTGAGTTCTATGTAGACTTGGGGGAGATACTGAAAGGTGGTGAGTTCGT
GGTGGGTTTAAGCTCTGCAAACGGGAACTCTTCCAATGCACATCTTCTCCATTCATGGAA
CTTTGACATAAGGCATCCAACGCCGGTGTGTGTGCCTCCATTGCCACCTCGGGGTCCAGA
TGGAAGTGTGAGTATGTAGAGAATGCTGGGTGGAGTATATTGGGGAATATGC

QA 3 774 3 774
DS 

RD RS1DV26JQ 838 0 0
TTCCGA
GTGAAGAGAGTCGTAGTAACTCGT*ATCTT*CTCGACTCACTTCTCGTTT*CCATGCCTA
ACGAGACCGATGGTGTCATGGCTTT*GTAATCATTCCAACTAGTTTGGATCTTAGTATGT
TCGGTAAAGAAAACAAAAGTTCCTCTGCCTTAGGGTTTTTGTTTGAGCATGCAAAGAACG
AGACAGTTGTGGCTTTTGAGTTTGATATTTCCAGTAGAGGAAACCGTGCAAGGATCTTGA
TAGGTAAACCTGAATCTTCCGAAACTAGAAACATTTCTTTTGAGGGTGACTTGTTGATGG
GCGATGGAGGGACGTTGAGCTGTATGGTTGAGTATGAGGCAAGTTTGAAGAGAATGATGG
TTCGGTTCAGAAAACTAGGCACGAGAAAGATGTTGGATCCGTTCTTTGAGTTCTATGTAG
ACTTGGGGGAGATACTGAAAGGTGGTGAGTTCGTGGTGGGTTTAAGCTCTGCAAACGGGA
ACTCTTCCAATGCACATCTTCTCCATTCATGGAACTTTGACATAAGGCATCCAACGCCGG
TGTGTGTGCCTCCATTGCCACCTCGGGGTCCAGATGGAAGTGTGAGTATGTAGAGAATGC
TGGGTGGAGTATATTGAGGAATATGCTCTGGTGAGGGATGTGCTATGAGTATTGTGGTGG
TTGCTGTTGAAGAGGTACTGAGGAGTTTTGTGTGGTTTAAGGTTGTGGTGTGAATGCAGA
GTCTTCTTCTGCTTTCTTTTGTGTTATTTTCTGTTGCTTTACTTAGTTTCTTGGTTTCAT
ATGTAAAATAGCTAATGAAAAGAAGCCGTGAGAATAATGATCTTGTGAAGTT

QA 7 838 7 838
DS 

RD RS1C355JQ 857 0 0
GAGAGTCGTAGTA*CTCGT*ATCTT*CTCGACTCACTTCTCGTTT*CCATGC*TAACGAG
ACTGATGGTGTCATGGCTTT*GTAATCGTTCCAACTAGTTTGGATCTTAGTATGTTCGGT
AAAGAAAACAAAAGTTCCTCTGCCTTAGGGTTTTTGTTTGAGCATGCAAAGAACGAGACA
GTTGTGGCTTTTGAGTTTGATATTTCCAGTAGAGGAAACCGTGCAAGGATCTTGATAGGT
AAACCTGAATCTTCCGAAACTAGAAACATTTCTTTTGAGTGTGACTTGTTGATGGGCGAT
GGAGGGACGTTGAGCTGTATGGTTGAGTATGAGGCAAGTTTGAAGAGAATGATGGTTCGG
TTCAGAAAACTAGGCACGAGAAAGATGTTGGATCCGTTCTTTGAGTTCTATGTAGACTTG
GGGGAGATACTGAAAGGTGGTGAGTTCGTGGTGGGTTTAAGCTCTGCAAACGGGAACTCT
TCCAATGCACATCTTCTCCATTCATGGAACTTTGACATAAGGCATCCAACGCCGGTGTGT
GTGCCTCCATTGCCACCTCGGGGTCCAGATGGAAGTGTGAGTATGTAGAGAATGCTGGGT
GGAGTATATTGAGGAATATGCTCTGGTGAGGGATGTGCTATGAGTATTGTGGTGGTTGCT
GTTGAAGAGGTACTGAGGAGTTTGGTGTGGTTTAAGGTTGTGGTGTGAATGCAGAGTCTT
CTTCTGCTTTCTTTTGTGTTATTTTCTGTTGCTTTACTTAGTTTCTTGGTTTCATATGTA
AAATAGCTAATGAAAAGAAGCCGTGAGAATAATGATCTTGTGAAGTTGATGTTTTCCTTG
AATCCATTTGGTTTTAT

QA 1 857 1 857
DS 

RD RS1AP61JQ 672 0 0
GTTC
GAGCATGCAAAGAACGAGACAGTTGTGGCTTTTGAGTTTGATATTTCCAGTAGAGGAAAC
CGTGCAAGGATCTTGATAGGTAAACCTGAATCTTCCGAAACTAGAAACATTTCTTTTGAG
GGTGACTTGTTGATGGGCGATGGAGGGACGTTGAGCTGTATGGTTGAGTATGAGGCAAGT
TTGAAGAGAATGATGGTTCGGTTCAGAAAACTAGGCACGAGAAAGATGTTGGATCCGTTC
TTTGAGTTCTATGTAGACTTGGGGGAGATACTGAAAGGTGGTGAGTTCGTGGTGGGTTTA
AGCTCTGCAAACGGGAACTCTTCCAATGCACATTTTCTCCATTCATGGAACTTTGACATA
AGGCATCCAACGCCGGTGTGTGTGCCTCCATTGCCACCTCGGGGTCCAGATGGAAGTGTG
AGTATGTAGAGAATGCTGGGTGGAGTATATTGGGGAATATGCTCTGGTGAGGGATGTGCT
ATGAGTATTGTGGTGGTTGCTGTTGAAGAGGTACTGAGGAGTTTGGTGTGGTTTAAGGTT
GTGGTGTGAATGCAGAGTCTTCTTTTGCTTTCTTTTGTGTTATTTTCTGTTGCTTTACTT
AGTTTCTTGGTTTCATATGTAAAATAGCTAATGAAAAGAAGCCGTGAGAATAATGATCTT
GTGAAGTT

QA 5 672 5 672
DS 

RD RS1DX22JQ 687 0 0
TTTTTGTTTGAGCATGCAAAGAACGAGACAGTTGTGGCTTTTGAGTTTGATATTTCCAGT
AGAGGAAACCGTGCAAGGATCTTGATAGGTAAACCTGAATCTTCCGAAACTAGAAACATT
TCTTTTGAGGGTGACTTGTTGATGGGCGATGGAGG*ACGTTGAGCTGTATGGTTGAGTAT
GAGGCAAGTTTGAAGAGAATGATGGTTCGGTTCAGAAAACTAGGCACGAGAAAGATGTTG
GATCCGTTCTTTGAGTTCTATGTAGACTTGGGGGAGATACTGAAAGGTGGTGAGTTCGTG
GTGGGTTTAAGCTCTGCAAACGGGAACTCTTCCAATGCACATCTTCTCCATTCATGGAAC
TTTGACATAAGGCATCCAACGCCGGTGTGTGTGCCTCCATTGCCACCTCGGGGTCCAGAT
GGAAGTGTGAGTATGTAGAGAATGCTGGGTGGAGTATATTGAGGAATATGCTCTGGTGAG
GGATGTGCTATGAGTATTGTGGTGGTTGCTGTTGAAGAGGTACTGAGGAGTTTGGTGTGG
TTTAAGGTTGTGGTGTGAATGCAGAGTCTTCTTCTGCTTTCTTTTGTGTTATTTTCTGTT
GCTTTACTTAGTTTCTTGGTTTCATATGTAAAATAGCTAATGAAAAGAAGCCGTGAGAAT
AATGATCTTGTGAAGTTGATGTTTTC
G

QA 1 686 1 686
DS 



AS 2 8

CO CL697Contig1 824 6 18 U
GGGAGAATGAACGAAGATCGGCCGGTGAATCGTCGAGGTGAACAGAGAAGATGTCGGGTC
ACTACAGATGGAAGAGCTTCGAGGAGAACGAAGACCGTCCGGAGAAGCCACGCCGTTACG
GTGTAACGGAGATGCGAGGTCCTCGTTACTCCGTTCTCAGCCAGAACGTTCTTCAGGAAA
TATTTGAATCCATGGGGCAGTTTGTTGACGGGTTAAAGTTCTCGGGAGGCTCCAACAGTT
TGATTCCAAAGTCATTCATCAAGCAAGCCATTGATATGGCTCATGAGCACGATGTTTATG
TTAGTACTGGTGATTGGGCTGAACATGTTCTTCGTAGTGGTGGCCCTTCAGCTTTCAAAG
AGTATGTAGAGGAGTGTAAGCAGTTAGGGTTCGACACTATTGAGCTGAATGCAAATTTAC
TTGAGATTCCAGAGGACACTCTTCTACGATATGTACGTATGATCAAGAACGGTGGTCTTA
GAGCCAAACCAATCTTTGCTGTGAAGTTCAACAAGTCTGATATTCCTGGGAGGAGGAACA
GGGCGTTTGGTTCCTATGTTGTTCCGGAGCCTCGATCAAGCGAGTTTGTGGAGGACATTG
ATCTCTTGATAAGAAAGGCTGAAAGGTGTTTAGAAGCAGGGGCAGACACCATTATGATTG
ATGCAGATGATGTATGCAAATACGCGGATTCTATCCGAGCGGACATAATCGCTAAAGTCA
TAG*ACGTTTGGGAATAGAGAAGACAAACACTGAAACATCTGATGCTA*CTTAGCTGAGT
GGTTCATCAACGTACGGTCAAACGTGATCCTCTATGTGGATCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 0 0 0 0 0 0 35 35 0 0 0 0 35 35 0 35 0 0 35 35 0 0 0 0 35 35 0 0 35 35 35 20 20 20 20 20 
20 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B984TF U 1
AF RS1D905JQ C 22
AF RS1D905TF U 22
AF RS1CC45TF U 15
AF RS1E486TF U 22
AF RS1BG06TF U 21
BS 1 476 RS1B984TF
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BS 604 686 RS1CC45TF
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BS 716 716 RS1D905TF
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BS 746 746 RS1D905TF
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BS 748 751 RS1D905TF
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RD RS1B984TF 603 0 0
GGGAGAATGAACGAAGATCGGCCGGTGAATCGTCGAGGTGAACAGAGAAGATGTCGGGTC
ACTACAGATGGAAGAGCTTCGAGGAGAACGAAGACCGTCCGGAGAAGCCACGCCGTTACG
GTGTAACGGAGATGCGAGGTCCTCGTTACTCCGTTCTCAGCCAGAACGTTCTTCAGGAAA
TATTTGAATCCATGGGGCAGTTTGTTGACGGGTTAAAGTTCTCGGGAGGCTCCAACAGTT
TGATTCCAAAGTCATTCATCAAGCAAGCCATTGATATGGCTCATGAGCACGATGTTTATG
TTAGTACTGGTGATTGGGCTGAACATGTTCTTCGTAGTGGTGGCCCTTCAGCTTTCAAAG
AGTATGTAGAGGAGTGTAAGCAGTTAGGGTTCGACACTATTGAGCTGAATGCAAATTTAC
TTGAGATTCCAGAGGACACTCTTCTACGATATGTACGTATGATCAAGAACGGTGGTTTTA
GAGCCAAACCAATCTTTGCTGTGAAGTTCAACAAGTCTGATATTCCTGGGAGGAGGAACA
GGGCGTTTGGTTCCTATGTTGTTCCGGAGCCTCGATCAAGCGAGTTTGTGGAGGACATTG
ATC

QA 1 603 1 603
DS 

RD RS1D905JQ 756 0 0
GG
GGTGAATCGTCGAGGTGAACAGAGAAGATGTCGGGTCACTACAGATGGAAGAGCTTCGAG
GAGAACGAAGACCGTCCGGAGAAGCCACGCCGTTACGGTGTAACGGATATGCGAGGTCCT
CGTTACTCCGTTCTCAGCCAGAACGTTCTTCAGGAAATATTTGAATCCATGGGGCAGTTT
GTTGACGGGTTAAAGTTCTCGGGAGGCTCCAACAGTTTGATTCCAAAGTCATTCATCAAG
CAAGCCATTGATATGGCTCATGAGCACGATGCTTATGTTAGTACTGGTGATTGGGCTGAA
CATGTTCTTCGTAGTGGTGGCCCTTCAGCTTTCAAAGAGTATGTAGAGGAGTGTAAGCAG
TTAGGGTTCGACACTATTGAGCTGAATGCAAATTTACTTGAGATTCCAGAGGACACTCTT
TTACGATATGTACGTATGATCAAGAACGGTGGTCTTAGAGCCAAACCAATCTTTGCTGTG
AAGTTCAACAAGTCTGATATTCCTGGGAGGAGGAACAGGGCGTTTGGTTCCTATGTTGTT
CCGGAGCCTCGCTCAAGCGAGTTTGTGGAGGACATTGATCTCTTGATAAGAAAGGCTGAA
AGGTGTTTAGAAGCAGGGGCAGACACCATTATGATTGATGCAGATGATGTATGCAAATAC
GCGGATTCTATCCGAGCGGACATAATCGCTAAAGTCATAGGACGTTTGGGAATAGAGAAG
ACACACACTGCTAGATTTTGTGTTT*CTT**CTG

QA 3 756 3 756
DS 

RD RS1D905TF 762 0 0
GG
GGTGAATCGTCGAGGTGAACAGAGAAGATGTCGGGTCACTACAGATGGAAGAGCTTCGAG
GAGAACGAAGACCGTCCGGAGAAGCCACGCCGTTACGGTGTAACGGATATGCGAGGTCCT
CGTTACTCCGTTCTCAGCCAGAACGTTCTTCAGGAAATATTTGAATCCATGGGGCAGTTT
GTTGACGGGTTAAAGTTCTCGGGAGGCTCCAACAGTTTGATTCCAAAGTCATTCATCAAG
CAAGCCATTGATATGGCTCATGAGCACGATGCTTATGTTAGTACTGGTGATTGGGCTGAA
CATGTTCTTCGTAGTGGTGGCCCTTCAGCTTTCAAAGAGTATGTAGAGGAGTGTAAGCAG
TTAGGGTTCGACACTATTGAGCTGAATGCAAATTTACTTGAGATTCCAGAGGACACTCTT
CTACGATATGTACGTATGATCAAGAACGGTGGTCTTAGAGCCAAACCAATCTTTGCTGTG
AAGTTCAACAAGTCTGATATTCCTGGGAGGAGGAACAGGGCGTTTGGTTCCTATGTTGTT
CCGGAGCCTCGCTCAAGCGAGTTTGTGGAGGACATTGATCTCTTGATAAGAAAGGCTGAA
AGGTGTTTAGAAGCAGGGGCAGACACCATTATGATTGATGCAGATGATGTATGCAAATAC
GCGGATTCTATCCGAGCGGACATAATCGCTAAAGTCATAG*ACGTTTGGGAATAGAGA*G
ACACACACTGCTAGATTTTGTGTTT*CTT**CTG
AAAAAA

QA 3 756 3 756
DS 

RD RS1CC45TF 810 0 0
GGTGCGGCC
GGTGAATCGTCGAGGTGAACAGAGAAGATGTCGGGTCACTACAGATGGAAGAGCTTCGAG
GAGAACGAAGACCGTCCGGAGAAGCCACGCCGTTACGGTGTAACGGAGATGCGAGGTCCT
CGTTACTCCGTTCTCAGCCAGAACGTTCTTCAGGAAATATTTGAATCCATGGGGCAGTTT
GTTGACGGGTTAAAGTTCTCGGGAGGCTCCAACAGTTTGATTCCAAAGTCATTCATCAAG
CAATCCATTGATATGGCTCATGAGCACGATGTTTATGTTAGTACTGGTGATTGGGCTGAA
CATGTTCTTCGTAGTGGTGGCCCTTCAGCTTTCAAAGAGTATGTAGAGGAGTGTAAGCAG
TTAGGGTTCGACACTATTGAGCCGAATGCAAATTTACTTGAGATTCCAGAGGACACTCTT
CTACGATATGTACGTATGATCAAGAACGGTGGTCTTAGAGCCAAACCAATCTTTGCTGTG
AAGTTCAACAAGTCTGATATTCCTGGGAGGAGGAACAGGGCGTTTGGTTCCTATGTTGTT
CCGGAGCCTCGATCAAGCGAGTTTGTGGAGGACATTGATCTCTTGATAAGAAAGGCTGAA
AGGTGTTTAGAAGCAGGGGCAGACACCATTATGATTGATGCAGATGATGTATGCAAATAC
GCGTATTCTATCCGAGCGGACATAATCGCTAA*GTCATAG*ACGTTTGGGAATAGAGAAG
ACTATGTTTGAAGCATCTGATGCCA*GTTAGCTGAGTGGTTCATCAACGTACGGTCAAAC
GTGATCCTCTATGTGGATCAT

QA 10 810 10 810
DS 

RD RS1E486TF 767 0 0
GG
GGTGAATCGTCGAGGTGAACAGAGAAGATGTCGGGTCACTACAGATGGAAGAGCTTCGAG
GAGAACGAAGACCGTCCGGAGAAGCCACGCCGTTACGGTGTAACGGAGATGCGAGGTCCT
CGTTACTCCGTTCTCAGCCAGAACGTTCTTCAGGAAATATTTGAATCCATGGGGCAGTTT
GTTGACGGGTTAAAGTTCTCGGGAGGCTCCAACAGTTTGATTCCAAAGTCATTCATCAAG
CAAGCCATTGATATGGCTCATGAGCACGATGTTTATGTTAGTACTGGTGATTGGGCTGAA
CATGTTCTTCGTAGTGGTGGCCCTTCAGCTTTCAAAGAGTATGTAGAGGAGTGTAAGCAG
TTAGGGTTCGACACTATTGAGCTGAATGCAAATTTACTTGAGATTCCAGAGGACACTCTT
CTACGACATGTACGTATGATCAAGAACGGTGGTCTTAGAGCCAAACCAATCTTTGCTGTG
AAGTTCAACAAGTCTGATATTCCTGGGAGGAGGAACAGGGCGTTTGGTTCCTATGTTGTT
CCGGAGCCTCGATCAAGCGAGTTTGTGGAGGACATTGATCTCTTGATAAGAAAGGCTGAA
AGGTGTTTAGAAGCAGGGGCAAACACCATTATGATTGATGCAGATGATGTATGCAAATAC
GCGGATTCTATCCGAGCGGACATAATCGCTAAAGTCATAG*ACGTTTGGGAATAGAGAAG
ACTATGTTTGAAGCATCTGATGCAA*GTTAGCTGAGTGGTTCATC

QA 3 767 3 767
DS 

RD RS1BG06TF 763 0 0
GGC
GGTGAATCGTCGAGGTGAACAGAGAAGATGTCGGGTCACTACAGATGGAAGAGCTTCGAG
GAGAACGAAGACCGTCCGGAGAAGCCACGCCGTTACGGTGTAACGGAGATGCGAGGTCCT
CGTTACTCCGTTCTCAGCCAGAACGTTCTTCAGGAAATATTTGAATCCATGGGGCAGTTT
GTTGACGGGTTAAAGTTCTCGGGAGGCTCCAACAGTTTGATTCCAAAGTCATTCATCAAG
CAAGCCATTGATATGGCTCATGAGCACGATGTTTATGTTAGTACTGGTGATTGGGCTGAA
CATGTTCTTCGTAGTGGTGGCCCTTCAGCTTTCAAAGAGTATGTAGAGGAGTGTAAGCAG
TTAGGGTTCGACACTATTGAGCTGAATGCAAATTTACTTGAGATTCCAGAGGACACTCTT
CTACGATATGTACGTATGATCAAGAACGGTGGTCTTAGAGCCAAACCAATCTTTGCTGTG
AAGTTCAACAAGTCTGATATTCCTGGGAGGAGGAACAGGGCGTTTGGTTCCTATGTTGTT
CCGGAGCCTCGATCAAGCGAGTTTGTGGAGGACATTGATCTCTTGATAAGAAAGGCTGAA
AGGTGTTTAGAAGCAGGGGCAGACACCATTATGATTGATGCAGATGATGTATGCAAATAC
GCGGATTCTATCCGAGCGGACATAATCGCTAAAGTCATAG*ACGTTTGGGAATAGAGAAG
ACTATGTTTGAAGCATCTGATGCCAAGTTAGCTGAGTGGT

QA 4 763 4 763
DS 



CO CL697Contig2 840 2 3 U
AATCAAACTGCTTATATTATTGCTCAAAATGTTTCAGTCAGTGATACTCCTAAGACAAAC
AAAGCCTTACGTGCATTGCTTACTTTACTAGGTTGTATACATTCTGAGAGACTTGCGAGA
TAGATCAATATATTATGAGACCGTCGAAAAGGTCACATATCACAATATTCTCCCAAAAGT
TCTCTCTTACACCATCAACGAAGCACATAACATAAGACATATTACGACATAATACATGAG
AAATTCACACAGGTTTACATGTAGTGTTGTTTTTAAAACAAGAAGTAGGAGGAACTGAGG
ACGGACTTGTGATCTTTACCCAGATGACGACCGCGAAGGCACTCCAGATCCATTATCTGA
GAATGATCCACATAGAGATTCACGTTTGGACCGTAACGTTTGATGAACCACTCAGCTAAC
TTGGCATCAGATGCTTCAAACATAGTCTTCTCTATTCCCAAACGTCCCATGACTTTAGCG
ATTATGTCCGCTCGGATAGAATCCGCGTATTTGCATACATCATCTGCATCAATCATAATG
GTGTCTGCCCCTGCTTCTAAACACCTTTCAGCCTTTCTTATCAAGAGATCAATGTCCTCC
ACAAAATCGCTTGATCGAGGCTCCGGAACAACATAGGAACCAAACGCCCTGTTCCTCCTC
CCAGGAATATCAGACTTGTTGAACTTCACAGCAAAGATTGGTTTGGCTCTAAGACCACCG
TTCTTGATCATACGTACATATCGTAGAAGAGTGTCCTCTGGAATCTCAAGTAAATTTGCA
TTCAGCTCAATAGTGTCGAACCCTAACTGCTTACACTCCTCTACATACTCTTTGAAAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B984JQ U 115
AF RS1FF42JQ U 1
BS 1 248 RS1FF42JQ
BS 249 249 RS1B984JQ
BS 250 840 RS1FF42JQ

RD RS1B984JQ 509 0 0
GCGAGATAGATCAATATATTATGAGACCGTCGAAAAGGTCACATATCACAATATTCTCCC
AAAAGTTCTCTCTTACACCATCAACGAAGCACATAACATAAGACATATTACGACATAATA
CATGAGAAATTCACACAGGTTTACATGTAGTGTTGTTTTTAAAACAAGAAGTAGGAGGAA
CTGAGGACGGACTTGTGATCTT*ACCCAGATGACGACCGCGAAGGCACTCCAGATCCATT
ATCTGAGAATGATCCACATAGAGATTCACGTTTGGACCGTAACGTTTGATGAACCACTCA
GCTAACTTGGCATCAGATGCTTCAAACATAGTCTTCTCTATTCCCAAACGTCCTATGACT
TTAGCGATTATGTCCGCTCGGATAGAATCCGCGTATTTGCATACATCATCTGCATCAATC
ATAATGGTGTCTGCCCCTGCTTCTAAACACCTTTCAGCCTTTCTTATCAAGAGATCAATG
TTCTCCACAAACTCGCTTGATCGAGGCTC

QA 1 509 1 509
DS 

RD RS1FF42JQ 840 0 0
AATCAAACTGCTTATATTATTGCTCAAAATGTTTCAGTCAGTGATACTCCTAAGACAAAC
AAAGCCTTACGTGCATTGCTTACTTTACTAGGTTGTATACATTCTGAGAGACTTGCGAGA
TAGATCAATATATTATGAGACCGTCGAAAAGGTCACATATCACAATATTCTCCCAAAAGT
TCTCTCTTACACCATCAACGAAGCACATAACATAAGACATATTACGACATAATACATGAG
AAATTCACGCAGGTTTACATGTAGTGTTGTTTTTAAAACAAGAAGTAGGAGGAACTGAGG
ACGGACTTGTGATCTTTACCCAGATGACGACCGCGAAGGCACTCCAGATCCATTATCTGA
GAATGATCCACATAGAGATTCACGTTTGGACCGTAACGTTTGATGAACCACTCAGCTAAC
TTGGCATCAGATGCTTCAAACATAGTCTTCTCTATTCCCAAACGTCCCATGACTTTAGCG
ATTATGTCCGCTCGGATAGAATCCGCGTATTTGCATACATCATCTGCATCAATCATAATG
GTGTCTGCCCCTGCTTCTAAACACCTTTCAGCCTTTCTTATCAAGAGATCAATGTCCTCC
ACAAAATCGCTTGATCGAGGCTCCGGAACAACATAGGAACCAAACGCCCTGTTCCTCCTC
CCAGGAATATCAGACTTGTTGAACTTCACAGCAAAGATTGGTTTGGCTCTAAGACCACCG
TTCTTGATCATACGTACATATCGTAGAAGAGTGTCCTCTGGAATCTCAAGTAAATTTGCA
TTCAGCTCAATAGTGTCGAACCCTAACTGCTTACACTCCTCTACATACTCTTTGAAAGCT

QA 1 840 1 840
DS 



AS 2 8

CO CL698Contig1 969 6 21 U
GTAAATGCAAATTATAACATTCTATTGATGATAGAAAAGCGAAATAAAAACCACAAGAAA
TGTAATACAAGGGCACTAATATATCAGCCAAATATAATAGTACTGAAAGGTCCAAAATCC
AAGCTTCCACATAGTCTTCATCATCACCATCATTATCATTGTCATCTTCACCACCATCCT
CATGAACAATGATGTCTCATCTACCTCTTTTCCCTCCTCAAAAACGACTTTTCTTAGGCA
ACATATTAAGAAAAAAACTAAAAAAAAAGCAGACACAAAAGTCATAAACACACAACGGCA
CACCATTGGGTAATGGCGTTGTAATTATTTGACAGAGAGACTCGATAAGTCAAACGTTGT
CCGTTGACTGATGGAGCAGTGGAGCTGTGATGGACGACTTGATGGAGCCGCGAGAAACGG
GTGCACGCTCGATAACATGCTCCGCGGAGGACTGGATCATTGCCTTCTCAAGAGCTGCAA
ACTTCCTCTCTTCGCTCTTACCATACAACACAAAGTAGAGTCCCGCTATGATCAGCACAG
CTCCAATAATCCCTCCCAAGTAAAACTCTTCGCCTAACGCAATCGAAGCCATAATCGCAA
CGACCAAAGTCTGAACAGGTTGGTAAACCGCAACGAAAACTGGACCCCCTCTGTCAATAC
ACCAAATCTGAACCGCAAACGCGATTCCAGACGCCACTATTCCTGCGTAGAGGATGGTGA
AAAGCTCCCAACCGGAGTGAAAAACCCAAGCCTGAGAATCTCTTTCACAGAAAGCAGCGA
TGATCACGAACTGGATAATTCCGAACAAAAGGGTGTAAGACGTAACCGAGAGCCTGGCCG
GATAAGATTTAAGAACCGGAGCTTGAAAAACGAGCCAGCCAGACCACGAAAGACAGTGAC
CTATTAGGTAGATGCAGCCAAGAGTCCAGTTTTTCGGCGCGGCGTCTCCAAGAGGCGCTA
GTACGGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CA44JQ U 6
AF RS1FR52JQ U 4
AF RS1BX94JQ U 1
AF RS1AY18JQ U 14
AF RS1AY18TF C 183
AF RS1CA44TF C 429
BS 1 25 RS1BX94JQ
BS 26 26 RS1CA44JQ
BS 27 267 RS1BX94JQ
BS 268 268 RS1AY18JQ
BS 269 308 RS1BX94JQ
BS 309 309 RS1FR52JQ
BS 310 384 RS1BX94JQ
BS 385 385 RS1FR52JQ
BS 386 571 RS1BX94JQ
BS 572 572 RS1FR52JQ
BS 573 619 RS1BX94JQ
BS 620 620 RS1FR52JQ
BS 621 743 RS1BX94JQ
BS 744 744 RS1AY18JQ
BS 745 793 RS1BX94JQ
BS 794 797 RS1AY18JQ
BS 798 798 RS1AY18TF
BS 799 812 RS1AY18JQ
BS 813 813 RS1AY18TF
BS 814 822 RS1AY18JQ
BS 823 969 RS1CA44TF

RD RS1CA44JQ 242 0 0
G
GCAAATTATAGCATTCTATTGATGATAGAAAAGCGAAATAAAAACCACAAGAAATGTAAT
ACAAGGGCACTAATATATCAGCCAAATATAATAGTACTGAAAGGTCCAAAATCCAAGCTT
CCACATAGTCTTCATCATCACCATCATTATCATTGTCATCTTCACCACCATCCTCATGAA
CAATGATGTCTCATCTACCTCTTTTCCCTCCTCAAAAACGACTTTTCTTAGGCAACATAT
T

QA 2 242 2 242
DS 

RD RS1FR52JQ 735 0 0
AAT
GCAAATTATAACATTCTATTGATGATAGAAAAGCGAAATAAAAACCACAAGAAATGTAAT
ACAAGGGCACTAATATATCAGCCAAATATAATAGTACTGAAAGGTCCAAAATCCAAGCTT
CCACATAGTCTTCACCATCACCATCATTATCATTGTCATCTTCACCACCATCCTCATGAA
CAATGATGTCTCATCTACCTCTTTTCCCTCCTCAAAAACGACTTTTCTTAGGCAACATAT
TAAGAAAAAAACTAAAAAAAA*GCAGACACAAAAGTCATAAACACACAACGGCACACCAT
TGGGTAATGGCGTTGTAATTATTTGACAGAGAGACTCGATAAGTCAAACGTTGTCCGTTG
ACTGATGGAGCAGTGGAGCTGTGATGGACAACTTGATGGAGCCGCGAGAAACGGGTGCAC
GCTCGATAACATGCTCCGCGGAGGACTGGATCATTGCCTTCTCAAGAGCTGCAAACTTCC
TCTCTTCGCTCTTACCATACAACGCAAAGTAGAGTCCCGCTATGATCAGCACAGCTCCAA
TAATCCCTCCCAAGTAAAACTCTTCGCCTAACGCAATCGAAGCCATAATCGCAACGACCA
AAGTCTGAACAGGTTGGTAAACCGCAACGAAAACTGGACCCCCTCTGTCAATACACCAAA
TCTGAACCGCAAACGCGATTCCAGACGCCACTATTCCTGCGTAGAGGATGGTGAAAAGCT
CCCAACCGGAGT

QA 4 735 4 735
DS 

RD RS1BX94JQ 793 0 0
GTAAATGCAAATTATAACATTCTATCGATGATAGAAAAGCGAAATAAAAACCACAAGAAA
TGTAATACAAGGGCACTAATATATCAGCCAAATATAATAGTACTGAAAGGTCCAAAATCC
AAGCTTCCACATAGTCTTCATCATCACCATCATTATCATTGTCATCTTCACCACCATCCT
CATGAACAATGATGTCTCATCTACCTCTTTTCCCTCCTCAAAAACGACTTTTCTTAGGCA
ACATATTAAGAAAAAAACTAAAAAAAA*GCAGACACAAAAGTCATAAACACACAACGGCA
CACCATTGAGTAATGGCGTTGTAATTATTTGACAGAGAGACTCGATAAGTCAAACGTTGT
CCGTTGACTGATGGAGCAGTGGAGATGTGATGGACGACTTGATGGAGCCGCGAGAAACGG
GTGCACGCTCGATAACATGCTCCGCGGAGGACTGGATCATTGCCTTCTCAAGAGCTGCAA
ACTTCCTCTCTTCGCTCTTACCATACAACACAAAGTAGAGTCCCGCTATGATCAGCACAG
CTCCAATAATCCCTCCCAAGTAAAACTCTTCACCTAACGCAATCGAAGCCATAATCGCAA
CGACCAAAGTCTGAACAGGGTGGTAAACCGCAACGAAAACTGGACCCCCTCTGTCAATAC
ACCAAATCTGAACCGCAAACGCGATTCCAGACGCCACTATTCCTGCGTAGAGGATGGTGA
AAAGCTCCCAACCGGAGTGAAAA*CCCAAGCCTGAGAATCTCTTTCACAGAAAGCAGCGA
TGATCACGAACTG

QA 1 793 1 793
DS 

RD RS1AY18JQ 810 0 0
ATAA
CATTCTATTGATGATAGAAAAGCGAAATAAAAACCACAAGAAATGTAATACAAGGGCACT
AATATATCAGCCAAATATAATAGTACTGAAAGGTCCAAAATCCAAGCTTCCACATAGTCT
TCATCATCACCATCATTATCATTGTCATCTTCACCACCATCCTCATGAACAATGATGTCT
CATCTACCTCTTTTCCCTCCTCAAAAACGACTTTTCTTAGGCAACATATTAAGAAAAAAA
CTAAAAAAAAAGCAGACACAAAAGTCATAAACACACAACGGCACACCATTGGGTAATGGC
GTTGTAATTATTTGACAGAGAGACTCGATAAGTCAAACGTTGTCCGTTGACTGATGGAGC
AGTGGAGCTGTGATGGACGACTTGATGGAGCCGCGAGAAACGGGTGCACGCTCGATAACA
TGCTCCGCGGAGGACTGGATCATTGCCTTCTCAAGAGCTGCAAACTTCCTCTCTTCGCTC
TTACCATACAACACAAAGTAGAGTCCCGCTATGATCAGCACAGCTCCAATAATCCCTCCC
AAGTAAAACTCTTCGCCTAACGCAATCGAAGCCATAATCGCAACGACCAAAGTCTGAACA
GGTTGGTAAACCGCAACGAAAACTGGACCCCCT*TGTCAATACACCAAATCTGAACCGCA
AACGCGATTCCAGACGCCACTATTCCTGCGTAGAGGATGGTGAAAAGCTCCCAACCGGAG
TGAAAAACCCAAGCCTGAGAATCTCTTTCACAGAAAGCAGCGATGATCACGAACTGGATA
*TTCCGAACAAAAGG*TGTAAGACG
C

QA 5 809 5 809
DS 

RD RS1AY18TF 641 0 0
TGAACAATGATGTCTCATCTACCTCTTTTCCCTCCTCAAAAACGACTTTTCTTAGGCAAC
ATATTAAGAAAAAAACTAAAAAAAAAGCAGACACAAAAGTCATAAACACACAACGGCACA
CCATTGGGTAATGGCGTTGTAATTATTTGACAGAGAGACTCGATAAGTCAAACGTTGTCC
GTTGACTGATGGAGCAGTGGAGCTGTGATGGACGACTTGATGGAGCCGCGAGAAACGGGT
GCACGCTCGATAACATGCTCCGCGGAGGACTGGATCATTGCCTTCTCAAGAGCTGCAAAC
TTCCTCTCTTCGCTCTTACCATACAACACAAAGTAGAGTCCCGCTATGATCAGCACAGCT
CCAATAATCCCTCCCAAGTAAAACTCTTCGCCTAACGCAATCGAAGCCATAATCGCAACG
ACCAAAGTCTGAACAGGTTGGTAAACCGCAACGAAAACTGGACCCCCT*TGTCAATACAC
CAAATCTGAACCGCAAACGCGATTCCAGACGCCACTATTCCTGCGTAGAGGATGGTGAAA
AGCTCCCAACCGGAGTGAAAAACCCAAGCCTGAGAATCTCTTTCACAGAAAGCAGCGATG
ATCACGAACTGGATAATTCCGAACAAAAGGGTGTAAGACG
C

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1CA44TF 541 0 0
TCGATAACATGCTCCGCGGAGGACTGGATCATTGCCTTCTCAAGAGCTGCAAACTTCCTC
TCTTCGCTCTTACCATACAACACAAAGTAGAGTCCCGCTATGATCAGCACAGCTCCAATA
ATCCCTCCCAAGTAAAACTCTTCGCCTAACGCAATCGAAGCCATAATCGCAACGACCAAA
GTCTGAACAGGTTGGTAAACCGCAACGAAAACTGGACCCCCTCTGTCAATACACCAAATC
TGAACCGCAAACGCGATTCCAGACGCCACTATTCCTGCGTAGAGGATGGTGAAAAGCTCC
CAACCGGAGTGAAAAACCCAAGCCTGAGAATCTCTTTCACAGAAAGCAGCGATGATCACG
AACTGGATAATTCCGAACAAAAGGGTGTAAGACGTAACCGAGAGCCTGGCCGGATAAGAT
TTAAGAACCGGAGCTTGAAAAACGAGCCAGCCAGACCACGAAAGACAGTGACCTATTAGG
TAGATGCAGCCAAGAGTCCAGTTTTTCGGCGCGGCGTCTCCAAGAGGCGCTAGTACGGCC
C

QA 1 541 1 541
DS 



CO CL698Contig2 740 2 6 U
GGAATCAAACACACTCATTCCTTCTCCATCGTCGTCTGATTCAAAAGTCAGTTCCAATGG
CTGATAACACCGATAACCGGAGAGCGATATGGGGAGTTCCGGAGAAGCTTCAGCTTCACA
TAGCGATGCTCACGTTGCAGTTCGGTTACGCTGGATTCCATGTGGTCTCGAGAGCTGCTC
TTAACATGGGAATCAGCAAACTCGTCTTCCCTGTTTATCGTAACATCATTGCCTTGCTTC
TCCTCCTTCCCTTCGCTTACTTCCTTGAAAAGAAGGAGAGACCAGCGATTACACTCAATT
TTCTCATTCAGTTCTTCTTTCTGGCACTCATCGGAATAACAGCGAACCAAGGCTTTTACT
TGTTGGGACTGGACTACACTTCACCAACATTTGCTTCTTCCATGCAAAACTCTGTTCCCG
CCATTACCTTTCTCATGGCTGCTCTTCTCAGGATTGAGAAAGTTAGAATAAACAGAAGAG
ACAGTATCTCCAAAGTCTTAGGAACAGCTCTTTGCGTCGCCGGAGCTTCCGTCATCACTC
TCTACAAGGGTCCCACCATCTACACTCCGACTAGCCACCTCCACACTCACCTCCTCACAA
CCAACCCCGCCGTACTAGCGCCTCTTGGAGACGCCGCGCCGAAAACTGGACTCTTGGCTG
CATCTACCTAATAGTCACTGTCTTTCGTGGTCTGGCTGGCTCGTTTTCAAGCTCCGTTCT
TAAATCTTATCCGCCAGCTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BX94TF U 1
AF RS1FR52TF U 1
BS 1 241 RS1BX94TF
BS 242 242 RS1FR52TF
BS 243 482 RS1BX94TF
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BS 646 740 RS1FR52TF

RD RS1BX94TF 646 0 0
GGAATCAAACACACTCATTCCTTCTCCATCGTCGTCTGATTCAAAAGTCAGTTCCAATGG
CTGATAACACCGATAACCGGAGAGCGATATGGGGAGTTCCGGAGAAGCTTCAGCTTCACA
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TTAACATGGGAATCAGCAAACTCGTCTTCCCTGTTTATCGTAACATCATTGCCTTGCTTC
TTCTCCTTCCCTTCGCTTACTTCCTTGAAAAGAAGGAGAGACCAGCGATTACACTCAATT
TTCTCATTCAGTTCTTCTTTCTGGCACTCATCGGAATAACAGCGAACCAAGGCTTTTACT
TGTTGGGACTGGACTACACTTCACCAACATTTGCTTCTTCCATGCAAAACTCTGTTCCCG
CCATTACCTTTCTCATGGCTGCTCTTCTCAGGATTGAGAAAGTTAGAATAAACAGAAGAG
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TCTACAAGGGTCCCACCATCTACACTCCGACTAGCCACCTCCACACTCACCTCCTCACAA
CCAACCCCGCCGTACTAGCGCCTCTTGGAGACGCCGCGCCGAAAA
A

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1FR52TF 740 0 0
GGAATCAAACACCCTCATTCCTTCTCCATCGTCGTCTGATTCAAAAGTCAGTTCCAATGG
CTGATAACACCGATAACCGGAGAGCGATATGGGGAGTTCCGGAGAAGCTTCAGCTTCACA
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TTAACATGGGAATCAGCAAACTCGTCTTCCCTGTTTATCGTAACATCATTGCCTTGCTTC
TCCTCCTTCCCTTCGCTTACTTCCTTGAAAAGAAGGAGAGACCAGCGATTACACTCAATT
TTCTCATTCAGTTCTTCTTTCTGGCACTCATCGGAATAACAGCGAACCAAGGCTTTTACT
TGTTGGGACTGGACTACACTTCACCAACATTTGCTTCTTCCATGCAAAACTCTGTTCCCG
CCGTTACCTTTCTCATGGCTGCTCTTCTCAGGATTGAGAAAGTTAGAATAAACAGAAGAG
ACAGTATCTCCAAAGTCTTAGGAACAGCTCTTTGCGTCGCCGGAGCTTCCGTCATCACTC
TCTACAAGGGTCCCACCATCTACACTCCGACTAGCCACCTCCACACTCACCTCCTCACAA
CCAGCCCCGCCGTACTAGCGCCTCTTGGAGACGCCGCGCCGAAAACTGGACTCTTGGCTG
CATCTACCTAATAGTCACTGTCTTTCGTGGTCTGGCTGGCTCGTTTTCAAGCTCCGTTCT
TAAATCTTATCCGCCAGCTC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 6

CO CL699Contig1 1012 6 8 U
TTTTGCTTCAACATACATTTATATTAATTTATAAAAATCATTCATGTTTCATCATACATT
AGTTACATTAGTCTTAATTCGCATTATGTAGAAGAGCCTGCAGTTTATAGCACTCAATGG
CAACACCTGTAACCGATAATGTTGATAATCAAACACACACAAAAATCTTCAATTTATATT
GTTTCCAAACTCAAGAAGTTTAAAACGCGATAGATAGATAGTACAAAAACACAACCACGC
ACATATTTTAATTAGGTGCATGTTTCACGGGAAATGCCGAGCCTGGAATTGGGTACGTCG
ATGAGGACACGGTGGTTCTGCTGCTGCATACTAGCGATAACGTTAAGGACAGAGTTTACG
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AGATTGTCCGGAGGCAGAGTCACGTTCATTCCCGCAAACATAAACGTGACAGGTGGGAAG
ACAACAGAGCCGGAGTAGCAAGTGTCAAAACCTCCGAGTGATGTTGCGTTTGCGTTCTTG
ACGCGTCGTCTGAACTCATCTCTTACGGCAAGGTAAGCTGGTTCAACTAGCCTCGTGAAG
ACCGTTCCAGAGTCAAAGATGGTGCCAGCTCCTGTGGCCGGATCAAAGGCGAGTGCACTT
GTAGGAATATCCACAATCTTATTCCCGACACGAATCCCGACCAAGTTAACATAATAAAGA
GAGGACCTCCTAGGGTTCTTCAACAATGGAGTTGTCTTGATCCTAAGTGGTTGAAACTTA
GGTCCCAATCTCAACGATCCCGAGAAGTTGCTGGACTTACTATTAGGCAAGCAATACGAG
AACGTGGACATATAAAGACTTTGTGTCTGTGAGATTAAAGACAATGGACCACGACCTAAA
CCCATGAGTCCTTGCGCTGGCACGATGTCCAGTGGCTTGGTTGTGCAACAAAAGTGTAGT
TTGGGATGACGTCATTGGCTAGTGTAGTGTATCTGTGTCAGAGATGCTGTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
10 10 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AK37JQ U 1
AF RS1AK37TF C 101
AF RS1DQ31TF C 245
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ACGCGTCGTCTGAACTCATCTCTTACGGCAAGGTAAGCTGGTTCAACTAGCCTCGTGAAG
ACCGTTCCAGAGTCAAAGATGGTGCCAGCTCCTGTGGCCGGATCAAAGGCGAGTGCACTT
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CGGAGGAGCTGTGGATGAGAAGATTGTCCGGAGGCAGAGTCACGTTCATTCCCGCAAACA
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TATTAGGC

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TACGGCAAGGTAAGCTGGTTCAACTAGCCTCGTGAAGACCGTTCCAGAGTCAAAGATGGT
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DS 

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CAAAAACACAACCACGCTTATATTTTAATTAGGTGCATGTTTCACGGGAAATGCCGAGCC
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AGGAGCTGTGGATGAAAAGATTGTCCGGAGGCAGAGTCACGTTCATTCCCGCAAACATAA
ACGTGACAGGTGGGAAGACAACAGAGCCGGAGTAGCAAGTGTCAAAACCTCCGAGTGATG
TTGCGTTTGCGTTCTTGACGCGTCGTCTGAACTCATCTCTTACGGCAAGGTAAGCTGGTT
CAACTAGCCTCGTGAAGACCGCTCCAGAGTCAAAGATGGTGCCAGCTCCTGTGGCCGGAT
CAAAGGCGAGTGCACTTGTAGGAATATCCACAATCTTATTCCCGACACGAATCCCGACCA
AGTTAACATAATAAAGAGAGGACCTCCTAGGGTTCTTCAACAATGGAGTTGTCTTGATCC
TAAGTGGTTGAAACTTAGGTCCCAATCTCAACGATCCCGAGAAGTTGCTGGACTTACTAT
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ATGGACCACGACCTAAACCCATGAG

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DS 

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AACGCGATAGATAGATAGTACAAAAACACAACCACGCTTATATTTTAATTAGGTGCATGT
TTCACGGGAAATGCCGAGCCTGGAATTGGGTACGTCGATGAGGACACGGTGGTTCTGCTG
CTGCATACTAGCGATAACGTTAAGGACAGAGTTTACGTTGTTCGGAGCTGCGGCCATGGC
GAGGCAACTGGTGTTGCCGGAGGAGCTGTGGATGAGAAGATTGTCCGGAGGCAGAGTCAC
GTTCATTCCCGCAAACATAAACGTGACAGGTGGGAAGACAACAGAGCCGGAGTAGCAAGT
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TACGGCAAGGTAAGCTGGTTCAACTAGCCTCGTGAAGACCGTTCCAGAGTCAAAGATGGT
GCCAGCTCCTGTGGCCGGATCAAAGGCGAGTGCACTTGTAGGAATATCCACAATCTTATT
CCCGACACGAATCCCGACCAAGTTAACATAATAAAGAGAGGACCTCCTAGGGTTCTTCAA
CAATGGAGTTGTCTTGATCCTAAGTGGTTGAAACTTAGGTCCCAATCTCAACGATCCCGA
GAAGTTGCTGGACTTACTATTAGGCAAGCAATACGAGAACGTGGACATATAAAGACTTTG
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GATGTCCAGTGGCTTGGTTGTGCAACAAAAGTGTAGTTTGGGATGACGTCATTGGCTAGT
GTAGTGTATCTGTGTCAGAGATGCTGTGA

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DS 



AS 1 8

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AGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTCCCTCAAGGGCTTCTTCA
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TGAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCGGAGGTTAAGAAGCTTAA*GGGTGTGCTTGGAG
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TCAAGTTCGTCTGCCATTCTGATTTTTATTTTAATGGTTTCTGTGTTGTTATTGATTTCA
GTGCTTCATTTATAATCACTTTGGCTTGAACTAAGGAATAAACATTCCATTGCAGACGCC


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GG
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QA 3 722 3 722
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C

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DS 

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TCAGCTTAACTCTGGGAAGGGTCCTGCATTGGCTTTTGTTGCTTTTGGAAGCTCCTCTCC
GGGGCTCCAGATTCTATCGTTTGCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACTTGTTGA
AGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCGGAGGTTAAGAAGCTTAA*GGGTGTGCTTGGAGGAA
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*GTTCGTCTGCCATTCTGATTTTTATTTTAATGGTTTCTGTGTTGTTATTGATTTCAGTG
CTTCATTTATA*TCACTTTGGCTTGA

QA 1 806 1 806
DS 

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GG
ATAACTTCACTCTCTAATAATCTATAAGAAAATGAAAATGATAATCCATATTTTCTTCAC
CCTTTCCTTCGTTTCATCCATATCTTTTGCCTCAGTTCAAGACTTTTGTGTAGCTGATCC
AAAGGGTCCCCAAAGCCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCAGGTCACCGAGAA
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AGTGACTCCGGCCTTTGCTCCTGCGTTCGCAGGCACCAATGGACTTGGCGTCTCAATGGC
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AGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTATCTCCTCTGCTAACAAAGT
TTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTGATTCTATGGTGTTCCCTCAAGGGCTTCTTCATTT
TCAGCTTAACTCTGGGAAGGGTCCTGCATTGGCTTTTGTTGCTTTTGGAAGCTCCTCTCC
GGGGCTCCAGATTCTATCGTTTGCTTTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACTTGTTGA
AGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCGGAGGTTAAGAAGCTTAA*GGGTGTGCTTGGAGGAA
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AGTTCGTCTGCCATTCTGATTTTA**TTTAATGGTTTCTGTGTTGTTATTGATTTCAGTG
CTTCATTTATAATCACTTT

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DS 

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ATC
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TACTCTTGCAAGAACCCTGACCAGGTCACCGAGAATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGC
AAAGCTGGAAACACTTCCAACATCATTAAAGCTGCAGTGACTCCGGCCTTTGCTCCTGCG
TTCGCAGGCACCAATGGACTTGGCGTCTCAATGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGT
GTCATCCCTCTTCACACTCATCCCGGTGCTTCGGAAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACC
ATTTGCGCTGGATTTATCTCCTCTGCTAACAAAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGT
GATTTTATGGTGTTCCCTCAAGGGCTTCTTCATTTTCAGCTTAACTCTGGGAAGGGTCCT
GCATTGGCTTTTGTTGCTTTTGGAAGCTCCTCTCCGGGGCTCCAGATTCTATCGTTTGCT
TTGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACTTGTTGAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCG
GAGGTTAAGAAGCTTAA*GGGTGTGCTTGGAGGAACTAATTAAGCTTCTCTTTTGTTTTC
AAAGTTTTCTTGTGTGTTTTATCTCTTTAAATTCAAGTTCGTCTGCCATTCTGATTTTTA
TTTTAATGGTTTCTGTGTTGTTATTGATTTCAGTGCTTCATTTATAATCACTTTGGCTTG
AACTAAGGAATAAACATTCCATTGCAGACGCC

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DS 

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G
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ACTTGGCGTCTCAATGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTGTCATTCCTCTTCACAC
TCATCCCGGTGCTTCGGAAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCATTTGCGCTGGATTTAT
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TCAAGGGCTTCTTCGTTTTCAGCTTAACTCTGGGAAGGGTCCTGCATTGGCTTTTGTTGC
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GCCTTCAGAACTTGTTGAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCGGAGGTTAAGAAGCTTAA
*GGGTGTGCTTGGAGGAACTAATTAAGCTTCTCTTTTGTTTTCAAAGTTTTCTTGTGTGT
TTTATCTCTTTAAATTCAAGTTCGTCTGCCATTCTGATTTTTATTTTAATGGTTTCTGTG
TTGTTATTGATTTCAGTGCTTCATTTATAATCACTTTGGCTTGA

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DS 

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TTGCCTCAGTTCAAGACTTTTGTGTAGCTGATCCAAAGGGTCCCCAAAGCCCATCAGGAT
ACTCTTGCAAGAACCCTGACCAGGTCACCGAGAATGACTTCGCATTCTCTGGTCTAGGCA
AAGCTGGAAACACTTCCAACATCATTAAAGCTGCAGTGACTCCGGCCTTTGCTCCTGCGT
TCGCAGGCACCAATGGACTTGGCGTCTCAATGGCTCGTCTTGACTTAGCCAGCGGTGGTG
TCATTCCTCTTCACACTCATCCCGGTGCTTCGGAAGTTCTTGTAGTCGTACAAGGAACCA
TTTGCGCTGGATTTATCTCCTCTGCTAACAAAGTTTACTTGAAGACTCTCGAGAAAGGTG
ATTTTATGGTGTTCCCTCAAGGGCTTCTTCATTTTCAGCTTAACTCTGGGAAGGGTCCTG
CATTGGCTTTTGTTGCTTTTGGAAGCTCCTCTCCGGGGCTCCAGATTCTATCGTTTGCTT
TGTTTGCAAATGACTTGCCTTCAGAACTTGTTGAAGCCACTACGTTCCTTAGCGATGCGG
AGGTTAAGAAGCTTAA*GGGTGTGCTTGGAGGAACTAATTAAGCTTCTCTTTTGTTTTCA
AAGTTTTCTTGTGTGTTTTATCTCTTTAAATTCAAGTTCGTCTGCCATTCTGATTTTTAT
TTTAATGGTTTCTGTGTTGTTATTGATTTCAGTGCTTCATTTATAATCACTTTGGCT
CG

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 8

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CCATACTCTTCATCTCTCTCCCATCTTCTCACAGCTCCTCCTCAAATGACAAGATTGCCC
TCCTCGAAATCAAGAAAGCCTTAAACAACCCTCCACTCCTCTCCTCCTGGAACCCACAAA
CCGACTTCTGCACCACCTGGACTGGCGTCGAGTGCACCAACGGCCGCGTCACCGCCCTCA
CCATCTCCTCCGGCGAAATTTCCGGCCAGATCCCTGCTCAGATCGGCGACCTCCTTGAGC
TCCGTACGCTTGACTTCAGTTACTTGACTCATCTCACTGGGAACATTCCACACACTATCA
CCAAACTCAAGTACCTGGACCTCCTCCGGTTAAAGGAGACCAATCTCTCTGGTTCAATTC
CTGATTTCGTCAGCGAGCTCAAGAGCGTTACGTTCTTAGACCTTTCCTTTAACCAGTTTA
CCGGTCCAATTCCCGGTTCGATTTCTCAGATACCGAAGCTAGGAGCCCTTCAGATCAACG
ATAATAAGTTAACCGGTTCTATACCAGACTCTTTCGGTTCTTTTGTAGGCACCGTTCCTA
ATCTCTACCTGTTTAACAATAAGCTCTCAGGAAAAGTACCGGAATCGTTGTCAAAGTACG
ACTTTAACGCAGTGGATCTGTCGGGAAACGGCTTCACAGGAGATGG*TTCGATGTTTTTC
GGACGTAACAAAACAACAATACGTGTGAATCTATCCAGGAACATGTTTGAGTTCGATCTC
GCCAAGGTTAAGTTTGCTAGGAGCATAGTGTCGTTGGATCTGAGCCATAACAAAATCTTC
GGGAAGTTTCCTAGGGAGCTGAGTAAGCTGCGTCTCGAGCATTTCGACGTTAGTTACAAT
CATCTATGCGGAAAAATCCCACGTGGTGGTCTCCTTCAGACATTTGAACCATCTGCTTTC
TCTCACAACCTCTGTCTTTGTGGGACCCCACTTAAGGCTTGTTGATTTGGTTTAATGGCG
TGAGAAGAAATAAGTAGCAGTATGTCTTTTATCTGTACGATGATGTTGTGTTAATTATCA
CGCCACCTATCAAAAGCGAATTGTTCTATTAAATAATGAATGTTAAGAGTTTGGTAAGAA
TGTTGTTGAGATATTCAAAGTGTACTCTCTAGACAATGATAAATTACCACATAAACAATG
AT


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 0 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 
25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1AN20TF U 1
AF RS1A775TF U 1
AF RS1BN15TF U 60
AF RS1EO08TF U 2
AF RS1A775JQ C 298
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AF RS1EO08JQ C 394
AF RS1AN20JQ C 429
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RD RS1AN20TF 835 0 0
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CCATACTCTTCATCTCTCTCCCATCTTCTCACAGCTCCTCCTCGAATGACAAGATTGCCC
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CCGACTTCTGCACCACCTGGACTGGCGTCGAGTGCACCAACGGCCGCGTCACCGCCCTCA
CCATCTCCTCCGGCGAAATTTCCGGCCAGATCCCTGCTCAGATCGGCGACCTCCTTGAGC
TCCGTATGCTTGACTTCAGTTACTTGACTCATCTCACTGGGAACATTCCACACACTATCA
CCAAACTCAAGTACCTGGACCTCCTCCGGTTAAAGGAGACCAATCTCTCTGGTTCAATTC
CTGATTTCGTCAGCGAGCTCAAGAGCGTTACGTTCTTAGACCTTTCCTTTAACCAGTTTA
CCGGTCCAATTCCCGGTTCGATTTCTCAGATGCCGAAGCTAGGAGCCCTTCAGATCAACG
ATAATAAGTTAACCGGTTCTATACCAGACTCTTTCGGTTCTTTTGTAGGCACCGTTCCTA
ATCTCTACCTGTTTAACAATAAGCTCTCAGGAAAAGTACCGGAATCGTTGTCAAAGTACG
ACTTTAACGCAGTGGATCTGTCGGGAAACGGCTTCACAGGAGATGGGTTCGATGTTTTTC
GGACGTGACAAA*CAACAATACGTGTGAATCTATCCAGGAATATGTTTGAGTTCGATCCC
GCCAAGGTTAAGTTTGCTAGGAGCATAGTGTCGTTGGATCTGAGCCATA
CAAATC

QA 1 829 1 829
DS 

RD RS1A775TF 781 0 0
GGAGG
ACACAACCACTCAGAATCACAATGAAGTTCCTTCTTCATCTCTCTGTCTTGTTGTCCATA
CTCTTCATCTCTCTCCCATCTTCTCACAGCTCCTCCTCAAATGACAAGATTGCCCTCCTC
GAAATCAAGAAAGCCTTAAACAACCCTCCACTCCTCTCCTCCTGGAACCCACAAACCGAC
TTCTGCATCACCTGGACTGGCGTCGAGTGCACCAACGGCCGTGTCACCGCCCTCACCATC
TCCTCCGGCGAAATTTCCGGCCAGATCCCTGCTCAGATCGGCGACCTCCTTGAGCTCCGT
ACGCTTGACTTCT*TTACTTGACTCATCTCACTGGGAACATTCCACACACTATCACCAAA
CTCAAGTACCTGGACCTCCTCCGGTTAAAGGAGACCAATCTCTCTGGTTCAATTCCTGAT
TTCGTCAGCGAGCTCAAGAGCGTTACGTTCTTAGACCTTTCCTTTAACCAGTTTACCGGT
CCAATTCCCAGTTCGATTTCTCAGATACCGAAGCTAGGAGCCCTTCAGATCAACGATAAT
AAGTTAACCGGTTCTATACCAGACTCTTTCGGTTCTTTTGTAGGCACCGTTCCTAATCTC
TACCTGTTTAACAATAAGCTCTCAGGAAAAGTACCGGAATCGTTGTCAAAGTACGACTTT
AACGCAGTGGACCTGTCGGGAAACGGCTTCACAGGAGATGG*TTCGATGTTTTTCGGACG
TAACAAAACAACAATACGTGTGAATCTATCCAGGAACATGTTTGAGTTCGATCTCG

QA 6 781 6 781
DS 

RD RS1BN15TF 722 0 0
TCCATACTCTTCATCTCTCTCCCATCTTCTCACAGCTCCTCCTCAAATGACAAGATTGCC
CTCCTCGAAATCAAGAAAGCCTTAAACAACCCTCCACTCCTCTCCTCCTGGAACCCACAA
ACCGACTTCTGCACCACCTGGACTGGCGTCGAGTGCACCAACGGCCGTGTCACCGCCCTC
ACCATCTCCTCCGGCGAAATTTCCGGCCAGATCCCTGCTCAGATCGGCGACCTCCTTGAG
CTCCGTACGCTTGACTTCAGTTACTTGACTCATCTCACTGGGAACATTCCACACACTATC
ACCAAACTCAAGTACCTGGACCTCCTCCGGTTAAAGGAGACCAATCTCTCTGGTTCAATT
CCTGATTTCGTCAGCGAGCTCAAGAGCGTTACGTTCTTAGACCTTTCCTTTAACCAGTTT
ACCGGTCCAATTCCCGGTTCGATTTCTCAGATACCGAAGCTAGGAGCCCTTCAGATCAAC
GATAATAAGTTAACCGGTTCTATACCAGACTCTTTCGGTTCTTTTGTAGGCACCGTTCCT
AATCTCTACCTGTTTAACAATAAGCTCTCAGGAAAAGTACCGGAATCGTTGTCAAAGTAC
GACTTTAACGCAGTGGATCTGTCGGGAAACGGCTTCACAGGAGATGG*TTCGATGTTTTT
CGGACGTAACAAAACAACAATACGTGTGAATCTATCCAGGAACATGTTTGATTTCGATCT
CG

QA 1 722 1 722
DS 

RD RS1EO08TF 780 0 0
GAGA
ACACAGCCACTCAAAATCACAATGAAGTTCCTTCTTCATCTCTCTGTCTTCTTCTCCATA
CTCTTCATCTCTCTCCCATCTTCTCACAGCTCCTCCTCGAATGACAAGATTGCCCTCCTC
GAAATCAAGAAAGCCTTAAACAACCCTCCACTCCTCTCCTCCTGGAACCCACAAACCGAC
TTCTGCACCACCTGGACTGGCGTCGAGTGCACCAACGGCCGCGTCACCGCCCTCACCATC
TCCTCCGGCGAAATTTCCGGCCAGATCCCTGCTCAGATCGGCGACCTCCTTGAGCTCCGT
ACGCTTGACTTCAGTTACTTGACTCATCTCACTGGGAACATTCCACACACTATCACCAAA
CTCAAGTACCTGGACCTCCTCCGGTTAAAGGAGACCAATCTCTCTGGTTCAATTCCTGAT
TTCGTCAGCGAGCTCAAGAGCGTTACGTTCTTAGACCTTTCCTTTAACCAGTTTACCGGT
CCAATTCCCGGTTCGATTTCTCAGATGCCGAAGCTAGGAACCCTTCAGATCAACGATAAT
AAGTTAACCGGTTCTATACCAGACTCTTTCGGTTCTTTTGTAGGCACCGTTCCTAATCTC
TACCTGTTTAACAATAAGCTCTCAGGAAAAGTACCGGAATCGTTGTCAAAGTACGACTTT
AACGCAGTGGATCTGTCGGGAAACGGCTTCACAGGAGATGG*TTCGATGTTTTTCGGACG
TAACAAA*CAACAATACGTGTGAATCTATCCAGGAATATGTTTGAGTTCGATCTCG

QA 5 780 5 780
DS 

RD RS1A775JQ 814 0 0
AGCTCCGTACGCTTGACTTCT*TTACTTGACTCATCTCACTGGGAACATTCCACACACTA
TCACCAAACTCAAGTACCTGGACCTCCTCCGGTTAAAGGAGACCAATCTCTCTGGTTCAA
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T

QA 1 813 1 813
DS 

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TTCAG
TACTTGACTCATCTCACTGGGAACATTCCACACACTATCACCAAACTCAAGTACCTGGAC
CTCCTCCGGTTAAAGGAGACCAATCTCTCTGGTTCAATTCCTGATTTCGTCAGCGAGCTC
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GAGTAAGCTGCGTCTCGAGCATTTCGACGTTAGTTACAATCATCTATGCGGAAAAATCCC
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TTGTTCTATTTAATAATGAATGTTAAGAGTTTGG
T

QA 6 819 6 819
DS 

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AGGAGACCAATCTCTCTGGTTCAATTCCTGATTTCGTCAGCGAGCTCAAGAGCGTTACGT
TCTTAGACCTTTCCTTTAACCAGTTTACCGGTCCAATTCCCGGTTCGATTTCTCAGATGC
CGAAGCTAGGAACCCTTCAGATCAACGATAATAAGTTAACCGGTTCTATACCAGACTCTT
TCGGTTCTTTTGTAGGCACCGTTCCTAATCTCTACCTGTTTAACAATAAGCTCTCAGGAA
AAGTACCGGAATCGTTGTCAAAGTACGACTTTAACGCAGTGGATCTGTCGGGAAACGGCT
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CTCGAGCATTTCGACGTTAGTTACAATCATCTATGCGGAAAAATCCCACGTGGTGGTCTC
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AAGGCTTGTTGATTTGGTTTAATGGCGTGAGAAGAAATAAGTAGCAGTATGTCTTTTATC
TGTACGATGATGTTGTGTTAATTATCACGCCACCTATCGAAAGCGAATTGTTCTATTAAA
TAATGAATGTTAAGAGTTTGG
CT

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1AN20JQ 774 0 0
GTCAGCGAGCTCAAGAGCGTTACGTTCTTAGACCTTTCCTTTAACCAGTTTACCGGTCCA
ATTCCCGGTTCGATTTCTCAGATGCCGAAGCTAGGAGCCCTTCAGATCAACGATAATAAG
TTAACCGGTTCTATACCAGACTCTTTCGGTTCTTTTGTAGGCACCGTTCCTAATCTCTAC
CTGTTTAACAATAAGCTCTCAGGAAAAGTACCGGAATCGTTGTCAAAGTACGACTTTAAC
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TAAGTTTGCTAGGAGCATAGTGTCGTTGGATTTGAGCCATAACAAAATCTTCGGGAAGTT
TCCTAGGGAGCTGAGTAAGCTGCGTCTCGAGCATTTCGACGTTAGTTACAATCATCTATG
CGGAAAAATCCCACGTGGTGGTCTCCTTCAGACATTTGAACCATCTGCTTTCTCTCACAA
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ATCGAAAGCGAATTGTTCTATTAAATAATGAATGTTAAGAGTTTGGTAAGAATGTTGTTG
AGATATTCAAAGTGTACTCTCTAGACAATGATAAATTACCACATAAACAATGAT

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 8

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CTCGACCAAAGGCCGGGGACACGTGGCGTCTTGTCGGATTTGACGTGTGACAGCGATGGG
AAGATTGATAAGTTCATAGGCGGCGAGTCTAGCTTGCCGTTGCATGAGCTAGAGAGCGAT
GGAGGGAGGTACTTCTTGGGAATGTTTCTTGGAGGGGCTTACGAGGAGGCGCTAGGTGGA
GTGCACAACTTGTTTGGTGGGCCGAGCGTTGTACGTGTCTTGCAGAGTGATGGGCCTCAT
GGCTTTGCTGTGACACGAGCCGTGCCTGGTCAGTCCTCTGCTGATGTTCTTCGTGGGATG
CAGCATGAGCCTGAGATGATGTTTCAGACGTTGAAGCACCGAGCAGAGGAGGTTATGCAT
CATACCAAAGGTGGTGAAGAAGAAGAAGATGATGAGGATGAAGCTGAGTTCGGTAATGTC
GCGACTTGTCTTGACCGTTCGTTTCATAACATGCCGTATCTAGCGACCGAGGAGGTGTCT
ATGAGTAACTCTCTTTCGGCTGCGGTCAGTAACCTTGGCTTTTACTATTGCGATGAAGAT
GACTACCTCTCTGCATGAGGAAAGGTGGTTTGTTGTTTGCAGTCTTGTGTTATCGTATGT
TTCTTTTAATAAAGTAGTAAAATAATCACAATGATGAGATTCATCGTTGTTTAATGTTGT
TTTTTTATTTTAATTAGAGGATCCGAATGATGAAAGTACTTTTGTGAAATTCGGATCTTT
GTACTATGTTATTTGATGTTTGAAATGTAACGTTCTTGTTTCATTTATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 10 10 10 10 10 

AF RS1DA58TF U 78
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AF RS1BI65TF U 78
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AF RS1BI65JQ C 78
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TAAAATA
CTCTTTTTTTTTACTTC

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G

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GTGCACAACTTGTTTGGTGGGCCGAGCGTTGTACGTGTCTTGCAGAGTGATGGGCCTCAT
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GCGACTTGTCTTGACCGTTCGTTTCATAACATGCCGTATCTAGCGACCGAGGAGGTGTCT
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DS 

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GGGAATGTTTCTTGGAGGGGCTTACGAGGAGGCGCTAGGTGGAGTGCACAACTTGTTTGG
TGGGCCGAGCGTTGTACGTGTCTTGCAGAGTGATGGGCCTCATGGCTTTGCTGTGACACG
AGCCGTGCCTGGTCAGTCCTTTGCTGATGTTTTTCGTGGGATGCAGCATGAGCCTGAGAT
GATGTTTCAGACGTTGAAGCACCGAGCAGAGGAGGTTATGCATCATACCAAAGGTGGTGA
AGAAGAAGAAGATGATGAGGATGAAGCTGAGTTCGGTAATGTCGCGACTTGTCTTGACCG
TTCGTTTCATAACATGCCGTATCTAGCGACCGAGGAGGTGTCTATGAGTAACTCTCTTTC
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TAAAATAATCACAATGATGAGATTCATCGTTGTTTAATGTTGTTTTTTTATTTTAATTAG
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GTTTGAAATGTAACGTTCTTGTTTCATTTATTG

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DS 

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G
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GGTGGTCTGTTGTTTGCAGTCTTGTGTTATCGTATGTTTCTTTTAATAAAGTAGTAAAAT
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CGAATGATGAAAGTACTTTTGTGAAATTCGGATCTTTGTACTATGTTATTTGATGCTTGA
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T

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DS 

RD RS1DD27TF 264 0 0
G
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AATCACAATGATGAGATTCATCGTTGTTTAATGTTGTTTTTTTATTTTAATTAGAGGATC
CGAATGATGAAAGTACTTTTGTGAAATTCGGATCTTTGTACTATGTTATTTGATGCTTGA
AATGTAACGTTCTTGTTTCATT
T

QA 2 263 2 263
DS 

RD RS1FH75TF 748 0 0
GACACGTGGCGTCTTGTCGGATTTGACGTGTGACAGCGATGGGAAGATTGATAAGTTCAT
AGGCGGCGAGTCTAGCTTGCCGTTGCATGAGCTAGAGAGCGATGGAGGGAGGTACTTCTT
GGGAATGTTTCTTGGAGGGGCTTACGAGGAGGCGCTAGGTGGAGTGCACAACTTGTTTGG
TGGGCCGAGCGTTGTACGTGTCTTGCAGAGTGATGGGCCTCATGGCTTTGCTGTGACACG
AGCCGTGCCTGGTCAGTCCTCTGCTGATGTTCTTCGTGGGATGCAGCATGAGCCTGAGAT
GATGTTTCAGACGTTGAAGCACCGAGCAGAGGAGGTTATGCATCATACCAAAGGTGGTGA
AGAAGAAGAAGATGATGAGGATGAAGCTGAGTTCGGTAATGTCGCGACTTGTCCTGACCG
TTCGTTTCATAACATGCCGTATCTAGCGACCGAGGAGGTGTCTATGAGTAACTCTCTTTC
GGCTGCGGTCAGTAACCTTGGCTTTTACTATTGCGATGAAGATGACTACCTCTCTGCATG
AGGAAAGGTGGTTTGTTGTTTGCAGTCTTGTGTTATCGTATGTTTCTTTTAATAAAGTAG
TAAAATAATCACAATGATGAGATTCATCGTTGTTTAATGTTGTTTTTTTATTTTAATTAG
AGGATCCGAATGATGAAAGTACTTTTGTGAAATTCGGATCTTTGTACTATGTTATTTGAT
GTTTGAAATGTAACGTTCTTGTTTCATT

QA 1 748 1 748
DS 



AS 2 7

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ATGTGTTCGTGGGTTCGGTTACAAGACCACAGGAGGCAAACGCGGTCGTATCTACGTGGT
CACAAGCAACAGAGACGATGACACGGTGAACCCTAGACCCGGAACACTGCGTCACGCTGT
GATTCAGAACGAACCGCTGTGGATCATTTTCAAGCACGATATGAGCATTAGGTTGAGCCA
AGAGCTGATGATTAATAGTCACAAGACGATCGATGCTCGTGGCACTAACGTGCACATCGC
ATATGGTGCTGGGATCACGATGCAGTACGTGCAAAATATCGTCATCCATGGGCTTCACGT
CCATCACATCGTCCAGGGCCGTGGTGGTATGATACGAAACTCTAATGACCACTTTGGGTT
TAGAGGAGAGGCCGATGGAGATGGTATCTCCATCTTTGGAGCAACAAACATTTGGCTTGA
CCACATTTCTATGTCTAAATGCCAAGATGGTCTTATCGACGCTATAATGGGCTCCACCGG
GATCACTATCTCTAACTCTCATTTCACCCACCACAACGATGTGATGTTGCTTGGTGCACA
AAATGACAACCACGCGGACAAGAAGATGCAAGTCACTGTGGCTTTCAACCACTTTGGTAA
AGGACTTGTGCAGAGGATGCCGAGGATTCGGTTTGGTTTCGTTCATGTTGTCAACAATGA
CTACACTCATTGGGAGCTTTACGCTATCGGGGGCAGCCAAGGTCCTACCATTTTCAGCCA
CGGAAACCGTTTCATTGCTCCTCCTCACCTACAACATTACAGAGAGGTGACAAAGAGGGA
TTCTGCTCCTGAATCGGAGTGGAAAAACTGGAATTGGAGATCCGAGAAAGACATTTTCAT
GAACAATGCATATTTCAGACAATCTGGAAACCCAAAGTTCAAGTGTTCACACTCTAGACA
ACAGATGATAAAGCCCAAACACGGTGTTGCCGTTTCAAAGCTTACCAAATACGCCGGAGC
ATTGGATTGCCGGGTCGGAAAACCACGCTAATTAAACAATATTACTCACTACTACTTCTA
TATTTTTTTTCGCTCTTGTATCTAGGCCAAAATATTTTTAAGAAAATCAAGGATTAAAAA
TTTGAAACAATTCTAATTTATGAAGATTTTTGGTGTAAAAAAGGAATGCAAATGGCTGGA
TACTTTGTAACTCTATTCTGTTTCTGTATTACATTAATTTGTTGTTGTGC


BQ
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AAATGACAACC

QA 1 731 1 731
DS 

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AAATTTGAAACAATTCTAATTTATGAAGATTTTTGGTGTAAAAAAGGAATGCAAATGGCT
GGATACTTTGTAACTCTATTCTGTTTCTGTATTACATTAATTTGTTGTTGTGC

QA 1 713 1 713
DS 



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CCGCTATGGATCATTCTCAAGCACGATATGAGCATTAGGTTGAGCCAAGAGCTAATGATT
AATAGTCGCAAGACGATTGATGCTCGTGGCACTAACGTGCACATCGCATATGGTGCTGGG
ATCACGATGCAGTACGTGCAAAATATCATCATCCATGGTCTTCACGTGCATCACATCGTC
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TCTAAATGCCAAGATGGTCTCATCGACGCTATAATGGGCTCCACCGGGATCACTATCTCT
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GCGGACAAGAAGATGCAAGTCACTGTGGCTTTCAACCACTTTGGTAAAGGACTTGTGCAG
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GAGCTTTACGCTATCGGCGGTAGCCAAAGTCCTACCATTCTCAGCCACGGAAACCGTTTC
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TTCAGACAATCTGGAAATCCAAGGTTCATGAGTTCACACTCTAGACAACAGATGATAAAG
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ATGAACCAAAAAATATTAATGGGGTAAAAATGAAAATAAGTATAATTTATGAGGTTCTTT
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ATTTTGCG


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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GH33TF U 1
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BS 464 529 RS1GH33TF
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BS 734 734 RS1EG46TF
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AATAGTCGCAAGACGATTGATGCTCGTGGCACTAACGTGCACATCGCATATGGTGCTGGG
ATCACGATGCAGTACGTGCAAAATATCATCATCCATGGGCTTCACGTGCATCACATCGTC
CCCGGCAGTGGTGGCATGATAAGAAACTCTAATGACCACTTTGGGTTTAGAGGACAGGCC
GATGGAGATGGTATCTCTATCTTTGGAGCAACAAACATTTGGCTTGACCACATTTCTATG
TCTAAATGCCAAGATGGTCTCATCGACGCTATAATGGGCTCCACCGGGATCACTATCTCT
AACTCTCATTTCACCCACCACAACGATGTGATGTTGCTTGGTACACAAAATGACAACCAA
GCGGACAAGAAGATGCAAGTCACTGTGGCTTTCAACCACTTTGGTAAAG*ACTTGTGCAG
A

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DS 

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G
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GCAGTACGTGCAAAATATCATCATCCATGGTCTTCACGTGCATCACATCGTCCCCGGCAG
TGGTGGCATGATAAGAAACTCTAATGACCACTTTGGGTTTAGAGGACAGGCCGATGGAGA
TTGTATCTCTATCTTTGGAGCAACAAACATTTGGCTTGACCACATTTCTATGTCTAAATG
CCAAGATGGTCTCATCGACGCTATAATGGGCTCCACCGGGATCACTATCTCTAACTCTCA
TTTCACCCACCACAACGATGTGATGTTGCTTGGTGCACAAAATGACAACCAAGCGGACAA
GAAGATGCAAGTCACTGTGGCTTTCAACCACTTTGGTAAAGGACTTGTGCAGAGGATGCC
GAGGATTCGGTGGGGTTTCGTCCATGTTGTCAACAATGACTACACTCACTGGGAGCTTTA
CGCTATCGGCGGTAGCCAAAGTCCTACCATTCTCAGCCACGGAAACCGTTTCATCGCTCC
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GAAAA*TTGGAATTGGAGATCCGACAAAGACATTTTCATGAACAATGCATATTTCAGACA
ATCTGGAAATC

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ATGTTGCTTGGTGCACAAAATGACAACCAAGCGGACAAGAAGATGCAAGTCACTGTGGCT
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CCTACCATTTTCAGCCACGGAAACCGTTTCATCGCTCCTCCTCACATACAACATTACAGA
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GACAAAGACATTTTCATGAACAATGCATATTTCAGACAATCTGGAAATCCAAGGTTCATG
AGTTCACACTCTAGACAACAGATGATAAAGCCCAAACACGGTTCGGCCGTTTCAAAGCTT
ACCAAATACGCCGGAGCATTGGATTGCCGGGTCGGAAAACCATGCTAAACCATATTAATC
ACTACTACTTTTCTCTCTTGTATCTAGGCCATGAACCAAAAAATATTAATGGGGTAAAAA
TGAAAATAAGTATAATTTATGAGGTT
CTTTCTGT

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DS 

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GGG
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TGGCTTGACCACATTTCTATGTCTAAATGCCAAGATGGTCTCATCGACGCTATAATGGGC
TCCACCGGGATCACTATCTCTAACTCTCATTTCACCCACCACAACGATGTGATGTTGCTT
GGTGCACAAAATGACAACCAAGCGGACAAGAAGATGCAAGTCACTGTGGCTTTCAACCAC
TTTGGTAAAGGACTTGTGCAGAGGATGCCGAGGATTCGGTGGGGTTTCGTCCATGTTGTC
AACAATGACTACACTCACTGGGAGCTTTACGCTATCGGCGGTAGCCAAAGTCCTACCATT
CTCAGCCACGGAAACCGTTTCATCGCTCCTCCTCACATACAACATTACAGAGAGGTGACA
AAGAGGGATTATGCTCCAGAATCGGAGTGGAAAAATTGGAATTGGAGATCCGACAAAGAC
ATTTTCATGAACAATGCATATTTCAGACAATCTGGAAATCCAAGGTTCATGAGTTCACAC
TCTAGACAACAGATGATAAAGCCCAAACACGGTTCGGCCGTTTCAAAGCTTACCAAATAC
GCCGGAGCATTGGATTGCCGGGTCGGAAAACCATGCTAA*CCATATTAATCACTACTACT
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GTATAATTTATGAGGTT
CTTTCTGTA

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DS 

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AATGACAACCAAGCGGACAAGAAGATGCAAGTCACTGTGGCTTTCAACCACTTTGGTAAA
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TACACTCACTGGGAGCTTTACGCTATCGGCGGTAGCCAAAGTCCTACCATTCTCAGCCAC
GGAAACCGTTTCATCGCTCCTCCTCACATACAACATTACAGAGAGGTGACAAAGAGGGAT
TATGCTCCAGAATCGGAGTGGAAAAATTGGAATTGGAGATCCGACAAAGACATTTTCATG
AACAATGCATATTTCAGACAATCTGGAAATCCAAGGTTCATGAGTTCACACTCTAGACAA
CAGATGATAAAGCCCAAACACGGTTCGGCCGTTTCAAAGCTTACCAAATACGCCGGAGCA
TTGGATTGCCGGGTCGGAAAACCATGCTAAACCATATTAATCACTACTACTTTTCTCTCT
TGTATTTAGGCCATGAACCAAAAAATATTAATGGGGTAAAAATGAAAATAAGTATAATTT
ATGAGGTTCTTTCTGTAAGGATACGTTGTAATTCTATTTTGTTTCTGTATTCATTTGTTG
TTTTGTATGTTTATTTTGCG

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 5

CO CL704Contig1 1167 5 7 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGAAGATTATTC
CCCACTCTCTCTCTCTATCTCTCTCTCTCTCTCTCCGACAGCCCCCCTTCGTGTCTACCT
GTTGAAAAGAATGGCGGACAAACCAAGCAGAGCACTTGTATTGTACGGAGACGGCTTGGC
TAGATCCGTCGACCCGTCGAATACTAACATCCATTCTCTCGCTTCCGTCGGTACCTGCGG
CTTCTTGAGCCTTCCTCATGCGCCTCCAGCAGAAACAGAGAACGAAAGAATAGTTCGAGA
ATTTTCCCATTTGCTTGATGCATCAGAAGCTTATGCTATAGCTAGTGGGTTAAAAACTAA
GGGAAGTGAAAATGATATCTCAACTTTGTCCGAAAGGTTTATGGGACTCAAGGCTGCTTT
AGTAACGGACACTTCCTCTCTGACATCTTTCGGAAAACTGATTGGCTTAGACGTGTTACA
ACTCAGTGAAATATCCCAAAAGAGTGATGATGATTCCTTTCCTTCTGATGCCACAGCAAC
TGAATTACTGAATCTGCTTGGCTTCGAAGGAGGAAAGTGCTTGGATGTGAGCCTATACGA
CTCCGTTTTCGTGCACATAGGTGGTGGTGATAACGTGGGAATGATCGACTCTTTGATTGG
TAGTGTTATGAGAATGGCTCAGCCTGGTTCAGAGATTGTACCTCGCTTGCATCTCTCGCT
TGTTCTCAGCTACGGTTCCGTCACGGACAAAGATGTCTCAGTTTTTTCTGTCGAGACTCC
ACAAGAAGGTGTTAACCCGGCGTTTCAAGGACTAGTCCCGCGTCAGAGCTACACTATGCG
TGGTGAAAAGACACGAGACGATGTTCGGGACTACTGCCCTATGTTGGTAGCTCAGTGGCA
GGATGCAGTGACACGGAAAGACTTGGTTGATACATTATCTTTCGAAGCTCTAAAAAAGCT
CTCTGGAAACCTTGTTATACCGGCTGATCGGTTCATCCACGAAGTTGCTTTCAAACTTTG
GAAGGCCCCAAAATACGGAGCTTGAGAAAATAAAACGGTATTTTTATTGTAATCATCCAA
GTCGTGATGAATAACAAGCTCTTTCCACTGTTTGTTGTTGATTGTGGATTGATCTCAACT
TTAAATAAAAGGGAAGAAATAAAAAAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1CD51TF U 56
AF RS1A345TF U 1
AF RS1A345TV U 1
AF RS1A345JQ C 423
AF RS1A345TR C 430
BS 1 734 RS1A345TF
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RD RS1CD51TF 721 0 0
GGAGATTATTCCCCA
CTCTCTCTCTATCTCTCTCTCTCTCCGACAGCCCCCCTTCGTGTCTACCTGTTGAAAAGA
ATGGCGGACAAACCAAGCAGAGCACTTGTATTGTACGGAGACGGCTTGGCTAGATCCGTC
GACCCGTCGAATACTAACATCCATTCTCTCGCTTCCGTCGGTACCTGCGGCTTCTTGAGC
CTTCCTCATGCGCCTCCAG***AAACAGAGAACGAAAGAATAGTTCGAGAATTTTCCCAT
TTGCTTGATGCATCAGAAGCTTATACTATAGCTAGTGGGTTAAAAACTAAGGGAAGTGAA
AATGATATCTCAACTTTGTCCGAAAGGTTTATGGGACTCAAGGCTGCTTTAGTAACGGAC
ACTTCCTCTCTGACATCTTTCGGAAAACTGATTGGCTTAGACGTGTTACAACTCAGTGAA
ATATCCCAAAAGAGTGATGATGATTCCTTTCCTTCTGATGCCACAGCAACTGAATTACTG
AATCTGCTTGGCTTCGAAGGAGGAAAGTGCTTGGATGTGAGCCTATACGACTCCGTTTTC
GTGCACATAGGTGGTGGTGATAACGTGG*AATGATCGACTCTTTGATTGGTAGTGTTATG
AGAATGGCTCAGCCTGGTTCAGAGAT*GTACCTCGCTTGCATCTCTCGCTTGTTCTCAGC
TACG*TCCCGTCACGGACAG*GATGTCTCAGTTTTTTCTGTCGAGA

QA 16 721 16 721
DS 

RD RS1A345TF 857 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGAAGATTATTC
CCCACTCTCTCTCTCTATCTCTCTCTCTCTCTCTCCGACAGCCCCCCTTCGTGTCTACCT
GTTGAAAAGAATGGCGGACAAACCAAGCAGAGCACTTGTATTGTACGGAGACGGCTTGGC
TAGATCCGTCGACCCGTCGAATACTAACATCCATTCTCTCGCTTCCGTCGGTACCTGCGG
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ATTTTCCCATTTGCTTGATGCATCAGAAGCTTATGCTATAGCTAGTGGGTTAAAAACTAA
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TGAATTACTGAATCTGCTTGGCTTCGAAGGAGGAAAGTGCTTGGATGTGAGCCTATACGA
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TAGATCCGTCGACCCGTCGAATACTAACATCCATTCTCTCGCTTCCGTCGGTACCTGCGG
CTTCTTGAGCCTTCCTCATGCGCCTCCAGCAGAAACAGAGAACGAAAGAATAGTTCGAGA
ATTTTCCCATTTGCTTGATGCATCAGAAGCTTATGCTATAGCTAGTGGGTTAAAAACTAA
GGGAAGTGAAAATGATATCTCAACTTTGTCCGAAAGGTTTATGGGACTCAAGGCTGCTTT
AGTAACGGACACTTCCTCTCTGACATCTTTCGGAAAACTGATTGGCTTAGACGTGTTACA
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TGAATTACTGAATCTGCTTGGCTTCGAAGGAGGAAAGTGCTTGGATGTGAGCCTATACGA
CTCCGTTTTCGTGCACATAGGTGGTGGTGATAACGTGGGAATGATCGACTCTTTGATTGG
TAGTGTTATGAGAATGGCTCAGCCTGGTTCAGAGATTGTACCTCGCTTGCATCTCTCGCT
TGTTCTCAGCTACGGTTCCGTCACGGACAAAGATGTCTCAGTTTTTTCTGTCGAGACTCC
ACAAGAAAGTGTTAACCCGGCGTTTCAAGGACTAGTCCCGCGTCAGAGCTACACTATGCG
TGGTGAAAAGACACGAGACGATGTTCGGGACTACTGCCCTAT

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AGGCCCCAAAATACGGAGCTTGAGAAAATAAAACGGTATTTTTATTGTAATCATCCAAGT
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AAATAAAAGGGAAGAAATAAAAAAG

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CGTGCACATAGGTGGTGGTGATAACGTGGGAATGATCGACTCTTTGATTGGTAGTGTTAT
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GACACGAGACGATGTTCGGGACTACTGCCCTATGTTGGTAGCTCAGTGGCAGGATGCAGT
GACACGGAAAGACTTGGTTGATACATTATCTTTCGAAGCTCTAAAAAAGCTCTCTGGAAA
CCTTGTTATACCGGCTGATCGGTTCATCCACGAAGTTGCTTTCAAACTTTGGAAGGCCCC
AAAATACGGAGCTTGAGAAAATAAAACGGTATTTTTATTGTAATCATCCAAGTCGTGATG
AATAACAAGCTCTTTCCACTGTTTGTTGTTGATTGTGGATTGATCTCAACTTTAAATAAA
AGGGAAGAAATAAAAAAG

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DS 



AS 1 7

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GCTGTCGAGAAGCGTATCACCTCCCC*TTTGCTGGAGCCGAGCAGTGTGGAGAAGATTAT
GGAAATTGATGACCATATTGGCTGTGCCATGAGCGGCTTAATTGCTGATGCCCGCACACT
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AGAATCAATGTCTCGGCCGTTTGGAGTCTCCCTTCTCATTGCTGGTCATGATGAAAATGG
ACCGAGCTTGTACTACACGGATCCGTCTGGAACGTTCTGGCAGTGCAATGCAAAAGCGAT
TGGTTCAGGATCAGAAGGAGCTGATAGTTCTCTTCAAGAGCAATTCAACAAAGATCTGTC
ACTTGATGAAGCTGAGACGATCGCTGTATCTATCCTCAAGCAAGTTATGGAAGAAAAGGT
GACTCCAAACAATGTGGACATTGCCAAGGTAGCTCCAGCTTACCATCTCTACACTCCACA
GGAAGTTGGAGCAGTCATTAGTCGTCTTTGAGGGAGACTCTCTCAATACGGGTGATGCAT
CTAATCCGCTTTGCGTCTACTTCGAATCTTGACACCAAGTGGCTCTTTCATTTTGTCTGT
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CTCGGATTATAAAACTTCAACTATTATATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
5 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

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QA 1 605 1 605
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QA 1 707 1 707
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AATTGCTGATGCCCGCACACTTGTTGAGCATGCCAGAGTTGAGACTCATAACCACAGATT
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AATTGCTGATGCCCGCACACTTGTTGAGCATGCCAGAGTTGAGACTCAAAACCACAGATT
CTCGTATGGCGAGCCAATGACTGTAGAGTCCACTACCCAAGCGCTGTGTGATCTCGCTTT
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C

QA 1 817 1 817
DS 

RD RS1C029JQ 774 0 0
TGGGTTCTACCGCA*TTGGAGTCAAGACAAAAGAGGGAGTTGTGCTTGCCGTCGAGAAGC
GTATCACCTCCCCCTTTGCTGGAGCCGAGCAGTGTGGAGAAGATTATGGAAATTGATGAC
CATATTGGCTGTGCCATGAGCGGCTTAATTGCTGATGCCCGCACACTTGTTGAGCATGCC
AGAGTTGAGACTCATAACCACAGATTCTCGTATGGCGAGCCAATGACTGTAGAGTCCACT
ACCCAAGCGCTGTGTGATCTCGCTTTACGGTTTGGTGAAGGAGATGAAGAATCAATGTCT
CGGCCGTTTGGAGTCTCCCTTCTCATTGCTGGTCATGATGAAAATGGACCGAGCTTGTAC
TACACGGATCCGTCTGGAACGTTCTGGCAGTGCAATGCAAAAGCGATTGGTTCAGGATCA
GAAGGAGCTGATAGTTCTCTTCAAGAGCAATTCAACAAAGATCTGTCACTTGATGAAGCT
GAGACGATCGCTGTATCTATCCTCAAGCAAGTTATGGAAGAAAAGGTGACTCCAAACAAT
GTGGACATTGCCAAGGTAGCTCCAGCTTACCATCTCTACACTCCACAGGAAGTTGAAGCA
GTCATTAGTCGTCTTTGAGGGAGACTCTCTCAATACGGGTGATGCATCTAATCCGCTTTG
CGTCTACTTCGAATCTTGACACCAAGTGGCTCTTTCATTTTGTCTGTTAGAGAGACTGAT
GTTTCATGAGACAGTTTTGTTGTGTAAGAGAATTTTTCAGTACCTTTCTCGGAT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RS1CT42JQ 780 0 0
GAGTCAAGACAAAAGAGGGAGTTGTGCTTGCTGTCGAGAAGCGTATCACCTCCCC*TTTG
CTGGAGCCGAGCAGTGTGGAGAAGATTATGGAAATTGATGACCATATTGGCTGTGCCATG
AACGGCTTAATTGCTGATGCCCGCACACTTGTTGAGCATGCCAGAGTTGAGACTCAAAAC
CACAGATTCTCGTATGGCGAGCCAATGACTGTAGAGTCCACTACCCAAGCGCTGTGTGAT
CTCGCTTTACGGTTTGGTGAAGGAGATGAAGAATCAATGTCTCGGCCGTTTGGAGTCTCC
CTTCTCATTGCTGGTCATGATGAAAATGGACCGAGCTTGTACTACACGGATCCGTCTGGA
ACGTTCTGGCAGTGCAATGCAAAAGCGATTGGTTCAGGATCAGAAGGAGCTGATAGTTCT
CTTCAAGAGCAATTCAACAAAGATCTGTCACTTGATGAAGCTGAGACGATCGCTGTATCT
ATCCTCAAGCAAGTTATGGAAGAAAAGGTGACTCCAAACAATGTGGACATTGCCAAGGTA
GCTCCAGCTTACCATCTCTACACTCCACAGGAAGTTGAAGCAGTCATTAGTCGTCTTTGA
GGGAGACTCTCTCAATACGGGTGATGCATCTAATCCGCTTTGCGTCTACTTCGAATCTTG
ACACCAAGTGGCTCTTTCATTTTGTCTGTTAGAGAGACTGATGTTTCATGAGACAGTTCT
GTTGTGTAAGAGAATCTTTCAGTACCTTTCTCGGATTATAAAACTTCAACTATTAT
TCCC

QA 1 776 1 776
DS 

RD RS1EP74JQ 644 0 0
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CGAGCCAATGACTGTAGAGTCCACTACCCAAGCGCTGTGTGATCTCGCTTTACGGTTTGG
TGAAGGAGATGAAGAATCAATGTCTCGGCCGTTTGGAGTCTCCCTTCTCATTGCTGGTCA
TGATGAAAATGGACCGAGCTTGTACTACACGGATCCGTCTGGAACGTTCTGGCAGTGCAA
TGCAAAAGCGATTGGTTCAGGATCAGAAGGAGCTGATAGTTCTCTTCAAGAGCAATTCAA
CAAAGATCTGTCACTTGATGAAGCTGAGACGATCGCTGTATCTATCCTCAAGCAGGTTAT
GGAAGAAAAGGTGACTCCAAACAATGTGGACATTGCCAAGGTAGCTCCAGCTTACCATCT
CTACACTCCACAGGAAGTTGGAGCAGTCATTAGTCGCCTTTGAGGGAGACTCTCTCAATA
CGGGTGATGCATCTAATCCGCTTTGCGTTTACTTCGAATCTTGACACCAAGTGGCTCTTT
CATTTTGTCTGTTAGAGAGACTGATGTTTCATGAGACAGTTCTGTTGTGTAAGAGAATCT
TTCAGTACCTTTCTCGGATTATAAAACTTCAACTATTATATCCC

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 7

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TACCTTGCAACTACTCCTAGTTCCAGCTTCAGCCTCTCCTCACATGAAATACATTGATGC
TATCTGCGATCGCTCCCACGACCAAGATTACTGCGTTAAAACATTGACTACCAACCCCCC
TACGGCTGCTCCCATTGGCCTGAACCCACTCGCCGAGGCCGTGATGGAGCTCACCATCGC
CCACGCCGAGAAGACAGCGGCTTTCCTGGACGAGACGGCGAAGAAAGATCCAGCGGTGCA
GGCTGCGTATGCCGAGTACCACAAGGCCTATCTAGCCGTGGTGGCTGATCTCAAGAGCGC
AAACCTGAAGCTCAAGCAATCCCCTGACACGGCTCACTACGACGTTAGGTCTTCGACCGA
CCAGATGAAGCGCGTGGAGGGATTAGTTGCCAAAAACAATGACCAGGCTTCAACCACTCT
CAAGGAAATGACCGTGCAGATGGAGAAGCTACTTGATCTTGCAGCTAGTGCCGCCGATGC
TGTGGACGATGATGATGAGAACATCCACCGTCGCGAATGATTTTAAAGCAGTGATCC*GG
TTTCGTTTTTTTGTGTTCACA*TACAAAATATAATAAATAAATGAATACATATACACACA
CACACAAAATGTGGTGTGATAAACTAGTAATTAAGTTTCTAAAATATTTGCAAACTAATG
TTGTCAATTTTCGGCATATATAAAAAGTTTGCTGTATGATCTTTTTACAAAACTAAATAT
AAATCTATTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 10 20 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 15 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 0 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 15 15 0 15 15 15 15 0 
0 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BR55TF U 1
AF RS1GC57TF U 1
AF RS1CS73TF U 2
AF RS1CK03TF U 4
AF RS1FA06TF U 4
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AF RS1CK03JQ C 159
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RD RS1BR55TF 716 0 0
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TACGGCTGCTCCCATTGGCCTGAACCCACTCGCCGAGGCCGTGATGGAGCTCACCATAAC
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TTTCGTTTTTT*GTGTTCACA*CTCCAAATATAATAAATAAATGA*TACATATACA

QA 1 716 1 716
DS 

RD RS1GC57TF 758 0 0
GGAAC
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AAA*TGTGGTGTGATAAACTAGTGATTAAGTTT

QA 6 758 6 758
DS 

RD RS1CS73TF 730 0 0
GAAC
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TGCAACTACTCCTAGTTCCAGCTTCAGCCTCTCCTCACATGAAATACATTGATGCTATCT
GCGATCGCTCCCACGACCAAGATTACTGCGTTAAAACATTGACTACCAACCCCCCTACGG
CTGCTCCCATTGGCCTGAACCCACTCGCCGAGGCCGTGATGGAGCTCACCATCGCCCACG
CCGAGAAGACAGCGGCTTTCCTGGACGAGACGGCGAAGAAAGATCCAGCGGTGCAGGCTG
CGTATGCCGAGTACCACAAGGCCTATCTAGCCGTGGTGGCTGATCTCAAGAGCGCAAACC
TGAAGCTCAAGCAATCCCCTGACACGGCTCACTACGACGTTAGGTCTTCGACCGACCAGA
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AAATGACCGTGCAGATGGAGAAGCTACTTGATCTTGCAGCTAGTGCCGCCGATGCTGTGG
ACGATGATGATGAGAACATCCACCGTCGCGAATGATTTTAAAGCAGTGATCC*GGTTTCG
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AAAATG

QA 5 730 5 730
DS 

RD RS1CK03TF 784 0 0
GG
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GCGATCGCTCCCACGACCAAGATTACTGCGTTAAAACATTGACTACCAACCCCCCTACGG
CTGCTCCCATTGGCCTGAACCCACTCGCCGAGGCCGTGATGGAGCTCACCATCGCCCACG
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TGAAGCTCAAGCAATCCCCTGACACGGCTCACTACGACGTTAGGTCTTCGACCGACCAGA
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AAATGACCGTGCAGATGGAGAAGCTACTTGATCTTGCAGCTAGTGCCGCCGATGCTGTGG
ACGATGATGATGAGAACATCCACCGTCGCGAATGATTTTAAAGCAGTGATCC*GGTTTCG
TTTTTTTGTGTTCACA*ATACAAATATAATAAATAAATGAATACATATACACACACACAC
AAA*TGTGGTGTGATAAACTAGTAATTAAGTTTCTGAA*TATTTGCA
AACTATGTTGTCAAT

QA 3 769 3 769
DS 

RD RS1FA06TF 785 0 0
GG
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ACGCATAAAAAATGGCAACATTCTCCGCTCTGTCCACTTTCGCCGCGGCGGCAATTACCT
TGCAACTACTCCTAGTTCCAGCTTCAGCCTCTCCTCAAATGAAATACATTGATGCTATCT
GCGATCGCTCCCACGACCAAGATTACTGCGTTAAAACATTGACTACCAACCCCCCTACGG
CTGCTCCCATTGGCCTGAACCCACTCGCCGAGGCCGTGATGGAGCTCACCATAGCCCACG
CCGAGAAGACAGCGGCTTTCCTGGACGAGGCGGCGAAGAAAGATCCAGCGGTGCAGGCTG
CGTATGCCGAGTACCACAAGGCCTATCTAGCAGTGGTGGCTGATCTCAAGAGCGCAAACC
TGAAGCTCAAGCAATCCCCTGACACGGCTCACTACGACGTTAGGTCTTCGACCGACCAGA
TGAAGCGCGTGGAGGGATTAGTTGCGAAAAACAATGACCAGGCTTCAACCACTCTCAAGG
AAATGACCGTGCAGATGGAGAAGCTACTTGATCTTGCAGCTAGTGCCGCCGATGCTGTGG
ACGATGATGATGAGAACATCCACCGTCGCGAATGATTTTAAAGCAGTGATCC*GGTTTCG
TTTTTTTGTGTTCACA*CTACAAATATAATAAATAAATGAATACATATACACACACACAC
AAAATGTGGTGTGATAAACTAGTAATTAAGTTCTTAAA*TATTTGCA
GACTGATGTCAATTTT

QA 3 769 3 769
DS 

RD RS1FA06JQ 345 0 0
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CAGCTAGTGCCGCCGATGCTGTGGACGATGATGATGAGAACATCCACCGTCGCGAATGAT
TTTAAAGCAGTGATCC*GGTTTTGTTTTTTTGTGTTCACACTACAAAATATAATAAATAA
ATGAATACATATACACACACACACAAAATGTGGTGTGATAAACTAGTAATTAAGTTTTTA
AAATATTTGCAGACTGATGT***CAATTTTTGGCATATATAAAAA

QA 1 345 1 345
DS 

RD RS1CK03JQ 696 0 0
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AAACATTGACTACCAACCCCCCTACGGCTGCTCCCATTGGCCTGAACCCACTCGCCGAGG
CCGTGATGGAGCTCACCATCGCCCACGCCGAGAAGACAGCGGCTTTCCTGGACGAGACGG
CGAAGAAAGATCCAGCGGTGCAGGCTGCGTATGCCGAGTACCACAAGGCCTATCTAGCCG
TGGTGGCTGATCTCAAGAGCGCAAACCTGAAGCTCAAGCAATCCCCTGACACGGCTCACT
ACGACGTTAGGTCTTCGACCGACCAGATGAAGCGCGTGGAGGGATTAGTTGCCAAAAACA
ATGACCAGGCTTCAACCACTCTCAAGGAAATGACCGTGCAGATGGAGAAGCTACTTGATC
TTGCAGCTAGTGCCGCCGATGCTGTGGACGATGATGATGAGAACATCCACCGTCGCGAAT
GATTTTAAAGCAGTGATCC*GGTTTCGTTTTTTTGTGTTCACAATACAAAATATAATAAA
TAAATGAATACATATACACACACACACAAAATGTGGTGTGATAAACTAGTAATTAAGTTT
CTGAAATATTTGCAAACTAATGTTGTCAATTTTCGGCATATATAAAAAGTTTGCTGTATG
ATCTTTTTACAAAACTAAATATAAATCTATTTTTTT

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 5

CO CL707Contig1 1116 5 12 U
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ACTGTTTTAGTTATGTTTTCTAGAGCACAATAGAAAAGCCTATATTATTATTACAAAACT
GTTTTCAGAAGATGTAGAATCCTTCAGATCTTGAAGTACTTGTAGCCAAAATCAGGATTT
GTCATCCCCTCTTCCCAATCTCCCATTCGTTTACCACCAAATACTACTTGCTGAATGCCC
AAGTACTCTGAACTCATGACAGTCAAACTGTTGAGAAGCACATCCAGGGCGAATATATCA
GAAGTGCCTAGATCAACCCAGACACGACCCC*AGTTGTCCTGAAATTCAACGTCGCTGAT
GTCATGGAAGGATGAAGGCATCACTTTGAAGCCCTTCTCTGCGTCGTAGAGAGGATCATA
TTCCATAGATGAGTTTGCTAGCTGCAAGTTGGATGTATTGAAAGCGCCCAATCTCCCC*A
TAACATACCATGCCTGTATAACACTTCCAAAAAGATCAACATCTCTATCTGAAGGTGATC
CATAGAGCTCAAACCATATGAAGGAGTCAACAGGATTAAAATCTCTGAAGCTAACTTTGA
AAGAAAGAACAGAGCCAGTCTTCTGCTTCTGGAAATCTTTTCCCTTCTTCCTCACCCTTT
CCTCAACCTTCTTTCTCATGAGCTCAGGGTTTCCTATGCTATCACCAAGAACAGCTCGAA
GCTCTTCGTCATCTTTACAAGCAGTCTCAAGTACCTTTGCCCAAGATGGGTAATTGTGGA
GACGATCGTAGTCACGTTTCCTCTTCTCTTCTCTAACTTTGAGTAGTCTCCTTCCTCTCG
CCGTCGTTCCCGACCCTTTCTTCTCCGCTTCCGACATCCCGTCGTCATTTTCGCCGGCGA
TGTTGTCGGAATTAGCAGAAACAGCGACCAGAGAGGGATAAGAGTTGAGTTTGTGGTGGA
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AGAGGGATAAGAGTTGAATCTTGTACATTCTGTTTCCCTTTACTTCCCCCGGCCGTAATG
GCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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CCGT

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TATATTATTATTACAAAACTGTTTTCAGAAGATGTAGAATCCTTCAGATCTTGAAGTACT
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ATCACCAAGAACAGCTCGAAGCTCTTCGTCATCTTTACAAGCAGTCTCAAGTACCTTTGC
CCAAGATGGGTAATTGTGGAGACGATCGTAGTCACGTTTCCTCTTCTCTTCTCTAACTTT
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GTCGTCATTTTCGCCCGCGATGTT

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CCC

QA 1 753 1 753
DS 

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TTCTCCGCTTCCGACATCCCGTCGTCATTTTCGCCGGCGATGTTGTCGGAATTAGCAGAA
ACAGCGACCAGAGAGGGATAAGAGTTGAGTTTGTGGTGGAGAGAAAGTGTTCGAGTATGG
GAGAAAAGGAAGGGGAGATTTAGAGTAACGGTACAAGCGGAGAGGGATAAGAGTTGAATC
TTGTACATTCTGTTTCCCTTTACTTCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATG
TCCGGTACCGTCGACT

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DS 



AS 2 8

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BQ
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AF RS1A364JQ C 50
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AF RS1A364TF U 162
BS 1 734 RS1A364TV
BS 735 735 RS1A364TF
BS 736 755 RS1A364TV
BS 756 756 RS1A364TF
BS 757 868 RS1A364TV
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RD RS1A364TV 871 0 0
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AGCCTCAGTGATGAAGTGCGGAAAGGGCAAAGTATGGCTCGATCCTAACGAAACCAGTGA
CATCTCCATGGCCAATTCGCGTCAAAACATCAGGAAGCTTGTGAACGATGGATTCATCAT
CAGGAAGCCAACGAAGATCCACTCGCGGTCCAGAGCTCGCCGCATGAAGATTGCCAAGAT
GAAGGGACGTCACTCTGGTTACGGTAAGAGGAAGGGTACCAGGGAGGCGAGGTTGCCAAC
AAAGGTACTGTGGATGAGGAGGATGAGAGTTCTCAGGCGTCTTCTCAAGAAGTACCGTGA
GTCCAAGAAGATTGACAAGCACATGTACCACGACATGTACATGAAAGTCAAGGGAAACGT
TTTCAAGAACAAGCGTGTTCTGATGGAGAGTATCCACAAATCCAAGGCAGAGAAGGCTAG
GGAGAAGACTTTGTCTGATCAGTTCGAAGCTAAGAGGGCTAAGAACAAGGCTAGCCGTGA
AAGGAAACATGCTCGTAGAGAGGAACGACTTGCCAAGGGTCCTGGAGGAGATGTACCTGC
CGCCGCACCGCATGCCCAAACCGCATAGGTCCCGGTGAAGAGGTCTAAGAAGTGAGGAGA
GAATAAGCTTTTTTTGCTTATAGTAATTTTTTTTTTAGCAGTGATTTTTGCATGGATTTT
GTGATTCAGTTTTGTCAAAACACCTACTCTACGCCGAATCTGAAAACCTTATCATTAGTT
TTGTCAGTAATTTGTTGTGTTTCGTATC
AAG

QA 1 868 1 868
DS 

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AAGCGGCTCGCAGCCTCAGTGATGAAGTGCGGAAAGGGCAAAGTATGGCTCGATCCTAAC
GAAACCAGTGACATCTCCATGGCCAATTCGCGTCAAAACATCAGGAAGCTTGTGAACGAT
GGATTCATCATCAGGAAGCCAACGAAGATCCACTCGCGGTCCAGAGCTCGCCGCATGAAG
ATTGCCAAGATGAAGGGACGTCACTCTGGTTACGGTAAGAGGAAGGGTACCAGGGAGGCG
AGGTTGCCAACAAAGGTACTGTGGATGAGGAGGATGAGAGTTCTCAGGCGTCTTCTCAAG
AAGTACCGTGAGTCCAAGAAGATTGACAAGCACATGTACCACGACATGTACATGAAAGTC
AAGGGAAACGTTTTCAAGAACAAGCGTGTTTTGATGGAGAGTATCCACAAATCCAAGGCA
GAGAAGGCTAGGGAGAAGACTTTGTCTGATCAGTTCGAAGCTAAGAGGGCTAAGAACAAG
GCTAGCCGTGAAAGGAAACATGCTCGTAGAGAGGAACGACTTGCCAAGGGTCCTGGAGGA
GATGTACCTGCCGCCGCACCGCATGCCCAAACCGCATAGGTCCCGGTGAAGAGGTCTAAG
AAGTGAGGAGAGAATAAGCTTTTTT*GCTTATAGTAATTTTTTTTT*AGCAGTGATTTTT
GCATGGATTTTGTGATTCAGTTTTGTCAAAACACCTACTTTACGCCGAATCTGAAAACCT
TATCATTAGTTTTGTCAGTAATTTGTTGTGTTTCGTATCAAG

QA 1 822 1 822
DS 

RD RS1A364TR 822 0 0
GGCTCGGCCAAAACCAGTGTCCAGAAGGGCGAAGCAAAAATGGTGTCGCTGAAGCCCCAG
AAGCGGCTCGCAGCCTCAGTGATGAAGTGCGGAAAGGGCAAAGTATGGCTCGATCCTAAC
GAAACCAGTGACATCTCCATGGCCAATTCGCGTCAAAACATCAGGAAGCTTGTGAACGAT
GGATTCATCATCAGGAAGCCAACGAAGATCCACTCGCGGTCCAGAGCTCGCCGCATGAAG
ATTGCCAAGATGAAGGGACGTCACTCTGGTTACGGTAAGAGGAAGGGTACCAGGGAGGCG
AGGTTGCCAACAAAGGTACTGTGGATGAGGAGGATGAGAGTTCTCAGGCGTCTTCTCAAG
AAGTACCGTGAGTCCAAGAAGATTGACAAGCACATGTACCACGACATGTACATGAAAGTC
AAGGGAAACGTTTTCAAGAACAAGCGTGTTCTGATGGAGAGTATCCACAAATCCAAGGCA
GAGAAGGCTAGGGAGAAGACTTTGTCTGATCAGTTCGAAGCTAAGAGGGCTAAGAACAAG
GCTAGCCGTGAAAGGAAACATGCTCGTAGAGAGGAACGACTTGCCAAGGGTCCTGGAGGA
GATGTACCTGCCGCCGCACCGCATGCCCAAACCGCATAGGTCCCGGTGAAGAGGTCTAAG
AAGTGAGGAGAGAATAAGCTTTTTT*GCTTATAGTAATTTTTTTTT*AGCAGTGATTTTT
GCATGGATTTTGTGATTCAGTTTTGTCAAAACACCTACTCTACGCCGAATCTGAAAACCT
TATCATTAGTTTTGTCAGTAATTTGTTGTGTTTCGTATC
AAG

QA 1 819 1 819
DS 

RD RS1A364TF 706 0 0
ATCCTAACGAAACCAGTGACATCTCCATGGCCAATTCGCGTCAAAACATCAGGAAGCTTG
TGAACGATGGATTCATCATCAGGAAGCCAACGAAGATCCACTCGCGGTCCAGAGCTCGCC
GCATGAAGATTGCCAAGATGAAGGGACGTCACTCTGGTTACGGTAAGAGGAAGGGTACCA
GGGAGGCGAGGTTGCCAACAAAGGTACTGTGGATGAGGAGGATGAGAGTTCTCAGGCGTC
TTCTCAAGAAGTACCGTGAGTCCAAGAAGATTGACAAGCACATGTACCACGACATGTACA
TGAAAGTCAAGGGAAACGTTTTCAAGAACAAGCGTGTTCTGATGGAGAGTATCCACAAAT
CCAAGGCAGAGAAGGCTAGGGAGAAGACTTTGTCTGATCAGTTCGAAGCTAAGAGGGCTA
AGAACAAGGCTAGCCGTGAAAGGAAACATGCTCGTAGAGAGGAACGACTTGCCAAGGGTC
CTGGAGGAGATGTACCTGCCGCCGCACCGCATGCCCAAACCGCATAGGTCCCGGTGAAGA
GGTCTAAGAAGTGAGGAGAGAATAAGCTTTTTT*GCTTATAGTAATTTTTTTTT*AGCAG
TGATTTTTGCATGGATTTTGTGATTCAGTTTTGTCAAA*CACCTACTCTACGCCGAATCT
GAAA*CCTTATCATTAGTTTTGTCAGTAATTTGTTGTGTTTCGTAT

QA 1 706 1 706
DS 



CO CL708Contig2 803 4 16 U
GGGTCCAGAAGGGAGAAGCAAAAATGGTGTCGCTGAAACCCCAGAAGCGGCTCGCAGCCT
CTGTGATGAAGTGCGGAAAGGGGAAAGTCTGGCTCGATCCTAACGAAACCAGTGACATCT
CCATGGCCAATTCGCGTCAAAACATCAGGAAGCTTGTGAACGATGGATTCATCATCAGGA
AGCCAACAAAGATCCACTCGCGTTCCAGAGCTCGCCGCATGAAGATTGCCAAGATGAAGG
GACGTCACTCTGGTTACGGTAAGAGGAAGGGTACCAGGGAGGCGAGGTTGCCAACAAAGG
TACTGTGGATGAGGAGGATGAGAGTTCTCAGGCGTCTTCTCAAGAAGTACCGTGAGTCCA
AGAAGATTGACAAGCACATGTACCACGACATGTACATGAAAGTCAAGGGAAACGTTTTCA
AGAACAAGCGTGTTCTGATGGAGAGCATCCACAAATCCAAGGCTGAGAAGGCTAGAGAGA
AGACTTTGTCTGATCAGTTCGAGGCTAAGAGGGCCAAGAACAAGGCTAGCCGAGAAAGGA
AACATGCTCGTAGAGAGGAACGACTTGCCAAGGGTCCTGGAGGAGATATACCTGCCGCCG
CACCGCATGCCCAAACCGCATAGCTCCCGGCGAAGAGGTCTAAGAAGTGAGGAGAATAAG
CTTTTTT*GCTTGATAGTAATTTTTTTTTTAGCAGTGATTTTTGCATGGATTTTGTGATT
CAGTTTTGTCAAAACACCTACTCTGCGCCGAATCTGAAAACCTTTATCATTAGTTTTGTC
AGTAATTTGTTGTGTTTCGTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RS1BQ69TF U 1
AF RS1BL45JQ C 265
AF RS1G549JQ C 106
AF RS1BL45TF U 330
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AGAACAAGCGTGTTCTGATGGAGAGCATCCACAAATTCAAGGCTGAGAAGGCTAGAGAGA
AGACTTTGTCTGATCAGTTCGAGGCTAAG*GGGCCAAGAACAAGGCTAGCCGAGAAAGGA
AACATGCTCGTAGAGAGGAACGACTTGCCAAGGGTCCTGGAGGAGATATACCTGCCGCCG
CACCGCATGCCCAAACCGCATAGTCCCGGGCGAAGAGGTCTAAGAAGTGAGGAGAATAAG
CTTTTTT*GCTTGATAGTAATTTTTTTTT**GCAGTGATTTT
GCA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RS1BL45JQ 465 0 0
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ACGACATGTACATGAAAGTCAAGGGAAACGTTTTCAAGAACAAGCGTGTTCTGATGGAGA
GCATCCACAAATCCAAGGCTGAGAAGGCTAGGGAGAAGACTTTGTCTGATCAGTTCGAGG
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TTGCCAAGGGTCCTGGAGGAGATGTACCTGCCGCCGCACCGCATGCCCAAACCGCATAGC
TCCCGGCGAAGGGGTCTAAGAAGTGAGGAGAATAAGCTTTTTT*GCTTGATAGTAATTTT
TTTTTTAGCAGTGATTTTTGCATGGATTTTGTGATTCAGTTTTGT

QA 1 465 1 465
DS 

RD RS1G549JQ 695 0 0
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TTGCCAAGATGAAGGGACGTCACTCTGGTTACGGTAAGAGGAAGGGTACCAGGGAGGCGG
GGTTGCCAACAAAGGTACTGTGGATGAGGAGGATGAGAGTTCTCAGGCGTCTTCTCAAGA
AGTACCGTGAGTCCAAGAAGATTGACAAGCACATGTACCACGACATGTACATGAAAGTCA
AGGGTAACGTTTTCAAGAACAAGCGTGTTCTGATGGAGAGCATCCACAAATCCAAGGCTG
AGAAGGCTAGAGAGAAGACTTTGTCTGATCAGTTCGAGGCTAAGAGGGCCAAGAACAAGG
CTAGCCGAGAAAGGAAACATGCTCGTAGAGAGGAACGACTTGCCAAGGGTCCTGGAGGAG
ATATACCTGCCGCCGCACCGCATGCCCAAACCGCATAGGTCCCGGCGAAGAGGTCTAAGA
AGTGAGGAGAATAAGCTTTTTTTGCTTGATAGTAATTTTTTTTTT*GCAGTGATTTTTGC
ATGGATTTTGTGTTTCAGTTTTGTCAAAACACCTACTCTGCGCCGAATCTGAAAACCTTT
ATCATTAGTTTTGTCAGTAGTTTGTTGTGTTTCGT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1BL45TF 474 0 0
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ATGTACATGAAAGTCAAGGGAAACGTTTTCAAGAACAAGCGTGTTCTGATGGAGAGCATC
CACAAATCCAAGGCTGAGAAGGCTAGGGAGAAGACTTTGTCTGATCAGTTCGAGGCTAAG
AGGGCTAAGAACAAGGCTAGCCGAGAAAGGAAACATGCTCGTAGAGAGGAACGACTTGCC
AAGGGTCCTGGAGGAGATGTACCTGCCGCCGCACCGCATGCCCAAACCGCATAGCTCCCG
GCGAAGGGGTCTAAGAAGTGAGGAGAATAAGCTTTTTT*GCTTGATAGTAATTTTTTTTT
TAGCAGTGATTTTTGCATGGATTTTGTGATTCAGTTTTGTCAAAACACCTACTCTGCGCC
GAATCTGAAAACCTTTATCATTAGTTTTGTCAGTAATTTGTTGTGTTTCGTATC

QA 1 474 1 474
DS 



AS 1 8

CO CL709Contig1 975 8 28 U
AATAATTAAAGTGAATTCAAGTTTTATATACATGAATCAGAAACAAAACACCTTTGGTAA
CACTAGAGATTTACATATTTGAAAGACATGACAAGTTTAACTCTCGGCAGCTCTGAAAAT
GGTAAGGAGAGACAAGAAGAGGTTGATGATGTCCAAGTAGAGAGAAACTGCTGCCCAGAT
GTACTCATCGTAATTGTAACGTTTGATGAGGTTGTCTGTATCGTACACTATGTAGCCGCA
GAATATTATCGATGCCAAGCAACCATAGATCATCACTGAGATCCGTCCCAACGGGAAAAA
TATCTGAATAAGAGCAAAGACCATGAGAACGATGAGAGCACCAAATAAGAATGGGCCGAG
GAAATTAAAGTCATATCCTTTCTTTGCTGCCCAGAAGGTGTAGAATGTTAAGGAAAGCAC
CACTACTGTTGTTAGAATCGCTGACTCAAGAATCACTTTCCCGCTGGTGAATGCACATGA
TAACCCCACGGCGAAAGCAAGAGCCACGGTGAAAATCCCAAGGAGCAAGTAGTTCACCGG
ATGTTTCTGGTGGTAATAGTACAAAGGACACAACACTATAAGAGGCATGATGATTAGAAC
TATCCAGAGAGCAAGACCGGCGCTAGTGGTGGAGAAGAACACGGCGATGGGACGAACAGA
GACGACCGTGGCGGCAACGGCGATTGTCGCTAAAAGCTGAAAAGCAATAATGGAGTAAAC
CTTACGGATGAAGCCCCACCGGAGCTCGGGGCTTTCAAGCATCGTCGGATACAGAGGTCT
CTCGCCGCTGTTACCGCCGCTTTCCACGTCATCTTTGCGGTAGGGAAGGTTCCACTTATG
CATTATGTAATAATATTCGCTGATGGAGGTATAGATTTTGCTTGTTACCCCCCGGCCGTA
ATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACTGATAACTTCGTATAATGTATG
CTATACGAAGTTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 20 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 50 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G134JQ U 1
AF RS1H504JQB U 1
AF RS1A012JQ U 8
AF RS1A012TR U 8
AF RS1H504TF C 86
AF RS1G134TF C 198
AF RS1A012TV C 83
AF RS1A012TF C 166
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BS 139 139 RS1H504JQB
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BS 160 160 RS1H504JQB
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BS 179 240 RS1G134JQ
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GTACTCATCGTAATTGTAACGTTTGATGAGGTTGTCTGTATCGTACACTATGTAGCCGCA
AAATATTATCGATGCCAAGCAACCATAGATCATCACTGAAATCCGTCCCAACGGGAAAAA
TATCTGAATAAAAGCAAAGACCATGAGAACGATGAGAGCACCAAATAAAAATGGGCCGAG
GAAATTAAAGTCATACCCTTTCTTTGCTGCCCAAAAGG

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DS 

RD RS1H504JQB 635 0 0
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AAGTCATATCCTTTCTTTGCTGCCCAGAAGGTGTAGAATGTTAAGGAAAGCACCACTACT
GTTGTTAGAATCGCTGACTCAAGAATCACTTTCCCGCTGGTGAATGCACATGATAACCCC
ACGGCGAAAGCAAGAGCCACGGTGAAAATCCCAAGGAGCAAGTAGTTCACCGGATGTTTC
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AGAGCAAGACCGGCGCTAGTGGTGGAGA

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DS 

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GATTTACATATTTGAAAGACATGACAAGTTTAACTCTCGGCAGCTCTGAAAATGGTAAGG
AGAGACAAGAAGAGGTTGATGATGTCCAAGTAGAGAGAAACTGCTGCCCAGATGTACTCA
TCGTAATTGTAACGTTTGATGAGGTTGTCTGTATCGTACACTATGTAGCCGCAGAATATT
ATCGATGCCAAGCAACCATAGATCATCACTGAGATCCGTCCCAACGGGAAAAATATCTGA
ATAAGAGCAAAGACCATGAGAACGATGAGAGCACCAAATAAGAATGGGCCGAGGAAATTA
AAGTCATATCCTTTCTTTGCTGCCCAGAAGGTGTAGAATGTTAAGGAAAGCACCACTACT
GTTGTTAGAATCGCTGACTCAAGAATCACTTTCCCGCTGGTGAATGCACATGATAACCCC
ACGGCGAAAGCAAGAGCCACGGTGAAAATCCCAAGGAGCAAGTAGTTCACCGGATGTTTC
TGGTGGTAATAGTACAAAGGACACAACACTATAAGAGGCATGATGATTAGAACTATCCAG
AGAGCAAGACCGGCGCTAGTGGTGGAGAAGAACACGGCGATGGGACGAACAGAGACGACC
GTGGCGGCAACGGCGATTGTCGCTAAAAGCTGAAAAGCAATAATGGAGTAAACCTTACGG
ATGAAGCCCCACCGGAGCTCGGGG

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DS 

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AGAGACAAGAAGAGGTTGATGATGTCCAAGTAGAGAGAAACTGCTGCCCAGATGTACTCA
TCGTAATTGTAACGTTTGATGAGGTTGTCTGTATCGTACACTATGTAGCCGCAGAATATT
ATCGATGCCAAGCAACCATAGATCATCACTGAGATCCGTCCCAACGGGAAAAATATCTGA
ATAAGAGCAAAGACCATGAGAACGATGAGAGCACCAAATAAGAATGGGCCGAGGAAATTA
AAGTCATATCCTTTCTTTGCTGCCCAGAAGGTGTAGAATGTTAAGGAAAGCACCACTACT
GTTGTTAGAATCGCTGACTCAAGAATCACTTTCCCGCTGGTGAATGCACATGATAACCCC
ACGGCGAAAGCAAGAGCCACGGTGAAAATCCCAAGGAGCAAGTAGTTCACCGGATGTTTC
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AGAGCAAGACCGGCGCTAGTGGTGGAGAAGAACACGGCGATGGGACGAACAGAGACGACC
GTGGCGGCAACGGCGATTGTCGCTAAAAGCTGAAAAGCAATAATGGAGTAAACCTTACGG
ATGAAGCCCCACCGGAGCTCGGGGCTTTCAAGCATCGTCGGATACAGAGGTCTCTCGCCG
CTGTTACCGCCGCTTTCCACGTCATCTTTGCGGT

QA 1 814 1 814
DS 

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ATGAGGTTAT**GTATCGTACACTATGTAGCCGCAGAATATTATCGATGCCAAGCAACCA
TAGATCATCACTGAGATCCGTCCCAACGGGAAAAATATCTGAATAAGAGCAAAGACCATG
AGAACGATGAGAGCGCCAAATAAGAATGGGCCGAGGAAATTAAAGTCATATCCTTTCTTT
GCTGCCCAGAAGGTGTAGAATGTTAAGGAAAGCACCACTACTGTTGTTAGAATCGCTGAC
TCAAGAATCACTTTCCCGCTGGTGAATGCACATGATAACCCCACGGCGAAAGCAAGAGCC
ACGGTGAAAATCCCAAGGAGCAAGTAGTTCACCGGATGTTTCTGGTGGTAATAGTACAAA
GGACACAACACTATAAGAGGCATGATGATTAGAACTATCCAGAGAGCAAGACCGGCGCTA
GTGGTGGAGAAGAACACGGCGATGGGACGAACAGAGACGACCGTGGCGGCAACGGCGATT
GTCGCTAAAAGCTGAAAAGCAATAATGGAGTAAACCTTACGGATGAAGCCCCACCGGAGC
TCGGGGCTTTCAAGCATCGTCGGATACAGAGGTCTCTCGCCGCTGTTACCGCCGCTTTCC
ACGTCATCTTTGCGGTAGGGAAGGTTCCACTTATGCATTATGTAATAATATTCGCTGGTG
GAGGTATAGATTTTGCTTGTTACCC

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DS 

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AGACCATGAGAACGATGAGAGCACCAAATAAGAATGGGCCGAGGAAATTAAAGTCATACC
CTTTCTTTGCTGCCCAGAAGGTGTAGAATGTTAAGGAAAGCACCACTACTGTTGTTAGAA
TCGCTGACTCAAGAATCACTTTCCCGCTGGTGAATGCACATGATAACCCCACGGCGAA*G
CAAGAGCCACGGTGAAAATCCCAAGGAGCAAGTAGTTCACCGGATGTTTCTGGTGGTAAT
AGTACAAAGGACACAACACTATAAGAGGCATGATGATTAGAACTATCCAGAGAGCAAGAC
CGGCGCTAGTGGTGGAGAAGAACACGGCGATGGGACGAACAGAGACGACCGTGGCGGCAA
CGGCGATTGTCGCTAAAAGCTGAAAAGCAATAATGGAGTAAACCTTACGGATGAAGCCCC
ACCGGAGCTCGGGGCTTTCAAGCATCGTCGGATACAGAGGTCTCTCGCCGCTGTTACCGC
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CGCTGGTGGAGGTATAGATTTTGCTTGTTACCC

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DS 

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CCATAGATCATCACTGAGATCCGTCCCAACGGGAAAAATATCTGAATAAGAGCAAAGACC
ATGAGAACGATGAGAGCACCAAATAAGAATGGGCCGAGGAAATTAAAGTCATATCCTTTC
TTTGCTGCCCAGAAGGTGTAGAATGTTAAGGAAAGCACCACTACTGTTGTTAGAATCGCT
GACTCAAGAATCACTTTCCCGCTGGTGAATGCACATGATAACCCCACGGCGAAAGCAAGA
GCCACGGTGAAAATCCCAAGGAGCAAGTAGTTCACCGGATGTTTCTGGTGGTAATAGTAC
AAAGGACACAACACTATAAGAGGCATGATGATTAGAACTATCCAGAGAGCAAGACCGGCG
CTAGTGGTGGAGAAGAACACGGCGATGGGACGAACAGAGACGACCGTGGCGGCAACGGCG
ATTGTCGCTAAAAGCTGAAAAGCAATAATGGAGTAAACCTTACGGATGAAGCCCCACCGG
AGCTCGGGGCTTTCAAGCATCGTCGGATACAGAGGTCTCTCGCCGCTGTTACCGCCGCTT
TCCACGTCATCTTTGCGGTAGGGAAGGTTCCACTTATGCATTATGTAATAATATTCGCTG
ATGGAGGTATAGATTTTGCTTGTTACCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATAT
GTCCGGTACCGTCGACT

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DS 

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TGTTAAGGAAAGCACCACTACTGTTGTTAGAATCGCTGACTCAAGAATCACTTTCCCGCT
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CAAGTAGTTCACCGGATGTTTCTGGTGGTAATAGTACAAAGGACACAACACTATAAGAGG
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GATGGGACGAACAGAGACGACCGTGGCGGCAACGGCGATTGTCGCTAAAAGCTGAAAAGC
AATAATGGAGTAAACCTTACGGATGAAGCCCCACCGGAGCTCGGGGCTTTCAAGCATCGT
CGGATACAGAGGTCTCTCGCCGCTGTTACCGCCGCTTTCCACGTCATCTTTGCGGTAGGG
AAGGTTCCACTTATGCATTATGTAATAATATTCGCTGATGGAGGTATAGATTTTGCTTGT
TACCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACTGATAAC
TTCGTATAATGTATGCTATACGAAGTTATG

QA 1 810 1 810
DS 



AS 2 8

CO CL710Contig1 742 4 4 U
TTTTTTGCCAAGCAGGATGATGTTGACATCTTATTACATGAAAAACAAGCAGAAACGAGT
GGTAGGGAATACATGAGTAAGAGCAGTAAGAACACCAACTCTCAATACTCTTTACATTGT
TGAAGTACACTTCAATAGATTTTGGTCTCTTTTAACTGTAGAAGCAGTGAGAGCTTGATT
AGGCCTCCTTGACTGCAACAGCCTCCTTGACCTCGGCGGCTTCACTGCTCTTTTCCTTGA
GAGCTTCTTCCTTGGCAGGTTCCACTTCCTCTGGGACTACAAAAGCTGAGACAGGGAAAG
TCCTAGACAGTGTGGTTGGTGACTTGAAAGTGATCTTCTCTTTGTCATCTGTATAGATAT
CACTGATAGAGACCCAGATAAGAAGCTCCTTGGCCTTGACTCCAGTGAGCTTCTTGATCT
TGCCGGTCTGGACCACGGCAGTGACCTCGGTTCCGTAGGAGACGAGCTTATCGATCTTTT
CAAACTTGTGGGTGATGCTCTGCTTCTGCTTCAGCCACACAACACCTGACTCTCTGTCAT
ACCCAACCTCTTCAATGTCCTTCAACGGTAGTAAACCATTAGGCATAGATATTTCCTCGA
GGAAACATTTTGTCTTCTCCCTGCATATCTCATCTCCGGTGTACATCTCTGCCTTAGCTC
TCACCTCCTCTGTGACCAAACCCATCTCTGTTATGTTTTTTTTCAGTTTAAGCTTTACCT
CAAAGCTGAAGTTGTGTATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1EK50JQ U 7
AF RS1ET91JQ U 7
AF RS1EK50TF C 1
AF RS1ET91TF C 32
BS 1 12 RS1EK50TF
BS 13 457 RS1EK50JQ
BS 458 600 RS1ET91JQ
BS 601 742 RS1EK50TF

RD RS1EK50JQ 451 0 0
GCCAAG
CAGGATGATGTTGACATCTTATTACATGAAAAACAAGCAGAAACGAGTGGTAGGGAATAC
ATGAGTAAGAGCAGTAAGAACACCAACTCTCAATACTCTTTACATTGTTGAAGTACACTT
CAATAGATTTTGGTCTCTTTTAACTGTAGAAGCAGTGAGAGCTTGATTAGGCCTCCTTGA
CTGCAACAGCCTCCTTGACCTCGGCGGCTTCACTGCTCTTTTCCTTGAGAGCTTCTTCCT
TGGCAGGTTCCACTTCCTCTGGGACTACAAAAGCTGAGACAGGGAAAGTCCTAGACAGTG
TGGTTGGTGACTTGAAAGTGATCTTCTCTTTGTCATCTGTATAGATATCACTGATAGAGA
CCCAGATAAGAAGCTCCTTGGCCTTGACTCCAGTGAGCTTCTTGATCTTGCCGGTCTGGA
CCACGGCAGTGACCTCGGTTCCGTA

QA 7 451 7 451
DS 

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GCCAAG
CAGGATGATGTTGACATCTTATTACATGAAAAACAAGCAGAAACGAGTGGTAGGGAATAC
ATGAGTAAGAGCAGTAAGAACACCAACTCTCAATACTCTTTACATTGTTGAAGTACACTT
CAATAGATTTTGGTCTCTTTTAACTGTAGAAGCAGTGAGAGCTTGATTAGGCCTCCTTGA
CTGCAACAGCCTCCTTGACCTCGGCGGCTTCACTGCTCTTTTCCTTGAGAGCTTCTTCCT
TGGCAGGTTCCACTTCCTCTGGGACTACAAAAGCTGAGACAGGGAAAGTCCTAGACAGTG
TGGTTGGTGACTTGAAAGTGATCTTCTCTTTGTCATCTGTATAGATATCACTGATAGAGA
CCCAGATAAGAAGCTCCTTGGCCTTGACTCCAGTGAGCTTCTTGATCTTGCCGGTCTGGA
CCACGGCAGTGACCTCGGTTCCGTAGGAGACGAGCTTATCGATCTTTTCAAACTTGTGGG
TGATGCTCTGCTTCTGCTTCAGCCACACAACACCTGACTCTCTGTCATACCCAACCTCTT
CAATGTCCTTCAACGGTAGTAAACCATTAGGCATAGATATTTCCTCGA

QA 7 594 7 594
DS 

RD RS1EK50TF 742 0 0
TTTTTTGCCAAGCAGGATGATGTTGACATCTTATTACATGAAAAACAAGCAGAAACGAGT
GGTAGGGAATACATGAGTAAGAGCAGTAAGAACACCAACTCTCAATACTCTTTACATTGT
TGAAGTACACTTCAATAGATTTTGGTCTCTTTTAACTGTAGAAGCAGTGAGAGCTTGATT
AGGCCTCCTTGACTGCAACAGCCTCCTTGACCTCGGCGGCTTCACTGCTCTTTTCCTTGA
GAGCTTCTTCCTTGGCAGGTTCCACTTCCTCTGGGACTACAAAAGCTGAGACAGGGAAAG
TCCTAGACAGTGTGGTTGGTGACTTGAAAGTGATCTTCTCTTTGTCATCTGTATAGATAT
CACTGATAGAGACCCAGATAAGAAGCTCCTTGGCCTTGACTCCAGTGAGCTTCTTGATCT
TGCCGGTCTGGACCACGGCAGTGACCTCGGTTCCGTAGGAGACGAGCTTATCGATCTTTT
CAAACTTGTGGGTGATGCTCTGCTTCTGCTTCAGCCACACAACACCTGACTCTCTGTCAT
ACCCAACCTCTTCAATGTCCTTCAACGGTAGTAAACCATTAGGCATAGATATTTCCTCGA
GGAAACATTTTGTCTTCTCCCTGCATATCTCATCTCCGGTGTACATCTCTGCCTTAGCTC
TCACCTCCTCTGTGACCAAACCCATCTCTGTTATGTTTTTTTTCAGTTTAAGCTTTACCT
CAAAGCTGAAGTTGTGTATTCC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RS1ET91TF 711 0 0
TATTACATGAAAAACAAGCAGAAACGAGTGGTAGGGAATACATGAGTAAGAGCAGTAAGA
ACACCAACTCTCAATACTCTTTACATTGTTGAAGTACACTTCAATAGATTTTGGTCTCTT
TTAACTGTAGAAGCAGTGAGAGCTTGATTAGGCCTCCTTGACTGCAACAGCCTCCTTGAC
CTCGGCGGCTTCACTGCTCTTTTCCTTGAGAGCTTCTTCCTTGGCAGGTTCCACTTCCTC
TGGGACTACAAAAGCTGAGACAGGGAAAGTCCTAGACAGTGTGGTTGGTGACTTGAAAGT
GATCTTCTCTTTGTCATCTGTATAGATATCACTGATAGAGACCCAGATAAGAAGCTCCTT
GGCCTTGACTCCAGTGAGCTTCTTGATCTTGCCGGTCTGGACCACGGCAGTGACCTCGGT
TCCGTAGGAGACGAGCTTATCGATCTTTTCAAACTTGTGGGTGATGCTCTGCTTCTGCTT
CAGCCACACAACACCTGACTCTCTGTCATACCCAACCTCTTCAATGTCCTTCAACGGTAG
TAAACCATTAGGCATAGATATTTCCTCGAGGAAACATTTTGTCTTCTCCCTGCATATCTC
ATCTCCGGTGTACATCTCTGCCTTAGCTCTCACCTCCTCTGTGACCAAACCCATCTCTGT
TATGTTTTTTTTCAGTTTAAGCTTTACCTCAAAGCTGAAGTTGTGTAT
TCC

QA 1 708 1 708
DS 



CO CL710Contig2 770 4 9 U
GGATACACAACTTCAGCTTGAGGTAAAGCTTAAACTTAAAAAAATAAACATAACAGAGAT
GGGTTTGGTCACAGAGGAGGTGAGAGCTAAGGCCGAGATGTACACAGGAGATGAGATATG
CAGAGAGAAGACAAAATGCTTCCTCGAGGAAATATCTATGCCTAATGGCTTACTACCATT
GAAGGACATTGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGTGTCGTGTGGCTGAAGCAGAA
ACAGAGCACCACCCACAAGTTTGAAAAGATCGATAAGCTTGTCTCCTACGGAACCGAGGT
CACTGCCGTGGTCCAGACCGGCAAGATTAAGAAGCTCACTGGAGTCAAGGCCAAGGAGCT
TCTTATCTGGGTCTCTATCAGTGATATCTATACAGATGACAAAGAGAAGATCACTTTCAA
GTCACCAACCACACTGTCCAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTTGTAGTCCCAGAGGAAGT
GGAACCTGCCAAGGAAGAACCTCTCAAGGAGAAGATCAGTGAAGCCGCCGAGGTCAAGGA
GGCTGTTGCAGTCAAGGAGGCCTAATCAAGCTTCTCCCTGCTTCTACTGTTAAAAGAGAC
CAAAATCTATTGAAGTGTACTTCCACAATGTAAAGAGACTATTGAGAGTTGGTGTTTCTC
ACTGCTCTTACTCTCATGTATTACCTACCACTCGTTTCTGCTTGTTTTACTACATGTAAT
AAGATGTCAAGATCATCCTGTTAAACAAAAAAATACCGTAATTATCTATG


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RS1GH61TF U 1
AF RS1B763JQ C 2
AF RS1GH61JQ C 365
AF RS1B763TF U 2
BS 1 248 RS1GH61TF
BS 249 249 RS1B763TF
BS 250 327 RS1GH61TF
BS 328 328 RS1B763TF
BS 329 665 RS1GH61TF
BS 666 707 RS1B763TF
BS 708 708 RS1B763JQ
BS 709 729 RS1B763TF
BS 730 770 RS1B763JQ

RD RS1GH61TF 665 0 0
GGATACACAACTTCAGCTTGAGGTAAAGCTTAAACTTAAAAAAATAAACATAACAGAGAT
GGGTTTGGTCACAGAGGAGGTGAGAGCTAAGGCCGAGATGTACACAGGAGATGAGATATG
CAGAGAGAAGACAAAATGCTTCCTCGAGGAAATATCTATGCCTAATGGCTTACTACCATT
GAAGGACATTGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGTGTCGTGTGGCTGAAGCAGAA
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CACTGCCGTGGTCCAGACCGGCAAGATCAAGAAGCTCACTGGAGTCAAGGCCAAGGAGCT
TCTTATCTGGGTCTCTATCAGTGATATCTATACAGATGACAAAGAGAAGATCACTTTCAA
GTCACCAACCACACTGTCCAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTTGTAGTCCCAGAGGAAGT
GGAACCTGCCAAGGAAGAACCTCTCAAGGAGAAGATCAGTGAAGCCGCCGAGGTCAAGGA
GGCTGTTGCAGTCAAGGAGGCCTAATCAAGCTTCTCCCTGCTTCTACTGTTAAAAGAGAC
CAAAATCTATTGAAGTGTACTTCCACAATGTAAAGAGACTATTGAGAGTTGGTGTTTCTC
ACTGC

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1B763JQ 769 0 0
G
ATACACAACTTCAGCTTGAGGTAAAGCTTAAACTTAAAAAAATAAACATAACAGAGATGG
GTTTGGTCACAGAGGAGGTGAGAGCTAAGGCCGAGATGTACACAGGAGATGAGATATGCA
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AGGACATTGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGTGTCGTGTGGCTGAAGCAGAAAC
AGAGCACCACCCACAAGTTTGAAAAGATCGATAAGCTTGTCTCCTACGGAACCGAGGTCA
CTGCCGTGGTCCAGACCGGCAAGATTAAGAAGCTCACTGGAGTCAAGGCCAAGGAGCTTC
TTATCTGGGTCTCTATCAGTGATATCTATACAGATGACAAAGAGAAGATCACTTTCAAGT
CACCAACCACACTGTCCAGGACTTTCCCTGTTTCAGCTTTTGTAGTCCCAGAGGAAGTGG
AACCTGCCAAGGAAGAACCTCTCAAGGAGAAGATCAGTGAAGCCGCCGAGGTCAAGGAGG
CTGTTGCAGTCAAGGAGGCCTAATCAAGCTTCTCCCTGCTTCTACTGTTAAAAGAGACCA
AAATCTATTGAAGTGTACTTCCACAATGTAAAGAGACTATTGAGAGTTGGTGTTTCTCAC
TGCTCTTACTCTCATGTATTACCTACCACTCGTTTCTGCTTGTTTTACTACATGTAATAA
GATGTCAAGATCATCCTGTTAAACAAAAAAATACCGTAATTATCTATG

QA 2 769 2 769
DS 

RD RS1GH61JQ 403 0 0
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CCAACCACACTGTCCAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTTGTAGTCCCAGAGGAAGTGGAA
CCTGCCAAGGAAGAACCTCTCAAGGAGAAGATCAGTGAAGCCGCCGAGGTCAAGGAGGCT
GTTGCAGTCAAGGAGGCCTAATCAAGCTTCTCCCTGCTTCTACTGTTAAAAGAGACCAAA
ATCTATTGAAGTGTACTTCCACAATGTAAAGAGACTATTGAGAGTTGGTGTTTCTCACTG
CTCTTACTTTCATGTATTACCTACCACTCGTTTCTGCTTGTTTTACTACATGTAATAAGA
TGTCAAGATCATCCTGTTAAACAAAAAAATACCGTAATTAT
TT

QA 1 401 1 401
DS 

RD RS1B763TF 745 0 0
G
ATACACAACTTCAGCTTGAGGTAAAGCTTAAACTTAAAAAAATAAACATAACAGAGATGG
GTTTGGTCACAGAGGAGGTGAGAGCTAAGGCCGAGATGTACACAGGAGATGAGATATGCA
GAGAGAAGACAAAATGCTTCCTCGAGGAAATATCTATGCCTAATGGCTTACTACCATTGA
AGGACATTGAAGAGGTTGGGTATGACAGAGAGTCAGGTGTCGTGTGGCTGAAGCAGAAAC
AGAGCACCACCCACAAGTTTGAAAAGATCGATAAGCTTGTCTCCTACGGAACCGAGGTCA
CTGCCGTGGTCCAGACCGGCAAGATTAAGAAGCTCACTGGAGTCAAGGCCAAGGAGCTTC
TTATCTGGGTCTCTATCAGTGATATCTATACAGATGACAAAGAGAAGATCACTTTCAAGT
CACCAACCACACTGTCCAGGACTTTCCCTGTCTCAGCTTTTGTAGTCCCAGAGGAAGTGG
AACCTGCCAAGGAAGAACCTCTCAAGGAGAAGATCAGTGAAGCCGCCGAGGTCAAGGAGG
CTGTTGCAGTCAAGGAGGCCTAATCAAGCTTCTCCCTGCTTCTACTGTTAAAAGAGACCA
AAATCTATTGAAGTGTACTTCCACAATGTAAAGAGACTATTGAGAGTTGGTGTTTCTCAC
TGCTCTTACTCTCATGTATTACCTACCACTCGTTTCTGCTTGTTT*ACTACATGTAATAA
GATGTCA
GATCATCCTGTTAACAA

QA 2 728 2 728
DS 



AS 1 4

CO CL711Contig1 1250 4 12 U
AGGGAAAGACAAGAAACCAAAATGGCATTGAAGCTAAACTCTTTGGCATGTCAGCCATAC
AAACTCGCTTCCTCGACTCGTCCGCCAATCTCTACTTTCAGATCTCCCCAGTTCCTCTGC
CACGCTTCTTCTTCACCCGCTCTCAGCTCCAAAGAGGTCGAGAGTTTGAAGAAGCCATTC
ACGCCACCAAAGGAAGTGCACGTTCAAGTCTTGCACTCCATGCCACCGCAGAAGATCGAG
ATCTTCAAATCCATGGAAGACTGGGCCGAGCAGAACCTCCTAACCCATCTCAAGGACGTG
GAGAAGTCATGGCAGCCCCAGGATTTCTTACCCGACCCTGCATCCGACGGGTTCGAAGAT
CAGGTGAAGGAGCTAAGAGAGAGGGCAAGAGAGCCCCCCGATGATTACTTTGTCGTTTTG
GTGGGAGACATGATCACAGAAGAAGCTCTTCCGACCTATCAGACTATGCTCAACACTTTG
GATGGAGTTAGGGATGAGACTGGTGCTAGTCCCACTTCATGGGCTGTTTGGACAAGAGCT
TGGACTGCTGAAGAGAACCGACATGGTGATCTTCTCAATAAGTATCTTTACTTGTCTGGT
CGTGTTGACATGAGGCAGATTGAGAAGACCATTCAGTACTTGATTGGTTCCGGAATGGAT
CCACGCACAGAGAACAATCCTTACCTTGGCTTCATCTACACTTCATTCCAAGAGAGAGCA
ACCTTCATCTCTCACGGGAACACAGCACGCCAAGCCAAAGAGCATGGGGACCTCAAGCTA
GCTCAGATATGTGGAACGATAGCTGCAGACGAGAAGCGTCACGAAACAGCTTACACCAAG
ATAGTTGAAAAGCTCCTTGAGATTGATCCTGATGGTACCGTGGTGGCTTTTGCAGACATG
ATGAGAAAGAAAATCTCGATGCCTGCTCACTTGATGTACGATGGGCGTGATGACAAGCTC
TTTGACAACTTCTCTTCCGTGGCTCAGAGGCTCGGTGTTTACACCGCCAAAGACTATGCG
GACATTCTTGAGTTTTTGGTTGGTAGGTGGAAGATCGAGAACTTGACTGGGCTCTCGGGT
GAAGGAAACAAAGCGCAAGAGTATTTATGTGGGTTGACTCCGAGAATCAGGAGATTGGAT
GAGAGAGCTCAAGCAAGAGCCAAGAAAGGACCTAAGGTTCCTTTCAGCTGGATACATGAC
AGAGAAGTGCAGCTTTGAACTAATAAACCCATTCTCTCTCTCCGTTCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F318TF U 435
AF RS1D212TF U 12
AF RS1F568TF U 1
AF RS1F568JQ C 482
BS 1 152 RS1F568TF
BS 153 153 RS1D212TF
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BS 156 413 RS1F568TF
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BS 774 1250 RS1F568JQ

RD RS1F318TF 206 0 0
G
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GAGACTGGTGCTAGTCCCACTTCATGGGCTGTTTGGACAAGAGCTTGGACTGCTGAAGAG
AACCGACATGGTGATCTTCTCAATAAGTATCTTTACTTGTCTGGTCGTGTTGACATGAGG
CAGATTGAGAAGACCATTCAG
ACTT

QA 2 202 2 202
DS 

RD RS1D212TF 643 0 0
G
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TCGACTCGTCCGCCAATCTCTACTTTCAGATCTCCCCAGTTCCTCTGCCACGCTTCTTCT
TCACCCGCTCTCAGCTCCAAAGAGGTCGAGAGTTTGAAGAAGCCATTCACGCCACCAAAG
GAAGTGCACGTTCAAGTCTTGCACTCCATGCCACCGCAGAAGATCGAGATCTTCCAATCC
ATGGAAGACTGGGCCGAGCAGAACCTCCTAACCCATCTCAAGGACGTGGAGAAGTCATGG
CAGCCCCAGGATTTCTTACCCGACCCTGCATCCGACGGGTTCGAAGATCAGGTGAAGGAG
CTAAGAGAGAGGGCGAGAGAGCTCCCCGATGATTACTTTGTCGTTTTGGTGGGAGACATG
ATCACAGAAGAAGCGCTTCCCACCTACCAAACTATGCTGAACACTTTGGATGGAGTTAGG
GATGAGACTGGTGCTAGTCCCACTTCATGGGCTGTTTGGACAAGAGCTTGGACTGCTGAA
GAGAACCGACATGGTGATCTTCTCAATAAGTATCTTTACTTGTCTGGTCGTGTTGACATG
AGGCAGATTGAGAAGACCATTCAGTACTTGATTGGTTCCGGA

QA 2 643 2 643
DS 

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AGGGAAAGACAAGAAACCAAAATGGCATTGAAGCTAAACTCTTTGGCATGTCAGCCATAC
AAACTCGCTTCCTCGACTCGTCCGCCAATCTCTACTTTCAGATCTCCCCAGTTCCTCTGC
CACGCTTCTTCTTCACCCGCTCTCAGCTCCAAGGGGGTCGAGAGTTTGAAGAAGCCATTC
ACGCCACCAAAGGAAGTGCACGTTCAAGTCTTGCACTCCATGCCACCGCAGAAGATCGAG
ATCTTCAAATCCATGGAAGACTGGGCCGAGCAGAACCTCCTAACCCATCTCAAGGACGTG
GAGAAGTCATGGCAGCCCCAGGATTTCTTACCCGACCCTGCATCCGACGGGTTCGAAGAT
CAGGTGAAGGAGCTAAGAGAGAGGGCAAGAGAGCCCCCCGATGATTACTTTGTTGTTTTG
GTTGGAGACATGATCACAGAAGAAGCTCTTCCGACCTATCAGACTATGCTCAACACTTTG
GATGGAGTTAGGGATGAGACTGGTGCTAGTCCCACTTCATGGGCTGTTTGGACAAGAGCT
TGGACTGCTGAAGAGAACCGACATGGTGATCTTCTCAATAAGTATCTTTACTTGTCTGGT
CGTGTTGACATGAGGCAGATTGAGAAGACCATTCAGTACTTGATTGGTTCCGGAATGGAT
CCACGCACAGAGAACAATCCTTACCTTGGCTTCATCTACACTTCATTCCAAGAGAGAGCA
ACCTTCATCTCTCACGGGAACACAGCACGCCA*GCCAAAGAGCATGGGGACCT

QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1F568JQ 769 0 0
ATGGAGTTAGGGATGAGACTGGTGCTAGTCCCACTTCATGGGCTGTTTGGACAAGAGCTT
GGACTGCTGAAGAGAACCGACATGGTGATCTTCTCAATAAGTATCTTTACTTGTCTGGTC
GTGTTGACATGAGGCAGATTGAGAAGACCATTCAGTACTTGATTGGTTCCGGAATGGATC
CACGCACAGAGAACAATCCTTACCTTGGCTTCATCTACACTTCATTCCAAGAGAGAGCAA
CCTTCATCTCTCACGGGAACACAGCACGCCAAGCCAAAGAGCATGGGGACCTCAAGCTAG
CTCAGATATGTGGAACGATAGCTGCAGACGAGAAGCGTCACGAAACAGCTTACACCAAGA
TAGTTGAAAAGCTCCTTGAGATTGATCCTGATGGTACCGTGGTGGCTTTTGCAGACATGA
TGAGAAAGAAAATCTCGATGCCTGCTCACTTGATGTACGATGGGCGTGATGACAAGCTCT
TTGACAACTTCTCTTCCGTGGCTCAGAGGCTCGGTGTTTACACCGCCAAAGACTATGCGG
ACATTCTTGAGTTTTTGGTTGGTAGGTGGAAGATCGAGAACTTGACTGGGCTCTCGGGTG
AAGGAAACAAAGCGCAAGAGTATTTATGTGGGTTGACTCCGAGAATCAGGAGATTGGATG
AGAGAGCTCAAGCAAGAGCCAAGAAAGGACCTAAGGTTCCTTTCAGCTGGATACATGACA
GAGAAGTGCAGCTTTGAACTAATAAACCCATTCTCTCTCTCCGTTCCTC

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 5

CO CL712Contig1 837 5 3 U
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AAAATTCTACGCAGCATTCTTAGAAAAGCTCAAATGCCCCGAGGTTTCGGACCAGTTTCG
CCTGGTGTTAGGTGACGAAACACAGCTTCAGATGGTTATGCACGGTATAGGAAGCATCGA
GTCTTACGAATCTAGTGTCTTGGAATCTCTGGGGTGTACTGTTTTGTCTGTGAACGAGCA
AGCTCGTAGGGAAGCTTTGAAGCCTACTCTTTTCTTCATGCCGCACTGTGAGGCTAATCT
GTATAGCAACCTGTTGCAAGCGAACTGGAGGATGGATCGGTTGCGCAGGATTGCATTGTT
TGGGAACAGCTTTCAGATGTATGAGGAGCAGGTGACGTTTAAACCGAATGTCATCCGTGC
TACCAAACGGATCATAGCTGCACGGGGATTCACTAGTGAGTTTGCTATTGAGACTGTATC
TGATGATTATTTTCCAGCGTTCCATGATTCGAGCTGGCATTTTTTCAGCCCCGGTTTAGA
TTCGGAGCTGCCATTGTTGGTTTCAGAGGGATTATAGATCATTGCTTTTTTGCACTTGTC
AGGTCTTTGTGTTTGTCTATCCTCTTCCTGCATAAGTTTAACCATTTGAAGTTGTTGACT
TATCATTGGTTTAATATTTGCTTGAAACAATGAAATATGTTATCACAAATTTTCATAATC
TCTTCAGTAAGTTGTATTTAGTTTTCACAGCTACGTTGTTGTTCTTGGCTATATTTGTGT
TTGTTCTGACTCCAAGTTGTGGTAATCAGTTGGTAGAATTGCAATTTGTCTGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1F135TF U 1
AF RS1CG96JQ C 295
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AF RS1A066TF U 346
AF RS1F135JQ C 68
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BS 565 767 RS1A066TV
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RD RS1F135TF 564 0 0
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AAAATTCTACGCAGCATTCTTAGAAAAGCTCAAATGCCCCGAGGTTTCGGACCAGTTTCG
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GTCTTACGAATCTAGTGTCTTGGAATCTCTGGGGTGTACTGTTTTGTCTGTGAACGAGCA
AGCTCGTAGGGAAGCTTTGAAGCCTACTCTTTTCTTCATGCCGCACTGTGAGGCTAATCT
GTATAGCAACCTGTTGCAAGCGAACTGGAGGATGGATCGGTTGCGCAGGATTGCATTGTT
TGGGAACAGCTTTCAGATGTATGAGGAGCAGGTGACGTTTAAACCGAATGTCATCCGTGC
TACCAAACGGATCATAGCTGCACGGGGATTCACTAGTGAGTTTGCTATTGAGACTGTATC
TGATGATTATTTTCCAGCGTTCCATGATTCGAGCTGGCATTTTTTCAGCCCCGGTTTAGA
TTCGGAGCTGCCATTGTTGGTTTC

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DS 

RD RS1CG96JQ 422 0 0
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ATTGTTTGGGAACAGCTTTCAGATGTATGAGGAGCAGGTGACGTTTAAACCGAATGTCAT
CCGTGCTACCAAACGGATCATAGCTGCACGGGGATTCACTAGTGAGTTTGCTATTGAGAC
TGTTTTTGATGATTATTTTCCAGCGTTCCATGATTCGAGCTGGCATTTTTTCAGCCCCGG
TTTAGATTCGGAGCTGCCATTGTTGGTTTCAGAGGGATTATAGATCATTGCTTTTTTGCA
CTTGTCAGGTCTTTGTGTTTGTCTATCCTCTTCCTGCATAAGTTTAACCATTTGAAGTTG
TTGACTTATCATTGGTTTAATATTTGCTTGAAACAATGAAATATGTTATCACAAATTTTC
AT

QA 1 422 1 422
DS 

RD RS1A066TV 542 0 0
TGAG
CGAGCAAGCTCGTAGGGAAGCTTTGAAGCCTACTCTTTTCTTCATGCCGCACTGTGAGGC
TAATCTGTATAGCAACCTGTTGCAAGCGAACTGGAGGATGGATCGGTTGCGCAGGATTGC
ATTGTTTGGGAACAGCTTTCAGATGTATGAGGAGCAGGTGACGTTTAAACCGAATGTCAT
CCGTGCTACCAAACGGATCATAGCTGCACGGGGATTCACTAGTGAGTTTGCTATTGAGAC
TGTATCTGATGATTATTTTCCAGCGTTCCATGATTCGAGCTGGCATTTTTTCAGCCCCGG
TTTAGATTCGGAGCTGCCATTGTTGGTTTCAGAGGGATTATAGATCATTGCTTTTTTGCA
CTTGTCAGGTCTTTGTGTTTGTCTATCCTCTTCCTGCATAAGTTTAACCATTTGAAGTTG
TTGACTTATCATTGGTTTAATATTTGCTTGAAACAATGAAATATGTTATCACAAATTTTC
ATAATCTCTTCAGTAAGTTGTATTTAGTTTTCACAGCTACGTTGTTGTTCTTG
GCTAT

QA 5 537 5 537
DS 

RD RS1A066TF 424 0 0
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GAATGTCATCCGTGCTACCAAACGGATCATAGCTGCACGGGGATTCACTAGTGAGTTTGC
TATTGAGACTGTATCTGATGATTATTTTCCAGCGTTCCATGATTCGAGCTGGCATTTTTT
CAGCCCCGGTTTAGATTCGGAGCTGCCATTGTTGGTTTCAGAGGGATTATAGATCATTGC
TTTTTTGCACTTGTCAGGTCTTTGTGTTTGTCTATCCTCTTCCTGCATAAGTTTAACCAT
TTGAAGTTGTTGACTTATCATTGGTTTAATATTTGCTTGAAACAATGAAATATGTTATCA
CAAATTTTCATAATCTCTTCAGTAAGTTGTATTTAGTTTTCACAGCTACGTTGTTGTTCT
TG
GC

QA 1 422 1 422
DS 

RD RS1F135JQ 770 0 0
TACGCAGCATTCTTAGAAAAGCTCAAATGCCCCGAGGTTTCGGACCAGTTTCGCCTGGTG
TTAGGTGACGAAACACAGCTTCAGATGGTTATGCACGGTATAGGAAGCATCGAGTCTTAC
GAATCTAGTGTCTTGGAATCTCTGGGGTGTACTGTTTTGTCTGTGAACGAGCAAGCTCGT
AGGGAAGCTTTGAAGCCTACTCTTTTCTTCATGCCGCACTGTGAGGCTAATCTGTATAGC
AACCTGTTGCAAGCGAACTGGAGGATGGATCGGTTGCGCAGGATTGCATTGTTTGGGAAC
AGCTTTCAGATGTATGAGGAGCAGGTGACGTTTAAACCGAATGTCATCCGTGCTACCAAA
CGGATCATAGCTGCACGGGGATTCACTAGTGAGTTTGCTATTGAGACTGTATCTGATGAT
TATTTTCCAGCGTTCCATGATTCGAGCTGGCATTTTTTCAGCCCCGGTTTAGATTCGGAG
CTGCCATTGTTGGTTTCAGAGGGATTATAGATCATTGCTTTTTTGCACTTGTCAGGTCTT
TGTGTTTGTCTATCCTCTTCCTGCATAAGTTTAACCATTTGAAGTTGTTGACTTATCATT
GGTTTAATATTTGCTTGAAACAATGAAATATGTTATCACAAATTTTCATAATCTCTTCAG
TAAGTTGTATTTAGTTTTCACAGCTAAGTTGTTGTTCTTGGCTATATTTGTGTTTGTTCT
GACTCCAAGTTGTGGTAATCAGTTGGTAGAATTGCAATTTGTCTGTTTCC

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 8

CO CL713Contig1 940 8 12 U
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AAAGCAATGTTGCTTGTTGGTTTTGCCGGCCTTGTAGCAGGTGCGTGCAGTATGGCCATT
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ATTGAGACTAAGACATCACTATCAGCAATCGACGAACAAGATGAGGAGGAGAAGAAAGAG
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GCAATGCCGCTTCTTGCAGCTGTATTCATAGAGAATCATAAGGTAAGAATGGCGGTGGTA
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GACAAGTGTGTTCAAGTCAAGCGTTAGGGTGGTCATTGGTGGCTGGATGGCTATGGCTCT
TACCTTTGGTCTTACCAAGTTCATTGGTTCCGAAGCCATGCAAATCTAGACACTCTTTCG
*TGATCATCTTGTTTTCATGCATCTCAATTAATAATGTTTGTTGTGTTTGTATCATATAA
GCCCACTATCTCACCTCAACTATGTATGGAATGATTAATACATCAAGTGCACAACAAACA
CCAAAAAGGTTAAATAAATGGTCTTGTTAATCGATCTTTCATTTGAGAGTTGTAATTATT
TTAAGTGTTAATACCTAGACGTCAGCAACGTCTCCTTTAC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 45 45 45 45 20 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 15 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FW55TF U 1
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QA 1 650 1 650
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GCGATCGTGGCCACCCTGGCATTGTTGGTGTTT*GGAGTGACCGGTGCGGTTCTGGGAAA
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TGATT

QA 1 810 1 810
DS 

RD RS1GF67TF 835 0 0
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GCGATCGTGGCCACCCTGGCATTGTTGGTGTTT*GGAGTGACCGGTGCGGTTCTGGGAAA
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TACCTTTGGTCTTACCAAGTTCATTGGTTCCGAAGCCATGCAAATCTAGACACTCTTTCG
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CA

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RD RS1AG79TF 673 0 0
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GCGTGCAGTATGGCCATTGGTGAGTTTGTGTCTGTCTGCACACAAAGGGATATTGAAACT
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GTAAGAATGGCGGTGGTAGCGATCGTGGCCACCCTGGCATTGTTGGTGTTTTGGAGTGAC
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CTGGATGGCTATGGCTCTTACCTTTGGTCTTACCAAGTTCATTGGTTCCGAAGCCATGCA
A*TCTAGACACTCTTTCG*TGATCATCTTGTTTTCATGCATCTCAATTAATAATGTTTGT
TGTGTTTGTATCATATAAGCCCACTATCTCAC*TCAACTATGTATGGAATGATTA*TACA
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DS 

RD RS1H435JQB 218 0 0
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CC

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DS 

RD RS1FE08JQ 619 0 0
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TTCATACATCTCAATTAATAATGTTTGTTGTGTTTGTATCATATAAGCCCACTATCTCAC
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TCG

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DS 

RD RS1AG79JQ 806 0 0
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TGTTGGTTTTGCCGGCCTTGTAGCAGGTGCGTGCAGTATGGCCATTGGTGAGTTTGTGTC
TGTCTGCACACAAAGGGATATTGAAACTGCTCAGATGAAGAGAGCTATTGAGACTAAGAC
ATCACTATCAGCAATCGACGAACAAGATGAGGAGGAGAAGAAAGAGCGGCTACCAAATCC
AGGACAAGCAGCGTTGGCATCAGCGTTAGCATTTTCAGTGGGAGCAGCAATGCCGCTTCT
TGCAGCTGTATTCATAGAGAATCATAAGGTAAGAATGGCGGTGGTAGCGATCGTGGCCAC
CCTGGCATTGTTGGTGTTT*GGAGTGACCGTTGCGGTTCTGGGAAAGACAAGTGTGTTCA
AGTCAAGCGTTAGGGTGGTCATTGGTGGCTGGATGGCTATGGCTCTTACCTTTGGTCTTA
CCAAGTTCATTGGTTCCGAAGCCATGCAAATCTAGACACTCTTTCGGTGATCATCTTGTT
TTCATGCATCTCAATTAATAATGTTTGTTGTGTTTGTATCATATAAGCCCACTATCTCAC
CTCAACTATGTATGGAATGATTAATACATCAAGTGCACAACAAACACCAAAAAGGTTAAA
TAAATGGTCTTGTTAATCGATCTTTCATTTGAGAGTTGTAATTATTTTAAGTGTTAATAC
CTAGACGTCAGCAACGTCTCCTTTAC

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DS 



AS 1 8

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AGGACCGGTGGCGGAAGACATGTTCCATTGGCAAGCGACGATAATGGGTCCTTCCGACAG
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ACCTCCCAAGGTGGCTTTTAGGACGAAGGTGTTCCATCCAAACATCAACAGCAATGGGAG
CATCTGCCTCGACATCTTGAAGGAGCAGTGGAGTCCTGCCCTCACCATTTCCAAGGTGCT
GCTGTCGATCTGTTCGTTGTTGACGGATCCGAACCCGGATGATCCTTTGGTTCCGGAGAT
TGCTCACATGTACAAGACTGACAAGAACAAGTACGAGTCTACTGCCCGTACCTGGACTCA
AAAGTACGGAATGGGCTGACCACTCTCCCCCTCAAGGACTTTCCCCCTTTTAATAACCTA
AAAGAACTCTTCTCATTTCTGTGTAATCATATTTATAAACTTTTCTGTCTTATTAAAAAA
AAA*TTGTGAAGACTGAGATCAGTAAGAAATCGCATGATCTCCCATTTTCATTTAAATCT
CATGGAATTTGTAAACTTTAAGTCATCTCGTTCCCATTTGCTTTTAAA


BQ
10 10 10 10 10 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 25 50 50 50 50 20 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 
50 50 50 50 50 50 20 50 25 50 50 15 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 50 25 50 50 50 50 50 50 50 50 50 0 50 
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 20 20 35 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 

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AF RS1B962TF U 4
AF RS1G680TF U 4
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AAAGAACTCTTCTCATTTCTGTGTAATCATATTTATAAACTTTTCTGTCTTATTAAAAAA
AAA*TTGTGAAGACTGAGATCAGTAAGAAATCGCATGATC

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GCCTCGACATCTTGAAGGAGCAGTGGAGTCCTGCCCTCACCATTTCCAAGGTGCTGCTGT
CGATCTGTTCGTTGTTGACGGATCCGAACCCGGATGATCCTTTGGTTCCGGAGATTGCTC
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AATTTG
C

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DS 

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CTAAAGCTAAGAAGCTGAACCAAAAACGTGAAAGGTGATTATCGGGGATGGCATCGAAAC
GGATATTGAAGGAATTGAAGGATCTGCAGAAGGATCCTCCTACTTCATGCAGCGCAGGAC
CGGTGGCGGAAGACATGTTCCATTGGCAAGCGACGATAATGGGTCCTTCCGACAGCCCTT
ACTCTGGCGGTGTTTTTCTTGTTACCATTCATTTCCCTCCCGATTATCCTTTTAAACCTC
CCAAGGTGGCTTTTAGGACGAAGGTGTTCCATCCAAACATCAACAGCAATGGGAGCATCT
GCCTCGACATCTTGAAGGAGCAGTGGAGTCCTGCCCTCACCATTTCCAAGGTGCTGCTGT
CGATCTGTTCGTTGTTGACGGATCCGAACCCGGATGATCCTTTGGTTCCGGAGATTGCTC
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ACGGAATGGGCTGACCACTCTCCCCCTCAAGGACTTTCCCC*TTTTAATAACCTAAAAGA
ACTCTTCTCATTTCTGTGTAATCATATTTATAAACTTTTCTGTCTTATTAAAAAAAAA*T
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AATTTG
C

QA 3 728 3 728
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GG
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CTAAAGCTAAG***CTGAACCAAAAACGTGAAAGGTGATTATCGGGGATGGCATCGAAAC
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CGGTGGCGGAAGACATGTTCCATTGGCAAGCGACGATAATGGGTCCATCCGACAGCCCTT
ACTCTGGCGGTGTTTTTCTTGTTACCATTCATTTCCCTCCTGATTATCCTTTTAAACCTC
CCAAGGTGGCTTTTAGGACTAAGGTGTTCCATCCAAACATCAACAGCAATGGGAGCATCT
GCCTCGACATCTTGAAGGAGCAGTGGAGTCCTGCCCTCACCATTTCCAAGGTGCTGCTGT
CGATCTGTTCGTTGTTGACGGATCCGAACCCGGATGATCCTTTGGTTCCGGAGATTGCTC
ACATGTACAAGACTGACAAGAACAAGTACGAGTCTACTGCCCGTACCTGGACTCAAAAGT
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C*TTTTAATAACCTAAAAGAACTCTTTTCATTTCTGTGTAATCATATTTATAAACTTTTC
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DS 

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GG
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TAAAGCTAAG***CTGAACCAAAAACGTGAAAGGTGATTATCGGGGATGGCATCGAAACG
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GGTGGCGGAAGACACGTTCCATTGGCAAGCGACGATAATGGGTCCATCCGACAGCCCTTA
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CATGTACAAGACTGACAAGAACAAGTACGAGTCTACTGCCCGTACCTGTACTCAAAAGTA
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ATTTGTAAACTTTAAGTCATCTCGTTCCCATTTGCTTTTAAA

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DS 

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CCTCCTGATTATCCTTTTAAACCTCCCAAGGTGGCTTTTAGGACTAAGGTGTTCCATCCA
AACATCAACAGCAATGGGAGCATTTGCCTCGACATCTTGAAGGAGCAGTGGAGTCCTGCC
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GATCCTTTGGTTCCGGAGATTGCTCACATGTACAAGACTGACAAGAACAAGTACGAGTTT
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TTTTTTGTTTTATTAAAACAAAA*TTGTGAAGACTGAGATCAGTAAGAAATCGCATGATT
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CTTTT
T

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DS 

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TTAGGACTAAGGTGTTCCATCCAAACATCAACAGCAATGGGAGCATTTGCCTCGACATCT
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TGTTGACGGATCCGAACCCGGATGATCCTTTGGTTCCGGAGATTGCTCACATGTACAAGA
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GACCACTTTCCCCCTCAAGGACTTTCCCCCTTTTAATAACCTAAAAGAACTTTTTTCATT
TCTGTGTAATCATATTTATAAACTTTTCTGTTTTATTAAAACAAAA*TTGTGAAGACTGA
GATCAGTAAGAAATCGCATGATCTCCCATTTTCATTTAAATTTCATGGAATTTGTAAACT
TTAAGTCATCTCGTTCCCATTTGCTTTT

QA 1 508 1 508
DS 



AS 2 5

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CGTCGCTCCTGACTTACGCGGTTACGGTGACTCCGATGCTCCTCCTGAGGTCTCTTCCTA
CACTTGCTTCCACATGGTGGGTGACCTGATCGCTGTCATATCCGCCTTAACCGAAGATAA
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TGCTTACTATGTTAGCAAGTTTCAAGAGAAAGGTTACACTGGTGGAGTTAATTACTACCG
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CATACATGGTCCCAAGTTCAAGGAAGACGTTCCTTTGCTCGAAGAGCCTGTGGTCATGGA
GGGGGTTGCTCACTTCATTAACCAAGAGAAGCCACAAGAGATCCTCCAAATTATCGTTGA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1C318TF U 1
AF RS1F817TF U 266
AF RS1B191JQ C 403
BS 1 319 RS1C318TF
BS 320 320 RS1F817TF
BS 321 408 RS1C318TF
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BS 508 815 RS1F817TF
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RD RS1C318TF 507 0 0
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CCACGTGGCGATCCAAGGCCCTTCCGATGGTCCTGTAGTCCTCCTCCTCCATGGATTCCC
TACTCTTTGGTACTCATGGCGTCACCAGATCCCCGGATTCGCTGCTCTCGGTTACCGCGC
CGTCGCTCCTGACTTACGCGGTTACGGTGACTCCGATGCTCCTCCTGAGGTCTCTTCCTA
CACTTGCTTCCACATGGTGGGTGACCTGATCGCTGTCATATCCGCCTTAACCGAAGATAA
AGTGTTTGTGGTTGGACATGACTGGGGAGCTCTGATCACTTGGTATCTTTGTCTTTTCCG
ACCTGATAAAGTCAAAGCTCTCGTCAACCTCTCTGTTCCTTTCTCTTTCGGTCCTAAAGA
TTCTACCGTTAAACCTCTTGACGCGCTGCGTAAGTTCTATGGCGACGATTTCTACATGTG
TAG*TTTCAG*AAGCGGGAGAAATAGA

QA 1 507 1 507
DS 

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G
TGATCGCTGTCATATCCGCCTTAACCGAAGATAAAGTGTTTGTGGTTGGACATAATTGGG
GAGCTCTGATCGCTTGGTATCTTTGTCTTTTCCGACCTGATAAAGTCAAAGCTCTGGTCA
ACCTCTCTGTTCCTTTCTCTTTTGGTCCTAAAGATTCTACCGTTAAACCTCTTGACGCGC
TGCGTAAGTTCTATGGCGACGATTTCTACATGTGTAGGTTTCAGGAAGCGGGAGAAATAG
AAGCTGAGATTGCAGAGGCTGGGGTTGAGAGAGTAGTGAGGAAGATACTCACATATAGAA
CACCTCGACCGCTTATTTTGCCCAAGGATAAAAGCTTTTGGGGACCTAAAGACGAAACTA
TTCCTTTACCGTCATGGCTAACGGAGGAAGATGTTGCTTACTATGTTAGCAAGTTTCAAG
AGAAAGGTTACACTGGTGGAGTTAATTACTACCGCAATTTTGACCTAAACAATGAGCTGT
TGGGCCCATGGGTAGGATGCAAAATCCAGGTACCTACAAAATTTGTGATCGGGGACCAGG
ATCTGGTCT

QA 2 550 2 550
DS 

RD RS1B191JQ 723 0 0
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CGACGATTTCTACATGTGTAGGTTTCAGGAAGCGGGAGAAATAGAAGCTGAGATTGCAGA
GGTTGGGGTTGAGAGAGTAGTGAGGAAGATACTCACATATAGAACACCTCGACCGCTTAT
TTTGCCCAAGGATAAAAGCTTTTGGGGACCTAAAGACGAAACTATTCCTTTACCGTCATG
GCTAACGGAGGAAGATGTTGCTTACTATGTTAGCAAGTTTCAAGAGAAAGGTTACACTGG
TGGAGTTAATTACTACCGCAATTTTGACCTAAACAATGAGCTGTTGGGTCCATGGGTAGG
ATGCAAAATCCAGGTACCTACAAAATTTGTGATCGGGGACCAGGATCTGGTCTACCATTT
TCCGGGTGCGAAGGAATACATACATGGTCCCAAGTTCAAGGAAGACGTTCCTTTGCTCGA
AGAGCCTGTGGTCATGGAGGGGGTTGCTCACTTCATTAACCAAGAGAAGCCACAAGAGAT
CCTCCAAATTATCGTTGACTTCATCTCCAAATTCTAGTCTTGCTTTCCTCAAGCCACCTT
GTAAGTTCCATACCTGAAGAGCATATATGCTTAATAAGTTGAACAATGAGGGTTATGGTT
ATATGTATTATAAAGTTGTTGTGTACGTTTTACGGAAGTTTTTTTTTTCTAAAGACCCGT
TAT

QA 1 723 1 723
DS 



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GTGGCGATCCAAGGCCCTTCCGATGGTCCTGTAGTCCTCCTCATCCATGGATTCCCAACT
CTTTGGTACTCATGGCGTCACCAGATCCCCGGACTCGCTGCTCTCGGATACCGCGCCGTC
GCTCCTGACTTACGCGGTTACGGTGACTCCGACGCTCCGCCTGAGATCTCTTCCTACACT
TGCCTCCACATGGTTGGTGACCTGATCGCTGTCATATCCGCCTTAACCGAAGATAAAGTG
TTTGTGGTTGGACATAATTGGGGAGCTCTGATCGCTTGGTATCTTTGTCTTTTCCGACCT
GATAAAGTCAAAGCTCTGGTCAACCTCTCTGTTCCTTTCTCTTTTGGTCCTAAAGATTCT
ACCGTTAAACCTCTTGACGCGCTGCGTAAGTTCTATGGCGACGATTTCTACATGTGTAGG
TTTCAGGTTCGTTCGTTTTTTCTGCTTCCCCCTGGAGAGGATTTTAAAATCTATATCATT
AATTAGTTTTAGAAGTTCTGTAAAAATCCCTATTTAATTTATGTATTTTTTCAGGTTTCT
TTGGCAAATTGTGTATACCTATGCATACATATTCATAGTAAAGGTTTTATGATC


BQ
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AF RS1FD02JQ C 1
AF RS1FD02TF U 2
BS 1 19 RS1FD02JQ
BS 20 654 RS1FD02TF

RD RS1FD02JQ 654 0 0
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GTGGCGATCCAAGGCCCTTCCGATGGTCCTGTAGTCCTCCTCATCCATGGATTCCCAACT
CTTTGGTACTCATGGCGTCACCAGATCCCCGGACTCGCTGCTCTCGGATACCGCGCCGTC
GCTCCTGACTTACGCGGTTACGGTGACTCCGACGCTCCGCCTGAGATCTCTTCCTACACT
TGCCTCCACATGGTTGGTGACCTGATCGCTGTCATATCCGCCTTAACCGAAGATAAAGTG
TTTGTGGTTGGACATAATTGGGGAGCTCTGATCGCTTGGTATCTTTGTCTTTTCCGACCT
GATAAAGTCAAAGCTCTGGTCAACCTCTCTGTTCCTTTCTCTTTTGGTCCTAAAGATTCT
ACCGTTAAACCTCTTGACGCGCTGCGTAAGTTCTATGGCGACGATTTCTACATGTGTAGG
TTTCAGGTTCGTTCGTTTTTTCTGCTTCCCCCTGGAGAGGATTTTAAAATCTATATCATT
AATTAGTTTTAGAAGTTCTGTAAAAATCCCTATTTAATTTATGTATTTTTTCAGGTTTCT
TTGGCAAATTGTGTATACCTATGCATACATATTCATAGTAAAGGTTTTATGATC

QA 1 654 1 654
DS 

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TGGAGCACCGAAAGATAAGAGGTAACGGCGTAGACATCCACGTGGCGATCCAAGGCCCTT
CCGATGGTCCTGTAGTCCTCCTCATCCATGGATTCCCAACTCTTTGGTACTCATGGCGTC
ACCAGATCCCCGGACTCGCTGCTCTCGGATACCGCGCCGTCGCTCCTGACTTACGCGGTT
ACGGTGACTCCGACGCTCCGCCTGAGATCTCTTCCTACACTTGCCTCCACATGGTTGGTG
ACCTGATCGCTGTCATATCCGCCTTAACCGAAGATAAAGTGTTTGTGGTTGGACATAATT
GGGGAGCTCTGATCGCTTGGTATCTTTGTCTTTTCCGACCTGATAAAGTCAAAGCTCTGG
TCAACCTCTCTGTTCCTTTCTCTTTTGGTCCTAAAGATTCTACCGTTAAACCTCTTGACG
CGCTGCGTAAGTTCTATGGCGACGATTTCTACATGTGTAGGTTTCAGGTTCGTTCGTTTT
TTCTGCTTCCCCCTGGAGAGGATTTTAAAATCTATATCATTAATTAGTTTTAGAAGTTCT
GTAAAAATCCCTATTTAATTTATGTATTTTTTCAGGTTTCTTTGGCAAATTGTGTATACC
TATGCATACATATTCATAGTAAAGGTTTTATGATC

QA 19 653 19 653
DS 



AS 1 4

CO CL716Contig1 902 4 16 U
GCCAACATACAATCAACACAAAAGATGGCTACTGGATAATAGAATTCAAAAGATAAAAAA
GCTTAAGATGATGAAATCATAAATATGCACTAATTTGATCAACAAAAGCAAAATATAATT
TTATCAAAACCTCATGTTGGCTTTTCTCATCTTCTTCTTTGTCTCCCCTGTTTTTTGTTA
TATATTAAAACCTAGCCATGTTACATTATGGACCCTCACCAGTTCGTCCTCTTTAGACCC
CAAACTTCTAGAGAGAGAGA*****GCCAAGACTTCTTTAATCTTCTTCTTCTGATCCTC
CGTGAGAGACGAAGGAAATAAAACCTCAAAAGTAACAAAAAGGTTGCCTTTCTTTGTGCT
GTAGTGAAGTGGCATCCCTTCTCCTTTAAACTTCTTCACTTCCTTGGGCTTTGTAATTCC
CTTGGAACTGATGTCAACTTCGTGCTCATCCAAGTGTTTGAATGATTTCTCAAATCCAAC
TAGCGCCTCAACCAGTGTAATGTTGACGGTCATGTGTAGATCGTTGCCATCTCTCCGGAA
ACGGGCATGTGGTGCAGTTTTTATTCGGAACTTAAGGTCACCAGGGTCACCGTCGAGAAT
GGGCTCACCATCTTCGTAGAAAGACACTTCTTCTCCGTCTTTCATTCCTTTCTCAATATC
AACTGTGACAAAGTATCCTTCGCGTTCGAACTTAACATTTGGGGGTT*GTCACAGACCTG
CTCTGTCATCTGTTGAAACATTCCAGGGCCAATTTGCCTGTGATAAACCTCATCTCTGCA
GTTGCAATTTCTCTTTCCAGGAGCTGGTTTTATTACATTCTTCTCCCTCCATACCTTCAT
AGAGCCTCCCATGTATAAATCTTCTAGAGTGGCCTCAAGTTCGACAATCACGTCATCACC
CC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RS1DZ10JQ U 1
AF RS1H106JQB U 87
AF RS1BE42JQ U 180
AF RS1BE42TF C 196
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BS 476 703 RS1H106JQB
BS 704 705 RS1BE42JQ
BS 706 707 RS1H106JQB
BS 708 708 RS1BE42JQ
BS 709 840 RS1H106JQB
BS 841 897 RS1BE42JQ
BS 898 902 RS1BE42TF

RD RS1DZ10JQ 313 0 0
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GCTTAAGATGATGAAATCATAAATATGCACTAATTTGATCAACAAAAGCAAAATATAATT
TTATCAAAACCTCATGTTGGCTTTTCTCATCTTCTTCTTTGTCTCCCCTGTTTTTTGTTA
TATATTAAAACCTAACCATGTTACATTATGGACCCTCACCAGTTCGTCCTCTTTAGACCC
CAAACTTCTAGAGAGAGAGAACTAAGCCAAGACTTCTTTAATCTTCTTCTTCTGATCCTC
CGTGAGAGACGAA

QA 1 313 1 313
DS 

RD RS1H106JQB 754 0 0
A
CACTAATTTGATCAACAAAAGCAAAATATAATTTTATCAAAACCTCATGTTGGCTTTTCT
CATCTTCTTCTTTGTCTCCCCTGTTTTTTGTTATATATTAAAACCTAGCCATGTTACATT
ATGGACCCTCACCAGTTCGTCCTCTTTAGACCCCAAACTTCTAGAGAGAGAGAACTAAGC
CAAGACTTCTTTAATCTTCTTCTTCTGATCCTCCGTGAGAGACGAAGGAAATAAAACCTC
AAAAGTAACAAAAAGGCTGCCTTTCTTTGTGCTGTAGTGAAGTGGCATCCCTTCTCCTTT
AAACTTCTTCACTTCCTTGGGCTTTGTAATTCCCTTGGAACTGATGTCAACTTCGTGCTC
ATCCAAGTGTTTGAATGATTTCTCAAAACCAACTAGCGCCTCAACCAGTGTAATGTTGAC
GGTCATGTGTAGATCGTTGCCATCTCTCCGGAAACGGGCATGTGGTGCAGTTTTTATTCG
GAACTTAAGGTCACCAGGGTCACCGTCGAGAATGGGCTCACCATCTTCGTAGAAAGACAC
TTCTTCTCCGTCTTTCATTCCTTTCTCAATATCAACTGTGACAAAGTATCCTTCGCGTTC
GAACTTAACATTTGGGCATTTGTCACAGACCTGCTCTGTCATCTGTTGAAACATTCCAGG
GCCAATTTGCCTGTGATAAACCTCATCTCTGCAGTTGCAATTTCTCTTTCCAGGAGCTGG
TTTTATTACATTCTTCTCCCTCCATACCTTCAT

QA 2 754 2 754
DS 

RD RS1BE42JQ 718 0 0
ATATATTAAAACCTAGCCATGTTACATTATGGACCCTCACCAGTTCGTCCTCTTTAGACC
CCAAACTTCTAGAGAGAGAGA*****GCCAAGACTTCTTTAATCTTCTTCTTCTGATCCT
CCGTGAGAGACGAAGGAAATAAAACCTCAAAAGTAACAAAAAGGTTGCCTTTCTTTGTGC
TGTAGTGAAGTGGCATCCCTTCTCCTTTAAACTTCTTCACTTCCTTGGGCTTTGTAATTC
CCTTGGAACTGATGTCAACTTCGTGCTCATCCAAGTGTTTGAATGATTTCTCAAATCCAA
CTAGCGCCTCAACCAGTGTAATGTTGACGGTCATGTGTAGATCGTTGCCATCTCTCCGGA
AACGGGCATGTGGTGCAGTTTTTATTCGGAACTTAAGGTCACCAGGGTCACCGTCGAGAA
TGGGCTCACCATCTTCGTAGAAAGACACTTCTTCTCCGTCTTTCATTCCTTTCTCAATAT
CAACTGTGACAAAGTATCCTTCGCGTTCGAACTTAACATTTGGGGGTT*GTCACAGACCT
GCTCTGTCATCTGTTGAAACATTCCAGGGCCAATTTGCCTGTGATAAACCTCATCTCTGC
AGTTGCAATTTCTCTTTCCAGGAGCTGGTTTTATTACATTCTTCTCCCTCCATACCTTCA
TAGAGCCTCCCATGTATAAATCTTCTAGAGTGGCCTCAAGTTCGACAATCACGTCATC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1BE42TF 707 0 0
GCCATG
TACATTATGGACCCTCACCAGTTCGTCCTCTTTAGACCCCAAACTTCTAGAGAGAGAGA*
****GCCAAGACTTCTTTAATCTTCTTCTTCTGATCCTCCGTGAGAGACGAAGGAAATAA
AACCTCAAAAGTAACAAAAAGGTTGCCTTTCTTTGTGCTGTAGTGAAGTGGCATCCCTTC
TCCTTTAAACTTCTTCACTTCCTTGGGCTTTGTAATTCCCTTGGAACTGATGTCAACTTC
GTGCTCATCCAAGTGTTTGAATGATTTCTCAAATCCAACTAGCGCCTCAACCAGTGTAAT
GTTGACGGTCATGTGTAGATCGTTGCCATCTCTCCGGAAACGGGCATGTGGTGCAGTTTT
TATTCGGAACTTAAGGTCACCAGGGTCACCGTCGAGAATGGGCTCACCATCTTCGTAGAA
AGACACTTCTTCTCCGTCTTTCATTCCTTTCTCAATATCAACTGTGACAAAGTATCCTTC
GCGTTCGAACTTAACATTTGGGGGTT*GTCACAGACCTGCTCTGTCATCTGTTGAAACAT
TCCAGGGCCAATTTGCCTGTGATAAACCTCATCTCTGCAGTTGCAATTTCTCTTTCCAGG
AGCTGGTTTTATTACATTCTTCTCCCTCCATACCTTCATAGAGCCTCCCATGTATAAATC
TTCTAGAGTGGCCTCAAGTTCGACAATCACGTCATCACCCC

QA 7 707 7 707
DS 



AS 1 2

CO CL717Contig1 908 2 2 U
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CCACCCCCAGGGAAGAAGAGATCGAAGTGTGGTTTTCTTCATAGCCGGTGAATTAAAGCA
AGATCCTCTAAGTAACCATGATGAATCGTCTGTTCGGGAAACCAAAGGTGGAGAACAATG
CTCTCCAGACATTAGACAAGCTTAACGAGACACTAGAGATGCTAGAGAATAAGGAGAAGG
TACTCTTGAAGAAGGCTGGTCAAGAGGTTGAGAAGGCTAAAGAATACACTCGTGCTAAGA
ACAAACGCGCGGCTATACAGTGTTTGAAAAGAAAGAGGTTATATGAGCAACAAGTCGAAC
AGCTTGGCAATTTCCAGCTCCGTATTCATGATCAAATGATTATGTTGGAAGGCGCAAAAG
CAACAACTGAAACTGTTGATGCGTTGAGGAGTGGAGCTTCCGCAATGAAAGCAATGCAGC
AGCCGACTTCGATGAGGATGAACTAGAAGCAGAGTTGGAAGAACTAGAAGGTGCAGAGCT
TGAAGAGCAGCTTCTTCAGCCCACCACAGTATTGCCTTCGGTTCCTGTGCCTGCAGGGCG
TCAAGCAGCACGTCCTACTCCTAAGCGGACCGCAGAGGAGGAAGAACTTGCTGCATTACA
GGCTGAGATGGCCCTCTAAGGTTGTATTCACGAACCTGAGCAGACCTGTATGCATTGATA
AACCAAGAACAGGCGATGTATATAAGGATCTCAATGTCAAAATTTAAAACCTGAGCGAAA
CTTATAATAAATAATCCTCGTCGTGCAATGTTATTTTTAATCAACATTTGACTGTTTCTT
CTTCTTCACATATACTATTTATCTTTTGTATTTGATTTTGGTAATCGGATGGGTTACTTA
CTACGTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H707TF U 1
AF RS1H707JQB C 441
BS 1 657 RS1H707TF
BS 658 908 RS1H707JQB

RD RS1H707TF 657 0 0
GGGGAACACAAACACGGAAGAACCTAACCAAACCAAACCAGCAAAGTCCTAAGATCTCCC
CCACCCCCAGGGAAGAAGAGATCGAAGTGTGGTTTTCTTCATAGCCGGTGAATTAAAGCA
AGATCCTCTAAGTAACCATGATGAATCGTCTGTTCGGGAAACCAAAGGTGGAGAACAATG
CTCTCCAGACATTAGACAAGCTTAACGAGACACTAGAGATGCTAGAGAATAAGGAGAAGG
TACTCTTGAAGAAGGCTGGTCAAGAGGTTGAGAAGGCTAAAGAATACACTCGTGCTAAGA
ACAAACGCGCGGCTATACAGTGTTTGAAAAGAAAGAGGTTATATGAGCAACAAGTCGAAC
AGCTTGGCAATTTCCAGCTCCGTATTCATGATCAAATGATTATGTTGGAAGGCGCAAAAG
CAACAACTGAAACTGTTGATGCGTTGAGGAGTGGAGCTTCCGCAATGAAAGCAATGCAGC
AGCCGACTTCGATGAGGATGAACTAGAAGCAGAGTTGGAAGAACTAGAAGGTGCAGAGCT
TGAAGAGCAGCTTCTTCAGCCCACCACAGTATTGCCTTCGGTTCCTGTGCCTGCAGGGCG
TCAAGCAGCACGTCCTACTCCTAAGCGGACCGCAGAGGAGGAAGAACTTGCTGCATT

QA 1 657 1 657
DS 

RD RS1H707JQB 468 0 0
GCGTTGAGGAGTGGAGCTTCCGCAATGAAAGCAATGCAGCAGCCGACTTCGATGAGGATG
AACTAGAAGCAGAGTTGGAAGAACTAGAAGGTGCAGAGCTTGAAGAGCAGCTTCTTCAGC
CCACCACAGTATTGCCTTCGGTTCCTGTGCCTGCAGGGCGTCAAGCAGCACGTCCTACTC
CTAAGCGGACCGCAGAGGAGGAAGAACTTGCTGCATTACAGGCTGAGATGGCCCTCTAAG
GTTGTATTCACGAACCTGAGCAGACCTGTATGCATTGATAAACCAAGAACAGGCGATGTA
TATAAGGATCTCAATGTCAAAATTTAAAACCTGAGCGAAACTTATAATAAATAATCCTCG
TCGTGCAATGTTATTTTTAATCAACATTTGACTGTTTCTTCTTCTTCACATATACTATTT
ATCTTTTGTATTTGATTTTGGTAATCGGATGGGTTACTTACTACGTAC

QA 1 468 1 468
DS 



AS 1 7

CO CL718Contig1 1007 7 19 U
GGACACTTCCACTACAAAAGAGAGGTCGTTCGTTGACACACAGATAAGTGTTTCAGAGAG
AGAGAAGTCTCGATGGCGTCTGTAGCTTCTTCAACCACTCTCATCTCCTCCTCCACCAGA
GCTCTCCCAGCCAAGTCTCCGCTTCCATCTCCCTCCATCTCTTTCCTTCCAACCCTCTCT
TCTCCTCTCCGCTCTGGGTTTTCTCAACGCTCTTCCCTCACCTCAATCCGCTCCACTTCT
CGCCGGAGCTTCGCTGTCAAGGCTCAAACCGATGATCTTCCATTGGTTGGAAACAAGGCG
CCTGATTTTGAGGCTGAGGCTGTGTTCGATCAGGAGTTCATCAAGGTTAAGCTCTCTGAG
TACATTGGGAAGAAGTATGTGATTCTCTTTTTCTACCCTTTGGACTTCACTTTCGTCTGC
CCAACAGAGATTACTGCCTTCAGTGACCGGTATGCAGAATTTGAGAAGTTGAACACAGAA
GTGTTAGGTGTCTCTGTTGATAGTGTGTTCTCCCACCTTGCTTGGGTTCAAACTGACAGA
AAATCTGGAGGACTTGGTGATCTCAACTACCCCCTTGTATCAGATGTCACTAAATCAATC
TCAAAATCTTTTGGAGTGCTCATCCCTGACCAGGGAATAGCGTTGAGAGGGCTTTTCATA
ATAGACAAGGAAGGAGTGATCCAACATTCAACCATCAACAATCTTGGTATTGGCCGAAGT
GTTGATGAGACAATGAGAACCCTTCAGGCACTACAGTACATCCAGGAGAACCCTGATGAA
GTCTGCCCTGCAGGATGGAAACCAGGGGAGAAGTCAATGAAACCTGACCCCAAGCTCAGC
AAAGAGTATTTTTCAGCTATTTAGAAATATCTACGAAACCTTTATTATATGTGAGCTGAG
TTTTTTTT*CTTTTAAGCGCCGAACAATCCGTTGTTTGGATCTCCACTTTGTTCCCCCAG
AATCCTTAAAACTTACATTTTCCATTAATAAAAGTCTTGTTATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 15 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 5 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

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AF RS1E176TF U 44
AF RS1EL79TF U 44
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TCTGAGTACATTGGGAAGAAGTATGTGATTCTCTTTTTCTACCCTTTGGACTTCACTTTC
GTCTGCCCAACAGAGATTACTGCCTTCAGTGACCGGTATGTAGAATTTGAGAAGTTGAAC
ACAGAAGTGTTAGGTGTCTCTGTTGATAGTGTGTTCTCCCACCTTGCTTGGGTTCAAACT
GACAGAAAATCTGGAGGACTTGGTGATCTCAACTACCCCCTTGTATCAGATGTCACTAAA
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TTCGTAATAGA

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TCTGAGTACATTGGGAAGAAGTATGTGATTCTCTTTTTCTACCCTTTGGACTTCACTTTC
GTCTGCCCAACAGAGATTACTGCCTTCAGTGACCGGTATGCAGAATTTGAGAAGTTGAAC
ACAGAAGTGTTAGGTGTCTCTGTTGATAGTGTGTTCTCCCACCTTGCTTGGGCTCAAACT
GACAGAAAATCTGGAGGACTTGGTGATCTCAACTACCCCCTTGTATCAGATGTCACTAAA
TCAATCTCAAGATCTTTTGGAGTGCTCATCCCTGACCAGGGAATAGCGTTGAGAGGGCTT
TTCATAATAGACAAGGAAGGAGTGATCCAACATTCAACCATCAACAATCTTGGTATTGGC
CGAAGTGTTGATGAGACAATGAGAACCCTTCAG*CACTACAGTACATCCAGGAGAACCCT
GATGAAGTCTGCC
T

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GACCGGTATGCAGAATTTGAGAAGTTGAACACAGAAGTGTTAGGTGTCTCTGTTGATAGT
GTGTTCTCCCACCTTGCTTGGGCTCAAACTGACAGAAAATCTGGAGGACTTGGTGATCTC
AACTACCCCCTTGTATCAGATGTCACTAAATCAATCTCAAGATCTTTTGGAGTGCTCATC
CCTGACCAGGGAATAGCGTTGAGAGGGCTTTTCATAATAGACAAGGAAGGAGTGATCCAA
CATTCAACCATCAACAATCTTGGTATTGGCCGAAGTGTTGATGAGACAATGAGAACCCTT
CAGGCACTACAGTACATCCAGGAGAACCCTGATGAAGTCTGCCCTGCAGGATGGAAACCA
GGGGAGAAGTCAATGAAACCTGACCCCAAGCTCAGCAAAGAGTATTTTTCAGCTATTTAG
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DS 

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TACCCCCTTGTATCAGATGTCACTAAATCAATCTCAAAATCTTTTGGAGTGCTCATCCCT
GACCAGGGAATAGCGTTGAGAGGGCTTTTCATAATAGACAAGGAAGGAGTGATCCAACAT
TCAACCATCAACAATCTTGGTATTGGCCGAAGTGTTGATGAGACAATGAGAACCCTTCAG
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GAGAAGTCAATGAAACCTGACCCCAAGCTCAGCAAAGAGTATTTTTCAGCTATTTAGAAA
TATTTACGAAACCTTTATTATATGTGAGCTGAGTTTTTTTT*CTTTTAAGCGCCGAACAA
TCCGTTGTTTGGATCTCCACTTTGTTCCCCCAGAATCCTTAAAACTTACATTTTCCATTA
ATAAAAGTCTTGTTATCTC
C

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CATCCCTGACCAGGGAATAGCGTTGAGAGGGCTTTTCGTAATAGACAAGGAAGGAGTGAT
CCAACATTCAACCATCAACAATCTTGGTATTGGCCGAAGTGTTGATGAGACAATGAGAAC
CCTTCAGGCATTACAGTACATCCAGGAGAACCCTGATGAAGTTTGCCCTGCAGGATGGAA
ACCAGGGGAGAAGTCAATGAAACCTGACCCCAAGCTCAGCAAAGAGTATTTTTCAGCTAT
TTAGAAATATCTACGAAACCTTTATTATATGTGAGCTGAGTTTTTTTTTCTTTTAAGCGC
CGAACAGTCCGTTGTTTGGATCTCCACTTTGTTCCCCCAGAATCCTTAAAACTTACATTT
TCCATTAATAAAAGTCTTGTTATCTCC

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DS 



AS 2 7

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GCTGAGATGCTCAAGTTGGTCCAAACAATGGATTATGCAACTATTGTCTTTGACACAGCT
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AAATTGATGTCCTTGAAGAGTCGCTTTGGTGGCT*GATGAATCAGATGAGCCGTATGTTT
GGCATGGAGGGTGAGTTTGGGG*AGGATGCTCTCTTGGGAAGACTTGAGGGCTTGAAAGA
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TTGAGATCGACACGCATAACATCATCATCACCAGTGCTATACGATGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1GU56TF U 22
AF RS1GP06TF U 22
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TCCCACTCTCGTTCAAGGCTTCTCCAATCTCTTTGCCATGGAGGTGGATCCTACTGTTGA
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CATCCCTGGTATCGATGAGGCCATGAGTTTTGCTGAGATGCTCAAGTTGGTCCAAACAAT
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TGGCT*GATGAATCAGATGAGCCGTATGTTTGGCATGGAGGGTGAGTTTGGGGGAGGATG
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ACCAGTGCTATACGATGA

QA 9 806 9 806
DS 



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ATAAAACTGATCCAGGTACTTCTGCTGCATCCTCATCCTTGCTCTTAGCAACTTGGATTC
CACATCTTCGTCATCGTATAGCACTTGGTTGATGATAATGTTATGCGTGTCGATCTCAAA
CTTTGCGAGTTCCTGAACTAATCTCTCCGTTTCATAGAGAGACAAGAACTCAAGAATGCA
GACGCAAACGAACGTTGTCAAATCCGGGTCTTTAAACTGGCGATTGACTTGTTCAATGAC
ATCCTTCAAGCCCTCAAGTCTACCCAAGAGAGCATCCTCTCCAAACTCATCCTCCATGCC
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GAGATTGGAGAAGCCTTGAACCAAAGTGGGAGAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GP06JQ U 1
AF RS1GU56JQ U 1
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AF RS1AQ57TFB C 470
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RD RS1GP06JQ 673 0 0
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CTTTGCGAGTTCC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RS1GU56JQ 799 0 0
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CCACTTGAAGAACTAGAGAGAAGAGAGAGAGAGAG**ACATTTGAGTACACCAAAAAAAA
CCTTATAGTTTTCCACCTATAAATTCTTTAAAAAAAAACAGAAACAACAAGAACGCTCAG
ATCCAGAAGTCTGCCATGTAGGAAGCAATTGAGTTCCGAGTATCTTCTTATGGTTGAGAA
AGAAACTTTTGGGATAGAACAAATCCTTCAACTCTTGAACCGTTCCAGTTCTTCTTCCGC
TGTTTTCAACTGCAATCGCAACGTGTGCACTTTCCTCTCCAGGTCTTCTACGTTGCTTCT
GCTTGTCGTGGGATGGTACGGCGTCAGGAACTTATCCGAGAATGCCTTTAAGGGTTCCAC
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ATAAAACTGATCCAGGTACTTCTGCTGCATCCTCATCCTTGCTCTTAGCAACTTGGATTC
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QA 1 799 1 799
DS 

RD RS1AQ57JQ 811 0 0
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GGTTGCGAAAGAAACTTTTGGGATAGAACAAATCCTTCAACTCTTGATCCGTTCCAGTTC
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GTTGTTTCTGCTTGTAGTGGGATGGTACGGCGTCATGAACTTATCCGAGAATGCCTTTAA
GGCTTCCACCCCTGTCACCTCTTCCGGAAGCAGAGGAAGTTTTGTGATATTGAAGTCATC
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CTTGGATTCCACATCTTCGTCATCGTATAGCACTTGGTTGATGATAATGTTATGCGTGTC
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CATCAATTTAGAAAGGCCCTTTTCAAGAGTG

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DS 

RD RS1AQ57TFB 705 0 0
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GACATCAATTTAGAAAGGCCCTTTTCAAGAGTGGTAGGGAACTGCAAGAGACGGAGAGTG
TGGCCAGTAGGAGCGGTGTCAAAGACAATAGTTGCATAATCCATTGTTTGGACCAACTTG
AGCATCTCAGCAAAACTCATGGCCTCATCGATACCAGGAATAGCATTGGCCAAGTCAGAG
AATAAACCATCCATCCCTTCAGGACCAGCTAAGTCATCAGTTTCAACAGTAGGATCCACC
TCCATGGCAAAGAGATTGGAGAAGCCTTGAACCAAAGTGGGAGAC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 7

CO CL720Contig1 822 7 12 U
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CAAAGGCAAATCCGTGATGGGTGCTGGTCGGAGATGGGCCGTCGATTTCTCGGACCAATC
CACTGTTCCATCTTCCCGCGACATCCTCGATCCCCCTGGGTTCTCTCGTGCTTCTCCCGA
ACAGGATGACTCAGCAACGAGCCGCCAAAAGAAAGACGCTGAAGCTAATTGGAAACTTCA
GAAAGCATGGGAAGTAGCGCAATCACCATTTAAGAATCTGATGATGATGGGTTTCATGAT
GTGGATGGCTGGCAACACTGTTCATCTCTTTAGCATTGGTATTACTTTCTCTGCTCTTTG
GCAGCCTCTCAGCGCCCTCCAGAGCGTTGGAAAGATTTTTGAGCCATTCAAGGATAATAA
AGTGGAACTACTTATGCCCAAACTAGTGTTTCTTGCCCTTAACCTTGGAGGCTTAGCTTT
GGGTATCTGGAAGCTCAATACTTTGGGGCTTCTTCCAACGCATGCATCAGATTGGGTTTC
ATCTCTACCACCTCCTCAGGAAGTTGAACACTCTGGCGGAGGATTTGCTTTCCACTGATG
AGATAACTACAAAAGATACTT*GAGTGATTTGTTCAATCCTGACATGAGGGGACCTTGTC
ATCTTGTGATCTTCTTGTAGCATTTTCAAAACTCAGAAACCATAGCTTTTTCACTTTCTA
GTATGATGTTCATTGCTCATCATAACTATGGATTGTATTATTTGGCACTTGAGCTACCTG
CTTCCCAGCTTTTTTAGACACGAATAGATAAAGTTCCAGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 10 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 20 35 35 10 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1GX49TF U 12
AF RS1C164TF U 1
AF RS1GM44TF U 15
AF RS1CY30TF U 27
AF RS1C164JQ C 34
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AF RS1GX49JQ C 456
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BS 649 679 RS1C164TF
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GGCTCT
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TGGGTGCTGGTCGGAGATGGGCCGTCGATTTCTCGGACCAATCCACTGTTCCATCTTCCC
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CGAGCCGCCAAAAGAAAGACGCTGAAGCTAATTGGAAACTTCAGAAAGCATGGGAAGTAG
CGCAATCACCATTTAAGAATCTGATGATGTTGGGTTTCATGATGTGGATGGCTGGCAACA
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TCCAGAGCGTTGGAAAGATTTTTGAGCCATTCAAGGATAATAAAGTGGAACTACTTATGC
CCAAACTAGTGTTTCTTGCCCTTAACCTTGGAGGCTTAGCTTTGGGTATCTGGAAGCTCA
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CACTGTTCCATCTTCCCGCGACATCCTCGATCCCCCTGGGTTCTCTCGTGCTTCTCCCGA
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ATCTTGTGATCTTCTTGTA

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GGC
TCTTCTTCTTCCCCGACAGATCGAAGAAGTAACGTTAGATGGACAAAGGCAAAGCAGTGG
TGGGTGCTGGTCGGAGATGGGCCGTCGATTTCTCGGACCAATCCACTGTTCCATCTTCCC
GCGACATCCTCGATCCCCCTGGGTTCTCTCGTGCTTCTCCCGAACAGGATGACTCAGCAA
CGAGCCGCCAAAAGAAAGACGCTGAAGCTAATTGGAAACTTCAGAAAGCATGGGAGGTAG
CGCAATCGCCATTTAAGAATCTGATGATGATGGGTTTCATGATGTGGATGGCTGGAAACA
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TCCAGAGCGTTGGAAAGATTTTTGAGCCATTCAAGGATAATAAAGTGGAACTACTTATGC
CCAAACTAGTGTTTCTTGCCCTTAACCTTGGAGGCTTAGCTTTGGGTATCTGGAAGCTCA
ATACTTTGGGGCTTCTTCCAACACATGCATCAGATTGGGTTTCTTCTCTACCACCTCCTC
AGGAAGTTGAACACTCTGGCGGAGGATTTGCTTTCCACTGATGAGATAACTGCAAAAGAT
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CATCATAACTATGGATTGTATTATTTGGCACTTGAGCTACCTGCTTCC
A

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DS 

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GG
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GATCCCCCTGGCTTCTCTCGTGCCTCTCCCGAACAGGATGACTCAGCAACGAGCCGCCAA
AAGAAAGACGCTGAAGCTAACTGGAAACTTCAGAAAGCATGGGAGGTAGCGCAATCACCA
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TTTAGCATTGGTATTATTTTCTCTGCTCTTTGGCAGCCTCTCAGCGCCCTCCAGAGCGTT
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TTTCTTGCCCTTAACCTTGGAGGCTTAGCTTTGGGTATCTGGAAGCTCAATACTTTGGGG
CTTCTTCCAACACATGCATCAGATTGGGTTTCTTCTCTACCACCTCCTCAGGAAGTTGAA
CACTCTGGCGGAGGATTTGCTTTCCACTGATGAGATAACTACAAAAGATACTT*GAGTGA
TTTGTTCAATCCTGACATGAGAGGACCTTGTCATCTTGTGATCTTCTTGTAGCATTTTCA
AA*CTCAGAAACCATAGCTTTTTCACTTTCTAGTATGATGTTCATTGCTCATCATAACTA
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AGACACCG

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ATGGGCCGTCGATTTCTCGGACCAATCCACTGTTCCATCTTCCCGCGACATCCTCGATCC
CCCTGGGTTCTCTCGTGCTTCTCCCGAACAGGATGACTCAGCAACGAGCCGCCAAAAGAA
AGACGCTGAAGCTAATTGGAAACTTCAGAAAGCATGGGAAGTAGCGCAATCACCATTTAA
GAATCTGATGATGATGGGTTTCATGATGTGGATGGCTGGCAACACTGTTCATCTTTTTAG
CATTGGTATTACTTTTTCTGCTCTTTGGCAGCCTCTCAGCGCCCTCCAGAGCGTTGGAAA
GATTTTTGAGCCATTCAAGGATAATAAAGTGGAACTACTTATGCCCAAACTAGTGTTTCT
TGCCCTTAACCTTGGAGGCTTAGCTTTGGGTATCTGGAAGCTCAATACTTTGGGGCTTCT
TCCAACGCATGCATCAGATTGGGTTTCATCTCTACCACCTCCTCAGGAAGTTGAACACTC
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CAGAAACCATAGTTTTTTCACTTTCTAGTATGATGTTCATCGCTCATCATAACTATGGAT
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TTCCAGAC

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DS 

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CCCTCCAGAGCGTTGGAAAGATTTTTGAGCCATTCAAGGATAATAAAGTGGAACTACTTA
TGCCCAAACTAGTGTTTCTTGCCCTTAACCTTGGAGGCTTAGCTTTGGGTATCTGGAAGC
TCAATACTTTGGGGCTTCTTCCAACACATGCATCAGATTGGGTTTCTTCTCTACCACCTC
CTCAGGAAGTTGAACACTCTGGCGGAGGATTTGCTTTCCACTGATGAGATAACTGCAAAA
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TAGACACCAATAGATAAAGTTCCAGAC

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AATCCTGACATGAGGGGACCTTGTCATCTTGTGATTTTCTTGTAGCATTTTCAAAACTCA
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TATTATTTGGCACTTGAGCTACCTGCTTCCCAGCTTTTTTAGACACGAATAGATAAAGTT
CCAGACT

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DS 



AS 1 5

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ATCACAGTAATTAACCGTAACCACCTCTCTCCCTCTCTCTCTCACACACACACACACACA
CACACACACACACACA******AAACTACCGAGTCTTGATCGTCTTTCATTCAAGATGAA
GCCGCTTCTGCTTCTTTTTCTTCTGCGTTTCCTTGTGATGTGGCTTCTTCTCCTTCAGCT
TCACTGGGCTTTTCTGGTCCAGGTCCAGCTGATACTTTCACCATTGAAGGACGTAAAAGC
CTTTCCCCTAGCAAGAAACCTTTCCTGTATTCTTCAAGTACTATACCTTCTTCATATTCT
GCAGAATCCTCCCTCATTATTGCCTCATGAAGCATTGGATCAAACTGCTTGCCAACTGTC
TCCACAGTGACCACACCGAGCGACCCCAGAATCTCCACAAACTGTTTGTATATGCTCTGA
TAGCTATTAGTAACTTTCTCCTCTCCTTCAGTCTCCACTTTAATCTGAGACTTAGCTCTC
TCGAAATTATCCAAAACAGCCAAAAGATTCTCCACAACCTCTCCCTGAGCATTGGAAACA
AGGTTCAGCCTTTCCCTCTCCGTCCTCTTCCTGAAATTGTCGAAATCCGCACTGATTCTT
ATCAGCCGATCCCTCTCCACAGTTAGCTCATTGGTTAAAGATGCTACTTTATCCTCGAGC
TGAAACTTTTCGTCTTCAATGGACTTCAGTGATGCTTCTATCTCAGCAATCTTCTCCTCG
TTGTTCTCTGCTAAAGCTTCTTTATACGAATTCAGCAATGCTATGGTAACCCCCGCTTCT
TCCTCAGAGCCAGTGTCTTCTTCACTCTCAACACCAACAGCACCATCCGTCTCCTGGGCT
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AGACCGGCCATCGGAGAGTTGGGTGAAAGAGTTTGCGGCGAGGGATAAGGAAGAGAGAGA
AAGAGAGGGAAACAGTTTTCTCTCTCCTTCTTGTGTAAATCTCCTTTCTTCCC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1FU15TF C 448
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DS 

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ACAGTAATTAACCGTAACCACCTCTCTCCCTCTCTCTCTCACACACACACACACACACAC
ACACACACACACA******AAACTACCGAGTCTTGATCGTCTTTCATTCAAGATGAAGCC
GCTTCTGCTTCTTTTTCTTCTGCGTTTCCTTGTGATGTGGCTTCTTCTCCTTCAGCTTCA
CTGGGCTTTTCTGGTCCAGGTCCAGCTGATACTTTCACCATTGAAGGACGTAAAAGCCTT
TCCCCTAG***GAAACCTTTCCTGTATTCTTCAAGTACTATACCTTCTTCATATTCTGCA
GAATCCTCCCTCATTATTGCCTCATGAAGCATTGGATCAAACTGCTTGCCAACTGTCTCC
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CTATTAGTAACTTTCTCCTCTCCTTCAGTCTCCACTTTAATCTGAGACTTAGCTCTCTCG
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TGCTTCTATCTCAGCAATCTTCTCCTCGTTGTTCTCT

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T*CTCCACAACCTCTCCCTGAGCATTGGAAACAAGGTTCAGCCTTTCCCTCTCCGTCCTC
TTCCTGAAATTGTCGAAACACGCACTGATTCTTATCAGCCGATCCCTCTCCACAGTTAGC
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AGTGATGCTTCTATCTCAGCAATCTTCTCCTCGTTGTTCTCTGCTAAAGCTTCTTTATAC
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TTCTTGTGTAAATCTCCTTTCTTCCC

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AACAAGGTTCAGCCTTTCCCTCTCCGTCCTCTTC*TGAAATTGTCGAAATCCGCACTGAT
TCTTATCAGCCGATCCCTCTCCACAGTTAGCTCATTGGTTAAAGATGCTACTTTATCCTC
GAGCTGAAACTTTTCGTCTTCAATGGACTTCAGTGATGCTTCTATCTCAGCAATCTTCTC
CTCGTTGTTCTCTGCTAAAGCTTCTTTATACGAATTCAGCAATGCTATGGTAACCCCCGC
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CTTAAAGGGCACGGAGGGTGCATGAAGAAGAGACGGTGTGAGGTGTAAAGACGGCGTTTT
TAGTAGACCGGCCATCGGAGAGTTGGGTGAAAGAGTTTGCGGCGAGGGATAAGGAAGAGA
GAGAAAGAGAGGGAAACAGTTTT
CTCTCTCC

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DS 



AS 1 7

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CTCTTCTCCCATGGCGGCGGCTTCTTCTTCTACCTTCTTCTCACCGGCACTTCTCTCCAA
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TCCAAGATCGTCTCGTTTGAGCTTCACAACTACACCTGAGAGGAGGAGAAGCCTGGTGGT
GAAATCAACGGTGGGAGAGGTGTCCTTTCGCGAACCGGAGACATCAGGATCGGGAGAAAA
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CACTGGTCGCTTGATTCCTGTCACTCTTGGCCAGGTTTTTCAAAGGATCGATGTGTTTAG
TAAAGATTTCGATAACATAGCGGAAGTGGAGATAGGAGCTCCATGGCCGTTTCCGCCTCT
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TCAATATATAGAAATAACATAAGCTGTAATCC


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GJ35TF U 1
AF RS1GQ32TF U 3
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AF RS1GJ35JQ C 382
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GGGTATAAT
AAGAAGATGCTTCTTCTC*TCTAGAAACATCTCTAAAACTTTTCTTCCTTTCTCTTCTCC
CATGGCGGCGGCTTCTTCTTCTACCTTCTTCTCACCGGCACTTCTCTCCAACAACAACCG
CTCTCAGCCACCATGCTGTTCCATCTCTTCCTCTCCGGTGCTCATCGCTACTCCAAGATC
GTCTCGTTTGAGCTTCACAACTACACCTGAGAGGAGGAGAGGCCTGGTGGTGAAATCAAC
GGTGGGAGAGGTGTCCTTTCGCGAACCGGAGACATCAGGATCGGGAGAAAACGAGGGAAT
CGAACCGCTGAAACTCAAGTTACTGAGTGTGGTTTCGGGATTGAACAGAGGACTGGTGGC
GAGTGTAGATGATCTAGAAAGAGCTGAGACTGCTGCTAAACAACTTGAATCGGCTGGTGG
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TAGTAGCGCCTTCTCTTCTCGCTCTCTTGGTGGTAGCCGTCCTGGTTTACCCACTGGTCG
CTTGATTCCTGTCACTCTTG

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DS 

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GGATAAT
AAGAAGATGCTTCTTCTCCTCTAGAAACATCTCTAAAACTTTTCTTCCTTTCTCTTCTCC
CATGGCGGCGGCTTCTTCTTCTACCTTCTTCTCACCGGCACTTCTCTCCAACAACAACCG
CTCTCAGCCACCATGCTGTTCCATCTCTTCCTCTCCGGTGCTCATCGCTACTCCAAGATC
GTCTCGTTTGAGCTTCACAACTACACCTGAGAGGAGGAGAAGCCTGGTGGTGAAATCAAC
GGTGGGAGAGGTGTCCTTTCGCGAACCGGAGACATCAGGATCGGGAGAAAACGAGGGAAT
CGAACCGCTGAAACTCAAGTTACTGAGTGTGGTTTCGGGATTGAACAGAGGACTGGTGGC
GAGTGTAGATGATCTAGAAAGAGCTGAGACTGCTGCTAAACAACTTGAATCGGCTGGTGG
ACCCGTGGATCTTACCGAGGTGGGTCTTGATAAGCTACAAGGGAAGTGGAGGCTCTTGTA
TAGTAGCGCCTTCTCTTCTCGCTCTCTTGGTGGTAGCCGTCCTGGTTTACCCACTGGTCG
CTTGATTCCTGTCACTCTTG

QA 8 567 8 567
DS 

RD RS1FR48TF 647 0 0
GGGTATAATAAGAAGATGCTTCTTCTCCTCTAGAAACATCTCTAAAACTTTTCTTCCTTT
CTCTTCTCCCATGGCGGCGGCTTCTTCTTCTACCTTCTTCTCACCGGCACTTCTCTCCAA
CAACAACCGCTCTCAGCCACCATGCTGTTCCATCTCTTCCTCTCCGGTGCTCATCGCTAC
TCCAAGATCGCCTCGTTTGAGCTTCACAACTACACCTGAGAGGAGGAGAAGCCTGGTGGT
GAAATCAACGGTGGGAGAGGTGTCCTTTCGCGAACCGGAGACATCAGGATCGGGAGAAAA
CGAGGGAATCGAACCGCTGAAACTCAAGTTACTGAGTGTGGTTTCGGGATTGAACAGAGG
ACTGGTGGCGAGTGTAGATGATCTAGAAAGAGCTGAGACTGCTGCTAAACAACTTGAATC
GGCTGGTGGACCCGTGGATCTTACCGAGGTGGGTCTTGATAAGCTACAAGGGAAGTGGAG
GCTCTTGTATAGTAGCGCCTTCTCTTCTCGCTCTCTTGGTGGTAGCCGTCCTGGTTTACC
CACTGGTCGCTTGATTCCTGTCACTCTTGGCCAGGTTTTTCAAAGGATCGATGTGTTTAG
TAAAGATTTCGATAACATAGCGGAAGTGGAGATAGGAGCTCCATGGC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RS1GG92TF 612 0 0
GG
AAGAAGATGCTTCTTCTCCTCTAGAAACATCTCTAAAACTTTTCTTCCTTTCTCTTCTCC
CATGGCGGCGGCTTCTTCCTCTACCTTCTTCTCACCGGCACTTCTCTCCAACAACAACCG
CTCTCAGCCACCATGCTGTTCCATCTCTTCCTCTCCGGTGCTCATCGCTACTCCAAGATC
GTCTCGTTTGAGCTTCACAACTACACCTGAGAGGAGGAGAAGCCTGGTGGTGAAATCAAC
GGTGGGAGAGGTGTCCTTTCGCGAACCGGAGACATCAGGATCGGGAGAAAACGAGGGAAT
CGAACCGCTGAAACTCAAGTTACTGAGTGTGGTTTCGGGATTGAACAGAGGACTGGTGGC
GAGTGTAGATGATCTAGAAAGAGCTGAGACTGCTGCTAAACAACTCGAATCGGCTGGTGG
ACCCGTGGATCTTACCGAGGTGGGTCTTGATAAGCTACAAGGGAAGTGGAGGCTCTTGTA
TAGTAGCGCCTTCTCTTCTCGCTCTCTTGGTGGTAGCCGTCCTGGTTTACCCACTGGTCG
CTTGATTCCTGTCACTCTTGGCCAGGTTTTTCAAAGGATCGATGTGTTTAGTAAAGATTT
CGATAACATA

QA 3 612 3 612
DS 

RD RS1GJ35JQ 617 0 0
TCTAGAAAGAGCTGAGACTGCTGCTAAACAACTTGAATCGGCTGGTGGACCCGTGGATCT
TACCGAGGTGGGTCTTGATAAGCTACAAGGGAAGTGGAGGCTCTTGTATAGTAGCGCCTT
CTCTTCTCGCTCTCTTGGTGGTAGCCGTCCTGGTTTACCCACTGGTCGCTTGATTCCTGT
CACTCTTGGCCAGGTTTTTCAAAGGATCGATGTGTTTAGTAAAGATTTCGATAACATAGC
GGAAGTGGAGATAGGAGCTCCATGGCCGTTTCCGCCTCTGGAAGCCACTGCCACACTGGC
ACACAAGTTTGAACTCTTAGGTACTTGCAAGATCAAGATCACATTTGAGAAAACAACTGT
GAAGACGTCTGGAAACTTAGCGCAGATCCCTCCCTTTGAGACCCCGAGGCTTCCTGATAG
TTTCAGGCCACCGTCAAACCCTGGAACTGGAGATTTTGAAGTCACCTATGTTGATGAGAA
CATGCGCATAACTCGTGGGGATGGAGGTGAACTTAGGGTGTTTGTCATTGCTTAAGTTCA
ACATGTAAAGATTTTAAGTACAAATCGTTTTAACGATTATAGAACTGAAGTATTCTATAA
TGAAAAGAATATCCT
AC

QA 1 615 1 615
DS 

RD RS1GG92JQ 771 0 0
CGGAGACATCAGGATCGGGAGAAAACGAGGGAATCGAACCGCTGAAACTCAAGTTACTGA
GTGTGGTTTCGGGATTGAACAGAGGACTGGTGGCGAGTGTAGATGATCTAGAAAGAGCTG
AGACTGCTGCTAAACAACTCGAATCGGCTGGTGGACCCGTGGATCTTACCGAGGTGGGTC
TTGATAAGCTACAAGGGAAGTGGAGGCTCTTGTATAGTAGCGCCTTCTCTTCTCGCTCTC
TTGGTGGTAGCCGTCCTGGTTTACCCACTGGTCGCTTGATTCCTGTCACTCTTGGCCAGG
TTTTTCAAAGGATCGATGTGTTTAGTAAAGATTTCGATAACATAGCGGAAGTGGAGATAG
GAGCTCCATGGCCGTTTCCGCCTCTGGAAGCCACTGCCACACTGGCACACAAGTTTGAAC
TCTTAGGTACTTGCAAGATCAAGATCACATTTGAGAAAACAACTGTGAAGACGTCTGGAA
ACTTAGCGCAGATCCCTCCCTTTGAGATCCCGAGGCTTCCTGATAGTTTCAGGCCACCGT
CAAACCCTGGAACTGGAGATTTTGAAGTCACCTATGTTGATGAGAACATGCGCATAACTC
GTGGGGATAGAGGTGAACTTAGGGTGTTTGTCATTGCTTAAGTTCAACATGTAAAGATTT
TAAGTACAAATCGTTTTAACGATTATAGAACTGAAGTATTCTATAATGAAAAGAATATCC
TGCTTAGTGAGACCAAAACATTATTTCAATATATAGAAATAACATAAGC
CT

QA 1 769 1 769
DS 

RD RS1GQ32JQ 633 0 0
CGGCTGGTGGACCCGTGGATCTTACCGAGGTGGGTCTTGATAAGCTACAAGGGAAGTGGA
GGCTCTTGTATAGTAGCGCCTTCTCTTCTCGCTCTCTTGGTGGTAGCCGTCCTGGTTTAC
CCACTGGTCGCTTGATTCCTGTCACTCTTGGCCAGGTTTTTCAAAGGATCGATGTGTTTA
GTAAAGATTTCGATAACATAGCGGAAGTGGAGATAGGAGCTCCATGGCTGTTTCCGCCTC
TGGAAGCCACTGCCACACTGGCACACAAGTTTGAACTCTTAGGTACTTGCAAGATCAAGA
TCACATTTGAGAAAACAACTGTGAAGACGTCTGGAAACTTAGCGCAGATCCCTCCCTTTG
AGATCCCGAGGCTTCCTGATAGTTTCAGGCCACCGTCAAACCCTGTAACTGGAGATTTTG
AAGTCACCTATGTTGATGAGAACATGCGCATAACTCGTGGGGATAGAGGTGAACTTAGGG
TGTTTGTCATCGCTTAAGTTCAACATGTAAAGATTTTAAGTACAAATCGTTTTAACGATT
ATAGAACTGAAGTATTCTATAATGAAAAGAATATCCTGCTTAGTGAGACCAAAACATTAT
TTCAATATATAGAAATAACATAAGCTGTAATCC

QA 1 633 1 633
DS 



AS 2 7

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GTCCACGAAATTTTTGTTTTCTCGGCAAAAGCCTAGATAATATAATATCCACCATATTAG
CACTAAACATAAAGGGTTCAGAAAAGTTTCGTCTACCCTGACGATTAGGAAAAAGATAAC
TAAAACTGGTTCACTCGCAAACTCAAGTTTTGAAAACCAAAAACATCAAAAGTCTAAAGA
GGATTATGGATAGTCTCTTTCTTCTTCATCAGACTTCAAGCAGCTGCACTGTGCTTGGCC
TTCGTGTGAGACTGCAAGCCCATCTCCGAGTTAAACGTTCTGTTGCAGGAGCTGCACCCA
AATGCACCTGCAGACTTGGGTGTCTGCTGCTGCTGCTTCGAGGTCTCTCCATTACTTCCC
GAGCTCTTTACTCCCTTTGATGGATGCGGAGTCGCAACGTGGACGTGTGGCTTCTTCGAT
TCTGATTTCTGAGGAGTTACGAATTTAGCCTTCTTGTTTGAAGCAGTCTTCGAGGTGTTG
GCTTCTGCAGGCCTCTTCTTGGCTTCTTCAACCTTCTTCTCTGGGGTCTCCTCGTCTGAT
GAGTCATCTTCCTCATCTTCCTCATCGTCAGATGAGTCTTCATCATCATCCTCGTCAGCT
TCAACTGTAACCTTCTTTTCTTCCTCCTCATCTTCAGAGTCAGCATCCTCATCATCACTA
TCATCCTCATCATCATCTTCCTCGGCCTTAGGCAACTGAAAGTTCACCTGTTTCACACCT
GATTTCGCAACATCTGGCTCAGCAAGCTCCTCGTCATCAGACTCAGTGAGAACGAATCAG
ATTCATGAGCATCAACTATGTAGCCGGTGAAGAAAACACTCCCATCCTTCCAGCTATGAG
ACAGCTCAAAAGACCTTGGCAGCACAATCTCCGTGCACAGCTG


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1FB85JQ U 1
AF RS1EQ92JQ U 3
AF RS1AI92JQ U 41
BS 1 273 RS1FB85JQ
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BS 275 599 RS1FB85JQ
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BS 808 883 RS1EQ92JQ

RD RS1FB85JQ 599 0 0
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CACTAAACATAAAGGGTTCAGAAAAGTTTCGTCTACCCTGACGATTAGGAAAAAGATAAC
TAAAACTGGTTCACTCGCAAACTCAAGTTTTGAAAACCAAAAACATCAAAAGTCTAAAGA
GGATTATGGATAGTCTCTTTCTTCTTCATCAGACTTCAAGCAGCTGCACTGTGCTTGGCC
TTCGTGTGAGACTGCAAGCCCATCTCCGAGTTAGACGTTCTGTTGCAGGAGCTGCACCCA
AATGCACCTGCAGACTTGGGTGTCTGCTGCTGCTGCTTCGAGGTCTCTCCATTACTTCCC
GAGCTCTTTACTCCCTTTGATGGATGCGGAGTCGCAACGTGGACGTGTGGCTTCTTCGAT
TCTGATTTCTGAGGAGTTACGAATTTAGCCTTCTTGTTTGAAGCAGTCTTCGAGGTGTTG
GCTTCTGCAGGCCTCTTCTTGGCTTCTTCAACCTTCTTCTCTGGGGTCTCCTCGTCTGAT
GAGTCATCTTCCTCATCTTCCTCATCGTCAGATGAGTCTTCATCATCATCCTCGTCAGC

QA 1 599 1 599
DS 

RD RS1EQ92JQ 881 0 0
CCACGAAATTTTTGTTTTCTCGGCAAAAGCCTAGATAATATAATATCCACCATATTAGCA
CTAAACATAAAGGGTTCAGAAAAGTTTCGTCTACCCTGACGATTAGGAAAAAGATAACTA
AAACTGGTTCACTCGCAAACTCAAGTTTTGAAAACCAAAAACATCAAAAGTCTAAAGAGG
ATTATGGATAGTCTCTTTCTTCTTCATCAGACTTCAAGCAGCTGCACTGTGCTTGGCCTT
CGTGTGAGACTGCAAGCCCATCTCCGAGTTAAACGTTCTGTTGCAGGAGCTGCACCCAAA
TGCACCTGCAGACTTGCGTGTCTGCTGCTGCTGCTTCGAGGTCTCTCCATTACTTCCCGA
GCTCTTTACTCCCTTTGATGGATGCGGAGTCGCAACGTGGACGTGTGGCTTCTTCGATTC
TGATTTCTGAGGAGTTACGAATTTAGCCTTCTTGTTTGAAGCAGTCTTCGAGGTGTTGGC
TTCTGCAGGCCTCTTCTTGGCTTCTTCAACCTTCTTCTCTGGGGTCTCCTCGTCTGATGA
GTCATCTTCCTCATCTTCCTCATCGTCAGATGAGTCTTCATCATCATCCTCGTCAGCTTC
AACTGTAACCTTCTTTTCTTCCTCCTCATCTTCAGAGTCAGCATCCTCATCATCACTGTC
ATCCTCATCATCATCTTCCTCGGCCTTAGGCAACTGAAAGTTCACCTGTTTCACACCTGA
TTTCGCAACATCTGGCTCAGCAAGCTCCTCGTCATCAGACTCAGTGAGAACGAATCAGAT
TCATGAGCATCAACTATGTAGCCG*TGAAGAAAACACTCCCATCCTTCCAGCTATGAGAC
AGCTCAAAAGACCTTGGCAGCACAATCTCCGTGCACAGCTG

QA 1 881 1 881
DS 

RD RS1AI92JQ 841 0 0
TATAATATCCACCATATTAGCACTAAACATAAAGGGTTCAGAAAAGTTTCGTCTACCCTG
ACGATTAGGAAAAAGATAACTAAAACTGGTTCACTCGCAAACTCAAGTTTTGAAAACCAA
AAACATCAAAAGTCTAAAGAGGATTATGGATAGTCTCTTTCTTCTTCATCAAACTTCAAG
CAGCTGCACTGTGCTTGGCCTTCGTGTGAGACTGCAAGCCCATCTCCGAGTTAAACGTTC
TGTTGCAGGAGCTGCACCCAAATGCACCTGCAGACTTGGGTGTCTGCTGCTGCTGCTTCG
AGGTCTCTCCATTACTTCCCGAGCTCTTTACTCCCTTTGATGGATGCTGAGTCGCAACGT
GGACGTGTGGCTTCTTCGATTCTGATTTCTGAGGAGTTACGAATTTAGCCTTCTTGTTTG
AAGCAGTCTTCGAGGTGTTGGCTTCTGCAGGCCTCTTCTTGGCTTCTTCAACCTTCTTCT
CTGGGGTCTCCTCGTCTGATGAGTCATCTTCCTCATCTTCCTCATCGTCAGATGAGTCTT
CATCATCATCCTCGTCAGCTTCAACTGTAACCTTCTTTTCTTCCTCCTCATCTTCAGAGT
CAGCATCCTCATCATCACTATCATCCTCATCATCATCTTCCTCGGCCTTAGGCAACTGAA
AGTTCACCTGTTTCACACCTGATTTCGCAACATCTGGCTCAGCAAGCTCCTCGTCATCAG
ACTCAG********AATCAGATTCATGAGCATCAACTATGTAGCCGGTGAAGAAAACACT
CCCATCCTTCCAGCTATGAGACAGCTCAAAAGACCTTGGCAGCACAATCTCCGTGCACAG
C

QA 1 841 1 841
DS 



CO CL723Contig2 815 4 22 U
GGATATCGACGTTTACGGCGTTGTCAATTTGTCACCACACTCGGCGCCCTAAAAAGCTAT
AATCGCTCTCGTCTTTTTCTCTTCTCCGTCGCAACCGTTACCGTCAGCTCGTTACCGATG
GAGTTCTGGGGTGTTGAAGTTAAGGGTGGTGAGCCACTTAGGGTGGACCCTGGGAAGGAT
ATGATTGTGCACATCTCACTGGCTGCTCTAGGTGAGAAGAAGAACGGTGGAAACGAGCCT
GTTAGGCTCTACACGAAAGTTGAAGATCAGAAGCTTCTGATTGGGACGCTCTCGCATGAT
AAGTTTCCTCAGCTGTGCACGGAGATTGTGCTGCCAAGGTCTTTTGAGCTGTCTCATAGC
TGGAAGGATGGGAGTGTTTTCTTCACCGGCTACATAGTTGATGCTCATGAATCTGATTCG
TTCTCACTGAGTCTGATGACGAGGAGCTTGCTGAGCCAGATGTTGCGAAATCAGGTGTGA
AACAGGTGAACTTTCAGTTGCCTAAGGCCGAGGAAGATGATGATGAGGATGACAGTGATG
ATGAGGATGCTGACTCTGAAGATGAGGAGGAAGAAAAGAAGGTTACAGTTGAAGCTGACG
AGGATGATGATGAAGACTCATCTGACGATGAGGAAGATGAGGAAGATGACTCATCAGACG
AGGAGACCCCAGAGAAGAAGGTTGAAGAAGCCAAGAAGAGGCCTGCAGAAGCCAACACCT
CGAAGACTGCTTCAAACAAGAAAGCTAAATTCGTAACTCCTCAGAAATCAGAATCGAAGA
AGCCACACGTCCACGTTGCGACTCAGCATCCATCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 
0 0 0 0 0 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EQ92TF U 35
AF RS1FB85TF U 35
AF RS1FI42TF U 1
AF RS1AI92TF U 38
BS 1 204 RS1FI42TF
BS 205 205 RS1EQ92TF
BS 206 232 RS1FI42TF
BS 233 233 RS1EQ92TF
BS 234 419 RS1FI42TF
BS 420 427 RS1EQ92TF
BS 428 532 RS1FI42TF
BS 533 533 RS1EQ92TF
BS 534 680 RS1FI42TF
BS 681 681 RS1AI92TF
BS 682 688 RS1FI42TF
BS 689 689 RS1AI92TF
BS 690 702 RS1FI42TF
BS 703 703 RS1AI92TF
BS 704 742 RS1FI42TF
BS 743 743 RS1AI92TF
BS 744 755 RS1FI42TF
BS 756 756 RS1AI92TF
BS 757 780 RS1FI42TF
BS 781 781 RS1AI92TF
BS 782 798 RS1FI42TF
BS 799 815 RS1AI92TF

RD RS1EQ92TF 595 0 0
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GAAAGTTACAGTTGAAGCTGACGAGGATGATGATGAAGACTCATCTGACGAT

QA 4 595 4 595
DS 

RD RS1FB85TF 630 0 0
GGA
CACTCGGCGCCCTAAAAAGCTATAATCGCTCTCGTCTTTTTCTCTTCTCCGTCGCAACCG
TTACCGTCAGCTCGTTACCGATGGAGTTCTGGGGTGTTGAAGTTAAGGGTGGTGAGCCAC
TTAGGGTGGACCCTGGGAAGGATATGATTGTGCACATCTCACTGGCTGCTCTAGGTGAGA
AGAAGAACGGTGGAAACGAGCCTGTTAGGCTCTACACGAAAGTTGAAGATCAGAAGCTTC
TGATTGGGACGCTCTCGCATGATAAGTTTCCTCAGCTGTGCACGGAGATTGTGCTGCCAA
GGTCTTTTGAGCTGTCTCATAGCTGGAAGGATGGGAGTGTTTTCTTCACCGGCTACATAG
TTGATGCTCATGAATCTGATTCGTTCTCACTGAGTCTGATGACGAGGAGCTTGCTGAGCC
AGATGTTGCGAAATCAGGTGTGAAACAGGTGAACTTTCAGTTGCCTAAGGCCGAGGAAGA
TGATGATGAGGATGACAGTGATGATGAGGATGCTGACTCTGAAGATGAGGAGGAAGAAAA
GAAGGTTACAGTTGAAGCTGACGAGGATGATGATGAAGACTCATCTGACGATGAGGAAGA
TGAGGAAGATGACTCATCAGACGAGGA

QA 4 630 4 630
DS 

RD RS1FI42TF 798 0 0
GGATATCGACGTTTACGGCGTTGTCAATTTGTCACCACACTCGGCGCCCTAAAAAGCTAT
AATCGCTCTCGTCTTTTTCTCTTCTCCGTCGCAACCGTTACCGTCAGCTCGTTACCGATG
GAGTTCTGGGGTGTTGAAGTTAAGGGTGGTGAGCCACTTAGGGTGGACCCTGGGAAGGAT
ATGATTGTGCACATCTCACTGGCTACTCTAGGTGAGAAGAAGAACGGTGGAAGCGAGCCT
GTTAGGCTCTACACGAAAGTTGAAGATCAGAAGCTTCTGATTGGGACGCTCTCGCATGAT
AAGTTTCCTCAGCTGTGCACGGAGATTGTGCTGCCAAGGTCTTTTGAGCTGTCTCATAGC
TGGAAGGATGGGAGTGTTTTCTTCACCGGCTACATAGTTGATGCTCATGAATCTGATTC*
*******TGAGTCTGATGACGAGGAGCTTGCTGAGCCAGATGTTGCGAAATCAGGTGTGA
AACAGGTGAACTTTCAGTTGCCTAAGGCCGAGGAAGATGATGATGAGGATGATAGTGATG
ATGAGGATGCTGACTCTGAAGATGAGGAGGAAGAAAAGAAGGTTACAGTTGAAGCTGACG
AGGATGATGATGAAGACTCATCTGACGATGAGGAAGATGAGGAAGATGACTCATCAGACG
AGGAGACCCCAGAGAAGAAG*TTGAAGA*GCCAAGAAGAGGC*TGCAGAAGCCAACACCT
CGAAGACTGCTTCAAACAAGAAGGCTAAATTCGTA*CTCCTCAGAAATCAGAATCGAAGA
*GCCACACGTCCACGTTG

QA 1 798 1 798
DS 

RD RS1AI92TF 778 0 0
CACTCGGCGCCCTAAAAAGCTATAATCGCTCTCGTCTTTTTCTCTTCTCCGTCGCAACCG
TTACCGTCAGCTCGTTACCGATGGAGTTCTGGGGTGTTGAAGTTAAGGGTGGTGAGCCAC
TTAGGGTGGACCCTGGGAAGGATATGATTGTGCACATCTCACTGGCTGCTCTAGGTGAGA
AGAAGAACGGTGGAAACGAGCCTGTTAGGCTCTACACGAAAGTTGAAGATCAGAAGCTTC
TGATTGGGACGCTCTCGCATGATAAGTTTCCTCAGCTGTGCACGGAGATTGTGCTGCCAA
GGTCTTTTGAGCTGTCTCATAGCTGGAAGGATGGGAGTGTTTTCTTCACCGGCTACATAG
TTGATGCTCATGAATCTGATTC********TGAGTCTGATGACGAGGAGCTTGCTGAGCC
AGATGTTGCGAAATCAGGTGTGAAACAGGTGAACTTTCAGTTGCCTAAGGCCGAGGAAGA
TGATGATGAGGATGATAGTGATGATGAGGATGCTGACTCTGAAGATGAGGAGGAAGAAAA
GAAGGTTACAGTTGAAGCTGACGAGGATGATGATGAAGACTCATCTGACGATGAGGAAGA
TGAGGAAGATGACTCATCAGACGAGGAGACCCCAGAGAAGAAGGTTGAAGAAGCCAAGAA
GAGGCCTGCAGAAGCCAACACCTCGAAGACTGCTTCAAACAAGAAAGCTAAATTCGTAAC
TCCTCAGAAATCAGAATCGAAGAAGCCACACGTCCACGTTGCGACTCAGCATCCATCA

QA 1 778 1 778
DS 



AS 2 6

CO CL724Contig1 991 2 2 U
GAGATCCAGAAACAGGCAAATGGTCTTTCTCATGGGACGAAGACTCTCTCCAGCTCCAGC
TAAAAGACGGCTTCCCTCCAGAAACAGAGTTCCTCTACGTCGGCTCCCTCAACGCAGACA
TCTCACCAAACGAGCAAGAAGAAATCTCGCAAACCCTAATCACCAAGTTCAACTCCGTCG
CCACGTTCTTGCCCAAAGACCTCCAAGAAATGTACTACCGCGGCTTCTGCAAACACCAGC
TGTGGCCTCTGTTCCACTACATGCTCCCCATGTTCCCCGACCACGGAGACTTGTTACTCG
TCTACGGGTACAGAGTGGAAGGCAATGGTGGAGCCTGTTATGAGATCATACATGGAGTCA
ACAGATGGGTCTAGTATAGAGTTTAAAGAGAGTGCTCTTGTGTGGCATCATCAAGATGCT
GATCCGGACTTTGGATCTTGTCAAGCTAAGGAGCTTCTTGATCATCTAGAGAGCGTGCTT
GCGAATGAGCCTGTTGTTGTCAAGAGAGGTCAACACATCGTTGAAGTAAAACCACAGGGT
GTAAGCAAAGGTCTAGCTTGTGAGAAAGTAATCAGAGGAATGGTTGAACGTGGGGAACCG
CCAGAGATGGTGATATGCATAGGAGATGATAGGTCGGATGAGGATATGTTTGAGGGTATG
TTGAGTACTGTGACGAATCCAGAGCTTTTGATTCAGCCAGAGGTTTTTGCCTGCACTGTT
GGGAGGAAACCAAGTAAGGCCAAGTACTTTTTGGACGATGTGGCTGATGTGCTTAAGCTA
CTAAAAGGTTTGGGGGATTCATCGTTGAGCTTGAAGACTACTTCTCACACAGAAGTTGCA
TTTGAAAGCATCTTTTAAAAGTGGAAGTGTCAAAAAATAACCGGAGTTAATTTTACTTAA
CATCAAAATGTAAAAAAAGAAAATGAGAAATGGTATTTAATCTGCTTTTGAAGGATTTAT
TGTTTCTTGGTTTTAACTATTGTTTTGGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AF51TF U 1
AF RS1AF51JQ C 304
BS 1 639 RS1AF51TF
BS 640 991 RS1AF51JQ

RD RS1AF51TF 639 0 0
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TAAAAGACGGCTTCCCTCCAGAAACAGAGTTCCTCTACGTCGGCTCCCTCAACGCAGACA
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CCACGTTCTTGCCCAAAGACCTCCAAGAAATGTACTACCGCGGCTTCTGCAAACACCAGC
TGTGGCCTCTGTTCCACTACATGCTCCCCATGTTCCCCGACCACGGAGACTTGTTACTCG
TCTACGGGTACAGAGTGGAAGGCAATGGTGGAGCCTGTTATGAGATCATACATGGAGTCA
ACAGATGGGTCTAGTATAGAGTTTAAAGAGAGTGCTCTTGTGTGGCATCATCAAGATGCT
GATCCGGACTTTGGATCTTGTCAAGCTAAGGAGCTTCTTGATCATCTAGAGAGCGTGCTT
GCGAATGAGCCTGTTGTTGTCAAGAGAGGTCAACACATCGTTGAAGTAAAACCACAGGGT
GTAAGCAAAGGTCTAGCTTGTGAGAAAGTAATCAGAGGAATGGTTGAACGTGGGGAACCG
CCAGAGATGGTGATATGCATAGGAGATGATAGGTCGGAT

QA 1 639 1 639
DS 

RD RS1AF51JQ 688 0 0
ACGGGTACAGAGTGGAAGGCAATGGTGGAGCCTGTTATGAGATCATACATGGAGTCAACA
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CCGGACTTTGGATCTTGTCAAGCTAAGGAGCTTCTTGATCATCTAGAGAGCGTGCTTGCG
AATGAGCCTGTTGTTGTCAAGAGAGGTCAACACATCGTTGAAGTAAAACCACAGGGTGTA
AGCAAAGGTCTAGCTTGTGAGAAAGTAATCAGAGGAATGGTTGAACGTGGGGAACCGCCA
GAGATGGTGATATGCATAGGAGATGATAGGTCGGATGAGGATATGTTTGAGGGTATGTTG
AGTACTGTGACGAATCCAGAGCTTTTGATTCAGCCAGAGGTTTTTGCCTGCACTGTTGGG
AGGAAACCAAGTAAGGCCAAGTACTTTTTGGACGATGTGGCTGATGTGCTTAAGCTACTA
AAAGGTTTGGGGGATTCATCGTTGAGCTTGAAGACTACTTCTCACACAGAAGTTGCATTT
GAAAGCATCTTTTAAAAGTGGAAGTGTCAAAAAATAACCGGAGTTAATTTTACTTAACAT
CAAAATGTAAAAAAAGAAAATGAGAAATGGTATTTAATCTGCTTTTGAAGGATTTATTGT
TTCTTGGTTTTAACTATTGTTTTGGGTT

QA 1 688 1 688
DS 



CO CL724Contig2 1285 4 5 U
GGTTCCTTATAAGTATATAGTCTGCAGGCAAGGAGGGAGTCTTGTTGATGACTCGTCTCC
TAGGACAAGTACACTTGTTGTGTCTGAGTTTATTGGATGCTCACCTTCTTTGAGCGGTGC
TATTAGAGTGAATCCATGGGATGTGGATGGCGTTGCTCAAGCGGTGAACTCGGCTCTTAA
AATGAGTGAAGCTGAGAAGCAGCTGAGGCATGAGAAGCATTATAATTATATCAGCACTCA
TGATGTTGGTTACTGGGCGAAGAGCTTTGTGCAGGATCTTGAGAGGGCTTGCAAGGATCA
CTACAGTAAACGCTGTTGGGGGATTGGGTTCGGATTAGGGTTTAGGGTTTTGTCGCTTTC
CCCTAGCTTTAGGAAGCTCTCTGTGGAGCACATTGTTCCTGTTTATAGAAAAGCGCAGAG
GAGAGCTATCTTTCTTGATTATGATGGGACTCTTGTCCCTGAAAGCTCCATTACTCAGGA
TCCAAGCGCTGAGGTTTTGTCTGTTCTGAAGGCTCTTTGTGAAGATGCTAAGAACACTGT
GTTTATTGTTAGTGGGAGAGGACCGGAGTCTTTGAGCGAGTGGTTGGCTCCTTGTGAGAA
TCTTGGTATAGCTGCTGAACATGTATACTTCATAAGGTGGAATAGCAAGAAAGAGTGGGA
GACTTGTTACTCGTCTACGGGTACAGAGTGGAAGGCAATGGTGGAGCCTGTGATGAGATC
ATACATGGAGGCAACAGATGGGTCTAGTATAGAGTTTAAAGAGAGTGCTCTTGTGTGGCA
TCATCAAGATGCTGATCCGGACTTTGGATCTTGTCAAGCTAAGGAGCTTCTTGATCATCT
AGAGAGTGTGCTTGCGAATGAGCCTGTTGTTGTCAAGAGAGGTCAACACATTGTTGAAGT
AAAACCACAGGGTGTAAGCAAAGGTCTAGCTTGTGAGAAAGTAATCAGAGGAATGGTTGA
ACGTGGGGAACCCCCAGAGATGGTGATATGCATAGGAGATGATAGGTCGGATGAGGATAT
GTTTGAGGGTATGTTGAGTACAGTGACCAATCCAGAGCTTTTGATTCAGCCAGAGGTTTT
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BQ
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AF RS1EY31TF U 1
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AATGAGTGAAGCTGAGAAGCAGCTGAGGCATGAGAAGCATTATAATTATATCAGCACTCA
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GAGAGCTATCTTTCTTGATTATGATGGGACTCTTGTCCCTGAAAGCTCCATTACTCAGGA
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AS 2 5

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DI20TF U 4
AF RS1CR12TF U 1
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GG
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CGTCTGAGCAATGGCTTTGGTATTGCACACATACAAGGGAAACAAAGGTGCTGAGAAGGC
ACTCATTGTCGCAGAGTACACTGGTGTGCAGATCGATGTACCCGACTTTGAGATGGGTGT
CTCTAACAAGACCCCTGAGTTCCTCAAGATGAACCCTATTGGAAAGGTTCCGGTGCTTGA
GACTCCCGAGGGTCCCATCTTTGAGAGCAACGCCATTGCCCGTTATGTGAGCCGATTGAA
CGGTGAGAACTCTTTGAATGGATCTTCCCTGATCGAATATGCACAAATTGAGCAATGGAT
CGATTTCTCCTCACTTGAGATTTTCGGAAGCATCTTCAAGTGGTTCGGTGCAAGAATTGG
CTACATGCCATACAGTGTTCCGGGTGAGGAAGCTGCTATCTCTGCGTTGAAAAGAGCACT
TGATGCTCTGAACACCCATCTCACTTCCAACACTTACCTTGTTGGACACTCTATCACCCT
TGCTGATATCGTCACCGTCTGCAACTTGAGCCTGGGATTTACCACTATCATGACCAAGAG
CTTCACCTCTGCA

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DS 

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GGTGTCTCTAACAAGACCCCCGAGTTCCTCAAGATGAACCCTATTGGAAAGGTTCCGGTG
CTTGAGACTCCCGAGGGTCCCATCTTTGAGAGCAACGCCATTGCCCGTTATGTGGGCCGA
TTGAACGGTGAGAACTCCTTGAACGGATCTTCCCTGATCGAATATGCGCAAATTGAGCAA
TGGATCGATTTCTCCTCACTTGAGATTTTCGGAAGCATCTTCAAGTGGTTCGGTGCAAGA
ATTGGCTACATGCCATACAGTGTTCCGGGTGAGGAAGCTGCTATCTCTGCGTTGAAAAGA
GCACTTGATGCTCTGAACACCCATCTCACTTCCAACACTTACCTTGTTGGACACTCTATC
ACCCTTGCCGATATCATCACTGTCTGCAACTTGAGCCTGGGATTTACCACTATCATGACC
AAGAGCTTCACCTCCGCATTCCCCCATGTTGAGAGATACTTCTGGACCTTGATTAACCAG
CCAAACTTCAAGAAAGTGGTGGGTGATGTCAAACAGACTGAAGCTGTCCCTCCTGTTACT
TCCAAGAAAGCTGCT

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DS 



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TTCACAATATGAAAATAAACCTCCGAAACAACGCGCAATTCCAGAACTATTAAGTATTAC
TTAAAACCACAACCTCTTGTCCTTAAACCACTGTACTAAACATAAGCGACTCATAGTATA
TCAAAACCAAAAACTAATTGTCAAACCAAACCAATTATCTTTTCACTTGAAGCACTTGGC
GTCCAAAAAAGCTTCACCTTCAAATGGCTCTGCGTCTTCAATCATCTGGCTAACACGCTC
CTTCTGTGCTTCATCCGAAATGTCAACCTTTGTCCATTCGTACAGCTCCATGTCGTACAC
CTCGTCCATTATGAACTTTGGGATCTCTGGCCCTCTGAACAACCACAAACCCTTCACCTT
GAACGGAGCCTCTGACCCGCAAATCAGCATCTTTCCAAAGGCGTACTTACAAGCCAAGTC
CATTCTCTGAAGGAACCCGCCTACCTTGTTGAGCGTAACAAAGGACACCATGTTCTCGTC
GTTGTACTTGTAGTCACAAAACCATAGTGAGTATCCCTCTGGGTCATACATGTCCCAAAA
TCCTTTAATAGCAACCTCACGGAAGTTAGATTTGGTGTTCGAGTAAAGCCTCTTCCACTC
ATCCAGAACCATTGGGCTTGGTGGTAGCAAATCAAGAGGGTTCTTTGCTTTGGGCTTTGG
TGCCTCTTCTTCCTCTTCAACAACCTTAGGTGCCTCTGGTGCAGGGGCAGCCTTTTTCTT
AGGCTCCTCCTTGGGCTTTGCAGACTGGGCAGCTTTCTTGGAAGCGACAGGAGGGACAGC
TTCAGTCTGTTTGACATCACCCACAACTTTCTTGAAGTTCGGTTGGTTGATAATGGTCCA
GAAGTATCTCTCAACATGAGGGAATGCAGAGGTAAAGCTCTTGGTCATGACAGTGGCAAA
TCCAAGGTTCAAGTTGCAGACAGTGATGATATCCGCGAGGGTAACGGAGTGTCCAACTAG
GTAGGTGTTGGAAGCGAGATGAGTGTTCAGGGCTTCAAGTGCTCTTTTCAACGCAGAGAT
AGCGGCTTCCTCACCAGGTGTACTGTATGCCATAAAGCCCATTCTTGGGCCGAACCACTT
CAAGATGTTACCATATATCTCCAACGTGGAGAAATCGCTCCATTGCTCAACGTGTGCGTA
TTCGATCAGAGAGGAACCGTTCAAGGAGTTCTCACCGTTCAACCGGCTTACATAACGGGC
AATGGCGTTGCTCTCAAATATGGGACCCTCGGGAGTCTCAAGTACAGGAGCCTTTCCCAA
AGGATTCATCTTGAGGAACTCTGGGGTCTTGTTGGTGACACCCATCTGAAAGTCAGAGGG
CACATCGATCTTCACACCAACGTACTCCGCAGCAATGAGTGCCTTGTCAGCATTTTTGTT
TCCCTTGTATGTGTGCACACCAAAGCCATTGCTCAGACGGACTCCAACTTCGGATACTGG
ATCAGAGAGAGGTTAGAGGCGAGCAAATCGAGAGAAGAGTCTAGTGAGGCGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EQ68JQ U 1
AF RS1AR68JQ U 101
AF RS1AR68TFB C 775
BS 1 124 RS1EQ68JQ
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RD RS1EQ68JQ 725 0 0
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TTCACAATATGAAAATAAACCTCCGAAACAACGCGCAATTCCAGAACTATTAAGTATTAC
TTAAGACCACAACCTCTTGTCCTTAAACCACTGTATTAAACATAAGCGACTCATAGTATA
TCAAAACCAAAAACTAATTGTCAAACCAAACCAATTATCTTTTCACTTGAAGCACTTGGC
GTCCAAGAAAGCTTCACCTTCAAATGGCTCTGCGTCTTCGATCATCTGGCTAACACGCTC
CTTCTGTGCTTCATCCGAGATGTCAACCTTTGTCCATTCGTACAGCTCCATGTCGTACAC
CTCGTCCATTATGAACTTTGGGATCTCTGGCCCTCTGAACAACCACAAACCCTTCACCTT
GAACGGAGCCTCTGACCCGCAGATCAGCATCTTTCCAAAGGCGTACTTACGAGCCAAGTC
CATTCTCTGAAGGAACCCGCCTACCTTGTTGAGCGTAACAAAGGACACCATGTTCTCGTC
GTTGTACTTGTAGTCACAGAACCATAGTGAGTATCCCTCTGGGTCATACATGTCCCAGAA
TCCTTTAATAGCAACCTCACGGAAGTTAGATTTGGTGTTCGAGTAAAGCCTCTTCCACTC
ATCCAGAACCATTGGGCTTGGTGGTAGCAAATCAAGAGGGTTCTTTGCTTTGGGCTTTGG
TGCCT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1AR68JQ 785 0 0
CCAA
AACTATTAAGTATTACTTAAAACCACAACCTCTTGTCCTTAAACCACTGTACTAAACATA
AGCGACTCATAGTATATCAAAACCAAAAACTAATTGTCAAACCAAACCAATTATCTTTTC
ACTTGAAGCACTTGGCGTCCAAAAAAGCTTCACCTTCAAATGGCTCTGCGTCTTCAATCA
TCTGGCTAACACGCTCCTTCTGTGCTTCATCCGAAATGTCAACCTTTGTCCATTCGTACA
GCTCCATGTCGTACACCTCGTCCATTATGAACTTTGGGATCTCTGGCCCTCTGAACAACC
ACAAACCCTTCACCTTGAACGGAGCCTCTGACCCGCAAATCAGCATCTTTCCAAAGGCGT
ACTTACAAGCCAAGTCCATTCTCTGAAGGAACCCGCCTACCTTGTTGAGCGTCACAAAGG
ACACCATGTTCTCGTCGTTGTACTTGTAGTCACAAAACCATAGTGAGTATCCCTCTGGGT
CATACATGTCCCAAAATCCTTTAATAGCAACCTCACGGAAGTTAGATTTGGTGTTCGAGT
AAAGCCTCTTCCACTCATCCAGAACCATTGGGCTTGGTGGTAGCAAATCAAGAGGGTTCT
TTGCTTTGGGCTTTGGTGCCTCTTCTTCCTCTTCAACAACCTTAGGTGCCTCTGGTGCAG
GGGCAGCCTTTTTCTTAGGCTCCTCCTTGGGCTTTGCAGACTGGGCAGCTTTCTTGGAAG
CGACAGGAGGGACAGCTTCAGTCTGTTTGACATCACCCACAACTTTCTTGAAGTT
CGGTTG

QA 5 779 5 779
DS 

RD RS1AR68TFB 780 0 0
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GACAGCTTCAGTCTGTTTGACATCACCCACAACTTTCTTGAAGTTCGGTTGGTTGATAAT
GGTCCAGAAGTATCTCTCAACATGAGGGAATGCAGAGGTAAAGCTCTTGGTCATGACAGT
GGCAAATCCAAGGTTCAAGTTGCAGACAGTGATGATATCCGCGAGGGTAACGGAGTGTCC
AACTAGGTAGGTGTTGGAAGCGAGATGAGTGTTCAGGGCTTCAAGTGCTCTTTTCAACGC
AGAGATAGCGGCTTCCTCACCAGGTGTACTGTATGCCATAAAGCCCATTCTTGGGCCGAA
CCACTTCAAGATGTTACCATATATCTCCAACGTGGAGAAATCGCTCCATTGCTCAACGTG
TGCGTATTCGATCAGAGAGGAACCGTTCAAGGAGTTCTCACCGTTCAACCGGCTTACATA
ACGGGCAATGGCGTTGCTCTCAAATATGGGACCCTCGGGAGTCTCAAGTACAGGAGCCTT
TCCCAAAGGATTCATCTTGAGGAACTCTGGGGTCTTGTTGGTGACACCCATCTGAAAGTC
AGAGGGCACATCGATCTTCACACCAACGTACTCCGCAGCAATGAGTGCCTTGTCAGCATT
TTTGTTTCCCTTGTATGTGTGCACACCAAAGCCATTGCTCAGACGGACTCCAACTTCGGA
TACTGGATCAGAGAGAGGTTAGAGGCGAGCAAATCGAGAGAAGAGTCTAGTGAGGCGGCC

QA 1 780 1 780
DS 



AS 2 7

CO CL726Contig1 887 5 19 U
GGAGTTGCGTGTTTGGTTATCTTTTCTTTCGTGTAACCTAAATTAAGGGATTTGTTCTAA
CAAATCTCTCTAGACTCCAAAAAGGAAGAATCGCGTCTCTCATCTTCTTCTCAGGAAGAT
CAGAAAACAATTTCTTTTTGTTTAAATTTCATCTTCAAGCTTCGAAGATCGCAGGAAAAA
TCCTCGTTTCGATCTGACCATTTCTGGCAGGATTTTAAAAGACAACAACAACAACAACAA
CAATGAGCTCTGAGCAAAACAACAGCACAAGCTTCCCACCAACAGAGCCAAAGCTCTGCG
ATAACGGATGCGGATTCTTCGGGTCACCTTCCAACATGAACCTTTGTTCCAAATGTTACC
GAAGCCTACGTGCCGAGGAAGATCAAACGGCAGTGGCAAAAGCTGCGGTGGAGAAATCAC
TAAAGCTTCCATCTTGCAGTCTCATCACCGCACCAGAGCCAAAACAGCCTCTGGAGACCG
AACCAGTCTCGGTGGAAACCGTTGTGATCGCTGAACCGACTGCTGTTCCTCCTGTAGCTA
CGGGACAGGAGGAGGGAGAGCCGTCGAAGCCTGCACGGCCTAACAGGTGTTTCAGCTGTA
ACAAGAAGGTTGGAGTTATGGGGTTTAAGTGCAAATGCGGGAGCACGTTTTGCGGGAGCC
ATAGGTACCCGGAGAAGCACGAGTGTAGCTTCGATTTCAAAGAGGTTGGACGCGGTGCAA
TCGCAAAGGCGAATCCTGTGGTCAAGGCCGATAAAGTCCAGAGGATTTGATTGTGATGTG
ATGTGTCTATCTTTCAGTTTATTCCGAGAATGTTGCTGTGATGTGGTCATGTTCGATGTT
GGGTTTCTATGAATCAAAATGAAAAAATTGCTGCTATTGGTTTTCTC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1C594TF U 46
AF RS1C594JQ C 93
AF RS1BI68JQ C 139
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RD RS1BI68TF 700 0 0
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TAAAGCTTCCATCTTGCAGTCTCATCACCGCACCAGAGCCAAAACAGCCTCTGGAGACCG
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ATAG*TACCCGGAGAAGCACGAGTGTAGCTTCGATTTCAA

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DS 

RD RS1C594TF 714 0 0
G
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AACAACAACAACAACAATGAGCTCTGAGCAAAACAACAGCACAAGCTTCCCACCAACAGA
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TTCCAAATGTTACCGAAGCCTACGTGCCGAGGAAGATCAAACGGCAGTGGCAAAAGCTGC
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GTTTTGCGGGAGCCATAGGTACCCGGAGAAGCACGAGTGTAGCTTCGATTTCAAAGAGGT
TGGACGCGGTGCAATCGCAAAGGCGAATCCTGTGGTCAAG*CCGATAAAGTCC

QA 2 714 2 714
DS 

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G
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TTTAAAAGACAACAACAACAACAACAACAATGAGCTCTGAGCAAAACAACAGCACAAGCT
TCCCACCAACAGAGCCAAAGCTCTGCGATAACGGATGCGGATTCTTCGGGTCACCTTCCA
ACATGAACCTTTGTTCCAAATGTTACCGAAGCCTACGTGCCGAGGAAGATCAAACGGCAG
TGGCAAAAGCTGCGGTGGAGAAATCACTAAAGCTTCCATCTTGCAGTCTCATCACCGCAC
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AACCGACTGCTGTTCCTCCTGTAGCTACGGGACAGGAGGAGGGAGAGCCGTCGAAGCCTG
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AATGCGGGAGCACGTTTTGCGGGAGCCATAGGTACCCGGAGAAGCACGAGTGTAGCTTCG
ATTTCAAAGAGGTTGGACGCGGTGCAATCGCAAAGGCGAATCCTGTGGTCAAGGCCGATA
AAGTCCAGAGGATTTGATTGTGATGTGATGTGTCTATCTTTCAGTTTATTCCGAGAATGT
TGCTGTGATGTGGTCATGTTCGATGTTGGGTTTCTATGAATCAAAATGAAAAA
ATTGCTGTC

QA 2 774 2 774
DS 

RD RS1BI68JQ 749 0 0
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CATTTCTGGCAGGATTTTAAAAGACAACAACAACAACAACAA***TGAGCTCTGAGCAAA
ACAACAGCACAAGCTTCCCACCAACAGAGCCAAAGCTCTGCGATAACGGATGCGGATTCT
TCGGGTCACCTTCCAACATGAACCTTTGTTCCAAATGTTACCGAAGCCTACGTGCCGAGG
AAGATCAAACGGCAGTGGCAAAAGCTGCGGTGGAGAAATCACTAAAGCTTCCATCTTGCA
GTCTCATCACCGCACCAGAGCCAAAACAGCCTCTGGAGACCGAACCAGTCTCGGTGGAAA
CCGTTGTGATCGCTGAACCGACTGCTGTTCCTCCTGTAGCTACGGGACAGGAGGAGGGAG
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TGGGGTTTAAGTGCAAATGCGGGAGCACGTTTTGCGGGAGCCATAGGTACCCGGAGAAGC
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TGGTCAAGGCCGATAAAGTCCAGAGGATTTGATTGTGATGTGATGTGTCTATCTTTCAGT
TTATTCCGAGAATGTTGCTGTGATGTGGTCATGTTCGATGTTGGGTTTCTATGAATCAAA
ATGAAAAAATTGCTGCTATTGGTTTTCTC

QA 1 749 1 749
DS 

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G
GCGATAACGGATGCGGATTCTTCGGGTCACCTTCCAACATGAACCTTTGTTCCAAATGTT
ACCGAAGCCTACGTGCCGAGGAAGATCAAACGGCAGTGGCAAAAGCTGCGGTGGAGAAAT
CACTAAAGCTTCCATCTTGCAGTCTCATCACCGCACCAGAGCCAAAACAGCCTCTGGAGA
CCGAACCAGTCTCGGTGGAAACCGTTGTGATCGCTGAACCGACTGCTGTTCCTCCTGTAG
CTACGGGACAGGAGGAGGGAGAGCCGTCGAAGCCTGCACGGCCTAACAGGTGTTTCAGCT
GTAACAAGAAGGTTGGAGTTATGGGGTTTAAGTGCAAATGCGGGAGCACGTTTTGCGGGA
GCCATAGGTACCCGGAGAAGCACGAGTGTAGCTTCGATTTCAAAGAGGTTGGACGCGGTG
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GTTATGTGTCTATCTTTCGGTTTATTCCGAGAATGTTGCTGTGATGTGGTCATGTTCGAT
GTTGGGTTTCTATGAATCAAAATGAA

QA 2 567 2 567
DS 



CO CL726Contig2 862 2 6 U
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CCAAAAAGGAAGAATCACGTCTCTCATCTTCTTCTCGGTAAGATCAGAAAACAACTTTTT
TTTTGTTTAAATTTCATCCTCAAGCTTCGAAGATCGCAGGAAAATTCCCATTTCGATCTG
ACCATTTCTGGTGAAGAAGGCAGAATTTTAAAAGACAACAACAACAATGAGCTCTGAGCA
AAACAACAGCACAAGCTTCCCACCAACAGAGCCAAAGCTCTGCGATAACGGATGCGGGTT
CTTCGGGTCACCCTCCAACGTGAACCTTTGTTCCAAATGTTACCGAAGTCTACGTGCCGA
GGAAGATCAAACGGCAGTGGCAAAAGCTGCGGTGGAGAAATCACTAAAGCTTCCATCTTG
CAGTCTCATCACCGCACCAGAAGAGCCAAAACAGCCTCTGGAGACCGAACCAGTCTCGGT
GGAAACCGTTGTGATCGCTGATCCGACTTCTGTTCCTCCTGTAGCTACGGGACAGGAGGA
GGGAGAGCCGTCGAAGCCTGCACGGCCGAACAGGTGTTTCAGCTGTAACAAGAAGGTTGG
AGTCATGGGGTTTAAGTGCAAATGCGGGAGCACGTTTTGCGGGAGCCATAGGTACCCGGA
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TTATTCCGAGAATGTTGCTGTGATGTGGTCATGTTCGATGTTGGGTTTCTATGAATCAAA
ATGAAAAATTGCTGCTATTGGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BR82TF U 1
AF RS1BR82JQ C 348
BS 1 650 RS1BR82TF
BS 651 651 RS1BR82JQ
BS 652 670 RS1BR82TF
BS 671 671 RS1BR82JQ
BS 672 682 RS1BR82TF
BS 683 862 RS1BR82JQ

RD RS1BR82TF 682 0 0
GGATCTTTTCTTTCGTGTAACCTAAATTAAGGGATTTGTTCTAACAAATCTCTCTAGACT
CCAAAAAGGAAGAATCACGTCTCTCATCTTCTTCTCGGTAAGATCAGAAAACAACTTTTT
TTTTGTTTAAATTTCATCCTCAAGCTTCGAAGATCGCAGGAAAATTCCCATTTCGATCTG
ACCATTTCTGGTGAAGAAGGCAGAATTTTAAAAGACAACAACAACAATGAGCTCTGAGCA
AAACAACAGCACAAGCTTCCCACCAACAGAGCCAAAGCTCTGCGATAACGGATGCGGGTT
CTTCGGGTCACCCTCCAACGTGAACCTTTGTTCCAAATGTTACCGAAGTCTACGTGCCGA
GGAAGATCAAACGGCAGTGGCAAAAGCTGCGGTGGAGAAATCACTAAAGCTTCCATCTTG
CAGTCTCATCACCGCACCAGAAGAGCCAAAACAGCCTCTGGAGACCGAACCAGTCTCGGT
GGAAACCGTTGTGATCGCTGATCCGACTTCTGTTCCTCCTGTAGCTACGGGACAGGAGGA
GGGAGAGCCGTCGAAGCCTGCACGGCCGAACAGGTGTTTCAGCTGTAACAAGAAGGTTGG
AGTCATGGGGTTTAAGTGCAAATGCGGGAGCACGTTTTGCGGGAGCCATATGTACCCGGA
GAAGCATGCGTGTAGCTTCGAT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1BR82JQ 515 0 0
GT
CTACGTGCCGAGGAAGATCAAACGGCAGTGGCAAAAGCTGCGGTGGAGAAATCACTAAAG
CTTCCATCTTGCAGTCTCATCACCGCACCAGAAGAGCCAAAACAGCCTCTGGAGACCGAA
CCAGTCTCGGTGGAAACCGTTGTGATCGCTGATCCGACTTCTGTTCCTCCTGTAGCTACG
GGACAGGAGGAGGGAGAGCCGTCGAAGCCTGCACGGCCGAACAGGTGTTTCAGCTGTAAC
AAGAAGGTTGGAGTCATGGGGTTTAAGTGCAAATGCGGGAGCACGTTTTGCGGGAGCCAT
AGGTACCCGGAGAAGCATGCGGGTAGCTTCGATTTCAAAGAGGTTGGACGCGGTGCAATC
GCAAAGGCGAATCCTGTGGTCAAGGCCGATAAAGTCCAGAGGATTTGATGTGATGTGTCT
TATCTTTCAGTTTATTCCGAGAATGTTGCTGTGATGTGGTCATGTTCGATGTTGGGTTTC
TATGAATCAAAATGAAAAATTGCTGCTATTGGT

QA 3 515 3 515
DS 



AS 2 7

CO CL727Contig1 706 3 2 U
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AAACACTACCAAGATTTGTCAGCTAAGCCCTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACATAATC
TCTGGCCCAGTCGTTGCAATGATCTGGGAGGGAAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAGGAAG
ATCATTGGAGCAACCAACCCTGCAGCTTCTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTTTGCA
ATTGACATTGGCAGGAACATTATCCATGGGAGTGACTCTGTTGATAGCGCTAACAAGGAA
TGTGCGTTGTGGTTCC*TGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTCCACTCTTGGATC
TACGAATGATTCCATCATTCAAAACATGTTTCTCCACTGTTATTGCTGTTATTTCTGTTG
CTTTCCACCTTTGCATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCTTAAAACATGACTTTGTTTTTTT
TTTTTTTTGTGTGGGGTTTCTTTTACTCGTCTTATATTCTCTTTCTCCTCGAGCAAGAAA
GCTCAACGGTGTTCATGCGCTAGTTGTATTAATTTTCTTGCATTCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GL42JQ C 1
AF RS1GL42TF U 1
AF RS1DS66TF U 407
BS 1 577 RS1GL42TF
BS 578 706 RS1DS66TF

RD RS1GL42JQ 602 0 0
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TCTGGCCCAGTCGTTGCAATGATCTGGGAGGGAAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAGGAAG
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ATTGACATTGGCAGGAACATTATCCATGGGAGTGACTCTGTTGATAGCGCTAACAAGGAA
TGTGCGTTGTGGTTCC*TGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTCCACTCTTGGATC
TACGAATGATTCCATCATTCAAAACATGTTTCTCCACTGTTATTGCTGTTATTTCTGTTG
CTTTCCACCTTTGCATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATCTTAAAACATGACTTTGTTTT
TTTTT

QA 1 597 1 597
DS 

RD RS1GL42TF 577 0 0
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ATGATCAAGCCCGACGGCGTCCAGAGGGGTCTGGTCGGTCAAATCATCTGCAGGTTCGAG
CAGAAGGGCTTCACTTTGAAAGGTCTAAAGCTGATCACAGTTGACCGTCCTTTTGCTGAG
AAACACTACCAAGATTTGTCAGCTAAGCCCTTCTTCAGTGGCCTTGTTGATTACATAATC
TCTGGCCCAGTCGTTGCAATGATCTGGGAGGGAAAGAACGTTGTGTTGACGGGAAGGAAG
ATCATTGGAGCAACCAACCCTGCAGCTTCTGAACCAGGAACCATCCGTGGGGATTTTGCA
ATTGACATTGGCAGGAACATTATCCATGGGAGTGACTCTGTTGATAGCGCTAACAAGGAA
TGTGCGTTGTGGTTCC*TGATGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTCCACTCTTGGATC
TACGAATGATTCCATCATTCAAAACATGTTTCTCCACTGTTATTGCTGTTATTTCTGTTG
CTTTCCACCTTTGCATCTTTGTTTTGAAGTTTGAATC

QA 1 577 1 577
DS 

RD RS1DS66TF 300 0 0
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TCCACTCTTGGATCTACGAATAATTCCATCATTCAAAACATGTTTCTCCACTGTTATTGC
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GACTTTGTTTTTTTTTTTTTTTGTGTGGGGTTTCTTTTACTCGTCTTATATTCTCTTTCT
CCTCGAGCAAGAAAGCTCAACGGTGTTCATGCGCTAGTTGTATTAATTTTCTTGCATTCT

QA 1 300 1 300
DS 



CO CL727Contig2 654 4 30 U
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GTTAGCGCTATCAACAGAGTCACTACCATGGATAATGTTCCTGCCAATGTCAATTGCAAA
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TCCCGCCAACACAACGTTCTTACCCTCCCAGATCATTGCAACGACTGGACCAGAGATTAT
GTAATCAACAAGGCCACTGAAGAAGGGCTTAGCTGACAAATCTTGGTAGTGTTTCTCAGC
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AGTTTGCTCCATTGTCGATACTTTTTTTT*GATGCTGTTACTCGTCGGCGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1GN35JQ U 1
AF RS1FQ13JQ U 49
AF RS1GN35TF C 97
AF RS1FQ13TF C 49
BS 1 51 RS1GN35JQ
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RD RS1GN35JQ 560 0 0
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CAATAACAGTGGAGAAACATGTTTTGAATCACAAAAACGATGGAATCATTCGTAGATCCA
AGAGTGGAGGCTGCTCTGCCAGTTCACAGGTCCATCAGGGAACCACAACGCACATTCTTT
GTTAGCGCTATCAACAGAGTCACTCCCATGGATAATGTTCCTGCCAATGTCAATTGCGAA
ATCCCCACGGATGGTTCCTGGTTCAAAAGCTGCAGGGTTGGTTGCTCCAATGATCTTCCT
TCCCGTCAACACAACGTTCTTACCCTCCCAGATCATTGCAACGACTGGGCCAGAAATTAT
GTAATCAACAAGGCCACTGAAGAAGGGCTTAACTGACAAATCTTGGTAGTGTTTCTCAGC
AAAAGGACGGTCAACTGCGATCAGCTTTAGACCTTTCAAAGTAAAACCCTTCTGCTCGAA
CCTGCAGATGATTTGACCGA

QA 1 560 1 560
DS 

RD RS1FQ13JQ 606 0 0
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CAGAGATAACAGCAATAACAGTGGAGAAACATGATTTGAATCACAAAAACGATAGAATCA
TTCGTAGATCCAAGAGTGAAGGCTGCTCTGCCAGTTAACAGGTCCATCAGGGAACCACAA
CGCACATTCTTTGTTAGCGCTATCAACAGAGTCACTACCATGGATAATGTTCCTGCCAAT
GTCAATTGCAAAATCCCCACGGATGGTTCCTGGTTAAGAAGCTGCAGGGTTGGTTGCTCC
AATGATCTTCCTTCCCGCCAACACAACGTTCTTTCCCTCCCAGATCATTGCAACGACTGG
ACCAGAGATTATGTAATCAACAAGGCCACTGAAGAAGGGCTTAGCTGACAAATCTTGGTA
GTGTTTCTCAGCAAAAGGACGGTCCACTGTGATCAGCTTTAGACCTTTCAAAGTGAAACC
CTTCTGCTCGAACCTGCAGATGATTTGACCGACCAGACCCCTCTGGACGCCGTCGGGCTT
GATCATGATGAAAGTTTGCTCCATTGTCGATACTTTTTTTT*GATGCTGTTACTCGTCGG
CGATCC

QA 1 606 1 606
DS 

RD RS1GN35TF 558 0 0
GGTGGAAAGCAACAGAGATAACAGCAATAACAGTGGAGAAACATGTTTTGAATCACAAAA
ACGATGGAATCATTCGTAGATCCAAGAGTGGAGGCTGCTCTGCCAGTTCACAGGTCCATC
AGGGAACCACAACGCACATTCTTTGTTAGCGCTATCAACAGAGTCACTCCCATGGATAAT
GTTCCTGCCAATGTCAATTGCGAAATCCCCACGGATGGTTCCTGGTTCAGAAGCTGCAGG
GTTGGTTGCTCCAATGATCTTCCTTCCCGTCAACACAACGTTCTTACCCTCCCAGATCAT
TGCAACGACTGGGCCAGAGATTATGTAATCAACAAGGCCACTGAAGAAGGGCTTAGCTGA
CAAATCTTGGTAGTGTTTCTCAGCAAAAGGACGGTCAACTGCGATCAGCTTTAGACCTTT
CAAAGTAAAACCCTTCTGCTCGAACCTGCAGATGATTTGACCGACCAGACCCCTCTGGAC
ACCGTCGGGCTTGATCATGATGAAAGTTTGCTCCATTGTCGATTCTTTTTTTTTGATGCT
GTTACTCGTCGGCGATCC

QA 1 558 1 558
DS 

RD RS1FQ13TF 606 0 0
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CAGAGATAACAGCAATAACAGTGGAGAAACATGATTTGAATCACAAAAACGATAGAATCA
TTCGTAGATCCAAGAGTGAAGGCTGCTCTGCCAGTTAACAGGTCCATCAGGGAACCACAA
CGCACATTCTTTGTTAGCGCTATCAACAGAGTCACTACCATGGATAATGTTCCTGCCAAT
GTCAATTGCAAAATCCCCACGGATGGTTCCTGGTTAAGAAGCTGCAGGGTTGGTTGCTCC
AATGATCTTCCTTCCCGCCAACACAACGTTCTTTCCCTCCCAGATCATTGCAACGACTGG
ACCAGAGATTATGTAATCAACAAGGCCACTGAAGAAGGGCTTAGCTGACAAATCTTGGTA
GTGTTTCTCAGCAAAAGGACGGTCCACTGTGATCAGCTTTAGACCTTTCAAAGTGAAACC
CTTCTGCTCGAACCTGCAGATGATTTGACCGACCAGACCCCTCTGGACGCCGTCGGGCTT
GATCATGATGAAAGTTTGCTCCATTGTCGATACTTTTTTTT*GATGCTGTTACTCGTCGG
CGATCC

QA 1 606 1 606
DS 



AS 2 7

CO CL728Contig1 1243 2 2 U
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TATTGGCTTTCATCAGCGGCTGGACAAAACAAATCCTTTTCTGCAGTTTTTGCTTTTGGA
GATTCAATACTAGATACTGGTAACAATAATCGTCTTCTTACTGTATTCAAGGGAAATTAC
TGGCCATATGGTTGGAACTATGACTTTAAGATACCGACGGGCAGATTTGGAAATGGGAGA
GTTTTCACCGATATGGTTGCTCAAGGGTTGGGGTTGAAAAGAGTTGTACCCGCCTATCGT
AGGATGCGTCGCATCAAGCGCAACGACCTTAAAACTGGCGTTTGTTTCGCATCAGGTGGT
TCAGGAATCGACGATCTTACATCTAGAATACATAGAGTCTTATCGACAGAGGACCAAGTA
AGAGATTTCAAAAAATATTTGAAGCAACTAAAAAATGCGACGAAAAATAAGAAATAGATG
AAAAATATAATTTCAAACGCGGTGTTTCTTATTTCTGAAGGAAATAACGATATTGCATAC
TTCGTGACTCCCGCTCGTCTACGATTACAATCCAAAGATACATACACAAGTAACATGGTT
TTTTGGACAAAAACATTCCTACAAGATTTATACGATCTTGGAGCGAGAAAATTCGCGGTG
ATTGGAGCGATTCCCGTAGGATGCTTGCCTTTCCATCGCTTCATATTTGGTGGAGTATTT
GCATGGTGTAACTTCATGATGAATAAAATTTCGGAGGACTTCAACACAAAATTGCGGAAA
GCTCTTATTGGTTACGAAGTAGAAGAATGTTTTAAAGGTGCAAAGTTTGTTTACGTCGAC
ATGTACGGCTCTATTATGAATCTTATCAACCATCCTAAGGTCTTTGGGTTTACAGAAGCG
AAAAGATCGTGTTGTTGTATGGTGACATCGATAATACCATGCCGAAACCCGGATGAGTAC
GTATTCTATGACTTTGCTCACCCCACCATGAAAGCCTATGAAGTAATATCTAAACCTCTT
ATCTATCAGATGAGGAAAGGCCTTGCATGATTTAGTTTCTTGTTTCTTACCATGATTAAT
TTTAATATTCATGTAACAGGCGACAATATCATACATGACGATATGTATTCTTAGTGTTAA
GAATGTATGATCCATTAGTTCAAAAAAAAAAGAATGTATGATCCAATTATGTATAATTGT
ATTGTCCTTTCTTTTATAATGTCACAGCACAAACGCGTTTGTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CO13TF U 1
AF RS1CO13JQ C 464
BS 1 674 RS1CO13TF
BS 675 1243 RS1CO13JQ

RD RS1CO13TF 675 0 0
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TGGCCATATGGTTGGAACTATGACTTTAAGATACCGACGGGCAGATTTGGAAATGGGAGA
GTTTTCACCGATATGGTTGCTCAAGGGTTGGGGTTGAAAAGAGTTGTACCCGCCTATCGT
AGGATGCGTCGCATCAAGCGCAACGACCTTAAAACTGGCGTTTGTTTCGCATCAGGTGGT
TCAGGAATCGACGATCTTACATCTAGAATACATAGAGTCTTATCGACAGAGGACCAAGTA
AGAGATTTCAAAAAATATTTGAAGCAACTAAAAAATGCGACGAAAAATAAGAAATAGATG
AAAAATATAATTTCAAACGCGGTGTTTCTTATTTCTGAAGGAAATAACGATATTGCATAC
TTCGTGACTCCCGCTCGTCTACGATTACAATCCAAAGATACATACACAAGTAACATGGTT
TTTTGGACAAAAACATTCCTACAAGATTTATACGATCTTGGAGCGAGAAAATTCGCGGTG
ATTGGAGCGATTCC
C

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1CO13JQ 780 0 0
AAAATAAGAAATAGATGAAAAATATAATTTCAAACGCGGTGTTTCTTATTTCTGAAGGAA
ATAACGATATTGCATACTTCGTGACTCCCGCTCGTCTACGATTACAATCCAAAGATACAT
ACACAAGTAACATGGTTTTTTGGACAAAAACATTCCTACAAGATTTATACGATCTTGGAG
CGAGAAAATTCGCGGTGATTGGAGCGATTCCCGTAGGATGCTTGCCTTTCCATCGCTTCA
TATTTGGTGGAGTATTTGCATGGTGTAACTTCATGATGAATAAAATTTCGGAGGACTTCA
ACACAAAATTGCGGAAAGCTCTTATTGGTTACGAAGTAGAAGAATGTTTTAAAGGTGCAA
AGTTTGTTTACGTCGACATGTACGGCTCTATTATGAATCTTATCAACCATCCTAAGGTCT
TTGGGTTTACAGAAGCGAAAAGATCGTGTTGTTGTATGGTGACATCGATAATACCATGCC
GAAACCCGGATGAGTACGTATTCTATGACTTTGCTCACCCCACCATGAAAGCCTATGAAG
TAATATCTAAACCTCTTATCTATCAGATGAGGAAAGGCCTTGCATGATTTAGTTTCTTGT
TTCTTACCATGATTAATTTTAATATTCATGTAACAGGCGACAATATCATACATGACGATA
TGTATTCTTAGTGTTAAGAATGTATGATCCATTAGTTCAAAAAAAAAAGAATGTATGATC
CAATTATGTATAATTGTATTGTCCTTTCTTTTATAATGTCACAGCACAAACGCGTTTGTC

QA 1 780 1 780
DS 



CO CL728Contig2 1238 5 3 U
GGGTGAACTTAATAGTCGATATGTTTAGGGAAAATATATTGGTGTTGACATTATTTTCCA
TTTATTGGCTTTCATCAGCGGCTGGACAAAACAAATCCTTTTCTGCAATTTTTGCTTTTG
GAGATTCAATACTAGATACTGGTAACAATAATCGTCTTCTTACTCTACTCAAGGGAAATT
TCTGGCCATATGGTTTGAACTATGACTTTAAGATACCGACGGGCAGATTTGGAAATGGAA
GAGTTTTCACCGATATGATTGCTCACGGGTTGGGGGTAAAAAAAGTTGTACCCGCTTATC
GTAGGTTTCGTCGCATCAAGCCCGACGACCTTAAAACTGGCGTTTGTTTCGCCTCAGGTG
GTTCAGGAATCGACGATCTTACATCTAAAACGCTGGGGGTTTTATCCACAGGCGACCAAG
TAAGAGATTTCAAAAAATATTTGAAGAAACTAAAGAATGCGACGAAAAATAAGAAACAAA
TGAAATCCATAATTTCAAACGCAGTGTTTCTTATTTCTGAAGGAAATAACGACATTGGAT
ACTTCGCGACTCCCGCTCGTCTACGATTACAATCCAAAGATACATACACAAGTAACATGG
TTTTTTGGACAAAAACATTCCTACAAGATTTATACGATCTTGGAGCGAGAAAATTCGCGG
TGATGGGAGCGATTCCGGTAGGATGCTTGCCTTTCCATCGCTTCCTATTTGGTGGAGTAT
TTGCATGGTGTAACTTCATGATGAATAAAGTTTCGGAAGACTTCAACACAAAATTGCAGA
AAGCTCTTATTGGTTACGAAGTAGAAGAATGTTTTAAAGGTGCAAAGTTTGTTTACGTCG
ACATGTACGGCTCTCTCATGGATCTTATCAACCATCCTAAGGCCTATGGGTTTACAGAAG
GGAAAAGATCGTGTTGTTGTATGGTGACATCGATAATACCATGCCTAAACCCGGACGAGT
ACGTATTCTATGACTTCGCTCACCCCACCATGAGAGCCTATGAAGTAATATCTAAACCTC
TTGTCTATCAGATAAGGAAAGGCCTTGCATGATTTAGTTTCTTGTTTCTTTACCATCTTT
AATTTTAATATTCATGTAACAGGCGACAATATCATACATGACGATATATATTCGTAGTCT
AAAGAATGTATGATCCAATGATGTATAATTGTATTGTCCTTTCTTTTATATTGTCACCAG
ACAAACGCGTCTATCAATAAATGCATGTATATTAACGG


BQ
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C

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ATTGTCACCAGACAAACGCGTCTATCAATAAATGCATGTATATTAACGG

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BQ
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25 25 25 25 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 

AF RS1GB29TF U 1
AF RS1EW89TF U 1
AF RS1ES89TF U 403
AF RS1ES89JQ C 636
AF RS1F842TF U 572
AF RS1BL21JQ C 1024
AF RS1GB29JQ C 1026
BS 1 7 RS1EW89TF
BS 8 8 RS1GB29TF
BS 9 128 RS1EW89TF
BS 129 129 RS1GB29TF
BS 130 273 RS1EW89TF
BS 274 274 RS1GB29TF
BS 275 346 RS1EW89TF
BS 347 347 RS1GB29TF
BS 348 525 RS1EW89TF
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BS 527 723 RS1EW89TF
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BS 725 759 RS1EW89TF
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BS 761 799 RS1EW89TF
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BS 1342 1448 RS1BL21JQ
BS 1449 1449 RS1GB29JQ
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RD RS1GB29TF 641 0 0
GGACAACATATCATAAACTCGTTTCTTTTCATACTTAAGGGTTTCGAGTTTTCAGAACCT
CCTGAATCAGGTTTCCTACGTTTGATATCTTTGGATAATTGTTTTGTGTTTGTACTAAGA
GATTAAAACTCCAGATCGTGATCAACATTTTTATACATCTAACAGAAGAGCGTGAATGAG
ATTATGATGGAATCGAAAGCTGGTAATAACAAGTCTAAAAGTTCCTTATTTTACGAAGCC
CCCCTCGGTTACAGCATTGAAGACGTTCGTCCTCTCGGTGGAATCAAGAAATTCAAATCT
TCTGTCTACTCTAACTGCTCTAAGAGGCCATCCTAGTCAACTCGGACATCCCTCGTAGTT
TAACTTGCTTTCTAGTTTCAATCTCTTTCAAGAAGATCTTTTCATCTCACAACAAAAAAA
AAGCGAGAAGACAATGTCAGTCTCTTCAATAGAGTTCGAAGGCTACGAGAAGCGCCTTGA
AGTAACCTTCTTTGAGCCGAGTATCTTCCTCGACACGCAAGGGTTAGGGCTCCGTACCCT
AACCAAGTCTCAAATCGACGAGATCCTCCAGTCAGCTGAGTGTACCATCGTTTCATCACT
CTCCAACGATCAGCTCGACTCTTACGTCCTCTCTGAGTCAA

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1EW89TF 799 0 0
GGACAACGTATCATAAACTCGTTTCTTTTCATACTTAAGGGTTTCGAGTTTTCAGAACCT
CCTGAATCAGGTTTCCTACGTTTGATATCTTTGGATAATTGTTTTGTGGTTGTACTAAGA
GATTAAAATTCCAGATCGTGATCAACATTTTTATACATCTAACAGAAGAGCGTGAATGAG
ATTATGATGGAATCGAAAGCTGGTAACAACAAGTCTAAAAGTTCCTTATTTTACGAAGCC
CCCCTCGGTTACAGCATTGAAGACGTTCGTCCTTTCGGTGGAATCAAGAAATTCAAATCT
TCTGTCTACTCTAACTGCTCTAAGAGGCCATCCTAGTCAACTCGGATATCCCTCGTAGTT
TAACTTGCTTTCTAGTTTCAATCTCTTTCAAGAAGATCTTTTCATCTCACAACAAAAAAA
AAGCGAGAAGACAATGTCAGTCTCTTCAATAGGGTTCGAAGGCTACGAGAAGCGCCTTGA
AGTAACCTTCTTTGAGCCGAGTATCTTCCTCGACACGCAAGGGTTGGGGCTCCGTACCCT
AACCAAGTCTCAAATCGACGAGATCCTCCAGTCAGCTGAGTGTACCATCGTTTCATCACT
CTCCAACGATCAGCTCGACTCTTACGTCCTCTCTGAGTCAAGCCTCTTTATCTTCCCTTA
CAAGATCATCATCAAGACTTGTGGGACGACAAAGCTCCTCCTCTCTATCGAACCACTCTT
GAG*TTAGCTAGAGAGCTCTCTCTTGACGTCGAGTCTGT*CGCTACACTCGTGGGAGCTT
CATCTGCCCTGGAGGGCAG

QA 1 799 1 799
DS 

RD RS1ES89TF 622 0 0
G
ATCTCACAACAAAAAAAA*GCGAGAAGACAATGTCAGTCTCTTCAATAGGGTTCGAAGGC
TACGAGAAGCGCCTTGAAGTAACCTTCTTTGAGCCGAGTATCTTCCTCGACACGCAAGGG
TTAGGGCTCCGTACCCTAACCAAGTCTCAAATCGACGAGATCCTCCAGTCAGCTGAGTGT
ACCATCGTTTCATCACTCTCCAACGATCAGCTCGACTCTTACGTCCTCTCTGAGTCAAGC
CTCTTTATCTTCCCTTACAAGATCATCATCAAGACTTGTGGGACGACAAAGCTCCTCCTC
TCTATCGAACCACTCTTGAGGTTAGCTAGAGAGCTCTCTCTTGACGTCGAGTCTGTTCGC
TACACTCGTGGGAGCTTCATCTGCCCTGGAGGGCAGCCTTTCCCTCACCGCAACTTCTCT
GAAGAAGCTTCTGTCCTCGATGCTCACTTCACCAAGCTAGGTTTGAGCAGTGTCGCGTAC
TTGATGGGTGATGATGATGAAACCAAGAAATGGCACGTTTACTCAGCTTCTTCTCCTACC
AAGAGCTCAAACAACAAGAATGTATACACGTTAGAGATGTGCATGACTGGTCTGGACAAA
GACAAGGCATCTATGTTCTAC

QA 2 622 2 622
DS 

RD RS1ES89JQ 450 0 0
AGTCAAGCCTCTTTATCTTCCCTTACAAGATCATCATCAAGACTTGTGGGACGACAAAGC
TCCTCCTCTCTATCGAACCACTCTTGAGGTTAGCTAGAGAGCTCTCTCTTGACGTCGAGT
CTGTTCGCTACACTCGTGGGAGCTTCATCTGCCCTGGAGGGCAGCCTTTCCCTCACCGCA
ACTTTTCTGAAGAAGCTTCTGTCCTCGATGCTCACTTCACCAAGCTAGGTTTGAGCAGTG
TCGCGTACTTGATGGGTGATGATGATGAAACCAAGAAATGGCACGTTTATTCAGCTTCTT
CTCCTACCAAGAGCTCAAACAACAAGAATGTATACACGTTAGAGATGTGCATGACTGGTC
TGGACAAAGACAAGGCATCTATGTTCTACAAGAACGAATCAAGTTCCATGACTGATACCT
CTGGCATCAGAAAGATACTTCCTCAATCCC

QA 1 450 1 450
DS 

RD RS1F842TF 770 0 0
G
CAGCTGAGTGTACCATCGTTTCATCACTCTCCAACGATCAGCTCGACTCTTACGTCCTCT
CTGAGTCAAGCCTCTTTATCTTCCCTTACAAGATCATCATCAAGACTTGTGGGACGACAA
AGCTCCTCCTCTCTATCGAACCACTCTTGAGGTTAGCTAGAGAGCTCTCTCTTGACGTCG
AGTCTGTTCGCTACACTCGTGGGAGCTTCATCTGCCCTGGAGGGCAGCCTTTCCCTCACC
GCAACTTCTCTGAAGAAGCTTCTGTCCTCGATGCTCACTTCACCAAGCTAGGTTTGAGCA
GTGTCGCGTACTTGATGGGTGATGATGATGAAACCAAGAAATGGCACGTTTACTCAGCTT
CTTCTCCTACCAAGAGCTCAAACAACAAGAATGTACACACGTTAGAGATGTGCATGACTG
GTCTGGACAAAGACAAGGCATCTATGTTCTACAAGAACGAATCAAGTTCCATGACTGATA
CCTCTGGCATCAGAAAGATACTTCCTCAATCCCAAATCTGCGACTTTGAGTTCGAGCCAT
GCGGTTACTCTATGAACAGCGTGGAAGGTGAGGCCATCTCCACCATCCACGTAACCCCTG
AAGACGGGTTCAGCTACGCAAGCTTTGAGGCAGTGGGGTACGATTTCGAAACCATGGACT
TGAGCTATCTTGTCTCGAAG*TTCTAACGTGTTTTAAGCCAAAGCAATTCTCAGTAGCCA
TACACTCTAGCATCGCAA*GACGAGT*ACTACAAAG*TCTATGTGTAGT

QA 2 770 2 770
DS 

RD RS1BL21JQ 661 0 0
CA
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CCATCTCCACCATCCACGTAACCCCTGAAGACGGGTTCAGCTACGCAAGCTTTGAGGCAG
TGGGGTACGATTTCGAAACCATGGACTTGAGCTATCTTGTCTCGAAGGTTCTAACGTGTT
TTAAGCCAAAGCAATTCTCAGTAGCCATACACTCTAGCATCGCAAAGACGAGTTACTACA
AAGGTCTATGTGTAGTAGACCTAGACGGTTATGGATGTAGAGAGTCAACTATGGAGTCTC
TAGGTGAAGAGAGAGGGACAATGATGTATCAAAGGTTTGAGAAGCTGGGAATGTGTTGTG
GTTTTCCGAGATCTACGTTGAAGTGTGAGTGGAGCAGCAACAGTAGTTGCACTAGCGAGG
ATGAGAAGGAAGAGGGAACCTAATTAAAGCTTTTATTTGTTTTGTTTACTTATTTTCGAA
TAATGCAAGTCTCTCATATGTTTGTGTTGTTATCCTCCTTAAAACAGCAAGTGTGTCTGG
CCTATGCCTATGTAAATTCGGATGATCAAATATTTATGAAATTATCTATCATTATAACC

QA 3 661 3 661
DS 

RD RS1GB29JQ 659 0 0
AGAACGAATCAAGTTCCATGACTGATACCTCTGGCATCAGAAAGATACTTCCTCAATCCC
AAATCTGCGACTTTGAGTTCGAGCCATGCGGTTACTCTATGAACAGCGTGGAAGGTGAGG
CCATCTCCACCATCCACGTAACCCCTGAAGACGGGTTCAGCTACGCAAGCTTTGAGGCAG
TGGGGTACGATTTCGAAACCATGGACTTGAGCTATCTTGTCTCGAAGGTTCTAACGTGTT
TTAAGCCAAAGCAATTCTCAGTAGCCATACACTCTAGCATCGCAAAGACGAGTTACTACA
AAGGTCTATGTGTAGTAGACCTAGACGGTTATGGATGTAGAGAGTCAACTATGGAGTCTC
TAGGTGAAGAGAGAGGGACAATGATGTATCAAAGGTTTGAGAAGCTGGGAATGTGTTGTG
GTTCTCCGAGATCTACGTTGAAGTGTGAGTGGAGCAGCGACAGTAGTTGCACTAGCGAGG
ATGAGAAGGAAGAGGGAACCTAATTAAAGCTTTTATTTGTTTTGTTTACTTATCTTCGAA
TAATGCAAGTCTCTCATATGTTTGTGTTGTTATCCTCCTTAAAACAGCAAGTGTGTCTGG
CCTATGCCTATGTAAATTCGGATGATCAAATATTTATGAAATTATCTATCGTTATAACC

QA 1 659 1 659
DS 



AS 2 7

CO CL730Contig1 613 5 12 U
TCCACACACATTTCATTTTGCAAACAACAAAATCTAAGAGAGAAATATGGCTGGTCTAAT
GAAGTTGGCCTGCTTGGTCTTTACCTGCATGATCGTGGCCGGTCCAATCACATCGAACGC
GGCTCTGAACTGTGGCACCGTTAACGCCAACGTGGCAGCGTGCATCGGCTACCTAGCCCA
GGGTGCGCCGGCCATTCCACCAGCGTGCTGCAGCGGCGTTACTAATCTAAACAACCTGGC
CCGTACAACCCCGGACCGTCAGCAAGCTTGCCGTTGCCTTGTAGGAGCCGCTAACGCCTT
CCCTAGTCTCAACGCTGCCCGTGCAGCTGGACTTCCTAAGGCATGTGGAGTCAATATCCC
TTACAAGATCAGCAAAAGCACCAACTGCAACAGTGTGAAATGAGCTGCGGTCGGATGAAG
CTAATGCGGACGTTTCAAATATTATGTAATGGATGAGAGAATACTAAAATAAGATGTTTC
AGTGGTTGTTGTTTCTAGAGTTTTTCAGTTTCCTGTCTTTTATGTTGTCATGCTCCTATC
ACTTTGGTCGTCTGTACTATGTTCACAATCAACGTTATATGAATTTCAGATCTAAGGTTT
AAGTTTTGTTGTC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1DJ84TF U 1
AF RS1DJ84JQ C 237
AF RS1ED09TF U 1
AF RS1CM63JQ C 1
AF RS1CM63TF U 1
BS 1 165 RS1DJ84TF
BS 166 166 RS1CM63TF
BS 167 234 RS1DJ84TF
BS 235 235 RS1ED09TF
BS 236 406 RS1DJ84TF
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BS 558 599 RS1ED09TF
BS 600 612 RS1CM63TF
BS 613 613 RS1CM63JQ

RD RS1DJ84TF 557 0 0
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CTAATGCGGACTTTTCAAATATTATGTAATGGATGAGAGAATACTAAAATAAGATGTTTC
AGTGGTTGTTGTTTCTAGAGTTTTTCAGTTTCCTGTCTTTTATGTTGTCATGCTCCTATC
ACTTTGGTCGTCTGTAC

QA 1 557 1 557
DS 

RD RS1DJ84JQ 319 0 0
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TCCCTTACAAGATCAGCAAAAGCACCAACTGCAACAGTGTGAAATGAGCTACGGTCGGAT
GAAGCTAATGCGGACTTTTCAAATATTATGTAATGGATGAGAGAATACTAAAATAAGATG
TTTCAGTGGTTGTTGTTTCTAGAGTTTTTCAGTTTCCTGTCTTTTATGTTGTCATGCTCC
TATCACTTTGGTCGTCTGT

QA 1 319 1 319
DS 

RD RS1ED09TF 599 0 0
TCCACACACATTTCATTTTGCAAACAACAAAATCTAAGAGAGAAATATGGCTGGTCTAAT
GAAGTTGGCCTGCTTGGTCTTTACCTGCATGATCGTGGCCGGTCCAATCACATCGAACGC
GGCTCTGAACTGTGGCACCGTTAACGCCAACGTGGCAGCGTGCATTGGCTACCTAGCCCA
GGGTGCGCCGGCCATTCCACCAGCGTGCTGCAGCGGCGTTACTAATCTAAACAACCTGGC
CCGTACAACCCCGGACCGTCAGCAAGCTTGCCGTTGCCTTGTAGGAGCCGCTAACGCCTT
CCCTAGTCTCAACGCTGCCCGTGCAGCTGGACTTCCTAAGGCATGTGGAGTCAATATCCC
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DS 

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GGCTCTGAACTGTGGCACCGTTAACGCCAACGTGGCAGCGTGCATCGGCTACCTAGCCCA
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CCCTAGTCTCAACGCTGCCCGTGCAGCTGGACTTCCTAAGGCATGTGGAGTCAATATCCC
TTACAAGATCAGCAAAAGCACCAACTGCAACAGTGTGAAATGAGCTGCGGTCGGATGAAG
CTAATGCGGACGTTTCAAATATTATGTAATGGATGAGAGAATACTAAAATAAGATGTTTC
AGTGGTTGTTGTTTCTAGAGTTTTTCAGTTTCCTGTCTTTTATGTTGTCATGCTCCTATC
ACTTTGGTCGTCTGTACTATGTTCACAATCAACGTTATATGAATTTCAGATCTAAGGTTT
AAGTTTTGTTGTC

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DS 

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GAAGTTGGCCTGCTTGGTCTTTACCTGCATGATCGTGGCCGGTCCAATCACATCGAACGC
GGCTCTGAACTGTGGCACCGTTAACGCCAACGTGGCAGCGTGCATCGGCTACCTAGCCCA
GGGTGCGCCGGCCATTCCACCAGCGTGCTGCAGCGGCGTTACTAATCTAAACAACCTGGC
CCGTACAACCCCGGACCGTCAGCAAGCTTGCCGTTGCCTTGTAGGAGCCGCTAACGCCTT
CCCTAGTCTCAACGCTGCCCGTGCAGCTGGACTTCCTAAGGCATGTGGAGTCAATATCCC
TTACAAGATCAGCAAAAGCACCAACTGCAACAGTGTGAAATGAGCTGCGGTCGGATGAAG
CTAATGCGGACGTTTCAAATATTATGTAATGGATGAGAGAATACTAAAATAAGATGTTTC
AGTGGTTGTTGTTTCTAGAGTTTTTCAGTTTCCTGTCTTTTATGTTGTCATGCTCCTATC
ACTTTGGTCGTCTGTACTATGTTCACAATCAACGTTATATGAATTTCAGATCTAAG*TTT
AAGTTTTGTTGT
C

QA 1 612 1 612
DS 



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GCTGCCCGTGCAGCTGGACTTCCTAAGGCATGTGGAGTCAATATCCCTTACAAGATCAGC
AAAAGCACCAACTGCAACAGTGTGAAATGAGCTGCGGTCGGATTAAGCTAATGCGGACGT
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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BS 420 420 RS1GS60JQ

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DS 

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GCTGCCCGTGCAGCTGGACTTCCTAAGGCATGTGGAGTCAATATCCCTTACAAGATCAGC
AAAAGCACCAACTGCAACAGTGTGAAATGAGCTGCGGTCGGATTAAGCTAATGCGGACGT
TTCAAATATTATGTAATGGATGAGAGAATACTAAAATAAGATGTTTCAGTGGTTGTTGTT
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GTACTATGTTCACAATCAACGTTATATGAATTTCAGATCTAAGGTTTAAGTTTTGTTGT
T

QA 1 419 1 419
DS 



AS 2 6

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CH19TF U 1
AF RS1EU75TF U 6
AF RS1AP22TFB U 488
AF RS1AP22JQ C 1102
BS 1 454 RS1CH19TF
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BS 636 1231 RS1AP22TFB
BS 1232 1478 RS1AP22JQ

RD RS1CH19TF 638 0 0
GGATCACACGACGAACGAACCCAAAGAAAAGTCCTCCAACCATCGCAGTCGTCGCCACCA
TGGCTGTGCTATCATCTACAGATCGAGAAGACGGTGAGAAGAAGGTGAAGAGTTCGTATC
TTGATTTGCCGGCTATGGACGTATCTATGGCATTTCCTCAAGCGACTCCAGCCTCTAAGT
TCCCACCCTGCACTTCAGACTATTATCATTTCAATGAACTATTGACTCCGGAGGAACAGG
CTGTGCGGAAGAGAGTGAGGGAGTTCATGGAGAAAGAAGTTGCCCCTATCATGACAGAGT
ACTGGGAGAAGGCAGAGTTCCCATTCCATATCATTCCAAAGCTTGGAGCTTTGGGCGTTG
TTGGTGGTTCCATCAAGGGCTATGGTTGTCCTGGACTCTCTATCACAGCCAACGCAATTG
CAACGGCAGAGATATCTAGAGTTGATGCAAGCTGTGGGACTTTTAATTTGGTGCATACCT
CTTTGGGCATGCTCACTATTGCACTTTGTGGATCAGAAGCACAGAAGCAGAACTATTTGC
CTTCTTTGGCTCAGATGAAAACTGTGACTTGTTGGGCTTTGACAGAACCTGACAACGGAA
GTGATGCAAGTGCTCTACAAACAACTGCCACAAAG
TTG

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1EU75TF 634 0 0
GG
ACGACGAACGAACCCAAAGAAAAGTCCTCCAACCATCGCAGTCGTCGCCACCATGGCTGT
GCTATCATCTACAGATCGAGAAGACGGTGAGAAGAAGGTGAAGAGTTCGTATCTTGATTT
GCCGGCTATGGACGTATCTATGGCATTTCCTCAAGCGACTCCAGCCTCTAAGTTCCCACC
CTGCACTTCAGACTATTATCATTTCAATGAACTATTGACTCCGGAGGAACAGGCTGTGCG
GAAGAGAGTGAGGGAGTTCATGGAGAAAGAAGTTGCCCCTATCATGACGGAGTACTGGGA
GAAGGCAGAGTTCCCATTCCATATCATTCCAAAGCTTGGAGCTTTGGGCGTTGTTGGTGG
TTCCATCAAGGGCTATGGTTGTCCTGTACTCTCTATCACAGCCAACGCAATTGCAACGGC
AGAGATATCTAGAGTTGATGCAAGCTGCGGGACTTTTAATTTGGTGCATACCTCTTTGGG
CATGCTCACTATTGCACTTTGTGGATCAGAAGCACAGAAGCAGAATTATTTGCCTTCTTT
GGCTCAGATGAAAACTGTGACTTGTTGGGCTTTGACAGAACCTGACAACGGAAGTGATGC
AAGTGCTCTACAAACAACTGCCACAAAG
GTTG

QA 3 630 3 630
DS 

RD RS1AP22TFB 744 0 0
G
ATGCTCACTATTGCACTTTGTGGTTCAGAAGCACAGAAGCAGAACTATTTGCCTTCTTTG
GCCCAGATGAAAACTGTGACTTGTTGGGCTTTGACAGAACCTGACAACGGAAGTGATGCA
AGTGCTCTACAAACAACTGCCACAAAGGTTGAAGGAGGTTGGGTACTTACGGGACAAAAG
CGTTGGATCGGTAACAGTACTTTTGCAGATCTGTTGATCATCCTTGCTAGGAATACGACA
ACGAACCAAGTGAACGGATTCATAGTCAAGAAAGATGCGCCTGGTTTAACAGTTACTAAG
ATCCCGAATAAAATAGGTTTACGTATTGTTCAAAATGGAGATATTCTATTACAGAATGTC
TTTGTTCCTGATGAGGAGCGGTTACCTGGAGTGAATTCTTTTCAAGACACAAGCAAGGTG
CTGGCTGTCCCACGTGTAATGGTGGCTTGGCAACCAATAGGTATATCAATGGGAGTCTAC
GATATGTGCCACAGGTATCTGATGGAGAGGAAACAGTTTGGAGCACAGTTGGCTGCTTTC
CAGATAAATCAACAGAAACTTGTGAAGATGCTAGGTAATGTTCAAGCGATGTTTCTGATG
GGTTGGCGCCTCTGCAAGCTATATGAGACGGGTCAGATGACTCCTGGTCAAGCCAGTTTA
GGAAAGGCATGGATTTCATCAAAGGCAAGGGGGACTGCTTCGTTAGGCCGAGAATTACTC
GGTGGGAAAGGAATTCTAGGGGA

QA 2 744 2 744
DS 

RD RS1AP22JQ 377 0 0
GCAAGCTATATGAGACGGGTCAGATGATTCCTGGTCAAGCCAGTTTAGGAAAGGCATGGA
TTTCATCAAAGGCAAGGGGGACTGTTTCGTTAGGCCGAGAATTACTCGGTGGGAAAGGAA
TTTTAGGGGATTTTTTGGTGGGGAAGGCTTTCTGTGCCCTTGAACCGATTTATACATACG
AAGGGACGTACGATATAAACACCTTAGTGACGGCGAGGGAAGTAACTGGGATCGCGAGTT
TCAAGCCTGCCGCTTCACGGAGCCGTAGCCGCCTTTAAGGTTGTGCAGTGTTTGTTATTT
GTTGTCTGTGAGTTTACTTTGGTAAAAATGTTACGTGGAAAAGCAAGTGCAACTGTGCAA
GTGCGTCAAATAAACTT

QA 1 377 1 377
DS 



CO CL731Contig2 406 2 1 U
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ACGAAGGGACGTACGATATAAACACCTTAGTGACGGCGAGGGAAGTAACTGGGATCGCGA
GTTTCAAGCCTGCCGCTTCACGGAGCCGTAGCCGCCTTTAAGGTTGTGCAGTGTTTGTTA
TTTGTTGTCTGTGAGTTTACTTTGGTAAAAATGTTACGTGGAAAACAAAGTGCAAGTGCA
AGTGCAAGTGCAACTGTGCAAGTGCGTCAAATAAACTTGACCTCCTAAGGGACGGGACAT
GTGCAAAACCATAATTGCAGTTTGGATTCGTGCTGTATTTGTCATGTAGTTTCTTCACAT
TTAACAAACTCAAGGAATAATACAAAAATTATGTTTTTAAATGTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DO62JQ C 1
AF RS1DO62TF U 1
BS 1 406 RS1DO62TF

RD RS1DO62JQ 406 0 0
GAATTCTAGGGGATTTTCTGGTGGCGAAGGCTTTCTGTGACCTTGAACCGATTTATACAT
ACGAAGGGACGTACGATATAAACACCTTAGTGACGGCGAGGGAAGTAACTGGGATCGCGA
GTTTCAAGCCTGCCGCTTCACGGAGCCGTAGCCGCCTTTAAGGTTGTGCAGTGTTTGTTA
TTTGTTGTCTGTGAGTTTACTTTGGTAAAAATGTTACGTGGAAAACAAAGTGCAAGTGCA
AGTGCAAGTGCAACTGTGCAAGTGCGTCAAATAAACTTGACCTCCTAAGGGACGGGACAT
GTGCAAAACCATAATTGCAGTTTGGATTCGTGCTGTATTTGTCATGTAGTTTCTTCACAT
TTAACAAACTCAAGGAATAATACAAAAATTATGTTTTTAAATGTTT

QA 1 406 1 406
DS 

RD RS1DO62TF 406 0 0
GAATTCTAGGGGATTTTCTGGTGGCGAAGGCTTTCTGTGACCTTGAACCGATTTATACAT
ACGAAGGGACGTACGATATAAACACCTTAGTGACGGCGAGGGAAGTAACTGGGATCGCGA
GTTTCAAGCCTGCCGCTTCACGGAGCCGTAGCCGCCTTTAAGGTTGTGCAGTGTTTGTTA
TTTGTTGTCTGTGAGTTTACTTTGGTAAAAATGTTACGTGGAAAACAAAGTGCAAGTGCA
AGTGCAAGTGCAACTGTGCAAGTGCGTCAAATAAACTTGACCTCCTAAGGGACGGGACAT
GTGCAAAACCATAATTGCAGTTTGGATTCGTGCTGTATTTGTCATGTAGTTTCTTCACAT
TTAACAAACTCAAGGAATAATACAAAAATTATGTTTTTAAATGTTT

QA 1 406 1 406
DS 



AS 1 6

CO CL732Contig1 876 6 9 U
GGGTGTCTCTCTTTCGAGGTTGAGATTGAGAACCAAATCCAATTAACCTTAAAAACCAGA
AGGCGAAAAATTTCCTGAACTCGCCTTCAATCAATCTCTGATTGCTTCTGTGGCTCTCTC
GCTCGAACTTGGATTCTGAGACCGTTTGGATTAGTGGGAGACACTTGTTTTAGGGTTTTT
GGTTAGGGGTGGAAGAACAATGTCCTCTTCCTCGGTAATTACACCAGAAGACGTTCTCGA
ATCTCTTATGAACGATGGCACCATCGATGCCCTTCGACTAAAGATCATCAATCAACTCAA
AGCCAATGAAGAGTTGAAGAGCACAACCATTAAGATGGCGGAGGAGAGCAAAGTTCTTAA
CACACCTGGTGCTGAGAAACAGACTAAACGAGAACTCTTTGATGCTCTTCGCCAAGAACT
CGAAGGGCCAGTGCTAGAGAAGGCATCAAAATCGGTTTGGGAATTGATTCTTGAGAAAGA
CGGGTTAGGGAAAGAGATAAATGAAACAGTAGAACGCGTCTTTTGTCGTCTGAGCGGGCG
AGAACCGCCCTTGTTTTCATCATCAAACGTGGAAAACCAGATGGTGATAGAGAAAGAGAT
GGAAACAAAGGAGGACAATAGCTCAAATACGGAAGCCAAGAAAAGAAGTCTTAGCGAGGT
GAATCACTCCGAAGTTACAATAAGGAAGAAGAAGCAACAAGGGGATTCCTCCAATGATCA
TGTAACGCCATGAGCCTGGTTATGAGACATTCATCATGTAACGTTCTGTTCATGTTTTTA
TTTGTGAAATATCTCTTCCCAGCAATATCTCATGTAATTTATATTTGCATAAAACATTGG
ACCGAATTAGTAATTACCATCACGTCACATTTCTGC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DZ93TF U 1
AF RS1H463TF U 3
AF RS1FZ15TF U 1
AF RS1EC20TF U 75
AF RS1FZ15JQ C 176
AF RS1EC20JQ C 533
BS 1 462 RS1DZ93TF
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RD RS1DZ93TF 626 0 0
GGGTGTCTCTCTTTCGAGGTTGAGATTGAGAACCAAATCCAATTAACCTTAAAAACCAGA
AGGCGAAAAATTTCCTGAACTCGCCTTCAATCAATCTCTGATTGCTTCTGTGGCTCTCTC
GCTCGAACTTGGATTCTGAGACCGTTTGGATTAGTGGGAGACACTTGTTTTAGGGTTTTT
GGTTAGGGGTGGAAGAACAATGTCCTCTTCCTCGGTAATTACACCAGAAGACGTTCTCGA
ATCTCTTATGAACGATGGCACCATCGATGCCCTTCGACTAAAGATCATCAATCAACTCAA
AGCCAATGAAGAGTTGAAGAGCACAACCATTAAGATGGCGGAGGAGAGCAAAGTTCTTAA
CACACCTGGTGCTGAGAAACAGACTAAACGAGAACTCTTTGATGCTCTTCGCCAAGAACT
CGAAGGGCCAGTGCTAGAGAAGGCATCAAAATCGGTTTGGGAGTTGATTCTTGAGAAAGA
CGGGTTAGGGAAAGAGATAAATTAAACAGTAGAACGCGTCTTTTGTCGTCTGAGCGGGCG
AGAACCGCCCTTGTTTTCATCATCAAACGTGGAAAACCAGATGGTGATAGAGAAAGAGAT
GGAAACAAAG
AGACAATAGCTCAAAT

QA 1 610 1 610
DS 

RD RS1H463TF 606 0 0
GG
GTCTCTCTTTCGAGGTTGAGATTGAGAACCAAATCCAATTAACCTTAAAAACCAGAAGGC
GAAAAATTTCCTGAACTCGCCTTCAATCAATCTCTGATTGCTTCTGTGGCTCTCTCGCTC
GAACTTGGATTCTGAGACCGTTTGGATTAGTGGGAGACACTTGTTTTAGGGTTTTTGGTT
AGGGGTGGAAGAACAATGTCCTCTTCCTCGGTAATTACACCAGAAGACGTTCTCGAATCT
CTTATGAACGATGGCACCATCGATGCCCTTCGACTAAAGATCATCAATCAACTCGAAGCC
AATGAAGAGTTGAAGAGCACAACCATTAAGATGGCGGAGGAGAGCAAAGTTCTTAACACA
CCTGGTGCTGAGAAACAGACTAAACGAGAACTCTTTGATGTTCTTCGCCAAGAACTCGAA
GGGCCAGTGCTAGAGAAGGCATCAAAATCGGTTTGGGAGTTGATTCTTGAGAAAGACGGG
TTAGGGAAAGAGATAAATGAAACAGTAGAACGCGTCTTTTGT*GTCTGAGCGGGCGAGAA
CCGCCCTTGTTTTCATCATCAAACGTGGAAAACCAGATGGTGATAGAGAAAGAGATGGAA
ACAA

QA 3 606 3 606
DS 

RD RS1FZ15TF 687 0 0
GGGA
GTCTCTCTTTCGAGGTTGAGATTGAGAACCAAATCCAATTAACCTTAAAAACCAGAAGGC
GAAAAATTTCCTGAACTCGCCTTCAATCAATCTCTGATTGCTTCTGTGGCTCTCTCGCTC
GAACTTGGATTCTGAGACCGTTTGGATTAGTGGGAGACACTTTTTTTAGGGTTTTTGGTT
AGGGGTGGAAGAACAATGTCCTCTTCTTCGGTAATTACACCAGAAGACGTTCTCGAATCT
CTTATGAACGATGGCACCATCGATGCCCTTCGACTAAAGATCATCAATCAACTCAAAGCC
AATGAAGAGTTGAAGAGCACAACCATTAAGATGGCGGAGGAGAGCAAAGTTCTTAACACA
CCTGGTGCTGAGAAACAGGCTAAACGAGAACTCTTTGATGCTCTTCGCCAAGAACTCGAA
GGGCCAGTGCTAGAGAAGGCATCAAAATCGGTTTGGGAATTGATTCTTGAGAAAGACGGG
TTAGGGAAAGAGATAAATGAAACAGTAGAACGCGTCTTTTGTCGTCTGAGCGGGCGAGAA
CCGCCCTTGTTTTCATCATCAAACGTGGAAAACCAGATGGTGATAGAGAAAGAGATGGAA
ACAAAGGAGGACAATAGCTCAAATACGGAAGCCAAGAAAAGAAGTCTTAGCGAGGTGA*T
CACTCCGAAGTTACAATAAG
AAG

QA 5 684 5 684
DS 

RD RS1EC20TF 605 0 0
GG
GAACTCGCCTTCAATCAATCTCTGATTGCTTCTGTGGCTCTCTCGCTCGAACTTGGATTC
TGAGACCGTTTGGATTAGTGGGAGACACTTGTTTTAGGGTTTTTGGTTAGGGGTGGAAGA
ACAACGTCCTCTTCCTCGGTAATTACACCAGAAGACGTTCTCGAATCTCTTATGAACGAT
GGCACCATCGATGCCCTTCGACTAAAGATCATCAATCAACTCAAAGCCAATGAAGAGTTG
AAGAGCACAACCATTAAGATGGCGGAGGAGAGCAAAGTTCTTAACACACCTGGTGCTGAG
AAACAGACTAAACGAGAACTCTTTGATGCTCTTCGCCAAGAACTCGAAGGGCCAGTGCTA
GAGAAGGCATCAAAATCGGTTTGGGAGTTGATTCTTGAGAAAGACGGGTTAGGGAAAGAG
ATAAATGAAACAGTAGAACGCGTCTTTTGTCGTCTGAGCGGGCGAGAACCGCCCTTGTTT
TCATCATCAAACGTGGAAAACCAGATGGTGATAGAGAAAGAGATGGAAACAAAGGAGGAC
AATAGCTCAAATACGGAAGCCAAGAAAAGAAGTCTTAGCGAGGTGAATCACTCCGAAGTT
GCA

QA 3 602 3 602
DS 

RD RS1FZ15JQ 701 0 0
TTTTTGGTTAGGGGTGGAAGAACAATGTCCTCTTCTTCGGTAATTACACCAGAAGACGTT
CTCGAATCTCTTATGAACGATGGCACCATCGATGCCCTTCGACTAAAGATCATCAATCAA
CTCAAAGCCAATGAAGAGTTGAAGAGCACAACCATTAAGATGGCGGAGGAGAGCAAAGTT
CTTAACACACCTGGTGCTGAGAAACAGGCTAAACGAGAACTCTTTGATGCTCTTCGCCAA
GAACTCGAAGGGCCAGTGCTAGAGAAGGCATCAAAATCGGTTTGGGAATTGATTCTTGAG
AAAGACGGGTTAGGGAAAGAGATAAATGAAACAGTAGAACGCGTCTTTTGTCGTCTGAGC
GGGCGAGAACCGCCCTTGTTTTCATCATCAAACGTGGAAAACCAGATGGTGATAGAGAAA
GAGATGGAAACAAAGGAGGACAATAGCTCAAATACGGAAGCCAAGAAAAGAAGTCTTAGC
GAGGTGAATCACTCCGAAGTTACAATAAGGAAGAAGAAGCAACAAGGGGATTCCTCCAAT
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QA 1 701 1 701
DS 

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AAAGAGATGGAAACAAAGGAGGACAATAGCTCAAATACGGAAGCCAAGAAAAGAAGTTTT
AGCGAGGTGAATCACTCCGAAGTTGCAATAAGGAAGAAGAGGCAACAAGGGGATTCCTCC
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TGTTTTTATTTGTGAAATATTTCTTCCCAGCAATATCTCATGTAATTTATATTTTCATAA
AACATTGGACCGAATTAGTAATTACCATC

QA 1 329 1 329
DS 



AS 1 6

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AGAATCGAACAATAACATTTCATCTTAAGAGTTTCAGTTTGGTGCACACGAAGCTCATAC
AACATTTGTCATGGCTCTTCGCTGCTTATCTCAATCTTCGACAACTTTCTCTTATCTCTC
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GTTTGGTTCTCCTGTTCAAAACTACTTTAAGGAAGGTACAGCAGCATTGAATCTCTACGT
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TGCTTCTGTTGGGAGCATCACGTTTCAGAACACAAGGACTGAGTACAAAGTGGGGGATGG
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CTCCGTAGCAGGTGACCCTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 10 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1CP63TF U 1
AF RS1EP16TF U 108
AF RS1D890TF U 572
AF RS1CP63JQ C 739
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AF RS1EP16JQ C 946
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RD RS1CP63TF 746 0 0
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AGAATCGAACAATAACATTTCATCTTAAGAGTTTCAGTTTGGTGCACACGAAGCTCATAC
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TAAGATCTGTGGATTTCGTATGCATGGGACCAAGGCAGCAGCTTCGGTTGTAGAAGAACA
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CGGTAGGGTTCTTCTCTTTCGTCCAGAGTTAAATGCCGTGCGTATGAAGAAAGGAGCAGA
GAGAATGTGCATGCATTCTCCTTCTGTTCAACAGTTTATTGAAGGTGTTAAGCAGACCGT
TCTTGCAAACAGACGTTGGGTTCCTCCTCCGGGAAAAG*CTCCTTGTATCTAAGACCATT
GTTGTTTGGAAGTGGAGCAAGCTTGGGTTTGTCAGCAGCATCAGAGTTTACGTTTCTTGT
GTTTGGTTCTCCTGTTCAAA
CTACTT

QA 1 740 1 740
DS 

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GG
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TCTTATCTCTCTAAGATCTGTGGATTTCGTATGCATGGGACCAAGGCAGCAGCTTCGGTT
GTAGAAGAACATGTTTCGGAGATGGTGGGGACAGAGCGTGTGGATGAAGATTATGCTGAT
GTGGATTGGGACAACCTCGGATTCAGTCTTGTACGGACAGATTACATGTTTGCCACCAGA
AGTCGCAGAGAAGGAAACTTCGAACAAGGTTGCCTTAGCCGTTACGGCAACATCGAGCTC
AACCCTGCTGCTGGAATTCTCAACTACGGCCAGGGACTAATCGAGGGGATGAAAGCTTAC
AGAAGAGAAGACGGTAGGGTTCTTCTCTTTCGTCCAGAGTTAAATGCCGTGCGTATGAAG
AAAGGAGCAGAGAGAATGTGCATGCATTCTCCTTCTGTTCAACAGTTTATTGAAGGTGTT
AAGCAGACCGTTCTTGCAAACAGACGTTGGGTTCCTCCTCCGGGAAAAGGCTCCTTGTAT
CTAAGACCATTGTTGTTTGGAAGTGGAGCAAGCTTGGGTTTGTCAGCAGCATCAGAGTTT
ACGTTTCTTGTGTTTGGTTCTCCTGTTCAAAACTACTTTA*GGAAGGTACAGCAGCATTG
AATCTCTACGTTGAGGAGGTGATTCCACGCGCGTATCT

QA 3 700 3 700
DS 

RD RS1D890TF 779 0 0
G
AGTTTATTGAAGGTGTTAAGCAGTCCGTTCTTGTAAACAGACGTTGGGTTCCTCCTCCGG
GAAAAGGCTCCTTTTATCTAAGACCATTGTTGTTTGGAAGTGGAGCAAGCTTGGGTTTGT
CAGCAGCATCAGAGTTTACGTTTCTTGTGTTTGGTTCTCCTGTTCAAAACTACTTTAAGG
AAGGTACAGCAGCATTGAATCTCTACGTTGAGGAGGTGATTCCACGCGCGTATCTTGGAG
GAAGTGGTGGCGTTAAGTCCATTTCTAATTATGGTCCAGTGCTTGAAGTGATGAGAAGAG
CGAAAGCGAGAGGGTTTTCGGATGTATTGTATCTGGATGCAGAAACTAAGAAGAACATAG
AGGAAGTTTCTGCTTCTAATATATTCCTTGTTAAGGGGAATACAATAGTGACTCCAGCTA
CAAACGGGACGATTCTCGGAGGGATCACGCGTAAGAGCGTAATCGAAATTGCTATTGATC
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TCGGAATACAAACTGGTTCTATCCAAGACAT*AAGAATTGGGTGGTGGAGATAGATTAAT
TTGAGAGAAAA*TAAATAAATTGTTATGTTGCGCTTCACAAATGTGTTTTTTTT
CCCA

QA 2 775 2 775
DS 

RD RS1CP63JQ 784 0 0
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CGCGTATCTTGGAGGAAGTGGTGGCGTTAAGTCCATTTCTAATTATGGTCCAGTGCTTGA
AGTGATGAGAAGAGCGAAAGCGAGAGGGTTTTCGGATGTATTGTATCTGGATGCAGAAAC
TAAGAAGAACATAGAGGAAGTTTCTGCTTCTAATATATTCCTTGTTAAGGGGAATACAAT
AGTGACTCCAGCTACAAACGGGACGATTCTCGGAGGGATCACACGTAAGAGCGTAATCGA
AATTGCTATTGATCTTGGTTACAAGGTGGAAGAACGAGTAGTTCCTGTAGAAGAACTAAA
GGATGCAGAAGAGGTTTTTTGCACTGGAACTGCCACTGGAGTTGCTTCTGTTGGGAGCAT
CACGTTTCAGAACACGAGAACTGAGTACAAAGTGGGGGATGGGCTTGTTACGCAGCAACT
TGGATCTATTCTTGTCGGAATACAAACTGGTTCTATCCAAGACATTAAGAATTGGGTGGT
GGAGATAGATTAATTTGAGAGAAAAATAAATAAATTGTTATGTTGCGCTTCACAAATGTG
TTTTTTTTT*CCCACCATTCCTTGCATCTCTTCCACAGTACAATAGTATCACAACAATTA
GTTCGGTTTGCTTTTTTTCTTTTT*ATAACATTGGGTAAATCATGCATTGCATTATCGTA
TAATCTTTAGCTTTCAGATCGATGTTAATGGACAATAATTCTCTCCGTAGCAGGTGACCC
TACG

QA 1 784 1 784
DS 

RD RS1D890JQ 277 0 0
TTCTTGTCGGAATACAAACTGGTTCTATCCAAGACATTAAGAATTGGGTGGTGGAGATAG
ATTAATTTGAGAGAAAAATAAATAAATTGTTATGTTGCGCTTCACAAATGTGTTTTTTTT
T*CCCACCATTCCTTGCATTTTTTCCACAGTACAATAGTATCACAACAATTAGTTCGGTT
TGCTTTTTTTTTTTTTTATAACATTGGGTAAATCATGCATTGCATTATCGTATAATCTTT
AGCTTTCAGATCGATGTTAATGGACAATAATTCTC
CC

QA 1 275 1 275
DS 

RD RS1EP16JQ 576 0 0
TTCTAATATATTCCTTGTTAAGGGGAATACAATAGTGACTCCAGCTACAAACGGGACGAT
TCTCGGAGGGATCACGCGTAAGAGCGTAATCGAAATTGCTATTGATCTTGGTTACAAGGT
GGAAGAACGAGTAGTTCCTGTAGAAGAACTAAAGGATGCAGAAGAGGTTTTTTGCACTGG
AACTGCCACTGGAGTTGCTTCTGTTGGGAGCATCACGTTTCAGAACACAAGGACTGAGTA
CAAAGTGGGGGATGGGCTTGTTACGCAGCAACTTGGATCTATTCTTGTCGGAATACAAAC
TGGTTCTATCCAAGACATTAAGTATTGGGTGGTGGAGATAGATTAATTTGAGAGAAAAAT
AAATAAATTGTTATGTTGCGCTTCACAAATGTGTTTTTTTTTTCCCACCATTCCTTGCAT
CTCTTCCACAGTACAATAGTATCACAACAATTAGTTCGGTTTGCTTTTTTCTTTTT**AT
AACATTGGGTAAATCATGCATTGCATTATCGTATAATCTTTAGCTTTCAGATCGATGTTA
ATGGACAATAATTCTCTCCGTAGCAGGTGACCCTAC

QA 1 576 1 576
DS 



AS 1 6

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TTATGAGAGAACAAGACGAAGGGCTGGAGAAGTTGGAGGAAACAGTGATGAGTACCAAAC
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TGAACAAGAATATGAAAGGAGGTTGCTCGTGCATGTCAATGCTATTGTCAGTGCTTGGAA
TCGTTGGTCTTGCTCTTGTCATTTGGCTGCTGGTTAAGTACCTCTAAATCTGATCCCCCA
CCACCACCAATATGACAATGAATGAATTTGATATATATAAGCAATGAAAAAA*TGTGTAC
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GCAAGAAACAAGTCACTTATTCAATCTGTATTTCCCTTGGTCGTGTATATGTTCACGAAT
TTGTATAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GG
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G
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GGCATGATGTCTGAAAGGAACTCGTCTGGTGTAACGGGGCCTGATGCTCAGCGTCGTGCT
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TGCTCGTGCATGTCAATGCTATTGTCAGTGCTTGGAATCGTTGGTCTTGCTCTTGTCATT
TGGCTGCTGGTTAAGTACCTCTAAATCTGATCCCCCACCACCACCAATATGACAATGAAT
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C*TCTATGCGAGAGTG

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AGTCTCTGGCATGGACAACCAAGACATTGTTGGATTTCAAAGACAAGTTATGAGAGAACA
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GAAAGGAGGTTGCTCGTGCATGTCAATGCTATTGTCAGTGCTTGGAATCGTTGGTCTTGC
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GACAATGAATGAATTTGATATATATAAGCAATGAAAAAAATGTGTACCTCTTCTCCTTCT
TTCTGCCTCTCCTCTATGCGAGAGTGGTTGTTATTATCAATATATTTGTATTGTT
CC

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TTTGGCTGCTGGTTAAGTACCTCTAAATCTGATCCCCCACCACCACCAATATGACAATGA
ATGAATTTGATATATATAAGCAATGAAAAAA*TGTGTACCTCTTCTCCTTCTTTCTGCCT
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CAATCTGTATTTCCCT
C

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G
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CTGCTGGTTAAGTACCTCTAAATCTGATCCCCCACCACCACCAATATGACAATGAATGAA
TTTGATATATATAAGCAATGAAAAAA*TGTGTACCTCTTCTCCTTCTTTCTGCCTCTCCT
CTATGCGAGAGTGGTTGTTATTATCAATATATTTGTATTGTTTCCTCTTTTGTGCCTTCT
CTCTCATTACTGTAAGAAGAATGTCGCTGCGTGTGCAAGAAACAAGTCACTTATTCAATC
TGTATTTCCCTTGGTCGTGTATATGTTCACGAATTTGTATAATC

QA 2 405 2 405
DS 



AS 2 6

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TCAAACATGTCGTCGTCTGAGATAAACAAGAACGATGTTGACATTGTCATTGGCGCTCTC
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ATCATCGTCAAAGACCCCGAGCTCAAGGACGAGCTCAACGTACCCGAAGGCTTTGATGTG
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ATCGATGATGACTGTGTCCCTGCTAAGGATCCCAAGGGAGTTCTAGTGGATGCTGTCTCT
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CCTTACTGCGAGGGAGCTGATTTTGTGCGTGGGTACCCGTTCAGCCTTAGAAGTGGCGTT
CCCTGTGCTGCTTCCTGTGGACTTTGGCTTAACTTGGCTGATCTTGACGCTCCGACGCAA
GCTCTCAAGACAGAGCAGAGGAACACTTCGTATGTTGATGCGGTTATGACCGTTCCCCTC
AAGGCGATGTTGCCGGTAAGCGGGATCAACATCGCTCTTAACCGTGAGTTGGTGGGACCA
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GATGTTTGGTGTGGGATGTGTTTGAAACACATCTCTGACCATTTGGGTTACGGTGTGAAA
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ATAATGTAAACCTTGACTTATGAAGCCCATCTCTTGTTAGTTTCGATG


BQ
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C

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DS 

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CAGGGATTTTTCATCATGTTTATTTCTCCTTTTATCTAATTATAAGCATGTTTTTTTTTA
TGAGACTTTCAATAATGTAAACCTTGACTTATGAAGCCCATCTCTTGTTAGTTTCGATG

QA 1 779 1 779
DS 



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TATTCTGCTGCATTCTCTCCAGAAGATTTACCTAAAAATCTGTTGATATTCAAACATGTC
GTCGTCTGAGATAAACAAGAACGAGGTTGACATTGTCATTGGCGCCCTCAACGCTGACCT
GACTAAGTTCCTCAACAGCTGGAAACCCTTTTTCTCCGGTTTCCATCTCATCATCGTCAA
AGACCCTGAGCTCAAGGACGACCTCAACGTACCCGAAGGCTTTGATGTGGACGTCTACTC
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CTGCAGATACTTCGGTTACCTCGTGTCCAAAAAGAAATACATTGTCTCCATCGATGATGA
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CAACCTCGAGAACCCTGCCACGCCTCTCTTCTTCAATGCCCTCTACGATCCTTACTGCGA
AGGAGCTGATTTTGTGCGTGGGTACCCGTTCAGCCTTAGAAGTGGCGTCCCTTGTGCTGC
TTCATGTGGGCTTTGGCTTAACTTGGCTGATCTTGATGCTCCCACGCAAGCTCTCAAGAC
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ACCCATAAGCGGGACCAACATCGCTTTTAACCGTGAGTTGGTGGGACCAGCTTTGGTGCC
TGCGCTTAGAATTGCTGGTGAAGGGAAAGTGAGATGGGAAACGCTTGAAGATGTTTGGTG
TGGGATGTGTCTGAAACACATCTCTGACCATTTGGGTTACGGTGTGAAAACTGGTCTGCC
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AGATGACCCTGCCTTCACTCAAGCTGCTGATGCTATGGTCAAGTGGGTCCAGCTCTGGAA
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TTTTAATCTAATTACAAGCATGTTTTTTTATGAGACTTTCAATAATGTAAACCTTGACAT
ATGAAGCCCATCTCTTGTTAGTTTTG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D945TF U 1
AF RS1E747TF U 11
AF RS1E747JQ C 499
AF RS1D945JQ C 613
BS 1 283 RS1D945TF
BS 284 285 RS1E747TF
BS 286 468 RS1D945TF
BS 469 666 RS1E747TF
BS 667 734 RS1E747JQ
BS 735 735 RS1D945JQ
BS 736 1207 RS1E747JQ
BS 1208 1208 RS1D945JQ
BS 1209 1328 RS1E747JQ
BS 1329 1346 RS1D945JQ

RD RS1D945TF 468 0 0
CGGTTCGGTCGTGTTCATCAATTCCTCTTAGGAAAGAAGAAGAAAAGCTCGGATCTATTC
TATTCTGCTGCATTCTCTCCAGAAGATTTACCTAAAAATCTGTTGATATTCAAACATGTC
GTCGTCTGAGATAAACAAGAACGAGGTTGACATTGTCATTGGCGCCCTCAACGCTGACCT
GACTAAGTTCCTCAACAGCTGGAAACCCTTTTTCTCCGGTTTCCATCTCATCATCGTCAA
AGACCCTGAGCTCAAGGACGACCTCAACGTACCCGAAGGCTTTT*TGTGGACGTCTACTC
CAAGCCCGACATTGAGAAAGTCGTCGGCGCTGCCAATGCCGCCATCTTCTCTGGCTATTC
CTGCAGATACTTCGGTTACCTCGTGTCCAAAAAGAAATACATTGTCTCCATCGATGATGA
CTGTGTCCCTGCTAAGGATCCCAAGGGAGTTCTAGTGGATGCTGTCTC

QA 1 468 1 468
DS 

RD RS1E747TF 656 0 0
GG
GTTCATCAATTCCTCTTAGGAAAGAAGAAGAAAAGCTCGGATCTATTCTATTCTGCTGCA
TTCTCTCCAGAAGATTTACCTAAAAATCTGTTGATATTCAAACATGTCGTCGTCTGAGAT
AAACAAGAACGAGGTTGACATTGTCATTGGCGCCCTCAACGCTGACCTGACTAAGTTCCT
CAACAGCTGGAAACCCTTTTTCTCCGGTTTCCATCTCATCATCGTCAAAGACCCTGAGCT
TAAGGACGACCTCAACGTACCCGAAGGCTTTGATGTGGACGTCTACTCCAAGCCCGACAT
TGAGAAAGTCGTCGGCGCTGCCA*TGCCGCCATCTTCTCTGGCTATTCCTGCAGATACTT
CGGTTACCTCGTGTCCAAAAAGAAATACATTGTCTCCATCGATGATGACTGTGTCCCTGC
TAAGGATCCCAAGGGAGTTCTAGTGGATGCTGTCTCTCAGCACGTGACCAACCTCGAGAA
CCCTGCCACGCCTCTCTTCTTCAATGCCCTCTACGATCCTTACTGCGAAGGAGCTGATTT
TGTGCGTGGGTACCCGTTCAGCCTTAGAAGTGGCGTCCCTTGTGCTGCTTCATGTGGGCT
TTGGCTTAACTTGGCTGATCTTGATGCTCCCACGCAAGCTCTCAAGACAGAGCA

QA 3 656 3 656
DS 

RD RS1E747JQ 830 0 0
CACGCCTCTCTTCTTCAATGCCCTCTACGATC*TTACTGCGAAGGAGCTGATTTTGTGCG
TGGGTACCCGTTCAGCCTTAGAAGTGGCGTCCCTTGTGCTGCTTCATGTGGGCTTTGGCT
TAACTTGGCTGATCTTGATGCTCCCACGCAAGCTCTCAAGACAGAGCAGAGGAACACTTC
CTATGTTGATGCGGTTATGACCGTCCCCTTGAAAGCTATGTTACCCATAAGCGGGATCAA
CATCGCTTTTAACCGTGAGTTGGTGGGACCAGCTTTGGTGCCTGCGCTTAGAATTGCTGG
TGAAGGGAAAGTGAGATGGGAAACGCTTGAAGATGTTTGGTGTGGGATGTGTCTGAAACA
CATCTCTGACCATTTGGGTTACGGTGTGAAAACTGGTCTGCCTTATGTGTGGAGGAACGA
GAGGGGAGATGCTGTGGAGAGTTTGAGGAAGAAATGGGAAGGGATGAAGCTGATGGAGAA
GAGTGTTCCGTTTTTCGAGTCTTTGAAGTTGCCTGAGACTGCGGTTAAGGTTGAAGATTG
TGTGGTTGAGCTTGCTAAAGCAGTGAAAGAGCAGTTGGGTTCAGATGACCCTGCCTTCAC
TCAAGCTGCTGATGCTATGGTCAAGTGGGTCCAGCTCTGGAACTCTGTTAACTCGAGCGG
CTAAAGTTGAATCTATCTCCCGAGGTTAGGTTCCTTTTATCACTTCTAAGCTTATTTAAT
GTCATGATGTCTCAGGGATTTATCATCATGTTTATTTCTCTTTTTTAATCTAATTACAAG
CATGTTTTTTTATGAGACTTTCAATAATGTAAACCTTGACATATGAAGCC

QA 1 830 1 830
DS 

RD RS1D945JQ 734 0 0
TTGGCTTAACTTGGCTGATCTTGATGCTCCCACGCAAGCTCTCAAGACAGAGCAGAGGAA
CACTTCCTATGTTGATGCGGTTATGACCGTCCCCTTGAAAGCTATGTTACCCATAAGCGG
GACCAACATCGCTTTTAACCGTGAGTTGGTGGGACCAGCTTTGGTGCCTGCGCTTAGAAT
TGCTGGTGAAGGGAAAGTGAGATGGGAAACGCTTGAAGATGTTTGGTGTGGGATGTGTCT
GAAACACATCTCTGACCATTTGGGTTACGGTGTGAAAACTGGTCTGCCTTATGTGTGGAG
GAACGAGAGGGGAGATGCTGTGGAGAGTTTGAGGAAGGAATGGGAAGGGATGAAGCTGAT
GGAGAAGAGTGTTCCGTTTTTCGAGTCTTTGAAGTTGCCTGAGACTGCGGTTAAGGTTGA
AGATTGTGTGGTTGAGCTTGCTAAAGTAGTGAAAGAGCAGTTGGGTTCAGATGACCCTGC
CTTCACTCAAGCTGCTGATGCTATGGTCAAGTGGGTCCAGCTCTGGAACTCTGTTAACTC
GAGCGGCTAAAGTTGAATCTATCTCCCGAGGTTAGGTTCCTTTTATCACTTCTAAACTTA
TTTAATGTCATGATGTCTCAGGGATTTATCATCATGTTTATTTCTCTTTTTTAATCTAAT
TACAAGCATGTTTTTTTATGAGACTTTCAATAATGTAAACCTTGACTTATGAAGCCCATC
TCTTGTTAGTTTTG

QA 1 734 1 734
DS 



AS 2 6

CO CL736Contig1 674 2 5 U
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AAAATACAGAACATATGCGAAGGAACCAAAATTTTAAGAAACAATTTTTGGATTCCGCAT
CCGAACTCTAGAATATATAATTTTTATGGCCATGGCTCAGTAAACAGTAGCTTCCCAAAT
TGTGGTTCCATCACAAGAACAAAGCTTTCTGCAACTCTCTCCTACTTCTCCACTTCTAGC
AACAACAGCGGCAGTAATGCCGTGTACCGACTTATCCTCTGTTTCATACACCACAATGGC
TCGTCCAATCAGATCCGTTACCTTCATATTCTCTTTCTTTACCGTATATAACGCTTCTCC
ATTTTGGTCTGCCTCCAACGTTCCTAGGTCGCCTGGTAGCTGTGTGGCGGCTTGATCATC
TTGTAAAGGATCGTATATGTTCCCGGTAGAAGCTGCTCCTTTTGTGAGATCTCCATACTC
ATTGATACACCAACTGTGTTTTCCTGGAGACAACCCGCCAAAACTGGCTTCAATTCTTAC
ATTTTCCATAGAAATTTGAACGAACCGAACCACCCCGAAGATGTTTGGTCCTTTGAATTC
AGATACTGCAGCAGCTGAAACTTGAGGAACACACGCCATGGGACCGCTTGCACGAAGTCG
AGGCGAAGATCGGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CQ31JQ U 1
AF RS1AT48JQ U 1
BS 1 86 RS1AT48JQ
BS 87 87 RS1CQ31JQ
BS 88 127 RS1AT48JQ
BS 128 128 RS1CQ31JQ
BS 129 674 RS1AT48JQ

RD RS1CQ31JQ 645 0 0
GGAAAGAGTACGCACAATCCACTATGATATTTATCGAATATATTCACACAATAATATAAG
AAAATACAGAACATATGCGAAGGAACCAAAATTTTAAGAAACAATTTTTGGATTCCGCAT
CCGAACTCTAGAATATATAATTTTTATGGCCATGGCTCAGTAAACAGTAGCTTCCCAAAT
TGTGGTTCCATCACAAGAACAAAGCTTTCTGCAACTCTCTCCTACTTCTCCGCTTCTAGC
AACAACAGCGGCAGTAATGCCGTGTACCGACTTATCCTCTGTTTCATACACCACAATGGC
TCGTCCAATCAGATCCGTTACCTTCATATTCTCTTTCTTTACCGTATATAACGCTTCTCC
ATTTTGGTCTGCCTCCAACGTTCCTAGGTCGCCTGGTAGCTGTGTGGCGGCTTGATCATC
TTGTAAAGGATTGTATATGTTCCCGGTAGAAGCTGCTCCTTTTGTGAGATCTCCATACTC
ATTGATACACCAACTGTGTTTTCCTGGAGACAACCCGCCAAAACTGGCTTCAATTCTTAC
ATTTTCCATAGAAATTTGAACGAACCGAACCACCCCGAAGATGTTTGGTCCTTTGAATTC
AGATACTGCAGCAGCTGAAACTTGAGGAACACACGCCATGGGACC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1AT48JQ 674 0 0
GGAAAGAGTACGCACAATCCACTATGATATTTATCGAATATATTCACACAATAATATAAG
AAAATACAGAACATATGCGAAGGAACTAAAATTTTAAGAAACAATTTTTGGATTCCGCAT
CCGAACTTTAGAATATATAATTTTTATGGCCATGGCTCAGTAAACAGTAGCTTCCCAAAT
TGTGGTTCCATCACAAGAACAAAGCTTTCTGCAACTCTCTCCTACTTCTCCACTTCTAGC
AACAACAGCGGCAGTAATGCCGTGTACCGACTTATCCTCTGTTTCATACACCACAATGGC
TCGTCCAATCAGATCCGTTACCTTCATATTCTCTTTCTTTACCGTATATAACGCTTCTCC
ATTTTGGTCTGCCTCCAACGTTCCTAGGTCGCCTGGTAGCTGTGTGGCGGCTTGATCATC
TTGTAAAGGATCGTATATGTTCCCGGTAGAAGCTGCTCCTTTTGTGAGATCTCCATACTC
ATTGATACACCAACTGTGTTTTCCTGGAGACAACCCGCCAAAACTGGCTTCAATTCTTAC
ATTTTCCATAGAAATTTGAACGAACCGAACCACCCCGAAGATGTTTGGTCCTTTGAATTC
AGATACTGCAGCAGCTGAAACTTGAGGAACACACGCCATGGGACCGCTTGCACGAAGTCG
AGGCGAAGATCGGG

QA 1 674 1 674
DS 



CO CL736Contig2 870 4 11 U
CTAACTTTGATTGGTTAGTGGTATCCCAAGATGTACTGTCATAATGTAATAAAAATATAA
AGTTCGAGCTCAGAACACAAGGGAATGATGTCATTTCTGAGATCAGTGGCAACTATTCCG
CGAGCTGGGTCTGCAATTCCGACCGAGTTTTCACTCTCTTCTTCCTGTTCTACCAAATCT
CAGATATTTCCATTTCCATCTTCTTCCCGATCTTCGCCTCGACTTCGTGCAAGCGGTCCC
ATGGCGTGTGTTCCTCAAGTTTCAGCTGCTGCAGTATCTGAATTCAAAGGACCAAACATC
TTCGGGGTGGTTCGGTTCGTTCAAATTTCTATGGAAAATGTAAGAATTGAAGCCAGTTTT
GGCGGGTTGTCTCCAGGAAAACACAGTTGGTGTATCAATGAGTATGGAGATCTCACAAAA
GGAGCAGCTTCTACCGGGAACATATACAATCCTTTACAAGATGATCAAGCCGCCACACAG
CTACCAGGCGACCTAGGAACGTTGGAGGCAGACCAAAATGGAGAAGCGTTATATACGGTA
AAGAAAGAGAATATGAAGGTAACGGATCTGATTGGACGAGCCATTGTGGTGTATGAAACA
GAGGATAAGTCGGTACACGGCATTACTGCCGCTGTTGTTGCTAGAAGCGGAGAAGTAGGA
GAGAGTTGCAGAAAGCTTTGTTCTTGTGATGGAACCACAATTTGGGAAGCTACTGTTTAC
TGAGCCATGGCCATAAAAATTATATATTCTAAAGTTCGGATGCGGAATCCAAAAATTGTT
TCTTAAAATTTTAGTTCCTTCGCATATGTTCTGTATTTTCTTATATTATTGTGTGAATAT
ATTCGATAAATATCATAGTGGATTGTGCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 
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DS 



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BQ
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AF RS1BU15TF U 125
AF RS1FO82TF U 607
AF RS1FO76TF U 788
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BS 602 602 RS1BU15TF
BS 603 611 RS1FJ71TF
BS 612 661 RS1BU15TF
BS 662 662 RS1FO82TF
BS 663 700 RS1BU15TF
BS 701 838 RS1FO82TF
BS 839 839 RS1FO76TF
BS 840 951 RS1FO82TF
BS 952 952 RS1FO76TF
BS 953 1147 RS1FO82TF
BS 1148 1469 RS1FO76TF

RD RS1FJ71JQ 594 0 0
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AAAAATCTCGTTAAAATAAATAACTATTTTTTTGACTGATCTCGTTCTCCGTGTAGGATA
CTGCTTTTTGGTTTAATTTCATAGATTAAATGAAGAAAACTGCTCTACTATATTAATCTA
CTTTATTCAAAAAAAGTTCTATGTTTTAACTGAAGTTATATAATAGAGTTATTTTTTTAT
GTATTATTTTTTCTTATTAATTTCTTAAAGTAAAGGGTTTTTCAATGAATCAGTTACGTG
AATTCTGAATCCTGAGATGGTACAGATGCCAAAGACGATGAATTTAGTTTTTTTCTTTTT
ATCTATTTTTGTTCATACCACCGATAATGATTGATAACTCACAAATTTTCAAGTGAATTT
TTTGATTCTTGGAACTAGTATTTGTATCTATCTTAAAAATTTTTTTTTATTGAAACTTCG
GGAAGTACTTTAGAGACATATGTATAAAAAAACATATTTTATTGAGTCCCTTCATGCTTA
CTATAACTAGTTATTTCGGTTTTTTACTAGCAGCTTTAACTATAACCTCAGTTC

QA 1 594 1 594
DS 

RD RS1FJ71TF 611 0 0
GAAAAAAAAACCTAAAACCTAGAAAGGAAACGATAAGAGAAATTGCTAATTACAAGTTTT
AAAAATCTCGTTAAAATAAATAACTATTTTTTTGACTGATCTCGTTCTCCGTGTAGGATA
CTGCTTTTTGGTTTAATTTCATAGATTAAATGAAGAAAACTGCTCTACTATATTAATCTA
CTTTATTCAAAAAAAGTTCTATGTTTTAACTGAAGTTATATAATAGAGTTATTTTTTTAT
GTATTATTTTTTCTTATTAATTTCTTAAAGTAAAGGGTTTTTCAATGAATCAGTTACGTG
AATTCTGAATCCTGAGATGGTACAGATGCCAAAGACGATGAATTTAGTTTTTTTCTTTTT
ATCTATTTTTGTTCATACCACCGATAATGATTGATAACTCACAAATTTTCAAGTGAATTT
TTTGATTCTTGGAACTAGTATTTGTATCTATCTTAAAAATTTTTTTTTATTGAAACTTCG
GGAAGTACTTTAGAGACATATGTATAAAAAAACATATTTTATTGAGTCCCTTCATGCTTA
CTATAACTAGTTATTTCGGTTTTCTACTAGCAGCTTTAACTATAACCTCAGTTCTATTTA
TTGGTCTAAGC

QA 1 611 1 611
DS 

RD RS1BU15TF 576 0 0
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ATTCAAAAAAAGTTCTATGTTTTAACTGAAGTTATATAATAGAGTTATTTTTTTATGTAT
TATTTTTTCTTATTAATTTCTTAAAGTAAAGGGTTTTTCAATGAATCAGTTACGTGAATT
CTGAATCCTGAGATGGTACAGATGCCAAAGACGATGAATTTAGTTTTTTTCTTTTTATCT
ATTTTTGTTCATACCACCGATAATGATTGATAACTCACAAATTTTCAAGTGAATTTTTTG
ATTCTTGGAACTAGTATTTGTATCTATCTTAAAA*TTTTTTTTTATTGAAACTTCGGGAA
GTACTTTAGAAACATATGTATAAAAAAACATATTTTATTGAGTCCCTTCATGCCTACTAT
AACTAGTTATTTCGGTTTTCTACTAGCAGCTTTAACTATAACCTCAGTTCTATTTATCGG
TCTAAGCAAAATACGACTTATTTGAAATTAATTGAATGAATCTTTTTTGATCAAAAA*GA
TTTATATGGTATTTCATATGTTCGATAGTTCTTTAC

QA 1 576 1 576
DS 

RD RS1FO82TF 541 0 0
G
AAGCAAAATACGACTTATTTGAAATTAATTGAATGAATCTTTTTTGATCAAAAAAGATTT
ATATGGTATTTCATATGTTCGATAGTTCTTTACCGTGTTAATTACCCAATTTTGGTCATT
GAGATTCATCGGCAATACAGATTAAGAGCTAGGAATAGATAGTACCTCTCTTTTCTCCCT
TTCAAAAATGAAAACAAAAGAAAATTGAAATGATTGAAGTTTCTTTATTTGGAATCGTCT
TAGGTCTAATTCCTATTACTTTGGCTGGATTATTCGTAACTGCTTATTTACAATACAGAC
GTGGTGATCAGTTGGACTTTTGATTAATTAACATCTCTTTTTTT*GACTGACCTCCTTCT
TGCTTTCATATGCGGGAGGTCTAATTCAGATTGCTGCTCAATTATTTGCGAACAGTGGAA
TTTTGACACAATCTAATAAACAAGAGTGACATCACGCTCTGTAGGATTTGAACCTACGAC
ATTGGGTTTTGGAGACCCACGTTCTACCGAACTGAACTAAGAGCGCTTTTCTTGTTTTTT

QA 2 541 2 541
DS 

RD RS1FO76TF 682 0 0
G
TCAAAAATGAAAACAAAAGAAAATTGAAATGATTGAAGTTTCTTTATTTGAAATCGTCTT
AGGTCTAATTCCTATTACTTTGGCTGGATTATTCGTAACTGCTTATTTACAATACAGACG
TGGTGATCAGTTGGACTTTTGATTAATTAACATCTCTTTTTTTTGACTGACCTCCTTCTT
GCTTTCATATGCGGGAGGTCTAATTCAGATTGCTGCTCAATTATTTGCGAACAGTGGAAT
TTTGACACAATCTAATAAACAAGAGTGACATCATGCTCTGTAGGATTTGAACCTACGACA
TTGGGTTTTGGAGACCCACGTTCTACCGAACTGAACTAAGAGCGCTTTTCTTGTTTTTTC
TAAAAAAACGAAAAGGCTAGAAAGAGGACATTCTTTAACCCGAATCTATTAGGTATGTTG
TCAAGTATAGACATTGTGATGGCAAGTTGGTTCTTAAGGTTACTGATAACAAAGAGTGTC
TCAAGTTTAAGACGGACCAAGCACAAGAAGCAAAGAAGATGGAGAAACTGAATAACATAT
TCTTTACCCTCATGGCCAGAGGACCTGATGTTGATCTTTCTGAAGTGAACGGGAAAGAAC
AGATGGAGACACAACCTGTGAAGAAAGGCAGAGGAAGGAAGCAATAAGTCCCATGATTCT
GTTTTTCTTTCTTTTTTTCTT

QA 2 682 2 682
DS 



AS 2 6

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TCTCTGAGCTTTTTTATCTGATTCTTTAGAGATGGCGGTTGCTCCGGCGAGAGCTCGTTC
TGACTATGATTACCTCATCAAGCTCCTTCTCATCGGAGACAGCGGTGTGGGGAAGAGTTG
CTTGTTGCTGCGTTTCTCAGATGATACTTTCACTACAAGTTTCATTACTACCATTGGAAT
TGACTTCAAGATAAGAACCGTGGAGCTTGATGGGAAGCGTATCAAATTGCAGATATGGGA
CACTGCTGGTCAAGAACGTTTCAGAACTATCACCACAGCGTATTACAGAGGAGCGATGGG
TATACTGCTTGTCTACGACGTAACCGATGAGTCATCCTTCAACAACATTAGGAACTGGAT
GAAGAACATAGAGCAGCATGCCTCAGATAACGTCAACAAAATACTGGTCGGTAACAAAGC
TGACATGGATGAAAGCAAAAGGGCTATCCCAACAGCAAAGGGCCAAGCTTTAGCTGATGA
ATATGGAATCAAATTCTTTGAAACGAGTGCAAAACAAACCTCATGTTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CG20TF U 106
AF RS1C474TF U 1
BS 1 590 RS1C474TF

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CATTAGGAACTGGATGAAGAACATAGAGCAGCATGCCTCAGATAAC

QA 1 346 1 346
DS 

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TGACTATGATTACCTCATCAAGCTCCTTCTCATCGGAGACAGCGGTGTGGGGAAGAGTTG
CTTGTTGCTGCGTTTCTCAGATGATACTTTCACTACAAGTTTCATTACTACCATTGGAAT
TGACTTCAAGATAAGAACCGTGGAGCTTGATGGGAAGCGTATCAAATTGCAGATATGGGA
CACTGCTGGTCAAGAACGTTTCAGAACTATCACCACAGCGTATTACAGAGGAGCGATGGG
TATACTGCTTGTCTACGACGTAACCGATGAGTCATCCTTCAACAACATTAGGAACTGGAT
GAAGAACATAGAGCAGCATGCCTCAGATAACGTCAACAAAATACTGGTCGGTAACAAAGC
TGACATGGATGAAAGCAAAAGGGCTATCCCAACAGCAAAGGGCCAAGCTTTAGCTGATGA
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QA 1 590 1 590
DS 



CO CL738Contig2 997 4 25 U
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CATTGTCTTTCCATATCAGGAAGATCAATTGTACAGAATCACAAAGATAACAAATTAGAC
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AAGAAAACCAGTGCAGGCGAAAGAAGAGCGATCATCAAACTCCTAAACATAACTACAGCA
AGCTGATTTCTCAGCTGTAGTAGAAGACGATGAAGCAGCATCTTGTTTAGTGATCTTGAT
GCCTTGAGGCTCTGCCTTTGTATCGGTTTCTGTCAATCTTTGTTTGATGTCTTTTGCGAT
AGAGAGGAAAACCGACTCAACATTGAGGTTTGTTTTTGCACTCGTTTCAAAGAATTTGAT
TCCATATTCATCAGCTAAAGCTTGGCCCTTTGCTGTTGGGATAGCCCTTTTGCTTTCATC
CATGTCAGCTTTGTTACCGACCAGTATTTTGTTGACGTTATCTGAGGCATGCTGCTCTAT
GTTCTTCATCCAGTTCCTAATGTTGTTAAAGGATGACTCATCGGTTACGTCGTAGACAAG
CAGTATACCCATCGCTCCTCTGTAATACGCTGTGGTGATAGTTCTGAAACGTTCTTGACC
AGCAGTGTCCCATATCTGCAATTTGAAGTCAATTCCAATGGTAGT*AATGAAACTTGTAG
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CTAGCTCTGCTTCTTCTTCTTTTTTCCAGAAGAGATT


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 10 10 25 25 25 25 10 25 25 10 10 10 10 10 25 25 25 10 25 10 10 10 25 25 25 10 25 10 10 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C474JQ U 5
AF RS1CG20JQ U 1
AF RS1CQ80JQ U 4
AF RS1CQ80TF C 265
BS 1 688 RS1CG20JQ
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A
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AAGAAAACCAGTGCAGGCGAAAGAAGAGCGATCATCAAACTCCTAAACATAACTACAGCA
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AGAGAGGAAAACCGACTCAACATTGAGGTTTGTTTTTGCACTCGTTTCAAAGAATTTGAT
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TGAA

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CG
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ATACAAGATCACAACCATCAATGAGATATATCCTACTCGTCCTATGTTACACAAAACAAG
AACGATCTCTGATTTGAGACAGTAAGAGATGAAACATCAGATGGCTAGAGACTTAAAGAA
AACCAGTGCAGGCGAAAGAAGAGCGATCATCAAACTCCTAAACATAACTACAGCAAGCTG
ATTTCTCAGCTGTAGTAGAAGACGATGAAGCAGCATCTTGTTTAGTGATCTTGATGCCTT
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DS 



AS 1 7

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CTTCGAGTACCTCGGCCCGCTCTTGATCTACCCGGTCTTCTACTACTTCCCTGTTTACAA
ATACCTCGGCTACGGAGAAGACCGTGTGATCCACCCGGTCCAGACCTACGCTATGTACTA
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CGCTACTCAGACCGTTGCAGGATATGTTTTCTTAGCTGTTGCAGCTCTGATTATGACCAA
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AGATTTTAGACACTTGCTTCTTGTTGTTC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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CTCTCTATTTAAATCTTCCCTTCTCTCTCCCCCTCATCTCTCAATTTCCTCGTTCTCTCC
GCTTTAAGCCATGAAAGTCACCGTCGTCTCCCGTAGCGGTAGAGAAGTTCTCAAAGCCCC
CCTCGACCTCCCCGATTCGGCGACTGTTGCTGATCTGCAGGAAGCTTTTCACAAGAGAGC
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CTTCGAGTACCTCGGCCCGCTCTTGATCTACCCGGTCTTCTACTACTTCCCTGTTTACAA
ATACCTCGGCTACGGAGAAGACCGTGTGATCCACCCGGTCCAGACCTACGCTATGTACTA
CTGGTGCTTTCACTACTTCAAACGTATCATGGAAACGTTCTTCGTCCACCGGTTCAGCCA
CGCAACTTCGCCGATCGGGAACGTGTTCAGGAACTGTACTTACTACTGGACCTTTGGTGC
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GATTGGGTTCGGGTTTGGTTTGGTTTGCCAAGTCGCCAACTTCTACTGTCACATTCTGTT
GAAGAATCTCAGAGACCCTAGTGGAGCTGGAGGGTA

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DS 

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TCACTACTTCAAACGTATCATGGAAACGTTCTTCGTCCACCGGTTCAGCCACGCAACTTC
GCCGATCGGGAACGTGTTCAGGAACTGTACTTACTACTGGACCTTTGGTGCTCACATTGC
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CGGGTTTGGTTTGGTTTGCCAAGTCGCCAACTTCTACTGTCACATTCTGTTGAAGAATCT
CAGAGACCCTAGTGGAGCTGGAGGGTACCAGATCCCACGTGGTTTCCTCTTCAACATTGT
TACGTGTGCCAATTACACGACCGAGATTTACCAGTGGCTAGGATTCAACATCGCTACTCA
GACCGTTGCAGGATATGTTTTCTTAGCTGTTGCAGCTCTGATTATGACCAACTGGGCTCT
TGGAAAGCACAGCCGTCTGAGAAAGATATTTGATGGGAAAGATGGGAAGCCAAAGTATCC
AAGAAGATGGGTTATATTGCCTCCATTCCTGTAGAAGACTCATCGTTGTGATCTTCGTTC
TATCAGTTTAAAAGCTTTCTTAATAAGAGGTTGTAAAAGAGATTTGGAAGATGTTCGTTT
TTCTCTGTATTTGTTATCACTTTTGTTTTGAGATGTTTTTTGTAAGTTTAGAGATTTTAG
AC
G

QA 1 842 1 842
DS 

RD RS1A195JQ 723 0 0
CTACGGAGAAGACCGTGTGATCCACCCGGTCCAGACCTACGCTATGTACTACTGGTGCTT
TCACTACTTCAAACGTATCATGGAAACGTTCTTCGTCCACCGGTTCAGCCACGCAACTTC
GCCGATCGGGAACGTGTTCAGGAACTGTACTTACTACTGGACCTTTGGTGCTCACATTGC
GTATTACGTGAACCATCCTTTGTACACACCGGTTAGTGACCTTCAGATGAAGATTGGGTT
CGGGTTTGGTTTGGTTTGCCAAGTCGCCAACTTCTACTGTCACATTCTGTTGAAGAATCT
CAGAGACCCTAGTGGAGCTGGAGGGTACCAGATCCCACGTGGTTTCCTCTTCAACATTGT
TACGTGTGCCAATTACACGACCGAGATTTACCAGTGGCTAGGATTCAACATCGCTACTCA
GACCGTTGCAGGATATGTTTTCTTAGCTGTTGCAGCTCTGATTATGACCAACTGGGCTCT
TGGAAAGCACAGCCGTCTGAGAAAGATATTTGATGGGAAAGATGGGAAGCCAAAGTATCC
AAGAAGATGGGTTATATTGCCTCCATTCCTGTAGAAGACTCATCGTTGTGATCTTCGTTC
TATCAGTTTAAAAGCTTTCTTAATAAGAGGTTGTAAAAGAGATTTGGAAGATGTTCGTTT
TTCTCTGTATTTGTTATCACTTTTGTTTTGAGATGTTTTTTGTAAGTTTAGAGATTTTAG
AC
G

QA 1 722 1 722
DS 

RD RS1C337JQ 582 0 0
GGACCTTTGGTGCTTACATTGCGTATTACGTGAACCATCCTTTGTACACACCGGTTAGTG
ACCTTCAGATGAAGATTGGGTTCGGGTTTGGTTTGGTTTGCCAAGTCGCCAACTTCTACT
GTCACATTCTGTTGAAGAATTTCAGAGACCCTAGTGGAGCTGGAGGGTACCAGATCCCAC
GTGGTTTCCTTTTCAACATTGTTACGTGTGCCAATTACACGACCGAGATTTACCAGTGGC
TAGGATTCAACATCGCTACTCAGACCGTTGCAGGATATGTTTTTTTAGCTGTTGCAGCTC
TGATTATGACCAACTGGGCTCTTGGAAAGCACAGCCGTCTGAGAAAGATATTTGATGGGA
AAGATGGGAAGCCAAAGTATCCAAGAAGATGGGTTATATTGCCTCCATTCCTGTAGAAGA
CTCATCGTTGTGATCTTCGTTCTATCAGTTTAAAAGCTTTCTTAATAAGAGGTTGTAAAA
GAGATTTGGAAGATGTTCGTTTTTCTCTGTATTTGTTATCACTTTTGTTTTGAGATGTTT
TTTGTAAGTTTAGAGATTTTAGACACTTGCTTCTTGTTGTTC

QA 1 582 1 582
DS 



AS 1 7

CO CL740Contig1 642 7 6 U
GGATTCACAGACTTAACATTCGATTCTCTCTCAATCTCTAAAACTTTCTCACGTCTCTTA
AAAAAAGTCACCGATAATGGCTCCCAAGGCGGCAGAGAAGAAACCGGCGGAGAAGAAGCC
AGCAGAGAAGGCTCCGGCGGAGAAGCGACCAAAGGCGGAGAAGAAGATCTCGAAGGAAGG
CGGGAGCGACAAGAAGAAGAAGAAGTCTAAGAAGAGCGTGGAGACGTACAAGATCTACAT
CTTCAAGGTCCTGAAGCAGGTCCATCCCGACATCGGAATCTCCGGGAAAGCCATGGGGAT
CATGAACAGTTTCATCAACGACATATTCGAGAAACTCGCCCAGGAATCGTCGAAGCTCGC
GAGGTACAACAAGAAGCCGACGATCACGTCAAGGGAGATCCAGACGGCGGTCAGGCTCGT
TTTGCCCGGAGAGCTCGCGAAGCACGCCGTTTCGGAAGGGACTAAGGCGGTTACCAAATT
CACAAGCACTTAGGGTTTCGTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTGCGTTTCAATCTGGGTTT
GCATGTTTAGATATATAATGGATTCTCTGTCTTGGATCTTTGGTTTCTGGATTGTATTCG
GTTAGTGAGATGGTTGAATGAACAGCTTTTTCTATGTTAACG


BQ
25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 0 0 0 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H036TF U 5
AF RS1G451TF U 1
AF RS1AF77TF U 1
AF RS1H036JQB C 517
AF RS1E169TF U 1
AF RS1E066TF U 1
AF RS1E066JQ C 97
BS 1 380 RS1AF77TF
BS 381 381 RS1G451TF
BS 382 511 RS1AF77TF
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BS 516 635 RS1AF77TF
BS 636 642 RS1E066JQ

RD RS1H036TF 474 0 0
GG
ACAGACTTAACATTCGATTCTCTCTCAATCTCTAAAACTTTCTCACGTCTCTTAAAAAAA
GTCACCGATAATGGCTCCCAAGGCGGCAGAGAAGAAACCGGCGGAGAAGAAGCCAGCAGA
GAAGGCTCCGGCGGAGAAGCGACCAAAGGCGGAGAAGAAGATCTCGAAGGAAGGCGGGAG
CGACAAGAAGAAGAAGAAGTCTAAGAAGAGCGTGGAGACGTACAAGATCTACATCTTCAA
GGTCCTGAAGCAGGTCCATCCCGACATCGGAATCTCCGGGAAAGCCATGGGGATCATGAA
CAGTTTCATCAACGACATATTCGAGAAACTCGCCCAGGAATCGTCGAAGCTCGCGAGGTA
CAACAAGAAGCCGACGATCACGTCAAGGGAGATCCAGACGGCGGTCAGGCTCGTTTTGCC
CGGAGAGCTCGCGAAGCACGCCGTTTCGGAAGGGACTAAGGCGGTTACCAAA

QA 3 474 3 474
DS 

RD RS1G451TF 576 0 0
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AAAAAAGTCACCGATAACGGCTCCCAAGGCGGCAGAGAAGAAACCGGCGGAGAAGAAGCC
AGCAGAGAAGGCTCCGGCGGAGAAGCGACCAAAGGCGGAGAAGAAGATCTCGAAGGAAGG
CGGGAGCGACAAGAAGAAGAAGAAGTCTAAGAAGAGCGTGGATACGTACAAGATCTTCAT
CTTCAAGGTCCTGAAGCAGGTCCATCCCGACATCGGAATCTCCGGGAAAGCCATGGGGAT
CATGAACAGTTTCATCAACGACATATTCGAGAAACTCGCCCAGGAATCGTCGAAGCTCGC
GAGGTACAACAAGAAGCCGACGATCACGTCAAGGGAGATCCAGACGGCGGTCAGGCTCGT
TTTGCCCGGAGAGCTCGCGAAGCACGCCGTTTCGGAAGGGACTAAGGCGGTTACCAAATT
CACAAGCACTTAGGGTTTCGTTTTTTTTTTT****TAAATTTGCGTTTCAATCTGGGTTT
GCATGTTTAGATATATAATGGATTCTCTGTCTTGGA

QA 1 576 1 576
DS 

RD RS1AF77TF 639 0 0
GGATTCACAGACTTAACATTCGATTCTCTCTCAATCTCTAAAACTTTCTCACGTCTCTTA
AAAAAAGTCACCGATAATGGCTCCCAAGGCGGCAGAGAAGAAACCGGCGGAGAAGAAGCC
AGCAGAGAAGGCTCCGGCGGAGAAGCGACCAAAGGCGGAGAAGAAGATCTCGAAGGAAGG
CGGGAGCGACAAGAAGAAGAAGAAGTCTAAGAAGAGCGTGGAGACGTACAAGATCTACAT
CTTCAAGGTCCTGAAGCAGGTCCATCCCGACATCGGAATCTCCGGGAAAGCCATGGGGAT
CATGAACAGTTTCATCAACGACATATTCGAGAAACTCGCCCAGGAATCGTCGAAGCTCGC
GAGGTACAACAAGAAGCCGA*GATCACGTCAAGGGAGATCCAGACGGCGGTCAGGCTCGT
TTTGCCCGGAGAGCTCGCGAAGCACGCCGTTTCGGAAGGGACTAAGGCGGTTACCAAATT
CACAAGCACTTAGGGTTTCGTTTTTTTTTTT****TAAATTTGCGTTTCAATCTGGGTTT
GCATGTTTAGATATATAATGGATTCTCTGTCTTGGATCTTTGGTTTCTGGATTGTATTCG
GTTAGTGAGATGGTTGAATGAACAGCTTTTTCTAT
GTTT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1H036JQB 117 0 0
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TCTTTGGTTTTTGGATTGTATTCGGTTAGTGAGATGGTTGAATGAACAGCTTTTT
TT

QA 1 115 1 115
DS 

RD RS1E169TF 635 0 0
GGATTCACAGACTTAACATTCGATTCCCTCTCAATCTCTAAAACTTTCTCACGTCTCTTA
AAAAAAGTCACCGATAATGGCTCCCAAGGCGGCAGAGAAGAAACCGGCGGAGAAGAAGCC
AGCAGAGAAGGCTCCGGCGGAGAAGCGACCAAAGGCGGAGAAGAAGATCTCGAAGGAAGG
CGGGAGCGACAAGAAGAAGAAGAAGTCTAAGAAGAGCGTGGAGACGTACAAGATCTACAT
CTTCAAGGTCCTGAAGCAGGTCCATCCCGACATCGGAATCTCCGGGAAAGCCATGGGGAT
CATGAACAGTTTCATCAACGACATATTCGAGAAACTCGCCCAGGAATCGTCGAAGCTCGC
GAGGTACAACAAGAAGCCTACGATCACGTCAAGGGAGATCCAGACGGCGGTCAGGTTCGT
TTTGCCCGGAGAGCTCGCGAAGCACGCCGTTTCGGAAGGGACTAAGGCGGTTACCAAATT
CACAAGCACTTAGGGTTTCGTTTTTTTTTTT****TAAATTTGCGTTTCAATCTGGGTTT
GCATGTTTAGATATATAATGGATTCTCTGTCTTGGATCTTTGGTTTCTGGATTGTATTCG
*TTAGTGAGATGGTTGAATGAACAGCTTTTTCTAT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1E066TF 642 0 0
GGATTCACAGACTTAACATTCGATTCTCTCTCAATCTCTAAAACTTTCTCACGTCTCTTA
AAAAAAGTCACCGATAATGGCTCCCAAGGCGGCAGAGAAGAAACCGGCGGAGAAGAAGCC
AGCAGAGAAGGCTCCGGCGGAGAAGCGACCAAAGGCGGAGAAGAAGATCTCGAAGGAAGG
CGGGAGCGACAAGAAGAAGAAGAAGTCTAAGATGAGCGTGGAGACGTACAAGATCTACAT
CTTCAAGGTCCTGAAGCAGGTCCATCCCGACATCGGAATCTCCGGGAAAGCCATGGGGAT
CATGAACAGTTTCATCAACGACATATTCGAGAAACTCGCCCAGGAATCGTCGAAGCTCGC
GAGGTACAACAAGAAGCCGACGATCACGTCAAGGGAGATCCAGACGGCGGTCAGGCTCGT
TTTGCCCGGAGAGCTCGCGAAGCACGCCGTTTCGGAAGGGACTAAGGCGGTTACCAAATT
CACAAGCACTTAGGGTTTCGTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTGCGTTTCAATCTGGGTTT
GCATGTTTAGATATATAATGGATTCTCTGTCTTGGATCTTTGGTTTCTGGATTGTATTCG
GTTAGTGAGATGGTTGAATGAACAGCTTTTTCTAT
GTTAACG

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1E066JQ 546 0 0
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GGAGAAGAAGATCTCGAAGGAAGGCGGGAGCGACAAGAAGAAGAAGAAGTTTAAGATGAG
CGTGGAGACGTACAAGATCTACATCTTCAAGGTCCTGAAGCAGGTCCATCCCGACATCGG
AATTTCCGGGAAAGCCATGGGGATCATGAACAGTTTCATCAACGACATATTCGAGAAACT
CGCCCAGGAATCGTCGAAGCTCGCGAGGTACAACAAGAAGCCGACGATCACGTCAAGGGA
GATCCAGACGGCGGTCAGGCTCGTTTTGCCCGGAGAGCTCGCGAAGCACGCCGTTTCGGA
AGGGACTAAGGCGGTTACCAAATTCACAAGCACTTAGGGTTTCGTTTTTTTTTTTTTTTT
AAATTTGCGTTTCAATCTGGGTTTGCATGTTTAGATATATAATGGATTCTCTGTCTTGGA
TCTTTGGTTTCTGGATTGTATTCGGTTAGTGAGATGGTTGAATGAACAGCTTTTTCTATG
TTAACG

QA 1 546 1 546
DS 



AS 2 7

CO CL741Contig1 983 2 2 U
GAATACACACTCCCCTGAATTTGGTAGATCGTCTTCGTCCACAGGATCGAGATGCGTTCC
TCAGGGTTGATGTTTTGGCGGATCTCGTTTCTTCTGGCGTTATCAATCTCACTCCCAGCT
TCATCGGACGATCAGTTCACAATCGACGGAACAGTACTCGAACTCACCGACTCCAACTTC
GAATCCGCGATTTCCACTTTCGATTGCGTCTTCGTCGATTTTTACGCTCCTTGGTGTGGT
CACTGCAAGCGTCTTAACCCTGAGTTAGATGCAGCTGCTCCTATTCTTGCTAAATTGAAG
CAGCCCATCGTCATTGCAAAGCTTAACGCTGACAAATACTCTCGTCTCGCACGCAAGCTT
GAGATCGATGCATTCCCCACCCTCATGCTCTATAACCATGGAGTGCCAATGGAGTATTAC
GGACCCAGGAAGGCTGATCTACTCGTCCGTTACTTGAAGAAGTTTGTTGCTCCAGATGTT
GCCGTTCTCGAATCAGACTCACACGTCAAGGAATTCGTCGAAGACGCTGGGACTGCCTTC
CCTGTGTTCATCGGCTTCGGGTTGAACGAGTCTTTGATATCTGGACTAGGTAGAAAGTAC
AAGAAAAAGGCATGGTTTGCTGTCGCAAAGGATGCCTCAGAGGATGTAATGGTTGCCTAT
GATTTCGATAGGGCTCCTGCTTTAGTTGCTCAGCATCCTGCGTACAATGAGCATAGCGTC
TTCTATGGTCCTTTTGAAGATGGTTTCTTGGAAGAGTTTGTGAAACAAAATTTCCTTCCT
TTGATTCTGCCAATTAACCATAACACCCTGAAGCTGCTGAAAGACGATGAGAGAAAGATG
GTGTTGACAATTGTGGAAGATGAGACTCATGAAAGCATGGGAAAACTGGTCAAGGCACTG
AGAGCAGCTGCTCATGCCACCGCGACCTTGTTTCGTTACGTCGTGTGGAGCAGTTTGAAG
AGTTTGCAGACTCGTTTCATGCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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BQ
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25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GS16JQ U 1
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DS 

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DS 

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CCACAATTGTCAACACCATCTTTCTCTCATCGTCTTTCAGCAGCTTCAGGGTGTTATGGT
TAATTGGCAGAATCAAAGGAAGGAAATTTTGTTTCACAAACTCTTCCAAGAAACCATCTT
CAAAAGGACCATAGAAGACGCTATGCTCATTGTAC
C

QA 1 575 1 575
DS 

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TCTTAGGCAGCTTTGCCTTCTTGTCAGCATGAAACGAGTCTGCAAACTCTTCAAACTGCT
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TAATCAGTTTCCCCATGCTTTCATGAGTCTCATCTTCCACAATTGTCAACACCATCTTCC
TCTCATCGTCTTTCGGCAGCTTCAGGGTGTTATGGTTAATTGGCAGAATCAAAGGAATGA
AATTCTGTTTCACAAACTCTTCCAAGAAACCATCTTCAAAAGGACCGTAAAAAACGCTAT
GCTCATTGTACGCAGGATGCTGAGCAACCAATGCAAGAGCCCTATCGAAATCATAGGAAA
CCATCACATCCTCCGAGGCATCCTTTGCAACAGCAAACCACGCCTTTTTCTTGTACTTTC
TACCTAGTGCCGATATCAAAGACTCGTTCAACCCAAAGCCGATGAACACAGGGAAGGAAG
TCCCGGCGTCTTCGACGAATTCCTTGACATGTGAGTCTGATTCAAGAACGGAAACATCTG
GAGCAACAAACTTCTTCAAGTAACGGACGAGTAAATCAGCCTTCCTAGGTCCGTAATACT
CCATTGGCACTCCATGGTTATAGAGCA

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1AG38TF 695 0 0
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CAACCCAAAGCCGATGAACACAGGGAAGGAAGTCCCGGCGTCTTCGACGAATTCCTTGAC
ATGTGAGTCTGATTCAAGAACGGAAACATCTGGAGCAACAAACTTCTTCAAGTAACGGAC
GAGTAAATCAGCCTTCCTAGGTCCGTAATACTCCATTGGCACTCCATGGTTATAGAGCAT
GAGGGTGGGGAATGCATCGATCTCAAGCTTGCGTGCGAGACGAGAGTATTTGTCAGCGTT
AAGCTTTGCAATGACGATAGGCTGCTTCAATTTAGCAAGAATAGGAGCAGCTGCATCTAA
CTCAGGGTTAAGACGCTTGCAGTGACCACACCAAGGAGCGTAGAAATCGACGAAGACGCA
ATCGAAAGTGGAAATCGCGGATTCGAAGTTGGAGTCGGTGAGTTCGAGTACTCTTCCGTC
GATTGTGAACTGATCGTCCGATGAAGCTGAGAGTGAAATTGATAGCGCCAGAAGAAACGA
GATCCGCCAAAACATCAACCCTGACGAACGCATCT

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

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AACATCTTAGTAGCCAGAGGAAAAGAAAAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1AM27JQ C 1
AF RS1AM27TF U 1
BS 1 208 RS1AM27TF
BS 209 210 RS1AM27JQ

RD RS1AM27JQ 210 0 0
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TAAGCGACGAAATGCTTCGGGGAGTTGAAAATAAGCGTAGATCCGGAGATTCCCGAATAG
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AACATCTTAGTAGCCAGAGGAAAAGAAAAC

QA 1 210 1 210
DS 

RD RS1AM27TF 210 0 0
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TAAGCGACGAAATGCTTCGGGGAGTTGAAAATAAGCGTAGATCCGGAGATTCCCGAATAG
GTTAACCTTTTGAACTGCTGCTGAATCCATGGGCAGGCAAGAGACAACCTGGCGAACTGA
AACATCTTAGTAGCCAGAGGAAAAGAAA
AC

QA 1 208 1 208
DS 



AS 1 7

CO CL743Contig1 1051 7 12 U
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CTCATCAAACTCTCTCACCTCCCGCCTCTTGTTCCCTACCACTTCATTCAAGGGCAATGT
AAGCGTCTTAGGAGCAAACCCATCTCACCAGATCCTCTCTCTGAAACTCCACCAAAATCG
TCGAATCGCGAGACCTCTGGTTGTGATGAACCAAACGGCGGCGACCTCGCCGGAAGCAGC
AGCAGTGATGAGCTCGGAGAGGTTCCGTCTGGATAACCTCGGACCACAACCCGGTTCGAG
AAAGAGGGCGAAGAGAAAGGGTAGAGGTATCTCCGCGGGACAAGGAGCGAGCTGCGGGTT
CGGTATGAGGGGACAGAAGTCGCGGTCTGGTCCTGGGATCATGAGAGGCTTTGAAGGAGG
TCAAACCGCTCTTTATCGCCGTCTTCCGAAGCTTAGAGGAATCGCTGGAGGTATGCGTGC
AGGGTTACCTAAGTACGTGCCAGTGAATCTCAAAGACATTGAAACAGCTGGGTTTGAAGA
TGGAGATGAAGTGTCACTGGAGACATTGAAGCAAAAGGGTTTGATTAATCCTTCAGGAAG
GGAAAGGAAACTCCCTCTTAAGATTCTTGGTACGGGAGAACTAAGCGTGAAGCTCACCTT
CAAAGCTCGTGCTTTCTCCACATCAGCAAAAGAGAAGCTTGAAGCTTCGGGTTGTACACT
CACTGTGTTGCCCGGAAGAAAGAAGTGGGTGAAGCCATCGGTTGCTAAGAACCAAGCACG
AGCAGATGAATACTTTGCTAAGAAGAGAGCTGCTGCAGCTGAAGCAGCTTCAGAACCTGC
AGCTTCGGCTTGAACTTGTTCATTTTCAAGCTCTTCAATGTTGTAAAGCTGCAGATATAA
GTTTAGCTTTTGTCTATGCTAAAATCTACAA*TTCCTTTTCTCTCTTTATGTATGGTGAA
GAAATTTACATTTTGTTGTTTATGAGTAAAATCCTTAACAGAAAGTTTTTGTAAAACTGT
ATTACATTATTCTTCAATCTCCAACAAAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 25 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 15 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DH42TF U 1
AF RS1BO86TF U 10
AF RS1E869TF U 316
AF RS1BO86JQ C 291
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AF RS1DB67JQ C 843
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RD RS1DH42TF 630 0 0
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CTCATCAAACTCTCTCACCTCCCGCCTCTTGTTCCCTACCACTTCATTCAAGGGCAATGT
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TCGAATCGCGAGACCTCTGGTTGTGATGAACCAAACGGCGGCGACCTCGCCGGAAGCAGC
AGCAGTGATGAGCTCGGAGAGGTTCCGTCTGGATAACCTCGGACCACAACCCGGTTCGAG
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CGGTATGAGGGGACAGAAGTCGCGGTCTGGTCCTGGGATCATGAGAGGCTTTGAAGGAGG
TCAAACCGCTCTTTATCGCCGTCTTCCGAAGCTTAGAGGAATCGCTGGAGGTATGCGTGC
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TGGAGATGAAGTGTCACTGGAGACATTGAAGCAAAAGGGTTTGATTAATCCTTCAG*AAG
GGAAAGGAAACTCCCTCTTAAGATTCTTGG

QA 1 630 1 630
DS 

RD RS1BO86TF 678 0 0
GG
GTCTGTAGTTGTTGTTGATGCCCTCCTCCATGGCTGTTCCTCTCTCCATCTCATCAAACT
CTCTCACCTCCCGCCTCTTGTTCCCTACCACTTCATTCAAGGGCAATGTAAGCGTCTTAG
GAGCAAACCCATCTCACCAGATCCTCTCTCTGAAACTCCACCAAAATCGTCGAATCGCGA
GACCTCTGGTTGTGATGAACCAAACGGCGGCGACCTCTCCGGAAGCAGCAGCAGTGATGA
GCTCGGAGAGGTTCCGTCTGGATAACCTCGGACCACAACCCGGTTCGAGAAAGAGGGCGA
AGAGAAAGGGTAGAGGTATCTCCGCGGGACAAGGAGCGAGCTGCGGGTTCGGTATGAGGG
GACAGAAGTCGCGGTCTGGTCCTGGGATCATGAGAGGCTTTGAAGGAGGTCAAACCGCTC
TTTATCGCCGTCTTCCGAAGCTTAGAGGAATCGCTGGAGGTATGCGTGCAGGGTTACCTA
AGTACGTGCCAGTGAATCTCAAGGACATTGAAACAGCTGGGTTTGAAGATGGAGATGAAG
TGTCACTGGAGACATTGAAGCAAAAGGGTTTGATTAATCCTTCAG*AAGGGAAAGGAAAC
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CTTTCTCCACATCAGC

QA 3 678 3 678
DS 

RD RS1E869TF 611 0 0
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GAAGTCACGGTCTGGTCCTGGGATCATGAGAGGCTTTGAAGGAGGCCAAACCGCTCTTTA
TCGCCGTCTTCCCAAACTTAGAGGAATCGCCGGAGGTATGCGTGCAGGGTTACCCAAGTA
CGTGCCAGTGAATCTCAAAGACATCGAAACGGCTGGGTTTGAAGATGGAGATGAAGTGTC
ACTGGAGACATTGAAGCAAAAGGGTTTGATCAATCCTTCTGGAAGGGAAAGGAAGCTCCC
TCTTAAGATTCTTGGTACGGGAGAACTAAGCGTGAAGCTCACCTTCAAAGCTCGTGCTTT
CTCGACATCAGCAAAAGAGAAGCTTGAAGCTTCGGGTTGTACACTCACTGTGTTGCCCGG
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ATGCTAAA
TCT

QA 1 608 1 608
DS 

RD RS1BO86JQ 679 0 0
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GCTGCGGGTTCGGTATGAGGGGACAGAAGTCGCGGTCTGGTCCTGGGATCATGAGAGGCT
TTGAAGGAGGTCAAACCGCTCTTTATCGCCGTCTTCCGAAGCTTAGAGGAATCGCTGGAG
GTATGCGTGCAGGGTTACCTAAGTACGTGCCAGTGAATCTCAAGGACATTGAAACAGCTG
GGTTTGAAGATGGAGATGAAGTGTCACTGGAGACATTGAAGCAAAAGGGTTTGATTAATC
CTTCAGGAAGGGAAAGGAAACTCCCTCTTAAGATTCTTGGTACGGGAGAACTAAGCGTGA
AGCTCACCTTCAAAGCTCGTGCTTTCTCCACATCAGCAAAGGAGAAGCTTGAAGCTTCGG
GTTGTACACTCACTGTGTTGCCCGGAAGAAAGAAGTGGGTGAAGCCATCGGTTGCTAAGA
ACCAAGCACGAGCAGATGAATACTTTGCTAAGAAGAGAGCTGCTGCAGCTGAAGCAGCTT
CAGAACCTGCAGCTTCGGCTTGAACTTGTTCATTTTCAAGCTCTTCAATGTTGTAAAGCT
GCAGATATAACTTTAGCTTTTGTCTATGCTAAAATCTACAAATTCCTTTTCTCTCTT*AT
GTATGGTGAAGAAATTTAC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1DH42JQ 671 0 0
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TGAGAGGCTTTGAAGGAGGTCAAACCGCTCTTTATCGCCGTCTTCCGAAGCTTAGAGGAA
TCGCTGGAGGTATGCGTGCAGGGTTACCTAAGTACGTGCCAGTGAATCTCAAAGACATTG
AAACAGCTGGGTTTGAAGATGGAGATGAAGTGTCACTGGAGACATTGAAGCAAAAGGGTT
TGATTAATCCTTCAGGAAGGGAAAGGAAACTCCCTCTTAAGATTCTTGGTACGGGAGAAC
TAAGCGTGAAGCTCACCTTCAAAGCTCGTGCTTTCTCCACATCAGCAAAGGAGAAGCTTG
AAGCTTCGGGTTGTACACTCACTGTGTTGCCCGGAAGAAAGAAGTGGGTGAAGCCATCGG
TTGCTAAGAACCAAGCACGAGCAGATGAATACTTTGCTAAGAAGAGAGCTGCTGCAGCTG
AAGCAGCTTCAGAACCTGTAGCTTCGTCTTGAACTTGTTCATTTTCAAGCTCTTCAATGT
TGTAAAGCTGCAGATATAACTTTAGCTTTTGTCTATGCTAAAATCTACAA*TTCCTTTTC
TCTCTT*ATGTATGGTGAAGAAATTTACATTTTGTTGTTTATGAGTAAAATCCTTATCAG
AAATTTTTTGT

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DS 

RD RS1DB67TF 598 0 0
G
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TGCCAGTGAATCTCAAAGACATCGAAACGGCTGGGTTTGAAGATGGAGATGAAGTGTCAC
TGGAGACATTGAAGCAAAAGGGTTTGATCAATCCTTCTGGAAGGGAAAGGAAGCTCCCTC
TTAAGATTCTTGGTACGGGAGAACTAAGCGTGAAGCTCACCTTCAAAGCTCGTGCTTTCT
CGACATCAGCAAAAGAGAAGCTTGAAGCTTCGGGTTGTACACTCACTGTGTTGCCCGGAA
GAAAGAAGTGGGTGAAGCCATCGGTTGCTAAGAATCAAGCACGAGCAGATGAATACTTTG
CTAAGAAGAGAGCTGCTGCAGCTGAAGCAGCTTCAGAACCTGCAGCTTCGGCTTGAACTT
GTTCATTTTCAAGCTCTTCAATGTTGTAAAGCTGCAGATATAAGTTTAGCTTTTGTCTAT
GCTAAAATCTACAA*TTCCTTTTCTCTCTTTATGTATGGTGAAGAAATTTACATTTTGTT
GTTTATGAGTAAAATCCTTAACAGAAAGTTTTTGTAAAACTGTATTACATTATTCTT

QA 2 598 2 598
DS 

RD RS1DB67JQ 209 0 0
CTTCGGCTTGAACTTGTTCATTTTCAAGCTCTTCAATGTTGTAAAGCTGCAGATATAAGT
TTAGCTTTTGTCTATGCTAAAATCTACAA*TTCCTTTTCTCTCTTTATGTATGGTGAAGA
AATTTACATTTTGTTGTTTATGAGTAAAATCCTTAACAGAAAGTTTTTGTAAAACTGTAT
TACATTATTCTTCAATCTCCAACAAAATG

QA 1 209 1 209
DS 



AS 1 7

CO CL744Contig1 719 7 21 U
GGTCCGATACTTGACCACACAGACAGACAGAGAGTTTTCTTCTCTTCGTCCGAGTTTCTT
CTATTTCAGGCAGGTTAGAAGGAGAGAGATGGCGTTTGTGACCACTGCAGAAGTTTGTGA
CGCGAATCAAGATCTGATCCGTAGTGGTCAGCTCCGAGCTCTGCAACCCTCTTTCCAAAT
TTACGGTCGTCGTCAAATCTTCTCAGGTCCTGTTGTTACTGCCAAAGTGTTTGAAGACAA
TGGCTTGATCCGTCAGTTTCTCGAAGAGAAAGGCAATGGAAGAGTCCTTGTGGTGGATGG
TGGAGGAAGTTTACGCTGTGCTATACTCGGAGGAAACCCAGTAGTACAAGCTCAGAACAA
CGGATGGGCGGGGATCATAGTAAACGGCTGCATCAGAGACGTTAACGAGATCAACGGTTG
CGACATTGGGGTGAGAGCTTTGGCTTCTCATCCCATAAAGGCTAGTAAGAAAGGACTCGG
TGAACAGAGAGTCCCTCTCAACATAGCAGGCACTAGGATTTCCGATGGCGAGTGGCTTTA
TGCAGATACCGATGGTATCCTTGTTTCTCATATCGAACTATCGGTTTAGAAACCAAGGAA
GAACGTGCTACTTGATTTGTTTGAACTTTGAAATGTTGAAGGAAAGCTTTGTCGTTAAAA
ATTGCATCTTTTTGTCGTTTTGTGGTAATAATGAAGAAAACGTTTCTCTTTTTTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 
45 45 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RS1FG36TF U 1
AF RS1GH66TF U 4
AF RS1E703TF U 11
AF RS1EQ24TF U 4
AF RS1FG36JQ C 78
AF RS1GH66JQ C 133
AF RS1EQ24JQ C 138
BS 1 198 RS1FG36TF
BS 199 199 RS1EQ24TF
BS 200 204 RS1FG36TF
BS 205 205 RS1EQ24TF
BS 206 221 RS1FG36TF
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BS 229 229 RS1EQ24TF
BS 230 309 RS1FG36TF
BS 310 310 RS1EQ24TF
BS 311 381 RS1FG36TF
BS 382 382 RS1EQ24TF
BS 383 403 RS1FG36TF
BS 404 404 RS1EQ24TF
BS 405 486 RS1FG36TF
BS 487 487 RS1EQ24TF
BS 488 521 RS1FG36TF
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BS 523 602 RS1FG36TF
BS 603 716 RS1EQ24TF
BS 717 719 RS1EQ24JQ

RD RS1FG36TF 602 0 0
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CTATTTCAGGCAGGTTAGAAGGAGAGAGATGGCGTTTGTGACCACTGCAGAAGTTTGTGA
CGCGAATCAAGATCTGATCCGTAGTGGTCAGCTCCGAGCTCTGCAACCCTCTTTCCAAAT
TTACGGTCGTCGTCAAATATTCTCTGGTCCTGTTGTTACTGTCAAAGTTTTTGAAGACAA
TGGCTTGATCCGTCAGTTTCTCGAAGAGAAAGGCAATGGAAGAGTCCTTGTGGTGGATGG
TGGAGGAAGCTTACGCTGTGCTATACTCGGAGGAAACCCAGTAGTACAAGCTCAGAACAA
CGGATGGGCGGGGATCATAGTGAACGGCTGCATCAGAGACGTTGACGAGATCAACGGTTG
CGACATTGGGGTGAGAGCTTTGGCTTCTCATCCCATAAAGGCTAGTAAGAAAGGACTCGG
TGAACATAGAGTCCCTCTCAACATAGCAGGCACTAGGATTTGCGATGGCGAGTGGCTTTA
TGCAGATACCGATGGTATCCTTGTTTCTCATATCGAACTATCGGTTTAGAAACCAAGGAA
GA

QA 1 602 1 602
DS 

RD RS1GH66TF 615 0 0
GGGATACTT
GACCACACAGACAGACAGAGAGTTTTCTTCTCTTCGTCCGAGTTTCTTCTATTTCAGGCA
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TCTGATCCGTAGTGGTCAGCTCCGAGCTCTGCAACCCTCTTTCCAAATTTACGGTCGTCG
TCAAATCTTCTCAGGTCCTGTTGTTACTGCCAAAGTGTTTGAAGACAATGGCTTGATCCG
TCAGTTTCTCGAAGAGAAAGGCAATGGAAGAGTCCTTGTGGTGGATGGTGGAGGAAGTTT
ACGCTGTGCTATACTCGGAGGAAACCCAGTAGTACAAGCTCAGAACAACGGATGGGCGGG
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GAGAGCTTTGGCTTCTCATCCCATAAAGGCTAGTAAGAAAGGACTCGGTGAACAGAGAGT
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TGATTT

QA 10 615 10 615
DS 

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GG
GACCACACAGACAGACAGAGAGTTTTCTTCTCTTCGTCCGAGTTTCTTCTATTTCAGGCA
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TCTGATCCGTAGTGGTCAGCTCCGAGCTCTGCAACCCTCTTTCCAAATTTACGGTCGTCG
TCAAATCTTCTCAGGTCCTGTTGTTACTGTCAAAGTGTTTGAAGACAATGGCTTGATCCG
TCAGTTTCTCGAAGAGAAAGGCAATGGAAGAGTCCTTGTGGTGGATGGTGGAGGAAGTTT
ACGCTGTGCTATACTCGGAGGAAACCCAGTAGTACAAGCTCAGAACAACGGATGGGCGGG
GATCATAGTAAACGGCTGCATCAGAGACGTTGACGAGATCAACGGTTGCGACATTGGGGT
GAGAGCTTTGGCTTCTCATCCCATAAAGGCTAGTAAGAAAGGACTCGGTGAACAGAGAGT
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TGGTATCCTTGTTTCTCATATCGAACTATCGGTTTAGAAACCAAAGAAGA

QA 3 592 3 592
DS 

RD RS1EQ24TF 715 0 0
GGGATACTT
GACCACACAGACAGACAGAGAGTTTTCTTCTCTTCGTCCGAGTTTCTTCTATTTCAGGCA
GGTTAGAAGGAGAGAGATGGCGTTTGTGACCACTGCAGAAGTTTGTGACGCGAATCAAGA
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TCAGTTTCTCGAAGAGAAAGGCAATGGAAGAGTCCTTGTGGTGGATGGTGGAGGAAGTTT
ACGCTGTGCTATACTCGGAGGAAACCCAGTAGTACAAGCTCAGAACAACGGATGGGCGGG
GATCATAGTAAACGGCTGCATCAGAGACGTTAACGAGATCAACGGTTGCGACATTGGGGT
GAGAGCTTTGGCTTCTCATCCCATAAAGGCTAGTAAGAAAGGACTCGGTGAACAGAGAGT
CCCTCTCAACATAGCAGGCACTAGGATTTCCGATGGCGAGTGGCTTTATGCAGATACCGA
TGGTATCCTTGTTTCTCATATCGAACTATCGGTTTAGAAACCAAGGAAGAACGTGCTACT
TGATTTGTTTGAACTTTGAAATGTTGAAGGAAAGCTTTGTCGTTAAAAATTGCATCTTTT
TGTCGTTTTGTGGTAATAATGAAGAAAACGTTTCTCTTTTTTTT
CC

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DS 

RD RS1FG36JQ 630 0 0
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TATTCTCTGGTCCTGTTGTTACTGTCAAAGTTTTTGAAGACAATGGCTTGATCCGTCAGT
TTCTCGAAGAGAAAGGCAATGGAAGAGTCCTTGTGGTGGATGGTGGAGGAAGCTTACGCT
GTGCTATACTCGGAGGAAACCCAGTAGTACAAGCTCAGAACAACGGATGGGCGGGGATCA
TAGTGAACGGCTGCATCAGAGACGTTGACGAGATCAACGGTTGCGACATTGGGGTGAGAG
CTTTGGCTTCTCATCCCATAAAGGCTAGTAAGAAAGGACTCGGTGAACATAGAGTCCCTC
TCAACATAGCAGGCACTAGGATTTGCGATGGCGAGTGGCTTTATGCAGATACCGATGGTA
TCCTTGTTTCTCATATCGAACTATCGGTTTAGAAACCAAGGAAGAACGTGTTACTTGATT
TGTTTGAACTTTGAAATGTTGAAGGAAAGCTTTGTCGTTAAAAATTGCATCTTTTTGTCG
TTTTGTGGTAATAATGAAGAAAACGTTT
CG

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DS 

RD RS1GH66JQ 587 0 0
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TCAAATCTTCTCAGGTCCTGTTGTTACTGCCAAAGTGTTTGAAGACAATGGCTTGATCCG
TCAGTTTCTCGAAGAGAAAGGCAATGGAGGAGTCCTTGTGGTGGATGGTGGAGGAAGTTT
ACGCTGTGCTATACTCGGAGGAAACCCAGTAGTACAAGCTCAGAACAACGGATGGGCGGG
GATCATAGTAAACGGCTGCATCAGAGACGTTAACGAGATCAACGGTTGCGACATTGGGGT
GAGAGCTTTGGCTTCTCATCCCATAAAGGCTAGTAAGAAAGGACTCGGTGAACAGAGAGT
CCCTCTCAACATAGCAGGCACTAGGATTTCCGATGGCGAGTGGCTTTATGCAGATACCGA
TGGTATCCTTGTTTCTCATATCGAACTATCGGTTTAGAAACCAAGGAAGAACGTGCTACT
TGATTTGTTTGAACTTTGAAATGTTGAAGGAAAGCTTTGTCGTTAAAAATTGCATCTTTT
TGTCGTTTTGTGGTAATAATGAAGAAAACGTTTTTCTTTTTTTT
TCC

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DS 

RD RS1EQ24JQ 582 0 0
TCCGTAGTGGTCAGCTCCGAGCTCTGCAACCCTCTTTCCAAATTTACGGTCGTCGTCAAA
TCTTCTCAGGTCCTGTTGTTACTGCCAAAGTGTTTGAAGACAATGGCTTGATCCGTCAGT
TTCTCGAAGAGAAAGGCAATGGAAGAGTCCTTGTGGTGGATGGTGGAGGAAGTTTACGCT
GTGCTATACTCGGAGGAAACCCAGTAGTACAAGCTCAGAACAACGGATGGGCGGGGATCA
TAGTAAACGGCTGCATCAGAGACGTTAACGAGATCAACGGTTGCGACATTGGGGTGAGAG
CTTTGGCTTCTCATCCCATAAAGGCTAGTAAGAAAGGACTCGGTGAACAGAGAGTCCCTC
TCAACATAGCAGGCACTAGGATTTCCGATGGCGAGTGGCTTTATGCAGATACCGATGGTA
TCCTTGTTTCTCATATCGAACTATCGGTTTAGAAACCAAGGAAGAACGTGCTACTTGATT
TGTTTGAACTTTGAAATGTTGAAGGAAAGCTTTGTCGTTAAAAATTGCATCTTTTTGTCG
TTTTGTGGTAATAATGAAGAAAACGTTTCTCTTTTTTTTTCC

QA 1 582 1 582
DS 



AS 1 5

CO CL745Contig1 1012 5 10 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGACCGCGTAA
TAGTTTAGTATAAACTAAAAACTCGTGGTCTACATACACGCATATTCTGTTTTTCTTTTG
TAATGGCTTCTTCCTCTTACGCACCATTCTCTGCAGTCTTCAGCGGTTTCGCTGCAACCA
AACCTAACCCACCTCCAACTTGTTCTGCTTTTCTCGTCCCTAAGCGAAGATCAAATTCTC
GAAATCTGAAAAATGGTGTTTCCTTGAAATCTTGGAATAACCATGGGTTTCAATTCAAAT
CAAGAAATTT*GAGTGTGTGTGCAAGAGCTACTGAAGAGAAGACTGTTCATGATTTCACT
GTAAAGGACATAAGTGGGAAGGATGTTTCCCTAGACATATTCAAAGGAAAACCTCTGTTG
ATCGTTAACGTTGCTTCAAAATGTGGTTTGACATCATCAAACTACACAGAGCTTTCACAG
TTGTACGATAAATACAGGAACCAAGGATTTGAGATTTTAGCTTTCCCTTGCAATCAATTT
GGAGGTCAAGAACCGGAATCAAACCCGGATATCAAGCGATTCGTGTGTACCAGATTCAAA
GCTGAGTTCCCTATATTCGACAAGGTTGATGTGAATGGACCGAGCACTGCTCCAATCTAC
CAGTTCTTGAAATCAAAGTCTGGTGGATTCTTGGGTGATCTCATCAAGTGGAACTTTGAG
AAATTCTTGGTTGACAAAAAGGGCAACGTCGTCCAGAGATACCCTCCCACGACTTCGCCT
TTACAAATTGAGAAAGACATCCAGAAGTTGCTTGTGGCTTAAATATTAATCTACTACTAT
TCATAATGTGTGTGTATAAGAGAGATTCGTAGTGTCTCAATAACCTGTTTACTGTTGGTA
TACCAAAAATTAAGATAGACATGCATTATGTTACAGAAATGACATTATACGATTGGAAAA
TCAAATGAACAATTTATGTAAACTTCGGAGACATCTGATTATGCTATTTACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A225TV U 1
AF RS1BA50TF U 115
AF RS1A225TF U 54
AF RS1BA50JQ C 214
AF RS1B020TF U 518
BS 1 310 RS1A225TV
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TAGTTTAGTATAAACTAAAAACTCGTGGTCTACATACACGCATATTCTGTTTTTCTTTTG
TAATGGCTTCTTCCTCTTACGCACCATTCTCTGCAGTCTTCAGCGGTTTCGCTGCAACCA
AACCTAACCCACCTCCAACTTGTTCTGCTTTTCTCGTCCCTAAGCGAAGATCAAATTCTC
GAAATCTGAAAAATGGTGTTTCCTTGAAATCTTGGAATAACCATGGGTTTCAATTCAAAT
CAAGAAATTTTGAGTGTGTGTGCAAGAGCTACTGAAGAGAAGACTGTTCATGATTTCACT
GTAAAGGACATAAGTGGGAAGGATGTTTCCCTAGACATATTCAAAGGAAAACCTCTGTTG
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GGAGGTCAAGAACCGGAATCAAACCCGGATATCAAGCGATTCGTGTGTACCAGATTCAAA
GCTGAGTTCCCTATATTCGACAAGGTTGATGTGAATGGACCGAGCACTGCTCCAATCTAC
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TTACAAATTGAGAAAGACATCCAGAAGTTGCTTGTGGCTTAAATATTAATCTACTACTAT
TCATAATGTGTGTGTATAAGAGAGATTCGTAGTGTCTCAATAACCTG

QA 1 887 1 887
DS 

RD RS1BA50TF 763 0 0
C
TTTTGTAATGGCTTCTTCCTCTTACGCACCATTCTCTGCAGTCTTCAGCGGTTTCGCTGC
AACCAAACCTAACCCACCTCCAACTTGCTCTGCTTTTCTCGTCCCTAAGCGAAGATCAAA
TTCTCGAAATCTGAAAAATGGTGTTTCCTTGAAATCTTGGAATAACCATGGGTTTCAATT
CAAATCAAGAAATTT*GAGTGTGTGTGCAAGAGCTACTGAAGAGAAGACTGTTCATGATT
TCACTGTAAAGGACATAAGTGGGAAGGATGTTTCCCTAGACATATTCAAAGGAAAACCTC
TGTTGATCGTTAACGTTGCTTCAAAATGTGGTTTGACATCATCAAACTACACAGAGCTTT
CACAGTTGTACGATAAATACAGGAACCAAGGATTTGAGATTTTAGCTTTCCCTTGCAATC
AATTTGGAGGTCAAGAACCGGAATCAAACCCGGATATCAAGCGATTCGTGTGTACCAGAT
TCAAAGCTGAGTTCCCTATATTCGACAAGGTTGATGTGAATGGACCGAGCACTGCTCCAA
TCTACCAGTTCTTGAAATCAAAGTCTGGTGGATTCTTGGGTGATCTCATCAAGTGGAGCT
TTGAGAAATTCTTGGTTGACAAAAAGGGCAACGTCGTCCAGAGATACCCTCCCACGACTT
CGCCTTTACAAATTGAGAAAGACATCCAGAAGTTGCTTGTGGCTTAA*TAT*AATCTACT
ACTATTCATAATGTGTGTGTATA*GAGAGATTCGTAGTGTCT

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DS 

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TCTTTTGTAATGGCTTCTTCCTCTTACGCACCATTCTCTGCAGTCTTCAGCGGTTTCGCT
GCAACCAAACCTAACCCACCTCCAACTTGTTCTGCTTTTCTCGTCCCTAAGCGAAGATCA
AATTCTCGAAATCTGAAAAATGGTGTTTCCTTGAAATCTTGGAATAACCATGGGTTTCAA
TTCAAATCAAGAAATTTTGAGTGTGTGTGCAAGAGCTACTGAAGAGAAGACTGTTCATGA
TTTCACTGTAAAGGACATAAGTGGGAAGGATGTTTCCCTAGACATATTCAAAGGAAAACC
TCTGTTGATCGTTAACGTTGCTTCAAAATGTGGTTTGACATCATCAAACTACACAGAGCT
TTCACAGTTGTACGATAAATACAGGAACCAAGGATTTGAGATTTTAGCTTTCCCTTGCAC
TCAATTTGGAGGTCAAGAACCGGAATCAAACCCGGATATCAAGCGATTCGTGTGTACCAG
ATTCAAAGCTGAGTTCCCTATATTCGACAAGGTTGATGTGAATGGACCGAGCACTGCTCC
AATCTACCAGTTCTTGAAATCAAAGTCTGGTGGATTCTTGGGTGATCTCGTCAAGTGGAA
CTTTGAGAAATTCTTGGTTGACAAAAAGGGCAACGTCGTCCAGAGATACCCTCCCACGAC
TTCGCCTTTACAAATTGAGAAAGACATCCAGAAGTTGCTTGTGGCTTAAATATTAATCTA
CTACTATTCATAATGTGTGT

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DS 

RD RS1BA50JQ 765 0 0
CTCGT
CCTAAGCGAAGATCAAATTCTCGAAATCTGAAAAATGGTGTTTCCTTGAAATCTTGGAAT
AACCATGGGTTTCAATTCAAATCAAGAAATTT*GAGTGTGTGTGCAAGAGCTACTGAAGA
GAAGACTGTTCATGATTTCACTGTAAAGGACATAAGTGGGAAGGATGTTTCCCTAGACAT
ATTCAAAGGAAAACCTCTGTTGATCGTTAACGTTGCTTCAAAATGTGGTTTGACATCATC
AAACTACACAGAGCTTTCACAGTTGTACGATAAATACAGGAACCAAGGATTTGAGATTTT
AGCTTTCCCTTGCAATCAATTTGGAGGTCAAGAACCGGAATCAAACCCGGATATCAAGCG
ATTCGTGTGTACCAGATTCAAAGCTGAGTTCCCTATATTCGACAAGGTTGATGTGAATGG
ACCGAGCACTGCTCCAATCTACCAGTTCTTGAAATCAAAGTCTGGTGGATTCTTGGGTGA
TCTCATCAAGTGGAGCTTTGAGAAATTCTTGGTTGACAAAAAGGGCAACGTCGTCCAGAG
ATACCCTCCCACGACTTCGCCTTTACAAATTGAGAAAGACATCCAGAAGTTGCTTGTGGC
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AATAACCTGTTTACTGTTGGTATACCAAAAATTAAGATAGACATGTATTATGTTACAGAA
ATGACATTATACGATTGGAAAATCAAATGAACAATTTATG

QA 6 765 6 765
DS 

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G
AGCTTTCCCTTGCAATCAATTTGGAGGTCAAGAACCGGAATCAAACCCGGATATCAAGCG
ATTCGTGTGTACCAGATTCAAAGCTGAGTTCCCTATATTCGACAAGGCTGATGTGAATGG
ACCGAGCACTGCTCCAATCTACCAGTTCTTGAAATCAAAGTCTGGTGGATTCTTGGGTGA
TCTCATCAAGTGGAACTTTGAGAAATTCTTGGTTGACAAAAAGGGCAACGTCGTCCAGAG
ATACCCTCCCACGACTTCGCCTTTACAAATTGAGAAAGACATCCAGAAGTTGCTTGTGGC
TTAAATATTAATCTACTACTATTCATAATGTGTGTGTATAAGAGAGATTCGTAGTGTCTC
AATAACCTGTTTACTGTTGGTATACCAAAAATTAAGATATACATGCATTATGTTACAGAA
ATGACATTATACGATTGGAAAATCAAATGAACAATTTATGTAAACTTCGGAGACATCTGA
TTATGCTATTTACA

QA 2 495 2 495
DS 



AS 2 7

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AAACAGATTATTAAAACGAAGAGCGACAACGATCTAAAATGCAACAATATCTTCGTATTA
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CGCAAGTGCACACCTTATGCTCTCAAGGACGGTAAACAGATATGCAAACGCAACAGCAGT
CCAGAAATGCATCCCAAACTTACCCCAATAGAGTCCAAGAGGCATCCACTTGCTGACAGT
TCCCACCACCTGAAGAGCGATTTCAAGCAGCATACCCATCACCACATGGAACCTGAAGAA
GTGAGGCCATTCTTTTCTTCTCACAACCCCAAGGTAAGCTACAAAGAAGTAAGCCATGAG
GAACCAGCCCGGTAACTTCCCTAAGGCGCTTAAAAACGGGTAGGTCAAGAACTCGAAATC
TTCTAGGAAAGGGTGGAGATGGTAAGCGGTTTCTGCGTACATCCAGGTTTCGTGCAGCGG
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AGAAGACGAGGCTGAGAGATATGACAAAGGCACACCTCTTTGTACACTAGCTTGAAGCCC
ATTGAATGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DM43JQ U 5
AF RS1BE80JQ U 1
AF RS1G243JQ U 5
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RD RS1DM43JQ 452 0 0
GA
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GCCCGGTAACTTCCCTAAGGGGCTTA
AAAA

QA 3 448 3 448
DS 

RD RS1BE80JQ 711 0 0
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AAACAGATTATTAAAACGAAAAGCGACAACGATCTAAAATGCAACAATATCTTCGTATTA
GTCGTACGGAATCTGGATATACGCAGCATCACAGACAAATGGGATGTCCGCGTACATACC
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AAACCAGCCCGGTAACTTCCCTAAGGCGCTTAAAAACGGGTGGGTCAAGAACTCGAAATC
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CATCAGGTAAGGTAGGCATGCTAAAGTTCTCCACCACCATTGTGGCTTTTTGGTCATTGG
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GCGGACGGGTAACACAGGTAACGCACCAAACAGACTACCTTGTTCCCCACT

QA 1 711 1 711
DS 

RD RS1G243JQ 786 0 0
GG
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CGGAATCTGGATATACGCAGCATCACAGACAAATGGGATGTCCGCGTACATACCCGCAAG
TGCACACCTTATGCTCTCAAGGACGGTAAACAGATATGCAAACGCAACAGCAGTCCAGAA
ATGCATCCCAAACTTACCCCAATAGAGTCCAAGAGGCATCCACTTGCTGACAGTTCCCAC
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GCCCGGTAACTTCCCTAAGGCGCTTAGAAACGGGTAGGTCAAGAACTCGAAATCTTCTAG
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GGGTAACACAGGTAACGCACCAAACAGACTACCTTGTTCCCCACTCAGAAGGCGAGAAGA
CGAGGCTGAGAGATATGACAAAGGCACACCTCTTTGTACACTAGCTTGAAGCCCATTGAA
TGAT

QA 3 786 3 786
DS 



CO CL746Contig2 797 4 9 U
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CACTCCACTCCAGCGAAGGTAGTTTAGGTTGGTAATGATGATGAGTGGATGCGGCACGTT
AACTTCGCATGTTCTGACAAGCTCTTGGGGGTTCAAGCCATCTTCATACAAAGCTACAGC
ATCAGGACAGACTCAACGATGTCCTGCAACAAGTTCATTGTCCGCCATAAAGAACTCTTT
GGGCTCACCTTTATCATTCAATGGGCTTCAAGCTAGTGTACAAAGAGGTGTGCCTTTGTC
ATATCTCTCAGCCTCGTCTTCTCGCCTTCTGAGTGGGGAACAAGGTAGTCTGTTTGGTGC
GTTACCTGTGTTACCCGTCCGCAGGAAAACCCTTTTGTCCCCAAGAGCATCAAAAGATGT
ACCTTCCAGCTTCCGGTTTCCTCCAATGACCAAAAAGCCACAATGGTGGTGGAGAACTTT
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CCATCTCCACCCTTTCCTAGAAGATTTCGAGTTCTTGACCTACCCGTTTCTAAGCGCCTT
AGGGAAGTTACCGGG*CTGGTTCCTCATGGCTTACTTCTTTGTAGCTTACCTTGGGGTTG
TGAGAAGAAAAGAT*GGCCTCACTTCTTCAGTTCCATGTGGTGATGGGTATGCTGCTTGA
A*TCGCTCTTCAGTGGTGGGA*CTGTCAGCAAGTGGATGCCTCTTGGACTCTATTGGGGT
AAGTTTGGGATGCATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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DS 



AS 1 7

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BQ
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GG
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TATGCCCTGATCTGCATATAGTTCGTGGGGAGTTTGATGAAGATGCACGATACCCTGAGA
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CATGGGGTGATCTAGAATCACTTGCCATGCTTCAGAGACAACTCGACGTGGACATACTTG
TAACGGGCCACACCCACCAGTTCACTGCCTACAAACACGAGGGAGGAGTCGTGATTAACC
CTGGCTCTGCTACTGGAGCTTATAGTAGCATAAACCAAGATGTTAACCCCAGCTTTGTTC
TTATGGATATCGATGGTCTTCGAGTTGTGGTC

QA 3 694 3 694
DS 

RD RS1ER10TF 755 0 0
GGAA
ACAGAAGAGGAGCGAGCGATCGATCATACAGAAGGAGAAAGGATCTTCCTTGTGCGATCT
CTGATTCCGGCGAACCAAATCTCGTAAGTTTCAATCGCCCCCTGCTCTAGGAAGGAAGCT
CGATCTTCTTCGATTCGCGCTAAGGGAAATCTTCACCTCTGACCTACCTCTCTCTCCAGA
TAGATTAATCGGGAAAGTTGGAAATGGTGCTGGTTCTGGCATTAGGGGATCTCCATGTAC
CCCATAGAGCGGCTGATCTGCCTCCAAAGTTCAAATCGATGCTTGTTCCTGGCAAGATTC
AACACATCATCTGCACTGGCAATCTCTGCATCAAAGAAATCCATGACTACTTGAAGACTA
TATGCCCTGATCTGCATATAGTTCGTGGGGAGTTTGATGAAGATGCACGATACCCTGAGA
CCAAAACCTTGACTATTGGCCAGTTCAAGCTTGGACTCTGCCACGGCCACCAGGTGATCC
CATGGGGTGATCTAGAATCACTTGCCATGCTTCAGAGACAACTCGACGTGGACATACTTG
TAACGGGCCACACCCACCAGTTCACTGCCTACAAACACGAGGGAGGAGTCGTGATTAACC
CTGGCTCTGCTACTGGAGCTTATAGTAGCATAAACCAAGATGTTAACCCCAGCTTTGTTC
TTATGGATATCGATGGTCTTCGAGTTGTGGTCTATGTCTACGAGCTCATCGACG*AGAGG
TTAAAGTCGACA*GATCGATTTCA
GAGACCT

QA 5 748 5 748
DS 

RD RS1A245TV 871 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAAAACAGAA
GAGGAGCGAGCGATCGATCATACAGAAGGAGAAAGGATCTTCCTTGTGCGATCTCTGATT
CCGGCGAACCAAATCTCGTAAGTTTCAATCGCCCCCTGCTCTAGGAAGGAAGCTCGATCT
TCTTCGATTCGCGCTAAGGGAAATCTTCACCTCTGACCTACCTCTCTCTCCAGATAGATT
AATCGGGAAAGTTGGAAATGGTGCTGGTTCTGGCATTAGGGGATCTCCATGTACCCCATA
GAGCGGCTGATCTGCCTCCAAAGTTCAAATCGATGCTTGTTCCTGGCAAGATTCAACACA
TCATCTGCACTGGCAATCTCTGCATCAAAGAAATCCATGACTACTTGAAGACTATATACC
CTGATCTGCATATAGTTCGTGGGGAGTTTGATGAAGATGCACGATACCCTGAGACCAAAA
CCTTGACTATTGGCCAGTTCAAGCTTGGACTCTGCCACGGCCACCAGGTGATCCCATGGG
GTGATCTAGAATCACTTGCCATGCTTCAGAGACAACTCGACGTGGACATACTTGTAACGG
GCCACACCCACCAGTTCACTGCCTACAAACACGAGGGAGGAGTCGTGATTAACCCTGGCT
CTGCTGCTGGAGCTTATAGTAGCATAAACCAAGATGTTAACCCCAGCTTTGTTCTTATGG
ATATCGATGGTCTTCGAGTTGTGGTCTATGTCTACGAGCTCATCGACGGAGAGGTTAAAG
TCGACAAGATCGATTTCAAGAAGACCTCCACTTCCAACTCTGCTCCTTAGCGTATTATAA
AGATGAACCCTGTTTTCTTTTGTTTTTTCGT

QA 1 871 1 871
DS 

RD RS1A245TF 712 0 0
CTAGGAAGGAAGCTCGATCTTCTTCGATTCGCGCTAAGGGAAATCTTCACCTCTGACCTA
CCTCTCTCTCCAGATAGATTAATCGGGAAAGTTGGAAATGGTGCTGGTTCTGGCATTAGG
GGATCTCCATGTACCCCATAGAGCGGCTGATCTGCCTCCAAAGTTCAAATCGATGCTTGT
TCCTGGCAAGATTCAACACATCATCTGCACTGGCAATCTCTGCATCAAAGAAATCCATGA
CTACTTGAAGACTATATACCCTGATCTGCATATAGTTCGTGGGGAGTTTGATGAAGATGC
ACGATACCCTGAGACCAAAACCTTGACTATTGGCCAGTTCAAGCTTGGACTCTGCCACGG
CCACCAGGTGATCCCATGGGGTGATCTAGAATCACTTGCCATGCTTCAGAGACAACTCGA
CGTGGACATACTTGTAACGGGCCACACCCACCAGTTCACTGCCTACAAACACGAGGGAGG
AGTCGTGATTAACCCTGGCTCTGCTGCTGGAGCTTATAGTAGCATAAACCAAGATGTTAA
CCCCAGCTTTGTTCTTATGGATATCGATGGTCTTCGAGTTGTGGTCTATGTCTACGAGCT
CATCGACGGAGAGGTTAAAGTCGACAAGATCGATTTCAAGAAGACCTCCACTTCCAACTC
TGCTCCTTAGCGTATTATAAAGATGAACCCTGTTTTCTTTTGTTTTTTCGTT

QA 1 712 1 712
DS 

RD RS1A245TR 879 0 0
GGAAA
ACAGAAGAGGAGCGAGCGATCGATCATACAGAAGGAGAAAGGATCTTCCTTGTGCGATCT
CTGATTCCGGCGAACCAAATCTCGTAAGTTTCAATCGCCCCCTGCTCTAGGAAGGAAGCT
CGATCTTCTTCGATTCGCGCTAAGGGAAATCTTCACCTCTGACCTACCTCTCTCTCCAGA
TAGATTAATCGGGAAAGTTGGAAATGGTGCTGGTTCTGGCATTAGGGGATCTCCATGTAC
CCCATAGAGCGGCTGATCTGCCTCCAAAGTTCAAATCGATGCTTGTTCCTGGCAAGATTC
AACACATCATCTGCACTGGCAATCTTTGCATCAAAGAAATCCATGACTACTTGAAGACTA
TATACCCTGATCTGCATATAGTTCGTGGGGAGTTTGATGAAGATGCACGATACCCTGAGA
CCAAAACCTTGACTATTGGCCAGTTCAAGCTTGGACTCTGCCACGGCCACCAGGTGATCC
CATGGGGTGATCTAGAATCACTTGCCATGCTTCAGAGACAACTCGACGTGGACATACTTG
TAACGGGCCACACCCACCAGTTCACTGCCTACAAACACGAGGGAGGAGTCGTGATTAACC
CTGGCTCTGCTGCTGGAGCTTATAGTAGCATAAACCAAGATGTTAACCCCAGCTTTGTTC
TTATGGATATCGATGGTCTTCGAGTTGTGGTCTATGTCTACGAGCTCATCGACGGAGAGG
TTAAAGTCGACAAGATCGATTTCAAGAAGACCTCCACTTCCAACTCTGCTCCTTAGCGTA
TTATAAAGATGAACCCTGTTTTCTTTTGTTTTTTCGTTTGGAATCACTCGTGAAGTTTGC
AACTTTCTTTAGCTTGCCTGTGAAAATAATTTTT

QA 6 879 6 879
DS 

RD RS1A245JQ 773 0 0
TCTAGGAAGGAAGCTCGATCTTCTTCGATTCGCGCTAAGGGAAATCTTCACCTCTGACCT
ACCTCTCTCTCCAGATAGATTAATCGGGAAAGTTGGAAATGGTGCTGGTTCTGGCATTAG
GGGATCTCCATGTACCCCATAGAGCGGCTGATCTGCCTCCAAAGTTCAAATCGATGCTTG
TTCCTGGCAAGATTCAACACATCATCTGCACTGGCAATCTCTGCATCAAAGAAATCCATG
ACTACTTGAAGACTATATACCCTGATCTGCATATAGTTCGTGGGGAGTTTGATGAAGATG
CACGATACCCTGAGACCAAAACCTTGACTATTGGCCAGTTCAAGCTTGGACTCTGCCACG
GCCACCAGGTGATCCCATGGGGTGATCTAGAATCACTTGCCATGCTTCAGAGACAACTCG
ACGTGGACATACTTGTAACGGGCCACACCCACCAGTTCACTGCCTACAAACACGAGGGAG
GAGTCGTGATTAACCCTGGCTCTGCTGCTGGAGCTTATAGTAGCATAAACCAAGATGTTA
ACCCCAGCTTTGTTCTTATGGATATCGATGGTCTTCGAGTTGTGGTCTATGTCTACGAGC
TCATCGACGGAGAGGTTAAAGTCGACAAGATCGATTTCAAGAAGACCTCCACTTCCAACT
CTGCTCCTTAGCGTATTATAAAGATGAACCCTGTTTTCTTTTGTTTTTTCGTTTGGAATC
ACTCGTGAAGTTTGCAACTTTCTTTAGCTTGCCTGTGAAAATAATTTTT
AAAG

QA 1 769 1 769
DS 

RD RS1ER10JQ 752 0 0
CGGGAAAGTTGGAAATGGTGCTGGTTCTGGCATTAGGGGATCTCCATGTACCCCATAGAG
CGGCTGATCTGCCTCCAAAGTTCAAATCGATGCTTGTTCCTGGCAAGATTCAACACATCA
TCTGCACTGGCAATCTCTGCATCAAAGAAATCCATGACTACTTGAAGACTATATGCCCTG
ATCTGCATATAGTTCGTGGGGAGTTTGATGAAGATGCACGATACCCTGAGACCAAAACCT
TGACTATTGGCCAGTTCAAGCTTGGACTCTGCCACGGCCACCAGGTGATCCCATGGGGTG
ATCTAGAATCACTTGCCATGCTTCAGAGACAACTCGACGTGGACATACTTGTAACGGGCC
ACACCCACCAGTTCACTGCCTACAAACACGAGGGAGGAGTCGTGATTAACCCTGGCTCTG
CTACTGGAGCTTATAGTAGCATAAACCAAGATGTTAACCCCAGCTTTGTTCTTATGGATA
TCGATGGTCTTCGAGTTGTGGTCTATGTCTACGAGCTCATCGACGGAGAGGTTAAAGTCG
ACAAGATCGATTTCAAGAAGACCTCCACTTCCAACTTTGCTCCTTAGCGTATTATAAAGA
TGAACCCTGTTTTTTTTTGTTTTTTCGTTTGGAATCACTCGTGAAGTTTGCAACTTTCTT
TAGCTTGCCTGTGAAAATAATTTTTAAAGATTTGGAAATTGGACCACTGATAACAATGTT
TTGCAAATCTCTTCGAAGTTGATCGACTTTAC

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 7

CO CL748Contig1 1065 7 24 U
GGAGTTTCTCTCTCGGTATTCCAAATTTCAAACCACCACTCAGATCTTTAGACGAAGAAC
AAAGGATTCAAAAGATGACATCATCATCACGGGAAGAGAATGTGTACATGGCGAAACTAG
CGGAGCAGGCGGAGCGTTACGAAGAAATGGTGGAGTTCATGGAGAAAGTAGCCAAATCCG
TCGACAACGAAGAACTCACCGTCGAAGAGAGGAACCTTCTCTCGGTCGCTTACAAGAACG
TGATTGGAGCCAGGAGGGCGTCGTGGAGGATCATCTCTTCCATCGAGCAGAAGGAAGAGA
GCAAAGGGAACGAGGATCACGTCGCTATCATCAAGGACTACAGGGGGAAGATCGAAGCCG
AGCTTAGCAAAATCTGCGACGGGACTTTGAATGTCCTCGAGGCTCATCTCATCCCGTCTG
CTTCGCCTCCTGAGTCTAAAGTGTTTTACCTCAAGATGAAGGGAGATTATCACAGGTACC
TTGCTGAGTTCAAGGCTGGCGACGAGAGGAAAGATGCTGCTGAAAGCACTTTGGTTGCTT
ACAAGTCTGCTCAGGACATTGCCACTGCTGAGTTGGCTCCCACTCACCCCATCAGGCTTG
GTCTTGCACTCAACTTCTCTGTCTTTTACTATGAGATCCTTAACTCCCCTGACCGTGCCT
GCAGCCTCGCCAAGCAGGCTTTTGATGAAGCAATTGCTGAGTTGGATACGTTGGGTGAGG
AATCATACAAGGACAGTACACTGATCATGCAGCTTCTCAGGGACAATCTCACTCTCTGGA
CTTCAGACATGACAGACGAAGCAGGAGATGAGATAAAGGAGACATCAAAGCCAGAAGGTG
CAGCAGAGTAAGGCTCAAGACTAGGAACTGGTTTTATGAAGGTAGAAACTTCCTAGAAGG
TTATGTGATAATTCTGAGTGATATAACTCAGAACTCGTATCAGATACCACTCTTATTGTT
TGTTTTGTTTGTTTGGATACAATTTGAAAACCACTTTGCGAATTTGCGATTGATTCCCTC
TAAATTTCCCATTTTTCAGTGAAATCAAATAATTCTTTTTATGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 10 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CL45TF U 86
AF RS1G034TF U 13
AF RS1DR16TF U 1
AF RS1EC77TF U 428
AF RS1CL45JQ C 434
AF RS1DR16JQ C 209
AF RS1G034JQ C 422
BS 1 577 RS1DR16TF
BS 578 578 RS1G034TF
BS 579 677 RS1DR16TF
BS 678 678 RS1EC77TF
BS 679 731 RS1DR16TF
BS 732 732 RS1EC77TF
BS 733 759 RS1DR16TF
BS 760 761 RS1EC77TF
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BS 766 766 RS1EC77TF
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BS 967 998 RS1EC77TF
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BS 1031 1046 RS1DR16JQ
BS 1047 1065 RS1G034JQ

RD RS1CL45TF 153 0 0
ATCACGGGAAGAGAATGTGTACATGGCGAAACTAGCGGAGCAGGCGGAGCGTTACGAAGA
AATGGTGGAGTTCATGGAGAAAGTAGCCAAATCCGTCGACAACGAAGAACTCACCGTCGA
AG*GAGGAACCTTCTCTCGGTCGCTTACAAGAA

QA 1 153 1 153
DS 

RD RS1G034TF 580 0 0
GG
GGTATTCCAAATTTCAAACCACCACTCAGATCTTTAGACGAAGAACAAAGGATTCAAAAG
ATGACATCATCATCACGGGAAGAGAATGTGTACATGGCGAAACTAGCGGAGCAGGCGGAG
CGTTACGAAGAAATGGTGGAGTTCATGGAGAAAGTAGCCAAATCCGTCGACAACGAAGAA
CTCACCGTCGAAGAGAGGAACCTTCTCTCGGTCGCTTACAAGAACGTGATTGGAGCCAGG
AGGGCGTCGTGGAGGATCATCTCTTCCATCGAGCAGAAGGAAGAGAGCAAAGGGAACGAG
GATCACGTCGCAATCATCAAGGACTACAGGGGGAAGATCGAAGTCGAGCTTAGCAAAATC
TGCGACGGGATTTTGAATGTCCTCGTGGCTCATCTCATCCCGTCTGCTTCGCCTCCTGAG
TCTAAAGTGTTTTACCTCAAGATGAAGGGAGATTATCACAGGTACCTTGCTGAGTTCAAG
GCTGGCGACGAGAGGAAAGATGCTGCTGAAAGCACTTTGGTTGCTTACAAGTCTGCTCAG
GACATTGCCACTGCTGAGTTGGCTCCCACTCACCCCAT

QA 3 580 3 580
DS 

RD RS1DR16TF 811 0 0
GGAGTTTCTCTCTCGGTATTCCAAATTTCAAACCACCACTCAGATCTTTAGACGAAGAAC
AAAGGATTCAAAAGATGACATCATCATCACGGGAAGAGAATGTGTACATGGCGAAACTAG
CGGAGCAGGCGGAGCGTTACGAAGAAATGGTGGAGTTCATGGAGAAAGTAGCCAAATCCG
TCGACAACGAAGAACTCACCGTCGAAGAGAGGAACCTTCTCTCGGTCGCTTACAAGAACG
TGATTGGAGCCAGGAGGGCGTCGTGGAGGATCATCTCTTCCATCGAGCAGAAGGAAGAGA
GCAAAGGGAACGAGGATCACGTCGCTATCATCAAGGACTACAGGGGGAAGATCGAAGCCG
AGCTTAGCAAAATCTGCGACGGGACTTTGAATGTCCTCGAGGCTCATCTCATCCCGTCTG
CTTCGCCTCCTGAGTCTAAAGTGTTTTACCTCAAGATGAAGGGAGATTATCACAGGTACC
TTGCTGAGTTCAAGGCTGGCGACGAGAGGAAAGATGCTGCTGAAAGCACTTTGGTTGCTT
ACAAGTCTGCTCAGGACATTGCCACTGCTGAGTTGGCCCCCACTCACCCCATCAGGCTTG
GTCTTGCACTCAACTTCTCTGTCTTTTACTATGAGATCCTTAACTCCCCTGACCGTGCCT
GCAGCCTCGCCAAGCAG*CTTTTGATGAAGCAATTGCTGAGTTGGATACGTTGGGTGAGG
AATCATACAAG*ACAGTACACTGATCATGCAGCTTCTCA**GACA*TCTCACTCTCTGGA
CTTCAGACATTACAGACGAAGCAG
AGATGAG

QA 1 804 1 804
DS 

RD RS1EC77TF 571 0 0
TCCTGAGTCTAAAGTGTTTTACCTCAAGATGAAGGGAGATTATCACAGGTACCTTGCTGA
GTCCAAGGCTGGCGACGAGAGGAAAGATGCTGCTGAAAGCACTTTGGTTGCTTACAAGTC
TGCTCAGGACATTGCCACTGCTGAGTTGGCTCCCACTCACCCCATCAGGCTTGGTCTTGC
ACTCAACTTCTCTGTCTTTTACTATGAGATCCTTAACTCCCCTGACCGTGCCTGCAGCCT
CGCCAAGCAGGCTTTTGATGAAGCAATTGCTGAGTTGGATACGTTGGGTGAGGAATCATA
CAAGGACAGTACACTGATCATGCAGCTTCTCAGGGACAATCTCACTCTCTGGACTTCAGA
CATGACAGACGAAGCAGGAGATGAGATAAAGGAGACATCAAAGCCAGAAGGTGCAGCAGA
GTAAGGCTCAAGACTAGGAACTGGTTCTATGAAGGTAGAAACTTCCTAGAAGGTTATGTG
ATAATTCTGAGTGATATAACTCAGAACTCGTATCAGATACCACTCTTATTGTTT*TTTCG
TTTGTTTGGATACAATTTGAAAACCACTTTG

QA 1 571 1 571
DS 

RD RS1CL45JQ 569 0 0
GTCTAAAGTGTTTTACCTCAAGATGAAGGGAGATTATCACAGGTACCTTGCTGAGTTCAA
GGCTGGCGACGAGAGGAAAGATGCTGCTGAAAGCACTTTGGTTGCTTACAAGTCTGCTCA
GGACATTGCCACTGCTGAGTTGGCTCCCACTCACCCCATCAGGCTTGGTCTTGCACTCAA
CTTCTCTGTCTTTTACTATGAGATCCTTAACTCCCCTGACCGTGCCTGCAGCCTCGCCAA
GCAGGCTTTTGATGAAGCAATTGCTGAGTTGGATACGTTGGGTGAGGAATCATACAAGGA
CAGTACACTGATCATGCAGCTTCTCAGGGACAATCTCACTCTCTGGACTTCAGACATGAC
AGACGAAGCAGGAGATGAGATAAAGGAGACATCAAAGCCAGAAGGTGCAGCAGAGTAAGG
CTCAAGACTAGGAACTGGTTTTATGAAGGTAGAAACTTCCTAGAAGGTTATGTGATAATT
CTGAGTGATATAACTCAGAACTCGTATCAGATACCACTCTTATTGTTTGTTTTGTTTGTT
TGGATACAATTTGAAAACCACTTTG
CGAA

QA 1 565 1 565
DS 

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AGAGAGAAC
TCTCTCGGTCGCT*ACAAGAACGTGAT*GGAGCCAGGAGGGCGTCGTGGAGGATCATCTC
TTCCATCGAGCAGAAGGAAGAGAGCAAAGGGAACGAGGATCACGTCGCTATCATCAAGGA
CTACAGGGGGAAGATCGAAGCCGAGCTTAGCAAAATCTGCGACGGGACTTTGAATGTCCT
CGAGGCTCATCTCATCCCGTCTGCTTCGCCTCCTGAGTCTAAAGTGTTTTACCTCAAGAT
GAAGGGAGATTATCACAGGTACCTTGCTGAGTTCAAGGCTGGCGACGAGAGGAAAGATGC
TGCTGAAAGCACTTTGGTTGCTTACAAGTCTGCTCAGGACATTGCCACTGCTGAGTTGGC
CCCCACTCACCCCATCAGGCTTGGTCTTGCACTCAACTTCTCTGTCTTTTACTATGAGAT
CCTTAACTCCCCTGACCGTGCCTGCAGCCTCGCCAAGCAGGCTTTTGATGAAGCAATTGC
TGAGTTGGATACGTTGGGTGAGGAATCATACAAGGACAGTACACTGATCATGCAGCTTCT
CAGGGACAATCTCACTCTCTGGACTTCAGACATTACAGACGAAGCAGGAGATGAGATAAA
GGAGACATCAAAGCCAGAAGGTGCAGCAGAGTAAGGCTCAAGACTAGGAACTGGTTTTAT
GAAGGTAGAAACTTCCTAGAAGGTTATGTGATAATTCTGAGTGATATAACTCAGAACTCG
TATCAGATACCACTCTTATTGTTTGTTTTGTTTGTTTGGATACAATTTGAAAACCACTTT
GCGAATTTGCGATTGATTCCCTCTAAATTTCCTATTTTTCAGTGAAATC

QA 10 838 10 838
DS 

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TGCTGAGTTCAAGGCTGGCGACGAGAGGAAAGATGCTGCTGAAAGCACTTTGGTTGCTTA
CAAGTCTGCTCAGGACATTGCCACTGCTGAGTTGGCTCCCACTCACCCCATCAGGCTTGG
TCTTGCACTCAACTTCTCTGTCTTTTACTATGAGATCCTTAACTCCCCTGACCGTGCCTG
CAGCCTCGCCAAGCAGGCTTTTGATGAAGCAATTGCTGAGTTGGATACGTTGGGTGAGGA
ATCATACAAGGACAGTACACTGATCATGCAGCTTTTCAGGGACAATCTCACTTTCTGGAC
TTCAGACATGACAGACGAAGCAGGAGATGAGATAAAGGAGACATCAAAGCCAGAAGGTGC
AGCAGAGTAAGGCTCAAGACTAGGAACTGGTTTTATGAAGGTAGAAACTTCCTAGAAGGT
TATGTGATAATTTTGAGTGATATAACTCAGAACTCGTATCAGATACCACTCTTATTGTTT
GTTTTGTTTGTTTGGATACAATTTGAAAACCACTTTGCGAATTTGCGATTGATTCCCTCT
AAATTTCCCATTTTTCAGTGAAATCAAATAATTCTTTTTATGCG

QA 1 644 1 644
DS 



AS 2 6

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TTCTCAGATTCTTATCTATTAAACACAAATAATAATACATCTTATTCCGATTAAGAGTTT
TAATTCCGATAGATCAGATTCGTTTCCTGAATCTGTTTCATAAAATTCTTTGAGAAGAAG
AAATCTCCGGTTCAAACAGGAAGAATGGGTTCTGAACAGAATGATAGCACGAGCTTCACA
CAATCATCAGAGCCGAAGCTGTGTGCAAACGGATGTGGTTTCTTCGGTTCGCCGTCAAAC
ATGGATCTGTGTTCGAAATGCTACCGAGACATATGCGCAGAGGAAGCTCAATCAGCTGTT
CTTGTTGTGGCCGAGCCATCTTCTTCTTCTGGTGCAGTTCCTGAGCAGAACGAACCATCT
AAACCACCTGCAAGGCCGAACCGGTGTCTATGTTGCAACAAGAAGGTTGGGATACTTGGT
TTCAAGTGCAAATGCGGGAGCACTTTCTGTGGCGAACACCGGTACCCTGAGAGACATGAT
TGCAACTTTGATTTCAAAGAAGCTGGGCGTGGTGTGATTGCAAAAGCCAATCCGGTTATT
AAAGCTGATAAACTTCAAAGGTTCTGAAAGGTCTATGGTGTTGGTCGCTTTTCTTTTAAC
TCGAATTGTATTTGAATGGAATTGGGTTTCTAGTGGAATGTTACCAAAGGGGGGTAAGAT
GATGAATTTGGTTTTATAATAAAAGTGGATCTATCAAGTTTGGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1A848TF U 1
AF RS1A848JQ C 37
BS 1 766 RS1A848TF

RD RS1A848TF 766 0 0
GGACGTGTTCCGTTTCATTTCTCTTATTCTCTCTTGGTAACGAAAGCCGAAAGGTTTGGT
TTCTCAGATTCTTATCTATTAAACACAAATAATAATACATCTTATTCCGATTAAGAGTTT
TAATTCCGATAGATCAGATTCGTTTCCTGAATCTGTTTCATAAAATTCTTTGAGAAGAAG
AAATCTCCGGTTCAAACAGGAAGAATGGGTTCTGAACAGAATGATAGCACGAGCTTCACA
CAATCATCAGAGCCGAAGCTGTGTGCAAACGGATGTGGTTTCTTCGGTTCGCCGTCAAAC
ATGGATCTGTGTTCGAAATGCTACCGAGACATATGCGCAGAGGAAGCTCAATCAGCTGTT
CTTGTTGTGGCCGAGCCATCTTCTTCTTCTGGTGCAGTTCCTGAGCAGAACGAACCATCT
AAACCACCTGCAAGGCCGAACCGGTGTCTATGTTGCAACAAGAAGGTTGGGATACTTGGT
TTCAAGTGCAAATGCGGGAGCACTTTCTGTGGCGAACACCGGTACCCTGAGAGACATGAT
TGCAACTTTGATTTCAAAGAAGCTGGGCGTGGTGTGATTGCAAAAGCCAATCCGGTTATT
AAAGCTGATAAACTTCAAAGGTTCTGAAAGGTCTATGGTGTTGGTCGCTTTTCTTTTAAC
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GATGAATTTGGTTTTATAATAAAAGTGGATCTATCAAGTTTGGTTC

QA 1 766 1 766
DS 

RD RS1A848JQ 730 0 0
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GGTTTCTTCGGTTCGCCGTCAAACATGGATCTGTGTTCGAAATGCTACCGAGACATATGC
GCAGAGGAAGCTCAATCAGCTGTTCTTGTTGTGGCCGAGCCATCTTCTTCTTCTGGTGCA
GTTCCTGAGCAGAACGAACCATCTAAACCACCTGCAAGGCCGAACCGGTGTCTATGTTGC
AACAAGAAGGTTGGGATACTTGGTTTCAAGTGCAAATGCGGGAGCACTTTCTGTGGCGAA
CACCGGTACCCTGAGAGACATGATTGCAACTTTGATTTCAAAGAAGCTGGGCGTGGTGTG
ATTGCAAAAGCCAATCCGGTTATTAAAGCTGATAAACTTCAAAGGTTCTGAAAGGTCTAT
GGTGTTGGTCGCTTTTCTTTTAACTCGAATTGTATTTGAATGGAATTGGGTTTCTAGTGG
AATGTTACCAAAGGGGGGTAAGATGATGAATTTGGTTTTATAATAAAAGTGGATCTATCA
AGTTTGGTTC

QA 1 730 1 730
DS 



CO CL749Contig2 890 4 6 U
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GTTTGGTTTCTCAGATTCTTATCTATTAAACACAAATAATAATACATCTTATTCCGATTA
AGAGTTTTAATTCCGATAGATCAGATTCGTTTCCTGAATCTGTTTCATAAAATTCTTTGA
GAAGAAGAAATCTCCGGTTCCAACAGGAAGAATGGGTTCTGAACAGAATGATAGCACGAG
CTTCACACAATCATCAGAGCCGAAGCTGTGTGCAAATGGATGTGGTTTCTTCGGTTCGCC
GTCAAACATGGATCTGTGTTCGAAATGCTACCGAGACATATGCGCAGAGGAAGCTCAAAC
AGCTGTTGCAAAAGCCGCTGTTGAGAAATCTTTCAAGCCTCCTCCTACCCTCTTCGTAGC
CGAGCCTGACGTGGCAGAGAAGGCAGTTACCGCTGCTGTTCTTGTGGTGGCCGAGCCATC
TTCTTCTGCTGCAGTTCCTGAACAGAACGAACCATCTAAACCACCTGCGAGGCCGAACCG
GTGTCTATGTTGCAACAAGAAGGTTGGGATACTTGGTTTTAAGTGCAGATGCGGGAGCAC
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TGGGCGTGGTGAGATTGCAAAAGCCAATCCGGTTATTAAAGCTGATAAACTTCAAAGGTT
CTGAAGATTTGTATTGTTGGAAAGGCCTCTATGGTGTTTGGTCTCTTTTCTTTGTTTAAC
TCAAATTGTACTTGAATGGAATATTGGGTTTCTAGTGGAATGTTACCAAAGGGGGTAAGA
TGATGAATTTGGTTTTATAATAAAAGTGAATCGATCAAGTTTGGTTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 25 
5 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E956JQ C 517
AF RS1EK63TF U 1
AF RS1EK63JQ C 291
AF RS1E956TF U 389
BS 1 715 RS1EK63TF
BS 716 716 RS1E956TF
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RD RS1E956JQ 203 0 0
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TTTTAAGTGCAGATGCGGGAGCACTTTTTGTGGCGAACATCGGTACCCTGAGAGACATGA
TTGCAACTTTGATTTCAAAGAAGCTGGGCGTGGTGAGATTGCAAAAGCCAATCCGGTTAT
TAAAGCTGATAAACTTCAAAGGT

QA 1 203 1 203
DS 

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GTTTGGTTTCTCAGATTCTTATCTATTAAACACAAATAATAATACATCTTATTCCGATTA
AGAGTTTTAATTCCGATAGATCAGATTCGTTTCCTGAATCTGTTTCATAAAATTCTTTGA
GAAGAAGAAATCTCCGGTTCCAACAGGAAGAATGGGTTCTGAACAGAATGATAGCACGAG
CTTCACACAATCATCAGAGCCGAAGCTGTGTGCAAATGGATGTGGTTTCTTCGGTTCGCC
GTCAAACATGGATCTGTGTTCGAAATGCTACCGAGACATATGCGCAGAGGAAGCTCAAAC
AGCTGTTGCAAAAGCCGCTGTTGAGAAATCTTTCAAGCCTCCTCCTACCCTCTTCGTAGC
CGAGCCTGACGTGGCAGAGAAGGCAGTTACCGCTGCTGTTCTTGTGGTGGCCGAGCCATC
TTCTTCTGCTGCAGTTCCTGAACAGAACGAACCATCTAAACCACCTGCGAGGCCGAACCG
GTGTCTATGTTGCAACAAGAAGGTTGGGATACTTGGTTTTAAGTGCAGATGCGGGAGCAC
TTTCTGTGGCGAACATCGGTACCCTGAGAGACATGATTGCAACTTTGATTTCAAAGAAGC
TGGGCGTGGTGAGATTGCAAAAGCCAATCCGGTTATTAAAGCTGATAAACTTCAA*GGTT
CTGAA
GATTTGTA

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1EK63JQ 555 0 0
TCGGTTCGCCGTCAAACATGGATCTGTGTTCGAAATGCTACCGAGACATATGCGCAGAGG
AAGCTCAAACAGCTGTTGCAAAAGCCGCTGTTGAGAAATCTTTCAAGCCTCCTCCTACCC
TCTTTGTAGCCGAGCCTGACGTGGCAGAGAAGGCAGTTACCGCTGCTGTTCTTGTGGTGG
CCGAGCCATCTTCTTTTGCTGCAGTTCCTGAACAGAACGAACCATTTAAACCACCTGCGA
GGCCGAACCGGTGTTTATGTTGCAACAAGAAGGTTGGGATACTTGGTTTTAAGTGCAGAT
GCGGGAGCACTTTTTGTGGCGAACATCGGTACCCTGAGAGACATGATTGCAACTTTGATT
TCAAAGAAGCTGGGCGTGGTGAGATTGCAAAAGCCAATCCGGTTATTAAAGCTGATAAAC
TTCAAAGGTTTTGAAGATTTGTATTGTTGGAAAGGCCTCTATGGTGTTTGGTCTCTTTTC
TTTGTTTAACTCAAATTGTACTTGAATGGAATATTGGGTTTCTAGTGGAATGTTACCAAA
GGGGGTAAGATGATG

QA 1 555 1 555
DS 

RD RS1E956TF 502 0 0
G
CTTTCAAGCCTCCTCCTACCCTCTTCGTAGCCGAGCCTGACGTGGCAGAGAAGGCAGTTA
CCGCTGCTGTTCTTGTGGTGGCCGAGCCATCTTCTTCTGCTGCAGTTCCTGAACAGAACG
AACCATCTAAACCACCTGCGAGGCCGAACCGGTGTCTATGTTGCAACAAGAAGGTTGGGA
TACTTGGTTTTAAGTGCAGATGCGGGAGCACTTTCTGTGGCGAACATCGGTACCCTGAGA
GACATGATTGCAACTTTGATTTCAAAGAAGCTGGGCGTGGTGAGATTGCAAAAGCCAATC
CGGTTATTAAAGCTGATAAACTTCAAAGGTTCTGAAGATTTGTATTGTTGGAAAGGCCTC
TATGGTGTTTGGTCTCTTTTCTTTGTTTAACTCAAATTGTACTTGAATGGAATATTGGGT
TTCTAGTGGAATGTTACCAAATGGGGTAAGATGATGAATTTGGTTTTATAATAAAAGTGA
ATCGATCAAGTTTGGTTTCTC

QA 2 502 2 502
DS 



AS 1 7

CO CL750Contig1 769 7 11 U
GGAACAATCTATTCTTCTCACCATATCCTCTGCTTCTCCCAAAGAAAACAAACAATATAA
AAGGAGAATATAAAAAAATGAAATTTCTGCTTTACCTAGTTACGTGCTTTCTCCTCTTAC
ACGTTTTCGCAACAGCAAAATCTCTCATTCAAGATTCTTGCAAGAAAGCTGCAGCGAAAA
ACCGAAAAGTACTCAAACTCGATTTCTGCCTCAAGTCTCTCGAAGGGTGTCGGCAGTGCC
AAACCGCAAAAAATCTCAGCGAGCTAGTCTTCGCGTCGATGAAGAACGCTAGGACGAAAA
CGAAGAGAGTGCAC**ATAGATGAAGAAGGATTTTGACGCGAAGAAGTATCCCAAGGACA
ATGACATGCTGGTAATGGAGTGTCTCAGCGATTATTCAAGCACTGTTCAGATATTGGGCT
TGGCTATGGAGACCTTTAAAGATCGTGATTACAATGACCTTATCAGTCGTATGACTCTTG
GGATGGAGAGCATGGATGCTTGCGATGAAGGATACAAAGAAAGATCAACGCCTCAGATAT
CTCCGTTTATAAAAAGCAACGAGTTTTTAACTAATTTGATTCAGATTCCTGTAGCTTTTA
CAAAGATGTTGAAAAGAGAATAATTAATTAAGGCATGGATTAAAGATTATCCTATGTGGT
ATGGTAAGTTAAGAGTAACTGGGTTGCTCAATAATGTACGTAGCCTCTAGGCCTTCTTTA
ACTGGATCTTTTATGGAAATTGAATACCAATGCTGATTATTTTGGTGTT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D060TF U 1
AF RS1CV35TF U 2
AF RS1FZ42TF U 63
AF RS1F583JQ C 63
AF RS1F583TF U 63
AF RS1FZ42JQ C 63
AF RS1D060JQ C 118
BS 1 314 RS1D060TF
BS 315 316 RS1F583TF
BS 317 317 RS1D060TF
BS 318 318 RS1F583TF
BS 319 509 RS1D060TF
BS 510 554 RS1CV35TF
BS 555 710 RS1F583TF
BS 711 711 RS1F583JQ
BS 712 721 RS1F583TF
BS 722 757 RS1F583JQ
BS 758 769 RS1D060JQ

RD RS1D060TF 509 0 0
GGAACAATCTATTCTTCTCACCATATCCTCTGCTTCTCCCAAAGAAAACAAACAATATAA
AAGGAGAATATAAAAAAATGAAATTTCTGCTTTACCTAGTTACGTGCTTTCTCCTCTTAC
ACGTTTTCGCAACAGCAAAATCTCTCATTCAAGATTCTTGCAAGAAAGCTGCAGCGAAAA
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AAACCGCAAAAAATCTCAGCGAGCTAGTCTTCGCGTCGATGAAGAACGCTAGGACGAAAA
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TGGCTATGGAGACCTTTAAAGATCGTGATTACAATGACCTTATCAGTCGTATGACTCTTG
GGATGGAGAGCATGGATGCTTGCGATGAA

QA 1 509 1 509
DS 

RD RS1CV35TF 560 0 0
T
AACAATCTATTCTTCTCACCATATCCTCTGCTTCTCCCAAAGAAAACAAACAATATAAAA
GGAGAATATAAAAAAATGAAATTTCTGCTTTACCTAGTTACGTGCTTTCTCCTCTTACAC
GTTTTCGCAACAGCAAAATCTCTCATTCAAGATTCTTGCAAGAAAGCTGCAGCGAAAAAC
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GACATGCTGGTAATGGAGTGTCTCAGCGATTATTCAAGCACTGTTCAGATATTGGGCTTG
GCTATGGAGACCTTTAAAGATCGTGATTACAATGACCTTATCAGTCGTATGACTCTTGGG
ATGGAGAGCATGGATGCTTGCGATGAAGGATACAAAGAAAGATCAACGCCTCAGATATCT
CCGTTTATAAAA
GCAACGA

QA 2 553 2 553
DS 

RD RS1FZ42TF 644 0 0
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GACATGCTGGTAATGGAGTGTCTCAGCGATTATTCAAGCACTGTTCAGATATTGGGCTTG
GCTATGGAGACCTTTAAAGATCGTGATTACAATGACCTTATCAGTCGTATGACTCTTGGG
ATGGAGAGCATGGATGCTTGCGATGAAGGATACAAAGAAAGATCAACGCCTCAGATATCT
CCGTTTATAAAAAGCAACGAGTTTTTAACTAATTTGATTCAGATTCCTGTAGCTTTTACA
AAGATGTTGAAAAGAGAATAATTAATTAAGGCATGGATTAAAGATTATCCTATGTGGTAT
GGTAAGTTAAGAGTAACTGGGTTGCTCAATAATGTACGTAGCCT

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1F583JQ 696 0 0
GGAGAATATAAAAAAATGAAATTTCTGCTTTACCTAGTTACGTGCTTTCTCCTCTTACAC
GTTTTCGCAACAGCAAAATCTCTCATTCAAGATTCTTGCAAGAAAGCTGCAGCGAAAAAC
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ACCGCAAAAAATCTCAGCGAGCTAGTCTTCGCGTCGATGAAGAACGCTAGGACGAAAACG
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GACATGCTGGTAATGGAGTGTTTCAGCGATTATTCAAGCACTGTTCAGATATTGGGCTTG
GCTATGGAGACCTTTAAAGATCGTGATTACAATGACCTTATCAGTCGTATGACTCTTGGG
ATGGAGAGCATGGATGCTTGCGATGAAGGATACAAAGAAAGATCAACGCCTCAGATATCT
CCGTTTATAAAAAGCAACGAGTTTTTAACTAATTTGATTCAGATTCCTGTAGCTTTTACA
AAGATGTTGAAAAGAGAATAATTAATTAAGGCATGGATTAAAGATTATCCTATGTGGTAT
GGTAAGTTAAGAGTAACTGGGTTGCTCAATAATGTACGTAGCCTCTAGGCCTTCTTTAAC
TGGATCTTTTATGGAAATTGAATACCAATGCTGAT
C

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1F583TF 659 0 0
GGAGAATATAAAAAAATGAAATTTCTGCTTTACCTAGTTACGTGCTTTCTCCTCTTACAC
GTTTTCGCAACAGCAAAATCTCTCATTCAAGATTCTTGCAAGAAAGCTGCAGCGAAAAAC
CGAAAAGTACTCAAACTCGATTTCTGCCTCAAGTCTCTCGAAGGGTGTCGGCAGTGCCAA
ACCGCAAAAAATCTCAGCGAGCTAGTCTTCGCGTCGATGAAGAACGCTAGGACGAAAACG
AAGAGAGTGCAC**ATAGATGAAGAAGGATTTTGACGCGAAGAAGTATCCCAAGGACAAT
GACATGCTGGTAATGGAGTGTCTCAGCGATTATTCAAGCACTGTTCAGATATTGGGCTTG
GCTATGGAGACCTTTAAAGATCGTGATTACAATGACCTTATCAGTCGTATGACTCTTGGG
ATGGAGAGCATGGATGCTTGCGATGAAGGATACAAAGAAAGATCAACGCCTCAGATATCT
CCGTTTATAAAAAGCAACGAGTTTTTAACTAATTTGATTCAGATTCCTGTAGCTTTTACA
AAGATGTTGAAAAGAGAATAATTAATTAAGGCATGGATTAAAGATTATCCTATGTGGTAT
GGTAAGTTAAGAGTAACTGGGTTGCTCAATAATGTACGTAGCCTCTAG*CCTTCTTTAA

QA 1 659 1 659
DS 

RD RS1FZ42JQ 696 0 0
GGAGAATATAAAAAAATGAAATTTCTGCTTTACCTAGTTACGTGCTTTCTCCTCTTACAC
GTTTTCGCAACAGCAAAATCTCTCATTCAAGATTCTTGCAAGAAAGCTGCAGCGAAAAAC
CGAAAAGTACTCAAACTCGATTTCTGCCTCAAGTCTCTCGAAGGGTGTCGGCAGTGCCAA
ACCGCAAAAAATCTCAGCGAGCTAGTCTTCGCGTCGATGAAGAACGCTAGGACGAAAACG
AAGAGAGTGCAC**ATAGATGAAGAAGGATTTTGACGCGAAGAAGTATCCCAAGGACAAT
GACATGCTGGTAATGGAGTGTCTCAGCGATTATTCAAGCACTGTTCAGATATTGGGCTTG
GCTATGGAGACCTTTAAAGATCGTGATTACAATGACCTTATCAGTCGTATGACTCTTGGG
ATGGAGAGCATGGATGCTTGCGATGAAGGATACAAAGAAAGATCAACGCCTCAGATATCT
CCGTTTATAAAAAGCAACGAGTTTTTAACTAATTTGATTCAGATTCCTGTAGCTTTTACA
AAGATGTTGAAAAGAGAATAATTAATTAAGGCATGGATTAAAGATTATCCTATGTGGTAT
GGTAAGTTAAGAGTAACTGGGTTGCTCAATAATGTACGTAGCCTCTAGGCCTTCTTTAAC
TGGATCTTTTATGGAAATTGAATACCAATGCTGAT
C

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1D060JQ 652 0 0
TACACGTTTTCGCAACAGCAAAATCTCTCATTCAAGATTCTTGCAAGAAAGCTGCAGCGA
AAAACCGAAAAGTACTCAAACTCGATTTCTGCCTCAAGTCTCTCGAAGGGTGTCGGCAGT
GCCAAACCGCAAAAAATCTCAGCGAGCTAGTCTTCGCGTCGATGAAGAACGCTAGGACGA
AAACGAAGAGAGTGCACGCACAGATGAAGAAGGATTTTGACGCGAAGAAGTATCCCAAGG
ACAATGACATGCTGGTAATGGAGTGTCTCAGCGATTATTCAAGCACTGTTCAGATATTGG
GCTTGGCTATGGAGACCTTTAAAGATCGTGATTACAATGACCTTATCAGTCGTATGACTC
TTGGGATGGAGAGCATGGATGCTTGCGATGAAGGATACAAAGAAAGATCAACGCCTCAGA
TATCTCCGTTTATAAAAAGCAACGAGTTTTTAACTAATTTGATTCAGATTCCTGTAGCTT
TTACAAAGATGTTGAAAGGAGAATAATTAATTAAGACATGGATTAAAGATTATCCTATGT
GGTATGGTAAGTTAAGAGTAACTGGGTTGCTCAATAATGTACGTAGCCTCTAGGCCTTCT
TTAACTGGATCTTTTATGGAAATTGAATACCAATGCTGATTATTTTGGTGTT

QA 1 652 1 652
DS 



AS 2 7

CO CL751Contig1 811 2 9 U
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ATTTATTGGGACGAAGACACTAAAAACCAAAAGAGACAGACGAGGGCTGTACAATGAAAC
AGAAGACAAAAGAGGGATACAACACTAAACACTTCATCACCAACCATTGATAGCTTTAAA
GAAACTCATAGGACAGCTTGTTTTTTCTACATCATTATTTCTTTTTGCTGTTAAAGAGTT
CTCATTCTCAATCTGCAAGAACTGTTGCTCCTTCCACCTTGAAGGTGGCTCCCCAAATTT
CTTCCTCTTTAGCAGGAATGGCAGTGATCTTATTCTTAGGGTTCTCAAAGCTCCTAAGCC
CACCTAACGCAGCTGAGTAAAAGCATCCTTGAGGGAAAGAAGCAAGAGATTTTCCACAAG
CCCCTTTTAGCAACTCAAGATCATCAGCAAATGCCACATATTCATCAGCTGTTATCCCCC
AATACAATGGAACCTTACCAACTTGGTCAGAGGCTACAAACAGAGTGGAGGTTGATTTAT
CAAAGACCACAAAGGCGAAATCGCCACTTAGGTGTGACACAACGTGGTTAGCCGGGTAAG
GAGCTCTGCCACGGAGAGTCTTGTAAGCCTCGATGACCAAGAGAACCTCGTTTGCATTTT
TTGCAAGCCCATATTGCTGCTTCAAGCTTCCTAGGTTGTCAAGGGAGCCTTGGAACAAAC
AGAATATCTCATCCTTAGCCCCAAATGACCTTGGCCGGAGAGGACTCTCTTTGTGGTGGG
TATACGCAAGCTGCACATAGTCGCCGACTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1B137JQ U 48
AF RS1H255JQB U 1
BS 1 89 RS1H255JQB
BS 90 90 RS1B137JQ
BS 91 372 RS1H255JQB
BS 373 373 RS1B137JQ
BS 374 414 RS1H255JQB
BS 415 415 RS1B137JQ
BS 416 608 RS1H255JQB
BS 609 609 RS1B137JQ
BS 610 811 RS1H255JQB

RD RS1B137JQ 672 0 0
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TGTACAATGAAACAGAAGACAAAAGAGGGATACAACACTAAACACTTCATCACCAACCAT
TGATAGCTTTAAAGAAACTCATAGGACAGCTTGTTTTTTCTACATCATTATTTCTTTTTG
CTGTTAAAGAGTTCTCATTCTCAATCTGCAAGAACTGTTGCTCCTTCCACCTTGAAGGTG
GCTCCCCAAATTTCTTCCTCTTTAGCAGGAATGGCAGTGATCTTATTCTTAGGGTTCTCA
AAGCTCCTAAGCCCACCTAACGCAGCTGAGTAAAAGCATCCTTGAGGGAAAGAAGCAAGA
GATTTTCCACAAGCCCCTTTTAGCGACTCAAGATCATCAGCAAATGCCACATATTCATCA
GCTGTTATCCCCCAATACAATGGAACCTTACCAACTTGGTCAGAGGCTACAAACAGAGTG
GAGGTTGATTTATCAAAGACCACAAAGGCGAAATCGCCACTTAGGTGTGACACAACGTGG
TTAGCCGGGTAAGGAGCTCTGCCACGGAGAGTCTTGTAAGCCTCGATGACCAAGAGAACC
TCGTTTGCATTTTTTGCAAGCCCATATTGCTGCTTCAAGCTTCCTAGGTTGTCAAGGGAG
CCTTGGAACAAA

QA 1 672 1 672
DS 

RD RS1H255JQB 811 0 0
AAACTGAGAATTGCAATATTTACGGGAGAAACAGGAGATGCAAACATCAAGAGAAGGTAG
ATTTATTGGGACGAAGACACTAAAAACCAGAAGAGACAGACGAGGGCTGTACAATGAAAC
AGAAGACAAAAGAGGGATACAACACTAAACACTTCATCACCAACCATTGATAGCTTTAAA
GAAACTCATAGGACAGCTTGTTTTTTCTACATCATTATTTCTTTTTGCTGTTAAAGAGTT
CTCATTCTCAATCTGCAAGAACTGTTGCTCCTTCCACCTTGAAGGTGGCTCCCCAAATTT
CTTCCTCTTTAGCAGGAATGGCAGTGATCTTATTCTTAGGGTTCTCAAAGCTCCTAAGCC
CACCTAACGCAGTTGAGTAAAAGCATCCTTGAGGGAAAGAAGCAAGAGATTTTCTACAAG
CCCCTTTTAGCAACTCAAGATCATCAGCAAATGCCACATATTCATCAGCTGTTATCCCCC
AATACAATGGAACCTTACCAACTTGGTCAGAGGCTACAAACAGAGTGGAGGTTGATTTAT
CAAAGACCACAAAGGCGAAATCGCCACTTAGGTGTGACACAACGTGGTTAGCCGGGTAAG
GAGCTCTGTCACGGAGAGTCTTGTAAGCCTCGATGACCAAGAGAACCTCGTTTGCATTTT
TTGCAAGCCCATATTGCTGCTTCAAGCTTCCTAGGTTGTCAAGGGAGCCTTGGAACAAAC
AGAATATCTCATCCTTAGCCCCAAATGACCTTGGCCGGAGAGGACTCTCTTTGTGGTGGG
TATACGCAAGCTGCACATAGTCGCCGACTTG

QA 1 811 1 811
DS 



CO CL751Contig2 1022 5 21 U
GGGTCCATTGTCCCATATTATCTCAAACAGAGAGAGAACTCAAAGATTCAGCAAGTAGTT
ACGTTATTATCATCGGTGGAGGTAGAAGATGTTGGGAATTTTCAGCGGAGCCATAGTATC
GCTACCGGAAGAGCTGGTTGCGGCCGGCAGTCGGACTCCTTCTCCAAAGACAACCGGGTC
GGCTCTAGTTAACAAGTTCGTCGAGAAAAACCCATCCGCTGTGTCCGTACAAGTCGGCGA
CTATGTGCAGCTTGCGTATACCCACCACAAAGAGAGTCCTCTCCGGCCAAGGTCATTTGG
GGCTAAGGATGAGATATTCTGTTTGTTCCAAGGCTCCCTTGACAACCTAGGAAGCTTGAA
GCAGCAATATGGGCTTGCTAAGAATGCAAACGAGGTTCTCTTGGTCATCGAGGCTTACAA
GACTCTCCGTGACAGAGCTCCTTACCCGGCTAACCACGTTGTGTCACACCTAAGTGGCGA
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TGGTAAGGTTCCGTTGTATTGGGGGATAACAGCTGATGGATATGTTGCATTTGCTGATGA
TCTTGAGTTGCTAAAAGGGGCTTGTGGAAAATCTCTTGCTTCTTTCCCTCAAGGATGCTT
TTATTCAACTGCGTTAGGTGGGCTTAGGAGCTTTGAGAACCCTAAGAATAAGAAATTTGG
GGAGCCACTTTCAAGGTGGAAGGAGCAACAGTTCTTGCAGATTGAGAATGAGAACTCTTT
AACAGCAAAAAGAAATAATGATGTAGAAAAAACAAGCTGTCCTATGAGTTTCTTTAAAGC
TATCAATGGTTGGTGATGAAGTGTTTAGTGTTGTATCCCTCTTTTGTCTTCTGTTTCATT
GTACAGCCCTTATCTGTCTCTTCTGGGTGTTTTTAGCGTCTTCGTCCCAATAAATCTACC
TTCTCTTGATGTTTGCACCTCCTGTTTCTCCCGTAAATATTGCAATTCTCAGATTGTCTA
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1B137TF U 5
AF RS1H255TF U 1
AF RS1BR16TF U 5
AF RS1BP03TF U 5
AF RS1BP03JQ C 355
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BS 380 381 RS1H255TF
BS 382 382 RS1BP03TF
BS 383 484 RS1H255TF
BS 485 485 RS1BP03TF
BS 486 546 RS1H255TF
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BS 586 586 RS1BP03TF
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BS 614 616 RS1BP03TF
BS 617 617 RS1BP03JQ
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BS 655 675 RS1BP03TF
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GG
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TTATCATCGGTGGAGGTAGAAGATGTTGGGAATTTTCAGCGGAGCCATAGTATCGCTACC
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GGATGAGATATTCTGTTTGTTCCAAGGCTCCCTTGACAACCTAGGAAGCTTGAAGCAGCA
ATATGGGCTTGCAAAAAATGCAAACGAGGTTCTCTTGGTCATCGAGGCTTACAAGACTCT
CCGTGGCAGAGCTCCTTACCCGGCTAACCACGTTGTGTCACACCTAAGTGGCGATTTCGC
CTTTGTGGTCTTTGATAAATCAACCTCCACTCTGTTTGTAGCCTCTGACCAAGTTGGTAA
GGTTCCATTGTATTGGGGGATAACAGCTGATGAATATGTGGCATTTGCT

QA 3 591 3 591
DS 

RD RS1H255TF 613 0 0
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ACGTTATTATCATCGGTGGAGGTAGAAGATGTTGGGAATTTTCAGCGGAGCCATAGTATC
GCTACCGGAAGAGCTGGTTGCGGCCGGCAGTCGGACTCCTTCTCCAAAGACAACCGGGTC
GGCTCTAGTTAACAAGTTCGTCGAGAAAAACCCATCCGCTGTGTCCGTACAAGTCGGCGA
CTATGTGCAGCTTGCGTATACCCACCACAAAGAGAGTCCTCTCCGGCCAAGGTCATTTGG
GGCTAAGGATGAGATATTCTGTTTGTTCCAAGGCTCCCTTGACAACCTAGGAAGCTTGAA
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TTTCGCCTTTGTGGTCTTTGATAAATCAACCTCCACTCTGTTTGTAGCCTCTGACCAAGT
TGGTAAAGTTCCATTGTATTGGGGGATAACAGCTGATGAATATGTGGCATTTGCTGATGA
TCTTGAGTTGCTA

QA 1 613 1 613
DS 

RD RS1BR16TF 609 0 0
GG
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TTATCATCGGTGGAGGTAGAAGATGTTGGGAATTTTCAGCGGAGCCATAGTATCGCTACC
GGAAGAGCTGGTTGCGGCCGGCAGTCGGACTCCTTCTCCAAAGACAACCGGGTCGGCTCT
AGTTAACAAGTTCGTCGAGAAAAACCCATCCGCTGTGTCCGTACAAGTCGGCGACTATGT
GCAGCTTGCGTATACCCACCACAAAGAGAGTCCTCTCCGGCCAAGGTCATTTGGGGCTAA
GGATGAGATATTCTGTTTGTTCCAAGGCTCGCTTGACAACCTAGGAAGCTTGAAGCAGCA
ATGTGGGCTTGCTAAGAATGCAAACGAGGTTCTCTTGGTCATCGAGGCTTACAAGACTCT
CCGTGACAGAGCTCCTTACCCGGCTAACCACGTTGTGTCACACCTAAGTGGCGATTTCTC
CTTTGTGGTCTTTGATAAATCAACCTCCACTCTGTTTGTAGCCTCTGACCAAGTTGGTAA
CGTTCCGTTGTATTGGGGGATAACAGCTGATGGATATGTTGCATTTGCTGATGATCTTGA
GTTGCTA

QA 3 609 3 609
DS 

RD RS1BP03TF 671 0 0
GG
ATTGTCCCATATTATCTCAAACAGAGAGAGAACTCAAAGATTCAGCAAGTAGTTACGTTA
TTATCATCGGTGGAGGTAGAAGATGTTGGGAATTTTCAGCGGAGCCATAGTATCGCTACC
GGAAGAGCTGGTTGCGGCCGGCAGTCGGACTCCTTCTCCAAAGACAACCGGGTCGGCTCT
AGTTAACAAGTTCGTCGAGAAAAACCCATCCGCTGTGTCCGTACAAGTCGGCGACTATGT
GCAGCTTGCGTATACCCACCACAAAGAGAGTCCTCTCCGGCCAAGGTCATTTGGGGCTAA
GGATGAGATATTCTGTTTGTTCCAAGGCTCGCTTGACAACCTAGGAAGCTTGAAGCAGCA
ATATGGGCTTGCTAAGAATGCAAACGAGGTTCTCTTGGTCATCGAGGCTTACAAGACTCT
CCGTGACAGAGCTCCTTACCCGGCTAACCACGTTGTGTCACACCTAAGTGGCGATTTCTC
CTTTGTGGTCTTTGATAAATCAACCTCCACTCTGTTTGTAGCCTCTGACCAAGTTGGTAA
GGTTCCGTTGTATTGGGGGATAACAGCTGATGGATATGTTGCATTTGCTGATGATCTTGA
GTTGCTAAAATGGGCTTGTGGAAAATCTCTTGCTTCTTTCCCTCAAG*ATGCTTTTATTC
AACTGCGTT

QA 3 671 3 671
DS 

RD RS1BP03JQ 668 0 0
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TTACAAGACTCTCCGTGACAGAGCTCCTTACCCGGCTAACCACGTTGTGTCACACCTAAG
TGGCGATTTCTCCTTTGTGGTCTTTGATAAATCAACCTCCACTCTGTTTGTAGCCTCTGA
CCAAGTTGGTAAGGTTCCGTTGTATTGGGGGATAACAGCTGATGGATATGTTGCATTTGC
TGATGATCTTGAGTTGCTAAAAGGGGCTTGTGGAAAATCTCTTGCTTCTTTCCCTCAAGG
ATGCTTTTATTCAACTGCGTTAGGTGGGCTTAGGAGCTTTGAGAACCCTAAGAATAAGAA
ATTTGGGGAGCCACTTTCAAGGTGGAAGGAGCAACAGTTCTTGCAGATTGAGAATGAGAA
CTCTTTAACAGCAAAAAGAAATAATGATGTAGAAAAAACAAGCTGTCCTATGAGTTTCTT
TAAAGCTATCAATGGTTGGTGATGAAGTGTTTAGTGTTGTATCCCTCTTTTGTCTTCTGT
TTCATTGTACAGCCCTTATCTGTCTCTTCTGGGTGTTTTTAGCGTCTTCGTCCCAATAAA
TCTACCTTCTCTTGATGTTTGCACCTCCTGTTTCTCCCGTAAATATTGCAATTCTCAGAT
TGTCTACC

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 6

CO CL752Contig1 648 6 10 U
GACAAAACCAAAAAAAAAACAATCTCGTGGGATCAAGGCTTGTGAGTTTGGAAAAGCTAA
AAGACAATGGCAAGCTTCACTTCCTCCGTCACTTGTCCTAATCTTCTTATGAAGCCTTCA
GTCACAGCTATCTCCACTGAGATTGTGTATGGTCTTCCAAGGATGATCAAGAGAAGCAGT
GGAGTGAAATGCTCGATGGAGACAAAGCAGCCCAAGCAAGAAAAGAGCTCAACGGCAGGT
TCGTCCGTGTTGGCGCTTATGTTAACAGCTGTGGTGAGTAGTAGCCCAGCAATGGCATTG
GTGGACGAGAGGATGTCCACGGAAGGAACAGGACTGCCTTTTGGTCTGAGCAATAACCTG
TTGGGTTGGATTTTGTTGGGCGTGTTTGGTTTGATATGGGCTGTTTACTTTAACTACACG
TCTTCCCTCGATGAGGATGATGATTCTGGGCTTTCCCTCTGAAAGTTCCCACTCTCTGTT
TCTCTCTCATTTTTCAGTGAACATGAAAGTGAAAATGCTCTGTACCTTCTTGTAAAGT**
*AAGTGAAAAAAAAGAGAGAGACCAGACCTTGTGTAAAATGCAGTAAAATGTGTATTGTT
TGTGGGTTCAATAAATTTATTGGGCCAATACAAAAGCCCATTAATGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 

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AF RS1CW81TF U 29
AF RS1DI46TF U 1
AF RS1D077JQ C 29
AF RS1D077TF U 29
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TCCCACTTTCTGTT

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DS 

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GACCAGAGTCACAGACC

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DS 

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*AAGTGAAAAAAAAGAGAGAGACCAGACCTTGTGTAAAATGCAGTAAAATGTGTATTGTT
TGTGGGTTCAATAAATTTATTGGGCCAATACAAAAGCCCA

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DS 

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TACAAAAGCCCATTAATGCG

QA 1 620 1 620
DS 



AS 2 7

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AGTCTCATCTCTTCTTTGATCCCTCTTCATCTTGGTTTATGAGCTCGAAGGAGAAACCCA
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TCTATATACAGAAGATTCTGCGGAGGAGGCCGTCGCTCATAAAGAACCTTGAAAATGTTA
CAAGGAGATTCCTGCAGTCTCTGGAGCTTTTTGAGGAAAATGAAAGGAAGAAGCTTGCCA
TCTTCACAGCACTTGCCTTTTCCCAGAAGCTCTCTGGATTACCTCCGGAGACTGTCTTCC
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TCTTCAAG*AGTATTTGGTTGAGAACAGTCTTGAAGACTTGATTTCTATTCTGAGGCGTG
GCAAAATGGAGGACAACCTTTTGGATTTCTTACCACCTGTAAGGCGGACTGCTGAAAGTT
TCTCAGAGCATTTCACGAAAGAGGGGTTGACTGATCTAGTAGAGTACCATTCAAAGAAAA
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TA


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 

AF RS1D623TF U 1
AF RS1H476TF U 86
AF RS1F801TF U 348
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AGTCTCATCTCTTCTTTGATCCCTCTTCATCTTGGTTTATGAGCTCGAAGGAGAAACCCA
CTCTCGGAGGTACGCGGATTAAGACCCGCAAGCGGAATATTGCTGCTCCTCTGGACCCTG
CTGCTTTTTCTGATGCAGTAGTCCAGATTTACCTTGATAATGCTGGTGATTTGGAACTTG
TTGCCAAAAGTATTGAGTCAACAGATCTTAATTTCTCAAGATACGGTGACATCTTCTTTG
AGGTTGTTTTCATTGGACGACGTACACAACCTGGAACAGTGAAGCCTGATGAGGGTGAAC
GTCATCCTTACTCTGTAATCGACTGCGAGCCCACGCGTGAAGCCATTTTGCCATCTGTTG
TCTATATACAGAAGATTCTGCGGAGGAGGCCGTCGCTCATAAAGAACCTTGAAAATGTTA
CAAGGAGATTCCTGCAGTCTCTGGGGCTTTTTGAGGAAAATGAAAGGAAGAAGCTTGCCA
TCTTCACAGCACTTGCCTTTTCCCAGAAGCTCTCTGGATTACCTCCGGAGACTGTCTTCC
AGCCTCTGCTCAAGGATAATCTTGTTGCCAAAGGGATAGTGCTCACTTTTGTAACAGACT
TCTTCAAG*AGTATTTGGTTGAGAACAGTCTTGAAGACTTGATTTCTATTCT

QA 1 712 1 712
DS 

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CCGCAAGCGGAATATTGCTGCTCCTCTGGACCCTGCTGCTTTTTCTGATGCAGTAGTCCA
GATTTACCTTGATAATGCTGGTGATTTGGAACTTGTTGCCAAAAGTATTGAGTCAACAGA
TCTTAATTTCTCAAGATACGGTGACATCTTCTTTGAGGTTGTTTTCATTGGACGACGTAC
ACAACCTGGAACAGTGAAGCCTGATGAGGGTGAACGTCATCCTTACTCTGTAATCGACTG
CGAGCCCACGCGTGAAGCTATTTTGCCATCTGTTGTCTATATACAGAAGATTCTGCGGAG
GAGGCCGTCGCTCATAAAGAACCTTGAAAATGTTACAAGGAGATTCCTGCAGTCTCTGGA
GCTTTTTGAGGAAAATGAAAGGAAGAAGCTTGCCATCTTCACAGCACTTGCCTTTTCCCA
GAAGCTCTCTGGATTACCTCCGGAGACTGTCTTCCAGCCTCTGCTCAAGGATAATCTTGT
TGCCAAAGGGATAGTGCTCACTTTTGTAACAGACTTCTTCAAG*AGTATTTGGTTGAGA*
CAGTCTTGAAGACTTGATTTCTATTCTGAG
CGTGG

QA 1 630 1 630
DS 

RD RS1F801TF 795 0 0
GATGAGGGTTAACGTCATCCTTACTCTGCAATCGACTGCGAGCCCACGCGTGAAGCCATT
TTGCCATCTGTTGTCTATATACAGAAGATTCTGCGGAGGAGGCCGCCGCTCATAAAGAAC
CTTGAAAATGTTACAAGGAGATTCCTGCAGTCTCTGGAGCTTTTTGAGGAAAATGAAAGG
AAGAAGCTTGCCATCTTCACAGCACTTGCCTTTTCCCAGAAGCTCTCTGGATTACCTCCG
GAGACTGTCTTCCAGCCTCTGCTCAAGGATAATCTTGTTGCCAAAGGGATAGTGCTCACT
TTTGTAACAGACTTCTTCAAGGAGTATTTGGTTGAGAACAGTCTTGAAGACTTGATTTCT
ATTCTGAGGCGTGGCAAAATGGAGGACAACCTTTTGGATTTCTTACCACCTGTAAGGCGG
ACTGCTGAAAGTTTCTCAGAGCATTTCACGAAAGAGGGGTTGACTGATCTAGTAGAGTAC
CATTCAAAGAAAATGTTTGAGGTGAAGCTGAAGGAAATCAAAACCGTTCTTACAAGCAAG
GTCACTGAGGAAAGTAGTGTAGATGAAGTCATTGAAACGGTGAAGCAGCTTGTCAGAGAT
GCTAAGCTCCCAGAGATCGAGGTTGTGCGTGTTGTTTGGGATGGTTTAATGGATGCTGTT
CAGTGGTCTGGTAAAACCAGCAGCAAATGCTAATTCTGTTCTGCGCAGGTGAAAGCATGG
GCTCCACTTCTGACACAGTCTGCAGCAGTGGAAAGCTAGAGCTGGAGCTGATGTACAAGT
CCAAATGCAATGCTA

QA 1 795 1 795
DS 



CO CL753Contig2 799 4 13 U
AAGAATTCAGAACCCCATATTGAAAACAGAGTAAAATATTCAACACTAAAAGGAAATACA
ATCATCACATACCAGAATTATTGTCAAAATACATTAAGAAAAAGAGAGAGCAGCAAAAGC
AAGCAAAAGAGTTTAGAATATAAACTCCGTTGGTTCATTGTCTTTAGCTGAAGAAACACA
AACACTGAGCAGGCTTTTATTGGAAACAGGGTTCACTCACGGTTCACTCACTCTTCTTCC
TCTGCCTCTTCAAGCCAATTCACAAATGGCTCAAGGCTCTTGACAAAGGTTTGCCTGCCC
TTCGGGTTAGTTCCTTTACGGAACCAGTGGAGGATGGTATCCTCAGCGAGGACATCCAGA
TCATAAAGCGACCTCACTACTTCTGGAAATACTTTCATAAGCTTGGCGTCCTCATAGCAT
TGCATTTGGACCTTGTACATCAGCTCCAGCCCTAGCTTTCCACTACTGCAAACTGTGTTC
AAAAGTGGAGCCCATGCTTTCACCTGGCGCAAAACAAAATTAGCATTTTGCTGCTGGTTT
TTACCAGACCACTGAACAGCATCCATTAAACCATCCCAAACAACACGCACAACCTCGATC
TCTGGGAGCTTAGCATCTCTGACAAGCTGCTTCACCGTTTCAATGACTTCATCTACACTA
CTTTCCTCAGTGACCTTGCTTGCAAGAACGGTTTTGATTTCCTTCAGCTTCACCTCAAAC
ATTTTCTTTGAATGGTACTCTACTAGATCAGTCAACCCCTCTTTCGTGAATGCTCTGAGA
ACTTTCAGCAGTCCGCCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BR71JQ U 106
AF RS1BR71TF C 8
AF RS1F801JQ U 25
AF RS1H476JQB U 1
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BS 518 799 RS1H476JQB

RD RS1BR71JQ 204 0 0
A
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AGGTTTGCCTGCCCTTCGGGTT
C

QA 2 203 2 203
DS 

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AGCAGGCTTTTATTGGAAACAGGGTTCACTCACGGTTCACTCACTCTTCTTCCTCTGCCT
CTTCAAGCCAATTCACAAATGGCTCAAGGCTCTTGACAAAGGTTTGCCTGCCCTTCGGGT
T
C

QA 1 301 1 301
DS 

RD RS1F801JQ 679 0 0
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CAAAATACATTAAAAAAAAGAGAGAGCAGCAAAAGCAAGCAAAAGAGTTTAAAATATAAA
CTCCGTTGGTTTATTGTCTTTAGCTGAAAAAACACAAACACTGAGCAGGCTTTTATTGGA
AACAGGGTTCACTCACGGTTCACTCACTCTTCTTCCTCTGCCTATTCAAGCCAATTCACA
AATGGCTCAAGGCTCTTGACAAAGGTTTGCCTGCCCTTCGGGTTAGTTCCTTTACGGAAC
CAGTGGAGGATGGTATCCTCAGCGAGGACATCCAGATCATAAAGCGACCTCACTACTTCT
GGAAATACTTTCATAAGCTTGGCGTCCTCATAGCATTGCATTTGGACCTTGTACATCAGC
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ATTAAACCATCCCAAACAACACGCACAACCTCGATCTCTGGGAGCTTAGCATCTCTGACA
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AGAACGGTTTTGATTTCCT

QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1H476JQB 799 0 0
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ATCATCACATACCAGAATTATTGTCAAAATACATTAAGAAAAAGAGAGAGCAGCAAAAGC
AAGCAAAAGAGTTTAGAATATAAACTCCGTTGGTTTATTGTCTTTAGCTGAAGAAACACA
AACACTGAGCAGGCTTTTATTGGAAACAGGGTTCACTCACGGTTCACTCACTCTTCTTCC
TCTGCCTCTTCAAGCCAATTCACAAATGGCTCAAGGCTCTTGACAAAGGTTTGCCTGCCC
TTCGGGTTAGTTCCTTTACGGAACCAGTGGAGGATGGTATCCTCAGCGAGGACATCCAGA
TCATAGGGCGACCTCACTACTTCTGGAAATACTTTCATAAGCTTGGCGTCCTCATAGCAT
TGCATTTGGACCTTGTACATCAGCTCCAGCCCTAGCTTTCCACTACTGCAGACTGTGTTC
AGAAGTGGAGCCCATGCTTTCACCTGGCGCAGAACAGAATTAGCATTTTGCTGCTGGTTT
TTACCAGACCACTGAACAGCATCCATTAAACCATCCCAAACAACACGCACAACCTCGATC
TCTGGGAGCTTAGCATCTCTGACAAGCTGCTTCACCGTTTCAATGACTTCATCTACACTA
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QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 7

CO CL754Contig1 1065 7 6 U
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ATAAAGATAAGGGTATTTTAACAAAACGCTACCGAGAAATACAATCGTATCTTATTTAGA
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AATGGAAACACACATTCATGGTTTGGCTAGTAGAGAAATCTCAATCTCTTGAAGTGTTTT
CCCTTTAGTCTCGATCACGTTCCTCTTCACGAACATCACTGCCATTAAACAGAACGTTGA
GAACATCGAGTATAGTAGCCGAGGACCAAGCTGCTCAAGCAATTTCAGGAATAGTAACCC
CACGAAGAAATTTATGACCCAATGCACAGACAAGCAGAGAGCCAAAGCTTTTGCTCTGAT
TCGACTTGGGAAGATTTCAGGCAGGAGTAAACCTGGTACTGGACCAGCTCCTAGGGCGAA
TGTTAGCACAAACACAAGAGTTCCACCGACTGATAAACACAAAGCCGGAAAATGTGGCAA
GTATGAACTTGTCGCACCAACTTGAAGTGCCATTGCTACTGCCATGCCAATGAAACTCCA
AAGGAGAAGAAGCTTTCTTCCTAGTTTATCCATCAACACCATTGCGATTAGAGACCCCAA
GAGGTTTGAAATTCCGACAAATATGTTGGCCATGTCTGATGGAACTCCGGCACTTTTGAA
AACGGTAGAAGAGAAATAAAAAACAGCATTTATACCAGATAGCTGTTGCAAAGCAAACAG
GGTTGATCCAATAAAAACAACTCTTGAATGCCGACCATATAAGAGCTCGGTGAGAGTCAC
AACATCTGGCTCATCCGTTTTGTCTAACTCTAGTTTGTGTAATTCTGCCATAGCTGTTTT
CACATGAGATCCTCCAAGCAGCCTCTCAAACTCAGCTTCCGCTTCAGCTATCTTCCCTTG
CTTAAATAGCCACTGGGGAGACTCGGCACAGAAGAACATCCCTAGTGCGAGTGCTGCAGC
AGGAATGGTTGATAACCAGAAACAGACACGCCACCAACCAGTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C811JQ U 46
AF RS1C811TF C 46
AF RS1BG50JQ U 13
AF RS1CV14JQ U 16
AF RS1GY48JQ U 98
AF RS1GM05JQ U 1
AF RS1GY48TF C 475
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RD RS1C811JQ 638 0 0
G
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GGAATAGGTAGGAAAATGGAAACACACATTCATGGTTTGGCTAGTAGAGAAATCTCAATC
TCTTGAAGTGTTTTCCCTTTAGTCTCGATCACGTTCCTCTTCACGAACATCACTGCCATT
AAACAGAACGTTGAGAACATCGAGTATAGTAGCCGAGGACCAAGCTGCTCAAGCAATTTC
AGGAATAGTAACCCCACGAAGAAATTTATGACCCAATGCACAGACAAGCAGAGAGCCAAA
GCTTTTGCTCTGATTCGACTTGGGAAGATTTCAGGCAGGAGTAAACCTGGTACTGGACCA
GCTCCTAGGGCGAATGTTAGCACAAACACAAGAGTTCCACCGACTGATAAACACAAAGCC
GGAAAATGTGGCAAGTATGAACTTGTCGCACCAACTTGAAGTGCCATTGCTACTGCCATG
CCAATGAAACTCCAAAGGAGAAGAAGCTTTTTTCCTAGTTTATCCATCAACACCATTGCG
ATTAGAGACCCCAAGAGGTTTGAAATTCCGACAAAT
C

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DS 

RD RS1C811TF 638 0 0
G
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GTATCTTATTTAGAGCATATTTTGATCTACAAACTCAAACAGTGGACAGTACAGTGTGAA
GGAATAGGTAGGAAAATGGAAACACACATTCATGGTTTGGCTAGTAGAGAAATCTCAATC
TCTTGAAGTGTTTTCCCTTTAGTCTCGATCACGTTCCTCTTCACGAACATCACTGCCATT
AAACAGAACGTTGAGAACATCGAGTATAGTAGCCGAGGACCAAGCTGCTCAAGCAATTTC
AGGAATAGTAACCCCACGAAGAAATTTATGACCCAATGCACAGACAAGCAGAGAGCCAAA
GCTTTTGCTCTGATTCGACTTGGGAAGATTTCAGGCAGGAGTAAACCTGGTACTGGACCA
GCTCCTAGGGCGAATGTTAGCACAAACACAAGAGTTCCACCGACTGATAAACACAAAGCC
GGAAAATGTGGCAAGTATGAACTTGTCGCACCAACTTGAAGTGCCATTGCTACTGCCATG
CCAATGAAACTCCAAAGGAGAAGAAGCTTTTTTCCTAGTTTATCCATCAACACCATTGCG
ATTAGAGACCCCAAGAGGTTTGAAATTCCGACAAAT
C

QA 2 637 2 637
DS 

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GTG
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TCATGGTTTGGCTAGTAGAGAAATCTCAATCTCTTGAAGTGTTTTCCCTTTAGTCTCGAT
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AAGAGTTCCACCGACTGATAAACACAAAGCCGGGAAATGTGGCAAGTATGAACTTGTCGC
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TCTTCCTAGTTTATCCATCAACACCATTGCGATTAGAGACCCCAAGAGGTTTGAAATTCC
GACAAATATGTTGGCCATGTCTGATGGA

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DS 

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TTTTAACAAAACGCTACCGAGAAATACAATCGTATCTTATTTAGAGCATATTTTGATCTA
CAAACTCAAACAGTGGACAGTACAGTGTGAAGGAATAGGTAGGAAAATGGAAACACACAT
TCATGGTTTGGCTAGTAGAGAAATCTCAATCTCTTGAAGTGTTTTCCCTTTAGTCTCGAT
CACGTTCCTCTTCACGAACATCACTGCCATTAAACAGAACGTTGAGAACATCGAGTATAG
TAGCCGAGGACCAAGCTGCTCAAGCAATTTCAGGAATAGTAACCCCACGAAGAAATTTAT
GACCCAATGCACAGACAAGCAGAAAGCCAAAGCTTTTGCTCTGATTCGACTTGGGAAGAT
TTCAGGCAGGAGTAAACCTGGTACTGGACCAGCTCCTAGGGCGAATGTTAGCACAAACAC
AAGAGTTCCACCGACTGATAAACACAAAGCCGGAAAATGTGGCAAGTATGAACTTGTCGC
ACCAACTTGAAGTGCCATTGCTACTGCCATGCCAATGAAACTCCAAAGGAGAAGAAGCTT
TCTTCCTAGTTTATCCATCAACACCATTGCGATTAGAGACCCCAAGAGGTTTGAAATTCC
GACAAATATGTTGGCCATGTCTGATGGAACTCCGGCA
CTTTT

QA 1 697 1 697
DS 

RD RS1GY48JQ 615 0 0
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CAGTGTGAAGGGATAGGTAGGAAAATGGAAACACACATTCATGGTTTGGCTAGTAGAGAA
ATCTCAATCTCTTGAAGTGTTTTCCCTTTAGTCTCGATCACGTTCCTCTTCACGAACATC
ACTGCCATTAAACAGAACGTTGAGAACATCGAGTATAGTAGCCGAGGACCAAGCTGCTCA
AGCAATTTCAGGAATAGTAACCCCACGAAGAAATTTATGACCCAATGCACAGACAAGCAG
AGAGCCAAAGCTTTTGCTCTGATTCGACTTGGGAAGATTTCAGGCAGGAGTAAACCTGGT
ACTGGACCAGCTCCTAGGGCGAATGTTAGCACAAACACAAGAGTTCCACCGACTGATAAA
CACAAAGCCGGAAAATGTGGCAAGTATGAACTTGTCGCACCAACTTGAAGTGCCATTGCT
ACTGCCATGCCAATGAAACTCCAAAGGAGAAGAAGCTTTCTTCCTAGTTTATCCATCAAC
ACCATTGCGATTAGAGACCCCAAGAGGTTTGAAATTCCGACAAATATGTTGGCCATGTCT
GATGGAACTCCGGCA

QA 1 615 1 615
DS 

RD RS1GM05JQ 797 0 0
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ATAAAGATAAGGGTATTTTAACAAAACGCTACCGAGAAATACAATCGTATCTTATTTAGA
GCATATTTTGATCTACAAACTCAAACAGTGGATAGTACAGTGTGAAGGAATAGGTAGGAA
AATGGAAACACACATTCATGGTTTGGCTAGTAGAGAAATCTCAATCTCTTGGAGTGTTTT
CCCTTTAGTCTCGATCACGTTCCTCTTCACGAACATCACTGCCATTAAACAGAACGTTGA
GAACATCGAGTATAGTAGCCGAGGACCAAGCTGCTCAAGCAATTTCAGGAATAGTAACCC
CACGAAGAAATTTATGACCCAATGCACAGACAAGCAGAGAGCCAAAGCTTTTGCTCTGAT
TCGACTTGGGAAGATTTCAGGCAGGAGTAAACCTGGTACTGGACCAGCTCCTAGGGCGAA
TGTTAGCACAAACACAAGAGTTCCACCGACTGATAAACACAAAGCCGGAAAATGTGGCAA
GTATGAACTTGTCGCACCAACTTGAAGTGCCATTGCTACTGCCATGCCAATGAAACTCCA
AAGGAGAAGAAGCTTTCTTCCTAGTTTATCCATCAACACCATTGCGATTAGAGACCCCAA
GAGGTTTGAAATTCCGACAAATATGTTGGCCATGTCTGATGGAACTCCGGCACTTTTGAA
AACGGTAGAAGAGAAATAAAAAACAGCATTTATACCAGATAGCTGTTGCAAAGCAAACAG
GGTTGATCCAATAAAAA

QA 1 797 1 797
DS 

RD RS1GY48TF 591 0 0
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TGGCAAGTATGAACTTGTCGCACCAACTTGAAGTGCCATTGCTACTGCCATGCCAATGAA
ACTCCAAAGGAGAAGAAGCTTTCTTCCTAGTTTATCCATCAACACCATTGCGATTAGAGA
CCCCAAGAGGTTTGAAATTCCGACAAATATGTTGGCCATGTCTGATGGAACTCCGGCACT
TTTGAAAACGGTAGAAGAGAAATAAAAAACAGCATTTATACCAGATAGCTGTTGCAAAGC
AAACAGGGTTGATCCAATAAAAACAACTCTTGAATGCCGACCATATAAGAGCTCGGTGAG
AGTCACAACATCTGGCTCATCCGTTTTGTCTAACTCTAGTTTGTGTAATTCTGCCATAGC
TGTTTTCACATGAGATCCTCCAAGCAGCCTCTCAAACTCAGCTTCCGCTTCAGCTATCTT
CCCTTGCTTAAATAGCCACTGGGGAGACTCGGCACAGAAGAACATCCCTAGTGCGAGTGC
TGCAGCAGGAATGGTTGATAACCAGAAACAGACACGCCACCAACCAGTTAC

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 6

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CAGATATCTAAAAAGCAGAGTTTGATTTCAACAATTATGGTGAGAATCTTCCTTCTATAC
AATCTTTTAAACTCTTTTCTCCTCTCCTTAGTACCAAAGAAGCTGCGAAGTCTATTCTCT
CTCTCCTGGTTCGACAAAACTCTCCACATGAACTCTCCACCTCCACCATCATCGTCCCCT
GCTCCAACGAGCAAAACAGATCCTTCCGAGCTAAAACGTGTTTTCCAGACTTTCGACAAG
AACGGAGACGGTCGGATCACCAAAGAAGAGCTCAACGACTCGCTAGAGAATCTTGGAATC
TACATACCGGACAAAGACCTCACTCAGATGATCCACAACATCGACGCCAACGGTGATGGA
TGCGTGGACATAGAGGAGTTCGAGTCGCTGTACAGCTCCATTGTGGATGAGCACCACAAG
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GATGGGTTTATCACTGTGGAGGAGTTGAAGTCTGTGATGGGTTCTTTGGGACTCAACCAA
GGTAAGACATTAGAAGGTTGCAAGAAGATGATTATGCAAGTGGATGCTGATGGTGATGGT
AGAGTCAATTACAAAGAGTTTCTTCAGATGATGAAAG*TGATGGTTTTAGCTGCAGTAAC
TGATCTTTATTTAGAGTTT*AACATAAGAGTGTGTGTGTTTATTTGTGTTTCTTTTTATG
TGTAAATAATTTTTTTGATGATGCATCAAGTGTGTAATTTTTTTTTCCTTTTTAGGATTT
CTCTTAAGGTTATGTAAGATTCTCTTTCTCATTACATTTGGTTTGGTGTTCTTTAGTAGA
TTGTT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 15 30 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1CU07TF U 1
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AF RS1FL76TF U 1
AF RS1FL76JQ C 166
AF RS1CU07JQ C 329
BS 1 141 RS1CU07TF
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BS 778 785 RS1FL76TF
BS 786 786 RS1FL76JQ
BS 787 795 RS1FL76TF
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BS 822 889 RS1FL76JQ
BS 890 905 RS1CU07JQ

RD RS1CU07TF 693 0 0
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AGAGTCAATTACAAAGAGTTTCTTCAGATGATG

QA 1 693 1 693
DS 

RD RS1DN17TF 771 0 0
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CAGATATCTAAAAAGCAGAGTTTGATTTCAACAATTATGGTGAGAATCTTCCTTCTATAC
AATCTTTTAAACTCTTTTCTCCTCTCCTTAGTACCAAAGAAGCTGCGAAGTCTATTCTCT
CTCTCCTGTTTCGACAAAACTCTCCACA*GAACTCTCCACCTCCACCATCATCGTCCCCT
GCTCCAACGAGCAAAACAGATCCTTCCGAGCTAAAACGTGTTTTCCAGACTTTCGACAAG
AACGGAGACGGTCGGATCACCAAAGAAGAGCTCAACGACTCGCTAGAGAATCTTGGAATC
TACATACCGGACAAAGACCTCACTCAGATGATCCACAACATCGACGCCAACGGTGATGGA
TGCGTGGACATAGAGGAGTTCGAGTCGCTGTACAGCTCCATTGTGGATGAGCACCACAAG
GATGGTGGAACAGAGGAAGAGGACATGAAGGACGCGTTTAACGTGTTTGACCAGGACGGT
GATGGGTTTATCACTGTGGAGGAGTTGAAGTCTGTGATGGGTTCTTTGGGACTCAACCAA
GGTAAGACATTAGAAGGTTGCAAGAAGATGATTATGCAAGTGGATGCTGATGGTGATGGT
AGAGTCA*TTACAAAGAGTTTCTTCAGATGATGAAAG*TGATGGTTTTAGCTGCAGTA*C
TGATCTTTATTTAGAGTTT*AACATA*GAGTGTGTGTGTT
ATTTGTGCTTG

QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1FQ51TF 768 0 0
GGACCATAAAAGCTCTGTTTCTAAGCTCTCTGTTTCCTCGAATCTCCTCTCTGTTTCCAT
CAGATATCTAAAAAGCAGAGTTTGATTTCAACAATTATGGTGAGAATCTTCCTTCTATAC
AATCTCTTAAACTCTTTTCTCCTCTCCTTAGTACCAAAGAAGCTGCGAAGTCTATTCTCT
CTCTCCTGGTTCGACAAAACTCTCCACATGAACTCTCCACCTCCACCATCATCGTCCCCT
GCTCCAACGAGAAAAACAGATCCTTCCGAGCTAAAACGTGTTTTCCAGACATTCGACAAG
AACGGAGATGGTCGGATTACCAAGGAAGAGCTCAACGACTCGCTAGAGAATCTTGGAATC
TACATACCAGACAAAGACCTCACTCAGATGATCCACAACATCGACGCCAACGGTGATGGA
TGCGTGGACATAGACGAGTTCGAGTCTCTGTACAGCTCCATTGTGGATGAGCACCACAAG
GATGGTGAAGCGGAGGAAGAGGACATGAAGGACGCGTTTAACGTGTTTGACCAGGACGGT
GATGGGTTTATCACTGTGGAGGAGTTGAAGTCTGTGATGGGTTCTTTGGGACTCAACCAA
GGTAAGACGTTAGAAGGTTGCAAGAAGATGATTATGCAAGTGGATGCTGATGGTGATGGT
AGAGTTAATTACAAAGAGTTTCTTCAGATGATGAAAG*TGATGGTTTTAGCTGCAGTAAC
TGATCTTTATTTAGAGTTT*AACATAAGAGTGTGTGTGTTTATTTGTG

QA 1 768 1 768
DS 

RD RS1FL76TF 821 0 0
GGACCATAAAAGCTCTGTTTCTAAGCTCTCTGTTTCCTCAAATCTCCTCTCTGTTTCCAT
CAGATATCTAAAAAGCAGAGTTTGATTTCAGCAATTATGGTGAGAATCTTCCTTCTATAC
AATCTTTTAAACTCTTTTCTCCTCTCCTTAGTACCAAAGAAGCTGCGAAGTCTATTCTCT
CTCTCCTGGTTCGACAAAACTCTCCACATGAACTCTCCACCTCCACCATCATCGTCCCCT
GCTCCAACGAGCAAAACAGATCCTTCCGAGCTAAAACGTGTTTTCCAGACTTTCGACAAG
AACGGAGACGGTCGGATCACCAAAGAAGAGCTCAACGACTCGCTAGAGAATCTTGGAATC
TACATACCGGACAAAGACCTCACTCAGATGATCCACAACATCGACGCCAACGGTGATGGA
TGCGTGGACATAGAGGAGTTCGAGTCGCTGTACAGCTCCATTGTGGATGAGCACCACAAG
GATGGTGAAACAGAGGAAGAGGACATGAAGGACGCGTTTAACGTGTTTGACCAGGACGGT
GATGGGTTTATCACTGTGGAGGAGTTGAAGTCTGTGATAGGTTCTTTGGGACTCAACCAA
GGTAAGACATTAGAAGGTTGCAAGAAGATGATTATGCAAGTGGATGCTGATGGTGATGGC
AGAGTCAATTACAAAGAGTTTCTTCAGATGATGAAAG*TGATGGTTTTAGCTGCAGTAAC
TGATCTTTATTTAGAGTTT*AACATAAGAGTGTGTGTGTTTATTTGTGTTTCTTTT*ATG
TGTAA*TAATTTTTT*GATGATGCATCAAGTGTGTAATTTT

QA 1 821 1 821
DS 

RD RS1FL76JQ 727 0 0
CGAAGTCTATTCTCTCTCTCCTGGTTCGACAAAACTCTCCACATGAACTCTCCACCTCCA
CCATCATCGTCCCCTGCTCCAACGAGCAAAACAGATCCTTCCGAGCTAAAACGTGTTTTC
CAGACTTTCGACAAGAACGGAGACGGTCGGATCACCAAAGAAGAGCTCAACGACTCGCTA
GAGAATCTTGGAATCTACATACCGGACAAAGACCTCACTCAGATGATCCACAACATCGAC
GCCAACGGTGATGGATGCGTGGACATAGAGGAGTTCGAGTCGCTGTACAGCTCCATTGTG
GATGAGCACCACAAGGATGGTGAAACAGAGGAAGAGGACATGAAGGACGCGTTTAACGTG
TTTGACCAGGACGGTGATGGGTTTATCACTGTGGAGGAGTTGAAGTCTGTGATAGGTTCT
TTGGGACTCAACCAAGGTAAGACATTAGAAGGTTGCAAGAAGATGATTATGCAAGTGGAT
GCTGATGGTGATGGCAGAGTCAATTACAAAGAGTTTCTTCAGATGATGAAAGGTGATGGT
TTTAGCTGCAGTAACTGATCTTTATTTAGAGTTTTAACATAAGAGTGTGTGTGTTTATTT
GTGTTTCTTTTTATGTGTAAATAATTTTTTTGATGATGCATCAAGTGTGTAATTTTTTTT
TCCTTTTTAGGATTTCTCTTAAGGTTATGTAAGATTCTCTTTCTCATTACATTTGGTTTG
GTGT
CCT

QA 1 724 1 724
DS 

RD RS1CU07JQ 577 0 0
AGCTCAACGACTCGCTAGAGAATCTTGGAATCTACATAC*GGACAAAGACCTCACTCAGA
TGATCCACAACATCGACGCCAACGGTGATGGATGCGTGGACATAGAGGAGTTCGAGTCGC
TGTACAGCTCCATTGTGGATGAGCACCACAAGGATGGTGAAACAGAGGAAGAGGACATGA
AGGACGCGTTTAACGTGTTTGACCAGGACGGTGATGGGTTTATCACTGTGGAGGAGTTGA
AGTCTGTGATGGGTTCTTTGGGACTCAACCAAGGTAAGACATTAGAAGGTTGCAAGAAGA
TGATTATGCAAGTGGATGCTGATGGTGATGGTAGAGTCAATTACAAAGAGTTTCTTCAGA
TGATGAAAGGTGATGGTTTTAGCTGCAGTAACTGATCTTTATTTAGAGTTTTAACATAAG
AGTGTGTGTGTTTATTTGCGTTTCTTTTTATGTGTAAATAATTTTTTTGATGATGCATCA
AGTGTGTAATTTTTTTTTCCTTTTTAGGATTTCTCTTAAGGTTATGTAAGATTCTCTTTC
TCATTACATTTGGTTTGGTGTTCTTTAGTAGATTGTT

QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 7

CO CL756Contig1 802 7 24 U
GGAACACAAACCATTAAACTCAAAACACCCAATTAAACAAATTTTTGGCACAAGAAAAAA
ACATGAGACCTGGAATGTATTTACTGTTGCTTACAGTTTCAGTGGCGGTGATGTCCAATG
TTTCTGCTCAATCGAGCTGCACAGATGTTCTAATGAGTATGGCGCCATGTCTAGGTTACA
TCACTGGAAACTCTTCTTCTCCTTCTCAACAATGCTGCAGCCAGTTGGCTCATGTTGTCA
GGTCTTCTGGTGAGTGTTTGTGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGATCA
ATTTTAATCAAACACAGGCTTTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCCAG
TTAGTAGCTGCAACGGTGGTTCTTCGGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTCAG
AACATGGAAATGGATCAAAACCAGATCCAGGACATAGATCATCATCATCATCATCATCTC
ATGGGAGTACTATCAAGTTCTCATTCCCTCTTCTTGCTATCCTTTCTGCGACTTCCTACA
TCACAATACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTC
TTTTTTTATTTCTTCTGAATCTCAGTGTAATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCT
ATAAAATCCCTACTTCCGGGGTGATATCGGTTTGTAGCTACAAATAGTGTCTTGTATCTG
TTTCCTTTATGAATAAGTATTGCTCTCCGTGACATTATTTAAAATATAGAACACTATACA
AACATATATTCTACAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 15 40 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AX40TF U 4
AF RS1FA80TF U 1
AF RS1FB55TF U 1
AF RS1EQ29TF U 4
AF RS1FB55JQ C 6
AF RS1G127TF U 1
AF RS1G127JQ C 448
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BS 402 474 RS1FA80TF
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RD RS1AX40TF 659 0 0
GG
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ATACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCTTTTT
TTATTTCTTCTGAATCTCAGTGTAATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCTAT

QA 3 659 3 659
DS 

RD RS1FA80TF 745 0 0
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TCACTGGAAACTCTTCTTCTCCTTCTCAACAATGCTGCAGCCAGTTGGCTCATGTTGTCA
GGTCTTCTGGTGAGTGTTTGTGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGATCA
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TTAGTAGCTGCAACGGTGGTTCTTCGGTTAATTCGCCTATGGGATCATCAAACACTTCAG
AACATGGAAATGGATCAAAACCAGATCCAGGACATAGATCATCATCATCATCAT***CTC
ATGGGAGTACTATCAAGTTCTCATTCCCTCTTCTTGCTATCTTTTCTGCGACTTCCTACA
TCACAATACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTC
TTTTTTTATTTCTTCTGAATCTTAGTGTAATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCT
ATAAAATCCCTACTTCTGGG*TGATATCGGTTTGTAGCTACAAATAGTGTCTTGTATCTG
TTTC*TTTATGAATAAGTATTGCTC

QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1FB55TF 753 0 0
GGAAC
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GCTCAATCGAGCTGCACAGATGTTCTAATGAGTATGGCGCCATGTCTAGGTTACATCACT
GGAAACTCTTCTTCTCCTTCTCAACAATGCTGCAGCCAGTTGGCTCATGTTGTCAGGTCT
TCTGGTGAGTGTTTGTGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGATCAATTTT
AATCAAACACAGGCTTTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCCAGTTAGT
AGCTGCAACGGTGGTTCTTCGGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTCAGAACAT
GGAAATGGATCAAAACCAGATCCAGGACATAGATCATCATCATCATCATCATCTCATGGG
AGTACTATCAAGTTCTCATTCCCTCTTCTTGCTATCCTTTCTGCGACTTCCTACATCACA
ATACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCTTTTT
TTATTTCTTCTGAATCTCAGTGTAATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCTATAAA
ATCCCTACTTCCGGG*TGATATCGGTTTGTAGCTACAAATAGTGTCTTGTATCTGTTCC*
TTTATGA*TAAGTATTGCTCTC
CGTGAC

QA 6 747 6 747
DS 

RD RS1EQ29TF 723 0 0
GG
ACAAACCATTAAACTCAAAACACCCAATTAAACAAATTTTTGGCACAAGAAAAAAACATG
AGACCTGGAATGTATTTACTGTTGCTTACAGTTTCAGTGGCGGTGATGTCCAATGTTTCT
GCTCAATCGAGCTGCACAGATGTTCTAATGAGTATGGCGCCATGTCTAGGTTACATCACT
GGAAACTCTTCTTCTCCTTCTTAACAATGCTGCAGCCAGTTGGCTCATGTTGTCAGGTCT
TCTGGTGAGTGTTTGTGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGATCAATTTT
AATCAAACACAGGCTTTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCCAGTTAGT
AGCTGCAACGGTGGTTCTTCGGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTCAGAACAT
GGAAATGGATCAAAACCAGATCCAGGACATAGATCATCATCATCATCATCATCTCATGGG
AGTACTATCAAGTTCTCATTCCCTCTTCTTGCTATCCTTTCTGCGACTTCCTACATCACA
ATACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCTTTTT
TTATTTCTTCTGAATCTCAGTGTAATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCTATAAA
ATCCCTACTTCCGGGGTGATATCGGTTTGTAGCTACAAATAGTGTCTTGTATCTGTTTCC
T

QA 3 723 3 723
DS 

RD RS1FB55JQ 748 0 0
ACAAACCATTAAACTCAAAACACCCAATTAAACAAATTTTTGGCACAAGAAAAAAACATG
AGACCTGGAATGTATTTACTGTTGCTTACAGTTTCAGTGGCGGTGATGTCCAATGTTTCT
GCTCAATCGAGCTGCACAGATGTTCTAATGAGTATGGCGCCATGTCTAGGTTACATCACT
GGAAACTCTTCTTCTCCTTCTCAACAATGCTGCAGCCAGTTGGCTCATGTTGTCAGGTCT
TCTGGTGAGTGTTTGTGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGATCAATTTT
AATCAAACACAGGCTTTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCCAGTTAGT
AGCTGCAACGGTGGTTCTTCGGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTCAGAACAT
GGAAATGGATCAAAACCAGATCCAGGACATAGATCATCATCATCATCATCATCTCATGGG
AGTACTATCAAGTTCTCATTCCCTCTTCTTGCTATCCTTTCTGCGACTTCCTACATCACA
ATACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCTTTTT
TTATTTCTTCTGAATCTCAGTGTAATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCTATAAA
ATCCCTACTTCCGGGGTGATATCGGTTTGTAGCTACAAATAGTGTCTTGTATCTGTTTCC
TTTATGAATAAGTATTGCTCTC
CGTGAC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RS1G127TF 802 0 0
GGAAC
ACAAACCATTAAACTCAAAACACCCAATTAAACAAATTTTTGGCACAAGAAAAAAACATG
AGACCTGGAATGTATTTACTGTTGCTTACAGTTTCAGTGGCGGTGATGTCCAATGTTTCT
GCTCAATCGAGCTGCACAGATGTTCTAATGAGTATGGCGCCATGTCTAGGTTACATCACT
GGAAACTCTTCTTCTCCTTCTCAACAATGCTTCAGCCAGTTGGCTCATGTTGCCAGGTCT
TCTGGTGAGTGTTTGTGTGAACTTCTCAAAGGTGGAGCCCCTCATCTTGGGATCAATTTT
AATCAAACACAGGCTTTTGCTTTGCCTAAAGCTTGTAATGTTCAAACTCCTCCAGTTAGT
AGCTGCAACGGTGGTTCTTCGGTTAATTCGCCTATAGGATCATCAAACACTTCAGAACAT
GGAAATGGATCAAAACCAGATCCCGGACATAGATCATCATCATCATCATCATCTCATGGG
AGTACTATCAAGTTCTCATTCCCTCTTCTTGCTATCCTTTCTGCGACTTCCTACATCACA
ATACTGACTTCTTAAAATCCATAAAGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCTTTTT
TTATTTCTTCTGAATCTCAGTGTAATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCTATAAA
ATCCCTACTTCCGGGGTGATATCGGTTTGTAGCTACAAATAGTGTCTTGTATCTGTTTCC
TTTATGAATAAGTATTGCTCTC*GTGACATTATTTAAA*TATAGA*CACTATACAA*CAT
ATATTCTACAAAAAAAA

QA 6 802 6 802
DS 

RD RS1G127JQ 347 0 0
CC
GGACATAGATCATCATCATCATCATCATCTCATGGGAGTACTATCAAGTTCTCATTCCCT
CTTCTTGCTATCCTTTCTGCGACTTCCTACATCACAATACTGACTTCTTAAAATCCATAA
AGATTATTATGCTCTCTTTGAAGACGCATTCTTTTTTTATTTCTTCTGAATCTCAGTGTA
ATGTGGTGTTGTATGATGTACTTTGTGCTCTATAAAATCCCTACTTCCGGGGTGATATCG
GTTTGTAGCTACAAATAGTGTCTTGTATCTGTTTCCTTTATGAATAAGTATTGCTCTCCG
TGACATTATTTAAAATATAGAACACTATACAAACATATATTCTAC

QA 3 347 3 347
DS 



AS 1 7

CO CL757Contig1 1629 7 19 U
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GGTGTTGCAAGCTTTGGTGCTTACTTGTTGAAGAGAGATTTCTTGGCTATGTCTTTTGCG
CCAAGAGATACTCATGAAGTTCAGGTCCAGTTTGCGTTGGAACGTGGAGTTCCTGCGATT
ATAGGGATTATGGGATCAATAAGGCTTCCTTATCCAGCCCGAGCTTTCGATCTTGCTCAT
TGTTCTCGTTGTTTGATTCCTTGGTTTCCGAACGATGGTCTGTACTTAACTGAAGTGGAC
CGAGTTTTAAGACCCGGAGGTTATTGGATCCTCTCCGGCCCACCGATCAACTGGAAGCAA
CACTGGAAAGGCTGGGAAAGATCACAAGAGGATTTGAAGCAAGAGCAAGATTCAATAGAA
AATGCAGCTAGAAGTCTTTGTTGGAAGAAAGTTACAGAGAAGGGTGATTTTTTAATTTGG
CAAAAACCAATTAATCACATTGAGTGCAAGAAACTCAAACGAGTTCATAAATCTCCTCCC
ATATGCACAAAAGCAGTTCAACCTGATTCCGCTTGGTATAAAGAATTAGAATCTTGTGTA
ACTCCGTTGCCAGAAGCAAAAGGTCCAGATGAATTCTCTGGAGGTGCATTGGAGGATTGG
CCGGACCGAGCATTTGCGGTCCCACCTAGGATTATCCAGGGAACTATACCGTAGATCAAT
GCTGAAAAATTCAGAGAAGACAATGAGGTTTGGAAGGAGAGAGTAGCATACTACAAACAG
ATAATGCCAGAGCTTTCAAGGGGAAGGTTCAGTAACATTATGGACATGAATGCATACCTC
GGTGGGTTCGCTGCAGCGATTGTGAAATATCCATCTCGGGTTATGAATGTGGTTCCGGTA
GACGCAGAGAAGCAAACGTTAGGTGTGATTTATGAGAGGGGATTTATAGGAACTTATCAA
GACTGG*TGTGAAGGATTCTCTACGTATCCAAGAACTTATGATCTTATTCACGCTGG*TG
GATTGTTCAGCATTTACGAGAACAGGTGTGATGTGACGTTGATCCTACTTGAGATGGATA
GAATACTGAGACCAGAAGGAACAGTGGTGTTTAGGGACACTGTGGAAATGTTAACGAAGA
TACAAAGCATAACCAATGGAATGAAGTGGACAAGTCGAATTATGGATCACGAGAAAGGTC
CTTTTATCCCTGAGAAGATCCTTCTCGCTGTAAAATCCTACTGGACCGGTCCTTCTTCTT
AAGCTAGTTTCAGTTTCCTTT*AGACTCTTTACTTTGAACTTCTTCATCCTCTGATTCTT
TCCAGGGTTGGGCGTGAATACTCGTTACTTGCTTTATATTCGTTACTTGATCCGTATTCG
CCTCGTTTTTTCAAGTACTCGTAGTTGCAAAGTCAAGTATCAAGTCGTTGAGTTTTGTTA
CTCGCAAATACAAAGCAAGTAACAAGTATCATAAAAAAGTTAACGACTTTCCTTGATACT
ACTCGTTACTTGTTTTACGACTGAAAAAATAATAACCAAACCATATAAACCAAAGTCTAA
ACTGATATTTCTCTGTTCTAAGAAGTAGCCAGTACTTTCATATCGAAATATATATGTTAT
ATTTTTTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 

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G
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ATACCTCGGTGGGTTCGCTGCAGCGATTGTGAAATATCCATCTTGGGTTATGAATGTGGT
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CTGG*TGGATTGTTCAGCATTTACGAGA

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GG*TGTGAAGGATTCTCTACGTATCCAAGAACTTATGATCTTATTCACGCTGG*TGGATT
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C

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TTGATCCTACTTGAGATGGATAGAATACTGAGACCAGAAGGAACAGTGGTGTTTAGGGAC
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TACTGGACCGGTCCTTCTTCTTAAGCTAGTTTCAGTTTCCTTT*AGACTCTTTACTTTGA
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CATATCGAAATATATATGTTATATTTTTT

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TTCCTTGATACTACTCGTTACTTGTTTTACGACTGAAAAAATAATAACCAAACCATATAA
ACCAAAGTTTAAACTGATATTTTTCTGTTTTAAGAAGTAGCCAGTACTTTCATATCGAAA
TATATATGTTATATTTTTTTT

QA 1 561 1 561
DS 



AS 1 7

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ACGATCCTTTCTTCCGAGACGATGGACATCCCCGAAAGCATTACCATCAAAGTTAACGCT
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CTCATCACCGGTGTCACCAGAGGGTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTCATTTT
CCCATCAACGCTTCCATCGGCGGTGACAGCAAGTCCATTGAGATCCGTAACTTCCTTGGG
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CTTATCAACCAGAAATGTCACGTGAAGAAAAAGGATATCAGGAAGTTCCTTGACGGTATC
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ATCCCTTGTCTTTTTGTTCGAGATTTTTATTTACTTTTGCAGAAGTTTCTGGAGACACAA
TTTGCTAGTCCTTTTACCTATTTCACTCTTTTGAATCGTCCTTTTTCTTTTGGCG


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 10 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 10 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FT17TF U 2
AF RS1GV46TF U 1
AF RS1FB13TF U 3
AF RS1FT17JQ C 131
AF RS1GV46JQ C 285
AF RS1D574JQ C 429
AF RS1D574TF U 429
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AGGATGAGATTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTTTCAAGGTCATGCGCTCTTA
TCAACCAGGAATGTCACGTGAAGAAGAAGGACATCAGGAAGTT

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CTCGATTTCCAGCTCATCAAGGACGCCGAGACCGGGAAGAAGAAGCTGAAGATCGACTCG
TGGTTCGGATCTCGCAAATCAAGTGCATCCATCAGAACCGCTCTTAGCCACGTCGATAAC
CTCATCACCGGTGTCACCAGAGGGTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTCATTTT
CCCATCAACGCTTCCATCGGCGGTGACAGCAAGTCCATTGAGATCCGTAACTTCCTTGGG
GAGAAGAAGGTGAGGAAGGTAGATATGTTGGATGGTGTAACCATTTTTCGGTCTGAGAAA
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CTTATCAACCAGAAATGTCACGTGAAGAAAAAGGATATCAGGAAGTTCCTTGACGGTATC
TATGTTAGCGAGAAGAGCAAGATCGTTGAAGAGGAATAGACAAATATGTCTCCTTCATCT
TTTGAATGTTTAGTTTGTTTTTCAGAC*AAAA*TCTCACCGGTGTTGCAAA*CTCGGCTT
ATCCCTTGTCTTTT*GTTCGAGATTTTTATTTACTTTTGCAGA
GT

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DS 

RD RS1FB13TF 758 0 0
GG
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TCCTTTCTTCCGAGACGATGGACATCCCCGAAAGCATTACCATCAAAGTTAACGCTAAGG
TGATCGAAGTCGAAGGACCTCGCGGCAAACTTGTTCGCGACTTCAAGCATCTCAACCTCG
ATTTCCAGCTCATCAAGGACGCCGAAACCGGGAAGAAGAAGCTGAAGATCGACTCGTGGT
TCGGATCCCGCAAATCAAGTGCATCCATCAGAACCACTCTTAGCCACGTCGATAACCTCA
TCACCGGTGTCACCAGAGGGTTCAGGTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTCATTTTCCCA
TCAACGCTTCCATCGGCGGTGACAGCAAGTCCATTGAGATCCGTAACTTCCTTGGGGAGA
AGAAGGTGAGGAAGGTAGATATGTTGGATGGTGTAACCATTGTTCGGTCTGAGAAAGTTA
AGGATGAGATTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTCTCAAGGTCGTGCGCTCTTA
TCAACCAGAAATGTCACGTGAAGAAGAAGGATATCAGGAAGTTCCTTGACGGTATCTATG
TTAGCGAGAAGAGCAAGATCGTTGAAGAGGAATAGACAAATATGTCTCCTTCATCTTTTG
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CTTGTCTTTT*GTTCGAGATTTT*ATTTACTTT
ATG

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DS 

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AGCTCATCAAGGACGCCGAAACCGGGAAGAAGAAGCTGAAGATCGACTCGTGGTTCGGAT
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CTTCCATCGGCGGTGACAGCAAGTCCATTGAGATCCGTAACTTCCTTGGGGAGAAGAAGG
TGAGGAAGGTAGATATGTTGGATGGTGTAACCATTGTTCGGTCTGAGAAAGTTAAGGATG
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AGGAATGTCACGTGAAGAAGAAGGACATCAGGAAGTTCCTTGACGGTATCTATGTTAGCG
AGAAGAGCAAGATCGTTGAAGAGGAATAGACAAATATGTCTCCTTCATCTTTTGAATGTT
TAGTTTGTTTTTCAGACCAAAA*TCTCGCCGGTGTTGCAAAACTCGGCTTATCCCTTGTC
TTTTTGTTCGAGATTTTTATTTACTTTTGCAGAAGTTTTTGGAGACACAATTTGCTAGTC
CTTTT
TACCTATTCC

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DS 

RD RS1GV46JQ 515 0 0
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TGTGTATGCTCATTTTCCCATCAACGCTTCCATCGGCGGTGACAGCAAGTCCATTGAGAT
CCGTAACTTCCTTGGGGAGAAGAAGGTGAGGAAGGTAGATATGTTGGATGGTGTAACCAT
TTTTCGGTTTGAGAAAGTTAAGGATGAGATTGTTTTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGT
TTCAAGGTCATGCGCTTTTATCAACCAGAAATGTCACGTGAAGAAAAAGGATATCAGGAA
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TATGTTTCCTTCATTTTTTGAATGTTTAGTTTGTTTTTCAGACCAAAA*TTTCACCGGTG
TTGCAAAACTCGGCTTATCCCTTGTTTTTTTGTTCGAGATTTTTATTTACTTTTGCAGAA
GTTTTTGGAGACACAATTTGCTAGTCCTTTT
ACCT

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TCCTTTTACCTATTTCACTCTTTTGAATCGTCCTTTTTCTTTTGGCG

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DS 

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TGAGATTGTTCTTGATGGAAATGACATTGAGCTTGTTTCAAGGTCATGCGCTCTTATCAA
CCAGAAATGTCACGTGAAGAAAAAGGATATCAGGAAGTTCCTTGACGGTATCTATGT**G
CGAGAAGAGCAAGATCGTCGAAGAGGAATGGACAAATATGTCTCCTTCATCTTTTGAATG
TTTAGTTTGTTTTTCAGACCAAAAATCTCACCGGTGTTGCAAAACTCGGCTTATCCCTTG
TCTTTTTGTTCGAGATTTTTATTTACTTCTGCAGAAGTTTCTGGAGACACAATTTGCTAG
TCCTTTTACCTATTTCACTCTTTTGAATCGTCCTTTTTCTTTTGGCG

QA 1 407 1 407
DS 



AS 1 7

CO CL759Contig1 739 7 1 U
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TGAAGATTGGGAAGGGGGTAGTAGCGAAAATGGCGTCGATTGCAGCTTCTTCTACTTTCC
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AAAACCTCACCTTTCGAACCAAACCCATCGGAACCAGCAGAGTTTGCAGCTTTACGAAAC
ATAACAACCGCCTTGGGTTGAAGAAGCTTTCGTCCCTTGGCGAAGGAGGAGTAGAAGCCG
TCGCAGTTGCAGATGAAGAGCAGCAACAACAGCAGCAAGAGACTGTCTCTGTCCCTGTCT
CTCCTTCAGACATGCTCACCATGTTTTTTCAGGCTGATGGAACTTTGAATGAAGCAGCTA
TTCCTAATGTGACAAAGGCCTTACAGGACATGGATGGAGTTTCCAACTTAAAGGTTCAAG
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TGAGCTTTGAAGACGAAGATGAAGTTCTTGTCTAATTAATATCATCTTTCTTCTCAAGCC
CAACTTTTTGTGATTAAAGAAAACACATTAATGTCAATGTGCCATATTACAAAAGTAATG
AACTCTCTCACTTTCTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 

AF RS1CX01TF U 47
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AF RS1A201TV U 1
AF RS1A201TF U 35
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BS 1 739 RS1A201TV

RD RS1CX01TF 428 0 0
GGATC
GAGTGAAAGTGAAGATTGGGAAGGGGGTAGTAGCGAAAATGGCGTCGATTGCAGCTTCTT
CTACTTTCCACTCGTTTTCAACAACCAAAAGCCCTAACCTTTCTTCGACCCATCTCCTTC
CTCTCTCCAAAAACCTCACCTTTCGAACCAAACCCATCGGAACCAGCAGAGTTTGCAGCT
TTACGAAACATAACAACCGCCTTGGGTTGAAGAAGCTTTCGTCCCTTGGCGAAGGAGGAG
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AAGCAGCTATTCCTAATGTGACAAAGGCCTTACAGGAGATGGATGGAGTTTCCAACTTAA
AGG

QA 6 428 6 428
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GAACTTTGAATGAAGCAGCTATTCCTAATGTGACAAAGGCCTTACAGGACATGGATGGAG
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CAACGGTTCAAGCAACAGGAGTGGCGTCAAGCTTGGTAGAGACTATACAAGGAGCTGGCT
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DS 

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TGAAGATTGGGAAGGGGGTAGTAGCGAAAATGGCGTCGATTGCAGCTTCTTCTACTTTCC
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CAACTTTTTGTGATTAAAGAAAACACATTAATGTCAATGTGCCATATTACAAAAGTAATG
AACTCTCTCACTTTCTTAC

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CAAAAGTAATGAACTCTCTCACTTTCTTAC

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AAGCCGTCGCAGTTGCAGATGAAGAGCAGCAACAACAGCAGCAAGAGACTGTCTCTGTCC
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CAGCTATTCCTAATGTGACAAAGGCCTTACAGGACATGGATGGAGTTTCCAACTTAAAGG
TTCAAGTTTCTGAAGGTGTTGCCGTTGTTGAGCTATCAAAGCAAACAACGGTTCAAGCAA
CAGGAGTGGCGTCAAGCTTGGTAGAGACTATACAAGGAGCTGGCTTTAAGTTACAAACCT
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AGTAGAAGCCGTCGCAGTTGCAGATGAAGAGCAGCAACAACAGCAGCAAGAGACTGTCTC
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AGCAACAGGAGTGGCGTCAAGCTTGGTAGAGACTATACAAGGAGCTGGCTTTAAGTTACA
AACCTTGAACCTGAGCTTTGAAGACGAAGATGAAGTTCTTGTCTAATTAATATCATCTTT
CTTCTCAAGCCCAACTTTTTGTGATTAAAGAAAACCCATTAATGTCAATGTGCCATATTA
CAAAAGTAATGAACTCTCTCACTTTC

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DS 



AS 1 5

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CATAAAATCTCATCCCCTTCCGTCACAAACTCCAATCCCCATTGAATATGGCGACCACTG
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CCTACACCGGCGTCGCCGACGGTCGTATCCTCTTCTGGGATGGCGCTCGCTGGAACGATT
TTGCTTACACGTCGAACAATCGGTCAGAACTGTGTGATACAAAGTCTTCACTGTTGGCTT
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TGGTGACTTCTCTTACATCTGAGGCGGATGGAGTGCCTTTGAGATTTACTAATGATCTCG
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GCAAAGACGGCTCCTTTTTCATTTTCTGTGAAGGATCAATTGGAAGATTACGGAAATACT
GGTTGAAAGGGGAAAAAGCAGGAACATCAGAAGTGGTAGCTCTATTACATGGGTTCCCTG
ACAACATCCGAACAAACAAAGACGGAGATTTCTGGGTGGCGGTCCACTGTCACCGCAACA
TATTCACACACGTGATGGCGCATCACCCAAAAGTGAGGAAGTTCTTCCTGAAGCTGCCAA
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AGGCAGTGAGTGAAGTGGAGGAGAAAGATGGGAAGCTTTGGATGGGAAGTGTATTGATGT
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TAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 

AF RS1BI22TF U 1
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AF RS1BI22JQ C 643
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RD RS1BI22TF 626 0 0
GGGTTGAAAATTTTCAACTACTCCCTCTCCAGAATCATCACCATCGTCAACTTCCCCAAC
CATAAAATCTCATCCCCTTCCGTCACAAACTCCAATCCCCATTGAATATGGCGACCACTG
TCTTCTCCAAACTCTCGAAGATCTTCTTCCTCTTCGCCATCTACTGCGCTCTCGATCCCT
TCAAACACAGCTCAATCTCCAAGTACCCTGACTTCCAGACTCACAAGATCGACATGCCGC
CGCTCTCGTCTCTCCCCAAGGAGAGAGACCACGAGAACCTGCTCCAGAACTCCGAGATCA
GATTCTCGAACGAGGTTCAGGGTCCAGAGAGCATTGCTTTCGATCCGCTCGGCCGTGGTC
CCTACACCGGCGTCACCGACGGTCGTATCCTCTTCTGGGATGGCGCTCGCTGGAACGATT
TTGCTTACACGTCGAACAATCGGTCAGAACTGTGTGATACAAAGTCTTCACTGTTGGCTT
ACTTAAAGAATGAACATATCTGTGGACGGCCTTTGGGTCTTCGTTTCCACAAGAGAACTG
GAGAGTTGTACATTGCAGATGCGTATTTTGGGATAATGAAGGTTGGTCCTGAAGGAGGTT
TGGTGACTTCTCTTACA
TCTGAGCGG

QA 1 617 1 617
DS 

RD RS1EG44TF 749 0 0
GGAAT
CCCCATTGAATATGGCGACCACTGTCTTCTCCAAACTCTCGAAGATCTTCTTCCTCTTCG
CCATCTACTGCGCTCTCGATCCCTTCAAACACAGCTCAATCTCCAAGTACCCTGACTTCC
AGACTCACAAGATCGACATGCCGCCGCTCTCGTCTCTCCCCAAGGAGAGAGACCACGAGA
ACCTGCTCCAGAACTCCGAGATCAGATTCTCGAACGAGGTTCAGGGTCCAGAGAGCATTG
CTTTCGATCCGCTCGGCCGTGGTCCCTACACCGGCGTCGCCGACGGTCGTATCCTCTTCT
GGGATGGCGCTCGCTGGAACGATTTTGCTTACACGTCGAACAATCGGTCAGAACTGTGTG
ATACAAAGTCTTCACTGTTGGCTTACTTAAAGAATGAACATATCTGTGGACGGCCTTTGG
GTCTTCGTTTCCACAAGAGAACTGGAGAGTTGTACATTGCAGATGCGTATTTTGGGATAA
TGAAGGTTGGTCCTGAAGGAGGTTTGGTGACTTCTCTTACATCTGAGGCGGATGGAGTGC
CTTTGAGATTTACTAATGATCTCGACGTTGATGAAGAAGGGAATGTCTACTTTACAGACA
GCAGCTCTGTTTTCCAGCGAAGGAACTTCATGCACTTGATTGTCTCTGGGGAAGACACCG
GGAGAGTGTTGAAATACAATCCAGAAACAAAGGAGACTACTACTCTCTTGAGAAATCTCC
AATTCCCTAATGGCTTATCACTTG

QA 6 749 6 749
DS 

RD RS1GW52TF 700 0 0
GACGAGAACCTG
CTCCAGAACTCCGAGATCAGATTCTCGAACGAGGTTCTGGGTCCAGAGAGCATTGCTTTC
GATCCGCTCGGCCGTGGTCCCTACACCGGCGTCGCCGACGGTCGTATCCTCTTCTGGGAT
GGCGCTCGCTGGAACGATTTTGCTTACACGTCGAACAATCGGTCAGAACTGTGTGATACA
AAGTCTTCACTGTTGGCTTACTTAAAGAATGAACATATCTGTGGACGGCCTTTGGGTCTT
CGTTTCCACAAGAGAACTGGAGAGTTGTACATTGCAGATGCGTATTTTGGGATAATGAAG
GTTGGTCCTGAAGGAGGTTTGGTGACTTCTCTTACATCTGAGGCGGATGGAGTGCCTTTG
AGATTTACTAATGATCTCGACGTTGATGAAGAAGGGAATGTCTACTTTACAGACAGCAGC
TCTGTTTTCCAGCGAAGGAACTTCATGCACTTGATTGTCTCTGGGGAAGACACCGGGAGA
GTGTTGAAATACAATCCAGAAACAAAGGAGACTACTACTCTCTTGAGAAATCTCCAATTC
CCTAATGGCTTATCACTTGGCAAAGACGGCTCCTTTTTCATTTTCTGTGAAGGATCAATT
GGAAGATTACGGAAATACTGGTTGAAAGGGGAAAAAGC*GGAACATCAGA*GTGGTAGCT
CTATTACATGGGT
CCCTGACACATCCGA

QA 13 685 13 685
DS 

RD RS1BI22JQ 741 0 0
GATTTACTAATGATCTCGACGTTGATGAAGAAGGGAATGTCTACTTTACAGACAGCAGCT
CTGTTTTCCAGCGAAGGAACTTCATGCACTTGATTGTCTCTGGGGAAGACACCGGGAGAG
TGTTGAAATACAATCCAGAAACAAAGGAGACTACTACTCTCTTGAGAAATCTCCAATTCC
CTAATGGCTTATCACTTGGCAAAGACGGCTCCTTTTTCATTTTCTGTGAAGGATCAATTG
GAAGATTACGGAAATACTGGTTGAAAGGGGAAAAAGCAGGAACATCAGAAGTGGTAGCTC
TATTACATGGGTTCCCTGACAACATCCGAACAAACAAAGACGGAGATTTTTGGGTGGCGG
TCCACTGTCACCGCAACATATTCACACACGTGATGGCGCATCACCCAAAAGTGAGGAAGT
TCTTCCTGAAGCTGCCAATAACGGTGAAGTTCCAGTACTTGCTTCAGGTAGGTGGTTGGC
CTCATGCTGTTGCCGTGAAGTACAGTGAAGAAGGGAAAGTGCTGAAAGTGTTGGAGGACA
AGCAAGGGAAAGTGGTGAAGGCAGTGAGTGAAGTGGAGGAGAAAGATGGGAAGCTTTGGA
TGGGAAGTGTATTGATGTCTTTCATTGCAGTATATGACTTGCCTTAGTTTCAAAAAAATA
ACTTTTGCAGATTTATTGTAGTTGCCACGGGATTGCAACATTTCTTTATCGAACTCTGTT
TTTGATGCAAACAATAAATAA

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1GW52JQ 677 0 0
TTTCCAGCGAAGGAACTTCATGCACTTGATTGTCTCTGGGGAAGACACCGGGAGAGTGTT
GAAATACAATCCAGAAACAAAGGAGACTACTACTCTCTTGAGAAATCTCCAATTCCCTAA
TGGCTTATCACTTGGCAAAGACGGCTCCTTTTTCATTTTCTGTGAAGGATCAATTGGAAG
ATTACGGAAATACTGGTTGAAAGGGGAAAAAGCAGGAACATCAGAAGTGGTAGCTCTATT
ACATGGGTTCCCTGACAACATCCGAACAAACAAAGACGGAGATTTCTGGGTGGCGGTCCA
CTGTCACCGCAACATATTCACACACGTGATGGCGCATCACCCAGAAGTGAGGAAGTTCTT
CCTGAAGCTGCCAATAACGGTGAAGTTCCAGTACTTGCTTCAGGTAGGTGGTTGGCCTCA
TGCTGTTGCCGTGAAGTACAGTGAAGAAGGGAAAGTGCTGAAAGTGTTGGAGGACAAGCA
AGGGAAAGTGGTGAAGGCAGTGAGTGAAGTGGAGGAGAAAGATGGGAAGCTTTGGATGGG
AAGTGTATTGATGTCTTTCATTGCAGTATATGACTTGCCTTAGTTTCAAAAAAATAACTT
TTGCAGATTTATTGTAGTTGCCACGGGATTGCAACATTTCTTTATCGAACACTGTTTTTG
ATGCAAACAATAAATAA

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 7

CO CL761Contig1 789 7 5 U
TGGAAGCATTTCCTCTCTCCTCCGTTTTATCTTCGCCCTTTCTCTCTGCTCTCTTATCTC
CTCCCTCCTCCGGTAGAAGAACCATGGCTTCAACCACCGATTTCACAAAGTCTTTACTAT
CTCCCTTCTCCCAACATGGCTTTAATTCCCAGAGAGGAAGTAGTAGACAGAACAAGAACG
CGACATGGCCAAATCAGCACAAGCCCAATAGGCCTCTTCGTGTGAATGGGTTGTTCGGAG
GTGGAAACAACAAAGATAATAACAATACTGAGGATGGACAGTCAAAGGCAGGAGGAATCT
TTGGTAATATGCAGAATATGTATGAGACTGTCAAGAAAGCTCAAATGGTTGTTCAAGTTG
AGGCTGTTCGTGTCCAAAAAGAGTTAGCTGCCGCAGAGTTCGATGGTTATTGTGAAGGCG
AGCTTGTCAAGGTTACGTTATCAGGTAACCAGCAACCAATCCGTACGGATATAACTGAGG
CAGCTATGGAGTTAGGCTCTGAGAAACTTTCACTGTTGGTCACGGAGGCTTACAAGGACG
CACACGCAAAGAGTGTTGTGGCTATGAAAGAAAGAATGAGTGACCTTGCGCAGAGCTTAG
GCATGCCGCCAGGCCTCAGCGAAGGAATGAAATGAAGAAACTGTTTTTGGTTTGTTTGTC
ACATTTAAGTTTCAGGTGTGAGCTTTTTTTTTCTCTATTTATCGGTCAGGCAGAGAGAAG
CAAAGACCTTTGTACTTTACTCTTATGGAATCAGATATTTGTCTTATTACCCTGAGTATG
ATCTTATAC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BP87TF U 20
AF RS1GD29TF U 1
AF RS1CK55TF U 20
AF RS1BT45JQ C 42
AF RS1GD29JQ C 326
AF RS1AG29TF U 1
AF RS1AG29JQ C 84
BS 1 77 RS1AG29TF
BS 78 78 RS1BP87TF
BS 79 237 RS1AG29TF
BS 238 238 RS1BP87TF
BS 239 789 RS1AG29TF

RD RS1BP87TF 579 0 0
GG
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CCATGGCTTCAACCACCGATTTCACAAAGTCTTTACTATCTCCCTTCTCCCAACATGGCT
TTAATTCCCAGAGAGGAAGTAGTAGACAGAACAAGAACGCGACATGGCCAAATCAGCACA
AGCCCAATAGGCCTCTTCGTGTGAATGGGTTGTTCGGAGGTGGAAACAACAAAGATAATA
ACAATACTGAGGATGGACAGTCAAAGGCAGGAGGAATCTTTGGTAATATGCAGAATATGT
ATGAGACTGTCAAGAAAGCTCAAATGGTTGTTCAAGTTGAGGCTGTTCGT*TCCAAAAAG
AGTTAGCTGCCGCAGAGTTCGATGGTTATTGTGAAGGCGAGCTTGTCAAGGTTACGTTAT
CAGGTAACCAGCAACCAATCCGTACGGATATAACTGAGGCAGCTATGGAGTTAGGCTCTG
AGAAACTTTCACTGTTGGTCACGGAGGCTTACAAGGACGCACACGCAAAGAGTGTTGTGG
CTATGAAAGAAAGAATGAGTGACCTTGCGCAGAGCTT

QA 3 579 3 579
DS 

RD RS1GD29TF 596 0 0
G
GGAAGCATTTCCTCTCTCCTCCGTTTTATCTTCGCCCTTTCTCTCTGCTCTCTTATCTCC
TCCCTCCTCCGGTAGAAGAACCATGGCTTCAACCACCGATTTCACAAAGTCTTTACTATC
TCCCTTCTCCCAACATGGCTTTAATTCCCAGAGAGGAAGTAGTAGACAGAACAAGAACGC
GACATGGCCAAATCAGCACAAGCCCAATAGGCCTCTTCGTGTGAATGGGTTGTTCGGAGG
TGGAAACAACAAAGATAATAACAATACTGAGGATGGACAGTCAAAGGCAGGAGGAATCTT
TGGTAATATGCAGAATATGTATGAGACTGTCAAGAAAGCTCAAATGGTTGTTCAAGTTGA
GGCTGTTCGTGTCCAAAAAGAGTTAGCTGCCGCAGAGTTCGATGGTTATTGTGAAGGCGA
GCTTGTCAAGGTTACGTTATCAGGTAACCAGCAACCAATCCGTACGGATATAACTGAGGC
AGCTATGGAGTTAGGCTCTGAGAAACTTTCACTGTTGGTCACGGAGGCTTACAAGGACGC
ACACGCAAAGAGTGTTGTGGCTATGAAAGAAAGAATGAGTGACCTTGCGCAGAGC

QA 2 596 2 596
DS 

RD RS1CK55TF 639 0 0
GG
CCGTTTTATCTTCGCCCTTTCTCTCTGCTCTCTTATCTCCTCCCTCCTCCGGTAGAAGAA
CCATGGCTTCAACCACCGATTTCACAAAGTCTTTACTATCTCCCTTCTCCCAACATGGCT
TTAATTCCCAGAGAGGAAGTAGTAGACAGAACAAGAACGCGACATGGCCAAATCAGCACA
AGCCCAATAGGCCTCTTCGTGTGAATGGGTTGTTCGGAGGTGGAAACAACAAAGATAATA
ACAATACTGAGGATGGACAGTCAAAGGCAGGAGGAATCTTTGGTAATATGCAGAATATGT
ATGAGACTGTCAAGAAAGCTCAAATGGTTGTTCAAGTTGAGGCTGTTCGT*TCCAAAAAG
AGTTAGCTGCCGCAGAGTTCGATGGTTATTGTGAAGGCGAGCTTGTCAAGGTTACGTTAT
CAGGTAACCAGCAACCAATCCGTACGGATATAACTGAGGCAGCTATGGAGTTAGGCTCTG
AGAAACTTTCACTGTTGGTCACGGAGGCTTACAAGGACGCACACGCAAAGAGTGTTGTGG
CTATGAAAGAAAGAATGAGTGACCTTGCGCAGAGCTTAGGCATGCCGCCAGGCCTCAGCG
AAAGAATGAAATGAAGAAACTGTTTTTGGTTTGTTTG

QA 3 639 3 639
DS 

RD RS1BT45JQ 674 0 0
CTCTCTACTCTCTTATCTCCTCCCTCCTCCGGTAGAAGAACCATGGCTTCAACCACCGAT
TTCACAAAGTCTTTACTATCTCCCTTCTCCCAACATGGCTTTAATTCCCAGAGAGGAAGT
AGTAGACAGAACAAGAACGCGACATGGCCAAATCAGCACAAGCCCAATAGGCCTCTTCGT
GTGAATGGGTTGTTCGGAGGTGGAAACAACAAAGATAATAACAATACTGAGGATGGACAG
TCAAAGGCAGGAGGAATCTTTGGTAATATGCAGAATATGTATGAGACTGTCAAGAAAGCT
CAAATGGTTGTTCAAGTTGAGGCTGTTCGTGTCCAAAAAGAGTTAGCTGCCGCAGAGTTC
GATGGTTATTGTGAAGGCGAGCTTGTCAAGGTCACGTTATCAGGTAACCAGCAACCAATC
CGTACGGATATAACTGAGGCAGCTATGGAGTTAGGCTCTGAGAAACTTTCACTGCTGGTC
ACGGAGGCTTACAAGGACGCACACGCAAAGAGTGTTGTGGCTA**AAAGAAAGAATGAGT
GACCTTGCGCAGAGCTTAGGCATGCCGCCAGGCCTCAGCGAAGGAATGAAATGAAGAAAC
TGTTTTTGGTTTGTTTGTCACATTTAAGTTTCAGGTGTGAGCTTTTTTTTTCTCTATTTA
TCAGTCAGGCAGAG

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1GD29JQ 440 0 0
GACTGTCAAGAAAGCTCAAATGGTTGTTCAAGTTGAGGCTGTTCGTGTCCAAAAAGAGTT
AGCTGCCGCAGAGTTCGATGGTTATTGTGAAGGCGAGCTTGTCAAGGTTACGTTATCAGG
TAACCAGCAACCAATCCGTACGGATATAACTGAGGCAGCTATGGAGTTAGGCTCTGAGAA
ACTTTCACTGTTGGTCACGGAGGCTTACAAGGACGCACACGCAAAGAGTGTTGTGGCTAT
GAAAGAAAGAATGAGTGACCTTGCGCAGAGCTTAGGCATGCTGCCAGGCCTCAGCGAAGG
AATGAAATGAAGAAACTGTTTTTGGTTTGTTTGTCACATTTAAGTTTCAGGTGTGAGCTT
TTTTT**CTCTATTTATCAGTCAGGCAGAGAGAAGCAAAGACCTTTGTACTTTACTCTTA
TGGAATCAGATATTTGTCT
C

QA 1 439 1 439
DS 

RD RS1AG29TF 789 0 0
TGGAAGCATTTCCTCTCTCCTCCGTTTTATCTTCGCCCTTTCTCTCTGCTCTCTTATCTC
CTCCCTCCTCCGGTAGACGAACCATGGCTTCAACCACCGATTTCACAAAGTCTTTACTAT
CTCCCTTCTCCCAACATGGCTTTAATTCCCAGAGAGGAAGTAGTAGACAGAACAAGAACG
CGACATGGCCAAATCAGCACAAGCCCAATAGGCCTCTTCGTGTGAATGGGTTGTTCGTAG
GTGGAAACAACAAAGATAATAACAATACTGAGGATGGACAGTCAAAGGCAGGAGGAATCT
TTGGTAATATGCAGAATATGTATGAGACTGTCAAGAAAGCTCAAATGGTTGTTCAAGTTG
AGGCTGTTCGTGTCCAAAAAGAGTTAGCTGCCGCAGAGTTCGATGGTTATTGTGAAGGCG
AGCTTGTCAAGGTTACGTTATCAGGTAACCAGCAACCAATCCGTACGGATATAACTGAGG
CAGCTATGGAGTTAGGCTCTGAGAAACTTTCACTGTTGGTCACGGAGGCTTACAAGGACG
CACACGCAAAGAGTGTTGTGGCTATGAAAGAAAGAATGAGTGACCTTGCGCAGAGCTTAG
GCATGCCGCCAGGCCTCAGCGAAGGAATGAAATGAAGAAACTGTTTTTGGTTTGTTTGTC
ACATTTAAGTTTCAGGTGTGAGCTTTTTTTTTCTCTATTTATCGGTCAGGCAGAGAGAAG
CAAAGACCTTTGTACTTTACTCTTATGGAATCAGATATTTGTCTTATTACCCTGAGTATG
ATCTTATAC

QA 1 789 1 789
DS 

RD RS1AG29JQ 706 0 0
ATGGCTTCAACCACCGATTTCACAAAGTCTTTACTATCTCCCTTCTCCCAACATGGCTTT
AATTCCCAGAGAGGAAGTAGTAGACAGAACAAGAACGCGACATGGCCAAATCAGCACAAG
CCCAATAGGCCTCTTCGTGTGAATGGGTTGTTCGTAGGTGGAAACAACAAAGATAATAAC
AATACTGAGGATGGACAGTCAAAGGCAGGAGGAATCTTTGGTAATATGCAGAATATGTAT
GAGACTGTCAAGAAAGCTCAAATGGTTGTTCAAGTTGAGGCTGTTCGTGTCCAAAAAGAG
TTAGCTGCCGCAGAGTTCGATGGTTATTGTGAAGGCGAGCTTGTCAAGGTTACGTTATCA
GGTAACCAGCAACCAATCCGTACGGATATAACTGAGGCAGCTATGGAGTTAGGCTCTGAG
AAACTTTCACTGTTGGTCACGGAGGCTTACAAGGACGCACACGCAAAGAGTGTTGTGGCT
ATGAAAGAAAGAATGAGTGACCTTGCGCAGAGCTTAGGCATGCCGCCAGGCCTCAGCGAA
GGAATGAAATGAAGAAACTGTTTTTGGTTTGTTTGTCACATTTAAGTTTCAGGTGTGAGC
TTTTTTTTTCTCTATTTATCGGTCAGGCAGAGAGAAGCAAAGACCTTTGTACTTTACTCT
TATGGAATCAGATATTTGTCTTATTACCCTGAGTATGATCTTATAC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 5

CO CL762Contig1 969 5 26 U
GGAGTGTGCTTTCTTTTCTTTCGTTGTTTCTGAAACGTACACACTTTCACCACCGATCTT
CGAATCTTTTGCGCTTTTTTTTCCTCAGTCTCTCTTGAAAAGCACACAAATGGCGTCTGC
GAACAGAGACATGGCTGTGTACTGTTTCGACACTTTGGTCTCTCACTACAACAACGAAGA
GTCTCCTCCACCTGCCTTTGACGACGCCAATCACCCATTGTTTGTCACCTGGAAGAAAAT
AGTTAATGGTGGGGAGCCTCGTTTGCGTGGATGTATCGGTACACTCGAAGCACGCCGCTT
GATCAGTGGCTTCAAGGACTATGCCTTGACCAGTGCCCTGAGGGATCGTAGGTTCCCGCC
AATCCAACCCAAAGAACTGCCGTTTCTGCAGTGTACGGTCTCAGTCCTTACTGATTATGA
AGATGCAGAGGATTATCTCGACTGGGAGGTTGGAAAGCATGGTATAATCATCGAGTTCAC
TGAACCTGTGACTAATATAAAGCGTAACGCCACGTATCTCCCTGAGGTGCCAGCTCATGA
AGGCTGGACAAAGATAGAGGCAATAGACTCGCTGGTGCGTAAAGCAGGATACAATGGGGA
GATAACGGAGTCAGTGCGTAGGCGTATCCAGCTAACACGTTACCAGAGCACATTATTCAG
CATGCATTATAGTGAATACCTTTCGTACGTGAAGGCCACAAGGGGCCTTGTCCCTGCTAT
TAATGGGACCAGCAAGCCCTCCACGGCCTTCTCCTGATTTGCACCATGAAACTGGGTGCG
TGAGATTGTGTCCTCTTTTGGGACCTCTCCTAATTTATCTTTAGTATTTGTGATTCGAAA
ACTGTAAGGCTCTTTTTGATTTGTTTTTCGAACGAGACGAGATTTGCCTGTTTCACCATT
TTTTGAAACGCAACCGCACTTGCCATTTTAATTATCAAACAATCAGTAGCAGTATGCTGT
TTTCTAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 30 30 30 30 30 30 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FL78TF U 73
AF RS1BA95TF U 1
AF RS1F824TF U 74
AF RS1BA95JQ C 178
AF RS1F824JQ C 188
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TTTTTTTTCTT
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GTTTCGACACTTTGGTCTCTCACTACAACAACGAAGAGTCTCCTCCACCTGCCTTTGACG
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TGCGTGGATGTATCGGTACACTCGAAGCACGCCGCTTGATCAGTGGCTTCAAGGACTATG
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TTCTGCAGTGTACGGTCTCAGTCCTTACTGATTATGAAGATGCAGAGGATTATCTCGACT
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TAGACTCGCTGGTGCGTAAA

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DS 

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CGAATCTTTTGCGCTTTTTTTTCCTCAGTCTCTCTTGAAAAGCACACAAATGGCGTCTGC
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CTCTCCTACACCTGCCTTTGACGACGCCAATCACCCATTGTTTGTCACCTGGAAGAAAAT
AGTTAACGGTGGGGAGCCTCGTTTGCGTGGATGTATCGGTACACTCGAAGCACGCCGCTT
GATCAGTGGCTTCAAGGACTATGCCTTGACCAGTGCCCTGAGGGATCGTAGGTTCCCGCC
AATACAACCCAAAGAACTGCCGTTTCTGCAGTGTACGGTCTCAGTCCTTACTGATTATGA
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TGAACCTGTGACTAATATAAAGCGTAACGCCACGTATCTCCCTGAGGTGCCAGCTCATGA
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GATAACGGAGTCGGTGCGTAG*CGTATCCAGCTAACACGTTATCAGAGCACATTATTCAG
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A

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DS 

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TTTTTTTCTT
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GTTTCGACACTTTGGTCTCTCACTACAACAACGAAGAGTCTCCTCCACCTGCCTTTGACG
ACGCCAATCACCCATTGTTTGTCACCTGGAAGAAAATAGTTAATGGTGGGGAGCCTCGTT
TGCGTGGATGTATCGGTACACTCGAAGCACGCCGCTTGATCAGTGGCTTCAAGGACTATG
CCTTGACCAGTGCCCTGAGGGATCGTAGGTTCCCGCCAATCCGACCCAAAGAACTGCCGT
TTCTGCAGTTTACGGTCTCAGTCCTTACTGATTATGAAGATGCAGAGGATTATCTCGACT
GGGAGGTTGGAAAGCATGGTATAATCATCGAGTTCACTGAACCTGTGACTAATATAAAGC
GTAACGCCACGTATCTCCCTGAGGTGCCAGCTCATGAAGGCTGGACAAAGATAGAGGCAA
TAGACTCGCTGGTGCGTAAAGCAGGATACAATGGGGAGATAACGGAGTCAGTGCGTAGGC
GTATCCAGCTAACACGTTACCAGAGCACATTATTCAGCATGCATTATAGTGAATACCTTT
CGTACGTGAAGGCCACAAGGGGCCTTGTCCCTGCTATTAATGGGACCAGCAAGCCCTCCA
CGGCCTTCTCCTGATTTGCACCATGAAACTGGGTGCGTGAGATTG
GTCCTCTTTTGGGACCTCT

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DS 

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AGAC
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GTTAACGGTGGGGAGCCTCGTTTGCGTGGATGTATCGGTACACTCGAAGCACGCCGCTTG
ATCAGTGGCTTCAAGGACTATGCCTTGACCAGTGCCCTGAGGGATCGTAGGTTCCCGCCA
ATACAACCCAAAGAACTGCCGTTTCTGCAGTGTACGGTCTCAGTCCTTACTGATTATGAA
GATGCAGAGGATTATCTCGACTGGGAGGTTGGAAAGCATGGTATAATCATCGAGTTCACT
GAACCTGTGACTAATATAAAGCGTAACGCCACGTATCTCCCTGAGGTGCCAGCTCATGAA
GGCTGGACAAAGATAGAGGCAATAGACTCGCTGGTGCGTAAAGCAGGATACAATGGGGAG
ATAACGGAGTCGGTGCGTAGGCGTATCCAGCTAACACGTTATCAGAGCACATTATTCAGC
ATGCATTATAGTGAATACCTTTCGTACGTGAAGGCCACAAGGGGCCTTGTTCCGGCTATT
AATGGGACCAGCAAGCCCGCCACGGCCTTCTCCTGATTTGCACCATGAAACTGGGTGCGT
GAGATTGTGTCCTGTTT*GGGACCTCTCCTAATTTATCTTTAGTATTTGTGATTCGAAAA
CTGTAAGGCTC

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DS 

RD RS1F824JQ 782 0 0
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GGCTTCAAGGACTATGCCTTGACCAGTGCCCTGAGGGATCGTAGGTTCCCGCCAATCCGA
CCCAAAGAACTGCCGTTTTTGCAGTTTACGGTCTCAGTCCTTACTGATTATGAAGATGCA
GAGGATTATCTCGACTGGGAGGTTGGAAAGCATGGTATAATCATCGAGTTCACTGAACCT
GTGACTAATATAAAGGGTAACGCCACGTATCTCCCTGAGGTGCCAGCTCATGAAGGCTGG
ACAAAGATAGAGGCAATAGACTCGCTGGTGCGTAAAGCAGGATACAATGGGGAGATAACG
GAGTCAGTGCGTAGGCGTATCCAGCTAACACGTTACCAGAGCACATTATTCAGCATGCAT
TATAGTGAATACCTTTCGTACGTGAAGGCCACAAGGGGCCTTGTCCCTGCTATTAATGGG
ACCAGCAAGCCCTCCACGGCCTTTTCCTGATTTGCACCATGAAACTGGGTGCGTGAGATT
G*GTCCTCTTTTGGGACCTCTCCTAATTTATCTTTAGTATTTGTGATTCGAAAACTGTAA
GGCTCTTTTTGATTTGTTTTTCGAACGAGACGAGATTTGCCTGTTTCACCATTTTTTGAA
ACGCAACCGCACTTGCCATTTTAATTATCAAACAATCAGTAGCAGTATGCTGTTTTCTAA
CG

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 6

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CTGACAGATATCAGTATAACGACCTTGGTATCAGATGGGATACTTGGGGCCGTTTTGTGG
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TGCCTTACATGGGGGAAGTGACACCTTTCAAGAATTACCTTGAGCGTTACACTACCCCAT
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TCATTGTCCTCTCCAGTTATTCTCCTTTTGTGAAGTATACACCGCAGTGGAGATGGCTTG
ATGAAGAGTTCAAAAGAGTTGACAGGGAGAAAACTCCTTGGCTAATTGTTCTGATGCATG
CCCCTATATACAACAGTAACGAAGCACATTTCAAGGAGGGTGAAAACATGCGAGCAGCTT
TTGAGGATTGGTTTGTCGAATACAGAGTCGATGTTATCTTTGCTGGACATGTTCACGCCT
ACGAGAGATCGTACCGAGCATCAAATGTGCGGTATAATGTGTCAAGTGGAGATCGTTTCC
CGGTTCCAGATACCTCAGCTCCTGTTTATATCACAGTTGGAGACGGAGGAAACCAAGAAG
GTCTTGCGGGAAGGTTTAGGGAACCACAGCCAGATTATTCTGCATTTAGAGAAGCTAGCT
ACGGCCACTCCACTCTGGACATAAAAAACAGAACACATGCGATATACCACTGGAACCGCA
ATGATGATGGGAAGAAAGTAGCAACAGATGAGTTTGTGTTATACAACCAGTACTGGGGAA
AGAACATTCGACGGAGAAAGCTGAAGAAGCATTATATCAAGAATGTTGTGGTTGACTGGA
TTGCCAGTTAATTTGCTTACTAAAGTAGAGGCGAAGATATTCGTCCAACTCTTTACTCTT
TTTCTACCAGATCTTGATTACTTATAATATTGTTTGTGCTTATTCATCCATGAAATTTAA
TATTCTAATAACATATAAACTGGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1GJ41TF U 1
AF RS1FJ53TF U 41
AF RS1GW35TF U 41
AF RS1GD75JQ C 730
AF RS1GW35JQ C 352
AF RS1FJ53JQ C 522
BS 1 83 RS1GJ41TF
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CTGACAGATATCAGTATAACGACGTTGGTATCAGATGGGATACTTGGGGCCGTTTTGTGG
AGCGAAGTACCGCTTATCAACCCTGGCTTTGGTCTGCTGGCAATCACGAGATCGATTACA
TGCCTTACATGGGGGAAGTGACACCTTTCAAGAATTACCTTGAGCGTTACACTACCCCAT
ACTTGGCTTCAAAAAGCAGTGATCCTCTGTGGTATGCTGTTAGGCGTGCCTCCGCTCATA
TCATTGTCCTCTCCAGTTATTCTCCTTTTGTGAAGTATACACC

QA 1 343 1 343
DS 

RD RS1FJ53TF 580 0 0
G
CTTGGAGATCTCTCTTACGCTGACAGATATCAGTATAACGACCTTGGTATCAGATGGGAT
ACTTGGGGCCGTTTTGTGGAGCGAAGTACCGCTTATCAACCCTGGCTTTGGTCTGCTGGC
AATCACGAGATCGATTACATGCCTTACATGGGGGAAGTGACACCTTTCAAGAATTACCTT
GAGCGTTACACTACCCCATACTTGGCTTCAAAAAGCAGTGATCCTCTGTGGTATGCTGTT
AGGCGTGCCTCCGCTCATATCATTGTCCTCTCCAGTTATTCTCCTTTTGTGAAGTATACA
CCGCAGTGGAGATGGCTTGATGAAGAGTTCAAAAGAGTTGACAGGGAGAAAACTCCTTGG
CTAATTGTTCTGATGCATGCCCCTATATACAACAGTAACGAAGCACATTTCAAGGAGGGT
GAAAACATGCGAGCAGCTTTTGAGGATTGGTTTGTCGAATACAGAGTCGATGTTATCTTT
GCTGGACATGTTCACGCCTACGAGAGATCGTACCGAGCATCAAATGTGCGGTATAATGTG
TCAAGTG*AGATCGTTTCCCGGTTC*AGATACCTCAGCT

QA 2 580 2 580
DS 

RD RS1GW35TF 628 0 0
G
CTTGGAGATCTCTCTTACGCTGACAGATATCAGTATAACGACCTTGGTATCAGATGGGAT
ACTTGGGGCCGTTTTGTGGAGCGAAGTACCGCTTATCAACCCTGGCTTTGGTCTGCTGGC
AATCACGAGATCGATTACATGCCTTACATGGGGGAAGTGACACCTTTCAAGAATTACCTT
GAGCGTTACACTACCCCATACTTGGCTTCAAAAAGCAGTGATCCTCTGTGGTATGCTGTT
AGGCGTGCCTCCGCTCATATCATTGTCCTCTCCAGTTATTCTCCTTTTGTGAAGTATACA
CCGCAGTGGAGATGGCTTGATGAAGAGTTCAAAAGAGTTGACAGGGAGAAAACTCCTTGG
CTAATTGTTCTGATGCATGCCCCTATATACAACAGTAACGAAGCACATTTCAAGGAGGGT
GAAAACATGCGAGCAGCTTTTGAGGATTGGTTTGTCGAATACAGAGTCGATGTTATCTTT
GCTGGACATGTTCACGCCTACGAGAGATCGTACCGAGCATCAAATGTGCGGTATAATGTG
TCAAGTGGAGATCGTTTCCCGGTTCCAGATACCTCAGCTCCTGTTTATATCACAGTTGGA
GACGGAGGAAACCAAGAAAGTCTTGCG

QA 2 628 2 628
DS 

RD RS1GD75JQ 275 0 0
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GGAAGAAAGTAGCAACAGATGAGTTTGTGTTATACAACCAGTACTGGGGAAAGAACATTC
GACGGAGAAAGCTGAAGAAGCATTATATCAAGAATGTTGTGGTTGACTGGATTGCCAGTT
AATTTGCTTACTAAAGTAGAGGCGAAGATATTCGTCCAACTCTTTACTCTTTTTCTACCA
GATCTTGATTACTTATAATATTGTTTGTGGTTATT

QA 1 275 1 275
DS 

RD RS1GW35JQ 695 0 0
GATGGCTTGATGAAGAGTTCAAAAGAGTTGACAGGGAGAAAACTCCTTGGCTAATTGTTC
TGATGCATGCCCCTATATACAACAGTAACGAAGCACATTTCAAGGAGGGTGAAAACATGC
GAGCAGCTTTTGAGGATTGGTTTGTCGAATACAGAGTCGATGTTATCTTTGCTGGACATG
TTCACGCCTACGAGAGATCGTACCGAGCATCAAATGTGCGGTATAATGTGTCAAGTGGAG
ATCGTTTCCCGGTTCCAGATACCTCAGCTCCTGTTTATATCACAGTTGGAGACGGAGGAA
ACCAAGAAGGTCTTGCGGGAAGGTTTAGGGAACCACAGCCAGATTATTCTGCATTTAGAG
AAGCTAGCTACGGCCACTCCACTCTGGACATAAAAAACAGAACACATGCGATATACCACT
GGAACCGCAATGATGATGGGAAGAAAGTAGCAACAGATGAGTTTGTGTTATACAACCAGT
ACTGGGGAAAGAACATTCGACGGAGAAAGCTGAAGAAGCATTATATCAAGAATGTTGTGG
TTGACTGGATTGCCAGTTAATTTGCTTACTAAAGTAGAGGCGAAGATATTCGTCCAACTC
TTTACTCTTTTTCTACCAGATCTTGATTACTTATAATATTGTTTGTGCTTATTCATCCAT
GAAATTTAATATTCTAATAACATATAAACTGGCTT

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DS 

RD RS1FJ53JQ 525 0 0
GCTGGACATGTTCACGCCTACGAGAGATCGTACCGAGCATCAAATGTGCGGTATAATGTG
TCAAGTGGAGATCGTTTCCCGGTTCCAGATACCTCAGCTCCTGTTTATATCACAGTTGGA
GACGGAGGAAACCAAGAAGGTCTTGCGGGAAGGTTTAGGGAACCACAGCCAGATTATTCT
GCATTTAGAGAAGCTAGCTACGGCCACTCCACTCTGGACATAAAAAACAGAACACATGCG
ATATACCACTGGAACCGCAATGATGATGGGAAGAAAGTAGCAACAGATGAGTTTGTGTTA
TACAACCAGTACTGGGGAAAGAACATTCGACGGAGAAAGCTGAAGAAGCATTATATCAAG
AATGTTGTGGTTGACTGGATTGCCAGTTAATTTGCTTACTAAAGTAGAGGGGAAGATATT
CGTCCAACTCTTTACTCTTTTTTTACCAGATCTTGATTACTTATAATATTGTTTGTGCTT
ATTCATCCATGAAATTTAATATTTTAATAACATATAAACTGGCTT

QA 1 525 1 525
DS 



AS 1 7

CO CL764Contig1 1067 7 10 U
GTTTTGCATACAAGTAATTTGTGAAGATTCGGTAATCTATACATATACTTAATCAAAGAA
CCAACAAACACTTCATTGATTTATTTTAATACATATAAACCTTAATCAAAACCAAAAGCA
AAGCTTCTATACAAGTTGCTTGCAACCTAACCAAAATTTTCAATCTTTTTTTCTTTTCTT
ATTAAAATTTTGAAGGTACTATTGAATAATGACGACTTTTTTTTATGTTAATGTACTTCT
CTTTGAACGATTTTGCTCATCCTAAAATATGAATATCCCGGCGGAGTTACTCTGCTCGCC
GGCACAAGGAGAGCTTGAAATGTCGACGTTTATGGAGATTTGCGATTTACATTTCTCATT
TTGTTCGTCCTGCATTATCTGCACTGATCTGCATTCTGCACTGCAGAATCCCATCTCTCC
TTTGTACATGTATATGTCTTTGCCTTGAAGTCTCTTCTTACACAAGCAACACGCGCTTAG
AAACTCTGTCGATTCCCTAAAAGCCTCTCTCTTAATAACCGGTGGTTCAACGGGGTTAAC
CAACGGTTTATGCTTTCTCCGATCATCATACTCCGACCCATTTTCAAACAGTTCAAACCC
CTCGTCACTGTAATACACTTTGGTCGGCCCACCAGGGCTCGTCACGTAAGTGTATTCCTC
ATCCGACAGATCGATCTCAGGGCACCGGAATCTCCCGGAGTAGCAAACCGGATCGTACCG
GTTACTTTCCTCCAACGCAGCGACGATACCTAAACCGATACCACCGGAGCTGTACCGTTT
CGAGTTAACCGGCGAGGGGAATTTCATATCTAACGGACTCCTCGGACTCGCCGAGGAATC
TTCCCGTTTGGTAGCAGATCTTCTTCCCGGAACCAACATCTCCGACAACTTTCGGATCAT
TAGATGAGATCTCTTGCTCAGTGTCATAATCAAGAATCAAGAAACGCAAGCTTATAGGAA
AGAATCTGAATGAAGAGGAGAAATATGGAGAAAGGTAGAGAGACTTTTCTTGAGCTCACT
GGTTTCCTTTGAAGTTTGGAATTTTGTGTGCGATGATCAATGATTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AW61JQ U 59
AF RS1B208JQ U 1
AF RS1G892JQ U 56
AF RS1G892TF C 487
AF RS1AT42JQ U 442
AF RS1AT42TF C 442
AF RS1B208TF C 310
BS 1 785 RS1B208JQ
BS 786 786 RS1G892JQ
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BS 838 1011 RS1AT42JQ
BS 1012 1067 RS1B208TF

RD RS1AW61JQ 722 0 0
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CAAAGCTTCTATACAAGTTGCTTGCAACCTAACCAAAATTTTCAATCTTTTTTTCTTTTC
TTATTAAAATTTTGAAGGTACTATTGAATAATGACGACTTTTTTTTATGTTAATGTACTT
CTCTTTGAACGATTTTGCTCATCCTAAAATATGAATATCCCGGCGGAGTTACTCTGCTCG
CCGGCACAAGGAGAGCTTGAAATGTCGACGTTTATGGAGATTTGCGATTTACATTTCTCA
TTTTGTTCGTCCTGCATTATCTGCACTGATCTGCATTCTGCACTGCAAAATCCCATCTCT
CCTTTGTACATGTATATGTCTTTGCCTTGAAGTCTCTTCTTACACAAGCAACGCGCGCTT
AAAAACTCTGTCGATTCCCTAAAAGCCTCTCTCTTAATAACCGGTGGTTCAACGGGGTTA
ACCAACGGTTTATGCTTTCTCCGATCATCATACTCCGACCCATTTTCAAACAGTTCAAAC
CCCTCGTCACTGTAATACACTTTGGTCGGCCCACCAGGGCTCGTCACGTAAGTGTATTCC
TCATCCGACAGATCGATCTCAGGGCACCGGAATCTCCCGGAGTAGCAAACCGGATCGTAC
CGGTTACTTTCCTCCAACGCAGCGACGATACCTAAACCGATACCACCGGAGCTGTACCGT
TT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RS1B208JQ 840 0 0
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CCAACAAACACTTCATTGATTTATTTTAATACATATAAACCTTAATCAAAACCAAAAGCA
AAGCTTCTATACAAGTTGCTTGCAACCTAACCAAAATTTTCAATCTTTTTTTCTTTTCTT
ATTAAAATTTTGAAGGTACTATTGAATAATGACGACTTTTTTTTATGTTAATGTACTTCT
CTTTGAACGATTTTGCTCATCCTAAAATATGAATATCCCGGCGGAGTTACTCTGCTCGCC
GGCACAAGGAGAGCTTGAAATGTCGACGTTTATGGAGATTTGCGATTTACATTTCTCATT
TTGTTCGTCCTGCATTATCTGCACTGATCTGCATTCTGCACTGCAGAATCCCATCTCTCC
TTTGTACATGTATATGTCTTTGCCTTGAAGTCTCTTCTTACACAAGCAACACGCGCTTAG
AAACTCTGTCGATTCCCTAAAAGCCTCTCTCTTAATAACCGGTGGTTCAACGGGGTTAAC
CAACGGTTTATGCTTTCTCCGATCATCATACTCCGACCCATTTTCAAACAGTTCAAACCC
CTCGTCACTGTAATACACTTTGGTCGGCCCACCAGGGCTCGTCACGTAAGTGTATTCCTC
ATCCGACAGATCGATCTCAGGGCACCGGAATCTCCCGGAGTAGCAAACCGGATCGTACCG
GTTACTTTCCTCCAACGCAGCGACGATACCTAAACCGATACCACCGGAGCTGTACCGTTT
CGAGT*AACCG*CGAGGGGA*TTTCATATCTAACGGACTCCTCGGACTCGC
GAGGATCTT

QA 1 831 1 831
DS 

RD RS1G892JQ 782 0 0
GAG
AACCAACAAACACTTCATTGATTTATTTTAATACATATAAACCTTAATCAAAACCAAAAG
CAAAGCTTCTATACAAGTTGCTTGCAACCTAACCAAAATTTTCAATCTTTTTTTCTTTTC
TTATTAAAATTTTGAAGGTACTATTGAATAATGACGACTTTTTTTTATGTTAATGTACTT
CTCTTTGAACGATTTTGCTCATCCTAAAATATGAATATCCCGGCGGAGTTACTCTGCTCG
CCGGCACAAGGAGAGCTTGAAATGTCGACGTTTATGGAGATTTGCGATTTACATTTCTCA
TTTTGTTCGTCCTGCATTATCTGCACTGATCTGCATTCTGCACTGCAGAATCCCATCTCT
CCTTTGTACATGTATATGTCTTTGCCTTGAAGTCTCTTCTTACACAAGCAACACGCGCTT
AGAAACTCTGTCGATTCCCTAAAAGCCTCTCTCTTAATAACCGGTGGTTCAACGGGGTTA
ACCAACGGTTTATGCTTTCTCCGATCATCATACTCCGACCCATTTTCAAACAGTTCAAAC
CCCTCGTCACTGTAATACACTTTGGTCGGCCCACCAGGGCTCGTCACGTAAGTGTATTCC
TCATCCGACAGATCGATCTCAGGGCACCGGAATCTCCCGGAGTAGCAAACCGGATCGTAC
CGGTTACTTTCCTCCAACGCAGCGACGATACCTAAACCGATACCACCGGAGCTGTACCGT
TTCGAGTTAACCGGCGAGGGGAATTTCATATCTAACGGACTCCTCGGACTCGCCGAGGA

QA 4 782 4 782
DS 

RD RS1G892TF 533 0 0
TGTCGATTCCCTAAAAGCCTCTCTCTTAATAACCGGTGGTTCAACGGGGTTAACCAACGG
TTTATGCTTTCTCCGATCATCATACTCCGACCCATTTTCAAACAGTTCAAACCCCTCGTC
ACTGTAATACACTTTGGTCGGCCCACCAGGGCTCGTCACGTAAGTGTATTCCTCATCCGA
CAGATCGATCTCAGGGCACCGGAATCTCCCGGAGTAGCAAACCGGATCGTACCGGTTACT
TTCCTCCAACGCAGCGACGATACCTAAACCGATACCACCGGAGCTGTACCGTTTCGAGTT
AACCGGCGAGGGGAATTTCATATCTAACGGACTCCTCGGACTCGCCGAGGAATCTTCCCG
TTTGGTAGCAGATCTTCTTCCCGGAACCAACATCTCCGACAACTTTCGGATCATTAGATG
AGATCTCTTGCTCAGTGTCATAATCAAGAATCAAGAAACGCAAGCTTATAGGAAAGAATC
TGAATGAAGAGGAGAAATATGAAGAAAGGTAGAGAGACTTTTCTT
GAGCTCCC

QA 1 525 1 525
DS 

RD RS1AT42JQ 572 0 0
GCCTTGAAGTCTCTTCTTACACAAGCAACACGCGCTTAGAAACTCTGTCGATTCCCTAAA
AGCCTCTCTCTTAATAACCGGTGGTTCAACGGGGTTAACCAACGGTTTATGCTTTCTCCG
ATCATCATACTCCGACCCATTTTCAAACAGTTCAAACCCCTCGTCACTGTAATACACTTT
GGTCGGCCCACCAGGGCTCGTCACGTAAGTGTATTCCTCATCCGACAGATCGATCTCAGG
GCACCGGAATCTCCCGGAGTAGCAAACCGGATCGTACCGGTTACTTTCCTCCAACGCAGC
GACGATACCTAAACCGATACCACCGGAGCTGTACCGTTTCGAGTTAACCGGCGAGGGGAA
TTTCATATCTAACGGACTCCTCGGACTCGCCGAGGAATCTTCCCGTTTGGTAGCAGATCT
TCTTCCCGGAACCAACATCTCCGACAACTTTCGGATCATTAGATGAGATCTCTTGCTCAG
TGTCATAATCAAGAATCAAGAAACGCAAGCTTATAGGAAAGAATCTGAATGAAGAGGAGA
AATATGGAGAAAGGTAGAGAGACTTTTCTT
CC

QA 1 570 1 570
DS 

RD RS1AT42TF 572 0 0
GCCTTGAAGTCTCTTCTTACACAAGCAACACGCGCTTAGAAACTCTGTCGATTCCCTAAA
AGCCTCTCTCTTAATAACCGGTGGTTCAACGGGGTTAACCAACGGTTTATGCTTTCTCCG
ATCATCATACTCCGACCCATTTTCAAACAGTTCAAACCCCTCGTCACTGTAATACACTTT
GGTCGGCCCACCAGGGCTCGTCACGTAAGTGTATTCCTCATCCGACAGATCGATCTCAGG
GCACCGGAATCTCCCGGAGTAGCAAACCGGATCGTACCGGTTACTTTCCTCCAACGCAGC
GACGATACCTAAACCGATACCACCGGAGCTGTACCGTTTCGAGTTAACCGGCGAGGGGAA
TTTCATATCTAACGGACTCCTCGGACTCGCCGAGGAATCTTCCCGTTTGGTAGCAGATCT
TCTTCCCGGAACCAACATCTCCGACAACTTTCGGATCATTAGATGAGATCTCTTGCTCAG
TGTCATAATCAAGAATCAAGAAACGCAAGCTTATAGGAAAGAATCTGAATGAAGAGGAGA
AATATGGAGAAAGGTAGAGAGACTTTTCTT
CC

QA 1 570 1 570
DS 

RD RS1B208TF 758 0 0
GAGAGC
TGAAATGTCGACGTTTATGGAGATT*GCGATTTACATT*CTCATTTTGTTCGTC*TGCAT
TATCTGCACTGATCTGCATTCTGCACTGCAGAATCCCATCTCTCCTTTGTACATGTATAT
GTCTTTGCCTTGAAGTCTCTTCTTACACAAGCAACACGCGCTTAGAAACTCTGTCGATTC
CCTAAAAGCCTCTCTCTTAATAACCGGTGGTTCAACGGGGTTAACCAACGGTTTATGCTT
TCTCCGATCATCATACTCCGACCCATTTTCAAACAGTTCAAACCCCTCGTCACTGTAATA
CACTTTGGTCGGCCCACCAGGGCTCGTCACGTAAGTGTATTCCTCATCCGACAGATCGAT
CTCAGGGCACCGGAATCTCCCGGAGTAGCAAACCGGATCGTACCGGTTACTTTCCTCCAA
CGCAGCGACGATACCTAAACCGATACCACCGGAGCTGTACCGTTTCGAGTTAACCGGCGA
GGGGAATTTCATATCTAACGGACTCCTCGGACTCGCCGAGGAATCTTCCCGTTTGGTAGC
AGATCTTCTTCCCGGAACCAACATCTCCGACAACTTTCGGATCATTAGATGAGATCTCTT
GCTCAGTGTCATAATCAAGAATCAAGAAACGCAAGCTTATAGGAAAGAATCTGAATGAAG
AGGAGAAATATGGAGAAAGGTAGAGAGACTTTTCTTGAGCTCACTGGTTTCCTTTGAAGT
TTGGAATTTTGTGTGCGATGATCAATGATTGC

QA 7 758 7 758
DS 



AS 2 6

CO CL765Contig1 927 3 28 U
TGCTGTAATATTCGCTGTGGTGATTGTGTGGATCTATGCTCACCTTCTTACAGTTGGTGG
GGCATACAATGGCGCTGCACCAACTACGCAAACAAGTTGCAGGACTGATCGTGCTGGCAT
CATAGGTGCTGCTCCATGGATAAGAGTTCCATGGCCATTCCAGTGGGGTGCACCTTCTTT
TGATGCTGGAGAAACTTTTGCAATGATGATGGCTTCTTTTGTTGCTCTAGTTGAGTCAAC
TGGTGGGTTCATAGCTGTCTCAAGATATGCAAGTGCAACAATGATGCCACCTTCTATTCT
CAGCCGTGGTATTGGCTGGCAGGGAGTGGCTATTCTGATATCAGGGCTGTTTGGTACTGG
TGCTGGTTCCTCTGTCTCTATAGAAAACGCTGGACTGTTAGCACTGACAAGAGTTGGTAG
CAGAAGGGTTGTTCAGATAGCTGCAGGCTTCATGATCTTCTTCTCTATTCTCGGAAAATT
CGGAGCTGTGTTTGCGTCAATCCCTGCACCTATAATCGCTGCTTTGTACTGCCTCTTCTT
TGCCTACGTAGGAGCTGGAGGTCTGAGTTTTCTTCAGTTCTGCAACTTAAACAGCTTCAG
GACCAAGTTCATCTTAGGTTTCTCTGTCTTCCTCGGCTTGTCCATCCCTCAGTACTTTAA
CGAATACACTGCAATCAAAGGCTATGGTCCTGTCCACACAGGCGCTCGTTGGTTCAATGA
TATGGTGAATGTCCCGTTCTCCTCTGAACCTTTTGTTGCTGGCGTGGTGGCCTTCTTCTT
GGACAACACGTTGCACAAGAAAGATTCGTCGATAAAGAAAGACAGAGGGAAGCATTGGTG
GGATAAGTTTAGATCTTTCAAAGTGACACAGAAGCGAAGAGTTCTACTCTCTTCCTTTCA
TCTCACAAGTACTTCCCTTCTGTCTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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TGCTGGATCCTCTGTCTCTATAGAAAACGCTGGACTCTTAGCATTGACAAGAGTTGGTAG
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QA 1 589 1 589
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TGGCAGGGAGTGGCTATTCTGATATCAGGGCTGTTTGGTACTGGTGCTGGTTCCTCTGTC
TCTATAGAAAACGCTGGACTGTTAGCACTGACAAGAGTTGGTAGCAGAAGGGTTGTTCAG
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GGTTTCTCTGTCTTCCTCGGCTTGTCCATCCCTCAGTACTTTAACGAATACACTGCAATC
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TTCTCCTCTGAACCTTTTGTTGCTGGCGTGGTGGCCTTCTTCTTGGACAACACGTTGCAC
AAGAAAGATTCGTCGATAAAGAAAGACAGAGGGAAGCATTGGTGGGATAAGTTTAGATCT
TT

QA 1 662 1 662
DS 

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TCCTCTGTCTCTATAGAAAACGCTGGACTGTTAGCACTGACAAGAGTTGGTAGCAGAAGG
GTTGTTCAGATAGCTGCAGGCTTCATGATCTTCTTCTCTATTCTCGGAAAATTCGGAGCT
GTGTTTGCGTCAATCCCTGCACCTATAATCGCTGCTTTGTACTGCCTCTTCTTTGCCTAC
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AATGTCCCGTTCTCCTCTGAACCTTTTGTTGCTGGCGTGGTGGCCTTCTTCTTGGACAAC
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QA 1 740 1 740
DS 



CO CL765Contig2 769 3 20 U
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CAAGATACTTTTTAGAAGTTTCCAAAGTTGTGAAAGGAACAGAACAAAAGAACTCAGAGG
CAACAATGGTGAAACTCTGAGTAAACTCTTTGCTCATCTCTCTCTCTCTCT**TCCGTTT
CTAGACAGAAGGGAAGTACTTGTTGAGATTGAAAGGAAGAGAGTAGAACTCTTCGCTTCT
TGTGTCACCTTTGAAAGATCTAAACTTATCCCACCAATGCTTCCCTCTGTCTTTCCTTAT
CGAAAAATCTTTCTTGTGCAACGTGTTGTCCAAGAAGAAAGCCACCACACCAGCAACAAA
AGGTTCAGAAAAAAACGGGACATTCACCATATCATTGAACCAACGAGCGCCTGTGTGGAC
AGGACCATAGCCTTTGATTGCAGTGTACTCGTTAAAGTACTGAGGGATGGACAAGCCGAG
GAAGACAGAGAAACCTAAGATGAACTTAGTCCTGAAGCTGTTTAAGTTGCAGAACTGAAG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 0 15 15 0 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FB53JQ U 72
AF RS1GF32JQ U 1
AF RS1GJ54JQ U 8
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TTAGAAGTTTCCAAAGTTGTGAAAGGAACGGAACAAAAGAACTCAGAGGCAACAATGGTG
AAACTCTGAGTAAACTCTTTGCTCATCTCTCTCTCTCTCT**TCCGTTTCTAGACAGAAG
GGAAGTACTTGTTGAGATTGAAAGGA

QA 1 206 1 206
DS 

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CAAGATACTTTTTAGAAGTTTCCAAAGTTGTGAAAGGAACAGAACAAAAGAACTCAGAGG
CAACAATGGTGAAACTCTGAGTAAACTCTTTGCTCATCTCTCTCTCTCTCT**TCCGTTT
CTAGACAGAAGGGAAGTACTTGTTGAGATTGAAAGGAAGAGAGTAGAACTCTTCGCTTCT
TGTGTCGCCTTTGAAAGATCTAAACTTATCCCACCAATGCTTCCCTCTGTCTTTCCTTAT
CGACGAATCTTTCTTGTGCAACGTGTTGTCCAAGAAGAAGGCCACCACGCCAGCAACAAA
AGGTTCAGAGGAGAACGGGACATTCACCATATCATTGAACCAACGAGCGCCTGTGTGGAC
AGGACCATAGCCTTTGATTGCAGTGTATTCGTTAAAGTACTGAGGGATGGACAAGCCGAG
GAAGACAGAGAAACCTAAGATGAACTTGGTCCTGAAGCTGTTTAAGTTGCAGAACTGAAG
AAAACTCAGACCTCCAGCTCCTACGTAGGCAAAGAAGAGGCAGTACAAAGCAGCGATTAT
AGGT

QA 1 664 1 664
DS 

RD RS1GJ54JQ 762 0 0
AATCACAAAGTTGTGTACCATTGGATTTACAGAGTCAAAAGCATTAGAAAGAGTAAACAA
CAATGCTCTTTAAGGTTCATGATCATTAATTTTGTAAATAAGACTATAGAATGCAAGATA
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GAAAAAAACGGGACATTCACCATATCGTTGAACCAACGAGCGCCTGTGTGGACAGGACCA
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AGACCTCCAGCTCCTACGTAGGCAAAGAAGAGACAGTACAAAGCAGCGATTATAGGTGCA
GGGACTGACGCAAACACAGCTCCGAATTTTCCGAGAATAGAGAAGAAGATCATGAAGCCT
GCAGCTATCTGAAAACCCTTCTGCTACCAACTCTTGTCATGC

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 7

CO CL766Contig1 1294 7 2 U
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CGAGGTCGTTTGCGGAGGGATTCAAGGGGTTCTGGGAGGAGAGGTTGTCGTTCCTGGAGA
ATTACACGAGGTTCACCAAACGCGACACGCCTCTTCCTTCTTGGTCTTCCTCCGACGTTG
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CGACTTTTGGTGTTGCCGGAGCTGCACTCGGAGCTCTATCTACTGCCGCTTTTGCCTGGA
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GGACCTTTGGGCAGGAAGTTGCGAACCACACCTTGCAACTCTATAAGCTGGACACAATGG
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AAAATAACAAAGACTGTTGCTACTTTTTCCATCGAAGTATCTATATTGCAATCAGCTTGA
AATGTGATAAAAGTTAAATCCATTTCCAGACCTTTTTTATTATGTTATCACTCGTTGAAC
ATGTTTGTTTTTCTTGTCTCAATAATACATGTCCTCACATGGAGAGTGTTTTTTTGTGGA
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GGTAAGGTGTACTCCACTCTATTTGAAAGAATTGAAGAAGCTCACAGTGTCTGCAAGTGC
AACGATGAGGGAGTCAACGTCTTCCTTTGTGTTGTAAAAGTAAAGGCTGGCGCGTGCACT
TGCATTCACTCCAAGATACCGGTGTAGTGGCTGCGCGCAGTGGTGTCCTGACCTTATCGC
AACTCCATGCTGTTGATCAAGAAAGGTTGCCAAATCAGTTGGGTGCAGTCCCTCCACATT
GAAGGAACAAAGAGCTGCCCTTCGAACACTTTCAGAAGGCTTTGGGCCGTATATCCGAAC
ATCAGGCACTGAAGACAGTTTCTCGTACAAATAGTTAGCAAGCTCTACCTCATATTCATG
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ACCAATTGCAGGTGTTCCAGCTTCAAATCTGGATGGAGGTTCTGCATAAGTCGAATGATC
AAGAAATACACCTGAGATCATTTCTCCGCCACCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BM63JQ C 1
AF RS1BM63TF U 1
AF RS1DJ91JQ U 544
AF RS1BC05TF C 580
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RD RS1BM63JQ 644 0 0
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ATGTTTGTTTTTCTTGTCTCAATAATACATGTCCTCACATG
AAA

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1BM63TF 642 0 0
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CGAGGTCGTTTGCGGAGGGATTCAAGGGGTTCTGGGAGGAGAGGTTGTCGTTCCTGGAGA
ATTACACGAGGTTCACCAAACGCGACACGCCTCTTCCTTCTTGGTCTTCCTCCGACGTTG
AGGAGTTCATAGCTTCCGATCCCGTTCATGGACCCACCCTGAAAACAGCTAGGGAAGCTG
CGACTTTTGGTGTTGCCGGAGCTGCACTCGGAGCTCTATCTACTGCCGCTTTTGCCTGGA
AATATTCTAGGAGTCCGCATGGTGCTGCATTGTCCTTCTTAGGAGGAGGTGTTTTTGGTT
GGACCTTTGGGCAGGAAGTTGCGAACCACACCTTGCAACTCTATAAGCTGGACACAATGG
CGGCTCAAGTTAAGTTCATGGAATGGTGGGAGCGCAAATCTCAATGAAGGTCTTGAATCC
AAAATAACAAAGACTGTTGCTACTTTTTCCATCGAAGTATCTATATTGCAATCAGCTTGA
AATGTGATAAAAGTTAAATCCATTTCCAGACCTTTTTTATTATGTTATCACTCGTTGAAC
ATGTTTGTTTTTCTTGTCTCAATAATACATGTCCTCACATGG

QA 1 642 1 642
DS 

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GC
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AAATAATTAGCCTTTGAAGCATATATATAGCATACAACAAGCTGCGAGATCCAGGGGTAA
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GCACTGAAGACAGTTTCTCGTACAAATAGTTAGCAAGCTCTACCTCATATTCATGGATTT
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TTGCAGGTGTTCCAGCTTCAAATCTGGATGGAGGTTCTGCATAAGTCGAATGATCAAGAA
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QA 3 751 3 751
DS 

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TCCTGACCTTATCGCAACTCCATGCTGTTGATCAAGAAAGGTTGCCAAATCAGTTGGGTG
CAGTCCCTCCACATTGAAGGAACAAAGAGCTGCCCTTCGAACACTTTCAGAAGGCTTTGG
GCCGTATATCCGAACATCAGGCACTGAAGACAGTTTCTCGTACAAATAGTTAGCAAGCTC
TACCTCATATTCATGGATTTTCGGCATGCCAATATCTGACAAGTAATCACATGCTGCTCC
AAGGGCAATTGCTTCACCAATTGCAGGTGTTCCAGCTTCAAATCTGGATGGAGGTTCTGC
ATAAGTCGAATGATCAAGAAATACACCTGAGAT
CATTTC

QA 7 699 7 699
DS 

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AGCAAGCTCTACCTCATATTCATGGATTTTTGGCATGCCAATATCTGACAAGTAATCGCA
TGCTGCTCCAAGGGCAATTGCTTCACCAATTGCAGGTGTTCCAGCTTCAAATCTGGATGG
AGGTTCTGCATAAGTCGAATGATCAAGAAATACATCTGAGAT

QA 1 222 1 222
DS 

RD RS1DJ91TF 716 0 0
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TATCACTCGTTGAACATGTTTGTTTT*CTTGTCTCAATAATACATGTCCTCACATGGAGA
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GGGACTTGAAGATGATAAGTAAATAATTAGCCTTTGAAGCATATATATAGCATACAACAA
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AGTGTCTGCAAGTGCAACGATGAGGGAGTCAACGTCTTCCTTTGTGTTGTAAAAGTAAAG
GCTGGCGCGTGCACTTGCATTCACTCCAAGATACCGGTGTAGTGGCTGCGCGCAGTGGTG
TCCTGACCTTATCGCAACTCCATGCTGTTGATCAAGAAAGGTTGCCAAATCAGTTGGGTG
CAGTCCCTCCACATTGAAGGAACAAAGAGCTGCCCTTCGAACACTTTCAGAAGGCTTTGG
GCCGTATATCCGAACATCAGGCACTGAAGACAGTTTCTCGTACAAATAGTTAGCAAGCTC
TACCTCATATTCATGGATTTTCGGCATGCCAATATCTGACAAGTAATCACATGCTGCTCC
AAGGGCAATTGCTTCACCAATTGCAGGTGTTCCAGCTTCAAATCTGGATGGAGGTTCTGC
ATAAGTCGAATGATCAAGAAATACACCTGAGATCATTTCTCCGCCACCC

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DS 

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ATTATGTTATCACTCGTTGAACATGTTTGTTTTTCTTGTCTCAATAATACATGTCCTCAC
ATGGAGAGTGTTTTTTTGTGGAACCGAATTTGAAAGAAACCCAATAATGAAATGGTCTCA
AAATATTGGGACTTGAAGATGATAAGTAAATAATTAGCCTTTGAAGCATATATATAGCAT
ACAACAAGCTGCGAGATCCAGGGGTAAGGTGTACTCCACTCTATTTGAAAGAATTGAAGA
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AGTAAAGGCTGGCGCGTGCACTTGCATTCACTCCAAGATACCGGTGTAGTGGCTGCGCGC
AGTGGTGTCCTGACCTTATCGCAACTCCATGCTGTTGATCAAGAAAGGTTGCCAAATCAG
TTGGGTGCAGTCCCTCCACATTGAAGGAACAAAGAGCTGCCCTTCGAACACTTTCAGAAG
GCTTTGGGCCGTATATCCGAACATCAGGCACTGAAGACAGTTTCTCGTACAAATAGTTAG
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CTGCTCCAAGGGCAATTGCTTCACCAATTGCAGGTGTTCCAGCTTCAAATCTGGATGGAG
GTTCTGCATAAGTCGAATGATCAAGAAATACACCTGAG

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 7

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GTTAAAAATATTCACAATAAAAAGTTGTTATTCAAACATACACATTTTCTTAAAACAAAA
CAACAACAAAGGTGCATATTACAAGACAAGAATCAAATTAGTTTACCAACAATAGGACGT
GCTTTGCACATGGTTCTCAATGACACTAGTTTAGGCAATGTGGCTCCTTTGTCTTCGGTC
ATGTCCACAAGCTCATCACCAACCCTTTCCCACTCGAAACACTGAACCAAAGTTGCAAGA
ACCAGGCTCACTAACCGTTGAGCAAGTCCAGCTCCAGGACAAGCTCTCCGTCCCATCCCA
AATGGCAATAGCTTATCAGCCTCTCCTGCTTTTTCAAATCCTTCGGGCTTGAATATCTCT
GGATCTTCCCATAACTTTGGATCTCTCTGCATAGCCCACACGTTAGTCAACACCATCGTA
CCACGTGGCATATCGTACCCCGCCACTCTACAATCACTCGACGACAAATGAGGTAGTAGT
AGCGGAACTGCAGGATACAAACGTAGTGTTTCCGACACAATCTTTTGGAGATAAGGGAGG
TTCACAATGTCCGGTTCGTCTACTAACCGGTCGAAACCGATTTTTTCATCTATTTCGATT
CTGGCCTTTTTAAGTACTTCTGGATAGTTCAACAGATTTGACATCGCCCATTCTAGTGTA
ACCGCTGTCGTATCTGTCCCTCCAATTGTTAGACTGAGTATGAGTCCTTTGATGATGTCA
TCTGTATAGTAATCCGGTTGGGTTGCTTGGAGGGAAAGCAAGCGATCGATCATCGTTTGA
CCTTTTTCTTTATCTTCACGTTTCTCGTCGACAATTCTTTGTAAAAACGCATCAAATCTA
TTCCCCAAGTCCTTGATTCGCTTTTTATAATTGGTGAACCGACGTACAACCGAAAGATAA
TCAGCTGGGTTCCCTGCACCGGAGCTGATCACCACCTCGGCCACAAGTTGCCTCACAAAC
TTAGCTTCGTCGTTTTCTTCACCGTAGTATCGCTTCCCGGCCACCATTCTGATGATGTTG
TTGGATGCCAAATTGCCTAATAATGATTTCATCTCCACCTCCACAAATCCGTGGAAGGAG
TCTTGAGAAAGACGTGGGATGAGCCGTCGGATCTCGTCCTTCCGGATATACAAAAACGAA
TTAAGTCTCTGAGTCGAGAGTAGCTCTACGGCGGCGATGCGGCGGAGATTCCTCCAGTGA
TCGCCGTAAGGTGCCGAGAGTAAATGAGTGGCGTCGTAGCCGACGTATTTGCTCACGATG
AACTTGGGACGGTTGGCGAGAACAACGTCGTTATCAGTGAAACATTCTTCGGCTACGGAA
CGTGAGGTGGTGACATAAACAAGGCGTTTTCCGAGGCGTAGGTGGAAGATTGGAGCATCT
CCGATGGATTTGCAGAGTGAAAGGAACCATCGGTGGAGTGGTGTCTTGAATAAGTGGAGG
TGGCCGAGTACCGGTAAAGATATCGCCGGAGATGGTGGAGGTTTTAGTTTCCGGCTGGAT
CTTGTGAGCAAGAATCTGGTAGAGATGAAGAGAAAGAGAGAAGAGAGGATTAAAATTTGG
ATGAGGTCCATTTTTTGTTTTTCTTTTCTCCCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1BP33JQ U 88
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AF RS1G381JQ U 88
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AGATG
C

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AS 1 7

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AACAAGCACAAACTCTCGCACGCCAAAACGCACGAGATCGTTCAGTTGCTTCCTCAAGAA
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GCTAACTTCTTCTACCGTCAGGGGATGTTTGAGATCGGTGACTGTTTCGTTGCCGAGACT
GGTGAATCTGAGTGTACTACAAGGCAGTCTTTCGTGGAGATGTTTATGATACTAGAGGCT
ATGAAGGGGAGAGATCTTGAACCGGCTCTTAACTGGGCGGCGGCTAACTCTGACAGGCTG
AAGCAAGCGAGGTCTGATCTCGAGATGAAGCTTCACAGCTTACAGTTTTTGAAAATATCT
CAAGGCCAAAACTCACAAGAGGCT*TCAGCTACGCGAG*GAGACATTTTGCAGTGTACGC
GGATAGCTGCCTCTCCGAGATTCAGAAGCTCGTTTGTTCTCTCTTATGTGACAAGAACCT
GGAGCAGTCACCGTACTCGGAGTTTCTCTCGCCCGTTATGTGGGACAACGCGGTGAGAGA
GCTGACGCGGCAGTACTGCAACCTACTCGGTGAATCGTCTGAGAGTCCGCTGAGTGTGAC
GGTAACGGCCGGTACGCAGGCTTTACCTGTGCTGTTGAAATACATGAACGTGATAGCGAA
CAAGAAGCTCGATTGGCAGACTATGGAGCAGCTTCCCGTGGCCGTGGAACTACCCGGGGA
GTTTCAGTTTCATTCGGTGTTTGTATGTCCCGTCTCCAAGGAACAGTCGAGTGAAGATAA
TCCTCCGATGATGATGTCTTGTGGCCACGTGCTTTGCAAGCAGACTATCACTAGAATGTC
TAAGAATGGCGCTAAGACTTCTTTCAAGTGTCCTTATTGCCCGACCGATGTAGACTCCAC
AAGGTGCAAGCAGTTACACTTCTGACCGGAAGATTGGAACTGAAAGTTCTGACCGGTGTT
GGAATGTATTGCTGCTGTGTTCTTTTTCGTTCAAGGTTTTCATGTACAAAAATCATCAGG
GAAGGTTTAGATAATTCGGACATTCCCCCAACCATAAGAACGTGTCTGTGTTTGTTCAAA
CTTTCTAAATATATAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 
10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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AF RS1G784TF U 682
AF RS1CJ91TF U 611
AF RS1CJ91JQ C 615
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AF RS1GW46JQ C 840
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RD RS1GW46TF 771 0 0
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CATTTAATTATCTAAAGAATGGAGTTAAAGAGCATCAAGGACGCGTTTGATCGTGTTGCG
AACAAGCACAAACTCTCGCACGCCAAAACGCACGAGATCGTTCAGTTGCTTCCTCAAGAA
ATCCACAAGGCGTTGAGCTTAATCCAGGACACTCAGTTTGATCACAGGTCCATCCTCCTC
GACGTCAAGAAACTCTTCATGGAGAGGTCTCCAGGGACACAACTCGAATCCGCTGAGAAA
GAACTCAACGTGGCTCTCACCAAGTACCCCAAAGTTCTCGAGAAGCAGCTCAACTCCGAG
ATATCGAAGGCTTATAGAAACAACGTCGAGTTCGATACTCATGTGGTGAACCAGATCATC
GCTAACTTCTTCTACCGTCAGGGGATGTTTGAGATCGGTGACTGTTTCGTTGCCGAGACT
GGTGAATCTGAGTGTACTACAAGGCAGTCTTTCGTGGAGATGTTTATGATACTAGAGGCT
ATGAAGGGGAGAGATCTTGAACCGGCTCTTAACTGGGCGGCGGCTAACTCTGACAGGCTG
AAGCAAGCGAGGTCTGATCTCGAGATGAAGCTTCACAGCTTACAGTTTTTGAAAATATCT
CAAGGCCAAAACTCACAAGAG*CTCTCAGCTACGCGAG*GAGACATTTTGCAGTGTACGC
GGATAGCTGCCTCTCCGAGAT*CAGAAGCTCGTTTGT*CTCTCTTATG
GGA

QA 1 768 1 768
DS 

RD RS1F675TF 609 0 0
G
TGAAGGGGAGAGATCTTGAACCGGCTCTTAACTGGGCGGCGGCTAACTCTGACAGGCTGA
AGCAAGCGAGGTCTGATCTCGAGATGAAGCTTCACAGCTTACAGTTTTTGAAAATATCTC
AAGGCCAAAACTCACAAGAGGCTCTCAGCTACGCGAG*GAGACATTTTGCAGTGTACGCG
GATAGCTGCCTCTCCGAGATTCAGAAGCTCGTTTGTTCTCTCTTATGGGACAAGAACCTG
GAGCAGTCACCGTACTCGGAGTTTCTCTCGCCCGTTATGTGGGACAACGCGGTGAGAGAG
CTGACGCGGCAGTACTGCAACCTACTCGGTGAATCGTCTGAGAGTCCGCTGAGTGTGACG
GTAACGGCCGGTACGCAGGCTTTACCTGTGCTGTTGAAATACATGAACGTGATAGCGAAC
AAGAAGCTCGATTGGCAGACTATGGAGCAGCTTCCCGTGGCCGTGGAACTACCCGGGGAG
TTTCAGTTTCATTCGGTGTTTGTATGTCCCGTCTCCAAGGAACAGTCGAGTGAAGATAAT
CCTCCGATGATGATGTCTTGTGGCCACGTGCTTTGCAAGCAGACTATCACTAGAATGTCT
AAGAATGG

QA 2 609 2 609
DS 

RD RS1G784TF 531 0 0
GCTC
TCAGCTACGCGAGAGAGAGATTTTGCAGTGTACGCGGATAGCTGCCTCTCCGAGATTCAG
AAGCTCGTTTGTTCTCTCTTATGGGACAAGAACCTGGAGCAGTCACCGTACTCGGAGTTT
CTCTCGCCCGTTATGTGGGACAACGCGGTGAGGGAGCTGACGCGGCAGTACTGCAACCTA
CTCGGTGAATCGTCTGAGAGTCCGCTGAGTGTGACGGTAACGGCCGGTACGCAGGCTTTA
CCTGTGCTGTTGAAATACATGAACGTGATAGCGAACAAGAAGCTCGATTGGCAGACTATG
GAGCAGCTTCCCGTGGCCGTGGAACTACCCGGGGAGTTTCAGTTTCATTCGGTGTTTGTA
TGTCCCGTCTCCAAGGAACAGTCGAGTGAAGATAATCCTCCGATGATGATGTCTTGTGGC
CACGTGCTTTGCAAGCAGACTATCACTAGAATGTCTAAGAATGGCGCTAAGACTTCTTTC
AAGTGTCCTTATTGCCCGACCGATGTAGACTCCACAAGGTGCAAGCA

QA 5 531 5 531
DS 

RD RS1CJ91TF 733 0 0
GGTC
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ACAAGAGGCT*TCAGCTACGCGAG*GAGACATTTTGCAGTGTACGCGGATAGCTGCCTCT
CCGAGATTCAGAAGCTCGTTTGTTCTCTCTTATGTGACAAGAACCTGGAGCAGTCACCGT
ACTCGGAGTTTCTCTCGCCCGTTATGTGGGACAACGCGGTGAGAGAGCTGACGCGGCAGT
ACTGCAACCTACTCGGTGAATCGTCTGAGAGTCCGCTGAGTGTGACGGTAACGGCCGGTA
CGCAGGCTTTACCTGTGCTGTTGAAATACATGAACGTGATAGCGAACAAGAAGCTCGATT
GGCAGACTATGGAGCAGCTTCCCGTGGCCGTGGAACTACCCGGGGAGTTTCAGTTTCATT
CGGTGTTTGTATGTCCCGTCTCCAAGGAACAGTCGAATGAAGATAATCCTCCGATGATGA
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AGACTTCTTTCAAGTGTCCTTATTGCCCGACCGATGTAGACTCCACAAGGTGCAAGCAGT
TACACTTCTGACCGGAAGATTGGAACTGAAAGTTCTGACCGGTGTTGGAATGTATTGCTG
CTGTGTTCTTTTTCGTTCAAG*TTTTCATGTACAAAA*TCATCAGGAA**GTTTAGATAA
TTCGGACAT

QA 5 733 5 733
DS 

RD RS1CJ91JQ 784 0 0
TGATCTCGAGATGAAGCTTCACAGCTTACAGTTTT*GAAAATATCTCAAGGCCAAAACTC
ACAAGAGGCT*TCAGCTACGCGAG*GAGACATTTTGCAGTGTACGCGGATAGCTGCCTCT
CCGAGATTCAGAAGCTCGTTTGTTCTCTCTTATGTGACAAGAACCTGGAGCAGTCACCGT
ACTCGGAGTTTCTCTCGCCCGTTATGTGGGACAACGCGGTGAGAGAGCTGACGCGGCAGT
ACTGCAACCTACTCGGTGAATCGTCTGAGAGTCCGCTGAGTGTGACGGTAACGGCCGGTA
CGCAGGCTTTACCTGTGCTGTTGAAATACATGAACGTGATAGCGAACAAGAAGCTCGATT
GGCAGACTATGGAGCAGCTTCCCGTGGCCGTGGAACTACCCGGGGAGTTTCAGTTTCATT
CGGTGTTTGTATGTCCCGTCTCCAAGGAACAGTCGAATGAAGATAATCCTCCGATGATGA
TGTCTTGTGGCCACGTGCTTTGCAAGCAGACTATCACTAGAATGTCTAAGAATGGCGCTA
AGACTTCTTTCAAGTGTCCTTATTGCCCGACCGATGTAGACTCCACAAGGTGCAAGCAGT
TACACTTCTGACCGGAAGATTGGAACTGAAAGTTCTGACCGGTGTTGGAATGTATTGCTG
CTGTGTTCTTTTTCGTTCAAGGTTTTCATGTACAAAAATCATCAGGGAAGGTTTAGATAA
TTCGGACATTCCCCCAACCATAAGAACGTGTCTGTGTTTGTTCAAACTTTCTAAATATAT
AAAT

QA 1 784 1 784
DS 

RD RS1G784JQ 517 0 0
AGAGTCCGCTGAGTGTGACGGTAACGGCCGGTACGCAGGCTTTACCTGTGCTGTTGAAAT
ACATGAACGTGATAGCGAACAAGAAGCTCGATTGGCAGACTATGGAGCAGCTTCCCGTGG
CCGTGGAACTACCCGGGGAGTTTCAGTTTCATTCGGTGTTTGTATGTCCCGTCTCCAAGG
AACAGTCGAGTGAAGATAATCCTCCGATGATGATGTCTTGTGGCCACGTGCTTTGCAAGC
AGACTATCACTAGAATGTCTAAGAATGGCGCTAAGACTTCTTTCAAGTGTCCTTATTGCC
CGACCGATGTAGACTCCACAAGGTGCAAGCAGTTACACTTCTGACCGGAAGATTGGAACT
GAAAGTTCTGACCGGTGTTGGAATGTATTGCTGCTGTGTTCTTTTTCGTTCAAGGTTTTC
ATGTACAAAAATCATCAGGGAAGGTTTAGATAATTCGGACATTCCCCCAACCATAAGAAC
GTGTCTGTGTTTGTTCAAACTTTCTAAATATATAAAT

QA 1 517 1 517
DS 

RD RS1GW46JQ 559 0 0
AGCTGACGCGGCAGTACTGCAACCTACTCGGTGAATCGTCTGAGAGTCCGCTGAGTGTGA
CGGTAACGGCCGGTACGCAGGCTTTACCTGTGCTGTTGAAATACGTGAACGTGATAGCGA
ACAAGAAGCTCGATTGGCAGACTATGGAGCAGCTTCCCGTGGCCGTGGAACTACCCGGGG
AGTTTCAGTTTCATTCGGTGTTTGTATGTCCCGTCTCCAAGGAACAGTCGAGTGAAGATA
ATCCTCCGATGATGATGTCTTGTGGCCACGTGCTTTGCAAGCAGACTATCACTAGAATGT
CTAAGAATGGCGCTAAGACTTCTTTCAAGTGTCCTTATTGCCCGACCGATGTAGACTCCA
CAAGGTGTAAGCAGTTACACTTCTGACCGGAAGATTGGAACTGAAAGTTCTGACCGGTGT
TGGAATGTATTGCTGCTGTGTTCTTTTTCGTTCAAGGTTTTCATGTACAAAAATCATCAG
GGAAGGTTTAGATAATTCGGACATTCCCCCAACCATAAGAACGTGTCTGTGTTTGTTCAA
ACTTTCTAAATATATAAAT

QA 1 559 1 559
DS 



AS 2 6

CO CL769Contig1 767 3 6 U
GCTTAGTTAATGCATCACCAAATTCAAACACGTTTATATTCTGAAAAACAATAACGAGAG
TAATAAGTGAACACAAAGTAATGACAAAGAAGAAGTCTTAAACGAATTCAACATTAAGGG
AACTAACATGAGCACTGGTCTTTCAAACCCAAAAAAGAAAAAGAAAAACACAAAAGCAAG
AGTCGAAACAACAACTAGAGAGAGCGAACCACCGGTTCCCTCATTCCTCTTCAGTACTTG
CTGCACTCAGATCAACACTTAGGTCCAGTTGCTTTCCAGTGATTAGAGTATACATGTTCA
ACACATCAGCAACGGTTGTCTCGAAGTGGGTTGTAGCATCATAGCTGGTTGATATAAAGC
AGTTGTCCAACTCAGGCTCGTTGACAGGCTCGTATCTGTCATACACGTCGAAAAATATCT
CATCAACGGGACCCAAAAGATCAATTCCAGCCTTTAGCTCAGTTTGAGGGTTATCAGTCT
CTGCATCTGTGGACACAAATGCAATGAACTTTCCCTTGGGAGCAACGTTGTGGGAGTAGG
AACAGCAGAAGACATACATGTCAGATTTTCGGGCAAGCTGCTTCTGGGGTATGATGACCT
GTACCGAGTGAGAGTCATTGGTGTTTGGAATAGGGTGGCTCATAATAGCAATGGCCCGAG
CAACTCCGCCAATCTTTCTAACCTTGTTGGGCAGGTAAGAAGGGTCACACACAATCTTTT
TGCATCTAGCAGTCTCTCCTTCAGATGTTACACCAGTAACCTTACCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AH49JQ U 67
AF RS1BO03JQ U 1
AF RS1FO19JQ U 83
BS 1 412 RS1BO03JQ
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BS 432 735 RS1BO03JQ
BS 736 767 RS1FO19JQ

RD RS1AH49JQ 496 0 0
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TCAGATCAACACTTAGGTCCAGTTGCTTTCCAGTGATTAGAGTATACATGTTCAACACAT
CAGCAACGGTTGTCTCGAAGTGGGTTGTAGCATCATAGCTGGTTGATATAAAGCAGTTGT
CCAACTCAGGCTCGTTGACAGGCTCGTATCTGTCATACACGTCGAAAAATATCTCATCAA
CGGGACCCAAAAGATCAATTCCAGCCTTTAGCTCAGTTTGAGGGTTATCAGTCTCTGCAT
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AGAAGACATACATGTC

QA 1 496 1 496
DS 

RD RS1BO03JQ 735 0 0
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AACTAACATGAGCACTGGTCTTTCAAACCCAAAAAAGAAAAAGAAAAACACAAAAGCAAG
AGTCGAAACAACAACTAGAGAGAGCGAACCACCGGTTCCCTCATTCCTCTTCAGTACTTG
CTGCACTCAGATCAACACTTAGGTCCAGTTGCTTTCCAGTGATTAGAGTATACATGTTCA
ACACATCAGCAACGGTTGTCTCGAAGTGGGTTGTAGCATCATAGCTGGTTGATATAAAGC
AGTTGTCCAACTCAGGCTCGTTGACAGGCTCGTATCTGTCATACACGTCGAAGAATATCT
CATCAACGGGGCCCAAAAGATCAATTCCAGCCTTTAGCTCAGTTTGAGGGTTATCAGTCT
CTGCATCTGTGGACACAAATGCAATGAACTTTCCCTTGGGAGCAACGTTGTGGGAGTAGG
AACAGCAGAAGACATACATGTCAGATTTTCGGGCAAGCTGCTTCTGGGGTATGATGACCT
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TGCATCTAGCAGTCT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RS1FO19JQ 685 0 0
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TCAAACCCAAAAAAGAAAAAGAAAAACACAAAAGCAAGAGTCGAGACAACAACTAGAGAG
AGCGAACCACCGGTTCCCTCATTCCTCTTCAGTACTTGCTGCACTCAGATCAACACTTAG
GTCCAGTTGCTTTCCAGTGATTAGAGTATACATGTTCAACACATCAGCAACGGTTGTCTC
GAAGTGGGTTGTAGCATCATAGCTGGTTGATATAAAGCAGTTGTCCAACTCAGGCTCGTT
GACAGGCTCGTATCTGTCATACACGTCGAAAAATATCTCATCAACGGGACCCAAAAGATC
AATTCCAGCCTTTAGCTCAGTTTGAGGGTTATCAGTCTCTGCATCTGTGGACACAAATGC
AATGAACTTTCCCTTGGGAGCAACGTTGTGGGAATAGGAACAGCAGAAGACATACATGTC
AGATTTTCGGGCAAGCTGCTTCTGGGGTATGATGACCTGTACCGAGTGAGAGTCATTGGT
GTTTGGAATAGGGTGGCTCATAATAGCAATGGCCCGAGCAACTCTGCCAATCTTTCTAAC
CTTGTTGGGCAGGTAAGAAGGGTCACACACAATCTTTTTGCATCTAGCAGTCTCTCCTTC
AGATGTTACACCAGTAACCTTACCT

QA 1 685 1 685
DS 



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AGGGGGGCGTGTTCATCATCTCTCTCTCTCAATCTCTTTTCTCGACGAGACTTTCTGGAT
CAAGCATGGATGAAGAGTACGAGGTTATCGTTCTCGGCACCGGTCTCAAGGAGTGTATCC
TCAGCGGTCTCCTCTCCGTCGATGGCGTCAAGGTGCTTCACATGGACAGGAATGATTACT
ATGGTGGTGAATCAACATCTCTTAATCTCAACCAGCTTTGGAAGAAGTTCAAGGGAGAAG
ACAAGGCTCCTGAGCATTTAGGTGCTAGCAGGGACTACAATGTTGACATGATGCCTAAGT
TTATGATGGGAAATGGCAAGCTTGTGCGTACCCTTATTCACACGGACGTTACAAAGTACT
TGTCGTTTAAAGCCGTTGATGGAAGCTATGTCTTCGTTAAAGGCAAGGTTCAAAAGGTGC
CAGTGACTCCTATGGAGGCCCTGAAGTCTCCTCTCATGGGTATTTTTGAGAAACGTCGAG
CTGGAAAGTTCTTCAGTTATGTTCAGGATTACGACGAGAAGGACCCCAAGACACACAACG
GGATGGATTTGACCAGACTTACAACCAAGGAACTGATTGCGAAATTTGGTCTTGATGAGA
ACACTATTGACTTTATTGGTCACGCAGTGGCACTTCACACCAATGACCAACATCTCAATC
AACCCGCCTTGGATACTGTGATGAGAATGAAGCTCTATGCGGAGTCTCTTGCACGTTTCC
AAGGACCTCTCATATATTATCCTCTCTATGGGTTGGGAGACTCCCTCAGCATTTGCACGA
CTTAGTGCTGTCTATGGTGGCACATACATGTTGAACAACCTGAGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AH49TF U 75
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GG
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CCTGAGCATTTAGGTGCTAGCAGGGACTACAATGTTGACATGATGCCTAAGTTTATGATG
GGAAATGGCAAGCTTGTGCGTACCCTTATTCACACGGACGTTACAAAGTACTTGTCGTTT
AAAGCCGTTGATGGAAGCTATGTCTTCGTTAAAGGCAAGGTTCAAAAGGTGCCAGTGACT
CCTATGGAGGCCCTGAAGTCTCCTCTCATGGGTATTTTTGAGAAACGTCGAGCTGGAAAG
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TTGACCAGACTTACAACCAAGGAACTGATTGCGAAATTTGGTCTTGATGAGAACACTATT
GACTTTATTGGTCACGCAGCGGCACTTCACACCAATGACCAACATCTCAATCAACCCGCC
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CTCATATATTATCCTCTCTATGGGTTGG

QA 3 750 3 750
DS 

RD RS1FO19TF 826 0 0
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CAAGCATGGATGAAGAGTACGAGGTTATCGTTCTCGGCACCGGTCTCAAGGAGTGTATCC
TCAGCGGTCTCCTCTCCGTCGATGGCGTCAAGGTGCTTCACATGGACAGGAATGATTACT
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TGTCGTTTAAAGCCGTTGATGGAAGCTATGTCTTCGTTAAAGGCAAGGTTCAAAAGGTGC
CAGTGACTCCTATGGAGGCCCTGAAGTCTCCTCTCATGGGTATTTTTGAGAAACGTCGAG
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AAGGACCTCTCATATATTATCCTCTCTATGGGTTGGGAGACTCCCTCAGCATTTGCACGA
CTTAGTGCTGTCTATGGTGGCACATACATGTTGAACAACCTGAGTG

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 6

CO CL770Contig1 975 6 13 U
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ATTCTCGTCCTTCTTCGATTCACAACCTGGTAGCAGAAGCTGGAGCTATGATTCTCTCAA
GAACCTCCGTCAGATCTCCCCGGCTGTCCAGAATCATCTTAAGCGGGTTTATCTTACTCT
GTGTTGTGCTCTTGTTGCGTCTGCATTTGGAGCTTACCTCCACGTCCTCTGGAACATCGG
TGGTATTCTCACTACCATTGGATGCGTTGGAAGCATGATTTGGCTGCTCTCTTGTCCTCC
TTATCAACAACAAAAGAGGCTCTCACTTCTGTTTCTGTCTGCTGTTCTTGAAGGTGCTTC
TGTTGGTCCCTTGATCAAAGTGGCAGTTGATTTTGACCCAAGCATCCTTATCACTGCATT
CGTCGGGACTGCGATAGCCTTTATCTGTTTCTCAGGAGCAGCGATGTTGGCTAGACGCAG
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GTTTGCCTCTTCCATCTTCGGTGGCTCTGCATCTATCTTTAAGTTCGAGCTCTACTTTGG
ACTCTTGATCTTTGTGGGATACATGGTGATGGACACTCAAGATATTATAGAGAAGGCCCA
CCTCGGTGACATGGACTACGTGAAACATTCCTTGACCCTTTTCACCGATTTTGCAGCTGT
GTTTGTTCGTATCCTAATCATAATGCTGAAGAACTCGGCAGATAAAGAAGAGAAAAAGAA
GAAGAGGAGGAACTGAGATTAAAAGTGAGAAAGAAAGCTAATAGAGAGTGGGTGATATAA
GTACATGAAAGCTTTGGTGTTTTTACTTGTTTGAGACGGTTTTGCTAAAAACACATGTTA
CCTTATTTGTGTATTCCTCTAAGTGGCTCCCGATTGTAAATGGATCTAGTGGTGTTCGTT
TTTCCCTTATAAGTA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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G
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GGCTTGTCCATGCTTATGTGGCTTCAGTTTGCCTCTTCCATCTTCGGTGGCTCTGCATCT
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DS 



AS 2 6

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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F822TF U 1
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AF RS1FT28TF U 268
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TGTCTTGGCTGCCTTAGAAGTTCAATCAACGCCTCCGCCTTTTGCTTAGCTCGACTCTTA
CCACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGACAACACTCACCACATTCTCTCTC
ACTTTTTCCCTCTTCTTCACATCAAATAGTACAGAGAAACAAAAAAGAAGAGAAACTCTT
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TCTGTTCCTCTTCTTGGCTCCTTCGATAACATTCAAGAGAATCATCAAGAGCAAATCGAC
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AGCAGTGATCGAGACAATCTACGTGCTGATCTTCCTTATCTACGCACCGAAGAAGGAGAA
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GAGTGTAGAGTACATGCCCTTCTTTCTCT

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TATGACTCTCCTCAACTGCCTCCTCTCCGCCTGGTACGGACTTCCCTTTGTGTCAAAGGA
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CTCACTCTTTGTGTTCCTCTGTGGAAC

QA 1 567 1 567
DS 

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CTGATCTTCCTTATCTACGCACCGAAGAAGGAGAAAGCTAAGATCTTTGGCATCTTCACC
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GACCCTTTTGTTGCA
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CACCATCTTCGGCGTTTTCGGAAATGCAACTGCTCTGTTTCTCTTCTTGGCTCCTTCGAT
AACATTCAAGAGAATCATCAAGAGCAAATCGACTGAACAGTTCTCTGGCATCCCTTACCC
TATGACTCTCCTCAACTGCCTCCTCTCCGCCTGGTACGGACTTCCCTTTGTGTCAAAGGA
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CATCTTCCTTATCTACGCACCGAAGAAGGAGAAAGCCAAGATCTTTGGCATCTTCACTGC
CGTCTTGGCCGTATTCGCAACGGTGGCTCTTGTCTCTCTCTTTGCCCTCCACGGTAACGC
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CTCACTCTTTGTGTTCCTCTGTGGAACTTCTTGGTTCATCTATGGTCTTATCGGTCGTGA
CCCTTTTGTTGCATCCCAAATGGGGTTTGGATGTGCTTTAGACACTGCAGCTGATTCTCT
ACGTCATCTACTGCGGAAACAAAGCGACAATCTGCTGAAAAGATGACAGTCCCTGGAGAT
G

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DS 



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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FT28JQ U 94
AF RS1GB71JQ U 1
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DS 



AS 1 7

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AATGTTTTATTTATCCGTTTCTGGCTTTTCTGTGTGATAAAAGTTATATATGTCTTTGCT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1DP48JQ C 289
AF RS1E359TF U 1
AF RS1FF48TF U 6
AF RS1FL54TF U 1
AF RS1DP48TF U 594
AF RS1E359JQ C 249
AF RS1FF48JQ C 299
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BS 971 971 RS1FF48JQ
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CTGCTGCTCGTGACGACTTGCTCGAAGCTGGCCTCGCTGACACTAAGACGGCTTCAGCTG
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TGCACAGTCAGAGACAG

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DS 

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GAATGATGATTGAGACTGAAGAGCTTGGCGTCTCTGTCCTCCAAGACTTGCACAGTCAGA
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GCAAGAAAATCTTGACGGGCATGACGA

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GG
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AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTATCAATCAATCAACAATGAGCGAGGTGTTTAACGG
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GATGTCAACTGATCGATTGGGTCGTACCACTGACAGAATCAAGGACAGTCGAAGAATGAT
GATTGAGACTGAAGAGCTTGGCGTCTCTGTCCTCCAAGACTTGCACAGTCAGAGACAGTC
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AATCTTGACGGGCATGACGAGGAGGATGAACAGGAACAAATGGACCATTGGAGCCATTTT
CACCGCTTTGGTCGCCGCTATTTTCCTCATCTTGTACT

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GGACCTT
ACCTTTGGATCTCCCTATCTTCCGATTCCGAGGGTTCTTCGTGTTATCAGAGAGAGAGAG
AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG**TATCAATCAATCAACAATGAGCGAGGTGTTTAACGG
TTACGAGCGTCAATACTGCGACCTCTCCGCCAATCTTTCCAAGAAATGCTCCTCTGCTAT
TGCCCTCCACGGAGAGCAAAAGAAGCAGAAGCTCTCTGAAATAAGGTCTGGCCTCGATAA
TGCTGAAGCTTTGATTAGGAAAATGGATGTTGAGGCGAGGAGCCTCCCACCGAGCGTTAA
GACCACCCTCCTTGTCAAATTAAGAGAGTTCAAGTCTGATCTCAACAACTTCAAAAGCGA
ACTCAAGACCATCACCACCTCTGCTAACTTGAACGCTGCTGCTGCTGCTCGTGACGACTT
GCTCGAAGCTGGCCTCGCTGACACTAAGACGGCTTCAGCTGATCAAAGAGCCAGATTGAT
GATGTCAACTGATCGATTGGGTCGTACCACTGACAGAATCAAGGACAGTCGAAGAATGAT
GATTGAGACTGAAGAGCTTGGCGTCTCTGTCCTCCAAGACTTGCACAGTCAGAGACAGTC
TCTCCTTCGCGCTGGCGACACGCTTAGTGGAGTAGACGATAATGTCGGAAAGAGCAAGAA
AATCTTGACGGGCATGACGAGGAGGATGAACAGGAACAAATGGACCATTGGAGCCATTTT
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TCTGTA

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DS 

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GGAAAGATCAAGAAGATCTTGATGGGCATGACGAGGAGGATGAACAGGAACAAATGGACC
ATTGGAGCCATTATCACCGCTTTGGTCGCCGCTATTTTCCTCATCTTGTACTTCAAACTC
ACCAAGTAATCCTCTCTGTA
TC

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DS 

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ACCACCCTCCTTGTCAAATTAAGAGAGTTCAAGTCTGATCTCAACAACTTCAAAAGCGAA
CTCAAGACCATCACCACCTCTGCTAACTTGAACGCTGCTGCTGCTGCTCGTGACGACTTG
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ATGTCAACTGATCGATTGGGTCGTACCACTGACAGAATCAAGGACAGTCGAAGAATGATG
ATTGAGACTGAAGAGCTTGGCGTCTCTGTCCTCCAAGACTTGCACAGTCAGAGACAGTCT
CTCCTTCGCGCTGGCGACACGCTTAGTGGAGTAGACGATAATGTCGGAAAGAGCAAGAAA
ATCTTGACGGGCATGACGAGGAGGATGAACAGGAACAAATGGACCATTGGGGCCATTTTC
ACCGCTTTGGTCGCCGCTATTTTCCTCATCTTGTACTTCAAACTCACCAAGTAATCCTCT
CTGTATCTATTAAACTCGACCAAATCTTTGTCCCTGATGAGCGAATGGTGTGAATGTTTT
ATTTATCCGTTTCTGGCTTTTCTGTGTGATAAAAGTTATATATGTCTTTGCTACCTTTTG
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CGGATTGTTTTGTTG

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DS 

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CAAAAGCGAACTCAAGACCATCACCACCTCTGCTAACTTGAACGCTGCTGCTGCTGCTCG
TGACGACTTGCTCGAAGCTGGCCTCGCTGACACTAAGACGGCTTCAGCTGATCAAAGAGC
CAGATTGATGATGTCAACTGATCGATTGGGTCGTACCACTGACAGAATCAAGGACAGTCG
AAGAATGATGATTGAGACTGAAGAGCTTGGCGTCTCTGTCCTCCAAGACTTGCACAGTCA
GAGACAGTCTTTCCTTCGCGCTGGCGACACGCTTAGTGGAGTAGACGATAATGTCGGAAA
GAGCAAGAAAATCTTGACGGGCATGACGAGGAGGATGAACAGGAACAAATGGACCATTGG
AGCCATTTTCACCGCTTTGGTCGCCGCTATTTTCCTCATCTTGTACTTCAAACTCACCAA
GTAATCCTCTCTGTATCTATTAAACTCGACCAAATCTTTGTCCCTGATGAACGAATGGTG
TGAATGTTTTATTTATCCGTTTCTGGCTTTTCTGTGTGATAAAAGTTATATATGTCTTTG
CTACCTTTTGTATTATCTATCACGTTCTCTTGTTTGCGTTTACAGCTGTGTATTTTTATA
CTAAATGATGCGAATTGTTTTGTT
T

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DS 



AS 1 7

CO CL773Contig1 754 7 14 U
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AAGTCATCCGCCACATTCCCAGTTACTCGCAAGACCAACACTGACATAACTTCCATCGTA
AGCAATGGAGGAAGAGTCAACTGCATGAAGGTGTGGCCACCATTGGGAAAGAAGAAATTT
GAGACTCTCTCTTACCTTCCTGACCTTACTGACGTTGAATTGGGTAAAGAAGTGGACTAT
CTTCTCCGCAACAAGTGGATTCCTTGCGTTGAATTTGAGTTGGAGCATGGATTTGTATAC
CGTGAGCACGGAAACACACCCGGATATTATGATGGACGTTACTGGACAATGTGGAAGCTC
CCCTTATTCGGATGCACTGACTCTGCTCAAGTGTTAAAAGAAGTTCAAGAGTGCAAGAAC
GAGTACCCTAACGCCTTCATTAGAATCATTGGATTCGATAACTACCGTCAAGTCCAATGC
ATCAGTTTTATTGCGTACAAGCCACCAAGCTTCACCGGTGCTTAATTTCTTTTCTAAAAC
ATTCATATAAAAATTTGTACGCATCTTCCTGTCTATTGTCTGTCTTTTTTT**CTTGTTG
GATTTACGTTTCAGAGACATTTTTATCGGATTGTTAAATGTCTGATTTATAAATATGTAA
TTTCTAAATCGCTTATTCTCTTTGGGTAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 35 35 35 35 35 30 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BH18TF U 1
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AF RS1H752TF U 3
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RD RS1BH18TF 719 0 0
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QA 1 719 1 719
DS 

RD RS1EN17TF 752 0 0
GGGT
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CCTAACGCCTTCATTAGAATCATTGGATTCGATAACTACCGTCAAGTCCAATGCATCAGT
TTTATTGCGTACAAGCCACCAAGCTTCACCGGTGCTTAATTTCTTTTCTAAAACATTCAT
ATAAAAATTTGTACGCATCTTCCTGTCTATTGTCTGTCTTTTTTT**CTTGTTGGATTTA
CGTTTCAGAGACATTTTTATCGGATTGTTAAATGTCTGATTTATAAATATGTAATTTCTA
A*TCGCTTAT*CTCTTTGGGTAAAAAAA

QA 5 752 5 752
DS 

RD RS1EN17JQ 669 0 0
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CCAGTTACTCGCAAGACCAACACTGACATAACTTCCATCGTAAGCAATGGAGGAAGAGTC
AACTGCATGAAGGTGTGGCCACCATTGGGAAAGAAGAAATTTGAGACTCTCTCTTACCTT
CCTGACCTTACTGACGTTGAATTGGGTAAAGAAGTGGACTATCTTCTCCGCAACAAGTGG
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GACTCTGCTCAAGTGTTAAAAGAAGTTCAAGAGTGCAAGAACGAGTACCCTAACGCCTTC
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AAGCCACCAAGCTTCACCGGTGCTTAATTTCTTTTTTAAAACATTCATATAAAAATTTGT
ACGCATCTTCCTGTCTATTGTCTGTCTTTTTTTT*CTTGTTGGATTTACGTTTCAGAGAC
ATTTTTATCGGATTGTTAAATGTCTGATTTATAAATATGTAATTTCTAAATCGCTTATTC
TCTTTGGG
T

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1H752JQB 684 0 0
GCCGCTGTGGCTACTTCACCGGCTCAAGCAACCATGGTTGCTCCATTCACCGGCTTGAAG
TCATCCGCCACATTCCCAGTTACTCGCAAGACCAACACTGACATAACTTCCATCGTAAGC
AATGGAGGAAGAGTCAACTGCATGAAGGTGTGGCCACCATTGGGAAAGAAGAAATTTGAG
ACTCTCTCTTACCTTCCTGACCTTACTGACGTTGAATTGGGTAAAGAAGTGGACTATCTT
TTCCGCAACAAGTGGATTCCTTGCGTTGAATTTGAGTTGGAGCATGGATTTGTATACCGT
GAGCACGGAAACACACCCGGATATTATGATGGACGTTACTGGACAATGTGGAAGCTCCCC
TTATTCGGATGCACTGACTCTGCTCAAGTGTTAAAAGAAGTTCAAGAGTGCAAGAACGAG
TACCCTAACGCCTTCATTAGAATCATTGGATTCGATAACTACCGTCAAGTCCAATGCATC
AGTTTTATTGCGTACAAGCCACCAAGCTTCACCGGTGCTTAATTTCTTTTCTAAAACATT
CATATAAAAATTTGTACGCATCTTCCTGTCTATTGTCTGTCTTTTTTTT*CTTGTTGGAT
TTACGTTTCAGAGACATTTTTATCGGATTGTTAAATGTCTGATTTATAAATATGTAATTT
CTAAATCGCTTATTCTCTTTGGG
T

QA 1 683 1 683
DS 

RD RS1H752TF 744 0 0
GGGT
AAAAGAAAAGAGAAAAAAAAAAGAAGATTACTTATGGCTTCCTCTATGCTCTCCTCCGCC
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GGAGGAAGAGTCAACTGCATGAAGGTGTGGCCACCATTGGGAAAGAAGAAATTTGAGACT
CTCTCTTACCTTCCTGACCTTACTGACGTTGAATTGGGTAAAGAAGTGGACTATCTTCTC
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CCTAACGCCTTCATTAGAATCATTGGATTCGATAACTACCGTCAAGTCCAATGCATCAGT
TTTATTGCGTACAAGCCACCAAGCTTCACCGGTGCTTAATTTCTTTTCTAAAACATTCAT
ATAAAAATTTGTACGCATCTTCCTGTCTATTGTCTGTCTTTTTTT**CTTGTTGGATTTA
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DS 

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CGCAAGACCAACACTGACATAACTTCCATCGTAAGCAATGGAGGAAGAGTTAACTGCATG
AAGGTGTGGCCACCATTGGGAAAGAAGAAATTTGAGACTCTCTCTTACCTTCCTGACCTT
ACTGACGTTGAATTGGGTAAAGAAGTGGACTATCTTCTCCGCAACAAGTGGATTCCTTGC
GTTGAATTTGAGTTGGAGCATGAATTTGTATACCGTGAGCACGGAAACACACCCGGATAT
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CCTGTCTATTGTCTGTCTTTTTTT**CTTGTTGGATTTACGTTTCAGAGACATTTTTATC
GGATTGTTAAATGTCTGATTTATAAATATGTAATTTCTAAATCGCTTATTCTC

QA 1 713 1 713
DS 

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G
AAAAGAAAAGAGAAAAAAAAA*GAAGATTACTTATGGCTTCCTCTATGCTCTCCTCCGCC
GCTGTGGCTACTTCACCGGCTCAAGCAACCATGGTTGCTCCATTCACCGGCTTGAAGTCA
TCCGCCACATTCCCAGTTACTCGCAAGACCAACACTGACATAACTTCCATCGTAAGCAAT
GGAGGAAGAGTTAACTGCATGAAGGTGTGGCCACCATTGGGAAAGAAGAAATTTGAGACT
CTCTCTTACCTTCCTGACCTTACTGACGTTGAATTGGGTAAAGAAGTGGACTATCTTCTC
CGCAACAAGTGGATTCCTTGCGTTGAATTTGAGTTGGAGCATGGATTTGTATACCGTGAG
CACGGAAACACACCCGGATATTATGATGGACGTTACTGGACAATGTGGAAGCTCCCCTTA
TTCGGATGCACTGACTCTGCTCAAGTGTTAAAAGAAGTTCAAGAGTGCAAGAACGAGTAC
CCTAACGCCTTCATTAGAATCATTGGATTCGATAACAACCGTCAAGTCCAATGCATCAGT
TTTATTGCGTACAAGCCACCAAGCTTCACCGGTGCTTAATTTCTTTTCTAAAACATTCAT
ATAAAAATTTGTACGCATCTTCCTGTCTATTGTCTGTCTTTTTTTTTCTTGTTGGATTTA
CGTTTCAGAGACATTTTTATCGGATTGTTAAATGTCTGATTTATAAATATGTAATTTCTA
AATCGCTTATTCTCTTTGG
TTATC

QA 2 740 2 740
DS 



AS 2 5

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GGCCCCTGCAAAAACCCTAATCCCTCTCTCCCATTTCTCCTTCTCCTCCTCTTCTTCGCC
GAGCAGAGCAGCCATGGATGCCAAAGAAGCCTCCGCCACCGATCTGAAGCGCCCGAGAGA
AGAGGAGGATAACGCCGCCGCCTCCATGGAGACAGAGAACGGAGATCAGACAAAGGAGCC
TGCTTGTTTCTCCTCCGTGATTCCTGGATGGTTCTCCGAGATGAGTCCCATGTGGCCAGG
AGAGGCACACTCTTTGAAGGTTGAGAAGGTTTTGTTTCAAGGGAAATCAGATTACCAGGA
TGTCATTGTTTTCCAGTCTGCGACATATGGAAAAGTGTTGGTTTTGGATGGAGTCATCCA
ACTTACGGAGAGAGCAGATTGACATGTGTGAAATTGATAAAATGGTTGTCGATGTCTCTA
AGCAGTTTTTCCCTAATGTAGCAATTGGATTCGAGGATCCTCGTGTTAACCTTGTCATTG
GCGATGGTGTTGCTTTCTTGAAGAATGCTGCTGAGGGATCATATGATGCAGTTATTGTTG
ACTCCTCAGATCCAATTGGTCCTGCAAAGGAGTTGTTTGAGAAACCGTTCTTCCAATCTG
TGGCGAGAGCTCTTCGACCTGGTGGAGTCGTGTGCACTCACGCTGAAAGCTTGTGGCTTC
ACATGGACATCATCGAAGATATTGTTTCCAATTGCCGTGAGATCTTCAAGGGCTCTGTGA
ACTACGCGTGGACCAGTGTTCCAACATACCCGAGTGGGGTGATCGGATTCATGCTCTGTT
CAACTGAAGGGCCTGACGTTGACTTCAAGAACCCTGTGAACCCGATTGATGACAGCTCCA
GCAAATCAAAGGGACCCTTAAAGTTTTACAACGCTGAGATTCATTCAGCTGCGTTCTGCT
TGCCTTCTTTCGCCAAGAAGGTAATAGAGTCAAAAGCCAATTAAAAAGGGAGAGAAGTCA
TCTGGGGGATTGTTGCATTTATCAAAATAAAACCTTTTCACAATTTTTAGAATGTTCTGG
TTTGTTTCAGTCATGTTTCTGTGACACTACTACTGCAAGCAATAACGGTCTTCTTTTAGC
AAATATTACTTCATTTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DY62TF U 1
AF RS1DY62JQ C 429
BS 1 743 RS1DY62TF
BS 744 744 RS1DY62JQ
BS 745 782 RS1DY62TF
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RD RS1DY62TF 801 0 0
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TGCTTGTTTCTCCTCCGTGATTCCTGGATGGTTCTCCGAGATGAGTCCCATGTGGCCAGG
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CA*CTGAAGG*CCTGACGTTG

QA 1 801 1 801
DS 

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AAGGGACCCTTAAAGTTTTACAACGCTGAGATTCATTCAGCTGCGTTCTGCTTGCCTTCT
TTCGCCAAGAAGGTAATAGAGTCAAAAGCCAATTAAAAAGGGAGAGAAGTCATCTGGGGG
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CTTCATTTAAGC

QA 1 672 1 672
DS 



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GGCAAGCAGAACGCAGCTGAATGAATCTCAGCGTTGTAAAACTTTAAGGGTCCCTTTGAT
TTGCTGGAGCTGTCATCAATCGGGTTCACAGGGTTCTTGAAGTCAACGTCAGGCCCTTCA
GTTGAACAGAGCATGAATCCGATCACCCCACTCGGGTATGTTGGAACACTGGTCCATGCG
TAGTTCACAGAGCCCTTGAAGATCTCACGGCAATTGGAAACAATGTCTTCGATGATGTCC
ATGTGAAGCCACAAGCTTTCAGCCTGAGTGCACACAACTCCACCAGGTCGAAGAGCTCTC
GCCACAGATTGGAAGAAGGGTTTCTCAAACAGCTCCTTTGCAGGACCAATTGGATCTGAG
GAGTCAACAATGACTGCATCATATGATCCTTCAGCAGCATTCTTCAAGAAAGCAACACCA
TCGCCAATGACGAGGTTAACGCGAGGATCCTCGAATCCAATTGCTACAGTAGGGAAAAAC
TGCTTAGAGACATCGACCACCATTTTATCAATCTCACACATATCAATATGCTCAACAGAA
GCATGGCGTGCAACCTCCCGCAGGACACCTCCATCTCCTCCTCCAATGACCAACACCTTC
TTTGGGTTAGGGATGGAGCACAAAGGAAGATGAGTGATCATCTCCTGATAAGCGCACTCG
TCTCTCTCCGTGAGTTGGATGACTCCATCCAAAACCAAAACTTTTCCATATGTCGCAGAC
TGGAAAACAATGACATCCTGATAATCTGATTTCC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FH26JQ U 1
AF RS1H783JQB U 1
AF RS1H783TF C 360
BS 1 477 RS1FH26JQ
BS 478 493 RS1H783JQB
BS 494 934 RS1H783TF

RD RS1FH26JQ 477 0 0
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AAACCAAAACATTCTAAAAATTGTTGAAAAGGTTTTATTTTGATAAATGCAACAATCCCC
CAGATGACTTCTTTCCTTTCTCAATTGGCTTTGGACTCTATTACCTTCTTGGCGAAAGAA
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TTGCTGGAGCTGTCATCAATCGGGTTCACAGGGTTCTTGAAGTCAACGTCAGGCCCTTCA
GTTGAACAGAGCATGAATCCGATCACCCCACTCGGGTATGTTGGAACACTGGTCCATGCG
TAGTTCACAGAGCCCTTGAAGATCTCACGGCAATTGGAAACAATGTCTTCGATGATGTCC
ATGTGAAGCCACAAGCTTTCAGCCTGAGTGCACACAACTCCACCAGGTCGAAGAGCT

QA 1 477 1 477
DS 

RD RS1H783JQB 493 0 0
GTGA
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CAGAACATTCTAAAAATTGTTGAAAAGGTTTTATTTTGATAAATGCAACAATCCCCCAGA
TGACTTCTTTCCTTTCTCAATTGGCTTTGGACTCTATTACCTTCTTGGCGAAAGAAGGCA
AGCAGAACGCAGCTGAATGAATCTCAGCGTTGTAAAACTTTAAGGGTCCCTTTGATTTGC
TGGAGCTGTCATCAATCGGGTTCACAGGGTTCTTGAAGTCAACGTCAGGCCCTTCAGTTG
AACAGAGCATGAATCCGATCACCCCACTCGGGTATGTTGGAACACTGGTCCATGCGTAGT
TCACAGAGCCCTTGAAGATCTCACGGCAATTGGAAACAATGTCTTCGATGATGTCCATGT
GAAGCCACAAGCTTTCAGCCTGAGTGCACACAACTCCACCAGGTCGAAGAGCTCTCGCCA
CAGATTGGA

QA 5 493 5 493
DS 

RD RS1H783TF 575 0 0
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CGCCACAGATTGGAAGAAGGGTTTCTCAAACAGCTCCTTTGCAGGACCAATTGGATCTGA
GGAGTCAACAATGACTGCATCATATGATCCTTCAGCAGCATTCTTCAAGAAAGCAACACC
ATCGCCAATGACGAGGTTAACGCGAGGATCCTCGAATCCAATTGCTACAGTAGGGAAAAA
CTGCTTAGAGACATCGACCACCATTTTATCAATCTCACACATATCAATATGCTCAACAGA
AGCATGGCGTGCAACCTCCCGCAGGACACCTCCATCTCCTCCTCCAATGACCAACACCTT
CTTTGGGTTAGGGATGGAGCACAAAGGAAGATGAGTGATCATCTCCTGATAAGCGCACTC
GTCTCTCTCCGTGAGTTGGATGACTCCATCCAAAACCAAAACTTTTCCATATGTCGCAGA
CTGGAAAACAATGACATCCTGATAATCTGATTTCC

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 7

CO CL775Contig1 1122 7 14 U
GGGAAACCCCTTCCCCTAAAACCCTAAAATCGCCACACCACAAACGAAACGAGTTCCTTC
GTAGCCTCTCCTCCCTCTGGACGAATCAAGATGTTGCGCAGGAACGTGAGGTTGAGAAAA
GAGTATCTCTACAGGAAGAACTTGGAAGGTGATGAGCGTGAGATCTACGAGAAGAAGCGC
AAGATAAGAGAAGCCCTCCAAGAAGGGAAGCCGATTCCTACTGAGCTCCGTAACGAGGAG
GCCAAGCTTCGACAGGAGATTGATCTCGAAGATCAGCACACTGCCGTACCGCGGAGTCAT
ATTGATGATGAATACGCAAATGCAACTGAAAAGGAGCCCAAGATTTTGCTGACAACTTCT
AGGGATCCAAGTGCTCCTCTTACGCGATTCGTCAAGGAATTGAATAATGTATTTCCTAAC
GCCAGTAGACTGAATCGTGGTAGTCAGGTTATTTCTGAGATTATTGAAACGGCGCGTTCT
CATGATTTTACTGATGTGATATTTGTTTCTGAGAACCGTGGCAAGCCTGATGGTCTTATT
ATCTCTCATCTCCCGTTCGGACCTACTGCCTACTTTCAGTTACTTAATGTGGTAACAAGA
CATGAAATTCAAACCAAGAAAGAAATGGGAAAAATGTCTGAGCAATATCCTCATCTCATT
TTTGAACGCTTTACAACCCAGATGGGTAAAAGAGTTATGAACATCTTAAAACACATCTTC
CCAGTTCCTAAACTTGATGCAAAGCGCATCGTTACGTTTTCTAATGAATCTGATTACATT
TCATTCAGGAATCATGTGTATGATAAAGGAGAAGGAGGCCCGAAATCGATTGAGCTAAAA
GAAATTGGTCCTCGGTTTGAGTTGCGGCTCTACCAGGTGAAATTAGGAACATTGGAACAA
GATGAGGCAGAGGTCGAATGGGTTCTGAGACCGTACATGAACACTGCTAAAAAACGCCAG
TTTCTCGGTGAATGATGATAATATGCTAAAACGCCAGCTATTTTCGAATTCTGTTTTACC
TTTTGATTTTGTTTTGTTGAAGGAGCTGTTCAAACCATTATGTGACACAGAATATTTCGA
AAAACTTTTATGATCTAAAATTAGCATTATAGATTTGCTGTT


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DQ48TF U 1
AF RS1DM12TF U 1
AF RS1CS68TF U 4
AF RS1EC08TF U 1
AF RS1CS68JQ C 358
AF RS1EC08JQ C 402
AF RS1DQ48JQ C 547
BS 1 150 RS1DM12TF
BS 151 151 RS1DQ48TF
BS 152 284 RS1DM12TF
BS 285 285 RS1DQ48TF
BS 286 665 RS1DM12TF
BS 666 666 RS1EC08TF
BS 667 686 RS1DM12TF
BS 687 790 RS1EC08TF
BS 791 791 RS1CS68JQ
BS 792 806 RS1EC08TF
BS 807 892 RS1CS68JQ
BS 893 893 RS1EC08JQ
BS 894 1112 RS1CS68JQ
BS 1113 1122 RS1EC08JQ

RD RS1DQ48TF 577 0 0
GGGAA
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TGATGAATACGCAAATGCAACTGAAAAGGAGCCCAAGATTTTGCTGACAACTTCTAGGGA
TCCAAGTGCTCCTCTTACGCGATTCGTCAAGGAATTGAATAATGTATTTCCTAACGCCAG
TAGACTGAATCGTGGTAGTCAGGTTATTTCTGAGATTATTGAAACGGCGCGTTCTCATGA
TTTTACTGATGTGATATTTGTTTCTGAGAACCGTGGCAAGCCTGATGGTCTTATTATCTC
TCATCTCCCGTTCGGACCTACTGCCTACTTTC

QA 6 577 6 577
DS 

RD RS1DM12TF 686 0 0
GGGAAACCCCTTCCCCTAAAACCCTAAAATCGCCACACCACAAACGAAACGAGTTCCTTC
GTAGCCTCTCCTCCCTCTGGACGAATCAAGATGTTGCGCAGGAACGTGAGGTTGAGAAAA
GAGTATCTCTACAGGAAGAACTTGGAAGGT*ATGAGCGTGAGATCTACGAGAAGAAGCGC
AAGATAAGAGAAGCCCTCCAAGAAGGGAAGCCGATTCCTACTGAGCTCCGTAACGAGGAG
GCCAAGCTTCGACAGGAGATTGATCTCGAAGATCAGCACACTGCTGTACCGCGGAGTCAT
ATTGATGATGAATACGCAAATGCAACTGAAAAGGAGCCCAAGATTTTGCTGACAACTTCT
AGGGATCCAAGTGCTCCTCTTACGCGATTCGTCAAGGAATTGAATAATGTATTTCCTAAC
GCCAGTAGACTGAATCGTGGTAGTCAGGTTATTTCTGAGATTATTGAAACGGCGCGTTCT
CATGATTTTACTGATGTGATATTTGTTTCTGAGAACCGTGGCAAGCCTGATGGTCTTATT
ATCTCTCATCTCCCGTTCGGACCTACTGCCTACTTTCAGTTACTTAATGTGGTAACAAGA
CATGAAATTCAAACCAAGAAAGAAATGGGAAAAATGTCTGAGCAATATCCTCATCTCATT
TTTGA*CGCTTTACAACCCAGATGGG

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1CS68TF 762 0 0
GG
ACCCCTTCCCCTAAAACCCTAAAATCGCCACACCACAAACGAAACGAGTTCCTTCGTAGC
CTCTCCTCCCTCTGGACGAATCAAGATGTTGCGCAGGAACGTGAGGTTGAGAAAAGAGTA
TCTCTACAGGAAGAACTTGGAAGGTGATGAGCGTGAGATCTACGAGAAGAAGCGCAAGAT
AAGAGAAGCCCTCCAAGAAGGGAAGCCGATTCCTACTGAGCTCCGTAACGAGGAGGCCAA
GCTTCGACAGGAGATTGATCTCGAAGACCAGCACACTGCCGTACCGCGGAGTCATATTGA
TGATGAATACGCAAATGCAACTGAAAAGGAGCCCAAGATTTTGCTGACAACTTCTAGGGA
TCCAAGTGTTCCTCTTACGCGATTCGTCAAGGAATTGAATAATGTATTTCCTAACGCCAG
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TTTTACTGATGTGATATTTGTTTCTGAGAACCGTGGCAAGCCTGATGGTCTTATTATCTC
TCATCTCCCGTTCGGACCTACTGCCTACTTTCAGTTACTTAATGTGGTAACAAGACATGA
A*TTCAAACCAAGAAAGAAATGGGAAAAATGTCTGAGCAATATCCTCATCTCATTTTTGA
ACGCTTTACAACCCAGATGGGTAAAAGAGTTATGAACATCTTAAAACACATCTTCCCAGT
TCCTAAACTTGATGCAAAGCGCATCGTTACGTTTTCTAAT

QA 3 762 3 762
DS 

RD RS1EC08TF 806 0 0
GGGAA
ACCCCTTCCCCTAAAACCCTAAAATCGCCACACCACAAACGAAACGAGTTCCTTCGTAGC
CTCTCCTCCCTCTGGACGAATCAAGATGTTGCGCAGGAACGTGAGGTTGAGAAAAGAGTA
TCTCTACAGGAAGAACTTGGAAGGTGATGAGCGTGAGATCTACGAGAAGAAGCGCAAGAT
AAGAGAAGCCCTCCAAGAAGGGAAGCCGATTCCTACTGAGCTCCGTAACGAGGAGTCCAA
GCTTCGACAGGAGATTGATCTCGAAGATCAGCACACTGCCGTACCGCGGAGTCATATTGA
TGATGAATACGCAAATGCAACTGAAAAGGAGCCCAAGATTTTGCTGACAACTTCTAGGGA
TCCAAGTGCTCCTCTTACGCGATTCGTCAAGGAATTGAATAATGTATTTCCTAACGCCAG
TAGACTGAATCGTGGTAGTCAGGTTATTTCTGAGATTATTGAAACGGCGCGTTCTCATGA
TTTTACTGATGTGATATTTGTTTCTGAGAACCGTGGCAAGCCTGATGGTCTTATTATCTC
TCATCTCCCGTTCGGACCTACTGCCTACTTTCAGTTACTTAATGTGGTAACAAGACATGA
AATTCAAACCAAGAAAGAAATGGGAAAAATGTCTGAGCAATATCCTCATCTCATTTTTGA
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TCCTAAACTTGATGCAAAGCGCATCGTTACGTTTTCTAATGAATCTGATTACATTTCATT
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GAAATCGATTGAGCTAAAAGAAATTGGTCCTCGGTTTGAGTTGCGGCTCTACCAGGTGAA
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T

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CCTAAACTTGATGCAAAGCGCATCGTTACGTTTTCTAATGAATCTGATTACATTTCATTC
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GCAGAGGTCGAATGGGTTCTGAGACCGTACATGAACACTGCTAAAAAACGCCAGTTTCTC
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TTTATGATCTAAAATTAGCATTATAGATTTGCTGTT

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DS 



AS 1 5

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CAAAGCCAACACAATTCTTACAGCCTTTCAAATATGTCCGAAACAAAAACAAAAGGGCAA
GTGTAATAGCCACCATTGAAGCAGCTGCTTGAGGAGCTCAGAAGATTCTTTGTGGTGGTC
CCATTGTGCTCTTGAGGTACAAACACCTCACGTTTTGCCAGTTCTTCTTCAACAAAGAGA
CGAGGAAGTTGACACTCATCTGGACATTCTGAAAAATGTGCTTCTCCTCCATGGAGAGGT
TACCAACAGCAACACCCATACACAGAACCTTCTTCAGCTGAAACTTCACTGTAGCCTTAG
TTTCATTCACCTTCCCCTCTAGCGATTCCTGGTGGCTCACAAGCGTCGGGAACTTGCCTG
CCTTGTTGAGTCCAGGACCGAGAAGACGAGGGATCTGCTTGATGACGGATTCAGAGGCCA
AGAAGGCGTGGTACTTCTTGGCAAGCTTCTTGACGAGCTTCTTGTTCTTGTTGAGCTTTT
TCAGAGACTCCACGTCCATAGAGTCCAGCCCCATTTTCTCAGCCTCCTCGACGTGCTGGG
CGTCTCCGAGCATGCAGATCTTCATCTTGGGACGGGGAATGTGTGGTAACTTGACGGAAC
CACTGAAACGTTTGTCCTTTTGAGGGTCATAATTTTTCAGACCAATCTGGAGCTCGAGAG
TCTCAACGAAGTTGCGTTTCTTCTCTTCTGATTTTCCTCTGATGACAGTTATGGCTTCTT
TAACAGCCTCACTCTGAAGCTTACTCATTTTGAGCTTGTCTCAAAAGATCTGATCCTAAT
GATGAGACCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RS1F042JQ U 18
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AF RS1D371JQ U 1
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CCGA
AAAAA

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DS 

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AAGA

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DS 

RD RS1D371TF 774 0 0
CAG
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GCTTCTTGACGAGCTTCTTGTTCTTGTTGAGCTTTTTCAGAGACTCCACGTCCATAGAGT
CCAGCCCCATTTTCTCGGCCTCCTCGACGTGCTGGGCGTCTCCGAGCATGCAGATCTTCA
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TCATTTTGAGCTTGTCTCAAAAGATCTGATCCTA
ATGATGAGACGGAAGCC

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DS 

RD RS1D371JQ 846 0 0
GC
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AAGCCAACACAATTCTTACAGCCTTTCAAATATGTCCGAAACAAAAACAAAAGGGCAAGT
GTAATAGCCACCATTGAAGCAGCTGCTTGAGGAGCTCAGAAGATTCTTTGTGGTGGTCCC
ATTGTGCTCTTGAGGTACAAACACCTCACGTTTTGCCAGTTCTTCTTCAACAAAGAGACG
AGGAAGTTGACACTCATCTGGACATTCTGAAAAATGTGCTTCTCCTCCATGGAGAGGTTA
CCAACAGCAACACCCATACACAGAACCTTCTTCAGCTGAAACTTCACTGTAGCCTTAGTT
TCATTCACCTTCCCCTCTAGCGATTCCTGGTGGCTCACAAGCGTCGGGAACTTGCC*GCC
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AAGGCGTGGTACTTCTTGGCAAGCTTCTTGACGAGCTTCTTGTTCTTGTTGAGCTTTTTC
AGAGACTCCACGTCCATAGAGTCCAGCCCCATTTTCTCGGCCTCCTCGACGTGCTGGGCG
TCTCCGAGCATGCAGATCTTCATCTTGGGACGGGGAATGTGTGGTAACTTGACGGAACCA
CTGAAACGTTTGTCCTTTTGAGGGTCATAATTTTTCAGACCAATCTGGAGCTCGAGAGTC
TCAACGAAGTTGCGTTTCTTCTCTTCTGATTTTCCTCTGATGACAGTTATGGCTTCTTTA
ACAGCCTCACTCTGAAGCTTACTCATTTTGAGCTTGTCTCAAA*GATCTGATCCTAATGA
TGAG

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DS 

RD RS1F042TF 740 0 0
C
AAAGGGCAAGTGTA*TAGCCACCAT*GAAGCAGCTGCTTGAGGAGCTCAGAAGATTCTTT
GTGGTG*TCCCATTGTGCTCTTGAGGTACAAACACCTCACGTTTTGCCAGTTCTTCTTCA
ACAAAGAGACGAGGAAGTTGACACTCATCTGGACATTCTGAAAAATGTGCTTCTCCTCCA
TGGAGAGGTTACCAACAGCAACACCCATACACAGAACCTTCTTCAGCTGAAACTTCACTG
TAGCCTTAGTTTCATTCACCTTCCCCTCTAGCGATTCCTGGTGGCTCACAAGCGTCGGGA
ACTTGCCTGCCTTGTTGAGTCCAGGACCGAGAAGACGAGGGATCTGCTTGATGACGGATT
CAGAGGCCAAGAAGGCGTGGTACTTCTTGGCAAGCTTCTTGACGAGCTTCTTGTTCTTGT
TGAGCTTTTTCAGAGACTCCACGTCCATAGAGTCCAGCCCCATTTTCTCAGCCTCCTCGA
CGTGCTGGGCGTCTCCGAGCATGCAGATCTTCATCTTGGGACGGGGAATGTGTGGTAACT
TGACGGAACCACTGAAACGTTTGTCCTTTTGAGGGTCATAATTTTTCAGACCAATCTGGA
GCTCGAGAGTCTCAACGAAGTTGCGTTTCTTCTCTTCTGATTTTCCTCTGATGACAGTTA
TGGCTTCTTTAACAGCCTCACTCTGAAGCTTACTCATTTTGAGCTTGTCTCAAAAGATCT
GATCCTAATGATGAGACCC

QA 2 740 2 740
DS 



AS 1 7

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GGAACAAGAGTCACACACTGTGTGTGAGATGTGGTCGTCGTAGCTTCCACATCCAGAAGA
GTCGCTGCTCTGCCTGCGCTTACCCCGCCGCTCGCAAGAGGACCTATAACTGGAGTGTGA
AGGCAATCAGGAGGAAGACAACCGGAACCGGTAGGATGAGGTATCTCAAAAATGTTCCCC
GCCGTTTCAAGACTGGTTTCAGAGAAGGTACTGAAGCCAAGCCAAGGAACAAGGGAGCAT
CAGCTTCCTCAGCCTAAAAGAGTATCCTCAGTTCTCGAGTTTAAACGCAGGAAGAAGACT
TGGCACTTTTCGCTCTTATCTAATTTTGAGATTTTGCTATTCCTGAAATACAATTTATGT
TTTTGTTTCATGTTTTGAACCTGGATCATATCCCTTCATTTTGCAACTTTCAAAAGTCTT
CCTTTCTTTGCCTAATTACATTCATTCAAGTG


BQ
40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D352JQ C 1
AF RS1DG74JQ C 1
AF RS1DG74TF U 1
AF RS1D352TF U 1
AF RS1DO37JQ C 1
AF RS1DO37TF U 1
AF RS1B791TF U 6
BS 1 89 RS1DG74TF
BS 90 90 RS1D352TF
BS 91 119 RS1DG74TF
BS 120 120 RS1D352TF
BS 121 343 RS1DG74TF
BS 344 344 RS1D352TF
BS 345 492 RS1DG74TF
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BS 494 512 RS1B791TF

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CCTTTCTTTGCCT

QA 1 493 1 493
DS 

RD RS1DG74JQ 492 0 0
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GTCGCTGCTCTGCCTGCGCTTACCCCGCCGCTCGCAAGAGGACCTATAACTGGAGTGTGA
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GCCGTTTCAAGACTGGTTTCAGAGAAGGTACTGAAGCCAAGCCAAGGAACAAGGGAGCAT
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TGGCACTTTTCGCTCTTATCTAATTTTGAGATTTTGCTATTCCTGAAATACAATTTATGT
TTTTGTTTCATGTTTTGAACCTGGATCATATCCCTTCATTTTGCAACTTTCAAAAGTCTT
CCTTTCTTTGCC

QA 1 492 1 492
DS 

RD RS1DG74TF 492 0 0
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GTCGCTGCTCTGCCTGCGCTTACCCCGCCGCTCGCAAGAGGACCTATAACTGGAGTGTGA
AGGCAATCAGGAGGAAGACAACCGGAACCGGTAGGATGAGGTATCTCAAAAATGTTCCCC
GCCGTTTCAAGACTGGTTTCAGAGAAGGTACTGAAGCCAAGCCAAGGAACAAGGGAGCAT
CAGCTTCCTCAGCCTAAAAGAGTATCCTCAGTTCTCGAGTTTAGACGCAGGAAGAAGACT
TGGCACTTTTCGCTCTTATCTAATTTTGAGATTTTGCTATTCCTGAAATACAATTTATGT
TTTTGTTTCATGTTTTGAACCTGGATCATATCCCTTCATTTTGCAACTTTCAAAAGTCTT
CCTTTCTTTGCC

QA 1 492 1 492
DS 

RD RS1D352TF 493 0 0
TTTTTGGTGGCAAGCAACTCGCTACAATGACAAAGGGAACAGGAAGTTTTGGTAAGAGGA
GGAACAAGAGTCACACACTGTGTGTGAGATGTGGTCGTCGTAGCTTCCACATCCAGAAGA
GTCGCTGCTCTGCCTGCGCTTACCCCGCCGCTCGCAAGAGGACCTATAACTGGAGTGTGA
AGGCAATCAGGAGGAAGACAACCGGAACCGGTAGGATGAGGTATCTCAAAAATGTTCCCC
GCCGTTTCAAGACTGGTTTCAGAGAAGGTACTGAAGCCAAGCCAAGGAACAAGGGAGCAT
CAGCTTCCTCAGCCTAAAAGAGTATCCTCAGTTCTCGAGTTTAAACGCAGGAAGAAGACT
TGGCACTTTTCGCTCTTATCTAATTTTGAGATTTTGCTATTCCTGAAATACAATTTATGT
TTTTGTTTCATGTTTTGAACCTGGATCATATCCCTTCATTTTGCAACTTTCAAAAGTCTT
CCTTTCTTTGCCT

QA 1 493 1 493
DS 

RD RS1DO37JQ 494 0 0
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GTCGCTGCTCTGCCTGCGCTTACCCCGCCGCTCGCAAGAGGACCTATAACTGGAGTGTGA
AGGCAATCAGGAGGAAGACAACCGGAACCGGTAGGATGAGGTATCTCAAAAATGTTCCCC
GCCGTTTCAAGACTGGTTTCAGAGAAGGTACTGAAGCCAAGCCAAGGAACAAGGGAGCAT
CAGCTTCCTCAGCCTAAAAGAGTATCCTCAGTTCTCGAGTTTAAACGCAGGAAGAAGACT
TGGCACTTTTCGCTCTTATCTAATTTTGAGATTTTGCTATTCCTGAAATACAATTTATGT
TCTTGTTTCATGTTTTGAACCTGGATCATATCCCTTCATTTTGCAACTTTCAAAAGTCTT
CCTTTCTTTGCCT
T

QA 1 493 1 493
DS 

RD RS1DO37TF 494 0 0
TTTTTGGTGGCAAGCAACTCGCTACAATGGCAAAGGGAACAGGAAGTTTTGGTAAGAGGA
GGAACAAGAGTCACACACTGTGTGTGAGATGTGGTCGTCGTAGCTTCCACATCCAGAAGA
GTCGCTGCTCTGCCTGCGCTTACCCCGCCGCTCGCAAGAGGACCTATAACTGGAGTGTGA
AGGCAATCAGGAGGAAGACAACCGGAACCGGTAGGATGAGGTATCTCAAAAATGTTCCCC
GCCGTTTCAAGACTGGTTTCAGAGAAGGTACTGAAGCCAAGCCAAGGAACAAGGGAGCAT
CAGCTTCCTCAGCCTAAAAGAGTATCCTCAGTTCTCGAGTTTAAACGCAGGAAGAAGACT
TGGCACTTTTCGCTCTTATCTAATTTTGAGATTTTGCTATTCCTGAAATACAATTTATGT
TCTTGTTTCATGTTTTGAACCTGGATCATATCCCTTCATTTTGCAACTTTCAAAAGTCTT
CCTTTCTTTGCCT
T

QA 1 493 1 493
DS 

RD RS1B791TF 507 0 0
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ATCAGGAGGAAGACAACCGGAACCGGTAGGATGAGGTATCTCAAAAATGTTCCCCGCCGT
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CTTTTCGCTCTTATCTAATTTTGAGATTTTGCTATTCCTGAAATACAATTTATGTTTTTG
TTTCATGTTTTGAACCTGGATCATATCCCTTCATTTTGCAACTTTCAAAAGTCTTCCTTT
CTTTGCCTAATTACATTCATTCAAGTG

QA 1 507 1 507
DS 



AS 1 7

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CTCATCTATAAAGGATATTTAAGTTTCGGTGCCAACTG


BQ
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CL03JQ C 1
AF RS1CL03TF U 1
AF RS1CN15JQ C 1
AF RS1DE06TF U 1
AF RS1FK83JQ C 1
AF RS1FK83TF U 1
AF RS1CN15TF U 1
BS 1 11 RS1CL03TF
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RD RS1CL03JQ 445 0 0
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GAGGAAATGCTCGGCAACAAACAGATTGATCACCTCAAAGGATCATGCCTCTGTTCAGCT
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CTCATCTATAAAGGATATTTAAGTT

QA 1 445 1 445
DS 

RD RS1CL03TF 445 0 0
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GAGGAAATGCTCGGCAACAAACAGATTGATCACCTCAAAGGATCATGCCTCTGTTCAGCT
CAACATTGGTCATCTTGACGCCGATGGTATCTACACTGGCCAGTTCACCACTCTTGCTCT
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GAAGAAAGTCGAAGCCAAACAACAGTGAGAGATAGAGATTAATCTATAAGCTGCCCTCTC
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CTCATCTATAAAGGATATTTAAGTT

QA 1 445 1 445
DS 

RD RS1CN15JQ 458 0 0
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CTCATCTATAAAGGATATTTAAGTTTCGGTGCCAACTG

QA 1 458 1 458
DS 

RD RS1DE06TF 453 0 0
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GAGGAAATGCTCGGCAACAAACAGATTGATCACCTCAAAGGATCATGCCTCTGTTCAGCT
CAACATTGGTCATCTTGACGCCGATGGTATCTACACTGGCCAGTTCACCACTCTTGCTCT
CTGCGGCTTTGTCCGTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTCGACAGGCTCTGGCAGAA
GAAGAAAGTCGAAGCCAAACAACAGTGAGAGATAGAGATTAATCTATAAGCTGCCCTCTC
T*GTTGTTTTTTGACATGTTTCCTTGAATTTTCTCTAGCTACGAACTCGTGTCTTTTTTT
CTCATCTATAAAGGATATTTAAGTTTCGGTGC
C

QA 1 452 1 452
DS 

RD RS1FK83JQ 452 0 0
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GAGGAAATGCTCGGCAACAAACAGATTGATCACCTCAAAGGATCATGCCTCTGTTCAGCT
CAACATTGGTCATCTTGACGCCGATGGTATCTACACTGGCCAGTTCACCACTCTTGCTCT
CTGCGGCTTTGTCCGTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTCGACAGGCTCTGGCAGAA
GAAGAAAGTCGAAGCCAAACAACAGTGAGAGATAGAGATTAATCTATAAGCTGCCCTCTC
TTGTTGTTTTTTGACATGTTTCCTTGAATTTTCTCTAGCTACGAACTCGTGTCTTTTTTT
CTCATCTATAAAGGATATTTAAGTTTCGGTGC

QA 1 452 1 452
DS 

RD RS1FK83TF 452 0 0
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CAACATTGGTCATCTTGACGCCGATGGTATCTACACTGGCCAGTTCACCACTCTTGCTCT
CTGCGGCTTTGTCCGTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTCGACAGGCTCTGGCAGAA
GAAGAAAGTCGAAGCCAAACAACAGTGAGAGATAGAGATTAATCTATAAGCTGCCCTCTC
TTGTTGTTTTTTGACATGTTTCCTTGAATTTTCTCTAGCTACGAACTCGTGTCTTTTTTT
CTCATCTATAAAGGATATTTAAGTTTCGGTGC

QA 1 452 1 452
DS 

RD RS1CN15TF 458 0 0
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GAGGAAATGCTCGGCAACAAACAGATTGATCACCTCAAAGGATCATGCCTCTGTTCAGCT
CAACATTGGTCATCTTGACGCCGATGGTATCTACACTGGCCAGTTCACCACTCTTGCTCT
CTGCGGCTTTGTCCGTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTCGACAGGCTCTGGCAGAA
GAAGAAAGTCGAAGCCAAACAACAGTGAGAGATAGAGATTAATCTATAAGCTGTCCTCTC
TTGTTGTTTTTTGACATGTTTCCTTGAATTTTCTCTAGCTACGAACTCGTGTCTTTTTTT
CTCATCTATAAAGGATATTTAAGTTTCGGTGC
CAACTG

QA 1 452 1 452
DS 



AS 1 7

CO CL779Contig1 1271 7 26 U
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TTATTTGGGGTGGTGCTTGGTTATACTATGCCACGGGGAACGTAACTTATCTCGATCTCA
TCACAAAGCCAACTATGGCTAAGCATGCTGGTGCCTTCTGGGGTGGGCCTTACTATGGTG
TATTTAGCTGGGACAACAAGCTTGCTGGTGCTCAGTTGCTGCTGAGCCGGTTGAGGTTGT
TTTTGAGTCCTGGATATCCTTATGAAGAAATTCTAAGGACATTTCATAATCAGACCAGCA
TAGTCATGTGCTCCTACTTGCCCTATTTCAACAAATTTAACAGAACCAGGGGAGGTTTGA
TAGAGTTAAATCATGGAGATCCACAGCCCCTCCAGTATGCTGCAAATGCAGCTTTCTTAG
CTACGTTGTACAGTGATTATCTGGATGCTGCTGATACTCCTGGATGGTACTGTGGACCTA
ATTTCTATTCAACCAATGTCCTACGAGAGTTTGCCAGAACTCAGATTGATTACATACTCG
GTAAAAACCCTAGGAAAATGAGTTATCTCGTAGGGTTTGGCCCAAAATACCCGAAACACG
TGCATCACAGAGGAGCTTCGATTCCCAAGAACAAAGTCAAATACAACTGCAAAGGAGGAT
GGAAATGGAGAGACAGCAAGAAACCGAATCCGAACACGATTGAAGGAGCCATGGTTGCTG
GTCCTGACAAGCGCGATGGGTTCCGCGATGTACGGACCAACTACAACTACACCGAACCGA
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CATCTGGTACTATAGACAAAAACACTATATTCTCAGCGGTTCCTCCATTGTTCCCTACTC
CCCCGCCGCCACCAGCACCATGGAAACCCTGAGAAACCTAAAAGCTGTGTGATTATGCCT
GTTACCAGAAAATAAATGAGGTAAGGATTTGGTTATTAGAGCTGAAGAATCAAGGTGGTG
CCCGCTAACACACACACACAAGTCAACCATAATCAACTACTAAGGATTTCATTTGCCTTT
TGCTGGATATAAACCGTCTGTCTGTGGTTAGCTTACCAAGAGTTTTTCTTTTTGTATTGC
GCTTTTGTTCTTGTGAGATATGACATATATTTACGTTTTACTCTGTATATGTATGATACC
AACTTGTATTAAAACAATCGAACGAACGTCTTAAACAGTGTTATTAGTGGGAGTGTGCTT
TCTGCTTGTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 10 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

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TAGAGTTAAATCATGGAGATCCACAGCCCCTCCAGTATGCTGCAAATGCAGCTTTCTTAG
CTACGTTGTACAGTGATTATCTGGATGCTGCTGATACTCCTGGATGGTACTGTGGACCTA
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G
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TTGGTTATACTATGCCACGGGGAATGTAACTTATCTCGATCTCATCACAAAGCCAACTAT
GGCTAAGCATGCTGGTGCCTTCTGGGGTGGGCCTTACTATGGTGTATTTAGCTGGGACAA
CAAGCTTGCTGGTGCTCAGTTGCTGCTGAGCCGGTTGAGGTTGTTTTTGAGTCCTGGATA
TCCTTATGAAGAAATTCTAAGGACATTTCATAATCAGACCAGCATAGTCATGTGCTCCTA
CTTGCCCTATTTCAACAAATTTAACAGAACCAGGGGAGGTTTGATAGAGTTAAATCATGG
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TTATCTGGATGCTGCTGATACTCCTGGATGGTACTGTGGACCTAATTTCTATTCAACCAA
TGTCCTACGAGAGTTTGCCAGAACTCAGATTGATTACATACTCGGTAAAAACCCTAGGAA
AATGAGTTATCTCGTAGGGTTTGGCCCAAAATACCCGAAACACGTGCATCACAGAGGAGC
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G
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TCCTACTTGCCCTATTTCAACAAATTTAACAGAACCAGGGGAGGTTTGATAGAGTTAAAT
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GGAGCTTCGATTCCCAAGAACAAAGTCAAATACAACTGCAAAGGAGGATGGAAATGGAGA
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ATAGACAAAAACACTATATTCTCAGCGGTTCCTCCATTGTTCCCTACTCCCC*GCCGCCA
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G
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GCCAGAACTCAGATTGATTACATACTCGGTAAAAACCCTAGGAAAATGAGTTATCTCGTG
GGTTTTGGCTCAAAATACCCGAAACACGTGCATCACAGAGGAGCTTCGATTCCCAAGAAC
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CGGACCAACTACAACTACACCGAACCGACTCTTGCAGGGAATGCTGGTCTGGTCGCAGCT
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TCAACTACTAAGGATTTCATTTGCGTTTTGCTGGATATAAACCGTCTTTCTGTGGTTAGC
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A

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CGTTTTACTCTGTATATGTACGATACCAACTTGTATTAAAACAATCGAACGAACGTCTTA
AACAGTGTTATTAGTGGGAGTGTGC
C

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DS 

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TTT
TTAGCTACGTTGTACAGTGATTATCTGGATGCTGCTGATACTCCTGGATGGTACTGTGGA
C*TAATTTCTATTCAACCAATGTCCTACGAGAGTTTGCCAGAACTCAGATTGATTACATG
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GGTGCCCGCTAACACACACACACAAGTCAACCATAATCAACTACTAAGGATTTCATTTGC
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TTGCGCTTTTGTTCTTGTGAGATATGACATATATCTACGTTTTACTCTGTATATGTATGA
TACCAACTTGTATTAAAACAATCGAACGAACGTCTTAAACAGTGTTATTAGTGGGAGTGT
GCTTTCTGCTTG
C

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DS 

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AAGAAACCGAATCCGAACACGATTGAAGGAGCCATGGTTGCTGGTCCTGACAAGCGCGAT
GGGTTCCGCGATGTACGGACCAACTACAACTACACCGAACCGACTCTTGCAGGAAATGCT
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TCGAACGAACGTTTTAAACAGTGTTATTAGTGGGAGTGTGCTTTCTGCTTGTAG

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DS 



AS 1 6

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CAAGATGTCGAAAGAAGTGAACGAAGAGGGACAAGCAACACACAGCCATGGAAAAGACTA
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CAGAGCTCTCATCGCCGAGTTCATCGCCACACTCCTCTTCCTCTACGTCACCATAGCAAC
CGTCATCGGCCACAAGAAACAAACCGGTCCTTGTGACGGCGTTGGTTTACTCGGTATCGC
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AGCTTTCATGAAGACTCCTTACAACACTCTCGGTGGGGGAGCTAACACTGTCGCCCCTGG
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CGTCTTCTCTGCTACCGACCCTAAGAGAAGCGCTCGTGACTCTCACATCCCCGTTTTGGC
TCCACTTCCAATTGGATTTGCTGTGTTCATGGTGCATTTGGCAACCATCCCCATCACTGG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 15 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 30 30 30 30 10 30 
30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

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CAGAGCTCTCATCGCCGAGTTCATCGCCACACTCCTCTTCCTCTACGTCACCATAGCAAC
CGTCATCGGCCACAAGAAACAAACCGGTCCTTGTGACGGCGTTGGTTTACTCGGTATCGC
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AGCTTTCATGAAGACTCCTTACAACACTCTCGGTGGGGGAGCTAACACTGTCGCCCCTGG
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CGTCTTCTCTGCTACCGACCCTAAGAGAAGCGCTCGTGACTCTCACACCCCCGTTTTGGC
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AACTGGAATTA

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DS 

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TTACATGATAGCTCAGTGTCTTGGAGCCATTTGTGGCGTGGGTTTCGTTAAAGCTTTCAT
GAAGACTCCTTACAACACTCTCGGTGGGGGAGCTAACACTGTCGCCCCTGGTTACAGTAC
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TCCACCAGCTCCCCTTCTCGACATGGAAGAGCTCAAGTCTTGGTCTTTCTACAGAGCTCT
CATCGCCGAGTTCATCGCCACACTCCTCTTCCTCTACGTCACCATAGCAACCGTCATCGG
CCACAAGAAACAAACCGGTCCTTGTGACGGCGTTGGTTTACTCGGTATCGCTTGGGCCTT
CGGTGGTATGATCTTCGTCCTCGTCTACTGCACCGCCGGTATCTCTGGTGGTCACATTAA
CCCAGCTGTGACTTTTGGTCTGTTCTTGGCACGTAAGGTGTCTTTGGTGAGAGCTGTTGG
TTACATGATAGCTCATTGTCTTGGAGCCATTTGTGGTGTGGGTTTCGTTAAAGCTTTCAT
GAAGACTCCTTACAACACTCTCGGTGGGGGAGCTAACACTGTCGCCCCTGGTTACAGTAC
TGGAACTGCTCTCGGTGCTGAGATCATTGGAACTTTCGTCCTCGTTTACACCGTCTTCTC
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ATGACATGGATCT

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TCTGCTACCGACCCTAAGAGAAGCGCTCGTGACTCTCACATCCCCGTTTTGGCTCCACTT
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GCTTTATTTGTGTGGTTAATGAGAGAGAGCTTAAGTTGGTGGATTGATGATTAATGTTAA
TTATGAAATGGGTGTATGAATTT

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TGGTTACATGATAGCTCAGTGTCTTGGAGCCATTTGTGGTGTGGGTTTCGTTAAAGCTTT
CATGAAGACTCCTTACAACACTCTCGGTGGGGGAGCTAACACTGTCGCCCCTGGTTACAG
TACTGGAACTGCTCTCGGTGCTGAGATCATTGGAACTTTCGTCCTCGTTTACACCGTCTT
TTTTGCTACCTACCCTAAGAGAAGCGCTCGTGACTCTCACATCCCCGTTTTGGCTCCACT
TCCAATTGGATTTGCTGTGTTCATGGTGCATTTGGCAACCATCCCCATCACTGGAACTGG
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TCAATACATTTTGAGAGCTGCTGCAGTTAAGGCCTTGGCCTCGTTCCGAAGCAGTGCAAC
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GGAACTGCTCTCGGTGCTGAGATCATTGGAACTTTCGTCCTCGTTTACACCGTCTTCTCT
GCTACCGACCCTAAGAGAAGCGCTCGTGACTCTCACACCCCCGTTTTGGCTCCACTTCCA
ATTGGATTTGCTGTGTTCATGGTGCATTTGGCAACCATCCC*ATCACTGGAACTGGAATT
AACCCAGCGAGAAGCTTTGGTGCTGCTGTTATCTACAACAACGAGAAGGCATGGGATGAC
CATTGGATCTTCTGGGTTGGGCCATTCGTTGGAGCATTAGCAGCAGCAGCTTACCATCAA
TACATTTTGAGAGCTGCAGCAGTTAAGGCCTAGGCCTCGTTCCGAAGCAGTGCAACCAAC
TGATGAATGGTGAAGAAAAAAGCTTAAGATTCGTTATGCTTTTTATTTTTATTTGTTGCT
TTATTTGTGTGGTTAATGAGAGAGAGCTTAAGTTGGTGGATTGATGATTAATGTTAATTA
TGAAATGGGTGTATGAATTTTTCTTTCTTTCTTTTTCTACCCACTTTGTTAGCTTTTTCA
ATATCTAGTTTAGTTTGGTGTGACTTGTGAATCATTTTCCTTTCTTAGTTATTATCATTT
TCTCTCTA
C

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 6

CO CL781Contig1 873 6 14 U
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GCGGAAGATCAAAATTTAACACCGAAATCAGCTGCTCATATCAGTACCAGGGTTAAAACA
GTTGTGAAATAAATCTCCCATTAAAAACTGAAACTAGAGCCGTCCGTCTCTTTGAAACAA
AATCTTGGTTGGTCTTTTCAGTTTTCCGCTATCTAAAAATAGGAGAGAGTTTAGTGTTCA
AGGTGGAACACATACTCTGTCAAGCGTTGCAGCTTCGAAGAATCCACCTTTTGCTCTCTT
TGAACCGCTTGCTTCTTCACAGTCACCATTTGAGATGCTGCATCCACTGTCCATCCTTTC
TCCACAACATAAGTAGTGGCATCATCTTGTGTCATGCCTAGGAAAAGAGCCAAATCGCTG
ATGGTAATTGTCGAGTAGGCAGACAACAAGAGCTGAAACATCCTTTTTGTGTAAACATCT
GAGAAAGCGGCAACCATATCTTTAGCATCTTGACTCCAATCAAAACCACGGATAGATTCA
TAGACACCAGCATAGTCACGTGTCCAGAGCTTCTGACCAATCCTCCAAGCAGCAGCAACT
TCAGGCTTGCTCTCCTTCACACTCGTAGGTATTGTTTTCCATAAGAAACGTGCACTATCA
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GAGATTCCTTCCGCAGAAACCTGGAGCATGAGACTATCGCAGATGTCGGCGATTTTGTCA
AAGGACTTGACGGCTAAAGCTTCGGTAACAGGAGAGAGATCCATGACTACTGGTTT*CGT
TTTACTATTGGAGCTTTGCCAAGATGACGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 15 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EH30JQ U 1
AF RS1DR62JQ U 78
AF RS1AZ56JQ U 61
AF RS1DR62TF C 85
AF RS1EH30TF C 169
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BS 829 856 RS1AZ56JQ
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BS 866 873 RS1AZ56TF

RD RS1EH30JQ 777 0 0
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GCGGAAGATCAAAATTTAACACCGAAATCAGCTGCTCATATCAGTACCAGGGTTAAAACA
GTTGTGAAACAAATCTCCCATTAAAAACTGAAACTAGAGCCGTCCGTCTCTTTGAAACAA
AATCTTGGTTGGTCTTTTCAGTTTTCCGCTATCTAAAAATAGGAGAGAGTTTAGTGTTCA
AGGTGGAACACATACTCTGTCAAGCGTTGCAGCTTCGAAAAATCCACCTTTTGCTCTCTT
TGAACCGCTTGCTTCTTCACAGTCACCATTTGAGATGCTGCATCCACTGTCCATCCTTTC
TCCACAACATAAGTAGTGGCATCATCTTGTGTCATGCCTAGGAAAAGAGCCAAATCGCTG
ATGGTAATTGTCGAGTAGGCAGACAACAAGAGCTGAAACATCCTTTTTGTGTAAACATCT
GAGAAAGCGGCAACCATATCTTTAGCATCTTGACTCCAATCAAAACCACGGATAGATTCA
TAGACACCAGCATAGTCACGTGTCCAGAGCTTCTGACCAATCCTCCAAGCAGCAGCAACT
TCAGGCTTGCTCTCCTTCACACTCGTAGGTATTGTTTTCCATAAGAAACGTGCACTATCA
CAATCGTCAACGAAGAAGTAAGCGAGGAGATGGATAGCGTGAGGCCAGTCTTCCCGGAAT
GAGATTCCTTCCGCAGAAACCTGGAGCATGAGACTATCGCAGATGTCGGCGATTTTG

QA 1 777 1 777
DS 

RD RS1DR62JQ 702 0 0
AACACCG
AAATCAGCTGCTCATATCAGTACCAGGGTTAAAACAGTTGTGAAATAAATCTCCCATTAA
AAACTGAAACTAGAGCCGTCCGTCTCTTTGAAACAAAATCTTGGTTGGTCTTTTCAGTTT
TCCGCTATCTAAAAATAGGAGAGAGTTTAGTGTTCAAGGGGGAACACATACTCTGTCAAG
CGTTGCAGCTTCGAAAAATCCACCTTTTGCTCTCTTTGAACCGCTTGCTTCTTCACAGTC
ACCATTTGAGATGCTGCATCCACTGTCCATCCTTTCTCCACAACATAAGTAGTGGCATCA
TCTTGTGTCATGCCTAGGAAAAGAGCCAAATCGCTGATGGTAATTGTCGAGTAGGCAGAC
AACAAGAGCTGAAACATCCTTTTTGTGTAAACATCTGAAAAAGCGGCAACCATATCTTTA
GCATCTTGACTCCAATCAAAACCACGGATAGATTCATAGACACCAGCATAGTCACGTGTC
CAGAGCTTCTGACCAATCCTCCAAGCAGCAGCAACTTCAGGCTTGCTCTCCTTCACACTC
GTAGGTATTGTTTTCCATAAGAAACGTGCACTATCACAATCGTCAACGAAGAAGTAAGCG
AGGAGATGGATAGCGTAAGGCCAGTCTTCCTGGAATGAGATTCCTTCCGCAGAAACCTGG
AGCATGAGACTATCGCAGATGTCGGCGATTTTGTC

QA 8 702 8 702
DS 

RD RS1AZ56JQ 812 0 0
GCGGAAGATCAAAATTTAACACCGAAATCAGCTGCTCATATCAGTACCAGGGTTAAAACA
GTTGTGAAATAAATCTCCCATTAAAAACTGAAACTAGAGCCGTCCGTCTCTTTGAAACAA
AATCTTGGTTGGTCTTTTCAGTCTTCCGCTATCTAAAAATAGGAGAGAGTTTAGTGTTCA
AGGTGGAACACATACTCTGTCAAGCGTTGCAGCTTCGAAGAATCCACCTTTTGCTCTCTT
TGAACCGCTTGCTTCTTCACAGTCACCATTTGAGATGCTGCATCCACTGTCCATCCTTTC
TCCACAACATAAGTAGTGGCATCATCTAGTGTCATGCCTAGGAAAAGAGCCAAATCGCTG
ATGGTAATTGTCGAGTAGGCAGACAACAAGAGCTGAAACATCCTTTTTGTGTAAACATCT
GAGAAAGCGGCAACCATATCTTTAGCATCTTGACTCCAATCAGAACCACGGATAGATTCA
TAGACACCAGCATAGTCACGTGTCCAGAGCTTCTGACCAATCCTCCAAGCAGCAGCAACT
TCAGGCTTGCTCTCCTTCACACTCGTAGGTATTGTTTTCCATAAGAAACGTGCACTATCA
CAATCGTCAACGAAGAAGTAAGCGAGGAGATGGATAGCGTAAGGCCAGTCTTCCTGGAAT
GAGATTCCTTCCGCAGAAACCTGAAGCATGAGACTATCGCAGATGTCGGCGATTTTGTCA
AAGGACTTGACGGCTAAAGCTTCGGTAACAGGAGAGAGATCCATGAC*ACTGGTTT*CGT
TTTACTATTGGAGCTT
GCCAAGATGACGATCT

QA 1 796 1 796
DS 

RD RS1DR62TF 783 0 0
AAATCAGCTGCTCATATCAGTACCAGGGTTAAAACAGTTGTGAAATAAATCTCCCATTAA
AA*CTGAAACTAGAGCCGTCCGTCTCTT*GAAACAAA*TCTTGGTTGGTCTTTTCAGTTT
TCCGCTATCTAAAAATAGGAGAGAGTTTAGTGTTCAAGGTGGAACACATACTCTGTCAAG
CGTTGCAGCTTCGAAGAATCCACCTTTTGCTCTCTTTGAACCGCTTGCTTCTTCACAGTC
ACCATTTGAGATGCTGCATCCACTGTCCATCCTTTCTCCACAACATAAGTAGTGGCATCA
TCTTGTGTCATGCCTAGGAAAAGAGCCAAATCGCTGATGGTAATTGTCGAGTAGGCAGAC
AACAAGAGCTGAAACATCCTTTTTGTGTAAACATCTGAGAAAGCGGCAACCATATCTTTA
GCATCTTGACTCCAATCAAAACCACGGATAGATTCATAGACACCAGCATAGTCACGTGTC
CAGAGCTTCTGACCAATCCTCCAAGCAGCAGCAACTTCAGGCTTGCTCTCCTTCACACTC
GTAGGTATTGTTTTCCATAAGAAACGTGCACTATCACAATCGTCAACGAAGAAGTAAGCG
AGGAGATGGATAGCGTAAGGCCAGTCTTCCTGGAATGAGATTCCTTCCGCAGAAACCTGG
AGCATGAGACTATCGCAGATGTCGGCGATTTTGTCAAAGGAATTGACGGCTAAAGCATCG
GTAACAGGAGAGAGATCCATGACTACTGGTTTTCGTTTTACTATTGGAGCTTTGCCAAGA
T
CC

QA 1 781 1 781
DS 

RD RS1EH30TF 699 0 0
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GTTTAGTGTTCAAGGTGGAACACATACTCTGTCAAGCGTTGCAGCTTCGAAGAATCCACC
TTTTGCTCTCTTTGAACCGCTTGCTTCTTCACAGTCACCATTTGAGATGCTGCATCCACT
GTCCATCCTTTCTCCACAACATAAGTAGTGGCATCATCTTGTGTCATGCCTAGGAAAAGA
GCCAAATCGCTGATGGTAATTGTCGAGTAGGCAGACAACAAGAGCTGAAACATCCTTTTT
GTGTAAACATCTGAGAAAGCGGCAACCATATCTTTAGCATCTTGACTCCAATCAAAACCA
CGGATAGATTCATAGACACCAGCATAGTCACGTGTCCAGAGCTTCTGACCAATCCTCCAA
GCAGCAGCAACTTCAGGCTTGCTCTCCTTCACACTCGTAGGTATTGTTTTCCATAAGAAA
CGTGCACTATCACAATCGTCAACGAAGAAGTAAGCGAGGAGATGGATAGCGTGAGGCCAG
TCTTCCCGGAATGAGATTCCTTCCGCAGAAACCTGGAGCATGAGACTATCGCAGATGTCG
GCGATTTTGTCCAAGGACTTGACGGCTAAAGCATCGGTAACAGGAGAGAGATCCATGACT
ACTGGTTTTCGTTTTACTATTGGAGCTTTGCCAAGAT
CC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RS1AZ56TF 702 0 0
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TAGTGTTCAAGGTGGAACACATACTCTGTCAAGCGTTGCAGCTTCGAAGAATCCACCTTT
TGCTCTCTTTGAACCGCTTGCTTCTTCACAGTCACCATTTGAGATGCTGCATCCACTGTC
CATCCTTTCTCCACAACATAAGTAGTGGCATCATCTAGTGTCATGCCTAGGAAAAGAGCC
AAATCGCTGATGGTAATTGTCGAGTAGGCAGACAACAAGAGCTGAAACATCCTTTTTGTG
TAAACATCTGAGAAAGCGGCAACCATATCTTTAGCATCTTGACTCCAATCAGAACCACGG
ATAGATTCATAGACACCAGCATAGTCACGTGTCCAGAGCTTCTGACCAATCCTCCAAGCA
GCAGCAACTTCAGGCTTGCTCTCCTTCACACTCGTAGGTATTGTTTTCCATAAGAAACGT
GCACTATCACAATCGTCAACGAAGAAGTAAGCGAGGAGATGGATAGCGTAAGGCCAGTCT
TCCTGGAATGAGATTCCTTCCGCAGAAACCTGAAGCATGAGACTATCGCAGATGTCGGCG
ATTTTGTCAAAGGACTTGACGGCTAAAGCTTCGGTAACAGGAGAGAGATCCATGACCACT
GGTTT*CGTTTTACTATTGGAGCTTTGCCAAGATGACGATCC

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DS 



AS 2 6

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GGACTCATGGGGTATCCCGGTTGATGCTAAAGTCTACTCCAAATGGCCCAAATCTCACTC
TTTCAAGATCGGTGACTCCCTCTTGTTCTTGTACCCACCAAGCGAAGATTCAATGAACGA
CGGCAACTCTCTCTTCAACCTCACCCAAAACGGAACCTTTTACTTCACCAGCGGACAGCC
TGGCCACTGTCTAAAGTACCAGAAGCTCATTGTCCCCGTCGGCACTTATTCCGCCGAAGC
AGACGCCTTGTCTCCTTCTTCTTCTGCCGATGCCGATGCTCCCTCTTACCAAAACGCATT
TGGATCTATCCCACTCTCTCAGAAATCTTCTTCTTCGTCGCTGCAATTTTCCACCGTCGT
TGCTTCGCTGGCCATTGCTGTCGTCGTCGGTGCTATCATGTGAAATTGGCAATTATTGAA
TGTTTTATTAATTTTGTTCTGTCCAAAAAGCAAAAGTAATTGGTTCTTTTTCGGATATTT
TATTATGTCTTAAATCATTTATTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1CS49TF U 2
AF RS1BM29JQ C 1
AF RS1BM29TF U 80
BS 1 16 RS1BM29JQ
BS 17 140 RS1CS49TF
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BS 626 626 RS1BM29JQ

RD RS1CS49TF 139 0 0
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GAGAGAGAGAGAGATATGGGAATGATGAGCTTGAGCAGCGTAATGGTTTTGGTGATGATA
CTGTTAGTGCAAGTATCTTCGACGCAGTACAAAGTTGGGAACTTGGACTCATGGGGTATC
CCGG

QA 16 139 16 139
DS 

RD RS1BM29JQ 626 0 0
GCTACACACCAATCAAGAGAGAGAGAGAGATATGGGAATGATGAGCTTGAGCAGCGTAAT
GGTTTTGGTGATGATACTGTTAGTGCAAGTATCTTCGACGCAGTACAAAGTTGGGAACTT
GGACTCATGGGGTATCCCGGTTGATGCTAAAGTCTACTCCAAATGGCCCAAATCTCACTC
TTTCAAGATCGGTGACTCCCTCTTGTTCTTGTACCCACCAAGCGAAGATTCAATGAACGA
CGGCAACTCTCTCTTCAACCTCACCCAAAACGGAACCTTTTACTTCACCAGCGGACAGCC
TGGCCACTGTCTAAAGTACCAGAAGCTCATTGTCCCCGTCGGCACTTATTCCGCCGAAGC
AGACGCCTTGTCTCCTTCTTCTTCTGCCGATGCCGATGCTCCCTCTTACCAAAACGCATT
TGGATCTATCCCACTCTCTCAGAAATCTTCTTCTTCGTCGCTGCAATTTTCCACCGTCGT
TGCTTCGCTGGCCATTGCTGTCGTCGTCGGTGCTATCATGTGAAATTGGCAATTATTGAA
TGTTTTATTAATTTTGTTCTGTCCAAAAAGCAAAAGTAATTGGTTCTTTTTCGGATATTT
TATTATGTCTTAAATCATTTATTATC

QA 1 626 1 626
DS 

RD RS1BM29TF 547 0 0
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GTTGATGCTAAAGTCTACTCCAAATGGCCCAAATCTCACTCTTTCAAGATCGGTGACTCC
CTCTTGTTCTTGTACCCACCAAGCGAAGATTCAATGAACGACGGCAACTCTCTCTTCAAC
CTCACCCAAAACGGAACCTTTTACTTCACCAGCGGACAGCCTGGCCACTGTCTAAAGTAC
CAGAAGCTCATTGTCCCCGTCGGCACTTATTCCGCCGAAGCAGACGCCTTGTCTCCTTCT
TCTTCTGCCGATGCCGATGCTCCCTCTTACCAAAACGCATTTGGATCTATCCCACTCTCT
CAGAAATCTTCTTCTTCGTCGCTGCAATTTTCCACCGTCGTTGCTTCGCTGGCCATTGCT
GTCGTCGTCGGTGCTATCATGTGAAATTGGCAATTATTGAATGTTTTATTAATTTTGTTC
TGTCCAAAAAGCAAAAGTAATTGGTTCTTTTTCGGATATTTTATTATGTCTTAA*TCATT
TATTAT
C

QA 1 546 1 546
DS 



CO CL782Contig2 764 3 4 U
GGCTACACACCAATCAAGAGAGAGAGAGAGATATGGGAATGATGAGCTTGAGCAGCGTAA
TGGTTTTGGTGATGATACTGTTAGTGCAAGTATCTTCGACGCAGTACAAAGTTGGGAACT
TGGACTCATGGGGTATCCCGGTTGATGCTAAAGTCTACTCCAAATGGCCCAAATCTCACT
CTTTCAAGATCGGTGACTCCCTCTTGTTCTTGTACCCACCAAGCGAAGATTCAATGATTC
AAGTGACACCTTCCAACTTCAAGAGCTGCAACACCAAAGATCCAATCTTGTACATGAACG
ACGGCAACTCTCTCTTCAACCTCACCCAAAACGGAACCTTTTACTTCACCAGCGGACAGC
CTGGCCACTGTCTAAAGTACCAGAAGCTCATTGTCTCCGTCGGCACTTATTCCGCCGAAG
CAGACGCCTTGTCTCCTTCTTCTTCTGCCGATGCCGATGCTCCCTCCTACCAAAACGCAT
TTGGATCTATCCCACTCTCTCAGAAATCTTCTTCTTCGTCGCTGCAATTTTCCACCGTCG
TTGCTTCGCTGGCCATTGCTGTCGTCGTCGGTGCTATCATGTGAAAATGGCAATTATTGA
ATGTTTTATTAATTTTGTTCTGTCCAAAAAGCAAAAGTAATTGGTTCTTTTTCGGATATT
TTATTATGTCTTAAATCATTTATTATTACCTCCGAATCTCCATTTCTAGTCAGTTCGAAT
TTTCTGTAATGTATTCTCTTCCAAATCTAGTTATGTACACAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1FO55TF U 1
AF RS1CL44TF U 5
AF RS1CL44JQ C 22
BS 1 466 RS1FO55TF
BS 467 467 RS1CL44TF
BS 468 758 RS1FO55TF
BS 759 764 RS1CL44JQ

RD RS1FO55TF 758 0 0
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TGGTTTTGGTGATGATACTGTTAGTGCAAGTATCTTCGACGCAGTACAAAGTTGGGAACT
TGGACTCATGGGGTATCCCGGTTGATGCTAAAGTCTACTCCAAATGGCCCAAATCTCACT
CTTTCAAGATCGGTGACTCCCTCTTGTTCTTGTACCCACCAAGCGAAGATTCAATGATTC
AAGTGACACCTTCCAACTTCAAGAGCTGCAACACCAAAGATCCAATCTTGTACATGAACG
ACGGCAACTCTCTCTTCAACCTCACCCAAAACGGAACCTTTTACTTCACCAGCGGACAGC
CTGGCCACTGTCTAAAGTACCAGAAGCTCATTGTCTCCGTCGGCACTTATTCCGCCGAAG
CAGACGCCTTGTCTCCTTCTTCTTCTGCCGATGCCGATGCTCCCTCTTACCAAAACGCAT
TTGGATCTATCCCACTCTCTCAGAAATCTTCTTCTTCGTCGCTGCAATTTTCCACCGTCG
TTGCTTCGCTGGCCATTGCTGTCGTCGTCGGTGCTATCATGTGAAAATGGCAATTATTGA
ATGTTTTATTAATTTTGTTCTGTCCAAAAAGCAAAAGTAATTGGTTCTTTTTCGGATATT
TTATTATGTCTTAAATCATTTATTATTACCTCCGAATCTCCATTTCTAGTCAGTTCGAAT
TTTCTGTAATGTATTCTCTTCCAAATCTAGTTATGTAC

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1CL44TF 759 0 0
GGACACACCTATCAAT
AGAGAGAGAGATATGGGAATGATGAGCTTGAGCAGCGTAATGGTTTTGGTGATGATACTG
TTAGTGCAAGTATCTTCGACGCAGTACAAAGTTGGGAACTTGGACTCATGGGGTATCCCG
GTTGATGCTAAAGTCTACTCCAAATGGCCCAAATCTCACTCTTTCAAGATCGGTGACTCC
CTCTTGTTCTTGTACCCACCAAGCGAAGATTCAATGATTCAAGTGACACCTTCCAACTTC
AAGAGCTGCAACACCAAAGATCCAATCTTGTACATGAACGACGGCAACTCTCTCTTCAAC
CTCACCCAAAACGGAACCTTTTACTTCACCAGCGGACAGCCTGGCCACTGTCTAAAGTAC
CAGAAGCTCATTGTCTCCGTCGGCACTTATTCCGCCGAAGCAGACGCCTTGTCTCCTTCT
TCTTCTGCCGATGCCGATGCTCCCTCCTACCAAAACGCATTTGGATCTATCCCACTCTCT
CAGAAATCTTCTTCTTCGTCGCTGCAATTTTCCACCGTCGTTGCTTCGCTGGCCATTGCT
GTCGTCGTCGGTGCTATCATGTGAAAATGGCAATTATTGAATGTTTTATTAATTTTGTTC
TGTCCAAAAAGCAAAAGTAATTGGTTCTTTTTCGGATATTTTATTATGTCTTAAATCATT
TATTATTACCTCCGAATCTCCATTTCTAGTCAGTTCGAATTTTCTGTAATGTATTCTCTT
CCAAATCTAGTTATGTAC
ACAGC

QA 17 754 17 754
DS 

RD RS1CL44JQ 743 0 0
GAGAGAGAGATATGGGAATGATGAGCTTGAGCAGCGTAATGGTTTTGGTGATGATACTGT
TAGTGCAAGTATCTTCGACGCAGTACAAAGTTGGGAACTTGGACTCATGGGGTATCCCGG
TTGATGCTAAAGTCTACTCCAAATGGCCCAAATCTCACTCTTTCAAGATCGGTGACTCCC
TCTTGTTCTTGTACCCACCAAGCGAAGATTCAATGATTCAAGTGACACCTTCCAACTTCA
AGAGCTGCAACACCAAAGATCCAATCTTGTACATGAACGACGGCAACTCTCTCTTCAACC
TCACCCAAAACGGAACCTTTTACTTCACCAGCGGACAGCCTGGCCACTGTCTAAAGTACC
AGAAGCTCATTGTCTCCGTCGGCACTTATTCCGCCGAAGCAGACGCCTTGTCTCCTTCTT
CTTCTGCCGATGCCGATGCTCCCTCCTACCAAAACGCATTTGGATCTATCCCACTCTCTC
AGAAATCTTCTTCTTCGTCGCTGCAATTTTCCACCGTCGTTGCTTCGCTGGCCATTGCTG
TCGTCGTCGGTGCTATCATGTGAAAATGGCAATTATTGAATGTTTTATTAATTTTGTTCT
GTCCAAAAAGCAAAAGTAATTGGTTCTTTTTCGGATATTTTATTATGTCTTAAATCATTT
ATTATTACCTCCGAATCTCCATTTCTAGTCAGTTCGAATTTTCTGTAATGTATTCTCTTC
CAAATCTAGTTATGTACACAAGC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 2 7

CO CL783Contig1 830 4 11 U
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TACAATTCTGATACAGAGGTAGGAAACATTGAGAAGTAGTGAAAAAGATTAAAAGTTATA
GAATGATCTTT*AACCAAAAGTATAGAAATACAAATCTGATAAAAAAAGATTAAGGAAAC
ATTGACAAGCAGCGTTAAAGATTGAAACTGTAGCATGGGTTCTCTTGTTTTGCTTTTTTC
TTGTTTAGGACATACTGGGAAAGACTGAAGAAACCCTAGTGAGCAGCGTCTTCCTCTTCG
CAGAACTTGGTGTATTCCGTTGGACCCATCAAGGATTCCAACTCTGCGGGGTTGCTTGGT
TTCACCTTTATCATCCAACCATCTTCGTAAGGGCTCGAGTTAATCAAGCCAGGTGAATCA
GCGAGCTTTGTGTTAACCTCGATGACTTCACCAGAGATTGGAGATATAATCTCACTCGTT
GCCTTAACACTCTCCACTGCTCCAAAGTTTTTCTCTTTGGTCACTGAACTTTTTTCTTCA
GGCAGCTCCACAAACACAACTTCTCCTAAATGATCCTGGGCATGGTCACTGATGCCAATA
GTAGCCACTGAGCCTTCATGTTTCACCCACTCATGTGAATTTGCATACTTAAGTCCTTCC
AATACTGAGGAGAAGCATCTAGAGATGGAGAAAGCTGGAAGGAGATGAGATTTGGATGCA
GAAGAAGAGAGCTTGAGAGCGTTTGCTGTTGAGGAAGCCCACATTCTCAGTGCCATATTT
TTCTGTTTTCTTTCTCTCTTTTTTTTTCTTGGTTCTGTTTTCTTTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BZ83JQ U 48
AF RS1GL69JQ U 105
AF RS1FT33TF C 1
AF RS1BZ83TF C 135
BS 1 49 RS1FT33TF
BS 50 413 RS1BZ83JQ
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BS 669 796 RS1FT33TF
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RD RS1BZ83JQ 366 0 0
GG
AGAGATACAAATACAATTCTGATACAGAGGTAGGAAACATTGAGAAGTAGTGAAAAAGAT
TAAAAGTTATAGAATGATCTTT*AACCAAAAGTATAGAAATACAAATCTGATAAAAAAAG
ATTAAGGAAACATTGACAAGCAGCGTTAAAGATTGAAACTGTAGCATGGGTTCTCTTGTT
TTGCTTTTTTCTTGTTTAGGACATACTGGGAAAGACTGAAGAAACCCTAGTGAGCAGCGT
CTTCCTCTTCGCAGAACTTGGTGTATTCCGTTGGACCCATCAAGGATTCCAACTCTGCGG
GGTTGCTTGGTTTCACCTTTATCATCCAACCATCTTCGTAAGGGCTCGAGTTAATCAAGC
CAGG

QA 3 366 3 366
DS 

RD RS1GL69JQ 564 0 0
AAA
ATTAAAAGTTATTGAATGATCTTTTAACCAAAAGTATAAAAATACAAATCTGATAAAAAA
AAAATAAGGAAACATTGACAAGTAGCGTTAAAGATTGAAACTGTAGCATGGGCTCTCTTG
TTTTGCTTTTTTCTTGTTTAGGACATACTGGGAAAGACTGAAAAAACCCTAGTGAGCAGC
GTCTTCCTCTTCCCAAAACTTGGTGTATTCCGTTGGACCCATCAAGGATTCCAACTCTGC
GGGGTTGCTTGGTTTCACCTTTATCATCCAACCATCTTCGTAAGGGCTCGAGTTAATCAA
GCCAGGTGAATCAGCGAGCTTTGTGTTAACCTCGATGACTTCACCAAAAATTGGAAATAT
AATCTCACTCGTTGCCTTAACACTCTCCACTGCTCCAAAGTTTTTCTCTTTGGTCACTGA
ACTTTTTTCTTCAGGCAGCTCCACAAACACAACTTCTCCTAAATGATCCTGGGCATGGTC
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CTTAAGTCCTTCCAATACTGA

QA 4 564 4 564
DS 

RD RS1FT33TF 798 0 0
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TACAATTCTGATACAGAGGTAGGAAACATTGAGAAGTAGTGAAAAAGATTAAAAGTTATA
GAATGATCTTT*AACCAAAAGTATAGAAATACAAATCTGA**AAAAAAGATTAAGGAAAC
ATTGACAAGTAGCGTTAAAGATTGAAACTGTAGCATGGGTTCTCTTGTTTTGCTTTTTTC
TTGTTTAGGACATACTGGGAAAGACTGAAGAAACCCTAGTGAGCAGCGTCTTCCTCTTCG
CAGAACCTGGTGTATTCCGTTGGACCCATCAAGGATTCCAACTCTGCGGGGTTGCTTGGT
TTCACCTTTATCATCCAACCATCTTCGTAAGGGCTCGAGTTAATCAAGCCAGGTGAATCA
GCGAGCTTTGTGTTAACCTCGATGACTTCACCAGAGATTGGAGATATAATCTCACTCGTT
GCCTTAACACTCTCCACTGCTCCAAAGTTTTTCTCTTTGGTCACTGAACTTTTTTCTTCA
GGCAGCTCCACAAACACAACTTCTCCTAAATGATCCTGGGCATGGTCACTGATGCCAATA
GTAGCCACTGAGCCTTCATGTTTCACCCACTCATGTGAATTTGCATACTTAAGTCCTTCC
AATACTGAGGAGAAGCATCTAGAGATGGAGAAAGCTGGAAGGAGATGAGATTTGGATGCA
GAAGAAGAGAGCTTGAGAGCGTTTGCTGTTGAGGAAGCCCACATTCTCAGTGCCATATTT
TTCTGTTTTCTTTCTC
CC

QA 1 796 1 796
DS 

RD RS1BZ83TF 696 0 0
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TTAAAGATTGAAACTGTAGCATGGGTTCTCTTGTTTTGCTTTTTTCTTGTTTAGGACATA
CTGGGAAAGACTGAAGAAACCCTAGTGAGCAGCGTCTTCCTCTTCGCAGAACTTGGTGTA
TTCCGTTGGACCCATCAAGGATTCCAACTCTGCGGGGTTGCTTGGTTTCACCTTTATCAT
CCAACCATCTTCGTAAGGGCTCGAGTTAATCAAGCCAGGTGAATCAGCGAGCTTTGTGTT
AACCTCGATGACTTCACCAGAGATTGGAGATATAATCTCACTCGTTGCCTTAACACTCTC
CACTGCTCCAAAGTTTTTCTCTTTGGTCACTGAACTTTTTTCTTCAGGCAGCTCCACAAA
CACAACTTCTCCTAAATGATCCTGGGCATGGTCACTGATGCCAATAGTAGCCACTGAGCC
TTCATGTTTCACCCACTCATGTGAATTTGCATACTTAAGTCCTTCCAATACTGAGGAGAA
GCATCTAGAGATGGAGAAAGCTGGAAGGAGATGAGATTTGGATGCAGAAGAAGAGAGCTT
GAGAGCGTTTGCTGTTGAGGAAGCCCACATTCTCAGTGCCATATTTTTCTGTTTTCTTTC
TCTCTTTTTTTTTCTTGGTTCTGTTTTCTTTCTCCC

QA 1 696 1 696
DS 



CO CL783Contig2 716 3 4 U
GACCATTTTCCCACTTCCCTTTGAGAAAGAAAACAGAACCAAGAAAAAAAAGAGAGAAAG
AAAACAGAAAAATATGGCACTGAGAATGTGGGCATCCTCAACAGCAAACGCTCTCAAGCT
CTCTTCTTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTC
CTCAGTATTGGAAGGACTTAAGTATGCAAATTCACATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCTC
AGTGGCTACTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGT
GGAGCTGCCTGAAGAAAAAAGTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAG
TGTTAAGGCAACGAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACAC
AAAGCTCGCTGATTCACCTGGCTTGATTAACTCGAGCCCTTACGAAGATGGTTGGATGAT
AAAGGTGAAACCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACAC
CAAGTTCTGCGAAGAGGAAGACGCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTCCCAGTATGTG
CTAAACAAGAAAAAGCAAAACAAGAGAACCCATGCTACGCTACTTGTCAATGTTTCCTAT
CTTTTTTCTATCAGATTTGTATTTCTATACTTTTGGTTAAAGATTATTCGATGAGC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1GL69TF U 1
AF RS1H326TF U 3
AF RS1H326JQB C 431
BS 1 77 RS1GL69TF
BS 78 78 RS1H326TF
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RD RS1GL69TF 552 0 0
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AAAACAGAAAAATATGGGACTGAGAATGTGGGCATCCTCAACAGCAAACGCTCTCAAGCT
CTCTTCTTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTC
CTCAGTATTGGAAGGACTTAAGTATGCAAATTCACATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCTC
AGTGGCTACTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGT
GGAGCTGCCTGAAGAAAAAAGTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAG
TGTTAAGGCAACGAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACAC
AAAGCTCGCTGATTCACCTGGCTTGATTAACTCGAGCCCTTACGAAGATGGTTGGATGAT
AAAGGTGAAACCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACAC
CAAGTTCTGCGA

QA 1 552 1 552
DS 

RD RS1H326TF 714 0 0
GG
ATTTTCCCACTTCCCTTTGAGAAAGAAAACAGAACCAAGAAAAAGAAGAGAGAAAGAAAA
CAGAAAAATATGGCACTGAGAATGTGGGCATCCTCAACAGCAAACGCTCTCAAGCTCTCT
TCTTCTGCATCCAAATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCA
GTATTGGAAGGACTTAAGTATGCAAATTCACATGAGTGGGTGAAACATGAAGGCT**GTG
GCTACTATTGGCATCAGTGACCATGCCCAGGATCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAG
CTGCCTGAAGAAAAAATTTCAGTGACCAAAGAGAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTT
AAGGCAACGAGTGAGATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATCGAGGTTAACACAAAG
CTCGCTGATTCACCTGGCTTGATTAACTCGAGCCCTTACGAAGATGGTTGGATGATAAAG
GTGAAACCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACACCAAG
TTCTGCGAAGAGGAAGACGCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTCCCAGTATGTGCTAA
ACAAGAAAAAGCAAAACAAGAGAACCCATGCTACGCTACTTGTCAATGTTTCCTATCTTT
TTTCTATCAGATTTGTATTTCTATACTTTTGGTTAAAGATTATTCGATGAGC

QA 3 714 3 714
DS 

RD RS1H326JQB 286 0 0
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CCAAGCAACCCCGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAACGGAATACACCAAGTTTTGC
GAAGAGGAAGACGCTGCTCACTAGGGTTTCTTTGTCTTTCCCAGTATGTGCTAAACAAGA
AAAAGCAAAACAAGAGAACCCATGCTACGCTACTTGTCAATGTTTCCTATCTTTTTTCTA
TCAGATTTGTATTTCTATACTTTTGGTTAAAGATTATTCGATGAGC

QA 1 286 1 286
DS 



AS 1 5

CO CL784Contig1 853 5 15 U
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TTCCTTTTTCTTCCGAGCTAGCTAACAAAAAAGGGACATAACATAATGGAGTGGGAGGAA
CAAGGTTTGAGGATGTCCTTAGTGCTTGATAGCGCTTCGGTGCTAATGCTCACCGCTTCG
GTTCTAACGGCTACTGTGCTTTCCTCTATACTAGAGCTCCTCTCTCAGGTGGCTGCCTTG
AAGGGTGATGTTAAAGAGAACGGAGACGAGGTTGTTGATGCAGAGGAAGGCAATGGAAAC
AATGAAGACGGTGATAGTGGTGATGATGATGGAGGGGAAGGGGAAGAGGAAGAAGGTGGT
GATGCAGAAGAAGTAAAGGAGACAAAGAAAGGATCTGCAAGTGGTCCTGGTGAGAATGGT
GAAGCTGGAGATGACGATGACGATGAACCTGAACAGGGTGACGACGGTGATGATGATGAT
GACAATGGGAACAATGATGATGATGATGATGAGGAAGAGGAGGATGAAGATGGTGGGGAA
GAAGATGAAGAAGAGGTGGAGGAAGAAGAAGAGGAAGAGGAAGAAGATGAGGAGGAAGAG
GCGCTACAGCCACCAAAGAAGAGGAAGAAGTAAACAACCCAACCACGCTTTGATCTTCTA
ACATTTTAGATTCAAAAAATCAAAAACTTCTTGTGGGTTTCTACCTGAAGAGAATCTTAA
GGCATCACCAGCTTCTTTGGCTTTCCACTGTAATCTCTGTTGTTCCATGAATCAAAAAGA
CCTTTGTTTACTGTGTACCATTGCATTTGAAGCTCCTTTGTTCATCAGTCAATTTTAGAT
ATCATATATGCAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E677TF U 1
AF RS1DI59TF U 243
AF RS1FJ88TF U 1
AF RS1DI59JQ C 243
AF RS1FJ88JQ C 142
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GTTCTAACGGCTACTGTGCTTTCCTCTATACTAGAGCTCCTCTCTCAGGTGGCTGCCTTG
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AATGAAGACGGTGATAGTGGTGATGATGATGGAGGGGAAGGGGAAGAGGAAGAAGGTGGT
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QA 1 416 1 416
DS 

RD RS1DI59TF 304 0 0
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AGAT

QA 1 304 1 304
DS 

RD RS1FJ88TF 719 0 0
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TTCCTTTTTCTTCCGAGCTAGCTAACAAAAAAGGGACATAACATAATGGAGTGGGAGGAA
CAAGGTTTGAGGATGTCCTTAGTGCTTGATAGCGCTTCGGTGCTAATGCTCACCGCTTCG
GTTCTAACGGCTACTGTGCTTTCCTCTATACTAGAGCTCCTCTCTCAGGTGGCTGCCTTG
AAGGGTGATGTTAAAGAGAACGGAGACGAGGTTGTTGATGCAGAGGAAGGCAATGGAAAC
AATGAAGACGGTGATAGTGGTGATGATGATGGAGGGGAAGGGGAAGAGGAAGAAGGTGGT
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GACAATGGGAACAATGATGATGATGATGATGAGGAAGAGGAGGGTGAAGATGGTGGGGAA
GAAGATGAAGAAGAGGTGGAGGAAGAAGAAGAGGAAGAGGAAGAAGATGAGGAGGAAGAG
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ACATTTTAGATTCAAAAA*TCAAAAACTTCTTGTGGGTTTCTACCTGA*GAGAATCTTA

QA 1 719 1 719
DS 

RD RS1DI59JQ 547 0 0
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TGAAGACGGTGATAGTGGTGATGATGATGGAGGGGAAGGGGAAGAGGAAGAAGGTGGTGA
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AGCTGGAGATGACGATGACGATGAACCTGAACAGGGTGACGACGGTGATGATGATGATGA
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AGATGAAGAAGAGGTGGAGGAAGAAGAAGAGGAAGAGGAAGAAGATGAGGAGGAAGAGGC
GCTACAGCCACCAAAGAAGAGGAAGAAGTAAACAACCCGACCACGCTTTGATCTTCTAAC
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CATCACCAGCTTCTTTGGCTTTCCACTGTAATCTCTGTTGTTCCATGAATCAAAAAGACC
TTTGTTT

QA 1 547 1 547
DS 

RD RS1FJ88JQ 712 0 0
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TCCTCTATACTAGAGCTCCTCTCTCAGGTGGCTGCCTTGAAGGGTGATGTTAAAGAGAAC
GGAGACGAGGTTGTTGATGCAGAGGAAGGCAATGGAAACAATGAAGACGGTGATAGTGGT
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ACAAAGAAAGGATCTGCAAGTGGTCCTGGTGAGAATGGTGAAGCTGGAGATGACGATGAC
GATGAACCTGAACAGGGTGACGACGGTGATGATGATGATGACAATGGGAACAATGATGAT
GATGATGATGAGGAAGAGGAGGGTGAAGATGGTGGGGAAGAAGATGAAGAAGAGGTGGAG
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AGGAAGAAGTAAACAACCCAACCACGCTTTGATTTTCTAACATTTTAGATTCAAAAAATC
AAAAACTTCTTGTGGGTTTTTACCTGAAGAGAATCTTAAGGCATCACCAGCTTCTTTGGC
TTTCCACTGTAATTTCTGTTGTTCCATGAATCAAAAAGACCTTTGTTTACTGTGTACCAT
TGCATTTGAAGCTCCTTTGTTCATCAGTCAATTTTAGATATCATATATGCAT

QA 1 712 1 712
DS 



AS 2 7

CO CL785Contig1 772 5 16 U
GGGCACACCGAAGACTCGACTCCCAATCATCTCCTTCCTTCCTTCTTCGTCTCTGAAACT
AATTTTGATTCAGCAGCCATGGCTAATGCAGCGTCAGGCATGGCAGTCCATGATGACTGC
AAGCTCAAGTTTCTGGAGCTCAAGGCCAAGCGGACTTACCGTTTCATCGTTTACAAGATC
GAGGAGCAGCAGAAACAAGTGGTCGTCGAGAAACTCGGCGAGCCTGGTCAATCCCACGAC
GACTTTGCTGCTAGTCTCCCTGCCGATGAATGCCGTTACGCTGTTTTCGATTTCGATTTC
GTCACTGCTGAGAGCTGCCAGAAGAGCAAGATCTTCTTCGTCGCATGGTCTCCGGACACA
GCAAGAGTGAGAAGCAAGATGATCTACGCGAGCTCTAAGGATAGGTTTAAGCGCGAGCTT
GATGGAATTCAAGTTGAGCTTCAAGCTACCGATCCAACCGAGATGGATCTCGATGTTTTC
AAAAGCCGAGCCAACTGAGGAGGAGTTAACATCCCTCCAGGAAAAAAATATATTTGGTTG
AATCCAATTACTATTACTGAATGATATGCTTGTTCTTTAAGTTTGCTGTGAAGGCAACCA
CCAACCAAAACAACTTCATTTCATTGGGTCTTTGTCTTCTTCCTATTGTCTTTTATATTT
TTTTTGGTCCTTGCAGTGTTTTGCTTAAAACTTTAAGAGATTTGGCTTGTGCTCTTTTAC
CATTGTGTAAGAAACCCCCCAAACCCTTTACCAAAAGATGAATCTTATTGGC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DZ53TF U 1
AF RS1BH94TF U 1
AF RS1D209TF U 4
AF RS1DZ53JQ C 334
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DS 

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GATG*AATTCAAGTTGAGCTTCAAGCTACCGATCCAACCGAGATGGATCTCGATGTTTTC
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TTTTTGGTCC

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DS 

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G
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GAGTGAGAAGCAAGATGATCTACGCGAGCTCTAAGGATAGGTTTAAGCGCGAGCTTGATG
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GCCGAGCCAACTGAGGAGGAGTTAACATCCCTCCAGGAAAAAAATATATTTGGTTGAATC
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CCAAAACAACTTCATTTCATTGGGTCTTTGTCTTCTTCCTATTGTCTTTTATATTTTTTT
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AAACCCTT

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TTT
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GAGATTTGGCTTGTGCTCTTTTACCATTGTGTAAGAAATCCCCCAAACCCTT
TACC

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DS 

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GAGATTTGGCTTGTGCTCTTTTACCATTGTGTAAGAAACCCCCCAAACCCTTTACCAAAA
GATGAATCTTATTGGC

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DS 



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TCAAGTTTCTCGAGCTCAAGGCCAAGCGGACTTACCGTTTCATCGTTTACAAGATCGAGG
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GAATTCAAGTTGAGCTTCAAGCTACCGATCCAACCGAGATGGATCTCGTTGTTTTCAAAA
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TTTTGGTCCTTGCAGTGTTTTGCTTAAAACTTTAAGAGATTTGGCTTGTGCCTG


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RS1FT21JQ C 1
AF RS1FT21TF U 1
BS 1 2 RS1FT21JQ
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RD RS1FT21JQ 714 0 0
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ACCAAAACAACTTCATTTCATTGGGTCTTTGTCTTCTTCCTATTGTCTTTTATATTTTTT
TTTTGGTCCTTGCAGTGTTTTGCTTAAAACTTTAAGAGATTTGGCTTGTGCCTG

QA 1 714 1 714
DS 

RD RS1FT21TF 709 0 0
GG
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CAGCAGAAACAAGTGGTCGTCGAGAAACTCGGCGAGCCTGGTCAATCCCACGACGACTTT
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GCTGAGAGCTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCGTCGCATGGTCTCCGGACACGGCGAGA
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AACTACTATTACTGAATGATATGCTTGTTCTTTAAGTTTGCTGTGAAGGCAACCACCAAC
CAAAACAACTTCATTTCATTGGGTCTTTGTCTTCTTCCTATTGTCTTTTATATTTTTTTT
TTGGTCCTTGCAGTGTTTTGCTTAAA*CTTTAAGAGATTTGGCTTGT

QA 3 709 3 709
DS 



AS 2 5

CO CL786Contig1 1381 2 4 U
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TCAGAGACCGCCGTGCACGGAGAAGCAATCGAGTGGGAGTCCGAAGACGAAGATTCCGAT
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TCTGACATGTTGGGTGATTGGAGTGGAATGGACAAGGAGAAGGCTAAGAATTACATATTA
AATTGTCAGTCATATGATGGTGGCTTTGGGTTGATCCCTGGTTCTGAATCTCATGCTATG
CAGGTGGTGGTACTTACTGTGCTATTGCATCCCTTAGATTGATGGGGTTTATTGGAGCTG
ATCTGCTGTCAAATGATCCATCCAGTTCAATTCTAGACCCTTCACTGCTTCTCAACTGGA
GCCTACAGAGACAAGCCAGTGATGGCGGATTCCAAGGTAGGACTAACAAACAGAGCGACA
CATGCTATGCATTTTGGATTGGAGCTGTCCTTAAACTCATAGGAGGCGATGCATTCATTG
ACAAAATTGCTTTCCGCCAATTTTTACTGAGCTGCCAGTCCAAGTATGGTGGGTTCAGTA
AATTTCCTGGAGCGTTACCAGATCTGTATCATTCATACTATGGCTACACTGCGTTTAGCT
TCTTGGAGGAACCGGGATTGAGTCCTCTATGCCCTGAGCTAGGGTTACCTCTTCTTGCAT
CCTTGGGAATCTGATCCCCCCCCTCAAAGTCCCACATTCTTTTTTATCAACCAACTGTAA
CTTTTATTTGGTATTTGATTATTGGTTTGTGTATTTTAGTGGATTTAGAAATCAAAACGA
AATCCAGAATTCTAGTGTCGTATATTTTCCTATGATTTTATAAATTTTAATTTGATATTT
C


BQ
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10 

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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RS1G876TF U 1
AF RS1AD62TF U 220
AF RS1AD62JQ C 302
BS 1 310 RS1G876TF
BS 311 311 RS1AD62TF
BS 312 338 RS1G876TF
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BS 344 344 RS1AD62TF
BS 345 354 RS1G876TF
BS 355 355 RS1AD62TF
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BS 370 370 RS1AD62TF
BS 371 396 RS1G876TF
BS 397 397 RS1AD62TF
BS 398 438 RS1G876TF
BS 439 439 RS1AD62TF
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BS 491 491 RS1AD62TF
BS 492 540 RS1G876TF
BS 541 1000 RS1AD62TF

RD RS1G876TF 540 0 0
GCAGGCCTTCCCTAGGAACAGAGCTTCACTCAAAGAAGGTGAATTCTACGGGTTCTACGG
TTCAAGGAGCTCTCAGTTTCCTATAGATGTTAATGGGGATCTAACTCACAACAACAGTCA
CCTGGCAAGTACATACTGTGCCTTGGCTATTCTTAAGGTGATTGGGCATGATCTCTCCAC
CATAGACTCTGAATCACTCTTGTTATCCATGAATAACCTTCAACAAGATGATGGAAGCTT
CATGCCTATCCATACTGGAGGCGAGACGGATCTTCGGTTTGTATATTGTGCTGCTGCAAT
CTCTGACATGCTGGGTGATTGGAGTGGAATGGACAAGGGGAAGCCTAAGAATTATATATT
AAATTGTCAATCATATGATGGTGGCTTTGGGTTGATACCTGGTTCTGAATCTCATGGTGG
TGGTACTTACTGTGCTATTGCATCCCTTAGATTGATGGGGTTTATTGGAGCTGATCTGCT
GTCAAATGATTCATCCAGTTCAATTCTAGACCCTTCACTGCTTCTCAACTGGAGCCTACA

QA 1 540 1 540
DS 

RD RS1AD62TF 781 0 0
G
CAACAAGATGATGGAAGCTTCATGCCTATCCATACTGGAGGCGAGACGGATCTTCGGTTT
GTATATTGTGCTGCTGCAATCTCTGACATGTTGGGTGATTGGAGTGGAATGGACAAGGAG
AAGGCTAAGAATTACATATTAAATTGTCAGTCATATGATGGTGGCTTTGGGTTGATCCCT
GGTTCTGAATCTCATGGTGGTGGTACTTACTGTGCTATCGCATCCCTTAGATTGATGGGG
TTTATTGGAGCTGATCTGCTGTCAAATGATCCATCCAGTTCAATTCTAGACCCTTCACTG
CTTCTCAACTGGAGCCTACAGAGACAAGCCAGTGATGGCGGATTCCAAGGTAGGACTAAC
AAACAGAGCGACACATGCTATGCATTTTGGATTGGAGCTGTCCTTAAACTCATAGGAGGC
GATGCATTCATTGACAAAATTGCTCTCCGCCAATTTTTACTGAGCTGCCAGTCCAAGTAT
GGTGGGTTCAGTAAATTTCCTGGAGCGTTACCAGATCTGTATCATTCATACTATGGCTAC
ACTGCGTTTATCTTCTTGGAGGAACCGGGATTGAGTCCTCTATGCCCTGAGCTAGGGTTA
CCTCTTCTTACATCCTTGGGAATCTGATCCCCCCCCTCAAAGTCCCACATTCTTTTTTTA
TCAACCAACTGTAACTTTTATTTGGTATTTGATTATTGGTTTGTGTATTTTAGTGGATTT
AGAAATCAAAACGAAATCCAGAATTCTAGTGTCGTATATTTTCCTATGATTTTATAAATT

QA 2 781 2 781
DS 

RD RS1AD62JQ 694 0 0
TCTGACATGTTGGGTGATTGGAGTGGAATGGACAAGGAGAAGGCTAAGAATTACATATTA
AATTGTCAGTCATATGATGGTGGCTTTGGGTTGATCCCTGGTTCTGAATCTCATGGTGGT
GGTACTTACTGTGCTATCGCATCCCTTAGATTGATGGGGTTTATTGGAGCTGATCTGCTG
TCAAATGATCCATCCAGTTCAATTCTAGACCCTTCACTGCTTTTCAACTGGAGCCTACAG
AGACAAGCCAGTGATGGCGGATTCCAAGGTAGGACTAACAAACAGAGCGACACATGCTAT
GCATTTTGGATTGGAGCTGTCCTTAAACTCATAGGAGGCGATGCATTCATTGACAAAATT
GCTTTCCGCCAATTTTTACTGAGCTGCCAGTCCAAGTATGGTGGGTTCAGTAAATTTCCT
GGAGCGTTACCAGATCTGTATCATTCATACTATGGCTACACTGCGTTTATCTTCTTGGAG
GAACCGGGATTGAGTCCTCTATGCCCTGAGCTAGGGTTACCTCTTCTTACATCCTTGGGA
ATCTGATCCCCCCCCTCAAAGTCCCACATTCTTTTTT*ATCAACCAACTGTAACTTTTAT
TTGGTATTTGATTATTGGTTTGTGTATTTTAGTGGATTTAGAAATCAAAACGAAATCCAG
AATTCTAGTGTCGTATATTTTCCTATGATTTTAT

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 7

CO CL787Contig1 829 7 6 U
GTGATATGACGTGATAACCAAAAACAGCTATTGAATCCTCAAAAGCTTTCTCTTCATTAC
ACCTTTAATGTAAAAACATAATAATTTCATAATTATACAAATATAATTAAATATTAAAAC
AGGAGATGTGCTGTAATCCTCTATCTAATCTGGTTTTAAATAGCTTAGAAAAGGTAGGGA
CATCATGCACATCCTAAGAGTGTTGATGATGTTTCCTCATGTTTCTAGCATGTCTATGTT
TCTCATAACTATCCTTGCTATTATCATCATCTCGACCGTAATGGCAAGACCCTCTTTCTT
AACTTCCAAATCTTCATCATCTCAAGATTTAGATTCTTCCTATAAGGTGAAATTCAAGAG
CCTTCGACCAAAGTTGTATGGAGATTACGGGTTTTGGAACCCTAGCCCGGTTTATGGAGG
CGGTTTTCCGTATCCTGGGCCAGTTCCTCATGGCAGTGTAGATTCAAAACAGAGACATAA
GAAGCCACAATGAACCCAGAAGTTATGTTGGATATGTTCTTCAACTTTGTTACTTGTGGG
TAAAGCGTTTGGTATATTGGTGGTCTATGAAAAAGTTAGTGCTAAGGCATGTATACTTAC
GGCATATGAACAATGTATTCGCTTGTGTTTGGTCATAGACATATACAGAGTATTAGTCAT
ACACACATTTTGTTTCACTCTCTTGGTAAACCATGTATCTATAAATGTAATACTTCATCA
GTTTCGAATTACTTATTGTTCTAAACTGAACTTTTTGTCAATAAGTATCGTTTTCGCTTT
CCAATATGATTTATACAAGATAATACTCTATCTGTTCATATAATGTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 
35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DI84TF U 185
AF RS1GA88TF U 272
AF RS1FZ67TF U 1
AF RS1FL38TF U 87
AF RS1GR55TF U 645
AF RS1FL38JQ C 420
AF RS1DI84JQ C 185
BS 1 540 RS1FZ67TF
BS 541 797 RS1FL38TF
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BS 799 802 RS1FL38TF
BS 803 803 RS1GR55TF
BS 804 829 RS1FL38TF

RD RS1DI84TF 186 0 0
GG
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AACTATCCTTGCTATTATCATCATCTCGACCGTAATGGCAAGACCCTCTTTCTTAACTTC
CAAATCTTCATCATCTCAAGATTTAGATTCTTCCTATAAGGTGAAATTCAAGAGCCTTCG
ACCA

QA 3 186 3 186
DS 

RD RS1GA88TF 151 0 0
GG
GACCGTAATGGCAAGACCCTCTTTCTTAACTTCCAAATCTTCATCATCTCAAGATTTAGA
TTCTTCCTATAAGGTGAAATTCAAGAGCCTTCGACCAAAGTTGTATGGAGATTACGGGTT
TTGGAACCCTATCCCGGTTTATGGAGGCG

QA 3 151 3 151
DS 

RD RS1FZ67TF 540 0 0
GTGATATGACGTGATAACCAAAAACAGCTATTGAATCCTCAAAAGCTTTCTCTTCATTAC
ACCTTTAATGTAAAAACATAATAATTTCATAATTATACAAATATAATTAAATATTAAAAC
AGGAGATGTGCTGTAATCCTCTATCTAATCTGGTTTTAAATAGCTTAGAAAAGGTAGGGA
CATCATGCACATCCTAAGAGTGTTGATGATGTTTCCTCATGTTTCTAGCATGTCTATGTT
TCTCATAACTATCCTTGCTATTATCATCATCTCGACCGTAATGGCAAGACCCTCTTTCTT
AACTTCCAAATCTTCATCATCTCAAGATTTAGATTCTTCCTATAAGGTGAAATTCAAGAG
CCTTCGACCAAAGTTGTATGGAGATTACGGGTTTTGGAACCCTAGCCCGGTTTATGGAGG
CGGTTTTCCGTATCCTGGGCCAGTTCCTCATGGCAGTGTAGATTCAAAACAGAGACATAA
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QA 1 540 1 540
DS 

RD RS1FL38TF 743 0 0
GG
ATAATTATACAAATATAATTAAATATTAAAACAGGAGATGTGCTGTAATCCTCTATCTAA
TCTGGTTTTAAATAGCTTAGAAAAGGTAGGGACATCATGCACATCCTAAGAGTGTTGATG
ATGTTTCCTCGTGTTTCTAGCATGTCTATGTTTCTCATAACTATCCTTGCTATTATCATC
ATCTCGACCGTAATGGCAAGACCCTCTTTCTTAACTTCCAAATCTTCATTATCTCAAGAT
TTAGATTCTTCCTATAAGGTGAAATTCAAGAGCCTTCGACCAAAGTTGTATGGAGATTAC
GGGTTTTGGAACCCTAGCCCGGTTTATGGAGGCGGTTTTCCGTATCCTGGGCCAGTTCCT
CATGGCAGTGTAGATTCAAAACAGAGACATAAGAAGCCACAATGAACCCAGAAGTTATGT
TGGATATGTTCTTCAACTTTGTTACTTGTGGGTAAAGCGTTTGGTATATTGGTGGTCTAT
GAAAAAGTTAGTGCTAAGGCATGTATACTTACGGCATATGAACAATGTATTCGCTTGTGT
TTGGTCATAGACATATACAGAGTATTAGTCATACACACATTTTGTTTCACTCTCTTGGTA
AACCATGTATCTATAAATGTAATACTTCATCAGTTTCGAATTACTTATTGTTCTAAACTG
AACTTTTTGTCAATAAGTATCGTTTTCGCTTTCCAATATGATTTATACA*GATA*TACTC
TATCTGTTCATATAATGTTGT

QA 3 743 3 743
DS 

RD RS1GR55TF 178 0 0
G
CAGAGTATTAGTCATACACACATTTTGTTTCACTCTCTTGGTAAACCATGTATCTATAAA
TGTAATACTTCATCAGTTTCGAATTACTTATTATTCTAAACTGAACTTTTTGTCAATAAG
TATCGTTTTCGCTTTCCAATATGATTTATACAAGATAATACTCTATCTGTT
TCATAA

QA 2 172 2 172
DS 

RD RS1FL38JQ 385 0 0
GCGGTTTTCCGTATCCTGGGCCAGTTCCTCATGGCAGTGTAGATTCAAAACAGAGACATA
AGAAGCCCCAATGAACCCAGAAGTTATGTTGGATATGTTTTTCAACTTTGTTACTTGTGG
GTAAAGCGTTTGGTATATTGGTGGTTTATGAAAAAGTTAGTGTTAAGGCATGTATACTTA
CGGCATATGAACAATGTATTCGCTTGTGTTTGGTCATAGACATATACAGAGTATTAGTCA
TACACACATTTTGTTTCACTTTTTTGGTAAACCATGTATTTATAAATGTAATACTTCATC
AGTTTCGAATTACTTATTGTTTTAAAATGAACTTTTTGTCAATAAGTATCGTTTTCGCTT
TCCAATATGATTTATACA
AGATAAT

QA 1 378 1 378
DS 

RD RS1DI84JQ 599 0 0
GG
GCACATCCTAAGAGTGTTGATGATGTTTCCTCATGTTTCTAGCATGTCTATGTTTCTCAT
AACTATCCTTGCTATTATCATCATCTCGACCGTAATGGCAAGACCCTCTTTCTTAACTTC
CAAATCTTCATCATCTCAAGATTTAGATTCTTCCTATAAGGTGAAATTCAAGAGCCTTCG
ACCAAAGTTGTATGGAGATTACGGGTTTTGGAACCCTAGCCCGGTTTATGGAGGCGGTTT
TCCGTATCCTGGGCCAGTTCCTCATGGCAGTGTAGATTCAAAACAGAGACATAAGAAGCC
ACAATGAACCCAGAAGTTATGTTGGATATGTTCTTCAACTTTGTTACTTGTGGGTAAAGC
GTTTGGTATATTGGTGGTCTATGAAAAAGTTAGTGCTAAGGCATGTATACTTACGGCATA
TGAACAATGTATTCGCTTGTGTTTGGTCATAGACATATACAGAGTATTAGTCATACACAC
ATTTTGTTTCACTCTCTTGGTAAACCATGTATCTATAAATGTAATACTTCATCAGTTTCG
AATTACTTATTGTTCTAAACTGAACTTTTTGTCAATAAGTATCGTTTTCGCTTTCC
G

QA 3 598 3 598
DS 



AS 1 7

CO CL788Contig1 1093 7 16 U
GGGTCACACGTCTTAACATTATTTTAGCTCGATACCAACAAAACAATCAGAGACTGATTG
AATAGTTAGTTCGATACCCATCAACGAACCCGTTAACCCGATCCAAATGACCCGCTCAGT
CAACTCCCCTCTCCTCGGCCTCGCCGCCGCGCTCCTCCTCTCATCTCTCCTCGTCGTTAT
CTCAGTTAAACTCCCCGAAGATGTCAAGCCGAACCGCCTGGAGGTTTACGGCGGAGGGAA
AATATTCGACATTAGCCACCGTTACACGCCGGAGATGCCGGCGTGGGAGTCTAAGGAGGG
ACTCTCGAATCACCTGAGGCTGATCGCGAGCATGAAGAACGGATCTTTCGCAAACGTGTC
GGAGATGAAACTGTCAGTTCACTCGGGAACACACGTGGATGCTCCAGGCCACTTCATCGA
CGAGTATTACGACGCTGGTTTCGACTCCGATTCGCTTGACCTCCAAACTCTAAACGGTCC
TGCTTTGTTGGTTGATGTTCCGAGAGACAAGAACATAACTGCTGAGGTGATGGAATCACT
TCATATTCCAAGGGGAGTTCGTCGTGTGCTCTTCAGAACATCCAACACTGACAAGCGGCT
TATGTTTAAGAAAGAGTTCGATTCAAGCTTTTCTGGTTTCATGACCGATGGGGCTAAATG
GTTGGTTGAGAACACAGACATCAAACTTGTTGGGCTTGATTATCTTTCCTTTGCTGCTTT
TGAGGAGTCACCTGCAACCCATAAGGTTATACTAAGAGGAA*GGGATATAATCCCTGTGG
AAGCGCTGAAGCTGGATGGTGTGGAGGCAGGAATGTACTCGCTTCATTGCTTACCGTTGA
GATTGGTTGGAGCTGAAGGAGCACCAACTAGGTGCATTCTCATCAAGTGATTCACTTTCT
TTGTAAGTTGGTCAGACAATATGAGGGAACTGATCATAAATAATATGCTTATTACTTCCA
AGATACCACAATCATAAAGCAGATGTCATAGATGTGATGATTCAGTTGTAAAAGTAAACA
ATACCTTATATAAATTTATGTGTAAGTTTGTTTGTGTGTAATTCTGAAAGATGTGGTAAT
AAAGTTAAGACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BQ49TF U 1
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AF RS1AF33TF U 88
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BS 805 853 RS1AF33TF
BS 854 931 RS1H064TF
BS 932 953 RS1BQ49JQ
BS 954 954 RS1CO44JQ
BS 955 1007 RS1BQ49JQ
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BS 1009 1039 RS1BQ49JQ
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AATAGTTAGTTCGATACCCATCAACGAACCCGTTAACCCGATCCAAATGACCCGCTCAGT
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CTCAGTTAAACTCCCCGAAGATGTCAAGCCGAACCGCCTGGAGGTTTACGGCGGAGGGAA
AATATTCGACATTAGCCACCGTTACACGCCGGAGATGCCGGCGTGGGAGTCTAAGGAGGG
ACTCTCGAATCACCTGAGGCTGATCGCGAGCATGAAGAACGGATCTTTCGCAAACGTGTC
GGAGATGAAACTGTCAGTTCACTCGGGAACACACGTGGATGCTCCAGGCCACTTCATCGA
CGAGTATTACGTCGCTGGTTTCGACTCCGATTCGCTTGACCTCCAAACTCTAAACGGTCC
TGCTTTGTTGGTTGATGTTCCGAGAGACAAGAACATAACTGCTGAGGTGATGGAATCACT
TCATATTCCAAGGGGAGTTCGTCGTGTGCTCTTCAGAA

QA 1 578 1 578
DS 

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GG
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AAATGACCCGCTCAGTCAACTCCCCTCTCCTCGGCCTCGCCGCCGCGCTCCTCCTCTCAT
CTCTCCTCGTCGTTATCTCAGTTAAACTCCCCGAAGATGTCAAGCCGAACCGCCTGGAGG
TTTACGGCGGAGGGAAAATATTCGACATTAGCCACCGTTACACGCCGGAGATGCCGGCGT
GGGAGTCTAAGGAGGGACTCTCGAATCACCTGAGGCTGATCGCGAGCATGAAGAACGGAT
CTTTCGCAAACGTGTCGGAGATGAAACTGTCAGTTCACTCGGGAACACACGTGGATGCTC
CAGGCCACTTCATCGACGAGTATTACGACGCTGGTTTCGACTCCGATTCGCTTGACTTCC
AAACTCTAAACGGTCCTGCTTTGTTGGTTGATGTTCCGAGAGACAAGAACATAACTGCTG
AGGTGATGGAATCACTTCATATTCCAAGGGGAGTTCGTCGTGTGCTCTTCAGAACATCCA
ACACTGACAAGCGGCTTATGTTTAAGAAAGAGTTCGATTCAAGCCTTTCTGGTTTCATGA
CCGATGGGGCTAAATGGTTGGTTGAGAACACAGACATCAAACTTGTTGGGCTTGATTATC
TTTCCTTTGCTGCTTTTGAGGAGTCACCTGCAACCCATAAGGTTATACTAAGAGGAAAGG
GATATAATCCCTGTGGAAGCGCTGAAGCTGGATGGTGTGG

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DS 

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GG
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CGCTCCTCCTCTCATCTCTCCTCGTCGTTATCTCAGTTAAACTCCCCGAAGATGTCAAGC
CGAACCGCCTGGAGGTTTACGGCGGAGGGAAAATATTCGACATTAGCCACCGTTACACGC
CGGAGATGCCGGCGTGGGAGTCTAAGGAGGGACTCTCGAATCACCTGAGGCTGATCGCGA
GCATGAAGAACGGATCTTTCGCAAACGTGTCGGAGATGAAACTGTCAGTTCACTCGGGAA
CACACGTGGATGCTCCAGGCCACTTCATCGACGAGTATTACGACGCTGGTTTCGACTCCG
ATTCGCTTGACCTCCAAACTCTAAACGGTCCTGCTTTGTTGGTTGATGTTCCGAGAGACA
AGAACATAACTGCTGAGGTGATGGAATCACTTCATATTCCAAGGGGAGTTCGTCGTGTGC
TCTTCAGAACATCCAACACTGACAAGCGGCTTATGTTTAAGAAAGAGTTCGATTCAAGCT
TTTCTGGTTTCATGGCCGATGGGGCTAAATGGTTGGTTGAGAACACAGACATCAAACTTG
TTGGGCTTGATTATCTTTCCTTTGCTGCTTTTGAGGAGTCACCTGCAACCCATAAGGTTA
TACTAAGAGGAA*GGGATATAATCCCTGTGGAAGCGCTGAAGCTGGATGGTGTGGAGGCA
GGAATGTACTCGCTTCATTGCTTACCGTTGAGATTGGTTGGAGC

QA 3 766 3 766
DS 

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CGTGGATGTTCCAGGCCACTTCATCGACGAGTATTACGACGCTGGTTTCGACTCCGATTC
GCTTGACCTCCAAACTCTAAACGGTCCTGCTTTGTTGGTTGATGTTCCGAGAGACAAGAA
CATAACTGCTGAGGTGATGGAATCACTTCATATTCCAAGGGGAGTTCGTCGTGTGCTCTT
CAGAACATCCAACACTGACAAGCGGCTTATGTTTAAGAAAGAGTTCGATTCAAGCTTTTC
TGGTTTCATGACCGATGGGGCTAAATGGTTGGTTGAGAACACAGACATCAAACTTGTTGG
GCTTGATTATCTTTCCTTTGCTGCTTTTGAGGAGTCACCTGCAACCCATAAGGTTATACT
AAGAGGAA*GGGATATAATCCCTGTGGAAGCGCTGAAGCTGGATGGTGTGGAGGCAGGAA
TGTACTCGCTTCATTGCTTACCGTTGAGATTGGTTGGAGCTGAAGGAGCACCAACTAGGT
GCATTCTCATCAAGTGATTCACTTTCTTTGTAAGTTGGTCAGACAATATGAGGGAACT

QA 1 598 1 598
DS 

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CGGAGATGAAACTGTCAGTTCACTCGGGAACACACGTGGATGCTCCAGGCCACTTCATCG
ACGAGTATTACGTCGCTGGTTTCGACTCCGATTCGCTTGACCTCCAAACTCTAAACGGTC
CTGCTTTGTTGGTTGATGTTCCGAGAGACAAGAACATAACTGCTGAGGTGATGGAATCAC
TTCATATTCCAAGGGGAGTTCGTCGTGTGCTCTTCAGAACATCCAACACTGACAAGCGGC
TTATGTTTAAGAAAGAGTTCGATTCAAGCTTTTCTGGTTTCATGACCGATGGGGCTAAAT
GGTTGGTTGAGAACACAGACATCAAACTTGTTGGGCTTGATTATCTTTCCTTTGCTGCTT
TTGAGGAGTCACCTGCAACCCATAAGGTTATACTAAGAGGAA*GGGATATAATCCCTGTG
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AGATTGGTTGGAGCTGAAGGAGCACCAACTAGGTGCATTCTCATCAAGTGATTCACTTTC
TTTGTAAGTTGGTCAGACAATATGAGGGAACTGATCATAAATAATATGCTTATTGCTTCC
AAGATACCACAATCATAAAGCAGATGTCATAGATGTGATGATTCAGTTATAAAAGTAAAC
AATACCTTATATAAATTTAT

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DS 

RD RS1CO44JQ 722 0 0
GGCTGATCGCGAGCATGAAGAACGGATCTTTCGCAAACGTGTCGGAGATGAAACTGTCAG
TTCACTCGGGAACACACGTGGATGCTCCAGGCCACTTCATCGACGAGTATTACGACGCTG
GTTTCGACTCCGATTCGCTTGACTTCCAAACTCTAAACGGTCCTGCTTTGTTGGTTGATG
TTCCGAGAGACAAGAACATAACTGCTGAGGTGATGGAATCACTTCATATTCCAAGGGGAG
TTCGTCGTGTGCTCTTCAGAACATCCAACACTGACAAGCGGCTTATGTTTAAGAAAGAGT
TCGATTCAAGCCTTTCTGGTTTCATGACCGATGGGGCTAAATGGTTGGTTGAGAACACAG
ACATCAAACTTGTTGGGCTTGATTATCTTTCCTTTGCTGCTTTTGAGGAGTCACCTGCAA
CCCATAAGGTTATACTAAGAGGAA*GGGATATAATCCCTGTGGAAGCGCTGAAGCTGGAT
GGTGTGGAGGCAGGAATGTACTCGCTTCATTGCTTACCGTTGAGATTGGTTGGAGCTGAA
GGAGCACCAACTAGGTGCATTCTCATCAAGTGATTCACTTTCTTTGTAAGTTGGTCAGAC
AATATGAGGGAACTGATCATAAATAATATGCTTATTACTTCCAAGATACCACAATCATAA
AGCAGATGTCATAGATGTGATGATTCAGTTGTAAAAGTAAACAATACCTTATATAAATTT
AT

QA 1 722 1 722
DS 

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TTTGTTGGTTGATGTTCCGAGAGACAAGAACATAACTGCTGAGGTGATGGAATCACTTCA
TATTCCAAGGGGAGTTCGTCGTGTGCTCTTCAGAACATCCAACACTGACAAGCGGCTTAT
GTTTAAGAAAGAGTTCGATTCAAGCTTTTCTGGTTTCATGACCGATGGGGCTAAATGGTT
GGTTGAGAACACAGACATCAAACTTGTTGGGCTTGATTATCTTTCCTTTGCTGCTTTTGA
GGAGTCACCTGCAACCCATAAGGTTATACTAAGAGGAA*GGGATATAATCCCTGTGGAAG
CGCTGAAGCTGGATGGTGTGGAGGCAGGAATGTACTCGCTTCATTGCTTACCGTTGAGAT
TGGTTGGAGCTGAAGGAGCACCAACTAGGTGCATTCTCATCAAGTGATTCACTTTCTTTG
TAAGTTGGTCAGACAATATGAGGGAACTGATCATAAATAATATGCTTATTACTTCCAAGA
TACCACAATCATAAAGCAGATGTCATAGATGTGATGATTCAGTTGTAAAAGTAAACAATA
CCTTATATAAATTTATGTGTAAGTTTGTTTGTGTGTAATTCTGAAAGATGTGGTAATAAA
GTTAAGACTG

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 6

CO CL789Contig1 1034 6 8 U
GGACCACTAAAACGCAATCGCGCCTCACACAAGAAGAAGACCCGTAGTTCCGTTTCGCTG
TCTCCCTGTCTAAATTCTAATTCCATCTCGTGTCCTCTCTTCCTCCTCTAGAAAAATCTC
CATGAACATACTCAACAGGTTCGGTTTAGGATCAGGCGGGCAAAGAAGCATGGATCCTTC
TCCGATCGCCCAGGGAAACGACGATGACTCTCCGGCGCCGGGAAATCACTTTGCGCAATT
CGCCGCCGGATGTTTCTGGGGAGTGGAGCTGGCGTTTCAGAGGCTCCCAGGGGTGACTCA
TACAGAGGTTGGATACACACAAGGGATCACCCACAACCCTTCGTACGAGGATGTCTGTTC
TGAAACCACGGGACATGCCGAGATCGTTAGGGTTCAGTATGATCCCAAAGACTGCACCTT
TGAGTCTCTCCTTGATTTGTTCTGGTCTAGGCATGATCCCACCACCTTGAATCGCCAGGG
AAATGATGTGGGAACCCGATACCGATCAGGGCTATACTACTACACACCC*GAGCAGGAGA
AACTAGCCC*GCGAGTCACTTGAACGTCACCAGGAAAAAATGGAGAGGAAGATCATGACT
GAGATCTTGCCTGCTAAGAAATTCTACAGAGCCGAGGAGCAACAGCAGCAGTATCTGTCC
AAGGGTGGAAGGTTCGGCCTCGGACAGTCCTGTGCCAAAGGCTGCACCGACCCAATCCGC
CGCTACGGCTAAAAGCCTGAGCTCCTCTGTTTCTCTCCCAAAACAGAGTGTGCTAGTGAC
TTTTGTGTAAAAGCTATGTGACGTATGTTTATCGTTTGTACGATTATTTGTTGGTGGTGT
TTCTCAAACTATTTGAATGAATAAGAGAATCTTGTGGACAAAAGAAATAGTCCAATGGAT
ATAGCCAAATGGGCTAATGGTAGGACACTTGGTTTATTGTCCATTTCTGCATGCTTGTGC
ACATCTTGTAAGACCATTTGTTCTGTTTTTAACTATTTAAAAAATAACTAAAAATAAAGA
TAAAATATGTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EE05JQ C 214
AF RS1EE05TF U 407
AF RS1BD07TF U 4
AF RS1DZ06TF U 1
AF RS1DZ06JQ C 449
AF RS1BD07JQ C 262
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BS 384 666 RS1DZ06TF
BS 667 904 RS1BD07JQ
BS 905 905 RS1DZ06JQ
BS 906 1034 RS1BD07JQ

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GTTTCAGAGGCTCCCAGGGGTGACTCATACAGAGGTTGGATACACACAAGGGATCACCCA
CAACCCTTCGT

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DS 

RD RS1EE05TF 174 0 0
AAAGACTGCACCTTTGAGTCTCTCCTTGATTTGTTCTGGTCTAGGCATGATCCCACCACC
TTGAATCGCCAGGGAAATGATGTGGGAACCCGATACCGATCAGGGCTATACTACTACACA
CCCCGAGCAGGAGAAACTAGCCCCGCGAGTCACTTGAACGTCACCAGGAAAAAA

QA 1 174 1 174
DS 

RD RS1BD07TF 655 0 0
GG
ACTAAAACGCAATCGCGCCTCACACAAGAAGAAGACCCGTAGTTCCGTTTCGCTGTCTCC
CTGTCTAAATTCTAATTCCATCTCGTGTCCTCTCTTCCTCCTCTAGAAAAATCTCCATGA
ACATACTCAACAGGTTCGGTTTAGGATCAGGCGGGCAAAGAAGCATGGATCCTTCTCCGA
TCGCCCAGGGAAACGACGATGACTCTCCGGCGCCGGGAAATCACTTTGCGCAATTCGCCG
CCGGATGTTTCTGGGGAGTGGAGCTGGCGTTTCAGAGGCTCC*AGGGGTGACTCATACAG
AGGTTGGATACACACAAGGGATCACCCACAACCCTTCGTACGAGGATGTCTGTTCTGAAA
CCACGGGACATGCCGAGATCGTTAGGGTTCAGTATGATCCCAAAGACTGCACCTTTGAGT
CTCTCCTTGATTTGTTCTGGTCTAGGCATGATCCCACCACCTTGAATCGCCAGGGAAATG
ATGTGGGAACCCGATACCGATCAGGGCTATACTACTACACACCC*GAGCAGGAGAAACTA
GCCC*GCGAGTCACTTGAACGTCACCAGGAAAAAATGGAGAGGAAGATCATGACTGAGAT
CTTGCCTGCTAAGAAATTCTACAGAGCCGAGGAGCAACAGCAGCAGTATCTGT

QA 3 655 3 655
DS 

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GGACCACTAAAACGCAATCGCGCCTCACACAAGAAGAAGACCCGT*GTTCCGTTTCGCTG
TCTCCCTGTCTAAATTCTAATTCCATCTCGTGTCCTCTCTTCCTCCTCTAGAAAAATCTC
CATGAACATACTCAACAGGTTCGGTTTAGGATCAGGCGGGCAAAGAAGCATGGATCCTTC
TCCGATCGCCCAGGGAAACGACGATGACTCTCCGGCGCCGGGAAATCACTTTGCGCAATT
CGCCGCCGGATGTTTCTGGGGAGTGGAGCTGGCGTTTCAGAGGCTCCCAGGGGTGACTCA
TACAGAGGTTGGATACACACAAGGGATCACCCACAACCCTTCGTACGAGGATGTCTGTTC
TGAAACCACGGGACATGCCGAGGTCGTTAGGGTTCAGTATGATCCCAAAGACTGCACCTT
TGAGTCTCTCCTTGATTTGTTCTGGTCTAGGCATGATCCCACCACCTTGAATCGCCAGGG
AAATGATGTGGGAACCCGATACCGATCAGGGCTATACTACTACACACCC*GAGCAGGAGA
AACTAGCCC*GCGAGTCACTTGAACGTCACCAGGAAAAAATGGAGAGGAAGATCATGACT
GAGATCTTGCCTGCTAAGAAATTCTACAGAGCCGAGGAGCAACAGCAGCAGTATCTGTCC
AAGGGT

QA 1 666 1 666
DS 

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AGGCATGATCCCACCACCTTGAATCGCCAGGGAAATGATGTGGGAACCCGATACCGATCA
GGGCTATACTACTACACACCC*GAGCAGGAGAAACTAGCCC*GCGAGTCACTTGAACGTC
ACCAGGAAAAAATGGAGAGGAAGATCATGACTGAGATTTTGCCTGCTAAGAAATTTTACA
GAGCCGAGGAGCAACAGCAGCAGTATCTGTCCAAGGGTG*AAGGTTCGGCCTCGGGCAGT
CCTGTGCCAAAGGCTGCACCGACCCAATCCGCTGCTACGGCTAAAAGCCTGAGCTCCTCT
GTTTCTCTCCCAAAGCAGAGTGTGCTAGTGACTTTTGTGTAAAAGCTATGTGACGTATGT
TTATCGTTTGTACGATTATTTGTTGGTGGTGTTTCTCAAACTATTTGAATGAATAAGAGA
ATTTTGTGGACAAAAGAAATAGTCCAATGGATATAGCCAAATGGGCTAATGGTAGGACAC
TTGGTTTATTGTCCATTTTTGCATGCTTGTGTACATCTTGTAAGACCATTTGTTCTGTTT
TTAACTATTT

QA 1 550 1 550
DS 

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AGGGATCACCCACAACCCTTCGTACGAGGATGTCTGTTCTGAAACCACGGGACATGCCGA
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CTGGTCTAGGCATGATCCCACCACCTTGAATCGCCAGGGAAATGATGTGGGAACCCGATA
CCGATCAGGGCTATACTACTACACACCC*GAGCAGGAGAAACTAGCCC*GCGAGTCACTT
GAACGTCACCAGGAAAAAATGGAGAGGAAGATCATGACTGAGATCTTGCCTGCTAAGAAA
TTCTACAGAGCCGAGGAGCAACAGCAGCAGTATCTGTCCAAGGGTGGAAGGTTCGGCCTC
GGACAGTCCTGTGCCAAAGGCTGCACCGACCCAATCCGCCGCTACGGCTAAAAGCCTGAG
CTCCTCTGTTTCTCTCCCAAAACAGAGTGTGCTAGTGACTTTTGTGTAAAAGCTATGTGA
CGTATGTTTATCGTTTGTACGATTATTTGTTGGTGGTGTTTCTCAAACTATTTGAATGAA
TAAGAGAATCTTGTGGACAAAAGAAATAGTCCAATGGATATAGTCAAATGGGCTAATGGT
AGGACACTTGGTTTATTGTCCATTTCTGCATGCTTGTGCACATCTTGTAAGACCATTTGT
TCTGTTTTTAACTATTTAAAAAATAACTAAAAATAAAGATAAAATATGTTTCG

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 7

CO CL790Contig1 1335 7 36 U
GATCAAAAAAAAACTAGTAGCCTTGTTGCTTGCATTGCATCTATACCTCTTTAGTAATAA
CGTCTTACATTTATAAATGCTGAAAATGATAATAAAAGGGTGATTCAAACCAAAAGTGAA
AAACACTCGAGCAATAATCGTTGAGAGATAATTGTTTTT*ATTTGAAA***GATATCACA
AAACTGAGCATGGACCAATAACTTAGTTGAAGTCTGGCTTCTCAGGGTAGGTGCAGCCAG
ATCTTTGGATCACCACGTTCGATGCGTAGCATCCGGCTTTCACGCACTCCTCAATGGACT
TCTCTTTCACCAACTGTGACATGAATCCTCCCACAAATGCATCACCTGCACCGTTGGTGT
CAACAAGCTTCTCCTTTGGGAGAGGGATCACAGGGTATTTCGTCACCTTTCCATCTTCAG
CAACGACCACTGGGTCTGCCCCCTGTGTAATCACGGTGGTCCTCTTGTACGTTCCTGTGG
CCTTGGGAAGCTGTGAAATCTTGATGGCTATTTGCTCCACATCTTCGGTCTCCCAGCCAT
GAACCCTTGAGAAGGTTATTGCCTCTGTCTCGTTGCCAAAAACAAAGTCCATGTACGGCA
AGAACTTCTCCTGCGCATCTTTGAAGAATTCACAGATGAATGGTGCAGAGAGGTTCATTG
TGAAGACCTTGTTGTTAGCAGCAGCATGCTCAGAAACCAACTGAATGGATTCAGGGGATA
CAGTGAGGAAGAATCCAGCAATGTAGTAGAACTTGGCCTTCTCAACTAGAGCCCAGTTTT
CAGGCTTCTTGAGGTGGTCAACCTTGTAGCAGTTAGCAGCGGAGAGATTAGCAATAAGAG
ACCTTTCTCCACCAACAACACAGACACCACAAGTTCCAGTAGGTGCAGACTCATCTTCAT
AGTAGTGAACATTGAGACCAGCAGCAGTAGCATCCTTCTTCATAGCCTCACCGTATTTGT
CATTTCCAATGGAGCCCATGTAACTGGTTGCCCCAGGAATTTGAAGCATCCACTGAGCCA
CCTTGATTGAGTTCTGAGTAGCACCTCCGGCAATGTATTCAACATTGAACTTGCTACTCA
TCTCTTCATACATGGGCAAATGTTTCTCCTCAGCGAGAATCGCATTGTTCAACTTGACGT
CGTATTTGGTGAGGAAATCCTCGTCTACAACGGCAGAGATATCGAGGAGAGGGTTTCCCA
TTCCCAGAAGGATTCCATCGTAGTTTTTAGAGGCAGACATGACCAGTATGAATCTGAGAT
TTGATACAGAGGATAAAGGTTTAGATTCAGATCTATTTATTTATGGATGCTCAAGTTTTG
TGGTGGTGAGAGTCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1FK48JQ U 6
AF RS1FC96JQ U 1
AF RS1DP38JQ U 12
AF RS1H314JQB U 25
AF RS1FK48TF C 565
AF RS1H314TF C 569
AF RS1DP38TF C 569
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AAAAAAAA
CTAGTATCTTTGTTGCTTGCATTGCATCTATACCTCTTTAGTAATAACGTCTTACATTTA
TAAATGCTGAAAATGATAATAAAAGGGGGATTCAAACCAAAAGTGAAAAACACTCGAGCA
ATAATCGTTGA
AAAA

QA 9 139 9 139
DS 

RD RS1FC96JQ 645 0 0
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CGTCTTACATTTATAAATGCTGAAAATGATAATAAAAGGGTGATTCAAACCAAAAGTGAA
AAACACTCGAGCAATAATCGTTGAGAGAGAATTGTTTTTTATTTGGAACAAGATATCACA
AAACTGAGCATGGACCAATAACTTAGTTGAAGTCTGGCTTCTCAGGGTAGGTGCAGCCAG
ATCTTTGGATCACCACGTTGGACGCGTAGCATCCGGCCTTCACGCACTCCTCAATGGACT
TTTCTTTCACCAACTGTGACATGAATCCTCCCACAAATGCATCACCTGCACCGTTGGTGT
CAACAAGCTTCTCCTTTGGGAGAGGGATCACAGGGTATTTCGTCACCTTTCCATCTTCAG
CAACGACCACTGGGTCTGCGCCTTGTGTAATCACGGTGGTCCTCTTGTATGTTCCTGTGG
CCTTGGGAAGCTGTGAAATCTTGATGGCTATTTGCTCTACATCTTCTGTCTCCCAGCCAT
GAACCCTTGAGAAGGTTATTGCCTCTGTCTCGTTGCCAAAAACAAAGTCCATGCACGGCA
AGAACTTCTCCTGCGCATCTTTGAAGAATTCACAGATGAATGGTG

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1DP38JQ 768 0 0
GGCTAGTATCT
TTGTTGCTTGCATTGCATCTATACCTCTTTAGTAATAACGTCTTACATTTATAAATGCTG
AAAATGATAATAAAAGGGTGATTCAAACCAAAAGTGAAAAACGCTCGAGCAATAATCGTT
GAGAGATAATTGTTTTT*ATTTGAAA***GATATCACAAAACTGAGCATGGACCAATAAC
TTAGTTGAAGTCTGGCTTCTCAGGGTAGGTGCAGCCAGATCTTTGGATCACCACGTTCGA
TGCGTAGCATCCGGCTTTCACGCACTCCTCAATGGACTTCTCTTTCACCAACTGTGACAT
GAATCCTCCCACAAATGCATCACCTGCACCGTTGGTGTCGACAAGCTTCTCCTTTGGGAG
AGGGATCACAGGGTATTTCGTCACCTTTCCATCTTCAGCAACGACCACTGGGTCTGCCCC
CTGTGTAATCACGGTGGTCCTCTTGTACGTTCCTGTGGCCTTGGGAAGCTGTGAAATCTT
GATGGCTATTTGCTCCACATCTTCGATCTCCCAGCCATGAACCCTTGAGAAGGTTATTGC
CTCTGTCTCGTTGCCAAAAACAAAGTCCATGTACGGCAAGAACTTCTCCTGCGCATCTTT
GAAGAATTCACAGATGAATGGTGCAGAGAGGTTCATTGTGAAGACCTTGTTGTTAGCAGC
AGCATGCTCAGAAACCAACTGAATGGATTCAGGGGATACAGTGAGGAAGAATCCAGCAAT
GTAGTAGAACTTGGCCTTCTCAACTAGAGCCCAGTTT

QA 12 768 12 768
DS 

RD RS1H314JQB 755 0 0
GC
TGCTTGCATTGCATCTATACCTCTTTAGTAATAACGTCTTACATTTATAAATGCTGAAAA
TGATAATAAAAGGGTGATTCAAACCAAAAGTGAAAAACACTCGAGCAATAATCGTTGAGA
GATAATTGTTTTT*ATTTGAAA***GATATCACAAAACTGAGCATGGACCAATAACTTAG
TTGAAGTCTGGCTTCTCAGGGTAGGTGCAGCCAGATCTTTGGATCACCACGTTCGATGCG
TAGCATCCGGCTTTCACGCACTCCTCAATGGACTTCTCTTTCACCAACTGTGACATGAAT
CCTCCCACAAATGCATCACCTGCACCGTTGGTGTCAACAAGCTTCTCCTTTGGGAGAGGG
ATCACAGGGTATTTCGTCACCTTTCCATCTTCAGCAACGACCACTGGGTCTGCCCCCTGT
GTAATCACGGTGGTCCTCTTGTACGTTCCTGTGGCCTTGGGAAGCTGTGAAATCTTGATG
GCTATTTGCTCCACATCTTCGGTCTCCCAGCCATGAACCCTTGAGAAGGTTATTGCCTCT
GTCTCGTTGCCAAAAACAAAGTCCATGTACGGCAAGAACTTCTCCTGCGCATCTTTGAAG
AATTCACAGATGAATGGTGCAGAGAGGTTCATTGTGAAGACCTTGTTGTTAGCAGCAGCA
TGCTCAGAAACCAACTGAATGGATTCAGGGGATACAGTGAGGAAGAATCCAGCAATGTAG
TAGAACTTGGCCTTCTCAACTAGAGCCCAGTTT

QA 3 755 3 755
DS 

RD RS1FK48TF 762 0 0
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CATGCTCAGAAACCAACTGAATGGATTCAGGGGATACAGTGAGGAAGAATCCAGCAATGT
AGTAGAACTTGGCCTTCTCAACTAGAGCCCAGTTTTCAGGCTTCTTGAGGTGGTCAACCT
TGTAGCAGTTAGCAGCGGAGAGATTAGCAATAAGAGACCTTTCTCCACCAACAACACAGA
CACCACAAGTTCCAGTAGGTGCAGACTCATCTTCATAGTAGTGAACATTGAGACCAGCAG
CAGTAGCATCCTTCTTCATAGCCTCACCGTATTTGTCATTTCCAATGGAGCCCATGTAAC
TGGTTGCCCCAGGAATTTGAAGCATCCACTGAGCCACCTTGATTGAGTTCTGAGTAGCAC
CTCCGGCAATGTATTCAACATTGAACTTGCTACTCATCTCTTCATACATGGGCAAATGTT
TCTACTAAGCGAGAATCGCATTGTTCAACTTGACGTCGTATTTGGTGAGGAAATCCTCGT
CTACAACGGCAGAGATATCGAGGAGAGGGTTTCCCATTCCCAGAAGGATTCCATCGTAGT
TTTTAGAGGCAGACATGACCAGTATGAATCTGAGATTTGATACAGAGGATAAAGGTTTAG
ATTCAGATCTATTTATTTATGGATGCTCAAGTTTTGTGGT
CC

QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1H314TF 767 0 0
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TTCACAGATGAATGGTGCAGAGAGGTTCATTGTGAAGACCTTGTTGTTAGCAGCAGCATG
CTCAGAAACCAACTGAATGGATTCAGGGGATACAGTGAGGAAGAATCCAGCAATGTAGTA
GAACTTGGCCTTCTCAACTAGAGCCCAGTTTTCAGGCTTCTTGAGGTGGTCAACCTTGTA
GCAGTTAGCAGCGGAGAGATTAGCAATAAGAGACCTTTCTCCACCAACAACACAGACACC
ACAAGTTCCAGTAGGTGCAGACTCATCTTCATAGTAGTGAACATTGAGACCAGCAGCAGT
AGCATCCTTCTTCATAGCCTCACCGTATTTGTCATTTCCAATGGAGCCCATGTAACTGGT
TGCCCCAGGAATTTGAAGCATCCACTGAGCCACCTTGATTGAGTTCTGAGTAGCACCTCC
GGCAATGTATTCAACATTGAACTTGCTACTCATCTCTTCATACATGGGCAAATGTTTCTC
CTCAGCGAGAATCGCATTGTTCAACTTGACGTCGTATTTGGTGAGGAAATCCTCGTCTAC
AACGGCAGAGATATCGAGGAGAGGGTTTCCCATTCCCAGAAGGATTCCATCGTAGTTTTT
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AGATCTATTTATTTATGGATGCTCAAGTTTTGTGGTGGTGAGAGTCC

QA 1 767 1 767
DS 

RD RS1DP38TF 767 0 0
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AATGGTGCAGAGAGGTTCATTGTGAAGAC*TTGTTGTTAGCAGCAGCATGCTCAGAAACC
AACTGAATGGATTCAGGGGATACAGTGAGGAAGAATCCAGCAATGTAGTAGAACTTGGCC
TTCTCAACTAGAGCCCAGTTTTCAGGCTTCTTGAGGTGGTCAACCTTGTAGCAGTTAGCA
GCGGAGAGATTAGCAATAAGAGACCTTTCTCCACCAACAACACAGACACCACAAGTTCCA
GTAGGTGCAGACTCATCTTAATAGTAGTGAACATTGAGACCAGCAGCAGTAGCATCCTTC
TTCATAGCCTCACCGTATTTGTCATTTCCAATGGAGCCCATGTAACTGGTTGCCCCAGGA
ATTTGAAGCATCCACTGAGCCACCTTGATTGAGTTCTGAGTAGCACCTCCGGCAATGTAT
TCAACATTGAACTTGCTACTCATCTCTTCATACATGGGCAAATGTTTCTCCTCAGCGAGA
ATCGCATTGTTCAACTTGACGTCGTATTTGGTGAGGAAATCCTCGTCTACAACGGCAGAG
ATATCGAGGAGAGGGTTTCCCATTCCCAGAAGGATTCCATCGTAGTTTTTAGAGGCAGAC
ATGACCAGTATGAATCTGAGATTTGATACAGAGGATAAAGGTTTAGATTCAGATCTATTT
ATTTATGGATGCTCAAGTTTTGTGGTGGTGAGAGTCC

QA 11 767 11 767
DS 



AS 1 7

CO CL791Contig1 1003 7 22 U
GGAAGTCACTAAGAGTCTCTTACATAAACATCAAATCCCAACAACTGATCTACTATAAAA
CCCCACCTTGAGAAAAATAATCCAAAACAATGTACTCTTCATCGTCTGTATCAAAATGCG
TCATTTTGATCCATGTCTTCGCCATGCAACTTCTCCTTATAAACAGCGAATTGCCCTTAA
ACACGACCAATGCGTATCTCAACCACAAATGCGTGGTTAGTCAAGGAAAATACAAGCCTG
GAAGTAAGTACGAGAAACAGTTAAAATTGACCATCAAAAGTTTTTATTCTAGCAGTGAAA
ATAAAGAAGGTTTAGACCTTTTAGGCGGTGACGGTTTTTCCGCTATCCTCCAGTGCCGCG
GCGACTCCTACGGG*GCAAGTGCCGCGACTGCTATGCCACCGCCGTCGCTGCGCTTCATA
GGAAATGTCCGTGGTACAAGGCGAAAATAATATGGTATGACCAATGTCTTCTCTCGTTTG
ATACAAAATATTCTACTGGGATGATCGACTACGACAATAATTTTTGTATGTCAAACGCTA
AGAAGTTGGGAGGAGATAAACTCTCGTTTATGAGGACTTGGAATACTTTCATGGACAATC
TGATGGCTTTAGCCACCCGTGCTGATAATGACACAACATATCCACCATTGTACTCTGTGG
GGAAGACGAGGTTCAACGGTGATACGATGTATGGAATGGTGCAGTGTACAAAAGACATAC
CCCCTAAAGCTTGTAAGGAGTGTCTGGTGTTTTATAGCATTCATTTTCAAGATTGCTTGA
ATGATAAACGAGGAGCGAGATTTATGAGTAGAAGCTGTACTTTTAGGTTTGAGTTTTACC
CTTTTATTGCCAAGCAGGTCAGGAATATTTTAAGAGTCAAATAAATATTTATTTTTTTAA
AAAATATTTTCAGTCAGAAGTTTATGTAACATCAAGTG*CAACTCTTTTT*TTGATGAAT
GTTTGAAGAATAAAACAACAAAATAATGACTGAATAAGGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FK93TF U 6
AF RS1FQ03TF U 1
AF RS1FM75TF U 7
AF RS1FQ03JQ C 179
AF RS1FK93JQ C 416
AF RS1FM75JQ C 521
AF RS1BP54TF U 564
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RD RS1FK93TF 669 0 0
GGACTAG
GAGTCTCTTACATAAACATCAAATCCCAACAACTGATCTACTATAAAACCCCACCTTGAG
AAAAATAATCCAAAACAATGTACTCTTCATCGTCTGTATCAAAATGCGTCATTTTGATCC
ATGTCTTCGCCATGCAACTTCTCCTTATAAACAGCGAATTGCCCTTAAACACGACCAATG
CGTATCTCAACCACAAATGCGTGGTTAGTCAAGGAAAATACAAGCCTGGAAGTAAGTACG
AGAAACAGTTAAAATTGACCATCAAAAATTTTTATTCTAGCAGTGAAAATAAAGAAGGTT
TAGACCTTTTAGGCGGTGACGGTTTTTCCGCTATCCTCCAGTGCCGCGGCGACTCCTACG
GGCGCAAGTGCCGCGACTGCTATGCCACCGCCGTCGCTGCGCTTCATAGGAAATGTCCGT
GGTACAAGGCGAAAATAATATGGTATGACCAATGTCTTCTCTCGTTTGATACAAAATATT
CTACTGGGATGATCGACTACGACAATAATTTTTGTATGTCAAACGCTAAGAAGTTGGGAG
GAGATAAACTCTCGTTTATGAGGACTTGGAATACTTTCATGGACAATCTGATGGCTTTAG
CCACCCGTGCTGATAATGACACAACATATCCACCATTGTACTCTGTGGGGAAGACGAGGT
TC

QA 8 669 8 669
DS 

RD RS1FQ03TF 733 0 0
GGAAGTCACTAAGAGTCTCTTACATAAACATCAAATCCCAACAACTGATCTACTATAAAA
CCCCACCTTGAGAAAAATAATCCAAAACAATGTACTCTTCATCGTCTGTATCAAAATGCG
TCATTTTGATCCATGTCTTCGCCATGCAACTTCTCCTTATAAACAGCGAATTGCCCTTAA
ACACGACCAATGCGTATCTCAACCACAAATGCGTGGTTAGTCAAGGAAAATACAAGCCTG
GAAGTAAGTACGAGAAACAGTTAAAATTGACCATCAAAAGTTTTTATTCTAGCAGTGAAA
ATAAAGAAGGTTTAGACCTTTTAGGCGGTGACGGTTTTTCCGCTATCCTCCAGTGCCGCG
GCGACTCCTACGGG*GCAAGTGCCGCGACTGCTATGCCACCGCCGTCGCTGCGCTTCATA
GGAAATGTCCGTGGTACAAGGCGAAAATAATATGGTATGACCAATGTCTTCTCTCGTTTG
ATACAAAATATTCTACTGGGATGATCGACTACGACAATAATTTTTGTATGTCAAACGCTA
AGAAGTTGGGAGGAGATAAACTCTCGTTTATGAGGACTTGGAATACTTTCATGGACAATC
TGATGGCTTTAGCCACCCGTGCTGATAATGACACAACATATCCACCATTGTACTCTGTGG
GGAAGACGAGGTTCAACGTTGATACGATGTATGGAATGGTGCAGTGTACAAA*GACATAC
CCCCTAA
GCTTGT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1FM75TF 816 0 0
AGGGAA
GAGTCTCTTACATAAACATCAAATCCCAACAACTGATCTACTATAAAACCCCACCTTGAG
AAAAATAATCCAAAACAATGTACTCTTCATCGTCTGTATCAAAATGCGTCATTTTGATCC
ATGTCTTCGCCATGCAACTTCTCCTTATAAACAGCGGATTGCCCTTAAACACGACCAATG
CGTATCTCAACCACAAATGCGTGGTTAGTCAAGGAAAATACAAGCCTGGAAGTAAGTACG
AGAAACAGTTAAAATTGACCATCAAAAATTTTTATTCTAGCAGTGAAAATAAAGAAGGTT
TAGACCTTT*AGGCGGTGACGGTTTTTCCGCTATCCTCCAGTGCCGCGGCGACTCCTACG
GGCGCAAGTGCCGCGACTGCTATGCCACCGCCGTCGCTGCGCTTCATAGGAAATGTCCGT
GGTACAAGGCGAAAATAATATGGTATGACCAATGTCTTCTCTCGTTTGATACAAAATATT
CTACTGGGATGATCGACTACGACAATAATTTTTGTATGTCAAACGCTAAGAAGTTGGGAG
GAGATAAACTCTCGTTTATGAGGACTTGGAATACTTTCATGGACAATCTGATGGCTTTAG
CCACCCGTGCTGATAATGACACAACATATCCACCATTGTACTCTGTGGGGAAGACGAGGT
TCAACGGTGATACGATGTATGGAATGGTGCAGTGTACAAA*GACATACCCCCTAAAGCTT
GTAAG*AGTGTCTGGTGTTTTATAGCATTCATTTTCA*GATTGCTTGA*TGATAAACGAG
*AGCGAGATTTATGAGTAGAAGCTGTACTT

QA 7 816 7 816
DS 

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AAACACGACCAATGCGTATCTCAACCACAAATGCGTGGTTAGTCAAGGAAAATACAAGCC
TGGAAGTAAGTACGAGAAACAGTTAAAATTGACCATCAAAAGTTTTTATTCTAGCAGTGA
AAATAAAGAAGGTTTAGACCTTTTAGGCGGTGACGGTTTTTCCGCTATCCTCCAGTGCCG
CGGCGACTCCTACGGG*GCAAGTGCCGCGACTGCTATGCCACCGCCGTCGCTGCGCTTCA
TAGGAAATGTCCGTGGTACAAGGCGAAAATAATATGGTATGACCAATGTCTTCTCTCGTT
TGATACAAAATATTCTACTGGGATGATCGACTACGACAATAATTTTTGTATGTCAAACGC
TAAGAAGTTGGGAGGAGATAAACTCTCGTTTATGAGGACTTGGAATACTTTCATGGACAA
TCTGATGGCTTTAGCCACCCGTGCTGATAATGACACAACATATCCACCATTGTACTCTGT
GGGGAAGACGAGGTTCAACGTTGATACGATGTATGGAATGGTGCAGTGTACAAAAGACAT
ACCCCCTAAAGCTTGTAAGGAGTGTCTGGTGTTTTATAGCATTCATTTTCAAGATTGCTT
GAATGATAAACGAGGAGCGAGATTTATGAGTAGAAGCTGTACTTTTAGGTTTGAGTTTTA
CCCTTTTATTGCCAAGCAGGTCAGGAATATTTTAAGAGTCAAATAAATATTTATTTTTTT
AAAAAATATTTTCAG
CC

QA 1 735 1 735
DS 

RD RS1FK93JQ 550 0 0
TCATAGGAAATGTCCGTGGTACAAGGCGAAAATAATATGGTATGACCAATGTCTTCTCTC
GTTTGATACAAAATATTCTACTGGGATGATCGACTACGACAATAATTTTTGTATGTCAAA
CGCTAAGAAGTTGGGAGGAGATAAACTCTCGTTTATGAGGACTTGGAATACTTTCATGGA
CAATCTGATGGCTTTAGCCACCCGTGCTGATAATGACACAACATATCCACCATTGTACTC
TGTGGGGAAGACGAGGTTCAACGGTGATACGATGTATGGAATGGTGCAGTGTACAAAAGA
CATACCCCCTAAAGCTTGTAAGGAGTGTCTGGTGTTTTATAGCATTCATTTTCAAGATTG
CTTGAATGATAAACGAGGAGCGAGATTTATGAGTAGCAGCTGTACTTTTAGGTTTGAGTT
TTACCCTTTTATTGCCAAGCAGGTCAGGAATATTTTAAGAGTCAAATAAATATTTATTTT
TTTAAAAAATATTTTCAGTCAGAAGTTTATGTAACATCAAGTG*CAACTCTTTTT*TTGA
TGAATGTTTG

QA 1 550 1 550
DS 

RD RS1FM75JQ 483 0 0
TTTTTGTATGTCAAACGCTAAGAAGTTGGGAGGAGATAAACTTTCGTTTATGAGGACTTG
GAATACTTTCATGGACAATCTGATGGCTTTAGCCACCCGTGCTGATAATGACACAACATA
TCCACCATTGTACTCTGTGGGGAAGACGAGGTTCAACGGTGATACGATGTATGGAATGGT
GCAGTGTACAAAAGACATACCCCCTAAAGCTTGTAAGGAGTGTCTGGTGTTTTATAGCAT
TCATTTTCAAGATTGCTTGAATGATAAACGAGGAGCGAGATTTATGAGTAGAAGCTGTAC
TTTTAGGTTTGAGTTTTACCCTTTTATTGCCAAGCAGGTCAGGAATATTTTAAGAGTCAA
ATAAATATTTATTTTTTTAAAAAATATTTTCAGTCAGAAGTTTATGTAACATCAAGTG*C
AACTCTTTTT*TTGATGAATGTTTGAAGAATAAAACAACAAAATAATGACTGAATAAGGT
TTC

QA 1 483 1 483
DS 

RD RS1BP54TF 428 0 0
G
CGTTTATGAGGACTTGGAATACTTTCATGGACAATCTGATGGCTTTAGCCACGCGTGCTG
ATAATGACACAACACATCCACCATTGTACTCTGTGGGGAAGACGAGGTTCAACGGTGATA
CGATGTATGGAATGGTGCAGTGTACAAAAGACATACCCCCTAAAGCTTGTAAGGAGTGTC
TGGTGTTTTATAGCATTCATTTTCAAGATTGCTTGAATGATAAACGAGGAGCGAGATTTA
TGAGTAGAAGCTGTACTTTTAGGTTTGAGTTTTACCCTTTTATTGCCAAGCAGGTCAGGA
ATATTTTAAGAGTCAAATAAATATTTATTTTTTTAAAAAATATTCTCAGTCAGAAGTTTA
TGTAACATCAAGTGGCAACTCTTTTTATTGATGAATGTTTGAAGAATAAAACAACAAAAT
AATGACT

QA 2 428 2 428
DS 



AS 2 7

CO CL792Contig1 718 5 4 U
TCCTTATCAAAGAGGGGCCCCCTAGGGGGTGTTTAGTAACTCGAGCATTTCTTGTTTACT
CGAACAGCAAAGGAGAGGTGCTTTAGCACCTCGACGCTGCCAAGCTCTCTGTCTTGGTTA
ATGGTTCTCCAAAAGGATATTTCTCATGTTAGGCGGTGTGAGACAGGGGGATCCTTTATC
TCCCGTTGTTATTTTGTATTGCGGAAGATGTCTTATCACGGGGTCTTACCGGGCTTAATC
ACCTGGGCATTCTTTCTTCAATTACCGAGACCTGGACATACAAAGATCTAGGCAGCTCAT
CTTCTTCTAACGAAGTCAGATCTTTTTCCATACCATAACGTATATAGAATCGATTTTCTT
TTCTGATCGCTAGCCTGCCGGGCCGCCCCCGCGATCAAACTATCAATCTCATAAGAGAAG
AAATCTCTATGCCCCCTTTTTCTTGGTTTTCTCC*ATGCTTTTGTTGGTCAACAACCAAC
CACAACTTTCTATAGTTCTTCACTACTCCTAGAGGCTTGACGGAGTGAAGCTGTCTGGAG
GGAATCATTTTGTTGAAATCAATTAATCTAATCATGCCTCAACTGGGTGACTCCATTTCA
CTAGGCATTTTAGGGGCGTTAATCTTTTCCTCACTCGGACTCGGACTAGTGGGTTATAAA
TTCTTTTTGATTTTAAAAA*GAGATTCCTACAACTACCTTGCTGTTTAAAATGAAAAA


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RS1C006JQ U 1
AF RS1C006TF C 2
AF RS1CV90JQ U 22
AF RS1AB06JQ U 131
AF RS1AB06TF C 108
BS 1 322 RS1C006JQ
BS 323 454 RS1CV90JQ
BS 455 455 RS1AB06JQ
BS 456 718 RS1CV90JQ

RD RS1C006JQ 323 0 0
TCCTTATCAAAGAGGGGCCCCCTAGGGGGTGTTTAGTAACTCGAGCATTTCTTGTTTACT
CGAACAGCAAAGGAGAGGTGCTTTAGCACCTCGACGCTGCCAAGCTCTCTGTCTTGGTTA
ATGGTTCTCCAAAAGGATATTTCTCATGTTAGGCGGTGTGAGACAGGGGGATCCTTTATC
TCCCGTTGTTATTTTGTATTGCGGAAGATGTCTTATCACGGGGTCTTACCGGGCTTAATC
ACCTGGGCATTCTTTCTTCAATTACCGAGACCTGGACATACAAAGATCTAGGCAGCTCAT
CTTCTTCTAACGAAGTCAGATC
C

QA 1 322 1 322
DS 

RD RS1C006TF 322 0 0
CCTTATCAGAGAGGGGCCCCCTAGGGGGTGTTTAGTAACTCGAGCATTTCTTGTTTACTC
GAACAGCAAAGGAGAGGTGCTTTAGCACCTCGACGCTGCCAAGCTCTCTGTCTTGGTTAA
TGGTTCTCCAAAAGGATATTTCTCATGTTAGGCGGTGTGAGACAGGGGGATCCTTTATCT
CCCGTTGTTATTTTGTATTGCGGAAGATGTCTTATCACGGGGTCTTACCGGGCTTAATCA
CCTGGGCATTCTTTCTTCAATTACCGAGACCTGGACATACAAAGATCTAGGCAGCTCATC
TTCTTCTAACGAAGTCAGATC
C

QA 1 321 1 321
DS 

RD RS1CV90JQ 697 0 0
CTAGGGGGGGTTTAGTAACTCGAGCATTTCTTGTTTACTCGAACAGCAAAGGAGAGGTGC
TTTAGCACCTCGACGCTGCCAAGCTCTCTGTCTTGGTTAATGGTTCTCCAAAAGGATATT
TCTCATGTTAGGCGGTGTGAGACAGGGGGATCCTTCATCTCCCGTTGTTATTTTGTATTG
CGGAAGATGTCTTATCACGGGGTCTTACCGGGCTTAATCACCTGGGCATTCTTTCTTCAA
TTACCGAGACCTGGACATACAAAGATCTAGGCAGCTCATCTTCTTCTAACGAAGTCAGAT
CTTTTTCCATACCATAACGTATATAGAATCGATTTTCTTTTCTGATCGCTAGCCTGCCGG
GCCGCCCCCGCGATCAAACTATCAATCTCATAAGAGAAGAAATCTCTATGCCCCCTTTTT
CTTGGTTTTCTCCCATGCTTTTGTTGGTCAACAACCAACCACAACTTTCTATAGTTCTTC
ACTACTCCTAGAGGCTTGACGGAGTGAAGCTGTCTGGAGGGAATCATTTTGTTGAAATCA
ATTAATCTAATCATGCCTCAACTGGGTGACTCCATTTCACTAGGCATTTTAGGGGCGTTA
ATCTTTTCCTCACTCGGACTCGGACTAGTGGGTTATAAATTCTTTTTGATTTTAAAAA*G
AGATTCCTACAACTACCTTGCTGTTTAAAATGAAAAA

QA 1 697 1 697
DS 

RD RS1AB06JQ 583 0 0
AAAAGGATATTTCTCATGTTAGGCGGTGTGAGACAGGGGGATCCTTTATCTCCCGTTGTT
ATTTTGTATTGCGGAAGATGTCTTATCACGGGGTCTTACCGGGCTTAATCACCTGGGCAT
TCTTTCTTCAATTACCGAGACCTGGACATACAAAGATCTAGGCAGCTCATCTTCTTCTAA
CGAAGTCAAATCTTTTTCCATACCATAACGTATATAGAATCGATTTTCTTTTCTGATCGC
TAGCCTGCCGGGCCGCCCCCGCGATCAAACTATCAATCTCATAAGAGAAGAAATCTCTAT
GCCCCCTTTTTCTTGGTTTTCTCC*ATGCTTTTGTTGGTCAACAACCAACCACAACTTTC
TATAGTTCTTCACTACTCCTAGAGGCTTGACGGAGTGAAGCTGTCTGGAGGGAATCATTT
TGTTGAAATCAATTAATCTAATCATGCCTCAACTGGGTGACTCCATTTCACTAGGCATTT
TAGGGGCGTTAATCTTTTCCTCACTCGGACTCGGACTAGTGGGTTATAAATTCTTTTTGA
TTTTAAAAAAGAGATTCCTACAACTACCTTGCTGTTTAAAATG

QA 1 583 1 583
DS 

RD RS1AB06TF 606 0 0
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GGGATCCTTTATCTCCCGTTGTTATTTTGTATTGCGGAAGATGTCTTATCACGGGGTCTT
ACCGGGCTTAATCACCTGGGCATTCTTTCTTCAATTACCGAGACCTGGACATACAAAGAT
CTAGGCAGCTCATCTTCTTCTAACGAAGTCAAATCTTTTTCCATACCATAACGTATATAG
AATCGATTTTCTTTTCTGATCGCTAGCCTGCCGGGCCGCCCCCGCGATCAAACTATCAAT
CTCATAAGAGAAGAAATCTCTATGCCCCCTTTTTCTTGGTTTTCTCC*ATGCTTTTGTTG
GTCAACAACCAACCACAACTTTCTATAGTTCTTCACTACTCCTAGAGGCTTGACGGAGTG
AAGCTGTCTGGAGGGAATCATTTTGTTGAAATCAATTAATCTAATCATGCCTCAACTGGG
TGACTCCATTTCACTAGGCATTTTAGGGGCGTTAATCTTTTCCTCACTCGGACTCGGACT
AGTGGGTTATAAATTCTTTTTGATTTTAAAAA*GAGATTCCTACAACTACCTTGCTGTTT
AAAATG

QA 1 606 1 606
DS 



CO CL792Contig2 995 2 2 U
GGAAGGGGATCTCGTAACGACCCCCCGATCCTCACATAGTAGTTTAAGGGAAGAGAATGG
AATGACTCGCAAAACAGCGTAGCAAACTACAAGCGAACGAACGAGCAGAAACAAGCTAGT
CATGGGTGTGGTTCCTCTCCTTTTAGTCGAGTTGCTAAAGCACCTCGACGCTGCCAAGCT
CTCTGTCTTGGTTAATGGTTCTCCAGAAGGATATTTCTCATGTTAGGCGGTGTGAGACAG
GGGGATCCTTTATCCCCCGTTGTTATTTTGTATTGCGGAAGATGTCTTATCACGGGGTCT
TACCGGGCTTAATCACCTGGGCATTCTTTCTTCAATTACCGAGACCTGGACATACAAAGA
TCTAGGCAGCTCATCTTCTTCTAACGAAGTCAGATCTTTTTCCATACCATAACGTATATA
GAATCGATTTTCTTTTCTGATCGCTAGCCTGCCGGGCCGCCCCCGCGATCAAACTATCAA
TCTCATAAGAGAAGAAATCTCTATGCCCCCTGTTCTTGGTTTTCTCCCATGCTTTTGTTG
GTCAACAACCAACCACAACTTTCTATAGTTCTTCACTACTCCTAGAGGCTTGACGGAGTG
AAGCTGTCTGGAGGGAATCATTTTGTTGAAATCAATTAATCTAATCATGCCTCAACTGGA
TAAATTCACTTATTTTTCACAATTCTTCTGGTTATGCCTTTTCTTCTTTACTTTCTATAT
TTTCATATGCAATGATGGAGATGGAGTACTTGGGATCAGCAGAATTCTAAAACTACGGAA
CCAACTGCTTTCACACCGGGGGAAGACCATCCAGAGCAAGGACCCCAACAGTTTGGAAGA
TCTCTTGAGAAAAGGTTTTAGCACTGGTGTATCCTATATGTATGCTAGTTTATTCGAAGT
ATCCCAATGGTGTAAGGCCGTCGACTTATTGGGAAAAAGGAGGAAAATCACTTTGATCTC
TTGTTTCGGAGAAATAAGTGGCTCACGAGGAATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1G683TF U 1
AF RS1G683JQ C 410
BS 1 581 RS1G683TF
BS 582 995 RS1G683JQ

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GGAAGGGGATCTCGTAACGACCCCCCGATCCTCACATAGTAGTTTAAGGGAAGAGAATGG
AATGACTCGCAAAACAGCGTAGCAAACTACAAGCGAACGAACGAGCAGAAACAAGCTAGT
CATGGGTGTGGTTCCTCTCCTTTTAGTCGAGTTGCTAAAGCACCTCGACGCTGCCAAGCT
CTCTGTCTTGGTTAATGGTTCTCCAGAAGGATATTTCTCATGTTAGGCGGTGTGAGACAG
GGGGATCCTTTATCCCCCGTTGTTATTTTGTATTGCGGAAGATGTCTTATCACGGGGTCT
TACCGGGCTTAATCACCTGGGCATTCTTTCTTCAATTACCGAGACCTGGACATACAAAGA
TCTAGGCAGCTCATCTTCTTCTAACGAAGTCAGATCTTTTTCCATACCATAACGTATATA
GAATCGATTTTCTTTTCTGATCGCTAGCCTGCCGGGCCGCCCCCGCGATCAAACTATCAA
TCTCATAAGAGAAGAAATCTCTATGCCCCCTGTTCTTGGTTTTCTCCCATGCTTTTGTTG
GTCAACAACCAACCACAACTTTCTATAGTTCTTCACTACTC

QA 1 581 1 581
DS 

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CAAACTATCAATCTCATAAGAGAAGAAATCTCTATGCCCCCTGTTCTTGGTTTTCTCCCA
TGCTTTTGTTGGTCAACAACCAACCACAACTTTCTATAGTTCTTCACTACTCCTAGAGGC
TTGACGGAGTGAAGCTGTCTGGAGGGAATCATTTTGTTGAAATCAATTAATCTAATCATG
CCTCAACTGGATAAATTCACTTATTTTTCACAATTCTTCTGGTTATGCCTTTTCTTCTTT
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AAACTACGGAACCAACTGCTTTCACACCGGGGGAAGACCATCCAGAGCAAGGACCCCAAC
AGTTTGGAAGATCTCTTGAGAAAAGGTTTTAGCACTGGTGTATCCTATATGTATGCTAGT
TTATTCGAAGTATCCCAATGGTGTAAGGCCGTCGACTTATTGGGAAAAAGGAGGAAAATC
ACTTTGATCTCTTGTTTCGGAGAAATAAGTGGCTCACGAGGAATGG

QA 1 586 1 586
DS 



AS 1 6

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CATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATCAGTCGACGGTACCGGACATATGCC
CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGAGGCTCGTTGTCGGGTGGCAATGGCTGGCGTGATGA
A***ATTGAAGAACTTAGACGCTTACCCTAAGATCAACGACGACTTCTACAGCCGCACAC
TCTCCGGCGGCTTGATCACACTAGCTTCTTCCGTCGTCATGCTCATCCTCTTCATCTCCG
AGCTTCGACTTTATCTCCATCCCATTACTGAGTCTCAGCTCCGTGTTGACACATCAAGAG
GAGAGAAGCTACGCATCAATTTCGATGTGACTTTCCCTGCTCTTGCTTGCTCGATTGTTA
GCCTTGATTCTATGGATATTAGCGGAGAGCAGCATCTAGATGTGAGGCATGATATATCTA
AAAGAAGGTTAGATTCTTATGGTAATGTTATTGAGACAAGACAAGATGGGATCGGTCACA
CAAAGATTGAAAACCCATTGCAAAAACATGGTGGCAGGCTAGGGCATAATGAAACATATT
GTGGTTCCTGTTATGGAGCTGAAGCTTCAGATGATGAGTGTTGCAACTCATGTGAGGAAG
TTCGTGAAGCTTATAGAAAGAAAGGTTGGGCCATGACAGACCCTGAGATCATTGACCAGT
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TTGGTTTCTTGGAAGTTAATAAAGTGGCTGGCAGTTTTCATTTCGTCCCCGGGAAAACCT
TCCGTCAATCAGGCTTTCATCTACAAGATCTGTTAGTGCTCCAGGGAGACACTTACAATA
TAAGCCACAAGGTTAACAGGCTGACCTTCGGTGATCATTTCCCTGGTTTAGTGAATCCCT
TAGATGGTGTGCAGTGGACTCAAGAGACATTGAATGGCATGTATCAGTATTTTATCAAGG
TTGTACCTACTGAATACACGGATGTTAAAGGCCATGTTATTCAGTCAAACCAGTTCTCTG
TGACTGAGCATTTCGAGAAAACGGAAGCTGGACGCACACAGTCACTGCCTGGTGTTTTCT
TTTTCTATGATCTTTCTCCAATTAAGGTGATTTTCACAGAGCAGCATGTGGAGTTCTTGC
ACTTCCTCACTAATGTTTGCGCTATAGTAGGAGGCATTTTCACGGTTTCCGGAATCATTG
ATTCATTTGTATATCATGGACAACGGGCGATAAAGAAAAAGATGGAGATTGGTAAATTCG
GCTGAGTTAATACAAAACCATTTGTATCAGGAACAAGAGGAGCAGCTCAAGAAAGCTCAA
GTTTATAATTGTTGTAAGTTTAATTTTTGAATAGAGTTGCAGAAACTAGTACTCTTTGTC
TCT*TTTTTTCATTCAAACTCATGATTACCAC


BQ
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AF RS1D205TF U 82
AF RS1A390TF U 1
AF RS1A390TV U 37
AF RS1A390TR C 553
AF RS1A390JQ C 647
AF RS1A337TF U 879
BS 1 788 RS1A390TF
BS 789 878 RS1A390TR
BS 879 887 RS1A337TF
BS 888 888 RS1A390TR
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RD RS1D205TF 584 0 0
GGAAGC
CTCGTTGTCGGGTGGCAATGGCTGGCGTGATGAACAGATTGAAGAACTTAGACGCTTACC
CTAAGATCAACGACGACTTCTACAACCGCACACTCTCTGGCGGCTTGATCACACTAGCTT
CTTCCGTCGTCATGCTCATCCTCTTCTTCTCCGAGCTTCGTCTTTATCTCCATCCCATTA
CTGAGTCTCAGCTCCGTTTTGACACATCAAGAGGAGAGAAGCTACGCATCAATTTCGATG
TGACTTTCCCTGCTCTTGCTTGCTCGATTGTTAGCCTTGATTCTATGGATATTAGCGGAG
AGCAGCATCTAGATGTGAGGCATGATATATCTAAAAGAAGGTTAGATTCTTATGGGAATG
TTATTGAGACAAGACAAGATGGGATCGGTCACACAAAGATTGAAAACCCATTGCAAAAAC
ATGGTGGCAGGCTAGAGCATAATGAAACATATTGTGGTTCCTGTTATGGAGCTGAAGCTT
CAGATGATGAGTGTTGTAACTCATGTGAGGAAGTTCGTGAAGCTTATAGAAAGAAAGGTT
GGGCCATGACAGACCCTGAGATCATTGACCAGTGTAAA

QA 7 584 7 584
DS 

RD RS1A390TF 788 0 0
CATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATCAGTCGACGGTACCGGACATATGCC
CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGAGGCTCGTTGTCGGGTGGCAATGGCTGGCGTGATGA
A***ATTGAAGAACTTAGACGCTTACCCTAAGATCAACGACGACTTCTACAGCCGCACAC
TCTCCGGCGGCTTGATCACACTAGCTTCTTCCGTCGTCATGCTCATCCTCTTCATCTCCG
AGCTTCGACTTTATCTCCATCCCATTACTGAGTCTCAGCTCCGTGTTGACACATCAAGAG
GAGAGAAGCTACGCATCAATTTCGATGTGACTTTCCCTGCTCTTGCTTGCTCGATTGTTA
GCCTTGATTCTATGGATATTAGCGGAGAGCAGCATCTAGATGTGAGGCATGATATATCTA
AAAGAAGGTTAGATTCTTATGGTAATGTTATTGAGACAAGACAAGATGGGATCGGTCACA
CAAAGATTGAAAACCCATTGCAAAAACATGGTGGCAGGCTAGGGCATAATGAAACATATT
GTGGTTCCTGTTATGGAGCTGAAGCTTCAGATGATGAGTGTTGCAACTCATGTGAGGAAG
TTCGTGAAGCTTATAGAAAGAAAGGTTGGGCCATGACAGACCCTGAGATCATTGACCAGT
GTAAAAGAGAAGGTTATGTGCAAAGGGTTAAGGAGGAGGAAGGTGAAGGTTGTAATATAT
TTGGTTTCTTGGAAGTTAATAAAGTGGCTGGCAGTTTTCATTTCGTCCCCGGGAAAACCT
TCCGTCAA

QA 1 788 1 788
DS 

RD RS1A390TV 752 0 0
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GGGTGGCAATGGCTGGCGTGATGAA***ATTGAAGAACTTAGACGCTTACCCTAAGATCA
ACGACGACTTCTACAGCCGCACACTCTCCGGCGGCTTGATCACACTAGCTTCTTCCGTCG
TCATGCTCATCCTCTTCATCTCCGAGCTTCGACTTTATCTCCATCCCATTACTGAGTCTC
AGCTCCGTGTTGACACATCAAGAGGAGAGAAGCTACGCATCAATTTCGATGTGACTTTCC
CTGCTCTTGCTTGCTCGATTGTTAGCCTTGATTCTATGGATATTAGCGGAGAGCAGCATC
TAGATGTGAGGCATGATATATCTAAAAGAAGGTTAGATTCTTATGGTAATGTTATTGAGA
CAAGACAAGATGGGATCGGTCACACAAAGATTGAAAACCCATTGCAAAAACATGGTGGCA
GGCTAGGGCATAATGAAACATATTGTGGTTCCTGTTATGGAGCTGAAGCTTCAGATGATG
AGTGTTGCAACTCATGTGAGGAAGTTCGTGAAGCTTATAGAAAGAAAGGTTGGGCCATGA
CAGACCCTGAGATCATTGACCAGTGTAAAAGAGAAGGTTATGTGCAAAGGGTTAAGGAGG
AGGAAGGTGAAGGTTGTAATATATTTGGTTTCTTGGAAGTTAATAAAGTGGCTGGCAGTT
TTCATTTCGTCCCCGGGAAAACCTTCCGTCAA

QA 1 752 1 752
DS 

RD RS1A390TR 860 0 0
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ATAGAAAGAAAGGTTGGGCCATGACAGACCCTGAGATCATTGACCAGTGTAAAAGAGAAG
GTTATGTGCAAAGGGTTAAGGAGGAGGAAGGTGAAGGTTGTAATATATTTGGTTTCTTGG
AAGTTAATAAAGTGGCTGGCAGTTTTCATTTCGTCCCCGGGAAAACCTTCCGTCAATCAG
GCTTTCATCTACAAGATCTGTTAGTGCTCCAGGGAGACACTTACAATATAAGCCACAAGG
TTAACAGGCTGACCTTCGGTGATCATTTCCCTGGTTTAGTGAATCCCTTAGATGGTGTGC
AGTGGACTCAAGAGACATTGAATGGCATGTATCAGTATTTTATCAAGGTTGTACCTACTG
AATACACGGATGTTAAAGGCCATGTTATTCAGTCAAACCAGTTCTCTGTGACTGAGCATT
TCGAGAAAACGGAAGCTGGACGCACACAGTCACTGCCTGGTGTTTTCTTTTTCTATGATC
TTTCTCCAATTAAGGTGATTTTCACAGAGCAGCATGTGGAGTTCTTGCACTTCCTCACTA
ATGTTTGCGCTATAGTAGGAGGCATTTTCACGGTTTCCGGAATCATTGATTCATTTGTAT
ATCATGGACAACGGGCGATAAAGAAAAAGATGGAGATTGGTAAATTCGGCTGAGTTAATA
CAAAACCATTTGTATCAGGAACAAGAGGAGCAGCTCAAGAAAGCTCAAGTTTATAATTGT
TGTAAGTTTAATTTTTGAATAGAGTTGCAGAAACTAGTACTCTTTGTCTCT*TTTTTTCA
TTCAAACTCATGATTACCAC

QA 1 860 1 860
DS 

RD RS1A390JQ 766 0 0
GATCATTGACCAGTGTAAAAGAGAAGGTTATGTGCAAAGGGTTAAGGAGGAGGAAGGTGA
AGGTTGTAATATATTTGGTTTCTTGGAAGTTAATAAAGTGGCTGGCAGTTTTCATTTCGT
CCCCGGGAAAACCTTCCGTCAATCAGGCTTTCATCTACAAGATCTGTTAGTGCTCCAGGG
AGACACTTACAATATAAGCCACAAGGTTAACAGGCTGACCTTCGGTGATCATTTCCCTGG
TTTAGTGAATCCCTTAGATGGTGTGCAGTGGACTCAAGAGACATTGAATGGCATGTATCA
GTATTTTATCAAGGTTGTACCTACTGAATACACGGATGTTAAAGGCCATGTTATTCAGTC
AAACCAGTTCTCTGTGACTGAGCATTTCGAGAAAACGGAAGCTGGACGCACACAGTCACT
GCCTGGTGTTTTCTTTTTCTATGATCTTTCTCCAATTAAGGTGATTTTCACAGAGCAGCA
TGTGGAGTTCTTGCACTTCCTCACTAATGTTTGCGCTATAGTAGGAGGCATTTTCACGGT
TTCCGGAATCATTGATTCATTTGTATATCATGGACAACGGGCGATAAAGAAAAAGATGGA
GATTGGTAAATTCGGCTGAGTTAATACAAAACCATTTGTATCAGGAACAAGAGGAGCAGC
TCAAGAAAGCTCAAGTTTATAATTGTTGTAAGTTTAATTTTTGAATAGAGTTGCAGAAAC
TAGTACTCTTTGTCTCT*TTTTTTCATTCAAACTCATGATTACCAC

QA 1 766 1 766
DS 

RD RS1A337TF 534 0 0
TTCCCTGGTGTAGTGAATCCCTTAGATGGTGTGCAGTGGACTCAAGAGACATTGAATGGC
ATGTATCAGTATTTTATCAAGGTTGTACCTACTGAATACACAGATGTTAAAGGCCATGTT
ATTCAGTCAAACCAGTTCTCTGTGACTGAGCATTTCGAGAAAACGGAAGCTGGACGCACA
CAGTCACTGCCTGGTGTTTTCTTTTTCTATGATCTTTCTCCAATTAAGGTGATTTTCACA
GAGCAGCATGTGGAGTTCTTGCACTTCCTCACTAATGTTTGCGCTATAGTAGGAGGCATT
TTCACGGTTTCCGGAATCATTGATTCATTTGTATATCATGGACAACGGGCGATAAAGAAA
AAGATGGAGATTGGTAAATTCGGCTGAGTTAATACAAAACCATTTGTATCAGGAACAAGA
GGAGCAGCTCAAGAAAGCTCAAGTTTATAATTGTTGTAAGTTTAATTTTTGAATAGAGTT
GCAGAAACTAGTACTCTTTGTCTCTCTTTTTTCATTCAA*CTCATGATTACCAC

QA 1 534 1 534
DS 



AS 2 5

CO CL794Contig1 843 2 14 U
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AGCAATTACACTTTTCGTCACTGGCCCATTTTTAGATGGCCTCCTAACCAACCAGAATGT
GTTTGCTTTCAAGTACACTTCTCAAGTTGTGTTCTTCATCGTCCTGTCCTGCATGATCTC
AGTCTCTGTAAACTTCAGCACTTTTCTGGTAATTGGGAAAACGTCTCCGGTCACATATCA
GGTGCTCGGACATCTGAAAACATGCCTGGTTCGAGCATTTGGATACGTATTGCTGAAGGA
CCCATTCAACTGGCGCAACATTCTTGGCATTATGGTGGCAGTGATTGGAATGGTGGTTTA
TTCCTATTTCTGCTCAGTTGAGACTCAGCAGAAGGCAAGTGAAACATCAACCCAATTGCC
TAAGATGAAAGAGAGCGAGAAGGATCCACTAATAGCAGTTGAAAATGGAAGCGGAGTGTT
ATCAGATGGTGGTGGTGTGCAAAAGACGGCGGCTCCTGTATGGAACTCAAATAAAGATTT
TCAAGCCTAAAGCTGTGAACGTTGCTATGTTTCTTTTGTATCAGAGATCTTTCAGAAGGA
AGAAAGAAAAACTTTTCAAATTTCCTTTTGTTTGTTTGTTGTTCTCTTTTTAAAGTCGCA
TAGTAAGGGAAGTAGGGGAGACTGAAAAATCAACAGCTTTCCACACTGTAATGGAAAATG
GAAGAAAGTAGGGACTAGGGAGGGAAGGGAAACACAGCTTTGATGAGATCCTTTAGCAGT
TTATTTTCAGTTTTGGATTCAGTGTTACAACTGTACTCTAAAGTTGAGGCTATGTTCATA
CAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1D423TF U 1
AF RS1B585JQ C 175
BS 1 272 RS1D423TF
BS 273 273 RS1B585JQ
BS 274 327 RS1D423TF
BS 328 328 RS1B585JQ
BS 329 339 RS1D423TF
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BS 341 354 RS1D423TF
BS 355 355 RS1B585JQ
BS 356 480 RS1D423TF
BS 481 481 RS1B585JQ
BS 482 593 RS1D423TF
BS 594 594 RS1B585JQ
BS 595 663 RS1D423TF
BS 664 843 RS1B585JQ

RD RS1D423TF 663 0 0
CATCCAGAAGAAGTTCAAAGTTTCATCTACGCAACTTCTTTATCAGTCTTGCCCCTATCA
AGCAATTACACTTTTCGTCACTGGCCCATTTTTAGATGGCCTCCTAACCAACCAGAATGT
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GGTGCTCGGACATCTGAAAACATGCCTGGTTCTAGCATTTGGATACGTATTGCTGAAGGA
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GTCAGATGGTGGTGGTGTGCAAAAGACGGCGGCTCCTGTATGGAACTCAAATAAAGATTT
TCAAGCCTAAAGCTGTGAACGTTGCTATGTTTCTTTTGTATCAGAGATCTTTCGGAAGGA
AGAAAGAAAAACTTTTCAAATTTCCTTTTGTTTGTTTGTTGTTCTCTTTTTAAAGTCGCA
TAG

QA 1 663 1 663
DS 

RD RS1B585JQ 669 0 0
CATA
TCAGTGTCTGTAAACTTCAGCACTTTTCTGGTAATTGGGAAAACGTCTCCGGTCACATAT
CAGGTGCTCGGACATCTGAAAACATGCCTGGTTCGAGCATTTGGATACGTGTTGCTGAAG
GACCCATTCAACTGGCGCAACATTCTTGGCATTATGGTGGCAGTGATTGGAATGGTGGTT
TATTCCTATTTCTGCTCGGTTGAGACTCAGCAGAAGGCAAGTGAAACATCAACCCAATTG
CCTCAGATGAAAGAGAGCGAGAAGGATCCGCTAATAGCAGTTGAAAATGGAAGCGGAGTG
TTATCAGATGGTGGTGGTGTGCAAAAGACGGCGGCTCCTGTATGGAACTCAAATAAAGAT
TTTCAAGCCTAAAGCTGTGAACGTTGCTATGTTTCTTTTGTATCAGAGATCTTTCAGAAG
GAAGAAAGAAAAACTTTTCAAATTTCCTTTTGTTTGTTTGTTGTTCTCTTTTTAAAGTCG
CATAGTAAGGGAAGTAGGGGAGACTGAAAAATCAACAGCTTTCCACACTGTAATGGAAAA
TGGAAGAAAGTAGGGACTAGGGAGGGAAGGGAAACACAGCTTTGATGAGATCCTTTAGCA
GTTTATTTTCAGTTTTGGATTCAGTGTTACAACTGTACTCTAAAGTTGAGGCTATGTTCA
TACAC

QA 5 669 5 669
DS 



CO CL794Contig2 1382 3 7 U
GGATCGAATCGAATTTGCAGAAATAGGATTCTCTCTTTTACCCCAAAAAAAATCTGAATC
TGTTCTCCGCCGTCGAAGTTTGAATTCTCTCTCGTCCTCCCTTGAGCTTCCCCTCCCCCA
GCTTCGATCCTTCTCGCATTTACGGTATACCTTATGCACAAGTGAGATCATCGTAGATCG
TGATTGAAGCGCGAGAGAAATAAATATTAAGAGAGCGAAGATGAGCGAGGGCCAGAAGTT
CCAGCTGGGAACCATCGGCGCTTTGAGTTTGTCCGTTGTATCGTCTGTGTCGATCGTGAT
CTGTAACAAGGCGCTTATTAGCACCCTTGGCTTCACCTTCGCGACTACTTTGACTAGTTG
GCATCTTCTGGTCACGTTTTGTTCCCTTCATGTGGCACTATGGATGAAGATGTTTGAACA
CAAGCCTTTTGATCCACGAGCTGTGATGGGATTTGGCATATTGAACGGGATCTCCATTGG
ACTATTGAACCTCAGCCTTGGCTTTAATTCCGTTGGCTTTTACCAGATGACAAAATTAGC
AATCATCCCCTGTACTGTTCTCTTAGAGACCCTCTTCTTCAGGAAAAAATTCAGTCGAAA
AATTCAGTTTTCATTAACCATCCTTCTCCTTGGTGTTGGAATTGCAACCGTCACAGATCT
TCAGCTTAATATGCTGGGTTCTGTCTTGTCGCTGCTGGCTGTTATCACAACTTGTGTTGC
TCAAATTATGACAAATACCATCCAGAAGAAGTTCAAAGTTTCATCCACGCAACTTCTTTA
TCAGTCTTGCCCTTATCAAGCAATTACACTTTTCGTCACTGGTCCGTTTCTGGATGGGCT
CCTAACCAATCAGAATGTGTTTGCTTTCAAGTACACTTCTCAAGTTGTGTTCTTCATCGT
CCTGTCCTGCCTCATATCAGTCTCTGTAAACTTCAGCACTTTTTTAGTGATTGGAAAAAC
GTCGCCGGTCACATATCAGGTTTTTGGACATCTTAAGACATGCCTGGTTTTAGCATTTGG
CTATGTTTTGCTGAAGGACCCATTCAACTGGCGCAACATTCTTGGTACTATGGTGGCTGT
GATTGGAATGGTTGTGTATTCCTATTTCTGCTCGGTTGAGACTCAGCAGAAGGCAAGTGA
AACGTCAACTCAGTTGCCTCAGATGAAAGAGAGCGAAAAGGATCCGCTAATAGCAGTTGA
AAATGGAAGCGGAGTGTTATCAGACGGTGGTGGTGGTGTGCAAAAGACGGCGGCTCCTGT
ATGGAACTCAAATAAAGAATATTAAGAAACATCGTTATATTTTTTTTATATATATGTCAA
CTCTCTTTTGTATCAGCATTGTCAGAGAGATTTTTTTTTTTTTAAAACTTGTTTAATTCC
CC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1DN92TF U 1
AF RS1F493TF U 1
AF RS1F493JQ C 653
BS 1 97 RS1DN92TF
BS 98 100 RS1F493TF
BS 101 746 RS1DN92TF
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TCAGTCTTGCCCTTATCAAGCA
TTACAC

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DS 

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TGTTCTCCGCCGTCGAAGTTTGAATTCTCTCTCGTCCTCCCTTGAGCTTCCCCTCCCCCA
GCTTCGATCCTTCTCGCATTTACGGTATACCTTATGCACAAGTGAGATCATCGTAGATCG
TGATTGAAGCGCGAGAGAAATAAATATTAAGAGAGCGAAGATGAGCGAGGGCCAGAAGTT
CCAGCTGGGAACCATCGGCGCTTTGAGTTTGTCCGTTGTATCGTCTGTGTCGATCGTGAT
CTGTAACAAGGCGCTTATTAGCACCCTTGGCTTCACCTTCGCGACTACTTTGACTAGTTG
GCATCTTCTGGTCACGTTTTGTTCCCTTCATGTGGCACTATGGATGAAGATGTTTGAACA
CAAGCCTTTTGATCCACGAGCTGTGATGGGATTTGGCATATTGAACGGGATCTCCATTGG
ACTATTGAACCTCAGCCTTGGCTTTAATTCCGTTGGCTTTTACCAGATGACAAAATTAGC
AATCATCCCCTGTACTGTTCTCTTAGAGACCCTCTTCTTCAGGAAAAAATTCAGTCGAAA
AATTCAGTTTTCATTAACCATCCTTCTCCTTGGTGTTGGAATTGCAACCGTCACAGATCT
TCAGCTTAATATGCTGGGTTCTGTCTTGTCGCTGCTGGCTGT*ATCACAACTTGTGTTGC
TCAAATTATGACAA*TACCATCCAGAAGAAGTTCAAAGTTTCATCCACGCA*CTTCTTTA
TCAGTCTTGCCCTTATCAAGCAAT
A

QA 1 804 1 804
DS 

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TGTGTTGCTCAAATTATGACAAATACCATCCAGAAGAAGTTCAAAGTTTCATCCACGCAA
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TTCATCGTCCTGTCCTGCCTCATATCAGTCTCTGTAAACTTCAGCACTTTTTTAGTGATT
GGAAAAACGTCGCCGGTCACATATCAGGTTTTTGGACATCTTAAGACATGCCTGGTTTTA
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GCAGTTGAAAATGGAAGCGGAGTGTTATCAGACGGTGGTGGTGGTGTGCAAAAGACGGCG
GCTCCTGTATGGAACTCAAATAAAGAATATTAAGAAACATCGTTATATTTTTTTTATATA
TATGTCAACTCTCTTTTGTATCAGCATTGTCAGAGAGATTTTTTTTTTTTTAAAACTTGT
TTAATTCCCC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 7

CO CL795Contig1 774 7 10 U
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CAAAAGGACTGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTGTACCG
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BQ
10 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 
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45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RS1AC03JQ C 1
AF RS1CH94JQ C 2
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AF RS1CH94TF U 2
AF RS1GS87JQ C 5
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BS 1 1 RS1AC03JQ
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TTCTAAACGACAGTTTAATGTTTTTGCTTAATAACATTTTAAGAATTTACTACC

QA 1 774 1 774
DS 

RD RS1CH94JQ 773 0 0
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AAAAGGACTGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTGTACCGG
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CCTGCTATGAAGGTTACCGCCTTGAGGTTTACCGAGAGAGCTAGGGCTAGAATTGAGAAA
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C

QA 1 772 1 772
DS 

RD RS1DQ76TF 596 0 0
G
ATGAGCAAAGTCAACAAAGCTCCTCTTTCCCTCTCCAAGCTCGTGGAGTTCATGAACGGC
AAGGATGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACGATAACTGATGATTTGAGAGTGCATGAG
ATTCCTGCTATGAAGGTTACCGCCTTGAGGTTTACCGAGAGAGCTAGGGCTAGAATTGAG
AAAGCTGGTGGGGAGTGTTTAACATTCGACCAGCTTGCTCTCGTTGCTCCATTGGGTCAG
AACACGGTTCTTCTTAGAGGACCAAAGAACTCTCGTGAAGCAGTGAAGCACTTTGGTCCA
GCTCCTGGTGTGCCGCACAGCCACTCCAAGCCCTATGTCAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTT
GAGAAAGCTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAGAAGCCTCTCTCTGC
TGTTTCGACGGGTGTTATTTTGTGTTATGGTTGCTTTCAGTGTAGCAATTTTGCTAGTGA
ACTCGTGTTGCTCCTCTTTGCATGTTCCAAGACATTGTTTTAAGTTATCTGTCTACTTTT
CGTTCTAAACGACAGTTTAATGTTTTTGCTTAATAACATTTTAAGAATTTACTAC

QA 2 596 2 596
DS 

RD RS1CH94TF 723 0 0
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AAAAGGACTGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTGTACCGG
TTTTTGGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTTAAGAGGCTTTTTATG
AGCAAAGTCAACAAAGCTCCTCTTTCCCTCTCCAAGCTCGTGGAGTTCATGAACGGCAAG
GATGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACGATAACTGATGATTTGAGAGTGCATGAGATT
CCTGCTATGAAGGTTACCGCCTTGAGGTTTACCGAGAGAGCTAGGGCTAGAATTGAGAAA
GCTGGTGGAGAGTGCTTAACATTCGACCAGCTTGCTCTCGTTGCTCCATTGGGTCAGAAC
ACGGTTCTTCTTAGAGGACCAAAGAACTCTCGCGAAGCAGTGAAGCACTTTGGTCCAGCT
CCTGGTGTGCCGCACAGCCACTCCAAGCCCTATGTCAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAG
AAAGCTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAGAAGCCTCTCTCTGCTGT
TTCGACGGGTGTTATTTTGTGTTATGGTTGCTTTCAGTGTAGCAATTTTGCTAGTGAACT
CGTGTTGTTCCTCTTTGCATGTTCCAAGACATTGTTTTAAGTTATCTGTCTACTTTTCGT
TCT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1GS87JQ 745 0 0
GG
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GACTGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTGTACCGGTTTTT
GGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTTAAGAGGCTTTTTATGAGCAA
AGTCAACAAAGCTCCTCTTTCCCTCTCCAAGCTCGTGGAGTTCATGAACGGCAAGGATGG
TAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACGATAACTGATGATTTGAGAGTGCATGAGATTCCTGC
TATGAAGGTTACCGCCTTGAGGTTTACCGAGAGAGCTAGGGCTAGAATTGAGAAAGCTGG
TGGAGAGTGCTTAACATTCGACCAGCTTGCTCTCGTTGCTCCATTGGGTCAGAACACGGT
TCTTCTTAGAGGACCAAAGAACTCTCGTGAAGCAGTGAAGCACTTTGGTCCAGCTCCTGG
TGTGCCGCACAGCCACTCCAAGCCCTATGTCAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAAGC
TAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAGAAGCCTCTTTCTGCTGTTTCGA
CGGGTGTTATTTTGTGTTATGGTTGCTTTCAGTGTAGCAATTTTGCTAGTGAACTCGTGT
TGTTCCTCTTTGCATGTTCCAAGACATTGTTTTAAGTTATCTGTCTACTTTTCGTTCTAA
ACGACAGTTTAATGTTTTTGCTT

QA 3 745 3 745
DS 

RD RS1GS87TF 742 0 0
GG
GACAGCACAAGCCATGGGTATCGATCTTATCGCGGGAGGTAAGAGCAAGAAGACCAAAAG
GACTGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTGTACCGGTTTTT
GGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTTAAGAGGCTTTTTATGAGCAA
AGTCAACAAAGCTCCTCTTTCCCTCTCCAAGCTCGTGGAGTTCATGAACGGCAAGGATGG
TAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACGATAACTGATGATTTGAGAGTGCATGAGATTCCTGC
TATGAAGGTTACCGCCTTGAGGTTTACCGAGAGAGCTAGGGCTAGAATTGAGAAAGCTGG
TGGAGAGTGCTTAACATTCGACCAGCTTGCTCTCGTTGCTCCATTGGGTCAGAACACGGT
TCTTCTTAGAGGACCAAAGAACTCTCGTGAAGCAGTGAAGCACTTTGGTCCAGCTCCTGG
TGTGCCGCACAGCCACTCCAAGCCCTATGTCAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAAGC
TAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAGAAGCCTCTCTCTGCTGTTTCGA
CGGGTGTTATTTTGTGTTATGGTTGCTTTCAGTGTAGCAATTTTGCTAGTGAACTCGTGT
TGTTCCTCTTTGCATGTTCCAAGACATTGTTTTAAGTTATCTGTCTACTTTTCGTTCTAA
*CGACAGTTTAATGTTTTTG

QA 3 742 3 742
DS 

RD RS1AC03TF 774 0 0
G
GGGTCGACAGCACAAGCCATGGGTATCGATCTTATCGCGGGAGGTAAGAGCAAGAAGACC
AAAAGGACTGCTCCAAAGTCCGATGATGTCTACCTCAAGCTTCTCGTCAAGCTGTACCGG
TTTTTGGTAAGGAGAACCGGAAGCAAGTTCGATGCTGTGATCCTTAAGAGGCTTTTTATG
AGCAAAGTCAACAAAGCTCCTCTTTCCCTCTCCAAGCTCGTGGAGTTCATGAACGGCAAG
GATGGTAAGATTGCTGTGTTGGTTGGGACGATAACTGATGATTTGAGAGTGCATGAGATT
CCT*CTATGAAGGTTACCGCCTTGAGGTTTACCGAGAGAGCTAGGGCTAGAATTGAGAAA
GCTGGTGGAGAGTGCTTAACATTCGACCAGCTTGCTCTCGTTGCTCCATTGGGTCAGAAC
ACGGTTCTTCTTAGAGGACCAAATAACTCTCGTGAAGCAGTGAAGCACTTTGGTCCAGCT
CCTGGTGTGCCGCACAGCCACTCCAAGCCCTATGTCAGGTCTAAGGGAAGGAAGTTTGAG
AAAGCTAGAGGAAAGCGAAAGAGTCGTGGATTCAAGGTCTAAGAAGCCTCTCTCTGCTGT
TTCGACGGGTGTTATTTTGTGTTATGGTTGCTTTCAGTGTAGCAATTTTGCTAGTGAACT
CGTGTTGTTCCTCTTTGCATGTTCCAAGACATTGTTTAAAGTTATCTGTCTACTTTTCGT
TCTAAACGACAGTTTAATGTTTTTGCTTAATAACATTTTAAGAATTTACTAC
C

QA 2 773 2 773
DS 



AS 1 5

CO CL796Contig1 710 5 17 U
TTTTTGGTTAAATGAGAGTAATTTCATGATAAATTAATTCGAAAACAAAAGAGACGATTA
ATCATTCATATGTTCTTACAAAGTCACCGCATCATAAAAGCTAAGACAAGCATAATCCGT
ACCAAAAGACAAAACCCAAAAGCGCTCAGATCTAGAATCCTAACAAGAGATTTTCATTCA
AGAGCTAGTAAACTTAGTCACAGCCTTGGTTCCTTCAGACACGGCGTGCTTAGCAAGCTA
ACCAGGAAGAACGAGTCTAACCGCTGTCTGGATCTCGCGAGAAGTAATCGTAGGCTTCTT
GTTGTACCTAGCGAGCTTCGACGCTTCCTGAGCAAGCTTCTCGAAAATGTCGTTGATGAA
GCTGTTCATGATCCCCATGGCCTTGCTCGAGATCCCGATGTCGGGGTGGACTTGCTTGAG
CACCTTGAAGATGTAGATCTTGTACGTCTCGACGCTCTTCTTGCTGCGCTTCTTCTTCTT
GTCGGTCGCGCCGATGGAGGCTTCCTTCGGCAGCTTCTTCCCGGCCTTGGGCTTCTTCTC
CGCTGGTGCTTTCTCAGCTACCTTCTCTTCCTCCGCTGGCCTCTCTGCAGCGGCGGCCGG
TTTCTTCTCTGCTGGTTT*TTTCCTGCCTTTGGTGCCATCTTGAATCTCTCTTTCTTTGA
TTTTTCTCGGGAACGAAGAGGCGGAAGTGGAGATTTAGGTTTTGAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1G667JQ U 42
AF RS1GL92JQ U 6
AF RS1GL92TF C 1
AF RS1AY17JQ U 44
AF RS1AY17TF C 51
BS 1 5 RS1GL92TF
BS 6 41 RS1GL92JQ
BS 42 292 RS1G667JQ
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BS 493 493 RS1AY17JQ
BS 494 510 RS1GL92JQ
BS 511 511 RS1AY17JQ
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BS 556 556 RS1AY17JQ
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BS 581 581 RS1AY17JQ
BS 582 585 RS1GL92JQ
BS 586 710 RS1AY17JQ

RD RS1G667JQ 265 0 0
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TAAGACAAGCATAATCCGTACCAAAAGACAAAACCCAAAAGCGCTCAGATCTAGAATCCT
AACAAGAGATTTTCATTCAAGAGCTAGTAAACTTAGTCACAGCCTTGGTTCCTTCAGACA
CGGCGTGCTTAGCAAGCTAACCAGGAAGAACGAGTCTAACCGCTGTCTGGATCTCGCGAG
AAGTAATCGTAAGCTTCTTGTTGTA

QA 1 265 1 265
DS 

RD RS1GL92JQ 592 0 0
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TCATATGTTCTTACAAAGTCACCGCATCATAAAAGCTAAGACAAGCATAATCCGTACCAA
AAGACAAAACCCAAAAGCGCTCAGATCTAGAATCCTAACAAGAGATTTTCATTCAAGAGC
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GAAGAACGAGTCTAACCGCTGTCTGGATCTCGCGAGAAGTAATCGTAGGCTTCTTGTTGT
ACCTAGCGAGCTTCGACGCTTCCTGAGCAAGCTTCTCGAAGATGTCGTTGATGAAGCTGT
TCATGATCCCCATGGCCTTGCTCGAGATCCCGATGTCGGGGTGGACTTGCTTGAGCACCT
TGAAGATGTAGATCTTGTACGTCTCGACGCTCTTCTTGCTGCGCTTCTTCTTCTTGTCGG
TCGCGCCTATGGAGGCTTCCTTCGGTAGCTTCTTCCCGGCCTTGGGCTTCTTCTCCGCTG
GTGCTTTCTCCGCTACCTTCTCTTCCTCCGCTGGCTTCTC
CGCGGCGGGTGG

QA 1 580 1 580
DS 

RD RS1GL92TF 674 0 0
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ATCATTCATATGTTCTTACAAAGTCACCGCATCATAAAAGCTAAGACAAGCATAATCCGT
ACCAAAAGACAAAACCCAAAAGCGCTCAGATCTAGAATCCTAACAAGAGATTTTCATTCA
AGAGCTAGTAAACTTAGTCACAGCCTTGGTTCCTTCAGACACGGCGTGCTTAGCAAGCTA
ACCAGGAAGAACGAGTCTAACCGCTGTCTGGATCTCGCGAGAAGTAATCGTAGGCTTCTT
GTTGTACCTAGCGAGCTTCGACGCTTCCTGAGCAAGCTTCTCGAAGATGTCGTTGATGAA
GCTGTTCATGATCCCCATGGCCTTGCTCGAGATCCCGATGTCGGGGTGGACTTGCTTGAG
CACCTTGAAGATGTAGATCTTGTACGTCTCGACGCTCTTCTTGCTGCGCTTCTTCTTCTT
GTCGGTCGCGCCTATGGAGGCTTCCTTCGGTAGCTTCTTCCCGGCCTTGGGCTTCTTCTC
CGCTGGTGCTTTCTCCGCTACCTTCTCTTCCTCCGCTGGCTTCTCC***GCGGCGGCTGG
TTTCTTCTCCGCTGGTTTCTTTCCTGCCTTTGGTGCCATCGTGAATCTCTCTTTCTTT
ATTTGATTTTTCTCCC

QA 1 658 1 658
DS 

RD RS1AY17JQ 667 0 0
GG
CAAAAGAGACGATTAATCATTCATATGTTCTTACAAAGTCACCGCATCATAAAAGCTAAG
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AGAGATTTTCATTCAAGAGCTAGTAAACTTAGTCACAGCCTTGGTTCCTTCAGACACGGC
GTGCTTAGCAAGCTCACCAGGAAGAACGAGTCTAACAGCTGTCTGGATCTCGCGAGAAGT
AATCGTCGGCTTCTTGTTGTACCTAGCGAGCTTCGACGCTTCCTGAGCAAGCTTCTCGAA
AATGTCGTTGATGAAGCTGTTCATGATCCCCATGGCCTTGCTCGAGATCCCGATGTCGGG
GTGGACTTGCTTGAGCACCTTGAAGATGTAGATCTTGTACGTCTCGACGCTCTTCTTGCT
GCGCTTCTTCTTCTTGTCGGTCGCGCCGATGGAGGCTTCCTTCGGCAGCTTCTTCCCGGC
CTTGGGCTTCTTCTCCGCTGGTGCTTTCTCAGCTACCTTCTCTTCCTCCGCTGGCCTCTC
TGCAGCGGCGGCCGGTTTCTTCTCTGCTGGTTT*TTTCCTGCCTTTGGTGCCATCTTGAA
TCTCTCTTTCTTTGATTTTTCTCGGGAACGAAGAGGCGGAAGTGGAGATTTAGGTTTTGA
GATCC

QA 3 667 3 667
DS 

RD RS1AY17TF 660 0 0
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CATAATCCGTACCAAAAGACAAAACCCAAAAGCGCTCAGATCTAGAATCCTAACAAGAGA
TTTTCATTCAAGAGCTAGTAAACTTAGTCACAGCCTTGGTTCCTTCAGACACGGCGTGCT
TAGCAAGCTCACCAGGAAGAACGAGTCTAACAGCTGTCTGGATCTCGCGAGAAGTAATCG
TCGGCTTCTTGTTGTACCTAGCGAGCTTCGACGCTTCCTGAGCAAGCTTCTCGAAAATGT
CGTTGATGAAGCTGTTCATGATCCCCATGGCCTTGCTCGAGATCCCGATGTCGGGGTGGA
CTTGCTTGAGCACCTTGAAGATGTAGATCTTGTACGTCTCGACGCTCTTCTTGCTGCGCT
TCTTCTTCTTGTCGGTCGCGCCGATGGAGGCTTCCTTCGGCAGCTTCTTCCCGGCCTTGG
GCTTCTTCTCCGCTGGTGCTTTCTCAGCTACCTTCTCTTCCTCCGCTGGCCTCTCTGCAG
CGGCGGCCGGTTTCTTCTCTGCTGGTTT*TTTCCTGCCTTTGGTGCCATCTTGAATCTCT
CTTTCTTTGATTTTTCTCGGGAACGAAGAGGCGGAAGTGGAGATTTAGGTTTTGAGATCC

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 7

CO CL797Contig1 485 7 11 U
GGAAGGCATCCTACAATAAACACACAAAACATTTATTTGCAGTGAAAAGTTACAATGTCG
GCATCCAAATTTGCTTTATTTTTT*ATTGTTCTGGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATG
TGCCAGCCTGGAAAAAAAACCCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTG
TTGCAGCTCCAATACACACTGCCGACAAACCAAAGCGTTATGTGAGAAGATATGCATCTG
GTAGCACCTGGGGCCGCTGAATTTACAAAACATCTAAGTTTATTTTCATACAATAAAACA
AAGCATTTATTTACAGTGAAGAGTTACAATGTCGGCATCCAAATTTACTATATTTTGTAT
TGTTCTGGTTTGTTTTGCTAGTTTTCATGAATGTAAGTCATATATCGCTTACGGTCCATC
CAATCCTTTAGCATCATTACCATTAATATAATATTATTATACTATATTATCTTTTTAATT
GTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RS1CQ55JQ C 158
AF RS1CE32TF U 6
AF RS1FL46TF U 1
AF RS1AT43JQ C 6
AF RS1AT43TF U 6
AF RS1G908JQ C 11
AF RS1G908TF U 11
BS 1 123 RS1FL46TF
BS 124 124 RS1CE32TF
BS 125 247 RS1FL46TF
BS 248 248 RS1CE32TF
BS 249 376 RS1FL46TF
BS 377 377 RS1CE32TF
BS 378 428 RS1FL46TF
BS 429 429 RS1AT43TF
BS 430 461 RS1FL46TF
BS 462 462 RS1AT43TF
BS 463 485 RS1G908TF

RD RS1CQ55JQ 194 0 0
AAAACACCAAAGAATGTTTGGTGTTGCAGCTCCAATACACACTGCCGACTAACCAAAGCA
TTATGTGAGAAGATATGCATCTGGTAGCACCTGGGGCCGCTGAATTTACAAAACATCTAA
GTTTATTTTCATACAATAAAACAAGGCATTTATTTACAGTGAAGAGTTACAATGTCGGCA
TCCAAATTTACTAT

QA 1 194 1 194
DS 

RD RS1CE32TF 412 0 0
GG
ATCCTACAATAAACACACAAAACATTTATTTGCAGTGAAAAGTTACAATGTTGGCATCCA
AATTTGCTTTATTTTTTTATTGTTCTGGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCCAGC
CTGGAAAAAAA*CCCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTGTTGCAGC
TCCAATACACACTGCCGACAAACCAAAGCGTTATGTGAGAAGATATGCATCTGGTAGCAC
CTGGGGCCGCTAAATTTACAAAACATCTAAGTTTATTTTCATACAATAAAACAAAGCATT
TATTTACAGTGAAGAGTTACAATGTCGGCATCCAAATTTACTATATTTTGTATTGTTCTG
GTTTGTTTTGCTTGTTTTCATGAATGTAAGTCATATATCGCTTACGGTCC

QA 3 412 3 412
DS 

RD RS1FL46TF 461 0 0
GGAAGGCATCCTACAATAAACACACAAAACATTTATTTGCAGTGAAAAGTTACAATGTCG
GCATCCAAATTTGCTTTATTTTTT*ATTGTTCTGGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATG
TGCTAGCCTGGAAAAAAAACCCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTG
TTGCAGCTCCAATACACACTGCCGACAAACCAAAGCGTTATGTGAGAAGATATGCATCTG
GTAGCACATGGGGCCGCTGAATTTACAAAACATCTAAGTTTATTTTCATACAATAAAACA
AAGCATTTATTTACAGTGAAGAGTTACAATGTCGGCATCCAAATTTACTATATTTTGTAT
TGTTCTGGTTTGTTTTTCTAGTTTTCATGAATGTAAGTCATATATCGCTTACGGTCCATC
CAATCCTTCAGCATCATTACCATTAATATAATATTATTATA

QA 1 461 1 461
DS 

RD RS1AT43JQ 458 0 0
GG
ATCCTACAATAAACACACAAAACATTTATTTGCAGTGAAAAGTTACAATGTCGGAATCCA
AATTTGCTTTATTTTTT*ATTGTTCTGGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTACCAGC
CTGGAAAAAAAACCCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAATAATGTTTGGTGTTGCAGC
TCCAATACACACTGCCGACAAACCAAAGCGTTATGTGAGAAGATATGCATCTGGTAGCAC
CTGGGGCCGCTGAATTTACAAAACATCTAAGTTTATTTTCATACAATAAAACAAAGCATT
TATTTACAGTGAAGAGTTACAATGTCGGCATCCAAATTTACTATATTTTGTATTGTTCTG
GTTTGTTTTGCTAGTTTTCATGAATGTAAGTTATATATCGCTTACGGTCCATCCAATCCT
TTAGCATCATTACCATTAATATAATATTATTATAC
C

QA 3 457 3 457
DS 

RD RS1AT43TF 458 0 0
GG
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AATTTGCTTTATTTTTT*ATTGTTCTGGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTACCAGC
CTGGAAAAAAAACCCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAATAATGTTTGGTGTTGCAGC
TCCAATACACACTGCCGACAAACCAAAGCGTTATGTGAGAAGATATGCATCTGGTAGCAC
CTGGGGCCGCTGAATTTACAAAACATCTAAGTTTATTTTCATACAATAAAACAAAGCATT
TATTTACAGTGAAGAGTTACAATGTCGGCATCCAAATTTACTATATTTTGTATTGTTCTG
GTTTGTTTTGCTAGTTTTCATGAATGTAAGTTATATATCGCTTACGGTCCATCCAATCCT
TTAGCATCATTACCATTAATATAATATTATTATAC
C

QA 3 457 3 457
DS 

RD RS1G908JQ 475 0 0
GG
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GCTTTATTTTTT*ATTGTTCTGGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCTAGCCTGGA
AAAAAAACCCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTGTTGCAGCTCCAA
TACACACTGCCGACAAACCAAAGCATTATGTGAGAAGATATGCATCTGGTAGCACCTGGG
GCCGCTGAATTTACAAAACATCTAAGTTTATTTTCATACAATAAAACAAAGCATTTATTT
ACAGTGAAGAGTTACAATGTCGGCATCCAAATTTACTATATTTTGTATTGTTCTGGTTTG
TTTTTCTAGTTTTCATGAATGTAAGTCATATATCGCTTACGGTCCATCCAATCCTTTAGC
ATCATTACCATTAATATAATATTATTATACTATATTATCTTTTTAATTGTTTC

QA 3 475 3 475
DS 

RD RS1G908TF 475 0 0
GG
ACAATAAACACACAAAACATTTATTTGCAGTGAAAAGTTACAATGTCGGCATCCAAATTT
GCTTTATTTTTT*ATTGTTCTGGTTTGTCTTGCTAGTCTTCATGAATGTGCTAGCCTGGA
AAAAAAACCCAAAGGAACCTGCTCTAAAACACCAAAGAATGTTTGGTGTTGCAGCTCCAA
TACACACTGCCGACAAACCAAAGCATTATGTGAGAAGATATGCATCTGGTAGCACCTGGG
GCCGCTGAATTTACAAAACATCTAAGTTTATTTTCATACAATAAAACAAAGCATTTATTT
ACAGTGAAGAGTTACAATGTCGGCATCCAAATTTACTATATTTTGTATTGTTCTGGTTTG
TTTTTCTAGTTTTCATGAATGTAAGTCATATATCGCTTACGGTCCATCCAATCCTTTAGC
ATCATTACCATTAATATAATATTATTATACTATATTATCTTTTTAATTGTTTC

QA 3 475 3 475
DS 



AS 1 6

CO CL798Contig1 964 6 46 U
TATAAACGCTAAATTTATTCTTCTTTCTTTAGTCTCCTGCCTTTCCTCTCTATCTTATCC
ACTTATCATTCAGACCAAACCAGCTTCCTTAAAAGCACAAGGAAGAGATGGAGGAGATCA
TCCTAGAGGATTCAGAGATGTACGGTCCTCTTGTCACGGCGCAGTACGCACGGTTGCATC
ATCATCACCACTGCAGAGAGAATCAGTGTACCTCTGTTCTCGTCAAATACATTAAAGCCC
CTGTTCATCTTGTCTGGTCACTTGTCCGAAGATTTGATCAGCCGCAGAAATACAAACCAT
TTGTAAGCAGATGCACAGTTCATGGTCATCCTGAGATAGGTAGTCTCAGAGAAGTCAACG
TCAAATCTGGTCTTCCGGCGACAACTAGTACCGAGAGATTGGAACAGCTTGATGATGATG
AACGCATCCTCGGTATCAACATCATTGGTGGTGATCATAGACTTAAGAACTATTCTTCAA
TCTTGACTGTACATCCGGAGATGATCGATGGGAGAGCAGGGACTATGGTGATTGAATCTT
TTGTTGTGGATGTTCCTCAAGGCAACACTAAAGATGAGACTTGTTATTTCGTGGAATCAC
TCATCAAGTGTAACTTGAAGTCCTTGGCTTGTGTCTCTGAAAGATTGGCTGCTCAGGACA
TAACCACTCCCATCGCCACCACCACTTTCTGAAGCTATTCATTTAGTCTGGTCATATATG
TATAGAGA*AGCAGCATGAGTGGTCACACTGCTATTATGTTTTAAATCAGCTCCATCCAT
ATGCCATTTTGAGCATGTGGTAAAAGTTTTGATGTAATTTAGTTTCTGGTGTTTGTTGGA
CAGTATCTTTGCATTGGGTCACCCATTATAAGAACAGAGCAAAGCTGCTTAGCATGTTGT
TGGATAGTGTATTTGTATTTTATTTTTTTGTCTCTGAAATGGTGAATTTTGAGACCCTTC
TTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 10 40 15 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 

AF RS1BT85TF U 55
AF RS1ER56TF U 1
AF RS1BD76TF U 112
AF RS1BL94TF U 121
AF RS1BD76JQ C 208
AF RS1BL94JQ C 216
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BS 224 224 RS1BD76TF
BS 225 250 RS1ER56TF
BS 251 251 RS1BD76TF
BS 252 253 RS1ER56TF
BS 254 254 RS1BD76TF
BS 255 259 RS1ER56TF
BS 260 260 RS1BD76TF
BS 261 304 RS1ER56TF
BS 305 305 RS1BD76TF
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BS 338 338 RS1BD76TF
BS 339 370 RS1ER56TF
BS 371 371 RS1BD76TF
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BS 380 380 RS1BD76TF
BS 381 475 RS1ER56TF
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BS 477 515 RS1ER56TF
BS 516 516 RS1BD76TF
BS 517 562 RS1ER56TF
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BS 730 731 RS1ER56TF
BS 732 732 RS1BD76TF
BS 733 762 RS1ER56TF
BS 763 784 RS1BD76TF
BS 785 785 RS1BL94TF
BS 786 809 RS1BD76TF
BS 810 810 RS1BL94TF
BS 811 816 RS1BD76TF
BS 817 817 RS1BL94TF
BS 818 833 RS1BD76TF
BS 834 898 RS1BL94TF
BS 899 964 RS1BD76JQ

RD RS1BT85TF 598 0 0
GG
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ATCATCCTAGAGGATTCAGAGATGTACGGTCCTCTTGTCACGGCGCAGTACGCACGGTTG
CATCATCATCACCACTGCAGAGAGAATCAGTGTACCTCTGTTCTCGTTAAATACATTAAA
GCCCCTGTTCATCTAGTTTGGTCTCTTGTCCGAAGATTTGATCAGCCGCAGAAATACAAA
CCATTTGTCAGCAGATGCACAGTTCATGGTCATCCTGAGATCGGTAGTCTCAGAGAAGTC
AACGTCAAATCTGGCCTTCCGGCTACAACTAGTACCGAGAGATTGGAACAGCTTGATGAT
GATGAACGCATCCTCGGTATCAACATCATTGGTGGTGATCATAGACTTAAGAACTATTCA
TCAATCTTGACTGTACATCCGGAGATGATCGATGGGAGATCAGGGACTATGGTGATTGAA
TCTTTTGTTGTGGATGTTCCTCAAGGAAACACTAAAGATGAGACTAGTTATTTCGTGGAA
TCACTCATCAAGTGTAACTTGAAGTCCTTGGCTTATGTCTCTGAAAGATTGGCTGC

QA 3 598 3 598
DS 

RD RS1ER56TF 762 0 0
TATAAACGCTAAATTTATTCTTCTTTCTTTAGTCTCCTGCCTTTCCTCTCTATCTTATCC
ACTTATCATTCAGACCAAACCAGCTTCCTTAAAAGCACAAGGAAGAGATGGAGGAGATCA
TCCTAGAGGATTCAGAGATGTACGGTCCTCTTGTCACGGCGCAGTACGCACGGTTGCATC
ATCATCACCACTGCAGAGAGAATCAGTGTACCTCTGTTCTCGTTAAATACATTAAAGCCC
CTGTTCATCTAGTTTGGTCTCTTGTCCGAAGATTTGATCAGCCGCAGAAATACAAACCAT
TTGTCAGCAGATGCACAGTTCATGGTCATCCTGAGATCGGTAGTCTCAGAGAAGTCAACG
TCAAATCTGGCCTTCCGGCTACAACTAGTACCGAGAGATTGGAACAGCTTGATGATGATG
AACGCATCCTCGGTATCAACATCATTGGTGGTGATCATAGACTTAAGAACTATTCATCAA
TCTTGACTGTACATCCGGAGATGATCGATGGGAGATCAGGGACTATGGTGATTGAATCTT
TTGTTGTGGATGTTCCTCAAGGAAACACTAAAGATGAGACTTGTTATTTCGTGGAATCAC
TCATCAAGTGTAACTTGAAGTCCTTGGCTTGTGTCTCTGAAAGATTGGCTGCTAAGGACA
TAACCACTCCCATCGCCACCACC***TTCTGAAGCTATTCATTTAGTCTGGTCATATATA
TGTATAGAGAGTAGCATGAGTGGTCACACTGCTATTATGTTT

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1BD76TF 732 0 0
G
GGAGATCATCGTAGATGATTCAGAGATGTACGGTCCTCTTGTCACGGCGCAGTACGCACG
GTTGCATCATCATCACCACTGCAGAGAGAATCAGTGTACCTCTGTTCTCGTCAAATACAT
TAAAGCCCCTGTTCATCTTGTCTGGTCACTTGTCCGAAGATTTGATCAGCCGCAGAAATA
CAAACCATTTGTAAGCAGATGCACAGTTCATGGTCATCCTGAGATAGGTAGTCTCAGAGA
AGTCAACGTCAAATCTGGTCTTCCGGCGACAACTAGTACCGAGAGATTGGAACAGCTTGA
TGATGATGAACGCATCCTCGGTATCAACATCATTGGTGGTGATCATAGACTTAAGAACTA
TTCTTCAATCTTGACTGTACATCCGGAGATGATCGATGGGAGAGCAGGGACTATGGTGAT
TGAATCTTTTGTTGTGGATGTTCCTCAAGGCAACACTAAAGATGAGACTTGTTATTTCGT
GGAATCACTCATCAAGTGTAACTTGAAGTCCTTGGCTTGTGTCTCTGAAAGATTGGCTGC
TCAGGACATAACCACTCCCATCGCCACCACCACTTTCTGAAGCTATTCATTTAGTCTGGT
CATATATGTATAGAGA*AGCAGCATGAGTGGTCACACTGCTATTATGTTTTAAATCAGCT
CCATCCATATGC*ATTTTGAGCATGTGGTAAAAGTTT*GATGTA*TTTAGTTTCTGGTGT
T
GTGGACAGTA

QA 2 722 2 722
DS 

RD RS1BL94TF 778 0 0
GGG
TAGATGATTCAGAGATGTACGGTCCTCTTGTCACGGCGCAGTACGCACGGTTGCATCATC
ATCACCACTGCAGAGAGAATCAGTGTACCTCTGTTCTCGTCAAATACATTAAAGCCCCTG
TTCATCTTTTCTGGTCACTTGTCCGAAGATTTGATCAGCCGCAGAAATACAAACCATTTG
TAAGCAGATGCACAGTTCATGGTCATCCTGAGATAGGTAGTCTCAGAGAAGTCAACGTCA
AATCTGGTCTTCCGGCGACAACTAGTACCGAGAGATTGGAACAGCTTGATGATGATGAAC
GCATCCTCGGTATCAACATCATTGGTGGTGATCATAGACTTAAGAACTATTCTTCAATCT
TGACTGTACATCCGGAGATGATCGATGGGAGAGCAGGGACTATGGTGATTGAATCTTTTG
TTGTGGATGTTCCTCAAGGCAACACTAAAGATGAGACTTGTTATTTCGTGGAATCACTCA
TCAAGTGTAACTTGAAGTCCTTGGCTTGTGTCTCTGAAAGATTGGCTGCTCAGGACATAA
CCACTCCCATCGCCACCACCACTTTCTGAAGCTATTCATTTAGTCTGGTCATATATGTAT
AGAGA*AGCAGCATGAGTGGTCACACTGCTATTATGTTTTAAATCAGCTCCATCCATATG
CCATTTTGAGCATGTGGTAAAAGTTTTGATGTAATTTAGTTTCTGGTGTTTGTTGGACAG
TATCTTTGCATTGGGTCACCCATTATAAGAACAGAGCAAAGCTGCTTAGCATGTT

QA 4 778 4 778
DS 

RD RS1BD76JQ 757 0 0
GTACCTCTGTTCTCGTCAAATACATTAAAGCCCCTGTTCATCTTGTCTGGTCACTTGTCC
GAAGATTTGATCAGCCGCAGAAATACAAACCATTTGTAAGCAGATGCACAGTTCATGGTC
ATCCTGAGATAGGTAGTCTCAGAGAAGTCAACGTCAAATCTGGTCTTCCGGCGACAACTA
GTACCGAGAGATTGGAACAGCTTGATGATGATGAACGCATCCTCGGTATCAACATCATTG
GTGGTGATCATAGACTTAAGAACTATTCTTCAATCTTGACTGTACATCCGGAGATGATCG
ATGGGAGAGCAGGGACTATGGTGATTGAATCTTTTGTTGTGGATGTTCCTCAAGGCAACA
CTAAAGATGAGACTTGTTATTTCGTGGAATCACTCATCAAGTGTAACTTGAAGTCCTTGG
CTTGTGTCTCTGAAAGATTGGCTGCTCAGGACATAACCACTCCCATCGCCACCACCACTT
TCTGAAGCTATTCATTTAGTCTGGTCATATATGTATAGAGA*AGCAGCATGAGTGGTCAC
ACTGCTATTATGTTTTAAATCAGCTCCATCCATATGCCATTTTGAGCATGTGGTAAAAGT
TTTGATGTAATTTAGTTTCTGGTGTTTGTTGGACAGTATCTTTGCATTGGGTCACCCATT
ATAAGAACAGAGCAAAGCTGCTTAGCATGTTGTTGGATAGTGTATTTGTATTTTATTTTT
TTGTCTCTGAAATGGTGAATTTTGAGACCCTTCTTGT

QA 1 757 1 757
DS 

RD RS1BL94JQ 749 0 0
GTTCTCGTCAAATACATTAAAGCCCCTGTTCATCTTTTCTGGTCACTTGTCCGAAGATTT
GATCAGCCGCAGAAATACAAACCATTTGTAAGCAGATGCACAGTTCATGGTCATCCTGAG
ATAGGTAGTCTCAGAGAAGTCAACGTCAAATCTGGTCTTCCGGCGACAACTAGTACCGAG
AGATTGGAACAGCTTGATGATGATGAACGCATCCTCGGTATCAACATCATTGGTGGTGAT
CATAGACTTAAGAACTATTCTTCAATCTTGACTGTACATCCGGAGATGATCGATGGGAGA
GCAGGGACTATGGTGATTGAATCTTTTGTTGTGGATGTTCCTCAAGGCAACACTAAAGAT
GAGACTTGTTATTTCGTGGAATCACTCATCAAGTGTAACTTGAAGTCCTTGGCTTGTGTC
TCTGAAAGATTGGCTGCTCAGGACATAACCACTCCCATCGCCACCACCACTTTCTGAAGC
TATTCATTTAGTCTGGTCATATATGTATAGAGA*AGCAGCATGAGTGGTCACACTGCTAT
TATGTTTTAAATCAGCTCCATCCATATGCCATTTTGAGCATGTGGTAAAAGTTTTGATGT
AATTTAGTTTCTGGTGTTTGTTGGACAGTATCTTTGCATTGGGTCACCCATTATAAGAAC
AGAGCAAAGCTGCTTAGCATGTTGTTGGATAGTGTATTTGTATTTTATTTTTTTGTCTCT
GAAATGGTGAATTTTGAGACCCTTCTTGT

QA 1 749 1 749
DS 



AS 2 7

CO CL799Contig1 518 2 7 U
CGTATAAAATTTTTGCATAAAAACATCAAATGAAATGAAAAAAATTCAAAGACATCTTAT
ACATTGAAATGGATGGGAGTATTGTTTGATGGTAATAAGGAAAACAAGTCTCCATATGCA
ATATTGTGATCTACTACCATACAATAAACAACTTAATTATAGATGCATTAACAAACATGA
AAAAAAAAAAAAAACTGAAAATGTCTCACTCAAGCGAAAAAACATGTTTGATTTTCCTAG
GCGGCCCATTTTGCCTGGGGGTGGGAAGCAATAAACTCAACAGCAAGATCGATGGACTGT
ATCTTATCTGCTTCGTTATCAGGTATCTCGAATCCAAACTCTTCTCCGAGTGCCATAACC
ACCTCCACTGTGTCCAAACTATCCAACCCTAAATCATTCTGGAAGTGTGCCTTTGGTGTC
ACCTTAAAAGGCTCTACTTTCTGGAAATTTTTGACAACAAAAACAACACGATCTGTGACT
TCGGATTTGTCGAGGAACGACCCTCTGACTTCCTCGGA


BQ
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BN95JQ U 1
AF RS1FB93JQ U 53
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RD RS1BN95JQ 518 0 0
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GCATTGAAATGGATGGGAGTATTGTTTGATGGTAATAAGGAAAACAAGTCTCCATATGCA
ATATTGTGATCTACTACCATACAATAGACAACTTAATTATAGATGCATTAACAAACATGA
AAAAAAAAAAAAAACTGAAAATGTCTCACTCAAGCGAAAAAACATGTTTGATTTTCCTAG
GCGGCTCATTTTGCCTGGGGGTGGGAAGCAATAAACTCAACAGCAAGATCGATGGACTGT
ATCTTATCTGCTTCGTTATCAGGTATCTCGAATCCAAACTCTTCTCCGAGTGCCATAACC
ACCTCCACTGTGTCCAAACTATCCAACCCTAAATCATTCTGGAAGTGTGCCTTTGGTGTC
ACCTTAAAAGGCTCTACTTTCTGGAAATTTTTGACAACAAAAACAACACGATCTGTGACT
TCGGATTTGTCGAGGAACGACCCTCTGACTTCCTCGGA

QA 1 518 1 518
DS 

RD RS1FB93JQ 438 0 0
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CATATGCAATATTGTGATCTACTACCATACAATAAACAACTTAATTATAGATGCATTAAC
AAACATGAAAAAAAAAAAAAAACTGAAAATGTCTCACTCAAGCGAAAAAACATGTTTGAT
TTTCCTAGGCGGCCCATTTTGCCTGGGGGTGGGAAGCAATAAACTCAACAGCAAGATCGA
TGGACTGTATCTTATCTGCTTCGTTATCAGGTATCTCGAATCCAAACTCTTCTTCGAGTG
CCATAACCACCTCCACTGTGTCCAAACTATCCAACCCTAAATCATTCTGGAAGTGTGCCT
TTGGTGTCACCTTAAAAGGCTCTACTTTCTGGAAATTTTTGACAACAGAAACAACACGAT
CTGTGACTTCGGATTTGT

QA 1 438 1 438
DS 



CO CL799Contig2 688 5 1 U
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AGAATCAGTGTCACGCCTCCTACTCTCCGAAGCCCCAGCATCGCTTCTCATCATCGAGGC
GTAGCTCCCTTGTACGTTATTCTTGGTCGTCGTTTCTCCGAGGAAGTCAGAGGGTCGTTC
TTCGACAAATCCGAAGTCACAGATCGTGTTGTCTCTGTTGTCAAAAATTTCCAGAAAGTA
GAGCCTTCTAAGGTGACACCAAAGGCACACTTCCAGAATGATCTAGGGTTGGATAGTTTG
GACACAGTGGAGGTGGTTATGGCACTCGAAGAAGAGTTTGGATTCGAGATACCTGATAAC
GAAGCAGATAAGATACAGTCCATCGATCTTGCTGTTGAGTTTATTGCTTCCCACCCCCAG
GCAAAATGGGCCGCCTAGGAAAATCAAACATGTTTCTTCGCTTGAGTGAGACATTTTCAG
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GTAGATCACAATATTGCATATGGAGACTTGTCTTCCTTATTACCATCAAACAATACTCCC
ATCCATTTCAATGTATAAGATGTCTCTGAATTTTCTTCATTTCATTTGATGTTTCTATGC
AAAATTTTATATGATTGATACAAAAAAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1FG92TF U 439
AF RS1FD71JQ C 124
AF RS1FB93TF U 1
AF RS1FD71TF U 337
AF RS1BN95TF U 65
BS 1 688 RS1FB93TF

RD RS1FG92TF 191 0 0
GGC
AATCAAACATGTTTCTTCGCTTGAGTGAGACATTTTCAGTTTCTTTCTTTTTCTCATGTT
TGTTAATGCATCTATAATTAAGTTGTCTATTGTATGGTAGTAGATCACAATATTGCATAT
GGAGACTTGTCTTCCTTATTACCATCAAACAATACTCCCATCCATTTCAATGTATAAGAT
GTCTCTGA

QA 4 191 4 191
DS 

RD RS1FD71JQ 499 0 0
GCTCCCTTGTACGTTATTCTTGGTCGTCGTTTCTCCGAGGAAGTCAGAGGGTCGTTTTTC
GACAAATCCGAAGTCACAGATCGTGTTGTCTCTGTTGTCAAAAATTTCCAGAAAGTAGAG
CCTTTTAAGGTGACACCAAAGGCACACTTCCAGAATGATCTAGGGTTGGATAGTTTGGAC
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GCAGATAAGATACAGTCCATCGATCTTGCTGTTGAGTTTATTGCTTCCCACCCCCAGGCA
AAATGGGCCGCCTAGGAAAATCAAACATGTTTTTTCGCTTGAGTGAGACATTTTCAGTTT
CTTTTTTTTTTTCATGTTTGTTAATGCATCTATAATTAAGTTGTCTATTGTATGGTAGTA
GATCACAATATTGCATATGGAGACTTGTCTTCCTTATTACCATCAAACAATACTCCCATC
CATTTCAATGTATAAGATG

QA 1 499 1 499
DS 

RD RS1FB93TF 688 0 0
GGGGGTTTATTTCTATTAGCAAGAGAAATGGCGTCGAGAAATGCTCTACTTCGATACCTT
AGAATCAGTGTCACGCCTCCTACTCTCCGAAGCCCCAGCATCGCTTCTCATCATCGAGGC
GTAGCTCCCTTGTACGTTATTCTTGGTCGTCGTTTCTCCGAGGAAGTCAGAGGGTCGTTC
TTCGACAAATCCGAAGTCACAGATCGTGTTGTCTCTGTTGTCAAAAATTTCCAGAAAGTA
GAGCCTTCTAAGGTGACACCAAAGGCACACTTCCAGAATGATCTAGGGTTGGATAGTTTG
GACACAGTGGAGGTGGTTATGGCACTCGAAGAAGAGTTTGGATTCGAGATACCTGATAAC
GAAGCAGATAAGATACAGTCCATCGATCTTGCTGTTGAGTTTATTGCTTCCCACCCCCAG
GCAAAATGGGCCGCCTAGGAAAATCAAACATGTTTCTTCGCTTGAGTGAGACATTTTCAG
TTTCTTTCTTTTTCTCATGTTTGTTAATGCATCTATAATTAAGTTGTCTATTGTATGGTA
GTAGATCACAATATTGCATATGGAGACTTGTCTTCCTTATTACCATCAAACAATACTCCC
ATCCATTTCAATGTATAAGATGTCTCTGAATTTTCTTCATTTCATTTGATGTTTCTATGC
AAAATTTTATATGATTGATACAAAAAAA

QA 1 688 1 688
DS 

RD RS1FD71TF 352 0 0
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GAGTTTATTGCTTCCCACCCCCAGGCAAAATGGGCCGCCTAGGAAAATCAAACATGTTTC
TTCGCTTGAGTGAGACATTTTCAGTTTCTTTCTTTTTCTCATGTTTGTTAATGCATCTAT
AATTAAGTTGTCTATTGTATGGTAGTAGATCACAATATTGCATATGGAGACTTGTCTTCC
TTATTACCATCAAACAATACTCCCATCCATTTCAATGTATAAGATGTCTCTGAATTTTCT
TCATTTCATTTGATGTTTCTATGCAAAATTTTATATGATTGATACAAAAAAA

QA 1 352 1 352
DS 

RD RS1BN95TF 610 0 0
GG
AGTGTCACGCCTCCTACTCTCCGAAGCTCCAGCATCGCTTCTCATCATCGAGGCGTAGCT
CCCTTGTACGTTATTCTTGGTCGTCGTTTCTCCGAGGAAGTCAGAGGGTCGTTCCTCGAC
AAATCCGAAGTCACAGATCGTGTTGTCTCTGTTGTCAAAAATTTCCAGAAAGTAGAGCCT
TCTAAGGTGACACCAAAGGCACACTTCCAGAATGATCTAGGGTTGGATAGTTTGGACACA
GTGGAGGTGGTTATGGCACTCGGAGAAGAGTTTGGATTCGAGATACCTGATAACGAAGCA
GATAAGATACAGTCCATCGATCTTGCTGTTGAGTTTATTGCTTCCCACCCCCAGGCAAAA
TGAGCCGCCTAGGAAAATCAAACATGTTTCTTCGCTTGAGTGAGACATTTTCAGTTTCTT
TCTTTTTCTCATGTTTGTTAATGCATCTATAATTAAGTTGTCTATTGTATGGTAGTAGAT
CACAATATTGCATATGGAGACTTGTCTTCCTTATTACCATCAAACAATACTCCCATCCAT
TTCAATGCATAAGATGTCTCTGAATTTTCTTCATTTCATTTGATGTTTCTATGCAAAA
ATTTTATACG

QA 3 600 3 600
DS 



AS 1 6

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GGTTCAATCTCCAGTAAAAGTTGATCAGACCCCTCCTGTACCTGCAGAACCCTCCAAACC
AAAGTTCAGACATGAATACTACCAGAAGCCAGAAGAAGTTGTGGTAACTGTATTTGCAAA
AGGGATACAGAAGCAGAATGTTAACATCGACTTTGGTGAACAGATTCTGAGTGTTGTGAT
TGATGTTCCTGGAGAAGAAGCTTATCATCTCCAACCGAGACTGTTTGGAAAGATAGTACC
AGAGAAGTGCAGATATGAAGTAATGTCAACCAAGATTGAGATCCGTCTAGCAAAAGCAGA
GATCATCACATGGGCCTCTCTTGAACACGGCAAAGGGCCAGCGGTTTTGCCAAA*GCCTA
ATGTCTCAACAGAGGTTTCAATGAGACCGGCTTATCCTTCTTCCAAGAGAGTTAAGGACT
GGGACAAGCTTGAAGCAGAAGTGAAGAAACAGGAGAAGGATGAGAAGCTGGAAGGAGACG
CGGCTTTGAACAAGTTCTTCCGTGAGATATATTCAAATGCTGATGAGGATATGAGGCGTG
CAATGAGCAAATCATTTGTGGAATCTAATGGGACAGTGCTCTCAACAGACTGGAAAGAGG
TTGGAGCTAAGAAGATCGAGAGCACTCCTCCTGATGGTATGGAGCTCAAGAAATGGGAGA
TCTGATCTCATGTAATATGTTTGTGCTCCTAAGGGTTTTGCTTTCTCTTCTTTACATGGA
CTTGGATTCTTTTGTATTTGCCTTAAAACTTTCATATTGTTTATACACAAACAACTGAAG
TTTTAAATTTAAATGTTCTAATTCTTTATTCATATGAGCACGTTTATAAAAGACTTTTAA
GATTGAAGAATTCAAATTACTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 15 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CC18TF U 1
AF RS1AY20TF U 22
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AF RS1CX69TF U 265
AF RS1DF77JQ C 155
AF RS1CC18JQ C 74
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CTTGGGTTCTTTTGTATTTGCCTTAAA*CTTTCATATTGTTCATACACAAA

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GG
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CCGGCTTATCCTTCTTCCAAGAGAGTTAAGGACTGGGACAAGCTTGAAGCAGAAGTGAAG
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AATGGGACAGTGCTCTCAACAGACTGGAAAGAGGTTGGAGCTAAGAAGATCGAGAGCACT
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DS 

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GG
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ACGGCAAAGGGCCAGCGGTTTTGCCAAAAGCCTAATGTCTCAACAGAGGTTTCAGTGAGA
CCGGCTTATCCTTCTTCCAAGAGAGTTAAGGACTGGGACAAGCTTGAAGCAGAAGTGAAG
AAACAGGAGAAGGATGAAAAGCTTGAAGGAGACGCGGCTTTGAACAAGTTCTTCCGTGAG
ATATATTCAAATGCTGATGAGGATATGAGGCGTGCAATGAGCAAATCATTTGTGGAATCT
AATGGGACAGTGCTCTCAACAGACTGGAAAGAGGTTGGAGCTAAGAAGATCGAGAGCACT
CCTCCTGATGGTATGGAGCTCAAGAAATGGGAGATCTGATCTCATGTAATATGTTTGTGC
TCTTAAGGGTTTTGCTTTCTCTTCTTTACATGGACTTGGATTCTTTTGTATTTGCCTTAA
AACTTTCATATTGTTTATACACAAACAACTGAAGTTTTAAATTTAA

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ATTGAGATCCGTCTAGCAAAAGCAGAGATCATCACTTGGGCCTCACTTGAACACGGAAAA
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GTTTTGCTTTCTCTTCTTTACATGGACTTGGATTCTTTTGTATTTGCCTTAAAACTTTCA
TATTGTTTATACACAAACAACTGAAGTTTTAAATTTAAATGTTCTAATTCTTTATTCATA
TGAGCACGTTTAT
T

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DS 

RD RS1CC18JQ 791 0 0
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AAATTACTTTC

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 7

CO CL801Contig1 868 7 11 U
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TGGCTTTCGAATACGTTAGCTTCGGTGTTCTTGCCATCGTCAACAATGTCTGGACATGGA
TCGCTGTCGTGACGGCAGCCGTCAGCTTCTGGAGGATGAGAGTCACCACCATTGGAGACG
ACGGCCGTCATGGATGTGGCTTGTTAGAGGAACAAACCGCCTCGAAATCTGAACAAGAAC
CACAAGAAGTAGCTGGTCCGGTTAAAGAAACGGCGGTGGCTCGAGTGGAGGAAACGGTGG
TTACAAAAACGGAGGTTTGGGAGACGTTAATATGCGATGACGGAGTGACAAAAGGGAAGA
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CCGCTGTTAACTATGGAGGTAGTTTGGGTGATTGTGAAGAGTGGTGGGAGAAGTGGGAAA
GAGTGGTGAAGATGAGAAATGGTGATGAAGATTGGTACCGTTACGTGGACTTGATGGTGA
TAAACGGAAGTGTCGTAAGATTATGGGATGACAAAAGGAGCCTGTAACGGCTGAAGGTGT
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TAAATCAAAAAAAAAAAAATAATTAGAATAAATCAGTATCAAATATTGTTGCTACCAGAA
GCGTTGTTGGTCGAACATTTGGACACAAGTATATTAACGCTTCTTAAGCCCACCAAAACT
TGACTACATATATACACTTTGGTTCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G812TF U 1
AF RS1DL88TF U 5
AF RS1F779TF U 5
AF RS1DL88JQ C 144
AF RS1BO67TF U 8
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QA 1 573 1 573
DS 

RD RS1DL88TF 720 0 0
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TTAGATAAATC

QA 6 709 6 709
DS 

RD RS1F779TF 684 0 0
GGATC
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AATACGTTAGCTTCGGTGTTCTTGCCATCGTCAACAATGTCTGGACATGGATCGCTGTCG
TGACGGCAGCCGTCAGCTTCTGGAGGATGAGAGTCACCACCATTGGAGACGACGGCCGTC
ATGGATGTGGCTTGTTAGAGGAACAAACCGCCTCGAAATCTGAACAAGAACCACAAGAAG
TAGCTGGTCCGGTTAAAGAAACGGCGGTGGCTCGAGTGGAGGAAACGGTGGTTACAAAAA
CGGAGGTTTGGGAGACGTTAATATGCGATGACGGAGTGACAAAAGGGAAGATGACTATGT
ACTACGAGGTAGACGTTGACGGAGGGAGGGGTGTTGACGGAGAGTTAACGTCCGCTGTTA
ACTATGGAGGTAGTTTGGGTGATTGTGAAGAGTGGTGGGAGAAGTGGGAAAGAGTGGTGA
AGATGAGAAATGGTGATGAAGATTGGTACCGTTACGTGGACTTGATGGTGATAAACGGAA
GTGTCGTAAGATTATGGGATGACAAAAGGAGCCTGTAACGGCTGAAGGTGTCTACTACAT
TATAGATACTTCAAAATTTGTTGGTTTTTAGTATATTATTTTTT*GGTCGATTATTTTTG
CAATTTGTAGATAATTTCT

QA 6 684 6 684
DS 

RD RS1DL88JQ 583 0 0
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TTAGAGGAACAAACCGCCTCGAAATCTGAACAAGAACCACAAGAAGTAGCTGGTCCGGTT
AAAGAAACGGCGGTGGCTCGAGTGGAGGAAACGGTGGTTACAAAAACGGAGGTTTGGGAG
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GTTGACGGAGGGAGGGGTGTTGACGGAGAGTTAACGTCCGCTGTTAACTATGGAGGTAGT
TTGGGTGATTGTGAAGAGTGGTGGGAGAAGTGGGAAAGAGTGGTGAAGATGAGAAATGGT
GATGAAGATTGGTACCGTTACGTGGACTTGATGGTGATAAACGGAAGTGTCGTAAGATTA
TGGGATGACAAAAGGAGCCTGTAACGGCTGAAGGTGTCTACTACATTATAGATACTTCAA
AATTTGTTGGTTTTAAGTATATTATTTTTT*GGTCGATTATTTTTGCAATTTGTAGATAA
TTTCTCGCAAACAAGACCAGGAGCTCTTGA
ATTAGAATAAATC

QA 1 570 1 570
DS 

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GG
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AATACGTTAGCTTCGGTGTTCTTGCCATCGTCAACAATGTCTGGGCATGGATCGCTGTCG
TGACGGCAGCCGTCAGCTTCTGGAGGATGAGAGTCACCACCATTGGAGACGACGGCCGTC
ATGGATGTGGCTTGTTAGAGGAACAAACCGCCTCGAAATCTGAACAAGAACCACAAGAAG
TAGCTGGTCCGGTTAAAGAAACGGCGGTGGCTCGAGTGGAGGAAACGGTGGTTACAAAAA
CGGAGGTTTGGGAGACGTTAATATGCGATGACGGAGTGACAAAAGGGAAGATGACTATGT
ACTACGAGGTAGACGTTGACGGAGGGAGGGGTGTTGACGGAGAGTTAACGTCCGCTGTTA
ACTATGGAGGTAGTTTGGGTGATTGTGAAGAGTGGTGGGAGAAGTGGGAAAGAGTGGTGA
AGATGAGAAATGGTGATGAAGATTGGTACCGTTACGTGGACTTGATGGTGATAAACGGAA
GTGTCGTAAGATTATGGGATGACAAAAGGAGCCTGTAACGGCTGAAGGTGTCTACTACAT
TATAGATACTTCAAAATTTGTTGGTTTTAAGTATATTATTTTTTTGGTCGATTATTTTTG
CAATTTGTAGATAATTTCTCGCAAACA*GACCAGGAGCTCTTGA*TTAGA*TAAATC
AAAAAA

QA 3 719 3 719
DS 

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ACAAACCGCCTCGAAATCTGAACAAGAACCACAAGAAGTAGCTGGTCCGGTTAAAGAAAC
GGCGGTGGCTCGAGTGGAGGAAACGGTGGTTACAAAAACGGAGGTTTGGGAGACGTTAAT
ATGCGATGACGGAGTGACAAAAGGGAAGATGACTATGTACTACGAGGTAGACGTTGACGG
AGGGAGGGGTGTTGACGGAGAGTTAACGTCCGCTGTTAACTATGGAGGTAGTTTGGGTGA
TTGTGAAGAGTGGTGGGAGAAGTGGGAAAGAGTGGTGAAGATGAGAAATGGTGATGAAGA
TTGGTACCGTTACGTGGACTTGATGGTGATAAACGGAAGTGTCGTAAGATTATGGGATGA
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GGTTTTAAGTATATTATTTTTT*GGTCGATTATTTT*GCAATTTGTAGATAATTTCTCGC
AAACAAGACCAGGAGCTCTTGAATTAGAATAAATCAAAAAAAAGAA*****TTAGAATAA
ATCAGTATCAAATATTGTTGCTACCAG

QA 1 627 1 627
DS 

RD RS1BO67JQ 735 0 0
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ATGTGGCTTGTTAGAGGAACAAACCGCCTCGAAATCTGAACAAGAACCACAAGAAGTAGC
TGGTCCGGTTAAAGAAACGGCGGTGGCTCGAGTGGAGGAAACGGTGGTTACAAAAACGGA
GGTTTGGGAGACGTTAATATGCGATGACGGAGTGACAAAAGGGAAGATGACTATGTACTA
CGAGGTAGACGTTGACGGAGGGAGGGGTGTTGACGGAGAGTTAACGTCCGCTGTTAACTA
TGGAGGTAGTTTGGGTGATTGTGAAGAGTGGTGGGAGAAGTGGGAAAGAGTGGTGAAGAT
GAGAAATGGTGATGAAGATTGGTACCGTTACGTGGACTTGATGGTGATAAACGGAAGTGT
CGTAAGATTATGGGATGACAAAAGGAGCCTGTAACGGCTGAAGGTGTCTACTACATTATA
GATACTTCAAAATTTGTTGGTTTTAAGTATATTATTTTTTTGGTCGATTATTTTTGCAAT
TTGTAGATAATTTCTCGCAAACAAGACCAGGAGCTCTTGAATTAGAATAAATCAAAAAAA
AAAAAATAATTAGAATAAATCAGTATCAAATATTGTTGCTACCAGAAGCGTTGTTGGTCG
AACATTTGGACACAAGTATATTAACGCTTCTTAAGCCCACCAAAACTTGACTACATATAT
ACACTTTGGTTCATC

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 7

CO CL802Contig1 842 7 10 U
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TCGGAAATGCCGTTCATGGTGGTCCATAAGAAAGCTACTCTCAACAGGCTCAAATCTGGC
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GTGACTCTGACTGATAAAACCTGGATTAAGAAAACTTTTGAACTTGTTAATGGAAACAAG
TCACGAACATGGGAGAGACTTGATGCAGGAGGCATCCTGTCTCATTCTTTCGAATTAGAG
GCTAAGGTTAAAGGACCCTTCTATGGCGCTCCTGCTCTGGTTACTTTCCGTATCCCCACT
AAGGCTGTTCTACAGGAAGCCTACTCAAATCCAATACTACCTCTAAACATCCTCGCTGAC
ATACCTCCAACAGACCTATTGGCCCTGGCCAAGAGGGTGCTTGCAAAATATGGATCGCCT
GTTTCAGTGATCTCCATGGTGGTTTTGTTCGTATACTTGATAGCAACACCTTCAAAGCCT
AATGCGGCAAAAGCGGGCAGCAAGAAGAAACGCTAAGTTCGTTGAATGAAGTTGAGAAAG
GTTGTTGTTTCTGTGCTTTAGTTGTGTGTTAGCAGATTAAAACACAGTTTCAAGACTTGT
AAGAATCGTAGAACACACTTTACTGATCGCGTTGCAGAGTACTTTTTTTATAAGTTATTT
TGTTCTTCGTAATAACATCGTTTTGAGAGCATAGTTATGAAGGTCTATTTTACTTTGATT
CT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 

AF RS1H649TF U 1
AF RS1EJ15TF U 1
AF RS1AL54TF U 562
AF RS1DP16JQ C 465
AF RS1DP16TF U 465
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ATACCTCCAACAGACCTATTGGCCCTGGCCAAGAGGGTGCTTGCAAAATATGGATCGCCT
GTTTCAGTGATCTCCATGGTGGTTTTGTTCGTATACTTGATAGCAACACCTTCAAAGCCT
AATGCGGCAAAAGCGGGCAGCA

QA 1 622 1 622
DS 

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TCGGAAATGCCGTTCATGGTGGTCCATAAGAAAGCTACTCTCAACAGGCTCAAATCTGGC
GCCGAGCGTGTCCTCGTCTCCTTCGACATCTACAATCAAGGATCTGCGACGGCGTATGAT
GTGACTCTGACTGATAAAACCTGGATTAAGAAAACTTTTGAACTTGTTAATGGAAACAAG
TCACGAACATGGGAGAGACTTGATGCAGGAGGCATCCTGTCTCATTCTTTCGAATTAGAG
GCTAAGGTTAAAGGACCCTTCTATGGCGCTCCTGCTCTGGTTACTTTCCGTATCCCCACT
AAGGCTGTTCTACAGGAAGCCTACTCAAATCCAATACTACCTCTAAACATCCTCGCTGAC
ATACCTCCAACAGACCTATTGGCCCTGGCCAAGAGGGTGCTTGCAAAATATGGATCGCCT
GTTTCAGTGATCTCCATGGTGGTTTTGTTCGTATACTTGATAGCAACACCTTCAAAGCCT
AATGCGGCAAAAGCGGGCAGCAAGAAGAAACGCTAAGTTCGTTGAATGAAGTTGAGAAAG
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QA 1 818 1 818
DS 

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TTTGAGAGC

QA 1 249 1 249
DS 

RD RS1DP16JQ 346 0 0
G
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AAATATGGATCGCTTGTTTCAGTGATCTCCATGGTGGTTTTGTTCGTATACTTGATAGCA
ACACCTTCAAAGCCCAATGCGGCAAAAGCGGGCAGCAAGAAGAAACGCTAAGTTCGTTGA
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QA 2 346 2 346
DS 

RD RS1DP16TF 346 0 0
G
AACATCCTCGCTGACATACCTCCAACAGACCTATTGGCCCTGGCCAAGAGGGTGCTTGCA
AAATATGGATCGCTTGTTTCAGTGATCTCCATGGTGGTTTTGTTCGTATACTTGATAGCA
ACACCTTCAAAGCCCAATGCGGCAAAAGCGGGCAGCAAGAAGAAACGCTAAGTTCGTTGA
ATGAAGTTGAGAAAGGTTGTTGTTTCTGTGCTTTAGTTGTGTGTTAGCAGATTAAAACAC
AGTTTCAAGACTTGTAAGAATCGTAGAACACACTTTACTGATCGCGTTGCAGAGTACTTT
TTTTATAAGTTATTTTGTTCTTCGTAATAACATCGTTTTGAGAGC

QA 2 346 2 346
DS 

RD RS1H649JQB 507 0 0
C
CTGTCTCATTCTTTCGAATTAGAGGCTAAGGTTAAAGGACCCTTCTATGGCGCTCCTGCT
CTGGTTACTTTCCGTATCCCCACTAAGGCTGTTCTACAGGAAGCCTACTCAAATCCAATA
CTACCTCTAAACATCCTCGCTGACATACCTCCAACAGACCTATTGGCCCTGGCCAAGAGG
GTGCTTGCAAAATATGGATCGCCTGTTTCAGTGATCTCCATGGTGGTTTTGTTCGTATAC
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ATGAAGGTCTATTTTACTTTGATTCT

QA 2 507 2 507
DS 

RD RS1EJ15JQ 506 0 0
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CTGGTTACTTCCCGTATCCCCACTAAGGCTGTTCTACAGGAAGCCTACTCAAATCCAATA
CTACCTCTAAACATCCTCGCTGACATACCTCCAACAGACCTATTGGCCCTGGCCAAGAGG
GTGCTTGCAAAATATGGATCGCCTGTTTCAGTGATCTCCATGGTGGTTTTGTTCGTATAC
TTGATAGCAACACCTTCAAAGCCTAATGCGGCAAAAGCGGGCAGCAAGAAGAAACGCTAA
GTTCGTTGAATGAAGTTGAGAAAGGTTGTTGTTTCTGTGCTTTAGTTGTGTGTTAGCAGA
TTAAAACACAGTTTCAAGACTTGTAAGAATCGTAGAACACACTTTACTGATCGCGTTGCA
GAGTACTTTTTTTATAAGTTATTTTGTTCTTCGTAATAACATCGTTTTGAGAGCATAGTT
ATGAAGGTCTATTTTACTTTGATTCT

QA 1 506 1 506
DS 



AS 1 7

CO CL803Contig1 1149 7 26 U
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CAGAAAACAATCATCAAATTCGAATAACAAACCTCCCTTTCTCTATATAATATCCGATTC
CATCCATCAGAGTGAGAAACAAAAAGAGATCACGAAATGTTTCGAGTAAGCAACTTCGTT
GTGGGTCTAGCCAACACGTTGATAATGCTAATGGGCGCATCAGCCATTGGTTATTCGATT
TACATGTTCGCTCACCAAGACGTGACCAATTGTGAAACAGCGATTCGTACACCACTTCTC
ACGACCGGTGTCGTCCTCTTCGCGGTGTCGTTGCTAGGAGTGATAGGATCTTGCTTCAAA
GAGAATCTCGCCATGGTCTCGTACTTGATCGTACTCCTTGCGGGCATTGTTGCGTTAATT
*GGTTTTTCGATATTTCTAGTCTTCGTGACTAACAAAGGAGCCGGTCGTGTGGTCTCTGG
TCGAGGCTATAGAGAGTACCAGACCATGGATTTCTCGACATGGCTTAACAGTTTCGTCGA
TGGGAAGAGATGGGTTGGTATAAGATCTTGTTTGGCTGAAGCTAGCGTTTGTGATGATTT
GAATGATGGTCCTGTTAGTCAAATCGCTGATGAGTTTTATCAGAAGAACTTGTCTCCACT
CCAGTCTGGTTGTTGTAAGCCACCGTCAGATTGCAACTTCGAGTTCAAAAACGCAACGTT
CTGGACACCACCAGCGAAAAACGAAACGGTTGTCGCGACCAATAACGGTGACTGCGGTGC
ATGGAGTAACGTGCAAACGGAGTTATGTTTCAACTGCAACGCATGCAAAGCTGGAGTGTT
GGCGAATATTAGAGAGAAGTGGAGGAACCTTTTGATTTTCAACGTTTGTCTCATCATCCT
CCTCATCACCGTCTATTCATGCGGTTGTTGTGCTCGTCGTAACAATCGTATGGTTGGGAA
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TTATCTTTTGGAGTCAGGTTTGTTTCCGACCATTCATCATGAATCTATCACATTTCACTT
TTATTTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

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G
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ACACGTTGATAATGCTAATGGGCGCATCAGCCATTGGTTATTCGATTTACATGTTCGCTC
ACCAAGACGTGACCAATTGTGAAACAGCGATTCGTACACCACTTCTCACGACCGGTGTCG
TCCTCTTCGCGGTGTCGTTGCTAGGAGTGATAGGATCTTGCTTCAAAGAGAATCTCGCCA
TGGTCTCGTACTTGATCGTACTCCTTGCGGGCATTGTTGCGTTAATT*GGTTTTTCGATA
TTTCTAGTCTTCGTGACTAACAAAGGAGCCGGTCGTGTGGTCTCTGGTCGAGGCTATAGA
GAGTACCAGACCATGGATTTCTCGACATGGCTTAACAGTTTCGTCGATGGGAGGAGATGG
GTTGGTATAAGATCTTGTTTGGCTGAAGCTAGCGTTTGTGATGATTTGAATGATGGTCCT
GTTAGTCAAATCGCTGATGAGTTTTATCAGAAG

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DS 

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CATCCATCAGAGTGAGAAACAAAAAGAGATCACGAAATGTTTCGAGTAAGCAACTTCGTT
GTGGGTCTAGCCAACACGTTGATAATGCTAATGGGCGCATCAGCCATTGGTTATTCGATT
TACATGTTCGCTCACCAAGACGTGACCAATTGTGAAACAGCGATTCGTACACCACTTCTC
ACGACCGGTGTCGTCCTCTTCGCGGTGTCGTTGCTAGGAGTGATAGGATCTTGCTTCAAA
GAGAATCTCGCCATGGTCTCGTACTTGATCGTACTCCTTGCGGGCATTGTTGCGTTAATT
*GGTTTTTCGATATTTCTAGTCTTCGTGACTAACAAAGGAGCCGGTCGTGTGGTCTCTGG
TCGAGGCTATAGAGAGTACCAGACCATGGATTTCTCGACATGGCTTAACAGTTTCGTCGA
TGGGAAGAGATGGGTTGGTATAAGATCTTGTTTGGCTGAAGCTAGCGTTTGTGATGATTT
GAATGATGGTCCTGTTAGTCAAATCGCTGATGAGTTTTATCAGAAGAACTTGTCTCCACT
CCAGTCTGGTTGTTGTAAGCCACCGTCAGAT*GCAACTTCGAGTTCAAAA*CGCAACGTT
CTGGACAC*ACCAGCGAAA

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DS 

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GG
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ACCTCCCTTTCTCTATATAATATCCGATTCCATCCATCAGAGTGAGAAACAAAAAGAGAT
CACGAAATGTTTCGAGTAAGCAACTTCGTTGTGGGTCTAGCCAACACGTTGATAATGCTA
ATGGGCGCATCAGCCATTGGTTATTCGATTTACATGTTCGCTCACCAAGACGTGACCAAT
TGTGAAACAGCGATTCGTACACCACTTCTCACGACCGGTGTCGTCCTCTTCGCGGTGTCG
TTGCTAGGAGTGATAGGATCTTGCTTCAAAGAGAATCTCGCCATGGTCTCGTACTTGATC
GTACTCCTTGCGGGCATTGTTGCGTTAATT*GGTTTTTCGATATTTCTAGTCTTCGTGAC
TAACAAAGGAGCCGGTCGTGTGGTCTCTGGTCGAGGCTATAGAGAGTACCAGACCATGGA
TTTCTCGACATGGCTTAACAGTTTCGTCGATGGGAAGAGATGGGTTGGTATAAGATCTTG
TTTGGCTGAAGCTAGCGTTTGTGATGATTTGAATGATGGTCCTGTTAGTCAAATCGCTGA
TGAGTTTTATCAGAAGAACTTGTCTCCACTCCAGTCTGGTTGTTGTAAGCCACCGTCAGA
TTGCAACTTCGAGTTCAAAA*CGCAACGTTCTGGACAC*ACCAGCGAAAA*CGAAACGGT
TGTCGCGACCAATA*CGGTGACTGCG*TGCATGGAGTA
CGTGTA

QA 3 760 3 760
DS 

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GGGCGCATCAGCCATTGGTTATTCGATTTACATGTTCGCTCACCAAGACGTGACCAATTG
TGAAACAGCGATTCGTACACCACTTCTCACGACCGGTGTCGTCCTCTTCGCGGTGTCGTT
GCTAGGAGTGATAGGATCTTGCTTCAAAGAGAATCTCGCCATGGTCTCGTACTTGATCGT
ACTCCTTGCGGGCATTGTTGCGTTAATTTGGTTTTTCGATATTTCTAGTCTTCGTGACTA
ACAAAGGAGCCGGTCGTGTGGTCTCTGGTCGAGGCTATAGAGAGTACCAGACCATGGATT
TCTCGACATGGCTTAACGGTTTCGTCGATGGGAATAGATGGGTTGGTATAAGATCTTGTT
TGGCTGAAGCTAGCGTTTGTGATGATTTGAATGATGGTCCTGTTAGTCAAATCGCTGATG
AGTTTTATCAGAAGAACTTGTCTCCACTCCAGTCTGGTTGTTGTAAGCCACCGTCAGATT
GCAACTTCGAGTTCAAAAACGCAACGTTCTGGACACCACCAGCGAAAA*CGAAACGGTTG
TCGCGACCAATAACGGTGACTGCGGTGCATGGAGTAACGTGCAAACGGAGTTATGTTTCA
*CTGCA*CGCATGCAAAGC

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DS 

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GAGAGTACCAGACCATGGATTTCTCGACATGGCTTAACAGTTTCGTCGATGGGAAGAGAT
GGGTTGGTATAAGATCTTGTTTGGCTGAAGCTAGCGTTTGTGATGATTTGAATGATGGTC
CTGTTAGTCAAATCGCTGATGAGTTTTATCAGAAGAACTTGTCTCCACTCCAGTCTGGTT
GTTGTAAGCCACCGTCAGATTGCAACTTCGAGTTCAAAAACGCAACGTTCTGGACACCAC
CAGCGAAAAACGAAACGGTTGTCGCGACCAATAACGGTGACTGCGGTGCATGGAGTAACG
TGCAAACGGAGTTATGTTTCAACTGCAACGCATGCAAAGCTGGAGTGTTGGCGAATATTA
GAGAGAAGTGGAGGAACCTTTTGATTTTCAACGTTTGTCTCATCATCCTCCTCATCACCG
TCTATTCATGCGGTTGTTGTGCTCGTCGTAACAATCGTATGGTTGGGAAAAGTGGTTTTG
CCTGATCACTCACTACTTTTTTATTTGTAACTTTTTTTTTTTGCTAAAATTTGATTTTCA
TTTGTAGCTTTTAAGTGTTATTTTTGTTTGTTGGTTTTTTT*AGTTAATTTATCTTTTGG
AG
GC

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DS 

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CGGTCGTGTGGTCTCTGGTCGAGGCTATAGAGAGTACCAGACCATGGATTTCTCGACATG
GCTTAACAGTTTCGTCGATGGGAAGAGATGGGTTGGTATAAGATCTTGTTTGGCTGAAGC
TAGCGTTTGTGATGATTTGAATGATGGTCCTGTTAGTCAAATCGCTGATGAGTTTTATCA
GAAGAACTTGTCTCCACTCCAGTCTGGTTGTTGTAAGCCACCGTCAGATTGCAACTTCGA
GTTCAAAAACGCAACGTTCTGGACACCACCAGCGAAAAACGAAACGGTTGTCGCGACCAA
TAACGGTGACTGCGGTGCATGGAGTAACGTGTAAACGGAGTTATGTTTCAACTGCAACGC
ATGCAAAGCTGGAGTGTTGGCGAATATTAGAGAGAAGTGGAGGAACCTTTTGATTTTCAA
CGTTTGTCTCATCATCCTCCTCATCCCCGTCTATTCATGCGGTTGTTGTGCTCGTCGTAA
CAATCGTATGGTTGGGAAAAGTGGTTTTGCCTGATCACTCACTACTTTTTTATTTGTAAC
TTTTTTTTTTTGCTAAAATTTGATTTTCATTTGTAGCTTTTAAGTGTTATTTTTGTTTGT
TGGTTTGTTTCAGTTAATTTATCTTTTGGAGTCAGGTTTGTTTCCGACCATTCATCATGA
ATCTATCACATTTCAC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1BY80JQ 720 0 0
GATATTTCTAGTCTTCGTGACTAACAAAGGAGCCGGTCGTGTGGTCTCTGGTCGAGGCTA
TAGAGAGTACCAGACCATGGATTTCTCGACATGGCTTAACGGTTTCGTCGATGGGAATAG
ATGGGTTGGTATAAGATCTTGTTTGGCTGAAGCTAGCGTTTGTGATGATTTGAATGATGG
TCCTGTTAGTCAAATCGCTGATGAGTTTTATCAGAAGAACTTGTCTCCACTCCAGTCTGG
TTGTTGTAAGCCACCGTCAGATTGCAACTTCGAGTTCAAAAACGCAACGTTCTGGACACC
ACCAGCGAAAAACGAAACGGTTGTCGCGACCAATAACGGTGACTGCGGTGCATGGAGTAA
CGTGCAAACGGAGTTATGTTTCAACTGCAACGCATGCAAAGCTGGAGTGTTGGCGAATAT
TAGAGAGAAGTGGAGGAACCTTTTGATTTTCAACGTTTGTCTCATCATCCTCCTCATCAC
CGTCTATTCATGCGGTTGTTGTGCTCTTCGTAACAATCGTATGGTTGGGAAAAGTGGTTT
TGCCTGATCACTCACTACTTTTTTATTTGTAACTTTTTTTTTT*GCTAAAATTTGATTTT
CATTTGTAGCTTTTAAGTGTTATTTTTGTTTGTTGGTTTGTTTCAGTTAATTTATCTTTT
GGAGTCATGTTTGTTTCCGACCATTCATCATGAATCTATCACATTTCACTTTTATTTGGT

QA 1 720 1 720
DS 



AS 2 6

CO CL804Contig1 1440 4 20 U
GGCTGGGACCCCTGTTCGAGGCGATAATTAGATGCGTACCTGGCCCAAATATTGAAAAAG
ATGGTGCTCTTCAGATGCTTGCCACAAATATTGAGTATGATGAGCATAAAGGACGTATTG
CTATTGGGCGGCTACACGCAGGGGCGTTACGCAAAGGAATGGATGTCAGGGTGTGCACTT
CTGAAGATTCCTGTAGATTTGCAAGAGTGAGTGAGCTCTTTGTTTATGAGAAATTCTACA
GAGTGCCTACTGATACAGTGGAAGCTGGAGATATTTGCGCTGTATGTGGCATAGATGACA
TTCAGATTGGGGAGACTATTGCTGATAAAACACATGGGAAGCCTCTGCCTACAATCAAAG
TAGAAGAGCCAACTGTAAAAATGTCCTTCCCTGTCAACACCTCTCCTTTCTCTGGTCGTG
AGGGCAAGTATGTAACGAGCAGGAACTTGCGAGATCGTTTAAACCGTGAACTTGAAAGAA
ATCTAGCTATGAAAGTGGAAGATGGTGAGACAGCTGACACATTCATCATTAGTGGACGCG
GTACATTACACATTACCATCCTGATAGAAAACATGAGAAGAGAGGGATATGAATTTATGG
TCGGACCCCCGAAAGTTATCAACAAAAGGGTTAACGACAAATTGCTGGAGCCATATGAGG
TAGCAACTGTTGAAGTACCAGAGAATCACATGGGGCCTGTTGTTGAACTTCTTGGCAAAA
GGCGTGGACAGATGTTTGATATGCAGGGTGTTGGGTCGGAAGGAACAGTCTTTCTGCGGT
ACAAAATCCCAACACGTGGACTTCTTGGATTGAGGAATGCAATTTTGACAGCTTCTCGTG
GGACAGCTATCCTCAACACGGTATTCGACAGTTATGGACCTTGGGCTGGAGATATTAGCA
CCCGTGATCTTGGTTCGCTGGTTGCCTTTGAAGATGGAACATCAACATCGTATGCTCTAG
CAAGTGCACAAGAGAGAGGGCAAATGTTTGTAGCTGCAGGTGTGGATGTATACAAAGGTC
AGATAGTTGGGATCCACCAGAGACCTGAGGACTTGGGACTTAACATCTGCAAGAAGAAGG
CAGCAACAAACATTCGCTCCAACAAAGATGTAACAGTGGTTCTTGACACTCCCTTGACTT
ATAGCCTGGACGACTGCATTGAATACATCGAAGAGGATGAACTTGTGGAAGTTACACCTC
TTAGTATTAGGATGTGCAAGAATCCTAAAATGGCCAAGAAAGGCAGGTAAAAAAGAAAAA
CACCATTTTGCAGCTGGGTTTGGAGGAAGCTGAAAAGCTTTTTTCATTAAAAGATGAAAT
CTAGTTTCTAATGATGATTTATATAGGGCTTGTTTGATTCTTATACATAAGTCTTAAATT
CTTATGAGGGGGTTGAGTCCTCGGATGTAATCAAAATTAATGCTTTTTGGGAAGCCCCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F003TF U 1
AF RS1GJ17TF U 317
AF RS1EA02TF U 524
AF RS1GJ17JQ C 740
BS 1 376 RS1F003TF
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BS 378 575 RS1F003TF
BS 576 576 RS1GJ17TF
BS 577 601 RS1F003TF
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BS 603 611 RS1F003TF
BS 612 745 RS1GJ17TF
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ATCTAGCTATGAAAGTGGAAGATGGTGAGACAGCTGACACATTCATCATTAGTGGACGCG
GTACATTACACATTACCATCCTGATAGAAAACATGCGAAGAGAGGGATATGAATTTATGG
TGGGACCCCCG

QA 1 611 1 611
DS 

RD RS1GJ17TF 429 0 0
G
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AAAATGTCCTTCTCTGTCAACACCTCTCCTTTCTCTGGTCGTGAGGGCAAGTATGTAACG
AGCAGGAACTTGCGAGATCGTTTAAACCGTGAACTTGAAAGAAATCTAGCTATGAAAGTG
GAAGATGGTGAGACAGCTGACACATTCATCATTAGTGGACGCGGTACATTACACATTACC
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ATCAACAAAAGGGTTAACGACAAATTGCTGGAGCCATATGAGGTAGCAACTGTTGAAGTA
CCAGAGAATCACATGGGGCCTGTTGTTGAACTTCTTGGCAAAAGGCGTGGACAGATGTTT
GATATGCA

QA 2 429 2 429
DS 

RD RS1EA02TF 714 0 0
G
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GGATATGAATTTATGGTCGGACCCCCGAAAGTTATCAACAAAAGGGTTAACGACAAATTG
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GAACTTCTTGGCAAAAGGCGTGGACAGATGTTTGATATGCAGGGTGTTGGGTCGGAAGGA
ACAGTCTTTCTGCGGTACAAAATCCCAACACGTGGACTTCTTGGATTGAGGAATGCAATT
TTGACAGCTTCTCGTGGGACAGCTATCCTCAACACGGTATTCGACAGTTATGGACCTTGG
GCTGGAGATATTAGCACCCGTGATCTTGGTTCGCTGGTTGCCTTTGAAGATGGAACATCA
ACATCGTATGCTCTAGCAAGTGCACAAGAGAGAGGGCAAATGTTTGTAGCTGCAGGTGTG
GATGTATACAAAGGTCAGATAGTTGGGATCCACCAGAGACCTGGGGACTTGGGACTTAAC
ATCTGCAAGAAGAAGGCAGCAACAAACATTCGCTCCAACAAAGATGTAACAGTGGTTCTT
GGCACTCCCTTGACTTATAGTCTGGACGACTGCATTGAATACATCGAAGAGGATGAACTT
GTGGAAGTTACACCTCTTAGTATTAG*ATGTGCA*GAATCCTAAA
TGGCCAAG

QA 2 706 2 706
DS 

RD RS1GJ17JQ 701 0 0
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GGTTGCCTTTGAAGATGGAACATCAACATCGTATGCTCTAGCAAGTGCACAAGAGATAGG
GCAAATGTTTGTAGCTGCAGGTGTGGATGTATACAAAGGTCAGATAGTTGGGATCCACCA
GAGACCTGAGGACTTGGGACTTAACATCTGCAAGAAGAAGGCAGCAACAAACATTCGCTC
CAACAAAGATGTAACAGTGGTTCTTGACACTCCCTTGACTTATAGCCTGGACGACTGCAT
TGAATACATCGAAGAGGATGAACTTGTGGAAGTTACACCTCTTAGTATTAGGATGTGCAA
GAATCCTAAAATGGCCAAGAAAGGCAGGTAAAAAAGAAAAACACCATTTTGCAGCTGGGT
TTGGAGGAAGCTGAAAAGCTTTTTTCATTAAAAGATGAAATCTAGTTTCTAATGATGATT
TATATAGGGCTTGTTTGATTCTTATACATAAGTCTTAAATTCTTATGAGGGGGTTGAGTC
CTCGGATGTAATCAAAATTAATGCTTTTTGGGAAGCCCCTT

QA 1 701 1 701
DS 



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GACTTATAGTCTGGACGACTGCATTGAATACATTGAAGAGGATGAACTTGTGGAAGTTAC
ACCTCTTAGTATAAGGATGTGCAATAATCCTAAAATGGCCAAGAAAGGCAGGTAAAAAAC
AAAAACACCATTTTGCAGCTGGGTTTGGAGGAAGCTGAAAATCTTTTTTTTCACTAAAAG
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TCTTAAATTCTTATGAGGGGGTTGAGTCCTCGGATGTAATTCAAACTAATGCTTTTTGGA
AACCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G264TF U 1
AF RS1G264JQ C 176
BS 1 659 RS1G264TF
BS 660 667 RS1G264JQ

RD RS1G264TF 666 0 0
GCGGTACAAAATCCCAACACGTGGACTTCTTGGATTGAGGAATGCAATTTTGACAGCTTC
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TAGCACCCGTGATCTTGGTTCGCTGGTTGCCTTTGAAGATGGAACATCAACATCGTATGC
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GACTTATAGTCTGGACGACTGCATTGAATACATTGAAGAGGATGAACTTGTGGAAGTTAC
ACCTCTTAGTATAAGGATGTGCAATAATCCTAAAATGGCCAAGAAAGGCAGGTAAAAAAC
AAAAACACCATTTTGCAGCTGGGTTTGGAGGAAGCTGAAAATCTTTTTTTTCACTAAAAG
ATGAAATCTAGTTTCTAATGATATTTTTTATATAGGGCTTGTTTGATTCTTATACATAAG
TCTTAAATTCTTATGAGGGGGTTGAGTCCTCGGATGTAATTCAAACTAATGCTTTTTGG
AAACCCC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RS1G264JQ 492 0 0
TATGCTCTAGCAAGTGCACAAGAGAGAGGGCAAATGTTTGTAGGTGCAGGTGTGGACGTA
TACAAAGGTCAGATAGTTGGGATCCACCAGAGACCTGGGGACTTGGGACTTAACATCTGC
AAGAAGAAGGCAGCAACAAACATTCGCTCCAACAAAGATGTAACAGTGGTTCTTGACACT
CCCTTGACTTATAGTCTGGACGACTGCATTGAATACATTGAAGAGGATGAACTTGTGGAA
GTTACACCTCTTAGTATAAGGATGTGCAATAATCCTAAAATGGCCAAGAAAGGCAGGTAA
AAAACAAAAACACCATTTTGCAGCTGGGTTTGGAGGAAGCTGAAAATCTTTTTTTTCACT
AAAAGATGAAATCTAGTTTCTAATGATATTTTTTATATAGGGCTTGTTTGATTCTTATAC
ATAAGTCTTAAATTCTTATGAGGGGGTTGAGTCCTCGGATGTAATTCAAACTAATGCTTT
TTGGAAACCCCC

QA 1 492 1 492
DS 



AS 1 6

CO CL805Contig1 536 6 5 U
GGACATTACCATTCCTTTTAGATTTTAAAACCATTATCAATTCACTTCTATCATATATGA
TGAAAAAAATCCCTCAACTATCTTTTACAGTCTTGACTGTCTTAAGCATTCTTGTGCTAG
GAATGATTGCAAATGCACAGGATAAGCAAAAATCGTGTAAACAACATCAGCTCCCTGTAA
AAGATGGGGTGTGTGTTGCTTCTGAATGCCAAGCTAATTGTGTTAAGTCAGTCGGAGCTA
AAGGGAAGAGTTTGTGTTCTGGGTCAAAGGAGAAAAAATCTATGCACTGCCATTGCCTTT
GTTAACATTCTGGTTTAGTATATTGAATAAATATGATGCTCAACCATGATATCGATCTCT
GAAGTATT*TTTTTTTTAATTTCTCTCTTGTTTTTT*CTTTAATATTTTTACTGGGAGCC
TTATAATAAAGTATTGAAGTTGACATATAATTGAAGTATTGAAATTTTTGTTTTGGATTT
GTTGCATTTTTATAATAATGAATAACATAAATATGAATCAAGACACAATGGTTAGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1D513JQ U 61
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ATATCTCTTCTTTGCCTCTAATCGATTC
TGCGGGG

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CGTACGCCCGCATTTTGACTGGTTTATGAAATTTTGAAAACGTA**CATAAGGAAGATTA
TCAAATGGTTGCAACCATTTTTTATTGGGTCATGGTTTTATTAGCCTATTTGTTTGTATT
ATTAGCTCGTGGGTCATAATCATATTCTGCATCAGCTTTTGTAAATCTTCCTTTCAGTCG
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TTTCTTTTTCTTTTCAAGATATCTCTTCTTTGCCTCTAATCGATTCTGCGGTGTGTATAT
AGGAGATTCAAGTAATTGTTCCTCCCATGTTAACATCTCATCGACATCGGTCAGAATCAA
CTGCGATGGTCGACACTCATCATGAATATGAGCGTTAGGGAATAAATTTCCAACGTTGTT
ATTGGTCTCCTCCTTTGCCTTTGATTGAATCATTTGATTCGTGATGTAATCTTCACAACT
TGCATTAGCCAAAGCTTCGATGTTGTAATCTTGATGTATAACCTCGGTTGTTGTTACTTC
ATTGTGTTTCATTATTTCATCGATGAGTTGATCGGTTAGGATCAATTCTTCCCTGGATAA
ATATTCTTTT*GATCTAATACTGACTTGTCGTCATCAAAATTGTTCAGCCAAACGTTCTC
TA
TA

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DS 

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GGCACGTA
AATTTTTTTTCAATATGTATAATTGTTTGTTTAGGAAACCATTACATAAGCTATTAAAAA
TTACTAAGGAAAACAAAAATCAGATGGGGTCACGTGCCCCCGTACGTCTTCACGTACACC
CGCATTTTGACTGGTTTATGAAATTTTGAAAACGTAAACATAAGGAAAATTATCAAATGG
TTGCAACCATTTTTTATTGGGTCATGGTTTTATTAGCCTATTTGTTTGTATTATTAGCTC
GGGGGTCATAATCATATTCTGCATCAGCTTTTGTAAATCTTCCTTTCAGTCGTTTCTTCG
TATCGGCTGAAGATTTTCGAGATTCATATCTAATTTTCTTCCCAAACTTGCGTTTCTTTT
TCTTTTCAAGATATCTCTTCTTTGCCTCTAATCGATTCAACGGTGTGTATATAGGAAATT
CAAGTAATTGTTCCTCCCATGTTAACATCTCATCGACATCGGTCAAAATCAACTGCGATG
GTCGACACTCATCATGAATATGAGCGTTAGGGAATAATTTTCCAACGTTGTTATTGGTCT
CCTCCTTTGCCTTTGATTGAATCATTTGATTCGTGATGTAATCTTCACAACTTGCATTAG
CCAAAGCTTCGATGTTGTAATCTTGATGTATAACCTCGGTTGTTGTTACTTCATTGTGTT
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TTCGATCTAATACTGACTTGTCGTCATCAAAATTGTTCAGCCAAACGTTCTCTATATCTT
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DS 

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TTTTTTC
GATCTAATACTGACTTGTCGTCATCAAAATTGTTCAGCCAAACGTTCTCTATATCTTTAG
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GAAGCATTTGCCCTCGTTGATCACTAATATACTTAGTATGATTATCAAAATTTTGAAAAA
TAATAGAAGAAGAGGATGATGAGTCCCCATTTTTTGGAGGTAATGGAACAAAGGGATATC
CCCAACTGAGATCAGTTAAAGAAGATGACAAAGAGGAGGAGAAAGAATCAAGATCGAGAT
CTCGTGGAAAACTATAACCAGAATGATTATTAGGAACGTTACAAAAATGAATGCCTGAGG
TGACGTTTGCGTTTGGAACACATGTTTGGCATAGGCACAATCCTTGCTCAAGGCACTGGA
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CCATAGTCACATAGTGGTGAAACTTCCGGTCACATTGAGAACAAACACTAGCCAAATGTG
TCTTACAATAAACAATGGCTTTTCCCATGTTGCAATGGTCGCACATTGGTGGACTCATTA
TATGCATTTTTCAAAAAAAAAAAAAGAAAACAAACAAACGAACGAACGAACAAAAATTAT
TAATCTGATCTGAGATTTTCAGATTAGGATCACACACATAATAGGCTCTCC

QA 8 718 8 718
DS 



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GATTAGGCATATGATAAAATGACAATTTCAAAAGATACTATTTTCTATACGTGACATATA
CGCCACTAATGTTTTCGACTGTGGTATAACATGAATAAAGATTTAGACCCAAAACAACCC
ATAATTTTGAAATATAATCCTGTTAATGTTATATTTAGATTCAAAAGCTAAGATCCTTAA
AAACAAATCTTATTCTAAAAGTTGAAAAAATCGAAAGCAAACGGAATATCCCGATCTACA
TGCCTTGCAACCATCCACATTTACCACGTGCTAATTCACTTAGTATGATCCTGAGCACGT
TAACTATAAATTAAGAAAACACAAGCTGGGAAAAGCAGAACCTGTTATGTGTGCGATCAG
GCTGTGTGCGATCCTAATCTGAAAATCTCAGACCAGATTAATAAATTTTGTTCGTTTGTT
TGTTTTCGTTTTTTCTTTTTTTTGAAAAATGCATATAATGAGTCCACCAATGTGCGACCA
TTGCAACATGGGAAAAGCCATTGTTTATTGTAAGACACATTTGGCTAGTGTTTGTTCTCA
ATGTGACCGGAAGTTTCACCACTATGTGACTATGGATAGTCCCGATCACTCCCGGCTTCT
GTTGTGTGAAAAATGCGTTTTGCATGCCGCAGATGTCCAGTGCCTTGAACAAGGATTGTG
CCTATGCCAAACATGCGTTCCAAACGCAAACGTCACCTCAGGCATTCATTTTTGTAACGT
TCCTAATAATCATTCTGGTTATAGTTTTCCACGAGATCTCAATCTTGATTCTTTCTCCTC
CTCTTTGTCATCTTCTTTAACTGATCTCAGTTGGGGATATCCCTTTGTTCCATTACCTCC
AAAAAATGGGGACTCATCATCCTCTTCTTCTATTATTTTTCAAAATTTTGATAATCATAC
AAAGAATATTAGTGATCAACGAGGGCAAATGCTTCAGCCCGATGATATGGACAATTCTAA
GGTATATTCTTATGGTTAGTTTAGATGGGAGTGGGATTTTATTAATATGACGATAAATTT
GTGTTCTTATTTTGATGTGTCACTCTACGCAGGATTTTTCATATTCAGGCTTCGAACCTT
ACAAAACTAAAGATGTAGAGAACGTTTGGCTGAACAATTTTGATGACGACAAGTCAGTAT
TAGATCAAAAAGAATATTTATCCAGGGAAGAATTGATCCTAACCGATCAACTCATCGATG
AAATAATGAAACACAATGAAGTAACAAC


BQ
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AF RS1FM78JQ U 1
AF RS1CN60TF U 395
AF RS1FM78TF C 817
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BS 453 453 RS1CN60TF
BS 454 457 RS1FM78JQ
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RD RS1FM78JQ 457 0 0
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GATTAGGCATATGATAAAATGACAATTTCAAAAGATACTATTTTCTATACGTGACATATA
CGCCACTAATGTTTTCGACTGTGGTATAACATGAATAAAGATTTAGACCCAAAACAACCC
ATAATTTTGAAATATAATCCTGTTAATGTTATATTTAGATTCAAAAGCTAAGATCCTTAA
AAACAAATCTTATTCTAAAAGTTGAAAAAATCGAAAGCAAACGGAATATCCCGATCTACA
TGCCTTGCAACCATCCACATTTACCACGTGCTAATTCACTTAGTATGATCCTGAGCACGT
TAACTATAAATTAAGAAAACACAAGCTGGGAAAAGCAGAACCTGTTATGTGTGCGATCAG
GCTGTGTGCGATCCTAATCTGAAAATCTCAGATCAGA

QA 1 457 1 457
DS 

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GG
AGAACCTGTTATGTGTGCGATCAGGCTGTGTGCGATCCTAATCTGAAAATCTCAGACCAG
ATTAATAAATTTTGTTCGTTTGTTTGTTTTCGTTTTTTCTTTTTTTTGAAAAATGCATAT
AATGAGTCCACCAATGTGCGACCATTGCAACATGGGAAAAGCCATTGTTTATTGTAAGAC
ACATTTGGCTAGTGTTTGTTCTCAATGTGACCGGAAGTTTCACCACTATGTGACTATGGA
TAGTCCCGATCACTCCCGGCTTCTGTTGTGTGAAAAATGCGTTTTGCATGCCGCAGATGT
CCAGTGCCTTGAACAAGGATTGTGCCTATGCCAAACATGCGTTCCAAACGCAAACGTCAC
CTCAGGCATTCATTTTTGTAACGTTCCTAATAATCATTCTGGTTATAGTTTTCCACGAGA
TCTCGATCTTGATTCTTTCTCCTCCTCTTTGTCATCTTCTTTAACTGATCTCAGTTGGGG
ATATCCCTTTGTTCCATTACCTCCAAAAAATGGGGACTCATCATCCTCTTCTTCTATTAT
TTTTCAAAATTTTGATAATCATACAAAGAATATTAGTGATCAACGAGGGCAAATGCT

QA 3 599 3 599
DS 

RD RS1FM78TF 472 0 0
TCTCAATCTTGATTCTTTCTCCTCCTCTTTGTCATCTTCTTTAACTGATCTCAGTTGGGG
ATATCCCTTTGTTCCATTACCTCCAAAAAATGGGGACTCATCATCCTCTTCTTCTATTAT
TTTTCAAAATTTTGATAATCATACAAAGGATATTAGTGATCAACGAGGGCAAATGCTTCA
GCCCGATGATATGGACAATTCTAAGGTATATTCTTATGGTTAGTTTAGATGGGAGTGGGA
TTTTATTAATATGACGATAAATTTGTGTTCTTATTTTGATGTGTCACTCTACGCAGGATT
TTTCATATTCAGGCTTCGAACCTTACAAAACTAAAGATGTAGAGAACGTTTGGCTGAACA
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QA 1 472 1 472
DS 



AS 1 4

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CGAGCTCAATGCATTTCTCTGCATCCTTCAATCCTTCGGGCATTGCCCCAAGTTTTGTGT
AACATGCGGCTCGGTTGCTGTATGCTCTCGGGTCTTTTGGATTCCTTTTGATCGCTTCAG
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TAGTCTCATC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G239TF C 1
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TAGTCTCATC

QA 1 850 1 850
DS 



AS 1 5

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CAATGCAGAGGAACTCAATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1AV13TF U 34
AF RS1BI55TF U 1
AF RS1CB18TF U 734
AF RS1AV13JQ C 285
AF RS1BI55JQ C 459
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RD RS1AV13TF 617 0 0
AGG
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AAATGGCGGAAGAACCCCAGAAGACATCTTCTTCAGCGTCACAGCAGCAACCTTCTCCTT
CTGATAAGAAACCCGATGATTCTGGGATCAAGCCTCAGAATCTAGAAGGAGCTCCAATTT
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CTGGGATCTATGCGGTTCCTGTGCATCATCATCAATTTGGAGCTCTTCCCTCTAATTATC
TTATCCCTCTCACTTACAATCTTCCCGCAGCTAGACCAAACAATGAGACTGAGGCTGGGG
GAGAGAACCAAGCCCAAGCTGGGCAAGGTCAGCAGCAGCAGCAGCCTGCACAACAACAAC
AAAGGCAAGTTGTTGTACGGAGATTCGAGATCGCCTTTCAGCTTGACATATTCCTCATCC
TCAAGCTTGCTGCTGTCATCTTTCTCTTCAACCAAGATGGTTCGAGACAGAGGCTTGCTG
TCCTTGTGATTTTCGCTACCATCATTTACTTATACCAAACTGGAGCCCTTGCACCTTTTG
TCCGATGGCTCTCA

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DS 

RD RS1BI55TF 665 0 0
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TCTGCGTCGTGTATACAGTACAATCCTTTTTGATAAAAATGGCGGAAGAACCCCAGAAGA
CATCTTCTTCAGCGTCACAGCAGCAACCTTCTCCTTCTGATAAGAAACCCGATGATTCTG
GGATCAAGCCTCAGAATCTAGAAGGAGCTCCAATTTATCCGGGTCTTGTTCCCGGATTGA
ATCCAGGGCAGTACGATGAACAAAGGAACCGTGGAGCTGGGATCTATGCGGTTCCTGTGC
ATCATTATCAATTTGGAGCTCTTCCCTCTAATTATCTTATCCCTCTCACTTACAATCTTC
CCACAGCTAGACCAAACAATGAGACTGAGGCTGGGGGAGAGAACCAAGCCCAAGCTGGGC
AAGGTCAGCAGCAGCAGCAGCCTGCACAACAACAACAAAGGCAAGTTGTTGTACGGAGAT
TCGAGATCGCCTTTCAGCTTGACATATTCCTCATTCTCAAGCTTGCTGCTGTCATCTTTC
TCTTCAACCAAGATGGTTCGAGACAGAGGCTTGCTGTCCTTGTGATTTTCGCTACCATCA
TTTACTTATACCAAACTGGAGCCCTTGCACCTTTTGTCCGATGGCTCTCACAGGGTATGC
ATAGA

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DS 

RD RS1CB18TF 329 0 0
G
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TGGTGGGGAATAGTGAAAGAGATTCAGATGATAGTTTTCGGCTTCATAACTTCACTTCTC
CCTGGCTTCCATAACATAGATTAGACTCTTGTTTTCTTCTCTTATCTTCTGTCGTCTTTG
ATCTCGTATGTGAGAAAGTACAGAAAATAGTAAACTTAAGACTCGAATCTTCCAACAACT
TTAATGTATGTGAGCCACAGTTTTCATC

QA 2 329 2 329
DS 

RD RS1AV13JQ 815 0 0
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CTCACTTACAATCTTCCCGCAGCTAGACCAAACAATGAGACTGAGGCTGGGGGAGAGAAC
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GTTGTTGTACGGAGATTCGAGATCGCCTTTCAGCTTGACATATTCCTCATCCTCAAGCTT
GCTGCTGTCATCTTTCTCTTCAACCAAGATGGTTCGAGACAGAGGCTTGCTGTCCTTGTG
ATTTTCGCTACCATCATTTACTTATACCAAACTGGAGCCCTTGCACCTTTTGTCCGATGG
CTCTCACAAGGTATGCATAGAGCCGCAGTACCCCCACCTCGACCTCAACCTCAACCTCAA
CCTCCTGTTGCTGCCAGAGCTGATAATGACCCCGCTGCTGCAGTCCCACTTAACGGAGAT
GCGGTTCCCGAGGGACAAGAGAATGAAGGTGAAAACGGGAACAGCGCAAACGCAAATGAA
AATGTGGATGCAAGACAACAGGGGAATCAGTGGTGGGGAATAGTGAAAGAGATTCAGATG
ATAGTTTTCGGCTTCATAACTTCACTTCTCCCTGGCTTCCATAACATAGATTAGACTCTT
GTTTTCTTCTCTTATCTTCTGTCGTCTTTGATCTCGTATGTGAGAAAGTACAGAAAATAG
TAAACTTAAGACTCGAATCTTCCAACAACTTTAATGTATGTGAGCTACAGTTTTCATCCT
TTTGCCTTTTATTGTTCAATGCAGAGGAACTCAA
C

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DS 

RD RS1BI55JQ 643 0 0
AGGCAAGTTGTTGTACGGAGATTCGAGATCGCCTTTCAGCTTGACATATTCCTCATTCTC
AAGCTTGCTGCTGTCATCTTTCTCTTCAACCAAGATGGTTCGAGACAGAGGCTTGCTGTC
CTTGTGATTTTCGCTACCATCATTTACTTATACCAAACTGGAGCCCTTGCACCTTTTGTC
CGATGGCTCTCACAGGGTATGCATAGATCCGCAGTACCCCCACCTCGACCTCAACCTCAA
CCTCAACCTCCTGTTGCTGCCAGAGCTGATAATGACCCCGCTGCTGCAGTCCCACTTAAC
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AATGAAAATGTGGATGCAAGACAACAGGGGAATCAGTGGTGGGGAATAGTGAAAGAGATT
CAGATGATAGTTTTCGGCTTCATAACTTCACTTCTCCCTGGCTTCCATAACATAGATTAG
ACTCTTGTTTTCTTCTCTTATCTTCTGTCGTCTTTGATCTCGTATGTGAGAAAGTACAGA
AAATAGTAAACTTAAGACTCGAATCTTCCAACAACTTTAATGTATGTGAGCTACAGTTTT
CATCCTTTTGCCTTTTATTGTTCAATGCAGAGGAACTCAATAC

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 7

CO CL809Contig1 852 7 10 U
GGAGAACTGATAAAAATATCGCGGCTTATGGATACCCTACCAAGCAAAGCCGATCTTCTC
GACTCGTCTTTGACGGACAGATCCAGGATGAGGATCATTGGGCTGGCATTGGACGACCCT
CGTACTCTTCGACTCAAATTCAAAACCCGTAACGTTGGGAGAGTTTTCGTTGCGGGGTAT
GACACCAGTCTTCCACATGATGATGTCGAAGGAGCGTTGAAAAAACTCTTGTCATCATGT
GGACAGGTCACTGATATTTTTATCCGCGAAACAGATGAAGGACTCGCAAGGCGTGCTATT
GTTTATATCTTGGGAGAAGGTGCAGCAGACAAGGCGTTGCTACTTAGTGGACTTGACGTT
GGAGGATGGAAGGCCATTGTTACGCCTTATCGTTTTCCGGAATCTACAGGCCGTCGTATT
ACCGTTAATGTTACTGGATATGACAACTCGCTTAGTGAGATTGAGAGTGCAATGCGTCAA
CATTTCTCTTCATGCGGAGAGATAAGTAACTTCGAATTTTTCTCGGGTTCAGTTTATTTT
ATTGTTGAGGGAGAAGATGCCCAAGACAAGGTGACGGATCTTGATGGAAGTGAAATGGGT
GGACGCACATTACATGTTATGGTTGTTTGTGGGGCAATAACCACTGTTCACACCAAGCGT
TATTCTGCCAAGATGTTTTAAGGTGCAATGGAGGAGCCTTTCTATCTTATTACTTTCTAT
CTGGATATGTTGTAGCGTGAGTCGTTGGATGTTTAATAATATCTTTCTATGGGAACAACG
TTTTTTCATTAGAAAAAGTCGAAACATGTTTGGTTTTTCTTGTTAGTAAAACATTTTTGA
AGCATTTTTCCG


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 5 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CU79TF U 1
AF RS1EV59TF U 2
AF RS1BJ45TF U 1
AF RS1EW63TF U 101
AF RS1CU79JQ C 54
AF RS1EW63JQ C 72
AF RS1EV59JQ C 86
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RD RS1CU79TF 680 0 0
GGA
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TCTGCCAAGATGTT
CTA

QA 4 677 4 677
DS 

RD RS1EV59TF 679 0 0
GG
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TCGTCTTTGACGGACAGATCCAGGATGAGGATCATTGGGCTGGCATTGGACGACCCTCGT
ACTCTTCGACTCAAATTCAAAACCCGTAACGTTGGGAGAGTTTTCGTTGCGGGGTATGAC
ACCAGTCTTCCACATGATGATGTCGAAGGAGCGTTGAAAAAACTCTTGTCATCATGTGGA
CAGGTCACTGATATTTTTATCCGCGAAACAGATGAAGGACTCGCAAGGCGTGCTATTGTT
TATATCTTGGGAGAAGGTGCAGCAGACAAGGCGTTGCTACTTAGTGGACTTGACGTTGGA
GGATGGAAGACCATTGTTACGCCTTATCGTTTTCCGGAATCTACAGGCCGTCGTATTACC
GTTAATGTTACTGGATATGACAACTCGCTTAGTGAGATTGAGAGTGCAATGCGTCAACAT
TTCTCTTCATGCGGAGAGATAAGTAACTTCGAATTTTTCTCGGGTTCAGTTTATTTTATT
GTTGAGGGAGAAGATGCCCAAGACAAGGTGACGGATCTTGATGGAAGTGAAATGGGTGGA
CGCACATTACATGTTATGGTTGTTTGTGGGGCAATAACCACTGTTCACACCAAGCGTTAT
TCTGCCAAGATGTT
CTA

QA 3 676 3 676
DS 

RD RS1BJ45TF 724 0 0
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CGTACTCTTCGACTCAAATTCAAAACCCGTAACGTTGGGAGAGTTTTCGTTGCGGGGTAT
GACACCAGTCTTCCACATGATGATGTCGAAGGAGCGTTGAAAAAACTCTTGTCATCATGT
GGACAGGTCACTGATATTTTTATCCGCGAAACAGATGAAGGACTCGCAAGGCGTGCTATT
GTTTATATCTTGGGAGAAGGTGCAGCAGACAAGGCGTTGCTACTTAGTGGACTTGACGTT
GGAGGATGGAAGGCCATTGTTACGCCTTATCGTTTTCCGGAATCTACAGGCCGTCGTATT
ACCGTTAATGTTACTGGATATGACAACTCGCTTAGTGAGATTGAGAGTGCAATGCGTCAA
CATTTCTCTTCATGCGGAGAGATAAGTAACTTCGAATTTTTCTCGGGTTCAGTTTATTTT
ATTGTTGAGGGAGAAGATGCCCAAGACAAGGTGACGGATCTTGATGGAAGTGAAATGGGT
GGACGCACATTACATGTTATGGTTGTTTGTGGGGCAATAACCACTGTTCACACCAAGCGT
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CTGG

QA 1 724 1 724
DS 

RD RS1EW63TF 632 0 0
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AAAAACTCTTGTCATCATGTGGACAGGTCACTGATATTTTTATCCGCGAAACAGATGAAG
GACTCGCAAGGCGTGCTATTGTTTATATCTTGGGAGAAGGTGCAGCAGACAAGGCGTTGC
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AATCTACAGGCCGTCGTATTACCGTTAATGTTACTGGATATGACAACTCGCTTAGTGAGA
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TCTCGGATTCAGTTTATTTTATTGTTGAGGGAGAAGATGCCCAAGACAAGGTGACGGATC
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CCACTGTTCACACCAAGCGTTAT*CTGCCA*GATGTTCTAA*GTGCAATGGAG*AGCCTT
T*TATCTTATTACTTTCTATCTGGATATGTTG

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1CU79JQ 790 0 0
ATC
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GTATGACACCAGTCTTCCACATGATGATGTCGAAGGAGCGTTGAAAAAACTCTTGTCATC
ATGTGGACAGGTCACTGATATTTTTATCCGCGAAACAGATGAAGGACTCGCAAGGCGTGC
TATTGTTTATATCTTGGGAGAAGGTGCAGCAGACAAGGCGTTGCTACTTAGTGGACTTGA
CGTTGGAGGATGGAAGGCCATTGTTACGCCTTATCGTTTTCCGGAATCTACAGGCCGTCG
TATTACCGTTAATGTTACTGGATATGACAACTCGCTTAGTGAGATTGAGAGTGCAATGCG
TCAACATTTCTCTTCATGCGGAGAGATAAGTAACTTCGAATTTTTCTCGGGTTCAGTTTA
TTTTATTGTTGAGGGAGAAGATGCCCAAGACAAGGTGACGGATCTTGATGGAAGTGAAAT
GGGTGGACGCACATTACATGTTATGGTTGTTTGCGGGGCAATAACCACTGTTCACACCAA
GCGTTATTCTGCCAAGATGTTTTAAGGTGCAATGGAGGAGCCTTTCTATCTTATTACTTT
CTATCTGGATATGTTGTAGCGTGAGTCGTTGGATGTTTAATAATATCTTTCTATGGGAAC
AACGTTTTTTCATTAGAAAAAGTCGAAACATGTTTGGTTTTTCTTGTTAGTAAAACATTT
CTGAAGC

QA 4 790 4 790
DS 

RD RS1EW63JQ 777 0 0
GG
CGGACAGATCCAGGATGAGGATCATTGGGCTGGCATTGGACGACCCTCGTACTCTTCGAC
TCAAATTCAAAACCCGTAACGTTGGGAGGGTTTTCGTTGCGGGGTATGACACCAGTCTTC
CACATGATGATGTCGAAGGAGCGTTGAAAAAACTCTTGTCATCATGTGGACAGGTCACTG
ATATTTTTATCCGCGAAACAGATGAAGGACTCGCAAGGCGTGCTATTGTTTATATCTTGG
GAGAAGGTGCAGCAGACAAGGCGTTGCTACTTAGTGGAATTGACGTTGGAGGATGGAAGG
CCATTGTTACGCCTTATCGTTTTCCGGAATTTACAGGCCGTCGTATTACCGTTAATGTTA
CTGGATATGACAACTCGCTTAGTGAGATTGAGAGTGCAATGCGTCAACATTTCTCTTCAT
GCGGAGAGATAAGTAACTTCGAATTTTTTTCGGATTCAGTTTATTTTATTGTTGAGGGAG
AAGATGCCCAAGACAAGGTGACGGATCTTGATGGAAGTGAAATGGGTGGACGCACATTAC
ATGTTATGGTTGTTTGTGGGGCAATAACCACTGTTCACACCAAGCGTTATTCTGCCAAGA
TGTTTTAAGGTGCAATGGAGGAGCCTTTCTATCTTATTACTTTCTATCTGGATATGTTGT
AGCGTGAGTCGTTGGATGTTTAATAATATCTTTTTATGGGAACAACGTTTTTTCATTAGA
AAAAGTCGAAACGTGTTTTGTTTTTCTTGTTAGTAAAACATTTTTGAAGC
ATTTT

QA 3 772 3 772
DS 

RD RS1EV59JQ 767 0 0
GGATGAGGATCATTGGGCTGGCATTGGACGACCCTCGTACTCTTCGACTCAAATTCAAAA
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QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 6

CO CL810Contig1 1291 6 15 U
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CE94JQ U 15
AF RS1EX63JQ U 1
AF RS1CH63JQ U 62
AF RS1GT16TF C 530
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RD RS1CE94JQ 613 0 0
G
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GTCGAGTAAAAT

QA 2 613 2 613
DS 

RD RS1EX63JQ 813 0 0
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QA 1 813 1 813
DS 

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C
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GGATGGACTGCATCCCAAAAAATATACTTGGTAGGATCTTTGCATACGTTCATATCTTTA
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GTTTTCAGACCAAATTTAGATTGCAGAAGCTCGAGATTCTTGATGATTTTTGAGTTGAAG
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QA 2 721 2 721
DS 

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TTCGGTGGATTTATGGTTCACGAAATTGCCACCATAAGGTGGAAAATTTCCTTTCAAATC
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AATTAATAGACAGGAGACTGATTGACAAAAAAAAGACAGGAGACTAAAAGACTTTTCTTT
TAGTTAGAAAGTTCCTTTAGAGAGAAGGTGAAT
CC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1CH63TF 753 0 0
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TCCCATACTCATAAGAAATATCGCATTATTTATCATTTTTGCGCTCTCTAAGGGTCCGAC
CAATTTATTGAGGTGAATTTTGTAATGCAAAAAGTAAGTTGCTTGCGTCGAGAAACTCCA
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AGTTCCTTTAGAGAGAAGGTGAAT
ATGTCATCC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1CE94TF 463 0 0
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CGGTGTTAAGAAAATTATTGTTTCCTGGATCAACACTAGAATCTCCAAACACAACTATTG
TTGTTACATTGTGCTTTGCAGCTAGCTGGCGGAGGAGGTGGACGTCCAAAGCCACGACCA
AAGATGGCGGCTGCAAAGCCATCGCGGCGAAAAGAGACATAAACATAGCAAGCAACATTT
TAATTAATAGACAGGAGACTGATTGACAAAAAAAAGACAGGAGACTAAAAGACTTTTCTT
TTAGTTAGAAAGTTCCTTTAGAGAGAAGGTGAATATGTCATCC

QA 1 463 1 463
DS 



AS 1 7

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TCCAGATGCGATCCGAGCGGCTTTTGCTGAGTTTTTCTCCATGGTTATATTCGTTTTCGC
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CGGTCTAGTGGCCGCGTCTTTGTCACATGCGTTTGCATTGTTCGTGGCGGTTTCCGTTGG
AGCAAACGTTTCAGGCGGTCACGTGAATCCCGCAGTTACGTTTGGAGCTTTTATAGGTGG
GAACATAACGTTGTTGAGAGCTATTCTTTATTGGATCGCTCAGTTACTTGGAGCAGTCGT
AGCTTGCTTGTTGCTCAAGGTAAGTACTGGCGGGATGGAAACGGCAGCGTTTTCGCTCTC
TTACGGAGTCACACCGTGGAATGCCGTCGTTTTCGAGATTGTGATGACGTTTGGGTTGGT
TTACACTGTTTATGCTACTGCCGTGGATCCCAAGAAAGGTGATATTGGAATCATTGCTCC
TTTAGCGATTGGGCTAATTGTTGGAGCTAATATTCTCGTTGGTGGTGCGTTTGATGGTGC
GTCGATGAACCCAGCGGTTTCGTTCGGTCCTGCCGTGGTTAGCTGGACGTGGACGAACCA
TTGGGTCTATTGGGTTGGTCCGTTTATTGGTGCAGCCATTGCAGCTATCGTTTATGACAC
TATCTTTATTGATAGTAATGGACATGAACCACTTCCTTCAAGTGATTTCTAAGTTAGGGT
GTTGCTGATTTCTTCAGAAGCAAGAAAACTGATGTTGTACTGACTACCGGTATTGTGAGA
GAGGTGTATGTTTTTAACTCTCATGCGTGTCTTTCTTTTAAAATATGGTTTTAGTCAAGT
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GTAAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 10 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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CGGTCTAGTGGCCGCGTCTTTGTCACATGCGTTTGCATTGTTCGTGGCGGTTTCCGTTGG
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TTGGGTCTATTGGGTTGGTCCGTTTATTGGTGCAGTCATTGCAGCTATCGTTTATGACAC
TATCTTTATTGATAGTAATG

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ATGCGATCCGAGCGGCTTTTGCTGAGTTTTTCTCCATGGTTATATTCGTTTTCGCCGGTC
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A

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T

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DS 

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GTTACTTTTTACTTACTTTGTTTTTTAAGTGATTAATAAACTAAATCTTGGTAAAAAAAA
A

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 7

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CTCTTAAGATTAAGAACAAAAACTTATTTATGGTAGTTAATCCAAAGTAGATTATACATT
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BQ
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1D492JQ U 8
AF RS1A049TR U 3
AF RS1A049JQ U 3
AF RS1BC81JQ U 3
AF RS1BC81TF C 3
AF RS1A049TF C 1
AF RS1A049TV C 6
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BS 657 705 RS1A049TF

RD RS1D492JQ 637 0 0
TTTTAG
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AAAATATAAGAAAATACATAGAAACAAAATTATGGAGTCGTAACAATTCTCTCTCCTTAT
TGAACTGTAACATTATTAAAAATGATTAAAAAGAAATAAAGAAATACCCGGCCAATTGAT
TGCTAATCTTATTATCTCTAGTTTGGTTTGAAGGTTCTGGTTAGTTAATAACCGTTCTTA
ATGTCAATAAACTTTGCTGTGATGGTAGTTTCGTGGCACTTGAATCGTTCGACACCACTA
GGTAATTTACACCTGTATAAAAGAACGCGAAGCAACTTCTCCATATTACGATATGTCATT
GCAAAGCATGCACAATATCTTGTTTTGTACGGTAGATTCCCGGTCCAAAGTTTACAACAT
TCGCGGTCGTTGTCCGGGTTACAATTATCAATATTATCATAGCAAAAAAGAAGGTTTTCA
GCCGTAGCCGGGAATGATGTTAAGAGTATGACAACAGAGATGCACATCAATGGAATTAAC
TTCATTTTTGGAATTAATTTGTAGTTCTCGTGATAATTAGCTTCGGACTAAATATTTTTT
GAGAAATTTGAAACAATGTAGTTTTGGATAA

QA 7 637 7 637
DS 

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TGTTTTTGCTAAAAATATAAGAAAATACATAGAAACAAAATTATGGAGTCGTAACAATTC
TCTCTCCTTATTGAACTGTAACATTATTAAAAATGATTAAAAAGAAATAAAGAAATACCC
GGCCAATTGATTGCTAATCTTATTATCTCTAGTTTGGTTTGAAGGTTCTGGTTAGTTAAT
AACCGTTCTTAATGTCAATAAACTTTGCTGTGATGGTAGTTTCGTGGCACTTGAATCGTT
CGACACCACTAGGTAATTTACACCTGTATAAAAGAACGCGAAGCAACTTCTCCATATTAC
GATATGTCATTGCAAAGCATGCACAATATCTTGTTTTGTACGGTAAATTCCCGGTCCAAA
GTTTACAACATTCGCGGTCGTTGTCCGGGTTACAATTATCAATATTATCACAGCAAAAAA
GAAGGTTTTCAGCCGTAGCCGGGAATGATGTTAAGAGTATGACAACAGCGATGCACATCA
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QA 1 654 1 654
DS 

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QA 1 654 1 654
DS 

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GGCCAATTGATTGCTAATCTTATTATCTCTAGTTTGGTTTGAAGGTTCTGGTTAGTTAAT
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QA 1 654 1 654
DS 

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TGTTTTTGCTAAAAATATAAGAAAATACATAGAAACAAAATTATGGAGTCGTAACAATTC
TCTCTCCTTATTGAACTGTAACATTATTAAAAATGATTAAAAAGAAATAAAGAAATACCC
GGCCAATTGATTGCTAATCTTATTATCTCTAGTTTGGTTTGAAGGTTCTGGTTAGTTAAT
AACCGTTCTTAATGTCAATAAACTTTGCTGTGATGGTAGTTTCGTGGCACTTGAATCGTT
CGACACCACTAGGTAATTTACACCTGTATAAAAGAACGCGAAGCAACTTCTCCATATTAC
GATATGTCATTGCAAAGCATGCACAATATCTTGTTTTGTACGGTAGATTCCCGGTCCAAA
GTTTACAACATTCGCGGTCGTTGTCCGGGTTACAATTATCAATATTATCACAGCAAAAAA
GAAGGTTTTCAGCCGTAGCCGGGAATGATGTTAAGAGTATGACAACAGCGATGCACATCA
ATGAAATTAACTTCATTTTTGGAATTAATTTGTAGTTCTCGTGATAATTAGCTTCGGACT
AAATATTTTTTGAGAAATTTGAAACAATGTAGTTTTGGATAATTGTTGTATCGC

QA 1 654 1 654
DS 

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TTTGTTTTTGCTAAAAATATAAGAAAATACATAGAAACAAAATTATGGAGTCGTAACAAT
TCTCTCTCCTTATTGAACTGTAACATTATTAAAAATGATTAAAAAGAAATAAAGAAATAC
CCGGCCAATTGATTGCTAATCTTATTATCTCTAGTTTGGTTTGAAGGTTCTGGTTAGTTA
ATAACCGTTCTTAATGTCAATAAACTTTGCTGTGATGGTAGTTTCGTGGCACTTGAATCG
TTCGACACCACTAGGTAATTTACACCTGTATAAAAGAACGCGAAGCAACTTCTCCATATT
ACGATATGTCATTGCAAAGCATGCACAATATCTTGTTTTGTACGGTAGATTCCCGGTCCA
AAGTTTACAACATTCGCGGTCGTTGTCCGGGTTACAATTATCAATATTATCACAGCAAAA
AAGAAGGTTTTCAGCCGTAGCCGGGAATGATGTTAAGAGTATGACAACAGCGATGCACAT
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CTAAATATTTTTTGAGAAATTTGAAACAATGTAGTTTTGGATAATTGTTGTATCGCCCCG
GCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 705 1 705
DS 

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CACCACTAGGTAATTTACACCTGTATAAAAGAACGCGAAGCAACTTCTCCATATTACGAT
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TATTTTTTGAGAAATTTGAAACAATGTAGTTTTGGATAATTGTTGTATCGCCCCGGCCGT
AATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

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TTAATGATTCTCTTTATTGTGCACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FY59TF U 1
AF RS1FY59JQ C 176
BS 1 703 RS1FY59TF
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BS 763 805 RS1FY59JQ

RD RS1FY59TF 762 0 0
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AGTTCGAAGGGAAGAAGCTTGTATCCGCAACCAAGGAAGGCTTGAAACTTGACGAGTCAG
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TCAAGGACGTCTTGGGAGACAAAGTGGAGAAGGTTATCGTATCTGACCGTGTGGTTGACT
CACCCTGCTGTCTTGTGACGGGAGAATACGGGTGGACAGCAAACATGGAGAGGATCATGA
AAGCACAGGCTTTGAGAGATAGCAGCATGGCTGGATACATGTCGAGCAAGAAGACGATGG
AGATTAATCCGGAGAATGCCATCATGGAGGAGCTGAGGAAAAGAGCGGAGGCCGATAAGA
ATGACAAGTCTGTGAAGGATCTCGTTCTTCTCCTGTTTGAGACTGCCCTACTCACATCTG
GTTTCAGCTTGGACGAGCCCAACACCTTCGGGAGCAGGATCCACAGGATGTTGAAGCTTG
GATTGAGCATTGATGAAGACGATTCTGCCGAAGCTGATGCAGAGATGCCTCCTCTTGAAG
ATGACGCTGATGCTGAGGGAAGCAAGATGGAAGAAGTGGATTAAGAAGTTGACCAAGGGT
TGCAGTTAATAATGGGTTTTTCTTTATTTTTCTCGTTTTTTTT*CATTGTTGGAACTATT
ATGTCAGAGTTTTATCTCTTCTTCTAGAGAGTATTATTAATG

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1FY59JQ 630 0 0
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TGACTCACCCTGCTGTCTTGTGACGGGAGAATACGGGTGGACAGCAAACATGGAGAGGAT
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GATGGAGATTAATCCGGAGAATGCCATCATGGAGGAGCTGAGGAAAAGAGCGGAGGCCGA
TAAGAATGACAAGTCTGTGAAGGATCTCGTTTTTCTCCTGTTTGAGACTGCCCTACTCAC
ATCTGGTTTCAGCTTGGACGAGCCCAACACCTTCGGGAGCAGGATCCACAGGATGTTGAA
GCTTGGATTGAGCATTGATGAAGACGATTCTGCCGAAGCTGATGCAGAGATGCCTCCTCT
TGAAGATGACGCTGATGCTGAGGGAAGCAAGATGGAAGAAGTGGATTAAGAAGTTGACCA
AGGGTTGCAGTTAATAATGGGTTTTTCTTTATTTTTCTCGTTTTTTTTTCATTGTTGGAA
CTATTATGTCAGAGTTTTATCTCTTCTTCTAGAGAGTATTATTAATGGTTTTTGATAACA
GGTTGTTAATGATTCTCTTTATTGTGCACG

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 7

CO CL814Contig1 1052 7 26 U
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CTTTACCCACTTCATCGTTGCAAAACCATTCACCTGGTGAGACATGCTCAGGGGATTCAT
AATGTTGCTGGAGAAATAGACCATAGTGCTTACTCTTCTGAGGATTATTTTGATGCTCAT
ATCACCCCACTTGGTTGGCAACAGGTGGATCATCTACGGAACCATGTTCTAGAAACTCAA
CTCTTAAACAAAGTTGAACTTGTCATTGTCTCTCCCTTGCTTAGAACTATACAAACTGCT
GTCGGTGCTTTTGGAGGCGGAGAAGATACTAATGGAGCAGATGCAACACCGCTAATGGTG
GCCAATGCTGGGAGCAGCGACCGTCCTGCCATTTCAAGCTTAAACAGCCCACCTTTCCTT
GCTGTTGAGCTATGCAGAGAAACTATGGGTGATCATCCCTGTGACAGGCGAAGAAGCGTT
ACAGAGTACAAGGCTATGTTTCCTGCAATCGATTTTTCAATTATTGAAAGCGACAAGGAT
GTTTTGTGGAAGCCTAGTCCAAGAGAGACCCCAGATGAAGTTGCAGTTAGAGGTGTAGAG
TTCATTAACTGGCTATGGACGAGGAAAGAAAAGGAGATTGCAATTGTATCTCACAGTGGC
TTCTTGCACGGTCTCTTGAGCTCTTATGGGAAGGATTGTGTCGACGACATAAAGAAAGAA
TTGTCTATACACTTCAAGAACTGTGAGCTTCGTTCAATGGTTATCGTTGATCAAGGAAAC
CTGGGGACTAATTATACAGAGACTACAAACTATTCTGGCAAGGTTCCTCAAGGACTTGAT
CATCCAAGCGACTAATCGATGACGAGTAAGAGATATAAATAAGAAGGGAACACCTGATGG
CTCGGCTCCATTGGAATATTATTTGGCATTTTCAGCTCGTATTATTGTATTTTGATAAAC
ATAATTTAAATTTTCGTATTTATGTCAGCTACTAAATGAATTTACTGATTATGGTTGTTA
TTTGGGGAAAATGAATCAATTTCAGAAGTCTC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 10 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

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GCTGTTGAGCTATGCAGAGAAACTATGGGTGATCATCCCTGTGACAGGCGAAGAAGCGTT
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GG
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ATCACCCCACTTGGTTGGCAACAGGTGGATCATCTACGGAACCATGTTCTAGAAACTCAA
CTCTTAAACAAAGTTGAACTTGTCATTGTCTCTCCCTTGCTTAGAACTATACAAACTGCT
GTCGGTGCTTTTGGAGGCGGAGAAGATACTAATGGAGCAGATGCAACACCGCTAATGGTG
GCCAATGCTGGGAGCAGCGACCGTCCTGCCATTTCAAGCTTAAACAGCCCACCTTTCCTT
GCTGTTGAGCTATGCAGAGAAACTATGGGTGATCATCCCTGTGACAGGCGAAGAAGCGTT
ACAGAGTACAAGGCTATGTTTCCTGCAATCGATTTTTCAATTATTGAAAGCGACAAGGAT
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CTGGGGACTAATTATACAGAGACTACAAACTATTCTGGCAAG*TTCCTCAAG*ACT*GAT
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TCCTGCAATCGATTTTTCAATTATTGAAAGCGACAAGGATGTTTTGTGGAAGCCTAGTCC
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CTCTTATGGGAAGGATTGTGTCGACGACATAAAGAAAGAATTGTCTATACACTTCAAGAA
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GACGAGTAAGAGATATAAATAAGAAGGGAACACCTGATGGCTCGGCTCCATTGGAATATT
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TATGTCAGCTACTAAATGAATTTACTGATTATGGTTGTTATTTGGGGAAAATGAATCAAT
TTCAGAAGTCTC

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DS 

RD RS1DL82JQ 638 0 0
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CTATTCTGGCAAGGTTCCTCAAGGACTTGATCATCCAAGCGACTAATCGATGACGAGTAA
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TACTAAATGAATTTACTGATTATGGTTGTTATTTGGGG

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GGATTGTGTGGACGACATAAAGAAAGAATTGTCTATACACTTCAAGAACTGTGAGCTTCG
TTCAATGGTTATCGTTGATCAAGGAAACCTGGGGACTAATTATACAGAGACTACAAACTA
TTCTGGCAAGGTTCCTCAAGGACTTGATCATCCAAGCGACTAATCGATGACGAGTAAGAG
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TAAATGAATTTACTGATTATGGTTGTTATTTGGGGAAAATGAATCAATTTCAGAAGTCTC

QA 1 540 1 540
DS 



AS 1 7

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AGAACAGAACAAATGCATAACAAAAAAACAAGAAGTAGAAAAAAAAATAGAATAATAATT
TATTACATAACTCTCAATGCATCTCGTTTCTTTATTCTCTCACTCGTCCATCCTGTCATC
AGCTTCTTTTTTTTT*ATCCTTAAGCTAAGAAGAATTTCACTATTGATATCATTTCTTAA
CCAAGAGAAATGAAATCAAAACCGAAGAATATTCCAAATCGGAACCTCCTTCTTTATCTT
TAATCTTTATAAAGCCATTTTCTCTAACTTTATTGATCAAATCATCGTGATACGTCTGTG
CTTAAAATATCATTGTAGTTTGGCTTAGACGGTGTAGTGCTGGTTGAGATTATCAATGTC
AAGGCCCTTAAGCTTTACGACAGACTCCACGTGGCCTTTGAGAGTGTGCACTTCTCTTAG
CCTTGCGACTTCAGCACGCTTTTTAGCCTGTTCAGCGATCTCAGAAAGCTCGGTGAAGGT
TGCCTTGTCTTCAAACATTGACTCCGGGGGTTTAAGTCCATGGAGTGTACGTTGAGCTAG
AGCCCATTGGGCCTCTCTTTCTCCCCTTCCATAGTCTTTCTTGGTTGTGAATGCAGTCCT
ATTCTCGATCATGTTATTACAAGCTTTGCCAGTGAGGATGTAGCGGGGTGATGAACTTGA
GGACGTCAAGAGGAATGTATGTGATGA


BQ
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 15 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DK03JQ U 1
AF RS1DK03TF C 1
AF RS1C451TF C 25
AF RS1C451JQ U 29
AF RS1DM29JQ U 25
AF RS1DM29TF C 25
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CC

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TATTACATAACTCTCAATGCATCTCGTTTCTTTATTCTCTCACTCGTCCATCCTGTCATC
AGCTTCTTTTTTTTT*ATCCTTAAGCTAAGAAGAATTTCACTATTGATATCATTTCTTAA
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CTTAAAATATCATTGTAGTTTGGCTTAGACGGTGTAGTGCTGGTTGAGATTATCAATGTC
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CCTTGCGACTTCAGCACGCTTTTTAGCCTGTTCAGCGATCTCAGAAAGCTCGGTGAAGGT
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AGCCC
CC

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C

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CCC

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CCC

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DS 

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GCTAAGAAGAATTTCACTATTGATATCATTTCTTAACCAAGAGAAATGAAATCAAAACCG
AAGAATATTCCAAATCGGAACCTCCTTCTTTATCTTTAATCTTTATAAAGCCATTTTCTC
TAACTTTATTGATCAAATCATCGTCATACGTCTGTGCTTAAAATATCATTGTAGTTTGGC
TTAGACGGTGTAGTGCTGGTTGAGATTATCAATGTCAAGGCCCTTAAGCTTTACGACAGA
CTCCACGTGGCCTTTGAGAGTGTGCACTTCTCTTAGCCTTGCGACTTCAGCACGTTTCTT
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TGA

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DS 



AS 2 6

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CGCTAAAACGGAAAAGAAAAGTCGATCAGAGATCGAATCC


BQ
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G963JQ U 1
AF RS1E154JQ U 1
AF RS1E154TF C 101
BS 1 696 RS1E154JQ
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RD RS1G963JQ 618 0 0
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QA 1 618 1 618
DS 

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GATTGAGACACT

QA 1 792 1 792
DS 

RD RS1E154TF 780 0 0
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GATGCCGACTCATCTAAATCGCCATTAGAAACAGCAAGACCAATCCAACATCACTTATTC
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TTTAGACGAAAGGGATCTGAGAATAAGACCGCGAAAGAGGAGATTTTCTTTTTTTCTTAT
ATATATATATATATCAATCTCAATCGAAGAACAAAGATTAGCCTTGAAGACAAGTTTCGA
CTGAGATTGAGACACTGCAAAATCGCCACCGCGAAAACTATATCGCCACCGCGAAAATTA
TTTCCGCTAAAACGGAAAAGAAAAGTCGATCAGAGATCGAATCC

QA 17 780 17 780
DS 



CO CL816Contig2 1098 3 5 U
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AAACGCGAAGAACAGAAACAGCTAGCTCTGATGATGTTTTCTCCACAAAGCTTTTAACTT
TGTGAGATTAAAATTAAGCTTTAAGTTTTCTCTCTCTTCTATATTTTCTCCAACTTCTCT
CTAAAAAAAAAAAAAACTCTCCGACCAAGATCTCGATTCGGTGGCCGGCGGCGCTTATCG
TTGTCGGTCGCCACTGATACTTGTTATTTTCTTTTTTGATGTACAATATTCGATCTCTGA
TCGACTTTTCTTTTCCGTTTTAGCGGATATAATTTTCGCGCGATATAGTTTTTGCGGTGG
TGATTTTGCAGTGTCTCAATCTCAGTCGAAACTTGTCTTCAAGGCTAATCTTTGTTCTTC
GATTGAGATTGATATATATATAAGAAAAAAGAAAATCTTCTCTTTCGCGGTCTTACTCTC
AGATCCCTTTCGTCTAAAGTGAAAACTCCTTTGTTTTCTGGTTTTGCACTAAATCCTTTT
TTAAAAGAATCAATCTTTGCTCATTCAAAAAATATGGCCGGTATATCGGCTAAGAGTAAA
GTCTCCTTGAAAGAAAGGAATAAGTGATGTTGGATTGGTCTTGCTGTTTCTAATGGCGAT
TTAGATGAGTCGGCATCTTCTTCAAGGTGGTCCGATAAAGATCGTTTATTGAAACAAGTG
AGTATTTCCAGAGTTAATTATCCAGTAGTAATAGAGATTCTGCGGAAGACGATGGTTTGA
GCGAAAGATAGGAGACACGGAGAGTTCATAAGCGTGCCCAGCAATGAAGCTAGTGCAGAT
CGTCTTCTTGCCGGCGTAGTTGCGTTTCTAGATCCTCGCTTTCCATGCGGTGGCGCGTTA
GGGTGGGGCGCGTGGTTACTACAACCGACTTAAATCTCAAGCAAAAGCAGATGAAGACAC
GTGTTCGCTAACGACTTTTCAGAAACCGTGTGGAATAATTATCTGAAGATAGTAGAGGAC
TCGAGACATATGTATCAACATGGGCCTGATATTTAGTTCATAATTTAGTAGAGTCTATAT
ATAATATGAGTCGTTGTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1G963TF U 1
AF RS1FO80TF U 52
AF RS1F805TF U 349
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GG
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TTAACTTTGTGAGATTAAAATTAAGCTTTAAGTTTTCTCTCTCTTCTATATTTTCTCCAA
CTTCTCTCTAAAAAAAAAAAAAACTCTCCGACCAAGATCTCGATTCGGTGGCCGGCGGCG
CTTATCGTTGTCGGTCGCCACTGATACTTGTTATTTTCTTTTTTGATGTACAATATTCGA
TCTCTGATCGACTTTTCTTTTCCGTTTTAGCGGATATAATTTTCGCGCGATATAGTTTTT
GCGGTGGTGATTTTGCAGTGTCTCAATCTCAGTCGAAACTTGTCTTCAAGGCTAATCTTT
GTTCTTCGATTGAGATTGATATATATATAAGAAAAAAGAAAATCTTCTCTTTCGCGGTCT
TACTCTCAGATCCCTTTCGTCTAAAGTGAAAACTCCTTTGTTTTCTGGTTTTGCACTAAA
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GGTTTGAGCGAA
GATAGAGA

QA 3 734 3 734
DS 

RD RS1F805TF 750 0 0
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GGTCTTACTCTCAGATCCCTTTCGTCTAAAGTGAAAACTCCTTTGTTTTCTGGTTTTGCA
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GGTGGCGCGTTAGGGTGGGGCGCGTGGTTACTACAACCGACTTAAATCTCAAGCAAAAGC
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QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 4

CO CL817Contig1 1001 4 9 U
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CAACCATTCAGAATGTATTGGTCAATAAAGATGACACGAGATACCTAGAATTAAAAGCGT
ATGAGATTTGTAACTATAGAAAACAAATGTTTGTGTATCTCACTATCTCAACTAAAACTG
AAAACAAAATTGCTTAGAGAATGATGTGAAAAATCAAAACCAGCACTTAACTAACCGGGA
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GTGGTTTCATCTTCACGACTGAGTTCTGGGCTCCATCGACTTATCGTTTGCTCTTCCACC
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GACCACACTCTTAACCGATCACCGTCACCAGACTAAACCAGAACAGAGTATTCAGAGTGG
ACAAGTGAAGGATGATGACGGTACGCCACGAAATCCACACCGTACTGCAGACCTGATTTC
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CTTTTTGATTTCATGTACATCCATGTGTCTACTTCGTTCTCCAAGAAACGACCTTGAAGG
GTGAGTTTGATGCATTTGAGGATGTAGAGCAAATAGAAAGCTTCTTCAAAGGACAAATGA
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AGCTTAGCTTGCTCTGGCTCAACGGCTAGAAGCACGTTGCAACTCGAGAGGGAACCGGAT
GACTCTGTTTTGGCTAGAGATAGCTGGAGCTCTGAGACTGATTTTGAAATAGGTTCTGCA
AGAGCCTCTGCTTCTGCGCCTTTTGATTTCCATCTTGGCCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CP85TF C 109
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CAACCATTCAGAATGTATTGGTCAATAAAGATGACACGAGATACCTAGAATTAAAAGCGT
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GACCACACTCTTAACCGATCACCGTCACCAGACTGAACCAGAACAGAGTATTCAGAGTGG
ACAAGTGAAGGATGATGACGGTACGCCACGAAATCCACACCGTACTGCAGACCTGATTTC
AAAACCCAGTTCTTGGATCGTAAATGTAAATAAGCTTTGAAAAACACCGGGAAGTTTGGT
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CA

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G
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AACTAACCGGGACCGGTTCTTCATGGGGTTGTCAAATTACTCACATTGGTGGTAACTTTT
GGTTTCGGGGTTGTGGTTTCATCTTCACGACTGAGTTCTGGGCTCCATCGACTTATCGTT
TGCTCTTCCACCCTGTAGTTCTCCAAACACATAGGCAGGTTCAAATTCTCTCCATTAGAA
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GAA

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DS 



AS 1 5

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AAAGTAGGCACCTTTCATCCTCCTCTTCAATGGCCGATCTCAAGTCAACCTTCCTCAACG
TCTACTCCACCCTCAAATCCGACCTCCTCCACGACCCTTCCTTCGAATTCACCGATGAAT
CCCGTCTCTGGGTCGAAAAGATGTTGGATTACAATGTACCGGGAGGGAAGCTGAATCGTG
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TGGAAAACCATATTGATGTGAAGAATGTTCTTGTTGACATGGGGATCTACTTCCAAGTGC
AGGATGATTATCTGGATTGTTTTGCTGACCCAGAGACACTTGGCAAGATAGGAACGGATA
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AAACTGAGATATTATATGAGAACTACGGTAAACCCGACCCATCAAACGTTGCTAAAGTGA
AGGAGCTTTACAAAGAGCTTGACCTTGAGGGAGTGTTCAAGGAGTATGAGAGCAAAAGCT
ACGAGAAGCTGACTGG*AGTGATTGAGACTCACAAAAGTAAAGCAATCCAAGCAGTGCTC
AAATCCTTCTTGGCTAAGATCTACAAGAGGCAGAAGTAGTCAGTCTTAAGCCTTTCCAGA
TTATGTCTTTGATTCTTCTTTGGTGATTTGTGTAATTCTGTTAAGTGCTCTTCATTTTCT
TAAACTAAAAAGTTATCATTTCCACTTTTATCTATTCACAAAATTTCGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GV72TF U 1
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AGGTTTTCCTCTCGTGTGCTCTTGGTTGGTGCATCGAATGGCTTCAAGCTTATTTCCTTG
TGCTTGATGACATTATGGATAACTCTGTCACTCGACGTGGACAACCTTGCTGGTTCAGAG
TTCCTCAGGTTGGTATGGTTGCCATCAACGATGGGATCTTACTTCGCAATCACATCCACA
GGATCCTCAAGAAGCACTTCAGGGGAAAGCCTTACTATGTTGACCTCGTTGATCTCTT

QA 1 538 1 538
DS 

RD RS1ET26TF 682 0 0
GG
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CCGATGAATCCCGTCTCTGGGTCGAAAAGATGTTGGGTTACAATGTACCGGGAGGGAAGC
TGAATCGTGGTCTCTCTGTCGTGGACAGCTTCAAGCTTTTGAAGGAAGGTGAAGATTTGA
CCGAGGAAGAGGTTTTCCTCTCGTGTGCTCTTGGTTGGTGCATCGAATGGCTTCAAGCTT
ATTTCCTTGTGCTTGATGACATTATGGATAACTCTGTCACTCGACGTGGACAACCTTGCT
GGTTCAGAGTTCCTCAGGTTGGTATGGTTGCCATCAACGATGGGATCTTACTTCGCAATC
ACATCCACAGGATCCTCAAGAAGCACTTCAGGGGAAAGCCTTACTATGTTGACCTCGTTG
ACCTCTTTAATGAGGTAGAGATGCAAACAGCTTGCGGCCAGATGATTGATCTGATCACCA
CCTTCGAAGGCGAAAAGGATTTGGCCAAGTACTCATTGCCAATCCACCGGCGTATTGTCC
AATACAAAACTGCTTATTACTCATTTTATCTCCCTGTTGCTTGTGCGTTACTTATGGCGG
GCGAAAACTTGGAAAACCAT

QA 3 682 3 682
DS 

RD RS1AL49TF 776 0 0
GGTGCATCGAATGGCTTCAAGCTTATTTCCTTGTGCTTGATGACATTATGGATAACTCTG
TCACTCGACGTGGACAACCTTGCTGGTTCAGAGTTCCTCAGGTTGGTATGGTTGCCATCA
ACGATGGGATCTTACTTCGCAATCACATCCACAGGATCCTCAAGAAGCACTTCAGGGGAA
AGCCTTACTATGTTGACCTCGTTGATCTCTTTAATGAGGTAGAGATGCAAACAGCTTGCG
GCCAGATGATTGATCTGATCACCACCTTCGAAGGCGAAAAGGATTTGGCCAAGTACTCAT
TGCCAATCCACCGGCGTATTGTCCAATACAAAACTGCTTATTACTCATTTTATCTCCCTG
TTGCTTGTGCGTTACTTATGGCGGGCGAAAACTTGGAAAACCATATTGATGTGAAGAATG
TTCTTGTTGACATGGGGATCTACTTCCAAGTGCAGGATGATTATCTGGATTGTTTTGCTG
ACCCAGAGACACTTGGCAAGATAGGAACGGATATAGAAGACTTCAAATGCTCCTGGTTGG
TGGTAAAGGCATTGGAACGCTGCAGCAAAGAACAAACTGAGATATTATATGAGAACTACG
GTAAACCCGACCCATCAAACGTTGCTAAAGTGAAGGAGCTTTACAAAGAGCTTGACCTTG
AGGGAGTGTTCAAGGAGTATGAGAGCAAAAGCTACGAGAAGCTGACTGGGAGTGATTGAG
*CTCACAAAAGTAAAGCAATCCAAGCAGTGCTCAAATCCTTCTTGGCTAAGAT
CTA

QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1ET26JQ 788 0 0
TTGGTATGGTTGCCATCAACGATGGGATCTTACTTCGCAATCACATCCACAGGATCCTCA
AGAAGCACTTCAGGGGAAAGCCTTACTATGTTGACCTCGTTGACCTCTTTAATGAGGTAG
AGATGCAAACAGCTTGCGGCCAGATGATTGATCTGATCACCACCTTCGAAGGCGAAAAGG
ATTTGGCCAAGTACTCATTGCCAATCCACCGGCGTATTGTCCAATACAAAACTGCTTATT
ACTCATTTTATCTCCCTGTTGCTTGTGCGTTACTTATGGCGGGCGAAAACTTGGAAAACC
ATATTGATGTGAAGAATGTTCTTGTTGACATGGGGATCTACTTCCAAGTGCAGGATGATT
ATTTGGATTGTTTTGCTGACCCAGAGACACTTGGCAAGATAGGAACGGATATAGAAGACT
TCAAATGCTCCTGGTTGGTGGTAAAGGCATTGGAACGCTGCAGCAAAGAACAAACTGAGA
TATTATATGAGAACTACGGTAAACCCGACCCATCAATCGTTGCTAAAGTGAAGGAGCTTT
ACAAAGAGCTTGACCTTGAGGGAGTGTTCAAGGAGTATGAGAGCAAAAGCTACGAGAAGC
TGACTGG*AGTGATTGAGACTCACAAAAGTAAAGCAGTCCAAGCAGTGCTCAAATCCTTC
TTGGCTAAGATTTACAAGAGGCAGAAGTAGTCAGTCTTAAGCCTTTCCAGATTATGTCTT
TGATTCTTCTTTGGTGATTTGTGTAATTCTGTTAAGTGCTCTTCATTTTCTTAAACTAAA
AAGTTATC

QA 1 788 1 788
DS 

RD RS1B239JQ 653 0 0
GGCGAAAAGGATTTGGCCAAGTACTCATTGCCAATCCACCGGCGTATTGTCCAATACAAA
ACTGCTTATTACTCATTTTATCTCCCTGTTGCTTGTGCGTTACTTATGGCGGGCGAAAAC
TTGGAAAACCATATTGATGTGAAGAATGTTCTTGTTGACATGGGGATCTACTTCCAAGTG
CAGGATGATTATCTGGATTGTTTTGCTGACCCAGAGACACTTGGCAAGATAGGAACGGAT
ATAGAAGACTTCAAATGCTCCTGGTTGGTGGTAAAGGCATTGGAACGCTGCAGCAAAGAA
CAAACTGAGATATTATATGAGAACTACGGTAAACCCGACCCATCAAACGTTGCTAAAGTG
AAGGAGCTTTACAAAGAGCTTGACCTTGAGGGAGTGTTCAAGGAGTATGAGAGCAAAAGC
TACGAGAAGCTGACTGG*AGTGATTGAGGCTCACAAAAGTAAAGCAATCCAAGCAGTGCT
CAAATCCTTCTTGGCTAAGATCTACAAGAGGCAGAAGTAGTCAGTCTTAAGCCTTTCCAG
ATTATGTCTTTGATTCTTCTTTGGTGATTTGTGTAATTCTGTTAAGTGCTCTTCATTTTC
TTAAACTAAAAAGTTATCATTTCCACTTTTATCTATTCACAAAATTTCGTCCC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 2 7

CO CL819Contig1 1018 5 21 U
GGTCGTCAATCGCAGTGAAGAAGGAAGGACCCTAAATCGAATCCATCAAAAATCAAATGG
CATCGATGCTGGCTCGCAGGTCACTGAATACTCTCCGTGCTCGCCATCTCGTTGTATCAG
GGCAAGCTTCGAAGGGATCTCATCTTTCTGGACTGCAGTCCCGTGCTATTTCTTACGGCT
CCAAAAAAGATGATGAAGAAGAGGAGCAACTTGCCAAGGGAATCTCCAAGGACTGGAATA
CTGTGTTCGAACGGAGTATAAACACACTATTTCTCACTGAAATGGTGCGTGGTTTGTCGT
TGACCCTCAAGTACTTCTTTGATCCCAAAGTTACTATCAATTATCCATTTGAGAAGGGTC
CACTGAGCCCTCGTTTCCGTGGCGAACATGCTCTTCGTCGTTATCCTACTGGGGAAGAAC
GCTGCATTGCCTGCAAACTCTGTGAAGCTGTATGTCCAGCTCAAGCAATCACAATAGAAG
CAGAAGAGCGGGAAGATGGAAGCCGTAGAACTACTAGGTATGACATCGACATGACAAAAT
GCATTTACTGTGGTTTCTGCCAAGAAGCTTGCCCCGTTGATGCAATTGTCGAAGGACCTA
ACTTTGAATTCGCAACCGAGACACACGAGGAACTACTCTATGACAAGGAAAAGCTTCTTG
AGAATGGAGATCGATGGGAGACTGAGATTGCTGAGAATCTTAAATCAGAGAGTCTCTACC
GTTAGAAAACATTCTACAACAGTCTTTGCTTCAAGTTATTCCCCGAGAAAACGTTTTTTC
GGTTGCTTCTGTTAGAAATAAAAAAAATATGAGATGTTATGCGTTTGAAAACTCCTCTTT
TGTATTCCAGCTTTGTGCTGTGTAATTGAATTGTTTGCTTCTTGTTTCGACCTGAGTTTG
ATTTCCGGTGAAGTTTGTTCGTTTTTCGCTGAAGACTGAAAACTAGGCCACGGTGTCCCT
GTTATGACCAGGTTTTCAGGTTGAGTTTCATAATATATGTTCGGTTCTATTCGGTTGT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RS1DW81TF U 1
AF RS1BB27TF U 3
AF RS1DW81JQ C 208
AF RS1BB27JQ C 188
AF RS1H143TF U 470
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BS 740 753 RS1DW81TF
BS 754 869 RS1H143TF
BS 870 870 RS1BB27JQ
BS 871 1014 RS1H143TF
BS 1015 1018 RS1BB27JQ

RD RS1DW81TF 771 0 0
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CATCGATGCTGGCTCGCAGGTCACTGAATACTCTCCGTGCTCGCCATCTCGTTGTATCAG
GGCAAGCTTTGAAGGGATCTCGTCTTTCTGGACTGCAGTCCCGTGCTATTTCTTACGGCT
CCAAAAAAGATGATGAAGAAGAGGAGCAACTTGCCAAGGGAATCTCCAAGGACTGGAATA
CTGTGTTCGAACGGAGTATAAACACACTATTTCTCACTGAAATGGTGCGTGGTTTGTCGT
TGACCCTCAAGTACTTCTTTGATCCCAAAGTTACTATCAATTATCCATTTGAGAAGGGTC
CACTTAGCCCTCGTTTCCGTGGCGAACATGCTCTTCGTCGTTATCCTACTGGGGAAGAAC
GCTGCATTGCCTGCAAACTCTGTGAAGCTGTATGTCCAGCTCAAGCAATCACAATAGAAG
CAGAAGAGCGGGAAGATGGAAGCCGTAGAACTACTAGGTATGACATCGACATGACAAAAT
GCATTTACTGTGGTTTCTGCCAAGAAGCTTGCCCCGTTGATGCAATTGTCGAAGGACCTA
ACTTTGAATTCGCAACCGAGACACACGAGGAACTACTCTATGACAAGGAAAAGCTTCTTG
AGAATGGAGATCGATGGGGGACTGAGATTGCTGAGA*TCT**AATCAGAGAGTCTCTACC
GTTAGAAA*CATTCTACA*CAGTCTTTGCTTCA
GTATCCCGAGAAACGTTT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1BB27TF 723 0 0
GG
GTCAATCGCAGTGAAGAAGGAAGGACCCTAAATCGAATCCATCAAAAATCAAATGGCATC
GATGCTGGCTCGCAGGTCACTGAATACTCTCCGTGCTCGCCATCTCGTTGTATCAGGGCA
AGCTTCGAAGGGATCTCATCTTTCTGGACTGCAGTCCCGTGCTATTTCTTACGGCTCCAA
AAAAGATGATGAAGAAGAGGAGCAACTTGCCAAGGAAATCTCCAAGGACTGGAATACTGT
GTTCGAACGGAGTATAAACACACTATTTCTCACTGAAATGGTGCGTGGTTTGTCGTTGAC
CCTCAAGTACTTCTTTGATCCCAAAGTTACTATCAATTATCCATTTGAGAAGGGTCCACT
GAGCCCTCGTTTCCGTGGCGAACATGCTCTTCGTCGTTATCCTACTGGGGAAGAACGCTG
CATTGCCTGCAAACTCTGTGAAGCTGTATGTCCAGCTCAAGCAATCACAATAGAAGCAGA
AGAGCGGGAAGAT**ATGCCGTAGAACTACTAGGTATGACATCGACATGACAAAATGCAT
TTACTGTGGTTTCTGCCAAGAAGCTTGCCCCGTTGATGCAATTGTCGAAGGACCTAACTT
TGAATTCGCAACCGAGACACACGAGGAACTACTCTATGACAAG*AAAAGCTTCTTGAGAA
TGGAGATCGATGGGAGACTGAGATTGCTGAGA*TCTTAAATCAGAGAGTCTCTACCGTTA
G

QA 3 723 3 723
DS 

RD RS1DW81JQ 698 0 0
AACTTGCCAAGGGAATCTCCAAGGACTGGAATACTGTGTTCGAACGGAGTATAAACACAC
TATTTCTCACTGAAATGGTGCGTGGTTTGTCGTTGACCCTCAAGTACTTCTTTGATCCCA
AAGTTACTATCAATTATCCATTTGAGAAGGGTCCACTTAGCCCTCGTTTCCGTGGCGAAC
ATGCTCTTCGTCGTTATCCTACTGGGGAAGAACGCTGCATTGCCTGCAAACTCTGTGAAG
CTGTATGTCCAGCTCAAGCAATCACAATAGAAGCAGAAGAGCGGGAAGATGGAAGCCGTA
GAACTACTAGGTATGACATCGACATGACAAAATGCATTTACTGTGGTTTCTGCCAAGAAG
CTTGCCCCGTTGATGCAATTGTCGAAGGACCTAACTTTGAATTCGCAACCGAGACACACG
AGGAACTACTCTATGACAAGGAAAAGCTTCTTGAGAATGGAGATCGATGGGGGACTGAGA
TTGCTGAGAATCTTAAATCAGAGAGTCTCTACCGTTAGAAAACATTCTACAACAGTCTTT
GCTTCAAGTTATTCCCCGAGAAAACGTTTTTTCGGTTGCTTCTGTTAGAAATAAAAAAAA
TATGAGATGTTATGCGTTTGAAAACTCCTCTTTTGTATTCCAGCTTTGTGCTGTGTAATT
GAATTGTTTGCTTCTTGTTTCGACCTGAGTTTGATT
AC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RS1BB27JQ 831 0 0
AGATGATGAAGAAGAGGAGCAACTTGCCAAGG*AATCTCCAAGGACTGGAATACTGTGT*
CGAACGGAGTATAAACACACTATTTCTCACTGAAATGGTGCGTGGTTTGTCGTTGACCCT
CAAGTACTTCTTTGATCCCAAAGTTACTATCAATTATCCATTTGAGAAGGGTCCACTGAG
CCCTCGTTTCCGTGGCGAACATGCTCTTCGTCGTTATCCTACTGGGGAAGAACGCTGCAT
TGCCTGCAAACTCTGTGAAGCTGTATGTCCAGCTCAAGCAATCACAATAGAAGCAGAAGA
GCGGGAAGAT**ATGCCGTAGAACTACTAGGTATGACATCGACATGACAAAATGCATTTA
CTGTGGTTTCTGCCAAGAAGCTTGCCCCGTTGATGCAATTGTCGAAGGACCTAACTTTGA
ATTCGCAACCGAGACACACGAGGAACTACTCTATGACAAGGAAAAGCTTCTTGAGAATGG
AGATCGATGGGAGACTGAGATTGCTGAGAATCTTAAATCAGAGAGTCTCTACCGTTAGAA
AACATTCTACAACAGTCTTTGCTTCAAGTTATTCCCCGAGAAAACGTTTTTTCGGTTGCT
TCTGTTAGAAATAAAAAAAATATGAGATGTTATGCGTTTGAAAACTCCTCTTTTGTATTC
CAGCTTTGTGCTGTGTAATTGAATTGTTTGCTTCTTGTTTCGACCTGAGTTTGATTTCCG
GTGAAGTTTGTTCGTTTTTCGCTGAAGACTGAAAACTAGGCCACGGTGTCCCTGTTATGA
CCAGGTTTTCAGGTTGAGTTTCATAATATATGTTCGGTTCTATTCGGTTGT

QA 1 831 1 831
DS 

RD RS1H143TF 545 0 0
G
ACAATAGAAGCAGAAGAGCGGGAAGATGGAAGCCGTAGAACTACTAGGTATGACATCGAC
ATGACAAAATGCATTTACTGTGGTTTCTGCCAAGGAGCTTGCCCCGTTGATGCAATTGTC
GAAGGACCTAACTTTGAATTCGCAACCGAGACACACGAGGAACTACTCTATGACAAGGAA
AAGCTTCTTGAGAATGGAGATCGATGGGAGACTGAGATTGCTGAGAATCTTAAATCAGAG
AGTCTCTACCGTTAGAAAACATTCTACAACAGTCTTTGCTTCAAGTTATTCCCCGAGAAA
ACGTTTTTTCGGTTGCTTCTGTTAGAAATAAAAAAAATATGAGATGTTATGCGTTTGAAA
ACTCCTCTTTTGTATTCCAGCTTTGTGCTGTGTAATTGAGTTGTTTGCTTCTTGTTTCGA
CCTGAGTTTGATTTCCGGTGAAGTTTGTTCGTTTTTCGCTGAAGACTGAAAACTAGGCCA
CGGTGTCCCTGTTATGACCAGGTTTTCAGGTTGAGTTTCATAATATATGTTCGGTTCTAT
TCGG

QA 2 545 2 545
DS 



CO CL819Contig2 758 2 6 U
GTGTCAATCGCAGTGAAGAAGGAAGGACCCTAAATCGAATCCATCAAAAATCAAATGGCA
TCGATGCTGGCTCGCAGGTCACTGAATACTCTCCGTGCTCGCCATCTCGTTGTATCAGGG
CAAGCTTTGAAGGGATCTCATCTTTCTGGACTGCAGTCCCATGCTATTTCTTACGGCTCC
AAAAAAGATGATGAAGAAGAGGAGCAACTTGCCAAGGAAATCTCCAAGGACTGGAATACT
GTGTTCGAACGGAGTATAAACACACTATTTCTCACTGAAATGGTGCGTGGTTTGTCGTTG
ACCCTCAAGTACTTCTTTGATCCCAAAGTTACTATCAATTATCCATTTGAGAAGGGTCCA
CTGAGCCCTCGTTTCCGTGGCGAACATGCTCTTCGTCGTTATCCTACTGGGGAAGAACGC
TGCACTGCCTGCAAACTCTGTGAAGCTGTCAGTCCTTTGATCTATTATGCTAAGACTTAT
TTTTATGTCCTCTACCGGCATCTCACGTGTGAAGCTGTATGTCCAGCTCAAGCAATCACA
ATAGAAGCAGAAGAGCGGGAAGATGGAAGCCGTAGAACTACTAGGTATGACATCGACATG
ACAAAATGCATTTACTGTGGTTTCTGCCAAGAAGCTTGCCCCGTTGATGCAATTGTCGAA
GACCTAACTTTGAATTCGCAACCGAGACACACGAGGAACTACTCTATGACAAGGAAAAGC
TTCTTGAGAATGGAGATCGATGGGAGACTGAGATTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DZ95TF U 1
AF RS1C080TF U 44
BS 1 77 RS1DZ95TF
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BS 79 424 RS1DZ95TF
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BS 696 758 RS1C080TF

RD RS1DZ95TF 707 0 0
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TCGATGCTGGCTCGCAGTTCACTGAATACTCTCCGTGCTCGCCATCTCGTTGTATCAGGG
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AAAAAAGATGATGAAGAAGAGGAGCAACTTGCCAAGGAAATCTCCAAGGACTGGAATACT
GTGTTCGAACGGAGTATAAACACACTATTTCTCACTGAAATGGTGCGTGGTTTGTCGTTG
ACCCTCAAGTACTTCTTTGATCCCAAAGTTACTATCAATTATCCATTTGAGAAGGGTCCA
CTGAGCCCTCGTTTCCGTGGCGAACATGCTCTTCGTCGTTATCCTACTGGGGAAGAACGC
TGCATTGCCTGCAAACTCTGTGAAGCTGTCAGTCCTTTGATCTATTATGCTAAGACTTAT
TTTTATGTCCTCTACCGGCATCTCACGTGTGAAGCTGTATGTCCAGCTCAAGCAATCACA
ATAGAAGCAGAAGAGCGGGAAGATGGAAGCCGTAGAACTACTAGGTATGACATCGACATG
ACAAAATGCATTTACTGTGGTTTCTGCCAAGAAGCTTGCCCCGTTGATGCAATTGTCGAA
GACCTAACTTTGAATTCGCAACCGAGACACACGAG
ACTACTCTATGA

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1C080TF 715 0 0
GG
AAAAATCAAATGGCATCGATGCTGGCTCGCAGGTCACTGAATACTCTCCGTGCTCGCCAT
CTCGTTGTATCAGGGCAAGCTTTGAAGGGATCTCATCTTTCTGGACTGCAGTCCCGTGCT
ATTTCTTACGGCTCCAAAAAAGATGATGAAGAAGAGGAGCAACTTGCCAAGGAAATCTCC
AAGGACTGGAATACTGTGTTCGAACGGAGTATAAACACACTATTTCTCACTGAAATGGTG
CGTGGTTTGTCGTTGACCCTCAAGTACTTCTTTGATCCCAAAGTTACTATCAATTATCCA
TTTGAGAAGGGTCCACTGAGCCCTCGTTTCCGTGGCGAACATGCTCTTCGTCGTTATCCT
ACTGGGGAAGAACGCTGCACTGCCTGCAAACTCTGTGAAGCTGTCAGTCCTTTGATCTAT
TATGCTAAGACTTATTTTTATGTCCTCTACCGGCATCTCACGTGTGAAGCTGTATGTCCA
GCTCAAGCAATCACAATAGAAGCAGAAGAGCGGGAAGATGGGAGCCGTAGAACTACTAGG
TATGACATCGACATGACAAAATGCATTTACTGTGGTTTCTGCCAAGAAGCTTGCCCCGTT
GATGCAATTGTCGAAGACCTAACTTTGAATTCGCAACCGAGACACACGAGGAACTACTCT
ATGACAAGGAAAAGCTTCTTGAGAATGGAGATCGATGGGAGACTGAGATTGCT

QA 3 715 3 715
DS 



AS 1 7

CO CL820Contig1 706 7 7 U
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TGCATGCTTGTCTCTCTCCTTCTTCTGGTTCTTGTGCTTTCCGATATGGATAAAGCCCTG
GGTGAACCAATTCAGCTCCTCAACCGCAAACTTAAAGTGACTGAACATCATGATCAATTG
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AAATATTGCAACAATAATGACTACGCATGTAAGAGGAAGTTGCTAGCCTTGATAAAAGCC
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TGGCTGAAGGCAAAATCCCATCCATCGCCTTGAAGGTCTTCCAAAGGCAAAAACATATGA
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TGCCACTCGGGATGATGGTATGATGATATGATGTTACAAGTTTTAAGCTATTGTCGAACT
GTTTTATTTTAATTTCCTTATAAATTATATATGTCCTATAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GE96TF U 27
AF RS1GE96JQ C 27
AF RS1FB64TF U 15
AF RS1G426JQ C 1
AF RS1G426TF U 1
AF RS1G638TF U 4
AF RS1G638JQ C 23
BS 1 5 RS1G426JQ
BS 6 226 RS1G426TF
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BS 452 696 RS1G426TF
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RD RS1GE96TF 428 0 0
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GGTTCTTGTGCTTTCCGATATGGATAAAGCCCTGGGTGAACCAATTCAGCTCCTCAACCG
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TTCTAAGAGTTTGCGGGATACGTTGCCGAAATGGTTCAGAAAGGTCCAGGAATTGGTGGG
CGCTGCTAAAGATAAACTCCCTCCTTCATCGCCGAAATATTGCAACAATAATGACTACGC
ATGTAAGAGGAAGTTGCTAGCCTTGATAAAAGCCTTTAACTTGTATAAGGCAAAACGTAT
GTCGCTGAGACAGGTGAAAATGGCCTATGACTCCTGGCTGAAGGCAAAATCCCATCCATC
GCCTTGAA

QA 1 428 1 428
DS 

RD RS1GE96JQ 561 0 0
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GGTTCTTGTGCTTTCCGATATGGATAAAGCCCTGGGTGAACCAATTCAGCTCCTCAACCG
CAAACTTAAAGTGACTGAACATCATGATCAATTGACGACAGACCGACGTCTCGCTGTTGT
TTCTAAGAGTTTGCGGGATACGTTGCCGAAATGGTTCAGAAAGGTCCAGGAATTGGTGGG
CGCTGCTAAAGATAAACTCCCTCCTTCATCGCCGAAATATTGCAACAATAATGACTACGC
ATGTAAGAGGAAGTTGCTAGCCTTGATAAAAGCCTTTAACTTGTATAAGGCAAAACGTAT
GTCGCTGAGACAGGTGAAAATGGCCTATGACTCCTGGCTGAAGGCAAAATCCCATCCATC
GCCTTGAAGGTCTTCCAAAGGCAAAAACATATGATTCCACAAATTTCTTTTTTTTT***G
ACAATATCCACAAATTTCTTGATGAAAAAAATATTTTCACAAGTTGTCACCATAAATGTA
ATTCTGAAAATTTCTTGCAAA

QA 1 561 1 561
DS 

RD RS1FB64TF 632 0 0
GG
AAGAAAGAGAGAATTTTAAGATGGCATCTTCTAAAGTATCATCTTGCATGCTTGTCTCTC
TCCTTCTTCTGGTTCTTGTGCTTTCCGATATGGATAAAGCCCTGGGTGAACCAATTCAGC
TCCTCAACCGCAAACTTAAAGTGACTGAACATCATGATCAATTGACGACAGACCGACGTC
TCGCTGTTGTTTCTAAGAGTTTGCGGGATACGTTGCCGAAATGGTTCAGAAAGGTCCAGG
AATTGGTGGGCGCTGCTAAAGATAAACTCCCTCCTTCATCGCCGAAATATTGCAACAATA
ATGACTACGCATGTAAGAGGAAGTTGCTAGCCTTGATAAAAGCCTTTAACTTGTATAAGG
CAAAACGTATGTCGCTGAGACAGGTGAAAATGGCCTATGACTCCTGGCTGAAGGCAAAAT
CCCATCCATCGCCTTGAAGGTCTTCCAAAGGCAAAAACATATGATTCCACAAATTTCTTT
TTTTTTTTTGACAATATCCACAAATTTCTTGATGAAAAAA*TATTTTCACAAGTTGTCAC
CATAAATGTAATTCTGAAAATTTCTTGCAAAATAAAAGATATTATGCCACTCGGGATGAT
GGTATGATGATATGATGTTACAAGTTTTAA

QA 3 632 3 632
DS 

RD RS1G426JQ 697 0 0
GGATCATCAGTAAATTAAGAAAGAGAGAATTTTAAGATGGCATCTTCTAAAGTATCATCT
TGCATGCTTGTCTCTCTCCTTCTTCTGGTTCTTGTGCTTTCCGATATGGATAAAGCCCTG
GGTGAACCAATTCAGCTCCTCAACCGCAAACTTAAAGTGACTGAACATCATGATCAATTG
ACGACAGACCGACGTCTCGCTGTTGTTTCTAAGAGTTTGCGGGATATGTTGCCGAAATGG
TTCAGAAAGGTCCAGGAATTGGTGGGCGCTGCTAAAGATAAACTCCCTCCTTCATCGCCG
AAATATTGCAACAATAATGACTACGCATGTAAGAGGAAGTTGCTAGCCTTGATAAAAGCC
TTTAACTTGTATAAGGCAAAACGTATGTCGCTGAGACAGGTGAAAATGGCCTATGACTCC
TGGCTGAAGGCAAAATCCCATCCATCGCCTCGAAGGTCTTCCAAAGGCAAAAACATATGA
TTCCACAAATTTCTTTTTTTTTTT*GACAATATCCACAAATTTCTTGATGAAAAAA*TAT
TTTCACAAGTTGTCACCATAAATGTAATTTTGAAAATTTCTTGCAAAATAAAAGATATTA
TGCCACTCGGGATGATGGTATGATGATATGATGTTACAAGTTTTAAGCTATTGTCGAACT
GTTTTATTTTAATTTCCTTATAAATTATATATGTCC
G

QA 1 696 1 696
DS 

RD RS1G426TF 697 0 0
GGATC
ATCAGTAAATTAAGAAAGAGAGAATTTTAAGATGGCATCTTCTAAAGTATCATCTTGCAT
GCTTGTCTCTCTCCTTCTTCTGGTTCTTGTGCTTTCCGATATGGATAAAGCCCTGGGTGA
ACCAATTCAGCTCCTCAACCGCAAACTTAAAGTGACTGAACATCATGATCAATTGACGAC
AGACCGACGTCTCGCTGTTGTTTCTAAGAGTTTGCGGGATATGTTGCCGAAATGGTTCAG
AAAGGTCCAGGAATTGGTGGGCGCTGCTAAAGATAAACTCCCTCCTTCATCGCCGAAATA
TTGCAACAATAATGACTACGCATGTAAGAGGAAGTTGCTAGCCTTGATAAAAGCCTTTAA
CTTGTATAAGGCAAAACGTATGTCGCTGAGACAGGTGAAAATGGCCTATGACTCCTGGCT
GAAGGCAAAATCCCATCCATCGCCTCGAAGGTCTTCCAAAGGCAAAAACATATGATTCCA
CAAATTTCTTTTTTTTTTT*GACAATATCCACAAATTTCTTGATGAAAAAA*TATTTTCA
CAAGTTGTCACCATAAATGTAATTCTGAAAATTTCTTGCAAAATAAAAGATATTATGCCA
CTCGGGATGATGGTATGATGATATGATGTTACAAGTTTTAAGCTATTGTCGAACTGTTTT
ATTTTAATTTCCTTATAAATTATATATGTCC
G

QA 6 696 6 696
DS 

RD RS1G638TF 703 0 0
GG
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GCTTGTCTCTCTCCTTCTTCTGGTTCTTGTGCTTTCCGATATGGATAAAGCCCTGGGTGA
ACCAATTCAGCTCCTCAACCGCAAACTTAAAGTGACTGAACATCATGATCAATTGACGAC
AGACCGACGTCTCGCTGTTGTTTCTAAGAGTTTGCGGGATACGTTGCCGAAATGGTTCAG
AAAGGTCCAGGAATTGGTGGGCGCTGCTAAAGATAAACTCCCTCCTTCATCGCCGAAATA
TTGCAACAATAATGACTACGCATGTAAGAGGAAGTTGCTAGCCTTGATAAAAGCCTTTAA
CTTGTATAAGGCAAAACGTATGTCGCTGAGACAGGTGAAAATGGCCTATGACTCCTGGCT
GAAGGCAAAATCCCATCCATCGCCTTGAAGGTCTTCCAAAGGCAAAAACATATGATTCCA
CAAATTTCTTTTTTTTT***GACAATATCCACAAATTTCTTGATGAAAAAA*TATTTTCA
CAAGTTGTCACCATAAATGTAATTCTGAAAATTTCTTGCAAAATAAAAGATATTATGCCA
CTCGGGATGATGGTATGATGATATGATGTTACAAGTTTTAAGCTATTGTCGAGCTGTTTT
ATTTTAGTTTCCTTATAAATTATATATGTCCTATAAAAAAA

QA 3 703 3 703
DS 

RD RS1G638JQ 677 0 0
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TTCTGGTTCTTGTGCTTTCCGATATGGATAAAGCCCTGGGTGAACCAATTCAGCTCCTCA
ACCGCAAACTTAAAGTGACTGAACATCATGATCAATTGACGACAGACCGACGTCTCGCTG
TTGTTTCTAAGAGTTTGCGGGATACGTTGCCGAAATGGTTCAGAAAGGTCCAGGAATTGG
TGGGCGCTGCTAAAGATAAACTCCCTCCTTCATCGCCGAAATATTGCAACAATAATGACT
ACGCATGTAAGAGGAAGTTGCTAGCCTTGATAAAAGCCTTTAACTTGTATAAGGCAAAAC
GTATGTCGCTGAGACAGGTGAAAATGGCCTATGACTCCTGGCTGAAGGCAAAATCCCATC
CATCGCCTTGAAGGTCTTCCAAAGGCAAAAACATATGATTCCACAAATTTCTTTTTTTTT
***GACAATATCCACAAATTTCTTGATGAAAAAA*TATTTTCACAAGTTGTCACCATAAA
TGTAATTCTGAAAATTTCTTGCAAAATAAAAGATATTATGCCACTCGGGATGATGGTATG
ATGATATGATGTTACAAGTTTTAAGCTATTGTCGAGCTGTTTTATTTTAGTTTCCTTATA
AATTATATATGTCC
TAT

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 7

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GGACATCTCATTTTGCCTCAAATCCATCGGTGGAGAGCAGAAGCAGCAGGAGGAGCAACC
AGTAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAGGCATTTCTAAAGCAACCAAAGGTGTTCCTAAG
CTCGAAGAAATCAGGGAAAGGAAAGAGGCCTGGCAAAGGTGGAAACCGTTTCTGGAAGAA
CATTGGTTTGGGTTTCAAGACTCCCCGCGATGCCATTGAAGGACATTACATTGACAAGAA
ATGTCCGTTCACTGGAACTGTCTCTGTGAGAGGACGTATCTTAGCTGGTACTTGCCACAG
TGCCAAGATGCAGAGAACCATCATTGTTCGCCGAAACTATCTCCACTTCGTCAAGAAGTA
TCAAAGATACGAGAAGAGGCATTCCAACATCCCAGCCCATGTCTCACCCTGCTTCCGTGT
TAAAGAAGGCGATCATGTCATCATTGGCCAATGCAGGCCGTTGTCAAAGACCGTGAGGTT
CAATGTGTTGAAGGTGATCCCAGCCGGCGCATCTGCCTTTGCAAAGAAGGCATTCACTGG
AATGTAATAGTTTTTGAAGTTATGGACAATTTCTCTGTTTCGTTTTTATGTTTCAGAATG
TTTTGTTTGTTGATCCTTCTTGTGTGAGAGACTTGGTTTATCCGCAGACTGAATAGAAAC
CTACGTACTACTTTCTTCATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 

AF RS1BA39JQ C 24
AF RS1BA39TF U 24
AF RS1BQ53JQ C 1
AF RS1GP37JQ C 129
AF RS1GP37TF U 32
AF RS1DW33TF U 28
AF RS1BQ53TF U 1
BS 1 25 RS1BQ53TF
BS 26 277 RS1BA39TF
BS 278 278 RS1GP37TF
BS 279 473 RS1BA39TF
BS 474 474 RS1GP37TF
BS 475 586 RS1BA39TF
BS 587 587 RS1GP37TF
BS 588 653 RS1BA39TF
BS 654 678 RS1GP37TF
BS 679 682 RS1BQ53JQ

RD RS1BA39JQ 631 0 0
GG
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GGCCAATGCAGGCCGTTGTCAAAGACCGCGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATCCCAGCC
GGCGCATCTGCCTTTGCAAAGAAGGCATTCACTGGAATGTAATAGTTTTTGAAGTTATGG
ACAATTTTTCTGTTTCGTTTTCATGTTTCAGAATGTTTTGTTTGTTGATCCTTCTTGTGT
GAGAGACTTGGTTTATCCGCAGACTGAA
C

QA 3 630 3 630
DS 

RD RS1BA39TF 631 0 0
GG
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AAGGCATTTCTAAAGCAACCAAAGGTGTTCCTAAGCTCGAAGAAATCAGGGAAAGGAAAG
AGGCCTGGCAAAGGTGGAAACCGTTTCTGGAAGAACATTGGTTTGGGTTTCAAGACTCCC
CGCGATGCCATTGAAGGACATTACATTGACAAGAAATGTCCGTTCACTGGAACTGTCTCT
GTGAGAGGACGTGTCTTAGCTGGTACTTGCCACAGTGCCAAGATGCAGAGAACCATCATT
GTTCGCCGAAACTATCTCCACTTCGTCAAGAAGTATCAAAGATACGAGAAGAGGCATTCC
AACATCCCAGCCCATGTCTCACCCTGCTTCCGTGTTAAAGAAGGCGATCATGTCATCATT
GGCCAATGCAGGCCGTTGTCAAAGACCGCGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATCCCAGCC
GGCGCATCTGCCTTTGCAAAGAAGGCATTCACTGGAATGTAATAGTTTTTGAAGTTATGG
ACAATTTCTCTGTTTCGTTTTCATGTTTCAGAATGTTTTGTTTGTTGATCCTTCTTGTGT
GAGAGACTTGGTTTATCCGCAGACTGAA
C

QA 3 630 3 630
DS 

RD RS1BQ53JQ 682 0 0
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CTCGAAGAAATCAGGGAAAGGAAAGAGGCCTGGCAAAGGTGGAAACCGTTTCTGGAAGAA
CATTGGTTTGGGTTTCAAGACTCCCCGCGATGCCATTGAAGGACATTACATTGACAAGAA
ATGTCCGTTCACTGGAACTGTCTCTGTGAGAGGACGTATTTTAGCTGGTACTTGCCACAG
TGCCAAGATGCAGAGAACCATCATTGTTCGCCGAAACTATCTCCACTTCGTCAAGAAGTA
TCAAAGATACGAGAAGAGGCATTCCAACATCCCAGCCCATGTCTCACCCTGCTTCCGTGT
TAAAGAAGGCGATCATGTCATCATTGGCCAATGCAGGCCGTTGTCAAAGACCGTGAGGTT
CAATGTGTTGAAGGTGATCCCAGCCGGCGCATCTGCCTTTGCAAAGAAGGCATTCACTGG
AATGTAATAGTTTTTGAAGTTATGGACAATTTCTCTGTTTCGTTTTTATGTTTCAGAATG
TTTTGTTTGTTGATCCTTCCTGTGTGAGAGACTTGGTTTATCCGCAGACTGAATAGAAAC
CTACGTACTACTTTCTTCATCC

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DS 

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TGGGTTTCAAGACTCCCCGCGATGCCATTGAAGGACACTACATTGACAAGAAATGTCCGT
TCACTGGAACTGTCTCTGTGAGAGGACGTATCTTAGCTGGTACTTGCCACAGTGCCAAGA
TGCAGAGAACCATCATTGTTCGCCGAAACTATCTCCACTTCGTCAAGAAGTATCAAAGAT
ACGAGAAGAGGCATTCCAACATCCCAGCCCATGTCTCACCCTGCTTCCGTGTTAAAGAAG
GCGATCATGTCATCATTGGCCAATGCAGGCCGTTGTCAAAGACCGTGAGGTTCAATGTGT
TGAAGGTGATCCCAGCCGGCGCATCTGCCTTTGCAAAGAAGGCATTCACTGGAATGTAAT
AGTTTTTGAAGTTATGGACAATTTCTCTGTTTCGTTTTTATGTTTCAGAATGTTTTGTTT
GTTGATCCTTCTTGTGTGAGAGACTTGGTTTATCCGCAGACTGAATAGAAACCTACGTAC
TACTTTCTTC

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DS 

RD RS1GP37TF 647 0 0
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AGCAAAGGTGGAAACCGTTTCTGGAAGAACATTGGTTTGGGTTTCAAGACTCCCCGCGAT
GCCATTGAAGGACACTACATTGACAAGAAATGTCCGTTCACTGGAACTGTCTCTGTGAGA
GGACGTATCTTAGCTGGTACTTGCCACAGTGCCAAGATGCAGAGAACCATCATTGTTCGC
CGAAACTATCTCCACTTCGTCAAGAAGTATCAAAGATACGAGAAGAGGCATTCCAACATC
CCAGCCCATGTCTCACCCTGCTTCCGTGTTAAAGAAGGCGATCATGTCATCATTGGCCAA
TGCAGGCCGTTGTCAAAGACCGTGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATCCCAGCCGGCGCA
TCTGCCTTTGCAAAGAAGGCATTCACTGGAATGTAATAGTTTTTGAAGTTATGGACAATT
TCTCTGTTTCGTTTTTATGTTTCAGAATGTTTTGTTTGTTGATCCTTCTTGTGTGAGAGA
CTTGGTTTATCCGCAGACTGAATAGAAACCTACGTACTACTTTCTTC

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DS 

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G
GGTGGAGAGCAGAAGCAGCAGGAGGAGCAACCAGTAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAG
GCATTTCTAAAGCAACCAAAGGTGTTCCTAAGCTCGAAGAAATCAGGGAAAGGAAAGAGG
CCTGGCAAAGGTGGAAACCGTTTCTGGAAGAACATTGGTTTGGGTTTCAAGACTCCCCGC
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AGAGGACGTATCTTAGCTGGTACTTGCCACAGTGCCAAGATGCAGAGAACCATCATTGTT
CGCCGAAACTATCTCCACTTCGTCAAGAAGTATCAAAGATACGAGAAGAGGCATTCCAAC
ATCCCAGCCCATGTCTCACCCTGCTTCCGTGTTAAAGAAGGCGATCATGTCATCATTGGC
CAATGCAGGCCGTTGTCAAAGACCGTGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATCCCAGCCGGC
GCATCTGCCTTTGCAAAGAAGGCATTCACTGGAATGTAATAGTTTTTGAAGTTATGGACA
ATTTCTCTGTTTCGTTTTTATGTTTCAGAATGTTT*GTTTGTTGATCCTTCTTGTGTGAG
AGACTTGGTTTATCCGCAGACTGAATAGAAACCTACGTACTACTTTCTTC
ATCT

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DS 

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AGTAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAGGCATTTCTAAAGCAACCAAAGGTGTTCCTAAG
CTCGAAGAAATCAGGGAAAGGAAAGAGGCCTGGCAAAGGTGGAAACCGTTTCTGGAAGAA
CATTGGTTTGGGTTTCAAGACTCCCCGCGATGCCATTGAAGGACATTACATTGACAAGAA
ATGTCCGTTCACTGGAACTGTCTCTGTGAGAGGACGTATCTTAGCTGGTACTTGCCACAG
TGCCAAGATGCAGAGAACCATCATTGTTCGCCGAAACTATCTCCACTTCGTCAAGAAGTA
TCAAAGATACGAGAAGAGGCATTCCAACATCCCAGCCCATGTCTCACCCTGCTTCCGTGT
TAAAGAAGGCGATCATGTCATCATTGGCCAATGCAGGCCGTTGTCAAAGACCGTGAGGTT
CA*TGTGTTGAAGGTGATCCCAGCCGGCGCATCTGCCTTTGCAAAGAAGGCATTCACTGG
AATGTAATAGTTTTTGAAGTTATGGACAATTTCTCTGTTTCGTTTTTATGTTTCAGAATG
TTTTGTTTGTTGATCCTTCCTGTGTGAGAGACTTGGTTTATCCGCAGACTGAATAGAAAC
CTACGTACTACTTTCTTC
ATC

QA 1 678 1 678
DS 



AS 2 7

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TCTACTCAGCATTCTCCATGGAGCTTGTTGAATTATTGAGACATGGAAAACAAACATGTT
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CCACCATCTCACGTTGTTTGCAAGACAAGCTTGGGCGAGAAAGTAGCACCCGTCTCTCTG
TTTTTTTGGGTTCAGGACCTTCCCTGAGACTTGCGTTCCCACCATTCCATGAACTTAACT
TGAGCCGCCATTGTGTCCAGCTTATACAATTGCATCGTGTGGTTGGCTACTTCTTGCCCA
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TTTTCAGGGTGGGTCCATTGACGGGATCGGAGGCAATGAACTCATCGACGTCGGAGGAAG
ACCAAGAAGGAAGAGGCGTGTCACGTTTGGTGAACCTCGTGTAATTCTCCAGGAATGATA
ACTTCTCCGCCCAGAATCCCTTCAATCCATCCATCTCTTTTTGATTCTTCTTCGCACGAC
GCTTTCTCTCTTTTCTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1AL67TF C 1
AF RS1AL67JQ U 282
BS 1 281 RS1AL67TF
BS 282 619 RS1AL67JQ
BS 620 621 RS1AL67TF

RD RS1AL67TF 621 0 0
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TCTACTCAGCATTCTCCATGGAGCTTGTTGAATTATTGAGACATGGAAAACAAACATGTT
TCGAGAGTGAGAACATAAAGAAGGGTTCGAAAGAGAGACTGAAAATGGATTTAACTGCTG
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TTTTTTTGGGTTCAGGACCTTCCCTGAGACTTGCGTTCCCACCATTCCATGAACTTAACT
TGAGCCGCCATTGTGTCCAGCTTATACAATTGCATCGTGTGGTTGGCTACTTCTTGCCCA
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ACCAAGAAGGAAGAGGCGTGTCACGTTTGGTGAACCTCGTGTAATTCTCCAGGAATGATA
ACTTCTCCGCCCAGAATCCCTTCAATCCATCCATCTCTTTTTGATTCTTCTTCGCACGAC
GCTTTCTCTCTTTTCTCTCCC

QA 1 621 1 621
DS 

RD RS1AL67JQ 340 0 0
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GTTGGCTACTTCTTGCCCAAAGGTCCAACCAAAAAGACCTCCTCCTAAGAAGCACCGAAA
GTCGCAGCTTCCCTAGCTGTTTTCAGGGTGGGTCCATTGACGGGATCGGAGGCAATGAAC
TCATCGACGTCGGAGGAAGACCAAGAAGGAAGAGGCGTGTCACGTTTGGTGAACCTCGTG
TAATTCTCCAGGAATGATAACTTCTCCGCCCAGAATCCCTTCAATCCATCCATCTCTTTT
TGATTCTTCTTCGCACGACGCTTTCTCTCTTTTCTCTC
CC

QA 1 338 1 338
DS 



CO CL822Contig2 761 5 5 U
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GAAAGCGTCGTGCGAAGAAGAATCAAAAAGAGATGGATGGATTGAAGGGATTCTGGGCGG
AGAAGTTATCATTCCTGGAGAATTACACGAGGTTCACCAAACGTGACACGCCTCTTCCTT
CTTGGTCTTCCTCCGACGTCGATGAGTTCATTGCCTCCGATCCCGTCAATGGACCCATCC
TGAAAACAGCTAGGGAAGCTGCGACTTTCGGTGCTACTGGAGCCGCACTTGGAGCTGTGT
CCACTGCTGCTTTTGCTTGGAAATACTCCAGGAGTCCACATGGTACTGCACTGTCCTTCT
TAGGAGGAGGTCTTTTTGGTTGGACCTTTGGGCAAGAAGTAGCCAACCACACGATGCAAT
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CTCAGGGAAGGTCCTGAACCCAAAAAAAAAAACAGAGAGACGGGTGCTACTTTCTCGCCC
AAGCTTGTCTTGCAAACAACGTGAGATGGTGGCAGCAGTTAAATCCATTTTCAGTCTCTC
TTTCGAACCTTTCTTTATGTTCTCACTCTCGAAA*CATGTTTGTTTTCCATGTCTCAATA
ATTCAACAAGCTCCATGGAGAATGCTGAGTAGATGAATCGAAACAAACTAAATGGTCTCA
TTTGGATTTTTATAATAAGAAGTTTATTCAGTGTTAAATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AAAT

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G
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DS 



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BQ
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BS 829 874 RS1E792JQ
BS 875 875 RS1FG24TF
BS 876 911 RS1E792JQ
BS 912 912 RS1FG24TF
BS 913 926 RS1E792JQ
BS 927 943 RS1FG24TF
BS 944 1159 RS1FU28TF

RD RS1FG24JQ 695 0 0
CG
GAAGTTTTCTAATAGCAATAGTTCATACTAATTTTTACACGACCAATTTGGTTAGGGAAA
TCGTTTTGGTTATTCTACTTTATTTCGGTTTTTTTTGTTGTAAAGAAAAATGAAAGAAGG
ATTTGAATGCCAAAAAAATAGAAACCAAAACAAATCTATCCTTTAAATTAAATTGCGGCA
AGTCTTGTCACAAGGATAAGCACAGTCTATTAATTTTGCTCCTCCTCTTTCGAAAAACCA
ATCTCCCACAGCAACTGCAATCCTCTTGTTCTTAATCGAAGGAAAGTTTTTGGAATACCA
TGTGTCCTGGTTCTCTGTTTGACAATGAGAAAAGCACGAGTTAAAAAACACTCCATTCTT
ACGTTGCTCTTTGAATGCACCGAGCAACTTCACCATCTGAAACCTGAACCCTTGAAAGAA
CTTGATCTGGGATGCATTGCACTTGGCGATGTTAAATGTACAGTTAGACCAACTTCCAGT
TGGATCTGCAGATTTAGAAGTTAAACTCTCTTGGATCTGCCACGTATCGTATGCAGCATT
TAGAATAAACAATGGAGCCTTGACTTGGTTTACTAGGTTTTGTGCGAAAAAACACGAAGT
TGGACTACGATTATCTAAACAGCCATCAGGGAGATCGTTTGTAATACTCTGTAATTGTAT
TACATCGTTGTATAACTTTCTAAGAGATCGATC

QA 3 695 3 695
DS 

RD RS1BG91JQ 724 0 0
CAGAAGTTTTCTAATAGCAATAGTTCATACTAATTTTTACACGACCAATTTGGTTAGGGA
AATAGTTTTGGTTATTCTACTTTATTTCGGGTTTTTTTGTTGTAAAGAAGAATGAAAGAA
GGATTTGAATGCCAAAAAAATAGAAACCAAAACAAATCTATCCTTTAGATTAAATTGCGG
CAAGTCTTGTCACAAGGATAAGCACAGTCTATTAATTTTGCTCCTCCTCTTTCGAAAAAC
CAATCTCCCACAGCAACTGCAATCCTCTTGTTCTTAATCGAAGGAGAGTTTTTGGAATAC
CATGTGTCCTGGTTCTCTGTTTGACAATGAGAAAAGCACGAGTTAAGAAACACTCCATTC
TTACGTTGCTCTTTGAATGCACCGAGCAACTTCACCATCTGAGACCTGAACCCTTGAAAG
AACTTGATCTGGGATGCATTGCACTTGGCGATGTTAAATGTACAGTTAGACCAACTTCCA
GTTGGATCTGCAGATTTAGAAGTTAAACTCTCTTGGATCTGCCACGTATCGTATGCAGCA
TTTAGAATAAACAATGGAGCCTTGACTTGGTTTACTAGGTTTTGCGCGAAAAAACACGAA
GTTGGACTACGATTATCTAAACAGCCATCAGGGAGATCGTTTGTAATACTCTGTAATTGT
ATTACATCGGTGTATAACCTTCTAAGAGATCGATCTCCAGAGACATCGGTGGCATCAACG
AAAA

QA 1 724 1 724
DS 

RD RS1E792JQ 823 0 0
AG
AGAAGAATGAAAGAAGGATTTGAATGCCAAAAAAATAGAAACCAAAACAAATCTATCCTT
TAGATTAAATTGCGGCAAGTCTTGTCACAAGGATAAGCACAGTCTATTAATTTTGCTCCT
CCTCTTTCGAAAAACCAATCTCCCACAGCAACTGCAATCCTCTTGTTCTTAATCGAAGGA
GAGTTTTTGGAATACCATGTGTCCTGGTTCTCTGTTTGACAATGAGAAAAGCACGAGTTA
AGAAACACTCCATTCTTACGTTGCTCTTTGAATGCACCGAGCAACTTCACCATCTGAGAC
CTGAACCCTTGAAAGAACTTGATCTGGGATGCATTGCACTTGGCGATGTTAAATGTACAG
TTAGACCAACTTCCAGTTGGATCTGCAGATTTAGAAGTTAAACTCTCTTGGATCTGCCAC
GTATCGTATGCAGCATTTAGAATAAACAATGGAGCCTTGACTTGGTTTACTAGGTTTTGC
GCGAAAAAACACGAAGTTGGACTACGATTATCTAAACAGCCATCAGGGAGATCGTTTGTA
ATACTCTGTAATTGTATTACATCGGTGTATAACTTTCTAAGAGATCGATCTCCAGAGACA
TCGGTGGCATCAACGAAAAAGCCAGCATCACTCAGACATTTAGTTCTGGTGGAAGAACTG
AGAAAAAGCTTAAAGTCATCACATTGGAATATTGCTGCAAGGCCTCCGGCAGAACATCCA
GAAAGCAGACCCTGCTTTGCACCTCTCATTCCATTCCTCAACAAATCTGACATCAAAGCA
CTCCATATTTTCTTTCCTCTAAACTGAAGTTTTGCATCCTT

QA 3 823 3 823
DS 

RD RS1FG24TF 656 0 0
TTTTTGGAATACCATGTGTCCTGGTTCTCTGTTTGACAATGAGAAAAGCACGAGTTAAGA
AACACTCCATTCTTACGTTGCTCTTTGAATGCACCGAGCAACTTCACCATCTGAGACCTG
AACCCTTGAAAGAACTTGATCTGGGATGCATTGCACTTGGCGATGTTAAATGTACAGTTA
GACCAACTTCCAGTTGGATCTGCAGATTTAGAAGTTAAACTCTCTTGGATCTGCCACGTA
TCGTATGCAGCATTTAGAATAAACAATGGAGCCTTGACTTGGTTTACTAGGTTTTGTGCG
AAAAAACACGAAGTTGGACTACGATTATCTAAACAGCCATCAGGGAGATCGTTTGTAATA
CTCTGTAATTGTATTACATCGTTGTATAACTTTCTAAGAGATCGATCTCCAGAGACATCG
GTGGCATCAACGAAAAAGCCAGCATCACTCAGACATTTAGTTCTGGTGGAAGAACTGAGA
AAACGCTTAAAGTCATCACATTGGAATATTGCTGCAAGGCCTCCGGCAGAACATCCAGAG
AGCAGACCCTGCTTTGCACCTCTCATTCCATTCCTCAACAAATCCGTCATCAAAGCACTC
CATATTTTCTTTCCTCTAAACTGGAGTTTTGCATCCTTATTTTCATTGTCTCCCA
C

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1FU28TF 748 0 0
CCTTGAAAGAACT*GATCTGGGATGCAT*GCACTTGGCGATGTTAAATGTACAGTTAGAC
CAACTTCCAGTTGGATCTGCAGATTTAGAAGTTAAACTCTCTTGGATCTGCCACGTATCG
TATGCAGCATTTAGAATAAACAATGGAGCCTTGACTTGGTCTACTAGGTTTTGTGCGAAA
AAACACGAAGTTGGGCTACGATTATCTAAACAGCCATCAGGGAGATCGTTTGTAACACTC
TGTAATTGTATTACATCGTTGTATAACTTTCTAAGAGATCGATCTCCAGAGACATCGGTG
GCATCAACGAAAAAGCCAGCATCACTCAGACATTTAGTTCTGGTGGAAGAACTGAGAAAA
CGCTTAAAGTCATCACATTGGAATATTGCTGCAAGGCCTCCGGCAGAACATCCAGAGAGC
AGACCCTGCTTTGCACCTCTCATTCCCT*CCTCAACAAATCTGTCATCAAAGCACTCCAT
ATTTTCTTTCCTCTAAACTGGAGTTTTGCATCCTTATTTTCATTGTCTCCCATAAAGGAT
CCACCGTCACAGTACCTAACTTTTACTCTGTTCCAGTTATAAAAGTCTGGATTTTCGGAG
GCTTTGTCACTTAGAATTCCTGTAAAAGGTATCTTTTTCTCCATATGCTTGGACGATCCG
TGACGAGTTCTTTTGCTGTATTCACAACTTTCAATGTCACTACACCATTCGCCTCCCTCC
AAATGAACGAGCCAATTCTTTGCTCCTC

QA 1 748 1 748
DS 



CO CL823Contig2 617 2 3 U
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ATCTTAATCCTCCCTGTTAATGGGGAGTTTGATAAAATGGAGAAGTTCACAGATTTTAAT
GGGACAAATGTGTATCAGACCGAAAATCATGATGTCAATTCCAAAGCAAATGTTACAATG
GTAGGACTCACGCTCATTAAAAATGCTGCTCTGAGATCAGCAGTGTGTCTGGATGGAAGT
CCTGCCGGTTATCATTTTCATCCCGGGTCTGGTTCAGGAGCAAAGAATTGGCTCGTTCAT
TTGGAGGGAGGCGAATGGTGTAGTGACATTGAAAGTTGTGAATACAGCAAAAGAACTCGT
CACGGATCGTCCAAGCATATGGAGAAAAAGATACCTTTTACAGGAATTCTAAGTGACAAA
GCCTCCGAAAATCCAGACTTTTATAACTGGAACAGAGTAAAAGTTAGGTACTGTGACGGT
GGATCCTTTATGGGAGACAATGAAAATAAGGATGCAAAACTTCAGTTTAGAGGAAAGAAA
ATATGGAGTGCTTTGATGTCAGATTTGTTGAGGAATGGAATGAGAGGTGCAAAGCAGGTC
TGCTTTCTGGATGTTCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1BG91TF U 1
AF RS1E792TF U 1
BS 1 586 RS1BG91TF
BS 587 587 RS1E792TF
BS 588 617 RS1BG91TF

RD RS1BG91TF 617 0 0
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TGCTTTCTGGATGTTCT

QA 1 617 1 617
DS 

RD RS1E792TF 617 0 0
GGACCTTGTGTCTCCTTTGAAATGAAGAAACTTTTATGGAGTCTGACTCTCTTTGGTGTC
ATCTTAATCCTCTCTGTTAATGGGGAGTTTGATAAAATGGAGAAGTTCACAGATTTTAAT
GGGACAAATGTGTATCAGACCGAAAATCATGATGTCAATTCCAAAGCAAATGTTACAATG
GTAGGACTCACGCTCATTAAAAATGCTGCTCTGAGATCAGCAGTGTGTCTGGATGGAAGT
CCTGCCGGTTATCATTTTCATCCCGGGTCTGGTTCAGGAGCAAAGAATTGGCTCGTTCAT
TTGGAGGGAGGCGAATGGTGTAGTGACATTGAAAGTTGTGAATACAGCAAAAGAACTCGT
CACGGATCGTCCAAGCATATGGAGAAAAAGATACCTTTTACAGGAATTCTAAGTGACAAA
GCCTCCGAAAATCCAGACTTTTATAACTGGAACAGAGTAAAAGTTAGGTACTGTGACGGT
GGATCCTTTATGGGAGACAATGAAAATAAGGATGCAAAACTTCAGTTTAGAGGAAAGAAA
ATATGGAGTGCTTTGATGTCAGATTTGTTGAGGAATGGAATGAGAGGTGCAAAGCAGGTC
TGCTTTCTGGATGTTCT

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 5

CO CL824Contig1 926 5 13 U
GGGTGAATCTAAAGGTCGAGAGAAAGATGAGCAGAGGAAGCGGCGCAGGATACGATCGTC
ACATCACGATCTTCTCACCGGAAGGTCGTCTCTTCCAAGTCGAATATGCATTCAAAGCCG
TCAAAGCAGCTGGAATCACCTCCATCGGCGTTCGCGGAAAAGATTCAGTATGCGTCGTCA
CCCAGAAGAAAGTTCCCGACAAGCTTCTAGATCAGTCAAGCGTATCTCACCTTTTCCCTG
TCACTAAGTACCTTGGCTTGTTAGCCACTGGCATGACAGCTGATTCAAGGTCCTTGGTCA
CACAAGCAAGGAATGAGGCAGCTGAGTTTAGGTTCCAATACGGATACGAGATGCCTGCCG
ACATCCTTGCTAAATGGATTGCAGACAAGTCACAGGTCTACACTCAGCATGCTTACATGA
GACCTCTTGGAGTAGTTGCCATGGTGCTGGGTATGGATGAAGAGAGAGGACCCCTGCTTT
ACAAGTGTGACCCAGCTGGACACTTTTACGGTCACAAGGCAACTAGTGCAGGTATGAAAG
AGCAAGAAGCAATCAATTTCTTGGAGAAGAAAATGAAAGAGAACCCTGCCTTCACTTATG
ATGAAACAGTGCAGACTGCCATATCTGCCCTGCAATCTGTTCTTCAAGAAGACTTCAAGG
CAACTGAGATTGAGGTTGGAGTTGTGAGAGCTGATAACCCGATCTTCCGTTCCCTTGAAA
CGGAGGAGATCGAGGAGCATTTGACTTCCATTAGCGAACGTGACTGATCACTTCGAAATC
AGACTTTGCAATCTCTTCCTTTTGCTTTCATTATCTTTCTAAGAACATTCACATCTCATA
GAAACTTGTTTCCGTCTGTGTTATGAATCTTGTGGTCTCCATTTGAACCTTCTGCTTTCT
CAGATCCTCTTTTATATTGTTTGCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DS36TF U 1
AF RS1DG55TF U 125
AF RS1DS36JQ C 228
AF RS1F853TF U 99
AF RS1F853JQ C 117
BS 1 166 RS1DS36TF
BS 167 167 RS1F853TF
BS 168 655 RS1DS36TF
BS 656 824 RS1F853TF
BS 825 825 RS1F853JQ
BS 826 866 RS1F853TF
BS 867 867 RS1F853JQ
BS 868 879 RS1F853TF
BS 880 880 RS1F853JQ
BS 881 886 RS1F853TF
BS 887 887 RS1F853JQ
BS 888 912 RS1F853TF
BS 913 926 RS1F853JQ

RD RS1DS36TF 655 0 0
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ACATCACGATCTTCTCACCGGAAGGTCGTCTCTTCCAAGTCGAATATGCATTCAAAGCCG
TCAAAGCAGCTGGAATCACCTCCATCGGCGTTCGCGGAAAAGATTCGGTATGCGTCGTCA
CCCAGAAGAAAGTTCCCGACAAGCTTCTAGATCAGTCAAGCGTATCTCACCTTTTCCCTG
TCACTAAGTACCTTGGCTTGTTAGCCACTGGCATGACAGCTGATTCAAGGTCCTTGGTCA
CACAAGCAAGGAATGAGGCAGCTGAGTTTAGGTTCCAATACGGATACGAGATGCCTGCCG
ACATCCTTGCTAAATGGATTGCAGACAAGTCACAGGTCTACACTCAGCATGCTTACATGA
GACCTCTTGGAGTAGTTGCCATGGTGCTGGGTATGGATGAAGAGAGAGGACCCCTGCTTT
ACAAGTGTGACCCAGCTGGACACTTTTACGGTCACAAGGCAACTAGTGCAGGTATGAAAG
AGCAAGAAGCAATCAATTTCTTGGAGAAGAAAATGAAAGAGAACCCTGCCTTCACTTATG
ATGAAACAGTGCAGACTGCCATATCTGCCCTGCAATCTGTTCTTCAAGAAGACTT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1DG55TF 752 0 0
G
GCAGCAGGAATCACCTCCATCGGTGTTCGCGGAAAAGATTCAGTATGCGTCGTCACCCAG
AAGAAAGTTCCCGACAAGCTTCTAGATCAGTCAAGCGTATCTCACCTTTTCCCTGTCACT
AAGTACCTTGGCTTGTTAGCCACTGGCATGACAGCTGATTCAAGGTCCTTGGTCACACAA
GCAAGGAATGAGGCAGCTGAGTTTAGGTTCCAATACGGATACGAGATGCCTGCCGACATC
CTTGCTAAATGGATTGCAGACAAGTCACAGGTCTACACTCAACATGCTTACATGAGACCT
CTTGGAGTAGTTGCCATGGTGCTGGGTATGGACGAAGAGAGAGGACCCCTGCTTTACAAG
TGTTACCCTGCTGGACACTTTTACGGTCACAAGGCAACTAGTGCAGGTATGAAAGAGCAA
GAAGCAATCAATTTCTTGGAGAAGAAAATGAAAGAGAACCCTGCCTTCACTTATGATGAA
ACTGTGCAGACTGCAATATCCGCCCTGCAATCTGTTCTTCAAGAAGACTTCAAGGCAACT
GAGATTGAGGTTGGAGTTGTGAGAGCTGATAACCCGATCTTCCGTTCCCTTGAAACGGAG
*AGATCGAGGAGCATTTGACTGCCATTAGCGAACGTGACTGATCACTTTGAAATCAGACT
TTGGATTCTCTTCCTTTTGCTTTCATTATCTTTCTAAGA*CATTCACATCTCAGAGAAAC
TTGTTTCCATCTGTGTTATGA
TCTGTGTTTC

QA 2 742 2 742
DS 

RD RS1DS36JQ 671 0 0
CACCTTTTCCCTGTCACTAAGTACCTTGGCTTGTTAGCCACTGGCATGACAGCTGATTCA
AGGTCCTTGGTCACACAAGCAAGGAATGAGGCAGCTGAGTTTAGGTTCCAATACGGATAC
GAGATGCCTGCCGACATCCTTGCTAAATGGATTGCAGACAAGTCACAGGTCTACACTCAG
CATGCTTACATGAGACCTCTTGGAGTAGTTGCCATGGTGCTGGGTATGGATGAAGAGAGA
GGACCCCTGCTTTACAAGTGTGACCCAGCTGGACACTTTTACGGTCACAAGGCAACTAGT
GCAGGTATGAAAGAGCAAGAAGCAATCAATTTCTTGGAGAAGAAAATGAAAGAGAACCCT
GCCTTCACTTATGATGAAACAGTGCAGACTGCCATATCTGCCCTGCAATCTGTTCTTCAA
GAAGACTTCAAGGCAACTGAGATTGAGGTTGGAGTTGTGAGAGCTGATAACCCGATCTTC
CGTTCCCTTGAAACGGAGGAGATCGAGGAGCATTTGACTTCCATTAGCGAACGTGACTGA
TCACTTCGAAATCAGACTTTGCAATCTCTTCCTTTTGCTTTCATTATCTTTCTAAGAACA
TTCACATCTCATAGAAACTTGTTTCCGTCTGTGTTATGAATCTTGTGGTCTCCATTTGAA
C
CTTCTGCTTT

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DS 

RD RS1F853TF 814 0 0
GTCGAATATGCATTCAAAGCCGTCAAAGCAGCTGGAATCACCTCCATCGGCGTTCGCGGA
AAAGATTCAGTATGCGTCGTCACCCAGAAGAAAGTTCCCGACAAGCTTCTAGATCAGTCA
AGCGTATCTCACCTTTTCCCTGTCACTAAGTACCTTGGCTTGTCAGCCACTGGCATTACA
GCTGATTCAAGGTCCTTGGTCACACAAGCAAGGAATGAGGCAGCTGAGTTTAGGTTCCAA
TACGGATACGAGATGCCTGCCGACATCCTTGCTAAATGGATTGCAGACAAGTCACAGGTC
TACACTCAGCATGCTTACATGAGACCTCTTGGAGTAGTTGCCATGGTGCTGGGTATGGAT
GAAGAGAGAGGACCCCTGCTTTACAAGTGTGACCCAGCTGGACACTTTTACGGTCACAAG
GCAACTAGTGCAGGTATGAAAGAGCAAGAAGCAATCAATTTCTTGGAGAAGAAAATGAAA
GAGAACCCTGCCTTCACTTATGATGAAACAGTGCAGACTGCCATATCTGCCCTGCAATCT
GTTCTTCAAGAAGACTTCAAGGCAACTGAGATTGAGGTTGGAGTTGTGAGAGCTGATAAC
CCGATCTTCCGTTCCCTTGAAACGGAGGAGATCGAGGAGCATTTGACTTCCATTAGCGAA
CGTGACTGATCACTTCGAAATCAGACTTTGCAATCTCTTCCTTTTGCTTTCATTATCTTT
CTAAGA*CATTCACATCTCATAGAAACTTGTTTCCGTCTGTGTTATGA*TCTTGTGGTCT
C*ATTTGA*CCTTCTGCTTTCTCAGATCCTCTTT

QA 1 814 1 814
DS 

RD RS1F853JQ 810 0 0
AG
CGTCAAAGCAGCTGGAATCAC*TCCATCGGCGT*CGCGGAAAAGATTCAGTATGCGTCGT
CACCCAGAAGAAAGTTCCCGACAAGCTTCTAGATCAGTCAAGCGTATCTCACCTTTTCCC
TGTCACTAAGTACCTTGGCTTGTCAGCCACTGGCATTACAGCTGATTCAAGGTCCTTGGT
CACACAAGCAAGGAATGAGGCAGCTGAGTTTAGGTTCCAATACGGATACGAGATGCCTGC
CGACATCCTTGCTAAATGGATTGCAGACAAGTCACAGGTCTACACTCAGCATGCTTACAT
GAGACCTCTTGGAGTAGTTGCCATGGTGCTGGGTATGGATGAAGAGAGAGGACCCCTGCT
TTACAAGTGTGACCCAGCTGGACACTTTTACGGTCACAAGGCAACTAGTGCAGGTATGAA
AGAGCAAGAAGCAATCAATTTCTTGGAGAAGAAAATGAAAGAGAACCCTGCCTTCACTTA
TGATGAAACAGTGCAGACTGCCATATTTGCCCTGCAATCTGTTTTTCAAGAAGACTTCAA
GGCAACTGAGATTGAGGTTGGAGTTGTGAGAGCTGATAACCCGATCTTCCGTTCCCTTGA
AACGGAGGAGATCGAGGAGCATTTGACTTCCATTAGCGAACGTGACTGATCACTTCGAAA
TCAGACTTTGCAATCTCTTCCTTTTGCTTTCATTATCTTTCTAAGAACATTCACATTTCA
TAGAAACTTGTTTCCGTCTGTGTTATGAATCTTGTGGTCTCCATTTGAACCTTCTGCTTT
CTCAGATCCTCTTTTATATTGTTTGCGT

QA 3 810 3 810
DS 



AS 1 7

CO CL825Contig1 658 7 6 U
GGGTTCCCTTTATAAAACCCTAAATCGTTGCCTCCTTCTCTTAGCCAAATTAATACCCTA
GCTTACTCCGTATCTTCTCTTCAGAACTCCGAGGCAGAGATGACGGTGGAAGCTGTGAAC
CCTAAGGCGTACCCTTTAGCTGATTCCCAGCTAGCGATAACAATCCTCGATCTTGTTCAG
CAAGCCACGAATTACAAACAGCTCAAGAAAGGAGCTAACGAAGCTACCAAGACACTGAAC
CGTGGGATCTCTGAGTTCGTTGTTATGGCTGCTGATGCTGAGCCTCTCGAGATTCTTCTT
CATCTCCCTCTTCTCGCTGAGGATAAGAATGTGCCTTATGTGTTTGTGCCATCCAAACAA
GCCCTTGGAAGAGCATGTGGGGTGACAAGACCCGTGATTGCTTGTTCCGTTACATCAAAC
GATGCTAGCCAGCTGAAGTCTCAAATTCAGCAGCTCAAGGATGCCATTGAGAAGCTCCTC
ATCTAAAGATTTATGGTAGCTTATGAGTGATGATTTTTATTGGGTTTTGAACAAGAATAA
TTATTTGTTTTCTTAGGTTTGGTTTGTTGGTTTGATGATTTTGGTCTTTTCTTGAAACTT
AATCTTGATGTAAGAAGCCAAATGAAGCATCAATAAACACAAATATTTCCTCCTCACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 25 45 45 
45 45 45 45 15 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AG55TF U 1
AF RS1EM75JQ C 293
AF RS1F652JQ C 75
AF RS1C107TF U 41
AF RS1EM75TF U 41
AF RS1F652TF U 41
AF RS1AG55JQ C 78
BS 1 193 RS1AG55TF
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RD RS1AG55TF 658 0 0
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GCTTACTCCGTATCTTCTCTTCAGAACTCCGAGGCAGAGATGACGGTGGAAGCTGTGAAC
CCTAAGGCGTACCCTTTAGCTGATTCCCAGCTAGCGATAACAATCCTCGATCTTGTTCAG
CAAGCCACGAATTGCAAACAGCTCAAGAAAGGAGCTAACGAAGCTACCAAGACACTGAAC
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CATCTCCCTCTTCTCGCTGAGGATAAGAATGTGCCTTATGTGTTCGTGCCATCCAAACAA
GCCCTTGGAAGAGCATGTGGGGTGACAAGACCCGTGATTGCTTGTTCCGTTACATCAAAC
GATGCTAGCCAGCTGAAGTCTCAAATTCAGCAGCTCAAGGATGCCATTGAGAAGCTCCTC
ATCTAAAGATTTATGGTAGCTTATGAGTGATGATTTTTATTGGGTTTTGAACAAGAATAA
TTATTTGTTTTCTTAGGTTTGGTTTGTTGGTTTGATGATTTTGGTCTTTTCTTGAAACTT
AATCTTGATGTAAGAAGCCAAATGAAGCATCAATAAACACAAATATTTCCTC
CTCACG

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DS 

RD RS1EM75JQ 360 0 0
TTTTTT
TTCATCTCCCTTTTCTCGCTGAGGATAAGAATGTGCCTTATGTGTTTGTGCCATCCAAAC
AAGCCCTTGGAAGAGCATGTGGGGTGACAAGACCCGTTATTGCTTGTTCCGTTACATCAA
ACGATGCTAGCCAGCTGAAGTTTCAAATTCAGCAGCTCAAGGATGCCATTGAGAAGCTCC
TCATCTAAAGATTTATGGTAGCTTATGAGTGATGATTTTTATTGGGTTTTGAACAAGAAT
AATTATTTGTTTTTTTAGGTTTGGTTTGTTGGTTTGATGATTTTGGTCTTTTCTTGAAAC
TTAATCTTGATGTAAGAAGCCAAATGAAGCATCAATAAACACAAATATTTCCTC

QA 7 360 7 360
DS 

RD RS1F652JQ 566 0 0
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TTTAGCTGATTCCCAGCTAGCGATAACAATCCTCGATCTTGTTCAGCAAGCCACGAATTA
CAAACAGCTCAAGAAAGGAGCTAACGAAGCTACCAAGACACTGAACCGTGGGATCTCTGA
GTTCGTTGTTATGGCTGCTGATGCTGAGCCTCTCGAGATTTTTCTTCATCACCCTCTTCT
CGCTGAGGATAAGAATGTGCCTTATGTGTTTGTGCCATCCAAACAAGCCCTTGGAAGAGC
ATGTGGGGTGACAAGACCCGTGATTGCTTGTTCCGTTACATCAAACGATGCTAGCCAGCT
GAAGTCTCAAATTCAGCAGCTCAAGGATGCCACTGAGAAGCTCCTCATCTAAAGATTTAT
TGTAGCTTATGAGTGATGATTTTTATTGGGTTTTGAACAAGAATAATTATTTGTTTTCTT
AGGTTTGGTTTGTTGGTTTGATGATTTTGGTCTTTTCTTGAAACTTAATCTTGATGTAAG
AAGCCAAATGAAGCATCAATAAAC
CC

QA 1 564 1 564
DS 

RD RS1C107TF 611 0 0
GG
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ACGGTGGAAGCTGTGAACCCTAAG*CGTACCCTTTAGCTGATTCCCAGCTAGCGATAACA
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GCTACCAAGACACTGAACCGTGGGATCTCTGAGTTCGTTGTTATGGCTGCTGATGCTGAG
CCTCTCGAGATTCTTCTTCATCTCCCTCTTCTCGCTGAGGATAAGAATGTGCCTTATGTG
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TGTTCCGTTACATCAAACGATGCTAGCCAGCTGAAGTCTCAAATTCAGCAGCTCAAGGAT
GCCATTGAGAAGCTCCTCATCTAAAGATTTATGGTAGCTTATGAGTGATGATTTTTATTG
GGTTTTGAACAAGAATAATTATTTGTTTTCTTAGGTTTGGTTTGTTGGTTTGATGATTTT
GGTCTTTTCTTGAAACTTAATCTTGATGTAAGAAGCCAAATGAAGCATCAATAAACACAA
ATATTTCCT

QA 3 611 3 611
DS 

RD RS1EM75TF 612 0 0
GG
AGCCAAATTAATACCCTAGCTTACTCCGTATCTTCTCTTCAGAACTCCGAGGCAGAGATG
ACGGTGGAAGCTGTGAACCCTAAGGCGTACCCTTTAGCTGATTCCCAGCTAGCGATAACA
ATCCTCGATCTTGTTCAGCAAGCCACGAATTACAAACAGCTCAAGAAAGGAGCTAACGAA
GCTACCAAGACACTGAACCGTGGGATCTCTGAGTTCGTTGTTATGGCTGCTGATGCTGAG
CCTCTCGAGATTCTTCTTCATCTCCCTCTTCTCGCTGAGGATAAGAATGTGCCTTATGTG
TTTGTGCCATCCAAACAAGCCCTTGGAAGAGCATGTGGGGTGACAAGACCCGTTATTGCT
TGTTCCGTTACATCAAACGATGCTAGCCAGCTGAAGTCTCAAATTCAGCAGCTCAAGGAT
GCCATTGAGAAGCTCCTCATCTAAAGATTTATGGTAGCTTATGAGTGATGATTTTTATTG
GGTTTTGAACAAGAATAATTATTTGTTTTCTTAGGTTTGGTTTGTTGGTTTGATGATTTT
GGTCTTTTCTTGAAACTTAATCTTGATGTAAGAAGCCAAATGAAGCATCAATAAACACAA
ATATTTCCTC

QA 3 612 3 612
DS 

RD RS1F652TF 591 0 0
GG
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ACGGTGGAAGCTGTGAACCCTAAGGCGTACCCTTTAGCTGATTCCCAGCTAGCGATAACA
ATCCTCGATCTTGTTCAGCAAGCCACGAATTACAAACAGCTCAAGAAAGGAGCTAACGAA
GCTACCAAGACACTGAACCGTGGGATCTCTGAGTTCGTTGTTATGGCTGCTGATGCTGAG
CCTCTCGAGATTCTTCTTCATCACCCTCTTCTCGCTGAGGATAAGAATGTGCCTTATGTG
TTTGTGCCATCCAAACAAGCCCTTGGAAGAGCATGTGGGGTGACAAGACCCGTGATTGCT
TGTTCCGTTACATCAAACGATGCTAGCCAGCTGAAGTCTCAAATTCAGCAGCTCAAGGAT
GCCACTGAGAAGCTCCTCATCTAAAGATTTATTGTAGCTTATGAGTGATGATTTTTATTG
GGTTTTGAACAAGAATAATTATTTGTTTTCTTAGGTTTGGTTTGTTGGTTTGATGATTTT
GGTCTTTTCTTGAAACTTAATCTTGATGTAAGAAGCCAAATGAAGCATC

QA 3 591 3 591
DS 

RD RS1AG55JQ 581 0 0
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AGCTGATTCCCAGCTAGCGATAACAATCCTCGATCTTGTTCAGCAAGCCACGAATTGCAA
ACAGCTCAAGAAAGGAGCTAACGAAGCTACCAAGACACTGAACCGTGGGATCTTTGAGTT
CGTTGTTATGGCTGCTGATGCTGAGCCTCTCGAGATTTTTTTTCATCTCCCTCTTCTCGC
TGAGGATAAGAATGTGCCTTATGTGTTCGTGCCATCCAAACAAGCCCTTGGAAGAGCATG
TGGGGTGACAAGACCCGTGATTGCTTGTTCCGTTACATCAAACGATGCTAGCCAGCTGAA
GTCTCAAATTCAGCAGCTCAAGGATGCCATTGAGAAGCTCCTCATCTAAAGATTTATGGT
AGCTTATGAGTGATGATTTTTATTGGGTTTTGAACAAGAATAATTATTTGTTTTTTTAGG
TTTGGTTTGTTGGTTTGATGATTTTGGTCTTTTCTTGAAACTTAATCTTGATGTAAGAAG
CCAAATGAAGCATCAATAAACACAAATATTTCCTCCTCACG

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 7

CO CL826Contig1 884 7 10 U
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TTCCGGAGTCAGTCCTGAAGAAGAAGAAGAGAGAGGAGGAGTGGGCTCTCGAGAAGAAGC
AGAGCGCTGAAGCTGCCAAGAAGACGAACGCCGCCAACAGGAAGGTTATCTACAAAAGAG
CCGAGCAGTACGCCAAGGAGTATGCCGAGAAGGAGAAGGAGTTGATCTCATTGAAACGTG
AGGCTAAGCTTAAGGGAGGTTTCTATGTCGACCCTGAAGCTAAGCTCTTGTTCATCATCC
GTATTCGTGGTATCAATGCCATTGACCCGAAGACTAAGAAGATTCTTCAGCTCTTGCGTT
TGAGACAGATATTCAACGGTGTGTTTCTCAAAGTTAACAAAGCTACAATGAACATGCTTC
GTCGTGTTGAGCCATACGTGACTTACGGGTTCCCCAATTTGAAGAGTGTTAAGGAATTGA
TCTACAAGAGAGGATACGGAAAGCTTAACCACCAGAGGGTGGCTTTGACTGACAACTCTA
TCGTAGAGCAGGCTCTAGGTAAACATGGGATCATCTGCACTGAGGATTTGATCCACGAGA
TTCTAACAGTTGGACCTCATTTCAAGGAGGCCAACAACTTCCTGTGGCCATTCCAACTCA
AGGCACCGCTCGGTGGCCTTAAGAAGAAGAGAAACCACTACGTTGAAGGTGGTGATGCTG
GAAACCGTGAGAACTTCATCAATGAGCTTATCAGGAGGATGAATTAGATGTTTTCTTTTC
CAATCTCAGTTTTTTTATCTATGTTGTCTTCACCAAATGCTTCCTCCAGGATTTTGATCT
TCATTTTGTTCAAGTTAAATGACATTTTGAGTTACTTTGCAACG


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 
35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 0 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1E724TF U 1
AF RS1GL91TF U 4
AF RS1G165TF U 1
AF RS1DT39TF U 2
AF RS1DT39JQ C 37
AF RS1E724JQ C 173
AF RS1G165JQ C 385
BS 1 84 RS1E724TF
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BS 86 622 RS1E724TF
BS 623 662 RS1DT39TF
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BS 825 873 RS1DT39JQ
BS 874 884 RS1E724JQ

RD RS1E724TF 622 0 0
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TTCCGGAGTCAGTCCTGAAGAAGAGGAAGAGAGAGGAGGAGTGGGCTCTCGAGAAGAAGC
AGAGCGCTGAAGCTGCCAAGAAGACGAACGCCGCCAACAGGAAGGTTATCTACAAAAGAG
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AGGCTAAGCTTAAGGGAGGTTTCTATGTCGACCCTGAAGCTAAGCTCTTGTTCATCATCC
GTATTCGTGGTATCAATGCCATTGACCCGAAGACTAAGAAGATTCTTCAGCTCTTGCGTT
TGAGACAGATATTCAACGGTGTGTTTCTCAAAGTTAACAAAGCTACAATGAACATGCTTC
GTCGTGTTGAGCCATACGTGACTTACGGGTTCCCCAATTTGAAGAGTGTTAAGGAATTGA
TCTACAAGAGAGGATACGGAAAGCTTAACCACCAGAGGGTGGCTTTGACTGACAACTCTA
TCGTAGAGCAGGCTCTAGGTAAACATGGGATCATCTGCACTGAGGATTTGATCCACGAGA
TTCTAACAGTTGGACCTCATTT

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DS 

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GG
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GAGTCAGTCCTGAAGAAGAGGAAGAGAGAGGAGGAGTGGGCTCTCGCGAAGAAGCAGAGC
GCTGAAGCTGCCAAGAAGACGAACGCCGCCAACAGGAAGGTTATCTACAAAAGAGCCGAG
CAGTACGCCAAGGAGTATGCCGAGAAGGAGAAGGAGTTGATCTCTTTGAAACGTGAGGCT
AAGCTTAAGGGAGGTTTCTATGTCGACCCTGAAGCTAAGCTCTTGTTCATCATCCGTATT
CGTGGTATCAATGCCATTGACCCGAAGACTAAGAAGATTCTTCAGCTCTTGCGTTTGAGA
CAGATATTCAACGGTGTGTTTCTCAAAGTTAACAAGGCTACAATGAACATGCTTCGTCGT
GTTGAGCCTTACGTGACTTACGGGTTCCCCAATTTGAAGAGTGTTAAGGAATTGATCTAC
AAGAGAGGATACGGAAAGCTTAACCACCAGAGGGTGGCTTTGACTGACAACTCTATCGTA
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ACAGTTGGACCTCATTT

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DS 

RD RS1G165TF 615 0 0
GGGTC
GTCGTCTGTTTGATTGATCTTAAGAATTCGGAAATGGCAGAGTCGAGGATCGTAGTTCCG
GAGTCAGTCCTGAAGAAGAGGAAGAGAGAGGAGGAGTGGGCTCTCGAGAAGAAGCAGAGC
GCTGAAGCTGCCAAGAAGACGAACGCCGCCAACAGGAAGGTTATCTACAAAAGAGCCGAG
CAGTACGCCAAGGAGTATGCCGAGAAGGAGAAGGAGTTGATCTCATTGAAACGTGAGGCT
AAGCTTAAGGGAGGTTTCTATGTCGACCCTGAAGCTAAGCTCTTGTTCATCATCCGTATT
CGTGGTATCAATGCCATTGACCCGAAGACTAAGAAGATTCTTCAGCTCTTGCGTTTGAGA
CAGATATTCAACGGTGTGTTTCTCAAAGTTAACAAAGCTACAATGAACATGCTTCGTCGT
GTTGAGCCATACGTGACTTACGGGTTCCCCAATTTGAAGAGTGTTAAGGAATTGATCTAC
AAGAGAGGATACGAAAAGCTTAACCACCAGAGGGTGGCTTTGACTGACAACTCTATCGTA
GAGCAGGCTCTAGGTAAACATGGGATCATCTGCACTGAGGATTTGATCCACGAGATTCTA
ACAGTTGGAC

QA 6 615 6 615
DS 

RD RS1DT39TF 682 0 0
GGTC
GTCGTCTGTTTGATTGATCTTAAGAATTCGGAAATGGCAGAGTCGAGGGTTGTAGTTCCG
GAGTCAGTCCTGAAGAAGAAGAAGAGAG**GAGGAGTGGGCTCTCGAGAAGAAGCAGAGC
GCTGAAGCTGCCAAGAAGACGAACGCCGCCAACAGGAAGGTTATCTACAAAAGAGCCGAG
CAGTACGCCAAGGAGTATGCCGAGAAGGAGAAGGAGTTGATCTCATTGAAACGTGAGGCT
AAGCTTAAGGGAGGTTTCTATGTCGACCCTGAAGCTAAGCTCTTGTTCATCATCCGTATT
CGTGGTATCAATGCCATTGACCCGAAGACTAAGAAGATTCTTCAGCTCTTGCGTTTGAGA
CAGATATTCAACGGTGTGTTTCTCAAAGTTAACAAAGCTACAATGAACATGCTTCGTCGT
GTTGAGCCATACGTGACTTACGGGTTCCCCAATTTGAAGAGTGTTAAGGAATTGATCTAC
AAGAGAGGATACGGAAAGCTTAACCACCAGAGGGTGGCTTTGACTGACAACTCTATCGTA
GAGCAGGCTCTAGGTAAACATGGGATCATCTGCACTGAGGATTTGATCCACGAGATTCTA
ACAGTTGGACCTCATTTCAAGGAGGCCAACAACTTCCTGTGGCCATTCCAACTCAAG*CA
CCGCTCGGTGGCCTTAAG

QA 5 682 5 682
DS 

RD RS1DT39JQ 837 0 0
G
AATGGCAGAGTCGAGGGTTGTAGT*CCGGAGTCAGTC*TGAAGAAGAAGAAGAGAG**GA
GGAGTGGGCTCTCGAGAAGAAGCAGAGCGCTGAAGCTGCCAAGAAGACGAACGCCGCCAA
CAGGAAGGTTATCTACAAAAGAGCCGAGCAGTACGCCAAGGAGTATGCCGAGAAGGAGAA
GGAGTTGATCTCATTGAAACGTGAGGCTAAGCTTAAGGGAGGTTTCTATGTCGACCCTGA
AGCTAAGCTCTTGTTCATCATCCGTATTCGTGGTATCAATGCCATTGACCCGAAGACTAA
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TTTGAAGAGTGTTAAGGAATTGATCTACAAGAGAGGATACGGAAAGCTTAACCACCAGAG
GGTGGCTTTGACTGACAACTCTATCGTAGAGCAGGCTCTAGGTAAACATGGGATCATCTG
CACTGAGGATTTGATCCACGAGATTCTAACAGTTGGACCTCATTTCAAGGAGGCCAACAA
CTTCCTGTGGCCATTCCAACTCAAGGCACCGCTCGGTGGCCTTAAGAAGAAGAGAAACCA
CTACGTTGAAGGTGGTGATGCTGGAAACCGTGAGAACTTCATCAATGAGCTTATCAGGAG
GATGAATTAGATGTTTTCTTTTCCAATCTCAGTTTTTTTATCTATGTTGTCTTCACCAAA
TGCTTCTTCCAGGATTTTGATCTTCATTTTGTTCAAGTTAAATGACATTTTGAGTT

QA 2 837 2 837
DS 

RD RS1E724JQ 712 0 0
CAAAAGAGCCGAGCAGTACGCCAAGGAGTATGCCGAGAAGGAGAAGGAGTTGATCTCATT
GAAACGTGAGGCTAAGCTTAAGGGAGGTTTCTATGTCGACCCTGAAGCTAAGCTCTTGTT
CATCATCCGTATTCGTGGTATCAATGCCATTGACCCGAAGACTAAGAAGATTCTTCAGCT
CTTGCGTTTGAGACAGATATTCAACGGTGTGTTTCTCAAAGTTAACAAAGCTACAATGAA
CATGCTTCGTCGTGTTGAGCCATACGTGACTTACGGGTTCCCCAATTTGAAGAGTGTTAA
GGAATTGATCTACAAGAGAGGATACGGAAAGCTTAACCACCAGAGGGTGGCTTTGACTGA
CAACTCTATCGTAGAGCAGGCTCTAGGTAAACATGGGATCATCTGCACTGAGGATTTGAT
CCACGAGATTCTAACAGTTGGACCTCATTTCAAGGAGGCCAACAACTTCCTGTGGCCATT
CCAACTCAAGGCACCGCTCGGTGGCCTTAAGAAGAAGAGAAACCACTACGTTGAAGGTGG
TGATGCTGGAAACCGTGAGAACTTCATCAATGAGCTTATCAGGAGGATGAATTAGATGTT
TTCTTTTCCAATCTCAGTTTTTTTATCTATGTTGTCTTCACCAAATGCTTCCTCCAGGAT
TTTGATCTTCATTTTGTTCAAGTTAAATGACATTTTGAGTTACTTTGCAACG

QA 1 712 1 712
DS 

RD RS1G165JQ 498 0 0
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ACGGGTTCCCCAATTTGAAGAGTGTTAAGGAATTGATCTACAAGAGAGGATACGAAAAGC
TTAACCACCAGAGGGTGGCTTTGACTGACAACTCTATCGTAGAGCAGGCTCTAGGTAAAC
ATGGGATCATCTGCACTGAGGATTTGATCCACGAGATTCTAACAGTTGGACCTCATTTCA
AGGAGGCCAACAACTTCCTGTGGCCATTCCAACTCAAGGCACCGCTCGGTGGCCTTAAGA
AGAAGAGAAACCACTACGTTGAAGGTGGTGATGCTGGAAACCGTGAGAACTTCATCAATG
AGCTTATCAGGAGGATGAATTAGATGTTTTCTTTTCCAATCTCAGTTTTTTTATCTATGT
TGTCTTCACCAAATGCTTCCTCCAGGATTTTGATCTTCATTTTGTTCAAGTTAAATGACA
TTTTGAGTTACTTTGCA
T

QA 1 497 1 497
DS 



AS 2 4

CO CL827Contig1 804 2 10 U
GGAATGCAAAAATAGAAAGAATATAAATAAAGGCGCATACACGGGAAGGGGGCACCACTA
CTTCCAGGGGGAGACTAGCCTCATTACTTCTTAGTGGGCGAGAGGCGCGCCTAACCCACC
TACCCACTCATAAATCACAGTGTTCAGCTGACTTGAACTGATAGACCCCTATTGTATTGG
AATTTAGCGCCCATCTTTTGACTGCTGTCAACGAATCTCTTCAATGTTCGATTCTACTCT
ATGTTAGAACATTTCTGTGAATGCTATTTTAATCTAAGTGGTCTTATTCTGTGTCCTGTG
CTAGGAAGCATTATTCTTCTTTTCATTCCAAATTCAAGAATACGACTGATACGATTAATT
GGTTTGTGTGCCTCTCTTATTACTTTTTTGTATTCTCTTGTTCTTTGGATACAATTCGAC
TCTTCTACGGCCAAATTTCAATTTGTGGAAAGCCTTCGATGGCTTCCTTATGAAAACATC
AATTTTTATTTGGGTATAGACGGTATCTCTTTATTCTTCGTGATATTGACCACATTTCTG
ATCCCTATTTGCATTTTAGTGGGTTGGTCTGGTATGAGAAGTTATGGGAAAGAGTATATT
ATAGCATTTTTAATTTGTGAATTTCTAATGATCGCCGTGTTCTGCATGCTGGATCTTCTA
CTATTCTATGTTTTTTTCGAAAGCGTGCTAATCCCTATGTTCATTATTATAGGAGTATGG
GGTTCGAGACAAGAAGATCAAGCAGCATATCAGTTTTCCTTTATACTTTACTTGGATCTC
TTTTATGCTATAGCTATTCTGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DX71TF U 1
AF RS1GH78TF U 12
BS 1 76 RS1DX71TF
BS 77 77 RS1GH78TF
BS 78 113 RS1DX71TF
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RD RS1DX71TF 704 0 0
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CTAGGAAGCATTATTCTTCTTTTTATTCCAAATTCAAGAATACGACTGATACGATTAATT
GGTTTGTGTGCCTCTCTTATTACTTTTTTGTATTCTCTTTTTCTTTGGATACAATTCGAC
TCTTCTACGGCCAAATTTCAATTTGTGGAAAGCCTTCGATGGCTTCCTTATGAAAACATC
AATTTTTATTTGGGTATAGACGGTATCTCTTTATTCTTCGTGATATTGACCACATTTCTG
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ATAGCATTTTTAATTTGTGAATTTCTAATGATCGCCGTGTTCTGCATGCTGGATCTTCTA
CTATTCTATGTTTTTTTCGAAAGCGTGCTAATCCCTATGTT
GTG

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DS 

RD RS1GH78TF 793 0 0
G
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ATCTTTTGACTGTTGTCAACGAATCTCTTCAATGTTCGATTCTACTCTATGTTAGAACAT
TTCTGTGAATGCTATTTTAATCTAAGTGGTCTTATTCTGTGTCCTGTGCTAGGAAGCATT
ATTCTTCTTTTCATTCCAAATTCAAGAATACGACTGATACGATTAATTGGTTTGTGTGCC
TCTCTTATTACTTTTTTGTATTCTCTTGTTCTTTGGATACAATTCGACTCTTCTACGGCC
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GGTATAGACGGTATCTCTTTATTCTTCGTGATATTGACCACATTTCTGATTCCTATTTGC
ATTTTAGTGGGTTGGTCTGGTATGAGAAGTTATGGGAAAGAGTATATTATAGCATTTTTA
ATTTGTGAATTTCTAATGATCGCCGTGTTCTGCATGCTGGATCTTCTACTATTCTATGTT
TTTTTCGAA*GCGTGCTAATCCCTATGTTCATTATTATAGGAGTATGGGGTTCGAGACAA
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GCTATTCTGTTG

QA 2 793 2 793
DS 



CO CL827Contig2 1164 2 6 U
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TCCAGGAACACTTTGGGGTAAACACCCATCCAAACGACTCCAACAAGAAAAGGTATAAAT
ATGAAAACTTCTCTGCCATTTAAATCGGAGAATTTATGGAGGAAATCGGGTTTTAATTTC
CAGAAACCACACGATTATATAGCCAAAGGGAATAGGCCGCACCTAAAATCATCCCAGGCG
CTGCTAATGTGGCTACTAAGCTATTTCTTTGGAAAGCTCCTACTAAGATGAGAAATTCCC
CGATAAAGCTGCTAGTACCAGGTAAACTCATATTGGCCAAAGTAAAAAAAAGAAAATGGT
AGAGAAATTCGGCATGGTGCTCACTAAACCTCCATAATATCTAACAAGTCGAGTCTTATG
TCGGTCATATAGAACACCAACACATAGAAAAAGGGCTGAAGAAACCAGTCCATGACTTAA
CATCAGTAGAATACTACCTCCAATTCCCTGTATGTTCAGACTAAACATACCAATAGTCAC
CAGATTCATATGGGCTACTGAGGAGTAAGCAATGATCTTCTTTAGATCGATCTGTCTTAA
AGTGGTCAAGGAAGTATATATTATAGCAATCGCGCTTAAAGTATAAATGAAAGGAGTAAA
ACAAAGTGTCGCTTCGGGAAACATGGGTATTGAAAATCTTAAAAACCCGTAGGTTCCAAA
TTTTAAAAGAATTCCTGCCAAGATGACGGATCCTGCCGTAGGTGCCTCTACATGAGCTTC
GGGTAACCAAATATGAACTGGTACCATAGGCACTTTGACGGCGAAAGGGGCGAAAAAAGC
AATCCATAGAAAGATTTGGCGCCGCTCACTAAATTCTGTGGTTAATAATATTTGTAAATC
GGTGGTTCCTGTTTGGAAAAGAATCAACAGAATAGCTAATAGCATAAAAAGAGATCCAAG
TAAAGTATAAAGGAAAAACTGATATGCTGCCTTGATCTTTCTTTGTCTCGAACCCCATAC
TCCTATAATAATGAACATAGGGATTAGCACGCTTTCGAAAAAAACATAGAATAGTAGAAG
ATCCAGCATGCAGAACACGGCGATCGTTAGAAATTCACAAATTAAAAATGCTATAATATA
CTCTTTCCCATAACTTCTCATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GH78JQ U 1
AF RS1D818TF C 512
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BS 763 793 RS1GH78JQ
BS 794 1164 RS1D818TF

RD RS1GH78JQ 793 0 0
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ACAAAGTGTCGCTTCGGGAAACATGGGTATTGAAAATCTTAAAAACCCGTAGGTTCCAAA
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GGGTAACCAAATA

QA 1 793 1 793
DS 

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AATTCACAAATTAAAAATGCTATAATATACTCTTTCCCATAACTTCTCATACC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 4

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ATGGTACCAACTCTGAGGAACGATGATTGGCTTTAGTGCCTCTACGGTTCCAGATTGAAG
TTGTCTCAATGAGCTTGAAGGGGACAAGCCTCCTCTCCCGCTTGCTTAGCTTCTTCTTGC
AGTTGTGAACCTTGAGCTTGGCAATCTCAGCTTCTTCCTCTGGAGTCGTCTCTCTAACTA
CGACAGTTAGACGACACTCGGGTCTTATCATCACCCCGGATTTTCCTTTTCCATGGATAG
ATATCCTCTCCTTGAACAGTCCCTTCCCAACAAACGCTTCCGCAATGATGAGACGGTCAG
GATCTAGTCCATGGTTATGAGAAGCATTAGCTCGGGCGGCGTGGATAACCCGGTACACGG
TATGGGAAGCCCGTTTAACAGTGACTTGCAGTTGCATCAGAGCATCTTCAACTCGCATAC
CACGTACTAGCGCTGCAACTAGGTTGACCTTCTTAGGACTCTGCTTAATGGCCTTGAGTA
CAGCCTGCACTTTCTTACGCTTAGGGATAATCTTCTGCTCTTTTTCTTCTTTTCTAGTAC
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TTGACGTCGAAATCCCCACTTGCTGTAGATAATGATGCAGTGGTGTTGAGGTGTAGGTTG
GTCTCAACAAACCCTGCAAGTAACCTTTTGAGAAAGGGGATTCCAAACTACGAGCTGAAG
AGTAATTGGCTCTCGAAGCGTTACTGTTCGTCACTCTTCTCGCAACTTGACGAATTAACT
GTAGATTCCTCTGCCAACCCGCCATTGTTTTTCCTGAGAAAAAACCTCTTCTGTAAACGC
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ATCAATCGGAACATCTAGGGTTTATCAATCGGAGAGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DK82JQ U 1
AF RS1DQ13JQ U 6
AF RS1DK82TF C 275
AF RS1C725TF C 342
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ATGGTTATGAGAAGCATTAGCTCGGGCGGCGTGGATAACCCGGTACACGGTATGGGAAGC
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C
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GAGAAAAAA

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TTTT
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DS 



AS 1 6

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BQ
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 

AF RS1A962JQ U 23
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AF RS1DI32TF C 27
AF RS1E123TF C 27
AF RS1DI32JQ U 31
AF RS1E123JQ U 31
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CGAG
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GAATCTTAGAGAGTTAAGAGAGAGACTACGACCACGAACCC

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DS 



AS 2 6

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TACATCACCACAACCACATGTTTCAGACGAAGAAAAAGTCACTGACATAGAAAAACATAC
ATCATATAGTTCTTAGGTGCCAAAAGACAAATGCTATACCCATATCTAAAGAGTTTTTAA
AGACATGTGAAAAAACATAAAACATGCGAAGGGAAAGGAGAGAAAAAAAAAAAAGAAAAC
AAACAGACACAGTCCGAGAAAACCCACATCCTCTTTACTCTTTAAAACCTGCAAAACATG
CTAGAGGAACGAGCAAGCCTAATAGTCAGACCACCAGGGTGAACACTAGTCTCGACCTTC
ACTGGGTTCTTCTCATACGGCTTCCTGCAGCCTGGACAACGCCCATCTCCATCGCAAATC
GTCTTGGGGCAAAAAAGGCAAAGCCGGAACCCACAAGGGCATGGCAAGAAACTAGAATCC
GTCAAGTCCAGATCCTCGTAGCAAATGGGGCATGAAAACGGCACTGCCACGGAACTAAAA
TGCATGTTCATGACAGGGAAACTACGCTGCTTCCCCAAATTAGGCAAACCCTGAGGACGG
AGCTTATCGTCTGCCCTCCACGCCTGGTTGCTCTTTTGCTTCCTTACAGGCTTCACATCA
GATGAATCCCTAAGCGAAGCTGATTGCTTGATACTCTCATGCTCTTGAGGAGGAGGATTC
ACTTTCTCATGCTTTTTTTCTTCATCAGCTGCTAAAGCATCAGCAAAAGCCTCCCAGTCA
TCCAAGCAACCGTCGTCGTTGTCATCATCAGCAGCAGCATCCTCTTCTTCTTCCTCTGTT
ATATTACCAGAGCAAGAGCCACCACTCCCACTGCTACTCCCGCTGCTAAAATCAGGGATT
GAATTGAGGATACTGTTGGGGCTATTCGAAAGCGATGATTCCATAAAGCTCTCCTCGTGA
CGATGTGCTTCTTCTTCTCCTCCACGCTGCTGCCCTTCTAAATTCTCAACCGGAAGAACA
GTTTTTCCATTTCCAGTTTTTCGATTGGGACTCGTCTCCTCCTTATCCCCTTTGTTAATC
ATCGCAACTTGAGAAAGCCATTGCTCACGGCGGAGACCTAGCTTGCTCTGTTTCAATTTC
GCCGCCCTGTTCGTCTGCCTTTTCTTCTTCCCCATATCCCTCGCGCATGGGGCTGCAGAA
GCAGATGCGTTGGTTATCGAATCAGAAATCATGTCTTTTTTTGCAGCTGATTCCGATATC
GCTAAATTCAAACACGAAGGTGTGTGTGAAGATTCTCAAAAACCCTAATCAGATTCGTCG
CGCGGACAAGGAGCTGTGACCTTTCTTTGTTTGTTGTTGTGTCTGTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1FM05JQ U 1
AF RS1DK49JQ U 103
AF RS1FM05TF C 673
AF RS1DK49TF C 739
BS 1 279 RS1FM05JQ
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BS 588 592 RS1FM05JQ
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BS 1340 1340 RS1DK49TF
BS 1341 1368 RS1FM05TF

RD RS1FM05JQ 592 0 0
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TACATCACCACAACCACATGTTTCAGACGAAGAAAAAGTCACTGACATAGAAAAACATAC
ATCATATAGTTCTTAGGTGCCAAAAGACAAATGCTATACCCATATCTAAAGAGTTTTTAA
AGACATGTGAAAAAACATAAAACATGCGAAGGGAAAGGAGAGAAAAAAAAAAAAGAAAAC
AAACAGACACAGTCCGAGAAAACCCACATCCTCTTTACTTTTTAAGACCTGCAAAACATG
CTAGAGGAACGAGCAAGCCTAATAGTCAGACCACCAGGGTGAACACTAGTCTCGACCTTC
ACTGGGTTCTTCTCATACGGCTTCCTGCAGCCTGGACAACGCCCATCTCCATCGCAAATC
GTCTTGGGGCAAAAAAGGCAGAGCCGGAACCCACAAGGGCATGGCAAGAAACTAGAATCC
GTCAAGTCCAGATCCTCGTAGCAAATGGGGCATGAAGACGGCACTGCCACGGAACTAAAA
TGCATGTTCATGACAGGGAAACTACGCTGCTTCCCCAAATTAGGCAGACCCT

QA 1 592 1 592
DS 

RD RS1DK49JQ 789 0 0
C
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ATCTAAAGAGTTTTTAAAGACATGTGAAAAAACATAGAACATGCGAAGGGAAAGGAGAGA
AAAAAAAAA**GAAAACAAACAGACACAGTCCGAGAAAACCCACATCCTCTTTACTCTTT
AAAACCTGCAAAACATGCTAGAGGAACGAGCAAGCCTAATAGTCAGACCACCAGGGTGAA
CACTAGTCTCGACCTTCACTGTGTTCTTCTCATACGGCTTCCTGCAGCCTGGACAACGCC
CATCTCCATCGCAAATCGTCTTGTGGCAAAAAAGGCAAAGCCGGAACCCACAAGGGCATG
GCAAGAAACTAGAATCCGTCAAGTCCAGATCCTCGTAGCAAATGGGGCATGAAAACGGCA
CTGCCACGGAACTAAAATGCATGTTCATGACAGGGAAACTACGCTGCTTCCCCAAATTAG
GCAAACCCTGAGGACGGAGCTTATCGTCTGCCCTCCACGCCTGGTTGCTCTTTTGCTTCC
TTACAGGCTTCACATCAGATGAATCCCTAAGCGAAGCTGATTGCTTGATACTCTCATGCT
CTTGAGGAGGAGGATTCACTTTCTCATGCTTTTTTTCTTCATCAGCTGCTAAAGCATCAG
CAAAAGCCTCCCAGTCATCCAAGCAACCGTCGTCGTTGTCATCATCAGCAGCAGCATCCT
CTTCTTCTTCCTCTGTTATATTACCAGAGCAAGAGCCACCACTCCCACTGCTACTCCCGC
TGCTAAAA

QA 2 789 2 789
DS 

RD RS1FM05TF 696 0 0
AGCGAAGCTGATTGCTTGATACTCTCATGCTCTTGAGGAGGAGGATTCACTTTCTCATGC
TTTTTT*CTTCATCAGCTGCTAAAGCATCAGCAAAAGCCTCCCAGTCATCCAAGCAACCG
TCGTCGTTGTCATCATCAGCAGCAGCATCCTCTTCTTCTTCCTCTGTTATATTACCAGAG
CAAGAGCCACCACTCCCACTGCTACTCCCGCTGCTAAAATCAGGGATTGAATTGAGGATA
CTGTTGGGGCTATTCGAAAGCGATGATTCCATAAAGCTCTCCTCGTGACGATGTGCTTCT
TCTTCTCCTCCACGCTGCTGCCCTTCTAAATTCTCAACCGGAAGAACAGTTTTTCCATTT
CCAGTTTTTCGATTGGGACTCGTCTCCTCCTTATCCCCTTTGTTAATCATCGCAACTTGA
GAAAGCCATTGCTCACGGCGGAGACCTAGCTTGCTCTGTTTCAATTTCGCCGCCCTGTTC
GTCTGCCTTTTCTTCTTCCCCATATCCCTCGCGCATGGGGCTGCAGAAGCAGATGCGTTG
GTTATCGAATCAGAAATCATGTCTTTTTTTGCAGCTGATTCCGATATCGCTAAATTCAAA
CACGAAGGTGTGTGTGAAGATTCTCAAAAACCCTAATCAGATTCGTCGCGCGGACAAGGA
GCTGTGATCTTTCTTTGTTTGTTGTTGTGTCTGTCC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RS1DK49TF 630 0 0
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TTGTCATCATCAGCAGCAGCATCCTCTTCTTCTTCCTCTGTTATATTACCAGAGCAAGAG
CCACCACTCCCACTGCTACTCCCGCTGCTAAAATCAGGGATTGAATTGAGGATACTGTTG
GGGCTATTCGAAAGCGATGATTCCATAAAGCTCTCCTCGTGACGATGTGCTTCTTCTTCT
CCTCCACGCTGCTGCCCTTCTAAATTCTCAACCGGAAGAACAGTTTTTCCATTTCCAGTT
TTTCGATTGGGACTCGTCTCCTCCTTATCCCCTTTGTTAATCATCGCAACTTGAGAAAGC
CATTGCTCACGGCGGAGACCTAGCTTGCTCTGTTTCAATTTCGCCGCCCTGTTCGTCTGC
CTTTTCTTCTTCCCCATATCCCTCGCGCATGGGGCTGCAGAAGCAGATGCGTTGGTTATC
GAATCAGAAATCATGTCTTTTTTTGCAGCTGATTTCGATATCGCTAAATTCAAACACGGA
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ACCTTTCTTTGTTTGTTGTTGTGTCTGTCC

QA 1 630 1 630
DS 



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GGGACTTGACGGGTTCTAGTTTCTTGCCATGCCCTTGTGGATTCCGGCTCTGCCTTTTCT
GCCACAAGACGATCTGCGATGGAGATGGGCGTTGTCCAGGCTGCAGGAAGCCGTATGAGA
AGAACACAGTGAAGATCGAGACTAGTGTTCACCCTGGTGGTCTGACTATTAGGCTTGCTC
GTTCCTCTAGCATGTTTTGCAGGTCTTAAAGTAAAGAGGATGTGGGTTTTCTCGGACTGT
GTCTGTTTGTTTTCTCTCACTTTTTTCTTTTTCCTTTCCCTTCGCATGTTCTATGTTTTT
TCACATGTCTTTAAAAACTCTTTAGATATGGGTATAGCATTTTGTCTTTTGGCACCTAAG
AACTATGATGTATGTTCTTCTATGTCAGTGGCTTCTTCTTCGTCCG


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1H776JQB C 1
AF RS1H776TF U 1
BS 1 1 RS1H776JQB
BS 2 404 RS1H776TF
BS 405 406 RS1H776JQB

RD RS1H776JQB 406 0 0
GGGACTTGACGGGTTCTAGTTTCTTGCCATGCCCTTGTGGATTCCGGCTTTGCCTTTTTT
GCCACAAGACGATTTGCGATGGAGATGGGCGTTGTCCAGGCTGCAGGAAGCCGTATGAGA
AGAACACAGTGAAGATCGAGACTAGTGTTCACCCTGGTGGTTTGACTATTAGGCTTGCTC
GTTCCTCTAGCATGTTTTGCAGGTCTTAAAGTAAAGAGGATGTGGGTTTTCTCGGACTGT
GTCTGTTTGTTTTCTCTCACTTTTTTCTTTTTCCTTTCCCTTCGCATGTTTTATGTTTTT
TCACATGTCTTTAAAAACTCTTTAGATATGGGTATAGCATTTTGTCTTTTGGCACCTAAG
AACTATGATGTATGTTTTTCTATGTCAGTGGCTTTTTCTTCGTCCG

QA 1 406 1 406
DS 

RD RS1H776TF 406 0 0
G
GGACTTGACGGGTTCTAGTTTCTTGCCATGCCCTTGTGGATTCCGGCTCTGCCTTTTCTG
CCACAAGACGATCTGCGATGGAGATGGGCGTTGTCCAGGCTGCAGGAAGCCGTATGAGAA
GAACACAGTGAAGATCGAGACTAGTGTTCACCCTGGTGGTCTGACTATTAGGCTTGCTCG
TTCCTCTAGCATGTTTTGCAGGTCTTAAAGTAAAGAGGATGTGGGTTTTCTCGGACTGTG
TCTGTTTGTTTTCTCTCACTTTTTTCTTTTTCCTTTCCCTTCGCATGTTCTATGTTTTTT
CACATGTCTTTAAAAACTCTTTAGATATGGGTATAGCATTTTGTCTTTTGGCACCTAAGA
ACTATGATGTATGTTCTTCTATGTCAGTGGCTTCTTCTTCGTC
CG

QA 2 404 2 404
DS 



AS 0 0

AS 2 6

CO CL832Contig1 723 4 16 U
GGATACACATCTTTCTTGATAATGTGTTCATCTATCCCTTCTCCAATGGCTATGCAGTTA
AGTTTCCTAGCTTTGTTCCTTTTCACGGCAGCTTTGATCTCATCTTCCCTCGTGGTCTCG
GTTTCGCTCGTCGAAGGAAGAGTCTCTTGTTACGACTGCCCCAGTGATTACGATTATTCA
GGAATCATGATCACTGTTAGTTGTAGCCACTCCAAGACGCGTTTCACCGTCTCAACCGAC
AAGAAGGGCGAGTTTATGTCGGAACTTCCCTAGAGAGTCAAATCGGATTGCAAAGCGGAG
CTCCAAGGTAGCTTCAAGTAACTTTATGCTTCCAAAAGGAACATTATGTCGAAGATTGTT
AAGCTCGAAGGTGACAAATATGGTCTCTCTTCGAAGTTGATCTTCTTGAAATCATGTCCA
AGAAGCCTCAGATCTTTCAGTTCGTCCAAGACCGTTGATTTGCCTGTTCCTCCGGAGTGG
GGGCTGGCTCCCACGAGCTATTATCTTCCCTTCTTCCCCATCATCGGTATCCCATAAGAT
GCACCGTTTAAACATATATCTTTTGCGGCTCATGTGTAATATTTAATAATGTAAGTGCAA
AGACATGTATTTATCTTAGCTGTCTTTTTAAGTCCATGCCCTGAACTGAAGTTTGTGTGT
GA*****GTGTACGAAGGTGGTTTGATGTTTTCTTTTTATATATGAAGCATAATTTAATA
GTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1D887TF U 1
AF RS1B848TF U 23
AF RS1BZ31JQ C 1
AF RS1BZ31TF U 42
BS 1 271 RS1D887TF
BS 272 272 RS1BZ31TF
BS 273 318 RS1D887TF
BS 319 319 RS1BZ31TF
BS 320 446 RS1D887TF
BS 447 447 RS1B848TF
BS 448 568 RS1D887TF
BS 569 569 RS1B848TF
BS 570 597 RS1D887TF
BS 598 602 RS1B848TF
BS 603 603 RS1BZ31TF
BS 604 662 RS1B848TF
BS 663 667 RS1BZ31TF
BS 668 671 RS1B848TF
BS 672 722 RS1BZ31TF
BS 723 723 RS1BZ31JQ

RD RS1D887TF 597 0 0
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AGTTTCCTAGCTTTGTTCCTTTTCACGGCAGCTTTGATCTCATCTTCCCTCGTGGTCTCG
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CTCCAAGGTAGCTTCAAGCAACTTTATGCTTCCAAAAGGAACATTATGTCGAAGATTGTT
AAGCTCGAAGGTGACAAATATGGTCTCTCTTCGAAGTTGATCTTCTTGAAATCATGTCCA
AGAAGCCTCAGATCTTTCAGTTCGTCTAAGACCGTTGATTTGCCTGTTCCTCCGGAGTGG
GGGCTGGCTCCCACGAGCTATTATCTTCCCTTCTTCCCCATCATCGGTATCCCATAAGAT
GCACCGTTTAAACATATATCTTTTGCGGTTCATGTGTAATATTTAATAATGTAAGTG

QA 1 597 1 597
DS 

RD RS1B848TF 649 0 0
TGTGTTCATCTATCCCTTCTCCAATGGCTATGCAGTTAAGTTTCCTAGCTTTGTTCCTTT
TCACGGCAGCTTTGATCTCATCTTCCCTCGTGGTCTCGGTTTCGCTCGTCGAAGGAAGAG
TCTCTTGTTACGACTGCCCCAGTGATTACGATTATTCAGGAATCATGATCACTGTTAGTT
GTAGCCACTCCAAGACGCGTTTCACCGTCTCAACCGACAAGAAGGGCGAGTT*ATGTCGG
AACTTCCCTCGAGAGTCAAATCGGATTGCAAAGCGGAGCTCCAAGGTAGTTTCAAGCAAC
TTTATGCTTCCAAAAGGAACATTATGTCGAAGATTGTTAAGCTCGAAGGTGACAAATATG
GTCTCTCTTCGAAGTTGATCTTCTTGAAATCATGTCCAAGAAGCCTCAGATCTTTCAGTT
CGTCCAAGACCGTTGATTTGCCTGTTCCTCCGGAGTGGGGGCTGGCTCCCACGAGCTATT
ATCTTCCCTTCTTCCCCATCATCGGTATCCCATAAGATGCACCGTTTAAACATATATCTT
TTGCGGCTCATGTGTAATATTTAATAATGTAAGTGCAAAGGCATGTATTTATCTTAGCTG
TCTTTTTAAGTCCATGCCCTGAACTGAAGTTTGTGTGTGATATTAGTGT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1BZ31JQ 723 0 0
GGATACACATCTTTCTTGATAATGTGTTCATCTATCCCTTCTCCAATGGCTATGCAGTTA
AGTTTCCTAGCTTTGTTCCTTTTCACGGCAGCTTTGATCTCATCTTCCCTCGTGGTCTCG
GTTTCGCTCGTCGAAGGAAGAGTCTCTTGTTACGACTGCCCCAGTGATTACGATTATTCA
GGAATCATGATCACTGTTAGTTGTAGCCACTCCAAGACGCGTTTCACCGTCTCAACCGAC
AAGAAGGGCGAGTTTATGTCGGAACTTCCCTAGAGAGTCAAATCGGATTGCAAAGCGGAG
CTCCAAGGTAGCTTCAAGTAACTTTATGCTTCCAAAAGGAACATTATGTCGAAGATTGTT
AAGCTCGAAGGTGACAAATATGGTCTCTCTTCGAAGTTGATCTTCTTGAAATCATGTCCA
AGAAGCCTCAGATCTTTCAGTTCGTCCAAGACCGTTGATTTGCCTGTTCCTCCGGAGTGG
GGGCTGGCTCCCACGAGCTATTATCTTCCCTTCTTCCCCATCATCGGTATCCCATAAGAT
GCACCGTTTAAACATATATCTTTTGCGGCTCATGTGTAATATTTAATAATGTAAGTGCAA
AGACATGTATTTATCTTAGCTGTCTTTTTAAGTCCATGCCCTGAACTGAAGTTTGTGTGT
GA*****GTGTACGAAGGTGGTTTGATGTTTTCTTTTTATATATGAAGCATAATTTAATA
GTG

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1BZ31TF 682 0 0
TCCAATGGCTATGCAGTTAAGTTTCCTAGCTTTGTTCCTTTTCACGGCAGCTTTGATCTC
ATCTTCCCTCGTGGTCTCGGTTTCGCTCGTCGAAGGAAGAGTCTCTTGTTACGACTGCCC
CAGTGATTACGATTATTCAGGAATCATGATCACTGTTAGTTGTAGCCACTCCAAGACGCG
TTTCACCGTCTCAACCGACAAGAAGGGCGAGTTTATGTCGGAACTTCCCTAGAGAGTCAA
ATCGGATTGCAAAGCGGAGCTCCAAGGTAGCTTCAAGTAACTTTATGCTTCCAAAAGGAA
CATTATGTCGAAGATTGTTAAGCTCGAAGGTGACAAATATGGTCTCTCTTCGAAGTTGAT
CTTCTTGAAATCATGTCCAAGAAGCCTCAGATCTTTCAGTTCGTCCAAGACCGTTGATTT
GCCTGTTCCTCCGGAGTGGGGGCTGGCTCCCACGAGCTATTATCTTCCCTTCTTCCCCAT
CATCGGTATCCCATAAGATGCACCGTTTAAACATATATCTTTTGCGGCTCATGTGTAATA
TTTAATAATGTAAGTGCAAAGACATGTATTTATCTTAGCTGTCTTTTTAAGTCCATGCCC
TGAACTGAAGTTTGTGTGTGA*****GTGTACGAAGGTGGTTTGATGTTTTCTTTTTATA
TATGAAGCATAATTTAATAGT
G

QA 1 681 1 681
DS 



CO CL832Contig2 692 2 2 U
TCCTTCTTCCAATGGCTATGCAGTTAAGTTTCCTAGCTTTGTTCCTGTTCACGGTAGCTT
TGATCTCATCTTCCCTCGTGGTCTCGGTTTCGCTCGTCGAAGGAAAAGTCTCTTGTTACG
ACTGTCCCAGTGATTACGATTATTCAGGAATCATGATCAGCGTTAGTTGTAGCCACTCCA
AGACGCGTTTCACCGTCTTAACCGACAAGAAGGGCGAGTTTATGTCGGAGCTTCCCTCGA
GAGTCAAATCGGATTGCGAAGCGGAGCTCCAAGGTAGTTTCAAGCAACTTTATGCTTCCA
AAAAGGACATTATGTCGAGGATTGTTAAGCTCGAAGGTGGCAAATATGGTCTCTCTTCGA
AGTTGATTTTCTTGAAATCATGTCCAAGAAGCCTCAGATCTTTCAGTTCGTCCAAGACCG
TTGATTTGCCTGTTCCTCCGGAGTGGGGGCTGGCTCCCACGAGCTATTATCTTCCCTTCT
TCCCCATCATCGGTATCCCATAAGATGCACCGTTTAAACATATCTTTTGCGGATCATGTA
ATATTTAATAATGTAAGTGCAAAGACATGTATTTATCTTAGTTGTCTTTTAAGTCCATGC
CTGAACTTAAGTTTGTGTGTGATATTAGTGTACGAAGGTGGTTGATGTTTTTTTTTTATA
TATGAAGCATAATTTAATAGTAAATCACTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DI66TF U 1
AF RS1DI66JQ C 71
BS 1 631 RS1DI66TF
BS 632 692 RS1DI66JQ

RD RS1DI66TF 634 0 0
TCCTTCTTCCAATGGCTATGCAGTTAAGTTTCCTAGCTTTGTTCCTGTTCACGGTAGCTT
TGATCTCATCTTCCCTCGTGGTCTCGGTTTCGCTCGTCGAAGGAAAAGTCTCTTGTTACG
ACTGTCCCAGTGATTACGATTATTCAGGAATCATGATCAGCGTTAGTTGTAGCCACTCCA
AGACGCGTTTCACCGTCTTAACCGACAAGAAGGGCGAGTTTATGTCGGAGCTTCCCTCGA
GAGTCAAATCGGATTGCGAAGCGGAGCTCCAAGGTAGTTTCAAGCAACTTTATGCTTCCA
AAAAGGACATTATGTCGAGGATTGTTAAGCTCGAAGGTGGCAAATATGGTCTCTCTTCGA
AGTTGATTTTCTTGAAATCATGTCCAAGAAGCCTCAGATCTTTCAGTTCGTCCAAGACCG
TTGATTTGCCTGTTCCTCCGGAGTGGGGGCTGGCTCCCACGAGCTATTATCTTCCCTTCT
TCCCCATCATCGGTATCCCATAAGATGCACCGTTTAAACATATCTTTTGCGGATCATGTA
ATATTTAATAATGTAAGTGCAAAGACATGTATTTATCTTAGTTGTCTTTTAAGTCCATGC
CTGAACTTAAGTTTGTGTGTGATATTAGTGT
ACG

QA 1 631 1 631
DS 

RD RS1DI66JQ 622 0 0
TTCCCTCGTGGTCTCGGTTTCGCTCGTCGAAGGAAAAGTCTCTTGTTACGACTGTCCCAG
TGATTACGATTATTCAGGAATCATGATCAGCGTTAGTTGTAGCCACTCCAAGACGCGTTT
CACCGTTTTAACCGACAAGAAGGGGGAGTTTATGTCGGAGCTTCCCTCGAGAGTCAAATC
GGATTGGGAAGCGGAGCTCCAAGGTAGTTTCAAGCAACTTTATGCTTCCAAAAAGGACAT
TATGTCGAGGATTGTTAAGCTCGAAGGTGGCAAATATGGTCTTTTTTCGAAGTTGATTTT
CTTGAAATCATGTCCAAGAAGCCTCAGATCTTTCAGTTCGTCCAAGACCGTTGATTTGCC
TGTTCCTCCGGAGTGGGGGCTGGCTCCCACGAGCTATTATCTTCCCTTCTTCCCCATCAT
CGGTATCCCATAAGATGCACCGTTTAAACATATCTTTTGCGGATCATGTAATATTTAATA
ATGTAAGTGCAAAGACATGTATTTATTTTAGTTGTCTTTTAAGTCCATGCCTGAACTTAA
GTTTGTGTGTGATATTAGTGTACGAAGGTGGTTGATGTTTTTTTTTTATATATGAAGCAT
AATTTAATAGTAAATCACTTTT

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 7

CO CL833Contig1 845 7 11 U
TACGGCCGGGGGGGCTGTGTGTGCGGCTCTGCGAAACTTCGAAAATGGGTGCGTACAAGT
ATGTATCTGAGCTATGGAGGAAGAAGCAGTCCGATGTCATGAGGTTCGTGCAGAGGGTGA
GGTGCTGGGAGTACAGACAGCAACCTTCCATTGTCCGTCTCGTCAGGCCTACTCGTCCCG
ACAAGGCTCGTCGTTTGGGTTACAAGGCCAAACAGGGCTTTGTGGTGTACCGTGTCCGTG
TGAGACGTGGTGGACGCAAGAGGCCAGTGCCAAAGGGTATTGTCTACGGTAAGCCCACAA
ACCAGGGAGTAACCCAGCTCAAGTTCCAGAGGAGCAAGCGTTCCGTTGCCGAGGAGCGTG
CTGGAAGAAAACTGGGCGGCCTCAGAGTCGTCAACTCCTACTGGCTCAACGAGGATTCGA
CTTACAAGTACTACGAGATCATCTTGGTTGACCCGGCGCACAACGCCGTGCGTAACGACC
CGAGAATCAACTGGATCTGCAACCCGGTGCACAAACACCGTGAGCTCAGAGGACTTACTT
CCGAGGGAAAGAAGAACAGAGGACTTCGCGGAAAGGGTCACAACAACCATAAGAACCGCC
CTTCTCGCAGAGCTACTTGGAAGAAGAACAATTCTCTCTCCCTTCGCCGTTACCGTTAAT
TGCATTTTTGCTGTTTTCGTTACTACTTCTATCATCAACTTCTAGTTTCTCTGTTGTTGC
TCTTTTATCTTTCGCATGATGTTTTTGCAAAATTTTGGAGGCTATGCAATTGCGTTCGTT
TATGGTTTTAAAAAAGACATTTGCTTTAGTGCTTGATCGTCCATCCAATTTCAAGTTATT
TATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 5 5 45 45 45 5 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1ER79TF U 12
AF RS1A863JQ C 8
AF RS1A863TF U 8
AF RS1A109TF U 1
AF RS1A109JQ C 31
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AF RS1ER79JQ C 149
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GG
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TACTTGGAAG

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DS 

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GGGCGGCCTCAGAGTCGTCAACTCCTACTGGCTCAACGAGGATTCGACTTACAAGTACTA
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GT

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GGGCGGCCTCAGAGTCGTCAACTCCTACTGGCTCAACGAGGATTCGACTTACAAGTACTA
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GCATGATGTTTTTGCAAAATTTTGGAG
T

QA 7 753 7 753
DS 

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TATGGTTTT

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TCAACTCCTACTGGCTCAACGAGGATTCGACTTACAAGTACTACGAGATCATCTTGGTTG
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ACAAACACCGTGAGCTCAGAGGACTTACTTCCGATGGAAAGG*GAA**GAGGACTTCGCG
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ATCATCAACTTCTAGTTTCTCTGTTGTTGCTCTTTTATCTTTCGCATGATGTTTTTGCAA
AATTTTGGAGGCTATGCAATTGCGTTCGTTTATGGTTTTAAAAAAGACATTTGCTTTAG
C

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DS 

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TTGTGGTGTACCGTGTCCGTGTGAGACGTGGTGGACGCAAGAGGCCAGTGCCAAAGGGTA
TTGTCTACGGTAAGCCCACAAACCAGGGAGTAACCCAGCTCAAGTTCCAGAGGAGCAAGC
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ACAACAACCATAAGAACCGCCCTTCTCGCAGAGCTACTTGGAAGAAGAACAATTCTCTCT
CCCTTCGCCGTTACCGTTAATTGCATTTTTGCTGTTTTCGTTACTACTTCTATCATCAAC
TTCTAGTTTCTCTGTTGTTGCTCTTTTATCTTTCGCATGATGTTTTTGCAAAATTTTGGA
G*CTATGCAATTGCGTTCGTTTATGGTTTTAAAAAAGACATTTGCTTTAG
C

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DS 

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CGTCAACTCCTACTGGCTCAACGAGGATTCGACTTACAAGTACTACGAGATCATCTTGGT
TGACCCGGCGCACAACGCCGTGCGTAACGACCCGAGAATCAACTGGATTTGCAACCCGGT
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CGGAAAGGGTCACAACAACCATAAGAACCGCCCTTCTCGCAGAGCTACTTGGAAGAAGAA
CAATTCTCTCTCCCTTCGCCGTTACCGTTAATTGCATTTTTGCTGTTTTCGTTACTACTT
CTATCATCAACTTCTAGTTTCTCTGTTGTTGCTCTTTTATCTTTCGCATGATGTTTTTGC
AAAATTTTGGAGGCTATGCAATTGCGTTCGTTTATGGTTTTAAAAAAGACATTTGCTTTA
GTGCTTGATCGTCCATCCAATTTCAAGTTATTTATCG

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 5

CO CL834Contig1 1058 5 4 U
GCTAGGGGAGTTCATTATATTCATCGGCCTGGACCAACGCTTCAAGATCTTGGATACATT
GCTCTTCCGGAGCTTGGTCAAGATAAAAGCTACATAAGTGAAACTGTGTTCACTTGTGTA
TTTCTTTCGTTTTTACTGTGGACTTTCCATCCATTCATCATGAAAAGCAAGAAGATATAC
ACGGTGTTGATATGGTGCAGGGTTCTCGCCTTCTTAGTTGTAAGTCTACCCTTTTCCCTT
TGCTACTTATAAAAAAAAAAAAAAAAGCTATTTTCAAGGCCTGCTCCGTCGTGTTGCATA
TCCTTTCCGTTTAACAGGCTTGTCAGTTTCTCCGAGTAATAACATTCTATGCTACTCAGC
TTCCTGGCCCTAACTATCACTGTCGAGAGGGTTCTGAGCTTGCCACGTTGCCACGCCCAC
ATAGCGTTCTTGAGGTGCTCTTGATTAACTGTTTATAAAGCTGTTAGGTTGGGTCATTGC
CATCTTGCAAAGCCTCTTGATTATTGCGTCCCGTAAACATTACACAGTGGATGTTGTCGT
TGCGTGGTATACAGTCAACTTGGTTGTTTTCTTCCTCGACAAGAAACTTCCAGAGTTGCC
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CAAACTCTTGAACGGGAACGGTGTTGATCCTACTGCAGATAGGGTAGGAGACCGAGGGCT
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GGCGCCTGAGGACTCGGCTCGAGTTTAGTTTCTTGCTCCTCGAGTATTTTAGGGTAACAC
GAAACGTTCTCTTTATACATATTAACCAGCCACCTTTTCTTTCTTTGCGTGCTTTGTTCA
TAAGTCTTCTTTAACACCATCTTACAACTTACAACTGTTTCTTAAAACTTCAGTTTAGGT
TATTAATTTTGCCATTTACCAACAGCAACGAGAAAATCGCAAGATTGTAGAGCATTTTAC
TAAATAGTAAATGACGTTTGAGAAACTTTTATATACTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

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TTTCTTTCGTTTTTACTGTGGACTTTCCATCCATTCATCATGAAAAGCAAGAAGATATAC
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TGATCGGACCACTGTG

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GCTCTTCCGGAGCTTGGTCAAGATAAAAGCTACATAAGTGAAACTGTGTTCACTTGTGTA
TTTCTTTCGTTTTTACTGTGGACTTTCCATCCATTCATCATGAAAAGCAAGAAGATATAC
ACGGTGTTGATATGGTGCAGGGTTCTCGCCTTCTTAGTTGTAAGTCTACCCTTTTCCCTT
TGCTACTTATAAAAAAAAAAAAAAAAGCTATTTTCAAGGCCTGCTCCGTCGTGTTGCATA
TCCTTTCCGTTTAACAGGCTTGTCAGTTTCTCCGAGTAATAACATTCTATGCTACTCAGC
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ATAGCGTTCTTGAGGTGCTCTTGATTAACTGTTTATAAAGCTGTTAGGTTGGGTCATTGC
CATCTTGCAAAGCCTCTTGATTATTGCGTCCCGTAAACATTACACAGTGGATGTTGTCGT
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CAAACTCTTGAACGGGAACGGTGTTGATCCTACTGCAGATAGGGTAG
AGAC

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G
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AAACGTTCTCTTTATACATATTAACCAGCCACCTTTTCTTTCTTTGCGTGCTTTGTTCAT
AAGTCTTCTTTAACACCATCTTACAACT

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CGAGTATTTTAGGGTAACACGAAACGTTCTCTTTATACATATTAACCAGCCACCTTTTCT
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AAGATTGTAGAGCATTTTACTAAATAGTAAATGACGTTTGAGAAACTTTTATATACTT

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TATACATATTAACCAGCCACCTTTTCTTTCTTTGCGTGCTTTGTTCATAAGTCTTCTTTA
ACACCATCTTACAACTTACAACTGTTTCTTAAAACTTCAGTTTAGGTTATTAATTTTGCC
ATTTACCAACAGCAACGAGAAAATCGCAAGATTGTAGAGCATTTTACTAAATAGTAAATG
ACGTTTGAGAAACTTTTATATACTT

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DS 



AS 1 7

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CTATGTTCCTCTAGGCCGCGAAATCACTGTGGTGTTTGCAGAGGAGAACAGAAAGAAGCC
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CAAGATCAAGCACAAGATCTCGCTATGAGTCGAGAAGCAGGAGCCAGAGTCCTGGATACT
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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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CTATGTTCTTCTAGGCCGCGAAATCACTGTGGTGTTTGCAGAGGAGAACAGAAAGAAGCC
TTCTGAAATGAGAGAACGATCAAGGGGAAGGACATCTACGAGATCTCCATATGGTTACTC
CCGGTCTCCTGGCTATTCACGTTCGCCAAACTACAGAAGG*AGCTACTCACGTTCGCCAG
TCCACAGGAGAAGCTACTCGCGTTCGCCAGTCTACAGGAGAAGCTATTCACGTTCGCCAT
ATGATGAAA*CCGTTCAAGATCTATTTCACCGGGGGA

QA 1 697 1 697
DS 

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G
GAGAGAGAGAGAGCGATCACAGGCGAATTGAGCACTTTGTTTCTCTGGTTGGGTGGGATA
CAGAGTGAGTGATAATGGGGAGGAGCTATAGTTACAGTCCATCACCACCAAGGAGAAGGT
ACAGAAGCCCAAGTCCCGTGGGACACTACAGAGGTCGGAGTAGAGATCCCTCAACCAGTC
TACTTGTTCGCAATCTCCGGCTCGACTGTCGGCCGGATGATCTCCGTAGACCATTTGGGC
GGTTTGGTCGTCTCAAGGATATCTACATACCTCGTAACTATTACACTGGGGAGCCTCGCG
GATTTGGCTTTGTGCAGTACTATGATCCTGCTGATGCTGCAGATGCAAAGTATCATCTGG
ATGGCTATGTTCCTCTAGGCCGCGAAATCACTGTGGTGTTTGCAGAGGAGAACAGAAAGA
AGCCTTCTGAAATGAGAGAACGATCAAGGGGAAGGACATCTACGAGATCTCCATATGGTT
ACTCCCGGTCTCCTGGCTATTCACGTTCGCCAAACTACAGAAGG*AGCTACTCACGTTCG
CCAGTCCACAGGAGAAGCTACTCACGTTCGCCAGTCTACAGGAGAAGCTATTCACGTTCG
CCATATGATGAAAACCGTTCAAGATCTAT

QA 2 630 2 630
DS 

RD RS1A152TV 328 0 0
GAAGGACATCTACGAGATCTCCATATGGTTACTCCCGGTCTCCTGGCTATTCACGTTCGC
CAAACTACAGAAGGGAGCTACTCACGTTCGCCAGTCCACAGGAGAAGCTACTCACGTTCG
CCAGTCTACAGGAGAAGCTATTCACGTTCGCCATATGATGAAAACCGTTCAAGATCTATT
TCACCGGGGGATAGGAGGCGAAAGCGATCGTACTCAAGATCAAGCACAAGATCTCGCTAT
GAGTCGAGAAGCAG*AGCCAGAGTCCTGGATACTCTCGCTGATTTGCTATATAACCCAAG
AATGGGAAGATGGGGTTGTGGTCTCT
TC

QA 1 326 1 326
DS 

RD RS1DB96JQ 755 0 0
CCAAGGAGAAGGTACAGAAGCCCAAGTCCCGTGGGACACTACAGAGGTCGGAGTAGAGAT
CCCTCAACCAGTCTACTTGTTCGCAATCTCCGGCTCGACTGTCGGCCGGATGATCTCCGT
AGACCATTTGGGCGGTTTGGTCGTCTCAAGGATATCTACATACCTCGTAACTATTACACT
GGGGAGCCTCGCGGATTTGGCTTTGTGCAGTACTATGATCCTGCTGATGCTGCAGATGCA
AAGTATCATCTGGATGGCTATGTTCCTCTAGGCCGCGAAATCACTGTGGTGTTTGCAGAG
GAGAACAGAAAGAAGCCTTCTGAAATGAGAGAACGATCAAGGGGAAGGACATCTACGAGA
TCTCCATATGGTTACTCCCGGTCTCCTGGCTATTCACGTTCGCCAAACTACAGAAGG*AG
CTACTCACGTTCGCCAGTCCACAGGAGAAGCTACTCACGTTCGCCAGTCTACAGGAGAAG
CTATTCACGTTCGCCATATGATGAAAACCGTTCAAGATCTATTTCACCGGGGGATAGGAG
GCGAAGGCGATCGTACTCAAGATCAAGCACAAGATCTCGCTATGAGTCGAGAAGCAGGAG
CCAGAGTCCTGGATACTCTCGCTGATTTGCTATATAACCCAAGAATGTGAAGGTGGGGT*
GTGGTCTCTCTCACACTCTGCTTGTTTAGTTCATGTATGAAAAAAATAATAAACCATAGT
TTGGAGTTAAGAGGACAAACGTATCTATGAGTTCT

QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1A152JQ 577 0 0
G
CGATCAAGGGGAAGGACATCTACGAGATCTCCATATGGTTACTCCCGGTCTCCTGGCTAT
TCACGTTCGCCAAACTACAGAAGG*AGCTACTCACGTTCGCCAGTCCACAGGAGAAGCTA
CTCACGTTCGCCAGTCTACAGGAGAAGCTATTCACGTTCGCCATATGATGAAAACCGTTC
AAGATCTATTTCACCGGGGGATAGGAGGCGAAGGCGATCGTACTCAAGATCAAGCACAAG
ATCTCGCTATGAGTCGAGAAGCAGGAGCCAGAGTCCTGGATACTCTCGCTGATTTGCTAT
ATAACCCAAGAATGTGAAGATGGGGT*GTGGTCTCTCTCACACTCTGCTTGTTTAGTTCA
TGTATGAAAAAAATAATAAACCATAGTTTGGAGTTAAGAGGACAAACGTATCTATGAGTT
CTAAAAAAAAAAAAAGAGGACAAACGTATCTACTATCTATGGCTTGGTTTCCTTTTAGTG
ACAGCCTTTTGTATGTTCACGCGTGACATCTATGCCTACTTATTGTGTTGTACCACGAGA
GAGTTCGGATTCTCATTAGTCACGACATTTGAAATC

QA 2 577 2 577
DS 

RD RS1A152TR 551 0 0
G
CGATCAAGGGGAAGGACATTTACGAGATCTCCATATGGTTACTCCCGGTTTCCTGGCTAT
TCACGTTCGCCAAACTACAGAAGG*AGCTACTCACGTTCGCCAGTCCACAGGAGAAGCTA
CTCACGTTCGCCAGTTTACAGGAGAAGCTATTCACGTTCGCCATATGATGAAAACCGTTC
AAGATTTATTTCACCGGGGGATAGGAGGGGAAGGCGATCGTACTCAAGATCAAGCACAAG
ATCTCGCTATGAGTCGAGAAGCAGGAGCCAGAGTCCTGGATACTCTCGCTGATTTGCTAT
ATAACCCAAGAATGTGAAGATGGGGT*GTGGTCTCTCTCACACTCTGCTTGTTTAGTTCA
TGTATGAAAAAAATAATAAACCATAGTTTGGAGTTAAGAGGACAAACGTATTTATGAGTT
CTAAAAAAAAAAAAAGAGGACAAACGTATCTACTATCTATGGCTTGGTTTCCTTTTAGTG
ACAGCCTTTTGTATGTTCACGCGTGACATCTATGCCTACTTATTGTGTTGTACCTCGAGA
GAGTTCGGAT

QA 2 551 2 551
DS 

RD RS1A152TF 545 0 0
CATATGGTTACTCCCGGTCTCCTGGCTATTCACGTTCGCCAAACTACAGAAGG*AGCTAC
TCACGTTCGCCAGTCCACAGGAGAAGCTACTCACGTTCGCCAGTCTACAGGAGAAGCTAT
TCACGTTCGCCATATGATGAAAACCGTTCAAGATCTATTTCACCGGGGGATAGGAGGCGA
AGGCGATCGTACTCAAGATCAAGCACAAGATCTCGCTATGAGTCGAGAAGCAGGAGCCAG
AGTCCTGGATACTCTCGCTGATTTGCTATATAACCCAAGAATGTGAAGATGGGGT*GTGG
TCTCTCTCACACTCTGCTTGTTTAGTTCATGTATGAAAAAAATAATAAACCATAGTTTGG
AGTTAAGAGGACAAACGTATCTATGAGTTCTAAAAAAAAAAAAAGAGGACAAACGTATCT
ACTATCTATGGCTTGGTTTCCTTTTAGTGACAGCCTTTTGTATGTTCACGCGTGACATCT
ATGCCTACTTATTGTGTTGTACCACGAGAGAGTTCGGATTCTCATTAGTCACGACATTTG
AAATC

QA 1 545 1 545
DS 



AS 1 4

CO CL836Contig1 1136 4 5 U
GAACGCATGAAAAGATATTCTCATTATCATCAAATACAATTAACAGAAGAATAGTTTTTT
GATAATAACATATATATGATCTGATCACTCAAGTTGACCATACCACACACCTTGGATCTT
CACATCCTTTGGCACCTTGGCACCCAAGTCAGTGTCCGACGGCTGAAGACTCTCGAACAC
TCCGATCACTTCTCCTGTCTCAGGTTTGCTCTTAGTCACTTTCAAAGTGATCTCTCCCAC
CGAAGCTGCCGTGTTTTTCACGTTCTCCTTTGAAAGCTCCTCTTCATCTCCTCTGCCTCC
AGCTGGCAATGCAACGGCGTTGTCATATCCTGTGGATCCACCACGACCCTTTGGGTCCAA
GAAGGACGAGCCACGGTATGAAGGGACCAAGAATTTTCCAGTGAAGTTGTCTGGCTTGCC
CGAGGCGTCAAGCTGCTTGACTGTGAAAAGGAATGGCACACGCTCGCCTCCTGGAAGCTG
AACTGCGACTGCAGCGTAGTCGATTCCGTCTTCTTCCTTGAAGTTCACGCTTCCGTCTGA
AGAAACCTCGAAGGGGCCTCCGATTTCGTCAAGAGTGTAAGTGAGACGGGTCATGAGCTT
GGTGTTCTGGAAGTCAGGAGGTGCGTTCTTGCTAACACTCTCAGCCTTGACGGTGAAGGA
AGTAGGCTCGAAGCAGAACTTCTTGCCAGCGTACTTACCGGGCTTGAAGGAGAAAGTCTC
AGAGCCACCGTCAATAGTTGGGCACTGGTTGGCAGTTCCAGTTCCTTTAACTTCCATGTA
TGTCTTGCTCTGTATCTCGTCATAAGTGAGTCTCTTCGGAGCTCCCTCTGCACTTGCTCC
CGAGACAACGAGAGCAGAGGTTGCAAGAGCGAATCCGGAGATTTTAACAGCGTCCGAGAA
TTTTCCGGAGAAGTCCTTGATGTCAGATTGGTAGGAACAAGTGAGGCGTGCAGAAGAAGT
CTCTAGCCCAAATGATTTGCCGACCGTCTGAGTCGACCGGAGGAGAGCACTGCTGCGAGA
AGGAGCGGTGGAGAGTTTGGTAGACTGGAGGAATGTGGCGGAGGATTGGAGAGAGGCTGC
CATGGCCGCAAAGTGTCTCTCAGATAGTTCTTGTTTTTTTGTTTTTCTTGGTCCCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CH14JQ U 2
AF RS1EB15JQ U 1
AF RS1F441JQ U 2
AF RS1EB15TF C 352
BS 1 35 RS1EB15JQ
BS 36 36 RS1CH14JQ
BS 37 812 RS1EB15JQ
BS 813 813 RS1F441JQ
BS 814 1136 RS1EB15TF

RD RS1CH14JQ 653 0 0
GG
CGCATGAAAAGATATTCTCATTATCATCAAATACAATTAACAGAAGAATAGTTTTTTGAT
AATAACATATATATGATC*****ACTCAAGTTGACCATACCACACACCTTGGATCTTCAC
ATCCTTTGGCACCTTGGCACCCAAGTCAGTGTCCGACGGCTGAAGACTCTCAAACACTCC
GATCACTTCTCCTGTCTCAGGTTTGCTCTTAGTCACTTTCAAAGTGATCTCTCCCACCGA
AGCTGCCGTGTTTTTCACATTCTCCTTTGAAAGCTCCTCTTCATCTCCTCTGCCTCCAGC
TGGCAATGCAACGGCGTTGTCATATCCTGTGGATCCACCACGACCCTTTGGGTCCAAGAA
GGACGAGCCACGGTATGAAGGAACCAAGAATTTTCCAGTGAAGTTGTCTGGCTTGCCCGA
GGCGTCAGGCTGCTTGACTGTGAAAAGGAATGGCACACGCTCGCCTCCTGGAAGCTGAAC
TGTGACTGCAGCGTAGTCGATTCCGTCTTCTTCCTTGAAGTTCACGCTTCCATCTGAAGA
AACCTCGAAGGGGCCTTCGATTTCGTCAAGGGTGTAGGTGAGACGGGTCCTGAGCTTGGT
GTTCTGGAAGTCAGGAGGTGCGTTCTTGCTAACACTCTCAGCCTTGACGGT

QA 3 653 3 653
DS 

RD RS1EB15JQ 812 0 0
GAACGCATGAAAAGATATTCTCATTATCATCAAATGCAATTAACAGAAGAATAGTTTTTT
GATAATAACATATATATGATCTGATCACTCAAGTTGACCATACCACACACCTTGGATCTT
CACATCCTTTGGCACCTTGGCACCCAAGTCAGTGTCCGACGGCTGAAGACTCTCGAACAC
TCCGATCACTTCTCCTGTCTCAGGTTTGCTCTTAGTCACTTTCAAAGTGATCTCTCCCAC
CGAAGCTGCCGTGTTTTTCACGTTCTCCTTTGAAAGCTCCTCTTCATCTCCTCTGCCTCC
AGCTGGCAATGCAACGGCGTTGTCATATCCTGTGGATCCACCACGACCCTTTGGGTCCAA
GAAGGACGAGCCACGGTATGAAGGGACCAAGAATTTTCCAGTGAAGTTGTCTGGCTTGCC
CGAGGCGTCAAGCTGCTTGACTGTGAAAAGGAATGGCACACGCTCGCCTCCTGGAAGCTG
AACTGCGACTGCAGCGTAGTCGATTCCGTCTTCTTCCTTGAAGTTCACGCTTCCGTCTGA
AGAAACCTCGAAGGGGCCTCCGATTTCGTCAAGAGTGTAAGTGAGACGGGTCATGAGCTT
GGTGTTCTGGAAGTCAGGAGGTGCGTTCTTGCTAACACTCTCAGCCTTGACGGTGAAGGA
AGTAGGCTCGAAGCAGAACTTCTTGCCAGCGTACTTACCGGGCTTGAAGGAGAAAGTCTC
AGAGCCACCGTCAATAGTTGGGCACTGGTTGGCAGTTCCAGTTCCTTTAACTTCCATGTA
TGTCTTGCTCTGTATCTCGTCATAAGTGAGTC

QA 1 812 1 812
DS 

RD RS1F441JQ 812 0 0
GG
CGCATGAAAAGATATTCTCATTATCATCAAATACAATTAACAGAAGAATAGTTTTTTGAT
AATAACATATATATGATCTGATCACTCAAGTTGACCATACCACACACCTTGGATCTTCAC
ATCCTTTGGCACCTTGGCACCCAAGTCAGTGTCCGACGGCTGAAGACTCTCGAACACTCC
GATCACTTCTCCTGTCTCAGGTTTGCTCTTAGTCACTTTCAAAGTGATCTCTCCCACCGA
AGCTGCCGTGTTTTTCACGTTCTCCTTTGAAAGCTCCTCTTCATCTCCTCTGCCTCCAGC
TGGCAATGCAACGGCGTTGTCATATCCTGTGGATCCACCACGACCCTTTGGGTCCAAGAA
GGACGAGCCACGGTATGAAGGGACCAAGAATTTTCCAGTGAAGTTGTCTGGCTTGCCCGA
GGCGTCAAGCTGCTTGACTGTGAAAAGGAATGGCACACGCTCGCCTCCTGGAAGCTGAAC
TGTGACTGCAGCGTAGTCGATTCCGTCTTCTTCCTTGAAGTTCACGCTTCCGTCTGAAGA
AACCTCGAAGGGGCCTTCGATTTCGTCAAGAGTGTAAGTGAGGCGGGTCATGAGCTTGGT
GTTCTGGAAGTCAGGAGGTGCGTTCTTGCTAACACTCTCAGCCTTGACGGTGAAGGAAGT
AGGCTCGAAGCAGAACTTCTTGCCAGCGTACTTACCGGGCTTGAAGGAGAAAGTCTCAGA
GCCACCGTCAATAGTTGGGCACTGGTTGGCAGTTCCAGTTCCTTTAACTTCCATGTATGT
CTTGCTCTGTATCTCGTCATAAGTGAGTCT

QA 3 812 3 812
DS 

RD RS1EB15TF 785 0 0
CCTTTGGTCCAGA
GACGAGCCACGGTATGAAGGGACCAG**ATTTTCCAGTGAAGT*GTCTGC**TGCCCGAG
GCGTCAAGCTGCT*GACTGTGAAAAGGAATGGCACACGCTCGCCTCCTGGAAGCTGAACT
GCGACTGCAGCGTAGTCGATTCCGTCTTCTTCCTTGAAGTTCACGCTTCCGTCTGAAGAA
ACCTCGAAGGGGCCTCCGATTTCGTCAAGAGTGTAAGTGAGACGGGTCATGAGCTTGGTG
TTCTGGAAGTCAGGAGGTGCGTTCTTGCTAACACTCTCAGCCTTGACGGTGAAGGAAGTA
GGCTCGAAGCAGAACTTCTTGCCAGCGTACTTACCGGGCTTGAAGGAGAAAGTCTCAGAG
CCACCGTCAATAGTTGGGCACTGGTTGGCAGTTCCAGTTCCTTTAACTTCCATGTATGTC
TTGCTCTGTATCTCGTCATAAGTGAGTCTCTTCGGAGCTCCCTCTGCACTTGCTCCCGAG
ACAACGAGAGCAGAGGTTGCAAGAGCGAATCCGGAGATTTTAACAGCGTCCGAGAATTTT
CCGGAGAAGTCCTTGATGTCAGATTGGTAGGAACAAGTGAGGCGTGCAGAAGAAGTCTCT
AGCCCAAATGATTTGCCGACCGTCTGAGTCGACCGGAGGAGAGCACTGCTGCGAGAAGGA
GCGGTGGAGAGTTTGGTAGACTGGAGGAATGTGGCGGAGGATTGGAGAGAGGCTGCCATG
GCCGCAAAGTGTCTCTCAGATAGTTCTTGTTTTTTTGTTTTTCTTGGTCCCC

QA 14 785 14 785
DS 



AS 1 7

CO CL837Contig1 1112 7 12 U
GGTTTATAATTGATAATTTTTTTTTGTAGAATCGGTTTTTCTTCTGTTTTACAAAAGTAA
AGGACCTTCCTGGATTTTCTTTGGGATGGACTACTTCATAGAGATTTCTAAAGCCAGAAA
GATTACAATCTCAAGATCAGTAATACAATAAAGAAATTATCTTGGGACTTTCACTTATCA
TCACAAACATCACATAAGAAAAGAGGAAACATAAGCCATTAATTTTCTTCACTTCTTTGA
AGAAACCGTTGATGATGATGATTCCGGCTCTTTCCATGCCGCTTGCCATTGCTTGTCATA
TAACGTTGTCTCTTCAATCAGACCCTTAAGTTTGTCTAAATCTTCGTTCTTGCGGATGAA
AAGAACTCCGGCAACAGCCACAAACAAGAGTGTTTTGCAGAAAAAGTTTCCCATCTGATC
AACAAGTCCTACTCCGGTAAGGCTATCAACAAAGTAAGCCATGAAGAACCCTACCATCGC
CGCACGACCGTTGAGGAGTTCAGCTTCGGGTAGATGGTATCTCTTCATCCATGCCCACCA
TGGAATGATGGAGGTATCGAAAAGGACAGGCTCGTCGTTAGTAGTTGTTTCCGGGTTATC
TTCAAGCCACTTTCTCCTCTTTGCCTCAGCAACGATAACAGAGTCCCAATCTGTTTTGCC
TTCTTTCTCGAACTGTTTCAGATCCCACGTTCCGTTAACCCACTTCGCATCCTGGAACTT
GATCTCAGTCGTCGTGGTGGTCGTCAAGTCAGTCTCTTCGCCTCCAACGGCGCCGTTTTC
AGACGGAGATTTTACTGAGACTTCCTCTACAGGCTTTGGAGCCTCCACGGTGGTTGCAGA
GACTGTGGAGGAAGCGGGTGTTGACGTACCGTTGTCGGAGGAGGCTCGAGTGAGGGAGAC
GAGAGAGAGGCGCTTGGTGGAGAGGAGAGAGAGCGAGATCTTGGGGATGGGGTTAGGGTT
TAGAAGTGGAGAAGAGATCGGCGGAGAGAATAACGCCATGGATATGGACATTTGTTGCTT
GCTCAGTCCTCACACACACACACACACTCCTCCTCTGTCTCTCCTCTGTTCAGTTCTTCA
GAGTTAGTTTTGAATGTGTGGTTCGAAATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
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GG
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ACAAACATCACATAAGAAAAGAGGAAACATAAGCCATTAATTTTCTTCACTTCTTTGAAG
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GAACTCCGGCAACAGCCACAAACAAGAGTGTTTTGCAGAAGAAGTTTCCCATCTGATCAA
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C

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TGGGGATGGGGTTAGGGTTTAGAAGTGGAGAAGAGATCGGCGGAGAGAATAACGCCATGG
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TCCTCTGTTCAGTTCTTCAGAGTTAGTTTTGAATGTGTGGTTCGAAATCCC

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DS 



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TAGTGCCCTTTTAAATGATCTCTACAAG


BQ
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BQ
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AF RS1A171TR U 4
AF RS1AJ46TF C 388
AF RS1A171TV C 464
AF RS1A171TF C 470
BS 1 212 RS1AJ46JQ
BS 213 213 RS1A171JQ
BS 214 511 RS1AJ46JQ
BS 512 512 RS1A171JQ
BS 513 593 RS1AJ46JQ
BS 594 594 RS1A171JQ
BS 595 641 RS1AJ46JQ
BS 642 642 RS1A171JQ
BS 643 687 RS1AJ46JQ
BS 688 688 RS1A171JQ
BS 689 896 RS1AJ46JQ
BS 897 913 RS1A171TR
BS 914 1215 RS1AJ46TF
BS 1216 1217 RS1A171TV
BS 1218 1252 RS1AJ46TF
BS 1253 1267 RS1A171TV
BS 1268 1275 RS1A171TF

RD RS1A171JQ 731 0 0
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TTTTGTTGATGAAGCTCAAAATACATTGATATATGTATTAGAGATTAAAGAAGATTGAAA
CTAAGAAGGGTGAAAGAAGAGACAAAGAGCAGAGATATCATCCATGGCGATGCTTCTTCT
CTTCCTACGCCAAAGTATCATAGCTCTCTCCACCAATCTCTTTGCACTCTTTCTTCTCTC
TTTTACTCCTCTTACTATCTCCACTGCCTCATCGTTTGTCATCACATCCCACATCCCATC
TGTGGCCAAGATGAGGAATTGGTCCTTGTCGGTTATCTTTCTGTATGTCACTTCCGGTAC
AGAGACTAAACCAAAGTCTTTAAGACAGTAGTCTCCAAACGCTCTTGAGACAGCTAAACC
AAGCGATCTGCCATTTGGCATGCCTACTCGGTACACTCCCGGTTCATCATCTAGGCAAAA
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TACTGATAGCTGAACCGGTACTAAACTGCTTCCGTCGTCAGAAGTTGTTGCTATTACTGC
TCGTGAGTCGCCGGCATTTGCTACAACAAGATGATCACTCTGCAAGACGGCAGTTAGAGC
GGTGCAGCCGCTGCAGTAAGAATCAATGGAAGGATGGATCTTGAGATCAAGATCGATGAG
GGAGAATGTTT

QA 1 731 1 731
DS 

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CATTTTTGTTGATGAAGCTCAAAATACATTGATATATGTATTAGAGATTAAAGAAGATTG
AAACTAAGAAGGGTGAAAGAAGAGACAAAGAGCAGAGATATCATCCATGGCGATGCTTCT
TCTCTTCCTACGCCAAAGTATCATAGCTCTCTACACCAATCTCTTTGCACTCTTTCTTCT
CTCTTTTACTCCTCTTACTATCTCCACTGCCTCATCGTTTGTCATCACATCCCACATCCC
ATCTGTGGCCAAGATGAGGAATTGGTCCTTGTCGGTTATCTTTCTGTATGTCACTTCCGG
TACAGAGACTAAACCAAAGTCTTTAAGACAGTAGTCTCCAAACGCTCTTGAGACAGCTAA
ACCGAGCGATCTGCCATTTGGCATGCCTACTCGGTACACTCCCGGTTCATCATCTAGGCA
AAACAATCGTCCATCTGATTGTTTTATCCGTTCTGCTTCCTCGGGAATGTTCGGTTTAAA
GTCTACTGATAGCTGAACCGGTACTAAACTGCTTCCGTCGTCAGAAGTTGTTGTTATTAC
TGCTCGTGAGTCGCCGGCATTTGCTACAACAAGATGATCACCCTGCAAGACGGCAGTTAG
AGCGGTGCAGCCGCTGCAGTAAGAATCTATGGAAGGATGGATCTTGAGATCAAGATCGAT
GAGGGAGAATGTTTTCAAGCAAGATTGCTTCCAGATATCAAATGGAGAGAAACATTCCGG
TGACGATGATAAGGATGCGAGAGTTTGTTGCCATTGGCAAAGCAATGAAGATGGAAATAG
CTTTTTTACTCTTTTGGTTATCACATGTCCCCATGGTCCATGTCCATCGAACATCC

QA 1 896 1 896
DS 

RD RS1A171TR 910 0 0
ATTAACAACTGTCTTCACAACATCTATTATTCTATGTAAATGTGTTTATATATATGACAT
TTTTGTTGATGAAGCTCAAAATACATTGATATATGTATTAGAGATTAAAGAAGATTGAAA
CTAAGAAGGGTGAAAGAAGAGACAAAGAGCAGAGATATCATCCATGGCGATGCTTCTTCT
CTTCCTACGCCAAAGTATCATAGCTCTCTCCACCAATCTCTTTGCACTCTTTCTTCTCTC
TTTTACTCCTCTTACTATCTCCACTGCCTCATCGTTTGTCATCACATCCCACATCCCATC
TGTGGCCAAGATGAGGAATTGGTCCTTGTCGGTTATCTTTCTGTATGTCACTTCCGGTAC
AGAGACTAAACCAAAGTCTTTAAGACAGTAGTCTCCAAACGCTCTTGAGACAGCTAAACC
AAGCGATCTGCCATTTGGCATGCCTACTCGGTACACTCCCGGTTCATCATCTAGGCAAAA
CAATCGTCCATCTGATTGTTTTATCCGTCCTGCTTCCTCGGGAATGTTCGGTTTAAAGTC
TACTGATAGCTGAACCGGTACTAAACTGCTTCCGTCGTCAGAAGTTGTTGCTATTACTGC
TCGTGAGTCGCCGGCATTTGCTACAACAAGATGATCACTCTGCAAGACGGCAGTTAGAGC
GGTGCAGCCGCTGCAGTAAGAATCAATGGAAGGATGGATCTTGAGATCAAGATCGATGAG
GGAGAATGTTTTCAAGCAAGATTGCTTCCAGATATCAAATGGAGAGAAACATTCCGGTGA
CGATGATAAGGATGCGAGAGTTTGTTGCCATTGGCAAAGCAATGAAGATGGAAATAGCTT
TTTTACTCTTTTGGTTATCACATGTCCCCATGGTCCATGTCCATCGAACATCCCACAAAA
TGTTATGTCT

QA 1 910 1 910
DS 

RD RS1AJ46TF 865 0 0
ACAGTAGTCTCCAAACGCTCTTGAGACAGCTAAACCGAGCGATCTGCCATTTGGCATGC*
TACTCGGTACACTCCCGGTTCATCATCTAGGCAAAACAATCGTCCATCTGATTGTTTTAT
CCGTTCTGCTTCCTCGGGAATGTTCGGTTTAAAGTCTACTGATAGCTGAACCGGTACTAA
ACTGCTTCCGTCGTCAGAAGTTGTTGTTATTACTGCTCGTGAGTCGCCGGCATTTGCTAC
AACAAGATGATCACCCTGCAAGACGGCAGTTAGAGCGGTGCAGCCGCTGCAGTAAGAATC
TATGGAAGGATGGATCTTGAGATCAAGATCGATGAGGGAGAATGTTTTCAAGCAAGATTG
CTTCCAGATATCAAATGGAGAGAAACATTCCGGTGACGATGATAAGGATGCGAGAGTTTG
TTGCCATTGGCAAAGCAATGAAGATGGAAATAGCTTTTTTACTCTTTTGGTTATCACATG
TCCCCATGGTCCATGTCCATCGAACATCCCACAAAATGTTATGTCTTCTTGGCACCCAAA
CCCCTCCCAAACGACGGCACGGTCTTGGTTGATTCCTTTCTCGCCTCTATTAGAACAAAT
AGAGGTGAATCTCTTAGAATTTTCTAAGTTAACAAAGCCTGATGAACCAAGCAAAGTCGA
GTTCTTCTTGGCATCTTTCATCAACAATTTTGCGATCTCTCTCCCTCCATCTTCATCTTC
TGATATATATTTTCCTTTCTTCATCGATACACTTCTCGCCAACCCATCCAAGAAAGCAGG
CAGAAGCACCATTCTCTAGTACTCTTACGATCCTACAATAACCTTTCTTTGGTGAGGATT
CTCGATCGGATTTTCTCTGTTAATC

QA 1 865 1 865
DS 

RD RS1A171TV 804 0 0
GGTTCATCATCTAGGCAAAACAATCGTCCATCTGATTGTTTTATCCGTCCTGCTTCCTCG
GGAATGTTCGGTTTAAAGTCTACTGATAGCTGAACCGGTACTAAACTGCTTCCGTCGTCA
GAAGTTGTTGCTATTACTGCTCGTGAGTCGCCGGCATTTGCTACAACAAGATGATCACTC
TGCAAGACGGCAGTTAGAGCGGTGCAGCCGCTGCAGTAAGAATCAATGGAAGGATGGATC
TTGAGATCAAGATCGATGAGGGAGAATGTTTTCAAGCAAGATTGCTTCCAGATATCAAAT
GGAGAGAAACATTCCGGTGACGATGATAAGGATGCGAGAGTTTGTTGCCATTGGCAAAGC
AATGAAGATGGAAATAGCTTTTTTACTCTTTTGGTTATCACATGTCCCCATGGTCCATGT
CCATCGAACATCCCACAAAATGTTATGTCTTCTTGGCACCCAAACCCCTCCCAAACGACG
GCACGGTCTTGGTTGATTCCTTTCTCGCCTCTATTAGAACAAATAGAGGTGAATCTCTTA
GAATTTTCTAAGTTAACAAAGCCTGATGAACCAAGCAAAGTCGAGTTCTTCTTGGCATCT
TTCATCAACAATTTTGCGATCTCTCTCCCTCCATCTTCATCTTCTGATATATATTTTCCT
TTCTTCATCGATACACTTCTCGCCAACCCATCCAAGAAAGCAGGCAGAAGCACCATTCTC
TAGTACTCTTACGATCCTACAATAACCTTTCTCCGGTGAGGATTCTCGATCGGATTTTCT
CTGTTAATCCCCCGGCCGTAATGG

QA 1 804 1 804
DS 

RD RS1A171TF 806 0 0
TCATCTAGGCAAAACAATCGTCCATCTGATTGTTTTATCCGTCCTGCTTCCTCGGGAATG
TTCGGTTTAAAGTCTACTGATAGCTGAACCGGTACTAAACTGCTTCCGTCGTCAGAAGTT
GTTGCTATTACTGCTCGTGAGTCGCCGGCATTTGCTACAACAAGATGATCACTCTGCAAG
ACGGCAGTTAGAGCGGTGCAGCCGCTGCAGTAAGAATCAATGGAAGGATGGATCTTGAGA
TCAAGATCGATGAGGGAGAATGTTTTCAAGCAAGATTGCTTCCAGATATCAAATGGAGAG
AAACATTCCGGTGACGATGATAAGGATGCGAGAGTTTGTTGCCATTGGCAAAGCAATGAA
GATGGAAATAGCTTTTTTACTCTTTTGGTTATCACATGTCCCCATGGTCCATGTCCATCG
AACATCCCACAAAATGTTATGTCTTCTTGGCACCCAAACCCCTCCCAAACGACGGCACGG
TCTTGGTTGATTCCTTTCTCGCCTCTATTAGAACAAATAGAGGTGAATCTCTTAGAATTT
TCTAAGTTAACAAAGCCTGATGAACCAAGCAAAGTCGAGTTCTTCTTGGCATCTTTCATC
AACAATTTTGCGATCTCTCTCCCTCCATCTTCATCTTCTGATATATATTTTCCTTTCTTC
ATCGATACACTTCTCGCCAACCCATCCAAGAAAGCAGGCAGAAGCACCATTCTCTAGTAC
TCTTACGATCCTACAATAACCTTTCTCCGGTGAGGATTCTCGATCGGATTTTCTCTGTTA
ATCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTC

QA 1 806 1 806
DS 



AS 2 6

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ACTCCCTCTTTATCTCTCAGGAATCTGCTGGACCCTTGTTTATGATACTACTTATGCACA
TCAGGATAAAGATGATGATGTGAAGGTTGGTGTTAAGTCGACGGCTCTTAGGTTCGGTGA
GAATACAAAGCTTTGGCTCACTGGGTTTGGCACAGCATCAATGGGGTTGCTTGTACTTTC
TGGACTGAGTGCAGATCTTGGGTGGCAATACTACGCATCGCCGGTGGCTGCATTGGGACA
GTTAGGATGGCAAATAGGGACAGCTGACTTATCATCTGGCGCTGACTGTAGTAGAAAATT
TGTGTCAAACAAGTGGTTTGGTGCTATTATATTTAGCGGAGTTGTACTTGGAAGAACTTT
TCAATAGAGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTGATGAAGCTGTTCCGAGA
GTATACAGAGTAAAGCTGTTCCTTCAGGATCCGAAAAGCTATTGTCAGATATAAGCTGAA
AAACTTTGACTTTTTTCTTCTGTTAATAAGGACTCTTGTTTTGGGATTTCACGTCTTTGT
TCATATTGTCGACCAAGTAAACCTTCTAGCCAGACTAGAGGCTTTACGCTTTTGGCTTCT
ATAAATAGTTAACATACGTAACAGTGTCAATTATTTTTAAACTACAGTGACTAAATCCCG
GTAGTAATTTTATTTTAATTTCAATCTCAAAAATGCAAAAGATTGAATTGGTCGTCTCAT
TGTAAGGATAACACATAAATATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CD71TF U 1
AF RS1CD71JQ C 344
BS 1 543 RS1CD71TF
BS 544 803 RS1CD71JQ

RD RS1CD71TF 543 0 0
GAACTGGGGAGCATTGTTAGGATGGGCTGCAGTTAAAGGAAGCGTAGAGACAGCTGTTGT
ACTCCCTCTTTATCTCTCAGGAATCTGCTGGACCCTTGTTTATGATACTACTTATGCACA
TCAGGATAAAGATGATGATGTGAAGGTTGGTGTTAAGTCGACGGCTCTTAGGTTCGGTGA
GAATACAAAGCTTTGGCTCACTGGGTTTGGCACAGCATCAATGGGGTTGCTTGTACTTTC
TGGACTGAGTGCAGATCTTGGGTGGCAATACTACGCATCGCCGGTGGCTGCATTGGGACA
GTTAGGATGGCAAATAGGGACAGCTGACTTATCATCTGGCGCTGACTGTAGTAGAAAATT
TGTGTCAAACAAGTGGTTTGGTGCTATTATATTTAGCGGAGTTGTACTTGGAAGAACTTT
TCAATAGAGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTGATGAAGCTGTTCCGAGA
GTATACAGAGTAAAGCTGTTCCTTCAGGATCCGAAAAGCTATTGTCAGATATAAGCTGAA
AAA

QA 1 543 1 543
DS 

RD RS1CD71JQ 460 0 0
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GTACTTGGAAGAACTTTTCAATAGAGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTG
ATGAAGCTGTTCCGAGAGTATACAGAGTAAAGCTGTTCCTTCAGGATCCGAAAAGCTATT
GTCAGATATAAGCTGAAAAACTTTGACTTTTTTCTTCTGTTAATAAGGACTCTTGTTTTG
GGATTTCACGTCTTTGTTCATATTGTCGACCAAGTAAACCTTCTAGCCAGACTAGAGGCT
TTACGCTTTTGGCTTCTATAAATAGTTAACATACGTAACAGTGTCAATTATTTTTAAACT
ACAGTGACTAAATCCCGGTAGTAATTTTATTTTAATTTCAATCTCAAAAATGCAAAAGAT
TGAATTGGTCGTCTCATTGTAAGGATAACACATAAATATA

QA 1 460 1 460
DS 



CO CL840Contig2 728 4 8 U
GATGATACTATTTATGCACATCAGGATAAAGATGATGATGTGAAGGTTGGTGTTAAGTCG
ACGGCTCTTAGGTTCGGTGAGAATACAAAGCTTTGGCTCACTGGGTTTGGCACAGCATCA
ATGGGGTTGCTTGTACTTTCTGGACTGAGTGCAGATCTTGGGTGGCAATACTACGCATCG
CTGGTGGCTGCATTGGGACAGTTAGGATGGCAAATAGGGACAGCTGACTTATCATCTGGC
GCTGACTGTAGTAGAAAATTTGTGTCAAACAAGTGGTTTGGTGCTATTATATTTAGCGGA
GTTGTACTTGGAAGAACTTTTCAATAGAGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTT
GATGAAGCTGTTCCGAGAGTATACAGAGTAAAGCTGTTCCTTCAGGATCCGAAAAGCTAT
TGTCAGATATAAGCTGAAAAACTTTGACTCTTCTCTTCTGTTAATAAGGACTCTTGTTTT
GGGATTTCACGTCTTTGTTCATATTGTCGACCAAGTAAACCTTCTAGCCAGACTAGAGGC
TTTACGCTTTTGGCTTCTATAAATAGTTAACATACGTAACAGTATCAATTATTTGTAAAC
TACAGTGACTAAATCCCAGTAGTAATTTTATTTTAATTTCAATCTCAAAAATGCAAAAGA
TTGAATTGGTCGTCTCATTGTAAGGATAACACATAAATATAAAGATTTAACATTTTTCTC
ATTCATTC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 0 0 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FW91TF U 1
AF RS1CT88JQ C 95
AF RS1CT88TF U 95
AF RS1FW91JQ C 1
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G
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DS 

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QA 1 599 1 599
DS 

RD RS1CT88TF 599 0 0
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TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTGATGAAGCTGTTCCGAGAGTATACAGAGTAAAGC
TGTTCCTTCAGGATCCGAAAAGCTATTGTCAGATATAAGCTGAAAAACTTTGACTCTTCT
CTTCTGTTAATAAGGACTCTTGTTTTGGGATTTCACGTCTTTGTTCATATTGTCGACCAA
GTAAACCTTCTAGCCAGACTAGAGGCTTTACGCTTTTGGCTTCTATAAATAGTTAACATA
CGTAACAGTATCAATTATTTGTAAACTACAGTGACTAAATCCCAGTAGTAATTTTATTTT
AATTTCAATCTCAAAAATGCAAAAGATTGAATTGGTCGTCTCATTGTAAGGATAACACA

QA 1 599 1 599
DS 

RD RS1FW91JQ 728 0 0
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ACGGCTCTTAGGTTCGGTGAGAATACAAAGCTTTGGCTCACTGGGTTTGGCACAGCATCA
ATGGGGTTGCTTGTACTTTCTGGACTGAGTGCAGATCTTGGGTGGCAATACTACGCATCG
CTGGTGGCTGCATTGGGACAGTTAGGATGGCAAATAGGGACAGCTGACTTATCATCTGGC
GCTGACTGTAGTAGAAAATTTGTGTCAAACAAGTGGTTTGGTGCTATTATATTTAGCGGA
GTTGTACTTGGAAGAACTTTTCAATAGAGATCTCTCTCTCTCTCTCTCT******CTCTT
GATGAAGCTGTTCCGAGAGTATACAGAGTAAAGCTGTTCCTTCAGGATCCGAAAAGCTAT
TGTCAGATATAAGCTGAAAAACTTTGACTCTTCTCTTCTGTTAATAAGGACTCTTGTTTT
GGGATTTCACGTCTTTGTTCATATTGTCGACCAAGTAAACCTTCTAGCCAGACTAGAGGC
TTTACGCTTTTGGCTTCTATAAATAGTTAACATACGTAACAGTATCAATTATTTGTAAAC
TACAGTGACTAAATCCCAGTAGTAATTTTATTTTAATTTCAATCTCAAAAATGCAAAAGA
TTGAATTGGTCGTCTCATTGTAAGGATAACACATAAATATAAAGATTTAACATTTTTCTC
ATTCATTC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 7

CO CL841Contig1 890 7 15 U
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AACCTTCAGTGACCCCTTTCCTCATCACTCTCCTGTTGGCTGCAGCTGTCTGCACCCACG
GCAAAGAAGTGGTGAAGGACTCTAACGGGAATCCAGTTAAGATCGGTGCCAAATACTTCA
TCCAGCCGGTTAAGAGCAACGGCGGTGGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAACATACTTCCGT
TTTGTCCACTTGGCATCACCCAAACACTTCTTCCCTACCAACCGGGCCTCCCAGTTATCT
TCGGATATTATCCACCTTTTGTCGGCACAGACTACATTGTCACATCTACCACTATAAACA
TCCAGTTCCATTCCGACATCTGGCCTGTATGCAACGAGCTTTCCAAGTTATGGGCAGTCG
ATGTTTCTTCATCCGCTGCCAAGGAGCCTGCCGTTATCATCGGTGGTGAACGGACGGCTC
CAAACAGCTTGTTTAAGATAGAAAAAGATGCAGGAGCACACACTTACAAGTTGACCACCT
CATATGGAACCGTTGGAACTACCCCAGGGGCTTGGTTGAGTGCACCACAGCTACTTGTCA
CCAATGATGAGGCTAAGACCTTACTCGTCAAGTTCGTGAAGGTTGATGATGATGCTACTA
AGGCTACTACTTCTTCTTCACGTGTTGAGAAGCTAGGTCTGAGGATGTTCCCATTCTACT
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GGTTGAGATAATACCCGCACGCATGTGTGTGTATGTGAACTTTGTTTAGTTTAATAACAA
GTCAAGTAAATTTGTGCTTTTCAGCGCTTTATGAGACATAACTTTACCCT


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1EN89TF U 1
AF RS1GK64TF U 1
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AF RS1EG53TF U 3
AF RS1FU05TF U 3
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DS 

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GG
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DS 

RD RS1EG53TF 655 0 0
GG
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A

QA 3 654 3 654
DS 

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GG
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AGAAGTGGTGAAGGACTCTAACGGGAATCCAGTTAAGATCGGTGCCAAATACTTCATCCA
GCCGGTTAAGAGCAACGGCGGTGGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAACATACTTCCGTTTTG
TCCACTTGGCATCACCCAAACACTTCTTCCCTACCAACCGGGCCTCCCAGTTATCTTCGG
ATATTATCCACCTTTTGTCGGCACAGACTACATTGTCACATCTACCACTATAAACATCCA
GTTCCATTCCGACATCTGGCCTGTATGCAACGAGCTTTCCAAGTTATGGGCAGTCGATGT
TTCTTCATCCGCTGCCAAGGAGCCTGCCGTTATTATCGGTGGTGAACGGACGGCTCCAAA
CAGCCTGTTTAAGATAGAAAAAGATGCAGGAGCACACACTTACAAGTTGACCACCTCATA
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TGATGAGGCTAAGACCTTACTCGTCAAGTTCGTGAAGGTTGATGATGATGCTACTAAG*C
TACTACTTCTTCTTCACGTGTTGAGAAGCTAGGTCTGAGGATG

QA 3 705 3 705
DS 

RD RS1GK64JQ 600 0 0
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CTACTTGTCACCAATGATGAGGCTAAGACCTTACTCGTCAAGTTCGTGAAGGTTGATGAT
GATGCTACTAAGGCTACTACTTCTTCTTCACGTGTTGAGAAGCTAGGTCTGAGGATGTTC
CCATTCTACTAGTGTCAAGATCATTAAATGTAAAA*AAAGCCCGAGACTCGTCCATGGCT
AAAAATAATGGGTTGAGATAATACCCGCACGCATGTGTGTGTATGTGAACTTTGTTTAGT
TTAATAACAAGTCAAGTAAATTTGTGCTTTTCAGCGCTTTATGAGACATAACTTTACC
TT

QA 1 598 1 598
DS 

RD RS1FU05JQ 185 0 0
TGTTCCCATTCTACTAGTGTCAAGATCATGAAATGTAAAAGAAAGCCCGAGACTCGTCCA
TGGCTAAAAATAATGGGTTGAGATAATACCCGCACGCATGTGTGTGTATGTGAACTTTGT
TTAGTTTAATAACAAGTCAAGTAAATTTGTGCTTTTCAGCGCTTTATGAGACATAACTTT
ACCCT

QA 1 185 1 185
DS 



AS 2 7

CO CL842Contig1 860 3 16 U
AGGCAATTGTCCTTTATTTTGGTTATTTGTTGCAAATAAGAATGACAAAAAGGATTTGAA
TGCCAAAATATATATAGAAACAAATTATCATTTGGAAACTTCATTACGGCAAGTCTTGTC
ACAGGGATAAGCACAGTCTATGAGTTTCGCTCCTCTTCTTTCGAAAAACCAATCTCCCAC
AGCTACTGCAATCCTCTTGTTCTTAATAGCAGGAGAGTTTTTGGAATACCAAGTGTCATG
ATTCTCTGTTTGGCAATGAGTAAAGCACGAGTTAATAAATACTCCGTTCTTACTTGGCTT
TGTAAAACTACTGATCAAATTCACCATACGAGTCCTGAAACCTTGCAAGAACTTGATCTG
AGATGCATTGCACTTTGCGATGTTAAGTCTACAGTCAGACCAACTTCCATTTGGATCTGC
AGATTTAGGAGTTAAACTCTCTTGGATCTGCCACGGATCGTATGCAGCATTTAAAATAAA
CAATGAAGTGTTGACTTGGTTTATTAGGTTTTGCCCGAAAAAACACGAAGTTGGATTAAG
ACGTCTTAAACATTCGTTAGAGAGCTGTGTTGTAATACTCTGTAATACTATTAAATCTCT
GTATAAATTTCTAAGAGGTCGATCTCCAGAGACATCGGGGGCATCAAGGAAAAGGCCAGC
ATCACTCAGACATTTTAGTCTGGCCTTAGGGAAATGCCATTTTAACTTGTCACAGTGAAG
TATCGCTGCAGGCCTCCAGAAGAACATCCAGAAAGCAGAACCTGCTTTGCTTCACGAAAT
TTGTTGTTTCCATCAAGTCTACATATACATCCCCATATTTGCTTCCTCTAAACTGAAGTT
TGCATCATATTTTCATTGTT


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EG90JQ U 1
AF RS1EZ65JQ U 2
AF RS1B158JQ U 2
BS 1 39 RS1EG90JQ
BS 40 40 RS1B158JQ
BS 41 76 RS1EG90JQ
BS 77 77 RS1B158JQ
BS 78 148 RS1EG90JQ
BS 149 149 RS1B158JQ
BS 150 214 RS1EG90JQ
BS 215 215 RS1B158JQ
BS 216 361 RS1EG90JQ
BS 362 362 RS1B158JQ
BS 363 397 RS1EG90JQ
BS 398 398 RS1B158JQ
BS 399 421 RS1EG90JQ
BS 422 422 RS1B158JQ
BS 423 523 RS1EG90JQ
BS 524 860 RS1B158JQ

RD RS1EG90JQ 523 0 0
AGGCAATTGTCCTTTATTTTGGTTATTTGTTGCAAATAAAAATGACAAAAAGGATTTGAA
TGCCAAAATATATATAAAAACAAATTATCATTTGGAAACTTCATTACGGCAAGTCTTGTC
ACAGGGATAAGCACAGTCTATGAGTTTCCCTCCTCTTCTTTCGAAAAACCAATCTCCCAC
AGCTACTGCAATCCTCTTGTTCTTAATAGCAGGAAAGTTTTTGGAATACCAAGTGTCATG
ATTCTCTGTTTGGCAATGAGTAAAGCACGAGTTAATAAATACTCCGTTCTTACTTGGCTT
TGTAAAACTACTGATCAAATTCACCATACGAGTCCTGAAACCTTGCAAGAACTTGATCTG
AAATGCATTGCACTTTGCGATGTTAAGTCTACAGTCAAACCAACTTCCATTTGGATCTGC
AAATTTAGGAGTTAAACTCTCTTGGATCTGCCACGGATCGTATGCAGCATTTAAAATAAA
CAATGAAGTGTTGACTTGGTTTATTAGGTTTTGCCCGAAAAAA

QA 1 523 1 523
DS 

RD RS1EZ65JQ 560 0 0
G
GCAATTGTCCTTTATTTTGGTTATTTGTTGCAAATAAGAATGACAAAAAGGATTTGAATG
CCAAAATATATATAGAAACAAATTATCATTTGGGAACTTCATTACGGCAAGTCTTGTCAC
AGGGATAAGCACAGTCTATGAGTTTCGCTCCTCTTCTTTCGAAAAACCAATCTCCCACAG
CTACTGAAATCCTCTTGTTCTTAATAGCAGGAGAGTTTTTGGAATACCAAGTGTCATGAT
TCTCTGTTTGGCAATGAGTAAAGCACGAGTTAATAAATACTCCGTTCTTACTTGGCTTTG
TAAAACTACTGATCAAATTCACCATACGAGTCCTGAAACCTTGCAAGAACTTGATCTGAG
ATGCATTGCACTTTGCGATGTTAAGTCTACAGTCAGACCAACTTCCATTTGGATCTGCAG
ATTTAGGAGTTAAACTCTCTTGGATCTGCCACGGATCGTATGCAGCATTTAAAATAAACA
ATGAAGTGTTGACTTGGTTTATTAGGTTTTGCCCGAAAAAACACGAAGTTGGATTAAGAC
GTCTTAAACATTCGTTAGA

QA 2 560 2 560
DS 

RD RS1B158JQ 859 0 0
A
GCAATTGTCCTTTATTTTGGTTATTTGTTGCAAATAAGAATGACAAAAAGGATTTGAATG
CCAAAATATATATAGAAACAAATTATCATTTGGAAACTTCATTACGGCAAGTCTTGTCAC
AGGGATAAGCACAGTCTATGAGTTTCGCTCCTCTTCTTTCGAAAAACCAATCTCCCACAG
CTACTGCAATCCTCTTGTTCTTAATAGCAGGAGAGTTTTTGGAATACCAAGTGTCATGAT
TCTCTGTTTGGCAATGAGTAAAGCACGAGTTAATAAATACTCCGTTCTTACTTGGCTTCG
TAAAACTACTGATCAAATTCACCATACGAGTCCTGAAACCTTGCAAGAACTTGATCTGAG
ATGCATTGCACTTTGCGATGTTAAGTCTACAGTCAGACCAACTTCCATTTGGATCTGCAG
ATTTAGGAGTTAAACTCTCTTGGATCTGCCACGGATCGTATGCAGCATTTAGAATAAACA
ATGAAGTGTTGACTTGGTTTATTAGGTTTTACCCGAAAAAACACGAAGTTGGATTAAGAC
GTCTTAAACATTCGTTAGAGAGCTGTGTTGTAATACTCTGTAATACTATTAAATCTCTGT
ATAAATTTCTAAGAGGTCGATCTCCAGAGACATCGGGGGCATCAAGGAAAAGGCCAGCAT
CACTCAGACATTTTAGTCTGGCCTTAGGGAAATGCCATTTTAACTTGTCACAGTGAAGTA
TCGCTGCAGGCCTCCAGAAGAACATCCAGAAAGCAGAACCTGCTTTGCTTCACGAAATTT
GTTGTTTCCATCAAGTCTACATATACATCCCCATATTTGCTTCCTCTAAACTGAAGTTTG
CATCATATTTTCATTGTT

QA 2 859 2 859
DS 



CO CL842Contig2 832 4 6 U
GGAAGTGCGAACCACCTTGCGTTTCCTTTGAAATGAAGAAAATTTTATGGAGTCTCACTC
TTTTTGGTGTCATCTTAATCCTCCCTGTTAATGGGGTGATGGAAAGGCTCCCAGATTCTA
ATGGGACAAATGTGTATCAGACCGAAAATGATGTCTATTCCAAAGCAAAGCCTACAATGG
TAGAACTCACTTTCGTTAAGAATCCTAATGAGAGATCAGCATTGTGTCTAGATGGAAGTC
CTTCCGGATATCATTTTCATCCCGGGTCCGGTTCAGGAGCAAATAATTGGATCATTCAGT
TTGAGGGAGGTGGATGGTGTGGTACCATTGAAGATTGTATAAATATGAAAAAAACTCGTC
ATGGATCGTCCAAATATATGGAGAAACAGATACCTTTTACAGGAATTCTAAGTGACAAAG
CCGCGCAAAATCCAGACTTTTATAACTGGAACAGAGTAAAAGTTAGGTCCTGTGATGGTG
GATCCTTTATGGGAAACAATGAAAATATGGATGCAAAACTTCAGTTTAGAGGAAGGCAAA
TATGGGGATGTATTATGGTAGACTTGATGGAAAACAACAAATTTCGTGAAGCAAAGCAGG
TTCTGCTTTCTGGATGTTCTTCTGGAGGCCTTGCAGCGATACTTCACTGTGACAAGTTAA
AATGGCATTTCCCTAAGCCAGACTAAAATGTCTGAGTGATGCTGGCCTTTTCCTTGATGC
CCCCGATGTCTCTGGAGATCGACCTCTTAGAAATTTATACAGAGATTTAATAGTATTACA
GAGTATTACAACACAGCTCTCTAACGAATGTTTAAGACGTCTTAATCCAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EZ65TF U 1
AF RS1GZ70TF U 11
AF RS1B158TF U 12
AF RS1AG40TF U 66
BS 1 274 RS1EZ65TF
BS 275 275 RS1GZ70TF
BS 276 576 RS1EZ65TF
BS 577 577 RS1GZ70TF
BS 578 595 RS1EZ65TF
BS 596 832 RS1AG40TF

RD RS1EZ65TF 595 0 0
GGAAGTGCGAACCACCTTGCGTTTCCTTTGAAATGAAGAAAATTTTATGGAGTCTCACTC
TTTTTGGTGTCATCTTAATCCTCCCTGTTAATGGGGTGATGGAAAGGCTCCCAGATTCTA
ATGGGACAAATGTGTATCAGACCGAAAATGATGTCTATTCCAAAGCAAAGCCTACAATGG
TAGAACTCACTTTCGTTAAGAATCCTAATGAGAGATCAGCATTGTGTCTAGATGGAAGTC
CTTCCGGATATCATTTTCATCCCGGGTCCGGTTCGGGAGCAAATAATTGGATCATTCAGT
TTGAGGGAGGTGGATGGTGTGGTACCATTGAAGATTGTATAAATATGAAAAAAACTCGTC
ATGGATCGTCCAAATATATGGAGAAACAGATACCTTTTACAGGAATTCTAAGTGACAAAG
CCGCGCAAAATCCAGACTTTTATAACTGGAACAGAGTAAAAGTTAGGTCCTGTGATGGTG
GATCCTTTATGGGAAACAATGAAAATATGGATGCAAAACTTCAGTTTAGAGGAAGGCAAA
TATGGGGATGTATTATGGTAGACTTGATGGAAAACAGCAAATTTCGTGAAGCAAA

QA 1 595 1 595
DS 

RD RS1GZ70TF 587 0 0
AGG
ACCTTGCGTTTCCTTTGAAATGAAGAAAATTTTATGGAGTCTCACTCTTTTTGGTGTCAT
CTTAATCCTCCCTGTTAATGGGGTGATGGAAAGGCTCCCAGATTCTAATGGGACAAATGT
GTATCAGACCGAAAATGATGTCTATTCCAAAGCAAAGCCTACAATGGTAGAACTCACTTT
CGTTAAGAATCCTAATGAGAGATCAGCATTGTGTCTATATGGAAGTCCTTCCGGATATCA
TTTTCATCCCGGGTCCGGTTCAGGAGCAAATAATTGGATCATTCAGTTTGAGGGAGGTGG
ATGGTGTGGTACCATTGAAGATTGTATAAATATGAAAAAAACTCGTCATGGATCGTCCAA
ATATATGGAGAAACAGATACCTTTTACAGGAATTCTAAGTGACAAAGCCGCGCAAAATCC
AGACTTTTATAACTGGAACAGAGTAAAAGTTAGGTCCTGTGATGGTGGATCCTTTATGGG
AAACAATGAAAATATGGATGCAAAACTTCAGTTTAGAGGAAGGCAAATATGGGGATGTAT
TATGGTAGACTTGATGGAAAACAACAAATTTCGTGAAGCAAA
GC

QA 4 585 4 585
DS 

RD RS1B158TF 584 0 0
GG
ACCTTGCGTTTCCTTTGAAATGAAGAAAATTTTATGGAGTCTCACTCTTTTTGGTGTCAT
CTTAATCCTCCCTGTTAATGGGGTGATGGAAAGGCTCCCAGATTCTAATGGGACAAATGT
GTATCAGACCGAAAATGATGTCTATTCCAAAGCAAAGCCTACAATGGTAGAACTCACTTT
CGTTAAGAATCCTAATGAGAGATCAGCATTGTGTCTAGATGGAAGTCCTTCCGGATATCA
TTTTCATCCCGGGTCCGGTTCAGGAGCAAATAATTGGATCATTCAGTTTGAGGGAGGTGG
ATGGTGTGGTACCATTGAAGATTGTATAAATATGAAAAAAACTCGTCATGGATCGTCCAA
ATATATGGAGAAACAGATACCTTTTACAGGAATTCTAAGTGACAAAGCCGCGCAAAATCC
AGACTTTTATAACTGGAACAGAGTAAAAGTTAGGTCCTGTGATGGTGGATCCTTTATGGG
AAACAATGAAAATATGGATGCAAAACTTCAGTTTAGAGGAAGGCAAATATGGGGATGTAT
TATGGTAGACTTGATGGAAAACAACAAATTTCGTGAAGCAAA

QA 3 584 3 584
DS 

RD RS1AG40TF 767 0 0
GGTGTCATCTTAATCCTCCCTGTTAATGGGGTGATGGAAAGGCTCCCAGATTCTAATGGG
ACAAATGTGTATCAGACCGAAAATGATGTCTATTCCAAAGCAAAGCCTACAATGGTAGAA
CTCACTTTCGTTAAGAATCCTAATGAGAGATCAGCATTGTGTCTAGATGGAAGTCCTTCC
GGATATCATTTTCATCCCGGGTCCGGTTCAGGAGCAAATAATTGGATCATTCAGTTTGAG
GGAGGTGGATGGTGTGGTACCATTGAAGATTGTATAAATATGAAAAAAACTCGTCATGGA
TCGTCCAAATATATGGAGAAACAGATACCTTTTACAGGAATTCTAAGTGACAAAGCCGCG
CAAAATCCAGACTTTTATAACTGGAACAGAGTAAAAGTTAGGTCCTGTGATGGTGGATCC
TTTATGGGAAACAATGAAAATATGGATGCAAAACTTCAGTTTAGAGGAAGGCAAATATGG
GGATGTATTATGGTAGACTTGATGGAAAACAACAAATTTCGTGAAGCAAAGCAGGTTCTG
CTTTCTGGATGTTCTTCTGGAGGCCTTGCAGCGATACTTCACTGTGACAAGTTAAAATGG
CATTTCCCTAAGCCAGACTAAAATGTCTGAGTGATGCTGGCCTTTTCCTTGATGCCCCCG
ATGTCTCTGGAGATCGACCTCTTAGAAATTTATACAGAGATTTAATAGTATTACAGAGTA
TTACAACACAGCTCTCTAACGAATGTTTAAGACGTCTTAATCCAACT

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 7

CO CL843Contig1 653 7 8 U
GGATCTCACAAAAAAATATCCCAAAAAAA*TATGAATAAATTCATAGTGTTTCTGTTTGC
TATTAAAATATGTTTTGTATTGAGTGAAGCTTGCGCAGAAAGTCGTATAGACCTCAAGAA
CGAACTCGGCGCAGGTGTGATGCTCGAAATCCATTGTAAATCTGACGATCCAACCAGAGA
TTTGGGGAGAGTCTCTATAAAATTCAATGACAAAATGGGTTATGGATTCTGGCCTCTTGT
TGAACGAAGACGCAGAACTATATATAGATGTGATCTATGGCATACGATTCCGAAAAGTCC
GGCACATCCTCGCGGCGGAATGAATAGTGTTAATAAGCTTGAAGCATTTGCCGGGGGCTC
GAATAGTAGACGTGGTCAATACCGTGAATGGGTTGCCAGACCTGATGGGATTTACTTTAG
AAGAAATGCTAATAGCCCATATGAACGTAGAAACGACTATCAATGGTTTACACTAAGATT
TTAAATAAGTTTTTTCTCTTATAACTTAAAAAGGAATATTTATGTAAGTTGATTCTTTGT
ATTTGTAAATAACTAATCCCTAAGTT*GTATTAATAATGTGCTACAAATATGTAGCAAAA
AA*TGTAATAAAATGTGAGATTATTAAATGATTATAGATACTCCATCCGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1AK39TF U 1
AF RS1DE29TF U 6
AF RS1DE29JQ C 6
AF RS1EF33JQ C 356
AF RS1EF33TF U 356
AF RS1FN61JQ C 356
AF RS1FN61TF U 356
BS 1 29 RS1AK39TF
BS 30 30 RS1DE29TF
BS 31 209 RS1AK39TF
BS 210 210 RS1DE29TF
BS 211 370 RS1AK39TF
BS 371 371 RS1EF33TF
BS 372 596 RS1AK39TF
BS 597 653 RS1EF33TF

RD RS1AK39TF 596 0 0
GGATCTCACAAAAAAATATCCCAAAAAAAATATGAATAAATTCATAGTGTTTCTGTTTGC
TATTAAAATATGTTTTGTATTGAGTGAAGCTTGCGCAGAAAGTCGTATAGACCTCAAGAA
CGAACTCGGCGCAGGTGTGATGCTCGAAATCCATTGTAAATCTGACGATCCAACCAGAGA
TTTGGGGAGAGTCTCTATAAAATTCAATG*CAAAATGGGTTATGGATTCTGGCCTCTTGT
TGAACGAAGACGCAGAACTATATATAGATGTGATCTATGGCATACGATTCCGAAAAGTCC
GGCACATCCTCGCGGCGGAATGAATAGTGTTAATAAGCTTGAAGCATTTGCCGGGGGCTC
GAATAGTAGATGTGGTCAATACCGTGAATGGGTTGCCAGACCTGATGGGATTTACTTTAG
AAGAAATGCTAATAGCCCATATGAACGTAGAAACGACTATCAATGGTTTACACTAAGATT
TTAAATAAGTTTTTTCTCTTATAACTTAAAAAGGAATATTTATGTAAGTTGATTCTTTGT
ATTTGTAAATAACTAATCCCTAAGTT*GTATTAATAATGTGCTACAAATATGTAGC

QA 1 596 1 596
DS 

RD RS1DE29TF 582 0 0
GG
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ATATGTTTTGTATTGAGTGAAGCTTGCGCAGAAAGTCGTATAGACCTCAAGAACGAACTC
GGCGCAGGTGTGATGCTCGAAATCCATTGTAAATCTGACGATCCAACCAGAGATTTGGGG
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AGACGCAGAACTATATATAGATGTGATCTATGGCATACGATTCCGAAAAGTCCGGCACAT
CCTCGCGGCGGAATGAATAGTGTTAATAAGCTTGAAGCATTTGCCGGGGGCTCGAATAGT
AGATGTGGTCAATACCGTGAATGGGTTGCCAGACCTGATGGGATTTACTTTAGAAGAAAT
GCTAATAGCCCATATGAACGTAGAAACGACTATCAATGGTTTACACTAAGATTTTAAATA
AGTTTTTTCTCTTATAACTTAAAAAGGAATATTTATGTAAGTTGATTCTTTGTATTTGTA
AATAACTAATCCCTAAGTTTGTATTAATAATGTGCTACAA

QA 3 582 3 582
DS 

RD RS1DE29JQ 621 0 0
GG
ACAAAAAAATATCCCAAAAAAA*TATGAATAAATTCATAGTGTTTCTGTTTGCTATTAAA
ATATGTTTTGTATTGAGTGAAGCTTGCGCAGAAAGTCGTATAGACCTCAAGAACGAACTC
GGCGCAGGTGTGATGCTCGAAATCCATTGTAAATCTGACGATCCAACCAGAGATTTGGGG
AGAGTCTCTATAAAATTCAATGACAAAATGGGTTATGGATTCTGGCCTCTTGTTGAACGA
AGACGCAGAACTATATATAGATGTGATCTATGGCATACGATTCCGAAAAGTCCGGCACAT
CCTCGCGGCGGAATGAATAGTGTTAATAAGCTTGAAGCATTTGCCGGGGGCTCGAATAGT
AGATGTGGTCAATACCGTGAATGGGTTGCCAGACCTGATGGGATTTACTTTAGAAGAAAT
GCTAATAGCCCATATGAACGTAGAAACGACTATCAATGGTTTACACTAAGATTTTAAATA
AGTTTTTTCTCTTATAACTTAAAAAGGAATATTTATGTAAGTTGATTCTTTGTATTTGTA
AATAACTAATCCCTAAGTT*GTATTAATAATGTGCTACAAATATGTAGCAAAAAAATGTA
ATAAAATGTGAGATTATT
G

QA 3 620 3 620
DS 

RD RS1EF33JQ 285 0 0
GGCTCGAATAGTAGACGTGGTCAATACCGTGAATGGGTTGCCAGACCTGATGGGATTTAC
TTTAGAAGAAATGCTAATAGCCCATATGAACGTAGAAACGACTATCAATGGTTTACACTA
AGATTTTAAATAAGTTTTTTCTCTTATAACTTAAAAAGGAATATTTATGTAAGTTGATTC
TTTGTATTTGTAAATAACTAATCCCTAAGTT*GTATTAATAATGTGCTACAAATATGTAG
CAAAAAA*TGTAATAAAATGTGAGATTATTAAATGATTATAGATA

QA 1 285 1 285
DS 

RD RS1EF33TF 298 0 0
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AGATTTTAAATAAGTTTTTTCTCTTATAACTTAAAAAGGAATATTTATGTAAGTTGATTC
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CAAAAAA*TGTAATAAAATGTGAGATTATTAAATGATTATAGATACTCCATCCGTTTC

QA 1 298 1 298
DS 

RD RS1FN61JQ 298 0 0
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AGATTTTAAATAAGTTTTTTTTCTTATAACTTAAAAAGGAATATTTATGTAAGTTGATTC
TTTGTATTTGTAAATAACTAATCCCTAAGTT*GTATTAATAATGTGCTACAAATATGTAG
CAAAAAA*TGTAATAAAATGTGAGATTATTAAATGATTATAGATACTCCATCCGTTTC

QA 1 298 1 298
DS 

RD RS1FN61TF 298 0 0
GGCTCGAATAGTAGACGTGGTCAATACCGTGAATGGGTTGCCAGACCTGATGGGATTTAC
TTTAGAAGAAATGCTAATAGCCCATATGAACGTAGAAACGACTATCAATGGTTTACACTA
AGATTTTAAATAAGTTTTTTCTCTTATAACTTAAAAAGGAATATTTATGTAAGTTGATTC
TTTGTATTTGTAAATAACTAATCCCTAAGTT*GTATTAATAATGTGCTACAAATATGTAG
CAAAAAA*TGTAATAAAATGTGAGATTATTAAATGATTATAGATACTCCATCCGTTTC

QA 1 298 1 298
DS 



AS 1 7

CO CL844Contig1 1190 7 17 U
GATCCCAAAGGCAACATTCCAAACCGCGTTTGGTATTTCGTGTTATCCACTTATATATAT
AAATTCTCAAAGTCAAGCACAACCCACAAAAACACATCTCAACAATTCTCTCGAATCATC
CGCCAAACTCGAGATAATTTTCAGCCATGACAGGATCCCAAGAAGAGACTCACCAGCCTC
ACACCGTTGAT*CAAGAACATCCCAAAACAGTAGAAACAGAGCACCAACAACAACAACAA
GAAGAACATCCTTCATCGTCTTCGTCTCCGGATCAGAAGAAATGGGGTACTCACGTGATG
GGAGCTCCGGCAGCTCCCGTGGCTCATCCCGATAACCAGCAGGCTGCCGCTTGGGTCGCT
GGTGATAACCGGCAGATGCCGCACCAACCTTACATCGTCTACTCTCCTGTTGAACATCCT
CCGTCTAACAACCCTCTCGAGCCCGTCATCGGAATGTTCCATACTTGGAGCCGCAAGGCT
GAAACCGTCGCTCGCAACATCTGGCACAATCTGAAGACGGGACCGTCTATGCCGGAAACG
GCGTGGGGAAAGGTTAACCTGACGGCGAAAGCGATAACAAAGGGAGGTTTCGAGTCTCTC
TTCAGGCAGATATTTGGAACGGACCCGAACGAGAAGCTGAAGAAGACTTTCGCATGTTAT
CTCTCCACGACAACAGGCCCTGTCGCTGGAACTTTGTATCTCTCGAACGTTCGCGTCGCT
TTCTGTAGCGACCGTCCTCTCTTCTTCACCGCGCCTTCCGGACAAGAAGCTTGGAGTTAC
TACAGGGTGGTGGTACCGTTGGTGAATATTGCGACGGTTAATCCGGTAGTAGTAAAGGAG
GATCCACCGGAAAAGTATATTCAGGTGACGACCGTGGACGGACATGACTTCTGGTTCATG
GGTTTTGTGAATTACGAGAAGGCTTCTCATCATTTGCTGACTAGTGTCTCGGATTCTCAT
ACCACTCCTACCTATGCGTCTGGTTAGAGAAATATATTACAGTGCTTGTATCTTGTTAAT
TTGCTTTCTTTTGTATGTGTGTGGTTGGTTTCTACTGCCGATTTTCTTTATATATGTTTA
TGTAAGTTTGATACTATAGTTGGACTTTTTGCAAGTCTTGAATTTAAATACATCTATGTT
TCGATTAGAGTTTGTTTTTCACTTATGTGTAAATGATAAATCCTTCTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
20 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FI34TF U 1
AF RS1C020TF U 84
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GGTGATAACCGGCAGATGCCGCACCAACCTTACATCGTCTACTCTCCTGTTGAACATCCT
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CTCTCCACGACA

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TCACCGCGCCTTCCGGACA
GAAGCTTGAGTACT

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T
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ACATCCCAAAACAGTAGAAACAGAGCACCAACAACAACAACAAGAAGGACATCCTTCATC
GTCTTCGTCTCCGGATCAGAAGAAATGGGGTACTCACGTGATGGGAGCTCCGGCAGCTCC
CGTGGCTCATCCCGATAACCAGCAGGCTGCCGCTTGGGTCGCTGGTTATAACCGGCAGAT
GCCGCACCAACCTTACATCGTCTACTCTCCTGTTGAACATCCTCCGTCTAACAACCCTCT
CGAGCCCGTCATCGGAATGTTCCATACTTGGAGCCGCAAGGCTGAAACCGTCGCTCTCAA
CATCTGGCACAATCTGAAGACGGGACCGTCTATGCCGGAAACGGCGTGGGAAAAGGTTAA
CCTGACGGCGAAAGCGATAACAAAGGGAGGTTTCGAGTCTCTCTTCAGGCAGATATTTGG
AACGGACCCGAACGAGAAGCTGAAGAAGACTTTCGCATTTTATCTCTCCACGACAACAGG
CCCTGTCGCTGGAACTTTGTATCTCTCGAACGTTCGCGTCGCTTTCTGTAGC

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DS 

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GG
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CATGACAGGATCCCAAGAAGAGACTTACCAGCCTCACACCGTTGAT*CAAGAACATCCCA
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CGAACGAGAAGCTGAAGAAGACTTTCGCATGTTATCTCTCCACGACAACAGGCCCTGTCG
CTGGAACTTTGTATCTCTCGAACGTTCGCGTCGCTTTCTGTAGCGACCGTCCTCTCT*CT
TCACCGCGCCTTCCGGACA
GAAGCTTG

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G
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CATGACAGGATCCCAAGAAGAGACTCACCAGCCTCACACCGTTGAT*CAAGAACATCCCA
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ATCCCGATAACCAGCAGGCTGCCGCTTGGGTCGCTGGTGATAACCGGCAGATGCCGCACC
AACCTTACATCGTCTACTCTCCTGTTGAACATCCTCCGTCTAACAACCCTCTCGAGCCCG
TCATCGGAATGTTCCATACTTGGAGCCGCAAGGCTGAAACCGTCGCTCGCAACATCTGGC
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CGAAAGCGATAACAAAGGGAGGTTTCGAGTCTCTCTTCAGGCAGATATTTGGAACGGACC
CGAACGAGAAGCTGAAGAAGACTTTCGCATGTTATCTCTCCACGACAACAGGCCCTGTCG
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TCACCGCGCCTTCCGGACAAGAAGCTTGGAGT*ACTACAGGGTGGTGGTACCGTTGGTGA
ATATTGCGACGGT*AATCCCGTAGTAGTAAAG
AGGA

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GAGCCGCAAGGCTGAAACCGTCGCTCGCAACATCTGGCACAATCTGAAGACGGGACCGTC
TATGCCGGAAACGGCGTGGGGAAAGGTTAACCTGACGGCGAAAGCGATAACAAAGGGAGG
TTTCGAGTCTCTCTTCAGGCAGATATTTGGAACGGACCCGAACGAGAAGCTGAAGAAGAC
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AGCTTGGAGTTACTACAGGGTGGTGGTACCGTTGGTGAATATTGCGACGGTTAATCCGGT
AGTAGTAAAGGAGGATCCACCGGAAAAGTATATTCAGGTGACGACCGTGGACGGACATGA
CTTCTGGTTCATGGGTTTTGTGAATTACGAGAAGGCTTCTCATCATTTGCTGACTAGTGT
CTCGGATTCTCATACCGCTCCTACCTATGCGTCTGGTTAGAGAAATATATTACAGTGTTT
GTATCTTGTTAATTTGCTTTCTTTTGTATGTGTGTGGTTGGTTTCTACTGCCGATTTTCT
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ATACATCTATGTTTCGATT

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DS 

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TGAAGAAGACTTTCGCATGTTATCTCTCCACGACAACAGGCCCTGTCGCTGGAACTTTGT
ATCTCTCGAACGTTCGCGTCGCTTTCTGTAGCGACCGTCCTCTCTTCTTCACCGCGCCTT
CCGGACAAGAAGCTTGGGGTTACTACAGGGTGGTGGTACCGTTGGTGAATATTGCGACGG
TTAATCCGGTAGTAGTAAAGGAGGATCCACCGGAAAAGTATATTCAGGTGACGACCGTGG
ACGGACATGACTTCTGGTTCATGGGTTTTGTGAATTACGAGAAGGCTTCTCATCATTTGC
TGACTAGTGTCTCGGATTCTCATACCACTCCTACCTATGCGTCTGGTTAGAGAAATATAT
TACAGTGCTTGTATCTTGTTAATTTGCTTTCTTTTTTATGTGTGTGGTTGGTTTCTACTG
CCGATTTTCTTTATATATGTTTATGTAAGTTTGATACTATAGTTGGACTTTTTGCAAGTC
TTGAATTTAAATACATCTATGTTTCGATTAGAGTTTGTTTTTCACTTATGTGTAAATGAT
AAATCCTTCTGTT

QA 1 673 1 673
DS 



AS 2 7

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CGACACATCTTATCCACAACCTTCTCCGACATCCCGAACCACCGTCTTCCTTCGGTCTCC
TCCTCAGACCCTTTCACTTCTCCGCTATAACATGTCAATCCAGCCGCGGAAACAAGCCTC
GCTTTCAATCAATCTCTTCAAAGCTTAAGCTTCCGCTTCCTTTCCACTCTACTTCTTCTT
CTTCACTCGTAGCAAAATCCTTCTCTGCCGTCGATGAGCCGGACCTCGGAGAAGAAGATG
AGAGCGAGGAAGACGATTACAACGAAGAAGAAGATGAAGAAGAAGAAGAGCTGGACAGTG
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AGAAGGCTCGGGGCTCGGGTTTGAAGTTGACTATTAAGGAGAAGAAGGAACTTGCTTCAT
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AAGTTCTCAAACTCGCGACCCACTAGACCTTTTAGGAGAGAGTATTCAGAGAGACCTGAT
GGACGTGGACGCAGAGGAGGAAGTAGAGTTGCAACCCCTTGATTTTTTTGTTATTGTTAA
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TCTTCAAAAAAATACAATCTCGTTGATCTGTAAACCCTCTATTGCTGGGAAGCTGTAACC
ATTTGTGGCCATGAAATGACGGGAAGAGTTAAAGACAATCTTAACTCTTAACTACTATTA
TTCTTATGAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AD22TF U 1
AF RS1AP54TFB U 1
AF RS1AP54JQ C 686
AF RS1AD22JQ C 288
BS 1 746 RS1AD22TF
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BS 805 805 RS1AP54TFB
BS 806 809 RS1AD22TF
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BS 816 845 RS1AP54TFB
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CTTCACTCGTAGCAAAATCCTTCTCTGCCGTCGATGAGCCGGACCTCGGAGAAGAAGATG
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TACGCAAGACGTCTCCAGAGGAGATGGAGGACGCTGTTAGGCATTTGGAGGAAGCCACTG
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AAGTTCTCAAACTCGCGACCCACTGGACC

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ACCCTTTCACTTCTCCGCTATAACATGTCAATCCAGCCGCGGAAACAAGCCTCGCTTTCA
ATCAATCTCTTCAAAGCTTAAGCTTCCGCTTCCTTTCCACTCTACTTCTTCTTCTTCACT
CGTAGCAAAATCCTTCTCTGCCGTCGATGAGCCGGACCTCGGAGAAGAAGATGAGAGCGA
GGAAGACGATTACAACTAAGAAGAAGATGAAGTAGAAGAAGAGCTGGACAGTGGAATGGT
ATCCGCGAGAGGAAATGAGGAGTACGAGGAGGATAAGATAGAGAAGATGAAGAAGAAGGC
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TAGTCTTGGTGACAAATTGAAATGTCAACTCGTCGGCAAATCTGGCGTTACTGATTCGGT
CGTTTTCTCATTCCTCGAGACTCTAGAGAAGAACGAGCTCTTAAAGGTGAAGATACGCAA
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CAAACTCGCGACCCACTAGACCTTTA**GAGAGAGTATTCAGAGAGACCTGATGGACG

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DS 

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AAGAAGTTGAGAGATTGTTGATTAGAAGGAGACAGAAGTTCTCAAACTCGCGACCCACTA
GACCTTTTAGGAGAGAGTATTCAGAGAGCCCTGATGGACGTGGACGCAGAGGAGGAAGTA
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CCCTAAGAAGACCAG

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DS 

RD RS1AD22JQ 806 0 0
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GAGCTGGACAGTGGAATGGTATCCGCGAGAGGAAATGAGGAGTACGAGGAGGATAAGATA
GAGAAGATGAAGAAGAAGGCTCGGGGCTCGGGTTTGAAGTTGACTATTAAGGAGAAGAAG
GAACTTGCTTCATACGCCCATAGTCTTGGTGACAAATTGAAATGTCAACTCGTCGGCAAA
TCTGGCGTTACTGATTCGGTCGTTTTCTCACTCCTCGAGACTCTAGAGAAGAACGAGCTC
TTAAAGGTGAAGATACGCAAGACGTCTCCAGAGGAGATGGAGGACGCTGTTAGGCATTTG
GAGGAAGCCACTGGTTCTGTTGCTGTTGGCCAGATCGGG*AGGACGGTGATATTGTACCG
GCCTAGTCCCACCAAAATGCAAGCTGAGGAGAAGAAGAAAGAAGTTGAGAGATTGTTGAT
TAGAAGGAGACAGAAGTTTTCAAACTCGCGACCCACTGGACCTTTTAGGAGAGAGTATTC
AGAGAGACCTGATGGACGTGGACGCAGAGGAGGAAGTAGAGTTGCAACCCCTTGATTTTT
TTGTTATTGTTAATTTGCTCGTTTTTTTTTTTATTATCACCTAAGAAGACCAGTTCTTTG
CTTTTGTGTGCATTCTTCAAAAAAATACAATCTCGTTGATCTGTAAACCCTCTATTGCTG
GGAAGCTGTAACCATTTGTGGCCATGAAATGACGGGAAGAGTTAAAGACAATCTTAACTC
TTAACTACTATTATTCTTATGAGACC

QA 1 806 1 806
DS 



CO CL845Contig2 931 3 7 U
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CATCTTATCCACAACCTTCTCCGACATCCCGAACCACCGTCTTCCTTCGGTCTCCTCCTC
AGACCCTTTCACTTCTCCGCTATAACATGTCAATCCAGCCGCGGAAACAAGCCTCGCTTT
CAATCAATCTCTTCAAAGCTCCACTCTACTTCTTCTTCGTCTTCACTCGTACCGAAATCC
TTCTCTGCCATCGATGAGCCGGACCTCCTCGGAGAAGAAGATGAAGAAGAGGTGGAGAGT
GGAATGGTATCCGCGAGAGAAAGTGAGGAGTACGAGGAGGATAAGATAGAGAAGATGAAG
AAGAAGGCTCGGGGCTCGGGTTTGAAGTTGACTATTAAGGAGAAGAAGGAACTTGCTTCA
TACGCCCATAGTCTTGGTGACAAATTGAAATGTCAACTCGTCGGCAAATCTGGCGTTACT
GATTCTGTCGTTTTCTCATTCCTCGAGACTCTCGAGAAGAACGAGCTCTTAAAGGTGAAG
ATACGCAAGACGTCTCCAGAGGAGATGGAGGACGCTGTTAGGCATTTGGAGGAAGCCACT
GGTTCTGTTGCTGTTGGCCAGATCGGGAGGACGGTGATATTGTACCGGCCTAGTCCCACC
AAAATGAAAGCTGAGGAGAAGAAGAAAGAAGTTGAGAGATTGTTGATTAGAAGGAGACAG
AAGTTCTCAAACTCGCGACCCACTAGACCTTTTAGGAGAGAGTATTCAGAGAGACCTGAT
GGACGTGGACGCAGAGGAGGAAGTAGAGTTGCAACGCCTTGATTTTTTTGTTATTGTTAA
TTTGCTCGGTTTTTTTTTTATTATCACCTAAGAAGACCAGTTCTTTGCTTTTGTGTGCAT
TCTTCAAAAAAATACAATCTCGTTGATCTGT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AG71TF U 1
AF RS1C685TF U 1
AF RS1C685JQ C 144
BS 1 200 RS1AG71TF
BS 201 201 RS1C685TF
BS 202 580 RS1AG71TF
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RD RS1AG71TF 679 0 0
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AGACCCTTTCACTTCTCCGCTATAACATGTCAATCCAGCCGCGGAAACAAGCCTCGCTTT
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GGAATGGTATCCGCGAGAGAAAGTGAGGAGTACGAGGAGGATAAGATAGAGAAGATGAAG
AAGAAGGCTCGGGGCTCGGGTTTGAAGTTGACTATTAAGGAGAAGAAGGAACTTGCTTCA
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AAAATGAAAGCTGAG
AGAA

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1C685TF 679 0 0
GG
AGGAATTAAAACACAGATGGGGAGCGTAAGAATACAACCACCGTCTTCTTCATCGACACA
TCTTATCCACAACCTTCTCCGACATCCCGAACCACCGTCTTCCTTCGGTCTCCTCCTCAG
ACCCTTTCACTTCTCCGCTATAACATGTCAATCCAGCCGCGGAAACAAGCCTCGCTTTCA
ATCAATCTCTTCAAAGCTCCACTCTACTTCTTCTTCGTCTTCACTCGTACCGAAATCCTT
CTCTGCCATCGATGAGCCGGACCTCCTCGGAGAAGAAGATGAAGAAGAGGTGGAGAGTGG
AATGGTATCCGCGAGAGAAAGTGAGGAGTACGAGGAGGATAAGATAGAGAAGATGAAGAA
GAAGGCTCGGGGCTCGGGTTTGAAGTTGACTATTAAGGAGAAGAAGGAACTTGCTTCATA
CGCCCATAGTCTTGGTGACAAATTGAAATGTCAACTCGTCGGCAAATCTGGCGTTACTGA
TTCTGTCGTTTTCTCATTCCTCGAGACTCTCGAGAAGAACGAGCTCTTAAAGGTGAAGAT
ACGCAAGACGTCTCCAGAGGAGATGGAGGACGCTGTTAGGCATTTGGAGGAAGCCACTGG
TTCTGTTGCTGTTGGCCAGATCGGGAGGACGGTGATATTGTACCGGCCTAGTCCCACCAA
AATGAAAGCTGAGGAGA

QA 3 679 3 679
DS 

RD RS1C685JQ 788 0 0
AACATGTCAATCCAGCCGCGGAAACAAGCCTCGCTTTCAATCAATCTCTTCAAAGCTCCA
CTCTACTTCTTCTTCGTCTTCACTCGTACCGAAATCCTTCTCTGCCATCGATGAGCCGGA
CCTCCTCGGAGAAGAAGATGAAGAAGAGGTGGAGAGTGGAATGGTATCCGCGAGAGAAAG
TGAGGAGTACGAGGAGGATAAGATAGAGAAGATGAAGAAGAAGGCTCGGGGCTCGGGTTT
GAAGTTGACTATTAAGGAGAAGAAGGAACTTGCTTCATACGCCCATAGTCTTGGTGACAA
ATTGAAATGTCAACTCGTCGGCAAATCTGGCGTTACTGATTCTGTCGTTTTCTCATTCCT
CGAGACTCTCGAGAAGAACGAGCTCTTAAAGGTGAAGATACGCAAGACGTCTCCAGAGGA
GATGGAGGACGCTGTTAGGCATTTGGAGGAAGCCACTGGTTCTGTTGCTGTTGGCCAGAT
CGGGAGGACGGTGATATTGTACCGGCCTAGTCCCACCAAAATGAAAGCTGAGGAGAAGAA
GAAAGAAGTTGAGAGATTGTTGATTAGAAGGAGACAGAAGTTCTCAAACTCGCGACCCAC
TAGACCTTTTAGGAGAGAGTATTCAGAGAGACCTGATGGACGTGGACGCAGAGGAGGAAG
TAGAGTTGCAACGCCTTGATTTTTTTGTTATTGTTAATTTGCTCGGTTTTTTTTTTATTA
TCACCTAAGAAGACCAGTTCTTTGCTTTTGTGTGCATTCTTCAAAAAAATACAATCTCGT
TGATCTGT

QA 1 788 1 788
DS 



AS 2 6

CO CL846Contig1 713 2 8 U
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GTGGCAAGCACTGGTGATGGCAAGCCGAAGCTTTTAGACGAGAAGCAAGCAACTGTATAC
AAGAAGGATGCGGATGTTAAATATCAGTTGAAGATGAAGGCCTCCAGATTCATATTCAGC
GAGATCAAAGAAAACTTTCCCCACATGCCATTCACTGCAAGGTCACTGGAGGAGAAAAGG
GCACGTCTTGGACTTGTGGAGTGTGTGAACCATGGCCATTTGCTACCGTATCCTGTACTT
TACGAGAAGCCTGGGGATTTTGTTGCTCAAATCAAGTTCACAGTTTTGCTGATGCCAAAT
GGTTCGGATAGGATCACTTCACATACACTTCAGGAGCTTCAACCTACGAAGACCATTGAT
GACCACCCGGAGATCAAAGGGTGGTTAGCCTTGGCTACCAAGAAGAAGAAGGGTGGTGGA
AAGAAGAAGAAAACCAAGAAGGCTGGAGAGAAAGGAGGGGAGACCTCAACGGAGGCTGAG
CCAATGGAAACAACTCAAGAATGAGGTACTTCTGTCGCTTTTGTTTTCTTTTTAAGAATT
TTTTGGAACTTTGAGGTACTTCTTTATTTGTATGTTTGGGGTTTCAGAGAGTCTCTGCTT
AAAAGTAAAAGAAAAGAACAAAAAGTTACTTATCAATTTGACTTCTTCTTTGC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1C321JQ C 1
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DS 

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G
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AGATCAAAGAAAACTTTCCCCACATGCCATTCACTGCAAGGTCACTGGAGGAGAAAAGGG
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ACGAGAAGCCTGGGGATTTTGTTGCTCAAATCAAGTTCACAGTTTTGCTGATGCCAAATG
GTTCGGATAGGATCACTTCACATACACTTCAGGAGCTTCAACCTACGAAGACCATTGATG
ACCACCCGGAGATCAAAGGGTGGTTAGCCTTGGCTACCAAGAAGAAGAAGGGTGGTGGAA
AGAAGAAGAAAACCAAGAAGGCTGGAGAGAAAGGAGGGGAGACCTCAACGGAGGCTGAGC
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DS 



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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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DS 

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CTCGTAAAGTACAGGATACGGTAGCAAATGGCCATGGTTCACACACTCCACAAGTCCAAG
ACGTGCCCTTTTCTCCTCCAGTGACCTTGCAGTGAATGGCATGTGGGGAAAGTTTTCTTT
AATCTCGCTGAATATGAATCTGGAGGCTTTCATCTTCAACTGATATTTAACATCCGCATC
CTTCTTGTAAACAGTTGTTTGCTTCTCGTCTAAAAGCTTCGGCTTGCCATCACCAGTGCT
GGCCACAATATCTACGGAATAGACTTCATTCTCTTCAAACTCAGCATCATCGACCCTTGT
CTCTGGAGTGGATACACTTAGGAAACACTTGCTTCCATCTATCACATTCTGTTTCATCTG
GTGGGAAATAACCCCTTCCACAATTTTGCAGTCATAAGCTTCAGCCACCTTCTGAATAGC
TTCAGTGACAGC

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DS 

RD RS1D620TF 739 0 0
GACTTCATTCTCTTCAAACTCAGCATCATCAACCCTTGTCTCTGGAGTGGATACACTTAG
GAAACACTTGCTTCCATCTATCACATTCTGTTTCATCTGGTGGGAAATAACCCCTTCCAC
AATTT*GCGGTCATAAGCTTCAGCCACCTTCTGAATAGCTTCAGTGACAGCATGGTTCTT
CTTCCCAGGACGAACGAGCCTCAAAGCAACTTCAGCAGCAGTATTGGCAGCAGCAATAAC
ATCAGCTTTGCGTCCAGTAACCGGCCCTTCTTGAAGAACATGTGTGTGTGCAACAAGAGC
AATGAACCCATCAATATGGCATCCCATATCGATTTTGCGCATATCGCCCTCTTCCAACAC
GGTCTCATCACTTGCAAGCGGTGAGAAATGACCAACAGTGTTGTTCACAGAAACGCACGT
GGGGAAAGCCACACCTCGGTCAATCTTCTTCTTGGCGTTCTTGTACATGCTCCCTGTTTG
CTCTTTGACAAAGGTGTCTCCTTTCTCGCAGATATCGACAATCTTAGCTTTTGGCTTGCA
TTCAGACAAAACAAACTGCAACGCCTTGTTAACGATATCAGCGGCGCTCTTGTACTTGGT
GACGACTTCAGAAGAGGTGAGATCCAGCTCCTTCTCGTCTCTCTCATCGTCAGAACTCAC
CTCTCCAAGGTCGTTAACTCGCTAGGGGTTTAAGGAAATGGTTAAAAGGGGATGGGAGGG
GAGCTATTGAGGGAA
GAAT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RS1CC33TF 713 0 0
CCC
TGTCTCTGGAGTGGATACACTTAGGAAACACTTGCTTCCATCTATCACATTCTGTTTCAT
CTGGTGGGAAATAACCCCTTCCACAATTTTGCAGTCATAAGCTTCAGCCACCTTCTGAAT
AGCTTCAGTGACAGCATGGTTCTTCTTCCCAGGACGAACGAGCCTCAAAGCAACTTCAGC
AGCAGTATTGGCAGCAGCAATAACATCAGCTTTGCGTCCAGTAACCGGCCCTTCTTGAAG
AACATGTGTGTGTGCAACAAGAGCAATGAACCCATCAATATGGCAACCCATATCAATTTT
GAGCATATCACCCTCTTCCAACACAGTCTCGTCACTTGCAAGCGGCGAGAAATGACCGAC
GGTGTTGTTCACAGACACGCACGTGGGGAAAGCCACACCTCGGTCAATCTTCTTCTTGGC
GTTCTTGTACATGCTCCCTGTTTGCTCTTTGATAAAGGTGTCTCCTTTCTCGCAGATATC
GACAATCTTAGCTTTTGGCTTGCATTCAGACAAAACAAACTGCAACGCCTTGTTAACGAT
CTCAGCGGCGCTCTTGTACTTGGTGACGACTTCGGAACAGGTGAGATCCAGCTCCTTCTC
GTCTCTCTCATCGTCAGAACCCATCTCTCGAAGGTCGTTAACTCGCTAGGGGTTTAAGGA
AATGGTTAGAGGGGTGGGGAGGGGGAGCTATTGAGGGAAAGAATGGGTCC

QA 4 713 4 713
DS 



AS 1 7

CO CL847Contig1 1305 7 29 U
TCCTCAGAAAATGGAAGTTCGGGTTAAAATCCTTTACTCCTCCATTTGTCACACCGATCT
CGGAGCTTGGACCGGAGTGAACGAAGCCGAACGAGCATTTCCTAGGATTCTTGGCCATGA
AGCTGTTGGGATAGTTGAAAGTGTAGGAGAAGGAGTAAAAGATGTGAAAGAAGGAGACTA
TGTGATTCCCACTTTCAATGGAGAATGTGGTGAATGTAGAGTGTGTACGAATGGAGTAAG
TAATCTCTGTGAGAGATATAAAGTTGATCCAATGAAAAGACTTATGGTTAATGATGGAGG
GACGAGATTCTCAACCACCACAAACAAGGAAGGTGGTTCGAGCCAGAAGCAACACGTTTA
TCACCTCCTTAACACATCCACGTTCACTGAATACACCGTCTTGGACTCTGCTTGCGTCGT
CAAGATCGATCCTAATGCTCCTCTCAAGCAAATGAGCCTCTTGAGCTGTGGTGTCTCCAC
TGGTGTGGGAGCAGCTTGGAACACTGCCAATGTGAAGGAAGGAACAACCACTGCTGTCTT
TGGATTGGGTTCTGTTGGACTCGCGGTTGCTGAAGGTGCAAGAGCAAGAGGTGCTTCTAG
GATCATTGGTATTGACGCTAATGCTTCCAAATTTGAGAAAGGTAAACTGATGGGTGTAAC
AGACTTCGTAAACCCTAAAGACTTAACAAAGCCAGTACATGAGAGGATTCGAGAGCTAAT
GAGTGGAGGCGTGGATTATAGCTTCGAATGTACAGGAAACGTCGATGTTCTTCGCGAAGC
CTTTTTATCCACTCAAGCAGGTTGGGGATCGACGGTGCTTGTAGGAATATATCCGACACC
AAAAACATTGCCCCTTCATCCAATGGAGCTTTTTGACGGCCGCACAATCACCGGTTCTAT
ATTCGGTGGTTTCAAGCCCAAATCTCAGCTTCCAAATTTTGCTCAACAATGCATGAAAGG
GGTTGTGAAATTAGAACCTTTTATTACCAATGAGCTTCCATTTGAGAAGATAAACGATGC
GTTTCAGCTGCTTCGCGATGGAAAATCTCTTCGTTGTCTTCTCCAAATCTCTAAATTTCT
CAAGAAATGATTCTACGTACCTTCCCAAAGGTTACTATTATATAATCAACAAGCACTTCT
CTTTTTATCATAAATTTATGTTTATCATCAATAGTTCGATGAAAAATTATTATTCGTCCT
CAGATATTATTTAATTTGATTAAACTCAAAAATGATCTCGTTCATTGTGAGAACCGAGAA
ACTTTCATACTAATCAAAATTTCCAATGGAACCGTAAATTTTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AI69TF U 1
AF RS1EJ96TF U 39
AF RS1AP32JQ C 875
AF RS1AI69JQ C 401
AF RS1B609TF U 582
AF RS1D567JQ C 489
AF RS1AP32TFB U 875
BS 1 202 RS1AI69TF
BS 203 203 RS1EJ96TF
BS 204 364 RS1AI69TF
BS 365 365 RS1EJ96TF
BS 366 403 RS1AI69TF
BS 404 404 RS1EJ96TF
BS 405 574 RS1AI69TF
BS 575 575 RS1EJ96TF
BS 576 630 RS1AI69TF
BS 631 631 RS1EJ96TF
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BS 642 642 RS1EJ96TF
BS 643 671 RS1AI69TF
BS 672 672 RS1EJ96TF
BS 673 678 RS1AI69TF
BS 679 679 RS1EJ96TF
BS 680 689 RS1AI69TF
BS 690 690 RS1EJ96TF
BS 691 708 RS1AI69TF
BS 709 709 RS1EJ96TF
BS 710 718 RS1AI69TF
BS 719 724 RS1EJ96TF
BS 725 874 RS1B609TF
BS 875 1197 RS1AP32TFB
BS 1198 1198 RS1D567JQ
BS 1199 1283 RS1AP32TFB
BS 1284 1284 RS1D567JQ
BS 1285 1294 RS1AP32TFB
BS 1295 1305 RS1D567JQ

RD RS1AI69TF 718 0 0
TCCTCAGAAAATGGAAGTTCGGGTTAAAATCCTTTACTCCTCCATTTGTCACACCGATCT
CGGAGCTTGGACCGGAGTGAACGAAGCCGAACGAGCATTTCCTAGGATTCTTGGCCATGA
AGCTGTTGGGATAGTTGAAAGTGTAGGAGAAGGAGTAAAAGATGTGAAAGAAGGAGACTA
TGTGATTCCCACTTTCAATGGATAATGTGGTGAATGTAGAGTGTGTACGAATGGAGTAAG
TAATCTCTGTGAGAGATATAAAGTTGATCCAATGAAAAGACTTATGGTTAATGATGGAGG
GACGAGATTCTCAACCACCACAAACAAGGAAGGTGGTTCGAGCCAGAAGCAACACGTTTA
TCACTTCCTTAACACATCCACGTTCACTGAATACACCGTCTTG*ACTCTGCTTGCGTCGT
CAAGATCGATCCTAATGCTCCTCTCAAGCAAATGAGCCTCTTGAGCTGTGGTGTCTCCAC
TGGTGTGGGAGCAGCTTGGAACACTGCCAATGTGAAGGAAGGAACAACCACTGCTGTCTT
TGGATTGGGTTCTGTTGGACTCGCGGTTGCTGAAAGTGCAAGAGCAAGAGGTGCTTCTAG
GATCATTGGTATTGACGCTAATGCTTCCAA*TTTGAGAAAG*TAAACTGATGGGTGTAAC
AGACTTCGTAA*CCCTAA*GACTTAACAA*GCCAGTACATGAGAGGAT*CGAGAGCTA

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1EJ96TF 686 0 0
G
CTCCATTTGTCACACCGATCTCGGAGCTTGGACCGGAGTGAACGAAGCCGAACGAGCATT
TCCTAGGATTCTTGGCCATGAAGCTGTTGGGATAGTTGAAAGTGTAGGAGAAGGAGTAAA
AGATGTGAAAGAAGGAGACTATGTGATTCCCACTTTCAATGGAGAATGTGGTGAATGTGG
AGTGTGTACGAATGGAGTAAGTAATCTCTGTGAGAGATATAAAGTTGATCCAATGAAAAG
ACTTATGGTTAATGATGGAGGGACGAGATTCTCAACCACCACAAACAAGGAAGGTGGTTC
GAGCCAGAAGCAACACGTTTATCACCTCCTTAACACATCCACGTTCACTGAATACACCGT
CTTGGACTCTGCTTGCGTCGTCAAGATCGATCCTAATGCTCCTCTCAAGCAAATGAGCCT
CTTGAGCTGTGGTGTCTCCACTGGTGTGGGAGCAGCTTGGAACACTGCCAATGTGTAGGA
AGGAACAACCACTGCTGTCCTTGGATTGGGTTCTGTTGGACTCGCGGTTGCTGAAGGTGC
AAGAGCAAGAGGTGCTTCTAGGATCATTGGTATTGACGCTAATGCTTCCAAATTTGAGAA
AGGTAAACTGATGGGTGTAACAGACTTCGTAAACCCTAAAGACTTAACAAAGCCAGTACA
TGAGAGTATTCGAGAGCTAATGAGT

QA 2 686 2 686
DS 

RD RS1AP32JQ 252 0 0
GACGGCCGCACAATCACCGGTTCTATATTCGGTGGTTTCAAGCCCAAATTTCAGCTTCCA
AATTTTGCTCAACAATGCATGAAAGGGGTTGTGAAATTAGAACCTTTTATTACCAATGAG
CTTCCATTTGAGAAGATAAACGATGCGTTTCAGCTGCTTCGCGATGGAAAATCTCTTCGT
TGTCTTCTCCAAATCTCTAAATTTCTCAAGAAATGATTCTACGTACCTTCCCAAAGGTTA
CTATTATATAAT

QA 1 252 1 252
DS 

RD RS1AI69JQ 769 0 0
CTT
GACTCTGCTTGCGTCGTCAAGATCGATCCTAATGCTCCTCTCAAGCAAATGAGCCTCTTG
AGCTGTGGTGTCTCCACTGGTGTGGGAGCAGCTTGGAACACTGCCAATGTGAAGGAAGGA
ACAACCACTGCTGTCTTTGGATTGGGTTCTGTTGGACTCGCGGTTGCTGAAGGTGCAAGA
GCAAGAGGTGCTTCTAGGATCATTGGTATTGACGCTAATGCTTCCAAATTTGAGAAAGGT
AAACTGATGGGTGTAACAGACTTCGTAAACCCTAAAGACTTAACAAAGCCAGTACATGAG
AGGATTCGAGAGCTAATGAGTGGAGGCGTGGATTATAGCTTCGAATGTACAGGAAACGTC
GATGTTCTTCGCGAAGCCTTTTTATCCACTCAAGCAGGTTGGGGATCGACGGTGCTTGTA
GGAATATATCCGACACCAAAAACATTGCCCCTTCATCCAATGGAGCTTTTTGACGGCCGC
ACAATCACCGGTTCTATATTCGGTGGTTTCAAGCCCAAATCTCAGCTTCCAAATTTTGCT
CAACAATGCATGAAAGGGGTTGTGAAATTAGAACCTTTTATTACCAATGAGCTTCCATTT
GAGAAGATAAACGATGCGTTTCAGCTGCTTCGCGATGGAAAATCTCTTCGTTGTCTTCTC
CAAATCTCTAAATTTCTCAAGAAATGATTCTACGTACCTTCCCAAAGGTTACTATTATAT
AATCAACAAGCACTTCTCTTTTTATCATAAATTTATGTTTATCATC

QA 4 769 4 769
DS 

RD RS1B609TF 600 0 0
GAGCAAGAGGTGCTTCTAGGGTCATTGGTATTGACGCTAATGCTTCCAAATTTGAGAAAG
GTAAACTGATGGGTGTAACAGACTTCGTAAACCCTAAAGACTTAACAAAGCCAGTACATG
AGAGGATTCGAGAGCTAATGAGTGGAGGCGTGGATTATAGCTTCGAATGTACAGGAAACG
TCGATGTTCTTCGCGAAGCCTTTTTATCCACTCAAGCAGGTTGGGGATCGACGGTGCTTG
TAGGAATATATCCGACACCAAAAACATTGCCCCTTCATCCAATGGAGCTTTTTGACGGCC
GCACAATCACCGGTTCTATATTCGGTGGTTTCAAGCCCAAATCTCAGCTTCCAAATTTTG
CTCAACAATGCATGAAAGGGGTTGTGAAATTAGAACCTTTTATTACCAATGAGCTTCCAT
TTGAGAAGATAAACGATGCGTTTCAGCTGCTTCGCGATGGAAAATCTCTTCGTTGTCTTC
TCCAAATCTCTAAATTTCTCAAGAAATGATTCTACGTACCTTCCCAAAGGTTACTATTAT
ATAATCAACAAGCACTTCTCTTTTTATCATAAATTTATGTTTATCATCAATAGTTCGATG

QA 1 600 1 600
DS 

RD RS1D567JQ 817 0 0
GGAGCAGC
TGGAACACTGCCAATGTGAAGGAAGGA*CAACCACTGCTGTCTTTG*ATTGGGTTCTGTT
GGACTCGCGGTTGCTGAAGGTGCAAGAGCAAGAGGTGCTTCTAGGATCATTGGTATTGAC
GCTAATGCTTCCAAATTTGAGAAAGGTAAACTGATGGGTGTAACAGACTTCGTAAACCCT
AAATACTTAACAAAGCCAGTACATGAGAGGATTCGAGAGCTAATGAGTGGAGGCGTGGAT
TATAGCTTCGAATGTACAGGAAACGTCGATGTTCTTCGCGAAGCCTTTTTATCCACTCAA
GCAGGTTGGGGATCGACGGTGCTTGTAGGAATATATCCGACACCAAAAACATTGCCCCTT
CATCCAATGGAGCTTTTTGACGGCCGCACAATCACCGGTTCTATATTCGGTGGTTTCAAG
CCCAAATCTCAGCTTCCAAATTTTGCTCAACAATGCATGAAAGGGGTTGTGAAATTAGAA
CCTTTTATTACCAATGAGCTTCCATTTGAGAGGATAAACGATGCGTTTCAGCTGCTTCGC
GATGGAAAATCTCTTCGTTGTCTTCTCCAAATCTCTAAATTTCTCAAGAAATGATTCTAC
GTACCTTCCCAAAGGTTACTATTATATAATCAACAAGCACTTCTCTTTTTATCATAAATT
TATGTTTATCATCAATAGTTCGATGAAAAATTATTATTCGTCCTCAGATATTATTTAATT
TGATTAAACTCAAAAATGATCTCGTTCATTGTGAGAACCGAGAAACTTTCATACTAATCA
AAATTTCCAATGGAACCGTAAATTTTCAT

QA 9 817 9 817
DS 

RD RS1AP32TFB 420 0 0
GACGGCCGCACAATCACCGGTTCTATATTCGGTGGTTTCAAGCCCAAATCTCAGCTTCCA
AATTTTGCTCAACAATGCATGAAAGGGGTTGTGAAATTAGAACCTTTTATTACCAATGAG
CTTCCATTTGAGAAGATAAACGATGCGTTTCAGCTGCTTCGCGATGGAAAATCTCTTCGT
TGTCTTCTCCAAATCTCTAAATTTCTCAAGAAATGATTCTACGTACCTTCCCAAAGGTTA
CTATTATATAATCAACAAGCACTTCTCTTTTTATCATAAATTTATGTTTATCATCAATAG
TTCGATGAAAAATTATTATTCGTGCTCAGATATTATTTAATTTGATTAAACTCAAAAATG
ATCTCGTTCATTGTGAGAACCGAGAAACTTTCATACTAATCAAAATTTCTAATGGAACCG

QA 1 420 1 420
DS 



AS 1 7

CO CL848Contig1 1201 7 18 U
TTTTTATGAAATCTTTCATAAATATTTAATTCTTTTAATTTTTTTTAATGTTCAAAAGTA
AAAAAAATGGATCCTTTTTTGAAAAGTTTCGCCTCAGCTTCAAAATCCTAGACCGGCGGC
CGCTGCCTCTTGCGGTCGCCGGATCTCGTCCTTGAAAACGTGTCTCTCCCCTCTCTTCTT
TCGGATATCTCCTTCTCCCCTACTAGATTTGTCCCTTGCCCTTGTTTGTTGCAGAACACA
TTGAAGAACTATTTGTTATCTCAGATCCGGGGGTCCTGTTGTAGATCTGGGCGCGTGGAG
TGGTGTTTACCAGGGGTGGAATGGGTTACTCTCTTCTCCGGTTTCCGTCTCCGTTTCCAG
ATGAAGGTCCAAGACTCAGTTTTTCTTGTGTGTTGCAGCAACTGTGCTTACAGTATGTTT
CAAGCGGTTTGGTTATCTTTTGTTAGGGGTTGAATCCGGTTGATTCTCATGGATGTTAGA
GCTAGTCTTAATGGTTGATTGATTTAGCAACGGTGAGCAGTGAGTGAGTGATGTGGTGGT
GTGTGGTGAGCAGTTGTTGGTTAGGGGTTTGAGAAGAAGATGGGTTATGATTACCTCTTC
ATCTCTCAATTCGAAGGTCTCCTTTTCTCGCTTCTTAAATAAGATGTTCTCATGTTATGC
CTTTGGTCTCCGGTTCCTCTGTGGCTTCCTTTGGTGAAGCAATATAATGAGGGTGAGATG
GGAAGGCGTCCAGATGAAGATGCGATTGATTTTATGGGTCTTTCTCAGGTGTTGTTTCTT
TTCAGTGCTAGAATCTGGTTTTACCTTGGTCTAGGTGTGAGGTTTGGGTATCATTGTAAA
CAGGTGGTTCAGATGAAGTCCCAGTGGTTCTTGTCATCTTAAACAGGTGGTTCAGATGAG
ATTTGTGCTCTTCATGAAGAAGTCTGCTGCGTTTTTACTCTCTTGCTCAGTTATTAGAAG
AATCTCGGCTAGTCATTGACTATTAAGTCTCTGTTTTTT*ATTCTATTGATGTTGTGTGT
TCTGGGTTTTTGAAGGAGATTATGGGTTTAGTTTATGTTTAAGGTGATAATATAAGACCC
GTGTGTTTGGGTGTAAGCTTCCCTGTTATGGGTTTAGTTGCTGGAGATTTCTATGTTTTC
TGCTAGCTTTAGTATTCCAACTCTGTATGTTCTTTGATGGTATCAATGAAATTCTTGTGA
C


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 15 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1GA53TF U 90
AF RS1DU49TF U 1
AF RS1GW30TF U 1
AF RS1H787TF U 85
AF RS1GW30JQ C 769
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AF RS1DU49JQ C 390
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G
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CGGTGAGCAGTGAGTGAGTGATGTGGTGGT

QA 2 451 2 451
DS 

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CGCTGCCTCTTGCGGTCGCCGGATCTCGTCCTTGAAAACGTGTCTCTCCCCTCTCTTCTT
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CTTTGGTCTCCG*TTCCTCTGTGGCTTCCTTTGGT

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DS 

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AAAAAAATGGATCCTTTTTTGAAAAGTTTCGCCTCAGCTTCAAAATCCTAGACCGGCGGC
CGCTGCCTCTTGCGGTCGCCGGATCTCGTCCTTGAAAACGTGTCTCTCCCCTCTCTTCTT
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TGGTGTTTACCAGGGGTGGAATGGGTTACTCTCTTCTCCGGTTTCCGTCTCCGTTTCCAG
ATGAAGGTCCAAGACTCAGTTTTTCTTGTGTGTTGCAGCAACTGTGCTTACAGTATGTTT
CAAGCGGTTTGGTTATCTTTTGTTAGGGGTTGAATCCGGTTGATTCTCATGGATGTTAGA
GCTAGTCTTAATGGTTGATTGATTTAGCAACGGTGAGCAGTGAGTGAGTGACGTGGTGGT
GTGTGGTGAGCAGTTGTTGGTTAGGGGTTTGAGAAGAAGATGGGTTATGATTACCTCTTC
ATCTCTCAATTCGAAGGTCTCCTTTTCTCGCTTCTTAAATAAGATGTTCTCATGTTATGC
CTTTGGTCTCCG*TTCCTCTGTGGCTTCCTTTGGTGA
GCATATAATGAGG

QA 1 697 1 697
DS 

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GGTTTC
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CTTGAAAACGTGTCTCTCCCCTCTCTTCTTTCGGATATCTCCTTCTCCCCTACTAGATTT
GTCCCTTGCCCTTGTTTGTTGCAGAACACATTGAAGAACTATTTGTCATCTCAGATCCGG
GGGTCCTGTTGTAGATCTGGGCGCGTGGAGTGGTGTTTACCAGGGGTGGAATGGGTTACT
CTCTTCTCCGGTTTCCGTCTCCGTTTCCAGATGAAGGTCCAAGACTCAGTTTTTCTTGTG
TATTGCAGCAACTGTGCTTACAGTATGTTTCAAGCGGTTTGGTTATCTTTTGTTAGGGGT
CGAATCCGGTTGATTCTCATGGATGTTAGAGCTAGTCTTAATGGTTGATTGATTTAGCAA
CGGTGAGCAGTGAGTGAGTGATGTGGTGGTGTGTGGTGAGCAGTTGTTGGTTAGGGGTTT
GAGAAGAAGATGGGTTATGATTACCTCTTCATCTCTCAATTCGAAGGTCTCCTTTTCTCG
CTTCTTAAATAAGATGTTCTCATGTTATGCCTTCGGTCTCCGGTTCCTCTGTGGCTTCCT
TTGGTGAAGCAATATAATGAGGGTGAGATGGGAAGGCGTCCAGATGAAGATGCGATTGAT
TTTATGGGTCTTTCTCAG*TGTTGTTTCTTTTCAGTGCTAGAATCTGGTTTTACCTTGGT
CTAG*TGTGAGGTT*GGGTATCATTGTAA

QA 7 755 7 755
DS 

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TATCATTGTAAACAGGTGGTTCAGATGAAGTCCCAGTGGTTCTTGTCATCTTAAACAGGT
GGTTCAGATGAGATTTGTGCTCTTCATGAAGAAGTCTGCTGCGTTTTTACTCTCTTGCTC
AGTTATTAGAAGAATCTCGGCTAGTCATTGACTATTAAGTCTCTGTTTTTTTATTCTATT
GATGTTGTGTGTTCTGGGTTTTTGAAGGAGATTATGGGTTTAGTTTATGTTTAAGGTGAT
AATATAAGACCCGTGTGTTTGGGTGTAAGCTTCCCTGTTATGGGTTTAGTTGCTGGAGAT
TTCTATGTTTTCTGCTAGCTTTAGTATTCCAACTCTGTATGTTCTTTGATGGTATCAATG
AAATTCTTGTGA
T

QA 1 432 1 432
DS 

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CTTT
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TGCTAGAATCTGGTTTTACCTTGGTCTAGGTGTGAGGTTTGGGTATCATTGTAAACAGGT
GGTTCAGATGAAGTCCCAGTGGTTCTTGTCATCTTAAACAGGTGGTTCAGATGAGATTTG
TGCTCTTCATGAAGAAGTCTGCTGCGTTTTTACTCTCTTGCTCAGTTATTAGAAGAATCT
CGGCTAGTCATTGACTATTAAGTCTCTGTTTTTT*ATTCTATTGATGTTGTGTGTTCTGG
GTTTTTGAAGGAGATTATGGGTTTAGTTTATGTTTAAGGTGATAATATAAGACCCGTGTG
TTTGGGTGTAAGCTTCCCTGTTATGGGTTTAGTTGCTGGAGATTTCTATGTTTTCTGCTA
GCTTTAGTATTCCAACTCTGTATG

QA 5 508 5 508
DS 

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TTGAATCCGGTTGATTCTCATGGATGTTAGAGCTAGTCTTAATGGTTGATTGATTTAGCA
ACGGTGAGCAGTGAGTGAGTGATGTGGTGGTGTGTGGTGAGCAGTTGTTGGTTAGGGGTT
TGAGAAGAAGATGGGTTATGATTACCTCTTCATCTCTCAATTCGAAGGTCTCCTTTTCTC
GCTTCTTAAATAAGATGTTCTCATGTTATGCCTTTGGTCTCCGGTTCCTCTGTGGCTTCC
TTTGGTGAAGCAATATAATGAGGGTGAGATGGGAAGGCGTCCAGATGAAGATGCGATTGA
TTTTATGGGTCTTTCTCAGGTGTTGTTTCTTTTCAGTGCTAGAATCTGGTTTTACCTTGG
TCTAGGTGTGAGGTTTGGGTATCATTGTAAACAGGTGGTTCAGATGAAGTCCCAGTGGTT
CTTGTCATCTTAAACAGGTGGTTCAGATGAGATTTGTGCTCTTCATGAAGAAGTCTGCTG
CGTTTTTACTCTCTTGCTCAGTTATTAGAAGAATCTCGGCTAGTCATTGACTATTAAGTC
TCTGTTTTTT*ATTCTATTGATGTTGTGTGTTCTGGGTTTTTGAAGGAGATTATGGGTTT
AGTTTATGTTTAAGGTGATAATATAAGACCCGTGTGTTTGGGTGTAAGCTTCCCTGTTAT
GGGTTTAGTTGCTGGAGATTTCTATGTTTTCTGCTAGCTTTAGTATTCCAACTCTGTATG
TTCTTTGATGGTATCAATGAAATTCTTGTGAC

QA 1 812 1 812
DS 



AS 2 7

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GAGGAAACTTTATTGGGAGAGTGATCTCATACGTTGCGAACGAGCTCATTGTTAATGGTT
TGTCTAACAGCCATGCTTTCCAGAGATTTGCTGTGAGGACTTCAAAAAGAATAGAGAACA
TCTCTAAAATGGCTGCAGAGAGCAAGGAGAAAGTCGCTCAGCATATGGAAGAACTTTCCA
AGAACTCTGACTCTTTCAAGAAACCGTGAGAATTCAAGTTCTTGGAAGTCGGGGATTACA
TGGGTCAAAGCTCAAATAGTGAGGGGGATGTTTGCTATGTCTATATAAAAAAGAATGCTT
GAATGTAATAAGCTTGTGTGTTAAACACAACCACTGATCTTTTGAGCCTTTTCTCTTATT
TTAAAAAAAAATTCACTTGACAAGGAGTGACTTTGGCTAATGAAAATATTTGTGAAGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AH86JQ C 1
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QA 1 539 1 539
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TCTCTAAAATGGCTGCAGAGAGCAAGGAGAAAGTCGCTCAGCATATGGAAGAACTTTCCA
AGAACTCTGACTCTTTCAAGAAACCGTGAGAATTCAAGTTCTTGGAAGTCGGGGATTACA
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GAATGTAATAAGCTTGTGTGTTAAACACAACCACTGATCTTTTGAGCCTTTTCTCTTATT
TTAAAAAAAAATTCACTTGACAAGGAGTGACTTTGGCTAATGAAAATATTTGTGAAGCC

QA 1 539 1 539
DS 



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BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1D188TF U 1
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QA 1 530 1 530
DS 



AS 1 7

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ATATATGTAACCTGAACTATGATCATATCTCATAATTTAAAATATTTCCCCGACCG


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 5 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1D016TF U 1
AF RS1F519TF U 19
AF RS1FT54TF U 3
AF RS1G639TF U 511
AF RS1FT54JQ C 497
AF RS1F519JQ C 583
AF RS1D016JQ C 620
BS 1 50 RS1D016TF
BS 51 51 RS1FT54TF
BS 52 201 RS1D016TF
BS 202 202 RS1FT54TF
BS 203 507 RS1D016TF
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BS 509 541 RS1D016TF
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BS 543 603 RS1D016TF
BS 604 624 RS1FT54TF
BS 625 625 RS1F519TF
BS 626 681 RS1FT54TF
BS 682 746 RS1G639TF
BS 747 747 RS1FT54JQ
BS 748 1089 RS1G639TF
BS 1090 1245 RS1FT54JQ
BS 1246 1246 RS1F519JQ
BS 1247 1316 RS1FT54JQ

RD RS1D016TF 603 0 0
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CCTAGCCCTTGTTGTAATGTCCGTATGGGGTTCGGACGCATCGGCACTGGAAAGTATGAA
GTTTGACGCGCCGCTTCTAACTGAAAAAATTGCAACAAATAGATCTATAATCGTCGATAT
TGAAGGGAAGGGAGACTACACCTCGGTTCAAAAAGCCATTGATGCTGTCCCTGCTGGTAA
CTCTAATTGGATCATCGTCCATGTCCGTAAAGGAATCTACAAGGAGAGAGTGCACATTCC
AGAGAACAAGCCTTTCATATTCATGAGAGGTAACGGAAGAGGAAAGACAGTCATCGAATC
ATCGCAAAGTTCGATAGACAATGTTGCTTCAGCCACTTTCAAAGTCGAAGCTAATCACTT
CGTTGCTTTTGGTATCAGCATCAGGAATGATGCACCGGTCGGACAGGCGTTCACGTCTGA
CAATCAATCGGTGGCAGCGTTTGTGGCAGCTGATAAAGTTGCGTTTTACCATTGTGCGTT
CTACAGCTTGCACAACACTTTGTTTGATAACAAAGGTAGACATTACTACCACGAGACTTA
CAT

QA 1 603 1 603
DS 

RD RS1F519TF 627 0 0
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GTCCGTATGGGGTTCGGACGCATCGGCACTGGAAAGTATGAAGTTTGACGCGCCGCTTCT
AACTGAAAAAATTGCAACAAATAGATCTATAATCGTCGATATTGAAGGGAAGGGAGACTA
CACTTCGGTTCAAAAAGCCATTGATGCTGTCCCTGCTGGTAACTCTAATTGGATCATCGT
CCATGTCCGTAAAGGAATCTACAAGGAGAGAGTGCACATTCCAGAGAACAAGCCTTTCAT
ATTCATGAGAGGTAACGGAAGAGGAAAGACAGTCATCGAATCATCGCAAAGTTCGATAGA
CAATGTTGCTTCAGCCACTTTCAAAGTCGAAGCTAATCACTTCGTTGCTTTTGGTATCAG
CATCAGGAATGATGCACCGGTCGGACAGGCGTTCACGTCTGACAATCAATCGGTGGCAGC
GTTTGTGGCAGCTGATAAAGTTGCGTTTTACCATTGTGCGTTCTACAGCTTGCACAACAC
TTTGTTTGATAACAAAGGTAGACATTACTACCACGAGACTTACATCCAAG*CTCCATCGA
CTTCATATTCGGTCGTGCAACTTCCAT

QA 1 627 1 627
DS 

RD RS1FT54TF 679 0 0
GGA
AAAACTAAAAACCCCAAAAGATAAAGATGGATCATCGAGCAGGAATGGTCCTTTTCCTAG
CCCTTGTTGTAATGTCCGTATGGGGTTCGGACGCATCGGCACTGGAAAGTATGAAGTTTG
ACGCGCCGCTTCTAACTGAAAAAATTGCAACAAATAGATCTATAATCGTCGATATTGAAG
GGAAGGGAGACTACACTTCGGTTCAAAAAGCCATTGATGCTGTCCCTGTTGGTAACTCTA
ATTGGATTATCGTCCATGTCCGTAAAGGAATCTACAAGGAGAGAGTGCACATTCCAGAGA
ACAAGCCTTTCATATTCATGAGGGGTAACGGAAGAGGAAAGACAGTCATCGAATCATCGC
AAAGTTCGATAGACAATGTTGCTTCAGCCACTTTCAAAGTCGAAGCTAACCACTTCGTTG
CTTTTGGTATCAGCATCAGGAATGATGCACCGGTCGGACAGGCGTTCACGTCTGACAACC
AATCGGTGGCAGCGTTTGTGGCGGCTGATAAAGTTGCGTTTTACCATTGTGCGTTCAACA
GCTTGCACAACACTTTGTTTGATAACAAAGGTAGACATTACTACCACGAGAGTTACATCC
AAGGCTCCATCGACTTCATCTTCGGTCGCGCAACTTCCATTTTCAACAATTGTGAGATAT
TTGTGATATCGGACAA

QA 4 679 4 679
DS 

RD RS1G639TF 579 0 0
G
GATAAAGTTGCGTTTTACCATTGTGCGTTCTACAGCTTGCACAACACTTTGTTTGATAAC
AAAGGTAGACATTACTACCACGAGAGTTACATCCAAGGCTCCATCGACTTCATCTTCGGT
CGCGCAACTTCCATTTTCAACAATTGTGAGATATTTGTGATATCGGACAAGAGGGTGAAA
CCATATGGGTCAATCACAGCACACCACAGGGAACACCCAGAGGAAAACACAGGTTGTGTG
TTCATAAGAGGCAAAGTGTACGGAATCGATGAGGTTTACCTAGGCAGAGCCAAAGGACCT
TATTCTCGGGTCATCTTTGCCAAGACTTACTTTTCCAAGACCGTTGTCCCTAGCGGTTGG
ACCAACTGGAGCTACGATGGCTCGACCAAGGATTTATACCATGCGGAGTACAAGTGTCAT
GGACCAGGTGCTGAGAGACAAGGTAGATCAGATTGGGCGAAAGAACTTACCAAACAAGAA
GTTGAGTCTTTCTTGTCCATTGATTTCATTGATGGAACTTCTTGGCTCCCTGTTTGGCTT
CAGCAAAAGTCTTAGAGCTCCTTAATCTGTGCGTGTCT

QA 2 579 2 579
DS 

RD RS1FT54JQ 820 0 0
GCGTTTGTGGCGGCTGATAAAGTTGCGTTT*ACCATTGTGCGTTCAACAGCTTGCACAAC
ACTTTGTTTGATAACAAAGGTAGACATTACTACCACGAGAGTTACATCCAAGGCTCCATC
GACTTCATCTTCGGTCGCGCAACTTCCATTTTCAACAATTGTGAGATATTTGTGATATCG
GACAAGAGGGTGAAACCATATGGGTCAATCACAGCACACCACAGGGAACACCCAGAGGAA
AACACAGGTTATGTGTTCATAAGAGGCAAAGTGTACGGAATCGATGAGGTTTACCTAGGC
AGAGCCAAAGGACCTTATTCTCGGGTCATCTTTGCCAAGACTTACTTTTCCAAGACCGTT
GTCCCTAGCGGTTGGACCAACTGGAGCTACGATGGCTCGACCAAGGATTTATACCATGCG
GAGTACAAGTGTCATGGACCAGGTGCTGAGAGACAAGGTAGATCAGATTGGGCGAAAGAA
CTTACCAAACAAGAAGTTGAGTCTTTCTTGTCCATTGATTTCATTGATGGAACTTCTTGG
CTCCCTGTTTGGCTTCAGCAAAAGTCTTAGAGCTCCTTAATCTGTGCGTGTCTCCCGTTT
GGCTTGGAAAAAGAAAACATATGAAGAAAGAAGGACCCATTCTTTTCTTCACTATACAAA
ATAGTTTTCTCTCTCTTTTTGTTCTACTCTAAAATGATTGTAGACTGATTGGAAAATTCT
TATGTCGTTTGCACACATTATATAAGATAGTTTCCATTTTTATTATATATGTAACCTGAA
CTATGATCATATCTCATAATTTAAAATATTTCCCCGACCG

QA 1 820 1 820
DS 

RD RS1F519JQ 716 0 0
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CATTTTCAACAATTGTGAGATATTTGTGATATCGGACAAGAGGGTGAAACCGTATGGGTC
AATCACAGCACACCACAGGGAACACCCAGAGGAAAACACGGGATATGTGTTCATAAGAGG
CAAAGTGTACGGAATCGATGAGGTTTACTTGGGCAGAGCCAAAGGACCTTATTCTCGGGT
CATCTTTGCCAAGACTTACTTTTCCAAGACCGTTGTCCCTAGCGGTTGGACCAACTGGAG
CTACGACGGCTCAACCAAGGATTTATACCATGCGGAGTATAAGTGTCATGGACCAGGTGC
TGAGAGACAAGGTAGATCAGATTGGGCCAAAGAACTTACCAAACAAGAAGTTGAGTCTTT
CTTGTCCATTGATTTCATTGATGGAACTTCTTGGCTCCCTGTTTGGCTTCAGCAAAAGTC
TTAGAGCTCCTTAATCTGTCCGTGTCTCCCGTTTGGCTTGGAAAAAGAAAACATATGAAG
AAAGAAGGACCCATTCTTTTCTTCACTATACAAAATAGTTTTCTCTCTCTTTTTGTTCTA
CTCTAAAATGATTGTAGACTGATTGGAAAATTCTTATGTCGTTTGCACACATTATATAAG
ATAATTTCCATTTTTATTATATATGTAACCTGAACTATGATCATATCTCATAATTT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RS1D016JQ 695 0 0
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AAGAGGGTGAAACCGTATGGGTCAATCACAGCACACCACAGGGAACACCCAGAGGAAAAC
ACGGGATATGTGTTCATAAGAGGCAAAGTGTACGGAATCGATGAGGTTTACTTGGGCAGA
GCCAAAGGACCTTATTCTCGGGTCATTTTTGCCAAGACTTACTTTTCCAAGACCGTTGTC
CCTAGCGGTTGGACCAACTGGAGTTACGACGGCTCAACCAAGGATTTATACCATGCGGAG
TATAAGTGTCATGGACCAGGTGCTGAGAGACAAGGTAGATCAGATTGGGCCAAAGAACTT
ACCAAACAAGAAGTTGAGTCTTTCTTGTCCATTGATTTCATTGATGGAACTTCTTGGCTC
CCTGTTTGGCTTCAGCAAAAGTCTTAGAGCTCCTTAATCTGTCCGTGTCTCCCGTTTGGC
TTGGAAAAAGAAAACATATGAAGAAAGAAGGACCCATTCTTTTTTTCACTATACAAAATA
GTTTTCTCTCTCTTTTTGTTCTACTCTAAAATGATTGTAGACTGATTGGAAAATTCTTAT
GTCGTTTGCACACATTATATAAGATAATTTCCATTTTTATTATATATGTAACCTGAACTA
TGATCATATCTCATAATTTAAAATATTTCCCCGAC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 7

CO CL851Contig1 505 7 2 U
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CCATGCTGATTTGAGCAGATTTGAATGGGCTGTGAACATTCAGCGTGACAGTTATGCTTC
CTACATTGGTCACTACCCCATGCTTGCTTACTTTGCTATCGCTGAGAACGAGTCCATTGG
ACGTGAACGCTAGAACTTCATGCAGAAAATGCTTCTACCTTGTGGCCTTCCTCCAGAAAG
AGAAGACGACTAAAGAGAGAGAGCTTGCAAGTGCTGTGTCGCAACTCTAATCAGAACCAA
AAATAAATAAAGAGACTATCTTTCTACTGCATTCTGTCCTAATGCATTCATGTATTGAAC
CGTATAAAACTCTCTCTCTCTCTGGCTCTCCCATTGTGTAAACCAAATTGTTTTTAATTC
AATGAAAAATTCTATGCTTTTTATG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 10 10 10 

AF RS1EL39TF U 1
AF RS1GF91JQ C 1
AF RS1GF91TF U 1
AF RS1AK25JQ C 29
AF RS1EL39JQ C 231
AF RS1AK25TF U 29
AF RS1EZ75TF U 59
BS 1 502 RS1EL39TF
BS 503 505 RS1AK25JQ

RD RS1EL39TF 502 0 0
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ACGTGAACGCTAGAACTTCATGCAGAAAATGCTTCTACCTTGTGGCCTTCCTCCAGAAAG
AGAAGACGACTAAAGAGAGAGAGCTTGCAAGTGCTGTGTCGCAACTCTAATCAGAACCAA
AAATAAATAAAGAGACTATCTTTCTACTGCATTCTGTCCTAATGCATTCATGTATTGAAC
CGTATAAAACTCTCTCTCTCTCTGGCTCTCCCATTGTGTAAACCAAATTGTTTTTAATTC
AATGAAAAATTCTATGCTTTTT

QA 1 502 1 502
DS 

RD RS1GF91JQ 502 0 0
GGAAATTGAATCAACTTCAGAAGAGCTCTTGCGAACTTAGGATCTGAAGATGCAGGCAAG
TGATAGGTTTAACATCAACTCACAGCTTGAACATCTTCAAGCCAAGTATGTTGGTACTGG
CCATGCTGATTTGAGCAGATTTGAATGGGCTGTGAACATTCAGCGTGACAGTTATGCTTC
CTACATTGGTCACTACCCCATGCTTGCTTACTTTGCTATCGCTGAGAACGAGTCCATTGG
ACGTGAACGCTAGAACTTCATGCAGAAAATGCTTTTACCTTGTGGCCTTCCTCCAGAAAG
AGAAGACGACTAAAGAGAGAGAGCTTGCAAGTGCTGTGTCGCAACTCTAATCAGAACCAA
AAATAAATAAAGAGACTATCTTTTTACTGCATTCTGTCCTAATGCATTCATGTATTGAAC
CGTATAAAACTCTCTCTCTCTCTGGCTCTCCCATTGTGTAAACCAAATTGTTTTTAATTC
AATGAAAAATTCTATGCTTTTT

QA 1 502 1 502
DS 

RD RS1GF91TF 502 0 0
GGAAATTGAATCAACTTCAGAAGAGCTCTTGCGAACTTAGGATCTGAAGATGCAGGCAAG
TGATAGGTTTAACATCAACTCACAGCTTGAACATCTTCAAGCCAAGTATGTTGGTACTGG
CCATGCTGATTTGAGCAGATTTGAATGGGCTGTGAACATTCAGCGTGACAGTTATGCTTC
CTACATTGGTCACTACCCCATGCTTGCTTACTTTGCTATCGCTGAGAACGAGTCCATTGG
ACGTGAACGCTAGAACTTCATGCAGAAAATGCTTCTACCTTGTGGCCTTCCTCCAGAAAG
AGAAGACGACTAAAGAGAGAGAGCTTGCAAGTGCTGTGTCGCAACTCTAATCAGAACCAA
AAATAAATAAAGAGACTATCTTTCTACTGCATTCTGTCCTAATGCATTCATGTATTGAAC
CGTATAAAACTCTCTCTCTCTCTGGCTCTCCCATTGTGTAAACCAAATTGTTTTTAATTC
AATGAAAAATTCTATGCTTTTT

QA 1 502 1 502
DS 

RD RS1AK25JQ 477 0 0
GG
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GCTTCTACCTTGTGGCCTTCCTCCAGAAAGAGAAGACGACTAAAGAGAGAGAGCTTGCAA
GTGCTGTGTCGCAACTCTAATCAGAACCAAAAATAAATAAAAAGACTATCTTTTTACTGC
ATTCTGTCCTAATGCATTCATGTATTGAACCGTATAAAACTCTCTCTCTCTCTGGCTCTC
CCATTGTGTAAACCAAATTGTTTTTAATTCAATGAAAAATTCTATGCTTTTTATG

QA 3 477 3 477
DS 

RD RS1EL39JQ 272 0 0
AGTCCATTGGACGTGAACGCTAGAACTTCATGCAGAAAATGCTTTTACCTTGTGGCCTTC
CTCCAGAAAGAGAAGACGACTAAAGAGAGAGAGCTTGCAAGTGCTGTGTCGCAACTTTAA
TCAGAACCAAAAATAAATAAAGAGACTATCTTTTTACTGCATTCTGTCCTAATGCATTCA
TGTATTGAACCGTATAAAACTCTCTCTCTTTCTGGCTCTCCCATTGTGTAAACCAAATTG
TTTTTAATTCAATGAAAAATTCTATGCTTTTT

QA 1 272 1 272
DS 

RD RS1AK25TF 477 0 0
GG
GCGAACTTAGGATCTGAAGATGCAGGCAAGTGATAGGTTTAACATCAACTCACAGCTTGA
ACATCTTCAAGCCAAGTATGTTGGTACTGGCCATGCTGATTTGAGCAGATTTGAATGGGC
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CTTTGCTATCGCTGAGAACGAGTCCATTGGACGTGAACGCTACAACTTCATGCAGAAAAT
GCTTCTACCTTGTGGCCTTCCTCCAGAAAGAGAAGACGACTAAAGAGAGAGAGCTTGCAA
GTGCTGTGTCGCAACTCTAATCAGAACCAAAAATAAATAAAAAGACTATCTTTCTACTGC
ATTCTGTCCTAATGCATTCATGTATTGAACCGTATAAAACTCTCTCTCTCTCTGGCTCTC
CCATTGTGTAAACCAAATTGTTTTTAATTCAATGAAAAATTCTATGCTTTTT
ATG

QA 3 474 3 474
DS 

RD RS1EZ75TF 441 0 0
AGTGATAGGTTTAACATCAACTCACAGCTTGAACATCTTCAAGCCAAGTATGTTGGTACT
GGCCATGCTGATTTGAGCAGATTTGAATGGGCTGTGAACATTCAGCGTGACAGTTATGCT
TCCTACATTGGTCACTACCCCATGCTTGCTTACTTTGCTATCGCTGAGAACGAGTCCATT
GGACGTGAACGCTACAACTTCATGCAGAAAATGCTTCTACCTTGTGGCCTTCCTCCA*AA
AGAGAAGACGACTAAAGAGAGAGAGCTTGCAAGTGCTGTGTCGCAACTCTAATCAGAACC
AAAAATAAATAAAAAGACTATCTTTCTACTGCATTCTGTCCTAATGCATTCATGTATTGA
ACCGTATAAAACTCTCTCTCTCTCTGGCTCTCCCATTGTGTAAACCAAATTGTTTTTAAT
TCAATGAAAAATTCTATGCTT

QA 1 441 1 441
DS 



AS 2 7

CO CL852Contig1 739 3 6 U
GGAAAAACACAAAAACCAAACAAAAGAAACCGTTAGAGAAAGAAAAAAACTGCGTTGTTT
CTTGAAAATGGAGATTGTTAGGTTCGCAGTCGCCGTCATTTTTGCACTTTCCTCCATCTC
GTCGTCTAACGCGGCAACTACACCAACTACACCACCAAGCGGCGGAGCAGGAGATGCTCA
CTCGATGCCATGTATACAGAAACTGATGCCGTGTCAGCCGTATCTTCACTCGTCGGCTCC
TCTGCCTCCAGCGTCGTGTTGCATGCCGTTGAAGGAGATCGTCGAGACCGACGTGACCTG
TCTTTGCTCAGTATTCAACAACGTAGATATGCTTAGATCGCTTAACTTAACTAAAGAAAA
CGCTCTTGTTCTCCCCAAAGCTTGTGGCGCTAACGCTGATGTGTCACAATGTAAAGCCAG
TACCGGTACTACTACGCCTTCGACGTCCCCGGGAACTACTAAAACTCCTCCGGCATCTCC
CGCTGAAAGCGGCTCAGCCGGAGGTTCAGCTTCTTCAACGGCCAAACCATCAGACTCGGC
TCCGGCCATCAACTTTTCCGGAATAAGTTTCGCCTCAGCTTTCGTGGCATTGGCAACAAT
CTTTTTCTGATATCCTACTAAGTCACGTCTTTATTCAGTTTAGTAAGTTTAAAATGTTGG
AAACTATTATTATCAGACAATATTTGGTAACCGATGAGTATTA*CATGTACTATGAATTT
CTGATATAGTAATACTTTT


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BS78TF U 1
AF RS1H553TF U 1
AF RS1CR95TF U 60
BS 1 197 RS1BS78TF
BS 198 199 RS1H553TF
BS 200 311 RS1BS78TF
BS 312 312 RS1H553TF
BS 313 731 RS1BS78TF
BS 732 739 RS1CR95TF

RD RS1BS78TF 737 0 0
GGAAAAACACAAAAACCAAACAAAAGAAACCGTTAGAGAAAGAAAAAAACTGCGTTGTTT
CTTGAAAATGGAGATTGTTAGGTTCGCAGTCGCCGTCATTTTTGCACTTTCCTCCATCTC
GTCGTCTAACGCGGCAACTACACCAACTACACCACCAAGCGGCGGAGCAGGAGATGCTCA
CTCGATGCCATGTATACCAAAACTGATGCCGTGTCAGCCGTATCTTCACTCGTCGGCTCC
TCTGCCTCCAGCGTCGTGTTGCATGCCGTTGAAGGAGATCGTCGAGACCGACGTGACCTG
TCTTTGCTCAGCATTCAACAACGTAGATATGCTTAGATCGCTTAACTTAACTAAAGAAAA
CGCTCTTGTTCTCCCCAAAGCTTGTGGCGCTAACGCTGATGTGTCACAATGTAAAGCCAG
TACCGGTACTACTACGCCTTCGACGTCCCCGGGAACTACTAAAACTCCTCCGGCATCTCC
CGCTGAAAGCGGCTCAGCCGGAGGTTCAGCTTCTTCAACGGCCAAACCATCAGACTCGGC
TCCGGCCATCAACTTTTCCGGAATAAGTTTCGCCTCAGCTTTCGTGGCATTGGCAACAAT
CTTTTTCTGATATCCTACTAAGTCACGTCTTTATTCAGTTTAGTAAGTTTAAAATGTTGG
AAACTATTATTATCAGACAATATTTGGTAACCGATGAGTATTA*CATGTACTATGAATTT
CTGATATAGTA
ATACTT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RS1H553TF 738 0 0
GGA
AAAACACAAAAACCAAACAAAAGAAACCGTTAGAGAAAGAAAAAAACTGCGTTGTTTCTT
GAAAATGGAGATTGTTAGGTTCGCAGTCGCCGTCATTTTTGCACTTTCCTCCATCTCATC
GTCTAACGCGGCAACTACACCAACTACACCACCAAGCGGCGGAGCAGGAGATGCTCACTC
GATGCCATGTATACAGAAACTGATGCCGTGTCAGCCGTATCTTCACTCGTCGGCTCCTCT
GCCTCCAGCGTCGTGTTGCATGCCGTTGAAGGAGATCGTCGAGACCGACGTGACCTGTCT
TTGCTCAGTATTCAACAACGTAGATATGCTTAGATCGCTTAACTTAACTAAAGAAAACGC
TCTTGTTCTCCCCAAAGCTTGTGGCGCTAACGCTGATGTGTCACAATGTAAAGCCAGTAC
CGGTACTACTACGCCTTCGACGTCCCCGGGAACTACTAAAACTCCTCCGGCATCTCCCGC
TGAAAGCGGCTCAGCCGGAGGTTCAGCTTCTTCAACGGCCAAACCATCAGACTCGGCTCC
GGCCATCAACTTTTCCGGAATAAGTTTCGCCTCAGCTTTCGTGGCATTGGCAACAATCTT
TTTCTGATATCCTACTAAGTCACGTCTTTATTCAGTTTAGTAAGTTTAAAATGTTGGAAA
CTATTATTATCAGACAATATTTGGTAACCGATGAGTATTA*CATGTACTATGAATTTCTG
ATATAGTA
TACTTTT

QA 4 731 4 731
DS 

RD RS1CR95TF 680 0 0
TCTTGAAAATGGAGATTGTTAGGTTCGCAGTCGCCGTCATTTTTGCACTTTCCTCCATCT
CGTCGTCTAACGCGGCAACTACACCAACTACACCACCAAGCGGCGGAGCAGGAGATGCTC
ACTCGATGCCATGTATACAGAAACTGATGCCGTGTCAGCCGTATCTTCACTCGTCGGCTC
CTCTGCCTCCAGCGTCGTGTTGCATGCCGTTGAAGGAGATCGTCGAGACCGACGCGACCT
GTCTTTGCTCAGTATTCAACAACGTAGATATGCTTAGATCGCTTAACTTAACTAAAGAAA
ACGCTCTTGTTCTCCCCAAAGCTTGTGGCGCTAACGCTGATGTGTCACAATGTAAAGCCA
GTACCGGTACTACTACGCCTTCGACGTCCCCGGGAACTACTAAAACTCCTCCGGCATCTC
CCGCTGAAAGCGGCTCAGCCGGAGGTTCAGCTTCTTCAACGGCCAAACCATCAGACTCGG
CTCCGGCCATCAACTTTTCCGGAATAAGTTTCGCCTCAGCTTTCGTGGCGTTGGCAACAA
TCTTTTTCTGATATCCTACTAAGTCACGTCTTTATTCAGTTTAGTAAGTTTAAAATGTTG
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TCTGATATAGTAATACTTTT

QA 1 680 1 680
DS 



CO CL852Contig2 734 4 5 U
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TATTGTCTGATAATAATAGTTTCCAACATTTTAAACTTACTAAACTGAATAAAGACGTGA
CTTAGTAGGATATCAGAAAAAGATTGTTGCCAATGCCACGAAAGCTGAGGCGAAGCTTAT
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TCCGGCTGAGCCGCTTTCAGCGGGAGATGCCGGAGGAGTTTTAGTAGTTCCCGGGGACGT
CGAAGGCGTAGTAGTACCGGTACTGGTTTTACATTGCGACACATCAGCGTTAGCACCACA
AGCTTTGGGGAGAACAAGAGCGTTTTCTTTGGTTAAGTTAACCGATCTAAGCATATCTAC
GTTGTTGAATACGGAGCAAAGACAGGCCACGTCAGTCTCGACGATCTCCTTCAATGGCAT
GCAACACGATGCTGGAGGGTGAGGAGTCGCCGAGTGGAGATACGGCTGACACGGCATCAG
TTTCTGTATACATGGCATCGAGTGAGCATCTCCTGCTCCGCCGCTTGGCGGTGTCGTTGC
CGCGTTAGACGATGAGGTGGAGGAAAGTGCAAAAATAACGGCGAATGCGAACCTAACAAT
CTCCATTTT*CAAGAAACAACGCAGTTTTTTCTTTCTTTAAAGGTTTCTTTAGTTTGGTT
TGTGTGTTTTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RS1D072JQ U 64
AF RS1E035JQ U 1
AF RS1E035TF C 49
AF RS1D072TF C 141
BS 1 669 RS1E035JQ
BS 670 670 RS1E035TF
BS 671 691 RS1E035JQ
BS 692 730 RS1E035TF
BS 731 734 RS1D072TF

RD RS1D072JQ 241 0 0
TGTCTGATAATAATAGTTTCCAACATTTTAAACTTACTAAACTGAATAAAGACGTGACTT
AGTAGGATATCAGAAAAAGATTGTTGCCAATGCCACGAAAGCTGAGGCGAAGCTTATTCC
GGAAAAGTTGATGGCCGGAGCCGAGTCTGATGGTTTGACCGTTGAAAAAGCTGAACCTCC
GGCTGAGCCGCTTTCAGCGGGAGATGCCGGAGGAGTTTTAGTAGTTCCCGGGGACGTCGA
A

QA 1 241 1 241
DS 

RD RS1E035JQ 696 0 0
GGAAAGTATTACTATTATTAGAAATTTCATAGTACATGTTAATACTCATCAGTTACCAAA
TATTGTCTGATAATAATAGTTTCCAACATTTTAAACTTACTAAACTGAATAAAGACGTGA
CTTAGTAGGATATCAGAAAAAGATTGTTGCCAATGCCACGAAAGCTGAGGCGAAGCTTAT
TCCGGAAAAGTTGATGGCCGGAGCCGAGTCTGATGGTTTGACCGTTGAAGAAGCTGAACC
TCCGGCTGAGCCGCTTTCAGCGGGAGATGCCGGAGGAGTTTTAGTAGTTCCCGGGGACGT
CGAAGGCGTAGTAGTACCGGTACTGGTTTTACATTGCGACACATCAGCGTTAGCACCACA
AGCTTTGGGGAGAACAAGAGCGTTTTCTTTGGTTAAGTTAACCGATCTAAGCATATCTAC
GTTGTTGAATACGGAGCAAAGACAGGCCACGTCAGTCTCGACGATCTCCTTCAATGGCAT
GCAACACGATGCTGGAGGGTGAGGAGTCGCCGAGTGGAGATACGGCTGACACGGCATCAG
TTTCTGTATACATGGCATCGAGTGAGCATCTCCTGCTCCGCCGCTTGGCGGTGTCGTTGC
CGCGTTAGACGATGAGGTGGAGGAAAGTGCAAAAATAACGGCGAATGCGAACCTAACAAT
CTCCATTTTTCAAGAAACAACGCAGTTTTTT
CTTTC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1E035TF 686 0 0
TCA
GTTACCAAATATTGTCTGATAATAATAGTTTCCAACATTTTAAACTTACTAAACTGAATA
AAGACGTGACTTAGTAGGATATCAGAAAAAGATTGTTGCCAATGCCACGAAAGCTGAGGC
GAAGCTTATTCCGGAAAAGTTGATGGCCGGAGCCGAGTCTGATGGTTTGACCGTTGAAGA
AGCTGAACCTCCGGCTGAGCCGCTTTCAGCGGGAGATGCCGGAGGAGTTTTAGTAGTTCC
CGGGGACGTCGAAGGCGTAGTAGTACCGGTACTGGTTTTACATTGCGACACATCAGCGTT
AGCACCACAAGCTTTGGGGAGAACAAGAGCGTTTTCTTTGGTTAAGTTAACCGATCTAAG
CATATCTACGTTGTTGAATACGGAGCAAAGACAGGCCACGTCAGTCTCGACGATCTCCTT
CAATGGCATGCAACACGATGCTGGAGGGTGAGGAGTCGCCGAGTGGAGATACGGCTGACA
CGGCATCAGTTTCTGTATACATGGCATCGAGTGAGCATCTCCTGCTCCGCCGCTTGGCGG
TGTCGTTGCCGCGTTAGACGATGAGGTGGAGGAAAGTGCAAAAATAACGGCGAATGCGAA
CCTAACAATCTCCATTTT*CAAGAAACAACGCAGTTTTTTCTTTCTTTAAAGGTTTCTTT
AGTTTGGTTTGTGTGTTTT
GTCC

QA 4 682 4 682
DS 

RD RS1D072TF 594 0 0
AGATTGTTGCCAATGCCACGAAAGCTGAGGCGAAGCTTATTCCGGAAAAGTTGATGGCCG
GAGCCGAGTCTGATGGTTTGACCGTTGAAGAAGCTGAACCTCCGGCTGAGCCGCTTTCAG
CGGGAGATGCCGGAGGAGTTTTAGTAGTTCCCGGGGACGTCGAAGGCGTAGTAGTACCGG
TACTGGTTTTACATTGCGACACATCAGCGTTAGCACCACAAGCTTTAGGGAGAACAAGAG
CGTTTTCTTTGGTTAAGTTAACCGATCTAAGCATATCTACGTTGTTGAATACGGAGCAAA
GACAGGCCACGTCAGTCTCGACGATCTCCTTCAATGGCATGCAACACGATGCTGGAGGGT
GAGGAGTCGCCGAGTGGAGATACGGCTGACACGGCATCAGTCTCTGTATACATGGCATCG
AGTGAGCATCTCCTGCTCCGCCGCTTGGCGGTGTCGTTGCCGCGTTAGACGATGAGGTGG
AGGAAAGTGCAAAAATAACGGCGACTGCGAACCTAACAATCTCCATTTT*CAAGAAACAA
CGCAGTTTTTTCTTTCTTTAAAGGTTTCTTTAGTTTGGTTTGTGTGTTTTGTCC

QA 1 594 1 594
DS 



AS 2 7

CO CL853Contig1 1046 5 5 U
GGGCATTGAGTCAAAGTGTGTGAGACTGTAGAGTGAAGATTTTTAAAAAATGGTGGGTAT
GGGTTGGTTCATGTGTATGATGATTGTGGTGTGTGTGGTTTCTTGTGGCGAAGCTGCTCC
AGGAGCTAAGTTCGAGGAACTTTACCGCTCAAGCTGGGCTATGGATCATTGTATCAACGA
TGGGGAAGTCACAAAACTCAAGCTTGACAACTCCTCTGGAGCTGGGTTTGAATCGAGAAG
CAAGTACTTGTTTGGTAAAGTCTCTATCCAGATTAAGCTCGTGGAGGGTGACTCAGCAGG
AACCGTCACTGCTTTCTACATGTCTTCGGAAGGTTCGAACCACAACGAGTTTGACTTCGA
GTTCTTAGGTAACACAACGGGTGAGCCTTACATAGTCCAGACAAACGTCTATGTGAACGG
TGTCGGAAACAGAGAGCAAAGACTCAACCTTTGGTTCGATCCCACCACTGAGTTCCACAC
CTACTCTATCCTCTGGAGTAAACGCAGTGTCGTGTTTATGGTAGATGAGACACCAATCCG
TGTTCACAAGAATCTTGAAGATAAAGGCATCCCTTTTGCTAAAGATCAAGCAATGGGAGT
CTGCAGCTCGATTTGGAATGCAGATGATTGGGCAACGCAAGGAGGTCTTGTGAAAACTGA
TTGGAGTCACGCTCCTTTCATTGCTTCTTACAAAGATTTCAAGATTGATGCTTGTGAGGT
TCCGACAACAACTGATCTAAGCAAGTGTAATGGAGAAGACCAGAGATTCTGGTGGGATGA
GCCAACTGTGTCTGAGTTGAGTCTTCATCAAAATCACCAGCTTATTTGGGTTCGAGCTAA
CCATATAATCTATGATTATTGTTTTGATGCTGCGAGGTTTCCTGTTACTCCTCTTGAGTG
CCAACACCATCGCCATTTGTAGTCTTAAAAGTCGATCTTTGTGTTTTAACTTAGTCATGA
AGTTGTTTTGATCAAAGAGAACATGTTGTAGCTCTTTGATGATTCTGTTTTATGTATAAA
TAATCAATTATCTATTGATTTTGTTG


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 10 35 35 35 35 35 30 30 30 15 30 30 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BW44TF U 1
AF RS1EV88TF U 3
AF RS1GP55TF U 3
AF RS1H619JQB C 604
AF RS1GP55JQ C 374
BS 1 602 RS1BW44TF
BS 603 603 RS1GP55TF
BS 604 788 RS1BW44TF
BS 789 795 RS1EV88TF
BS 796 1046 RS1GP55JQ

RD RS1BW44TF 788 0 0
GGGCATTGAGTCAAAGTGTGTGAGACTGTAGAGTGAAGATTTTTAAAAAATGGTGGGTAT
GGGTTGGTTCATGTGTATGATGATTGTGGTGTGTGTGGTTTCTTGTGGCGAAGCTGCTCC
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TGTCGGAAACAGAGAGCAAAGACTCAACCTTTGGTTCGATCCCACCACTGAGTTCCACAC
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TGTTCACAAGAATCTTGAAGATAAAGGCATCCCTTTTGCTAAAGATCAAGCAATGGGAGT
CTACAGCTCGATTTGGAATGCAGATGATTGGGCAACGCAAGGAGGTCTTGTGAAAACTGA
TTGGAGTCACGCTCCTTTCATTGCTTCTTACAAAGATTTCAAGATTGATGCTTGTGAGGT
TCCGACAACAACTGATCTAAGCAAGTGTAATGGAGAAGACCAGAGATTCTGGTGGGATGA
GCCAACTG

QA 1 788 1 788
DS 

RD RS1EV88TF 793 0 0
GG
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TGGTTCATGTGTATGATGATTGTGGTGTGTGTGGTTTCTTGTGGCGAAGCTGCTCCAGGA
GCTAAGTTCGAGGAACTTTACCGCTCAAGCTGGGCTATGGATCATTGTATCAACGATGGG
GAAGTCACAAAACTCAAGCTTGACAACTCCTCTGGAGCTGGGTTTGAATCGAGAAGCAAG
TACTTGTTTGGTAAAGTCTCTATCCAGATTAAGCTCGTGGAGGGTGACTCAGCAGGAACC
GTCACTGCTTTCTACATGTCTTCGGAAGGTTCGAACCACAACGAGTTTGACTTCGAGTTC
TTAGGTAACACAACGGGTGAGCCTTACATAGTCCAGACAAACGTCTATGTGAACGGTGTC
GGAAACAGAGAGCAAAGACTCAACCTTTGGTTCGATCCCACCACTGAGTTCCACACCTAC
TCTATCCTCTGGAGTAAACGCAGTGTCGTGTTTATGGTAGATGAGACACCAATCCGTGTT
CACAAGAATCTTGAAGATAAAGGCATCCCTTTTGCTAAAGATCAAGCAATGGGAGTCTAC
AGCTCGATTTGGAATGCAGATGATTGGGCAACGCAAGGAGGTCTTGTGAAAACTGATTGG
AGTCACGCTCCTTTCATTGCTTCTTACAAAGATTTCAAGATTGATGCTTGTGAGGT*CCG
ACAACAACTGATCTAAGCAAGTGTAATGGAGAAGAC*AGAGAT*CTGGTGGGATGAGC*A
ACTGTGTCTGA

QA 3 793 3 793
DS 

RD RS1GP55TF 792 0 0
GG
ATTGAGTCAAAGTGTGTGAGACTGTAGAGTGAAGATTTTTAAAAAATGGTGGGTATGGGT
TGGTTCATGTGTATGATGATTGTGGTGTGTGTGGTTTCTTGTGGCGAAGCTGCTCCAGGA
GCTAAGTTCGAGGAACTTTACCGCTCAAGCTGGGCTATGGATCATTGTATCAACGATGGG
GAAGTCACAAAACTCAAGCTTGACAACTCCTCTGGAGCTGGGTTTGAATCGAGAAGCAAG
TACTTGTTTGGTAAAGTCTCTATCCA**TTAAGCTCGTGGAGGGTGACTCAGCAGGAACC
GTCACTGCTTTCTACATGTCTTCGGAAGGTTCGAACCACAACGAGTTTGACTTCGAGTTC
TTAGGTAACACAACGGGTGAGCCTTACATAGTCCAGACAAACGTCTATGTGAACGGTGTC
GGAAACAGAGAGCAAAGACTCAACCTTTGGTTCGATCCCACCACTGAGTTCCACACCTAC
TCTATCCTCTGGAGTAAACGCAGTGTCGTGTTTATGGTAGATGAGACACCAATCCGTGTT
CACAAGAATCTTGAAGATAAAGGCATCCCTTTTGCTAAAGATCAAGCAATGGGAGTCTGC
AGCTCGATTTGGAATGCAGATGATTGGGCAACGCAAGGAGGTCTTGTGAAAACTGATTGG
AGTCACGCTCCTTTCATTGCTTCTTACAAAGATTTCAAGATTGATGCTTGTGAG*TTCCG
ACAACAACTGATCTAAGCAAGTGTAATGGAGA*GAC*AGAGATTCTGGTGGGATGAGC*A
ACTGTGTCTG

QA 3 792 3 792
DS 

RD RS1H619JQB 414 0 0
CAGCTCGATTTGGAATGCAGATGATTGGGCAACGCAAGGAGGTCTTGTGAAAACTGATTG
GAGTCACGCTCCTTTCATTGCTTCTTACAAAGATTTCAAGATTGATGCTTGTGAGGTTCC
GACAACAACTGATCTAAGCAAGTGTAATGGAGAAGACCAGAGATTCTGGTGGGATGAGCC
AACTGTGTCTGAGTTGAGTCTTCATCAAA*TCACCAGCTTATTTGGGTTCGAGCTAACCA
TATAATCTATGATTATTGTTTTGATGCTGCGAGGTTTCCTGTTACTCCTCTTGAGTGCCA
ACACCATCGCCATTTGTAGTCTTAAAAGTCGATCTTTGTGTTTTAACTTAGTCATGAAGT
TGTTTTGATCAAAGAGAACATGTTGTAGCTCTTTGATGATTCTGTTTTATGTAT

QA 1 414 1 414
DS 

RD RS1GP55JQ 673 0 0
ACAACGGGTGAGCCTTACATAGTCCAGACAAACGTCTATGTGAACGGTGTCGGAAACAGA
GAGCAAAGACTCAACCTTTGGTTCGATCCCACCACTGAGTTCCACACCTACTCTATCCTC
TGGAGTAAACGCAGTGTCGTGTTTATGGTAGATGAGACACCAATCCGTGTTCACAAGAAT
CTTGAAGATAAAGGCATCCCTTTTGCTAAAGATCAAGCAATGGGAGTCTGCAGCTCGATT
TGGAATGCAGATGATTGGGCAACGCAAGGAGGTCTTGTGAAAACTGATTGGAGTCACGCT
CCTTTCATTGCTTCTTACAAAGATTTCAAGATTGATGCTTGTGAGGTTCCGACAACAACT
GATCTAAGCAAGTGTAATGGAGAAGACCAGAGATTTTGGTGGGATGAGCCAACTGTGTTT
GAGTTGAGTCTTCATCAAAATCACCAGCTTATTTGGGTTCGAGCTAACCATATAATCTAT
GATTATTGTTTTGATGCTGCGAGGTTTCCTGTTACTCCTCTTGAGTGCCAACACCATCGC
CATTTGTAGTCTTAAAAGTCGATCTTTGTGTTTTAACTTAGTCATGAAGTTGTTTTGATC
AAAGAGAACATGTTGTAGCTCTTTGATGATTCTGTTTTATGTATAAATAATCAATTATCT
ATTGATTTTGTTG

QA 1 673 1 673
DS 



CO CL853Contig2 644 2 2 U
GAGACAAACGTTTATGTGAACGGAGTTGGAAACAGAGAGCAAATACTCAACCTTTGGTTC
GATCCCACTACTGAGTTCCACACCTACTCTATCCTCTGGAGTAAACGCAGTGTTGTGTTT
ATGGTGGATGAGACTCCCATTCGTGTCCACAAGAATCTTGAAGATAAAGGCATCCCATTT
GCTAAAGACCAAGCCATGGGAGTGTACAGTTCGATTTGGAACGCAGATGACTGGGCGACC
CAAGGAGGTCTTGTGAAAACTGATTGGAGTCACGCTCCTTTCGTTGCTTCTTACAAAGAT
TTCAAGATTGATGCTTGTGAGGTTCCTACAACAACTGATCTAAGCAAGTGTAATGGAGAA
GACCAGAGATTCTGGTGGGATGAGCCAACTGTGTCTGAGTTGAGTCTTCATCAGAATCAC
CAGCTTATTTGGGTTCGAGCTAACCATATAATCTATGATTATTGTTTTGATGCTGCGAGG
TTTCCTGTTACTCCTCTTGAGTCAACACCATCGCCATTTGTAGTCTTAAAAGTTCATCTT
TGTGTTTTAACTTAGTCATGAAGTTGTTGTGATCAAAGATAACATGTTGTAGCTCTTTGA
TGATTCTGTTTTATGTATAAATAATCAATTATCTATTGATTTTG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1GZ69TF U 1
AF RS1H793TF U 1
BS 1 643 RS1GZ69TF
BS 644 644 RS1H793TF

RD RS1GZ69TF 643 0 0
GAGACAAACGTTTATGTGAACGGAGTTGGAAACAGAGAGCAAATACTCAACCTTTGGTTC
GATCCCACTACTGAGTTCCACACCTACTCTATCCTCTGGAGTAAACGCAGTGTTGTGTTT
ATGGTGGATGAGACTCCCATTCGTGTCCACAAGAATCTTGAAGATAAAGGCATCCCATTT
GCTAAAGACCAAGCCATGGGAGTGTACAGTTCGATTTGGAACGCAGATGACTGGGCGACC
CAAGGAGGTCTTGTGAAAACTGATTGGAGTCACGCTCCTTTCGTTGCTTCTTACAAAGAT
TTCAAGATTGATGCTTGTGAGGTTCCTACAACAACTGATCTAAGCAAGTGTAATGGAGAA
GACCAGAGATTCTGGTGGGATGAGCCAACTGTGTCTGAGTTGAGTCTTCATCAGAATCAC
CAGCTTATTTGGGTTCGAGCTAACCATATAATCTATGATTATTGTTTTGATGCTGCGAGG
TTTCCTGTTACTCCTCTTGAGTCAACACCATCGCCATTTGTAGTCTTAAAAGTTCATCTT
TGTGTTTTAACTTAGTCATGAAGTTGTTGTGATCAAAGATAACATGTTGTAGCTCTTTGA
TGATTCTGTTTTATGTATAAATAATCAATTATCTATTGATTTT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RS1H793TF 644 0 0
G
AGACAAACGTTTATGTGAACGGAGTTGGAAACAGAGAGCAAATACTCAACCTTTGGTTCG
ATCCCACTACTGAGTTCCACACCTACTCTATCCTCTGGAGTAAACGCAGTGTTGTGTTTA
TGGTGGATGAGACTCCCATTCGTGTCCACAAGAATCTTGAAGATAAAGGCATCCCATTTG
CTAAAGACCAAGCCATGGGAGTGTACAGTTCGATTTGGAACGCAGATGACTGGGCGACCC
AAGGAGGTCTTGTGAAAACTGATTGGAGTCACGCTCCTTTCGTTGCTTCTTACAAAGATT
TCAAGATTGATGCTTGTGAGGTTCCTACAACAACTGATCTAAGCAAGTGTAATGGAGAAG
ACCAGAGATTCTGGTGGGATGAGCCAACTGTGTCTGAGTTGAGTCTTCATCAGAATCACC
AGCTTATTTGGGTTCGAGCTAACCATATAATCTATGATTATTGTTTTGATGCTGCGAGGT
TTCCTGTTACTCCTCTTGAGTCAACACCATCGCCATTTGTAGTCTTAAAAGTTCATCTTT
GTGTTTTAACTTAGTCATGAAGTTGTTGTGATCAAAGATAACATGTTGTAGCTCTTTGAT
GATTCTGTTTTATGTATAAATAATCAATTATCTATTGATTTTG

QA 2 644 2 644
DS 



AS 1 7

CO CL854Contig1 674 7 10 U
GGCTAGCCTTTGTGGGGGAGTAAACGTGAGAAGATTCAGCTGCGTTAGGCAAAATCACCA
GACGAAA*ATCGCTGATTTCTGTTAGCTTTTTTTTTAAAGCAATGGCAACGGGTAAAACA
GTGAAAGACGTCTCTCCACATGACTTTGTCAAGGCTTACGCTTCTCATCTCAAGCGATCT
GGCAAGATCGAGCTTCCATCATGGACAGACATTGTGAAGACCGGGAAGTTGAAGGAGCTT
GCCCCTTATGATCCTGATTGGTATTACATCAGAGCTGCATCTATGGCAAGGAAGGTATAC
CTGAGGGGAGGTCTTGGAGTAGGTGCTTTCCGTAGAATCTATGGTGGCAGCAAGAGAAAC
GGGAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAGCGGTGGCATTGCCCGTCACATTCTCCAG
CAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGGAGGAAGAAGAATCACTTCA
AGTGGACAACGGGATTTGGACCAGGTTGCTGGACGTATTGCAGTTGAAATTTGAAGATCT
GAATGTTGTTTTTAGTTCTTCTACTACTTTTGATGAAACCAATGTGCTGTTTTTAGTGTT
TTTGTCTTTTTCTCCCAAAGAACAATTTTTATCAATGCCATTGCTCAAGACTGTTACCAT
AATGTTCGGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 15 45 45 15 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 15 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 15 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 10 10 10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CB52TF U 1
AF RS1E861JQ C 10
AF RS1E861TF U 10
AF RS1H566JQB C 4
AF RS1EZ53JQ C 2
AF RS1EZ53TF U 2
AF RS1H566TF U 4
BS 1 165 RS1CB52TF
BS 166 214 RS1EZ53TF
BS 215 215 RS1H566TF
BS 216 236 RS1EZ53TF
BS 237 237 RS1H566TF
BS 238 241 RS1EZ53TF
BS 242 242 RS1H566TF
BS 243 363 RS1EZ53TF
BS 364 364 RS1H566TF
BS 365 674 RS1EZ53TF

RD RS1CB52TF 165 0 0
GGCTAGCCTTTGTGGGGGAGTAAACGTGAGAAGATTCAGCTGCGTTAGGCAAAATCACCA
GACGAAA*ATCGCTGATTTCTGTTAGCTTTTTTTTTAAAGCAATGGCAACGGGTAAAACA
GTGAAAGACGTCTCTCCACATGACTTTGTCAAGGCTTACGCTTCT

QA 1 165 1 165
DS 

RD RS1E861JQ 624 0 0
GG
GTGGGGGAGTAAACGTGAGAAGATTGAGCTGCCTTGGGCTAAATCACCAGTCGAAGGATC
GCTGATTTCTGTTAGCTTCTTTTTTAA*GCAATGGCAACCGGTAAAACAGTGAAAGACGT
CTCTCCACATGACTTTGTCAAGGCTTACGCTTCTCACCTCAAGCGATCTGGCAAGATCGA
GCTTCCATCGTGGACAGACATTGTGAAGACCGGGAAGTTGAAGGAGCTTGCCCCTTATGA
TCCTGATTGGTACTACATCAGAGCTGCATTTATGGCAAGGAAGGTATACCTGAGGGGAGG
TCTTTG*****GTGCTTTCCGTAGAATCTATGGAGGCAGCAAGAGAAACGGCAGTCGCCC
ACCACATTTCTGCAAAAGCAGCGGTGGCATTGCCCGTCACATCCTCCAGCAGTTGGAGAC
TATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGGAGGAAGAAGAATCACTTCAAGTGGACAACG
GGATTTGGACCAGGTTGCTGGACGTATTGCAGTTGAAATTTGAAGATCTGAATGTTGTTT
TTAGTTCTTCTACTACTTTTGATGAAACCAATGTGCTGTTTTTAGTGTTTT*GTCTTTTT
CTCCCAAAGAACAATTTTTA
CC

QA 3 622 3 622
DS 

RD RS1E861TF 624 0 0
GG
GTGGGGGAGTAAACGTGAGAAGATTGAGCTGCCTTGGGCTAAATCACCAGTCGAAGGATC
GCTGATTTCTGTTAGCTTCTTTTTTAA*GCAATGGCAACCGGTAAAACAGTGAAAGACGT
CTCTCCACATGACTTTGTCAAGGCTTACGCTTCTCACCTCAAGCGATCTGGCAAGATCGA
GCTTCCATCGTGGACAGACATTGTGAAGACCGGGAAGTTGAAGGAGCTTGCCCCTTATGA
TCCTGATTGGTACTACATCAGAGCTGCATCTATGGCAAGGAAGGTATACCTGAGGGGAGG
TCTTTG*****GTGCTTTCCGTAGAATCTATGGAGGCAGCAAGAGAAACGGCAGTCGCCC
ACCACATTTCTGCAAAAGCAGCGGTGGCATTGCCCGTCACATCCTCCAGCAGTTGGAGAC
TATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGGAGGAAGAAGAATCACTTCAAGTGGACAACG
GGATTTGGACCAGGTTGCTGGACGTATTGCAGTTGAAATTTGAAGATCTGAATGTTGTTT
TTAGTTCTTCTACTACTTTTGATGAAACCAATGTGCTGTTTTTAGTGTTTT*GTCTTTTT
CTCCCAAAGAACAATTTTTA
CC

QA 3 622 3 622
DS 

RD RS1H566JQB 642 0 0
GG
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AA*ATCGCTGATTTCTGTTAGCTTTTTTTTTAAAGCAATGGCAACGGGTAAAACAGTGAA
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GATCGAGCTTCCATCATGGACAGACATTGTGAAGACCGGGAAGTTGAAGGAGCTTGCCCC
TTATGATCCTGATTGGTATTACATCAGAGCTGCATCTATGGCAAGGAAGGTATACCTGAG
GGGAGGTCTTGGAGTAGGTGCTTTCCGTAGAATCTATGGTGGCAGCAAGAGAAACGGGAG
TCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAGCGGTGGCATTGCCCGTCACATTCTCCAGCAGTT
GGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGGAGGAAGAAGAATCACTTCAAGTGG
ACAACGGGATTTGGACCAGGTTGCTGGACGTATTGCAGTTGAAATTTGAAGATCTGAATG
TTGTTTTTAGTTCTTCTACTACTTTTGATGAAACCAATGTGCTGTTTTTAGTGTTTTTGT
CTTTTTCTCCCAAAGAACAATTTTTATCAATGCCATTGCT

QA 3 642 3 642
DS 

RD RS1EZ53JQ 668 0 0
GGGA
GCCTTTGTGGGGGAGTAAACGTGAGAAGATTCAGCTGCGTTAGGCAAAATCACCAGACGA
AA*ATCGCCGATTTCTGTTAGCTTTTTTTT*AAAGCAATGGCAATGGGTAAAACAGTGAA
AGACGTCTCTCCACATGACTTTGTCAAGGCTTACGCTTCTCATCTCAAGCGATCTGGCAA
GATCGAGCTTCCATCATGGACAGACATTGCGAAGACCGGGAAGTTGAAGGAACTTGTCCC
TTATGATCCTGATTGGTATTACATCAGAGCTGCATTTATGGCAAGGAAGGTATACCTGAG
GGGAGGTCTTGGAGTAGGTGCTTTCCGTAGAATCTATGGTGGCAGCAAGAGAAACGGGGG
TCGCCCACCACATTTTTGCAAAAGCAGCGGTGGCATTGCCCGTCACATTCTCCAGCAGTT
GGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGGAGGAAGAAGAATCACTTCAAGTGG
ACAACGGGATTTGGACCAGGTTGCTGGACGTATTGCAGTTGAAATTTGAAGATCTGAATG
TTGTTTTTAGTTCTTTTACTACTTTTGATGAAACCAATGTGCTGTTTTTAGTGTTTTTGT
CTTTTTCTCCCAAAGAACAATTTTTATCAATGCCATTGCTCAAGACTGTTACCATAA
TGTTCGG

QA 5 661 5 661
DS 

RD RS1EZ53TF 673 0 0
GGGA
GCCTTTGTGGGGGAGTAAACGTGAGAAGATTCAGCTGCGTTAGGCAAAATCACCAGACGA
AA*ATCGCCGATTTCTGTTAGCTTTTTTTT*AAAGCAATGGCAATGGGTAAAACAGTGAA
AGACGTCTCTCCACATGACTTTGTCAAGGCTTACGCTTCTCATCTCAAGCGATCTGGCAA
GATCGAGCTTCCATCATGGACAGACATTGCGAAGACCGGGAAGTTGAAGGAACTTGTCCC
TTATGATCCTGATTGGTATTACATCAGAGCTGCATCTATGGCAAGGAAGGTATACCTGAG
GGGAGGTCTTGGAGTAGGTGCTTTCCGTAGAATCTATGGTGGCAGCAAGAGAAACGGGGG
TCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAGCGGTGGCATTGCCCGTCACATTCTCCAGCAGTT
GGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGGAGGAAGAAGAATCACTTCAAGTGG
ACAACGGGATTTGGACCAGGTTGCTGGACGTATTGCAGTTGAAATTTGAAGATCTGAATG
TTGTTTTTAGTTCTTCTACTACTTTTGATGAAACCAATGTGCTGTTTTTAGTGTTTTTGT
CTTTTTCTCCCAAAGAACAATTTTTATCAATGCCATTGCTCAAGACTGTTACCATAATGT
TCGGAAAAA

QA 5 673 5 673
DS 

RD RS1H566TF 663 0 0
GG
GCCTTTGTGGGGGAGTAAACGTGAGAAGATTCAGCTGCGTTAGGCAAAATCACCAGACGA
AA*ATCGCTGATTTCTGTTAGCTTTTTTTTTAAAGCAATGGCAACGGGTAAAACAGTGAA
AGACGTCTCTCCACATGACTTTGTCAAGGCTTACGCTTCTCATCTCAAGCGATCTGGCAA
GATCGAGCTTCCATCATGGACAGACATTGTGAAGACCGGGAAGTTGAAGGAGCTTGCCCC
TTATGATCCTGATTGGTATTACATCAGAGCTGCATCTATGGCAAGGAAGGTATACCTGAG
GGGAGGTCTTGGAGTAGGTGCTTTCCGTAGAATCTATGGTGGCAGCAAGAGAAACGGGAG
TCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAGCGGTGGCATTGCCCGTCACATTCTCCAGCAGTT
GGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGGAGGAAGAAGAATCACTTCAAGTGG
ACAACGGGATTTGGACCAGGTTGCTGGACGTATTGCAGTTGAAATTTGAAGATCTGAATG
TTGTTTTTAGTTCTTCTACTACTTTTGATGAAACCAATGTGCTGTTTTTAGTGTTTTTGT
CTTTTTCTCCCAAAGAACAATTTTTATCAATGCCATTGCTCAAGACTGTTACCATAA
AAAA

QA 3 659 3 659
DS 



AS 1 6

CO CL855Contig1 1031 6 7 U
GGATTCATTACAATCTGAGATCTTTAGCCGTAGCAGAGCAATGGCTGGAGCAGAGCAACT
CCAAAGATGGAGCCTTCAAGTCAAGACTGCACTTGTAACCGGTGGAACCAAAGGCATTGG
ACATGCTGTGGTAGAGGAACTTGCAGGATTTGGAGCCATAATACATACTTGCGCCAGAGA
CGAATCTCAGCTTAACGAGTGTATAAGCCAATGGCAAAAGAAAGGGTTTCAAGTCACAGG
TTCAGTCTGTGACGTCACTTCTAGAACAGACAGAGAGAAGCTTATGGAGACGGTTTCATC
GATGTTTGGCGGGAAGCTCGATATCCTTGTAAACAATGCGGGAGCCATTCGGTCAAAGCC
AACAGTGGATCATACAGCAGAAGACTTTTCATTTCATATCTCGACCAACTTAGAATCTGC
TTTCCATCTAAGCCAGCTTTCACACCCCTTGCTTAAGGCTTCAGGATACGGTAGCATCGT
GTTCATGTCCTCTGTTGCTGGAGTTGTATCGCTTAGCGTCGGTTCCATCTACTCTGCAAC
AAAAGGGGCTATGAATCAGCTAGCAAGGAATTTGGCATGCGAATGGGCTAGTGATGGCAT
TAGGGCTAATGCTGTGGCTCCTGCTGTCATCGCAACTGATCTGGCTAAAGCTGTGTATGA
TGAAGAGTTTAAGAAGGCTGCGATATCTAGAAAGCCGTTGGGGCGTTTTGGGGAGCCTGA
AGAGGTTGCCTCACTTGTGGCTTTTCTATGTATGCCTGCAGCTTCTTACATAACTGGTCA
GACCATTTGTGTCGATGGAGGTCTCTCTGTCAATGGCTTCTCGTATCAGCCACATGGTTA
AAATCCAATGCTCCAAATAAATTAAAAACTTCAAATTTTTACAAATAAGTTTCAGTGTCT
AGAAACAGAATTTGTATGTTCACTATGTTTCTCGTTATCATATTGGGCTAATTCACCAAT
ATATAAGAGACTTCATAAACTTCCAGAACGAATCTCTCCTCTGTTCAGTACATAATAACC
CTATTCAGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 10 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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ACATGCTGTGGTAGAGGAACTTGCAGGATTTGGAGCCATAATACATACTTGCGCCAGAGA
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GATGTTTGGCGGGAAGCTCGATATCCTTGTAAACAATGCGGGAGCCATTCGGTCAAAGCC
AACAGTGGATCATACAGCAGAAGACTTTTCATTTCATATCTCGACCAACTTAGAATCTGC
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AAAAGGGGCTATGAATCAGCTAGCAAGGAATTTGGCATGCGAATGGGCTAGTGATGGCAT
TAGGGCTAATGCTGTGGCTCCTGCTGTCATCGCAACTGATCTGGCTAAAGCTGTGTATGA
TGAAGAGTTTAAGAACGCTGCGATATCTAGAAAGCCGTTGGGGCGTTTTGGGGAGCCT
TA

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GG
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AATGGCAAAAGAAAGGGTTTCAAGTCACAGGTTCAGTCTGTGACGTCACTTCTAGAACAG
ACAGAGAGAAGCTTATGGAGACGGTTTCATCGATGTTTGGCGGGAAGCTCGATATCCTTG
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CATTTCACATCTCGACCAACTTAGAATCTGCTTTCCATCTAAGCCAGCTTTCACACCCCT
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ACAGTGGATCATACAGCAGAAGACTTTTCATTTCATATCTCGACCAACTTAGAATCTGCT
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GA

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ATGTTTGGCGGGAAGCTCGATATCCTTGTAAACAATGCGGGAGCCATTCGGTCAAAGCCA
ACAGTGGATCATACAGCAGAAGACTTTTCATTTCATATCTCGACCAACTTAGAATCTGCT
TTCCATCTAAGCCAGCTTTCACACCCCTTGCTTAAGGCTTCAGGATACGGTAGCATCGTG
TTCATGTCCTCTGTTGCTGGAGTTGTATCGCTTAGCGTCGGTTCCATCTACTCTGCAACA
AAAGGGGCTATGAATCAGCTAGCAAGGAATTTGGCATGCGAATGGGCTAGTGATGGCATT
AGGGCTAATGCTGTGGCTCCTGCTGTCATCGCAACTGATCTGGCTAAAGCTGTGTATGAT
GAAGAGTTTAAGAAGGCTGCGATATCTAGAAAGCCGTTGGGGCGTTTTGGGGAGCCTTAA
GAGGTTGCCTCACTTGTGGCTTTTCTATGTATGCCTGCAGCTTCTTACATAACTGGTCAG
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AATCCAATGCTCCAAATAAATTAAAAACTTCAAATTTTTACAAATAAGTTTCAGTGTCTA
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G

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DS 

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CGCTTAGCGTCGGTTCCATCTACTCTGCAACAAAAGGGGCTATGAATCAGCTAGCAAGGA
ATTTGGCATGCGAATGGGCTAGTGATGGCATTAGGGCTAATGCTGTGGCTCCTGCTGTCA
TCGCAACTGATCTGGCTAAAGCTGTGTATGATGAAGAGTTTAAGAAGGCTGTGATATCTA
GAAAGCCGTTGGGGCGTTTTGGGGAGCCTGAAGAGGTTGCCTCACTTGTGGCTTTTCTAT
GTATGCCTGCAGCTTCTTACATAACTGGTCAGACCATTTGTGTCGATGGAGGTCTCTCTG
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AAATAAGTTTCAGTGTCTAGAAACAGAATTTGTATGTTCACTATGTTTCTCGTTATCATA
TTGGGCTAATTCACCAATATATAAGAGACTTCATAAACTTCCAGAACGAATCTCTCCTCT
GTTCAGTACATAATAACCCTATTCAGCCC

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DS 



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TCCGTTTCTCCTCCAGCTGGATTCCCAGATCATCCTCACAGAGGTTTTGAAACTGTTACA
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GCTGGTGATGTTCAGTGGATGACTGCAGGAAGAGGAATCATTCACTCTGAAATGCCTGAA
GAAGAAGTTAACAAAGGTTTACAACTCTGGATCAATCTGTCATCTAACGAGAAAATGATA
GAGCCAAACTACCAAGAACTGTCGAGTTCAGACATACCGAAAGCAGAAGAAAACGGTGTT
CAAGTCAAAGTAATAGCAGGAGAATCAATGGGAGTTCAATCCCCTGTTTACACAAGAACA
GCAACAATGTTCCTCGATTTCACTCTAGATCCAGGAGCTCAGTTCCACCAGAACGTTCCT
GAATCTTGGAACGCGTTTGCTTACGTTCTTGAAAGCGGTGAAGGCGGAGCTGTTTTCGGC
TCATCAAACGCTTCCCCTGTTTCAGCGCACAATGTTGTAGTCTTCGGACAAGGAAATGAC
GGTGTTAGCGTGTGGAACAAGTCAGCTTCCAAGAAATTGCGGTTTGTGTTAATTGCTGGA
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ATTGATATGACCATTGAAGATTATCACTATGGTAAAAATGGCTTCGAAATGGCCAAGTAT
TGGAGGTCACAATGATAGAGACTAATAATAAATAATCAATGTTTTAATTATTATTTTCAT
ACTTGTTTTATCTTATGTGTGATTTGAATGGGACAATAATAAAGTTTAAAACCCAATTTT
TTTTGCT


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E867TF U 1
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AF RS1EP17TF U 2
AF RS1EP56TF U 2
AF RS1EP56JQ C 469
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AF RS1EP17JQ C 702
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RD RS1E867TF 617 0 0
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GCTGGTGATGTTCAGTGGATGACTGCAGGAAGAGGAATCATTCACTCTGAAATGCCTGAA
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CAAGTCAAAGTAATAGC

QA 1 617 1 617
DS 

RD RS1CL82TF 613 0 0
GACACAACCAAAATTCATCTTAACGAGAACACAAGTTAAGAAGAACAAAAAGAGAAACAC
GTTTAGTTTGTAGTATATGAGAGCTGCTTTAAACAGAGCAAATCTTCTTGGAGGGTTGTT
TTCATTCAGAAACGTTAAATCGATGTCGTCGTCTTCTTCTCAAAACTTTGTATCAAGATC
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TGGCATTTCCAGGAGTGGGCAGAAGTTATTAGATCCGTTCTTGATGCTTGATGAATTCTC
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DS 

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G
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QA 2 674 2 674
DS 

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G
GACACAACCAAAATTCATCTTAACGAGAACACAAGTTAAGAAGAACAAAAAGAGAAACAC
GTTTAGTTTGTAGTATATGAGAGCTGCTTTAAACAGAGCAAATCTTCTTGGAGGGTTGTT
TTCATTCAGAAACGTTAAATCGATGTCGTCGTCTTCTTCTCAAAACTTTGTATCAAGATC
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TGGCATTTCCAGGAGTGAGCGGAAGTTATTAGATCCGTTCTTGATGCTTGATGAATTCTC
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AACAATGTTCCTCGATTTCACTCTAGATCCAGGAGCTCAGTTCCACCAGAACGTTCCTGA
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QA 1 666 1 666
DS 

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CGCACAATGTTGTAGTCTTCGGACAAGGAAATGACGGTGTTAGCGTGTGGAACAAGTCAG
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DS 

RD RS1EP17JQ 446 0 0
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QA 1 446 1 446
DS 



AS 2 7

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ATTAAAAAAAATCCACTCCTCACAATTGTCTTCCCCTTCTTCTTCTTCTCTTCCTGTCGC
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CTCCCCAAAGCTTGGTTCATCTACTTGTTCATCGGTATCGGCGTGGCTCTCTTTGTTATT
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CTGCTTCTCATCTTGTTGATCTTGGCTGAGCTTGGAGCTGCAGCTTTTATTTTCTTCGAC
AACAGCTGGAGAGATCAAATTCCTTCTGACAAGACTGGAAATTTCGATACCATCTATCAT
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ACGATGCACCATCATGTGAGTCCCATGTTATAACGGTCTCAAATTAAAAGTTCAGTCAAT
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TTATTAGAGGTATGCTTCTATGGAAACTCTTTTTGTTGCGTCTGTGTAGTCTTTTTGTAA
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TAGATAAAATACATCTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A208TF U 1
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AF RS1A208TR C 758
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BS 1 746 RS1A208TF
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RD RS1A208TF 746 0 0
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ATTAAAAAAAATCCACTCCTCACAATTGTCTTCCCCTTCTTCTTCTTCTCTTCCTGTCGC
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AAAAAAGGGATGGCTTGTAGAGGTTGTTTGGAGTGTTTGCTAAAGTTACTCAACTTCGTT
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GTCTCCTCTGGGAGGCCCATGCTTATGGCTCTCGCACTCTCTTCCAATTTCTTTGACAAT
CTCCCCAAAGCTTGGTTCATCTACTTGTTCATCGGTATCGGCGTGGCTCTCTTTGTTATT
TCATGTTGTGGCTGTGTTGGTACTTGTTCAAGGAGCATCTGCTGCTTATCTTGTTACTCT
CTGCTTCTCATCTTGTTGATCTTGGCTGAGCTTGGAGCTGCAGCTTTTATTTTCTTCGAC
AACAGCTGGAGAGATCAAATTCCTTCTGACAAGACTGGAAATTTCGATACCATCTATCAT
TTCCTGAGAGAAAACTGGAACATTGT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1A208TV 824 0 0
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TCTTCTTCTTCTCTTCCTGTCGCGAAGATCGAAAAATCATCATCTCAAACCTTCTCCGAT
TATTCTCTGGATTGATGAATTAAGGGTTATAAAAGCTGAGTACCCCATACAAAGCGTTTC
AAGTGGTTAGTGAATTAAAAGAAAAAAAAGGGATGGCTTGTAGAGGTTGTTTGGAGTGTT
TGCTAAAGTTACTCAACTTCGTTCTGGCTATTGCTGGACTAGGCATGATTGGTTATGGTA
TCTACTTATTTGTTGAGTACCAGAGAGCAACTGATGATCACTCTGTTTCATTCATTCCTA
CAAATGTCAACGACCAAAGTTACGTCTCCTCTGGGAGGCCCATGCTTATGGCTCTCGCAC
TCTCTTCCAATTTCTTTGACAATCTCCCCAAAGCTTGGTTCATCTACTTGTTCATCGGTA
TCGGCGTGGCTCTCTTTGTTATTTCATGTTGTGGCTGTGTTGGTACTTGTTCAAGGAGCA
TCTGCTGCTTATCTTGTTACTCTCTGCTTCTCATCTTGTTGATCTTGGCTGAGCTTGGAG
CTGCAGCTTTTATTTTCTTCGACAACAGCTGGAGAGATCAAATTCCTTCTGACAAGACTG
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GCTAACACCCCAGATGAGTATGACAGTGATGATGAGTTTATTGC

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DS 

RD RS1A208TR 224 0 0
TCTAG
GGAGCCGTTGTTTTCGAGGCTTTGCTTTTCTTGCTCGCCCTCATGGTCAGGGGCAGCTAA
CACCCCAGATGAGTATGACAGTGATGATGAGTTTATTGCTCCTCCTAGGCAAATCAGGCA
GCCATTCATCAACCGCCAACCCGCCCCTGTTACGGGTGTCCCAGTTGCTCCTACTTTGGA
CCAACGCCCGAGCCGCAGTGACCCTTGGAGCGCACGTAT

QA 6 224 6 224
DS 

RD RS1A208JQ 854 0 0
AAAGCTTGGTTCATCTACTTGTTCATCGGTATCGGCGTGGCTCTCTTTGTTATTTCATGT
TGTGGCTGTGTTGGTACTTGTTCAAGGAGCATCTGCTGCTTATCTTGTTACTCTCTGCTT
CTCATCTTGTTGATCTTGGCTGAGCTTGGAGCTGCAGCTTTTATTTTCTTCGACAACAGC
TGGAGAGATCAAATTCCTTCTGACAAGACTGGAAATTTCGATACCATCTATCATTTCCTG
AGAGAAAACTGGAACATTGTCAGGTGGGTAGCTCTAGGAGCCGTTGTTTTCGAGGCTTTG
CTTTTCTTGCTCGCCCTCATGGTCAGGG*CAGCTAACACCCCAGATGAGTATGACAGTGA
TGATGAGTTTATTGCTCCTCCTAGGCAAATCAGGCAGCCATTCATCAACCGCCAACCCGC
CCCTGTTACGGGTGTCCCAGTTGCTCCTACTTTGGACCAACGCCCGAGCCGCAGTGACCC
TTGGAGCGCACGTATGAGGGAGAAGTATGGGCTAGACACATCTGAGTTCACATACAATCC
CTCAGAGTCACACCGGTTCCAGCAAATGCCGACGCAACCAAATGAAGAAAAGGGACGATG
CACCATCATGTGAGTCCCATGTTATAACGGTCTCAAATTAAAAGTTCAGTCAATTCTCTT
TTCTTGTTATCTTTTCTGCGTGTGTGTGTGTAACAATCAAGAGTGTCAGTGATATTATTA
GAGGTATGCTTCTATGGAAACTCTTTTTGTTGCGTCTGTGTAGTCTTTTTGTAAGTACTT
TACCATCATGAATATTCATCTTGGTTGTCTGATTTGGTCCTCTCATTTTTATTATAGATA
AAATACATCTGTTT

QA 1 854 1 854
DS 



CO CL857Contig2 1219 3 13 U
GGACTCCTCACAATTGTCTTCTTCATCTTCTTCTTCCTGTCGCGAAGATCGAAAAATCAT
CATCATCTCAAACCTTCTCCGATTATTCTTCGGATTGATGAGTTAAGGGTTAAAAGCTGA
GTAACCCCCCATACACAGCATTTCAAGTCGTTACTGAATTAAAAAAGAGAAGAAATGGCT
TGTAGAGGTTGTTTGGAATGTTTGCTTAAGTTACTCAACTTCCTTCTTGCTGTTGCTGGA
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CACTCTGTTTCATTCATTCCCGACCAAAGTTACGTCTCTTCTGGGAGGCCCATGCTTATG
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BQ
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GTATGCTTCTATGGAAACTCTTTTTGTTGCGTCTGTGTAGTCTTTTTGTAAGTACTTTAC
CATCATGAATATTCATCTTGGTTGTCTGATTTGGTCCTCTCATTTTTAT

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 7

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GACAAAGCAATTATTCATCAAAAACAAAATCAAAATCAAACAGAGAGAGAGAAAGAAAGA
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BQ
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30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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BS 418 418 RS1AN21TF
BS 419 475 RS1EX73TF
BS 476 712 RS1AN21TF
BS 713 713 RS1AK20TF
BS 714 722 RS1AN21TF
BS 723 744 RS1C176TF

RD RS1EX73TF 475 0 0
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GACAAAGCAATTATTCATCAAAAACAAAATCAAAATCAAACAGAGAGAGAGAAAGAAAGA
ACAGAGAAAAAATGGCCGCACCAGCAGAATTGATCCCAGCAGGAGAAGTGATCGCTTGCC
ACACCGTTGATGACTGGAACAACAAGTTCAAGGCCGCCAAAGAATCCAACAAGCTGATTG
TGATAGACTTCACAGCAACATGGTGCCCACCTTGCCGTTTCATTGCACCCATCTTCGTCG
AGTTGGCTAAGAAGCACCTTGATGTCGTTTTCTTCAAGGTCGATGTCGATGAATTGAATT
CTGTTGCTAAGGATTTCGAAGTTGAGGCCATGCCGACCTTTGTCTACATGAAGGGTGGAG
AGAAGGTCGACAAGGTGGTCGGTGCTGCGAAAGATGAAATCGTAGCCAAGCTTGA

QA 1 475 1 475
DS 

RD RS1EL69JQ 605 0 0
GG
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CGCACCAGCAGAATTGATCCCAGCAGGAGAAGTGATCGCTTGCCACACCGTTGATTACTG
GAACAACAAGTTCAAGGCCGCCAAAGAATCCAACAAGCTGATTGTGATAGACTTCACAGC
AACATGGTGCCCACCTTGCCGTTTCATTGCACCCATTTTTGTCGAGTTGGCTAAGAAGCA
CCTTGATGTCGTTTTTTTCAAGGTCGATGTCGATGAATTGAATTTTGTTGCTAAGGATTT
TGAAGTTGAGGCCATGCCGACCTTTGTTTACATGAAGGGTGAAGAGAAGGTCGACAAGGT
GGTCGGTGCTGCGAAAGATGAAATTGTAGCCAAGCTTGAGAAGCACTCTCAAGTTGCTTC
GGCTTGATTTGGTTTATCGTTCTTTTCATAACTATTTACCTAGTAGTGTGTTTGGTGTTT
TTTAATAAAAATCCTTTGTTGCGTTATTGTCACTTTCACTTGAATCATCATCATTTTCCC
TTTGTGTTGGTTTGGTGTGGTGCCTACATGCCTTGGG*TGTGTGAATAAATGTTTGCAGA
CTG

QA 3 605 3 605
DS 

RD RS1EL69TF 605 0 0
GG
ATCAAAAACAAAATCAAAATCAAACAGAGAGAGAGAAAGAAAGAACAGAGAAAAAATGGC
CGCACCAGCAGAATTGATCCCAGCAGGAGAAGTGATCGCTTGCCACACCGTTGATTACTG
GAACAACAAGTTCAAGGCCGCCAAAGAATCCAACAAGCTGATTGTGATAGACTTCACAGC
AACATGGTGCCCACCTTGCCGTTTCATTGCACCCATCTTCGTCGAGTTGGCTAAGAAGCA
CCTTGATGTCGTTTTCTTCAAGGTCGATGTCGATGAATTGAATTCTGTTGCTAAGGATTT
CGAAGTTGAGGCCATGCCGACCTTTGTCTACATGAAGGGTGAAGAGAAGGTCGACAAGGT
GGTCGGTGCTGCGAAAGATGAAATCGTAGCCAAGCTTGAGAAGCACTCTCAAGTTGCTTC
GGCTTGATTTGGTTTATCGTTCTCTTCATAACTATTTACCTAGTAGTGTGTTTGGTGTTT
TTTAATAAAAATCCTTTGTTGCGTTATTGTCACTTTCACTTGAATCATCATCATCTTCCC
TTTGTGTTGGTTTGGTGTGGTGCCTACATGCCTTGGG*TGTGTGAATAAATGTTTGCAGA
CTG

QA 3 605 3 605
DS 

RD RS1AN21TF 652 0 0
GG
ATTCATCAAAAACAAAATCAAAATCAAACAGAGAGAGAGAAAGAAAGAACAGAGAAAAAA
TGGCCGCACCAGCAGAATTGATCCCAGCAGGAGAAGTGATCGCTTGCCACACCGTTGATG
ACTGGAACAACAAGTTCAAGGCCGCCAAAGAATCCAACAAGCTGATTG**ATAGACTTCA
CAGCAACATGGTGCCCACCTTGCCGTTTCATTGCACCCATCTTCGTCGAGTTGGCTAAGA
AGCACCTTGATGTCGTTTT*TTCAAGGTCGATGTCGATGAGTTGAATTCTGTTGCTAAGG
ATTTCGAAGTTGAGGCCATGCCGACCTTTGTCTACATGAAGGGTGAAGAGAAGGTCGACA
AGGTGGTCGGTGCTGCGAAAGATGAAATCATAGCCAAGCTTGAGAAGCACTCTCAAGTTG
CTTCGGCTTGATTTGGTTTATCGTTCTCTTCATAACTATTTACCTAGTAGTGTGTTTGGT
GTTTTTTAATAAAAATCCTTTGTTGCGTTATTGTCACTTTCACTTGAATCATCATCATCT
TCCCTTTGTGTTGGTTTGGTGTGGTGCCTACATGCCTTGGG*TGTGTGAATAAATGTTTG
CAGACTGTATAACTCGCACGCATCTATGCTAAATTTTCAT*TTATTAACT

QA 3 652 3 652
DS 

RD RS1C176JQ 674 0 0
GG
ATTCATCAAAAACAAAATCAAAATCAAACAGAGAGAGAGAAAGAAAGAACAGAGAAAAAA
TGGCCGCACCAGCAGAATTGATCCCAGCAGGAGAAGTGATCGCTTGCCACACCGTTGATG
ACTGGAACAACAAGTTCAAGGCCGCCAAAGAATCCAACAAGCTGATTGTGATAGACTTCA
CAGCAACATGGTGCCCACCTTGCCGTTTCATTGCACCCATCTTCGTCGAGTTGGCTAAGA
AGCACCTTGATGTCGTTTTCTTCAAGGTCGATGTCGATGAATTGAATTCTGTTGCTAAGG
ATTTCGAAGTTGAGGCCATGCCGACCTTTGTCTACATGAAGGGTGAAGAGAAGGTCGACA
AGGTGGTCGGTGCTGCGAAAGATGAAATCGTAGCCAAGCTTGAGAAGCACTCTCAAGTTG
CTTCGGCTTGATTTGGTTTATCGTTCTCTTCATAACTATTTACCTAGTAGTGTGTTTGGT
GTTTTTTAATAAAAATCCTTTGTTGCGTTATTGTCACTTTCACTTGAATCATCATCATCT
TCCCTTTGTGTTGGTTTGGTGTGGTGCCTACATGCCTTGGG*TGTGTGAATAAATGTTTG
CAGACTGTATAACTCGCACGCATCTATGCTAAATTTTCATGTTATTAACTCTTGAGGTTA
TTGTGTTACGAC

QA 3 674 3 674
DS 

RD RS1AK20TF 651 0 0
GG
ATCAAAAACAAAATCAAAATCAAACAGAGAGAGA**AAGAAAGAACAGAGAAAAAATGGC
CGCACCAGCAGAATTGATCCCAGCAGGAGAAGTGATCGCTTGCCACACCGTCGATGACTG
GAACAACAAGTTCAAGGCCGCCAAAGAATCCAACAAGCTGATTGTGATAGACTTCACAGC
AACATGGTGCCCACCTTGCCGTTTCATTGCACCCATCTTCGTCGAGTTGGCTAAGAAGCA
CCTTGATGTCGTCTTCTTCAAGGTCGATGTCGATGAATTGAATTCTGTTGCTAAGGATTT
CGAAGTTGAGGCCATGCCGACCTTTGTCTACATGAAGGGTGAAGAGAAGGTCGACAAGGT
GGTCGGTGCTGCGAAAGATGAAATCGTAGCCAAGCTTGAGAAGCACTCTCAAGTTGCTTC
GGCTTGATTTGGTTTATCGTTCTCTTCATAACTATTTACCTAGTAGTGTGTTTGGTGTTT
TTTAATAAAAATCCTTTGTTGCGTTATTGTCACTTTCACTTGAATCATCATCATCTTCCC
TTTGTGTTGGTTTGGTGTGGTGCCTACATGCCTTGGG*TGTG*GAATAAATGTTTGCAGA
CTGTATAACTCGCACGCATCTATGCTAAATTTTCATGTTATTAACT
AAG

QA 3 648 3 648
DS 

RD RS1C176TF 674 0 0
GG
ATTCATCAAAAACAAAATCAAAATCAAACAGAGAGAGAGAAAGAAAGAACAGAGAAAAAA
TGGCCGCACCAGCAGAATTGATCCCAGCAGGAGAAGTGATCGCTTGCCACACCGTTGATG
ACTGGAACAACAAGTTCAAGGCCGCCAAAGAATCCAACAAGCTGATTGTGATAGACTTCA
CAGCAACATGGTGCCCACCTTGCCGTTTCATTGCACCCATCTTCGTCGAGTTGGCTAAGA
AGCACCTTGATGTCGTTTTCTTCAAGGTCGATGTCGATGAATTGAATTCTGTTGCTAAGG
ATTTCGAAGTTGAGGCCATGCCGACCTTTGTCTACATGAAGGGTGAAGAGAAGGTCGACA
AGGTGGTCGGTGCTGCGAAAGATGAAATCGTAGCCAAGCTTGAGAAGCACTCTCAAGTTG
CTTCGGCTTGATTTGGTTTATCGTTCTCTTCATAACTATTTACCTAGTAGTGTGTTTGGT
GTTTTTTAATAAAAATCCTTTGTTGCGTTATTGTCACTTTCACTTGAATCATCATCATCT
TCCCTTTGTGTTGGTTTGGTGTGGTGCCTACATGCCTTGGGGTGTGTGAATAAATGTTTG
CAGACTGTATAACTCGCACGCATCTATGCTAAATTTTCATGTTATTAACTCTTGAGGTTA
TTGTGTTACGAC

QA 3 674 3 674
DS 



AS 1 7

CO CL859Contig1 699 7 7 U
GGACGGACTCATTCCTCTCATGATATTTTCCTTTTAACAACTTATAATTTGATCTATTTC
AAATTAAGTTGAGGGAAAATTAATCATTAAACATGGCAAAAATCTCTTTTGTACTTCTCG
TCGTCGCCCTTATTGTCTTTCTACATGTCTCTGAGGCTCATCGTTCGATAAATTCCAACG
AATTAGTACTAGAAAACAACCTGAATGAAGCCAAGGGCTTGATCGAAGAGGAGTTGAAGA
AAACGGAAAAGAACATTCAGAAGTTGGAAACCGATGTGAGTATATTAAGCAAATCTGAGA
TGATGTTGAAGAAACTCGAAGAAGCTTACAAAAATGGTAAGAGTATAGAGCCTTTCAGAA
AAAATCTCAAGGCATCCGACGATAAGATCGAGCAGGAGCCAGAAGAAGTGAGATACATTT
CCATAATTAAATGCATTTTGAAGGATTTAGGATTAAACGGAGGGAGATGTTGAAACAAGA
TTTAGGGTGTGATGGATGTTGATGCGTTCAAAGGAGGTTTCAATTGGCCCATGGAGTTTG
GCTTTACAACTGAGAGGAGCAAATAATTTGCCCACCGTATATATTAACTAATTGCATCAA
TTGTATACATTTAAACAAAATGCATTACTTATAGTTAATAATGTAATCTATCTTTGTGCT
AACATTTGGTTAATTAGTTATCAACACATTATAATAGCC


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EE36TF U 1
AF RS1GC85JQ C 193
AF RS1G371TF U 2
AF RS1G371JQ C 168
AF RS1GC85TF U 4
AF RS1AQ24TFB U 3
AF RS1AQ24JQ C 124
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RD RS1EE36TF 657 0 0
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AAATTAAGTTGAGGGAAAATTAATCATTAAACATGGCAAAAATCTCTTTTGTACTTCTCG
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AATTAGTACTAGAAAACAACCTGAATGAAGCCAAGGGCTTGATCGAAGAGGAGTTGAAGA
AAACGGAAAAGAACATTCAGAAGTTGGAAACCGATGTGAGTATATTAAGCAAATCTGAGA
TGATGTTGAAGAAACTCGAAGAAGCTTACAAAAATGGTAAGAGTATAGAGCCTTTCAGAA
AAAATCTCAAGGCATCCGACGATAAGATCGAGCAGGAGCCAGAAGAAGTGAGATACATTT
CCATAATTAAATGCACTTTGAAGGATTTAGGATTAAACGGAGGGAGATGTTGAAACAAGA
TTTAGGGTGTGATGGATGTTGATGCGTTCAAAGGAGGTTTCAATTGGCCCATGGAGTTTG
GCTTTACAACTGAGAGGAGCAAATAATTTGCCCACCGTAT*TATTAACTAATTGCATCAA
TTGTATACATTTAAACAAAATGCATTACTTATAGTTAATAATGTAATCTATCTTTGT

QA 1 657 1 657
DS 

RD RS1GC85JQ 455 0 0
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ACATTCAGAAGTTGGAAACCGATGTGAGTATATTAAGCAAATCTGAGATGATGTTGAAGA
AACTCGAAGAAGCTTACAAAAATGGTAAGAGTATAGAGCCTTTCAGAAAAAATCTCAAGG
CATCCGACGATAAGATCGAGCAGGAGCCAGAAGAAGTGAGATACATTTCCATAATTAAAT
GCATTTTGAAGGATTTAGGATTAAACGGAGGGAGATGTTGAAACAAGATTTAGGGTGTGA
TGGATGTTGATGCTTTCAAAGGAGGTTTCAATTGGCCCATGGAGTTTGGCTTTACAACTG
AGAGGAGCAAATAATTTGCCCACCGTATATATTAACTAATTGCATCAATTGTATACATTT
AAACAAAATGCATTACTTATAGTTAATAATGTAAT

QA 1 455 1 455
DS 

RD RS1G371TF 686 0 0
GAC
GGACTCATTCCTCTCATGATATTTTCCTTTTAACAACTTATAATTTGATCTATTTCAAAT
TAAGTTGAGGGAAAATTAATCATTAAACATGGCAAAAATCTCTTTTGTACTTCTCGTCGT
CGCCCTTATTGTCTTTCTACATGTCTCTGAGGCTCATCGTTCGATAAATTCCAACGAATT
AGTACTA*AAAACAACCTGAATGAAGCCAAGGGCTTGATCGAAGAGGAGTTGAAGAAAAC
GGAAAAGAACATTCAGAAGTTGGAAACCGATGTGAGTATATTAAGCAAATCTGAGATGAT
GTTGAAGAAACTCGAAGAAGCTTACAAAAATGGTAAGAGTATAGAGCCTTTCAGAAAAAA
TCTCAAGGCATCCGACGATAAGATCGAGCAGGAGCCAGAAGAAGTGAGATACATTTCCAT
AATTAAATGCATTTTGAAGGATTTAGGATTAAACGGAGGGAGATGTTGAAACAAGATTTA
GGGTGTGATGGATGTTGATGCGTTCAAAGGAGGTTTCAATTGGCCCATGGAGTTTGGCTT
TACAACTGAGAGGAGCAAATAATTTGCCCACCGTATATATTAACTAATTGCATCAATTGT
ATACATTTAAACAAAATGCATTACTTATAGTTAATAATGTAATCTATCTTTGTGCTAACA
TTTGGTTAATTAGTTATCA
ACAC

QA 4 682 4 682
DS 

RD RS1G371JQ 512 0 0
ATAAATTCCAACGAATTAGTACTA*AAAACAACCTGAATGAAGCCAAGGGCTTGATCGAA
GAGGAGTTGAAGAAAACGGAAAAGAACATTCAGAAGTTGGAAACCGATGTGAGTATATTA
AGCAAATCTGAGATGATGTTGAAGAAACTCGAAGAAGCTTACAAAAATGGTAAGAGTATA
GAGCCTTTCAGAAAAAATCTCAAGGCATCCGACGATAAGATCGAGCAGGAGCCAGAAGAA
GTGAGATACATTTCCATAATTAAATGCATTTTGAAGGATTTAGGATTAAACGGAGGGAGA
TGTTGAAACAAGATTTAGGGTGTGATGGATGTTGATGCGTTCAAAGGAGGTTTCAATTGG
CCCATGGAGTTTGGCTTTACAACTGAGAGGAGCAAATAATTTGCCCCCCGTATATATTAA
CTAATTGCATCAATTGTATACATTTAAACAAAATGCATTACTTATAGTTAATAATGTAAT
CTATCTTTGTGCTAACATTTGGTTAATTAGTT

QA 1 512 1 512
DS 

RD RS1GC85TF 682 0 0
G
GGACTCATTCCTCTCATGATATTTTCCTTTTAACAACTTATAATTTGATCTATTTCAAAT
TAAGTTGAGGGAAAATTAATCATTAAACATGGCAAAAATCTCTTTTGTACTTCTCGTCGT
CGCCCTTATTGTCTTTCTACATGTCTCTGAGGCTCATCGTTCGATAAATTCCAACGAATT
AGTACTAGAAAACAACCTGAATGAAGCCAAGGGCTTGATCGAAGAGGAGTTGAAGAAAAC
GGAAAAGAACATTCAGAAGTTGGAAACCGATGTGAGTATATTAAGCAAATCTGAGATGAT
GTTGAAGAAACTCGAAGAAGCTTACAAAAATGGTAAGAGTATAGAGCCTTTCAGAAAAAA
TCTCAAGGCATCCGACGATAAGATCGAGCAGGAGCCAGAAGAAGTGAGATACATTTCCAT
AATTAAATGCATTTTGAAGGATTTAGGATTAAACGGAGGGAGATGTTGAAACAAGATTTA
GGGTGTGATGGATGTTGATGCTTTCAAAGGAGGTTTCAATTGGCCCATGGAGTTTGGCTT
TACAACTGAGAGGAGCAAATAATTTGCCCACCGTATATATTAACTAATTGCATCAATTGT
ATACATTTAAACAAAATGCATTACTTATAGTTAATAATGTAATCTATCTTTGTGCTAACA
TTTGGTTAATTAGTT
ATCAGT

QA 2 676 2 676
DS 

RD RS1AQ24TFB 674 0 0
GG
GGACCCATTCCTCTCATGATATTTTCCTTTTAACAACTTATAATTTGATCTATTTCAAAT
TAAGTTGAGGGAAAATTAATCATTAAACATGGCAAAAATCTCTTTTGTACTTCTCGTCGT
CGCCCTTATTGTCTTTCTACATGTCTCTGAGGCTCATCGTTCGATAAATTCCAACGAATT
AGTACTAGAAAACAACCTGAATGAAGCCAAGGGCTTGATCGAAGAGGAGTTGAAGAAAAC
GGAAAAGAACATTCAGAAGTTGGAAACCGATGTGAGTATATTAAGCAAATCTGAGATGAT
GTTGAAGAAACTCGAAGAAGCTTACAAAAATGGTAAGAGTATAGAGCCTTTCAGAAAAAA
TCTCAAGGCATCCGACGATAAGATCGAGCAGGAGCCAGAAGAAGTGAGATACATTTCCAT
AATTAAATGCATTTTGAAGGATTTAGGATTAAACGGAGGGAGATGTTGAAACAAGATTTA
GGGTGTGATGGATGTTGATGCGTTCAAAGGAGGTTTCAATTGGCCCATGGAGTTTGGCTT
TACAACTGAGAGGAGCAAATAATTTGCCCACCGTATATATTAACTAATTGCATCAATTGT
ATACATTTAAACAAAATGCATTACTTATAGTTAATAATGTAATCTATCTTTGTGCTAACA
TTTGGTTAATTA

QA 3 674 3 674
DS 

RD RS1AQ24JQ 576 0 0
TCGCCCTTATTGTCTTTCTACATGTCTCTGAGGCTCATCGTTCGATAAATTCCAACGAAT
TAGTACTAGAAAACAACCTGAATGAAGCCAAGGGCTTGATCGAAGAGGAGTTGAAGAAAA
CGGAAAAGAACATTCAGAAGTTGGAAACCGATGTGAGTATATTAAGCAAATCTGAGATGA
TGTTGAAGAAACTCGAAGAAGCTTACAAAAATGGTAAGAGTATAGAGCCTTTCAGAAAAA
ATCTCAAGGCATCCGACGATAAGATCGAGCAGGAGCCAGAAGAAGTGAGATACATTTCCA
TAATTAAATGCATTTTGAAGGATTTAGGATTAAACGGAGGGAGATGTTGAAACAAGATTT
AGGGTGTGATGGATGTTGATGCGTTCAAAGGAGGTTTCAATTGGCCCATGGAGTTTGGCT
TTACAACTGAGAGGAGCAAATAATTTGCCCACCGTATATATTAACTAATTGCATCAATTG
TATACATTTAAACAAAATGCATTACTTATAGTTAATAATGTAATCTATCTTTGTGCTAAC
ATTTGGTTAATTAGTTATCAACACATTATAATAGCC

QA 1 576 1 576
DS 



AS 1 6

CO CL860Contig1 960 6 13 U
CATCTTTAAATGCCATAAACACAATTACACATAAACCACACAACATAGCTTTATACAACG
TTACTTTTCCTGCAACAACAACACAAACGCAACATAGCTTTAAGACAATTACTGAATGAT
ACTAAAGGAAGTAAGAGAGCTGTTCCTTCTTCCTGGACCCTCCTTCTCCATACAAATCGT
TCCACTGCTTCAGTTCATTCATTCCTGCTCCTTCTGCTGCAATACTAGCAGAAACCTGGT
TTTTAGCTACTCTCATGTCTTCCATGCTCAAAGCTCTCAGCGTTATCACTCTCTCCTCAG
ATGCTTCTTCTTTTGCTTCATATTCCTCTTCTCGGCTTCCTCTCTCTTTTTCCTCTCCTG
GTCTTTCAAGCACTCATGCTTTATCAGCTCCCTCACAGGTCTATATGCAGCTGTTGTGCA
AAAGTTCTTGATATCACTTCCACTATATAGCTATCTGTCATCTGTGCTAGCTCATGGAAA
TCAAGATTCTCTGTTTTCTCTTTTTGACAGTAAAGTTCTCAAGATCTTCTCTCTGCTCTC
AACTGATGGGAGACCAACCATGATTCTCCCTCACAACAAAAGCTGGAGTTAGTACAACTC
AAGCTCAGGATTTCAAGTAATACAAGGTCCACTTACCTTCGCTCAAACCTCCTAATGATG
GCTTCATCAAGATAAAACGGCCTGTTTGTTGCTGCAAGAACGAGAATCTTATCACCTGGA
GTCGACATAAGCCCGTCCCGAGAGAGAGTGAGATGCGGTGAGAGTGAGATCCGACGAGAG
AGAGAGAGATCCCGCGAGAGAGAGAGA**TCCGGCGAGAAAGAGAGATCCGACGAGAGAG
AGATCCGGCGAGAGAGAGCTCCGGCGAGAGAGAGAGCTCGAGCTTTCATGGAGTTCGAGA
AAGAGAGAGATCCTGAGGCTGACTCTCGACGAAAGTGAAGAAGAGAGAGATACGACTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 10 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 
35 35 35 20 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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TCCACTGCTTCAGTTCATTCATTCCTGCTCCTTCTGCTGCAATACTAGCAGAAACCTGGT
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ATGCTTCTTCTTTTGCTTCATATTCCTCTTCTCGGCTTCCTCTCTCTTTTTCCTCTCCTG
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AACTGATGGGAGACCAACCATGATTCTCCCT

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TAAGAGAGCTGTTCCTTCTTCCTGGACCCTCCTTCTCCATACAAATCGTTCCACTGCTTC
AGTTCATTCATTCCTGCTCCTTCTGCTGCAATACTAGCAGAAACCTGGTTTTTAGCTACT
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TTTGCTTCATATTCCTCTTCTCGGCTTCCTCTCTCTTTTTCCTCTCCTGGTCTTTCAAGC
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TATCACCTCCATTATATAGCTATCTGTCATCTGTGCTAGCTCATGGAAATCAAGATTCTC
TGTTTTCTCTTTTTGACAGTAAAGTTCTCAAGATCTTCTCTCTGCTCTCAACTGATGGGA
GACCAACCATGATTCTCCCTCACAACAAAAGCTGGAGTTAGTACAACTCAAGCTCAGGAT
TTCAAGTAATACAGGGTCCACTTACCTTCGCTCAAACCTCCTAATGATGGCTTCATCAAG
ATAAAACGGCCTGTTTGTTGCTGCAAGAACGAGAATCTTATCACCTGGAGTCGACATAAG
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CCGCGAGAGAGAGAGA

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GCAACAACAACACAAACGCAACATAGCTTTAAGACAATTACTGAATGATACTAAAGGAAG
TAAGAGAGCTGTTCCTTCTTCCTGGACCCTCCTTCTCCATACAAATCGTTCCACTGCTTC
AGTTCATTCATTCCTGCTCCTTCTGCTGCAATACTAGCAGAAACCTGGTTTTTAGCTACT
CTCATGTCTTCCATGCTCAAAGCTCTCAGCGTTATCACTCTCTCCTCAGATGCTTCTTCT
TTTGCTTCATATTCCTCTTCTCGGCTTCCTCTCTCTTTTTCCTCTCCTGGTCTTTCAAGC
ACTCATGCTTTATCAGCTCCCTCACAGGTCTATATGCAGCTGTTGTGCAAAAGTTCTTGA
TATCACTTCCACTATATAGCTATCTGTCATCTGTGCTAGCTCATGGAAATCAAGATTCTC
TGTTTTCTCTTTTTGACAGTAAAGTTCTCAAGATCTTCTCTCTGCTCTCAACTGATGGGA
GACCAACCATGATTCTCCCTCACAACAAAAGCTGGAGTTAGTACAACTCAAGCTCAGGAT
TTCAAGTAATACAAGGTCCACTTACCTTCGCTCAAACCTCCTAATGATGGCTTCATCAAG
ATAAAACGGCCTGTTTGTTGCTGCAAGAACGAGAATCTTATTACCTGGAGTCGACATAAG
CCCGTCCCGAGAGAGAGTGAGATGCGGTGAGAGTGAGATCCGACGAGAGAGAGAGA

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GATGCTTCTTCTTT*GCTTCATATTCCTCTTCTCGGCTTCCTCTCTCTTTTTCCTCTCCT
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AAAAGTTCTTGATATCACCTCCATTATATAGCTATCTGTCATCTGTGCTAGCTCATGGAA
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CAAGCTCAGGATTTCAAGTAATACAGGGTCCACTTACCTTCGCTCAAACCTCCTAATGAT
GGCTTCATCAAGATAAAACGGCCTGTTTGTTGCTGCAAGAACGAGAATCTTATCACCTGG
AGTCGACATAAGCCCGTCCCGAGAGAGAGTGAGATGCGGTGAGAGTGAGATCCGACGAGA
GAGAGAGAGATCCCGCGAGAGAGAGAGA**TCCGGCGAGAAAGAGAGATCCGACGAGAGA
GAGATCCGGCGAGAGAGAGCTCCGGCGAGAGAGAGAGCTCGAGCTTTCATGGAGTTCGAG
AAAGAGAGAGATCCTGAGGCTGTCTCTCGACGAAAGTGAAGAAGAGAGAGATACGACTTC
C

QA 1 781 1 781
DS 

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GATGCTTCTTCTTTTGCTTCATATTCCTCTTCTCGGCTTCCTCTCTCTTTTTCCTCTCCT
GGTCTTTCAAGCACTCATGCTTTATCAGCTCCCTCACAGGTCTATATGCAGCTGTTG**C
AAAAGTTCTTGATATCACTTCCACTATATAGCTATCTGTCATCTGTGCTAGCTCATGGAA
ATCAAGATTCTCTATT**CTCTTTTTGACAGTAAAGTTCTCAAGATCTTCTCTCTGCTCT
CAACTGATGGGAGACCAACCATGATTCTCCCTCACAACAAAAGCTGGAGTTAGTACAACT
CAAGCTCAGGATTTCAAGTAATACAAGGTCCACTTACCTTCGCTCAAACCTCCTAATGAT
GGCTTCATCAAGATAAAACGGCCTGTTTGTTGCTGCAAGAACGAGAGTCTTATCACCTGG
AGTCGACATAAGCCCGTCCCGAGAGAGAGTGAGATGCGGTGAGAGTGAGATCCGACGAGA
GAGAGAGAGATCCCGCGAGAGAGAGAGAGATCCGGCGAGAAAGAGAGATCCGACGAGAGA
GAGATCCGGCGAGAGAGAGCTCCGGCGAGAGAGAGAGCTCGAGCTTTCATGGAGTTCGAG
AAAGAGAGAGATCCT
CC

QA 1 675 1 675
DS 

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TCTTCTTTTGCTTCATATTCCTCTTCTCGGCTTCCTCTCTCTTTTTCCTCTCCTGGTCTT
TCAAGCACTCATGCTTTATCAGCTCCCTCACAGGTCTATATGCAGCTGTTGTGCAAAAGT
TCTTGATATCACTTCCACTATATAGCTATCTGTCATCTGTGCTAGCTCATGGAAATCAAG
ATTCTCTGTTTTCTCTTTTTGACAGTAAAGTTCTCAAGATCTTCTCTCTGCTCTCAACTG
ATGGGAGACCAACCATGATTCTCCCTCACAACAAAAGCTGGAGTTAGTACAACTCAAGCT
CAGGATTTCAAGTAATACAAGGTCCACTTACCTTCGCTCAAACCTCCTAATGATGGCTTC
ATCAAGATAAAACGGCCTGTTTGTTGCTGCAAGAACGAGAATCTTATTACCTGGAGTCGA
CATAAGCCCGTCCCGAGAGAGAGTGAGATGCGGTGAGAGTGAGATCCGACGAGAGAGAGA
GA**TCCCGCGAGAGAGAGAGA**TCCGGCGAGAAAGAGAGATCCGACGAGAGAGAGATC
CGGCGAGAGAGAGCTCCGGCGAGAGAGAGAGCTCGAGCTTTCATGGAGTTCGAGAAAGAG
AGAGATCCTGAGGCTGACTCTCGACGAAAGT
CCT

QA 1 691 1 691
DS 



AS 2 6

CO CL861Contig1 1153 2 2 U
CAATATTCAACTTGTGTTCTTAATTTCATGGCTTCCAAACACAGGGTGAAGAGTTTAACA
AGCTGATCGAAGAGAGCAACGTTTAAAAAAAAAACGAGAATCTTAATAGAGTGAATACCA
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ATAGTGTAGCTCCCCGACATCATCTCCTGACAGTTTCGTCCATCCATTAGGACCCACGTG
GTACACGCTAGCAACACCACCACTGGCTCCATCACGGAATGTAGCATGGTAGATTGATCT
CCTTGCTAACTCGGAAGCTTCATCAACTGACATATCGAACTTGTACCCGCTGTCTAGTAC
ACCGTAAGCGTATGGTGAACCGGAACAGACTGAGAACCTGTCTCCCTTGAGCCTTCCTCC
TTCGTTGTCCACATAGTATAGTCCAGGACCAGTTTCGTCCCATCCAGCGATCATGGTGCC
GACGGAAAGTCCCATTCCACGGTATGAGTAGAGCATGTTTGCGAGAAGTTTTGAAGCTCC
CGAAACAGAGATTCTCCGCTTGTTTGCCAGCTCATGCAGACGGCACTTAATTCCAAGATT
CCTGTGCCAGAATTGGCAGTCAGCAGCTCCTCCAGCCATTGTACCAAGCATATAAGGATT
GATTTCAATAATCTTCTTCACGGATTGTGAGGAAATATATCCACCCATACTAGCACGAGA
ATCAGCAGCGACCATGACACCTTCTTTGAAGATAAAAGCAAGTGTGGTTGTTCCTTTCGC
TGGCTTCACCATCTGTACTGCTTCTTTCTGAAACCCATCAAAATCTGTGGTCCGGGGAAG
ATCAAAGGAGGGCACAGTAGAAAACCCATCAAGCATGTCGCTGCTAGAGCCGAAGCCAAT
CGTAGGCATGGAGGTCTCGAACCCACTCGTATCAAGCTTCATTGTTAAAACCCTTTAACG
TTATTGACAAGACAAGTTAACGATGCTCGAGCTCGATTAGGGACCGGAAACGCACCTTGC
TGAAGAAAAGTTATCAAATTGAAGCGAGAAGAAGAAGATGAATAAGCTCTAAGTGACAAA
CGAAGAGGAGACC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D946JQ U 1
AF RS1CU05TF C 462
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AGCTGATCGAAGAGAGCAACGTTTAAAAAAAAAACGAGAATCTTAATAGAGTGAATACCA
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CTCGGCAGCTGCTTCCTCCATGACTCGTTCCGCAATTGCTGGTGGCACGGGGTAGTAGTG
ATAGTGTAGCTCCCCGACATCATCTCCTGACAGTTTCGTCCATCCATTAGGACCCACGTG
GTACACGCTAGCAACACCACCACTGGCTCCATCACGGAATGTAGCATGGTAGATTGATCT
CCTTGCTAACTCGGAAGCTTCATCAACTGACATATCGAACTTGTACCCGCTGTCTAGTAC
ACCGTAAGCGTATGGTGAACCGGAACAGACTGAGAACCTGTCTCCCTTGAGCCTTCCTCC
TTCGTTGTCCACATAGTATAGTCCAGGACCAGTTTCGTCCCATCCAGCGATCATGGTGCC
GACGGAAAGTCCCATTCCACGGTATGAGTAGAGCATGTTTGCGAGAAGTTT
CGAA

QA 1 591 1 591
DS 

RD RS1CU05TF 692 0 0
CTCCCTTGAGC*TTCCTCTTTCGTTGTCCACATAGTATAGTCCAGGACCAGTTTCGTCCC
ATCCAGCGATCATGGTGCCGACGGAAAGTCCCATTCCACGGTATGAGTAGAGCATGTTTG
CGAGAAGTTTTGAAGCTCCCGAAACAGAGATTCTCCGCTTGTTTGCCAGCTCATGCAGAC
GGCACTTAATTCCAAGATTCCTGTGCCAGAATTGGCAGTCAGCAGCTCCTCCAGCCATTG
TACCAAGCATATAAGGATTGATTTCAATAATCTTCTTCACGGATTGTGAGGAAATATATC
CACCCATACTAGCACGAGAATCAGCAGCGACCATGACACCTTCTTTGAAGATAAAAGCAA
GTGTGGTTGTTCCTTTCGCTGGCTTCACCATCTGTACTGCTTCTTTCTGAAACCCATCAA
AATCTGTGGTCCGGGGAAGATCAAAGGAGGGCACAGTAGAAAACCCATCAAGCATGTCGC
TGCTAGAGCCGAAGCCAATCGTAGGCATGGAGGTCTCGAACCCACTCGTATCAAGCTTCA
TTGTTAAAACCCTTTAACGTTATTGACAAGACAAGTTAACGATGCTCGAGCTCGATTAGG
GACCGGAAACGCACCTTGCTGAAGAAAAGTTATCAAATTGAAGCGAGAAGAAGAAGATGA
ATAAGCTCTAAGTGACAAACGAAGAGGAGACC

QA 1 692 1 692
DS 



CO CL861Contig2 1103 4 13 U
GAGGTCACTTAGAGCTTATTCATCTTCTTCTTCTCGCTTCAATTTGATAACTTTTCTTCA
GCAAGGGTTTTAACAATGAAGCTTGATACGAGTGGGTTCGAGACCTCCATGCCTACGATT
GGCTTCGGATCTAGCAACGACATGCTTGATGGGTTTTCTACTGTGCCCTCCTTTGATCTT
CCCCGGACCACAGATTTTGATGGGTTTCAGAAAGAAGCAGTACAGATGGTGAAGCCAGCG
AAAGGAACAACCACACTTGCTTTTATCTTCAAAGAAGGTGTCATGGTCGCTGCTGATTCT
CGTGCTAGTATGGGTGGATATATTTCCTCACAATCCGTGAAGAAGATTATTGAAATCAAT
CCTTATATGCTTGGTACAATGGCTGGAGGAGCTGCTGACTGCCAATTCTGGCACAGGAAT
CTTGGAATTAAGTGCCGTCTGCATGAGCTGGCAAACAAGAGGAGAATCTCTGTTTCGGGA
GCTTCAAAACTTCTCGCAAACATGCTCTACTCATACCGTGGAATGGGACTTTCCGTCGGC
ACCATGATCGCTGGATGGGACGAAACTGGTCCTGGACTATACTATGTGGACAACGAAGGA
GGAAGGCTCAAGGGAGACAGGTTCTCAGTCGGTTCCGGTTCACCATACGCTTACGGTGTA
CTAGACAGCGGGTACAAGTTCGATATGTCAGTTGAAGAAGCTTCCGAGTTAGCAAGGAGA
TCAATCTACCATGCTACATTCCGTGATGGAGCCAGTGGTGGTGTTGCTAGCGTTTACCAC
GTGGGTCCTAATGGATGGACGAAACTGTCAGGAGATGATGTCGGGGAGCTACACTATCAC
TACTACCCCGTGCCACCAGCCATTGCCGAACAAGTTATGGAGGAAGCAGCTGCCGAGTAA
AACTAAGATTCTCTTTTGCTTCCAAATCATTTCACTCCATTTCTCTAGCTTAAGCTGTGT
GGTATTCACCCTATTAAGATTCTCCTTTTTTTTTTCTTCTTTAAACATTGCTCTCTTCGA
TCAGCTTGTTAAACTCTTCACCCTGTGTTCCCAACCCATGAAATTAAGAACACAAGTTGA
ATATTATTAAAAGAATGTTTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D946TF U 16
AF RS1F558TF U 1
AF RS1AK27JQ C 216
AF RS1CU05JQ C 247
BS 1 128 RS1F558TF
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RD RS1D946TF 580 0 0
GGC
TTCATCTTCTTCTTCTCGCTTCAATTTGATAACTTTTCTTCAGCAAGGGTTTTAACAATG
AAGCTTGATACGAGTGGGTTCGAGACTTCCATGCCTACGATTGGCTTCGGATGTAGCAAC
GACATGCTTGATGGGTTTTCTACTGTGCCCTCCTTTGATCTTCCCCGGACCACAGATTTT
GATGGGTTTCAGAAAGAAGCAGTACAGATGGTGAAGCCAGCGAAAGGAACAACCACACTT
GCTTTTATCTTCAAAGAAGGTGTCATGGTCGCTGCAGATTCCCGTGCTAGCATGGGTGGA
TATATCTCCTCGCAATCCGTGAAGAAGATTATTGAAATCAATCCTTATATGCTTGGTACA
ATGGCTGGAGGAGCTGCTGACTGCCAATTCTGGCACAGGAATCTTGGAATTAAGTGCCGT
CTGCATGAGCTGGCAAACAAGAGGAGAATTTCTGTTTCCGGAGCTTCGAAACTTCTCGCA
AACATGCTCTACTCATACCGTGGAATGGGACTTTCCGTCGGCACCATGATCGCTGGATGG
GACGAAACTGGTCCTGGACTATACTATGTGGACAACG

QA 4 580 4 580
DS 

RD RS1F558TF 809 0 0
GAGGTCACTTAGAGCTTATTCATCTTCTTCTTCTCGCTTCAATTTGATAACTTTTCTTCA
GCAAGGGTTTTAACAATGAAGCTTGATACGAGTGGGTTCGAGACCTCCATGCCTACGATT
GGCTTCGGCTCTAGCAGCGACATGCTTGATGGGTTTTCTACTGTGCCCTCCTTTGATCTT
CCCCGGACCACAGATTTTGATGGGTTTCAGAAAGAAGCAGTACAGATGGTGAAGCCAGCG
AAAGGAACAACCACACTTGTTTTTATCTTCAAAGAAGGTGTCATGGTCGCTGCTGATTCT
CGTGCTAGTATGGGTGGATATATTTCCTCACAATCCGTGAAGAAGATTATTGAAATCAAT
CCTTATATGCTTGGTACAATGGCTGGAGGAGCTGCTGACTGCCAATTCTGGCACAGGAAT
CTTGGAATTAAGTGCCGTCTGCATGAGCTGGCAAACAAGAGGAGAATCTCTGTTTCGGGA
GCTTCAAAACTTCTCGCAAACATGCTCTACTCATACCGTGGAATGGGACTTTCCGTCGGC
ACCATGATCGCTGGATGGGACGAAACTGGTCCTGGACTATACTATGTGGACAACGAAGGA
GGAAGGCTCAAGGGAGACAGGTTCTCAGTCGGTTCCGGTTCACCATACGCTTACGGTGTA
CTAGACAGCGGGTACAAGTTCGATATGTCAGTTGAAGAAGCTTCCGAGTTAGCAAGGAGA
TCAATCTACCATGCTACATTCCGTGACGGAGCCAGTGGTGGTGTTGCTAGCGTTTACCAC
GTGGGTCCTAATGGATGGACGAAACTGTC

QA 1 809 1 809
DS 

RD RS1AK27JQ 870 0 0
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AGGTGTCATGGTCGCTGCTGATTCTCGTGCTAGTATGGGTGGATATATTTCCTCACAATC
CGTGAAGAAGATTATTGAAATCAATCCTTATATGCTTGGTACAATGGCTGGAGGAGCTGC
TGACTGCCAATTCTGGCACAGGAATCTTGGAATTAAGTGCCGTCTGCATGAGCTGGCAAA
TAAGAGGAGAATCTCTGTTTCGGGAGCTTCAAAACTTCTCGCAAACATGCTCTACTCATA
CCGTGGAATGGGACTTTCCGTCGGCACCATGATCGCTGGATGGGACGAAACTGGTCCTGG
ACTATACTATGTGGACAACGAAGGAGGAAGGCTCAAGGGAGACAGGTTCTCAGTCGGTTC
CGGTTCACCATACGCTTACGGTGTACTAGACAGCGGGTACAAGTTCGATATGTCAGTTGA
AGAAGCTTCCGAGTTAGCAAGGAGATCAATCTACCATGCTACATTCCGTGATGGAGCCAG
TGGTGGTGTTGCTAGCGTTTACCACGTGGGTCCTAATGGATGGACGAAACTGTCAGGAGA
TGATGTCGGGGAGCTACACTATCACTACTACCCCGTGCCACCAGCCATTGCCGAACAAGT
TATGGAGGAAGCAGCTGCCGAGTAAAACTAAGATTCTCTTTTGCTTCCAAATCATTTCAC
TCCATTTCTCTAGCTTAAGCTGTGTGGTATTCACCCTATTAAGATTCTCCTTTTTTT**T
CTTCTTTAAACATTGCTCTCTTCGATCAGCTTGTTAAACTCTTCACCCTGTGTTCCCAAC
CCATGAAATTAAGAACACAAGTTGAATATT

QA 1 870 1 870
DS 

RD RS1CU05JQ 857 0 0
ACAACCACACTTGCTTT*ATCT*CAAAGAAGGTGTCATGGTCGCTGCTGAT*CTCGTGCT
AGTATGGGTGGATATATTTCCTCACAATCCGTGAAGAAGATTATTGAAATCAATCCTTAT
ATGCTTGGTACAATGGCTGGAGGAGCTGCTGACTGCCAATTCTGGCACAGGAATCTTGGA
ATTAAGTGCCGTCTGCATGAGCTGGCAAACAAGCGGAGAATCTCTGTTTCGGGAGCTTCA
AAACTTCTCGCAAACATGCTCTACTCATACCGTGGAATGGGACTTTCCGTCGGCACCATG
ATCGCTGGATGGGACGAAACTGGTCCTGGACTATACTATGTGGACAACGAAGGAGGAAGG
CTCAAGGGAGACAGGTTCTCAGTCGGTTCCGGTTCACCATACGCTTACGGTGTACTAGAC
AGCGGGTACAAGTTCGATATGTCAGTTGAAGAAGCTTCCGAGTTAGCAAGGAGATCAATC
TACCATGCTACATTCCGTGATGGAGCCAGTGGTGGTGTTGCTAGCGTTTACCACGTGGGT
CCTAATGGATGGACGAAACTGTCAGGAGATGATGTCGGGGAGCTACACTATCACTACTAC
CCCGTGCCACCAGCCATTGCCGAACAAGTTATGGAGGAAGCAGCTGCCGAGTAAAACTAA
GATTCTCTTTTGCTTCCAAATCATTTCACTCCATTTCTCTAGCTTAAGCTGTGTGGTATT
CACTCTATTAAGATTCTCCTTTTTTTTTTCTTCTTTAAACATTGCTCTCTTCGATCAGCT
TGTTAAACTCTTCACCCTGTGTTTCCAACCCATGAAATTAAGAACACAAGTTGAATATTA
TTAAAAGAATGTTTGGT

QA 1 857 1 857
DS 



AS 1 2

CO CL862Contig1 1083 2 10 U
GGAAGATCTCTGTTTCAGGCACATAATAATCGTGACAAAAGATGTCGTCAGGATCCGACA
AAGAGAGAGACATTCGTCTACACGGCAAAGCTCTCCGAACAAGCCGAGCGATACGACGAG
ATGGTTGAGACGATGAAGAAAGTGGCGAAAGTGGACAGCGAGCTGACGGTGGAGGAGAGG
AATCTGTTGTCCGTTGGGTACAAGAACGTGATCGGAGCAAGAAGGGCCTCGTGGAGGATC
ATGTCGTCGATTGAGCAGAAGGAAGAGTCTAAAGGCAACGAGACAAACGTGAAACACATC
AAGGGTTATCGTCAGAAGGTGGAAGATGAGCTCGCTGACATATGTAAAGACATTCTTTCC
ATCATTGATGAGCATCTCATCCCTCACGCTACCTCTGGTGAAGCCACTGTTTTCTATTAC
AAGATGAAAGGAGATTATTACCGTTACTTGGCTGAGTTTAAGACTGAGCAAGAGAGGAAG
GAAGCTTCTGAACAGTCTCTTAAAGGCTATGAGGCTGCAACACAAGCTGCAAGCACTGAC
CTTCCTTCGACCCACCCGATTCGTCTTGGTCTTGCTCTTAACTTCTCTGTTTTCTACTAT
GAGATCATGAACTCTCCTGAAAGAGCTTGCCATTTGGCGAAGCAAGCCTTCGATGAGGCG
ATTGCAGAGTTGGATACTCTAAGCGAGGAGTCGTACAAGGACAGCACTTTGATCATTCAG
CTCCTGAGAGACAATCTCACCCTCTGGACTTCTGATCTTCCTGAAGATGGAGGAGAAGAC
AACGTCAAGTCGTCTGATGAACCCAATCAAGAACATTGCAAGATCATAGAAGCCACTGAT
AAATGATCAGAGGCTTTGGAAGTTGAATGAGTTTAGATTAAACTCCATATAGCTTGGTTT
TATCAAGAGATGGGATCAGAGATAACTGAATTTAAATTTTCGTTATTTTTAATTAACTTT
TTTGTTTTTTCTTTTGTTGACAATCTCATGATATCAAATATGTTTTCTGTTACGCATTTT
TATATTATGCCTTGATCTGTGATATGTTTTGACTATTTATAATACACAAAGCAATCAACT
GTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1AF17TF U 1
AF RS1AF17JQ C 190
BS 1 699 RS1AF17TF
BS 700 700 RS1AF17JQ
BS 701 781 RS1AF17TF
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BS 822 860 RS1AF17TF
BS 861 1083 RS1AF17JQ

RD RS1AF17TF 869 0 0
GGAAGATCTCTGTTTCAGGCACATAATAATCGTGACAAAAGATGTCGTCAGGATCCGACA
AAGAGAGAGACATTCGTCTACACGGCAAAGCTCTCCGAACAAGCCGAGCGATACGACGAG
ATGGTTGAGACGATGAAGAAAGTGGCGAAAGTGGACAGCGAGCTGACGGTGGAGGAGAGG
AATCTGTTGTCCGTTGGGTACAAGAACGTGATCGGAGCAAGAAGGGCCTCGTGGAGGATC
ATGTCGTCGATTGAGCAGAAGGAAGAGTCTAAAGGCAACGAGACAAACGTGAAACACATC
AAGGGTTATCGTCAGAAGGTGGAAGATGAGCTCGCTGACATATGTAAAGACATTCTTTCC
ATCATTGATGAGCATCTCATCCCTCACGCTACCTCTGGTGAAGCCACTGTTTTCTATTAC
AAGATGAAAGGAGATTATTACCGTTACTTGGCTGAGTTTAAGACTGAGCAAGAGAGGAAG
GAAGCTTCTGAACAGTCTCTTAAAGGCTATGAGGCTGCAACACAAGCTGCAAGCACTGAC
CTTCCTTCGACCCACCCGATTCGTCTTGGTCTTGCTCTTAACTTCTCTGTTTTCTACTAT
GAGATCATGAACTCTCCTGAAAGAGCTTGCCATTTGGCGAAGCAAGCCTTCGATGAGGCG
ATTGCAGAGTTGGATACTCTAAGCGAGGAGTCGTACAAG*ACAGCACTTTGATCATTCAG
CTCCTGAGAGACAATCTCACCCTCTGGACTTCTGATCTTCCTGAAGATGGAGGAGAAGAC
A*CGTCAAGTCGTCTGATGAACCCAATCAAGA*CATTGCA*GATCATAGAAGCCACTGAT
AAATGATCAGAGGCTTTGGA
GTTGATGAG

QA 1 860 1 860
DS 

RD RS1AF17JQ 894 0 0
TCCGTTGGGTACAAGAACGTGATCGGAGCAAGAAGGGCCTCGTGGAGGATCATGTCGTCG
ATTGAGCAGAAGGAAGAGTCTAAAGGCAACGAGACAAACGTGAAACACATCAAGGGTTAT
CGTCAGAAGGTGGAAGATGAGCTCGCTGACATATGTAAAGACATTCTTTCCATCATTGAT
GAGCATCTCATCCCTCACGCTACCTCTGGTGAAGCCACTGTTTTCTATTACAAGATGAAA
GGAGATTATTACCGTTACTTGGCTGAGTTTAAGACTGAGCAAGAGAGGAAGGAAGCTTCT
GAACAGTCTCTTAAAGGCTATGAGGCTGCAACACAAGCTGCAAGCACTGACCTTCCTTCG
ACCCACCCGATTCGTCTTGGTCTTGCTCTTAACTTCTCTGTTTTCTACTATGAGATCATG
AACTCTCCTGAAAGAGCTTGCCATTTGGCGAAGCAAGCCTTCGATGAGGCGATTGCAGAG
TTGGATACTCTAAGCGAGGAGTCGTACAAGGACAGCACTTTGATCATTCAGCTCCTGAGA
GACAATCTCACCCTCTGGACTTCTGATCTTCCTGAAGATGGAGGAGAAGACAACGTCAAG
TCGTCTGATGAACCCAATCAAGAACATTGCAAGATCATAGAAGCCACTGATAAATGATCA
GAGGCTTTGGAAGTTGAATGAGTTTAGATTAAACTCCATATAGCTTGGTTTTATCAAGAG
ATGGGATCAGAGATAACTGAATTTAAATTTTCGTTATTTTTAATTAACTTTTTTGTTTTT
TCTTTTGTTGACAATCTCATGATATCAAATATGTTTTCTGTTACGCATTTTTATATTATG
CCTTGATCTGTGATATGTTTTGACTATTTATAATACACAAAGCAATCAACTGTA

QA 1 894 1 894
DS 



AS 1 7

CO CL863Contig1 704 7 25 U
TTTTTCGCCGCTCCAGATTTTGTGGAAAGGATCTGACTTTTGAGTAATGGCTCCAGCTAA
AGTTGATGTAACCAAGAAGGCTGACCCAAAGGCCAAGGCCTTGAAAGCTGCGAAAGCGGT
GAAATCAGGGCAAATCATTAAGAAGAAGGTGAAGAAGATCAGGACAAAGGTGACATTCCA
CAGGCCAAAGACATTGACAAAGGCTAGAGACCCCAAGTACCCACGCATCAGTGCAACTCC
AAGGAACAAGTTGGACCATTACGGAATCCTCAAGTACCCACTCACCACCGAGTCTGCCAT
GAAGAAGATCGAAGACAACAACACCTTGGTCTTTATTGTTGATATCCGTGCTGACAAGAA
GAAGATCAAAGATGCTGTCAAGAAGATGTATGACATTCAGACCAAGAAAGTCAACACACT
CATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAGGCGTACGTGAGATTGACTCCTGATTATGATGCTTT
GGACGTTGCTAACAAAATTGGAATCATCTAAGTTAATTATCATACCATCTGAGCTGTCAT
TTTACATTTGGAGTTTGAAAACAGGGTCTTGTCTTAGTCTCAGTTTTGCTAGAAAAAAGG
ATAATCTCTTTGTTGTGCTTTATCGTTGGGATTCTAAGCTATGTTTTGGTATTTATTTCT
CATCTTGTTCCCCAATTCGATTTAAGTAGTACCATTTCTGTTCC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 10 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GJ64TF U 1
AF RS1DI37JQ C 113
AF RS1GI06TF U -2
AF RS1DI37TF U 1
AF RS1CX06JQ C 1
AF RS1CX06TF U 1
AF RS1GJ64JQ C 531
BS 1 13 RS1GJ64TF
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BS 52 52 RS1GJ64TF
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BS 73 73 RS1GJ64TF
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BS 150 150 RS1GJ64TF
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BS 166 166 RS1GJ64TF
BS 167 258 RS1GI06TF
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BS 260 333 RS1GI06TF
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BS 335 483 RS1GI06TF
BS 484 484 RS1GJ64TF
BS 485 520 RS1GI06TF
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BS 655 704 RS1GJ64JQ

RD RS1GJ64TF 521 0 0
TTTTTCGCCGCTCCAGATTTTGTGGAAAGGATCTGACTTTTGAGTAATGGCTCCAGCTAA
AGTTGATGTAACCAAGAAGGCTGACCCAAAGGCCAAGGCCTTGAAAGCTGCGAAAGCGGT
GAAATCAGGGCAAATCATTAAGAAGAAGGTGAAGAAGATCAGGACAAAGGTGGCATTCCA
CAGGCCAATGACATTGACAAAGGCTAGAGACCCCAAGTACCCACGCATCAGTGCAACTCC
AAGGAACAAGTTGGACCATTACGGAATCCTCAAGTACCCACTCACCACCGAGTCTGCCAT
GAAGAAGATCGAAGACAACAACACCTTGGTCTTTATTGTTGATATCCGTGCTGACAAGAA
GAAGATCAAAGATGCTGTCAAGAAGATGTATGACATTCAGACCAAGAAAGTCAACACACT
CATCAGGCCTGATGGAACGAAGAAAGCGTACGTGAGATTGACTCCTGATTATGATGCTTT
GGACGTTGCTAACAAAATTGGAATCATCTAAGTTAATTATC

QA 1 521 1 521
DS 

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GATGCTTTGGACGTTGCTAACAAAATTGGAATCATCTAAGTTAATTATCATAC

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DS 

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AAAATTGGAATCATCTAAGTTAATTATTATACCATCTGAGCTGTCATTTTACATTTGGAG
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DS 

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GAAGATCAAAGATGCTGTCAAGAAGATGTATGACATTCAGACCAAGAAAGTCAACACACT
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TTTACATTTGGAGTTTGAAAACAGGGTCTTGTCTTAGTCTCAGTTTTGCTAGAAAAAAGG
ATAATCTCTTTGTTGTGCTTTATCGTTGGGATTCTAAGCTATGTTTTGGTATTT

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AGAAAAAAGGATAATCTCTTTGTTGTGCTTTATCGTTGGGATTTTAAGCTATGTTTTGGT
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QA 1 174 1 174
DS 



AS 1 5

CO CL864Contig1 1532 5 8 U
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CGTTGCGGTGCTCTTGCATTGTGATGTCTGGATCGTGTAGCACATCATCATAGTTCCCTC
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ATTCAGTGGGTTGGCCAAATCATCAACAGATATATAGAGATCTTTGTCCCTTCGTTGCTC
AGCCTCAGGGGTTGTGTTAATCACTCTGCCAGTATTGGAAGCAGAGACCAACTCATTGGA
GTTATTACCGTACAAACTGTCTCCGTCAGCACCCTTGTACATTACTTGGCAGATAACATA
GTTCCTCTGAGTAGGAGGCAAGGACGTGATGTGATACTCGTGCATGACCCAAGGAGTCCA
AACACCATTAGCTGATTTACCATGATGGTACACAAGTGTCTTCTTGATCCCAATCTCCAC
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GAAGTACCATACAAGATCCTTTGATTCCAGCTTCGATAACGAAGGCAAGAACTCTGGATC
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AATACAAACACTAGTAGACCGTGAGAGGGTCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E265JQ U 1
AF RS1D167JQ U 1
AF RS1CV47JQ U 35
AF RS1CV47TF C 459
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RD RS1E265JQ 630 0 0
CA
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QA 3 630 3 630
DS 

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TCATGAGATAGATATACGGTGGATTCTTGCGGTTTCTTCCGTCCACTGGCTCCTCTGTAA
TAAACCAGCCCATCTTCTCTGTCTTCAACATAGATAATGATGATGATGAATTCTTCTCCA
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GCCGAGATTTCCGGGTCTTTCCATTAATAGAAGTTTCTGCGGGAAGTTGAATATCTGTGA
CAGAGTCTTTCCTCAAAGATGGAATCTCGTCTGCACTAGAGTGGAACTTCCCACTCAAAC
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CATCGCTGTCACTGCTACAACCAACAATGATCCCTGTCAAAGCTTTCTTTGGCCTGTGAT
CGTTGCGGTGCTCTTGCATTGTGATGTCTGGATCGTGTAGCACATCATCATAGTTCCCTC
CGTTAAAACT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RS1CV47JQ 745 0 0
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AAAAGCCAAATAAAAACAAGTTCTTCCATCTACTATGCCACTCCTCGCAATCAAACTTCA
CCAGCAGTTTCAAGTTTTGACGCTTTGTAAAACGGATATGATGTTGCTAATGACAGCCAT
CAAGAGGATGAAGCCTATGATCATGTTCATGAAATAGATATACGGTGGATTCTTGCGGTT
TCTTCCGTCCACTGGCTCCTCTGTAATAAACCAGCCCATCTTCTCTGTCTTCAACATAAA
TAATGATGATGATGAATTCTTCTCCATGGATGCATTAATGACTTTAGACTTGCCTTCTTT
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TTCTGCGGGAAGTTGAATATCTGTGACAGAGTCTTTCCTCAAAGATGGAATCTCGTCTGC
ACTAAAGTGGAACTTCCCACTCAAACTATGAAAGCTATCTGGACTTGATGTTCCTTGGTA
ACTCGTTGCAAATATGGATTCAGCATCATCGCTGTCACTGCTACAACCAACAATGATCCC
TGTCAAAGCTTTCTTTGGCCTGTGATCGTTGCGGTGCTCTTGCATTGTGATGTCTGGATC
GTGTAGCACATCATCATAGTTCCCTCCGTTAAAACTCAGCAGTTCATTGATATAATCATC
ATCCCAGGGAGCTTGCGGCTGCTGG

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DS 

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GCGGGAAGTTGAATATCTGTGACAGAGTCTT*CCTCAAAGATGGAATCTCGTCTGCACTA
GAGTGGAACTTCCCACTCAAACTATGAAAGCTATCTGGACTTGATGTTCCTTGGTAACTC
GTTGCAGATATGGATTCAGCATCATCGCTGTCACTGCTACAACCAACAATGATCCCTGTC
AAAGCTTTCTTTGGCCTGTGATCGTTGCGGTGCTCTTGCATTGTGATGTCTGGATCGTGT
AGCACATCATCATAGTTCCCTCCGTTAAAACTCAGCAGTTCATTGATATAATCATCATCC
CAGGGAGCTTGCGGCTGCTGGTAAGGGCAGTAGCTGTCGTTGAAAAACGTGTCTGGATTG
AATAGAGAGACATCATCCTGCTATTCAGTGGGTTGGCCAAATCATCAACAGATATATAGA
GATCTTTGTCCCTTCGTTGCTCAGCCTCAGGGGTTGTGTTAATCACTCTGCCAGTATTGG
AAGCAGAGACCAACTCATTGGAGTTATTACCGTACAAACTGTCTCCGTCAGCACCCTTGT
ACATTACTTGGCAGATAACATAGTTCCTCTGAGTAGGAGGCAAGGACGTGATGTGATACT
CGTGCATGACCCAAGGAGTCCAAACACCATTAGCTGATTTACCATGATGGTACACAAGTG
TCTTCTTGATCCCAATCTCCACACCATTCCCTC

QA 1 693 1 693
DS 

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AGCAGAGACCAACTCATTGGAGTTATTACCGTACAAACTGTCTCCGTCAGCACCCTTGTA
CATTACTTGGCAGATAACATAGTTCCTCTGAGTAGGAGGCAAGGACGTGATGTGATACTC
GTGCATGACCCAAGGAGTCCAAACACCATTAGCTGATTTACCATGATGGTACACAAGTGT
CTTCTTGATCCCAATCTCCACACCATTCCCTCTTTTATCCTTGACCTTCCGATCAACACC
AGTAGCTTTCCAATACCCAGAAGGCGTTGTCCTCTTGGTTCCCTTCTTCTTCTCAGATGC
GTGGTACTCCCTGGGAGTGAAGAAGTACCATACAAGATCCTTTGATTCCAGCTTCGATAA
CGAAGGCAAGAACTCTGGATCGTAAGCACAGATGTTGATCTCGTTAATGGCTTCGTTGAC
GAGCCATGGTTTATCAAGAATCTTGTTCTTGAGGTAATAGTTGATCACTTCCTCTCCCGT
AGGACTAAACCTATATCCCACGAGATTCCTCTCCATTTTTACACACGATCTAGGGTTTGC
TCTCTGTTTTTTTTTTTTTGAAATACAAACACTAGTAGACCGTGAGAGGGTCC

QA 1 593 1 593
DS 



AS 1 6

CO CL865Contig1 1350 6 23 U
GGGGAAGAAGAATGAGCACGCCGAGGTCGATGCTGTCAACGCGCGGGCGCGTGTTACCGT
TTACGGAGAAGGAGAGAACGGCAGAAGAGGCCGGAACACTAGAATCGAGTCTCCCCAGCT
GATCGAGGACAACCGTCGGTCGTCGCTGCAGCTCCCGTCGTATCTCAGCCTCGCTCTCAT
CTTCATCCTCTTCCTTTCGCTGTTGCATCCTCCCATTGAAATTAAATATCAGATCGCTAC
GCTCCCGTAAGCTACCTCCTATTTGTTGCGATTCGAGTTCTACCTCCCGATCCGGCCTAG
GGGATCCCGATCTTGAGTTTCTCCAAGCCTCCGTCCTCGTTGCAGAGACAAGTATGCATT
ACAAAATGAGGAGACATGGATTCCGGGAAGATTCCATTTGGCAAGCTTCAAGGCATCTCC
CTCCTTTTGCTGTGCGAGCCAGTGAATCCAGGGTTGGTGTTCTCCCTATTGGTCTTGGCT
TCCTCCGCCAATTCACCCACCCCACTATTTTTCTCAAGATCTCTTGTGATGGCGACTACT
TGCTTCCCCTTATTGTTGGTGATTCTGCTGTTGAGAAACTATTAGACGTACCTCCTCTCC
ATGGCCCCATTGAGGAGTGCCCTGATCAGTTCCACTTTGTGTCTTCTCTTGTCGACAAAC
TTGGTCATGAGGTTAAAATGGTGAAGCTTACAAGTAGAGTATTCAACACTTATTATGCAA
GCCTATATCTCGGCAAGCCAGGAGACAATGATGTTATATGCATTGACTCACGGCCATCTG
ATGCCATCAACGTTGCAAGAGCATGCCAGGCTCCGATATATGTGAATAAATCAATAGTCC
TGGAAGATGCTATCAAGATTGGTTATGGAGGCAGACCGCAGAGCACAAAGCCCATTTTCA
ATGTTATCCTTGACAGCGCTCCAGAGGGACCAGATCCCATATCGGAGGAGCTTAAACTAC
TGAGGAATATGGATTTGGCGTCTAAAGAGGAAAGGTACACCGACGCAGCGATGTGGAGAG
ACAGATTGAAGAAGCTTCAGAACTCGAGCTCTGTTGTATACGAGGGTGTAGCAACTCCTG
AGAGCTACGACTAGAGAAAGAATAGGAGGAAATGGATGTAGATAAAGGCTTGGGTCAAGA
GAATGCAGGTGTGATGAAAAGGGTATGGTGAGGACTCAGGAGAAATATAAGATGCGCTTA
GATTGATAGGGTATCCCTATCGCATGTAGTAAGTTTAGAGGAAGGGCGTTGATTGTCGGT
ATTATGAAGAAACTAAAAGTAGACCAAAGATGAAATGAATATCCGAGGGAAAGTGTAAAA
AAAATGTAAATAGAAGAATGACGATGAATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1C905TF U 1
AF RS1A465TF U 184
AF RS1FR36TF U 520
AF RS1A465JQ C 553
AF RS1C905JQ C 626
AF RS1FR36JQ C 734
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TTACGGAGAAGGAGAGAACGGCAGAAGAGGCCGGAACACTAGAATCGAGTCTCCCCAGCT
GATCGAGGACAACCGTCGGTCGTCGCTGCAGCTCCCGTCGTATCTCAGCCTCGCTCTCAT
CTTCATCCTCTTCCTTTCGCTGTTGCATCCTCCCATTGAAATTAAATATCAGATCGCTAC
GCTCCCGTAAGCTACCTCCTATTTGTTGCGATTCGAGTTCTACCTCCCGATCCGGCCTAG
GGGATCCCGATCTTGAGTTTCTCCAAGCCTCCGTCCTCGTTGCAGAGACAAGTATGCATT
ACAAAATGAGGAGACATGGATTCCGGGAAGATTCCATTTGGCAAGCTTCAAGGCATCTCC
CTCCTTTTGCTGTGCGAGCCAGTGAATCCAGGGTTGGTGTTCTCCCTATTGGTCTTGGCT
TCCTCCGCCAATTCACCCACCCCACTATTTTTCTCAAGATCTCTTGTGATGGCGACTACT
TGCTTCCCCTTATTGTTGCTGATTCTGCTGTTGAGAAACTATTAGACGTACCTCCTCTCC
AAGGCCCCATTGAGGAATGCCCTGATCAGTTCCACTTTGTGTCTTCTCTTGTCGACAAAC
TTGGTCATGAGGTTAAAATGGTGAAGCTTACAAGTAGAGTATTCAACACTTATTATGCAA
GCCTATATCTCGGCA
CG

QA 1 735 1 735
DS 

RD RS1A465TF 800 0 0
G
ATCCTCTTCCTTTCGCTGTTGCATCCTCCCATTGAAATTAAATATCAGATCGCTACGCTC
CCGTAAGCTACCTCCTATTTGTTGCGATTCTAGTTCTACCTCCCGATCCGGCCTAGGGGA
TCCCGATCTTGAGTTTCTCCAAGCCTCCGTCCTCGTTGCAGAGACAAGTATGCATTACAA
AATGAGGAGACATGGATTCCGGGAAGATTCCATTTGGCAAGCTTCAAGGCATCTCCCTCC
TTTTGCTGTGCGAGCCAGTGAATCCAGGGTTGGTGTTCTCCCTTTTGGTCTTGGCTTCCT
CCGCCAATTCACCCACCCCACTATTTTTCTCAAGATCTCTTGTGATGGCGACTACTTGCT
TCCCCTTATTGTTGGTGATTCTGCTGTTGAGAAACTATTAGACGTACCTCCTCTCCATGG
CCCCATTGAGGAGTGCCCTGATCAGTTCCACTTTGTGTCTTCTCTTGTCGATAAACTTGG
CCATGAGGTTAAAATGGTGAAGTTTACAAGTAGAGTATTCAACACTTATTATGTAAGCCT
ATATCTCGGCAAGCCAGGAGACAATGATGTTATATGCATTGACTCACGGCCATCTGATGC
CATCAACGTTGCAAGAGCATGCCAGGCTCCGATATATGTGAATAAAACAATAGTCCCGGA
AGATGCTATCAAGATTGGTTATGGAGGCAGACCACAGAGCACAAAGCCCATTTTCAATGT
TATCCTTGACAGCGCTCCAGAGGGACCAGATCCCATATCGGAG*AGCTTAAACTACTGAG
*AATATGGATTTGGCGTCT

QA 2 800 2 800
DS 

RD RS1FR36TF 639 0 0
TCTCTTGTGATGGCGACTACTTGCTTCCCCTTATTGTTGCTGATTCTGCTGTTGAGAAAC
TATTAGACGTACCTCCTCTCCAAGGCCCCATTGAGGAATGCCCTGATCAGTTCCACTTTG
TGTCTTCTCTTGTCGACAAACTTGGTCATGAGGTTAAAATGGTGAAGCTTACAAGTAGAG
TATTCAACACTTATTATGCAAGCCTATATCTCGGCAAGCCAGGAGACAATGATGTTATAT
GCATTGACTCACGGCCATCTGACGCCATCAACGTTGCAAGAGCATGCCAGGCTCCGATAT
ATGTGAATAAATCAATAGTCCTGGAAGATGCTATCAAGATTGGTTATGGAGGCAGACCGC
AGAGCACAAAGCCCATTTTCAATGTTATCCTTGACAGCGCTCCAGAGGGACCAGATCCCA
TATCGGAGGAGCTTAAACTACTGAGGAATATGGATTTGGCGTCTAAAGAGGAAAGGTACA
CCGACGCAGCGATGTGGAGAGACAGATTGAAGAAGCTTCAGAACTCGAGCTCTGTTGTAT
ACGAGGGTGTAGCAACTCCTGAGAGCTACGACTAGAGAAAGAATAGGAGGAAATGGATGT
AGATAAAGGCTTGGGTCAAGAGAATGCAGGTGTGATGAA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RS1A465JQ 797 0 0
TTGTTGGTGATTCTGCTGTTGAGAAACTATTAGACGTACCTCCTCTCCATGGCCCCATTG
AGGAGTGCCCTGATCAGTTCCACTTTGTGTCTTCTCTTGTCGATAAACTTGGCCATGAGG
TTAAAATGGTGAAGTTTACAAGTAGAGTATTCAACACTTATTATGTAAGCCTATATCTCG
GCAAGCCAGGAGACAATGATGTTATATGCATTGACTCACGGCCATCTGATGCCATCAACG
TTGCAAGAGCATGCCAGGCTCCGATATATGTGAATAAAACAATAGTCCCGGAAGATGCTA
TCAAGATTGGTTATGGAGGCAGACCACAGAGCACAAAGCCCATTTTCAATGTTATCCTTG
ACAGCGCTCCAGAGGGACCAGATCCCATATCGGAGGAGCTTAAACTACTGAGGAATATGG
ATTTGGCGTCTAAAGAGGAAAGGTACACCGACGCAGCGATGTGGAGAGACAGATTGAAGA
AGCTTCAGAACTCGAGCTCTGTTGTATACGAGGGTGTAGCAACTCCTGAGAGCTACGACT
AGAGAAAGAATAA*AGGAAATGGATGTAGATAAAGACTTGGGTCAAGAGAATGCAGGTGT
GATGAAAAGGGTATGGTGAGGACTCAGGAGAAATATAAGATGCGCTTAGATTGATAGGGT
ATCCCTATCGCATGTAGTAAGTTTAGAGGAAGGGCGTTGATTGTCGGTATTATGAAGAAA
CTAAAAGTAGACCAAAGATGAAATGAATATCCGAGGGAAAGTGTAAAAAGAATGTAAATA
GAAGAATGACGATGAAT

QA 1 797 1 797
DS 

RD RS1C905JQ 725 0 0
TCAGTTCCACTTTGTGTCTTCTCTTGTCGACAAACTTGGTCATGAGGTTAAAATGGTGAA
GCTTACAAGTAGAGTATTCAACACTTATTATGCAAGCCTATATCTCGGCACGCCAGGAGA
CAATGATGTTATATGCATTGACTCACGGCCATTTGATGCCATCAACGTTGCAAGAGCATG
CCAGGCTCCGATATATGTGAATAAATCAATAGTCCTGGAAGATGCTATCAAGATTGGTTA
TGGAGGCAGACCGCAGAGCACAAAGCCCATTTTCAATGTTATCCTTGACAGCGCTCCAGA
GGGACCAGATCCCATATCGGAGGAGCTTAAACTACTGAGGAATATGGATTTGGCGTCTAA
AGAGGAAAGGTACACCGACGCAGCGATGTGGAGAGACAGATTGAAGAAGCTTCAGAACTC
GAGCTCTGTTGTATACGAGGGTGTAGCAACTCCTGAGAGCTACGACTAGAGAAAGAATAG
GAGGAAATGGATGTAGATAAAGGCTTGGGTCAAGAGAATGCAGGTGTGATGAAAAGGGTA
TGGTGAGGACTCAGGAGAAATATAAGATGCGCTTAGATTGATAGGGTATCCCTATCGCAT
GTAGTAAGTTTAGAGGAAGGGCGTTGATTGTCGGTATTATGAAGAAACTAAAAGTAGACC
AAAGATGAAATGAATATCCGAGGGAAAGTGTAAAAAAAATGTAAATAGAAGAATGACGAT
GAATA

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1FR36JQ 617 0 0
CAAGCCAGGAGACAATGATGTTATATGCATTGACTCACGGCCATCTGACGCCATCAACGT
TGCAAGAGCATGCCAGGTTCCGATATATGTGAATAAATCAATAGTCCTGGAAGATGCTAT
CAAGATTGGTTATGGAGGCAGACCGCAGAGCACAAAGCCCATTTTCAATGTTATCCTTGA
CAGCGCTCCAGAGGGACCAGATCCCATATCGGAGGAGCTTAAACTACTGAGGAATATGGA
TTTGGCGTCTAAAGAGGAAAGGTACACCGACGCAGCGATGTGGAGAGACAGATTGAAGAA
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GAGAAAGAATAGGAGGAAATGGATGTAGATAAAGGCTTGGGTCAAGAGAATGCAGGTGTG
ATGAAAAGGGTATGGTGAGGACTCAGGAGAAATATAAGACGCGCTTAGATTGATAGGGTA
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TAAAAGTAGACCAAAGATGAAATGAATATCCGAGGGAAAGTGTAAAAAAAATGTAAATAG
AAGAATGACGATGAAT
A

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 7

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TCGATTCCCGCCTCCGCGTGGTTTTCAGGCGGCGCCATTCCTCCTCTGAACGTGAGACTT
TCTGCGCCGTACCTCCTCCGGAAACCGCAGAGCAGGAATTCCAGACGCTTGTCCGCCTTT
AACGCCGCTTCTCGCTCTGTGAGTGAGCTTGTGGGGGAGGAGGATGTGCTACAAATGTTC
TTGAAAGACAGAGAAGAAAATGGAGATTTCATTTCCAAAGTCTCTGATAGGCTCTGGTTA
AGGGAGGTTCTCGAGTCCATTGATCTTAACTCTAATGCTGCTTCTTCAGCCATCGGACTC
GAGGATAATCAGGAGAGATTGATGATGGATGGCGCAGATGATGATGATGATGAAAGCGGT
TTCTTGAAACTTAAACCGATACAAGAATGGATTGCTGGAGAAATTGAGTCCGCCCCCATG
AATAGAAAAGCTCTAGCTAAGGCATTACGGGATGATAGCGAGCGGAGGAAGAAACTTAAC
TTTCTGAAATATGAAGCTCTGAAGCGCGAACTGATGTACCTGTCAATTGTAATTGGAACT
GGGTGCAGCGGATATTGCTTACTAGCTTTATCACCCCAGGCTGCAGTCAGTTATGGAGTT
GGAGTTCTTTTCAGTTGCTTGTACCTTCAGCTTTTGTACGGATATGCGGATGGTGTTTCA
CGTGAAGATGTTCCTAATATCTTCCTGAAAAGGAAGATTAAAAAAATCGGGATTAGAAGT
GAAGACCTTGAAGACTTTGTAAAGAGGACAATCAGGGGCAGTGGCATGGCACTCTCTTCC
CCACGTCTAGTGATCCCAGCTGCTATCTATGCTCTGTGGATTCTCTCGCACAAGTACTTC
CAGAATGACTTGTTCGATTTTCAGATAGTTCCAGCCATGGTTGGTTTGTTTGTATACAAA
GCTGCAGCTCTGGTTCAAGTGTACAGAGACAACCAAGATCTTCAGTTCATCTTCCCAGAC
GACCTTTGACCTTTGTAGTTGGACGTTTGTGAATGGTTTGGTTCATGATCTCAAAGGGAA
ACAGAAACTGGACTCATCTGCTAAGACTAAAAGCTCAGCCTGAGGATGTAGAGTAACCTG
TGTGTTCTCGTTATTTTTTTCTTTTTTCTTTGACGTCGTCTCCTTGTAAATTTTTGAGGG
AAAATACAATATATTTCGTATGTCAATGTATCAGAACAGAAACTATTGATATATGTATGA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1E566TF U 1
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AF RS1GM31JQ C 563
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AF RS1DI31TF U 600
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BS 993 1023 RS1E576TF
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BS 1050 1277 RS1DI31TF

RD RS1E566TF 735 0 0
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GGAGTTCTTTTCAGTTGCTTGTACCTTCAGCTTTTGTACG*ATATGCGGATGGTGTTTCA
CGTGAAGATGTTCCT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RS1GM31TF 604 0 0
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ATACAAGAATGGATTGCTGGAGAAATTGAGTCCGCCCCCATGAATAGAAAAGCTCTAGCT
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GTAA

QA 1 604 1 604
DS 

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G
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TTAAACCGATACAAGAATGGATTGCTGGAGAAATTGAGTCCGCCCCCATGAATAGAAAAG
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TGATCCCAGCTGCTATCTATGCTCTGTGGATTCTCTCGCACAAGTACTTCCAGAATGACT
TGTTCGATTTTCAGATAGT*CCAGCCATGGTTGGTTTGTTTGTATACAAAGCTGCAGCTC
TGGTTCA*GTGTACAGAGACA*CCAAGATCTTCAGTTCATCTTCCCAGACGAC*TTTGAC
CTTTGTAGTTGGACGTTTG

QA 2 800 2 800
DS 

RD RS1GM31JQ 715 0 0
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TCCTGAAAAGGAAGATTAAAAAAATCGGGATTAGAAGTGAAGACCTTGAAGACTTTGTAA
AGAGGACAATCAGGGGCAGTGGCATGGCACTCTCTTCCCCACGTCTAGTGATCCCAGCTG
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AGATAGTTCCAGCCATGGTTGGTTTGTTTGTATACAAAGCTGCAGCTCTGGTTCAAGTGT
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ACGCTTGTGAATGGTTTGGTTCATGATCTCAAAGGGAAACAGAAACTGGACTCATCTGCT
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TTTTTCTTTGACGTCGTCTCCTTGTAAATTTTTGAGGGAAAATACAATATATTTCGTATG
TCAATGTATCAGAACAGAAACTATTGATATATGTATGAGAGGAATAGTTATAACC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1DI31JQ 678 0 0
G
GGGTGCAGCGGATATTGCTTACTAGCTTTATCACCCCAGGCTGCAGTCAGTTATGGAGTT
GGAGTTCTTTTCAGTTGCTTGTACCTTCAGCTTTTGTACGGATATGCGGATGGTGTTTCA
CGTGAAGATGTTCCTAATATCTTCCTGAAAAGGAAGATTAAAAAAATCGGGATTAGAAGT
GAAGACCTTGAAGACTTTGTAAAGAGGACAATCAGGGGCAGTGGCATGGCACTTTCTTCC
CCACGTCTAGTGATCCCAGCTGCTATCTATGCTCTGTGGATTCTCTCGCACAAGTACTTC
CAGAATGACTTGTTCGATTTTCAGATAGTTCCAGCCATGGTTGGTTTGTTTGTATACAAA
GTTGCAGCTCTGGTTCAAGTGTACAGAGACAACCAAGATCTTCAGTTCATCTTCCCAGAC
GACCTTTGACCTTTGTAGTTGGACGTTTGTGAATGGTTTGGTTCATGATCTCAAAGGGAA
ACAGAAACTGGACTCATCTGCTAAGACTAAAAGCTCAGCCTGAGGATGTAGAGTAACCTG
TGTGTTCTCGTTATTTTTTTCTTTTTTTTTTGACGTCGTCTCCTTGTAAATTTTTGAGGG
AAAATACAATATATTTCGTATGTCAATGTATCAGAACAGAAACTATTGATATATGTATGA
GAGGAATAGTTATAACC

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DS 

RD RS1E566JQ 314 0 0
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GTTCTCGTTATTTTTTTCTTTTTTTTTTGACGTCGTCTCCTTGTAAATTTTTGAGGGAAA
ATACAATATATTTCGTATGTCAATGCATCAGAACAGAAACTATTGATATATGTATGAGAG
GAATAGTTATAACC

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DS 

RD RS1DI31TF 678 0 0
G
GGGTGCAGCGGATATTGCTTACTAGCTTTATCACCCCAGGCTGCAGTCAGTTATGGAGTT
GGAGTTCTTTTCAGTTGCTTGTACCTTCAGCTTTTGTACGGATATGCGGATGGTGTTTCA
CGTGAAGATGTTCCTAATATCTTCCTGAAAAGGAAGATTAAAAAAATCGGGATTAGAAGT
GAAGACCTTGAAGACTTTGTAAAGAGGACAATCAGGGGCAGTGGCATGGCACTCTCTTCC
CCACGTCTAGTGATCCCAGCTGCTATCTATGCTCTGTGGATTCTCTCGCACAAGTACTTC
CAGAATGACTTGTTCGATTTTCAGATAGTTCCAGCCATGGTTGGTTTGTTTGTATACAAA
GTTGCAGCTCTGGTTCAAGTGTACAGAGACAACCAAGATCTTCAGTTCATCTTCCCAGAC
GACCTTTGACCTTTGTAGTTGGACGTTTGTGAATGGTTTGGTTCATGATCTCAAAGGGAA
ACAGAAACTGGACTCATCTGCTAAGACTAAAAGCTCAGCCTGAGGATGTAGAGTAACCTG
TGTGTTCTCGTTATTTTTTTCTTTTTTCTTTGACGTCGTCTCCTTGTAAATTTTTGAGGG
AAAATACAATATATTTCGTATGTCAATGTATCAGAACAGAAACTATTGATATATGTATGA
GAGGAATAGTTATAACC

QA 2 678 2 678
DS 



AS 1 7

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CATTCCGTCCTAAGAAGAGTGCACCTTCTGGAAGCAAGGGTGCACAGCTTCGACAGCATA
TAGATGCAACTTTAGGAAGTGGCAACTTGAGAGAAGCTGTTCGACTTCCTCCTGGAGAGG
ATG**CCAACGAGTGGCTTGCTGTCAACACTGTGGATTTTTTTAATCAAGTGAACTTGCT
ATATGGTACCCTTACCGAGTTCTGCACACCTGATAACTGTCCTACTATGACTGCTGGCCC
CAAGTACGAGTATAGATGGGCAGATGGTGTGCAGATCAAGAAGCCAATAGAGGTTTCTGC
TCCAAAGTATGTCGAGTACTTGATGGATTGGATCGAGACACAGCTCGATGATGAGACTTT
ATTCCCTCAAAGGCTTGGAGCACCGTTTCCTCAGAACTTCAAGGATGTGGTGAAGACAAT
ATTTAAACGACTTTTCCGTGTGTATGCCCACATATACCATTCTCATTTCCAGAAAATCGT
TAGCCTTAAAGAAGAAGCTCATCTCAACACTTGCTTCAAACACTTCATCCTCTTCACTCA
TGAGTTTGGACTGATTGACAAGAAAGAACTGGCGCCTCTACAAGAGCTCATAGAATCTAT
CGTTTCACCGTATTGAGCAAAAGAAGCCAACTTCAGATATTAAAATCAAAAGAAATAAAT
TAAATGGTAATATGGTTTTTAATTATAAATCTATCCCGTTTGTTTCCAGTTTTCTTTTTC
TTCCTAATTTTCTCTGTAAAATTGAAACATCTACTATGTAAGAAAATCGATGTTGATGAG
TCCTTGAATATCTCCTTTACTCATGTGTTTGATGCATGTGAAAGAAAAAGGAACTTTACA
T


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 10 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BU65TF U 105
AF RS1GI05TF U 95
AF RS1FZ48TF U 3
AF RS1FS85TF U 3
AF RS1CB13TF U 1
AF RS1CT30JQ C 164
AF RS1CB13JQ C 152
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BS 9 9 RS1FS85TF
BS 10 97 RS1CB13TF
BS 98 98 RS1FS85TF
BS 99 125 RS1CB13TF
BS 126 126 RS1FS85TF
BS 127 459 RS1CB13TF
BS 460 460 RS1FS85TF
BS 461 600 RS1CB13TF
BS 601 601 RS1FS85TF
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RD RS1BU65TF 289 0 0
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CAGCTTCGACAGCATATAGATGCAACTTTAGGAAGTGGCAACTTGAGAGAAGCTGTTCGA
CTTCCTCCTGGAGAGGATG**CCAACGAGTGGCTTGCTGTCAACACTGTGGATTTTTTTA
ATCAAGTGAACTTGCTATATGGTACCCTTACCGAGTTCTGCACACCTGATAACTGTCCTA
CTATGACTGCTGGCCCCAAGTACGAGTATAGATGGGCAGATGGTGTGCA

QA 1 289 1 289
DS 

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GT
TTGGATTGGGAAGAAATCAGAAGACATTCCGTCCTAAGAAGAGTGCACCTTCTGGAAGCA
AGGGTGCACAGCTTCGACAGCATATAGATGCAACTTTAGGAAATGGCAACTTGAGAGAAG
CTGTTCGACTTCCTCCTGGAGAGGATG**CCAACGAGTGGCTTGCTGTCAACACTGTGGA
TTTTTTTAATCAAGTGAACTTGCTATATGGTACCCTTACCGAGTTCTGCACACCTGATAA
CTGTCCTACTATGACTGCTGGCCCCAAGTACGAGTATAGATGGGCAGATGGTGTGCAGAT
CAAGAAGCCAATAGAGGTTTCTGCTCCAAAGTATGTCGAGTACTTGATGGATTGGATCGA
GACACAGCTCGATGATGAGACTTTATTCCCTCAAAGGCTTGGAGCACCGTTTCCTCAGAA
CTTCAAGGATGTGGTGAAGACAATATTTAAACGACTTTTCCGTGTGTATGCCCACATATA
CCATTCTCAT

QA 3 492 3 492
DS 

RD RS1FZ48TF 652 0 0
GG
AGACTCTTTTCTCGTTTTCACCTTAGGAAAAAATAAGAAAAAAGAAAACTCTTTCCCCCT
CTCTC**GATCGCTTTATCGCCATGAGTCTGTTTGGATTGGGAAGAAATCAGAAGACATT
CCGTCCTAAGAAGAGTGCACCTTCTGGAAGCAAGGGTGCACAGCTTCGACAGCATATAGA
TGCAACTTTAGGAAGTGGCAACTTGAGAGAAGCTGTTCGACTTCCTCCTGGAGAGAATTA
CCCAACGAGTGGCTTGCTGTCAACACTGTGGATTTTTTTAATCAAGTGAACTTGCTATAT
GGTACCCTTACCGAGTTCTGCACACCTGATAACTGTCCTACTATGACTGCTGGCCCCAAG
TACGAGTATAGATGGGCAGATGGTGTGCAGATCAAGAAGCCAATAGAGGTTTCTGCTCCA
AAGTATGTCGAGTACTTGATGGATTGGATCGAGACACAGCTCGATGATGAGACTTTATTC
CCTCAAAGGCTTGGAGCACCGTTTCCTCAGAACTTCAAGGATGTGGTGAAGACAATATTT
AAACGACTTTTCCGTGTGTATGCCCACATATACCATTCTCATTTCCAGAAAATCGTTAGC
CTTAAAGAAGAAGCTCATCTCAACACTTGCTTCAAACACTTCATCCTCTT

QA 3 652 3 652
DS 

RD RS1FS85TF 685 0 0
GG
AGACTCTTTTCCCGTTTTCACCTGAGGAAAAAATAAGAAAAAAGAAAACTCTTTCCCTCT
CTCTCTCGATCGCTTTATCGCCATGAGTCTGTTTGGATTGGGAAGAAATCAGAAGACATT
CCGTCCTAAGAAGAGTGCACCTTCTGGAAGCAAGGGTGCACAGCTTCGACAGCATATAGA
TGCAACTTTAGGAAGTGGCAACTTGAGAGAAGCTGTTCGACTTCCTCCTGGAGAGGATG*
*CCAACGAGTGGCTTGCTGTCAACACTGTGGATTTTTTTAATCAAGTGAACTTGCTATAT
GGTACCCTTACCGAGTTCTGCACACCTGATAACTGTCCTACTATGACTGCTGGCCCCAAG
TACGAGTATAGATGGGCAGATGGTGTGCAGATCAAGAAGCCAATAGAGGTTTCTGCTCCA
AAGTATGTCGAGTACTTGATGGATTGGATCGAGACACAGCTCGATGATGAGACTTTATTC
CCTCAAAGGCTTGGAGCACCGTTTCCTCAGAACTTCAAGGATGTGGTGAAGACAATATTT
AAACGACTTTTCCGTGTGTATGCCCACATATACCATTCTCATTTCCAGAAAATCGTTAGC
CTTAAAGAAGAAGCTCATCTCAACACTTGCTTCAAACACTTCATCCTCTTCACTCATGAG
TTTGGACTGATTGACAAGAAAGA

QA 3 685 3 685
DS 

RD RS1CB13TF 765 0 0
GGCCAGACCCTTTTCTCGTTTTCACCTGAGGAAAAAATAAGAAAAAAGAAAACTCTTTCC
CTCTCTCTCTCGATCGCTTTATCGCCATGAGTCTGTT*GGATTGGGAAGAAATCAGAAGA
CATTCTGTCCTAAGAAGAGTGCACCTTCTGGAAGCAAGGGTGCACAGCTTCGACAGCATA
TAGATGCAACTTTAGGAAGTGGCAACTTGAGAGAAGCTGTTCGACTTCCTCCTGGAGAGG
ATG**CCAACGAGTGGCTTGCTGTCAACACTGTGGATTTTTTTAATCAAGTGAACTTGCT
ATATGGTACCCTTACCGAGTTCTGCACACCTGATAACTGTCCTACTATGACTGCTGGCCC
CAAGTACGAGTATAGATGGGCAGATGGTGTGCAGATCAAGAAGCCAATAGAGGTTTCTGC
TCCAAAGTATGTCGAGTACTTGATGGATTGGATCGAGACGCAGCTCGATGATGAGACTTT
ATTCCCTCAAAGGCTTGGAGCACCGTTTCCTCAGAACTTCAAGGATGTGGTGAAGACAAT
ATTTAAACGACTTTTCCGTGTGTATGCCCACATATACCATTCTCATTTCCAGAAAATCGT
CAGCCTTAAAGAAGAAGCTCATCTCAACACTTGCTTCAAACACTTCATCCTCTTCACTCA
TGAGTTTGGACTGATTGACAAGAAAGAACTGGCGCCTCTACAAGAGCTCATAGAATCTAT
CGTTTCACCGTATTGAGCAAA*GAAGCCAACTTCAGATATTAAAA

QA 1 765 1 765
DS 

RD RS1CT30JQ 659 0 0
ACAGCTTCGACAGCATATAGATGCAACTTTAGGAAGTGGCAACTTGAGAGAAGCTGTTCG
ACTTCCTCCTGGAGAGGATG**CCAACGAGTGGCTTGCTGTCAACACTGTGGATTTTTTT
AATCAAGTGAACTTGCTATATGGTACCCTTACCGAGTTCTGCACACCTGATAACTGTCCT
ACTATGACTGCTGGCCCCAAGTACGAGTATAGATGGGCAGATGGTGTGCAGATCAAGAAG
CCAATAGAGGTTTCTGCTCCAAAGTATGTCGAGTACTTGATGGATTGGATCGAGACACAG
CTCGATGATGAGACTTTATTCCCTCAAAGGCTTGGAGCACCGTTTCCTCAGAACTTCAAG
GATGTGGTGAAGACAATATTTAAACGACTTTTCCGTGTGTATGCCCACATATACCATTCT
CATTTCCAGAAAATCGTTAGCCTTAAAGAAGAAGCTCATCTCAACACTTGCTTCAAACAC
TTCATCCTCTTCACTCATGAGTTTGGACTGATTGACAAGAAAGAACTGGCGCCTCTACAA
GAGCTCATAGAATCTATCGTTTCACCGTATTGAGCAAAAGAAGCCAACTTCAGATATTAA
AATCAAAAGAAATAAATTAAATGGTAATATGGTTTTTAATTATAAATCTATCCCGTTTG

QA 1 659 1 659
DS 

RD RS1CB13JQ 810 0 0
AAGCAAGGGTGCACAGCTTCGACAGCATATAGATGCA*CTTTAGGAAGTGGCAACTTGAG
AGAAGCTGTTCGACTTCCTCCTGGAGAGGATG**CCAACGAGTGGCTTGCTGTCAACACT
GTGGATTTTTTTAATCAAGTGAACTTGCTATATGGTACCCTTACCGAGTTCTGCACACCT
GATAACTGTCCTACTATGACTGCTGGCCCCAAGTACGAGTATAGATGGGCAGATGGTGTG
CAGATCAAGAAGCCAATAGAGGTTTCTGCTCCAAAGTATGTCGAGTACTTGATGGATTGG
ATCGAGACGCAGCTCGATGATGAGACTTTATTCCCTCAAAGGCTTGGAGCACCGTTTCCT
CAGAACTTCAAGGATGTGGTGAAGACAATATTTAAACGACTTTTCCGTGTGTATGCCCAC
ATATACCATTCTCATTTCCAGAAAATCGTCAGCCTTAAAGAAGAAGCTCATCTCAACACT
TGCTTCAAACACTTCATCCTCTTCACTCATGAGTTTGGACTGATTGACAAGAAAGAACTG
GCGCCTCTACAAGAGCTCATAGAATCTATCGTTTCACCGTATTGAGCAAAAGAAGCCAAC
TTCAGATATTAAAATCAAAAGAAATAAATTAAATGGTAATATGGTTTTTAATTATAAATC
TATCCCGTTTGTTTCCAGTTTTCTTTTTCTTCCTAATTTTCTCTGTAAAATTGAAACATC
TACTATGTAAGAAAATCGATGTTGATGAGTCCTTGAATATCTCCTTTACTCATGTGTTTG
ATGCATGTGAAAGAAAAAGGAACTTTACAT

QA 1 810 1 810
DS 



AS 2 7

CO CL868Contig1 628 2 2 U
GTATCATCATCTCCGTCTCCGCCCCGTCTCCAATCTCCGTTCATACACCGTCCAATCAAT
GCCACTCCGTCTTCTCCCTGTTTACTCTCCGCGAGGAACCTCCGTTCGCCGTCAACAACA
TCTTATCCGCGGATCAAATCAGAAGTCGATACGAACACGGTAATCGCAATCTCAGTTGGC
GTGGCGAGCGTCGCGCTGGGAATCGGAATCCCTGTCTTCTACGAGACGCAGATCGATAGC
GCCGCTAAGAGAGAGAACACTCAACCTTGTTTTCCTTGCAATGGCACTGGAGCTCAGAAG
TGCAGGTTGTGTGTGGGTAGTGGTAACGTGACGGTGGAGCTTGGTGGAGGAGAGAAGGAA
GTCTCCAGCTGTATCAATTGTGATGGTGTTGGTTCCTTGACTTGCACTACTTGTCAAGGC
TCTGGTGTTCAACCTCGATACCTTGATCGGAGGGAGTTCAAGGATGATGACTAGATATCC
TCCACCAGTTAACCATATCAAACGAGTCTCTTCTCCTCCCTTTCTTCATTGTGTTGTCTA
CATTTGCACAATACTGTATTTTTTTTTGTTCACCAAATCATGACCTTGTAAACAAATGAA
GGAGTAAGCTTCCTGCACTTGACTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1AR69TFB U 1
AF RS1AR69JQ C 76
BS 1 626 RS1AR69TFB
BS 627 628 RS1AR69JQ

RD RS1AR69TFB 628 0 0
GTATCATCATCTCCGTCTCCGCCCCGTCTCCAATCTCCGTTCATACACCGTCCAATCAAT
GCCACTCCGTCTTCTCCCTGTTTACTCTCCGCGAGGAACCTCCGTTCGCCGTCAACAACA
TCTTATCCGCGGATCAAATCAGAAGTCGATACGAACACGGTAATCGCAATCTCAGTTGGC
GTGGCGAGCGTCGCGCTGGGAATCGGAATCCCTGTCTTCTACGAGACGCAGATCGATAGC
GCCGCTAAGAGAGAGAACACTCAACCTTGTTTTCCTTGCAATGGCACTGGAGCTCAGAAG
TGCAGGTTGTGTGTGGGTAGTGGTAACGTGACGGTGGAGCTTGGTGGAGGAGAGAAGGAA
GTCTCCAGCTGTATCAATTGTGATGGTGTTGGTTCCTTGACTTGCACTACTTGTCAAGGC
TCTGGTGTTCAACCTCGATACCTTGATCGGAGGGAGTTCAAGGATGATGACTAGATATCC
TCCACCAGTTAACCATATCAAACGAGTCTCTTCTCCTCCCTTTCTTCATTGTGTTGTCTA
CATTTGCACAATACTGTATTTTTTTTTGTTCACCAAATCATGACCTTGTAAACAAATGAA
GGAGTAAGCTTCCTGCACTTGACTTT
CT

QA 1 626 1 626
DS 

RD RS1AR69JQ 553 0 0
CCCT
GTTTACTCTCCGCGAGGAACCTCCGTTCGCCGTCAACAACATTTTATCCGCGGATCAAAT
CAGAAGTCGATACGAACACGGTAATCGCAATTTCAGTTGGCGTGGCGAGCGTCGCGCTGG
GAATCGGAATCCCTGTTTTTTACGAGACGCAGATCGATAGCGCCGCTAAGAGAGAGAACA
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TGACTTTTT

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DS 



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CCCGTTTACTCTCCGTGAGGAACCTCCGTTCGCCGTCAACAACATCTTATCCGCGGATCA
AATCAGAAGTCGATACGAACACGGTAATCGCAATCTCAGTTGGCGTGGCGAGCGTCGCGC
TGGGAATCGGAATCCCTGTCTTCTACGAGACGCAGATCGATAACGCCGCTAAGAGAGAGA
ACACTCAACCTTGTTTTCCTTGCAATGGCACTGGAGCTCAGAAGTGCAGGTTGTGTGTGG
GAAGTGGTAACGTGACGGTGGAGCTCGGTGGAGGAGAGAAGGAAGTCTCCAGCTGTATCA
ATTGTGATGGTGTTGGTTCCTTGACTTGCACTACTTGTCAAGGCTCTGGTGTTCAACCTC
GATACCTTGATCGGAGGGAGTTCAAGGATGATGACTAGATATCTTCCATTTGATAACCAT
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ATTTTTTTTGTTCACCAAATCATGACCTTGTAAACAATTGAAGGAGTAAGCTTCCTGCAC
TTGACTTTCAAAAAAAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DG22TF U 1
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G
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QA 2 593 2 593
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GG
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C

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GG
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GATACGAACACGGTAATCGCAATCTCAGTTGGCGTGGCGAGCGTCGCGCTGGGAATCGGA
ATCCCTGTCTTCTACGAGACGCAGATCGATAACGCCGCTAAGAGAGAGAACACTCAACCT
TGTTTTCCTTGCAATGGCACTGGAGCTCAGAAGTGCAGGTTGTGTGTGGGAAGTGGTAAC
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GTTGGTTCCTTGACTTGCACTACTTGTCAAGGCTCTGGTGTTCAACCTCGATACCTTGAT
CGGAGGGAGTTCAAGGATGATGACTAGATATCTTCCATTTGATAACCATATCAAAAGAGT
CTCTTCTCCTCCCTTTCTTCATTGTGTGTCTACATTTGTACAATACTGTATTTTTTTTGT
TCACCAAATCATGACCTTGTAAACAATTGAAAGAGTAAGCTTCCTGCACTTGACTTTCAA
AAAAAA

QA 3 668 3 668
DS 



AS 1 7

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TCGAAAAAAAAGGGAACTTTTAGAAGATAGGAGTAGCAACAGGAGTGAAACCGAGCAACT
TCTTAGAATGAAGCCATGGTTGAACAACCACAATAGAGTCGAACATCCTGCTCGTGCCAT
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CGAAGTGTTTGTGTGTGAGATCC


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1BE47TF C 123
AF RS1BO72TF C 1
AF RS1BE47JQ U 9
AF RS1BO72JQ U 9
AF RS1DR84JQ U 9
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CT
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CT

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DS 

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AG
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AGAATGAAGCCATGGTTGAACAACCACAATAGAGTCGAACATCCTGCTCGTGCCATCAGT
TTGAGTCACTTCAATCCTTAGATAGTATTTAAGACCAGCCACGACCTGTTGCTGAGCTGA
CACAACTCGGCTAAATGTCAACGGACTTGACACGGCCGTTTCTCTTTTCGCAATCGAAGC
TACGTTTCCTTTCTCGCTCTGT

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DS 

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CAAAACTAGCCACTAACACATTGTTAATAGCTTCATATCATACACCTCTCGAGTCTTTTC
TCGAAAAAAAAGGGAACTTTTAGAAGATAGGAGTAGCAACAGGAGTGAAACCGAGCAACT
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CTGACACAACTCGGCTAAATGTCAACGGACTCGACACGGCCGTTTCTCTTTTCGCAATCG
AAGCTACGTTTCCTTTCTCGCTCTGTTCCTCTAGATTAAATTGTTCTACGCAGTACCTTC
CAAGTTCTTGAACTTCCATGTTGGTCTGAACGTTCGGAACATCCGACTTCCCTCCGACAA
GGATGGACTTCCTTATCGCGTTCGCCGATGGAGTCACGACGGCCATCACCAAAAGGCCTA
ACAATGACAATTTTAGATAGACTTGTGACATTGCTTCTGCTTTGGCTTTTAAGTTGATAT
ATATTTCGTGTGATTTCTTTTGACTTCTTAATGTTTCTCCAAAGCTTTTGATATATTGTA
CGAAGTGTTTGTGTGT
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GCCACTAACACATTGTTAATAGCTTCATATCATACACCTCTCGAGTCTTTTCTAGAAAAA
AA*GGGAACTTTTAGAAGATAGGAGTAGCAACAGGAGTGAAACCGAGCAACTTCTTAAAA
TGAAGCCATGGTTGAACAACCACAATAGAGTCGAACATCCTGCTCGTGCCATCAGTTTGA
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ACTCGGCTAAATGTCAACGGACTCGACACGGCCGTTTCTCTTTTCGCAATCGAAGCTACG
TTTCCTTTCTCGCTCTGTTCCTCTAGATTGAATTGTTCTACGCAGTACCTTCCAAGTTCT
TGAACTTCCATGTTGGTCTGAACGTTCGGAACATCCGACTTCCCTCCGACAAGGATGGAC
TTCCTTATCGCGTTCGCCGATGGAGTCACGACGGCCATCACCAAAAGGCCTAACAATGAC
AATTTTAGATAGACTTGTGACATTGCTTCTGCTTTGGCTTTTAAGTTGATATATATTTCG
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TTGTGTGTGAGATCC

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DS 

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GCCACTAACACATTGTTAATAGCTTCATATCATACACCTCTCGAGTCTTTTCTCGAAAAA
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ACTCGGCTAAATGTCAACGGACTCGACACGGCCGTTTCTCTTTTCGCAATCGAAGCTACG
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TGAACTTCCATGTTGGTCTGAACGTTCGGAACATCCGACTTCCCTCCGACAAGGATGGAC
TTCCTTATCGCGTTCGCCGATGGAGTCACGACGGCCATCACCAAAAGGCCTAACAATGAC
AATTTTAGATAGACTTGTGACATTGCTTCTGCTTTGGCTTTTAAGTTGATATATATTTCG
TGTGATTTCTTTTGACTTCTTAATGTTTCTCCAAAGCTTTTGATATATTGTACGAAGTGT
TTGTGTGT
GAGATCC

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DS 

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GCCACTAACACATTGTTAATAGCTTCATATCATACACCTCTCGAGTCTTTTCTCGAAAAA
AAAGGGAACTTTTAGAAGATAGGAGTAGCAACAGGAGTGAAACCGAGCAACTTCTTAGAA
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ACTCGGCTAAATGTCAACGGACTCGACACGGCCGTTTCTCTTTTCGCAATCGAAGCTACG
TTTCCTTTCTCGCTCTGTTCCTCTAGATTGAATTGTTCTACGCAGTACCTTCCAAGTTCT
TGAACTTCCATGTTGGTCTGAACGTTCGGAACATCCGACTTCCCTCCGACAAGGATGGAC
TTCCTTATCGCGTTCGCCGATGGAGTCACGACGGCCATCACCAAAATGCCTAACAATGAC
AATTTTAGATAGACTTGTGACATTGCTTCTGCTTTGGCTTTTAAGTTGATATATATTTCG
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TTGTGTGT
C

QA 1 668 1 668
DS 

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AG
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TTGAACTTCCATGTTGGTCTGAACGTTCGGAACATCCGACTTCCCTCCGACAAGGATGGA
CTTCCTTATCGCGTTCGCCGATGGAGTCACGACGGCCATCACCAAAATGCCTAACAATGA
CAATTTTAGATAGACTTGTGACATTGCTTCTGCTTTGGCTTTTAAGTTGATATATATTTC
GTGTGATTTCTTTTGACTTCTTAATGTTTCTCCAAAGCTTTTGATATATTGTACGAAGTG
TTTGTGTGT
C

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DS 



AS 1 5

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CAACGCTATGAGCAAGAGCTCCTAACACTACAAACACATGGAATATCTGATGGCTATGTC
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AGAGGTGTGACATGGAGCTGCAGATCAAGCAGGTCATTGCTCCGGTTAAGAAGACTAGCC
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ACGACCACGGCCAGCGAATTGTCACTCCGGAGAAGGCGCTGACAAATCCGGCGAGGCCGA
GCTCCGTGGTTTCCATGGAGCTCACCACCATCATCCATCCGAATATCAGAAACCCACCTA
AGTGCGTCCAGATGTTGAGAGTCTCGTTGTGCCACGAGAAAGCGCTGAGGAAAGTCTCCT
TGAGAGACCATTCACATCGGTAATGATTGTGTATGTACTCGTTGTCTTTGAGATACCTCG
GCAACTCCTCGAACTTCATCAATCTCTTCTCAGATCTCTTCTTCTCACATGAATCCAAAG
CCTTTTCATTTCTTGACGTTGTTGTCTTGGAAGATTCCCTCACCGCTCTCCGTTTCTGCA
TGATTGTTACCTCCCTCTCGGACCTCCCCGGAAAACAATAAAACAAATGGGAGGACAAAT
CGAGAGTTCGAGCTCCGGCGAGATTTCCGGCGAAGCAACCACCGTCGTTTATCTCTTTTA
TGTATTTTTTTTCTTGATATTGAGAATTAGTTTTGGTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 10 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G445JQ U 38
AF RS1DN27JQ U 1
AF RS1F004JQ U 61
AF RS1DN27TF C 170
AF RS1EZ47TF C 557
BS 1 409 RS1DN27JQ
BS 410 410 RS1G445JQ
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BS 846 936 RS1DN27TF
BS 937 1361 RS1EZ47TF

RD RS1G445JQ 542 0 0
G
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AAATCCATGATAAGAAGAGAGGCAACACTATGAGCAAGGGCTCCTAACACTACAAACACA
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GCTGAGAGCGCTGGAGAGAGGAGAGCAAAGATGGCGAGGAGACCAAGGATAGAGATCGAG
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A

QA 2 542 2 542
DS 

RD RS1DN27JQ 636 0 0
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TGTAACACATACATTATGATACGTTGAATGAAATATCACTAAACGTTTTACAGTTCTGTT
ACTTGCTTCAAAAGGCACAAGAAGGCGAAGCACGTCGAAAATCCATGATAAGAAGAGAGG
CAACGCTATGAGCAAGAGCTCCTAACACTACAAACACATGGAATATCTGATGGCTATGTC
CCGCAATATCGAAAGCACCAGGCTTCCATCTCTCCGGTATACGGCTAACGTAAAACCCTG
CCCCCGTTGCATACAACACAGCCATCGCTAGCTCGTAACCAAGAGCGATAAGCACGTTGG
GATGATCCCAGTGAAGGTAAAGCACGTGCGAAGCGGGTATGGCGCCTGAAAATCCCATCG
TTAGGAAAAGAGCTGCCCTGAAAGATCTGAAACGGGGAGCTGAGAGTGCTGGAGAGAGGA
GAGCAAAGATGGCGAGGAGACCAAGGATAGAGATCGAGGAGAGGTAGAAGAGGCGCCAGT
TAGTGTGGCAAGAGAATGCGTAGTAGATTGGTGCGAAGAAGGAGCAGACGATCATGAGGG
AGATTCCTGCGTAGTCTAGGCGCCAGAAGAAGAGGT

QA 1 636 1 636
DS 

RD RS1F004JQ 785 0 0
C
GTAACACATACATTATGATACGTTGAATGAAATATCACTAAACGTTTTACAGTTCTGTTA
CTTGCTTCAAAAGGCACAAGAAGGCGAAGCACGTCGAAAATCCATGATAAGAAGAGAGGC
AACACTATGAGCAAGGGCTCCTAACACTACAAACACATGGAATATCTGATGGCTATGTCC
CGCAATATCGAAAGCACCAGGCTTCCATCTCTCCGGTATACGGCTAACGTAAAACCCTGC
CCCCGTTGCATACAACACAGCCATCGCTAGCTCGTAACCAAGAGCGATAAGCACGTTGGG
ATGATCCCAGTGAAGGTAAAGCACGTGCGAGGCGGGTATGACGCCTGAAAATCCCATCGT
TAGGAAAAGAGCTGCTCTGAAAGATCTGAAACGGGGAGCTGAGAGCGCTGGAGAGAGGAG
AGCAAAGATGGCGAGGAGACCAAGGATAGAGATCGAGGAGAGGTAGAAGAGGCGCCAGTT
AGTGTGGCAAGAGAATGCGTAATAAATTGGTGCGAAGAAGGAGCAAACGATCATAAGGGA
GATCCCTGCGTAGTCTAGGCGCCAGAAAAAGAGGTTGAAACGTCTGGAGTGGCAGGCGAA
GAGGTGTGACATGGAGCTGCATATCAAGCAGGTCATTGCTCCGGTTAAGAAGACTAGCCA
TGGCCATTTGGGAATTGTTTCGTAGTTAACTTCTCCTTGTGTGTTCAAGAACAAGCTAGT
GTGTGTCACGTTCGAGTCGTGATGATCGCTGGAGAAGAAGTAAACGGCTTTAGCCATTGA
CGAC

QA 2 785 2 785
DS 

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GATAGAGAGAGGC
ACGCTATGAGCA*GAGCTCCTAACACTACAAACACATGGAATATCTGATGGCTATGTCCC
GCAATATCGAAAGCACCAGGCTTCCATCTCTCCGGTATACGGCTAACGTAAAACC*TGCC
CCCGTTGCATACAACACAGCCATCGCTAGCTCGTAACCAAGAGCGATAAGCACGTTGGGA
TGATCCCAGTGAAGGTAAAGCACGTGCGAAGCGGGTATGGCGCCTGAGAATCCCATCGTT
AGGAAAAGAGCTGCCCTGAAAGATCTGAAACGGGGAGCTGAGAGTGCTGGAGAGAGGAGA
GCAAAGATGGCGAGGAGACCAAGGATAGAGATCGAGGAGAGGTAGAAGAGGCGCCAGTTA
GTGTGGCAAGAGAATGCGTAGTAGATTGGTGCGAAGAAGGAGCAGACGATCATGAGGGAG
ATTCCTGCGTAGTCTAGGCGCCAGAAGAAGAGGTTGAAACGTCTGGAGTGGCAGGCGAAG
AGGTGTGATATGGAGCTGCAGATCAAGCAGGTCATTGCTCCGGTTAAGAAGACTAGCCAT
GGCCATTTGGGAACTGTTTCGTAGTTAACTTCTCCTTGTGTGTTCAAGAACGAGCTAGTG
TGTGTCACGTTCGAGTCGTGATGATCGCTGGAGAAGAAGTAAACGGCTTTAGCCATTGAC
GACCACGGCCAGCGAATTGTCACTCCGGAGAAGGCGCTGACAAATCCGGCGAGGCCGAGC
TCCGTGGTTTCCATGGAGCTCACCACCATCATCC

QA 14 767 14 767
DS 

RD RS1EZ47TF 805 0 0
TGCGTAGTAGATTGGTGCGAAGAAGGAGCAGACGATCATGAGGGAGATTC*TGCGTAGTC
TAGGCGCCAGAAGAAGAGGTTGAAACGTCTGGAGTGGCAGGCGAAGAGGTGTGACATGGA
GCTGCAGATCAAGCAGGTCATTGCTCCGGTTAAGAAGACTAGCCATGGCCATTTGGGAAC
TGTTTCGTAGTTAACTTCTCCTTGTGTGTTCAAGAACGAGCTAGTGTGTGTCACGTTCGA
GTCGTGATGATCGCTGGAGAAGAAGTAAACGGCTTTAGCCATTGACGACCACGGCCAGCG
AATTGTCACTCCGGAGAAGGCGCTGACAAATCCGGCGAGGCCGAGCTCCGTGGTTTCCAT
GGAGCTCACCACCATCATCCATCCGAATATCAGAAACCCACCTAAGTGCGTCCAGATGTT
GAGAGTCTCGTTGTGCCACGAGAAAGCGCTGAGGAAAGTCTCCTTGAGAGACCATTCACA
TCGGTAATGATTGTGTATGTACTCGTTGTCTTTGAGATACCTCGGCAACTCCTCGAACTT
CATCAATCTCTTCTCAGATCTCTTCTTCTCACATGAATCCAAAGCCTTTTCATTTCTTGA
CGTTGTTGTCTTGGAAGATTCCCTCACCGCTCTCCGTTTCTGCATGATTGTTACCTCCCT
CTCGGACCTCCCCGGAAAACAATAAAACAAATGGGAGGACAAATCGAGAGTTCGAGCTCC
GGCGAGATTTCCGGCGAAGCAACCACCGTCGTTTATCTCTTTTATGTATTTTTTTTCTTG
ATATTGAGAATTAGTTTTGGTCTCC

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 6

CO CL871Contig1 1181 6 17 U
CCATCTGGTTTCATTAAAAACATTGAAAGATACAAGGTGAAATACAGAGCCGGCGGAACA
TTCGGAACATCCCCGGAAGCTAATGCCCATAAAGGGAGACTAGAACCCAAACAACCGGGC
TGCATACTAACATCAAGAACTTAAACTAAATACCTACACTCCTTTATAGAAACTCATAAT
CAAACTCCCATAGATAAAAAGAACAGACTTAAAAGCCTATGACTAGCCGGAATCCAAGCA
ACAACGCAATGCAAAACGCATGACAACTTCAGACAGAGCAGAAACCTCATCTGAACCCCC
CTGTTCACGATGACCACAGCTACACCTCTTCGACAAACTGAAGACAACAACCAGGATGAA
ACAACACCCACCAGAGCACTAACTCAACCGCATACTAAGCTGGAAGCCTCCATGTCTCAA
CCTCTGTATATTGCTTTAACCAAACAAAGCCACGAGGAACACAAAGACCAAAGGACAGCC
AGAAGAAACACCAATTCAAAAGGCGGGAGAAAGTCTCCTTCAAACCTGAAAGACTAATAG
GTGGTCTGAAACAACCTATTTCTCAAGGACCAAAACCTCCAATTGCTCACTACACACCAC
CACGTCACTGCCACACCGTTGCTGAATCAAAGACCAACTAAGAGAAGCTCAAAATCAAGG
GAGATTAACCGGACTCAACCCCTTTGCCGGAAGTACACAAAGCTGATGGAGAGACACCAG
AACGGAACTGAGGAGCTCTCACTACCAATGGATACATAAGACTTCGGCCGGATCTGATAC
CCAGAAAAAGCGGATCTGAAAACTTGAACAAAACTGCAAAATCCAGAACCCTAGATCTAC
AAAGGAGAAAAATAACAAATCTGCAAACAGGCCACAGATCTGTCAACAAAGAGCCTTAAC
AAAGGTTAACAAAAGCACATCAGTGCCATCAAAAACCAAAGAGAGAACATACAAAAGGAG
ATGCAAGTTTGAGAAGAAAGGAAAAGCAACAACCAACGATTACAACTAGACAGACTGCTC
CGACGGCGACGCAAAGGACGCGCCACCGCCGGAACCAACACAAATCAACCGGAGGAGAAG
AAGAAACTTAAGAGAGAAGGGAGAGCAAAACTAGAGAGAGAGCGATTATCAGGTTCCACT
TCTAATACATCTTCAAGTTCAAAAGCTCCATTCTATATTCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CN09JQ U 45
AF RS1FM92JQ U 1
AF RS1CN84JQ U 1
AF RS1B689JQ U 1
AF RS1B689TF C 528
AF RS1CN84TF C 894
BS 1 280 RS1B689JQ
BS 281 281 RS1CN09JQ
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BS 425 801 RS1B689JQ
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BS 821 821 RS1B689TF
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BS 986 1129 RS1B689TF
BS 1130 1181 RS1CN84TF

RD RS1CN09JQ 323 0 0
CAGAGCCGGCGGAACATTCGGAACATCCCCGGAAGCTAATGCCCATAAAGGGAGACTAGA
ACCCAAACAACCGGGCTGCATACTAACATCAAGAACTTAAACTAAATACCTACACTCCTT
TATAGAAACTAATAATCAAACTCCCATAGATAAAAAGAACAGACTTAAAAGCCTATGACT
AGCCGGAATCCAAGCAACAACGCAATGCAAAACGCATGACAACTTCAGACAGAGCAGAAA
CCTCATCTGAACCCCCCTGTTCACGATGACCACAGCTACACCTCTTCGACAAACTGAAGA
CAACAACCAGGATGAAACAACAC

QA 1 323 1 323
DS 

RD RS1FM92JQ 655 0 0
G
CATCTGGTTTCATTAAAAACATTGAAAGATACAAGGTGAAATACAGAGCCGGTGGAACAT
TCGGAACATCCCCGGAAGCTAATGCCCATAAAGGGAGACTAGAACCCAAACAACCGGGCT
GCATACTAACATCAAGAACTTAAACTAAATACCTACACTCCTTTATAGAAACTCATAATC
AAACTCCCATAGATAAAAAGAACAGACTTAAAAGCCTATGACTAGCCGGAATCCAAGCAA
CAACGCAATGCAAAACGCATGACAACTTCAGACAGAGCAGAAACCTCATCTGAACCCCCC
TGTTCACGATGACCACAGCTACACCTCTTCGACAAACTGAAGACGACAACCAGGATGAAA
CAACACCCACCAGAGCACTAACTCAACCGCATACTAAGCTGGAAGCCTCCATGTCTCAAC
CTCTGTATATTGCTTTAACCAAACAAAGCCACGAGGAACACAAAGACCAAAGGACAGCCA
GAAGAAACACCAATTCAAAAGGCGGGAGAAAGTCTCCTTCAAACCTGAAAGACTAATAGG
TGGTCTGAAACAACCTATTTCTCAAGGACCAAAACCTCCAATTGCTAACTACACACCACC
ACGTCACTGCCACACCGTTGCTGAATCAAAGACCAACTAAGAGAAGCTCAAAAT

QA 2 655 2 655
DS 

RD RS1CN84JQ 691 0 0
G
CATCTGGTTTCATTAAAAACATTGAAAGATACAAGGTGAAATACAGAGCCGGTGGAACAT
TCGGAACATCCCCGGAAGCTAATGCCCATAAAGGGAGACTAGAACCCAAACAACCGGGCT
GCATACTAACATCAAGAACTTAAACTAAATACCTGCACTCCTTTATAGAAACTCATAATC
AAACTCCCATAGATAAAAAGAACAGACTTAAAAGCCTATGACTAGCCGGAATCCAAGCAA
CAACGCAATGCAAAACGCATGACAACTTCAGACAGAGCAGAAACCTCATCTGAACCCCCC
TGTTCACGATGACCACAGCTACACCTCTTCGACAAACTGAAGACAACAACCAGGATGAAA
CAACACCCACCAGAGCACTAACTCAACCGCATACTAAGCTGGAAGCCTCCATGTCTCAAC
CTCTGTATATTGCTTTAACCAAACAAAGCCACGAGGAACACAAAGACCAAAGGACAGC*A
GAAGAAACACCAATTCAAAAGGCGGGAGAAAGTCTCCTTCAAACCTGAAAGACTAATAGG
TGGTCTGAAACAACCTATTTCTCAAGGACCAAAACCTCCAATTGCTCACTACACACCACC
ACGTCACTGCCAC**CGTTGCTGAATCAAAGACCAACTAAGAGAAGCTCAAAATCAAGGG
AGATTAACCGGACTCAACCCCTTTGCCGGA

QA 2 691 2 691
DS 

RD RS1B689JQ 838 0 0
CCATCTGGTTTCATTAAAAACATTGAAAGATACAAGGTGAAATACAGAGCCGGCGGAACA
TTCGGAACATCCCCGGAAGCTAATGCCCATAAAGGGAGACTAGAACCCAAACAACCGGGC
TGCATACTAACATCAAGAACTTAAACTAAATACCTACACTCCTTTATAGAAACTCATAAT
CAAACTCCCATAGATAAAAAGAACAGACTTAAAAGCCTATGACTAGCCGGAATCCAAGCA
ACAACGCAATGCAAAACGCATGACAACTTCAGACAGAGCAAAAACCTCATCTGAACCCCC
CTGTTCACGATGACCACAGCTACACCTCTTCGACAAACTGAAGACAACAACCAGGATGAA
ACAACACCCACCAGAGCACTAACTCAACTGCATACTAAGCTGGAAGCCTCCATGTCTCAA
CCTTTGTATATTGCTTTAACCAAACAAAGCCACGAGGAACACAAAGACCAAAGGACAGCC
AGAAGAAACACCAATTCAAAAGGCGGGAGAAAGTCTCCTTCAAACCTGAAAGACTAATAG
GTGGTCTGAAACAACCTATTTCTCAAGGACCAAAACCTCCAATTGCTCACTACACACCAC
CACGTCACTGCCACACCGTTGCTGAATCAAAGACCAACTAAGAGAAGCTCAAAATCAAGG
GAGATTAACCGGACTCAACCCCTTTGCCGGAAGTACACAAAGCTGATGGAGAGACACCAG
AACGGAACTGAGGAGCTCTCACTACCAATGGATACATAAGACTTCGGCCGGATCTGATAC
CCAGAAAAAGCGGATCTGAAA*CTTGAACAAA*CTGCAAA*TCCAGAACCCTAGATCT

QA 1 838 1 838
DS 

RD RS1B689TF 618 0 0
GAAAGACTAATAGGTGGTCTGAAACAACCTATTTCTCAAGGACCAAAACCTCCAATTGCT
CACTACACACCACCACGTCACTGCCACACCGTTGCTGAATCAAAGACCAACTAAGAGAAG
CTCAAAATCAAGGGAGATTAACCGGACTCAACCCCTTTGCCGGAAGTACACAAAGCTGAT
GGAGAGACACCAGAACGGAACTGAGGAGCTCTCACTACCAATGGATACATAAGACTTCGG
CCGGATCTGATACCCAGAAAAAGCGGATCTGAAAACTTGAACAAAACTGCAAAATCCAGA
ACCCTAGATCTACAAAGGAGAAAAATAACAAATCTGCAAACAGGCCACAGATCTGTCAAC
AAAGAGCCTTAACAAAGGTTAACAAAAGCACATCAGTGCCATCAAAAACCAAAGAGAGAA
CATACAAAAGGAGATGCAAGTTTGAGAAGAAAGGAAAGGCAACAACCAACGATTACAACT
AGACAGACTGCTCCGACGGCGACGCAAAGGACGCGCCACCGCCGGAACCAACACAAATCA
ACCGGAGGAGAAGAAGAAACTTAAGAGAGAAGGGAGAGCAAAACTAGAGAGAGAGCGATT
AT
TCTGTCGTTGTCTCCC

QA 1 602 1 602
DS 

RD RS1CN84TF 288 0 0
CCTTACCAAAGGTTAACAAAAGCACATCAGTGCCATCAAAAACCAAAGAGAGAACATACA
AAAGGAGATGCAAGTTTGAGAAGAAAGGAAAAGCAACAACCAACGATTACAACTAGACAG
ACTGCTCCGACGGCGACGCAAAGGACGCGCCACCGCCGGAACCACCACAAATCAACCGGA
GGAGAAGAAGAAACTTAAGAGAGAAGGGAGAGCAAAACTAGAGAGAGAGCGATTATCAGG
TTCCACTTCTAATACATCTTCAAGTTCAAAAGCTCCATTCTATATTCC

QA 1 288 1 288
DS 



AS 1 6

CO CL872Contig1 1222 6 19 U
GGACTCAGATGAATGCTCTTTGTCCCTTGTTGTCGCATATTCGAAATCCCCAACTTTCCT
TTCATGGCATCCTCCTCTCCCACTCACCCCTTCTTCTATCTCTCCCATGATCCTTCTTCT
TCCACCTCTCTCCTTCATCTTCAAACCCAAATAACGATCTCAGGTTCTAAGGACTTTGAG
AAGACCCGTTTGAGAATTCCCGTTTCTTTCAGGAAAAAAGCTGCCAACTTGCAAATGATG
GCATCAGGGAAGACACCTGGACTGACTCAGGAAGCTACAATTGACAGAGAAGATAACGCT
GACGTGTTCGACGACATGAAACAGCGGTTCCTCGCCTTTAAGAAGCAAAAGTACATGGAT
AACTTGGAACATTTCAAAAAACTGGCAGATGCTCAAGCTCCAAAGTTTCTGGTGATTGCT
TGTGCAGACTCTAGGGTTTGTCCTTCAGCCATACTGGGATTCCAACCTGGTGATGCATTC
ACTGTTCGTAACATTGCAAACTTAGTTCCCTCATATGAGTCTGGACCTACTGAAACAAAA
GCTGCTCTGGAGTTCTCTGTGAATACTCTTAAGGTGGAGAACATCTTAATTATTGGTCAT
AGCCGGTGTGGAGGAATTCAAGCTTTGATGGGTATGCAAGACGAAAGAGATCCCAGAAGT
TTCATACATAACTGGGTGATTGTGGGAAAAAAGGCAAAGGAAAGCACAAAAGCTGTTGCT
TCAAACCTCAATTTTGATCATCAGTGCCAACATTGTGAAAAGGCGTCGATAAATCATTCA
TTAGAAAGGCTGCTTGGTTATCCTTGGATAGAAGAGAAAGTGCGGAAAGGATTACTGTCT
CTCCATGGTGGATACTATGATTTTGTAAACTGTACATTTGAGAAATGGACTGTAGATTAT
GGTGAAAGCAGAGGCAAGAAAGAAGGCAGTGGGATTGCTGTTAAAAACCGGTCTGTTTGG
TGATGATGACTTATGACCATCTCCTAGGACTGTCTTTCATAATTTTGAGACTCCATTTTC
TTGGAATGAGATCAAGCTTACGTGTTTTATTTGTTGCAGCTGTGTGTTGAAACTTTGGGT
GATTCCTACAGAGACCCACGTTTGTTTCTTCTTTTGATTTTCTTGATATAATCATCTTTG
TCCACTGTAGTGGGGATAAGATGCTTACAGTCAGTACTCAATACATTTGCCACTCATTTA
TAATTTTATTGTATGGTTGGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 15 35 35 35 35 35 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GG
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CATAACTGGGTGATTGTGGG
AAA

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TT
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T

QA 3 543 3 543
DS 



AS 1 6

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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FT63JQ U 1
AF RS1A838JQ U 14
AF RS1BI52JQ U 16
AF RS1A838TF C 283
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AF RS1BI52TF C 430
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BS 209 209 RS1A838JQ
BS 210 262 RS1FT63JQ
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BS 269 346 RS1FT63JQ
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BS 388 388 RS1A838JQ
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RD RS1FT63JQ 645 0 0
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AGTCCATTTTCTGTCGAGGGATAGGAATGAACAGGCTTCACAATCTCATGAAACTACCTT
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AATTGAGTTTCAGTACTGGAAATGTGCGAAAGAAGAATTATAAACCAACTTATGGCACTT
TGCAACAGCCAGGCTTAGACTGTTCAATAGTTTCAGTATGCATTCCGGTCAAGAGACCAA
GCTCAGTGTCATTCTAGCTTAAGACATCAACTGAATCCAATAGCT

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DS 

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TT
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ATAATGTTAACTAACCAAATTTGAAAGAAAATGGATCGCTTGGCCCCTCTCTTTCCAGCG
GAGGACGCTTTGTATGTTACTAAGGAAACTGGTCACTCGAGGAACAGTCCATTTTCTGTC
GAGGGATAGGAATAAACAGGCTTCACAATCTCATGAAACTACCTTCGCTCACGTTGACAT
GATCACC******AAACATGTTTGACGAAGCTGGGGCGACCTTCTCGTTTTCTAATCGGC
GGTGAAAACCGAGACGGC*GGGGAGGGATTAGATAGTTTCCGAGAGATGCTCAACGAATG
CTGAGTGATGACAACAGCACATGTGGTTTTAGTTAATAATATACACAGCCCTAATTACAA
TTTGTGGCAGACTGATAGCCTAAAACCCACTAAGCCAGTAACCAAAATTGAGTTTCAGTA
CTGGAAATGTGCGAAAGAAGAATTATAAACCAACTTATGGCACTTTGCAACAGCCAGGCT
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AGCTTAAGACATCAACTGAATCCAATAGCTCATTAGGGAACGGCGTATCCATTCCTCCAA
CGTCAAGGATGACTGAAACAACTGCTCTATTTA

QA 3 695 3 695
DS 

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ATAATGTTAACTAACCAAATTTGAAAGAAAATGGATCGCTTGGCCCCTCTCTTTCCAGCG
GAGGACGCTTTGTATGTTACTAAGGAAACTGGTCACTCGAGGAACAGTCCATTTTCTGTC
GAGGGATAGGAATAAACAGGCTTCACAATCTCATGAAACTACCTTCGCTCACGTTGACAT
GATCACC******AAACATGTTTGACGAAGCTGGGGCGACCTTCTCGTTTTCTAATCGGC
GGTGAAAACCGAGACGGC*GGGGAGGGATTAGATAGTTTCCGAGAGATGCTCAACGAATG
CTGAGTGATGACGACAGCACATGTGGTTTTAGTTAATAATATACACAGCCCTAATTACAA
TTTGTGGCAGACTGATAGCCTAAAACCCACTAAGCCAGTAACCAAAATTGAGTTTCAGTA
CTGGAAATGTGCGAAAGAAGAATTATAAACCAACTTATGGCACTTTGCAACAGCCAGGCT
TAGACTGTTCAATAGTTTCAGTATGCATTCCGGTCAAGAGACCAAGCTCAGTGTCATTCT
AGCTTAAGACATCAACTGAATCCAATAGCTCATTAGGGAACGGCGTATCCATTCCTCCAA
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TGAGTCAGGGATCTCTCTTTGAAGCAGCACACCACCGGCATTCCTCAAGATCTCGAGCTC
ATCATCGCTCCTCTTCTCAGTCCATCCTCTCATATTAGCACCACCTTTGATAATGATCGA
CATC

QA 1 844 1 844
DS 

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TTTAGTTAATAATATACACAGCCCTAATTACAATTTGTGGCAGACTGATAGCCTAAAACC
CACTAAGCCAGTAACCAAAATTGAGTTTCAGTACTGGAAATGTGCGAAAGAAGAATTATA
AACCAACTTATGGCACTTTGCAACAGCCAGGCTTAGACTGTTCAATAGTTTCAGTATGCA
TTCCGGTCAAGAGACCAAGCTCAGTGTCATTCTAGCTTAAGACATCAACTGAATCCAATA
GCTCATTAGGGAACGGCGTATCCATTCCTCCAACGTCAAGGATGACTGAAACAACTGCTC
TATTTAAGGCCTTAGCAACTTGAGAATGTTGACTGAGTCAGGGATCTCTCTTTGAAGCAG
CACACCACCGGCATTCCTCAAGATCTCGAGCTCATCATCGCTCCTCTTCTCAGTCCATCC
TCTCATATTAGCACCACCTTTGATAATGATCGACATCTTCGAATCAGCGAGGATACGGAA
GACGCCATACCGTGCACGACATCAACAGATGAACAAACTGTATGCTGGAGATCTTGTATA
TAAACCACAGACCCACAGCTTTCCAATAATTGGAAGATGAAGCGTGCTGGTTTTCAAGGA
TTCAGTGATCTCTGTCAAGAAGAGACCATGCTTCTATAATCCATCTACAAATCCAAATAC
AATGATTTCGTTAGTATAACATAGCATCTACGAATTTACAAAATAACAGGATAATTGACA
TTGCATTTCTGAGATTCC

QA 1 858 1 858
DS 

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TATAAACCAACTTATGGCACTTTGCAACAGCCAGGCTTAGACTGTTCAATAGTTTCAGTA
TGCATTCCG*TCAAGAGACCACGCTCAGTGTCATTCTAGCTTAAGACATCAACTGAATCC
AATAGCTCATTAGGGAACGGCGTATCCATTCCTCCAACGTCAAGGATGACTGAAACAACT
GCTCTATTTAAGGCCTTAGCAACTTGAGAATGTTGACTGAGTCAGGGATCTCTCTTTGAA
GCAGCACACCACCGGCATTCCTCAAGATCTCGAGCTCATCATCGCTCCTCTTCTCAGTCC
ATCCTCTCATATTAGCACCACCTTTGATAATGATCGACATCTTCGAATCAGCGAGGATAC
GGAAGACGCCATACCGTGCACGACATCAACAGATGAACAAACTGTATGCTGGAGATCTTG
TATATAAACCACAGACCCACAGCTTTCCAATAATTGGAAGATGAAGCGTGCTGGTTTTCA
AGGATTCAGTGATCTCTGTCAAGAAGAGACCATGCTTCTATAATCCATCTACAAATCCAA
ATACAATGATTTCGTTAGTATAACATAGCATCTACGAATTTACAAAATAACAGGATAATT
GACATTGCATTTCTGAGATTCC

QA 1 682 1 682
DS 

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TCAGTACTGGAAATGTGCGAAAGAAGAATTATAAACCAACTTATGGCACTTTGCAACAGC
CAGGCTTAGACTGTTCAATAGTTTCAGTATGCATTCCGGTCAAGAGACCAAGCTCAGTGT
CATTCTAGCTTAAGACATCAACTGAATCCAATAGCTCATTAGGGAACGGCGTATCCATTC
CTCCAACGTCAAGGATGACTGAAACAACTGCTCTATTTAAGGCCTTAGCAACTTGAGAAT
GTTGACTGAGTCAGGGATCTCTCTTTGAAGCAGCACACCACCGGCATTCCTCAAGATCTC
GAGCTCATCATCGCTCCTCTTCTCAGTCCATCCTCTCATATTAGCACCACCTTTGATAAT
GATCGACATCTTCGAATCAGCGAGGATACGGAAGACGCCATACCGTGCACGACATCAACA
GACGAACAAACTGTATGCTGGAGATCTTGTATATAAACCACAGACCCACAGCTTTCCAAT
AATTGGAAGATGAAGCGTGCTGGTTTTCAAGGATTCAGTGATCTCTGTCAAGAAGAGACC
ATGCTTCTATAATCCATCTACAAATCCAAATACAATGATTTCGTTAGTATAACATAGCAT
CTACGAATTTACAAAATAACAGGATAATTGACATTGCATTTCTGAGATTCC

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 6

CO CL874Contig1 804 6 4 U
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TCCCTATCAACTCTTTGCAGCTCTACTTCGTCTTCTCTTCATCCCAAATCAAATTCTCTT
TCGGCAAAGTTATCCTCCAAAGCAAATGTATCAGTCCAGTTCCTGGGAAAGAGACAGTCC
CCACTTCTCTCCTCAACCCCGAGATTTCTCACCGTCATCGCCATGGCTCCACCCAAACCC
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TGCAAGGACTACAATGCTAGAACCGCTGATAAAGCTGGTTACATCATTCCTGTCGAAATC
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GTGATAACAATAGACCAGCTTCGCACAATCGCAGCTGAGAAGCTGCCCGATCTGAACTGC
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ATAGACCCTCCAGTTCTTGAACCCAAAAAGAAAGCAGTTTTGTTGTAAAAGCCTGCACTG
TGGTTTCTGTGCTTTTGTTTGTTTCTAAATGTAATTTCCAACAAGACACTTGGGAGATCT
CCATATGAACATTATCTTGCGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RS1BF53TF U 9
AF RS1GC35TF U 11
AF RS1GC35JQ C 60
AF RS1AI55TF U 1
AF RS1GV42TF U 28
AF RS1AI55JQ C 41
BS 1 788 RS1AI55TF
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BS 804 804 RS1GV42TF

RD RS1BF53TF 672 0 0
GGGA
GAACTCGCCTTCTGCTATCACAACCTTGTTCCTTCAATGGCGTCTTCTTCCCTATCAACT
CTTTGCAGCTCTACTTCGTCTTCTCTTCATCCCAAATCAAATTCTCTTTCGGCAAAGCTA
TCCTCCAAAGCAAATGTATCAGTCCAGTTCCTGGGAAAGAGACAGTCCCCACTTCTCTCC
TCAACCCCGAGATTTCTCACCGTCATCGCCATGGCTCCACCCAAACCCGGAGGCAAAGCC
AAGAAAGTTGTGGGGCTGATAAAACTGGCTCTTGAGGCCGGGAAAGCAACTCCGGCTCCT
CCGGTAGGTCCGGCGCTTGGTTCAAAGGGTGTCAACATTATGGCTTTCTGCAAGGACTAC
AATGCTAGAACCGCTGATAAAGCTGGTTATATCATTCCTGTCGAAATCACTGTCTTCGAT
GATAAGAGCTTCACCTTTATCCTCAAGACCCCGCCTGCTTCGGTTTTGTTGCTTAAGGCT
GCAGGTGTTGAGAAGGGATCGAAAGATCCAAAGCAAGATAAAGTTGGGGTGATAACAATA
GACCAGCTTCGCACAATCGCAGCTGAGAAGCTGCCCGATCTGAACTGCACGACCATTGAA
TCCGCTATGAGAATCATTGCAG*AACTGCAGCTAACATGGGGATCGACATAGACCCTCCA
GTTCTTGA

QA 5 672 5 672
DS 

RD RS1GC35TF 674 0 0
GG
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CTTTGCAGCTCTACTTCGTCTTCTCTTCATCCCAAATCAAATTCTCTTTCGGCAAAGTTA
TCCTCCAAAGCAAATGTATCAGTCCAGTTCCTGGGAAAGAGACAGTCCCCACTTCTCTCC
TCAACCCCGAGATTTCTCACCGTCATCGCCATGGCTCCACCCAAACCCGGAGGCAAAGCC
AAGAAAGTTGTGGGGCTGATAAAACTGGCTCTTGAGGCCGGGAAAGCAACTCCGGCTCCT
CCGGTAGGTCCGGCTCTTGGTTCAAAGGGTGTCAACATTATGGCTTTCTGCAAGGACTAC
AATGCTAGAACCGCTGATAAAGCTGGTTACATCATTCCTGTCGAAATCACTGTCTTCGAT
GATAAGAGCTTCACCTTTATCCTCAAGACCCCGCCTGCTTCGGTTTTGTTGCTTAAGGCT
GCAGGTGTTGAGAAGGGATCGAAAGATCCAAAGCAAGATAAAGTTGGGGTGATAACAATA
GACCAGCTTCGCACAATCGCAGCTGAGAAGCTGCCCGATCTGAACTGCACGACCATTGAA
TCCGCTATGAGAATCATTGCAG*AACTGCAGCTAACATGGGGATCGACATAGACCCTCCA
GTTCTTGAACCC

QA 3 674 3 674
DS 

RD RS1GC35JQ 707 0 0
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TTCGGCAAAGTTATCCTCCAAAGCAAATGTATCAGTCCAGTTCCTGGGAAAGAGACAGTC
CCCACTTCTCTCCTCAACCCCGAGATTTCTCACCGTCATCGCCATGGCTCCACCCAAACC
CGGAGGCAAAGCCAAGAAAGTTGTGGGGCTGATAAAACTGGCTCTTGAGGCCGGGAAAGC
AACTCCGGCTCCTCCGGTAGGTCCGGCTCTTGGTTCAAAGGGTGTCAACATTATGGCTTT
CTGCAAGGACTACAATGCTAGAACCGCTGATAAAGCTGGTTACATCATTCCTGTCGAAAT
CACTGTCTTCGATGATAAGAGCTTCACCTTTATCCTCAAGACCCCGCCTGCTTCGGTTTT
GTTGCTTAAGGCTGCAGGTGTTGAGAAGGGATCGAAAGATCCAAAGCAAGATAAAGTTGG
GGTGATAACAATAGACCAGCTTCGCACAATCGCAGCTGAGAAGCTGCCCGATTTGAACTG
CACGACCATTGAATCCGCTATGAGAATCATTGCAGGAACTGCAGCTAACATGGGGATCGA
CATAGACCCTCCAGTTCTTGAACCCAAAAAGAAAGCAGTTTTGTTGTAAAAGCCTGCACT
GTGGTTTCTGTGCTTTTGTTTGTTTCTAAATGTAATTTCCAACAAGA

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1AI55TF 803 0 0
GGGGCAATCCGAGAACTCGCCTTCTGCTATCACAACCTTGTTCCTTCAATGGCGTCTTCT
TCCCTATCAACTCTTTGCAGCTCTACTTCGTCTTCTCTTCATCCCAAATCAAATTCTCTT
TCGGCAAAGTTATCCTCCAAAGCAAATGTATCAGTCCAGTTCCTGGGAAAGAGACAGTCC
CCACTTCTCTCCTCAACCCCGAGATTTCTCACCGTCATCGCCATGGCTCCACCCAAACCC
GGAGGCAAAGCCAAGAAAGTTGTGGGGCTGATAAAACTGGCTCTTGAGGCCGGGAAAGCA
ACTCCGGCTCCTCCGGTAGGTCCGGCTCTTGGTTCAAAGGGTGTCAACATTATGGCTTTC
TGCAAGGACTACAATGCTAGAACCGCTGATAAAGCTGGTTACATCATTCCTGTCGAAATC
ACTGTCTTCGATGATAAGAGCTTCACCTTTATCCTCAAGACCCCGCCTGCTTCGGTTTTG
TTGCTTAAGGCTGCAGGTGTTGAGAAGGGATCGAAAGATCCAAAGCAAGATAAAGTTGGG
GTGATAACAATAGACCAGCTTCGCACAATCGCAGCTGAGAAGCTGCCCGATCTGAACTGC
ACGACCATTGAATCCGCTATGAGAATCATTGCAGGAACTGCAGCTAACATGGGGATCGAC
ATAGACCCTCCAGTTCTTGAACCCAAAAAGAAAGCAGTTTTGTTGTAAAAGCCTGCACTG
TGGTTTCTGTGCTTTTGTTTGTTTCTAAATGTAATTTCCAACAAGACACTTGGGAGATCT
CCATATGA*CATTATCTTGCGTG

QA 1 803 1 803
DS 

RD RS1GV42TF 777 0 0
G
ATCACAACCTTGTTCCTTCAATGGCGTCTTCTTCCCTATCAACTCTTTGCAGCTCTACTT
CGTCTTCTCTTCATCCCAAATCAAATTCTCTTTCGGCAAAGTTATCCTCCAAAGCAAATG
TATCAGTCCAGTTCCTGGGAAAGAGACAGTCCCCACTTCTCTCCTCAACCCCGAGATTTC
TCACCGTCATCGCCATGGCTCCACCCAAACCCGGAGGCAAAGCCAAGAAAGTTGTGGGGC
TGATAAAACTGGCTCTTGAGGCCGGGAAAGCAACTCCGGCTCCTCCGGTAGGTCCGGCGC
TTGGTTCAAAGG*TGTCAACATTATGGCTTTCTGCAAGGACTACAATGCTAGAACCGCTG
ATAAAGCTGGTTATATCATTCCTGTCGAAATCACTGTCTTCGATGATAAGAGCTTCACCT
TTATCCTCAAGACCCCGCCTGCTTCGGTTTTGTTGCTTAAGGCTGCAGGTGTTGAGAAGG
GATCGAAAGATCCAAAGCAAGATAAAGTTGGGGTGATAACAATAGACCAGCTTCGCACAG
TCGCAGCTGAGAAGCTGCCCGATCTGAACTGCACGACCATTGAATCCGCTATGAGAATCA
TTGCAG*AACTGCAGCTAACATGGGGATCGACATAGACCCTCCAGTTCTTGAACCCAAAA
*GAAAGCAGTTTTGTTGTAAAG**CTGCACTGTGGTTTCTGTGCTTTTGTT*GTTTCTAA
*TGTA*TTTCCAACAAGACACTTGAGAGATCTCCATATGAACATTATCTTGCGTGG

QA 2 777 2 777
DS 

RD RS1AI55JQ 763 0 0
TTCCTTCAATGGCGTCTTCTTCCCTATCAACTCTTTGCAGCTCTACTTCGTCTTCTCTTC
ATCCCAAATCAAATTCTCTTTCGGCAAAGTTATCCTCCAAAGCAAATGTATCAGTCCAGT
TCCTGGGAAAGAGACAGTCCCCACTTCTCTCCTCAACCCCGAGATTTCTCACCGTCATCG
CCATGGCTCCACCCAAACCCGGAGGCAAAGCCAAGAAAGTTGTGGGGCTGATAAAACTGG
CTCTTGAGGCCGGGAAAGCAACTCCGGCTCCTCCGGTAGGTCCGGCTCTTGGTTCAAAGG
GTGTCAACATTATGGCTTTCTGCAAGGACTACAATGCTAGAACCGCTGATAAAGCTGGTT
ACATCATTCCTGTCGAAATCACTGTTTTCGATGATAAGAGCTTCACCTTTATCCTCAAGA
CCCCGCCTGCTTCGGTTTTGTTGCTTAAGGCTGCAGGTGTTGAGAAGGGATCGAAAGATC
CAAAGCAAGATAAAGTTGGGGTGATAACAATAGACCAGCTTCGCACAATCGCAGCTGAGA
AGCTGCCCGATTTGAACTGCACGACCATTGAATCCGCTATGAGAATCATTGCAGGAACTG
CAGCTAACATGGGGATCGACATAGACCCTCCAGTTCTTGAACCCAAAAAGAAAGCAGTTT
TGTTGTAAAAGCCTGCACTGTGGTTTCTGTGCTTTTGTTTGTTTCTAAATGTAATTTCCA
ACAAGACACTTGGGAGATCTCCATATGAACATTATCTTGCGTG

QA 1 763 1 763
DS 



AS 2 6

CO CL875Contig1 821 2 8 U
GGATAACGCCCATCGGACCAATTCTCGACGGATCTGCAAACTCTGTTGATTCCTTCTTCT
GTTCTTCCTCTCCTTGTACGAAGCAGTATCTCTTGATTTTTTCTTCAGACAAAAGGAATA
TCTAATGGGACCCAAAGCTGGAACCTTTGTTCTTTTCTTGCTGGGTTTGACCCTTCTTTC
TCACGCTAGATCCTTCCTTCCCTCCACCCTCTCAGAGGAAGTGTACAAGGATGAAAAGGT
TTGCAGTCTATGTGAGGAGTATGTTAACTCTGCTCTCAGCTACCTTGAGAAAAACGAAAC
ACAGAGTCAGATATTAGAGGACCTTCATGACCAGTGTTCCCATATCCGCGGATTTGAACA
ACAGTGCATAACTTTGGTTGACTACTACCTCCCTCTCTTCTTCTTGCATCTTGAGTCCTT
TCAACCTCATTATTTCTGCAAGAGGTTGAATCTTTGTGGTCACGTCGTAGCTCTTGTTGA
AGAAGCTCGTCAGGATACTTGCGATGTTTGCCACAGGACTGTTTCTGAGATTCTCATCAA
ACTACAAGATCCCGACACACAGCTGGATATAGTTGAGCTGCTTCTTAAGGGATGCAAGTC
GTTCAAAAACCACGAGTACGAGAAGAAGTGCAAGAAGTTGGTGTTCGAGTATGGACCTTT
GATCCTCGTGAATGCAGAGGAATTCCTAGTGAAAACGACATCTGCACACTCTTACGCGCA
TGTCCCAACCAGCAAAGGTTCTAAGCTGCCAGCAGGTTGGCGGATTCTTGATATGTTATG
TAAGTGGTAGACGCACAACAAGTTTGATTGTGTATTTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B660TF U 1
AF RS1BQ86TF U 10
BS 1 562 RS1B660TF
BS 563 563 RS1BQ86TF
BS 564 681 RS1B660TF
BS 682 682 RS1BQ86TF
BS 683 725 RS1B660TF
BS 726 726 RS1BQ86TF
BS 727 736 RS1B660TF
BS 737 821 RS1BQ86TF

RD RS1B660TF 736 0 0
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GTTCTTCCTCTCCTTGTACGAAGCAGTATCTCTTGATTTTTTCTTCAGACAAAAGGAATA
TCTAATGGGACCCAAAGCTGGAACCTTTGTTCTTTTCTTGCTGGGTTTGACCCTTCTTTC
TCACGCTAGATCCTTCCTTCCCTCCACCCTCTCAGAGGAAGTGTACAAGGATGAAAAGGT
TTGCAGTCTATGTGAGGAGTATGTTAACTCTGCTCTCAGCTACCTTGAGAAAAACGAAAC
ACAGAGTCAGATATTAGAGGACCTTCATGACCAGTGTTCCCATATCCGCGGATTTGAACA
ACAGTGCATAACTTTGGTTGACTACTACCTCCCTCTCTTCTTCTTGCATCTTGAGTCCTT
TCAACCTCATTATTTCTGCAAGAGGTTGAATCTTTGTGGTCACGTCGTAGCTCTTGTTGA
AGAAGCTCGTCAGGATACTTGCGATGTTTGCCACAGGACTGTTTCTGAGATTCTCATCAA
ACTACAAGATCCCGACACACAGTTGGATATAGTTGAGCTGCTTCTTAAGGGATGCAAGTC
GTTCAAAAACCACGAGTACGAGAAGAAGTGCAAGAAGTTGGTGTTCGAGTATGGACCTTT
GATCCTCGTGAATGCAGAGGA*TTCCTAGTGAAAACGACATCTGCACACTCTTACGCGCA
TGTCC*AACCAGCAAA

QA 1 736 1 736
DS 

RD RS1BQ86TF 812 0 0
GG
ATCGGACCAATTCTCGACGGATCTGCAAACTCTGTTGATTCCTTCTTCTGTTCTTCCTCT
CCTTGTACGAAGCAGTATCTCTTGATTTTTTCTTCAGACAAAAGGAATATCTAATGGGAC
CCAAAGCTGGAACCTTTGTTCTTTTCTTGCTGGGTTTGACCCTTCTTTCTCACGCTAGAT
CCTTCCTTCCCTCCACCCTCTCAGAGGAAGTGTACAAGGATGAAAAGGTTTGCAGTCTAT
GTGAGGAGTATGTTAACTCTGCTCTCAGCTACCTTGAGAAAAACGAAACACAGAGTCAGA
TATTAGAGGACCTTCATGACCAGTGTTCCCATATCCGCGGATTTGAACAACAGTGCATAA
CTTTGGTTGACTACTACCTCCCTCTCTTCTTCTTGCATCTTGAGTCCTTTCAACCTCATT
ATTTCTGCAAGAGGTTGAATCTTTGTGGTCACGTCGTAGCTCTTGTTGAAGAAGCTCGTC
AGGATACTTGCGATGTTTGCCACAGGACTGTTTCTGAGATTCTCATCAAACTACAAGATC
CCGACACACAGCTGGATATAGTTGAGCTGCTTCTTAAGGGATGCAAGTCGTTCAAAAACC
ACGAGTACGAGAAGAAGTGCAAGAAGTTGGTGTTCGAGTATGGACCTTTGATCCTCGTGA
ATGCAGAGGAATTCCTAGTGAAAACGACATCTGCACACTCTTACGCGCATGTCCCAACCA
GCAACGGTTCTAAGCTGCCAGCAGGTTGGCGGATTCTTGATATGTTATGTAAGTGGTAGA
CGCACAACAAGTTTGATTGTGTATTTGTCC

QA 3 812 3 812
DS 



CO CL875Contig2 951 4 14 U
TTTTAATCAAGGTAAACATAAACGTTAATGAAAAGAAGAATAAAGAGTATATTTTGTATA
ATACAAGCAGTTGGTGATGGTCCGATGGAGATAGTACAAATTGTATGCGACAAATCTTAT
GGACAAATACACAATCAAACTTGT****TGCTTTCCTACCACCTTACATAACATATTCAA
GAATCCGCCAACCCTGCTGGCAGCCTTAGAACCGTTTGCTGGTTGGGACATGCGCGTAAG
AGTGTGCAGATGTCGTTTTTCACTAGGAATTCCTCTGCATTCACGAGGATCAAAGGTCCA
TACTCGAACACCAACTTCTTGCACTTTTTCTCGTACTCGTAGTTTTTGAACGATTTGCAT
CCCTTAAAAAGCAACTCGACTATATCCAGCTGTGTGTCGGGATCTTGTAGTTTGATGAGA
ATCTCAGAAACAGTCCTGTGGCAAACATCGCAAGTATCCTGACGAGCTTCTTCAACAAGA
GCTACGACGTGACCACAAAGATTCAACCTCTTGCAGAAATAATGAGGCTGAAAGGACTCA
AGATGCAAGAAGAAGAGAGGGAGATAGTAGTCAACCAAAGTTATGCACTGTTGTTCAAAT
CCGCGGATATGGGAACACTGATCATGAAGGTCCTCTAATATCTGACTCTGTGTTTCGTTT
TTCTCAAGGTAGCTCAGAGCAGAGTTAACATACTCCTCACATAGACTGCAAACCTTTTCA
TCCTTGTAAACTTCCTCTGAGAGGGTGGAGGGAAGGAAGGATCTAGCGTGAGAAAGAAGG
GTCAAACCCAACAAAAATATAACAAAGGTTCCAGCTTTGGGTCCCATTAGATAATACTAT
GCCTTTTGTCTGAAAAAAAATCAAGAGATACTGCTTCGTACAAGGAGAGGAAGAACAGAA
GAAGGAATCAACAGAGTTTGCAGATCCGTCGAGAATTGGTCCGATGGGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FW93TF C 1
AF RS1BP45JQ U 9
AF RS1B660JQ U 30
AF RS1BP45TF C 198
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BS 752 769 RS1FW93TF
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RD RS1FW93TF 773 0 0
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GGACAAATACACAATCAAACTTGT****TGCTTTCCTACCACCTTACATAACATATTCAA
GAATCCGCCAACCCTGCTGGCAGCCTTAGAACCGTTTGCTGGTTGGGACATGCGCGTAAG
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TACTCGAACACCAACTTCTTGCACTTTTTCTCGTACTCGTAGTTTTTGAACGATTTGCAT
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GCTACGACGTGACCACAAAGATTCAACCTCTTGCAGAAATAATGAGGTTGAAAGGACTCG
AGATGCAAGAAGAAGAGAGGGAGATAGTAGTCAACCAAAGTTACGCACTGTTGTTCAAAT
CCGCGGATATGGGAACACTGATAATGAAGGTCATCTAATATCTGACTCTGTGTTTCGTTT
TTCTCAAGGTAGCTGAGAGCAGAGTTAACATACTCCTCACATAGACTGCAAACCTTTTCA
TCCTTGTAAACTTCCTCTGAGAGGGTGGAGGGAAGGAAGGATCTAGCGT
CAGC

QA 1 769 1 769
DS 

RD RS1BP45JQ 743 0 0
G
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GTTGGTGATGGTCCGATGGAGATAGTACAAATTGTATGCGACAAATCTTATGGACAAATA
CACAATCAAACTTGT****TGCTTTCCTACCACCTTACATAACATATTCAAGAATCCGCC
AACCCTGCTGGCAGCCTTAGAACCGTTTGCTGGTTGGGACATGCGCGTAAGAGTGTGCAG
ATGTCGTTTTTCACTAGGAATTCCTCTGCATTCACGAGGATCAAAGGTCCATACTCGAAC
ACCAACTTCTTGCACTTTTTCTCGTACTCGTAGTTTTTGAACGATTTGCATCCCTTAAAA
AGCAACTCGACTATATCCAGCTGTGTGTCGGGATCTTGTAGTTTGATGAGAATCTCAGAA
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AAGAAGAGAGGGAGATAGTAGTCAACCAACGTTATGCACTGTTGTTGAAATCCGCGGATA
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ACTTCCTCTGAGAGGGTGGAGG

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DS 

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GGAAAGA
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TACCACCTTACATAACATATTCAAGAATCCGCCAACCCTGCTGGCAGCCTTAGAACCGTT
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GCATTCACGAGGATCAAAGGTCCATACTCGAACACCAACTTCTTGCACTTCTTCTCGTAC
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TCGGGATCTTGTAGTTTGATGAGAATCTCAGAAACAGTCCTGTGGCAAACATCGCAAGTA
TCCTGACGAGCTTCTTCAACAAGAGCTACGACGTGACCACAAAGATTCAACCTCTTGCAG
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TCACATAGACTGCAAACCTTTTCATCCTTGT

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DS 

RD RS1BP45TF 754 0 0
GCTGGCAGCTTAG
ACCGTTTGCTGGTTGGGACATGCGCGTAAGAGTGTGCAGATGTCGTTTT*CACTAGGAAT
TCCTCTGCATTCACGAGGATCAAAGGTCCATACTCGAACACCAACTTCTTGCACTTTTTC
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TTGCAGAAATAATGAGGCTGAAAGGACTCAATATGCAAGAAGAAGAGAGGGAGATAGTAG
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TCCTCTAATATCTGAGTCTGTGTTTCGTTTTTCTCAAGGTAGCTCAGAGCAGAGTTAACA
TACTCCTCACATAGACTGCAAACCTTTTCATCCTTGTAAACTTCCTCTGAGAGGGTGGAG
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CCAGCTTTGGGTCCCATTAGATAATACTATGCCTTTTGTCTGAAAAAAAATCAAGAGATA
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GAGAATTGGTCCGATGGGCCC

QA 14 754 14 754
DS 



AS 2 7

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CAACAATTACAAAATATATTACAAAATAAAACCCATTGACAACATTATTTTTGCTTCAAA
GTCGAATAGGTTGTTCGCTCACTCGAACCCTCGCATAACACATACATTTAGTTCAAATTA
TTAGGCCATGGACCTTATATCGTTAGAAACCGAGTTCTTAAGGGGGTATGCAGCACGCAT
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GTGAGCAACCGCTTTCATTAGAGAAAGCTCGTCGTTGGAAGGCAAATTCTCATACCCATC
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ATAAGGATAATCTCTGTTTGTACCAAGACAACCATTGTTGACTATGTACTCATAGGCAGT
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GGACAAAGTGACTAACTCTCCTGTCACGATCTTGTTTAAGCCTTCCACTGCCCCCACCGT
CGAGAAAGCCCAACAACTCTGGCAATGGCCTTGATCTTTGACTTCAGTCACTGCACC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1DI63JQ U 23
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RD RS1DI63JQ 754 0 0
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CCATTATTTTCTTTGTTACAGTTGATCAAATCTTGCTCGGACAAAGTGACTAACTCTCCT
GTCACGATCTTGTTTAAGCCTTCCACTGCCCC
AC

QA 1 752 1 752
DS 

RD RS1E512JQ 836 0 0
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ATAAGGATAATCTCTGTTTGTACCAAGACAACCATTGTTGACTATGTACTCATAGGCAGT
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DS 

RD RS1BI75JQ 836 0 0
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TAAGGATAATCTCTGTTTGTACCAAGACAACCATTGTTGACTATGTACTCATAGGCAGTC
TCGACTTTACCTCCTCCGCAACCATTATTTTCTTTGTTACAGTTGATCAAATCTTGCTCG
GACAAAGTGACTAACTCTCCTGTCACGATCTTGTTTAAGCCTTCCACTGCCCCCACCGTC
GAGAA*GCCCAACAACTCTGGCA*TGGCCTTGATCTTTGACTTCAGTCACTGCACC

QA 1 836 1 836
DS 



CO CL876Contig2 770 4 7 U
GGACACAAACCCAAAGTTTCATTAGCATTAACCTCAGAATGAAAATGGGTAATGCTAAAT
CAGCCATACTAATCTTCTTATTATCAGTGGGCATCGCATCTTGCGCCATTGCCATGGACA
TGTCCGTCGTTTCCTACGATGACGATCACCAAGTAACCGCTGGTCCCGGCCGCCGCAGCA
GCGTTTTTGATTCCGAGGCATCGTTGATATTCGAGTCATGGATGGTCAAGCACGGGAAGG
TGTACGAGTCCGTCGCCGAGAAGGAACGGCGTTTAACGATTTTCGAGGACAACCTTCGTT
TCATCACTAGCCGCAACGCTGAAAACTTTGGTTATCGGCTTGGTTTGAACCGGTTTGCAG
ATTTGTCCCTCCATGAATACGGACACATTTGCCATGGGGCTGATCCTAGACCACCTAAGA
ACCATGTTTTCATGACTAGCAGCAACCGATACAAGACTAGTGCTGGTGATGTGCTTCCTA
AGTCTGTTGACTGGAGGAAGGAAGGTGCAGTGACTGAAGTCAAAGATCAAGGCCATTGCC
AGAGTTGTTGGGCTTTCTCGACGGTGGGGGCAGTGGAAGGCTTAAACAAGATCGTGACAG
GAGAGTTAGTCACTTTGTCCGAGCAAGATTTGATCAACTGTAACAAAGAAAATAATGGTT
GCGGAGGAGGTAAAGTCGAGACTGCCTATGAGTACATAGTCAACAATGGTTGTCTTGGTA
CAAACAGAGATATCCTTATAAGCTGTTAATGGAGTATGCCACGCCGGCTC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E512TF U 1
AF RS1BS64TF U 148
AF RS1BI75TF U 3
AF RS1DI63TF U 3
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BS 597 742 RS1BI75TF
BS 743 770 RS1DI63TF

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GCGTTTTTGATTCCGAGGCATCGTTGATATTCGAGTCATGGATGGTCAAGCACGGGAAGG
TGTACGAGTCCGTCGCCGAGAAGGAACGGCGTTTAACGATTTTCGAGGACAACCTTCGTT
TCATCACTAGCCGCAACGCTGAAAACTTTGGTTATCGGCTTGGTTTGAACCGGTTTGCAG
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AGAGTTGTTGGGCTTTCTCGACGGTGGGGGCAATGGAAGGCTTAAACAAGATCGTG

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DS 

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TATTCGAGTCATGGATGGTCAAGCACGGGAAGGTGTACGAGTCCGTCGCCGAGAAGGAAC
GGCGTTTAACGATTTTCGAGGACAACCTTCGTTTCATCACTAGCCGCAACGCTGAAAACT
TTGGTTATCGGCTTGGTTTGAACCGGTTTGCAGATTTGTCCCTCCATGAATACGGACACA
TTTGCCATGGGGCTGATCCTAGACCACCTAAGAACCATGTTTTTATGACTAGCAGCAACC
GATACAAGACTAGTGCTGGTGATGTGCTTCCTAAGTCTGTTGACTGGAGGAAGGAAGGTG
CAGTGACTGAAGTCAAAGATCAAGGCCATTGCCAGAGTTGTTGGGCTTTCTCGACGGTGG
GGGCAGTGGAAGGCTTAAACAAGATCGTGACAGGAGAGTTAGTCACTTTGTCCGAGCAAG
ATTTGATCAACTGTAACAAAGAAAATAATGGTTGCGGAGGAGG

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DS 

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GG
ACAAACCCAAAGTTTCATTAGCATTAACCTCAGGATGAAAATGGGTAATGCTAAATCAGC
CATACTAATCTTCTTATTATCAGTGGGCATCGCATCTTGCGCCATTGCCATGGACGTGTC
CGTCGCTTCCTACGATGACGATCACCAAGTAACCGCTGGTCCCGGCCGCCGCAGCAGCGT
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CGAGTCCGTCGCCGAGAAGGAACGGCGTTTAACGATTTTCGAGGACAACCTTCGTTTCAT
CACTAGCCGCAACGCTGAAAACTTTGGTTATCGGCTTGGTTTGAACCGGCTTGCAGATTT
GTCCCTCCATGAATACGGACACATTTGCCATGGGGCTGATCCTAGACCACCTAAGAACCA
TGTTTTCATGACTAGCAGCAACCGATACAAGACTAGTGCTGGTGATGTGCTTCCTAAGTC
TGTTGACTGGAGGAAGGAAGGTGCAGTGACTGAAGTCAAAGATCAAGGCCATTGCCAGAG
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CAGAGATATCCTTATAAG
CTGT

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DS 

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GG
ACAAACCCAAAGTTTCATTAGCATTAACCTCAGAATGAAAATGGGTAATGCTAAATCAGC
CATACTAATCTTCTTATTATCAGTGGGCATCGCATCTTGCGCCATTGCCATGGACATGTC
CGTCGTTTCCTACGATGACGATCACCAAGTAACCGCTGGTCCCGGCCGCCGCAGCAGCGT
TTTTGATTCCGAGGCATCGTTGATATTCGAGTCATGGATGGTCAAGCACGGGAAGGTGTA
CGAGTCCGTCGCCGAGAAGGAACGGCGTTTAACGATTTTCGAGGACAACCTTCGTTTCAT
CACTAGCCGCAACGCTGAAAACTTTGGTTATCGGCTTGGTTTGAACCGGTTTGCAGATTT
GTCCCTCCATGAATACGGACACATTTGCCATGGGGCTGATCCTAGACCACCTAAGAACCA
TGTTTTCATGACTAGCAGCAACCGATACAAGACTAGTGCTGGTGATGTGCTTCCTAAGTC
TGTTGACTGGAGGAAGGAAGGTGCAGTGACTGAAGTCAAAGATCAAGGCCATTGCCAGAG
TTGTTGGGCTTTCTCGACGGTGGGG*CAGTGGAAGGCTTAAACAAGATCGTGACAGGAGA
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AGGAG*TAAAGTCGAGACTGCCTATGAGTACATAGTCAACAATGGTTGTCT*GGTACAAA
CAGAGATATCCTTATAAGCTGTTAATGGAGTATGCCACGCCGGCTC

QA 3 768 3 768
DS 



AS 1 6

CO CL877Contig1 1446 6 8 U
TTTTTACAAGGGTGCTTTATTAAAGGATTAAGTTATTACTCAACAAATAGAAATTAAAAT
TTGTAAAGGATGAGATGAATTCCGAAGCGCGTTTTTTAGTTTTAGAATTTGAGCAGACAG
AATTCCATTGGTATAATTCGGGATCCCAGATATATTTTTATTTAATCCATTTTAGAACAC
ATCATATCCATCTAAATAATACTAATCTGGTCCTTATATTTATTTACGGCCCCCGAGGAG
CCGTATGAGGCGAAGACCTCATGTACGGTTTTGTAATAGCGGTGAGAATAGTAATGTTAT
CACCGACTAGGATTATCTAACAGTTTAAGTACAGTTGATATAGTTGAGGCACAATCAAAA
TATGGTTTTTGGGGATGGAATTTGTGGCGTCAACCTATAGGTTTTATCATTTTTCTAATT
TCTTCCCTAGCAGAATGCGAGAGGTTACCTTTTGATTTACCAGAAGCGGAAGAAGAATTA
ATAGCAGGTTATCAAACTGAATATTCCGGTATCAAATTTGGTTTATTTTACGTTGCTTCT
TATCTAAATCTATTAATTTCCTCATTATTTGTAACAGTTCTATACTTAGGCGGTTGGAAT
ATTTCTATTCCGTATATATCTATTCTGGAGCTATTTGAAAAGGA**AAATTTTTGGAACA
ACAATTGGTATCTTTATTACATTAGCTAAAACTTATTTGTTCTTGTTCATTTCTATCGCA
ACCAGATGGACTTTACCTAGGCTAAGAATGGATCAACTATTAAATCTTGGATGGAAATTT
CTTTTACCGATTTCCCTTGGTAATCTATTATTAACAACTTCTTTCCAACTCTTTTCACTC
TAAATTGAAAATCAATCCAAGATATTCATTACTTGTTTTAAACAAGAGAAAGAAACAAAG
ATCAAATTATTCATAGATAATTACAATATGCTTCCTATGATAACCGGGTTCATGAATTAT
GGTCAACAAACCCTACGAGCTGCAAGGTATATTGGTCAGGGTTTCATGATTACCTTATCC
CACACAAATCGTTTACCTGTAACTATTCAATACCCCTATGAAAAATTAATAACATCAGAA
CGTTTCCGCGGTCGAATCCATTTCGAATTTGATAAATGCATTGCTTGTGAAGTATGTGTT
CGAGTATGTCCTATAGATCTGCCGGTTGTTGATTGGAAATTGGAAACCAATATTCGAAAA
AAACGATTGCTTAATTACAGTATTGATTTTGGAATTTGTATATTTTGTGGTAATTGTGTT
GAGTATTGTCCAACAAATTGTTTGTCAATGACTGAAGAATATGAATTTTCAACTTATGAT
CGTCACGAGTTGAATTATAATCAAATCGCTTTGGGTCGTTTACCAATGTCAGTAATTGAC
GATTACACTATTCGAACAATTTTGAATTCACCTCAAACAAAAAATGGATAAACCCATTAA
TTTTAT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 

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TCTTCCCTAGCAGAATGCGAGAGGTTACCTTTTGATTTACCAGAAGCGGAAGAAGAATTA
ATAGCAGGTTATCAAACTGAATATTCCGGTATCAAATTTGGTTTATTTTACGTTGCTTCT
TATCTAAATCTATTAATTTCCTCATTATTTGTAACAGTTCTATACTTAGGCGGTTGGAAT
ATTTCTATTCCGTATATATCTATTCTGGAGCTATTTGAAAAGGA**AAATTTTTGGAACA
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AATTCCATTGGTATAATTCGGGATCCCAGATATATTTTTATTTAATCCATTTTAGAACAC
ATCATATCCATCTAAATAATACTAATCTGGTCCTTATATTTATTTACGGCCCCCGAGGAG
CCGTATGAGGCGAAGACCTCATGTACGGTTTTGTAATAGCGGTGAGAATAGTAATGTTAT
CACCGACTAGGATTATCTAACAGTTTAAGTACAGTTGATATAGTTGAGGCACAATCAAAA
TATGGTTTTTGGGGATGGAATTTGTGGCGTCAACCTATAGGTTTTATCATTTTTCTAATT
TCTTCCCTAGCAGAATGCGAGAGGTTACCTTTTGATTTACCAGAAGCGGAAGAAGAATTA
ATAGCAGGTTATCAAACTGAATATTCCGGTATCAAATTTGGTTTATTTTACGTTGCTTCT
TATCTAAATCTATTAATTTCCTCATTATTTGTAACAGTTCTATACTTAGGCGGTTGGAAT
ATTTCTATTCCGTATATATCTATTCTGGAGCTATTTGAAAAGGA**AAATTTTTGGAACA
ACAATTGGTATCTTTATTACATTAGCTAAAACTTATTTGTTCTTGTTCATTTCTATCGCA
ACCAGATGGACTTTACCTAG
CTA

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G
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GAATGGATCAACTATTAAATCTTGGATGGAAATTTCTTTTACCGATTTCCCTTGGTAATC
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TCATTACTTGTTTTAAACAAGAGAAAGAAACAAAGATCAAATTATTCATAGATAATTACA
ATATGCTTCCTATGATAACCGGGTTCATGAATTATGGTCAACAAACCCTACGAGCTG

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TGTTCGAGTATGTCCTATAGATCTGCCGGTTGTTGATTGGAAATTGGAAACCAATATTCG
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TGTTGAGTATTGTCCAACAAATTGTTTGTCAATGACTGAAGAATATGAATTTTCAACTTA
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TGACGATTACACTATTCGAACAATTTTGAATTCACCTCAAACAAAAAATGGATAAACCCA
TTAATTTTA
G

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DS 

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G
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CCCTTGGTAATCTATTATTAACAACTTCTTTCCAACTCTTTTCACTCTAAATTGAAAATC
AATCCAAGATATTCATTACTTGTTTTAAACAAGAGAAAGAAACAAAGATCAAATTATTCA
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TACCTGTAACTATTCAATACCCCTATGAAAAATTAATAACATCAGAACGTTTCCGCGGTC
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G
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CCCTTGGTAATCTATTATTAACAACTTCTTTCCAACTCTTTTCACTCTAAATTGAAAATC
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GAACAATTTTGAATTCACCTCAAACAAAAA*TGGATAAACCCATTAATTTTA
T

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DS 



AS 1 6

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AATCTGTTGTCTAGTGATCAACAATTGGCGGTGACTCGAACCGTTGAAGCTTTAACTGAA
GGAAAACCGAACCCAGAGTTTGATTCTTACCTTTTGCTTGACCCGAGAGCTCCAAAGCCT
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 10 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1DT68TF U 1
AF RS1CD30TF U 188
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BS 1174 1206 RS1CD30JQ

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CTCTTGAGTTTCCGGAAGTCGCTGTGGAGATCGAGACTCAGTTGAACAAGTACAAGAGAG
ACGTTGAAGAGGTTAACAAGAGAACAGGAAGTGGGAGTGGTGCTGAGTTTGATGGGACGG
ATTTGATTGGGAACACTAAGCATCTCATGAACGCTGTGAACTCTCTCCCGGAGTTAACTG
AGAGGAAGCAGGTGATTGACAAGCACACCAACATCGCTACCGCGCTCTTAGGACAGATCA
AGGAGAGATCTATCGATGCTTTCACTAAGAAAGAGAGTGACATGATGGTGAGAGGCGGAA
TCGACAGAGCTGAGCTTATGGCTGCTCTTAAAGGCAAAGGTACAAAGATGGACAAGCTCA
GGTTCGCAATCATGTACTTGATCTCCACGGAGACCATAAACCAATCCGAAGTTGAATCCG
TGGAAGCAGCACTGAACGAAGCTGGAGCTGACACAAGCGCGTTTCAGTACGTGAAGAAGA
TCAA*TCC*TTGAACGTGTCTCT

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DS 

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G
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TCTATCGATGCTTTCACTAAGAAAGAGAGTGACATGATGGTGAGAGGCGGAATCGACAGA
GCTGAGCTTATGGCTGCTCTTAAAGGCAAAGGTACAAAGATGGACAAGCTCAGGTTCGCA
ATCATGTACTTGATCTCCACGGAGACCATAAACCAATCCGAAGTTGAATCCGTGGAAGCA
GCACTGAACGAAGCTGGAGCTGACACAAGCGCGTTTCAGTACGTGAAGAAGATCAAATCC
*TTGAACATGTCTCTCGCAGCTTCGGCGAACTCAGCGAGCAGAAGCAACATTGTAGACTG
GGCCGAAAAGCTTTACGGGCAATCTATAAGCGCGGTCACTGCAGGAGTCAAGAATCTGTT
GTCTAGTGATCAACAATTGGCGGTGACTCGAACCGTTGAAGCTTTAACTGA

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DS 

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G
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GGGAGTGGTGCTGAGTTTGATGGGACGGATTTGATTGGGAACACTAAGCATCTCATGAAC
GCTGTGAACTCTCTCCCGGAGTTAACTGAGAGGAAGCAGGTGATTGACAAGCACACCAAC
ATCGCTACCGCGCTCTTAGGACAGATCAAGGAGAGATCTATCGATGCTTTCACTAAGAAA
GAGAGTGACATGATGGTGAGAGGCGGAATCGACAGAGCTGAGCTTATGGCTGCTCTTAAA
GGCAAAGGTACAAAGATGGACAAGCTCAGGTTCGCAATCATGTACTTGATCTCCACGGAG
ACCATAAACCAATCCGAAGTTGAATCCGTGGAAGCAGCACTGAACGAAGCTGGAGCTGAC
ACAAGCGCGTTTCAGTACGTGAAGAAGATCAAATCC*TTTAACGTGTCTCTCGCAGCTTC
AGCGAACTCAGCGAGCAGAAGCAACATTGTAGACTGGGCCGAAAAGCTTTACGGGCAATC
TATAAGCGCGGTCACTGCAGGAGTCGAGAATCTGTTGTCTAGTGATCAACAATTGGCGGT
GACTCGAACCGTTGAAGCTTTAACTGAAGGAAAACCGAACCCAGAGTTTGATTCTTACCT
TTTGCTTGACCCGAGAGCTCCAAAGCCTGGCTCCGGTGGTGGTAGCCATGTGAAGGGACC
GTTTAGAGAAGCAATGGTGTTCATG

QA 2 746 2 746
DS 

RD RS1DT68JQ 816 0 0
GG
ATCGACAGAGCTGAGCTTATGGCTGCTCTTAAAGGCAAAGGTACAAAGATGGACAAGCTC
AGGTTCGCAATCATGTACTTGATCTCCACGGAGACCATAAACCAATCCGAAGTTGAATCC
GTGGAAGCAGCACTGAACGAAGCTGGAGCTGACACAAGCGCGTTTCAGTACGTGAAGAAG
ATCAAATCC*TTGAACGTGTCTCTCGCAGCTTCAGCGAACTCAGCGAGCAGAAGCAACAT
TGTAGACTGGGCCGAAAAGCTTTACGGGCAATCTATAAGC*CGGTCACTGCAGGAGTCAA
GAATCTGTTGTCTAGTGATCAACAATTGGCGGTGACTCGAACCGTTGAAGCTTTAACTGA
AGGAAACCCGAACCCAGAGTTTGATTCTTACCTTTTGCTTGACCCGAGAGCTCCAAAGCC
TGGCTCCGGTGGTGGTAGCCATGTGAAGGGACCGTTTAGAGAAGCAATGGTGTTCATGAT
AGGTGGGGGGAACTATGTTGAGTATGGGAGTTTGCAGGAGCTTACTCAGAGACAGTTGAC
GGTTAAGAACGTTATCTATGGAGCCACTGAGATTCTTACAGGAAGTGAGTTGGTGGAACA
GCTGGGGCTTTTGGGTAAGAAGATGGGTTTGGGAGGTCCGGTCGCTTCGTCTTCTTCGTC
TGGTCACTGAATTCTTTGTTTGGTCACTGTGCTTGAGAGTTTTTCTTTTTTCTTATGAGA
GTTTTTCTGTTTTGTTAAATAAATCTCTTGAATGCTTTTATATTTTAAGTCTTTAATACG
GATTTAGATTCTTAAGAAAAAACTTTGCTATTCG

QA 3 816 3 816
DS 

RD RS1BX35JQ 776 0 0
TATGGCTGCTCTTAAAGGCAAAGGTACAAAGATGGACAAGCTCAGGTTCGCAATCATGTA
CTTGATCTCCACGGAGACCATAAACCAATCCGAAGTTGAATCCGTGGAAGCAGCACTGAA
CGAAGCTGGAGCTGACACAAGCGCGTTTCAGTACGTGAAGAAGATCAAATCC*TTTAACG
TGTCTCTCGCAGCTTCAGCGAACTCAGCGAGCAGAAGCAACATTGTAGACTGGGCCGAAA
AGCTTTACGGGCAATCTATAAGCGCGGTCACTGCAGGAGTCGAGAATCTGTTGTCTAGTG
ATCAACAATTGGCGGTGACTCGAACCGTTGAAGCTTTAACTGAAGGAAAACCGAACCCAG
AGTTTGATTCTTACCTTTTGCTTGACCCGAGAGCTCCAAAGCCTGGCTCCGGTGGTGGTA
GCCATGTGAAGGGACCGTTTAGAGAAGCAATGGTGTTCATGATAGGTGGGGGGAACTATG
TTGAGTATGGGAGTTTGCAGGAGCTTACTCAGAGACAGTTGACGGTTAAGAACGTTATCT
ATGGAGCCACTGAGATTCTTACAGGAAGTGAGTTGGTGGAACAGCTGGGGCTTTTGGGTA
AGAAGATGGGTTTGGGAGGTCCGGTCGCTTCGTCTTCTTCGTCTGGTCACTGTATTCTTT
GTTTGGTCACTGTGCTTGAGAGTTTTTCTTTTTTCTTATGAGAGTTTTTCTGTTTTGTTA
AATAAATCTCTTGAATGCTTTTATATTTTAAGTCTTTAATACGGTTTTAGATTCTT

QA 1 776 1 776
DS 

RD RS1CD30JQ 708 0 0
AAGCTGGAGCTGACACAAGCGCGTTTCAGTACGTGAAGAAGATCAAATCCCTTGAACATG
TCTCTCGCAGCTTCGGCGAACTCAGCGAGCAGAAGCAACATTGTAGACTGGGCCGAAAAG
CTTTACGGGCAATCTATAAGCGCGGTCACTGCAGGAGTCAAGAATCTGTTGTCTAGTGAT
CAACAATTGGCGGTGACTCGAACCGTTGAAGCTTTAACTGAAGGAAAACCGAACCCAGAG
TTTGATTCTTACCTTTTGCTTGACCCGAGAGCTCCAAAGCCTGGCTCCGGTGGTGGTAGC
CATGTGAAGGGACCGTTTAGAGAAGCAATGGTGTTCATGATAGGTGGGGGGAACTATGTT
GAGTATGGGAGTTTGCAGGAGCTTACTCAGAGACAGTTGACGGTTAAGAACGTTATCTAT
GGAGCCACTGAGATTCTTACAGGAAGTGAGTTGGTGGAACAGCTGGGGCTTTTGGGTAAG
AAGATGGGTTTGGGAGGTCCGGTCGCTTCGTCTTCTTCGTCTGGTCACTGAATTCTTTGT
TTGGTCACTGTGCTTGAGAGTTTTTCTTTTTTCTTATGAGAGTTTTTCTGTTTTGTTAAA
TAAATCTCTTGAATGCTTTTATATTTTAAGTCTTTAATACGGATTTAGATTCTTAAGAAA
AAACTTTGCTATTCGAAACTAAATTTTAGAATTTTCAGTTATTTTTTC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 5

CO CL879Contig1 834 5 14 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGATAGCATCT
CCTCTCAAACAAAACTAACAACTTTTGTTTTCACTCCAACAACTAATATTACAAATTTAT
AAAGTCCCCAAACGTAAGAGAGGAGAATATTACTCTTAAGACTAATAATGGCCAAATTCT
TCATCGTCTTCCTTGCCTCTGCCCTATGTTTCACCACCCTTCTTCACTTTGCCGCCGCTG
ATGCCGACGACTTGGACCGTTTCCACATCAAAGGATCCGTCTACTGCGATACCTGCCGTG
TCCAATTCATGACCCGCCTCAGTAAAGTCCTCGAAGGGGCAAAGGTAAAGCTTGAGTGCA
AGGGTCGTGAGAACCAGACAGTGACACTGACGAAAGAAGCCGTGACCGACAAAGACGGAA
AGTACGAGATGGTAGTTATGGGAGACCACGAAGAGGAAGTGTGTGAGATCATCCTCGAGG
AATCACCGGACGCAGAGTGCAGCGAGGTGAACAACCAAGAGTTCCTAAGAAACGCAGCCA
GGATCAGTCTTACGGCGAATGATGGCATTGTCTCTAACGAGGTTCGAACCATTAACCCAC
TTGGGTTCATGAGGAAGACTTCTCTCGCTGATTGTCCTCTAGTTTTCAAGGAGCTCGGAA
TCGTCCCTGATGTCATCTTCTAAGCTTTATTATATATATTTTACCTACATATGCACCGAT
CTGTCAACAATTTTTAATTTCTTGTTAACTCTTTTTCAACATATTATATAAAACTTTTTT
TCTTGAAGTTGTCGTCTGAGTTTACTTAACTGATGGTGTTTTCTTTCGTTTTCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A095TF U 1
AF RS1A095TV U 1
AF RS1C726TF U 50
AF RS1B941JQ C 66
AF RS1C726JQ C 94
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RD RS1A095TF 776 0 0
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QA 1 776 1 776
DS 

RD RS1A095TV 783 0 0
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CCTCTCAAACAAAACTAACAATTTTTGTTTTCACCCCAACAACTAATATTACAAATTTAT
AAAGTCCCCAAACGTAAGAGAGGAGAATATTACTCT*AAGACTAATAATGGCCAAATTCT
TCATCGTCTTCCTTGCCTCTGTCCTATGTTTCACCACCCTTCTTCACTTTGCCGCCGCTG
ATGCCGACGACTTGGACCGTTTCCACATCAAAGGATCCGTCTACTGCGATACCTGCCGTG
TCCAATTCATGACCCGCCTCAGTAAAGTCCTCGAAGGGGCAAAGGTAAAGCTTGAGTGCA
AGGGTCGTGAGAACCAGACAGTGACACTGACGAAAGAAGCCGTGACCGACAAAGACGGAA
AGTACGAGATGGTAGTTATGGGAGACCACGAAGAGGAAGTGTGTGAGATCATCCTCGAGG
AATCACCGGACGCAGAGTGCAGCGAGGTGAACAACCAAGAGTTCCTAAGAAACGCAGCCA
GGATCAGTCTTACGGCGAATGATGGCATTGTCTCTAACGAGGTTCGAACCATTAACCCAC
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TCGTCCCTGACGTCATCTTCTAAGCTTTATTATATATATTTTACCTACATATGCACCGAT
CTGTCAACAATTTTTAATTTCTTGTTAACTCTTTTTCAACATATTATATAAAACTTTTTT
TCT

QA 1 783 1 783
DS 

RD RS1C726TF 756 0 0
GGATAGCATCTCCTCTCAAACAAAACTAACAACTTTTGTTTTC*CTCCAACAACTAATAT
TACAAATTTATAAAGTCCCCAAACGTAAGAGAGGAGAATATTACTCTTAAGACTAATAAT
GGCCAAATTCTTCATCGTCTTCCTTGCCTCTGCCCTATGTTTCACCACCCTTCTTCACTT
TGCCGCCGCTGATGCCGACGACTTGGACCGTTTCCACATCAAAGGATCCGTCTACTGCGA
TACCTGCCGTGTCCAATTCATGACCCGCCTCAGTAAAGTCCTCGAAGGGGCAAAGGTAAA
GCTTGAGTGCAAGGGTCGTGAGAACCAGACAGTGACACTGACAAAAGAAGCCGTGACCGA
CAAAGACGGAAAGTACGAGATGGTAGTTATGGGAGACCACGAAGAGGAAGTGTGTGAGAT
CATCCTCGAGGAATCACCGGACGCAGAGTGCAGCGAGGTGAACAACCAAGAGTTCCTAAG
AAACGCAGCCAGGATCAGTCTTACGGCGAATGATGGCATTGTCTCTAACGAGGTTCGAAC
CATTAACCCACTTGGGTTCATGAGGAAGACTTCTCTCGCTGATTGTCCTCTAGTTTTCAA
GGAGCTCGGAATCGTCCCTGATGTCATCTTCTAAGCTTTATTATATATATTTTACCTACA
TATGCACCGATCTGTCAACAATTTTTAATTTCTTGTTAACTCTTTTTCAACATATTATAT
AAAACTTTTTTTCTTGAAGTTGTCGTCTGAGTTTAC

QA 1 756 1 756
DS 

RD RS1B941JQ 720 0 0
CAAACAAAACTAACAACTTTTGTTTTCACTCCAACAACTAATATTACAAATTTATAA*GT
CCCCAAACGTAAGAGAGGAGAATATTACTCTTAAGACTAATAATGGCCAAATTCTTCATC
GTCTTCCTTGCCTCTGCCCTATGTTTCACCACCCTTCTTCACTTTGCCGCCGCTGATGCC
GACGACTTGGACCGTTTCCACATCAAAGGATCCGTCTACTGCGATACCTGCCGTGTCCAA
TTCATGACCCGCCTCAGTAAAGTCCTCGAAGGGGCAACGGTAAAGCTTGAGTGCAAGGGT
CGTGAGAACCAGACAGTGACACTGACGAAAGAAGCCGTGACCGACAAAGACGGAAAGTAC
GAGATGGTAGTTATGGGAGACCACGAAGAGGAAGTGTGTGAGATCATCCTCGAGGAATCA
CCGGACGCAGAGTGCAGCGAGGTGAACAACCAAGAGTTCCTAAGAAACGCAGCCAGGATC
AGTCTTACGGCGAATGATGGCATTGTCTCTAACGAGGTTCGAACCATTAACCCACTTGGG
TTCATGAGGAGGACTTCTCTCGCTGATTGTCCTCTAGTTTTCAAGGAGCTCGGAATCGTC
CCTGATGTCATCTTCTAAGCTTTATTATATATATTTTACCTACATATGCACCGATCTGTC
AACAATTTTTAATTTCTTGTTAACTCTTTTTCAACATATTATATAAAACTTTTTTTCT
TG

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1C726JQ 741 0 0
CTCCAACAACTAATATTACAAATTTATAAAGTCCCCAAACGTAAGAGAGGAGAATATTAC
TCTTAAGACTAATAATGGCCAAATTCTTCATCGTCTTCCTTGCCTCTGCCCTATGTTTCA
CCACCCTTCTTCACTTTGCCGCCGCTGATGCCGACGACTTGGACCGTTTCCACATCAAAG
GATCCGTCTACTGCGATACCTGCCGTGTCCAATTCATGACCCGCCTCAGTAAAGTCCTCG
AAGGGGCAAAGGTAAAGCTTGAGTGCAAGGGTCGTGAGAACCAGACAGTGACACTGACAA
AAGAAGCCGTGACCGACAAAGACGGAAAGTACGAGATGGTAGTTATGGGAGACCACGAAG
AGGAAGTGTGTGAGATCATCCTCGAGGAATCACCGGACGCAGAGTGCAGCGAGGTGAACA
ACCAAGAGTTCCTAAGAAACGCAGCCAGGATCAGTCTTACGGCGAATGATGGCATTGTCT
CTAACGAGGTTCGAACCATTAACCCACTTGGGTTCATGAGGAAGACTTCTCTCGCTGATT
GTCCTCTAGTTTTCAAGGAGCTCGGAATCGTCCCTGATGTCATCTTCTAAGCTTTATTAT
ATATATTTTACCTACATATGCACCGATCTGTCAACAATTTTTAATTTCTTGTTAACTCTT
TTTCAACATATTATATAAAACTTTTTTTCTTGAAGTTGTCGTCTGAGTTTACTTAACTGA
TGGTGTTTTCTTTCGTTTTCT

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 6

CO CL880Contig1 1389 6 6 U
GTACAAATTCTTCTATTAAAAACATGGGGAAGAAGTACAGCATGGTAAAATATAAAAAGA
ACAACAATACTTAAAGACTAGAGCAGCAGAAAAGCAACAAAAAAGATCAAGCTAAGGATA
CTCAAAGGATATTGCATCGGGTGAGCAGAACTCAGTTGAAGAAGAAGATGAGCAACTGAA
CCAAACCTCACTTGACGACAGTAGGAGATGGAAGGGAGTGAAGAACCCAAACGGAGGAAG
AAGCTCATCTTGTCGAAGATCCAGAAGCCAAAACCACCAAGAGGAGAAGAACACAAGAAC
CCACCATAACCTCCAAGCTAAGCCAGCCAGCAGATAGCTCAGCAACAGAACCAAGACGCA
ACAGCCACATACACAAGCTAAGATCGATCCGGCGCAGTCGACGATGGGCAGCTAGAAAAG
AAGCACCAGCACAGGACCACTAGTACTAAGCTGACATCGCCACGAGATGCATAGGAGAGC
AAAGACGAAGCAACCGGAAGACAGGAAACTAGAATAGAAGCACCAGCACAGGACCACTGA
TACTAAGAATCACCGCCGCAAGAACACCATCTGAGCAGAGACGCAAAGACAGTGAGAAAC
GGAAAAGAGAACCGCTTCAAGCAACGACCTACGCCTTCAAGATAGCCTGAACCTGATACA
AAGAAGCGCCAACAAGCCACAAGAACCTAGACAACGAACCGATAAGCCTCTCGACAAACC
GATTCCAGAGAGCAAACAACAAATGGAGACAACAACGGGAACGCCCTACTCCGATGAACA
ACCTGCAGAAGAAGAACCCGAGAAGACTGGAAGAGGTGGCTGAGAGTAAACCGGAGGGAG
ACAAACGAACCAGCAACACCAGTGACACCAAAGGAAGTAAAGAGAAAGAGCCGCCGCTAC
AACGACGAGGGCATAGAATCAGAGACAGCCAGGAGAGTGAGGGTCAGAGCCGTCCTCAAG
CTCAACACAACCTAACCAAGACCTAACCAAGACTCAGACCCAAAACAGGTAGCTACAGAG
CTCTCAACGGCGGAGGAACTCGGAGGACCCAGCGCACTGAAAAACGGAGATAACCCACAG
CCGTAAACAACCACCGTCCTCAAGTGGAAGAGACAGGAGGGGAACACCGGAGACCAGAGG
CAAGAGAACAATCCACAGCAACCGCTAGCACCGAAGTCAACACAACCGAGGCGAAATAAA
TCTCTAGATCTAGAACTGAAGGCATGGAGAAAACTCACAGGAGGGGTATCGATAGGAAGC
TAAAAGAGCGGCGGTCCCTCCCACGGTGACGGTGAGAAGCACGGACAACCGGAGAGGGAG
ATCGGAACTTATGAAGCTGAGCCCCCGGAGAAGAAAAGAGAGAGAGAAGAAGAGGTATGA
TTGACCTCC


BQ
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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CAAGCTAAGATCGATCCGGCGCAGTCGACGATGGGCAGCTAGAAAAGAAGCACCAGCACA
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AAGCCACAAGAACCTAGACAACGAACCGATAAGCCTCTCGACAAACCGATTCCAGAGAGC
AAACAACA

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A
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GACAAACCGATTCCAGAGAGCAAACAACAAATGGGGACAACAACGGGAACGCCCTACTCC
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CC

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DS 



AS 1 6

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BQ
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 10 10 

AF RS1AO91JQ C 1
AF RS1AO91TFB U 1
AF RS1A786JQ C 23
AF RS1EN15TF U 23
AF RS1F278TF U 23
AF RS1A786TF U 23
BS 1 22 RS1AO91TFB
BS 23 24 RS1EN15TF
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TCTCTGCCTGTCTTTGTAAGACTTCAGATTATTATATTCTCTTTTTGCAACAAACTGGAT
TATGTAAGAGACTTTTGTTTGTCTTTTAATTAAATCAAATCCATTTTACA
AG

QA 1 650 1 650
DS 

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ATGCGACAAAGTTCTTGGACGACCATCCTGGTGGTGACGAGGTCATCTTGACTTCTACAG
GGAAAGACGCGACGGATGATTTTGAGGATGTGGGACACAGTTCCACTGCAAAAGCCATGC
TTGATGAGTACTACGTCGGTGATATCGACTCCGCCACTGTCCCTGCCAAAACCAAGTTTG
TTCCTCCTCCTCCTAACCAGACCACCCAGTCTACCCAGAGCTCCGATTTTCTCATTAAGA
TCCTTCAGTTCCTTGTTCCTCTTCTTATCTTAGGCTTGGCTCTCGGTATCCGCTCTTACA
CCAAGACCCCTTCCTCTTGAGGAGTGTCTTTGAATGTGTACTACGTGTTTGCCCCCTTTA
TCTCTGCCTGTCTTTGTAAGACTTCAGATTATTATATTCTCTTTTTGCAACAAACTGGAT
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QA 1 643 1 643
DS 

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TCTTATCTTAGGCTTGGCTCTCGGTATCCGCTCTTACACCAAGACCCCTTCCTCTTGAGG
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TTCAGATTATTATATTCTCTTTTTGCAACAAACTGGATTATGTAAGAGACTTTTGTTTGT
CTTTTAATTAAATCAAATCCATTTTACAAG

QA 1 630 1 630
DS 

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TCTTATCTTAGGCTTGGCTCTCGGTATCCGCTCTTACACCAAGACCCCTTCCTCTTGAGG
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CTTTTAATTAAATCAAATCCATTTTACA

QA 1 628 1 628
DS 

RD RS1F278TF 628 0 0
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CACCCAGTCTACCCAGAGCTCCGATTTTCTCATTAAGATCCTTCAGTTCCTTGTTCCTCT
TCTTATCTTAGGCTTGGCTCTCGGTATCCGCTCTTACACCAAGACCCCTTCCTCTTGAGG
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CTTTTAATTAAATCAAATCCATTTTACA

QA 1 628 1 628
DS 

RD RS1A786TF 630 0 0
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CCAGGATTGTTGGATCGTCATCGATGGCAAGGTTTATGATGTGACAAAGTTCTTGGACGA
CCATCCTGGTGGTGACGAGGTCATCTTGACTTCTACAGGGAAAGACGCGACGGATGATTT
TGAGGATGTGGGACACAGTTCCACTGCAAAAGCCATGCTTGATGAGTACTACGTCGGTGA
TATCGACTCCGCCACTGTCCCTGCCAAAACCAAGTTTGTTCCTCCTCCTCCTAACCAGAC
CACCCAGTCTACCCAGAGCTCCGATTTTCTCATTAAGATCCTTCAGTTCCTTGTTCCTCT
TCTTATCTTAGGCTTGGCTCTCGGTATCCGCTCTTACACCAAGACCCCTTCCTCTTGAGG
AGTGTCTTTGAATGTGTACTACGTGTTTGCCCCCTTTATCTCTGCCTGTCTTTGTAAGAC
TTCAGATTATTATATTCTCTTTTTGCAACAAACTGGATTATGTAAGAGACTTTTGTTTGT
CTTTTAATTAAATCAAATCCATTTTACA
AG

QA 1 628 1 628
DS 



AS 2 7

CO CL882Contig1 770 4 7 U
CTACTTTAAAGTTGCAGCTCACTCACTTGGGCTTTGGACCAAACTTTAAAAGTTAACAAC
ACATTGAGACGACTGAAATTTCAACTACAGGTACCAAAAACAGATATCACCTTCTCTGTA
ATAAGAAGCTTGTAGTGAAGATTTTGTCAAGCCTTTTGAGTGATGGATCCAAGGATCAAA
TCACGGATCTCCTCGCTGTTGGCTCTGTCAAGAGCAGTTCTTCCATCAGCGTCCTTGACA
GTGTAGTTAGCACCGGCTCTGAAAAGCTCCTCGATCTTAGGCTTGTCTCCTTCTGATGCT
GCTAACATCAAAAGGATATCTACAGGATGAATGTTTTGGTTGAAAAGAGCCTCCATCTTA
TCGTAGGTTCCTTCCACCGCAAGCATCCCCATATAGTTGAAATACTGCTCGACATCGTCT
CTGTCGAAATCATCCCGTGACTGGCTGCCATAAATGCCAGCATTCTCAGCATCTACGCCG
TTCTTTCCGAACTTGAACCAGCAAGCGGCTCTAGACCCATTGGAGGGTCCGAGTCGGATA
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GAACTGTTGACAGTTTTGGTGGTGGAGAAGAAGGAGCTCGCAGAAGGAGCTGTGCATGAT
GAAATGGAAGCCATGGCTGCCTCCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTC
CGGTACCGTCGACTGATAACTTCGTATAATGTATGCTATACGAAGTTATG


BQ
10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A381JQ U 3
AF RS1A381TR U 3
AF RS1A381TV C 1
AF RS1A381TF C 3
BS 1 2 RS1A381TV
BS 3 346 RS1A381JQ
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RD RS1A381JQ 598 0 0
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QA 1 598 1 598
DS 

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ATTGAGACGACTGAAATTTCAACTACAGGTACCAAAAACAGATATCACCTTCTCTGTAAT
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ACGGATCTCCTCGCTGTTGGCTCTGTCAAGAGCAGTTCTTCCATCAGCGTCCTTGACAGT
GTAGTTAGCACCGGCTCTGAAAAGCTCCTCGATCTTAGGCTTGTCTCCTTCTGATGCTGC
TAACATCAAAAGGATATCTACAGGATGAATGTTTTGGTTGAAAAGAGCCTCCATCTTATC
GTAGGTTCCTTCCACCGCAAGCATCCCCATATAGTTGAAATACTGCTCGACATCGTCTCT
GTCGAAATCATCCCGTGACTGGCTGCCATAAATGCCAGCATTCTCAGCATCTACGCCGTT
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GGTGG

QA 1 618 1 618
DS 

RD RS1A381TV 734 0 0
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ATAAGAAGCTTGTAGTGAAGATTTTGTCAAGCCTTTTGAGTGATGGATCCAAGGATCAAA
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GTGTAGTTAGCACCGGCTCTGAGAAGCTCCTCGATCTTAGGCTTGTCTCCTTCTGATGCT
GCTAACATCAAAAGGATATCTACAGGATGAATGTTTTGGTTGAGAAGAGCCTCCATCTTA
TCGTAGGTTCCTTCCACCGCAAGCATCCCCATATAGTTGAAATACTGCTCGACATCGTCT
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GAAATGGAAGCCATGGCTGCCTCCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTC
CGGTACCGTCGACT

QA 1 734 1 734
DS 

RD RS1A381TF 768 0 0
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AAGAAGCTTGTAGTGAAGATTTTGTCAAGCCTTTTGAGTGATGGATCCAAGGATCAAATC
ACGGATCTCCTCGCTGTTGGCTCTGTCAAGAGCAGTTCTTCCATCAGCGTCCTTGACAGT
GTAGTTAGCACCGGCTCTGAGAAGCTCCTCGATCTTAGGCTTGTCTCCTTCTGATGCTGC
TAACATCAAAAGGATATCTACAGGATGAATGTTTTGGTTGAGAAGAGCCTCCATCTTATC
GTAGGTTCCTTCCACCGCAAGCATCCCCATATAGTTGAAATACTGCTCGACATCGTCTCT
GTCGAAATCATCCCGTGACTGGCTGCCATAGATGCCAGCATTCTCAGCATCTACGCCGTT
CTTTCCGAACTTGAACCAGCAAGCGGCTCTAGACCCATTGGAGGGTCCGAGTCGGATACT
GAGCTTCACAACCCGAGTTCCAAGAAACCGAGAGGAGAGTCTTACTGAGGAAGGAGAAGA
ACTGTTGACAGTTTTGGTGGTGGAGAAGAAGGAGCTCGCAGAAGGAGCTGTGCATGATGA
AATGGAAGCCATGGCTGCCTCCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCG
GTACCGTCGACTGATAACTTCGTATAATGTATGCTATACGAAGTTATG

QA 1 768 1 768
DS 



CO CL882Contig2 734 3 3 U
GAGAGAAAAAAGGTTGCCTTCTGGTAATAGAATCAGTCTATACTTTAAAGTTG*AGCTCA
CTCACTTAGGCTTTGGACCAAACTTTAAAAGTTAACAACACATTGAGACGACTGAGATTT
CAACTACAGGTACCAAAAACAGATATCACCTTCTCTGTAATAAGAAGCTTGTAGTGAAGA
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GCTCTGTCAAGAGCAGTTCTTCCATCAGCGTCCTTGACAGTGTAGTTAGCACCGGCTCTG
AGGAGCTCCTCGATCTTAGGCTTGTCTCCTTCTGATGCTGCTAACATCAAAAGGATATCT
ACAGGATGAATGTTTTGGTTGAGAAGAGCCTCCATCTTATCGTAGGTTCCTTCCACCGCA
AGCATCCCCATATAGTTGAAATACTGCTCGACATCGTCTCTGTCGAAATCATCCCGTGAC
TGGCTGCCATAGATTCCAGCATTCTCAGCATCGACACCGTTCTTTCCGAACTTGAACCAG
CAAGTGGCTCTAGACCCATTGGAGGGTCCGAGTCCGATACTACTGAGCTTCACAACCCGA
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GTTGTAGAGAAGAAGAAGCTCGTAGAAGGAGCTCTGCATGATGAAATGGAAGCCATGGCT
GCCTCAATGATTCT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GTTCCA

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GCATCCCCATATAGTTGAAATACTGCTCGACATCGTCTCTGTCGAAATCATCCCGTGACT
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T

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ATACTGCTCGACATCGTCTCTGTCGAAATCATCCCGTGACTGGCTGCCATAGATTCCAGC
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GAGTCTTACTGAGGAAGGAGAAGAACTGTTGATAGTTTTGGTTGTAGAGAAGAAGAAGCT
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QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 7

CO CL883Contig1 892 7 18 U
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TGTGCTTAAAGAAGTTGCATGGGCCCAAACTACCGAAGACAAGACATCATTGTACCAGTT
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TGTTTTCGCTTTTCAATTTGGTGTTGAGACTTACCTTTATATGATCTGGTGTTGTGGCTA
CATGTAAAACACTTTTCACTTGTGTCTATCTATATATATCATGAGTTGTGGT


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 
35 35 35 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

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CGAGGAGGTTGATGGAGGGAAGGAGAAGGAGAAGGAGGAGGAGAAGG

QA 1 647 1 647
DS 

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TAGGCGTCTGCTGTGTACAACCCCCTATGATGATGATTATGATATAGATTCAACTTATGG
TAGGCCTTTCCCTAGACTCGTGGAGATAGATCTCTTTGATAGACCATTGCCTTCTGAGAA
AATCTTGTCGCTGATTGAGACTTTGGAACATCTAACTATAAAAGAAAAACACGAGTTTAG
GTTTATATTTAGTGAAGCGTTGGGACTTCCAACCCCTCCCAAAACTCCAAGAAGAGCAGA
TCAGAGGTTTCTTGTGAAGTTGATGGAGTGTGAAAAGCCTTATTATAATGGTGTGCTTAA
AGAAGTTGCATGGGCCCAAACTACCGAAGACAAGACATCATTGTACCAGTTTTACATGGG
CGATAGTTATGAGATTGCTGAAAATGTCCCTTCCATTGTTAAACAATATATCACAAAGGA
ATAAGCTGAAGACCTTGCAGCCAAGCTCAATGCTGCTGGTGGAGTCGCTGTTGTCGAGGA
GGTTGATGGAGGGAAGGAGAAGGAGAAGGAGGAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGA
GAAGGAGAAGGAGAAGGAAAAGGAGGAATGACTGGGAAATTGTCCTAATGATGTGGAAGC
TTGTCTTTTATTGTGTGTGTTTGGCATAAGACTATTATCATCTTCTAATTATGTTTTCGC
TTTTCAATTTGGTGTTGAGACTTACCTTTATATGATCTGGTGTTGTGGCTACATGTAAAA
CACTTTTCACTTGTGTCTATCTATATATATTATGAGTTGTGGT

QA 1 823 1 823
DS 

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GTTTAGGTTTATATTTAGTGAAGCGTTGGGACTTCCAACCCCTCCCAAAACTCCAAGAAG
AGCAGATCAGAGGTTTCTTGTGAAGTTGATGGAGTGTGAAAAGCCTTATTATAATGGTGT
GCTTAAAGAAGTTGCATGGGCCCAAACTACCGAAGACAAGACATCATTGTACCATTTTTA
CATGGGCGATAGTTATGAGATTGCTGAAAATGTCCCTTCCATTGTTAAACAATATATCAC
AAAGGAAGAAGCTGAAGACCTTGCAGCCAAGCTCAATGCTGCTGGTGGAGTCGCTGTTGT
CGAGGAGGTTGATGGAGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGA
GAAGGAGAAGGAGAGGGAGAAGGAGAAGGAGGAATGACTGAGAAATTGTCCTAATGATGT
GGAAGCTTGTCTTTTATTGTGTGTGTTTGGCATAAGACTATTATCATCTTCTAATTATGT
TTTCGCTTTTCAATTTGGTGTTGAGACTTACCTTTATATGATCTGGTGTTGTGGCTACAT
GTAAAACACTTTTCACTTGTGTCTATCTATATATATCATGAGTTGTG

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1CE06JQ 695 0 0
GGTAGGCCTTTCCCTAGACTCGTGGAGATAGATCTCTTTGATAGACCATTGCCTTCTGAG
AAAATCTTGTCGCTGATTGAGACTTTGGAACATCTAACTATAAAAGAAAAACACGAGTTT
AGGTTTATATTTAGTGAAGCGTTGGGACTTCCAACCCCTCCCAAAACTCCAAGAAGAGCA
GATCAGAGGTTTCTTGTGAAGTTGATGGAGTGTGAAAAGCCTTATTATAATGGTGTGCTT
AAAGAAGTTGCATGGGCCCAAACTACCGAAGACAAGACATCATTGTACCAGTTTTACATG
GGCGATAGTTATGAGATTGCTGAAAATGTCCCTTCCATTGTTAAACAATATATCACAAAG
GAAGAAGCTGAAGACCTTGCAGCCAAGCTCAATGCTGCTGGTGGAGTCGCTGTTGTCGAG
GAGGTTGATGGAGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAG
GAGAAGGAGAAGGAGAAGGAAAAGGAGGAATGACTGAGAAATTGTCCTAATGATGTGGAA
GCTTGTCTTTTATTGTGTGTGTTTGGCATAAGACTATTATCATCTTCTAATTATGTTTTC
GCTTTTCAATTTGGTGTTGAGACTTACCTTTATATGATCTGGTGTTGTGGCTACATGTAA
AACACTTTTCACTTGTGTCTATCTATATATAT
TAC

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 6

CO CL884Contig1 1093 6 9 U
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CAAATTCTGACTGAGGCTCCAATGAGATCGGCTCAAGAAGAGATGGATCTTGAGGAATGG
GAGTTACTCCCCAGTCCCAAGAACAGCTTCAAGGATCTTGATCACGACGAGGATCATCAT
GGAGACATGGTGATGGACTACTTCCTCTGTCCATCTGCTCAACAAGAACCTCTCCACAAG
ATAGAGTCTCCTCCAAGATCCAAAGTGATCCCCACAAAGCTCCTCCAAGTTCCCATAGCT
TGGGAACCCGTGTTGGATCACGAGAACAAGAAGATACCTAATGAGCCTGATCCAACACAA
ACCCTTTTGACGGACTCTGTTCTGTCACCAACAGTATCCTTCAAGAAAACGAAGGAAACC
GAATTTGCCGACATGAAAGTGGACCCACCAGCGAGGATCACGAGTCCTGTGTCTTTGATC
GATGCTGCGAAACCCTCTGATTCCGAAGGAAGTGATGACGTGCGAGAGAAGAAAGAAGAT
GACGATGTGGGGAGTGATCATGGTGGTGAGAAGGCTAATCTGTGGAAGATTGGTCTGAAT
GGGATCGGAGCAATATGCTCTTTTGGTGTTGCAGCAGCCGCAGCTACCGTGTGTGTCTTA
TTCCTCGGACACAACGACATCAAAGTTTGTAAGAACAAGAACCACAAGCTTAGGTTCCAG
ATTTACTCCGATGATAATAAGTTGAGGGAAGCTGTAAATCATGCAACAAAGGTCAATGAA
GCAATCTTTGCCATGAAAGGTGTTCCTGTCGTAAGAGCTCAAATATCTTTTGGAGGTTAC
TACGATGGACTTTGAATTTCAGCCATCCATAATCGTCTATGGAATCATGGGGTCAGCTCG
AGGCTACATCGCCCACCAGCTTCTTCATAAGTTGAATAGTTTTTTTTTGTTTTTGAAAAG
CATAAGTTCAATAGTTAATAGCGTGCATGCATGATTATTGTCTATAAACTTTGTAAATTA
ACTTATTTTGTTAAAATCAGATTTATTAGTAGATCATTGTAAAATTTCAAGTAAATTTTA
ATCGTCATTGAGG


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1DH11TF U 4
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AF RS1DH11JQ C 582
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RD RS1GY54TF 689 0 0
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QA 1 689 1 689
DS 

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TTACTCCCCAGTCCCAAGAACAGCTTCAAGGATCTTGATCACGACGAGGATCATCATGGA
GACATGGTGATGGACTACTTCCTCTGTCCATCTGCTCAACAAGAACCTCTCCACAAGATA
GAGTCTCCTCCAAGATCCAAAGTGATCCCCACAAAGCTCCTCCAAGTTCCCATAGCTTGG
GAACCCGTGTTGGATCACGAGAACAAGAAGATACCTAATGAGCCTGATCCAACACAAACC
CTTTTGACGGACTCTGTTCTGTCACCAACAGTATCCTTCAAGAAAACGAAGGAAACCGAA
TTTGCCGACATGAAAGTGGACCCACCAGCGAGGATCACGAGTCCTGTGTCTTTGATCGAT
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CTCGGACACAACGACATCAAAGTTTGTA

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DS 

RD RS1DH11TF 668 0 0
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ATTCTGACTGAGGCTCCAATGAGATCGGCTCAAGAAGAGATGGATCTTGAGGAATGGGAG
TTACTCCCCAGTCCCAAGAACAGCTTCAAGGATCTTGATCACGACGAGGATCATCATGGA
GACATGGTGATGGACTACTTCCTCTGTCCATCTGCTCAACAAGAACCTCTCCACAAGATA
GAGTCTCCTCCAAGATCCAAAGTGATCCCCACAAAGCTCCTCCAAGTTCCCATAGCTTGG
GAACCCGTGTTGGATCACGAGAACAAGAAGATACCTAATGAGCCTGATCCAACACAAACC
CTTTTGACGGACTCTGTTCTGTCACCAACAGTATCCTTCAAGAAAACGAAGGAAACCGAA
TTTGCCGACATGAAAGTGGACCCACCAGCGAGGATCACGAGTCCTGTGTCTTTGATCGAT
GCTGCGAAACCCTCTGATTCCGAAGGAAGTGATGACGTGCGAGAGAAGAAAGAAGATGAC
GATGTGGGGAGTGATCATGGTGGTGAGAAGGCTAATCTGTGGAAGATTGGTCTGAATGGG
ATCGGAGCAATATGCTCTTTTGGTGTTGCAGCAGCCGCAGCTACCGTGTGTGTCTTATTC
CTCGGACA

QA 1 668 1 668
DS 

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CGAGAGAAGAAAGAAGATGACGATGTGGGGAGTGATCATGGTGGTGAGAAGGCTAATCTG
TGGAAGATTGGTTTGAATGGGATCGGAGCAATATGCTTTTTTGGTGTTGCAGCAGCCGCA
GCTACCGTGTGTGTTTTATTCCTCGGACACAACGACATCAAAGTTTGTAAGAACAAGAAC
CACAAGCTTAGGTTCCAGATTTACTCCGATGATAATAAGTTGAGGGAAGCTGTAAATCAT
GCAACAAAGGTCAATGAAGCAATTTTTGCCATGAAAGGTGTTCCTGTCGTAAGAGCTCAA
ATATCTTTTGGAGGTTACTACGATGGACTTTGAATTTCAGCCATCCATAATCGTCTATGG
AATCATGGGGTCAGCTCGA

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DS 

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AGCTACCGTGTGTGTCTTATTCCTCGGACACAACGACATCAAAGTTTGTAAGAACAAGAA
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TGCAACAAAGGTCAATGAAGCAATCTTTGCCATGAAAGGTGTTCCTGTCGTAAGAGCTCA
AATATTTTTTGGAGGTTATTACGATGGACTTTGAATTTCAGCCATCCATAATCGTCTATG
GAATCATGGGGTCAGCTCGAGGCTACATCGCCCACCAGCTTCTTCATAAGTTGAATAGTT
TTTTTTTGTTTTTGAAAAGCATAAGTTCAATAGTTAATAGCGTGCATGCATGATTATTGT
CTATAAACTTTGTAAATTAACTTATTTTGTTAAAATCAGATTTATTAGTAGATCATTGTA
AAATTTCAAGTAAATTTTAATCGTC

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DS 

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TCAGCCATCCATAATCGTTTATGGAATCATGGGGTCAGCTCGAGGCTACATCGCCCACCA
GCTTCTTCATAAGTTGAATAGTTTTTTTTTGTTTTTGAAAAGCATAAGTTCAATAGTTAA
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AGATTTATTAGTAGATCATTGTAAAATTTCAAGTAAATTTTAATCGTCATTGAGG

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DS 



AS 1 3

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AAACAAGAATACAAAAGCGGAAACAGATTACATGCAGAAAAAGCTTTACTTGGTTTGTCT
TTTCTTATTTCTTTTCAAGAAAGCTGAGAACTTCAGCTTCTGAAGGAAGAGCTGGAATAG
CTCCTTTTTTGGTTGTGGTGATTGCTCCACAAGCATTAGCGAACCTTAGCACCTTTATCA
ATCTCTCTTCGTCCTCGAGAATGGAATGATCTTCGGCAATCTTGTTTAGGAGGGCACCAA
CAAAGGAATCTCCAGCTCCGGTTGTATCGACGGCGTTCACATGGAAAGGATCAACGGATC
CACGGAAGTTCTTGGCGTAATACCGGCAACCCTTTTCACCAAGAGTGACAAGCAAGAGCT
TCAAGTTGGGATGCCACAAGGACATT*GCGGTTTCATCATCGATCTTGTTGCTTCCAGTT
AGAAACTCAAGCTCGACGTCGCTTACCTTGATGATCTCAGCCTTGTCCCAGATGCTCATG
ATCTGTGTCTTGGCTTCTTCCTTTGATGGCCACAGAGGCTCCCTGAGGTTTGGGTCGTAG
GAAAGAAGAGCTCCGGCTTCTTTCGCCACTTCCATTGCCTTCAAGTGAGCCGACCTACAT
GGCTCCACTATTAAGCTTATTGATCCGTAGTGAAACACTTTAGCGGATCTGATGAGCTCG
AGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1AP52JQ U 397
AF RS1AK53JQ U 51
AF RS1AP52TFB C 1
BS 1 50 RS1AP52TFB
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QA 1 533 1 533
DS 

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TTTCTTATTTCTTTTCAAGAAAGCTGAGAACTTCAGCTTCTGAAGGAAGAGCTGGAATAG
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ATCTCTCTTCGTCCTCGAGAATGGAATGATCTTCGGCAATCTTGTTTAGGAGGGCACCAA
CAAAGGAATCTCCAGCTCCGGTTGTATCGACGGCGTTCACATGGAAAGGATCAACGGATC
CACGGAAGTTCTTGGCGTAATACCGGCAACCCTTTTCACCAAGAGTGACAAGCAAGAGCT
TCAAGTTGGGATGCCACAAGGACATT*GCGGTTTCATCATCGATCTTGTTGCTTCCAGTT
AGAAACTCAAGCTCGACGTCGCTTACCTTGATGATCTCAGCCTTGTCCCA*ATGCTCATG
ATCTGTGTCTTGGCTTCTTCCTTTGATGGCCACAGAGGCTCCCTGAGGTTTGGGTCGTAG
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GGCTCCACTATTAAGCTTATTGATCCGTAGTGAAACACTTTAGCGGATCTGATGAGCTCG
AGC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 7

CO CL886Contig1 888 7 4 U
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GATGTTCTCGGCGACTGCCCTTTCAGCCAACGGGTTCTTCTCACCCTCGAGGAGAAGAAT
CTGCCCTACAAAATGCATCTCATTAACGTCTCCGACAAACCTCAATGGTTCTTAGCCATC
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GTCATCACCGGCATTCTCGAGGAGAAGTACCCTGACCCATCTCTCAAAACCCCTCCCGAG
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TCCAGCGACGGATCCGAGAAGGCCTTGCTCGATGAGCTTGAAGCTCTCGAGAATCATCTC
AAGACTCATGACGGTCCTTTCATCGCGGGTGGGAAAGTCAGCGCGGTGGATCTTAGCTTA
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TATCTTCTCTTATATCAGTTAAAATAATGTTCTTGGACCTGTTTATGTTGTTGTTATTGT
GTATCAAATCAAATAATAAGGATCGTTTGAATTAAAAGATTAGCGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 45 45 45 15 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1A008TR C 325
AF RS1ES53TF U 50
AF RS1GT36TF U 49
AF RS1A008TF U 1
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GCGGGTGGGAAAGTCAGCGCG

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AGGCTCACCTCAAGACTCATGACGGTCCTTTCATCGCGGGTGGGAAAGTCAGCGCGGTGG
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ACTCCTTTGAG

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DS 

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A
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AGGAGAAGAATCTGCCCTACAAAATGCATCTCATTAACGTCTCCGACAAACCTCAATGGT
TCTTAGCCATCAGTCCTGAAGGGAAAGTACCAGTGCTCAAGAACGACGACAAGTGGGTGC
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GG

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GATGTTCTCGGCGACTGCCCTTTCAGCCAACGGGTTCTTCTCACCCTCGAGGAGAAGAAT
CTGCCCTACAAAATGCATCTCATTAACGTCTCCGACAAACCTCAATGGTTCTTAGCCATC
AGTCCTGAAGGGAAAGTACCAGTGCTCAAGGACGACGACAAGTGGGTGCCTGATTCCGAC
GTCATCACCGGCATTCTCGAGGAGAAGTACCCTGACCCATCTCTCAAAACCCCTCCCGAG
TTCGCCTCTGTCGGATCCAAAATCTTCGGCGCTTTCGTCACTTTCTTGAAGAGCAAAGAC
TCCAGCGACGGATCCGAGAAGGCCTTGCTCGATGAGCTTGAAGCTCTCGAGAATCATCTC
AAGACTCATGACGGTCCTTTCATCGCGGGTGGGAAAGTCAGCGCGGTGGATCTTAGCTTA
GCACCAAAGCTTTACCATCTCAAGGTCGCTCTCGGACACTACAAAAGCTGGTCTGTCCCG
GAGAGCTTGCCTCATGTTCATGGCTACATGAAAGCTTTGTTCTCTCTCGACTCTTTTGAG
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TATCTTCTCTTATATCAGT
TAAAAT

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DS 

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CGACGTCATCACCGGCATTCTCGAGGAGAAGTACCCTGACCCATCTCTCAAAACCCCTCC
CGAGTTCGCCTCTGTCGGATCCAAAATCTTCGGCGCTTTCGTCACTTTCTTGAAGAGCAA
AGACTCCAGCGACGGATCCGAGAAGGCCTTGCTCGATGAGCTTGAAGCTCTCGAGAATCA
TCTCAAGACTCATGACGGTCCTTTCATCGCGGGTGGGAAAGTCAGCGCGGTGGATCTTAG
CTTAGCACCAAAGCTTTACCATCTCAAGGTCGCTCTCGGACACTACAAAAGCTGGTCTGT
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GGTCTATCTTCTCTTATATCAGTTAAAATAATGTTCTTGGACCTGTTTATGTTGTTGTTA
TTGTGTATCAA

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DS 

RD RS1A008JQ 646 0 0
TTCTTAGCCATCAGTCCTGAAGGGAAAGTACCAGTGCTCAAGGACGACGACAAGTGGGTG
CCTGATTCCGACGTCATCACCGGCATTCTCGAGGAGAAGTACCCTGACCCATCTCTCAAA
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AAGAGCAAAGACTCCAGCGACGGATCCGAGAAGGCCTTGCTCGATGAGCTTGAAGCTCTC
GAGAATCATCTCAAGACTCATGACGGTCCTTTCATCGCGGGTGGGAAAGTCAGCGCGGTG
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TGGTCTGTCCCGGAGAGCTTGCCTCATGTTCATGGCTACATGAAAGCTTTGTTCTCTCTC
GACTCTTTTGAGAAAACAAAGACCGAGGAGAAGTATGTGATCGCAGGATGGGAACATAAG
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TGGTTCAAGGTCTATCTTTTCTTATATCAGTTAAAATAATGTTCTTGGACCTGTTTATGT
TGTTGTTATTGTGTATCAAATCAAATAATAAG
CCTCGTTTCGAATT

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1ES53JQ 591 0 0
GACGTCATCACCGGCATTCTCGAGGAGAAGTACCCCGAGCCATCTCTCAAAACCCCTCCC
GAGTTTGCCTCCGTCGGATCCAAAATCTTCGGCGCTTTCGTCACTTTCTTGAAGAGCAAA
GACTCCAGCGACGGATCCGAGAAGGCCTTGCTCGATGAGCTTGAAGCTCTCGAGGCTCAC
CTCAAGACTCATGACGGTCCTTTCATCGCGGGTGGGAAAGTCAGCGCGGTGGATTTTAGC
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CCCGAGAGCTTGCCTCATGTTCATGGCTACATGAAAGCGTTGTTCTCTCTCGACTCCTTT
GAGAAAACAAAGACCGAGGAGAAGTATGTGATAGCAGGATGGGAACACAAGGTCAACCCC
TGATGTCAAGTACTACTAGTTCCTCCATCTGTTGTGTGATGGATGATGATGTGGTTCAAG
GTCTATCTTCTCTTATATCAGT*AAAATAATGTTCTTGGACCTGTTTATGTTGTTGTTAT
TGTGTATCAAATCAAATAATAAGGATCGTTTGAATTAAAAGATTAGCGTCC

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 7

CO CL887Contig1 1501 7 10 U
GGAGAACCACAAAAGAAGCAAAAGCTTCATCATCATCACCTCCCTCTCTGTTCTCAAACT
AAATAATCGATCCCTCAATCACTCAACGAACTCTCTCATCTTTCGACCGATCTAAATCGA
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CACGCGCACCAGAACGACGCGGCTGCGGTTCGGAAGCTCCTGGAGGAAGATCCGTCTCTG
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ATCGATGTCGTCAAATGTCTGATCGAGTTTGGTGCTGATGTCAACGCTCAGGACAGGTGG
AAGAACACGCCTCTGGCTGATGCAGAAGGAGCTAGGAAGCAGAAAATGATCGAGCTACTC
AAATCTCATGGCGGTTTATCTTATGGTCAAAACGGAAGTCACTTTGAACCAAAGCCTGTG
CAACCACCAATCCCAAAGAAATGTGACTGGGAGATTGAACCTGCTGAGCTGGATTTCTCT
AATGCAGCCATGATTGGAAAGGGTTCCTTTGGTGAGATTGTGAAAGCCTATTGGAGAGGA
ACACCAGTTGCTGTCAAACGTATTCTTCCCTCTCTCTCAGATGATAGACTGGTTATTCAG
GACTTCAGGCATGAGGTTGATTTGCTAGTTAAGCTTCGCCATCCCAATATAGTCCAATTC
TTAGGAGCCGTTACCGAGAGAAAGCCCCTTATGTTAATCACTGAATACTTACGCGGGGGA
GATCTTCACCAATACCTCAAGGAAAAGGGTGGTCTTACTCCAGCAACTGCTGTTAACTTT
GCCTTGGACATCGCTAGAGGAATGACATATCTTCACAATGAACCTAATGTTATCATTCAC
CGAGATCTTAAACCGAGGAACGTTCTTCTGGTTAATTCGAGTGCAGACCACTTGAAAGTT
GGAGACTTTGGGCTTAGTAAGCTCATAAAGGTTCAAAACTCACATGATGTCTACAAAATG
ACTGGAGAAACCGGGAGCTACCGGTATATGGCTCCTGAAGTATTCAAGCATAGAAAATAC
GACAAGAAAGTGGACGTCTTCTCCTTTGCAATGATACTTTACGAGATGCTAGAAGGAGAG
CCACCATTTGCGAACTACGAGCCGTATGAAGCGGCCAAACATGTATCAGATGGACACAGA
CCTACTTTCCGTTCCAAAGGATGCACACCTGATTTAAGAGAGTTAATAGTGAAATGCTGG
GACGCAGACATGAACCAGAGACCATCGTTTCTGGACATTCTCAAGAGACTTGACAAGATC
AAGGAAACTCTGCCATCAGATCATCATTGGGGCTTATTCACTTCATAATACACAAAAAAA
TCCTCTTCCTGAAAACAAGAAAGTGACATTCTGTTTGCTTATTATTATTATTATTCTATG
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T


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 10 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1F892TF U 1
AF RS1GB38TF U 1
AF RS1FM33TF U 401
AF RS1F892JQ C 813
AF RS1GB38JQ C 1153
AF RS1FM94TF U 855
AF RS1FM33JQ C 758
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BS 657 986 RS1FM33TF
BS 987 1055 RS1FM94TF
BS 1056 1056 RS1FM33JQ
BS 1057 1288 RS1FM94TF
BS 1289 1289 RS1FM33JQ
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BS 1491 1501 RS1FM33JQ

RD RS1F892TF 656 0 0
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CACGCGCACCAGAACGACGCGGCTGCGGTTCGGAAGCTCCTGGAGGAAGATCCGTCTCTG
GTTCACGCCAGAGACTATGACAAGCGAACGCCTCTCCACGTGGCGTCTCTTCATGGGTGG
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AATGCAGCCATGATTGGAAAGGGTTCCTTTGGTGAGATTGTGAAAGCCTATTGGAGAGGA
ACACCAGTTGCTGTCAAACGTATTCTTCCCTCTCTCTCAGATGATAGACTGGTTAT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RS1GB38TF 663 0 0
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AAATAATCGATCCCTCAATCACTCAACGAACTCTCTCATCTTTCGACCGATCTAAATCGA
AACCCTTTTTATTCTCAAAATAATCTCACTGAGATGAGCAGAACGTCTCTGATCCTGTGG
CACGCGCACCAGAACGACGCGGCTGCGGTTCGGAAGCTCCTGGAGGAAGATCCGTCTCTG
GTTCACGCCAGAGACTATGACAAGCGAACGCCTCTCCACGTGGCGTCTCTTCATGGGTGG
ATCGATGTCGTCAAATGTCTGATCGAGTTTGGTGCTGATGTCAACGCTCAGGACAGGTGG
AAGAACACGCCTCTGGCTGATGCAGAAGGAGCTAGGAAGCAGAAAATGATCGAGCTACTC
AAATCTCATGGCGGTTTATCTTATGGTCAAAACGGAAGTCACTTTGAACCAAAGCCTGTG
CAACCACCAATCCCAAAGAAATGTGACTGGGAGATTGAACCTGCTGAGCTGGATTTCTCT
AATGCAGCCATGATTGGAAAGGGTTCCTTTGGTGAGATTGTGAAAGCCTATTGGAGAGGA
ACACCAGTTGCTGTCAAACGTATTCTTCCCTCTCTCTCAGATGATAGACTGGTTAT
TCAGACT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RS1FM33TF 586 0 0
G
GAAAATGATCGAGCTACTCAAATCTCATGGCGGTTTGTCTTATGGTCAAAACGGGAGTCA
CTTTGAACCAAAGCCTGTGCAACCACCAATTCCAAAGAAATGTGACTGGGAGATCGAACC
TGCTGAGCTGGATTTCTCTAATGCAGCCATGATTGGAAAGGGTTCATTTGGTGAGATTGT
GAAAGCCTATTGGAGAGGAACACCAGTTGCTGTCAAACGTATTCTTCCCTCTCTCTCAGA
TGATAGACTGGTTATTCAGGACTTCAGGCATGAGGTTGATTTGCTAGTTAAGCTTCGCCA
TCCCAATATAGTCCAATTCTTAGGAGCCGTTACCGAGAGAAAGCCCCTTATGTTAATCAC
TGAATACTTACGCGGGGGAGATCTTCACCAATACCTCAAGGAAAAGGGTGGTCTTACTCC
AGCAACTGCTGTTAACTTTGCCTTGGACATCGCTAGAGGAATGACATATCTTCACAATGA
ACCTAATGTTATCATTCACCGAGATCTTAAACCGAGGAACGTTCTTCTGGTTAATTCGAG
TGCAGACCACTTGAAAGTTGGAGACTTTGGGCTTAGTAAGCTCAT

QA 2 586 2 586
DS 

RD RS1F892JQ 688 0 0
TCTTACTCCAGCAACTGCTGTTAACTTTGCCTTGGACATCGCTAGAGGAATGACATATCT
TCACAATGAACCTAATGTTATCATTCACCGAGATCTTAAACCGAGGAACGTTCTTCTGGT
TAATTCGAGTGCAGACCACTTGAAAGTTGGAGACTTTGGGCTTAGTAAGCTCATAAAGGT
TCAAAACTCACATTATGTTTACAAAATGACTGGAGAAACCGGGAGCTACCGGTATATGGC
TCCTGAAGTATTCAAGCATAGAAAATACGACAAGAAAGTGGACGTCTTCTCCTTTGCAAT
GATACTTTACGAGATGCTAGAAGGAGAGCCACCATTTGCGAACTACGAGCCGTATGAAGC
GGCCAAACATGTATCAGATGGACACAGACCTACTTTCCGTTCCAAAGGATGCACACCTGA
TTTAAGAGAGTTAATAGTGAAATGCTGGGACGCAGACATGAACCAGAGACCATCGTTTCT
GGACATTCTCAAGAGACTTGACAAGATCAAGGAAACTCTGCCATCAGATCATCATTGGGG
CTTATTCACTTCATAATACACAAAAAAATCCTCTTCCTGAAAACAAGAAAGTGACATTCT
GTTTGCTTATTATTATTATTATTCTATGTTAAAACATTGTTTATTCTCATTTGTTTCACA
GTAAACGACTTAAAAAAAG
TTGCGACAT

QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1GB38JQ 348 0 0
AAT
TACGAGCCGTATGAAGCGGCCAAACATGTATCAGATGGACACAGACCTACTTTCCGTTCC
AAAGGATGCACACCTGATTTAAGAGAGTTAATAGTGAAATGCTGGGACGCAGACATGAAC
CAGAGACCATCGTTTCTGGACATTCTCAAGAGACTTGACAAGATCAAGGAAACTCTGCCA
TCAGATCATCATTGGGGCTTATTCACTTCATAATACACAAAAAAATCCTCTTCCTGAAAA
CAAGAAAGTGACATTCTGTTTGCTTATTATTATTATTATTCTATGTTAAAACATTGTTTA
TTCTCATTTGTTTCACAGTAAACGACTTAAAAAAAG
TTGCGACAT

QA 4 339 4 339
DS 

RD RS1FM94TF 636 0 0
G
AGAGGAATGACATATCTTCACAATGAACCTAATGTTATCATTCACCGAGATCTTAAACCG
AGGAACGTTCTTCTGGTTAATTCGAGTGCAGACCACTTGAAAGTTGGAGACTTTGGGCTT
AGTAAGCTCATAAAGGTTCAAAACTCACATGATGTCTACAAAATGACTGGAGAAACCGGG
AGCTACCGGTATATGGCTCCCGAAGTATTCAAGCATAGAAAATACGACAAGAAAGTGGAC
GTCTTCTCCTTTGCAATGATACTTTACGAGATGCTAGAAGGAGAGCCACCATTTGCGAAC
TACGAGCCGTATGAAGCGGCCAAACATGTATCAGATGGACACAGACCTACTTTCCGTTCC
AAAGGATGCACACCTGATTTAAGAGAGTTAATAGTGAAATGCTGGGACGCAGACATGAAC
CAGAGACCATCGTCTCTGGACATTCTCAAGAGACTTGACAAGATCAAGGAAACTCTGCCA
TCAGATCATCATTGGGGCTTATTCACTTCATAATACACAAAAAAATCC*CTTCCTGAAAA
CAAGAAAGTGACATTCTGTTTGCTTATTATTATTATTATTCTATGTTAAAACATTGTTTA
TTCTCATTTGTTTCACAGTAAACGACTTAAAAAAA

QA 2 636 2 636
DS 

RD RS1FM33JQ 744 0 0
TCACTGAATACTTACGCGGGGGAGATCTTCACCAATACCTCAAGGAAAAGGGTGGTCTTA
CTCCAGCAACTGCTGTTAACTTTGCCTTGGACATCGCTAGAGGAATGACATATCTTCACA
ATGAACCTAATGTTATCATTCACCGAGATCTTAAACCGAGGAACGTTCTTCTGGTTAATT
CGAGTGCAGACCACTTGAAAGTTGGAGACTTTGGGCTTAGTAAGCTCATAAAGGTTCAAA
ACTCTCATGATGTCTACAAAATGACTGGAGAAACCGGAAGCTACCGGTATATGGCTCCTG
AAGTATTCAAGCATAGAAAATACGACAAGAAAGTGGACGTCTTCTCCTTTGCAATGATAC
TTTACGAGATGCTAGAAGGAGAGCCACCATTTGCGAACTACGAGCCGTATGAAGCGGCCA
AACATGTATCAGATGGACACAGACCTACTTTCCGTTCCAAAGGATGCACACCTGATTTAA
GAGAGTTAATAGTGAAATGCTGGGACGCAGACATGAACCAGAGACCATCGTTTTTGGAGA
TTCTCAAGAGACTTGACAAGATCAAGGAAACTTTGCCATCAGATCATCATTGGGGGTTAT
TCACTTCATAATACACAAAAAAATCCTCCTCCTGAAAACAAGAAAGTGACATTCTGTTTG
CTTATTATTATTATTATTCTATGTTAAAACATTGTTT***CTCATTTGTTTCACAGTAAA
CGACTAAAAAAAAGGTTGTGACAT

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 7

CO CL888Contig1 810 7 8 U
ATAAGACAAAGTTGATATCTTTATTGTAGGAATCAACATCCAGACAAAAGATGAAAGTCA
A*TCTCCATAAACACAGGAGTAAACAAGAGTTCTATGATTTCATATCTCCAGATACAGTA
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GACCTCCAGAGTCAATCAAAGCCGATGTAACTGCTAGTGTTGCACCTGCAGCTATCGCTG
TGGGAATGCTCCTTGCTCTATAGCCAAGGACAGAAGCTCCAGCCACAAACCCACCAATAG
CACCATTGAAAAAATCTCTCTTTCCTCTATAACTCTGAACCACCTGCTCAACACCGATGT
AAACTCCTCCAATAGCAGCAAAAGTGAGCCCGTGAGTTCCCATCATCTTCAGCGTCCTGA
TGAGCCCCGGAAGCGCCACGTTCCTCTCCACTCTCGGAACGTCTTTCCACGTGGCCAAAA
TGGTTCCGTAGATCGTCCCAGCGGCGAAACCAGTCACGCTGCCTTTGATTGTCTTCATCA
TCGGGCCGTCCTCTTCTTCCAAGTACCTCATCTCAGCCGGATCCATGGTTTTTTTCTTTC
CTACGGTTCTTTTTAGGGTTTGAGACACGGACAAGAGGAATGAGCGAGAGGAGCGAGAGG
GAAGAATCAAAGATGTGTTCTTTGTTTCCC


BQ
10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FH44JQ U 2
AF RS1GY58JQ U 2
AF RS1E526JQ U 1
AF RS1BX15TF C 44
AF RS1BX15JQ U 49
AF RS1FH44TF C 4
AF RS1E526TF C 366
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GG
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TTCCGT

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DS 

RD RS1GY58JQ 669 0 0
GA
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CTCCATAAACACGGGAGTAAACAAGAGTTCTATGATTTCATATCTCCAGATACAGTAGAT
TAAAAAAGAAAAAAAAA*GAGATGACAACAAAGAGAGATAGACATTCTTCACGAGGCCTG
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GAATGCTCCTTGCTCTATAGCCAAGGACAGAAGCTCCAGCAACAAACCCACCAATAGCAC
CATTGAAAAAATCTCTCTTTCCTCTATAACTCTGAACCACCTGCTCAACACCGATGTAAA
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GGGACCGTC

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DS 

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C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RS1BX15TF 723 0 0
TTTTT
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TTTTTTTCTTTCCTACGGTTCTTTTTAGGGTTTGAGACACGGACAAGAG
GAATGAGCG

QA 6 714 6 714
DS 

RD RS1BX15JQ 718 0 0
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CCAGATACAGTAGATTAAAAAAGAAAAAAAAAAGAGATGACAACAAAGAGAGACAGACAT
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CATCAGCTTTAGCTGTTTTCTCGACGGGGGGGTAAGGATAATACTCTCTGCCGTTGTCTA
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CAGCTATCGCTGTGGGAATGCTCCTTGCTCTATAGCCAAGGACAGAAGCTCCAGCCACAA
ACCCACCAATAGCACCATTGAAAAAATCTCTCTTTCCTCTATAACTCTGAACCACCTGCT
CAACACCGATGTAAACTCCTCCAATAGCAGCAAAAGTGAGCCCGTGAGTTCCCATCATCT
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ACGTGGCCAAAATGGTTCCGTAGATCGTCCCAGCGGCGAAACCAGTCACGCTGCCTTTGA
TTGTCTTCATCATCGGGCCGTCCTCTTCTTCCAAGTACCTCATCTCAGCCGGATCCATGG
TTTTTTTCTTTCCTACGGTTCTTTTTAGGGTTTGAGACACGGACAAGAG
GAATGAGCG

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1FH44TF 792 0 0
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TAAAAAAGAAAAAAAAA*GAGATGACAACAAAGAGAGACAGACATTCTTCACGAGGCCTG
GGATAAGCCTTATTGACTTCAGACGCCAAAAGGAGAGAGATCAGGCATCAGCTTTAGCTG
TTTTCTCGACGGGGGTGTAAGGATAATACTCTCTGCCGTTGTCTACTCTTGTGGTCTGAC
CTCCAGAGTCAATCAAAGCCGATGTAACTGCTAGTGTTGCACCTGCAGCTATCGCTGTGG
GAATGCTCCTTGCTCTATAGCCAAGGACAGAAGCTCCAGCCACAAACCCACCAATAGCAC
CATTGAAAAAATCTCTCTTTCCTCTATAACCCTGAACCACCTGCTCAACACCGATGTAAA
CTCCTCCAATAGCAGCAAAAGTGAGCCCGTGAGTTCCCATC*TCTTCAGCGTCCTGATGA
GCCCCGGAAGCGCCACGTTCCTCTCCACTCTCGGAACGTCTTTCCACGTGGCCAAAATGG
TTCCGTAGATCGTCCCAGCGGCGAAACCAGTCACGCTGCCTTTGATTGTCTTCATCATCG
GGCCGTCCTCTTCTTCCAAGTACCTCATCTCAGCCGGATCCACGGTTTTTTTCTTTCCTA
CGGTTCTTTTTAGGGTTTGAGACACGGACAAGAGGAATGAGCGAGAGGAGCGAGAGGGAA
GAATCAAAGAT
C

QA 1 791 1 791
DS 

RD RS1E526TF 445 0 0
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TTGAAAAAATCTCTCTTTCCTCTATAACTCTGAACCACCTGCTCAACACCGATGTAAACT
CCTCCAATAGCAGCAAAAGTGAGCCCGTGAGTTCCCATCATCTTCAGCGTCCTGATGAGC
CCCGGAAGCGCCACGTTCCTCTCCACTCTCGGAACGTCTTTCCACGTGGCCAAAATGGTT
CCGTAGATCGTCCCAGCGGCGAAACCAGTCACGCTGCCTTTGATTGTCTTCATCATCGGG
CCGTCCTCTTCTTCCAAGTACCTCATCTCAGCCGGATCCATGGTTTTTTTCTTTCCTACG
GTTCTTTTTAGGGTTTGAGACACGGACAAGAG*AATGAGCGAGAGGAGCGAGAGGGAAGA
ATCAAAGATGTGTTCTTTGTTTCCC

QA 1 445 1 445
DS 



AS 1 6

CO CL889Contig1 828 6 12 U
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AACCACAGAGAGAGAACTAAAGGGGGTTTCTTTATTTAATTGTAAGAGTAAAAAGATGAA
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GCATAGCCGACAGCTAGGGGCACAGCTGTCGGGAAGCATGAGTTTCAGCAGCCAAATGTC
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GTTGGGTCATACTGTTCAGAAAAAGGAACGAGAGTACAAAGAAGCTCTCGAAGCATTCAA
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CGAAAAGGTCAGAATGAAGAAGCTGGAAGAGCTAAGCAAGAACATAGATTCTATACACTG
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TTAACTCTACGTTTAGGTTTTGTGATGGTTGAATGTAATTTATATTTTTATAATCGTCGT
GTGTTATATTTGCCACTACTATCTTCTTCTGTTAGGGTTTTCTGGAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 10 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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T
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GTCTGCTTTCAGGGCGAAAGAAGAGGAGATCGAGAAGAAGAAGATGGAGATTAGGGAAAG
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AAGCAAGAACATAGATTCTATACACTGACTTTGAA

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AACCACAGAGAGAGAACTAAAGGGGGTTTCTTTATTTAATTGTAAGAGTAAAAAGATGAA
GGAGATGCAGGCGATAGAGACGTCACAGCCGACGGTGGCTCCTCCGGCACCGGCAGTGGT
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GATCGAGAAGAAGAAGATGGAGATTAGGGAAAGGGTTCAAGCTCAGCTCGGTCGTGTCGA
AGAAGAGACCAAGCGTCTCGCTTTGATCCGTGAGGAGCTTGAGGGTTTAGCTGACCCCAT
GAGGAAAGAAGTTGCTTTGGTTAGGAAGAAGATTGATTCTGTCAACAAAGAGTTGAAGCC
GTTGGGTCATACTGTTCAGAAAAAGGAACGAGAGTACAAAGAAGCTCTCGAAGCATTCAA
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CGAAAAGGTCAGAATGAAGAAGCTGGAAGAGCTAAGCAAGAACATAGATTCTATACACTG
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T**ACTCTACGTTTAG*TTTTGTGATGGTTGA
TGTAATTATATTTTAT

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DS 

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T
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ATTTAATTGTAAGAGTAAAAAGGTGAAGGAGATGCAGGCGATAGAGACGTCACAGCCGAC
GGTGGCTCCTCCGGCACCGGCAGTGGTGCATAGCCGACAGCTAGGGGCACAGCTGTCGGG
AAGCATGAGTTTCAGCAGCCAAATGTCGAAGGAAGACGAGGAGATGTCGAGGACGGCTTT
GTCTGCTTTCAGGGCGAAAGAAGAGGAGATCGAGAAGAAGAAGATGGAGATTAAGGAAAG
GGTTCAAGCTCAGCTCGGTCGTGTCGAAGAAGAGACCAAGCGTCTCGCTTTGATCCGTGA
GGAGCTTGAGGGTTTAGCTGACCCCATGAGGAAAGAAGTTGCTTTGGTTAGGAAGAAGAT
TGATTCTGTCAACAAAGAGTTGAAGCCGTTGGGTCATACTGTTCAGAAAAAGGAACGAGA
GTACAAAGAAGCTCTCGAAGCATTCAACGAAAAGAACAGGGAGAAGGTTCAGCTAATCAC
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AAGCAAGAACATAGATTCTATACACTGGCTTTGAATCCAAGACAGGAAAAGCTCTTCTTG
GGGGCCAGAGACCATTCTCTGAGTGTTT*AACTCTACGT

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T
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ATTTAATTGTAAGAGTAAAAAGGTGAAGGAGATGCAGGCGATAGAGACGTCACAGCCGAC
GGTGGCTCCTCCGGCACCGGCAGTGGTGCATAGCCGACAGCTAGGGGCACAGCTGTCGGG
AAGCATGAGTTTCAGCAGCCAAATGTCGAAGGAAGACGAGGAGATGTCGAGGACGGCTTT
GTCTGCTTTCAGGGCGAAAGAAGAGGAGATCGAGAAGAAGAAGATGGAGATTAAGGAAAG
GGTTCAAGCTCAGCTCGGTCGTGTCGAAGAAGAGACCAAGCGTCTCGCTTTGATCCGTGA
GGAGCTTGAGGGTTTAGCTGACCCCATGAGGAAAGAAGTTGCTTTGGTTAGGAAGAAGAT
TGATTCTGTCAACAAAGAGTTGAAGCCGTTGGGTCATACTGTTCAGAAAAAGGAACGAGA
GTACAAAGAAGCTCTCGAAGCATTCAACGAAAAGAACAGGGAGAAGGTTCAGCTAATCAC
CAAGCTTATGGAGCTGGTGGGA*AAAGCGAAAAGGTCAGAATGAAGAAGCTGGAAGAGCT
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TGTAATTTATATTTTTATAATCGTCGTGTGTTATATTTGC

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DS 

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GGAGATGCAGGCGATAGAGACGTCACAGCCGACGGTGGCTCCTCCGGCACCGGCAGTGGT
GCATAGCCGACAGCTAGGGGCACAGCTGTCGGGAAGCATGAGTTTCAGCAGCCAAATGTC
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GATCGAGAAGAAGAAGATGGAGATTAGGGAAAGGGTTCAAGCTCAGCTCGGTCGTGTCGA
AGAAGAGACCAAGCGTCTCGCTTTGATCCGTGAGGAGCTTGAGGGTTTAGCTGACCCCAT
GAGGAAAGAAGTTGCTTTGGTTAGGAAGAAGATTGATTCTGTCAACAAAGAGTTGAAGCC
GTTGGGTCATACTGTTCAGAAAAAGGAACGAGAGTACAAAGAAGCTCTCGAAGCATTCAA
CGAAAAGAACAGGGAGAAGGTTCAGCTAATCACCAAGCTTATGGAGCTGGTGGGAGAAAG
CGAAAAGGTCAGAATGAAGAAGCTGGAAGAGCTAAGCAAGAACATAGATTCTATACACTG
ACTTTGAATCCAAGACAGGAAAAGCTCTTCTTGGGGGCCAGAGACCATTCTCTGAGTGTT
TTAACTCTACGTTTAGGTTTTGTGATGGTTGAATGTAATTTATATTTTTATAATCGTCGT
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DS 

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GGGCG
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ACAGCTAGGGGCACAGCTGTCGGGAAGCATGAGTTTCAGCAGCCAAATGTCGAAGGAAGA
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GAAGAAGATGGAGATTAGGGAAAGGGTTCAAGCTCAGCTCGGTCGTGTCGAAGAAGAGAC
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TTGCCACTACTATCTTCTTCTG

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DS 



AS 1 5

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TACCATTATCATAAGACATCCATGGAACAGCTGAATGATTCCAGAAGAGAACCTGATTAT
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AACCGGCATGATGTGCTCTTCCCACACGTGGGATATGGAGTAGCTGAGCTAGTTTAGATA
AACCGAGGTGTTCACCGAGCCCGTCGCACAATCCAGCCATGACCTTCAAGTCGTAAACCT
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CCACGTTGGCTTTCATGGCAAGGTAACAATCGTCATCCGACGAATATAGGAACGTGCGGT
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AGGGCTGTTTGTTTAGGAGGAAGAGGCATGAGAATACGATAAGCCTGCTTTCC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1E003JQ U 4
AF RS1BX86JQ U 1
AF RS1CV46JQ U 52
AF RS1E003TF C 624
AF RS1CV46TF C 728
BS 1 781 RS1BX86JQ
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BS 789 1373 RS1E003TF

RD RS1E003JQ 720 0 0
AGAATAATTCGCTTTTATTTATCATAGATTGCAGACAAGCGTGCCCAGTTGATAGAGTAA
GCCATGTAAACAATCCATTAAATATTAAAGAAAATCAAGGCTAGCAAATGCTAGAAAAAA
CCAAGAAGAAAAAATCTCAATTCCATCTAAATAAGTCCTAAAAGCAGGAAAAATCTCAAC
CTAGCAATTTTTATTGTAGTAAATCCGGAAGCTGACCAAGATAATCAGCAGCATATGGTG
TCTGATACGGGTATACGAATGTGCTTGACGGTAGATGATTAAGCTGATTGACATACATAC
CATTATCATAAGACATCCATGGAACAGCTGAATGATTCCAGAAGAGAACCTGATTATTAT
CATAGCTTGGGATGTATCCATTATGGAAGAGCATATCCTGCGTACAAGGATAAGAAACTA
GATTCTGCTGGCACATCATAGGCATAGAGGCCGCTGGAGAAGGCATGATGGTGGTGGTGG
TCGTAGGAGTAACCATCATCCTTTTCCCAATTCCATAAAGCATTCCTTTAGCAAACCTAG
AGTCTTCAAACACTTGCCTGAGCTTGATAAACACAAGTGCAGTCATTAAACTGTCTGAAC
CGGCATGATGTGCTCTTCCCACACGTGGGATATGGAGTAGCTGAGCTAGTTTAGATAAAC
CGAGGTGTTCACCGAGCCCGTCGCACAATCCAGCCATGACCTTCAAGTCGTAAACCTCGC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RS1BX86JQ 792 0 0
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TAAGCCATGTAAACAACCCATTAAATATTAAAGAAAATCAAGGCTAGCAAATGCTAGAAA
AAACCAAGAAGAAAAAATCTCAATTCCATCTAAATAAGTCCTAAAAGCAGGAAAAATCTC
AACCTAGCAATTTTTATTGTAGTAAATCCGGAAGCTGACCAAGGTAATCAGCAGCATATG
GTGTCTGATACGGGTATACGAATGTGCTTGACGGTAGATGATTAAGCTGATTGACATACA
TACCATTATCATAAGACATCCATGGAACAGCTGAATGATTCCAGAAGAGAACCTGATTAT
TATCATAGCTTGGGATGTATCCATTATGGAAGAGCATATCCTGCGTACAAGGATAAGAAA
CTAGATTCTGCTGGCACATCATAGGCATAGAGGCCGCTGGAGAAGGCATGATGGTGGTGG
TGGTCGTAGGAGTAACCATCATCCTTTTCCCAATTCCATAAAGCATTCCTTTAGCAAACC
TAGAGTCTTCAAACACTTGCCTGAGCTTGATAAACACAAGTGCAGTCATTAAACTGTCTG
AACCGGCATGATGTGCTCTTCCCACACGTGGGATATGGAGTAGCTGAGCTAGTTTAGATA
AACCGAGGTGTTCACCGAGCCCGTCGCACAATCCAGCCATGACCTTCAAGTCGTAAACCT
CGCCGAATACTTTCACAACCTCCGATGCAAATTCCCCACGAGTCTCGGGTAGTTTCCCGT
GATTGAGA
TGCA

QA 1 788 1 788
DS 

RD RS1CV46JQ 740 0 0
TTGATAGAGTAAGCCATGTAAACAACCCATTAAATATTAAAGAAAATCAAGGCTAGCAAA
TGCTAGAAAAAACCAAGAAGAAAAAATCTCAATTCCATCTAAATAAGTCCTAAAAGCAGG
AAAAATCTCAACCTAGCAAATT**ATTGTAGTAAATCCGGAAGCTGACCAAGGTAATCAG
CAGCATATGGTGTCTGATACGGGTATACGAATGTGCTTGACGGTAGATGATTAAGCTGAT
TGACATACATACCATTATCATAAGACATCCATGGAACAGCTGAATGATTCCAGAAGAGAA
CCTGATTATTATCATAGCTTGGGATGTATCCATTATGGAAGAGCATATCCTGCGTACAAG
GATAAGAAACTAGATTCTGCTGGCACATCATAGGCATAGAGGCCGCTGGAGAAGGCATGA
TGGTGGTGGTGGTCGTAGGAGTAACCATCATCCTTTTCCCAATTCCATAAAGCATTCCTT
TAGCAAACCTAGAGTCTTCAAACACTTGCCTGAGCTTGATAAACACAAGTGCAGTCATTA
AACTGTCTGAACCGGCATGATGTGCTCTTCCCACACGTGGGATATGGA**AGCTGAGCTA
GTTTAGATAAACCGAGGTGTTCACCGAGCCCGTCGCACAATCCAGCCATGACCTTCAAGT
CGTAAACCTCGCCGAATACTTTCACAACCTCCGATGCAAATTCCCCACGAGTCTCGGGTA
GTTTCCCGTGGTTGAGA
TGC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RS1E003TF 750 0 0
ACACGTGGGATATG*AGTAGCTGAGCTAGTTTAGATAAACCGAGGTGTTCACCGAGCCCG
TCGCACAATCCAGCCATGACCTTCAAGTCGTAAACCTCGC*GAATACTTTCACAACCTCC
GATGCAAATTCCCCACGAGTCTCGGGTAGTTTCCCGTGGTTGAGAATGCACAGGACGTAC
GCGAAATCATACGCTCCTTGGAAAGTTACGAACTCGACGTACTTGTGAGAGTATAGGGCA
GACAAAAGCTTTGGGAAAAATCCGTATTTGAACATATCGACTCCTTCGTTTCTGATTTTG
TTCAAGTCGACGCCGTGTTTCTTCAAGAAATCGATCGAGTTCTGGTTGCGTGTGTCGGAC
GGGTCCCCGAAGTTGGAGAAGTTAATCTCCCATACGCCGCCGATCTCTCCCTTGGCGTTG
AAGAGAGTGAAGCCGCATTGGATCAGCTTCGACGATTCCACGTTGGCTTTCATGGCAAGG
TAACAATCGTCATCCGACGAATATAGGAACGTGCGGTGAGTAATACCGGGATACTCTGTA
TCAAAAGCTATCAGTGGATATAGCTTATGACATTCCATCAATCGAGCCAGCCCTTGATCA
ACGTTCCACCTCCATACCATCCACGTCTTCGGTACTGGCCTCGAGTGCTGATGAGGATGA
TGATTCTCGTTCATCGGTTCTGCAGAAGAAAAAAATTAGGGCTGTTTGTTTAGGAGGAAG
AGGCATGAGAATACGATAAGCCTGCTTTCC

QA 1 750 1 750
DS 

RD RS1CV46TF 646 0 0
TACTTTCACAACCTCCGATGCAAATTCCCCACGAGTCTCGGGTAGTTTCCCGTGGTTGAG
AATGCACAGGACGTACGCGAAATCATACGCTCCTTGGAAAGTTACGAACTCGACGTACTT
GTGAGAGTATAGGGCAGACAAAAGCTTTGGGAAAAATCCGTATTTGAACATATCGACTCC
TTCGTTTCTGATTTTGTTCAAGTCGACGCCGTGTTTCTTCAAGAAATCGATCGAGTTCTG
GTTGCGTGTGTCGGACGGGTCCCCGAAGTTGGAGAAGTTAATCTCCCATACGCCGCCGAT
CTCTCCCTTGGCGTTGAAGAGAGTGAAGCCGCATTGGATCAGCTTCGACGATTCCACGTT
GGCTTTCATGGCAAGGTAACAATCGTCATCCGACGAATATAGGAACGTGCGGTGAGTAAT
ACCGGGATACTCTGTATCAAAAGCTATCAGTGGATATAGCTTATGACATTCCATCAATCG
AGCCAGCTCTTGATCAACGTTCCACCTCCATACCATCCACGTCTTCGGTACTGGCCTCGA
GTGCTGATGAGGATGATGATTCTCGTTCATCGGTTCTGCAGAAGAAAAAAATTAGGGCTG
TTTGTTTAGGAGGAAGAGGCATGAGAATACGATAAGTCTGCTTTCC

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 7

CO CL891Contig1 624 7 7 U
GGACTTTCATTTCGTGACTCTCATCCAAATCCCTAAATCTCGAGAGCTCGACGGAGATGG
CACTGAGAACTGCAGTCCTTCGTCACCTTAGGGTTCCCGTGACGGGATCGAACCAGTCTC
AAATTGGGTTCCTTGGTTCGATCCGTGCTTTCTCTTCTCACGATGATCATCTCAGCAAGC
AGGATGTCGTCGACAGAGTTCTCGATGTTGTCAAGTGCTTCCCTAAAGTCGATCCAGCTA
AGGTGACTCCTGAAGTTCATTTCCAAAAGGATTTGGGGTTAGATAGTTTGGACACTGTGG
AGATAGTGATGGCTATTGAAGAGGAGTTCAAGCTCGAGATCCCAGACAAAGAAGCTGACA
AGATCGACTCTTGCCCTCTTGCCATTGAATACGTTTTCAACCATCCCATGTCTAGCTGAT
CTCTCGTGGTTTCTCTCCTTTTGTTTTGTTTGTATGATGTTCTCTCAAGTTATCTCTTGA
AAATGAGATTTTGCAAATAAATTGGAGCATATTCTTGTGACTCTTTCATTTTTCCATAAA
AGAAACCATTTTGGCTTTTGAGTCTTTTGTAATTCGACACTTTTCGGAGCTATTACAATC
TGTCTTTTATGCAAAAATAAAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 35 35 15 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 5 45 30 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 0 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EM56JQ C 208
AF RS1AB10JQ C 12
AF RS1AB10TF U 12
AF RS1EM56TF U 9
AF RS1G593TF U 21
AF RS1GO48TF U 1
AF RS1F791TF U 1
BS 1 541 RS1F791TF
BS 542 542 RS1EM56TF
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RD RS1EM56JQ 145 0 0
GTTGTCAA
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GGATTAGATAGTTTGGACCCGGGGGAGATAGTGATGGCTATTGAAGAGGAGTTCAAGCTT
GAGATCCCAGACAAAGA

QA 9 145 9 145
DS 

RD RS1AB10JQ 497 0 0
GG
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TATTGAAGAGGAGTTCAAGCTCGAGATCCCAGACAAATAAGCTGACAAGATCGACTCTTG
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TCTCCTTTTGTTTTGTTTGTATGATGTTCTCTCAAGTTATCTCTTGAAAATGAGATTTTG
CAAATAAATTGGA
AC

QA 3 495 3 495
DS 

RD RS1AB10TF 497 0 0
GG
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AGTCCTTCGTCACCTTAGGGTTCCCGTGACGGGATCGAACCAGTCTCAAATTGGGTTCCT
TGGTTCGATCCGTGCTTTCTCTTCTCACGATGATCATCTCAGCAAGCAGGATGTCGTCGA
CAGAGTTCTCGATGTTGTCAAGTGCTTCCCTAAAGTCGATCCAGCTAAGGTGACTCCTGA
AGTTCATTTCCAAAAGGATTTGGGGTTAGATAGTTTGGACACTGTGGAGATAGTGATGGC
TATTGAAGAGGAGTTCAAGCTCGAGATCCCAGACAAATAAGCTGACAAGATCGACTCTTG
CCCTCTTGCCATTGAATACGTTTTCAACCATCCTATGTCTAGCTGATCTCTCGTGGTTTC
TCTCCTTTTGTTTTGTTTGTATGATGTTCTCTCAAGTTATCTCTTGAAAATGAGATTTTG
CAAATAAATTGGA
AC

QA 3 495 3 495
DS 

RD RS1EM56TF 551 0 0
GGACTCTCT
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CTTCGTCACCTTAGGGTTCCCGTCACGGGATCGAACCAGTCTCAAATTGGGTTCCTTGGT
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CTTTTGTTTTGTTTGTATGATGTTCTCTCAAGTTATCTCTTGAAAATGAGATTTTGCAAA
TAAATTCGAGCATATTCTTGTGACTCTTTCATTTTTCCATAAAAGAAACCATTTTG
GCTAAA

QA 10 545 10 545
DS 

RD RS1G593TF 578 0 0
GG
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TCACCTTAGGGTTCCCGTCACGGGATCGAACCAGTCTCAAATTGGGTTCCTTGGTTCGAT
CCGTGCTTTCTCTTCTCACGATGACCATCTCAGCAAGCAGGATGTCGTCGACAGAGTTCT
CGATGTTGTCAAGTGCTTCCCTAAAGTCGATCCAGCTAAGGTGACTCCTGAAGTTCATTT
CCAAAAGGATTTGGGATTAGATAGTTTGGACACGGTGGAGATAGTGATGGCTATTGAAGA
GGAGTTCAAGCTTGAGATCCCAGACAAAGAAGCTGACAAGATCGACTCTTGCCCTCTTGC
CATTGAATACGTTTTCAACCATCCCATGTCTAGCTGATCTCTCGTGGTTTCTCTCCTTTT
GTTTTGTTTGTATGATGTTCTCTCAAGTTATCTCTTGAAAATGAGATTTTGCAAATAAAT
TCGAGCATATTCTTGTGACTCTTTCATTTTTCCATAAAAGAAACCATTTTGGCTTTTGAT
TCTTT*GTAATTCGACACTTTT*GGAGCTATTACAA

QA 3 578 3 578
DS 

RD RS1GO48TF 553 0 0
GGACTTTCATTTCGTGACTCTCATCCAAATCCCTAAATCTCGAGAGCTCGACGGAGATGG
CACTGAGAACTGCAGTCCTTCGCCACCTTAGGGTTCCCGTGACGGGATCGAACCAGTCTC
AAATTGGGTTCCTTGGTTCGATCCGTGCTTTCTCTTCTCACGATGATCATCTCAGCAAGC
AGGATGTCGTCGACAGAGTTCTCGATGTTGTCAAGTGCTTCCCTAAAGTCGATCCAGCTA
AGGTGACTCCTGAAGTTCATTTCCAAAAGGATTTGGGGTTAGATAGTTTGGACACTGTGG
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AGATCGACTCTTGCCCTCTTGCCATTGAATACGTTTTCAACCATCCCATGTCTAGCTGAT
CTCTCGTGGTTTCTCTCCTTTTGTTTTGTTTGTATGATGTTCTCTCAAGTTATCTCTTGA
AAATGAGATTTTGCAAATAAATTGGAGCATATTCTTGTGACTCTTTCATTTTTCCATAAA
ATAAACTATTTTG

QA 1 553 1 553
DS 

RD RS1F791TF 624 0 0
GGACTTTCATTTCGTGACTCTCATCCAAATCCCTAAATCTCGAGAGCTCGACGGAGATGG
CACTGAGAACTGCAGTCCTTCGTCACCTTAGGGTTCCCGTGACGGGATCGAACCAGTCTC
AAATTGGGTTCCTTGGTTCGATCCGTGCTTTCTCTTCTCACGATGATCATCTCAGCAAGC
AGGATGTCGTCGACAGAGTTCTCGATGTTGTCAAGTGCTTCCCTAAAGTCGATCCAGCTA
AGGTGACTCCTGAAGTTCATTTCCAAAAGGATTTGGGGTTAGATAGTTTGGACACTGTGG
AGATAGTGATGGCTATTGAAGAGGAGTTCAAGCTCGAGATCCCAGACAAAGAAGCTGACA
AGATCGACTCTTGCCCTCTTGCCATTGAATACGTTTTCAACCATCCCATGTCTAGCTGAT
CTCTCGTGGTTTCTCTCCTTTTGTTTTGTTTGTATGATGTTCTCTCAAGTTATCTCTTGA
AAATGAGATTTTGCAAATAAATTGGAGCATATTCTTGTGACTCTTTCATTTTTCCATAAA
ATAAACTATTTTGGCTTTTGAGTGTTTTGTAATTCGACACTTTTCGGAGCTATTACAATC
TGTCTTTTATGCAAAAATAAAAAA

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 4

CO CL892Contig1 959 4 2 U
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GGGTTTCAAACTTGGAAATACAATAGATAAAAGAATAGCAAAGCTATGGAAAACAAAAGA
AAAGGATTCAACGAGTTGTCAATTGTAGAAGTCTTACATGCAATGCAAACAAATGATTAT
AATGGTTGTAATGATCCAAAGAGACTTGTTGAGACTAATGGGGAATCAAGATGAGCAGCA
GCCTGATTGCTGGTTCACTGACTGTCCGCGAATCTGGACAGTCGGTGGCTTGGCACCTCC
AGATGGTTGGCTAGCCATTCTGGTCTTAATTGCAGCAGTCATGGCCATGAAGGCTTCTTC
AACATTGGTTACATTTTTAGCACTTGTTTCCAAGAAAGGGATCCCAAGTTCATCTGCAAA
AGCCTGAGCTGCCTCAGTGGAGACAACTTTCTGTGAAGTGAGATCGTTTTTGTTCCCAAC
CAGTAGCTTGTTCACATTCTCACTGGCGTAACGGTCGATTTCGTTCAGCCATTGCTTGAC
GTTGTTGAAGCTCTCTTGGTCAGTGACATCATAGGTGACAATGATGCCGTGAGCTCCTCT
GTAGTAGCTGCTTGTGATTGTCCTGAAACGCTCTTGGCCTGCTGTGTCCCAGATCTGGAG
TTTGATTGTCTTTCCGTCCTGTTCAACTGTGCGGATTTTAAAGTCAACACCAATGGTACT
GATGTAGCTGTCCAGGTAAGAATCATCAGCAAATCTTAGAAGCAAGCAGGATTTTCCAAC
ACCAGAATCACCGATAAGCAAAAGCTTGAACAGATAGTCATATTCAGGATTCATGGCGTA
TCTAGATCGATCTTTCCAACGTAGAGAATCTGGCGATCAACGGAATATCAGGCGATTGTA
ATTTCAGCAAATCGTCGTCTGAACAAAGAGAGGGAGAGAGAGGGAGAGAGACCTAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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GCTGCTTGTGATTGTCCTGAAACGCTCTTGGCCTGCTGTGTCCCAGATCTGGAGTTTGAT
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GGAGAGAGACCTAAAAA

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AS 1 7

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ATCCAGAGCTTGAGTTTCATATCAATGAATTATCCACTAAACAGTTTCAGGCTTGCTTCA
CAGATCTTCCAGAAGCTGTCTCAAAGCAGCCAATGATGGTGGATGCAAGTTTTTTTCCAT
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GCTCT***AAAGATCAGACATCATCAAGCTGGGAACTTCACTCACAATGTCTTTACAACA
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CAGAGGAAACCAATCCAAAGATCTTTCAACCTATTGTGGTCAAAAAACTTATTGTTGTAC
ATTTGTAGTATACATATGATATGTCAAAAATACAATCTCACTTATTACTATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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35 35 20 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 5 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 10 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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GGA
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QA 4 351 4 351
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ATCCAGAGCTTGAGTTTCATATCAATGAATTATCCACTAAACAGTTTCA

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DS 

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AAGG
AAAAGATAAGAGCTTTAAGTTTCTTTACCTTCTCTACATGGACTTGTCTGTACTTGAAAG
AGTTAATTGGCTGCAT*AGCAGCAAATGGTCTCACCAGATTTTTTTGAGATACTTGGCTC
AGATAGGAGAGAAGAGCTCAAAAGGGTTGAGAGTTATTTGGGAAACAATAATGATGAGGT
GCAGGGTTTCAGACATTATGAAACTATTGATGGTTGCATCTCAAGGACAAGTAGCTTCCA
AATGGAACAAGTGAAGAACAATGAAGAAAACAGAGTCATTGCCTTGCAGCACAAGAGAAA
AACAGAGGGTAAGACAGAAAAGATAGAGAACAACAAGAAGAAGAAGATCAAAACAGAGGA
TGAAACAGAGTCAAGCATGAAAGGAAAATCAAACATGAGCAACTCAGAGACATCCTCAGA
GATTCAGAAGCGAGACTACATCCATGTGAGAGCTAGGCGAGGTGAAGCCACCGACAGACA
TAGCTTAGCAGAAAGGGCAAGGAGAGAAAAGTTAAGCAAGAAGATGAAATGTCTTCAAGA
CATTGTTCCTGGATGCAATAAAGTTACTGGTAAAGCCGGTATGCTTGATGAGATCATCAA
CTATGTCCAATCTCTGCAACAACAAGTCGAGTTCTTGTCTATGAAACTCTCTGTCTTAAA
TCCAGAGCTTGAGTTTCATATCAATGAATTATCCACTAAACAGTTTCAG*CTTGCTTCAC
AGATCTTCCAGAAGCTGTCTCAA*GCAGCCAATGATGGTGGATGCAAG

QA 5 772 5 772
DS 

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GG
AGCTTTAACCCCCAAAGGAAAAGATAAGAGCTTTAAGTTTCTTTACCTTCTCTACATTGA
CTTGTCTGTACTTGAAAGAGTTAATTGGCTGCAACAGCAGCAAATGGCCTCACCAGATTT
TTTTGAGATACTTGGCTCAGATGGGAGAGAAGAGCTCAAAAGGGTTGAGAGTTATTTGGG
AAACAATAATGATGAGGTGCAGGGTTTCAGACATTATGAAACTATTGATGGTTGCATCTC
AAGGACAAGTAGCTTCCAAATGGAACAAGTGAAGAACCATGAAGAAAACATAGTCATTGC
CTTGCAGCCCAAGAGAAAAACAGAGGGTAAGACAGAAAAGATAGAGAACAAGAAGAAGAA
GAAGATCAAAACAGAGGATGAAACAGAGTCAAGCATGAAAGGAAAATCAAACATGAGCAA
CTCAGAGACATCCTCAGAGATTCAGAAGCGAGACTACATCCATGTGAGAGCTAGGCGAGG
TGAAGCCACCGACAGACATAGCTTAGCAGAAAGGGCAAGGAGAGAAAAGTTAAGCAAGAA
GATGAAATGTCTTCAAGACATTGTTCCTGGATGCAATAAAGTTACTGGTAAAGCCGGTAT
GCTTGATGAGATCATCAACTATGTCCAATCTCTGCAGCAACAAGTCGAGTTCTTGTCTAT
GAAACTCTCTGTCTTAAATCCAGAGCTTGAGTTTCATATCAATGAATTATCCACTAAACA
GTTTCAG*CTTGCTTCACAGATCTTCCAGA*GCTGTCCCAAAGCAGCCAATGATGGTGGA
TGCAAGTTCTTTTCCATTACAGCAGCATGGATCTCTAGACTACTCTCTCATAAA

QA 3 836 3 836
DS 

RD RS1D422JQ 834 0 0
GCA
CAAGAGAAAAACAGAGGGTAAGACAGAAAAGATAGAGAACAACAAGAAGAAGAAGATCAA
AACAGAGGATGAAACAGAGTCAAGCATGAAAGGAAAATCAAACATGAGCAACTCAGAGAC
ATCCTCAGAGATTCAGAAGCGAGACTACATCCATGTGAGAGCTAGGCGAGGTGAAGCCAC
CGACAGACATAGCTTAGCAGAAAGGGCAAGGAGAGAAAAGTTAAGCAAGAAGATGAAATG
TCTTCAAGACATTGTTCCTGGATGCAATAAAGTTACTGGTAAAGCCGGTATGCTTGATGA
GATCATCAACTATGTCCAATCTCTGCAACAACAAGTCGAGTTCTTGTCTATGAAACTCTC
TGTCTTAAATCCAGAGCTTGAGTTTCATATCAATGAATTATCCACTAAACAGTTTCAGGC
TTGCTTCACAGATCTTCCAGAAGCTGTCTCAAAGCAGCCAATGATGGTGGATGCAAGTTT
TTCTCCATTACAGCAGCATGGATCTCTAGATTACTCTCTCATAAATTCAAACCAAACCAC
AATTTTTAGCTCT***AAAGATCAGACATCATCAAGCTGGGAACTTCACTCACAATGTCT
TTACAACAACTTGAGAACCGATTCAGTTTCAAGTTTCTTCAGCCTCAAGTAAAAAAAAAA
AAACTCGGGATAGGGCTCACTGAAAAATCTGTCTTATCCATGTTATCTTTAAATTTAAAC
CAGAAAGACAGAGGAAACCAATCCAAAGATCTTTCAACCTATTGTGGTCAAAAAACTTAT
TGTTGTACATTTGTAGTATACATATGATATGTCAAAAATACAATCTCACTT

QA 4 834 4 834
DS 

RD RS1CR46JQ 792 0 0
GAAGAAGAAGATCAAAACAGAGGATGAAACAGAGTCAAGCATGAAAGGAAAATCAAACAT
GAGCAACTCAGAGACATCCTCAGAGATTCAGAAGCGAGACTACATCCATGTGAGAGCTAG
GCGAGGTGAAGCCACCGACAGACATAGCTTAGCAGAAAGGGCAAGGAGAGAAAAGTTAAG
CAAGAAGATGAAATGTCTTCAAGACATTGTTCCTGGATGCAATAAAGTTACTGGTAAAGC
CGGTATGCTTGATGAGGTCATCAACTATGTCCAATTTCTGCAGCAACAAGTCGAGTTTTT
GTTTATGAAACTCTCTGTCTTAAATCCAGAGCTTGAGTTTCATATCAATGAATTATCCAC
TAAACAGTTTCAGGCTTGCTTCACAAATTTTCCAGAAGCTGTCCCAAAGCAGCCAATGAT
GGTGGATGCAAGTTTTTTTCCATTACAGCAGCATGGATCTCTAGACTACTCTCTCATAAA
TTCAAACCAAACCACAATTTTTAGCTCT***AAAGATCAGACATCATCAAGCTGGGAAAT
TCACTCACAATGTCTTTACAACAACTTGAGAACCGATTCAGTTTCAAGTTTCTTCAGCCA
CAAGTGAAAAAAAAA***CTCAGGATAGGGCTCACTGAAAAATCTGTCTTATCCATGTTA
TCTTTAAATTTAAACCAGAAAGACAGAGGAAACCAATCCAAAGATCTTTCAACCTATTGT
GGTCAAAAAACTTATTGTTGTACATTTGTAGTATACATATGATATGTCAAAAATACAATC
TCACTT
ATTACT

QA 1 786 1 786
DS 

RD RS1FO89JQ 777 0 0
AGGATGAAACAGAGTCAAGCATGAAAGGAAAATCAAACATGAGCAACTCAGAGACATCCT
CAGAGATTCAGAAGCGAGACTACATCCATGTGAGAGCTAGGCGAGGTGAAGCCACCGACA
GACATAGCTTAGCAGAAAGGGCAAGGAGAGAAAAGTTAAGCAAGAAGATGAAATGTCTTC
AAGACATTGTTCCTGGATGCAATAAAGTTACTGGTAAAGCCGGTATGCTTGATGAGATCA
TCAACTATGTCCAATCTTTGCAACAACAAGTCGAGTTTTTGTTTATGAAACTTTCTGTTT
TAAATCCAGAGCTTGAGTTTCATATCAATGAATTATCCACTAAACAGTTTCAGGCTTGCT
TCACAGATTTTCCAGAAGCTGTTTCAAAGCAGCCAATGATGGTGGATGCAAGTTTTTTTC
CATTACAGCAGCATGGATCTTTAGATTACTCTTTCATAAATTCAAACCAAACCACAATTT
TTAGCTTTCAGAAAGATCAGACATCATCAAGCTGGGAACTTCACTCACAATGTCTTTACA
ACAACTTGAGAACCGATTCAGTTTCAAGTTTTTTCAGCCTCAAGTAAAAAAAAAA***CT
CGGGATAGGGCTCACTGAAAAATCTGTTTTATCCATGTTATCTTTAAATTTAAACCAGAA
AGACAGAGGAAACCAATCCAAAGATCTTTCAACCTATTGTGGTCAAAAAACTTATTGTTG
TACATTTGTAGTATACATATGATATGTCAAAAATACAATCTCACTTATTACTATTTG

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 6

CO CL894Contig1 736 6 11 U
GGTCTCACCCCACGCCGCGTGAAACCGAAATGACGAACTATGGCTCAATCCCGACATCGT
CTCATCCATCTCCGCCGATCGATCTCGAGTACATCTCACGCGCCAAACACCGCATCAAAG
CAGGTCTCGCCACGCGCCGGCCATGGAAAACGATGTTCGATCTCCGATCGATGAACCTCC
CGCACGGCTTCTTCGACGCGATCTCGAGGATCAAGACGAACCTCGTCTACTTCAGAGCCA
ACTACGCCGTCGTCGTCCTCTTAATCCTCTTCCTAAGCCTTCTCTACCACCCGACGTCGC
TCCTCGTCTTGGCCGTCCTGGTCGTCTTCTGGATCTTCCTCTACTTCCTCCGCGACGAGC
CTCTCGTGGTCTTCGGTCACCAGATCGATGATCGGACGGTCATGATCTGCTTATCGGTTT
TGACGATTGGTATGCTTTTGTTCACGCACGCGACGGCGAATATTCTCGGGGCGGTGTTGA
CGGCTCTAGTGTTGGTTGTGATCCACGCGGCGGTTAGGAGGAGCGATAATTTGTATCTTG
ATGAGGATGCTGCGGCGGTGACTGAAGCTTCAGGGCTGACGTCATATCCATAACCGAATC
AATTTGTTATTTTATCTTTTTGAATGTTAGTGTGTTTGATTGAGTGGCTTTTGAAAAA**
TGTTCGTTTCTAGTCTGTACAATTTGTTCCTACTCTGTTTATTTCTCTTCTCAACGATAA
TCTCTTGAAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GL13TF U 5
AF RS1AC90TF U 396
AF RS1BG86JQ C 1
AF RS1D320JQ C 30
AF RS1BG86TF U 1
AF RS1D320TF U 5
BS 1 6 RS1BG86JQ
BS 7 158 RS1BG86TF
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BS 160 363 RS1BG86TF
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RD RS1GL13TF 653 0 0
GG
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CATCTCCGCCGATCGATCTCGAGTACATCTCACGCGCCAAGCACCGCATCAAAGCAGGTC
TCGCCACGCGCCGGCCATGGAAAACGATGTTCGATCTCCAATCGATGAACCTCCCGCACG
GCTTCTTCGACGCGATCTCGAGGATCAAGACGAACCTCGTCTACTTCAGAGCCAACTACG
CTGTCGTCGTCCTCTTGATCCTCTTCCTAAGCCTTCTCTACCACCCGACGTCGCTCCTCG
TCTTGGCCGTCCTGGTCGTGTTCTGGATCTTCCTCTACTTCCTCCGCGACGAGCCTCTCG
TGGTCTTCCGTCACCAGATCGATGATCGGACGGTCATGATCCGCTTATCGGTTTTGACGA
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ATGCTGCGGCCGTGACTGAAGCTTCAGGGCTGACGTCATATCCATAACCGAATCAATTTG
TTATTTTATCTTTTTGAATGTTAGTGTGTTTGATTGAGTGGCTTTTGAAAA

QA 3 653 3 653
DS 

RD RS1AC90TF 283 0 0
G
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CGAATATTCTCGGGGCGGTGTTGACGGCTCTAGTGTTGGTTGTGGTACACGCGGCGGTTA
GGAGGAGTGATAATTTGTATCTTGATGAGGATGCTGCGGCCGTGACTGAAGCTTCAGGGC
TGACGTCATATCCATAACCGAATCAATTTGTTATTTTATCTTTTTGAATGTTAGTGTGTT
TGATTGAGTGGCTTTTGAAAAAAATGATCGTTTCTAGTCTGT

QA 2 283 2 283
DS 

RD RS1BG86JQ 727 0 0
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CTCATCCATCTCCGCCGATCGATCTCGAGTACATCTCACGCGCCAAACACCGCATCAAAG
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CGCACGGCTTCTTCGACGCGATCTCGAGGATCAAGACGAACCTCGTCTACTTCAGAGCCA
ACTACGCCGTCGTCGTCCTCTTAATCCTCTTCCTAAGCCTTCTCTACCACCCGACGTCGC
TCCTCGTCTTGGCCGTCCTGGTCGTCTTCTGGATCTTCCTCTACTTCCTCCGCGACGAGC
CTCCCGTGGTCTTCGGTCACCAGATCGATGATCGGACGGTCATGATCTGCTTATCGGTTT
TGACGATTGGTATGCTTTTGTTCACGCACGCGACGGCGAATATTCTCGGGGCGGTGTTGA
CGGCTCTAGTGTTGGTTGTGATCCACGCGGCGGTTAGGAGGAGCGATAATTTGTATCTTG
ATGAGGATGCTGCGGCGGTGACTGAAGCTTCAGGGCTGACGTCATATCCATAACCGAATC
AATTTGTTATTTTATCTTTTTGAATGTTAGTGTGTTTGATTGAGTGGCTTTTGAAAAA**
TGTTCGTTTCTAGTCTGTACAATTTGTTCCTACTCTGTTTATTTCTCTTCTCAACGATAA
TCTCTTG

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1D320JQ 698 0 0
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TACATCTCACGCGCCAAACACCGCATCAAAGCAGGTCTCGCCACGCGCCGGCCATGGAAA
ACGATGTTCGATCTCCGATCGATGAACCTCCCGCACGGCTTCTTCGACGCGATCTCGAGG
ATCAAGACGAACCTCGTCTACTTCAGAGCCAACTACGCCGTCGTCGTCCTCTTAATCCTC
TTCCTAAGCCTTCTCTACCACCCGACGTCGCTCCTCGTCTTGGCCGTCCTGGTCGTCTTC
TGGATCTTCCTCTACTTCCTCCGCGACGAGCCTCTCGTGGTCTTCGGTCACCAGATCGAT
GATCGGACGGTCATGATCTGCTTATCGGTTTTGACGATTGGTATGCTTTTGTTCACGCAC
GCGACGGCGAATATTCTCGGGGCGGTGTTGACGGCTCTAGTGTTGGTTGTGATCCACGCG
GCGGTTAGGAGGAGCGATAATTTGTATCTTGATGAGGATGCTGCGGCGGTGACTGAAGCT
TCAGGGCTGACGTCATATCCATAACCGAATCAATTTGTTGTTTTATCTTTTTGAATGTTA
GTGTGTTTGATTGAGTGGCTTTTGAAAAA**TGTTCGTTTCTAGTCTGTACGATTTGTTC
CTACTCTGTTTATTTCTCTTCTCAACGATAATCTCTTG

QA 1 698 1 698
DS 

RD RS1BG86TF 728 0 0
GGTCTC
ACCCCACGCCGCGTGAAACCGAAATGACGAACTATGGCTCAATCCCGACATCGTCTCATC
CATCTCCGCCGATCGATCTCGAGTACATCTCACGCGCCAAACACCGCATCAAAGCAGGTC
TCGCCACGCGCCGGCCATGGAAAACGATGTTCTATCTCCGATCGATGAACCTCCCGCACG
GCTTCTTCGACGCGATCTCGAGGATCAAGACGAACCTCGTCTACTTCAGAGCCAACTACG
CCGTCGTCGTCCTCTTAATCCTCTTCCTAAGCCTTCTCTACCACCCGACGTCGCTCCTCG
TCTTGGCCGTCCTGGTCGTCTTCTGGATCTTCCTCTACTTCCTCCGCGACGAGCCTCCCG
TGGTCTTCGGTCACCAGATCGATGATCGGACGGTCATGATCTGCTTATCGGTTTTGACGA
TTGGTATGCTTTTGTTCACGCACGCGACGGCGAATATTCTCGGGGCGGTGTTGACGGCTC
TAGTGTTGGTTGTGATCCACGCGGCGGTTAGGAGGAGCGATAATTTGTATCTTGATGAGG
ATGCTGCGGCGGTGACTGAAGCTTCAGGGCTGACGTCATATCCATAACCGAATCAATTTG
TTATTTTATCTTTTTGAATGTTAGTGTGTTTGATTGAGTGGCTTTTGAAAA***TGTTCG
TTTCTAGTCTGTACAATTTGTTCCTACTCTGTTTATTTCTCTTCTCA*CGATAATCTCTT
G
A

QA 7 727 7 727
DS 

RD RS1D320TF 732 0 0
GG
ACCCCACGCCGCGTGAAACCGAAATGACGAACTATGGCTCAATCCCGACATCGTCTCATC
CATCTCCGCCGATCGATCTCGAGTACATCTCACGCGCCAAACACCGCATCAAAGCAGGTC
TCGCCACGCGCCGGCCATGGAAAACGATGTTCGATCTCCGATCGATGAACCTCCCGCACG
GCTTCTTCGACGCGATCTCGAGGATCAAGACGAACCTCGTCTACTTCAGAGCCAACTACG
CCGTCGTCGTCCTCTTAATCCTCTTCCTAAGCCTTCTCTACCACCCGACGTCGCTCCTCG
TCTTGGCCGTCCTGGTCGTCTTCTGGATCTTCCTCTACTTCCTCCGCGACGAGCCTCTCG
TGGTCTTCGGTCACCAGATCGATGATCGGACGGTCATGATCTGCTTATCGGTTTTGACGA
TTGGTATGCTTTTGTTCACGCACGCGACGGCGAATATTCTCGGGGCGGTGTTGACGGCTC
TAGTGTTGGTTGTGATCCACGCGGCGGTTAGGAGGAGCGATAATTTGTATCTTGATGAGG
ATGCTGCGGCGGTGACTGAAGCTTCAGGGCTGACGTCATATCCATAACCGAATCAATTTG
TTGTTTTATCTTTTTGAATGTTAGTGTGTTTGATTGAGTGGCTTTTGAAAA***TGTTCG
TTTCTAGTCTGTACGATTTGTTCCTACTCTGTTTATTTCTCTTCTCA*CGATAATCTCTT
GAAAAAAAAA

QA 3 732 3 732
DS 



AS 1 7

CO CL895Contig1 866 7 16 U
GGACACAAAAAAAATCTCTCAAAACACTTCTTCTCCACTAATACAATACTAATTACTTCT
GATCAACAACATTGTTGCTGCGATTCAAGCCATGGCCTCACTTTCAGTCTCTTCTTCCTC
GACAATCATCGACTCAAGAGCTCCTCCTCTTCCTTCTCGACAAGCATCTTCTCCTTCGTG
TATTTCCCTTCCGACACTTCCTCCTCAGCCGCTTCAGTCTCAGACCCGCGCCGCCAAAGC
CACTGCTTACTGTCGGAAGATAGTGAGGAACGTTTTGACACGAGCTGCCGATGTTGAAGT
TGTTGCCACTACCCAAGTCGAAGCTCCTGCCGCCAATAGTGAAGCTGCGAGTACAGAGTT
ACCGGATATCGTCAAGACCGTTCAAGAAGCTTGGGAAAAAGTAGAGGATAAGTATGCAGT
TAGTTCTCTCGCAGTTTCTGGTTTTGTGGCTCTTTGGGGAACTGCTGGTGTAATCTCGGC
TATCGACAGGCTTCCATTGGTTCCTGGTGTTCTTGAAGTTGTTGGCATTGGTTACACTGG
GTGGTTTGCTTACAAGAACCTGATATTCAAGCCAGACAGGGAGACTCTGTTTCAGAAAGT
GAAGGACACATACAGAGACATAATAGGGAGCAACTGAACCAAATGATGATGAAGAAGAAG
CCTTTTAGGGTGGGCAATTCATAAATTGAATGAATCTAACACATCCCACATCCTTCATTC
AATCTCCCTTCTCGTAACTAAATAAATTATACATCCTCTTTGTCTCAGGTGTCTTTTTAG
CTCAAAA*TATATCATCCATACATCCATCTGTGTCGATGTTGTAAATTCCTCAGACTATA
TATATATGAGATGTTTGGTACATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 5 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 15 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 15 40 40 40 15 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AV12TF U 49
AF RS1AK86TF U 1
AF RS1B044TF U 49
AF RS1DL86TF U 38
AF RS1B044JQ C 176
AF RS1AV12JQ C 223
AF RS1DL86JQ C 208
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BS 341 402 RS1AK86TF
BS 403 403 RS1B044TF
BS 404 427 RS1AK86TF
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BS 643 764 RS1AK86TF
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DS 

RD RS1AK86TF 770 0 0
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GACAATCATCGACTCAAGAGCTCCTCCTCTTCCTTCTCGACAAGCATCTTCTCCTTCGTG
TATTTCCCTTCCGACACTTCCTCCTCAGCCGCTTCAGTCTCAGACCCGCGCCGCCAAAGC
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TCATGT

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DS 

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CTTCTTCCTCGACAATCATCGACTCAAGAGCTCCTCCTCTTCCTTCTCGACAAGCATCTT
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DS 

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GG
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AA

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CATTCAATCTCCCTTTTGGTAACTAAATAAATTATACATCCTCTTTGTTTCAGGTGTCTT
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DS 

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DS 



AS 1 7

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TATTCTCCTTTTTTTTTTC


BQ
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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AF RS1BD86TF U 1
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AF RS1GA06JQ C 0
AF RS1GA06TF U 0
AF RS1GD79JQ C 1
AF RS1GD79TF U 1
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BS 235 236 RS1GR96TF
BS 237 367 RS1BD86TF
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RD RS1BD86JQ 559 0 0
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AC

QA 1 557 1 557
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RD RS1BD86TF 559 0 0
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TAATAACTCAATCAAAATTAAATTATCCACAAGAACACCAATTTTTGTTATGCTTAATAT
ATTTAATTTGATCTGTATTTGTTTTAATTCGGCCCTTTTTTCAAGCACTTTTTT**TCGC
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TAGATTCGAGTTCACTC
AC

QA 1 557 1 557
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RD RS1GR96TF 521 0 0
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TTTTTGGTAGCCATACTAAATCTGGATCATTTGATTTCCTCAGTTTTATCCTCTTTTCTC
TAAATGAAAGAACTTAATTAGATTCGAGTTCACTCAC
AAAA

QA 1 517 1 517
DS 

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TTAATTTGATCTGTATTTGTTTTAATTCGGCCCTTTTTTCAAGCACTTTTTTAGTCGCCA
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GATTCGAGTTCACTCGC

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ATTTAATTTGATCTGTATTTGTTTTAATTCGGCCCTTTTTTCAAGCACTTTTTTAGTCGC
CAAATTGCCGGAGGCCTACGCCTTTTTGAATCCAATCATAGATGTTATGCCCGTAATACC
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TTAATACTGTCTTAGACAAATTCACGATTTTGATTCTTGCAACAATTCAAAAGATTCAAA
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TAGATTCGAGTTCACTCGCAAAAAAAAATATCTAGATATTTAGTATAAAAATAGAGAATC
TATTCTCCTTTTTTTTTTC

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 5

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AAAACTTCAAAAAAAAAGTATGGAAAACAAAGCTTAAAATTTCGAATGCAACTCATAAAT
GATATTTTGTGACACTACATGATTGAAAATATTGTATGGAACCCAAAAGAAAATGAGCTA
ATAGTTCGTTAGAATCTGTAATCATTCAAATGAACTGAAAGAAACCTTTTTGCTTGGTTT
AGCATTCACACCCTGTTGATCTGTGTTGCTGACCTCCAGCAACATCAATCGTGTCGGGTA
GGTACGGTTCTTCTTCAGGTTCATTCTTGAAAGCATTTTTGGTGATGCACTCGAAAGCTG
CGTCTACATTGAATCCTTCTTTGGCAGATGTCTCAAAGTAAGGAATGTTTCCTTTTGAAG
CACACCACGCCTTTGCTTTCTTCTCAGAAACCACTCGGCTTTTGCCACCATCAACATCGG
TCTTGTTCCCCAAGACGACAAACGGGAAGTTGTCAGGATCTGATGGACCAGCCTGAATCA
AGAACTCTTCCCTCCAGTTATTAAGATTCTCGAAAGATTTCATAACATTGACATCGTACA
CAAGAACACAACAGTCAGCTCCTCTGTAGAACGCAACTCCCAAGCTTTGGAACCTTTCTT
GTCCCGCAGTATCCCAAATCTGTAAAGTGAAGACGCGGTCATCAATTTGAACCTCTTTAG
TCAAGAAATCAGCTCCAATCGTAGCTTTGTACTGATTACTAAACTTGCGGTTCACAAACT
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CTCTCCGGCGAGAAGACATTTGAAGACGGAAGGGTTGATGATGATGATTATTAGTTTATT
TGATTATCCTTTTTTTTGTTACCGGCGAAGAAAGTGCCTCCCTCCCTCCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DH66JQ U 1
AF RS1EY63JQ U 22
AF RS1FI33JQ U 21
AF RS1FI33TF C 260
AF RS1EY63TF C 150
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RD RS1DH66JQ 684 0 0
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QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1EY63JQ 663 0 0
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TGGCAAATGTCTCAAAGTAAA*AATGTTTCCTTTTGAAGCACACCACGCCTTTGCTTTCT
TCTCAAAAACCACTCGGCTTTTGCCACCATCAACATCGGTCTTGTTCCCCAAGACGACAA
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TAAGATTCTCGAAAGATTTCATAACATTGACATCGTACACAAGAACACAACAGTCAGCTC
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GTA

QA 1 663 1 663
DS 

RD RS1FI33JQ 731 0 0
T
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GGAAAACAAAGCTTAAAATTTCGAATGCAACTCATAAATGATATTTTGTGACACTACATG
ATTGAAAATATTGTATGGAACCCAAAAGAAAATGAGCTAATAGTTCGTTAGAATCTGTAA
TCATTCAAATGAACTGAAAGAAACCTTTTTGCTTGGTTTAGCATTCACACCCTGTTGATC
TGTGTTGCTGACCTCCAGCAACATCAATCGTGTCGGGTAGGTACGGTTCTTCTTCAGGTT
CATTCTTGAAAGCATTTTTGGTGATGCACTCGAAAGCTGCGTCTACATTGAATCCTTCTT
TGGCAGATGTCTCAAAGTAAGGAATGTTTCCTTTTGAAGCACACCACGCCTTTGCTTTCT
TCTCAGAAACCACTCGGCTTTTGCCACCATCAACATCGGTCTTGTTCCCCAAGACGACAA
ACGGGAAGTTGTCAGGATCTGATGGACCAGCCTGAATCAAGAACTCTTCCCTCCAGTTAT
TAAGATTCTCGAAAGATTTCATAACATTGACATCGTACACAAGAACACAACAGCCAGCTC
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GTAAAGTGAAGACGCGGTCATCAATTTGAACCTCTTTAGTCAAGAAATCAGCTCCAATCG
TAGCTTTGTA

QA 2 731 2 731
DS 

RD RS1FI33TF 647 0 0
ATCTGTG
TGCTGACCTCCAGCAACATCAATCGTGTCGGGTAGGTACGGTT*TTCTTCAGGTTCATTC
TTGAAAGCATTTT*GGTGATGCACTCGAAAGCTGCGTCTACATTGAATC*TTCTTTGGCA
GATGTCTCAAAGTAAGGAATGTTTCCTTTTGAAGCACACCACGCCTTTGCTTTCTTCTCA
GAAACCACTCGGCTTTTGCCACCATCAACATCGGTCTTGTTCCCCAAGACGACAAACGGG
AAGTTGTCAGGATCTGATGGACCAGCCTGAATCAAGAACTCTTCCCTCCAGTTATTAAGA
TTCTCGAAAGATTTCATAACATTGACATCGTACACAAGAACACAACAGCCAGCTCCTCTG
TAGAACGCAACTCCCAAGCTTTGGAACCTTTCTTGTCCCGCAGTATCCCAAATCTGTAAA
GTGAAGACGCGGTCATCAATTTGAACCTCTTTAGTCAAGAAATCAGCTCCAATCGTAGCT
TTGTACTGATTACTAAACTTGCGGTTCACAAACTGATTCATCAACGATGTCTTCCCAACC
CCGCTATCGCCGAGGATGATAACCTTAAGCAGAACTCTCCGGCGAGAAGACATTTGAAGA
CGGAAGGGTTGATGATGATGAT
TATTAGTTTATTTGATTC

QA 8 629 8 629
DS 

RD RS1EY63TF 804 0 0
AAATATGTATGGACCC
AAAGAAAATGAGCTAATAGT*CGTTAGAATCTGTA*TCAT*CAAATGAACTGAAAGAAAC
*TTTTTGCTTGGTTTAGCATTCACACCCTGTTGATCTGTGTTGCTGAC*TCCAGCAACAT
CAATCGTGTCGGGTAGGTACGGTTCTTCTTCAGGTTCATTCTTGAAAGCATTTTTGGTGA
TGCACTCGAAAGCTGCGTCTACATTGAATCCTTCTTTGGCAGATGTCTCAAAGTAAG*AA
TGTTTCCTTTTGAAGCACACCACGCCTTTGCTTTCTTCTCAGAAACCACTCGGCTTTTGC
CACCATCAACATCGGTCTTGTTCCCCAAGACGACAAACGGGAAGTTGTCAGGATCTGATG
GACCAGCCTGAATCAAGAACTCTTCCCTCCAGTTATTAAGATTCTCGAAAGATTTCATAA
CATTGACATCGTACACAAGAACACAACAGTCAGCTCCTCTGTAGGACGCAACTCCCAAGC
TTTGGAACCTTTCTTGTCCCGCAGTATCCCAAATCTGTAAAGTGAAGATGCGGTCATCAA
TTTGAACCTCTTTAGTCAAGAAATCAGCTCCAATCGTAGCTTTGTACTGATTACTAAACT
TGCGGTTCACAAACTGATTCATCAACGATGTCTTCCCAACCCCGCTATCGCCGAGGATGA
TAACCTTAAGCAGAACTCTCCGGCGAGAAGACATTTGAAGACGGAAGGGTTGATGATGAT
GATTATTAGTTTATTTGATTATCCTTTTTTTTGTTACCGGCGAAGAAAGTGCCTCCCTCC
CTCCCTCC

QA 17 804 17 804
DS 



AS 1 5

CO CL898Contig1 987 5 11 U
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CTATTCAAAGTTT*CGAGATTTCGATCATGATGAATTCCATCTTCGGAAAGCGGAAAACT
CCTGCAGAACTACTGCGGGAAAACAAGAGGATGCTTGATAAGTCAATCAGAGACATTGAG
AGGGAGAGACAAGGCCTTCAAACACAAGAGAAAAAACTTATTACCGAGATTAAAAAGACC
GCAAAGCAGGGCCAAATGGGAGCTGTGAAAGTGATGGCAAAGGACCTCATCAGAACACGG
CACCAGATTGAGAAGTTTTACAAGCTTAAATCCCAACTCCAAGGAGTTTCTCTCAGGATC
CAGACTTTAAAATCAACACAAGCAATGGGAGAGGCAATGAAAGGTGTGACTAAAGCGATG
GGTCAAATGAACAGGCAGATGAATCTGCCTTCTCTGCAGAAAATCATGCAAGAGTTTGAG
AGGCAGAACGAGAAAATGGAGATGGTCTCTGAGGTGATGGGAGATGCAATTGATGATGCT
TTGGAAGGAGACGAGGAAGAGGAAGAGACTGAAGATCTTGTTAGCCAAGTCCTTGACGAG
ATCGGTATCGATATCAACCAAGAGCTGGTGAATGCTCCATCTGGTGCGGTGGCAGCACCA
GCAGCAAAGAACAAGGTTGTGCAAGCTGAGGCGGCAGGAGCTGATGACGGTGGGGGAATA
GATAGTGATCTTCAGGCAAGGTTGGACAACCTTCGAAAAATGTGAGGCCTTCCCGGATTC
TGTATAATACTGTTTGACTGTTACCCGATTATTACTTTTAAACTCCAAAGGAATATGTGG
CAAACTAGATACATGGTTACGTTTTGAGAGTTTGTTTGTAATAATTTCATAATTTGAGCC
CTGAATTTATAAAATCTCATTGTTGCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H403TF U 38
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AF RS1BF46TF U 1
AF RS1FL09TF U 1
AF RS1FL09JQ C 137
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CTTAAATCCCAGCTCCAAGGTGTTTCTCTCAAGATCCAGACTTTAAAATCAACACAAGCA
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CTGGTGAAT

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AGGGAGAGACAAGGCCTTCAAACACAAGAGAAAAAACTTATTACCGAGATTAAAAAGACC
GCAAAGCAGGGCCAAATGGGAGCTGTGAAAGTGATGGCAAAGGACCTCATCAGAACACGG
CACCAGATTGAGAAGTTTTACAAGCTTAAATCCCAACTCCAAGGAGTTTCTCTCAGGATC
CAGACTTTAAAATCAACACAAGCAATGGGAGAGGCAATGAAAGGTGTGACTAAAGCGATG
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CACAAGCAATGGGAGAGGCAATGAAAGGTGTGACTAAAGCGATGGGTCAAATGAACAGGC
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TTACGTTTTGAGAGTTTGTTTGTAATAATTTCATAATTTGAGCCCTGAATTTATAAAATC
TCATTGTTGCC

QA 1 851 1 851
DS 



AS 1 6

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TCCGTCACCTTTCCACCCGAAATTGTCTCTTGACAGCGTTTTGATCCAGCAACCATGGCT
AACGCGGCTTCGGGGATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCAGGTTTCTTGAACTCAAG
GCCAAAAGGACACACCGTTTCATTGTCTACAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTT
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GCAACTGATCCAACTGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAAAGCCGCGTCAACTAAAAGAAT
TAAACTTCTTTGGCTCATATTCTATCTACTATTCCTAAATTGTGTTTTCTTTTCTCTTAT
ACAGTTTCTTCTTGCAACTGTGATAAAAAAAACCAACTCCCCGTCACTCTATCCATCTGG
TCTCTCTTTTGTCTTATATTGAGAATTGTCCCAAGGGTTTGCATCCTTTTGTGTAAACTG
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TCATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RS1G045TF U 11
AF RS1EV92TF U 11
AF RS1G045JQ C 472
AF RS1EV92JQ C 110
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AF RS1BY63JQ C 4
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GATA

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ATTGTCTACAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTTGAGAAAGTTGGTGAGCCT
ATTCTGTCCTACGAGGATTTCGCTGCTAGCCTCCCTGCTGAAGAATGCCGTTACGCCATT
TATGATTTCGACTTTGTCACTGTCGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATTGCT
TGGTGTCCGGATGCAGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGGTCTACGCGAGCTCCAAGGACAGG
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GATCTCGATGTTTTCAAAAGCCGCGTCAACTAAAAGAATTAAACTTCTTTGGCTCATATT
CTATCTACTATTCCTAAATTGTGTTTTCTTTTCTCTTATACAGTTTCTTCTTGCAACTGT
GATAAAAAAA*CCAACTCCCCGTCACTCTATCCATCTGGTCTCTCTTTTGTCTTATATTG
AGAATTG

QA 12 678 12 678
DS 

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TTTTCTTATACAGTTTCTTCTTGCAACTGTGATAAAAAAAACCAACTCCCCGTCACTCTA
CCCATCTGGTCTCTCTTTTGTCTTATATTGAGAATTGTCCCAAGTGTTTGC

QA 1 231 1 231
DS 

RD RS1EV92JQ 641 0 0
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TTGAACTCAAGGCCAAAAGGACACACCGTTTCATTGTCTACAAGATCGAGGAGAAGCAGA
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GCAAGATGGTCTACGCGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAGCTTGATGGGATTCAAT
TGGAGCTTCAGGCAACTGATCCAACTGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAAAGCCGCGTCA
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TTTTCTCTTATACAGTTTCTTCTTGCAACTGTGATAAAAAAAACCAACTCCCCGTCACTC
TATCCATCTGGTCTCTCTTTTGTCTTATATTGAGAATTGTCCCAAGGGTTTGCATCCTTT
TGTGTAAACTGTGATGATTCCTTTAAGCGTTTTGTTATCT
C

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1BY63TF 786 0 0
GGAAAACAACGCAGGAGAAAGGAAAAGAGAAGAAAAAAAACAAACATCTGTCTTCTTCTC
TCCGTCACCTTTCCACCCGAAATTGTCTCTTGACAGCGTTTTGATCCAGCAACCATGGCT
AACGCGGCTTCGGGGATGGCAGTCCATGATGACTGCAAGCTCAGGTTTCTTGAACTCAAG
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GTTGAGAAAGTTGGTGAGCCTATTCTGTCCTACGAGGATTTCGCTGCTAGCCTCCCTGCT
GAAGAATGCCGTTACGCCATTTATGATTTCGACTTTGTCACTGTCGAGAACTGCCAGAAG
AGCAAGATTTTCTTCATTGCTTGGTGTCCGGATGCAGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATC
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GCAACTGATCCAACTGAGATGGATCTCGATGTTTTCAAAAGCCGCGTCAACTATAAGAAT
TAAACTTCTTTGGCTCATATTCTATCTACTATTCCTAAATTGTGTTTTCTTTTCTCTTAT
ACAGTTTCTTCTTGCAACTGTGATAAAAAAAACCAACTCCCCGTCACTCTATCCATCTGG
TCTCTCTTTTGTCTTATATTGAGAATTGTCCCAAGGGTTTGCATCCTTTTGTGTAAACTG
TGATGATTCCTTTAAGCGTTTTGTTATCTTTGTTACAGTGTTGATGAACAAATGCAAACT
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QA 1 786 1 786
DS 

RD RS1BY63JQ 783 0 0
GAAACAACGCAGGAGAAA
GAAAAGAGAAGAAAAAAA*CAAACATCTGTCTTCTTCTCTCCGTCACCTTTCCACCCGAA
ATTGTCTCTTGACAGCGTTTTGATCCAGCAACCATGGCTAACGCGGCTTCGGGGATGGCA
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ATTGTCTACAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTTGAGAAAGTTGGTGAGCCT
ATTCTGTCCTACGAGGATTTCGCTGCTAGCCTCCCTGCTGAAGAATGCCGTTACGCCATT
TATGATTTCGACTTTGTCACTGTCGAGAACTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATTGCT
TGGTGTCCGGATGCAGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATCTACGCGAGCTCCAAGGACAGG
TTCAAGCGTGAGCTTGATGGGATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACTGATCCAACTGAGATG
GATCTCGATGTTTTCAAAAGCCGCGTCAACTATAAGAATTAAACTTCTTTGGCTCATATT
CTATCTACTATTCCTAAATTGTGTTTTCTTTTCTCTTATACAGTTTCTTCTTGCAACTGT
GATAAAAAAAACCAACTCCCCGTCACTCTATCCATCTGGTCTCTCTTTTGTCTTATATTG
AGAATTGTCCCAAGGGTTTGCATCCTTTTGTGTAAACTGTGATGATTCCTTTAAGCGTTT
TGTTATCTTTGTTACAGTGTTGATGAACAAATGCAAACTTCATAC

QA 19 783 19 783
DS 



AS 2 7

CO CL900Contig1 1204 5 27 U
GTCTTCAAGAATTTACATAATCTACTACATAAGCCAATATGGTGCAGCATCAGATCTCTG
AATAAAGATACAATATACAGAACCAATCTGGGAATCAAGATTCAGTATACTAGCTAGACA
AAGCACTTAATACAAAGGGAATGAGAGAACGAATTCCGAATCCACAACAAAGTGATAAAC
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ATAGCG*AGAGCTCATAAACACACCTTAAAAAATCCCGGAATGCAACAGTATAGTACTGC
TCATAAATGTATTTTCAGTCTTCATTCATTCATATACTCTCTTTCTCTTTAGCAGAGCAG
GGAATATGGAGATGGATCCAATGAGGAATAACACAGACAAAGTCTTGAAATCATACAGAT
CTTTCACTGATTTGAGATCTCCAAGAGCCAGACCAGCTCTAACGGTGATGTACGAAGCAG
GCATAAGACCGACAAGAGTGGCTAAAAAGAAGACGTGAAAAGGTATGTCAACGATTGGAG
AAGACAAATTGATGAAGAGGTTAGGAAGTGTGGGTGTTATCCTTAAGAAGAGCATGTAGT
TTAGTAGCTTATCTCTTCTTTTCCCAATCTCGGCTTGGAAAAACCTCAACTTGTCAGGCC
ACAGCCAGCAAACAAGAGGCCTTCCGACCAATTTTGATAAGAAGAAACAAGAAGAGGCTC
CAGCTGTTGCATTGAGGACGACAAGAACAAAACCTCTAACCACACCGAAAAGAGCTCCGG
CAAGTAGTGACATAAAGATAGTTCCAGGTATCATGAAGGTTTGCATAAAGATGTAGGTTG
AACAGTAACCTAAAATGAATCTTGCTGGGTACTCACTTGCATATGACCCAAGATTATCTT
TGAGCAATCGGAGACCGGAGATGGTTGTAGGAAGTTTGAGCTTGACGTATTCAGCGGCGG
GCATTGTGAGGTAAATAGAGACAAGTCCGGTGGTGAAGACGAGGAAGACGGTGAAAAACA
CGACCAACTCCCAACGTGAAAGAGGAAACCGCTTCGATTTGGTGCGTTTCGAGGAAGACG
CGGCCGCGCTTTCTTCGTCCTTCACGAGTAGCTTTCCGCCGCCGTCTCCGGTTAAGTTCC
GAGGAGCCGCCATTACCGTAAAGCTCTTCCCTCCTCTTTAGAAAGCCAAATTCCAAAGAA
GTCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 

AF RS1GE73JQ U 4
AF RS1E493JQ U 4
AF RS1FK92JQ U 1
AF RS1GE73TF C 513
AF RS1E493TF C 588
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RD RS1GE73JQ 348 0 0
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TAAATGTATTTTCAGTCTTCATTCATTCATATACTCTCTTTCTCTTTA

QA 1 348 1 348
DS 

RD RS1E493JQ 640 0 0
TTCAAGAATTTACATAATCTACTACATAAGCCAATATGGTGCAGCATCAGATCTCTGAAT
AAAGATACAATATACAGAACCAATCTGGGAATCAAGATTCAGTATACTAGCTAGACAAAG
CACTTAATACAAAGGGAATGAGAGAACGAATTCCGAATCCACAACAAAGTGATAAACCAA
TCAAAGACAGAGTTAGCGGTTCAATACTCTGTGATGTCTCAAAAGCGATCTTCTTCTATA
GCG*AGAGCTCATAAACACACCTTAAAAAATCCCGGAATGCAACAGTATAGTACTGCTCA
TAAATGTATTTTCAGTCTTCATTCATTCATATACTCTCTTTCTCTTTAGCAGAGCAGGGA
ATATGGAGATGGATCCAATGAGGAATAACACAGACAAAGTCTTGAAATCATACAGATCTT
TCACTGATTTGAGATCTCCAAGAGCCAGACCAGCTCTAACGGTGATGTACGAAGCTGGCA
TAAGACCGACAAGAGTGGCTAAAAAGAAGACGTGAAAAGGTATGTCAACGATTGGAGAAG
ACAAATTGATGAAGAGGTTAGGAAGTGTGGGTGTTATCCTTAAGAAGAGCATGTAGTTTA
GTAGCTTATCTCTTCTTTTCCCAATCTCGGCTTGGAAAAA

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1FK92JQ 698 0 0
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AATAAAGATACAATATACAGAACCAATCTTGGAATCAAGATTCAGTATACTAGCTAGACA
AAGCGCTTAATACAAAGGGAATGAGAGAACGAATTCCGAATCCACAACAAAGTGATAAAC
CAATCAAAGACAGAGTTAGCGGTTCAATACTCTGTGATGTCTCAAAAGCGATCTTCTTCT
ATAGCTTAAAGCTCATAAACACACCTTAAAAA*TCCCGGAATGCAACAGTATAGTACTGC
TCATAAATGTATTTTCAGTCTTCATTCATTCATACACTCTCTTTCTCTTTAGCAGAGCAG
GGAATATGGAGATGGATCCAATGAGGAATAACACAGACAAAGTCTTGAAATCATACAGAT
CTTTCACTGATTTGAGATCTCCAAGAGCCAGACCAGCTCTAACGGTGATGTACGAAGCAG
GCATAAGACCGACAAGAGTGGCTAAAAAGAAGACGTGAAAAGGTATGTCAACGATTGGAG
AAGACAAATTGATGAAGAGGTTTGGAAGGGTGGGTGTTATCCTTAAGAAGAGCATGTAGT
TTAGTAGCTTATCTCTTCTTTTCCCAATCTCGGCTTGGAAAAACCTCAACTTGTCAGGCC
ACAGCCAGCAAACCAGAGGCCTTCCGACCAATTT
CGAT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RS1GE73TF 692 0 0
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GGTGTTATCTTTAAGAAGAGCATGTAGTTTAGTAGCTTATCTCTTCTTTTCCCAATCTCG
GCTTGGAAAAACCTCAACTTGTCAGGCCACAGCCAGCAAACAAGAGGCCTTCCGACCAAT
TTTGATAAGAAGAAACAAGAAGAGGCTCCAGCTGTTGCATTGAGGACGACAAGAACAAAA
CCTCTAACCACACCGAAAAGAGCTCCGGCAAGTAGTGACATAAAGATAGTTCCAGGTATC
ATGAAGGTTTGCATAAAGATGTAGGTTGAACAGTAACCTAAAATGAATCTTGCTGGGTAC
TCACTTGCATATGACCCAAGATTATCTTTGAGCAATCGGAGACCGGAGATGGTTGTAGGA
AGTTTGAGCTTGACGTATTCAGCGGCGGGCATTGTGAGGTAAATAGAGACAAGTCCGGTG
GTGAAGACGAGGAAGACGGTGAAAAACACGACCAACTCCCAACGTGAAAGAGGAAACCGC
TTCGATTTGGTGCGTTTCGAGGAAGACGCGGCCGCGCTTTCTTCGTCCTTCACGAGTAGC
TTTCCGCCGCCGTCTCCGGTTAAGTTCCGAGGAGCCGCCATTACCGTAAAGCTCTTCCCT
CCTCTTTAGAAAGCCAAATTCCAAAGAAGT
CC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1E493TF 617 0 0
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AACTTGTCAGGCCACAGCCAGCAAACAAGAGGCCTTCCGACCAATTTTGATAAGAAGAAA
CAAGAAGAGGCTCCAGCTGTTGCATTGAGGACGACAAGAACAAAACCTCTAACCACACCG
AAAAGAGCTCCGGCAAGTAGTGACATAAAGATAGTTCCAGGTATCATGAAGGTTTGCATA
AAGATGTAGGTTGAACAGTAACCTAAAATGAATCTTGCTGGGTACTCACTTGCATATGAC
CCAAGATTATCTTTGAGCAATCGGAGACCGGAGATGGTTGTAGGAAGTTTGAGCTTGACG
TATTCAGCGGCGGGCATTGTGAGGTAAATAGAGACAAGTCCGGTGGTGAAGACGAGGAAG
ACGGTGAAAAACACGACCAACTCCCAACGTGAAAGAGGAAACCGCTTCGATTTGGTGCGT
TTCGAGGAAGACGCGGCCGCGCTTTCTTCGTCCTTCACGAGTAGCTTTCCGCCGCCGTCT
CCGGTTAAGTTCCGAGGAGCCGCCATTACCGTAAAGCTCTTCCCTCCTCTTTAGAAAGCC
AAATTCCAAAGAAGTCC

QA 1 617 1 617
DS 



CO CL900Contig2 805 2 1 U
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AATTCAATTCAATTCACTTCTTTGGAATTTGGCTTTCGAAAGAGGAGAGCTTTACGGTAA
TGGCGGCTCCTCGTAACTTAACCGGTGACGGCGGCGGAAAGGTAGTCGTGAAGGACGAAG
AAAGCGCCGCGGCCGCGACTTCCTCGAAACGCACCAAATCGGAGCGGTTTCCTCTTTCAC
GTTGGGAGTTGGTCGTGTTTTTCACCGTCTTCCTCGTCTTCACCACCGGACTTGTCTCTA
TTTACCTCACAATGCCCGCCGCTGAATACGCCAAGCTCAAACTTCCTACAACCATCTCCG
ATCTCCGTTTGCTCAAAGATAATCTTGGGTCATATGCAAGTGAGTACCCAGCAAGATTCA
TTTTAGGTTACTGTTCAACCTACATCTTTATGCAAACCTTCATGATACCTGGAACTATCT
TTATGTCACTACTCGCCGGAGCTCTTTTCGGTGTGGTTAGAGGTTTTGTTCTTGTCGTCC
TCAATGCAACAGCTGGAGCCTCTTCTTGTTTCTTCTTATCGAAATTGGTCGGAAGGCCTC
TGGTTTGCTGGCTGTGGCCTGACAAGTTGAGGTTTTTCCAAGCCGAGATTGGGAAAAGAA
GAGATAAGCTACTAAACTACATGCTCTTCTTAAGATAACACCCACCCTTCCAAACCTCTT
CATCAATTTGTCTTCTCCAATCGTGACATACCTTTTCACGTCTCTTTTAGCCACTCTGTC
GGTCTATGCCTGCTTCGTACATCAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1G180TF U 1
AF RS1FK92TF U 1
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ATCTCCGTTTGCTCAAAGATAATCTTGGGTCATATGCAAGTGAGTACCCAGCAAGATTCA
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DS 



AS 1 7

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BQ
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AF RS1EZ35JQ U 14
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TCTTCGCGAGA

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DS 

RD RS1B254TF 674 0 0
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ACGTCCGCTAGCGAATTGATCCTCGATGTGGGAATCAAGGCTGCGTCCCTCTTGACGGCT
CTCGATCTTCCTCAAGACGTGGTTACTCTTCTTGGTCTCCTCAGGAGCGGCGGCAGCTGG
AGCAGCTTCTTCACCTTCCTCTCCGTCCTTCTTGGCGGCGACAGAAGCAGCACTCTTCTT
CTTGCGACCAACCTCAACTCCGTAATGCTGCAAGTACCACTGCTTGAAAGGAGCGGCATC
GACCTGAACAATAGCACTCTTAACAAGAGTCTTGGTCCTGACGAGCTCATTGTTGGAAGC
GTTGTAGACGACATCAAGAACCCTGGTCTTGCGGGTAACAGCTTCACTTCCCCACGAGTA
GTTACCGGTGTCGAGCCTCAACGCGCGCCACTTGACGTTACCTCCACGGACTCGGATTCT
TCTCACCGTCTTGTTGCTTGACAACTTGGTGTTGGCTGGCTGCCTTCCCATCTCGTACTT
TCGCTTCTTCCTCCATCCCTTCTGCTTGCCTCCAGTGGCACGCCTCTTGTGGATGGAGTC
ACGAGAGATACCCATGGTTGCCTCTTCCGCGAGATAAACTTCTCAGCTGCGCCGGTAGGA
GTTGGAAGAAC
CCC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1EZ35TF 727 0 0
TAG
AACTCTAGCTCTTTGC*TTCCAGAATGTATCCATCGGCACGTCCACACTGGCCTGGCCTA
GATGAGATGCAAGCCAACAGACGTCCGCTAGCGAATTGATCCTCGATGTGGGAATCAAGG
CTGCGTCCCTCTTGACGGCTCTCGATCTTCCTCAAGACGTGGTTACTCTTCTTGGTCTCC
TCAGGAGCGGCAGCAGCTGGAGCAGCTTCTTCACCTTCCTCTCCGTCCTTCTTGGCGGCG
ACAGAAGCAGCACTCTTCTTCTTGCGACCAACCTCAACTCCGTAATGCTGCAAGTACCAC
TGCTTGAAAGGAGCGGCATCGACCTGAACAATAGCACTCTTAACAAGAGTCTTGGTCCTG
ACGAGCTCATTGTTGGAAGCGTTGTAGACGACATCAAGAACCCTGGTCTTGCGGGTAACA
GCTTCACTTCCCCACGAGTAGTTACCGGTGTCGAGCCTCAACGCGCGCCACTTGACGTTA
CCTCCACGGACTCGGATTCTTCTCACCGTCTTGTTGCTTGACAACTTGGTGTTGGCTGGC
TGCCTTCCCATCTCGTACTTACGCTTCTTCCTCCATCCCTTCTGCTTGCCTCCAGTGGCA
CGCCTCTTGTGGATGGAGTCACGAGAGATACCCATGGTTGCCTCTTCCGCGAGATAAACT
TCTCAGCTGCGCCGGTAGGAGTTGGAAGAACGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTATTAT
AT
CC

QA 4 725 4 725
DS 

RD RS1BG38TF 740 0 0
AG
AACTCTAGCTCTTTGC*TTCCAGAATGTATCCATCGGCACGTCCACACTGGCCTGGCCTA
GATGAGATGCAAGCCAACAGACGTCCGCTAGCGAATTGATCCTCGATGTGGGAATCAAGG
CTGCGTCCCTCTTGACGGCTCTCGATCTTCCTCAAGACGTGGTTACTCTTCTTGGTCTCC
TCAGGAGCGGCAGCAGCTGGAGCAGCTTCTTCACCTTCCTCTCCGTCCTTCTTGGCGGCG
ACAGAAGCAGCACTCTTCTTCTTGCGACCAACCTCAACTCCGTAATGCTGCAAGTACCAC
TGCTTGAAAGGAGCGGCATCGACCTGAACAATAGCACTCTTAACAAGAGTCTTGGTCCTG
ACGAGCTCATTGTTGGAAGCGTTGTAGACGACATCAAGAACCCTGGTCTTGCGGGTAACA
GCTTCACTTCCCCACGAGTAGTTACCGGTGTCGAGCCTCAACGCGTGCCACTTGACGTTA
CCTCCACGGACTCGGATTCTTCTCACCGTCTTGTTGCTTGACAACTTGGTGTTGGCTGGC
TGCCTTCCCATCTCGTACTTTCGCTTCTTCCTCCATCCCTTCTGCTTGCCTCCAGTGGCA
CGCCTCTTGTGGATGGAGTCACGAGAGATACCCATGGTTGCCTCTTCCGCGAGATAAACT
TCTCAGCTGCGCCGGTAGGAGTTGGAAGAACGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTATTAT
ATGGGGACAAGGAGTCCC

QA 3 740 3 740
DS 



AS 1 7

CO CL902Contig1 1097 7 36 U
CCTGAAAATGAACTTTTGTCTGTTTCTAAATTGCAATTTCGGAAAACTACAACAAGAGTC
AAAATCTTATACAAACTTTGTCAAAAAAAA**TTGAAACCAAAAGTAACATTCCACATTT
TTCAGTAAAACCATTAGGAATCAAAAGCTGATTACAGCATCTGAGCAGCTGTGTTGAGCT
TCTCCGCTAGACTCAACTGTGTCCTTATTATGCTTGATAAGTACAACAGAAGCAATTGAT
CCTGGAGACTATCATTCACGACATTATCGAAAACTTGTGGGGGTAACTTGAGAAGGGATG
CTACTGCCTCTGCAATAAACCGTCCTATGTTGTTGTCTGGAGATGTTTGACCTTCCACGA
CACTGTCAACATATTTGTAGACATCGTTGATTAGAGTCAACAGCCTCTCCATTGTCAGCT
CCATTCCTTCCATGTCATTTGGAAGTTTGTCAACAGCTGTTGCTTTCAGGACATCGTATC
CGACTCTCTCGGCATCAACCATACGGAGATCAACAGGAATCTCTTGAAACTGTGCAGCGA
GTTGTCGGTCACCAAGTGAAAGGTTAGAAGAGACGTAAGCTTTTATGGTACCTTCACCGT
TAGTGAATCCAGTGTCCACTGTAAGGTGAATAGGGTTGGTGACTTCCCTAGCAAAGAAGT
CATGAATCAGTGCACTACCACCATTGACCCCAGCACCAGTAGAATACCATCCAACGATTA
CTTCCTTTGGATTCACCTTAAGGTGTGAAGCTAACATGTTGTGGTGGTAATCAATATCCA
CAGCAACCTGATCGGAGGATTCATTGTGAGGGACGGCGTACGAGTTGCGGATATCGACGG
TGCCGTCAGGTAGGATGGATCCGAGGAGAGTGCCGATGACTCGTTCAGCTGAGTCGGGAC
GTCTCACGAAGCAGTCGCAGACGTTGAAGATGACGAGAGGGTGGATTCGCGCTGTGAGAA
CTGGGGTTGTGGTGGTTGTGGAAGCCGTCGATGATGGAGTCACGAATTGCAAGACGGTGA
GATCGTTTGTTGCCGCCATGGTTGAGATTTGCGAGGATCGAGAACGGTGAAAAGGCGCGA
GTCTGGAGATTTTAGGG


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 20 35 0 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BI91JQ U 4
AF RS1BU13JQ U 1
AF RS1EJ46JQ U 26
AF RS1CT58JQ U 118
AF RS1EJ46TF C 336
AF RS1BI91TF C 411
AF RS1CT58TF C 444
BS 1 63 RS1BU13JQ
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BS 143 224 RS1BU13JQ
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BS 827 1097 RS1EJ46TF

RD RS1BI91JQ 570 0 0
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ATCTTATACAAACTTTGTCAAAAAAAA**TTGAAACCAAAAGTAACATTCCACATTTTTC
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CCGCTAGACTCAACTGTGTCCTTATTATGCTTGATAAGTACAACAGAAGCAATTGATCCT
GGAGACTATCATTCACGACATTATCGAAGACTTGTGGGGGTAACTTGAGAAGGGATGCTA
CTGCCTCTGCAATAAACCGTCCTATGTTGTTGTCTGGAGATGTTTGACCTTCCACGACAC
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TTCCTTCCATGTCATTTGGAAGTTTGTCAACAGCTGTTGCTTTCAGGACATCGTATCCGA
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GTCGGTCACCAAGTGAAAGGTTAGAAGAGA

QA 1 570 1 570
DS 

RD RS1BU13JQ 715 0 0
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AAA*TCTTATACAAACTTTGTCAAAAAAAAAATTGAAACCAAAAGTAACATTCCACATTT
TTCAGTAAAACCATTAGGAATAAAAAGCTGATTACAGCATCTGAGCAGCTGTGTTGAGCT
TCTCCGCTAGACTCAACTGTGTCCTTATTATGCTTGATAAGTACCACAGAAGCAATTGAT
CCTGGAGACTATCATTCACGACATTATCGAAAACTTGTGGGGGTAACTTGGGAAGGGATG
AGACTGCCTCTGCAATAAACCGTCCTATGTTGTTGTCTGGAGATGTTTGACCCTCCACGA
CACTGTCAACATATTTGTAGACATCGTTAATTAGAGTCAAGAGCCTCTCCATTGTCAGCT
CCATTCCTTCCATGTCATTTGGAAGTTTGTCAACAGCTGTTGCCTTGAGGACATCGTATC
CGACTCTCTCGGCATCAACCATACGGAGATCAACAGGAATCTCTTGAAACTGTGCAGCGA
GTTGTCGGTCACCAAGTGAAAGGTTAGAAGAGACGTAAGCTTTTATGGTACCTTCACCGT
TAGTGAATCCAGTGTCCACTGTAAGGTGAATAGGGTTGGTGACTTCCCTAGCAAAGAAGT
CATGAATCAGTGCACTACCGCCATTGACCCCAGCACCCGTAGAATACCAGCCAAC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1EJ46JQ 713 0 0
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AAAAA**TTGAAATCAAAAGTAACATTCCACATTTTTCAGTAAAACCATTAGGAATCAAA
AGCTGATTACAGCATCTGAGCAGCTGTGTTGAGCTTCTCCGCTAGACTCAACTGTGTCCT
TATTATGCTTGATAAGTACAACAGAAGCAATTGATCCTGGAGACTATCATTCACGACATT
ATCGAAAACTTGTGGGGGTAACTTGAGAAGGGATGCTACTGCCTCTGCAATAAACCGTCC
TATGTTGTTGTCTGGAGATGTTTGACCTTTCACGACACTGTCAACATATTTGTAGACATC
GTTGATTAGAGTCAACAGCCTCTCCATTGTCAGCTCCATTCCTTCCATGTCATTTGGAAG
TTTGTCAACAGCTGTTGCTTTCAGGACATCGTATCCGACTCTCTCGGCATCAACCATACG
GAGATCAACAGGAATCTCTTGAAACTGTGCAGCGAGTTGTCGGTCACCAAGTGAAAGGTT
AGAAGAGACGTAAGCTTTTATGGTACCTTCACCGTTAGTGAATCCAGTGTCCACTGTAAG
GTGAATAGGGTTGGTGACTTCCCTAGCAAAGAAGTCATGAATCAGTGCACTACCACCATT
GACCCCAGCACCAGTAGAATACCATCCAACGATTACTTCCTTTGGATTCACCT

QA 1 713 1 713
DS 

RD RS1CT58JQ 709 0 0
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GCTTCTCCGCTAGACTCAACTGTGTCCTTATTATGCTTGATAAGTACAACAGCAGCAATT
GATCCTGGAGACTATCATTCACGACATTATCGAAGACTTGTGGGGGTAACTTGAGAAGGG
ATGCTACTGCCTCTGCAATAAACCGTCCTATGTTGTTGTCTGGAGATGTTTGACCTTCCA
CGACACTGTCAACATATTTGTAGACATCGTTGATTAGAGTCAACAGCCTCTCCATTGTCA
GCTCCATTCCTTCCATGTCATTTGGAAGTTTGTCAACAGCTGTTGCTTTCAGGACATCGT
ATCCGACTCTCTCGGCATCAACCATACGGAGATCAACAGGGATCTCTTGAAACTGTGCAG
CGAGTTGTCGGTCACCAAGTGAAAGGTTAGAAGAGGCGTAAGCTTTTATGGTACCTTCAC
CGTTAGTGAATCCAGTGTCCACTGTAAGGTGAATAGGGTTGGTGACTTCCCTAGCAAAGA
AGTCATGAATCAGTGCACTACCACCATTGACCCCAGCACCAGTAGAATACCATCCAACGA
TTACTTACTTTGGATTCACCTTAAG*TGTGAAGCTAACATGTTGTGGTGGTAATCAATAT
CCACAGCAACCTGATCGGAGGAT*CATTGTGAGGGACGGCGTACGAGTT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1EJ46TF 762 0 0
TGTCTGGAGATGTTGA
CTTTCACGACACTGTCAACATATT*GTAGACATCGTTGATTAGAGTCAACAGCCTCTCCA
TTGTCAGCTCCAT*CCTTCCATGTCATTTGGAAGTTTGTCAACAGCTGTTGCTTTCAGGA
CATCGTATCCGACTCTCTCGGCATCAACCATACGGAGATCAACAGGAATCTCTTGAAACT
GTGCAGCGAGTTGTCGGTCACCAAGTGAAAGGTTAGAAGAGACGTAAGCTTTTATGGTAC
CTTCACCGTTAGTGAATCCAGTGTCCACTGTAAGGTGAATAGGGTTGGTGACTTCCCTAG
CAAAGAAGTCATGAATCAGTGCACTACCACCATTGACCCCAGCACCAGTAGAATACCATC
CAACGATTACTTCCTTTGGATTCACCTTAAGGTGTGAAGCTAACATGTTGTGGTGGTAAT
CAATATCCACAGCAACCTGATCGGAGGATTCATTGTGAGGGACGGCGTACGAGTTGCGGA
TATCGACGGTGCCGTCAGGTAGGATGGATCCGAGGAGAGTGCCGATGACTCGTTCAGCTG
AGTCGGGACGTCTCACGAAGCAGTCGCAGACGTTGAAGATGACGAGAGGGTGGATTCGCG
CTGTGAGAACTGGGGTTGTGGTGGTTGTGGAAGCCGTCGATGATGGAGTCACGAATTGCA
AGACGGTGAGATCGTTTGTTGCCGCCATGGTTGAGATTTGCGAGGATCGAGAACGGTGAA
AAGGCGCGAGTCTGGAGATTTTAGGG

QA 17 762 17 762
DS 

RD RS1BI91TF 687 0 0
CA
TGTCAGCTCCAT*CCTTCCATGTCATTTGGAAGTTTGTCAACAGCTGTTGCTTTCAGGAC
ATCGTATCCGACTCTCTCGGCATCAACCATACGGAGATCAACAGGAATCTCTTGAAACTG
TGCAGCGAGTTGTCGGTCACCAAGTGAAAGGTTAGAAGAGACGTAAGCTTTTATGGTACC
TTCACCGTTAGTGAATCCAGTGTCCACTGTAAGGTGAATAGGGTTGGTGACTTCCCTAGC
AAAGAAGTCATGAATCAGTGCACTACCACCATTGACCCCAGCACCAGTAGAATACCATCC
AACGATTACTTCCTTTGGATTCACCTTAAGGTGTGAAGCTAACATGTTGTGGTGGTAATC
AATATCCACAGCAACCTGATCGGAGGATTCATTGCGAGGGACGGCGTACGAGTTGCGGAT
ATCGACAGTGCCGTCAGGTAGGATGGATCCGAGGAGAGTGCCGATGACTCGTTCAGCTGA
GTCGGGACGTCTCACGAAGCAGTCGCAGACGCTGAAGATGACGAGAGGGTGGATTCGCGC
TGTGAGAACTGGGGTTGTGGTGGTTGTGGAAGCCGTCGATGATGGAGTCACGAATTGCAA
GACGGTGAGATCGTTTGTTGCCGCCATGGTTGAGATTTGCGAGGATCGAGAACGGTGAAA
AGGCGCGAGTCTGGAGATTTTAGGG

QA 3 687 3 687
DS 

RD RS1CT58TF 654 0 0
AAG
TTGTCAACAGCTGTTGCTTTCAGGACATCGTATCCGACTCTCTCGGCATCAACCATACGG
AGATCAACAGGAATCTCTTGAAACTGTGCAGCGAGTTGTCGGTCACCAAGTGAAAGGTTA
GAAGAGGCGTAAGCTTTTATGGTACCTTCACCGTTAGTGAATCCAGTGTCCACTGTAAGG
TGAATAGGGTTGGTGACTTCCCTAGCAAAGAAGTCATGAATCAGTGCACTACCACCATTG
ACCCCAGCACCAGTAGAATACCATCCAACGATTACTTACTTTGGATTCACCTTAAGGTGT
GAAGCTAACATGTTGTGGTGGTAATCAATATCCACAGCAACCTGATCGGAGGATTCATTG
TGAGGGACGGCGTACGAGTTGCGGATATCGACGGTGCCGTCAAGTAGGATGGATCCGAGG
AGAGTGCCGATGACTCGTTCAGCTGAGTCGGGACGTCTCACGAAGCAGTCGCAGACGTTG
AAGATGACGAGAGGGCGGATTCGCGCTGTGAGAACTGGGGTTGTGGTGGTTGTGGAAGCC
GTCGATAATGGAGTCACGAATTGCAAGACGGTGAGATCGTTTGTTGCCGCCATGGTTGAG
ATTTGCGAGGATCGAGAACGGTGAAAAGGCGCGAGTCTGGAGATTTTAGGG

QA 4 654 4 654
DS 



AS 2 7

CO CL903Contig1 417 2 2 U
GGACTCACAGCAGGTCCATCGTCTGAAACTTAAATTTTCCCCAATTCTCAGATCAGCATC
AAACCCTAGGGCTCGAGGAACCAGCCATGTCGTCCAAGCAAGGAGGAAAGGCGAAACCTT
TGAAGCAGCCAAAAGCTGATAAGAAGGAATACGATGAGCACGATATGGCCAACCTTCAGA
AGAATAAAGACGAGGAAAAGGCACTTAAAGAACTAAGAGCCAAGGCATCGCAGAAGGGAT
CTTTTGGAGGATCTGGTCTTAAGAAGAGTGGCAAGAAATAATCCCGTTTTGTATCCATGA
AGCCTGTCTTTGACAGAGTGCTTATTTATCAACTTATAATGTTGTGTAACTTCCTATCAT
ATCTGTAGGGGAGTGACTTTTCCTTATCCCATAACATAACGTATGTTTTGCTTTCGC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CJ95JQ C 1
AF RS1CJ95TF U 1
BS 1 5 RS1CJ95JQ
BS 6 417 RS1CJ95TF

RD RS1CJ95JQ 417 0 0
GGACTCACAGCAGGTCCATCGTCTGAAACTTAAATTTTCCCCAATTCTCAGATCAGCATC
AAACCCTAGGGCTCGAGGAACCAGCCATGTCGTCCAAGCAAGGAGGAAAGGCGAAACCTT
TGAAGCAGCCAAAAGCTGATAAGAAGGAATACGATGAGCACGATATGGCCAACCTTCAGA
AGAATAAAGACGAGGAAAAGGCACTTAAAGAACTAAGAGCCAAGGCATCGCAGAAGGGAT
CTTTTGGAGGATCTGGTCTTAAGAAGAGTGGCAAGAAATAATCCCGTTTTGTATCCATGA
AGCCTGTCTTTGACAGAGTGCTTATTTATCAACTTATAATGTTGTGTAACTTCCTATCAT
ATCTGTAGGGGAGTGACTTTTCCTTATCCCATAACATAACGTATGTTTTGCTTTCGC

QA 1 417 1 417
DS 

RD RS1CJ95TF 417 0 0
GGACT
CACAGCAGGTCCATCGTCTGAAACTTAAATTTTCCCCAATTCTCAGATCAGCATCAAACC
CTAGGGCTCGAGGAACCAGCCATGTCGTCCAAGCAAGGAGGAAAGGCGAAACCTTTGAAG
CAGCCAAAAGCTGATAAGAAGGAATACGATGAGCACGATATGGCCAACCTTCAGAAGAAT
AAAGACGAGGAAAAGGCACTTAAAGAACTAAGAGCCAAGGCATCGCAGAAGGGATCTTTT
GGAGGATCTGGTCTTAAGAAGAGTGGCAAGAAATAATCCCGTTTTGTATCCATGAAGCCT
GTCTTTGACAGAGTGCTTATTTATCAACTTATAATGTTGTGTAACTTCCTATCATATCTG
TAGGGGAGTGACTTTTCCTTATCCCATAACATAACGTATGTTTTGCTTTCGC

QA 6 417 6 417
DS 



CO CL903Contig2 500 5 2 U
GGATGGGTTGCGTTGTTACTACGAACTCAATATAATAAATGAGCAGCTAAGCTAGAGATT
CATTCGCAAACACACAGCAGGTCCATCGTCTGAAACTTAAATTTTCCCCAATTCTCAGAT
CAGCATCAAACCCTAGACCTCGAGGAACCAACCATGTCGTCTAAGCAAGGAGGAAAGGCG
AAACCTTTGAAGCAGCCAAAAACTGATAAGAAGGAATACGATGAGCACGATATGGCCAAC
CTTCAGAAGAAGAAAGACGAGGAAAAGGCACTTAAAGAACTAAGAGCCAAGGCATCGCAG
AAGGGATCTTTTGGAGGCTCTGGTCTTAAGAAGAGTGGCAAGAAATAATCCCGCTTTGTA
TCCATGAAGCGTGTCTTTGACAGTGCTTATTTATCAACTTAAAATGTTGTGTAACTTCCT
ATCATGTCTGTAGGGGAGTGACTCTTATCCCATAACATATGTTTGCTTTCGCCACTTTTT
CATTTCAAAAGAAAAGAAAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1E196JQ C 1
AF RS1E196TF U 1
AF RS1F544JQ C 83
AF RS1F544TF U 83
AF RS1CY23TF U 131
BS 1 473 RS1E196TF
BS 474 500 RS1F544TF

RD RS1E196JQ 473 0 0
GGATGGGTTGCGTTGTTACTACGAACTCAATATAATAAATGAGCAGCTAAGCTAGAGATT
CATTCGCAAACACACAGCAGGTCCATCGTCTGAAACTTAAATTTTCCCCAATTCTCAGAT
CAGCATCAAACCCTAGACCTCGAGGAACCAACCATGTCGTCTAAGCAAGGAGGAAAGGCG
AAACCTTTGAAGCAGCCAAAAACTGATAAGAAGGAATACGATGAGCACGATATGGCCAAC
CTTCAGAAGAAGAAAGACGAGGAAAAGGCACTTAAAGAACTAAGAGCCAAGGCATCGCAG
AAGGGATCTTTTGGAGGCTCTGGTCTTAAGAAGAGTGGCAAGAAATAATCCCGCTTTGTA
TCCATGAAGCGTGTCTTTGACAGTGCTTATTTATCAACTTAAAATGTTGTGTAACTTCCT
ATCATGTCTGTAGGGGAGTGACTCTTATCCCATAACATATGTTTGCTTTCGCC

QA 1 473 1 473
DS 

RD RS1E196TF 473 0 0
GGATGGGTTGCGTTGTTACTACGAACTCAATATAATAAATGAGCAGCTAAGCTAGAGATT
CATTCGCAAACACACAGCAGGTCCATCGTCTGAAACTTAAATTTTCCCCAATTCTCAGAT
CAGCATCAAACCCTAGACCTCGAGGAACCAACCATGTCGTCTAAGCAAGGAGGAAAGGCG
AAACCTTTGAAGCAGCCAAAAACTGATAAGAAGGAATACGATGAGCACGATATGGCCAAC
CTTCAGAAGAAGAAAGACGAGGAAAAGGCACTTAAAGAACTAAGAGCCAAGGCATCGCAG
AAGGGATCTTTTGGAGGCTCTGGTCTTAAGAAGAGTGGCAAGAAATAATCCCGCTTTGTA
TCCATGAAGCGTGTCTTTGACAGTGCTTATTTATCAACTTAAAATGTTGTGTAACTTCCT
ATCATGTCTGTAGGGGAGTGACTCTTATCCCATAACATATGTTTGCTTTCGCC

QA 1 473 1 473
DS 

RD RS1F544JQ 418 0 0
CCATCGTTTGAAACTTAAATTTTCCCCAATTTTCAGATC**CATCAAACCCTAGACCTCG
AGGAACCAACCATGTCGTTTAAGCAAGGAGGAAAGGCGAAACCTTTGAAG*AGCCAAAAA
CTTATAAGAAGGAATACGATGAGCACGATATGTCCAACCTTCAGAAGAAGAAAGACGAGG
AAAAGGCACTTAAAGAACTAAGAGCCAAGGCATCGCAGAAGGGATCTTTTGGAGGCTCTG
GTCTTAAGAAGAGTGGCAAGAAATAATCCCGCTTTGTATCCATGAAGCGTGTCTTTGACA
GTGCTTATTTATCAACTTAAAATGTTGTGTAACTTCCTATCATGTCTGTAGGGGAGTGAC
TCTTATCCCATAACATATGTTTGCTTTCGCCACTTTTTCATTTCAAAAGAAAAGAAAG

QA 1 418 1 418
DS 

RD RS1F544TF 418 0 0
CCATCGTCTGAAACTTAAATTTTCCCCAATTCTCAGATC**CATCAAACCCTAGACCTCG
AGGAACCAACCATGTCGTCTAAGCAAGGAGGAAAGGCGAAACCTTTGAAG*AGCCAAAAA
CTTATAAGAAGGAATACGATGAGCACGATATGTCCAACCTTCAGAAGAAGAAAGACGAGG
AAAAGGCACTTAAAGAACTAAGAGCCAAGGCATCGCAGAAGGGATCTTTTGGAGGCTCTG
GTCTTAAGAAGAGTGGCAAGAAATAATCCCGCTTTGTATCCATGAAGCGTGTCTTTGACA
GTGCTTATTTATCAACTTAAAATGTTGTGTAACTTCCTATCATGTCTGTAGGGGAGTGAC
TCTTATCCCATAACATATGTTTGCTTTCGCCACTTTTTCATTTCAAAAGAAAAGAAAG

QA 1 418 1 418
DS 

RD RS1CY23TF 370 0 0
GG
CTAGACCTCGAGGAACCAGCCATGTCGTCTAAGCAAGGAGGAAAGGCGAAACCTTTGAAG
CAGCCAAAAACTGATAAGAAGGAATACGATGAGCACGATATGGCCAACCTTCAGAAGAAG
AAAGACGAGGAAAAGGCACTTAAAGAACTAAGAGCCAAGGCATCGCAGAAGGGATCTTTT
GGAGGCTCTGGTCTTAAGAAGAGTGGCAAGAAATAATCCCGCTTTGTATCCATGAAGCGT
GTCTTTGACAGTGCTTATTTATCAACTTAAAATGTTGCGTAACTTCCTATCATGTCTGTA
GGGGAGTGACTCTTATCCCATAACATATGTTTGCTTTTGCCACTTTTTCATTTCAAAAGA
AAAGAAAG

QA 3 370 3 370
DS 



AS 2 7

CO CL904Contig1 671 3 4 U
GGAGGAAGGAAAGATCTCATCGAGACAGACAGCGAAGAAAACTCTTCTAGTACTTCAAGA
TGGGGCGTATGCATTCAAGAGGAAAGGGGATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGTT
CACCTCCCGCTTGGCTCAAGACCACCGCGCTCGATGTTGATGAGTCGATATGCAAGTTTG
CAAAGAAGGGTTTGACACCTTCTCAGATTGGTGTCATTCTCCGTGACTCCCACGGTATCC
CTCAGGTCAAGAGTGTTACCGGTAACAAGATCTTGCGTATCTTGAAAGCACACGGTCTTG
CACCTGAGATTCCTGAGGATCTCTACCACTTGATCAAGAAGGCAGTTGCTATCCGCAAGC
ACTTGGAGAGGAACAGGAAAGACAAAGATTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTTGAGAGCA
GGATCCACCGTCTTGCTCGCTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCTGTCTGGAAGT
ACGAGTCTACTACTGCCAGCACCCTTGTTACTTAGAGAGCATGGATTGAATTGGAAGTTC
TTCAAGAACTCGCGTTTCTATTCTCACTTCGTGTATCAACTGGATTTAATTTCTCATTTT
CGTGTTAGTGCTTGTTTTGTTTTGTCATGTCACAATTGTGGTTTTAATCATTTCAAGGAA
ACTTAAATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CC86TF U 21
AF RS1BG60TF U 1
AF RS1CC86JQ C 95
BS 1 509 RS1BG60TF
BS 510 510 RS1CC86JQ
BS 511 631 RS1BG60TF
BS 632 671 RS1CC86JQ

RD RS1CC86TF 465 0 0
CGAGACAGACAGTGAAGAAAACTCTTCTAGTACTTCAAGATGGGGCGTATGCATTCAAGA
GGAAAGGGGATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGTTCACCTCCCGCTTGGCTCAAG
ACCACCGCGCTCGATGTTGATGAGTCGATATGCAAGTTTGCAAAGAAGGGTTTGACACCT
TCTCAGATTGGTGTCATTCTCCGTGACTCCCACGGTATCCCTCAGGTCAAGAGTGTTACC
GGTAACAAGATCTTGCGTATCTTGAAAGCACACGGTCTTGCACCTGAGATTCCTGAGGAT
CTCTACCACTTGATCAAGAAGGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAGAGGAACAGGAAA
GACAAAGATTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTTGAGAGCAGGATCCACCGTCTTGCTCGC
TACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCTGTCTGGAAGTACGAG

QA 1 465 1 465
DS 

RD RS1BG60TF 631 0 0
GGAGGAAGGAAAGATCTCATCGAGACAGACAGCGAAGAAAACTCTTCTAGTACTTCAAGA
TGGGGCGTATGCATTCAAGAGGAAAGGGGATCTCTGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGTT
CACCTCCCGCTTGGCTCAAGACCACCGCGCTCGATGTTGATGAGTCGATATGCAAGTTTG
CAAAGAAGGGTTTGACACCTTCTCAGATTGGTGTCATTCTCCGTGACTCCCACGGTATCC
CTCAGGTCAAGAGTGTTACCGGTAACAAGATCTTGCGTATCTTGAAAGCACACGGTCTTG
CACCTGAGATTCCTGAGGATCTCTACCACTTGATCAAGAAGGCAGTTGCTATCCGCAAGC
ACTTGGAGAGGAACAGGAAAGACAAAGATTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTTGAGAGCA
GGATCCACCGTCTTGCTCGCTACTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCTGTCTGGAAGT
ACGAGTCTACTACTGCCAGCACCCTTGTTGCTTAGAGAGCATGGATTGAATTGGAAGTTC
TTCAAGAACTCGCGTTTCTATTCTCACTTCGTGTATCAACTGGATTTAATTTCTCATTTT
CGTGTTAGTGCTTGTTTTGTTTTGTCATGTC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RS1CC86JQ 577 0 0
T
GCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGTTCACCTCCCGCTTGGCTCAAGACCACCGCGCTCGAT
GTTGATGAGTCGATATGCAAGTTTGCAAAGAAGGGTTTGACACCTTCTCAGATTGGTGTC
ATTCTCCGTGACTCCCACGGTATCCCTCAGGTCAAGAGTGTTACCGGTAACAAGATCTTG
CGTATCTTGAAAGCACACGGTCTTGCACCTGAGATTCCTGAGGATCTCTACCACTTGATC
AAGAAGGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAGAGGAACAGGAAAGACAAAGATTCCAAG
TTTAGGTTGATTCTTGTTGAGAGCAGGATCCACCGTCTTGCTCGCTACTACAAGAAGACC
AAGAAGCTTCCTCCTGTCTGGAAGTACGAGTCTACTACTGCCAGCACCCTTGTTACTTAG
AGAGCATGGATTGAATTGGAAGTTCTTCAAGAACTCTCGTTTCTATTCTCACTTCGTGTA
TCAACTGGATTTAATTTCTCATTTTCGTGTTAGTGCTTGTTTTGTTTTGTCATGTCACAA
TTGTGGTTTTAATCATTTCAAGGAAACTTAAATTTT

QA 2 577 2 577
DS 



CO CL904Contig2 741 4 7 U
GGGAAAAGATCTCATCGAGACAGACAGTGAAGAAACTCTAGCTAGCACTTCAAGATGGGG
CGTATGCATTCAAGAGGAAAGGGAATCTCCGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGTTCACCT
CCGGCTTGGCTCAAGACCACCGCTCTCGATGTTGATGAGTCGATATGCAAGTTTGCAAAG
AAGGGTTTGACACCATCTCAGATTAGTGTCATTCTCCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAG
GTCAAGAGTGTTACCGGTAACAAGATCTGGCGAATCTTGAAAGCACACGGTCTTGCACCT
GAGATTCCTGAGGATCTATACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTG
GAGAGGAACAGGAAAGACAAAGATTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATC
CACCGTCTTGCTCGCTATTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAG
TCTACTACTGCCAGCACCCTTGTTGCTTAGAGAGCATGGATTGAATTTGGAAGTTCTTCA
AGAATTCTCGTTTCTATTCACTCCGTGTCTCAACTGGATTTAATTTCTCATTTTCGTGTT
AGTGCTTGTTTTGTTTTGTCATGTCACAATTGTGGTTTTAATCATTTCAAGGAACAAACT
TGCTTAAATTTTATGGTCATGGTTACTAAACATATAAAGATCACAAACAGAATATTCATT
CCTTAGTTACAAAGTTTCTAT


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GK17TF U 1
AF RS1B454JQ C 126
AF RS1B454TF U 126
AF RS1GK17JQ C 4
BS 1 204 RS1GK17TF
BS 205 205 RS1B454TF
BS 206 419 RS1GK17TF
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BS 648 652 RS1B454TF
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RD RS1GK17TF 647 0 0
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AGAATTCTCGTTTCTATTCACTCCGTGTCTCAACTGGATTTAATTTCTCATTTTCGTGTT
AGTGCTTGTTTTGTTTTGTCATGTCACAATTGTGGTTTTAATCATTT

QA 1 647 1 647
DS 

RD RS1B454JQ 527 0 0
G
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TGTTTTGTTTTGTCATGTCACAATTGTGGTTTTAATCATTTCAAGG

QA 2 527 2 527
DS 

RD RS1B454TF 527 0 0
G
TGGCTCAAGACCACCGCTCTCGATGTTGATGAGTCGATATGCAAGTTTGCAAAGAAGGGT
TTGACACCATCTCAGATTAGTGTCATTCTCCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTCAAG
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CCTGAGGATCTATACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAGAGG
AACAGGAAAGACAAAGATTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATCCACCGT
CTTGCTCGCTATTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCTACT
ACTGCCAGCACCCTTGTTGCTTAGAGAGCATGGATTGAATTTGGAAGTTCTTCAAGAATT
CTCGTTTCTATTCACTTCGTGTCTCAACTGGATTTAATTTCTCATTTTCGTGTTAGTGCT
TGTTTTGTTTTGTCATGTCACAATTGTGGTTTTAATCATTTCAAGG

QA 2 527 2 527
DS 

RD RS1GK17JQ 738 0 0
A
AAAGATCTCATCGAGACAGACAGTGAAGAAACTCTAGCTAGCACTTCAAGATGGGGCGTA
TGCATTCAAGAGGAAAGGGAATCTCCGCATCTGCTTTGCCGTACAAGCGTTCACCTCCGG
CTTGGCTCAAGACCACCGCTCTCGATGTTGATGAGTCGATATGCAAGTTTGCAAAGAAGG
GTTTGACACCATCTCAGATTGGTGTCATTCTCCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTCA
AGAGTGTTACCGGTAACAAGATCTGGCGAATCTTGAAAGCACACGGTCTTGCACCTGAGA
TTCCTGAGGATCTATACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTTGGAGA
GGAACAGGAAAGACAAAGATTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTCGAGAGCAGGATTCACC
GTCTTGCTCGCTATTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCAGTCTGGAAGTACGAGTCTA
CTACTGCCAGCACCCTTGTTGCTTAGAGAGCATGGATTGAATTTGGAAGTTCTTCAAGAA
TTCTCGTTTCTATTCACTCCGTGTCTCAACTGGATTTAATTTCTCATTTTCGTGTTAGTG
CTTGTTTTGTTTTGTCATGTCACAATTGTGGTTTTAATCATTTCAAGGAACAAACTTGCT
TAAATTTTATGGTCATGGTTACTAAACATATAAAGATCACAAACAGAATATTCATTCCTT
AGTTACAAAGTTTCTAT

QA 2 738 2 738
DS 



AS 1 5

CO CL905Contig1 954 5 12 U
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TTTCTCTTTCGTATTGTGTTTCTTCTCAATCAGATCCGAGGAGTTTGTTTGGTGATGTTT
TTGTTCGATTGGTTCTATGGAATCCTAGCGACGTTAGGATTGTGGCAGAAAGAGGCGAAG
ATATTGTTTCTGGGCCTCGACAATGCCGGCAAAACTACTTTGCTTCACATGCTCAAAGAC
GAGAGATTAGTACAACACCAGCCAACACAGCATCCAACATCTGAGGAACTGAGCATTGGC
AAAATCAAATTCAAGGCTTTTGACTTGGGTGGCCATCAGATTGCCCGTAGGGTCTGGAAA
GACTACTATGCCAAGGTTGATGCAGTTGTGTACCCAGTGGATGCTTACGACAAGGAGAGA
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CCCTTTCTTATTCTTGGCAACAAGATTGATATTCCTTATGCAGCCTCTGAAGATGAGCTT
AGGTATCACTTGGGTCTCACCAATTTCACCACGGGTAAAAGCAATGTGAATCTAGAAGAA
TCTGGTGTTCGTCCCCTTGAGGTCTTCATGTGCAGCATCGTCCGCAAAATGGGATATGGC
GAGGGCTTTAAATGGTTATCTTACTACATCAAGTGAGTGGGAAACCAAACAAGCACGGTT
TTATGAATGAGACTATCTCAATGTTTCCCTCTTTGAAAAGACATAAACTCTTTCCCTCTT
GTAGTATCATCTTCCAAGATTTAATATATCTGAGTAAGTCGAGGGTTGTGTATTAGTAGT
AGTACTCACGTTTCTTTTGTTGAATCAAACTGAACAAGAACATCATTCTGATTTCGAGCT
AAAACACTATGACCTCGACGTTGTGTCTGTAAGCAAATGAAATGTCATTATGAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H224TF U 1
AF RS1B864TF U 1
AF RS1FD82TF U 611
AF RS1B864JQ C 62
AF RS1H224JQB C 134
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RD RS1H224TF 574 0 0
GGACCCTCGTCTGATCAACCAAACCTTTTGTTGTTGATTTGGTTCTTTCTTCTTCACCTC
TTTCTCTTTCGTATTGTGTTTCTTCTCAATCAGATCCGAGGAGTTTGTTTGGTGATGTTT
TTGTTCGATTGGTTCTATGGAATCCTAGCGACGTTAGGATTGTGGCAGAAAGAGGCGAAG
ATATTGTTTCTGGGCCTCGACAATGCCGGCAAAACTACTTTGCTTCACATGCTCAAAGAC
GAGAGATTAGTACAACACCAGCCAACACAGCATCCAACATCTGAGGAACTGAGCATTGGC
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GACTACTATGCCAAGGTTGATGCAGTTGTGTACCTAGTGGATGCTTACGACAAGGAGAGA
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CCCTTTCTTATTCTTGGCAACAAGATTGATATTCCTTATGCAGCCTCTGAAGATGAGCTT
AGGTATCACTTGGGTCTCACCAATTTCACCACGG

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DS 

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ATATTGTTTCTGGGCCTCGACAATGCCGGCAAAACTACTTTGCTTCACATGCTCAAAGAC
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AAAATCAAATTCAAGGCTTTTGACTTGGGTGGCCATCAGATTGCCCGTAGGGTCTGGAAA
GACTACTATGCCAAGGTTGATGCAGTTGTGTACCCAGTGGATGCTTACGACAAGGAGAGA
TTTGTGGAGTCAAAAAGAGAGCTTGATGCTCTTCTATCTGACGAAGGCTTAGCAAATGTT
CCCTTTCTTATTCTTGGCAACAAGATTGATATTCCTTATGCAGCCTCTGAAGATGAGCTT
AGGTATCACTTGGGTCTCACCAATTTCACCATGGGTAAAAGCAATGTGAATCTAGAAGAA
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GAGGGCTTTAAATGGTTATCTTACTACATCAAGTGAGTGGGAA**CCAACAAGCACGGTT
TTATGAATGAGACTATCTC

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DS 

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GACTATCTCAATGTTTCCCTCTTTGAAAAGAC
ATAAACTCTT

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DS 

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TTTCTGGGCCTCGACAATGCCGGCAAAACTACTTTGCTTCACATGCTCAAAGACGAGAGA
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AAATTCAAGGCTTTTGACTTGGGTGGCCATCAGATTGCCCGTAGGGTCTGGAAAGACTAC
TATGCCAAGGTTGATGCAGTTGTGTACCCAGTGGATGCTTACGACAAGGAGAGATTTGTG
GAGTCAAAAAGAGAGCTTGATGCTCTTCTATCTGACGAAGGCTTAGCAAATGTTCCCTTT
CTTATTCTTGGCAACAAGATTGATATTCCTTATGCAGCCTCTGAAGATGAGCTTAGGTAT
CACTTGGGTCTCACCAATTTCACCATGGGTAAAAGCAATGTGAATCTAGAAGAATCTGGT
GTTCGTCCCCTTGAGGTCTTCATGTGCAGCATCGTCCGCAAAATGGGATATGGCGAGGGC
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CG

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DS 

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AACACCAGCCAACACAGCATCCAACATCTGAGGAACTGAGCATTGGCAAAATCAAATTCA
AGGCTTTTGACTTGGGTGGCCATCAGATTGCCTGTAGGGTCTGGAAAGACTACTATGCCA
AGGTTGATGCAGTTGTGTACCTAGTGGATGCTTACGACAAGGAGAGATTTGTGGAGTCAA
AAAGAGAGCTTGATGCTCTTCTATCTGACTAAGGCTTAGCAAATGTTCCCTTTCTTATTC
TTGGCAACAAGATTGATATTCCTTATGCAGCCTCTGAAGATGAGCTTAGGTATCACTTGG
GTCTCACCAATTTCACCACGGGTAAAAGCAATGTGAATCTAGAAGAATCTGGTGTTCGTC
CCCTTGAGGTCTTCATGTGCAGCATCGTCCGCAAAATGGGATATGGCGAGGGCTTTAAAT
GGTTATCTTACTACATCAAGTGAGTGGGAAACCAAACAAGCGCGGTTTTATGAATGAGAC
TATCTCAATGTTTCCCTCTTTGAAAAGACATAAACTCTTTCCCTCTTGTAGTATTATCTT
CCAAGATTTAATATATCTGAGTAAGTCGAGGGTTGTGTATTAGTAGTAGTACTCACGTTT
CTTTTGTTGAATCAAACTGAACAAGAACATCATTCTGATTTCGAGCTAAAACACTATGAC
CTCGACGTTGTGTCTGTAAGCAAATGAAATGTCATTATGAT

QA 1 821 1 821
DS 



AS 1 7

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GATCTTGGGTCTGGCTCTTCTCGTCCGTCAATATACCAAGAAAGAGTAGAAACAGAGGCT
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ATCGTTTGGTTTTTCACCTTTTTTTTTTGTGTTGATTGAGATGTTTACAACTTTGATGAT
CAACTAAAAGAGTGCTTCCATTTAAAAAAAAA


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 15 5 0 45 45 45 45 45 45 45 15 15 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 5 5 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BY36JQ C 1
AF RS1C491JQ C 306
AF RS1C491TF U 1
AF RS1BY36TF U 1
AF RS1D491TF U 1
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CC

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CC

QA 1 645 1 645
DS 

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TGAAGACGTCGGTCACAGCGACACCGCAAGGGACATGATGGAGAAGTACTACATTGGCGA
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GATCTTGGGTCTGGCTCTTCTCGTCCGTCAATATACCAAGAAAGAGTAGAAACAGAGGCT
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QA 1 648 1 648
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TGAAGACGTCGGTCACAGCGACACCGCAAGGGACATGATGGAGAAGTACTACATTGGCGA
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CAACCAAGACAAGACACCAGAGTTCATCATCAAGATTCTGCAGTTCCTTGTCCCTATCTT
GATCTTGGGTCTGGCTCTTCTCGTCCGTCAATATACCAAGAAAGAGTAGAAACAGAGGCT
TTGCATTTTTTTGCTTGCCACTGGATAACTCTTTTCTGATTTCTCTCTGTATTTGCAAAA
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RD RS1BM73TF 660 0 0
GG
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CAAGATTCTGCAGTTCCTTGTCCCTATCTTGATCTTGGGTCTGGCTCTTCTCGTCCGTCA
ATATACCAAGAAAGAGTAGAAACAGAGGCTTTGCATTTTTTTGCTTGCCACTGGATAACT
CTTTTCTTATTTCTCTCTGTATTTGCAAAAAAAAA*ATACAGTTACTGTTGTTTGGTACT
AGACTTTATCTCTGTCCTTAAAAGTGATTCTTGTTGAAACTACTACGAAGTAA*TAATCA
G*TGTGTTTTGCTAGTCTCTTTGTGGTCGTATCGTTTGGTTTTTCACCTTTTTTT
TGT

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DS 

RD RS1D491JQ 667 0 0
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TTGTCCTCAACAGGGAAAGATGCTACGAATGACTTTGAAGACGTCGGTCACAGCGACACC
GCAAGGGACATGATGGAGAAGTACTACATTGGCGAGATCGATTCGTCTACTGTTCCAGCC
ACAAGGACATACGTTGCACCTTCTCAACCCGCTTACAACCAAGACAAGACACCAGAGTTC
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AATCAG*TGTGTTTTGCTAGTCTCTTTGTGGTCGTATCGTTTGGTTTTTCACCTTTTTTT
TTTGTGTTGATTGAGATGTTTACAACTTTGATGATCAACTAAAAGAGTGCTTCCATTTAA
AAAAAAA

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 7

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AGAAGAATCATGGGAGCTGGTGGACCGGAGGAGGAAGATAACAGGCAGCCGCCATGGCTG
AAACCTCTGCTTCAAGAGAAATTTTTTGGTCATTGCAAGTTTCATGTAGACTCTCACAAG
AGTGAATGCAATATGTACTGCTTAGACTGTACCAACGGTCCGCTTTGCTCTCTCTGTCTT
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AGTGCTAAAGTCATCTTCTTGAACGAGAGGCCACAGCCTAGGCCAGGGAAAGGTGTGACC
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GGCTGCAAGATTGCTGGATCTTCTAGAGGATATGAAAAGGGAAGGAAGAACCTTGTGGTG
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GAAGCTCATTTACCAGTTTCTTGATCTATAAGATTACACACAAAGGTTTAGCTAAGAGAA
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GTATATTAATGTGATGCATAAAGGGTAGAAAGGTAAATATAGGGCTTTGAAGGGGGTAAA
AGTGGGAATAAAACAAAATTAGTTTTTTGTTGTAAATTTGGTTTGGTTAGGTGCATACAT
GCATCTGGAATAACAAAATAAGTAATGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AGTGAGTGCAATATGTACTGCTTAGACTGTACCAACGGTCCGCTTTGCTCTCTCTGTCTT
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AGTGCTAAAGTCATCTTCTTGAACGAGAGGCCACAGCCTAGGCCAGGGAAAGGTGTGACC
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TGCTTAGACTGTACCAACGGTCCGCTTTGCTCTCTCTGTCTTGCCCATCACAAGAATCAT
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GACA

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TAGTCATTGCAGAATCGCCAAGGGAAGAAAGGGAATCCCTCCCCGGTTTCCAATGGGATA
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G
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TGGGAAGAACATTCAGAGTTTCGGCCCATCAACACCTCCACTTACTGCATCTAGTCATTG
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CTTTCGTCTGTGTTAGGTGAAGAAAAGGCCATATAGGTTTTGTCCTACTAATGGCAAAAG
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C

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DS 

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CAGCATTGGAATTGGGAAGAACATTCAGAGTTTCGGCCCATCAACACCTCCACTTACTGC
ATCTAGTCATTGCAGAATCGCCAAGCGAAGAAAGGGAATCCCTCACCGGTCTCCAATGGG
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TTGATCTATAAGATTACACACAAAGGTTTAGCTAAGAGAAGCCTTTGTCTCTTATCTTTT
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AGTTTTTTGTTGTAAATTTGGTTTGGTTAGGTGCATACATGCATCTGGAATAACAAAATA
AGTAATGAG

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DS 



AS 2 7

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TGATAACGGCTCACCACCAAAAATTCCCGGTGGGGCGACATTGATATTCGACACCGAGCT
AGTTGCTGTGAACGGGAAACCATCCAGCGAAGGAAAAGCAAAGAGCGAGCTT*GAATGCA
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ACATGCTAGAGACTAGAGTCGTTTACTTTTTGCTAGTTGAGGACAATAACTAATGTTATG
GTTGCAGTTCAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RS1C582TF U 55
AF RS1B911TF U 1
AF RS1CS58JQ C 35
AF RS1CS58TF U 35
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BS 541 541 RS1C582TF
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GAGAGGTGACCCTATTGAGTTTGAGCTTGGAAGTGGTCAAGTCATTCCAGGATGGGACCA
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DS 

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TGGTGTTAAGTTCAAGCCTCAGACGTGTGATGTCCAGGCTCACAAAGGGGACAAGATCAA
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AGTTGCTGTGAACGGGAAACCATCCAGCGAAGGAAAAGCAAAGAGCGAGCTTTGAATGCA
*CCGTCTTCTTCTTAATTTCCTTATGAAACCATGTTATGTCGTCAGCATTTGAATCTCAA
ACATGCTAGAG

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DS 

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GACAATAACTAATGTTATGGTTGCAGTTCAAAAA

QA 8 641 8 641
DS 



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GAAAAGATATTTATTCAC


BQ
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25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FH41TF U 13
AF RS1BP25TF U 1
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G
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QA 2 644 2 644
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GTTATGGTTGCAGTTCAAAAATAAGGTGGAATCCCAGAGTATGAGAACTTTCTATAATCA
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GAAAGATATTT

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DS 

RD RS1BP25JQ 734 0 0
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TGGTTGCAGTTCAAAAATAAGGTGGAATCCCAGAGTAGGAGAACTTTCTATAATCAATTC
ACCTGGCTAGTCGAAGATAAATCTGTGTAGACTATATATTGTTAATCATGGCAAAAGAAA
AGATATTTATTCAC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 4

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TGCCTGAGGAGGTTCATATCCACCAGCATAGTGAAAGTATGATCCAACAATGAGAGCATG
ATCTGCGTCACCAGTCGATGTCCATATCGAGATTGCTTTAGTAAAGAAGCAACGGTTGGA
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AGCTGGATAATGACTTACCCAACTGCCACACATATCGAGTATGCTCACTCCAGGAGTCTC
GCTCTGAGGCAGAACCTTGGAGTAGTACTTTGTCAACGCAGCTATTGCTGGATCATCAAT
GTGTGTCACAAACCGCGGAGCTTCATAAAACGTTGAATCAGACGACTCGTCGAATCGCCG
GAAATCTTCTTCTTTGAAAGGGAAGTTCTCAGGCCATTCCACTTTACTCAACGCCTGTTC
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ACCGGACATGTTGTCGTTCATCCACAAGGACGTGCCGGCGAAACCGCCGAGAACCAGCCG
ACGACGTGAAGAGGCTCGAATCCAACGGTCGAAAGGTCTCGAAGCAGCAGCCGTTGGGAG
GAGATTCAGAGGAGAGGAGTTTGAGAATGACGGTGGGAGAGGATTGGATCTAACTCTGAG
GCCGAGAAAGTTGCAAGTTTTTGACATGGCGAACTCTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
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25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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G

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TGGCGAACTCT
CC

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TGGTATTGATTCTTGC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GACGAGCTTGAGAGGGAAGATTTCTTCAG
CTTAGA

QA 1 689 1 689
DS 

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GG
AATCTCAGTGATCTACTTGCAAAAGTCTCCTCGAGAGGCCCAGT***TAACATGGCTGGC
CAAAACGCGCGTTTGAATGTGGTTCCCACTGTTACTATGCTCGGAGTTATGAAAGCCCGT
CTTGTTGGAGCCACAAGAGGCCATGCTCTCCTCAAGAAGAAGAGCGATGCTTTAACTGTT
CAGTTCAGGGCTCTTCTCAAGAAAATCGTCACGGCCAAGGAATCAATGGGAGACATGATG
AAGACATCGTCTT**GCTCTTACCGAAGTCAAGTACGTTGCTGGTGAGAATGTCAAACAC
GTTGTCCTCGAGAACGTCAAAGAAGCTACGCTCAAAGTCCGTTCAAGGCAAGAGAACATC
GCTGGTGTGAAGCTTCCGAAGTTTGATCACTTCTCTGAAGGCGAGACCAAGAATGACTTA
ACCGGTTTAGCTAGAGGTGGTCACCAGGTCCAAGCTTGCCGTGTCGCTTATGTGAAAGCC
ATTGAGGTTCCCGTTGAGCTTGCTTCTCTCCAGACTTCGTTCTTGACGCTTGATGAAGCA
ATCAAGACGACGAACCGCAGGGTCAACGCTCTGGAGAATGTGGTGAAACCGAAGATTGAG
AATACCCTCAGTTACATCAAGGGAGAGCTTGACGAGCTTGAGAGGGAAGATTTCT

QA 3 657 3 657
DS 

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AAAATGGATTTGATGTAGATGAAATACTGTATCATCTTGGATTGTGCTTTGCTATAATTT
TCCTCTTGAGAGATTTGTGATTGTTACTCTTCTGCGTTATGATAAATGTAAAACGTTAC
TTGTC

QA 1 119 1 119
DS 

RD RS1BJ68TF 724 0 0
G
CGTCAAAGAAGCTACGCTCAAAGTCCGTTCAAGGCAAGAGAACATCGCTGGTGTGAAGCT
TCCGAAGTTTGATCACTTCTCTGAAGGCGAGACCAAGAATGACTTAACCGGTTTAGCTAG
AGGTGGTCAACAGGTCCAAGCTTGCCGTGTCGCTTATGTGAAAGCCATTGAGGTTCTCGT
TGAGCTTGCTTCTCTCCAGACTTCGTTCTTGACGCTTGATGAAGCAATCAAGACGACGAA
CCGCAGGGTCAACGCTCTGGAGAATGTGGTGAAACCGAAGATTAAGAATACCCTCAGTTA
CATCAAGGGAGAGCTTGACGAGCTTGAGAGGGAGGATTTCTTCAGGCTTAAGAAGATTCA
GGGATACAAGAGGAGGGAAGTCGAGAGACAAGCTGCTAACGCTAAGGCGTTTGCTGAGGA
GATGGTTCTTGAAGGAATCTCTATGCAGAGAGGGATTTCTATAAACGCTGCTCGTAACTT
GCTTGAAGGTGGGGCAGAGAAGGATGCAGACATTATTTTCTAAAGTGTGAGGCTCTCTCG
CTATTTATCTTTTGTTATTATTACTCTCTTCATAAGACTTCATGTTTCTACAAATAAAAT
GGATTTGATGTAGATGAAATACTGTATCATCTTGGATTGTGCTTTGCTATAATTTTCCTC
T*GAGAGATTTGTGATTGTTACTCTTCTGCGTTACGATAAATGTAAAACGTTAC
CTTGCTTAA

QA 2 715 2 715
DS 

RD RS1BJ68JQ 630 0 0
ACCAAGAATGACTTAACCGGTTTAGCTAGAGGTGGTCAACAGGTCCAAGCTTGCCGTGTC
GCTTATGTGAAAGCCATTGAGGTTCTCGTTGAGCTTGCTTCTCTCCAGACTTCGTTCTTG
ACGCTTGATGAAGCAATCAAGACGACGAACCGCAGGGTCAACGCTTTGGAGAATGTGGTG
AAACCGAAGATTAAGAATACCCTCAGTTACATCAAGGGAGAGCTTGACGAGCTTGAGAGG
GAGGATTTTTTCAGGCTTAAGAAGATTCAGGGATACAAGAGGAGGGAAGTCGAGAGACAA
GCTGCTAACGCTAAGGCGTTTGCTGAGGAGATGGTTCTTGAAGGAATCTTTATGCAGAGA
GGGATTTCTATAAACGCTGCTCGTAACTTGCTTGAAGGTGGGGCAGAGAAGGATGCAGAC
ATTATTTTTTAAAGTGTGAGGCTCTCTCGCTATTTATCTTTTGTTATTATTACTCTTTTC
ATAAGACTTCATGTTTTTACAAATAAAATGGATTTGATGTAGATGAAATACTGTATCATC
TTGGATTGTGCTTTGCTATAATTTTCCTTT*GAGAGATTTGTGATTGTTACTTTTTTGCG
TTACGATAAATGTAAAACGTTAC
CTTGCTT

QA 1 623 1 623
DS 

RD RS1GT53JQ 756 0 0
AGAACGTCAAAGAAGCTACGCTCAAATTCCGTTCAAGGCAAGAGAACATCGCTGGTGTGA
AGCTTCCGAAGTTTGATCACTTCTCTGAAGGCGAGACCAAGAATGACTTAACCGGTTTAG
CTAGAGGTGGTCAACAGGTCCAAGCTTGCCGTGTCGCTTATGTAAAAGCCATTGAGGTTC
TCGTTGAGCTTGCTTCTCTCCAGACTTCGTTCTTGACGCTTGATGAAGCAATCAAGACGA
CGAACCGCAGGGTCAACTTTCTGGAGAATGTGGTGAAACCGAAGATTGAGAATACCCTCA
GTTACATCAAGGGAGAGCTTGACGAGCTTGAGAGGGAAGATTTCTTCAGGCTTAAGAAGA
TTCAGGGATACAAGAGGAGGGAAGTCGAGAGACAAGCTGCTAACGCTAAGGCGTTTGCTG
AGGAGATGGTTCTTGAAGGAATCTCTATGCAGAGAGGGGTTTCTATAAACGCTGCTCGTA
ACTTGCTTGAAGGTGGGGCAGAGAAGGATGCAGACATTATTTTCTAAAGTGTGAGGCTCT
CTCGCTATTTATCTTTTGTTATTATTACTCTCTTCATAAGACTTCATGTTTCTACAAATA
AAATGGATTTGATGTAGATGAAATACTGTATCATCTTGGATTGTGCTTTGCTATAATTTT
CCTCT*GAGAGATTTGTGATTGTTACTCTTCTGCGTTATGATAAATGTAAAACGTTACCT
TGCTTATAGACCAACTTGTCTGGTATTGATTCTTGC

QA 1 756 1 756
DS 



AS 2 6

CO CL911Contig1 751 2 7 U
GGATAATATGGTAGCTATATAAGAATCAAGAGATCATCTTCTTCGAGCATCATCATCATC
ATCATCATCATCAGCGATTTCTCTGCCTCCATTCCGCGAAAACACTTTTCGACTCTCCCG
CCCCAATCCGATGGCTGCTACATCCGCCCCAAAATCCGTCCATGATTTCACCGTCAAGGA
TGCGAAGGGAAATGAGGTGGATCTAAGTAGTTACAAGGGGAAGGCTCTCTTGATTGTCAA
CGTTGCTTCTCAGTGTGGCTTGACCAATTCCAACTATACTGAGCTTGCCCAGCTCTATCA
GAAGTACAAGGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCATTCCCTTGTAACCAGTTTGGGAATCA
AGAACCTGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCTTGTACCCGTTTCAAGGCTGAGTA
CCCTATTTTCGACAAGGTTGATGTGAACGGTGACAAGGCTGCTCCGATCTACAAGTTTCT
CAAATCAAGCAAAGGCGGGCTTTTTGGAAGCGGCATCAAGTGGAACTTCTCCAAGTTCTT
GGTTGACAAAGATGGAAATGTCGTTGACCGCTACGCTCCGACCACTTCTCCTCTCAGCAT
CGAGAAGGACCTGAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTAAATAAAAAGAACAACGAAGAGG
GCATTACTCATTAGGAGTCAAATAAAAAGCTCATAGTATTGTATTTATCAATACTGTAAT
ATATCTCTTGAGTTCGCAAGTGTCTTTTGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RS1BV85TF U 1
AF RS1BE49TF U 47
BS 1 325 RS1BV85TF
BS 326 326 RS1BE49TF
BS 327 645 RS1BV85TF
BS 646 646 RS1BE49TF
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BS 676 751 RS1BV85TF

RD RS1BV85TF 751 0 0
GGATAATATGGTAGCTATATAAGAATCAAGAGATCATCTTCTTCGAGCATCATCATCATC
ATCATCATCATCAGCGATTTCTCTGCCTCCATTCCGCGAAAACACTTTTCGACTCTCCCG
CCCCAATCCGATGGCTGCTACATCCGCCCCAAAATCCGTCCATGATTTCACCGTCAAGGA
TGCGAAGGGAAATGAGGTGGATCTAAGTAGTTACAAGGGGAAGGCTCTCTTGATTGTCAA
CGTTGCTTCTCAGTGTGGCTTGACCAATTCCAACTATACTGAGCTTGCCCAGCTCTATCA
GAAGTACAAGGATCATGGGTTTGAGGTCCTTGCATTCCCTTGTAACCAGTTTGGGAATCA
AGAACCTGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCTTGTACCCGTTTCAAGGCTGAGTA
CCCTATTTTCGACAAGGTTGATGTGAACGGTGACAAGGCTGCTCCGATCTACAAGTTTCT
CAAATCAAGCAAAGGCGGGCTTTTTGGAAGCGGCATCAAGTGGAACTTCTCCAAGTTCTT
GGTTGACAAAGATGGAAATGTCGTTGACCGCTACGCTCCGACCACTTCTCCTCTCAGCAT
CGAGAAGGACCTGAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTAAATAAAA*GAACAACGAAGAGG
GCATTACTCATTAG*AGTCAAATAAAAAGCTCATAGTATTGTATTTATCAATACTGTAAT
ATATCTCTTGAGTTCGCAAGTGTCTTTTGGA

QA 1 751 1 751
DS 

RD RS1BE49TF 703 0 0
GG
ATCATCATCATCATCATCATCATCAGCGATTTCTCTGCCTCCATTCCGCGAAAACACTTT
TCGACTCTCCCGCCCCAATCCGATGGCTGCTACATCCGCCCCAAAATCCGTCCATGATTT
CACCGTCAAGGATGCGAAGGGAAATGAGGTGGATCTAAGTAGTTACAAGGGGAAGGCTCT
CTTGATTGTCAACGTTGCTTCTCAGTGTGGCTTGACCAATTCCAACTATACTGAGCTTGC
CCAGCTCTATCAGAAGTACAAGGATCATGGGTTTGAGATCCTTGCATTCCCTTGTAACCA
GTTTGGGAATCAAGAACCTGGTTCTAATGAAGAGATTGTTCAGTTTGCTTGTACCCGTTT
CAAGGCTGAGTACCCTATTTTCGACAAGGTTGATGTGAACGGTGACAAGGCTGCTCCGAT
CTACAAGTTTCTCAAATCAAGCAAAGGCGGGCTTTTTGGAAGCGGCATCAAGTGGAACTT
CTCCAAGTTCTTGGTTGACAAAGATGGAAATGTCGTTGACCGCTACGCTCCGACCACTTC
TCCTCTCAGCATCGAGAAGGACCTGAAGAAACTGTTGGGAGTTACTGCTAAATAAAAAGA
ACAACGAAGAGGGCATTACTCATTAGGAGTCAAATAAAAAGCTCATAGTATTGTATTTAT
CAATACTGTAATATATCTCTTGAGTTCGCAAGTGTCTTT
GG

QA 3 701 3 701
DS 



CO CL911Contig2 785 4 24 U
CTATAATATCCATCTTTATGAAAAGGAGAGCATATTACACATTATCCGTTAATACAAACG
AATTTAAGTGATAGGAAACAACTAATCCAAAAGACACTTGCGAACTCAAGAGATATATTA
CAGTATTGATAAATACAATACTATGAGCTTTTTATTTGACTCCTAATGAGTAATGCCCTC
TTCGTTGTTCTTTTTATTTAGCAGTAACTCCCAACAGTTTCTTCAGGTCCTTCTCGATGC
TGAGAGGAGAAGTGGTTGGAGCGTAGCGGTCAACTACATTTCCATCTTTGTCAACCAAGA
ACTTGGAGAAGTTCCACTTGATGCCGCTTCCAAAAAGCCCGCCTTTGCTTGATTTGAGAA
ACTTGTAGATTGGAGCAGCCTTGTCACCGTTCACATCAACCTTGTCGAAAATAGGGTACT
CAGCCTTGAAACGGGTACAAGCAAACTGAACAATCTCTTCATTAGAACCAGGTTCTTGAT
TCCCAAACTGGTTACAAGGGAATGCAAGGATCTCAAACCCATGATCTTTGTACTTGTGAT
AGAGCTGGGCAAGCTCAGTATAGTTGGAATTGGTCAAGCCACACTGAGAAGCAACGTTGA
CAATCAAGAGAACCTTCCCCTTGTAACTACTTAGATCCACCTCATTTCCCTTCGCATCCT
TGACGGTGAAATCATGGACGGATGTAGCAGCCATCGGACCTCGAAACTTAAGCTAATGGA
AGAGAAGGAATCCGATTATTGAGAGTCGAAAAGTGTTTTCGCAGAATGGAGACAGAGAAA
ATCGC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1H742JQB U 1
AF RS1BV85JQ U 3
AF RS1B248JQ U 20
AF RS1B248TF C 195
BS 1 60 RS1H742JQB
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BS 357 370 RS1H742JQB
BS 371 371 RS1B248JQ
BS 372 565 RS1H742JQB
BS 566 566 RS1BV85JQ
BS 567 661 RS1H742JQB
BS 662 663 RS1BV85JQ
BS 664 676 RS1B248JQ
BS 677 785 RS1B248TF

RD RS1H742JQB 661 0 0
CTATAATATCCATCTTTATGAAAAGGAGAGCATATTACACATTATCCGTTAATACAAACG
GATTTAAGTGATAGGAAACAACTAATCCAAAAGACAATTGCGAACTCAAGAGATATATTA
CAGTATTGATAAATACAATACTATCAGCTTTTTATTTGACTCCTAATGAGTAATGCCCTC
TTCGTTGTTCTTTTTATTTAGCAGTAACTCCCAACAGTTTCTTAAGGTCCTTCTCGATGC
TGAGAGGAGAAGTGGTCGGAGCGTAGCGGTCAACGACATTTCCATCTTTGTCAACCAAGA
ACTTGGAGAAGTTCCACTTGATGCCGCTTCCAAAAAGCCCGCCTTTGCCTGATTTCAGAA
ACTTGTAGATCGGAGCAGCCTTGTCACCGTTCACATCAACCTTGTCGAAAATAGGGTACT
CAGCCTTGAAACGGGTACAAGCAAACTGAACAATCTCTTCATTAGAACCAGGTTCTTGAT
TCCCAAACTGGTTACAAGGGAATGCAAGGATCTCAAACCCATGATCTTTGTACTTGTGAT
AGAGCTGGGCAAGCTCAGTATAGTTCGAATTGGTCAAGCCACACTGAGAAGCAACGTTGA
CAATCAAGAGAACCTTCCCCTTGTAACTACTTAGATCCACCTCATTTCCCTTCGCATCCT
T

QA 1 661 1 661
DS 

RD RS1BV85JQ 661 0 0
ATAATATCCATCTTTATGAAAAGGAGAGCATATTACACATTATCCGTTAATACAAACGAA
TTTAAGTGATAGGAAACAACTAATCCAAAAGACACTTGCGAACTCAAGAGATATATTACA
GTATTGATAAATACAATACTATGAGCTTTTTATTTGACTCCTAATGAGTAATGCCCTCTT
CGTTGTTCTTTTTATTTAGCAGTAACTCCCAACAGTTTCTTCAGGTCCTTCTCGATGCTG
AGAGGAGAAGTGGTCGGAGCGTAGCGGTCAACGACATTTCCATCTTTGTCAACCAAGAAC
TTGGAGAAGTTCCACTTGATGCCGCTTCCAAAAAGCCCGCCTTTGCTTGATTTGAGAAAC
TTGTAGATCGGAGCAGCCTTGTCACCGTTCACATCAACCTTGTCGAAAATAGGGTACTCA
GCCTTGAAACGGGTACAAGCAAACTGAACAATCTCTTCATTAGAACCAGGTTCTTGATTC
CCAAACTGGTTACAAGGGAATGCAAGGACCTCAAACCCATGATCCTTGTACTTCTGATAG
AGCTGGGCAAGCTCAGTATAGTTGGAATTGGTCAAGCCACACTGAGAAGCAACGTTGACA
ATCAAGAGAGCCTTCCCCTTGTAACTACTTAGATCCACCTCATTTCCCTTCGCATCCTTG
A

QA 1 661 1 661
DS 

RD RS1B248JQ 657 0 0
GAAAAGGAGAGCATATTACACATTATCCGTTAGTACAAACGAATTTAAGTGATAGGAAAC
AACTAATCCAAAAGACACTTGCGAACTCAAGAGATATATTACAGTATTGATAAATACAAT
ACTATGAGCTTTTTATTGGACTCCTAATGAGTAAAGGCGTCTTCGTTGTTCGTTTTA***
AGCAGTAACTCCCAACAGTTTCTTCAGGTCCTTCTCGATGCTGAGAGGAGAAGTGGTTGG
AGCGTAGCGGTCAACTACATTTCCATCTTTGTCAACCAAGAACTTGGAGAAGTTCCACTT
GATGCCGCTTCCAAAAAGCCCGCCTTTGCTTGATTTGAGAAACTTGTAGATTGGAGCAGC
CTTGTCACCGTTCACATCAACCTTGTCGAAAATAGGGTACTCAGCCTTGAAACGGGTACA
AGCAAACTGAACAATCTCTTCATTAGAACCAGGTTCTTGATTCCCAAACTGGTTACAAGG
GAATGCAAGGATCTCAAACCCATGATCTTTGTACTTGTGATAGAGCTGGGCAAGCTCAGT
ATAGTTGGAATTGGTCAAGCCACACTGAGAAGCAACGTTGACAATCAAGAGAACCTTCCC
CTTGTAACTACTTAGATCCACCTCATTTCCCTTCGCATCCTTGACGGTGAAATCATG

QA 1 657 1 657
DS 

RD RS1B248TF 591 0 0
TTTTA
AGCAGTAACTCCCAACAGTTTCTTCAGGTCCTTCTCGATGCTGAGAGGAGAAGTGGTTGG
AGCGTAGCGGTCAACTACATTTCCATCTTTGTCAACCAAGAACTTGGAGAAGTTCCACTT
GATGCCGCTTCCAAAAAGCCCGCCTTTGCTTGATTTGAGAAACTTGTAGATTGGAGCAGC
CTTGTCACCGTTCACATCAACCTTGTCGAAAATAGGGTACTCAGCCTTGAAACGGGTACA
AGCAAACTGAACAATCTCTTCATTAGAACCAGGTTCTTGATTCCCAAACTGGTTACAAGG
GAATGCAAGGATCTCAAACCCATGATCTTTGTACTTGTGATAGAGCTGGGCAAGCTCAGT
ATAGTTGGAATTGGTCAAGCCACACTGAGAAGCAACGTTGACAATCAAGAGAACCTTCCC
CTTGTAACTACTTAGATCCACCTCATTTCCCTTCGCATCCTTGACGGTGAAATCATGGAC
GGATGTAGCAGCCATCGGACCTCGAAACTTAAGCTAATGGAAGAGAAGGAATCCGATTAT
TGAGAGTCGAAAAGTGTTTTCGCAGAATGGAGACAGAGAAAATCGC

QA 6 591 6 591
DS 



AS 1 6

CO CL912Contig1 1183 6 34 U
GGCCCACAGATCTCCATCGCGATCGAGATCCAACGACCCAGATCCACTCCCTCTCCTTCT
TCCTCAAAAGAGAACAAAAAAAAAATATTCTGAATCTTCGAAAGGTCGATCGGGAGGAAA
CAAAAAAAAATCAACGGCCGATTCTGACGATTCATCTCCGCCGAGCAGATCTGTGAATTG
ATTCTCGTCTATTACTACTCATTCACGCGATGGCTGCTCCTCCTGCTAGAGCCCGTGCTG
ATTACGATTACCTCATCAAACTTCTCTTGATCGGAGACAGCGGTGTGGGTAAAAGTTGCC
TCCTTCTACGTTTCTCTGATGGCTCATTCACCACCAGTTTCATCACAACTATTGGTATTG
ATTTCAAGATACGGACTATTGAGCTAGATGGGAAGAGAATCAAGCTGCAAATCTGGGATA
CTGCTGGACAGGAGCGGTTCAGGACTATCACAACTGCATACTACCGTGGAGCCATGGGCA
TCTTGCTCGTGTATGATGTCACTGATGAATCATCTTTCAACAATATCAGGAATTGGATCC
GTAACATTGAGCAGCACGCTTCTGATAATGTCAACAAGATTCTTGTGGGGAACAAGGCTG
ATATGGATGAAAGCAAACGAGCTGTGCCAAAAGCGAAGGGTCAAGCTCTTGCAGATGAAT
ACGGAATGAAGTTTTTCGAGACTAGTGCCAAGACTAACCTAAACGTTGAGGAAGTTTTCT
TTTCAATTGGTAAAGACATTAAGCAAAGACTTGCAGATACCGATGCAAAGGCTGAGCCAC
AAACAATCAAAATCAACCAAACCGATCAGG*TGCAGG*ACATCTCAAGCTACTCAGAAAT
CAGCATGTTGTGGTTAGTAGAAAACTGGTCCCTCACACCACCATCGAAGGAGAGAATCTG
GCTTCTGAGAAAGAAAATCTTCTAAATGCGATGGTGTTTTCTACGTATTCTTTTTACAAT
TCTCTGTTTCCCCCTAACGGGTATAGTGTGAAGGACATATGTTTCTGGTATGGACTCCCT
CACATCAGACTTGACTTGTGATAATATCAGATTTTCTCACTCACACTCCAACCGCATCTT
TTTCTATTTGATCTTGCTGTGAAACTGGTACCACTTGTGATATTTGCAGCAACTGTTATG
AATTTGTATACACATGACCAAAAGAATGAAAATAATATTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FN64TF U 1
AF RS1FT20TF U 85
AF RS1EZ14TF U 92
AF RS1DS13TF U 110
AF RS1DS13JQ C 308
AF RS1FN64JQ C 825
BS 1 103 RS1FN64TF
BS 104 104 RS1FT20TF
BS 105 129 RS1FN64TF
BS 130 130 RS1FT20TF
BS 131 163 RS1FN64TF
BS 164 164 RS1FT20TF
BS 165 204 RS1FN64TF
BS 205 205 RS1FT20TF
BS 206 340 RS1FN64TF
BS 341 343 RS1FT20TF
BS 344 344 RS1DS13TF
BS 345 346 RS1FT20TF
BS 347 347 RS1DS13TF
BS 348 487 RS1FT20TF
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BS 585 640 RS1FT20TF
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BS 864 864 RS1DS13JQ
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BS 897 916 RS1DS13TF
BS 917 1062 RS1DS13JQ
BS 1063 1183 RS1FN64JQ

RD RS1FN64TF 340 0 0
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TCCTCAAAAGAGAACAAAAAAAAAATATTCTGAATCTTCGAAAAGTCGATCGGGAGGAAA
CAAAAAAAA*TCAACGGCCGATTCTGACGATTCATCTCCGCCGGGCAGATCTGTGAATTG
ATTCTCGTCTATTACTACTCATTCTCGCGATGGCTGCTCCTCCTGCTAGAGCCCGTGCTG
ATTACGATTACCTCATCAAACTTCTCTTGATCGGAGACAGCGGTGTGGGTAAAAGTTGCC
TCCTTCTACGTTTCTCTGATGGCTCATTCACCACCAGTTT

QA 1 340 1 340
DS 

RD RS1FT20TF 682 0 0
GGATTCTGA
ATCTTCGAAAGGTCGATCGGGAGGAAACAAAAAAAAATCAACGGCCGATTCTGACGATTC
ATCTCCGCCGAGCAGATCTGTGAATTGATTCTCGTCTATTACTACTCATTCACGCGATGG
CTGCTCCTCCTGCTAGAGCCCGTGCTGATTACGATTACCTCATCAAACTTCTCTTGATCG
GAGACAGCGGTGTGGGTAAAAGTTGCCTCCTTCTACGTTTCTCTGATGGCTCATTCACCA
CCAGTTTCATTACGACTATTGGTATTGATTTCAAGATACGGACTATTGAGCTAGATGGGA
AGAGAATCAAGCTGCAAATCTGGGATACTGCTGGACAGGAGCGGTTCAGGACTATCACAA
CTGCATACTACCGTGGAGCCATGGGCATCTTGCTTGTGTATGATGTCACTGATGAATCAT
CTTTCAACAATATCAGGAATTGGATCCGTAACATTGAGCAGCACGCTTCTGATAATGTCA
ACAAGATTCTGGTGGGGAACAAGGCTGATATGGATGAAAGCAAACGAGCTGTGCCAAAAG
CGAAGGGCCAAGCTCTTGCAGATGAATACGGAATGAAGTTTTTCGAGACTAGTGCCAAGA
CTAACCTAAACGTTGAGGAAGTTTTCTTTTCAATTGGTAAAGACATTAAGCAAAGACTTG
CAGATACCGATGC

QA 10 682 10 682
DS 

RD RS1EZ14TF 750 0 0
GG
ATCTTCGAAAGGTCGATCGGGAGGAAACAAAAAAAAATCAACGGCCGATTCTGACGATTC
ATCTCCGCCGAGCAGATCTGTGAATTGATTCTCGTCTATTACTACTCATTCACGCGATGG
CTGCTCCTCCTGCTAGAGCCCGTGCTGATTACGATTACCTCATCAAACTTCTCTTGATCG
GAGACAGCGGTGTGGGTAAAAGTTGCCTCCTTCTACGTTTCTCTGATGGCTCATTCACCA
CCAGTTTCATTACGACTATTGGTATTGATTTCAAGATACGGACTATTGAGCTAGATGGGA
AGAGAATCAAGCTGCAAATCTGGGATACTGCTGGACAGGAGCGGTTCAGGACTATCACAA
CTGCATACTACCGTGGAGCCATGGGCATCTTGCTTGTGTATGATGTCACTGATGAATCAT
CTTTCAACAATATCAGGAATTGGATCCGTAACATTGAGCAGCACGCTTCTGATAATGTCA
ACAAGATTCTGGTGGGGAACAAGGCTGATATGGATGAAAGCAAACGAGCTGTGCCAAAAG
CGAAGGGCCAAGCTCTTGCAGATGAGTACGGAATGAAGTTTTTCGAGACTAGTGCCAAGG
CTAACCTAAACGTTGAG*AAGTTTTCTTTTCA*TTGGTAAAGACATTAAGCAAAGACTTG
CAGATACCGATGCAAAG*CTGAGCCACAAACAATCAAA*TCAACCAAACCGATCAGG*TG
CAGG*ACATCTCAAGCTACTCAGAAATC

QA 3 750 3 750
DS 

RD RS1DS13TF 823 0 0
GG
GGGAGGAAACAAAAAAAAATCAACGGCCGATTCTGACGATTCATCTCCGCCGAGCAGATC
TGTGAATTGATTCTCGTCTATTACTACTCATTCTCGCGATGGCTGCTCCTCCTGCTAGAG
CCCGTGCTGATTACGATTACCTCATCAAACTTCTCTTGATCGGAGACAGCGGTGTGGGTA
AAAGTTGCCTCCTTCTACGTTTCTCTGATGGCTCATTCACCACCAGTTTCATCACAACTA
TTGGTATTGATTTCAAGATACGGACTATTGAGCTAGATGGGAAGAGAATCAAGCTGCAAA
TCTGGGATACTGCTGGACAGGAGCGGTTCAGGACTATCACAACTGCATACTACCGTGGAG
CCATGGGCATCTTGCTCGTGTATGATGTCACTGATGAATCATCTTTCAACAATATCAGGA
ATTGGATCCGTAACATTGAGCAGCACGCTTCTGATAATGTCAACAAGATTCTTGTGGGGA
ACAAGGCTGATATGGATGAAAGCAAACGAGCTGTGCCAAAAGCGAAGGGTCAAGCTCTTG
CAGATGAATACGGAATGAAGTTTTTCGAGACTAGTGCCAAGACTAACCTAAACGTTGAGG
AAGTTTTCTTTTCAATTGGTAAAGACATTAAGCAAAGACTTGCAGATACCGATGCAAAGG
CTGAGCCACAAACAATCAAAATCAACCAAACCGATCAGG*TGCAGG*ACATCTCAAGCTA
CTCAGAAATCAGCATGTTGTGGTTAGTAGAAA*CTGGTCCCTCACACCACCATCGAAG*A
GAGA*TCTGGCTTCTGAGAAAGAAA
TCTTCTAATGCGATGG

QA 3 807 3 807
DS 

RD RS1DS13JQ 757 0 0
ACGTTTCTCTGATGGCTCATTCACCACCAGTTTCATCACAACTATTGGTATTGATTTCAA
GATACGGACTATTGAGCTAGATGGGAAGAGAATCAAGCTGCAAATCTGGGATACTGCTGG
ACAGGAGCGGTTCAGGACTATCACAACTGCATACTACCGTGGAGCCATGGGCATCTTGCT
CGTGTATGATGTCACTGATGAATCATCTTTCAACAATATCAGGAATTGGATCCGTAACAT
TGAGCAGCACGCTTCTGATAATGTCAACAAGATTCTTGTGGGGAACAAGGCTGATATGGA
TGAAAGCAAACGAGCTGTGCCAAAAGCGAAGGGTCAAGCTCTTGCAGATGAATACGGAAT
GAAGTTTTTCGAGACTAGTGCCAAGACTAACCTAAACGTTGAGGAAGTTTTCTTTTCAAT
TGGTAAAGACATTAAGCAAAGACTTGCAGATACCGATGCAAAGGCTGAGCCACAAACAAT
CAAAATCAACCAAACCGATCAGGGTGCAGGGACATCTCAAGCTACTCAGAAATCAGCATG
TTGTGGTTAGTAGAAAACTGGTCCCTCACACCACCATCGAAGGAGAGAATCTGGCTTCTG
AGAAAGAAAATCTTCTAAATGCGATGGTGTTTTCTACGTATTCTTTTTACAATTCTCTGT
TTCCCCCTAACGGGTATAGTGTGAAGGACATATGTTTCTGGTATGGACTCCCTCACATCA
GACTTGACTTGTGATAATATCAGATTTTCTCACTC
AC

QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1FN64JQ 359 0 0
CAAGCTACTCAGAAATCAGCATGTTGTGGTTAGTAGAAAACTGGTCCCTCACACCACCAT
CGAAGGAGAGAATCTGGCTTCTGAGAAAGAAAATCTTCTAAATGCGATGGTGTTTTCTAC
GTATTCTTTTTACAATTCTCTGTTTCCCCCTAACGGGTATAGTGTGAAGGACATATGTTT
TTGGTATGGACTCCCTCACATCAGACTTGACTTGTGATAATATCAGATTTTCTCACTCAC
ACTCCAACCGCATCTTTTTCTATTTGATCTTGCTGTGAAACTGGTACCACTTGTGATATT
TGCAGCAACTGTTATGAATTTGTATACACATGACCAAAAGAATGAAAATAATATTTGGC

QA 1 359 1 359
DS 



AS 1 6

CO CL913Contig1 959 6 8 U
AAAACAAGTTGTGTGTGAATTTCTCATATAATAATCGAAATGTATCATTTATGTGATCAT
GAACATAAAAAAGTTGAGGAGATATAAAAGATGGACAAGAAGGATTTCCTTTCATCTTTG
AAGAACTTCACTCTCATCGCTACATCAAGAATAAATGATCTATCTCTCTCTCCCTCCCTC
CTTGAGATACAAGTTGAGTGAATGGATGGATGTTTAGGATTTTGCAGATCTCCCTGTTGA
ATTTTTGTTTAGCTGCAATGCACGTGCAACGGAAGGTAGCCATTTCTCTCCTCTTACTTT
CTTCAGTTCAGCGACTCTCTCTTCTTCTTTCTTGGCTTTAGCTTTAGCAGCCGCCTCTTT
AGCCTCTAGTCTAGCTGAGGCTTTCTTAGCTGCTTCCACAGCAGCAGACAATACATCCGA
CCCGTCAACAGCAATGGATTTTATTCGTTTCTTAAACTCTTTAGAGCTTGCTTCAAGTCC
TCTAGAAGGGTGTAAATTAGGCTTCTTCTTAGGTCCTTGAAGCTCATCTACGTGATCAAA
GACTATGCCAGTTGAACAGCGCTTAAACAGCCGAACTCCACAGTCATTCTCGGGTTCTTC
ATCATCTTGGGGAACAAGAGTGAGAGTAGGATCTTTCACAAAGTCTAAAGTATTCTCCAC
CATCTCATTCAATAGCTTCTTCACCTTGATTTGGGCATGTGTTAGCTTTTTAGGTTTGAC
TCGAAACTCTCCAGCTTCGTTTTGCTGAGTAGCAGCTGCGGCGGCTGCTTTCGTGGCGGA
GGCGGCGTAAGCTGTGGTGGTGACTATGGAATTGATGGCGGCTTTCCACTTGGGATCATC
TTCCTCTTCGCTGCTGCTGTCTCCTCCCCTGTCACCCATTCTTATTTTCTCTTTCTCTCT
GTCTCGGCCAACTTTTTGAACTCTCCGGCAGAACAAAGGGTCGACGAGGGTTTAATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 10 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G316JQ U 1
AF RS1GW58JQ U 13
AF RS1E249JQ U 11
AF RS1G316TF C 178
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BS 1 80 RS1G316JQ
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CTTGAGATACAAGTTGAGTGAATGGATGGATGTTTAGGATTTTGCAGATCTCCCTGTTGA
ATTTTTGTTTAGCTGCAATGCACGTGCAACGGAAGGTAGCC

QA 1 281 1 281
DS 

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TAAATTAGGCTTCTT

QA 1 495 1 495
DS 

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GT
GTGTGAATTTCTCATATAATAATCGAAATGTATCATTTATGTGATCATGAACATAAAAAA
GTTGAGGAGATATAAAAGATGGACAAGAAGGATTTCCTTTCATCTTTGAAGAACCTCACT
CTCATCGCTACATCAAGAATAAATGATCTATCTCTCTCTCCCTCCCTCCTTGAGATACAA
GTTGAGTGAATGGATGGACGTTTAGGATTTTGCAGATCTCCCTGTTGAATTTTTGTTTAG
CTGCAATGCACGTGCAACGGAAGGTAGCCATTTCTCTCCTCTTACTTTCTTCAGTTCAGC
GACTCTCTCTTCTTCTTTCTTGGCTTTAGCTTTAGCAGCCGCCTCTTTAGCCTCTAGTCT
AGCTGAGGCTTTCTTAGCTGCTTCCACAGCAGCAGACAATACATCCGACCCGTCAACAGC
AATGGATTTTATTCGTTTCTTAAACTCTTTAGAGCTTGCTTCAAGTCCTCTAGAAGGGTG
TAAATTAGGCTTCTTCTTAGGTCCTTGAAGCTCATCTACGTGATCAAAGACTATGCCAGT
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AACAAGAGTGAGAGTAGGATCTTTCACAAAGTCTAAAGTATTCTCCACCATCTCATTCAA
TAGCTTCTTCACCTTGATTTGGGCATGTGTTAGCTTT

QA 3 699 3 699
DS 

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TGAATTTT*GTTTAGCTGCAATGCACGTGCAACGGAAGGTAGCCATTTCTCTCCTCTTAC
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TTTAGCCTCTAGTCTAGCTGAGGCTTTCTTAGCTGCTTCCACAGCAGCAGACAATACATC
CGACCTGTCAACAGCAATGGATTTTATTCGTTTCTTAAACTCTTTAGAGCTTGCTTCAAG
TCCTCTAGAAGGGTGTAAATTAGGCTTCTTCTTAGGTCCTTGAAGCTCATCTACGTGATC
AAAGACTATGCCAGTTGAACAGCGCTTAAACAGCCGAACTCCACAGTCATTCTCGGGTTC
TTCATCATCTTGGGGAACAAGAGTGAGAGTAGGATCTTTCACAAAGTCTAAAGTATTCTC
CACCATCTCATTCAATAGCTTCTTCACCTTGATTTGGGCATGTGTTAGCTTTTTAGGTTT
GACTCGAAACTCTCCAGCTTCGTTTTGCTGAGTAGCAGCTGCGGCGGCTGCTTTCGTGGC
GGAGGCGGCGTAAGCTGTGGTGGTGACTATGGAATTGATGGCGGCTTTCCACTTGGGATC
ATCTTCCTCTTCGCTGCTGCTGTCTCCTCCCCTGTCACCCATTCTTATTTTCTCTTTCTC
TCTGTCTCGGCCAACTTTTTGAACTCTCC
C

QA 1 749 1 749
DS 

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TGTTGAATTTTG
TTAGCTGCAATGCACGTGCAACGGAAGGTAGCCATTTCTCTCCTCTTACTTTCTTCAGT*
CAGCGACTCTCTCTTCTTCTTTCTTGGCTTTAGCTTTAGCAGCCGCCTCTTTAGCCTCTA
GTCTAGCTGAGGCTTTCTTAGCTGCTTCCACAGCAGCAGACAATACATCCGACCCGTCAA
CAGCAATGGATTTTATTCGTTTCTTAAACTCTTTAGAGCTTGCTTCAAGTCCTCTAGAAG
GGTGTAAATTAGGCTTCTTCTTAGGTCCTTGAAGCTCATCTACGTGATCAAAGACTATGC
CAGTTGAACAGCGCTTAAACAGCCGAACTCCACAGTCATTCTCGGGTTCTTCATCATCTT
GGGGAACAAGAGTGAGAGTAGGATCTTTCACAAAGTCTAAAGTATTCTCCACCATCTCAT
TCAATAGCTTCTTCACCTTGATTTGGGCATGTGTTAGCTTTTTAGGTTTGACTCGAAACT
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CGCTGCTGCTGTCTCCTCCCCTGTCACCCATTCTTATTTTCTCTTTCTCTCTGTCTCGGC
CAACTTTTTGAACTCTCCGGCAGAACAAAGGGTCGACGAGGGTTTAATTCC

QA 13 723 13 723
DS 

RD RS1GW58TF 433 0 0
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TTCACAAAGTCTAAAGTATTCTCCACCATCTCATTCAATAGCTTCTTCACCTTGATTTGG
GCATGTGTTAGCTTTTTAGGTTTGACTCGAAACCCTCCAGCTTCGTTTTGCTGAGTAGCA
GCTGCGGCGGCTGCTTTCGTGGCGGAGGCGGCGTAAGCTGTGGTGGTGACTATGGAATTG
ATGGCGGCTTTCCACTTGGGATCATCTTCCTCTTCGCTGCTGCTGTCTCCTCCCCTGTCA
CCCATTCTTATTTTCTCTTTCTCTCTGTCTCGGCCAACTTTTTGAACTCTCCGGCAGAAC
AAAGGGTCGAC
CC

QA 1 431 1 431
DS 



AS 1 7

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GTTCGATTCTCCAGCGACGATGCTAAGCGACGATTTCACGGCGAAACGAGCTGCGACTGA
GGAGGAATCGGACTCTTCTGTGTCGAAAAAGCAGAAGTTGGAAGATGAAGACGACGACGA
CGACACAAGCATGGAAGAGGATAGCGATACCGACAGCGGACGCGCATGGTCTGTCGACAC
TGAAGAAGAAGACGAAGGAGTGGTGAGATCTCCTAGGATTAATTACTTAAACTTCCCAGA
ACCGGAACCGGAGTGGGATAAGGATAGCTTCGATGGTTACGAGTTCTACGACCCTGAGGA
CCGTAAAAGCTTCTCTGACGAAGAGGAGTACAAAGTGTTCCGCGACTTTAAGATCCAGGC
CTGGAAGAATCGGGGTTTTTATGAACAAGATCCCTTCAGGTCCATCTTCCCCCTTACTGA
TCTGGAAGAACCTTGGATTGACATGACCACAAGGGAATATTTGGAGTCTATTGCCTCCTT
ATGTGTTAAGAAACTCAACGAGGAGAAGAATAAGACCGTGGAATTGGTAAGCATCGTTAG
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TACCAATGGTCCTCTCGTGGAGTATCAAGCCAAGGCTATGGATTTTGGAGCAAAACCTCC
CTTTCCCATCCTCTGCCGACCAGCTTCTCCCAAATCCTAATCTGTGACCTGCATAGATTT
GGTATGCTGGTGGTAGTCTACGAGGAAGACCAAGATCATAATGTATTAAAATGAGTCTTT
TATGATTAAGCCGAGTCCCAGATGGATTTAGGTTGTATTAATGTTATCTATGTCTTTTGC
GTTGAGACTTATGGATTTAATATTATGGATCTTAATGATGGTTGTTATATTATGTTTGAT
GTTTATTCT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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35 15 15 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 35 5 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1D448TF U 35
AF RS1FI41TF U 1
AF RS1BB30TF U 2
AF RS1EX71TF U 1
AF RS1BB30JQ C 72
AF RS1D448JQ C 352
AF RS1FI41JQ C 381
BS 1 316 RS1EX71TF
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BS 695 695 RS1BB30TF
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BS 787 947 RS1BB30JQ
BS 948 969 RS1D448JQ

RD RS1D448TF 422 0 0
GG
GAGAGAGAGAGATATCTAGGGTTTGTTCGATTCTCCAGCGACGATGCTAAGCGACGATTT
CACGGCGAAACGAGCTGCGACTGAGGAGGAATCGGACTCTTCTGTGTCGAAAAAGCAGAA
GTTGGAAGATGAAGACGACGACGACGACACAAGCATGGAAGAGGATAGCGATACCGACAG
CGGACGCGCATGGTCTGTCGACACTGAAGAAGAAGACGAAGGAGTGGTGAGATCTCCTAG
GATTAATTACTTAAACTTCCCAGAACCGGAACCGGAGTGGGATAAGGATAGCTTCGATGG
TTACGAGTTCTACGACCCTGAGGACCGTAAAAGCTTCTCTGACGAAGAGGAGTACAAAGT
GTTCCGCGACTTTAAGATCCAGGCCTGGAAGAATCGGGGTTTTTATGAACAAGATCCCTT

QA 3 422 3 422
DS 

RD RS1FI41TF 615 0 0
G
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TTCGATTCTCCAGCGACGATGCTAAGCGACGATTTCACGGCGAAACGAGCTGCGACTGAG
GAGGAATCGGACTCTTCTGTGTCGAAAAAGCAGAAGTTGTAAGATGAAGACGACGACGAC
GACACAAGCATGGAAGAGGATAGCGATACCGACAGCGGACGCGCATGGTCTGTCGACACT
GAAGAAGAAGACGAAGGAGTGGTGAGATCTCCTAGGATTAATTACTTAAACTTCCCAGAA
CCGGAACCGGAGTGGGATAAGGATAGCTTCGATGGTTACGAGTTCTACGACCCTGAGGAC
CGTAAAAGCTTCTCTGACGAAGAGGAGTACAAAGTGTTCCGCGACTTTAAGATCCAGGCC
TGGAAGAATCGGGGTTTTTATGAACAAGATCCCTTCAGGTCCATCTTCCCCCTTACTGAT
CTGGAAGAACCTTGGATTGACATGACCACAAGGGAATATTTGGAGTCTATTGCCTCCTTA
TGTGTTAAGAAACTCAACGAGGAGAAGAATAAGACCGTGGAATTGGTAAGCATCGTTAGA
GGCAATATGAAAGT

QA 2 615 2 615
DS 

RD RS1BB30TF 784 0 0
GATTGTCATATCTGCTCCGTTCCCAATTGTGTGTCGAGAGAGAGAGATATCTAGGGTTTG
TTCGATTCTCCAGCGACGATGCTAAGCGACGATTTCACGGCGAAACGAGCTGCGACTGAG
GAGGAATCGGACTCTTCTGTGTCGAAAAAGCAGAAGTTGGAAGATGAAGACGACGACGAC
GACACAAGCATGGAAGAGGATAGCGATACCGACAGCGGACGCGCATGGTCTGTCGACACT
GAAGAAGAAGACGAAGGAGTGGTGAGATCTCCTAGGATTAATTACTTAAACTTCCCAGAA
CCGGAACCGGAGTGGGATAAGGATAGCTTCGATGGTTACGAGTTCTACGACCCTGAGGAC
CGTAAAAGCTTCTCTGACGAAGAGGAGTACAAAGTGTTCCGCGACTTTAAGATCCAGGCC
TGGAAGAATCGGGGTTTTTATGAACAAGATCCCTTCAGGTCCATCTTCCCCCTTACTGAT
CTGGAAGAACCTTGGATTGACATGACCACAAGGGAATATTTGGAGTCTATTGCCTCCTTA
TGTGTTAAGAAACTCAACGAGGAGAAGAATAAGACCGTGGAATTGGTAAGCATCGTTAGA
GGCAATATGAAAGTAGGAGATGGTTGGAAGCTGTACATCACCTTTATGGCTCGAGAGTAT
ACCAATGGTCCTCTCGTGGAGTATCAAGCCAAGGCTATGGATTTTGGAGCAAA*CCTCCC
TTTCCCATCCTCTGCCGACCAGCT*CTCCCAA*TCCTAATCTGTGACCTGCATAGATT
GGTATG

QA 1 778 1 778
DS 

RD RS1EX71TF 786 0 0
GGATTGTCATATCTGCTCCGTTCCCAATTGTGTGTCGAGAGAGAGAGATATCTAGGGTTT
GTTCGATTCTCCAGCGACGATGCTAAGCGACGATTTCACGGCGAAACGAGCTGCGACTGA
GGAGGAATCGGACTCTTCTGTGTCGAAAAAGCAGAAGTTGGAAGATGAAGACGACGACGA
CGACACAAGCATGGAAGAGGATAGCGATACCGACAGCGGACGCGCATGGTCTGTCGACAC
TGAAGAAGAAGACGAAGGAGTGGTGAGATCTCCTAGGATTAATTACTTAAACTTCCCAGA
ACCGGAACCGGAGTGGAATAAGGATAGCTTCGATGGTTACGAGTTCTACGACCCTGAGGA
CCGTAAAAGCTTCTCTGACGAAGAGGAGTACAAAGTGTTCCGCGACTTTAAGATCCAGGC
CTGGAAGAATCGGGGTTTTTATGAACAAGATCCCTTCAGGTCCATCTTCCCCCTTACTGA
TCTGGAAGAACCTTGGATTGACATGACCACAAGGGAATATTTGGAGTCTATTGCCTCCTT
ATGTGTTAAGAAACTCAACGAGGAGAAGAATAAGACCGTGGAATTGGTAAGCATCGTTAG
AGGCAATATGAAAGTAGGAGATGGTTGGAAGCTGTACATCACCTTTATGGCTCGAGAGTA
TACCAATGGTCCTCTCGTGGAGTATCAAGCCAAG*CTATGGATTTTGGAGCAAA*CCTCC
CTTTCCCA*CCTCTGCCGACAGCTT*CTCCCAAATCCTAATCTGTGACCTGCATAGATTT
GGTATG

QA 1 786 1 786
DS 

RD RS1BB30JQ 877 0 0
CAGCGACGATGCTAAGCGACGATT*CACGGCGAA*CGAGCTGCGACTGAGA**GAATCGG
ACTCTTCTGTGTCGAAAA*GCAGAAGTTGGAAGATGAAGACGACGACGACGACACAAGCA
TGGAAGAGGATAGCGATACCGACAGCGGACGCGCATGGTCTGTCGACACTGAAGAAGAAG
ACGAAGGAGTGGTGAGATCTCCTAGGATTAATTACTTAAACTTCCCAGAACCGGAACCGG
AGTGGGATAAGGATAGCTTCGATGGTTACGAGTTCTACGACCCTGAGGACCGTAAAAGCT
TCTCTGACGAAGAGGAGTACAAAGTGTTCCGCGACTTTAAGATCCAGGCCTGGAAGAATC
GGGGTTTTTATGAACAAGATCCCTTCAGGTCCATCTTCCCCCTTACTGATCTGGAAGAAC
CTTGGATTGACATGACCACAAGGGAATATTTGGAGTCTATTGCCTCCTTATGTGTTAAGA
AACTCAACGAGGAGAAGAATAAGACCGTGGAATTGGTAAGCATCGTTAGAGGCAATATGA
AAGTAGGAGATGGTTGGAAGCTGTACATCACCTTTATGGCTCGAGAGTATACCAATGGTC
CTCTCGTGGAGTATCAAGCCAAGGCTATGGATTTTGGAGCAAAACCTCCCTTTCCCATCC
TCTGCCGACCAGCTTCTCCCAAATCCTAATCTGTGACCTGCATAGATTTGGTATGCTGGT
GGTAGTCTACGAGGAAGACCAAGATCATAATGTATTAAAATGAGTCTTTTATGATTAAGC
CGAGTCCCAGATGGATTTAGGTTGTATTAATGTTATCTATGTCTTTTGCGTTGAGACTTA
TGGATTTAATATTATGGATCTTAATGATGGTTGTTA
C

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DS 

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CCCTGAGGACCGTAAAAGCTTCTCTGACGAAGAGGAGTACAAAGTGTTCCGCGACTTTAA
GATCCAGGCCTGGAAGAATCGGGGTTTTTATGAACAAGATCCCTTCAGGTCCATCTTCCC
CCTTACTGATCTGGAAGAACCTTGGATTGACATGACCACAAGGGAATATTTGGAGTCTAT
TGCCTCCTTATGTGTTAAGAAACTCAACGAGGAGAAGAATAAGACCGTGGAATTGGTAAG
CATCGTTAGAGGCAATATGAAAGTAGGAGATGGTTGGAAGCTGTACATCACCTTTATGGC
TCGAGAGTATACCAATGGTCCTCTCGTGGAGTATCAAGCCAAGGCTATGGATTTTGGAGC
AAAACCTCCCTTTCCCATCCTCTGCCGACCAGCTTCTCCCAAATCCTAATCTGTGACCTG
CATAGATTTGGTATGCTGGTGGTAGTCTACGAGGAAGACCAAGATCATAATGTATTAAAA
TGAGTCTTTTATGATTAAGCCGAGTCCCAGATGGATTTAGGTTGTATTAATGTTATCTAT
GTCTTTTGCGTTGAGACTTATGGATTTAATATTATGGATCTTAATGATGGTTGTTATATT
ATGTTTGATGTTTATTCT

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DS 

RD RS1FI41JQ 589 0 0
AAGAGGAGTACAAAGTGTTCCGCGACTTTAAGATCCAGGCCTGGAAGAATCGGGGTTTTT
ATGAACAAGATCCCTTCAGGTCCATCTTCCCCCTTACTGATCTGGAAGAACCTTGGATTG
ACATGACCACAAGGGAATATTTGGAGTCTATTGCCTCCTTATGTGTTAAGAAACTCAACG
AGGAGAAGAATAAGACCGTGGAATTGGTAAGCATCGTTAGAGGCAATATGAAAGTAGGAG
ATGGTTGGAAGCTGTACATCACCTTTATGGCTCGAGAGTATACCAATGGTCCTCTCGTGG
AGTATCAAGCCAAGGCTATGGATTTTGGAGCAAAACCTCCCTTTCCCATCCTTTGCCGAC
CAGCTTTTCCCAAATCCTAATCTGTGACCTGCATAGATTTGGTATGCTGGTGGTAGTTTA
CGAGGAAGACCAAGATCATAATGTATTAAAATGAGTCTTTTATGATTAAGCCGAGTCCCA
GATGGATTTAGGTTGTATTAATGTTATCTATGTCTTTTGCGTTGAGACTTATGGATTTAA
TATTATGGATCTTAATGATGGTTGTTATATTATGTTTGATGTTTATT
TT

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 6

CO CL915Contig1 1838 6 15 U
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TTATCTCCGCCGTCTTCAGCTCACCGGCGCATTGGTTGAAATGGCTGGTCCAAGTGGAAA
GAAAGAGAGTGGAAAGAAAGAGAAGGTAGACAAGGCAGGTCCAAGTGGCGGTGGAAAGAA
GAAGAAGGACGTCAAGAAGGAAACAGGTCTCGGCCTCAGCGTTAAGAAGGATGAGAACTT
CGGTGAATGGTACTCTGAGGTTTGTAAGCACGAGATGATCGAGTACTACGATATCTCTGG
ATGTTACATCCTTAGGCCATGGTCTATGGCCATTTGGGAGATTATGCAAACTTTCTTTGA
TGCTGAAATCAAGAAGATGAAGGTGAAGAATTGCTACTTCCCTCTCTTTGTATCTCCTGG
TGTCCTCGAGAAGGAGAAGGACCACATTGAGGGTTTCGCTCCTGAGGTTGCTTGGGTTAC
GAAATCTGGCAAATCTGACTTGGAAGTCCCGATTGCTATTCGTCCTACCAGTGAGACTGT
GATGTACCCTTACTACAGCAAGTGGATTAGGGGCCACCGTGACTTGCCTTTGAAGCTTAA
CCAGTGGTGCAATGTTGTCAGATGGGAGTTCAGCAACCCTACCCCATTTATCCGGAGCCG
TGAGTTCCTTTGGCAGGAAGGGCACACTGCTTTCGCCACTAAAGAAGAAGCTGATAAAGA
GGTCCTTGAAATTTTGGAGCTTTACCGTCGCATATATGAAGAGTATCTCGCAGTCCCAGT
TGTGAAAGGTATGAATAGTGAAAACGAAAAGTTTGCTGGGGGACTTTACACTACAAGTGT
GGAGGCTTTCATTCCAAACACGGGTCGTGGTGTACAAGGTGCAACTTCTCATTGTTTGGG
ACAAAACTTTGCGAAGATGTTTGAGATCAACTTTGAGAATGAGAAAGGAGAGACTGAAAT
GGTGTGGCAGAATTCTTGGGCCTACAGTACCAGGACGATTGGAGTAATGATTATGACTCA
TGGAGATGACAAAGGCCTGATACTTCCTCCTAAAGTCGCATCTGTGCAAGTTGCGGTGAT
CCCTGTGCCCTACAAAGATGCTAATACACAAGGAATTTTTGATGCTTGTACTGCTACCGT
ATCTGCTTTGAGTGAAGCCGGTATTCGTGCAGAAGAAGATTTAAGGGATAACTACTCTCC
AGGATGGAAGTATTCAAACTGGGAAATGAAGGGTGTCCCCTTGAGAATTGAGATTGGACC
CCGAGATCTGGAAAATGATCAGGTCAGAACTGTGAGAAGGGACAACGGAGCAAAGGAAGA
TATCCCAAGAGGTTCCTTAGTGGAACATGTTAAGGAACTGCTTGAGAAGATCCAGGAGAA
CATGTACGAAGTGGCGAAGGCAAAGAGGGAAGCTTGTGTTGAAGAAATTAAGACTTGGGA
CGAGTTTATCGTAGCTCTCAACAAGAAGAAACTCATCTTAGCTCCCTGGTGCGATGAGGA
GGAAGTGGAGAGAGATGTCAAGGCACGTACTAAAGGTGAAACTGGAGCAGCGAAAACCCT
CTGTTCTCCATTTGAGCAGCCAGAGCTCCCTGAAGGTACTCTCTGCTTTGCATCTGGAAA
GCCTGCCAAGAAATGGACCTATTGGGGCAGGAGTTACTAAGTGTTCACCATGTTTTCGTT
CAGTTCATGAAATTTACTTTTGTAAAGACTCTCAAGTTCGTTGTGTTTTGATTTGATATT
TTGACTGAAAGCTATTTCAATTTTATAACTGTGTGTGATTGCACTATGAACAACTACAGA
ATGATGTTTTTGTTTCAAAAGAACTGTTAAGAAAAAAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RS1BP13TF U 1
AF RS1BR17TF U 494
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TTATCTCCGCCGTCTTCAGCTCACCGGCGCATTGGTTGAAATGGCTGGTCCAAGTGGAAA
GAAAGAGAGTGGAAAGAAAGAGAAGGTAGACAAGGCAGGTCCAAGTGGCGGTGGAAAGAA
GAAGAAGGACGTCAAGAAGGAAACAGGTCTCGGCCTCAGCGTTAAGAAGGATGAGAACTT
CGGTGAATGGTACTCTGAGGTTTGTAAGCACGAGATGATCGAGTACTACGATATCTCTGG
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TGCTGAAATCAAGAAGATGAAGGTGAAGAATTGCTACTTCCCTCTCTTTGTATCTCCTGG
TGTCCTCGAGAAGGAGAAGGACCACATTGAGGGTTTCGCTCCTGAGGTTGCTTGGGTTAC
GAAATCTGGCAAATCTGACTTGGAAGTCCCGATTGCTATTCGTCCTACCAGTGAGACTGT
GATGTACCCTTACTACAGCAAGTGGAT*AGGGGCCACCGTGACTTGCCTTTGAAGCTTAA
CCAGTGGTGCAATGTTGTCAGATGGGAGTTCAGCAACCCTACCCCATTT

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DS 

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TACAGCAAGTGGATTAGGGGCCACCGTGACTTGCCTTTGAAGCTTAACCAGTGGTGCAAT
GTTGTCAGATGGGAGTTCAGCAACCCTACCCCATTTATCCGGAGCCGTGAGTTCCTTTGG
CAGGAAGGGCACACTGCTTTCGCCACTAAAGAAGAAGCTGATAAAGAGGTCCTTGAAATT
TTGGAGCTTTACCGTCGCATATATGAAGAGTATCTCGCAGTCCCAGTTGTGAAAGGTATG
AATAGTGAAAACGAAAAGTTTGCTGGGGGACTTTACACTACAAGTGTGGAGGCTTTCATT
CCAAACACGGGTCGTGGTGTACAAGGTGCAACTTCTCATTGTTTGGGACAAAACTTTGCG
AAGATGTTTGAGATCAACTTTGAGAATGAGAAAGGAGAGACTGAAATGGTGTGGCAGAAT
TCTTGGGCCTACAGTACCAGGACGATTGGAGTAATGATTATGACTCATGGAGATGACAAA
GGCCTGATACTTCCTCCTAAAGTCGCATCTGTGCAAGTTGCGGTGATCCCTGTGCCCTAC
AAAGATGCTAATACACAAG*AATTTTTGATGCTTGTACTGCTACCGTATCTGCTTTGAGT
GAA

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DS 

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GGAT
AATGAGAAAGGAGAGACTGAAATGGTGTGGCAGAATTCTTGGGCCTACAGTAC*AGGACG
ATTGGAGTAATGATTATGACTCATGGAGATGACAAAGGCCTGATACTTCCTCCTAAAGTC
GCATCTGTGCAAGTTGTGGTGATCCCTGTGCCCTACAAAGATGCTAATACACAAGGAATT
TTTGATGCTTGTACTGCTACCGTATCTGCTTTGAGTGAAGCCGGTATTCGTGCAGAAGAA
GATTTAAGGGATAACTACTCTCCAGGATGGAAGTATTCAAACTGGGAAATGAAGGGTGTC
CCCTTGAGAATTGAGATTGGACCCCGAGATCTGGAAAATGATCAGGTCAGAACTGTGAGA
AGGGACAACGGAGCAAAGGAAGATATCCCAAGAGGTTCCTTAGTGGAACATGTTAAGGAA
CTGCTTGAGAAGATCCAGGAGAACATGTGCGAAGTGGCGAAGGCAAAGAGGGAAGCTTGT
GTTGAAGAAATTAAGACTTGGGACGAGTTTATCGTAGCTCTCAACAAGAAGAAACTCATC
TTAGCTCCCTGGTGCGATGAGGAGGAAGTGGAGAGAGATGTCAAGGCACGTACTAAAGGT
GAAACTGGAGCAGCGAAAACCCTCTGTTCTCCATTTGAGCAGCCAGAGCTCCCTGAATGT
ACTCTCTGCTTTGCATCTGGAAAGCCTGCCAAGAAATGGACCTATTGGGGCAG*AGTTAC
TAAGTGTTCACCATGTTTTCGTTCAGTTCATGAAATTTACTTTTGTAAAGACTCTCAAGT
TCGTTGTGTTTTG

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DS 

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TAATACACAAGGAATTTTTGATGCTTGTACTGCTACCGTATCTGCTTTGAGTGAAGCCGG
TATTCGTGCAGAAGAAGATTTAAGGGATAACTACTCTCCAGGATGGAAGTATTCAAACTG
GGAAATGAAGGGTGTCCCCTTGAGAATTGAGATTGGACCCCGAGATCTGGAAAATGATCA
GGTCAGAACTGTGAGAAGGGACAACGGAGCAAAGGAAGATATCCCAAGAGGTTCCTTAGT
GGAACATGTTAAGGAACTGCTTGAGAAGATCCAGGAGAACATGTACGAAGTGGCGAAGGC
AAAGAGGGAAGCTTGTGTTGAAGAAATTAAGACTTGGGACGAGTTTATCGTAGCTCTCAA
CAAGAAGAAACTCATCTTAGCTCCCTGGTGCGATGAGGAGGAAGTGGAGAGAGATGTCAA
GGCACGTACTAAAGGTGAAACTGGAGCAGCGAAAACCCTCTGTTCTCCATTTGAGCAGCC
AGAGCTCCCTGAAGGTACTTTTTGCTTTGCATCTGGAAAGCCTGCCAAGAAATGGACCTA
TTGGGGCAGGAGTTACTAAGTGTTCACCATGTTTTCGTTCAGTTCATGAAATTTACTTTT
GTAAAGACTCTCAAGTTCGTTGTGTTTTGATTTGATATTTTGACTGAAAGCTATTTCAAT
T

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DS 

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ATCTGCTTTGAGTGAAGCCGGTATTCGTGCAGAAGAAGATTTAAGGGATAACTACTCTCC
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CCGAGATCTGGAAAATGATCAGGTCAGAACTGTGAGAAGGGACAACGGAGCAAAGGAAGA
TATCCCAAGAGGTTCCTTAGTGGAACATGTTAAGGAACTGCTTGAGAAGATCCAGGAGAA
CATGTGCGAAGTGGCGAAGGCAAAGAGGGAAGCTTGTGTTGAAGAAATTAAGACTTGGGA
CGAGTTTATCGTAGCTCTCAACAAGAAGAAACTCATCTTAGCTCCCTGGTGCGATGAGGA
GGAAGTGGAGAGAGATGTCAAGGCACGTACTAAAGGTGAAACTGGAGCAGCGAAAACCCT
CTGTTCTCCATTTGAGCAGCCAGAGCTCCCTGAAGGTACTCTCTGCTTTGCATCTGGAAA
GCCTGCCAAGAAATGGACCTATTGGGGCAGGAGTTACTAAGTGTTCACCATGTTTTCGTT
CAGTTCATGAAATTTACTTTTGTAAAGACTCTCAAGTTCGTTGTGTTTTGATTTGATATT
TTGACTGAAAGCTATTTCAATTTTATAACTGTGTGTGATTGCACTATGAACAACTACAGA
ATGATGTTTTTGTTTCAAAAGAACTGTTAAGAAAAAAA

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DS 

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G
GAAGGGTGTCCCCTTGAGAATTGAGATTGGACCCCGAGATCTGGAAAATGATCAGGTCAG
AACTGTGAGAAGGGACAACGGAGCAAAGGAAGATATCCCAAGAGGTTCCTTAGTGGAACA
TGTTAAGGAACTGCTTGAGAAGATCCAGGAGAACATGTACGAAGTGGCGAAGGCAAAGAG
GGAAGCTTGTGTTGAAGAAATTAAGACTTGGGACGAGTTTATCGTAGCTCTCAACAAGAA
GAAACTCATCTTAGCTCCCTGGTGCGATGAGGAGGAAGTGGAGAGAGATGTCAAGGTACG
TACTAAAGGTGAAACTGGAGCAGCGAAAACCCTCTGTTCTCCATTTGAGCAGCTAGAGCT
CCCTGAAGGTACTCTCTGCTTTGCATCTGGAAAGCCTGCCAAGAAATGGACCTATTGGGA
CAGGAGTTACTAAGTGTTCACCATGTTTTCGTTCAGTTCATGAAATTTACTTTTGTAAAG
ACTCTCAAGTTCGTTGTGTTTTGATTTGATATTTTGACTGAAAGCTATTTCAATTTTATA
ACTGTGTGTGATTGCACTATGAACAACTACAGAATGATGTTTTTGTTTCAAAAGAACTGT
TAAGAAA

QA 2 608 2 608
DS 



AS 1 7

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AATACATCCTCTCCGGCAGGCAGACAAGAAAACACAAACACCAAAAAGGTCAATCAATCA
CCGATGGCTCGTCTCCTCCCTCTCCTCCTCCTCATCGCCACCGTCTCCGCCGTCGCATTC
GCCGACGATGAACCGGACTGCGTCTACACATTCTACCTCCGAACCGGATCAATCTGGAAA
GCCGGAACCGACTCGATCATCAGCGCTAGAATCTACGACAAGTACGGAGACTACATCGGG
ATCAAGAACCTAGAGGCTTGGGGCGGACTAATGGGCCCTGACTACAACTACTACGAGAGA
AGCAACCTCGACATTTTCAGCGGAAGAGCGCCGTGTTTACCTAGTCCGATCTGCTCTCTC
AACCTAACCTCCGACGGCTCCGGCGATCACCACGGCTGGTACGTTAACTACGTCGAGGTC
TCGACGGCTGGAGTCCACGCTCAGTGCTCCGCTCAGAATTTCGAGATCGAGCAGTGGCTT
GCAACCGATACGTCACCGTATGAGCTTACTGCCGTGAGGAACAATTGTCCGGTGTCGCTT
AGGGATAGTGTCAGTCGGGTCGGGTCGGAGATCCGGAAACAGCTTTCTTGGGTCATCTGA
GTGAGGATGAGAGTGTGTGTGATTCGTATTGTATGTTTATCATTGTCTTATGAGTGTAAT
CTGGCCTTTGATTATATGATTCGATAAATAAAACTTTTTAGTTACTTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 25 25 25 25 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FY60TF U 39
AF RS1EW42TF U 1
AF RS1AM49TF U 41
AF RS1CO91TF U 68
AF RS1FY60JQ C 158
AF RS1EW42JQ C 116
AF RS1AM49JQ C 69
BS 1 94 RS1EW42TF
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RD RS1FY60TF 598 0 0
GA
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CCGTCTCCGCCGTCGCATTCGCCGACGATGAACCGGACTGCGTCTACACATTCTACCTCC
GAACCGGATCAATCTGGAAAGCCGGAACCGACTCGATCATCAGCGCTAGAATCTACGACA
AGTACGGAGACTACATCGGGATCAAGAACCTAGAGGCTTGGGGCGGACTAATGGGCCCTG
ACTACAACTACTACGAGAGAAGCAACCTCGACATTTTCAGCGGAAGAGCGCCGTGTTTAC
CTAGTCCGATCTGCTCTCTCAACCTAACCTCCGACGGCTCCGGCGATCACCACGGCTGGT
ACGTTAACTACGTCGAGGTCTCGACGGCTGGAGTCCACGCTCAGTGCTCCGCTCAGAATT
TCGAGATCGAGCAGTGGCTTGCAACCGATACGTCACCGTATGAGCTTACTGCCGTGAGGA
ACAATTGTCCGGTGTCGCTTAGGGATAGTGTCAGTCGGGTCGGGTCGGAGATCCGGAAAC
AGCTTTCTTGGGTCATCTGAGTGAGGATGAGAGTGTGTGTGATTCGTATTGTATGT

QA 3 598 3 598
DS 

RD RS1EW42TF 693 0 0
AATACATCCTCTCCGGCAGGCAGACAAGAAAACACAAACACCAAAAAGGTCAATCAATCA
CCGATGGCTCGTCTCCTCCCTCTCCTCCTCCTCACCGCCACCGTCTCCGCCGTCGCATTC
GCCGACGATGAACCGGACTGCGTCTACACATTCTACCTCCGAACCGGATCAATCTGGAAA
GCCGGAACCGACTCGATCATCAGCGCTAGAATCTACGACAAGTACGGAGACTACATCGGG
ATCAAGAACCTAGAGGCTTGGGGCGGACTAATGGGCCCTGACTACAACTACTACGAGAGA
AGCAACCTCGACATTTTCAGCGGAAGAGCGCCGTGTTTACCTAGTCCGATCTGCTCTCTC
AACCTAACCTCCGACGGCTCCGGCGATCACCACGGCTGGTACGTTAACTACGTCGAGGTC
TCGACGGCTGGAGTCCACGCTCAGTGCTCCGCTCAGAATTTCGAGATCGAGCAGTGGCTT
GCAACCGATACGTCACCGTATGAGCTTACTGCCGTGAGGAACAATTGTCCGGTGTCGCTT
AGGGATAGTGTCAGTCGGGTCGGGTCGGAGATCCGGAAACAGCTTTCTTGGGTCATCTGA
GTGAGGATGAGAGTGTGTGTGATTCGTATTGTATGTTTATCATTGTCTTATGAGTGTAAT
CTGGCCTTTGATTATATGATTCGATAAATAAA
C

QA 1 692 1 692
DS 

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CCAAAAAGGTCAATCAATCACTGATGGCTCGCCTCCTCCCTCTCCTCCTCCTCATCGCCA
CCGTCTCCGCCGTCGCATTCGCCGACGATGAACCGGACTGCGTCTACACATTCTACCTCC
GAACCGGATCAATCTGGAAAGCCGGAACCGACTCGATCATCAGCGCTAGAATCTACGACA
AGTACGGAGACTACATCGGGATCAAGAACCTAGAGGCTTGGGGCGGACTAATGGGCCCTG
ACTACAACTACTACGAGAGAAGCAACCTCGACATTTTCAGCGGAAGAGCGCCGTGTTTAC
CTAGTCCGATCTGCTCTCTCAACCTAACCTCCGACGGCTCCGGCGATCACCACGGCTGGT
ACGTTAACTACGTCGAGGTCTCGACGGCTGGAGTCCACGCTCAGTGCTCCGCTCAGAATT
TCGAGATCGAGCAGTGGCTTGCAACCGATACGTCACCGTATGAGCTTACTGCCGTGAGGA
ACAATTGTCCGGTGTCGCTTAGGGATAGTGTCAGTCGGGTCGGGTCGGAGATCCGGAAAC
AGCTTTCTTGGGTCATCTGAGTGAGGATGAGAGTGTGTGTGATTCGTATTGTATGTTTAT
CATTGTCTTATGAGTGTAATCTGGCCTTTGATTATATGATTCGATAAATAAAACTTTTTA
GTT

QA 1 663 1 663
DS 

RD RS1CO91TF 644 0 0
CTCGTCTCCTCCCTCTCCTCCTCCTTATCGCCACCGTCTCCACCGTCGCCTTCGCCGACG
ATGAACCGGACTGCGTCTACACGTTCTACCTCCGAACCGGATCAATCTGGAAAGCCGGAA
CCGACTCGATCATCAGCGCAAGAATCTACGACAAGTACGGCGACTACATCGGGACCAAGA
ACCTAGAGGCTTGGGGCGGACTAATGGGCCCTGACTACAACTACTTCGAGAGAAGCAACC
TCGGCATTTTCAGCGGAAGAGCGCCGTGTTTGCCTAGCCCGATCTGCTCTCTGAACCTAA
CCTCCGACGGCTCCGGCGATCACCATGGCTGGTACGTTAACTACGTCGAGGTTTCGACGG
CTGGAGTTCACGCTCAGTGCTCCACTCAGAATTTCGAGATCGAGCAGTGGCTTGCAACCG
ATACGTCACCGTATGAGCTTACTGCCGTGAGGAACAATTGTCCCGTGTCGCTTAGGGATA
GTGTCAGTCGGGTCGGGTCGGAGATTCGGAAACAGCTTTCTTGGGTCATCTGAGTGATGA
TGAAAGTGTGTGTGATTCGTATTGTATGTTTATCATCGTCTTATGAGTGTAATCTGGCCT
TTGATTATATGATTCGATAAATAAAACTTTTTAGTTACTTTTGC

QA 1 644 1 644
DS 

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ACAAGTACGGAGACTACATCGGGATCAAGAACCTAGAGGCTTGGGGCGGACTAATGGGCC
CTGACTACAACTACTACGAGAGAAGCAACCTCGACATTTTCAGCGGAAGAGCGCCGTGTT
TACCTAGTCCGATCTGCTCTCTCAACCTAACCTCCGACGGCTCCGGCGATCACCACGGCT
GGTACGTTAACTACGTCGAGGTCTCGACGGCTGGAGTCCACGCTCAGTGCTCCGCTCAGA
ATTTCGAGATCGAGCAGTGGCTTGCAACCGATACGTCACCGTATGAGCTTACTGCCGTGA
GGAACAATTGTCCGGTGTCGCTTAGGGATAGTGTCAGTCGGGTCGGGTCGGAGATCCGGA
AACAGCTTTCTTGGGTCATCTGAGTGAGGATGAGAGTGTGTGTGATTCGTATTGTATGTT
TATCATTGTCTTATGAGTGTAATCTGGCCTTTGATTATATGATTCGATAAATAAAACTTT
TTAGTT
ACTTTGC

QA 1 546 1 546
DS 

RD RS1EW42JQ 595 0 0
CATTCGCCGACGATGAACCGGACTGCGTCTACACATTCTACCTCCGAACCGGATCAATCT
GGAAAGCCGGAACCGACTCGATCATCAGCGCTAGAATTTACGACAAGTACGGAGACTACA
TCGGGATCAAGAACCTAGAGGCTTGGGGCGGACTAATGGGCCCTGACTACAACTACTACG
AGAGAAGCAACCTCGACATTTTCAGCGGAAGAGCGCCGTGTTTACCTAGTCCGATCTGCT
CTCTCAACCTAACCTCCGACGGCTCCGGCGATCACCACGGCTGGTACGTTAACTACGTCG
AGGTCTCGACGGCTGGAGTCCACGCTCAGTGCTCCGCTCAGAATTTCGAGATCGAGCAGT
GGCTTGCAACCGATACGTCACCGTATGAGCTTACTGCCGTGAGGAACAATTGTCCGGTGT
CGCTTAGGGATAGTGTCAGTCGGGTCGGGTCGGAGATCCGGAAACAGCTTTCTTGGGTCA
TCTGAGTGAGGATGAGAGTGTGTGTGATTCGTATTGTATGTTTATCATTGTCTTATGAGT
GTAATCTGGCCTTTGATTATATGATTCGATAAATAAAACTTTTTAGTT
ACTTTGC

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DS 

RD RS1AM49JQ 635 0 0
TCGC
CTCCTCCCTCTCCTCCTCCTCATCGCCACCGTCTCCGCCGTCGCATTCGCCGACGATGAA
CCGGACTGCGTCTACACATTCTACCTCCGAACCGGATCAATCTGGAAAGCCGGAACCGAC
TCGATCATCAGCGCTAGAATTTACGACAAGTACGGAGACTACATCGGGATCAAGAACCTA
GAGGCTTGGGGCGGACTAATGGGCCCTGACTACAACTACTACGAGAGAAGCAACCTCGAC
ATTTTCAGCGGAAGAGCGCCGTGTTTACCTAGTCCGATCTGCTCTCTCAACCTAACCTCC
GACGGCTCCGGCGATCACCACGGCTGGTACGTTAACTACGTCGAGGTCTCGACGGCTGGA
GTCCACGCTCAGTGCTCCGCTCAGAATTTCGAGATCGAGCAGTGGCTTGCAACCGATACG
TCACCGTATGAGCTTACTGCCGTGAGGAACAATTGTCCGGTGTCGCTTAGGGATAGTGTC
AGTCGGGTCGGGTCGGAGATCCGGAAACAGCTTTCTTGGGTCATCTGAGTGAGGATGAGA
GTGTGTGTGATTCGTATTGTATGTTTATCATTGTCTTATGAGTGTAATCTGGCCTTTGAT
TATATGATTCGATAAATAAAACTTTTTAGTT

QA 5 635 5 635
DS 



AS 2 7

CO CL917Contig1 892 3 4 U
GGGGTTCTTTGTTATGGCACAAGTGGAAATAAAAATGCAAAAAAGGCTGACAGAAAAATA
GAGAGAAACAGTTTGAGGGTGCGAGAGAGAGAGATCAGAGATGGCGAGGTCAGTGAAACT
GCTTCTATGGAGTCTTCTTCTTCTGGGAACCCTAATCTCTATTCAGGCCAAAAAGAAGGA
AAAGATCACACACAAGGTTTATTTCGATGTCGAAATTAATGGCAAAGAAGCCGGTCGTAT
TGTCATGGGTCTATTTGGCAAGACAGTCCCTAAAACTGCAGAGAATTTCCGAGCTTTGTG
CACAGGGGAGAAAGGAGTAGGTAAGAAAGGGAAGGCTCTGCATTACAAGGGGAGTTCCTT
CCATAGGATCATACCAAGCTTTATGCTCCAGGGAGGCGACTTTACTGATGGTAATGGTAT
GGGTGGTGAATCTATTTATGGTGAGAAGTTTGCTGATGAGAACTTCAAACTCAAGCATAC
TGGTCCAGGGTATCTATCAATGGCAAACGCCGGTGAAGACACCAACGGATCACAGTTTTT
CATCACAACAGTTACAACAAGCTGGTTGGACGGGAGGCACGTAGTGTTCGGGAAGGTAGT
TACAGGAATGGGCGTGGTGTACAAAATCGAAGCTGAGGGTACTCAGAGTGGAACTCCTAA
GAGTAAAGTTGTGATTGTTGACAGTGGTGAGCTTCCTCTGTAACTCTCAACTTCTCATGA
AGTTTTCTCCATCTGATCATCCATTGCTGTGAGCTTAGTGATTTGAAGACTTTTGTTTTT
CCAAACGACTATGTTTAGCCACTTAATAAAGATTCAACCATTCTGCTTTTTATTTCTTCT
CTCTGCTATAACTCAAATCTACATACATGAGATATGTATGTCCTGCAGATGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A472TF U 1
AF RS1A472JQ C 1
AF RS1G216TF U 59
BS 1 779 RS1A472TF
BS 780 781 RS1G216TF
BS 782 783 RS1A472JQ
BS 784 892 RS1G216TF

RD RS1A472TF 779 0 0
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QA 1 779 1 779
DS 

RD RS1A472JQ 826 0 0
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GAGAGAAACAGTTTGAGGGTGCGAGAGAGAGAGATCAGAGATGGCGAGGTCAGTGAAACT
GCTTCTATGGAGTCTTCTTCTTCTGGGAACCCTAATCTCTATTCAGGCCAAAAAGAAGGA
AAAGATCACACACAAGGTTTATTTCGATGTCGAAATTAATGGCAAAGAAGCCGGTCGTAT
TGTCATGGGTCTATTTGGCAAGACAGTCCCTAAAACTGCAGAGAATTTCCGAGCTTTGTG
CACAGGGGAGAAAGGAGTAGGTAAGAAAGGGAAGGCTCTGCATTACAAGGGGAGTTCCTT
CCATAGGATCATACCAAGCTTTATGCTCCAGGGAGGCGACTTTACTGATGGTAATGGTAT
GGGTGGTGAATCTATTTATGGTGAGAAGTTTGCTGATGAGAACTTCAAACTCAAGCATAC
TGGTCCAGGGTATCTATCAATGGCAAACGCCGGTGAAGACACCAACGGATCACAGTTTTT
CATCACAACAGTTACAACAAGCTGGTTGGACGGGAGGCACGTAGTGTTCGGGAAGGTAGT
TACAGGAATGGGCGTGGTGTACAAAATCGAAGCTGAGGGTACTCAGAGTGGAACTCCTAA
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GATTCAACCATTCTGC

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DS 

RD RS1G216TF 834 0 0
GG
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GCTTCTATGGAGTCTTCTTCTTCTGGGAACCCTAATCTCTATTCAGGCCAAAAAGAAGGA
AAAGATCACACACAAGGTTTATTTCGATGTCGAAATTAATGGCAAAGAAGCCGGTCGTAT
TGTCATGGGTCTATTTGGCAAGACAGTCCCTAAAACTGCAGAGAATTTCCGAGCTTTGTG
CACAGGGGAGAAAGGAGTAGGTAAGAAAGGGAAGGCTCTGCATTACAAGGGGAGTTCCTT
CCATAGGATCATACCAAGCTTTATGCTCCAGGGAGGCGACTTTACTGATGGTAATGGTAT
GGGTGGTGAATCTATTTATGGTGAGAAGTTTGCTGATGAGAACTTCAAACTCAAGCATAC
TGGTCCAGGGTATCTATCAATGGCAAACGCCGGTGAAGACACCAACGGATCACAGTTTTT
CATCACAACAGTTACAACAAGCTGGTTGGACGGGAGGCACGTAGTGTTCGGGAAGGTAGT
TACAGGAATGGACGTGGTGTACAAAATCGAAGCTGAGGGTACTCAGAGTGGAACTCCTAA
GAGTAAAGTTGTGATTGTTGACAGTGGTGAGCTTCCTCTGTAACTCTCAACTTCTCATGA
AGTTTTCTCCATCTGATCATCCATTGCTGTGAGCTTAGTGATTTGAAGACTTTTGTTTTT
C**AACGACTATGTTTAGCCACTTAATAAAGATTCAACCATTCTGCTTTTTATTTCTTCT
CTCTGCTATAACTCAAATCTACATACATGAGATATGTATGTCCTGCAGATGC

QA 3 834 3 834
DS 



CO CL917Contig2 761 4 8 U
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ATGGGTGGTGAATCTATTTATGGTGAGAAGTTTGCTGATGAGAACTTCAAACTCAAGCAT
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CATCTGATCCTCCATTGCTTTGAGCTTAGTGATTTGAAGACTTTTGTTTTTAAACGACTA
AGTTAGCCACTTAATAAAAGATTTCAACCGTTCTGCTTTCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

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AF RS1BO28JQ C 2
AF RS1E552JQ C 381
AF RS1E552TF U 381
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G
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G
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G
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QA 2 381 2 381
DS 



AS 2 7

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1CE17TF U 1
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GG
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AGC

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DS 

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ATGAGGCTGAGGAGAAGCAAACTGATGAGGCTGAGGAGAACGAAGGTGAGAACAAAGAGG
CTGAAGGTAAAGAAGAGGAAGATGAGATTTTGGATGACTACTAGACATGTTAAAATCTTT
CTTTGGTTTAATCTCAATGAAATGGATTCAACTCTTTATCCTTATGGTGCATTGTAAATT
TTGAACTTTCATTAGTTATCTTAAGATGGTTGGTGTGAGCATGTGAGGCTTTTGTAGTTC
ACTCCTTTTGTTTAGACTAGTATGGAAGATTAATGTTTTTAGTTTTCACCACTGTTGTAG
AACTGAAAGCTGTTGTAGATGAACTATATATTTCATTACATTATTCAC

QA 1 588 1 588
DS 



CO CL918Contig2 1054 2 2 U
GGGATTCAATCTCAAAAGAAAAAAAAAAGATTACATTCTCTCCTTCCGATCTAGAAAAAC
GAAAGAGATGGCCGGTGGTGGTTCGAAGTCAACTGCGCCCAAGGCGAGGAAGAGAGTGGA
TGCTGAAACCAAACCCGAAACCACCGCTAACAACATCAACACCTTACTTCGCGCCAAAGA
CGGCAGCGCCTTCGTTCGATGCGAAGGATGCAACAAGAACGTAGCGGTTGCGCTTATCAG
TATGCATAATTGTAGCCTCGACGCTAAAATTCGTGTCAATCTCGAAGCTCAAGTTGTTGA
GACACAAACCGAGGCTAAGAAGAAACCTGCTGAGAGGAAGAAGTCAACATCTGATGAACC
TAAGGCAAAGAGACTCAGGAAGGCCAAGGATGAGAATAAGAAGAAGAGCTCTTCTTCCTC
TAACAAACCCAAGCGACCTCTTACTGCTTTCTTCATCTTCATGGCTGATTTCCGCAAAAC
TTTTAAAGAAGAGAATCCTGACGCTGGCGTTAAGGATGTTGCAAAACAGGGTGGTGAAAA
GTGGAAGTCTTTGGATGAGGAAGAGAAGAAAGTTTATTTGGACAAAGCTGCTGAACTAAA
GGCAGAGTATAACAAGTCACTTGAGAGCAACAACGATGCTGATGAGGAAGAAGTGGACGA
GGAGAAGGAAGCTACTGATGTTGATGATGCTGATGATAAACAGTTTGATGAGGCTGAGGA
GAAGCAAACTGATGAGGTTGAGGAGAATGAAGGTGAAAACAAAGAGGCTGAAGGTAAAGA
AGAGGAAGATGAGATTTTGGATGACTACTAGACATGTTAAAATCTTTCTTTGGTTTAATC
TCAATGAAATGGATTCAAGTCTTTATCCTTATGGTGCATTGTAAATTTTGAACTTTCATT
AGTTATCTTAAGATGGTTGGTGTGAGCATGTGAGGCTTTTGTAGTTCACTCCTTTTGCTT
AGACAAGTATGGAAGATTAATGTTTTTAGTTTCACCACTGTTGTAGAACTGAAAGCTTGT
TGTAGATGAACTATATATTTCATTACATTATTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AU60TF U 1
AF RS1AU60JQ C 353
BS 1 651 RS1AU60TF
BS 652 1054 RS1AU60JQ

RD RS1AU60TF 651 0 0
GGGATTCAATCTCAAAAGAAAAAAAAAAGATTACATTCTCTCCTTCCGATCTAGAAAAAC
GAAAGAGATGGCCGGTGGTGGTTCGAAGTCAACTGCGCCCAAGGCGAGGAAGAGAGTGGA
TGCTGAAACCAAACCCGAAACCACCGCTAACAACATCAACACCTTACTTCGCGCCAAAGA
CGGCAGCGCCTTCGTTCGATGCGAAGGATGCAACAAGAACGTAGCGGTTGCGCTTATCAG
TATGCATAATTGTAGCCTCGACGCTAAAATTCGTGTCAATCTCGAAGCTCAAGTTGTTGA
GACACAAACCGAGGCTAAGAAGAAACCTGCTGAGAGGAAGAAGTCAACATCTGATGAACC
TAAGGCAAAGAGACTCAGGAAGGCCAAGGATGAGAATAAGAAGAAGAGCTCTTCTTCCTC
TAACAAACCCAAGCGACCTCTTACTGCTTTCTTCATCTTCATGGCTGATTTCCGCAAAAC
TTTTAAAGAAGAGAATCCTGACGCTGGCGTTAAGGATGTTGCAAAACAGGGTGGTGAAAA
GTGGAAGTCTTTGGATGAGGAAGAGAAGAAAGTTTATTTGGACAAAGCTGCTGAACTAAA
GGCAGAGTATAACAAGTCACTTGAGAGCAACAACGATGCTGATGAGGAAGA

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1AU60JQ 702 0 0
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TCTTCCTCTAACAAACCCAAGCGACCTCTTACTGCTTTCTTCATCTTCATGGCTGATTTC
CGCAAAACTTTTAAAGAAGAGAATCCTGACGCTGGCGTTAAGGATGTTGCAAAACAGGGT
GGTGAAAAGTGGAAGTCTTTGGATGAGGAAGAGAAGAAAGTTTATTTGGACAAAGCTGCT
GAACTAAAGGCAGAGTATAACAAGTCACTTGAGAGCAACAACGATGCTGATGAGGAAGAA
GTGGACGAGGAGAAGGAAGCTACTGATGTTGATGATGCTGATGATAAACAGTTTGATGAG
GCTGAGGAGAAGCAAACTGATGAGGTTGAGGAGAATGAAGGTGAAAACAAAGAGGCTGAA
GGTAAAGAAGAGGAAGATGAGATTTTGGATGACTACTAGACATGTTAAAATCTTTCTTTG
GTTTAATCTCAATGAAATGGATTCAAGTCTTTATCCTTATGGTGCATTGTAAATTTTGAA
CTTTCATTAGTTATCTTAAGATGGTTGGTGTGAGCATGTGAGGCTTTTGTAGTTCACTCC
TTTTGCTTAGACAAGTATGGAAGATTAATGTTTTTAGTTTCACCACTGTTGTAGAACTGA
AAGCTTGTTGTAGATGAACTATATATTTCATTACATTATTCG

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 7

CO CL919Contig1 1024 7 9 U
TTTTTTAATCTTAATTTTGTCATTTTATTTATATTTTTTTGAATTATGCATCCACTACAA
AAGTTTTCTAGATTCGCCACTGCGTACAACCCGACTAACACCTACATAAGCAAACCACAC
ACATAAAAGCATAAGTAAAAGTCCGATAGAGAGTCTAAAATGGTCTGATAAAGAGTCTAT
ATGTGGCTCGAGATTAATAGGACACACACATTCATAAAGACAAATTAAGGGACCATGAAA
TAGTAGTAGATGGGTTATGAGCTTGCAAATCTTGATGATCAGTCGATGACCAAAGACATA
ATCTTTTCCTGAAGATTTGGTTGAATCGGCTGAACTCTATATCCAAATTGCTCATCTTGA
TCTCTCATCATCATTCCTCTTGTGTTGCTAGCTATAGCCATCTCTTGTTGTTGCAGCTGG
AAACTGAGTTGCCGATTCTCCTCCACCAATATTTTCTCATTTCTCCTCTTTGTCATGAGG
AACTCCATCTGGTGGTCTCGGACTTTGTCGAGGCCATGTTCAATGGCATGCTCTACGGCC
ATCAGGTTTTTTAAGTTGAGAGATTGTATATCTTCCCCCTTCAAATGCCTGAGTTCCAGT
TGTAAGCTGTCATTCTCTTTTTTGATCCTATCAATTTCATTGTTGAGGTTCTCATGCTTA
GTATCCCATAGTTTCTTGCCAGATAACTTCTGGTATTGGTCCAACATAGCACCAAGATCC
ATGGAAGGACAACAATAGTCAGTCATCTTACCATTACTTGCAAAGATTATGAGAGCAACT
TTTGCATCGCAGAGAACAGTGATCTCTTTAGCCTTCTTCACCAACCCATTCCTCCTCTTT
GAGAAAGTCACCACTCTGTTGTTTGCGTTTTCTATCCTTTTTATCTCTATCTTCCCTCTT
CCCATCTTTCTCTCTCTAGCTCTCTTTTCTCAGTTTTAGGGTTTGCTATGAAATTGTTAA
GATACGAAGGAGATTATATGTGGAGAAAAGGAGTAGCATTGGTCTCAAAGAAACATTGAT
GTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 30 30 30 30 30 30 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1BF95JQ U 7
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AF RS1C212JQ U 41
AF RS1BX72JQ U 1
AF RS1C212TF C 314
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AAGCATAAGTAAAAGTCCGATAGAGAGTCTAAAATGGTCTGATAAAGAGTCTATATGTGG
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CATCTGGTGGTCTCGGACTTTGTCGAGGCCATGTTCAATGGCATGCTCTACGGCCATCAG
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CCATAGTTTCTTG

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DS 

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AGTCGATGACCAAAGACATAATCTTTTCCTGAAGATTTGGTTGAATCGGCTGAACTCTAT
ATCCAAATTGCTCATCTTGATCTCTCATCATCATTCCTCTTGTGTTGCTAGCTATAGCCA
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TCAAATGCCTGAGTTCCAGTTGTAAGCTGTCATTCTCTTTTTTGATCCTATCAATTTCAT
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CCAACATAGCACC

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DS 

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ACATAAAAGCATAAGTAAAAGTCCGATAGAGAGTCTAAAATGGTCTGATAAAGAGTCTAT
ATGTGGCTCGAGATTAATAGGACACACACATTCATAAAGACAAATTAAGGGACCATGAAA
TAGTAGTAGATGGGTTATGAGCTTGCAAATCTTGATGATCAGTCGATGACCAAAGACATA
ATCTTTTCCTGAAGATTTGGTTGAATCGGCTGAACTCTATATCCAAATTGCTCATCTTGA
TCTCTCATCATCATTCCTCTTGTGTTGCTAGCTATAGCCATCTCTCGTTGTTGCAGCTGG
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AACTCCATCTGGTGGTCTCGGACTTTGTCGAGGCCATGTTCAATGGCATGCTCTACGGCC
ATCAGGTTTTTTAAGTTGAGAGATTGTATATCTTCCCCCTTCAAATGCCTGAGTTCCAGT
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GTATCCCATAGTTTCTTGCCAGATAACTTCTGGTATTGGTCCAACATAGCACCAAGATCC
ATGGAAGGACAACAATAGTCAGTCATCTTACCATTACTTGCAAAGATTATGAG

QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1C212TF 638 0 0
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TTCCTCTTGTGTTGCTAGCTATAGCCATCTCTTGTTGTTGCAGCTGGAAACTGAGTTGCC
GATTCTCCTCCACCAATATTTTCTCATTTCTCCTCTTTGTCATGAGGAACTCCATCTGGT
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AGTTGAGAGATTGTATATCTTCCCCCTTCAAATGCCTGAGTTCCAGTTGTAAGCTGTCAT
TCTCTTTTTTGATCCTATCAATTTCATTGTTGAGGCTCTCACGCTTAGTATCCCATAGTT
TCTTGCCAGATAACTTCTGGTATTGGTCCAACATAGCACCAAGATCCATGGAAGGACAAC
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CTCTAGCTCTCTTTTCTCAGTTTTAGGGTTTGCTAT
CC

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DS 

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AAGGGACCATGAAATAGTAGTAGATGGGTTATGAGCTTGCAAATCTTGATGATCAGTCGA
TGACCAAAGACATAATCTTTTC*TGAAGATTTGGTTGAATCGGCTGAACTCTATATCCAA
ATTGCTCATCTTGATCTCTCATCATCATTCCTCTTGTGTTGCTAGCTATAGCCATCTCTC
GTTGTTGCAGCTGGAAACTGAGTTGCCGATTCTCCTCCACCAATATTTTCTCATTTCTCC
TCTTTGTCATGAGGAACTCCATCTGGTGGTCTCGGACTTTGTCGAGGCCATGTTCAATGG
CATGCTCTACGGCCATCAGGTTTTTTAAGTTGAGAGATTGTATATCTTCCCCCTTCAAAT
GCCTGAGTTCCAGTTGTAAGCTGTCATTCTCTTTTTTGATCCTATCAATTTCATTGTTGA
GGTTCTCATGCTTAGTATCCCATAGTTTCTTGCCAGATAACTTCTGGTATTGGTCCAACA
TAGCACCAAGATCCATGGAAGGACAACAATAGTCAGTCATCTTACCATTACTTGCAAAGA
TTATGAGAGCAACTTTTGCATCGCAGAGAACAGTGATCTCTTTAGCCTTCTTCACCAACC
CATTCCTCCTCTTTGAGAAAGTCACCACTCTGTTGTTTGCGTTTTCTATACTTTTTATCT
CTATCTTCCCTCTTCCCATCTTTCTCTCTCTAGCTCTCTTTTCTCAGTTTTAGGGTTTGC
TATGAAATTGTTAAGATACGATGGAGATTATATGTGGAGAA

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DS 

RD RS1CS90TF 689 0 0
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AGCCATCTCTTGTTGTTGCAGCTGGAAACTGAGTTGCCGATTCTCCTCCACCAATATTTT
CTCATTTCTCCTCTTTGTCATGAGGAACTCCATCTGGTGGTCTCGGACTTTGTCGAGGCC
ATGTTCAATGGCATGCTCTACGGCCATCAGGTTTTTTAAGTTGAGAGATTGTATATCTTC
CCCCTTCAAATGCCTGAGTTCCAGTTGTAAGCTGTCATTCTCTTTTTTGATCCTATCAAT
TTCATTGTTGAGGTTCTCATGCTTAGTATCCCATAGTTTCTTGCCAGATAACTTCTGGTA
TTGGTCCAACATAGCACCAAGATCCATGGAAGGACAACAATAGTCAGTCATCTTACCATT
ACTTGCAAAGATTATGAGAGCAACTTTTGCATCGCAGAGAACAGTGATCTCTTTAGCCTT
CTTCACCAACCCATTCCTCCTCTTTGAGAAAGTCACCACTCTGTTGTTTGCGTTTTCTAT
CCTTTTTATCTCTATCTTCCCTCTTCCCATCTTTCTCTCTCTAGCTCTCTTTTCTCAGTT
TTAGGGTTTGCTATGAAATTGTTAAGATATGAAGGAGATTATATGTGGAGAAAAGGAGTA
GCATTGGTCTCAAAGAAACATTGATGTCC

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 7

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AGGTTGCGTAGCCAGGAAGACGAGTAAAAAATTAAGCCCTAGGGTTTACTTTTCATCTCT
CATTGACAATTTCAGACCGTTTTTTTTTT*AATTTTGCGTATTAAGTTTGTTTTATTCAT
AATCTGTTTTACATTCGATAATACAGTTTCATATATTTAAAAGTAAAACATTGAACCGAA
TCTTCAAACTTTT


BQ
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 15 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 30 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1D411TF U 1
AF RS1D411JQ C 1
AF RS1FX41TF U 1
AF RS1DB47TF U 1
AF RS1FX41JQ C 14
AF RS1B855JQ C 1
AF RS1B855TF U 1
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A

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AT

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T

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DS 

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TCTTCAAACTTTT

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DS 

RD RS1B855TF 613 0 0
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AATCTGTTTTACATTCGATAATACAGTTTCATGTATTTAAAAGTAAAACATTGAACCGAA
TCTTCAAACTTTT

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 6

CO CL921Contig1 1357 6 6 U
GGACCCTCCGATTGAACACAAAATTAGGGTTTCATTTTCCCCCTTTTCGACTTGCTTCTT
CCCCTTTCAGAGCCACTTCACTATGATTCTCCCCTCTTCTTCTTCTTCTCCTCAAGCTTT
TGATTCTTCTTCTTGAATTTTGCAGATTTTTTTTTCCTCATTAATTTATAATAAATCTGC
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TGGGTGATACTGTCCCTGCTTACTTGCAGAAGCACCTCTTCTCCAACATCCTCAAGGAGG
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CGATTCTATCTAACAGTTCTGACTTGGGACGTGGCGGGTCCACGGCTGTTACTGCTATAT
TGATCAACGGGAGGAAGCTGTGGGTAGCTAACGTTGGAGATTCGCGAGCGGTTCTTTCGA
GAGGAGGTTCGGTAATGCAGATGAGTACGGATCATGAGCCTCGTGCCGAACGGTCGAGTA
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CACAGAAGGCGGCTAAGGAGTTAACAGCTGAAGCATTGAGAAGAGAGAGTAAAGACGACA
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TGGTTTCTGACAGCTTTCTTGCTATATAGCTTTTTATGTGCGTTCGTTGTTATGTAAATT
GTGTATGTGTTTAAAGGAGGAGTTTGGTTGGGTGATGATATGGTGGGGTTGTGTTTATTA
TTATTGGTTGATTTGTTATATTTAATCATCGTGACATAAAATATTAGGGCCTATTTTGAA
TAATATTTATATATGTGGTAGTACTTTTGTGTTTCGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RS1AO04TFB U 1
AF RS1AZ84TF U 1
AF RS1D130TF U 59
AF RS1DV82TF U 24
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AF RS1D130JQ C 668
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CCCCTTTCAGAGCCACTTCACTATGATTCTCCCCTCTTCTTCTTCTTCTCCTCAAGCTTT
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TGA

QA 1 603 1 603
DS 

RD RS1AZ84TF 706 0 0
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CCCCTTTCAGAGCCACTTCACTATGATTCTCCCCTCTTCTTCTTCTTCTCCTCAAGCTTT
TGATTCTTCTTCTTGAATTTTGCAGATTTTTTTTTCCTCATTAATTTATAATAAATCTGC
AAAAAA*TATCTCTTCGATCCAAATGGGAAAATTCTGCTGCTTCACTTCCCCTTCCGAGG
TTGTGGGAGGACAAGCATCATCACGATCTGGTAAAGGAAGAAGCGATGAAGGGCTGATCA
AGTACGGTTTCAGTCTAGTGAAAGGCAAAGCTAACCACCCCATGGAGGATTATCACGTCG
CTAACTTCGTCAACAGCCAAGGCCACGAGCTAGGTCTCTTCGCTATCTACGACGGTCATA
TGGGTGATACTGTCCCTGCTTACTTGCAGAAGCACCTCTTCTCCAACATCCTCAAGGAGG
GATAGTTCTGGGTGGATCCACGAAGGTCTATAGCAAAGGCTTACGAGAAGACGGACCAGG
CGATTCTATCTAACAGTTCTGACTTGGGACGTGGCGGGTCCACGGCTGTTACTGCTATAT
TGATCAACGGGAGGAAGCTGTGGGTAGCTAACGTTGGAGATTCGCGAGCGGTTCTTTCGA
GAGGAGGTTCGGTAATGCAGATGAGTACGGATCATGAGCCTCGTGC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RS1D130TF 627 0 0
G
TCCCCTTTCAGAGCCGCTTCACTATGATTCTCCCCTCTTCTTCTTCTTCTCCTCAAGCTT
TTGATTCTTCTTCTTGAATTTTGCAGATTTTTTTTTCCTCATTAATTTATAATAAATCTG
CAAAAAA*TATCTCTTCGATCCAAATGGGAAAATTCTGCTGCTTCACTTCCCCTTCCGAG
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AAGTACGGTTTCAGTCTAATGAAAGGCAAAGCTAACCACCCCATGGAGGATTATCACGTC
GCTAACTTCGTCAACAGCCAAGGCCACGAGCTAGGTCTCTTCGCTATCTACGACGGTCAT
ATGGGTGATACTTTCCCTGCTTACTTGCAGAAGCACCTCTTCTCCAACATCCTCAAGGAG
GGAGAGTTCTGGGTGGATCCACGAAGGTCTATAGCAAAGGCTTACGAGAAGACGGACCAG
GCGATTCTATCTAACAGTTCTGACTTGGGACGTGGCGGGTCCACGGCTGTTACTGCTATA
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AGAGGAGGTTCGGTAATGCAGATGAG

QA 2 627 2 627
DS 

RD RS1DV82TF 639 0 0
GG
AGGGTTTCATTTTCCCCCTTTTCGACTTGCTTCTTCCCCTTTCAGAGCCGCTCCACTATG
ATTCTCCCCTCTTCTTCTTCTTCTCCTCAAGCTTTTGATTCTTCTTCTTGAATTTTGCAG
ATTTTTTTTTCCTCATTAATTTATAATAAATCTGCAAAAAAATATCTCTTCGATCCAAAT
GGGAAAATTCTGCTGCTTCACTTCCCCTTCCGAGGTTGTGGGAGGACAAGCATCATCACG
ATCTGGTAAAGGAAGAAGCGATGAAGGGCTGATCAAGTACGGTTTCAGTCTAGTGAAAGA
CAAAGCTAACCACCCCATGGAGGATTATCACGTCGCTAACTTCGTCAACAGCCAAGGCCA
CGAGCTAGGTCTCTTCGCTATCTACGACGGTCATATGGGTGATACTGTCCCTGCTTACTT
GCAGAAGCACCTCTTCTCCAACATCCTCAAGGAGGGAGAGTTCTGGGTGGATCCACGAAG
GTCTATAGCAAAGGCTTACGAGAAGACGGACCAGGCGATTCTATCTAACAGTTCTGACTT
GGGACGTGGCGGGTCCACGGCTGTTACTGCTATATTGATCAACGGGAGGAAGCTGTGGGT
AGCTAACGTTGGAGATTCGCGAGCGGTTCTTTCGAGA

QA 3 639 3 639
DS 

RD RS1DV82JQ 773 0 0
ACGGCTGTTACTGCTATATTGATCAACGGGAGGAAGCTGTGGGTAGCTAACGTTGGAGAT
TCGCGAGCGGTTCTTTCGAGAGGAGGTTCGGTAATGCAGATGAGTACGGATCATGAGCCT
CGTGCCGAACGGTCGAGTATTGAGGATAGAGGTGGATTTGTATCCAATCTACCAGGTGAT
GTTCCTCGGGTGAATGGTCAGTTAGCTGTGTCTCGTGCCTTTGGAGATAAGGGTCTTAAG
ACGCATCTGAGTTCAGAGCCTGATATTAGAGATGTTACTGTAGATAGCCAGACTGATGTT
CTTGTCCTTGCCAGTGATGGGATTTGGAAGGTGATGACAAATGAGGAGGCGATGGAGATA
GCTAAAAGGGTGAAAGATCCACAGAAGGCGGCTAAGGAGTTAACAGCTGAAGCATTGAGA
AGAGAGAGTAAAGACGACATATCTTGTGTCGTGGTCCGTTTCAGATGACAAAACTCTGGA
TTTCATCAAGAAAGAACACAAAAGCTGGATTACTGACTCTGATAAATTTTGGTTCCGGTT
TTGGACCGGTCTAAAGTTTTGGTTTCTGACAGCTTTCTTGCTATATAGCTTTTTATGTGC
GTTCGTTGTTATGTAAATTGTGTATGTGTTTAAAGGAGGAGTTTGGTTGGGTGATGATAT
GGTGGGGTTGTGTTTATTATTATTGGTTGATTTGTTATATTTAATCATCGTGACATAAAA
TATTAGGGCCTATTTTGAATAATATTTATATATGTGGTAGTACTTTTGTGT
CT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RS1D130JQ 690 0 0
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TAGAGGTGGATTTGTATCCAATCTACCAGGTGATGTTCCTCGGGTGAATGGTCAGTTAGC
TGTGTCTCGTGCCTTTGGAGATAAGGGTCTTAAGACGCATCTGAGTTCAGAGCCTGATAT
TAGAGATGTTACTGTAGATAGCCAGACTGATGTTCTTGTCCTTGCCAGTGATGGGATTTG
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GGCGGCTAAGGAGTTAACAGCTGAAGCATTGAGAAGAGAGAGTAAAGACGACATATCTTG
TGTCGTGGTCCGTTTCAGATGACAAAACTCTGGATTTCATCAAGAAAGAACACAAAAGCT
GGATTACTGACTCTGATAAATTTTGGTTCCGGTTTTGGACCGGTCTAAAGTTTTGGTTTC
TGACAGCTTTCTTGCTATATAGCTTTTTATGTGCGTTCGTTGTTATGTAAATTGTGTATG
TGTTTAAAGGAGGAGTTTGGTTGGGTGATGATATGGTGGGGTTGTGTTTATTATTATTGG
TTGATTTGTTATATTTAATCATCGTGACATAAAATATTAGGGCCTATTTTGAATAATATT
TATATATGTGGTAGTACTTTTGTGTTTCGC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 6

CO CL922Contig1 1414 6 6 U
ATTATTTATGAATTTAGAGCTCAGAGTTATACTCCCAAAAGCTCTAAATCCGAATAAAGT
CAAACCGATCAAACAACGTCCATGTAATTTATGCAAAACGAACACTCAAACAGATGTCTC
GGTCTGTCTTTATTTATTTTTAGTACAATAGCTCCTTTTTAAGCTTTGATCACATCGTGG
TAACACAATCTTAAATGAGGAAGGAGACAGCCTTGTCAACTAGAGAAAGCCATTGATTCT
CCATCTCCGACTGCATCTTGATATCATAAAGGCTCTCTATTTTGATCTGCTTCGGGCTCA
CTGCAGCCATGGCTTCCTGTATCTCAGCTAACATGACTGAAGTATTCAGAGGAAGGACAA
GAAGCTCCCTGAGATTGTTCGGTCCAACCACTACCGGATCAGCTCCCCACATCAAATGGC
CAACCTGAAGGTTCCCTTCTTGCGTCAAATGCTTACCGTCAAAGAAGAGATAATCTCCAG
GCTTAGTGCATACGTTGTTAGTCGAACAACTGGTTCCATTGACAGACCCGGTTCCACAAC
AAGCTGCCATTCCTGTCTCAAATGTGTAGGTCTTGGAATTGATAACTCTGTGTTGGATCG
AGCTATAGAAGTCGTAAAACGAGTACTGGAAGCCACTGAGTTGTCTTGAAAGCTCAACCA
AGAGCTGCAACAGCTTCTTGTTATGCAAATCCGCCATCTCCGAAGGCAACCTCACGCATT
CCTGAACGTTTCCGTTGGCTTGTTTCACGGCTGGTAAGCAACCTAATGGTGCTAAGTTCT
GGAACGCGAACTTCCTACCTCCAGACCCGTAAATCACCTTGAGTTCTGCTTCTATAGCAG
TGATGACTCGATTTACAAAAGCTTGTTTCTGATCATCAGATGGATTGGGATTATTCTTGG
CGAAGCTCAAGTAATCATCAGAGCCGATGTAGAACAAGTAGACAGCTTCAGAACGGGCTT
GAGCTGACCACTTGTTCTTGCTGTCCGAGAACTTGATCACTTGTTGTGAGAAAGTCAACG
TCTCCGGAGGGGAGCCGAGGACGGTGGCGTCGGCAATGGAGAAGTTAGCTCCGTGAGAGA
AGTCCGCCGTGCCCTTGAGAATTGGAGGGATGTGAGGAATACCCATGAAACTAGCGAGAT
AGTCGGGAACGATACGACCATCGGACCACCGTCCAGTAGCTTCTCCGACAGTAATTCCAT
AGGGAGGAAAGCTAGCGTCGACACGGTTCGAAGAGACGAACTGTTTGTTGCCGGCGTCGT
AAAGACCGTCGCCGAAGACGAAGAGCGTCTGGGCGAAGGAGACGGTGGGGATGTGGAGAA
GGAGAAGTGAGAAGAAGGAGAGAGAGAAGAGGTGAGGTTTGGGATTCGCCATTGAAGCTC
TGAGAGAAACTGAAACCGACGCTGCTTTGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DG85JQ U 1
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CG
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TTGGCTTGTTTCACGGCTGGTAAGCAACCTAATGGTGCTAAGTTCTGGAACGCGAACTTC
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CGCCATTGAAGCTCTGAGAGAAACTGAAACCGACGCTGCTTTGTTTCC

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DS 



AS 1 7

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GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGTGATTTTGAAATTAAATTTTCACTCT
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GGTAGAGTTATTCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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G
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CTCTCCGACTACCTTATCCACCGGAGTTTCTTATCCCACTGTCTATTCTTCTCGCAGCTG
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TGGTGCCAGTACTGGATATTGGTTGCTTGCTTGACAGTCTTTGAGAGAGTTGGTGATGCC
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CAGTATGTTGCTGCACAATCAACTC

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GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA******GGTGATTTTGAAATTAAATTTTCACTCT
CCGACTACCTTATCCACCGGAGTTTCTTATCCCACTGTCTATTCTTCTCGCAGCTGTTCT
CCTCACAAGTACTCTTTCCTCCGCCGGGCAGTTTCCGATCTCTCGAATCATTCTTCAAGA
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GCCAGTACTGGATATTGGTTGCTTGCTTGACAGTCTTTGAGAGAGTTGGTGATGCCTTTG
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ATGTTGCTGCACAATCAACTCCAAG*CCGCAACA*CCTCAGAAACGTGGAG*CAGAGCTA
ATCAAGTTCCTGTTAAGCCTAAGAA

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G
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AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGTGATTTTGAAATTAAATTTTCACTCTCCGACTACCTTAT
CCACCGGAGTTTCTTATCCCACTGTCTATTCTTCTCGCAGCTGTTCTCCTCACAAGTACT
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TAAGCCTAAGAA

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TTTTTTCCCCCAACCCAATCACCCTCCCAAGTGGAAGCGGAACCAATGCAGATAGAAGAA
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GAGACAGTTATGGAGCAGACAATCAGGATGACTCGCGGGAGGTTGAGGAAGACGCGGTCA
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ATTCGTTGCGTTAGGTG
C

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DS 

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TGAGATTCTCCAGTATGTTGCTGCACAATCAACTCCAAGGCCGCAACAACCTCAGAAACG
TGGAGGCAGAGCTAATCAAGTTCCTGTTAAGCCTAAGAAATCCCCTAACATTCAAACAGA
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TTTCTTTCTTTTATTCAATTCGTTGCGTTAGGTGTAGCAATGGCACTCTTTGTTTTGTTT
GTTTCTCCTGATTTGGTAGAGTTATTCAGC

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 7

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ATCTCTCTCTTCCACACCCATTTTGATTCCATTGCTATCTTCGTAGCGTGAGAGATATCA
TCTCGCGGCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCCCCACCGACAAAAATACAATGGCGAACGCG
GCCGTTAGATTGGATCTGGACGGAAAGCCGATCAAGCCGATCACGATCTGCATGATCGGC
GCCGGAGGTTTCATCGGCTCTCACCTCTGCGAGAAGCTCCTGAACGAGACTCCACACAAG
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GAGTGGGCGGAGAGGATCCAGTTCCATCGCATCAACATCATGCATGATTCTAGACTCGAG
GGACTCGTCAAAATGGCAGATCTGACGATCAATCTCGCAGCGATCTGTACACCGGCTGAT
TACAATACGCGTCCTCTTGACACTATCTACAGCAACTTCACCGATGCTCTCCCTGTGGTT
AAGTACTGCTCAGAGAACAACAAGCGTCTTATTCACTTTTCCACCTGTGAAGTGTATGGG
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CTTGAGTTCACCATTGTAAGACCGTTTAACTGGATTGGACCTAGGATGGATTTCATCCCT
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ATGACTAAGGTTTACTCAAAAGTGAGTGGAGAGACAGCAATTGAGAGTCCAACGATAGAC
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AAACCTGTCGCTTCTTAGAGGTCCATCATCACTTCGAATCATTTAGTGGCTACTATTCCA
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TGTCTTTAAATTCGTTGTTGACGCTTTTATATCTTTGTACTTTGGCCGAAATTAAAAAAA
GGAATTGTTTTTTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

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AAAACTATTGGAAGCTTTCTTCCT

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G
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GG

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TGCTATATAGTATATGTTAATGTCTTTAAATTCGTTGTTGACGCTTCTATA*CTTTGTAC
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CC

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DS 

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CATATTTTCAACGTAGGTAACCCGAACAATGAAGTGACAGTAAGACAACTTGCTGAAATG
ATGACTAAGGTTTACTCAAAAGTGAGTGGAGAGACAGCAATTGAGAGTCCAACGATAGAC
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GGAATTGTTTTTTT
CC

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TGTTTTTTTTT*AATTCACCCATATCACTAAAAACAGGCCAGTTCATGCGAGTGATA*CA
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ATTCGTTGTTGACGCTTTTATATCTTTGTACTTTGGCCGAAATTAAAAAAAGGAATTGTT
TTTTTTAC

QA 1 548 1 548
DS 



AS 1 6

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GTTCTTGGATTTGATACTGTTGATGCTTACAAGAATGATACAACTTACTTTGGAGCAATT
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GGCCGGATCCACGAGTTACCCGGCGGCTACGACATCAACTACGTCATCGAGGGAAAGGCC
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TCCAGATTCCGTGAACCACAAGAATTTTCCGTCGCAGATTGTGAACCCTGGAGAGAGCTA
CTTGCATGTTATGCTCTTTAGGTTCACTGCTCACTGATTCCTTTTTCTTTTGTATATTTG
CTTTCGTAAGGTCGTCTCGGGGGGTTTGGGCTTTAAGGTTTATTGTTCACGATGAGTAAT
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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TATGGTGCTGTCATGACCTCTCTTCTTCTCCCAGACAGACATGGAAAGCAAGACGATGTT
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GTGGGGAGAGTGGCTAATAGAATTGGAGGTGCTAAGTTCAAGCTGAATGGTCAATTGTAC
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AACTTAGCCCTGCACACATACTGGAACCTC

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GG
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TTTGATACTGTTGATGCTTACAAGAATGATACAACTTACTTTGGAGCAATTGTGGGAAGA
GTGACTAATAGAATTGGAGGTGCTAAGTTCAAGCTAAATGGTCAATTGTACAAGACCGAT
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G
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CTCGGGGGGTTTGGGCTT
C

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TTCCTCGAGCCCCGCGAGATCGGTGGCCGGATCCACGAGTTACCCGGCT*CTACGACATC
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AAGGAACTCCTTACGACTTCCTCGAGCCCCGCGAGATCGGTGGCCGGATCCACGAGTTAC
CCGGCT*TTACGACATCAACTACGTCATCGAGGGAAAGGCCGGGAAGCATTTTAGGAAAA
CCGCTGTCGTGTTTGAAGAAGTTACTGGG*AGGAAGATGGAGCTGTGGTCGAACCAGCCA
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AAGAATTTTCCGTCGCAGATTGTGAACCCTGGAGAGAGCTACTTGCATGTTATGCTCTTT
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GGGGGTTTGGGCTTTAAGGTTTATTGTTCACGATGAGTAATAATTTGAATGATAGT

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DS 



AS 1 7

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AGTCGGTAGTGTGACTTTAATGGATGATAGCTTAGTGACCGAGGAGTCCTTGAACGCCAA
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TGATATTTCCTTGTTTGTAGAATAATTTGTTGAGCAACGGATATTTTGAATTGTCAGTTT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
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CACAGTGGATT

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AGATTAGGGTTTGGGGCGCTAATGCTCAGCGAAGATTGACCAAATCTCATATCTTGGTCT
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G
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ATTTGTTGAGCAACGGATATTTTGAATTG
CG

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G
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CCAAAAAAAA

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TGAATTATTCTAAATGTTTCGGTTATGATATTTCCTTGTTTGTAGAATAATTTGTTGAGC
AACGGATATTTTGAATTGTCAGTTTCAACTT
CC

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 7

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TC****TCAAAGAGGGAGCTTTGATTTGAATCTGAATTTTGATCAAAAGATGGGTTTCTT
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CC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 20 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
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AF RS1A932TF U 11
AF RS1CV27TF U 6
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TCTGGGCGTTGGAATTTGCTTCGCTAGAGGTCCCTCCACAAATTTGCTTCACTTCACCTA
GGTCATTACTGCCACAGTTTGCTGCTGGATGATGTGGGGGATTGTATACATTGCACAGAT
GAATCCTTTGATTGTCCCAATCCTAAGCGAAACAGAGTAGCATCCTCTCACTCAAACTCA
CTCAGGCTATGCGCAAAGTGAGTGGTAATACCGGGTTGCTTGCCTTTTTTTGCTTTCGAT
TCTTGTGTATTTTCAATCTTTTAAATGGGTTTGTAATTATGTTTCCTAGTGTGTGAACAA
AATCCATAAACTTTTTGCCTCTGTATTATTGGAAATTTCCATGTATTCAATTCCCAAAA

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DS 

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GGGATCCAAATCCAGATCATACCGAAGAAGAAGAAGAAGAAGACACGCACCATCCATCCA
TCCATCTCAAAGAGGGAGCTTTGATTTGAATTTGAATTTTGATCAAAAGATGGGTTTCCT
GATAACAAGCCTAATTTTCGTGGTCGTTGGGATAATTGCTTCTCTGTGCGTTCGAATTTG
CTTCGCTAGAGGTCCCTCCACAAATTTGCTTCACTTCACCTTGGTCATTACTGCCACGGT
TTGCTGCTGGATGATGTGGGCGATTGTATACATTGCACAGATGAATCCTCTGATTGTCCC
AATCCTAAGCGAAACAGAGTAGCATCCTCTCACTCAAACTCACTCAGGCTATGCGCAAAG
TGAGTGGTAATACCGGGTTGCTTGCCTTTTTTTGCTTTCGATTCTTGTGTATCTTCAATC
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CTCTGTATTATCGGAAATTTCCATGTATTCAATTCCCAAAACAAGCTGAGATGCTCAAAA
CAATGTATT*GTTGTTG

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DS 

RD RS1H073TF 557 0 0
G
GGATCCAAATCCAGATCATACCGAAGAAGAAGAAGAAGAAGACACGCACCATCCATCCAT
CCATCTCAAAGAGGGAGCTTTGATTTGAATCTGAATTTTGATCAAAAGATGGGTTTCCTG
ATAACAAGCCTAATCTTCGTGGTCGTTGGGATAATTGCTTCTCTGTGCGTTCGAATCTGC
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TGCTGCTGGATGATGTGGGCGATTGTATACATTGCACAGATGAATCCTCTGATTGTCCCA
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GAGTGGTAATACCGGGTTGCTTGCCTTCTTCTGCTTTCGATTCTTGTGTATCTTCAATCT
TTTAAATGGGTTTGTAATTATGTTTCCTAGTGTGTGAACAAAATCCATAAACTTTTTGCC
TCTGTATTATCGGAAATTTCCATGTATTCAATTCCCAAAACAAGCTGAGATGCTCAAAAC
AATGTATT*GTTGTTG

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DS 

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GGATCC
AAATCCAGATCATACCGAAGAAGAAGAAGAAGA***CACGCACCATCCATCCATC****T
CAAAGAGGGAGCTTTGATTTGGATCTGAATTTTGATCAAAAGATGGGTTTCTTGATAACA
AGCCTAATCTTCGTGGTCGTTGGGATAATTGCTTCTCTGTGCGTTCGAATCTGCTTCGCT
AGAGGTCCCTCCACAAATCTGCTTCACTTCACCTTGGTCATTACTGCCACAGTCTGCTGC
TGGATGATGTGGGCGATTGTATACATTGCACAGATGAATCCTCTGATTGTCCCAATCCTA
AGCGAAACAGAGTAGCATCCTCTCACTCAAACTCACTCAGGCTATACGCAAAGTGAGTGG
TAATACCGGGTTGCTTGCCTTCTTCTGCTTTCGATTCTTGTGTATCTTCAATCTTTTAAA
TGGGTTTGTAATTATGTTTCCTAGTGTGTGAACAAAATCCATAAACTTTTTGCCTCTGTA
TTATTGGAAATTTCCATGTATTCAATTCCCAAAACAAGCTGAGATGCTCAAAACAATGTA
TT*GTTGTTGAAATAATGTCTTTGAGAG
AGAGGGACGAGTTTTCT

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DS 

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AATCTTCGTGGTCGTTGGGATAATTGCTTCTCTGTGCGTTCGAATCTGCTTCGCTAGAGG
TCCCTCCACAAATCCGCTTCACTTCACCTTGGTCATTACTGCCACAGTCTGCTGCTGGAT
GATGTGGGCGATTGTATACATTGCACAGATGAATCCTCTGATTGTCCCAATCCTAAGCGA
AACAGAGTAGCATCCTCTCACTCAAACTCACTCAGGCTATGCGCAAAGTGAGTGGTAATA
CCGGGTTGCTTGCCTTCTTCTGCTTTCGATTCTTGTGTATCTTCAATCTTTTAAATGGGT
TTGTAATTCTGTTTCCTAGTGTGTGAACAAAATCCATAAACTTTTTGCCTCTGTATTATT
GGAAATTTCCATGTATTCTATTCCCAAAACAAGCTGAGATGCTCAAAACAATGTATTTGT
TGTTGAAATAATGTCTTTGAGA

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DS 

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GG
CAGATCATACCGAAGAAGAAGAAGAAGA***CACGCACCATCCATCCATC****TCAAAG
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AATCTTCGTGGTCGTTGGGATAATTGCTTCTCTGTGCGTTCGAATCTGCTTCGCTAGAGG
TCCCTCCACAAATCTGCTTCACTTCACCTAGGTCATTACTGCCACAGTCTGCTGCTGGAT
GATGTGGGCGATTGTATACATTGCACAGATGAATCCTCTGATTGTCCCAATCCTAAGCGA
AACAGAGTAGCATCCTCTCACTCAAACTCACTCAGGCTATGCGCAAAGTGAGTGGTAATA
CCGGGTTGCTTGCCTTCTTCTGCTTTCGATTCTTGTGTATCTTCAATCTTTTAAATGGGT
TTGTAATTATGTTTCCTAGTGTGTGAACAAAATCCATAAACTTTTTGCCTCTGTATTATT
GGAAATTTCCATGTATTCAATTCCCAAAACAAGCTGAGATGCTCAAAACAATGTATT*GT
TGTTGAAATAATGTCTTTGAGAG
AGAGGGACGAGTTTTCTC

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DS 

RD RS1CV27TF 597 0 0
GGAAATC
CAGATCATACCGAAGAAGAAGAAGAAGA***CACGCACCATCCATCCATC****TCAAAG
AGGGAGCTTTGATTTGAATCTGAATTTTGATCAAAAGATGGGTTTCTTGATAACAAGCCT
AATCTTCGTGGTCGTTGGGATAATTGCTTCTCTGTGCGTTCGAATCTGCTTCGCTAGAGG
TCCCTCCACAAATCCGCTTCACTTCACCTTGGTCATTACTGCCACAGTCTGCTGCTGGAT
GATGTGGGCGATTGTATACATTGCACAGATGAATCCTCTGATTGTCCCAATCCTAAGCGA
AACAGAGTAGCATCCTCTCACTCAAACTCACTCAGGCTATGCGCAAAGTGAGTGGTAATA
CCGGGTTGCTTGCCTTCTTCTGCTTTCGATTCTTGTGTATCTTCAATCTTTTAAATGGGT
TTGTAATTCTGTTTCCTAGTGTGTGAACAAAATCCATAAACTTTTTGCCTCTGTATTATT
GGAAATTTCCATGTATTCTATTCCCAAAACAAGCTGAGATGCTCAAAACAATGTATTTGT
TGTTGAAATAATGTCTTTGAGAGGAACGAGGTTTTATCCGTCCTTTTACC

QA 8 597 8 597
DS 



AS 1 7

CO CL928Contig1 1012 7 20 U
AGAGGAGGAGGCTCGTCTAAAGGTCGTAAATCTCCGACGATGAGCGAAACCGAAGCAAAC
GGCGTTCCCGATGATTCCGCTCCAGCGACTGTAGTAGTCTCCGCCGATGCGACGGAGCAT
AAAGCGATCGGAGTGATAGAATCGGTGGAGGAAGCAGTAGGAGGAGCAGAGAAATGGGTG
GATGATTTGCAGCGGACGGTGAAGGAATCGACGGATTCCGCCATGCGCTCCGCTCGTTCT
CTCCGTGAGAACTCCACCTCTCACTTCCGATCTATACAGGATTTCATTCCACATGCTTTG
AATCAGTATAAGACCTATGAGAATGCTTTCTTCAGTAAAGTTACAGAGGAATTGGGAAAC
GCAAAGGAGCATCCAGCTGCTGCTGCTGGAATTGGTCTCGCTGCTGGTCTCGTTCTTTTG
CGAGGGCCAAGAAGATTCTTGTTTCGTCATACTCTGGGTCGATTTCAGAGCGAAGAGGCA
CAGTTCTTGAGAGCTGAGAAGCATGTCCAGGAGTTGAACATGTCTGTGGACTTGATGAAA
AAGGAGAGCATGAAATTGCTTGAGAGGTCGGCTTTAGCAGAGAAGGATATGAAACGCGGT
CTTTCTGAACTCATGGACTCTGGAAACAATATACATCGTCTTGCTAAGTCTGTCCACAAG
GTTGAATGCGAAGCTGCAGATTTAATGGAAGGACTACGACAAATTCCTGGAAGGGAAGCT
ATCAAGCTTAGAGCCGAAGTGGCTTCCATGACTTCGCTCCTGAGACAGAAGAGGATTGCA
TTGAACAAAAGGATCATGAGGATGTCTGAGCTTGGAGTTCCGGTCTAATATACAACACAA
AACCACCATGTCTTTAGTTTTTCTCTCCACAAGGTATTTCAAGCATGTTCTCGTCAATAA
ACATCTAACTCTGTCTGAAAAACAAAACCTTAGCATGAGATAGAAATTTGTCTTTTGCTA
CTGTTCCTGATATTTGAAATTTGAGACCGTCAAAGAAAAAAAGTTGAGACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D870TF U 24
AF RS1GD94TF U 34
AF RS1GM81TF U 1
AF RS1BD09TF U 271
AF RS1D870JQ C 319
AF RS1GD94JQ C 458
AF RS1GM81JQ C 456
BS 1 46 RS1GM81TF
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BS 61 61 RS1D870TF
BS 62 243 RS1GM81TF
BS 244 244 RS1D870TF
BS 245 659 RS1GM81TF
BS 660 660 RS1BD09TF
BS 661 691 RS1GM81TF
BS 692 692 RS1BD09TF
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BS 760 760 RS1BD09TF
BS 761 769 RS1GM81TF
BS 770 913 RS1BD09TF
BS 914 914 RS1D870JQ
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BS 979 979 RS1D870JQ
BS 980 1012 RS1BD09TF

RD RS1D870TF 442 0 0
GG
GTAAATCTCCGACGATGAGCGAAACCGAAGCAAACGGCGTTCCCGATGATTCCGCTCCAG
CGACTGTAGTAGTCTCCGCCGATGCGACGGAGCATAAAGCGATCGGAGTGATAGAATCGG
TGGAGGAAGCAGTAGGAGGAGCAGAGAAATGGGTGGATGATTTGCAGCGGACGGTGAAGG
AATCGACGGATTCCGCCATGCGCTCCGCTCGTTCTCTCCGTGAGAACTCCACCTCTCACT
TCCGATCTATACAGGATTTCATTCCGCATGCTTTGAATCAGTATAAGACCTATGAGAATG
CTTTCTTCAGTAAAGTTACAGAGGAATTGGGAAACGCAAAGGAGCATCCAGCTGCTGCTG
CTGGAGTTGGTCTCGCTGCTGGTCTCGTTCTTTTGCGAGGGCCAAGAAGATTCTTGTTTC
GTCATACTCTGGGTCGATTT

QA 3 442 3 442
DS 

RD RS1GD94TF 664 0 0
GG
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AGTCTCCGCCGATGCGACGGAGCATAAAGCGATCGGAGTGATAGAATCGGTGGAGGAAGC
AGTAGGAGGAGCAGAGAAATGGGTGGATGATTTGCAGCGGACGGTGAAGGAATCGACGGA
TTCCGCCATGCGCTCCGCTCGTTCTCTCCGTGAGAACTCCACCTCTCACTTCCGATCTAT
ACAGGATTTCATTCCACATGCTTTGAATCAGTATAAGACCTATGAGAATGCTTTCTTCAG
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TCTCGCTGCTGGTCTCGTTCTTTTGCGAGGGCCAAGAAGATTCTTGTTTCGTCATACTCT
GGGTCGATTTCAGAGCGAAGAGGCACAGTTCTTGAGAGCTGAGAAGCATGTCCAGGAGTT
GAACATGTCTGTGGACTTGATGAAAAAGGAGAGCATGAAATTGCTTGAGAGGTCGGCTTT
AGCAGAGAAGGATATGAAACGCGGTCTTTCTGAACTCATGGACTCTGGAAACAATATACA
TCGTCTTGCTAAGTCTGTCCACAATGTTGAATGCGAAGCTGCAGATTTAATGGAAG
ACTACG

QA 3 658 3 658
DS 

RD RS1GM81TF 769 0 0
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TGCGTTCCCGATGATTCCGCTCCAGCGACTGTAGTAGTCTCCGCCGATGCGACGGAGCAT
AAAGCGATCGGAGTGATAGAATCGGTGGAGGAAGCAGTAGGAGGAGCAGAGAAATGGGTG
GATGATTTGCAGCGGACGGTGAAGGAATCGACGGATTCCGCCATGCGCTCCGCTCGTTCT
CTCAGTGAGAACTCCACCTCTCACTTCCGATCTATACAGGATTTCATTCCACATGCTTTG
AATCAGTATAAGACCTATGAGAATGCTTTCTTCAGTAAAGTTACAGAGGAATTGGGAAAC
GCAAAGGAGCATCCAGCTGCTGCTGCTGGAATTGGTCTCGCTGCTGGTCTCGTTCTTTTG
CGAGGGCCAAGAAGATTCTTGTTTCGTCATACTCTGGGTCGATTTCAGAGCGAAGAGGCA
CAGTTCTTGAGAGCTGAGAAGCATGTCCAGGAGTTGAACATGTCTGTGGACTTGATGAAA
AAGGAGAGCATGAAATTGCTTGAGAGGTCGGCTTTAGCAGAGAAGGATATGAAACGCGGT
CTTTCTGAACTCATGGACTCTGGAAACAATATACATCGTCTTGCTAAGTCTGTCCACAA*
GTTGAATGCGAAGCTGCAGATTTAATGGAAG*ACTACGACAAATTCCTGGAAGG*AAGCT
ATCAAGCTTAGAGCCGAAGTGGCTTCCATGACTTCGCTC*TGAGACAGA

QA 1 769 1 769
DS 

RD RS1BD09TF 742 0 0
G
CTATACAGGATTTCATTCCACATGCTTTGAATCAGTATAAGACCTATGAGAATGCTTTCT
TCAGTAAAGTTACAGAGGAATTGGGAAACGCAAAGGAGCATCCAGCTGCTGCTGCTGGAA
TTGGTCTCGCTGCTGGTCT*GTTCTTTTGCGAGGGCCAAGAAGATTCTTGTTTCGTCATA
CTCTGGGTCGATTTCAGAGCGAAGAGGCACAGTTCTTGAGAGCTGAGAAGCATGTCCAGG
AGTTGAACATGTCTGTGGACTTGATGAAAAAGGAGAGCATGAAATTGCTTG*GAGGTCGG
CTTTAGCAGAGAAGGATATGAAACGCGGTCTTTCTGAACTCATGGACTCTGGAAACAATA
TACATCGTCTTGCTAAGTCTGTCCACAAGGTTGAATGCGAAGCTGCAGATTTAATGGAAG
GACTACGACAAATTCCTGGAAGGGAAGCTATCAAGCTTAGAGCCGAAGTGGCTTCCATGA
CCTCGCTCCTGAGACAGAAGAGGATTGCATTGAACAAAAGGATCATGAGGATGTCTGAGC
TTGGAGTTCCGGTCTAATATACAACACAAAACCACCATGTCTTTAGTTTTTCTCTCCACA
AGGTATTTCAAGCATGTTCTCGTCAATAAACATCTAACTCTGCCTGAAAAACAAAACCTT
AGCATGAGATAGAAATTTGTCTTTTGCTACTGTTCCTGATATTTGAA*TTTGAGACCGTC
AAAGAAAAAAAGTTGAGACCG

QA 2 742 2 742
DS 

RD RS1D870JQ 673 0 0
GAGAATGCTTTCTTCAGTAAAGTTACAGAGGAATTGGGAAACGCAAAGGAGCATCCAGCT
GCTGCTGCTGGAGTTGGTCTCGCTGCTGGTCTCGTTCTTTTGCGAGGGCCAAGAAGATTC
TTGTTTCGTCATACTCTGGGTCGATTTCAGAGCGAAGAGGCACAGTTCTTGAGAGCTGAG
AAGCATGTCCAGGAGTTGAACATGTCTGTGGACTTGATGAAAAAGGAGAGCATGAAATTG
CTTGAGAGGTCGGCTTTAGCAGAGAAGGATATGAAACGCGGTCTTTCTGAACTCATGGAC
TCTGGAAACAATATACATCGTCTTGCTAAGTCTGTCCACAAGGTTGAATGCGAAGCTGCG
GATTTAATGGAAGGACTACGGCAAATTCCTGGAAGGGAAGCTATCAAGCTTAGAGCCGAA
GTGGCTTCCATGACTTCGCTCCTGAGACAGAAGAGGATTGCATTGAACAAAAGGATCATG
AGGATGTCTGAGCTTGGAGTTCCGGTCTAATATACAACACAAAACCACCATGTCTTTAGT
TTTTCTCTCCACAAGGTATTTCAAGCATGTTCTCGTCAATAAACATCTAACTCTGTCAGA
AAAACAAAACCTTAGCATGAGATAGAAATTTGTCTTTTGCTACTGTTCCTGATATTTGAA
ATTTGAGACCGT
T

QA 1 672 1 672
DS 

RD RS1GD94JQ 534 0 0
GTCGATTTCAGAGCGAAGAGGCACAGTTCTTGAGAGCTGAGAAGCATGTCCAGGAGTTGA
ACATGTCTGTGGACTTGATGAAAAAGGAGAGCATGAAATTGCTTGAGAGGTCGGCTTTAG
CAGAGAAGGATATGAAACGCGGTCTTTTTGAACTCATGGACTCTGGAAACAATATACATC
GTCTTGCTAAGTCTGTCCACAAGGTTGAATGCGAAGCTGCAGATTTAATGGAAGGACTAC
GACAAATTCCTGGAAGGGAAGCTATCAAGCTTAGAGCCGAAGTGGCTTCCATGACTTCGC
TCCTGAGACAGAAGAGGATTGCATTGAACAAAAGGATCATGAGGATGTTTGAGCTTGGAG
TTCCGGTTTAATATACAACACAAAACCACCATGTCTTTAGTTTTTCTCTCCACAAGGTAT
TTCAAGCATGTTTTCGTCAATAAACATCTAACTCTGTTTGAAAAACAAACCCTTAGCATG
AGATAGAAATTTGTCTT**GCTACTGTTCCTGATATTTGAAATTTGAGACCGT
T

QA 1 533 1 533
DS 

RD RS1GM81JQ 536 0 0
GGGTCGATTTCAGAGCGAAGAGGCACAGTTCTTGAGAGCTGAGAAGCATGTCCAGGAGTT
GAACATGTCTGTGGACTTGATGAAAAAGGAGAGCATGAAATTGCTTGAGAGGTCGGCTTT
AGCAGAGAAGGATATGAAACGCGGTCTTTCTGAACTCATGGACTCTGGAAACAATATACA
TCGTCTTGCTAAGTCTGTCCACAAGGTTGAATGCGAAGCTGCAGATTTAATGGAAGGACT
ACGACAAATTCCTGGAAGGGAAGCTATCAAGCTTAGAGCCGAAGTGGCTTCCATGACTTC
GCTCCTGAGACAGAATAGGATTGCATTGAACAAAAGGATCATGAGGATGTCTGAGCTTGG
AGTTCCGGTCTAATATACAACACAAAACCACCATGTCTTTAGTTTTTCTCTCCACAAGGT
ATTTCAAGCATGTTCTCGTCAATAAACACCTAACTCTGTCTGAAAAACAAAACCTTAGCA
TGAGATAGAAATTTGTCTTTTGCTACTGTTCCTGATATTTGAAATTTGAGACCGT
T

QA 1 535 1 535
DS 



AS 2 5

CO CL929Contig1 725 3 16 U
ATGAAGATTGAAGTGCTTCTTACAAGGCTATTAGTTCTTAATCTCATCCAAATCAATGTA
AACTGCTTAAAAGTAGATAGACTGAGTGGGATGTGTTCCAAATAACCATGATTAAACCTA
AACACATAGAAAGCAAAAACAATCCTCAGCTACAACAACAACAAGTACAAACGTTTTGGT
CATTTCAGGATCAGAAACATTTCCGGTGAACCACAGATGGTCCAGTCTCGTCGTAGTCAG
CTTTAGTAACATGCTGATTCTGCGGAAACACCACCTTGGCTAGTATTGCTCCTCCTACCC
AAGCCGAATACAATCCCAAATTCTCATGCATATATTCCGGCGGCTTCACCAGCGTTGGCC
TAATAGCAGATGAGCACAAGCTTGCTTCTTTCTGAAACCTGCCTTCGAATCCTGTCATGG
AGGTTGTACCACCACAAAGCACAGTGTTCTCCAAGAGTTGCCTATGGTTCTCAGATGATA
CTGTGGAGATAATCCGGACAAGCTGTTCAACGATTCCATGCTCCTGGAGTCCCAGTATTG
ATGGCTGAAACAAAGCTTCACCAACAGAGTATCTCTCTCGCCCAATGCTTATCACCTGTC
CATCAGGAAGTGTATGCTGCTCAACTTCACAGTTTTGAGTTTTCTCGTAAGCAAGTTAGT
CCTCAGCACAGTTTGCATACTGTTCCTTCAGCGTTTCAACATCAGACATGCTGAGATTCA
TGGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 

AF RS1GY46JQ U 54
AF RS1CG36JQ U 1
AF RS1A923JQ U 45
BS 1 61 RS1CG36JQ
BS 62 62 RS1A923JQ
BS 63 71 RS1CG36JQ
BS 72 72 RS1A923JQ
BS 73 126 RS1CG36JQ
BS 127 127 RS1A923JQ
BS 128 128 RS1CG36JQ
BS 129 130 RS1A923JQ
BS 131 178 RS1CG36JQ
BS 179 179 RS1A923JQ
BS 180 346 RS1CG36JQ
BS 347 347 RS1A923JQ
BS 348 420 RS1CG36JQ
BS 421 421 RS1A923JQ
BS 422 723 RS1CG36JQ
BS 724 725 RS1A923JQ

RD RS1GY46JQ 601 0 0
CAATGTAAACTGCTTAAAAGTAGATAGACTGAGTGGGATGTGTTCCAAATAACCATGATT
AAACCTAAACACATAGAAAGCAAAAACAATCCTCAGCTACAACAACAACAAGTACAAACG
TTTTGGTCATTTCAGGATCAAAAACATTTCCGGTGAACCACAGATGGTCCAGTCTCGTCG
TAGT*AGCTTTAGTAACATGCTGATTCTGCGGAAATACCACCTTGGCTAGTATTGCTCCT
CCTACCCAAGCCGAATACAATCCCAAATTCTCATGCATATATTCCGGCGGTTTCACCAGC
GTTGGCCTTATAGCAAATGAGCACAAGCTTGCTTCTTTCTGAAAC*TGCCTTCGAATCCT
GTCATGGAGGTTGTACCACCACAAAGCACAGTGTTCTCCAAGAGTTGCCTATGGTTCTCT
GATGATACTGTGGAGATAATCCGGACAAGCTGTTCAACGATTCCATGCTCCTGGAGTCCC
AGTATTGATGGCTGAAACAAAGCTTCACCAACAGAGTATCTCTCTCGCCCAATGCTTATC
ACCTGTCCATCAGGAAGTGTATGCTGCTCAACTTCACAGTTTTGAGTTTTCTCGTAAGCA
A

QA 1 601 1 601
DS 

RD RS1CG36JQ 723 0 0
ATGAAGATTGAAGTGCTTCTTACAAGGCTATTAGTTCTTAATCTCATCCAAATCAATGTA
AGCTGCTTAAATGTAGATAGACTGAGTGGGATGTGTTCCAAATAACCATGATTAAACCTA
AACACAGAAGAAGCAAAAACAATCCTCAGCTACAACAACAACAAGTACAAACGTTTTGTT
CATTTCAGGATCAGAAACATTTCCGGTGAACCACAGATGGTCCAGTCTCGTCGTAGTCAG
CTTTAGTAACATGCTGATTCTGCGGAAACACCACCTTGGCTAGTATTGCTCCTCCTACCC
AAGCCGAATACAATCCCAAATTCTCATGCATATATTCCGGCGGCTTAACCAGCGTTGGCC
TAATAGCAGATGAGCACAAGCTTGCTTCTTTCTGAAACCTGCCTTCGAATCCTGTCATGG
GGGTTGTACCACCACAAAGCACAGTGTTCTCCAAGAGTTGCCTATGGTTCTCAGATGATA
CTGTGGAGATAATCCGGACAAGCTGTTCAACGATTCCATGCTCCTGGAGTCCCAGTATTG
ATGGCTGAAACAAAGCTTCACCAACAGAGTATCTCTCTCGCCCAATGCTTATCACCTGTC
CATCAGGAAGTGTATGCTGCTCAACTTCACAGTTTTGAGTTTTCTCGTAAGCAAGTTAGT
CCTCAGCACAGTTTGCATACTGTTCCTTCAGCGTTTCAACATCAGACATGCTGAGATTCA
TGG

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1A923JQ 681 0 0
GGTCG
AAATCAATGTAAACTGCTTAAAAGTAGATAGACTGAGTGGGATGTGTTCCAAATAACCAT
GATTAAACCTAAACACATAGAAAGCAAAAACAATCCTCAGCTACAACAACAACAAGTACA
AACGTTTTGGTCATTTCAGGATCAGAAACATTTCCGGTGAACCACAGATGGTCCAGTCTC
GTCGTAATCAGCTTTAGTAACATGCTGATTCTGCGGAAACACCACCTTGGCTAGTATTGC
TCCTCCTACCCAAGCCGAATACAATCCCAAATTCTCATGCATATATTCCGGCGGCTTCAC
CAGCGTTGGCCTAATAGCAGATGAACACAAGCTTGCTTCTTTCTGAAACCTGCCTTCGAA
TCCTGTCATGGAGGTTGTACCACCACAAAGCACAGTGTTCTCCAAGAGTTGCCTATGGTT
CTCAGATGATACTGTGGAGATAATCCGGACAAGCTGTTCAACGATTCCATGCTCCTGGAG
TCCCAGTATTGATGGCTGAAACAAAGCTTCACCAACAGAGTATCTCTCTCGCCCAATGCT
TATCACCTGTCCATCCGGAAGTGTATGCTGCTCAACTTCACAGTTTTGAGTTTTCTCGTA
AGCAAGTTCGTCCTCAGCACAGTTTGCATACTGTTCCTTCAGCGTTTCAACATCAGACAT
GCTGAGATTCATGGAA

QA 6 681 6 681
DS 



CO CL929Contig2 948 2 6 U
GGGAAACGAATGGTTGATGATGGGTCTGATAATAACCCCACCACCGCCGTGTTTGAAGAC
GTCACTCTTGATCCGATTGAAAGGGGGTTCATCAGAGACTGGGACGCTATGGAGGATCTG
TTGCGTTACGTTGTGTACACTGGGCTTGGATGGGAAGAGGGAACCGATCTTACTAAACTA
TTCGCTCAAGAGCTTGGGAAATCCAACCCTTCCATGAATCTCAGCATGTCTGATGTTGAA
ACGCTGAAGGAACAGTATGCAAACTGTGCTGAGGACGAACTTGCTTACGAGAAAACTCAA
AACTGTGAAGTTGAGCAGCATACACTTCCTGATGGACAGGTGATAAGCATTGGGCGAGAG
AGATACTCCGTTGGTGAAGCTTTGTTTCAGCCATCAATACTGGGACTCCAGGAGCATGGA
ATCGTTGAACAGCTTGTCCGGATTATCTCCACAGTATCATCAGAGAACCATAGGCAACTC
TTGGAGAACACTGTGCTTTGTGGTGGTACAACCTCCATGACAGGATTCGAAGGCAGGTTT
CAGAAAGAAGCAAGCTTGTGCTCATCTGCTATAAGGCCAACGCTGGTGAAACCGCCGGAA
TATATGCATGAGAATTTGGGATTGTATTCGGCTTGGGTAGGAGGAGCAATACTAGCCAAG
GTGGTATTTCCGCAGAATCAGCATGTTACTAAAGCTGACTACGACGAGACTGGACCATCT
GTGGTTCACCGGAAATGTTTCTGATCCTGAAATGACCAAAACGTTTGTACTTGTTGTTGT
AGCCGAGGATTGTTTTTGCTTTCTATGTGTTTAGGTTTAATCATGGTTATTTGGAACACA
TCCCACTCAGTCTATCTACTTTTAAGCAGTTTACATTGATTTCGACCAGATTAAGAACTA
ATAGCCTTGTAAGAAGCACTTCAATCTTCATAAAACCAGTAGTATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GY46TF U 1
AF RS1CM82JQ C 186
BS 1 368 RS1GY46TF
BS 369 369 RS1CM82JQ
BS 370 536 RS1GY46TF
BS 537 537 RS1CM82JQ
BS 538 628 RS1GY46TF
BS 629 948 RS1CM82JQ

RD RS1GY46TF 628 0 0
GGGAAACGAATGGTTGATGATGGGTCTGATAATAACCCCACCACCGCCGTGTTTGAAGAC
GTCACTCTTGATCCGATTGAAAGGGGGTTCATCAGAGACTGGGACGCTATGGAGGATCTG
TTGCGTTACGTTGTGTACACTGGGCTTGGATGGGAAGAGGGAACCGATCTTACTAAACTA
TTCGCTCAAGAGCTTGGGAAATCCAACCCTTCCATGAATCTCAGCATGTCTGATGTTGAA
ACGCTGAAGGAACAGTATGCAAACTGTGCTGAGGACGAACTTGCTTACGAGAAAACTCAA
AACTGTGAAGTTGAGCAGCATACACTTCCTGATGGACAGGTGATAAGCATTGGGCGAGAG
AGATACTCTGTTGGTGAAGCTTTGTTTCAGCCATCAATACTGGGACTCCAGGAGCATGGA
ATCGTTGAACAGCTTGTCCGGATTATCTCCACAGTATCATCAGAGAACCATAGGCAACTC
TTGGAGAACACTGTGCTTTGTGGTGGTACAACCTCCATGACAGGATTCGAAGGCAG*TTT
CAGAAAGAAGCAAGCTTGTGCTCATCTGCTATAAGGCCAACGCTGGTGAAACCGCCGGAA
TATATGCATGAGAATTTGGGATTGTATT

QA 1 628 1 628
DS 

RD RS1CM82JQ 763 0 0
TCAAGAGCTTGGGAAATCCAACCCTTCCATGAATCTCAGCATGTCTGATGTTGAAACGCT
GAAGGAACAGTATGCAAACTGTGCTGAGGACGAACTTGCTTACGAGAAAACTCAAAACTG
TGAAGTTGAGCAGCATACACTTCCTGATGGACAGGTGATAAGCATTGGGCGAGAGAGATA
CTCCGTTGGTGAAGCTTTGTTTCAGCCATCAATACTGGGACTCCAGGAGCATGGGATCGT
TGAACAGCTTGTCCGGATTATCTCCACAGTATCATCAGAGAACCATAGGCAACTCTTGGA
GAACACTGTGCTTTGTGGTGGTACAACCTCCATGACAGGATTCGAAGGCAGGTTTCAGAA
AGAAGCAAGCTTGTGCTCATCTGCTATAAGGCCAACGCTGGTGAAACCGCCGGAATATAT
GCATGAGAATTTGGGATTGTATTCGGCTTGGGTAGGAGGAGCAATACTAGCCAAGGTGGT
ATTTCCGCAGAATCAGCATGTTACTAAAGCTGACTACGACGAGACTGGACCATCTGTGGT
TCACCGGAAATGTTTCTGATCCTGAAATGACCAAAACGTTTGTACTTGTTGTTGTAGCCG
AGGATTGTTTTTGCTTTCTATGTGTTTAGGTTTAATCATGGTTATTTGGAACACATCCCA
CTCAGTCTATCTACTTTTAAGCAGTTTACATTGATTTCGACCAGATTAAGAACTAATAGC
CTTGTAAGAAGCACTTCAATCTTCATAAAACCAGTAGTATACC

QA 1 763 1 763
DS 



AS 2 7

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TGACAATGGTTTCAAGTGACTGACTAGCAAGAAGCAAAAGATGAAGTACAAACATAAGAC
AAAGAGAAAAAGTAAGCAAAGTTCACATTGACATGAAGTCCCTCGTGGCTTACCAGATTT
ATTACTGTTTGATCAGATTCCTGATTACGTATTGCAATATACCTCCGTGATTGAAATAAG
CCAACTCCACCTCTGTGTCGAATCGGAGTGTACATGTGAAAGATTTGCCATTGTTTGTGA
TAACCGTTACATCTTGTCCTGGTTTGATCTCACTGACATTGCTTGGGAGCTCAATGGTGT
AGAGCTCCTCACCGGTTAAGCCTAGAGTCTCCGCATCTTCTCCTGTCTTGAAGCACAATG
GAATGATTCCCATTCCCACCAGATTGCTTCGGTGAATCCTCTCAAAGCTCTTTGAGATCA
CAGCTTTCACTCCCAGAAGCATTGGACCCTTAGCAGCCCAATCACGGGAACTTCCACTTC
CATACTCAGCACCAGCCAAAATGACTGTGTCACGTCCCTCGTTCCTGTATTTCATGGCAG
CATCGAAGACAGAAAGCTTCTCTCCACTGGGAATGTGAACTGTTTT*GGGACCAACTTCT
CCTTTCAAGTGTTTGTTGACAATACGGATATTGGCGAAAGTGCCTCTCGCCATTATCTCA
TCATTACCACGGCGACTCCCGTAAGAGTTGAAGTCTCTTCTATCCACCCCTCGCTCCATC
AAGTACTTAGCCGCAGGACTGTCTTTGTGGATGCTACCAGCTGGTGAGATGTGATCAGTG
GTGATACTGTCTCCGAAATTGAGCAAACAGTACGCGTCTTTCACGCCATGTGGACCGGGT
GGAGACATGGTCATGCCCTTGAAATAAGGTGGCTCGTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EN31JQ U 98
AF RS1H584JQB U 1
AF RS1B507JQ U 1
AF RS1EN31TF C 108
AF RS1B507TF C 235
BS 1 549 RS1B507JQ
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QA 1 109 1 109
DS 

RD RS1H584JQB 707 0 0
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QA 1 707 1 707
DS 

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TGACAATGGTTTCAAGTGACTGACTAGCAAGAAGCAAAAGATGAAGTACAAACATAAGAC
AAAGAGAAAAAGTAAGCAAAGTTCACATTGACATGAAGTCCCTCGTGGCTTACCAGATTT
ATTACTGTTTGATCAGATTCCTGATTACGTATTGCAATATACCTCCGTGATTGAAATAAG
CCAACTCCACCTCTGTGTCGAATCGGAGTGTACATGTGAAAGATTTGCCATTGTTTGTGA
TAACCGTTACATCTTGTCCTGGTTTGATCTCACTGACATTGCTTGGGAGCTCAATGGTGT
AGAGCTCCTCACCGGTTAAGCCTAGAGTCTCCGCATCTTCTCCTGTCTTGAAGCACAATG
GAATGATTCCCATTCCCACCAGATTGCTTCGGTGAATCCTCTCAAAGCTCTTTGAGATCA
CAGCTTTCACTCCCAGAAGCATTGGACCCTTAGCAGCCCAATCACGGGAACTTCCACTTC
CATACTCAG***CAGCCAAAATGACTGTGTCACGTCCCTCGTTCCTGTATTTCATGGCAG
CATCGAAGACAGAAAGCTTCTCTCCACTGGGAATGTGAACTGTTTT*GGGACCAACTTCT
CCTTTCAAGTGTTTGTTGACAATACGGATATTGGCGAAAGTGCCTCTCGCCATTATCTCA
TCATTACCACGGCGACTCCCGTAAGAGTTGAAGTCTCTTCTATCCACCCCTCGCTCCAT

QA 1 779 1 779
DS 

RD RS1EN31TF 682 0 0
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GCTTACCAGATTTATTACTGTTTGATCAGATTCCTGATTACGTATTGCAATATACCTCCG
TGATTGAAATAAGCCAACTCCACCTCTGTGTCGAATCGGAGTGTACATGTGAAAGATTTG
CCATTGTTTGTGATAACCGTTACATCTTGTCCTGGTTTGATCTCACTGACATTGCTTGGG
AGCTCAATGGTGTAGAGCTCCTCACCGGTTAAGCCTAGAGTCTCCGCATCTTCTCCTGTC
TTGAAGCACAACGGAATGATTCCCATTCCCACCAGATTGCTTCGGTGAATCCTCTCAAAG
CTCTTTGAGATCACAGCTTTCACTCCCAGAAGCATTGGACCCTTAGCAGCCCAATCACGG
GAACTTCCACTTCCATACTCAGCACCAGCCAAAATGACTGTGTCACGTCCCTCGTTCCTG
TATTTCATGGCAGCATCGAAGACAGAAAGCTTCTCTCCACTGGGAATGTGAACTGTTTT*
GGGACCAACTTCTCCTTTCAAGTGTTTGTTGACAATACGGATATTGGCGAAAGTGCCTCT
CGCCATTATCTCATCATTACCACGACGACTCCCGTAAGAGTTGAAGTCTCTTCTATCCAC
CCCTCGCTCCATCAAGTACTT
C

QA 1 681 1 681
DS 

RD RS1B507TF 704 0 0
AATAAGCCAACTCCACCTCTGTGTCGAATCGGAGTGTACATGTGAAAGATTTGCCATTGT
TTGTGATAACCGTTACATCTTGTCCTGGTTTGATCTCACTGACATTGCTTGGGAGCTCAA
TGGTGTAGAGCTCCTCACCGGTTAAGCCTAGAGTCTCCGCATCTTCTCCTGTCTTGAAGC
ACAATGGAATGATTCCCATTCCCACCAGATTGCTTCGGTGAATCCTCTCAAAGCTCTTTG
AGATCACAGCTTTCACTCCCAGAAGCATTGGACCCTTAGCAGCCCAATCACGGGAACTTC
CACTTCCATACTCAG***CAGCCAAAATGACTGTGTCACGTCCCTCGTTCCTGTATTTCA
TGGCAGCATCGAAGACAGAAAGCTTCTCTCCACTGGGAATGTGAACTGTTTT*GGGACCA
ACTTCTCCTTTCAAGTGTTTGTTGACAATACGGATATTGGCGAAAGTGCCTCTCGCCATT
ATCTCATCATTACCACGGCGACTCCCGTAAGAGTTGAAGTCTCTTCTATCCACCCCTCGC
TCCATCAAGTACTTAGCCGCAGGACTGTCTTTGTGGATGCTACCAGCTGGTGAGATGTGA
TCAGTGGTGATACTGTCTCCGAAATTGAGCAAACAGTACGCGTCTTTCACGCCATGTGGA
CCGGGTGGAGACATGGTCATGCCCTTGAAATAAGGTGGCTCGTC

QA 1 704 1 704
DS 



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GGTGCACCACATGCATCGGAAACTCGGGGGATATCCATGAAGCTGTGGCTTCAGCAATAG
TTGATAATGACTTGGTGGCATCCGCTGTCTTGTCCGGGAACAGAAACTTCGAGGGACGTG
TTCATCCGTTAACAAGAGCTAACTACCTAGCTTCCCCTCCACTTGTTGTAGCCTATGCGC
TGGCTGGCACTGTTGACATTGATTTCGAGACAGAGCCTATTGGAACTGGTAAAGACGGCA
AACAGATATTTTTCAGGGACATCTGGCCCTCTAACAAAGAAGTTGCCGAGGTTGTGCAAG
CTAGCGTCCTTCCTGACATGTTCAAAGCTACATATGAAGCAATTACGAAAGGCAATTCCA
TGTGGAATGAGTTATCTGTCGCGTCAGGCACACTCTACGAGTGGGATCCAAAATCAACTT
ACATTCACGAGCCTCCTTATTTCAAGGGCATGACCATGTCTCCACCAGGTCCACATGGTG
TGAAAGACGCTTACTGTTTGCTCAATTTCGGAGACAGTATTACCACAGATCACATCTCAC
CAGCTGGTAGCATCCACAAGGACAGTCCCGCGGCTAAGTACTTGATGGAACGTGGTGTGG
ACAGAAGAGACTTCAACTCTTACGGGAGTCGCCGTGGTAATGATGAGATTATGGCGAGAG
GTACTTTCGCCAATATCCGTATTGTTAACAAACACTTGAAAGGAGAAGTTGGTCCCAAGA
CAGTTCACATTCCCAGTGGAGAGAAGCTTTCTGTCTTCGATGCTGCCATGAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BV81TF U 1
AF RS1CW82TF U 192
BS 1 247 RS1BV81TF
BS 248 248 RS1CW82TF
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BS 688 834 RS1CW82TF

RD RS1BV81TF 687 0 0
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GGTGCACCACATGCATCGGAAACTCGGGGGATATCCATGAAGCTGTGGCTTCAGCAATAG
TTGATAATGACTTGGTGGCATCCGCTGTCTTGTCCGGGAACAGAAACTTCGAGGGACGTG
TTCATCCGTTAACAAGAGCTAACTACCTAGCTTCCCCTCCACTTGTTGTAGCCTATGCGC
TGGCTGGTACTGTTGACATTGATTTCGAGACAGAGCCTATTGGAACTGGTAAAGACGGCA
AACAGATATTTTTCAGGGACATCTGGCCCTCTAACAAAGAAGTTGCCGAGGTTGTGCAAG
CTAGCGTCCTTCCTGACATGTTCAAAGCTACATATGAAGCAATTACGAAAGGCAATTCCA
TGTGGAATGAGTTATCTGTCGCGTCAGGCACACTCTACGAGTGGGATCCAAAATCAACTT
ACATTCACGAGCCTCCTTATTTCAAGGGCATGACCATGTCTCCACCAGGTCCACATGGTG
TGAAAGACGCTTACTGTTTGCTCAATTTCGGAGACAGTATTACCACAGATCACATCTCAC
CAGCTGGTAGCATCCACAAG*ACAGTCCCGCGGCTAAGTACTTGATGGAACGTGGTGTGG
ACAGAAGAGACTTCAACTCTTACGGGA

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1CW82TF 643 0 0
G
CAAGAGCTAACTACCTAGCTTCCCCTCCACTTGTTGTAGCCTATGCGCTGGCTGGCACTG
TTGACATTGATTTCGAGACAGAGCCTATTGGAACTGGTAAAGACGGCAAACAGATATTTT
TCAGGGACATCTGGCCCTCTAACAAAGAAGTTGCCGAGGTTGTGCAAGCTAGCGTCCTTC
CTGACATGTTCAAAGCTACATATGAAGCAATTACGAAAGGCAATTCCATGTGGAATGAGT
TATCTGTCGCGTCAGGCACACTCTACGAGTGGGATCCAAAATCAACTTACATTCACGAGC
CTCCTTATTTCAAGGGCATGACCATGTCTCCACCAGGTCCACATGGTGTGAAAGACGCTT
ACTGTTTGCTCAATTTCGGAGACAGTATTACCACAGATCACATCTCACCAGCTGGTAGCA
TCCACAAGGACAGTCCCGCGGCTAAGTACTTGATGGAGCGTGGTGTGGACAGAAGAGACT
TCAACTCTTACGGGAGTCGCCGTGGTAATGATGAGATTATGGCGAGAGGTACTTTCGCCA
ATATCCGTATTGTTAACAAACACTTGAAAGGAGAAGTTGGTCCCAAGACAGTTCACATTC
CCAGTGGAGAGAAGCTTTCTGTCTTCGATGCTGCCATGAAAT

QA 2 643 2 643
DS 



AS 1 7

CO CL931Contig1 807 7 2 U
CTCCAAAAGCTGCATAATTGAAAACCAAAATAGTCTGAGAGATTCAAAAACAAGGTAGAA
GAAAATTAAGAAAAAGGCTCAAACGCCATCAAAGTTTTGTTGTAACGCAAAGAAAAACCA
AAGACGAGAGAAGTCTCATCATTTAGCTCCCTTCTCGACTGCGGCCTTGGTGACCTTAGC
ACCGGTTGGGTCCTTCTTGTCGACGCTCTTGATAACACCAACAGCCACCGTCTGCCTCAT
GTCCCTAACAGCGAAACGACCCAATGGTGGGTACTCGGAGAAAGTCTCGACAACCATGGG
CTTGGTTGGAGTCATCTTAACCATACCAGCATCACCATTCTTCAAGAACTTGGGCTCCTT
CTCGATCTCCTTACCAGATCGCCTGTCAATCTTGGTGAGGATCTCAGAGAACTTGACTGC
AATGTGGGATGTGTGGCAATCAAGAACCGGAGCGTAACCGTTACCGATCTGACCAGGGTG
GTTCAAGGTGATGACCTGGGAGGTGAAGTTGGCAGCACCCTTGGCAGGGTCATCCTTGGA
GTTGGATGCAACATACCCACGCTTAAGATCCTTCACAGCAACATTCTTGACATTGAATCC
AACGTTGTCACCTGGAAGAGCCTCCACAAGAGACTCGTGGTGCATCTCAACGGACTTAAC
CTCAGTGGTCAACCCTGAAGGAGCGAAGGTGACAACCATACCGGGCTTGAGCATACCGGT
CTCAACACGTCCCACTGGCACCGTTCCAATACCACCGCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTC
CCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT


BQ
30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 
20 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 15 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CU60TF C 1
AF RS1DR73JQ U 1
AF RS1D832JQ U 1
AF RS1A318JQ U 1
AF RS1A318TR U 1
AF RS1A318TV C 1
AF RS1A318TF C 1
BS 1 751 RS1A318JQ
BS 752 807 RS1A318TF

RD RS1CU60TF 245 0 0
A
TCCAAAAGCTGCATAATTGAAAACCAAAATAGCCTGAGAGATTCAAAAACAAGGTAGAAG
AAAATTAAGAAAAAGGTTCAAACGCCATCAAAGTTTTGTTGTAACGCAAAGAAAAACCAA
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CCGGTTGGGTCCTTCTTGTCGACGCTCTTGATAACACCAACAGCCACCGTCTGCCTCATG
TCCC

QA 2 245 2 245
DS 

RD RS1DR73JQ 563 0 0
A
TCCAAAAGCTGCATAATTGAAAACCAAAATAGTCTGAAAGATTCAAAAACAAGGTAAAAA
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CCGGTTGGGTCCTTCTTGTCGACGCTCTTGATAACACCAACAGCCACCGTCTGCCTCATG
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ATGTGGGATGTGTGGCAATCAAGAACCGGAACGTAACCGTTACCGATCTGACCAGGGTGG
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TTGGATGCAACATACCCACGCT

QA 2 563 2 563
DS 

RD RS1D832JQ 559 0 0
A
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AAAATTAAAAAAAAGGCTCAAACGCCATCAAAGTTTTGTTGTAACGCAAAGAAAAACCAA
AGACGAAAGAAGTCTCATCATTTAGCTCCCTTCTTGACTGCGGCCTTGGTGACCTTAGCA
CCGGTTGGGTCCTTCTTGTCGACGCTCTTGATAACACCAACAGCCACCGTCTGCCTCATG
TCCCTAACAGCGAAACGACCCAATGGTGGGTACTCGGAAAAAGTCTCGACAACCATGGGC
TTGGTTGGAGTCATCTTAACCATACCAGCATCACCATTCTTCAAGAACTTGGGCTCCTTC
TCGATCTCCTTACCAAATCGCCTGTCAATCTTGGTGAGGATCTCAAAAAACTTGACTGCA
ATGTGGGATGTGTGGCAATCAAGAACCGGAGCGTAACCGTTACCGATCTGACCAGGGTGG
TTCATGATGATGACCTGGGAGGTGAAGTTGGCAGCACCCTTGGCAGGGTCATCCTTGGAG
TTGGATGCAACATACCCA

QA 2 559 2 559
DS 

RD RS1A318JQ 758 0 0
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AAGACGAGAGAAGTCTCATCATTTAGCTCCCTTCTCGACTGCGGCCTTGGTGACCTTAGC
ACCGGTTGGGTCCTTCTTGTCGACGCTCTTGATAACACCAACAGCCACCGTCTGCCTCAT
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CTTGGTTGGAGTCATCTTAACCATACCAGCATCACCATTCTTCAAGAACTTGGGCTCCTT
CTCGATCTCCTTACCAGATCGCCTGTCAATCTTGGTGAGGATCTCAGAGAACTTGACTGC
AATGTGGGATGTGTGGCAATCAAGAACCGGAGCGTAACCGTTACCGATCTGACCAGGGTG
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GTTGGATGCAACATACCCACGCTTAAGATCCTTCACAGCAACATTCTTGACATTGAATCC
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CTCAACACGTCCCACTGGCACCGTTCCAATA
CCACCGC

QA 1 751 1 751
DS 

RD RS1A318TR 758 0 0
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GAAAATTAAGAAAAAGGCTCAAACGCCATCAAAGTTTTGTTGTAACGCAAAGAAAAACCA
AAGACGAGAGAAGTCTCATCATTTAGCTCCCTTCTCGACTGCGGCCTTGGTGACCTTAGC
ACCGGTTGGGTCCTTCTTGTCGACGCTCTTGATAACACCAACAGCCACCGTCTGCCTCAT
GTCCCTAACAGCGAAACGACCCAATGGTGGGTACTCGGAGAAAGTCTCGACAACCATGGG
CTTGGTTGGAGTCATCTTAACCATACCAGCATCACCATTCTTCAAGAACTTGGGCTCCTT
CTCGATCTCCTTACCAGATCGCCTGTCAATCTTGGTGAGGATCTCAGAGAACTTGACTGC
AATGTGGGATGTGTGGCAATCAAGAACCGGAGCGTAACCGTTACCGATCTGACCAGGGTG
GTTCAAGGTGATGACCTGGGAGGTGAAGTTGGCAGCACCCTTGGCAGGGTCATCCTTGGA
GTTGGATGCAACATACCCACGCTTAAGATCCTTCACAGCAACATTCTTGACATTGAATCC
AACGTTGTCACCTGGAAGAGCCTCCACAAGAGACTCGTGGTGCATCTCAACGGACTTAAC
CTCAGTGGTCAACCCTGAAGGAGCGAAGGTGACAACCATACCGGGCTTGAGCATACCGGT
CTCAACACGTCCCACTGGCACCGTTCCAATA
CCACCGC

QA 1 751 1 751
DS 

RD RS1A318TV 751 0 0
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GAAAATTAAGAAAAAGGCTCAAACGCCATCAAAGTTTTGTTGTAACGCAAAGAAAAACCA
AAGACGAGAGAAGTCTCATCATTTAGCTCCCTTCTCGACTGCGGCCTTGGTGACCTTAGC
ACCGGTTGGGTCCTTCTTGTCGACGCTCTTGATAACACCAACAGCCACCGTCTGCCTCAT
GTCCCTAACAGCGAAACGACCCAATGGTGGGTACTCGGAGAAAGTCTCGACAACCATGGG
CTTGGTTGGAGTCATCTTAACCATACCAGCATCACCATTCTTCAAGAACTTGGGCTCCTT
CTCGATCTCCTTACCAGATCGCCTGTCAATCTTGGTGAGGATCTCAGAGAACTTGACTGC
AATGTGGGATGTGTGGCAATCAAGAACCGGAGCGTAACCGTTACCGATCTGACCAGGGTG
GTTCAAGGTGATGACCTGGGAGGTGAAGTTGGCAGCACCCTTGGCAGGGTCATCCTTGGA
GTTGGATGCAACATACCCACGCTTAAGATCCTTCACAGCAACATTCTTGACATTGAATCC
AACGTTGTCACCTGGAAGAGCCTCCACAAGAGACTCGTGGTGCATCTCAACGGACTTAAC
CTCAGTGGTCAACCCTGAAGGAGCGAAGGTGACAACCATACCGGGCTTGAGCATACCGGT
CTCAACACGTCCCACTGGCACCGTTCCAATA

QA 1 751 1 751
DS 

RD RS1A318TF 807 0 0
CTCCAAAAGCTGCATAATTGAAAACCAAAATAGTCTGAGAGATTCAAAAACAAGGTAGAA
GAAAATTAAGAAAAAGGCTCAAACGCCATCAAAGTTTTGTTGTAACGCAAAGAAAAACCA
AAGACGAGAGAAGTCTCATCATTTAGCTCCCTTCTCGACTGCGGCCTTGGTGACCTTAGC
ACCGGTTGGGTCCTTCTTGTCGACGCTCTTGATAACACCAACAGCCACCGTCTGCCTCAT
GTCCCTAACAGCGAAACGACCCAATGGTGGGTACTCGGAGAAAGTCTCGACAACCATGGG
CTTGGTTGGAGTCATCTTAACCATACCAGCATCACCATTCTTCAAGAACTTGGGCTCCTT
CTCGATCTCCTTACCAGATCGCCTGTCAATCTTGGTGAGGATCTCAGAGAACTTGACTGC
AATGTGGGATGTGTGGCAATCAAGAACCGGAGCGTAACCGTTACCGATCTGACCAGGGTG
GTTCAAGGTGATGACCTGGGAGGTGAAGTTGGCAGCACCCTTGGCAGGGTCATCCTTGGA
GTTGGATGCAACATACCCACGCTTAAGATCCTTCACAGCAACATTCTTGACATTGAATCC
AACGTTGTCACCTGGAAGAGCCTCCACAAGAGACTCGTGGTGCATCTCAACGGACTTAAC
CTCAGTGGTCAACCCTGAAGGAGCGAAGGTGACAACCATACCGGGCTTGAGCATACCGGT
CTCAACACGTCCCACTGGCACCGTTCCAATACCACCGCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTC
CCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 807 1 807
DS 



AS 1 4

CO CL932Contig1 1331 4 9 U
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GAAGCTCAAGGTCTCTCTCGATTCCTATACTCTGTTTAGGAACTATGGACAGCTTCTGGC
AATTGGGTGATGAGCTCCGAGGTCAGTCACGAGCCTCCGAGGATCACAAATGGTCCACTG
TTGCTACCAAGCTAGCGGAGCAGACTAGGATGAAAGGAGAAAGGATGAACAACCTTGATC
TCTCCAAACCCTACTCTGAGTTCAGGCCTACCGACAAGTTTAGTTTCCAGGGCAACAACA
ACCTTAACTTCAACATGTTGAACTTTGACGGAAAATTTGTGCAAGGCATGGGCAAGGCTC
CGGTGCAGAGCAATGTTTACAACAACGTGAACAATGTTTTCCAGAAGAACGACTTCAAGA
GCGGAGGAGGCAACATGAAGGTTAACAAGTACAGTGGAAATGTTGTTGCTAACAAGGAGC
TGAGCAGCAACAACAAGCACAACAATAATGATAATCTGGCTGTTGACAAGAGGTTTAAGA
CCCTACCTGCTTCGGAGACGCTTCCAAGGAACGAAGTACTTGGCGGATACATCTTTGTTT
GCAACAATGATACCATGCAAGAGGACTTGAAACGTCACCTCTTTGGTTTACCTCCAAGAT
ACAGGGACTCTGTTCGGGCGATAACACCTGGATTGCCTTGTTTCTGTACAACTACACCAC
TCACCAACTGCATGGCATCTTTGAGGCAACAACTTTTGGAGGTACCAATATTGATGCAAC
TGCTTGGGAAGACAAAAAGTGCAAAGGAGAGTCAAGATTTCCGGCTCAGGTAAGGATCAG
AGTGAGGAAGATCTGCAAAGCCTTGG**GAGGATTCCTTCAGGCCTGTTCTTCACCACTA
TGATGGACCAAAATTCCGTCTTGAGCTCTCTGTTCCTGAGACGTTGGATCTTCTAGATCT
CTGCGAACAAGCTGGTTCTGCATAAGCCGATCAACCTTGCAATACCACGTTGCTTAGGGA
AGTGATGTGAAATCTATCTATCTATATATATGTATGCATATTACCATAAGAGCGTAAGCT
TTTGGGAGTTAGCTAAGAGTCGAGCAAAAGGGTGAAGAAGCTCTGCCGAATAAGCGACTA
CCCTTGTTCTTGTTGTGTCTAATGTGTGAGTTTCT**GTGTGTTTGTGAGAGATTTGAAA
CAAAAGATTTATGTAGAGAGAAAGTGAGACTAAGTAACAGGGCCAAAAACCAATGGTATG
AGCTACTCTGTTTGTGGTTTGCTTTGTGTAAGGGAAAAACAAATGTTCTAAATGGCAAGT
TTAACTTTTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1FU63TF U 715
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ACGAAGTACTTGGCGGATACATCTTTGTTTGCAACAATGATACCATGCAAGAGGACTTGA
AACGTCACCTCTTTGGTTTACCTCCAAGATACAGGGACTCTGTTCGGGCGATAACACCTG
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AACTTTTGGAGGTACCAATATTGATGCAACTGCTTGGGAAGACAAAAAGTGCAAAGGAGA
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*GTATGCATATTATCATAAGAGCGTAAGCTTTTGGGAGTTAGCTAAGAGTCGAGCAAAAG
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TATGATGGACCAAAATTCCGTCTTGAGCTCTCTGTTCCTGAGACGTTGGATCTTCTAGAT
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CTTTTGGGAGTTAGCTAAGAGTCGAGCAAAAGGGTGAAGAAGCTCTGCCGAATAAGCGAC
TACCCTTGTTCTTGTTGTGTCTAATGTGTGAGTTTCT**GTGTGTTTGTGAGAGATTTGA
AACAAAAGATTTATGTAGAGAGAAAGTGAGACTAAGTAACAGGGCCAAAAACCAATGGTA
TGAGCTACTCTGTTTGTGGTTTGCTTTGTGTAAGGGAAAAACAAATGTTCTAAATGGCAA
GTTT
TAACTTTT

QA 5 608 5 608
DS 



AS 1 6

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GAAGCGGCGCATCTGACAATCCATCCAAAAAACGAGAAAGATGACGACGACCGATTCGCA
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CCATTGGACATCAAAGTGTCCTTACAAGGATCTAGCTGCACCAACCGATGTCTTTGTCGA
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CGGATTAGACCAGAAGATGTTATGTTCGTCTTTAATACATAAGCAATGTTTCGAATACTT
GGAAGTTTATTTAATCAATTTATATCTACCCAACTCGTAGTTAACT


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1EN58TF U 1
AF RS1BC49TF U 30
AF RS1A067TF U 348
AF RS1A067JQ C 295
AF RS1BC49JQ C 425
AF RS1A067TR C 295
BS 1 60 RS1EN58TF
BS 61 61 RS1BC49TF
BS 62 180 RS1EN58TF
BS 181 181 RS1BC49TF
BS 182 216 RS1EN58TF
BS 217 217 RS1BC49TF
BS 218 337 RS1EN58TF
BS 338 555 RS1BC49TF
BS 556 556 RS1A067TF
BS 557 612 RS1BC49TF
BS 613 613 RS1A067TF
BS 614 616 RS1BC49TF
BS 617 617 RS1A067TF
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BS 631 683 RS1BC49TF
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BS 712 1093 RS1A067TF
BS 1094 1186 RS1A067JQ

RD RS1EN58TF 337 0 0
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TAAGCGGCGCATCTGACAATCCATCCAAAAAACGAGAAAGATGACGACGACCGATTCGCA
GCAGAAAACGAGCAAGTTCCGATGGGGCGAGATGGACGAAGACGACGATCTGGATTTCCT
TCTCCCTCCCAAGCAGGTGATCGGCCCAGACGAGAATGGATTGAAGACGGTGATCGAGTA
CAAGTTCAACGACGAAGGCAACAAGGTCAAGATCACGACCAGGTCACGCGTCCGTAAGCT
AGCTTCCGCGAGGCTCAACAAACGAGCCATGGAGCGG

QA 1 337 1 337
DS 

RD RS1BC49TF 682 0 0
GG
AAGCGCATCATTCATCATCGAACCA*CAAGAAGCGGCGCATCTGACAATCCATCCAAAAA
ACGAGAAAGATGACGACGACCGATTCGCAGCAGAAAACGAGCAAGTTCCGATGGGGCGAG
ATGGACGAAGACGACGATCTGGATTTCCTCCTCCCTCCGAAGCAGGTGATCGGCCCAGAC
GAGAACGGGTTGAAGACGGTGATCGAGTACAAGTTCAACGACGAAGGCAACGAGGTCAAG
ATCACGACCAGGTCACGCGTCCGTAAGCTAGCTTCCGCGAGGCTCAACAAACGAGCCATG
GAGCGGAGGAGCTGGCCTAAGTTCGGAGACGCCGCGAACGAGGACGCTGGTAGCCATCTC
ACCATGGTTTCGACCGAAGAGATTCTTCTGGAACGACCTAGGGCTCCTGGTACCAAAGCA
GATGAATCAAAGGCAGCAGGAGACGGCTTGTCTCAGCTGAGTAAAGGTGCAGTCCTCATG
GTTTGCAGGACATGCGGCAAGAAAGGTGACCATTGGACATCAAAATGTCCTTACAAGGAT
CTAGCTGCACCAACCGATGTCTTTGTCGACAAGCCACCCACAGGAGAAACATCTGCCGTA
CCCGCTGCACCTGGTGGCAAGGCCGCTTATGTGCCTCCTAGCATGAGAGCAG*TGCAGAC
AGAAGCACTGGTGGTTCGGA

QA 3 682 3 682
DS 

RD RS1A067TF 746 0 0
CTAAGTTCGGAGACGCCGCGAACGAGGACGCTGGTAGCCATCTCACCATGGTTTCGACCG
AAGAGATTCTTCTGGAACGACCTAGGGCTCCTGGTACCAAAGCAGATGAATCAAAGGCAG
CAGGAGACGGCTTGTCTCAGCTGAGTAAAGGTGCAGTCCTCATGGTTTGCAGGACATGCG
GCAAGAAAGGTGACCATTGGACATCAAAGTGTCCTTACAAGGATCTAGCTGCACCAACCG
ATGTCTTTGTCGACAAGCCACCCACTGGA*AAACATCTGCCGCACCCGCTGCACCTGGTG
GCAAGGCCGCTTATGTGCCTCCTAGCATGAGAGCAGGTGCAGACAGAAGCACTGGTGGTT
CGGACATGAGGAGGAGGAACGATGAGAACTCTGTGCGTGTGACTAACTTGTCTGAGGACA
CCCGTGAACCCGATTTGATGGAGCTCTTCCATCCGTTTGGAGCTGTCTCCCGTGTCTATG
TGGCCATTGATCAGAAAACTGGAGTGAGCAGAGGGTTTGGTTTCGTCAATTTCGTGAGCA
GAGAAGACGCTCAACGAGCCATCAACAAACTGAATGGTTATGGTTATGATAACCTCATCC
TCAGGGTTGAGTGGGCCACTCCAAGACCCACTTAGACAATGTCTCGAGTCCTTCGCAAAC
TCTTCTCATTTTTCGTCTTTCCTGCTATGGCTTCTTGTTTATCAGACTGTTT**CTGTTG
GTTTGGTTTTGGTCGGATTAGACCAG

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1A067JQ 892 0 0
G
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GGAGACGCCGCGAACGAGGACGCTGGTAGCCATCTCACCATGGTTTCGACCGAAGAGATT
CTTCTGGAACGACCTAGGGCTCCTGGTACCAAAGCAGATGAATCAAAGGCAGCAGGAGAC
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GGTGACCATTGGACATCAAAGTGTCCTTACAAGGATCTAGCTGCACCAACCGATGTCTTT
GTCGACAAGCCACCCACTGGA*AAACATCTGCCGCACCCGCTGCACCTGGTGGCAAGGCC
GCTTATGTGCCTCCTAGCATGAGAGCAGGTGCAGACAGAAGCACTGGTGGTTCGGACATG
AGGAGGAGGAACGATGAGAACTCTGTGCGTGTGACTAACTTGTCTGAGGACACCCGTGAA
CCCGATTTGATGGAGCTCTTCCATCCGTTTGGAGCTGTCTCCCGTGTCTATGTGGCCATT
GATCAGAAAACTGGAGTGAGCAGAGGGTTTGGTTTCGTCAATTTCGTGAGCAGAGAAGAC
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TACTTGGAAGTTTATTTAATCAATTTATATCTACCCAACTCGTAGTTAACT

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DS 

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ACGA
CTAGGGCTCCTGGTACCAAAGCAGATGAATCAAAGGCAGCAGGAGACGGCTTGTCTCAGC
TGAGTAAAGGTGCAGTCCTCATGGTTTGCAGGACATGCGGCAAGAAAGGTGACCATTGGA
CATCAAAATGTCCTTACAAGGATCTAGCTGCACCAACCGATGTCTTTGTCGACAAGCCAC
CCACAGGAGAAACATCTGCCGTACCCGCTGCACCTGGTGGCAAGGCCGCTTATGTGCCTC
CTAGCATGAGAGCAGGTGCAGACAGAAGCACTGGTGGTTCGGACATGAGGAGGAGGAACG
ATGAGAACTCTGTGCGTGTGACTAACTTGTCTGAGGACACCCGTGAACCCGATTTGATGG
AGCTCTTCCATCCGTTTGGAGCTGTCTCCCGTGTCTATGTGGCGATTGATCAGAAAACTG
GAGTGAGCAGAGGGTTTGGTTTCGTCAACTTCGTGAGCAGAGAAGACGCTCAACGAGCCA
TCAACAAGCTGAATGGTTATGGTTATGATAACCTCATCCTCAGGGTTGAGTGGGCCACTC
CAAGACCCACTTAGAAAATGTCTCGAGTCCTTCGTAAACTCTTCTCATTT**CGTCTTTC
TTGCTATGGCTTCTTGTTTATCAGACTGTTTGTCTGTTGGTTTGGTTTTGGTCGGATTAG
ATCAGAAGATGTTATGTTCGTCTTTAATACATAAGCAATGTTTCGAATACTTGGAAGTTT
A

QA 5 725 5 725
DS 

RD RS1A067TR 892 0 0
G
AAGCTAGCTTCCGCGAGGCTCAACAAACGAGCCATGGAGCGGAGGAGCTGGC*TAAGTTC
GGAGACGCCGCGAACGAGGACGCTGGTAGCCATCTCACCATGGTTTCGACCGAAGAGATT
CTTCTGGAACGACCTAGGGCTCCTGGTACCAAAGCAGATGAATCAAAGGCAGCAGGAGAC
GGCTTGTCTCAGCTGAGTAAAGGTGCAGTCCTCATGGTTTGCAGGACATGCGGCAAGAAA
GGTGACCATTGGACATCAAAGTGTCCTTACAAGGATCTAGCTGCACCAACCGATGTCTTT
GTCGACAAGCCACCCACTGGA*AAACATCTGCCGCACCCGCTGCACCTGGTGGCAAGGCC
GCTTATGTGCCTCCTAGCATGAGAGCAGGTGCAGACAGAAGCACTGGTGGTTCGGACATG
AGGAGGAGGAACGATGAGAACTCTGTGCGTGTGACTAACTTGTCTGAGGACACCCGTGAA
CCCGATTTGATGGAGCTCTTCCATCCGTTTGGAGCTGTCTCCCGTGTCTATGTGGCCATT
GATCAGAAAACTGGAGTGAGCAGAGGGTTTGGTTTCGTCAATTTCGTGAGCAGAGAAGAC
GCTCAACGAGCCATCAACAAACTGAATGGTTATGGTTATGATAACCTCATCCTCAGGGTT
GAGTGGGCCACTCCAAGACCCACTTAGACAATGTCTCGAGTCCTTCGCAAACTCTTCTCA
TTTTTCGTCTTTCCTGCTATGGCTTCTTGTTTATCAGACTGTTT**CTGTTGGTTTGGTT
TTGGTCGGATTAGACCAGAAGATGTTATGTTCGTCTTTAATACATAAGCAATGTTTCGAA
TACTTGGAAGTTTATTTAATCAATTTATATCTACCCAACTCGTAGTTAACT

QA 2 892 2 892
DS 



AS 2 7

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TAAACATCATCCTTAAACTTAACCATTGAAGGGTTATCCTTGGATGAAAGATTTACAGGT
AAAAAGTGAATATTTGGCATTTTAAGGTGAATCGATGCTACATCAGCGAACCTTCTCAGT
ACAGCGCCTCCCATAAAATAGAGAGTGCGTTGGACAGAAGGGCTGTACACACCGGTTTCA
GGAGGACCAAAGAAAGTATCCATCAAAACTTTCTTTACTTCCATGAACTTCTCATTGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D656JQ U 1
AF RS1BE48JQ U 28
BS 1 187 RS1D656JQ
BS 188 188 RS1BE48JQ
BS 189 273 RS1D656JQ
BS 274 274 RS1BE48JQ
BS 275 436 RS1D656JQ
BS 437 539 RS1BE48JQ

RD RS1D656JQ 438 0 0
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AAGGAAGCTCTGTACTACATAGTTATATAGCATATAAATGCAAACCCATGCATCACATAC
ATTTCTGTGTACCTCATGAAGAGTGTCCCTCTTTATTTCATAAACAAGGCAAAAGCCAAA
AGTTGTAGAACATGTGAAGTAGTCTTTAATCCATCATTGCATTGTCCAAAAGCTTACATT
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TAAACATCATCCTTAAACTTAACCATTGAAGGGTTATCCTTGGATGAAAGATTTACAGGT
AAAAAGTGAATATTTGGCATTTTAAGGTGAATCGATGCTACATCAGCGAACCTTCTCAGT
ACAGCGCCTCCCATAA
GA

QA 1 436 1 436
DS 

RD RS1BE48JQ 512 0 0
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TAGTATATAAATGCAAACCCATGCATCACATACATTTCTGTGTACCTCATGAAGAGTGTC
CCTCTTTATTTCATAAACAAGGCAAAAGCCAAAAGTTGTAAAACATGTGAAGTAGTCTTT
AATCCATCATTGCATTGTCCAAAAGCTTACATTTTCGAGGTTATGCGGCTTAGGGTTGCT
TCAATAAATCCATGAGGTTCATCCGTTGGCAGGTAAACATCATCCTTAAA****ACCATT
GAAGGGTTATCCTTGGATGAAAGATTTACAGGTAAAAAGTGAATATTTGGCATTTTAAGG
TGAATCGATGCTACATCAGCGAACCTTCTCAGTACAGCGCCTCCCATAAAATAGAGAGTG
CGTTGGACAGAAGGGCTGTACACACCGGTTTCAGGAGGACCAAAGAAAGTATCCATCAAA
ACTTTCTTTACTTCCATGAACTTCTCATTGAA

QA 1 512 1 512
DS 



CO CL934Contig2 1013 5 4 U
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TCTCAGAAACTGTGACCTTTTGATCCTCTCTAGTAATCATCGTACGATCTGTTCAAAATT
TTAAATGGCAGCAGAAGGGTTGAGAGTGGATCAAAGACATGGAAAGGCTAGAGTTAGAGT
TGGGAGAGTTTGGCGTCAAGGCCTGGATGGATCTCATCACTTTGTCGAATGGAACGTTAG
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CGCCACCGATACCATGAAAAACACCGTTTATGTCAAGGCGAAAGAGTGTGGAGATCGACT
CTCTGTTGAGGAATTTGCAATACTTTTAGGGAATCACTTTTGCTCCTTTTATCCTCAGGT
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TAAGTCTGGTGCACTAACCTTAACTTCCGGTGTTGCAGGACTAGCTCTGCTTAAGACAAC
CCAGTCAGGATTTGAGAAGTTTGTGAGAGACAAGTACACCATTCTCCCTGATACTCGAGA
GAGAATGCTTGCTACAGAGGTGAATGCATCTTGGAGGTACTCGTACGAGTCTGTTGCAAG
CATTCCAAAAAAGGAACTCTACTTCAATGAGAAGTTCATGGAAGTAAAGAAAGTTCTGAT
GGATACTTTCTTTGGTCCTCCTGAAACCGGTGTGTACAGCCCTTTTGTCCAACGCACTCT
TTATCTTATGGGAGGCGCTGTACTGAGAAGGTTCGCTGATGTAGCATCGATTCACCTTAA
AATGCCAAATATTCACTTTTTACCTGTAAATCTTTCATCCAAGGATAACCCTTCAATGGT
TAAGTTTAAGGATGATGTTTACCTGCCAACGGATGAACCTCATGGATCTATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DL11TF U 295
AF RS1D656TF U 1
AF RS1EL84TF U 70
AF RS1BE48TF U 145
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BS 689 776 RS1BE48TF
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TCACGTTTACACTACTATTGTTAATATCATTGATAAGCCATGGGAGCGTGTATGCATCGA
TGGAAAGCCCCATTTACATGGTTTCAAGCTCGGGTCAGAGAACCATACTGTGGAGGCTAC
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DS 

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TCTCAGAAACTGTGACCTTTTGATCCTCTCTAGTAATCATCGTACGATCTGTTCAAAATT
TTAAATGGCAGCAGAAGGGTTGAGAGTGGATCAAAGACATGGAAAGGCTAGAGTTAGAGT
TGGGAGAGTTTGGCGTCAAGGCCTGGATGGATCTCATCACTTTGTCGAATGGAACGTTAG
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CGCCACCGATACCATGAAAAACACCGTTTATGTCAAGGCGAAAGAGTGTGGAGATCGACT
CTCTGTTGAGGAATTTGCAATACTTTTAGGGAATCACTTTTGCTCCTTTTATCCTCAGGT
TTACACTGCTATTGTTAATATCATTGAGAAGCCATGGGAGCGTGTATGCATCGATGGAAA
GCCCCATTTACATGGTTTCAAGCTCGGGTCAGAGAACCATACTGTGGAGGCTACAGTACA
TAAGTCTGGTGCACTAACCTTAACTTCCGGTGTTGCAGGACTAGCTCTGCTTAAGACAAC
CC

QA 1 602 1 602
DS 

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GG
GTGACCTTTTGATCCTCTCTAGTAATCATCGTACGATCTGTTCAAAATTTTAAATGGCAG
CAGAAGGGTTGAGAGTGGATCAAAGACATGGAAAGGCTAGAGTTAGAGTTGGGAGAGTTT
GGCGTCAAGGCCTGGATGGATCTCATCACTTTGTCGAATGGAACGTTAGCATCAGTCTTC
TCTCTCACTGCCTCTCTTCTTACCACCGTGACGATAACTCCGACATCGTCGCCACCGATA
CCATGAAAAACACCGTTTATGTCAAGGCGAAAGAGTGTGGAGATCGACTCTCTGTTGAGG
AATTTGCAATACTTTTAGGGAATCACTTTTGCTCCTTTTATCCTCAGGTTTACACTGCTA
TTGTTAATATCATTGAGAAGCCATGGGAGCGTGTATGCATCGATGGAAAGCCCCATTTAC
ATGGTTTCAAGCTCGGGTCAGAGAACCATACTGTGGAGGCTACAGTACATAAGTCTGGTG
CACTAACCTTAACTTCCGGTGTTGCAGGACTAGCTCTGCTTAAGACAACCCAGTCAGGAT
TTGAGAAGTTTGTGAGAGACAAGTACACCATTCTCCCTGATACTCGAGAGAGAATGCTTG
CTACAGAGGTGAATGCA

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DS 

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G
GTGGATCAAAGACATGGAAAGGCTAGAGTTAGAGTTGGGAGAGTTTGGCGTCAAGTCCTG
GATGGATCTCATCACTTTGTCGAATGGAACGTTAGCATCAGTCTTCTCTCTCACTGCCTC
TCTTCTTACCACCGTGACGATAACTCCGACATCGTCGCCACCGATACCATGAAAAACACC
GTTTATGTCGAGGCGAAAGAGTGTGGAGATCGACTCTCTGTTGAGGAATTTGTAATACTT
TTAGGGAATCACTTTTGCTCCTTTTATCCTCAGGTTTACACTGCTATTGTTAATATCATT
GAGAAGCCATGGGAGCGTGTATGCATCGATGGAAAGCCCCATTTACATGGTTTCAAGCTC
GGGTCAGAGAACCATACTGTGGAGGCTACAGTACATAAGTCTGGTGCACTAACCTTAACT
TCCGGTGTTGCAGGACTAGCTCTGCTTAAGACAACCCAGTCAGGATTTGAGAAGTTTGTG
AGAGACAAGTACACCATTCTCCCTGATACTCGAGAGAGAATGCTTGCTACAGAGGTGAAT
GCATCTTGGAGGTACTCGTACGAGTCTGTTGCAAGCATTCCAAAAAAGGAACTCTACTTC
AATGAGAAGTTCATGGAAGTAAAGAAAGTTC

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DS 

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CTGATGGATACTTTCTTTGGTCCTCCTGAAACCGGTGTGTACAGCCCTTTTGTCCAACGC
ACTCTTTATCTTATGGGAGGCGCTGTACTGAGAAGGTTCGCTGATGTAGCATCGATTCAC
CTTAAAATGCCAAATATTCACTTTTTACCTGTAAATCTTTCATCCAAGGATAACCCTTCA
ATGGTTAAGTTTAAGGATGATGTTTACCTGCCAACGGATGAACCTCATGGATCTATTG

QA 1 298 1 298
DS 



AS 1 7

CO CL935Contig1 827 7 7 U
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GACGTTTGTGACGGGAAATGCGAAGAAGTTCGAAGAGGTCAAAGCTATCATCGGAAGCTC
AATTCCTTTCAAATCTCTCAAACTCGACCTGCCTGAGCTTCAAGGTGAGCCTGAGGATAT
CTCCAAAGAGAAAGCTCGTTTGGCTGCTCTTCAGGTTAATGGGCCGGTCCTAGTGGAGGA
TACATGTCTCTGTTTCAATGCTCTGAAGGGTCTTCCTGGGCCTTACATCAAGTGGTTTCT
TGAGAAGCTTGGCCATGAAGGTTTGAACAACTTACTGATGGCCTATGAAGATAAATCAGC
TTATGCATTGTGTGCATTCTCTTTCTCGCATGGTCCCGGTGCTGAACCTCTTACATTTTT
GGGGAAAACTCCGGGTAAGATAGTTCCAGCCAGAGGACCAACTGATTTCGGGTGGGATCC
AGTGTTTCAACCTGATGGATATGACCAAACTTATGCAGAAATGGCAAAGGAAGAAAAGAA
CAAGATATCTCATAGGTACAAGTCTTTAGCAATGGTGAAATCTCACTTTAAGGAGGCTGG
CTACGTGTTCCAGACAACTGATGATGATACCAATTAAAGTGAACCCAGTTACCATTTTCC
TTCAGCTTTTGAATATTTGAGCACTTGTTCTCCTTTTTTACAAGTAGAAACACTTCTGTT
CACAAGTTTCTAACCAAAACATATAATAGCAAACATATTCATTGGATTTTGTTTTCTGGT
CAAGAGATTGTAAATCATTGCCATCATTTATGAAAGCTTGTTGCGCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1FA04TF U 1
AF RS1AM56TF U 45
AF RS1GM87TF U 1
AF RS1B905TF U 61
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TTATGCATTGTGTGCATTCTCTTTCTCGCATGGTCCCGGTGCTGAACCTCTTACATTTTT
GGGGAAAACTCCGGGTAAGATAGTTCCAGCCAGAGGACCAACTGATTTCGGGTGGGATCC
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CAAGATATCTCATAGGTACAAGTCTTTAGCAATGGTGAAATCTCACTTTAAGGAGGCTGG
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TTCAGCTTTTGAATATTTGAGCACTTGTTCTCCTTTTTTACAAGTAGAAACACTTCTGTT
CACAAGTTTCTA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1AM56TF 720 0 0
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CGGTCCTAGTGGAGGATACATGTCTCTGTTTCAATGCTCTGAAGGGTCTTCCTGGGCCTT
ACATCAAGTGGTTTCTTGAGAAGCTTGGCCATGAAGGTTTGAACAACTTACTGATGGCCT
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AACCTCTTACATTTTTGGGGAAAACTCCGGGTAAGATAGTTCCAGCCAGAGGACCAACTG
ATTTCGGGTGGGATCCAGTGTTTCAACCTGATGGATATGACCAAACTTATGCAGAAATGG
CAAAGGAAGAAAAGAACAAGATATCTCATAGGTACAAGTCTTTAGCAATGGTGAAATCTC
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CCAGTTACCATTTTCCTTCAGCTTTTGAATATTTGAGCACTTGTTCTCCTTTTTTACAAG
TAGAAACACTTCTGTTCACAAGTTTCTAACCAAAACATATAATAGCAA*CATATTCATTG

QA 1 720 1 720
DS 

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TACATGTCTCTGTTTCAATGCTCTGAAGGGTCTTCCTGGGCCTTACATCAAGTGGTTTCT
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CAAGATATCTCATAGGTACAAGTCTTTAGCAATGGTGAAATCTCACTTTAAGGAGGCTGG
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CACAAGTTTCTAACCAAAACATATAATAGCAAACATATTCATTGGATTTTGTTTTCTGGT
CA*GAGAT*GTAAATCATTGCCATCA
TTTATGAAAG

QA 1 806 1 806
DS 

RD RS1B905TF 749 0 0
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AATTCCTTTCAAATCTCTCAAACTCGACCTGCCTGAGCTTCAAGGTGAGCCTGAGGATAT
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TACATGTCTCTGTTTCAATGCTCTGAAGGGTCTTCCTGGGCCTTACATCAAGTGGTTTCT
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GGGGAAAACTCCGGGTAAGATAGTTCCAGCCAGAGGACCAACTGATTTCGGGTGGGATCC
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CAAGATATCTCATAGGTACAAGTCTTTAGCAATGGTGAAATCTCACTTTAAGGAGGCTGG
CTACGTGTTCCAGACAACTGATGATGATACCAATTAAAGTGAACCCAGTTACCATTTTCC
TTCAGCTTTTGAATATTTGAGCACTTGTTCTCCTTTTTTACAATTAGAAACACTTCTGTT
CACAAGTTTCTAACCAAAACATATAATAGCAAACATATTCATTGGATTTTGTTTTCTGGT
CAAGAGATTGTAAACCATTGCCATCA
AAA

QA 1 746 1 746
DS 

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AATTCCTTTCAAATCTCTCAAACTCGACCTGCCTGAGCTTCAAGGTGAGCCTGAGGATAT
CTCCAAAGAGAAAGCTCGTTTGGCTGCTCTTCAGGTTAATGGGCCGGTCCTAGTGGAGGA
TACATGTCTCTGTTTCAATGCTCTGAAGGGTCTTCCTGGGCCTTACATCAAGTGGTTTCT
TGAGAAGCTTGGCCATGAAGGTTTGAACAACTTACTGATGGCCTATGAAGATAAATCAGC
TTATGCATTGTGTGCATTTTCTTTCTCGCATGGTCCCGGTGCTGAACCTCTTACATTTTT
GGGGAAAACTCCGGGTAAGATAGTTCCAGCCAGAGGACCAACTGATTTCGGGTGGGATCC
AGTGTTTCAACCTGATGGATATGACCAAACTTATGCAGAAATGGCAAAGGAAGAAAAGAA
CAAGATATTTCATAGGTACAAGTCTTTAGCAATGGTGAAATCTCACTTTAAGGAGGCTGG
CTACGTGTTCCAGACAACTGATGATGATACCAATTAAAGTGAACCCAGTTACCATTTTCC
TTCAGCTTTTGAATATTTGAGCACTTGTTTTCCTTTTTTACAATTAGAAACACTTCTGTT
CACAAGTTTCTAACCAAAACATATAATAGCAAACATATTCATTGGATTTTGTTTTTTGGT
CAAGAGATTGTAAACCATTGCCATC

QA 1 745 1 745
DS 

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CAAATCTCTCAAACTCGACCTGCCTGAGCTTCAAGGTGAGCCTGAGGATATCTCCAAAGA
GAAAGCTCGTTTGGCTGCTCTTCAGGTTAATGGGCCGGTCCTAGTGGAGGATACATGTCT
CTGTTTCAATGCTCTGAAGGGTCTTCCTGGGCCTTACATCAAGTGGTTTCTTGAGAAGCT
TGGCCATGAAGGTTTGAACAACTTACTGATGGCCTATGAAGATAAATCAGCTTATGCATT
GTGTGCATTCTCTTTCTCGCATGGTCCCGGTGCTGAACCTCTTACATTTTTGGGGAAAAC
TCCGGGTAAGATAGTTCCAGCCAGAGGACCAACTGATTTCGGGTGGGATCCAGTGTTTCA
ACCTGATGGATATGACCAAACTTATGCAGAAATGGCAAAGGAAGAAAAGAACAAGATATC
TCATAGGTACAAGTCTTTAGCAATGGTGAAATCTCACTTTAAGGAGGCTGGCTACGTGTT
CCAGACAACTGATGATGATACCAATTAAAGTGAACCCAGTTACCATTTTCCTTCAGCTTT
TGAATATTTGAGCACTTGTTCTCCTTTTTTACAAGTAGAAACACTTCTGTTCACAAGTTT
CTAACCAAAACATATAATAGCAAACATATTCATTGGATTTTGTTTTCTGGTCAAGAGATT
GTAAATCATTGCCATCATTTATGAAAGCTTGTTGCGCC

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1GM87JQ 412 0 0
TTTTTGGGGAAAACTCCGGGTAAGATAGTTCCAGCCAGAGGACCAACTGATTTCGGGTGG
GATCCAGTGTTTCAACCTGATGGATATGACCAAACTTATGCAGAAATGGCAAAGGAAGAA
AAGAACAAGATATTTCATAGGTACAAGTCTTTAGCAATGGTGAAATCTCACTTTAAGGAG
GCTGGCTACGTGTTCCAGACAACTGATGATGATACCAATTAAAGTGAACCCAGTTACCAT
TTTCCTTCAGCTTTTGAATATTTGAGCACTTGTTCTCCTTTTTTACAAGTAGAAACACTT
CTGTTCACAAGTTTCTAACCAAAACATATAATAGCAAACATATTCATTGGATTTTGTTTT
CTGGTCAAGAGATTGTAAATCATTGCCATCATTTATGAAAGCTTGTTGCGCC

QA 1 412 1 412
DS 



AS 2 6

CO CL936Contig1 1217 4 14 U
TTGTTTGGGTCTAGACTCTGCTTACATCTCACCTGCAGAGGCCCGTTCTTTATTCTCCCG
GACACGAAAGTTCCCAAGAAGTGGGGAACTTGCACTGAGAAGAGCTATTCCCTGCTAATC
CCCAACATGAAGACTATACAGGCTTCGTTGGAAGATATATCTTATCTTCTGAGAATCCCC
TCAAAGAAAGCCTTACGGTACCATGGAGAGCAATGTGAAGAAAGCTCTAAAGGTGGCTAT
AGACGATAAAGATTCAATATTGGCTAGTATACCAGCAGAGTTGAGAGACAAAGGCTCAGA
GCTGTATGCATCTCTGGTTGACGGCAAGGGTGGACTTCAAGCACTTATAGAATCAATTAG
GTATCAAGATCCTGATAAAGTGTCTATTCGCCTGGCATCATCACTAGACACAGTTGCGGA
GATGGAGTTATTGCAAGCATCTGGATTGTCATTTTTGCTTCCCCAGCAATACATGACCTA
CCCTAGGTTAGCAGGAAGAGGCACTGTGGAAATCACCATCGAGAAACCTGATGGTTCCAC
ATTTCAAGCTGAAGCTGGGGGAGATCAGAGAAAGAGTGCTACAATCCAGGTTGTTATAGA
TGGCTATTCAGCTCCATTAACAGCAGGGAATTTCGCTAAACTGGTAACAAGTGGTGCATA
TGATGGAACCAAACTCAACACGGTGAACCAAGCTGTTATTACAGAGGATGGGAGTGGTAA
GGTGGAGAGTGTTAGTGTTCCATTGGAAGTTATGCCTTCTGGACAGTTCGAACCTCTCTA
CAGAACTCCATTGAGTGTCCAGGATGGGGAGCTGCCAGTTCTTCCTTTATCAGTTTATGG
AGCTGTTGCAATGGCTCACAGTGAAAACTCAGAGGATTACTCATCTCCTTACCAGTTCTT
CTTCTACCTATACGATAAAAGAAACTCTGGCTTAGGAGGTTTATCATTCGACGAAGGGCA
GTTCTCGGTGTTCGGGTACACAACAGCAGGAAGAGACATTCTTGGGCAGATCAAGACAGG
AGATATCATCAAATCAGCAAAACTAATCGAAGGCCAAGATCGTCTTATTTTGCCTGCTCA
GAACAGTCCATCCACTTGATTCTTCTTCCTTTTAAGACTACAAAGATGTTCTAAATACTT
TCTTGTCCAATAACAGAGTACAAGTTCCTTCTTTACCGGATTAACATTACTGTAATAAAA
AGTTCTCATTTTTATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A217TF U 1
AF RS1GN16TF U 261
AF RS1A217TR C 323
AF RS1A217JQ C 328
BS 1 320 RS1A217TF
BS 321 935 RS1GN16TF
BS 936 938 RS1A217TR
BS 939 957 RS1GN16TF
BS 958 958 RS1A217TR
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BS 1001 1013 RS1GN16TF
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BS 1033 1201 RS1A217TR
BS 1202 1217 RS1A217JQ

RD RS1A217TF 320 0 0
TTGTTTGGGTCTAGACTCTGCTTACATCTCACCTGCAGAGGCCCGTTCTTTATTCTCCCG
GACACGAAAGTTCCCAAGAAGTGGGGAACTTGCACTGAGAAGAGCTATTCCCTGCTAATC
CCCAACATGAAGACTATACAGGCTTCGTTGGAAGATATATCTTATCTTCTGAGAATCCCC
TCAAAGAAAGCCTTACGGTACCATGGAGAGCAATGTGAAGAAAGCTCTAAAGGTGGCTAT
AGACGATAAAGATTCAATATTGGCTAGTATACCAGCAGAGTTGAGAGACAAAGGCTCAGA
GCTGTATGCATCTCTGGTTG

QA 1 320 1 320
DS 

RD RS1GN16TF 775 0 0
G
GGCTAGTATACCAGCAGAGTTGAGAGACAAGGGCTCAGAGCTGTATGCATCTCTGGTTGA
CGGCAAGGGTGGACTTCAAGCACTTATAGAATCAATTAGGTATCAAGATCCTGATAAAGT
GTCTATTCGCCTGGCATCATCACTAGACACAGTTGCGGAGATGGAGTTATTGCAAGCATC
TGGATTGTCATTTTTGCTTCCCCAGCAATACATGACCTACCCTAGGTTAGCAGGAAGAGG
CACTGTGGAAATCACCATCGAGAAACCTGATGGTTCCACATTTCAAGCTGAAGCTGGGGG
AGATCAGAGAAAGAGTGCTACAATCCAGGTTGTTATAGATGGCTATTCAGCTCCATTAAC
AGCAGGGAATTTCGCTAAACTGGTAACAAGTGGTGCATATGATGGAACCAAACTCAACAC
GGTGAACCAAGCTGTTATTACAGAGGATGGGAGTGGTAAGGTGGAGAGTGTTAGTGTTCC
ATTGGAAGTTATGCCTTCTGGACAGTTCGAACCTCTCTACAGAACTCCATTGAGTGTCCA
GGATGGGGAGCTGCCAGTTCTTCCTTTATCAGTTTATGGAGCTGTTGCAATGGCTCACAG
TGAAAACTCAGAGGATTACTCATCTCCTTACCAGTTCTTCTTCTACCTATACGATAAAAG
AAACTCTGGCTTAGA**GTTTATCATTCGACGAAGG*CAGTTCTCGGTGTTCGGGTACAC
AACAGCAG*AAGAGACAT*CTTGGGCAGATCA*GACAGGAGATATCATCAA
TCA

QA 2 772 2 772
DS 

RD RS1A217TR 895 0 0
GGCAA
GGGTGGACTTCAAGCACTTATAGAATCAATTAGGTATCAAGATCCTGATAAAGTGTCTAT
TCGCCTGGCATCATCACTAGACACAGTTGCGGAGATGGAGTTATTGCAAGCATCTGGATT
GTCATTTTTGCTTCCCCAGCAATACATGACCTACCCTAGGTTAGCAGGAAGAGGCACTGT
GGAAATCACCATCGAGAAACCTGATGGTTCCACATTTCAAGCTGAAGCTGGGGGAGATCA
GAGAAAGAGTGCTACAATCCAGGTTGTTATAGATGGCTATTCAGCTCCATTAACAGCAGG
GAATTTCGCTAAACTGGTAACAAGTGGTGCATATGATGGAACCAAACTCAACACGGTGAA
CCAAGCTGTTATTACAGAGGATGGGAGTGGTAAGGTGGAGAGTGTTAGTGTTCCATTGGA
AGTTATGCCTTCTGGACAGTTCGAACCTCTCTACAGAACTCCATTGAGTGTCCAGGATGG
GGAGCTGCCAGTTCTTCCTTTATCAGTTTATGGAGCTGTTGCAATGGCTCACAGTGAAAA
CTCAGAGGATTACTCATCTCCTTACCAGTTCTTCTTCTACCTATACGATAAAAGAAACTC
TGGCTTAGGAGGTTTATCATTCGACGAAGGGCAGTTCTCGGTGTTCGGGTACACAACAGC
AGGAAGAGACATTCTTGGGCAGATCAAGACAGGAGATATCATCAAATCAGCAAAACTAAT
CGAAGGCCAAGATCGTCTTATTTTGCCTGCTCAGAACAGTCCATCCACTTGATTCTTCTT
CCTTTTAAGACTACAAAGATGTTCTAAATACTTTCTTGTCCAATAACAGAGTACAAGTTC
CTTCTTTACCGGATTAACATTACTGTAATAAAAA
GTTCTCATTTTTATTT

QA 6 879 6 879
DS 

RD RS1A217JQ 890 0 0
GGGTGGACTTCAAGCACTTATAGAATCAATTAGGTATCAAGATCCTGATAAAGTGTCTAT
TCGCCTGGCATCATCACTAGACACAGTTGCGGAGATGGAGTTATTGCAAGCATCTGGATT
GTCATTTTTGCTTCCCCAGCAATACATGACCTACCCTAGGTTAGCAGGAAGAGGCACTGT
GGAAATCACCATCGAGAAACCTGATGGTTCCACATTTCAAGCTGAAGCTGGGGGAGATCA
GAGAAAGAGTGCTACAATCCAGGTTGTTATAGATGGCTATTCAGCTCCATTAACAGCAGG
GAATTTCGCTAAACTGGTAACAAGTGGTGCATATGATGGAACCAAACTCAACACGGTGAA
CCAAGCTGTTATTACAGAGGATGGGAGTGGTAAGGTGGAGAGTGTTAGTGTTCCATTGGA
AGTTATGCCTTCTGGACAGTTCGAACCTCTCTACAGAACTCCATTGAGTGTCCAGGATGG
GGAGCTGCCAGTTCTTCCTTTATCAGTTTATGGAGCTGTTGCAATGGCTCACAGTGAAAA
CTCAGAGGATTACTCATCTCCTTACCAGTTCTTCTTCTACCTATACGATAAAAGAAACTC
TGGCTTAGGAGGTTTATCATTCGACGAAGGGCAGTTCTCGGTGTTCGGGTACACAACAGC
AGGAAGAGACATTCTTGGGCAGATCAAGACAGGAGATATCATCAAATCAGCAAAACTAAT
CGAAGGCCAAGATCGTCTTATTTTGCCTGCTCAGAACAGTCCATCCACTTGATTCTTCTT
CCTTTTAAGACTACAAAGATGTTCTAAATACTTTCTTGTCCAATAACAGAGTACAAGTTC
CTTCTTTACCGGATTAACATTACTGTAATAAAAAGTTCTCATTTTTATTT

QA 1 890 1 890
DS 



CO CL936Contig2 723 2 4 U
GAACCTGATGGTTCCACATTTCAAGCTGAAGCTGGGGGAGATCAGAGAAAGAGTGCTACA
ATCCAGGTTGTTATAGATGGCTATTCTGCTCCATTAACAGCAGGGAATTTCGCTAAACTG
GTAACAAGTGGTGCATATGATGGAACCAAACTCAACACGGTGAACCAAGCTGTTATTACA
GAGGATGGGAGTGGTAAGGTGGAGAGTGTTAGTGTTCCATTGGAAGTTATGCCTTCTGGA
CAGTTCGAACCTCTCTACAGAACTCCATTGAGTGTCCAGGATGGGGAGCTGCCAGTTCTT
CCTTTATCAGTTTATGGAGCTGTTGCAATGGCTCACAGTGAAAACTCAGAGGATTACTCA
TCTCCTTACCAATTCTTCTTCTACCTATACGATAAAAGAAACTCTGGCTTAGGAGGCTTA
TCATTCGACGAAGGGCAGTTCTCGGTGTTCGGGTACACAACAGCAGGAAGAGACATTCTT
GGGCAGATCAAGACAGGAGATATCATCAAATCCGCTAAACTAATCGAAGGCCAAGATCGT
CTTATTTTGCCTGCTCAGAACAACAACAGTCCATCCACTTGATTCTTCTTCCTTTTAAGA
CTACAAACATGTTCTAAATACTTTCTTGTCCCATATCAGAGTTACAAGTTCCTTCTTTTA
CCGGATTGACATTACTGTAATAAAAAAAGTTCTCATTTTTATTTACAAATTACAATCAAA
CCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 

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T

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ATCTTCTTTGTAAAGGAGATAAGGAAGCGCTTCGGCTCCTTGATGAGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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DS 

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AGTGAAAACAGGCTTAAACAAAGTTACTCTCGATTCCCAAAGGCATTCTTGTACCCCAAG
AAACGCAACATATTTTTTTCCGATGAAAGATGAAGTAGTAAAAGCGGCAAAAGGAGATGG
GAAATATGGGGATTTTACCAGATCGTCGCCTAACACCCATGCCAGTTACACCTTCAACAA
TTCCTTCTCTTTCTGTTTGCAGAGCTCCTCTACCTTCTTCATGTATGTGTCAATTAGTTT
CTGCAAATCGCTTGACAAATCCTTCACGTTGTCTTCTGACAGCTTCTTCTCCTTCTCGAG
TTTATCATAAGATTTCAAGGCATCCCTCCTTATGTTTCTCAGTGCAACCTTCCCTTCTTC
AGTCTGTTTGGCTACAACCTTTGTTAGTTCCTTTCTTCGCTCAGAAGTGAGGGGAGGCAA
GGACAAGCGAATGACATCACCATCGTTATTAGGAGTGACACCAAGATCAGAACTGACAAT
GGCCTTTTCTATAGCCTTCAAGCTAGATTTGTCATAAGGCTGAAGCAAAAGAAAAGTGCC
ATCGGGGGTACTGATTTGGGCAATGCTTTTCAGACTTACAGGACTTCCATAGTATTCAAC
CTCAATCTTGTCAAGCATAGCAACATTGGCTCTCCCGGTCCTTATGGAGTTGAAACTAGT
CCTAAGCGTTTCAATCGTCCTCTCCATTTTTGATTTAACGTCTTTCTCAATAGCAGATTT
CTCGGCTTCAATTTCTTCAATAGCTGCAGATCTTATCACCACTCTCTTCTGTAGTGACCG
CTTGACAACGGGGCCACCACCAGAGAGCTTA*CTCCCGCAC*GAGCCAAG*ATTGTCGCT
CCTTAA

QA 1 906 1 906
DS 

RD RS1BJ76TF 710 0 0
TTAGGAGTGACACCAAGATCAGAACTGACAATGGC*TTTTCTATAGC*TTCAAGCTAGAT
TTGTCATAAGGCTGAAGCAAAAGAGAAGTGCCATCGGGGGTACTGATTTGGGCAATGCTT
TTCAGACTTACAGGACTTCCATAGTATTCAACCTCAATCTTGTCAAACATAGCAACATTG
GCTCTCCCGGTCCTTATGGAGTTGAAACTAGTCCTAAGCGTTTCAATCGTCCTCTCCATT
TTTGATTTAACGTCTTTCTCAATAGCAGATTTCTCGGCTTCAATTTCTTCAATAGTTGCA
GATCTTATCACCACTCTCTTCTGTAGTGACCGCTTGACAACGGGGCCACTACCAGAGAGC
TTAACTCCCGCACCGAGCCAAGGATTGTCGCTCCTTAAAGAACACGCAATTGCGCGTGCA
GATGAAGCATTGTTCGAAGCCATGACCCTCAAACACGAACCTACCCAAAAGGTGCTTTAA
ATAACATTGTGTTCGAAGCCAACTAAATAAAACAGCAAGTCTGATTCCCCATTTTACGTA
ACTGGGGGAGAGACGAGGGACTTGGAATCACTGGCTCTGAATCGAAGAATCGGTGTGGTC
TGAGCATTGGAAGAGAGTGAAGCCGCCATCGCAGTCTGTGAGAGACTCGAGTTCGAAAAT
ATCTTCTTTGTAAAGGAGATAAGGAAGCGCTTCGGCTCCTTGATGAGCCC

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 6

CO CL938Contig1 1018 6 5 U
GGTGATGATAATTCATGTAAAAGATTTGTGTCTACTTAAACTATACACACATGTAATACA
TGGTTTCAGACATCAAATGTAGCACAAACTGCAAATAACTATCACAGAAGAGCTTTGAAA
ATGAATCTGATGACTATATATTTAGATACAGAAGGGTTTTTTTTTGCTTTCTTTGGTTTA
TGATTGGTAAACCGGTCGGTTTTGCTACTTGTAAATCCATTCGTTTGCTCGTCCACCTGT
TGAATCCATGTCTATGAAAATGCTAACAGCCTTCCCTATCCTGGGTCGCTCTTTGGACTT
TGCTAGGCTGTTACGGATATGGGAGACCGCTCCCC*AGCATTTCAACATGTTGGCTACAT
CGTCAAGTCTAAGTATGTATTCTTCTTCGGTTAGAGGAAAAGACCTCTGTTCTCTGTACT
TCCACATGACATTCATTGCAAGAAGATTCCTCCCCATGAACTCCTTCTTGATGAGCTGAA
CATCATAAGATCTCCCATACTTCTGCCTGATGAGGGTTGCAAGATCTAAGCCGTTAAATG
CAGAATCATCCGACCCAACCATTCTTTCAAGGTTTGCCCGATTCATATCATTGGCTTCCC
TTTTAGATTTATCATCGAGTGATTCCTTTTCTTCGTCATCCGAACTATCTGGATTCATGC
CGTCATCGAGAACACTGCAAATTCTTGAAAACATTCTCCTACTACCAGTTTGCTCCTTAC
AAGAACTCTTCAAGCAGAGGCTATGCGAGAAAGCTAATCTTCCGGAGAAACAGGGACCGG
AGTAAGAAACCTTAGAGAGTGTTCCTATACCGCATCGTTGTTCGTGTGTAAACGATGGTT
GACAATGATGGTGATGACTTGAAACAATGCTCATCATCTTCTAGAAGTTGAGGGATCACG
TAAGCTTACCGCCGTGAGGGAGAGCACGACGGTGATGCGGGGGAGGAGATGAGGAGAATG
GAGATATAAGAGATAAAAAAATCAGTGAATGAACGGTGAAGGAGGAGCCACAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FJ26JQ U 1
AF RS1FB92JQ U 19
AF RS1GS83JQ U 23
AF RS1BB56TF C 69
AF RS1FB92TF C 284
AF RS1GS83TF C 511
BS 1 630 RS1FJ26JQ
BS 631 767 RS1FB92JQ
BS 768 769 RS1GS83JQ
BS 770 843 RS1BB56TF
BS 844 1018 RS1FB92TF

RD RS1FJ26JQ 630 0 0
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TGGTTTCAGACATCAAATGTAGCACAAACTGCAAATAACTATCACAGAAGAGCTTTGAAA
ATGAATCTGATGACTATATATTTAGATACAGAAGGGTTTTTTTTTGCTTTCTTTGGTTTA
TGATTGGTAAACCGGTCGGTTTTGCTACTTGTAAATCCATTCGTTTGCTCGTCCACCTGT
TGAATCCATGTCTATGAAAATGCTAACAGCCTTCCCTATCCTGGGTCGCTCTTTGGACTT
TGCTAGGCTGTTACGGATATGGGAGACCGCTCCCC*AGCATTTCAACATGTTGGCTACAT
CGTCAAGTCTAAGTATGTATTCTTCTTCGGTTAGAGGAAAAGACCTCTGTTCTCTGTACT
TCCACATGACATTCATTGCAAGAAGATTCCTCCCCATGAACTCCTTCTTGATGAGCTGAA
CATCATAAGATCTCCCATACTTCTGCCTGATGAGGGTTGCAAGATCTAAGCCGTTAAATG
CAGAATCATCCGACCCAACCATTCTTTCAAGGTTTGCCCGATTCATATCATTGGCTTCCC
TTTTAGATTTATCATCGAGTGATTCCTTTT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RS1FB92JQ 749 0 0
AAAAGA
TTTGTGTCTACTTAAACTATACACACATGTAATACATGGTTTCAGACATCAAATGTAACA
CAAACTGCAAATAACTATCACAGAAGAGCTTTGAAAATGAATCTGATGACTATATATTTA
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CTACTTGTAAATCCATTCGTTTGCTCGTCCACCTGTTGAATCCATGTCTATGAAAATGCT
AACAGCCTTCCCTATCCTGGGTCGCTCTTTGGACTTTGCTAGGCTGTTACGGATATGGGA
GACCGCTCCCC*AGCATTTCAACATGTTGGCTACATCGTCAAGTCTAAGTATGTATTCTT
CTTCGGTTAGAGGAAAAGACCTCTGTTCTCTGTACTTCCACATGACATTCATTGCAAGAA
GATTCCTCCCCATGAACTCCTTCTTGATGAGCTGAACATCATAAGATCTCCCATACTTCT
GCCTGATGAGGGTTGCAAGATCTAAGCCGTTAAATGCAGAATCATCCGACCCAACCATTC
TTTCAAGGTTTGCCCGATTCATATCATTGGCTTCCCTTTTAGATTTATCATCGAGTGATT
CCTTTTCTTCGTCATCCGAACTATCTGGATTCATGCCGTCATCGAGAACACTGCAAATTC
TTGAAAACATTCTCCTACTACCAGTTTGCTCCTTACAAGAACTCTTCAAGCAGAGGCTAT
GCGAGAAAGCTAATCTTCCGGAG

QA 7 749 7 749
DS 

RD RS1GS83JQ 747 0 0
GG
TTTGTGTCTACTTAAACTATACACACATGTAATACAGGGTTTCAGACATCAAATGTAGCA
CAAACTGCAAATAACTATCACAGAAGAGCTTTGAAAATGAATCTGATGACTATATATTTA
GATACAGAAGGGTTTTTTTTTGCTTTCTTTGGTTTATGATTGGTAAACCGGTCGGTTTTG
CTACTTGTAAATCCATTCGTTTGCTCGTCCACCTGTTGAATCCATGTCTATGAAAATGCT
AACAGCCTTCCCTATCCTGGGTCGCTCTTTGGACTTTGCTAGGCTGTTACGGATATGGGA
GACCGCTCCCC*AGCATTTCAACATGTTGGCTACATCGCCAAGTCTAAGTATGTAATCTT
CTTCGGTTAGAGGAAAAGACCTCTGTTCTCTGTACTTCCACATGACATTCATTGCAAGAA
GATTCCTCCCCATGAACTCCTTCTTGATGAGCTGAACATCATAAGATCTCCCATACTTCT
GCCTGATGAGGGTTGCAAGATCTAAGCCGTTAAATGCAGAATCATCCGACCCAACCATTC
TTTCAAGGTTTGCCCGATTCATATCATTGGCTTCCCTTTTAGATTTATCATCGAGTGATT
CCTTTTCTTCGTCATCCGAACTATCTGGATTCATGCCGTCATCGAGAACACTGCAAATTC
TTGAAAACATTCTCCTACTACCAGTTTGCTCCTTACAAGAACTCTTCAAGCAGAGGCTAT
GCGAGAAAGCTAATCTTCCGGAGAA

QA 3 747 3 747
DS 

RD RS1BB56TF 776 0 0
GACATCAAATGTAGCACAAACTGCAAA*AACTATCACAGAAGAGCTTTGAAAATGAATCT
GATGACTATATATTTAGATACAGAAGGGTTTTTTTT*GCTTTCTTTGGTTTATGATTGGT
AAACCGGTCGGTTTTGCTACTTGTAAATCCATTCGTTTGCTCGTCCACCTGTTGAATCCA
TGTCTATGAAAATGCTAACAGCCTTCCCTATCCTGGGTCGCTCTTTGGACTTTGCTAGGC
TGTTACGGGTATGGGAGACCGCTCCCC*AGCATTTCAACATGTTGGCTACATCGTCAAGT
CTAAGTATGTATTCTTCTTCGGTTAGAGGAAAAGACCTCTGTTCTCTGTACTTCCACATG
ACATTCATTGCAAGAAGATTCCTCCCCATGAACTCCTTCTTGATGAGCT*AACATCATAA
GATCTCCCATACTTCTGCCTGATGAGGGTTGCAAGATCTAAGCCGTTAAATGCAGAATCA
TCCGACCCAACCATTCTTTCAAGGTTTGCCCGATTCATATCATTGGCTTCCCTTTTAGAT
TTATCATCGAGTGATTCCTTTTCTTCGTCATCCGGACTATCTGGATTCATGCCGTCATCG
AGAACACTGCAAATTCTTGAAAACATTCTCCTACTACCAGTTTGCTCCTTACAAGAACTC
TTCAAGCAGAGGCTATGCGAGAAAGCTAATCTTCCGGAGAAACAGGGACCGGAGTAAGAA
ACCTTAGAGAGTGTTCCTATACCGCATCGTTGTTCGTGTGTAAACGATGGTTGAC
C

QA 1 775 1 775
DS 

RD RS1FB92TF 735 0 0
GGTCGCTCTTTGGACTTTGCTAGGCTGTTACGGATATGGGAGACCGCTCCCCCAGCATTT
CAACATGTGGGCTACATCGTCAAGTCTAAGTATGTATTCTTCTTCGGTTAGAGGAAAAGA
CCTCTGTTCTCTGTACTTCCACATGACATTCATTGCAAGAAGATTCCTCCCCATGAACTC
CTTCTTGATGAGCTGAACATCATAAGATCTCCCATACTTCTGCCTGATGAGGGTTGCAAG
ATCTAAGCCGTTAAATGCAGAATCATCCGACCCAACCATTCTTTCAAGGTTTGCCCGATT
CATATCATTGGCTTCCCTTTTAGATTTATCATCGAGTGATTCCTTTTCTTCGTCATCCGA
ACTATCTGGATTCATGCCGTCATCGAGAACACTGCAAATTCTTGAAAACATTCTCCTACT
ACCAGTTTGCTCCTTACAAGAACTCTTCAAGCAGAGGCTATGCGAGAAAGCTAATCTTCC
GGAGAAACAGGGACCGGAGTAAGAAACCTTAGAGAGTGTTCCTATACCGCATCGTTGTTC
GTGTGTAAACGATGGTTGACAATGATGGTGATGACTTGAAACAATGCTCATCATCTTCTA
GAAGTTGAGGGATCACGTAAGCTTACCGCCGTGAGGGAGAGCACGACGGTGATGCGGGGG
AGGAGATGAGGAGAATGGAGATATAAGAGATAAAAAAATCAGTGAATGAACGGTGAAGGA
GGAGCCACAAAAAAA

QA 1 735 1 735
DS 

RD RS1GS83TF 471 0 0
TGAGGGTTGCAAGATCTAAGCCGTTAAATGCAGAATCATCCGACCCAACCATTCTTTCAA
GGTTTGCCCGATTCATATCATTGGCTTCCCTTTTAGATTTATCATCGAGTGATTCCTTTT
CTTCGTCATCCGAACTATCTGGATTCATGCCGTCATCGAGAACACTGCAAATTCTTGAAA
ACATTCTCCTACTACCAGTTTGCTCCTTACAAGAACTCTTCAAGCAGAGGCTATGCGAGA
AAGCTAATCTTCCGGAGAAACAGGGACCGGAGTAAGAAACCTTAGAGAGTGTTCCTATAC
CGCATCGTTGTTCGTGTGTAAACGATGGTTGACAATGATGGTGATGACTTGAAACAATGC
TCATCATCTTCTAGAAGTTGAGGGATCACGTAAGCTTACCGCCGTGAGGGAGAGCACGAC
GGTGATGCGGGGGAGGAGATGAGGAGAATGGAGATATAAGAGATAAAAAAA

QA 1 471 1 471
DS 



AS 2 4

CO CL939Contig1 741 2 3 U
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AACCAAGGGCAGAGAGAAGAGAAAGAGATAACATCAACCAAAAGAAATGGCATCAACCTC
ACTCCTCAAGGCATCCCCAGTGTTGGACAAATCCGAGTGGGTCAAGGGCCAAAGCGTTCT
CTTCCGTCAGCCTTCTTCCGCCTCCGTCGTCCTACGCAACCGTGCCACCGCCCTTACCAC
CCGTGCCGCTTCTTCCTACGCCGATGAGCTTGTTAAGACAGCGAAAACAATTGCGTCTCC
CGGACGCGGAATCCTGGCGATGGACGAGTCGAACGCGACTTGCGGGAAGCGTTTGGACTC
GATCGGGCTAGAGAACACCGAGGCAAACCGTCAAGCGTACCGGACGTTGCTTGTCTCTGC
ACCTGGTCTCGGTCAGTACATCTCCGGAGCAATCCTGTTCGAGGAGACTCTCTATCAGTC
TACCACCGAAGGCAAGAAAATGGTCGACGTCCTCGTCGAGCAGAACATCGTCCCCGGTAT
CAAAGTTGACAAGGGTTTGGTGCCACTTGTTGGTTCTAACAATGAGTCATGGTGCCAAGG
ACTCGATGGTCTATCCTCTCGCACCGCTGCTTACTACCAACAGGGTGCTCGTTTCGCTAA
ATGGCGTACTGTTGTGAGCATTCCCAACGGTCCGTCTGCTCTCGCTGTGAAAGAGCTGCT
TGGGGGCTTGCTCGATACGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CL17TF U 65
AF RS1DK70TF U 1
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AAA
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CAGCCTTCTTCCGCC

QA 4 138 4 138
DS 

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CTTCCGTCAGCCTTCTTCCGCCTCCGTCGTCCTACGCAACCGTGCCACCGCCCTTACCAC
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CGGACGCGGAATCCTGGCGATGGACGAGTCGAACGCGACTTGCGGGAAGCGTTTGGACTC
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ACCTGGTCTCGGTCAGTACATCTCCGGAGCAATCCTGTTCGAGGAGACTCTCTATCAGTC
TACCACCGAAGGCAAGAAAATGGTCGACGTCCTCGTCGAGCAGAACATCGTCCCCGGTAT
CAAAGTTGACAAGGGTTTGGTGCCACTTGTTGGTTCTAACAATGAGTCATGGTGCCAAGG
ACTCGATGGTCTATCCTCTCGCACCGCTGCTTACTACCAACAGGGTGCTCGTTTCGCTAA
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TGGGGGCTTGCTCGATACGCT

QA 1 741 1 741
DS 



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AAATCTGAGTGGGTCAAGGGCCAAAGCGTTCTCTTCCGTCAGCCATCTTCCGCCGCCGTT
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CTTGTTAAGACAGCGAAAACAATTGCGTCTCCGGGACGCGGAATCTTGGCGATGGACGAG
TCGAACGCGACTTGTGGGAAGCGTTTGGACTCGATAGGGCTAGAGAACACTGAGGCAAAC
CGTCAAGCATACAGGACAGAGCTACTCCTGAACAAGTTGCCTCCTACACCCTTAAGCTCC
TCCGCAACAGAATCCCTCCAGCCGTCCCTGGAATCATGTTCTTGTCCGGAGGACAGTCTG
AGTTAGAGGCAACGTTGAACCTCAATGCGATGAACCAGGCACCAAACCCGTGGCACGTGT
CCTTCTCCTACGCACGTGCTCTGCAGAACACTTGTCTGAAAACATGGGGAGGCAGAGCTG
AGAACGTGAACGCAGCTCAGACCACTCTCTTGGCTCGAGCCAAGGCCAATTCATTGGCTC
AGCTCGGAAAATACACAGGAGAAGGTGAGTCTGAAGAGGCTAAGGAGGGTATGTTTGTCA
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TTTTACTTACATTTGTTTTTTGAGTTTGGTTGTGTTATTATCTCATATGTCAAAACACTT
ATATTTTTTCTGCTTAAATTTGCATTAGCTACTCCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FC46TF U 1
AF RS1FC46JQ C 77
BS 1 634 RS1FC46TF
BS 635 819 RS1FC46JQ

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CTTGTTAAGACAGCGAAAACAATTGCGTCTCCGGGACGCGGAATCTTGGCGATGGACGAG
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CGTCAAGCATACAGGACAGAGCTACTCCTGAACAAGTTGCCTCCTACACCCTTAAGCTCC
TCCGCAACAGAATCCCTCCAGCCGTCCCTGGAATCATGTTCTTGTCCGGAGGACAGTCTG
AGTTAGAGGCAACGTTGAACCTCAATGCGATGAACCAGGCACCAAACCCGTGGCACGTGT
CCTTCTCCTACGCACGTGCTCTGCAGAACACTTGTCTGAAAACATGGGGAGGCAGAGCTG
AGAACGTGAACGCAGCTCAGACCACTCTCTTGGCTCGAGCCAAGGCCAATTCATTGGCTC
AGCTCGGAAAATACACAGGAGAAGGTGAGTCTGA
GAGGC

QA 1 634 1 634
DS 

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CCACCTCCCTTACCGTCCGTGCCGCTTCTTCCTACGCCGATGAGCTTGTTAAGACAGCGA
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GGAAGCGTTTGGACTCGATAGGGCTAGAGAACACTGAGGCAAACCGTCAAGCATACAGGA
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TCCAGCCGTCCCTGGAATCATGTTCTTGTCCGGAGGACAGTTTGAGTTAGAGGCAACGTT
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TGCTTTGCAGAACACTTGTTTGAAAACATGGGGAGGCAGAGCTGAGAACGTGAACGCAGC
TCAGACCACTCTCTTGGCTCGAGCCAAGGCCAATTCATTGGCTCAGCTCGGAAAATACAC
AGGAGAAGGTGAGTTTGAAGAGGCTAAGGAGGGTATGTTTGTCAAAGGCTACACCTACTG
AAGACAACAATGTTGAAGAGGAGAGGAGGTCAATGAAGCAAGTGTTTTACTTACATTTGT
TTTTTGAGTTTGGTTGTGTTATTATCTCATATGTCAAAACACTTATATTTTTTCTGCTTA
AATTTGCATTAGCTACTCCTTTT

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 5

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AATCAGCGAAACCACAAACACAAAGT*GTTTTTCACTACAAATACATCAAATAAGAATAT
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AGCGTTTTCATATAGCAGAGTAGCTGTAGTTGTCAGCATCATCAATGGAGGAGGGAGACT
TAGCAGAAGCAGTGAGCACCACTAAGGCACCAAAGAGAATGGTGACGATGGCTGTGAAGT
TCACAAGAAACGCTTCTGGACCGTACTTGTCAAGCTTAGCACCACTCTCCAGGAAAGTCA
GCTTCTCCAGAAACCCTAAAGCTGCGTTCCCAACCGCAAGAATATAAACAAATAGGCCTA
GAATTGCGTGCCACGGAAGCAAACCGCTTCTAAGGTTTGGTGAGCCTCCTGGGAAGAAGA
ACACTGCGAAGCTGTACACCCACTGGAAGGCATAAAGAGAAATGACACCAATACCAATCC
AAGAATGGAGGCTGTAGAGGTTAGGGATGCCACTTTCGTTGTGGTTCTTGAAGGCTGCAC
AGATTCCCCAGATCCCAAGAGCCAGAGCAATGGCATGGAGAATAAGGTGGATCAGCTTCT
TCACTGGTTTCTCCAACGGGAGCGATTTGTAACTTATAATTGCTTCTCCTCCCAAGATTA
CAAATCCAATGAGCATCAGAACAGGATGCAGGTTAAAGATGAGATTCTTGTTTTCAGCTT
CCCAAGCCAGACCACCTCTGTAGCTGATATTCCAAACAAGAACCATAATCGCCGCTATTA
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AACTCTTTTGTTTCCTTTTTTTCTTGTTCTTGTCTTTTTCTCTCCTCTTCTTCTACTTCT
GTTGTCAGATTAATCTCGATGGTTGTGGGCC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RS1AO10JQ U 18
AF RS1FL96JQ U 43
AF RS1CB31JQ U 1
AF RS1E055TF C 213
AF RS1AO10TFB C 387
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AATA
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AGCTGTAGTTGTCAGCATCATCAATGGCAGAGGGAGACTTAGCAGAAGCAGTGAGCACCA
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AACCGCTTCTAAGGTTTGGTGAGCCTCCTGGGAAGAAGAACACTGCGAAGCTGTACACCC
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DS 

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CAG
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TGGAGGAGGGAGACTTAGCAGAAGCAGTGAGCAACACTAAAGCACCAAAGAGAATGGTGA
CGATGGCTGTGAAGTTCACAAGAAACGCTTCTGGACCGTACTTGTCAAGCTTAGCACCAC
TCTCCAGGAAAGTCAGCCTCTCCAGAAACCCTAAAGCTGCGTTCCCAACCGCAAGAATAT
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CACCAATACCAATCCAAGAATGGAGGCTGTAGAGGTTA

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AATCAGCGAAACCACAAACACAAAGT*GTTTTTCACTACAAATACATCAAATAAGAATAT
GATCTGTTGATAGCACCAAGTAGCAACAAAAGATATGCGAGGAACTGCGGAAATATACAA
AGCGTTTTCATATAGCAGAGTAGCTGTAGTTGTCAGCATCATCAATGGCAGAGGGAGACT
TAGCAGAAGCAGTGAGCACCACTAAGGCACCAAAGAGAATGGTGACAATGGCTGTGAAGT
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GCTTCTCCAGAAACCCTAAAGCTGCGTTCCCAACCGCAAGAATATAAACAAATAGGCCTA
GAATTGCGTGCCACGGAAGCAAACCGCTTCTAAGGTTTGGTGAGCCTCCTGGGAAGAAGA
ACACTGCGAAGCTGTACACCCACTGGAAGGCATAAAGAGAAATGACACCAATACCAATCC
AAGAATGGAGGCTGTAGAGGTTAGGGATGCCACTTTCGTTGTGGTTCATGAAGGCTGCAC
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TCACTGGTTTCTCCAACGGGAGCGATTTGTAACTTATAATTGCTTCTCCTCCCAAGATTA
CAAATCCAATGAGCATCAGAACAGGATGCAGGTTAAAGATGAGATTCTTGTTTTCAGCTT
CCCAAGCCAGACCACCTCTGTAGCTGATAT

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DS 

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AGCTTAGCACCACTCTCCAGGAAAGTCAGCTTCTCCAGAAACCCTAAAGCTGCGTTCCCA
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AGATTCGGTGACCCTCCTGGGAAGAAGAACACTGCGAAGCTGTACGCCCACTGGAAGGCA
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CTTTCATTGTGGTTCTTGAAGGCTGCGCAGATTCCCCAGATCCCAAGAGCCAGAGCAATG
GCATGGAGAATAAGATGGATCAGCTTCTTCACCGGTTTCTCCAAGGGAAGCGATTTGTAA
CTTATAATTGCTTCTCCTCCCAAGATTACAAATCCAATGAGCATCAGAACAGGATGCAGA
TTAAATATGAGATTCTTGTTTTCAGCTTCCCAAGCAAGACCACCTCTGTAGCTGATATTC
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DS 

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CTTCTAAGGTTTGGTGAGCCTCCTGGGAAGAAGAACACTGCGAAGCTGTACACCCACTGG
AAGGTATAAAGAGAAATGACACCAATACCAATCCAAGAATGGAGGCTGTAGAGGTTAGGG
ATGCCACTTTCGTTGTGGTTCTTGAAGGCTGCACAGATTCCCCAGATCCCAAGAGCCAGA
GCAATGGCATGGAGAATAAGGTGGATCAGCTTCTTCACTGGTTTCTCCAACGGGAGCGAT
TTGTAAATTATAATTGCTTCTCCTCCCAAGATTACAAATCCAATGAGCATCAGAGCAGGA
TGCAGGTTAAAGATGAGATTCTTGTTTTCAGCTTCCCAAGCCAGACCACCTCTGTAGCTG
ATATTCCAAACCAGCACCATAATCGCCGCTATTACAGCCAGCGCGTGGGCCGCAAACGTC
ACCGGCATCGCGTTTATCCCGACAGCCATAACTGAACTCTTTTGTTTCCTTTTTTTTTTG
TTCTTGTCTTTTTCTCTCCTCTTCTTCTACTTCTGTTGTCAGATTAATCTCGATGGTTGT
CC

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 3

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AAACTGATCAAACAAATTACACAGCACAGCCGGAGAATCATATGGACGTTCACAGAGCTA
TACTCGACCGAAAAACACCGACCATTATGATAGTTATTGGCTCAAAAAACACGAGAAGAT
GATGATACTCTTTTACTTCCAAACGACCCAACTCGGAGGACTGTTTTAGACTTGTGGCGA
GACTGACGACAGCTTACCGAGTTTCATCCTCCAAGGCACGGAATCCAGCAGTGAGATCCT
CGTACAGTTTCTTGAATTTAGCCACGAGAGCAGCCTCACCTTCTGCTGGATCTTCGAACT
TCTGTGACACTAAACGGTAGAAAAGATCTCCCAAGCGATGCTTGATGAGAGTGTATGTAA
TCTTTTGACCATCCATTCCCGCTGCTCTTTCAACCGCCTGATTGGCTAGGTTGTAGAAAT
GGATAATGTTACGCATCATCCACACAGACTTGTAGAAAGGGCAGAATTTGTCATATGGTG
TGAAAGCGTTTTGAGCAAGGTAGTCTTCCCTCAATAGCTTAGCGGTTTCCAAGGTGATTT
TGTCACCTTCTGCTAGCGCATCTTTTCCCACAAGCTGGACAATTTCATTAAGATCATCTT
CCCTCTGCAACACCTCTCTGGCCTTTGTCCTGATGTTGATGAAATCCGGATCGAACTTCT
CATAGAAAGATTCCAACGCCGTTGAATACTTAGAGTAGGAAATCAACCAATTAACAGAAG
GGAAATGCTTTCTCTGGGCAAGCTTTTTGTCCAAACCCCAGAAGACCTGCACAATACTGA
GGGTAGCAGACGTCACAGGATCTGAAAAGTCTCCACCAGGAGGTGAAACAGCGCCAACAA
TTGTGACACTTCCATCACGCTATGGTCCACCGAGACATTTCACTTTACCAGCACGCTAAT
AGAAAGATGCTAAACGTGCTGCTAGATAGGCAGGGTATCCACTGTCGGCAGGCATTTCAG
CCAGACGTCCTGAAATTTCTCTCAATGCTTCTGCCCAACGGGAAGTTGAGTCTGCCATCA
TACTCACATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DD54JQ U 1
AF RS1GE11JQ U 121
AF RS1B023TF C 382
BS 1 557 RS1DD54JQ
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RD RS1DD54JQ 773 0 0
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TCTGTGACACTAAACGGTAGAAAAGATCTCCCAAGCGATGCTTGATGAGAGTGTATGTAA
TCTTTTGACCATCCATTCCCGCTGCTCTTTCAACCGCCTGATTGGCTAGGTTGTAGAAAT
GGATAATGTTACGCATCGTCCACACAGACTTGTAGAAAGGGCAGAATTTGTCATATGGTG
TGAAAGCGTTTTGAGCAAGGTAGTCTTCCCTCAATAGCTTAGCGGTTTCCAAGGTGATTT
TGTCACCTTCTGCTAGCGCATCTTTTCCCACAAGCTGGACGATTTCATTAAGATCATCTT
CCCTCTGCAACACCTCTCTGGCCTTTGTCCTGATGTTGATGAAATCCGGATCG

QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1GE11JQ 678 0 0
AAACTGATCAAACAAATTACACAGCACAGCCGGAGAATCATATGGACGTTCACAGAGCTA
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GATGATACTCTTTTACTTCCAAACGACCCAACTCGGAGGACTGTTTTAGACTTGTGGCGA
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CAATG

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TGATTGGCTAGGTTGTAGAAATGGATAATGTTACGCATCATCCACACAGATTTGTAGAAA
GGGCAGAACTTGTCATATGGTGTGAAAGCGTCTTGAGCAAGGTAGTCTTCTCTCAATAGC
TTAGCTGTTTCCAAGGTGATTTTGTCACCTTCCGCTAGCGCATCTTTTCCCACAAGCTGG
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CCACTGTCGGCAGGCATTTCAGCCAGACGTCCTGAAATTTCTCTCAATGCTTCTGCCCAA
CGGGAAGTTGAGTCTGCCATCATACTCACATTCC

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DS 



AS 1 6

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GAAGATTCGTCTTCAGCTTACAAAGCCAGTTACTTGGCCTCCATTAGTCTGGGGAGTTGT
CTGTGGTGCTGCTGCTTCAGGGAACTTCCACTGGACCCCAGAGGACGTTGCTAAGTCGAT
TCTTTGCATGATGATGTCTGGCCCATGTCTTACTGGCTATACACAGACAATCAACGACTG
GTATGATCGAGAGATTGATGCAATTAATGAGCCATATCGCCCTATCCCATCCGGAGCAAT
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TGCAGTCTTAGATGTGTGGGCAGGACATACCACTCCCACTTTGTTCTACCTTGCTTTGGG
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GGTTGGAAATTTTGCGCTTGGAGCAAGCTATATTAGTTTGCCATGGTGGGCTGGGCAAGC
ATTGTTTGGCACTCTTACACCAGACGTTGTTGTTCTTACACTCTTGTACAGCGTAGCTGG
GTTGGGAATAGCGATTGTTAATGACTTTAAAAGTGTTGAAGGAGACAGAGCAATGGGACT
TCAGTCTCTCCCTGTAGCTTTTGGCACCGAGGCTGCCAAATGGATATGCGTTAGTGCTAT
TGACGTTACTCAGCTCTCTGTTTCCGGATATCTATTAGCATCTGGCAAACCTTACTATGC
GTTGGCGCTGCTTGCTTTGATCATTCCACAGATTGTTTTCCAGTTTAAATACTTTCTCAA
GGACCCTGTCAAATACGACGTCAAGTACCAGGCCAGTGCACAGCCATTCTTGGTGCTCGG
TATATTCGTGACGGCATTAGCATCAAGTCACTGAACGAGCATATTATGATCAGTTTTGGT
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AAAACAACATGTATCTACCATCACTTGAAATGACTCTTGTTGTAACAACTTAAAGCGTCT
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CACATGATTTTACTGCTCGGTCTTGTTACTTTCACCGGATGCTTATATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A148TF U 1
AF RS1A148TV U 37
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BS 1332 1369 RS1A148JQ

RD RS1A148TF 775 0 0
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TGCAGTCTTAGATGTGTGGGCAGGACATACCACTCCCACTTTGTTCTACCTTGCTTTGGG
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QA 1 775 1 775
DS 

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CCCAGAGGACGTTGCTAAGTCGATTCTTTGCATGATGATGTCTGGCCCATGTCTTACTGG
CTATACACAGACAATCAACGACTGGTATGATCGAGAGATTGATGCAATTAATGAGCCATA
TCGCCCTATCCCATCCGGAGCAATATCAGAGCAAGAGGTTATTACACAAGTGTGGGTGCT
ATTACTGGGAGGTCTTGGGATCGCTGCAGTCTTAGATGTGTGGGCAGGACATACCACTCC
CACTTTGTTCTACCTTGCTTTGGGAGGATCCTTGTTGTCTTATATTTACTCTGCTCCACC
TCTTAAGCTGAAACAAAATGGATGGGTTGGAAATTTTGCGCTTGGAGCAAGCTATATTAG
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QA 1 819 1 819
DS 

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G
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TTACTGGCTATACACAGACAATCAACGACTGGTATGATCGAGAGATTGATGCAATTAATG
AGCCATATCGCCCTATCCCATCCGGAGCAATATCAGAGCAAGAGGTTATTACACGAGTGT
GGGTGCTATTACTGGGAGGTCTTGGGATCGCTGCAGTCTTAGATGTGTGGGCAGGACATA
CCACTCCCACTTTGTTCTACCTTGCTTTGGGAGGATCCTTGTTGTCTTATATTTACTCTG
CTCCACCTCTTAAGCTGAAACAAAATGGATGGGTTGGAAATTTTGCGCTTGGAGCAAGCT
ATATTAGTTTGCCATGGCGGGCTGGGCAAGCATTGTTTGGCACTCTTACACCAGACGTTG
TTGTTCTTACACTCTTGTACAGCGTAGCTGGGTTGGGAATAGCGATTGTTAATGACTTTA
AAAGTGTTGAA*GAGACAGAGCAATGGGACTTCAGTCTCTCCCTGTAGCTTTTGGC

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DS 

RD RS1EV87JQ 738 0 0
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ATGGATGGGTTGGAAATTTTGCGCTTGGAGCAAGCTATATTAGTTTGCCATGGCGGGCTG
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GCTATGCGTTGGCGCTGCTTGCTTTGATCATTCCACAGATTGTTTTCCAGTTTAAATACT
TTCTCAAGGACCCTGTCAAATACGACGTCAAGTACCAGGCCAGTGCACAGCCATTCTTGG
TGCTCGGTATATTCGTGACGGCATTAGCATCAAGTCACTGAACGAGCATATTATGATCAG
TTTTGGCCACCAATCAAATGCTCCAATTGCGACCCACAAGTTTGTGCAAGCGGGTTAGCA
TGCTGTAAAAACAACATGTATCTACCATCACTTGAAATGACTCTTGTTGTAACAACTTAA
AGCGTCTTGGGTGAAATTGAAATCATTTCTTATAATCCCTTCCTAGGGTTCGACTGTTAT
GAATCTACACATGATTTT

QA 1 738 1 738
DS 

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GGATCCT
TTGTTGTCTTATATTTACTCTGCTCCACCTCTTAAGCTGAAACAAAATGGATGGGTTGGA
AATTTTGCGCTTGGAGCAAGCTATATTAGTTTGCCATGGTGGGCTGGGCAAGCATTGTTT
GGCACTCTTACACCAGACGTTGTTGTTCTTACACTCTTGTACAGCGTAGCTGGGTTGGGA
ATAGCGATTGTTAATGACTTTAAAAGTGTTGAAGGAGACAGAGCAATGGGACTTCAGTCT
CTCCCTGTAGCTTTTGGCACCGAGGCTGCCAAATGGATATGCGTTAGTGCTATTGACGTT
ACTCAGCTCTCTGTTTCCGGATATCTATTAGCATCTGGCAAACCTTACTATGCGTTGGCG
CTGCTTGCTTTGATCATTCCACAGATTGTTTTCCAGTTTAAATACTTTCTCAAGGACCCT
GTCAAATACGACGTCAAGTACCAGGCCAGTGCACAGCCATTCTTGGTGCTCGGTATATTC
GTGACGGCATTAGCATCAAGTCACTGAACGAGCATATTATGATCAGTTTTGGTCACCAAT
CAAATGCTCCAATTGCGACCCACAAGTTTGTGCAAGCGGGTTAGCATGCTGTAAAAACAA
CATGTATCTACCATCACTTGAAATGACTCTTGTTGTAACAACTTAAAGCGTCTTGGGTGA
AATTGAAATCATTTCTTATAATCCCTTCCTAGGGTTCGACTGTTATGAATCTACACATGA
TTTTACTGCTCGGTCTTGTTACTTTCACCGGATGCTTATATG

QA 8 769 8 769
DS 

RD RS1A148TR 731 0 0
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TGCCATGGTGGGCTGGGCAAGCATTGTTTGGCACTCTTACACCAGACGTTGTTGTTCTTA
CACTCTTGTACAGCGTAGCTGGGTTGGGAATAGCGATTGTTAATGACTTTAAAAGTGTTG
AAGGAGACAGAGCAATGGGACTTCAGTCTCTCCCTGTAGCTTTTGGCACCGAGGCTGCCA
AATGGATATGCGTTAGTGCTATTGACGTTACTCAGCTCTCTGTTTCCGGATATCTATTAG
CATCTGGCAAACCTTACTATGCGTTGGCGCTGCTTGCTTTGATCATTCCACAGATTGTTT
TCCAGTTTAAATACTTTCTCAAGGACCCTGTCAAATACGACGTCAAGTACCAGGCCAGTG
CACAGCCATTCTTGGTGCTCGGTATATTCGTGACGGCATTAGCATCAAGTCACTGAACGA
GCATATTATGATCAGTTTTGGTCACCAATCAAATGCTCCAATTGCGACCCACAAGTTTGT
GCAAGCGGGTTAGCATGCTGTAAAAACAACATGTATCTACCATCACTTGAAATGACTCTT
GTTGTAACAACTTAAAGCGTCTTGGGTGAAATTGAAATCATTTCTTATAATCCCTTCCTA
GGGTTCGACTGTTATGAATCTACACATGATTTTACTGCTCGGTCTTGTTACTTTCACCGG
ATGCTTATATG

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 7

CO CL943Contig1 889 7 14 U
GGAATCTCCACTCTTCGTCAATGGCTTCTCTGAAGCTTTCACCTTCTTCGCCAATCTCTA
TCCCTAAGAGCAGTGGATATGTTGGTAGGAGAGGAGTTTCATTTCTTGTTCGGGCTGAGC
AGTCTCCGTCTTCCCCTTCTGATCTTCAGGATAAATGTCAGAGGAGACGTGTGGTGGTAA
CTTTAGGTGTTGTTGCTCCTTGGATCTCTTTGCTTAGTAAAGCTCCATCATCATTTGCTG
CAGAAAGCAAGAAAGGATTCATGAGTGTCTCTGACAATAAGGATGCATATGCCTTTGTAT
ATCCCTTTGGGTGGCAGGAAGTTGTGATTGAAGGTCAAGACAAGGTATACAAAGATGTGA
TTGAGCCGTTAGAAAGCGTTAGTGTCAATTTGATCCCTACTAGCAAACAGACTATCAAAG
ATTTCGGCCCACCAAAGGAGATTGCTGAGACACTGGTAAAGAAAGTTTTGGCACCACCAA
ATCAGAAGACAACTCTTATTGATGCATCAGAGCATGAAGTTGATGGGAAGACTTATTATC
AGTTTGAGTTCACTGCTCAGGCTAGGAACTACACCCGCCATGCTTTGGGCGTAATTACAG
TTTTTAATGGAAAATTCTACACATTGACAACTGGGGCTAATGAGAGGAGGTGGGAGAAGA
TGAAAGATAGGCTTCACACTGTGATAGATTCTTTCAAGATCACTGTTTGAAAAAAATATC
AAGTTTGGTATGGTCACTTTATGTTTTGAAAAAGCCTGAGTTGTATTTTTTGTTCATTCT
TCCTCTCTCTCT**TTCCCTTAACATTATTCTTCTCCATTAAGAGAGATTCAATACTCTG
ACTTCTTCACATTATCTCCCATTATATAACTGATCGTCCGATGGGAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 10 10 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GY36TF U 1
AF RS1GZ19TF U 8
AF RS1AE21TF U 1
AF RS1AE21JQ C 51
AF RS1GY36JQ C 457
AF RS1GZ19JQ C 302
AF RS1A861TF U 325
BS 1 450 RS1AE21TF
BS 451 451 RS1GY36TF
BS 452 636 RS1AE21TF
BS 637 640 RS1GZ19TF
BS 641 641 RS1A861TF
BS 642 670 RS1AE21TF
BS 671 671 RS1A861TF
BS 672 715 RS1AE21TF
BS 716 716 RS1A861TF
BS 717 752 RS1AE21TF
BS 753 753 RS1A861TF
BS 754 770 RS1AE21TF
BS 771 845 RS1A861TF
BS 846 889 RS1AE21JQ

RD RS1GY36TF 556 0 0
GGAATCTCC
ACTCTTCGTCAATGGCTTCTCTGAAGCTTTCACCTTCTTCGCCAATCTCTATCCCTAAGA
GCAGTGGATATGTTGGTAGGAGAGGAGTTTCATTTCTTGTTCGGGCTGAGCAGTCTCCGT
CTTCCTCTTCTGATCTTCAGGATAAATGTCAGAGGAGACGTGTGGTGGTAACTTTAGGTG
TTGTTGCTCCTTGGATCTCTTTGCTTAGTAAAGCTCCATCATCATTTGCTGCAGAAAGCA
AGAAAGGATTCATGAGTGTCTCTGACAATAAGGATGCATATGCCTTTGTATATCCCTTTG
GGTGGCAGGAAGTTGTGATTGAAGGTCAAGACAAGGTATACAAAGATGTGATTGAGCCGT
TAGAAAGCGTTAGTGTCAATTTGATCCCTACTAGCAAACAGACTATCAAAGATTTCGGCC
CACCAAAGGAGATTGCTGAGACACTGGTAAAGAAAGTTTTGGCACCACCAAATCAGAAGA
CAACTCTTATTGATGCATCAGAGCATGAAGTTGATGGGAAGACTTATTATCAGTTTGAGT
TCACTGC

QA 10 556 10 556
DS 

RD RS1GZ19TF 633 0 0
GG
ACTCTTCGTCAATGGCTTCTCTGAAGCTTTCACCTTCTTCGCCAATCTCTATCCCTAAGA
GCAGTGGATATGTTGGTAGGAGAGGAGTTTCATTTCTTGTTCGGGCTGAGCAGTCTCCGT
CTTCCTCTTCTGATCTTCAGGATAAATGTCAGAGGAGACGTGTGGTGGTAACTTTAGGTG
TTGTTGCTCCTTGGATCTCTTTGCTTAGTAAAGCTCCATCATCATTTGCTGCAGAAAGCA
AGAAAGGATTCATGAGTGTCTCTGACAATAAGGATGCATATGCCTTTGTATATCCCTTTG
GGTGGCAGGAAGTTGTGATTGAAGGTCAAGACAAGGTATACAAAGATGTGATTGAGCCGT
TAGAAAGCGTTAGTGTCAATTTGATCCCTACTAGCAAACAGACTATCAAAGATTTCGGCC
CACCAAAGGAGATTGCTGAGACACTGGTAAAGAAAGTTTTGGCACCACCAAATCAGAAGA
CAACTCTTATTGATGCATCAGAGCATGAAGTTGATGGGAAGACTTATTATCAGTTTGAGT
TCACTGCTCAG*CTAGGAACTACACCCGCCATGCTTTGGGCGTAATTACAGTTTTTAATG
GAAAATTCTACACATTGACAACTGGGGCTAA

QA 3 633 3 633
DS 

RD RS1AE21TF 773 0 0
GGAATCTCCACTCTTCGTCAATGGCTTCTCTGAAGCTTTCACCTTCTTCGCCAATCTCTA
TCCCTAAGAGCAGTGGATATGTTGGTAGGAGAGGAGTTTCATTTCTTGTTCGGGCTGAGC
AGTCTCCGTCTTCCCCTTCTGATCTTCAGGATAAATGTCAGAGGAGACGTGTGGTGGTAA
CTTTAGGTGTTGTTGCTCCTTGGATCTCTTTGCTTAGTAAAGCTCCATCATCATTTGCTG
CAGAAAGCAAGAAAGGATTCATGAGTGTCTCTGACAATAAGGATGCATATGCCTTTGTAT
ATCCCTTTGGGTGGCAGGAAGTTGTGATTGAAGGTCAAGACAAGGTATACAAAGATGTGA
TTGAGCCGTTAGAAAGCGTTAGTGTCAATTTGATCCCTACTAGCAAACAGACTATCAAAG
ATTTCGGCCCACCAAAGGAGATTGCTGAGATACTGGTAAAGAAAGTTTTGGCACCACCAA
ATCAGAAGACAACTCTTATTGATGCATCAGAGCATGAAGTTGATGGGAAGACTTATTATC
AGTTTGAGTTCACTGCTCAGGCTAGGAACTACACCCGCCATGCTTTGGGCGTAATTACAG
TTTTTAATGGAAAATTCTACACATTGACAACTGGGGGCTT*GAGAGGAGGTGGGAGAAGA
TGAAAGATAG*CTTCACACTGTGATAGATTCTTTCAAGATCACTGTTTGAAAAAA*TATC
AAGTTTGGTATGGTCACTTTATGTTTTGAAAA*GCCTGAGTTGTATTTTT
GTT

QA 1 770 1 770
DS 

RD RS1AE21JQ 839 0 0
CCAATCTCTATCCCTAAGAGCAGTGGATATGTTGGTAGGAGAGGAGTTTCATTTCTTGTT
CGGGCTGAGCAGTCTCCGTCTTCCCCTTCTGATCTTCAGGATAAATGTCAGAGGAGACGT
GTGGTGGTAACTTTAGGTGTTGTTGCTCCTTGGATCTCTTTGCTTAGTAAAGCTCCATCA
TCATTTGCTGCAGAAAGCAAGAAAGGATTCATGAGTGTCTCTGACAATAAGGATGCATAT
GCCTTTGTATATCCCTTTGGGTGGCAGGAAGTTGTGATTGAAGGTCAAGACAAGGTATAC
AAAGATGTGATTGAGCCGTTAGAAAGCGTTAGTGTCAATTTGATCCCTACTAGCAAACAG
ACTATCAAAGATTTCGGCCCACCAAAGGAGATTGCTGAGATACTGGTAAAGAAAGTTTTG
GCACCACCAAATCAGAAGACAACTTTTATTGATGCATCAGAGCATGAAGTTGATGGGAAG
ACTTATTATCAGTTTGAGTTCACTGCTCAGGCTAGGAACTACACCCGCCATGCTTTGGGC
GTAATTACAGTTTTTAATGGAAAATTCTACACATTGACAACTGGGGCTT**GAGAGGAGG
TGGGAGAAGATGAAAGATAGGCTTCACACTGTGATAGATTCTTTCAAGATCACTGTTTGA
AAAAAATATCAAGTTTGGTATGGTCACTTTATGTTTTGAAAAAGCCTGAGTTGTATTTTT
TGTTCATTCTTCCTCTCTCTCT**TTCCCTTAACATTACTCTTCTCCATTAAGAGAGATT
CAATACTCTGACTTCTTCACATTATCTCCCATTATATAACTGATCGTCCGATGGGAATG

QA 1 839 1 839
DS 

RD RS1GY36JQ 392 0 0
TAAAGAAAGTTTTGGCACCACCAAATCAGAAGACAACTCTTATTGATGCATCAGAGCATG
AAGTTGATGGGAAGACTTATTATCAGTTTGAGTTCACTGCTCAGGCTAGGAACTACACCC
GCCATGCTTTGGGCGTAATTACAGTTTTTAATGGAAAATTCTACACATTGACAACTGGGG
CTAATGAGAGGAGGTGGGAGAAGATGAAAGATAGGCTTCACACTGTGATAGATTCTTTCA
AGATCACTGTTTGAAAAAAATATCAAGTTTGGTATGGTCACTTTATGTTTTGAAAAAGCC
TGAGTTGTATTTTTTGTTCATTCTTCCTCTCTCTCTCTTTCCCTTAACATTATTCTTCTC
CATTAAGAGAGATTCAATACTCTGACTTC
TTC

QA 1 389 1 389
DS 

RD RS1GZ19JQ 547 0 0
TCCCTTTGGGTGGCAGGAAGTTGTGATTGAAGGTCAAGACAAGGTATACAAAGATGTGAT
TGAGCCGTTAGAAAGCGTTAGTGTCAATTTGATCCCTACTAGCAAACAGACTATCAAAGA
TTTCGGCCCACCAAAGGAGATTGCTGAGACACTGGTAAAGAAAGTTTTGGCACCACCAAA
TCAGAAGACAACTCTTATTGATGCATCAGAGCATGAAGTTGATGGGAAGACTTATTATCA
GTTTGAGTTCACTGCTCAGGCTAGGAACTACACCCGCCATGCTTTGGGCGTAATTACAGT
TTTTAATGGAAAATTCTACACATTGACAACTGGGGCTAATGAGAGGAGGTGGGAGAAGAT
GAAAGATAGGCTTCACACTGTGATAGATTCTTTCAAGATCACTGTTTGAAAAAAATATCA
AGTTTGGTATGGTCACTTTATGTTTTGAAAAAGCCTGAGTTGTATTTTTTGTTCATTCTT
CCTCTCTCTCT**TTCCCTTAACATTATTCTTCTCCATTAAGAGAGATTCAATACTCTGA
CTTC
TTC

QA 1 544 1 544
DS 

RD RS1A861TF 521 0 0
G
GATTGAAGGTCAAGACAAGGTATACAAAGATGTGATTGAGCCGTTAGAAAGCGTTAGTGT
CAATTTGATCCCTACTAGCAAACAGACTATCAAAGATTTCGGCCCACCAAAGGAGATTGC
TGAGACACTGGTAAAGAAAGTTTTGGCACCACCAAATCAGAAGACAACTCTTATTGATGC
ATCAGAGCATGAGGTTGATGGGAAGACTTATTATCAGTTTGAGTTCACTGCTCAGGCTAG
GAACTACACCCGCCATGCTTTGGGCGTAATTACAGTTTTTAATGGAAAATTCTACACATT
GACAACTGGGGCTAATGAGAGGAGGTGGGAGAAGATGAAAGATAGGCTTCACACTGTGAT
AGATTCTTTCAAGATCACTGTTTGAAAAAAATATCAAGTTTGGTTTGGTCACTTTATGTT
TTGAAAAAGCCTGAGT*GTATTTTTTGTTCATTCTTCCTCTCTCTCT**TTCCCTTAACA
TTATTCTTCTCCATTAAGAGAGATTCAATACTCTGACTTC

QA 2 521 2 521
DS 



AS 1 7

CO CL944Contig1 537 7 12 U
TTTTTCTTACCGTTTCTCGATTGATTTCTGATCATGGCGATGAACACAGGAATCCGATCT
ATCTCAAAGATAATAGCTTCATCCGAATCATCAGTCTCCAGATCTGTGAGCAGAAGCTTC
CACTCAACTGGAGCTAAGAAGATGAGCGGAGGAGGAGGGCATGGTCATGACGAGCCATAC
TACCTCCACGCAAAGCACATGTACAATTTGGACCGCATGAAGTACCAAGGTCTCAAGATG
TCTCTCGGTGTCTTTACTGCTTTCAGCATTGGCGTTGGAGTTCCCATCTTTGCTGTTGTC
TTCCAGCAGAGGAAGACTGCCTCTGGTTGACTTCACTCTCTCTCTCTCTCTCTTCTTCTC
TGCTTCAATAATTTTGTTTTTAATTCGTAGCCACAAGTCTGATCGTTATGGTAAAAGTAC
ATTATTCATCCTCCTTTTACTGGCTGTTCGACGCTGGAATAATGTAACTTTGATTGGAAT
CCCAAGTTAATTGTTTGAATATTTTTCATTTTGAGCAAGCAATTTGTTTTATTCACC


BQ
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 5 5 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1C955JQ C 1
AF RS1E302TF U 16
AF RS1CW94TF U 1
AF RS1FA10JQ C 1
AF RS1CZ63TF U 1
AF RS1FA10TF U 1
AF RS1C955TF U 1
BS 1 15 RS1CW94TF
BS 16 171 RS1E302TF
BS 172 172 RS1CW94TF
BS 173 354 RS1E302TF
BS 355 355 RS1CW94TF
BS 356 395 RS1E302TF
BS 396 396 RS1CZ63TF
BS 397 448 RS1E302TF
BS 449 449 RS1CZ63TF
BS 450 497 RS1E302TF
BS 498 529 RS1CZ63TF
BS 530 537 RS1C955TF

RD RS1C955JQ 537 0 0
TTTTTCTTACCGTTTCTCGATTGATTTCTGATCATGGCGATGAACACAGGAATCCGATCT
ATCTCAAAGATAATAGCTTCATCCGAATCATCAGTCTCCAGATCTGTGAGCAGAAGCTTC
CACTCAACTGGAGCTAAGAAGATGAGCGGAGGAGGAGGGCATGGTCATGACGAGCCATAC
TACCTCCACGCAAAGCACATGTACAATTTGGACCGCATGAAGTACCAAGGTCTCAAGATG
TCTCTCGGTGTCTTTACTGCTTTCAGCATTGGCGTTGGAGTTCCCATCTTTGCTGTTGTC
TTCCAGCAGAGGAAGACTGCCTCTGGTTGACTTCACTCTCTCTCTCTCTCTCTTCTTCTC
TGCTTCAATAATTTTGTTTTTAATTCGTAGCCACAAGTCTGATCGTTATGGTAAAAGTAC
ATTATTCATCCTCCTTTTACTGGCTGTTCGACGCTGGAATAATGTAACTTTGATTGGAAT
CCCAAGTTAATTGTTTGAATATTTTTCATTTTGAGCAAGCAATTTGTTTTATTCACC

QA 1 537 1 537
DS 

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GTTTTTAATTCGTAGCCACATGTCTGATCGTTATGGTAAAAGTACATTATTCATCCTCCT
TTTACTGGCTGTTTGACGCTGGAATAATGTAACTTTGATTGGAATCCCAAGTTAATTGTT
TG

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TGCTTCAATAATTTTGTTTTTAATTCGTAGCCACATGTCTGATCGTTATGGTAAAAGTAC
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TGCTTCAATAATTTTGTTTTTAATTCGTAGCCACAAGTCTGATCGTTATGGTAAAAGTAC
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CCCAAGTTAATTGTTTGAATATTTTTCATTTTGAGCAAGCAATTTGTTTTATTCACC

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DS 



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CGTTAAACAACTTACCACCACCATTCGCCAAGGCAGACCAGCTCATCGCCGACTTTGCCA
ACAGAAACCTCAACATCACCGACTTAGTTGCACTCTCCGGTGGACACACCATCGGGATCG
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CTTTCGCCAACAACCTCAAACGCACTTGCCCCACCACTAACTCGAGCAACACGCAAGTGA
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AGAGCTTTGCGATCGACCAGAAGCTGTTTTTTGATCATTTTGTGGTGGGGATGATCAAGA
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TGATCTAGATGAAACCCATATA****ACTATCGTCTCTTATTTTCCTTTGACTTTGTTTT
CTTAGTGAACGCACTTGTGGTTTGTAGAATGCTTAAGACTATCTGATAAATAAGAGTGTT
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TCC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TAACCTTCGTGCCCTTGTCCACAAGCAATGTGGTCAAGTCGTCTCTTGTTCTGACATCCT
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CGACTTAGTTGCACTC

QA 1 676 1 676
DS 

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TGGCAATGAACCTTCTGTCCACGGTAGAGGCACAGGATAAGAAGAAGCCGAGGAGAGATG
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CGCATTGTCCATCTTTCACAGACAGGCTCTACCCGAAC

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1A744TF 890 0 0
GG
AGCAAAGGCAGAGAAGAGAAAAACTTTTAAAACAAAACACCAACAAGAGAGGAAAATGGG
TGAGGGTTTATCCAAACGTGTCCTCACTTTTCTGATATTGATCTCGTTAGTGGCGGTGGC
AATGAACCTTCTGTCCACGGTAGAGGCACAGGATAAGAAGAAGCCGAGGAGAGATGTTCC
TCTAGTGAAAGGTCTCTCATGGAGCTTTTACCAGAAAGCATGTCCAAAAGTGGAAAGCAT
CATCAGGAAAGAGCTCAAGAAAGTCTTCAAGAGAGGTATTGGTTTAGCCGCAGCCATCCT
TCGTATACATTTCCATGACTGCTTCGTTCAGGGATGTGAAGCATCCGTGCTGCTAGATGG
ATCAGCGAGTGGACCAGGAGAGCAATCATCGATCCCGAATCTGACACTCCGTCAAGCCGC
CTTTGTCGTCATCAATAACCTCCGTGCCCTTGTCCACAAGCAATGTGGTCAAGTCGTCTC
TTGTTCTGACATCCTCGCTCTAGCCGCCCGTGACTCCGTCGTCCTATCAGGAGGGCCAGA
CTATGCTGTACCACTTGGCCGACGTGACTCACTAGCGTTCGCGAGCCAGAACACGACGTT
AAACAACTA**CACCACAATTCGCCAAGGCAGACCAGCTCATCGCCGACTTTGCCAACAG
AAACCTCAACATCACCGACTTAGTTGCACTCTCCGGTGGACACACCATCGGGATCGCGCA
TTGTCCATCTTTCACAGACAGGCTCTACCCGAACCAAGACCCAACAATGAACAAGTCTTT
CGCCAACAACCTCAAACGCACTTGCCCCACCACTAACTCGAGCAACACGCAAGTGAATTA
CATAAG*AGCCCTGACGTGTTTGACA*CAAGTACTACGTTGATCTCA
T

QA 3 889 3 889
DS 

RD RS1A744JQ 844 0 0
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GTTCTGACATCCTCGCTCTAGCCGCCCGTGACTCCGTCGTCCTATCAGGAGGGCCAGACT
ATGCTGTACCACTTGGCCGACGTGACTCACTAGCGTTCGCGAGCCAGAACACGACGTTAA
ACAACTA**CACCACAATTCGCCAAGGCAGACCAGCTCATCGCCGACTTTGCCAACAGAA
ACCTCAACATCACCGACTTAGTTGCACTCTCCGGTGGACACACCATCGGGATCGCGCATT
GTCCATCTTTCACAGACAGGCTCTACCCGAACCAAGACCCAACAATGAACAAGTCTTTCG
CCAACAACCTCAAACGCACTTGCCCCACCACTAACTCGAGCAACACGCAAGTGAATTACA
TAAGGAGCCCTGACGTGTTTGACAACAAGTACTACGTTGATCTCATGAACCGACAAGGGC
TATTCACATCCGACCAGGACCTGTTCACGGACAAGAGGACACGTGGTATCGTGGAGAGCT
TTGCGATCGACCTGAAGCTGTTTTTTGATCATTTTGTGGTGGGGATGATCAAGATGGGTC
AGATGAGTGTTTTGACGGGGTCACAAGGAGAGATTCGTGCAAACTGTTCCGCCAGAAACA
CTGAAAGTTTCATGTCTGTTTTGGAAGATGGCATACTCGAGGAGGCTCTTTCCATGATCT
AGATGAAACCCATATA****ACTATCGTCTCTTATTTTCCTTTGACTTTGTTTTCTTAGT
GAACGCACTTGTGGTTTGTAGAATGCTTAAGACTATCTGATAAATAAGAGTGTTGCTTCA
TCT
T

QA 1 843 1 843
DS 

RD RS1CI18TF 765 0 0
G
AGCCGCCCGTGACTCCGTCGTCCTATCAGGAGGGCCAGACTATGCTGTACCACTTGGCCG
ACGTGACTCACTAGCGTTCGCGAGCCAGAACACGACGTTAAACAACTTACCACCACCATT
CGCCAAGGCAGACCAGCTCATCGCCGACTTTGCCAACAGAAACCTCAACATCACCGACTT
AGTTGCACTCTCCGGTGGACACACCATCGGGATCGCGCATTGTCCATCTTTCACAGACAG
GCTCTACCCGAACCAAGACCCAACAATGAACAAGTCTTTCGCCAACAACCTCAAACGCAC
TTGCCCCACCACTAACTCGAGCAACACGCAAGTGAATGACATAAGGAGCCCTGACGTGTT
TGACAACAAGTACTACGTTGATCTCACGAACCGACAAGGGCTATTCACATCCGACCAGGA
CCTGTTCACGGACCAGAGGACACGTGGTATCGTGGAGAGCTTTGCGATCG*CCAGAAGCT
GTTTTTTGATCATTTTGTGGTGGGGATGATCAAGATGGGTCAGATGAGTGTTTTGACGGG
GTCACAAGGAGAGATTCGTGCAAACTGTTCCGCCAGAAACACTGAAAGTTTCATGTCTGT
TTTGGAAGATGGCATACTCGAGGAGGCTCTTTCCATGATCTAGATGAAACCCATATATAT
AACTATCGTCTCTTATTTTCCTTTGACTTTGTTTTCTTAGTGA*CGCACTTGTGGTTTGT
AGAATGCTTAAGACTATCTGATAAATAAGAGTGTTGCTTCATCT

QA 2 765 2 765
DS 

RD RS1BY34JQ 740 0 0
TCAGGAGGGCCAGACTATGCTGTACCACTTGGCCGACGTGACTCACTAGCGTTCGCGAGC
CAGAACACGACGTTAAACAACTTACCACCACCATTCGCCAAGGCAGACCAGCTCATCGCC
GACTTTGCCAACAGAAACCTCAACATCACCGACTTAGTTGCACTCTCCGGTGGACACACC
ATCGGGATCGCGCATTGTCCATCTTTCACAGACAGGCTCTACCCGAACCAAGACCCAACA
ATGAACAAGTCTTTCGCCAACAACCTCAAACGCACTTGCCCCACCACTAACTCGAGCAAC
ACGCAAGTGAATGACATAAGGAGCCCTGACGTGTTTGACAACAAGTACTACGTTGATCTC
ATGAACCGACAAGGGCTATTCACATCCGACCAGGACCTGTTCACGGACAAGAGGACACGT
GGTATCGTGGAGAGCTTTGCGATCGACCAGAAGCTGTTTTTTGATCATTTTGTGGTGGGG
ATGATCAAGATGGGTCAGATGAGTGTTTTGACGGGGTCACAAGGAGAGATTCGTGCAAAC
TGTTCCGCCAGAAACACTGAAAGTTTCATGTCTGTTTTGGAAGATGGCATACTCGAGGAG
GCTCTTTCCACGATCTAGATGAAACCCATATA****ACTATCGTCTCTTATTTTCCTTTG
ACTTTGTTTTCTTAGTGAACGCACTTGTGGTTTGTAGAATGCTTAAGACTATCTGATAAA
TAAGAGTGTTGCTTCATCT
T

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1DB19JQ 534 0 0
GGAGCCCTGACGTGTTTGACAACAAGTACTACGTTGATCTCATGAACCGACAAGGGCTAT
TCACATCCGACCAGGACCTGTTCACGGACAAGAGGACACGTGGTATCGTGGAGAGCTTTG
CGATCGACCAGAAGCTGTTTTTTGATCATTTTGTGGTGGGGATGATCAAGATGGGTCAGA
TGAGTGTTTTGACGGGGTCACAAGGAGAGATTCGTGCAAACTGTTCCGCCAGAAACACTG
AAAGTTTCATGTCTGTTTTGGAAGATGGCATACTCGAGGAGGCTCTTTCCATGATCTAGA
TGAAACCCATATA****ACTATCGTTTCTTATTTTCCTTTGACTTTGTTTTCTTAGTGAA
CGCACTTGTGGTTTGTAGAATGCTTAAGACTATCTGATAAATAAGAGTGTTGCTTCATCT
TAGCTTTGATTTTAATTTCATGCACGTATGCTTCATCTTAGTTAACGCACTTGTGGTTTG
TGGAATGCTTAAGACTATATGATAAATAAGAGTGTTGCTCTTCATCTTTTGTCC

QA 1 534 1 534
DS 



AS 1 6

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AGCCGGAGAAGACGAAAAGAGAAGATGTCGTGGCAATCATACGTCGATGACCATCTCCTG
TGCGATGTGGAAGGCAGCCGCCTCACATCCGCCGCCATCCTCGGCCAAGACGGCAGTGTC
TGGGCCCAAAGCTCGAACTTCCCTCAGTTGAAGACTACTGAGATAGATGGAATCAGGAAA
GACTTTGAGGAACCTGGGCATCTTGCCCCAACAGGGCTCTTCCTTGGCGGAGAGAAGTAC
ATGGTTATCCAAGGTGAAGCCGGAGCTGTCATCCGAGGCAAAAAGGGACCTGGTGGAGTC
ACTATCAAGAAGACCAACCAAGCCTTTGTCTTTGGCATCTACGATGAACCAATGACTGGA
GGTCAGTGCAACTTGGTGGTGGAGAGGCTCGGCGATTACCTTATCGAGTCTGATCTCTAA
GTTTACACTCTTTCAAAAACGTGCTTCAAACCAAAATTTGAACTTTAAGGTTCTTCTTTT
ACTACATAAAACACTCTTCTGCCGTGTATTATGATTTGATTTGTGGTCGTGCATCAAAAA
CAAAAACCTAAACTATACTCTTGAAAATGATCTAAGAAACAAATCACCCTTTGTGTTTTT
GTTTTGGAGTCTCTCT********CTATTGTTCTTCTTGTGTTGTATTTCTTAATGTATC
TCTCTTGTTTTCGATTTTAATAATAAAGTAACTCCTGTTTGGT


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 35 35 
35 35 35 35 35 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B844TF U 1
AF RS1BI90JQ C 1
AF RS1CZ43TF U 351
AF RS1DI53JQ C 284
AF RS1DI53TF U 3
AF RS1BI90TF U 1
BS 1 22 RS1B844TF
BS 23 23 RS1BI90TF
BS 24 605 RS1B844TF
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BS 726 752 RS1CZ43TF
BS 753 763 RS1BI90JQ

RD RS1B844TF 728 0 0
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TGCGATGTGGAAGGCAGCCGCCTCACATCCGCCGCCATCCTCGGCCAAGACGGCAGTGTC
TGGGCCCAAAGCTCGAACTTCCCTCAGTTGAAGACTACTGAGATAGATGGAATCAGGAAA
GACTTTGAGGAACCTGGGCATCTTGCCCCAACAGGGCTCTTCCTTGGCGGAGAGAAGTAC
ATGGTTATCCAAGGTGAAGCCGGAGCTGTCATCCGAGGCAAAAAGGGACCTGGTGGAGTC
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GGTCAGTGCAACTTGGTGGTGGAGAGGCTCGGCGATTACCTTATCGAGTCTGATCTCTAA
GTTTACACTCTTTCAAAAACGTGCTTCAAACCAAAATTTGAACTTTAAGGTTCTTCTTTT
ACTACATAAAACACTCTTCTGCCGTGTATTATGATTTGATTTGTGGTCGTGCATCAAAAA
CAAAAGCCTAAACTATACTCTTGAAAATGATCTAAGAAACAAATCACCCTTTGTGTTTTT
GTTTTGGAGTCTCTCT********CTATTGTTCTTCTTGTGTTGTATTTCTTAATGTATC
TCTCT
GTT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1BI90JQ 763 0 0
GGAC
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GGAGAAGACGAAAAGAGAAGATGTCGTGGCAATCATACGTCGATGACCATCTCCTGTGCG
ATGTGGAAGGCAGCCGCCTCACATCCGCCGCCATCCTCGGCCAAGACGGCAGTGTCTGGG
CCCAAAGCTCGAACTTCCCTCAGTTGAAGACTACTGAGATAGATGGAATCAGGAAAGACT
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TTATCCAAG*TGAAGCCGGAGCTGTCATCCGAGGCAAAAAGGGACCTGGTGGAGTCACTA
TCAAGAAGACCAACCAAGCCTTTGTCTTTGGCATCTACGATGAACCAATGACTGGAGGTC
AGTGCAACTTGGTGGTGGAGAGGCTCGGCGATTACCTTATCGAGTCTGATCTCTAAGTTT
ACACTCTTTCAAAAACGTGCTTCAAACCAAAATTTGAACTTTAAGGTTCTTCTTTTACTA
CATAAAACACTCTTCTGCCGTGTATTATGATTTGATTTGTGGTCGTGCATCAAAAACAAA
AACCTAAACTATACTCTTGAAAATGATCTAAGAAACAAATCACCCTTTGTGTTTTTGTTT
TGGAGTCTCTCT********CTATTGTTCTTCTTGTGTTGTATTTCTTAATGTATCTCTC
TTGTTTTCGATTTTAATAATAAAGTAACTCCTGTTTGGT

QA 5 763 5 763
DS 

RD RS1CZ43TF 402 0 0
G
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ATGACTGGAGGTCAGTGCAACTTGGTGGTGGAGAGGCTCGGCGATTACCTTATCGAGTCT
GATCTCTAAGTTTACACTCTTTCAAAAACGTGCTTCAAACCAAAATTTGAACTTTAAGGT
TCTTCTTTTACTACATAAAACACTCTTCTGCCGTGTATTATGATTTGATTTGTGGTCGTG
CATCAAAAACAAAAACCTAAACTATACTCTTGAAAATGATCTAAGAAACAAATCACCCTT
TGTGTTTTTGTTTTGGAGTCTCTCT********CTATTGTTCTTCTTGTGTTGTATTTCT
TAATGTATCTCTCTTGTTTTCGATTTTAATAATAAAGTAAC

QA 2 402 2 402
DS 

RD RS1DI53JQ 469 0 0
TTGGCGGAGAGAAGTACATGGTTATCCAAGGTGAAGCCGGAGCTGTCATCAGAGGCAAAA
AGGGACCTGGTGGAGTCACTATCAAGAAGACCAACCAAGCCTTTGTCTTTGGCGTCTACG
ATGAACCAATGACTGGAGGTCAGTGCAACTTGGTGGTGGAGAGGCTCGGCGATTACCTTA
TCGAGTCTGATCTCTAAGTTTACACACTTTCAAAAA*GTGCTTCAAACCAAAATTTCAAC
TT*AAGGTTGTTCTTT*ACTACATAAA*CACTCTTCTGCCGTGTATTATGATTTGATTTG
TGGTCGTGCATCAAAA*CAAAAACCTAAACTATACTCTTGAAAATGATCTAAGAAACAAA
TCACC*TTTGTGTTTTTGTTTTGGAGTCTCTCTATTGTTCTCTATTGTTCTTCTTGTGTT
GTATTTCTTAATGTATCTCTCTGGTTTTCGATTTTAATAATAAAGTAAC

QA 1 469 1 469
DS 

RD RS1DI53TF 731 0 0
GG
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GGAGAAGACGAAAAGAGAAGATGTCGTGGCAATCATACGTCGATGACCATCTCCTGTGCG
ATGTGGAAGGCAGCCGCCTCACATCCGCCACCATCCTCGGCCAAGACGGCAGTGTCTGGG
CCCAAAGCTCGAACTTCCCTCAGTTGAAGACTACTGAGATAGATGGAATCAGGAAAGACT
TTGAGGAACCTGGGCATCTTGCCCCAACAGGGCTCTTCCTTGGCGGAGAGAAGTACATGG
TTATCCAAGGTGAAGCCGGAGCTGTCATCAGAGGCAAAAAGGGACCTGGTGGAGTCACTA
TCAAGAAGACCAACCAAGCCTTTGTCTTTGGCGTCTACGATGAACCAATGACTGGAGGTC
AGTGCAACTTGGTGGTGGAGAGGCTCGGCGATTACCTTATCGAGTCTGATCTCTAAGTTT
ACACACTTTCAAAAA*GTGCTTCAAACCAAAATTTCAACTT*AAGGTTGTTCTTT*ACTA
CATAAA*CACTCTTCTGCCGTGTATTATGATTTGATTTGTGGTCGTGCATCAAAA*CAAA
AACCTAAACTATACTCTTGAAAATGATCTAAGAAACAAATCACC*TTTGTGTTTTTGTTT
TGGAGTCTCTCTATTGTTCTCTATTGTTCTTCTTGTGTTGTATTTCTTAATGTATCTCTC
TGGTTTTCG

QA 3 731 3 731
DS 

RD RS1BI90TF 734 0 0
GGAC
GAACAAAAGCTCACAAAGGAGAGAAAACACAAAGAGAGAGAGAGAAGAAACAATCCAGCC
GGAGAAGACGAAAAGAGAAGATGTCGTGGCAATCATACGTCGATGACCATCTCCTGTGCG
ATGTGGAAGGCAGCCGCCTCACATCCGCCGCCATCCTCGGCCAAGACGGCAGTGTCTGGG
CCCAAAGCTCGAACTTCCCTCAGTTGAAGACTACTGAGATAGATGGAATCAGGAAAGACT
TTGAGGAACCTGGGCATCTTGCCCCAACAGGGCTCTTCCTTGGCGGAGAGAAGTACATGG
TTATCCAAG*TGAAGCCGGAGCTGTCATCCGAGGCAAAAAGGGACCTGGTGGAGTCACTA
TCAAGAAGACCAACCAAGCCTTTGTCTTTGGCATCTACGATGAACCAATGACTGGAGGTC
AGTGCAACTTGGTGGTGGAGAGGCTCGGCGATTACCTTATCGAGTCTGATCTCTAAGTTT
ACACTCTTTCAAAAACGTGCTTCAAACCAAAATTTGAACTTTAAGGTTCTTCTTTTACTA
CATAAAACACTCTTCTGCCGTGTATTATGATTTGATTTGTGGTCGTGCATCAAAAACAAA
AACCTAAACTATACTCTTGAAAATGATCTAAGAAACAAATCACCCTTTGTGTTTTTGTTT
TGGAGTCTCTCT********CTATTGTTCTTCTTGTGTTGTATTTCTTAATGTATCTCTC
TTGTTTTCGA

QA 5 734 5 734
DS 



AS 1 7

CO CL947Contig1 593 7 12 U
GGAAGAAGAAGCGATGGGTCTCGTCCTAATTTCTTCTTGTCCCGCACCGTCCTCCCTCGT
CCTCGTCTCTCGGCTTCACCAGTTCTCTGCCGGAATAAAAAACAGTGAAATTTCGCTCAA
TCATCAAATTTCTCCTACCCGTAAACCCTTAATTGCGAAACCATGTTGTTTCAATCTTCC
TCAAGAACCTATCCTCTCGGAGGCTCTCAAGGAGCCAATTGCATTTGTGGGTGGGGTGTT
TGCTGGACTACTTAGACTGGATCTAAACGATGAACCGCTTAAGGAATGGGTGACGCGAAC
TGTCGAAGCTTCTGGTATTACAGACGAGGATGTTGGTGGATATGGGGTATCATCTAATGA
AGAAGAATCTCCTCAACAGATTGAGATTGAATGAGGTCATTGTCCTTTAATATGGTTGCC
CTTGTGTATGTGTATGTTTATGTGCTAGAAACATAAACCCAAAGAAGATTGTGCTCTTAG
AAAAACCAAGGCTTGATTGACATCTTGCTCTATGTATCTTAATTAAATGATGAAAACACT
AATAAGAGAGTGGCCATCTTATAATAGAACAGGAAGATATTACATTTACGTTC


BQ
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CN73TF U 52
AF RS1GC94TF U 1
AF RS1BI59JQ C 1
AF RS1BI59TF U 1
AF RS1C564TF U 1
AF RS1CN73JQ C 1
AF RS1C564JQ C 72
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BS 371 505 RS1BI59TF
BS 506 507 RS1C564TF
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BS 528 528 RS1C564TF
BS 529 556 RS1BI59TF
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TGGGGTG

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CTTGTGTATGTGTATGTTTATGTGCTAGAAACATAAACCCAAAGACGATTGTGCTCTTA*
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CTTGTGTATGTGTATGTTTATGTGCTAGAAACATAAACCCAAAGAAGATTGTGCTCTTAG
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CTTGTGTATGTGTATGTTTATGTGCTAGAAACATAAACCCAAAGAAGATTGTGCTCTTAG
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AATAAGAGAGTGGCCA
AAAAAAA

QA 1 556 1 556
DS 

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TCATCAAATTTCTCCTACCCGTAAACCCTTAATTGCGAAACCATGTTGTTTCAATCTTCC
TCAAGAACCTATCCTCTCGGAGGCTCTCAAGGAGCCAATTGCATTTGTGGGTGGGGTGTT
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AATAAGAGAGTGGCC

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DS 

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TTAGACTGGATCTAAACGATGAACCGCTTAAGGAATGGGTGACGCGAACTGTCGAAGCTT
CTGGTATTACAGACGAGGATGTTGGTGGATATGGGGTATCATCTAATGAAGAAGAATCTC
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GTATGTTTATGTGCTAGAAACATAAACCCAAAGAAGATTGTGCTCTTAGAAAAACCAAGG
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GGCCATCTTATAATAGAACAGGAAGATATTACATTTACGTTC

QA 1 522 1 522
DS 



AS 2 7

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1FM39JQ U 60
AF RS1GZ46JQ U 58
AF RS1C567JQ U 1
BS 1 116 RS1C567JQ
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RD RS1FM39JQ 516 0 0
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DS 

RD RS1GZ46JQ 621 0 0
AA
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ACATTCATATTAGACATTCGTTGCTCAAAAAAGAAGAAAAAACATTCATCTCATCTATAC
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TTGTCACCCCTTGACAGCCGTAGCTCCTCGTCCACATAGGTAATCTCTAGTTCACCACGT
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QA 3 621 3 621
DS 

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TGTCACCCCTTGACAGCCGTAGCTCCTCGTCCACATAGGTAATCTCTAGTTCACCACGTG
CGGTTTCAGGTGCGTTTACAGGGATAAGGCCGAGAATTTTGAACACTTTGAGCTGCACAG
CAACCTTCCTTGAATTGAGAGGTCTTATGTCTCCAGTTACCGAGTTGAAGAAAGGCCAAG
TCTCCATGTTTTGAACCTTGAGTGTATCCACATTGATAGATTGGTAGTTTGTTATTGATC
TCAAGAACCTTGGTTTCTTGGCCTGCAGAATAGAAGCAGAGGTTGTGTAAATGAGCTCCC
ATTTCCCATTGATTAAATCAGATTTCAAAGGCTCCTTCGTTGGATTCACTGCTTCAACTT
TACGCGCCAACTGATCAATACGAAGCTGGTCGTCAGGAGAAGCAGTGGCGCCGCGTTCGA
GAGGCT

QA 1 726 1 726
DS 



CO CL948Contig2 805 4 10 U
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GTGACAAGGGAAATTTGTTATACTG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C567TF U 24
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TT

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GG
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G
TGACA

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GGGAAATGGGAGCTCATTTACACAACCTCTGCTTCTATTCTGCAGGCCAAGAAACCAAGG
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ATGGAGACTTGGCCTTTCTTCAACTCGGTAACTGGAGACATAAGACCTCTCAATTCAAGG
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TGACAAGGGAAATTTGTTATACTG

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DS 



AS 1 7

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AATCTTTTTTTTCTTTCTTTTTGTTTCTGAAAATCTTAGAGAGTTTATGATCATGGTTTT
AAGAGTGCATTTCTTGCCTTTGAGAAACATAAAATTGAATCATAGCACAGTACGATGTTT
GGACTCTATTAAGAGGAATACAAATTTCCAATATTTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 20 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
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30 30 30 30 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1BW20TF U 23
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G
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CATGGTGT

QA 2 609 2 609
DS 

RD RS1G347TF 694 0 0
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CTTCTGCTAAGAGATGGCTTCCACTTGAAGCTAACCCAGAGGTTATGAATCAGTTTCTTT
GGGGGCTTGGGCTTGAACCAGATGCGGCGGAGTGCAATGACGTGTTTGGATTAGACGACG
AACTTCTTGAGATGGTTCCAAAGCCTGTCCTTGCTGTTCTCTTCCTTTACCCTATCACCA
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ATAAGGTTTACTTCATGAAACAAACTGTGGGTAATGCTTGCGGAACCATTGGTCTTCTCC
ATGCTATTGGCAACATTACCTCTGAAATCAAGCTTTCTGAGGGATCTTTCTTGGATAAAT
TCTTCAAATCCACAGCCAATATGACTCCCATGGAGCGTGCAAGGTTTCTTGAGAATGACA
GTCAAATAGAAGATGCGCATTCTGTGGCGGTTACCGCTGGTGAAACACCGGCTACAGACG
ACGCGGACACACATTTCATCTGTTTAGCGTGTGTAGATGGTGAGCTCTATGAACTCGATG
GAAGGAAAGCTGGGCCAATTTCACATGGTGTTTCCTCTCCAGCTACTCTCTTGAA*GATG
CGACGAA*GTAATGAAGAAGTTTATTGATAAGAA

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DS 

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TGGGGAA
GAAAGAAAGACGATCACGAAGATGGCGACGGAGAGTTCTTCTGCTAAGAGATGGCTTCCA
CTTGAAGCTAACCCATAGGTTATGAATCAGTTTCTTTGGGGGCTTGGGCTTGAACCAGAT
GCGGCGGAGTGCAATGACGTGTTTGGATTAGACGACGAACTTCTTGAGATGGTTCCAAAG
CCTGTCCTTGCTGTTCTCTTCCTTTACCCTATCACCAAAAAGAGTGAAGAAGAGAGGATC
GAGCAAGACAAGGAAATCAAGGAGAAGGTGCATAGTGATAAGGTTTACTTCATGAAACAA
ACTGTGGGTAATGCTTGCGGAACCATTGGTCTTCTCCATGCTATTGGCAACATTACCTCT
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ACTCCCATGGAGCGTGCAAGGTTTCTTGAGAATGACAGTCAAATAGAAGATGCGCATTCT
GTGGCGGTTACCGCTGGTGAAACACCGGCTACAGACGACGCGGACACACATTTCATCTGT
TTAGCGTGTGTAGATGGTGAGCTCTATGAACTCGATGGAAGGAAAGCTGGACCAATTTCA
CATGGTGTTTCCTCTCCAGCTACTCTCTTGAAAGATGCGACGAATGTAATGAAGAAGTTT
ATTGATAAGAATCCGGACACGCTCAACTTCAACGTGATGGCCATCTCTAAGAGAACCTGA
GCTTTTTCTTCAAGAAGCAAGGATCTGTTTCTGCATTTATGACTTAACTATC

QA 8 779 8 779
DS 

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G
GAAAGAAAGACGATCACGAAGATGGCGACGGAGAGTTCTTCTGCTAAGAGATGGCTTCCA
CTTGAAGCTAACCCAGAGGTTATGAATCAGTTTCTTTGGGGGCTTGGGCTTGAACCAGAT
GCGGCGGAGTGCAATGACGTGTTTGGATTAGACGACGAACTTCTTGAGATGGTTCCAAAG
CCTGTCCTTGCTGTTCTCTTCCTTTACCCTATCACCAAAAAGAGTGAAGAAGAGAGGATC
GAGCAAGACAAGGAAATCAAGGAGAAGGTGCATAGTGATAAGGTTTACTTCATGAAACAA
ACTGTGGGTAATGCTTGCGGAACCATTGGTCTTCTCCATGCTATTGGCAACATTACCTCT
GAAATCAAGCTTTCTGAGGGATCTTTCTTGGATAAATTCTTCAAATCCACAGCCAATATG
ACTCCCATGGAGCGTGCAGGGTTTCTTGAGAATGACAGTCAAATAGAAGATGCGCATTCT
GTGGCGGTTACCGCTGGTGAAACACCGGCTACAGACGACGCGGACACACATTTCATCTGT
TTAGCGTGTGTAGATGGTGAGCTCTATGAACTCGATGGAAGGAAAGCTGGACCAATTTCA
CATGGTGTTTCCTCTCCAGCTACTCTCTTGAAGGATGCGACGAAGGTAATGAAGAAGTTT
ATTGATAAGAATCCGGACACGCTCAACTTCAATGTGATGTCCATCTCTAAGAGAACCTGA
GCTTTTTCTTCAAGAAGCAAGGATCTGTTTCTGCATTTATGACTTAACTATCCACGCAGA
TTTTATATCTTTGTGGATTGTGATTTACTGTATTCTGAATC

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DS 

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ACAGAGGACGGGGACACACATTTCATTTGTTTAGCGTGTGTAGATGGTGAGCTCTATGAA
CTCGATGGAAGGAAAGCTGGACCAATTTCACATGGTGTTTCCTCTCCAGCTACTTTCTTG
AAGGATGCGACGAAGGTAATGAAGAAGTTTATTGATAAGAATCCGGACACGCTCAACTTC
AATGTGATGTCCATCTTTAAGAGAACCTGAGCTTTTTTTTCAAGAAGCAAGGATCTGTTT
CTGCATTTATGACTTAACTATCCACGCAGATTTTATATCTTTGTGGATTGTGATTTACTG
TATTTTGAATCTTTTTTTTCTTTCTTTTTGTTTTTGAAAA

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DS 

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TGTTCTCTTCCTTTACCCTATCACCAAAAAGAGTGAAGAAGAGAGGATCGAGCAAGACAA
GGAAATCAAGGAGAAGGTGCATAGTGATAAGGTTTACTTCATGAAACAAACTGTGGGTAA
TGCTTGCGGAACCATTGGTCTTCTCCATGCTATTGGCAACATTACCTCTGAAATCAAGCT
TTCTGAGGGATCTTTCTTGGATAAATTCTTCAAATCCACAGCCAATATGACTCCCATGGA
GCGTGCAAGGTTTCTTGAGAATGACAGTCAAATAGAAGATGCGCATTCTGTGGCGGTTAC
CGCTGGTGAAACACCGGCTACAGACGACGCGGACACACATTTCATCTGTTTAGCGTGTGT
AGATGGTGAGCTCTATGAACTCGATGGAAGGAAAGCTGGACCAATTTCACATGGTGTTTC
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TCCGGACACGCTCAACTTCAACGTGATGGCCATCTCTAAGAGAACCTGAGCTTTTTCTTC
AAGAAGCAAGGATCTGTTTCTGCATTTATGACTTAACTATCCACGCAGATTTTATATCTT
TGTGGATTGTGATTTACTGTATTCTGAATCTTTTTCTTCTTTCTTTTTGTTTCTGAAAAT
CTTAGAGAGTTTATGATCATGGTTTTAAGAGTGCATTTCTTGCCTTTGAGAAACATAAAA
TTGAATCATAGCGCAGTACGATGTTTGGACTCTATTAAGAGGAATACAAATTTCCAATAT
TTGTTC

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DS 

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AAGATGCGCATTTTGTGGCGGTTACCGCTGGTGAAACACCGGCTACAGACGACGCGGACA
CACATTTCATCTGTTTAGCGTGTGTAGATGGTGAGCTCTATGAACTCGATGGAAGGAAAG
CTGGACCAATTTCACATGGTGTTTCCTCTCCAGCTACTTTCTTGAAGGATGCGACGAAGG
TAATGAAGAAGTTTATTGATAAGAATCCGGACACGCTCAACTTCAATGTGATGTCCATCT
TTAAGAGAACCTGAGCTTTTTTTTCAAGAAGCAAGGATCTGTTTCTGCATTTATGACTTA
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TTTCTTTCTTTTTGTTTCTGAAAATTTTAGAGAGTTTATGATCATGGTTTTAAGAGTGCA
TTTCTTGCCTTTGAGAAACATAAAATTGAATCATAGCACAGTACGATGTTTGGACTCTAT
TAAGAGGAATACAAATTTCC

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DS 



AS 1 6

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GGAATCTCGAAATCAAAATAGAGAGAGCATCCATTGTTTGTTTCAGAGAAAGAGAGAGAG
AGAGAGAGAGAGAGAGAG****GAGAAAGAAGGCATGGAGACTGAGAGGGAAAAGCAGGT
TTACTCGGCGAAGCTCTCCGAGCAAACCGAACGATACGATGAGATGGTTGAGGCAATGAA
GAAAGTAGCAGAGATGGATGTGGAGCTCACGGTAGAGGAGAGAAACCTCGTATCTGTGGG
TTACAAGAACGTCATTGGCGCAAGGAGAGCTTCGTGGAGGATACTATCCTCCATCGAGCA
GAAGGAAGAGTCCAAGGGGAACGAGGAGAATGTCAAGAGGATTCAGACTTACCGAAAGAG
GGTTGAAGACGAGCTTGCCAAAGTTTGTAATGACATCTTGTCTGTCATTGACAAGCACCT
CATTCCTTCCTCTACCGCTGTTGAGTCCACTGTCTTTTTCTACAAAATGAAAGGAGATTA
TTATCGCTATCTGGCAGAGTTCAGTTCTGGTACTGAACGCAAGGAAGCTGCAGATCAGTC
TCTTGAAGCCTACAAGGCTGCTGTTGCTGCTGCAGACACTGGTTTGGCACCTACGCATCC
AGTTAGACTTGGCTTGGCTTTGAACTTTTCTGTTTTCTACTACGAGATCTTAAACTCTCC
TGAAAGCGCATGCCAATTGGCTAAGCAAGCATTTGACGATGCAATCGCTGAACTTGACAG
CCTCAACGAGGAGTCATACAAGGACAGCACTCTTATCATGCAGCTACTTAGAGACAATCT
CACCCTGTGGACTTCTGACCTCCCGGAGGAAGGAGAAGAGAAATCCAAAGGTGATGAGCC
GAAAGAAGAGAACTGAATCCTCTGTGTGAAGAGAAACGACCTTTGATGCATCCGAAGACA
GCAAGTGTCGTTGCTCGGAAAAATGTGTATTTTTTTTTTAATTTTATCGTCTTTCTTTAT
CATGTTTTTCAGATATTTGACGTTCTACAACATACTACTACTGCATAACTTCGAATGCTT
GATGTCATACACTTAGTTTGCTTTGTTGTTGTTGAATTGAGACCATGCATTTTTGGTTTT
GCACTCTCTTTGACGAATTAAGAACCTTGAGTGTTCAAAATAAATATAATTTTCACT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1GO06TF U 1
AF RS1GP21TF U 1
AF RS1FS63TF U 11
AF RS1GO06JQ C 472
AF RS1GP21JQ C 569
AF RS1EB95JQ C 683
BS 1 78 RS1GO06TF
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BS 1061 1137 RS1GO06JQ

RD RS1GO06TF 806 0 0
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AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGAAAGAAGGCATGGAGACTGAGAGGGAAAAGCAGGT
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TCTTGAAGCCTACAAGGCTGCTGTTGCTGCTGCAGACACTGGTTTGGCACCTACGCATCC
AGTTAGACTTGGCTTGGCTTTGAACTTTTCTGTTTTCTACTACGAGATCTTAAACTCTCC
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CACCCTGTGGACTTCTGACCTCCCGG

QA 1 806 1 806
DS 

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AGAGAGAGAGAGAGAG******GAGAAAGAAGGCATGGAGACTGAGAGGGAAAAGCAGGT
TTACTCGGCGAAGCTCTCCGAGCAAACCGAACGATACGATGAGATGGTTGAGGCAATGAA
GAAAGTAGCAGAGATGGATGTGGAGCTCACGGTAGAGGAGAGAAACCTCGTATCTGTGGG
TTACAAGAACGTCATTGGCGCAAGGAGAGCTTCGTGGAGGATACTATCCTCCATCGAGCA
GAAGGAAGAGTCCAAGGGGAACGAGGGGAATGTCAAGAGGATTCAGACTTACCGAAAGAG
GGTTGAAGACGAGCTTGCCAAAGTTTGTAATGACATCTTGTCTGTCATTGACAAGCACCT
CATTCCTTCCTCTACCGCTGTTGAGTCCACTGTCTTTTTCGACAAAATGAAAGGAGATTA
TTATCGCTATCTGGCAGAGTTCAGCTCTGGTACTAAACGCAAGGAAGCTGCAGATCAGTC
TCTTGAAGCCTACAAGGCTGCTGTTGCTGCTGCAGACACTGGTTTGGCACCTACGCATCC
AGTTAGACTTGGCTTGGCTTTGAACTTTTCTGTTTTCTACTACGAGATCTTAAACTCTCC
TGAAAGCGCATGCCAATTGGCTAAGCAAGCATTTGACGATGCAATCGCTGAACTTGACAG
CCTCAACGAGGAGTCATACAAG*ACAGCACTCTTATCATGCAGCTACTTAGAGACA*TCT
CACCCTGTGGACTTCTGACCTCC

QA 1 803 1 803
DS 

RD RS1FS63TF 792 0 0
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AGAGAGAG****GAGAAAGAAGGCATGGAGACTGAGAGGGAAAAGCGGGTTTACTCGGCG
AAGCTCTCCGAGCAAACCGAACGATACGATGAGATGGTTGAGGCAATGAAGAAAGTAGCA
GAGATGGATGTGGAGCTCACGGTAGAGGAGAGAAACCTCGTATCTGTGGGTTACAAGAAC
GTCATTGGCGCAAGGAGAGCTTCGTGGAGGATACTATCCTCCATCGAGCAGAAGGAAGAG
TCCAAGGGGAACGAGGAGAATGTCAAGAGGATTCAGACTTACCGAAAGAGGGTTGAAGAC
GAGCTTGCCAAAGTTTGTAATGACATCTTGTCTGTCATTGACAAGCACCTCATTCCTTCC
TCTACCGCTGTTGAGTCCACTGTCTTTTTCTACAAAATGAAAGGAGATTATTATCGCTAT
CTGGCAGAGTTCAGTTCTGGTACTGAACGCAAGGAAGCTGCTGGTCAGTCTCTTGAAGCC
TACAAGGCTGCTGTTGCTGCTGCAGACACTGGTTTGGCACCTACGCATCCAGTTAGACTT
GGCTTGGCTTTGAACTTTTCTGTTTTCTACTACGAGATCTTAAACTCTCCTGAAAGCGCA
TGCCAATTGGCTAAGCAAGCATTTGACGATGCAATCGCTGAACTTGACAGCCTCAACGAG
GAGTCATACAAG*ACAGCACTCTTATCATGCATCTACTTAGAGACA*TCTCACCCTGTGG
ACTTCTGACCTC

QA 1 792 1 792
DS 

RD RS1GO06JQ 666 0 0
AGGAGATTATTATCGCTATCTGGCAGAGTTCAGTTCTGGTACTGAACGCAAGGAAGCTGC
AGATCAGTCTCTTGAAGCCTACAAGGCTGCTGTTGCTGCTGCAGACACTGGTTTGGCACC
TACGCATCCAGTTAGACTTGGCTTGGCTTTGAACTTTTCTGTTTTCTACTACGAGATCTT
AAACTCTCCTGAAAGCGCATGCCAATTGGCTAAGCAAGCATTTGACGATGCAATCGCTGA
ACTTGACAGCCTCAACGAGGAGTCATACAAGGACAGCACTCTTATCATGCAGCTACTTAG
AGACAATCTCACCCTGTGGACTTCTGACCTCCCGGAGGAAGGAGAAGAGAAATCCAAAGG
TGATGAGCCGAAAGAAGAGGACTGAATCCTCTGTGTGAAGAGAAACGACCTTTGATGCAT
CCGAAGACAGCAAGTGTCGTTGCTCGGAAAAATGTGTATTTTTTTTTTAATTTTATCGTC
TTTCTTTATCATGTTTTTCAGATATTTGACGTTTTACAACATACTACTACTGCATAACTT
CGAATGCTTGATGTCATACACTTAGTTTGCTTTGTTGTTGTTGAATTGGGACCATGCATT
TTTGGTTTTGCACTCTCTTTGACGAATTAAGAACCTTGAGTGTTCAAAATAAATATAATT
TTCACT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RS1GP21JQ 569 0 0
GCTGCAGACACTGGTTTGGCACCTACGCATCCAGTTAGACTTGGCTTGGCTTTGAACTTT
TCTGTTTTCTACTACGAGATCTTAAACTCTCCTGAAAGCGCATGCCAATTGGCTAAGCAA
GCATTTGACGATGCAATCGCTGAACTTGACAGCCTCAACGAGGAGTCATACAAGGACAGC
ACTCTTATCATGCAGCTACTTAGAGACAATCTCACCCTGTGGACTTCTGACCTCCCGGAG
GAAGGAGAAGAGGAATCCAAAGGTGATGAGCCGAAAGAAGAGAACTGAATCCTCTGTGTG
AAGAGAAACGACCTTTGATGCATCCGAAGACAGCAAGTGTCGTTGCTCGGAAAAATGTGT
ATTTTTTTTTTAATTTTATCGTCTTTCTTTGTCATGTTTTTCAGATATTTGACGTTCTAC
AACATACTACTACTGCATAACTTCGAATGCTTGATGTCATACACTTAGTTTGCTTTGTTG
TTGTTGAATTGAGACCATGCATTTTTGGTTTTGCACTCTCTTTGACGAATTAAGAACCTT
GAGTGTTCAAAATAAATATAATTTTCAC
C

QA 1 568 1 568
DS 

RD RS1EB95JQ 454 0 0
AAGCAAGCATTTGACGATGCAATCGCTGAACTTGACAGCCTCAACGAGGAGTCATACAAG
GACAGCACTCTTATCATGCAGCTACTTAGAGACAATCTCACCCTGTGGACTTCTGACCTC
CCGGAGGAAGGAGAAGAGAAATCCAAAGGTGATGAGCCGAAAGAAGAGAACTGAATCCTC
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QA 1 454 1 454
DS 



AS 1 5

CO CL951Contig1 1931 5 14 U
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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
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CTCAAGGGACGCTTGGACTACTTGTGGCTGCTGAGATCA

QA 1 759 1 759
DS 

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G
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AGGGACGCTTGGACTACTTGTGGCTGCTGAGATCAGGCTTATACCGGTTAAGGAGTACAT
GAGGCTCACTTACATACCGGTCAAGGGAGATCTTCAGACGTTAGCGCAAGGGTACATGGA
CTCTTTCGCTCCCAGAGATGGAGACGAGTCCAAGATCCCTGACTTCGTGGAAGGCATGGT
TTACAATCCGACAGAAGGTGTGATGATGGTTGGTACTTACGCGTCTAAGCAAGAAGCCAA
GAAGAAAGGGAATAAGATCAACAACGTGGGGTGGTGGTTCAAGCCGTGGTTCTACCAGCA
CGCGCAGACCGCGCTGACGAAAGGACAGTTTGTTGAGTACATCCCGACTCGTGAGTACTA
TCACAGACACACGAGGTGCTTGTACTGGGAAGGGAAGCTGATTCTTCCTTTTGGCGATCA
GTTTTGGTTTAGGTTCCTCTTTGGTTGGTTGATGCCTCCGAAGGTGTCTCTTCTCAAGGC
TACTCAAGGTGAAGCTATTAGAAACTATTACCATGATATGCATGTGATTCAGGACATGCT
TGTTCCCCTCTACAAG*TTGGTGATGCTCTCGAATGGGTTCACCAAGAAATGGAG*TTTA
TCCCATTTGGCTTTGCCCACACAAACTTTACA*GACACCAATCAA
CACAGAT

QA 2 706 2 706
DS 

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TCTTTCGCTCCCAGAGATGGAGACGAGTCCAAGATCCCTGACTTCGTGGAAGGCATGGTT
TACAATCCGACAGAAGGTGTGATGATGGTTGGTACTTACGCGTCTAAGCAAGAAGCCAAG
AAGAAAGGGAATAAGATCAACAACGTGGGGTGGTGGTTCAAGCCGTGGTTCTACCAGCAC
GCGCAGACCGCGCTGACGAAAGGACAGTTTGTTGAGTACATCCCGACTCGTGAGTACTAT
CACAGACACACGAGGTGCTTGTACTGGGAAGGGAAGCTGATTCTTCCTTTTGGCGATCAG
TTTTGGTTTAGGTTCCTCTTTGGTTGGTTGATGCCTCCGAAGGTGTCTCTTCTCAAGGCT
ACTCAAGGTGAAGCTATTAGAAACTATTACCATGATATGCATGTGATTCAGGACATGCTT
GTTCCCCTCTACAAGGTTGGTGATGCTCTCGAATGGGTTCACCAAGAAATGGAGGTTTAT
CCCATTTGGCTTTGCCCACACAAACTTTACAAGACACCAATCAAACAACAGATTTATCCA
GAACCAGGGTTTGAGTATGAGAAGAGACAAGGAGACACAGATGATGCACAGATGTACACT
GACGTTGGAGTATACTACGCACCAGGTCCTGTCCTAAGAGGTGAGGAGTTTGGTGGAGCA
GAAGCTGTGCGTAAGCTGGAGAAGTGGCTGATTGAGAACCACGGGTTCCAGCCTCAGTAT
GCTGTGT
CTGCGCTGG

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DS 

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GGTTTATCCCATTTGGCTTTGCCCACACAAACTTTACAAGACACCAATCAAACAACAGAT
TTATCCAGAACCAGGGTTTGAGTATGAGAAGAGACAAGGAGACACAGATGATGCACAGAT
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TGGAGCAGAAGCTGTGCGTAGGCTGGAGAAGTGGCTGATTGAGAACCACGGGTTCCAGCC
TCAGTATGCTGTGTTTGAGCTGGACGAGAAGAGTTTCTGGAGGATGTTTGATGCTGACTT
GTATGAGCATTGCCGTAAGAAGTACAGAGCTGTTGGAACGTTCATGAGTGTTTACTATAA
GTCTAAGAAAGGGAGGAAGACTGAGAAAGAAGTTAAAGAAGCAGAGCAAGCTCATCTTGA
AACAGCTTATGCAGAAGCAGATTAAGTAACGAAAATGTGGGTTTGAGATTATGATTGCTA
TGGGTGGTAGTATGTTGTTTCTTTTTCAATTTGTCTGTTATGTGTGTTTCCTGTTTTCAG
TGTAGTGTCTTGATGATGACTATCCTTGTTGGTTGTTTGGACTTATGGTTTGAATAAATG
TTAGATTTTGAG

QA 1 792 1 792
DS 

RD RS1AU11JQ 711 0 0
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GTTGGTGATGCTCTCGAATGGGTTCACCAAGAAATGGAGGTTTATCCCATTTGGCTTTGC
CCACACAAACTTTACAAGACACCAATCAAACAACAGATTTATCCAGAACCAGGGTTTGAG
TATGAGAAGAGACAAGGAGACACAGATGATGCACAGATGTACACTGACGTTGGAGTATAC
TACGCACCAGGTCCTGTCCTAAGAGGTGAGGAGTTTGGTGGAGCAGAAGCTGTGCGTAAG
CTGGAGAAGTGGCTGATTGAGAACCACGGGTTCCAGCCTCAGTATGCTGTGTCTGCGCTG
GACGAGAAGAGTTTCTGGAGGATGTTTGATGCTGACTTGTATGAGCATTGCCGTAAGAAG
TACAGAGCTGTTGGAACGTTCATGAGTGTTTACTATAAGTCTAAGAAAGGGAGGAAGACT
GAGAAAGAAGTTAAAGAAGCAGAGCAAGCTCATCTTGAAACAGCTTATGCAGAAGCAGAT
TAAGTAACGAAAATGTGGGTTTGAGATTATGATTGCTATGGGTGGTAGTATGTTGCATCT
TTTTCAATTTGTCTGTTATGTGTGTTTCCTGTTTTCAGTGTAGTGTCTTGATGATGACTA
TCCTTGTTGGTTGTTTGGACTTATGGTTTGAATAAATGTTAGATTTTGAGC

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 7

CO CL952Contig1 1209 7 25 U
GGACTCTCCAAAATATCAAATCCTCTTCCTACATATTCTCCCTTGAGTATCATGAGACAG
TCTTCGTAGAATAACTCATTTGAAGATAGCTAGTTGATGGAAAACATGGGGGATTCGACC
ATAGGGCCGGGTCATCCGCATCTCCCTCCCGGGTTTCGGTTTCACCCGACCGACGAAGAA
CTTGTAGTTCATTACCTCAAGAAGAAAGCTGCTTCTATTCCACTCCCGGTCTCAATCATC
GCCGAGATTGATCTTTACAAGTTTGATCCTTGGGAGCTTCCAAGCAAGGCAAGTTTTGGA
GAACAAGAGTGGTACTTCTTTAGTCCTAGAGATCGGAAGTATCCCAATGGCGTTAGGCCG
AATCGGGCAGCAACTTCTGGTTACTGGAAAGCCACTGGAACCGATAAACCAATATTTACG
TGCAATAGTCACAAGGTTGGGGTCAAGAAAGCGCTTGTATTCTATGGTGGAAAACCTCCT
AAAGGGATTAAAACTGATTGGATCATGCATGAATATCGCCTCACTGATGGTAATCTTAAC
ACCGCTGCTAAGCCACCTGACTCAACCACGTCAAGGAAAAACTCACTACGGCTAGACGAT
TGGGTTCTTTGTAGGATCTATAAGAAGAATAGTTCACAGAGACCAACAATGGAGAGAGTA
TTACTAAGAGAGGATCTCATGGAAGGA*TGCTCTCAAA*TCATCTGCTAATTCATCTTCC
ACATCGGTCTTAGACAACAACAACAACAACAATAATAACAATGAAGAACACTTTTTCGAT
GGTATGGCCGTTTCATCGGACAAACGTTCCTTGT*TGGTCAGTATCGTATAGGTCATGAG
GCCACTGGATCATCTTCTTTCGGGTCATTCTTATCGAGCAAGAGGTTCCATCATACGAGT
GATCTCAATAATGATAACTACAATGTCTCATTTGTCTCGATGCTTACTGAAATTCCTCAG
AGTTCGGGGTTTCATGGAAATGGAGTCATCGATACGACGTCGACTCTAGCTGATCATGGG
GTTTTAAGACAGGCGTTTCAGCTTCCTAACATGAACTGGCACCCATAATCTACATAGCTA
TGTATGTATGTATTTATGCACACACATTATAGTTTATACAGTATATATAGATAAATTCAT
ATATACACACGTGATCTCACATATGTATACGTATCTGTTTACGTCAAGAAAGGTCATACG
TCTCTTTCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 40 40 40 40 40 25 40 40 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 

AF RS1ES60TF U 1
AF RS1ET62TF U 16
AF RS1CM88TF U 1
AF RS1ED08TF U 1
AF RS1ED08JQ C 735
AF RS1ES60JQ C 445
AF RS1ET62JQ C 486
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RD RS1ES60TF 567 0 0
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ACCGCTGCTAAGCCACCTGACTCAACC

QA 1 567 1 567
DS 

RD RS1ET62TF 746 0 0
GG
AAATCCTCTTCCTACATATTCTCCCTTGAGTATCATGAGACAGTCTTCGTAGAATAACTC
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GCATCTCCCTCCCGGGTTTCGGTTTCACCCGACCGACGAAGAACTTGTAGTTCATTACCT
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CAAGTTTGATCCTTGGGAGCTTCCAAGCAAGGCAAGTTTTGGAGAACAAGAGTGGTACTT
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TGGGGTCAAGAAAGCGCTTGTATTCTATGGTGGAAAACCTCCTAAAGGGATTAAAACTGA
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TGACTCAACCACGTCAAGGAAACACTCACTACGGCTAGACGATTGGGTTCTTTGTAGGAT
CTATAAGAAGAATAGTTCACAGAGACCAACAATGGAGAGAGTATTACTAAGAGAGTATCT
CATGGAAGGA*TGCTCTCAAA*TCATCTGCTAATTCATCTTCCACATCGGTCTTAGACAA
CAACAACA
CACAATAATACAATGA

QA 3 730 3 730
DS 

RD RS1CM88TF 784 0 0
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CTTGTAGTTCATTACCTCAAGAAGAAAGCTGCTTCTATTCCACTCCCGGTCTCAATCATC
GCCGAGATTGATCTTTACAAGTTTGATCCTTGGGAGCTTCCAAGCAAGGCAAGTTTTGGA
GAACAAGAGTGGTACTTCTTTAGTCCTAGAGATCGGAAGTATGCCAATGGCGTTAGGCCG
AATCGGGCAACAACTTCTGGTTACTGGAAAGCCACTGCA*CCGATAAACCAATATTTACG
TGCAATAGTCACAAGGTTGGGGTCAAGAAAGCGCTTGTATTCTATGGTGGAAAACCTCCT
AAAGGGATTAAAACTGATTGGATCATGCATGAATATCGCCTCACTGATGGTAATCTTAAC
ACCGCTGCTAAGCCACCTGACTCAACCACGTCAAGGAAAAACTCACTACGGCTAGACGAT
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ACATCGGTCTTAGACA*CAACA*CAACA*CAATAATA**CATGAAGA*CACTTTTTCGAT
GGTA

QA 1 784 1 784
DS 

RD RS1ED08TF 828 0 0
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TCTTCGTAGAATAACTCATTTGAAGATAGCTAGTTGATGGAAAACATGGGGGATTCGACC
ATAGGGCCGGGTCATCCGCATCTCCCTCCCGGGTTTCGGTTTCACCCGACCGACGAAGAA
CTTGTAGTTCATTACCTCAAGAAGAAAGCTGCTTCTATTCCACTCCCGGTCTCAATCATC
GCCGAGATTGATCTTTACAAGTTTGATCCTTGGGAGCTTCCAAGCAAGGCAAGTTTTGGA
GAACAAGAGTGGTACTTCTTTAGTCCTAGAGATCGGAAGTATCCCAATGGCGTTAGGCCG
AATCGGGCAGCAACTTCTGGTTACTGGAAAGCCACTGGAACCGATAAACCAATATTTACG
TGCAATAGTCACAAGGTTGGGGTCAAGAAAGCGCTTGTATTCTATGGTGGAAAACCTCCT
AAAGGGATTAAAACTGATTGGATCATGCATGAATATCGCCTCACTGATGGTAATCTTAAC
ACCGCTGCTAAGCCACCTGACTCAACCACGTCAAGGAAAAACTCACTACGGCTAGACGAT
TGGGTTCTTTGTAGGATCTATAAGAAGAATAGTTCACAGAGACCAACAATGGAGAGAGTA
TTACTAAGAGAGGATCTCATGGAAGGA*TGCTCTCAAA*TCATCTGCTAATTCATCTTCC
ACATCGGTCTTAGACA*CAACAACAACA*CAATAATAACAATGAAGA*CACTTTTTCGAT
GGTATGGCCGTTTCATCGGACAAACGTTCCTTGT*TGGTCAGTATCGT

QA 1 828 1 828
DS 

RD RS1ED08JQ 362 0 0
CA
ACAACAACAACAACAATAATAACAATGAAGAACACTTTTTCGATGGTATGGCCGTTTCAT
CGGACAAACGTTCCTTGT*TGGTCAGTATCGTATAGGTCATGAGGCCACTGGATCATTTT
CTTTCGGGTCATTTTTATCGAGCAAGAGGTTCCATCATACGAGTGATCTCAATAATGATA
ACTACAATGTTTCATTTGTCTCGATGCTTACTGAAATTCCTCAGAGTTCGGGGTTTCATG
GAAATGGAGTCATCGATACGACGTCGACTCTAGCTGATCATGGGGTTTTAAGACAGGCGT
TTCAGCTTCCTAACATGAACTGGCACCCATAATCTACATAGCTATGTATGTATGTA
CTTA

QA 3 358 3 358
DS 

RD RS1ES60JQ 765 0 0
AAGAAAGCGCTTGTATTCTATGGTGGAAAACCTCCTAAAGGGATTAAAACTGATTGGATC
ATGCATGAATATCGCCTCACTGATGGTAATCTTAACACCGCTGCTAAGCCACCTGACTCA
ACCATGTCAAGGAAAAACTCACTACGGCTAGACGATTGGGTTCTTTGTAGGATCTATAAG
AAGAATAGTTCACAGAGACCAACAATGGAGAGAGTATTACTAAGAGAGGATCTCATGGAA
GGAATGCTCTCAAAATCATCTGCTAATTCATCTTCCACCTCGGTCTTAGACAACAACAAC
AACAACAATAATAACAATGAAGAACACTTTTTCGATGGTATGGCCGTTTCATCGGACAAA
CGTTCCTTGTGTGGTCAGTATCGTATAGGTCATGAGGCCACTGGATCATCTTCTTTCGGG
TCATTCTTATCGAGCAAGAGGTTCCATCATACGAGTGATCTCAATAATGATAACTACAAT
GTCTCATTTGTCTCGATGCTTACTGAAATTCCTCAGAGTTCGGGGTTTCATGGAAATGGA
GTCATCGATACGACGTCGACTCTAGCTGATCATGGGGTTTTAAGACAGGCGTTTCAGTTT
CCTAACATGAACTGGCACCCATAATCTACATAGCTATGTATGTATGTATTTATGCACACA
CATTATAGTTTATACAGTATATATAGATAAATTCATATATACACACGTGATCTCACATAT
GTATACGTATCTGTTTACGTCAAGAAAGGTCATACGTCTCTTTCT

QA 1 765 1 765
DS 

RD RS1ET62JQ 724 0 0
GATTAAAACTGATTGGATCATGCATGAATATCGCCTCACTGATGGTAATCTTAACACCGC
TGCTAAGCCACCTGACTCAACCACGTCAAGGAAACACTCACTACGGCTAGACGATTGGGT
TCTTTGTAGGATCTATAAGAAGAATAGTTCACAGAGACCAACAATGGAGAGAGTATTACT
AAGAGAGTATCTCATGGAAGGAATGCTCTCAAAATCATCTGCTAATTCATCTTCCACATC
GGTCTTAGACAACAACAACAACAACAATAATAACAATGAAGAACACTTTTTCGATGGTAT
GGCCGTTTCATCGGACAAACGTTCCTTGTGTGGTCAGTATCGTATAGGTCATGAGGCCAC
TGGATCATCTTCTTTCGGGTCATTCTTATCGAGCAAGAGGTTCCATCATACGAGTGATCT
CAATAATGATAACTACAATGTCTCATTTGTCTCGATGCTTACTGAAATTCCTCATAGTTC
GGGGTTTCATGGAAATGGAGTCATCGATACGACGTCGACTCTAGCTGATCATGGGGTTTT
AAGACAGGCGTTTCAGCTTCCTAACATGAACTGGCACCCATAATCTACATAGCTATGTAT
GTATGTATTTATGCACACACATTATAGTTTATACAGTATATATAGATAAATTCATATATA
CACACGTGATCTCACATATGTATACGTATCTGTTTACGTCAAGAAAGGTCATACGTCTCT
TTCT

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 7

CO CL953Contig1 940 7 18 U
ATTACGGCCGGGGGACTCACTCAGACTTCGATCCTCCTCTCGTTGACGCCGTCCACAAAC
ATCCGACGTATCCTCGCCGCAAATATCAGCAAAGAGTTGACAAAGAATGGAGTACGTAAA
CCCTGAAGGTCTTCGGTTAGATGGTCGACGATTCAATTAGATGAGGCAAATCGTAGCTGA
AGTTGGAGTGGTTTCCAAGGCTGATGGTTCTGCTGTTTTCGAGATGGGTAACACCAAAGT
AATAGCAGCTGTTTATGGCCCTAGAGAGATTCAAAACAAGAGCCAACAAAAGAATGGTCA
TGCATTGGTGCTTTGTGAGTATAGTATGGCTCATTTTAGTACTGGTGATCGTAGAAGACA
GAAAAACGACAGGCGATCAACAGAGCTATCTCTTGTCATCCGTCAGACAATGGAAGCTTG
CATATTAACCGAACTGTTGCCTCATTCTCAGATTGACATTTTCCTTCAGGTCCTACAAGC
T***GGAGGAACAAGATCAGCTTGTATCAATGCTGCGACGCTAGCTCTCGCAGACGCTGG
GATTCCGATGCGTGATCTCGCTGTATCCTGCAGTGCTGGATACTTGAACAGTACTCCACT
TCTTGATCTCAACTATGTCGAAGATAGCGCTGG*AGGAGCTGATGTAACTGTCGGCATTC
TACCTAAACTAGACAAAGTGACACTCCTTCAGATGGATGCAAAGTTACCGATGGAAACAT
TTGAAACGGTGTTTGCGTTGGCTTCCGAAGGCTGCAAGGCGATTGCAGAGAGAGTACGCG
AGGTACTTCAAGAAAACACCAAACAGCTAGAGTATCGTCGTGCTTCATAAACTTCAGAGC
TAATGTACCAAAAGATTTTTGTCAATGAGTTTGTTAAATGTTGCTTCTAACTTTCCCAAA
CTCAAAAGTTAGTAATGCAAAAGACATGCTGTTTTTGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 
45 45 45 45 30 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 15 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 
30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1BQ04TF U 11
AF RS1A178TV U 1
AF RS1A178TF U 51
AF RS1A853TF U 35
AF RS1A178TR C 37
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AF RS1A853JQ C 391
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BS 804 842 RS1A853TF
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BS 849 849 RS1A178TR
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BS 939 940 RS1A178JQ

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CCCC
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TGTTGCCTCATTCTCAGATTGACATTTTCCTTCAGGTCCTACAAGCTGATGGAGGAACAA
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ATGTCGAAGATAGCGCTGG*AGGAGCTGATGTAACTGTCGGCATTCTACCTAAACTAGAC
AAAGTGACACTCCTTCAGAT

QA 5 684 5 684
DS 

RD RS1A178TV 741 0 0
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AATAGCAGCTGTTTATGGCCCTAGAGAGATTCAAAACAAGAGCCAACAAAAGAATGGTCA
TGCATTGGTGCTTTGTGAGTATAGTATGGCTCATTTTAGTACTGGTGATCGTAGAAGACA
GAAAAACGACAGGCGATCAACAGAGCTATCTCTTGTCATCCGTCAGACAATGGAAGCTTG
CATATTAACCGAACTGTTGCCTCATTCTCAGATTGACATTTTCCTTCAGGTCCTACAAGC
T***GGAGGAACAAGATCAGCTTGTATCAATGCTGCGACGCTAGCTCTCGCAGACGCTGG
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TCTTGATCTCAACTATGTCGAAGATAGCGCTGG*AGGAGCTGATGTAACTGTCGGCATTC
TACCTAAACTAGACAAAGTGACACTCCTTCAGATGGATGCAAAGTTACCGATGGAAACAT
TTGAAACGGTGTTTGCGTTGG

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1A178TF 749 0 0
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ACACCAAAGTAATAGCAGCTGTTTATGGCCCTAGAGAGATTCAAAACAAGAGCCAACAAA
AGAATGGTCATGCATTGGTGCTTTGTGAGTATAGTATGGCTCATTTTAGTACTGGTGATC
GTAGAAGACAGAAAAACGACAGGCGATCAACAGAGCTATCTCTTGTCATCCGTCAGACAA
TGGAAGCTTGCATATTAACCGAACTGTTGCCTCATTCTCAGATTGACATTTTCCTTCAGG
TCCTACAAGCT***GGAGGAACAAGATCAGCTTGTATCAATGCTGCGACGCTAGCTCTCG
CAGACGCTGGGATTCCGATGCGTGATCTCGCTGTATCCTGCAGTGCTGGATACTTGAACA
GTACTCCACTTCTTGATCTCAACTATGTCGAAGATAGCGCTGG*AGGAGCTGATGTAACT
GTCGGCATTCTACCTAAACTAGACAAAGTGACACTCCTTCAGATGGATGCAA*GTTACCG
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AGAGTACGCGAGGTACTTCAAGAAA
CACC

QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1A853TF 883 0 0
GG
CTCTCGTTGACGCCGTCCACAAACATCCGACGTATCCTCGCCGCAAATATCAGCAAAGAG
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TTTCGAGATGGGTAACACCAAAGTAATAGCAGCTGTTTATGGCCCTAGAGAGATTCAAAA
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GACGCTAGCTCTCGCAGACGCTGGGATTCCGATGCGTGATCTCGCTGTATCCTGCAGTGC
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ATGCAAAGTTACCGATGGAAACATTTGAAACGGTGTTTGCGTTGGCTTCCGAAG*CTGCA
AAGCGATTGCAGAGAGAGTACGCGAGGTACTTCAAGAAAACACCAA*CAGCTAGAGTATC
GTCGTGCTTCATAAACTTCAGAGCTA*TGTAC*AAAAGATTTT*GTCAATGAGTTTGTTA
AATGTTGCTTCTA*CTTTCCCAAACTCAAA
GTAGTATGCAA

QA 3 872 3 872
DS 

RD RS1A178TR 904 0 0
CTCTCGTTGACGCGGTCCACAAACATCCGACGTATCCTCGCCGCAAATATCAGCAAAGAG
TTGACAAAGAATGGAGTACGTAAACCCTGAAGGTCTTCGGTTAGATGGTCGACGATTCAA
TTAGATGAGGCAAATCGTAGCTGAAGTTGGAGTGGTTTCCAAGGCTGATGGTTCTGCTGT
TTTCGAGATGGGTAACACCAAAGTAATAGCAGCTGTTTATGGCCCTAGAGAGATTCAAAA
CAAGAGCCAACAAAAGAATGGTCATGCATTGGTGCTTTGTGAGTATAGTATGGCTCATTT
TAGTACTGGTGATCGTAGAAGACAGAAAAACGACAGGCGATCAACAGAGCTATCTCTTGT
CATCCGTCAGACAATGGAAGCTTGCATATTAACCGAACTGTTGCCTCATTCTCAGATTGA
CATTTTCCTTCAGGTCCTACAAGCT***GGAGGAACAAGATCAGCTTGTATCAATGCTGC
GACGCTAGCTCTCGCAGACGCTGGGATTCCGATGCGTGATCTCGCTGTATCCTGCAGTGC
TGGATACTTGAACAGTACTCCACTTCTTGATCTCAACTATGTCGAAGATAGCGCTGG*AG
GAGCTGATGTAACTGTCGGCATTCTACCTAAACTAGACAAAGTGACACTCCTTCAGATGG
ATGCAAAGTTACCGATGGAAACATTTGAAACGGTGTTTGCGTTGGCTTCCGAAGGCTGCA
AGGCGATTGCAGAGAGAGTACGCGAGGTACTTCAAGAAAACACCAAACAGCTAGAGTATC
GTCGTGCTTCATAAACTTCAGAGCTAATGTACCAAAAGATTTTTGTCAATGAGTTTGTTA
AATGTTGCTTCTAACTTTCCCAAACTCAAAAGTTAGTAATGCAAAAGACATGCTGTTTTT
GG
CT

QA 1 902 1 902
DS 

RD RS1A178JQ 900 0 0
CTCGTGACG
CGTCCACAAACATCCGACGTATCCTCGC*GCAAATATCAGCAAAGAGTTGACAAAGAATG
GAGTACGTAAACCCTGAAGGTCTTCGGTTAGATGGTCGACGATTCAATTAGATGAGGCAA
ATCGTAGCTGAAGTTGGAGTGGTTTCCAAGGCTGATGGTTCTGCTGTTTTCGAGATGGGT
AACACCAAAGTAATAGCAGCTGTTTATGGCCCTAGAGAGATTCAAAACAAGAGCCAACAA
AAGAATGGTCATGCATTGGTGCTTTGTGAGTATAGTATGGCTCATTTTAGTACTGGTGAT
CGTAGAAGACAGAAAAACGACAGGCGATCAACAGAGCTATCTCTTGTCATCCGTCAGACA
ATGGAAGCTTGCATATTAACCGAACTGTTGCCTCATTCTCAGATTGACATTTTCCTTCAG
GTCCTACAAGCT***GGAGGAACAAGATCAGCTTGTATCAATGCTGCGACGCTAGCTCTC
GCAGACGCTGGGATTCCGATGCGTGATCTCGCTGTATCCTGCAGTGCTGGATACTTGAAC
AGTACTCCACTTCTTGATCTCAACTATGTCGAAGATAGCGCTGG*AGGAGCTGATGTAAC
TGTCGGCATTCTACCTAAACTAGACAAAGTGACACTCCTTCAGATGGATGCAAAGTTACC
GATGGAAACATTTGAAACGGTGTTTGCGTTGGCTTCCGAAGGCTGCAAGGCGATTGCAGA
GAGAGTACGCGAGGTACTTCAAGAAAACACCAAACAGCTAGAGTATCGTCGTGCTTCATA
AACTTCAGAGCTAATGTACCAAAAGATTTTTGTCAATGAGTTTGTTAAATGTTGCTTCTA
ACTTTCCCAAACTCAAAAGTTAGTAATGCAAAAGACATGCTGTTTTTGGCT

QA 10 900 10 900
DS 

RD RS1A853JQ 550 0 0
TCTTGTCATCCGTCAGACAATGGAAGCTTGCATATTAACCGAACTGTTGCCTCATTTTCA
GATTGACATTTTCCTTCAGGTCCTACAAGCTGATGGAGGAACAAGATCAGCTTGTATCAA
TGCTGGGACGCTAGCTTTCGCAGACGCTGGGATTCCGATGGGTGATCTCGCTGTATCCTG
CAGTGCTGGATACTTGAACAGTACTCCACTTTTTGATTTCAACTATGTCGAAGATAGCAC
TGG*AGGAGCTGATGTAACTGTCGGCATTTTACCTAAACTAGACAAAGTGACACTCCTTC
AGATGGATGCAAAGTTACCGATGGAAACATTTGAAACGGTGTTTGCGTTGGCTTCCGAAG
GCTGCAAGGCGATTGCAGAGAGAGTACGCGAGGTACTTCAAGAAAACCCCAAACAGCTAG
AGTATCGTCGTGCTTCATAAACTTCAGAGCTAATGTACCAAAAGATTTTTGTCAATGAGT
TTGTTAAATGTTGCTTCTAACTTTCCCAAACTCAAAAGTTAGTAATGCAAAAGACCTGCT
GTTTTTGG
TT

QA 1 548 1 548
DS 



AS 1 6

CO CL954Contig1 1242 6 19 U
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GTTGGAAGTTGGTTCTTCTCTGCGTTATTTATCTACCACCTAAACTATGTTTTTCGATGG
ATACCATTACCCTGGAACCACCTTTGAGCAGAGTTACCGGTGCTATCCTGCATCTTTTAT
CGACAAGCCTCAAATTGAAAGTGGTGACAAGATTATAATGCCACCATCAGCTCTTGACCG
TCTCGCCTCTTTGCATATTGACTATCCTATGCTGTTTGAGCTTCGTAATGCTGGAATCGA
ACGTGTTTCACACTGTGGAGTCCTTGAGTTCATTGCTGAAGAAGGCATGATTTACATGCC
ATATTGGATGATGCAGAATCTGCTGCTGCAAGAAGGAGACATTGTGAGAGTTAGAAATGT
CACTCTTCCAAAAGGAACCTATGTTAAACTACAGCCGCACACTACGGACTTCCTGGATAT
ATCTAATCCGAAAGCCATCTTGGAGACTGCTTTGAGGAACTACTCATGCCTAACCACTGG
GGATAGCATTATGGTTCCATACAACAATAAGAAGTACTTTATAGATATAGTTGAAACAAA
GCCTGCTAATGGAATCAGCATCATAGAAACAGACTGTGAGGTTGATTTTGCACCTCCCCT
TGATTACAAGGAGCCTGAACGTCCCAAAACAGCACCTGCTGCAGCCAAGGGTCCGGCAAA
AGCTGAGGAAGTTGTGCCTGAACCTGAACCAAAGTTCAACCCTTTCACGGGATCTGGAAG
ACGGTTAGATGGGAGACCTCTTTCCAATGCGCCGCCACCTGCATCTTCTTCTTCTTCTTC
CTCTAGCTCAAAAGATAAACAGCCTGCTGTTGCTAATGGCAATGGACAGGCATCTGTAGC
AAGTAGTAGCTCAGAGAAAGCTGCTCGACAGGCTCAAGGAAAGCTTGTGTTTGGGGGCAA
CGCAAACCGTGCCCCAAAAGAAGCTCCAAAGGTTGGAGCTGGAAAAGAGACAAAACAAGA
GGAAGAGGAGAAGAAAGAAGAGCCGAAGTTCCAAGCTTTCACTGGGAAGAAGTATTCGTT
GAGGGGTTGATCAAGCAACTGCTGTCTCTGCTCAGTTTATTTTATGATCTGTTGTGTACT
ATATAAGTATTCGTTGTGCTTCGAATCAAACAAGGAAAAACAAATAATTTTAATAAAGCT
ATTGCTTATTTATAAGTCGCAGGGTCTGTGATTTAGAAACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B558TF U 8
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AF RS1DP32TF U 2
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G
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T
TA

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TTT
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AAAACAAGAGGAAGAGGAGAAGAAAGAAGAGCCGAAGTTCCAAGCTTTCACTGGGAAGAA
GTATTCGTTGAGGGGTTGATCAAGCAACTG***TCTCTGCTCGGTTTATTTTATGATCTG
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AATAAAGC

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TATTCGTTGTGCTTCGAATCAAACAAGGAAAAACAAATAATTTTAATAAAGCTATTGCTT
ATTTATAAGTCGCAGGGTCTGTGATTTAGAAACTC

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DS 



AS 1 5

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BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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AF RS1C727JQ C 1
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AF RS1C727TF U 1
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TTTACAATGCTTATCGTCTTTGTTTAATAACTTCGTTAGCTATTTGGTATTCCAATCCTC
CTTTCTTGTGCTGGGAATTAAGAATGCTACTTTTTTTTGTCAATCATTTAAGACTCTATG
TTCTCTTCAAATCTCTTATGATTCAATC

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CGATCCTCCTGCGTATCCTTATATGCACATCCGTAACAAGGAGTTTCCTTGGGGTCCAGA
CGGTCTGTTTGAGGTGAAGCACAACGATGGGCACTGAGATGTTGCGTCTTTACAATGCTT
ATCGTCTTTGTTTAATAACTTCGTTAGCTATTTGGTATTCCAATCCTCCTTTCTTGTGCT
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CTCTTATGAT

QA 19 508 19 508
DS 

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GGACACTGAGAAACGAGAGAGAGAGAGAGA**TCAGGAGAATGGCGACGGCGATAATACG
TTCAGCTCTATCCCGAGCAGCTATCCGCGCAGCTCCGAGGACATCCCTTTCTCCAAAGCG
GAGATTTTCATCTTCTGCCGGCCTTGACGATGCTTTCGAAGCAGGAAAGTGGGAGAGCAT
AACATACGGGGGCATTTTTAGTTGCACTCTTCTTGCCGCCTATGTTCTATCCAAGGGTCA
TCTTCACGGCGACGATCCTCCTGCGTATCCTTATATGCACATCCGTAACAAGGAGTTTCC
TTGGGGTCCAGACGGTCTGTTTGAGGTGAAGCACAACGATGGGCACTGAGATGTTGCGTC
TTTACAATGCTTATCGTCTTTGTTTAATAACTTCGTTAGCTATTTGGTATTCCAATCCTC
CTTTCTTGTGCTGGGAATTAAGAATGCTACTTTTTTTTGTCAATCATTTAAGACTCTATG
TTCTCTTCAAATCTCTTATGATTCAATC
TCG

QA 1 508 1 508
DS 

RD RS1DY65JQ 513 0 0
GGACACTGAGAAACGAGAGAGAGAGAGAGAGATCAGGAGAATGGCGACGGCGATAATACG
TTCAGCTCTATCCCGAGCAGCTATCCGCGCAGCTCCGAGGACATCCCTTTCTCCAAAGCG
GAGATTTTCATCTTCTGCCGTCCTTGACGATGCTTTCGAAGCAGGAAAGTGGGAGAGCAT
AACATACGGGGGCATTTTTAGTTGCACTCTTCTTGCCGCCTATGTTCTATCCAAGGGTCA
TCTTCACGGCGACGATCCTCCTGCGTATCCTTATATGCACATCCGTAACAAGGAGTTTCC
TTGGGGTCCAGACGGTCTGTTTGAGGTGAAGCACAACGATGGGCACTGAGATGTTGCGTC
TTTACAATGCTTATCGTCTTTGTTTAATAACTTCGTTAGCTATTTGGTATTCCAATCCTC
CTTTCTTGTGCTGGGAATTAAGAATGCTACTTTTTTT*GTCAATCATTTAAGACTCTATG
TTCTCTTCAAATCTCTTATGATTCAATCTCGAT

QA 1 513 1 513
DS 

RD RS1DY65TF 513 0 0
GGACACTGAGAAACGAGAGAGAGAGAGAGAGATCAGGAGAATGGCGACGGCGATAATACG
TTCAGCTCTATCCCGAGCAGCTATCCGCGCAGCTCCGAGGACATCCCTTTCTCCAAAGCG
GAGATTTTCATCTTCTGCCGTCCTTGACGATGCTTTCGAAGCAGGAAAGTGGGAGAGCAT
AACATACGGGGGCATTTTTAGTTGCACTCTTCTTGCCGCCTATGTTCTATCCAAGGGTCA
TCTTCACGGCGACGATCCTCCTGCGTATCCTTATATGCACATCCGTAACAAGGAGTTTCC
TTGGGGTCCAGACGGTCTGTTTGAGGTGAAGCACAACGATGGGCACTGAGATGTTGCGTC
TTTACAATGCTTATCGTCTTTGTTTAATAACTTCGTTAGCTATTTGGTATTCCAATCCTC
CTTTCTTGTGCTGGGAATTAAGAATGCTACTTTTTTT*GTCAATCATTTAAGACTCTATG
TTCTCTTCAAATCTCTTATGATTCAATC
TCGAT

QA 1 508 1 508
DS 



AS 1 7

CO CL956Contig1 593 7 11 U
GGACTTCTTTCATTGCCGTCTTCAGAAACCCCCTTAGCTTTCCGCTGCCTCGTGCGAGAT
CCTCCCATCAACTTCCGCAAAAATGAAGGTTGTCGCCGCGTTCTTGCTAGCCGTTCTGAG
CGGAAAAGCTTGCCCAACCAGTGCTGATATCAAGGGTATCCTCAATTCAGTTGGTGCCGA
AACAGAGGAGTCTCAGATTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAATGGGAAAGACGTGGCTGA
GCTGATTGCTGTCGGAAGGGAGAAGTTGGCTTCAGTACCAAGCGGTGGTGG***CGTTGC
CATGGCTTCTGCTCCATCTGCTGGTGGTGGAGGAGGTGCTGCCCCGGCTGCTGAGTCCAA
GAAAGAAGAGAAGAAAGAGGAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGCCTGTT
CGAGTAAGGCGGTATGCTTGGCCACTGGTTTTTGCTGTCATTTTGTAACCTCTTGGAACC
TATATGTTGTTGTTTTCTAGTTTGTTCTCGGTCAGTATCTTTGACATTCCTGAAATTCTC
AAGAGATTTTACACAAACATGATCTTATATTTGCATTTCTATTTTTTGTTTTG


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 30 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 10 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 15 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 30 30 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 45 
45 45 45 45 45 45 45 45 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CI80TF U 1
AF RS1CW35TF U 10
AF RS1D076TF U 1
AF RS1ED48JQ C 1
AF RS1ED48TF U 1
AF RS1CK81JQ C 14
AF RS1CK81TF U 14
BS 1 32 RS1CI80TF
BS 33 33 RS1ED48TF
BS 34 144 RS1CI80TF
BS 145 145 RS1ED48TF
BS 146 279 RS1CI80TF
BS 280 280 RS1ED48TF
BS 281 291 RS1CI80TF
BS 292 294 RS1ED48TF
BS 295 561 RS1CI80TF
BS 562 572 RS1D076TF
BS 573 593 RS1CK81TF

RD RS1CI80TF 561 0 0
GGACTTCTTTCATTGCCGTCTTCAGAAACCCC*TTAGCTTTCCGCTGCCTCGTGCGAGAT
CCTCCCATCAACTTCCGCAAAAATGAAGGTTGTCGCCGCGTTCTTGCTAGCCGTTCTGAG
CGGAAAAGCTTGCCCAACCAGTGCCGATATCAAGGGTATCCTCAATTCAGTTGGTGCCGA
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GCTGATTGCTGTCGGAAGGGAGAAGTTGGCTTCAGTACCCAGCGGTGGTGGTGGCGTTGC
CATGGCTTCTGCTCCATCTGCTGGTGGTGGAGGAGGTGCTGCCCCGGCTGCTGAGTCCAA
GAAAGAAGAGAAGAAAGAGGAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGCCTGTT
CGAGTAAGGCGGTATGCTTGGCCACTGGTTTTTGCTGTCATTTTGTAACCTCTTGGAACC
TATATGTTGTTGTTTTCTAGTTTGTTCTCGGTCAGTATCTTTGACATTCCTGAAATTCTC
AAGAGATTTTACACAAACATG

QA 1 561 1 561
DS 

RD RS1CW35TF 542 0 0
GG
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CTTCCGCAAAAATGAAGGTTGTCGCCGCGTTCTTGCTAGCCGTTCTGGGCGGAAAAGCTT
GCCCAACCAGTGCCGATATCAAGGGTATCCTCAATTCAGTTGGTGCCGAAACAGAGGAGT
CTCAGATTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAATGGGAAAGACGTGGCTGAGCTGATTGCTG
TCGGAAGGGAGAAGTTGGCTTCAGTACCCAGCGGTGGTGGTGGCGTTGCCATGGCTTCTG
CTCCATCTGCTGGTGGTGGAGGAGGTGCTGCCCCGGCTGCTGAGTCCAAGAAAGAAGAGA
AGAAAGAGGAGAAGGAAGAATCCGATGATGATATGGGTTTCAGCCTGTTCGAGTAAGGCG
GTATGCTTGGCCACTGGTTTTTGCTGTCATTTTGTAACCTCTTGGAACCTATATGTTGTT
GTTTTCTAACTTGTTCTCGGTCAGTATCTTTGACATTCCTGAAATTCTCAAGAGATTTTA

QA 3 542 3 542
DS 

RD RS1D076TF 572 0 0
GGACTTCTTTCATTGCCGTCTTCAGAAACCCC*TTAGCTTTCCGCTGCCTCGTGCGAGAT
CCTCCCATCAACTTCCGCAAAAATGAAGGTTGTCGCCGCGTTCTTGCTAGCCGTTCTGAG
CGGAAAAGCTTGCCCAACCAGTGCCGATATCAAGGGTATCCTCAATTCAGTTGGTGCCGA
AACAGAGGAGTCTCAGATTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAATGGGAAAGACGTGGCTGA
GCTGATTGCTGTCGGAAGGGAGAAGTTGGCTTCAGTACCCAGCGGTGGTGGTGGCGTCGC
CATGGCTTCTGCTCCATCTGCTGGTGGTGGAGGAGGTGCTGCCCCGGCTGCTGAGTCCAA
GAAAGAAGAGAAGAAAGAGGAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGCCTGTT
CGAGTAAGGCGGTATGCTTGGCCACTGGTTTTTGCTGTCATTTTGTAACCTCTTGGAACC
TATATGTTGTTGTTTTCTAGTTTGTTCTCGGTCAGTATCTTTGACATTCCTGAAATTCTC
AAGAGATTTTACACAAACATGATCTTATATTT

QA 1 572 1 572
DS 

RD RS1ED48JQ 561 0 0
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CCTCCCATCAACTTCCGCAAAAATGAAGGTTGTCGCCGCGTTCTTGCTAGCCGTTTTGAG
CGGAAAAGCTTGCCCAACCAGTGCTGATATCAAGGGTATCCTCAATTCAGTTGGTGCCGA
AACAGAGGAGTCTCAGATTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAATGGGAAAGACGTGGCTGA
GCTGATTGCTGTCGGAAGGGAGAAGTTGGCTTCAGTACCAAGCGGTGGTGG***CGTTGC
CATGGCTTTTGCTCCATCTGCTGGTGGTGGAGGAGGTGCTGCCCCGGCTGCTGAGTCCAA
GAAAGAAGAGAAGAAAGAGGAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGCCTGTT
CGAGTAAGGCGGTGTGCTTGGCCACTGGTTTTTGCTGTCATTTTGTAACCTCTTGGAACC
TATATGTTGTTGTTTTCTAGTTTGTTCTCGGTCAGTATCTTTGACATTCCTGAAATTCTC
AAGAGATTTTACACAAACA
GG

QA 1 559 1 559
DS 

RD RS1ED48TF 561 0 0
GGACTTCTTTCATTGCCGTCTTCAGAAACCCCCTTAGCTTTCCGCTGCCTCGTGCGAGAT
CCTCCCATCAACTTCCGCAAAAATGAAGGTTGTCGCCGCGTTCTTGCTAGCCGTTCTGAG
CGGAAAAGCTTGCCCAACCAGTGCTGATATCAAGGGTATCCTCAATTCAGTTGGTGCCGA
AACAGAGGAGTCTCAGATTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAATGGGAAAGACGTGGCTGA
GCTGATTGCTGTCGGAAGGGAGAAGTTGGCTTCAGTACCAAGCGGTGGTGG***CGTTGC
CATGGCTTCTGCTCCATCTGCTGGTGGTGGAGGAGGTGCTGCCCCGGCTGCTGAGTCCAA
GAAAGAAGAGAAGAAAGAGGAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGCCTGTT
CGAGTAAGGCGGTGTGCTTGGCCACTGGTTTTTGCTGTCATTTTGTAACCTCTTGGAACC
TATATGTTGTTGTTTTCTAGTTTGTTCTCGGTCAGTATCTTTGACATTCCTGAAATTCTC
AAGAGATTTTACACAAACA
GG

QA 1 559 1 559
DS 

RD RS1CK81JQ 580 0 0
G
GCCGTCTTCAGAAACCCCCTTAGCTTTCCGCTGCCTCGTGCGAGATCCTCCCATCAACTT
CCGCAAAAATGAAGGTTGTCGCCGCGTTCTTGCTAGCCGTTTTGAGCGGAAAAGCTTGCC
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AGATTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAATGGGAAAGACGTGGCTGAGCTGATTGCTGTCG
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CATCTGCTGGTGGTGGAGGAGGTGCTGCCCCGGCTGCTGAGTCCAAGAAAGAAGAGAAGA
AAGAGGAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGCCTGTTCGAGTAAGGCGGTA
TGCTTGGCCACTGGTTTTTGCTGTCATTTTGTAACCTCTTGGAACCTATATGTTGTTGTT
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AAACATGATCTTATATTTGCATTTCTATTTTTTGTTTTG

QA 2 580 2 580
DS 

RD RS1CK81TF 580 0 0
G
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CCGCAAAAATGAAGGTTGTCGCCGCGTTCTTGCTAGCCGTTCTGAGCGGAAAAGCTTGCC
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AGATTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAATGGGAAAGACGTGGCTGAGCTGATTGCTGTCG
GAAGGGAGAAGTTGGCTTCAGTACCAAGCGGTGGTGG***CGTTGCCATGGCTTCTGCTC
CATCTGCTGGTGGTGGAGGAGGTGCTGCCCCGGCTGCTGAGTCCAAGAAAGAAGAGAAGA
AAGAGGAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGCCTGTTCGAGTAAGGCGGTA
TGCTTGGCCACTGGTTTTTGCTGTCATTTTGTAACCTCTTGGAACCTATATGTTGTTGTT
TTCTAGTTTGTTCTCGGTCAGTATCTTTGACATTCCTGAAATTCTCAAGAGATTTTACAC
AAACATGATCTTATATTTGCATTTCTATTTTTTGTTTTG

QA 2 580 2 580
DS 



AS 2 7

CO CL957Contig1 866 4 19 U
AAGGAAACATTACTATTTCAAAGGAGACGAATAAAACAGTATTATATGAAAAACTACTGA
ATAGACGACAGAAACATATGTTATTGGGAAGTGGAACAAAGCAAAAGAGAGAGAGAGAG*
*GATCATCGTGTTCATGTTTATGTTAACACATAGCACATGCTAAAAGACATGATCCCAAA
AACAAAAAAACAGAAATATGCATATTACTCCCTTCTTCTAAAGCCGCCTGCAGTCTCTTC
CTGCGTTTCACCCTCTAGACTCGCATTGAATTTGACCATCTGCGAGATTAACCGCACGGT
TAGCTTGAGCATCAGCCTCAGAGTTGAATTCCCTGCCAATGTGTTGAATACGGCATGAGT
TAAACCGGCTCATAAGATCCTTGGCATATTCATTAAGCTCCGCCAATTTCGGGTGGTTGA
CTCTCCATTCATCTAGAACCTGATTACAGACAAGCAACGAGTCTCCCTTGATGCGAACAT
TTCGAAAGCCTTTGTCAAGAGCATACTCGAGACCAAGAATGAGAGCTCGATACTCAGCAA
CGTTGTTGGTGGCAATGCCAAGACCCTGACGCAAATAGAAGAGAACCCTGTTATCATGTG
TAGAACGGAGAACGGCTCCCGCACCAGCTTTTCCTGGGTTTCCTCTGGAAGCACCGTCAA
ATTGAGCAAAGTTGCGAGGTGGTGGAGGGTAAGTAGGTCGCTCATATTGAGCAACTTGGT
CTCAGGATTCCAATAGATGTCGTAGCCGTTAGCGTCCATACGGAGTTCCCAAGGCTGAGG
AAGAGAAGGAGCCATAGCAATCAAATCAACGCAAAGCAAAGAGTTTTCTACTTATTTCGA
GTGCCGTTCAAGTGGAAACGATTGTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H557JQB U 1
AF RS1FI65JQ U 1
AF RS1BP15JQ U 24
AF RS1BP15TF C 216
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BS 167 167 RS1H557JQB
BS 168 192 RS1FI65JQ
BS 193 193 RS1H557JQB
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CTGCGTTTCACCCTCTAAACTCCCATTGAATTTGACCATCTGCGAAATTAACCGCACGGT
TAGCTTGAGCATCAGCC

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DS 

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ATAGACGACAGAAACATATGTTATTGGGAAGTGGAACAAAGCAAAAGAGAGAGAGAGAG*
*GATCATCGTGTTCATGTTTATGTTAACACATAGCACATGCTAAAAAACATGATCCCAAA
AACAAAAAAACAAAAATATGCATATTACTCCCTTCTTCTAAAGCCGCCTGCAGTCTCTTC
CTGCGTTTCACCCTCTAAACTCGCATTGAATTTGACCATCTGCGAAATTAACCGCACGGT
TAGCTTGAGCATCAGCCTCAAAGTTGAATTCCCTGCCAATGTGTTGAATACGGCATGAGT
TAAACCGGCTCATAAAATCCTTGGCATATTCATTAAGCTCCGCCAATTTCGGGGGGTTGA
CTCTCCATTCATCTAAAACCTGATTACAGACAAGCAACGAGTCTCCCTTGATGCGAACAT
TTCGAAAGCCTTTGTCAAGAGCATACTCGAGAC

QA 1 513 1 513
DS 

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GG
GACGAATAAAACAGTATTATATGAAAAACTACTGAATAGACGACAGAGACATATGTTATT
GGGAAGTGGAACAAAGCAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAATCATCGTGTTCATGTTTATGTT
AACACATAGCACATGCTAAAAGACATGATCCCAAAAACAAGAAAACAGAAATATGCATAT
TACTCCCTTCTTCTAAAGCCGCCTGCAGTCTCTTCCTGCGTTTCACCCTCTAGACTCGCA
TTGAATTTGACCATCTGCGAGATTAACCGCACGGTTAGCTTGAGCATCAGCCTCAGAGTT
GAATTCCCTGCCAATGTGTTGAATACGGCATGAGTTAAACCGGCTCATAAGATCCTTGGC
ATATTCATTAAGCTCCGCCAATTTCGGGTGGTTGACTCTCCATTCATCTAGAACCTGATT
ACAGACAAGCAACGAGTCTCCCTTGATGCGAACATTTCGAAAGCCTTTGTCAAGAGCATA
CTCGAGACCAAGAATGAGAGCTCGATACTCAGCAACGTTGTTGGTGGCAATGCCAAGACC
CTGACGCAAATAGAAGAGAACCCTGTTATCATGTGTAGAACGGAGAACGGCTCCCGCACC
AGCTTTTCCTGGGTTTCCTCTGGAAGCACCGTCAAATTGAGCAAAGTTGCGAGGTGGTGG
AGGGTAAGTAGGTCGCTCATATTGAGCAACTTGGTCTCAGGATTCCAATAGATGTCGTAG
CCGTTAGCGT

QA 3 732 3 732
DS 

RD RS1BP15TF 651 0 0
TTCTAAAGCCGC*TGCAGTCTCTTCGTGCGTTTCACCCTCTAGACTCGCATTGAATTTGA
CCATCTGCGAGATTAACCGCACGGTTAGCTTGAGCATCAGCCTCAGAGTTGAATTCCCTG
CCAATGTGTTGAATACGGCATGAGTTAAACCGGCTCATAAGATCCTTGGCATATTCATTA
AGCTCCGCCAATTTCGGGTGGTTGACTCTCCATTCATCTAGAACCTGATTACAGACAAGC
AACGAGTCTCCCTTGATGCGAACATTTCGAAAGCCTTTGTCAAGAGCATACTCGAGACCA
AGAATGAGAGCTCGATACTCAGCAACGTTGTTGGTGGCAATGCCAAGACCCTGACGCAAA
TAGAAGAGAACCCTGTTATCATGTGTAGAACGGAGAACGGCTCCCGCACCAGCTTTTCCT
GGGTTTCCTCTGGAAGCACCGTCAAATTGAGCAAAGTTGCGAGGTGGTGGAGGGTAAGTA
GGTCGCTCATATTGAGCAACTTGGTCTCAGGATTCCAATAGATGTCGTAGCCGTTAGCGT
CCATACGGAGTTCCCAAGGCTGAGGAAGAGAAGGAGCCATAGCAATCAAATCAACGCAAA
GCAAAGAGTTTTCTACTTATTTCGAGTGCCGTTCAAGTGGAAACGATTGTC

QA 1 651 1 651
DS 



CO CL957Contig2 902 3 2 U
GGAAAAATCACAATTCACAATGAAGCTCCTTCTTTGTCTCTCTATACTCTTCATCTCTCT
TCCATCATCTTACAGCTGCAACTCAAAAGAAGAACATACCCTCCTTCAAATCAAGAAATC
TTTCAACAACCCGGACCTCCTCGCCACATGGAGTCCTGGAACCGACTGCTGTACAAGCTG
GACCGGCATCGAGTGCACTAACGGCCGCGTCACATTACTCTGCGTTGATACCACTGCTTA
CGGCCGGGGGACAATCGTTTCCACTTGAGCGGCACTCGAAATAAGTAGAAAACTCTTTGC
TTTGCGTTGATTTGATTGCTATGGCTCCTTCTCTTCCTCAGCCTTGGGAACTCCGTATGG
ACGCTAACGGCTACGACATCTATTGGAATCCTGAGACCAAAGTTGCTCAATATGAGCGAC
CTACTTACCCTCCACCACCTCGCAACTTTGCTCAAGTTGCTTGTACCATCGAGTTTGACG
GTGCTTCCAGAGGAAACCCAGGAAAAGCTGGTGCGGGAGCCGTTCTCCGTTCTACACATG
ATAACAGGGTTCTCTTCTATTTGCGTCAGGGTCTTGGCATTGCCATCAACAACGTTGCTG
AGTATCGAGCTCTCATTCTTGGTCTCGAGTATGCTCTTGACAAAGGCTTTCGAAATGTTC
GCATCAAGGGAGACTCGTTGCTTGTCTGTAATCAGGTTCTAGATGAATGGAGAGTCAACC
ACCCGAAATTGGCGGAGCTTAATGAATATGCCAAGGATCTTATGAGCCGGTTTAACTCAT
GCCGTATTCAACACATTGGCAGGGAATTCAACTCTGAGGCTGATGCTCAAGCTAACCGTG
CGGTTAATCTCGCAGATGGTCAAATTCAATGCGAGTCTAGAGGGTGAAACGCAGAAGAGA
CT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1GW17TF U 1
AF RS1H557TF U 247
AF RS1FI65TF U 247
BS 1 565 RS1GW17TF
BS 566 902 RS1FI65TF

RD RS1GW17TF 565 0 0
GGAAAAATCACAATTCACAATGAAGCTCCTTCTTTGTCTCTCTATACTCTTCATCTCTCT
TCCATCATCTTACAGCTGCAACTCAAAAGAAGAACATACCCTCCTTCAAATCAAGAAATC
TTTCAACAACCCGGACCTCCTCGCCACATGGAGTCCTGGAACCGACTGCTGTACAAGCTG
GACCGGCATCGAGTGCACTAACGGCCGCGTCACATTACTCTGCGTTGATACCACTGCTTA
CGGCCGGGGGACAATCGTTTCCACTTGAGCGGCACTCGAAATAAGTAGAAAACTCTTTGC
TTTGCGTTGATTTGATTGCTATGGCTCCTTCTCTTCCTCAGCCTTGGGAACTCCGTATGG
ACGCTAACGGCTACGACATCTATTGGAATCCTGAGACCAAAGTTGCTCAATATGAGCGAC
CTACTTACCCTCCACCACCTCGCAACTTTGCTCAAGTTGCTTGTACCATCGAGTTTGACG
GTGCTTCCAGAGGAAACCCAGGAAAAGCTGGTGCGGGAGCCGTTCTCCGTTCTACACATG
ATAACAGGGTTCTCTTCTATTTGCG

QA 1 565 1 565
DS 

RD RS1H557TF 644 0 0
GGGC
ACAATCGTTTCCACTTGAGCGGCACTCGAAATAAGTAGAAAACTCTTTGCTTTGCGTTGA
TTTGATTGCTATGGCTCCTTCTCTTCCTCAGCCTTGGGAACTCCGTATGGACGCTAACGG
CTACGACATCTATTGGAATCCTGAGACCAAAGTTGCTCAATATGAGCGACCTACTTACCC
TCCACCACCTCGCAACTTTGCTCAAGTTGCTTGTACCATCGAGTTTGACGGTGCTTCCAG
AGGAAACCCAGGAAAAGCTGGTGCGGGAGCCGTTCTCCGTTCTACACATGATAACAGGGT
TCTCTTCTATTTGCGTCAGGGTCTTGGCATTGCCATCAACAACGTTGCTGAGTATCGAGC
TCTCATTCTTGGTCTCGAGTATGCTCTTGACAAAGGCTTTCGAAATGTTCGCATCAAGGG
AGACTCGTTGCTTGTCTGTAATCAGGTTCTAGATGAATGGAGAGTCAACCACCCGAAATT
GGCGGAGCTTAATGAATATGCCAAGGATCTTATGAGCCGGTTTAACTCATGCCGTATTCA
ACACATTGGCAGGGAATTCAACTCTGAGGCTGATGCTCAAGCTAACCGTGCGGTTAATCT
CGCAGATGGTCAAATTCAATGCGAGTCTAGAGGGTGAAAC

QA 5 644 5 644
DS 

RD RS1FI65TF 656 0 0
GGGC
ACAATCGTTTCCACTTGAGCGGCACTCGAAATAAGTAGAAAACTCTTTGCTTTGCGTTGA
TTTGATTGCTATGGCTCCTTCTCTTCCTCAGCCTTGGGAACTCCGTATGGACGCTAACGG
CTACGACATCTATTGGAATCCTGAGACCAAAGTTGCTCAATATGAGCGACCTACTTACCC
TCCACCACCTCGCAACTTTGCTCAAGTTGCTTGTACCATCGAGTTTGACGGTGCTTCCAG
AGGAAACCCAGGAAAAGCTGGTGCGGGAGCCGTTCTCCGTTCTACACATGATAACAGGGT
TCTCTTCTATTTGCGTCAGGGTCTTGGCATTGCCATCAACAACGTTGCTGAGTATCGAGC
TCTCATTCTTGGTCTCGAGTATGCTCTTGACAAAGGCTTTCGAAATGTTCGCATCAAGGG
AGACTCGTTGCTTGTCTGTAATCAGGTTCTAGATGAATGGAGAGTCAACCACCCGAAATT
GGCGGAGCTTAATGAATATGCCAAGGATCTTATGAGCCGGTTTAACTCATGCCGTATTCA
ACACATTGGCAGGGAATTCAACTCTGAGGCTGATGCTCAAGCTAACCGTGCGGTTAATCT
CGCAGATGGTCAAATTCAATGCGAGTCTAGAGGGTGAAACGCAGAAGAGACT

QA 5 656 5 656
DS 



AS 1 6

CO CL958Contig1 920 6 24 U
GCAACGTCTCTAAAATTCAGAAACATAGTAAATCTTGAAGTCACCGGTATTAGCTCGGTC
AACGCAAAGGCCTTCCACATGTTCTTGGTGAAAACTACGAATGTCAACATCCACAACATC
AATATTGTTGCCCCTGCTGAAAGTCCCAACACCGATGGTATCCATTTGAGCAATGCAGAC
AACGTTAGCATCGTTGACAGTAATATAGGGACAGGAGACGATTGTATTTCTGTCGGTCGT
GGTTCCAACAATGTAACTGTCGAACGCGTGGTTTGTGGCCCAGGACACGGCCTAAGTGTC
GGTAGTCTCGGAAAGTACCCGAACGAGGAGGATGTTAGCGGCATTCACTTTAAGAGCTGC
ACGATGAAAGGTACCGACAATGGTCTTAGAATCAAGAGTTGGGGTGGTTCGTCTCCAAGC
AAGGCTACGGACATTAAGTTTGAAGATATTATAATGGAAAGCGTGAAGAACCCAATCATC
ATTGACCAAAACTACGGCTCAAGAGGCGGAGAATCAAGAGTTGCCATTAGCGATGTATTG
TTCAAGAACGTAAGAGGAACAACAATTACAAAAGATGAAGTTCAGATCATGTGCAGCAAA
ACAGTACCGTGCGCAGGAGTCAGCGTCATTGACGTGAACTTGAACTTCATTGGTAACAAA
GGAGGACATCCCTCGTCGTCAGGAGGTTTGGTCGGAGCTCTTTGTACCAACGCCAACGTT
ATCTTCGGTGGAAAACTTAGTTTCCCTATGTGTCCCAAATAAGCTTTTTGATATAATTAA
TTTTATAACAAAAAAAAA*GTCAAAAGTTTCCACAAACATTTGTTTTGTTTGTGAGTTAA
CTAGATTGTGACTTTATCAACAATTTATTAATTCATTGGAATATTTGACTTATGAAAGAA
AAATCCCACTGCTTTATGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1FI51TF U 1
AF RS1DR67TF U 98
AF RS1DR67JQ C 130
AF RS1GD27JQ C 272
AF RS1DT16TF U 228
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DS 

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G
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AGTTCAGATCATGTGCAGCAAAACAGCACCGTGCGCAGGAGTCAGCGTCATTGACGTGAA
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TCTTTGTACCAACGCCAACGTTATCTTCGGTGGAAAACTTAGTTTCCCTATGTGTCCCAA
ATAAGCTTTTTGATATAATTAATTTTATAACAAAAAAAAA*GTCAAAAGTT*CCACAAAC
ATTTGTTT*GTTTGTGAGT*AACTAGATTGTGACTTTATCA*CAATTTATTAATTCATTG
GAATATT

QA 2 788 2 788
DS 

RD RS1DR67JQ 766 0 0
TG
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CTACGGCCCAAGAGGCGGAGAATCAAGAGTTGCCATTAGCGATGTATTGTTCAAGAACGT
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CGCAGGAGTCAGCGTCATTGACGTGAACTTGAACTTCATTGGTAACAAAGGAGGACATCC
CTCGTCGTCAGGAGGTTTGGTCGGAGCTCTTTGTACCAACGCCAACGTTATCTTCGGTGG
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AAAAAAAAGTCAAAAGTTTCCACAAACATTTGTTTTGTTTGTGAGTTAACTAGATTGTGA
CTTTATCAACAATTTATTAATTCATTGGAATATTTGACTT
TTGG

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DS 

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TAATGGAAAGCGTGAAGAACCCAATCATCATTGACCAAAACTACGGCTCAAGAGGCGGAG
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AAGATGAAGTTCAGATCATGTGCAGCAAAACAGTACCGTGCGCAGGAGTCAGCGTCATTG
ACGTGAACTTGAACTTCATTGGTAACAAAGGAGGACATCCCTCGTCGTCAGGAGGTTTGG
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GTCCCAAATAAGCTTTTTGATATAATTAATTTTATAACAAAAAAAA**GTCAAAAGTTTC
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TTCATTGGAATATTTGACTT
TTG

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DS 

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G
TCTGTCGGTCGTGGTTCCAACAATGTAACTGTCGAACGCGTGGTTTGTGGCCCAGGACAC
GGCCTAAGTGTCGGTAGTCTCGGAAAGTACCCGAACGAGGAGGATGTTAGCGGCATTCAC
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TCGTCTCCAAGCAAGGCTACGGACATTAAGTTTGAAGATATTATAATGGAAAGCGTGAAG
AACCCAATCATCATTGACCAAAACTACGGCTCAAGAGACGGAGAATCAAGAGTTGCCATT
AGCGATGTATTGTTCAAGAACGTAAGAGGAACAACAATTACAAAAGATGAAGTTCAGATC
ATGTGCAGCAAAACAGTACCGTGCGCAGGAGTCAGCGTCATTGACGTGAACTTGAACTTC
ATTGGTAACAAATGAGGACATCCCTCGTCGTCAGGAGGTTTGGTCGGAGCTCTTTGTACC
AACGCCAACGTTATCTTCGGTGGAAAACTTAGTTTCCCTATGTGTCCCAAATAAGCTTTT
TGATATAATTAATTTTATAACAAAAAAAAG*GTCAAAAGTTTCCACAAACATTTGTTTTG
TTTGTGAGTTAACTAGATTGTGACTTTATCAACAATTTATTAATTCATTGGAATATTTGA
CTTATGAAAGAAAA*TCCCACTGCTTTATG

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DS 

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GTATTGTTCAAGAACGTAAGAGGAACAACAATTACAAAAGATGAAGTTCAGATCATGTGC
AGCAAAACAGTACCGTACGCAGGAGTCAGCGTCATTGACGTGAACTTGAACTTCATTGGT
AACAAAGGAGGACATCCCTCGTCGTCAGGAGGTTTGGTCGGAGCTCTTTGTACCAACGCC
AACGTTATTTTCGGTGGAAAACTTAGTTTCCCTATGTGTCCCAAATAAGCTTTTTGATAT
AATTAATTTTATAACAAAAAAAAA*GTCAAAAGTTTCCACAAACATTTGTTTTGTTTGTG
AGTTAACTATATTGTGACTTTATCAACAATTTATTAATTCATTGGAATATTTGACTTTTG
AAAGAAAAATCCCACTGCTTTATGAC

QA 1 506 1 506
DS 



AS 1 6

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AACTGGAGTCACAGCTTTTGAAGGAAAAACCACGAAACCATCTTGATTTGAGAAACCGAC
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AATCTAAAAATAGTGAATGGGTCAAAGTGGAAAGTTTTGACAATCTAACAAATAAACAAG
AAGCTAAAGCGCATGCCAATGACATTTCAACTTATTGCGGAAGATTGCTGGAGGAAACGG
AAGATGAGCTTGCTGAGGTAATAAAGAATGGATCGTTAAAAGTAGGAGATGCGCGCAAGG
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AGGACGCCGATGACGATGCAGATGAATTATAGCTCATTCCGGGGAAACGTCA***CTTTT
TTTACCAACAAGGTCCGACTACAAAGACATTTTTTTACGACTCATTTGTAGCTTATACAC
CTTTTTCAGCCTTTATGTTCCATCGATGATCCGTTCTAGAAA*CTTATTCAGACTGTGAC
AGCGTTCTGTTTTAGAGATTTTTTTCTCAAGACATTTAAATTAACTTCACAGACAAAAAA
A


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B496TF U 1
AF RS1DL58JQ C 307
AF RS1FQ38TF U 1
AF RS1B496JQ C 290
AF RS1DL58TF U 15
AF RS1BU43TF U 15
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RD RS1B496TF 579 0 0
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AGTACGCCGATGACGATGCAGATGAATTATAGCTCATTC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RS1DL58JQ 388 0 0
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AGCTTGCTGAGGTATTAAAGAATGGATCGTTAAAAGTAGGAGATGCGCGCAAGGTTTTGT
GTCAAACTTTAAGTAATCACTGCAGCAAATCAAGTGAAACAGATTCAGAAGATGAGGACG
CCGATGACGATGCAGATGAATTATAGCTCATTCCGGGGAAACGTCA***CTTTTTTTACC
AACAAGGTCCGACTACAAAGACATTTTTTTACGACTCATTTGTAGCTTATACCCCTTTTT
CACCCTTTATGTTCCATCGATGATCCGT

QA 1 388 1 388
DS 

RD RS1FQ38TF 770 0 0
GGG
AAGGAAGAAATCGAAGGATGGCGAAGCTGGTGTCCTTCACCGTAGTTGTTATCACCATTT
GCTCCTTTGGAGTCTCCGTTGATGACAAATGTGCTGCTTGCAACGCCGTCGCGGAGGAAC
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ATTCTAAAGGCCAGCGTGAAGGAAAGGTTATTGATTATAGAATGAGTGACCTGAGGGTGG
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ATGAGCTTGCTGAGGTAATAAAGAATGGATCGTTAAAAGTAGGAGATGCGCGCAAGGTTC
TGTGTCAAACTTTAAGTAATCACTGCAGCAAATCAAGTAAAACAGATTCAGAAGATGAGG
ACGCCGATGACGATGCAGATGAATTATAGCTCATTCCGGGGAAATGTCATCACTTTTTTT
ACCAACAAGGTCCGACTACAAAGACATTTTTTTACGACTCATTTGTAGCTTATACACCTT
TTTCAGCCTTTATGTTCCATCGATGATCCGTTCTAGAAA*CTTATTCAGACTGTGACAGC
GTTCTGTTTTAGAGATTTTTTTCTCAAGACATT
AAATTAGCTTCAAA

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AAATAAACAAGAAGCTAAAGCGCATGCCAATGACATTTCAACTTATTGCGGAATATTGCT
GGAGGAAACGGAAGATGAGCTTGCTGAGGTAATAAAGAATGGATCGTTAAAAGTAGGAGA
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TTCAGGAGATGAGTACGCCGATGACGATGCAGATGAATTATAGCTCATTCCGGGGAAATG
TCATCACTTTTTTTACCAACAAGGTCCGACTACAAAGACATTTTTTTACGACTCATTTGT
AGCTTATACACCTTTTTCAGCCTTTATGTTCCATCGATGATCCGTTCTAGAAAACTTATT
CAGACTGTGACAGCGTTCTGTTTTAGAGATTTTTTT
TTTC

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DS 

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G
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ACGGGCTGTGTGATAGAATGCAGGACTATACTCTACAAAAGGTGAAATCTAAAAATAGTG
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CCAATGACATTTCAACTTATTGCGGAAGATTGCTGGAGGAAACGGAAGATGAGCTTGCTG
AGGTATTAAAGAATGGATCGTTAAAAGTAGGAGATGCGCGCAAGGTTCTGTGTCAAACTT
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ATGCAGATGAATTATAGCTCATTCCGGGGAAACGTCA***CTTTTTTTACCAACAAGGTC
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AGATTTTTTTCTCAAGACATT
TAAATTAACTTCACAGAC

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DS 

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G
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AGCGTGAAGGAAAGTTTATTGATTATAGAATGAGTGACCTGAGGGTGGTTGATTTGTTGG
ACGGGCTGTGTGATAGAATGCAGGACTATACTCTACAAAAGGTGAAATCTAAAAATAGTG
AATGGGTCAAAGTGGAAAGTTTTGACAATCTAACAAATAAACAAGAAGCTAAAGCGCATG
CCAATGACATTTCAACTTATTGCGGAAGATTGCTGGAGGAAACGGAAGATGAGCTTGCTG
AGGTATTAAAGAATGGATCGTTAAAAGTAGGAGATGCGCGCAAGGTTCTGTGTCAAACTT
TAAGTAATCACTGCAGCAAATCAAGTGAAACAGATTCAGAAGATGAGGACGCCGATGACG
ATGCAGATGAATTATAGCTCATTCCGGGGAAACGTCA***CTTTTTTTACCAACAAGGTC
CGACTACAAAGACATTTTTTTACGACTCATTTGTAGCTTATACACCTTTTTCAGCCTTTA
TGTTCCATCGATGATCCGTTCTAGAAA*CTTATTCAGACTGTGACAGCGT*CTGTTTTGG
AGATTTTTTTCTCAAGACATTTAAATTAACTTCACAGACAAAAAAA

QA 2 767 2 767
DS 



AS 1 6

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ACTACACAAGTCACAACCAAAGCCTCAAACGGCTTCATCACAGCAGGGGCAGAAGCAGTA
GGAGCAGCCTTTCCACCTTCTAAAGTCGGAGAAGGTGTAGTTTTGGCGGTGGCACCGTCC
CCACCACCACCGGAAGAGACTACTGCACCTACGTTGACAGAGAGCTTCATGCCACCAGTG
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GTGGTTCCACTACTGTCGGAAGAAATTGAGTTCCCCAATGTGCAACTTTTGTAGTCACTT
TCACTCACTTCGTCCACCGTATGACCCGCACCGTAGTTGAACACGATCGTATCGCCAACG
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TGAGTGGCTGAGGAG*CAGGTGCCACATATGTGAAGAAGAAGATGGCAAGGCAACCAACA
AGTGCACTCGAGTTTGTCATTCTTGTGTATACAGTTTATTTTAAATGAATTTTTTTTGTG
ACTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1E041JQ U 36
AF RS1CZ67JQ U 1
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AF RS1BM90TF C 31
AF RS1E041TF C 108
AF RS1BM90JQ U 36
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TTTTTGTCC

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TTTTT
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CATGCCACCAGTGCAGTGGCCGGGGATAGCGCAAATGAAGTAGTGAGAACCAGATGTCTT
GAGAGCTATGCTTGTGGTTCCACTACTGTCGGAAGAAATTGAGTTCCCCAATGTGCAACT
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CGTATCGCCAACGGCATAGGGTTTTCCGGTAGCCAAGGAGCTATAGTCATTCCCAAGCGA
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AAGGCAACCAACAAGTGCACTCGAGTTTGTCATTCTTGTGTATACAGTTTATTTTAAATG
AATTTTTTTT
GTGACTTCC

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DS 

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AAGAGCCAAAGCATATAATAACGCAACTACACAAGTCACAACCAAAGCCTCAAACGGCTT
CATCACAGCAGGGGCAGAAGCAGTAGGAGCAGCCTTTCCACCTTCTAAAGTCGGAGAAGG
TGTAGTTTTGGCGGTGGCACCGTCCCCACCACCACCGGAAGAGACTACTGCACCTACGTT
GACAGAGAGCTTCATGCCACCAGTGCAGTGGCCGGGGATAGCGCAAATGAAGTAGTGAGA
ACCAGATGTCTTGAGAGCTATGCTTGTGGTTCCACTACTGTCGGAAGAAATTGAGTTCCC
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DS 



AS 1 6

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GACGCCGTGGTCGAGGACCGCCGAGAACTTCGCTAACTACACAGGAGATCAAGGGTACCC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G209TF U 1
AF RS1E364TF U 53
AF RS1FM76TF U 58
AF RS1AK26TF U 23
AF RS1AK26JQ C 418
AF RS1G209JQ C 418
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BS 188 193 RS1G209TF
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BS 195 280 RS1G209TF
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CTCGCTACCCGGAGATTTCGGGTTCGACCCACTGGGTTTGGGAAAAGACCCGGCTTTTCT
TAAATGGTACAGAGAGGCAGAGCTGATCCACGGCCGGTGGGCGATGGCTGCTGTTCTTGG
*ATCTTCGTTGGTCAGGCTTGGAGCGGCGTGCCATGGTTCGAAGCCGGAGCTGATCCACG
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DS 

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GGGG

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DS 

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GG
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CATTCCTCACCGGAGGCAAGAGAAGTGCCACGGCACTGGGGAGCGGTGTAGGTACTGGAG
CTGCGAGAGTTGGCCGGAAAACTCTGATTGTCGCTGCAGCAGCTGCTTCTCAGCCCAAGA
AGTCGTGGATCCCCGCCGTTAAAGGTGGCGGCAACTTCCTCGACCCTGAATGGCTCGATG
GCTCGCTACCCGGAGATTTCGGGTTCGACCCATTGGGTTTGGGAAAAGACCCGGCTTTTC
TTAAATGGTACAGAGAGGCAGAGCTGATCCACGGCCAGTGGGCGATGGCTGCTGTTCTTG
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GG
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CGACCCATTGGGTTTGGGAAAAGACCCGGCTTTTCTTAAATGGTACAGAGAGGCAGAGCT
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ATCGCTTCTCGGGACCCAACTGCTTCTCATGGGTTGGGTGGAGAGCAAACGGTGGGTCGA
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GCTGAAACTTGCGGAGATTAAGCACTCTAG*CTCGCAATGCTTGCAATGCTGATCTTTTA
CTTTG

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TG
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CACTTGGTTTGTGAGAACTATGTCTTTAGAGTCTGTAGATATAATTACTTATGATGCTGT
TCTTC

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DS 

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TT
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CAGGAGGGAGATTCTTTGATCCGTTGGGTCTAGCGGGGAAGTCACGGGACGGTGTTTACG
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CAATGCTTGCAATGCTGATCTTTTACTTTGAGGCCGGGCAGGGTAAAACGCCTCTTGGTG
CACTTGGTTTGTGAGAACTATGTCTTTAGAGTCTGTAGATATAATTACTTATGATGCTGT
TCTTCAAAAATATCAGATCATTGCTTTGAAGTGGCAATCAAATCATGAGTTCAGCTTGTG
AACAATGTGAAATTAATAATTATATCATGAAAAGGCTTATTAGTAT

QA 3 588 3 588
DS 



AS 1 6

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AATGGCGTCGATTGCAGCTTCTTCTACTTTCCACTCCTTTTCAACAACCAAAAGCCCTAA
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CGGAAACAGCAGAGTTTGCAGCTTTACGAAACAGAACAACCGCCTTGGGTCGAAGAGGAA
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GCAACAGACTGTCTCTGTCCCTGTCTCTCCTTCAGACATGCTCACCATGTTTTTTCAGGC
TGATGGAACTTTGAATGAAGCAGCTATTCCTAATGTGACAAAGGCCTTACAGGACATGGA
TGGAGTTTCCAATTTAAAGGTTCAAGTTTCTGAAGGTGTTGCAGTTGTTGAGCTATCAAA
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TGGCTTCAAGTTACAAACCTTGAACCTGAGCTTTGAAGACGAAGATGAAGTTCTTGTCTA
ATTAATTAATATCATCTTTCTCCTCCTCCATTTTTTTTGTGTGATTAAAGAAAAACACAT
TAATGTTCAATTTTAATTACAAGAATTACAATGTGCCATATTACAAAAGTAATGAACTCT
CACTTTCTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 5 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1G939TF U 1
AF RS1D394TF U 38
AF RS1FC79JQ C 141
AF RS1G939JQ C 235
AF RS1BN80JQ C 17
AF RS1BN80TF U 42
BS 1 224 RS1G939TF
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GCAAACAACGGTTC

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GGGG
AAGGGGTAGTAGCGAAAAAA*TGGCGTCGATTGCAGCTTCTTCTACTTTCCACTCCTTTT
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CAGTTGTTGAGCTATCAAAGCAAACAACGGTTCAGGCAACAGGAGTGGCGTCAAGCTTGG
TGGAGACTATACAAGGAGCTGGCTTCAAGTTACAAACCTTGAACCTGAGCTTTGAAGACG
AAGATGAAGTTCTTGTCTAATTAATTAATATCATCTTTCTCCTCCTCCATTTTTTTTGTG
TGATTAAAGAAAAA

QA 5 618 5 618
DS 

RD RS1FC79JQ 540 0 0
TTCCTCTCTCCAAAAACCTCACCTTTCCAACCAAACCCATCGGAAACAGCAGAGTTTGCA
GCTTTACGAAACAGAACAACCGCCCTGGGTCGAAGAGGAAACTTTCGTCCGTTGGCGAAG
GAGGAGGAGGAGAAGCCGTCGCAGTTGCAGATGAAGAGCAGCAACAGACTGTTTCTGTCC
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CAGCTATTCCTAATGTGACAAAGGCCTTACAGGACATGGATGGAGTTTCCAATTTAAAGG
TTCAAGTTTTTGAAGGTGTTGCAGTTGTTGAGCTATCAAAGCAAACAACGGTTCAGGCAA
CAGGAGTGGCGTCAAGCTTGGTGGAGACTATACAAGGAGCTGGCTTCAAGTTACAAACCT
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TCCTCCTCCATTTTTTTTGTGTGATTAAAGAAAAACATATTAATGTTCAATTTTAATTAC

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DS 

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TCAGGCTGATGGAACTTTGAATGAAGCAGCTATTCCTAATGTGACAAAGGCCTTACAGGA
CATGGATGGAGTTTCCAATTTAAAGGTTCAAGTTTCTGAAGGTGTTGCAGTTGTTGAGCT
ATCAAAGCAAACAACGGTTCAGGCAACAGGAGTGGCGTCAAGCTTGGTGGAGACTATACA
AGGAGCTGGCTTCAAGTTACAAACCTTGAACCTGAGCTTTGAAGACGAAGATGAAGTTCT
TGTCTAATTAATTAATATCATCTTTCTCCTCCTCCATTTTTTTTGTGTGATTAAAGAAAA
ACATATTAATGTTCAATTTTAATTAC

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GG
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CCCTGTCTCTCCTTCAGACATGCTCACCATGTTTTTTCAGGCTGATGGAACTTTGAATGA
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GGTTCAAGTTTCTGAAGGCGTTGCAGTTGTTGAGCTATCAAAGCAAACAACGGTTCAGGC
AACAGGAGTGGCGTCAAGCTTGGTGGAGACTATACAAGGAGCTGGCTTCAAGTTACAAAC
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TCTCCTCCTCCATTTTTTTTGTGTGATTAAAGAAAAACACATTAATGTTCAATTTTAATT
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DS 

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GCCTTGGGTCGAAGAGGAAACTTTCGTCCGTTGGCGAAGGAGGAGGAGGAGAAGCCGTCG
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TCACCATGTTTTTTCAGGCTGATGGAACTTTGAATGAAGCAGCTATTCCTAATGTGACAA
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CAGTTGTTGAGCTATCAAAGCAAACAACGGTTCAGGCAACAGGAGTGGCGTCAAGCTTGG
TGGAGACTATACAAGGAGCTGGCTTCAAGTTACAAACCTTGAACCTGAGCTTTGAAGACG
AAGATGAAGTTCTTGTCTAATTAATTAATATCATCTTTCTCCTCCTCCATTTTTTTTGTG
TGATTAAAGAAAAACACATTAATGTTCAATTTTAATTACAAGAATTACAATGTGCCATAT
TACAAAAGTAATGAACTCTCACTTTCTTAC

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DS 



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TTGGCTTCATGACAAAACCGATGTGTAGACTTTAGATTAATGTCAAGAATCTACAGAGAG
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AATCTCATTTGTTCTCTTTTAAACTTCCTGTTTGCATACCATATCCCTCCGCGCCACCCC
AACCCATACCCGATGATCAAAGTGGTTCCAGCGGTGGCAATTGTTGAAGTGAATCTGGAA
CCCACTGGATCAACAAGCTCCTTGAGTTCTCCTCGTTCCAATTCATGGGTGTGTTTCATC
GCATTCTCAATCGATTCCAGCCTCTGATCGATCCTAGTTTCATTGTAGTGTCGTAATGAA
TAACCAATCCAAGCGGTAGCAACAGATGCAACAGAAGTTGCAACTGTAAACACGACCCTC
TGCCTCTCGAGCAAATCCTTGGTGGAGAGATAGGAGTCTTGGATAGCGACCAATGAGTTC
TGGGCTCTCTTCTTCAGATGAGGCATAGCTGCCGAACCTAGAATCCATGCCCCTCGCCCT
CTCAGCCGATTCATGGCTCGGTGGAGCGGGTCAACTCGGCGGCGTTAGATTGAGATACGC
TGGCAACGGAAAATCGTCTGGGAGAGAAGAGAATCCACCCAGGCGATTTCCCCCACACGC
AAAAAGGACGAAGCTTCACGCAGGTTCTCTTTTTTTTTTCTCCGACCAAAAGCCCCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 10 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1EL90TF C 157
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AAAGCATTTTCTGTGGTCTGCCTTGGGAACGGTCGTCTGAGGAGCCTTGAGGTAGGCCAA
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DS 

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GAAAAATAATCCTTCTTTGTTTCGATTAGCTATTGCTTTTGAATTGTTTCTCCTCCTCCC
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AA*TCGTCTGGGAGAGA
GAGA

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DS 

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CTGAGGAGCCTTGAGGTAGGCCAAGCTCGGGGTTTTATCCTCCCTAATAACAACTTCCAT
TCTCTCGGTTTTAACTGACCAGCCAATCTCATTTGTTCTCTTTTAAACTTCCTGTTTGCA
TACCATATCCCTCCGCGCCACCCCAACCCATACCCGATGATCAAAGTGGTTCCAGCGGTG
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TCCAATTCATGGGTGTGTTTCATCGCATTCTCAATCGATTCCAGCCTCTGATCGATCCTA
GTTTCATTGTAGTGTCGTAATGAATAACCAATCCAAGCGGTAGCAACAGATGCAACAGAA
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TCTTGGATAGCGACCAATGAGTTCTGGGCTCTCTTCTTCAGATGAGGCATAGCTGCCGAA
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ACCCAGGC
CC

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TGAATCTGGAACCCACTGGATCAACAAGCTCCTTGAGTTCTCCTCGTTCCAATTCATGGG
TGTGTTTCATCGCATTCTCAATCGATTCCAGCCTCTGATCGATCCTAGTTTCATTGTAGT
GTCGTAATGAATAACCAATCCAAGCGGTAGCAACAGATGCAACAGAAGTTGCAACTGTAA
ACACGACCCTCTGCCTCTCGAGCAAATCCTTGGTGGAGAGATAGGAGTCTTGGATAGCGA
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CCCCTCGCCCTCTCAGCCGATTCATGGCTCGGTGGAGCGAGTCAACTCGGCGGTGTTAGA
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CC

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DS 

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ACCCCAACCCATACCCGATGATCAAAGTGGTTCCAGCGGTGGCAATTGTTGAAGTGAATC
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TCATAGCATTCTCAATCGATTCCAGCCTCTGATCGATCCTAGTTTCATTGTAGTGTCGTA
ATGAATAACCAATCCAAGCGGTAGCAACAGATGCAACAGAAGTTGCAACTGTAAACACGA
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AGTTCTGGGCTATCTTCTTCAGATGAGGCATAGCTGCCGAACCTAGAACCCATGCCCCTC
GCCCTCTCAGCCGATTCATGGCTCGGTGGAGCGGGTCAACTCGGCGGCGTTAGATTGAGA
TACGCTGGCAACGGAAAATCGTCTGGGAGAGAAGAGAATCCACCCAGGCGATTTCCCCCA
CACGCAAAAAGGACGAAGCTTCACGCAGGTTCTCTTTTTTTTTTCTCCGACCAAAAGCCC
CT

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DS 



AS 1 6

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ATGACAAGGAAATATTACATCAACAAATATATAGGTAGATTAAAGACAACAACGTTTAGT
ACGCACTTATTTAAATTTATTAATACACAGTATATAATAAAGATCAATAATCACTTCATG
AAACCTTGAGCCATCTTAGCATAACCTCCCAAGCCACCACCAGACTCCTCTTCGGGCTTC
TTAGCTTCTGGTTCAGCCTCACTTGCCGGAGGAGGAGCACCGGCGGAAGCCGGGGGAGGA
GTACCGGCGGCGCCGGAGGAATGTGAGGACTCGAAGTCGTTTAGATACTTCTCGGCCTTC
TCCAGGTACTGACCAGTACCGCTCTTCTCATCGAGCTTTCCGTATTTCTGGGCGGCATCT
AAGATATCAGCGCTGGCTCCAGCGACTTTAGCCTTGTCGAGTTTGTCTGACTCGTTACGA
GCAGCGGCTTGAGCAGCTTCGGCTACGACCTTGGCACTAGCCATGAGCTCGGAGGATGAA
GCTGGTCTGTTGGTTGTTTCGGTTCCTTCGGCGGGCTTGTTGTGGTCTGGCTCCTCTGGT
TTGGAGTCGGAGAATTACTTTACCTGATCGGAGAGGAAGTTCATCTTTAGTTTCTTTTTT
CTTGGTTTGCTGAATATGATTTCTTGTGTTGGATGTCC


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G458TF C 19
AF RS1G458JQ U 19
AF RS1GR24JQ U 19
AF RS1EV57JQ U 3
AF RS1EV57TF C 3
AF RS1CV44TF C 1
BS 1 2 RS1CV44TF
BS 3 18 RS1EV57JQ
BS 19 267 RS1G458JQ
BS 268 341 RS1EV57JQ
BS 342 377 RS1CV44TF
BS 378 378 RS1EV57TF
BS 379 698 RS1CV44TF

RD RS1G458TF 249 0 0
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ATCAACAAATATATAGGTAGATTAAAGACAACAACGTTTAGTACGCACTTATTTAAATTT
ATTAATACACAGTATATAATAAAGATCAATAATCACTTCATGAAACCTTGAGCCATCTTA
GCATAACCTCCCAAGCCACCACCAGACTCCTCTTCGGGCTTCTTAGCTTCTGGTTCAGCC
TCACTTGCC

QA 1 249 1 249
DS 

RD RS1G458JQ 249 0 0
GCATAATCACAACAAATATATAGGTAGATTAAGGACATAACAATGACAAGGAAATATTAC
ATCAACAAATATATAGGTAGATTAAAGACAACAACGTTTAGTACGCACTTATTTAAATTT
ATTAATACACAGTATATAATAAAGATCAATAATCACTTCATGAAACCTTGAGCCATCTTA
GCATAACCTCCCAAGCCACCACCAGACTCCTCTTCGGGCTTCTTAGCTTCTGGTTCAGCC
TCACTTGCC

QA 1 249 1 249
DS 

RD RS1GR24JQ 249 0 0
GCATAATCACAACAAATATATAGGTAGATTAAGGACATAACAATGACAAGGAAATATTAC
ATCAACAAATATATAGGTAGATTAAAGACAACAACGTTTAGTACGCACTTATTTAAATTT
ATTAATACACAGTATATAATAAAGATCAATAATCACTTCATGAAACCTTGAGCCATCTTA
GCATAACCTCCCAAGCCACCACCAGACTCCTCTTCGGGCTTCTTAGCTTCTGGTTCAGCC
TCACTTGCC

QA 1 249 1 249
DS 

RD RS1EV57JQ 339 0 0
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GACAAGGAAATATTACATCAACAAATATATAGGTAGATTAAAGACAACAACGTTTAGTAC
GCACTTATTTAAATTTATTAATACACAGTATATAATAAAGATCAATAATCACTTCATGAA
ACCTTGAGCCATCTTAGCATAACCTCCCAAGCCACCACCAGACTCCTCTTCGGGCTTCTT
AGCTTCTGGTTCAGCCTCACTTGCCGGAGGAGGAGCACCGGCGGAAGCCGGGGGAGGAGT
ACCGGCGGCGCCGGAGGAATGTGAGGACTCGAAGTCGTT

QA 1 339 1 339
DS 

RD RS1EV57TF 608 0 0
AACACCAAAACGTTCAGCATAATCACAACAAATATATAGGTAGATTAAGGACATAACAAT
GACAAGGAAATATTACATCAACAAATATATAGGTAGATTAAAGACAACAACGTTTAGTAC
GCACTTATTTAAATTTATTAATACACAGTATATAATAAAGATCAATAATCACTTCATGAA
ACCTTGAGCCATCTTAGCATAACCTCCCAAGCCACCACCAGACTCCTCTTCGGGCTTCTT
AGCTTCTGGTTCAGCCTCACTTGCCGGAGGAGGAGCACCGGCGGAAGCCGGGGGAGGAGT
ACCGGCGGCGCCGGAGGAATGTGAGGACTCGAAGTCGTTTAGATACTTCTCGGCCTTCTC
CAGGTACTGACCAGTACCGCTCTTCTCATCGAGCTTTCCGTATTTCTGGGCGGCATCTAA
GATATCAGCGCTGGCTCCAGCGACTTTAGCCTTGTCGAGTTTGTCTGACTCGTTACGAGC
AGCGGCTTGAGCAGCTTCGGCTACGACCTTGGCACTAGCCATGAGCTCGGAGGATGAAGC
TGGTCTGTTGGTTGTTTCGGTTCCTTCGGCGGGCTTGTTGTGGTCTGGCTCCTCTGGTTT
GGAGTCG
C

QA 1 607 1 607
DS 

RD RS1CV44TF 698 0 0
TAAACACCAAAACGTTTAGCATAATCACAACAAATATATAGGTAGATTAAGGACATAACA
ATGACAAGGAAATATTACATCAACAAATATATAGGTAGATTAAAGACAACAACGTTTAGT
ACGCACTTATTTAAATTTATTAATACACAGTATATAATAAAGATCAATAATCACTTCATG
AAACCTTGAGCCATCTTAGCATAACCTCCCAAGCCACCACCAGACTCCTCTTCGGGCTTC
TTAGCTTCTGGTTCAGCCTCACTTGCCGGAGGAGGAGCACCGGCGGAAGCCGGGGGAGGA
GTACCGGCGGCGCCGGAGGAATGTGAGGACTCGAAGTCGTTTAGATACTTCTCGGCCTTC
TCCAGGTACTGACCAGTGCCGCTCTTCTCATCGAGCTTTCCGTATTTCTGGGCGGCATCT
AAGATATCAGCGCTGGCTCCAGCGACTTTAGCCTTGTCGAGTTTGTCTGACTCGTTACGA
GCAGCGGCTTGAGCAGCTTCGGCTACGACCTTGGCACTAGCCATGAGCTCGGAGGATGAA
GCTGGTCTGTTGGTTGTTTCGGTTCCTTCGGCGGGCTTGTTGTGGTCTGGCTCCTCTGGT
TTGGAGTCGGAGAATTACTTTACCTGATCGGAGAGGAAGTTCATCTTTAGTTTCTTTTTT
CTTGGTTTGCTGAATATGATTTCTTGTGTTGGATGTCC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 6

CO CL965Contig1 679 6 4 U
GGGACAATAAACCATCTTTCAAAACACTTCAAAGCAATGGCAAAGCAAATACTCTACGCC
CTCTTTCTATTCCTCTTCTTATCTACGACGATGGATCTCACCACGGCGTCCTCCGCCGCA
GCTTCAGGAACTTCCAAACGTGCAGTAAACTTCATTCAAGCCTCTTGCAAATCCACCACC
TACCCGACCGTCTGCTTCAGTTCTCTCTCCGGCTACGCCAACTCCATCCAAACAAGCCCT
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TTCGTCTCACGCTTGGCCCGTTTCAAGGGTCTCAAGAAACGAGAGGTTCAAGCCATTAGG
GACTGCATCGAGGAGATCAGTGACACGGTTGACCGTTTGACCAAGTCCGTCCAAGAAGTG
AAGATGTGTGGCCGTGCTAAGGGGCGAGACCAGTTTTGGTTCCACATGAGCAATGCTCAG
ACTTGGACGAGCGCAGCTTTGACGAATGCAATCACTTGCTCCGATGGATTCGCGCGTAGG
ATCATGGATGGGCGGATCAAGAACTCGGTCCGGGCACGGATCGTGAATTTGGGCAGAGGA
ACCAGCAACGCTTTAGCTTTGATTAACGCTTTTGCAAAAAAATACTAGTAACTAATACAC
GTAACTTTTCTATGTTCAA


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 40 40 40 40 40 15 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 10 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RS1GA22TF U 1
AF RS1G242TF U 2
AF RS1CK53TF U 2
AF RS1CK53JQ C 254
AF RS1G242JQ C 71
AF RS1GA22JQ C 295
BS 1 569 RS1GA22TF
BS 570 641 RS1CK53TF
BS 642 642 RS1CK53JQ
BS 643 679 RS1CK53TF

RD RS1GA22TF 569 0 0
GGGACAATAAACCATCTTTCAAAACACTTCAAAGCAATGGCAAAGCAAATACTCTACGCC
CTCTTTCTATTCCTCTTCTTATCTACGACGATGGATCTCACCACGGCGTCCTCCGCCGCA
GCTTCAGGAACTTCCAAACGTGCAGTAAACTTCATTCAAGCCTCTTGCAAATCCACCACC
TACCCGACCGTCTGCTTCAGTTCTCTCTCCGGCTACGCCAACTCCATCCAAACAAGCCCT
CAACGTCTAGCTGAAACCGCACTCACTGTGACCGTTAGCCAGGCCCAGTCTACGAAAGTC
TTCGTCTCACGCTTGGCCCGTTTCAAGGGTCTCAAGAAACGAGAGGTTCAAGCCATTAGG
GACTGCATCGAGGAGATCAGTGACACGGTTGACCGTTTGACCAAGTCCGTCCAAGAAGTG
AAGATGTGTGGCCGTGCTAAGGGGCGAGACCAGTTTTGGTTCCACATGAGCAATGCTCAG
ACTTGGACGAGCGCAGCTTTGACGAATGCAATCACTTGCTCCGATGGATTCGCGCGTAGG
ATCATGGATGGGCGGATCAAGAACTCGGT

QA 1 569 1 569
DS 

RD RS1G242TF 634 0 0
GGACAATAAACCATCTTTCAAAACACTTCAAAGCAATGGCAAAGCAAATACTCTACGCCC
TCTTTCTATTCCTCTTCTTATCTACGACGATGGATCTCACCACGGCGTCCTCCGCCGCAG
CTTCAGGAACTTCCAAACGTGCAGTAAACTTCATTCAAGCCTCTTGCAAATCCACCACCT
ACCCGACCGTCTGCTTCAGTTCTCTCTCCGGCTACGCCAACTCCATCCAAACAAGCCCTC
AACGTCTAGCTGAAACCGCACTCACTGTGACCGTTAGCCAGGCCCAGTCTACGAAAGTCT
TCGTCTCACGCTTGGCCCGTTTCAAGGGTCTCAAGAAACGAGAGGTTCAAGCCATTAGGG
ACTGCATCGAGGAGATCAGTGACACGGTTGACCGTTTGACCAAGTCCGTCCAAGAAGTGA
AGATGTGTGGCCGTGCTAAGGGGCGAGACCAGTTTTGGTTCCACATGAGCAATGCTCAGA
CTTGGACGAGCGCAGCTTTGACGAATGCAATCACTTGCTCCGATGGATTCGCGCGTAGGA
TCATGGATGGGCGGATCAAGAACTCGGTCCGGGCACGGATCGTGAATTTGGGCAGAGGAA
CAAGCAACGCTTTAGCTTTGATTAACGCTTTTGC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1CK53TF 678 0 0
GGACAATAAACCATCTTTCAAAACACTTCAAAGCAATGGCAAAGCAAATACTCTACGCTC
TCTTTCTATTCCTCTTCTTATCTACGACGATGGATCTCACCACGGCGTCCTCCGCCGCAG
CTTCAGGAACTTCCAAACGTGCAGTAAACTTCATTCAAGCCTCTTGCAAATCCACCACCT
ACCCGACCGTCTGCTTCAGTTCTCTCTCCGGCTACGCCAACTCCATCCAGACAAGCCCTC
AACGTCTAGCTGAAACCGCACTCACTGTGACCGTTAGCCAGGCCCAGTCTACGAAAGTCT
TCGTCTCACGCTTGGCCCGTTTCAAGGGTCTCAAGAAACGAGAGGTTCAAGCCATTAGGG
ACTGCATCGAGGAGATCAGTGACACGGTTGACCGTTTGACCAAGTCCGTCCAAGAAGTGA
AGATGTGTGGCCGTGCTAAGGGGCGAGACCAGTTTTGGTTCCACATGAGCAATGCTCAGA
CTTGGACGAGCGCAGCTTTGACGAATGCAATCACTTGCTCCGATGGATTCGCGCGTAGGA
TCATGGATGGGCGGATCAAGAACTCGGTCCGGGCACGGATCGTGAATTTGGGCAGAGGAA
CCAGCAACGCTTTAGCTTTGATTAACGCTTTTGCAAAAAA*TACTAGTAACTAATACACG
TAACTTTTCTATGTTCAA

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1CK53JQ 424 0 0
AAACCGCACTCACTGTGACCGTTAGCCAGGCCCAGTTTACGAAAGTTTTCGTCTCACGCT
TGGCCCGTTTCAAGGGTCTCAAGAAACGAGAGGTTCAAGCCATTAGGGACTGCATCGAGG
AGATCAGTGACACGGTTGACCGTTTGACCAAGTCCGTCCAAGAAGTGAAGATGTGTGGCC
GTGTTAAGGGGCGAGACCAGTTTTGGTTCCACATGAGCAATGTTCAGACTTGGACGAGCG
CAGCTTTGACGAATGCAATCACTTGTTCCGATGGATTCGCGGGTAGGATCATGGATGGGC
GGATCAAGAACTCGGTCCGGGCACGGATCGTGAATTTGGGCAGAGGAACCAGCAACGCTT
TAGCTTTGATTAACGCTTTTGCAAAAAAATACTAGTAACTAATACACGTAACTTTTCTAT
GTTC

QA 1 424 1 424
DS 

RD RS1G242JQ 607 0 0
TCCTCTTCTTATCTACGACGATGGATCTCACCACGGCGTCCTCCGCCGCAGCTTCAGGAA
CTTCCAAACGTGCAGTAAACTTCATTCAAGCCTCTTGCAAATCCACCACCTACCCGACCG
TCTGCTTCAGTTCTCTCTCCGGCTACGCCAACTCCATCCAAACAAGCCCTCAACGTCTAG
CTGAAACCGCACTCACTGTGACCGTTAGCCAGGCCCAGTTTACGAAAGTCTTCGTCTCAC
GCTTGGCCCGTTTCAAGGGTCTCAAGAAACGAGAGGTTCAAGCCATTAGGGACTGCATCG
AGGAGATCAGTGACACGGTTGACCGTTTGACCAAGTCCGTCCAAGAAGTGAAGATGTGTG
GCCGTGCTAAGGGGCGAGACCAGTTTTGGTTCCACATGAGCAATGCTCAGACTTGGACGA
GCGCAGCTTTGACGAATGCAATCACTTGCTCCGATGGATTCGCGCGTAGGATCATGGATG
GGCGGATCAAGAACTCGGTCCGGGCACGGATCGTGAATTTGGGCAGAGGAACAAGCAACG
CTTTAGCTTTGATTAACGCTTTTGCAAAAAAATACTAGTAACTAATACACGTAACTCTTC
TATGTTC

QA 1 607 1 607
DS 

RD RS1GA22JQ 383 0 0
AAAGTTTTCGTCTCACGCTTGGCCCGTTTCAAGGGTCTCAAGAAACGAGAGGTTCAAGCC
ATTAGGGACTGCATCGAGGAGATCAGTGACACGGTTGACCGTTTGACCAAGTCCGTCCAA
GAAGTGAAGATGTGTGGCCGTGCTAAGGGGCGAGACCAGTTTTGGTTCCACATGAGCAAT
GCTCAGACTTGGACGAGCGCAGCTTTGACGAATGCAATCACTTGCTCCGATGGATTCGCG
CGTAGGATCATGGATGGGCGGATCAAGAACTCGGTCCGGGCACGGATCGTGAATTTGGGC
AGAGGAACCAGCAACGCTTTAGCTTTGATTAACGCTTTTGCAAAAAAACACTAGTAACTA
ATACACGTAACTTTTTTATGTTC

QA 1 383 1 383
DS 



AS 2 6

CO CL966Contig1 763 3 6 U
ATTAACTTCAAATGTATTAAGATGGAATCCCCACGGTACTGAGTATTAGGCAAATGTTTT
ATGATCTGTTTACCAATCGAAAAAGGAACAAAGTAAAACTCGATGGGTATCCTTTTTTCG
TTATTTTTTAAGGAGAAAACTTCTCTCATTTGCGAGCATCTACTTTCTTGGCGTCTCTTG
CTGCTTTTTCCTCTTCTCGCTTCTTGGCAGCTTCTTCTCTCTGTTGGCGAATCAGAGCCA
GACGATCCAAATCCTTTCTTGATTGTTCGGTTTTGCCTTGCTCCTGCAACTTCATGTATC
GCTCATGAGCTCGCTGCTTCTCTAGCTCCTCCCTTTCACGCCTTGAGAGTTCAGTGGTTT
TACTAGCATCAAGGTCTCTAGCTTTTAAAGTCTTTGGTTTGGCTCTGTTAGGGTTATCAA
CTTCAATCAGAGCTTCATGTCCTTTCTTCTTCACATCAGATTCATCTTCGGACTCCTCTT
CAGATTCCTCTTCAGACTCCTCTTCAACATCTTCTTCATATTCAGCTTCTTTCTGCTTGA
ATGACCGAGGACGTGCGGCGGAAGTGCCAGCAAGAATATCAGCTGCACTTGAGAATCGAC
GCTGGCCCGTAGGTTTCCCCTTGAACTTGCCTCTTCCCATCGTTTGTTTCTCTCGAGAAA
GAGATTGAGATCGAAAACTGGAGAATAATAAGAAAAGGAAATCAGGGGGTTGGATTCGTG
ACGAATCGATTCGAAAGCGAATCAAGAATTGGTTTGGAGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B743JQ U 247
AF RS1AU52JQ U 1
AF RS1AU52TF C 18
BS 1 110 RS1AU52JQ
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RD RS1B743JQ 202 0 0
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GAGCTCGCTGCTTCTCTAGCTCCTCCCTTTCACGCCTTGAAAGTTCAGTGGTTTTACTAG
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TCAAAACTTCATGTCCTTTCTT

QA 1 202 1 202
DS 

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CTTCAATCAGAGCTTCATGTCCTTTCTTCTTCACATCAGATTCATCTTCGGACTCCTCTT
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GCTGGCCCGTAG*TTTCCCCTTGAACTTGCCTCTTCCCATCGTTTGTTTCTCTCGAGAAA
GAGATTGAGATCGAAAACTGGAGAA
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DS 

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ATAAGATGG
ATCCCCACGGTACTGAGTAT*AGGCAA*TGTTTTATGATCTGTT*ACCAATCGAAAA*GG
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CATTTGCGAGCATCTACTTTCTTGGCGTCTCTTGCTGCTTTTTCCTCTTCTCGCTTCTTG
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TCCTCCCTTTCACGCCTTGAGAGTTCAGTGGTTTTACTAGCATCAAGGTCTCTAGCTTTT
AAAGTCTTTGGTTTGGCTCTGTTAGGGTTATCAACTTCAATCAGAGCTTCATGTCCTTTC
TTCTTCACATCAGATTCATCTTCGGACTCCTCTTCAGATTCCTCTTCAGACTCCTCTTCA
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TTGCCTCTTCCCATCGTTTGTTTCTCTCGAGAAAGAGATTGAGATCGAAAACTGGAGAAT
AATAAGAAAAGGAAATCAGGGGGTTGGATTCGTGACGAATCGATTCGAAAGCGAATCAAG
AATTGGTTTGGAGACCC

QA 10 746 10 746
DS 



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AATACATTTGAAGTTAATAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G360TF U 1
AF RS1B743TF U 86
AF RS1G360JQ C 290
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RD RS1G360TF 710 0 0
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AGTTTTCGATTTCAATCTCTTTCTTTTGAGAAACAAACGATGGGAAGAGGCAAGTTCAAG
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GCCGCACGTCCTCGGTCATTCAAGCAGAAAGAAGCTGAATATGAAGAAGATGTTGAAGAG
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CATGAAGCTCTGATTGAAGTTGATAACCCTAACAGAGCCAAACCAAAGACTTTAAAAGCT
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AGAAAGGATTTGGATCTTCTCGCTCTGATTCGCCAACAGAGAGAAGAAGCTGCCAAGAAG
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TCTCACCCTAAAAAATAACGAAAGAAGAATACTCATCGAGTTTTACTTTGTTCCTTTTTC
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QA 1 710 1 710
DS 

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GG
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ATTCGCCAACAGAGAGAAGAAGCTGCCAAGAAGCGAGAAGAGGAAAAAGCAGCGAGAGAC
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GCCTAATACTCAGTACCGCGGGGATTCCATCTTAATACATTTGAAGT

QA 3 649 3 649
DS 

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AGGAGCTAGAGAAGCAGCGAGCTCATGAGCGATACATGAAGTTGCGGGAGCAAGGCAAAA
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CTGCCAAGAAGCGAGAAGAGGAAAAAGCAGCGAGAGACGCCAAGAAAGTTGATGCTCGCA
AATGAGAGAGCTCTCACCCTAAAAAATAACGAAAGAAGAATACTCATCGAGTTTTACTTT
GTTCCTTTTTCGATTGGTAAACAGATCATAAAACCTTTGCCTAATACTCAGTACCGCGGG
GATTCCATCTTAATACATTTGAAGTTAATAATC

QA 1 453 1 453
DS 



AS 1 4

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AATAAGGCAAATCTGATCTTCTTATGGGCTATGCTCGTTGCAGTAGTCGCCATGGCCACG
GAGCACCATTCCTTTGAGCGTACTAAGGGCATCAATGGTCTCGACAAGCTCATCGTCCGC
GACCGTCGCGGTCGATCTTTCGAGGTTTACTTGTATGGAGGTCAAGTGACTTCTTGGAAA
AATGAGAAAGGAGAGGAATTACTATTTATGAGTACCAAGGCTATATTCCAGCCACCGACA
CCTATTCGTGGAGGGATTCCAGTATTGTTTCCGCAATACGCTAACACTGGTCCACTTCCC
TCACATGGGTTTGTCAGACAAAGGTTTTGGGAAGTTGATGCTAATCCACCTCCTATACAT
TCACATCCTTCTTCTGGTGCTCACGTTGACCTCATCCTTAAATCATCCGAAGCTGATTTG
AAGATCTGGCCTCATAAATTTATATATCGCCTGAGAGTAGCTTTGGGGCATGGTGGAGAC
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TTTCATCCCTATTTCTCTGTTTCCGATATCAGTCAAATCCAGGTGGAAGGATTGCAAAAT
TTGGATTATCTTGACCAACAAAAGAACAGAACACGTTTCACTGACCATGGCAAATTTATA
ACTTTTAATTCACAGCTTGACAGGCTTTACTTAAGGACTCCAAATACGCTCAGAATCGTG
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GCTGTGGAACCCGTTGCGGTCGAGAAACCGATCATATTGAAACCTGGACAAGAGTGGAAA
GCGATAGTCCACGTGTCTGTGGTTCCTTCTGGTTGCTCCAGGAAGTCATGCATTCCTCAT
AAATAAAAACTTTTAAAAAATGCCGTTACAGAAAATACTATACGTTACAGAATCATATGT
TGAACACCGAGTCAGGATCCACACCTGACCTTACCAGTTTATTTGTTTCGTAATTTTCGT
ATTCTTGGATCATGTTATCTACAATAATTGATATTTTCAATAATAATTTCAATTTTAGTT
CTCC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 

AF RS1D811TF U 2
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AF RS1EX34TF U 313
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GG
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CATGGGTTTGTCAGACAAAGGTTTTGGGAAGTTGATGCTAATCCACCTCCTATACATTCA
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ATTTTGACACC

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AATAAGGCAAATCTGATCTTCTTATGGGCTATGCTCGTTGCAGTAGTCGCCATGGCCACG
GAGCACCATTCCTTTGAGCGTACTAATGGCATCAATGGTCTCGACAAGCTCATCGTCCGC
GACCGTCGCGGTCGATCTTTCGAGGTTTACTTGTATGGAGGTCAAGTGACTTCTTGGAAA
AATGAGAAAGGAGAGGAATTACTATTTATGAGTACCAAGGCTATATTCCAGCCACCGACA
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TCACATGGGTTTGTCAGACAAAGGTTTTGGGAAGTTGATGCTAATCCACCTCCTATACAT
TCACATCCTTCTTCTGGTGCTCACGTTGACCTCATCCTTAAATCATCCGAAGCTGATTTG
AAGATCTGGCCTCATAAATTTATATATCGCCTGAGAGTAGCTTTGGGGCATGGTGGAGAC
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TTGGATTATCTTGACCAACAAAAGA*CAGAACACGTTTCACTGACCATGGCAAATTTATA
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GACCAC

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DS 

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ATTTATATATCGCCTGAGAGTAGCTTTGGGGCATGGTGGAGACTTGATTTTGACACCTCG
TATTAAAAACTCTGATGTAGAGCCGTTTAACTTCACATTTGGTTTTCATCCCTATTTCTC
TGTTTCCGATATCAGTCAAATCCAGGTGGAAGGATTGCAAAATTTGGATTATCTTGACCA
ACAAAAGAACAGAACACGTTTCACTGACCATGGCAAATTTATAACTTTTAATTCACAGCT
TGACAGGCTTTACTTAAGGACTCCAAATACGCTCAGAATCGTGGACCACAAGAAAAATAA
GACAATCGTGGTACGCAAGGAAGGACAAGCTGATGCAGTGGTGTGGAATCCATGGGACAA
GAAAGTGTCAGATTTGGGAGTTGAAGATTACAGAAGTTTTGTTGCTGTGGA*CCCGTTGC
GGTCGAGAAACCGATCATATTGAAACCTGGACAAGAGTGGAAAGCGATAGTCCACGTGTC
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TTCTGGTGCT

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GGTGGAGACTTGATTTTGACACCTCGTATTAAAAACTCTGATGTAGAGCCGTTTAACTTC
ACATTTGGTTTTCATCCCTATTTCTCTGTTTCCGATATCAGTCAAATCCAGGTGGAAGGA
TTGCAAAATTTGGATTATCTTGACCAACAAAAGAACAGAACACGTTTCACTGACCATGGC
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AGAATCGTGGACCACAAGAAAAATAAGACAATCGTGGTACGCAAGGAAGGACAAGCTGAT
GCAGTGGTGTGGAATCCATGGGACAAGAAAGTGTCAGATTTGGGAGTTGAAGATTACAGA
AGTTTTGTTGCTGTGGAACCCGTTGCGGTCGAGAAACCGATCATATTGAAACCTGGACAA
GAGTGGAAAGCGATAGTCCACGTGTCTGTGGTTCCTTCTGGTTGCTCCAGGAAGTCATGC
ATTCCTCATAAATAAAAACTTTTAAAAAATGCCGTTACAGAAAATACTATACGTTACAGA
ATCATATGTTGAACACCGAGTCAGGATCCACACCTGACCTTACCAGTTTATTTGTTTCGT
AATTTTCGTATTCTTGGATCATGTTATCTACAATAATTGATATTTTCAATAATAATTTCA
ATTTTAGTTCTCC

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 6

CO CL968Contig1 940 6 6 U
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ACCACCACGGCCCGGAGTTCATATCAGAACTTTTTGGCCACATTTGTGACAACGATCTTC
CCGAACAGCTACTGCTGCTCACCCCCGGCCTGGCCACCTCCTACTCTGGTACACTCTACC
TCTGGCGCCAAGCTCGCTCTCAACTACAAAGGTCCCTCTTCCCTGAGGCACTCACTGTCA
ACGACGTAGTGCCCAATACATGGACCTCCTTCCTCTGCCTGGACAATGATGATTCATGGT
TCAGTCCCCTCGCCGCTATGATGAACAAGTACTGCCAATATTGGCATGGCTCAGCTCCCC
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GATCCTCTATTTACCGGCTGGCTCAATGGACCGCTCCTATTATGGACCCCCCCGCTGACG
AGGATGCCCCACCTGTCATTGCCGAACCTGGCTACTACTACCTCAATCCCAACCCAGTCC
TCATCTTTGACGCTCGCACCTGCATTGAAGACATCTCTTCTGCACACATGTTCTCCGCTA
TGACTTTCCATCCCAATCTCATACCATACGGAGCCAACAGAGCTAACTTTCTGAAAGGAC
AGTTTTGGAATTGCCACCCCCCAAGCTACAGCGCTCCTGCCCACCAGGTCTATCCAGCTG
TATCCGCCCTTATCGCTCGTGAGTATCACAGTGAAACTAACCTTTCATCTGACAAGTGAC
TCTCTCGACACCCCCGACACCCCTCTCGCTGATGACGAAGATGTGACCGGAGTAGACGCT
TGCGCGTTCCTTCGGAATTTTTCGGTTCTTTTGTTTTGTCGTTAGCTACGACTTTTTCTT
ATTTCAATGTAAACCCTACCTATTAGCTATCTTTTAAATT


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1G614TF U 273
AF RS1BM96TF U 1
AF RS1DJ89TF U 91
AF RS1BM96JQ C 227
AF RS1G614JQ C 273
AF RS1DJ89JQ C 227
BS 1 774 RS1BM96TF
BS 775 775 RS1DJ89TF
BS 776 793 RS1BM96TF
BS 794 844 RS1DJ89TF
BS 845 845 RS1G614JQ
BS 846 940 RS1BM96JQ

RD RS1G614TF 382 0 0
G
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GCCAATATTGGCATGGCTCAGCTCCCCTCTCCTCCATCCCCGCTGATGGATCCGCTGCTG
GCTCAATGATTTGCAATGAGCTCAATGGATCCTCTATTTACCGGCTGGCTCAATGGACCG
CTCCTATTATGGACCCCCCCGCTGACGAGGATGCCCCACCTGTCATTGCCGAACCTGGCT
ACTACTACCTCAATCCCAACCCAGTCCTCATCTTTGACGCTCGCACCTGCATTGAAGACA
TCTCTTCTGCACACATGTTCTCCGCTATGACTTTCCATCCCAATCCCATACCATACGGAG
CCAACAGAGCTAACTTTCTGA

QA 2 382 2 382
DS 

RD RS1BM96TF 793 0 0
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ACCACCACGGCCCGGAGTTCATATCAGAACTTTTTGGCCACATTTGTGACAACGATCTTC
CCGAACAGCTACTGCTGCTCACCCCCGGCCTGGCCACCTCCTACTCTGGTACACTCTACC
TCTGGCGCCAAGCTCGCTCTCAACTACAAAGGTCCCTCTTCCCTGAGGCACTCACTGTCA
ACGACGTAGTGCCCAATACATGGACCTCCTTCCTCTGCCTGGACAATGATGATTCATGGT
TCAGTCCCCTCGCCGCTATGATGAACAAGTACTGCCAATATTGGCATGGCTCAGCTCCCC
TCTCCTCCATCCCCGCTGATGGATCCGCTGCTGGCTCAATGATTTGCAATGAGCTCAATG
GATCCTCTATTTACCGGCTGGCTCAATGGACCGCTCCTATTATGGACCCCCCCGCTGACG
AGGATGCCCCACCTGTCATTGCCGAACCTGGCTACTACTACCTCAATCCCAACCCAGTCC
TCATCTTTGACGCTCGCACCTGCATTGAAGACATCTCTTCTGCACACATGTTCTCCGCTA
TGACTTTCCATCCCAATCTCATACCATACGGAGCCAACAGAGCTAACTTTCTGAAAGGAC
AGTTTTGGAATTGCCACCCCCCAAGCTACAGCGCTCCTGCCCACCAGGTCTATCCAGCTG
TATCCGCCCTTATCGCTCGTGAGTATCACAGTGAAACTAACCTTTCATCTGACA*GTGAC
TCTCTCGACACCC

QA 1 793 1 793
DS 

RD RS1DJ89TF 756 0 0
TTTTTGGCCACATTTGTGACAACGATCTTCCCGAACAGCTACTGCTGCTCACCCCCGGCC
TGGCCACCTCCTACTCTGGTACACTCTACCTCTGGCGCCAAGCTCGCTCTCAACTACAAA
GGTCCCTCTTCCCTGAGGCACTCACTGTCAACGACGTAGTGCCCAATACATGGACCTCCT
TCCTCTGCCTGGACAATGATGATTCATGGTTCAGTCCCCTCGCCGCTATGATAAACAAGT
ACTGCCAATATTGGCATGGCTCAGCTCCCCTCTCCTCCATCCCCGCTGATGGATCCGCTG
CTGGCTCAATGATTTGCAATGAGCTCAATGGATCCTCTATTTACCGGCTGGCTCAATGGA
CCGCTCCTATTATGGACCCCCCCGCTGACGAGGATGCCCCACCTGTCATTGCCGAACCTG
GCTACTACTACCTCAATCCCAACCCAGTCCTCATCTTTGACGCTCGCACCTGCATTGAAG
ACATCTCTTCTGCACACATGTTCTCCGCTATGACTTTCCATCCCAATCTCATACCATACG
GAGCCAACAGAGCTAACTTTCTGAAAGGACAGTTTTGGAATTGCCACCCCCCAAGCTACA
GCGCTCCTGCCCACCAGGTCTATCCAGCTGTATCCGCCCTTATCGCTCGTGAGTATCACA
GTGAAACTAACCTTTCATCTGACAAGTGACTCTCTCGACACCCCCGACACCCCTCTCGCT
GATGACGAAGATGTGACCGGAGTAGACGCTTGCG
CG

QA 1 754 1 754
DS 

RD RS1BM96JQ 714 0 0
GGCACTCACTGTCAACGACGTAGTGCCCAATACATGGACCTCCTTCCTCTGCCTGGACAA
TGATGATTCATGGTTCAGTCCCCTCGCCGCTATGATGAACAAGTACTGCCAATATTGGCA
TGGCTCAGCTCCCCTCTCCTCCATCCCCGCTGATGGATCCGCTGCTGGCTCAATGATTTG
CAATGAGCTCAATGGATCCTCTATTTACCGGCTGGCTCAATGGACCGCTCCTATTATGGA
CCCCCCCGCTGACGAGGATGCCCCACCTGTCATTGCCGAACCTGGCTACTACTACCTCAA
TCCCAACCCAGTCCTCATCTTTGACGCTCGCACCTGCATTGAAGACATCTCTTCTGCACA
CATGTTCTCCGCTATGACTTTCCATCCCAATCTCATACCATACGGAGCCAACAGAGCTAA
CTTTCTGAAAGGACAGTTTTGGAATTGCCACCCCCCAAGCTACAGCGCTCCTGCCCACCA
GGTCTATCCAGCTGTATCCGCCCTTATCGCTCGTGAGTATCACAGTGAAACTAACCTTTC
ATCTGACAAGTGACTCTCTCGACACCCCCGACACCCCTCTCGCTGATGACGAAGATGTGA
CCGGAGTAGACGCTTGCGTGTTCCTTCGGAATTTTTCGGTTCTTTTGTTTTGTCGTTAGC
TACGACTTTTTCTTATTTCAATGTAAACCCTACCTATTAGCTATCTTTTAAATT

QA 1 714 1 714
DS 

RD RS1G614JQ 668 0 0
G
TCTGCCTGGACAATGATGATTCATGGTTCAGTCCCCTCGCCGCTATGATGAACAAGTACT
GCCAATATTGGCATGGCTCAGCTCCCCTCTCCTCCATCCCCGCTGATGGATCCGCTGCTG
GCTCAATGATTTGCAATGAGCTCAATGGATCCTCTATTTACCGGCTGGCTCAATGGACCG
CTCCTATTATGGACCCCCCCGCTGACGAGGATGCCCCACCTGTCATTGCCGAACCTGGCT
ACTACTACCTCAATCCCAACCCAGTCCTCATCTTTGACGCTCGCACCTGCATTGAAGACA
TCTCTTCTGCACACATGTTTTCCGCTATGACTTTCCATCCCAATCCCATACCATACGGAG
CCAACAGAGCTAACTTTTTGAAAGGACAGTTTTGGAATTGCCACCCCCCAAGCTACAGCG
CTCCTGCCCACCAGGTCTATCCAGCTGTATCCGCCCTTATCGCTCGTGAGTATCACAGTG
AAACTAACCTTTCATTTGACAAGTGACTCTCTCGACACCCCCGACACCCCTCTCGCTGAT
GACGAAGATGTGACCGGAGTAGACGCTTGCGCGTTCCTTCGGAATTTTTCGGTTCTTTTG
TTTTGTCGTTAGCTACGACTTTTTTTTATTTCAATGTAAACCCTACCTATTAGCTATCTT
TTAAATT

QA 2 668 2 668
DS 

RD RS1DJ89JQ 714 0 0
GGCACTCACTGTCAACGACGTAGTGCCCAATACATGGACCTCCTTCCTCTGCCTGGACAA
TGATGATTCATGGTTCAGTCCCCTCGCCGCTATGATAAACAAGTACTGCCAATATTGGCA
TGGCTCAGCTCCCCTCTCCTCCATCCCCGCTGATGGATCCGCTGCTGGCTCAATGATTTG
CAATGAGCTCAATGGATCCTCTATTTACCGGCTGGCTCAATGGACCGCTCCTATTATGGA
CCCCCCCGCTGACGAGGATGCCCCACCTGTCATTGCCGAACCTGGCTACTACTACCTCAA
TCCCAACCCAGTCCTCATCTTTGACGCTCGCACCTGCATTGAAGACATCTTTTCTGCACA
CATGTTTTCCGCTATGACTTTCCATCCCAATCTCATACCATACGGAGCCAACAGAGCTAA
CTTTTTGAAAGGACAGTTTTGGAATTGCCACCCCCCAAGCTACAGCGCTCCTGCCCACCA
GGTCTATCCAGCTGTATCCGCCCTTATCGCTCGTGAGTATCACAGTGAAACTAACCTTTC
ATCTGACAAGTGACTCTCTCGACACCCCCGACACCCCTCTCGCTGATGACGAAGATGTGA
CCGGAGTAGACGCTTGCGCGTTCCTTCGGAATTTT*CGGTTCTTTTGTTTTGTCGTTAGC
TACGACTTTTTCTTATTTCAATGTAAACCCTACCTATTAGCTATCTTTTAAATT

QA 1 714 1 714
DS 



AS 2 6

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CGATTACTTCCTCAGGGATGCTGTTGAGTAGGGTTTTATCGAGAGTTTCTCGCACCTCGA
GCTTACGCTCGTCTCTCTCCTCCTTGGCTTCTTCTCCTCAGAGGAATCAGATTGTTCCCA
TTCTTTCCAGCCAATTTCACTCCCTCGTACGCGGAACTCCCAATCAGCTTGTTGCAGCTC
CAGTGTCGCTTCTAAACCATTCATCTCAAGATCTCAATGTCTTTCAAAGGTTTGGCTTTT
TCTCCTCTTCCTCTGCTGAATCCAAGGAAAATGAGGCCACTCAAGCTTCTGAGGACGATG
TGGAGGCTATGAAACCTACAACAGATGATTTTGAGGGTTTGTCAAGGGACGATTTGGTGA
AGCTTGTGGTTGAGAAGGAAGATCTTGTCAATGTTCAGAAGGAAGAGGTGAAGGAAATGC
AAGATAAAGTTCTTCGAACTTATGCTGAGATGGAGAATCTAACGGCCAGGACTAAACGTA
ATGCTGAGAACGACAAAAAGTTCGCCATACAGAAATTTGCAACAAGCCTTCTGGATGTGG
CGGATAATCTTGGGAGAGCTTCTTCTGTTGTCAAGGAGAGTTTTTCCAAGATTGACACTT
CAAAAGATTTGGCTGGTGCTACTCCGCTGTTGAAAACCCTTTTAGAAGAGTGGAGATGAC
TGAGAACAGTTAGCTGAGGTATTTAAGAAATCTGGTTTGGTGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RS1E820TF U 1
AF RS1GW67TF U 57
BS 1 206 RS1E820TF
BS 207 207 RS1GW67TF
BS 208 522 RS1E820TF
BS 523 523 RS1GW67TF
BS 524 664 RS1E820TF
BS 665 665 RS1GW67TF
BS 666 695 RS1E820TF
BS 696 696 RS1GW67TF
BS 697 738 RS1E820TF
BS 739 739 RS1GW67TF
BS 740 764 RS1E820TF

RD RS1E820TF 764 0 0
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CGATTACTTCCTCAGGGATGCTGTTGAGTAGGGTTTTATCGAGAGTTTCTCGCACCTCGA
GCTTACGCTCGTCTCTCTCCTCCTTGGCTTCTTCTCCTCAGAGGAATCAGATTGTTCCCA
TTCTTTCCAGCCAATTTCACTCCCTCTTACGCGGAACTCCCAATCAGCTTGTTGCAGCTC
CAGTGTCGCTTCTAAACCATTCATCTCAAGATCTCAATGTCTTTCAAAGGTTTGGCTTTT
TCTCCTCTTCCTCTGCTGAATCCAAGGAAAATGAGGCCACTCAAGCTTCTGAGGACGATG
TGGAGGCTATGAAACCTACAACAGATGATTTTGAGGGTTTGTCAAGGGACGATTTGGTGA
AGCTTGTGGTTGAGAAGGAAGATCTTGTCAATGTTCAGAAGGAAGAGGTGAAGGAAATGC
AAGATAAAGTTCTTCGAACTTATGCTGAGATGGAGAATCTAATGGCCAGGACTAAACGTA
ATGCTGAGAACGACAAAAAGTTCGCCATACAGAAATTTGCAACAAGCCTTCTGGATGTGG
CGGATAATCTTGGGAGAGCTTCTTCTGTTGTCAAGGAGAGTTTTTCCAAGATTGACACTT
CAAA*GATTTGGCTGGTGCTACTCCGCTGTTGAAA*CCCTTTTAGAAGAGTGGAGATGAC
TGAGAACAGTTAGCTGAG*TATTTAAGAAATCTGGTTTGGTGAA

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1GW67TF 704 0 0
GG
GCCGATTACTTCCTCAGGGATGCTGTTGAGTAGGGTTTTATCGAGAGTTTCTCGCACCTC
GAGCTTACGCTCGTCTCTCTCCTCCTTGGCTTCTTCTCCTCAGAGGAATCAGATTGTTCC
CATTCTTTCCAGTCAATTTCACTCCCTCGTACGCGGAACTCCCAATCAGCTTGTTGCAGC
TCCAGTGTCGCTTCTAAACCATTCATCTCAAGATCTCAATGTCTTTCAAAGGTTTGGCTT
TTTCTCCTCTTCCTCTGCTGAATCCAAGGAAAATGAGGTCACTCAAGCTTCTGAGGACGA
TGTGGAGGCTATGAAACCTACAACAGATGATTTTGAGGGTTTGTCAAGGGACGATTTGGT
GAAGCTTGTGGTTGAGAAGGAAGATCTTGTCAATGTTCAGAAGGAAGAGGTGAAGGAAAT
GCAAGATAAAGTTCTTCGAACTTATGCTGAGATGGAGAATCTAACGGCCAGGACTAAACG
TAATGCTGAGAACGACAAAA*GTTCGCCATACAGAAATTTGCAACAAGCCTTCTGGATGT
GGCGGATAATCTTGGGAGAGCTTCTTCTGTTGTCAAGGAGAGTTTTTCCAAGATTGACAC
TTCAAAAGATTTGGCTGGTGCTACTCCGCTGTTGAAAACCCTTTTAGAGGAGTGGAGATG
ACTGAGAACAGTTAGCTGAGGTATTTAAGAAATCTGGTTTGG

QA 3 704 3 704
DS 



CO CL969Contig2 804 4 4 U
CGATGTTCCATTTTTTTAATTTCATGAAAATTTTGTGAAATAAAGTTACAGAACCAGGGG
CTTCCCTGGAAGTGCAGCAACGTTAAGCTACTTTTATGAGATCTTGTTCATCCAATGAAT
ATGTGAGTATGTGTGAGAGAGCTAACAAGTATAAAAGAAAACAACAACATGAAGGTGTAA
AAGTTCAAACAAAGCTCAACTCTTTGTTGTTTTTGAGTTTTTTCAAGCTTCAGACTCTTT
CTCTTGGTTCACCACAGCGCAAGTAACACCAACCTCAGCTGGTCTTATAACTCGATCAAA
CAACGAGTATCCAGACTTAAGGACATGAGCGATTGTGCCTGCTGGCTTGGAAGCATCTGG
GACTTGGAACACTGCGTTATGTCGGTTTGGATCAAACAGTTCATTTACAGGATCTTCTTT
CACCAAACCAGATTTCTTAAATACCTCAGCTAACTGTTTCTCAGTCATCTCCACTCCTTC
TAGAAGGGTTTCCAACAGCGGAGTAGCACCAGCCAAATCTTTTGAAGTGTCAATCTTGGA
AAAACTCTCCTTGACAACAGAAGAAGCTCTCCCAAGATTATCCGCCACATCCAGAAGGCT
TGTTGCAAATTTCTGTATGGCGAACTTTTTGTCGTTCTCAGCATTACGTTTAGTCCTGGC
CATTAGATTCTCCATCTCAGCATAAGTTCGAAGAACTTTATCTTGCATTTCCTTCACCTC
TTCCTTCTGAACATTGACAAGATCTTCCTTCTCAACCACAAGCTTCACCAAATCGTCCCT
TGACAAACCCTCAAAATCATCTGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1G896JQ U 1
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AF RS1GW67JQ U 31
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GGAAAAA

QA 1 536 1 536
DS 

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AG
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TCTGT

QA 3 787 3 787
DS 



AS 1 5

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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A

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QA 1 747 1 747
DS 

RD RS1GR13JQ 457 0 0
CAGAACCCGTGGCTCGTGCACAAGGCTTCTATTTCTATGACATGAAGACGGACTTCAACT
CGTGGTTTTCCTACACCTTGGTGTTTAACTCGACGGAACACAAAGGCACACTGAATATAA
TGGGTGCGGACTTGATGATGGAGCCGACAAGAGATCTATCGGTCGTTGGTGGGACTGGTG
ACTTCTTCATGGCTCGTGGTATCGCTACCTTTGTGACGGATCTGTTTCAAGGGGCTAAGT
ATTTCCGTGTTAAGATGGATATTAAACTATATGAATGTTACTAACTAATTACATGTTTTA
TTTTGAAAATTGTGTGCTGACACAGAGATAAAATGTATTACTAGTGATAAGTAAGTGGTT
TTCGTTTCTGTTTTACAGTTTATTGTATGTTTCTGCTTTTATATAATTCATGTTATCCCG
ATTGTAGAAGCCTTAATGAACAAAAGAATGTTCCCCG

QA 1 457 1 457
DS 



AS 1 5

CO CL971Contig1 916 5 11 U
TTTTTTTTTGTCCTTCTGGTTTGGGCTGTCTGAAAAATTGATGTGGAAAAGAAGAACGAT
GAAGCAGTAAGCTTTTTAGTTGCGATGATTGTCTCATCAGGTTCATGGGTTTTGTCCCCA
TCTTCTTCTTCTGTCTTTTTTAGTCGTCGCCAGAGACTACCTTTGGTGAGATCAACGGTC
GATGGTAGGAGCCAGATTGTTCCACCGGGACAAAGCCAAACGCCTAACAAAGAAGTATTA
GAGAGCGTGAGTCTGCTAAAAACGGCTGCAAAAACACGGAAAGTTGCAGCAGAGGAGATT
TTAGCTGCTTTTACTGCTATCGAGAAGGCTAAGGTTGATCCATCACCATTCCTTGAAACA
CTAGGTGGAACCGAGTCCCCTGGACGTACATGGATGCACATCTTCACTGCCGAGAAGAAA
CTGAAGAAAGGTCGTTATTTCCCTCTAACCGCTGTTCAGAGATTTGATGCTGCGGGGAAG
AGAATAGAGAATGGGGTGTATCTTGGTCCAGTAGGAGCTTTGACATTCGAAGGAAAGTTT
TCATGGAAGAACCGTATCCTAGCTTTCATCTTCGAACAGATACGCATAAAGATTGGACCT
TTGGATCCCATAGAGATCGGTTTGGGAAAGAAAGATGCAGAGTATGAGCCGAGTAACAAA
GACCCTTTCTTCATTTGGTTTTATGTCGATGAAGAAATAGCAGTTGCTCGTGGAAGAAGC
GGCGGTACAGCTTTCTGGTGTCGTTGTCGCCGCATTGCTTCATGATGATCACTCTCTTCT
TCTTCTCAAAAATACTTCCCCCTGTAAAAATCTTTGAATGTGTGAATGAATGATACAATA
TGAGTCAGCTGCAGTGTTGTGATGTAAACTAAACCCGAATGGTTTAAGGTAGTAAAAATT
CATGGGGATTCAGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B567TF U 10
AF RS1EG67TF U 1
AF RS1CA28JQ C 188
AF RS1B567JQ C 166
AF RS1BP37TF U 423
BS 1 397 RS1EG67TF
BS 398 398 RS1B567TF
BS 399 498 RS1EG67TF
BS 499 499 RS1B567TF
BS 500 692 RS1EG67TF
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BS 793 916 RS1BP37TF

RD RS1B567TF 718 0 0
GTCCTTCTGGTTTGGGCTGTCTGAAAAATTGATGTGGAAAAGAAGAACGATGAAGCAGTA
AGCTTTTTAGTTGCGATGATTGTCTCATCAGGTTCATGGGTTTTGTCCCCATCTTCTTCT
TCTGTCTTTTTTAGTCGTCGCCAGAGACTACCTTTGGTGAGATCAACGGTCGATGGTAGG
AGCCAGATTGTTCCACCGGGACAAAGCCAAACGCCTAACAAAGAAGTATTAGAGAGCGTG
AGTCTGCTAAAAACGGCTGCAAAAACACGGAAAGTTGCAGCAGAGGAGATTTTAGCTGCT
TTTACTGCTATCGAGAAGGCTAAGGTTGATCCATCACCATTCCTTGAAACACTAGGTGGA
ACCGAGTCCCCTGGACGTACATGGATGCACATCTTCACTGCCGAGAAGAAACTGAAGAAA
GGTCGTTATTTCCCTCTAACCGCTGTTCAGAGATTTGATGCTGCGGGGAAGAGAATAGAG
AATGGGGTGTATCTTGGTCCAGTAGGAGCTTTGACATTCGAAGGAAAGTTTTCATGGAAG
AACCGTATCCTAGCTTTCATCTTCGAACAGATGCGCATAAAGATTGGACCTTTGGATCCC
ATAGAGATCGGTTTGGGAAAGAAAGATGCAGAGTATGAGCCGAGTAACAAAGACCCTTTC
TTCATTTGGTTTTATGTCGATGA*GAA*TAGCAGTTGCTCGTGGAAGA
GCGCGGTACA

QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1EG67TF 792 0 0
TTTTTTTTTGTCCTTCTGGTTTGGGCTGTCTGAAAAATTGATGTGGAAAAGAAGAACGAT
GAAGCAGTAAGCTTTTTAGTTGCGATGATTGTCTCATCAGGTTCATGGGTTTTGTCCCCA
TCTTCTTCTTCTGTCTTTTTTAGTCGTCGCCAGAGACTACCTTTGGTGAGATCAACGGTC
GATGGTAGGAGCCAGATTGTTCCACCGGGACAAAGCCAAACGCCTAACAAAGAAGTATTA
GAGAGCGTGAGTCTGCTAAAAACGGCTGCAAAAACACGGAAAGTTGCAGCAGAGGAGATT
TTAGCTGCTTTTACTGCTATCGAGAAGGCTAAGGTTGATCCATCACCATTCCTTGAAACA
CTAGGTGGAACCGAGTCCCCTGGACGTACATGGATGCTCATCTTCACTGCCGAGAAGAAA
CTGAAGAAAGGTCGTTATTTCCCTCTAACCGCTGTTCAGAGATTTGATGCTGCGGGGAAG
AGAATAGAGAATGGGGTGCATCTTGGTCCAGTAGGAGCTTTGACATTCGAAGGAAAGTTT
TCATGGAAGAACCGTATCCTAGCTTTCATCTTCGAACAGATACGCATAAAGATTGGACCT
TTGGATCCCATAGAGATCGGTTTGGGAAAGAAAGATGCAGAGTATGAGCCGAGTAACAAA
GACCCTTTCTTCATTTGGTTTTATGTCGATGA*TAAATAGCAGTTGCTCGTGGAAGAAGC
GGCGGTACAGCTTTCTGGTGTCGTTGTCGC*GCATTGCTTCATGATGATCACTCTCTTCT
TCTTCTCAAAAA

QA 1 792 1 792
DS 

RD RS1CA28JQ 605 0 0
GGAGCCAGATTGTTCCACCGGGACAAAGCCAAACGCCTAACAAAGAAGTATTAGAGAGCG
TGAGTCTGCTAAAAACGGCTGCAAAAACACGGAAAGTTGCAGCAGAGGAGATTTTAGCTG
CTTTTACTGCTATCGAGAAGGCTAAGGTTGATCCATCACCATTCCTTGAAACACTAGTTG
GAACCGAGTCCCCTGGACGTACATGGATGTTCATCTTCACTGCCGAGAAGAAACTGAAGA
AAGGTCGTTATTTCCCTCTAACCGCTGTTCAGAGATTTGATGCTGCGGGGAAGAGAATAG
AGAATGGGGTGTATCTTGGTCCAGTAGGAGCTTTGACATTCGAAGGAAAGTTTTCATGGA
AGAACCGTATCCTAGCTTTCATCTTCGAACAGATACGCATAAAGATTGGACCTTTGGATC
CCATAGAGATCGGTTTGGGAAAGAAAGATGCAGAGTATGAGCCGAGTAACAAAGACCCTT
TCTTCATTTGGTTTTATGTCGATGAAGAAATAGCAGTTGCTCGTGGAAGAAGCGGCGGTA
CAGCTTTCTGGTGTCGTTGTCGCCGCATTGCTTCATGATGATCACTCTCTTCTTCTTCTC
AAAAA

QA 1 605 1 605
DS 

RD RS1B567JQ 742 0 0
GTGAGATCAACGGTCGATGGTAGGAGCCAGATTGTTCCACCGGGACAAAGCCAAACGCCT
AACAAAGAAGTATTAGAGAGCGTGAGTCTGCTAAAAACGGCTGCAAAAACACGGAAAGTT
GCAGCAGAGGAGATTTTAGCTGCTTTTACTGCTATCGAGAAGGCTAAGGTTGATCCATCA
CCATTCCTTGAAACACTAGGTGGAACCGAGTCCCCTGGACGTACATGGATGCACATCTTC
ACTGCCGAGAAGAAACTGAAGAAAGGTCGTTATTTCCCTCTAACCGCTGTTCAGAGATTT
GATGCTGCGGGGAAGAGAATAGAGAATGGGGTGTATCTTGGTCCAGTAGGAGCTTTGACA
TTCGAAGGAAAGTTTTCATGGAAGAACCGTATCCTAGCTTTCATCTTCGAACAGATGCGC
ATAAAGATTGGACCTTTGGATCCCATAGAGATCGGTTTGGGAAAGAAAGATGCAGAGTAT
GAGCCGAGTAACAAAGACCCTTTCTTCATTTGGTTTTATGTCGATGAAGAAATAGCAGTT
GCTCGTGGAAGAAGCGGCGGTACAGCTTTCTGGTGTCGTTGTCGCCGCATTGCTTCCTGA
TGATCACTCTCTTCTTCTTCTCAAAAATACTTCCCCCTGTAAAAATCTTTGAATGTGTGA
ATGAATGATACAATATGAGTCAGCTGCAGTGTTGTGATGTAAACTAAACCCGAATGGTTT
AAGGTAGTAAAAATTCATGGGG

QA 1 742 1 742
DS 

RD RS1BP37TF 494 0 0
GAAGAAAGGTCGTTATTTCCCTCTAACCGCTGTTCAGAGATTTGATGCTGCGGGGAAGAG
AATAGAGAATGGGGTGTATCTTGGTCCAGTAGGAGCTTTGACATTCGAAGGAAAGTTTTC
ATGGAAGAACCGTATCCTAGCTTTCATCTTCGAACAGATACGCATAAAGATTGGACCTTT
GGATCCCATAGAGATCGGTTTGGGAAAGAAAGATGCAGAGTATGAGCCGAGTAACAAAGA
CCCTTTCTTCATTTGGTTTTATGTCGATGAAGAAATAGCAGTTGCTCGTGGAAGAAGCGG
CGGTACAGCTTTCTGGTGTCGTTGTCGCCGCATTGCTTCATGATGATCACTCTCTTCTTC
TTCTCAAAAATACTTCCCCCTGTAAAAATCTTTGAATGTGTGAATGAATGATACAATATG
AGTCAGCTGCAGTGTTGTGATGTAAACTAAACCCGAATGGTTTAAGGTAGTAAAAATTCA
TGGGGATTCAGATT

QA 1 494 1 494
DS 



AS 1 6

CO CL972Contig1 593 6 4 U
GGATTCATATCAAAGATTAAAACATCAATAACTTATTACAATTTCTCTAATAAAAAATGT
GGACGATCAACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGCATTCATGGCCGTGTTCGGTACAG
CTCAAACGTTACCTTCGCAGCCTATACCTGGACCGGACCCAACAGATTGTATGTCATCCC
TGTATGCTATTCCCAACTGTCTCCAAGAAATTGTCCAATCGTTTGTAAACGGAGAAATCG
GGACTATTGGTCACTCTTGTTGTCATGCCTTCTTGGGTCTCAGTGCAGATTGTATTACTG
AGAGGTTTGCCTTCGCTCCCGACTTCCCTCCGACTCTAAGGGATCATTGTTCCGGACATT
TATGATAATAACAATTAATGCCATTATCCTTTCGAGTCTTCGTTTCAAGGGAGTTTATTG
TTATTATCCGACATGTTCTAGGTCATAAAGATTTGCTATCAAACAAAATTTACTGTTTCT
GCTCAAAAAACAACTTTTAACTGCCATATATATTTTGTTGTTAAAAAACTGCCATATTTC
ATGTTGATGTAAACATCTTGCGTATAACTAAATAATAATAAGGATAATTTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 30 

AF RS1H312JQB C 1
AF RS1H312TF U 1
AF RS1AH07JQ C 5
AF RS1AH07TF U 5
AF RS1FS27TF U 7
AF RS1GB06TF U 7
BS 1 6 RS1H312JQB
BS 7 377 RS1H312TF
BS 378 378 RS1AH07TF
BS 379 593 RS1H312TF

RD RS1H312JQB 593 0 0
GGATTCATATCAAAGATTAAAACATCAATAACTTATTACAATTTCTCTAATAAAAAATGT
GGACGATCAACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGCATTCATGGCCGTGTTCGGTACAG
CTCAAACGTTACCTTCGCAGCCTATACCTGGACCGGACCCAACAGATTGTATGTCATCCC
TGTATGCTATTCCCAACTGTCTCCAAGAAATTGTCCAATCGTTTGTAAACGGAGAAATCG
GGACTATTGGTCACTCTTGTTGTCATGCCTTCTTGGGTCTCAGTGCAGATTGTATTACTG
AGAGGTTTGCCTTCGCTCCCGACTTCCCTCCGACTTTAAGGGATCATTGTTCCGGACATT
TATGATAATAACAATTAGTGCCATTATCCTTTCGAGTCTTCGTTTCAAGGGAGTTTATTG
TTATTATCCGACATGTTCTAGGTCATAAAGATTTGCTATCAAACAAAATTTACTGTTTCT
GCTCAAAAAACAACTTTTAACTGCCATATATATTTTGTTGTTAAAAAACTGCCATATTTC
ATGTTGATGTAAACATCTTGCGTATAACTAAATAATAATAAGGATAATTTCAC

QA 1 593 1 593
DS 

RD RS1H312TF 593 0 0
GGATTC
ATATCAAAGATTAAAACATCAATAACTTATTACAATTTCTCTAATAAAAAATGTGGACGA
TCAACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGCATTCATGGCCGTGTTCGGTACAGCTCAAA
CGTTACCTTCGCAGCCTATACCTGGACCGGACCCAACAGATTGTATGTCATCCCTGTATG
CTATTCCCAACTGTCTCCAAGAAATTGTCCAATCGTTTGTAAACGGAGAAATCGGGACTA
TTGGTCACTCTTGTTGTCATGCCTTCTTGGGTCTCAGTGCAGATTGTATTACTGAGAGGT
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AAAACAACTTTTAACTGCCATATATATTTTGTTGTTAAAAAACTGCCATATTTCATGTTG
ATGTAAACATCTTGCGTATAACTAAATAATAATAAGGATAATTTCAC

QA 7 593 7 593
DS 

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GG
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AAAACAACTTTTAACTGCCATATATATTTTGTTGTTAAAAAACTGCCATATTTCATGTTG
ATGTAAACATCTTGCGTATAACTAAATAATAATAAGGATAATTTCAC

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DS 

RD RS1AH07TF 589 0 0
GG
ATATCAAAGATTAAAACATCAATAACTTATTACAATTTCTCTAATAAAAAATGTGGACGA
TCAACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGCATTCATGGCCGTGTTCGGTACAGCTCAAA
CGTTACCTTCGCAGCCTATACCTGGACCGGACCCAACAGATTGTATGTCATCCCTGTATG
CTATTCCCAACTGTCTCCAAGAAATTGTCCGATCGTTTGTAAACGGAGAAATCGGGACTA
TTGGTCACTCTTGTTGTCATGCCTTCTTGGGTCTCAGTGCAGATTGTATTACTGAGAGGT
TTGCCTTCGCTCCCGACTTCCCTCCGACTCTAAGGGATCATTGTTCCGGACATTTATGAT
AATAACAATTAATGCCATTATCCTTTCGAGTCTTCGTTTCAAGGGAGTTTATTGTTATTA
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AAAACAACTTTTAACTGCCATATATATTTTGTTGTTAAAAAACTGCCATATTTCATGTTG
ATGTAAACATCTTGCGTATAACTAAATAATAATAAGGATAATTTCAC

QA 3 589 3 589
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GG
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AACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGCATTCATGGCCGTGTTCGGTACAGCTCAAACG
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ATTCCCAACTGTCTCCAAGAAATTGTCCAATCGTTTGTAAACGGAGAAATCGGGACTATT
GGTCACTCTTGTTGTCATGCCTTCTTGGGTCTCAGTGCAGATTGTATTACTGAGAGGTTT
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AACAACTTTTAACTGCCATATATATTTTGTTGTTAAAAAACTGCCATATTTCATGTTGAT
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GG
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AACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGCATTCATGGCCGTGTTCAGTACAGCTCAAACG
TTACCTTCGCAGCCTATACCTGGACCGGACCCAACAGATTGTATGTCATCCCTGTATGCT
ATTCCCAACTGTCTCCAAGAAATTGTCCAATCGTTTGTAAACGGAGAAATCGGGACTATT
GGTCACTCTTGTTGTCATGCCTTCTTGGGTCTCAGTGCAGATTGTATTACTGAGAGGTTT
GCCTTCGCTCCCGACTTCCCTCCGACTCTAAGGGATCATTGTTCCGGACATTTATGATAA
TAACAATTAATGCCATTATCCTTTCGAGTCTTCGTTTCAAGGGAGTTTATTGTTATTATC
CGACATGTTCTAGGTCATAAAGATTTGCTATCAAACAAAATTTACTGTTTCTGCTCAAAA
AACAACTTTTAACTGCCATATATATTTTGTTGTTAAAAAACTGCCATATTTCATGTTGAT
GTAAACATCTTGCGTATAACTAAATAATAATAAGGATAATTTCA

QA 3 586 3 586
DS 



AS 1 6

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TTTTTTTTGTTACCGGGGTCGACCCCAAAGCCATAATGTCTTAAAACAAGGAGGCCATAT
GGAAAGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTCTCGAACTTTGTGAAGAACTCAATTTTATCTCTCC
CTCGTTACGAACAAGAAAGTGGTTTGAAAAATCAGTTGTACACTCCCATCGTTCTACGAA
CCCTTGTTGATTCTGAACTTCGTTTGCGAAGGAACCGGACTTTTGACGGACCAGCCCTTT
TTTATGCGCCGCTTGATCCTGAAAGGAAAATGAGCTTTGCTTCTCTGGACGCTTGGCGCT
CCCGTGGTTCGCGAGAAGGAAAAAGGACTCATCCTTTGTTGCATCTGGCACGAGATGATA
AAGAGAGAGCTTCGTCTATCGATGAACAGCGAATTGACGGAGCTCTTGGCATTGCTTTGT
TTTTCTCTTTTTTCCTATCAGCGAGTTCCGATCCTTTTGTTCGAAATTTCTTTGTTTGTA
CCGAACCGCTTGCAGAATTAAATCCTGTTCTACAAGATCCTATATTAGCTATACATCCTC
CTTGCATTTATGCCGGGGACGTCGCCAGTGCGGAGGGCTTTGGCTTATGTAGATCAAAAA
TGATGAATGGGATTGTGGCACTCCACTCGCCGCCAATGCGGAAGGATGCCGCCGAAAAGA
ATGGAACGCTGCTTTGCTCTGCTGGATGCGTCGGATCCCGTATAACAAGCGAGCTTTTTA
CCTTCAAATTCAAACATGTGGGCGCAAAATGCTATCCTGCTCTATTGTTACGTAGCAATA
GAAGCCCGCTCATGCTGCTTCGGCGGCGCTTTTTCGCCTTCTCTTCGTTCTGGACAGGAG
CGAGAAGCCACTCGACTAAAAGGTACTGACGTAACTCGACTAAAAGGAGAGGAGCGCTAG
TGGACACGGGGAGGGAAAGAAGACTGGAACCGTGCATCTTTGCTTAGCATGGTTCGACAA
AAGAAAGAGGTGGAAAATGGACCGAGAAAATAATGCTTTGTGAACCCAATTGCTTTGACA
AAAATATATGAAGAATCAGTGCTATTGAGGAACATTTTATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1BG29TF U 1
AF RS1BP14TF U 220
AF RS1BG29JQ C 324
AF RS1BP14JQ C 399
AF RS1AT40JQ C 422
AF RS1AT40TF U 422
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RD RS1BG29TF 654 0 0
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TTTTTTTTGTTACCGGGGTCGACCCCAAAGCCATAATGTCTTAAAACAAGGAGGCCATAT
GGAAAGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTCTCGAACTTTGTGAAGAACTCAATTTTATCTCTCC
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CCCTTGTTGATTCTGAACTTCGTTTGCGAAGGAACCGGACTTTTGGCGGACCAGCCCTTT
TTTATGCGCCGCTTGATCCTGAAAGGAAAATGAGCTTTGCTTCTCTGGACGCTTGGCGCT
CCCGTGGTTCGCGAGAAGGAAAAAGGACTCATCCTTTGTTGCATCTGGCACGAGATGATA
AAGAGAGAGCCTCGTCTATCGATGAACAGCGAATTGACGGAGCTCTTGGCAT*GCTTTGT
TTTTCTCTTTTTTCCTATCAGCGAGTTCCGATCCTTTTGTTCGAAATTTCTTTGTTTGTA
CCGAACCGCTTGCAGAATTAAATCCTGTTCTACAAGATCCTATATTAGCTATACATCCTC
CTTGCATTTATGCCGGGGACGTCGCCAGTGCGGAGGGCTTTGGCTTATGTAGAT

QA 1 654 1 654
DS 

RD RS1BP14TF 723 0 0
G
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TTTTGACGGACCAGCCCTTTTTTATGCGCCGCTTGATCCTGAAAGGAAAATGAGCTTTGC
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GCATCTGGCACGAGATGATAAAGAGAGAGCTTCGTCTATCGATGAACAGCGAATTGACGG
AGCTCTTGGCATTGCTTTGTTTTTCTCTTTTTTCTTATCAGCGAGTTCCGATCCTTTTGT
TCGAAATTTCCTTGTTTGTACCGAACCGCTTGCAGAATTAAATCCTGTTCTACAAGATCC
TATATTAGCTATACATCCTCCTTGCATTTATGCCGGGGACGTCGCCAGTGCGGAGGGCTT
TGGCTTATGTAGATCAAAAATGTTGAATGGGATCGTGGCACTCCACTCGCCGCCAATGCG
GAAGGATGCCGCCGAAAAGAATGGAACGCTGCTTCGCTCTGCTGGATGCGTCGGATCCCG
TATAACAAGCGAGCTTTTTACCTTCAAATTCAAACATGTGGGCGCAAAATGCTATCCTGC
TCTATTGTTACGTAGCAATAGAAGCCCGCTCATGCTGCTTCGGCGGCGCTTTTTCGCCTT
CTCTTCGTTCTGGACAGGAGCGAGAAGCCACTCGACTAAAAG*TACTGACGTAACTCGAC
TA

QA 2 723 2 723
DS 

RD RS1BG29JQ 795 0 0
AGGAAAATGAGCTTTGCTTCTCTGGACGCTTGGCGCTCCCGTGGTTCGCGAGAAGGAAAA
AGGACTCATCCTTTGTTGCATCTGGCACGAGATGATAAAGAGAGAGCCTCGTCTATCGAT
GAACAGCGAATTGACGGAGCTCTTGGCAT*GCTTTGTTTTTCTCTTTTTTCCTATCAGCG
AGTTCCGATCCTTTTGTTCGAAATTTCTTTGTTTGTACCGAACCGCTTGCAGAATTAAAT
CCTGTTCTACAAGATCCTATATTAGCTATACATCCTCCTTGCATTTATGCCGGGGACGTC
GCCAGTGCGGAGGGCTTTGGCTTATGTAGATCAAAAATGATGAATGGGATTGTGGCACTC
CACTCGCCGCCAATGCGGAAGGATGCCGCCGAAAAGAATGGAACGCTGCTTTGCTCTGCT
GGATGCGTCGGATCCCGTATAACAAGCGAGCTTTTTACCTTCAAATTCAAACATGTGGGC
GCAAAATGCTATCCTGCTCTATTGTTACGTAGCAATAGAAGCCCGCTCATGCTGCTTCGG
CGGCGCTTTTTCGCCTTCTCTTCGTTCTGGACAGGAGCGAGAAGCCACTCGACTAAAAGG
TACTGACGTAACTCGACTAAAAGGAGAGGAGCGCTAGTGGACACGGGGAGGGAAAGAAGA
CTGGAACCGTGCATCTTTGCTTAGCATGGTTCGACAAAAGAAAGAGGTGGAAAATGGACC
GAGAAAATAATGCTTTGTGAACCCAATTGCTTTGACAAAAATATATGAAGAATCAGTGCT
ATTGAG
GAACATTTT

QA 1 786 1 786
DS 

RD RS1BP14JQ 724 0 0
TTGCATCTGGCACGAGATGATAAAGAGAGAGCTTCGTCTATCGATGAACAGCGAATTGAC
GGAGCTCTTGGCATTGCTTTGTTTTTCTCTTTTTTCTTATCAGCGAGTTCCGATCCTTTT
GTTCGAAATTTCCTTGTTTGTACCGAACCGCTTGCAGAATTAAATCCTGTTCTACAAGAT
CCTATATTAGCTATACATCCTCCTTGCATTTATGCCGGGGACGTCGCCAGTGCGGAGGGC
TTTGGCTTATGTAGATCAAAAATGTTGAATGGGATCGTGGCACTCCACTCGCCGCCAATG
CGGAAGGATGCCGCCGAAAAGAATGGAACGCTGCTTCGCTCTGCTGGATGCGTCGGATCC
CGTATAACAAGCGAGCTTTTTACCTTCAAATTCAAACATGTGGGCGCAAAATGCTATCCT
GCTCTATTGTTACGTAGCAATAGAAGCCCGCTCATGCTGCTTCGGCGGCGCTTTTTCGCC
TTCTCTTCGTTCTGGACAGGAGCGAGAAGCCACTCGACTAAAAGGTACTGACGTAACTCG
ACTAAAAGGAGAGGAGCGCTAGTGGACACGGGGAGGGAAAGAAGACTGGAACCGTGCATC
TTTGCTTAGCATGGTTCGACAAAAGAAAGAGGTGGAAAATGGACCGAGAAAATAATGCTT
TGTGAACCCAATTGCTTTGACAAAAATATATGAAGAATCAGTGCTATTGAG
GAACATTTTATAG

QA 1 711 1 711
DS 

RD RS1AT40JQ 701 0 0
G
GAGAGAGCTTCGTCTATCGATGAACAGCGAATTGACGGAGCTCTTGGCATTGCTTTGTTT
TTCTCTTTTTTCCTATCAGCGAGTTCCGATCCTTTTGTTCGAAATTTCTTTGTTTGTACC
GAACCGCTTGCAGAATTAAATCCTGTTCTACAAGATCCTATATTAGCTATACATCCTCCT
TGCATTTATGCCGGGGACGTCGCCAGTGCGGAGGGCTTTGGCTTATGTAGATCAAAAATG
ATGAATGGGATTGTGGCACTCCACTCGCCGCCAATGCGGAAGGATGCCGCCGAAAAGAAT
GGAACGCTGCTTTGCTCTGCTGGATGCGTCGGATCCCGTATAACAAGCGATCTTTTTGCC
TTCAAATTCAAACATGTGGGCGCAAAATGCTATCCTGCTCTATTGTTACGTAGCAATAGA
AGCCCGCTCATGCTGCTTCGGCGGCGCTTTTTCGCCTTCTTTTCGTTCTGGACAGGAGCG
AGAAGCCACTCGACTAAAAGGTACTGACGTAACTCGACTAAAAGGAGAGGAGCGCTAGTG
GACACGGGGAGGGAAAGAAGACTGGAACCGTGCATCTTTGCTTAGCATGGTTCGACAAAA
GAAAGAGGTGGAAAATGGACCGAGAAAATAATGCTTTGTGAACCCAATTGCTTTGACAAA
AATATATGAAGAATCAGTGCTATTGAGGAACATTTTATAG

QA 2 701 2 701
DS 

RD RS1AT40TF 699 0 0
G
GAGAGAGCTTCGTCTATCGATGAACAGCGAATTGACGGAGCTCTTGGCATTGCTTTGTTT
TTCTCTTTTTTCCTATCAGCGAGTTCCGATCCTTTTGTTCGAAATTTCTTTGTTTGTACC
GAACCGCTTGCAGAATTAAATCCTGTTCTACAAGATCCTATATTAGCTATACATCCTCCT
TGCATTTATGCCGGGGACGTCGCCAGTGCGGAGGGCTTTGGCTTATGTAGATCAAAAATG
ATGAATGGGATTGTGGCACTCCACTCGCCGCCAATGCGGAAGGATGCCGCCGAAAAGAAT
GGAACGCTGCTTTGCTCTGCTGGATGCGTCGGATCCCGTATAACAAGCGATCTTTTTGCC
TTCAAATTCAAACATGTGGGCGCAAAATGCTATCCTGCTCTATTGTTACGTAGCAATAGA
AGCCCGCTCATGCTGCTTCGGCGGCGCTTTTTCGCCTTCTCTTCGTTCTGGACAGGAGCG
AGAAGCCACTCGACTAAAAGGTACTGACGTAACTCGACTAAAAGGAGAGGAGCGCTAGTG
GACACGGGGAGGGAAAGAAGACTGGAACCGTGCATCTTTGCTTAGCATGGTTCGACAAAA
GAAAGAGGTGGAAAATGGACCGAGAAA*TAATGCTTTGTGA*CCCAATTGCTTTGACAAA
A*TATATGAAGA*TCAGTGCTATTGAG
ACATTTTATAG

QA 2 688 2 688
DS 



AS 2 5

CO CL974Contig1 503 2 4 U
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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G
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 4

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TAGCCCAATCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BJ24JQ U 14
AF RS1GA93JQ U 1
AF RS1GA93TF C 367
AF RS1BJ24TF C 380
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ACAGAGGACGGTAAGACCATCGGTACGCTTGACGTGGAAGACGTACCGATCCTGAGAGTA
GGACACGTGGCTATCCACGTATTCTTCACCCGGCAGCTTCTCCAAAATCTGCTTCGCGAT
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CCGACTTGCAAAATCAAAGAGTGTCTCCCTCCTC
CC

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TAAGCTTGAGCAGAGTGAATGGCACGGCCGTAACTTCTCACAAATCTCTGATGTATCTCT
TCCAGAAACCCAAACGGAATACTCCTTCCGGCGGTTTCATCGGCCATACAGAGGACGGTA
AGACCATCGGTACGCTTGACGTGGAAGACGTACCAATCCTGAGAGTAGGACACGTGGCTA
TCCACGTCTTCTTCACCCGGCAGCTTCTCCAAAATCTGCTTCGCGATTGAGCTCGCGTTG
GTGGATGTTGCGCTGAACTCCGATAACACCACCGATCCACGCGCCACCAACGCATATAAG
ATCGCCATCTACTCCTCCGACTCGCAAAATCTCAGAAGGGTTCAACACCGACTTGCAAAA
TCAAAGAGTGTCTCCCTCCTCTCCTTGGTAATCAATTAATAATGATTTTAGAGATGGTAA
AGTCTTATCTGAAGCCCGCTTTACAGTGACCACTTTTTGAATTTTGAATATTTTTAGGCA
CAACCAACATATCTGGCCTCTTTTTGAACCTCTTGGGCGTTTAGCCCAATCC

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 6

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BQ
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40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AX29TF U 19
AF RS1DS53JQ C 1
AF RS1DS53TF U 1
AF RS1C795JQ C 6
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BS 1 7 RS1DS53JQ
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G
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TCTAATATGTTTTCATTTGTAACTTAAGAAAAC

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DS 

RD RS1DS53JQ 450 0 0
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AAAATCGGTGGGAAAAAATGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTGTGTTTGAATAA
ATATTTGGCATAATATGTTGCGTAATAACTCTTTTAACCTTGACTTTTTCCTGCTTCTAT
GTGTT*GATTGTGTGATTGTTTAATATGTTTTCATTTGTAACTTAAGAAAACAAAAAAAA
ATATATTGACTTTTGTGATTGTTA
AGATTT

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DS 

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GCTGTGGGGACAGCTGCAGCTGTTAATTGTGATGTAAATCACATGTACGCAGGAAAATCG
GTGGGAAAAAATGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTGTGTTTGAATAAATATTTG
GCATAATATGTTGCGTAATAACTCTCTTAACCTTGACTTTTTCCTGCTTCTATGTGTT*G
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GACTTTTGTGATTGTTA
AGATTT

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DS 

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GG
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GCTGTGGGGACAGCTGCAGCTGTTAATTGTGATGTAAATCACATGTACGCAGGAAAATCG
GTGGGAAAAAATGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTGTGTTTGAATAAATATTTG
GCATAATATGTTGCGTAATAACTCTCTTAACCTTGACTTTTTCCTGCTTCTATGTGTT*G
ATTGTGTGATTGTTTAATATGTTTTCATTTGTAACTTAAGAAAACAAAAAAAAATATATT
GACTTTTGTGATTG
CC

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DS 

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TGTATTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTGTGTTTGAATAAATATTTGGCATAATATGT
TGTGTAATAACTCTCTTAACCTTAACTTTTTCCTGCTTCTATGTGTTTGATTGTGTGATT
GTCTAATATGCTTTCATTTGTAACTTAAGAAAACAAAAAAAAATATATTGACTTTTGTGA
TTGTTATTATCTATGTCTCCTCTCTCCATATAGGGTTAGTCAGCTTAATGACTATGATCC
ATGAACAATTATTTCTTTGGTATATT

QA 1 506 1 506
DS 

RD RS1CH30TF 506 0 0
AATCAAAAAGAAGAAAAGAAAACAAACTACAACTTTAAATTAAAGGGAAGAGAAGCAATG
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AAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCAGCTGCGGATCAAACTGTAGCTGTGGGGAC
AGCTGCAGCTGTTAATTGTGGTGTAAATCACATGTATCCAGGAAAACCGGTGGGAAAAAA
TGTATTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTGTGTTTGAATAAATATTTGGCATAATATGT
TGTGTAATAACTCTCTTAACCTTAACTTTTTCCTGCTTCTATGTGTTTGATTGTGTGATT
GTCTAATATGCTTTCATTTGTAACTTAAGAAAACAAAAAAAAATATATTGACTTTTGTGA
TTGTTATTATCTATGTCTCCTCTCTCCATATAGGGTTAGTCAGCTTAATGACTATGATCC
ATGAACAATTATTTCTTTGGTATATT

QA 1 506 1 506
DS 



AS 1 3

CO CL977Contig1 1280 3 23 U
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ATGATTAAACATTAGATACATCAAGATCCCAAAACCAAGTATCGAAAAAAACATGCTTAT
ACAAAAATAAACAACGATGAGAAAACTTACCAAAGACAAGCACGCACGTTCGAATTTTTT
TAAAAGACACACACATCACACTCACACACCCCCTTTCTAAACATTTGGTATTATATGTCA
AGGAGATGCATATTACTGAGAGAGAAAGAGAGAGAGCCAGGGAGGGAGATAGAGTCAGAG
GCTAAACTTAGGGTTCTGAGAGACAAATTTGTTCTTACTACTTGTCTTTTGCATCTGTCT
TAATGGTCTTCTCTTTCTCTTCTTCAACATCTTCCTCCTCGTCATAGTATCGTTCCTCTT
CATCCTCGTCACTGCCCATGTCATGGTCGAAATATTCTTCATAGAACTGATCGTCTGTGT
CATCATCCTGACCGTTCTCCAGCCTGTTTCTGGGAATTTGTCTGATTAACCTCTCTTGGA
TGCTGTCTCTTATTGCAGTCCCCATCTTATGGCAACCTTCTTCAAATATTTCCAGAAATC
CAGCGACCCACCGATCTGCATTCTCTACCCACTCGTTGCGCAGCATTTTTACGGTTTGAA
TCTTTTCTCCCACTTTTTCTTGCTGTTCTTTGACTCTCTCCTGGAGTTTCTTTAGCCTCA
TATTAACTCTAAGTCTCTTTTCCTTGACAAAGCTAACTCCAAGATCTTCCCCTGGAATAA
CCTCTATCCAGGTTACGCATGACATACTGGTTGTAATCTTTCACTATTCTCACAATAATG
TCCGAAGTTGATATCCCTTCAGTCCGCATTGTTTCCTTAAACCCCCCAACTTTCTTAACA
AATTCATAGACATCCTTTCCTGCTCCGCTGGTGTCAGCATACGGAAGGGAATCATGGGCA
ACATAGTCAATGCGGTGGTTATCAAGAAACTCTTGGTTGATCACCCACGGTGCATCCGGA
ATAACTTCATCCACCCACTTGCAATGACGAAGAGATTCATAACGCTCTTCAGCAGTCATA
ACAGTCCTTCCCTTGTACTTATGAGTAGTCTCATCGTTGCAACATCCAACGAGAAGGTAA
GTGTTTGGAAACGATTTTTTGGCTTGTTCGAGAGGTCGAGCGTGGCCAAAGTGGAAAAGA
TCGTAGATCCCATCGGCGTAGACGCGGACGGGACGATCAGTCGGAGGAGAACTCTGGACT
GCGGACTCTGCGACGGCGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DM81JQ U 1
AF RS1BW43JQ U 67
AF RS1BW43TF C 721
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BS 127 130 RS1DM81JQ
BS 131 133 RS1BW43JQ
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BS 147 229 RS1DM81JQ
BS 230 230 RS1BW43JQ
BS 231 238 RS1DM81JQ
BS 239 239 RS1BW43JQ
BS 240 367 RS1DM81JQ
BS 368 368 RS1BW43JQ
BS 369 481 RS1DM81JQ
BS 482 482 RS1BW43JQ
BS 483 503 RS1DM81JQ
BS 504 504 RS1BW43JQ
BS 505 725 RS1DM81JQ
BS 726 771 RS1BW43JQ
BS 772 772 RS1BW43TF
BS 773 819 RS1BW43JQ
BS 820 1280 RS1BW43TF

RD RS1DM81JQ 725 0 0
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ACAAACATAA***ACGATGAGACAATTTACCAAAGACAAGCACGCACGTTCGAATTTTTT
TAAAAGACACACACATCACACTCACACACCCCCTTTCTAAACATTTGGTCTTATATGTTA
AGGAGATGCATATTACTGAGAGAGAAAGAGAGAGAGCCAGGGAGGGAGATAGAGTCAGAG
GCTAAACTTAGGGTTCTGAGAGACAAATTTGTTCTTACTACTTGTCTTTTGCATCTGTCT
TAATGGTTTTCTCTTTCTCTTCTTCAACATCTTCCTCCTCGTCATAGTATCGTTCCTCTT
CATCCTCGTCACTGCCCATGTCATGGTCGAAATATTCTTCATAGAACTGATCGTCTGTGT
CGTCATCCTGACCGTTCTCCAGCTTGTTTCTGGGAATTTGTCTGATTAACCTCTCTTGGA
TGCTGTCTCTTATTGCAGTCCCCATCTTATGGCAACCTTCTTCAAATATTTCCAGAAATC
CAGCGACCCACCGATCTGCATTCTCTACCCACTCGTTGCGCAGCATTTTTACGGTTTGAA
TCTTTTCTCCCACTTTTTCTTGCTGTTCTTTGACTCTCTCCTGGAGTTTCTTTAGCCTCA
TATTA

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1BW43JQ 753 0 0
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ATAAACAACGATGAGAAAACTTACCAAAGACAAGCACGCACGTTCGATTTTTTTTAAAAG
ACACACACATCACACTCACACACCCCCTTTCTAAACATTTGGTATTATATGTCAAGGAGA
TGCATATTACTGAGAGAGAAAGAGAGAGAGCCAGGGAGGGAGATAGAGTCGGAGGCTAAA
CTTAGGGTTCTGAGAGACAAATTTGTTCTTACTACTTGTCTTTTGCATCTGTCTTAATGG
TCTTCTCTTTCTCTTCTTCAACATCTTCCTCCTCGTCATAGTATCGTTCCTCTTCATCCT
CGTCACTGCCCATGTCATGGTCGAAATATTCTTCATAGAACTGATCGTCTGTGTCATCAT
CCTGACCGTTCTCCAGCCTGTTTCTGGGAATTTGTCTGATTAACCTCTCTTGGATGCTGT
CTCTTATTGCAGTCCCCATCTTATGGCAACCTTCTTCAAATATTTCCAGAAATCCAGCGA
CCCACCGATCTGCATTCTCTACCCACTCGTTGCGCAGCATTTTTACGGTTTGAATCTTTT
CTCCCACTTTTTCTTGCTGTTCTTTGACTCTCTCCTGGAGTTTCTTTAGCCTCATATTAA
CTCTAAGTCTCTTTTCCTTGACAAAGCTAACTCCAAGATCTTCCC*TGGAATAACCTCTA
TCCAGGTTACGCATGACATACTGGTTGTAATCT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1BW43TF 560 0 0
TATTAACTCTAAGTCTCTTTTCCTTGACAAAGCTAACTCCAAGATCTTCCCCTGGAATAA
CCTCTATCCAGGTTACGCATGACATACTGGTTGTAATCTTTCACTATTCTCACAATAATG
TCCGAAGTTGATATCCCTTCAGTCCGCATTGTTTCCTTAAACCCCCCAACTTTCTTAACA
AATTCATAGACATCCTTTCCTGCTCCGCTGGTGTCAGCATACGGAAGGGAATCATGGGCA
ACATAGTCAATGCGGTGGTTATCAAGAAACTCTTGGTTGATCACCCACGGTGCATCCGGA
ATAACTTCATCCACCCACTTGCAATGACGAAGAGATTCATAACGCTCTTCAGCAGTCATA
ACAGTCCTTCCCTTGTACTTATGAGTAGTCTCATCGTTGCAACATCCAACGAGAAGGTAA
GTGTTTGGAAACGATTTTTTGGCTTGTTCGAGAGGTCGAGCGTGGCCAAAGTGGAAAAGA
TCGTAGATCCCATCGGCGTAGACGCGGACGGGACGATCAGTCGGAGGAGAACTCTGGACT
GCGGACTCTGCGACGGCGGT

QA 1 560 1 560
DS 



AS 1 6

CO CL978Contig1 740 6 15 U
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AGGGATATCAAGGTTCAGAAGCTCGTCCTTAACATCTCTGTTGGTGAGAGTGGTGATCGT
CTCACCCGTGCCTCCAAGGTGTTGGAACAGCTCAGTGGTCAAACCCCTGTCTTCTCCAAG
GCAAGGTACACTGTGAGGTCGTTCGGTATTAGGCGTAACGAAAAGATTGCGTGCTACGTC
ACCGTGAGAGGAGACAAGGCAATGCAGCTTCTTGAGAGTGGTTTGAAAGTGAAGGAGTAC
GAGCTTTTGAGGAGGAACTTCAGTGACACTGGCTGTTTTGGATTCGGTATCCAGGAGCAC
ATTGATCTCGGAATCAAGTACGATCCTTCTACGGGTATCTATGGAATGGACTTCTATGTT
GTTCTTGAGCGTCCTGGATACCGTGTTGCACGTCGCCGTAGGTGCAAGACTCGCGTTGGG
ATTCAACATAGAGTTACAAAGGATGATGCCATGAAGTGGTTCCAAGTTAAGTATGAAGGT
GTTATCCTCAACAAGTCTCAGAACATCACTGGTTGAAGAGTTTTGTTTTGTTTTGTCGTG
TTTTGGCTCTGTTTCAAGTTGTTATAATTTGCGATTCTGGATGATAAGGCTTTCTTGTTG
TGGTAGAATCCTTTTAAGTACTCTCGAGATATGAACAATTTTTGGAGGTTATCGTTTTCA
ATTTTAGAACTCTTTATCCG


BQ
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1F174TF U 1
AF RS1H589JQB C 1
AF RS1H589TF U 1
AF RS1F174JQ C 172
AF RS1CR27JQ C 27
AF RS1CR27TF U 88
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GTTCTTGAGCGTCCTGGATACCGTGTTGCACGTCGCCG

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AGGGATATCAAGGTTCAGAAGCTCGTCCTTAACATCTCTGTTGGTGAGAGTGGTGATCGT
CTCACCCGTGCCTCCAAGGTGTTGGAACAGCTCAGTGGTCAAACCCCTGTCTTCTCCAAG
GCAAGGCACACTGTGAGGTCGTTCGGTATTAGGCGTAACGAAAAGATTGCGTGCTACGTC
ACCGTGAGGGGAGACAAGGCAATGCAGCTTCTTGAGAGTGGTTTGAAAGTGAAGGAGTAC
GAGCTTTTGAGGAGGAACTTCAGTGACACTGGCTGTTTTGGATTCGGTATCCAGGAGCAC
ATTGATCTCGGAATCAAGTACGATCCTTCTACGGGTATCTATGGAATGGACCTCTATGTT
GTTCTTGAGCGTCCTGGATACCGTGTTGCACGTCGCCGTAGGTGCAAGACCCGCGTTGGG
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GTTATCCTCAACAAGTCTCAGAACATCACTGGTTGAAGAGTTTTGTTTTGTTTTGTCGTG
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TGGTAGAATCCTTTTAAGTA
GC

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AGGGATATCAAGGTTCAGAAGCTCGTCCTTAACATCTCTGTTGGTGAGAGTGGTGATCGT
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GCAAGGCACACTGTGAGGTCGTTCGGTATTAGGCGTAACGAAAAGATTGCGTGCTACGTC
ACCGTGAGGGGAGACAAGGCAATGCAGCTTCTTGAGAGTGGTTTGAAAGTGAAGGAGTAC
GAGCTTTTGAGGAGGAACTTCAGTGACACTGGCTGTTTTGGATTCGGTATCCAGGAGCAC
ATTGATCTCGGAATCAAGTACGATCCTTCTACGGGTATCTATGGAATGGACCTCTATGTT
GTTCTTGAGCGTCCTGGATACCGTGTTGCACGTCGCCGTAGGTGCAAGACCCGCGTTGGG
ATTCAACATAGAGTTACAAAGGATGATGCCATGAAGTGGTTCCAAGTTAAGTATGAAGGT
GTTATCCTCAACAAGTCTCAGAACATCACTGGTTGAAGAGTTTTGTTTTGTTTTGTCGTG
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TGGTAGA*TCCTTTTAAGTA
GC

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DS 

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TTT
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GAGCACATTGATCTCGGAATCAAGTACGATCCTTTTACGGGTATCTATGGAATGGACTTC
TATGTTGTTCTTGAGCGTCCTGGATACCGTGTTGCACGTCGCCGTAGGTGCAAGACTCGC
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GAAGGTGTTATCCTCAACAAGTCTCAGAACATCACTGGTTGAAGAGTTTTGTTTTGTTTT
GTCGTGTTTTGGCTCTGTTTCAAGTTGTTATAATTTGCGATTCTGGATGATAAGGCTTTC
TTGTTGTGGTAGAATCCTTTTAAGTACTCTCGAGATATGAACAATTTTTGGAGGTTATCG
TTTTC

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DS 

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CACTGGCTGTTTTGGATTCGGTATCCAGGAGCACATTGATCTCGGAATCAAGTACGATCC
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TGCACGTCGCCGTAGGTGCAAGACTCGCGTTGGGATTCAACATAGAGTTACAAAGGATGA
TGCCATGAAGTGGTTCCAAGTTAAGTATGAAGGTGTTATCCTCAACAAGTCTCAGAACAT
CACTGGTTGAAGAGTTTTGTTTTGTTTTGTCGTGTTTTGGCTCTGTTTCAAGTTGTTATA
ATTTGCGATTCTGGATGATAAGGCTTTCTTGTTGTGGTAGAATCCTTTTAAGTACTCTCG
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TCTACGGGTATCTATGGAATGGACTTCTATGTTGTTCTTGAGCGTCCTGGATACCGTGTT
GCACGTCGCCGTAGGTGCAAGACTCGCGTTGGGATTCAACATAGAGTTACAAAGGATGAT
GCCATGAAGTGGTTCCAAGTTAAGTATGAAGGTGTTATCCTCAACAAGTCTCAGAACATC
ACTGGTTGAAGAGTTTTGTTTTGTTTTGTCGTGTTTTGGCTCTGTTTCAAGTTGTTATAA
TTTGCGATTCTGGATGATAAGGCTTTCTTGTTGTGGTAGAATCCTTTTAAGTACTCTCGA
GATATGAACAATTTTTGGAGGTTATCGTTTTCAATTTTAGAACTCTTTATCCG

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DS 



AS 1 6

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GCGATCGTTTCTCGGTTTTTCGAGAGATTAGATCGGTTTGCGCGTTATGCCTAAACAGTC
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ATGATAAAATTTTCTAAGTCGGACATACCTTAGTCTCATTGATTACTCGAGATTGCCTCA
TGTCCGTTCCTCTTTGTCTTCTAACGTTTTATTGTCAAAGGTCTTCGCCTAAGTTCATAT
CCTCGTTTCCTCGTACTGCTGGTTAAATCGACCATGTACCCGAAGGAATAGTGCAGAATC
GTTGAAGCAAAGGGAGGAGAAGTAGGCGAAACTCGAAGAAGGCTAAGGTGGGCGGACAAG
CGAAAATGATTGGCAAGACGTCACTTGAGTGAGACTTGATATTTCGTCAAGCTATGAGTG
AACTGGTCAGGTCAAGAAGCTTATGATATTGTTTTTCTTTACGAATGATATTTCGTAAAA
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AGAAACTGTTTCGTAAAATGTTGTCGAGTTTAGTCGTGCAGAAGCTGTCTCGTGAAGTAT
TGTCTAGGATTATTTTACGAAAGGTGCAAAGTATTGGATTGGACTATCGTCGGAATAGTT
TTGCGAGGATTTGCCGTGCTTGACGAATGTTGTGTCGCCCGATAACCAGCGCAGTACGGG
TGCGCTAGTCGTCCGGCGCCTAGAGGCAGCACGGGGGCTAGCCAACACTTGGATGTCGAG
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CCGGTACCGTCGACT


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C312JQ U 3
AF RS1A371TR U 1
AF RS1A371JQ U 3
AF RS1A371TV C 360
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GATAAAATTTTCTAAGTCGGACATACCTTAGTCTCATTGATTACTCGAGATTGCCTCATG
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TTGCCGAGCTTTTACTTT

QA 1 678 1 678
DS 

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TTGGCGAAAGTTGCTTCGGGTTACTCATGAAGTTTTACCGAAGGTTATTTCGTTAATTTT
GTAGCTCTCCGTCGTGCCATTAGTCTCACGGAAGCGGAAAGAGTATGCCAAGGATGCGCG
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CCTAGGTCCTAAGTTCCCTAAATTTTACGGCGGTTTACAAGACGTTCCCATTCCTTTCCT
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AGAAACTGTTTCGTAAAATGTTGTCGAGTTT

QA 1 751 1 751
DS 

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AGCTCTCCGTCGTGCCATTAGTCTCACGGAAGCGGAAAGAGTATGCCAAGGATGCGCGGC
GATCGTTTCTCGGTTTTTCGAGAGATTAGATCGGTTTGCGCGTTATGCCTAAACAGTCAA
GGAACAATAGAACGAAACTGGAAGAAAATGCCTAAGACTTGGCTAGCTAGACTTTCCACC
TAGGTCCTAAGTTCCCTAAATTTTACGGCGGTTTACAAGACGTTCCCATTCCTTTCCTAT
GATAAAATTTTCTAAGTCGGACATACCTTAGTCTCATTGATTACTCGAGATTGCCTCATG
TCCGTTCCTCTTTGTCTTCTAACGTTTTATTGTCAAAGGTCTTCGCCTAAGTTCATATCC
TCGTTTCCTCGTACTGCTGGTTAAATCGACCATGTACCCGAAGGAATAGTGCAGAATCGT
TGAAGCAAAGGGAGGAGAAGTAGGCGAAACTCGAAGAAGGCTAAGGTGGGCGGACAAGCG
AAAATGATTGGCAAGACGTCACTTGAGTGAGACTTGATATTTCGTCAAGCTATGAGTGAA
CTGGTCAGGTCAAGAAGCTTATGATATTGTTTTTCTTTACGAATGATATTTCGTAAAATA
TTGCCGAGCTTTTACTTTACGAGAGTTTTTCAACAAAATGTTGTCGAGTTAATTTTACAG
AAACTGTTT

QA 1 729 1 729
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TCCTCGTTTCCTCGTACTGCTGGTTAAATCGACCATGTACCCGAAGGAATAGTGCAGAAT
CGTTGAAGCAAAGGGAGGAGAAGTAGGCGAAACTCGAAGAAGGCTAAGGTGGGCGGACAA
GCGAAAATGATTGGCAAGACGTCACTTGAGTGAGACTTGATATTTCGTCAAGCTATGAGT
GAACTGGTCAGGTCAAGAAGCTTATGATATTGTTTTTCTTTACGAATGATATTTCGTAAA
ATATTGCCGAGCTTTTACTTTACGAGAGTTTTTCAACAAAATGTTGTCGAGTTAATTTTA
CAGAAACTGTTTCGTAAAATGTTGTCGAGTTTAGTCGTGCAGAAGCTGTCTCGTGAAGTA
TTGTCTAGGATTATTTTACGAAAGGTGCAAAGTATTGGATTGGACTATCGTCGGAATAGT
TTTGCGAGGATTTGCCGTGCTTGACGAATGTTGTGTCGCCCGATAACCAGCGCAGTACGG
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GTCTTTCGGAAGATCTT

QA 1 617 1 617
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TCCTCGTACTGCTGGTTAAATCGACCATGTACCCGAAGGAATAGTGCAGAATCGTTGAAG
CAAAGGGAGGAGAAGTAGGCGAAACTCGAAGAAGGCTAAGGTGGGCGGACAAGCGAAAAT
GATTGGCAAGACGTCACTTGAGTGAGACTTGATATTTCGTCAAGCTATGAGTGAACTGGT
CAGGTCAAGAAGCTTATGATATTGTTTTTCTTTACGAATGATATTTCGTAAAATATTGCC
GAGCTTTTACTTTACGAGAGTTTTTCAACAAAATGTTGTCGAGTTAATTTTACAGAAACT
GTTTCGTAAAATGTTGTCGAGTTTAGTCGTGCAGAAGCTGTCTCGTGAAGTATTGTCTAG
GATTATTTTACGAAAGGTGCAAAGTATTGGATTGGACTATCGTCGGAATAGTTTTGCGAG
GATTTGCCGTGCTTGACGAATGTTGTGTCGCCCGATAACCAGCGCAGTACGGGTGCGCTA
GTCGTCCGGCGCCTAGAGGCAGCACGGGGGCTAGCCAACACTTGGATGTCGAGTCTTTCG
GAAGATCTTCGATCAATTGCCGAGGCAAATGGTGCTTTAAGATAACCATCACCGTTTTAT
ACGAAGTCTTCCTGTCCCC

QA 1 679 1 679
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TGTCCGTTCCTCTTTGTCTTCTAACGTTTTATTGTCAAAGGTCTTCGCCTAAGTTCATAT
CCTCGTTTCCTCGTACTGCTGGTTAAATCGACCATGTACCCGAAGGAATAGTGCAGAATC
GTTGAAGCAAAGGGAGGAGAAGTAGGCGAAACTCGAAGAAGGCTAAGGTGGGCGGACAAG
CGAAAATGATTGGCAAGACGTCACTTGAGTGAGACTTGATATTTCGTCAAGCTATGAGTG
AACTGGTCAGGTCAAGAAGCTTATGATATTGTTTTTCTTTACGAATGATATTTCGTAAAA
TATTGCCGAGCTTTTACTTTACGAGAGTTTTTCAACAAAATGTTGTCGAGTTAATTTTAC
AGAAACTGTTTCGTAAAATGTTGTCGAGTTTAGTCGTGCAGAAGCTGTCTCGTGAAGTAT
TGTCTAGGATTATTTTACGAAAGGTGCAAAGTATTGGATTGGACTATCGTCGGAATAGTT
TTGCGAGGATTTGCCGTGCTTGACGAATGTTGTGTCGCCCGATAACCAGCGCAGTACGGG
TGCGCTAGTCGTCCGGCGCCTAGAGGCAGCACGGGGGCTAGCCAACACTTGGATGTCGAG
TCTTTCGGAAGATCTTCGATCAATTGCCGAGGCAAATGGTGCTTTAAGATAACCATCACC
GTTTTATACGAAGTCTTCCTGTCCCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGT
CCGGTACCGTCGACT

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 5

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TATACACATATATAAAAGAAAAGCATGTACGTAAAGACAGAAGCACATATATACAAGAAA
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AACCTCAAGAACAAATCAATTTAATATTTTTAAAAATGGATCTTAGTTTAATACAAGATC
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ATGACGGCTGCGGCGGCTGCACCACTCCTACTTCCACCGACCACAAGATCCCTCCCTCCA
CCGCCACTACTCCTCCTCCTCCGCCTCAGAAACGGCGCCCACCTCCGTCGCCATCGTCTC
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AAGAGGAGATCGAACGCTTCTTCTCCTCTGTTTACAATCACTCAGCGACGTCATCCCCCA
CACCAACCACCGCCAAGACGGCTCTCGCGGTGGTTAGGCGACGGAGAAGTTTCCGTTCTT
GTTCTCGAAGATGATCAATAATTGGGAGTTAACCACAATAATGTTAAAGGTTCCTTCATT
TCGATAACTTTTTTTATTTATTTTAATGTAATGATTCTCAACTTTACACGTCGACCTACT
CTATAAATATACATGTGCTATCGATCGTTGGAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 10 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 5 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 5 35 20 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1H696JQB U 1
AF RS1DV07JQ C 434
AF RS1CC22TF U 156
AF RS1DV07TF U 156
AF RS1CC22JQ C 373
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RD RS1H696JQB 609 0 0
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TATACACATATATAAAAGAAAAGCATGTACGTAAAGACAGAAGCACATATATACAAGAAA
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ATGACGGCTGCGGCGGCTGCACCACTCCTACTTCCACCGACCACAAGATCCCTCCCTCCA
CCGCCACTACTCCTCCTCCTCCGCCTCAGAAACGGCGCCCACCTCCGTCGCCATCGTCTC
TCATCAGATCTTGCAAGAGGAAGCTTTTGACGCCATCAAAAGTTGAGATCATCGTCAACA
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CACCAACCACCGCCAAGACGGCTCTCGCGGTGGTTAGGCGACGGAGAAGTTTCCGTTCTT
GTTCTCGAA

QA 1 609 1 609
DS 

RD RS1DV07JQ 286 0 0
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CAAGACGGCTCTCGCGGTGGTTAGGGGACGGAGAAGTTTCCGTTTTTGTTTTCGAAGATG
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DS 

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GG
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ATCCAACAACACCAACATAGATGATGACGGCTGCGGCGGCTGCACCACTCCTACTTCCAC
CGACCACAAGATCCCTCCCTCCACCGCCACTACTCCTCCTCCTCCGCCTCAGAAACGGCG
CCCACCTCCGTCGCCATCGTCTCTCATCAGATCTTGCAAGAGGAAGCTTTTGACGCCATC
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TCACTCAGCGACGTCATCCCCCACACCAACCACCGCCAAGACGGCTCTCGCGGTGGTTAG
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TCAACTTTACACGTCGACCTACTCTATAAATATACATGTGCTATCGATCGTTGGAATC

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DS 

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GG
ACACGACAAAACACAAAAACAAAAACCTCAAGAACAAATCAATTTAATATTTTTAAAAAT
GGATCTTAGTTTAATACAAGATCTGCCCATGCTCAAGTTCCCATCATCCATCAAGACCCC
ATCCAACAACACCAACATAGATGATGACGGCTGCGGCGGCTGCACCACTCCTACTTCCAC
CGACCACAAGATCCCTCCCTCCACCGCCACTACTCCTCCTCCTCCGCCTCAGAAACGGCG
CCCACCTCCGTCGCCATCGTCTCTCATCAGATCTTGCAAGAGGAAGCTTTTGACGCCATC
AAAAGTTGAGATCATCGTCAACAAAGAGGAGATCGAACGCTTCTTCTCCTCTGTTTACAA
TCACTCAGCGACGTCATCCCCCACACCAACCACCGCCAAGACGGCTCTCGCGGTGGTTAG
GCGACGGAGAAGTTTCCGTTCTTGTTCTCGAAGATGATCAATAATTGGGAGTTAACCACA
ATAATGTTAAAGGTTCCTTCATTTCGATAACTTTTTTTATTTATTTTAATGTAATGATTC
TCAACTTTACACGTCGACCTACTCTATAAATATACATGTGCTATCGATCGTTGGAATC

QA 3 600 3 600
DS 

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GCAAGAGGAAGCTTTTGACGCCATCAAAAGTTGAGATCATCGTCAACAAAGAGGAGATCG
AACGCTTTTTTTCCTCTGTTTACAATCACTCAGGGACGTCATCCCCCACCCCAACCCCCG
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GATCAATAATTGGGAGTTAACCACAATAATGTTAAAGGTTCCTTCATTTCGATAACTTTT
TTTATTTATTTTAATGTAATGATTTTCAACTTTACACGTCGACCTACTCTATAAATATAC
ATGGGCTATCGATCGTTGGAATC

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DS 



AS 1 6

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AGATTTGAGGTTTTCTGGTGAGCCATGGGACAGTATCACTTCACACGCCAAGGATCTGAT
CCGTGGGATGCTCTGTGTTGATCCTTCACAGAGGTTATCAGCTGATGATGTTCTAGCTCA
CTCATGGATGGAGGAGTTAACTGAATCAGGAGAAGGACAGTATGATCAAGATGGGTTTGG
ATGTGAAGGATTGGAGAACGGTGGATGTTCTTTCTCCACAGGATATGTTTCTAGGGAGCA
GGACTATAGCTTCAGCATGGGGCAGTTAGAGCCGTTGGCTGATAATGACTGTAGATCATC
ATTCTCCTCTTTCTTACCTGCGGATAGCAACAACAACAATAACAACATACAGCCAAGTTC
TGGTTTTGGTGGGTTTTCTTTTGATGGGAAACAACCTGAATCAACCTCTGTTGGCGGCTT
CTCATCAACTGGAGTTCCATCTATGCCAAGCTTTAGCTTCTTTAGTCCAAGCCAAGCGAC
GACAGAGAACAACAACATTGATGAAACAGATGGGAAACTTCGAGACTCAAGCCCAAAGAG
GTTACATCCTTCACAGGATGCTTCTTTACAACTTGAGAGGCGAGAGGAAGATGGTGAGAA
TCAGACAGGAGCAGTAGTAGGAAAGTCAGAGACGAGAA*GGGAAAGAGGAAACTGGTCAA
GAATGTCAGGTCTGCACAGCAAAAGAAACCGGACGATAGGACTTGGTGAGCTAGACCAGT
TGGTGGTGGATGTTGCAGTCACTGAGTCGATCATCCGATGGGCGTCTTGCACGCATATTC
CCACCGCTCCATCTCTCAGATTGTCTCTCGTCTGCTAGAACCAATGAAGAGGACTCTTAT
GAGTATAAATTATTGTATGTAAAAACAACATCTGATTTTGGTCTTGTATTGGTCTTTGTT
TTCTGTAGTAACATCTGTCCATGGAAAAACTGACCACAGCTGTAAAAACAAACAACCGGA
GGTGTCTCAGCAATAGAGTGTGGTTTTGAATTTCTTTAGAAAAGTTACTGCCAGATTATA
ATTAGTTCACAATGATTCAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1F806TF U 421
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G
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GGACTATAGCTTCAGCATGGGGCAGTTAGAGCCGTTGGCTGATAATGACTGTAGATCATC
ATTCTCCTCTTTCTTACCTGCGGATAGCAACAACAACAATAACAACATACAGCCAAGTTC
TGGTTTTGGTGGGTTTTCTTTTGATGGGAAACAACCTGAATCAACCTCTGTTGGCGGCTT
CTCATCAACTGGAGTTCCATCTATGCCAAGCTTTAGCTTCTTTAGTCCAAGCCAAGCGAC
GACAGAGAACAACAACATTGATGAAACAGATGGGAAACTTCGAGACTCAAGCCCAAAGAG
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GAATG

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G
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TAACAACATACAGCCAAGTTCTGGTTTTGGTGGGTTTTCTTTTGATGGGAAACAACCTGA
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CTTTAGTCCAAGCCAAGCGACGACAGAGAACAACAACATTGATGAAACAGATGGGAATCT
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GTGGT

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G
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ACAGAGAACAACAACATTGATGAAACAGATGGGAAACTTCGAGACTCAAGCCCAAAGAGG
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GGTGGTGGATGTTGCAGTCACTGAGTCGATCATCCGATGGGCGTCTTGCACGCATATTCC
CACCGCTCCATCTCTCAGATTGTCTCTCGTCTGCTAGAACCAATGAAGGGGACTCTTGTG
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TCTGTAGTAACATCTGTCCATGGAAAAACTGACCACAGCTGTAAAAACAAACAACCGGAG
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CTGAATCAACCTCTGTTGGCGGCTTCTCATCAACTGGAGTTCCATCTATGCCAAGCTTTA
GCTTCTTTAGTCCAAGCCAAGCGACGACAGAGAACAACAACATTGATGAAACAGATGGGA
AACTTCGAGACTCAAGCCCAAAGAGGTTACATCCTTCACAGGATGCTTCTTTACAACTTG
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GAA*GGGAAAGAGGAAACTGGTCAAGAATGTCAGGTCTGCACAGCAAAAGAAACCGGACG
ATAGGACTTGGTGAGCTAGACCAGTTGGTGGTGGATGTTGCAGTCACTGAGTCGATCATC
CGATGGGCGTCTTGCACGCATATTCCCACCGCTCCATCTCTCAGATTGTCTCTCGTCTGC
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TTTTGGTCTTGTATTGGTCTTTGTTTTCTGTAGTAACATCTGTCCATGGAAAAACTGACC
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TTAGAAAAGTTACTGCCAGATTATAATTAGTTCACAATGATTCAGAC

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DS 



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TTCTCCCCACCACCCCCGGAGAAACAAAAACCACCACCACCATGACCTCCAAAGACTGTG
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CACGTTTCATCCTCCAAGACGCCACCGTCTACGCCTTCAACGTCTCCGGCAATCCACCGA
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TTATATGTTATAGTCTTCTTAATTATCATAAGTGATGTGAATTGTACATTTTGCTTATAC
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CTTTTTAAATAATTGAATCCTAAATTTTATTTC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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AF RS1B139TF U 243
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GCTCCCACACTCACTCTCGCCGGAAACTGATCCGGCGAATAATATGGTCAGTAATCTTCG
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GCATCTACTACGACCGCCTTGACGTCTACGCTACTTACCATAGCCAACAGATCACTTTCC
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TCTACGGGACCTCTGTTCCCGTCGCTCCGTTCAACGCCGTTAGTCTTGGCGGCGATCAAG
ATAACGGCGCTGTTACGCTGATCATCCGTGGTG

QA 1 573 1 573
DS 

RD RS1DY78TF 606 0 0
GGATTTACAACACATCAAATAAACAATAAACAAAGAAATCTCTTAACAACTTCTCCACGT
TCTCCCCACCGCCCCCGGAGAAACAAAAACCACCACCACCATGACCTCCAAAGACTGTGG
CTCCCACACTCACTCTCGCCGGAAACTAATCCGGCGAATAATATGGTCAGTAATCTTCGT
CCTCTTCATCATCTTACTCACAATCCTCCTCATTTGGGCAATCCTCCAGCCTTCAAAGCC
ACGTTTCATCCTCCAAGACGCCACCGTCTACGCCTTCAACGTCTCCGGCAATCCACCGAA
CCTCCTCACCTCCAACTTCCAAATCACTCTCTCTTCACGGAACCCTAACGACAAGATCGG
CATCTACTACGACCGTCTGGACGTCTACGCTACTTACCATAGCCAACAGATCACTTTCCG
AACATCGATCCCTCCTACGTATCAGGGACACAAAGAAGTCAACATATGGTCGCCGTTTGT
CTACGGCACCTCTGTTCCCGTCGCTCCGTTCAACGCCGTCAGTCTTGGCGGCGATCAAGA
TAACGGCGCTGTTACGCTGATCATCCGTGGTGACG*TAAAGTGAGGTGGAAAGTTGGGGC
GTT
ATT

QA 1 603 1 603
DS 

RD RS1CZ04JQ 780 0 0
CCAAAGACTGTGGCTCCCACACTCACTCTCGCCGGAAACTGATCCGGCGAATAATATGGT
CAGTAATCTTCGTCCTCTTCATCATCTTACTCACAATCCTCCTCGTTTGGGCAATCCTCC
AACCTTCAAAGCCACGTTTCATCCTCCAAGACGCCACCGTCTACGCCTTTAACGCCTCCG
GCAATCCACCGAACCTCCTCACCTCCAACTTCCAAATCACTCTCTCTTCCCGGAACCCTA
ACGACAAGATCGGCATCTACTACGACCGCCTTGACGTCTACGCTACTTACCATAGCCAAC
AGATCACTTTCCGAACATCGATCCCTCCGACGTATCAGGGACACAAAGAAGTCAACATAT
GGTCGCCTTTTGTTTACGGGACCTCTGTTCCCGTCGCTCCGTTCAACGCCGTTAGTCTTG
GCGGCGATCAAGATAACGGCGCTGTTACGCTGATCATCCGTGGTGACGGTAAAGTGAGGT
GGAAAGTTGGGGCGTTTATTACAGGGAAGTATCATCTTTACGTGAGGTGTCTTGCGTATA
TTAACTTCGGTAATAAAGCTGCCGGAGTTATTGTCGGAGATAACGCCGTTAAGTATACGC
TTACGAGTAGCTGTAGTGTTAGTGTCTAAAACGGCGACGGAGCGAAATTAGGTGAGCTAA
TTAACGACTCCATTATATATTATAGTCTTCTTAATTATCATAAATGATGTGAATTGTACA
TTTTGCTTATACGATGGCAAATATTACAAATCCCCGATGTTGTGATGAGTTGTAAGAATT

QA 1 780 1 780
DS 

RD RS1DY78JQ 621 0 0
GCCTTCAACGTCTCCGGCAATCCACCGAACCTCCTCACCTCCAACTTCCAAATCACTCTC
TCTTCACGGAACCCTAACGACAAGATCGGCATCTACTACGACCGTCTGGACGTCTACGCT
ACTTACCATAGCCAACAGATCACTTTCCGAACATCGATCCCTCCTACGTATCAGGGACAC
AAAGAAGTCAACATATGGTCGCCGTTTGTCTACGGCACCTCTGTTCCCGTCGCTCCGTTC
AACGCCGTCAGTCTTGGCGGCGATCAAGATAACGGCGCTGTTACGCTGATCATCCGTGGT
GACGGTAAAGTGAGGTGGAAAGTTGGGGCGTTTATTACAGGGAAGTATCATCTTTACGTG
AGGTGTCTTGCGTATATTAACTTCGGTAATAAAGCTGCCGGAGTTATTGTCGGAGATAAC
GCCGTTAAGTATACGCTTACGAGTAGCTGTAGTGTTAGTGTCTAAAACGGCGACGGAGCG
AAATTAGGTGAGCTAATTAACGACTCCATTATATATTATAGTCTTCTTAATTATCATAAG
TGATGTGAATTGTACATTTTGCTTATACGATGGCAAATATTACAGATCCCCGATGTTGTG
ATGAGTTGTAAGAATT
TAAAT

QA 1 616 1 616
DS 

RD RS1B139JQ 691 0 0
G
GTTTCATCCTCCAAGACGCCACCGTCTACGCCTTCAACGTCTCCGGCAATCCACCGAACC
TCCTCACCTCCAACTTCCAAATCACTCTCTCTTCACGGAACCCTAACGACAAGATCGGCA
TCTACTACGACCGTCTGGACGTCTACGCTACTTACCATAGCCAACAGATCACTTTCCGAA
CATCGATCCCTCCTACGTATCAGGGACACAAAGAAGTCAACATATGGTCGCCGTTTGTCT
ACGGCACCTCTGTTCCCGTCGCTCCGTTCAACGCCGTCAGTCTTGGCGGCGATCAAGATA
ACGGCGCTGTTACGCTGATCATCCGTGGTGACGGTAAAGTGAGGTGGAAAGTTGGGGCGT
TTATTACAGGGAAGTATCATCTTTACGTGAGGTGTCTTGCGTATATTAACTTCGGTAATA
AAGCTGCCGGAGTTATTGTCGGAGATAACGCCGTTAAGTATACGCTTACGAGTAGCTGTA
GTGTTAGTGTCTAAAACGGCGACGGAGCGAAATTAGGTGAGCTAATTAACGACTCCATTA
TATGTTATAGTCTTCTTAATTATCATAAGTGATGTGAATTGTACATTTTGCTTATACGAT
GGCAAATATTACAGATCCCCGATGTTGTGATGAGTTGTAAGAATTTAAATACGAATACTT
TTTAAATAATTGAATCCTAAATTTTATTTC

QA 2 691 2 691
DS 

RD RS1B139TF 691 0 0
G
GTTTCATCCTCCAAGACGCCACCGTCTACGCCTTCAACGTCTCCGGCAATCCACCGAACC
TCCTCACCTCCAACTTCCAAATCACTCTCTCTTCACGGAACCCTAACGACAAGATCGGCA
TCTACTACGACCGTCTGGACGTCTACGCTACTTACCATAGCCAACAGATCACTTTCCGAA
CATCGATCCCTCCTACGTATCAGGGACACAAAGAAGTCAACATATGGTCGCCGTTTGTCT
ACGGCACCTCTGTTCCCGTCGCTCCGTTCAACGCCGTCAGTCTTGGCGGCGATCAAGATA
ACGGCGCTGTTACGCTGATCATCCGTGGTGACGGTAAAGTGAGGTGGAAAGTTGGGGCGT
TTATTACAGGGAAGTATCATCTTTACGTGAGGTGTCTTGCGTATATTAACTTCGGTAATA
AAGCTGCCGGAGTTATTGTCGGAGATAACGCCGTTAAGTATACGCTTACGAGTAGCTGTA
GTGTTAGTGTCTAAAACGGCGACGGAGCGAAATTAGGTGAGCTAATTAACGACTCCATTA
TATGTTATAGTCTTCTTAATTATCATAAGTGATGTGAATTGTACATTTTGCTTATACGAT
GGCAAATATTACAGATCCCCGATGTTGTGATGAGTTGTAAGAATTTAAATACGAATACTT
TTTAAATAATTGAATCCTAAATTTTATTTC

QA 2 691 2 691
DS 



AS 2 4

CO CL983Contig1 329 2 3 U
TTTTTTTACCGAAGTTACATTTTACAAAGATTGAGAATCTCCATACAGAGGGAAACGTTA
AATATACAAGCTTTTATACAGACAAAAAGAAAAGGAACAAAGAGACTCCAAATTGGTTTT
AATATGTTACAACGAGACTCAATAAACACATCTTTGTTGTTACGGTATATATACACAAAT
ATTGACCTCAAAGTTAAAGAAAACTGTGGTCAAAAAGCCTTAACTGGTGTTGTAGACAGA
TCTTCAAAGATTTATAGTCTTGATTTTGGAATTTTATTTACACTTTGTGAATCTCTGTTC
CTTTTTTTTTTCCTCTTATACGCCACGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BN12JQ U 58
AF RS1BN12TF C 1
BS 1 60 RS1BN12TF
BS 61 216 RS1BN12JQ
BS 217 329 RS1BN12TF

RD RS1BN12JQ 159 0 0
TTA
AATATACAAGCTTTTATACAGACAAAAAGAAAAGGAACAAAGAGACTCCAAATTGGTTTT
AATATGTTACAACGAGACTCAATAAACACATCTTTGTTGTTACGGTATATATACACAAAT
ATTGACCTCAAAGTTAAAGAAAACTGTGGTCAAAAA

QA 4 159 4 159
DS 

RD RS1BN12TF 329 0 0
TTTTTTTACCGAAGTTACATTTTACAAAGATTGAGAATCTCCATACAGAGGGAAACGTTA
AATATACAAGCTTTTATACAGACAAAAAGAAAAGGAACAAAGAGACTCCAAATTGGTTTT
AATATGTTACAACGAGACTCAATAAACACATCTTTGTTGTTACGGTATATATACACAAAT
ATTGACCTCAAAGTTAAAGAAAACTGTGGTCAAAAAGCCTTAACTGGTGTTGTAGACAGA
TCTTCAAAGATTTATAGTCTTGATTTTGGAATTTTATTTACACTTTGTGAATCTCTGTTC
CTTTTTTTTTTCCTCTTATACGCCACGGC

QA 1 329 1 329
DS 



CO CL983Contig2 761 2 9 U
AATACAAAGAGCATTCATATTTATCGAAGTTACATTTTACAAAGATTGAGAATCTCCATA
CAGAGAAAAACGTTAAATATACAAGCTTTTATACAGACAAAAAAGAAAAGGAACAAAGAG
ACTCCAAATTGGTTTTAATATGTTACAACGAGACTCAATAAACACATCTTTGTTGTTACG
GTATATATACACAAATATTGACCTCAAAGTTAAAAAAAACTGTGGTCAAAAAGCCTTAAC
TGGTGTTGTAAACAGATCTTCAAAGATTTATAGTCTTGATTTTGGAATTTTATTTACACT
TTTGTGAATCTCTGTTCCTTTCTTCTTTCCTCTTCTAAGCCATGGCAAATATGTTTGAGC
TTTGGCGGTCCCTGTTAAAGCAGTTGAATCCTTCAACTCTAACAGCTGCCGGTTTGAGCC
CAAACTTCACTCGACCACCACAACCTCCTCCTTTGACACGAGATGGCGATGGAGATGGAG
ATGTAAGGAATGGTGAGAGCGAGGGGGAGACAGGGTTGAGTTTTTCATCTCCAAATCGTG
CATCTTGAGCTAATGGGTTTGATACTCTGCTTGGGGGAGACCCGAGGAAAAATGGAGGCG
ATGAAGCTACACCAGATAATGTTTCTTCCTTTCTACGAATGATGTCCAAAAGATCTGCCC
CGGCTTGAGAATCACATACATCAGCTGCTCCAGGCTGACTAGGATGTGATGATCTAAACA
GATGAATAGCGTTGTTGGAGAGAATGCTAACGCGACGAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1CJ19JQ U 1
AF RS1FF92JQ U 43
BS 1 76 RS1CJ19JQ
BS 77 77 RS1FF92JQ
BS 78 214 RS1CJ19JQ
BS 215 215 RS1FF92JQ
BS 216 331 RS1CJ19JQ
BS 332 332 RS1FF92JQ
BS 333 637 RS1CJ19JQ
BS 638 638 RS1FF92JQ
BS 639 761 RS1CJ19JQ

RD RS1CJ19JQ 761 0 0
AATACAAAGAGCATTCATATTTATCGAAGTTACATTTTACAAAGATTGAGAATCTCCATA
CAGAGAAAAACGTTAA*TATACAAGCTTTTATACAGACAAAAAAGAAAAGGAACAAAGAG
ACTCCAAATTGGTTTTAATATGTTACAACGAGACTCAATAAACACATCTTTGTTGTTACG
GTATATATACACAAATATTGACCTCAAAGTTAAAGAAAACTGTGGTCAAAAAGCCTTAAC
TGGTGTTGTAAACAGATCTTCAAAGATTTATAGTCTTGATTTTGGAATTTTATTTACACT
TTTGTGAATCTCTGTTCCTTTCTTCTTTCCTTTTCTAAGCCATGGCAAATATGTTTGAGC
TTTGGCGGTCCCTGTTAAAGCAGTTGAATCCTTCAACTCTAACAGCTGCCGGTTTGAGCC
CAAACTTCACTCGACCACCACAACCTCCTCCTTTGACACGAGATGGCGATGGAGATGGAG
ATGTAAGGAATGGTGAGAGCGAGGGGGAGACAGGGTTGAGTTTTTCATCTCCAAATCGTG
CATCTTGAGCTAATGGGTTTGATACTCTGCTTGGGGGAGACCCGAGGAAAAATGGAGGCG
ATGAAGCTACACCAGATAATGTTTCTTCCTTTCTACGGATGATGTCCAAAAGATCTGCCC
CGGCTTGAGAATCACATACATCAGCTGCTCCAGGCTGACTAGGATGTGATGATCTAAACA
GATGAATAGCGTTGTTGGAGAGAATGCTAACGCGACGAGGC

QA 1 761 1 761
DS 

RD RS1FF92JQ 719 0 0
AGATTGAGAATCTCCATACAGAGGGAAACGTTAAATATACAAGCTTTTGTACAGACAAAA
A*GAAAAGGAACAAAGAGACTCCAAATTGGTTTTAATATGTTACAACGAGACTCAATAAA
CACATCTTTGTTGTTACGGTATATATACACAAATATTGACCTCAAAGTTAAAAAAAACTG
TGGTCAAAAAGCCTTAACTGGTGTTGTAGACAGATCTTCAAAGATTTATAGTCTTGATTT
TGGAATTTTATTTACACTTT*GTGAATCTCTGTTCCTTTCTTCTTTCCTCTTCTAAGCCA
TGGCAAATATGTTTGAGCTTTGGCGGTCCCTGTTAAAGCAGTTGAATCCTTCAACTCTAA
CAGCTGCCGGTTTGAGCCCAAACTTCACTCGACCACCACAACCTCCTCCTTTGACACGAG
ATGGCGATGGAGATGGAGATGTAAGGAATGGTGAGAGCGAGGGGGAGACAGGGTTGAGTT
TTTCATCTCCAAATCGTGCATCTTGAGCTAATGGGTTTGATACTCTGCTTGGGGGAGACC
CGAGGAAAAATGGAGGCGATGAAGCTACACCAGATAATGTTTCTTCCTTTCTACGAATGA
TGTCCAAAAGATCTGCCCCGGCTTGAGAATCACATACATCAGCTGCTCCTGGCTGACTAG
GATGTGATGATCTAAACAGATGAATAGCGTTGTTGGAGAGAATGCTAACGCGACGAGGC

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 5

CO CL984Contig1 972 5 19 U
ATGTAAATTCATATAATTTATAAAATACATATCTCACACCATAGCTTAAAGCTACTACTC
TACATGGTTCACCATCAAAACCACATGCCCATCTCATCAGAGTTGCAAGAAAGAATAAAT
TTTTCCGTTAGTTATATGTATACGTTCTCTCTTTTTTTCAGTCAAGGGACCAATAGAAAA
ATAATAATAACAACACGACAATTCACCGGCGAGCAAGTCTCTGACCAGCTCCAGCAAGTA
ACGCTTTACCAATGACCCC*AGTGTGAAGGCCACAAGCCAATGCAACACCTCCTACAACG
ACCCATTTCCAGTCCATCCTCAAATGGTCCCGTTGCCTTCTCGCATAACCCATTGCTCTG
CTTCTGTCTTCATCGCTAGTAGATGTTTCTGCAGAATCCATGTCAAGCACTGTGGTGATT
CTTGCCATCTGGGCGATCCGGGATAGACTCGAGTCTGACTTTCTACCGGTTTGGTAGGCT
CTTAAACCGGAGTTTAGCTTCTTGACGGCTCCCCACATGCCATGACGGACGCCTAACTTC
GCTACGTCTTTAGGGATCCCCATGTCTTCGTAGTGGACTAGGGATACTTCACAAGCCGTT
GGCTGTCCATCTCCTTTTCGAGATTCAACTGCTCTGATAACCCAACTTGAGAAATAAAGC
TCAACACGCCTAGGCTTATCACGCTTTGGTAAAGCTGGATAAGGAACTCCCTTTGTAACA
CAGTAGTACTTGTTTCCAGACTCCCATATTCTCCGGCCAATGATATACTCTCGGTCACTA
CAGAAAAAGGGAAACTTTTTTCTCCACTGGACAATCATAGTTCCTGTCTGAGTGTCCTCT
TCCAAAGTTCTGAACTTGGCAAGCATAAAGTCCCATTTAGGTCGAAACTCATCATCCCAG
AAGAAATCCCTAACAATATCTGGAGTTGCATCTTCAAACACACTTCGACTGCGATAAATA
ACAGGACCTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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CA

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C

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C

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CTTGCCATCTGGGCGATCCGG*ATAGACTCGAGTCTGACTTTCTACCGGTTTGGTAGGCT
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T

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C

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DS 



AS 1 6

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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TGGTGTCTCTGAAAGCGAGATGTGTGTGATTGCCAATGTTTGTCCAGAAAGCATTGATGA
AGTCTTCGCTTTTGTTCCATC

QA 1 621 1 621
DS 

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GGGCCATCTCCGCCGTT*GTAGCTGACGACACTCTCCTCCTCTTTGCTTCCGCCTCGATC
ATCGGCACTAGTCATGTCGGAGAAAGGAGGAAAAGGGTTCAAATCTGCTCTCAAGTCCAC
TTATGGAGCCACCAAGGACGATAACTCAACCAAGTCCAAGAAGACAAGGAAAGTCCAGTT
TGATCCTCAAGGCCCACGAGAGTCCAAGTACACGTTTCTTCAAGACCCTGATGATCAGAT
CCAAGGTTCTTCTGCTAAAGGTGGGAAGGGAAGCAAGGCTAAGAAGAGCTCTCTGTCTAA
AGAGTCTCAGCCGCTTGAGCTTAAGACTGATAAGGAGCTTCCGGAGAATGCAAAGTGCAT
GATGGATTGTGAAGCTTTTGAGATTCTACAAGGCGTCAAGGAACAGATGGCTGTTCTATC
TGAAGATCCTAGCTTAAAGCTTCCTGTGTCTTTCGACAGAGGACTGGAGTATGTGAAGTA
TGGTCGTTGCTACATGAATCCTCAGTCTGTCAGACAGATCCTTGAGCCTCTGAAAAAGCA
TGGTGTCTCTGAAAGCGAGATGTGTGTGATTGCCAATGTTTGTCCAGAAAGCATTGATGA
AGTCTTCGCTTTTGTTCCATCCAT

QA 1 624 1 624
DS 

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GGGT
TTGTAGCTGACGACACTCTCCTCCTCTTTGCTTCCGCCTCGATCATCGGCACTAGTCATG
TCGGAGAAAGGAGGAAAAGGGTTCAAATCTGCTCTCAAGTCCACTTATGGAGCCACCAAG
GACGATAACTCAACCAAGTCCAAGAAGACAAGGAAAGTCCAGTTTGATCCTCAAGGCCCA
CGAGAGTCCAAGTACACGTTTCTTCAAGACCCTGATGATCAGATCCAAGGTTCTTCTGCT
AAAGGTGGGAAGGGAAGCAAGGCTAAGAAGAGCTCTCTGTCTAAAGAGTCTCAGCCGCTT
GAGCTTAAGACTGATAAGGAGCTTCCGGAGAATGCAAAGTGCATGATGGATTGTGAAGCT
TTTGAGATTCCACAAGGCGTCAAGGAACAGATGGCTGTTCTATCTGAAGATCCTAGCTTA
AAGCTTCCTGTGTCTTTCGACAGAGGACTGGAGTATGTGAAGTATGGTCGTTGCTACATG
AATCCTCAGTCTGTCAGACAGATCCTTGAGCCCCTGAAAAAGCATGGTGTCTCTGAAAGC
GAGATGTGTGTGATTGCCAATGTTTGTCCAGAAAGCATTGATGAAGTCTTCGCTTTTGTT
CCATCCATGAAGGGAAGAAAAGACAAGATCAGTGAGCCCTTAGAAGAGGCATTGGCGAAG
CTCTCCA
GCTCAAA

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DS 

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ATGATGGATTGTGAAGCTTTTGAGATTCCACAAGGCGTCAAGGAACAGATGGCTGTTCTA
TCTGAAGATCCTAGCTTAAAGCTTCCTGTGTCTTTCGACAGAGGACTGGAGTATGTGAAG
TATGGTCGTTGCTACATGAATCCTCAGTCTGTCAGACAGATCCTTGAGCCCCTGAAAAAG
CATGGTGTTTCTGAAAGCGAGATGTGTGTGATTGCCAATGTTTGTCCAGAAAGCATTGAT
GAAGTCTTCGCTTTTGTTCCATCCATGAAGGGAAGAAAAGACAAGATCAGTGAGCCCTTA
GAAGAGGCATTGGCGAAGCTCTCCAAGCTCAAAAGATCTGCTTA

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DS 

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AACTCAACCAAGTCCAAGAAGACAAGGAAAGTCCAGTTTGATCCTCAAGGCCCACGAGAG
TCCAAGTACACGTTTCTTCAAGACCCTGATGATCAGATCCAAGGTTCTTCTGCTAAAGGT
GGGAAGGGAAGCAAGGCTAAGAAGAGCTCTCTGTCTAAAGAGTCTCAGCCGCTTGAGCTT
AAGACTGATAAGGAGCTTCCGGAGAATGCAAAGTGCATGATGGATTGTGAAGCTTTTGAG
ATTCTACAAGGCGTCAAGGAACAGATGGCTGTTCTATCTGAAGATCCTAGCTTAAAGCTT
CCTGTGTCTTTCGACAGAGGACTGGAGTATGTGAAGTATGGTCGTTGCTACATGAATCCT
CAGTCTGTCAGACAGATCCTTGAGCCTCTGAAAAAGCATGGTGTCTCTGAAAGCGAGATG
TGTGTGATTGCCAATGTTTGTCCAGAAAGCATTGATGAAGTCTTCGCTTTTGTTCCATCC
ATGAAGGGAAGAAAAGACAAGATCAGTGAGCCCTTAGAAGAGGCATTGGCGAAGCTCTCC
AAGCTCAAAAGATCTGCTTAATGATGATGTTATCCAAGCTGTTTAACCATAGTAGTAAAG
TAAGGATGTTTAAATGATGTGACAACAACATTTGATGTAAGTTTTTAATCGTTATGGAAT
GTTCTTAAATC

QA 1 731 1 731
DS 

RD RS1AA71JQ 562 0 0
TGCTAAAGGTGGGAAGGGAAGCAAGGCTAAGAAGAGCTCTCTGTCTAAAGAGTTTCAGCC
GCTTGAGCTTAAGACTGATAAGGAGCTTCCGGAGAATGCAAAGTGCATG***GATTGTGA
AGCTTTTGAGATTTTACAAGGCGTCAAGGAACAGATGGCTGTTCTATTTGAAGATCCTAG
CTTAAAGCTTCCTGTGTCTTTCGACAGAGGACTGGAGTATGTGAAGTATGGTCGTTGCTA
CATGAATCCTCAGTCTGTCAGACAGATCCTTGAGCCTCTGAAAAAGCATGGTGTCTCTGA
AAGCGAGATGTGTGTGATTGCCAATGTTTGTCCAGAAAGCATTGATGAAGTTTTCGCTTT
TGTTCCATCCATGAAGGGAAGAAAAGACAAGATCAGTGAGCCCTTAGAAGAGGCATTGGC
GAAGCTCTCCAAGCTCAAAAGATCTGCTTAATGATGATGTTATCCAAGCTGTTTAACCAT
AGTAGTAAAGTAAGGATGTTTAAATGATGTGACAACAACATTTGATGTAAGTTTTTAATC
GTTATGGAATGTTCTTAAATCG

QA 1 562 1 562
DS 



AS 1 5

CO CL986Contig1 1286 5 12 U
GAGACAAAAGCTTCGTTCTTTGTAGTTTCCCTCTCTCAAATCTTCGTTTCCAAGTTTCTA
TTAGCGGTTCTTCAATGGCGAAAGACGGACCCAATTGGGATGGATTGCTTAAATGGAGTC
TCTCTCACGCCGACGGTACTCGACCAACTCGCCAGTTGAGCGAGGAGGATAGGAAGTGGT
TCATGGAGGCTATGCAGTCGCAGACGCTAGATGTAGTCAAACGCATGAAGGAGATTACAT
TAGTTATGCAAACACCTGAACAGGTTTTGGTGGAACATGGTGTAACACCTGAAGACATTG
AAGATTTGCTGGATGAGTTGCAGGAGCACGTTGAGTCGATCGATATGGCTAATGATCTTC
ATTCGATTGGAGGTTTGGTTCCTCTTCTCGGGTTTCTGAAAAACTCTCATGCTAATATTA
GAGCCAAAGCTGCTGATGTCGTGAGCACGATAGTTCAGAACAATCCTCGAAGTCAGGAGT
TGGTTATGGAAGCCAATGGTTTGGAGTCATTGCTGACGAACTTCACCTCCGACACAGATG
TTCATGCTCGAACTCAAGCTCTCACCGCTATTTCATCTTTGATTCGCCATAACAAACCTG
GAGTCACTGCTTTCAAGCTTGCCAACGGTTATGCTGGCCTAAGGGATGCTATGGCATCTG
ATAGTGTGAGATTTCAGAGGAAAGCCTTAAACTTGTTGCAATATCTTCTCCAAGAAGATG
ATTCAGACCGAAGCATCGC*ACGGGACTCGGCTTCCCTCGAGTGATGATCCATCTCGCGT
CTAGCGAAGATGCAGAGACGAGAGAAGCTGCTCTCCGAGGATTACTCGAGCTCACAAGAG
AGAAAAACGACGGGAGTGGATGCAGCAGCATGGAGAAAGGCGACGAGAAGCTGAGGCAGC
TGCTAGAAGAGCGTATCGAAGGGATCAGCTTGATGTCACGAGAGGATCTAGGAACGGTCA
AAGAAGAGAGACAGCTCGTGGATTCACTGTGGAGGGTTTGCTACAACGAACCTTCTTCTC
TGAGAGAGAAAGGGCTTCTTGTTCTTCCAGGGGAAGACGAGTTGCCTCCTGATGTGGCGA
GCAAGCTCTTCGAGCCTCCTCTCACAGCTTCTGCGGGGAGTCGTGATGCCACTGAGAAGA
AGAAAGAAGAGCCTATCAAACTACTTGGACCCGCACCATAAGAGCGCTGTACTTTTATGT
TTTTGTTTGTCTTGTAACGTTTCAAAGCTTTCAGAAAAGATTGATAAACTTCAATGTTTA
TGTGATGGCAGTTCCTATTTTTGATT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 0 
20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 10 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GV78TF U 1
AF RS1EY28TF U 62
AF RS1G690TF U 1
AF RS1G690JQ C 481
AF RS1GV78JQ C 766
BS 1 418 RS1G690TF
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RD RS1GV78TF 671 0 0
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TTAGCGGTTCTTCAATGGCGAAAGACGGACCCAATTGGGATGGATTGCTTAAATGGAGTC
TCTCTCACGCCGACGGTACTCGACCAACTCGCCAGTTGAGCGAGGAGGATAGGAAGTGGT
TCATGGAGGCTATGCAGTCGCAGACGCTAGATGTAGTCAAACTCATGAAGGAGATTACAT
TAGTTATACAAACACCTGAACAGGTTTTGGTGGAACATGGTGTAACACCTGAAGACATTG
AAGATTTGCTGGATGAGTTGCAGGAGCACGTTGAGTCGATCGATATGGCTAATGATCTTC
ATTCGATTGGAGGTTTGGTTCCTCTTCTCGGGTTTCTGAAAAACTCTCATGCTAATATTA
GAGCCAAAGCTGCTGATGTCGTGAGCACGATAGTTCAGAACAATCCTCGAAGTCAGGAGT
TGGTTATGGAAGCCAATGGTTTGGAGTCATTGCTGACGAACCTCACCTCCGACACAGATG
TTCATGCTCGAACTCAAGCTCTCACCGCTATTTCATCTTTGATTCGCCATAACAAACCTG
GAGTCACTGCTTTCAAGCTTGCCAACGGTTATGCTGGCCTAAGAGATGCTATGGCATCTG
ATAGTGTGAGA

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1EY28TF 704 0 0
TAA
CGGTTCTTCAATGGCGAAAGACGGACCCAATTGGGATGGATTGCTTAAATGGAGTCTCTC
TCACGCCGACGGTACTCGACCAACTCGCCAGTTGAGCGAGGAGGATAGGAAGTGGTTCAT
GGAGGCTATGCAATCTCAGACTTTAGATGTAGTCAAACGCATGAAGGAGATTACATTAGT
TATGCAAACACCTGAACAGGTTTTGGTGGAACATGGAGTAACACCTGAAGACATTGAAGA
TTTGCTGGATGAGTTGCAGGAGCACGTTGAATCGATCGATATGGCTAATGATCTTCATTC
GATTGGAGGTTTGGTTCCTCTTCTCGGGTTTCTTAAGAATTCTCATGCTAATATTCGGAC
CAAAGCTGCTGATGTCATGAGCACGATAGTTCAGAACAATCCTCGAAGTCAGGAGTTGGT
TATGGAAGCCAATGGTTTGGAGTCGTTGCTGACAAACTTCACCTCCGACACAGATGTTCA
TGCTCGAACTCAAGCTCTCACCGCAATTTCATCTTTGATTCGCCATAACAAACCTGGAGT
CACTGCTTTCAAGCTTGCCAACGGTTATGCTGGCCTAAGAGATGCTATGGCATCTGATAG
TGTGAGATTTCAGAGGAAAGCCTTAAACTTGTTGCAATATCTTCTCCAAGAAGATGATTC
AGACCGAAGCATCGC*ACGG*ACTCGGCT*CCCTCGAGTGA

QA 4 704 4 704
DS 

RD RS1G690TF 797 0 0
GAGACAAAAGCTTCGTTCTTTGTAGTTTCCCTCTCTCAAATCTTCGTTTCCAAGTTTCTA
TTAGCGGTTCTTCAATGGCGAAAGACGGACCCAATTGGGATGGATTGCTTAAATGGAGTC
TCTCTCACGCCGACGGTACTCGACCAACTCGCCAGTTGAGCGAGGAGGATAGGAAGTGGT
TCATGGAGGCTATGCAGTCGCAGACGCTAGATGTAGTCAAACGCATGAAGGAGATTACAT
TAGTTATGCAAACACCTGAACAGGTTTTGGTGGAACATGGTGTAACACCTGAAGACATTG
AAGATTTGCTGGATGAGTTGCAGGAGCACGTTGAGTCGATCGATATGGCTAATGATCTTC
ATTCGATTGGAGGTTTGGTTCCTCTTCTCGGGTTTCTGAAAAACTCTCATGCTAATATA*
GAGCCAAAGCTGCTGATGTCGTGAGCACGATAGTTCAGAACAATCCTCGAAGTCAGGAGT
TGGTTATGGAAGCCAATGGTTTGGAGTCATTGCTGACGAACTTCACCTCCGACACAGATG
TTCATGCTCGAACTCAAGCTCTCACCGCTATTTCATCTTTGATTCGCCATAACAAACCTG
GAGTCACTGCTTTCAAGCTTGCCAACGGTTATGCTGGCCTAAGGGATGCTATGGCATCTG
ATAGTGTGAGATTTCAGAGGAAAGCCTTAAACTTGTTGCAATATCTTCTCCAAGAAGATG
ATTCAGACCGAAGCATCGC*ACGGGACTCGGCTTCCCTCGAGTGATGATCCATCTCGCGT
CTAGCGAAGATGCAGAG

QA 1 797 1 797
DS 

RD RS1G690JQ 796 0 0
TGGTTATGGAAGCCAATGGTTTGGAGTCAT*GCTGACGAACTTCACCCCCGACACAGATG
TTCATGCTCGAACTCAAGCTCTCACCGCTATTTCATCTTTGATTCGCCATAACAAACCTG
GAGTCACTGCTTTCAAGCTTGCCAACGGTTATGCTGGCCTAAGGGATGCTATGGCATCTG
ATAGTGTGAGATTTCAGAGGAAAGCCTTAAACTTGTTGCAATATCTTCTCCAAGAAGATG
ATTCAGACCGAAGCATCGCCACCGGACTCGGCTTCCCTCGAGTGATGATCCATCTCGCGT
CTAGCGAAGATGCAGAGACGAGAGAAGCTGCTCTCCGAGGATTACTCGAGCTCACAAGAG
AGAAAAACGACGGGAGTGGATGCAGCAGCATGGAGAAAGGCGACGAGAAGCTGAGGCAGC
TGCTAGAAGAGCGTATCGAAGGGGTCAGCTTGATGTCACGAGAGGATCTAGGAACGGTCA
AAGAAGAGAGACAGCTCGTGGATTCACTGTGGAGGGTTTGCTACAACGAACCTTCTTCTC
TGAGAGAGAAAGGGCTTCTTGTTCTTCCAGGTGAAGACGAGTTGCCTCCTGATGTGGCGA
GCAAGCTCTTCGAGCCTCCTCTCAGAGCTTCTGCGGGGAGTCGTGATGCCACTGAGAAGA
AGAAAGAAGAGCCTATCAAACTACTTGGACCCGCACCATAAGAGCGCTGTACTTTTATGT
TTTTGTTTGTCTTGTAACGTTTCAAAGCTTTCAGAAAAGATTGATAAACTTCAATGTTTA
TGTGATGGCAGTTCC
C

QA 1 795 1 795
DS 

RD RS1GV78JQ 521 0 0
TGATCCATCTCGCGTCTAGCGAAGATGCAGAGACGAGAGAAGCTGCTTTCCGAGGATTAC
TCGAGCTCACAAGAGAGAAAAACGACGGGAGTGGATGCAGCAGCATGGAGAAAGGGGACG
AGAAGCTGAGGCAGCTGCTAGAAGAGCGTATCGAAGGGATCAGCTTGATGTCACGAGAG*
ATTTAGGAACGGTCAAAGAAGAGAGACAGCTCGTGGATTCACTGTGGAGGGTTTGCTACA
ACGAACCTTTTTTTTTGAGAGAGAAAGGGCTTTTTGTTTTTCCAGGGGAAGACGAGTTGC
CTCCTGATGTGGCGAGCAAGCTTTTCGAGCCTCCTCTCACAGCTTTTGGGGGGGGTCGTG
ATGCCACTGAGAAGAAGAAAGAAGAGCCTATCAAACTACTTGGACCCGCCCCATAAGAGC
GCTGTACTTTTATGTTTTTGTTTGTCTTGTAACGTTTCAAAGCTTTCAGAAAAGATTGAT
AAACTTCAATGTTTATGTGATGGCAGTTCCTATTTTTGATT

QA 1 521 1 521
DS 



AS 1 6

CO CL987Contig1 724 6 14 U
GAAATAAAATAAAGATTCATTGAAGAAGTGGTTTAACTCATTAGTTCAGGAACCTTAAAG
AGTAGAATAGAACAGAAGATGCGAGGCTTTAATAAAAGAAAACTGAACTAACAAAAGGTG
GGATTATAGCATTAAAACAACTTAAAAGCTTGAAGGGTTGTTGTCTAAGATCTTGGCTTC
TCCTTCTTCTCCTTGAAGAGGGCCAAGAGTGAGACACCAGAAACCTTGACGACCTTGAAC
CTGACTCCGGGAATATCTCCCACGGCATGACCCTTACGACCAAACCCAGCAATCAACACC
TCGTCATTTTCCTCAATGTAGTTCAAGCAACCATCGTTGGGAACAAAAGCGGCAATCTTC
TTTCCGTTCTTAATAAGCTGCACTCTAGCACACTTACGGATAGCAGAGTTAGGCTGCTTA
GCCTCAATACCAATTTTCTCAAGAACGATTCCTTTGGCGTGAGAAGAACCGGCAAAAGGC
TTCTTCCATTCGTTTCCCTGATGGGACTTCTTGTACTGCTTGTCAGCCCACCTCTGATTG
ATACGAAGCCTTTTGAGCTTGCGACCAGCTCCCATACCCCTTGTCTTACCCATGGTTGTT
TGTCGAAGGAGGAGAAGATCAACAGCAAAGAGGTTGATGCGGCAAGCAAGAGGATGATAA
TACTGAAAACCCTCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTC
GACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 

AF RS1A265TR U 35
AF RS1CC62JQ U 1
AF RS1A265JQ U 35
AF RS1CC62TF C 1
AF RS1A265TF C 35
AF RS1A265TV C 35
BS 1 80 RS1CC62JQ
BS 81 81 RS1A265JQ
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BS 596 676 RS1CC62JQ
BS 677 724 RS1A265TF

RD RS1A265TR 582 0 0
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QA 1 582 1 582
DS 

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TACTGAAAACCCTCCC

QA 1 676 1 676
DS 

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TACGACCAAACCCAGCAATCAACACCTCGTCATTTTCCTCAATGTAGTTCAAGCAACCAT
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TGGCGTGAGAAGAACCGGCAAAAGGCTTCTTCCATTCGTTTCCCTGATGGGACTTCTTGT
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QA 1 641 1 641
DS 

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GCCTCAATACCAATTTTCTCAAGAACGATTCCTTTGGCGTGAGAAGAACCGGCAAAAGGC
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TACTGAAAACCCTCCC

QA 1 676 1 676
DS 

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TACGACCAAACCCAGCAATCAACACCTCGTCATTTTCCTCAATGTAGTTCAAGCAACCAT
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TGGCGTGAGAAGAACCGGCAAAAGGCTTCTTCCATTCGTTTCCCTGATGGGACTTCTTGT
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QA 1 690 1 690
DS 

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CACCAGAAACCTTGACGACCTTGAACCTGACTCCGGGAATATCTCCCACGGCATGACCCT
TACGACCAAACCCAGCAATCAACACCTCGTCATTTTCCTCAATGTAGTTCAAGCAACCAT
CGTTGGGAACAAAAGCGGCAATCTTCTTTCCGTTCTTAATAAGCTGCACTCTAGCACACT
TACGGATAGCAGAGTTAGGCTGCTTAGCCTCAATACCAATTTTCTCAAGAACGATTCCTT
TGGCGTGAGAAGAACCGGCAAAAGGCTTCTTCCATTCGTTTCCCTGATGGGACTTCTTGT
ACTGCTTGTCAGCCCACCTCTGATTGATACGAAGCCTTTTGAGCTTGCGACCAGCTCCCA
TACCCCTTGTCTTACCCATGGTTGTTTGTCGAAGGAGGAGAAGATCAACAGCAAAGAGGT
TGATGCGGCAAGCAAGAGGATGATAATACTGAAAACCCTCCCCCGGCCGTAATGGCCGAA
TTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 6

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GCTCTGGAGCTTCTAGGGCTAGACAACGAGAAAGCCTCCGTCGAGTTACAGAGGTTGAAA
GTCGATATGATCATCACCGATTATTGTATGCCTGGAATGACCGGTTACGAGCTTCTCAAG
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AACGGAAACAAACGGAAGCTTCCGGAAGATTCCGTTACCGTCGTCCAGGCTTCGCTTCCT
CCTCCACTGCCAACGCCGCAGCCATCGTTGATGACTCTTTCCACTGATTCGTCGGACTCT
TCTCCGCCGTTATCTCCCGTGGAGGTCTTTTCTTCGCCGCTCTCGTCTCTTGGTGATGAT
GATGTGTTGACTTCTTCGCCGGAGTGTTCGCCGACGCCGGAGGAATCGCCGATTCGACGG
CAGAAGATGGGGAGTCCGGGGTTAGATCAGTGAAAGTGTGTTTTGCTTTTACTGGGATCC
GTGTAGTAATCTATCTCCGTTAACTTTTTTTTTT**TACCTTTGACGGTTTTTTT*AATT
GCACGTTGACTTGACGCCGTCAATTTATAGTTGTCCTTTAATCTCTTTTTTTTCTCTTGT
TTCTAAAAACTTTTCGCATTTCCTATAATTATTTTGATTATATTATGCAGAAAGTTACGG
TTTTGACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1H777TF U 1
AF RS1C052TF U 273
AF RS1AK44JQ C 488
AF RS1AK44TF U 488
AF RS1C052JQ C 274
AF RS1H777JQB C 732
BS 1 360 RS1H777TF
BS 361 361 RS1C052TF
BS 362 466 RS1H777TF
BS 467 467 RS1C052TF
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BS 692 952 RS1C052TF
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BS 960 984 RS1C052JQ
BS 985 1029 RS1H777JQB

RD RS1H777TF 693 0 0
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TCTTGTCTACGTAGCTCGGAGATGCTGAACGTCGGCATCGGAGGAATGGAACCTCCACCG
TTAGATTTAGACGAAGTTCATGTCTTGGTCGTCGATGACAGCCTCGTCGATCGGATTGTC
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GCTCTGGAGCTTCTAGGGCTAGACAACGAGAAAGCCTCCGTCGAGTTACAGAGGTTGAAA
GTCGATATGATCATCACCGATTATTGTATGCCTGGAATGACCGGTTACGAGCTTCTCAAG
GAGATTAAGGAGTCGTCCAGTTTCCGACAAGTTCCGGTTGTAATAATGTCGTCGGAGAAC
GTGTTGACCAGAATCGACATGTGCCTCGAGGAAGGCGCGGAGGATTTCTTGCTGAAACCG
GTGAAACTCGCCGACGTGAAACGCCTGAGAAACTGTTTGACGGGAGACGTTAAGCTCTCC
AACGGAAACAAACGGAAGCTTCCGGAAGATTCCGTTACCGTCGTCCAGGCTTCGCTTCCT
CCTCCACTGCCAACGCCGCAGCCATCGTTGATGACTCTTTCCACTGATTCGTCG*ACTCT
TCTCCGCCGT*ATCTCCCGTGGAGGTCTTTT
CT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1C052TF 689 0 0
GGC
CTCCGTCGAGTTACAGAGGTTGAAAGTCGATATGATCATCACCGATTATTGTATGCCTGG
AATGACCGGTTACGAGCTTCTCAAGAAGATTAAGGAGTCGTCCAGTTTCCGACAAGTTCC
GGTTGTAATAATGTCGTCGGAGAACGTGTTGACCAGAATCGACATGTGCCTCGAGGAAGG
CGCGGAGGATT*CTTGCTGAAACCGGTGAAACTCGCCGACGTGAAACGCCTGAGAAACTG
TTTGACGGGAGACGTTAAGCTCTCCAACGGAAACAAACGGAAGCTTCCGGAAGATTCCGT
TACCGTCGTCCAGGCTTCGCTTCCTCCTCCACTGCCAACGCCGCAGCCATCGTTGATGAC
TCTTTCCACTGATTCGTCGGACTCTTCTCCGCCGTTATCTCCCGTGGAGGTCTTTTCTTC
GCCGCTCTCGTCTCTTGGTGATGATGATGTGTTGACTTCTTCGCCGGAGTGTTCGCCGAC
GCCGGAGGAATCGCCGATTCGACGGCAGAAGATGGGGAGTCCGGGGTTAGATCAGTGAAA
GTGTGTTTTGCTTTTACTGGGATCCGTGTAGTAATCTATCTCCGTTAACTTTTTTTTTT*
*TACCTTTGACGGTTTTTTT*AATTGCACGTTGACTTGACGCCGTCAATTTATAGTTGTC
CTTTAATCTCTTTTTTT
CTCTTTTTC

QA 4 680 4 680
DS 

RD RS1AK44JQ 427 0 0
G
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CAAACGGAAGCTTCCGGAAGATTCCGTTACCGTCGTCCAGGCTTCGCTTCCTCCTCCACT
GCCAACGCCGCAGCCATCGTTGATGACTCTTTCCACTGATTCGTCGGACTCTTCTCCGCC
GTTATCTCCCG**GAGGTCTTTTTTTCGCCGCTCTCGTCTCTTGGTGATGATGATGTGTT
GACTTCTTCGCCGGAGTGTTCGCCGACGCCGGAGGAATCGCCGATTCGACGGCAGAAGAT
GGGGAGTCCGGGGTTAGATCAGTGAAAGTGTGTTTTGCTTTTACTGGGATCCGTGTAGTA
ATCTATCTCCGTTAACTTTTTTTTTT**TACCTTTGACGGTTTTTTT*AATTGCACGTTG
ACTTGA

QA 2 427 2 427
DS 

RD RS1AK44TF 458 0 0
G
CGCCGACGTGAAACGCCTGAGAAACTGTTTGACGGGAGACGTTAAGCTCTCCAACGGAAA
CAAACGGAAGCTTCCGGAAGATTCCGTTACCGTCGTCCAGGCTTCGCTTCCTCCTCCACT
GCCAACGCCGCAGCCATCGTTGATGACTCTTTCCACTGATTCGTCGGACTCTTCTCCGCC
GTTATCTCCCG**GAGGTCTTTTCTTCGCCGCTCTCGTCTCTTGGTGATGATGATGTGTT
GACTTCTTCGCCGGAGTGTTCGCCGACGCCGGAGGAATCGCCGATTCGACGGCAGAAGAT
GGGGAGTCCGGGGTTAGATCAGTGAAAGTGTGTTTTGCTTTTACTGGGATCCGTGTAGTA
ATCTATCTCCGTTAACTTTTTTTTTT**TACCTTTGACGGTTTTTTT*AATTGCACGTTG
ACTTGACGCCGTCAATTTATAGTTGTCCTTTAATC
CC

QA 2 456 2 456
DS 

RD RS1C052JQ 711 0 0
GG
CTCCGTCGAGTTACAGAGGTTGAAAGTCGATATGATCATCACCGATTATTGTATGCCTGG
AATGACCGGTTACGAGCTTCTCAAGAAGATTAAGGAGTCGTCCAGTTTCCGACAAGTTCC
GGTTGTAATAATGTCGTCGGAGAACGTGTTGACCAGAATCGACATGTGCCTCGAGGAAGG
CGCGGAGGATT*CTTGCTGAAACCGGTGAAACTCGCCGACGTGAAACGCCTGAGAAACTG
TTTGACGGGAGACGTTAAGCTCTCCAACGGAAACAAACGGAAGCTTCCGGAAGATTCCGT
TACCGTCGTCCAGGCTTCGCTTCCTCCTCCACTGCCAACGCCGCAGCCATCGTTGATGAC
TCTTTCCACTGATTCGTCGGACTCTTCTCCGCCGTTATCTCCCGTGGAGGTCTTTTTTTC
GCCGCTCTCGTCTCTTGGTGATGATGATGTGTTGACTTCTTCGCCGGAGTGTTCGCCGAC
GCCGGAGGAATCGCCGATTCGACGGCAGAAGATGGGGAGTCCGGGGTTAGATCAGTGAAA
GTGTGTTTTGCTTTTACTGGGATCCGTGTAGTAATCTATCTCCGTTAACTTTTTTTTTT*
*TACCTTTGACGGTTTTTTT*AATTGCACGTTGACTTGACGCCGTCAATTTATAGTTGTC
CTTTAATCTCTTTTTTTTCTCTTTTTTCTAAAAACTTTTCGCATTTCCT

QA 3 711 3 711
DS 

RD RS1H777JQB 298 0 0
TTT
TTCGCCGGAGTGTTCGCCGACGCCGGAGGAATCGCCGATTCGACGGCAGAAGATGGGGAG
TCCGGGGTTAGATCAGTGAAAGTGTGTTTTGCTTTTACTGGGATCCGTGTAGTAATCTAT
CTCCGTTAACTTTTTTTTTTTTTACCTTTGACGGTTTTTTTTAATTGCACGTTGACTTGA
CCCCGTCAATTTATAGTTGTCCTTTAATCTCTTTTTTTTCTCTTGTTTCTAAAAACTTTT
CGCATTTCCTATAATTATTTTGATTATATTATGCAGAAAGTTACGGTTTTGACTT

QA 4 298 4 298
DS 



AS 3 6

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GTGTCACATCGTTGGTGTGTTTGACATTGTATTTGCGCTTCCTCTCATCTTTTTCTTCTC
TCTTACGCTCATCCTCCTTTTTCAGAGCATTAGCAAGTGCCTCCTCGTTCAATTCCAAAT
CTTCAGGAACATCGGTTCCCCAAGAGGCCATCTTCTTCTCTTCAACCTTCTTTGGGCTCT
CTTCACATGCTTCTTTGCGAGCAATATTAGCCTTCATCAGATCAAGGGAAGCCTCTGCAG
CCTCGATACCAGCAGAGCCTGTGCAGTAACTATTGCGAATCGTCTGCTGGCAACATCTAT
ATCCCCATTGATGGTCTTTCCACCACGAGCCCCAAACACTAGTGTGATTGTTAGTAAGAA
CATCTTCCTCGTATTTGCTCTTTGGCAGTATAACCTCCTGTCCCTTTATAATCCTCCCTG
CTCGGTCATACTCAACTTGTCTTTCGCTCTGTCCAAGCAAAAAGCTCCATTGGAATTTCA
TCTTCTGTAGAAGCATTCCCATACTTTTCCATGATTGTGTCCTTTGTCTGAGTCTTCAGT
TTGTCCTTTGCAACCTTGAAATTCTTGTAGAGCAACTCAGCTTGAGATGGAGCAGCTTGC
ATGTGCACGTCCTGTCCCTTGTCAATGCTTCCATGAGTGGATGTTCATCTGTTTGACTCT
AAGCTTGGCCACTGTTTCTGTACTGATATC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FW34JQ U 1
AF RS1E331JQ U 1
BS 1 53 RS1E331JQ
BS 54 54 RS1FW34JQ
BS 55 642 RS1E331JQ
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BS 654 654 RS1FW34JQ
BS 655 870 RS1E331JQ

RD RS1FW34JQ 717 0 0
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TCTTACGCTCATCCTCCTTTTTCAGAGCATTAGCAAGTGCCTCCTCGTTCAATTCCAAAT
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CTTCACATGCTTCTTTGCGAGCAATATTAGCCTTCATCAGATCAAGGGAAGCCTCTGCAG
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TCTTCTGTAGAAGC***CCCATACTTTTCCATGATTGTGTCCTTTGTCTGAGTCTTC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1E331JQ 870 0 0
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AGTTTTCTTCAGGCTAAAATGGTAACACAGGACAAACGAGAAACATTTTTTTTCAGAGGA
AATCTTTCATCGGGTCATCGTAGTGAACTCTCTTCATTCTGTAAGCTTCCATTTCTTCCA
GTGTCACATCGTTGGTGTGTTTGACATTGTATTTGCGCTTCCTCTCATCTTTTTCTTCTC
TCTTACGCTCATCCTCCTTTTTCAGAGCATTAGCAAGTGCCTCCTCGTTCAATTCCAAAT
CTTCAGGAACATCGGTTCCCCAAGAGGCCATCTTCTTCTCTTCAACCTTCTTTGGGCTCT
CTTCACATGCTTCTTTGCGAGCAATATTAGCCTTCATCAGATCAAGGGAAGCCTCTGCAG
CCTCGATACCAGCAGAGCCTGTGCAGTAACTATTGCGAATCGTCTGCTGGCAACATCTAT
ATCCCCATTGATGGTCTTTCCACCACGAGCCCCAAACACTAGTGTGATTGTTAGTAAGAA
CATCTTCCTCGTATTTGCTCTTTGGCAGTATAACCTCCTGTCCCTTTATAATCCTCCCTG
CTCGGTCATACTCAACTTGTCTTTCGCTCTGTCCAAGCAAAA*GCTCCATTGGGATTTCA
TCTTCTGTAGAAGCATTCCCATACTTTTCCATGATTGTGTCCTTTGTCTGAGTCTTCAGT
TTGTCCTTTGCAACCTTGAAATTCTTGTAGAGCAACTCAGCTTGAGATGGAGCAGCTTGC
ATGTGCACGTCCTGTCCCTTGTCAATGCTTCCATGAGTGGATGTTCATCTGTTTGACTCT
AAGCTTGGCCACTGTTTCTGTACTGATATC

QA 1 870 1 870
DS 



CO CL989Contig2 648 2 3 U
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TAAAGGGACAGGAGGTTATACTGCCAAAGAGCAAATACGAGGAAGATGTTCTTACTAACA
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CCCTTGATCTGATGAAGGCTAATATTGCTCGCAAAGAAGCATGTGAAGAGAGCCCAAAGA
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AATGTTTCTCGTTTGTCCTGTATTACCATTTTAGCCTGAAGAAAACTTATTACTTTTGCA
TCTGTTTACTCTCAACACTTGTGGTGGAAATAAACGAACCTTATTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1F169JQ C 1
AF RS1F169TF U 33
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BS 33 647 RS1F169TF
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AAGCTTACAGAATGAAGAGAGTCCACTACGATGACCCGATGAAAGACTTCCTTTGAAAAA
AATGTTTTTCGTTTGTCCTGTATTACCATTTTAGCCTGAAGAAAACTTATTACTTTTGCA
TCTGTTTACTCTCAACACTTGTGGTGGAAATAAACGAACCTTATTACG

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DS 

RD RS1F169TF 616 0 0
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AAATACGAGGAAGATGTTCTTACTAACAATCACACTAGTGTTTGGGGCTCGTGGTGGAAA
GACCATCAATGGGGATATAGATGTTGCCAGCAGACGATTCGCAATAGTTACTGCACAGGC
TCTGCTGGTATTGAGGCTGCAGAGGCTTCCCTTGATCTGATGAAGGCTAATATTGCTCGC
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ACCGATGTTCCTGAAGATTTGGAATTGAACGAGGAGGCACTTGCTAATGCTCTGAAAAAG
GAGGATGAGCGTAAGAGAGAAGAAAAAGATGAGAGGAAGCGCAAATACAATGTCAAACAC
ACCAACGATGTGACACTGGAAGAAATGGAAGCTTACAGAATGAAGAGAGTCCACTACGAT
GACCCGATGAAAGACTTCCTCTGAAAAAAATGTTTCTCGTTTGTCCTGTATTACCATTTT
AGCCTGAAGAAAACTTATTACTTTTGCATCTGTTTACTCTCAACACTTGTGGTGGAAATA
AACGAACCTTATTAC
G

QA 1 615 1 615
DS 



CO CL989Contig3 1061 2 4 U
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TGCTTTCAAGTCTAGGGAAGACCATAGGAAGCAAATCGAGTTAGAGGAGGCTCGTAAAGC
CGGGCCTGCACCAGCTGAGGTAGATGAGGATGGAAAGGAAATCAATCCTCACATTCCCCA
GTACATGTCCTCTGCTCCATGGTATCTCAACTCTGAGAAGCCGAGTCTGAAGCATCAAAG
GAAATGGAAGAGTGATCCCAATTACACTAAGTCATGGTATGACAGAGGTGCAAAGATCTA
CCAAGCTGAAAAGTACCGCAAGGGAGCATGTCAAAACTGTGGTGCGATGACACATACTGC
AAAGGCGTGTATGGATAGACCTCGCAAGATTGGAGCGAAGTACACGAACAAGAACATTGC
ACCTGATGAAAAAATCGAGAGTTTTGAACTCGACTATGACGGCAAGAGGGACAGATGGAA
TGGGTACGATACTTCAACCTACCACCGTGTGATAGACCTTTATGAAGCAAAAGAGGATGC
ACGGAAGAAGTATCTCAAGGAGCAGCAGATTAAGAAACTAGAGGACAAGAACAATAACCA
GGAAGGTAATGATGCTGCAACCAGTGATGGGGACGAAGAAGAGGATGACTTGAGGGTTGA
TGAAGCTAAGGTTGATGAGAGCAGGCAGATGGACTTTGCAAAGGTTGAGAAGCGTGTGCG
AACAACTGGTGGTGGTAGTACAGGAACTGTAAGAAATCTGCGTATCAGAGAAGACACAGC
AAAATACCTGTTGAACCTTGATATCAATTCGGCTCATTATGACCCTAAAACGCGATCCAT
GCGTGAAGACCCACTTTCAGATGCAGATCCCAATGATAAATTTTATTTGGGAGATAATCA
GTACAGAAACAGTGGCCAAGCTTTAGAGTTCAAACAGATGAACATCCACTCATGGGAAGC
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CAGAATTTCAAGGTTGCAAAGGACAAACTGAAGACTCAGAC


BQ
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AF RS1FW34TF U 1
AF RS1E331TF U 292
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BS 352 352 RS1E331TF
BS 353 601 RS1FW34TF
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GAAATGGAAGAGTGATCCCAATTACACTAAGTCATGGTATGACAGAGGTGCAAAGATCTA
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ACGGAAGAAGTATCTCAAGGAGCAGCAGATTAAGAAACTAGAGGACAAGAACAATAACCA
G

QA 1 601 1 601
DS 

RD RS1E331TF 770 0 0
G
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CATACTGCAAAGGCGTGTATGGATAGACCTCGCAAGATTGGAGCGAAGTACACGAACAAG
AACATTGCACCTGATGAAAAAATCGAGAGTTTTGAACTCGACTATGACGGCAAGAGGGAC
AGATGGGATGGGTACGATACTTCAACCTACCACCGTGTGATAGACCTTTATGAAGCAAAA
GAGGATGCACGGAAGAAGTATCTCAAGGAGCAGCAGATTAAGAAACTAGAGGACAAGAAC
AATAACCAGGAAGGTAATGATGCTGCAACCAGTGATGGGGACGAAGAAGAGGATGACTTG
AGGGTTGATGAAGCTAAGGTTGATGAGAGCAGGCAGATGGACTTTGCAAAGGTTGAGAAG
CGTGTGCGAACAACTGGTGGTGGTAGTACAGGAACTGTAAGAAATCTGCGTATCAGAGAA
GACACAGCAAAATACCTGTTGAACCTTGATATCAATTCGGCTCATTATGACCCTAAAACG
CGATCCATGCGTGAAGACCCACTTTCAGATGCAGATCCCAATGATAAATTTTATTTGGGA
GATAATCAGTACAGAAACAGTGGCCAAGCTTTAGAGTTCAAACAGATGAACATCCACTCA
TGGGAAGCATTTGACAAGGGACAGGACGTGCACATGCAAGCTGCTCCATCTCAAGCTGAG
TTGCTCTACAGAATTTCAAGGTTGCAAAGGACAAACTGAAGACTCAGAC

QA 2 770 2 770
DS 



AS 1 4

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CATAACTTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATCAGTCGACGGTACCGGACATATGC
CCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGTTGTACCTGATGAACTCAAATTCCTTTTTGAAC
TCGAGAAACAAAGCTACTGTGATCTTAAAGTTGCCAATAAAACTGACAACTATGCTGCTT
TCAAGGTAAAGACAACATCTCCAAAAAAGTATTTTGTTAGACCCAACACTGGTGTCATTC
AGCCATGGGACTCCTGCATCATTCGAGTTACTCTACAAGCGCAAAGGGAGTATCCTCCAG
ACATGCAGTGCAAAGACAAGTTTCTCCTTCAAAGCACCCTTGTTCCTCCACACACCGATG
TTGATGATCTTCCACAAGATACATTTACAAAGGACAGTGGGAAAACGTTAACGGAGTGTA
AGCTCAAGGTCTCTTATATCTCCTCCTCTACTACAACCCAAAGATCCTCTGATTCTGGAG
CTACCAATGTCGATGCAAATTCCTCTGAAACCATCTCTACTGTTCAGCGGTTGAAGGAAG
AGCGAGATGCAGCTGTAAAGCAAACACAACAGCTGCAACATGAATTGGAGATGGTGAAGA
AACGAAGAAATAACAGCGGAAATGGGTTATCCTTAAAGTTGGCAGCTTTGGTTGGACTCA
TTGGACTTATCATCGGTTTCATCCTAAAACTCACCTTAGCTTCTTCTCCCACATAGAAAG
CTATCCAAAACGGTTTTGGGGTATTCTACTCTGTTAACCCTCTCTCTCTCTCTATGATCT
GTTCTACTTTTGTTTTTGTCCATTAAAAGGTTTGCTTCTTCGTCAGTTGTATTGGATGTA
CATTTTTTGACTCAACAGACTCTTTCGTGATTTGCTTTGTACTCTTTCATTGCTTCATTT
AGTGTTGAAATGCCTAATCCTTTATTGTGAAGGAAAATCTGTTTCG


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A157TV U 1
AF RS1A157TF U 69
AF RS1A157TR C 117
AF RS1A157JQ C 163
BS 1 790 RS1A157TV
BS 791 809 RS1A157TF
BS 810 810 RS1A157TR
BS 811 910 RS1A157TF
BS 911 931 RS1A157TR
BS 932 946 RS1A157JQ

RD RS1A157TV 790 0 0
CATAACTTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATCAGTCGACGGTACCGGACATATGC
CCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGTTGTACCTGATGAACTCAAATTCCTTTTTGAAC
TCGAGAAACAAAGCTACTGTGATCTTAAAGTTGCCAATAAAACTGACAACTATGCTGCTT
TCAAGGTAAAGACAACATCTCCAAAAAAGTATTTTGTTAGACCCAACACTGGTGTCATTC
AGCCATGGGACTCCTGCATCATTCGAGTTACTCTACAAGCGCAAAGGGAGTATCCTCCAG
ACATGCAGTGCAAAGACAAGTTTCTCCTTCAAAGCACCCTTGTTCCTCCACACACCGATG
TTGATGATCTTCCACAAGATACATTTACAAAGGACAGTGGGAAAACGTTAACGGAGTGTA
AGCTCAAGGTCTCTTATATCTCCTCCTCTACTACAACCCAAAGATCCTCTGATTCTGGAG
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AGCGAGATGCAGCTGTAAAGCAAACACAACAGCTGCAACATGAATTGGAGATGGTGAAGA
AACGAAGAAATAACAGCGGAAATGGGTTATCCTTAAAGTTGGCAGCTTTGGTTGGACTCA
TTGGACTTATCATCGGTTTCATCCTAAAACTCACCTTAGCTTCTTCTCCCACATAGAAAG
CTATCCAAAACGGTTTTGGGGTATTCTACTCTGTTAACCCTCTCTCTCTCTCTATGATCT
GTTCTACTTT

QA 1 790 1 790
DS 

RD RS1A157TF 842 0 0
TCGGCCATTACGGCCGGGG
TTGTACCTGATGAACTCAAATTCCTTTTTGAACTCGAGAAACAAAGCTACTGTGATCTTA
AAGTTGCCAATAAAACTGACAACTATGCTGCTTTCAAGGTAAAGACAACATCTCCAAAAA
AGTATTTTGTTAGACCCAACACTGGTGTCATTCAGCCATGGGACTCCTGCATCATTCGAG
TTACTCTACAAGCGCAAAGGGAGTATCCTCCAGACATGCAGTGCAAAGACAAGTTTCTCC
TTCAAAGCACCCTTGTTCCTCCACACACCGATGTTGATGATCTTCCACAAGATACATTTA
CAAAGGACAGTGGGAAAACGTTAACGGAGTGTAAGCTCAAGGTCTCTTATATCTCCTCCT
CTACTACAACCCAAAGATCCTCTGATTCTGGAGCTACCAATGTCGATGCAAATTCCTCTG
AAACCATCTCTACTGTTCAGCGGTTGAAGGAAGAGCGAGATGCAGCTGTAAAGCAAACAC
AACAGCTGCAACATGAATTGGAGATGGTGAAGAAACGAAGAAATAACAGCGGAAATGGGT
TATCCTTAAAGTTGGCAGCTTTGGTTGGACTCATTGGACTTATCATCGGTTTCATCCTAA
AACTCACCTTAGCTTCTTCTCCCACATAGAAAGCTATCCAAAACGGTTTTGGGGTATTCT
ACTCTGTTAACCCTCTCTCTCTCTCTATGATCTGTTCTACTTTTGTTTTTGTCCATTAAA
AG*TTTGCTTCTTCGTCAGTTGTATTGGATGTACATTTTTTGACTCAACAGACTCTTTCG
TGATTTGCTTTGTACTCTTTCATTGCTTCATTTAGTGTTGAAA

QA 20 842 20 842
DS 

RD RS1A157TR 815 0 0
GAACTCGAGAAACAAAGCTACTGTGATCTTAAAGTTGCCAATAAAACTGACAACTATGCT
GCTTTCAAGGTAAAGACAACATCTCCAAAAAAGTATTTTGTTAGACCCAACACTGGTGTC
ATTCAGCCATGGGACTCCTGCATCATTCGAGTTACTCTACAAGCGCAAAGGGAGTATCCT
CCAGACATGCAGTGCAAAGACAAGTTTCTCCTTCAAAGCACCCTTGTTCCTCCACACACC
GATGTTGATGATCTTCCACAAGATACATTTACAAAGGACAGTGGGAAAACGTTAACGGAG
TGTAAGCTCAAGGTCTCTTATATCTCCTCCTCTACTACAACCCAAAGATCCTCTGATTCT
GGAGCTACCAATGTCGATGCAAATTCCTCTGAAACCATCTCTACTGTTCAGCGGTTGAAG
GAAGAGCGAGATGCAGCTGTAAAGCAAACACAACAGCTGCAACATGAATTGGAGATGGTG
AAGAAACGAAGAAATAACAGCGGAAATGGGTTATCCTTAAAGTTGGCAGCTTTGGTTGGA
CTCATTGGACTTATCATCGGTTTCATCCTAAAACTCACCTTAGCTTCTTCTCCCACATAG
AAAGCTATCCAAAACGGTTTTGGGGTATTCTACTCTGTTAACCCTCTCTCTCTCTCTATG
ATCTGTTCTACTTTTGTTTTTGTCCATTAAAAGGTTTGCTTCTTCGTCAGTTGTATTGGA
TGTACATTTTTTGACTCAACAGACTCTTTCGTGATTTGCTTTGTACTCTTTCATTGCTTC
ATTTAGTGTTGAAATGCCTAATCCTTTATTGTGAA

QA 1 815 1 815
DS 

RD RS1A157JQ 784 0 0
CTGACAACTATGCTGCTTTCAAGGTAAAGACAACATCTCCAAAAAAGTATTTTGTTAGAC
CCAACACTGGTGTCATTCAGCCATGGGACTCCTGCATCATTCGAGTTACTCTACAAGCGC
AAAGGGAGTATCCTCCAGACATGCAGTGCAAAGACAAGTTTCTCCTTCAAAGCACCCTTG
TTCCTCCACACACCGATGTTGATGATCTTCCACAAGATACATTTACAAAGGACAGTGGGA
AAACGTTAACGGAGTGTAAGCTCAAGGTCTCTTATATCTCCTCCTCTACTACAACCCAAA
GATCCTCTGATTCTGGAGCTACCAATGTCGATGCAAATTCCTCTGAAACCATCTCTACTG
TTCAGCGGTTGAAGGAAGAGCGAGATGCAGCTGTAAAGCAAACACAACAGCTGCAACATG
AATTGGAGATGGTGAAGAAACGAAGAAATAACAGCGGAAATGGGTTATCCTTAAAGTTGG
CAGCTTTGGTTGGACTCATTGGACTTATCATCGGTTTCATCCTAAAACTCACCTTAGCTT
CTTCTCCCACATAGAAAGCTATCCAAAACGGTTTTGGGGTATTCTACTCTGTTAACCCTC
TCTCTCTCTCTATGATCTGTTCTACTTTTGTTTTTGTCCATTAAAAGGTTTGCTTCTTCG
TCAGTTGTATTGGATGTACATTTTTTGACTCAACAGACTCTTTCGTGATTTGCTTTGTAC
TCTTTCATTGCTTCATTTAGTGTTGAAATGCCTAATCCTTTATTGTGAAGGAAAATCTGT
TTCG

QA 1 784 1 784
DS 



AS 2 6

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GGGAGGTCGTTTCGTTCGTGAAGTTTGGATCTTTTGAAACAGAGAAGGAGAATCAGGAAG
GAAGAGGAAGAAGATGTCGTTGGTGTGGCTAGAAGCGGCTCTGCCTCTGGGAATCATCGG
AGGGATGCTCTGTATTATGGGAAACTCTCAGTACTACATCCACAAAGCTTATCATGGCCG
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CGTCGAGAAAGCCTCAGCTCCTTCCTCATGAATCATGATCAGATCTGGGGCTTCAGGTGA
ACAACTTGTTGTCACAAATAAAGTTTATTCAAGAAGCTGGAGAGTCCAATACTGTTATGC
CCGTTTGATTTTTCTTGTGAGACAAGTTCCGATAAAGCTTTGAAGTTAAAAAACCTTTTT
TCTTTCTGCTTCCAAAATTCAGAGTTCAGACTTAATGACATTTGGTTTTAACTTGTCTCC
ATTTATTTGTGCATGGCATTTGGTATACAAACACTTCTTGCTGTGTGAATGAATAATAAT
CTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 

AF RS1AB20TF U 1
AF RS1FL94TF U 123
BS 1 412 RS1AB20TF
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RD RS1AB20TF 542 0 0
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GAAGAGGAAGAAGATGTCGTTGGTGTGGCTAGAAGCGGCTCTGCCTCTGGGAATCATCGG
AGGGATGCTCTGTATTATGGGAAACTCTCAGTACTACATCCACAAAGCTTATCATGGCCG
TCCGAAGCACATCGGGCACGATGAGTGGGATGTTGCAATGGAGAGACGCGATAAGAAAGT
CGTCGAGAAAGCCTCAGCTCCTTCCTCATGAATCATGATCAGATCTGGGGCTTCAGGTGA
ACAACTTGTTGTCACAAATAAAGTTTATTCAAGAAGCTGGAGAGTCCAATACTGTTATGC
CCGTTTGATTTTTCTTGTGAGACAAGTTCCGATAAAGCTTTGAAGTTAAAAACCTTTTTT
TCTTTCTGCTTCCAAAATTCAGAGTTCAGACTTAATGACATTTGGTTTTAACTTGTCTCC
ATTTATTTGTGCATGGCATTTGGTATACAAACACTTCTTGCTGTGTGAATGAGTAATAAT
CT

QA 1 542 1 542
DS 

RD RS1FL94TF 422 0 0
GGATGCTCTGTATTATGGGAAACTCTCAGTACTACATCCACAAAGCTTATCATGGCCGTC
CGAAGCACATCGGGCACGATGAGTGGGATGTTGCAATGGAGAGACGCGATAAGAAAGTCG
TCGAGAAAGCCTCAGCTCCTTCCTCATGAATCATGATCAGATCTGGGGCTTCAGGTGAAC
AACTTGTTGTCACAAATAAAGTTTATTCAAGAAGCTGGAGAGTCCAATACTGTTATGCCC
GTTTGATTTTTCTTGTGAGACAAGTTCCGATAAAGCTTTGAAGTTTAAAAACCTTTTTTC
TTTCTGCTTCCAAAATTCAGAGTTCAGACTTAATGACATTTGGTTTTAACTTGTCTCCAT
TTATTTGTGCATGGCATTTGGTATACAAACACTTCTTGCTGTGTGAATGAATAATAATCT
TG

QA 1 422 1 422
DS 



CO CL991Contig2 544 4 1 U
GGAAGTTTGGATATTTTGATACAGAGAAGGAGAATCAGGAAGGAAGAAGAAGATGTCGTT
GGTGTGGCTAGAAGCGGCTTTGCCTCTGGGAATCATCGGAGGGATGCTTTGTATTATGGG
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TTCTTCATGATCCTCCGACCAGGGGGCTTCAGGTGAACAACTTGTTGTCACAAATAAAGT
TTATTCCAGAAGAAGAAGCTGGAGAGTCCAATACTGTTATTCCCGTTTGATTTTTCTTGT
GAGACAAGTTCCGATAAAGCTTTGAAGTTTAAAAACCTTTTTTTCTTTCTGCTTCCAAAA
TTCAGAGTTCAGACTTAATGACATTTGGTTTATAACTTGTCTCCATTTATTTGTGCATGG
CATTTGGTATACAAACACTTCTTGCTGTGTGAATGAATAATAATCTTGAAAAAGGGGTCA
TCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RS1DK50JQ C 261
AF RS1DK50TF U 261
AF RS1EN42TF U 1
AF RS1EN42JQ C 241
BS 1 544 RS1EN42TF

RD RS1DK50JQ 268 0 0
G
GGGGGCTTCAGGTGAACAACTTGTTGTCACAAATAAAGTTTATTCCAGAAGAAGAAGCTG
GAGAGTCCAATACTGTTATTCCCGTTTGATTTTTCTTGTGAGACAAGTTCCGATAAAGCT
TTGAAGTTTAAAAACCTTTTTTTCTTTCTGCTTCCAAAATTCAGAGTTCGGACTTAATGA
CATTTGGTTTATAACTTGTCTCCATTTATTTGTGCATGGCATTTGGTATACAAACACTTC
TTGCTGTGTGAATGAATAATAATCTTG

QA 2 268 2 268
DS 

RD RS1DK50TF 268 0 0
G
GGGGGCTTCAGGTGAACAACTTGTTGTCACAAATAAAGTTTATTCCAGAAGAAGAAGCTG
GAGAGTCCAATACTGTTATTCCCGTTTGATTTTTCTTGTGAGACAAGTTCCGATAAAGCT
TTGAAGTTTAAAAACCTTTTTTTCTTTCTGCTTCCAAAATTCAGAGTTCGGACTTAATGA
CATTTGGTTTATAACTTGTCTCCATTTATTTGTGCATGGCATTTGGTATACAAACACTTC
TTGCTGTGTGAATGAATAATAATCTTG

QA 2 268 2 268
DS 

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GGTGTGGCTAGAAGCGGCTTTGCCTCTGGGAATCATCGGAGGGATGCTTTGTATTATGGG
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TTATTCCAGAAGAAGAAGCTGGAGAGTCCAATACTGTTATTCCCGTTTGATTTTTCTTGT
GAGACAAGTTCCGATAAAGCTTTGAAGTTTAAAAACCTTTTTTTCTTTCTGCTTCCAAAA
TTCAGAGTTCAGACTTAATGACATTTGGTTTATAACTTGTCTCCATTTATTTGTGCATGG
CATTTGGTATACAAACACTTCTTGCTGTGTGAATGAATAATAATCTTGAAAAAGGGGTCA
TCGC

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DS 

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TTT
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TTCCAGAAGAAGAAGCTGGAGAGTCCAATACTGTTATTCCCGTTTGATTTTTCTTGTGAG
ACAAGTTCCGATAAAGCTTTGAAGTTTAAAAACCTTTTTTTCTTTCTGCTTCCAAAATTC
AGAGTTCAGACTTAATGACATTTGGTTTATAACTTGTCTCCATTTATTTGTGCATGGCAT
TTGGTATACAAACACTTCTTGCTGTGTGAATGAATAATAATCTTGAAAAAGGGGTCATCG
C

QA 4 304 4 304
DS 



AS 1 5

CO CL992Contig1 1354 5 18 U
CTGTGCAAATCAATATTTTTCATGAGATTATAAATATACCTCAAAGCAAATATTGCTTCT
ATGGTTTCCAAAAAAAAGACATTGATTTGTACTTAATGTCTCTTTAATACAAATAAGTGA
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GTTTGTTAGTTAAAAGCGTTGGGATCTGTCCGTGATTCACGAAATCAATCTTGTTCAACC
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TGAATGGCACTATTGATTCTCTTGTGAATCCTTTCACTTTCTCCATCTCATCATCCATAA
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TGAAGTATAAGACTAAGCTAAGTCCTTCACCATCATAGTCACCAAACATAGAGGTCTGAT
ACATTGGAAGCTGGATGTTCACAATCAAGATATTAGGGACATCACAGACTTGTGATGACG
TTGGTTTCAAGTTAGGGAGCTCAATGTGTTGAGCAATGTGGTTTATCTTCTTAGGACACG
CGAAAAGATCGACTCCGATTGGTGTGTATGGACTACAGTTTGGTGCTGGATTCTTTTGTC
TGTCTCTGAAGAAGCTCAATCCACGTAGCTTGAAATTCGATGGAGCAAGTTCTAACCAGC
TCCCTTGATTGTTCAGCTTCTCTCCCAAAGAACGTTGAATCACAGAACCGGCTTTTGGTC
GGTATAATTCAGATGATGTTGATTTTCTGTCAATAGATGTTCTTCGAACCGAAACCATAA
CAACTTTTGATGATCTCTTATTGTGATCTTGATGTTCTTGACAAGTAGTAGTCTTGACAG
TTTCTTGGTGACATTCATCAGCAATTTGGTCTCTCTTTATGCTGACTTCATTCTTGCTTG
AGTATGTCTCAGCTTTGTTCCCATCTATTTTCAGGTAACTCTCGTAGAACTCTTCATACT
GAATCAATTGTCCCATCCCAGAAGGATTTGCATCTTCAAAAACACTACAATTTGATCCAT
CATCAGACTCAGAGTCAATGTAACTATAGGAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 5 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EY15JQ U 43
AF RS1DT65TF C 46
AF RS1DT65JQ U 55
AF RS1BB51JQ U 1
AF RS1BB51TF C 552
BS 1 69 RS1BB51JQ
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BS 783 1354 RS1BB51TF

RD RS1EY15JQ 584 0 0
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CTTCTATGGTTTCCAAAAAAAAGACATTGATTTGTACTTAATGTCTCTTTAATACAAATA
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CTCTCTGAATGGCACTATTGATTCTCTTGTGAATCCTTTCACTTTCTCCATCTCATCATC
CATAAATCTCTTGATGGTGTCTTGAAAGTGA

QA 14 584 14 584
DS 

RD RS1DT65TF 657 0 0
TTTTTTTTTA
CTTCTATGGTTTCCAAAAAAAAGACATTGATTTGTACTTAATGTCTCTTTAATACAAATA
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TCATTGTTTGTTAGTTAAAAGCGTTGGGATCTGTCCGTGATTCACGAAATCAATCTTGTT
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CGATATGTAACTGAACCTGTGTATATCCAAATCGATCTCGAAGTAGTTTGGTCCCTTAAA
GAAATCGTGTTGGGGAC*AGAAAGAACAGGTTTATCACTGTAAGCTGTGATAAGTTTCCT
TTCAGTAGAACATAGCTGAAGATCGTCAGGATTCACCAAACCGGCCAAGATCTTCAACCT
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CATAAATCTCTTGATGGTGTCTTGAAAGTGAGATGAGATCTCTTTGTGATAATTCTCATT
CAGTTTGAAGTATAAGACTAAGCTAAGTCCTTCACCATCATAGTCAC

QA 11 657 11 657
DS 

RD RS1DT65JQ 648 0 0
A
CTTCTATGGTTTCCAAAAAAAAGACATTGATTTGTACTTAATGTCTCTTTAATACAAATA
AGTGAGAAGGTTCTCTGTTTTGGTTTTGTCTCTTCGTAGTGAATTAGATGGGGACACTCA
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TAAACCAAGATCAAGAACCCCATTCTTGATCCTATCCCTGAAAGATTCCTGTCCTTTCCT
CGATATGTAACTGAACCTGTGTATATCCAAATCGATCTCGAAGTAGTTTGGTCCCTTAAA
GAAATCGTGTTGGGGAC*AGAAAGAACAGGTTTATCACTGTAAGCTGTGATAAGTTTCCT
TTCAGTAGAACATAGCTGAAGATCGTCAGGATTCACCAAACCGGCCAAGATCTTCAACCT
CTCTCTGAATGGCACTATTGATTCTCTTGTGAATCCTTTCACTTTCTCCATCTCATCATC
CATAAATCTCTTGATGGTGTCTTGAAAGTGAGATGAGATCTCTTTGTGATAATTCTCATT
CAGTTTGAAGTATAAGACTAAGCTAAGTCCTTCACCATCATAGTCAC

QA 2 648 2 648
DS 

RD RS1BB51JQ 782 0 0
CTGTGCAAATCAATATTTTTCATGAGATTATAAATATACCTCAAAGCAAATATTGCTTCT
ATGGTTTCCGAAAAAAAGACATTGATTTGTACTTAATGTCTCTTTAATACAAATAAGTGA
GAAGGTTCTCTGTTTTGGTTTTGTCTCTTCGTAGTGAATTAGATGGGGACACTCATCATT
GTTTGTTAGTTAAAAGCGTTGGGATCTGTCCGTGATTCACGAAATCAATCTTGTTCAACC
TGACACAACACAGTACTTGCTCTGGAAGTTCCTCTGGTGATTGAGCCTGAATAGTTAAAC
CAAGATTAAGAAACCCATTCTTGATCCTATCCCTGAAAGATTCCAGTCCTTTCCTCGATA
TGTAACTGAACCTGTGTATATCCAAATCGATCTCGAAGTAGTTTGGTCCCTTAAAGAAAT
CGTGTTGGGGACGAGAAAGAACAGGTTTATCATTGTAAGCTGTGATAAGTTTCCTTTCAG
TAGAACATAGCTGAAGATCGTCAGGATTCACCAAACCGGCCAAGATCTTCAACCTCTCTC
TGAATGGCACTATTGATTCTCTTGTGAATCCTTTCACTTTCTCCATCTCATCATCCATAA
ATCTCTTGATGGTGTCTTGAACGTGAGATGAGATCTCTTTGTGATAATTCTCATTCAGTT
TGAAGTATAAGACTAAGCTAAGTCCTTCACCATCATAGTCACCAAACATAGAGGTCTGAT
ACATTGGAAGCTGGATGTTCACAATCAAGATATTAGGGACATCACAGACTTGTGATGACG
TT

QA 1 782 1 782
DS 

RD RS1BB51TF 803 0 0
ACTATTGATCTCTGTG
ATCCTTTCACTTTCTCCATCTCATCATCCATAAATCTCTTGATGGTGTCT*GAACGTGAG
ATGAGATCTCTTTGTGATAAT*CTCATTCAGTTTGAAGTATAAGACTAAGCTAAGTCCTT
CACCATCATAGTCACCAAACATAGAGGTCTGATACATTGGAAGCTGGATGTTCACAATCA
AGATATTAGGGACATCACAGACTTGTGATGACGTTGGTTTCAAGTTAGGGAGCTCAATGT
GTTGAGCAATGTGGTTTATCTTCTTAGGACACGCGAAAAGATCGACTCCGATTGGTGTGT
ATGGACTACAGTTTGGTGCTGGATTCTTTTGTCTGTCTCTGAAGAAGCTCAATCCACGTA
GCTTGAAATTCGATGGAGCAAGTTCTAACCAGCTCCCTTGATTGTTCAGCTTCTCTCCCA
AAGAACGTTGAATCACAGAACCGGCTTTTGGTCGGTATAATTCAGATGATGTTGATTTTC
TGTCAATAGATGTTCTTCGAACCGAAACCATAACAACTTTTGATGATCTCTTATTGTGAT
CTTGATGTTCTTGACAAGTAGTAGTCTTGACAGTTTCTTGGTGACATTCATCAGCAATTT
GGTCTCTCTTTATGCTGACTTCATTCTTGCTTGAGTATGTCTCAGCTTTGTTCCCATCTA
TTTTCAGGTAACTCTCGTAGAACTCTTCATACTGAATCAATTGTCCCATCCCAGAAGGAT
TTGCATCTTCAAAAACACTACAATTTGATCCATCATCAGACTCAGAGTCAATGTAACTAT
AGGAATC

QA 17 803 17 803
DS 



AS 1 5

CO CL993Contig1 786 5 17 U
GGATCGTCTAATTCGCTGTTTTCATATTTGGCTGAGAGAGACTATGGCTGAGGAACAAAA
GATAACATTAGACACAGCACCTCCGGCTCCGGCTCCGGCTGAGACTCTTGCTCCACCTCC
GGCTGCAGCTGAGACTCCTTCTCCAACTCCAGCTCCGGCTCCGGAAAAAACTGCTGATGA
CTCCAAAGCCCTTACCATCGTGGAGAAACCTTTAGAGCCTTCACCAAAGAAAGCTTCGTC
TGGTGGTTCGATCGATAGAGATATTAAGCTAGCTGATTTGTCAAAGGAGAAGACATTGGC
TTATGTCAAAGCATGGGAAGATAGCGAAAAGACCAAAGCTGAGAACAAAGCTGAGAAGAA
GATGTCTGATATTCTTGCTTGGGAAAACAGCAAGAAAGCAGCTGTTGAAGCCCAACTCAA
GAAAATCGAGGAGCAACTTGAGAATAAGAAAGCAGAGTATGCAGAGAAGATGAAGAACAA
AGTTGCAGCAATTCACAAAGAGGCAGAAGAGAGAAGAGCCATGATTGAAGCTAAGTGTGG
AGAAGATGTTCTCAAAGCTGAAGAGATGGCTGCTAAACACAGAGCCACCGGTATTGTCCC
CAAGGCAACCTGTGGTTGTTTCTGATCTTTTAAATTTGCTTTCAAATGAATTTTTTTTTT
*CAAACTGTAAAGTGTAAACATTTCACTCTTTCTCCTATTCAGTGGCTTTGTAATATTTG
TTTGTATATTGACTTTTTGTGTGAACATCAGAGTGAGAAAAAATGTGTTAATTGTTCATT
CCTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1BS45TF U 1
AF RS1D843TF U 69
AF RS1FW75TF U 8
AF RS1D843JQ C 239
AF RS1FW75JQ C 121
BS 1 102 RS1BS45TF
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BS 781 786 RS1FW75JQ

RD RS1BS45TF 714 0 0
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CAAG*CAACCTGTGGTTGTTTCTGATCTTTTAAATTTGCTTTCAAATGAATTTTTTTTT*
*CAAACTGTAAAGTGTAA*CATTTCACTCTT*CTCCTATTCAGTGGCTTTGTAA

QA 1 714 1 714
DS 

RD RS1D843TF 606 0 0
GAGACACAA
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CTTCTCCAACTCCAGCTCCGGCTCCGGAAAAAACTGCTGATGACTCCAAAGCCCTTGCCA
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GAGATATTAAGCTAGCTGATTTGTCAAAGGAGAAGACATTGGCTTATGTCAAAGCATGGG
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CTTGGGAAAACAGCAAGAAAGCAGCTGTTGAAGCCCAACTCAAGAAAATCGAGGAGCAAC
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AAGAGGCAGAAGAGAGAAGAGCCATGATTGAAGCTAAGTGTGGAGAAGATGTTCTCAAAG
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GTTTCTGATCTTTTAAATTTGCTTTCAAATGAATTTTTTTTTT*CAAACTGTAAAGT

QA 10 606 10 606
DS 

RD RS1FW75TF 779 0 0
GG
AATTCGCTGTTTTCATATTTGGCTGAGAGAGACTATGGCTGAGGAACAAAAGATAACATT
AGACACAGCACCTCCGGCTCCGGCTCCGGCTGAGACTCTTGCTCCACCTCCGGCTGCAGC
TGAGACTCCTTCTCCAACTCCAGCTCCGGCTCCGGAAAAAACTGCTGATGACTCCAAAGC
CCTTACCATCGTGGAGAAACCTTTAGAGCCTTCACCAAAGAAAGCTTCGTCTGGTGGTTC
GATCGATAGAGATATTAAGCTAGCTGATTTGTCAAAGGAGAAGACATTGGCTTATGTCAA
AGCATGGGAAGATAGCGAAAAGACCAAAGCTGAGAACAAAGCTGAGAAGAAGATGTCTGA
TATTCTTGCTTGGGAAAACAGCAAGAAAGCAGCTGTTGAAGCCCAACTCAAGAAAATCGA
GGAGCAACTTGAGAATAAGAAAGCAGAGTATGCAGAGAAGATGAAGAACAAAGTTGCAGC
AATTCACAAAGAGGCAGAAGAGAGAAGAGCCATGATTGAAGCTAAGTGTGGAGAAGATGT
TCTCAAAGCTGAAGAGATGGCTGCTAAACACAGAGCCACCGGTATTGTCCCCAAGGCAAC
CTGTGGTTGTTTCTGATCTTTTAAATTTGCTTTCAAATGAATTTTTTTTTTTCAAACTGT
AAAGTGTAAACATTTCACTCTTTCTCCTATTCAGTGGCTTTGTAATATTTGTTTGTATAT
TGACTTTTTGTGTGAACATCAGAGTGAGAAAAA*TGTGTTAATTGTTCATT
CCTTGC

QA 3 773 3 773
DS 

RD RS1D843JQ 542 0 0
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GCTTATGTCAAAGCATGGGAAGATAGCGAAAAGACCAAAGCTGAGAACAAAGCTGAGAAG
AAGATGTCTGATATTCTTGCTTGGGAAAACAGCAAGAAAGCAGCTGTTGAAGCCCAACTC
AAGAAAATCGAGGAGCAACTTGAGAATAAGAAAGCAGAGTATGCAGAGAAGATGAAGAAC
AAAGTTGCAGCAATTCACAAAGAGGCAGAAGAGAGAAGAGCCATGATTGAAGCTAAGTGT
GGAGAAGATGTTTTCAAAGCTGAAGAGATGGCTGCTAAACACAGAGCCACCGGTATTGTC
CCCAAGGCAACCTGTGGTTGTTTCTGATCTTTTAAATTTGCTTTCAAATGAATTTTTTTT
TT*CAAACTGTAAAGTGTAAACATTTCACTCTTTCTCCTATTCAGTGGCTTTGTAATATT
TGTTTGTATATTGACTTTTTGTGTGAACATCAGAGTGAGAAAAAATGTGTTAATTGTTCA
TT

QA 1 542 1 542
DS 

RD RS1FW75JQ 666 0 0
GGCTGCAGCTGAGACTCCTTCTCCAACTCCAGCTCCGGCTCCGGAAAAAACTGCTGATGA
CTCCAAAGCCCTTACCATCGTGGAGAAACCTTTAGAGCCTTCACCAAAGAAAGCTTCGTC
TGGTGGTTCGATCGATAGAGATATTAAGCTAGCTGATTTGTCAAAGGAGAAGACATTGGC
TTATGTCAAAGCATGGGAAGATAGCGAAAAGACCAAAGCTGAGAACAAAGCTGAGAAGAA
GATGTCTGATATTCTTGCTTGGGAAAACAGCAAGAAAGCAGCTGTTGAAGCCCAACTCAA
GAAAATCGAGGAGCAACTTGAGAATAAGAAAGCAGAGTATGCAGAGAAGATGAAGAACAA
AGTTGCAGCAATTCACAAAGAGGCAGAAGAGAGAAGAGCCATGATTGAAGCTAAGTGTGG
AGAAGATGTTCTCAAAGCTGAAGAGATGGCTGCTAAACACAGAGCCACCGGTATTGTCCC
CAAGGCAACCTGTGGTTGTTTCTGATCTTTTAAATTTGCTTTCAAATGAATTTTTTTTTT
TCAAACTGTAAAGTGTAAACATTTCACTCTTTCTCCTATTCAGTGGCTTTGTAATATTTG
TTTGTATATTGACTTTTTGTGTGAACATCAGAGTGAGAAAAAATGTGTTAATTGTTCATT
CCTTGC

QA 1 666 1 666
DS 



AS 2 5

CO CL994Contig1 671 3 2 U
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TTCCATTGTCTACCTACCTCAGGACCTTCAAAGTCGGCGACTACGTCGATGTTAAAGTGA
ACGGTGCGATCCACAAGGGTATGCCTCACAAGTTCTACCACGGTCGTACCGGTCGTGTCT
GGAACGTCACCAAACGTGCTGTCGGTGTCGAAGTTAACAAACAGATTGGCAACAGGATCA
TTAAGAAGAGGCTTCATGTGCGTGTGGAGCACGTGCAGCAGTCAAGGTGCGCAGAGGAGT
TCAAGCTGAGGAAGAAAAAGAACGATGAGCTCAAGGCTGCAGCCAAAGCCAAGGGTGAGA
CGATAAGCACCAAGAGGCAGCCTAAAGGCCCCAAACCAGGATTCATGGTTGAGGGTATGA
CCTTGGAGACTGTCACTCCTATCCCTTACGATGTCGTCAACGATCTCAAGGGAGGCTATT
AGTTTTCTACTTACCTTCCCCCAGTGTTTTGTGTGTTTCTATCTTTCCTTCATATGTTTT
GTAGCAACTCAAGACTTTCGTCTTCAATCAAGAACATGATTTTATTATATAGCAGAAGTT
TTGTTATTGAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RS1A527TF U 1
AF RS1A549TF U 1
AF RS1DD80JQ C 25
BS 1 669 RS1A527TF
BS 670 671 RS1DD80JQ

RD RS1A527TF 669 0 0
GACTGGTTCGGCGGCTCCCTAGGGTTTTCACTTGTAGCAGGAAAAAAATGCCGGCAGGAC
ATGGAGTTCGTGCTAGAACAAGAGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAA
TTCCATTGTCTACCTACCTCAGGACCTTCAAAGTCGGCGACTACGTCGATGTTAAAGTGA
ACGGTGCGATCCACAAGGGTATGCCTCACAAGTTCTACCACGGTCGTACCGGTCGTGTCT
GGAACGTCACCAAACGTGCTGTCGGTGTCGAAGTTAACAAACAGATTGGCAACAGGATCA
TTAAGAAGAGGCTTCATGTGCGTGTGGAGCACGTGCAGCAGTCAAGGTGCGCAGAGGAGT
TCAAGCTGAGGAAGAAAAAGAACGATGAGCTCAAGGCTGCAGCCAAAGCCAAGGGTGAGA
CGATAAGCACCAAGAGGCAGCCTAAAGGCCCCAAACCAGGATTCATGGTTGAGGGTATGA
CCTTGGAGACTGTCACTCCTATCCCTTACGATGTCGTCAACGATCTCAAGGGAGGCTATT
AGTTTTCTACTTACCTTCCCCCAGTGTTTTGTGTGTTTCTATCTTTCCTTCATATGTTTT
GTAGCAACTCAAGACTTTCGTCTTCAATCAAGAACATGATTTTATTATATAGCAGAAGTT
TTGTTATTG

QA 1 669 1 669
DS 

RD RS1A549TF 669 0 0
GACTGGTTCGGCGGCTCCCTAGGGTTTTCACTTGTAGCAGGAAAAAAATGCCGGCAGGAC
ATGGAGTTCGTGCTAGAACAAGAGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAA
TTCCATTGTCTACCTACCTCAGGACCTTCAAAGTCGGCGACTACGTCGATGTTAAAGTGA
ACGGTGCGATCCACAAGGGTATGCCTCACAAGTTCTACCACGGTCGTACCGGTCGTGTCT
GGAACGTCACCAAACGTGCTGTCGGTGTCGAAGTTAACAAACAGATTGGCAACAGGATCA
TTAAGAAGAGGCTTCATGTGCGTGTGGAGCACGTGCAGCAGTCAAGGTGCGCAGAGGAGT
TCAAGCTGAGGAAGAAAAAGAACGATGAGCTCAAGGCTGCAGCCAAAGCCAAGGGTGAGA
CGATAAGCACCAAGAGGCAGCCTAAAGGCCCCAAACCAGGATTCATGGTTGAGGGTATGA
CCTTGGAGACTGTCACTCCTATCCCTTACGATGTCGTCAACGATCTCAAGGGAGGCTATT
AGTTTTCTACTTACCTTCCCCCAGTGTTTTGTGTGTTTCTATCTTTCCTTCATATGTTTT
GTAGCAACTCAAGACTTTCGTCTTCAATCAAGAACATGATTTTATTATATAGCAGAAGTT
TTGTTATTG

QA 1 669 1 669
DS 

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TTTTTACTTGTAGCAGGAAAAAAATGCCGGCAGGACATGGAGTTCGTGCTAGAACAAGAG
ATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAATTCCATTGTCTACCTACCTCAGGA
CCTTCAAAGTCGGCGACTACGTCGATGTTAAAGTGAACGGTGCGATCCACAAGGGTATGC
CTCACAAGTTCTACCACGGTCGTACCGGTCGTGTCTGGAACGTCACCAAACGTGCTGTCG
GTGTCGAAGTTAACAAACAGATTGGCAACAGGATCATTAAGAAGAGGCTTCATGTGCGTG
TGGAGCACGTGCAGCAGTCAAGGTGCGCAGAGGAGTTCAAGCTGAGGAAGAAAAAGAACG
ATGAGCTCAAGGCTGCAGCCAAAGCCAAGGGTGAGACGATAAGCACCAAGAGGCAGCCTA
AAGGCCCCAAACCAGGATTCATGGTTGAGGGTATGACCTTGGAGACTGTCACTCCTATCC
CTTACGATGTCGTCAACGATCTCAAGGGAGGCTATAAGTTTTCTACTTACCTTCCCCCAG
TGTTTTGTGTGTTTCTATCTTTCCTTCATATGTTTTGTAGCAACTCAAGACTTTCGTCTT
CAATCAAGAACATGATTTTATTATATAGCAGAAGTTTTGTTATTGAC

QA 1 647 1 647
DS 



CO CL994Contig2 700 2 2 U
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CTAAAGCACATGAAGAACACTCAAATAACGAACAAGAAACAGCCAAAAAAGTCTGAGCAA
AACACTGGGGGAGGGGGAAGAAAGTAGAAAAACTAATAGCCACCCTTGAGATCGTTGACG
ACATCGTAAGGGATAGGAGTGACAGTCTCCAAGGTCATACCCTCAACCATGAATCCTGGT
TTGGGGCCTTTAGGCTGCCTCTTGGTGCTTATTGTCTCACCTTTGGCTTTAGCTGCAGCC
TTGAGCTCATCATTTTTCTTCTTCCTCAGCTTGAACTCCTCTGCGCACCTTGACTGCTGC
ACGTGTTTCACACGCACATGAAGCCTCTTCCTTATGATCCTGTTGCCAATCTGTTTATTG
ACTTCGACACCGACAGCACGTTTGGTGACGTTCCAGACACGACCGGTACGACCGTGGTAG
AACTTGTGAGGCATACCCTTGTGGATCGCACCATTCACCTTAACATCGACGTAGTCACCC
ACCTTGAAGGTCCTGAGGTAGGTAGACAATGGAATTGTACCCTTCTTCCTGAACCCTCTA
GCGAACAGATCTCTTGTCCTAGCACGAACTCCATGACCCGCCGGCATTTTTTTCTCTCGA
GTGGGACGCGACAAGTGATAAACCTAAAATCGCCGACCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CA26TF C 1
AF RS1CA26JQ U 143
BS 1 148 RS1CA26TF
BS 149 700 RS1CA26JQ

RD RS1CA26TF 700 0 0
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TTGGGGCCTTTAGGCTGCCTCTTGGTGCTTATTGTCTCACCTTTGGCTTTAGCTGCAGCC
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ACCTTGAAGGTCCTGAGGTAGGTAGACAATGGAATTGTACCCTTCTTCCTGAACCCTCTA
GCGAACAGATCTCTTGTCCTAGCACGAACTCCATGACCCGCCGGCATTTTTTTCTCTCGA
GTGGGACGCGACAAGTGATAAACCTAAAATCGCCGACCCT

QA 1 700 1 700
DS 

RD RS1CA26JQ 558 0 0
AGTAGA
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GCTTGAACTCCTCTGCGCACCTTGACTGCTGCACGTGTTTCACACGCACATGAAGCCTCT
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CGTTCCAGACACGACCGGTACGACCGTGGTAGAACTTGTGAGGCATACCCTTGTGGATCG
CACCATTCACCTTAACATCGACGTAGTCACCCACCTTGAAGGTCCTGAGGTAGGTAGACA
ATGGAATTGTACCCTTCTTCCTGAACCCTCTAGCGAACAGATCTCTTGTCCTAGCACGAA
CTCCATGACCCGCCGGCATTTTTTTCTCTCGAGTGGGACGCGACAAGTGATAAACCTAAA
ATCGCCGACCCT

QA 7 558 7 558
DS 



AS 2 6

CO CL995Contig1 840 2 6 U
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CGGTGATGCAGATGCTCAAGGACCGTGGCTACTTCGTCGCTGATTCCGAGATCACGATGA
CCCTATCACAGTTTGTTAGGAAGTATGGTGACAACATGAAAAGGGATGATCTTGTTACTC
TCAGAGCTAAGAGAAACGATAGCAGTGATCAGGTACTTGATTATCTCATTGGTGTAAGAG
ACAACATGTGATCTTGTTTAATCTGAATGTTTTGCCATTAAAAGCATAGAGCAAGATTGT
TTTCATGTTGTACGTAGCTGTATATCTTCTTCCCTGAAGAGTCGAAAGTGGGAGTGAACA
CAATGAAAGTGTACACAAACCGGATGAAGTCGGAGAATGTTCACAGAGCAATCCTGGTTG
TGCAACAGAACCTCACTCCTTTTGCTCGTAATTGCATTAGTCAGATCTCTTCTATTTTCC
ATTTGGAAGTTTTCCAGGAGGCAGAAATGCTAGTGAGCATTAAAGAACATGTACTTGTTC
CGGAGCATCAAGTTCTGACCACTGAAGAGAAGAAAACTTTACTCGAGAGGTACACTGTCA
AGGAGACACAGCTTCCAAGGATTCAAGTGACGATCCAATCGCAAGACACTTTGGACTAAA
ACGTGGCCAAGTCATCAAGATCATACGTCCCAGTGAAACCGCTGGTCGTTATGTTACCTA
TCGTTATGTTGTATAATAAAGCTAAAAGTGCTTCTTGATTTTGTGAAAGATTAGAGAATA
ATTGTTTTGTTCCAAACTCTTGACAATATTCTTTGTTTTGTTTTTTTTAACACGCAACGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CK26TF U 1
AF RS1CK26JQ C 103
BS 1 735 RS1CK26TF
BS 736 736 RS1CK26JQ
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BS 748 771 RS1CK26TF
BS 772 840 RS1CK26JQ

RD RS1CK26TF 780 0 0
GGGATAGACAGATGGGGCTAACGGAAGAAGAAATCAGAAGACTTCACAGAATCCAGAAGA
CGGTGATGCAGATGCTCAAGGACCGTGGCTACTTCGTCGCTGATTCCGAGATCACGATGA
CCCTATCACAGTTTGTTAGGAAGTATGGTGACAACATGAAAAGGGATGATCTTGTTACTC
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ACAACATGTGATCTTGTTTAATCTGAATGTTTTGCCATTAAAAGCATAGAGCAAGATTGT
TTTCATGTTGTACGTAGCTGTATATCTTCTTCCCTGAAGAGTCGAAAGTGGGAGTGAACA
CAATGAAAGTGTACACAAACCGGATGAAGTCGGAGAATGTTCACAGAGCAATCCTGGTTG
TGCAACAGAACCTCACTCCTTTTGCTCGTAATTGCATTAGTCAGATCTCTTCTATTTTCC
ATTTGGAAGTTTTCCAGGAGGCAGAAATGCTAGTGAGCATTAAAGAACATGTACTTGTTC
CGGAGCATCAAGTTCTGACCACTGAAGAGAAGAAAACTTTACTCGAGAGGTACACTGTCA
AGGAGACACAGCTTCCAAGGATTCAAGTGACGATCCAATCGCAAGACACTTTGGACTAAA
ACGTGGCCAAGTCATCAAGATCATACGTCCCAGTGAAACCGCTGGTCGTTATGTTACCTA
TCGTTATGTTGTATA*TAAAGCTAAA*GTGCTTCTTGATTTTGTGAAAGAT
AGAGAAAAT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RS1CK26JQ 738 0 0
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GGGATGATCTTGTTACTCTCAGAGCTAAGAGAAACGATAGCAGTGATCAGGTACTTGATT
ATCTCATTGGTGTAAGAGACAACATGTGATCTTGTTTAATCTGAATGTTTTGCCATTAAA
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CGAAAGTGGGAGTGAACACAATGAAAGTGTACACAAACCGGATGAAGTCGGAGAATGTTC
ACAGAGCAATCCTGGTTGTGCAACAGAACCTCACTCCTTTTGCTCGTAATTGCATTAGTC
AGATCTCTTCTATTTTCCATTTGGAAGTTTTCCAGGAGGCAGAAATGCTAGTGAGCATTA
AAGAACATGTACTTGTTCCGGAGCATCAAGTTCTGACCACTGAAGAGAAGAAAACTTTAC
TCGAGAGGTACACTGTCAAGGAGACACAGCTTCCAAGGATTCAAGTGACGATCCAATCGC
AAGACACTTTGGACTAAAACGTGGCCAAGTCATCAAGATCATACGTCCCAGTGAAACCGC
TGGTCGTTATGTTACCTATCGTTATGTTGTATAATAAAGCTAAAAGTGCTTCTTGATTTT
GTGAAAGATTAGAGAATAATTGTTTTGTTCCAAACTCTTGACAATATTCTTTGTTTTGTT
TTTTTTAACACGCAACGT

QA 1 738 1 738
DS 



CO CL995Contig2 791 4 10 U
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GGGGCTAACGGAAGAAGAAATCAGAAGACTTCACAGAATCCAGAAGACGGTGATGCAGAT
GCTCAAGGACCGTGGCTACTTCGTCGCTGATTCCGAGATCACGATGACCCTATCACAGTT
TGTTAGGAAGTATGGTGACAACATGAAAAGGGATGATCTTGTTACTCTCAGAGCTAAGAG
AAACGATAGCAGTGATCAGCTGTATATCTTCTTCCCTGAAGAGTCGAAAGTGGGAGTGAA
CACAATGAAAGTGTACACAAACCGGATGAAGTCGGAGAATGTTCACAGAGCAATCCTGGT
TGTGCAACAGAACCTCACTCCTTTTGCTCGTAATTGCATTAGTCAGATCTCTTCTATTTT
CCATTTGGAAGTTTTCCAGGAGGCAGAAATGCTAGTGAACATTAAAGAACACGTACTTGT
TCCGGAGCACCAAGTTCTGACCACTGAAGAGAAGAAAACTTTACTCGAGAGGTACACTGT
CAAGGAGACACAGCTTCCAAGGATTCAAGTGACTGATCCAATCGCAAGATACTTTGGACT
AAAACGTGGCCAAGTCATCAAGATCATACGTCCCAGTGAAACCGCTGGTCGTTATGTTAC
CTATCGTTATGTTGTATAATAAAGCTAAAAGTGCTTCTTGATTTTGTGAAAGATTAGAGA
ATAATTGTTTTGTTCCAAACTCTTGACAATATTTTTTGTTTTGTTTTTTTTAACACGCAA
CGTTTTTTTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 

AF RS1E589TF U 1
AF RS1F807TF U 1
AF RS1F807JQ C 151
AF RS1E589JQ C 269
BS 1 734 RS1E589TF
BS 735 748 RS1F807TF
BS 749 749 RS1F807JQ
BS 750 753 RS1F807TF
BS 754 754 RS1F807JQ
BS 755 770 RS1F807TF
BS 771 771 RS1F807JQ
BS 772 784 RS1F807TF
BS 785 785 RS1F807JQ
BS 786 791 RS1F807TF

RD RS1E589TF 734 0 0
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GGGGCTAACGGAAGAAGAAATCAGAAGACTTCACAGAATCCAGAAGACGGTGATGCAGAT
GCTCAAGGACCGTGGCTACTTCGTCGCTGATTCCGAGATCACGATGACCCTATCACAGTT
TGTTAGGAAGTATGGTGACAACATGAAAAGGGATGATCTTGTTACTCTCAGAGCTAAGAG
AAACGATAGCAGTGATCAGCTGTATATCTTCTTCCCTGAAGAGTCGAAAGTGGGAGTGAA
CACAATGAAAGTGTACACAAACCGGATGAAGTCGGAGAATGTTCACAGAGCAATCCTGGT
TGTGCAACAGAACCTCACTCCTTTTGCTCGTAATTGCATTAGTCAGATCTCTTCTATTTT
CCATTTGGAAGTTTTCCAGGAGGCAGAAATGCTAGTGAACATTAAAGAACACGTACTTGT
TCCGGAGCACCAAGTTCTGACCACTGAAGAGAAGAAAACTTTACTCGAGAGGTACACTGT
CAAGGAGACACAGCTTCCAAGGATTCAAGTGACTGATCCAATCGCAAGATACTTTGGACT
AAAACGTGGCCAAGTCATCAAGATCATACGTCCCAGTGAAACCGCTGGTCGTTATGTTAC
CTATCGTTATGTTGTATAATAAAGCTAAAAGTGCTTCTTGATTTTGTGAAAGATTAGAGA
ATAATTGTTTTGTT

QA 1 734 1 734
DS 

RD RS1F807TF 791 0 0
GGAAAGCAACAAGATTGATGATAACCTAAAGTTTTTGCCGTCAATTCTTGATAGACAGAT
GGGGCTAACGGAAGAAGAAATCAGAAGACTTCACAGAATCCAGAAGACGGTGATGCAGAT
GCTCAAGGACCGTGGCTACTTCGTCGCTGATTCCGAGATCACGATGACCCTATCACAGTT
TGTTAGGAAGTATGGTGACAACATGAAAAGGGATGATCTTGTTACTCTCAGAGCTAAGAG
AAACGATAGCAGTGATCAGCTGTATATCTTCTTCCCTGAAGAGTCGAAAGTGGGAGTGAA
CACAATGAAAGTGTACACAAACCGGATGAAGTCGGAGAATGTTCACAGAGCAATCCTGGT
TGTGCAACAGAACCTCACTCCTTTTGCTCGTAATTGCATTAGTCAGATCTCTTCTATTTT
CCATTTGGAAGTTTTCCAGGAGGCAGAAATGCTAGTGAACATTAAAGAACACGTACTTGT
TCCGGAGCACCAAGTTCTGACCACTGAAGAGAAGAAAACTTTACTCGAGAGGTACACTGT
CAAGGAGACACAGCTTCCAAGGATTCAAGTGACTGATCCAATCGCAAGATACTTTGGACT
AAA*CGTGGCCAAGTCATCAAGATCATACGTCCCAGTGAAACCGCTGGTCGTTATGTTAC
CTATCGTTATGTTGTATAATAAAGCTAAAAGTGCTTCTTGATTTTGTGAAAGAT*AGAGA
ATAATTGTTT*GTTCCAAACTCTTGACA*TATTCTTTGTTTTGTTTTTTT*AACACGCAA
CGTTCTTTTTT

QA 1 791 1 791
DS 

RD RS1F807JQ 641 0 0
TTCCGAGATCACGATGACCCTATCACAGTTTGTTAGGAAGTATGGTGACAACATGAAAAG
GGATGATCTTGTTACTTTCAGAGCTAAGAGAAACGATAGCAGTGATCAGCTGTATATTTT
TTTCCCTGAAGAGTCGAAAGTGGGAGTGAACACAATGAAAGTGTACACAAACCGGATGAA
GTCGGAGAATGTTCACAGAGCAATCCTGGTTGTGCAACAGAACCTCACTCCTTTTGCTCG
TAATTGCATTAGTCAGATTTTTTTTATTTTCCATTTGGAAGTTTTCCAGGAGGCAGAAAT
GCTAGTGAACATTAAAGAACACGTACTTGTTCCGGAGCACCAAGTTTTGACCACTGAAGA
GAAGAAAACTTTACTCGAGAGGTACACTGTCAAGGAGACACAGCTTCCAAGGATTCAAGT
GACTGATCCAATCGCAAGATACTTTGGACTAAAACGTGGCCAAGTCATCAAGATCATACG
TCCCAGTGAAACCGCTGGTCGTTATGTTACCTATCGTTATGTTGTATAATAAAGCTAAAA
GTGCTTCTTGATTTTGTGAAAGATTAGAGAATAATTGTTTTGTTCCAAACTCTTGACAAT
ATTTTTTGTTTTGTTTTTTTTAACACGCAACGTTTTTTTTT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1E589JQ 523 0 0
TTCTTCCCTGAAGAGTCGAAAGTGGGAGTGAACACAATGAAAGTGTACACAAACCGGATG
AAGTCGGAGAATGTTCACAGAGCAATCCTGGTTGTGCAACAGAACCTCACTCCTTTTGCT
CGTAATTGCATTAGTCAGATTTTTTTTATTTTCCATTTGGAAGTTTTCCAGGAGGCAGAA
ATGCTAGTGAACATTAAAGAACACGTACTTGTTCCGGAGCACCAAGTTTTGACCACTGAA
GAGAAGAAAACTTTACTCGAGAGGTACACTGTCAAGGAGACACAGCTTCCAAGGATTCAA
GTGACTGATCCAATCGCAAGATACTTTGGACTAAAACGTGGCCAAGTCATCAAGATCATA
CGTCCCAGTGAAACCGCTGGTCGTTATGTTACCTATCGTTATGTTGTATAATAAAGCTAA
AAGTGCTTCTTGATTTTGTGAAAGATTAGAGAATAATTGTTTTGTTCCAAACTCTTGACA
ATATTTTTTGTTTTGTTTTTTTTAACACGCAACGTTTTTTTTT

QA 1 523 1 523
DS 



AS 2 5

CO CL996Contig1 632 3 4 U
GGGCTCGCCCTCCCAGTTATCTCTTCGTTCATCTTCTTCTTCCTTCTCAGCCACCATGTT
TCGTTTCGTTTCCAGTCTCGCCTCCAAGGCCAGGATTGCAAGTAACACAAGACAGGTTTC
CAGCAGGATGAGCTGGAGCAGGAACTATGCAGCGAAAGAGATTAAGTTTGGGGTCGAAGC
TCGTGCTTTGATGCTTAGAGGTGTTGAAGAGCTTGCCGATGCTGTTAGGGTCACTATGGG
TCCCAAGGGACGAACTGTCGTGATTGAGCAAAGCTGGGGAGCTCCTAAAGTGACTAAAGA
TGGTGTCACCGTTGCCAAGAGCATTGAGTTTAAGGATAAAGTGAAGAACGTTGGCGCCAG
TCTTGTCAAGCAGGTTGCTAATGCTACTAATGATGTCGCTGGTGATGGTACTACATGTGC
TACTGTGCTCACCAGGGCTATATTCACGGAAGGTTGCAAATCAGTTGCGGCGGGAATGAA
CGCCATGGACCTGAGGCGAGGTATTTCCATGGCGGTTGATGCTGTGGTGACTAACCTTAA
AAGCAGAGCTAGGATGATCAGCACATCCGAGGAGATTGCTCAGGTTGGGACCATTTCTGC
AAATGGAGAGAGGGAGATTGGTGAATTGATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1GN64TF U 5
AF RS1AC86TF U 1
AF RS1EU72TF U 5
BS 1 409 RS1AC86TF
BS 410 411 RS1EU72TF
BS 412 631 RS1AC86TF
BS 632 632 RS1EU72TF

RD RS1GN64TF 563 0 0
GG
GCCCTCCCAGTTATCTCTTCGTTCATCTTCTTCTTCCTTCTCAGCCACCATGTTTCGTTT
CGTTTCCAGTCTCGCCTCCAAGGCCAGGATTGCAAGTAACACAAGACAGGTTTCCAGCAG
GATGAGCCGGAGCAGGAACTATGCAGCGAAAGAGATTAAGTTTGGGGTCGAAGCTCGTGC
TTTGATGCTTAGAGGTGTTGAAGAGCTTGCCGATGCTGTTAGGGTCACTATGGGTCCCAA
GGGACGAACTGTCGTGATTGAGCAAAGCTGGGGAGCTCCTAAAGTGACTAAAGATGGTGT
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GCTCACCAGGGCTATATTCACGGAAGGTTGCAAATCAGTTGCGGCGGGAATGAACGCCAT
GGACCTGAGGCGAGGTATTTCCATGGCGGT*GATGCTGTGGTGACTAACCTTAAA*GCAG
AGCTAGGATGATCAGCACATC

QA 3 563 3 563
DS 

RD RS1AC86TF 631 0 0
GGGCTCGCCCTCCCAGTTATCTCTTCGTTCATCTTCTTCTTCCTTCTCAGCCACCATGTT
TCGTTTCGTTTCCAGTCTCGCCTCCAAGGCCAGGATTGCAAGTAACACAAGACAGGTTTC
CAGCAGGATGAGCTGGAGCAGGAACTATGCAGCGAAAGAGATTAAGTTTGGGGTCGAAGC
TCGTGCTTTGATGCTTAGAGGTGTTGAAGAGCTTGCCGATGCTGTTAGGGTCACTATGGG
TCCCAAGGGACGAACTGTCGTGATTGAGCAAAGCTGGGGAGCTCCTAAAGTGACTAAAGA
TGGTGTCACCGTTGCCAAGAGCATTGAGTTTAAGGATAAAGTGAAGAACGTTGGCGCCAG
TCTTGTCAAGCAGGTTGCTAATGCTACTAATGATGTCGCTGGTGATGGT**TACATGTGC
TACTGTGCTCACCAGGGCTATATTCACGGAAGGTTGCAAATCAGTTGCGGCGGGAATGAA
CGCCATGGACCTGAGGCGAGGTATTTCCATGGCGGTTGATGCTGTGGTGACTAACCTTAA
AAGCAGAGCTAGGATGATCAGCACATCCGAGGAGATTGCTCAGGTTGGGACCATTTCTGC
AAATGGAGAGAGGGAGATTGGTGAATTGATT

QA 1 631 1 631
DS 

RD RS1EU72TF 628 0 0
GG
GCCCTCCCAGTTATCTCTTCGTTCATCTTCTTCTTCCTTCTCAGCCACCATGTTTCGTTT
CGTTTCCAGTCTCGCCTCCAAGGCCAGGATTGCAAGTAACACAAGACAGGTTTCCAGCAG
GATGAGCTGGAGCAGGAACTATGCAGCGAAAGAGATTAAGTTTGGGGTCGAAGCTCGTGC
TTTGATGCTTAGAGGTGTTGAAGAGCTTGCCGATGCTGTTAGGGTCACTATGGGTCCCAA
GGGACGAACTGTCGTGATTGAGCAAAGCTGGGGAGCTCCTAAAGTGACTAAAGATGGTGT
CACCGTTGCCAAGAGCATTGAGTTTAAGGATAAAGTGAAGAACGTTGGCGCCAGTCTTGT
CAAGCAGGTTGCTAATGCTACTAATGATGTCGCTGGTGATGGTACTACATGTGCTACTGT
ACTCACCAGGGCTATACTCACGGAAGGTTGCAAATCAGTTGCGGCGGGAATGAACGCCAT
GGACCTGAGGCGAGGTATTTCCATGGCGGTTGATGCTGTGGTGACTAACCTTAAAAGCAG
AGCTAGGATGATCAGCACATCCGAGGAGATTGCTCAGGTTGGGACCATTTCTGCAAATGG
AGAGAGGGAGATTGGTGAATTGATTG

QA 3 628 3 628
DS 



CO CL996Contig2 473 2 7 U
TTTTTGGGTTTTCTGATTGGTGATAAAGTAAGGTGATGTGTAACCTCTGTCCAGCTTCAT
CCCTTCTACCACTTCCAACTCGTTAATCAACGTCTTCCCATCTTGGATTGTGATAACACC
TTCTTTCCCAACCTTCTCCATAGCTTTTGCAATCAATTCACCAATCTCCCTCTCTCCATT
TGCAGAAATGGTCCCAACCTGAGCAATCTCCTCGGATGTGCTGATCATCCTAGCTCTGCT
TTTAAGGTTTGTCACCACAGCATCAACCGCCATGGAAATACCTCACCTCAGGTCCACGGC
GTTCATTCCAGCTGCAACAGATTTGCAACCTTCCGTGAATATCGCCCTGGTGAGCACAGT
AGCACATGTAGTACCATCACCAGCGACATCATTAGTAGCGTTAGCAACCTGCTTGACAAG
ACTGGCACCAACGTTCTTCACTTTATCCTTAAACTCAATGCTCTTGGCAACGC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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DS 



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TATATTATACCTCTGCAAAACCCTCTCTATCACTCATACGAATATAGACAATATAGGACA
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ATTCCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 

AF RS1FU09JQ U 1
AF RS1EA59JQ U 85
AF RS1FV90JQ U 85
AF RS1FU09TF C 425
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AGCCGC

QA 3 608 3 608
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C
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CATCTGCTTTAATCTCTGGAGGTGACCAGATGTGTTGGGATCAAACACAATTCCAATAAA
TCTGTAGACTTCAGCAAAGTTGGGCATCACTCTACGTGGCTTTTCACAACTATCTTCTTC
ATCATCATTCGACTCTGTCACCGCTGGTAATCTCGGCGTAGCTTCCTTATTACCGGTGCT
GCAACAGCGATTCTTTGGGAGAGCCGCAGCCGAGACTCCTGGTTCCTCTTGAATCACGGG
TTTTGTTGTTAATGCATGATTCTGAGAAGAAGAGCTAGACGCAGGAGGAGGGTTCCCCAC
AAGTGAGTGTGAATCAGAAGAAGAGCTGTAGAAATAAGCAGGTTGAAGTAAGGGTGCGCT
TGAAGCAGGAAGGGAGGGAAGAGCAAAATTTTTAGGAGCCTTGTGAGGATAAGGATGACT
AGCTTTCCTCTTAGGTCGTGGAGGAGGAAGGTGTTCGTTAGCACCGCTCTTCTGAACTTT
GAGAAAGTACTTCTGTGCGTGGCTACGTATCTGGACGACTGTCTTTGATCCAACAAATGC
TTCGATTTTCTTCCAATCTCGATCGAATAAATGGAGAGCTTCTAGAAACTTATCGTGCTC
CTGCTCTGTCCAGTTCTCTCTA
C

QA 2 683 2 683
DS 

RD RS1FV90TF 804 0 0
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GGCTTT*CACAACTATCTTCTTCATCATCATTCGACTCTGTCACCGCTGGTAATCTCGGC
GTAGCTTC*TTATTACCGGTGCTGCAACAGCGATTCTTTGGGAGAGCCGCAGCCGAGACT
CCTGGTTCCTCTTGAATCACGGGTTTTGTTGTTAATGCATGATTCTGAGAAGAAGAGCTA
GACGCAGGAGGAGGGTTCCCCACAAGTGAGTGTGAATCAGAAGAAGAGCTGTAGAAATAA
GCAGGTTGAGGTAAGGGTGCGCTTGAAGCAGGAAGGGAGGGAAGAGCAAAATTTTTAGGA
GCCTTGTGAGGATAAGGATGACTAGCTTTCCTCTTAGGTCGTGGAGGAGGAAGGTGTTCG
TTAGCACCGCTCTTCTGAACTTTGAGAAAGTACTTCTGTGCGTGGCTACGTATCTGGACG
ACTGTCTTTGATCCAACAAATGCTTCGATTTTCTTCCAATCTCGATCGAATAAATGGAGA
GCTTCTAGAAACTTATCGTGCTCCTGCTCTGTCCAGTTCTCTCTAGACTTTTTGATCGTG
TAAGGCTTCCGAATCTTCGCCGTCGTATCCTCGCGAAACGACGCCGCATCTCTCCTTGCG
ATCGGAGTCAAACCAAACCCACCGTCGGAGTCCGACGCCCTCGAATCAAGACCAGGTAAA
CTCATGCTCACGGGATCGAAGAACGGAGCAGGTCTAGCGTTTAGAGACACCATTAGATTT
AGTGAACTCGAAATCGCGATTCCC

QA 1 804 1 804
DS 

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GCATGATTCTGAGAAGAAGAGCTAGACGCAGGAGGAGGGTTCCCCACAAGTGAGTGTGAA
TCAGAAGAAGAGCTGTAGAAATAAGCAGGTTGAGGTAAGGGTGCGCTTGAAGCAGGAAGG
GAGGGAAGAGCAAAATTTTTAGGAGCCTTGTGAGGATAAGGATGACTAGCTTTCCTCTTA
GGTCGTGGAGGAGGAAGGTGTTCGTTAGCACCGCTCTTCTGAACTTTGAGAAAGTACTTC
TGTGCGTGGCTACGTATCTGGACGACTGTCTTTGATCCAACAAATGCTTCGATTTTCTTC
CAATCTCGATCGAATAAATGGAGAGCTTCTAGAAACTTATCGTGCTCCTGCTCTGTCCAG
TTCTCTCTAGACTTTTTGATCGTGTAAGGCTTCCGAATCTTCGCCGTCGTATCCTCGCGA
AACGACGCCGCATCTCTCCTTGCGATCGGAGTCAAACCAAACCCACCGTCGGAGTCCGAC
GCCCTCGAATCAAGACCAGGTAAACTCATGCTCACGGGATCGAAGAACGGAGCAGGTCTA
GCGTTTAGAGACACCATTAGATTTAGTGAACTCGAAATCGCGATTCCC

QA 1 648 1 648
DS 



AS 2 6

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GGCTTCGTCCCTGCTAACACCCGCAGCAGCAGCAGTCACTGTCATGCTTCTTAGCCTACT
GCTTGGATCTGCAGAGCAAGTTAGCGGACTGCGTCATGTCCCCAAGTCCCATAAGATCAC
CACTGATGTCAAACACCCTGATTTTCTTGTCACCATTGAGCCCAAACCAACAATTCTCAT
ACCCGGTGTTGGAAGGTTCTTGCTTCCTCCCAAATGTAAGAAACCATTCTACCCTTACAA
TCCTGTCACTGGAGCTCCACTTACTGGTGGGTCTATCGGTGGCCAAATCCCATCATATGG
TGGTGGACAAGGGGGCGGAACTCACACCCAGCTCCCTGGTGGCGATGATACCCTTGTCCC
AAACCCCGGATATGAAACTCCAACCCCGACCATTGGAGCTGGAGCTGGAGCTAGCGCAGG
AAACAACGGCCAAGTTCCTCCGGTGCCACTACCCTGATTTATTTTTCAATATCTGTCAAC
AAATAAGCATTTCTTTTATGCAAAAGAGCTCTATATGAGTCTTACCTTCTGGTTTACTAG
CCGTTACCTTATTATGAGTCATATGTTTGTCATCTCTTTTCTTTCTTTTCGGATGTCTCT
ATAACAAGAGAGAATCTTGTGTCTTGTTCTTCACTCAATGTTGTCATCTATGGGTATTTA
TTTACATTCCATTACATTTAAATATCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AE30JQ C 1
AF RS1AE30TF U 1
BS 1 7 RS1AE30JQ
BS 8 747 RS1AE30TF

RD RS1AE30JQ 747 0 0
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AAACAACGGCCAAGTTCCTCCGGTGCCACTACCCTGATTTATTTTTCAATATCTGTCAAC
AAATAAGCATTTCTTTTATGCAAAAG*GCTCTATATGAGTCTTACCTTCTGGTTTACTAG
CCGTTACCTTATTATGAGTCATATGTTTGTCATCTCTTT*CTTTCTTTTCGGATGTCTCT
ATAACAAGAGAGAATCTTGTGTCTTGTTCTTCACTCAATGTTGTCATCTATGGGTATTTA
TTTACATTCCATTACATTTAAATATCA

QA 1 747 1 747
DS 

RD RS1AE30TF 747 0 0
GGAAGAC
AAACAAACACACTACCTTCCCAAACTTTTCTCAATAACAATAAAAAAACAAATGGCTTCG
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GTTGGAAGGTTCTTGCTTCCTCCCAAATGTAAGAAACCATTCTACCCTTACAATCCTGTC
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GGATATGAAACTCCAACCCCGACCATTGGAGCTGGAGCTGGAGCTAGCGCAGGAAACAAC
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CTTATTATGAGTCATATGTTTGTCATCTCTTTTCTTTCTTTTCGGATGTCTCTATAACAA
GAGAGAATCTTGTGTCTTGTTCTTCACTCAATGTTGTCATCTATGGGTATTTATTTACAT
TCCATTACATTTAAATATCA

QA 8 747 8 747
DS 



CO CL998Contig2 736 4 4 U
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TTCGTCCCTGCTAACACCCGCAGCAGCAGCAGTCACTGTCATGCTTCTTGGCCTACTGCT
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TGTCACCGGAGCTCCCCTTACTGGTGGGTCTATCGGTGGCCAAATCCCATCATATGGTGG
TGGACAAGGGGGCGGAACTCGCACCCAGCTCCCTGGTGGTGATGATACGCTTGTCCCAAA
CCCCGGATATGAAACTCCAACCCCGACCACTGGAGCTGGAGCTGGAGCTGGCGCTGGAAA
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TAAGCATTTCTTAGATGCAAAAGGGTCTATGAGTCTTACCTTCTGGTTTACTAGCCGTTA
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TTACATTTAAATATCA


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C586TF U 2
AF RS1EV55TF U 1
AF RS1C586JQ C 26
AF RS1EV55JQ C 65
BS 1 707 RS1EV55TF
BS 708 708 RS1C586JQ
BS 709 724 RS1EV55TF
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RD RS1C586TF 629 0 0
GG
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GTCCCTGCTAACACCCGCAGCAGCAGCAGTCACTGTCATGCTTCTTGGCCTACTGCTTGG
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ACAAGGGGGCGGAACTCGCACCCAGCTCCCTGGTGGTGATGATACGCTTGTCCCAAACCC
CGGATATGAAACTCCAACCCCGACCACTGGAGCTGGAGCTGGAGCTGGCGCTGGAAACAA
CGGCCAAGTTCCTCCGGTGCCACTACCCTGATTTCTTTTTCAATATCTGTCAACAAATAA
GCATTTCTTAGATGCAAAAGGGTCTATGAGTCTTACCTTCTGGTTTACTAGCCGTTACCT
TATGAGTCATATGTTTGTCATCTCTCT

QA 3 629 3 629
DS 

RD RS1EV55TF 724 0 0
GGAAAACAAACACAGTACCTTCCCAAACTCTTCTCAATAACAATAAAAAAAACAAATGGC
TTCGTCCCTGCTAACACCCGCAGCAGCAGCAGTCACTGTCATGCTTCTTGGCCTACTGCT
TGGATCTGCAGAGCAAGTTAGCGGACTGCGTCATGTCCCTAAGTCCCATAAGACCACCAC
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CGGTGTTGGAAGGTTCTTGCTTCCTCCCAAATGTAAGAAACCATTCTACCCTTACAATCC
TGTCACCGGAGCTCCCCTTACTGGTGGGTCTATCGGTGGCCAAATCCCATCATATGGTGG
TGGACAAGGGGGCGGAACTCGCACCCAGCTCCCTGGTGGTGATGATACGCTTGTCCCAAA
CCCCGGATATGAAACTCCAACCCCGACCACTGGAGCTGGAGCTGGAGCTGGCGCTGGAAA
CAACGGCCAAGTTCCTCCGGTGCCACTACCCTGATTTCTTTTTCAATATCTGTCAACAAA
TAAGCATTTCTTAGATGCAAAAGGGTCTATGAGTCTTACCTTCTGGTTTACTAGCCGTTA
CCTTATGAGTCATATGTTTGTCATCTCTCTCCTTCTTTATGGATCTCTCTGTAACAAGAG
AGAATCTTGTGTCTTGTTCTTCACTCAATGTTGTCATCTATAGTATT*ATTGACATTCCA
TTAC

QA 1 724 1 724
DS 

RD RS1C586JQ 699 0 0
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GCAGCAGTCACTGTCATGCTTCTTGGCCTACTGCTTGGATCTGCAGAGCAAGTTAGCGGA
CTGCGTCATGTCCCTAAGTCCCATAAGACCACCACTGATGTAAAACACCCTGATTTTCTT
GTCACCATTGAGCCCAAACCAACTATTTTCATCCCTGGTGTTGGAAGGTTCTTGCTTCCT
CCCAAATGTAAGAAACCATTCTACCCTTACAATCCTGTCACCGGAGCTCCCCTTACTGGT
GGGTCTATCGGTGGCCAAATCCCATCATATGGTGGTGGACAAGGGGGCGGAACTCGCACC
CAGCTCCCTGGTGGTGATGATACGCTTGTCCCAAACCCCGGATATGAAACTCCAACCCCG
ACCACTGGAGCTGGAGCTGGAGCTGGCGCTGGAAACAACGGCCAAGTTCCTCCGGTGCCA
CTACCCTGATTTCTTTTTCAATATCTGTCAACAAATAAGCATTTTTTAGATGCAAAAGGG
TCTATGAGTCTTACCTTCTGGTTTACTAGCCGTTACCTTATGAGTCATATGTTTGTCATC
TCTCTCTTTCTTTATGGATCTCTCTGTAACAAGAGAGAATCTTGTGTCTTGTTCTTCACT
CAATGTTGTCATCTATAGTATTTATTGACATTCCATTAC

QA 1 699 1 699
DS 

RD RS1EV55JQ 672 0 0
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QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 6

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TTTTGATTTAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

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RD RS1EY76TF 763 0 0
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TAC

QA 1 760 1 760
DS 

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AATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCCGGTGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCT
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QA 1 796 1 796
DS 

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GG
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GTT

QA 3 725 3 725
DS 

RD RS1GS68JQ 753 0 0
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QA 1 753 1 753
DS 

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QA 1 750 1 750
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TGGTTTGCTTTCGGGTTTGTAGGGGTTCTCTTATCGTTCGGTTCTGTAATAAAGAGCTCT
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TTTGTTTTGATTT
AC

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 6

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ATTTGCTACTTGTTTCGTGTTTAGGTCAGTTGTATGGTCGGATAATATCAGTTGGGATGC
TATATCTCCTCATTACCTTCTGTGTTTATTTATTAAGGATTTATTTGACGAGTGGTATAT
GGATTTAGTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

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CC

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GG
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AAAAAAAA

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TTACCTTCTGTGTTTATTTATTAAGGATTTATTTGACGAGTGGTATATGGATTTAGTTT

QA 3 721 3 721
DS 



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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CV85JQ U 1
AF RS1CV85TF C 71
AF RS1GT65JQ U 158
AF RS1GT65TF C 189
AF RS1AM46JQ U 242
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RD RS1CV85JQ 745 0 0
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CAGAACTTTCATTTGTTTTCGGAAGTGATAATGGTCCCCAAATGAGTAAACAATCTGCCT
CTGGAGGACACTGTTTTCGCTGTTTTTCGGTTTTTGCAAGACTCGGAGAAGTAGTTTCCT
TATGGGAGCTAACCCC*AGAAGCCATTTGTCTATAAATGAAACCTCGAACAACTGAAGAT
CTTTCCTGTCGCCAAACGATTCAAT

QA 1 745 1 745
DS 

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TTTTTTTCTCTAATTGTATAAGACAAAAGCCTTTGGCCATTAGGTTGTGTTCTCATATGA
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AAAGAGAAAGAACTGAAGAATTTATTGTCTTCTGGAAGACCTTCTGTAAAGGAGCAATTG
TCCTTTTTTAGATAGCCTCTGGTTTAAGCAGTGATCTCACATCGATCTTTCAAGAGAAGT
GAGGTGGAAGAGAGAAGTTGAGATACTTCCTCTGGAGTTGCTGTTCCAAAACCTTGCCAT
CTTATTCTCCCGGATTTGTCGAGTAAGAGAATGTACCCGGTGAGAAGGTTCAGAACTTTC
ATTTGTTTTCGGAAGTGATAATGGTCCCCAAATGAGTAAACAATCTGCCTCTGGAGGACA
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AACCCC*AGAAGCCATTTGTCTATAAATGAAACCTCGAACAACTGAAGATCTTTCCTGTC
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TCCCC

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DS 

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GGAAGAACTGAAGAGTGACACCAATGCAGATTGAAAGAGAAAGAACTGAAGAATTTATTG
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GCAGTGATCTCACATTGATCTTTCAAGAGAAGTGAGGTGGAAGAGAGAAGTTGAGATACT
TCCTCTGGAGTTGCTGCTCCAAAACCTTGCCATCTTATTCTCCCGGATTTGTCGAGTAAG
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CCAAATGAGTAAACAATCTGCCTCTGGAGGACACTGTTTTCGCTGTTTTTCGGTTTTTGC
AAGACTCGGAGAAGTAGTTTCCTTAGGGGAGCTAACCCC*AGAAGCCATTTGTCTATAAA
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CCACGAGCTGATCATTTCCTG
TCC

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DS 

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GAATACAACAAAAGTATCTGAAAGAAAGAGGAAGAACTGAAGAGTGACACCAATGCAGAT
TGAAAGAGAAAGAACTGAAGAATTTATTGTCTTCTGGAAGACCTTCTGTAAAGGAGCAAT
TGTCCTTTTTTAGATAGCCTCTGGTTTAAGCAGTGATCTCACATTGATCTTTCAAGAGAA
GTGAGGTGGAAGAGAGAAGTTGAGATACTTCCTCTGGAGTTGCTGCTCCAAAACCTTGCC
ATCTTATTCTCCCGGATTTGTCGAGTAAGAGAATGTACCCGGTGAGAAGGTTCAGAACTT
TCATTTGTTTTCGGAAGTGATAATGGTCCCCAAATGAGTAAACAATCTGCCTCTGGAGGA
CACTGTTTTCGCTGTTTTTCGGTTTTTGCAAGACTCGGAGAAGTAGTTTCCTTAGGGGAG
CTAACCCC*AGAAGCCATTTGTCTATAAATGAAACCTCGAACAACTGAAGATCTTTCCTG
TCGCCAAACGATTCAATGAATGGTTTGCTCCACGAGCTGATCATTTCCTG
TCC

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DS 

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TGCAGATTGAAAGAGAAAGAACTGAAGAATTTATTGTCTTCTGGAAGACCTTCTGTAAAG
GAGCAATTGTCCTTTTTTAGATAGCCTCTGGTTTAAGCAGTGATCTCACATTGATCTTTC
AAGAGAAGTGAGGTGGAAGAGAGAAGTTGAGATACTTCCTCTGGAGTTGCTGTTCCAAAA
CCTTGCCATCTTATTCTCCCGGATTTGTCGAGTAAGAGAATGTACCCGGTGAGAAGGTTC
AGAACTTTCATTTGTTTTCGGAAGTGATAATGGTCCCCAAATGAGTAAACAATCTGCCTC
TGGAGGACACTGTTTTCGCTGTTTTTCGGTTTTTGCAAGACTCGGAGAAGTAGTTTCCTT
ATGGGAGCTAACCCC*AGAAGCCATTTGTCTATAAATGAAACCTCGAACAACTGAAGATC
TTTCCTGTCGCCAAACGATTCAATGAATGGTTTGCTCCACGAGCTGATCATTTCCTGAGA
GCTAGCTCGGAAAGACAAACACACCAATGTCACCTTAGGAACAGCCAAGCTCTCTTTGTC
AACCTCATTGCTGTTGGAAGTAGTAATAGGCAACTTCGTGATTTTTCCATTAGAGAAAGT
CACTGCTAACACCGGAAACTTCATGGCCGACACAGCAGGGATTAAAGTCTTACTAGCAGC
AGCTATCTTACCGCCATGTTCCTTGAACTCTTTCATATCAGCAAAGTACCCTCGATTCAT
CTCATCATTAAGTCTAGCACGTTCGTCCTCGATCGCTTTCTT

QA 1 822 1 822
DS 

RD RS1AM46TF 652 0 0
AGAACTTTCATTTGTTT*CGGAAGTGATAATGGTCCCCAAATGAGTAAACAATCTGCCTC
TGGAGGACACTGTTTTCGCTGTTTTTCGGTTTTTGCAAGACTCGGAGAAGTAGTTTCCTT
ATGGGAGCTAACCCCCAGAAGCCATTTGTCTATAAATGAAACCTCGAACAACTGAAGATC
TTTCCTGTCGCCAAACGATTCAATGAATGGTTTGCTCCACGAGCTGATCATTTCCTGAGA
GCTAGCTCGGAAAGACAAACACACCAATGTCACCTTAGGAACAGCCAAGCTCTCTTTGTC
AACCTCATTGCTGTTGGAAGTAGTAATAGGCAACTTCGTGATTTTTCCATTAGAGAAAGT
CACTGCTAACACCGGAAACTTCATGGCCGACACAGCAGGGATTAAAGTCTTACTAGCAGC
AGCTATCTTACCGCCATGTTCCTTGAACTCTTTCATATCAGCAAAGTACCCTCGATTCAT
CTCATCATTAAGTCTAGCACGTTCGTCCTCGATCGCTTTCTTGTTCCCGAACTGATAGAA
GTCGAGGAACGAGCGGGTGGTTGATCGAAGAGCTGGTATTTGCAGACAAGGGAGAGCGTC
GTAGCGAGTGAAATTGAAGAGGACTTGATGCGAGAGAGAGGTGACTGATCTA

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 5

CO CL1002Contig1 946 5 8 U
GGATTGGTAGTCTTTTCTTCATATAGTTTAGTCTTCTCAAAAAAAAAAAAAGAATAGAAT
GAGCAAATTGTGGGAAAGAACGTGTTGAATAGTTTGGGGATAACATTAAACACTTTATTT
CTTCTAATCAATTAATCATCATCATCATCATCCCCAAGTCTTTTTCCTTTTCCCAATCAT
TCATCGTTATCTCCAAAGCTTCGTTGATTATCTCCCATCTTCTGAAAAAGTCCAATGGAT
CAAAGGCCTCTGGGATTGCTA*CGATCCACGTCAAAAAAAGGTATTAATCTCGCCATTCG
CGACCACAGAAGCAGCGATCCTTACGTTGTTATCACCGTCGCCGACCAGACATTGAAGAC
GCGTGTGGTGAAGAAAAACTGCAATCCTGTATGGAACGAAGAGATGACCGTTGCTATCAA
AGATCCCAATGTTCCCATCCGCTTGACAGTGTTTGACTGGGACAAGTTTACTGGAGATGA
CAAAATGGGAGATGCAAACTTAGACATCCAACCCTACTTAGAATCTCTCAAAATGGGAAT
GGAGCTTTTGAAGCTACCTAATGGATGCGCTATCAAAAGGGTTCAGCCCTCCAGGCACAA
CTGTTTATCTGATGAAAGCAGCATCGTGTGGAACAATGGAAAGATCACGCAAGACATGAT
ACTTAGGCTCAACAATGTCGAGTGCGGCGAGATTGAGATCATGCTTGAATGGCATGAAGG
TGCTGGTTGCAGAGGTATCACTTCCAAAGGAGTAGGTGAGGGCTCTTCTTACTCTACCTA
AAAAAAAGAATATGCTTGTTCTTCTTGTTGAATGAATGAATGAATGATCGATTTGTTGTT
TCCATATGTATTAGATAAATCGTGTATTTCTTTGATGACCATACTAACCGAGAAACAATC
TCGAAACTTTTTTTTTGTATCTCTTCTTCCATTTGAATGTCTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DV80TF U 1
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AF RS1AK94TF U 166
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GAGCAAATTGTGGGAAAGAACGTGTTGAATAGTTTGGGGATAACATTAAACACTTTATTT
CTTCTAATCAATTAATCATCATCATCATCATCCCCAAGTCTTTTTCCTTTTCCCAATCAT
TCATCGTTATCTCCAAAGCTTCGTTGATTATCTCCCATCTTCTGAAAAAGTCCAATGGAT
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ACTT

QA 1 664 1 664
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TCCCATCCGCTTGACAGTGTTTGACTGGGACAAGTTTACTGGAGATGACAAAATGGGAGA
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GCTACCTAATGGATGCGCTATCAAAAGGGTTCAGCCCTCCAGGCACAACTGTTTATTTGA
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AGGTATCACTTCCAAAGG
GGT

QA 1 378 1 378
DS 

RD RS1DH19TF 576 0 0
GG
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ATCAAAGGCCTCTGGGATTGCTAACGATCCACGTCAAAAAA*GGTATTAATCTCGCCATT
CGCGACCACAGAAGCAGCGATCCTTATGTTGTTATCACCGTCGCCAACCAGACATTGAAG
ACGCGTGTGGTGAAGAAAAACTGCAATCCTGTATGGAACGAAGAGATGACCGTTGCTATC
AAAGATCCCAATGTCCCTATCCGCTTGACAGTGTTTGACTGGGACAAGTTTACTGGAGAT
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GGTGCTGGTTGCAGAGGTATCACTTCCAAAGGAG

QA 3 576 3 576
DS 

RD RS1AK94JQ 729 0 0
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AAAAGTCCAATGGATCAAAGGCCTCTGGGATTGCTA*CGATCCACGTCAAAAAAAGGTAT
TAATCTCGCCATTCGCGACCACAGAAGCAGCGATCCTTACGTTGTTATCACCGTCGCCGA
CCAGACATTGAAGACGCGTGTGGTGAAGAAAAACTGCAATCCTGTATGGAACGAAGAGAT
GACCGTTGCTATCAAAGATCCCAATGTTCCCATCCGCTTGACAGTGTTTGACTGGGACAA
GTTTACTGGAGATGACAAAATGGGAGATGCAAACTTAGACATCCAACCCTACTTAGAATC
TCTCAAAATGGGAATGGAGCTTTTGAAGCTACCTAATGGATGCGCTATCAAAAGGGTTCA
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CACGCAAGACATGATACTTAGGCTCAACAATGTCGAGTGCGGCGAGATTGAGATCATGCT
TGAATGGCATGAAGGTGCTGGTTGCAGAGGTATCACTTCCAAAGGAGTAGGTGAGGGCTC
TTCTTACTCTACCTAAAAAAAAGAATATGCTTGTTCTTCTTGTTGAATGAATGAATGAAT
GATCGATTTGTTGTTTCCATATGTATTAGATAAATCGTGTATTTCTTTGATGACCATACT
AACCGAGAA

QA 1 729 1 729
DS 

RD RS1AK94TF 781 0 0
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TAATCTCGCCATTCGCGACCACAGAAGCAGCGATCCTTACGTTGTTATCACCGTCGCCGA
CCAGACATTGAAGACGCGTGTGGTGAAGAAAAACTGCAATCCTGTATGGAACGAAGAGAT
GACCGTTGCTATCAAAGATCCCAATGTTCCCATCCGCTTGACAGTGTTTGACTGGGACAA
GTTTACTGGAGATGACAAAATGGGAGATGCAAACTTAGACATCCAACCCTACTTAGAATC
TCTCAAAATGGGAATGGAGCTTTTGAAGCTACCTAATGGATGCGCTATCAAAAGGGTTCA
GCCCTCCAGGCACAACTGTTTATCTGATGAAAGCAGCATCGTGTGGAACAATGGAAAGAT
CACGCAAGACATGATACTTAGGCTCAACAATGTCGAGTGCGGCGAGATTGAGATCATGCT
TGAATGGCATGAAGGTGCTGGTTGCAGAGGTATCACTTCCAAAGGAGTAGGTGAGGGCTC
TTCTTACTCTACCTAAAAAAAAGAATATGCTTGTTCTTCTTGTTGAATGAATGAATGAAT
GATCGATTTGTTGTTTCCATATGTATTAGATAAATCGTGTATTTCTTTGATGACCATACT
AACCGAGAAACAATCTCGAAACTTTTTTTTTGTATCTCTTCTTCCATTTGAATGTCTTTC
G

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 5

CO CL1003Contig1 1339 5 57 U
GAAGGCAAAAACATGTTGGAAGACATACCAAAGAGATGGGAGGTGCTAAGCGGCCAAAAC
AAATGGAAAGGCCTGCTTGATCCACTTGACTCCGACTTGCGTCGCTACCTCATCCACTAT
GGCGAGATGGCTCAGGTTGGTTATGACGCCTTTAACTGGGACCGTAAGTCCGAATACTGC
GGTGATTGTTATTACCCCAAGAGTCAAATCCACGCTCGAACCGGCTACCTTAAAGCCAAT
CCTTTCAGGTACAATGTGACTAAGTACATCTACGCAACAGCTTCTATAAAGCTACCGCTC
TGTTTCATTGTCAAGTCTTTGTCGAAGAAAGCGTCACGCGTGCAGACTAACTGGATGGGT
TACATTGCGGTTGCTACAGACGAGGGAAAGGCGATGCTAGGAAGGAGAGACATTGTTGTA
GCTTGGAGGGGAACTCTTCAGCCGTACGAATGGGCTAACGACTTCGATTTTCCTCTCGAG
TCGGGTGGCAAAGTTTTCCCTGTGACCGACTCCAAACACGTGCCTCGTATTGGAAGTGGC
TGGCTCGATGTTTATACAGCTTCTGATGCTATGTCTCCTTATGACACAAGTAGCGCACGA
GAACAGGTACAAGCAGAGCTCAAGAGACTGCTAGAAGTATACAAGAACGAAGAAGTAAGC
ATCACTTTCACAGGCCACAGCTTGGGCGGAGTAATGTCAACTCTAGCAGCAGCAGATCTT
GTCCACAGCAGGAAAAACAAGATCGAAACAGGTCTTCAAAGCAAACAAGTTCCCATCACG
GTTTTCGCATTCGGGTGTCCTCGAATCGGGGATCAAGACTTCAAAAGAACTGTCAACTCA
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CTCTTCCTGTATGCAGAAGTAGGCGAGATGCTGCAGATCAATACGCTGAAGTCGACTTAC
CTCAAACGGTCTTTGAACTGGAGGAACTACCATAACCTGGAGATATACCTGCACGGGATA
GCAGGGATGCAAGACAAATCCGGGGTGTTTAGACTGGAGATTGGTCGGGATGTTGCGTTG
GTGAATAAAGGATTAGATGCTCTGAAAGATAAGTACTTGGTGCCGAGTGTCTGGAGGTGT
CTTGCAAACAAAGGGATGGTTCAATTGGATGATGGGACATGGAAGCTGGATGTACACAGG
TATGAAGATGATGATGATGCTGATGACTCCACAAATAAGTAACAAGTTCAGTTACAAAAC
ACTTGTATAATGTTCCGGACAATATGTTTGTAATTGTACACAAAAAAAATCAATTAGAAG
AAGAAAGAATCTAAGGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 
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ATCGCTTTCACAGGCCACAGCTTGGGAGGAGTAATGTCAACTCTAGCAGCTGCAGATCTT
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CAGTCCCATCACAGT

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GACTAACTGGATGGGTTACATTGCGGTTGCTACAGACGAGGGAAAGGCGATGCTAGGAAG
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CGATTTTCCTCTCGAGTCGGGTGGCAAAGTTTTCCCTGTGACCGACTCCAAACACGTGCC
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G
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TACGCTGAAGTCGACTTACCTCAAACGGTCTTTGAACTGGAGGAACTACCATAACCTGGA
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CTCAAACGGTTTTTGAACTGGAGGAACTACCATAACCTGGAGATATACCTGCACGGGATA
GCAGGGATGCAAGACAAATCCGGGGTGTTTAGACTGGAGATTGGTCGGGATGTTGCGTTG
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AAGAAAGAATCTAAGGGCC

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DS 



AS 1 6

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AGCCACCGCTTCGTCCCTTGGGTAGTCCCGTTGGAGACGAAGCTACAGCTATTCTCAAAT
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AGTACGACAGTATAATGCAGAACTTGAATTCGCAGTTGTCACCACACTTTGGCGCAGAGA
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CATTAATGATGTGAAAGAAACAGGAGAAGTTGGCATGTACAGGGAAGGTCTAAAGCTTGT
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AAAGATGACTGAGAAGGTGCAACGGTTTTGATTTTTTTTCTTTCTGAACCAAAATCTTAT
ACAGTTCTTTGGTTTTTGTTTTTGTCTTTTAATGTGTCAACAAAGTGGCTGATTGTAGCT
AAGTATTCTTCCAGCTGTGATTTCTATTGCCTCTCGATCAATTCAAATGTACCACCATGG
TTTTAGTAGGTGAAATGTAAGCTGTTAAACAGTGATCATTATTGAAGTGTCTGGCTATGA
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AAGCAGAAAAAGAAAGAAAGGTAACATACATTATCTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
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30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ET82TF U 1
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AF RS1DO49TF U 38
AF RS1CK37JQ C 187
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AF RS1ET82JQ C 152
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G
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C

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DS 

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G
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TCACCACACTTTGGCGCAGAGATGTCTGAAGCTGCTGCACAAGCCATTGTCAGGGAAATG
CCAATCGAGCTTCTACGTGCGAGTTTCCCACACATTAGTGATGAGCAGAAGAGAATACTT
GTGGAATTCTTGAAGCTTGGTAGCCAGAAAACGGACACAGTCATAAATCAATGATAGTAA
AAAAAAGAAAAAATCGGTATGGAGCAGAAAAGTGTTGCCAAGCTCTTCTTTCTTTGATAC
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TCTTTCTGAACCAAAATCTTATACAGTTCTTTGGTTTTTGTTTTTGTCTTTTAATGTGTC
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C

QA 2 782 2 782
DS 

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CTTTGGTTTTTGTTTTTGTCTTTTAATGTGTCAACAAAGTGGCTGATTGTAGCTAAGTAT
TCTTCCAGCTGTGATTTCTATTGCCTCTCGATCAATTCAAATGTACCACCATGGTTTTAG
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TT

QA 1 722 1 722
DS 

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AAGCTGCTGCACAAGCCATTGTCAGGGAAATGCCAATCGAGCTTCTACGTGCGAGTTTCC
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TGATGTGAAAGAAACAGGAGAAGTTGGCATGTACAGGGAAGGTCTAAAGCTTGTTTTACA
TATAAGATAGAAAATGAAAGTTACTGTTTTATTTGCGT******GTTTTACATAAAAGAT
GACTGAGAAGGTGCAACGGTTTTGATTTTTTTTCTTTCTGAACCAAAATCTTATACAGTT
CTTTGGTTTTTGTTTTTGTCTTTTAATGTGTCAACAAAGTGGCTGATTGTAGCTAAGTAT
TCTTCCAGCTGTGATTTCTATTGCCTCTCGATCAATTCAAATGTACCACCATGGTTTTAG
TATGTGAAATGTAAGCTGTTAAACAGTGATCATTATTGAAGTGTCTGGCTATGAGTTCTC
TT

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DS 

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TG
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TCGATCAATTCAAATGTAC*ACCATGGTTTTAGTAGGTGAAATGCAAGCTGTTAAACAGT
GATCATTATTGAAGTGTCTGGCTATGAGTTCTCTTATTTTGTCTTCATGATTCTCATCTT
CATGTCTTACAAACTTAAGTTTTGGAGAAGCAGAAAAAGAAAGAAAGGTAACATACATTA
TCTCG

QA 3 847 3 847
DS 



AS 1 6

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CGGCTCCGTTCTTT*GACGTCTTGATGACAAGCCCTAAAAGCCCACTTGACTTCAAGATT
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GCATTTTGCAGCACAGAGTGTCGATCGAGTCATATAGCAAATGTTGAAAGGAAAGAGAGA
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GACTAAAATGCTCCTGTCTGTTTTTCAAAAAAAAAAAGAAATGGACTAATGCCCTTGTTT
GTTTTTTATTGTTATATTGGTATGTTGTGGTAATTAACAT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CH51TF U 1
AF RS1C936TF U 3
AF RS1DE09TF U 3
AF RS1DE09JQ C 364
AF RS1CH51JQ C 385
AF RS1C936JQ C 616
BS 1 190 RS1CH51TF
BS 191 191 RS1C936TF
BS 192 194 RS1CH51TF
BS 195 195 RS1C936TF
BS 196 597 RS1CH51TF
BS 598 598 RS1C936TF
BS 599 622 RS1CH51TF
BS 623 635 RS1C936TF
BS 636 670 RS1DE09TF
BS 671 827 RS1DE09JQ
BS 828 828 RS1CH51JQ
BS 829 1000 RS1DE09JQ
BS 1001 1093 RS1CH51JQ
BS 1094 1094 RS1C936JQ
BS 1095 1106 RS1CH51JQ
BS 1107 1180 RS1C936JQ

RD RS1CH51TF 632 0 0
GGGTGTGGAAACACCACCAGTCTTCATCCTTTTCTTCTCTCATCTCCTTTTTTTAAGTTT
TAAGGTTGATCTGATCAAAACCCTTCTCTCCACCAAGTATCATGCTTAGCAAAAGAACCC
ATCCCATGATCGGAAAGATATCTGAGCTCCTCGTCGGCGTGAACCGATCTGCGGCCGCGG
CGGCTCCGTTTTTTTGACGTCTTGATGACAAGCCCTAAAAGCCCACTTGACTTCAAGATT
CTCCCTCAGATATCTCAAAGAAACAGCTCAAAGAGATTCTACGATGACAACCTTGGTGGG
TCCGTTGGTCTAGGGATTGTAGCCGCACTCGAGAACTCAACCACTCGTCTAATCACTAGA
TCGGAACCGAACCAATCAAACCGGTCTGATCCGGTCCAGTTCATGAGCCATGAAGGAAGC
ACGGACGAAGAAGAAGAAGACGAGGAGATGTTCATAATGGACGAGGAGGAGTATACGTTG
GTAACGTGTCACCATGGTCCTAGTGGATCTTGTAGTACAAGGGTTTATGACAGAGATGGG
TTTGAGTGCTTGGCAAGTGAGATCAACGAGGATCGTCGTGATAGACTTTTCATGGTCAAT
GTCGGTAACGAATCTCCTGAGA
CTCGCCCGAG

QA 1 622 1 622
DS 

RD RS1C936TF 633 0 0
GG
GTGGAAACACCACCAGTCCTCATCCTTTTCTTCTCTCATCTCCTTTT***AAGTTTTAAG
GTTGATCTGATCAAAACCCTTCTCTCCACCAAGTATCATGCTTAGCAAAAGAACCCATCC
CATGATCGGAAAGATATCTGAGCTCCTCGTCGGCGTGAACCGATCTGCGGCCGCGGCGGC
TCCGTTCTTT*GACGTCTTGATGACAAGCCCTAAAAGCCCACTTGACTTCAAGATTCTCC
CTCAGATATCTCAAAGAAACAGCTCAAAGAGATTCTACGATGACAACCTTGGTGGGTCCG
TTGGTCTAGGGATTGTAGCCGCACTCGAGAACTCAACCACTCGTCTAATCACTAGATCGG
AACCGAACCAATCAAACCGGTCTGATCCGGTCCAGTTCATGAGCCATGAAGGAAGCACGG
ACGAAGAAGAAGAAGACGAGGAGATGTTCATAATGGACGAGGAGGAGTATACGTTGGTAA
CGTGTCACCATGGTCCTAGTGGATCTTGTAGTACAAGGGTTTATGACAGAGATGGGTTTG
AGTGCTTGGCAAGTGAGATCAACGAGGATCGTCGTGATAGACTTTTCATGGTCGATGTCG
GTAACGAATCTCCTGAGAACTCGCCGGAGTT

QA 3 633 3 633
DS 

RD RS1DE09TF 668 0 0
GG
GTGGAAACACCACCAGTCTTCATCCTTTTCTTCTCTCATCTCCTTTTTTTAAGTTTTAAG
GTTGATCTGATCAAAACCCTTCTCTCCACCAAGTATCATGCTTAGCAAAAGAACCCATCC
CATGATCGGAAAGATATCTGAGCTCCTCGTCGGCGTGAACCGACCTGCGGCCGCGGCGGC
TCCGTTCTTT*GACGTCTTGATGACAAGCCCTAAAAGCCCACTTGACTTCAAGATTCTCC
CTCAGATATCTCAAAGAAACAGCTCAAAGAGATTCTACGATGACAACCTTGGTGGGTCCG
TTGGTCTAGGGATTGTAGCCGCACTCGAGAACTCAACCACTCGTCTAATCACTAGATCGG
AACCGAACCAATCAAACCGGTCTGATCCGGTCCAGTTCATGAGCCATGAAGGAAGCACGG
ACGAAGAAGAAGAAGACGAGGAGATGTTCATAATGGACGAGGAGGAGTATACGTTGGTAA
CGTGTCACCATGGTCCTAGTGGATCTTGTAGTACAAGGGTTTATGACAGAGATGGGTTTG
AGTGCTTGGCAAGTGAGATCAACGAGGATCGTCGTGATAGACTTTTCATGGTCGATGTCG
GTAACGAATCTCCTGAGAACTCGCCGGAGTTTAAGGGTTTGGGTTTCCTCAGTTCTTGTT
ACTTAT

QA 3 668 3 668
DS 

RD RS1DE09JQ 637 0 0
GAACCGAACCAATCAAACCGGTCTGATCCGGTCCAGTTCATGAGCCATGAAGGAAGCACG
GACGAAGAAGAAGAAGACGAGGAGATGTTCATAATGGACGAGGAGGAGTATACGTTGGTA
ACGTGTCACCATGGTCCTAGTGGATCTTGTAGTACAAGGGTTTATGACAGAGATGGGTTT
GAGTGCTTGGCAAGTGAGATCAACGAGGATCGTCGTGATAGACTTTTCATGGTCGATGTC
GGTAACGAATCTCCTGAGAACTCGCCGGAGTTTAAGGGTTTGGGTTTCCTCAGTTCTTGT
TACTTATGCAGGAAGAAACTCCACGGTCACGACATATTTATTTATAGAGGAGAAAAAGCA
TTTTGCAGCACAGAGTGTCGATCGAGTCATATAGCAAATGTTGAAAGGAAAGAGAGATGT
AGATCAAAACTTTCAGCCTCTCCTTACACCGCCGGACAAATTATCTCCGCCGGAGTTCTA
GTGACTTAGCCGGAGTTCTACCGAGTATACATTATATATGGGTGGGGGATCAGGGGTGAA
TAAAATAAGTACGCATACAACATATGCGGACGAAATAAATTAGCATATATATAAATTGTG
ACATGTATGTCTATATAAATGGTATATGGTGGAGGTG

QA 1 637 1 637
DS 

RD RS1CH51JQ 722 0 0
TCTGATCCGGTCCAGTTCATGAGCCATGAAGGAAGCACGGACGAAGAAGAAGAAGACGAG
GAGATGTTCATAATGGACGAGGAGGAGTATACGTTGGTAACGTGTCACCATGGTCCTAGT
GGATCTTGTAGTACAAGGGTTTATGACAGAGATGGGTTTGAGTGCTTGGCAAGTGAGATC
AACGAGGATCGTCGTGATAGACTTTTCATGGTCAATGTCGGTAACGAATCTCCTGAGAAC
TCGCCCGAGTTTAAGGGTTTGGGTTTCCTCAGTTCTTGTTACTTATGCAGGAAGAAACTC
CACGGTCACGACATATTTATTTATAGAGGAGAAAAAGCATTTTGCAGCACAGAGTGTCGA
TCGAGTCATATAGCAAATGTTGAAAGGAAAGAGAGATGTAGATCAAAACTTTCAGCCTCT
CCTTACACCGCCGGACAAATTATTTCCGCCGGAGTTCTAGTGGCTTAGCCGGAGTTCTAC
CGAGTATACATTATATATGGGTGGGGGATCAGGGGTGAATAAAATAAGTACGCATACAAC
ATATGCGGACGAAATAAATTAGCATATATATAAATTGTGACATGTATGTCTATATAAATG
GTATATGGTGGAGGTGAAACAACATGAAAATTTTGGTGAGGGGGGTTAATGATAGTAGAG
AGAGCTAGTTTTTGATCGTTAACATGGCGAGAAATGGACTAAAATGCTCTTGTCTGTTTT
TC

QA 1 722 1 722
DS 

RD RS1C936JQ 565 0 0
CCTGAGAACTCGCCGGAGTTTAAGGGTTTGGGTTTCCTCAGTTCTTGTTACTTATGCAGG
AAGAAACTCCACGGTCACGACATATTTATTTATAGAGGAGAAAAAGCATTTTGCAGCACA
GAGTGTCGATCGAGTCATATAGCAAATGTTGAAAGGAAAGAGAGATGTAGATCAAAACTT
TCAGCCTCTCCTTGCACCGCCGGACAAATTATTTCCGCCGGAGTTTTAGTGACTTAGCCG
GAGTTCTACCGAGTATACATTATATATGGGTGGGGGATCAGGGGTGAATAAAATAAGTAC
GCATACAACATATGCGGACGAAATAAATTAGCATATATATAAATTGTGACATGTATGTCT
ATATAAATGGTATATGGTGGAGGTGAAACAACATGAAAATTTTGGTGAGGGGGGTTAATG
ATAGTAGAGAGAGCTAGTTTTTGATCGTTAACATGGCGAGAAATGGACTAAAATGCTCCT
GTTTGTTTTTCAAAAAAAAAAAGAAATGGACTAATGCCCTTGTTTGTTTTTTATTGTTAT
ATTGGTATGTTGTGGTAATTAACAT

QA 1 565 1 565
DS 



AS 1 5

CO CL1006Contig1 881 5 12 U
GGAAGCTATCATGGGTTCGATCTCTCTGTCCAATTCTCTGCCCATACCGCGACTTCCATT
ACATACTTCATCACTCAATCCATGCCTTGTTCCCACTTCTTCTTCGCTTCCTCCTCCTCT
CTCTAATTCTCGTCGTCGCTCCGCTTTTTCACCGTTAGTCACCGCCTCTGCAGTCTTCGC
TGCTCCTTCAGGCGTTAATAACTCTGTTCCTGGTAAAAACGGGAGTTACACGGTTGGTGA
CTTTATGACAGGGAAACAGCATCTTCATGTTGTTAAGCCCACAACATCCGTTGATGATGC
ATTGGAACTTCTGGTTGAGAAGAAAGTCACGGGCTTGCCTGTGATTGATGATGACTGGAA
TCTGGTTGGGGTTGTTTCTGATTACGACTTGCTTGCACTTGACTCCATTTCTGGGCGCAG
CAGCCAAAATGATACAAACATTTCCCTAACGTCGACAGTTCATGGAAAACGTTTAACGAA
CTCCAGAAGCTGATAAGCAAGACACATGGAAAAGTAGTTGGAGATTTGATGACGCCTTCT
CCTCCGGTTGTCCGTGGTTCCACCAATTTAGAAGATGCTGCCAGGTTGCTACTGGAAACG
AAGTTCCGAAGATTACCAGTCGTGAATTCAGATGGAAAACTGATTGGGATCCTGACAAGG
GGGAACGTTGTAAGGGCTGCACTGCAGATCAAGCGGGAAACCGAGAACTCAACCTAGCCA
GCAGCAGTTGTAGAGCAGAGCCCTTCATTTTCTGCCATATAGTTAAATAGCAAATCTGTT
GATTCCATTTGATATAAAGTATATATAAAAAATGTGTAACTATGCCCTCTCATCTTTCCA
CCTCCACAAGCAATTTTTTACTTAAAAAAACATTTTCTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 10 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1G673TF U 246
AF RS1GH18TF U 1
AF RS1EK37TF U 1
AF RS1GH18JQ C 150
AF RS1EK37JQ C 170
BS 1 662 RS1EK37TF
BS 663 663 RS1GH18JQ
BS 664 675 RS1EK37TF
BS 676 676 RS1GH18JQ
BS 677 711 RS1EK37TF
BS 712 712 RS1GH18JQ
BS 713 749 RS1EK37TF
BS 750 750 RS1GH18JQ
BS 751 755 RS1EK37TF
BS 756 756 RS1GH18JQ
BS 757 769 RS1EK37TF
BS 770 881 RS1GH18JQ

RD RS1G673TF 170 0 0
GGGGG
GGGAAACAGCATCTTCATGTTGTTAAGCCCACAACATCCGTTGATGATGCATTGGAACTT
CTGGTTGAGAAGAAAGTCACGGGCTTGCCTGTGATTGATGATGACTGGAATCTGGTTGGG
GTTGTTTCTGATTACGACTTGCTTGCACTTGACTCCTTTTCTGGG

QA 6 170 6 170
DS 

RD RS1GH18TF 662 0 0
GGAAGCT
ATCATGGGTTCGATCTCTCTGTCCAATTCTCTGCCCATACCGCGACTTCCATTACATACT
TCATCACTCAATCCATGCCTTGTTCCCACTTCTTCTTCGCTTCCTCCTCCTCTCTCTAAT
TCTCGTCGTCGCTCCGCTTTTTCACCGTTAGTCACCGCCTCTGCAGTCTTCGCTGCTCCT
TCAGGCGTTAATAACTCTGTTCCTGGTAAAAACGGGAGTTACACGGTTGGTGACTTTATG
ACAGGGAAACAGCATCTTCATGTTGTTAAGCCCACAACATCCGTTGATGATGCATTGGAA
CTTCTGGTTGAGAAGAAAGTCACGGGCTTGCCTGTGATTGATGATGACTGGAATCTGGTT
GGGGTTGTTTCTGATTACGACTTGCTTGCACTTGACTCCATTTCTGGGCGCAGCAGCCAA
AATGATACAAACATTTCCCTAACGTCGACAGTTCATGGAAAACGTTTAACGAACTCCAGA
AGCTGATAAGCAAGACACATGGAAAAGTAGTTGGAGATTTGATGACGCCTTCTCCTCCGG
TTGTCCGTGGTTCCACCAATTTAGAAGATGCTGCCAGGTTGCTACTGGAA*CGAAGTTCC
GAAGATTACCAGTCGTGAATTCAGATGGAAA*CTGATTGGGATCCTGACAAGGGG

QA 8 662 8 662
DS 

RD RS1EK37TF 769 0 0
GGAAGCTATCATGGGTTCGATCTCTCTGTCCAATTCTCTGCCCATACCGCGACTTCCATT
ACATACTTCATCACTCAATCCATGCCTTGTTCCCACTTCTTCTTCGCTTCCTCCTCCTCT
CTCTAATTCTCGTCGTCGCTCCGCTTTTTCACCGTTAGTCACCGCCTCTGCAGTCTTCGC
TGCTCCTTCAGGCGTTAATAACTCTGTTCCTGGTAAAAACGGGAGTTACACGGTTGGTGA
CTTTATGACAGGGAAACAGCATCTTCATGTTGTTAAGCCCACAACATCCGTTGATGATGC
ATTGGAACTTCTGGTTGAGAAGAAAGTCACGGGCTTGCCTGTGATTGATGATGACTGGAA
TCTGGTTGGGGTTGTTTCTGATTACGACTTGCTTGCACTTGACTCCATTTCTGGGCGCAG
CAGCCAAAATGATACAAACATTTCCCTAACGTCGACAGTTCATGGAAAACGTTTAACGAA
CTCCAGAAGCTGATAAGCAAGACACATGGAAAAGTAGTTGGAGATTTGATGACGCCTTCT
CCTCCGGTTGTCCGTGGTTCCACCAATTTAGAAGATGCTGCCAGGTTGCTACTGGAAACG
AAGTTCCGAAGATTACCAGTCGTGAATTCAGATGGAAAACTGATTGGGATCCTGACAAGG
GG*AACGTTGTAAGG*CTGCACTGCAGATCAAGCGGGAAACCGAGAACTCA*CCTAGCCA
GCAGCAGTTGTAGAGCAGAGCCCTTCATTCTCTGC*ATATAGTTAAATA

QA 1 769 1 769
DS 

RD RS1GH18JQ 732 0 0
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CTGGTAAAAACGGGAGTTACACGGTTGGTGACTTTATGACAGGGAAACAGCATCTTCATG
TTGTTAAGCCCACAACATCCGTTGATGATGCATTGGAACTTCTGGTTGAGAAGAAAGTCA
CGGGCTTGCCTGTGATTGATGATGACTGGAATCTGGTTGGGGTTGTTTCTGATTACGACT
TGCTTGCACTTGACTCCATTTCTGGGCGCAGCAGCCAAAATGATACAAACATTTCCCTAA
CGTCGACAGTTCATGGAAAACGTTTAACGAACTCCAGAAGCTGATAAGCAAGACACATGG
AAAAGTAGTTGGAGATTTGATGACGCCTTCTCCTCCGGTTGTCCGTGGTTCCACCAATTT
AGAAGATGCTGCCAGGTTGCTACTGGAAACGAAGTTCCGAAGATTACCAGTCGTGAATTC
AGATGGAAAACTGATTGGGATCCTGACAAGGGGGAACGTTGTAAGGGCTGCACTGCAGAT
CAAGCGGGAAACCGAGAACTCAACCTAGCCAGCAGCAGTTGTAGAGCAGAGCCCTTCATT
TTCTGCCATATAGTTAAATAGCAAATCTGTTGATTCCATTTGATATAAAGTATATATAAA
AAATGTGTAACTATGCCCTCTCATCTTTCCACCTCCACAAGCAATTTTTTACTTAAAAAA
ACATTTTCTCGC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1EK37JQ 712 0 0
GCAGTCTTCGCTGCTCCTTCAGGCGTTAATAACTCTGTTCCTGGTAAAAACGGGAGTTAC
ACGGTTGGTGACTTTATGACAGGGAAACAGCATCTTCATGTTGTTAAGCCCACAACATCC
GTTGATGATGCATTGGAACTTCTGGTTGAGAAGAAAGTCACGGGCTTGCCTGTGATTGAT
GATGACTGGAATCTGGTTGGGGTTGTTTCTGATTACGACTTGCTTGCACTTGACTCCATT
TCTGGGCGCAGCAGCCAAAATGATACAAACATTTCCCTAACGTCGACAGTTCATGGAAAA
CGTTTAACGAACTCCAGAAGCTGATAAGCAAGACACATGGAAAAGTAGTTGGAGATTTGA
TGACGCCTTCTCCTCCGGTTGTCCGTGGTTCCACCAATTTAGAAGATGCTGCCAGGTTGC
TACTGGAAACGAAGTTCCGAAGATTACCAGTCGTGAATTCAGATGGAAAACTGATTGGGA
TCCTGACAAGGGGGAACGTTGTAAGGGCTGCACTGCAGATCAAGCGGGAAACCGAGAACT
CAACCTAGCCAGCAGCAGTTGTAGAGCAGAGCCCTTCATTTTTTGCCATATAGTTAAATA
GCAAATCTGTTGATTCCATTTGATATAAAGTATATATAAAAAATGTGTAACTATGCCCTC
TCATCTTTCCACCTCCACAAGCAATTTTTTACTTAAAAAAACATTTTCTCGC

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 6

CO CL1007Contig1 769 6 6 U
GGACAAAACATTCAAACACAAGATAAAGAAACAGTCTTACAAGAACTACATACGTTGTTT
CAAAGCTCTTTGTTTTTCAAAATGGAGAATATTGTAAGATTCGCGGTCACCATCATTTTT
GTACTTTACTCTGTATCATCATCACACGCCGCAACTACGTCACCGAGCGGTGGAGGCGGC
GGAGGAGGAGATGCTCAAGCAATGCCGTGTATACAGAAACTTATGCCGTGTCAGCCGTTT
CTTCACTCGGTGATTCCACCACCGCCTCCATCGTGCTGCCTGCCAATGAGGGAGATCGTC
GCCAATGACGCGACGTGTCTTTGCTCCGTCTTTAACAACGTAGATATGCTCAAATCGCTT
AACCTCACTAAAGACAATGCTCTTGATCTCCCTAAAGCCTGTGGCGCTAACCCTGACATC
TCACTATGCAAAGCCAGTCCCGTGGGTGGTACTACTACGCCTTCGACATCTCCGGCAACT
CCAAAAACTCCTCCGGTGTCTTCCACTGGAAGCGGTTCCACCGGAGCTTCATCAGCTTCT
TCAACATCCACACCAACAAGCTCTGCTCCGGCCATCAACTTTGCTAAACTAAGCTTCGCA
TCGACTATTGTGGCATTGGCAACAACCGTTTTCTGATCGACTACTATATATATATATTAT
TACATAACGTCTTTATTCATTATTAGATAGGTTTAATTTGTTTTAAATTATGTTTGGTAA
CTTAATATTCATATGTAATGAAAAAATTCTAATAATATTAATGACTTCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1EH77TF U 3
AF RS1EC91TF U 1
AF RS1EB81TF U 4
AF RS1EB81JQ C 79
AF RS1EC91JQ C 79
AF RS1EH77JQ C 467
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RD RS1EH77TF 537 0 0
GG
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GCTCTTTGTTTTTCAAAATGGAGAATATTGTAAGATTCGCGGTCACCATCATTTTTGTAC
TTTACTCTGTATCATCATCACACGCCGCAACTACGTCACCGAGCGGTGGAGGCGGCGGAG
GAGGAGATGCTCAAGCAATGCCGTGTATACAGAAACTTATGCCGTGTCAGCCGTTTCTTC
ACTCGGTGATTCCACCACCGCCTCCATCGTGCTGCCTGCCAATGAGGGAGATCGTCGCCA
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TCACTAAAGACAATGCTCTTGATCTCCCTAAAGCCTGTGGCGCTAACCCTGACATCTCAC
TATGCAAAGCCAGTCCCGTGGGTGGTACTACTACGCCTTCGACATCTCTGGCAACTCCAA
AAACTCCTCCGGTGTCTTCCACTGGAAGCGGTTCCACCGGAGCTTCATCAGCTTC

QA 3 537 3 537
DS 

RD RS1EC91TF 739 0 0
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CAAAGCTCTTTGTTTTTCAAAATGGAGAATATTGTAAGATTCGCGGTCACCATCATTTTT
GTACTTTACTCTGTATCATCATCACACGCCGCAACTACGTCACCGAGCGGTGGAGGCGGC
GGAGGAGGAGATGCTCAAGCAATGCCGTGTATACAGAAACTTATGCCGTGTCAGCCGTTT
CTTCACTCGGTGATTCCACCACCGCCTCCATCGTGCTGCCTGCCAATGAGGGAGATCGTC
GCCAATGACGCGACGTGTCTTTGCTCCGTCTTTAACAACGTAGATATGCTCAAATCGCTT
AACCTCACTAAAGACAATGCTCTTGATCTCCCTAAAGCCTGTGGCGCTAACCCTGACATC
TCACTATGCAAAGCCAGTCCCGTGGGTGGTACTACTACGCCTTCGACATCTCCGGCAACT
CCAAAAACTCCTCCGGTGTCTTCCACTGGAAGCGGTTCCACCGGAGCTTCATCAGCTTCT
TCAACATCCACACCAACAAGCTCTGCTCCGGCCATCAACTTTGCTAAACTAAGCTTCGCA
TCGACTATTGTGGCATTGGCAACAACCGTTTTCTGATCGACTACTATATATATATATTAT
TACATAACGTCTTTATTCATTATTAGATAGGTT*AATTTGTTT*AAATTATGTTTGGTAA
CTTAATATTCATATGTAAT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1EB81TF 737 0 0
G
AAAACATTCAAACACAAGATAAAGAAACAGTCTTACAAGAACTACATACGTTGTTTCAAA
GCTCTTTGTTTTTCAAAATGGAGAATATTGTAAGATTCGCGGTCACCATCATTTTTGTAC
TTCACTCTGTATCATCATCACACGCCGCAACTACGTCACCGAGCGGTGGAGGCGGCGGAG
GAGGAGATGCTCAAGCAATGCCGTGTATACAGAAACTTATGCCGTGTCAGCCGTTTCTTC
ACTCGGTGATTCCACCACCGCCTCCATCGTGCTGCCTGCCAATGAGGGAGATCGTCGCCA
ATGACGCGACGTGTCTTTGCTCCGTCTTTAACAACGTAGATATGCTCAAATCGCTTAACC
TCACTAAAGACAATGCTCTTGATCTCCCTAAAGCCTGTGGCGCTAACCCTGACATCTCAC
TATGCAAAGCCAGTCCCGTGGGTGGTACTACTACGCCTTCGACATCTCCGGCAACTCCAA
AAACTCCTCCGGTGTCTTCCACTGGAAGCGGTTCCACCGGAGCTTCATCAGCTTCTTCAA
CATCCACACCAACAAACTCTGCTCCGGCCATCAACTTTGCTAAACTAAGCTTCGCATCGA
CTATTGTGGCATTGGCAACAACCGTTTTCTGATCGACTACTATATATATAT**TATTACA
TAACGTCTTTATTCATTATTAGATAGTTT*AATTTGTTTTAAATTATGTTTGGTAACTTA
ATATTCATATGTAAT
G

QA 2 736 2 736
DS 

RD RS1EB81JQ 691 0 0
AAAATGGAGAATATTGTAAGATTCGCGGTCACCATCATTTTTGTACTTCACTCTGTATCA
TCATCACACGCCGCAACTACGTCACCGAGCGGTGGAGGCGGCGGAGGAGGAGATGCTCAA
GCAATGCCGTGTATACAGAAACTTATGCCGTGTCAGCCGTTTCTTCACTCGGTGATTCCA
CCACCGCCTCCATCGTGCTGCCTGCCAATGAGGGAGATCGTCGCCAATGACGCGACGTGT
CTTTGCTCCGTCTTTAACAACGTAGATATGCTCAAATCGCTTAACCTCACTAAAGACAAT
GCTCTTGATCTCCCTAAAGCCTGTGGCGCTAACCCTGACATCTCACTATGCAAAGCCAGT
CCCGTGGGTGGTACTACTACGCCTTCGACATCTCCGGCAACTCCAAAAACTCCTCCGGTG
TCTTCCACTGGAAGCGGTTCCACCGGAGCTTCATCAGCTTCTTCAACATCCACACCAACA
AACTCTGCTCCGGCCATCAACTTTGCTAAACTAAGCTTCGCATCGACTATTGTGGCATTG
GCAACAACCGTTTTCTGATCGACTACTATATATATAT**TATTACATAACGTCTTTATTC
ATTATTAGATAGGTTTAATTTGTTTTAAATTATGTTTGGTAACTTAATATTCATATGTAA
TGAAAAAATTCTAATAATATTAATGACTTCC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1EC91JQ 691 0 0
AAAATGGAGAATATTGTAAGATTCGCGGTCACCATCATTTTTGTACTTTACTCTGTATCA
TCATCACACGCCGCAACTACGTCACCGAGCGGTGGAGGCGGCGGAGGAGGAGATGCTCAA
GCAATGCCGTGTATACAGAAACTTATGCCGTGTCAGCCGTTTCTTCACTCGGTGATTCCA
CCACCGCCTCCATCGTGCTGCCTGCCAATGAGGGAGATCGTCGCCAATGACGCGACGTGT
CTTTGCTCCGTCTTTAACAACGTAGATATGCTCAAATCGCTTAACCTCACTAAAGACAAT
GCTCTTGATCTCCCTAAAGCCTGTGGCGCTAACCCTGACATCTCACTATGCAAAGCCAGT
CCCGTGGGTGGTACTACTACGCCTTCGACATCTCCGGCAACTCCAAAAACTCCTCCGGTG
TCTTCCACTGGAAGCGGTTCCACCGGAGCTTCATCAGCTTTTTCAACATCCACACCAACA
AGCTTTGCTCCGGCCATCAACTTTGCTAAACTAAGCTTCGCATCGACTATTGTGGCATTG
GCAACAACCGTTTTCTGATCGACTACTATATATATATATTATTACATAACGTCTTTATTC
ATTATTAGATAGGTTTAATTTGTTTTAAATTATGTTTGGTAACTTAATATTCATATGTAA
TGAAAAAATTCTAATAATATTAATGACTTCC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1EH77JQ 264 0 0
CATTTCT
GGCAACTCCAAAAACTCCTCCGGTGTCTTCCACTGGAAGCGGTTCCACCGGAGCTTCATC
AGCTTCTTCAACATCCACACCAACAAGCTCTGCTCCGGCCATCAACTTTGCTAAACTAAG
CTTCGCATCGACTATTGTGGCATTGGCAACAACCGTTTTCTGATCGACTACTATATATAT
ATATTATTACATAACGTCTTTATTCATTATTAGATAGGTTTAATTTGTTTTAAATTATGT
TTGGTAACTTAATATTC

QA 8 264 8 264
DS 



AS 1 6

CO CL1008Contig1 587 6 6 U
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TGGGCTGCATTGGTCTTATCGATTCAGCCAGTATCAATATTTACCGGCCGGTGCTTACAA
GAACATCAAACAAACCCTACACGAGAAGAGGACTATCGATGGCTGCGAGTCGAGCTGAGT
CAATGGCTACTGAAAAATTAGGGATCTTTATCGAGAAGAATCCTCCCGAGTCCAAACTCA
CCCAACTAGGTGTTCGTAATTGGCCCAAGTGGGGTTGTCCTCCAAGCAAGTTTCCATGGA
CTTACGATGCAAAGGAGACTTGTTTTCTGCTAGAAGGGAAAGTGAAAGTTTACCCTAATG
GATCCGATGAAGGCGTGGAGATCGAAGCAGGCGACTTTGTTGTTTTCCCTAAAGGAATGA
GTTGCACTTGGGACGTCTCTGTTGCAGTTGATAAGCACTACCAATTCGAGTGAATGGCTA
TTTACTTCTACGTACTCCTCATATTGGTGATATGTTTGATATAGCTTCACTGTCTTTGTA
TGTTGTGGATACTTAATATAGAAGTTCGTTTGCGTTATTTAAGACTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 20 20 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AP10JQ C 42
AF RS1DA36JQ C 1
AF RS1DA36TF U 1
AF RS1FI06JQ C 35
AF RS1FI06TF U 35
AF RS1AP10TFB U 42
BS 1 158 RS1DA36TF
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RD RS1AP10JQ 128 0 0
GGAGAGA
AGAGAAGCAAGATGGGCTGCATTGGTCTTATCGATTCAGCCAGTATCAATATATACCGGC
CGGTGCTTACAAGAACATCAAACAAACCCTACACGAGAAGAGGACTATCGATGGCTGCGA
G

QA 8 128 8 128
DS 

RD RS1DA36JQ 576 0 0
GGAAAAACAGAGAAATTAAACAAACAAAAAAGATAGAGAGGTATTACCAGAGAAGCAAGA
TGGGCTGCATTGGTCTTATCGATTCAGCCAGTATCAATATTTACCGGCCGGTGCTTACAA
GAACATCAAACAAACCCTACACGAGAAGAGGACTATCGTTGGCTGCGAGTCGAGCTGAGT
CAATGGCTACTGAAAAATTAGGGATCTTTATCGAGAAGAATCCTCCCGAGTCCAAACTCA
CCCAACTAGGTGTTCGTAATTGGCCCAAGTGGGGTTGTCCTCCAAGCAAGTTTCCATGGA
CTTACGATGCAAAGGAGACTTGTTTTCTGCTAGAAGGGAAAGTGAAGGTTTACCCTAATG
GATCCGATGAAGGCGTGGAGATCGAAGCAGGCGACTTTGTTGTTTTCCCTAAAGGAATGA
GTTGCACTTGGGACGTCTCTGTTGCAGTTGATAAGCACTACCAATTCGAGTGAATGGCTA
TTTACTTCTACGTACTCCTCATATTGGTGATATGTTTGATATAGCTTCACTGTCTTTGTA
TGTTGTGGATACTTAATATAGAAGTTCGTTTGCGTT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RS1DA36TF 576 0 0
GGAAAAACAGAGAAATTAAACAAACAAAAAAGATAGAGAGGTATTACCAGAGAAGCAAGA
TGGGCTGCATTGGTCTTATCGATTCAGCCAGTATCAATATTTACCGGCCGGTGCTTACAA
GAACATCAAACAAACCCTACACGAGAAGAGGACTATCGTTGGCTGCGAGTCGAGCTGAGT
CAATGGCTACTGAAAAATTAGGGATCTTTATCGAGAAGAATCCTCCCGAGTCCAAACTCA
CCCAACTAGGTGTTCGTAATTGGCCCAAGTGGGGTTGTCCTCCAAGCAAGTTTCCATGGA
CTTACGATGCAAAGGAGACTTGTTTTCTGCTAGAAGGGAAAGTGAAGGTTTACCCTAATG
GATCCGATGAAGGCGTGGAGATCGAAGCAGGCGACTTTGTTGTTTTCCCTAAAGGAATGA
GTTGCACTTGGGACGTCTCTGTTGCAGTTGATAAGCACTACCAATTCGAGTGAATGGCTA
TTTACTTCTACGTACTCCTCATATTGGTGATATGTTTGATATAGCTTCACTGTCTTTGTA
TGTTGTGGATACTTAATATAGAAGTTCGTTTGCGTT

QA 1 576 1 576
DS 

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CAATATTTACCGGCCGGTGCTTACAAGAACATCAAACAAACCCTACACGAGAAGAGGACT
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GAAGAATCCTCCCGAGTCCAAACTCACCCAACTAGGTGTTCGTAATTGGCCCAAGTGGGG
TTGTCCTCCAAGCAAGTTTCCATGGACTTACGATGCAAAGGAGACTTGTTTTTTGCTAGA
AGGGAAAGTGAAAGTTTACCCTAATGGATCCGATGAAGGCGTGGAGATCGAAGCAGGCGA
CTTTGTTGTTTTCCCTAAAGGAATGAGTTGCACTTGGGACGTCTCTGTTGCAGTTGATAA
GCACTACCAATTCGAGTGAATGGCTATTTACTTCTACGTACTCCTCATATTGGTGATATG
TTTGATATAGCTTCACTGTCTTTGTATGTTGTGGATACTTAATATAGAAGTTCGTTTGCG
TT
GG

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DS 

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CAATATTTACCGGCCGGTGCTTACAAGAACATCAAACAAACCCTACACGAGAAGAGGACT
ATCGATGGCTGCGAGTCGAGCTGAGTCAATGGCTACTGAAAAATTAGGGATCTTTATCGA
GAAGAATCCTCCCGAGTCCAAACTCACCCAACTAGGTGTTCGTAATTGGCCCAAGTGGGG
TTGTCCTCCAAGCAAGTTTCCATGGACTTACGATGCAAAGGAGACTTGTTTTCTGCTAGA
AGGGAAAGTGAAAGTTTACCCTAATGGATCCGATGAAGGCGTGGAGATCGAAGCAGGCGA
CTTTGTTGTTTTCCCTAAAGGAATGAGTTGCACTTGGGACGTCTCTGTTGCAGTTGATAA
GCACTACCAATTCGAGTGAATGGCTATTTACTTCTACGTACTCCTCATATTGGTGATATG
TTTGATATAGCTTCACTGTCTTTGTATGTTGTGGATACTTAATATAGAAGTTCGTTTGCG
TT
GG

QA 1 542 1 542
DS 

RD RS1AP10TFB 546 0 0
GGAGAGA
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CGGTGCTTACAAGAACATCAAACAAACCCTACACGAGAAGAGGACTATCGATGGCTGCGA
GTGGATCTGAGTCAATGGCTACTGAAAAATTAGGGATCTTTATCGAGAAGAATCCTCCCG
AGTCCAAACTCACCCAACTAGGTGTTCGTAATTGGCCCAAGTGGGGTTGTCCTCCAAGCA
AGTTTCCATGGACTTACGATGCAAAGGAGACTTGTTTCCTGCTAGAGGGGAAAGTGAAAG
TGTACCCTGATGGGTCCGATGAAGGCGTGGAGATCGAAGCAGGCGACTTTGTTGTTTTCC
CTAAAGGAATGAGTTGCACTTGGGACGTCTCTGTTGCTGTTGATAAGCACTACCAGTTCG
AGTGAATGGCTATTTACTTCTGC****TCCGCATATTGGTGATATGTTTGATATAGCTTC
ACTGTCTTTGTATGTTGTGGATACTTAATATAGAAGTTCGTTTGCGTTATTTAAGACTT

QA 8 546 8 546
DS 



AS 1 4

CO CL1009Contig1 1273 4 11 U
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GCCGACGATGCAGAAAGGAATATTCGTGAGCGTTCCGGTACTCGTCCTCTCCGTTTCCTT
CGCAGCTGCCGTCTTCTTCCTCCTCTCCTCCTCCTCCTGCTCATGTCCTTCTTCTCCGAA
CATAGCTTCCCTCGGAGGAAGCGTTAGTGACGTGAGATTAGAGGAGAGGATATCGACGAC
GCGAGAGGATATAGAGTGGGTTAGAGATCTGATTAGATCGAATGGTTTGCATATGCAGAA
GAATGAGCTTAGGAAAGGCATCAATCCTCGCACTAGAGATCAACAACTCGCAGATCTAAG
ACAGTACAAGGGTATATCTCATTACGAAGGAGACGAAGCAAACAACCACACAGCTCTTCC
ATGCCCTGGTGAGTTACTAGTCGAGCAGCATCACAGCAACTACGGTGAGCCGTGGGCAGG
TGGCCGCGACGTATTCGAGTTCTTGGCTCAATCATCCAATCTCAAACCAAACTCTCGCGT
CCTCGAAATCGGATGCGGCACCTTACGAGTCGGTTTGCATTTCATCCGCTATCTCGATCC
AAGACACTTCCACTGCCTTGAAAGAGACGAGCTTTCTCTAATGGCTGCTTTGAGATACGA
GCTTCCATCACAAGGTCTTCTACACAAACGGCCCCTTATACTCAGAGGAGAAGATATGGA
GTTCAGCAAGTTTGGCTCGGATGTAAGCTATGATCTTATATACGCGAGTGCGGTCTTTCT
TCACATGCCTGATAAGCTCGTGTGGACTGGACTCGAGAGGCTGGTGGAGAAGTTAAAGCC
TTATGAAGGGAGGATCTTTGTGTCGCATAATGTCAAGTTTTGTTCAAGGTTAGGTGGAGA
CGAGTGTGGAAAGAAGCTAGCGAGTTTGGGGCTTGAGTATCTTGGTAAGCAGACACATGA
TAGCTTGCTGTTTAATCACTACGAGATCTGGTTTGGGTTTAGACGGGTGGAACCATAAAA
AAAACAAAAATTTGTCGGAAGTAGTTTAAATATGGGTTTGGTGACACGCCATTGCTCTCC
ATTATCTGAGGATTGGATCAGAACTTGAAGGAGAGAAACGTCCACAAAAGCTTTGAAGTA
CACTCACTGGTTTTTTGGTCAGAGAGATACGTGTATTGTGCATGTAATAGCCAAATGATA
TAAGATACGAGAGTAGATTCATATTATTCTGTAACCAAAAAATATTGTTTTCATATTTCA
AGAGTTGTTACCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 5 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1FB04TF U 1
AF RS1H390TF U 1
AF RS1FB04JQ C 497
AF RS1H390JQB C 497
BS 1 672 RS1FB04TF
BS 673 674 RS1H390TF
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BS 1086 1086 RS1H390JQB
BS 1087 1273 RS1FB04JQ

RD RS1FB04TF 672 0 0
GGAACGACACAGATCTCTCTCATCTCATCAATCATCATCATCAATGATGTTTCTCTCCTC
GCCGACGATGCAGAAAGGAATATTCGTGAGCGTTCCGGTACTCGTCCTCTCCGTTTCCTT
CGCAGCTGCCGTCTTCTTCCTCCTCTCCTCCTCCTCCTGCTCATGTCCTTCTTCTCCGAA
CATAGCTTCCCTCGGAGGAAGCGTTAGTGACGTGAGATTAGAGGAGAGGATATCGACGAC
GCGAGAGGATATAGAGTGGGTTAGAGATCTGATTAGATCGAATGGTTTGCATATGCAGAA
GAATGAGCTTAGGAAAGGCATCAATCCTCGCACTAGAGATCAACAACTCGCAGATCTAAG
ACAGTACAAGGGTATATCTCATTACGAAGGAGACGAAGCAAACAACCACACAGCTCTTCC
ATGCCCTGGTGAGTTACTAGTCGAGCAGCATCACAGCAACTACGGTGAGCCGTGGGCAGG
TGGCCGCGACGTATTCGAGTTCTTGGCTCAATCATCCAATCTCAAACCAAACTCTCGCGT
CCTCGAAATCGGATGCGGCACCTTACGAGTCGGTTTGCATTTCATCCGCTATCTCGATCC
AAGACACTTCCACTGCCTTGAAAGAGACGAGCTTTCTCTAATGGCTGCTTTGAGATACGA
GCTTCCATCACA

QA 1 672 1 672
DS 

RD RS1H390TF 768 0 0
GGAACGACACAGATCTCTCTCATCTCATCAATCATCATCATCAATGATGTTTCTCTCCTC
GCCGACGATGCAGAAAGGAATATTCGTGAGCGTTCCGGTACTCGTCCTCTCCGTTTCCTT
CGCAGCTGCCGTCTTCTTCCTCCTCTCCTCCTCCTCCTGCTCATGTCCTTCTTCTCCGAA
CATAGCTTCCCTCGGAGGAAGCGTTAGTGACGTGAGATTAGAGGAGAGGATATCGACGAC
GCGAGAGGATATAGAGTGGGTTAGAGATCTGATTAGATCGAATGGTTTGCATATGCAGAA
GAATGAGCTTAGGAAAGGCATCAATCCTCGCACTAGAGATCAACAACTCGCAGATCTAAG
ACAGTACAAGGGTATATCTCATTACGAAGGAGACGAAGCAAACAACCACACAGCTCTTCC
ATGCCCTGGTGAGTTACTAGTCGAGCAGCATCACAGCAACTACGGTGAGCCGTGGGCAGG
TGGCCGCGACGTATTCGAGTTCTTGGCTCAATCATCCAATCTCAAACCAAACTCTCGCGT
CCTCGAAATCGGATGCGGCACCTTACGAGTCGGTTTGCATTTCATCCGCTATCTCGATCC
AAGACACTTCCACTGCCTTGAAAGAGACGAGCTTTCTCTAATGGCTGCTTTGAGATACGA
GCTTCCATCACAAG*TCTTCTACACAAACG*CCCCTTATACTCAGAGGAGAAGATATGGA
GTTCAGCA*GTTTGGCTCGGATGTAAGCTATGATCTTATATACGCGAG

QA 1 768 1 768
DS 

RD RS1FB04JQ 777 0 0
GAGTTCTTGGCTCAATCATCCAATCTCAAACCAAACTCTCGCGTCCTCGAAATCGGATGC
GGCACCTTACGAGTCGGTTTGCATTTCATCCGCTATCTCGATCCAAGACACTTCCACTGC
CTTGAAAGAGACGAGCTTTCTCTAATGGCTGCTTTGAGATACGAGCTTCCATCACAAGGT
TTTCTACACAAACGGCCCCTTATACTCAGAGGAGAAGATATGGAGTTCAGCAAGTTTGGC
TCGGATGTAAGCTATGATCTTATATACGCGAGTGCGGTCTTTCTTCACATGCCTGATAAG
CTCGTGTGGACTGGACTCGAGAGGCTGGTGGAGAAGTTAAAGCCTTATGAAGGGAGGATC
TTTGTGTCGCATAATGTCAAGTTTTGTTCAAGGTTAGGTGGAGACGAGTGTGGAAAGAAG
CTAGCGAGTTTGGGGCTTGAGTATCTTGGTAAGCAGACACATGATAGCTTGCTGTTTAAT
CACTACGAGATCTGGTTTGGGTTTAGACGGGTGGAACCATAAAAAAAACAAAAATTTGTC
GGAAGTAGTTTAAATATGGGTTTGGTGACACGCCATTGCTCTCCATTATTTGAGGATTGG
ATCAGAACTTGAAGGAGAGAAACGTCCACAAAAGCTTTGAAGTACACTCACTGGTTTTTT
GGTCAGAGAGATACGTGTATTGTGCATGTAATAGCCAAATGATATAAGATACGAGAGTAG
ATTCATATTATTCTGTAACCAAAAAATATTGTTTTCATATTTCAAGAGTTGTTACCG

QA 1 777 1 777
DS 

RD RS1H390JQB 777 0 0
GAGTTCTTGGCTCAATCATCCAATCTCAAACCAAACTCTCGCGTCCTCGAAATCGGATGC
GGCACCTTACGAGTCGGTTTGCATTTCATCCGCTATCTCGATCCAAGACACTTCCACTGC
CTTGAAAGAGACGAGCTTTCTCTAATGGCTGCTTTGAGATACGAGCTTCCATCACAAGGT
CTTCTACACAAACGGCCCCTTATACTCAGAGGAGAAGATATGGAGTTCAGCAAGTTTGGC
TCGGATGTAAGCTATGATCTTATATACGCGAGTGCGGTCTTTCTTCACATGCCTGATAAG
CTCGTGTGGACTGGACTCGAGAGGCTGGTGGAGAAGTTAAAGCCTTATGAAGGGAGGATC
TTTGTGTCGCATAATGTCAAGTTTTGTTCAAGGTTAGGTGGAGACGAGTGTGGAAAGAAG
CTAGCGAGTTTGGGGCTTGAGTATCTTGGTAAGCAGACACATGATAGCTTGCTGTTTAAT
CACTACGAGATCTGGTTTGGGTTTAGACGGGTGGAACCATAAAAAAAACAAAAATTTGTC
GGAAGTAGTTTAAATATGGGTTTGGTGACACGCCATTGCTCTCCATTATCTGAGGATTGG
ATCAGAACTTGAAGGAGAGAAACGTCCACAAAAGCTTTGAAGTACACTCACTGGTTTTTT
GGTCAGAGAGATACGTGTATTGTGCATGTAATAGCCAAATGATATAAGATACGAGAGTAG
ATTCATATTATTCTGTAACCAAAAAATATTGTTTTCATATTTCAAGAGTTGTTACCG

QA 1 777 1 777
DS 



AS 2 5

CO CL1010Contig1 770 2 5 U
AATACATCTCAACTACATATTGATATAGAAGGTAAGCACATGAGTCTTGCTCATGACATT
ATTAGGAAATGTTGTGCTAATAAACATAGTAAGATTACTTAAGCGGCTTGAAATGATCAA
TCTGGATGCTCTCACCTTGGAGCTTTTTGTAATCACTTCTGTTTCTCGCAGCAAAGAACT
TGCCCCAATTGTACTTTTTGTAACAAGGCGGGTTGTCTTCGGTTATAAACTCCTCCAATG
GCTCAATGTTGACTTCATGGGATGGAAACAGGAAAAATGGCATTGAAAATCTCTCTTTGC
TTGAATTCACTACCACTCTATGTCCTGCACTCCAATACTTGTCATTTGTCCATACCTGCA
TGCAGTTGCCAACGTTAATGATGAAAGCATCAGGGTTTGGTTTCACCGAGATCCATTGTC
CATCCGATCTACGGCTCACTTGTAACCCACCCACATTATCTTGGGCCAAGACGGTTATAA
CTCCTGCGTCTGCGTGGCGTCCAACGCCTAATGCTAGCTCCGGGTTCGGGCAAGGAGGGT
AATGGTTAAACCTCAACTTCTCTTGCATATTCTTGGCATATCTCCCTAAAGTCGGAAGGG
TTTTGAGGCCACGGGTTAGTCAGCTTCCTGAGCTCGGTGTCTTCCGGCACGGTAGACGCC
GGAACCGTCGTCGAGTCCTGCAAAAAGAAATCGAAAATCTCTTTCCAGTCTCTAACGTGT
TTGGTATGTTCTCCGTCGTGATAACCCATAGGGTTCACTTCATCTCTTTC


BQ
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AA

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DS 



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ATGGAAAAAGAAAGAATGGCATTGAGAATCTCTCTTTGCTTGAATTCACTACCACTCTAT
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TCCAGTCTCTAACGTTTTTGGTATGTTCTCCGTCGTGATAACCCATAGGGTTCACTTCAT
CTCTTTTCACTCTTCTCTTCTCCTCCAATGGTAAACTGAAAAAATCCGCCATCGTCTTCT
CAATCCGACTCTTTAAGTCCAACGACAATCCATGGTTGGTCACCTGGAAAAAACCCCATC
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GATCC


BQ
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CAACGCCTAATGCTAGCTCCGGGTTCGGGCAAGGAGGGTAATGGTTAAGCCTCAAAAAGC
TTGTTTGGTCATTGAAGTACCCCGTAAACCGATCACCAGGTAGACCCAAGCTAATGGAGA
TAAGTTCCAAAAGCTTGAAAGCTAGCTTCTCAACTTCTCTTGCATATTCTTGGCA
TATCTCCCTAAA

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1EG12JQ 713 0 0
GGGTTA
AGTGCTTCTTTTATTATTATAAAATAAACACAATGTATTTCAACCACATATTGATATAGA
AGT**AGAACACGAGTCGTGTTCATCGACATTATTAGGAAATGTTGTGCTAATAAACATA
GTAAGATTACTTAAGCGGCCTTGAAGTGATCAATCTGGATGCTCTCACTTTGGAGCTTCT
TGTAATCACTTCTGTTTCTCGCAGCAAAAAACTTGCCCCAATTGTACTTTTTGTAACAAG
GCGGGTTGTCTTCCCTTATAAACTCCTCCAATGGCTCAATGTTGACTTCATGGGATGGGA
AAAGAAAGAATGGCATTGAGAATCTCTCTTTGCTTGTATTCACTACCACTCTATGTTCTG
CACTCCAGTACTTGTCATTTGTCCATACCTGCATGCAGTTGCCAATGTTAATGATGAAAG
CATCAGGGTTCGGTTTCACCGAGATCCATTGTCCATCCGATCTACGGCTCACTTGTAACC
*ACCCACATTATCTTGGGCCAAGACGGTTATAACTCCTGCGTCTGTGTGGCGTCCAACGC
CTAATGCTAGCTCCGGGTTCGGGCAAGGAGGGTAACGGTTAAACCTCAAAAAGCTTGTTT
GGTCATTGAAGTACCCCGTTAACCGATCACCGGGTAGACCCAAGCTAATGGAGATAAGTT
CCAAAAGCTTGAAAGCTAACTTCTCAACTTCTCTTGCATATTCTTGG

QA 7 713 7 713
DS 

RD RS1CP89TF 739 0 0
GCGTGC
GTGGCGTCCAACGC*TAATGCTAGCTCCGGGTTCGGGCAAGGAGGGTAATGGTTAAGCCT
CAAAAAGCTTGTTTGGTCATTGAAGTACCCCGTAAACCGATCACCAGGTAGACCCAAGCT
AATGGAGATAAGTTCCAAAAGCTTGAAAGCTAGCTTCTCAACTTCTCTTGCATATTCTTG
GCATATCTCCCTAAAGTCGGAAGGGTTTTGAGGCCACGGGTTAGTCAGCTTCCTGAGCTC
GGTGTCTTCCGGCACGGTAGACGCCGGAACCGTCGTCGAGTCCTGCAAAAAGAAATCGAA
AATCTCTTTCCAGTCTCTAACGTTTTTGGTATGTTCTCCGTCGTGATAACCCATAGGGTT
CACTTCATCTCTTTTCACTCTTCTCTTCTCCTCCAATGGTAAACTGAAAAAATCCGCCAT
CGTCTTCTCAATCCGACTCTTTAAGTCCAACGACAATCCATGGTTGGTCACCTGGAAAAA
ACCCCATCTCATGCATGCTTCTGCAATCTCTGTCGTGAGCGCTGTCTTGTCGGAGTGTGG
GTCCTGGAGAGAAGAGAGGTCGATGGTCGGGATCTCTTTGGAAAGAATGTAGTCATCGGA
GTGTTTGAGATGAGTTTTGGGTCTGTGTTCTGGAGCTTGGATAAAAGCTTCGTCGAGTAC
TCCCATGGTGTTTTTTTTCTTTGCGGTGATTCTTATGTTATCTTTTTAAGGCTTTGGAGA
TATCTGATGATCC

QA 7 739 7 739
DS 



AS 2 5

CO CL1011Contig1 592 2 3 U
GCGTTTCAGCAGATAGCTACTCCTCAGGGACCAGAACTCCCGCCGTATTTCCCCCCTTCG
TTTTCGAACCTACAGAGCTCCTCCCTCCCTTCGCCCCCTAACGACACTGTTACGCTTCGT
GAGCTCACCGAGCGTGGGTTTCTCCACCCATCTGGTCTTCCTTCCCTCGAGTTCTTCTTG
CCAGAAGTTGATCCTTCAAGTGAGCCATTGCTTTTATTCCCCAAGAGGACATTCCAACCT
AGCACCATCAGGCGCAAACGTAACCATGGATTCTTTGCTCGCAAAGCAACAAAAGGTGGA
CGGAGAGTCATTGCTCGGAGAATAGCTAAAGGGCGTCACAGAGTCACTGCCTAGAATCTC
CGGTTATCAAATAGGCCGGTTAAGTCCCCTCTTCTTGTGTCCTTTCAGGCTAGAAAACTC
TGAAACTTCGATTTCATAAATAACTCGGATGTATTAAGATCCATGTTTTGATGTGTTGTT
GAATCTTGGAGTCCAGTTCTAAATTTTTAAAGATCTCATTGTTTTTTTCCTGTCAATAAC
CTTTTTAACTCCTTGATGGATAGTTTATTATCCAAGTAATCTTTTTATTCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1CX20JQ C 1
AF RS1CX20TF U 1
BS 1 19 RS1CX20JQ
BS 20 590 RS1CX20TF
BS 591 592 RS1CX20JQ

RD RS1CX20JQ 592 0 0
GCGTTTCAGCAGATAGCTACTCCTCAGGGACCAGAACTCCCGCCGTATTTCCCCCCTTCG
TTTTCGAACCTACAGAGCTCCTCCCTCCCTTCGCCCCCTAACGACACTGTTACGCTTCGT
GAGCTCACCGAGCGTGGGTTTCTCCACCCATCTGGTCTTCCTTCCCTCGAGTTCTTCTTG
CCAGAAGTTGATCCTTCAAGTGAGCCATTGCTTTTATTCCCCAAGAGGACATTCCAACCT
AGCACCATCAGGCGCAAACGTAACCATGGATTCTTTGCTCGCAAAGCAACAAAAGGTGGA
CGGAGAGTCATTGCTCGGAGAATAGCTAAAGGGCGTCACAGAGTCACTGCCTAGAATCTC
CGGTTATCAAATAGGCCGGTTAAGTCCCCTCTTCTTGTGTCCTTTCAGGCTAGAAAACTC
TGAAACTTCGATTTCATAAATAACTCGGATGTATTAAGATCCATGTTTTGATGTGTTGTT
GAATCTTGGAGTCCAGTTCTAAATTTTTAAAGATCTCATTGTTTTTTTCCTGTCAATAAC
CTTTTTAACTCCTTGATGGATAGTTTATTATCCAAGTAATCTTTTTATTCAA

QA 1 592 1 592
DS 

RD RS1CX20TF 590 0 0
GCGTTTCAGCAGATAGCTA
CTCCTCAGGGACCAGAACTCCCGCCGTATTTCCCCCCTTCGTTTTCGAACCTACAGAGCT
CCTCCCTCCCTTCGCCCCCTAACGACACTGTTACGCTTCGTGAGCTCACCGAGCGTGGGT
TTCTCCACCCATCTGGTCTTCCTTCCCTCGAGTTCTTCTTGCCAGAAGTTGATCCTTCAA
GTGAGCCATTGCTTTTATTCCCCAAGAGGACATTCCAACCTAGCACCATCAGGCGCAAAC
GTAACCATGGATTCTTTGCTCGCAAAGCAACAAAAGGTGGACGGAGAGTCATTGCTCGGA
GAATAGCTAAAGGGCGTCACAGAGTCACTGCCTAGAATCTCCGGTTATCAAATAGGCCGG
TTAAGTCCCCTCTTCTTGTGTCCTTTCAGGCTAGAAAACTCTGAAACTTCGATTTCATAA
ATAACTCGGATGTATTAAGATCCATGTTTTGATGTGTTGTTGAATCTTGGAGTCCAGTTC
TAAATTTTTAAAGATCTCATTGTTTTTTTCCTGTCAATAACCTTTTTAACTCCTTGATGG
ATAGTTTATTATCCAAGTAATCTTTTTATTC

QA 20 590 20 590
DS 



CO CL1011Contig2 684 3 1 U
AGGGGGGAAGCAATCGCAATCTCGGCAAAAAAGGTAGAAGAAATGGCGGCCAAAACCCTA
ATCAGGTCGGGAGCTTCGCTGATGAATCGGTTCCTCTCGAAGCCGGCGGCGAATCTCGTG
AAGAACAATCTCAGATCGTTTCAGCAGATAGCTCCTCAGGGACCAGAACTCCCGCCGTAT
TTCCCCCCTTCGTTTTCGAACCTACAGAGCTCCTCCCTCCCTTCGCCCCCTAACGACACT
GTCACGCTTCGTGAGCTCACCGAGCGTGGGTTTCTCCACCCCTCTGGTCTTCCTTCCCTC
GAGTTCTTCTTACCAGAAGTCGATCCTTCAAGTGAGCCATTGCTTTTATTCCCCAAGAGG
ACATTCCAACCTAGCACCATCAGGCGCAAACGTAACCATGGTTTCTTTGCTCGCAAAGCA
ACCAAAGGTGGACGGAGAGTCATTGCTCGGAGAATAGCTAAAGGGCGTCACAGAGTCACT
GCCTAGAATCTCTGGCTATCAAATAGGCCGGTTAAGTCCCCTCTTCTTGTGTCCTCTCAG
GCTAGAAAACTCTGAAACTTCCTTCGATTTCATAAATAACTCGGATGTATTAAGATCCAT
GTTTTGATGTGTTGTTGAATCTTGGAGTCCAGTTATAATTTTTTTAGATCTCATTGTTTT
TTCCCGTCATAACCTTTTAACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H183JQB C 393
AF RS1H183TF U 21
AF RS1GL39TF U 1
BS 1 684 RS1GL39TF

RD RS1H183JQB 132 0 0
TAACCATGGTTTCTTTGCTCGCAAAGCAACCAAAGGTGGACGGAGAGTCATTGTTCGGAG
AATAGCTAAAGGGCGTCACAGAGTCACTGCCTAGAATTTCTGGCTATCAAATAGGCCGGT
TAAGTCCCCTCT

QA 1 132 1 132
DS 

RD RS1H183TF 620 0 0
GGG
GGCAAAAAAGGTAGAAGAAATGGCGGCCAAAACCCTAATCAGGTCGGGAGCTTCGCTGAT
GAATCGGTTCCTCTCGAAGCCGGCGGCGAATCTCGTGAAGAACAATCTCAGATCGTTTCA
GCAGATAGCTCCTCAGGGACCAGAACTCCCGCCGTATTTCCCCCCTTCGTTTTCGAACCT
ACAGAGCTCCTCCCTCCCTTCGCCCCCTAACGACACTGTCACGCTTCGTGAGCTCACCGA
GCGTGGGTTTCTCCACCCCTCTGGTCTTCCTTCCCTCGAGTTCTTCTTACCAGAAGTCGA
TCCTTCGAGTGAGCCATTGCTTTTATTCCCCAAGAGGACATTCCAACCTAGCACCATCAG
GCGCAAACGTAACCATGGTTTCTTTGCTCGCAAAGCAACCAAAGGTGGACGGAGAGTCAT
TGCTCGGAGAATAGCTAAAGGGCGTCACAGAGTCACTGCCTAGAATCTCTGGCTATCAAA
TAGGCCGGTTAAGTCCCCTCTTCTTGTGTCCTTTCAGGCTAGAAAACTCTGAAACTTCCT
TCGATTTCATAAATAACTCGGATGTATTAAGATCCATGTTTTGATGTGTTGTTGAATCTT
GGAGTCCAGTT
ATAATT

QA 4 614 4 614
DS 

RD RS1GL39TF 684 0 0
AGGGGGGAAGCAATCGCAATCTCGGCAAAAAAGGTAGAAGAAATGGCGGCCAAAACCCTA
ATCAGGTCGGGAGCTTCGCTGATGAATCGGTTCCTCTCGAAGCCGGCGGCGAATCTCGTG
AAGAACAATCTCAGATCGTTTCAGCAGATAGCTCCTCAGGGACCAGAACTCCCGCCGTAT
TTCCCCCCTTCGTTTTCGAACCTACAGAGCTCCTCCCTCCCTTCGCCCCCTAACGACACT
GTCACGCTTCGTGAGCTCACCGAGCGTGGGTTTCTCCACCCCTCTGGTCTTCCTTCCCTC
GAGTTCTTCTTACCAGAAGTCGATCCTTCAAGTGAGCCATTGCTTTTATTCCCCAAGAGG
ACATTCCAACCTAGCACCATCAGGCGCAAACGTAACCATGGTTTCTTTGCTCGCAAAGCA
ACCAAAGGTGGACGGAGAGTCATTGCTCGGAGAATAGCTAAAGGGCGTCACAGAGTCACT
GCCTAGAATCTCTGGCTATCAAATAGGCCGGTTAAGTCCCCTCTTCTTGTGTCCTCTCAG
GCTAGAAAACTCTGAAACTTCCTTCGATTTCATAAATAACTCGGATGTATTAAGATCCAT
GTTTTGATGTGTTGTTGAATCTTGGAGTCCAGTTATAATTTTTTTAGATCTCATTGTTTT
TTCCCGTCATAACCTTTTAACTCC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 6

CO CL1012Contig1 729 6 8 U
TTTTTTTCTTTTTAGCTAATATTTCTACTTTTAATAATTAAAAATCAAAATCGGCATATA
CGA*****TTTATCAACAAAGACCGTATTTCAGATCATGACAAAAGACCAAAAA*CTAAA
AGAAGAGATTAATAATTTGTTATTAATTTAGTCAAGAGCTCGACTCGGAACCAGAACCTT
TTTTGTATAATTTGATTCTCCGACTAATCTCCTTCTCTAACTCCTCATCTCCTCCAACTT
CTTCCAATTCCTTCGGTCCAAGAAACAACCCGTATGGCACACCATCGAACTTGTCAGTGT
GATGTAGCTGGTGAGCGGCGGCGACCTTCCGGAGATAAGGGACGTCAGCGATAGGACCGA
CAGGGAAACGCTTGTGCACCAAACCATCGTGGACAAACATGTAGGCGATCCCAAACACCG
TTATTCCTAGTCCGGCGCCAAAGCAAAGACCAGGGACGAGTCCTTTATTAAAGAAACCAT
AAGAGAGCAGACCGATCGCAGGAACAGCGTTTATAATTGCAAATACATCGTTCAGCTCAA
ACGGCCCTTCTCTTGGTTTGTGATGTGACTCATGCATGTTCCAAAGAGAAGCGTGCCAGA
GAGCTCTATGAGCCCATCTCGCCCAAAACTCCATCCCCACAGCAGCACCAACAGAGAGAG
CAAATGTACCAAACATCTCTGACATTGGGATCACACCTCCCTCCATTTGCCAAGAGAATC
TGTAGTAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 

AF RS1DX62JQ U 43
AF RS1E447TF C 1
AF RS1AW80JQ U 51
AF RS1E447JQ U 13
AF RS1DX62TF C 42
AF RS1AW80TF C 51
BS 1 15 RS1E447TF
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RD RS1DX62JQ 444 0 0
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AGGCGATCCCAAACACCGTTATTCCTAGTCCGGCGCCAAAGCAAAAACCAGGGACGAGTC
CTTTATTGAAGAAACCATAAGA
AA

QA 1 442 1 442
DS 

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CGA*****TTTATCAACAAAGACCGTATTTCAGATCATGACAAAAGACCAAAAA*CTAAA
AGAAGAGATTAATAATTTGTTATTAATTTAGTCAAGAGCTCGACTCGGAACCAGAACCTT
TTTTGTATAATTTGATTCTCCGACTAATCTCCTTCTCTAACTCCTCATCTCCTCCAACTT
CTTCCAATTCCTTCGGTCCAAGAAACAACCCGTATGGCACACCATCGAACTTGTCAGTGT
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ACGGCCCTTCTCTTGGTTTGTGATGTGACTCATGCATGTTCCAAAGAGAAGCGTGCCAGA
GAGCTCTATGAGCCCATCTCGCCCAAAACTCCATCCCCACAGCAGCACCAACAGAGAGAG
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TGTAGTAAA

QA 1 729 1 729
DS 

RD RS1AW80JQ 677 0 0
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AAAA*CTAAAAGAAGAGATTAATAATTTGTTATTAATTTAGTCAAGAGCTCGACTCGGAA
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CCTCCAACTTCTTCCAATTCCTTCGGTCCAAGAAACAACCCGTATGGCACACCATCGAAC
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AAGAAACCATAAGAGAGCAGACCGATCGCAGGAACAGCGTTTATAATTGCAAATACATCG
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GCGTGCCAGAGAGCTCTATGAGCCCATCTCGCCCAAAACTCCATCCCCACAGCAGCACCA
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DS 

RD RS1E447JQ 717 0 0
AGC
CTAATATTTCTACTTTTAATAATTAAAAATCAAAATCGGCATATACGA*****TTTATCA
ACAAAGACCGTATTTCAGATCATGACAAAAGACCAAAAA*CTAAAAGAAGAGATTAATAA
TTTGTTATTAATTTAGTCAAGAGCTCGACTCGGAACCAGAACCTTTTTTGTATAATTTGA
TTCTCCGACTAATCTCCTTCTCTAACTCCTCATCTCCTCCAACTTCTTCCAATTCCTTCG
GTCCAAGAAACAACCCGTATGGCACACCATCGAACTTGTCAGTGTGATGTAGCTGGTGAG
CGGCGGCGACCTTCCGGAGATAAGGGACGTCAGCGATAGGACCGACAGGGAAACGCTTGT
GCACCAAACCATCGTGGACAAACATGTAGGCGATCCCAAACACCGTTATTCCTAGTCCGG
CGCCAAAGCAAAGACCAGGGACGAGTCCTTTATTAAAGAAACCATAAGAGAGCAGACCGA
TCGCAGGAACAGCGTTTATAATTGCAAATACATCGTTCAGCTCAAACGGCCCTTCTCTTG
GTTTGTGATGTGACTCATGCATGTTCCAAAGAGAAGCGTGCCAGAGAGCTCTATGAGCCC
ATCTCGCCCAAAACTCCATCCCCACAGCAGCACCAACAGAGAGAGCAAATGTACCAAACA
TCTCTGACATTGGGATCACACCTCCCTCCATTTGCCAAGAGAATCTGTAGTAAA

QA 4 717 4 717
DS 

RD RS1DX62TF 688 0 0
T
AATCAAAATCGGCATATATGATTTGATTTATCAACAAAGACCGTATTTCAGATCATGACA
AAAGACCAAAAAACTAAAAGAAGAGATTAATAATTTGTTTTTAATCTAGTCAAGAGCTCG
ACTCGGAACCAGAACCTTTTTTGTATAATTTGATTCTCAGACTAATCTCCTTCTCCAACT
CCTCATCTCCTCCAACTTCTTCCAATTCCTTCGGTCCAAGAAACAACCCGTATGGCACAC
CATCGAACTTGTCAGTGTGATGTAGCTGGTGAGCGGCAGCGACCTTCCGGAGATAAGGGA
CGTCAGCGATAGGACCGACAGGGAAACGCTTGTGCACCAAACCATCGTGGACAAACATGT
AGGCGATCCCAAACACCGTTATTCCTAGTCCGGCGCCAAAGCAGAGACCAGGGACGAGTC
CTTTATTGAAGAAACCATAAGAGAGCAGACCGATCGCAGGAACAGCGTTTATAATTGCAA
ATACATCGCTCAGCTCAAACGGCCCTTCTCTTGGTTTGTGATGTGACTCATGCATGTTCC
AAAGAGAAGCGTGCCAGAGAGCTCTATGAGCCCATCTTGCCCAAAACTCCATCCCCACAG
CAGCACCAACAGAGAGAGCAAATGTACCAAACATCTCTGACATTGGGATCACACCTCCCT
CCATTTGCCAAGAGAATCTGTAGTAAA

QA 2 688 2 688
DS 

RD RS1AW80TF 679 0 0
TCGGCATATACGA*****TTTATCAACAAAGAC*GTATTTCAGATCATGACAAAAGACTA
AAAA*CTAAAAGAAGAGATTAATAATTTGTTATTAATTTAGTCAAGAGCTCGACTCGGAA
CCAGAACCTTTTTTGTATAATTTGATTCTCCGACTAATCTCCTTCTCTAACTCCTCATCT
CCTCCAACTTCTTCCAATTCCTTCGGTCCAAGAAACAACCCGTATGGCACACCATCGAAC
TTGTCAGTGTGATGTAGCTGGTGAGCGGCGGCGACCTTCCGGAGATAAGGGACGTCAGCG
ATAGGACCGACAGGGAAACGCTTGTGCACCAAACCATCGTGGACAAACATGTAGGCGATC
CCAAACACCGTTATTCCTAGTCCGGCGCCAAAGCAAAGACCAGGGACGAGTCCTTTATTA
AAGAAACCATAAGAGAGCAGACCGATCGCAGGAACAGCGTTTATAATTGCAAATACATCG
TTCAGCTCAAACGGCCCTTCTCTTGGTTTGTGATGTGACTCATGTATGTTCCAAAGAGAA
GCGTGCCAGAGAGCTCTATGAGCCCATCTCGCCCAAAACTCCATCCCCACAGCAGCACCA
ACAGAGAGAGCAAATGTACCAAACATCTCTGACATTGGGATCACACCTCCCTCCATTTGC
CAAGAGAATCTGTAGTAAA

QA 1 679 1 679
DS 



AS 2 6

CO CL1013Contig1 828 4 11 U
CACTATATATCTCATACTAAAATGCCATAAACACAATTACACATAAACCACAAAATATAG
CTTTATACATCGTTACATTTCCTGCAACAACAACACAAACACAACATAGGTTTAACAATT
ACTGAATCATACATCATCATTCACCATTTCTCAAAACTAAAACCCACACATATGAGACTT
GACTCAACACAAAATGATCTCAGACTCAACAAACAAACTCGTGACTGATAATAAGATCCA
TCAACTGAAAAAGGCACGCTACAGTCTTAAGGATACACACGACATTGGGCAAAGATCAAA
CCGTGTATGTGCTGATTTTTGGAGGTGCTTGCAAGTCAGTCACATCAATGTACTGCACAT
CGACAGAGAATGTTCCAGAGCGGTAAAACGTTAGAGCGCCTTGGCACTAGGAATTGAGTT
TCCTTTGGGGAAAACAATGGTGCTCTGCTGATTCTCAGCTCCTTCATTTTGAGCATCAAC
AGCTGCTCCTTTCCACGCCAGCGAAATGGAGAAAGGGAAACTCTCATGAACCTGGAACTC
ACAGACTTTGAAGGTGGGTCTGAGAATGGCACACTGCAAGGCACACCCCCTGAGAGAGAG
AGAGGCGGAGAGAGAGAGACGCGGAGAGAGAGAGACACGGAGAGAGAGAGGCGGAGAGAG
AGATCTCAAGCTTTCATAGCGATTTCATGGCGAGAGAGATGCGAAGAGAGAGACGCGGAC
AGAGAGACGCAGAGAGAGAGAGAGAGTCACGGAGAGAGAGAGCTCAAGCTTTCATGGCGA
TGAATTCATGGCCAGAGGAGAGATGTGGAGGTTTCATCGTTCACGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RS1AD94JQ U 1
AF RS1CR89JQ U 46
AF RS1GV13JQ U 25
AF RS1GV13TF C 241
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BS 593 825 RS1GV13JQ
BS 826 828 RS1GV13TF

RD RS1AD94JQ 606 0 0
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CTTTATACATCGTTACATTTCCTGCAACAACAACACAAACACAACATAGGTTTAACAATT
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GACTCAACACAAAATGATCTCAGACTCAACAAACAAACTCGTGACTGATAATAAGATCCA
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AGCTGCTCCTTTCCACGCCAGCGAAATGGAGAAAGGGAAACTCTCATGAACCTGGAACTC
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GAAGCTGAGAGAGA

QA 1 592 1 592
DS 

RD RS1CR89JQ 546 0 0
GG
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GGCAAAGATCAAACAGTGTATGTGCTGATTTTTGGAGGGGCTTGCAAGTCAGTCACATCA
ATGTACTGCACATCGACAGAAAATGTTCCAAAACGGTAAAACGTTAGAGCGCCTTGGCAC
TAGGAATTGAGTTTCCTTTGGGGAAAACAATGGGGCTCTGCTGATTCTCAGCTCCTTCAT
TTTGAGCATCAACAGCTGCTCCTTTCCACGCCAGCGAAATGGGGAAAGGGAAACTCTCAT
GAACCTGGAACTCACAGACTTTGAAGGGGGGTCTGAAAATGGCACACTGCAAGGCACATC
CCCT

QA 3 546 3 546
DS 

RD RS1GV13JQ 803 0 0
CCATAAACACAATTACACATAAACCACAAAATATAGCTTTATACATCGTTACATTTCCTG
CAACAACAACACAAACACAACATAGGTTTAACAATTACTGAATCATACATCATCATTCAC
CATTTCTCAAAACTAAAACCCACACATATGAGACTTGACTCAACACAAAATGATCTCAGA
CTCAACAAACAAACTCGTGACTGATAATAAGATCCATCAACTGAAAAAGGCACGCTACAG
TCTTAAGGATACACACGACATTGGGCAAAGATCAAACCGTGTATGTGCTGATTTTTGGAG
GTGCTTGCAAGTCAGTCACATCAATGTACTGCACATCGACAGAGAATGTTCCAGAGCGGT
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CTGCTGATTCTCAGCTCCTTCATTTTGAGCATCAACAGCTGCTCCTTTCCACGCCAGCGA
AATGGAGAAAGGGAAACTCTCATGAACCTGGAACTCACAGACTTTGAAGGTGGGTCTGAG
AATGGCACACTGCAAGGCACACCCCCTGAGAGAGAGAGAGGCGGAGAGAGAGAGACGCGG
AGAGAGAGAGACACGGAGAGAGAGAGGCGGAGAGAGAGATCTCAAGCTTTCATAGCGATT
TCATGGCGAGAGAGATGCGAAGAGAGAGACGCGGACAGAGAGACGCAGAGAGAGAGAGAG
AGTCACGGAGAGAGAGAGCTCAAGCTTTCATGGCGATGAATTCATGGCCAGAGGAGAGAT
GTGGAGGTTTCATCGTTCACG
CC

QA 1 801 1 801
DS 

RD RS1GV13TF 588 0 0
TCAACTGAAAAAGGCACGCTACAGTCTTAAGGATACACACGACATTGGGCAAAGATCAAA
CCGTGTATGTGCTGATTTTTGGAGGTGCTTGCAAGTCAGTCACATCAATGTACTGCACAT
CGACAGAGAATGTTCCAGAGCGGTAAAACGTTAGAGCGCCTTGGCACTAGGAATTGAGTT
TCCTTTGGGGAAAACAATGGTGCTCTGCTGATTCTCAGCTCCTTCATTTTGAGCATCAAC
AGCTGCTCCTTTCCACGCCAGCGAAATGGAGAAAGGGAAACTCTCATGAACCTGGAACTC
ACAGACTTTGAAGGTGGGTCTGAGAATGGCACACTGCAAGGCACACCCCCTGAGAGAGAG
AGAGGCGGAGAGAGAGAGACGCGGAGAGAGAGAGACACGGAGAGAGAGAGGCGGAGAGAG
AGATCTCAAGCTTTCATAGCGATTTCATGGCGAGAGAGATGCGAAGAGAGAGACGCGGAC
AGAGAGACGCAGAGAGAGAGAGAGAGTCACGGAGAGAGAGAGCTCAAGCTTTCATGGCGA
TGAATTCATGGCCAGAGGAGAGATGTGGAGGTTTCATCGTTCACGGCC

QA 1 588 1 588
DS 



CO CL1013Contig2 719 2 11 U
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CTCTGCGTCTCTCTGTCCGCGTCTCTCTCTTCGCATCTCTCTCGCCATGAAATCGCCATG
AAAGCTTGAGATCTCTCTCTCCGCCTCTCTCTCTCCGTGTCTCTCTCTCTCCGCGTCTCT
CTCTCTCCGCCTCTCTCTCTCTCTCAGCTCCCAGGGGATGTGCCTTGCAGTGTGCCATTC
TCAGACCCACCTTCAAAGTCTGTGAGTTCCAGGTTCATGAGAGTTTCCCTTTCCCCATTT
CGCTGGCGTGGAAAGGAGCAGCTGTTGATGCTCAAAATGAAGGAGCTGAGAATCAGCAGA
GCACCATTGTTTTCCCCAAAGGAAACTCAATTCCTAGTGCCAAGGCGCTCTAACGTTTTA
CCGCTCTGGAACATTCTCTGTCGATGTGCAGTACATTGATGTGACTGACTTGCAAGCACC
TCCAAAAATCAGCACATACACGGTTTGATCTTTGCCCAATGTCGTGTGTATCCTTAAGAC
TGTAGCGTGCCTTTTTCAGTTGATGGATCTTATTATCAGTCACGAGTTTGTTTGTTGAGT
CTGAGATCATTTTGTGTTGAGTCAAGTCTCATATGTGTGGGTTTTAGTTTTGAGAAATGG
TGAATGATGATGTATGATTCAGTAATTGTTAAACCTATGTTGTGTTTGTGTTGTTGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 0 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1AD94TF U 1
AF RS1CR89TF U 6
BS 1 52 RS1AD94TF
BS 53 54 RS1CR89TF
BS 55 209 RS1AD94TF
BS 210 210 RS1CR89TF
BS 211 217 RS1AD94TF
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BS 414 414 RS1CR89TF
BS 415 719 RS1AD94TF

RD RS1AD94TF 719 0 0
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CTCTGCGTCTCTCTGTCCGCGTCTCTCTCTTCGCATCTCTCTCGCCATGAAATCGCCATG
AAAGCTTGAGATCTCTCTCTCCGCCTCTCTCTCTCCGTGTCTCTCTCTCTCCGCGTCTCT
CTCTCTCCGCCTCTCTCTCTCTCTCAGCTTCCAGGGGGTGTGCCTTGCAGTGTGCCATTC
TCAGACCCACCTTCAAAGTCTGTGAGTTCCAGGTTCATGAGAGTTTCCCTTTCTCCATTT
CGCTGGCGTGGAAAGGAGCAGCTGTTGATGCTCAAAATGAAGGAGCTGAGAATCAGCAGA
GCACCATTGTTTTCCCCAAAGGAAACTCAATTCCTAGTGCCAAGGCGCTCTAATGTTTTA
CCGCTCTGGAACATTCTCTGTCGATGTGCAGTACATTGATGTGACTGACTTGCAAGCACC
TCCAAAAATCAGCACATACACGGTTTGATCTTTGCCCAATGTCGTGTGTATCCTTAAGAC
TGTAGCGTGCCTTTTTCAGTTGATGGATCTTATTATCAGTCACGAGTTTGTTTGTTGAGT
CTGAGATCATTTTGTGTTGAGTCAAGTCTCATATGTGTGGGTTTTAGTTTTGAGAAATGG
TGAATGATGATGTATGATTCAGTAATTGTTAAACCTATGTTGTGTTTGTGTTGTTGTTG

QA 1 719 1 719
DS 

RD RS1CR89TF 704 0 0
GG
ATCGCCATGAAAGCTTGAGCTCTCTCTC**CGTGACTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTGCG
TCTCTCTGTCCGCGTCTCTCTCTTCTCATCTCTCTCGCCATGAAATCGCCATGAAAGCTT
GAGATCTCTCTCTCCGCCTCTCTCTCTCCGTGTCTCTCTCTCTCCGCGTCTCTCTCTCTC
CGCCTCTCTCTCTCTCTC***TCTCAGGGGATGTGCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGACC
CACCTTCAAAGTCTGTGAGTTCCAGGTTCATGAGAGTTTCCCTTTCCCCATTTCGCTGGC
GTGGAAAGGAGCAGCTGTTGATGCTCAAAATGAAGGAGCTGAGAATCAGCAGAGCACCAT
TGTTTTCCCCAAAGGAAACTCAATTCCTAGTGCCAAGGCGCTCTAACGTTTTACCGCTCT
GGAACATTCTCTGTCGATGTGCAGTACATTGATGTGACTGACTTGCAAGCACCTCCAAAA
ATCAGCACATACACTGTTTGATCTTTGCCCAATGTCGTGTGTATCCTTAAGACTGTAGCG
TGCCTTTTTCAGTTGATGGATCTTATTATCAGTCACGAGTTTGTTTGTTGAGTCTGAGAT
CATTTTGTGTTGAGTCAAGTCTCATATGTGTGGGTTTTAGTTTTGAGAAATGGTGAATGA
TGATGTATTATTCAGTAATTGTTAAACCTATGTTGTGTTTGT

QA 3 704 3 704
DS 



AS 2 6

CO CL1014Contig1 1246 3 2 U
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AATCTACAAGACAAATGATACACAGGAGTATAAACGAGCTACTTCAAAACTATTGAGAGT
TTGATTCTTATGGGTGTAGATGTCGAATGGAATCTGGTGAATGACAACAACAACAACAAC
ATAAACATCTCGGTGATCTGTCTTATGACCTTGTTGCTTCACATTACACAGCCACAGCTT
CTGGCTTCTTGCTGGTCTTGATTCCTTTTATAGCTTCTTCATAGTCTTTAGCTCCAAATA
CAGCTGATCCAGCTACTAGAGCATTTGCTCCAGCCTCAATAACCTTGTATGCATTCTTTG
GAGTGACACCACCATCAACTTCAATCCATGGGTTTACTCCCTTTTCGACACACATTCTTC
TCAAATCGGAGATTTTCTTAACTTGGCTTTCGATAAAGCTCTGTCCACCAAACCCGGGGT
TGACCGACATTATCAAGACCAGATCCACCACCTCCAATACATATTCTATAGCACTCAATG
GGGTTCCAGGGTTTAGAACAACTCCAGCTTTAGCACCTAAGCTTTTGATTTGATTGACAG
TGCGGTGCAAATGGATGGTGGATGACTGCTCACAGTGTACACTGACGATGTCTGCACCTG
CTTTGATGAAATCTGGTACCCTCAGATCTGGTTCCACTATCATAAGATGAACATCCAGAG
GAAGATCAGTAACAGGACGCAAAGCATCAACCACAAGAGGTCCAATAGTGATGTTGGGAA
CAAAACGACCATCCATCACATCAACATGGATCCAATCACAACCTGCACACTCTACTGCTT
TTACCTGCTCGCCTAATTTGGCGAAATTAGCAGAGAGAATGGAGGGAGAGATGATGATAT
CACTCTTGGAATATTTATCAACACGAGCAGTGGCCTTCACAATACCATCATGAGTTCTCC
TTCTGGAGAAAGAAAAGGAAATGGGTTGGTAAAAGGAGGAACCTTTGAGGCCTAAGACCG
AACCCATTGACCTGGGCTGACGAACAGCACAACGAAGTGGATACTGAGCTCGACATATCC
GATACTCTAGATTCTATTCCTTCTTTTTTTTTCAAAAAAAAAAAGAGAAAGATTCAAAGC
TTCTTTCTCTCCACTAGAATCCACAAAAAGGTTGGTGGTGGGTTTAGCTTAGTAGTGAGA
GAAAACACCCAAATCGTTATCTCTCTTCTTCCTTCGTCTCAACTCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DW29JQ U 3
AF RS1GC69JQ U 1
AF RS1C336TF C 516
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BS 710 1246 RS1C336TF

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TCTACAAGACAAATGATACACAGGAGTATAAACGAGCTACTTCAAAACTATTGAGAGTTT
GATTCTTATGGGTGTAGATGTCGAATGGAATCTGGTGAATGACAACAACAACAACAACAT
AAACATCTCGGTGATCTGTCTTATGACCTTGTTGCTTCACATTACACAGCCACAGCTTCT
GGCTTCTTGCTGGTCTTGATTCCTTTTATAGCTTCTTCATAGTCTTTAGCTCCAAATACA
GCTGATCCAGCTACTAGAGCATTTGCTCCAGCCTCAATAACCTTGTATGCATTCTTTGGA
GTGACACCACCATCAACTTCAATCCATGGGTTTACTCCCTTTTCGACACACATTCTTCTC
AAATCGGAGATTTTCTTAACTTGGCTTTCGATAAAGCTCTGTCCACCAAACCCGGGGTTG
ACCGACATTATCAAGACCAGATCCACCACCTCCAATACATATTCTATAGCACTCAATGGG
GTTCCAGGGTTTAGAACAACTCCAGCTTTAGCACCTAAGCTTTTGATTTGATTGACAGTG
CGGTG

QA 1 605 1 605
DS 

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ATGTAACACGGCTTATTTCTTATTAATTGCATAATGTATTGTTGAATCTGCATATCCCCA
AATCTACAAGACAAATGATACACAGGAGTATAAACGAGCTACTTCAAAACTATTGAGAGT
TTGATTCTTATGGGTGTAGATGTCGAATGGAATCTGGTGAATGACAACAACAACAACAAC
ATAAACATCTCGGTGATCTGTCTTATGACCTTGTTGCTTCACATTACACAGCCACAGCTT
CTGGCTTCTTGCTGGTCTTGATTCCTTTTATAGCTTCTTCATAGTCTTTAGCTCCAAATA
CAGCTGATCCAGCTACTAGAGCATTTGCTCCAGCCTCAATAACCTTGTATGCATTCTTTG
GAGTGACACCACCATCAACTTCAATCCATGGGTTTACTCCCTTTTCGACACACATTCTTC
TCAAATCGGAGATTTTCTTAACTTGGCTTTCGATAAAGCTCTGTCCACCAAACCCGGGGT
TGACCGACATTATCAAGACCAGATCCACCACCTCCAATACATATTCTATAGCACTCAATG
GGGTTCCAGGGTTTAGAACAACTCCAGCTTTAGCACCTAAGCTTTTGATTTGATTGACAG
TGCGGTGCAAATGGATGGTGGATGACTGCTCACAGTGTACACTGACGATGTCTGCACCTG
CTTTGATGAAATCTGGTACCCTCAGATCTGGTTCCACTATCATAAGATG

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1C336TF 731 0 0
C
ATACATATTCTATAGCACTCAATGGGGTTCCAGGGTTTAGAACAACTCCAGCTTTGGCAC
CTAAGCTTTTAATTTGATTGACAGTGCGGTGCAAATGGATGGTGGATGACTGCTCACAGT
GTACACTGACGATGTCTGCACCTGCTTTGATGAAATCTGGTACCCTCAGATCTGGTTCCA
CTATCATAAGATGAACATCCAGAGGAAGATCAGTAACAGGACGCAAAGCATCAACCACAA
GAGGTCCAATAGTGATGTTGGGAACAAAACGACCATCCATCACATCAACATGGATCCAAT
CACAACCTGCACACTCTACTGCTTTTACCTGCTCGCCTAATTTGGCGAAATTAGCAGAGA
GAATGGAGGGAGAGATGATGATATCACTCTTGGAATATTTATCAACACGAGCAGTGGCCT
TCACAATACCATCATGAGTTCTCCTTCTGGAGAAAGAAAAGGAAATGGGTTGGTAAAAGG
AGGAACCTTTGAGGCCTAAGACCGAACCCATTGACCTGGGCTGACGAACAGCACAACGAA
GTGGATACTGAGCTCGACATATCCGATACTCTAGATTCTATTCCTTCTTTTTTTTTCAAA
AAAAAAAAGAGAAAGATTCAAAGCTTCTTTCTCTCCACTAGAATCCACAAAAAGGTTGGT
GGTGGGTTTAGCTTAGTAGTGAGAGAAAACACCCAAATCGTTATCTCTCTTCTTCCTTCG
TCTCAACTCC

QA 2 731 2 731
DS 



CO CL1014Contig2 1238 3 10 U
GGAGAAAGAGATAGAACGATTTGGGTGTTTTCTCTCACTACTAAGCTAAACCCACCACCA
ACCAACCCTTTTTGGGGGATCCTAGTGAGAGAAAGAAGCTTTGAATCTTTCTCATTTTTT
GAAAAAAAAAAAGAAGGAATAGAATCTAGAAATTCGGAAATGTCGAGCTCAGTATCCACA
TCGTTGTGCTGTTCGTCAACCCAGGTCAATGGGTTCGGTCTTAGGCCTCAAAGGTCGCTC
CTTTACCAACCCACTTCCTTTTCTTCTTTCTCCAGAAGGAGAACTCATGGTGTTGTGAAG
GCCACAGCTCGTGTTGATAAGTATTCCAAGAGTGATATCATCGTCTCTCCCTCCATTCTC
TCTGCTAATTTCGCCAAATTAGGCGAGCAGGTAAAAGCAGTAGAGTGTGCAGGTTGTGAT
TGGATCCATGTTGATGTGATGGATGGTCGTTTTGTTCCCAACATCACCATTGGACCTCTT
GTGGTTGATGCTTTGCGTCCTGTTACTGATCTTCCTTTGGATGTTCATCTTATGATAGCG
GAACCAGATCTGAGGGTACCAGATTTCATCAAAGCAGGTGCAGACATCGTCAGTGTACAC
TGTGAGCAGTCATCCACCATCCATTTGCACCGCACTGTCAATCAAATCAAAAGCTTAGGT
GCCAAAGCTGGAGTTGTTCTAAACCCTGGAACCCCATTGAGTGCTATAGAATATGTATTG
GAGGTGGTGGATCTGGTCTTGATAATGTCGGTCAACCCCGGGTTTGGTGGACAGAGCTTT
ATCGAAAGCCAAGTTAAGAAAATCTCGGATTTGAGAAGAATGTGTGTCGAAAAGGGAGTA
AACCCATGGATTGAAGTTGATGGTGGTGTCACTCCAAAGAATGCATACAAGGTTATTGAG
CTGGAGCAAATGCTCTAGTAGCTGGATCAGCTGTATTTGGAGCTAAAGACTATGAAGAAG
CTATAAAAGGAATCAAGACCAGCAAGAAGCCAGAAGCTGTGGCTGTGTAATGTGAAGTAA
CAAGCTAAAAAGATCATAATACAGATCACCGAGATGTTTATGTTGTTGTTGTTGTCATTC
ACCAGATTGCATTCGACATAAAAAAGTCCATAAGAATCAAACTCTCAATAGTTTTGAAGT
AGCTCGTTTATACTCCTGTGTATCATCATTGTCTTGTAGATTTGGGGATATGCAGATTCA
ATACATTATGCAATTAATAAGAAATAAGCTGTGTTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DW29TF U 11
AF RS1GC69TF U 1
AF RS1C336JQ C 551
BS 1 80 RS1GC69TF
BS 81 81 RS1DW29TF
BS 82 417 RS1GC69TF
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BS 419 465 RS1GC69TF
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BS 540 654 RS1GC69TF
BS 655 1238 RS1C336JQ

RD RS1DW29TF 563 0 0
GGAG
AACGATTTGGGTGTTTTCTCTCACTACTAAGCTAAACCCACCACCGACCAACCCTTTTTG
GGGGATCCTAGTGAGAGAAAGAAGCTTTGAATCTTTCTCATTTTTTGAAAAAAAAAA*GA
AGGAATAGAATCTAGAAATTCGGAAATGTCGAGCTCAGTATCCACATCGTTGTGCTGTTC
GTCAACCCAGGTCAATGGGTTCGGTCTTAGGCCTCAAAGGTCGCTCCTTTACCAACCCAC
TTCCTTTTCTTCTTTCTCCAGAAGGAGAACTCATGGTGTTGTGAAGGCCACAGCTCGTGT
TGATAAGTATTCCAAGAGTGATATCATCGTCTCTCCCTCCATTCTCTCTGCTAATTTCGC
CAAATTAGGCGAGCAGGTAAAAGCAGTAGAGTGTGCAGGTTGTGATTGGATCCATGTTGA
TGTGATGGATGGTCGTTTTGTTCCCAACATCACCATTGGACCTCTTGTGGTTGATGCTTT
GCGTCCTGTTACTGATCTTCCTTTGGATGTTCATCTTATGATAGCGGAACCAGATCTGAG
GGTACCAGATTTCATCAAA

QA 5 563 5 563
DS 

RD RS1GC69TF 654 0 0
GGAGAAAGAGATAGAACGATTTGGGTGTTTTCTCTCACTACTAAGCTAAACCCACCACCA
ACCAACCCTTTTTGGGGGATTCTAGTGAGAGAAAGAAGCTTTGAATCTTTCTCATTTTTT
GAAAAAAAAAAAGAAGGAATAGAATCTAGAAATTCGGAAATGTCGAGCTCAGTATCCACA
TCGTTGTGCTGTTCGTCAACCCAGGTCAATGGGTTCGGTCTTAGGCCTCAAAGGTCGCTC
CTTTACCAACCCACTTCCTTTTCTTCTTTCTCCAGAAGGAGAACTCATGGTGTTGTGAAG
GCCACAGCTCGTGTTGATAAGTATTCCAAGAGTGATATCATCGTCTCTCCCTCCATTCTC
TCTGCTAATTTCGCCAAATTAGGCGAGCAGGTAAAAGCAGTAGAGTGTGCAGGTTGTTAT
TGGATCCATGTTGATGTGATGGATGGTCGTTTTGTTCCCAACATCCCCATTGGACCTCTT
GTGGTTGATGCTTTGCGTCCTGTTACTGATCTTCCTTTGGATGTTCATCTTATGATAGTG
GAACCAGATCTGAGGGTACCAGATTTCATCAAAGCAGGTGCAGACATCGTCAGTGTACAC
TGTGAGCAGTCATCCACCATCCATTTGCACCGCACTGTCAATCAAATCAAAAGC

QA 1 654 1 654
DS 

RD RS1C336JQ 688 0 0
TGAGGGTACCAGATTTCATCAAAGCAGGTGCAGACATCGTCAGTGTACACTGTGAGCAGT
CATCCACCATCCATTTGCACCGCACTGTCAATCAAATTAAAAGCTTAGGTGCCAAAGCTG
GAGTTGTTCTAAACCCTGGAACCCCATTGAGTGCTATAGAATATGTATTGGAGGTGGTGG
ATCTGGTCTTGATAATGTCGGTCAACCCCGGGTTTGGTGGACAGAGCTTTATCGAAAGCC
AAGTTAAGAAAATCTCGGATTTGAGAAGAATGTGTGTCGAAAAGGGAGTAAACCCATGGA
TTGAAGTTGATGGTGGTGTCACTCCAAAGAATGCATACAAGGTTATTGAGCTGGAGCAAA
TGCTCTAGTAGCTGGATCAGCTGTATTTGGAGCTAAAGACTATGAAGAAGCTATAAAAGG
AATCAAGACCAGCAAGAAGCCAGAAGCTGTGGCTGTGTAATGTGAAGTAACAAGCTAAAA
AGATCATAATACAGATCACCGAGATGTTTATGTTGTTGTTGTTGTCATTCACCAGATTGC
ATTCGACATAAAAAAGTCCATAAGAATCAAACTCTCAATAGTTTTGAAGTAGCTCGTTTA
TACTCCTGTGTATCATCATTGTCTTGTAGATTTGGGGATATGCAGATTCAATACATTATG
CAATTAATAAGAAATAAGCTGTGTTACG

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 6

CO CL1015Contig1 732 6 11 U
GGACATCAATTCAAAGTTTAGAAATGAATAAACACACGACAACACGAGTCGTGCTTTCAT
TTCTTCTCTTGGTCTCCGATCACACAAGGCTAATGATTCACGTTCACTCGTACGTACCGT
TTTGTGCATACACGTATGATTATTTCTCTTATTGTCTTGAATTTCTCACGGGCAATTACT
ACAAACCCGGTAAGAAATGTTGTGTCCACATCGCAAAACTTAACATAATTGCCAAGCACA
AAAA*GGAGAATCCGAGACTTCTGTGTAATTGTGTTGAGATGATGACGAGAGGTTATACA
CCTCCGATGTTGGCTGATAAGATCCAAGAGCTTCCTCCTCTTTGCAACACACATCTCAGC
TTCCCTATCTCATCTAGCATGGACTGCTCCACGGTTTAAGTCTAGAGAGGTTGAGTGGCT
AATCTATTTTGGAAGGTTCAACAAAAATGGATCTAAGTGTGTATCAGTGTATGTATTCAG
TTTTGTTTTTTTTTTCTAATTGTTTTTGGTTCAAGGTTTCGTTTAGAAAATGTGACTGCC
AAATTATATATTGAATTTAGTCTTGGTGTAATTTTCATGAAAAAATTACATTAGAAGACA
CATTTTCACTTCAATTACACCTAGAGCCACATTCTGTTTGAGGTATATTTCCTAGAGGTG
ATTTGTCTATTTTGTTCTTATAGTTATGTAACAATTATATTTGCTTGGTTCTTCTTATCT
ATTTATATCCAT


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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G
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TTGTGCATACACGTATGATTATTTCTCTTATTGTCTTGAATTTCTCACGGGCAATTACTA
CAAACCCGGTAAGAAATGTTGTGTCCACATCGCAAAACTTAACATAATTGCCAAGCACAA
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TTTGTTTTTTTT*TCTAATTGTTTTTGGTTCAAGGTTTCGTTTAGAAAATGTGACTGCCA
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TTTATATCCAT

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DS 



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AATTTACTGTTCTCTGCTTCAACTTTCTGGGTATCGATTTCAGGTTCACCTTTCACACAG
CATTTCCACCACTCCATCTGATCTTGCTTAGTCAACAGGATCGATATCATCTTCTGATCC
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E663JQ U 48
AF RS1A308TR U 258
AF RS1A308JQ U 1
AF RS1A308TF C 398
AF RS1A308TV C 414
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BS 226 805 RS1A308JQ
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RD RS1E663JQ 471 0 0
C
ACCGGATAAAAAAGCTTCAATCAACAAAACCAAACCATAAGGTTGAAGGGAATAACCGAA
GCAGTGGAACTATGCCTTCAAGTACACAAAACAAAAGAAGTTTAGAGGAACACAAGTTTT
AAAAGATGCAGACAACACGAGCATCAGTTTATCTTTGCGTTTGTGAAGTCCATCTCCGGA
TGCTGAGACATGAATTTCTTGAGAATGTCTTGCTTCTGTAGTTCGTCGCTTGTTGGAAGA
CCCATCTGCTTTTGTCTTTGATCAAACATCATTTTCTCAACAGTGGAGCGAGTTTCAGGG
TCAAGGTCAGCTAATTTACTGTTCTCTGGTTCAACTTTCTGGGTATCGATTTCAGGTTCA
CCTTTCACACAGCATTTCCACCACTCCATCTGATCTTGCTTAGTCAACAGGATCGATATC
ATCTTCTGATCCTCGATATTCCAGTAGCAGTCATCGGGCTTCACAGGTCG

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DS 

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CATTTTCTCAACAGTGGAGCGAGTTTCAGGGTCAAGGTCAGCTAATTTACTGTTCTCTGC
TTCAACTTTCTGGGTATCGATTTCAGGTTCACCTTTCACACAGCATTTCCACCACTCCAT
CTGAACTTGCTTAGTCAACAGGATCGATATCATCTTCTGATCCTCGATATTCCAGTAGCA
GTCATCAGGCTTCACAGGTCGGTAGAGCTCACCATCGATGATTGGATCCTGACCTTTGAG
ACCAAGCTTAAGACGGTTCTTCTTA

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DS 

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AGCTTCAATCAACAAAACCAAACCATAAGGTTGAAGGGAATAACCGAAGCAGTGGAACTA
TGCCTTCAAGTACACAAAACAAAAGAAGTTTAGAGGAAC**AAGTTTTAAAAGATGCAGA
CAACACGAGTATCAGTTAATCTTTGCGTTTGTGAAGTCCATCTCTGGATGCTGAGACATG
AATTTATTGAGAATGTCTTGCTTCTGTAGTTCGTCGCTTGTTGGAAGACCCATCTGCTTT
TGTCTTTGATCAAACATCATTTTCTCAACAGTGGAGCGAGTTTCAGGGTCAAGGTCAGCT
AATTTACTGTTCTCTGCTTCAACTTTCTGGGTATCGATTTCAGGTTCACCTTTCACACAG
CATTTCCACCACTCCATCTGATCTTGCTTAGTCAACAGGATCGATATCATCTTCTGATCC
TCGATATTCCAGTAGCAGTCATCAGGCTTCACAGGTCGGTAGAGCTCACCATCGATGATT
GGATCCTGACCTTTGAGACCAAGCTTAAGACGGTTCTTCTTAATCTCACATACAACAGAG
CGTGCTTTAGTGCCGGTAGGCACTGGAATGTTAACTGTAACCTCCTGAAGAGTCTGAACC
CATGAGTAGTTCTCAAGATCAGTTCCATTACCTTTGTTAGGAACAATGGGACAAGCTTCT
TTATTCTCCTCCTTAGGCTTCTCAGCTTCAATAGGCTTTGAGCTTGAAGCAGCCATGGTC
GGCTTCTTCACACTCTCCTTCTCCA

QA 1 805 1 805
DS 

RD RS1A308TF 861 0 0
TTTCAGGTTCAC*TTTCACACAGCATTTCCACCACTCCATCTGATCTTGCTTAGTCAACA
GGATCGATATCATCTTCTGATCCTCGATATTCCAGTAGCAGTCATCAGGCTTCACAGGTC
GGTAGAGCTCACCATCGATGATTGGATCCTGACCTTTGAGACCAAGCTTAAGACGGTTCT
TCTTAATCTCACATACAACAGAGCGTGCTTTAGTGCCGGTAGGCACTGGAATGTTAACTG
TAACCTCCTGAAGAGTCTGAACCCATGAGTAGTTCTCAAGATCAGTTCCATTACCTTTGT
TAGGAACAATGGGACAAGCTTCTTTATTCTCCTCCTTAGGCTTCTCAGCTTCAATAGGCT
TTGAGCTTGAAGCAGCCATGGTCGGCTTCTTCACACTCTCCTTCTCCACAGGCTTCTTCT
CCAAAGGTTTAACACTTTCCTTCTCAGCTTTCTGCTTGGCTGCCCTGACCGCGGCGGCGA
TCTCCTCCTCCGCGGAGGGTTTCTTCAGGTAATCGCTCTGTTCGCCGAGAAAGTCAAACA
CTTTGTGCAAGAAACCTAGTGGGTTGGAAGAATCGAAGGTCGCCCTGAACGGTAACATCG
AGGGTCGGCTGCTGCTTTCCTCTTCAACCTCGGAGATGATCGCCATCGTGGTGGGGTTAG
GGTTTTGCTCTGTTTGTGGTTAGATTATAACGAAGATTCGAGTTAGAGAGTGAATTTTTT
CAATTCTAATGTAAGGAAAAGCCCCAAATCGAGAGGGTTCGCAAATTCTTGTCCAGCTTT
TTACTTCACACTGCTAATTGCTAAAAGGGCCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGC
ATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 861 1 861
DS 

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CTGATCCTCGATATTCCAGTAGCAGTCATCAGGCTTCACAGGTCGGTAGAGCTCACCATC
GATGATTGGATCCTGACCTTTGAGACCAAGCTTAAGACGGTTCTTCTTAATCTCACATAC
AACAGAGCGTGCTTTAGTGCCGGTAGGCACTGGAATGTTAACTGTAACCTCCTGAAGAGT
CTGAACCCATGAGTAGTTCTCAAGATCAGTTCCATTACCTTTGTTAGGAACAATGGGACA
AGCTTCTTTATTCTCCTCCTTAGGCTTCTCAGCTTCAATAGGCTTTGAGCTTGAAGCAGC
CATGGTCGGCTTCTTCACACTCTCCTTCTCCACAGGCTTCTTCTCCAAAGGTTTAACACT
TTCCTTCTCAGCTTTCTGCTTGGCTGCCCTGACCGCGGCGGCGATCTCCTCCTCCGCGGA
GGGTTTCTTCAGGTAATCGCTCTGTTCGCCGAGAAAGTCAAACACTTTGTGCAAGAAACC
TAGTGGGTTGGAAGAATCGAAGGTCGCCCTGAACGGTAACATCGAGGGTCGGCTGCTGCT
TTCCTCTTCAACCTCGGAGATGATCGCCATCGTGGTGGGGTTAGGGTTTTGCTCTGTTTG
TGGTTAGATTATAACGAAGATTCGAGTTAGAGAGTGAATTTTTTCAATTCTAATGTAAGG
AAAAGCCCCAAATCGAGAGGGTTCGCAAATTCTTGTCCAGCTTTTTACTTCACACTGCTA
ATTGCTAAAAGGGCCCCCCGGCCGTAATGG

QA 1 810 1 810
DS 



AS 1 4

CO CL1017Contig1 1305 4 14 U
GGGTTTCAACATATATGTTGGTGGAGGTATGGGAAGAACACACAGAATGGAGTCTACATT
TGCCCGCATTGCAGAACCATTAGGCTACGTACCCAAGGAGGATATCTTGTATGCTGTGAA
GGCCATTGTTGTCACACAACGTGAACACGGGAGAAGAGATGACCGCAAATACAGCAGAAT
GAAGTATCTGCTCAGCTCCTGGGGGATTGACAAGTTCAGAGATGTGGTTGAGCAATACTA
TGGCAAAAATTTTGAGTCTTCCCGTGATTTGCCAGAGTGGGAGTTCAAAAGCTATTTGGG
ATGGCACGAGCAGGGAGATGGTGCTTGGTTTTGTGGGCTTCATGTAGACAGTGGACGTGT
TGGTGGTAACATGAAGAAGACGCTGAGAGAAGTCATTGAGAAGTACAAACTCGATGTTCG
TATCACACCTAATCAGAACATTGTGTTATGTGATATCAAGAGTGAGTGGAAGCAATCCAT
CACCACTGTGCTTGCTCAGGCTGGCCTATTGCAACCAGAGTTTGTAGACCCTCTCAACCA
AACTGCAATGGCCTGTCCAGCTTTTCCTTTGTGTCCTCTGGCTATAACTGAGTCAGAGTG
TGGGATCCCTAGCATTCTAAAGCGAGTGAGAGCAATGTTTGAGAAGGTTGGTCTTGAGTA
TGAAGAATCAGTTGTGGTGAGAGTAACTGGTTGCCCTAATGGATGTGCTAGACCATACAT
GGCTGAAGTGGGTCTAGTCGGAGATGGTCCAAACAGCTATCAGATTTGGTTAGGAGGAAC
ACCAAACCAGACACAGATAGCGAGGGCTTTCATGGACAAGGT*AAGATTCAAGACTTAGA
GAAGGTCTTTGAGCCATTGTTTTACAACTGGAAACTTGGGAGACAAGCGAAGGAATCATT
TGGAGAATTCACAACCCGTATGGGATTTGAGAAACTCAAGGAGCTGATAAGTACATACGA
AGCATCTCCACAGTAAAAAAAACAAGAAGAAGGAACTTTTTGTCTTTTGGAATTTACCCC
AAAACAAAAACAAAAGGATCTAATTCTCTTGTCGTGGTGTTACTCTTCGGTAACATCTGA
CGAATAAAGATTATGTTCTCTTGTCTGTACTTTCTGTACTTCTGTACTTGAGTTGAGAGA
CCACCAAATAAACTTATAAGCATTTGGTGGTATGTTTGATTGCTGTATGGACAAAATAAT
TATTTCCTTTTTTGGGAGTGGTAATGTATTTTGCTATTTGCTCAAAAAGATCAGCATCCA
TGGTCTTGGAGTAATTACTTTTCTTTTTCTTTTAATGTCAAAGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C962TF U 1
AF RS1BQ75TF U 298
AF RS1C962JQ C 510
AF RS1BQ75JQ C 618
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BS 1241 1305 RS1BQ75JQ

RD RS1C962TF 687 0 0
GGGTTTCAACATATATGTTGGTGGAGGTATGGGAAGAACACACAGAATGGAGTCTACATT
TGCCCGCATTGCAGAACCATTAGGCTACGTACCCAAGGAGGATATCTTGTATGCTGTGAA
GGCCATTGTTGTCACACAACGTGAACACGGGAGAAGAGATGACCGCAAATACAGCAGAAT
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ATGGCACGAGCAGGGAGATGGTGCTTGGTTTTGTGGGCTTCATGTAGACAGTGGACGTGT
TGGTGGTAACATGAAGAAGACGCTGAGAGAAGTCATTGAGAAGTACAAACTCGATGTTCG
TATCACACCTAATCAGAACATTGTGTTATGTGATATCAAGAGTGAGTGGAAGCAATCCAT
CACCACTGTGCTTGCTCAGGCTGGCCTATTGCAACCAGAGTTTGTAGACCCTCTCAACCA
AACTGCAATGGCCTGTCCAGCTTTTCCTTTGTGTCCTCTGGCTATAACTGAGTCAGAGTG
TGGGATCCCTAGCATTCTAAAGCGAGTGAGAGCAATGTTTGAGAAAGTTGGTCTTGAGTA
TGAAGAATCAGTTGTGGTGAGAGTAAC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1BQ75TF 679 0 0
GGGATGGCACGAGCAGGGAGATGGTGCTTGGTTTTGTGGGCTTCATGTAGACAGTGGACG
TGTTGGTGGTAACATGAAGAAGACGCTGAGAGAAGTCATTGAGAAGTACAAACTCGATGT
TCGTATCACACCTAATCAGAACATTGTGTTATGTGATATCAAGAGTGAGTGGAAGCAATC
CATCACCACTGTGCTTGCTCAGGCTGGCCTATTGCAACCAGAGTTTGTAGACCCTCTCAA
CCAAACTGCAATGGCCTGTCCAGCTTTTCCTTTGTGTCCTCTGGCTATAACTGAGGCAGA
GCGTGGGATCCCTAGCATTCTAAAGCGAGTGAGAGCAATGTTTGAGAAGGTTGGTCTTGA
GTATGAAGAATCAGTTGTGGTGAGAGTAACTGGTTGCCCTAATGGATGTGCTAGACCATA
CATGGCTGAAGTGGGTCTAGTCGGAGATGGTCCAAACAGCTATCAGATTTGGTTAGGAGG
AACACCAAACCAGACACAGATAGCGAGGGCTTTCATGGACAAGGT*AAGATTCAAGACTT
AGAGAAGGTCTTTGAGCCATTGTTTTACAACTGGAAACTTGGGAGACAAGCGAAGGAATC
ATTTGGAGA*TTCACAACCCGTATGGGATTTGAGAAACTCAAG*AGCTGATAAGTACATA
CGAAGCATCTCCACAGTAA

QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1C962JQ 731 0 0
TGCAAC
CAGAGTTTGTAGACCCTCTCAACCAAACTGCAATGGCCTGTCCAGCTTTTCCTTTGTGTC
CTCTGGCTATAACTGAGTCAGAGTGTGGGATCCCTAGCATTCTAAAGCGAGTGAGAGCAA
TGTTTGAGAAGGTTGGTCTTGAGTATGAAGAATCAGTTGTGGTGAGAGTAACTGGTTGCC
CTAATGGATGTGCTAGACCATACATGGCTGAAGTGGGTCTAGTCGGAGATGGTCCAAACA
GCTATCAGGTTTGGTTAGGAGGAACACCAAACCAGACACAGATAGCGAGGGCTTTCATGG
ACAAGGTGAAGATTCAAGACTTAGAGAAGGTCTTTGAGCCATTGTTTTACAACTGGAAAC
TTGGGAGACAAGCGAAGGAATCATTTGGAGAATTCACAACCCGTATGGGATTTGAGAAAC
TCAAGGAGCTGATAAGTACATACGAAGCATCTCCACAGTAAAAAAAACAAGAAGAAGGAA
CTTTTTGTCTTTTGGAATTTACCCCAAAACAAAAACAAAAGGATCTAATTCTCTTGTCGT
GGTGTTACTCTTCGGTAACTTCTGACGAATAAAGATTATGTTCTCTTGTCTGTACTTTCT
GTACTTCTGTACTTGAGTTGAGAGACCCCCAAATAAACTTATAAGCATTTGGTGGTATGT
TTGATTGCTGTATGGACAAAATAATTATTTCCTTTTTTGGGAGTGGTAATGTATTTTGCT
ATTTG

QA 7 731 7 731
DS 

RD RS1BQ75JQ 688 0 0
TAAAGCGAGTGAGAGCAATGTTTGAGAAGGTTGGTCTTGAGTATGAAGAATCAGTTGTGG
TGAGAGTAACTGGTTGCCCTAATGGATGTGCTAGACCATACATGGCTGAAGTGGGTCTAG
TCGGAGATGGTCCAAACAGCTATCAGATTTGGTTAGGAGGAACACCAAACCAGACACAGA
TAGCGAGGGCTTTCATGGACAAGGT*AAGATTCAAGACTTAGAGAAGGTCTTTGAGCCAT
TGTTTTACAACTGGAAACTTGGGAGACAAGCGAAGGAATCATTTGGAGAATTCACAACCC
GTATGGGATTTGAGAAACTCAAGGAGCTGATAAGTACATACGAAGCATCTCCACAGTAAA
AAAAACAAGAAGAAGGAACTTTTTGTCTTTTGGAATTTACCCCAAAACAAAAACAAAAGG
ATCTAATTCTCTTGTCGTGGTGTTACTCTTCGGTAACATCTGACGAATAAAGATTATGTT
CTCTTGTCTGTACTTTCTGTACTTCTGTACTTGAGTTGAGAGACCACCAAATAAACTTAT
AAGCATTTGGTGGTATGTTTGATTGCTGTATGGACAAAATAATTATTTCCTTTTTTGGGA
GTGGTAATGTATTTTGCTATTTGCTCAAAAAGATCAGCATCCATGGTCTTGGAGTAATTA
CTTTTCTTTTTCTTTTAATGTCAAAGAA

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 6

CO CL1018Contig1 907 6 26 U
GGAAACCTAACAAAAGAAGTAGTATACGCACTTTCAAAAAAACAATATATCAATAATGAA
GCAATATATATTTCTTTCTGTCTTGGTACTACTATCCTCTTCATTTGCACCCATCCACGC
CCGCAAGAAGTCACATTCCGCAATGTCTCCCTCACCGGTAGCAACTCCGGCGCCAGGACC
ATCAAATTCTGATTGCTCGAGCGTAATATATAACATGATGGACTGTCTATCGTACATCAC
CCCCGGATCAAATGATACTAGACCTACGAAAGTGTGTTGTGGGGGAATCCTATCTGTTTT
ACAATATAATCCTAACTGTATTTGTGTCGGCTTAGCCAGTAGCAAAGATATGGGGATTGA
AATTAATAACACTAGAGCCCATTCCATGCCTACGACGTGCAAGCTCCCCATTGCTGCTCC
GCACTGTGCTATACCGGGCGCGTCAGCACCGGGTGCATCTACTCCTGTTTCGCCATCAGC
TGGAACACCTATGACTTCACCATCTTCAGACGAGTCACCAACATCATCGCCAAAATCAGA
CCAGTCACCAACATCGCCAACATCAGACGGGTCACCCACATCGCCAAAATCAGACGAGTC
ACCAACATCCCCAACATCAGACGAGTCACCAACATCGCCAACATCAGACGGGTCACCGAC
ATCTTTACCAGAGTCACCTGAAATGACGGCACCATCTCCCTCAAGTTCGGGCACCAACCA
GCTCCTAGTTTCA*CACTGACACTCTTTGCCGTTATCGTATCTACA*CATACATTTCGAC
CTTTTCTAATTAATTGTTTTTT*CACATTTCATATATTTTTTTTACTGAGTTATATTTTA
TGGTTGTGATTTCATGACTGATTTTAATATAATGTTTTTTTTTTTTGAAAAAAATTATAA
TATAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 20 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 10 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1CS52TF U 1
AF RS1A460JQ C 194
AF RS1EX59TF U 5
AF RS1EW04TF U 1
AF RS1A460TF U 1
AF RS1EW04JQ C 196
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BS 690 705 RS1CS52TF
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BS 716 775 RS1EW04TF
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BS 824 846 RS1A460TF
BS 847 907 RS1EW04JQ

RD RS1CS52TF 705 0 0
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GCTATATATATTTCTTTCTGTCTTGGTACTACTATCCTCTTCATTTGCACCCATCCACGC
CCGCAAGAAGTCACATTCCGCAATGTCTCCCTCACCGGTAGCAACTCCGGCGCCAGGACC
ATCAAATTCTGATTGCTCGAGCGTAATATATAACATGATGGACTGTCTATCGTACATCAC
CCCCGGATCAAATGATACTAGGCCTACGAAAGTGTGTTGTGGGGGAATCCTATCTGTTTT
ACAATATAATCCTAACTGTATTTGTGTCGGCTTAGCCAGTAGCAAAGATATGGGGATTGA
AATTAATAACACTAGAGCCCATTCCATGCCTACGACGTGCAAGCTCCCCATTGCTGCTCC
GCACTGTGCTATACCGGGCGCGTCAGCACCGGGTGCATCTACTCCTGTTTCGCCATCAGC
TGGAACACCTATGACTTCACCATCTTCAGACGAGTCACCAACATCATCGCCAAAATCAGA
CCAGTCACCAACATCGCCAGCATCAGACGGGTCACCCACATCGCCAAAATCAGACGAGTC
ACCAACATCGCCAACATCAGACGAGTCACCAACATCGCCA*CATCAGACGGGTCACCGAC
ATCTTTACCAGAGTCACCTGAAATGACGTCACCATCTCCCTCAAG

QA 1 705 1 705
DS 

RD RS1A460JQ 518 0 0
TTGCTC
AGCGTAATATATAACATGATGGACTGTCTATCGTACATCACCCCCGGATCAAATGATACT
AGACCTACGAAAGTGTGTTGTGGGGGAATCCTATTTGTTTTACAATATAATCCTAACTGT
ATTTGTGTCGGCTTAGCCAGTAGCAAAGATATGGGGATTGAAATTAATAACACTAGAGCC
CATTCCATGCCCACGACGTGCAAGCTCCCCATTGGTGCTCCGCACTGTGCTATACCGGGG
GGGTCAGCACCGGGTGCATTTACTCCTGTTTCGCCATCAGGTGGAACACCTATGACTTCA
CCATTTTCAGACGAGTCACCAACATCATCGCCAAAATCAGACCAGTCACCAACATCGCCA
GCATCAGACGGGTCACCCACATCGCCAAAATCAGACGAGTCACCAACATCGCCAACATCA
GACGAGTCACCAACATCGCCAACATCAGACGGGTCACCGACATCTTTACCAGAGTCACCT
GAAATGACGGCACCATTTCCCTCAAGTTCGGG

QA 7 518 7 518
DS 

RD RS1EX59TF 778 0 0
GGCT
AACAAAAGAAGTAGTATACGCACTTTCAAAAAAACAATATATCAATAATGAAGCAATATA
TATTTCTTTCTGTCTTGGTACTACTATCCTCTTCATTTGCACCCATCCACGCCCGCAAGA
AGTCACATTCCGCAATGTCTCCCTCACCGGTAGCAACTCCGGCGCCAGGACCATCAAATT
CTGATTGCTCGAGCGTAATATATAACATGATGGACTGTCTATCGTACATCACCCCCGGAT
CAAATGATACTAGACCTACGAAAGTGTGTTGTGGGGGAATCCTATCTGTTTTACAATATA
ATCCTAACTGTATTTGTGTCGGCTTAGCCAGTAGCAAAGATATGGGGATTGAAATTAATA
ACACTAGAGCCCATTCCATGCCTACGACGTGCAAGCTCCCCATTGCTGCTCCGCACTGTG
CTATACCGGGCGCGTCAGCACCGGGTGCATCTACTCCTGTTTCTCCATCAGCTGGAACAC
CTATGACTTCACCATCTTCAGACGAGTCACCAACATCATCGCCAAAATCAGACCAGTCAC
CAACATCGCCAACATCAGTCGGGTCACCCACATCGCCAAAATCAGACGAGTCACCAACAT
CCCCAACATCAGACGAGTCACCAACATCGCCCACATCAGACGGGTCACCGACATCTTTAC
CAGAGTCACCTGAAATGACGGCACCATCTCCCTCAAGTTCGGGCACCAACCAGCTCCTAG
TTTCA*CACTGACACTCTTTGCCGTTATCGTATCTACA*CATACATT
TCGACCT

QA 5 771 5 771
DS 

RD RS1EW04TF 830 0 0
GGAAAC
CTAACAAAAGAAGTAGTATACGCACTTCCAAAAAAACAATATATCAATAATGAAGCAATA
TATATTTCTTTCTGTCTTGGTACTACTATCCTCTTCATTTGCACCCATCCACGCCCGCAA
GAAGTCACATTCCGCAATGTCTCCCTCACCGGTAGCAACTCCGGCGCCAGGACCATCAAA
TTCTGATTGCTCGAGAGTAATATATAACATGATGGACTGTCTATCGTACATCACCCCCGG
ATCAAATGATACTAGACCTACGAAAGTGTGTTGTGGGGGAATCCTATCTGTTTTACAATA
TAATCCTAACTGTATTTGTGTCGGCTTAGCCAGTAGCAAAGATATGGGGATTGAAATTAA
TAACACTAGAGCCCATTCCATGCCTACGACGTGCAAGCTCCCCATTGCTGCTCCGCACTG
TGCTATACCGGGCGCGTCAGCACCGGGTGCATCTACTCCTGTTTCGCCATCAGCTGGAAC
ACCTATGACTTCACCATCTTCAGACGAGTCACCAACATCATCGCCAAAATCAGACCAGTC
ACCAACATCGCCAACATCAGTCGGGTCACCCACATCGCCAAAATCAGACGAGTCACCAAC
ATCCCCAACATCAGATGAGTCACCAACATCGCCAACATCAGACGGGTCACCGACATCTTT
ACCAGAGTCACCTGAAATGACGGCACCATCTCCCTCAAGTTCGGGCAC*AACCAGCTCCT
AGTTTCA*CACTGACACTCTTTGCCGTTATCGTATCTACA*CATACATT*CGAC*TTTTC
TAAT**AATGTTTTTT*CACATTTCATATATTTTTTT
ACTGAGT

QA 7 823 7 823
DS 

RD RS1A460TF 846 0 0
GGAAACCA
AACAAAAGAAGTAGTATACGCACTTTCAAAAAAACAATATATCAATAATGAAGCAATATA
TATTTCTTTCTGCCTAG*TACTACTATCCTCTTCATTTGCACCCATCCACGCCCGCAAGA
AGTCACATTCCGCAATGTCTCCCTCACCGGTAGCAACTCCGGCGCCAGGACCATCAAATT
CTGATTGCTC*AGCGTAATATATAACATGATGGACTGTCTATCGTACATCACCCCCGGAT
CAAATGATACTAGACCTACGAAAGTGTGTTGTGGGGGAATCCTATCTGTTTTACAATATA
ATCCTAACTGTATTTGTGTCGGCTTAGCCAGTAGCAAAGATATGGGGATTGAAATTAATA
ACACTAGAGCCCATTCCATGCCCACGACGTGCAAGCTCCCCATTGCTGCTCCGCACTGTG
CTATACCGGGCGCGTCAGCACCGGGTGCATCTACTCCTGTTTCGCCATCAGCTGGAACAC
CTATGACTTCACCATCTTCAGACGAGTCACCAACATCATCGCCAAAATCAGACCAGTCAC
CAACATCGCCAGCATCAGACGGGTCACCCACATCGCCAAAATCAGACGAGTCACCAACAT
CGCCAACATCAGACGAGTCACCAACATCGCCA*CATCAGACGGGTCACCGACATCTTTAC
CAGAGTCACCTGAAATGACGGCACCATCTCCCTCAAGTTCGGGCACCAACCAGCTCCTAG
TTTCA*CACTGACACTCTTTGCCGTTATCGTATCTACA*CATACATTTCGACCTTTTCTA
ATTAATTGTTTTTT*CACATTTCATATATTTTTTTTACTGAGTTATATTTTATGGTTG

QA 9 846 9 846
DS 

RD RS1EW04JQ 712 0 0
CTCGAGAGTAATATATAACATGATGGACTGTCTATCGTACATCACCCCCGGATCAAATGA
TACTAGACCTACGAAAGTGTGTTGTGGGGGAATCCTATCTGTTTTACAATATAATCCTAA
CTGTATTTGTGTCGGCTTAGCCAGTAGCAAAGATATGGGGATTGAAATTAATAACACTAG
AGCCCATTCCATGCCTACGACGTGCAAGCTCCCCATTGCTGCTCCGCACTGTGCTATACC
GGGCGCGTCAGCACCGGGTGCATCTACTCCTGTTTCGCCATCAGCTGGAACACCTATGAC
TTCACCATCTTCAGACGAGTCACCAACATCATCGCCAAAATCAGACCAGTCACCAACATC
GCCAACATCAGTCGGGTCACCCACATCGCCAAAATCAGACGAGTCACCAACATCCCCAAC
ATCAGATGAGTCACCAACATCGCCAACATCAGACGGGTCACCGACATCTTTACCAGAGTC
ACCTGAAATGACGGCACCATCTCCCTCAAGTTCGGGCACCAACCAGCTCCTAGTTTCAAC
ACTGACACTCTTTGCCGTTATCGTATTTACAACATACATTTCGACCTTTTTTAATTAATT
GTTTTTTTCACATTTCATATATTTTTTTTACTGAGTTATATTTTATGGTTGTGATTTCAT
GACTGATTTTAATATAATGTTTTTTTTTTTTGAAAAAAATTATAATATAATG

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 5

CO CL1019Contig1 1067 5 13 U
GGATTCTGCATTTCATTAATAAAAGTTAACCTTTCTTCTCACTTTACCGAGAAAATCTGA
GAAAAAAAAGCGAAAAGGCGAAGAATTTGAGCATGAAGGCCGTGAAAAGTCCGATCCACA
CGGTGTGGTCATGGGTGAGGAGGCAACCACCGAAGGTGAAGGCTTTTCTCGCTGTGGTCA
CCGGCATGGCGGCTTTGGTTCTGCTCAGATTCATTGTTCACGATCACGACAATCTCTTCG
TCGCCGCCGAAGCTGTTCACTCCATAGGGATCTGCGTGCTCATCTACAAACTCATGAAAG
AAAAAACCTGCGCTGGATTGTCACTGAAATCTCAGGAGCTCACGGCGATATTTCTAGCTG
TTAGGCTGTATTGCAGCTTTGTGATGGAATATGATATACACACCGTTCTGGATCTGGCGA
CTCTGGGAACAACTCTCTGGGTTATATTTATGATCCGGTTTAAGTTGAAGGCTAGTTACA
TGGAGGACAAAGACAACTTTGCTCTCTATTATGTGCTTGTGCCGTGTGTTGTGCTGGCTG
TGTTGATCCATCCATCGACCTCTCACAACATATTAAACAGGATTTCGTGGGCATTGTGTG
TATACCTTGAAGCTGTTTCAGTACTGCCTCAGCTGCGAGTGATGCAGAACACCAAGATTG
TTGAACCGTTCACGGCGCATTATGTATTTGCACTTGGAGTAGCAAGGTTCCTAAGCTGTG
CCCACTGGGTTTTACAGGTTGTGGACACGAGGGGAAGATTGCTTGTAGCATAAGGTTATG
GATTGTGGCCATCAATGGTTCTCATCTCAGAAATTGTTCAAACTTTTATCCTTGCAGATT
TCTGTTACTACTACGTCAAAAGCGTTTTTGGAGGGCAGCTTGTTCTCAGGCTTCCGTCTG
GAGTAGTATAAGTTACTATCAGTGATGTAATACGGAAAGAGACATCATTTTTTTCTTTTA
CATTTGATCTTAACGTTTGTGTCTGAGATGACTTGGTAACGAATTAGTTTCACTGTGTTG
TATATTTTGTCGACTATTGACTGGTGTTTCCATGTCTTTCCGGTTTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1G935TF U 3
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AF RS1FT53TF U 1
AF RS1BS07TF U 47
AF RS1BT34JQ C 272
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TCACTGAAATCTCAGGAGCTCACGGCGATATTTCTAGCTGTTAGGCTGTATTGCAGCTTT
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GTTATATTTATGATCCGGTTTAAGTTGAAGGCTAGTTACATGGAGGACAAAGACAATTTT
GCTCTCTATTACGTGCTTGTGCCGT

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AAAAAACCTGCGCTGGATTGTCACTGAAATCTCAGGAGCTCACGGCGATATTTCTAGCTG
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AAAAAACCTGCGCTGGATTGTCACTGAAATCTCAGGAGCTCACGGCGATATTTCTAGCTG
TTAGGCTGTATTGCAGCTTTGTGATGGAATATGATATACACACCGTTCTGGATCTGGCGA
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TGTTGATCCATCCATCGACCTCTCACAACATATTAAACAGGATTTCGTGGGCATTGTGTG
TATACCTTGAAGCTGTTTCAGTACTGCCTCAGCTGCGAGTGATGCAGAACACCAAGATTG
TTGAACCGTTCACGGCGCATTATGTATTTGCACTTGGAGTAGCAAGGTTCCTAAGCTGTG
CCCACTGGGTTTTACAGGT
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GG
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TCGCTGTGGTCACCGGCATGGCGGCTTTGGTTCTGCTCAGATTCATTGTTCACGATCACG
ACAATCTCTTCGTCGCCGCCGAAGCTGTTCACTCCATAGGGATCTGCGTGCTCATCTACA
AACTCATGAAAGAAAAAACCTGCGCTGGATTGTCACTGAAATCTCAGGAGCTCACGGCGA
TATTTCTAGCTGTTAGGCTGTATTGCAGCTTTGTGATGGAATATGATATACACACCGTTC
TGGATCTGGCGACTCTGGGAACAACTCTCTGGGTTATATTTATGATCCGGTTTAAGTTGA
AGGCTAGTTACATGGAGGACAAAGACAATTTTGCTCTCTATTACGTGCTTGTGCCGTGTG
TTGTGTTGGCTGTGTTGATCCATCCATCGACCTCTCACAACATATTAAACAGGATTTCGT
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CATA**GTTATGGATTGTGGCCATCA
TGGTCTCATCTCAA

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TGATATACACACCGTTCTGGATCTGGCGACTCTGGGAACAACTCTCTGGGTTATATTTAT
GATCCGGTTTAAGTTGAAGGCTAGTTACATGGAGGACAAAGACAACTTTGCTCTCTATTA
TGTGCTTGTGCCGTGTGTTGTGCTGGCTGTGTTGATCCATCCATCGACCTCTCACAACAT
ATTAAACAGGATTTCGTGGGCATTGTGTGTATACCTTGAAGCTGTTTCAGTACTGCCTCA
GCTGCGAGTGATGCAGAACACCAAGATTGTTGAACCGTTCACGGCGCATTATGTATTTGC
ACTTGGAGTAGCAAGGTTCCTAAGCTGTGCCCACTGGGTTTTACAGGTTGTGGACACGAG
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AATTGTTCAAACTTTTATCCTTGCAGATTTCTGTTACTACTACGTCAAAAGCGTTTTTGG
AGGGCAGCTTGTTCTCAGGCTTCCGTCTGGAGTAGTATAAGTTACTATCAGTGATGTAAT
ACGGAAAGAGACATCATTTTTTTCTTTTACATTTGATCTTAACGTTTGTGTCTGAGATGA
CTTGGTAACGAATTAGTTTCACTGTGTTGTATATTTTGTCGACTATTGACTGGTGTTTCC
ATGTCTTTCCGGTTTC

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DS 



AS 1 5

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TCTTCGTCGAAGATGAGGATCACGCAGATCTTATTACCTCTGCTAATAATTTCACTCTCT
TCAATCTCCTCCCATGTTTTGTCTGATCAGATCTTTCCAGCTCATCTAGTAGGAACATTC
AGCCGAAACAATCGTGAGCCAAAGTACACGATCGAGTATCTCCCCGAAGATGCACCTTTT
CACCCGGGTGATAATCTGGAATCTATGGTGATGCATGACAAGCAAGGACGTAGATTCTTA
TGTTTCTTACCAAAGGAGGAAGAATCTAGTACCGGATGGACCTCTCCTCAGCAGAACATC
AGCACTGTCTTGATGGAAACTGATAAACAACAACAGCTCAAACTCAAGACCCCTGACGAA
CTTCTTCAACCACTCAACGACCAATGCCTTCTCAGGCAAGAGGGTAGGTGGTCCTATGAG
TTTTGTCATCTGAAGTCAGTAAGGCAGCTACACCTTGAGGATGGCACCAAGATTGTCCAA
GAGTTTTCTTTGGGTAATTATGACCCAGAGGCAACTGCTGCTTTTAATCAAAATGTATCT
CATGCTTCTACTATGAAAGAGAGGTATCATTCTCATATATTCACCAATGGGACCACCTGT
GATCTTACAGGGACGCCTCGTGAAGTCGAGGTGAGGTTTGTCTGCGCAGAAACCAGGGCT
ATGGTCACTTCTCTCACTGAGCTATCCACTTGCAAGTACGCACTGACTGTTCAGTGTCCG
ACCTTGTGCAAGCATCCGCTGTTTCAGCTAGAGAAACCAGTGTCACACACGATCCACTGC
AATTTGATCCCACAGGAAGAAGACACAACAAGAAACGAGGAAGAACGAGTGGTAAGCGAA
TCACCTAAGGTTGCCGATTCTTGAGAACCACTTAAGTGAATCACAGGATCAACAGTTAAA
ACAGTAACTATATATAAGAGCTAGTATATATCCAGTGTCGGTGTTGTTGAATTGTTCATG
GTTATAAACCTGTTTTGATGAAGAATGAATGAGATGAATCTATCCAAGTTTTACTTT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GP68TF U 14
AF RS1H565TF U 17
AF RS1GE58TF U 1
AF RS1EO88JQ C 606
AF RS1H565JQB C 454
BS 1 465 RS1GE58TF
BS 466 466 RS1H565TF
BS 467 507 RS1GE58TF
BS 508 508 RS1GP68TF
BS 509 815 RS1GE58TF
BS 816 816 RS1H565JQB
BS 817 820 RS1GE58TF
BS 821 821 RS1H565JQB
BS 822 830 RS1GE58TF
BS 831 831 RS1H565JQB
BS 832 841 RS1GE58TF
BS 842 842 RS1H565JQB
BS 843 851 RS1GE58TF
BS 852 949 RS1H565JQB
BS 950 950 RS1EO88JQ
BS 951 1077 RS1H565JQB

RD RS1GP68TF 653 0 0
GGGGT
CAACAAACATCGTCTCTCCTCCATTGCTATTCGCTTCCTGAATCTTCGTCGAAGATGAGG
ATCACGCAGATCTTATTACCTCTGCTAATAATTTCACTCTCTTCAATCTCCTCCCATGTT
TTGTCTGATCAGATCTTTCCAGCTCATCTAGTAGGAACATTCAGCCGAAACAATCGTGAG
CCAAAGTACACGATCGAGTATCTCCCCGAAGATGCACCTTTTCACCCGGGTGATAATCTG
GAATCTATGGTGATGCATGACAAGCAAGGACGTAGATTCTTATGTTTCTTACCAAAGGAG
GAAGAATCT*GTACCGGATGGACCTCTCCTCAGCAGAACATCAGCACTGTCTTGATGGAA
ACTGATAAACAACAACAGCTCAAACTCAAGACCCCTGACGAACTTCTTCAACCACTCAAC
GACCAATGCCTTCTCAGGCAAGAGGGTTGGTGGTCCTATGAGTTTTGTCATCTGAAGTCA
GTAAGGCAGCTACACCTTGAGGATGGCACCAAGATTGTCCAAGAGCTTTCTTTGGGTAAT
TATGACCCAGAGGCAACTGCTGCTTTTAATCAAAATGTATCTCATGCTTCTACTATGAAA
GAGAGGTATCATTCTCATATATTCACCAATGGGACCACCTGTGATCTT

QA 6 653 6 653
DS 

RD RS1H565TF 670 0 0
GG
CAACAAACATCGTCTCTCCTCCAATGCTATTCGCTTCCTGAATCTTCGTCGAAGATGAGG
ATCACGCAGATCTTATTACCTCTGCTAATAATTTCACTCTCTTCAATCTCCTCCCATGTT
TTGTCTGATCAGATCTCTTCAGCTCATCTAGTAGGAACATTCAGCCGAAACAATCGTGAG
CCAAAGTACACGATCGAGTATCTCCCCGAAGATGCACCTTTTCACCCGGGTGATAATCTG
GAATCTATGGTGATGTATGACAAGCAAGGACGTAGATTCTTATGTTTCTTACCAAAGGAG
GAAGAATCTAGTACCGGATGGACCTCTCCTCAGCAGAACATCAGCACTGTCTTGATGGAA
ACTGATAAACAACAACAGCTCAAACTCAAGACCCCTGACGAACTTCTTCAACCACTCAAC
GACCAATGCCTTCTCAGGCAAGAGGGTAGGTGGTCCTATGAGTTTTGTCATCTGAAGTCA
GTAAGGCAGCTACACCTTGAGGATGGCACCAAGATTGTCCAAGAGTTTTCTTTGGGTAAT
TATGACCCAGAGGCAACTGCTGCTTTTAATCAAAATGTATCTCATGCTTCTACTATGAAA
GAGAGGTATCATTCTCATATATTCACCAATGGGACCACCTGTGATCTTACAGG*ACGCCT
CGTGAAGT

QA 3 670 3 670
DS 

RD RS1GE58TF 860 0 0
GGGATTCCCCTTCATCGTCAACAAACATCGTCTCTCCTCCATTGCTATTCGCTTCCTGAA
TCTTCGTCGAAGATGAGGATCACGCAGATCTTATTACCTCTGCTAATAATTTCACTCTCT
TCAATCTCCTCCCATGTTTTGTCTGATCAGATCTTTCCAGCTCATCTAGTAGGAACATTC
AGCCGAAACAATCGTGAGCCAAAGTACACGATCGAGTATCTCCCCGAAGATGCACCTTTT
CACCCGGGTGATAATCTGGAATCTATGGTGATGCATGACAAGCAAGGACGTAGATTCTTA
TGTTTCTTACCAAAGGAGGAAGAATCTAGTACCGGATGGACCTCTCCTCAGCAGAACATC
AGCACTGTCTTGATGGAAACTGATAAACAACAACAGCTCAAACTCAAGACCCCTGACGAA
CTTCTTCAACCACTCAACGACCAATGCCTTCTCAGGCAAGAGGGTTGGTGGTCCTATGAG
TTTTGTCATCTGAAGTCAGTAAGGCAGTTACACCTTGAGGATGGCACCAAGATTGTCCAA
GAGTTTTCTTTGGGTAATTATGACCCAGAGGCAACTGCTGCTTTTAATCAAAATGTATCT
CATGCTTCTACTATGAAAGAGAGGTATCATTCTCATATATTCACCAATGGGACCACCTGT
GATCTTACAGGGACGCCTCGTGAAGTCGAGGTGAGGTTTGTCTGCGCAGAAACCAGGGCT
ATGGTCACTTCTCTCACTGAGCTATCCACTTGCAAGTACGCACTGACTGTTCAGTGTCCG
ACCTTGTGCAAGCATCCGCTGTTTCAGCTAGAGAA*CCAGCGTCACACAC*ATCCACTGC
A*TTTGATCCC
CAGGAGAGA

QA 1 851 1 851
DS 

RD RS1EO88JQ 395 0 0
TTT
TACTATGAAAGAGAGGTATCATCCTCATATATTCACCAATGGGACCACCTGTGATTTTAC
AGGGACGCCTCGTGAAGTCGAGGTGAGGTTTGTTTGCGCAGAAACCAGGGCTATGGTCAC
TTTTTTCACTGAGCTATCCACTTGCAAGTACGCACTGACTGTTCAGTGTCCGACCTTGTG
CAAGCATCCGCTGTTTCAGCTAGAGAAACCAGTGTCACACACGATCCACTGCAATTTGAT
CCCCCAGGAAGAAGACACAACAAGAAACGAGGAAGAACGAGTGGTAAGGGAATCACCTAA
GGTTGCCGATTTTTGAGAACCACTTAAGTGAATCACAGGATCAACAGTTAAAACAGTAAC
TATATATAAGAGCTAGTATATATCCAGTGTCG

QA 4 395 4 395
DS 

RD RS1H565JQB 624 0 0
AGGCAAGAGGGTAGGTGGTCCTATGAGTTTTGTCATCTGAAGTCAGTAAGGCAGCTACAC
CTTGAGGATGGCACCAAGATTGTCCAAGAGTTTTCTTTGGGTAATTATGACCCAGAGGCA
ACTGCTGCTTTTAATCAAAATGTATCTCATGCTTCTACTATGAAAGAGAGGTATCATTCT
CATATATTCACCAATGGGACCACCTGTGATCTTACAGGGACGCCTCGTGAAGTCGAGGTG
AGGTTTGTCTGCGCAGAAACCAGGGCTATGGTCACTTCTCTCACTGAGCTATCCACTTGC
AAGTACGCACTGACTGTTCAGTGTCCGACCTTGTGCAAGCATCCGCTGTTTCAGCTAGAG
AAACCAGTGTCACACACGATCCACTGCAATTTGATCCCACAGGAAGAAGACACAACAAGA
AACGAGGAAGAACGAGTGGTAAGCGAATCACCTAAGGTTGCCGATTCTTGAGAACCACTT
AAGTGAATCACAGGATTAACAGTTAAAACAGTAACTATATATAAGAGCTAGTATATATCC
AGTGTCGGTGTTGTTGAATTGTTCATGGTTATAAACCTGTTTTGATGAAGAATGAATGAG
ATGAATCTATCCAAGTTTTACTTT

QA 1 624 1 624
DS 



AS 2 6

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TTTCAAGGCATGAAAACACATGTTTTGTAATATGACTTGTTCTTTCTCACGGTCACGGCA
AGTTTTGAAGCTTATCGGCCTCGCCACCCGGAAACAGACTTGGGGACAAGTGAAATAGCG
TTTGAAGCAGCTTCCAACTTTGAAATATCTTCAACAGCCTTCATGACTTCCGTGGAACTA
GTTTCAAGAACCTGTCCTCCAAACACAATCTCATCTAACACTGTGTGCATCTTGCTGTAG
TTGAACACAATGTCGAGTTCACAGACATTGCTGAAGCATTTGTCCAGTGTTTCAACAAGA
ACTTGAATGAGATCAAGCATAGCAAGCTCATTCTCTGATGCATCAAAAACAAGCACGAAA
TAGAGAGTGGCATAGTGTTTGTATACAAGCCGAGAATCCGGGCCAAACAATGAATCAACC
TCCAGGAAATTGCTTACATTCTCAGGTCTACTGCACAACTCTGAAAATACGCCGCGGATA
AGCTCTTGTTGCTTCTCTACCGTAATGAAATCGTAGAACTTGGACAGGCGTGGCTTGCCC
TGTGTGTTTATCATCATCACTGCCTTTATCATTTTCTCAAATCTCTCTTTCTCCCTCGGA
CTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FC63JQ U 6
AF RS1AE18TF C 1
BS 1 5 RS1AE18TF
BS 6 202 RS1FC63JQ
BS 203 203 RS1AE18TF
BS 204 513 RS1FC63JQ
BS 514 514 RS1AE18TF
BS 515 584 RS1FC63JQ
BS 585 585 RS1AE18TF
BS 586 655 RS1FC63JQ
BS 656 667 RS1AE18TF

RD RS1FC63JQ 662 0 0
AAGCAATGCAACACACTTCAAAGAGAAACTGAATTACAAAGTGTGATGAGAGTAATTTCA
AGGCATGAAAACACATGTTTTGTAATATGACTTGTTCTTTCTCACGGTCACGGCAAGTTT
TGAAGCTTATCGGCCTCGCCACCCGGAAACAGACTTGGGGACAAGTGAAATAGCGTTTGA
AGCAGCTTCCAACTTTGGAATATCTTCAACAGCCTTCATGACTTCCGTGGAACTAGTTTC
AAGAACCTGTCCTCCAAACACAATCTCATCTAACACTGTGTGCATCTTGCTGTAGTTGAA
CACAATGTCGAGTTCACAGACATTGCTGAAGCATTTGTCCAGTGTTTCAACAAGAACTTG
AATGAGATCAAGCATAGCAAGCTCATTCTCTGATGCATCAAAAACAAGCACGAAATAGAG
AGTGGCATAGTGTTTGTATACAAGCCGAGAATCCGGGCCAAACAATGAATCAACCTCCAG
GAAATTGCTTACATTCTCAGGTCTACTGTACAACTCTGAAAATACGCCGCGGATAAGCTC
TTGTTGCTTCTCTACCGTAATGAAATCGTAGAACTTGGATAGGCGTGGCTTGCCCTGTGT
GTTTATCATCATCACTGCCTTTATCATTTTCTCAAATCTCTCTTTCTCCC
TCGGACTCTCCC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RS1AE18TF 667 0 0
CGTGTAAGCAATGCAACACACTTCAAAGTGAAACTGAATTACAAAGTGTGATGAGAGTAA
TTTCAAGGCATGAAAACACATGTTTTGTAATATGACTTGTTCTTTCTCACGGTCACGGCA
AGTTTTGAAGCTTATCGGCCTCGCCACCCGGAAACAGACTTGGGGACAAGTGAAATAGCG
TTTGAAGCAGCTTCCAACTTTGAAATATCTTCAACAGCCTTCATGACTTCCGTGGAACTA
GTTTCAAGAACCTGTCCTCCAAACACAATCTCATCTAACACTGTGTGCATCTTGCTGTAG
TTGAACACAATGTCGAGTTCACAGACATTGCTGAAGCATTTGTCCAGTGTTTCAACAAGA
ACTTGAATGAGATCAAGCATAGCAAGCTCATTCTCTGATGCATCAAAAACAAGCACGAAA
TAGAGAGTGGCATAGTGTTTGTATACAAGCCGAGAATCCGGGCCAAACAATGAATCAACC
TCCAGGAAATTGTTTACATTCTCAGGTCTACTGCACAACTCTGAAAATACGCCGCGGATA
AGCTCTTGTTGCTTCTCTACCGTCATGAAATCGTAGGACTTGGACAGGCGTGGCTTGCCC
TGTGTGTTTATCATCATCACTGCCTTTATCATTTTCTCAAATCTCTCTTTCTCCCTCGGA
CTCTCCC

QA 1 667 1 667
DS 



CO CL1021Contig2 876 4 8 U
GGGGAATCGAATGGAAGACTCTAACTGATACAGAAGGTTTTAGAGATTAGTTAGAATTTT
ATGAGATCGGAGTTCTTGGAGAGGGTTTGAGGGGGAGAGAGAGAGATTTGAGAAAATGAT
AAAGGCAGTGATGATGATAAACACACAGGGCAAGCCACGCCTATCCAAGTTCTACGATTT
CATGACTGTAGAGAAGCAACAAGAGCTTATCCGCGGCGTATTCTCAGAATTGTGCAGTAG
ACCTGAGAATGTAAGCAATTTTCTGGAGATTGATTCATTGTTTGGCCCGGATTCTCGGCT
TGTATACAAACACTATGCTACTCTCTATTTCGTGCTTGTTTTTGATGCATCAGAGAATGA
GCTTGCTATGCTTGATCTCATTCAAGTTCTTGTTGAAACACTGGACAAATGCTTCAGCAA
TGTCTGTGAACTCGACATTGTGTTCAACTACAGCAAGATGCACACAGTGTTAGATGAGAT
TGTGTTTGGAGGACAGGTTCTTGAAACTAGTTCCACGGAAGTCATGAAGGCTGTTGAAGA
TATTTCAAAGTTGGAAGCTGCTTCAAACGCTATTTCACTTGTCCCCAAGTCTGTTTCCGG
GTGGAGAGGCCGATAGCTTCAAAACTTGCCGTAACCGTGACAAAGAACAAGTCATATTCC
AAAACATGTTTTTTCATGCCTTGAAATTACTCTCATCACATTCCTTTGTAATTCAGTTTC
TCTTTGAAGTGTGTTGCGTTGCTTACACGAAATTGTGTTTCTAGCCCTTTGAGCGTGTAA
TGCTTGCTTAATGGACTCAAATATGGGCCTGATAATCGCAATTAGGGGAATTATACTGCA
TGCTGGTTTGATATGTTATAATAAAACTGTAGAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CK48TF U 1
AF RS1AV31TF U 104
AF RS1AV31JQ C 105
AF RS1CK48JQ C 184
BS 1 671 RS1CK48TF
BS 672 814 RS1AV31TF
BS 815 815 RS1AV31JQ
BS 816 820 RS1AV31TF
BS 821 821 RS1AV31JQ
BS 822 827 RS1AV31TF
BS 828 829 RS1AV31JQ
BS 830 876 RS1AV31TF

RD RS1CK48TF 671 0 0
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ATGAGATCGGAGTTCTTGGAGAGGGTTTGAGGGGGAGAGAGAGAGATTTGAGAAAATGAT
AAAGGCAGTGATGATGATAAACACACAGGGCAAGCCACGCCTATCCAAGTTCTACGATTT
CATGACTGTAGAGAAGCAACAAGAGCTTATCCGCGGCGTATTCTCAGAATTGTGCAGTAG
ACCTGAGAATGTAAGCAATTTTCTGGAGATTGATTCATTGTTTGGCCCGGATTCTCGGCT
TGTATACAAACACTATGCTACTCTCTATTTCGTGCTTGTTTTTGATGCATCAGAGAATGA
GCTTGCTATGCTTGATCTCATTCAAGTTCTTGTTGAAACACTGGACAAATGCTTCAGCAA
TGTCTGTGAACTCGACATTGTGTTCAACTACAGCAAGATGCACACAGTGTTAGATGAGAT
TGTGTTTGGAGGACAGGTTCTTGAAACTAGTTCCACGGAAGTCATGAAGGCTGTTGAAGA
TATTTCAAAGTTGGAAGCTGCTTCAAACGCTATTTCACTTGTCCCCAAGTCTGTTTCCGG
GTGGAGAGGCCGATAGCTTCAAAACTTGCCGTAACCGTGACAAAGAACAAGTCATATTCC
AAAACATGTTT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1AV31TF 773 0 0
G
GATTTGAGAAAATGATAAAGGCAGTGATGATGATAAACACACAGGGCAAGCCACGCCTAT
CCAAGTTCTACGATTTCATGACTGTAGAGAAGCAACAAGAGCTTATCCGCGGCGTATTCT
CAGAATTGTGCAGTAGACCTGAGAATGTAAGCAATTTTCTGGAGATTGATTCATTGTTTG
GCCCGGATTCTCGGCTTGTATACAAACACTATGCTACTCTCTATTTCGTGCTTGTTTTTT
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ACAAATGCTTCAGCAATGTCTGTGAACTCGACATTGTGTTCAACTACAGCAAGATGCACA
CAGTGTTAGATGAGATTGTGTTTGGAGGACAGGTTCTTGAAACTAGTTCCACGGAAGTCA
TGAAGGCTGTTGAAGGTATTTCAAAGTTGGAAGCTGCTTCAAACGCTATTTCACTTGTCC
CCAAGTCTGTTTCCGGGTGGAGAGGCCGATAGCTTCAAAACTTGCCGTAACCGTGACAAA
GAACAAGTCATATTCCAAAACATGTTTTTTCATGCCTTGAAATTACTCTCATCACATTCC
TTTGTAATTCAGTTTCTCTTTGAAGTGTGTTGCGTTGCTTACACGAAATTGTGTTTCTAG
CCCTTTGAGCGTGTAATGCTTGCTTAATGGACTCAAATATGGGCCTGATA*TCGCA*TTA
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DS 

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GGA
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AGTTCTACGATTTCATGACTGTAGAGAAGCAACAAGAGCTTATCCGCGGCGTATTCTCAG
AATTGTGCAGTAGACCTGAGAATGTAAGCAATTTTCTGGAGATTGATTCATTGTTTGGCC
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AATGCTTCAGCAATGTCTGTGAACTCGACATTGTGTTCAACTACAGCAAGATGCACACAG
TGTTAGATGAGATTGTGTTTGGAGGACAGGTTCTTGAAACTAGTTCCACGGAAGTCATGA
AGGCTGTTGAAGGTATTTCAAAGTTGGAAGCTGCTTCAAACGCTATTTCACTTGTCCCCA
AGTCTGTTTCCGGGTGGAGAGGCCGATAGCTTCAAAACTTGCCGTAACCGTGACAAAGAA
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GTAATTCAGTTTCTCTTTGAAGTGTGTTGCGTTGCTTACACGAAATTGTGTTTCTAGCCC
TTTGAGCGTGTAATGCTTGCTTAATGGACTCAAATATGGGCCTGATAATCGCAATTAGGG
GAATTATACTGCATGCTGGTTT
TGA

QA 4 745 4 745
DS 

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ATACAAACACTATGCTACTCTCTATTTCGTGCTTGTTTTTGATGCATCAGAGAATGAGCT
TGCTATGCTTGATCTCATTCAAGTTCTTGTTGAAACACTGGACAAATGCTTCAGCAATGT
CTGTGAACTCGACATTGTGTTCAACTACAGCAAGATGCACACAGTGTTAGATGAGATTGT
GTTTGGAGGACAGGTTCTTGAAACTAGTTCCACGGAAGTCATGAAGGCTGTTGAAGATAT
TTCAAAGTTGGAAGCTGCTTCAAACGCTATTTCACTTGTCCCCAAGTCTGTTTCCGGGTG
GAGAGGCCGATAGCTTCAAAACTTGCCGTAACCGTGACAAAGAACAAGTCATATTCCAAA
ACATGTTTTTTCATGCCTTGAAATTACTCTCATCACATTCCTTTGTAATTCAGTTTCTCT
TTGAAGTGTGTTGCGTTGCTTACACGAAATTGTGTTTCTAGCCCTTTGAGCGTGTAATGC
TTGCTTAATGGACTCAAATATGGGCCTGATAATCGCAATTAGGGGAATTATACTGCATGC
TGGTTT
TGA

QA 1 666 1 666
DS 



AS 2 5

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ATTCTGCCACCGATGATGATGAAATGGTGAAACAAAGTTTCTTGGAATCTGACAAAGTAA
AACTTGCACTTCCATGTTATAGTGTCGTTCCAAATCCTTCAAATAAGCAACCCCAGCTTT
GATTGCTAAAAAACAGCAACGAAGTGAGTAAAGCTGAAGCAGTAACACTATGTAACGGTA
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GACCAAAAAAAAACGCAGCTGAAAAAAAACGAGCGAAAAGTGTTCTCCCTGTCGTCGATG
ACGACAATAGTTTATTGAGGGCCCTTCTCACGCCATTGGCCGCCATGTTTCTTCAACTCC
TTTTCGCTCCTCCTCTTCACCCTCTCAAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A013TR U 79
AF RS1A013JQ U 1
BS 1 105 RS1A013JQ
BS 106 106 RS1A013TR
BS 107 354 RS1A013JQ
BS 355 355 RS1A013TR
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BS 390 572 RS1A013JQ

RD RS1A013TR 363 0 0
AAG
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AAGTGAGTAAAGCTGAAGCAGTAACACTATGTAACGGTATAAGCGACACTCCTGCACTCA
GCTCCACTGGGACCCTGGAGGATGTGAGCCTACAAAGTGAGGAGCGAGATGAAAATGCTC
CGTTCGAAAAAGCGAATCCAGCTGATTTTCCGACATTCGGACCA
AAAAAAAACGCACCTG

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DS 

RD RS1A013JQ 572 0 0
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AAGGAGCCCTTTGAAAGAAATGTTTATCTTAAACCTTTGGGGGAAGAAAAAAAACTGCAA
ATTCTGCCACCGATGATGATGAAATGGTGAAACAAAGTTTCTTGGAATCTGACAAAGTAA
AACTTGCACTTCCATGTTATAGTGTCGTTCCAAATCCTTCAAATAAGCAACCCCAGCTTT
GATTGCTAAAAAACAGCAACGAAGTGAGTAAAGCTGAAGCAGTAACACTATGTAACGGTA
TAAGCGACACTCCTGCACTCAGCTCCACTGGGACCCTGGAGGATGTGAGCCTACGAAGTG
AGGAGCGAGATGAAAATGCTCCGTTCGAGAAAGCGAATCCAGCTGATTTTCCGACATTCG
GACCAAAAAAAAACGCAGCTGAAAAAAAACGAGCGAAAAGTGTTCTCCCTGTCGTCGATG
ACGACAATAGTTTATTGAGGGCCCTTCTCACGCCATTGGCCGCCATGTTTCTTCAACTCC
TTTTCGCTCCTCCTCTTCACCCTCTCAAAGCC

QA 1 572 1 572
DS 



CO CL1022Contig2 713 3 2 U
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AGGGTGAAGAGGAGGAGCGAAAAGGAGTTGAAGAAACATGGCGGCCAATGGCGTGAGAAG
GGCCCTCAATAAACTATCGTCGTCATCGACGACAGGGAGAACACTCTTCGCTCGTTCTTC
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CGGAGCATCTTCATCTCGCTCCTCACTTCGTAGGCTCACATCCTCCAGGGTCCCAGTGGA
GCTGAGTGCAGGAGTGTCGCTTATACCGTTACATAGTGTTACTGCTTCAGCTTTACTCAC
TTCGTTGCTGTCTCTTAGCAATCAAAGCTGGGGTTGCTTATCTGAAGGATTTGGAACGAC
ACTATAACATGGAAGTGCAAGTTTTACTTTGTCAGATTCCAAGAAACTTTGTTTCACCAT
TTCATCATCATCGGTGGCAGAATCTGCAGTTTTTTTTCTTCCCCCAAAGGTTTAAGATAA
ACATTTCTTTCAAAGGGCTCCTTTGTTCCGTTTTGCTTTTATACTATTGTCATCTTCCAG
TTTGATGATTTCTCTTTACTTTTACAACTCTGCCTCTCACTTAACTACTCTTTTTTTTTT
GCTAGAGTTTTACCTAAAGGAATCTATCGAAAAAGAGTTCTTGACTTCCATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 5 5 5 25 5 5 25 25 25 5 25 5 5 5 25 25 25 25 5 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GCAGAATCTGCAGTTTTTTTTCTTCCCCCAAAGGTTTAAGATAAACATTTCTTTCAAAGG
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TACTTTT

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CATAGATGGACCGAGAAAACCGACCACTCATTGTTTGCAAAGCTTGTTAGGTAACAAGTG
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BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BB89JQ U 35
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ATCTAGATTTTGATAACGATCTTGAAAGAGAACGTCTGGGTGATTTACTCAGATCCTTTC
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TCCTGCTTCTGCTTGGGCTTCTAGACTGGGAGCTTTCATACTTCTTAACCCGGATATAGC
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CATCATAATTGGTGTAGTCAACAACACCATAAGTTCCATCACTGTCTCGAGTGACCTCAG
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CAAAGTTGTACCCGT

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GACTCCCTTATGTCACCGGGCAAGTTACCAACATAGATGGACCGAGAAAACCGACCACTC
ATTGTTTGCAAAGCTTGTTAGGTAACAAGTGAGAGCAATCCATGGTAAAGAGCAGTGCTC
CACAAGCTCCAAAATTGCTTATTTGCTCCAATGTGCTCCCAAAAGCTAGTATAATTTTTT
TTAAAATCTATTTTGTTTTCTCCACATCTTCCCCATGATTTAAGCATAAATAAAATAAAT
ACACT

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DS 

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AGAGCCGTCAAAGTTGTACCCGTCACGGCCATCGATAGCATCTTCAGCATCCCGAGGATG
CTCAAACTCAACAAAACAATAACATGGAGGACGAGGTGGAACCTTCAATTCAATATCCAC
AATGCGACCATACTTGTAGAAGAGATCTTCAATCTCAGACTCCCTTATGTCACCGGGCAA
GTTACCAACATAGATGGACCGAGAAAACCGACCACTCATTGTTTGCAAAGCTTGTTAGGT
AACAAGTGAGAGCAATCCATGGTAAAGAGCAGTGCTCCACAAGCTCCAAAATTGCTTATT
TGCTCCAATGTGCTCCCAAAAGCTAGTATAATTTTTTTTAAAATCTATTTTGTTTTCTCC
ACATCTTCCCCATGATTTAAGCATAAATAAAATAAATACACTGATCTCCCCATTCCCTCT
CTATATCACTATGAACCATTGCAATGCTCATGTTCCAAGCGCTTTG

QA 1 526 1 526
DS 



AS 1 5

CO CL1024Contig1 790 5 16 U
TTTTTTTTCTCTCTCCGATCAGATCCAAAAAGTAAATTCGCTTTCCCTACGCTGCGCGAT
GTCTCTCCGCCGTTCCATCCTCGGCCTCCACCGCCAAACCCACAACCTCTCCCTCTCAAA
GTCTTCACCTTTCTCGATAACAAACAACATCTCCTCCCCGTCCGCCGCCGCGAGGAACCC
AATCGGAAGAGAAATCTCCTCGATCCCATTTTCCCTAACCCAGAGACTCAAACCCGACTC
CAGGAGCACCGATCGTGCGGTTGCTTCTCTCGGGCAATCTCAATTGGCTCGTCTCCCGTC
TTCCAGAGGCTACAGCAACGCGTCTCTCGTACGGAAGATCCCTGTTCTGTTTCACATCAA
CGCGGGAATGGAGGAGGTTTTGGCGGATTACGTTCACCAAGAGCTGACCAGGAATCTGAT
GGTGATCTCTCTGGGCTTGTTCCAGATCATCGTTATCAAAGACGTCGTCGTGTTTCTTTT
CTTCTGAGCAAAGGAATCATCTTTGTGTGGGGATGACCTGTTAATGAAATAGTGAGCTTA
ATAAAAGTCGTTCCTTTTTATCTTTCTTCTGTTATGAATAACAACATTGATGCAATCGCA
TAACCTTGCTTGTGTT*********CTCTCTTGTTTTTAAGTTTGGTCTGTTTGATTCAG
TTCGTATTACTATTAAGGCTTAAGTGGAATGAAAAGTGTGTGTGTTTTAAGTCCTTTACT
TTCCTGGATTGGAGACAGAAAAATGAGAATCTCTGTGAAGCTTTGAATTGAATAAAAGAC
AAGTTTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 
10 10 10 10 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1AZ53TF U 12
AF RS1AZ53JQ C 129
AF RS1AX93TF U 9
AF RS1FR92TF U 1
AF RS1FR92JQ C 51
BS 1 39 RS1FR92TF
BS 40 40 RS1AX93TF
BS 41 210 RS1FR92TF
BS 211 211 RS1AX93TF
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BS 360 409 RS1FR92TF
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BS 411 602 RS1FR92TF
BS 603 603 RS1AX93TF
BS 604 676 RS1FR92TF
BS 677 677 RS1AX93TF
BS 678 729 RS1FR92TF
BS 730 730 RS1FR92JQ
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BS 743 790 RS1FR92JQ

RD RS1AZ53TF 231 0 0
GGG
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TCTCCTCGATCCCATTTTCCCTAACCCAGAGACTCGAACCCGACTCCA

QA 4 231 4 231
DS 

RD RS1AZ53JQ 547 0 0
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GAGAAATCTCCTCGATCCCATTTTCCCTAACCCAGAGACTCAAACCCGACTCCAGGAGCA
CCGATCGTGCGGTTGCTTCTTTCGGGCAATCTCAATTGGCTTGTCTCCCGTTTTCCAGAG
GCTACAGCAACGCGTCTCTTGTACGGAAGATCCCTGTTCTGTTTCACATCAACGCGGGAA
TGGAGGAGGTTTTGGCGGATTACGTTCACCAAGAGCTGACCAGGAATCTCATGGTGATCT
CTCTGGGCTTGTTCCAGATCATCGTTATCAAAGACGTCGTCGTGTTTCTTTTCTTTTGAG
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CGTTCCTTTTTATCTTTCTTTTGTTATGAATAACAACATTGATGCAATCGCATAACCTTG
CTTGTGTT*********TTCTCTTGTTTTTAAGTTTGGTCTGTTTGATTCAGTTCGTATT
A
AGGCTT

QA 1 541 1 541
DS 

RD RS1AX93TF 696 0 0
CTCTCT
CCGATCAGATCCAAAAAGTAAATTCGCTTTCCCTACGCTGCGCGATGTCTCTCCGCCGTT
CCATCCTCGGCCTCCACCGCCAAACCCACAACCTCTCCCTCTCAAAGTCTTCACCTTTCT
CGATAACAAACAACATCTCCTCCCCGTCCGCCGCCGCGAGGAACCCAATCGGAAGAGAAA
TCTCCTCGATCCCATTTTCCCTAACCCAGAAACTCAAACCCGACTCTAGGAGTACCGATC
GTGCGGTTGCTTCTCTCGGGCAATCTCAATTGGGTCGTCTCCCATCTTCCAGAGGCTACA
GCAACGCGTCACTCGTACGGAAGATCCCTGTTCTGTTTCACATCAACGCGGGAATGGAGG
AGGTTTTGGCGGATTACGTTCACCAAGAGCTGACCAGGAATCTGATGGTGATCTCTCTGG
GCTTGTTCCAGATCATCGTTATCAAAGACGTCGTCGTGTTTCTTTTCTTCTGAGCAAAGG
AATCATCTTTGTGTGGGGATGACCTGTTAATGAAATAGTGAGCTTAATAAAAGTCGTTCC
TTTTTATCTTTCTTCTGTTATGAATAACAACATTGATGCAATCGCATAATCTTGCTTGTG
TTGCTTCAGTTTTCTCTTGTTTTTAAGTTTGGTCTGTTTGATTCAGTTCGTAT*******
AAGGCTTAAGTTGAATTAAAAG
TGTGTGTC

QA 7 688 7 688
DS 

RD RS1FR92TF 744 0 0
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GTCTCTCCGCCGTTCCATCCTCGGCCTCCACCGCCAAACCCACAACCTCTCCCTCTCAAA
GTCTTCACCTTTCTCGATAACAAACAACATCTCCTCCCCGTCCGCCGCCGCGAGGAACCC
AATCGGAAGAGAAATCTCCTCGATCCCATTCTCCCTAACCCAGAGACTCAAACCCGACTC
CAGGAGCACCGATCGTGCGGTTGCTTCTCTCGGGCAATCTCAATTGGCTCGTCTCCCGTC
TTCCAGAGGCTACAGCAACGCGTCTCTCGTACGGAAGATCCCTGTTCTGTTTCACATCGA
CGCGGGAATGGAGGAGGTTTTGGCGGATTACGTTCACCAAGAGCTGACCGGGAATCTGAT
GGTGATCTCTCTGGGCTTGTTCCAGATCATCGTTATCAAAGACGTCGTCGTGTTTCTTTT
CTTCTGAGCAAAGGAATCATCTTTGTGTGGGGATGACCTGTTAATGAAATAGTGAGCTTA
ATAAAAGTCGTTCCTTTTTATCTTTCTTCTGTTATGAATAACAACATTGATGCAATCGCA
TACCCTTGCTTGTGTT*********CTCTCTTGTTTTTAAGTTTGGTCTGTTTGATTCAG
TTCGTATTACTATTAAAGCTTAAGTGGAATGAAAAGTGTGTGTGTTTTAAGTCCTTTACT
TTCCTGGAT*GGAGACAGAAAA
TG

QA 1 742 1 742
DS 

RD RS1FR92JQ 740 0 0
GCTGCGCGATGTCTCTCCGCCGTTCCATCCTCGGCCTCCACCGCCAAACCCACAACCTCT
CCCTCTCAAAGTCTTCACCTTTCTCGATAACAAACAACATCTCCTCCCCGTCCGCCGCCG
CGAGGAACCCAATCGGAAGAGAAATCTCCTCGATCCCATTCTCCCTAACCCAGAGACTCA
AACCCGACTCCAGGAGCACCGATCGTGCGGTTGCTTCTCTCGGGCAATCTCAATTGGCTC
GTCTCCCGTCTTCCAGAGGCTACAGCAACGCGTCTCTCGTACGGAAGATCCCTGTTCTGT
TTCACATCGACGCGGGAATGGAGGAGGTTTTGGCGGATTACGTTCACCAAGAGCTGACCG
GGAATCTGATGGTGATCTCTCTGGGCTTGTTCCAGATCATCGTTATCAAAGACGTCGTCG
TGTTTCTTTTCTTCTGAGCAAAGGAATCATCTTTGTGTGGGGATGACCTGTTAATGAAAT
AGTGAGCTTAATAAAAGTCGTTCCTTTTTATCTTTCTTCTGTTATGAATAACAACATTGA
TGCAATCGCATACCCTTGCTTGTGTT*********CTCTCTTGTTTTTAAGTTTGGTCTG
TTTGATTCAGTTCGTATTACTATTAAGGCTTAAGTGGAATGAAAAGTGTGTGTGTTTTAA
GTCCTTTACTTTCCTGGATTGGAGACAGAAAAATGAGAATCTCTGTGAAGCTTTGAATTG
AATAAAAGACAAGTTTTCCC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 2 6

CO CL1025Contig1 684 3 3 U
GGATTCACCAAAGCATCACATACACTCTTACTTCTCTTCTCATTTTCTTTATATTTTTCC
TCTTTACCTTTGTCATTTAGAGATGGCCGACGTTAAGGTTGAACAAGTCATTACTCCAGC
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GGCGGAAGAAGTCGTGGCCACCAGGGATTCTGCTCCTGCTCCAGCCGCCGTAACTGAACA
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AAAAGATGAAGAAACTGAGAAGAAACCAGAGGAGCCAAAGGTAGAGGAGGAAGAAGAGAA
GACAGAAACTCCGGTCGTTGAGGAGGAGGCAAAGACAGAAGAGAAGGACGAGGTGACTGA
AACTCCGGCGGTTGTGGAGGAGGAGAAGAAGGCTGAGGCAGGGGAATTTGTGGCTGCTGG
TGAAGTCGCCGCCGAGAAGGCTGACGAGTAAAGAGAAAGAAACTATATATGAATCTTTGG
TCTCATACTCTCATTTCGTTGTCTTTTAAAAATATTATATTTTATCAACAGTTAATAAGT
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TATATTGCTTACATGCTTGGTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BF64JQ C 1
AF RS1BF64TF U 1
AF RS1C357TF U 1
BS 1 6 RS1BF64JQ
BS 7 605 RS1BF64TF
BS 606 684 RS1C357TF

RD RS1BF64JQ 607 0 0
GGATTCACCAAAGCATCACATACACTCTTACTTCTCTTCTCATTTTCTTTATATTTTTCC
TCTTTACCTTTGTCATTTAGAGATGGCCGACGTTAAGGTTGAACAAGTCATTACTCCAGC
AGCAGAGAACGTTGAGGTACCAACCAAGACAGTGGAGGAGCCAGTTGTGGTTACCGAACA
GGCGGAAGAAGTCGTGGCCACCAGGGATTCTGCTCCTGCTCCAGCCGCCGTAACTGAACA
AGAATCCGAAGTATCAGTCGAAGAAACGAGAAAAGAAGTGGTTGTGGAAGAGGCAGAGAA
AAAAGATGAAGAAACTGAGAAGAAACCAGAGGAGCCAAAGGTAGAGGAGGAAGAAGAGAA
GACAGAAACTCCGGTCGTTGAGGAGGAGGCAAAGACAGAAGAGAAGGACGAGGTGACTGA
AACTCCGGCGGTTGTGGAGGAGGAGAAGAAGGCTGAGGCAGGGGAATTTGTGGCTGCTGG
TGAAGTCGCCGCCGAGAAGGCTGACGAGTAAAGAGAAAGAAACTATATATGAATCTTTGG
TCTCATACTCTCATTTCGTTGTCTTTTAAAAATATTATATTTTATCAACAGTTAATAAGT
TTCTA
CC

QA 1 605 1 605
DS 

RD RS1BF64TF 607 0 0
GGATTC
ACCAAAGCATCACATACACTCTTACTTCTCTTCTCATTTTCTTTATATTTTTCCTCTTTA
CCTTTGTCATTTAGAGATGGCCGACGTTAAGGTTGAACAAGTCATTACTCCAGCAGCAGA
GAACGTTGAGGTACCAACCAAGACAGTGGAGGAGCCAGTTGTGGTTACCGAACAGGCGGA
AGAAGTCGTGGCCACCAGGGATTCTGCTCCTGCTCCAGCCGCCGTAACTGAACAAGAATC
CGAAGTATCAGTCGAAGAAACGAGAAAAGAAGTGGTTGTGGAAGAGGCAGAGAAAAAAGA
TGAAGAAACTGAGAAGAAACCAGAGGAGCCAAAGGTAGAGGAGGAAGAAGAGAAGACAGA
AACTCCGGTCGTTGAGGAGGAGGCAAAGACAGAAGAGAAGGACGAGGTGACTGAAACTCC
GGCGGTTGTGGAGGAGGAGAAGAAGGCTGAGGCAGGGGAATTTGTGGCTGCTGGTGAAGT
CGCCGCCGAGAAGGCTGACGAGTAAAGAGAAAGAAACTATATATGAATCTTTGGTCTCAT
ACTCTCATTTCGTTGTCTTTTAAAAATATTATATTTTATCAACAGTTAATAAGTTTCTA
CC

QA 7 605 7 605
DS 

RD RS1C357TF 684 0 0
GGATTC
ACCAAAGCATCACATACACTCTTACTTCTCTTCTCATTTTCTTTATATTTTTCCTCTTTA
CCTTTGTCATTTAGAGATGGCCGACGTTAAGGTTGAACAAGTCATTACTCCAGCAGCAGA
GAACGTTGAGGTACCAACCAAGACAGTGGAGGAGCCAGTTGTGGTTACCGAACAGGCGGA
AGAAGTCGTGGCCACCAGGGATTCTGCTCCTGCTCCAGCCGCCGTAACTGAACAAGAATC
CGAAGTATCAGTCGAAGAAACGAGAAAAGAAGTGGTTGTGGAAGAGGCAGAGAAAAAAGA
TGAAGAAACTGAGAAGAAACCAGAGGAGCCAAAGGTAGAGGAGGAAGAAGAGAAGACAGA
AACTCCGGTCGTTGAGGAGGAGGCAAAGACAGAAGAGAGGGACGAGTTGACTGAAACTCC
GGCGGTTGTGGAGGAGGAGAAGAAGGCTGAGGCAGGGGAATTTGTGGCTGCTGGTGAAGT
CGCCGCCGAGAAGGCTGACGAGTAAAGAGAAAGAAACTATATATGAATCTTTGGTCTCAT
ACTCTCATTTCGTTGTCTTTTAAAAATATTATATTTTATCAACAGTTAATAAGTTTCTAT
CATTTGCTGTGTTTATTATGATGAAATCAGATGTTTGGATAATTTGATGGTTGCTATATT
GCTTACATGCTTGGTCTT

QA 7 684 7 684
DS 



CO CL1025Contig2 672 3 13 U
GGACCAAAGCATCACATACACTCTTACTTCTCTTCTCATTTTCTTTATATTTTTCCTCTT
TACCTTTGTCATTTAGAGATGGCCGACGTTAAGGTTGAACAAGTCATTACTCCAGCAGCA
GAGAACGTTGAGGTACCAACCAAGACAGTGGAGGAGCCAGTTGTGGTTACCGAACAGGCG
GAAGAAGTCGTGGCCACCAGGGATTCTGCTCCTGCTCCAGCCGCCGTAACTGAACAAGAA
TCCGAAGTATCAGTCGAAGAAACGAGAAAAGAAGTGGTTGTGGAAGAGGCAGAGAAAAAA
GATGAAGAAACTGAGAAGAAACCAGAGGAGCCAAAGGTAG**GAGGAAGAAGAGAAGACA
GAAACTCCGGTCGTTGAGGAGGAGGCAAAGACAGAAGAGGAGGACGAGGTGTCTGAAACT
CCGGCGGTTGTGGAGGAGGAGAAGAAGGCTGAGGCAGGGGAAGTTGTGGCTGCTGGTGAA
GTCGCCGCCGAGAAGGCTGACGAGTAAAGAGAAAGAAACTATATATGAATCTTTGGTCTC
ATTTCGTTGTCTTTTAAAAATATTATATTTTATCAACAGTTCATAAGTTTCTATCATTTG
CTGTGTTTATTATGATGAAATCAGATGTTTGGATAATTTGATGGTTGCTATATTGCTTAC
ATGCTAAAAAAA


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EH83TF U 1
AF RS1EH83JQ C 1
AF RS1DE19TF U 1
BS 1 17 RS1DE19TF
BS 18 18 RS1EH83TF
BS 19 340 RS1DE19TF
BS 341 342 RS1EH83TF
BS 343 355 RS1DE19TF
BS 356 356 RS1EH83TF
BS 357 395 RS1DE19TF
BS 396 396 RS1EH83TF
BS 397 399 RS1DE19TF
BS 400 400 RS1EH83TF
BS 401 411 RS1DE19TF
BS 412 412 RS1EH83TF
BS 413 672 RS1DE19TF

RD RS1EH83TF 520 0 0
GG
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TGAAGAAACTGAGAAGAAACCAGAGGAGCCAAAGGTAG**GAGGAAGAAGAGAAGACAGA
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GGCGGTTGTGGAGGAGGAGAAGAAGGCTGAGGCAGGGGAAGTTGTGGCTGCTGGTGAAGT
CGCCGCCGAGAAGGCTGACGAGTAAAGAGAAAGAAACT

QA 3 520 3 520
DS 

RD RS1EH83JQ 632 0 0
GG
ACCAAAGCATCACATACACTCTTACTTCTCTTCTCATTTTCTTTATATTTTTCCTCTTTA
CCTTTGTCATTTAGAGATGGCCGACGTTAAGGTTGAACAAGTCATTACTCCAGCAGCAGA
GAACGTTGAGGTACCAACCAAGACAGTGGAGGAGCCAGTTGTGGTTACCGAACAGGCGGA
AGAAGTCGTGGCCACCAGGGATTTTGCTCCTGCTCCAGCCGCCGTAACTGAACAAGAATC
CGAAGTATCAGTCGAAGAAACGAGAAAAGAAGTGGTTGTGGAAGAGGCAGAGAAAAAAGA
TGAAGAAACTGAGAAGAAACCAGAGGAGCCAAAGGTAG**GAGGAAGAAGAGAAGACAGA
AACTCCGGTCGTTGAGGAGGAGGCAAAGACAGAAGAGGAGGACGAGGTGTTTGAAACTCC
GGCGGTTGTGGAGGAGGAGAAGAAGGCTGAGGCAGGGGAAGTTGTGGCTGCTGGTGAAGT
CGCCGCCGAGAAGGCTGACGAGTAAAGAGAAAGAAACTATATATGAATCTTTGGTCTCAT
TTCGTTGTCTTTTAAAAATATTATATTTTATCAACAGTTCATAAGTTTCTATCATTTGCT
GTGTTTATTATGATGAAATCAGATGTTTGG

QA 3 632 3 632
DS 

RD RS1DE19TF 672 0 0
GGACCAAAGCATCACATGCACTCTTACTTCTCTTCTCATTTTCTTTATATTTTTCCTCTT
TACCTTTGTCATTTAGAGATGGCCGACGTTAAGGTTGAACAAGTCATTACTCCAGCAGCA
GAGAACGTTGAGGTACCAACCAAGACAGTGGAGGAGCCAGTTGTGGTTACCGAACAGGCG
GAAGAAGTCGTGGCCACCAGGGATTCTGCTCCTGCTCCAGCCGCCGTAACTGAACAAGAA
TCCGAAGTATCAGTCGAAGAAACGAGAAAAGAAGTGGTTGTGGAAGAGGCAGAGAAAAAA
GATGAAGAAACTGAGAAGAAACCAGAGGAGCCAAAGGTAGAGGAGGAAGAAGAGAGGACA
GAAACTCCGGTCGTTGAGGAGGAGGCAAAGACAGAGGAGAAGGACGAGGTGACTGAAACT
CCGGCGGTTGTGGAGGAGGAGAAGAAGGCTGAGGCAGGGGAAGTTGTGGCTGCTGGTGAA
GTCGCCGCCGAGAAGGCTGACGAGTAAAGAGAAAGAAACTATATATGAATCTTTGGTCTC
ATTTCGTTGTCTTTTAAAAATATTATATTTTATCAACAGTTCATAAGTTTCTATCATTTG
CTGTGTTTATTATGATGAAATCAGATGTTTGGATAATTTGATGGTTGCTATATTGCTTAC
ATGCTAAAAAAA

QA 1 672 1 672
DS 



AS 2 4

CO CL1026Contig1 900 2 8 U
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TCGTGTGTTCTCTATGGCGTCGGAAGCGAAGGAATCACCAGCAAACAATCCTGGCTTGTC
AACAGTTCGTGATGAAGCTACCAAAGGGTATATCATGCAGCAGACTATGTTTCGGGTGAA
GGACCCTAAGGCTAGTCTTGACTTCTACTCACGTATCCTTGGAATGTCATTGCTGAAGAG
GCTAGATTTCTCTGAGATGAAATTCAGCTTGTACTTCCTCGGCTACGAGGATACTTCGAC
AGCTCCAACGGATCCAACTGAGAGGACGGTTTGGACCTTTGGTCGACCAGCAACAATTGA
GCTGACTCACAACTGGGGCACAGAGAGTGATCCTGAGTTTAAAGGTTATCATAATGGGAA
CTCCGAACCTAAAGGATTTGGGCATATTGGGGTTACAGTTGATGATGTGCACAAGGCATG
CGAGAGATTTGAACAACTGGGGGTGGAGTTTGTCAAGAAACCTAACGATGGAAAGATGAA
GAACATAGCCTTCATTAAGGATCCTGATGGCTACTGGATCGAGATCTTTGATCTCAAGAC
TATCGGGACAACAGCCGGAAACGCAGCTTGAAGTAGTACCGATTGTGTGCTGTCTGTCTT
GTTCTTGTGCTCCTTCCACCTGAGCTTGAATACAAATAAAGATGTTGCCTGTCTCAACGA
ATAAAAGAAACTACATTATCAATGTGTCTTTTTTTTTTTCTTGATATTAACAATGAGTTG
AGTTAAATAAGTTGTTATCAATGAGAATCAGTTTGTTTTGATGTCAATGTGTGAATGTTA
TCTGTTTCTCAACATATTTTTGACTGTTACTTGGTACAAGAATGAACTTAACCATTATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GQ73TF U 1
AF RS1AU13JQ C 281
BS 1 495 RS1GQ73TF
BS 496 496 RS1AU13JQ
BS 497 653 RS1GQ73TF
BS 654 654 RS1AU13JQ
BS 655 669 RS1GQ73TF
BS 670 670 RS1AU13JQ
BS 671 711 RS1GQ73TF
BS 712 900 RS1AU13JQ

RD RS1GQ73TF 711 0 0
CAAAGCTCTCGGTCGGTTCATCGTACATCGAGCCCTGAGGCCAAAGAGATTTGATCAGCT
TCGTGTGTTCTCTATGGCGTCGGAAGCGAAGGAATCACCAGCAAACAATCCTGGCTTGTC
AACAGTTCGTGATGAAGCTACCAAAGGGTATATCATGCAGCAGACTATGTTTCGGGTGAA
GGACCCTAAGGCTAGTCTTGACTTCTACTCACGTATCCTTGGAATGTCATTGCTGAAGAG
GCTAGATTTCTCTGAGATGAAATTCAGCTTGTACTTCCTCGGCTACGAGGATACTTCGAC
AGCTCCAACGGATCCAACTGAGAGGACGGTTTGGACCTTTGGTCGACCAGCAACAATTGA
GCTGACTCACAACTGGGGCACAGAGAGTGATCCTGAGTTTAAAGGTTATCATAATGGGAA
CTCCGAACCTAAAGGATTTGGGCATATTGGGGTTACAGTTGATGATGTGCACAAGGCATG
CGAGAGATTTGAACAGCTGGGGGTGGAGTTTGTCAAGAAACCTAACGATGGAAAGATGAA
GAACATAGCCTTCATTAAGGATCCTGATGGCTACTGGATCGAGATCTTTGATCTCAAGAC
TATCGGGACAACAGCCGGAAACGCAGCTTGAAGTAGTACCGATTGTGTGCTGTTTGTCTT
GTTCTTGTGTTCCTTCCACCTGAGCTTGAATACAAATAAAGATGTTGCCTG

QA 1 711 1 711
DS 

RD RS1AU13JQ 620 0 0
GGCTACGAGGATACTTCGACAGCTCCAACGGATCCAACTGAGAGGACGGTTTGGACCTTT
GGTCGACCAGCAACAATTGAGCTGACTCACAACTGGGGCACAGAGAGTGATCCTGAGTTT
AAAGGTTATCATAATGGGAACTCCGAACCTAAAGGATTTGGGCATATTGGGGTTACAGTT
GATGATGTGCACAAGGCATGCGAGAGATTTGAACAACTGGGGGTGGAGTTTGTCAAGAAA
CCTAACGATGGAAAGATGAAGAACATAGCCTTCATTAAGGATCCTGATGGCTACTGGATC
GAGATCTTTGATCTCAAGACTATCGGGACAACAGCCGGAAACGCAGCTTGAAGTAGTACC
GATTGTGTGCTGTCTGTCTTGTTCTTGTGCTCCTTCCACCTGAGCTTGAATACAAATAAA
GATGTTGCCTGTCTCAACGAATAAAAGAAACTACATTATCAATGTGTCTTTTTTTTTTTC
TTGATATTAACAATGAGTTGAGTTAAATAAGTTGTTATCAATGAGAATCAGTTTGTTTTG
ATGTCAATGTGTGAATGTTATCTGTTTCTCAACATATTTTTGACTGTTACTTGGTACAAG
AATGAACTTAACCATTATGC

QA 1 620 1 620
DS 



CO CL1026Contig2 1051 2 8 U
GGACACAGACACAGTTCTCGGTCGGTTCATCGTACATCGGTAATAAAAAATCTCTCCTTT
TTCATATTTTTTTTCCTCTAATAATTTCTGTGGCACGAATTGAAAAAGCATAGGAAAACG
TAAATGGGTTCGTACTCAATAGCCAGTGCTATATCTCGATTTGCGCCTCTAACCCGCTTC
GTTAAACCTTTTTCTTACATCAATTGCCCTTGCAACAGAGCCCTGAGGCCAAAGAGATTT
GATCAGCTTCGTGTGTTCTCAATGGCGTCGGAAGCGAAGGAATCACCAGCAAACAATCCT
GGCTTGTCAACGGTTCGTGATGAAGCTACCAAAGGGTATATCATGCAGCAGACTATGTTT
CGAGTGAAGGACCCTAAGGCTAGTCTTGACTTTTACTCACGTGTCCTGGGAATGTCATTG
CTGAAGAGGCTAGATTTCGCTGAGATGAAATTTAGCTTGTACTTCTTGGGCTACGAGGAC
ACTTCAACAGCTCCAACGGATCCAACTGAGAGAACGGTTTGGACCTTTGGTCGACCTGCC
ACAATTGAGCTGACTCACAACTGGGGCACAGAGAGTGATCCCGAGTTTAAAGGTTATCAT
AATGGGAACTCCGAACCTAAAGGATTTGGGCATATTGGGGTTACAGTTGATGATGTGCAC
AAGGCATGCGAGAGATTGGAACAACTGGGGGTGGAGTTTGTCAAGAAACCTAACGATGGA
AAGATGAAGAACATAGCCTTCATTAAGGATCCTGATGGCTACTGGATCGAGATCTTTGAT
CTCAAGACTATCGGGACAACAGCCGGAAACGCAGCTTGAATAAGCACCGATTGTGTGCTG
TTTGTCTTCTTCTTGTGTTCCTTCCAGCTGAGCTTTGAATACAAATAAAGATGTTGCCTG
TCTCAACGAATAAAAGAAACTACATTATCAATGTGTCTTTTTCTTGATATTAACAATGAG
TTGAGTTAAATAAGTTGTTATCAATGAGAATCAGTTTGGTTTGATGTCAATGTGTTAATG
TTATCTGTTTCTTAATATATTTTTGGTTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GS18TF U 1
AF RS1BD15JQ C 279
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CCTA

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DS 

RD RS1BD15JQ 773 0 0
AGG
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CGAGTTTAAAGGTTATCATAATGGGAACTCCGAACCTAAAGGATTTGGGCATATTGGGGT
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QA 4 773 4 773
DS 



AS 1 5

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TCTCTTTCTCACTGAGACACTCGTCGCCATAAAGCTACCGCCAAACTTGAAGTTTCCAGC
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AAGAATAGCCGTGTTTGGTGCACCGCCACTTGGTTGTGTACCATCACAGAGAACCTTAGG
AGGAGGTCTTTTGAGAGAATGTGCTGAGAATTACAACGAAGCAGCAAAGCTTTTTAATTC
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TAGATGATTTT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DL29TF U 8
AF RS1BY70TF U 1
AF RS1AE33TF U 2
AF RS1BY70JQ C 430
AF RS1DL29JQ C 519
BS 1 142 RS1BY70TF
BS 143 143 RS1AE33TF
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BS 782 795 RS1AE33TF
BS 796 1249 RS1BY70JQ
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RD RS1DL29TF 736 0 0
GGAA
GCGTGATGACATAAAAGAAAAGTTTATATAGTTCTCTCTTTGTCCTGGTTCAAAGCAAAC
ATTTCTTTTAGTAAATCTTGTCTTATTTACCTTACAATAAAGCAAACATGAAAGACAATA
CAAGCTGGTCCTGTTCTTGTTTTTCAGTGAAACTATGCTTGTTGTCCCTTCTCTTTCTCA
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TCGGTGACTCCATTGTCGACACCGGAAATAATAACAATGTCAAAACCGTAGTTAAGAGCG
ATTTTCAGCCTTACGGTATCAATTTCCAAGGCGGAGTTCCCACCGGGAGATTTTGCGACG
GACGGGTCCCCACCGACTTGATTGCCGAAGAATTGGGAATAAAATCAGTTGTACCTGCAT
ATCTCGATCCAAGTTTAAAGACTGAAGATATTTTAACCGGTGTTTCATTTGCGTCGGGAG
GTTCTGGTTACGATCCTTTAACACCTAAACTCGTGGCAGTAATATCATTAGAAGAGCAAT
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CTTACTATGTCCTCCGTGCAAGACCTAACTACGACGCCCATTCGTACACTACTCTTATGG
CCA
CTCTGCACA

QA 5 727 5 727
DS 

RD RS1BY70TF 788 0 0
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TCAAAGCAAACATTTCTTTTAGTAAATCTTGTCTTATTTACCTTACAATAAAGCAAACAT
GAAAGACAATACAAGCTGGTCCCGTTCTTGTTTTTCAGTGAAACTATGCTTGTTGTCCCT
TCTCTTTCTCACTGAGACACTCGTCGCCATAAAGCTACCGCCAAACTTGAAGTTTCCAGC
GCTAATAGCTTTCGGTGACTCCATTGTCGACACCGGAAATAATAACAATGTCAAAACCGT
AGTTAAGAGCGATTTTCAGCCTTACGGTATCAATTTCCAAGGCGGAGTTCCCACCGGGAG
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TGTACCTGCATATCTCGATCCAAGTTTAAAGACTGAAGATATTTTAACCGGTGTTTCATT
TGCGTCGGGAGGTTCTGGTTACGATCCTTTAACACCTAAACTCGTGGCAGTAATATCATT
AGAAGAGCAATTAAAATATTTCGAGGAGTACATAGAGAAAGTGAAGAATATAGTTGGGGA
AGAAAGAAAAGGGTTCATATTAGCCAACAGCTTGTTCTTATTGGTCGCAGGCAGCGACGA
CATAGCCAACACTTACTATGTCCTCCGTGCAAGACCTAACTACGACGCCCATTCGTACAC
TACTCTTATGGCCAACTCTGCCACAGATTTTGTAAATAAACTATACGGATATGGAGTGAG
A
GAATAGC

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DS 

RD RS1AE33TF 794 0 0
GGATGAACAG
GCGTGATGACATAAAAGAAAAGTTTATATAGTTCTCTCTTTGTCCTGGTTCAAAGCAAAC
ATTTCTTTTAGTAAATCTTGTCTTATTTACCTTACAATAAAGCAAACATGAAAGACAATA
CAAGCTGGTCCTGTTCTTGTTTTTCAGTGAAACTTTGCTTGTTGTCCCTTCTCTTTCTCA
CTGAGACACTCGTCGCCATAAAGCTACCGCCAAACTTGAAGTTTCCAGCGCTAATAGCTT
TCGGTGACTCCATTGTCGACACCGGAAATAATAACAATGTCAAAACCGTAGTTAAGAGCG
ATTTTCAGCCTTACGGTATCAATTTCCAAGGCGGAGTTCCCACCGGGAGATTTTGCGACG
GACGAGTCCCCACCGATTTGATTGCCGAAGAATTGGGAATAAAATCAGTTGTACCTGCAT
ATCTCGATCCAAGTTTAAAGACTGAAGATATTTTAACCGGTGTTTCATTTGCGTCGGGAG
GTTCTGGTTACGATCCTTTAACACCTAAACTCGTGGCAGTAATATCATTAGAAGAGCAAT
TAAAATATTTCGAGGAGTACATAGAGAAAGTGAAGAATATAGTTGGGGAAGAAAGAAAAG
GGTTCATATTAGCCAACAGCTTGTTCTTATTGGTCGCAG*CAGCGACGACATAGCCAACA
CTTACTATGTCCTCCGTGCAAGACCTAACTACGACGCCGATTCGTACACTACTCTTATGG
CCAACTCTGCCACAGATTTTGTAAATAAACTATACGGATATGGAGTGAGAAGAATAGCCG
TGTT

QA 11 794 11 794
DS 

RD RS1BY70JQ 822 0 0
ATATCTCGATCCAAGTTTAAAGACTGAAGATATTTTAACCGGTGTTTCATTTGCGTCGGG
AGGTTCTGGTTACGATCCTTTAACAC*TAAACTCGTGGCAGTAATATCATTAGAAGAGCA
ATTAAAATATTTCGAGGAGTACATAGAGAAAGTGAAGAATATAGTTGGGGAAGAAAGAAA
AGGGTTCATATTAGCCAACAGCTTGTTCTTATTGGTCGCAGGCAGCGACGACATAGCCAA
CACTTACTATGTCCTCCGTGCAAGACCTAACTACGACGCCCATTCGTACACTACTCTTAT
GGCCAACTCTGCCACAGATTTTGTAAATAAACTATACGGATATGGAGTGAGAAGAATAGC
CGTGTTTGGTGCACCGCCACTTGGTTGTGTACCATCACAGAGAACCTTAGGAGGAGGTCT
TTTGAGAGAATGTGCTGAGAATTACAACGAAGCAGCAAAGCTTTTTAATTCAAAGATCTC
CGCAAAATTGGATTTGTTGCATAAAACTCTACCGGGTATCAAACCGGTCTACATTAATAT
CTATGACCCTCTTCTCAATATCATCCAGAGTCCTGCAAAATACGGATTTGAAGTGTCTAA
TAAAGGATGCTGTGGAACTGGACTCGTAGAAGTTGCTGTCCTGTGCAATAAAATCACATC
TTCTGTATGTTCTGACTTGTCTAGCCATGTGTTTTGGGACAGTTATCATCCCACAGAAAA
AACTTACAAAGTGTTAATCTCACTGTTGATTAGCAAATTTATTGATCAGTTTGTCTGAAT
ATAAACTAAAGTTCATTTCGTAGTGATTGATTATATTTCA
CC

QA 1 820 1 820
DS 

RD RS1DL29JQ 813 0 0
AACTCGTGGCAGTAATATCATTAGAAGAGCAATTAAAATATTTCGAGGAGTACATAGAGA
AAGTGAAGAATATAGTTGGGGAAGAAAGAAAAGGGTTCATATTAGCCAACAGCTTGTTCT
TATTGGTCGCAGGCAGCGACGACATAGCCAACACTTACTATGTCCTCCGTGCAAGACCTA
ACTACGACGCCCATTCGTACACTACTCTTATGGCCAACTCTGCCACAGATTTTGTAAATA
AACT*TACGGATATGGAGTGAGAAGAATAGCCGTGTTTGGTGCACCGCCACTTGGTTGTG
TACCATCACAGAGAACCTTAGGAGGAGGTCTTTTGAGAGAATGTGCTGAGAATTACAACG
AAGCAGCAAAGCTTTTTAATTCAAAGATCTCCGCAAAATTGGATTTGTTGCATAAAACTC
TACCGGGTATCAAACCGGTCTACATTAATATCTATGACCCTCTTCTCAATATCATCCAGA
GTCCTGCAAAATACGGATTTGAAGTGTCTAATAAAGGATGCTGTGGAACTGGACTCGTAG
AAGTTGCTGTCCTGTGCAATAAAATCACATCTTCTGTATGTTCTGACTTGTCTAGCCATG
TGTTTTGGGACAGTTATCATCCCACAGGAAAAACTTACAAAGTGTTAATCTCACTGTTGA
TTAGCAAATTTATTGATCAGTTTGTCTGAATATAAACTAAAGTTCATTTCGTAGTGATTG
ATTATATTTCATCATGTTTTGTCTAGCCATGTGTTTTGCTGTTTCGTTGTAATTTGATGT
GATTTGATTTTTAATGGAGTTTTAGATGATTTT

QA 1 813 1 813
DS 



AS 1 6

CO CL1028Contig1 832 6 8 U
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GCAGAGTCTAGCCTTGATCCGTCTAGCTCTTCAACCGTTGTCTCTCTTCTTGAAGACGCT
CTTAAATGCCCCTCTGATAGGTTGCGGAAAGGCCAGGCTCTAAACAATCTTGGGAGTGTC
TATGTGGACTGTGAGAAGCTAGACTTAGCTGCAGATTGTTATATAAACGCTTTGAAAGTG
AGGCACACACGTGCGCACCAGGGTCTAGCTCGTGTCCATTTCCTTAGAAATGATAAAGCT
GCTGCTTATGAAGAAATGACCAGACTAATAGAAAAGGCTCAGAACAATGCATCTGCTTAC
GAGAAAAGATCAGAGTACTGCGACCGTGAGCTGGCCAAGTCTGATCTCGAAATGGTCACG
CGGTTAGACCCTCTCAGGGTTTATCCTTACCGTTACCGAGCCGCAGTGTTGATGGATAGT
CGGAAGGAGGCAGAGGCTATTGAGGAGTTATCACGAGCTATTGCCTTCAAAGCTGATCTC
CATCTACTTCACTTAAGGGCGGCTTTCCACGAGCACAATGGTGATGTTAGTAGTGCGTTG
CGGGACTGTCGTGCGGCTCTCTCGGTTGATCCTAACCATCAAGAGATGCTGGAGCTTCAT
AGCCGTGTTAATAGCCATGAACCTTGAGTGTCAAGAAAGGTTGGAGATGGTGGTAAAGTG
TGAACAAATTTGTATTCATAGTTGTAAACTTGTATTCTCTCGTTACTCTTTTTTATTCTT
TGTTGTTTTTGTTAAATCTATATTATATTTTCAACCTATCAGCGTAAACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 10 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EQ23TF U 1
AF RS1FU88TF U 42
AF RS1FQ15TF U 42
AF RS1FQ15JQ C 63
AF RS1FU88JQ C 267
AF RS1EQ23JQ C 84
BS 1 441 RS1EQ23TF
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BS 443 771 RS1EQ23TF
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BS 817 832 RS1EQ23JQ

RD RS1EQ23TF 771 0 0
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CTTAAATGCCCCTCTGATAGGTTGCGGAAAGGCCAGGCTCTAAACAATCTTGGGAGTGTC
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GCTGCTTATGAAGAAATGACCAGACTAATAGAAAAGGCTCAGAACAATGCATCTGCTTAC
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CGGAAGGAGGCAGAGGCTATTGAGGAGTTATCACGAGCTATTGCCTTCAAAGCTGATCTC
CATCTACTTCACTTAAGGGCGGCTTTCCACGAGCACAATGGTGATGTTAGTAGTGCGTTG
CGGGACTGTCGTGCGGCTCTCTCGGTTGATCCTAACCATCAAGAGATGCTGGAGCTTCAT
AGCCGTGTTAATAGCCATGAACCTTGAGTGTCAAGAAAGGTTGGAGATGGTGGTAAAGTG
TGAACAAATTTGTATTCATAGTTGTAAACTTGTATTCTCTCGTTACTCTTT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RS1FU88TF 689 0 0
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CTCTCTTCTTGAAGACGCTCTTAAATGCCCCTCTGATAGGTTGCGGAAAGGCCAGGCTCT
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TGATCTCGAAATGGTCACGCGGTTAGACCCTCTCAGGGTTTATCCTTACCGTTACCGAGC
CGCAGTGTTGATGGATAGTCGGAAGGAGGCAGAGGCTATTGAGGAGTTATCACGAGCTAT
TGCCTTCAAAGCTGATCTCCATCTACTTCACTTAAGGGCGGCTTTCCACGAGCACAATGG
TGATGTTAGTAGTGCGTTGCGGGACTGTCGTGCGGCTCTCTCGGTTGATCCTAACCATCA
AGAGATGCTGGAGCTTCATAGCCGTGTTAATAGCCATGAACCTTGAGTGTCAAGAAAGGT
*GGAGATGGTGGTAAAGTGTGAACAAATT

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1FQ15TF 763 0 0
CCTCCAAGCTTATGCCTTGGCAGAGTCTAGCCTTGATCCGTCTAGCTCTTCAACCGTTGT
CTCTCTTCTTGAAGACGCTCTTAAATGCCCCTCTGATAGGTTGCGGAAAGGCCAGGCTCT
AAACAATCTTGGGAGTGTCTATGTGGACTGTGAGAAGCTAGACTTAGCTGCAGATTGTTA
TATAAACGCTTTGAAAGTGAGGCACACACGTGCGCACCAGGGTCTAGCTCGTGTCCATTT
CCTTAGAAATGATAAAGCTGCTGCTTATGAAGAAATGACCAGACTAATAGAAAAGGCTCA
GAACAATGCATCTGCTTACGAGAAAAGATCAGAGTACTGCGACCGTGAGCTGGCCAAGTC
TGATCTCGAAATGGTCACGCGGTTAGACCCTCTCAGGGTTTATCCTTACCGTTACCGAGC
CGCAGTGTTGATGGATAGTCGGAAGGAGGCAGAGGCTATTGAGGAGTTATCACGAGCTAT
TGCCTTCAAAGCTGATCTCCATCTACTTCACTTAAGGGCGGCTTTCCACGAGCACAATGG
TGATGTTAGTAGTGCGTTGCGGGACTGTCGTGCGGCTCTCTCGGTTGATCCTAACCATCA
AGAGATGCTGGAGCTTCATAGCCGTGTTAATAGCCATGAACCTTGAGTGTCAAGAAAGGT
TGGAGATGGTGGTAAAGTGTGAACAAATTTGTATTCATAGTTGTAA*CTTGTATTCTCTC
GTTACTCTTTTT*ATTCTTTGTTGTTTT
GTAAATCTATATTAT

QA 1 748 1 748
DS 

RD RS1FQ15JQ 754 0 0
AGAGTCTAGCCTTGATCCGTCTAGCTCTTCAACCGTTGTCTCTCTTCTTGAAGACGCTCT
TAAATGCCCCTCTGATAGGTTGCGGAAAGGCCAGGCTCTAAACAATCTTGGGAGTGTCTA
TGTGGACTGTGAGAAGCTAGACTTAGCTGCAGATTGTTATATAAACGCTTTGAAAGTGAG
GCACACACGTGCGCACCAGGGTCTAGCTCGTGTCCATTTCCTTAGAAATGATAAAGCTGC
TGCTTATGAAGAAATGACCAGACTAATAGAAAAGGCTCAGAACAATGCATCTGCTTACGA
GAAAAGATCAGAGTACTGCGACCGTGAGCTGGCCAAGTCTGATCTCGAAATGGTCACGCG
GTTAGACCCTCTCAGGGTTTATCCTTACCGTTACCGAGCCGCAGTGTTGATGGATAGTCG
GAAGGAGGCAGAGGCTATTGAGGAGTTATCACGAGCTATTGCCTTCAAAGCTGATCTCCA
TTTACTTCACTTAAGGGCGGCTTTCCACGAGCACAATGGTGATGTTAGTAGTGCGTTGCG
GGACTGTCGTGCGGCTCTCTCGGTTGATCCTAACCATCAAGAGATGCTGGAGCTTCATAG
CCGTGTTAATAGCCATGAACCTTGAGTGTCAAGAAAGGTTGGAGATGGTGGTAAAGTGTG
AACAAATTTGTATTCATAGTTGTAAACTTGTATTCTCTCGTTACTCTTTTTTATTCTTTG
TTGTTTTTGTTAAATCTATATTATATTTTCAACC

QA 1 754 1 754
DS 

RD RS1FU88JQ 550 0 0
AGCTCGTGTCCATTTCCTTAGAAATGATAAAGCTGCTGCTTATGAAGAAATGACCAGACT
AATAGAAAAGGCTCAGAACAATGCATCTGCTTACGAGAAAAGATCAGAGTACTGCGACCG
TGAGCTGGCCAAGTCTGATCTCGAAATGGTCACGCGGTTAGACCCTCTCAGGGTTTATCC
TTACCGTTACCGAGCCGCAGTGTTGATGGATAGTCGGAAGGAGGCAGAGGCTATTGAGGA
GTTATCACGAGCTATTGCCTTCAAAGCTGATCTCCATCTACTTCACTTAAGGGCGGCTTT
CCACGAGCACAATGGTGATGTTAGTAGTGCGTTGCGGGACTGTCGTGCGGCTCTCTCGGT
TGATCCTAACCATCAAGAGATGCTGGAGCTTCATAGCCGTGTTAATAGCCATGAACCTTG
AGTGTCAAGAAAGGTTGGAGATGGTGGTAAAGTGTGAACAAATTTGTATTCATAGTTGTA
AACTTGTATTCTCTCGTTACTCTTTTTTATTCTTTGTTGTTTTTGTTAAATCTATATTAT
ATTTTCAACC

QA 1 550 1 550
DS 

RD RS1EQ23JQ 749 0 0
TAGCTCTTCAACCGTTGTCTCTCTTCTTGAAGACGCTCTTAAATGCCCCTCTGATAGGTT
GCGGAAAGGCCAGGCTCTAAACAATCTTGGGAGTGTCTATGTGGACTGTGAGAAGCTAGA
CTTAGCTGCAGATTGTTATATAAACGCTTTGAAAGTGAGGCACACACGTGCGCACCAGGG
TCTAGCTCGTGTCCATTTCCTTAGAAATGATAAAGCTGCTGCTTATGAAGAAATGACCAG
ACTAATAGAAAAGGCTCAGAACAATGCATCTGCTTACGAGAAAAGATCAGAGTACTGCGA
CCGTGAGCTGGCCAAGTCTGATCTCGAAATGGTCACGCGGTTAGACCCTCTCAGGGTTCA
TCCTTACCGTTACCGAGCCGCAGTGTTGATGGATAGTCGGAAGGAGGCAGAGGCTATTGA
GGAGTTATCACGAGCTATTGCCTTCAAAGCTGATCTCCATCTACTTCACTTAAGGGCGGC
TTTCCACGAGCACAATGGTGATGTTAGTAGTGCGTTGCGGGACTGTCGTGCGGCTCTCTC
GGTTGATCCTAACCATCAAGAGATGCTGGAGCTTCATAGCCGTGTTAATAGCCATGAACC
TTGAGTGTCAAGAAAGGTTGGAGATGGTGGTAAAGTGTGAACAAATTTGTATTCATAGTT
GTAAACTTGTATTCTCTCGTTACTCTTTTTTATTCTTTGTTGTTTTTGTTAAATCGATAT
TATATTTTCAACCTATCAGCGTAAACTCC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 6

CO CL1029Contig1 768 6 6 U
CAACCGTTTCAACATATTCTTTGATTTGTATTCTTTTGTGTATCATACAACCAACATTGA
GGGACAAGAACCAACATTAAAA*CCTGCCTGTGATTCTTTTACTAATTTTGCAGGTGAAC
GGAACAGTAGAGGAGCCTAAGCCTACTAAACTTGTCTCTTCTCTTCATCAACTTGTTCCA
TCAACGCCTCTAACTCCGCCTCAGATAAGCTCTCCAACCGTTTCTGCATGACTTGAGACT
CGTAGTCACGAAGCTGCTGAGCATAAGTCATCTCCTTGTTACCGACTCTAAAGATGTAA*
GTCGATATCCAACCTAGTGTCAA*GCCTAGCACCAATATCAGCTGTACAGCATTACCTGC
TTGCAAAGGATCTACTCCCACATACTCAAGTCCGCTCTCTAGCCCGATACCAAGTGCAGT
CACTCCCACTCCTATCAACAGAACATCCTTCCTCGTGTATCCAAACGGCGTCTTCTTGGT
CTTTGTGGCAGAATCTTCTTCAGTTTCAGTAGATGATTCTGAGCTCACTCTACACATCAT
TCTTTGTGTATTGACTCTCCCCTCCACTGATGATGACAATCCATTATATAAGATTTTCTT
CGCAGCTCTGATTCTTCCTGTGATATGTAGCCCAGTGGGACGAATCTGAACCGTTGCCGA
CAGAATCTCTTGGCTTCTGCATATGTTCGAAACTCCGTACGATAGAGAAGCCATGTTTGC
GTGTAACCCAGAAGCGGTGCTTACATGTACAGAGATGAAACACGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BM41TF C 34
AF RS1BM41JQ U 99
AF RS1CU18TF C 34
AF RS1AC30JQ U 34
AF RS1CN91JQ U 1
AF RS1C412TF C 485
BS 1 203 RS1CN91JQ
BS 204 204 RS1BM41JQ
BS 205 363 RS1CN91JQ
BS 364 364 RS1AC30JQ
BS 365 746 RS1CN91JQ
BS 747 768 RS1C412TF

RD RS1BM41TF 334 0 0
TTTTGTGTATCATACAACCAACATTGAGGGACAAGAACCAACATTAAAAACCTGCCTGTG
ATTCTTTTACTAATTTTGCAGGTGAACGGAACAGTAGAGGAGCCTAAGCCTACTAAACTT
GTCTCTTCTCTTCATCAACTTGTTCCATCAACGCCTCTAACTCCGCCTCAGATAAGCTCT
CCAACCGTTTCTGCATGACTTGAGACTCGTAGTCACGAAGCTGCTGAGCATAAGTCATCT
CCTTGTTACCGACTCTAAAGATGTAAAGTCGATATCCAACCTAGTGTCAAAGCCTAGCAC
CAATATCAGCTGTACAGCATTACCTGCTTGCAAA

QA 1 334 1 334
DS 

RD RS1BM41JQ 391 0 0
TTTACTAATTTTGCAGGTGAACGGAACAGTAGAGGAGCCTAAGCCTACTAAACTTGTCTC
TTCTCTTCATCAACTTGTTCCATCAACGCCTCTAACTCCGCCTCAGATAAGCTCTCCAAC
CGTTTCTGCATGACTTGAGACTCGTAGTCACGAAGCTGCTGAGCATAAGTCATCTCCTTG
TTACCGACTCTAAAGATGTAA*GTCGATATCCAACCTAGTGTCAA*GCCTAGCACCAATA
TCAGCTGTACAGCATTACCTGCTTGCAAAGGATCTACTCCCACATACTCAAGTCCGCTCT
CTAGCCCGATACCAAGTGCAGTCACTCCCACTCCTATCAACAGAACATCCTTCCTCGTGT
ATCCAAACGGCGTCTTCTTGGTCTTTGTGGC

QA 1 391 1 391
DS 

RD RS1CU18TF 624 0 0
TTTTGTGTATCATACAACCAACATTGAGGGACAAGAACCAACATTAAAA*CCTGCCTGTG
ATTCTTTTACTAATTTTGCAGGTGAACGGAACAGTAGAGGAGCCTAAGCCTACTAAACTT
GTCTCTTCTCTTCATCAACTTGTTCCATCAACGCCTCTAACTCCGCCTCAGATAAGCTCT
CCAACCGTTTCTGCATGACTTGAGACTCGTAGTCACGAAGCTGCTGAGCATAAGTCATCT
CCTCGTTACCGACTCTAAAGATGTAA*GTCGATATCCAACCTAGTGTCAA*GCCTAGCAC
CAATATCAGCTGTACAGCATTACCTGCTTGCAAAGGATCTACTCCCACATACTCAAGTCC
GCTCTCTAGCCCGATACCAAGTGCAGTCACTCCCACTCCTATCAACAGAACATCCTTCCT
CGTGTATCCAAACGGCGTCTTCTTGGTCTTTGTGGCAGAATCTTCTTCAGTTTCAGTAG*
TGATTCTGAGCTCACTCTACACATCATTCTTTGTGTATTGACTCTCCCCTCCACTGATGA
TGACAATCCATTATATAAGATTTTCTTCGCAGCTCTGATTCTTCCTGTGATATGTAGCCC
AGTGGGACGAATCTGAACCGTTGC

QA 1 624 1 624
DS 

RD RS1AC30JQ 688 0 0
TTTTGTGTATCATACAACCAACATTGAGGGACAAGAACCAACATTAAAA*CCTGCCTGTG
ATTCTTTTACTAATTTTGCAGGTGAACGGAACAGTAGAGGAGCCTAAGCCTACTAAACTT
GTCTCTTCTCTTCATCAACTTGTTCCATCAACGCCTCTAACTCCGCCTCAAATAAGCTCT
CCAACCGTTTCTGCATGACTTGAGACTCGTAGTCACGAAGCTGCTGAGCATAAGTCATCT
CCTTGTTACCGACTCTAAAGATGTAA*GTCGATATCCAACCTAGTGTCAA*GCCTAGCAC
CAATATCAGCTGTACAGCATTACCTGCTTGCAAAGGATCTACTCCCACATACTCAAGTCC
GCTCTCTAGCCCCATACCAAGTGCAGTCACTCCCACTCCTATCAACAGAACATCCTTCCT
CGTGTATCCAAACGGCGTCTTCTTGGTCTTTGTGGCAGAATCTTCTTCAGTTTCAGTAGA
TGATTCTGAGCTCACTCTACACATCATTCTTTGTGTATTGACTCTCCCCTCCACTGATGA
TGACAATCCATTATATAAGATTTTCTTCGCAGCTCTGATTCTTCCTGTGATATGTAGCCC
AGTGGGACGAATCTGAACCGTTGCCGACAGAATCTCTTGGCTTCTGCATATGTTCGAAAC
TCCGTACGATAGAGAAGCCATGTTT
CCC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RS1CN91JQ 746 0 0
CAACCGTTTCAACATATTCTTTGATTTGTATTCTTTTGTGTATCATACAACCAACATTGA
GGGACAAGAACCAACATTAAAA*CCTGCCTGTGATTCTTTTACTAATTTTGCAGGTGAAC
GGAACAGTAGAGGAGCCTAAGCCTACTAAACTTGTCTCTTCTCTTCATCAACTTGTTCCA
TCAACGCCTCTAACTCCGCCTCAAATAAGCTCTCCAACCGTTTCTGCATGACTTGAGACT
CGTAGTCACGAAGCTGCTGAGCATAAGTCATCTCCTTGTTACCGACTCTAAAGATGTAA*
GTCGATATCCAACCTAGTGTCAA*GCCTAGCACCAATATCAGCTGTACAGCATTACCTGC
TTGTAAAGGATCTACTCCCACATACTCAAGTCCGCTCTCTAGCCCGATACCAAGTGCAGT
CACTCCCACTCCTATCAACAGAACATCCTTCCTCGTGTATCCAAACGGCGTCTTCTTGGT
CTTTGTGGCAGAATCTTCTTCAGTTTCAGTAGATGATTCTGAGCTCACTCTACACATCAT
TCTTTGTGTATTGACTCTCCCCTCCACTGATGATGACAATCCATTATATAAGATTTTCTT
CGCAGCTCTGATTCTTCCTGTGATATGTAGCCCAGTGGGACGAATCTGAACCGTTGCCGA
CAGAATCTCTTGGCTTCTGCATATGTTCGAAACTCCGTACGATAGAGAAGCCATGTTTGC
GTGTAACCCAGAAGCGGTGCTTACAT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1C412TF 284 0 0
GTGGCAGAATCTTCTTCAGTTTCAGTAGATGATTCTGAGCTCACTCTACACATCATTCTT
TGTGTATTGACTCTCCCCTCCACTGATGATGACAATCCATTATATAAGATTTTCTTCGCA
GCTCTGATTCTTCCTGTGATATGTAGCCCAGTGGGACGAATCTGAACCGTTGCCGACAGA
ATCTCTTGGCTTCTGCATATGTTCGAAACTCCGTACGATAGAGAAGCCATGTTTGCGTGT
AACCCAGAAGCGGTGCTTACATGTACAGAGATGAAACACGAGCC

QA 1 284 1 284
DS 



AS 1 6

CO CL1030Contig1 801 6 4 U
GGAACAGAAGTATCCAGAAGCAGTGAAGCACTACTCTGAAGCAATCAAAAGGAACCCGAG
GGATGTGAGGGCGTACAGCAACAGAGCTGCTTGTTACACAAAGCTAGGAGCATTACCAGA
GGGATTGAAAGATGCTGAGAAATGCATTGAGCTTGACACAAGTTTCACCAAAGGATACAG
TAGGAAAGGAGCCATTCAGTTTTTCATGAAGGAATATGATAAAGCCATGGAGACGTATCA
AGAAGGACTGAAGCATGATCCTAAGAACCAGGAGTTGCTTGATGGTGTTAGAAGATGTGT
GGAGCAGATAAATAAAGCGAGCCGGGGTGATCTGACTCCGGAAGAAATGAAGGAAAGACA
AGCAAAGGCTATGCAAGATCCAGAAGTTCAGAACATATTGTCTGATCCGGTGATGAGACA
GGTACTGGTTGATTTTCAAGAGAACCCAAAAGCTGCACAAGAGCACATGAAGAACCCAAT
GGTGATGAACAAGATACAGAAGCTGGTTAGTGCTGGTATTGTTCAGGTTCGGTAGAATGG
TTCTGGCAAAATTGGATTCTAAGAAAAATGTATCCAAGTTCCTACCGGGTTGTACTGGTT
AGCTGAGAGTCTGATCTGGTTTGGGTCATGTTTTGTGAGGTCGAATTGTGTTCTCATATT
TTTCTCTTTCTTATTTGTGTTTACCTCCTTTGAATCTTCTATGTGTTCAAGCTTCTAAGT
CTATAAAGCTGTTCCTCCTGTATTATATCCTGGTAAACTTTTCACAGAGGTTTTTAAGTA
TTTTCCGCTCTTATCGTTTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B649TF U 59
AF RS1GC68TF U 1
AF RS1B649JQ C 59
AF RS1EE66TF U 327
AF RS1G416TF U 327
AF RS1AL72TF U 209
BS 1 406 RS1GC68TF
BS 407 407 RS1AL72TF
BS 408 695 RS1GC68TF
BS 696 801 RS1AL72TF

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G
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AGGGATTGAAAGATGCTGAGAAATGCATTGAGCTTGACACAAGTTTCACCAAAGGATACA
GTAGGAAAGGAGCCATTCAGTTTTTCATGAAGGAATATGATAAAGCCATGGAGACGTATC
AAGAAGGACTGAAGCATGATCCTAAGAACCAGGAGTTGCTTGATGGTGTTA

QA 2 232 2 232
DS 

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GGATGTGAGGGCGTACAGCAACAGAGCTGCTTGTTACACAAAGCTAGGAGCATTACCAGA
GGGATTGAAAGATGCTGAGAAATGCATTGAGCTTGACACAAGTTTCACCAAAGGATACAG
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AGAAGGACTGAAGCATGATCCTAAGAACCAGGAGTTGCTTGATGGTGTTAGAAGATGTGT
GGAGCAGATAAATAAAGCGAGCCGGGGTGATCTGACTCCGGAAGAAATGAAGGAAAGACA
AGCAAAGGCTATGCAAGATCCAGAAGTTCAGAACATATTGTCTGATTCGGTGATGAGACA
GGTACTGGTTGATTTTCAAGAGAACCCAAAAGCTGCACAAGAGCACATGAAGAACCCAAT
GGTGATGAACAAGATACAGAAGCTGGTTAGTGCTGGTATTGTTCAGGTTCGGTAGAATGG
TTCTGGCAAAATTGGATTCTAAGAAAAATGTATCCAAGTTCCTACCGGGTTGTACTGGTT
AGCTGAGAGTCTGATCTGGTTTGGGTCATGTTTTGTGAGGTCGAATTGTGTTCTCATATT
TTTCTCTTTCTTATTTGTGTTTACCTCCTTTGAAT

QA 1 695 1 695
DS 

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G
GGGATGTGAGGGCGTACAGCAACAGAGCTGCTTGTTACACAAAGCTAGGAGCATTACCAG
AGGGATTGAAAGATGCTGAGAAATGCATTGAGCTTGACACAAGTTTCACCAAAGGATACA
GTAGGAAAGGAGCCATTCAGTTTTTCATGAAGGAATATGATAAAGCCATGGAGACGTATC
AAGAAGGACTGAAGCATGATCCTAAGAACCAGGAGTTGCTTGATGGTGTTAGAAGATGTG
TGGAGCAGATAAATAAAGCGAGCCGGGGTGATCTGACTCCGGAAGAAATGAAGGAAAGAC
AAGCAAAGGCTATGCAAGATCCAGAAGTTCAGAACATATTGTCTGATCCGGTGATGAGAC
AGGTACTGGTTGATTTTCAAGAGAACCCAAAAGCTGCACAAGAGCACATGAAGAACCCAA
TGGTGATGAACAAGATACAGAAGCTGGTTAGTGCTGGTATTGTTCAGGTTCGGTAGAATG
GTTCTGGCAAAATTGGATTTTAAGAAAAATGTATCCAAGTTCCTACCGGGTTGTACTGGT
TAGCTGAGAGTCTGATCTGGTTTGGGTCATGTTTTGTGAGGTCGAATTGTGTTCTCATAT
TTTTCTCTTTCTTATTTGTGTTTACCTCCTCTGAATCTTCTATGTGTTCAAGCTTCTAAG
TCTATAAAGCCGTTCCTCCTGT
ATTAT

QA 2 683 2 683
DS 

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GTGATCTGACTCCGGAAGAAATGAAGGAAAGACAAGCAAAGGCTATGCAAGATCCAGAAG
TTCAGAACATATTGTCTGATCCGGTGATGAGACAGGTACTGGTTGATTTTCAAGAGAACC
CAAAAGCTGCACAAGAGCACATGAAGAACCCAATGGTGATGAACAAGATACAGAAGCTGG
TTAGTGCTGGTATTGTTCAGGTTCGGTAGAATGGTTCTGGCAAAATTGGATTCTAAGAAA
AATGTATCCAAGTTCCTACCGGGTTGTACTGGTTAGCTGAGAGTCTGATCTAGTTTGGGT
CATGTTTTGTGAGGTCGAATTGTGTTCTCATATTTTTCTCTTTCTTATTTGTGTTTACCT
CCTTTGAATCTTCTATGTGTTCAAGCTTCTAAGTCTATAAAGCTGTTCCTCCTGT

QA 1 415 1 415
DS 

RD RS1G416TF 450 0 0
GTGATCTGACTCCGGAAGAAATGAAGGAAAGACAAGCAAAGGCTATGCAAGATCCAGAAG
TTCAGAACATATTGTCTGATCCGGTGATGAGACAGGTACTGGTTGATTTTCAAGAGAACC
CAAAAGCTGCACAAGAGCACATGAAGAACCCAATGGTGATGAACAAGATACAGAAGCTGG
TTAGTGCTGGTATTGTTCAGGTTCGGTAGAATGGTTCTGGCAAAATTGGATTCTAAGAAA
AATGTATCCAAGTTCCTACCGGGTTGTACTGGTTAGCTGAGAGTCTGATCTGGTTTGGGT
CATGTTTTGTGAGGTCGAATTGTGTTCTCATATTTTTCTCTTTCTTATTTGTGTTTACCT
CCTTTGAATCTTCTATGTGTTCAAGCTTCTAAGTCTATAAAGCTGTTCCTCCTGTATTAT
ATCCTGGTAAACTTTTCACAGAGGTTTTTA

QA 1 450 1 450
DS 

RD RS1AL72TF 593 0 0
G
AGGAATATGATAAAGCCATGGAGACGTATCAAGAAGGACTGAAGCATGATCCTAAGAACC
AGGAGTTGCTTGATGGTGTTAGAAGATGTGTGGAGCAGATAAATAAAGCGAGCCGGGGTG
ATCTGACTCCGGAAGAAATGAAGGAAAGACAAGCAAAGGCTATGCAAGATCCAGAAGTTC
AGAACATATTGTCTGATCCGGTGATGAGACAGGTACTGGTTGATTTTCAAGAGAACCCAA
AAGCTGCACAAGAGCACATGAAGAACCCAATGGTGATGAACAAGATACAGAAGCTGGTTA
GTGCTGGTATTGTTCAGGTTCGGTAGAATGGTTCTGGCAAAATTGGATTCTAAGAAAAAT
GTATCCAAGTTCCTACCGGGTTGTACTGGTTAGCTGAGAGTCTGATCTGGTTTGGGTCAT
GTTTTGTGAGGTCGAATTGTGTTCTCATATTTTTCTCTTTCTTATTTGTGTTTACCTCCT
TTGAATCTTCTATGTGTTCAAGCTTCTAAGTCTATAAAGCTGTTCCTCCTGTATTATATC
CTGGTAAACTTTTCACAGAGGTTTTTAAGTATTTTCCGCTCTTATCGTTTCA

QA 2 593 2 593
DS 



AS 2 6

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GGGTGAAGAAGAAGAAGAAACCATTTACTGAACATGGCGAATTCGGGAGAGAAGGAGAAG
CTGAAGCTCTACTCTTACTGGAGAAGCTCCTGCGCTCATCGTGTCCGTATCGCCCTCTCT
CTCAAAGGGCTTGAGTATGAGTATATACCAGTTAATCTCCTCAAAGGTGAACAATCCGAT
CCAGAATTCAAGAAGATCAATCCAATGGGTACTGTACCAGCCCTTGTTGTTGATGGAGAT
ATTGTCATTTCTGATTCTCTCGCCATCATAATGTATCTAGATGACAAGTATCCTGAACCA
CCTCTCTTACCTCCTGACCTCCACAAACGTGCTGTCAATTTCCAGGCAGCGAGTATTGTC
TTGTCTGGCATACAGCCTCATCAAAACCTCGGTGTTATTAGGTTCATTGAGGAAAAGATC
AATTCGGAGGAGAAAACTGCTTGGGTTACTAATGCTATCACAAAAGGATTCACAGCTCTC
GAGAAACTGTTGGTGAGCTGCGCTGGCAAACACGCAACTGGTGATGAAGTTTACTTGGCT
GATCTCTTTCTAGCACCACAGATCTACGGAGCTATCGACAGGTTCCAGATTAACATGGAA
CCGTACCCGACCCTTGCAAAGTGTTACCAGTCATACAAAGATCTTCCCGCGTTTCAAAAC
GCAGCCCCAGAGAAGCAGCCAGATGCTCCTGCTTCCACCAGCTGATCCTGTGAACCGGTC
TCAGTTCAATAAAACCTCACAGAACAACAACAACAACAACGATGATGACAATACCTTGTA
CACACAATATATATATACATGGATGTATCATATGAACCAGTTCACTTCTTAGTCCCTCTA
CTTGTATTATACAATAAAGATCACAGACATTCGAAGTCGCAAACATATTTATATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CT76TF U 1
AF RS1CT76JQ C 267
BS 1 733 RS1CT76TF
BS 734 734 RS1CT76JQ
BS 735 746 RS1CT76TF
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BS 787 896 RS1CT76JQ

RD RS1CT76TF 790 0 0
GGGTGAAGAAGAAGAAGAAACCATTTACTGAACATGGCGAATTCGGGAGAGAAGGAGAAG
CTGAAGCTCTACTCTTACTGGAGAAGCTCCTGCGCTCATCGTGTCCGTATCGCCCTCTCT
CTCAAAGGGCTTGAGTATGAGTATATACCAGTTAATCTCCTCAAAGGTGAACAATCCGAT
CCAGAATTCAAGAAGATCAATCCAATGGGTACTGTACCAGCCCTTGTTGTTGATGGAGAT
ATTGTCATTTCTGATTCTCTCGCCATCATAATGTATCTAGATGACAAGTATCCTGAACCA
CCTCTCTTACCTCCTGACCTCCACAAACGTGCTGTCAATTTCCAGGCAGCGAGTATTGTC
TTGTCTGGCATACAGCCTCATCAAAACCTCGGTGTTATTAGGTTCATTGAGGAAAAGATC
AATTCGGAGGAGAAAACTGCTTGGGTTACTAATGCTATCACAAAAGGATTCACAGCTCTC
GAGAAACTGTTGGTGAGCTGCGCTGGCAAACACGCAACTGGTGATGAAGTTTACTTGGCT
GATCTCTTTCTAGCACCACAGATCTACGGAGCTATCGACAGGTTCCAGATTAACATGGAA
CCGTACCCGACCCTTGCAAAGTGTTACCAGTCATACAAAGATCTTCCCGCGTTTCAAAAC
GCAGCCCCAGAGAAGCAGCCAGATGCTCCTGCTTCCACCAGCTGATCCTGTGAACCGGTC
TCAGTTCAATAAA*CCTCACAGAACA*CAACAACAACAACGATGATGACA*TACCTTGTA
CACACA
TATA

QA 1 786 1 786
DS 

RD RS1CT76JQ 630 0 0
CATA
ATGTATCTAGATGACAAGTATCCTGAACCACCTCTCTTACCTCCTGACCTCCACAAACGT
GCTGTCAATTTCCAGGCAGCGAGTATTGTCTTGTCTGGCATACAGCCTCATCAAAACCTC
GGTGTTATTAGGTTCATTGAGGAAAAGATCAATTCGGAGGAGAAAACTGCTTGGGTTACT
AATGCTATCACAAAAGGATTCACAGCTCTCGAGAAACTGTTGGTGAGCTGCGCTGGCAAA
CACGCAACTGGTGATGAAGTTTACTTGGCTGATCTCTTTCTAGCACCACAGATCTACGGA
GCTATCGACAGGTTCCAGATTAACATGGAACCGTACCCGACCCTTGCAAAGTGTTACCAG
TCATACAAGGATCTTCCCGCGTTTCAAAACGCAGCCCCAGAGAAGCAGCCAGATGCTCCT
GCTTCCACCAGCTGATCCTGTGAACCGGTCTCAGTTCAATAAAACCTCACAGAACAACAA
CAACAACAACGATGATGACAATACCTTGTACACACAATATATATATACATGGATGTATCA
TATGAACCAGTTCACTTCTTAGTCCCTCTACTTGTATTATACAATAAAGATCACAGACAT
TCGAAGTCGCAAACATATTTATATAT

QA 5 630 5 630
DS 



CO CL1031Contig2 900 4 10 U
AATACATTAATAAATATGTTTGCGACTTCCAAAGTCTGTGATCTTTATTATTGTATAATA
CCAAGTAGATGGACTAAGAAGTGAACTGGTTCATATGATACAATCTATATATATGTGTGT
ACAAGGTATTATCATCATCGTTGTTGTAGTCGTCTGTGAGGTTTTATTGAACTGAAACCG
GTTCACAGGATCAGCTGGTGGAAGCAGGAGCATCTGGCTGCTTCTCTGGTGCCGCGTTTT
GAAACGCAGGAAGATCCTTGTATGACTGGTAACACTTTGCAAGGGTCGGGTACGGTTCCA
TGTTAACCTGGAACCTGTTGATAGCTCCATAGATCTGTGGTGCTAGAAAGAGACCAGCCA
AGTAGACTTCATCACCAGTTGCGTGTTTGCCAGCGCAGCTCACCAACAGTTTCTCGAGAG
CAGTGAATCCTTTTGTGATAGCATTAGTAACCCAAGCAGTTTTCTCCTCAGAATTTATCT
TTTCCTCGATGAACCTAATAACACCCAGGTTTTGATGAGGCTGTATGCCAGACAAAACAA
TACTCGCTGCCTGGAAGTTCACAGCACGTTTGTGGAGGTCAGGAGGTAAGAGAGGTGGTT
CAGGATACTTCTCATCCAGACACATAATGATGGCAAGAGAATCAGAAATGACAATATCTC
CATCAACAACAAGGGCTGGTACAGTACCCATTGG*ATTGATCTTCTTGAACTCTGGATCG
GATTGTTCACCCTTGAGCAGATTAACTGGTATATACTCATACTCAAGCCCTTTGAGAGAG
AGGGCGATACGGACACGATGAGCGCAGGAGCCTCTCCAGTAGGAGTAGAGCTTCAACTTC
TCCTTCTCTTCTCCCGAATTCGCCATGTTCAGTAAATGGTTTCTTCTTCTTCTTCACCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RS1F486JQ U 1
AF RS1EY20JQ U 87
AF RS1F486TF C 161
AF RS1EY20TF C 261
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BS 308 715 RS1F486JQ
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BS 717 731 RS1F486JQ
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BS 733 736 RS1F486JQ
BS 737 764 RS1EY20JQ
BS 765 895 RS1F486TF
BS 896 900 RS1EY20TF

RD RS1F486JQ 736 0 0
AATACATTAATAAATATGTTTGCGACTTCCAAAGTCTGTGATCTTTATTATTGTATAATA
CCAAGTAGATGGACTAAGAAGTGAACTGGTTCATATGATACAATCTATATATATGTGTGT
ACAAGGTATTATCATCATCGTTGTTGTAGTCGTCTGTGAGGTTTTATTGAACTGAAACCG
GTTCACAGGATCAGCTGGTGGAAGCAGGAGCATCTGGCTGCTTCTCTGGTGCCGCGTTTT
GAAACGCAGGAAGATCCTTGTATGACTGGTAACACTTTGCAAGGGTCGGGTACGGTTCCA
TGTTAATCTGGAACCTGTTGATAGCTCCATAGATCTGTGGTGCTAGAAAGAGACCAGCCA
AGTAGACTTCATCACCAGTTGCGTGTTTGCCAGCGCAGCTCACCAACAGTTTCTCGAGAG
CAGTGAATCCTTTTGTGATAGCATTAGTAACCCAAGCAGTTTTCTCCTCAGAATTTATCT
TTTCCTCGATGAACCTAATAACACCCAGGTTTTGATGAGGCTGTATGCCAGACAAAACAA
TACTCGCTGCCTGGAAGTTCACAGCACGTTTGTGGAGGTCAGGAGGTAAGAGAGGTGGTT
CAGGATACTTCTCATCCAGACACATAATGATGGCAAGAGAATCAGAAATGACAATATCTC
CATCAACAACAAGGGCTGGTACAGTACCCATTGG*ATTGATCTTCTTGAACTCTGTATCG
GATTGTTCACCTTTGA

QA 1 736 1 736
DS 

RD RS1EY20JQ 678 0 0
ATATGATACAATCTATATA
TATATATATGTGTGTACAAGGTATTATCATCATCGTTGTTGTAGTCGTCTGTGAGGTTTT
ATTGAACTGAAACCGGTTCACAGGATCAGCTGGTGGAAGCAGGAGCATCTGGCTGCTTCT
CTGGTGCCGCGTTTTGAAACGCAGGAAGAACCTTGTATGACTGGTAACACTTTGCAAGGG
TCGGGTACGGTTCCATGTTAACCTGGAACCTGTTGATAGCTCCATAGATCTGTGGTGCTA
GAAAGAGATCAGCCAAGTAGACTTCATCACCAGTTGCGTGTTTGCCAGCGCAGCTCACCA
ACAGTTTCTCGAGAGCAGTGAATCCTTTTGTGATAGCATTAGTAACCCAAGCAGTTTTCT
CCTCAAAATTTATCTTTTTCTCGATGAACCTAATAACACCCAGGTTTTGATGAGGCTGTA
TGCCAAACAAAACAATACTCGCTGCCTGGAAGTTCACAGCACGTTTGTGGAGGTCAGGAG
GTAAAAGAGGTGGTTCAGGATACTTCTCATCCAGATACATAATGATGGCAAGAGAATCAG
AAATGACAATATCTCCATCAACAACAAGGGCTGGTACAGTACCCATTGGGATTGATCTTC
TTGAACTCTGGATCGGATTGTTCACCCTTGAGCAGATTAACTGGTATATACTCATACTC

QA 20 678 20 678
DS 

RD RS1F486TF 737 0 0
GGTTTTA
TGAACTGAAACCTGTTCACAGGATCAGCTGGTGGAAGCAGGAGCATCTGGCTGCTTCTCT
GGTGCCGCGTTTTGAAACGCAGGAAGATCCTTGTATGACTGGTAACACTTTGCAAGGGTC
GGGTACGGTTCCATGTTAATCTGGAACCTGTTGATAGCTCCATAGATCTGTGGTGCTAGA
AAGAGACCAGCCAAGTAGACTTCATCACCAGTTGCGTGTTTGCCAGCGCAGCTCACCAAC
AGTTTCTCGAGAGCAGTGAATCCTTTTGTGATAGCATTAGTAACCCAAGCAGTTTTCTCC
TCAGAATTTATCTTTTCCTCGATGAACCTAATAACACCCAGGTTTTGATGAGGCTGTATG
CCAGACAAAACAATACTCGCTGCCTGGAAGTTCACAGCACGTTTGTGGAGGTCAGGAGGT
AAGAGAGGTGGTTCAGGATACTTCTCATCCAGACACATAATGATGGCAAGAGAATCAGAA
ATGACAATATCTCCATCAACAACAAGGGCTGGTACAGTACCCATTGG*ATTGATCTTCTT
GAACTCTGTATCGGATTGTTCACCTTTGAGCAGATTAACTGGTATATACTCATACTCAAG
CCCTTTGAGAGAGAGGGCGATACGGACACGATGAGCGCAGGAGCCTCTCCAGTAGGAGTA
GAGCTTCAACTTCTCCTTCTCTTCTCCCGAATTCGCCATGTTCAGTAAATGGTTTCTTCT
TCTTCTTC
CC

QA 8 735 8 735
DS 

RD RS1EY20TF 640 0 0
TATGACTGGTAACACTTTGCAAGGGTCGGGTACGGTTCCATGTTAACCTGGAACCTGTTG
ATAGCTCCATAGATCTGTGGTGCTAGAAAGAGATCAGCCAAGTAGACTTCATCACCAGTT
GCGTGTTTGCCAGCGCAGCTCACCAACAGTTTCTCGAGAGCAGTGAATCCTTTTGTGATA
GCATTAGTAACCCAAGCAGTTTTCTCCTCAGAATTTATCTTTTCCTCGATGAACCTAATA
ACACCCAGGTTTTGATGAGGCTGTATGCCAGACAAAACAATACTCGCTGCCTGGAAGTTC
ACAGCACGTTTGTGGAGGTCAGGAGGTAAGAGAGGTGGTTCAGGATACTTCTCATCCAGA
TACATAATGATGGCAAGAGAATCAGAAATGACAATATCTCCATCAACAACAAGGGCTGGT
ACAGTACCCATTGG*ATTGATCTTCTTGAACTCTGGATCGGATTGTTCACCCTTGAGCAG
ATTAACTGGTATATACTCATACTCAAGCCCTTTGAGAGAGAGGGCGATACGGACACGATG
AGCGCAGGAGCTTCTCCAGTAGGGGTAGAGCTTCAACTTCTCCTTCTCTTCTCCCGAATT
CGCCATGTTCAGTAAATGGTTTCTTCTTCTTCTTCACCCC

QA 1 640 1 640
DS 



AS 2 6

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GCTGAAAAGCCAAGGATATATAAAAATATTTAGTCTTTAATTATAAAGGAGTGAGCTTAG
AGATACAAAGCCTCTCCTCTGATTCAATTATTTCATTCCTCTTTATAAAGAAGAGTTTAT
ATATATGGGAGGGGATAAAGTAAAACAGTCAAAGCCAAACAGACGTCAAGAAGAAGCAAG
AAGTGAAGCCACTTCTCTCCGGAGGAATGTGGGCAGTGCGAAAGCTGCTCTGTGCATATC
AGAGTTATAAAACTTCATTTCTCGTTTATAGGTCATGGCACCGTCTAGTTTCTCAATAGG
GTTGATAGGGTTCTTGAAATCAACAGCAGGTCCTTCGGTAGAGCACAAGACAAAGCCAAT
CACGCCGCTAGGATATGTTGGGACGCTGCTCCACGCGTACTGAACGTTTTCGAATGTCTG
GCGGCAAATGGAGATCATGTCTTCGATAAGATGAGTATGGAGCCACATACTTTCAGCCAT
GTTGCAAAGAATACCACCAGGCTTCAACGCTCTAGCTAACGTTTCAAAGAAAGGCTTCTC
AACAAGCGCCTGAGCAGGACCAACAGGATCTGAAGAATCGACAATAATGGCATCATATTT
CCCTGCAGGGGACTTACGAAGGAACTCAACAGCATCACCAATGTGAAGTTGAACACGAGG
GTCTTCAAATCCAACAGCTAACTCGGGAAAGAACTTCTTAGACACATCTATAACCATCTT
GTCTATCTCACAAATGTCAATAACCTCAACAGAGCTATGGCGAGAAATCTCCCTGAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G250JQ U 20
AF RS1H381JQB U 20
AF RS1G250TF C 20
AF RS1CW29JQ U 1
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BS 414 414 RS1G250JQ
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AT
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ATTCAATTATTTCATTCCTCTTTATAAAGAAGAGTTTATATATATGGGAGGGGATAAAGT
AAAACAGTCAAAGCCAAACAGACGTCAAGAAGAAGCAAGAAGTGAAGCCACTTCTCTCCG
GAGGAATGTGGGCAGTGCGAAAGCTGCTCTGTGCATATCAGAGTTATAAAACTTCATTTC
TCGTTTATAGGTCATGGCACCGTCTAGTTTCTCAATAGGGTTGATAGGGTTCTTGAAATC
AACAGCAGGTCCTTCGGTAGAGCACAAGACAAAGCCAATCACGCCGCTAGGATATGTTGG
GACGCTGCTCCACGCGTACTGAACGTTTTCGAATGTCTGGCGGCAAATGGAGATCATGTC
TTCGATAAGATGAGTATGGAGCC
C

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DS 

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AA
AAAAATATTTAGTCTTTAATTATAAAGGAGTGAGCTTAAAGATACAAAGCCTCTCCTCTG
ATTCAATTATTTCATTCCTCTTTATAAAGAAAAGTTTATATATAAGGGAGGGGATAAAGT
AAAACAGTCAAAGCCAAACAGACGTCAAGAAAAAGCAAGAAGTGAAGCCCCTTCTCTCCG
GAGGAATGTGGGCAGTGCGAAAGCTGCTCTGTGCATATCAAAATTATAAAACTTCATTTC
TCGTTTATAGGTCATGGCACCGTCTAGTTTCTCAATAGGGTTGATAGGGTTCTTGAAATC
AACAGCAGGTCCTTCGGTAAAGCACAAAACAAAGCCAATCACGCCGCTAGGATATGTTGG
GACGCTGCTCCACGCGTACTGAACGTTTTCGAATGTCTGGCGGCAAATGGAAATCATGTC
TT

QA 3 424 3 424
DS 

RD RS1G250TF 446 0 0
AT
AAAAATATTTAGTCTTTAATTATAAAGGAGTGAGCTTAGAGATACAAAGCCTCTCCTCTG
ATTCAATTATTTCATTCCTCTTTATAAAGAAGAGTTTATATATATGGGAGGGGATAAAGT
AAAACAGTCAAAGCCAAACAGACGTCAAGAAGAAGCAAGAAGTGAAGCCACTTCTCTCCG
GAGGAATGTGGGCAGTGCGAAAGCTGCTCTGTGCATATCAGAGTTATAAAACTTCATTTC
TCGTTTATAGGTCATGGCACCGTCTAGTTTCTCAATAGGGTTGATAGGGTTCTTGAAATC
AACAGCAGGTCCTTCGGTAGAGCACAAGACAAAGCCAATCACGCCGCTAGGATATGTTGG
GACGCTGCTCCACGCGTACTGAACGTTTTCGAATGTCTGGCGGCAAATGGAGATCATGTC
TTCGATAAGATGAGTATGGAGCC
C

QA 3 445 3 445
DS 

RD RS1CW29JQ 778 0 0
GCTGAAAAGCCAAGGATATATAAAAATATTTAGTCTTTAATTATAAAGGAGTGAGCTTAG
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ATATGAGGGAGGGGATAAAGTAAAACAGTCAAAGCCAAACAGACGTCAAGAAGAAGCAAG
AAGTGAAGCCACTTCTCTCCGGAGGAATGTGGGCAGTGCGAAAGCTGCTCTGTGCATATC
AGAGTTATAAAACTTCATTTCTCGTTTATAGGTCATGGCACCGTCTAGTTTCTCAATAGG
GTTGATAGGGTTCTTGAAATCAACAGCAGGTCCTTCGGTAGAGCACAAGACAAAGCCAAT
CACGCCGCTAGGATATGTTGGGACGCTGCTCCACGCGTACTGAACGTTTTCGACTGTCTG
GCGGCAAATGGAGATCATGTCTTCGATAAGATGAGTATGGAGCCACATACTTTCAGCCAT
GTTGCAAAGAATACCACCAGGCTTCAACGCTCTAGCTAACGTTTCAAAGAAAGGCTTCTC
AACAAGCGCCTGAGCAGGACCAACAGGATCTGAAGAATCGACAATAATGGCATCATATTT
CCCTGCAGGGGACTTACGAAGGAACTCAACAGCATCACCAATGTGAAGTTGAACACGAGG
GTCTTCAAATCCAACAGCTAACTCGGGAAAGAACTTCTTAGACACATCTATAACCATCTT
GTCTATCTCACAAATGTCAATAACCTCAACAGAGCTATGGCGAGAAATCTCCCTGAGA

QA 1 778 1 778
DS 



CO CL1032Contig2 950 2 2 U
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GAGAGAGAAGTGAGAAGAAACGCAAAGATTCAAAAGAGAACCAGACTTCTCTCACTGTTT
CATCTTCTCAAATCACCTTTTAGCTCCCGATTCGTTTCTCACTCTTCTTTGCCGTTAACC
ACAAGTAAACAGAGGCTGGAGCTGGGGAAGAAAAGGATTGTCTATGGAGGGAGACGGCGT
AAAAGGTTTGGGATGCCAGAAGACTATGGATGGGAAGGCGAGTAACAACGGGAACAAGGC
TGTACCTTCTTGTTGCCTCAAGGCCATGGCTTGCTTACCTGAGGAAGATGCTAAGTGCCA
CTCCACTGTTGTTTCTGGATGGTTCTCCGAACCTCACTCTCGCTCTGGGAAAAAAGGGGA
AGCTGTCTATTTCAATAACCCTATGTGGCCTGGTGAAGCACACTCACTGAAAGTTGAGAA
AGTTCTTTTCAAGGACAAGTCAGAGTATCAGGAAGTCCTAGTGTTTGAGTCAGCTACCTA
CGGGAAAGTGCTTGTTCTAGATGGTATTGTACAGCTGACTGAAAAAGACGAATTCGCATA
TCAGGAGATGAGTGCCCATCTTCCTCTTTGCTCTACTCCTTCTCCTAAAAATGTCCTAGT
TGTTGGTGGAGGTGATGGTGGTGTTCTCAGGGAGATTTCTCGCCATAGCTCTGTTGAGGT
TATTGACATTTGTGAGATAGACAAGATGGTTATAGATGTGTCTAAGAAGTTCTTTCCCGA
GTTAGCTGTTGGATTTGAAGACCCTCGTGTTCAACTTCACATTGGTGATGCTGTTGAGTT
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GGTCTGCTCAGCGCTTGTTGAGAGCCTTTCTTTGAACGTTAGCTAGAGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H381TF U 1
AF RS1CW29TF U 169
BS 1 573 RS1H381TF
BS 574 950 RS1CW29TF

RD RS1H381TF 573 0 0
GGGGGCGTGGAGGGTTCTTCTAGAAAACACAAATACGCAGAGAAAGGAAGGAGCCCCTGA
GAGAGAGAAGTGAGAAGAAACGCAAAGATTCAAAAGAGAACCAGACTTCTCTCACTGTTT
CATCTTCTCAAATCACCTTTTAGCTCCCGATTCGTTTCTCACTCTTCTTTGCCGTTAACC
ACAAGTAAACAGAGGCTGGAGCTGGGGAAGAAAAGGATTGTCTATGGAGGGAGACGGCGT
AAAAGGTTTGGGATGCCAGAAGACTATGGATGGGAAGGCGAGTAACAACGGGAACAAGGC
TGTACCTTCTTGTTGCCTCAAGGCCATGGCTTGCTTACCTGAGGAAGATGCTAAGTGCCA
CTCCACTGTTGTTTCTGGATGGTTCTCCGAACCTCACTCTCGCTCTGGGAAAAAAGGGGA
AGCTGTCTATTTCAATAACCCTATGTGGCCTGGTGAAGCACACTCACTGAAAGTTGAGAA
AGTTCTTTTCAAGGACAAGTCAGAGTATCAGGAAGTCCTAGTGTTTGAGTCAGCTACCTA
CGGGAAAGTGCTTGTTCTAGATGGTATTGTACA

QA 1 573 1 573
DS 

RD RS1CW29TF 782 0 0
GG
GCCGTTAACCACAAGTAAACAGAGGCTGGAGCTGGGGAAGAAAAGGATTGTCTATGGAGG
GAGACGGCGTAAAAGGTTTGGGATGCCAGAAGACTATGGATGGGATGGCGAGTAACAACG
GGAACAAGGCTGTACCTTCTTGTTGCCTCAAGGCCATGGCTTGCTTACCTGAGGAAGATG
CTAAGTGCCACTCCACTGTTGTTTCTGGATGGTTCTCCGAACCTCACTCTCGCTCTGGGA
AAAAAGGGGAAGCTGTCTATTTCAATAACCCTATGTGGCCTGGTGAAGCACACTCACTGA
AAGTTGAGAAAGTTCTTTTCAAGGACAAGTCAGAGTATCAGGAAGTCCTAGTGTTTGAGT
CAGCTACCTACGGGAAAGTGCTTGTTCTAGATGGTATTGTACAGCTGACTGAAAAAGACG
AATTCGCATATCAGGAGATGAGTGCCCATCTTCCTCTTTGCTCTACTCCTTCTCCTAAAA
ATGTCCTAGTTGTTGGTGGAGGTGATGGTGGTGTTCTCAGGGAGATTTCTCGCCATAGCT
CTGTTGAGGTTATTGACATTTGTGAGATAGACAAGATGGTTATAGATGTGTCTAAGAAGT
TCTTTCCCGAGTTAGCTGTTGGATTTGAAGACCCTCGTGTTCAACTTCACATTGGTGATG
CTGTTGAGTTCCTTCGTAAGTCCCCTGCAGGAAATATGATGCCATTATTGTCGATTCTTC
AGATCCTGTTGGTCTGCTCAGCGCTTGTTGAGAGCCTTTCTTTGAACGTTAGCTAGAGCG

QA 3 782 3 782
DS 



AS 1 6

CO CL1033Contig1 796 6 14 U
GCAAGAAGTTCCAGAATGTGTCAAAAGAAGGACTGAAGGTTGGAAAGGATTCGAAAGTGA
AGGAGCTGAAAGAAGCTTTCAAGGAGCTAACCAAGTGGTGGAAAGAGAGTCTCGCTAGCG
AGAACGTGGACGATGTTAAAATCAGTAACCGATTGGCCGACACTCCCTGTGTAGTTGTGA
CGTCCAAGTTTGGATGGAGTGCAAATATGGAGAGGATCATGCAGTCCCAAACTCTCTCCG
ATGCAAACAAGCAAGCTTACATGCGAGGAAAGCGAGTCCTTGAGATCAACCCACGACACC
CAATCATCAAAGAACTCAAGGAAAGAGTTGCTAGCGACCCAGAGGATGAGAGTGTGAAAG
AAACAGCACAGCTCATGTACCAGACAGCTTTGATCGAGAGTGGATTCATACTCAACGACC
CAAAGGACTTTGCAGGCCGTATCTACAACTCCGTCAAGAGCAGCCTGAAGATCAGCCCTG
ATGCCGTAGCCGAAGAGGAAGTCGAGGCAGAGGAGACAGAGACCAGTGAGGAAGCTACTG
AGACAAAATCAGATGACTTGCCTGGTGGTCTAAACATTGAAGCCGAACCTGTTGAGGAAG
AGACACCAACCAAGGACGAACTGTAGATTTCACTTCTGATGTTTTTCTTTGTGTTTC*TC
TACTGTCTTAGTTAAAAACAGAACATCGTGTTTCACTCGTACTTCTTTCCAAGATTAGTT
TTTACTATATGGTTTTTGATGAATTATGTAATAGCAGCACAACTTTGATTCTAGATCATT
GCTAAATGAGTGCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DC57TF U 1
AF RS1FG41TF U 29
AF RS1D027JQ C 245
AF RS1D027TF U 245
AF RS1DH29TF U 314
AF RS1FG41JQ C 138
BS 1 44 RS1DC57TF
BS 45 45 RS1FG41TF
BS 46 244 RS1DC57TF
BS 245 245 RS1FG41TF
BS 246 250 RS1DC57TF
BS 251 252 RS1FG41TF
BS 253 657 RS1DC57TF
BS 658 658 RS1FG41TF
BS 659 672 RS1DC57TF
BS 673 677 RS1FG41TF
BS 678 678 RS1DH29TF
BS 679 708 RS1FG41TF
BS 709 777 RS1DH29TF
BS 778 796 RS1FG41JQ

RD RS1DC57TF 672 0 0
GCAAGAAGTTCCAGAATGTGTCAAAAGAAGGACTGAAGGTTGGATAGGATTCGAAAGTGA
AGGAGCTGAAAGAAGCTTTCAAGGAGCTAACCAAGTGGTGGAAAGAGAGTCTCGCTAGCG
AGAACGTGGACGATGTTAAAATCAGTAACCGATTGGCCGACACTCCCTGTGTAGTTGTGA
CGTCCAAGTTTGGATGGAGTGCAAATATGGAGAGGATCATGCAGTCCCAAACTCTCTCCG
ATGCGAACAATTAAGCTTACATGCGAGGAAAGCGAGTCCTTGAGATCAACCCACGACACC
CAATCATCAAAGAACTCAAGGAAAGAGTTGCTAGCGACCCAGAGGATGAGAGTGTGAAAG
AAACAGCACAGCTCATGTACCAGACAGCTTTGATCGAGAGTGGATTCATACTCAACGACC
CAAAGGACTTTGCAGGCCGTATCTACAACTCCGTCAAGAGCAGCCTGAAGATCAGCCCTG
ATGCCGTAGCCGAAGAGGAAGTCGAGGCAGAGGAGACAGAGACCAGTGAGGAAGCTACTG
AGACAAAATCAGATGACTTGCCTGGTGGTCTAAACATTGAAGCCGAACCTGTTGAGGAAG
AGACACCAACCAAGGACGAACTGTAGATTTCACTTCTGATGTTTTTCTTTGTGTTTCCTC
TACTGTCTTAGT

QA 1 672 1 672
DS 

RD RS1FG41TF 680 0 0
G
GGACTGAAGGTTGGAAAGGATTCGAAAGTGAAGGAGCTGAAAGAAGCTTTCAAGGAGCTA
ACCAAGTGGTGGAAAGAGAGTCTCGCTATCGAGAACGTGGACGATGTTAAAATCAGTAAC
CGATTGGCCGACACTCCCTGTGTAGTTGTGACGTCCAAGTTTGGATGGAGTGCAAATATG
GAGAGGATCATGCAGTCCCAAACTCTCTCCGATGCAAACAAGCAAGCTTACATGCGAGGA
AAGCGAGTCCTTGAGATCGACCCACGACACCCAATCATCAAAGAACTCAAGGAAAGAGTT
GCTAGCGACCCAGAGGATGAGAGTGTGAAAGAAACAGCACAGCTCATGTACCAGACAGCT
TTGATCGAGAGTGGATTCATACTCAACGACCCAAAGGACTTTGCAGGCCGTATCTACAAC
TCCGTCAAGAGCAGCCTGAAGATCAGCCCTGATGCCGTAGCCGGAGAGGAAGTCGAGGCA
GAGGAGACAGAGACCAGTGAGGAAGCTACTGAGACAAAATCAGATGACTTGCCTGGTGGT
CTAAACATTGAAGCCGAACCTGTTGAGGAAGAGACACCAACCAAGGACGAACCGTAGATT
TCACTTCTGATGTTTTTCTTTGTGTTTC*TCTACTGTCTTAGTTAAAA*CAGAACATCGT
GTTTCACTCGTACTTCTTT

QA 2 680 2 680
DS 

RD RS1D027JQ 476 0 0
AGG
CAAGCAAGCTTACATGCGAGGAAAGCGAGTCCTTGAGATCAACCCACGACACCCAATCAT
CAAAGAACTCAAGGAAAGAGTTGCTAGCGACCCAGAGGATGAGAGTGTGAAAGAAACAGC
ACAGCTCATGTACCAGACAGCTTTGATCGAGAGTGGATTCATACTCAACGACCCAAAGGA
CTTTGCAGGCCGTATCTACAACTCCGTCAAGAGCAGCCTGAAGATCAGCCCTGATGCCGT
AGCCGAAGAGGAAGTCGAGGCAGAGGAGACAGAGACCAGTGAGGAAGCTACTGAGACCAA
ATCAGATGACTTGCCTGGTGGTCTAAACATTGAAGCCGAACCTGTTGAGGAAGAGACACC
AACCAAGGACGAACTGTAGATTTCACTTCTGATGTTTTTCTTTGTGTTTC*TCTACTGTC
TTAGTTAAAAACAGAACATCGTGTTTCACTCGTACTTCTTTCCAAGATTAGTT

QA 4 476 4 476
DS 

RD RS1D027TF 476 0 0
AGG
CAAGCAAGCTTACATGCGAGGAAAGCGAGTCCTTGAGATCAACCCACGACACCCAATCAT
CAAAGAACTCAAGGAAAGAGTTGCTAGCGACCCAGAGGATGAGAGTGTGAAAGAAACAGC
ACAGCTCATGTACCAGACAGCTTTGATCGAGAGTGGATTCATACTCAACGACCCAAAGGA
CTTTGCAGGCCGTATCTACAACTCCGTCAAGAGCAGCCTGAAGATCAGCCCTGATGCCGT
AGCCGAAGAGGAAGTCGAGGCAGAGGAGACAGAGACCAGTGAGGAAGCTACTGAGACCAA
ATCAGATGACTTGCCTGGTGGTCTAAACATTGAAGCCGAACCTGTTGAGGAAGAGACACC
AACCAAGGACGAACTGTAGATTTCACTTCTGATGTTTTTCTTTGTGTTTC*TCTACTGTC
TTAGTTAAAAACAGAACATCGTGTTTCACTCGTACTTCTTTCCAAGATTAGTT

QA 4 476 4 476
DS 

RD RS1DH29TF 465 0 0
G
CTCAAGGAAAGAGTTGCTAGCGACCCAGAGGATGAGAGTGTGAAAGAAACAGCACAGCTC
ATGTACCAGACAGCTTTGATCGAGAGTGGATTCATACTCAACGACCCAAAGGACTTTGCA
GGCCGTATCTACAACTCCGTCAAGAGCAGCCTGAAGATCAGCCCTGATGCCGTAGCCGAA
GAGGAAGTCGAGGCAGAGGAGACAGAGACCAGTGAGGAAGCTACTGAGACCAAATCAGAT
GACTTGCCTGGTGGTCTAAACATTGAAGCCGAACCTGTTGAGGAAGAGACACCAACCAAG
GACGAACTGTAGATTTCACTTCTGATGTTTTTCTTTGTGTTTC*TCTACTGTCTTAGTTA
AAAACAGAACATCGTGTTTCACTCGTACTTCTTTCCAAGATTAGTTTTTACTATATGGTT
TTTGATGAATTATGTAATAGCAGCACAACTTTGATTCTAGATC
C

QA 2 464 2 464
DS 

RD RS1FG41JQ 659 0 0
AAAATCAGTAACCGATTGGCCGACACTCCCTGTGTAGTTGTGACGTCCAAGTTTGGATGG
AGTGCAAATATGGAGAGGATCATGCAGTCCCAAACTCTCTCCGATGCAAACAAGCAAGCT
TACATGCGAGGAAAGCGAGTCCTTGAGATCGACCCACGACACCCAATCATCAAAGAACTC
AAGGAAAGAGTTGCTAGCGACCCAGAGGATGAGAGTGTGAAAGAAACAGCACAGCTCATG
TACCAGACAGCTTTGATCGAGAGTGGATTCATACTCAACGACCCAAAGGACTTTGCAGGC
CGTATTTACAACTCCGTCAAGAGCAGCCTGAAGATCAGCCCTGATGCCGTAGCCGGAGAG
GAAGTCGAGGCAGAGGAGACAGAGACCAGTGAGGAAGCTACTGAGACAAAATCAGATGAC
TTGCCTGGTGGTCTAAACATTGAAGCCGAACCTGTTGAGGAAGAGACACCAACCAAGGAC
GAACCGTAGATTTCACTTCTGATGTTTTTCTTTGTGTTTC*TCTACTGTCTTAGTTAAAA
ACAGAACATCGTGTTTCACTCGTACTTCTTTCCAAGATTAGTTTTTACTATATGGTTTTT
GATGAATTATGTAATAGCAGCACAACTTTGATTCTAGATCATTGCTAAATGAGTGCATC

QA 1 659 1 659
DS 



AS 2 6

CO CL1034Contig1 752 3 2 U
GCCACGCCTATGATCAGTATCCTCAAGGACATCATCAACAACATGAAGTCTCGTGACAGT
GATAGTGACATCGAGAACAACAACAGTAATGGGAATAGTAAAGGGTTTAAGACGAAGAAA
GCTTATTTCTACTGGGTGACTAGAGAGCAAGGCTCGTTTGAGTGGTTTAAGGGGATAATG
GACGAGGTTTCGGAGCTGGACGAGGAAGGAGTGATCGAGCTACACAACTATTGCACGAGT
GTGTACGAGGAAGGAGATGCTAGGGTTGCTCTTATTGCTATGCTTCAGTCGTTGCAACAC
GCTAAGAACGGTGTTGATGTCGTCTCGGGGACACGGGTTAAGTCCCACTTCGCTAAACCT
AACTGGAGACAAGTGTACAAGAGGATCGCTGTTCAGCATCCCGACAAAGGAATCGGAGTC
TTCTATTGTGGGGCACCAGGACTGACAAGGGACCTGAAAAATCTAGCTTTGGATTTCTCT
CGAAAGACGAGCACCAAGTTTGACTTCCACAAAGAGAACTTCTAAATTCCAATTTATATC
AATTGGGAGGAAGTTGCGTAGAGAATAAAACAAGAAACTGCATATAAATTTTCTTTTATA
AAAAATATTTGAGTTGTATTCCTTCGTTTCTTCTTTCCTACTTTTTGTTCAGTTTTACGG
AATTTAGTCTATTGCCGAATTAAATATAAAATCGCAGAAGTATAGTTGCAGATTTGCTGA
TTTGGTATTTTGACATGTAATATGGAGTCATG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AC87JQ C 1
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AACTGGAGACAAGTGTACAAGAGGATCGCTGTTCAGCATCCCGACAAAGGAATCGGAGTC
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AATTGGGAGGAAGTTGCGTAGAGAATAAAACAAGAAACTGCATATAAATTTTCTTTTATA
AAAAATATTTGAGTTGTATTCCTTCGTTTCTTCTTTCCTACTTTTTGTTCAGTTTTACGG
AATTTAGTCTATTGCCGAATTAAATATAAAATCGCA

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ATCCCGACAAAAGAATCGGAGTCTTCTATTGTGGGGCACCAGGACTGACAAAGGACCTGA
AAAATCTAGCTTTGGATTTCTCTCGAAAGACGAGCACCAAGTTTGACTTCCACAAAGAGA
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CTACTTTTTGTTCAGTTTTACGGAATTTAGTCTATTGCCGAATTAA*TATAAA*TCGCAG
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QA 1 535 1 535
DS 



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BQ
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25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EE39JQ U 1
AF RS1CR81JQ U 1
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CCA

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AGAAAATTTATATGCAGTTTCCTGTTTTATTCTCTACGCAACTTCCTCCCAATTGATATA
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DS 

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ACTATACTTCTGCGATTTTATATTTAATTCGGCAATAGACTAAATTCCGTAAAACTGAAC
AAAAAGTAGGAAAGAAGAAACGAAGGAATACAACTCAAATATTTTTTATAAAAGAAAATT
TATATGCAGTTTCCTGTTTTATTCTCTACGCAACTTCCTCCCAATTGATATAAATTGGAA
TTTGGAAGTTCTCTTTGTGGAAGTCAAACTTGGTGCTCGTCTTTCGAGAGAAATCCAAAG
CTAGATTTTTCAGGTCCTTTGTCAGTC

QA 9 335 9 335
DS 



AS 2 6

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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D626JQ C 1
AF RS1D626TF U 1
AF RS1AW83TF U 10
AF RS1AW83JQ C 19
BS 1 1 RS1D626JQ
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RD RS1D626JQ 590 0 0
GCATCGCTTTGTCACCGGCCTTCCGCCGCCGTTCTCCCTCCGTCCTCACACGGGCTCAAA
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AAGCTCAAGGACTACGTCGCCGTGTGGAAAGGGAAACGGATATCAGCTAATCTTCCTTAC
AAGGTCGAGTTCTTGAAAGAGGTTGAAGGTCGTGGTCCTGTTAAGTTCGTTGCTCATCTC
AAGGAAGACGAGTTCGAGTTCATCGATACTTGATGATGAAAAACAACAAAGGCACATTCT
TTCTTTCTCTCACTCTCTGTTGTTCTTGTGTTTACTGAAAAAACTTGGGAGTGGAGAATG
ATTTGTATGTACTGAGAATATACTGATGTATTTGTATGTATACCTTTAGC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RS1D626TF 590 0 0
G
CATCGCTTTGTCACCGGCCTTCCGCCGCCGTTCTCCCTCCGTCCTCACACGGGCTCAAAT
CTTGCATCGTCTCCCCTCTCGCCTCTCAATCTCGAATCAAACGAACCAGCTCGAGAAGAG
CTTCCACGATGACGGTTCGATGCGACGTAGCTGTGTCAGTGAACGCAGAGGAGGCCGAGC
TTTCGGAAGAAGAGATCGAAGCGAAAGGAAAGGTGGGATCTTTGGTCAGAGTGACTGCGC
CGCTGAAGGTTTACCACGTGAACCGAGTCCCGGAGATTGATTTGGAAGGTATGGAAGGTA
AGCTCAAGGACTACGTCGCCGTGTGGAAAGGGAAACGGATATCAGCTAATCTTCCTTACA
AGGTCGAGTTCTTGAAAGAGGTTGAAGGTCGTGGTCCTGTTAAGTTCGTTGCTCATCTCA
AGGAAGACGAGTTCGAGTTCATCGATACTTGATGATGAAAAACAACAAAGGCACATTCTT
TCTTTCTCTCACTCTCTGTTGTTCTTGTGTTTACTGAAAAAACTTGGGAGTGGAGAATGA
TTTGTATGTACTGAGAATATACTGATGTATTTGTATGTATACCTTTAGC

QA 2 590 2 590
DS 

RD RS1AW83TF 611 0 0
GCACCGGCCTTC
TCCGCCGCCGTTCTCCCTCCGTCCTCACACGGGCTCAAATCTTGCATCGTCTCCCCTCTC
GCCTCTCAATCTCGAATCAAACGAACCAGCTCGAGAAGAGCTTCCACGATGACGGTTCGA
TGCGACGTAGCTGTGTCAGTGAACGCAGAGGAGGCCGAGCTTTCGGAAGAAGAGATCGAA
GCGAAAGGAAAGGTGGGATCTTTGGTCAGAGTGACTGCGCCGCTGAAGGTTTACCACGTG
AACCGAGTCCCGGAGATTGATTTGGAAGGTATGGAAGGTAAGCTCAAGGACTACGTCGCC
GTGTGGAAAGGGAAACGGATATCAGCTAATCTTCCTTACAAGGTCGAGTTCTTGAAAGAG
GTTGAAGGTCGTGGTCCTGTTAAGTTCGTTGCTCATCTCAAGGAAGACGAGTTCGAGTTC
ATCGATACTTGATGATGAAAAACAACAAAGGCACATTCTTTCTTTCTCTCACTCTCTGTT
GTTCTTGTGTTTACTGAAAAAACTTGGGAGTGGAGAATGATTTGTATGTACTGAGAATAT
ACTGATGTATGTGTATGTATACCTTTAGCAATCGTATACATAATCAGCTCTTC
ATCCCC

QA 13 605 13 605
DS 

RD RS1AW83JQ 602 0 0
TTC
TCCGCCGCCGTTCTCCCTCCGTCCTCACACGGGCTCAAATCTTGCATCGTCTCCCCTCTC
GCCTCTCAATCTCGAATCAAACGAACCAGCTCGAGAAGAGCTTCCACGATGACGGTTCGA
TGCGACGTAGCTGTGTCAGTGAACGCAGAGGAGGCCGAGCTTTCGGAAGAAGAGATCGAA
GCGAAAGGAAAGGTGGGATCTTTGGTCAGAGTGACTGCGCCGCTGAAGGTTTACCACGTG
AACCGAGTCCCGGAGATTGATTTGGAAGGTATGGAAGGTAAGCTCAAGGACTACGTCGCC
GTGTGGAAAGGGAAACGGATATCAGCTAATCTTCCTTACAAGGTCGAGTTCTTGAAAGAG
GTTGAAGGTCGTGGTCCTGTTAAGTTCGTTGCTCATCTCAAGGAAGACGAGTTCGAGTTC
ATCGATACTTGATGATGAAAAACAACAAAGGCACATTCTTTCTTTCTCTCACTCTCTGTT
GTTCTTGTGTTTACTGAAAAAACTTGGGAGTGGAGAATGATTTGTATGTACTGAGAATAT
ACTGATGTATGTGTATGTATACCTTTAGCAATCGTATACATAATCAGCTCTTCATCCCC

QA 4 602 4 602
DS 



CO CL1035Contig2 707 2 2 U
TTTTTTCCGACAGATTGATTCCACTTTCCCAAATCTTCTACCAAACACACATATTCTCCT
CTCTCGGCGGCACTCAGGTATGAGTAGCCCCATCGCTTTTTCACCGGCCTTCTCCGCCGC
CGTTCTCCCTCCGTCCTCACACGGGCTCAAATCTTGCATCGTCTCGCCTCTCGCCTCTCA
ATCTCGAATCAAACGAACCAGCTCGAGAAGAGCTTCCACGATGACGGTTCGATGCGACGT
AGCTGTGTCAGTGAACGCAGAGGAGGCCGAGCTTTCGGAAGAAGAGATCGAAGCGAAAGG
AAAGGTGGGATCTTTGGTCAGAGTGACTGCGCCGCTGAAGGTTTACCACGTGAACCGCGT
CCCGGAGATTGATTTGGAAGGGATGGAAGGTAAGCTCAAGGACTACGTCGCCGTGTGGAA
AGGGAAAAGAATATCAGCTAATCTTCCTTACAGGGTCGAGTTCTTCAAAGAGGTTGAAGG
TCGTGGTCCTGTTAAGTTCGTCGCTCATCTCAAAGAAGACGAGTTCGAGTTCATCGAACC
ATGATGATGAAAAACAACAAAAGGCAACATTGTTTCCTTCTCTCACTCTCTGTTGTTCTT
TTGTTTTACTGAAAAACTTGGGAGTGGAGAATGATTTGTATGTACTGAGAATATACTGAT
GTATGTGTATGTATACCTTTAGCAATCATATACATAATCAGCTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DO03TF U 1
AF RS1DO03JQ C 412
BS 1 685 RS1DO03TF
BS 686 707 RS1DO03JQ

RD RS1DO03TF 685 0 0
TTTTTTCCGACAGATTGATTCCACTTTCCCAAATCTTCTACCAAACACACATATTCTCCT
CTCTCGGCGGCACTCAGGTATGAGTAGCCCCATCGCTTTTTCACCGGCCTTCTCCGCCGC
CGTTCTCCCTCCGTCCTCACACGGGCTCAAATCTTGCATCGTCTCGCCTCTCGCCTCTCA
ATCTCGAATCAAACGAACCAGCTCGAGAAGAGCTTCCACGATGACGGTTCGATGCGACGT
AGCTGTGTCAGTGAACGCAGAGGAGGCCGAGCTTTCGGAAGAAGAGATCGAAGCGAAAGG
AAAGGTGGGATCTTTGGTCAGAGTGACTGCGCCGCTGAAGGTTTACCACGTGAACCGCGT
CCCGGAGATTGATTTGGAAGGGATGGAAGGTAAGCTCAAGGACTACGTCGCCGTGTGGAA
AGGGAAAAGAATATCAGCTAATCTTCCTTACAGGGTCGAGTTCTTCAAAGAGGTTGAAGG
TCGTGGTCCTGTTAAGTTCGTCGCTCATCTCAAAGAAGACGAGTTCGAGTTCATCGAACC
ATGATGATGAAAAACAACAAAAGGCAACATTGTTTCCTTCTCTCACTCTCTGTTGTTCTT
TTGTTTTACTGAAAAACTTGGGAGTGGAGAATGATTTGTATGTACTGAGAATATACTGAT
GTATGTGTATGTATACCTTTAGCAA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RS1DO03JQ 296 0 0
CGTGTGGAAAGGGAAAAGAATATCAGCTAATCTTCCTTACAGGGTCGAGTTCTTCAAAGA
GGTTGAAGGTCGTGGTCCTGTTAAGTTCGTCGCTCATCTCAAAGAAGACGAGTTCGAGTT
CATCGAACCATGATGATGAAAAACAACAAAAGGCAACATTGTTTCCTTCTCTCACTCTTT
GTTGTTCTTTTGTTTTACTGAAAAACTTGGGAGTGGAGAATGATTTGTATGTACTGAGAA
TATACTGATGTATGTGTATGTATACCTTTAGCAATCATATACATAATCAGCTCTTC

QA 1 296 1 296
DS 



AS 1 6

CO CL1036Contig1 725 6 5 U
GGACCACGCGCTCGAGGGAATCGAAGAAACAACGACACCAGCGAACTAAATTAGAAGAAA
AAAACAATGGCGGATCAGCTTACCGATGACCAGATCTCCGAGTTCAAGGAAGCCTTCAGC
CTATTCGACAAGGACGGAGATGGCTGCATCACGACAAAGGAGCTGGGGACGGTGATGAGA
TCGCTTGGGCAAAACCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAGGTTGACGCA
GACGGGAACGGGACAATAGATTTCCCGGAGTTTCTGAACCTCATGGCCCGCAAGATGAAA
GACACTGATTCGGAGGAAGAGCTTAAAGAAGCCTTCAGGGTTTTCGACAAGGACCAGAAC
GGTTTCATCTCCGCGGCCGAGCTCCGCCACGTCATGACAAATCTCGGGGAGAAGCTGACC
GACGAGGAGGTGGATGAGATGATCCGTGAGGCTGACGTGGATGGTGATGGTCAGATCAAC
TATGATGAGTTCGTCAAAGTTATGATGGCAAAGTGAAAAAAAGTACAGATTTGGTTCGTG
ACTTTTTTATTATTATTCCGTAACTCTGCTTCTCTAAATTGCTTCTTCTGTATTCGGTTC
GTGACTTTTATTATAACTCTGCTTATCGTTTTATTTCGTGCTCGTCCTTCTTGCAATCTC
CTTATGTGATTAGTCTTGTATGACTCTGAATCCAACAATGTTGTAGAGCCATTAGTATTA
CTCGT


BQ
30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 

AF RS1BK77JQ C 1
AF RS1BK77TF U 1
AF RS1FH40JQ C 1
AF RS1FH40TF U 1
AF RS1AQ25JQ C -3
AF RS1AQ25TFB U -3
BS 1 408 RS1BK77TF
BS 409 409 RS1FH40TF
BS 410 632 RS1BK77TF
BS 633 656 RS1FH40TF
BS 657 725 RS1AQ25TFB

RD RS1BK77JQ 558 0 0
GGACCACGCGCTCGAGGGAATCGAAGAAACAACGACACCAGCGAACTAAATTAGAAGAAA
AAAACAATGGCGGATCAGCTTACCGATGACCAGATCTCCGAGTTCAAGGAAGCCTTCAGC
CTATTCGACAAGGACGGAGATGGCTGCATCACGACAAAGGAGCTGGGGACGGTGATGAGA
TCGCTTGGGCAAAACCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAGGTTGACGCA
GACGGGAACGGGACAATAGATTTCCCGGAGTTTCTGAACCTCATGGCCCGCAAGATGAAA
GACACTGATTCGGAGGAAGAGCTTAAAGAAGCCTTCAGGGTTTTCGACAAGGACCAGAAC
GGTTTCATCTCCGCGGCCGAGCTCCGCCACGTCATGACAAATCTCGGG*AGAAGCTGACC
GACGAGGAGGTGGATGAGATGATCCGTGAGGCTGACGTGGATGGTGATGGTCAGTTCAAC
TATGATGAGTTCGTCAAAGTTATGATGGCAAAGTGAAAAAAAGTACAGATTTGGTTCGTG
ACTTTTTTATTATTATTC

QA 1 558 1 558
DS 

RD RS1BK77TF 632 0 0
GGACCACGCGCTCGAGGGAATCGAAGAAACAACGACACCAGCGAACTAAATTAGAAGAAA
AAAACAATGGCGGATCAGCTTACCGATGACCAGATCTCCGAGTTCAAGGAAGCCTTCAGC
CTATTCGACAAGGACGGAGATGGCTGCATCACGACAAAGGAGCTGGGGACGGTGATGAGA
TCGCTTGGGCAAAACCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAGGTTGACGCA
GACGGGAACGGGACAATAGATTTCCCGGAGTTTCTGAACCTCATGGCCCGCAAGATGAAA
GACACTGATTCGGAGGAAGAGCTTAAAGAAGCCTTCAGGGTTTTCGACAAGGACCAGAAC
GGTTTCATCTCCGCGGCCGAGCTCCGCCACGTCATGACAAATCTCGGG*AGAAGCTGACC
GACGAGGAGGTGGATGAGATGATCCGTGAGGCTGACGTGGATGGTGATGGTCAGATCAAC
TATGATGAGTTCGTCAAAGTTATGATGGCAAAGTGAAAAAAAGTACAGATTTGGTTCGTG
ACTTTTTTATTATTATTCCGTAACTCTGCTTCTCTAAATTGCTTCTTCTGTATTCGGTTC
GTGACTTTTATTATAACTCTGCTTATCGTTTT

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1FH40JQ 654 0 0
GGACCACGCGCTCGAGGGAATCGAAGAAACAACGACACCAGCGAACTAAATTAGAAGAAA
AAAACAATGGCGGATCAGCTTACCGATGACCAGATCTCCGAGTTCAAGGAAGCCTTCAGC
CTATTCGACAAGGACGGAGATGGCTGCATCACGACAAAGGAGCTGGGGACGGTGATGAGA
TCGCTTGGGCAAAACCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAGGTTGACGCA
GACGGGAACGGGACAATAGATTTCCCGGAGTTTCTGAACCTCATGGCCCGCAAGATGAAA
GACACTGATTCGGAGGAAGTGCTTAAAGAAGCCTTCAGGGTTTTCGACAAGGACCAGAAC
GGTTTCATCTCCGCGGCCGAGCTCCGCCACGTCATGACAAATCTCGGGGAGAAGCTGACC
GACGAGGAGGTGGATGAGATGATCCGTGAGGCTGACGTGGATGGTGATGGTCAGATCAAC
TATGATGAGTTCGTCAAAGTTATGATGGCAAAGTGAAAAAAAGTACAGATTTGGTTCGTG
ACTTTTTTATTATTATTCCGTAACTCTGCTTCTCTAAATTGCTTCTTCTGTATTCGGTTC
GTGACTTTTATTATAACTCTGCTTATCGTTTTATTTCGTGCTCGTCCTTCTTGC

QA 1 654 1 654
DS 

RD RS1FH40TF 662 0 0
GGACCACGCGCTCGAGGGAATCGAAGAAACAACGACACCAGCGAACTAAATTAGAAGAAA
AAAACAATGGCGGATCAGCTTACCGATGACCAGATCTCCGAGTTCAAGGAAGCCTTCAGC
CTATTCGACAAGGACGGAGATGGCTGCATCACGACAAAGGAGCTGGGGACGGTGATGAGA
TCGCTTGGGCAAAACCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACGAGGTTGACGCA
GACGGGAACGGGACAATAGATTTCCCGGAGTTTCTGAACCTCATGGCCCGCAAGATGAAA
GACACTGATTCGGAGGAAGTGCTTAAAGAAGCCTTCAGGGTTTTCGACAAGGACCAGAAC
GGTTTCATCTCCGCGGCCGAGCTCCGCCACGTCATGACAAATCTCGGGGAGAAGCTGACC
GACGAGGAGGTGGATGAGATGATCCGTGAGGCTGACGTGGATGGTGATGGTCAGATCAAC
TATGATGAGTTCGTCAAAGTTATGATGGCAAAGTGAAAAAAAGTACAGATTTGGTTCGTG
ACTTTTTTATTATTATTCCGTAACTCTGCTTCTCTAAATTGCTTCTTCTGTATTCGGTTC
GTGACTTTTATTATAACTCTGCTTATCGTTTTATTTCGTGCTCGTCCTTCTTGCAA
AAAAAA

QA 1 656 1 656
DS 

RD RS1AQ25JQ 729 0 0
GGATCC
ACCACGCGCTCGAGGGAATCGAAGAAACAACGACACCAGCGAACTAAATTAGAAGAAAAA
AACAATGGCGGATCAGCTTACCGATGACCAGATCTCCGAGTTCAAGGAAGCCTTCAGCCT
ATTCGACAAGGACGGAGATGGCTGCATCACGACAAAGGAGCTGGGGACGGTGATGAGATC
GCTTGGGCAAAACCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACG**GTTGACGCAGA
CGGGAACGGGACAATAGATTTCCCGGAGTTTCTGAACCTCATGGCCCGCAAGATGAAAGA
CACTGATTCGGAGGAAGAGCTTAAAGAACCCTTCAGGGTTTTCGACAAGGACCAGAACGG
TTTCATCTCCGCGGCCGAGCTCCGCCACGTCATGACAAATCTCGGGGAGAAGCTGACCGA
CGAGGAGGTGGATGAGATGATCCGTGAGGCTGACGTGGATGGTGATGGTCAGATCAACTA
TGATGAGTTCGTCAAAGTTATGATGGCAAAGTGAAAAAAAGTACAGATTTGGTTCGTGAC
TTTTTTATTATTATTCCGTAACTCTGCTTCTCTAAATTGCTTCTTCTGTATTCGGTTCGT
GACTTTTATTATAACTCTGCTTATCGTTTTATTTCGTGCTCGTCCTTCTTGCAATCTCCT
TATGTGATTAGTCTTGTATGACTCTGAATCCAACAATGTTGTAGAGCCATTAGTATTACT
CGT

QA 7 729 7 729
DS 

RD RS1AQ25TFB 729 0 0
GGATCC
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AACAATGGCGGATCAGCTTACCGATGACCAGATCTCCGAGTTCAAGGAAGCCTTCAGCCT
ATTCGACAAGGACGGAGATGGCTGCATCACGACAAAGGAGCTGGGGACGGTGATGAGATC
GCTTGGGCAAAACCCGACAGAAGCCGAGCTCCAAGACATGATCAACG**GTTGACGCAGA
CGGGAACGGGACAATAGATTTCCCGGAGTTTCTGAACCTCATGGCCCGCAAGATGAAAGA
CACTGATTCGGAGGAAGAGCTTAAAGAACCCTTCAGGGTTTTCGACAAGGACCAGAACGG
TTTCATCTCCGCGGCCGAGCTCCGCCACGTCATGACAAATCTCGGGGAGAAGCTGACCGA
CGAGGAGGTGGATGAGATGATCCGTGAGGCTGACGTGGATGGTGATGGTCAGATCAACTA
TGATGAGTTCGTCAAAGTTATGATGGCAAAGTGAAAAAAAGTACAGATTTGGTTCGTGAC
TTTTTTATTATTATTCCGTAACTCTGCTTCTCTAAATTGCTTCTTCTGTATTCGGTTCGT
GACTTTTATTATAACTCTGCTTATCGTTTTATTTCGTGCTCGTCCTTCTTGCAATCTCCT
TATGTGATTAGTCTTGTATGACTCTGAATCCAACAATGTTGTAGAGCCATTAGTATTACT
CGT

QA 7 729 7 729
DS 



AS 1 6

CO CL1037Contig1 1169 6 6 U
GGACGTAAACATTGGATTTTCACACTTCAGGACATAAAATAAAAAGCTCTCAAGTAAGAA
ACAAAACAACACAGGTGAATTGTCTGAGTAGCACAAACACACAAGAAACTCCTTTTTTTT
CTTTAGTACTGATCAAAATCTGGATACAGAGTTGAGAATCAAACAGCAACAAAATAAATG
GCCTTACGAGCTCTTCGATACTTCCTTGAAGATGCGAGGGAGAATCTCATGTGCACCGAT
ATCTAGACCTTGAGGCTCCCTGCATAATGTCTGCCCCTTTTCTTTCGAGCTAGGAATGAA
CCAAACATTTCGAATAGATGGAGATTCAAACTGAACAAAGATTCCGTCGTTTTGTCCGAG
CTTCCACTTCCTCGAGCCTTGACCTTTCCACACCTGCGGGTAAGATATACTACTCTTTGA
TGTCACCAGGAAAGCAGCTTTGGAAAAGGACTCTTCTGCGTATTGCCTCAGATATGTGAA
GCAGTTACTGTGTGTGTG**GTGACTCAAAAGCCTTATCGATGTTGACTACTGGTGCGTA
CTTATCGGTTTGTGTTTTCTCT**TTGTCAAGAAGGAAATAGACTCTACTATCCACTTTA
GATGTCTCGTGCCACGACTTGACAGCTGTTTCCATGGTCTCAACAAGAAAAGAAAA*CAT
CTCTTTCCAACACTCTTCAGCTCCATAGTTTGCAGACAGTTCAGATTTAAAGCTGTCAAG
ATGCTTGGCCATGTTGACATTAGACCTCAAGTTCTCGAGTTCTTGAGCTCGCTGTTTCTC
CTTCTGCAGCTGACCGAGCCTCTTGATCTTTCTTGAGACTTCTGCGCTTTGTGGGTTGTA
CTGTAGAGCCATTTCAAATGCAGCCAAGGAATCATCATATTTCTCCATGGCTTCAAGCAC
AGAACCTTTCCTGAAGTACCCCTTCTCCCATTGCGGGTTGAGTTTGATGGTTGTCTCAGC
ATCAGCCAAGGCTTTGCTAAGCTTAACGAGACTCAAGAAGGCAGCAGCTCGGTTACTGTA
AAGAGTAGCGTTAGAAGGATCGAGCTTGATGGCCTGAGTGTAGAGAGCTGCGGCTTTTAG
GTAGTTCCCAGCTTTGAAGAACTCGTTCCCTTTCTCCTTTAGAGATTTCTCACCTGTTTC
CACTCCTTTCTCCGCCATCGCCAATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1F255JQ U 90
AF RS1F255TF C 115
AF RS1DA52JQ U 21
AF RS1E222JQ U 1
AF RS1DA52TF C 539
AF RS1E222TF C 609
BS 1 374 RS1E222JQ
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BS 1003 1003 RS1E222TF
BS 1004 1169 RS1DA52TF

RD RS1F255JQ 380 0 0
G
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GTTGAGAATCAAACAGCAACAAAATAAATGGCCTTACGAGCTCTTCGATACTTCCTTGAA
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CTGCCCCTTTTCTTTCGAGCTAGGAATGAACCAAACATTTCGAATAGATGGAGATTCAAA
CTGAACAAAGATTCCGTCGTTTTGTCCGAGCTTCCACTTCCTCGAGCCTTGACCTTTCCA
CACCTGCGGGTAAAATATACTACTCTTTGATGTCACCAGGAAAGCAGCTTTGGAAAAGGA
CTCTTCTGCGTATTGCCTC

QA 2 380 2 380
DS 

RD RS1F255TF 641 0 0
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TAAATGGCCTTACGAGCTCTTCGATACTTCCTTGAAGATGCGAGGGAGAATCTCATGTGC
ACCGATATCTAGACCTTGAGGCTCCCTGCATAATGTCTGCCCCTTTTCTTTCGAGCTAGG
AATGAACCAAACATTTCGAATAGATGGAGATTCAAACTGAACAAAGATTCCGTCGTTTTG
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CTTTGATGTCACCAGGAAAGCAGCTTTGGAAAAGGACTCTTCTGCGTATTGCCTCAGATA
TGTGAAGCAGTCACTGTGTGTGTG**GTGACTCAAAAGCCTTATCGATGTTGACTACTGG
TGCGTACTTATCGGTTTGTGTTTTCTCT**TTGTCAAGAAGGAAATAGACTCTACTATCC
ACTTTAGATGTCTCGTGCCACGACTTGACAGCTGTTTCCATGGTCTCAACAAGAAAAGAA
AA*CATCTCTTTCCAACACTCTTCAGCTCCATAGTTTGCAGACAGTTCAGATTTAAAGCT
GTCAAGATGCTTGGCCATGTTGACATTAGACCTCAAGTTC
C

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1DA52JQ 718 0 0
CG
CACTTCAGGACATAAAATAAAAAGCTCTCAAGTAAGAAACAAAACAACACAGGTGAATTG
TCTGAGTAGCACAAACACACAAGAAACTCCTTTTTTTTCTTTAGTACTGATCAAAATCTG
GATACAGAGTTGAGAATCAAACAGCAACAAAATAAATGGCATTACGAGCTCTTCGATACT
TCCTTGAAGATGCGAGGGAGAATCTCATGTGCACCGATATCTAGACCTTGAGGCTCCCTG
CATAATGTCTGCCCCTTTTCTTTCGAGCTAGGAATGAACCAAACATTTCGAATAGATGGA
GATTCAAACTGAACAAAGATTCCGTCGTTTTGTCCGAGCTTCCACTTCCTCGAGCCTTGA
CCTTTCCACACCTGCGGGTAAGATATACTACTCTTTGATGTCACCAGGAAAGCAGCTTTG
GAAAAGGACTCTTCTGCGTATTGCCTCAGATATGTGAAGCAGTTACTGTGTGTGTGTGGT
GACTCAAAAGCCTTATCGATGTTGACTACTGGTGCGTACTTATCGGTTTGTGTTTTCTCT
**TTGTCAAGAAGGAAATAGACTCTACTATCCACTTTAGATGTCTCGTGCCACGACTTGA
CAGCTGTTTCCATGGTCTCAACAAGAAAAGAAAA*CATCTCTTTCCAACACTCTTCAGCT
CCATAGTTTGCAGACAGTTCAGATTTAAAGCTGTCAAGATGCTTGGCCATGTTGAC

QA 3 718 3 718
DS 

RD RS1E222JQ 792 0 0
GGACGTAAACATTGGATTTTCACACTTCAGGACATAAAATAAAAAGCTCTCAAGTAAGAA
ACAAAACAACACAGGTGAATTGTCTGAGTAGCACAAACACACAAGAAACTCCTTTTTTTT
CTTTAGTACTGATCAAAATCTGGATACAGAGTTGAGAATCAAACAGCAACAAAATAAATG
GCCTTACGAGCTCTTCGATACTTCCTTGAAGATGCGAGGGAGAATCTCATGTGCACCGAT
ATCTAGACCTTGAGGCTCCCTGCATAATGTCTGCCCCTTTTCTTTCGAGCTAGGAATGAA
CCAAACATTTCGAATAGATGGAGATTCAAACTGAACAAAGATTCCGTCGTTTTGTCCGAG
CTTCCACTTCCTCGGGCCTTGACCTTTCCACACCTGCGGGTAAGATATACTACTCTTTGA
TGTCACCAGGAAAGCAGCTTTGGAAAAGGACTCTTCTGCGTATTGCCTCAGATATGTGAA
GCAGTTACTGTGTGTGTG**GTGACTCAAAAGCCTTATCGATGTTGACTACTGGTGCGTA
CTTATCGGTTTGTGTTTTCTCT**TTGTCAAGAAGGAAATAGACTCTACTATCCACTTTA
GATGTCTCGTGCCACGACTTGACAGCTGTTTCCATGGTCTCAACAAGAAAAGAAAA*CAT
CTCTTTCCAACACTCTTCAGCTCCATAGTTTGCAGACAGTTCAGATTTAAAGCTGTCAAG
ATGCTTGGCCATGTTGACATTAGACCTCAAGTTCTCGAGTTCTTGAGCTCGCTGTTTCTC
CTTCTGCAGCTG

QA 1 792 1 792
DS 

RD RS1DA52TF 631 0 0
TACTTATCGGTTTGTGTTTTCTCTCTTTGTCAAGAAGGAAATAGACTCTACTATCCACTT
TAGATGTCTCGTGCCACGACTTGACAGCTGTTTCCATGGTCTCAACAAGAAAAGAAAA*C
ATCTCTTTCCAACACTCTTCAGCTCCATAGTTTGCAGACAGTTCAGATTTAAAGCTGTCA
AGATGCTTGGCCATGTTGACATTAGACCTCAAGTTCTCGAGTTCTTGAGCTCGCTGTTTC
TCCTTCTGCAGCTGACCGAGCCTCTTGATCTTTCTTGAGACTTCTGCGCTTTGTGGGTTG
TACTGTAGAGCCATTTCAAATGCAGCCAAGGAATCATCATATTTCTCCATGGCTTCAAGC
ACAGAACCTTTCCTGAAGTACCCCTTCTCCCATTGCGGGTTGAGTTTGATGGTTGTCTCA
GCATCAGCCAAGGCTTTGCTAAGCTTAACGAGACTCAAGAAGGCGGCAGCTCGGTTACTG
TAAAGAGTAGCGTTAGAAGGATCGAGCTTGATGGCCTGAGTGTAGAGAGCTGCGGCTTTT
AGGTAGTTCCCAGCTTTGAAGAACTCGTTCCCTTTCTCCTTTAGAGATTTCTCACCTGTT
TCCACTCCTTTCTCCGCCATCGCCAATCTCC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RS1E222TF 561 0 0
GTGCCACGACTTGACAGCTGTTTCCATGGTCTCAACAAGAAAAGAAAAACATCTCTTTCC
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CCATGTTGACATTAGACCTCAAGTTCTCGAGTTCTTGAGCTCGCTGTTTCTCCTTCTGCA
GCTGACCGAGCCTCTTGATCTTTCTTGAGACTTCTGCGCTTTGTGGGTTGTACTGTAGAG
CCATTTCAAATGCAGCCAAGGAATCATCATATTTCTCCATGGCTTCAAGCACAGAACCTT
TCCTGAAGTACCCCTTCTCCCATTGCGGGTTGAGTTTGATGGTTGTCTCAGCATCAGCCA
AGGCTTTGCTAAGCTTAACGAGACTCAAGAAGGCAGCAGCTCGGTTACTGTAAAGAGTAG
CGTTAGAAGGATCGAGCTTGATGGCCTGAGTGTAGAGAGCTGCGGCTTTTAGGTAGTTCC
CAGCTTTGAAGAACTCGTTCCCTTTCTCCTTTAGAGATTTCTCACCTGTTTCCACTCCTT
TCTCCGCCATCGCCAATCTCC

QA 1 561 1 561
DS 



AS 1 2

CO CL1038Contig1 834 2 8 U
GGGTCAAATTTTTATTATTCAAAGGATACGAGAATAATGCTATGGAGCTCATATCAGATT
ACTTATTAAACATTTACATCAAATCAAACACAGGATAAAGTATTAAAAGCTAACGAGCAT
GATCCATCTTGAATTGTCTTAAAGACAATAGACTGAATCTTGGACATTAGGGATGAAAAG
CTGAAACAATATGATCCCTTTATTTCTTTACGTCTCTCCTCAAGCGCTGCTCACAAGCAC
GTTAGTAGCCTTCGTGGTCGCAGTCGCTGGGCCTCGGGTCAAAGCTTTTACGCTTAACGG
ACTGTTTGCCTTCATTCTACAAGTACCGGCCTTCAAATCGCAAACAGGGTACGCCTGAGG
GCAGCAGCTAGAGCCATCCTCGCAGCAAGTAGCTGACTCTAGCGGACAGCATCCCCAGCT
ATAGCATTTGCTTTTATACTCATAGAGACAACAACAAGTGGACTTGGCTGGACAAGTGTA
AGATTTGTCACAAACAACTGGTGCAGGTGGTGGCGGTTTTGGTGGGTTTGAGCTCGATGA
TTTGGTTGGGTATGAAGCCATCATCGCCACACCACATTTCCCTGACGAATCTTTAATGTT
ACGTTCGAGCTTAACGTATCCACTCTCTCCCCAGTTTGATCCCCATGAGTTACGAACAAT
CCAATAGTCTTGACCTCCTGATGTTCCGTATCCCACGGCTACTACACCATGATCCAAAGC
GGTTCCACATGTTCCTGTAAACACGCCAGATTTGTAAAGCTGGAAAGCTCGGCCACCAGC
TTCAATGGCACACTAATAGTTGATAGCAACAGCTTTCTTCAATGAATTCTCGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DO85JQ U 1
AF RS1BX88JQ U 28
BS 1 232 RS1DO85JQ
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GATCCATCTTGAATTGTCTTAAAGACAATAGACTGAATCTTGGACATTAGGGATGAAAAG
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DS 

RD RS1BX88JQ 807 0 0
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ATAGACTGAATCTTGGACATTAGGGATGAAAAGCTGAAACAATATGATCCCTTTATTTCT
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TGGGCCTCGGGTCAAAGCTTTTACGCTTAACGGACTGTTTGCCTTCATTCTACAAGTACC
GGCCTTCAAATCGCAGACAGGGTACGCCTGAGGGCAGCAGCTAGAGCCATCCTCGCAGCA
AGTAGCTGACTCTAGCGGACAGCATCCCCAGCTATAGCATTTGCTTTTATACTCATAGAG
ACAACAACAAGTGGACTTGGCTGGACAAGTGTAAGATTTGTCACAAACAACTGGTGCAGG
TGGTGGCGGTTTTGGTGGGTTTGAGCTCGATGATTTGGTTGGGTATGAAGCCATCATCGC
CACACCACATTTCCCTGACGAATCTTTAATGTTACGTTCGAGCTTAACGTATCCACTCTC
TCCCCAGTTTGATCCCCATGAGTTACGAACAATCCAATAGTCTTGACCTCCTGATGTTCC
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AGATTTGTAAAGCTGGAAAGCTCGGCCACCAGCTTCAATGGCACACTAATAGTTGATAGC
AACAGCTTTCTTCAATGAATTCTCGTT

QA 1 807 1 807
DS 



AS 1 6

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GGTTTCAAACCTCGCCTCTTCACTCTCCTCTCTCTCTTTCTCTTCCCAGGTCTCTCAGAG
ACCAACCACCCTCTCCTTCCCCCGGGCGAACTCGGCGTTCTCGCTGCCGGTGAAATCAGC
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CACCGGCAAAGTTATTATTAACTATCGCGATGCCAAGGAGTACCTTCAGGGGAACCCACT
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GTTTGTGAAGGCCCATGGTGGCGGTCTCTCTGGTCAAGCTCAAGCCATTACTCTCGGAGT
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GGATGTCAACTCTTCTGAGTACACTTCTTTGCCTTCAATCCTGTTTCTAAGTTGATGTGT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 20 35 10 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1CE96TF U 1
AF RS1BO62TF U 29
AF RS1EE86TF U 136
AF RS1G835TF U 309
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RD RS1CE96TF 644 0 0
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GGTTTCAAACCTCGCCTCTTCACTCTCCTCTCTCTCTTTCTCTTCCCAGGTCTCTCAGAG
ACCAACCACCCTCTCCTTCCCCCGGGCGAACTCGGCGTTCTCGCTGCCGGTGAAATCAGC
TCGTCGCGCCTCTCTCTCAATCACTGCCACGGTGGAAGCTCCTCCCGCGGAGGTAGCGGA
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GAAAATCATAGGCACGGGACGCCGCAAGTGCGCCATCGCTCGTGTCGTTCTCCAAGAAGA
CACCGGCAAAGTTATTATTAACTATCGCGATGCCAAGGAGTACCTTCAGGGGAACCCACT
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GTTTGTGAAGGCCCATGGTGGCGGTCTCTCTGGTCAAGCTCAAGCCATTACTCTCGGAGT
TGCTCGTGCCCTCCTCAAGGTGAGTGCGGACCATAGATCGCCGTTGAAGAAG**AAGTTT
ACTCACCAGAGACGCGAGAGTCGTTGAGAGAA
GAAGTTGGGCTC

QA 1 632 1 632
DS 

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GG
AAGCTTTCCTCCAGCGACAATGGCGTTATCGGTTTCAAACCTCGCCTCTTCACTCTCCTC
TCTCTCTTTCTCTTCCCAGGTCTCTCAGAGACCAACCACCCTCTCCTTCCCCCGGGCGAA
CTCGGCGTTCTCGCTGCCGGTGAAATCAGCTCGTCGCGCCTCTCTCTCAATCACTGCCAC
GGTGGAAGCTCCTCCCGCGGAGGTAGCGGAGGATACGATGGAGCTGAAGAAGTACGTGAA
ATCGAGGCTCCCGGGAGGCTTCGCAGCTCAGAAAATCATAGGCACGGGACGCCGCAAGTG
CGCCATCGCTCGTGTCGTTCTCCAAGAAGGCACCGGCAAAGTTATTATTAACTATCGCGA
TGCCAAGGAGTACCTTCAGGGGAACCCACTGTGGCTTCAGTACGTTAAAGTGCCATTAGT
GACACTGGGTTACGAGAACAGCTACGACGTGTTTGTGAAGGCCCATGGTGGCGGTCTCTC
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CCATAGATCGCCGTTGAAGAAGGAAGGTTTACTCACCAGAGACGCGAGAGTCGTTGAGAG
AAA
TAAAGTTGGGCTCAAG

QA 3 605 3 605
DS 

RD RS1EE86TF 512 0 0
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CTCAATCACTGCCACGGTGGAAGCTCCTCCCGCGGAGGTAGCGGAGGATACGATGGAGCT
GAAGAAGTACGTGAAATCGAGGCTCCCGGGAGGCTTCGCAGCTCAGAAAATCATAGGCAC
GGGACACCGCAAGTGCGCCATCGCTCGTGTCGTTCTCCAAGAAGGCACCGGCAAAGTTAT
TATTAACTATCGCGATGCCAAGGAGTACCTTCAGGGGAACCCACTGTGGCTTCAGTACGT
TAAAGTGCCATTAGTGACACTGGGTTACGAGAACAGCTACGACGTGTTTGTGAAGGCCCA
TGGTGGCGGTCTCTCTGGTCAAGCTCAAGCCATTACTCTCGGAGTTGCTCGTGCCCTCCT
CAAGGTGAGTGCGGACCATAGATCGCCGTTGAAGAAGTAAAGTTTACTCACCAGAGACGC
GAGAGTCGTTGAGAGAAA
GATGTTGGGCTCAA

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DS 

RD RS1G835TF 531 0 0
G
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CCTCCTCAAGGTGAGTGCGGACCATAGATCGCCGTTGAAGAAGGAAGGTTTACTCACCAG
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ACCAATCTCTGTGTTGTTGATTGAATAGAATGCAATTATGATTGTGACCT

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DS 

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ATTACTCTCGGAGTTGCTCGTGCCCTCCTCAAGGTGAGTGCGGACCATAGATCGCCGTTG
AAGAAGGAAGGTTTACTCACCAGAGACGCGAGAGTCGTTGAGAGAAAGAAGGTTGGGCTC
AAGAAGGCCCGTAAAGCACCACAGTTCTCCAAGCGTTAACGAGCCTTCTTTTGTTTTATT
ATTATTGTTGTTTTGGATGTCAACTCTTCTGAGTACACTTCTTTGCCTTCAATCCTGTTT
CTAAGTTGATGTGTAGATGATGAACCAATCTCTGTGTTGTTGATTGAATAGAATGCAATT
ATGATTGTG

QA 1 369 1 369
DS 

RD RS1GQ81TF 219 0 0
GG
AGTCGTTGAGAGAAAGAAGGTTGGGCTCAAGAAGGCCCGTAAAGCACCACAGTTCTCCAA
GCGTTAACGAGCCTTCTTTTGTTTTATTATTATTGTTGTTTTGGATGTCAACTCTTCTGA
GTACACTTCTTTGCCTTCAATCCTGTTTCTAAGTTGATGTGTAGATGATGAACCAATCTC
TGTGTTGTTGATTGAATAGAATGCAATTATGATTGTG

QA 3 219 3 219
DS 



AS 1 6

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AAAACAGCATAAACGGATAGAGTTTTATTATTAGACGTAAGTTATAACTCTTATCCTCTT
TATTAAGGGGTCTTTATTTCTCTTAGATAATAGACATAATCTTGGGTGAACTCTCTGTCT
CAGTAGCTTTCACGAACACAATCTCGAATGGGTTACCGAATGGTGGGGTAGAGCCTATAA
CCAAACCCCGAACGCCACCTTCCTCGTTTTTACCGACATCGGTGCAATCGTTACCGTCCC
TACAAAATACAAACTTGTAAGCGTTAAGGTTTGCTCTAGTTTTCTTGATCTGGAAGAAAC
TCCTCGACGAATCTTCTCCTCCAGCTTCTGGCTTAGGACCAACCGCTATGAACGACGATC
TCCAGTGACTGGGGGCTGTAGTAACCCACCAATAAGTTGACTTAGCGCAGATCGTAGGTT
CGACATCCATCTTGATGTTGAGGTTCTCTGATTCGGGAACGAACCCAACTCTAGACATCC
AGTTTGAGAATTTCACGGGAATGCCCCTGTTGACCTCTGAACGCTCCAGTCCGACAAAGA
GGGGACACTGGTTGCCATTACGGGGGGTGAGAGTTAGGCCGCCACCTGTAGGGCCCCATA
TGAGGGGGAGAACGTAGTAACTGCCACCGAATATGATATCACCATTCACGTCGAGAACTG
GCCCGGCGTTTGCGGTGGTAGCCAAAACAGCTGTTAGGGCAAGAAGGAAGTAAAACATAG
GATTCATCTCTTTTTTTTTAGTTTATTTAGTCGATGAGATTTGAATGTTACCTGGATCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1DY54JQ U 1
AF RS1GP88JQ U 2
AF RS1CL64JQ U 2
AF RS1GP88TF C 115
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RD RS1DY54JQ 647 0 0
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AAAACAGCATAAACGGATAGAGTTTTATTATTAGACGTAAGTTATAACTCTTATCCTCTT
TATTAAGGGGTCTTTATTTCTCTTAGATAATAGACATAATCTTGGGTGAACTCTCTGTCT
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CCAAACCCCGAACGCCACCTTCCTCGTTTTTACCGACATCGGTGCAATCGTTACCGTCCC
TACAAAATACAAACTTGTAAGCGTTAAGGTTTGCTCTAGTTTTCTTGATCTGGAAGAAAC
TCCTCGACGAATCTTCTCCTCCAGCTTCTGGCTTAGGACCAACCGCTATGAACGACGATC
TCCAGTGACTGGGGGCTGTAGTAACCCACCAATAAGTTGACTTAGCGCAGATCGTAGGTT
CGACATCCATCTTGATGTTGAGGTTCTCTGATTCGGGAACGAACCCAACTCTAGACATCC
AGTTTGAGAATTTCACGGGAATGCCCCTGTTGACCTCTGAACGCTCCAGTCCGACAAAGA
GGGGACACTGGTTGCCATTACGGGGGGTGAGAGTTAGGCCGCCACCT

QA 1 647 1 647
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AGTAGCTTTCACGAACACAATCTCGAATGGGTTACCGAATGGGGGGGTAGAGCCTATAAC
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ACAAAATACAAACTTGTAAGCGTTAAGGTTCGCTCTAGTCTTCTTGATCTGGAAGAAACT
CCTCGACGAATCTTCTCCTCCAGCTTCTGGCTTAGGACCAACGGCTATGAACGACGATCT
CCAGTGACTGGGGGCTGTAGTAACCCACCAATAAGTTGACTTAGCGCAGATCGTAGGTTC
GACATCCATCTTGATGTTGAGGTTCTCTGATTCGGGGACGAACCCAACTCTAGACATCCA
GTTTGAGAATTTCACGGGAATGCCCCTGTTGACCTCAGAACGCTCCAGTCCGACAAAGAG
GGGACACTGGTTACCATTACGGGGGGTGAGAG

QA 1 632 1 632
DS 

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AAACAGCATAAACGGATAGAGTTTTATTATTAGACGTAAGTTATAACTCTTATCCTCTTT
ATTAAGGGGTCTTTATTTCTCTTAGATAATAGACATAATCTTGGGTGAACTCTCTGTCTC
AGTAGCTTTCACGAACACAATCTCGAATGGGTTACCGAATGGTGGGGTAGAGCCTATAAC
CAAACCCCGAACGCCACCTTCCTCGTTTTTACCGACATCGGTGCAATCGTTACCGTCCCT
ACAAAATACAAACTTGTAAGCGTTAAGGTTTGCTCTAGTTTTCTTGATCTGGAAGAAACT
CCTCGACGAATCTTCTCCTCCAGCTTCTGGCTTAGGACCAACCGCTATGAACGACGATCT
CCAGTGACTGGGGGCTGTAGTAACCCACCAATAAGTTGACTTAGCGCAGATCGTAGGTTC
GACATCCATCTTGATGTTGAGGTTCTCTGATTCGGGAACGAACCCAACTCTAGACATCCA
GTTTGAGAATTTCACGGGAATGCCCCTGTTGACCTCTGAACGCTCCAGTCCGACAAAGAG
GGGACACTGGTTGCCATTACGGGGGGTGAGAGTTAGGCCGCCACCTGTAGGGCCCCATAT
GAGGGGGAGAACGTAGTAACTGCCACCGAATATGATATCACCATTCACGTCGAGAACTGG
CCCGGCGTTTGCGGTGGTA

QA 1 739 1 739
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RD RS1GP88TF 697 0 0
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CTGTCTCAGTAGCTTTCACGAACACAATCTCGAATGGGTTACCGAATGGGGGGGTAGAGC
CTATAACCAAACCCCGAACGCCACCTTCCTCGTTTTTACCGACATCGGTGCAATCGTTAC
CGTCCCTACAAAATACAAACTTGTAAGCGTTAAGGTTCGCTCTAGTCTTCTTGATCTGGA
AGAAACTCCTCGACGAATCTTCTCCTCCAGCTTCTGGCTTAGGACCAACGGCTATGAACG
ACGATCTCCAGTGACTGGGGGCTGTAGTAACCCACCAATAAGTTGACTTAGCGCAGATCG
TAGGTTCGACATCCATCTTGATGTTGAGGTTCTCTGATTCGGGGACGAACCCAACTCTAG
ACATCCAGTTTGAGAATTTCACGGGAATGCCCCTGTTGACCTCAGAACGCTCCAGTCCGA
CAAAGAGGGGACACTGGTTACCATTACGGGGGGTGAGAGTAAGGCCGCCACCTGTAGGGC
CCCATATGAGGGGGAGAACGTAGTAACTGCCACCGAATATGATATCACCTCTCACGTCGA
GAACTGGCCCGGCGTTTGCGGTGGTAGCCAAAACAGCTGTTAGGGCAAGAAGGAAGTAAA
ACATAGGATTCATCTCTTTTTTTCGAGTTTATTTAGT

QA 1 697 1 697
DS 

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CTCTATCCTCTTATAA
GGGTCTTTATTTCTCTTAGATAATAGACATAATCTTGGGTGAACTCTCTGTCTCAGTAGC
TTTCACGAACACAATCTCGAATGGGTTACCGAATGGTGGGGTAGAGCCTATAACCAAACC
CCGAACGCCACCTTCCTCGTTTTTACCGACATCGGTGCAATCGTTACCGTCCCTACAAAA
TACAAACTTGTAAGCGTTAAGGTTTGCTCTAGTTTTCTTGATCTGGAAGAAACTCCTCGA
CGAATCTTCTCCTCCAGCTTCTGGCTTAGGACCAACCGCTATGAACGACGATCTCCAGTG
ACTGGGGGCTGTAGTAACCCACCAATAAGTTGACTTAGCGCAGATCGTAGGTTCGACATC
CATCTTGATGTTGAGGTTCTCTGATTCGGGAACGAACCCAACTCTAGACATCCAGTTTGA
GAATTTCACGGGAATGCCCCTGTTGACCTCTGAACGCTCCAGTCCGACAAAGAGGGGACA
CTGGTTGCCATTACGGGGGGTGAGAGTTAGGCCGCCACCTGTAGGGCCCCATATGAGGGG
GAGAACGTAGTAACTGCCACCGAATATGATATCACCATTCACGTCGAGAACTGGCCCGGC
GTTTGCGGTGGTAGCCAAAACAGCTGTTAGGGCAAGAAGGAAGTAAAACATAGGATTCAT
CTCTTTTTTTTTAGTTTATTTAGTCGATGAGATTTGAATGTTACCTGGATCC

QA 17 728 17 728
DS 

RD RS1DY54TF 573 0 0
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AGGTTTGCTCTAGTTTTCTTGATCTGGAAGAAACTCCTCGACGAATCTTCTCCTCCAGCT
TCTGGCTTAGGACCAACCGCTATGAACGACGATCTCCAGTGACTGGGGGCTGTAGTAACC
CACCAATAAGTTGACTTAGCGCAGATCGTAGGTTCGACATCCATCTTGATGTTGAGGTTC
TCTGATTCGGGAACGAACCCAACTCTAGACATCCAGTTTGAGAATTTCACGGGAATGCCC
CTGTTGACCTCTGAACGCTCCAGTCCGACAAAGAGGGGACACTGGTTGCCATTACGGGGG
GTGAGAGTTAGGCCGCCACCTGTAGGGCCCCATATGAGGGGGAGAACGTAGTAACTGCCA
CCGAATATGATATCACCATTCACGTCGAGAACTGGCCCGGCGTTTGCGGTGGTAGCCAAA
ACAGCTGTTAGGGCAAGAAGGAAGTAAAACATAGGATTCATCTCTTTTTTTTTAGTTTAT
TTAGTCGATGAGATTTGAATGTTACCTGGATCC

QA 1 573 1 573
DS 



AS 2 6

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GAAGAACTAAAAAACAGATACAAAATCCATTGACATAGAAATTGAGTTTGCAATGCAGCA
ATGAAATTGTAGTTCATCAAGGACTTTGCCCAACTCTATGATTCCCTAAGCGACAAGAGT
GCTTGCGGTTGTAGATTCATACTTCCAGACGGGAGGGAGCTTCTTGGTCTTCTTGTAGTA
ACGAGCAAGACGGTGGATTCTGCTCTCCACAAGAATCAACCTGAACTTGGAGTCCTTGTC
CTTCCTGTTCCTCTCAAGATGCTTGCGGATGGCAACAGCTTTCTTGATCAGGTGGTAAAG
ATCCTCAGGGATCTCAGGAGCAAGACCATGAGCTTTCAAGATTCTCAAAATCTTGTTTCC
AGTAACACTCTTCACCTGTGGGATACCGTGAGAGTCACGAAGAATGACACCAATCTGAGA
CGGAGTCAAACCCTTCTTTGCAAACTTGCAAATGGACTCATCAACATCCTGAGAGGTTGT
CTTGAGCCAACTCGGGGGTGAACGCTTGTACGGCAAAGCAGATGCTGAGATTCCCTTCCC
TTTAGAGTGGAGTCGCCCCATGCCGACGTTTGTTAACGGAGTTTGCTTTCTCTGAGAACG
TTCTTCGTCCGGCTGCGACTGCGCTCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DM17TF C 1
AF RS1DM17JQ U 4
BS 1 3 RS1DM17TF
BS 4 687 RS1DM17JQ

RD RS1DM17TF 687 0 0
TTTGCCATAAACAAGAGTACTCTCTT*AATCCAAAATCGTATTATAACTGTAACTCATCA
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GCTTGCGGTTGTAGATTCATACTTCCAGACGGGAGGGAGCTTCTTGGTCTTCTTGTAGTA
ACGAGCAAGACGGTGGATTCTGCTCTCCACAAGAATCAACCTGAACTTGGAGTCCTTGTC
CTTCCTGTTCCTCTCAAGATGCTTGCGGATGGCAACAGCTTTCTTGATCAGGTGGTAAAG
ATCCTCAGGGATCTCAGGAGCAAGACCATGAGCTTTCAAGATTCTCAAAATCTTGTTTCC
AGTAACACTCTTCACCTGTGGGATACCGTGAGAGTCACGAAGAATGACACCAATCTGAGA
CGGAGTCAAACCCTTCTTTGCAAACTTGCAAATGGACTCATCAACATCCTGAGAGGTTGT
CTTGAGCCAACTCGGGGGTGAACGCTTGTACGGCAAAGCAGATGCTGAGATTCCCTTCCC
TTTAGAGTGGAGTCGCCCCATGCCGACGTTTGTTAACGGAGTTTGCTTTCTCTGAGAACG
TTCTTCGTCCGGCTGCGACTGCGCTCC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1DM17JQ 684 0 0
GCCATAAACAAGAGTACTCTCTTTAATCCAAAATCGTATTATAACTGTAACTCATCAGAA
GAACTAAAAAACAGATACAAAATCCATTGACATAGAAATTGAGTTTGCAATGCAGCAATG
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TGCGGTTGTAGATTCATACTTCCAGACGGGAGGGAGCTTCTTGGTCTTCTTGTAGTAACG
AGCAAGACGGTGGATTCTGCTCTCCACAAGAATCAACCTGAACTTGGAGTCCTTGTCCTT
CCTGTTCCTCTCAAGATGCTTGCGGATGGCAACAGCTTTCTTGATCAGGTGGTAAAGATC
CTCAGGGATCTCAGGAGCAAGACCATGAGCTTTCAAGATTCTCAAAATCTTGTTTCCAGT
AACACTCTTCACCTGTGGGATACCGTGAGAGTCACGAAGAATGACACCAATCTGAGACGG
AGTCAAACCCTTCTTTGCAAACTTGCAAATGGACTCATCAACATCCTGAGAGGTTGTCTT
GAGCCAACTCGGGGGTGAACGCTTGTACGGCAAAGCAGATGCTGAGATTCCCTTCCCTTT
AGAGTGGAGTCGCCCCATGCCGACGTTTGTTAACGGAGTTTGCTTTCTCTGAGAACGTTC
TTCGTCCGGCTGCGACTGCGCTCC

QA 1 684 1 684
DS 



CO CL1041Contig2 692 4 2 U
GTCATGCTTAAAGATCACATAGTACTCATCAAATTCAAAATTGCACAGTAAGTTGTAATT
CATCAGAAAAAAAACTAAAAACAGATACAAAATCCATTGTCATAGAAATGGAGTTGCAAT
GCAGCAAAGAAATTGTAGTTCAAAGACTTTATAACCAGCTCTATGATTCCTTAAGCGACA
AGAGTGCTTGCGGTAGTAGATTCATACTTCCAGACGGGAGGGAGCTTCTTGGTCTTCTTG
TAGTAACGAGCAAGACGGTGGATTCTGCTCTCCACAAGAATCAACCTGAACTTGGAGTCC
TTGTCCTTCCTGTTCCTCTCAAGATGCTTGCGGATAGCAACTGCTTTCTTGATCAGGTGG
TAAAGATCCTCAGGGATCTCAGGAGCAAGACCATGAGCTTTCAAGATTCTCAAAATCTTG
TTTCCAGTAACACTCTTCACCTGTGGGATACCGTGAGAGTCACGGAGAATGACACCAATC
TGAGACGGAGTCAAACCCTTCTTTGCAAACTTGCAAATGGATTCATCAACATCCTGGGAG
GTTGTCTTGAGCCAACTCGGGGGTGAACGCTTGTACGGCAAAGCAGATGCTGAGATTCCC
TTACCTTTAGAGTGGAGTCGCCCCATATCGACGGCTGTGAACGGAGTTTGCCTTCTCTGA
GATTGTTCTTCGTCCGGCTGCGACTGCGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 

AF RS1EZ56JQ U 143
AF RS1EZ56TF C 1
AF RS1E844JQ U 13
AF RS1E844TF C 13
BS 1 12 RS1EZ56TF
BS 13 692 RS1E844JQ

RD RS1EZ56JQ 222 0 0
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QA 1 222 1 222
DS 

RD RS1EZ56TF 699 0 0
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TAGTAACGAGCAAGACGGTGGATTCTGCTCTCCACAAGAATCAACCTGAACTTGGAGTCC
TTGTCCTTCCTGTTCCTCTCAAGATGCTTGCGGATAGCAACTGCTTTCTTGATCAGGTGG
TAAAGATCCTCAGGGATCTCTGGAGCAAGACCATGAGCTTTCAAGATTCTCAAAATCTTG
TTTCCAGTAACACTCTTCACCTGTGGGATACCGTGAGAGTCGCGGAGAATGACACCAATC
TGAGACGGAGTCAAACCCTTCTTTGCAAACTTGCAAATGGATTCATCAACATCCTGGGAG
GTTGTCTTGAGCCAACTCGGGGGTGAACGCTTGTACGGCAAGGCAGATGCTGAGATTCCC
TTACCTTTAGAGTGGAGTCGCCCCATATCGACGGCTGTGAACGGAGTTTGCCTTCTCTGA
GATTGTTCTTCGTCCGGCTGCGACTGCGCT
AAAGAAAAA

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1E844JQ 680 0 0
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GTAGTAGATTCATACTTCCAGACGGGAGGGAGCTTCTTGGTCTTCTTGTAGTAACGAGCA
AGACGGTGGATTCTGCTCTCCACAAGAATCAACCTGAACTTGGAGTCCTTGTCCTTCCTG
TTCCTCTCAAGATGCTTGCGGATAGCAACTGCTTTCTTGATCAGGTGGTAAAGATCCTCA
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QA 1 680 1 680
DS 

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AACTAAAAACAGATACAAAATCCATTGTCATAGAAATGGAGTTGCAATGCAGCAAAGAAA
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GTAGTAGATTCATACTTCCAGACGGGAGGGAGCTTCTTGGTCTTCTTGTAGTAACGAGCA
AGACGGTGGATTCTGCTCTCCACAAGAATCAACCTGAACTTGGAGTCCTTGTCCTTCCTG
TTCCTCTCAAGATGCTTGCGGATAGCAACTGCTTTCTTGATCAGGTGGTAAAGATCCTCA
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CTCTTCACCTGTGGGATACCGTGAGAGTCACGGAGAATGACACCAATCTGAGACGGAGTC
AAACCCTTCTTTGCAAACTTGCAAATGGATTCATCAACATCCTGGGAGGTTGTCTTGAGC
CAACTCGGGGGTGAACGCTTGTACGGCAAAGCAGATGCTGAGATTCCCTTACCTTTAGAG
TGGAGTCGCCCCATATCGACGGCTGTGAACGGAGTTTGCCTTCTCTGAGATTGTTCTTCG
TCCGGCTGCGACTGCGCTCC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL1042Contig1 733 2 4 U
GGCCTCACCCAGAATCTTCTCTGACTCATTACATTCCATTTATCACTTAAATTCCCTAGA
GAAAAAAAAATGTCGGCAGCAGAGGCAGAGAACATCCCCACCAACGTCTCCTCAGGAGAT
GCTAAAGCGAAGAAGACGAAGGAAGCTAAACCTAAGAAGAAGCCTGCAGCAGAGAAGAAG
TCTCCGAAGAAGAAGAAAGCTTCCTCTCCACCATCTCACCCTAAATACGAAGAGATGATT
AAAGATGCAATCACGACGTTGAAGGAGAGGACCGGATCTAGCCAATACGCGATTCAGAAG
TTCATCGAGGAGAAGGAGAAGTCTCTTCCAACTACCTTCAGGAAGCTTCTCCTCGTTAAT
CTCAAGAGGCTCGTCGCTGCTGAGAAGTTGGTTAAGGTGAAAGGATCTTTCAAACTTCCC
TCTGCTAAATCCGTTTCAGCAGCAGCGGCAGCTAAACCGGCGGCGGTTAAGAAGAAACCA
GCGGCTGTATCTAAACCTAAGGCTCCGGTTAAAGCCAAACCGGCAGGTAAAGAAACTAAG
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AGCGTTGCCGCTGTGTCCAAGACTGCGGCTAAGCCTAAGGCGAAGGAGAGACCTGCTAAA
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TGTGGCTGTGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F947TF U 1
AF RS1FP41TF U 5
BS 1 430 RS1F947TF
BS 431 431 RS1FP41TF
BS 432 606 RS1F947TF
BS 607 733 RS1FP41TF

RD RS1F947TF 606 0 0
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GAAAAAAAAATGTCGGCAGCAGAGGCAGAGAACATCCCCACCAACGTCTCCTCAGGAGAT
GCTAAAGCGAAGAAGACGAAGGAAGCTAAACCTAAGAAGAAGCCTGCAGCAGAGAAGAAG
TCTCCGAAGAAGAAGAAAGCTTCCTCTCCACCATCTCACCCTAAATACGAAGAGATGATT
AAAGATGCAATCACGACGTTGAAGGAGAGGACCGGATCTAGCCAATACGCGATTCAGAAG
TTCATCGAGGAGAAGGAGAAGTCTCTTCCAACTACCTTCAGGAAGCTTCTCCTCGTTAAT
CTCAAGAGGCTCGTCGCTGCTGAGAAGTTGGTTAAGGTGAAAGGATCTTTCAAACTTCCC
TCTGCTAAATTCGTTTCAGCAGCAGCGGCAGCTAAACCGGCGGCGGTTAAGAAGAAACCA
GCGGCTGTATCTAAACCTAAGGCTCCGGTTAAAGCCAAACCGGCAGGTAAAGAAACTAAG
AAGCCTGCTGCAAAGCCAAAGGCTAAAGTTGTTGCTGCTAAGCCTAAAGCGAAGACAAAG
AGCGTT

QA 1 606 1 606
DS 

RD RS1FP41TF 729 0 0
GG
ACCCAGAATCTTCTCTGACTCATTACATTCCATTTATCACTTAAATTCCCTAGAGAAAAA
AAAATGTCGGCAGCAGAGGCAGAGAACATCCCCACCAACGTCTCCTCAGGAGATGCTAAA
GCGAAGAAGACGAAGGAAGCTAAACCTAAGAAGAAGCCTGCAGCAGAGAAGAAGTCTCCG
AAGAAGAAGAAAGCTTCCTCTCCACCATCTCACCCTAAATACGAAGAGATGATTAAAGAT
GCAATCACGACGTTGAAGGAGAGGACCGGATCTAGCCAATACGCGATTCAGAAGTTCATC
GAGGAGAAGGAGAAGTCTCTTCCAACTACCTTCAGGAAGCTTCTCCTCGTTAATCTCAAG
AGGCTCGTCGCTGCTGAGAAGTTGGTTAAGGTGAAAGGATCTTTCAAACTTCCCTCTGCT
AAATCCGTTTCAGCAGCAGCGGCAGCTAAACCGGCGGCGGTTAGGAAGAAACCAGCGGCT
GTATCTAAACCTAAGGCTCCGGTTAAAGCTAAACCGGCAGGTAAAGAAACTAAGAAGCCT
GCTGCAAAGCCAAAGGCTAAAGTTGTTGCTGCTAAGCCTAAAGCGAAGACAAAGAGCGTT
GCCGCTGTGTCCAAGACTGCGGCTAAGCCTAAGGCGAAGGAGAGACCTGCTAAAGCGGCG
AGGACTTCGAGTAGAACGTCTCCGGGAAGAAAGCTGCTGCTCTGGCTAAGAAGCTGTGGC
TGTGGCT

QA 3 729 3 729
DS 



AS 1 6

CO CL1043Contig1 1378 6 19 U
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CCTCAAACGACGCTGGAGCTCGCCGGATCTACGTCGGAAGGGTCTAAGGCGGACAATCCC
CCAGTTTAGCCGATCTCCAGGGCTGATGCTTTTTCCGAGCGACGGTGGTTGTGTGTTGTA
CGACCCTAAAGAAGACAATTTCAAAAGGAACGTGGGAGACGACTTTTCAGGGTGTCGATT
CCTGGCAAACTCGGGTAACTGGCTCTTGGTTTTAGATTCTAGATCCGATTTATATATCGA
AGATGTTTTTAGTGGTAAAAAGATGCCTCTACCGTCTCTAGAGTCGGTTAAGTCAGCTGA
TTGTATTGTCAAGCGCGTGGGAGATAGAGAATTTATAAGGGATGAGTCTGGCGCTATTTA
TGAGGATCTGATTGCTGACGTGGTGAGGGGACTTTTGTGGGTTTCCGAGAGTGGAAAAGA
GTACGTTGTGGTGTGGTTGTTCGACCTCCCTGGCCACTCTTACATGTCATTCTGCAAGAA
TGGGGATACTCATTACACCGACATTCCTCTCTTTTTCGATGACCGTGCCTTTCACAAGTT
TGATGGCTTATCGGATATGGTGCTACGTGGTCACCGTCTTTACGTCTCAACAAGTCGGCG
TTTTGTTCGAATCTTTGATCTGTCTGGACCGCAAGGTTTCTTCAAGGACATTACCGGTCA
TCAAACACCATTCCCAATGCTTTCTCGTCATGATTTTGCCTACGATTCTAACATTGCGGT
TACAACATCAGGAGAGGTTTTGTTGGTTGAGAGTGATTCATGCGATAGGACCTGGTTCCG
CGTCTACAAGAGGGATCCTGATGTTGAAGACCCAAATAACGCCTGCCACACGGTTACTGA
GGTAGATTCTCTTGGTGGTGAGGCCCTGCTTCTTGACTTGGGTTTCACTGTGCCTGCTAA
CAAGGCCCTTGGTATCGAACCTGACTCCATCTATTTCACCCGTCACTTTCGTCCCTGCCA
GTGCGCAAGTCGCGACCTCGACATCTGTGTCTACAATCTTGCAACCAAGTCCCTCCATCG
CTATCACAATCTTCTTGACACGATGGATCTCGTGGATGCTCGATGGTTTCTCCCCCGGAA
TTAATTTCCTTTTATTTGTGCTTTCGAATAAAAATTTAGGATGTTCCCCCTCTGTTTAGT
TAACGAATCACATATCATATCTTGTTGACGGTTGTGAGTGGTGGACAGCTCTCATGTTAG
TATTTATCCCTAGTTCCCTTTGCGCTTGATTTTCAAAAGTTGCTCTTTTATTTCTTTCAT
GGACGTTGTCCGCCTTAAGTTTGCAAACCGATTTTCTCAATTTGATTTAAACTCCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GF24TF U 6
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TCATTACACCGACATTCCTCTCTTTTTCGATGACCGTGCCTTTCACAAGTTTGATGGCTT
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CGACCCTAAAGAAGACAATCTCAAAAGGAACGTGGGAGACGACTTTTCAGGGTGTCGATT
CCTGGCAAACTCGGGTAACTGGCTCTTGGTTTTAGATTCTAGATCCGATTTATATATCG*
**ATGTTTTTAGTGGTAAAAAGATGCCTCTATCGTCTCTAGAGTCGGTTAAGTCAGCTGA
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TGGGGATACTCATTACACCGACATTCCTCTCTTTTTCGATGACCGTGCCTTTCACAAGTT
TGATGGCTTATCGGATATGGTGCTACGTGGTCACCGTCTTTACGTCCCAACAAGTCGGCG
TTTTGTTCGAATCTTTGATCTGTCTGGACCGCAAGGTTTCT

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CCGATCTCCAGGGCTGATGCTTTTTCCGAGCGACGGTGGTTGTGTGTTGTACGACCCTAA
AGAAGACAATTTCAAAAGGAACGTGGGAGACGACTTTTCAGGGTGTCGATTCCTGGCAAA
CTCGGGTAACTGGCTCTTGGTTTTAGATTCTAGATCCGATTTATATATCGAAGATGTTTT
TAGTGGTAAAAAGATGCCTCTACCGTCTCTAGAGTCGGTTAAGTCAGCTGATTGTATTGT
CAAGCGCGTGGGAGATAGAGAATTTATAAGGGATGAGTCTGGCGCTATTTATGAGGATCT
GATTGCTGACGTGGTGAGGGGACTTTTGTGGGTTTCCGAGAGTGGAAAAGAGTACGTTGT
GGTGTGGTTGTTCGACCTCCCTGGCCACTCTTACATGTCATTCTGCAAGAATGGGGATAC
TCATTACACCGACATTCCTCTCTTTTTCGATGACCGTGCCTTTCACAAGTTTGATGGCTT
ATCGGATATGGTGCTACGTGGTCACCGTCTTTACGTCTCAACAAGTCGGCGTTTTGTTCG
AATCTTTGATCTGTCTGGACCGCAAGGTTTCTTCAAG*ACATTACCGGTCATCAAACACC
ATTCCCAATGCTTTCTCGTCATGATTTTGCCTACGATTCTAACATTGCGGTTACA
CA

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DS 

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ATGCTCGATGGTTTCTCCCCCGGAATTAATTTCCTTTTATTTGTGCTTTCGAATAAAAAT
TTAGGATGTTCCCCCTCTGTTTAGTTAACGAATCACATATCATATCTTGTTGACGGTTGT
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TTTTC

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AAGTCCCTCCATCGCTATCACAATCTTCTTGACACGATGGATCTCGTGGATGCTCGATGG
TTTTTCCCCCGGAATTAATTTCCTTTTATTTGTGCTTTCGAATAAAAATTTAGGTT**TC
CCCCTCTGTTTAGTTAACGAATCACATATCATATCTTGTTGACGGTTGTGAGTGGTGGAC
AGCTCTCATGTTAGTATTTATCCCTAGTTCCCTTTGCGCTTGA
AA

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TCTTCAAGGACATTACCGGTCATCAAACACCATTCCCAATGCTTTCTCGTCATGATTTTG
CCTACGATTCTAACATTGCGGTTACAACATCAGGAGAGGTTTTGTTGGTTGAGAGTGATT
CATGCGATAGGACCTGGTTCCGCGTCTACAAGAGGGATCCTGATGTTGAAGACCCAAATA
ACGCCTGCCACACGGTTACTGAGGTAGATTCTCTTGGTGGTGAGGCCCTGCTTCTTGACT
TGGGTTTCACTGTGCCTGCTAACAAGGCCCTTGGTATCGAACCTGACTCCATCTATTTCA
CCCGTCACTTTCGTCCCTGCCAGTGCGCAAGTCGCGACCTCGACATCTGTGTCTACAATC
TTGCAACCAAGTCCCTCCATCGCTATCACAATCTTCTTGACACGATGGATCTCGTGGATG
CTCGATGGTTTCTCCCCCGGAATTAATTTCCTTTTATTTGTGCTTTCGAATAAAAATTTA
GGATGTTCCCCCTCTGTTTAGTTAACGAATCACATATCATATCTTGTTGACGGTTGTGAG
TGGTGGACAGCTCTCATGTTAGTATTTATCCCTAGTTCCCTTTGCGCTTGATTTTCAAAA
GTTGCTCTTTTATTTCTTTCATGGACGTTGTCCGCCTTAAGTTTGCAAACCGATTTTCTC
AATTTGATTTAAACTCCTTC

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DS 



AS 1 6

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TGAGATAGATGTAGTCCGAATGAATATTTAAAGAACTCGAGACCAACAAGAGTAATTTAA
CCACTATCCAACAAAAGTTACAGCAAAATTCAAAAGAAAGAAAAAACAAAGGGAGGGCAT
ATCCTTCACCATATAACATATATCAATAGAAGAATCCGAGGACCTTGCCTCCGACATTCT
TTCTCCTGGCTTCTTCATGGTCCATAATACCGGCGGAGGTAGTCAGAACGATGTAACCAA
ACTGTCGGGAAGGAAGCAAACGAGCAGTCCAACCTTCAATCTCCTTAACACCAACATCAA
AACGAGGGCTGATAACGCCACACTTGTTCAACCTTCCGTTCAACTCAACAACAATTTTGC
CAGATCTATGGTCATCCACATACTCAAACTCACCAATGTAACCGTGCTTCTGCATGACGA
TAAGAAACTTGATAATGACTTTGGAAGAAGGCCTGATCATGACCTGCCTCTTGCCTCGTT
TCTCCGCATTGTACATGCTCTTTAGCGCATCGTTAAGTACACTTATTCTCACCATTCTTT
TTTTCTTCTCCTTAGCTCAAGCCTTAGACTGGCAGGTCGCTAAGTGACGGAGAAAAAAAA


BQ
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 

AF RS1FB32TF C 1
AF RS1F926JQ U 68
AF RS1FB32JQ U 3
AF RS1F926TF C 68
AF RS1DT30JQ U 73
AF RS1DT30TF C 73
BS 1 2 RS1FB32TF
BS 3 67 RS1FB32JQ
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TGAGATAGATGTAGTCCGAATGAATATTTAAAGAACTCGAGACCAACAAGAGTAATTTAA
CCACTATCCAACAAAAGTTACAGCAAAATTCAAAAGAAAGAAAAAACAAAGGGAGGGCAT
ATCCTTCACCATATAACATATATCAATAGAAGAATCCGAGGACCTTGCCTCCGACATTCT
TTCTCATGGCTTCTTCATGGTCCATAATACCGGCGGAGGTAGTCAGAACGATGTAACCAA
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TCTCCGCATTGTACATGCTCTTTAGCGCATCGTTAAGTACACTTATTCTCACCATTCTTT
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CGAGGGCTGATAACGCCACACTTGTTCGACCTTCCGTTCAACTCAACAACAATTTTGCCA
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TCCGCATTGTACATGCTCTTTAGCGCATCGTTAAGTACACTTATTCTCACCATTCTTTTT
TTCTTCTCCTTAGCTCAAGCCTTAGACTGGCAGGTCGCTAAGTGACGGAGAAAAAAA

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GGCTTCTTCATGGTCCATAATACCGGCGGAGGTAGTCAGAACGATGTAACCAAACTGTCG
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GCTGATAAAGCCACACTTGTTCAACCTTCCGTTCAACTCAACAACAATTTTGCCAGATCT
ATGGTCATCCACATACTCAAACTCACCAATGTAACCGTGCTTCTGCATGACGATAAGAAA
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CTCCTTAGCTCAAGCCTTAGACTGGCAGGTCGCTAAGTGACGGAGAAAAAAAA

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CTTCATGGTCCATAATACCGGCGGAGGTAGTCAGAACGATGTAACCAAACTGTCGGGAAG
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DS 

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AAAAGTTACAGCAAAATTCAAAAGAAAGAAAAAACAAAGGGAGGGCATATCCTTCACCAT
ATAACATATATCAATAGAAGAATCCGAGGACCTTGCCTCCGACATTCTTTCTCCTGGCTT
CTTCATGGTCCATAATACCGGCGGAGGTAGTCAGAACGATGTAACCAAACTGTCGGGAAG
GAAGCAAACGAGCAGTCCAACCTTCAATCTCCTTAACACCAACATCAAAACGAGGGCTGA
TAACGCCACACTTGTTCAACCTTCCGTTCAACTCAACAACAATTTTGCCAGATCTATGGT
CATCCACATACTCAAACTCACCAATGTAACCGTGCTTCTGCATGACGATAAGAAACTTGA
TAATGACTTTGGAAGAAGGCCTGATCATGACCTGCCTCTTGCCTCGTTTCTCCGCATTGT
ACATGCTCTTTAGCGCATCGTTAAGTACACTTATTCTCACCATTCTTTTTTTCTTCTCCT
TAGCTCAAGCCTTAGACTGGCAGGTCGCTAAGTGACGGAGAAAAAAAA

QA 1 588 1 588
DS 



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GTCTTATTAGTGTCTTCGGTTAAGATAGTGACATCGTCGATCAAGAACACTTTTGGTGAG
TCTGTCATGTTTGAAATGTAAACTAGCGAAGTTGCAGCAAAAGACTGAATGAATATTGGC
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GGGTTCTTGATCTCTGGATATATCCCAACAACT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B682JQ U 1
AF RS1C663JQ U 136
AF RS1EY04JQ U 3
BS 1 129 RS1B682JQ
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TCTGTCATGTTTGAAATGTAAACTAGCGAAGTTGCAGCAAAAGACTGAATGAATATTGGC
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QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1C663JQ 538 0 0
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TGAGACATATATGAGCCTTTGTATCCATATTTCTTCAAAGTTGCAACAATCTTATCCT

QA 1 538 1 538
DS 

RD RS1EY04JQ 751 0 0
C
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TTACGGTATGTGTATGGATGCACCTGAAGGTTACGTGAATGTGCTCTTGCAACCAAATCC
GTTGGTGTAGTGAGACGATTATTGCTAACAGGAACAATAGTGTCCTTCCATGGACCAATC
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GTCATGTTTGAAATGTAAACTAGCGAAGTTGCAGCAAAAGACTGAATGAATATTGGCTGT
TTCAGCCAATCTTGAGACATATATGAGCCTTTGTATCCATATTTCTTCAAAGTTGCAACA
ATCTTATCCTCGAACTTTTTACCATCAGCCCATTTCACTTGCTGATTGATGAAAACAGGG
TTCTTGATCTCTGGATATATCCCAACAACT

QA 2 751 2 751
DS 



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CTAGAGTTGTTGGGATATATCCAGAGATCAAGAACCCTGTTTTCATCAATCAGCAAGTGA
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ACAAAG*CTCATATATGTCTCAAGATTGGCTGAAACAGCCAATATTCATTCAGTCTTT*G
CTGCACTTCGCTAGTTTACATTTCAAACATGACAGACTCACAAAAGTGTTCTTGATCGAC
GATGTCACTATCTACCGAGACAC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B682TF U 16
AF RS1EY04TF U 1
AF RS1C663TF U 3
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BS 337 337 RS1B682TF
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BS 787 803 RS1C663TF

RD RS1B682TF 759 0 0
GG
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ATTATTACTTTGGACGAGTTTATAGCAATAGCACTGGATGCACCTAGAGTTGTTGGGATA
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TCTCAAGATTGGCTGAAACAGCCAATATTCATTCAGTCTTT*GCTGCACTTCGCTAGTTT
ACATTTCAAACATGACAGACTCACAAAAGTGTTCTTG

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TTTTACTGTCATTGTTGATTGCTGAATGTGCCTCAAGGCCATTGTATACGCTCCCAAGTC
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GAGGAGCAAACGGCGAGTTCCCTGAAGAAACTGCTCCTGCATATATGAGGGCCATCGAGG
AAGGTGCAGATTTCATAGAATCTGATATTCTATCTACGAAAGACGGTGTTCTTATATGCC
ATCACGATGTGAATCTCGATGATACAACCGATGTTGTGGACCACAAGGAGTTTGCAGACC
GTAAGAGAACTTATGAAGTCCAAGGGATGAACATGACCGGCTTCTTTACTGTTGATTTTA
CTCTCGAGGAGCTGAAAACAATTGGAGCTAAGCAGAGGTATCCTTTCAGGGATCAACAGT
ACAATGGGAAGTTTCCAATTATTACTTTGGACGAGTTTATAGCAATAGCACTGGATGCAC
CTAGAGTTGTTGGGATATATCCAGAGATCAAGAACCCTGTTTTCATCAATCAGCAAGTGA
AATGGGCTGATGGTAAAAAGTTCGAGGATAAGATTGTTGCAACTTTGAAGAAATATGGAT
ACAAAG*CTCATATATGTCTCAAGATTGGCTGAAACAGCCA*TATTCATTCAGTCTTTTG
CTGCACTTCGCTAGTTTACATTTCAAACATGACAGACTCACCAAAGTGTTCTTGATCGAC
GATGTC

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GG
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AGCAAACGGCGAGTTCCCTGAAGAAACTGCTCCTGCATATATGAGGGCCATCGAGGAAGG
TGCAGATTTCATAGAATCTGATATTCTATCTACGAAAGACGGTGTTCTTATATGCCATCA
CGATGTGAATCTCGATGATACAACCGATGTTGCGGACCACAAGGAGTTTGCAGACCGTAA
GAGAACTTATGAAGTCCAAGGGATGAACATGACCGGCTTCTTTACTGTTGATTTTACTCT
CGAGGAGCTGAAAACAATTGGAGCTAAGCAGAGGTATCCTTTCAGGGATCAACAGTACAA
TGGGAAGTTTCCAATTATTACTTTGGACGAGTTTATAGCAATAGCACTGGATGCACCTAG
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GGCTGATGGTAAAAAGTTCGAGGATAAGATTGTTGCAACTTTGAAGAAATATGGATACAA
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TCACTATCTACCGAGACAC

QA 3 801 3 801
DS 



AS 1 4

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TGGTTCAAAAGCTTCAAATTGATTTGCGTTTTGATAGCATTACGATTCAATCACAATGAA
AAGAAGAGACTTTTGAAACTGAAAAATTTAGAGATCAGACTCGATGAGGTAATCCCCGAG
CCTCTCCACAACCAAGTTGCATTGACCACCAGTCATGGGCTCCTCGTAGATGCCAATGAC
CAATGCTTGATTCGTCTTCTTGATAGTAACTCCTCCAGGTCCCTTCTTGCCTCGGATCAC
AGCTCCTGGCTCACCTTGAATAACCATGTACTTGGCTCCACCCAGAAAGAGTCCGGTTGG
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CTGAGGGAAATTGGCGCTCTGAGCCCAGACACTGCCGTCTTGGCCGAGAATAGCGGCGGC
GGTGAGCTGGCTGCCTTCGACGTCACACATGAGGTGGTCATCAACGTACGATTGCCACGA
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GTTGTCTACTTCTCTCTCTTAATGTCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AK31JQ U 285
AF RS1DM39JQ U 1
AF RS1C268JQ U 111
AF RS1DM39TF C 53
BS 1 348 RS1DM39JQ
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TCTTGCCTCGGATCACAGCTCCTGGCTCACCTTGAATAACCATGTACTTGGCTCC
CCCC

QA 1 175 1 175
DS 

RD RS1DM39JQ 591 0 0
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CAATGCTTGATTCGTCTTCTTGATAGTAACTCCTCCAGGTCCCTTCTTGCCTCGGATCAC
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QA 1 591 1 591
DS 

RD RS1C268JQ 608 0 0
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AATCCCCGAGCCTCTCCACAACCAAGTTGCATTGACCACCAGTCATGGGCTCCTCGTAGA
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TTTTTTTTAAAT

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DS 

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TGATCAAAATGCCATTACAT****AAGACACA**AACCCGGTAGTAACAAAGACCAACAA
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CCAATGACCAATGCTTGATTCGTCTTCTTGATAGTAACTCCTCCAGGTCCCTTCTTGCCT
CGGATCACAGCTCCTGGCTCACCTTGAATAACCATGTACTTGGCTCCACCCAGAAAGAGT
CCGGTTGGTGCAAGATGCCCAGGCTCCTCGAAGTCCTTTGTGATTCCTTTGATTTCTTCA
CTCTTCAACTGAGGGAAATTGGCGCTCTGAGCCCAGACACTGCCGTCTTGGCCGAGAATA
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AAAGACTTGTTGTCTACTTCTCTCTCTTAATGTCCCT

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 4

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GCGCTTCGTGCTGCTGCTACTCATCATCAAGGGACTAGCCGTATCGCGGCGACGCTACGG
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GAGATCGGCAAGGTCTCCGGAATCCCTGAGGAGCATCTTTCTCGCAAGGTGATAATATAT
TCACCAGCTAGAAGTGCTACTCAGCAAGGATCTGGCAAACTTGGCAAATGGAAGATTAAC
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TATGCCAATGTAGGCGACTCTGCTCTTTCTTTTGATTCTGAGCTTGCTGCCAAGTCCTTT
GCTCAGCGTCACGGCTGGGATTATGTGGTCAAGAAGCCCAAAACGCCCTTATTGAAGCCT
AAGTCTTACTCGGACAACTTCAAGTGGAAAGGCAAACCTCAACCACAGAACTGATCTTCT
TCCATTTCTCGAGAAAAAAAAGGAGAAACTTCATCTGATAAATAAAAAGAAACCTCTCAT
GGTTTCTTTCTTGTTTTAGCATCTCTGAGCTTGTTCTCTGAACTATGTATTATACATGTT
TGGATTTTTTTT*GTCTGTATCCTTATTTTAACAATAATATGATATGATGGTAATGATAA
ACACTCTTTATGAGGTTTCGTCAAAGCTTTCTGACC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1FL22JQ C 3
AF RS1BJ57JQ C 36
AF RS1BJ57TF U 36
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GTTTCGTC

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DS 

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C

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DS 

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TAGCCGTATCGCGGCGACGCTACGGCGTGTCGCTCGGCCATTCTCAACAGACGCGGTGGT
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GGGATGGACTTCTACGGGTGACCCTTATGCCAATGTAGGCGACTCTGCTCTTTCTTTTGA
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GCCCAAAACGCCCTTATTGAAGCCTAAGTCTTACTCGGACAACTTCAAGTGGAAAGGCAA
ACCTCAACCACAGAACTGATCTTCTTCCATTTCTCGAGAAAAAAAAGGAGAAACTTCATC
TGATAAATAAAAAGAAACCTCTCATGGTTTCTTTCTTGTTTTAGCATCTCTGAGCTTGTT
CTCTGAACTATGTATTATACATGTTTGGATTTTTTTT*GTCTGTATCCTTATTTTAACAA
TAATATGATATGATGGTAATGATAAACACTCTT
TAT

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DS 



AS 1 6

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ACAGGGGTTTAAAAGCCAAGCAAATGAAGCATTATAGCATTTTGAGCATGCATACGATTC
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AAGATCATAGACATAGACTTGCCTTTGAAAGGCAGATAGTTCCTCTCACCTGACTTCAAC
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TCTATGGCCAGAAAGTCTTTCAGGTCACAACTTCCTTTCAAATCGGAAGTTGTGGGGGAA
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1ED80TF C 8
AF RS1F989JQ U 5
AF RS1GF46JQ U 1
AF RS1EJ11JQ U 5
AF RS1GF46TF C 660
AF RS1F989TF C 746
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BS 1187 1339 RS1GF46TF

RD RS1ED80TF 390 0 0
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ACCATCCACAATATTATTCATCAAGGTTCCTCAAACAAAGGTTAACAACAACACAAAGTC
AATGGCACACCAGTAAACACGTGAGAGAGAGAGAG****AGCAAAGATAACAAACAGGGG
TTTAAAAGCCAAGCAAATGAAGCATTATAGCATTTTGAGCATGCATACGATTCTCAGCCT
GTGGGAAGACAATGGAATAAGGAGCTTCCACGACTCCATTGGTCACCTCAACTCCTCTTT
CTGCAGGCAAACAATGCATGAAATAGGCTTTTGGTCCAGCCAACTTCATAAGAGCTTCAT
CCACCTGGAATCCTAGGAATGCTTTTCGGC

QA 1 390 1 390
DS 

RD RS1F989JQ 565 0 0
AAA
AACATCTGTAACCATGTCATATTATATAAAAAAAAGCTCATCATTCTTATTCCCAGCTAC
ACCATCCACAATATTATTCATCAAGGTTCCTCAAACAAAGGTTAACAACAACACAAAGTC
AATGGCACACCAGTAAACACGTGAAAAAAAGAGAGAG**AGCAAAGATAACAAACAGGGG
TTTAAAAGCCAAGCAAATGAAGCATTATAGCATTTTGAGCATGCATACAATTCTCAGCCT
GTGGGAAAACAATGGAATAAGGAGCTTCCACGACTCCATTGGTCACCTCAACTCCTCTTT
CTGCAGGCAAACAATGCATGAAATAGGCTTTTGGTCCAGCCAACTTCATAAAAGCTTCAT
CCACCTGGAATCCTAGGAATGCTTTTCGGCGGTATTCAGCTTCATCCTTTTGGCCCATAC
TGGCCCATACGTCTGAATACACAACATCAGCTCCTATCACAGCTTCTTTAGCATCATGCA
CGATCTCTATCTTACTTAAACCAGCTTGTTCTGCCTTTAAAACTCTCTCTTTGTCTGGCT
CAAACCCTTTTGGGCAAGCGCA

QA 4 565 4 565
DS 

RD RS1GF46JQ 753 0 0
ATATATAAACATCTGTAACCATGTCATATTATATAAAAAGAAGCCCATCATTCTTATTCC
CAGCTACACCATCCACAATATTATTCATCAAGGTTCCTCAAACAAAGGTTAACAACAACA
CAAAGTCAATGGCACACCAGTAAACACGTGAGAGAGAGAGAG****AGCAAAGATAACAA
ACAGGGGTTTAAAAGCCAAGCAAATGAAGCATTATGGCATTTTGAGCATGCATACGATTC
TCAGCCTGTGGGAAGACAATGGAATAAGGAGCTTCCACGACTCCATTGGTCACCTCAACT
CCTCTTTCTGCAGGCAAACAATGCAAGAAATAGGCTTTTGGTCCAGCCAACTTCATAAGA
GCTTCATCCACCTGGAATCCTAGGAATGCTTTTCGGCGGTATTCAGCTTCATCCTTTTGA
CCCATACTGGCCCATACGTCTGAGTACACAACATCAGCTCCTATCACAGCTTCTTTAGCA
TCATGCACGATCTCTATCTTACTTAAACCAGCTTGTTCTGCCTTTAGAACTCTCTCTTTG
TCTGGCTCAAACCCTTTTGGGCAAGCGCAGACGAAGTGGAAAGGAATAACTGATGCCAAT
TCTAACCATGAGTGAGCCATATTGTTCCCATCTCCAACATAAACAACCTTTGTCCCTTCG
ACTTGACCAATGTGCTCAATGATTGTGAGGGCATCAGCCATAATCTGACAAGGATGGTTA
TGATCTGTCAGACCATTGACAACTGGTACACTC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1EJ11JQ 790 0 0
ATA
AACATCTGTAACCATGTCATATTATATAAAAAGAAGCTCATCATTCTTATTCCCAGCTAC
ACCATCCACAATATTATTCATCAAGGTTCCTCAAACAAAGGTTAACAACAACACAAAGTC
AATGGCACACCAGTAAACACGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCAAAGATAACAAACAGGGG
TTTAAAAGCCAA*CAAATGAAGCATTATAGCATTTTGAGCATGCATACGATTCTCAGCCT
GTGGGAAGACAATGGAATAAGGAGCTTCCACGACTCCATTGGTCACCTCAACTCCTCTTT
CTGCAGGCAAACAATGCATGAAATAGGCTTTTGGTCCAGCCAACTTCATAAAAGCTTCAT
CCACCTGGAATCCTAGGAATGCTTTTCGGCGGTATTCAGCTTCATCCTTTTGGCCCATAC
TGGCCCATACGTCTGAGTACACAACATCAGCTCCTATCACAGCTTCTTTAGCATCATGCA
CGATCTCTATCTTACTTAAACCAGCTTGTTCTGCCTTTAAAACTCTCTCTTTGTCTGGCT
CAAACCCTTTTGGGCAAGCGCAAACGAAGTGGAAAGGAATAACTGATGCCAATTCTAACC
ATGAGTGAACCATATTGTTCCCATCTCCAACATAAACAACCTTTGTCCCTTCGACTTGAC
CAATGTGCTCAATGATTGTGAGGGCATCAGCCATAATCTGACAAGGATGGTTATGATCTG
TCAGACCATTGACAACTGGTACACTCGAGTAGTTAGCCAAATCAAGAATGTCCTGATGAG
CAAAGAC

QA 4 790 4 790
DS 

RD RS1GF46TF 680 0 0
GACTTGACCAATGTGCTCAATGATTGTGAGGGCATCAGCCATAATCTGACAAGGATGGTT
ATGATCTGTCAGACCATTGACAACTGGTACACTCGAGTAGTTAGCCAAATCAAGAATGTC
CTGATGAGCAAAGACACGGGCCATAATGATGTCATTATATCTCGACAGAACACGAGCAAC
GTCGCGAGTCTCCTCCCTCTTGCCCATCTGGATGTCATCGGGACCAAGATACAAGGCATG
TCCACCGAGCAAGAAGAAGCCAGTCTCGAAGGAAACACGAGTCCTCATGGAGGGCTTTGC
GAAGATCATAGACATAGACTTGCCTTTGAAAGGCAGATAGTTCCTCTCACCTGATTTCAA
CAGGGCCTTGACCTCTGAGGCCTTGTCGAGAATCTTTTTGATGGTCTCTGTGTCAAAATC
ATCTATGGCCAGAAAGTCTTTCAGGTCACAACTTCCTTTCAAATCGGAAGTTGTGGGG*A
AGTGACGGAGGAGGCTTGGCAGGAGACACGAAGACGGAGGGAGGAGGAGGTCGCCGGAGA
AGAGAGTGATACGGCGGAGAAGCGAGTGAGAGTGGTGGACGGTGAAGAGGAGAGGGAAAG
AGCAGGTGATCGTGGCGTCGAGACGTGAGAAGCCATAGCCGCCATTGTCCTAGTTAGGTT
GATGAGTTGATGACTCTTCC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RS1F989TF 594 0 0
GTACACTCGAGTAGTTAGCCAAATCAAGAATGTC*TGATGAGCAAAGACACGGGCCATAA
TGATGTCATTATATCTCGACAGAACACGAGCAACGTCGCGAGTCTCCTCCCTCTTGCCCA
TCTGGATGTCATCGGGACCAAGATACAAGGCATGTCCACCGAGCAAGAAGAAGCCAGTCT
CGAAGGAAACACGAGTCCTCATGGAGGGCTTTGCGAAGATCATAGACATAGACTTGCCTT
TGAAAGGTAGATAGTTCCTCTCACCTGACTTCAACAGGGCTTTGACCTCTGAGGCCTTGT
CTAGAATCTTTTTGATGGTCTCCGTGTCAAAATCATCTATGGCCAGAAAGTCTTTGAGGT
CACAACTTCCTTTCACATCGGAAGTTGTGGGGGAAGTGACAGAGGAGGCTTGGCAGGAGA
CACGAAGGCGGAGGGAGGAGAAGGTCGCCGGAGAAGAGAGTGATACGGCGGAGAAGCGAG
TGAGAGTGGTGGACGGTGAAGAGGAGAGGGAAAGAGCAGGTGATCGTGGCGTCGAGACGT
GAGAAGCCATAGCCGCCATTGTCCTAGTTAGGTTGATGAGTTGATGACTCTTCC

QA 1 594 1 594
DS 



AS 2 6

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AACGCAACTTGAGAATATCATAATCATCAAAGACGTTTTAAATTAAACAAAAAATACGAG
ACAAGAAACATGGGTAAAGAACAGAGTTTACGAAATAGCATATAGCAAAAAGCTAATCCA
ACACATACGATCTCAGAGACACTAGAAACTGAAAACTCAAAACATGTCCCATGTAAACAT
AAAGCTTTCAAGCCAGCAACAAGCTTTAAGCGGCACCCTTGCCCTTCTTCTTTTGGATTT
TCTTCTGGTAGAATTCTAGCTCCTTGCCTTCAAGAATGTATCCATCAGCACGTCCACATT
GGCCGGGCCTTGAGGAGATGCAGGCCAACAACCTTCCGCTTGCAAACTGGTCCTCAATGT
GGGAATCAAGACTGCGACCTTCTTGACGGCTCTCAATCTTCCTCAGCACGTGGTTGCTCT
TCTTCACCTCCTCAGGAGCAGCAGCAGCTGGTGCAGCATCCTCACCATCCTCGCCTTCCT
TCTTGGCGGCAGCAGGAGCACTCTTCTTCTTGCGACCAACCTCAACACCATAGTGCTGCA
AGTACCACTGCTTGAAAGGAGCGGCATCAACCTGAACAATGGCGCTCTTAACAAGTGTCT
TGGTACGGACAAGCTCGTTGTTGGAGGCGTTGTAGACAACGTCAAGGACTCTGGTCTTGC
GGGTGACAGCTTCGCTTACCCAGGAGTAGTTACCGGTATCGAGCCTCAACGCACGCCACT
TGACGTTACCTCCACGGACACGGATTCTTCTGACCGTCTTGTTGCTGGAGAGCTTGGTGT
TGGCTGGCTGCCTTCCCATCTCATACTTTCGCTTCTTCCTCCATCCCTTCTGCTTGCCTC
CAGTGGCACGCCTCTTGTGGATGAGTCACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GE28JQ U 72
AF RS1CY46JQ U 1
AF RS1BB90JQ U 11
BS 1 166 RS1CY46JQ
BS 167 167 RS1GE28JQ
BS 168 652 RS1CY46JQ
BS 653 653 RS1GE28JQ
BS 654 677 RS1CY46JQ
BS 678 678 RS1BB90JQ
BS 679 738 RS1CY46JQ
BS 739 870 RS1BB90JQ

RD RS1GE28JQ 598 0 0
GGGTAAAGAACAGAGTTTACGAAATAGCATATAGCAAAAAGCTAATCCAACACATACGAT
CTCAGAGACACTAGAAACTGAAAACTCAAAACATGTCCCATGTAAACATAAAGCTTTCAA
GCCAGCAACAAGCTTTAAGCGGCACCCTTGCCCTTCTTCTTTTGGATTTTCTTCTGGTAG
AATTCTAGCTCCTTGCCTTCAAGAATGTATCCATCAGCACGTCCACATTGGCCGGGCCTT
GAGGAGATGCAGGCCAACAACCTTCCGCTTGCAAACTGGTCCTCAATGTGGGAATCAAGA
CTGCGACCTTCTTGACGGCTCTCAATCTTCCTCAGCACGTGGTTGCTCTTCTTCACCTCC
TCAGGAGCAGCAGCAGCTGGTGCAGCATCCTCACCATCCTCGCCTTCCTTCTTGGCGGCA
GCAGGAGCACTCTTCTTCTTGCGACCAACCTCAACACCATAGTGCTGCAAGTACCACTGC
TTGAAAGGAGCGGCATCAACCTGAACAATGGCGCTCTTAACAAGTGTCTTGGTACGGACA
AGCTCGTTGTTGGAGGCGTTGTAGACAACGTCAAGGACTCTGGTCTTGCGGGTGACAG

QA 1 598 1 598
DS 

RD RS1CY46JQ 738 0 0
AACGCAACTTGAGAATATCATAATCATCAAAGACGTTTTAAATTAAACAAAAAATACGAG
ACAAGAAACATGGGTAAAGAACAGAGTTTACGAAATAGCATATAGCAAAAAGCTAATCCA
ACACATACGATCTCAGAGACACTAGAAACTGAAAACTCAAAACATGCCCCATGTAAACAT
AAAGCTTTCAAGCCAGCAACAAGCTTTAAGCGGCACCCTTGCCCTTCTTCTTTTGGATTT
TCTTCTGGTAGAATTCTAGCTCCTTGCCTTCAAGAATGTATCCATCAGCACGTCCACATT
GGCCGGGCCTTGAGGAGATGCAGGCCAACAACCTTCCGCTTGCAAACTGGTCCTCAATGT
GGGAATCAAGACTGCGACCTTCTTGACGGCTCTCAATCTTCCTCAGCACGTGGTTGCTCT
TCTTCACCTCCTCAGGAGCAGCAGCAGCTGGTGCAGCATCCTCACCATCCTCGCCTTCCT
TCTTGGCGGCAGCAGGAGCACTCTTCTTCTTGCGACCAACCTCAACACCATAGTGCTGCA
AGTACCACTGCTTGAAAGGAGCGGCATCAACCTGAACAATGGCGCTCTTAACAAGTGTCT
TGGTACGGACAAGCTCGTTGTTGGAGGCGTTGTAGACAACGTCAAGGACTCTAGTCTTGC
GGGTGACAGCTTCGCTTCCCCAGGAGTAGTTACCGGTATCGAGCCTCAACGCACGCCACT
TGACGTTACCTCCACGGA

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1BB90JQ 860 0 0
GAGAATATCATAATCATCAAAGACGTTTTAAATTAAACAAAAAATACGAGACAAGAAACA
TGGGTAAAGAACAGAGTTTACGAAATAGCATATAGCAAAAAGCTAATCCAACACATACGA
TCTCAGAGACACTAGAAACTGAAAACTCAAAACATGTCCCATGTAAACATAAAGCTTTCA
AGCCAGCAACAAGCTTTAAGCGGCACCCTTGCCCTTCTTCTTTTGGATTTTCTTCTGGTA
GAATTCTAGCTCCTTGCCTTCAAGAATGTATCCATCAGCACGTCCACATTGGCCGGGCCT
TGAGGAGATGCAGGCCAACAACCTTCCGCTTGCAAACTGGTCCTCAATGTGGGAA****G
ACTGCGACCTTCTTGACGGCTCTCAATCTTCCTCAGCACGTGGTTGCTCTTATTCACCTC
CTCAGGAGCAGCAGC***TGGTGCAGCATCCTCACCATCCTCGCCTTCCTTCTTGGCGGC
AGCAGGAGCACTCTTCTTCTTGCGACCAACCTCAACACCATAGTGCTGCAAGTACCACTG
CTTGAAAGGAGCGGCATCAACCTGAACAATGGCGCTCTTAACAAGTGTCTTGGTACGGAC
AAGCTCGTTGTTGGAGGCGTTGTAGACAACGTCAAGGACTCTGGTCTTGCGGGTGACAGC
TTCGCTTACCCAGGAGTAGTTACCGGTATCGAGCCTCAACGCACGCCACTTGACGTTACC
TCCACGGACACGGATTCTTCTGACCGTCTTGTTGCTGGAGAGCTTGGTGTTGGCTGGCTG
CCTTCCCATCTCATACTTTCGCTTCTTCCTCCATCCCTTCTGCTTGCCTCCAGTGGCACG
CCTCTTGTGGATGAGTCACG

QA 1 860 1 860
DS 



CO CL1049Contig2 646 3 4 U
TTTTTTTGTCTACAGAGAAAACCTAAGTTGCAACCATGGGTATTTCTCGTGACTCAATCC
ACAAGAGGCGTGCCACTGGAGGCAAGCAGAAGGGATGGAGGAAGAAGCGAAAGTATGAGA
TGGGAAGGCAGCCAGCCAACACCAAGCTCTCCAGCAACAAGACGGTCAGAAGAATCCGTG
TCCGTGGAGGTAACGTCAAGTGGCGTGCGTTGAGGCTCGATACCGGTAACTACTCCTGGG
GAAGCGAAGCTGTCACCCGCAAGACCAGAGTCCTTGACGTTGTCTACAACGCCTCCAACA
ACGAGCTTGTCCGTACCAAGACACTTGTTAAGAGCGCCATTGTTCAGGTTGATGCCGCTC
CTTTCAAGCAGTGGTACTTGCAGCACTATGGTGTTGAGGTTGGTCGCAAGAAGAAGAGTG
CTCCTGCTGCCGCCAAGAAGGAAGGCGAGGATGGTGAGGATGCTGCACCAGCTGCTGCTG
CTCCTGAGGAGGTGAAGAAGAGCAACCACGTGCTGAGGAAGATTGAGAGCCGTCAAGAAG
GTCGCAGTCTTGATTCCCACATTGAGGACCAGTTTGCAAGCGGAAGGTTGTTGGCCTGCA
TCTCCTCAAGCCCGGCCAATGTGGACGTGCTGATGGATACATTCTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CY46TF U 1
AF RS1E058TF U 1
AF RS1GE28TF U 1
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QA 1 604 1 604
DS 

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TCTC

QA 1 604 1 604
DS 

RD RS1GE28TF 646 0 0
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CTTTCAAGCAGTGGTACTTGCAGCACTATGGTGTTGAGGTTGGTCGCAAGAAGAAGAGTG
CTCCTGCTGCCGCCAAGAAGGAAGGCGAGGATGGTGAGGATGCTGCACCAGCTGCTGCTG
CTCCTGAGGAGGTGAAGAAGAGCAACCACGTGCTGAGGAAGATTGAGAGCCGTCAAGAAG
GTCGCAGTCTTGATTCCCACATTGAGGACCAGTTTGCAAGCGGAAGGTTGTTGGCCTGCA
TCTCCTCAAGCCCGGCCAATGTGGACGTGCTGATGGATACATTCTT

QA 1 646 1 646
DS 



AS 2 5

CO CL1050Contig1 887 3 18 U
CGTACGCAATTTTTGTTTTATTCAAATGGAAATTTTCCTACTGTAAAAGTTGGATGGGGA
AGAGTACATTATTGAATCGTAATTCAAACATTCATATCTCGTTTCATTTTGTTTGATGAC
TATTGAAAAGAAGTGAATAAGATATCCCCTTATAGCTTGGCCGGGAGGTAATGAGGAAAG
TCCCAATCGGTCTTGATGTGGTTCCGACTTATCTCTCTCAGGGAACGACAGCCGCTAAGT
GCCATTGTCAGCTCGAACTCGTCTCTAAGCATTTGCAGCATCTTCCTCACTCCCGCCTCT
CCATTCGCTGCAAGCGAGAACAAGCTAGGCCTCCCAACAAAGACACCTGAAGCTCCAAGA
GCCAATGCTTTAAAGACATCAGTTCCACGGCGAACTCCACCGTCAAGAAACACCGGTAAC
CGACCCCCCACCGCTTTAACCACCTCTTCAAGAGCCATTATAGTTGCAGGGACATAATCA
AGCTGACGAGCTCCATGGTTAGAAACTATAATCCCTGAAGCTCCATACTCAACCGCGATT
CTTGCATCCCCAGCTGTAATAACACCCTTAACAAGAATTGGCAAGCTTGTGATAGACTGA
AGCCACTTTATATCCTTCCAGCTAAGTGATTGATCAACTTGACCCGCAACATATGAAGCT
AGCCCTGAGTCATCGGTCTTGTCTATTTTCCCAAGATCCAACCCTTCAAAATTCTTCAAG
GTCAGACCTCTAGGAAGCGCAAATCTGTTTTTGATGTCGGATTCTCTGCGTCCAAGCCTA
GGGGTATCAACAGTAAGAGCAATAGCTTTGAAACCAGCTTCTTCAGCTCGTTTCACAAGC
TGTCTAACCACATTTCTGTCCTTATAGACATAGAGTTGGAAAAGCGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1A101JQ U 157
AF RS1A101TR U 1
AF RS1FZ05JQ U 55
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RD RS1A101JQ 199 0 0
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CTCAGGGAACGACAGCCGCTAAGTGCCATTGTCAGCTCGAACTCGTCTCTAAGCATTTGC
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ACAAAGACACCTGAAGCTC

QA 1 199 1 199
DS 

RD RS1A101TR 867 0 0
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TATTGAAAAGAAGTGAATAAGATATCCCCTTATAGCTTGGCCGGGAGGTAATGAGGAAAG
TCCCAATCGGTCTTGATGTGGTTCCGACTTATCTCTCTCAGGGAACGACAGCCGCTAAGT
GCCATTGTCAGCTCGAACTCGTCTCTAAGCATTTGCAGCATCTTCCTCACTCCCGCCTCT
CCATTCGCTGCAAGCGAGAACAAGCTAGGCCTCCCAACAAAGACACCTGAAGCTCCAAGA
GCCAATGCTTTAAAGACATCAGTTCCACGGCGAACTCCACCGTCAAGAAACACCGGTAAC
CGACCCCCCACCGCTTTAACCACCTCTTCAAGAGCCATTATAGTTGCAGGGACATAATCA
AGCTGACGGGCTCCATGGTTAGAAACTATAATCCCTGAAGCTCCATATTCAACTGCGATT
CTTGCATCCCCAGCTGTAATAACACCCTTAACAAGAATTGGCAAGCTTGTGATAGACTGG
AGCCACTTTATATCCTTCCAGCTAAGTGATTGATCAACTTGACCCGCAACATATGAAGCT
AGCCCTGAGTCATCGGTCTTGTCTATTTTCCCAAGATCCAACCCTTCGAAGTTCTTCAAG
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GGGGTATCAACAGTAA*AGCAATAGCTTTGAAACCAGCTTCTTCAGCTCGTTTCACAAGC
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QA 1 867 1 867
DS 

RD RS1FZ05JQ 833 0 0
C
GGGGAAGAGTACATTATTGAATCGTAATTCAAACATTCATATCTCGTTTCATTTTGTTTG
ATGACTATTGAAAAGAAGTGAATAAGATATCCCCTTATAGCTTGGCCGGGAGGTAATGAG
GAAAGTCCCAATCGGTCTTGATGTGGTTCCGACTTATCTCTCTCAGGGAACGACAGCCGC
TAAGTGCCATTGTCAGCTCGAACTCGTCTCTAAGCATTTGCAGCATCTTCCTCACTCCCG
CCTCTCCATTCGCTGCAAGCGAGAACAAGCTAGGCCTCCCAACAAAGACACCTGAAGCTC
CAAGAGCCAATGCTTTAAAGACATCAGTTCCACGGCGAACTCCACCGTCAAGAAACACCG
GTAACCGACCCTCCACCGCTTTAACCACCTCTTCAAGAGCCATTATAGTTGCAGGGACAT
AATCAAGCTGACGAGCTCCATGGTTAGAAACTATAATCCCTGCAGCTCCATACTCAACCG
CGATTCTTGCATCCTCAGCTGTAATAACACCTTTGACAAGAATTGGCAAGCTTGTGATAG
ACTGAAGCCACTTTATATCCTTCCAGCTAAGTGATTGATCAACTTGACCCGCAACATATG
AAGCTAGCCCTGAGTCATCGGTTTTGTCTATTTTCCCAAGATCCAACCCTTCAAAATTCT
TCAAGGTCAGACCTCTAGGAAGTGCGAATCTGTTTTTGATGTCGGATTCTCTGCGTCCAA
GCCTAGGGGTATCAACAGTAAGAGCAATAGCTTTGAAACCAGCTTCTTCAGCTCGTTTCA
CAAGCTGTCTAACCACATTTCTGTCCTTATAGACATAGAGTTGGAAAAGCGA

QA 2 833 2 833
DS 



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ACACCAACCAAGCCGCCCTCTCTCGCTCTAGAAATTTTATAAAAAGATGGAGATAACGAA
CGTGATGGAATACGAGAAGATAGCAAAGGAGAAACTACCGAAGATGGTTTATGATTACTA
TGCTTCTGGTGCAGAGGATCAGTGGACTCTTCAGGAGAATCGTAACGCCTTTTCCAGGAT
TCTGTTTAGGCCTCGGATTCTGATCGATGTAAGCAAGATTGATGTGAGCACGACTGTTTT
AGGGTTTAACATATCTATGCCAATCATGGTTGCTCCTACAGCTATGCAGAAAATGGCTCA
CCCTGATGGTGAGCTTGCAACCGCTAGAGCTACTTCTGCTGCTGGAACAATCATGACATT
ATCTTCATGGGCTACGTGTAGTGTTGAGGAAGTTGCTTCCACAGGACCTGGGATTCGTTT
TTTCCAACTTTATGTCTATAAGGACAGAAATGTGGTTAGACAGCTTGTGAAACGAGCTGA
AGAAGCTGGTTTCAAAGCTATTGCTTTACTGTTGATACCCCTAGGCTTGGACGCAGAGAA
TCCGACATCAAAAACAGATTTGCGCTTCCTAGAGGACTGACCTTGAAGAACTTCGAAGGG
TTGGATCTTGGGAAAATAGACAAGACCGATGACTCAGGGCTAGCTTCATATGTTGCGGGT
CAAGTTGATCAATCACTTAGCTGGAAGGATATAAAGTGGCTCCAGTCTATCACAAGCTTG
CCAATTCTTGTTAAAGGGTGTTATTACAGCTGGGGATGCAAGAATCGCAGTTGAATATGG
AGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AGCT

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CCTAGAGGACTGACCTTGAAGAACTTCGAAGGGTTGGATCTTGGGAAAATAGACAAGACC
GATGACTCAGGGCTAGCTTCATATGTTGCGGGTCAAGTTGATCAATCACTTAGCTGGAAG
*ATATAAAGTGGCTCCAGTCTATCACAAGCTTGCCAATTCTTGTTAAAGGGTGTTATTAC
AGCTGGGGATGCAAGAATCGCAGTTGAATATGGAGCT

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DS 



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AGCTCCTCGACCTCTGCAACGCCTTCAGCTCTGAGCTTAGCCGCCTCAACCAAGGCCATC
TCTTTCTCCAGTTTGCTTTGCATAACTTGGACACCAACGCTCCTCAGAATCTTTCCAAAG
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GCTGTCATTCAATCCTGACCAGCCTTGTTCAGACCTTGAATCTCCCCAAGGTGAAAAACT
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TCTCAAACGAGCTTCCATGGGCACCATCCTTCATGCAAATGCAGAACACGATGAACGCAG
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CAGTGAAACTATTACTATTTGTATAAGAAAAAGGTTTTACC


BQ
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BS 1 650 RS1EH89TF
BS 651 657 RS1FU27TF
BS 658 658 RS1AR58TFB
BS 659 688 RS1FU27TF
BS 689 906 RS1AR58TFB
BS 907 1145 RS1EH89JQ
BS 1146 1146 RS1AR58JQ
BS 1147 1149 RS1EH89JQ
BS 1150 1150 RS1AR58JQ
BS 1151 1299 RS1EH89JQ
BS 1300 1301 RS1AR58JQ

RD RS1EH89TF 653 0 0
GGCTGACCGCCCCTCTCCAGTTTATTGTCCTTTGATTTTGCGAAACACTTGTATCAGGCG
AATCCCAGTTTCGTTCTTCTTCACTTTAGTTGAAACTTTATAAGATGGCACGTCCACAAG
ACCCTCCACGCGGTTTCTTCCCTTTTGGAAACCCCTTTAAGAACCTCTCTTCCAAGAACC
CTCTACTATCCTCTAAGCTTCTCTCCCTCTTGAACACTTTCGAGACCAACTTATCTTCTT
CCATCTCAAAGCTTGTCCCCAAGGAAAAGTCCCAAATCCTCACTCTTTCATGGATGAGTC
AAGCTATGGTTTCTCTTTGCCAGACCCACGATGCTATCAAGACTCTTATAACCGCTCTTG
AGCTTCCTGTCTCTGACTGGGAGGACAAGTGGGTCGATGTCTACCTAGACATCAGCGTCA
AGCTCCTCGACCTCTGCAACGCCTTCAGCTCTGAGCTTAGCCGCCTCAACCAAGGCCATC
TCTTTCTCCAGTTTGCTTTGCATAACTTGGACACCAACGCTCCTCAGAATCTTTCCAAAG
CTCAATCGTCCCTCGACAGCTGGAAGCGACACATCGTTTCCAAGAACCCAAGGTTGGAAA
GCTGTCATTCAATCCTGACCAGCCTTGTTCAGACCTTGAATCTCCCCAAG
TGA

QA 1 650 1 650
DS 

RD RS1FU27TF 682 0 0
CCGCCCCTCTCCAGTTTATTGTCCTTTGATTTTGCGAAACACTTGTATCAGGCGAATCCC
AGTTTCGTTCTTCTTCACTTTAGTTGAAACTTTATAAGATGGCACGTCCACAAGACCCTC
CACGCGGTTTCTTCCCTTTTGGAAACCCCTTTAAGAACCTCT*TTCCAAGAACCCTCTAC
TATCCTCTAAGCTTCTCTCCCTCTTGAACACTTTCGAGACCAACTTATCTTCTTCCATCT
CAAAGCTTGTCCCCAAGGAAAAGTCCCAAATCCTCACTCTTTCATGGATGAGTCAAGCTA
TGGTTTCTCTTTGCCAGACCCACGATGCTATCAAGACTCTTATAACCGCTCTTGAGCTTC
CTGTCTCTGGCTGGGAGGACAAGTGGGTCGATGTCTACCTAGACATCAGCGTCAAGCTCC
TCGACCTCTGCAACGCCTTCAGCTCTGAGCTTAGCCGCCTCAACCAAGGCCATCTCTTTC
TCCAGTTTGCTTTGCATAACTTGGACACCAACGCTCCTCAGAATCTTTCCAAAGCTCAAT
CGTCCCTCGACAGCTGGAAGCGACACATCGTTTCCAAGAACCCAAGGTTGGAAAGCTGTC
ATTCAATCCTGACCAGCCTTGTTCAGACCTTGAATCTCCCCAAGGTGAAAA*CTCTGCCA
AAGGAAAAGTCCTGATGCGTGC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1AR58TFB 830 0 0
GGGTA
AGTTGAAACTTTATAAGATGGCACGTCCACAAGACCCTCCACGCGGTTTCTTCCCTTTTG
GAAACCCCTTTAAGAACCTCTCTTCCAAGAACCCTCTACTATCCTCTAAGCTTCTCTCCC
TCTTGAACACTTTCGAGACCAACTTATCTTCTTCCATCTCAAAGCTTGTCCCCAAGGAAA
AGTCCCAAATCCTCACTCTTTCATGGATGAGTCAAGCTATGGTTTCTCTTTGCCAGACCC
ACGATGCTATCAAGACTCTTATAACCGCTCTTGAGCTTCCTGTCTCTGACTGGGAGGACA
AGTGGGTCTATGTCTACCTAGACATCAGCGTCAAGCTCCTCGACCTCTGCAACGCCTTCA
GCTCTGAGCTTAGCCGCCTCAACCAAGGCCATCTCTTTCTCCAGTTTGCTTTGCATAACT
TGGACACCAACGCTCCTCAGAATCTTTCCAAAGCTCAATCGTCCCTCGACAGCTGGAAGC
GACACATCGTTTCCAAGAACCCAAGGTTGGAAAGCTGTCATTCAATCCTGACCAGCCTTG
TTCAGACCTTGAATCTCCCCAAGGTGAAAAACTCTGCCAAAGGAAAAGTCCTGATGCGTG
CTCTCTACGGTGTCAAGGTCAAGACTCTGTACATTTCTGGTGTCTTTGCTGCTGCCTTCT
CAGGTTCCTCGCAGAACCTGCTCTACGTTACGGTCTCAAACGAGCTTCCATGGGCACCAT
CCTTCATGCAAATGCAGAACACGATGAACGCAGAGATCAAGAGCATATTTTTATCTGACG
GTTTAACCGTTATGAAAGAGCTCGAGGCTGTTGATTCAG
TGTTAG

QA 6 824 6 824
DS 

RD RS1EH89JQ 746 0 0
ACAGCTGGAAGCGACACATCGTTTCCAAGAACCCAAGGTTGGAAAGCTGTCATTCAATCC
TGACCAGCCTTGTTCAGACCTTGAATCTCCCCAAGGTGAAAAACTCTGCCAAAGGAAAAG
TCCTGATGCGTGCTCTCTACGGTGTCAAGGTCAAGACTCTGTACATTTCTGGTGTCTTTG
CTGCTGCCTTCTCAGGTTCCTCGCAGAACCTGCTCTACGTTACGGTCTCAAACGAGCTTC
CATGGGCACCATCCTTCATGCAAATGCAGAACACGATGAACGCAGAGATCAAGAGCATAT
TTTTATCTGACGGTTTAACCGTTATGAAAGAGCTCGAGGCTGTTGATTCAGGTGTTAAGA
ACCTTGCTCCTGCGATCCAACAAGGGTCAATAGATCCCATCGTACTGCAGCCATTGAAGG
ACTCGGTCACGAAGTTAACGAGTGGGATAGACCTTGTTTCCAAGGAGGTGGATTGCTTCT
TCAAGATTCTCTTGTCGGGGAGAGACACTTTGCTGGAGAACCTCAGGTCGATGGGCGCAT
CAACGGTACTGCAGGCAACATCACCAAAAAAGGCTGCTGGAAAAAAGCAGGGAGTATTCT
GATAAAGTGGTATTGTGTGAATAGATGGTATTGTAAGTGTTCCATCTTGGTCGTCAATGT
ATTATTATTAGGTGCTTGTCATATTGTGGTCGTTTGTAAGGGACGCAGTGAAACTATTAC
TATTTGTATAAGAAAAAGGTTTTA
TC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1AR58JQ 606 0 0
GGT
GTCAAGGTCAAGACTCTGTACATTTCTGGTGTCTTTGCTGCTGCCTTCTCAGGTTCCTCG
CAGAACCTGCTTTACGTTACGGTCTCAAACGAGCTTCCATGGGCACCATCCTTCATGCAA
ATGCAGAACACGATGAACGCAGAGATCAAGAGCATATTTTTATCTGACGGTTTAACCGTT
ATGAAAGAGCTCGAGGCTGTTGATTCAGGTGTTAAGAACCTTGCTCCTGCGATCCAACAA
GGGTCAATAGATCCCATCGTACTGCAGCCATTGAAGGACTCGGTCACGAAGTTAACGAGT
GGGATAGACCTTGTTTCCAAGGAGGTGTATTGCTTCTTCAAGATTCTCTTGTCGGGGAGA
GACACTTTGCTGGAGAACCTCAGGTCGATGGGCGCATCAACGGTACTGCAGGCAACATCA
CCAAAAAAGGCTGCTGGAAAAAAGCAGAGAGGATTCTGATAAAGTGGTATTGTGTGAATA
GATGGTATTGTAAGTGTTCCATCTTGGTCGTCAATGTATTATTATTAGGTGCTTGTCATA
TTGTGGTCGTTTGTAAGGGACGCAGTGAAACTATTACTATTTGTATAAGAAAAAGGTTTT
ACC

QA 4 606 4 606
DS 

RD RS1FU27JQ 606 0 0
GGC
GTCAAGGTCAAGACTCTGTACATTTCTGGTGTCTTTGCTGCTGCCTTCTCAGGTTCCTCG
CAGAACCTGCTCTACGTTACGGTCTCAAACGAGCTTCCATGGGCACCATCCTTCATGCAA
ATGCAGAACACGATGAACGCAGAGATCAAGAGCATATTTTTATCTGACGGTTTAACCGTT
ATGAAAGAGCTCGAGGCTGTTGATTCAGGTGTTAAGAACCTTGCTCCTGCGATCCAACAA
GGGTCAATAGATCCCATCGTACTGCAGCCATTGAAGGACTCGGTCACGAAGTTAACGAGT
GGGATAGACCTTGTTTCCAAGGAGGTGGATTGCTTCTTCAAGATTCTCTTGTCGGGGAGA
GACACTTTGCTGGAGAACCTCAGGTCGATGGGCGCGTCAACGGTACTGCAGGCAACATCA
CCAAAAAAGGCTGCTGGAAAAAAGCAGAGAGGATTCTGATAAAGTGGTATTGTGTGAATA
GATGGTATTGTAAGTGTTCCATCTTGGTCGTCAATGTATTATTATTAGGTGCTTGTCATA
TTGTGGTCGTTTGTAAGGGACGCAGTGAAACTATTACTATTTGTATAAGAAAAAGGTTTT
A
TC

QA 4 604 4 604
DS 



AS 1 6

CO CL1052Contig1 390 6 9 U
GGAGTCCACCTTTGAGAAAAAATGGCAAGCAATATGGAAGTTTTCTGCGAGATCTTGATC
GCAGTCCTTCTTCCTCCTCTTGGAGTCTGCCTCAAGCGTGGCTGCTGCACTGTAGAGTTC
TTGATATGCTTGGTGTTGACTATCTTGGGCTACATCCCTGGGATAATCTATGCTATATAC
GTGATCGTATTTCAGAACCGTGAAGGGGAAACTCAGGACTACAGTGCTCCACTCAACTCA
GCTTGAGACTATCTGTTGGTCCATTCAATGTCTTTGAGGCTGTTTTAATTATGTAACCAC
TAAATAAGTTGCTATGCAATCTCATCAGTTTCCTTATCATGTATATTCAGCTATTCAAGT
CATGCCAATTTCATAGAATGACTTTTGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EV58TF U 1
AF RS1EV58JQ C 90
AF RS1EK03JQ C 15
AF RS1EK03TF U 15
AF RS1A829TF U 26
AF RS1A829JQ C 47
BS 1 216 RS1EV58TF
BS 217 217 RS1EK03TF
BS 218 251 RS1EV58TF
BS 252 252 RS1EK03TF
BS 253 338 RS1EV58TF
BS 339 356 RS1EK03TF
BS 357 357 RS1A829TF
BS 358 376 RS1EK03TF
BS 377 390 RS1A829TF

RD RS1EV58TF 338 0 0
GGAGTCCACCTTTGAGAAAAAATGGCAAGCAATATGGAAGTTTTCTGCGAGATCTTGATC
GCAGTCCTTCTTCCTCCTCTTGGAGTCTGCCTCAAGCGTGGCTGCTGCACTGTAGAGTTC
TTGATATGCTTGGTGTTGACTATCTTGGGCTACATCCCTGGGATAATCTATGCTATATAC
GTGATCGTATTTCAGAACCGTGAAGGGGAAACTCAGTACTACAGTGCTCCACTCAACTCA
GCTTGAGACTACCTGTTGGTCCATTCAATGTCTTTGAGGCTGTTTTAATTATGTAACCAC
TAAATAAGTTGCTATGCAATCTCATCAGTTTCCTTATC

QA 1 338 1 338
DS 

RD RS1EV58JQ 249 0 0
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CTACATCCCTGGGATAATTTATGCTATATACGTGATCGTATTTCAGAACCGTGAAGGGGA
AACTCAGTACTACAGTGCTCCACTCAACTCAGCTTGAGACTACCTGTTGGTCCATTCAAT
GTTTTTGAGGCTGTTTTAATTATGTAACCACTAAATAAGTTGCTATGCAATTTCATCAGT
TTCCTTATC

QA 1 249 1 249
DS 

RD RS1EK03JQ 362 0 0
AGAAAAAATGGCAAGCAATATGGAAGTTTTTTGCGAGATCTTGATCGCAGTCCTTCTTCC
TCCTCTTGGAGTCTGCCTCAAGCGTGGCTGCTGCACTGTAGAGTTCTTGATATGCTTGGT
GTTGACTATCTTGGGCTACATCCCTGGGATAATCTATGCTATATACGTGATCGTATTTCA
GAACCGTGAAGGGGAAACTCAGGACTACAGTGCTCCACTCAACTCAGCTTGAGACTATCT
GTTGGTCCATTCAATGTCTTTGAGGCTGTTTTAATTATGTAACCACTAAATAAGTTGCTA
TGCAATCTCATCAGTTTCCTTATCATGTATATTCAGCTATTCGAGTCATGCCAATTTCAT
AG

QA 1 362 1 362
DS 

RD RS1EK03TF 362 0 0
AGAAAAAATGGCAAGCAATATGGAAGTTTTCTGCGAGATCTTGATCGCAGTCCTTCTTCC
TCCTCTTGGAGTCTGCCTCAAGCGTGGCTGCTGCACTGTAGAGTTCTTGATATGCTTGGT
GTTGACTATCTTGGGCTACATCCCTGGGATAATCTATGCTATATACGTGATCGTATTTCA
GAACCGTGAAGGGGAAACTCAGGACTACAGTGCTCCACTCAACTCAGCTTGAGACTATCT
GTTGGTCCATTCAATGTCTTTGAGGCTGTTTTAATTATGTAACCACTAAATAAGTTGCTA
TGCAATCTCATCAGTTTCCTTATCATGTATATTCAGCTATTCGAGTCATGCCAATTTCAT
AG

QA 1 362 1 362
DS 

RD RS1A829TF 365 0 0
CAAGCAATATGGAAGTTTTCTGCGAGATCTTGATCGCAGTCCTTCTTCCTCCTCTTGGAG
TCTGCCTCAAGCGTGGCTGCTGCACTGTAGAGTTCTTGATATGCTTGGCGTTGACTATCT
TGGGCTACATCCCTGGGATAATCTATGCTATATACGTGATCGTATTTCAGAACCGTGAAG
GGGAAACTCAGGACTACAGTGCTCCACTCAACTCAGCTTGAGACTATCTGTTGGTCCATT
CAATGTCTTTGAGGCTGTTTTAATTATGTAACCACTAAATAAGTTGCTATGCAATCTCAT
CAGTTTCCTTATCATGTATATTCAGCTATTCAAGTCATGCCAATTTCATAGAATGACTTT
TGACT

QA 1 365 1 365
DS 

RD RS1A829JQ 344 0 0
GCGAGATCTTGATCGCAGTCCTTCTTCCTCCTCTTGGAGTTTGCCTCAAGCGTGGCTGCT
GCACTGTAGAGTTCTTGATATGCTTGGCGTTGACTATCTTGGGCTACATCCCTGGGATAA
TTTATGCTATATACGTGATCGTATTTCAGAACCGTGAAGGGGAAACTCAGGACTACAGTG
CTCCACTCAACTCAGCTTGAGACTATCTGTTGGTCCATTCAATGTCTTTGAGGCTGTTTT
AATTATGTAACCACTAAATAAGTTGCTATGCAATCTCATCAGTTTCCTTATCATGTATAT
TCAGCTATTCAAGTCATGCCAATTTCATAGAATGACTTTTGACT

QA 1 344 1 344
DS 



AS 1 6

CO CL1053Contig1 876 6 19 U
ACCCAACAAAAGAGAATAATTGATCTAAATTCCAAAAGGAAACAATACAAGTAAACGATT
TGTAAGAAAATCAGTCATAAGATACTTGAGTAAACATGCACTCATCTCTAGTGAACAGCA
ACAATTTCAGGTATGGCTATTAAAAGCCCATGATTAAAGATCATTTTGCTACAACGATGA
TAATCATGTTAAAAGACTTCTTGCCAGGTGCTCTC**GCCGTTGCAAATGCTTGGGTTAA
TGTCTGTTCAGAGAGTGAACCACTTGCTTCTGTGCTCTGCATTGCTACTTTTCCCGCAAT
GACATTGGCATCTGTTTCCAATACCATCCCCTGATCAACCATCTCATCAAGGCACAAAAA
GATGAGATCCAAGTTTTCAAGGGCTTCCATCTTTTCAACATTGTTCCTGAGAAGTAATGC
AACGGCATCAAAAAAGCCTTGTAGAACAGATGATAAGATGAGCTCGTTTTCATCTTCACC
TCCTGTAACAAAGAAGTGAAGGTCCTGGGCAAACTTATAGACAACAATGTTATTCTCCAA
CAGTGTGATCTCCGCTTCTGTGCGAGCATTGGTTTTAGAGGTCTTCGTGAAGACATACTT
TTCAAAAGCTAACTTGGCAGCATTAGTTGTCCAATCATCCGAGTAATACTTGACAGCCAC
ACGTTTTCCTTCAGAGTCTAGAAGAAGGATGTTTTTTACCAAAGGACAAGAATCATTAGC
TCTTGACATTGCTGTTGAACCAAGTTACACCTTTGAGATCGATGATGACTTGCTTGAGCC
GAAGGAACTCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT
GATAACTTCGTATAATGTATGCTATACGAAGTTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1DX80JQ U 1
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AF RS1A266JQ U 11
AF RS1A266TV C 11
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DS 

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GATGAGATCCAAGTTTTCAAGGGCTTCCATCTTTTCAACATTGTTCCTGAAAAGTAATGC
AACGGCATCAAAAAAGCCTTGTAGAACAGATGATAAGATGAGCTCGTTTTCATCTTCACC
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CAGTGTGATCTCCGCTTCTGTGCGAGCATTGGTTTTAGAGGTCTTCGTGAAGACATACTT
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CC

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DS 

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TGCTTGGGTTAATGTCTGTTCAGAGAGTGAACCACTTGCTTCTGCGCTCTGCATTGCTAC
TTTTCCCGCAATGACATTGGCATCTGTTTCCAATACCATCCCCTGATCAACCATCTCATC
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GAGAAGTAATGCAACGGCATCAAAAAAGCCTTGTAGAACAGATGATAAGATGAGCTCGTT
TTCATCTTCACCTCCTGTAACAAAGAAGTGAAGGTCCTGGGCAAACTTATAGACAACAAT
GTTATTCTCCAACAGTGTGATCTCCGCTTCTGTGCGAGCATTGGTTTTAGAGGTCTTCGT
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CTTGACAGCCACACGTTTTCCTTCAGAGTCTAGAAGAAGGATGTTTTT*ACCAAAGGACA
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CC

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C

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AAGTTTTCAAGGGCTTCCATCTTTTCAACATTGTTCCTGAGAAGTAATGCAACGGCATCA
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CCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 830 1 830
DS 

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GAGAGTGAACCACTTGCTTCTGTGCTCTGCATTGCTACTTTTCCCGCAATGACATTGGCA
TCTGTTTCCAATACCATCCCCTGATCAACCATCTCATCAAGGCACAAAAAGATGAGATCC
AAGTTTTCAAGGGCTTCCATCTTTTCAACATTGTTCCTGAGAAGTAATGCAACGGCATCA
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TCCGCTTCTGTGCGAGCATTGGTTTTAGAGGTCTTCGTGAAGACATACTTTTCAAAAGCT
AACTTGGCAGCATTAGTTGTCCAATCATCCGAGTAATACTTGACAGCCACACGTTTTCCT
TCAGAGTCTAGAAGAAGGATGTTTTTTACCAAAGGACAAGAATCATTAGCTCTTGACATT
GCTGTTGAACCAAGTTACACCTTTGAGATCGATGATGACTTGCTTGAGCCGAAGGAACTC
CCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACTGATAACTTCG
TATAATGTATGCTATACGAAGTTATG

QA 1 866 1 866
DS 



AS 1 6

CO CL1054Contig1 767 6 28 U
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CCAAGTTTCTTTCGATCTCCTCGCCGCAGATCAAATTCTCCTATTCCTCGGATAAACCTT
TCCTTCTGCGGCGGCGATAAAAAA*GAACAAACCTCCCAAACAACAACAAAA*GTTTCAA
CCTTTTATTGTCTGTTCCATCTCTCTCTCTCTCTTTCAAGAAACCACATATTTCGATAAA
CATGGCTCGCTCTCTCTCTAACGTTAAGATGGTATCTGCGTTCGTCTCTCAAGAACTCTC
TAATGCAATCTTCCGACGCGGTTATGCGGCCACGGCGGGTAAGTCTAGCGGTGGAAAAGG
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TTGGATTCCAGACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGGAAACCGGTTCCAACGAGATTGA
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GAAGAGGGTAATTATCCGTTGTGGTGAACCCTATTTTCATCTGCTATGTGAGATTCTTTA
ATAAACTAATAGAGAAGCCTTCTTGGTTTTTCTATTTTGTAACAAAAAGGATCGTTGGAT
GTTTATGTATTATCCATAATATAGTTTTTAATCAATTATTTACTAGT


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CG25TF U 1
AF RS1GL21TF U 3
AF RS1FG75TF U 3
AF RS1FG75JQ C 253
AF RS1GL21JQ C 41
AF RS1CG25JQ C 113
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RD RS1CG25TF 679 0 0
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ATAAACTAATAGAGAAGCC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1GL21TF 685 0 0
GG
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ACTAATAGAGAAGCCTTCTTGGT

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DS 

RD RS1FG75TF 756 0 0
GG
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TCTGCGGCGGCGATAAAAAA*GAACAAACCTCCCAAACAACAACAAAA*GTTTCAACCTT
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GCAATCTTCCGACGCGGTTATGCGGCCACGGCGGGTAAGTCTAGCGGTGGAAAAGGTGGA
GCCGTTGTTTCGGCGGTAGTGAAGAAGGGAGTGGAAGAATCGAACCAGAAGATTGCTTGG
ATTCCAGACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGGAAACCGGTTCCAACGAGATTGACCCA
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ATGTATTATCCATAATATAGTTTT
ACCGAAAAAA

QA 3 746 3 746
DS 

RD RS1FG75JQ 502 0 0
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TATCCGTTGTGGTGAACCCTATTTTCATTTGCTATGTGAGATTCTTTAATAAACTAATAG
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TCCATAATATAGTTTT
TAACCG

QA 1 496 1 496
DS 

RD RS1GL21JQ 690 0 0
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CTATTCCTCGGATAAACCTTTCCTTCTGCGGCGGCGATAAAAAAAGAACAAACCTCCCAA
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TTCGTCTCTCAAGAACTCTCTAATGCAATCTTCCGACGCGGTTATGCGGCCACGGCGGGT
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GAATCGAACCAGAAGATTGCTTGGATTCCAGACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGGAA
ACCGGTTCCAACGAGATTGACCCAGCGGAGTTACGAGCAGCTCTCTTAAACAACAAGCAG
TGATTGATTAATTCAGAAAAACTCTGATTTATTTGGATTATTAGTTATATTAATGTTAAT
TAAATGTCTTAAGATTAGGGGAAGAGGGTAATTATCCGTTGTGGTGAACCCTATTTTCAT
CTGCTATGTGAGATTCTTTAATAAACTAATAGAGAAGCCTTCTTGGTTTTTCTATTTTGT
AACAAAAAGGATCGTTGGATGTTTATGTAT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1CG25JQ 655 0 0
TAAACCTCTCCTTCTGCGGCGGCGATAAAAAA*GAACAAACCTCCCAAACAACAAAAAAA
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TCGATAAACATGGCTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGATGGTATCTGCTTTCGTCTCTCAA
GAACTCTCTAATGCAATCTTCCGACACGGTTATGCGGCCACGGCGGGTCAGTCTAGCGGT
GGAAAAGGTGGAGCCGTTGTTTCGGCGGTAGTGAAGAAGGGAGTGGAAGAATCAAACCAG
AAGATTGCTTGGATTCCAGACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGGAAACCGGTTCCAAC
GAGATTGACCCAGCGGAGTTACGAGCAGCTCTCTTAAACAACAAGCAGTGATTGATTAAT
TCAGAAAAACTCTGATTTATTTGGATTA***GTTATATTAATGTTAATTAAATGTCTTAA
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ATTCTTTAATAAACTAATAGAGAAGCCTTCTTGGTTTTTCTATTTTGTAACAAAAAGGAT
CGTTGGATGTTTATGTATTATCCATAATATAGTTTTTAATCAATTATTTACTAGT

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 5

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CAACAAAATTCATCAACACACTCCCCAACCAAAGCTTCCCATCTTTTTCTTCTACCTCAC
TCACTGATCTCACAACTTTTCCTTCGCTATCTTCCAGTACCTTCACAAGCTTCCCTTCAG
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TTGCGGTGATTGGGAGTCTCAGTATGAACATCCTTAGCTTAGGGTATCTTGCCATTATGT
ACGAGTAGTAGTTGCGCCTGCAGTGAAGCGCCACCCAAAATTCACCTTCTTTGTTTGTCC
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CTTTTAACCAGTATCTTCGCAGGCTTCCAATATCACCCTCGCAGAAAACAAAGAAAGAAC
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TCTTTGCTATTGGATCATACCTAAGAACCCTCCCAGTATTGTCTCCAGAGAAAACGAGCT
GCAAAAAGTTCCTTCTCTGGTAATTGATGCTGCTATCAGTAAAGTAAACAGTTCCATCAT
CATCAATGTCAAGGTCGTTAGTAAACTCCAACGGGACGCCTTCAGCCTCAGTTACAAGCG
GCATTGCTAAGCCACCTTCAGGACCTACTTTCAAAAGTCCCATATAAGCGTCGGCTATGT
ACAAATCACCGGTTCTCTTATCGAAACGGAGTCCCAGAGGACGCCCACATATATGCTCGT
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TGTATGCGAAGTCAGTCCAGTTGTGACCATTCCAGAACAAAACCCTACCATCAGCAACGC
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TCTGAAACAGAATCTCGGATCTCTGAAGAGAGTTCTGTGAGTCTCTCTCCCATGGAACTT
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AGTGGTTGAAAGGGTCGAGGCTGCAGTAGAGGGCGAGGGAGAAGGTGAGGAAGAAAAGAG
AAGAGGTAGCAGGGGAGAAGAACAAGGCCATGATGGAACCGAGGGTGATGTGGAGAGAAA
CTGTTAGGGTTTAAAAGGGGGAAGAAGAAGAGTGGTAGGTGGAATCCATCGAGTGGTTGA
GCAATGCCAAGAGAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GZ53JQ U 1
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AF RS1E940JQ U 23
AF RS1E940TF C 566
AF RS1B249TF C 718
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CTTTTAACCAGTATCTTCGCAGGCTTCCAATATCACCCTCGCAGAAAACAAAGAAAGGAC
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TCTTTGCT

QA 1 548 1 548
DS 

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CGTGTAAG
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AGCTTCCCATCTTTTTCTTCCACTTCACTCACTGATCTCACAACTTTCCCTTCACTATCT
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AACAGTCCCATATATGCGTCGGCTATG

QA 9 755 9 755
DS 

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TTTTAATAAAATCAAAGATCATAGACAGCAACAAAATTCATCAACACACTCCCCAACCAA
AGCTTCCCATCTTTTTCTTCTACCTCACTCACTGATCTCACAACTTTTCCTTAGCTATCT
TCCAGTACCTTCACAAGCTTCCCTTCAGGGCTATACTTCACCACCAAGCCGTGCGGCCGC
ATCCCGATCTGGAACATGTAGTGTATTCTTGCGGTGATTGGGAGTCTCAGTATGAACATC
CTTAGCTTAGGGTATCTTGCCATTATGTACGAGTAGTAGTTGCGCCTGCAGTGAAGCGCC
ACCCAAAATTCACCTTCTTTGTTTGTCCTTACGTTATCAGGATGCCCTGGTAACATTGCA
AACACATCTGTCGTTCCAGCTTTCTCTCCTTTTAACCAGTATCTTCGCAGGCTTCCAATA
TCACCCTCGCAGAAAACAAAGAAAGAACCGTCTTTGCTGATAGACACACCGTTGGGAAAC
TGAACATTTGAGACTAGAACAACAGCTTTCTTTGCTATTGGATCATACCTAAGAACCCTC
CCAGTATTGTCTCCAGAGAAAACGAGCTGCAAAAAGTTCCTTCTCTGGTAATTGATGCTG
CTATCAGTAAAGTAAACAGTTCCATCATCATCAATGTCAAGGTCGTTAGTAAACTCCAAC
GGGACGCCTTCAGCCTCAGTTACAAGCGGCATTGCTAAGCCACCTTCAGGACCTACTTTC
AAAAGTCCCATATAAGCGTCGGCTATGTACAAATCACCGGTTCTCTTATCGAAACGGAGT
CCCAGAGGACGCCCACATATATGCT

QA 11 815 11 815
DS 

RD RS1E940TF 684 0 0
G
ACCCTCCCAGTAT*GTCTCCAGAGAAAACGAGCTGCAAAAAGTTCCTTCTCTGGTAATTG
ATGCTGCTATCAGTAAAGTAAACAGTTCCATCATCATCAATGTCAAGGTCGTTAGTAAAC
TCCAACGGGACGCCTTCAGCCTCAGTTACAAGCGGCATTGCTAAGCCACCTTCAGGACCT
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CGGAGTCCCAGAGGACGCCCACATATATGCTCGTTCCTCAAGTAACTCAGAGCAGAAGGC
TTCGGATCACAAATCTCCGACCTATTGCTTGACGTGTATGCGAAGTCAGTCCAGTTGTGG
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TCAAAGGCGACGCTCTCAGGACCCTGGACTTGGTTCTGAAACAGAATCTCGGATCTCTGG
GGAGAGTTCTGTGAGTCTCTCTCCCATGGAACTTGATCGGGGCGTGGAGAGACAACCTCG
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GCCATGATGGAACCGA
AGGGTCC

QA 2 677 2 677
DS 

RD RS1B249TF 657 0 0
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CGTTCCTCAAGTAACTCATAGCAGAAGGCTTCAGATCACA**TCTCCGATCTATTGCTTG
ACGTGTATGCGAAGTCAGTCCAGTTGTGACCATTCCAGAACAAAACCCTACCATCAGCAA
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GGTTCTGAAACAGAATCTCGGATCTCTGAAGCGAGTTCTGTGAGTCTCTCTCCCATGGCA
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CGCAGTGGTTGAAGGGGTCGAGGCTGCAGTAGAGGGCGAGGGAGAAGGTGAGGAAGAGAA
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TGAGCAATGCCAAGAGAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 5

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ACATCTTTTTGAAGTTCTTCAGTGAATCAGCTGTTCAATGGGTTTGTGGGAAGCTTTTCT
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GAATGCAGGGAAGACATCCCTTGTCAATGTTGTTGCAACTGGTGGTTATAGTGAGGACAT
GATTCCTACGGTGGGTTTTAACATGAGGAAAGTGACAAAAGGAAATGTTACTATCAAGCT
ATGGGATCTTGGTGGTCAACCTAGGTTCCGCAGCATGTGGGAACGTTACTGCCGCGCTGT
CTCCGCCATTGTGTATGTAGTTGATGCTGCAGATCCTGACAACCTAAGTGTCTCCAAAAG
CGAACTCCATGATCTGTTGAGCAAGACTTCGCTTAACGGTATCCCTCTTCTGGTTCTTGG
GAACAAGATCGACAAACCTGGAGCTCTCTCTAAAGAAGCCTTAACCCACGAAATGGAGCT
TCAGTCGCTTACAGATAGAGAAGTTTGCTGTTTCATGATATCTTGCAAGAACTCTACCAA
CATTGATCAGGTCATTGATTGGCTGGTGAAGCATTCAAAATCAAAGAACTAAAAAA*CTT
CACCAAGAAGAACACACATTCTCTCTTCTCAAGTCCTCTTCCTGTATTGTGTGCCTGATG
AAGACTATTTTAAAACTCGTGTGAAAACAAGAGTTTGTCTCTATTCTCCAGGTTGTCTCT
GTATATTGGATGTGGGATGGTATTCTATTCTAAAGCATTTGCAATTTTTGGAAACTCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

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*TCATTGATTGGCTGGTGAAGCATTCAAAATCAAAGAACTAAAAAA*CTTCACCAAGA
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CAATTGGCTTCGTAGCCTCTTCTTCAAGCAAGAAATGGAACTTTCTCTGATAGGGCTTCA
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GATTCCTACGGTGGGTTTTAACATGAGGAAAGTGACAAAAGGAAATGTTACTATCAAGCT
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CTCCGCCATTGTGTATGTAGTTGATGCTGCAGATCCTGACAACCTAAGTGTCTCCAAAAG
CGAACTCCATGATCTGTTGAGCAAGACTTCGCTTAACGGTATCCCTCTTCTGGTTCTTGG
GAACAAGATCGACAAACCTGGAGCTCTCTCTAAAGAAGCCTTAACCCACGAAATGGAGCT
TCAGTCGCTTACAGATAGAGAAGTTTGCTGTTTCATGATATCTTGCAAGAACTCTACCAA
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AAGACTATTTTAAAACTCGTGTGAAAA

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AGAACTAAAAAAACTTCACCAAGAAGAACACACATTCTCTCTTCTCAAGTCCTCTTCCTG
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TTTTTGGAAACTCG

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TGGGATCTTGGTGGTCAATCTAGGTTCCGCAGCATGTGGGAACGTTACTGCCGCGCTGTT
TCCGCCATTGTGTATGTAGTTGATGCTGCAGATCCTGACAACCTAAGTGTCTCCAAAAGC
GAACTCCATGATCTGTTGAGCAAGACTTCGCTTAACGGTATCCCTCTTCTGGTTCTTGGG
AACAAGATCGACAAACCTGGAGCTCTCTCTAAAGAAGCCTTAACCCACGAAATGGAGCTT
CAGTCGCTTACAGATAGAGAAGTTTGCTGTTTCATGATATCTTGCAAGAACTCTACCAAC
ATTGATCAGGTCATTGATTGGCTGGTGAAGCATTCAAAATCAAAGAACTAAAAAA*CTTC
ACCAAGAAGAACACACATTCTCTCTTCTCAAGTCCTCTTCCTGTATTGTGTGCCTGATGA
AGACTATTTTAAAACTCGTGTGAAAACAAGAGTTTGTCTCTATTCTCCAGGTTGTCTCTG
TATATTGGATGTGGGATGGTATTCTATTTTAAAGCATTTGCAATTTTTGGAAACTC

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 6

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TAACGAGATTTGAGTTTTAACAATGTTGCCACAGAATCAAATTCAGAGATCGAATCTATC
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TAAAACCAAAT*CATCATCAAAGTAAAAAAGAACTACAAACGCAGCCAAGAACAATCAGT
TTTTCTTTTTCACCTTCAGAAAATTTTTGGGACTTTTT*AAGTTCCACAGCATGCAGACT
TCTGCGTAGCCTGTCCGGCTCCAGCAGCCTGGTCGGTTTGGCTGATCCTAATCGTCGAAG
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CCATTGCCCCTCTGTAATAAGCAGTGGTGATGGTTCGAAAACGTTCTTGACCAGCAGTAT
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AACTTTTACCAACACCGCTGTCACCGATAAGGAGAAGCTTGATGAGGTAATTGCAATCGG
CTCTAGCCCTAGCAGGTGGTGCAGCCATCGAAATCAGATCAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CU27TF C 1
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TAACGAGATTTGAGTTTTAACAATGTTGCCACAGAATCAAATTCAGAGATCGAATCTATC
TGAGAATGAACGATTTCTTCAAGACTCTATTACCATCAGAACAAGCTAAGAATGCCAACT
TAAAACCAAAT*CATCATCAAAGTAAAAAAGAACTACAAACGCAGCCAAGAACAATCAGT
TTTTCTTTTTCACCTTCAGAAAATTTTTGGGACTTTTT*AAGTTCCACAGCATGCAGACT
TCTGCGTAGCCTGTCCGGCTCCAGCAGCCTGGTCGGTTTGGCTGATCCTAATCGTCGAAG
GCTCTGCCCTGGAGTCAGTATCTGCGAGTCTCTGCTTAATGTCCTTTGCTATCGAGAAGA
AAACTTCCTCCACATTTAAATTTGTTTTGGCACTTGTTTCAAAGAACTTGATTCCGTATT
CATCAGCAAGTGCTTGGCCCTTTGCTTTTGGTACGGCCCTCTTGCTCTCGTCCATATCGG
CTTTGTTCCCTACCAAGATCTTGTTGACATTGTCGGAAGCGTGCTGATCGATGTTACGAA
TCCAGTTCCTAATGTTGTTGAAGG
C

QA 1 624 1 624
DS 

RD RS1CU27JQ 346 0 0
AAGTTCCACAGCATGCAGACTTCTGCGTAGCCTGTCCGGCTCCAGCAGCCTGGTCGGTTT
GGCTGAACCTAATCGTCGAAGGCTCTGCCCTGGAGTCAGTATCTGCGAGTCTCTGCTTAA
TGTCCTTTGCTATCGAGAAGAAAACTTCCTCCACATTTAAATTTGTTTTGGCACTTGTTT
CAAAGAACTTGATTCCGTATTCATCAGCAAGTGCTTGGCCCTTTGCTTTTGGTACGGCCC
TCTTGCTCTCGTCCATATCGGCTTTGTTCCCTACCAAGATCTTGTTGACATTGTCGGAAG
CGTGCTGATCGATGTTACGAATCCAGTTCCTAATGTTGTTGAAGG
C

QA 1 345 1 345
DS 

RD RS1E251JQ 667 0 0
AAGAATTGATGTTGTAACAGAGAAAGACAAAAGACAATAACGAGATTTGAGTTTTAACAA
TGTTGCCACGGAATCAAATTCAGAGATCGAATCTATCTGAAAATGAACGATTTCTTCAAG
ACTCTATTACCATCAGAACAAGCTAAGAATGCCAACTTAAAACCAAAT*CATCATCAAAG
TAAAAAAGAACTACAAACGCAGCCAAGAACAATCAGTTTTTCTTTTTCACCTTCAGAAAA
TTTTTGGGACTTTTT*AAGTTCCACAGCATGCAAACTTCTGCGTAGCCTGTCCGGCTCCA
GCAGCCTGGTCGGTTTGGCTGATCCTAATCGTCGAAGGCTCTGCCCTGGAGTCAGTATCT
GCGAGTCTCTGCTTAATGTCCTTTGCTATCGAGAAAAAAACTTCCTCCACATTTAAATTT
GTTTTGGCACTTGTTTCAAAGAACTTGATTCCGTATTCATCAGCAAGTGCTTGACCCTTT
GCTTTTGGTACGGCCCTCTTGCTCTCGTCCATATCGGCTTTGTTCCCTACCAAGATCTTG
TTGACATTGTCGGAAGCGTGCTGCTCGATGTTACGAATCCAGTTCCTAATGTTGTTGAAG
GATGACTCGTCTGTGACATCATACACCAGCAAAATGCCCATTGCCCCTCTGTAATAAGCA
GTGGTGA

QA 1 667 1 667
DS 

RD RS1E251TF 765 0 0
TGCCACGG
ATCAAATTCAGAGATCGA*TCTATCTGAGAATGAACGATTTCTTCAAGACTCTATTACCA
TCAGA*CAAGCTAAGAATGCCAACTTAAAACCAAAT*CATCATCAAAGTAAAAAAGAACT
ACAAACGCAGCCAAGAACAATCAGTTTTTCTTTTTCACCTTCAGAAAATTTTTGGGACTT
TTT*AAGTTCCACAGCATGCAGACTTCTGCGTAGCCTGTCCGGCTCCAGCAGCCTGGTCG
GTTTGGCTGATCCTAATCGTCGAAGGCTCTGCCCTGGAGTCAGTATCTGCGAGTCTCTGC
TTAATGTCCTTTGCTATCGAGAAGAAAACTTCCTCCACATTTAAATTTGTTTTGGCACTT
GTTTCAAAGAACTTGATTCCGTATTCATCAGCAAGTGCTTGACCCTTTGCTTTTGGTACG
GCCCTCTTGCTCTCGTCCATATCGGCTTTGTTCCCTACCAAGATCTTGTTGACATTGTCG
GAAGCGTGCTGCTCGATGTTACGAATCCAGTTCCTAATGTTGTTGAAGGATGACTCGTCT
GTGACATCATACACCAGCAAAATGCCCATTGCCCCTCTGTAATAAGCAGTGGTGATGGTT
CGAAAACGTTCTTGACCAGCAGTATCCCAAATCTGAAGCTTGATGCGTTTGCCATCAAGC
TCAATAGTTCTTATCTTAAAATCAATCCCAATGGTGGTGATGAAGCTAGTGGTGAAAGAG
CCATCAGAGAACCTCAACAGCAAACAACTTTTACCAA

QA 9 765 9 765
DS 

RD RS1AZ14JQ 742 0 0
CCGAG
AATGAACGATTTCTTCAAGATTCTATTACCATCATAACAAGCTAAGAATGCCAACTTAAA
ACCAAATTCATCATCAAAGTAAAAAAGAACTACAAACGCAGCCAAGAACAATCAGTTTTT
CTTTTTCACCTTCAGAAATTCTTTGGGACTTTTTTAAGTTCCACAGCAAGCAGACTTCTG
CGTAGCCTGTCCGGCTCCAGCAGCCTGGTCTGTTTGGCTGATCCTAATCGTCGAAGGCTC
TGCCCTGGAGTCAGTATCTGCGAGTCTCTGCTTAATGTCCTTTGCTATCGAGAAGAAAAC
TTCTTCCACATTTAGATTTGTTTTGGCACTTGTTTCAAAGAACTTGATTCCGTATTCATC
AGCAAGTGCTTGACCCTTTGCTTTTGGTACGGCCCTCTTGCTCTCGTCCATATCGGCTTT
GTTCCCTACCAAGATCTTGTTGACGTTATCGGAAGCGTGCTGCTCGATGTTACGAATCCA
GTTCCTAATGTTGTTGAAGGATGACTCGTCTGTGACATCATACACCAACAAAATGCCCAT
TGCCCCTCTGTAATAAGCAGTGGTGATGGTTCGAAAACGTTCTTGACCAGCAGTATCCCA
AATCTGGAGCTTGATGCGTTTGCCATCAAGCTCAATAGTTCTTATCTTAAAATCAATCCC
AATGGTGGTGATGAAGCTAGTGGTGAAAGAGCCATCTGAGAACCTCAACAGCAAACAACT
TTTACCAACACCGCTGT

QA 6 742 6 742
DS 

RD RS1AZ14TF 666 0 0
AAG
TCCACAGCAAGCAGACTTCTGCGTAGCCTGTCCGGCTCCAGCAGCCTGGTCTGTTTGGCT
GATCCTAATCGTCGAAGGCTCTGCCCTGGAGTCAGTATCTGCGAGTCTCTGCTTAATGTC
CTTTGCTATCGAGAAGAAAACTTCTTCCACATTTAGATTTGTTTTGGCACTTGTTTCAAA
GAACTTGATTCCGTATTCATCAGCAAGTGCTTGACCCTTTGCTTTTGGTACGGCCCTCTT
GCTCTCGTCCATATCGGCTTTGTTCCCTACCAAGATCTTGTTGACGTTATCGGAAGCGTG
CTGCTCGATGTTACGAATCCAGTTCCTAATGTTGTTGAAGGATGACTCGTCTGTGACATC
ATACACCAACAAAATGCCCATTGCCCCTCTGTAATAAGCAGTGGTGATGGTTCGAAAACG
TTCTTGACCAGCAGTATCCCAAATCTGGAGCTTGATGCGTTTGCCATCAAGCTCAATAGT
TCTTATCTTAAAATCAATCCCAATGGTGGTGATGAAGCTAGTGGTGAAAGAGCCATCTGA
GAACCTCAACAGCAAACAACTTTTACCAACACCGCTGTCACCGATAAGGAGAAGCTTGAT
GAGGTAATTGCAATCGGCTCTAGCCCTAGCAGGTGGTGCAGCCATCGAAATCAGATCAGA
TCC

QA 4 666 4 666
DS 



AS 1 6

CO CL1058Contig1 929 6 36 U
CTTACTACAAGTTACTTGTGTTGATTGATTTGGTTTGGAACACCGTATATGACAATAACA
GAGTTTTGCTTTCGACTAATTCAAACCCGATCAAATCTCATTCCTTTTCTGGAATTGTTT
TTTT*CTTAACCAACCAAGTCCAAGCATCTATGGCAGCAGCAACATACAAACGCTTTCGA
CTATATGACACTCTCACTCAACCTTGCCAAACTCTCCAACATTCGAGCTGCTTTCCACAA
CCGTCTCTCTTACAAACCTCGCCAGCTTCTCTCTTGAAGATTGTAAGACGTAAATGGAGA
GTACGAAAGAGAATGTGAGAGCTGAACCAAAGAGGACATAAAATCCTGAGGAAACATCAA
TCTCTGACTGTTCCTTCCATGTGTATCTAACAAGAACATGTTTTGGCCAGTGTTGAGGGT
CCCAGAACTGCTTGCGGATCTCCGGGTGTGTATTCAAATAGCTAAGAGGCATATCGACAA
CTTGAGCTGTAACTCCAAGCAAATCTCCTCCAGAATATCTCAAATTGACATCGATCATTG
GAACTTCTGAACTCTTCCGGTTTATCACCAAAAGCCAGTGTATTAGAAATTTCTCACTTC
CAACTTGGAATTTTATCTTATAAGGATCTGTGCCGGTGTAGCCAACTGGTTTCGCTATGG
GGATCAGCACCTCGCGATTAACGGCGAAGATCGGGCAATGCTTTCCGATCACATCATGCC
AAGTCGTTCTCGAGGAATGGTACTGTCCCATCTTGCTCATCGCCACGATGTCTCCTGGTC
GGTAAGCGCTGGAGAGATGCGGGAATGATAGTGA***TACCACTAGTAGTAGAGCTTCAA
TTAACCATTTCCACC*GTCGCGATCCTGCCGACGTAACCATGCCCGCCGCCATAACTTGA
TTCTTCGGTGAGGTTTCTCCGCCGGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AH13JQ U 1
AF RS1A917JQ U 69
AF RS1CJ75JQ U 88
AF RS1AH13TF C 126
AF RS1A917TF C 129
AF RS1CJ75TF C 207
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BS 109 262 RS1AH13JQ
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BS 893 903 RS1AH13TF
BS 904 929 RS1A917TF

RD RS1AH13JQ 687 0 0
CTTACTACAAGTTACTTGTGTTGATTGATTTGGTTTGGAACACCGTATATGACAATAACA
GAGTTTTGCTTTCGACTAATTCAAACCCGATCAAATCTCATTCCTTTCCTGGAATTGTTT
TTTT*CTTAACCAACCAAGTCCAAGCATCTATGGCAGCAGCAACATACAAACGCTTTCGA
CTATATGACACTCTCACTCAACCTTGCCAAACTCTCCAACATTCGAGCTGCTTTCCACAA
CCGTCTCTCTTACAAACCTCGCTAGCTTCTCTCGTGAAGATTGTAAGACGTAAATGGAGA
GTACGAAAGAAAATGTGAGAGCTGAGCCAAAGAGGACATAAAATCCTGAGGAAACATCAA
TCTCTGACTGTTCCTTCCATGTGTATCTAACAAGAACATGTTTTGGCCAGTGTTGAGGGT
CCCAAAACTGCCTGCGGATCTCCGGGTGGGTATTCAAATAGCTAAAAGGCATATCGACAA
CTTGAGCTGTAACTCCGAGCAAATCTCCTCCAAAATATCTCAAATTGACATCGATCATTG
GAACTTCTGAACTCTTCCGGTTTATCACCAAAAGCCAGTGTATTAAAAATTTCTCACTTC
CAACTTGGAATTTTATCTTATAAGGATCTGTGCCGGTGTAGCCAACTGGTTTTGCTATGG
GGATCAGCACCTCGCGATTAACGGCGA

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1A917JQ 824 0 0
CTTTCGACTAATTCAAACTCGATCAAATCTCATTCCTTTTCTGGAATTGTTTTTTT**TT
AACCAACCAAGTCCAAGCATCTATGGCAGCAGCAACATACAAACGCTTTCGACTATATGA
CACTCTCACTCAACCTTGCCAAACTCTCCAACATTCGAGCTGCTTTCCACAACCGTCTCT
CTTACAAACCTCGCCAGCTTCTCTCTTGAAGATTGTAAGACGTAAATGGAGAGTACGAAA
GAGAATGTGAGAGCTGAACCAAAGAGGACATAAAATCCTGAGGAAACATCAATCTCTGAC
TGTTCCTTCCATGTGTATCTAACAAGAACATGTTTTGGCCAGTGTTGAGGGTCCCAGAAC
TGCTTGCGGATCTCCGGGTGTGTATTCAAATAGCTAAGAGGCATATCGACAACTTGAGCT
GTAACTCCAAGCAAATCTCCTCCAGAATATCTCAAATTGACATCGATCATTGGAACTTCT
GAACTCTTCCGGTTTATCACCAAAAGCCAGTGTATTAGAAATTTCTCACTTCCAACTTGG
AATTTTATCTTATAAGGATCTGTGCCGGTGTAGCCAACTGGTTTCGCTATGGGGATCAGC
ACCTCGCGATTAACGGCGAAGATCGGGCAATGCTTTCCGATCACATCATGCTAAGTCGTT
CTCGAGGAATGGTACTATCCCATCTTGCTCATCGCCACGATGTCTCCTGGTCGGTAAGCG
CTGGAGAGATGCGGGAATGATAGTGA***TACCACTAGTAGTAGAGCTTCAATTAACCAT
TTCCACCCGTCGCGATCCTGCCGACGTAACCATGCCCGCCGCCA

QA 1 824 1 824
DS 

RD RS1CJ75JQ 796 0 0
CGATCAAATCTCATTCCTTTTCTGGAATTGTTTTTTTTCTTAACCAACCAAGTCCAAGCA
TCTATGGCAGCAGCAACATACAAACGCTTTCGACTATATGACACTCTCACTCAACCTTGC
CAAACTCTCCAACATTCGAGCTGCTTTCCACAACCGTCTCTCTTACAAACCTCGCCAGCT
TCTCTCTTGAAGATTGTAAGACGTAAATGGAGAGTACGAAAGAGAATGTGAGAGCTGAAC
CAAAGAGGACATAAAATCCTGAGGAAACATCAATCTCTGACTGTTCCTTCCATGTGTATC
TAACAAGAACATGTTTTGGCCAGTGTTGAGGGTCCCAGAACTGCTTGCGGATCTCCGGGT
GTGTATTCAAATAGCTAAGAGGCATATCGACAACTTGAGCTGTAACTCCAAGCAAATCTC
CTCCAGAATATCTCAAATTGACATCGATCATTGGAACTTCTGAACTCTTCCGGTTTATCA
CCAAAAGCCAGTGTATTAGAAATTTCTCACTTCCAACTTGGAATTTTATCTTATAAGGAT
CTGTGCCGGTGTAGCCAACTGGTTTCGCTATGGGGATCAGCACCTCGCGATTAACGGCGA
AGATCGGGCAATGCTTTCCGATCACATCATGCCAAGTCGTTCTCGAGGAATGGTACTGTC
CCATCTTGCTCATCGCCACGATGTCTCCTGGTCGGTAAGCGCTGGAGAGATGCGGGAATG
ATAGTGA***TACCACTAGTAG***AGCTTCAATTAACCATTTACACC*GTCGCGATCCT
GCCGACGTAACCATGC

QA 1 796 1 796
DS 

RD RS1AH13TF 780 0 0
C
TTAACCAACCAAGTCCAAGCATCTATGGCAGCAGCAACATACAAACGCTTTCGACTATAT
GACACTCTCACTCAACCTTGCCAAACTCTCCAACATTCGAGCTGCTTTCCACAACCGTCT
CTCTTACAAACCTCGCTAGCTTCTCTCGTGAAGATTGTAAGACGTAAATGGAGAGTACGA
AAGAGAATGTGAGAGCTGAGCCAAAGAGGACATAAAATCCTGAGGAAACATCAATCTCTG
ACTGTTCCTTCCATGTGTATCTAACAAGAACATGTTTTGGCCAGTGTTGAGGGTCCCAGA
ACTGCCTGCGGATCTCCGGGTGTGTATTCAAATAGCTAAGAGGCATATCGACAACTTGAG
CTGTAACTCCGAGCAAATCTCCTCCAGAATATCTCAAATTGACATCGATCATTGGAACTT
CTGAACTCTTCCGGTTTATCACCAAAAGCCAGTGTATTAGAAATTTCTCACTTCCAACTT
GGAATTTTATCTTATAAGGATCTGTGCCGGTGTAGCCAACTGGTTTTGCTATGGGGATCA
GCACCTCGCGATTAACGGCGAAGATCGGGCAATGCTTTCCGATCACATCATGCCAAGTCG
TTCTCGAGGAATGGTACTGTCCCATCTTGCTCATCGCGACGATGTCTCCTGGTCGGTAAG
CGCTGGAGAGATGCGGGAATGATAGTGATATTACCACTAGTAGTAGAGCTTCAATTAACC
ATTTCCACC*GTCGCGATCCTGCCGACGTAACCATGCCCGCCGCCATAACTTGATTC
CC

QA 2 778 2 778
DS 

RD RS1A917TF 801 0 0
AACCAACCAAGTCCAAGCATCTATGGCAGCAGCAACATACAAACGCTTTCGACTATATGA
CACTCTCACTCA*CCTTGCCAAACTCTCCAACATTCGAGCTGCTTTCCACAAC*GTCTCT
CTTACAAACCTCGCCAGCTTCTCTCTTGAAGATTGTAAGACGTAAATGGAGAGTACGAAA
GAGAATGTGAGAGCTGAACCAAAGAGGACATAAAATCCTGAGGAAACATCAATCTCTGAC
TGTTCCTTCCATGTGTATCTAACAAGAACATGTTTTGGCCAGTGTTGAGGGTCCCAGAAC
TGCTTGCGGATCTCCGGGTGTGTATTCAAATAGCTAAGAGGCATATCGACAACTTGAGCT
GTAACTCCAAGCAAATCTCCTCCAGAATATCTCAAATTGACATCGATCATTGGAACTTCT
GAACTCTTCCGGTTTATCACCAAAAGCCAGTGTATTAGAAATTTCTCACTTCCAACTTGG
AATTTTATCTTATAAGGATCTGTGCCGGTGTAGCCAACTGGTTTCGCTATGGGGATCAGC
ACCTCGCGATTAACGGCGAAGATCGGGCAATGCTTTCCGATCACATCATGCTAAGTCGTT
CTCGAGGAATGGTACTATCCCATCTTGCTCATCGCCACGATGTCTCCTGGTCGGTAAGCG
CTGGAGAGATGCGGGAATGATAGTGA***TACCACTAGTAGTAGAGCTTCAATTAACCAT
TTCCACC*GTCGCGATCCTGCCGACGTAACCATGCCCGCCGCCATAACTTGATTCTTCGG
TGAGGTTTCTCCGCCGGTCCC

QA 1 801 1 801
DS 

RD RS1CJ75TF 705 0 0
CCAAACTCTCCAACATTCGAGCTGCTTTCCACAACCGTCTCTCTTACAAACCTCGCCAGC
TTCTCTCTTGAAGATTGTAAGACGTAAATGGAGAGTACGAAAGAGAATGTGAGAGCTGAA
CCAAAGAGGACATAAAATCCTGAGGAAACATCAATCTCTGACTGTTCCTTCCATGTGTAT
CTAACAAGAACATGTTTTGGCCAGTGTTGAGGGTCCCAGAACTGCTTGCGGATCTCCGGG
TGTGTATTCAAATAGCTAAGAGGCATATCGACAACTTGAGCTGTAACTCCAAGCAAATCT
CCTCCAGAATATCTCAAATTGACATCGATCATTGGAACTTCTGAACTCTTCCGGTTTATC
ACCAAAAGCCAGTGTATTAGAAATTTCTCACTTCCAACTTGGAATTTTATCTTATAAGGA
TCTGTGCCGGTGTAGCCAACTGGTTTCGCTATGGGGATCAGCACCTCGCGATTAACGGCG
AAGATCGGGCAATGCTTTCCGATCACATCATGCCAAGTCGTTCTCGAGGAATGGTACTGT
CCCATCTTGCTCATCGCCACGATGTCTCCTGGTCGGTAAGCGCTGGAGAGATGCGGGAAT
GATAGTGA***TACCACTAGTAG***AGCTTCAATTAACCATTTACACC*GTCGCGATCC
TGCCGACGTAACCATGCCCGCCGCCATAACTTGATTC
TTCGGTCC

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 2

CO CL1059Contig1 674 2 5 U
GCTTGAATCATACATTTAGCACTCCAAAAGACACACATGGGTTTATTAAAATAACAATAG
AAGAACCCTCCTTTTTTTAGATAGCCAATAGACAAGACAAACGTACATTAAGATATAAGA
CAAACCAAAAACAACAACAATAGACCATGCAACTCCATAAGTTCACATGATAATCTTATT
CATACACAATATAAGATTGGTTCTGCATCAGCTGGCTATGGGCGCCACTCTAACTCCGAT
CTTGTAAAGAAACTCACCAGCTTGTCCATAGAACCCAACGACCTTGTGGTCTTTCTTCTC
CAGCACGAATTCAGTTCCTGAGTCCATTCCATACGGGTCAGAAATTCTCTTGTTTGTCTT
GAATTTAAGACAGATGATGGCCGGGGCATCGACACCATAAATCTTGTCATAGTAGCCTAT
CACACCTGTGAGATATTCACCATCTTCAAGCACAAACTCTTCAGCATCAAGCAATGACTT
CTTCCCATGAACACTTCCAAGGACAGGCTTTGAAGCATTTACATACTCAGCCTCGAAATA
AGTCACACAAGAGTCACCTTGTCCTACATATATCTTCTTCACATCATCATGAACACCATC
GTCCCCACTTAACTCCAGCGTCTCCCCCTTGTGCTGGAATAGTATCGACGGGAGTCACTG
GTGTTGACGTAGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AD65JQ U 374
AF RS1DX92JQ U 1
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BS 385 385 RS1AD65JQ
BS 386 605 RS1DX92JQ
BS 606 606 RS1AD65JQ
BS 607 674 RS1DX92JQ

RD RS1AD65JQ 250 0 0
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TCACCTTGTCCTACATATATCTTCTTCACATCATCATGAACACCATCGTCCCCACTTAAC
TCC
CAGCGTC

QA 1 243 1 243
DS 

RD RS1DX92JQ 674 0 0
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AAGAACCCTCCTTTTTTTAGATAGCCAATAGACAAGACAAACGTACATTAAGATATAAGA
CAAACCAAAAACAACAACAATAGACCATGCAACTCCATAAGTTCACATGATAATCTTATT
CATACACAATATAAGATTGGTTCTGCATCAGCTGGCTATGGGCGCCACTCTAACTCCGAT
CTTGTAAAGAAACTCACCAGCTTGTCCATAGAACCCAACGACCTTGTGGTCTTTCTTCTC
CAGCACGAATTCAGTTCCTGAGTCCATTCCATACGGGTCAGAAATTCTCTTGTTTGTCTT
GAATTTAAGACAGATGATGGCCGGTGCATCGACACCATAAATCTTGTCATAGTAGCCTAT
CACACCTGTGAGATATTCACCATCTTCAAGCACAAACTCTTCAGCATCAAGCAATGACTT
CTTCCCATGAACACTTCCAAGGACAGGCTTTGAAGCATTTACATACTCAGCCTCGAAATA
AGTCACACAAGAGTCACCTTGTCCTACATATATCTTCTTCACATCATCATGAACACCATC
GTCCC*ACTTAACTCCAGCGTCTCCCCCTTGTGCTGGAATAGTATCGACGGGAGTCACTG
GTGTTGACGTAGGA

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 6

CO CL1060Contig1 1226 6 4 U
CATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATCAGTCGACGGTACCGGACATATGCC
CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGCTCACTACTTCGCCTCTCTCTCTCTCTCTGCA
CAAAAATAAGTAAGACCAAAAAAACTGATTATAGAAAATTTCTTATCCCCTCACTTGAAA
ATGCAAGATATTCATGACTACTCGATGACCGGAGGCGGCGGAGGAGGAAGTACAGGGAGG
TTTTACGGTGGCGGAGGAGGCGGAGATAAGAGGATGAGAGCGCATCAGAACAATATACTT
AACCATCACCAATCTCTCAGGTGTCCTCGTTGCAACTCTCTTAACACAAAGTTCTGTTAC
TACAACAACTACAATCTCTCTCAGCCTCGACACTTCTGCAAGAACTGCCGTCGTTACTGG
ACCAAAGGCGGGGTCCTCCGTAACGTCCCCGTCGGAGGCGGTTGCCGGAAAGCCAAACGT
TCCAAGTCTAAGCAGGAGCAGCCTCCGTCCTCCTCCGCCGACAAAACAACGACTCAAGAC
GTCGAGGAGAAATCCACTAGCAGCGAGAGCTCTTCTCTTACCGCCTCTAACTCCACTGTC
CCCACCGCCGTCACCACCACCACCACCACTACCGCCGCCGCCGTGAAGGTTGCACCTTCG
GGGTTGGTAGACACCGACATGCCTAATCTTAAACTGTACGGAGACAGGACAGAATGGTCG
GGGTTGCTCGGGCAAGGTTCATCAGACGGTGGAGCTTCCTCGGAGGTCGGCGGATTTTCG
GCGGCGGCGATAGAACCGACGTCGTTTGGATACGGGGGTAGTTCAGTAAATCAACTGTGT
ATAGCTGATCATCTGAAGTTGGAAGGTAATACTGTACAGCAGCAGTTTGGAGATCTAACG
GCTCAGATTGATCCAGAGATGAGATATGAACCGTTGGATTGGGGAAGTGGTGGAGGAGAT
CAAACACTATTTGATCTAACGACTACCGTTGATCATGAATACTGGAGTCGAAGTCAATGG
AGGTCTTCTAACCACCAAGATGATCGGAATGGTCTCTACCTTCCTTAAAACTTCTCATAG
CTTCTTTTTAACCTAAAAATATACAGATAAGGTAAAGTTTGATAAGTTTTCTTTTTAATC
TTTATGGGTTTAAAATTTGGATTTATTATATAATATATGACTGCTTGTGAATTATTTACC
AAGAATAAAATTTACCTCTTGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A025TF U 1
AF RS1A025TV U 37
AF RS1AE91JQ C 628
AF RS1AE91TF U 628
AF RS1A025TR C 442
AF RS1A025JQ C 470
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BS 942 1136 RS1AE91TF
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RD RS1A025TF 861 0 0
CATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATCAGTCGACGGTACCGGACATATGCC
CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGCTCACTACTTCGCCTCTCTCTCTCTCTCTGCA
CAAAAATAAGTAAGACCAAAAAAACTGATTATAGAAAATTTCTTATCCCCTCACTTGAAA
ATGCAAGATATTCATGACTACTCGATGACCGGAGGCGGCGGAGGAGGAAGTACAGGGAGG
TTTTACGGTGGCGGAGGAGGCGGAGATAAGAGGATGAGAGCGCATCAGAACAATATACTT
AACCATCACCAATCTCTCAGGTGTCCTCGTTGCAACTCTCTTAACACAAAGTTCTGTTAC
TACAACAACTACAATCTCTCTCAGCCTCGACACTTCTGCAAGAACTGCCGTCGTTACTGG
ACCAAAGGCGGGGTCCTCCGTAACGTCCCCGTCGGAGGCGGTTGCCGGAAAGCCAAACGT
TCCAAGTCTAAGCAGGAGCAGCCTCCGTCCTCCTCCGCCGACAAAACAACGACTCAAGAC
GTCGAGGAGAAATCCACTAGCAGCGAGAGCTCTTCTCTTACCGCCTCTAACTCCACTGTC
CCCACCGCCGTCACCACCACCACCACCACTACCGCCGCCGCCGTGAAGGTTGCACCTTCG
GGGTTGGTAGACACCGACATGCCTAATCTTAAACTGTACGGAGACAGGACAGAATGGTCG
GGGTTGCTCGGGCAAGGTTCATCAGACGGTGGAGCTTCCTCGGAGGTCGGCGGATTTTCG
GCGGCGGCGATAGAACCGACGTCGTTTGGATACGGGGGTAGTTCAGTAAATCAACTGTGT
ATAGCTGATCATCTGAAGTTG

QA 1 861 1 861
DS 

RD RS1A025TV 905 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGCTCACTAC
TTCGCCTCTCTCTCTCTCTCTGCACAAAAATAAGTAAGACCAAAAAAACTGATTATAGAA
AATTTCTTATCCCCTCACTTGAAAATGCAAGATATTCATGACTACTCGATGACCGGAGGC
GGCGGAGGAGGAAGTACAGGGAGGTTTTACGGTGGCGGAGGAGGCGGAGATAAGAGGATG
AGAGCGCATCAGAACAATATACTTAACCATCACCAATCTCTCAGGTGTCCTCGTTGCAAC
TCTCTTAACACAAAGTTCTGTTACTACAACAACTACAATCTCTCTCAGCCTCGACACTTC
TGCAAGAACTGCCGTCGTTACTGGACCAAAGGCGGGGTCCTCCGTAACGTCCCCGTCGGA
GGCGGTTGCCGGAAAGCCAAACGTTCCAAGTCTAAGCAGGAGCAGCCTCCGTCCTCCTCC
GCCGACAAAACAACGACTCAAGACGTCGAGGAGAAATCCACTAGCAGCGAGAGCTCTTCT
CTTACCGCCTCTAACTCCACTGTCCCCACCGCCGTCACCACCACCACCACCACTACCGCC
GCCGCCGTGAAGGTTGCACCTTCGGGGTTGGTAGACACCGACATGCCTAATCTTAAACTG
TACGGAGACAGGACAGAATGGTCGGGGTTGCTCGGGCAAGGTTCATCAGACGGTGGAGCT
TCCTCGGAGGTCGGCGGATTTTCGGCGGCGGCGATAGAACCGACGTCGTTTGGATACGGG
GGTAGTTCAGTAAATCAACTGTGTATAGCTGATCATCTGAAGTTGGAAGGTAATACTGTA
CAGCAGCAGTTTGGAGATCTAACGGCTCAGATTGATCCAGAGATGAGATATGAACCGTTG
GATTG

QA 1 905 1 905
DS 

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G
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TTAAACTGTACGGAAACAGGACAGAATGGTCGGGGTTGCTCGGGCAAGGTTCATCAGACG
GTGGAGCTTCCTCGGAGGTCGGCGGATTTTCGGCGGCGGCGATAGGACCGACGTCGTTTG
GATACGGGGGTAGTTCAGTAAATCAACTGTGTATAGCTGATCATCTGAAGTTGGAAGGTA
ATACTGTACAGCAGCAGTTTGGAGATCTAACGGCTCAGATTGATCCAGAGATGAGATATA
AACCGTTGGATTGGGGAAGTGGTGGAGGAGATCAAACACTATTTGATCTAACGACTACCG
TTGATCATGAATACTGGAGTCGAAGTCAATGGAGGTCTTCTAACCACCAAGATGATCGGA
ATGGTCTCTACCTTCCTTAAAACTTCTCATAGCTTCTTTTTAACCTAAAAATATACAGAT
AAGGTAAAGTTTGATAAGTTTTCTTTTT

QA 2 509 2 509
DS 

RD RS1AE91TF 509 0 0
G
CTACCGCCGCCGCCGTGAAGGTTGCACCTTCGGGGTTTGTAGACACCGACATGCCTAATC
TTAAACTGTACGGAAACAGGACAGAATGGTCGGGGTTGCTCGGGCAAGGTTCATCAGACG
GTGGAGCTTCCTCGGAGGTCGGCGGATTTTCGGCGGCGGCGATAGGACCGACGTCGTTTG
GATACGGGGGTAGTTCAGTAAATCAACTGTGTATAGCTGATCATCTGAAGTTGGAAGGTA
ATACTGTACAGCAGCAGTTTGGAGATCTAACGGCTCAGATTGATCCAGAGATGAAATATA
AACCGTTGGATTGGGGAAGTGGTGGAGGAGATCAAACACTATTTGATCTAACGACTACCG
TTGATCATGAATACTGGAGTCGAAGTCAATGGAGGTCTTCTAACCACCAAGATGATCGGA
ATGGTCTCTACCTTCCTTAAAACTTCTCATAGCTTCTTTTTAACCTAAAAATATACAGAT
AAGGTAAAGTTTGATAAGTTTTCTTTTT

QA 2 509 2 509
DS 

RD RS1A025TR 785 0 0
AACGTCCCCGTCGGAGGCGGTTGCCGGAAAGCCAAACGTTCCAAGTCTAAGCAGGAGCAG
CCTCCGTCCTCCTCCGCCGACAAAACAACGACTCAAGACGTCGAGGAGAAATCCACTAGC
AGCGAGAGCTCTTCTCTTACCGCCTCTAACTCCACTGTCCCCACCGCCGTCACCACCACC
ACCACCACTACCGCCGCCGCCGTGAAGGTTGCACCTTCGGGGTTGGTAGACACCGACATG
CCTAATCTTAAACTGTACGGAGACAGGACAGAATGGTCGGGGTTGCTCGGGCAAGGTTCA
TCAGACGGTGGAGCTTCCTCGGAGGTCGGCGGATTTTCGGCGGCGGCGATAGAACCGACG
TCGTTTGGATACGGGGGTAGTTCAGTAAATCAACTGTGTATAGCTGATCATCTGAAGTTG
GAAGGTAATACTGTACAGCAGCAGTTTGGAGATCTAACGGCTCAGATTGATCCAGAGATG
AGATATGAACCGTTGGATTGGGGAAGTGGTGGAGGAGATCAAACACTATTTGATCTAACG
ACTACCGTTGATCATGAATACTGGAGTCGAAGTCAATGGAGGTCTTCTAACCACCAAGAT
GATCGGAATGGTCTCTACCTTCCTTAAAACTTCTCATAGCTTCTTTTTAACCTAAAAATA
TACAGATAAGGTAAAGTTTGATAAGTTTGCTTTTTAATCTTTATGGGTTTAAAATTTGGA
TTTATTATATAATATATGACTGCTTGTGAATTATTTACCAAGAATAAAATTTACCTCTTG
TTTCC

QA 1 785 1 785
DS 

RD RS1A025JQ 757 0 0
AAGCCAAACGTTCCAAGTCTAAGCAGGAGCAGCCTCCGTCCTCCTCCGCCGACAAAACAA
CGACTCAAGACGTCGAGGAGAAATCCACTAGCAGCGAGAGCTCTTCTCTTACCGCCTCTA
ACTCCACTGTCCCCACCGCCGTCACCACCACCACCACCACTACCGCCGCCGCCGTGAAGG
TTGCACCTTCGGGGTTGGTAGACACCGACATGCCTAATCTTAAACTGTACGGAGACAGGA
CAGAATGGTCGGGGTTGCTCGGGCAAGGTTCATCAGACGGTGGAGCTTCCTCGGAGGTCG
GCGGATTTTCGGCGGCGGCGATAGAACCGACGTCGTTTGGATACGGGGGTAGTTCAGTAA
ATCAACTGTGTATAGCTGATCATCTGAAGTTGGAAGGTAATACTGTACAGCAGCAGTTTG
GAGATCTAACGGCTCAGATTGATCCAGAGATGAGATATGAACCGTTGGATTGGGGAAGTG
GTGGAGGAGATCAAACACTATTTGATCTAACGACTACCGTTGATCATGAATACTGGAGTC
GAAGTCAATGGAGGTCTTCTAACCACCAAGATGATCGGAATGGTCTCTACCTTCCTTAAA
ACTTCTCATAGCTTCTTTTTAACCTAAAAATATACAGATAAGGTAAAGTTTGATAAGTTT
GCTTTTTAATCTTTATGGGTTTAAAATTTGGATTTATTATATAATATATGACTGCTTGTG
AATTATTTACCAAGAATAAAATTTACCTCTTGTTTCC

QA 1 757 1 757
DS 



AS 2 5

CO CL1061Contig1 831 3 15 U
GGACGGAGAATCCAACAGATTCAGCGACCTTCCTTCCACTCTCTCCGGCGAGATCTAATT
TCCGATCCTTCACGGTGGCGTCAACGTCAGGGCAACAACAACAAGGTCTCTCAAGAAGGA
AGCCTCCACCATCATCATCTCCATCATCTCCTCCTTCCTCTGATTCGCCTCTACTACGAA
CTCCCTCGGCGAGGAAAGCGAGCCCCGAGTTTCCTTTTTATCAGCAGAACTGGTTCATCG
CTCTCCTCTTCCTGATGGCTATGGGATTCTTCTGCCTCGCTCTCTTCCTTTACCTCAGCC
TTGATCCCGATTCCGGCTACACCTCTGCCTCCGCCGCAGCGCCTTCCGGTAAAGAAGGTG
TCCAGGTAAGTTATGGGAGTGCGATAAAGCTGATGCACGAGAAAACGAAGTTTCGTCTGC
ATTCTCACGATGTGCCTTATGGATCCGGCAGTGGTCAGCAGTCTGTTACTGGCTTCCCTG
GCGTCACTGATTCCAACAGCTACTGGATTGTAAAACCTGTGCCTGGGACAAAAGCCAAGC
AAGGTGATGCCATCAAGAATGGAGAAACCGTTAGATTGCAGCACATGAAGACCAGAAAAT
GGCTCCACAGTCACCTACATGCATCCCCTATCTCTGGAAACTTAGAGGTTAGCTGCTTTG
GAGATGATTCAAATTCTGATACTGGGGATCACTGGAAGCTTACAATCGAAGGTAGTGGAA
AGATATGGAAACAAGACCAAAGAGTCCGTCTACACACATTGACACTAGTGGCTACCTCAT
AGCCACGACAGAAGTACAACGCATTGCCGTGGTCAGCAAGAGGTCTGTGGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FT18TF U 1
AF RS1G252TF U 1
AF RS1DO16TF U 24
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BS 24 214 RS1FT18TF
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RD RS1FT18TF 534 0 0
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TCCGATCCTTCACGGTGGCGTCAACGTCAGGGCAACAACAACAAGGTCTCTCAAGAAGGA
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CTCCCTCGGCGAGGAAAGCGAGCCCCGAGTTTCCCTTTTATCAGCAGAACTGGTTCATCG
CTCTCCTCTTCCTGATGGCTATGGGATTCTTCTGCCTCGCTCTCTTCCTTTACCTCAGCC
TTGATCCCGATTCCGGCTACACCTCTGCCTCCGCCGCAGCGCCTTCCGGTAAAGAAGGTG
TCCAGGTAAGTTATGGGAGTGCGATAAAGCTGATGCACGAGAAGACGAAGTTTCGTCTGC
ATTCTCACGATGTGCCTTATGGATCCGGCAGTGGTCAGCAGTCTGTTACTGGCTTCCCTG
GCGTCACTGATTCCAACAGCTACTGGATTGTAAAACCTGTGCCTGGGACAAAAG

QA 1 534 1 534
DS 

RD RS1G252TF 798 0 0
GGACGGAGAATCCAACAGATTCAGCGACCTTCCTTCCACTCTCTCCGGCGAGATCTAATT
TCCGATCCTTCACGGTGGCGTCAACGTCAGGGCAACAACAACAAGGTCTCTCAAGAAGGA
AGCCTCCACCATCATCATCTCCATCATCTCCTCCTTCCTCTGATTCGCCTCTACTACGAA
CTCCCTCGGCGAGGAAAGCGAGCCCCGAGTTTCCTTTTTATCAGCAGAACTGGTTCATCG
CTCTCCTCTTCCTGATGGCTATGGGATTCTTCTGCCTCGCTCTCTTCCTTTACCTCAGCC
TTGATCCCGATTCCGGCTACACCTCTGCCTCCGCCGCAGCGCCTTCCGGTAAAGAAGGTG
TCCAGGTAAGTTATGGGAGTGCGATAAAGCTGATGCACGAGAAAACGAAGTTTCGTCTGC
ATTCTCACGATGTGCCTTATGGATCCGGCAATGGTCAGCAGTCTGTTACTGGCTTCCCTG
GCGTCACTGATTCCAACAGCTACTGGATTGTAAAACCTGTGCCTGGGACAAAAGCCAAGC
AAGGTGATGCCATCAAGAATGGAGAAACCGTTAGATTGCAGCACATGAAGACCAGAAAAT
GGCTCCACAGTCACCTACATGCATCCCCTATCTCTGGAAACTTAGAGGTTAGCTGCTTTG
GAGATGATTCAAATTCTGATACTGGGGATCACTGGAAGCTTACA*TCGAAGGTAGTGGAA
AGATATGGAAACAAGACCAAAGAGTCCGTCTTCACACATTGACACTAGTGGCTAC*TCAT
AGCCACGACAGA
GTACAC

QA 1 792 1 792
DS 

RD RS1DO16TF 808 0 0
GGGACCTTCCTTCCACTC
TCTCCGGCGAGATCTAATTTCCGATCCTTCACGGTGGCGTCAACGTCAGGGCAACAACAA
CAAGGTCTCTCAAGAAGGAAGCCTCCACCATCATCATCTCCATCATCTCCTCCTTCCTCT
GATTCGCCTCTACTACGAACTCCCTCGGCGAGGAAAGCGAGCCCCGAGTTTCCTTTTTAT
CAGCAGAACTGGTTCATCGCTCTCCTCTTCCTGATGGCTATGGGATTCTTCTGCCTCGCT
CTCTTCCTTTACCTCAGCCTTGATCCCGATTCCGGCTACACCTCTGCCTCCGCCGCAGCG
CCTTCCGGTAAAGAAGGTGTCCAGGTAAGTTATGGGAGTGCGATAAAGCTGATGCACGAG
AAAACGAAGTTTCGTCTGCATTCTCACGATGTGCCTTATGGATCCGGCAGTGGTCAGCAG
TCTGTTACTGGCTTCCCTGGCGTCACTGATTCCAACAGCTACTGGATTGTAAAACCTGTG
CCTGGGACAAAAGCCAAGCAAGGTGATGCCATCAAGAATGGAGAAACCGTTAGATTGCAG
CACATGAAGACCAGAAAATGGCTCCACAGTCACCTACATGCATCCCCTATCTCTGGAAAC
TTAGAGGTTAGCTGCTTTGGAGATGATTCAAATTCTGATACTGGGGATCACTGGAAGCTT
ACAATCGAAG*TAGTGGAA*GATATGGAAACA*GACCAAAGAGTCCGTCTACACACATTG
ACACTAGTGGCTACCTCATAGCCACGACAGAAGTACAACGCATTGCCGTGGTCAGCAAGA
GGTCTGTGGA

QA 19 808 19 808
DS 



CO CL1061Contig2 814 2 6 U
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ATCAATCGCAGATTAGCAAAATACATATATTTTATATTTTCTTGTTTTCGAGTTCAGAGA
GTAAAAGATGAGATTCAAAGTCCTCGAGAGAAGTTAACACAACTCTTTACCTTACTTACT
ACTCTCATTAACGGGAAGGTAGACTCCCTCTGCCGCCAACCAAACATTATCAGCCCGCTT
CTCCCGGATTCCACAGACCTCTTGCTGACCACCGGCAATGCGTTGGTACTTCTTGTCGTG
GCTATGGAGGTAGCCACTAGTGTCAATGTGTTGAAAACGGACTCTTTGGTCTTGTTTCCA
TATCTTTCCACTACCTTCGATTGTAAGCTTCCAGTGATCCCCAGTATCAGAATTTGAATC
ATCTCCAAAGCAGCTAACCTCTAAGTTTCCAGAAATAGGGGATGCATGTAGGTGACTGTG
GAGCCATTTTCTGGTCTTCATGTGCTGCAATCTAACGGTTTCTCCATTCTTGATGGCATC
ACCTTGCTTGGCTTTTGTCCCAGGCACAGGTTTTACAATCCAGTAGCTGTTGGAATCAGT
GACGCCAGGGAAGCCAGTAACAGACTGCTGACCACTGCCGGATCCATAAGGCACATCGTG
AGAATGCAGACGAAACTTCGTCTTCTCGTGCATCAGCTTTATCGCACTCCCATAACTTAC
CTGGACACCTTCTTTACCGGAAGGCGCTGCGGCGGAGGCAGAGGTGTAGCCGGAATCGGG
ATCAAGCTGAGTAAAGGAAGAGAGCGAGGCAGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G252JQ U 1
AF RS1FT18JQ U 7
BS 1 213 RS1G252JQ
BS 214 214 RS1FT18JQ
BS 215 634 RS1G252JQ
BS 635 635 RS1FT18JQ
BS 636 666 RS1G252JQ
BS 667 814 RS1FT18JQ

RD RS1G252JQ 666 0 0
GAGATTAATGCAAAATACCTAGCAAAACAATATGTAAATTCGCGTGACTACAGTATCATC
ATCAATCGCAGATTAGCAAAATACATATATTTTATATTTTCTTGTTTTCGAGTTCAGAGA
GTAAAAGATGAGATTCAAAGTCCTCGAGAGAAGTTAACACAACTCTTTACCTTACTTACT
ACTCTCATTAACGGGAAGGTAGACTCCCTCTGCTGCCAACCAAACATTATCAGCCCGCTT
CTCCCGGATTCCACAGACCTCTTGCTGACCACCGGCAATGCGTTGGTACTTCTTGTCGTG
GCTATGGAGGTAGCCACTAGTGTCAATGTGTTGAAAACGGACTCTTTGGTCTTGTTTCCA
TATCTTTCCACTACCTTCGATTGTAAGCTTCCAGTGATCCCCAGTATCAGAATTTGAATC
ATCTCCAAAGCAGCTAACCTCTAAGTTTCCAGAAATAGGGGATGCATGTAGGTGACTGTG
GAGCCATTTTCTGGTCTTCATGTGCTGCAATCTAACGGTTTCTCCATTCTTGATGGCATC
ACCTTGCTTGGCTTTTGTCCCAGGCACAGGTTTTACAATCCAGTAGCTGTTGGAATCAGT
GACGCCAGGGAAGCCAGTAACAGACTGCTGACCATTGCCGGATCCATAAGGCACATCGTG
AGAATG

QA 1 666 1 666
DS 

RD RS1FT18JQ 808 0 0
AG
TGCAAAATACCTAGCAAAACAATATGTAAATTCGCGTGACTACAGTATCATCATCAATCG
CAGATTAGCAAAATACATATATTTTATATTTTCTTGTTTTCGAGTTTAGAGAGTAAAAGA
TGAGATTCAAAGTCCTCGAGAGAAGTTAACACAACTCTTTACCTTACTTGCTACTCTCAT
TAACGGGAAGGTAGACTCCCTCTGCCGCCAACCAAACATTATCAGCCCGCTTCTCCCGGA
TTCCACAGACCTCTTGCTGACCACCGGCAATGCGTTGGTACTTCTTGTCGTGGCTATGGA
GGTAGCCACTAGTGTCAATGTGTTGAAGACGGACTCTTTGGTCTTGTTTCCATATCTTTC
CACTACCTTCGATTGTAAGCTTCCAGTGATCCCCAGTATCGGAATTTGAATCATCTCCAA
AGCAGCTAACCTCTAAGTTTCCAGAGATAGGGGATGCATGTAGGTGACTGTGGAGCCATT
TTCTGGTCTTCATGTGCTGCAATCTAACGGTTTCTCCATTCTTGATGGCATCACCTTGCT
TGGCTTTTGTCCCAGGCACAGGTTTTACAATCCAGTAGCTGTTGGAATCAGTGACGCCAG
GGAAGCCAGTAACAGACTGCTGACCACTGCCGGATCCATAAGGCACATCGTGAGAATGCA
GACGAAACTTCGTCTTCTCGTGCATCAGCTTTATCGCACTCCCATAACTTACCTGGACAC
CTTCTTTACCGGAAGGCGCTGCGGCGGAGGCAGAGGTGTAGCCGGAATCGGGATCAAGCT
GAGTAAAGGAAGAGAGCGAGGCAGAA

QA 3 808 3 808
DS 



AS 1 3

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GGAAACAAACAAAACATGTTCTAAAAGGCGGCATTATCTTTTGGGGGAATCAAATTAAAC
ACCAGAAAGACAAAAAAACAATTCAGCCTTGTCCGAACTTGCTATTAGGCTGATGAGTTT
CCTTCATTATTCGTACCCCACTCTTCTTCAGCTTCACTTCCGTTTACAAGCACTGCTCCA
TCAGTTGAGTCACCATCAACAACAACTCCTTCTTCTTCTTGCTCTTCGTGGTGATGTTCC
TCTACACCCTCATCATCATTCTTTTCTTCATCTCCGTTTTCTTCTCCTACCACCTCCTCG
TGATCCATATCTCCATTTTCAAGTGATTCCTCCTCTTCCTCAACTTGCAAGTTTCTAAAG
GCTTCCACGAGGGTCATTGAAGATCTATCCGCATGACTAGGATAATTTTCTGCTGCTGTA
TAAACTCCCCTTGTCTCTGCAGCTTTTGCTTCGACGGAAAGAGCAACTTGCCAATCATCA
AACAGGTTTGAGTACTCCTCAGGATCAGCCAAAGATTCTGCTGCTTTTGAATTTATCTTG
CTGAGATCTTTCCTCCAAAGAGCTACTATCTCAGATACTTTGCTCGGAAGGTATGATCTC
GCCATTAGAGCAGCTTCTGGTAT


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BC42JQ U 5
AF RS1BC42TF C 5
AF RS1G762JQ U 1
BS 1 118 RS1G762JQ
BS 119 119 RS1BC42JQ
BS 120 175 RS1G762JQ
BS 176 176 RS1BC42JQ
BS 177 276 RS1G762JQ
BS 277 277 RS1BC42JQ
BS 278 683 RS1G762JQ

RD RS1BC42JQ 436 0 0
G
GTTTCAAAAACCATGGTATTATGTTTCCTAAAGGCAAATGAATTCACAGAATCACGGAAA
CAAACAAAACATGTTCTAAAAGGGGGCATTATCTTTTGGGGGAATCAAATTAAACACCAG
AAAGACAAAAAAACAATTCAGCCTTGTCCGAACTTGCTATTAGGCTGATGAGTTTCCTTC
ATTATTCGTACCCCACTCTTCTTCAGCTTCACTTCCGTTTACAAGCACTGCTCCATCAGT
TGAGTCACCATCAACAACAACTCCTTCTTCTTCTTGCTCTTCGTGGTGATGTTCCTCTAC
ACCCTCATCATCATTCTTTTCTTCATCTCCGTTTTCTTCTCCTACCACCTCCTCGTGATC
CATATCTCCATTTTCAAGTGATTCCTCCTCTTCCTCAACTTGCAAGTTTCTAAAGGCTTC
CACGAGGGTCATTGA

QA 2 436 2 436
DS 

RD RS1BC42TF 491 0 0
G
GTTTCAAAAACCATGGTATTATGTTTCCTAAAGGCAAATGAATTCACAGAATCACGGAAA
CAAACAAAACATGTTCTAAAAGGCGGCATTATCTTTTGGGGGAATCAAATTAAACACCAG
AAAGACAAAAAAACAATTCAGCCTTGTCCGAACTTGCTATTAGGCTGATGAGTTTCCTTC
ATTATTCGTACCCCACTCTTCTTCAGCTTCACTTCCGTTTACAAGCACTGCTCCATCAGT
TGAGTCACCATCAACAACAACTCCTTCTTCTTCTTGCTCTTCGTGGTGATGTTCCTCTAC
ACCCTCATCATCATTCTTTTCTTCATCTCCGTTTTCTTCTCCTACCACCTCCTCGTGATC
CATATCTCCATTTTCAAGTGATTCCTCCTCTTCCTCAACTTGCAAGTTTCTAAAGGCTTC
CACGAGGGTCATTGAAGATCTATCCGCATGACTAGGATAATTTTCTGCTGCTGTATAAAC
TCCCCTTGTC

QA 2 491 2 491
DS 

RD RS1G762JQ 683 0 0
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GGAAACAAACAAAACATGTTCTAAAAGGCGGCATTATCTTTTGGGGGAATCAAATTAATC
ACCAGAAAGACAAAAAAACAATTCAGCCTTGTCCGAACTTGCTATTAGGCTGATGGGTTT
CCTTCATTATTCGTACCCCACTCTTCTTCAGCTTCACTTCCGTTTACAAGCACTGCTCCA
TCAGTTGAGTCACCATCAACAACAACTCCTTCTTCT*CTTGCTCTTCGTGGTGATGTTCC
TCTACACCCTCATCATCATTCTTTTCTTCATCTCCGTTTTCTTCTCCTACCACCTCCTCG
TGATCCATATCTCCATTTTCAAGTGATTCCTCCTCTTCCTCAACTTGCAAGTTTCTAAAG
GCTTCCACGAGGGTCATTGAAGATCTATCCGCATGACTAGGATAATTTTCTGCTGCTGTA
TAAACTCCCCTTGTCTCTGCAGCTTTTGCTTCGACGGAAAGAGCAACTTGCCAATCATCA
AACAGGTTTGAGTACTCCTCAGGATCAGCCAAAGATTCTGCTGCTTTTGAATTTATCTTG
CTGAGATCTTTCCTCCAAAGAGCTACTATCTCAGATACTTTGCTCGGAAGGTATGATCTC
GCCATTAGAGCAGCTTCTGGTAT

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 3

CO CL1063Contig1 801 3 10 U
GTTTTATTGCAATATAGTTTTCATTCTCTGAATAGTCTTGTCTTGTGTTTATTGCTCTGG
CGAGACACACTTATTGTTAACAACATTTGAAGAAGATTTGATTATGTTTTTTT*ACATTG
TACTAGAAGGAAGTAA*GAGAGAAAATGATGGATCCCTTGACTTGAGTGATAAGGCCAAA
CATCTAAAACCTTTTTACTCTCGTCAACCCATCACCTTTGGTCTCCAACCAGCAATCACA
TCCTCTGTTTGCGCCTCTGTATTCTTGAATGATTCCCTCGAGAACACATTCTCCATGTAG
GATTTAAGGAAAGGAAGTGAATCTGGAACAGACCAGTTCTTGAAATGTCCCAGTGCAATC
TTCATGTGGTATAACTTTGGTGTCAAGGACAAATCAGCTGCTGAGATTTTCTCTCCGTTT
ATGTAAGGTCCATTTTCTTTGAGATAATTGTTGAATGTACTAAGCTCATCTAGTAACACT
TGCTCAGTTCCATCTCCTGAATCTTTGCTCTTGAGAAAACCGATAAACGTGGAGAAGATC
TTTGACCCAACTGAAGCCTTTTCGAGTGGAGTTGCTAGAGGAGGCTCAGGGTACTTGTCT
TCCAAAGTTTGTGTTATGACATCAGAATCCGGAACCCATTTCTCATCAAACTTCACCACT
GGAACTTTACCTTCTGCACTAATTTGCAAGAACCACTCAGGCTTGTTACTCAAATCCACC
ATTTTCATGTCATAAGGTACATGCTTCTCCGCCATAGTCAACAAAACCCTTTGACGCAGA
TTTCGAGAGGAGCAGCGGCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 0 0 0 0 0 15 0 15 15 0 15 0 0 0 15 0 0 15 0 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BF63JQ U 9
AF RS1B308JQ U 1
AF RS1CO62JQ U 9
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RD RS1BF63JQ 671 0 0
G
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CCTTCTGCAC

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DS 

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TCCTCTGTTTGCGCCTCTGTATTCTTGAATGATTCCCTCGAGAACACATTCTCCATGTAG
GATTTAAGGAAAGGAAGTGAATCTGGAACAGACCAGTTCTTGAAATGTCCCAGTGCAATC
TTCATGTGGTATAACTTTGGTGTCAAGGACAAATCAGCTGCTGAGATTTTCTCTCCGTTT
ATGTAAGGTCCATTTTCTTTGAGATAATTGTTGAATGTACTAAGCTCATCTAGTAACACT
TGCTCAGTTCCATCTCCTGAATCTTTGCTCTTGAGAAAACCGATAAACGTGGAGAAGATC
TTTGACCCAACTGAAGCCTTTTCGAGTGGAGTTGCCAGAGGAGGCTCAGGGTACTTGTCT
TCCAAAGTTTGTGTTATGACATCAGAATCCGGAACCCATTTCTCATCAAACTTCACCACT
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QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1CO62JQ 793 0 0
A
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CTTATTGTTAACAACATTCGAAGAAGATTTGATTATGTTTTTTTTACATTGTACTAGAAG
GAAGTAAAGAGAGAAGATGATGGATCCCTTGACTTGAGTGATGAGGCCAAACATCTAAAA
CCTTTTTACTCTCGTCAACCTATCACCTTTGGTCTCCAACCAGCAATCACATCCTCTGTT
TGTGCCTCTGTATTCTTGAATGATTCCCTCGAGAACACATTCTCCATGTAGGATTTAAGG
AAAGGAAGTGAATCTGGAACAGACCAGTTCTTGAAATGTCCCAGTGCAATCTTCATGTGG
TATAATTTTGGTGCCAAGGACAAATCAGCTGCTGAGATCTTCTCTCCGTTTATGTAAGGT
CCATTTTCTTTGAAATAATCGTTGAATGTACTAAGCTCATCTAGTAACACTTGCTCAGTT
CCATCTCCTGAATCTTTGCTCTTGAGAAAACCGATAAACGTGGAGAAGATCTTTGACCCA
ACTGAAGCCTTTTCGGGTGGAGTTGCTAGAGGAGGCTCAGGGTACTTGTCTTCCAAAGTT
TGTGTTATGACATCAGAATCCGGAACCCATTTCTCATCAAACTTCACCACTGGGACTTTA
CCTTCTGCACTAATTTGCAAGAACCACTCAGGCTTGTTACTCAAATCCACCATTTTCATG
TCATAAGGTACATGCTTGTTGGGTGTGGTGATGGAAGC**TTTGACGCAGATTTCGAGAG
GAGCAGCGGCCA

QA 2 793 2 793
DS 



AS 2 6

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CCTTCCCTTTACCACCATCCCGCTCGTTCTCTCCGTTGTTACTTCAGCCATCAACAAGTG
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TATGATGAGGAACAAGTTCATCACACGAAGATACTAGACTCGCCGTCCCCGTTTTTATGT
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AACGAGTTAA*GGGTCTGGAAAATTG


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1A528JQ C 1
AF RS1A528TF U 1
AF RS1AJ22TF U 1
AF RS1AJ22JQ C 1
BS 1 746 RS1A528TF

RD RS1A528JQ 746 0 0
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DS 

RD RS1A528TF 746 0 0
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CTCTCACTGGTCTCCTCACCGATACCGACTCCGCTGGGCCAACCTCAGTCCTCCTCAGGG
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AACGAGTTAA*GGGTCTGGAAAATTG

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1AJ22TF 746 0 0
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QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1AJ22JQ 746 0 0
GGGCCTAACAACACTACCCACACGCCTTTCATCATCCTTTCTCTACTCCCTTCTTTTATT
TATCTTCTTACCGCCATAGCTCTAGCTTGCTTGCAACAGAGGCTCTAAAGTTAACCTTAA
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CCTTCCCTTTACCACCATCCCGCTCGTTCTTTCCGTTGTTACTTCAGCCATCAACAAGTG
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TATGATGAGGAACAAGTTCATCACACGAAGATACTAGACTCGCCGTCCCCGTTTTTATGT
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QA 1 746 1 746
DS 



CO CL1064Contig2 734 2 13 U
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ACTGGTCTCCTCACCGATGCCGACTCCGCTGGGCCAACCTCAGTCCTCCTCAGGGAGGAA
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BQ
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20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GG
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AGTT
GTTTAGC

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DS 



AS 1 5

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BQ
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5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GM72JQ U 61
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AF RS1D415TF C 601
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G
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DS 

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TCTCTTTTAGGTTTAATCTTTGCAGAATCCCATTGCAAGGTTTTTT*CACTTGAGGAAGT
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CCTTCAAGTAAACCGATGAGAGTTCCTTTGGTCCGATGCATAGCCATTACATTCTCGAAC
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AGAAAGAAGAAGCTGTAGATCACATACAACTTCTTCCAAATCATCACTCTCTTATTATAA
ATAATTTCCATAGTAATTTTCCTGAAGAGATTAGCTGGACCGCATGACCATCGATGTTGC
TGGAATCTAAAAGCCTTGAACTGGCTTGGAAGCTCACTTTTCACCTCGATGTCATTGACA
AAGACAAATTTCCAGCCGTGT

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DS 

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AAGAGAGTGATCATAAAAGGAACGTAGATAGTTGACCAAGTAGGAATGTTGACTTCATAA
AAGAATACGCTCGTAGGAAGAACGATGCAATAGAAGAAAAATGTGAAGAAATGAACTAAT
ATTTTCCGTAGAAAGAAGAAGCTGTAGATCACATACAACTTCTTCCAAATCATCACTCTC
TTATTATAAATAATTTCCATAGTCATTTTCCTGAAGAGATTAGCTGGACCGCATGACCAT
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GTCCGGTCTTTCCAACCTCCAGCTTCTTCCATCCCTGCCAATCTCCACACACCCGCTGTC
CCATTGAAGCCAAAGAAGGCATGTCTGGTGGATCCGGATTCTTGCTCTGCCATAAGATGG
TAATTTAGTGACATCTCCTGCATCCTAGTCATCAAGCACTTGTTTGCGTTCACAAATTTC
CATCGAGCTTGAACAAGAGCAAGCTCGGGATTGTGAATGAGAAACGGGACAGTGCGGTGG
AGGTAATCGGGCTCTGGCTGGAAATCAGCATCGAAGATCGCAATGTAGTTGCACTGTTTG
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CTCCTTTCACATTTTATGTTTATGCTTTTGCTTGCCCACTTTGCACATTCCATGCTCACC
ATTTC
CTCTCG

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ACACCCGCTGTCCCATTGAAGCCAAAGAAGGCATGTCTGGTGGATCCGGATTCTTGCTCT
GCCATAAAATGGTAATTTAGTGACATCTCCTGCATCCTAGTCATCAAGCACTTGTTTGCG
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ACAGTGCGGTGGAGGTAATCGGGCTCTGGCTGGAAATCAGCATCGAAGATCGCAATGTAG
TTGCACTGTTTGACATAGCTATGCCTCATGCCTTGTTTAAGAGCTCCAGCTTTGTAGCCA
TTTCTATTGTCTCTCCTTTCACATTTTATGTTTATGCCTTTGCTTGCCCACTTTGCACAT
TCCATGCTCACCATTTCGTGCTTCAAGCTTTTCAAAAGTCGCAGCTGCTTCTTCATAACT
CCTTCCATGGATGTCGCAAAAGAAACATAGCTATTTTGCTTCTCAGAATCAAGATATGGG
AGTGAGATAGATTGGTGGAAGAAGAGGAGAGGGGTTTAGAAAGGTTTTTGTATTATTGTC
TAGAAGTTCC

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DS 



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TCTCCGCGCTCACCGCAAGAAGTACAACCGTATTACCGAGATGGAAGAGTCGGTTTCTCA
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CCTTATCGAAGAACTCGAAAAGCTCCGTCTTCCTCCTTCTCCTCCTCCTTCCGCGGCTGG
TTCAGAAGAGATCAGCCTCCCCGCTAAGAAAAACAAAAAGAAAAAGGAACGTAAGGAGGT
AGCCGAGGAGAAAGACGTGACCCTCAAGGAGGATATCGAGGAGTGCAAGATCTCTGATGG
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TGGGACGTCGTCACCACCCCCAGCGAGTAGTGGAAAGCCACGACGTAAACGGAAGGCGAA
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TCCGCTCGTTCACAAGAGCTTTTTTTTTTTTTTTTCCGTTTGAGCTTTCTTTCTTTCTAC
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TTTGCT


BQ
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35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 30 10 

AF RS1EU88TF U 49
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BS 1 844 RS1A120TF
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TTTG

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T

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RD RS1A120TV 791 0 0
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TCTCAGGGAAAAACGCTAAACAAGGAGCAAAAAGAAGCCATCCGCTCGAAGCCAATCGTC
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GCTGGTTCAGAAGAGATCAGCCTCCCCGCTAAGAAAAACAAAAAGAAAAAGGAACGTAAG
GAGGTAGCCGAGGAGAAAGACGTGACCCTCAAGGAGGATATCGAGGAGTGCAAGATCTCT
GATGGTCTTGATGCTGGTGAAGTTACGAAGGATGATGTTTCTCCGTGTAGCGTAAGCTCA
CAAGATGGGACGTCGTCACCACCCCCAGCGAGTAGTGGAAAGCCACGACGTAAACGGAAG
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AGTGCAAATATAAGTGCCATGAATTGCTTTGGTCACAATCCTTGGCAGTTTCCTTTTAGT
ATTCTTCCGCTCGTTCACAAGAGCTTTTTTTTTTTTTTTTCCGTTTGAGCTTTCTTTCTT
TCTACTATTTTTGGTATTGTTTGGTCACCTTGAGTTTTTTGATTCCTATGAAAGTCGATT
AATATTTTGC
T

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TCTCCGCGCTCACCGCAAGAAGTACAACCGTATTACCGAGATGGAAGAGTCGGTTTCTCA
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CCTTATCGAAGAACTCGAAAAGCTCCGTCTTCCTCCTTCTCCTCCTCCTTCCGCGGCTGG
TTCAGAAGAGATCAGCCTCCCCGCTAAGAAAAACAAAAAGAAAAAGGAACGTAAGGAGGT
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TCTTGATGCTGGTGAAGTTACGAAGGATGATGTTTCTCCGTGTAGCGTAAGCTCACAAGA
TGGGACGTCGTCACCACCCCCAGCGAGTAGTGGAAAGCCACGACGTAAACGGAAGGCGAA
GAAACCTCTGACTTCGAACTGATCGTGTCTCCAACTGTTGTACGAAGCGGAAGTCAGTGC
AAATATAAGTGCCATGAATTGCTTTGGTCACAATCCTTGGCAGTTTCCTTTTAGTATTCT
TCCGCTCGTTCACAAGAGCTTTTTTTTTTTTTTTTCCGTTTGAGCTTTCTTTCTTTCTAC
TATTTTTGGTATTGTTTGGTCACCTTGAGTTTTTTGATTCCTATGAAAGTCGATTAATAT
TTTGCT

QA 1 786 1 786
DS 

RD RS1EU88JQ 487 0 0
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GATGGGACGTCGTCACCACCCCCAGCGAGTAGTGGAAAGCCACGACGTAAACGGAAGGGG
AAGAAACCTCTGACTTCGAACTGATCGTGTCTCCAACTGTTGTACGAAGCGGAAGTCAGT
GCAAATATAAGTGCCATGAATTGCTTTGGTCACAATCCTTGGCAGTTTCCTTTTAGTATT
TTTCCGCTCGTTCACAAGAGCTTTTTTTTTTTTTTT*CCGTTTGAGCTTTCTTTCTTTCT
ACTATTTTTGGTATTGTTTGGTCACCTTGAGTTTTTTGATTCCTATGAAAGTCGATTAAT
ATTTTGC

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DS 



AS 1 3

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AAAGTAGTTACAGAAAAAGAAGATAAAAAGCGGTGGTAACTTGATCCACAAGTTAGAGTG
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CGACTCCACATTTTCCGGCTGAACATTGGCCGCCGAATCCACCGCTTTGGCGATGACCTC
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GTTGTGTTCAGAGATGTAATGCTCTCCTGGTTTCTGTGTTCTAGAAGCTTCCACCCAGCT
TTTGCCTCCATCCATGGATATATCCACTCGCTCTATCCCGCGCCCACCTCCGGAAACCGC
ATATCCTTTGATGCTTACCTTTCCAGGCTTCACCATTTGCACGTCCTCCAAAGAGCAGAT
TGCACTCTGAACAGGGAAATCCATTTGCGGCCTCCTTGAGGACCAGTCGATATTGTCCCA
ATTAACAGAAGGTGGGAACATTTTGTAATCTTTTTGCATAAAAAAACCCTGGCATTCTTC
AGCGAGTATATTGATGGAATCAAGCCATTTGACCGAACGAGCACCAATCACGCCGGGGAC
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CCCACCTTTCTCCTCCTTGCAGCGATCGACACTGACCCCCGGCCGTAATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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TCCTTGCAGCGATCGACACTGACCCCCGGCCGTAATGG

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DS 



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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

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AGTAAGAGTTTCACCACCACAACCACTACCAAGTTTCATAAACCCTTTTGTTCTCCCAGC
GAGACCTGGACAACCAGCTTGTGCTAGCTTCAAGACTTATGGTTTCTGCAAGTTTGGACA
AAACTGCAACTTCGACCACTCGGTGCTGCCATATCCTCCTACGGGATTGCACATGCCTTC
GTCTCTGCCTAGTCCTTATCCTTCGCATGTTTCATCTGATAATTATCAGAGGATCTCACC
ATCGCCAAGCCGCACTGGTTCAA*GACTATTATGCATGATGATAAGCCTGGTGTGA

QA 1 776 1 776
DS 

RD RS1DA85TF 632 0 0
G
GACCTATGTTCCCGTCATGGTAACACCTTCTCAAGGCATCTTGCCTCCTCAGAGCTGGGC
CACTTACATGGGTGCATCTAACTCCATGTATGGTGTGAAGAATCAAGCTTATTACTCTGG
TTCCAGCGGACCGATGCCCATGGCTGTGGCATTGAATGGTGATTTGTCTGAAAGATCTGA
ACAACAACAGCAACAATGTCGGTTTTTCATGAACACTGGGACATGTAAATATGGAGAACA
CTGCAAATACACTCACCTCGGAGTAAGAGTTTCACCACCACAACCACTACCAAGTTTCAT
AAACCCTTTTGTTCTCCCAGCGAGACCTGGACAACCAGCTTGTGCTAGCTTCAAGACTTA
TGATTTCTGCAAGTTTGGACAAAACTGCAACT*CGACCACTCGGTGCTGCCATATCCCCC
TACGGGATTGCACATGCCTTCGTCTCTGCCTAGTCCTTATCCTTCGCATGTTTCATCTGA
TAATTATCAGAGGATCTCACCATCGCCAAGCCGCACTGGTTCAAAGACTATTATGCATGA
TGATAAGCCTGGTGTGAAAAAGGAAAAGTCAGGGAATGAGAAACGTGATGGGGATTCGGA
ACAAGTGCAGGATTGGTCAGAGAATTTGTCA

QA 2 632 2 632
DS 

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TCATAAACCCTTTTGTTCTCCCAGCGAGACCTGGACAACCAGCTTGTGCTAGCTTCAAGA
CTTATGATTTCTGCAAGTTTGGACAAAACTGCAACT*CGACCACTCGGTGCTGCCATATC
CCCCTACGGGATTGCACATGCCTTCGTCTCTGCCTAGTCCTTATCCTTCGCATGTTTCAT
TTGATAATTATCAGAGGATCTCACCATCGCCAAGCCGCACTGGTTCAAAGACTATTATGC
ATGATGATAAGCCTGGTGTGAAAAAGGAAAAGTCAGGGAATGAGAAACGTGATGGGGATT
CGGAACAAGTGCAGGATTGGTCAGAGAATTTGTCATCACCAAGATCATGATTCATGTTCA
CAGCAACGAGAAACTCAGGCTTTTAAAAGATCTCTCTGTCCTTTTTTTGGTGAAAGTGTC
TCTTTTTTTTTTGGTTTTTTTTTTATGAAAATTGCAGTGGATGAAAACTACATAGGACGA
AACTTTTAATGTCATATGTATATCGAAACCTTTCTGTCGGCAGGGGATGAACATGTTTTT
GTTTCAATATAAACATTTACGA
CG

QA 1 622 1 622
DS 

RD RS1AJ49TF 759 0 0
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CTGGTTCCAGCGGACCGATGCCCATGGCTGTGGCATTGAATGGTGATTTGTCTGAAAGAT
CTGAACAACAACAGCAACAATGTCGGTTTTTCATGAATACTGGGACATGTAAATATGGAG
AACACTGCAAATACACTCACCTCGGAGTAAGAGTTTCACCACCACAACCACTACCAAGTT
TCATAAACCCTTTTGTTCTCCCAGCGAGACCTGGACAACCAGCTTGTGCTAGCTTCAAGA
CTTATGGTTTCTGCAAGTTTGGACAAAACTGCAACTTCGACCACTCGGTGCTGCCATATC
CTCCTACGGGATTGCACATGCCTTCGTCTCTGCCTAGTCCTTATCCTCCGCATGTTTCAT
CTGATAATTATCAGAGGATCTCACCATCGCCAAGCCGCACTGGTTCAAAGACTATTATGC
ATGATGATAAGCCTGGTGTGAAAAAGGAATAGTCAGGGAATGAGAAACGTGATGGGGATT
CTGAACAAGTGCAGGATTGGTCAGAGAATTTGTCATCACCAAGATCATGATTCATGTTCA
CAGCAACGAGAAACTCAGGCTTCTAAAAGATCTCTCTGTCCTTTTTT*GGTGAAAGTGTC
TCTTTTTTTTTGGTTTTTTTTTTTATGAAAATTGCAGTGGATGAAAACTACATAGGACGA
AACTTTTAATGTCATATGTATATCGAAACCTTTCTGTCG

QA 1 759 1 759
DS 

RD RS1AJ49JQ 835 0 0
GGGCCACTTACATGGGTGCATCTAACTCCATGTATGGTGTGAAGAATCAAGCTTATTACT
CTGGTTCCAGCGGACCGATGCCCATGGCTGTGGCATTGAATGGTGATTTGTCTGAAAGAT
CTGAACAACAACAGCAACAATGTCGGTTTTTCATGAATACTGGGACATGTAAATATGGAG
AACACTGCAAATACACTCACCTCGGAGTAAGAGTTTCACCACCACAACCACTACCAAGTT
TCATAAACCCTTTTGTTCTCCCAGCGAGACCTGGACAACCAGCTTGTGCTAGCTTCAAGA
CTTATGGTTTCTGCAAGTTTGGACAAAACTGCAACTTCGACCACTCGGTGCTGCCATATC
CTCCTACGGGATTGCACATGCCTTCGTTTCTGCCTAGTCCTTATCCTCCGCATGTTTCAT
CTGATAATTATCAGAGGATCTCACCATCGCCAAGCCGCACTGGTTCAAAGACTATTATGC
ATGATGATAAGCCTGGTGTGAAAAAGGAATAGTCAGGGAATGAGAAACGTGATGGGGATT
CTGAACAAGTGCAGGATTGGTCAGAGAATTTGTCATCACCAAGATCATGATTCATGTTCA
CAGCAACGAGAAACTCAGGCTTCTAAAAGATCTCTCTGTCCTTTTTT*GGTGAAAGTGTC
TCTTTTTTTTTGGTTTTTTTTTTTATGAAAATTGCAGTGGATGAAAACTACATAGGACGA
AACTTTTAATGTCATATGTATATCGAAACCTTTCTGTCGGCAGGGGATGAACATGTTTTT
GTTTCAATATAAACATTTACGATGAGATCCCTTAGAAAGATCTCTCTATTTGCAC

QA 1 835 1 835
DS 

RD RS1E741TF 631 0 0
G
CTCGGAGTAAGAGTTTCACCACCACAACCACTACCAAGTTTCATAAACCCTTTTGTTCTC
CCAGCGAGACCTGGACAACCAGCTTGTGCTAGCTTCAAGACTTATGGTTTCTGCAAGTTT
GGATAAAACTGCAACTTCGACCACTCGGTGCTGCCATATCCTCCTACGGGATTGCACATG
CCTTCGTCTCTGCCTAGTCCTTATCCTTCGCATGTTTCATCTGATAATTATCAGAGGATC
TCACCATCGCCAAGCCGCACTGGTTCAAAGACTATTATGCATGATGATAAGCCTGGTGTG
AAAAAGGAAAAGTCAGGGAATGAGAAACGTGATGGGGATTCGGAACAAGTGCAGGATTGG
TCAGAGAATTCGTCATCACCAAGATCATGATTCATGTTCACAGCAACGAGAAACTCAGGC
TTCTAAAAGATCTCTCTGTCCTTTTTTTGGTGAAAGTGTCTCTTTTTTTTTTGGTTTTTT
TTT*ATGAAAATTGCAGTGGATGAAAACTACATAGGACGAAACTTTTAATGTCATATGTA
TATCGAAACCTTTCTGTCGGCAGGGGATGAACATGTTTTTGTTTCAATATAAACATTTAC
GATGAGATCCCTTAGAAAGATCTCTCTATT

QA 2 631 2 631
DS 



AS 1 6

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CAGAATCAAGATCTGCGAGGAAAACATTACAACCTTTTTTACAGATCTAAACCCATAGAA
TATCTATCTCATACGGGTTTCTTTCTTGTTAGACGAGTAAATTATCAACTCGTGAAAAAC
CCTTAGATGGCTTAAAATAGAAGGAAAAAGACTTAAAAAAA***AAGAGAAGAGATGCTG
TTATTTTTTGTAAAATGAAGCTTCTGCTTCTTCTTCAACCATCTTCTTCTTCAAACGATT
TAGCTTAAATATCATCGAATCATGGAGGTTAGGCTTTGGAAAACGACTTCATCACAGGGA
ATGGTGAGACCCATGTCGTGGTCGAATCCAAACTCTTCCTCAGCTCGTCGTAAGAGAGAC
TGGAACTCAGGGTGAGTCAAGAAGGAGACTGGGACAATGTATCTGCTTCTGTTCTCTCCG
ACATAGACAGGAAAGTGTCCCTTTGGAACATCGAGAGGGAGGCAACCGTGGTCGTACCCT
CCTCCGTTCTTCTTTCCTAAGCTCGAGCATCTCTTAAGAATCTGTTTCAGCATTGCTGTT
TGAGTGAGTTTTAAAGATTTCTTCATTATAGCCATTTGGTTTTGTTCTTGAGAGAGAAAA
GCTTTTGGTTCTGTATGGAAGGAGAGAGCGTTATAGAGAAGGAGATGGGTGGTTATTGAG
GGGTTGATGAGTATATATTTATAAATAAAGATTTGGTTGTCTAAATGTCTGTACATATTT
GTGTGGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GO33JQ U 1
AF RS1B891JQ U 20
AF RS1GO33TF C 97
AF RS1GH50JQ U 25
AF RS1B891TF C 21
AF RS1GH50TF C 101
BS 1 225 RS1GO33JQ
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RD RS1GO33JQ 628 0 0
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QA 1 628 1 628
DS 

RD RS1B891JQ 693 0 0
CTTTT
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AGAGCGTTATAGAGAAGGAGATGGGT
CC

QA 6 691 6 691
DS 

RD RS1GO33TF 616 0 0
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GTAAATTATCAACTCGTGAAAAACCCTTAGATGGCTTAAAATAGAAGGAAAAAGACTTAA
AAAAA***A*GAGAAGAGATGCTGTTATTTTTTGTAAAATGAAGCTTCTGCTTCTTCTTC
AACCATCTTCTTCTTCAAACGATTTAGCTTAAATATCATCGAATCATGGAGGTTAGGCTT
TGGAAAACGACTTCATCACAGGGAATGGTGAGACCCATGTCGTGGTCGAATCCAAACTCT
TCCTCAGCTCGTCGTAAGAGAGACTGGAACTCAGGGTGAGTCAAGAAGGAGACTGGGACA
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GGGAGGCAACCGTGGTCGTACCCTCCTCCGTTCTTCTTTCCTAAGCTCGAGCATCTCTTA
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TGGTTTTGTTCTTGAGAGAGAAAAGCTTTTGGTTCTGTATGGAAGGAGAGAGCGTTATAA
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CC

QA 1 614 1 614
DS 

RD RS1GH50JQ 671 0 0
AGAGAAATACTTTCTAGCATTACTCAACTTCTCTCACAGAATCAAGATCTGCGAGGAAAA
CATTACAACCTTTTTTACAGATCTAAACCCATAGGATATCTATCTCATACGGGTTTCTTT
CTTGTTAGACGAGTAAATTATCAACTCGTGAAAAACCCTTAGATGGCTTAAAATAGAAGG
AAAAAGACTTAAAAAAAAAAAAGAGAAGAGATGCTGTTATTTTTTGTAAAGTGAAGCTTC
TGCTTCTTCTTCAACCATCTTCTTCTTCAAACGATTTAGCTTAAATATCATCGAATCATG
GAGGTTAGGCTTTGGAAAACGACTTCATCACAGGGAATGGTGAGACCCATGTCGTGGTCG
AATCCAAACTCTTCCTCAGCTCGTCGTAAGAGAGACTGGAACTCAGGGTGAGTCAAGAAG
GAGACTGGGACAATGTATCTGCTTCTGTTCTCTCCGACATAGACAGGAAAGTGTCCCTTT
GGAACATCGAGAGGGAGGCAACCGTGGCCGTACCCTCCTCCGTTCTTATT*CCTAAGCTC
GAGCATCTCTTAAGAATCTGTTTCAGCATTGCTGTTTGAGTGAGTTTTAAAGATTTCTTC
ATTATAGCCATTTGGTTTTGTTCTTGAGAGAAAAAAGCTTTTGGTTCTGTATGGAAGGAG
AG
CGTTATAGA

QA 1 662 1 662
DS 

RD RS1B891TF 692 0 0
CTTT
AGAGAAATACTTTCTAGCAT*ACTCAACTTCTCTCACAGAATCAAGATCTGCGAGGAAAA
CATTACAACCTTTTT*ACAGATCTAAACCCATAGAATATCTATCTCATACGGGTTTCTTT
CTTGTTAGACGAGTAAATTATCAACTCGTGAAAAACCCTTAGATGGCTTAAAACAGAAGG
AAAAAGACTTAAAAAAA***AAGAGAAGAGATGCTGTTATTTTTTGTAAAATGAAGCTTC
TGCTTCTTCTTCAACCATCTTCTTCTTCAAACGATTTAGCTTAAATATCATCGAATCATG
GAGGTTAGGCTTTGGAAAACGACTTCATCACAGGGAATGGTGAGACCCATGTCGTGGTCG
AATCCAAACTCTTCCTCAGCCCGTCGTAAGAGAGACTGGAACTCAGGGTGAGTCAAGAAG
*AGACTGGGACAATGTATCTGCTTCTGTTCTCTCCGACATAGACAGGAAAGTGTCCCTTT
GGAACATCGAGAGGGAGGCAACCGTGGTCGTACCCTCCTCCGTTCTCCTTTCCTAAGCTC
GAGCATCTCTTAAGAATCTGTTTCAGCATTGCTGTTTGAGTGAGTTTTAAAGATTTCTTC
ATTATAGCCATTTGGTTTTGTTCTTGAGAGAGAAAAGCTTTTGGTTCTGTATGGAAGGAG
AGAGCGTTATAGAGAAGGAGATGGGT
CC

QA 5 690 5 690
DS 

RD RS1GH50TF 690 0 0
ACAGATCTAAACCCATAGGATATCTATCTCATACGGGTTTCTTTCTTGTTAGACGAGTAA
ATTATCAACTCGTGAAAAACCCTTAGATGGCTTAAAATAGAAGGAAAAAGACTTAAAAAA
AAAAAAGAGAAGAGATGCTGTTATTTTTTGTAAAGTGAAGCTTCTGCTTCTTCTTCAACC
ATCTTCTTCTTCAAACGATTTAGCTTAAATATCATCGAATCATGGAGGTTAGGCTTTGGA
AAACGACTTCATCACAGGGAATGGTGAGACCCATGTCGTGGTCGAATCCAAACTCTTCCT
CAGCTCGTCGTAAGAGAGACTGGAACTCAGGGTGAGTCAAGAAGGAGACTGGGACAATGT
ATCTGCTTCTGTTCTCTCCGACATAGACAGGAAAGTGTCCCTTTGGAACATCGAGAGGGA
GGCAACCGTGGCCGTACCCTCCTCCGTTCTTATT*CCTAAGCTCGAGCATCTCTTAAGAA
TCTGTTTCAGCATTGCTGTTTGAGTGAGTTTTAAAGATTTCTTCATTATAGCCATTTGGT
TTTGTTCTTGAGAGAAAAAAGCTTTTGGTTCTGTATGGAAGGAGAG**CGTTATAGAGAA
GGAGATGGGTGGTTATTGAGGGGTTGATGAGTATATATTTATAAATAAAGATTTGGTTGT
CTAAATGTCTGTACATATTTGTGTGGGTCC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 2 6

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AGATCCAAGAAAACTAAAAAGATAAGGAAAGGTCCGGTCCTTGTGTTTTTCTTTTTCTCT
GTATGTTCAGTCAGGAAACACAAACACACACGAAACATAGCGCATCAAGAACTAAAGAGA
AAAAGGCTTTTTCCGTGTTCTTCTGCCTAAGCATCAGAAACTTTCTCTGCGGGTTTTCCT
TCTTTGTTGATGTGAAAGCCTTCAATCTTCTTAGCCACTTCATCCACACTATGGTTTGGT
GTCGTCTGCCAGATCCTGATGGTCCCGTCTTCAGACCCCGAGGCGTACGACTCACCCGTC
GGTGAAAACCTCACGCAGTGTACCGGACCATGATGCCCCTTGTTGCATCCAATCTCCTCT
CCGGTGTAGAAATCAAACATTCGGACCCACATATCCTCACCGCCAGCTACAAACTTTTCA
CCAGATTTAGGCTCCAGAGATGCAGACTCAATATTGCATGGCATGTCATAACTCTTCACC
AGTCCAAAATGGTTAGCGTCCCAGAATTTAACAGTTGACCCATCAGCAGTAGTAATGTAT
CGTCCATCTTGGCTCACTTCAGCACTGGTGACAGGAGACTTTGTTTCCAGTGTCTGCACA
ATCTTCCCACTCCTAACATCCCATAACCTCACGCCACCAATATCAGTGCAAGAACTTAAT
ATTGTTTGATCACTGTGAAGCCATGTGAGAGTTCTGATGGATCCAGGGGATTTATCGACT
CTGGGGGAGGTGCATCCCA


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F625JQ U 1
AF RS1GS56JQ U 24
AF RS1CA77JQ U 3
BS 1 31 RS1F625JQ
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BS 176 176 RS1CA77JQ
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RD RS1F625JQ 579 0 0
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GTATATTCAGTCAGGAAACACAAACACACACGAAACATAGCGCATCAAGAACTAA*GAGA
AAAAGGCTTTT*CCGTGTTCTTCTGCCTAAGCATCAGAAACTTTCTCTGCGGGTTTGCCT
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GGTGAAAACCTCACGCAGTGTACCGGACCATGATGCCCCTTGTTGCATCCAATCTCCTCT
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CCAGATTTAGGCTCCAGAGATGCAGACTCAATATTGCATGGCATGTCATAACTCTTCACC
AGTCCAAAATGGTTAGCGTCCCAGAATTTAACAGTTGAC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RS1GS56JQ 766 0 0
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ACACACACGAAACATAGCGCATCAAGAACTAAAGAGAAAAAGGCTTTTTCCGTGTTCTTC
TGCCTAAGCATCAGAAACTTTCTCTGCGGGTTTTCCTTCTTTGTTGATGTGAAAGCCTTC
AATCTTCTTAGCCACTTCATCCACACTATGGTTTGGTGTCGTCTGCCAGATCCTGATGGT
CCCGTCTTCAGACCCCGAGGCGTACGACTCACCCGTCGGTGAAAACCTCACGCAGTGTAC
CGGACCATGATGCCCCTTGTTGCATCCAATCTCCTCTCCGGTGTAGAAATCAAACATTCG
GACCCACATATCCTCACCGCCAGCTACAAACTTTTCACCAGATTTAGGCTCCAGAGATGC
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GAATTTAACAGTTGACCCATCAGCAGTAGTAATGTATCGTCCATCTTGGCTCACTTCAGC
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TAACCTCACGCCACCAATATCAGTGCAAGAACTTAATATTGTTTGATCACTGTGAAGCCA
TGTGAGAGTTCTGATGGATCCAGGGGATTTATCGAC
CTCTGTGGGA

QA 1 756 1 756
DS 

RD RS1CA77JQ 797 0 0
G
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TCCAAGAAAACTAAAAAGATAAGGAAAGGTCCGGTCCTTGTGTTTTTCTTTTTCTCTGTA
TGTTCAGTCAGGAAACACAAACACACACGAAACATAGCGCATCAAGAACTAAAGAGAAAA
AGGCTTTTTCCGTGTTCTTCTGCCTAAGCATCAGAAACTTTCTCTGCGGGTTTTCCTTCC
TTGTTGATGTGAAAGCCTTCAATCTTCTTAGCCACTTCATCCACACTATGGTTTGGTGTC
GTCTGCCAGACCCTGATGGTCCCGTCTTCAGACCCCGAGGCGTACGACTCACCCGTCGGT
GAAAACCTCACGCAGTGTACCGGACCATGATGCCCCTTGTTGCATCCAATCTCCTCTCCG
GTGTAGAAATCAAACATTCGGACCCACATATCCTCACCGCCAGCTACAAACTTTTCACCA
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CCAAAATGGTTAGCGTCCCAGAATTTAACAGTTGACCCATCAGCAGTAGTAATGTATCGT
CCATCTTGGCTCACTTCAGCACTGGTGACAGGAGACTTTGTTTCCAGTGTCTGCACAATC
TTCCCACTCCTAACATCCCATAACCTCACGCCACCAATATCAGTGCAAGAACTTAATATT
GTTTGATCACTGTGAAGCCATGTGAGAGTTCTGATGGATCCAGGGGATTTATCGACTCTG
GGGGAGGTGCATCCCA

QA 2 797 2 797
DS 



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TGAATCCGCTTGAAATTAGAAAAACAAAAAACATATTCTTTAGGGTTTTGGTTTTGTTTC
CACTGGTGGTGTTGGATTAATATATA**AATATGGATAAGAAGAAGGTCGCCGTTCCACT
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TGGTTTCTTCCTCATCAGCGCCAGTAAAGATTCACATCCAATGTTGAGAAACGGGGAGAC
TGGAGACTGGATTGGTACCTTTGAAGGTCATAAAGGTGCGGTGTGGAGTTCTTGCCTCGA
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TTTGAACCGGTTGGATGCACCTCCCACAGAGGTCGATAAATCCCCTGGATCCATCAGAAC
TCTCACATGGCTTCACAGTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CA77TF U 25
AF RS1GS56TF U 36
AF RS1F625TF U 1
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GG
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AAAAACATATTCTTTAGGGTTTTGGTTTTGTTTCCACTGGTGGTGTTGGATTAATATATA
**AATATGGATAAGAAGAAGGTCGCCGTTCCACTTGTCTGCCATGGCCATTCAAGACCTG
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AAGATTCACATCCAATGTTGAGAAACGGGGAGACTGGAGACTGGATTGGTACCTTTGAAG
GTCATAAAGGTGCGGTGTGGAGTTCTTGCCTCGACAACAACGCTCTACGTGCTGCCTCTG
CATCTGCTGATTTTTCAGCGAAACTCTGGGATGCGTTAACAGGAGATGTGCTGCATTCTT
TTGAGCACAAGCATATTGTTCGAGCATGTGCCTTCTCAGAG*ATACAAAATTGCTGATCA
CTGGAGGATTT

QA 3 613 3 613
DS 

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GG
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CTTTAGGGTTTTGGTTTTGTTTCCACTGGTGGTGTTGGATTAATATATA**AATATGGAT
AAGAAGAAGGTCGCCGTTCCACTTGTCTGCCATGGCCATTCAAGACCTGTTGTTGATTTG
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CCAATGTTGAGAAACGGGGAGACTGGAGACTGGATTGGTACCTTTGAAGGTCATAAAGGT
GCGGTGTGGAGTTCTTGCCTCGACAACAACGCTCTACGTGCTGCCTCTGCATCTGCTGAT
TTTTCAGCGAAACTCTGGGATGCGTTAACAGGAGATGTGCTGCATTCTTTTGAGCACAAG
CATATTGTTCGAGCATGTGCCTTCTCAGAGGATACAAAACTGCTGATCACTGGAGGATTT
GAGAAGATTCTTCGTGTATTTGAT

QA 3 626 3 626
DS 

RD RS1F625TF 741 0 0
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GCAGCATTCAACTGTACCTGCAGATTCGATCGAAGTTTATTAGATCCGGGATTTTCCTCC
CTATATATTTGTATAAAACTAAGAAAAAAAGTTTCGATTTCTTTAAGCGTAGTTCGTGTT
TGAATCCGCTTGAA*TTAAAAAAACAAAAAACATATTCTTTGGGGTTTTGGTTTTGTTTC
CACTGTGTGTGTTGGATTAATATATATAAATATGGATAAGAAGAAGGTCGCCGTTCCACT
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TGGTTTCTTCCTCATCAGCGCCAGTAAAGATTCACATCCAATGTTGAGAAACGGGGAGAC
TGGAGACTGGATTGGTACATTTGAAGGTCATAAGGGTGCGGTGTGGAGTTCTTGCCTCGA
CAACAACGCTCTACGTGCTGCTTCTGCTTCTGCTGATTTTTCAGCGAAACTCTGGGATGC
GTTAACAGGAGATGTGCTGCATTCTTTTGAGCACAAGCATATTGTTCGAGCGTGTGCTTT
CTCTGAGGATACAAAATTGCTGATCACTGGAGGATTTGAGAAGATTCTTCGTGTATTTGA
TTTGAACCGGTTGGATGCACCTCCCACAGAGGTCGATAAATCCCCTGGATCCATCAGAAC
TCTCACATGGCTTCACAGTGA

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 5

CO CL1071Contig1 644 5 1 U
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ATTGGAAACAAACAAAGAAACCACACACCATAAGGATCAATTTTGGATATAACAAACTTG
GTCCTGATAAGAAGATTGAAAACTCAGTAGAAATAATGATTGTTAAGGAACTGAGACGCA
GTTGCAAGAGCGCCACCCATGATTGCATCCACCACCACCTTGTCTTTGCCTTTGTTAGTA
GCGGCAGAGATCACCGCTCCTGTCGCCGCTCCTGCCAACATTGCGTTTTTCCAATCCCTA
GTGCCACGGATACGTTCGATTCCATACTCTGTTCCAACGTAAACCCCAGCCACAGATCCC
CAGTAAACACCTTCTTTGCACATCTTCTTAAGCGCATGCTCAATAGTGCTCTTGGAAACA
CTCCCTTTGTCGATGGCTTTGTAAGTGTCTTCCACAAGAGATTTAGTGACTCCAACAGCT
CCGATCTTGAGGAAACCATCGACGGTGAGGTTGAGAAAAGGGTTGCCCATGTCCACTGCC
ACCGACAGCTTCGGTGAGCTAACAGTTCCAGAGAATGTGCTTGAAGGCATCTTCTTCCTC
TTTCTTTTCTTTGGATGTTTTTCTCTTTGGATCTTTTGTTCTCC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1G540JQ U 57
AF RS1GX47JQ U 1
AF RS1FD13TF C 1
AF RS1FD13JQ U 1
AF RS1GX47TF C 125
BS 1 644 RS1FD13JQ

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CCTAGTGCCACGGATACGTTCGATTCCATACTCTGTTCCAACGTAA

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DS 

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DS 

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GCGGCAGAGATCACCGCTCCTGTCGCCGCTCCTGCCAACATTGCGTTTTTCCAATCCCTA
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CTCCCTTTGTCGATGGCTTTGTAAGTGTCTTCCACAAGAGATTTAGTGACTCCAACAGCT
CCGATCTTGAGGAAACCATCGACGGTGAGGTTGAGAAAAGGGTTGCCCATGTCCACTGCC
ACCGACAGCTTCGGTGAGCTAACAGTTCCAGAGAATGTGCTTGAAGGCATCTTCTTCCTC
TTTCTTTTCTTTGGATGTTTTTCTCTTTGGATCTTTTGTTCTCC

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DS 

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CTTTGTCGATGGCTTTGTAAGTGTCTTCCACAAGAGATTTAGTGACTCCAACAGCTCCGA
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ACAGCTTCGGTGAGCTAACAGTTCCAGAGAATGTGCTTGAAGGCATCTTCTTCCTCTTTC
TTTTCTTTGGATGTTTTTCTCTTTGGATCTTTTGTTCT
CC

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DS 



AS 2 5

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CAATGACAGAACACAGACAGTCGAGAACATGTTCTTCACTCATAACCTTTACTTAATACG
TTTCTAATAAAAAGACCACTCGTGCATCCATTGCATAACAAACATAGGCGAAGAGCTTAG
TACGGTCCAAAACAGCCATCCTCTCACATAACTCTATATTCTTCGAAGCGCCCTCCAGAA
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TCAGCTTCGGAGACTCTGATTTGTCTACCGTCCAAATCGGCACCATTCAAGTTCCTGATG
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TCGAGAGCCATGTCATCGACTCCCCAAGATAGGTTGCCGACGTAAACACGGTTTCCTGAA
CCAGAACCACCTCCTCCACCACCACCATATCCAGAGCTTCCAAAGCTGCCTCTGGGTCCT
CTGGAGAAGGAGTCTTCCCTCTTCGGTGGAGGAGGACCCGCATTAACTCTCAAGGCTCTA
CCATCTAACTCATAGCCATTAAACTGTTGGGCAGCTGCCTCAACTTCAGACACTGAAGAC
ATAGTCACGAACCCAAAACCCCTGCTTCGTCCTGTCACTTTGTCATAGATTACCTCAACC
ATCTCGACATTTCCGCGCTCTCGAGAGCTGAGCGAGCTGAGCACTATCGACGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DY69JQ U 1
AF RS1FM44JQ U 27
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RD RS1DY69JQ 646 0 0
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DS 

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GCTGAGCGAGCTGAGCACTATCGACGTC

QA 1 808 1 808
DS 



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TCCACCTTCAACCCTAAATCCCTTCCTTTCTCCATCTCCAAACCCGCCTCCACTCCCTTC
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BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DY69TF U 1
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AF RS1H368TF U 11
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GCGTCTCGCTTCGTCCGCAACGTTGCCGTCACAGATGACATCAACGTAGAAGAAGAAGAA
GACAGCCTTTTCTCCGATGACGCTCCGCAGCAGGAGCAATCCTTCTCTGCTGACCTCAAA
CTCTTCGTCGGTAACCTCCCTTTCGACGTCGATAGTGCTCAGCTCGCTCAGCTCTTCGAG
AGCGCCGGAAATGTCGAGATGGTTGAGGTAATCTATGACAAAGTGACAGGACGAAGCAGG
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AATGGCTATGAGTTAGATGGTAGAGCCTTGAGAGTTAATGCGGGTCCTCCTCCACCGAAG
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ACCC

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DS 

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GG
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CCTAAATCCCTTCCTTTCTCCATCTCCAAACCCGCCTCCACTCCCTTCCTCCCTCCTTCC
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CGCTTCGTCCGCAACGTTGCCGTCACAGATGACATCAACGTAGAAGAAGAAGAAGACAGC
CTTTTCTCCGATGACGCTCCGCAGCAGGAGCAATCCTTCTCTGCTGACCTCAAACTCTTC
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GGGTTCGTGACTATGTCTTCAGTGTCTGAAGTTGAGGCAGCTGCCCAACAGTTTAATGGC
TATGAGTTAGATGGTAGAGCCTTGAGAGTTAATGCGGGTCCTCCTCCACCGAAGAGGGAA
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AGGGAGGGTGGTTCTGGTTCAGAAACCGTGTTTACGTCGGTAACCTATCTTGGGGAGTCG
ATGACATGGCTCTCGAGAGTTTGTTCGGGAG

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DS 



AS 1 5

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ATTTCTCCTTTCCTCTCAAAACCTTTGTTCCCCCTCTCTTATAGGGTTTACTCTTCCCTG
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AGTGCAATCGATGTTGCCTGTGGAAAGAATGGAGCCGTATCTGGAATTAGCTCAGGAAAA
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AAGGACACCGGAGCACTGTTCTTGGAGGCACCAGTTTCCGGTTCCAAAAAGCCTGCGGAA
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TTCTTAGACATCATGGGAAAGTCGAGATTCTATTTGGGCGATGTTGGTAATGGAGCAGCA
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ACAGCTTTTCCATTGAAGCACCAGCAGAAGGATATGAGACTGGCACTGGGACTGGCTGAG
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TCTTATGGTTTGAGTGATGAAGACTTCTCTGCGGTTATTGAGGCACTGAAAGCTGCAAAA
TCTCAACAAAGCTAAAGCTTTTAAAAAGATTCGTTCTTCCATTTCTCATTTCTATGTGGA
AAAGAAAAAGAGAGTTTCTTTGTTGTTGTTGTTGTATGTAAAGATGTCAACTTTACTGTT
AAAAGCGTCAAACACAATTCAACCTTTGATCTCCTCTGATGTTTTGACTAAAAAGCGATA
AAAGAAATGTTTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EC51TF U 54
AF RS1CY06TF U 1
AF RS1AT89TF U 222
AF RS1CY06JQ C 455
AF RS1AT89JQ C 566
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TTCCCTGCAACCTACCCCCTCTACCAAAGATGAACTTGGAAGTGTAAGCATTGGGTTTCT
GGGTATGGGAATCATGGGTTCTCCAATGGCACAGAACCTCATCAAAGCTGGGTGTGATGT
TACTGTGTGGAACCGAACTAAGAGCAAATGTGGTCCTCTCATCGGATTAGGAGCAAAATA
CAAGTCTTCTCCTGAAGAAGTGACTGCAGCTTGCGATCTCACATTTGCAATGCTAGCTGA
TCCTGAAAGTGCAATCGATGTTGCCTGTGG
GAAAAAA

QA 1 330 1 330
DS 

RD RS1CY06TF 773 0 0
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ATTTCTCCTTTCCTCTCAAAACCTTTGTTCCCCCTCTCTTATAGGGTTTACTCTTCGCTG
CAACCTACCCCCTCTACCAAAGATGAACTTGGAAGTGTAAGCATTGGGTTTCTAGGTATG
GGAATCATGGGTTCTCCAATGGCACAGAACCTCATCAAAGCTGGGTGTGATGTGACTGTG
TGGAACCGAACTAAGAGCAAATGTGATCCTCTCATCGGATTAGGAGCAAAATACAAGTCT
TCTCCTGAAGAAGTGACTGCAGCTTGCGATCTCACATTTGCAATGCTAGCAGATCCTGAG
AGTGCAATCGATGTTGCCTGTGGAAAGAATGGAGCCGTATCTGGAATTAGCTCAGGAAAA
GGGTATGTTGATGTCTCAACCGTTGATGCTGCTTCATCGATGTTAATCAGCAAGCAAATA
AAGGACACCGGAGCACTGTTCTTGGAGGCACCAGTTTCCGGTTCCAAAAAGCCTGCGGAA
GATGGTCAGCTGATATTCCTCACTGCAGGTGACAAGCTGCTATACGAGAAAGCTGCTCCT
TTCTTAGACATCATGGGAAAGTCGAGATTCTATTTGGGCGATGTTGGTAATGGAGCAGCA
ATGAAACTCGTGGTCA*CATGATCATGGGAAGTATGATGGCATCATTCGCCGAGGGA*TA
CTTCTAATCCAAAA*GTAGG*CTTGATCCAA*TGTACTGGTCGAAGTTGTCTC

QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1AT89TF 646 0 0
G
GGGTGTGATGTGACTGTGTGGAACCGAACTAAGAGCAAATGTGATCCTCTCATCGGATTA
GGAGCAAAATACAAGTCTTCTCCTGAAGAAGTGACTGCAGCTTGCGATCTCACATTTGCA
ATGCTAGCAGATCCTGAGAGTGCAATCGACGTTGCCTGTGGAAAGAATGGAGCCGTATCT
GGAATTAGCTCAGGAAAAGGGTATGTTGATGTCTCAACCGTTGATGCTGCTTCATCGATG
TTAATCAGCAAGCAAATAAAGGACACCGGAGCACTGTTCTTGGAGGCACCAGTTTCCGGT
TCCAAAAAGCCTGCGGAAGATGGTCAGCTGATATTCCTCACTGCAGGTGACAAGCTGCTA
TACGAGAAAGCTGCTCCTTTCTTAGACATCATGGGAAAGTCGAGATTCTATTTGGGTGAT
GTTGGTAATGGAGCAGCAATGAAACTCGTGGTCAACATGATCATGGGAAGTATGATGGCA
TCATTCGCCGAGGGAATACTTCTAAGCCAAAAAGTAGGGCTTGATCCAAATGTACTGGTC
GAAGTTGTCTCACAGGGAGCCATCAACGCGCCAATGTACTCACTTAAGGGTCCTTCAATG
ATCAAGTCAGTGTACCCTACAGCTTTTCCATTGAAGCACCAGCAG

QA 2 646 2 646
DS 

RD RS1CY06JQ 724 0 0
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TTTCCGGTTCCAAAAAGCCTGCGGAAGATGGTCAGCTGATATTCCTCACTGCAGGTGACA
AGCTGCTATACGAGAAAGCTGCTCCTTTCTTAGACATCATGGGAAAGTCGAGATTCTATT
TGGGCGATGTTGGTAATGGAGCAGCAATGAAACTCGTGGTCAACATGATCATGGGAAGTA
TGATGGCATCATTCGCCGAGGGAATACTTCTAATCCAAAAAGTAGGGCTTGATCCAAATG
TACTGGTCGAAGTTGTCTCACAGGGAGCCATCAACGCGCCAATGTACTCACTTAAGGGTC
CTTCAATGATCAAGTCAGTGTACCCTACAGCTTTTCCATTGAAGCACCAGCAGAAGGATA
TGAGACTGGCACTGGGACTGGCTGAGTCAGTCTCTCAGTCAACTCCAATTGCGGCTGCAG
CAAACGAGCTTTACAAAGTTGCCAAGTCTTATGGTTTGAGTGATGAAGACTTCTCTGCGG
TTATTGAGGCACTGAAAGCTGCAAAATCTCAACAAATCTAAAGCTTTTAAAAAGATTCGT
TCTTCCATT*CTCATTTCTATGTGGAAAAGAAAAAGAGAGTTTCTTTGTTGTTGTTGTTG
TATGTAAAGATGTCAACTTTACTGTTAAAAGCGTCAAACACAATTCAACCTTTGA
TCTCCTCCG

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1AT89JQ 651 0 0
CAGGTGACAAGCTGCTATACGAGAAAGCTGCTCCTTTCTTAGACATCATGGGAAAGTCGA
GATTCTATTTGGGTGATGTTGGTAATGGAGCAGCAATGAAACTCGTGGTCAACATGATCA
TGGGAAGTATGATGGCATCATTCGCCGAGGGAATACTTTTAAGCCAAAAAGTAGGGCTTG
ATCCAAATGTACTGGTCGAAGTTGTCTCACAGGGAGCCATCAACGCGCCAATGTACTCAC
TTAAGGGTCCTTCAATGATCAAGTCAGTGTACCCTACAGCTTTTCCATTGAAGCACCAGC
AGAAGGATATGAGACTGGCACTGGGACTGGCTGAGTCAGTCTCTCAGTCAACTCCAATTG
CGGCTGCAGCAAACGAGCTTTACAAAGTTGCCAAGTCTTATGGTTTGAGTGATGAAGACT
TTTCTGCGGTTATTGAGGCACTGAAAGCTGCAAAATCTCAACAAAGCTAAAGCTTTTAAA
AAGATTCGTTCTTCCATTTCTCATTTCTATGTGGAAAAGAAAAAGAGAGTTTCTTTGTTG
TTGTTGTTGTATGTAAAGATGTCAACTTTACTGTTAAAAGCGTCAAACACAATTCAACCT
TTGATCTCCTCTGATGTTTTGACTAAAAAGCGATAAAAGAAATGTTTGACC

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 6

CO CL1074Contig1 972 6 16 U
AAAAATACTAAGTGAGATTGACAGTAAGAATGGGAAAAGATAAATTTATCCATAAATAAC
CGGTAAAATACCAATGTTTAGGATCAATGATGAAACTGAATGAAACTTAGGAAGAGGTTT
TATATGTACAGAAAACCCCAAGCAGCAGAATCAGCAATTTTAAGATAATCAGAACAACAA
CAATAAGAAAGCTTTTTGATGAATTCTCTTGACTCATGTCTCTCCTCTCTTAAAAAGGAA
TTAAATTCATCAGCGATGTTTCCTTGCATTTCTCTTAAGCCATGTTCTTCCTGCTATGTG
CCCAGAAAGGTTTGGCGGGTGTACGCTTCAAAGCCTTAACACTGAATGGACTGTTCTTAC
TCATCAAACAGGTATCGCCATTGCAAACCGGGTACTCATGAGGACAGCAGCTAGTGTTGT
CATCGCAGCAAGTAGCAGCTTCGAGAGGGCAACATCCCCAACCAAAGCAGTACTTGCCGT
ACTGGAAGAGACAACAACAAGTGTTGCTCTCGGGGCAAGAGTAGTACTTGTCACACTGGG
TCGGTGGCTTAATGGGAGATGGTGGTGACGGTCCAGGGTTTGGTGGGTTCTGACCTTTCT
TGATAGGGTATGAAGCCTCCATAGCGATTCCACACTTTCCTGTTGCCTCCGCAATGTTAC
GTGCCATCTTTATGTATCCGCTCTCACCCCAGCTTCCTCCCCATGAATTTCTCACAATCC
AGTAGTCCTTTCCGTTCTCAGTTCCGTAACCCACAGCTACAACTCCATGGTCTAGCTCTG
TTCCACATATTCCATCAAATACACCCGAAGAATAGAGCTGGAAAGCGCGACCCCCAGCTT
CAATGGCGACACTAATAGGCTGATTAGCCAAAGCTTTCTTAAGCGCAGCCTCGTTGTTCT
CAGGCACATCCTCGTAGGCATCAATCGTGACAACCTTTGCGTTTTTCCTGCTCTGATCAC
AATGATTATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 35 35 20 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D831JQ U 1
AF RS1EI41JQ U 32
AF RS1GO31JQ U 32
AF RS1FV95JQ U 32
AF RS1EI41TF C 25
AF RS1DP64TF C 198
BS 1 171 RS1D831JQ
BS 172 173 RS1EI41JQ
BS 174 191 RS1D831JQ
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BS 193 451 RS1D831JQ
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BS 783 791 RS1FV95JQ
BS 792 800 RS1EI41TF
BS 801 972 RS1DP64TF

RD RS1D831JQ 494 0 0
AAAAATACTAAGTGAGATTGACAGTAAGAATGGGAAAAGATAAATTTATCCATAAATAAC
CGGTAAAATACCAATGTTTAGGATCAATGATGAAACTGAATGAAACTTAGGAAGAGGTTT
TATATGTACAGAAAACCCCAAGCAGCAGAATCAGCAATTTTAAGATAATCA**ACAACAA
CAATAAGAAAGATTTTTGATGAATTCTCTTGACTCATGTCTCTCCTCTCTTAAAAAGGAA
TTAAATTCATCAGCGATGTTTCCTTGCATTTCTCTTAAGCCATGTTCTTCCTGCTATGTG
CCCAGAAAGGTTTGGCGGGTGTACGCTTCAAAGCCTTAACACTGAATGGACTGTTCTTAC
TCATCAAACAGGTATCGCCATTGCAAACCGGGTACTCATGAGGACAGCAGCTAGTGTTGT
CATCGCAGCAAGTAGCAGCTTCGAGAGGGCA*CATCCCCAACCAAAGCAGTACTTGCCGT
ACTGGAAGAGACAA

QA 1 494 1 494
DS 

RD RS1EI41JQ 456 0 0
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CTCTTAAGCCATGTTCTTCCTGCTATGTGCCCAGAAAGGTTTGGCGGGTGTACGCTTCAA
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GTACTCATGAGGACAGCAGCTAGTGTTGTCATCGCGGCAAGTAGCAGCTTCGAGAGGGCA
ACATCCCCAACCAAAGCAGTACTTGCCGTACTGGAA

QA 1 456 1 456
DS 

RD RS1GO31JQ 655 0 0
GGGAAAAGATAAATTTATCCATAAATAACCGGTAAAATACCAATGTTTAGGATCAATGAT
GAAACTGAATGAAACTTAGGAAGAGGTTTTATATGTACAGAAAACCCCAAGCAGCAGAAT
CAGCAATTTTAAGATAATCGGAACAACAACAATAAGAAAGCTTTTTGATGAATTCTCTTG
ACTCATGTCTCTCCTCTCTTAAAAAGGAATTAAATTCATCAGCGATGTTTCCTTGCATTT
CTCTTAAGCCATGTTCTTCCTGCTATGTGCCCAGAAAGGTTTGGCGGGTGTACGCTTCAA
AGCCTTAACACTGAATGGACTGTTCTTACTCATCAAACAGGTATCGCCATTGCAAGCCGG
GTACTCATGAGGACAGCAGCTAGTGTTGTCATCGCAGCAAGTAGCAGCTTCGAGAGGGCA
ACATCCCCAACCAAAGCAGTACTTGCCGTACTGGAAGAGACAACAACAAGTGTTGCTCTC
GGGGCAAGAGTAGTGCTTGTCACACTGGGTCGGTGGCTTAATGGGAGATGGTGGTGACGG
TCCAGGGTTTGGTGGGTTCTGACCTTTCTTGATAGGGTATGAAGCCTCCATAGCGATTCC
ACACTTTCCTGTTGCCTCCGCAATGTTACGTGCCATCTTTATGTATCCGCTCTCA

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1FV95JQ 760 0 0
GGGAAAAGATAAATTTATCCATAAATAACCGGTAAAATACCAATGTTTAGGATCAATGAT
GAAACTGAATGAAACCTAGGAAGAGGTTTTATATGTACAGAAAACCCCAAGCAGCAGAAT
CAGCAATTTTAAGATAATCAGAACAACAACAATAAGAAAGCTTTTTGATGAATTCTCTTG
ACTCATGTCTCTCCTCTCTTAAAAAGGAATTAAATTCATCAGCGATGTTTCCTTGCATTT
CTCTTAAGCCATGTTCTTCCTGCTATGTGCCCAGAAAGGTTTGGCGGGTGTACGCTTCAA
AGCCTTAACACTGAATGGACTGTTCTTACTCATCAAACAGGTATCGCCATTGCAAACCGG
GTACTCACGAGGACAGCAGCTAGTGTTGTCATCGCAGCAAGTAGCAGCTTCGAGAGGGCA
ACATCCCCAACCAAAGCAGTACTTGCCGTACTGGAAGAAACAACAACAAGTGTTGCTCTC
GGGGCAAGAGTAGTACTTGTCACACTGGGTCGGTGGCTTAAGGGGAGATGGTGGTGACGG
TCCAGGGTTTGGTGGGTTCTGACCTTTCTTGATAGGGTATGAAGCCTCCATAGCGATTCC
ACACTTTCCTGTTGCCTCCGCAATGTTGCGTGCCATCTTTATGTATCCGCTCTCACCCCA
GCTTCCTCCCCATGAATTTCTCACAATCCAGTAGTCCTTTCCGTTCTCAGTTCCGTAACC
CACAGCTACAACTCCATGGTCTAGCTCTGTACCACATATT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1EI41TF 777 0 0
TTTTTTTTGGG
AAAGATAAATTTATCCATAAATAACCGGTAAAATACCAATGTTTAGGATCAATGATGAAA
CTGAATGAAACTTAGGAAGAGGTTTTATATGTACAGAAAACCCCAAGCAGCAGAATCAGC
AATTTTAAGATAATCAGAACAACAACAATAAGAAAGCTTTTTGATGAATTCTCTTGACTC
ATGTCTCTCCTCTCTTAAAAAGGAATTAAATTCATCAGCGATGTTTCCTTGCATTTCTCT
TAAGCCATGTTCTTCCTGCTATGTGCCCAGAAAGGTTTGGCGGGTGTACGCTTCAAAGCC
TTAACACTGAATGGACTGTTCTTACTCATCAAACAGGTATCGCCATTGCAAACCGGGTAC
TCATGAGGACAGCAGCTAGTGTTGTCATCGCGGCAAGTAGCAGCTTCGAGAGGGCAACAT
CCCCAACCAAAGCAGTACTTGCCGTACTGGAAGAGACAACAACAAGTGTTGCTCTCGGGG
CAAGAGTAGTACTTGTCACACTGGGTCGGTGGCTTAATGGGAGATGGTGGTGACGGTCCA
GGGTCTGGTGGGTTCTGACCTTTCTTGATAGGGTATGAAGCCTCCATAGCGATTCCACAC
TTTCCTGTTGCCTCCGCAATGTTACGTGTCATCTTTATGTATCCGCTCTCACCCCAGCTT
CCTCCCCATGAATTTCTCACAATCCAGTAGTCCTTTCCGTTCTCAGTTCCGTAACCCACA
GCTACAACTCCATGGTCTAGCTCTGTTCCACATATTCCATCAAAT
C

QA 12 776 12 776
DS 

RD RS1DP64TF 775 0 0
TGATG
ATTCTCTTGACTCATGTCTCTCCTCTCTTAAAAAGGAATTAAATTCATCAGCGATGTTTC
*TTGCATT*CTCTTAAGCCATGTTCTTC*TGCTATGTGCCCAGAAAGGTTTGGCGGGTGT
ACGCTTCAAAGC*TTAACACTGAATGGACTGTTCTTACTCATCAAACAGGTATCGCCATT
GCAAACCGGGTACTCATGAGGACAGCAGCTAGTGTTGTCATCGCAGCAAGTAGCAGCTTC
GAGAGGGCAACATCCCCAACCAAAGCAGTACTTGCCGTACTGGAAGAGACAACAACAAGT
GTTGCTCTCGGGGCGAGAGTAGTACTTGTCACACTGGGTCGGTGGCTTAATGGGAGATGG
TGGTGACGGTCCAGGGTTTGGTGGGTTCTGACCTTTCTTGATAGGGTATGAAGCCTCCAT
AGCGATTCCACACATTCCTGTTGCCTCCGCAGTGTTACGTGCCATCTTTATGTATCCGCT
CTCACCCCAGCTTCCTCCCCATGAATTTCTCACAATCCAGTAGTCCTTTCCGTTCTCAGT
TCCGTAACCCACAGCTACAACTCCATGGTCTAGCTCTGTTCCACATATTCCATCAAATAC
ACCCGAAGAATAGAGCTGGAAAGCGCGACCCCCAGCTTCAATGGCGACACTAATAGGCTG
ATTAGCCAAAGCTTTCTTAAGCGCAGCCTCGTTGTTCTCAGGCACATCCTCGTAGGCATC
AATCGTGACAACCTTTGCGTTTTTCCTGCTCTGATCACAATGATTATCCC

QA 6 775 6 775
DS 



AS 2 5

CO CL1075Contig1 962 3 7 U
GCAATGATGGCACATTGGTCTTGCAGGTTATGCTACACTCCCTTGTCAAGGCCAACTGGA
TAGTTCTTGATGCTTGGCTTGATCTTCAAGATGGATTTGTACATGGAAAAAGTGATGGAA
GACCAACTTCGACATTCTTTCCCCTTGTTGTGTCACCGGGATCTAGAGCAGCAGTCGTGT
TCAGTATATCCCTAGAGAAGACAATGTCATCAGGGAAAGATTTGCAGGTACCAGAGAGCA
TTCTGAATATCAAATATGAAATCCATGGTGATAGAGCCGCTGGAGCACACAAACCAGTGG
ATGCAGATTATTCTGAAACTGATGCTGAAAGGAAAGATTTGGTGTTCAAGAGTGCTATTG
TTTTGCAGCGTCCAGTGCTTGATCCTTGTCTGACAGTTGGATTCCTCCCACTTCCTTCCG
ATGGTCTTAGGGTCGGGAAACTTATTACCATGCAGTGGAGAGTCGAAAGGCTGAAAGAGC
TCAAGGGAAGTGAAGCCATAGAACAGCAACAAGATGAGGTATTATACGAAGTCAATGCAA
ATTCGGAGAACTGGATGATCGCGGGTAGGAAGAGAGGTTATGTCTCTCTCTCAGAGGAGC
AAGGTTCAAGAGTGGTAATATCGATACTATGTGTTCCATTAGTTGCGGGTTATGTCCGTC
CTCCTCAGCTGGGTTTGCCAAACGTGGAAGAAGCAAATGTAAGCAGCAATCCACCGGGTC
CTCACTTAGTGTGCGTTTTGCCTCCACTTCTCAGTTCTTCCTTTTGCGTCCCTGTCAAGT
AGAGTAAAGGTGGTGTTCCCACTTCAACTTTTTCCACTCTTTGACTCAAATTTTCATTAG
AGTATTTGCCGCGAGGACAGTCGAGAATAGGTATTTTATTGTATGTTTGTTTTTTGTTGG
TTTGCGATCGTAGAAATATCAAAGCATTGAGTTCATTGATCGTCAATGAGGTTGAATTAC
GG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
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10 10 

AF RS1DU85TF U 1
AF RS1H567TF U 130
AF RS1DD57JQ C 284
BS 1 213 RS1DU85TF
BS 214 219 RS1H567TF
BS 220 521 RS1DU85TF
BS 522 522 RS1H567TF
BS 523 684 RS1DU85TF
BS 685 785 RS1H567TF
BS 786 962 RS1DD57JQ

RD RS1DU85TF 684 0 0
GCAATGATGGCACATTGGTCTTGCAGGTTATGCTACACTCCCTTGTCAAGGCCAACTGGA
TAGTTCTTGATGCTTGGCTTGATCTTCAAGATGGATTTGTACATGGAAAAAGTGATGGAA
GACCAACTTCGACATTCTTTCCCCTTGTTGTGTCACCGGGATCTAGAGCAGCAGTCGTGT
TCAGTATATCCCTAGAGAAGACAATGTCATCAG******ATTTGCAGGTACCAGAGAGCA
TTCTGAATATCAAATATGAAATCCATGGTGATAGAGCCGCTGGAGCACACAAACCAGTGG
ATGCAGATTATTCTGAAACTGATGCTGAAAGGAAAGATTTGGTGTTCAAGAGTGCTATTG
TTTTGCAGCGTCCAGTGCTTGATCCTTGTCTGACAGTTGGATTCCTCCCACTTCCTTCCG
ATGGTCTTAGGGTCGGGAAACTTATTACCATGCAGTGGAGAGTCGAAAGGCTGAAAGAGC
TCAAGGGAAGTGAAGCCATAGAACAGCAACAAGATGAGGTACTATACGAAGTCAATGCAA
ATTCGGAGAACTGGATGATCGCGGGTAGGAAGAGAGGTTATGTCTCTCTCTCAGAGGAGC
AAGGTTCAAGAGTGGTAATATCGATACTATGTGTTCCATTAGTTGCGGGTTATGTCCGTC
CTCCTCAGCTGGGTTTGCCAAACG

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1H567TF 656 0 0
GGACA
TTCTTTCCCCTTGTTGTGTCACCGGGATCTAGAGCGGCAGTCGTGTTCAGTATATCCCTA
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TATGAAATCCATGGTGATAGAGCCGCTGGAGCACACAAACCAGTGGATGCAGATTATTCT
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GGGAAACTTATTACCATGCAGTGGAGGGTCGAAAGGCTGAAAGAGCTCAAGGGAAGTGAA
GCCATAGAACAGCAACAAGATGAGGTATTATACGAAGTCAATGCAAATTCGGAGAACTGG
ATGATCGCGGGTAGGAAGAGAGGTTATGTCTCTCTCTCAGAGGAGCAAGGTTCAAGAGTG
GTAATATCGATACTATGTGTTCCATTAGTTGCGGGTTATGTCCGTCCTCCTCAGCTGGGT
TTGCCAAACGTGGAAGAAGCAAATGTAAGCAGCAATCCACCGGGTCCTCACTTAGTGTGC
GTTTTGCCTCCACTTCTCAGTTCTTCCTTTTGCGTCCCTGTCAAGTAGAGT

QA 6 656 6 656
DS 

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GTTCAAGAGTGCTATTGTTTTGCAGCGTCCAGTGCTTGATCCTTGTCTGACAGTTGGATT
CCTCCCACTTCCTTCCGATGGTCTTAGGGTCGGGAAACTTATTACCATGCAGTGGAGAGT
CGAAAGGCTGAAAGAGCTCAAGGGAAGTGAAGCCATAGAACAGCAACAAGATGAGGTATT
ATACGAAGTCAATGCAAATTCGGAGAACTGGATGATTGCGGGTAGGAAGAGAGGTTATGT
CTCTCTTTCAGAGGAGCAAGGTTCAAGAGTGGTAATATCGATACTGTGTGTTCCATTAGT
TGCGGGTTATGTCCGTCCTCCTCAGCTAGGTTTGCCAAACGTGGAAGAAGCAAATGTAAG
CAGCAATCCACCGGGTCCTCACTTAGTGTGCGTTTTGCCTCCACTTTTCAGTTCTTCCTT
TTGCGTCCCTGTCAAGTAGAGTAAAGGTGGTGTTCCCACTTCAACTTTTTCCACTCTTTG
ACTCAAATTTTCATTAGAGTATTTGCCGCGAGGACAGTCGAGAATAGGTATTTTATTGTA
TGTTTGTTTTTTGTTGGTTTGCGATCGTAGAAATATCAAAGCATTGAGTTCATTGATCGT
CAATGAGGTTGAATTACGG

QA 1 679 1 679
DS 



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GTGAAAAAAATAATATTAACCATCGGAAATGCTCTAATAGTATCAAACAAAAGTGTTGTT
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AAACCAACAAAAAACAAACATACAATAAAATACTTATTCTTGACTGTCCTCGCGGCAAAA
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TACTTGACAGGGACGCAAAAGGAAAAACTGAAAAGTGGAGGCAAAACGCACACTAAGTGA
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GGACGGACATAACCCGCAACTAATGGAACACATAGTATCGATATTACCACTCTTGAACCT
TGCTCCTCTGAAAAAGAGACATAACCTCTCTTCCTACCCGCGATCATCCAGTTCTCCGAA
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TCGGAAGGAAGTGGGAGGAATTCAACTGTCAGACAAGGATCAAGCACTGGACGCTGCAAA
ACAATAGCACTCTTGAACACCAAATCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1DU85JQ U 18
AF RS1H567JQB U 1
BS 1 27 RS1H567JQB
BS 28 28 RS1DU85JQ
BS 29 264 RS1H567JQB
BS 265 265 RS1DU85JQ
BS 266 271 RS1H567JQB
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BS 273 431 RS1H567JQB
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BS 434 434 RS1DU85JQ
BS 435 688 RS1H567JQB

RD RS1DU85JQ 586 0 0
AACCATCGGAAATGC*CTAATAGTATCAAACAAAAGTGTTGTTTGCGTAATTCAACCTCA
TTGACGATCAATGAACTCAATTCTTTGATATTTCTACGATCATAAACCAACAAAAAACAA
ACATACAATAAAATACTTATTCTTGACTGTCCTCGCGGCAAAATACTCTAATGAAAATTT
GAGTCGAGAGTGGAAAAAGTTGAAGTGGGAACCACCTTTACTCTACTTGACAGGGACGCA
AAAGGAAAAACTGAAAAGTGGAGGCAAAACGCACACTAAGTGAGGACCCGGTGGATTGCT
GCTTACATTTGCTTCTTCCACGTTTGGCAAACCCAGCTGAGGAGGACGGACATAACCCGC
AACTAATGGAACACATAGTATCGATATTACCACTCTTGAACCTTGCTCCTCTGAAAAAGA
GACATAACCTCTCTTCCTACCCGCGATCATCCAGTTCTCCGAATTTGCATTGACTTCGTA
TAGTACCTCATCTTGTTGCTGTTCTATGGCTTCACTTCCCTTGAGCTCTTTCAGCCTTTC
GACTCTCCACTGCATGGTAATAAGTTTCCCGACCCTAAGACCATCG

QA 1 586 1 586
DS 

RD RS1H567JQB 688 0 0
GTGAAAAAAATAATATTAACCATCGGAGATGCTCTAATAGTATCAAACAAAAGTGTTGTT
TGCGTAATTCAACCTCATTGACGATCAATGAACTCAATTCTTTGATATTTCTACGATCAT
AAACCAACAAAAAACAAACATACAATAAAATACTTATTCTTGACTGTCCTCGCGGCAAAA
TACTCTAATGAAAATTTGAGTCGAGAGTGGAAAAAGTTGAAGTGGGAACCACCTTTACTC
TACTTGACAGGGACGCAAAAGGAAGAACTGAGAAGTGGAGGCAAAACGCACACTAAGTGA
GGACCCGGTGGATTGCTGCTTACATTTGCTTCTTCCACGTTTGGCAAACCCAGCTGAGGA
GGACGGACATAACCCGCAACTAATGGAACACATAGTATCGATATTACCACTCTTGAACCT
TGCTCCTCTGAGAGAGAGACATAACCTCTCTTCCTACCCGCGATCATCCAGTTCTCCGAA
TTTGCATTGACTTCGTATAATACCTCATCTTGTTGCTGTTCTATGGCTTCACTTCCCTTG
AGCTCTTTCAGCCTTTCGACCCTCCACTGCATGGTAATAAGTTTCCCGACCCTAAGACCA
TCGGAAGGAAGTGGGAGGAATTCAACTGTCAGACAAGGATCAAGCACTGGACGCTGCAAA
ACAATAGCACTCTTGAACACCAAATCTT

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 6

CO CL1076Contig1 1102 6 21 U
GGAAGGTCTCTGTCTTGTGTAAAAAAGCAGGAGTGTGAAGAAGCAAACTCTCTGTTTTCT
CTAACAATGGCTTCTTGTGTTGTGACGACGACAAGCAGTTTCTGTACTCTTTCAGATTCT
TCTAGTATTCGTTTGAAGTCCTCCAAGCTTGTCCCTCTGAGTAATCAGCAGAGAAGACGT
TCTCTTCGGTCAGGAGGTGGTTTAAAGGTTGAAGCTTACTATGGTCTGAAGACCCCTCCT
TATCCTCTTGATGCTTTGGAACCGTATATGAGTCAGAGAACACTAGAATTGCATTGAGGT
AAACACCACC*GAGGCTATGTGGACAATCTAAATAAACAGTTAGGGAAAGACGATAGACT
CTATGG*ATACACCATGGAAGAGCTTATCAAGGCCACATACAACAACGGCAATCCTTTAC
CTGAGTTCAACAACGCTGCGCAGGTCTATAACCATGATTTCTTCTGGGAGTCGATGCAAC
CTGGTGGTGGAGACATGCCTCAAAAGGGTGTTCTTGAGCAGATTGAGAAAGATTTTGGGT
CCTTTACCAATTTCAGAGAGAAGTTCACTAATGCTGCT*CTTACTCAGTTTGGTTCTGGC
TGGGTCTGGCTTGTTTTGAAGAGGGAAGAGAGAAGACTTGAAGTGGTTAAAACCTCAAAC
GCCATTAACCCACTAGTGTGGGACGATATTCCAATCATCTGCTTGGATGTGTGGGAGCAC
TCTTATTATCTGGACTACAAGAACGAGAGGGCTAGGTACATAAACACGTTTCTGAACCAT
TTGGTGTCGTGGAACGCTGCAACGAGTAGGATGGCCCGTGCTGAGGCGTTTGTGAACCTT
GGTGAACCCAACATCCCAATTGCCTAAGCTAAAGAAAACTATTGTTCGAGAGAGAGTCCA
TGTGAAAGCGTATCCTTGACAGCTTGAACAGTCTCATTTTTGCAACATAGGTCCTAAACA
AGAAATAAGTGCTGCTTCCTCCCTCATGTGACCCATCTTTTTGTCATGTGTAGTTGAGAG
TGTCTAATATGACATAGACTTGTTTGTTTGTTATATACCAAAACGATTTTGCTAGTGTTA
AAGTTGCTACTCATCGCAATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AR56JQ C 245
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DS 

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GG
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GAAAGACGATAGACTCTATGG*ATACACCATGGAAGAGCTTATCAAGGCCACATACAACA
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GTTAAAACC**AAACGCCATTAACCCACTAGTGTGGGACGATATTCCAATCATCTGCTTG
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AGAACACTAGAAGTGCATTGGGGTAAACACCACC*GAGGCTATGTGGACAATCTAAATAA
ACAGTTAGGGAAAGACGATAGACTCTATGG*ATACACCATGGAAGAGCTTATCAAGGCCA
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ATTTCTTCTGGGAGTCGATGCAACCTGGTGGTGGAGACATGCCTCAAAAGGGTGTTCTTG
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CT*CTTACTCAGTTTGGTTCTGGCTGGGTCTGGCTTGTTTTGAAGAGGGAAGAGAGAAGA
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TATCCTCTTGATGCTTTGGAACCATATATGAGTCAAAGAACACTAGAAGTGCATTGGGGT
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CTATGG*ATACACCATGGAAGAGCTTATCAAGGCCACATACAACAACGGCAATCCTTTAC
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TCTTACTATCTGGACTACAAGAACGAGAGGGCTAGGTACATAAACACGTTTCTGAACCAT
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TGA

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DS 

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ATGCCTCAAAAGGGTGTTCTTGAGCAGATTGAGAAAGATTTTGGGTCCTTTACCAATTTC
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TTTGAAGAGGGAAGAGAGAAGACTTGAAGTGGTTAAAACCTCAAACGCCATTAACCCACT
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TAGACTTGTTTGTTTGTTATATACCAAAACGATTTTGCTAGTGTTAAAGTTGCTACTCAT
CGCAATCT

QA 1 788 1 788
DS 

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AGAGCTTATCAAGGCCACATACAACAACGGCAATCCTTTACCTGAGTTCAACAACGCTGC
GCAGGTCTATAACCATGATTTCTTCTGGGAGTCGATGCAACCTGGTGGTGGAGACATGCC
TCAAAAGGGTGTTCTTGAGCAGATTGAGAAAGATTTTGGGTCCTTTACCAATTTCAGAGA
GAAGTTCACTAATGCTGCT*CTTACTCAGTTTGGTTCTGGCTGGGTCTGGCTTGTTTTGA
AGAGGGAAGAGAGAAGACTTGAAGTGGTTAAAACCTCAAACGCCATTAACCCACTAGTGT
GGGACGATATTCCAATCATCTGCTTGGATGTGTGGGAGCACTCTTATTATTTGGACTACA
AGAACGAGAGGGCTAGGTACATAAACACGTTTTTGAACCATTTGGTGTCGTGGAACGCTG
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TTGCCTAAGCTAAAGAAAACTATTGTTCGAGAGAGAGTCCATGTGAAAGCGTATCCTTGA
CAGCTTGAACAGTCTCATTTTTGCAACATAGGTCCTAAACAAGAAATAAGTGCTGCTTCC
TCCCTCATGTGACCCATCTTTTTGTCATGTGTAGTTGAGAGTGTCTAATATGACATAGAC
TTGTTTGTTTGTTATATACCAAAACGATTTTGCTAGTGTTAAAGTTGCTAC
CC

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 6

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TATCTTTGGAATCCGGATCCAAGATCCAAGTTCCGGAGCCGGTAGAGTCCAAGCCAAGTT
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ATCGATGATCGGAGACCGTGGATTCGACCCCTTCGGTTTAGGTAAACCGGCTGAGTATCT
TCAGTACGATTTCGACGGGCTTGATCAAAACCTCGCGAAGAACGTGGCGGGTGAAATCCT
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GTTCGGGATCGAACGTTTCAGAGAATGCGAGCTTATCCATGGAAGGTGGGCCATGCTTGG
TGTTCTTGGCGCTCTTGCCGTCGAAGGTCTCACCGGCATCGCCTGGCAAGACGCCGGGAA
GGTGGAACTGGTGGAAGGTTCGTCGTATTTGGGACAGCCATTACCATTCTCCTTGACGAC
GTTGATATGGATCGAGGTGTTAGTGGTTGGCTACATCGAGTTCCAGCGTAACGCTGAGCT
GGATCCGGAGAAACGTATTTACCCGGGTGGGTATTTTGACCCGTTGGGACTCGTGGCTGA
CCCAGCGAAGTTGGATACCTTGAAGCTGGCTGAGATCAAGCACTCTCGTCTCGCCATGAT
CGCATTCCTCATCTTTTCACTTCAGGCGGCCTTTACTGGCAAAGGCCCCATCAGCTTCCT
CGCTACTTTTAGCAGCTAAAATGAGCCTTTCTATCTTTGTGTTTCTATGTATGTTTTCTA
AAACCATCTAAAACTAAAAATGTATGTTTACCTTAAAAAGGCTGTGATGTACTCTATCGA
CCGTGTTAAATCCGAACGAGTTTGTTATCGTTTTGGTGTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 10 5 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G557TF U 1
AF RS1CO67TF U 24
AF RS1CS84TF U 1
AF RS1EZ48TF U 1
AF RS1G557JQ C 380
AF RS1EZ48JQ C 280
BS 1 31 RS1CS84TF
BS 32 32 RS1G557TF
BS 33 222 RS1CS84TF
BS 223 223 RS1G557TF
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BS 490 490 RS1G557TF
BS 491 681 RS1CS84TF
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GTTGATATGGATC

QA 1 613 1 613
DS 

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GG
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CAAAACCTCGCCAAGAACGTGGCGGGTGAAATCCTTGGGGTCAGGCAGGAATCGAAGGAG
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TGCGAGCTTATCCATGGAAGGTGGGCCATGCTTGGTGTTCTTGGCGCTCTTGCCGTCGAA
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GTTGGTTACATCGAGTTCCAGC

QA 3 624 3 624
DS 

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GGATCCGGAGAAACGTATTTA

QA 1 681 1 681
DS 

RD RS1EZ48TF 771 0 0
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TATCTTTGGAATCCGGATCCAAGATCCAAGTTCCGGAGCCGGTAGAGTCCAAGCCAAGTT
CAATTTCAGCTTCGGGAAAAAGAAAGCAGCTCCACCGCCGAAGAAAACCAAGCAGGTCCA
AAACGAAGGAGACCGACTAGTTTGGTTCCCCGGCGCAAACCCGCCGGAATGGCTAGACGG
ATCGATGATCGGAGACCGTGGATTCGACCCCTTCGGTTTAGGTAAACCGGCTGAGTATCT
TCAGTACGATTTCGACGGGCTTGATCAAAACCTCGCGAAGAACGTGGCGGGTGAAATCCT
TGGGGTCAGGCAGGAATCGAAGGAGATCAACCCGACGCCGTTTCAGCCATACACTGAAGT
GTTCGGGATCGAACGTTTCAGAGAATGCGAGCTTATCCATGGAAGGTGGGCCATGCTTGG
TGTTCTTGGGGCTCTTGCCGTCGAAGGTCTCACCGGCATCGCCTGGCAAGACGCCGGGAA
GGTGGAACTGGTGGAAGGTTCGTCGTATTTGGGACAGCCATTACCATTCTCCTTGACGAC
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CC*AGCGAAGTTGGATACCTTGAAGCTGGCTGAGATCAAGCACTCTCGTCT

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DS 

RD RS1G557JQ 576 0 0
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TTAGTGGTTGGTTACATCGAGTTCCAGCGTAACGCTGAGCTGGATCCGGAGAAACGTATT
TACCCGGGTGGGTATTTTGACCCGTTGGGACTTGCGGCTGACTCAGGGAAGTTGGATACC
TTGAAGCTGGCTGAGATCAAGCACTCTCGTCTCGCCATGATCGCATTCCTCATCTTTTCA
CTTCAGGCGGCCTTTACTGGCAAAGGCCCCATCAGCTTCCTCGCTACTTTTAGCAGCTAA
AATGAGCCTTTCTATTTTTGTGTTTTTATGTATGTTTTTTACAATCATCTAAAACTAAAA
ATGTATGTTTATTTTAAAGAGGCTGTGATGTACT
TT

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DS 

RD RS1EZ48JQ 721 0 0
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GAACGTGGCGGGTGAAATCCTTGGGGTCAGGCAGGAATCGAAGGAGATCAACCCGACGCC
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CGCCTGGCAAGACGCCGGGAAGGTGGAACTGGTGGAAGGTTCGTCGTATTTGGGACAGCC
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CCCGTTGGGACTCGTGGCTGACCCAGCGAAGTTGGATACCTTGAAGCTGGCTGAGATCAA
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CAAAGGCCCCATCAGCTTCCTCGCTACTTTTAGCAGCTAAAATGAGCCTTTCTATCTTTG
TGTTTCTATGTATGTTTTCTAAAACCATCTAAAACTAAAAATGTATGTTTACCTTAAAAA
GGCTGTGATGTACTCTATCGACCGTGTTAAATCCGAACGAGTTTGTTATCGTTTTGGTGT
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 2 6

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TGTTAACAGCAAAGTTGACTTGGTCTTGGCTGGTCACGTCCATGCCTATGAGAGATCCGA
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TAATGCTCCAATGTACATCACTATTGGAGATGGAGGAAACATCGAAGGAATCGCAAACAG
TTACACTGACCCACAACCAAGTTACTCAGCCTATAGAGAGGCTAGTTTCGGTCACGCTCT
CTTGGAGATTAAGAACAAGACACACGCGCTTTACACATGGCATAGGAACCAAGACAATGA
GCCTGTCGCAGCTGATTCTGTCATGTTGTTTAACAGATACAATTTACAGACCGATGAGTA
GTTTGAAGGTTCTTGTTTTTTTGTTATTTGATTTAGGATTTTATTTGTTTTTTCTGATTT
TCTGTTACGATTTGTTTTTTCATCATATTTAATAAAAAAATTCAATTTAGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EM17TF U 1
AF RS1EM17JQ C 180
BS 1 668 RS1EM17TF
BS 669 669 RS1EM17JQ
BS 670 681 RS1EM17TF
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BS 713 774 RS1EM17JQ

RD RS1EM17TF 715 0 0
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CTG

QA 1 712 1 712
DS 

RD RS1EM17JQ 595 0 0
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TTAATGCTCCAATGTACATCACTATTGGAGATGGAGGAAACATCGAAGGAATCGCAAACA
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TCTTGGAGATTAAGAACAAGACACACGCGCTTTACACATGGCATAGGAACCAAGACAATG
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AGTTTGAAGGTTCTTGTTTTTTTGTTATTTGATTTAGGATTTTATTTGTTTTTTCTGATT
TTCTGTTACGATTTGTTTTTTCATCATATTTAATAAAAAAATTCAATTTAGTTTG

QA 1 595 1 595
DS 



CO CL1078Contig2 1142 4 8 U
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AAAAGCAGAGAAAAAAAACAAAATCCTAAATCAAATAACAAAAAAACAAGAACTTAGACA
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GTTGCTGTTGTACCACGGCGAATGAACCATGACAATCAACCACGGAGTCTCCTCTCTGTT
CACGTTCTTCAGCTCTTGCTCCAGCCACAAGTATTGTGGTGTGTATTTGCCGTAGGCAGA
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TATGCTCCCTGAGGCTTTGTAGGAGTTAGTGTAACGGTGCATGTAAGGCTTGAAGGGGTG
AGTCTCATCAATCTCCGGAGCGAAATCTATCTCGTGATTCCCAGCGGCATAGATAAATGG
CTGGTAAGCAGCGCAAGGCTCCATGAATCTTCCCCATGTATCCCACTTTCTCTGGTCATG
GTTTGGATGGTCGTCTGCGTAAGACAAGTCTCCGGCAAAGAGAACTGCTTGGCCTTTAGG
GTTCGACATGTAATGGTACAATGTCTCGTTTGAAGCATAGGTTTGTCCAAGATCACCAAT
AATCCCGAATGTGTAGGGAACATCAGGTCCAACCATGGGAGGAGTCGTGAAGTGAAACTG
TCTAACGGATTTATGGGTACCAACCTCATAGATGTACTTAGTATCATACTCGAGTCCTTT
AC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 

AF RS1GR68JQ U 1
AF RS1F608JQ U 7
AF RS1GR68TF C 262
AF RS1F608TF C 342
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BS 76 175 RS1GR68JQ
BS 176 176 RS1F608JQ
BS 177 627 RS1GR68JQ
BS 628 761 RS1F608JQ
BS 762 1017 RS1GR68TF
BS 1018 1142 RS1F608TF

RD RS1GR68JQ 627 0 0
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AAAAGCAGAGAAAACAAACAAAATCCTAAATCAAATAACAAAAAAACAAGAACTTAGACA
TTCAAACTACTCATCGGTCTGTAAATTGTATCGGTTATACAACATGACAGAATCAGCTGC
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CTCCAAGAGAGCGTGACCGAAACTAGCCTCTCTATACGCTGAGTAGCTTAGTTGTGGGTC
AGTGTAGCTGTTTGCGATTCCTTCAATGTTTCCTCCATCTCCAATAGTGATGTACATTGG
AGCAGTAAGATCTTTCACAGGGGTACTCAAGCCATTGGTGATGTTGTACTTAATATTGGA
GAAACGTTCTGATCTCTCATAGGCATGGACGTGACCAGCCAAGACCAAGTCAACTTTGCT
GTTAACAAGCCACGACTCAAACATAATCCTCATGCTCTCACCTTCCATGTAATGGTAGTT
GTTGCTGTTGTACCACGGCGAATGAACCATGACAATCAACCACGGAGTCTCCTCTCTGTT
CACGTTCTTCAGCTCTTGCTCCAGCCA

QA 1 627 1 627
DS 

RD RS1F608JQ 755 0 0
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AGAGAAAAAAAACAAAATCCTAAATCAAATAACAAAAAAACAAGAACTTAGACATTTAAA
CTACTCATCGGTCTGTAAATTGTATCGGTTATACAACATGACAGAATCAACTGCGACGGG
CTCATTGTCTTGGTTCCTATGCCAAGTGTAAAGCGCATGGGTCTTGTTCTTAATCTCCAA
GAGAGCGTGACCGAAACTAGCCTCTCTATACGCTGAGTAGCTTGGTTGTGGGTCAGTGTA
GCTGTTTGCGATTCCTTCAATGTTTCCTCCATCTCCAATAGTGATGTACATTGGAGCAGT
AAGATCTTTCACGGGGGTACTCAAGCCATTGGTGATGTTGTACTTAATATTGGAGAAACG
TTCTGATCTCTCATAGGCATGGACGTGACCAGCCAAGACCAAGTCAACTTTGCTGTTAAC
AAGCCACGACTCAAACATAATCCTCATGCTCTCACCTTCCATGTAATGGTAGTTGTTGCT
GTTGTACCACGGCGAATGAACCATGACAATCAACCACGGAGTCTCCTCTCTGTTCACGTT
CTTCAGCTCTTGCTCCAGCCACAAGTATTGTGGTGTGTATTTGCCGTAGGCAGAGTAAGA
GGAAAGGACGATGATGTGAGCAGGGCCACGTCTGACTGAGTACCAAAGTAGAGATATGCT
CCCTGAGGCTTTGTAGGAGTTAGTGTAACGGTGCA

QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1GR68TF 756 0 0
ACTAGCCTCTCTATACGCTGAGTAGCTTAGTTGTGGGTCAGTGTAGCTGTTTGCGATTC*
TTCAATGTTTC*TCCATCTCCAATAGTGATGTACATTGGAGCAGTAAGATCTTTCACAGG
GGTACTCAAGCCATTGGTGATGTTGTACTTAATATTGGAGAAACGTTCTGATCTCTCATA
GGCATGGACGTGACCAGCCAAGACCAAGTCAACTTTGCTGTTAACAAGCCACGACTCAAA
CATAATCCTCATGCTCTCACCTTCCATGTAATGGTAGTTGTTGCTGTTGTACCACGGCGA
ATGAACCATGACAATCAACCACGGAGTCTCCTCTCTGTTCACGTTCTTCAGCTCTTGCTC
CAGCCACAAGTATTGTGGTGTGTATTTGCCGTAGGCAGAGTAAGAGGAAAGGACGATGAT
GTGAGCAGGGCCACGTCTGACTGAGTACCAAAGTGGAGATATGCTCCCTGAGGCTTTGTA
GGAGTTAGTGTAACGGTGCATGTAAGGCTTGAAGGGGTGAGTCTCATCAATCTCCGGAGC
GAAATCTATCTCGTGATTCCCAGCGGCATAGATAAATGGCTGGTAAGCAGCGCAAGGCTC
CATGAATCTTCCCCATGTATCCCACTTTCTCTGGTCATGGTTTGGATGGTCGTCTGCGTA
AGACAAGTCTCCGGCAAAGAGAACTGCTTGGCCTTTAGGGTTCGACATGTAATGGTACAA
TGTCTCGTTTGAAGCATAGGTTTGTCCAAGATCACC

QA 1 756 1 756
DS 

RD RS1F608TF 801 0 0
CAATAGTGATGTACAT*GGAGCAGTAAGATCTTTCAC*GGGGTACTCAAGCCATTGGTGA
TGTTGTACTTAATATTGGAGAAACGTTCTGATCTCTCATAGGCATGGACGTGACCAGCCA
AGACCAAGTCAACTTTGCTGTTAACAAGCCACGACTCAAACATAATCCTCATGCTCTCAC
CTTCCATGTAATGGTAGTTGTTGCTGTTGTACCACGGCGAATGAACCATGACAATCAACC
ACGGAGTCTCCTCTCTGTTCACGTTCTTCAGCTCTTGCTCCAGCCACAAGTATTGTGGTG
TGTATTTGCCGTAGGCAGAGTAAGAGGAAAGGACGATGATGTGAGCAGGGCCACGTCTGA
CTGAGTACCAAAGTAGAGATATGCTCCCTGAGGCTTTGTAGGAGTTAGTGTAACGGTGCA
TGTAAGGCTTGAAGGGGTGAGTCTCATCAATCTCCGGAGCGAAATCTATCTCGTGATTCC
CAGCGGCATAGATAAATGGCTGGTAAGCAGCGCAAGGCTCCATGAATCTTCCCCATGTAT
CCCACTTTCTCTGGTCATGGTTTGGATGGTCGTCTGCGTAAGACAAGTCTCCGGCAAAGA
GAACTGCTTGGCCTTTAGGGTTCGACATGTAATGGTACAATGTCTCGTTTGAAGCATAGG
TTTGTCCAAGATCACCAATAATCCCGAATGTGTAGGGAACATCAGGTCCAACCATGGGAG
GAGTCGTGAAGTGAAACTGTCTAACGGATTTATGGGTACCAACCTCATAGATGTACTTAG
TATCATACTCGAGTCCTTTAC

QA 1 801 1 801
DS 



AS 2 6

CO CL1079Contig1 879 4 6 U
CGGTGAATAATTGATCATTTTATATATAGAACTCAGAAATATATAGTTCTACAACATTTG
GCTGATTCTTGAAATTTGCCATACCCTGAAGAAGAAATCATCCAGGGTTTATTACTGTTC
TCGTACTTCGATAACAAAAATAAAATAACTTTCCTCAAAAGGGCTTGACCTTTTTTCTCT
CTTTTATTTGTTTAAACCCTAAAGGCAAACAAAAGAGTCTTTGATAAAAGATCTTTAAAC
TTAACCTGTTTCAGAGTCCTCGAGGTACTGAGAGTGCGAGGCAGCGAGTAGCGCAGCTCC
AACGCCAGATCCATCATTCGAATGAATCACCTCCACGCTCTCTGATGCTTCATCTCCAAG
CAACTCTTTCAATGAGCTCTCCATACACTCGCTGAACTGAGTGTAGTGCTCAAACAGTCC
ACCGTCCATGGCTATCACAGATTTCTGTGTTTCTCCGTCTTTTGGTGTGTCTCTTCCTAT
CTTCTTGAGGATTCCGTAGATCCCTGCAGCTGATAGACGAGCTCCTCGGAAAGCAATGAT
GTCACAGAGACGGATCACAACTTCTCTCATTTTCAGAGAAGTGGTAGGGACCTCCAATAT
GTCCTTTAACTTGATTCCAACAACCTTCAAATCCGGAGAAGTGTCGCTGTGCATAGCAGA
CATGTTTGGTGTCCTTATAATGAATGGTATTCTCAGCTTAGGTGGAACAGAGTCACCAAA
GAAAGCAGCCTCGTCAGCCATTTTCAGAAGAACTCTCCACAAGATTTCTCCCAGATACAT
ACCCGAAATGATTTTCTCAAGAATCTGTTCACCAGGATTCAGACTGTCGAAATCAAGCAA
GTGGTCGTACTCTGTCAATGGAAGATGTGATGACCTGAA


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H716JQB U 2
AF RS1BU76JQ U 1
AF RS1BU76TF C 1
AF RS1E545JQ U 2
BS 1 253 RS1BU76JQ
BS 254 254 RS1H716JQB
BS 255 498 RS1BU76JQ
BS 499 499 RS1E545JQ
BS 500 605 RS1BU76JQ
BS 606 879 RS1E545JQ

RD RS1H716JQB 510 0 0
GG
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TTATTTGTTTAAACCCTAAAGGCAAACAAAAGAGTCTTTGATAAAAGATCTTTAAACTTA
ACCTGTTTCAGAGTCCTCGAGGTACTGAGAGTGCGAGGCAGCGAGTAGCGCAGCTCCAAC
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CTCTTTCAATGAGCTCTCCATACACTCGCTGAACTGAGTGTAGTGCTCAAACAGTCCACC
GTCCACGGCTATCACAGATTTCTGTGTTTCTCCGTCTTTTGGTGTGTCTCTTCCTATCTT
CTTGAGGATTCCGTAAATCCCTGCAGCT

QA 3 510 3 510
DS 

RD RS1BU76JQ 605 0 0
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GCTGATTCTTGAAATTTGCCATACCCTGAAGAAGAAATCATCCAGGGTTTATTACTGTTC
TCGTACTTCGATAACAAAAATAAAATAACTTTCCTCAAAAGGGCTTGACCTTTTTTCTCT
CTTTTATTTGTTTAAACCCTAAAGGCAAACAAAAGAGTCTTTGATAAAAGATCTTTAAAC
TTAACCTGTTTCAAAGTCCTCGAGGTACTGAGAGTGCGAGGCAGCGAGTAGCGCAGCTCC
AACGCCAGATCCATCATTCGAATGAATCACCTCCACGCTCTCTGATGCTTCATCTCCAAG
CAACTCTTTCAATGAGCTCTCCATACACTCGCTGAACTGAGTGTAGTGCTCAAACAGTCC
ACCGTCCATGGCTATCACAGATTTCTGTGTTTCTCCGTCTTTTGGTGTGTCTCTTCCTAT
CTTCTTGAGGATTCCGTAAATCCCTGCAGCTGATAGACGAGCTCCTCGGAAAGCAATGAT
GTCACAGAGACGGATCACAACTTCTCTCATTTTCAGAGAAGTGGTAGGGACCTCCAATAT
GTCCT

QA 1 605 1 605
DS 

RD RS1BU76TF 605 0 0
CGG
TGAATAATTGATCATTTTATATATAGAACTCAGAAATATATAGTTCTACAACATTTGGCT
GATTCTTGAAATTTGCCATACCCTGAAGAAGAAATCATCCAGGGTTTATTACTGTTCTCG
TACTTCGATAACAAAAATAAAATAACTTTCCTCAAAAGGGCTTGACCTTTTTTCTCTCTT
TTATTTGTTTAAACCCTAAAGGCAAACAAAAGAGTCTTTGATAAAAGATCTTTAAACTTA
ACCTGTTTCAGAGTCCTCGAGGTACTGAGAGTGCGAGGCAGCGAGTAGCGCAGCTCCAAC
GCCAGATCCATCATTCGAATGAATCACCTCCACGCTCTCTGATGCTTCATCTCCAAGCAA
CTCTTTCAATGAGCTCTCCATACACTCGCTGAACTGAGTGTAGTGCTCAAACAGTCCACC
GTCCATGGCTATCACAGATTTCTGTGTTTCTCCGTCTTTTGGTGTGTCTCTTCCTATCTT
CTTGAGGATTCCGTAGATCCCTGCAGCTGATAGACGAGCTCCTCGGAAAGCAATGATGTC
ACAGAGACGGATCACAACTTCTCTCATTTTCAGAGAAGTGGTAGGGACCTCCAATATGTC
CT

QA 4 605 4 605
DS 

RD RS1E545JQ 878 0 0
GC
TGAATAATTGATCATTTTATATATAGAACTCAGAAATATATAGTTCTACAACATTTGGCT
GATTCTTGAAATTTGCCATACCCTGAAGAAGAAATCATCCAGGGTTTATTACTGTTCTCG
TACTTCGATAACAGAAATAAAATAACTTTCCTCAAAAGGGCTTGACCTTTTTTCTCTCCT
TTATTTGTTTAAACCCTAAAGGCAAACAAAAGAGTCTTTGATAAA*GATCTTTAAACTTA
ACCTGTTTCAGAGTCCTCGAGGTACTGAGAGTGCGACGCAGCGAGTAGCGCAGCTCCAAC
GCCAGATCCATCATTCGAATGAATCACCTCCACGCTCTCTGATGCTTCATCTCCAAGCAA
CTCTTTCAATGAGCTCTCCATACACTCGCTGAACTGAGTGTAGTGCTCAAACAGTCCACC
GTCCATGGCTATCACAGATTTCTGTGTTTCTCCGTCTTTTGGTGTGTCTCTTCCTATCTT
CTTGAGGATTCCGTAGATCCCTGCAGCTGATAGACGAGCTCCTCGGGAAGCAATGATGTC
ACAGAGACGGATCACAACTTTTCTCATTTTCAGAGAAGTGGTAGGGACCTCCAATATGTC
CTTTAACTTGATTCCAACAACCTTCAAATCCGGAGAAGTGTCGCTGTGCATAGCAGACAT
GTTTGGTGTCCTTATAATGAATGGTATTCTCAGCTTAGGTGGAACAGAGTCACCAAAGAA
AGCAGCCTCGTCAGCCATTTTCAGAAGAACTCTCCACAAGATTTCTCCCAGATACATACC
CGAAATGATTTTCTCAAGAATCTGTTCACCAGGATTCAGACTGTCGAAATCAAGCAAGTG
GTCGTACTCTGTCAATGGAAGATGTGATGACCTGAA

QA 3 878 3 878
DS 



CO CL1079Contig2 840 2 16 U
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AACTGTTCAATTTTATAGCTGAGGCGCTTGCGAAGTTCGTGGCTACAGAAGGAGAGGACT
TTCATCTCCCAGAGGGTAGACAAAGGGAGTTAGGTTTCACTTTCTCGTTTCCGGTCAAGC
AGACATCTCTGTCCTCTGGCACTCTCATCAAGTGGACCAAAGGCTTCTCCATCGAAGATA
CAGTTGGACAAGATGTGGTGGGGGAGCTTGTTAAAGCTATGGAAAGAGTTGGGCTTGACA
TGAACGTCACAGCCCTTGTTAATGATACGGTTGGAACACTAGCTGGTGGTAGATACAATA
ACCCGGATGTTGTAGCCGCTGTTATCTTAGGCACTGGCACTAATGCAGCTTATGTCGAAC
GAGCACATGCCATTCCAAAATGGCACGGCTTACTTCCCAAATCCGGAGAAATGGTGATCA
ACATGGAGTGGGGAAACTTCAGGTCATCACATCTTCCATTGACAGAGTACGACCACTTGC
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ATCTGGGAGAAATCTTGCGGAGAGTTCTTCTGAAAATGGCTGACGAGGCTGCTTTCTTTG
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CTATGCACAGCGACACTTCTCCGGATTTGAAGTTGTTGGAAGCAAGTTAAAGACATATTG
GAGTCCCTACACTTCTCTGAAATGAGAAAAGTTGTGATCCGTCTCTGTGACATCATTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E545TF U 1
AF RS1H716TF U 74
BS 1 108 RS1E545TF
BS 109 109 RS1H716TF
BS 110 235 RS1E545TF
BS 236 236 RS1H716TF
BS 237 297 RS1E545TF
BS 298 298 RS1H716TF
BS 299 333 RS1E545TF
BS 334 334 RS1H716TF
BS 335 356 RS1E545TF
BS 357 357 RS1H716TF
BS 358 385 RS1E545TF
BS 386 386 RS1H716TF
BS 387 421 RS1E545TF
BS 422 422 RS1H716TF
BS 423 498 RS1E545TF
BS 499 840 RS1H716TF

RD RS1E545TF 498 0 0
GCAAACAAGAATCCGAAGAAGTCTCTATTCCTCCTCATTTGATGATCAGCGGTTCAGATG
AACTGTTCAATTTTATAGCTGAGGCGCTTGCGAAGTTCGTGGCTACAGGAGGAGAGGACT
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AGACATCTCTGTCCTCTGGCACTCTCATCAAGTGGACCAAAGGCTTCTCCATCGAGGATA
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TGAACGTCACAGCCCTTGTTAATGATACGGTTG*AACACTAGCTGGTGGTAGATACTATA
ACCCGGATGTTGTAGCCGCTGTTATTTTAGGCACTGGCACTAATGCAGCTTATGTCGAAC
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ACATGGAGTGGGGAAACT

QA 1 498 1 498
DS 

RD RS1H716TF 767 0 0
G
ATAGCTGAGGCGCTTGCGAAGTTCGTGGCTACAGAAGGAGAGGACTTTCATCTCCCAGAG
GGTAGACAAAGGGAGTTAGGTTTCACTTTCTCGTTTCCGGTCAAGCAGACATCTCTGTCC
TCTGGCACTCTCATCAAGTGGACCAAAGGCTTCTCCATCGAAGATACAGTTGGACAAGAT
GTGGTGGGGGAGCTTGTTAAAGCTATGGAAAGAGTTGGGCTTGACATGAACGTCACAGCC
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GCCGCTGTTATCTTAGGCACTGGCACTAATGCAGCTTATGTCGAACGAGCACATGCCATT
CCAAAATGGCACGGCTTACTTCCCAAATCCGGAGAAATGGTGATCAACATG*AGTGGGGA
AACTTCAGGTCATCACATCTTCCATTGACAGAGTACGACCACTTGCTTGATTTCGACAGT
CTGAATCCTGGTGAACAGATTCTTGAGAAAATCATTTCGGGTATGTATCTGGGAGAAATC
TTGCGGAGAGTTCTTCTGAAAATGGCTGACGAGGCTGCTTTCTTTGGTGACTCTGTCCCA
CCTAAGCTGAGAATACCATTCATTATAAGGACACCAAACATGTCTGCTATGCACAGCGAC
ACTTCTCCGGATTTGAAGTTGTTGGAAGCAAGTTAAAGACATATTGGAGTCCCTACACTT
CTCTGAAATGAGAAAAGTTGTGATCCGTCTCTGTGACATCATTGCT

QA 2 767 2 767
DS 



AS 1 5

CO CL1080Contig1 1000 5 6 U
TTGTGGAAACAACTAACTCGATTTTATTAAATGCCAAACCAGAAATAACCCAAAGTTATT
TCTACCGAGTCCGGTGCGATCCGGTTCGGTCTTTGACGTATTTATCTTTGCTATACCGAA
CCAGAGTTGTCTTATGAACTCACAAGTCACAAATACACAAATTCTTTAAAACAAAAACAA
TAAAACTAAACCAAATCCAAATCATGTTCCGGCCTGGTTCAAGCATAGAGGTTTCTTCCG
CAGCGATCACACTCGGTTAAGTGAGAAACCGGGGTTTTACCCGCATTGATTTTCTGCAGA
TTTGGAAGATCGACCTCAAGAACATCACGAAAAGCCTTAGAGCCTTCTCGGAGTTCATCA
GAGCTTATGGAGAGTGGTGGAGTTAACCGGACAATTGTGTTGTGAGTCGGTTTAGCCAAC
ACTCCTCTCTCCTTCAAGCTCAAGCAAACATCATAAGCTGAAACAGGAGATAAGCTTTCA
CTGTTAAACTCAACAGCATTGAACAATCCTCTTCCTCGTACTTCTTTAATGTGATTAGGA
AACTGTTTCTTGATTTCATTCAGTTGAATCCTCAGTTCTTCTCCAAGACTTGCTGATCTT
TCGACGAGTTTCTCTTCCTCGATAACATCTAAAGAAGCCATAGCTACAGCACTAGCTAAA
GGGTTCCCACCAAATGTGCTTCCGTGTTGGCCAGGTTTGATATGAAGCATCACATCTTTG
TCAGCAAGCACTGCGCTTACTGGAATCACTCCTCCACCTAATGCTTTCCCGAGTATCACC
ATGTCGGGACGAATCTCTTCCCAGTCACAAGCTAACATCTTTCCAGATCTGGCAAGACCG
CTTTGCACTTCATCAGCTATCATCAAAACGTTATGTTTTGTGCAGAGTTATCTAACAGCT
TTCAGATAACCCTCAGGAGGAATAACAACTCCAGCTTCTCCTTGAATAGGCTCGAAAAGA
AATCCAGCTATTTTATCTCCCTTCTCTTTAAAGAGGATCC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 20 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EL02JQ U 3
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AF RS1GC46JQ U 29
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CGAGTCCGGGGCGATCCGGTTCGGTCTTTGACGTATTTATCTTTGCTATACCGAACCAGA
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CTAAACCAAATCCAAATCATGTTCCGGCCTGGTTCAAGCATAAAGGTTTCTTCCGCAGCG
ATCACACTCGGTTAAGTGAGAAACCGGGGTTTTACCCGCATTGATTTTCTGCAGATTTGG
AAGATCGACCTCAAGAACATCACGAAAAGCCTTAAAGCCTTCTCGGAGTTCATCAGAACT
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DS 

RD RS1EL02TF 689 0 0
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C

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TGAAGCATCACATCTTTGTCAGCAAGCACTGCGCTTACTGGAATCACTCCTCCACCTAAT
GCTTT

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DS 

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TTTAATGTAATTAGGAAACTGTTTCTTGATTTCATTCAGTTGAATCCTCAGTTCTTCTCC
AAGACTTGCTGATCTTTCGACGAGTTTCTCTTCCTCGATAACATCTAAAGAAGCCATAGC
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AAGCATCACATCTTTGTCAGCAAGCACTGCGCTTACTGGAATCACTCCTCCACCTAATGC
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GAGTTATCTAACAGCTTTCAGATAACCCTCAGGAGGAATAACAACTCCAGCTTCTCCTTG
AATAGGCTCGAAAAGAAATCCAGCTATTTTATCTCCCTTCTCTTTAAAGAGGATCC

QA 6 661 6 661
DS 



AS 1 5

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BE35JQ U 1
AF RS1A153TF C 88
AF RS1A153JQ U 88
AF RS1A153TR U 88
AF RS1A153TV C 88
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RD RS1BE35JQ 404 0 0
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GGCTGCAACCGAGTACTTCCGGGAACTTCTTCAGCACTTTGTGA

QA 1 404 1 404
DS 

RD RS1A153TF 666 0 0
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CAAAAT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RS1A153JQ 753 0 0
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CAAACCAACTCTTCTCCTTGAGGAACAAACGAACTAGTGAAAGACTAAAACCGAACCC*A
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GGGATTCCGAAGCACCAGACTTCGCAGCGACTTACCCGTAATCCCCC*ATTGGCTTTCCA
AGATCCCAATGTTGGGTTTCATCTCTTCTTCTAGGCTGCAACCGAGTACTTCCGGGAACT
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CATGATTCAAAGTTTCCACCTTTAGATTCTCTTTCACTCGTTCTTCTGTCCAGTACGGCG
AGTGGATATGACCAAACGCCTTTCCTAGTATCTTGTCTTGCTCCTCTACGCTGAAATCAA
AACAAGACAAAGCTTCTTTGCATTCTTCCCATGTCTTTGGCTCATCACCAGAGGTTTCCA
CTTGTGTTGTTGAACAGAGCACTATCCACTTGTTTCGCGGAAGACGAGATGTTCTTACTC
CTCCAACTACCCCATGATACGACAAGTTCAGTCTCAATGGTAAAACATTACTGTATGTTA
CAAAATCACCCGCAGAGTGTCGAAAACATTTGACAGAACCCACTGTAGCCAAAGGTGAAG
CTAAAGAGCTTCCTAACATTTCCTGAACTGCGA

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DS 

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AGTGGATATGACCAAACGCCTTTCCTAGTATCTTGTCTTGCTCCTCTACGCTGAAATCAA
AACAAGACAAAGCTTCTTTGCATTCTTCCCATGTCTTTGGCTCATCACCAGAGGTTTCCA
CTTGTGTTGTTGAACAGAGCACTATCCACTTGTTTCGCGGAAGACGAGATGTTCTTACTC
CTCCAACTACCCCATGATACGACAAGTTCAGTCTCAATGGTAAAACATTACTGTATGTTA
CAAAATCACCCGCAGAGTGTCGAAAACATTTGACAGAACCCACTGTAGCCAAAGGTGAAG
CTAAAGAGCTTCCTAACATTTCCTGAACTGCGAAGATACTCTTTAACTTGGTCGCTAGCT
AATCAGAAACACTGAGTCAGATAT
CC

QA 1 804 1 804
DS 

RD RS1A153TV 855 0 0
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CAAACCAACTCTTCTCCTTGAGGAACAAACGAACTAGTGAAAGACTAAAACCGAACCC*A
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GGGATTCCGAAGCACCAGACTTCGCAGCGACTTACCCGTAATCCCCC*ATTGGCTTTCCA
AGATCCCAATGTTGGGTTTCATCTCTTCTTCTAGGCTGCAACCGAGTACTTCCGGGAACT
TCTTCAGCACTTTGTGAAGATCTTCGTCAGACAAACCGAGACTTCTAAGGAACTCGACTA
CATGATTCAAAGTTTCCACCTTTAGATTCTCTTTCACTCGTTCTTCTGTCCAGTACGGCG
AGTGGATATGACCAAACGCCTTTCCTAGTATCTTGTCTTGCTCCTCTACGCTGAAATCAA
AACAAGACAAAGCTTCTTTGCATTCTTCCCATGTCTTTGGCTCATCACCAGAGGTTTCCA
CTTGTGTTGTTGAACAGAGCACTATCCACTTGTTTCGCGGAAGACGAGATGTTCTTACTC
CTCCAACTACCCCATGATACGACAAGTTCAGTCTCAATGGTAAAACATTACTGTATGTTA
CAAAATCACCCGCAGAGTGTCGAAAACATTTGACAGAACCCACTGTAGCCAAAGGTGAAG
CTAAAGAGCTTCCTAACATTTCCTGAACTGCGAAGATACTCTTTAACTTGGTCGCTAGCT
AATCAGAAACACTGAGTCAGATATCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGT
CCGGTACCGTCGACT

QA 1 855 1 855
DS 



AS 1 6

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GATGACAACAATCTTGGAGGACTATGGGGAAAAGGGAGAGGAAAAGGAAGAGGACGATCT
CCAAGAACCTATGTGGTAGGAGGAGGAGGCGGAGAACGTAGCTTCGGTATCGGGCTCGGA
CTCAGCCTCGGCCCTATGTCACCGAGCCTAGGCCTACACGGATCTTCGTCTCCGAAAACA
GCAACAAAGGGACCAAGGATGCCTGATGGGACAAGAGGCTTCACTATGGGACGTGGCAAA
CCTGTCAATCTCAGTCTTATCTAACAATCTCTAAGTAAAAGAGGTAAAAGCTATAGAATT
AACCAAATAATACATGTTGGTTGTTGTTTTTTTGAGATATGGGTTCACAGAAGCAAGGAC
ATGGGTTTGGGATGAGGTATGGTGAAGTTTTCTGAGTGTTTTTTCTTTCTTCTTTTTGCA
TTTCTTTTATTCTCTAATTTGGGCAATTTCTTTTGTATGTTTTGATTTGTTTATTTTTGT
GTGAGACTAACTGAATAATAAAGGGTTTATAGCACAAGGACTGCAACCCTGTTGTGTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 35 35 35 35 35 35 35 35 40 25 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1FA36TF U 1
AF RS1EK13TF U 44
AF RS1EK94TF U 44
AF RS1EK13JQ C 180
AF RS1GI72JQ C 473
AF RS1EK94JQ C 465
BS 1 48 RS1FA36TF
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GATGACAACAATCTTGGAGGACTATGGGGAAAAGGGAGAGGAAAAGGAAGAGGACGATCT
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QA 1 631 1 631
DS 

RD RS1EK13TF 785 0 0
G
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AACC

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G
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CGGTATCGGGCTCGGACTCAGCCTCGGCCCTATGTCACCGAGCCTAGGCCTACACGGATC
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CTTTCTTCTTTTTGCATTTCTTTTATTCTCTAATTTGGGCAATTTCTTTTGTATGTTTTG
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QA 2 771 2 771
DS 

RD RS1EK13JQ 661 0 0
ATCAGTGCTCAAGCACAGAAGAAACTTTGATGGCATCCTCATAGATGATGAAAGTCCTTA
TGAATCTGGAGAAGAATCTCCACGTCTCCATTTAACCGAGCATCAGCTTGATAACGAGGG
TGATGACAACAATCTTGGAGGACTATGGGGAAAAGGGAGAGGAAAAGGAAGAGGACGATC
TCCAAGAACCTATGTGGTAGGAGGAGGAGGCGGAGAACGTAGCTTCGGTATCGGGCTCGG
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AGCAACAAAGGGACCAAGGATGCCTGATGGGACAAGAGGCTTCACTATGGGACGTGGCAA
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TAACCAAATAATACATGTTGGTTGTTGTTTTTTTGAGATATGGGTTCACAGAAGCAAGGA
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C

QA 1 661 1 661
DS 

RD RS1GI72JQ 368 0 0
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GCAAGGACATGGGTTTGGGATGAGGTATGGTGAAGTTTTTTGAGTGTTTTTTCTTTTTTC
TTTTTGCATTTCTTTTATTCTCTAATTTGGGCAATTTCTTTTGTATGTTTTGATTTGTTT
ATTTTTGTGTGAGACTAACTGAATAATAAAGGGTTTATAGCACAAGGACTGCAACCCTGT
TGTGTA
CC

QA 1 366 1 366
DS 

RD RS1EK94JQ 376 0 0
TTCGTCTCCGAAAACAGCAACAAAGGGACCAAGGATGCCTGATGGGACAAGAGGCTTCAC
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TAAAAGCTATAGAATTAACCAAATAATACATGTTGGTTGTTGTTTTTTTGAGATATGGGT
TCACAGAAGCAAGGACATGGGTTTGGGATGAGGTATGGTGAAGTTTTCTGAGTGTTTTTT
CTTTCTTCTTTTTGCATTTCTTTTATTCTCTAATTTGGGCAATTTCTTTTGTATGTTTTG
ATTTGTTTATTTTTGTGTGAGACTAACTGAATAATAAAGGGTTTATAGCACAAGGACTGC
AACCCTGTTGTGTA
TC

QA 1 374 1 374
DS 



AS 1 6

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GGACGCGCTTCCCTCTCTCTCCTCTGCTCTGTTTCCTCAACTCTCTCTCCTTCTGTTTCT
CTCACTAAAAACTGGCGATCGAAGAGAATCAACAAGCTATTGTCAGAGAAATCATGGGAG
CTGAAGAAGAAAACAACAAGAGTTGGCCTCCATGGCTTAAACCTCTGCTTCAAGAGAAGT
TCTTTGTACAATGCAAATTACACGCAGACTCACACAAGAGTGAGTGTAATATGTACTGTT
TAGACTGTACCAATGGTCCTCTTTGTTCTCTCTGCCTCTCTTTCCACAAGGATCATCACG
CCATTCAGATAAGGAGATCATCATATCACGATGTGATAAGAGTATCGGAAATTCAGAAAT
TTCTGGACATAACAGGAGTTCAGACATATGTGATTAACAGCGCTAAGGTTGTCTTCTTGA
ACGAGAGGCCTCAGCCTCGACCAGGTAAAGGCGTTGTCAACACCTGCCAAGTCTGTTATC
GCAGCCTCGTTGATTCCTTCAGATTCTGTTCGCTTGGTTGCAAGATCTCTGGAACGTCAA
AGAATTTCGAGAAAAAAAGAAAGGATTGGGCAAACAATATTTCAGATTCTGATGATTCGT
ATAGCAGTACTACTACTAGTATCGGGAGACTCAAGAAGAACAATGACATTCTTAATAACA
ATAGTTTCACGCCATCAACACCACCACTATCGGCCGTAAATGACCGAATAGTGAAACGAA
GGAAAGGAATTCCGCATCGTGCTCCTTTTGGAGGACTTCCGATGGTAATGTAGAATTAAT
GCTCGTAACACTCACCAGTAGTGGGGGG*TATGTGTTTGTATATATATACCTGTAGTGGT
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ATGAAAGAAATGCTTTCGCCTGTATATTTTAGGCTCAAAGGGTAATATGTAAATACAGAA
TACTGTTTGTGGATCAAATAATAGTAATAAAAGTATGTGATACAATGCAAATGTTAATGA
AATAAAGGCATTTTTAACACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 10 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 10 30 10 10 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FS60TF U 1
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AF RS1FA05TF U 18
AF RS1F839JQ C 152
AF RS1FA05JQ C 532
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TAGACTGTACCAATGGTCCTCTTTGTTCTCTCTGCCTCTCTTCCCACAAGGATCATCACG
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CTTTGTTCTCTCTGCCTCTCTTTCCACAAGGATCATCACGCCATTCAGATAAGGAGATCA
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AAGGATTGGGCAAACAATATTTCAGATTCTGATGATTCGTATAGCAGTACTACTACTAGT
ATCGGGAGACTCAAGAAGAACAATGACATTCTTAATAACAATAGTTTCACGCCATCAACA
CCACCACTAT

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AGTTGGCCTCCATGGCTTAAACCTCTGCTTCAAGAGAAGTTCTTTGTACAATGCAAATTA
CACGCAGATTCACACAAGAGTGAGTGTAATATGTACTGGTTAGACTGTACCAATGGTCCT
CTTTGTTCTCTCTGCCTCTCTTTCCACAAGGATCATCACGCCATTCAGATAAGGAGATCA
TCATATCACGATGTGATAAGAGTATCGGAAATTCAGAAATTTCTGGACATAACAGGAGTT
CAGACATATGTGATTAACAGCGCTAAGGTTGTCTCCTTGAACGAGAGACCTCAGCCTCGA
CCAGGTAAAGGCGTTGTCAACACCTGCCAAGTCTGTTATCGCAGCCTCGTTGATTCCTTC
AGATTCTGTTCGCTTGGTTGCAAGATCTCTGGAACGTCAAAGAATTTCGAGAAAAAAAGA
AAGGATTGGGCAAACAATATT*CAGATTCTGATGATTCGTATAGCAGTACTACTACTAGT
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CCACCACTATCGGCCGTAAATGACCGAATAGTGAAACGAAG*AAAGGA*TTCCGCATCGT
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GTGGGGGG*TATGTGTT*GTAAATATATAC*TGTAGTGGT
CTAA

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GCTTGGTTGCAAGATCTCTGGAACGTCAAAGAATTTCGAGAAAAAAAGAAAGGATTGGGC
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GGCCGTAAATGACCGAATAGTGAAACGAAGGAAAGGAATTCCGCATCGTGCCCCTTTTGG
AGGACTTCCGATGGTAATGTAGAATTAATGCTCGTAACACTCACCAGTAGTGGGGGG*TA
TGTGTTTGTATATATATACCTGTAGTGGTCTAAAGCGATGTATAAAGAGAAGCTTAAAGT
TGCCAAAAA****AAA
GAGAAGCTT

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AGCTTAACATGATAGTGTGAAATAGTAGATACTAAAGGTTAAAAAGTGGGGAAGATTATA
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AATACAGAATACTGTTTGTGGATCAAATAATAGTAATAAAAGTATGTGATAC

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DS 

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GATGATTCGTATAGCAGCACTACTACTAGTATCGGGAGACTCAAGAAGAACAATGACATT
CTTAATAACAATAGTTTCACGCCATCAACACCACCACTATCGGCCGTAAATGACCGAATA
GTGAAACGAAGGAAAGGAATTCCGCATCGTGCTCCTTTTGGAGGACTTCCGATGGTAATG
TAGAATTAATGCTCGTAACACTCACCAGTAGTGGGGGGGTATGTGTTTGTATATATATAC
CTGTAGTGGTCTAAAGCGATGTATAAAGAGAAGCTTAAAGTTGCCAAAAA****AAAGAG
AAGCTTAACATGATAGTGTGAAATAGTAGATACTAAAGGTTAAAAAGTGGGGAAGATTAT
AGAATGAAGAATGAAAGAAATGCTTTCGCCTGTATATTTTAGGCTCAAAGGGTAATATGT
AAATACAGAATACTGTTTGTGGATCAAATAATAGTAATAAAAGTATGTGATACAATGCAA
ATGTTAATGAAATAAAGGCATTTTTAACACC

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DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL1085Contig1 854 2 8 U
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GGAGCAGGTCTTCTCCACTTATTCCGACAACCAGCCTGGTGTGTTGATCCAAGTCTACGA
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CAACGACAAGGGTCGCTTGTCTAAAGACGAGATTGAGAAGATGGTGCAAGAGGCTGAGAA
GTACAAGTCTGAAGATGAGGAGCACAAGAAGAAGGTTGAGGCCAAGAATGCTCTTGAAAA
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TGCAGACAAGAAGAAGATTGAAGACTCGGTTGAGGAAGCCATCCAGTGGCTTGATGGTAA
CCAGACTGCTGAAGCAGATGAGTTTGAGGACAAGATGAAAGAGTTGGAGAGCGTTTGCAA
CCCCATCATTGCGAAGATGTACCAAGGAGCTGGTGGTGAGGCAGGTGGTCCCGCTGGAAT
GGATGACGATGAAGCTCCTCCTTCTACCGGAGGTGCTGGCCCCAAGATTGAGGAAGTCGA
CCAATCTTGTTATGTTTACATGATTTTGGCTTGATTTTCAGTATCGGTTTATGTTTGGTT
CTATTTGAGCCATG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FU91TF U 1
AF RS1E256TF U 170
BS 1 291 RS1FU91TF
BS 292 292 RS1E256TF
BS 293 504 RS1FU91TF
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RD RS1FU91TF 697 0 0
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GGAGCAGGTCTTCTCCACTTATTCCGACAACCAGCCTGGTGTGTTGATCCAAGTCTACGA
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TATCCTCAACGTCTCTGCCGAGGACAAGACCACCGGCCAAAAGAACAAGATCACCATCAC
CAACGACAAGGGTCGCTTGTCTAAAGACGAGATTGAGAAGATGGTGCAAGAGGCTGAGAA
GTACAAGTCTGAAGATGAGGAGCACAAGAAGAAGGTTGAGGCCAAGAATGCTCTTGAAAA
CTATGCTTACAACATGAGGAACACCATTCGTGATGACAAGATTGGTGAGAAGCTTCCTGC
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CCAGACTGCTGAAGCAGATGAGTTTGAGGACAAGATGAAAGAGTTGGAGAGCGTTTGCAA
CCCCATCATTGCGAAGATGTACCAAGGAGCTGGTGGT

QA 1 697 1 697
DS 

RD RS1E256TF 685 0 0
G
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CTCTTGAAAACTATGCTTACAACATGAGGAACACAATTCGTGATGACAAGATTGGTGAGA
AGCTTCCTGCTGCAGACAAGAAGAAGATTGAGGATTCGGTTGAGGAAGCCATCCAGTGGC
TTGATGGTAACCAGACTGCTGAAGCAGATGAGTTTGAGGACAAGATGAAGGAGTTGGAGA
GCGTTTGCAACCCCATCATTGCGAAGATGTACCAAGGAGCTGGTGGTGAGGCAGGTGGTC
CCGCTGGAATGGATGACGATGAAGCTCCTCCTTCTACCGGAGGTGCTGGCCCCAAGATTG
AGGAAGTCGACCAATCTTGTTATGTTTACATGATTTTGGCTTGATTTTCAGTATCGGTTT
ATGTTTGGTTCTATTTGAGCCATG

QA 2 685 2 685
DS 



AS 1 5

CO CL1086Contig1 1038 5 32 U
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CATCGTATTTGATTTCGACAAGACGATCATCGACGTGGACAGCGATAATTGGGTTGTCGA
TGAACTTGGCTTCACTGATTTGTTCGACCAGCTTCTCCCCACTATGCCTTGGAACTCCCT
CATGGATCGGATGATGAAGGAGCTTCATGATCATGATAAAACCATTGAAGAAATCAAACA
AGTCTTGAAAAGAGTCCCTATTCATCCTCGTGTCATCGCTGCCATCAAATCTGCTCATGC
TTTAGGGTGCGAGCTGAGAATAGTGAGCGACGCGAACACGTTATTTATCGAAACGATGCT
TGAACATCTCAAGATTCGTGAGTATTTCTCTGAGATTAACACAAACCCTGGACTTGTAGA
TGAACAAGGAAGGTTAATAATCTCTCCTTACCACGACTTCACTAAATCCTCCCACGGTTG
CTCTCGTTGCCCTCCTAACATGTGCAAGGGGTTGATAATTGAGAGGATTCAAGCTTCTTT
TGCCAAAGAAGGAAATAAGATGAAGATGATCTATCTAGGAGATGGTGCTAATGATTACTG
TCCGAGTCTTAGACTCAAACCTGAAGATTGCATGATGCCAAGGAAGAATTTCCCTGTTTG
GGATTTGATTAGTCAAAACCCCTCCTTGGTTAAGGCCACGGTTAAAGACTGGACCGATGG
GGAAGCTATGGAAAGAATGCTAATGGGAAAGATCAACGAGATTATATCATCAGATGAAGA
AGAAAAGGAGAAGATGTTGAGCTCTGATCATTGCAAGATGTCTGTTGGGATTGTTCACGA
GCCTTTGGTGCCTCTTGCTCTTCAAGTTCCTCTTAATCTCGTTAAGTGATTGATGAAGAG
AACGAGGAATCTAAGATTCTTTTGTTTCGAATATAGTATTATATCTCTCATGTACTGGAG
AATATTTGTATAAGATACCTAAAGTTGATTGTTTTGGATTGGTATTGATGTAACTCTCTT
GAAAGCTTAAACGGGCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CF31TF U 1
AF RS1CA88TF U 1
AF RS1F247TF U 1
AF RS1CF31JQ C 191
AF RS1F247JQ C 601
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DS 

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A

QA 1 642 1 642
DS 

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CATCGTATTTGATTTCGACAAGACGATCATCGACGTGGACAGCGATAATTGGGTTGTCGA
TGAACTTGGCTTCACTGATTTGTTCGACCAGCTTCTCCCCACTATGCCTTGGAACTCCCT
CATGGATCGGATGATGAAGGAGCTTCATGATCATGATAAAACCATTGAAGAAATCAAACA
AGTCTTGAAAAGAGTCCCTATTCATCCTCGTGTCATCGCTGCCATCAAATCTGCTCATGC
TTTAGGGTGCGAGCTGAGAATAGTGAGCGACGCGAACACGTTATTTATCGAAACGATCCT
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TGAACAAGGAAGGTTAATAATCTCTCCTTACCACGACTTCACTAAATCCTCCCACGGTTG
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TGCCAAAGAAGGAAATAAGATGAAGATGATCTATCTAGGAGATGGTGCTAATGATTACTG
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CGAGATATATC

QA 1 755 1 755
DS 

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AAGATTCGTGAGTATTTCTCTGAGATTAACACAAACCCTGGACTTGTAGATGAACAAGGA
AGGTTAATAATCTCTCCTTACCACGACTTCACTAAATCCTCCCACGGTTGCTCTCGTTGC
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GGAAATAAGATGAAGATGATCTATCTAGGAGATGGTGCTAATGATTACTGTCCGAGTCTT
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AGTCAAAACCCCTCCTTGGTTAAGGCCACGGTTAAAGACTGGACCGATGGGGAAGCTATG
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AAGATGTTGAGCTCTGATCATTGCAAGATGTCTGTTGGGATTGTTCACGAGCCTTTGGTG
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CTAAGATTCTTTTGTTTCGAATATAGTATTATATCTCTCATGTACTGGAGAATATTTGTA
TAAGATACCTAAAGTTGATTGTTTTGG

QA 1 807 1 807
DS 

RD RS1F247JQ 438 0 0
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GGAAGCTATGGAAAGAATGCTAATGGGAAAGATCAACGAGATTATATCATCAGATGAAGA
AGAAAAGGAGAAGATGTTGAGCTCTGATCATTGCAAGATGTCTGTTGGGATTGTTCACGA
GCCTTTGGTGCCTCTTGCTTTTCAAGTTCCTTTTAATCTCGTTAAGTGATTGATGAAGAG
AACGAGGAATTTAAGATTCTTTTGTTTCGAATATAGTATTATATCTCTCATGTACTGGAG
AATATTTGTATAAGATACCTAAAGTTGATTGTTTTGGATTGGTATTGATGTAACTCTCTT
GAAAGCTTAAACGGGCCC

QA 1 438 1 438
DS 



AS 2 6

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CAACATAAAACATAACTCATTTTCTTGAAAACAAAAACACATGAAAGTTTTCAAAAAATA
TATAAAACATATTGTTTTAAAGGCATGGAATACCCGATGGAACACCACAAGCATTGAGTG
TAAGGCTGACAGCTAGGGGAATGTTCAACAAGGGAAGAAGGCTTCCGATATTAGCTTTAA
CAGCGGTACAAAGACAAACTGCTGCATTTGCGTCCACAATGCCTTTGAGAAGTGTGCAAC
ATTCGGTTCCTGCTGGCAGAGAAACCTTGACCACGCCATTCAACAAATCTGCACACACAG
TAACTAAATTTCCGGCATTGGGACGACCTGTAGCGTTAACTGCAGTGAAGCAGATGATGT
TGAAGAGGAGAACAATGGCAAGAGTTTTGGAAGCCATATTGAAGAGGAGAAAATGTTAAC
CTTTTTAGAGAACGATTGTTTGTTTGTGAGATTTGTCTTTGTCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CI73JQ U 3
AF RS1CI73TF C 1
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BS 3 166 RS1CI73JQ
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AGGCTGACAGCTAGGGGAATGTTCAACAAGGGAA
AAA

QA 1 214 1 214
DS 

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TATAAAACATATTGTTTTAGAGGCATGGAATACCCGATGGAACACCACAAGCATTGAGTG
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CAGCGGTACAAAGACAAACTGCTGCATTTGCGTCCACAATGCCTTTGAGAAGTGTGCAAC
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TGAAGAGGAGAACAATGGCAAGAGTTTTGGAAGCCATATTGAAGAGGAGAAAATGTTAAC
CTTTTTAGAGAACGATTGTTTGTTTGTGAGATTTGTCTTTGTCC

QA 1 524 1 524
DS 



CO CL1087Contig2 609 4 14 U
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GCACACACCGTAACTAAATTTACGGCATTGGGACAACCTGTAGCGTTAACTGCAGTGAAG
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ATGTTAACTTTTTAGAGAAAGATTGTTTGTTTGTGGGATTTGTGTTTGTGAGATTTGTGT
TTGTGATCC


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1EH55JQ U 1
AF RS1DL79JQ U 47
AF RS1DL79TF C 1
AF RS1EH55TF C 4
BS 1 3 RS1DL79TF
BS 4 48 RS1EH55JQ
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RD RS1EH55JQ 105 0 0
AAA
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DS 

RD RS1DL79JQ 190 0 0
AAAAAA
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AAAAAAAAAAA*CTTAAACAACATAAAACATAACTCATTTTCTTGAAAACAAAAACCCAT
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CACC

QA 7 190 7 190
DS 

RD RS1DL79TF 609 0 0
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AAA*CTTAAACAACATAGAACATAACTCATTTTCTTGAAAACAAAAACACATAAAAGTTT
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GCACACACCGTAACTAAATTTACGGCATTGGGACAACCTGTAGCGTTAACTGCAGTGAAG
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TTGTGATCC

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DS 

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AGAAATATATAAAACATATTGTTTTAGAGGCATGGAATACCCGATGGAACACCACAAGCA
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TTAACTTTTTAGAGAAAGATTGTTTGTTTGTGGGATTTGTGTTTGTGAGATTTGTGTTTG
TGATCC

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 5

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TTCATACGGCTGCTCCGGTCAAGTACATCGTCACGGATCCTCAGACTGAGCTAATAGATC
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TTAATTTTTCGGCTGGATTCATTGTGGATATGATAAATGGTAAGAACCCTTTCAACTTCA
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TGAAGAATCTGGGAGTTGACTTCACTCCTCTCGAGTCAAGCCTTAGAGACACTATCATCA
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AACTTTCATATATGTATTTACAACCTTGCCGGTTAATGTAAGTTGCCTCTATCATGACAA
AACACTCATGGTTATTCATTCATCAGCCAATGGTAAGGTTGTGAAAATGAAATTGACAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DD10TF U 21
AF RS1CU16TF U 24
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GG
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CACCGGAGCTTCCGGTTACATAGCTTCTTGGATTGTTAAGCTTTTGCTCCTCCGTGGCTA
CACCGTCAGGGCTACCGTTCGAAACCCAACGGACACGGCGAAAACAGAACATCTTCTTGC
ACTAGAGGGTGCAAAAGAAAGACTTGAACTGTTCAAAGCAGATCTTCTGGAAGAGTGTTC
CTTCGAGCAAGCAATCGAAGGTTGTGACGCTGTCTTTCATACGGCTGCTCCGGTCAAGTA
CATCGTCACGGATCCTCAGACTGAGCTAATAGATCCAATCGTGAAGGGTACTATCAACGT
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GAGTCATCGTAACATCGTCCACTGCTGCGGTTCTTGTTCGTCAACCCCCTGTGGAGCCAA
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GGTATCCACTCTCCGAAACTTTGGCAGAAAATGCAGCTTGGCAATTTGCTAAAGACAATG
GAATGGACATGGTCGTGATAATTCCAGGATTTGTAATCGGGCCACTTTTGCAACCAACAC
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TAAACTACAG
TTCGTG

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AATGGAATGGACATGGTCGTGATAATTCCAGGATTTGTAATCGGGCCACCTTTGCAACCA
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AAAGACAATGGAATGGACATGGTCGTGATAATTCCAGGATTTGTAATCGGGCCACTTTTG
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ATAAACGACATTCAAAAGACTATGCGTGCACTATTTCCAGATTTGGGTATTGCTGATACG
ATTAACGGAGAAAGTGTGATGAAAGATATCATGAAGAAAGAAATCATTTACAAAGTGTGT
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ACTATCATCAGCCTCCAAGAAAAATGTCTCTTATGAGAGAATACGAATCATGTTTCATAT
ATCTATTTACAACTTTCATATATGTATTTACAACCTTGCCGGTTAATGTAAGTTGCCTCT
ATCATGACAAAACACTCATGGTTATTCATTCATCAGCCAATGGTAAGGTTGTGAAAATGA
AATTGACAGC

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DS 



AS 1 6

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GAGACATATATGAAGCCATGAAAATGAACGAATCTTCTACTTTCCAGTACAAATTCATCG
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ATGGTTCTAAGCGCCGAATCCCTTTCCTAGCCTGATCATTTGAAGGGTCCAGTTCTAATA
TCTTCTTCAAGTCAGTGAGGGCTTCTTCAAAGTGTTCAAGCTTTTCATGAGCTTCTGCAC
GACGAACCAAAGCTTTAGTATAGCTCGGATTCAGCTCTATCGCTTTTGTGCTTTCCTTGA
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ATCGAAGCTCCAAAGATTCAGGAAACTCCTGAGCAAACTGTAAAGCAAGCTCATACTTTG
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TTGCATCCTCCAAAGCTTTCTCCT***GATTTGATTCAACATCGGCAATGGCCTCCACCT
GATCTTCCTCCTCCTTCTCAGGTTTATCCGACGGTTGCGGCTCCTGATTCTCTACAGCTT
CATGTTTCCTATCACCTTCTTCCTCTTCTTCTTCGTTATCGCTAACTCCACGTTCGCTGG
CAGTTTCGAACCCGTCGGAATCATCTCCGCCGACGATTTTCGCCTCCGTTGTTTTGGGCG
GCGACGAGGAAGAACGTGATGGATTTGGTTCTTCTATGACGGAGATTTCATCGTCGCTTT
CGCTTTCGATCAACACCATTTTCAACTCAGTGACTTGGGATTGTTTCCAAAAGATTCAAC
GATGGTGATTAACCGACGATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GH94JQ U 1
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RD RS1GH94JQ 657 0 0
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GAGTAAGTGTATTGTTGGTCAACTAGTTTTGGAAAGAAAAAGAGTAAGAGCCAGTGTTGG
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ATGGTTCTAAGCGCCGAATCCCTTTCCTAGCCTGATCATT*GAAGGGTCCAGTTCTAATA
TCTTCTTCAAGTCAGTGAGGGCTTCTTCAAAGTGTTCAAGCTTTTCATGAGCTTCTGCAC
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ATCGAAGCTCCAAAGATTCAGGAAACTCCTGAGCAAACTGTAAAGCAAGCTCATACT

QA 1 657 1 657
DS 

RD RS1BM60JQ 638 0 0
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TATTGTTGGTCAACTAGTTTTGGAAAGAAAAAGAGTAAGAGCCAGTGTTGGGATCTTTAA
CAGCCTTGAAGTTGTCTACACTCATCCCAAATTTGCCCAATATCGTGTTTCCCATCTCCT
TCAACTTTGCTATGGCTTCTTCTTTCATCTTTTCTCGCTTCTCGGCCGCCAATGGTTCTA
AGCGCCGAATCCCTTTCCTAGCCTGATCATTTGAAGGGTCCAGTTCTAATATCTTCTTCA
AGTCAGTGAGGGCTTCTTCAAAGTGTTCAAGCTTTTCATGAGCTTCTGCACGACGAGCCA
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CATATTTGCCCAATTTGAGATAACATATCGCTCTGTTTGAATGGCAGATAGATCGAAGCT
CCAAAGATTCAGGAAAATCCTGAGCAAACTGTAAAGCAAGCTCATACTTTGACAATGCAT
CTTCGTATAAGCCATTTCCAAACAATTTGTTTCCTTCC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1B095JQ 701 0 0
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CGATGAACACAAAATGGTTGATGCAAGTATACCATGAGTAAGTGTATTGTTGGTCAACTA
GTTTTGGAAAGAAAAAGAGTAAGAGCCAGTGTTGGGATCTTTAACAGCCTTGAAGTTGCC
TACACTCATCCCAAATTTGCCCAATATCGTGTTTCCCATCTCCTTCAACTTTGCTATGGC
TTCTTCTTTCATCTTTTCTCGCTTCTCAGCCGCCAATGGTTCTAAGCGCCGAATCCCTTT
CCTAGCCTGATCATTTGAAGGGTCCAGTTCTAATATCTTCTTCAAGTCAGTGAGGGCTCC
TTCAAAGTGTTCAAGCTTTTCATGAGCTTCTGCACGACGAACCAAAGCTTTAGTATAGCT
CGGATTCAGTTCTATCGCTTTTGTGCTTTCCTTGATTGCTTCTGCATATTTGCCCAATTT
GAGATAACATATCGCTCTGTTTGAATGGCAGATAGATCGAAGCTCCAAAGATTCAGGAAA
CTCCTGAGCAAACTGTAAAGCAAGCTCATACTTTGACAATGCATCTTCGTATAAGCCATT
TCCAAACAATTTGTTTCCTTCCATTTTAGCTTCGTTTGCATCCTCCAAAGCTTTCTCCA*
**GATTTGATTCAACATCGGCAATGGCCTCCACCTGATCTT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RS1GH94TF 616 0 0
TCA
TTGAAGGGTCCAGTTCTAATATCTTCTTCAAGTCAGTGAGGGCTTCTTCAAAGTGTTCAA
GCTTTTCATGAGCTTCTGCACGACGAACCAAAGCTTTAGTATAGCTCGGATTCAGCTCTA
TCGCTTTTGTGCTTTCCTTGATTGCTTCTGCATATTTGCCCAATTTGAGATAACATATCG
CTCTGTTTGAATGGCAGATAGATCGAAGCTCCAAAGATTCAGGAAACTCCTGAGCAAACT
GTAAAGCAAGCTCATACTTTGACAATGCATCTTCGTATAAGCCATTTCCAAACAATTTGT
TTCCTTCCATTTTAGCTTCGTTTGCATCCTCCAAAGCTTTCTCCT***GATTTGATTCAA
CATCGGCAATGGCCTCCACCTGATCTTCCTCCTCCTTCTCAGGTTTATCCGACGGTTGTG
GCTCCTGATTCTCTACAGCTTCATGTTTCCTATCACCTTCTTCCTCTTCTTCTTCGTTAT
CGCTAACTCCACGTTCGCTGGCAGTTTCGAACCCGTCGGAATCATCTCCGCCGACGATTT
TCGCCTCCGTTGTTTTGGGCGGCGACGAGGAAGAACGTGATGGATTTGGTTCTTCTATGA
CGGAGATTTCATC

QA 4 616 4 616
DS 

RD RS1BM60TF 650 0 0
TTCTTCAAAGTGTTCAAGCTTTTCATGAGCTTCTGCACGACGAGCCAAAGCTTTAGTATA
GCTCGGATTCAGCTCTATCGCTTTTGTGCTTTCCTTGATTGCTTCTGCATATTTGCCCAA
TTTGAGATAACATATCGCTCTGTTTGAATGGCAGATAGATCGAAGCTCCAAAGATTCAGG
AAAATCCTGAGCAAACTGTAAAGCAAGCTCATACTTTGACAATGCATCTTCGTATAAGCC
ATTTCCAAACAATTTGTTTCCTTCCATTTTAGCTTCGTTTGCATCCTCCAAAGCTTTCTC
CTTCTGATTTGATTCAACATCGGCAATGGCCTCCACCTGATCTTCCTCCTCCTTCTCAGG
TTTATCCGACGGTTGCGGCTCCTGATTCTCTACAGCTTCATGTTTCCTATCACCTTCTTC
CT**TCTTCTTCGTTATCGCTAACTCCACGTTCGCTGGCAGTTTCGAACCCGTCGGAATC
ATCTCCGCCGACGATTTTCGCCTCCGTTGTTTTGGGCGGCGACGAGGAAGAACGTGATGG
ATTTGGTTCTTCTATGACGGAGATTTCATCGTCGCTTTCGCTTTCGATCAACACCATTTT
CAACTCAGTGACTTGGGATTGTTTCCAAAAGATTCAACGATGGTGATT
CC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1B095TF 273 0 0
CTACAGCTTCATGTTTCCTATCACCTTCTTCCTCTTCTTCTTCGTTATCGCTAACTCCAC
GTTCGCTGGCAGTTTCGAACCCGTCGGAATCATCTCCGCCGACGATTTTCGCCTCCGTTG
TTTTGGGCGGCGACGAGGAAGAACGTGATGGATTTGGTTCTTCTATGACGGAGATTTCAT
CGTCGCTTTCGCTTTCGATCAACACCATTTTCAACTCAGTGACTTGGGATTGTTTCCAAA
AGATTCAACGATGGTGATTAACCGACGATCTCC

QA 1 273 1 273
DS 



AS 1 6

CO CL1090Contig1 714 6 6 U
GCTCAGTTTCCAATTATAACCAGCATCACTACAACAGAATGTGACAAGAAAATAATGCAA
CAAGAACAAAACACATATAATGTTTTACCACCAGTTTCTTCTTAAACTCAGAATTCATGC
GTGTCAAATTGAAAATACAAACGGAAACGGTAAAGAAATGCCAAACAACACTTTAGATCC
TATCGATATCCTCATCCTCAAACTCAACATAGTCTTCGGCCAGATTTTCCTCATCTTCTT
CAAGATCACCAACAATTCCTTCGTTAAGACGAGTATTCTCTGGAAGCTCACCATACGCCT
TGAGAAGCCTGGCCTCATCAGACATGTACTTGAGGATGACATCCGCTTTGTCATCTTGGT
AGTCTCTCAGACCAACAAGTATGATGTCACCTGCTGCAATCCAAACCTTCTTGTGCATTT
TACCACGGATATGGCAGAGGCGTTTAGTGCCATCGATGCACATACATTCACATCTTCCAT
TACCAAGCATACGAAGGACTTGAGCGTATTCTTGTCCATCTTCCTTGAATATAAGCTCTC
GCTTCTCGTCATCCGCTTCATTCTTTCCTCTCTTCCTGTTCTTTCCTCCCTTTCCCTTGT
TCTTCGGCATGGTAACACTAAGAAGAGATCAATTAACTGCTTGGCTGAGATAAGATTCGC
AAATTCCTCTTAGAAATTGGATCAAAGTTTTCTTCTCCTGCTGTGCGGCTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1G796JQ U 1
AF RS1FR76JQ U 73
AF RS1FT14JQ U 43
AF RS1FT14TF C 43
AF RS1FR76TF C 73
AF RS1G796TF C 88
BS 1 121 RS1G796JQ
BS 122 122 RS1FT14JQ
BS 123 490 RS1G796JQ
BS 491 559 RS1FT14JQ
BS 560 560 RS1FR76JQ
BS 561 714 RS1FT14JQ

RD RS1G796JQ 490 0 0
GCTCAGTTTCCAATTATAACCAGCATCACTACAACAGAATGTGACAAGAAAATAATGCAA
CAAGAACAAAACACATATAATGTTTTACCACCAGTTTCTTCTTAAACTCAGAATTCATGC
GCGTCAAATTGAAAATACAAACGGAAACGGTAAAGAAATGCCAAACAACACTTTAGATCC
TATCGATATCCTCATCCTCAAACTCAACATAGTCTTCGGCCAGATTTTCCTCATCTTCTT
CAAGATCACCAACAATTCCTTCGTTAAGACGAGTATTCTCTGGAAGCTCACCATACGCCT
TGAGAAGCCTGGCCTCATCAGACATGTACTTGAGGATGACATCCGCTTTGTCATCTTGGT
AGTCTCTCAGACCAACAAGTATGATGTCACCTGCTGCAATCCAAACCTTCTTGTGCATTT
TACCACGGATATGGCAGAGGCGTTTAGTGCCATCGATGCACATACATTCACATCTTCCAT
TACCAAGCAT

QA 1 490 1 490
DS 

RD RS1FR76JQ 554 0 0
G
CATATAATGTTTTACCACCAGTTTCTTCTTAAACTCAAAATTCATGCGTGTCAAATTGAA
AATACAAACGGAAACGGTAAAGAAATGCCAAACAACACTTTAAATCCTATCGATATCCTC
ATCCTCAAACTCAACATAGTCTTCGGCCAGATTTTCCTCATCTTCTTCAAGATCACCAAC
AATTCCTTCGTTAAAACGAGTATTCTCTGGAAGCTCACCATACGCCTTGAGAAGCCTGGC
CTCATCAAACATGTACTTGAGGATGACATCCGCTTTGTCATCTTGGTAGTCTCTCAAACC
AACAAGTATGATGTCACCTGCTGCAATCCAAACCTTCTTGTGCATTTTACCACGGATATG
GCAAAGGCGTTTAGTGCCATCGATGCACATACATTCACATCTTCCATTACCAAGCATACG
AAGGACTTGAGCGTATTCTTGTCCATCTTCCTTGAATATAAGCTCTCGCTTCTCGTCATC
CGCTTCATTCTTTCCTCTCTTCCTGTTCTTTCCTCCCTTTCCCTTGTTCTTCGGCATGGT
AACACTAA
AAAAA

QA 2 549 2 549
DS 

RD RS1FT14JQ 672 0 0
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TAAACTCAGAATTCATGCGTGTCAAATTGAAAATACAAACGGAAACGGTAAAGAAATGCC
AAACAACACTTTAGATCCTATCGATATCCTCATCCTCAAACTCAACATAGTCTTCGGCCA
GATTTTCCTCATCTTCTTCAAGATCACCAACAATTCCTTCGTTAAGACGAGTATTCTCTG
GAAGCTCACCATACGCCTTGAGAAGCCTGGCCTCATCAGACATGTACTTGAGGATGACAT
CCGCTTTGTCATCTTGGTAGCCTCTCAGACCAACAAGTATGATGTCACCTGCTGCAATCC
AAACCTTCTTGTGCATTTTACCACGGATATGGCAGAGGCGTTTAGTGCCATCGATGCACA
TACATTCACATCTTCCATTACCAAGCATACGAAGGACTTGAGCGTATTCTTGTCCATCTT
CCTTGAATATAAGCTCTCGCTTCTCGTCATCCGCTTCGTTCTTTCCTCTCTTCCTGTTCT
TTCCTCCCTTTCCCTTGTTCTTCGGCATGGTAACACTAAGAAGAGATCAATTAACTGCTT
GGCTGAGATAAGATTCGCAAATTCCTCTTAGAAATTGGATCAAAGTTTTCTTCTCCTGCT
GTGCGGCTGCCC

QA 1 672 1 672
DS 

RD RS1FT14TF 672 0 0
GACAAGAAAATAATGCAACAAGAACAAAACACATATAATGTTTTACCACCAGTTTCTTCT
TAAACTCAGAATTCATGCGTGTCAAATTGAAAATACAAACGGAAACGGTAAAGAAATGCC
AAACAACACTTTAGATCCTATCGATATCCTCATCCTCAAACTCAACATAGTCTTCGGCCA
GATTTTCCTCATCTTCTTCAAGATCACCAACAATTCCTTCGTTAAGACGAGTATTCTCTG
GAAGCTCACCATACGCCTTGAGAAGCCTGGCCTCATCAGACATGTACTTGAGGATGACAT
CCGCTTTGTCATCTTGGTAGCCTCTCAGACCAACAAGTATGATGTCACCTGCTGCAATCC
AAACCTTCTTGTGCATTTTACCACGGATATGGCAGAGGCGTTTAGTGCCATCGATGCACA
TACATTCACATCTTCCATTACCAAGCATACGAAGGACTTGAGCGTATTCTTGTCCATCTT
CCTTGAATATAAGCTCTCGCTTCTCGTCATCCGCTTCGTTCTTTCCTCTCTTCCTGTTCT
TTCCTCCCTTTCCCTTGTTCTTCGGCATGGTAACACTAAGAAGAGATCAATTAACTGCTT
GGCTGAGATAAGATTCGCAAATTCCTCTTAGAAATTGGATCAAAGTTTTCTTCTCCTGCT
GTGCGGCTGCCC

QA 1 672 1 672
DS 

RD RS1FR76TF 642 0 0
G
CATATAATGTTTTACCACCAGTTTCTTCTTAAACTCAGAATTCATGCGTGTCAAATTGAA
AATACAAACGGAAACGGTAAAGAAATGCCAAACAACACTTTAGATCCTATCGATATCCTC
ATCCTCAAACTCAACATAGTCTTCGGCCAGATTTTCCTCATCTTCTTCAAGATCACCAAC
AATTCCTTCGTTAAGACGAGTATTCTCTGGAAGCTCACCATACGCCTTGAGAAGCCTGGC
CTCATCAGACATGTACTTGAGGATGACATCCGCTTTGTCATCTTGGTAGTCTCTCAGACC
AACAAGTATGATGTCACCTGCTGCAATCCAAACCTTCTTGTGCATTTTACCACGGATATG
GCAGAGGCGTTTAGTGCCATCGATGCACATACATTCACATCTTCCATTACCAAGCATACG
AAGGACTTGAGCGTATTCTTGTCCATCTTCCTTGAATATAAGCTCTCGCTTCTCGTCATC
CGCTTCATTCTTTCCTCTCTTCCTGTTCTTTCCTCCCTTTCCCTTGTTCTTCGGCATGGT
AACACTAAGAAGAGATCAATTAACTGCTTGGTTGAGATAAGATTCGCAAATTCCTGTTGG
GAATTGGATCAACGTTTTCTTCTCGTGCTGTGCGGCTGCCC

QA 2 642 2 642
DS 

RD RS1G796TF 627 0 0
CCACCAGTTTCTTCTTAAACTCAGAATTCATGCGCGTCAAATTGAAAATACAAACGGAAA
CGGTAAAGAAATGCCAAACAACACTTTAGATCCTATCGATATCCTCATCCTCAAACTCAA
CATAGTCTTCGGCCAGATTTTCCTCATCTTCTTCAAGATCACCAACAATTCCTTCGTTAA
GACGAGTATTCTCTGGAAGCTCACCATACGCCTTGAGAAGCCTGGCCTCATCAGACATGT
ACTTGAGGATGACATCCGCTTTGTCATCTTGGTAGTCTCTCAGACCAACAAGTATGATGT
CACCTGCTGCAATCCAAACCTTCTTGTGCATTTTACCACGGATATGGCAGAGGCGTTTAG
TGCCATCGATGCACATACATTCACATCTTCCATTACCAAGCATACGAAGGACTTGAGCGT
ATTCTTGTCCATCTTCCTTGAATATAAGCTCTCGCTTCTCGTCATCCGCTTCATTCTTTC
CTCTCTTCCTGTTCTTTCCTCCCTTTCCCTTGTTCTTCGGCATGGTAACACTAAGAAGAG
ATCAATTAACTGCTTGGTTGAGATAAGATTCGCAAATTCCTGTTGGGAATTGGATCAACG
TTTTCTTCTCGTGCTGTGCGGCTGCCC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 6

CO CL1091Contig1 858 6 7 U
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ATCCTCAACAAAACCAATCTCTCATTTGTTCTTCTGCACAATCTCTATCACTTTATATTT
CTCCCTCTCCTTACATAAGGAAAGGTCGTAGAAGAAACCAAAAACTAACGAAAAGGGGTT
TTAATATAACTCATCTGTAAAAAAAACAAATATATATACAAAATGGGTGGTGTCAAGTTG
TTAATCATCTTTGGTCTCTTGATCTTAGCTATGGTAGCTACAACCGTCAATGCGACGTAC
CCTTTGACTAAATCTTGCTTCAACGGGCAAGGTTGTATCGGAGATGATGATGAACTAGAA
TCTCTAATGGATTCAGAGACAAACCGACGTCAACTCGCTAGAGGACGTCGTTACATTGGC
TACGATGCTCTTAAAAAGAATAATGTGCCTTGCAATAGACGTGGCCGGTCTTACTACGAT
TGCAAGAAGAGGAGAAGGAATAATCCTTATAGGCGTGGATGCAGTGCGATCACGCATTGC
TATAGATACGCTAAGTGATAACAAAATGATAGAGAAGAGGACTGGATTCAACACCGTTCA
ATCTTCATTCTTGATCGTTAATGATTTTTCTTCCGTAACGTACCCTATGATTCTAACTTT
ACAATTATTTTTGTTGTATTTACTTTCTTTATATAATCATATCATCATGATGCATATATA
AGCTTTTGATTCTTCGATATATCGAAGATTTTCTTTCGTTGTTGTCCTTTTCGTTTCGTT
CATATATTAAGTTCCGTCTGTCTATATATTATATACATCATGATGTTTTAGTATATCAAA
ATTAAACATTTGTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1G951TF U 1
AF RS1G951JQ C 257
AF RS1EO59TF U 54
AF RS1EO59JQ C 134
AF RS1A509JQ C 68
AF RS1A509TF U 122
BS 1 623 RS1G951TF
BS 624 824 RS1EO59TF
BS 825 828 RS1A509TF
BS 829 829 RS1A509JQ
BS 830 840 RS1A509TF
BS 841 841 RS1A509JQ
BS 842 858 RS1A509TF

RD RS1G951TF 623 0 0
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CTCCCTCTCCTTACATAAGGAAAGGTCGTAGAAGAAACCAAAAACTAACGAAAAGGGGTT
TTAATATAACTCATCTGTAAAAAAAACAAATATATATACAAAATGGGTGGTGTCAAGTTG
TTAATCATCTTTGGTCTCTTGATCTTAGCTATGGTAGCTACAACCGTCAATGCGACGTAC
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TCTCTAATGGATTCAGAGACAAACCGACGTCAACTCGCTAGAGGACGTCGTTACATTGGC
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TGCAAGAAGAGGAGAAGGAATAATCCTTATAGGCGTGGATGCAGTGCGATCACGCATTGC
TATAGATACGCTAAGTGATAACAAAATGATAGAGAAGAGGACTGGATTCAACACCGTTCA
ATCTTCATTCTTGATCGTTAATG

QA 1 623 1 623
DS 

RD RS1G951JQ 480 0 0
TCTTGATTTTAGCTATGGTAGCTACAACCGTCAATGCGACGTACCCTTTGACTAAATCTT
GCTTCAACGGGCAAGGTTGTATCGGAGATGATGATGAACTAGAATCTTTAATGGATTCAG
AGACAAACCGACGTCAACTCGCTAGAGGACGTCGTTACATTGGCTACGATGCTCTTAAAA
AGAATAATGTGCCTTGCAATAGACGTGGCCGGTCTTACTACGATTGCAAGAAGAGGAGAA
GGAATAATCCTTATAGGCGTGGATGCAGTGCGATCACGCATTGCTATAGATACGCTAAGT
GATAACAAAATGATAGAGAAGAGGACTGGATTCAACACCGTTCAATCTTCATTCTTGATC
GTTAATGATTTTTCTTCCGTAACGTACCCTATGATTCTAACTTTACAATTATTTTTGTTG
TATTTACTTTCTTTATATAATCATATCATCATGATGCATATATAAGCTTTTGATTCTTCG

QA 1 480 1 480
DS 

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TATATTTCTCCCTCTCCTTACATAAGGAAAGGTCGTAGAAGAAACCAAAAACTAACGAAA
AGGGGTTTTAATATAACTCATCTGTAAAAAAAACAAATATATATACAAAATGGGTGGTGT
CAAGTTGTTAATCATCTTTGGTCTCTTGATCTTAGCTATGGTAGCTACAACCGTCAATGC
GACGTACCCTTTGACTAAATCTTGCTTCAACGGGCAAGGTTGTATCGGAGATGATGATGA
ACTAGAATCTCTAATGGATTCAGAGACAAACCGACGTCAACTCGCTAGAGGACGTCGTTA
CATTGGCTACGATGCTCTTAAAAAGAATAATGTGCCTTGCAATAGACGTGGCCGGTCTTA
CTACGATTGCAGGAAGAGGAGAAGGAATAATCCTTATAGGCGTGGATGCAGTGCGATCAC
GCATTGCTATAGATACGCTAAGTGATAACAAAATGATAGAGAAGAGGACTGGATTCAACA
CCGTTCAATCTTCATTCTTGATCGTTAATGATTTTTCTTCCGTAACGTACCCTATGATTC
TAACTTTACAATTATTTTTGTTGTATTTACTTTCTTTATATAATCATATCATCATGATGC
ATATATAAGCTTTTGATTCTTCGATATATCGAAGATTTTCTTTCGTTGTTGTCCTTTTCG
TTTCGTTCATATATTAAGTTCCGTCTGTCTATATATTATATACATCATGAT
ATTTTAGT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RS1EO59JQ 699 0 0
CATAAGGAAAGGTCGTAGAAGAAACCAAAAACTAACGAAAAGGGGTTTTAATATAACTCA
TCTGTAAAAAAAACAAATATATATACAAAATGGGTGGTGTCAAGTTGTTAATCATCTTTG
GTCTCTTGATCTTAGCTATGGTAGCTACAACCGTCAATGCGACGTACCCTTTGACTAAAT
CTTGCTTCAACGGGCAAGGTTGTATCGGAGATGATGATGAACTAGAATCTCTAATGGATT
CAGAGACAAACCGACGTCAACTCGCTAGAGGACGTCGTTACATTGGCTACGATGCTCTTA
AAAAGAATAATGTGCCTTGCAATAGACGTGGCCGGTCTTACTACGATTGCAGGAAGAGGA
GAAGGAATAATCCTTATAGGCGTGGATGCAGTGCGATCACGCATTGCTATAGATACGCTA
AGTGATAACAAAATGATAGAGAAGAGGACTGGATTCAACACCGTTCAATCTTCATTCTTG
ATCGTTAATGATTTTTCTTCCGTAACGTACCCTATGATTCTAACTTTACAATTATTTTTG
TTGTATTTACTTTCTTTATATAATCATATCATCATGATGCATATATAAGCTTTTGATTCT
TCGATATATCGAAGATTTTCTTTCGTTGTTGTCCTTTTCGTTTCGTTCATATATTAAGTT
CCGTCTGTCTATATATTATATACATCATGAT
ATTTTAGT

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DS 

RD RS1A509JQ 791 0 0
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TCCTTACATAAGGAAAGGTCGTAGAAGAAACCAAAAACTAACGAAAAGGGGTTTTAATAT
AACTCATCTGTAAAAAAAACAAATATATATACAAAATGGGTGGTGTCAAGTTGTTAATCA
TCTTTGGTCTCTTGATCTTAGCTATGGTAGCTACAACCGTCAATGCGACGTACCCTTTGA
CTAAATCTTGCTTCAACGGGCAAGGTTGTATCGGAGATGATGATGAACTAGAATCTCTAA
TGGATTCAGAGACAAACCGACGTCAACTCGCTAGAGGACGTCGTTACATTGGCTACGATG
CTCTTAAAAAGAATAATGTGCCTTGCAATAGA*GTGGCCGGTCTTACTACGATTGCAAGA
AGAGGAGAAGGAATAATCCTTATAGGCGTGGATGCAGTGCGATCACGCATTGCTATAGAT
ACGCTAAGTGATAACAAAATGATAGAGAAGAGGACTGGATTCAACACAGTTCAATCTTCA
TTCTTGATCGTTAATGATTTTTCTTCCGTAACGTACCCTATGATTCTAACTTTACAATTA
TTTTTGTTGTATTTACTTTCTTTATATAATCATATCATCATGATGCATATATAAGCTTTT
GATTCTTCGATATATCGGCTATTTTCTTTCGTTGTTGTCCTTTTCGTTTCGTTCATATAT
TAAGTTCCGTTTGTCTATATATTATATACATCATGATGTTTTAGTATATCAAAATTAAAC
ATTTGTTTTCC

QA 1 791 1 791
DS 

RD RS1A509TF 737 0 0
TCCCTCTCCTTACATAAGGAAAGGTCGTAGAAGAAACCAAAAACTAACGAAAAGGGGTTT
TAATATAACTCATCTGTAAAAAAAACAAATATATATACAAAATGGGTGGTGTCAAGTTGT
TAATCATCTTTGGTCTCTTGATCTTAGCTATGGTAGCTACAACCGTCAATGCGACGTACC
CTTTGACTAAATCTTGCTTCAACGGGCAAGGTTGTATCGGAGATGATGATGAACTAGAAT
CTCTAATGGATTCAGAGACAAACCGACGTCAACTCGCTAGAGGACGTCGTTACATTGGCT
ACGATGCTCTTAAAAAGAATAATGTGCCTTGCAATAGA*GTGGCCGGTCTTACTACGATT
GCAAGAAGAGGAGAAGGAATAATCCTTATAGGCGTGGATGCAGTGCGATCACGCATTGCT
ATAGATACGCTAAGTGATAACAAAATGATAGAGAAGAGGACTGGATTCAACACAGTTCAA
TCTTCATTCTTGATCGTTAATGATTTTTCTTCCGTAACGTACCCTATGATTCTAACTTTA
CAATTATTTTTGTTGTATTTACTTTCTTTATATAATCATATCATCATGATGCATATATAA
GCTTTTGATTCTTCGATATATCGGCTATTTTCTTTCGTTGTTGTCCTTTTCGTTTCGTTC
ATATATTAAGTTCCGTTTGTCTATATATTATATACATCATGATGTTT*AGTATATCAAA*
TTAAACATTTGTTTTCC

QA 1 737 1 737
DS 



AS 2 5

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TGGAAAAGACGAGGAGTATGACTCAATGCTTGGTATTGTGAGGGAAACTCCATCAGAACT
TAAACACCCTAACAACATAGGGCCCGAGAAGCCAAAAATTCTCCAAACCTGAACTGATTT
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TTTATGTTCTGGTCTCTGGTTTGAATAGTGGTGGGTAGAGTACAATAAAGTAGAGTGAAT
TTACAGCTTTGGAGAAACTTTTGCTCGACTTTTCTTCATGGTTTCTTAGGGATGAATGGT
ATTGTCAGATCAAATTATGAATGCTACTACTTTGTTGTCTGT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RS1AZ52JQ C 1
AF RS1AZ52TF U 1
BS 1 1 RS1AZ52JQ
BS 2 518 RS1AZ52TF
BS 519 522 RS1AZ52JQ

RD RS1AZ52JQ 522 0 0
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AATTGATTTTATCCCAAAGTCAGCTGAAAACTACTCAAACCTCGCGAAGGTTCACGCTGC
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TGGAAAAGACGAGGAGTATGACTCAATGCTTGGTATTGTGAGGGAAACTCCATCAGAACT
TAAACACCCTAACAACATAGGGCCCGAGAAGCCAAAAATTCTCCAAACCTGAACTGATTT
TTTCTGGGGTATGTTTTCTGATCGAAACCTTGATAGTATGTATGGGATGTCTCGAGAAGA
TTTATGTTCTGGTCTCTGGTTTGAATAGTGGTGGGTAGAGTACAATAAAGTAGAGTGAAT
TTACAGCTTTGGAGAAACTTTTGCTCGACTTTTCTTCATGGTTTCTTAGGGATGAATGGT
ATTGTCAGATCAAATTATGAATGCTACTACTTTGTTGTCTGT

QA 1 522 1 522
DS 

RD RS1AZ52TF 522 0 0
G
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GAGAATGCAAAGCCACTAAATGCGATCGAGTTTGAGAAGGTTCTACGCAAGAGGCATGCT
GGAAAAGACGAGGAGTATGACTCAATGCTTGGTATTGTGAGGGAAACTCCATCAGAACTT
AAACACCCTAACAACATAGGGCCCGAGAAGCCAAAAATTCTCCAAACCTGAACTGATTTT
TTCTGGGGTATGTTTTCTGATCGAAACCTTGATAGTATGTATGGGATGTCTCGAGAAGAT
TTATGTTCTGGTCTCTGGTTTGAATAGTGGTGGGTAGAGTACAATAAAGTAGAGTGAATT
TACAGCTTTGGAGAAACTTTTGCTCGACTTTTCTTCATGGTTTCTTAGGGATGAATGGTA
TTGTCAGATCAAATTATGAATGCTACTACTTTGTTGT
CTGT

QA 2 518 2 518
DS 



CO CL1092Contig2 1006 3 6 U
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AATGCTTGGTATTGTGAGAGAAACTCCACCAGAGCTTAAACTCCCTAACAACATAGGGCC
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AACCTTGATATTATGTATGGATTTTCTCAAGAAGATTATGTTCTGGTCTCTGGTTTGAAT
AATGGCGGGTAGAGTACAATAAAAGTAGAGTGAATTTACAGCTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DN31TF U 37
AF RS1C063TF U 1
AF RS1C063JQ C 224
BS 1 685 RS1C063TF
BS 686 686 RS1C063JQ
BS 687 736 RS1C063TF
BS 737 737 RS1C063JQ
BS 738 746 RS1C063TF
BS 747 1006 RS1C063JQ

RD RS1DN31TF 579 0 0
GG
GACGAAGACCAATGGGAACCCTAGGCAGAGCATTCTACTCCGTCGGATTTTGGATCCGTG
AGACCGGCCAGGCTCTCGATCGCCTCGGATGTCGCCTTCAAGGCAAAA*CTGCTTCCGAG
AACAACTATCAAGGCATCGGACGCTGATGAACGTATTCGATAAGGCTCCGGTTGTGGATA
AGGAAGCTTTTGTAGCACCAAGCGCCTCAGTCATTGGGAACGTCCAGGTCGGAAGAGGAT
CGTCTATTTGGTATGGATGCGTACTACGAGGAGATGTGAACACCATTAGTGTTGGATCAG
GGACGAATATTCAGGACAACTCCCTTGTGCACGTGGCGAAATCTAACTTGAGCGGGAAGG
TCCCTGCAACCATCATCGGAGACAATGTAACCATTGGTCATAGTGCTGTTTTACATGGAT
GTACTGTTGAGGATGAGGCTTTTATCGGGAGGGGAGCGACGGTTCTGGACGGTGTCGTGG
TTGAGAAGCATGCTCTGGTTGCTGCTGGTGCGCTTGTGCGACAAAACACTAGAATTCCTT
CCGGAGAGATATGGGGAGGCAACCCAGCGAAGTTCCT

QA 3 579 3 579
DS 

RD RS1C063TF 752 0 0
GGACTGTAGATTCCCTCGCCTGTGGACTCTAGGAAGGTGACGAAGACCAATGGGAACCCT
AGGCAGAGCATTCTACTCCGTCGGATTTTGGATCCGTGAGACCGGCCAGGCTCTCGATCG
CCTCGGATGTCGCCTTCAAGGCAAAAACTGCTTCCGAGAACAACTATCAAGGCATCGGAC
GCTGATGAACGTATTCGATAAGGCTCCGGTTGTGGATAAGGAAGCTTTTGTAGCACCAAG
CGCCTCAGTCATTGGGAACGTCCAGATCGGAAGAGGATCGTCTATTTGGTATGGATGCGT
ACTACGAGGAGATGTGAACACCATTAGTGTTGGATCAGGGACGAATATTCAGGACAACTC
CCTTGTGCACGTGGCAAAATCGAACTTGAGCGGGAAGGTCCCTGCAACCATCATCGGAGA
CAATGTGACCATTGGTCATAGTGCTGTTTTACATGGATGTACTGTTGAGGATGAGGCTTT
TATCGGGATGGGAGCGACGGTTCTGGACGGTGTCGTGGTTGAGAAGCATGCCCTGGTTGC
TGCTGGTGCGCTTGTGCGACAAAACACTAGAATTCCTTCCGGAGAGATATGGGGAGGCAA
CCCAGCAAAGTTCCTCAGGAAGCTCAAGAGTAAGGAAATTGATTTTATCCCAAAGTCAGC
TGAAAACTACTCAAACCTCGCGAAG*TTCACGCTGCAGAGAATGCAAAGCCACTAAATGC
GATCGAGTTTGAGAAG*TTCTACGCA
GAGCAT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1C063JQ 783 0 0
AGC
TTTGTAGCACCAAGCGCCTCAGTCATTGGGAACGTCCAGATCGGAAGAGGATCGTCTATT
TGGTATGGATGCGTACTACGAGGAGATGTGAACACCATTAGTGTTGGATCAGGGACGAAT
ATTCAGGACAACTCCCTTGTGCACGTGGCAAAATCGAACTTGAGCGGGAAGGTCCCTGCA
ACCATCATCGGAGACAATGTGACCATTGGTCATAGTGCTGTTTTACATGGATGTACTGTT
GAGGATGAGGCTTTTATCGGGATGGGAGCGACGGTTCTGGACGGTGTCGTGGTTGAGAAG
CATGCCCTGGTTGCTGCTGGTGCGCTTGTGCGACAAAACACTAGAATTCCTTCCGGAGAG
ATATGGGGAGGCAACCCAGCAAAGTTCCTCAGGAAGCTCAAGAGTAAGGAAATTGATTTT
ATCCCAAAGTCAGCTGAAAACTACTCAAACCTCGCGAAGGTTCACGCTGCAGAGAATGCA
AAGCCACTAAATGCGATCGAGTTTGAGAAGGTTCTACGCAAGAGGCATGCAGGAAAAGAC
GAGGAGTATGACTCAATGCTTGGTATTGTGAGAGAAACTCCACCAGAGCTTAAACTCCCT
AACAACATAGGGCCCGAGAAGCCAAGCGCCCTTCAAACCTGAACTGATTTTTTTTGGGGT
ATGTTTTCTGATCGAACCTTGATATTATGTATGGATTTTCTCAAGAAGATTATGTTCTGG
TCTCTGGTTTGAATAATGGCGGGTAGAGTACAATAAAAGTAGAGTGAATTTACAGCTTAG

QA 4 783 4 783
DS 



AS 2 4

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CTTACAGGTAAACATAATTTAAAAGTAAATAATTATATACTTCTGGGTATTTGTCAAAAA
CAAATTTCCAATTACAAAGGGGATCATACTTATACGTTGTAAGTTGTAACTGTATTTTTA
TTAAATGTTGCATGATTAATCATTATAATTTAATAAAATTGAAAGCATTACACATAAATA
TATTGGCTTGTCAAAATCTTATACAATTGACTATTTTGCATGGGTTTTAAACTGAAATGC
TCCTGAAACAAACGAGTAGTGGGAGGGAATGTCCAATATTTTTGTAATGTGTTGTAATCC
C


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 

AF RS1EF41JQ U 1
AF RS1GF80JQ U 4
BS 1 301 RS1EF41JQ

RD RS1EF41JQ 301 0 0
CTTACAGGTAAACATAATTTAAAAGTAAATAATTATATACTTCTGGGTATTTGTCAAAAA
CAAATTTCCAATTACAAAGGGGATCATACTTATACGTTGTAAGTTGTAACTGTATTTTTA
TTAAATGTTGCATGATTAATCATTATAATTTAATAAAATTGAAAGCATTACACATAAATA
TATTGGCTTGTCAAAATCTTATACAATTGACTATTTTGCATGGGTTTTAAACTGAAATGC
TCCTGAAACAAACGAGTAGTGGGAGGGAATGTCCAATATTTTTGTAATGTGTTGTAATCC
C

QA 1 301 1 301
DS 

RD RS1GF80JQ 298 0 0
ACAGGTAAACATAATTTAAAAGTAAATAATTATATACTTCTGTGTATTTGTCAAAAACAA
ATTTCCAATTACAAAGTGGATCATACTTATACTTTGTAAGTTGTAACTGTATTTTTATTA
AATGTTGCATGATTAATCATTATAATTTAATAAAATTGAAAGCATTACACATAAATATAT
TGGCTTGTCAAAATCTTATACAATTGACTATTTTGCATGTGTTTTAAACTGAAATGCTCC
TGAAACAAACGAGTAGTGGGAGGGAATGTCCAATATTTTTGTAATGTGTTGTAATCCC

QA 1 298 1 298
DS 



CO CL1093Contig2 298 2 1 U
GGGATTACAACACATTACAAAAATATTGGACATTCCCTCCCACTACTCGTTTGTCTCAGG
AGCATTTCAGTCTAAAACACATGCAAAATAGTCAATTGTATAAGATTTTGACAAGCCAAT
ATATTTATGTGTAATGCTCTCAATTTTATTAAATTATAATGATTAATCATGCAACATTTA
ATAAAAATACAGTTACAACTTACAACGTATAAGTATGATCCACTTTGTAATCGGAAATTT
GTTTTTGACAAATACACAGAAGTATATAATTATCTACTTTTAAATTATGTTTACCTGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1EF41TF U 1
AF RS1GF80TF U 1
BS 1 298 RS1EF41TF

RD RS1EF41TF 298 0 0
GGGATTACAACACATTACAAAAATATTGGACATTCCCTCCCACTACTCGTTTGTCTCAGG
AGCATTTCAGTCTAAAACACATGCAAAATAGTCAATTGTATAAGATTTTGACAAGCCAAT
ATATTTATGTGTAATGCTCTCAATTTTATTAAATTATAATGATTAATCATGCAACATTTA
ATAAAAATACAGTTACAACTTACAACGTATAAGTATGATCCACTTTGTAATCGGAAATTT
GTTTTTGACAAATACACAGAAGTATATAATTATCTACTTTTAAATTATGTTTACCTGT

QA 1 298 1 298
DS 

RD RS1GF80TF 298 0 0
GGGATTACAACACATTACAAAAATATTGGACATTCCCTCCCACTACTCGTTTGTCTCAGG
AGCATTTCAGTCTAAAACACATGCAAAATAGTCAATTGTATAAGATTTTGACAAGCCAAT
ATATTTATGTGTAATGCTCTCAATTTTATTAAATTATAATGATTAATCATGCAACATTTA
ATAAAAATACAGTTACAACTTACAACGTATAAGTATGATCCACTTTGTAATCGGAAATTT
GTTTTTGACAAATACACAGAAGTATATAATTATCTACTTTTAAATTATGTTTACCTGT

QA 1 298 1 298
DS 



AS 1 6

CO CL1094Contig1 1026 6 5 U
GGGTTTTCCAAAAAATCAATCCTCCTCCAGATCTGTCTCGAAGACCGTTTCCCTGAGAGC
CATGGAGAAACCGTACGGATACGCGAGCGTGAGCATGAGCGGCGTAGATCGCTCCGCCGG
GAAGGATATCGACTTGGAGATGGGAGGCGGAGAGGCGACGCTTTACCCTGGGCTAAGCTA
CGGAGAGAATCAGCTCCGCTGGGGATTCATCCGCAAGGTCTACGGGATTCTCTCCGCCCA
GCTCCTCCTTACCACGCTTATCTCCGCCGTCGTCGTCCTCAATCCTCCTGTCAACGATCT
CCTTACCGGATCTCCCGGACTCCTCCTCTTCCTCTGCATCATCCCTTTCGTCTTGATCTG
GCCTCTGCACGTTTACCACCAGAAGCATCCTGTTAACCTCATCCTCCTTGCCCTCTTCAC
TATCTCTTTGAGCTTCACCGTTGGCGTCAGCTGTGCCATGACTGAAGGAAGAATCGTCCT
TGAAGCCTTGATATTGACATTCTCCGTGGTGGGATCTCTAACCGCATACACTTTCTGGGC
TGCAAAGAAAGGAAAAGACTTCAGCTTCCTTGGACCCATTCTCTTCACCAGTCTCATCAT
TCTTGTGGTGACCAGCTTCATGCAGATGTTCTTCCCGCTTGGCCCAACCTCTGTTGCCAT
ATATGGAGGAATCAGCGCGCTGGTGTTCTGCGGGTACATAGTCTATGATACGGACAATCT
CATCAAGCGTTTCACATATGATGAATACATCCTTGCATCGGTGGCTCTCTACTTGGATAT
CCTCAATCTCTTCTTGACCATTTTGCGTATTCTGAGGCAAGGTGACAACTAAAGAAGCCA
CAGATAAGATGAAGTTTCAGTGATGGGATTTTATAAACCCAAGGCATCTATGTGATTTAC
ATTTGTGTGTATATCTGACTTTATGTTTCGAGTTTTTTTT*ACTATATGCTGCTATGTGG
TTAAACGTTTGGTAAAACAAAGTCAAGCGAAGTGAAAATTTCAATGTTAAATAAATTTGT
TAAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 

AF RS1EU50TF U 1
AF RS1C135TF U 1
AF RS1DG81JQ C 691
AF RS1DG81TF U 691
AF RS1C135JQ C 271
AF RS1EU50JQ C 351
BS 1 703 RS1C135TF
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BS 705 743 RS1C135TF
BS 744 961 RS1DG81TF
BS 962 1026 RS1C135JQ

RD RS1EU50TF 605 0 0
GGGTTTCCA
AAAAAATCAATCCTCCTCCAGATCTGTCTCGAAGACCGTTTCCCTGAGAGCCATGGAGAA
ACCGTACGGATACGCGAGCGTGAGCATGAGCGGCGTAGATCGCTCCGCCGGGAAGGATAT
CGACTTGGAGATGGGAGGCGGAGAGGCGACGCTTTACCCTGGGCTAAGCTACGGAGAGAA
TCAGCTCCGCTGGGGATTCATCCGCAAGGTCTACGGGATTCTCTCCGCCCAGCTCCTCCT
TACCACGCTTATCTCCGCCGTCGTCGTCCTCAATCCTCCTGTCAACGATCTCCTTACCGG
ATCTCCCGGACTCCTCCTCTTCCTCTGCATCATCCCTTTCGTCTTGATCTGGCCTCTGCA
CGTTTACCACCAGAAGCATCCTGTTAACCTCATCCTCCTTGCCCTCTTCACTATCTCTTT
GAGCTTCACCGTTGGCGTCAGCTGTGCCATGACTGAAGGAAGAATCGTCCTTGAAGCCTT
GATATTGACATTCTCCGTGGTGGGATCTCTAACCGCATACACTTTCTGGGCTGCAAAGAA
AGGAAAAGACTTCAGCTTCCTTGGACCCATTCTCTTCACCAGTCTCATCATTCTTG

QA 10 605 10 605
DS 

RD RS1C135TF 743 0 0
GGGTTTTCCAAAAAATCAATCCTCCTCCAGATCTGTCTCGAAGACCGTTTCCCTGAGAGC
CATGGAGAAACCGTACGGATACGCGAGCGTGAGCATGAGCGGCGTAGATCGCTCCGCCGG
GAAGGATATCGACTTGGAGATGGGAGGCGGAGAGGCGACGCTTTACCCTGGGCTAAGCTA
CGGAGAGAATCAGCTCCGCTGGGGATTCATCCGCAAGGTCTACGGGATTCTCTCCGCCCA
GCTCCTCCTTACCACGCTTATCTCCGCCGTCGTCGTCCTCAATCCTCCTGTCAACGATCT
CCTTACCGGATCTCCCGGACTCCTCCTCTTCCTCTGCATCATCCCTTTCGTCTTGATCTG
GCCTCTGCACGTTTACCACCAGAAGCATCCTGTTAACCTCATCCTCCTTGCCCTCTTCAC
TATCTCTTTGAGCTTCACCGTTGGCGTCAGCTGTGCCATGACTGAAGGAAGAATCGTCCT
TGAAGCCTTGATATTGACATTCTCCGTGGTGGGATCTCTAACCGCATACACTTTCTGGGC
TGCAAAGAAAGGAAAAGACTTCAGCTTCCTTGGACCCATTCTCTTCACCAGTCTCATCAT
TCTTGTGGTGACCAGCTTCATGCAGATGTTCTTCCCGCTTGGCCCAACCTCTGTTGCCAT
ATATGGAGGAATCAGCGCGCTGGTGTTCTGCGGGTACATAGTCCATGATACGGACAATCT
CATCAAGCGTTTCACATATGATG

QA 1 743 1 743
DS 

RD RS1DG81JQ 272 0 0
G
GGGTACATAGTCTATGATACGGACAATCTCATCAAGCGTTTCACATATGATGAATACATC
CTTGCATCGGTGGCTCTCTACTTGGATATCCTCAATCTCTTCTTGACCATTTTGCGTATT
CTGAGGCAAGGTGACAACTAAAGAAGCCACAGATAAGATGAAGTTTCAGTGATGGGATTT
TATAAACCCAAGGCATCTATGTGATTTACATTTGTGTGTATATCTGACTTTATGTTTCGA
GTTTTTTTT*ACTATATGCTGCTATGTGGT
C

QA 2 271 2 271
DS 

RD RS1DG81TF 272 0 0
G
GGGTACATAGTCTATGATACGGACAATCTCATCAAGCGTTTCACATATGATGAATACATC
CTTGCATCGGTGGCTCTCTACTTGGATATCCTCAATCTCTTCTTGACCATTTTGCGTATT
CTGAGGCAAGGTGACAACTAAAGAAGCCACAGATAAGATGAAGTTTCAGTGATGGGATTT
TATAAACCCAAGGCATCTATGTGATTTACATTTGTGTGTATATCTGACTTTATGTTTCGA
GTTTTTTTT*ACTATATGCTGCTATGTGGT
C

QA 2 271 2 271
DS 

RD RS1C135JQ 756 0 0
CGTCGTCCTCAATCCTCCTGTCAACGATCTCCTTACCGGATCTCCCGGACTCCTCCTCTT
CCTCTGCATCATCCCTTTCGTCTTGATCTGGCCTCTGCACGTTTACCACCAGAAGCATCC
TGTTAACCTCATCCTCCTTGCCCTCTTCACTATCTCTTTGAGCTTCACCGTTGGCGTCAG
CTGTGCCATGACTGAAGGAAGAATCGTCCTTGAAGCCTTGATATTGACATTCTCCGTGGT
GGGATCTCTAACCGCATACACTTTCTGGGCTGCAAAGAAAGGAAAAGACTTCAGCTTCCT
TGGACCCATTCTCTTCACCAGTCTCATCATTCTTGTGGTGACCAGCTTCATGCAGATGTT
CTTCCCGCTTGGCCCAACCTCTGTTGCCATATATGGAGGAATCAGCGCGCTGGTGTTCTG
CGGGTACATAGTCCATGATACGGACAATCTCATCAAGCGTTTCACATATGATGAATACAT
CCTTGCATCGGTGGCTCTCTACTTGGATATCCTCAATCTCTTCTTGACCATTTTGCGTAT
TCTGAGGCAAGGTGACAACTAAAGAAGCCACAGATAAGATGAAGTTTCAGTGATGGGATT
TTATAAACCCAAGGCATCTATGTGATTTACATTTGTGTGTATATCTGACTTTATGTTTCG
AGTTTTTTTT*ACTATATGCTGCTATGTGGTTAAACGTTTGGTAAAACAAAGTCAAGCGA
AGTGAAAATTTCAATGTTAAATAAATTTGTTAAAGC

QA 1 756 1 756
DS 

RD RS1EU50JQ 676 0 0
TCTTGATCTGGCCTCTGCACGTTTACCACCAGAAGCATCCTGTTAACCTCATCCTCCTTG
CCCTCTTCACTATCTCTTTGAGCTTCACCGTTGGCGTCAGCTGTGCCATGACTGAAGGAA
GAATCGTCCTTGAAGCCTTGATATTGACATTCTCCGTGGTGGGATCTCTAACCGCATACA
CTTTCTGGGCTGCAAAGAAAGGAAAAGACTTCAGCTTCCTTGGACCCATTCTTTTCACCA
GTCTCATCATTCTTGTGGTGACCAGCTTCATGCAGATGTTCTTCCCGCTTGGCCCAACCT
CTGTTGCCATATATGGAGGAATCAGCGCGTTGGTGTTCTGCGGGTACATAGTTTATGATA
CGGACAATCTCATCAAGCGTTTCACATATGATGAATACATCCTTGCATCTGTGGCTCTCT
ACTTGGATATCCTCAATCTCTTCTTGACCATTTTGCGTATTTTGAGGCAAGGTGACAACT
AAAGAAGCCACAGATAAGATGAAGTTTCAGTGATGGGATTTTATAAACCCAAGGCATCTA
TGTGATTTACATTTGTGTGTATATCTGACTTTATGTTTCGAGTTTTTTTTTACTATATGC
TGCTATGTGGTTAAACGTTTGGTAAAACAAAGTCAAGCGAAGTGAAAATTTCAATGTTAA
ATAAATTTGTTAAAGC

QA 1 676 1 676
DS 



AS 2 5

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GCAGAACATACTAGCTTATTTGGCTGTTCGAAATCTTCCAAAGAAAAAATATTCAAAGAC
ACAAGCTGAAGAGCTAAGTCTGGGGGATACCGAGAGTATATAAGTAACTCCATTATTTTA
CATCACTTAAAAGCTCCTCAATCTCAGTTATTAAATACACATAAAAGCTTAACCATTCCT
TCTACTTCCTCCAGCATCCTTCAGGTTCTTTTGCGTTTCACAGTTTTGATGTCGTTCGAA
ATGAAGTTAATCACTTCCTTCAGTGTTGCTTTCCTACCTTCTTTGAAGTTCCAAAGTTCT
GGGGTGGTGTATCGACCACTGGCATTATACTCATTCATCTCCTCGAGAGCTGTTTTAACA
GCGTTATGCACCTCTTCTCCCCACTCTCCTCTAAGCTTCTTCAGCTGCTCATCATCTTCG
TCCACCACTTCCTTTGCTTTGTCCCCGGTTCCTTCACGTTTGAACGGTTGCCACGAGGAG
TCCTTGAGGTTCTCTTGCCATGTAGAGCAAAGGGTGGCAGCTTCAACCGTAGCTTCATCT
TCCGAAAATCTCTTCTTGCAAACATTCAGGAAGGGCTTCTCATCAAGTTCTCCCATCCTC
TTGACCCCGATATCAGTTTCAGCACCCAACAACCCCGTCAAACCCGCAATGAGTTTCTTC
CGTGCTGCTTGTATCTCATCATTGCTTTGACGCTCTTTTGTCATCAAGGCTGAGTTCATC
TGCTCCAGCCCTTCTAACTCAGACTTCTTATCCTCCAGCTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CG78JQ U 22
AF RS1BO42JQ U 1
BS 1 48 RS1BO42JQ
BS 49 49 RS1CG78JQ
BS 50 131 RS1BO42JQ
BS 132 132 RS1CG78JQ
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BS 140 140 RS1CG78JQ
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BS 254 422 RS1BO42JQ
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BS 637 656 RS1BO42JQ
BS 657 657 RS1CG78JQ
BS 658 762 RS1BO42JQ

RD RS1CG78JQ 682 0 0
A
GCTGTTCGAAATCTTCCAAAGAAAAAATATTCAAAGACACAAGCTGAAGAGCTAAGTCTG
GGGGATACCGAGAGTATATAAGTAACTCCATTATTTTACATCACTTAAAAGCTCCTCAAT
CTCAGTTATTAAATACACATAAA*GCTTAACTATTCCTTCTACTTCCTCCAGCATCCTTC
AGGTTCTTTTGCGTTTCACAGTTTTGATGTCGTTCGAAATGAAGTTAATCACTTCCTTCA
GTGTTGCTTTCCTACCTTCTTTGAAGTTCCAAAGTTCTGGGGTGGTGTATCGACCACTTG
CATTATACTCATTCATCTCCTCGAGAGCTGTTTTAACAGCGTTATGCACCTCTTCTCCCC
ACTCTCCTTTAAGCTTCTTCAGCTGCTCATCATCTTCGTCCACCACTTCCTTTGCTTTGT
CCCCGGTTCCTTCACGTTTGAACGGTTGCCACGAGGAGTCCTTGAGGTTCTCTTGCCATG
TAGAGCAAAGGGTGGCAGCTTCAACCGTAGCTTCATCTTCCGAAAATCTCTTCTTGCAAA
CATTCAGGAAGGGCTTCTCATCAAGTTCTCCCATCCTCTTGACCCCGATATCAGTTTCGG
CACCCAACAATCCCGTCAGACCCGCAATGAGTTTCTTCCGTGCTGCTTGTATCTCATCAT
TGCTTTGACGTTCTTTTGTCA

QA 2 682 2 682
DS 

RD RS1BO42JQ 762 0 0
GCAGAACATACTAGCTTATTTGGCTGTTCGAAATCTTCCAAAGAAAAA*TATTCAAAGAC
ACAAGCTGAAGAGCTAAGTCTGGGGGATACCGAGAGTATATAAGTAACTCCATTATTTTA
CATCACTTAAA*GCTCCTCCATCTCAGTTATTAAATACACATAAAAGCTTAACCATTCCT
TCTACTTCCTCCCGCATCCTTCAGGTTCTTTTGCGTTTCACAGTTTTGATGTCGTTCGAA
ATGAAGTTAATCGCTTCCTTCAGTGTTGCTTTCCTACCTTCTTTGAAGTTCCAAAGTTCT
GGGGTGGTGTATCGACCACTGGCATTATACTCATTCATCTCCTCGAGAGCTGTTTTAACA
GCGTTATGCACCTCTTCTCCCCACTCTCCTCTAAGCTTCTTCAGCTGCTCATCATCTTCG
TCTACCACTTCCTTTGCTTTGTCCCCGGTTCCTTCACGTTTGAACGGTTGCCACGAGGAG
TCCTTGAGGTTCTCTTGCCATGTAGAGCAAAGGGTGGCAGCTTCAACCGTAGCTTCATCT
TCCGAAAATCTCTTCTTGCAAACATTCAGGAAGGGCTTCTCATCAAGTTCTCCCATCCTC
TTGACCCCGATATCAGTTTCAGCACCCAACAACCCTGTCAAACCCGCAATGAGTTTTTTC
CGTGCTGCTTGTATCTCATCATTGCTTTGACGCTCTTTTGTCATCAAGGCTGAGTTCATC
TGCTCCAGCCCTTCTAACTCAGACTTCTTATCCTCCAGCTCA

QA 1 762 1 762
DS 



CO CL1095Contig2 1481 3 21 U
GGCGGTGTCCAAAGCCTATGGTTGGTGTGCACGTGCGGAAGACTATCACTCTGGAGGGCC
GATTGGTGAGTACCTCACCAAGGAAGGGAAGCTGAGAACCGTTTCAGATATTTCTCAAGA
AAAAGCGGAGGATAGGAACAGTGTTCTTGATAAACTCTCGGATATCATTGCTATGACGAA
TGAAGATCTGAACAAGGTTCAGTACAGTTACAACAAGACGGCCATGTCACTGCAGAGGGT
CTTAGACGAGAAGAAAACCTTGCACGAGGCTTATGCTAACGAAACAAAGAAGATGCAGCA
GATGTCGATTCTCAGTATCCAGAAGATCCTTAACGATAAAGAGAGGCTAAGCAATGAACT
GGAGAAGAAGATGCAGAAACTATCGGAATGGTCCAAAGCGTTGGACAAAAAGGAAGCACT
AACTGAACTGGAGAGGCAAAAGCTTGATGAAGAGAAGAAAAAGAATGATGCTATGAACAT
CTCCCTCCAGTTAGCCTCCCACGAGCAGAAAAAGGCTGACGAGAGCGTTCTGAGACTAGT
CGAAGAGCACAAGAGGCAAAAAGAAGAGGCTTTGAGCAAGATCCTTCAGCTTGAGACTCA
GCTAGACACCAAACAGACACTGGAAATGGAGATTCAAGAGCTGAAAGCGAAATTACAAGT
GATGAAGCATTTGGGGGATGATGATGACGAGGCGGTCAAGCAGAAAATGAAGGAGATGAA
TGATGAGCTGGAGGATAAGAAGTCTGAGTTAGAAGGGCTGGAGCAGATGAACTCAGCCTT
GATGACAAAAGAACGTCAAAGCAATGATGAGATACAAGCAGCACGGAAGAAACTCATTGC
GGGTTTGACAGGGTTGTTGGGTGCTGAAACTGATATCGGGGTCAAGAGGATGGGAGAACT
TGATGAGAAGCCCTTCCTGAATGTTTGTAAGAAGAGATTTTCGGAAGATGAAGCTACGGT
TGAAGCTGCCACCCTTTGCTCTACATGGCAAGAGAACCTCAAGGATTCGTCATGGCAACC
ATTCAAACGTGAAGGAACCGGGGACAAAGCAAAGGAAGTGGTGGACGAAGATGATGAGCA
GCTGAAGAAGCTTAAAGGAGAGTGGGGAGAGGAGGTGCATAACGCTGTTAAAACAGCTCT
CGAGGAGATGAATGAGTATAATGCAAGTGGCCGATACACCACCCCAGAACTTTGGAACTT
CAAAGAAGGTAGGAAAGCAACACTGAAGGAAGTGATTAACTTCATTTCGAACGACATCAA
AACTGTGAAACGCAAAAGAACCTGAAGGATGCGGGAGGAAGTAGAAGGAATGGTTAAGCT
TTATGTGTATTTAATAACTGAGTTTGAGGAGCTTTAAGTAATGTAAAATAATGGAGTTAC
TTGTATACTCTCGGTGTCCCCCAGACTTAGCTCTTCAGCTTGTAGCTTTGAATATTTTCT
TTGGAAGATTTCGAACAGCTAAATAAGCTAATGTGTTTTTC


BQ
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AF RS1DH25TF U 1
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BS 794 827 RS1BO42TF
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GATTGGTGAGTACCTCACCAAGGAAGGGAAGCTGAGAACCGTTTCAGATATTTCTCAAGA
AAAAGCGGAGGATAGGAACAGTGTTCTTGATAAACTCTCGGATATCATTGCTATGACGAA
TGAAGATCTGAACAAGGTTCAGTACAGTTACAACAAGACGGCCATGTCACTGCAGAGGGT
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GATGTCGATTCTCAGTATCCAGAAGATCCTTAACGATAAAGAGAGGCTAAGCAATGAACT
GGAGAAGAAGATGCAGAAACTATCGGAATGGTCCAAAGCGTTGGACAAAAAGGAGGCACT
AACTGAACTGGAGAGGCAAAAGCTTGATGAAGAGAAGAAAAAGAATGATGCTATGAACAT
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CGAAGAGCATAAGAGGCAAAAAGAAGAGGCTTTGAGCAAGATCCTTCAGCTTGAGACTCA
GCTAGACACCAAACAGACACTTGAAATGGAGATTCAAGAGCTGAAAGC*AAATTACAAGT
GATGAAGCATTTGGGGGATGATGATGACGAGGCGGTCAAGCAGAAAATGAAG*AGATGAA
TGATGAGCTGGAGGATA*GAAGTCTGAGT*AGAAGG*CTGGAGCAGATGA
CTCAGCC

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DS 

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GGTCCAAAGCGTTGGACAAAAAGGAAGCACTAACTGAACTGGAGAGGCAAAAGCTTGATG
AGGAGAAGAAAAAGAATGATGCTATGAACATCTCCCTCCAGTTAGCCTCCCATGAGCAGA
AAAAGGCTGACGAGAGCGTTCTGAGACTAGTCGAAGAGCACAAGAGGCAAAAAGAAGAGG
CTTTGAGCAAGATCCTTCAGCTTGAGACTCAGCTAGACACCAAACAGACACTGGAAATGG
AGATTCAAGAGCTGAAAGGGAAATTACAAGTGATGAAGCATTTGGGGGATGATGATGACG
AGGCGGTCAAGCAGAAAATGAAGGAGATGAATGATGAGCTGGAGGATAAGAAGTCTGAGT
TAGAAGGGCTGGAGCAGATGAACTCAGCCTTGATGACAAAAGAGCGTCAAAGCAATGATG
AGATACAAGCAGCACGGA

QA 1 498 1 498
DS 

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ATGAATGATGAGCTGGAGGATAAGAAGTCTGAGTTAGAAGGGCTGGAGCAGATGAACTCA
GCCTTGATGACAAAAGAACGTCAAAGCAATGATGAGATACA*GCAGCACGGAAGAAACTC
ATTGCGGGTTTGACAGGGTTGTTGGGTGCTGAAACTGATATCGGGGTCAAGAGGATGGGA
GAACTTGATGAGAAGCCCTTCCTGAATGTTTGTAAGAAGAGATTTTCGGAAGATGAAGCT
ACGGTTGAAGCTGCCACCCTTTGCTCTACATGGCAAGAGAACCTCAAGGATTCGTCATGG
CAACCATTCAAACGTGAAGGAACCGGGGACAAAGCAAAGGAAGTGGTGGACGAAGATGAT
GAGCAGCTGAAGAAGCTTAAAGGAGAGTGGGGAGAGGAGGTGCATAACGCTGTTAAAACA
GCTCTCGAGGAGATGAATGAGTATAATGCAAGTGGCCGATACACCACCCCAGAACTTTGG
AACTTCAAAGAAGGTAGGAAAGCAACACTGAAGGAAGTGATTAACTTCATTTCGAACGAC
ATCAAAACTGTGAAACGCAAAAGAACCTGAAGGATGCGGGAGGAAGTAGAAGGAATGGTT
AAGCTTTATGTGTATTTAATAACTGAGTTTGAGGAGCTTTAAGTAATGTAAAATAATGGA
GTTACTTGTATACTCTCGGTGTCCCCCAGACTTAGCTCTTCAGCTTGTAGCTTTGAATAT
TTTCTTTGGAAGATTTCGAACAGCTAAATAAGCTAATGTGTTTTTC

QA 1 826 1 826
DS 



AS 2 6

CO CL1096Contig1 1552 4 8 U
GTCATCGGCCATGTCGACTCTGGAAAATCGACCACCACTGGTCACTTGATCTACAAGCTC
GGTGGTATCGACAAGCGTGTAATCGAGAGGTTCGAGAAGGAAGCCGCTGAGATGAACAAG
AGGTCTTTCAAGTACGCGTGGGTGTTGGACAAACTTAAGGCCGAGCGTGAGCGTGGTATC
ACCATTGATATTGCTCTGTGGAAGTTCGAGACCACCAAGTACTACTGCACGGTCATTGAT
GCTCCTGGACATCGTGATTTCATCAAGAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGT
GCTGTCCTCATCATTGACTCCACCACTGGTGGTTTCGAAGCTGGTATCTCCAAGGATGGT
CAGACCCGTGAGCATGCTCTTCTTGCTTTCACCCTTGGTGTCAAGCAAATGATTTGCTGT
TGTAACAAGATGGATGCTACTACTCCTAAGTACTCCAAGGCTAGGTACGATGAAATCATC
AAGGAGGTGTCTTCCTACTTGAAGAAGGTCGGATACAACCCTGACAAAATCCCATTCGTC
CCCATCTCCGGGTTCGAGGGTGACAACATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTAC
AAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCTGGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGACCCTCAGAC
AAGCCCCTCCGTCTCCCACTTCAGGATGTCTACAAGATCGGTGGTATTGGAACGGTGCCA
GTTGGACGTGTTGAGACTGGTATGCTCAAGCCTGGTATGGTTGTCACCTTCGCTCCTTCA
GGGTTGACCACTGAGGTTAAATCTGTCGAGATGCACCACGAGTCTCTTGTGGAGGCACTT
CCAGGTGACAACGTTGGATTCAATGTTAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTCAAGCGTGGG
TATGTTGCATCCAACTCCAAGGATGACCCTGCTAAGGGAGCTGCCAACTTCACATCCCAG
GTCATCATCATGAACCACCCTGGTCAGATCGGTAACGGATACGCCCCAGTTCTCGATTGC
CACACGTCCCACATTGCAGTCAAGTTCTCTGAGATCTCGACCAAGATTGACAGGCGATCT
GGTAAGGAGATCGAGAAGGAGCCCAAGTTTTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTTAAG
ATGACTCCGACCAAGCCCATGGTTGTCGAGACTTTCTCTGAGTACCCACCGTTGGGACGT
TTCGCTGTTAGGGACATGAGGCAGACCGTTGCTGTTGGTGTCATCAAGAGTGTTGACAAG
AAGGACCCAACCGGTGCCAAGGTCACCAAGGCCGCAGTGAAGAAGGGAGCCAAATGATGA
GACTTCTCTCGTCTTTGTGTTTTCTTTTTGCTTTTAAGAAAAACTTTGATGGCGTTTGAG
CCTTTGTTCTTTTATTTTCTGTTTCTTTCTCATCTCTACCTCCTTTTTGCATATCTCTGA
GACTTGTGGGTTTACAATTATGCAGTTTTCTGGATAATTTTTCCTAATGTGTTTTAGCGT
TCCGTTGTGCTACTCATTAATTTTCTTTCTTCTTGAATGCCCTTGTTAAATT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BL37TF U 1
AF RS1DC42TF U 305
AF RS1DC42JQ C 773
AF RS1BL37JQ C 809
BS 1 673 RS1BL37TF
BS 674 1061 RS1DC42TF
BS 1062 1062 RS1DC42JQ
BS 1063 1101 RS1DC42TF
BS 1102 1453 RS1DC42JQ
BS 1454 1454 RS1BL37JQ
BS 1455 1499 RS1DC42JQ
BS 1500 1552 RS1BL37JQ

RD RS1BL37TF 673 0 0
GTCATCGGCCATGTCGACTCTGGAAAATCGACCACCACTGGTCACTTGATCTACAAGCTC
GGTGGTATCGACAAGCGTGTAATCGAGAGGTTCGAGAAGGAAGCCGCTGAGATGAACAAG
AGGTCTTTCAAGTACGCGTGGGTGTTGGACAAACTTAAGGCCGAGCGTGAGCGTGGTATC
ACCATTGATATTGCTCTGTGGAAGTTCGAGACCACCAAGTACTACTGCACGGTCATTGAT
GCTCCTGGACATCGTGATTTCATCAAGAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGT
GCTGTCCTCATCATTGACTCCACCACTGGTGGTTTCGAAGCTGGTATCTCCAAGGATGGT
CAGACCCGTGAGCATGCTCTTCTTGCTTTCACCCTTGGTGTCAAGCAAATGATTTGCTGT
TGTAACAAGATGGATGCTACTACTCCTAAGTACTCCAAGGCTAGGTACGATGAAATCATC
AAGGAGGTGTCTTCCTACTTGAAGAAGGTCGGATACAACCCTGACAAAATCCCATTCGTC
CCCATCTCCGGGTTCGAGGGTGACAACATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTAC
AAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCTGGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGACCCTCAGAC
AAGCCCCTCCGTC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RS1DC42TF 797 0 0
GGCTC
ATCATTGACTCCACCACTGGTGGTTTCGAAGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGT
GAGCATGCTCTTCTTGCTTTCACCCTTGGTGTCAAGCAAATGATTTGCTGTTGTAACAAG
ATGGATGCTACTACTCCTAAGTACTCCAAGGCTAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTG
TCTTCCTACTTGAAGAAGGTCGGATACAACCCTGACAAAATCCCATTCGTCCCCATCTCC
GGGTTCGAGGGTGACAACATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCA
ACTCTCCTTGAGGCTCTGGACCAGATCAACGAGCCCAAGATACCCTCAGACAAGCCCCTC
CGTCTCCCACTTCAGGATGTCTACAAGATCGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTTGGACGT
GTTGAGACTGGTATGCTCAAGCCTGGTATGGTTGTCACCTTCGCTCCTTCAGGGTTGACC
ACTGAGGTTAAATCTGTCGAGATGCACCACGAGTCTCTTGTGGAGGCACTTCCAGGTGAC
AACGTTGGATTCAATGTTAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTCAAGCGTGGGTATGTTGCA
TCCAACTCCAAGGATGACCCTGCTAAGGGAGCTGCCAACTTCACATCCCAGGTCATCATC
ATGAACCACCCTGGTCAGATCGGTAACGGATACGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACGTCC
CACATTGCAGTCAAGTTCTCTGAGATCTCGAC*AAGATTGACAGGCGATCTGGTAAGGAG
ATCGAGAAGGAG

QA 6 797 6 797
DS 

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CTCCTTCAGGGTTGACCACTGAGGTTAAATCTGTCGAGATGCACCACGAGTCTCTTGTGG
AGGCACTTCCAGGTGACAACGTTGGATTCAATGTTAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTCA
AGCGTGGGTATGTTGCATCCAACTCCAAGGATGACCCTGCTAAGGGAGCTGCCAACTTCA
CATCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCAGATCGGTAACGGATACGCCCCAGTTC
TCGATTGCCACACGTCCCACATTGCAGTCAAGTTCTCTGAGATCTCGACCAAGATTGACA
GGCGATCTGGTAAGGAGATCGAGAAGGAGCCCAAGTTTTTGAAGAATGGTGATGCTGGTA
TGGTTAAGATGACTCCGACCAAGCCCATGGTTGTCGAGACTTTCTCTGAGTACCCACCGT
TGGGACGTTTCGCTGTTAGGGACATGAGGCAGACCGTTGCTGTTGGTGTCATCAAGAGTG
TTGACAAGAAGGACCCAACCGGTGCCAAGGTCACCAAGGCCGCAGTGAAGAAGGGAGCCA
AATGATGAGACTTCTCTCGTCTTTGTGTTTTCTTTTTGCTTTTAAGAAAAACTTTGATGG
CGTTTGAGCCTTTGTTCTTTTATTTTCTGTTTCTTTCTCATCTCTACCTCCTTTTTGCAT
ATCTCTGAGACTTGTGGGTTTGCAATTATGCAGTTTTCTGGATAATTTTTCCTAATGTGT
TTTAGCG

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1BL37JQ 744 0 0
AGATGCACCACGAGTCTCTTGTGGAGGCACTTCCAGGTGACAACGTTGGATTCAATGTTA
AGAATGTTGCTGTCAAGGATCTCAAGCGTGGGTATGTTGCATCCAACTCCAAGGATGACC
CTGCTAAGGGAGCTGCCAACTTCACATCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCAGA
TCGGTAACGGATACGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACGTCCCACATTGCAGTCAAGTTCT
**GAGATCTTGACCGAGATTGACAGGCGATCTGGTAAGGAGATCGAGAAGGAGCCCAAGT
TTTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTTAAGATGACTCCGACCAAGCCCATGGTTGTCG
AGACTTTCTCTGAGTACCCATCGTTGGGACGTTTCGCTGTTAGGGACATGAGGCAGACCG
TTGCTGTTGGTGTCATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGTGCCAAGGTCACCA
AGGCCGCAGTGAAGAAGGGAGCCAAATGATGAGACTTCTCTCGTCTTTGTGTTTTCTTTT
TGCTTTTAAGAAAAACTTTGATGGCGTTTGAGCCTTTGTTCTTTTATTTTCTGTTTCTTT
CTCATCTCTACCTCCTTTTTGCATATCTCTGAGACTTGTGGGTTTACAATTATGCAGTTT
TCTGGATAATTTTTCCTAATGTGTTTTAGCGTTCCGTTGTGCTACTCATTAATTTTCTTT
CTTCTTGAATGCCCTTGTTAAATT

QA 1 744 1 744
DS 



CO CL1096Contig2 623 2 2 U
GGTTCTCATTTACTCCTCTCCACTCAGTTTCGTAGCCGCATCTCGCATTCTTACTTGCAG
CTATGGGTAAAGAGAAGTTCCACATCAACATCGTGGTCATCGGCCATGTCGACTCTGGAA
AATCGACCACCACCGGTCACTTGATCTACAAGCTCGGTGGTATCGACAAGCGTGTCATCG
AGAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCATTCAAGTACGCGTGGGTGC
TGGACAAACTTAAGGCCGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGATATCGCTCTCTGGAAGT
TCGAGACCACCAAGCACTACTGCACGGTCATTGACGCTCCTGGACATCGTGATTTCATCA
AGAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTTCTTATCATTGACTCCACCA
CCGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCTAAGGACGGTCAGACCCGTGAGCATGCTCTTCTTG
CTTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATTTGCTGCTGTAACAAGATGGATGCTACTACCC
CTAAGTACTCCAAGGCTAGGTACGATGAGATCATCAAGGAGGCGTCTTCCTACTTGAAGA
ACGTTGGGTACAACCCTGACAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D832TF U 1
AF RS1DR73TF U 1
BS 1 598 RS1D832TF
BS 599 623 RS1DR73TF

RD RS1D832TF 598 0 0
GGTTCTCATTTACTCCTCTCCACTCAGTTTCGTAGCCGCATCTCGCATTCTTACTTGCAG
CTATGGGTAAAGAGAAGTTCCACATCAACATCGTGGTCATCGGCCATGTCGACTCTGGAA
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TGGACAAACTTAAGGCCGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGATATCGCTCTCTGGAAGT
TCGAGACCACCAAGCACTACTGCACGGTCATTGACGCTCCTGGACATCGTGATTTCATCA
AGAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTTCTTATCATTGACTCCACCA
CCGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCTAAGGACGGTCAGACCCGTGAGCATGCTCTTCTTG
CTTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATTTGCTGCTGTAACAAGATGGATGCTACTACCC
CTAAGTACTCCAAGGCTAGGTACGATGAGATCATCAAGGAGGCGTCTTCCTACTTGAA

QA 1 598 1 598
DS 

RD RS1DR73TF 623 0 0
GGTTCTCATTTACTCCTCTCCACTCAGTTTCGTAGCCGCATCTCGCATTCTTACTTGCAG
CTATGGGTAAAGAGAAGTTCCACATCAACATCGTGGTCATCGGCCATGTCGACTCTGGAA
AATCGACCACCACCGGTCACTTGATCTACAAGCTCGGTGGTATCGACAAGCGTGTCATCG
AGAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCATTCAAGTACGCGTGGGTGC
TGGACAAACTTAAGGCCGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGATATCGCTCTCTGGAAGT
TCGAGACCACCAAGCACTACTGCACGGTCATTGACGCTCCTGGACATCGTGATTTCATCA
AGAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTTCTTATCATTGACTCCACCA
CCGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCTAAGGACGGTCAGACCCGTGAGCATGCTCTTCTTG
CTTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATTTGCTGCTGTAACAAGATGGATGCTACTACCC
CTAAGTACTCCAAGGCTAGGTACGATGAGATCATCAAGGAGGCGTCTTCCTACTTGAAGA
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QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 6

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CAATAAATGCAAAAGAAAAAGATGTAACAATATCTTTAGCAAACGATAGAAATTATTATT
TTGCAATGTACAAAGATCTATAATGAGCAGTGGAATAGTTTACATTCTCGCAAATACAAC
AGTTGGTCACTTTGAACGGCTTTGCTTCTCCTCGATACCAGATTGAGAGAAGCGTTTCCT
AAGAACTTCAAGAACATCTTCAAACTTGACATCCCTTTTAGACAGAAGTACCATCGCATG
GTACAACACATCCGCCATCTCTGATGCTGTTCTTGATACTTCCTCCTTATCCTCAAGTGT
TCTGCATAACTCGTCTGCTTCTTCCCTGATCTTTGAGCAAAGCAGAGCATCATCGGTCAA
TAACCGTTGAGTCCATGACGGTTTGCCTTCTTGAGGAACTGTTGATTCCTCCTTCCGCTT
TGAAATGATTGATTCTAACGAGTACAATGTTGTTGATGCTAGCTTGTCTCCTGAAGCCTC
ATCATTGTTTAATTGATCCAAAACTGATGTGTAGTAACAAGTCTCTGCCCCTGTGTGACA
AGTAGGCCCATCTGGTGTTCCAAGGTAAATTATCGAATCACGATCACAGTCAAGGTAAAC
ATCAAGGACATTGATGAAGTTATTTGATGTCTCTCCCTTAGTCCATAAAGTAGACCTTGA
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CTTATCATTAGAAGCGAATACGACACTACTGGATCTGCTTCTTTGCTTAGCATCTCTAAT
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CGAAGGTGGCGGCGGGATTAAAGAGAAAAAAACCCTAATTGTTCTCACCGATGATTGAGT
TTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1FD47JQ U 1
AF RS1DO74JQ U 81
AF RS1EZ27JQ U 81
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RD RS1FD47JQ 596 0 0
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QA 1 596 1 596
DS 

RD RS1DO74JQ 662 0 0
GG
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QA 3 662 3 662
DS 

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GA
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GATGCTGTTCTTGATACTTCCTCCTTATCCTCAAGTGTTCTGCATAACTCGTCTGCTTCT
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TACAATGTTGTTGATGCTAGCTTGTCTCCTGAAGCCTCATCATTGTTTAATTGATCCAAA
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QA 3 721 3 721
DS 

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QA 1 684 1 684
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TATCGAATCACGATCACAGTCAAGGTAAACATCAAGGACATTGATGAAGTTATTTGATGT
CTCTCCCTTAGTCCATAAAGTAGACCTTGATCGACTGAAGAAAGTAGCTTTACGAGTAGT
GATTGTTGTGGAGAGAGCCTCTCTGTTAGCAAAGCCTTGCATTAACACAGCTCCAGTGTC
AACGTTTTGTGCTATTGCCACAGCTAATCCCTTGTCATCCCATTTTATGCGGTCCAACAA
CTTATCTACCTTAGCTTGAAGAGCAATGTTCTTATCATTAGAAGCGAATACGACACTACT
GGATCTGCTTCTTTGCTTAGCATCTCTAATGCACAAGGCTTTTGGGGTGAAGCAGCAGCT
ACTCCTCCCCTGTAGAGACTGTGCTAATGCATTGTACGATATCGCCATCTAACGAGATGC
GAATCGTGGACGGTTTATATATAGAGGGGACGAAGGTGGCGGCGGGATTAAAGAGAAAAA
AACCCTAATTGTTCTCACCGATGA

QA 1 624 1 624
DS 

RD RS1EZ27TF 670 0 0
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GCCTCATCATTGTTTAATTGATCCAAAACTGATGTGTAGTAACAAGTCTCTGCCCCTGTG
TGACAAGCAGGCCCATCTGGTGTTCCAAGGTAAATTATCGAATCACGATCACAGTCAAGG
TAAACATCAAGGACATTGATGAAGTTATTTGATGTCTCTCCCTTAGTCCATAAAGTAGAC
CTTGATCGACTGAAGAAAGTAGCTTTACGAGTAGTGATTGTTGTGGAGAGAGCCTCTCTG
TTAGCAAAGCCTTGCATTAACACAGCTCCAGTGTCAACGTTTTGTGCTATTGCCACAGCT
AATCCCTTGTCATCCCATTTTATGCGGTCCAACAACTTATCTACCTTAGCTTGAAGAGCA
ATGTTCTTATCATTAGAAGCGAATACGACACTACTGGATCTGCTTCTTTGCTTAGCATCT
CTAATGCACAAGGCTTTTGGGATGAAGCAGCAGCTACTCCTCCCCTGTAGAGACTGTGCT
AATGCATTGTACGATATCGCCATCTAACGAGATGCGAATCGTGGACGGTTTATATATAGA
GGGGACGAAGGTGGCGGCGGGATTAAAGAGAAAAAAACCCTAATTGTTCTCACCGATGAT
TGAGTTTGTC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 2 6

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AGTGACACAACCATATAGGTGGTTTTATTCTAAGCATTTAGTCTACTTACTTTATATAAG
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GCTTTATGAAATTGAAATCATTTCATTTAGTCGCTGTCGCTACCGCTGCTGCTTCCACTC
TCATTGCCACTTCCATTCCCATCCTTCTTCTTCTTCTTGTGCTCATTTTGCTTCTTATGT
TTCTTCTCTCCATTGTAATGAACGTTCCTAGGCCGTAATCACCTTTGTTTGTCTCATGAG
TTTTCTTCTGGTGCTGTCCTAAGAGCTTACCATGTCCATGGCCCTTGTTAGCCTCTTGGC
TCTTGTACCCTAAAAACGTCCCTAAGCCGTTCTGATCCTTTTGGGCATTTTTACCCTTGA
ACAGCCCATCAAGAAACCCACCGTGGCTACGGTAATTCAGAGTCGGGCTTTTCCCATATA
CTGGGCGGGTCTGGCTCTGGCCATATCCCTGGTGGTGGTTCTGACCATTAGCCTGGCGAC
TCTGGGCTTGAGCCACATCGTAGTATTCTTTTCCACGTGTTTCGTAGTACTGCATTGTGG
TTGAGAAGAGCTGAGTTTTATGTTTTCAATTTGCGCTGTGTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E891JQ U 26
AF RS1E891TF C 1
BS 1 27 RS1E891TF
BS 28 516 RS1E891JQ
BS 517 705 RS1E891TF

RD RS1E891JQ 491 0 0
GA
TTCATAGTAGTGAAGCTCATATAACACATGCAGAGTGACACAACCATATAGGTGGTTTTA
TTCTAAGCATTTAGTCTACTTACTTTATATAAGTCTCTCTTTATTCTAAGTATTACGTTT
ACTTACTTTATACAGTCTTTCTTATAGCATCAGGCTTTATGAAATTGAAATCATTTCATT
TAGTCGCTGTCGCTACCGCTGCTGCTTCCACTCTCATTGCCACTTCCATTCCCATCCTTC
TTCTTCTTCTTGTGCTCATTTTGCTTCTTATGTTTCTTCTCTCCATTGTAATGAACGTTC
CTAGGCCGTAATCACCTTTGTTTGTCTCATGAGTTTTCTTCTGGTGCTGTCCTAAGAGCT
TACCATGTCCATGGCCCTTGTTAGCCTCTTGGCTCTTGTACCCTAAAAACGTCCCTAAGC
CGTTCTGATCCTTTTGGGCATTTTTACCCTTGAACAGCCCATCAAGAAACCCACCGTGGC
TACGGTAAT

QA 3 491 3 491
DS 

RD RS1E891TF 705 0 0
GGTTTGGAGCAAAAGTTAGAAAGTAGATTCATAGTAGTGAAGCTCATATAACACATGCAG
AGTGACACAACCATATAGGTGGTTT*ATTCTAAGCATTTAGTCTACTTACTTTATATAAG
TCTCTCTTTATTCTAAGTATTACGTTTACTTACTTTATACAGTCTTTCTTATAGCATCAG
GCTTTATGAAATTGAAATCATTTCATTTAGTCGCTGTCGCTACCGCTGCTGCTTCCACTC
TCATTGCCACTTCCATTCCCATCCTTCTTCTTCTTCTTGTGCTCATTTTGCTTCTTATGT
TTCTTCTCTCCATTGTAATGAACGTTCCTAGGCCGTAATCACCTTTGTTTGTCTCATGAG
TTTTCTTCTGGTGCTGTCCTAAGAGCTTACCATGTCCATGGCCCTTGTTAGCCTCTTGGC
TCTTGTACCCTAGAAACGTCCCTAAGCCGTTCTGATCCTTTTGGGCATTTTTACCCTTGA
ACAGCCCATCAAGAAACCCACCGTGGCTACGGTAATTCAGAGTCGGGCTTTTCCCATATA
CTGGGCGGGTCTGGCTCTGGCCATATCCCTGGTGGTGGTTCTGACCATTAGCCTGGCGAC
TCTGGGCTTGAGCCACATCGTAGTATTCTTTTCCACGTGTTTCGTAGTACTGCATTGTGG
TTGAGAAGAGCTGAGTTTTATGTTTTCAATTTGCGCTGTGTGTCC

QA 1 705 1 705
DS 



CO CL1098Contig2 686 4 5 U
GACACACAGCACAGATTGGAAACATAAAACTCAGCTCTTCTCAACCACAATGCAGTACTA
CGAAACACGTGGAAAAGAATACTACGATGTGGCTCAAGCCCAGAGTCGCCAGGCTAATGG
TCAGAACCACCACCAGGGATATGGCCAGAGCCAGACCCGCCCAGTATATGGGAAAAGCCC
GACTCTGAATTACCGTAGCCACGGTGGGTTTCTTGATGGGCTGTTCAAGGGTAAAAATGC
CCAAAAGGATCAGAACGGCTTAGGGACGTTTCTAGGGCACAAGAGCCAAGAGGCTAACAA
GGGCCATGGACATGGTAAGCTCTTAGGACAGCACCAGAAGAAAACTCATGAGACAAACAA
AGGTGTTAATGGCCTAGGAACGTTCACTAACAATGGAGAGAAGAAACATAAGAAGCAAAA
TGAGCACAAGAAGAAGAAGAACAAGGATGGGCATGGCAGTGGCAATGAGAGTGGAAGCAG
CAGCGGTAGCGACAGCGACTAAATGAAATGATTT*CATAAAGCCTGATGCTATAAGAAAG
ACTGTATAAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAAACTTATATAAAGTAAGTA
GACTAAATGCTTAGAATAAAACCACTTAGATGGTTGTGTCTCTCTGCATGTGTTATATGA
GCTTCACTACTATGAATCTAATTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 
25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1H274TF U 1
AF RS1C295TF U 482
AF RS1C295JQ C 93
AF RS1DZ66JQ C 475
BS 1 428 RS1H274TF
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BS 430 646 RS1H274TF
BS 647 676 RS1C295JQ
BS 677 686 RS1DZ66JQ

RD RS1H274TF 646 0 0
GACACACAGCACAGATTGGAAACATAAAACTCAGCTCTTCTCAACCACAATGCAGTACTA
CGAAACACGTGGAAAAGAATACTACGATGTGGCTCAAGCCCAGAGTCGCCAGGCTAATGG
TCAGAACCACCACCAGGGATATGGCCAGAGCCAGACCCGCCCAGTATATGGGAAAAGCCC
GACTCTGAATTACCGTAGCCACGGTGGGTTTCTTGATGGGCTGTTCAAGGGTAAAAATGC
CCAAAAGGATCAGAACGGCTTAGGGACGTTTCTAGGGCACAAGAGCCAAGAGGCTAACAA
GGGCCATGGACATGGTAAGCTCTTAGGACAGCACCAGAAGAAAACTCATGAGACAAACAA
AGGTGTTAATGGCCTAGGAACGTTCACTAACAATGGAGAGAAGAAACATAAGAAGCAAAA
TGAGCACAGGAAGAAGAAGAACAAGGATGGGCATGGCAGTGGCAATGAGAGTGGAAGCAG
CAGCGGTAGCGACAGCGACTAAATGAAATGATTT*CATAAAGCCTGATGCTATAAGAAAG
ACTGTATAAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAAACTTATATAAAGTAAGTA
GACTAAATGCTTAGAATAAAACCACTTAGATGGTTGTGTCTCTCTG

QA 1 646 1 646
DS 

RD RS1C295TF 136 0 0
AGCGGTAGCGACAGCGACTAAATGAAATGATTTTCATAAAGCCTGATGCTATAAGAAAGA
CTGTATAAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAAACTTATATAAAGTAAGTAG
ACTAAATGCTTAGAAT

QA 1 136 1 136
DS 

RD RS1C295JQ 584 0 0
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AGACCCGCCCAGTATATGGGAAAAGCCCGACTCTGAATTACCGTAGCCACGGTGGGTTTC
TTGATGGGCTGTTCAAGGGTAAAAATGCCCAAAAGGATCAGAACGGCTTAGGGACGTTTC
TAGGGCACAAGAGCCAAGAGGCTAACAAGGGCCATGGACATGGTAAGCTCTTAGGACAGC
CCCAGAAGAAAACTCATGAGACAAACAAAGGTGTTAATGGCCTAGGAACGTTCACTAACA
ATGGAGAGAAGAAACATAAGAAGCAAAATGAGCACAAGAAGAAGAAGAACAAGGATGGGC
ATGGCAGTGGCAATGAGAGTGGAAGCAGCAGCGGTAGCGACAGCGACTAAATGAAATGAT
TT*CATAAAGCCTGATGCTATAAGAAAGACTGTATAAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGA
ATAAAGAGAAACTTATATAAAGTAAGTAGACTAAATGCTTAGAATAAAACCACTTAGATG
GTTGTGTCTCTCTGCATGTGTTATATGAGCTTCACTACTATGAA

QA 1 584 1 584
DS 

RD RS1DZ66JQ 212 0 0
AAGCAGCAGCGGTAGCGACAGCGACTAAATGAAATGATTT*CATATAGCCTGATGCTATA
AGAAAGACTGTATAAAGTAAGTAAACGTAATACTTAGAATAAAGAGAAACTTATATAAAG
TAAGTAGACTAAATGCTTAGAATAAAACCACTTAGATGGTTGTGTCTCTCTGCATGTGTT
ATATGAGCTTCACTACTATGAATCTAATTTCT

QA 1 212 1 212
DS 



AS 1 6

CO CL1099Contig1 890 6 16 U
GGATGTGCGTCTCTCTCCCGGTTTCATTCGTCACCTCAAAGGCTAAAACTGAATCTCTCT
TTCGAATTCAAATAACGAGGCTCCGTCCGACAGATCTCGCCGGCGTTTCACAATGGATAA
TCCTATTCAAGAGATTCTGGAGAAGCAGCTTCTGACGGTGGCGAAAGCGATGGAGGACAA
GCTCGACGAGGAGATCGCGTCGCTGGAAAAGCCCGACGAGGACGATCTGGAGGTTTTGAG
GGAGAGGAGGCTGCAGCAGATGAAGAGAATGGCGGAGAAAAAGAAACGTTGGATGAGTCA
TGGACACGGAGAATACACCGAGATCCCATCGGAGAAAGACTTCTTCGCCGCCGTCAAGGC
CAGCGAACGCGTCGTCTGCCATTTCTACCGCGAGAATTGGCCTTGCAAAGTGATGGATAA
GCACTTGGGTATATTGGCAAAGCAGCACATTGAGACACGTTTTGTGAAGATCCAAGCTGA
GAAAAGTCCCTTCTTGGCTGAGAGGCTCAAGATTGTGGTTCTTCCCACTCTTGCACTCAT
CAAGAACACTAAAGTGGATGATTATGTGGTTGGGTTCAATGAGCTGGGAGGGAAAGACGA
TTTCAGCACCGAGGATCTGGAAGAGAGATTAGCTAGAGCTCAAGTCATCCATTACGAGGG
AGAATCATCTCATAAACCAAAGTCTACTACACAAACCAAGAGGAGCGTCAGGCAGAGTGC
TCGTTCAGATTCTGACTCTGATGAATAAATCCCAAGTCACTATCTTCACCTTTTCTTGTG
TCTCTGCTATATGTAAAAGAGGAATATATACGATCTTGCTCCTAAGTTGTATTGAACGCA
TTAAGTTGTGATCTGTAATTTGATTCTATGGATTTTGACCTTTCCTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CS35TF U 1
AF RS1EX14TF U 30
AF RS1CS35JQ C 94
AF RS1AQ93JQ C 270
AF RS1AQ93TFB U 270
AF RS1F856TF U 442
BS 1 555 RS1CS35TF
BS 556 557 RS1EX14TF
BS 558 613 RS1CS35TF
BS 614 614 RS1EX14TF
BS 615 659 RS1CS35TF
BS 660 660 RS1EX14TF
BS 661 663 RS1CS35TF
BS 664 664 RS1EX14TF
BS 665 697 RS1CS35TF
BS 698 711 RS1EX14TF
BS 712 712 RS1AQ93TFB
BS 713 797 RS1EX14TF
BS 798 798 RS1AQ93TFB
BS 799 822 RS1EX14TF
BS 823 880 RS1AQ93TFB
BS 881 890 RS1F856TF

RD RS1CS35TF 697 0 0
GGATGTGCGTCTCTCTCCCGGTTTCATTCGTCACCTCAAAGGCTAAAACTGAATCTCTCT
TTCGAATTCAAATAACGAGGCTCCGTCCGACAGATCTCGCCGGCGTTTCACAATGGATAA
TCCTATTCAAGAGATTCTGGAGAAGCAGCTTCTGACGGTGGCGAAAGCGATGGAGGACAA
GCTCGACGAGGAGATCGCGTCGCTGGAAAAGCCCGACGAGGACGATCTGGAGGTTTTGAG
GGAGAGGAGGCTGCAGCAGATGAAGAGAATGGCGGAGAAAAAGAAACGTTGGATGAGTCA
TGGACACGGAGAATACACCGAGATCCCATCGGAGAAAGACTTCTTCGCCGCCGTCAAGGC
CAGCGAACGCGTCGTCTGCCATTTCTACCGCGAGAATTGGCCTTGCAAAGTGATGGATAA
GCACTTGGGTATATTGGCAAAGCAGCACATTGAGACACGTTTTGTGAAGATCCAAGCTGA
GAAAAGTCCCTTCTTGGCTGAGAGGCTCAAGATTGTGGTTCTTCCCACTCTTGCACTCAT
CAAGAACACTAAAGT**ATGATTATGTGGTTGGGTTCAATGAGCTGGGAGGGAAAGACGA
TTTCAGCACCGAG*ATCTGGAAGAGAGATTAGCTAGAGCTCAAGTCATCCATTACGAGG*
AGA*TCATCTCATAAACCAAAGTCTACTACACAAACC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RS1EX14TF 793 0 0
GG
CACCTCAAAGGCTAAAACTGAATCTCTCTTTCGAATTCAAATAACGAGGCTCCGTCCGAC
AGATCTCGCCGGCGTTTCACAATGGATAATCCTATTCAAGAGATTCTGGAGAAGCAGCTT
CTGACGGTGGCGAAAGCGATGGAGGACAAGCTCGACGAGGAGATCGCGTCGCTGGAAAAG
CCCGACGAGGACGATCTGGAGGTTTTGAGGGAGAGGAGGCTGCAGCAGATGAAGAGAATG
GCGGAGAAAAAGAAACGTTGGATGAGTCATGGACACGGAGAATACACCGAGATCCCATCG
GAGAAAGACTTCTTCGCCGCCGTCAAGGCCAGCGAACGCGTCGTCTGCCATTTCTACCGC
GAGAACTGGCCTTGCAAAGTGATGGATAAGCACTTGGGTATATTGGCAAAGCAGCACATT
GAGACACGTTTTGTGAAGATCCAAGCTGAGAAAAGTCCCTTCTTGGCTGAGAGGCTCAAG
ATTGTGGTTCTTCCCACTCTTGCACTCATCAAGAACACTAAAGTGGATGATTATGTGGTT
GGGTTCAATGAGCTGGGAGGGAAAGACGATTTCAGCACCGAGGATCTGGAAGAGAGATTA
GCTAGAGCTCAAGTCATCCATTACGAGGGAGAATTATCTCATAAACCAAAGTCTACTACA
CAAACCAAGAGGAGCGTCAG*CAGAGTGCTCGTTCAGATTCTGACTCTGATGAATAAATC
CCAAGTCACTATCTTCACCTTTTCTTGTGTCTCTGCTATATGTAAA*GAGGAATATATAC
GATCTTGCTCC

QA 3 793 3 793
DS 

RD RS1CS35JQ 740 0 0
AGATCTCGCGGCG
TTCACAATGGATAATCCTATTCAAGAGATTCTGGAGAAGCAGCTTCTGACGGTGGCGAAA
GCGATGGAGGACAAGCTCGACGAGGAGATCGCGTCGCTGGAAAAGCCCGACGAGGACGAT
CTGGAGGTTTTGAGGGAGAGGAGGCTGCAGCAGATGAAGAGAATGGCGGAGAAAAAGAAA
CGTTGGATGAGTCATGGACACGGAGAATACACCGAGATCCCATCGGAGAAAGACTTCTTC
GCCGCCGTCAAGGCCAGCGAACGCGTCGTCTGCCATTTCTACCGCGAGAATTGGCCTTGC
AAAGTGATGGATAAGCACTTGGGTATATTGGCAAAGCAGCACATTGAGACACGTTTTGTG
AAGATCCAAGCTGAGAAAAGTCCCTTCTTGGCTGAGAGGCTCAAGATTGTGGTTCTTCCC
ACTCTTGCACTCATCAAGAACACTAAAGT**ATGATTATGTGGTTGGGTTCAATGAGCTG
GGAGGGAAAGACGATTTCAGCACCGAGGATCTGGAAGAGAGATTAGCTAGAGCTCAAGTC
ATCCATTACGAGGGAGAATCATCTCATAAACCAAAGTCTACTACACAAACCAAGAGGAGC
GTCAGGCAGAGTGCTCGTTCAGATTCTGACTCTGATGAATAAATCCCAAGTCACTATCTT
CACCTTTTCTTGTGTCTCTGCTATATGTAAAAGAGGAATATATACGTTCTTGCTCCTGAG
TTGTATT

QA 14 740 14 740
DS 

RD RS1AQ93JQ 605 0 0
G
GGCGGAGAAAAAGAAACGTTGGATGAGTCATGGACACGGAGAATACACCGAGATCCCATC
GGAGAAAGACTTCTTCGCCGCCGTCAAGGCCAGCGAACGCGTCGTCTGCCATTTCTACCG
CGAGAATTGGCCTTGCAAAGTGATGGATAAGCACTTGGGTATATTGGCAAAGCAGCACAT
TGAGACACGTTTTGTGAAGATCCAAGCTGAGAAAAGTCCCTTCTTGGCTGAGAGGCTCAA
GATTGTGGTTCTTCCCACTCTTGCACTCATCAAGAACACTAAAGTGGATGATTATGTGGT
TGGGTTCAATGAGCTTGGAGGGAAAGACGATTTCAGCACCGAGGATCTGGAAGAGAGATT
AGCTAGAGCTCAAGTCATCCATTACGAGGGAGAATCATCTCATAAACCAAAGTCTACTAC
ACAAACCAAGAGGAGCGTCAGGCAGAGTGCTCGTTCAGATTCTGACTCTGATGAATAAAT
CCCAAGTCACTATCTTCACCTTTTCTTGTGTTTCTGCTATATGTAAAAGAGGAATATATA
CGTTCTTGCTCCTAAGTTGTATTGAACGCATTAAGTTGTGATCTGTAATTTGATTCTATG
GATT

QA 2 605 2 605
DS 

RD RS1AQ93TFB 613 0 0
G
GGCGGAGAAAAAGAAACGTTGGATGAGTCATGGACACGGAGAATACACCGAGATCCCATC
GGAGAAAGACTTCTTCGCCGCCGTCAAGGCCAGCGAACGCGTCGTCTGCCATTTCTACCG
CGAGAATTGGCCTTGCAAAGTGATGGATAAGCACTTGGGTATATTGGCAAAGCAGCACAT
TGAGACACGTTTTGTGAAGATCCAAGCTGAGAAAAGTCCCTTCTTGGCTGAGAGGCTCAA
GATTGTGGTTCTTCCCACTCTTGCACTCATCAAGAACACTAAAGTGGATGATTATGTGGT
TGGGTTCAATGAGCTTGGAGGGAAAGACGATTTCAGCACCGAGGATCTGGAAGAGAGATT
AGCTAGAGCTCAAGTCATCCATTACGAGGGAGAATCATCTCATAAACCAAAGTCTACTAC
ACAAACCAAGAGGAGCGTCAGGCAGAGTGCTCGTTCAGATTCTGACTCTGATGAATAAAT
CCCAAGTCACTATCTTCACCTTTTCTTGTGTCTCTGCTATATGTAAAAGAGGAATATATA
CGATCTTGCTCCTAAGTTGTATTGAACGCATTAAGTTGTGATCTGTAATTTGATTCTATG
GATTTTGACC
CC

QA 2 611 2 611
DS 

RD RS1F856TF 449 0 0
GCAGCACATTGAGACACGTTTTGTGAAGATCCAAGCTGAGAAAAGTCCCTTCTTGGCTGA
GAGGCTCAAGATTGTGGTTCTTCCCACTCTTGCACTCATCAAGAACACTAAAGTGGATGA
TTATGTGGTTGGGTTCAATGAGCTGGGAGGGAAAGACGATTTCAGCACCGAGGATCTGGA
AGAGAGATTAGCTAGAGCTCAAGTCATCCATTACGAGGGAGAATCATCTCATAAACCAAA
GTCTACTACACAAACCAAGAGGAGCGTCAGGCAGAGTGCTCGTTCAGATTCTGACTCTGA
TGAATAAATCCCAAGTCACTATCTTCACCTTTTCTTGTGTCTCTGCTATATGTAAAAGAG
GAATATATACGATCTTGCTCCTGAGTTGTATTGAACGCATTAAGTTGTGATCTGTAATTT
GATTCTATGGATTTTGACCTTTCCTTGCC

QA 1 449 1 449
DS 



AS 1 4

CO CL1100Contig1 1041 4 10 U
GGAAGCTTCAATCAAACGTGAAAAGACAGATCCGTGAGTTGTCTCTCTTCAAAGTTCAAA
CCAAAAGCTACTTGTCCGTCCCTTTGTTTCCGAGAGAGATGTCTGTCTTCGATGATTCTT
TCGTTATACTCGGAGACGATGCATCTGAGTCTGTTCCAGTCTCAGGCTCCTTCGACACCA
CCACTGATCATCACTCCTTCTCACACCACGTAGATGACTCCATCGACGATGTTTTCGCAG
CGCCGTCTTCCGACTACGGAGCTTACACTAACGCAGACGACGTCTTCGGATCCAACGGTG
GACACGACGGTCCCATCTTGCCACCGCCGTCGGAGATGAAATCTGATGAAGGGCATGCTC
TTAGGGAGTGGAGAAGACACAATGCAGTTCTCCTTGAGGAGAAGGAGAAGAAGGAAAAGG
AGTTACGGAACCAAATCATTGAAGAGGCTAATCAATTCAAAGAGGATTTCCATAAGAAGA
GGGAACTAACTTGTGAAAACAACAAAGCAGCTAATAGGGAGAAGGAAAAGCTATACATGG
AGACACAAGAGAAGTTCTACGCGGAAGCCAGCAAGAACTACTGGAAGGCAATCGCAGAGC
TAGTTCCTAAAGAAGTTCCAACCATAGAGAAAAGAAGAGGGAAGAAAGAGCAAGACCCTA
AGAAGCCAACTATTTCTGTCATTCAAGGTCCCAAACCCGGTAAGCCAACCGATCTCGCGA
GAATGAGACAGATTTTGCTCAAGCTCAAACAGAACCCACCAGCTCACCTGAAACTAGCTC
CTCAACCTCCACCAGAGGCGGCTGCTGCTGCTACTACTCCTACTCCTCCAAAGAATGCTC
CTGAAACCAAGCCCACCGAAGCAGTTGCTACTGCTTAAGAAACCCTCTTTGGTTTTGTTT
TTTTTTTCATTTGCTTACATCTATGTGATTCTCTCTTTGCATTTCATTATGTGTGTGTGA
TATAAACAGCTTATCTACTATCGGATTATACTCTATGACATTCATGTTTGAATTCAATAA
GAGGAGTGGTTAAACATAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 10 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DG85TF U 389
AF RS1BU88TF U 1
AF RS1BU88JQ C 299
AF RS1ER20JQ C 345
BS 1 507 RS1BU88TF
BS 508 508 RS1DG85TF
BS 509 642 RS1BU88TF
BS 643 643 RS1BU88JQ
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BS 964 964 RS1ER20JQ
BS 965 1041 RS1BU88JQ

RD RS1DG85TF 236 0 0
TCTCCTTGAGGAGAAGGAGAAGAAGGAAAAGGAGTTACGGAACCAAATCATTGAAGAGGC
TAATCAATTCAAAGAGGATTTCCATAAGAAGAGGGAACTAACTTGTGAAAACAACAAAGC
AGCTAATAGGGAGAAGGAAAAGCTATACATGGAGACACAAGAGAAGTTCTACGCGGAAGC
CAGCAAGAACTACTGGAAGGCAATCGCAGAGCTAGTTCCTAAAGAAGTTCCAACCA

QA 1 236 1 236
DS 

RD RS1BU88TF 683 0 0
GGAAGCTTCAATCAAACGTGAAAAGACAGATCCGTGAGTTGTCTCTCTTCAAAGTTCAAA
CCAAAAGCTACTTGTCCGTCCCTTTGTTTCCGAGAGAGATGTCTGTCTTCGATGATTCTT
TCGTTATACTCGGAGACGATGCATCTGAGTCTGTTCCAGTCTCAGGCTCCTTCGACACCA
CCACTGATCATCACTCCTTCTCACACCACGTAGATGACTCCATCGACGATGTTTTCGCAG
CGCCGTCTTCCGACTACGGAGCTTACACTAACGCAGACGACGTCTTCGGATCCAACGGTG
GACACGACGGTCCCATCTTGCCACCGCCGTCGGAGATGAAATCTGATGAAGGGCATGCTC
TTAGGGAGTGGAGAAGACACAATGCAGTTCTCCTTGAGGAGAAGGAGAAGAAGGAAAAGG
AGTTACGGAACCAAATCATTGAAGAGGCTAATCAATTCAAAGAGGATTTCCATAAGAAGA
GGGAACTAACTTGTGAAAACAACAAAGTAGCTAATAGGGAGAAGGAAAAGCTATACATGG
AGACACAAGAGAAGTTCTACGCGGAAGCCAGCAAGAACTACTGGAAGGCAATCGCAGAGC
TAGTTCCTAAAGAAGTTCCAACCATAGAGAAAAGAAGAGGGA*GAAAGAGCAAGACCCTA
AGAAGCCAACTATCTCTGTCATT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RS1BU88JQ 743 0 0
TGGACACGACGGTCCCATCTTGCCACCGCCGTCGGAGATGAAATCTGATGAAGGGCATGC
TCTTAGGGAGTGGAGAAGACACAATGCAGTTCTCCTTGAGGAGAAGGAGAAGAAGGAAAA
GGAGTTACGGAACCAAATCATTGAAGAGGCTAATCAATTCAAAGAGGATTTCCATAAGAA
GAGGGAACTAACTTGTGAAAACAACAAAGTAGCTAATAGGGAGAAGGAAAAGCTATACAT
GGAGACACAAGAGAAGTTTTACGCGGAAGCCAGCAAGAACTACTGGAAGGCAATCGCAGA
GCTAGTTCCTAAAGAAGTTCCAACCATAGAGAAAAGAAGAGGGAAGAAAGAGCAAGACCC
TAAGAAGCCAACTATTTCTGTCATTCAAGGTCCCAAACCCGGTAAGCCAACCGATCTCGC
GAGAATGAGACAGATTTTGCTCAAGCTCAAACAGAACCCACCAGCTCACCTGAAACTAGC
TCCTCAACCTCCACCAGAGGCGGCTGCTGCTGCTACTACTCCTACTCCTCCAAAGAATGC
TCCTGAAACCAAGCCCACCGAAGCAGTTGCTACTGCTTAAGAAACCCTCTTTGGTTTTGT
TTTTTTTTTCATTTGCTTACATCTATGTGATTCTCTCTTTGCATTTCATTATGTGTGTGT
GATATGAACAGCTTATCTACTATCGGATTATACTCTATGACATTCATGTTTGAATTCAAT
AAGAGGAGTGGTTAAACATAACG

QA 1 743 1 743
DS 

RD RS1ER20JQ 687 0 0
GATGAAGGGTATGCTCTTATTGAGTGGAGAAGACACAATGCAGTTCTCCTTGAGGAGAAG
GAGAAGAAGGAAAAGGAGTTACGGAACCAAATCATTGAAGAGGCTAATCAATTCAAAGAG
GATTTCCATAAGAAGAGGGAACTAACTTGTGAAAACAACAAAGCAGCTAATAGGGAGAAG
GAAAAGCTATACATGGAGACACAAGAGAAGTTTTACGCGGAAGCCAGCAAGAACTACTGG
AAGGCAATCGCAGAGCTAGTTCCTAAAGAAGTTCCAACCATAGAGAAAAGAAGGGGGAAG
AAAGAGCAAGACCCTAAGAAGCCAACTATTTTTGTCATTCAAGGTCCCAAACCCGGTAAG
CCAACCGATCTCGCGAGAATGAGACAGATTTTGCTCAAGCTCAAACAGAACCCACCAGCT
CACCTGAAACTAGCTCCTCAACCTCCACCAGAGGCGGCTGCTGCTGCTACTACTCCTACT
CCTCCAAAGAATGCTCCTGAAACCAAGCCCACCGAAGCAGTTGCTGCTGCTTAAGAAACC
CTCTTTGGTTTTGTTTTTTTTT*CATTTGCTTACATCTATGTGATTCTCTCTTTGCATTT
CATTATGTGTGTGTGATATAAACAGCTTATCTACTATCGGATTATACTTTATGACATTCA
TGTTTGAATTCAATAAGAGGAGTGGTT

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 6

CO CL1101Contig1 728 6 10 U
GGAGAAGAAAAATAAAACTCCACGTACTATTAACTTAAGTTATTTTTATTGCTAACTCTT
ACAAACAAATATCAACATCATACTTTGAGACATGAGAATCAAATTGTAAGAGAGTTAGAC
AAGATCGATATATATTAACAAAAACTCTCTGTACATAAACAGAGTTCAAATCCCATAAAA
AAAAGTAAGTAATAAAACACGAAACGAGTTAAAAATCAAGGTATAGAAAGGATCGACGAA
AGGATTACACAATCAAGTTTGTGGGGAAGAAAAAATACAGTAGAGATTCAGGCGCTATTA
CTCTTCCGTTTCTTACGGACAGGGTTTGAGTTATGAACAAAGAGAGTCTCTACCTCGTGG
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BQ
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F256JQ U 26
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AF RS1CD62JQ U 26
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G
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CC

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TCTTCTAGGGGCTCGAGAACTTTGGACATGGTCACACGGGATATGATAATTTCGTGTGAT
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CC

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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FY15JQ U 1
AF RS1EI32JQ U 1
AF RS1B693JQ U 12
AF RS1B693TF C 407
AF RS1EI32TF C 498
BS 1 467 RS1EI32JQ
BS 468 468 RS1B693JQ
BS 469 739 RS1EI32JQ
BS 740 757 RS1B693TF
BS 758 758 RS1EI32TF
BS 759 890 RS1B693TF
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RD RS1FY15JQ 718 0 0
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TACACCTATGGCTCGTGCCTTTCCCGAATCAAAGAGTGCTTCCATTGCTTTCCATGTG

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1EI32JQ 739 0 0
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ACGATTAGAGAAATCTTGTACCTCTCCGAAAGAAACAAGTTTGCAGTACTAACAACAAAC
TGACATCTTTCACGAACCCGTGAATGATTTGGGCATATGATGATCCGATGATGATGGAGT
CTCATATCATATCTCACCGTCCCAAAGCTGTTCAAGACTCTTATAAGGACTCGTCTCATG
AACAAAAGACATGCCTCTCACCAACCTTCCCTGTTCAATCTCAGAAAACATGGATAACAT
GTCATCGGGTATGGACCAGCTGAAAACATCGAAGTTCTGTTTGATCCTGTCTTCATGTGT
GCTCTTTGGAAGCACACTTTGACCCATTTGGAGACCCCAGCGTAAAGCAACTTGAGCAGG
AGTCTTGCCTAGCTTCTCAGCAACCGTGCCTAGAATCGGGTTCTTCAAAACATCACTCGT
GAGCCAAGTTGTCCCTGGAGAACCCAACGGAGAGTAACCAGAGAGGTGAACGCCTTTGGA
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TACACCTATGGCTCGTGCCTTTCCCGAATCAAAGAGTGCTTCCATTGCTTTCCATGTGCT
AGGAATATCAGTCGGCAGA

QA 1 739 1 739
DS 

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AATCTTGTACCTCTCCGAAAGAAACAAGTTTGCAGTACTAACAACAAACTGACATCTTTC
ACGAACCCGTGAATGATTTGGGCATATGATGATCCGATGATGATAGAGTCTCATATCATA
TCTCACCGTCCCAAAGCTGTTCAAGACTCTTATAAGGACTCGTCTCATGAACAAAAGACA
TGCCTCTCACCAACCTTCCCTGTTCAATCTCAGAAAACATGGATAACATGTCATCGGGTA
TGGACCAGCTGAAAACATCGAAGTTCTGTTTGATCCTGTCTTCATGTGTGCTCTTTGGAA
GCACACTTTGACCCATTTGGAGACCCCAGCGTAAAGCAACTTGAGCAGGAGTCTTGCCTA
GCTTCTCAGCAACCGTGCCTAGAATCGGGTTCTTCAGAACATCACTCGTGAGCCAAGTTG
TCCCTGGAGAACCCAACGGAGAGTAACCAGAGAGGTGAACGCCTTTGGATTTGCAGAAAT
CTCTGAACACGGTTTGTTGCCAAGAAGGGTGACACTCCACCTGGTTAACAGCTGGAGGGA
CACGAGCCACCTCCAAGAGAACTGCTAGCTTCTTGGTTGAGAAGTTGCTTACACCTATGG
CTCGTGCCTTTCCCGAATCAAAGAGTGCTTCCATTGCTTTCCATGTGCTA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1B693TF 745 0 0
AGCAAC
TGAGCAGGAGTCTTGCCTAGCTTCTCAGCAACCGTGC*TAGAATCGGGTTCTTCAGAACA
TCACTCGTGAGCCAAGTTGTCCCTGGAGAACCCAACGGAGAGTAACCAGAGAGGTGAACG
CCTTTGGATTTGCAGAAATCTCTGAGCACGGTTTGTTGCCAAGAAGGGTGACACTCCACC
TGGTTAACAGCTGGAGGGACACGAGCCACCTCCAAGAGAACTGCTAGCTTCTTGGTTGAG
AAGTTGCTTACACCTATGGCTCGTGCCTTTCCCGAATCAAAGAGTGCTTCCATTGCTTTC
CATGTGCTAGGAATATCAGTCGGCAGAATGTTCTCTGGCTTGAAATCAGTAGAACCTTTC
TTGAGACTAACAGGCCAATGGATGAGGTACAAATCGACATAGTCAAGCTGTAGATCCTGT
AGAGTTCTGTTAAGAGCGTCTGGGACATCGTGAGGATCATGATAAGTACACCAGAGTTTG
GATGTGATGAAGATTTCCTCACGCTTAACAACTCCATCATCAAACAGTTTCTTCAGGACT
AACCCTATCTCCTTTTCGTTGCCATAGATTTGAGCACAATCAATGTGGCGATACCCGATC
TTAACGGCGGCTTCTACAGCGTTTCCGACAAGACCAGGATCAGACTGCCACGTTCCGAGA
CCGACCGATGGTATCTTCGCTCCGGTGTTGAGCTCGAAGAACCTGATTTCCTCTGCCATG
AGCCACAGAAAGTTGGT
CC

QA 7 743 7 743
DS 

RD RS1EI32TF 693 0 0
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GCACGGTTTGTTGCCAAGAAGGGTGACACTCCACCTGGTTAACAGCTGGAGGGACACGAG
CCACCTCCAAGAGAACTGCTAGCTTCTTGGTTGAGAAGTTGCTTACACCTATGGCTCGTG
CCTTTCCCGAATCAAAGAGTGCTTCCATTGCTTTCCATGTGCTAGGAATATCAGTCGGCA
GAATGTTCTCTGGCTTGAAACCAGTAGAACCTTTCTTGAGACTAACAGGCCAATGGATGA
GGTACAAATCGACATAGTCAAGCTGTAGATCCTGTAGAGTTCTGTTAAGAGCGTCTGGGA
CATCGTGAGGATCATGATAAGTACACCAGAGTTCGGATGTGATGAAGATTTCCTCACGCT
TAACAACTCCATCATCAAACAGTTTCTTCAGGACTAACCCTATCTCCTTTTCGTTGCCAT
AGATTTGAGCACAATCAATGTGGCGATACCCGATCTTAACGGCGGCTTCTACAGCGTTTC
CGACAAGACCAGGATCAGACTGCCACGTTCCGAGACCGACCGATGGTATCTTCGCTCCGG
TGTTGAGCTCGAAGAACCTGATTTCCTCTGCCATGAGCCACAGAAAGTTGGTGAGAGTGA
GTGAGTGAGATCAGAAAGAGACAAGAAGGATCC

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 5

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GTGTCGCTCGTCACATTCTTCAGCAGCTCCAGACTATGAACATTGTCGACCTTGACACTA
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TTGCATTGGAAACCAGTAGTGGAATATCCCTTCTCTGATTTTTTTTTGTTTTTGTTTTGA
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GATTTAATCGTCGACCGTGTTTCTCTCTTCATTTTAATGAAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 5 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AH27TF U 1
AF RS1EM89TF U 1
AF RS1FH80TF U 21
AF RS1AH27JQ C 31
AF RS1EM89JQ C 165
BS 1 586 RS1AH27TF
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BS 588 670 RS1AH27TF
BS 671 702 RS1EM89TF

RD RS1AH27TF 672 0 0
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CAATAATGGCGACAGGGAAAACGGTGAAGGATGTCTCTCCACACGAGTTCGTCAAGGCAT
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TTGCATTGGAAACCAGTAGTGGAATATCCCTTCTCTGATTTTTTTT*GTTTTTGTTTTGA
TGAGTTGTTTCTCTTTTGTTCTTCTTCTTAAACTCTGATGAGCAGACATATACGCAATCT
GATTTAATCG
CC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RS1EM89TF 702 0 0
GGGCCCACACTCGAATAATATTATACGCCTCTGGCAGCGCCGCCAACGACGAAGCAGGAA
CAATAATGGCGACAGGGAAAACGGTGAAGGATGTCTCTCCACACGAGTTCGTCAAGGCAT
ACGCTGCCCATCTCAAGCGCTCCGGCAAGATCGAGCTGCCACCGTGGACAGATATAGTCA
AGACTGGTAAACTTAAGGAGCTTGCTCCATATGACCCTGACTGGTACTACATCAGAGCCG
CGTCAATGGCAAGGAAAGTGTACTTGAGAGGTGGACTTGGAGTTGGTGCCTTCAGAAGGA
TATATGGAGGA*GCAAGAGGAACGGAAGCAGACCACCTCATTTCTGCAAGAGCAGTGGTG
GTGTCGCTCGTCACATTCTTCAGCAGCTCCAGACTATGAACATTGTCGACCTTGACACTA
AAGGTGGGAGGAAGATCACATCAAGTGGTCAGAGAGATCTTGACCAAGTCGCTGGAAGGA
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TTGCATTGGAAACCAGTAGTGGAATATCCCTTCTCTGATTTTTTTTTGTTTTCGTTTTGA
TGAGTTGTTTCTCTTCTGTTCTTCTTCTTAAACTCTGATGAGCAGACATATACGCAATCT
GATTTAATCGTCGACCGTGTTTCTCTCTTCATTTTAATGAAT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RS1FH80TF 656 0 0
GG
ATACGCCTCTGGCAGCGCCGCCAACGACGAAGCAGGAACAATAATGGCGACAGGGAAAAC
GGTGAAGGATGTCTCTCCACACGAGTTCGTCAAGGCATACGCTGCCCATCTCAAGCGCTC
CGGCAAGATCGAGCTGCCACCGTGGACAGATATAGTCAAGACTGGTAAACTTAAGGAGCT
TGCTCCATATGACCCTGACTGGTACTACATCAGAGCCGCGTCAATGGCAAGGAAAGTGTA
CTTGAGAGGTGGACTTGGAGTTGGTGCCTTCAGAAGGATATATGGAGGAAGCAAGAGGAA
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GCAGCTCCAGACTATGAACATTGTCGACCTTGACACTAAAGGTGGGAGGAAGATCACATC
AAGTGGTCAGAGAGATCTTGACCAAGTCGCTGGAAGGATCGCAGCTGCCGTCTAAAATCC
AAGATCACAAAGCTTTTTGTTTTTTCTTGGAATGAGTTTTGCATTGGAAACCAGTAGTGG
AATATCCCTTCTCTGATTTTTTTTTGTTTTTGTTTTGATGAGTTGTTTCTCTTTTGTTCT
TCTTCTTAAACTCTGATGAGTAGACATATACGCAATCTGATTTAATCGTCGAC
G

QA 3 655 3 655
DS 

RD RS1AH27JQ 642 0 0
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ATGTCTCTCCACACGAGTTCGTCAAGGCATACGCTGCCCATCTCAAGCGCTCCGGCAAGA
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ATGACCCTGACTGGTACTACATCAGAGCCGCGTCAATGGCAAGGAAAGTGTACTTGAGAG
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TTCTCTGATTTTTTTT*GTTTTTGTTTTGATGAGTTGTTTCTCTTTTGTTCTTCTTCTTA
AACTCTGATGAGCAGACATATACGCAATCTGATTTAATCG
CC

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1EM89JQ 538 0 0
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TACTACATCAGAGCCGCGTCAATGGCAAGGAAAGTGTACTTGAGAGGTGGACTTGGAGTT
GGTGCCTTCAGAAGGATATATGGAGGA*GCAAGAGGAACGGAAGCAGACCCCCTCATTTT
TGCAAGAGCAGTGGTGGTGTCGCTCGTCACATTTTTCAGCAGCTCCAGACTATGAACATT
GTCGACCTTGACACTAAAGGTGGGAGGAAGATCACATCAAGTGGTCAGAGAGATCTTGAC
CAAGTCGCTGGAAGGATCGCAGCTGCCGTCTAAAATCCAAGATCACAAAGCTTTTTGTTT
TTTCTTGGAATGAGTTTTGCATTGGAAACCAGTAGTGGAATATCCCTTCTCTGATTTTTT
TTTGTTTTCGTTTTGATGAGTTGTTTTTCTTCTGTTTTTCTTCTTAAACTTTGATGAGCA
GACATATACGCAATTTGATTTAATCGTCGACCGTGTTTCTCTCTTCATTTTAATGAAT

QA 1 538 1 538
DS 



AS 1 5

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GGATTAAATCAACCGGGTTGATTCAGCACCCTTTGTCACATTTTATTAAGTTCAAGTCTT
ACCATGAACAATTCATTAACAAGCCCCCCAGTTTTTTTTTT*ACATGAAAAAAGTTTCGT
TCTTTGTTTTTCTTTTTTTTTACCAACATGATCCTTAAGATTGCATTATGAATGAGGAAG
TTAGTAAAAAAAATTTAATATCTTGGTCTCTTCTTCTTTCTTCTTTCTTCACAAGCACAC
ACTTGTTTTTCTTTTGTCCTGAGAAGGGATCTTCTTAGTTCTTAAACAGAGTCAACTCCT
TCGCCTTGTTGCTGTGCAAGATATCTCTCTCTGCGCTCCTTCCATTCATCGATTACAAGT
CCTTCTCCAATCATCTTTGGACCTGTTTCCTCTGGTGGTTTCTTTCTTGCCTCCACTGCT
GCATCCGCTTCTGCTAACTGGCGCTTCAGTTTCTCCAGTGCAGGGTTGGGGCGTTCTGGG
TCCAGAAAGATAACACGCAATATTTGCTCCTTAGACACATCATCCTTTTGCTCATCGAAC
AGCTCAGGCACATAGTCCATTGGACCTTTCACCTTCAGGCTCATGATCTTAAACTTAACT
CTGCTCCTTTGATCCATTGGCTTCTCATTATTCTCAGGAGGCTCAACAAATTTGAACACA
GTGGCGATAATAGTCTCTCCAGGAGCAAGAATAGCACCCGGTGGACGCATAAAGCAACTC
TTCGGTGCAGTTGTTTGAAACTTAAAGGCTACATGTGATTTGCTGGTATTTTTAATCTTA
ATAGCGCTCCTCACTTGCTTTCCAGGCTCATAAGGAAAATAGAGTTTCTACGACGGATCA
AGCTTCAATCTGCGTTTCGTAGGCAGAAACGACTTAGCTACCGATGATACCGAAGGAGAA
GGAGTCTGATGTTGATTTTGACCCGATCCATCACCGTGGGGCCCGTTATAGCCAAGCTGA
TGATGATGGTGGTGGTGGTGGTGTTGGTGGTGGTTATGGAGCAGAGAAGATGTAGTAGAA
GAAGAAGAAGAAGACGTGGCGGCGGCACTTGATGCTACGTTTCCGCAGCCGCTAGAGTTT
CGAAACGGGATCTTGAAGAAACCCCAACCTCCTCGGCCATCGGAAGATGGTTTCTCCTCC
GTTGTCGTCGTCATGGTCATCTCTTTGTCGCAGTTAAGACATGCAATATTCCGACAGATG
GAAGAGTTGACTTTGTTGTAGAGAGGAGAGAGAGAGAGAAAGGAGATCGGACGCGAGAGG
GAGATAGAAAGTGGATTTTAAGTCGTTGATTTCGCCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
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G
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AA

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C

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AS 1 6

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BQ
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D789TF U 1
AF RS1D789JQ C 2
AF RS1BH38TF U 1
AF RS1D227JQ C 1
AF RS1CK34TF U 304
AF RS1D227TF U 1
BS 1 60 RS1BH38TF
BS 61 61 RS1D789TF
BS 62 112 RS1BH38TF
BS 113 113 RS1D789TF
BS 114 280 RS1BH38TF
BS 281 281 RS1D789TF
BS 282 384 RS1BH38TF
BS 385 385 RS1CK34TF
BS 386 591 RS1BH38TF
BS 592 592 RS1CK34TF
BS 593 691 RS1BH38TF
BS 692 699 RS1D227TF

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ATGAGTAGATGCTCATTGAATATCTATATACGTATCTATCTTTATGTATTT*GGGTGTTT
TATATCAATAATGTACTCTCTAGATCTAAAGAGATGTGATATGAAAGTG

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1D789JQ 655 0 0
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AATGGCACAAGCGATGTTGAAGCCTTCTCTACAAGGAGAGATTGAGGCAGATGTTGAGAT
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AGCCAGTCCTGAAAACCTCAAGGGATGTCGTGTGGAAGAGGGAGAGACGGGCAAAGTTGG
CACTCTCCTCACCTGGAACTATGTCCAGGATGGCAAGCCGATGGTGGCCTATCAGAGGAT
CGAGGCAGTGGAACCGAAGAACAATATGATAAAGTATAGAGTACTAGAGGGAGATATGAT
GAAAAAGTTCAAGAGCTTCCTATGCACTATCCAGGTGACCCCGAAGCAAGGAGGATCTGG
AGGTGTGGTGAAATGGCGCATGGAATACGAGAGGATTGACGAAAACGTGGCTCCCCCGGA
GTCTCTGCTCCGAGTGGCTGTCAAAACGACCAAAGAAACCGACGAAATGCTTTTGTCTAA
TGAGTAGATGCTCATTGAATATCTATATACGTATCTATCTTTATGTATTT*GGGTGTTTT
ATATCAATAATGTACTCTCTAGATCTAAAGAGATGTGATATGAAAGTGTTACGAG

QA 1 655 1 655
DS 

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TGAAAAAGTTCAAGAGCTTCCTATACACTATCCAGGTGACCCCGAAGCAAGGAGGATCTG
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ATGAGTAGATGCTCATTGAATATCTATATACGTATCTATCTTTATGTATTTTGGGTGTTT
TATATCAATAATGTACTCTCTAGATCTAAAGAGATGTGATATGAAAGTGTTACGAGATAT
ATCTATCTAGTTAAATAAAACTATATCTTTA
T

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DS 

RD RS1D227JQ 695 0 0
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ATGAGTAGATGCTCATTGAATATCTATATACGTATCTATCTTTATGTATTT*GGGTGTTT
TATATCAATAATGTACTCTCTAGATCTAAAGAGATGTGATATGAAAGTGTTACGAGATAT
ATCTATCTAGTTAAATAAAACTATATCTTTA
TGCT

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DS 

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TATCTAGTTAAATAAAACTATATCTTTA

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DS 

RD RS1D227TF 699 0 0
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AAGCCAGTCCTGAAAACCTCAAGGGATGTCGTGTGGAAGAGGGAGAGACGGGCAAAGTTG
GCACTCTCCTCACCTGGAACTATGTCCAGGATGGCAAGCCGATGGTGGCCTATCAGAGGA
TCGAGGCAGTGGAACCGAAGAACAATATGATAAAGTATAGAGTACTAGAGGGAGATATGA
TGAAAAAGTTCAAGAGCTTCCTATGCACTATCCAGGTGACCCCGAAGCAAGGAGGATCTG
GAGGTGTGGTGAAATGGCGCATGGAATACGAGAGGATTGACGAAAACGTGGCTCCCCCGG
AGTCTCTGCTCCGAGTGGCTGTCAAAACGACCAAAGAAACCGACGAAATGCTTTTGTCTA
ATGAGTAGATGCTCATTGAATATCTATATACGTATCTATCTTTATGTATTT*GGGTGTTT
TATATCAATAATGTACTCTCTAGATCTAAAGAGATGTGATATGAAAGTGTTACGAGATAT
ATCTATCTAGTTAAATAAAACTATATCTTTATGCTAAAG

QA 1 699 1 699
DS 



AS 2 5

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AGACTCACCGCTGAAAAGACCGCCAGATTCAACCACCTCAATGGTTCCATTGTAGAAAAC
ATTCTGGTATGCCTTCCCTTCCACGTCGTAAATAACATAACCCACCAGATCAAATGCTCC
AGGCTGCAGGTACTGGCTGACAGCAAAGACGTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1B614JQ U 1
AF RS1G757JQ U 44
BS 1 572 RS1B614JQ
BS 573 574 RS1G757JQ

RD RS1B614JQ 572 0 0
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AGACTCACCGCTGAAAAGACCGCCAGATTCAACCACCTCAATGGTTCCATTGTAGAAAAC
ATTCTGGTATGCCTTCCCTTCCACGTCGTAAATAACATAACCCACCAGATCAAATGCTCC
AGGCTGCAGGTACTGGCTGACAGCAAAGACGT

QA 1 572 1 572
DS 

RD RS1G757JQ 531 0 0
CAGTT
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CTTTGATTTCCCAGACAATGTCTTGGCCAAATGAGTTCCCTCGAGCCACTCGTCCAGTGA
TGCGTCGACAGACCTTGTTCCTACTTCCACCTTTGACACCTTTTTGGTTTTCTTAGTGAG
ACGCTGAACTTGGCTGTATGCCCATAGACCGAGGAGGAG******AGCAATCCCGAGTGT
TATAAGGAAGACAGACTCACCGCTGAGAAGACCGCCAGATTCAACCACCTCAATGGTTCC
ATTGTAGAAAACATTCTGGTATGCCTTCCCTTCCACGTCGTAGATAACATAACCCACCAG
ATCAAATGCTCCAGGCTGCAGGTACTGGCTGACAGCAAAGACGTAG

QA 6 531 6 531
DS 



CO CL1106Contig2 1042 3 8 U
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GTTTTCCCCCAAAACAGTGGCAGATTGGTTATAGCTGGAGAAGATACTGAGCTCATTGTT
GCTCTCAGGAATGATGGGAAATCTAGAGTTGGTGTGATGGGAATTAGGGCCAGCGTCCAT
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CAGCCTGGAGCATTTGATCTGGTGGGTTATGTTATCTACGACGTGGAAGGGAAGGCATAC
CAGAATGTTTTCTACAATGGAACCATTGAGGTGGTTGAATCTGGAGGTCTTCTCAGCGGT
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GCATACAGCCAAGTTCAGCGTCTCACTAAGAAAACCAAAAAGGTGTCAAAGGTGGAAGTA
GGAACAAGGTCTGTCGACGCATCACTGGACGAGTGGCTCGAGGGAACTCATTTGGCCAAG
ACATTGTCTGGGAAATCAAAGAGCAAGAAGAACTAAAAGAGAGCCTTTTTGGCTCCTTTA
CAGCTTATAGACTTCAGCTTTTGGCGTTTTTAAAGAGTTTTAAGTTTGTCTTTGAGGAAG
TTTTAGGGTTACGTTACCTCTTTTTTGTTCATGCATTGTACCATCTTAGACAATCTTTCT
TTCTCTTCATACTATTCTCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B614TF U 1
AF RS1G757TF U 32
AF RS1DO25JQ C 277
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GAAACAAGAAAAAAAAAAAGAGAGGCGAAGAAGAAGATGAAGATGAACGTTAGGGTTTTG
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GAAGATGACCAGGACTTGGATCTCAACTTGTCCTCAGCTCCAGGAGTTGAGACTGTCTCT
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GCTCTCAGGAATGATGGGAAATCTAGAGTTGGTGTGATGGGAATTAGGGCCAGCGTCCAT
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CAGAATGTTTTCTACA*TGGAACCATTGAG*TGGTTGAATCTGGCGGTCTTCTCAG

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GG
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AAGATGAAGATGAACGTTAGGGTTTTGTTTCTGGCTCTCCTTCTCCTCGCATCTCCTCTG
CTCCAAGTTGCTAGATGTCAAGTGGACGATGATCATTCCAGCATTGTTGACGATGTTGTG
GGAGAACACAGTGATTCTGGTGCCGAGGAAGATGACCAGGACTTGGATCTCAACTTGTCC
TCAGCTCCAGGAGTTGAGACTGTCTCTGTTTTCCCCCAAAACAGTGGCAGATTGGTTATA
GCTGGAGAAGATACTGAGCTCATTGTTGCTCTCAGGAATGATGGGAAATCTAGAGTTGGT
GTGATGGGAATTAGGGCCAGCGTCCATCTTCCTTATGATCATAAGTTGTTGGTTCAGAAT
CTTACCGTCCTGAGAATCAACAATGCCTCCATCCCATTTTCTGTTCAAGCAACATTCTCC
TACGTCTTTGCTGTCAGCCAGTACCTGCAGCCTGGAGCATTTGATCTGGTGGGTTATGTT
ATCTACGACGTGGAAGGGAAGGCATACCAGAATGTTTTCTACAATGGAACCATTGAG
TGGTT

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DS 

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GCTCCAGGAGTTGAGACTGTCTCTGTTTTCCCCCAAAACAGTGGCAGATTGGTTATAGCT
GGAGAAGATACTGAGCTCATTGTTGCTCTCAGGAATGATGGGAAATCTAGAGTTGGTGTG
ATGGGAATTAGGGCCAGCGTTCATCTTCCTTATGATCATAAGTTGTTGGTTCAGAATCTT
ACCGTCCTGAGAATCAACAATGCCTCCATCCCATATTCAGTTCAAGCAACATTCTCCTAC
GTCTTTGCTGTCAGCCAGTACCTACAGCCTGGAGCATTTGATCTGGTGGGTTATGTTATC
TACGACGTGGAAGGGAAGGCATACCAGAATGTCTTCTACAATGGAACCATTGAGGTGGTT
GAATCTGGAGGTCTTTTCAGCGGTGAGTCTGTCTTCCTTATAACACTTGGGATTGCTCTC
CTCCTCCTCCTCCTCGGTCTATGGGCATACAGCCAAGTTCAGCGTCTCACTAAGAAAACC
AAAAAGGTGTCAAAGGTGGAAGTAGGAACAAGGTCTGTCGACGCATCACTGGACGAGTGG
CTCGAGGGAACTCATTTGGCCAAGACATTGTCTGGGAAATCAAAGAGCAAGAAGAACTAA
AAGAGAGCCTTTTTGGCTCCTTTACAGCTTATAGACTTCAGCTTTTGGCGTTTTTAAAGA
GTTTTAAGTTTGTCTTTGAGGAAGTTTTAGGGTTACGTTACCTCTTTTTTGTTCATGCAT
TGTACCATCTTAGACAATCTTTCTTTCTCTTCATACTATTCTCCTC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 6

CO CL1107Contig1 991 6 30 U
GGTTTTGTGAAGAAAAAAGTGAAAGAAGCTTAAGGAGCCAAGCCGTTATCTTTAGTTGCT
CTTTAACTTTTCGCTTCATCCCCTAGAAGAAGACATGCCTAAATCAAAGAGAGACAGACC
AGTTACTTTGTCAATGACAAAGAAGAAAGGAAGAGCGCACAAGGAGGTTATTGTAAATGG
AATCAGAGAGGCTGTCGAGAAGTATTCATCCGTCTATGTTTTCTCTTTTGAAAACATGAG
AAACATCAAGTTCAAGGAGTTCAGACAGCAGTTTAGGCAGAACGGAAAGTTCTTCCTCGG
TTCGAACAAGGTGATGCAGGTTGCTCTAGGTCGTTCTGCTTCTGATGAAATGAGTCCTGG
TATCTTCAAAGCCTCCAAGATGCTTCATGGTGATGCTGGACTTCTTGTTACGGATATGCC
AAAGGAAGAGGTCGAAAGCTTATTTAACGCTTATGAGGATTCAGACTTTTCAAGAACCGG
AAGCACTGCTGTAGAAACGGTTGAGCTGAAGGAAGGACCTCTAGAACAGTTCACACATGA
GATGGAACCCTTTCTTAGGAAGCAGGGTATGCCTGTTCGTCTTAACAAAGGTACGGTGGA
GTTACTCTCCGACTTTGTAGTTTGTGAAGAAGGGAAACCTCTTTCGCCAGAATCTTCTCG
CATTTTGCGTCTGTTGGGAATCAAGTTGGCTACTTTCAAACTCAACTTAGTCTGCAGATG
GAGCCCTAGTGACTTTGAGCTTTACAGAGAAGGCTTGGATCTCTCTGACGTTGAAACCTC
TTGAAAAAGCCAAGATTTTGATGATCAACTCTTTTAAGTTTCTGAATATCGTATTATTCA
CATGCGTTCTGCTTTGTTCTATTTGGTTCTCTGGTTTGCACTTGGATGCTTTTATGTCAA
AGTTTTGTTGCTTTAATGTCTGTAGTATATCAAATTATCTTTATGACTTCACCTATTCTA
GTATTTTTAACTGAAATACAATATGAAGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 20 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 5 5 5 35 20 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BT19TF U 24
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TTAACGCTTATGAGGATTCAGACTTTTCAAGAACCGGAAGCACTGCTGTAGAAACGGTTG
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AGGGTATGCCTGTTCGTCTTAACAAAGGTACGGTGGAGTTACTCTCCGACTTTGTAGTTT
GTGAAGAAGGGAAACCTCTTTCGCCAGAATCTTCTCGCATTTTGCGTCTGTGGGGA*TCA
AGTTGGCTACTTTCAA*CTCAACTTAGTCTGCAGATGGAGCCCTAGTGACTTTGAGCTTT
ACAGAGAAG*CTTGGATCTCTCTGA

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DS 

RD RS1H554TF 828 0 0
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CTTTAACTTTTCGCTTCATCCCCTAGAAGAAGACATTCCTAAATCAAAGAGAGACAGACC
AGTTACTTTGTCAAAGACAAAGAAGAAAGGAAGAGCGCACAAGGAGGTTATTGTAAATGG
AATCAGAGAGGCTGTCGAGAAGTATTCATCCGTCTATGTTTTCTCTTTTGAGAACATGAG
AAACATCAAGTTCAAGGAGTTCAGACAGCAGTTTAGGCAGAACGGAAAGTTCTTCCTCGG
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TATCTTCAAAGCCTCCAAGATGCTTCATGGTGATGCTGGACTTCTTGTTACGGATATGCC
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AAGCACTGCTGTAGAAACGGTTGAGCTGAAGGAAGGACCTCTAGAACAGTTCACACATGA
GATGGAACCCTTTCTTAGGAAGCAGGGTATGCCTGTTCGTCTTAACAAAGGTACGGTGGA
GTTACTCTCCGACTTTGTAGTTTGTGAAGAAAGGAAACCTCTTTCGCCAGAATCTTCTCG
CATTTTGCGTCTGTTGGGAATCAAGTTGGCTACTTTCAA*CTCAACTTAGTCTGCAGATG
GAGCCCTAGTGACTTTGAGCTTTACAGAGAAG*CTTGGATCTCTCTGACGT*GAAAC*TC
T*GAAAAG**CAAGATTT*GATGATCA*CTCTTT
AAGTTCTGAATATC

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DS 

RD RS1CY63TF 828 0 0
GG
GTGAAGAAAGAAGTGAAAGAAGCTTAAGGAGCCAAGCTGTTATCTTTAGTTGCTCTTTAA
CTTTTCGCTTCATCCCCTAGAAGAAGACATGCCTAAATCAAAGAGAGACAGACCAGTTAC
TTTGTCAAAGACAAAGAAGAAAGGAAGAGCGCACAAGGAGGTTATTGTAAATGGAATCAG
AGATGCTGTCGAGAAGTATTCATCCGTCTATGTTTTCTCTTTTGAGAACATGAGAAACAT
CAAGTTCGAGGAGTTCAGACAGCAGTTTAGGCAGAACGGAAAGTTCTTCCTCGGTTCGAA
CAAGGTGATGCAGGTTGCTCTAGGTCGTTCTGCCTCTGATGAAATGCGTCCTGGTATCTT
CAAAGCCTCCAAGATGCTTCATGGTGATGCTGGACTTCTTGTTACTGATATGCCAAAGGA
AGAGGTCGAAAGCTTATTTAACGCTTATGAGGATTCAGACTTTTCAAGGACCGGAAGCAC
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ACCATTTCTTAGGAAGCAGGGTATGCCTGTTCGTCTTAACAAAGGTACGGTGGAGTTACT
CTCCGACTTTGTAGTTTGTGAAGAAGGGAAACCTCTTTCGCCAGAATCTTCTCGCATTTT
GCGTCTGTTGGGAATCAAGTTGGCTACTTTCAA*CTCAACTTAGTCTGCAGATGGAGCCC
TAGTGACTTTGAGCTTTACAGAGAAG*CTTGGATCTCTCTGACGTTGAAAC*TCTTGAAA
AG**CCAGATTT*GATGATCA*CTCTTTTAAGTTTCTGAATATCGT

QA 3 828 3 828
DS 

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AAGAGAGACAGACCAGTTACTTTGTCAATGACAAAGAAGAAAGGAAGAGCGCACAAGGAG
GTTATTGTAAATGGAATCAGAGAGGCTGTCGAGAAGTATTCATCCGTCTATGTTTTCTCT
TTTGAAAACATGAGAAACATCAAGTTCAAGGAGTTCAGACAGCAGTTTAGGCAGAACGGA
AAGTTCTTCCTCGGTTCGAACAAGGTGATGCAGGTTGCTCTAGGTCGTTCTGCTTCTGAT
GAAATGAGTCCTGGTATCTTCAAAGCCTCCAAGATGCTTCATGGTGATGCTGGACTTCTT
GTTACGGATATGCCAAAGGAAGAGGTCGAAAGCTTATTTAACGCTTATGAGGATTCAGAC
TTTTCAAGAACCGGAAGCACTGCTGTAGAAACGGTTGAGCTGAAGGAAGGACCTCTAGAA
CAGTTCACACATGAGATGGAACCCTTTCTTAGGAAGCAGGGTATGCCTGTTCGTCTTAAC
AAAGGTACGGTGGAGTTACTCTCCGACTTTGTAGTTTGTGAAGAAGGGAAACCTCTTTCG
CCAGAATCTTCTCGCATTTTGCGTCTGTTGGGAATCAAGTTGGCTACTTTCAAACTCAAC
TTAGTCTGCAGATGGAGCCCTAGTGACTTTGAGCTTTACAGAGAAGGCTTGGATCTCTCT
GACGTTGAAACCTCTTGAAAAAGCCAAGATTTTGATGATCAACTCTTTTAAGTTTCTGAA
TATCGTATTATTCACATGCGTTCTGCTTTGTTCTATTTGGTTCTCTGGTTTGCACTTGGA
TGCTTTTATGTCAAAGTTTTGTTGCTTTAATGTCTGTAGTATATCAAATTATCTT
TATG

QA 1 835 1 835
DS 

RD RS1CY63JQ 594 0 0
AAATGCGTCCTGGTATCTTCAAAGCCTCCAAGATGCTTCATGGTGATGCTGGACTTCTTG
TTACTGATATGCCAAAGGAAGAGGTCGAAAGCTTATTTAACGCTTATGAGGATTCAGACT
TTTCAAGGACCGGAAGCACTGCTGTAGAAACGGTTGAGCTGAAGGAAGGACCTCTAGAAC
AGTTCACACATGAGATGGAACCATTTCTTAGGAAGCAGGGTATGCCTGTTCGTCTTAACA
AAGGTACGGTGGAGTTACTCTCCGACTTTGTAGTTTGTGAAGAAGGGAAACCTCTTTCGC
CAGAATCTTCTCGCATTTTGCGTCTGTTGGGAATCAAGTTGGCTACTTTCAAACTCAACT
TAGTCTGCAGATGGAGCCCTAGTGACTTTGAGCTTTACAGAGAAGGCTTGGATCTCTCTG
ACGTTGAAACCTCTTGAAAAAGCCAAGATTTTGATGATCAACTCTTTTAAGTTTCTGAAT
ATCGTATTATTCACCTGCGTTCTGCTTTGTTCTATTTGGTTCTCTGGTTTGCACTTGGAT
GCTTTTATGTCGAAGTTTTGTTGCTTTAATGTTTGTAGTATATCAAATTATCTT

QA 1 594 1 594
DS 

RD RS1H554JQB 685 0 0
CAAGTTGATGCAGGTTGCTCTAGGTCGTTCTGCTTCTGATGAAATGAGTCCTGGTATCTT
CAAAGCCTCCAAGATGCTTCATGGTGATGCTGGACTTCTTGTTACGGATATGCCAAAGGA
AGAGGTCGAAAGCTTATTTAACGCTTATGAGGATTCAGACTTTTCAAGAACCGGAAGCAC
TGCTGTAGAAACGGTTGAGCTGAAGGAAGGACCTCTAGAACAGTTCACACATGAGATGGA
ACCCTTTCTTAGGAAGCAGGGTATGCCTGTTCGTCTTAACAAAGGTACGGTGGAGTTACT
CTCCGACTTTGTAGTTTGTGAAGAAGGGAAACCTCTTTCGCCAGAATCTTCTCGCATTTT
GCGTCTGTTGGGAATCAAGTTGGCTACTTTCAAACTCAACTTAGTCTGCAGATGGAGCCC
TAGTGACTTTGAGCTTTACAGAGAAGGCTTGGATCTCTCTGACGTTGAAACCTCTTGAAA
AAGCCAAGATTTTGATGATCAACTCTTTTAAGTTTCTGAATATCGTATTATTCACATGCG
TTCTGCTTTGTTCTATTTGGTTCTCTGGTTTGCACTTGGATGCTTTTATGTCAAAGTTTT
GTTGCTTTAATGTCTGTAGTATATCAAATTATCTTTATGACTTCACCTATTCTAGTATTT
TTAACTGAAATACAATATGAAGCTT

QA 1 685 1 685
DS 



AS 2 6

CO CL1108Contig1 649 4 11 U
TTTTTTTAGAGAGAAAAGTTACCAGAATGGTATAAAGAGCAAAACGAAAACAGTTGTAGC
ATTGAAAGAAAAGCGGAGATTCTCACAATTGATAATCGTTAATAGACTCAAGAGTTGAAC
CAAATCTCAGAATAATACACACACCAAACAACAGCTCACGGGATGGATAGTAAAAATCAG
GCATCTTCAGTGGGAAACTGCTTCTCCACATCTGCAACTGTCTTCTTTGCATCTTCAACT
TCTGGACCTGTCGTCTCTTCCAATTCCACCAAAGTGGACTTGAGGTCAGCTAAAGCAGCC
TCGAGACGTTTGTGGCAGTCAGGAACCATCATCCTTGACTCACCCAACACATTCTCCTGC
TGTTTGAGGTCGTAAGGGTCAGCACCACTGTCTTTCATAGCAGCAGTCTTGGCAGCTTCC
CTCTCGACCTCTTTCTCGTAGGAGTGAAGCTCTTTCACAATCCTTTTGCAAGTTGATGTT
TTTATCTTCAGATTCCTTTTCGCTTCCATTGTTTTGGTTTCACAGAGGAATGGGATCGAA
GAAAGACGAAGCTTTACGAGAGAGGACGCGGCGCAGAGCGACAAAATCCAAAACCAAAAT
ACACCACCCCTTTCCCTTTCCCTTTCCCTTTCCCTTTTGAAAAGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D918JQ U 22
AF RS1FH69JQ U 8
AF RS1FH69TF C 1
AF RS1D918TF C 3
BS 1 10 RS1FH69TF
BS 11 51 RS1FH69JQ
BS 52 52 RS1D918JQ
BS 53 123 RS1FH69JQ
BS 124 124 RS1D918JQ
BS 125 436 RS1FH69JQ
BS 437 542 RS1FH69TF
BS 543 543 RS1D918TF
BS 544 604 RS1FH69TF
BS 605 606 RS1D918TF
BS 607 649 RS1FH69TF

RD RS1D918JQ 149 0 0
CCAGAATGGTATAAAGAGCAAAACGAAAACAGTTGTAGCATTGAAAGAAAAGCGGAGATT
CTCACAATTGATAATCGTTAATAGACTCAAGAGTTGAACCAAATCTCAGAATAATACACA
CACCAAACAACAGCTCACGGGATGGATAG

QA 1 149 1 149
DS 

RD RS1FH69JQ 429 0 0
AGA
GAGAAAAGTTACCAGAATGGTATAAAGAGCAAAACGAAAACGGTTGTAGCATTGAAAGAA
AAGCGGAGATTCTCACAATTGATAATCGTTAATAGACTCAAGAGTTGAACCAATTCTCAG
AATAATACACACACCAAACAACAGCTCACGGGATGGATAGTAAAAATCAGGCATCTTCAG
TGGGAAACTGCTTCTCCACATCTGCAACTGTCTTCTTTGCATCTTCAACTTCTGGACCTG
TCGTCTCTTCCAATTCCACCAAAGTGGACTTGAGGTCAGCTAAAGCAGCCTCGAGACGTT
TGTGGCAGTCAGGAACCATCATCCTTGACTCACCCAACACATTCTCCTGCTGTTTGAGGT
CGTAAGGGTCAGCACCACTGTCTTTCATAGCAGCAGTCTTGGCAGCTTCCCTCTCGACCT
CTTTCT

QA 4 429 4 429
DS 

RD RS1FH69TF 649 0 0
TTTTTTTAGAGAGAAAAGTTACCAGAATGGTATAAAGAGCAAAACGAAAACGGTTGTAGC
ATTGAAAGAAAAGCGGAGATTCTCACAATTGATAATCGTTAATAGACTCAAGAGTTGAAC
CAATTCTCAGAATAATACACACACCAAACAACAGCTCACGGGATGGATAGTAAAAATCAG
GCATCTTCAGTGGGAAACTGCTTCTCCACATCTGCAACTGTCTTCTTTGCATCTTCAACT
TCTGGACCTGTCGTCTCTTCCAATTCCACCAAAGTGGACTTGAGGTCAGCTAAAGCAGCC
TCGAGACGTTTGTGGCAGTCAGGAACCATCATCCTTGACTCACCCAACACATTCTCCTGC
TGTTTGAGGTCGTAAGGGTCAGCACCACTGTCTTTCATAGCAGCAGTCTTGGCAGCTTCC
CTCTCGACCTCTTTCTCGTAGGAGTGAAGCTCTTTCACAATCCTTTTGCAAGTTGATGTT
TTTATCTTCAGATTCCTTTTCGCTTCCATTGTTTTGGTTTCACAGAGGAATGGGATCGAA
GACAGACGAAGCTTTACGAGAGAGGACGCGGCGCAGAGCGACAAAATCCAAAACCAAAAT
ACACT*CCCCTTTCCCTTTCCCTTTCCCTTTCCCTTTTGAAAAGAAAAA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1D918TF 619 0 0
TTTTTTGC
GAGAAAAGTCACCAGAATGGTATAAAGAGCAAAACGAAAACAGTTGTAGCATTGAAAGAA
AAGCGGAGATTCTCACAATTGATAATCGTTAATAGACTCAAGAGTTGAACCAAATCTCAG
AATAATACACACACCAAACAACAGCTCACGGGATGGATAGTAAAAATCAGGCATCTTCAG
TGGGAAACTGCTTCTCCACATCTGCAACTGTCTTCTTTGCATCTTCAACTTCTGGACCTG
TCGTCTCTTCCAATTCCGCCAAAGTGGACTTGAGGTCAGCTAAAGCAGCCTCGAGACGTT
TGTGGCAGTCAGGAACCATCATCCTTGACTCACCCAACACATTCTCCTGCTGTTTGAGGT
CGTAAGGGTCAGCACCACTGTCTTTCATAGCAGCAGTCTTGGCAGCTTCCCTCTCGGCCT
CTTTCTCGTAGGAGTGAAGCTCTTTCACAATCCTTTTGCAAGTTGATGTTTTTATCTTCA
GATTCCTTTTCGCTTCCATTGTTTTGGTTTCACAGAGGAATGGGATCGAAGGAAGACGAA
GCTTTACGAGAGAGGACGCGGCGCAGAGCGACAAAATCCAAAACCAAAATACACCACCCC
TTTCCCTTTCC

QA 9 619 9 619
DS 



CO CL1108Contig2 556 2 3 U
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CGTCTGTCTTCGATCCCATTCCTCTGTGAAACCAAAACAATGGAAGCGAAAAGGAATCTG
AAGATAAAAACATCAACTTGCAAAAGGATTGTGAAAGAGCTTCACTCCTACGAGAAAGAG
GTCGAGAGGGAAGCTGCCAAGACTGCTGCTATGAAAGACAGTGGTGCTGACCCTTACGAC
CTCAAACAGCAGGAGAATGTGTTGGGTGAGTCAAGGATGATGGTTCCTGATTGCCACAAA
CGTCTCGAGGCTGCTTTAGCTGACCTCAAGTCCACTTTGGCGGAATTGGAAGAGACAACA
GGTCCAGAAGTTGAAGATGCAAAGAAGACAGTTGCAGATGTGGAGAAGCAGTTTCCTACT
GAAGATGCCTGATTTTACTATCCGTGTTGTTTGGTGTGTATTATTCTGAGAATTGGTTCA
ACTCTTGAGTCTATTAACGATCATCAATTGTAAGAATCTGCGGGTTTTCATTCAATGCTA
CAACTATTTTCGTTTT


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FS09JQ C 1
AF RS1FS09TF U 1
BS 1 4 RS1FS09JQ
BS 5 545 RS1FS09TF
BS 546 556 RS1FS09JQ

RD RS1FS09JQ 556 0 0
GGGAGTGTATTTTGGTTTTGGATTTTGTCGCTCTGCGCCGCGTCCTCTCTCGTAAAGCTT
CGTCTGTCTTCGATCCCATTCCTCTGTGAAACCAAAACAATGGAAGCGAAAAGGAATCTG
AAGATAAAAACATCAACTTGCAAAAGGATTGTGAAAGAGCTTCACTCCTACGAGAAAGAG
GTCGAGAGGGAAGCTGCCAAGACTGCTGCTATGAAAGACAGTGGTGCTGACCCTTACGAC
CTCAAACAGCAGGAGAATGTGTTGGGTGAGTCAAGGATGATGGTTCCTGATTGCCACAAA
CGTCTCGAGGCTGCTTTAGCTGACCTCAAGTCCACTTTGGCGGAATTGGAAGAGACAACA
GGTCCAGAAGTTGAAGATGCAAAGAAGACAGTTGCAGATGTGGAGAAGCAGTTTCCTACT
GAAGATGCCTGATTTTACTATCCGTGTTGTTTGGTGTGTATTATTCTGAGAATTGGTTCA
ACTCTTGAGTCTATTAACGATCATCAATTGTAAGAATCTGCGGGTTTTCATTCAATGCTA
CAACTATTTTCGTTTT

QA 1 556 1 556
DS 

RD RS1FS09TF 545 0 0
GGGA
GTGTATTTTGGTTTTGGATTTTGTCGCTCTGCGCCGCGTCCTCTCTCGTAAAGCTTCGTC
TGTCTTCGATCCCATTCCTCTGTGAAACCAAAACAATGGAAGCGAAAAGGAATCTGAAGA
TAAAAACATCAACTTGCAAAAGGATTGTGAAAGAGCTTCACTCCTACGAGAAAGAGGTCG
AGAGGGAAGCTGCCAAGACTGCTGCTATGAAAGACAGTGGTGCTGACCCTTACGACCTCA
AACAGCAGGAGAATGTGTTGGGTGAGTCAAGGATGATGGTTCCTGATTGCCACAAACGTC
TCGAGGCTGCTTTAGCTGACCTCAAGTCCACTTTGGCGGAATTGGAAGAGACAACAGGTC
CAGAAGTTGAAGATGCAAAGAAGACAGTTGCAGATGTGGAGAAGCAGTTTCCTACTGAAG
ATGCCTGATTTTACTATCCGTGTTGTTTGGTGTGTATTATTCTGAGAATTGGTTCAACTC
TTGAGTCTATTAACGATCATCAATTGTAAGAATCTGCGGGTTTTCATTCAATGCTACAAC
T

QA 5 545 5 545
DS 



AS 1 6

CO CL1109Contig1 657 6 5 U
GGTGAGTTAAAAGACAAACAAAAATATCATCAGAAAGCATCAGAGCAAAGACGTAAATCA
GTTCACACTATGGATTTCGCAAGGTTTCCTATCATCTCAATCCTCGAAGACATGCTCGAA
GTCCCCGAAGAGCACAACGAGAAGACCCGCAACAACCCGTCGAGAGCTTACATGCGAGAC
CAGAAGGCGATGGCTGCTACGCCTGCTGACGTCATCGAGCAGCCTGACGCGTTCGCTTTC
GTGGTGGACATGCCGGGAATCAAAGGAGACGAGATCAAGGTTCAGGTCGAGAGCGACAAC
GTGCTCGTGGTGAGCGGAGAGAGGAAGAGGGAGAACAAGGAGAGCGAGGGAGTTGAGTAC
GTGAGGATGGAGAGGAGGATGGGGAAGTTTATGAGGAAGTTTCAGTTGCCTGAGAACGCG
GATCTGGAGAAGATCTCTGCTGCTTGTAACGACGGTGTGTTGAAAGTGACGGTTGGGAAG
CTTCCTCCTCCTGAGCCTAAGAAGCCGAAGACTATTCAGGTCCAGGTCGCTTGAGCTTGC
TGGTTTTTTCTCTTTCGGTTCTGTCGTATGTCTGTTTAGTTTTCCGGTTTGTACGTAATC
CGTGTCAAATACTCGCGCATGTGTTCTAAAGTAAAATAAAAGGTGCTCTGTTTTTAT


BQ
10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 

AF RS1FI30JQ C 1
AF RS1GC41TF U 1
AF RS1GC41JQ C 15
AF RS1FI30TF U 1
AF RS1CF62JQ C 2
AF RS1CF62TF U 2
BS 1 3 RS1FI30JQ
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GTCCCCGAAGAGCACAACGAGAAGACCCGCAACAACCCGTCGAGAGCTTACATGCGAGAC
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GTGCTCGTGGTGAGCGGAGAGAGGAAGAGGGAGAACAAGGAGAGCGAGGGAGTTGAGTAC
GTGAGGATGGAGAGGAGGATGGGGAAGTTTATGAGGAAGTTTCAGTTGCCTGAGAACGCG
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TGGTTTTTTCTCTTTCGGTTCTGTCGTATGTCTGTTTAGTTTTCCGGTTTGTACGTAATC
CGTGTCAAATACTCGCGCATGTGTTCTAAAGTAAAATAAAAGGTGCTCTGTTTTTAT

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DS 

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GTGGACATGCCGGGAATCAAAGGAGACGAGATCAAGGTTCAGGTCGAGAGCGACAACGTG
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AGGATGGAGAGGAGGATGGGGAAGTTTATGAGGAAGTTTCAGTTGCCTGAGAACGCGGAT
CTGGAGAAGATCTCTGCTGCTTGTAACGACGGTGTGTTGAAAGTGACGGTTGGGAAGCTT
CCTCCTCCTGAGCCTAAGAAGCCGAAGACTATTCAGGTCCAGGTCGCTTGAGCTTGCTGG
TTTTTTCTCTTTCGGTTCTGTCGTATGTCTGTTTAGTTTTCCGGTTTGTACGTAATCCGT
GTCAAATACTCGCGCATGTGTTCTAAAGTAAAATAA

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DS 

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TGCTACGCCTGCTGACGTCATCGAGCAGCCTGACGCGTTCGCTTTCGTGGTGGACATGCC
GGGAATCAAAGGAGACGAGATCAAGGTTCAGGTCGAGAGCGACAACGTGCTCGTGGTGAG
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GCGCATGTGTTCTAAAGTAAAATAAAAGGTGCTCTGTTTTTAT

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DS 

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GGT
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CTGGAGAAGATCTCTGCTGCTTGTAACGACGGTGTGTTGAAAGTGACGGTTGGGAAGCTT
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DS 

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GG
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CTGGAGAAGATCTCTGCTGCTTGTAACGACGGTGTGTTGAAAGTGACGGTTGGGAAGCTT
CCTCCTCCTGAGCCTAAGAAGCCGAAGACTATTCAGGTCCAGGTCGCTTGAGCTTGCTGG
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GTCAAATACTCGCGCATGTGTTCTAAAGTAAAATAAAAGGTGCTCTGTTTTTAT

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DS 

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GG
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CTCGTGGTGAGCGGAGAGAGGAAGAGGGAGAACAAGGAGAGCGAGGGAGTTAAGTACGTG
AGGATGGAGAGGAGGATGGGGAAGTTTATTAGGAAGTTTCAGTTGCCTGAGAACGCGGAT
CTGGAGAAGATCTCTGCTGCTTGTAACGACGGTGTGTTGAAAGTGACGGTTGGGAAGCTT
CCTCCTCCTGAGCCTAAGAAGCCGAAGACTATTCAGGTCCAGGTCGCTTGAGCTTGCTGG
TTTTTTCTCTTTCGGTTCTGTCGTATGTCTGTTTAGTTTTTCGGTTTGTACGTAATTCGT
GTCAAATACTCGCGCATGTGTTCTAAAGTAAAATAAAATGTGCTCTGTTTT
ATAA

QA 3 653 3 653
DS 



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CTCCTCCTTCTCTTCTTCCTTTGGCTCCTCCACAACCACCGGAGTTTCTGTCTTCTCTTC
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TATGATGCTTTAGTGAGTCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RS1B859TF C 1
AF RS1GD87JQ U 9
AF RS1GD87TF C 9
AF RS1B859JQ U 6
BS 1 8 RS1B859TF
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RD RS1B859TF 622 0 0
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TTCCTCTTCTACCTTCGGCTCTTCCGTTTCTTTCTCTGCTTCTTCTTCTTTTTGCTCTGC
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GAAAGGACAAAAGCTAAAGAGAGAAAAAACAAAGAGGATGAGAAGAGAAGTAAAAGTTTA
TATGATGCTTTAGTGAGTCC
CT

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DS 

RD RS1GD87JQ 593 0 0
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TCTCTTCTTCCTTTGGCTCCTCCACAACCACCGGAGTTTCTGTCTTCTCTTCCTCCTCTT
CTACCTTTGGCTCTTCCGTTTCTTTCTCTGCTTCTTCTTCTTTTTGCTCTGCCTCTTCCA
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QA 1 593 1 593
DS 

RD RS1GD87TF 613 0 0
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CAACCACATCTTTGCTCGTTTCTTCCACTGGTGCTTCAGATTATTCTTCTGTCGCGGTGA
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TTTAGTGAGTCC
C

QA 1 612 1 612
DS 

RD RS1B859JQ 617 0 0
ATC
CAAATAATCATCATAACCAAAGATCTGATTACATCATCATAAACCCAAACAAACGATACA
GAAAATACATATGAAATTTTGATAATTTAAAAAGACAACGAAACGAGACCAAAGAAGGTC
ATATATAGTTTCTTGCTCTTTACTCGGCGGCGACTTCCGCAGCAGGCACAACTTCCTCTG
CCTCAGTCTTCTTCTCGTCCTCCTCCTCCACAACAGCTGGAGTTTCAGTCTCCTCCTCCT
TCTCTTCTTCCTTTGGCTCCTCCACAACCACCGGAGTTTCTGTCTTCTCTTCTTCCTCTT
CTACCTTCGGCTCTTCCGTTTCTTTCTCTGCTTCTTCTTCTTTTTGCTCTGCCTCTTCCA
CAACCACATCTTTGCTCGTTTCTTCCACTGGTGCTTCAAATTCTTCTTCTGTCGCGGTGA
CGACTTCTTCCGGCTGTTCCGTCACTTCTGGCTCCTCCACCGTCTTTGTTGGCAACTCAA
CGTTCTCTTCTGCTGGAGCAATCACTTGTTCATTCTCAACGTTGGACATTTCGAAAGGAC
AAAAGCTAAAGAGAGAAAAAACAAAGAGGATGAGAAGAGAAGTAAAAGTTTATATGATGC
TTTAGTGAGTCCCT

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DS 



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TCTTTAGCTTTTGTCTTTTCGAAATGGCCAACGTTGAGAATGAACAAGTGATTGCTCCAG
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CGGAAGAAGTCGTCACCGCGACAGAAGAAGAATCTGAAGCACCAGTTGAAGAAACGAGCA
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AGAAGACTGAGGCAGAGGAAGTTGTGGCTGCTGAGGAAGTCGCCGCCGAGTAAAGAGCAA
GAAACTGTATATGACCTTCTTTGGTCTCATTTCGTTGTCTTTTTAAATTATATTTTATCA
AAATTTCATATGTATTTTCTGTATCGTTTGTTTGGGTTTATGATGATGTAATCAGATCTT
TGGTTAATGATTACTGGACATTTTTTATATGCTCG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D117JQ C 1
AF RS1D117TF U 1
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RD RS1D117JQ 635 0 0
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TCTTTAGCTTTTGTCTTTTCGAAATGGCCAACGTTGAGAATGAACAAGTGATTGCTCCAG
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AAGATGTGGTTGTGGAAGAGGCAGAGCAAAAAGAAGAAGAAGCAGAGAAAGAAACGGAAG
AGTCAAAGGTAGAAGAGGAAGAAGAGAAGACAGAAACTCCGGTGGTTGTGGAGGAGCCAA
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AGAAGACTGAGGCAGAGGAAGTTGTGGCTGCTGAGGAAGTCGCCGCCGAGTAAAGAGCAA
GAAACTGTATATGACCTTCTTTGGTCTCATTTCGTTGTCTTTTTAAATTATATTTTATCA
AAATTTCATATGTATTTTCTGTATCGTTTGTTTGGGTTTATGATGATGTAATCAGATTTT
TG

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 6

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AACACACGATAGTATGATACATTCATTAGGTTACACCTCATAACCTTTTATTCACACACC
ATTTCTTATTAACTCACACGCGCAAGACCAACATCATAGCATGAAGGCTGCCATATTAAC
CACATTTATTATCTTTAACAACTAAGACTCGTTCCAGGAGTGATCCCAAACAACCTACAG
AACTCCAAGTAGAGATTAACTCTGCTTTGAACCGCTGCCGGACGCCCACCGCTGCACTCC
CCACCGTTAATCTTCCTTATGGTGGCTCCAAAGCCTTGGTCCAAGACCGGACGGACATTT
TGGTTCCAGAACCACATGGCACACTTAAAGGCCACATCAGGATTACGAGCCACCATATCT
GGATCAGTCAATAGAGGGAGTCCAAGGAACTTTCCGGCTGCACCGTAGTTGTAGTTCCAT
GTGATCTGGATAGGACCACGTCCGTAGTAGTTCTTTCCCGGTTGACAAGGGTAGACTGAG
CTAGCTTGGCAGTACCTTCCTCTTGCTATTTCTTCTTTGTAACAAAAACTTCCAGATTCG
TGTGAGAACTGAGCCAACATGGCGGCGATTTCACGCTTAGCGACGGTTCCTCGATAGGCC
GGGAACGATTGAGCAGCCGAGATGAAAGCCTGACGAGTGTAGAACCCTTTTGCTGGGCAG
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GTATCACGAGGGTCAGCGTTTAGACCTCCACCGCCACCGCCACCGCTTTGGGAGCTGCAA
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GTTGTTAGGATGGTTAAGGTGAAGAGAAAAAGGATGAGAGTGTTTTTTGGAATCGATATT
TGGGTAGCCATTTTTTTCTGTTTGAGAGTGGGTTGGGAGATATTGTTGTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CH66JQ U 1
AF RS1BR44JQ U 56
AF RS1CS85JQ U 56
AF RS1BR44TF C 312
AF RS1CH66TF C 356
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BS 1 125 RS1CH66JQ
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TGTGAGAACTGAGCCAACATGGCGGCGATTTCACGCTTAGC

QA 1 641 1 641
DS 

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GT
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CAGCCGTTTCCTGCTTTGCTCATGATACCAT

QA 3 693 3 693
DS 

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GT
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ACCATTTCTTATTAACTCACACGCGCAAGACCAACATCATAGCATGAAGGCTGCCATATT
AACCACATTTATTATCTTTAACAACTAAGACTCGTTCCAGGAGTGATCCCAAACAACCTA
CAGAACTCCAAGTAGAGATTAACTCTGCTTTGAACCGCTGCCGGACGCCCACCGCTGCAC
TCCCCACCGTTAATCTTCCTTATGGTGGCTCCAAAGCCTTGGTCCAAGACCGGACGGACA
TTTTGGTTCCAGAACCACATGGCACACTTAAAGGCCACATCAGGATTACGAGCCACCATA
TCTGGATCAGTCAATAGAGGGAGTCCAAGGAACTTTCCGGCTGCACCGTAGTTGTAGTTC
CATGTGATCTGGATAGGACCACGTCCGTAGTAGTTCTTTCCCGGTTGACAAGGGTAGACT
GAGCTAGCTTGGCAGTACCTTCCTCTTGCTATTTCTTCTTTGTAACAAAAACTTCCAGAT
TCGTGTGAGAACTGAGCCAACATGGCGGCGATTTCACGCTTAGCGACGGTTCCTCGATAG
GCCGGGAACGATTGAGCAGCCGAGATGAAAGCCTGACGAGTGTAGAACCCTTTTGCTGGG
CAGCCGTTTCCTGCTTTGCTCATGATACCATCAAAAACTGCTGGTGTGACAACATTTGCA
ATTGTATCACGAGGGTCAGCGTTTAGACCTCCACCGCCACCGCCACCGCTTTGGGAGCTG
CAAG*TCCGCTTCTGCATCCTGTGCCACAGTA

QA 3 814 3 814
DS 

RD RS1BR44TF 762 0 0
ATCTTCTTATGG
GGCTCCAAAGCCTTG*TCCAAGACCGGACGGACATTT*GGTTCCAGAACCACATGGCACA
CTTAAAGGCCACATCAGGATTACGAGCCACCATATCTGGATCAGTCAATAGAGGGAGTCC
AAGGAACTTTCCGGCTGCACCGTAGTTGTAGTTCCATGTGATCTGGATAGGACCACGTCC
GTAGTAGTTCTTTCCCGGTTGACAAGGGTAGACTGAGCTAGCTTGGCAGTACCTTCCTCT
TGCTATTTCTTCTTTGTAACAAAAACTTCCAGATTCGTGTGAGAACTGAGCCAACATGGC
GGCGATTTCACGCTTAGCGACGGTTCCTCGATAGGCCGGGAACGATTGAGCAGCCGAGAT
GAAAGCCTGACGAGTGTAGAACCCTTTTGCTGGGCAGCCGTTTCCTGCTTTGCTCATGAT
ACCATCAAAAACTGCTGGTGTGACAACATTTGCAATTGTATCACGAGGGTCAGCGTTTAG
ACCTCCACCGCCACCGCCACCGCTTTGGGAGCTGCAAGGTCCGCTTCTGCATCCTGTGCC
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TCCTGTTGTACCGCAGTTCTGCGAGAACGCGGTTTTTGTTGTTAGGATGGTTAAGGTGAA
GAGAAAAAGGATGAGAGTGTTTTTTGGAATCGATATTTGGGTAGCCATTTTTTTCTGTTT
GAGAGTGGGTTGGGAGATATTGTTGTGTCC

QA 13 762 13 762
DS 

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CAGTCAATAGAGGGAGTCCAAGGAACTTTCCGGCTGCACCGTAGTTGTAGTTCCATGTGA
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CTTGGCAGTACCTTCCTCTTGCTATTTCTTCTTTGTAACAAAAACTTCCAGATTCGTGTG
AGAACTGAGCCAACATGGCGGCGATTTCACGCTTAGCGACGGTTCCTCGATAGGCCGGGA
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TTCCTGCTTTGCTCATGATACCATCAAAAACTGCTGGTGTGACAACATTTGCAATTGTAT
CACGAGGGTCAGCGTTTAGACCTCCACCGCCACCGCCACCGCTTTGGGAGCTGCAAGGTC
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TAGCCATTTTTTTCTGTTTGAGAGTGAGTTGGGAGATATTGTTGTGTCC

QA 10 718 10 718
DS 

RD RS1CS85TF 720 0 0
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CATATCTGGATCAGTCAATAGAGGGAGTCCAAGGAACTTTCCGGCTGCACCGTAGTTGTA
GTTCCATGTGATCTGGATAGGACCACGTCCGTAGTAGTTCTTTCCCGGTTGACAAGGGTA
GACTGAGCTAGCTTGGCAGTACCTTCCTCTTGCTATTTCTTCTTTGTAACAAAAACTTCC
AGATTCGTGTGAGAACTGAGCCAACATGGCGGCGATTTCACGCTTAGCGACGGTTCCTCG
ATAGGCCGGGAACGATTGAGCAGCCGAGATGAAAGCCTGACGAGTGTAGAACCCTTTTGC
TGGGCAGCCGTTTCCTGCTTTGCTCATGATACCATCAAAAACTGCTGGTGTGACAACATT
TGCAATTGTATCACGAGGGTCAGCGTTTAGACCTCCACCGCCACCGCCACCGCTTTGGGA
GCTGCAAGGTCCGCTTCTGCATCCTGTGCCACAGTAAGCGGCTGTGGTGCCACAGTATCC
ATATCTACTGCAGCATAGGTTCCTCGCACATCCTGTTGTACCGCAGTTCTGCGAGAACGC
GGTTTTTGTTGTTAGGATGGTTAAGGTGAAGAGAAAAAGGATGAGAGTGTTTTTTGGAAT
CGATATTTGGGTAGCCATTTTTTTCTGTTTGAGAGTGGGTTGGGAGATATTGTTGTGTCC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 5

CO CL1112Contig1 1074 5 11 U
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GCAAAAAAAAAGAAAAGAAAACCATAACACAAAAATGGTTTCTGTTACATAAAAAAAAAA
GAAAACACAATGTTCAGATTTAGAACTTTCAATAGCACACAACATAGATCTACACAACTA
GAGTTTAAATTAGACATTTCCTCACAATTATGCTTAACACCGTTTAAGCCTTCTCTCTGG
TACATTTGTTATCATCAGAATCAAGAACACCACAAGAAAGTGAATATTTTAACCGATGAG
GAAAAGATTCACAGTTATGTTCGTAAGACACATCTTCCCCCGAAAACCCAAGCAGTTTCA
AAGCTCTTACAAAACAGAAAAAACAGAAAAAAACTCTGTTTCTGAATCCTCTTTTATTAA
ACACTACAACCGAGACCTTTAGCTTCTGATCCTTTCATGATCCTTAGCCTCTTACAAGAC
GAAACAAACATCTCCCAAGGAACATCTCCAACAAGCATCCAATCACCATCTTTGTCTTCA
TAAGTAGGCACAAAGTCTGAGCCTTTATATCCTTCTCTCTCAAAATATTCTCCCACAGAG
AATTTAAACATGTTTTCAAGTGATTTCATCAATTCTGAATATTGCTTATACACCGTTAGA
TCTATCTTCCTCAGATAGGGAGCACCATCCATACTTACTTTCACATACATTCCTTGACCT
TCAGATTCATTTTTCTTTGTCTGAATATTGTTCTTCCTGTAAGATCTTACAGGTGGCCAT
CCAACAATCTGAGCCTTTGGAGGAGAAGCTGTTTCTGTTTTTCCAGTAGATTCAATATCT
TTCTCAGTTTCAGGCAAGGCTCTTTTGTTGCTTCTACCGCAAGGAACCTTTTGTTTCTCT
TCTTCACCTCCATCTTCTGTTCCTGGTAATCCCAGTCTCAGCTCTGTTGCCTTTAGGTTA
ACAAACTCATCACAAACTCCAACGTTTTCCATTTCTTAACTAGGTTAGTCTTCAAAGAAA
GAAACTCTGTTCTTTGTGTGGTGTCTCAGAGAGAGAAAGAGTTATTGATAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RS1GA41JQ U 1
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GCAAAAAAAAAGAAAAGAAAACCATAACACAAAAATGGTTTCTGTTACATAAAAAAAAAA
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TACATTTGTTATCATCAGAATCAAGAACACCACAAGAAAGTGAATATTTTAACCGATGAG
GAAAAGATTCACAGTTATGTTCGTAAGACACATCTTCCCCCGAAAACCCAAGCAGTTTCA
AAGCTCTTACAAAACAGAAAAAACAGAAAAAAACTCTGTTTCTGAATCTTCTTTTATTAA
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GAAACAAACATCTCCCAAGGGACATCTCCAACAAGCATCCAATCACCATCTTTGTCTTCA
TAAGTAGGCACAAAGTCTGAGCCTTTATATCCTTCTCTCTCAAAATATTCTCCCACAGA

QA 1 599 1 599
DS 

RD RS1H105JQB 573 0 0
GC
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TTTCCAGTAGATTCAATATCTTTCTCAGTTT

QA 3 573 3 573
DS 

RD RS1DY48JQ 757 0 0
C
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AAGCAGTTTCAAAGCTCTTACAAAACAGAAAAAACAGAAAAAAACTCTGTTTCTGAATCT
TCTTTTATTAAACACTACAACCGAGACCTTTAGCTTCTGATCCTTTCATGATCCTTAGCC
TCTTACAAGACGAAACAAACATCTCCCAAGGAACATCTCCAACAAGCATCCAATCACCAT
CTTTGTCTTCATAAGTAGGCACAAAGTCTGAGCCTTTATATCCTTCTCTCTCAAAATATT
CTCCCACAGAGAATTTAAACATGTTTTCAAGTGATTTCATCAATTCTGAATATTGCTTAT
ACACCGTTAGATCTATCTTCCTCAGATAGGGAGCACCATCCATCCTTACTTTCACATACA
TTCCTTGACCTTCAGATTCATTTTTCTTTGTCTGAATATTGTTCTTCCTGTAAGATCTTA
CAGGTGGCCATCCAACAAACTGAGCCTTTGGAGGAGAAGCTGTTTCTGTTTTTCCAGTAG
ATTCAATATCTTTCTCAGTTTCAGGCAAGGCTCTTTTGTTGCTTCTACCGCAAGGAACCT
TTTGTTTCTCTTCTTCACCTCCATCTTCTGTTCCTG

QA 2 757 2 757
DS 

RD RS1H105TF 670 0 0
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TAGCCTCTTACAAGACGAAACAAACATCTCCCAAGGAACATCTCCAACAAGCATCCAATC
ACCATCTTTGTCTTCATAAGTAGGCACAAAGTCTGAGCCTTTATATCCTTCTCTCTCAAA
ATATTCTCCCACAGAGAATTTAAACATGTTTTCAAGTGATTTCATCAATTCTGAATATTG
CTTATACACCGTTAGATCTATCTTCCTCAGATAGGGAGCACCATCCATACTTACTTTCAC
ATACATTCCTTGACCTTCAGATTCATTTTTCTTTGTCTGAATATTGTTCTTCCTGTAAGA
TCTTACAGGTGGCCATCCAACAATCTGAGCCTTTGGAGGAGAAGCTGTTTCTGTTTTTCC
AGTAGATTCAATATCTTTCTCAGTTTCAGGCAAGGCTCTTTTGTTGCTTCTACCGCAAGG
AACCTTTTGTTTCTCTTCTTCACCTCCATCTTCTGTTCCTGGTAATCCCAGTCTCAGCTC
TGTTGCCTTTAGGTTAACAAACTCATCACAAACTCCAACGTTTTCCATTTCTTAACTAGG
TTAGTCTTCAAAGAAAGAAACTCTGTTCTTTGTGTGGTGTCTCAGAGAGAGAAAGAGTTA
TTGATAATCC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RS1GA41TF 587 0 0
ACAAACATCTCCCAAGGAACATCTCCAACAAGCATCCAATCACCATCTTTGTCTTCATAA
GTAGGCACAAAGTCTGAGCCTTTATATCCTTCTCTCTCAAAATATTCTCCCACAGAGAAT
TTAAACATGTTTTCAAATGATTTCATCAATTCTGAATATTGCTTATACACCGTTAGATCT
ATCTTCCTCAGATAGGGAGCACCATCCATACTTACTTTCACATACATTCCTTGACCTTCA
GATTCATTTTTCTTTGTCTGAATATTGTTCTTCCTGTAAGATCTTACAGGTGGCCATCCA
ACAATCTGAGCCTTTGGAGGAGAAGCTGTTTCTGTTTTTCCAGTAGATTCAATATCTTTC
TCAGTTTCAGGCAAGGCTCTTTTGTTGCTTCTACCGCAAGGAACCTTTTGTTTCTCTTCT
TC*CCTCCATCTTCTGTTCCTGGTAATCCCAGTCTCAGCTCTGTTGCCTTTAGGTTAACA
AACTCATCACAAACTCCAACGTTTTCCATTTCTTAACTAGGTTAGTCTTCAAAGAAAGAA
ACTCTGTTCTTTGTGTGGTGTCTCAGAGAGAGAAAGAGTTATTGAT
C

QA 1 586 1 586
DS 



AS 1 6

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CATCCCTTAAGACACTAAACCAAACAACTCTATCAGCTCTTGTCTCCCTCAGATTGGTTA
CTTCTCCATCAAGCTTCACCACTTCTGTATCTACTTCGACATCAACTACAACCTCACTTT
CTGCTTCGTTGTAACTACATGAGTAAACCTCTTCCCATCTTTGTTTAAGAGTCATGCTGT
AATAAGTTGAGTTTTTCATCTGCTCCTTTGCGTCTCCTTCTTTCACGAATATGAAAGGAA
CATACCATTTTCCTACCACAACGCTTGTATTCACATCATTGGGAAGCTCAGAACGAAGCT
CAGCGTTGATTCCCTTTGCATCATCTCTCAAACCAAAATCTTGAGAGTTCGAGTACTCAA
CGGTCCAATACTTTCTTTTAAGGAACTCAGGTGGTATCCCATTAGGAGCAACAGAAATGG
CTGTGTTATAGCAAGATAATACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGGGATTC
AAAGTTAAATCTGCATTGAATTCATCTCAGAGGTTGGGAGCAAACCTTAGTAGTTGAATC
TCCAGAGCTTCAATGGCGATTCGATGGTCAGAGCTATGTATCGTACTGTTGGCACTGTCT
TACGCCATCTGCGTCATTGCAGCGAAGAGCTACTACGATGTGTTGCAAGTTCCTAAAGGC
GCCTCTGACGAGCAGATCAAGAGAGCTTATCGCAAACTCGCTTTGAAGTATCATCCCGAC
AAGAATCAAGGCAACGAGGAAGCTACTCGCAAGTTCGCGGACATCAACAACGCTTATGAA
GTGCTATCGGATGAGGAGAAGAGGGAGATATATAACAAGTATGGTGAAGAAGGGCTTAAA
CAGCATGCTGCTAATGGAGGACGTGGAGGTGGTGGTGGGGGCATGAATATGCAGGACATC
TTTAGCCAGTTTTTTGGGGGTGGTGGTTCGAGGGAGGAAGAAGAGAAGGTCGTCAAGGGT
GATGACGTGATTGTGGAACTTGAGGCCACTCTTGAAGATTTGTACATGGGAGGCTCTGTC
AAGGTATGGAGGGAGAAGAATGTAATAAAACCAGCTCCTGGAAAGAGAAAGTTCAACTGC
AGGAATGAGGTTTATCACCGACAAGTTGGTCCCGGAATGTTCCAACAGATGACAGAGCAG
GTCTGTGACAAATGCCCAAATGTCAAATACGAACGCGAAGGATACTTTGTCACAGTTGAT
ATCGAAAAAGGCATGAAAGATGGAGAAGAAGTGTCTTTCTACGAAGATGGCGAACCTATT
CTTGACGGTGATCCTGGTGACCTTAAGTTCCGAATCAAAACTGCACCACATGCCCGTTTC
CGGAGAGATGGCAACGATCTACACATGACCGTCAACATTACACTGGTTGAGGCGCTTGTT
GGTTTTGAGAAGTCATTCAAACACTTGGATGATCACGATGTTGACATCGGTTCCAAGGGA
ATTACAAAGCCAAAGGAAGTGAAGAAGTTCAAAGGAGAAGGGATGCCACTTCACTACAGC
ACAAAGAAAGGCAACCTCTTTGTCACTTTTGAGGTTTTGTTTCCTTCTTCACTCACTGAG
GATCAGAAGAAGAATATCAAACAAATCTTGGCTTAGTACTCTCTCTTTAGAATTTTGTTG
TTTAAATAGAACTTGTAATGATCCTTAATATTTGTAACACTACTAGGTTTGTTTTAATAT
AGAATGATTGATCTAATTGTCTTTTTATGTATCAAATCCTTTCATGATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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GG
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TAT

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G
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TGTAATGATCCTTAATATTTGTAACACTACTAGGTTTGTTTTAATATAGAATGATTGATC
T

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DS 



AS 1 6

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TCCGGCTCAATGACAACCGATTGACCGGTTCAATCCCTAGAGAACTAACGAAAATCCCAA
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CTTTTGAACACATTCCTTTGGAGAACTTTGAGAACAACTCGCGATTGGAGGGACCGGAAC
TACTCGGTCTTGCAAGCTACGACACCAACTGCAACTGAGACAACTTTTTAAAAAATTGGG
GGTGGATCTTGTAAGAACACTTCACCACTTTTTATCAAATATCACATCTTTTATTTTGTA
ATAAGTATATATATGTCAGTAGTTGAAAAACAAAGAAAAAAGAGCCG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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TTCTGAACTTGGAAAATTGAAAAGTCTCATCAGCTTGGATCTTTACAACAACAATCTTAC
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ATGTCAGTAGTTGAAAAACAAAGAAAAAAGAGCCG

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AACGAAAATCCCAAGCCTTAAAGTCTTTGATGTGTCGAACAATAATTTGTGTGGAACTAT
CCCAATAGAAGGACCTTTTGAACACATTCCTTTGGAGAACTTTGAGAACAACTCGCGATT
GGAGGGACCGGAACTACTCGGTCTTGCAAGCTACGACACCAACTGCAACTGAGACAACTT
TTTAAAAAATTGGGGGTGGATCTTGTAAGAACACTTCACCACTTTTTATCAAATATCACA
TCTTTTATTTTGTAATAAGTATATATATGTCAGTAGTTGAAAAACAAAGAAAAAA

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ATTCAAACCTTTCTGGACATCTTGCCCCTGAGCTTGGGAAGCTCGAACATTTACAGTATC
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CAAATATCACATCTTTTATTTTGTAATAAGTATATATATGTCAGTAGTTG

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DS 



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BQ
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5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1BK45TF U 94
AF RS1GG89TF U 31
AF RS1CQ38TF U 1
AF RS1GG89JQ C 626
AF RS1G006JQ C 833
BS 1 640 RS1CQ38TF
BS 641 641 RS1GG89TF
BS 642 809 RS1CQ38TF
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TCTCTATTCCCATGGGAACGCCGCTGATTTGGGTCAGATGTTTGAGCTTTTCGTCGAGCT
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TGGAAAGGCAAGCGAATGTAACACATATGCTGATATAGATGCATCGTATAACTGCCTGAA
AGAACATTACGGTGTAAAAGATGATCAACTGATATTATATGGTCAGTCTGTTGGTAGTGG
ACCCACGATTGATTTATCTTCGCGCACGCCTAATTTAAGAGGAGTTGTTTTGCATAGCCC
TATTCTCTCTGGGATGAGAGTTCTGTACCCGGTTAAACGAACATATTGGTTTGACATTTA
CAAGAATATC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RS1GG89TF 655 0 0
GGG
GGAAACCTAAAGAAAGAGAGGAATCTAGGGTTTATGAGTAAGAAGAGGTGGTTCTGATGA
TAAAATCGTCTTCCTCTCAATGGGAGGAGTAACTTCATCAATCGCCGCCAAATTCGCTTT
CTTCCCGCCAACCCCGCCTTCTTACGGTTTGATTACCGACGACAGCTCCTCCTCCGTTGA
CCGATTGTACATTACCGATGTTCCTCGCCGCGATGACGTTAACGTCCTGAAGCTACGCAC
TCGCCGTGGCAACGAGATCGTTGCTATTTACGTCAAGCACCCTAAAGCTAATTGTACGCT
TCTCTATTCCCATGGGAACGCCGCTGATTTGGGTCAGATGTTTGAGCTTTTCGTCGAGCT
TAGCAGCCGCCTCCGTGTTAATCTCATGGGGTATGATTACTCTGGCTATGGTCAATCTAC
TGGAAAGGCAAGCGAATGTAACACAT**GCTGATATAGATGCATCGTATAACTGCCTGAA
AGAACATTACGGTGTAAAAGATGATCAACTGATATTATATGGTCAGTCTGTTGGTAGTGG
ACCCACGATTGATTTAGCTTCGCGCACGCCTAATTTAAGAGGAGTTGTTTTGCATAGCCC
TATTCTCCCTGGGATGAGAGTTCTGTACCCGGTTAAACGAACATATTGGTTT

QA 4 655 4 655
DS 

RD RS1CQ38TF 815 0 0
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GGGTTTATGAGTAAGAAGAGGTGGTTCTGATGATAAAATCGTCTTCCTCGCAATGGGAGG
AGTAACTTCATCAATCGCCGCCAAATTCGCTTTCTTCCCGCCAACCCCGCCTTCTTACGG
TTTGATTACCGACGACAGCTCCTCCTCCGTTGACCGATTGTACATTACCGATGTTCCTCG
CCGCGATGACGTTGACGTCCTGAAGCTACGCACTCGCCGTGGCAACGAGATCGTTGCTAT
TTACGTCAAACACCCTAAAGCTAATTGTACGCTTCTCTATTCCCATGGGAACGCCGCTGA
TTTGGGTCAGATGTTTGAGCTTTTCGTCGAGCTTAGCAGCCGCCTCCGTGTTAATCTCAT
GGGGTATGATTACTCTGGCTATGGTCAATCTACTGGAAAGGCAAGCGAATGTAACACATA
TGCTGATATAGATGCATCGTATAACTGCCTGAAAGAACATTACGGTGTAAAAGATGATCA
ACTGATATTATATGGTCAGTCTGTTGGTAGTGGACCCACGATTGATTTAGCTTCGCGCAC
GCCTAATTTAAGAGGAGTTGTTTTGCATAGCCCTATTCTCTCTGGGATGAGAGTTCTGTA
CCCGGTTAAACGAACATATTGGTTTGACATTTACAAGAATATCGACAAGATCGGTTCTGT
TTCCTGTCCTATCTTAGTCATCCATGGAACTGCAGATGAAGTAGTTGATTGGTCTCATGG
GAAACAACTTTGGGAACTTTCCAAAGAAA
GTATGA

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DS 

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GACATTTACAAGAATATCGACAAGATCGGTTCTGTTTCCTGTCCTATCTTAGTCATCCAT
GGAACTGCAGATGAAGTAGTTGATTGGTCTCATGGGAAACAACTTTGGGAACTTTCCAAA
GAAAAGTATGAACCTCTATGGGTCTCTGGTGGAGGACACTGCAACCTTGAACTCTATCCA
GAGTTCATCAAACATCTGAAGAAGTTTGTAATATATATTTCTAAACCCAAGGGACCAAGA
GACGGTTCAAACAAGACGAATGCAACAGATGCAACCAAGGACCAAAGCAAGCCTTCAGAG
AATGGACGTGCTGACACGTTTCAACTCGGCTGCTGCCTTCCGGAAGTTTCCAGAAACAGT
GTTGACAGTCAGCTTGAGAAATCTAAGAAGACTAATAAACCTGAGAAGTCTCGGATGAGT
GTTGATAGGTTTAGAAGGAAAAAAGGCCTGGTCTGGTGACATAAAACTGGTCTAAGCAAC
GATCAAAAACAGGTTATTTGTTGTACCACTTGTTTCTGTAATACTATCTATTTTTGTTTC
TGCATAAGTTGTGATGATGTGTGTGTGTGTATTTTATCTCTCTTTTGTTGTATGTATTTT
CTGACGGACATATCAAACTCAAAAGTCCTAGATTTTGTTACTTGGAGTGTTAAAAAATGC
TGTGGTGACTGATTAGTTTGACAGCTTAAACCG

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DS 

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GTAATATATATTTCTAAACCCAAGGGACCAAGAGACGGTTCAAACAAGACGAATGCAACA
GATGCAACCAAGGACCAAAGCAAGTCTTCAGAGAATGGACGTGCTGACACGTTTCAACTC
GGCTGCTGCCTTCCGGAAGTTTCCAGAAACAGTGTTGACAGTCAGCTTGAGAAATCTAAG
AAGACTAATAAACCTGAGAAGTCTCGGATGAGTGTTGATAGGTTTAGAAGGAAAAAAGGC
CTGGTCTGGTGACATAAAACTGGTTTAAGCAACGATCAAAAACAGGTTATTTGTTGTACC
ACTTGTTTCTGTAATACTATCTATTTTTGTTTCTGCATAAGTTGTGATGATGTGTGTGTG
TGTATTTTATCTCTCTTTTGTTGTATGTATTTTCTGACGGACATATCAAACTCAAAAGTC
CTAGATTTTGTTACTTGGAGTGGTAAAAAATGCTGTGGTGACTGATTAGTTTGACAGCTT
AAACC

QA 1 545 1 545
DS 



AS 3 6

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TCATCCGTGGCCAAGGCGGAGGCCTGACTCTACGCGGCCGCGGTGGTGAGATATGTCCTT
TCGACATCGTGCAAGAATCATCCGAGGTCGACGAGGGTATTCCCGTAAAATTCTCAAACT
GGAGGATCAAAGTTGCGTTCGTTCCCGAATCACAGAACCTTAACATCGAGACAGACGTTG
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AATCTGGAGATGATGCTTACAAGTTTGTGTTCTGTCCTCCCGCTCTTGAGACTGGCCGTC
CTAGATGCAGGAATGTCGGTATATTTGTGGATGAAAAAGGCATCAGGCGTTTGGCTTTAA
CCTCGAAGCCGTTCTTGGTTATGTTCAAGAAAGCTAAAGTTACTGAAACTTCGTCCAAGA
CTATGTGGGACTTGCATGGGAGAACAAGACTCGATGTTTACTTTGACTTATAATAAAACC
TCTCTATGTTGTTTTCCTTTGAAGATTACATATTGAATAAAATATCTCTTATCTC


BQ
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AF RS1BR09TF U 1
AF RS1BR09JQ C 1
BS 1 177 RS1BR09TF
BS 178 775 RS1BR09JQ

RD RS1BR09TF 177 0 0
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TGAATCGTACGTTTTACTTCTTTCTTGCCTTAACCGCAGTTTTGGCCACAAACACATATG
GCCAGGTTCTTGACATCGACGGTGACACCATCTTCCGCGGCAGTTACTATGTTCTCC

QA 1 177 1 177
DS 

RD RS1BR09JQ 775 0 0
GGATCCACCAAACACCCAATTAAATTACGACAACAAAAAAA*CTCAAAAATACAATATCA
TGAATCGTACGTTTTACTTCTTTCTTGCCTTAACCGCAGTTTTGGCCACAAACACATATG
GCCAGGTTCTTGACATCGACGGTGACACCATCTTCCGCGGCAGTTACTATGTTCTCCCCG
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TCTCTATGTTGTTTTCCTTTGAAGATTACATATTGAATAAAATATCTCTTATCTC

QA 1 775 1 775
DS 



CO CL1116Contig2 697 2 11 U
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TTTTATTACAAGTCAAAGTAAACATCGAGTCTTGTTCTCCCACGCAAGTCTCACATAGTC
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CGGCCAGTCTCAAGAGCGGGAGGACAGAACACAAACTTGTAAGCATCATCTCCAGATTTC
TCGATCTGGAAAAAACTCTTCAGTGAATCTTGTGGACCAGCCCTCACGAAGTACTGCTTC
CTCTCCTCGTCAAAATCACCGACTTGCCAATACGTTGACTGGATGCATATCGTGGCTACA
ACGTCCGTCTCGATGTTAAGGTTCTGTGATTCGGGAACGAACGCAACTTTGATCCTCCAG
TTTGAGAATTTTACGGGAATACCCTCGTCGACCTCGGATGATTCTTGCACGATGTCGAAA
GGACATATCTCACCACCGTCGATGTCAGGAACCTGGCCATATGTGTTTGTGGCCAAAACT
GCGGTTAAGGCAAGAAAGAAGTAAAACGTACGATTCATGATATTGTATTTTTGAGTTTTT
TTTGTTGTTGTAATTTAATTGGGTGTTTGGTGGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
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C

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DS 



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BQ
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AF RS1AM78JQ U 87
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QA 1 208 1 208
DS 

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ATTTTACGGGAATACCCTCATCGACCTCGGATGATTTTTGCACGATGTCGAGAGGACATA
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QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 5

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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DR95JQ U 153
AF RS1AC41JQ U 312
AF RS1CY08JQ U 54
AF RS1AC41TF C 48
AF RS1CY08TF C 1
BS 1 58 RS1CY08TF
BS 59 79 RS1CY08JQ
BS 80 80 RS1CY08TF
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BS 138 138 RS1CY08TF
BS 139 140 RS1CY08JQ
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BS 142 142 RS1CY08JQ
BS 143 143 RS1CY08TF
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BS 153 239 RS1DR95JQ
BS 240 240 RS1CY08JQ
BS 241 311 RS1DR95JQ
BS 312 410 RS1AC41JQ
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BS 485 485 RS1DR95JQ
BS 486 502 RS1AC41JQ
BS 503 503 RS1CY08JQ
BS 504 585 RS1AC41JQ
BS 586 598 RS1CY08JQ
BS 599 622 RS1CY08TF
BS 623 623 RS1AC41TF
BS 624 803 RS1CY08TF

RD RS1DR95JQ 345 0 0
ATCCTTTTAAAACCCACGCCTCGGACGCTCCTCAGCTACGTTCACTCTGATTGCTCTACC
CTCCATGTTCTGTCCATCAAGAGCAGCGATAGCGTCGTTGAGTTCAGTCTCGTTAGACAT
TGTGACAAAACCGAACCCACGTGAACGACCCGTCTCACGGTCATAAACCACACGAGCTTA
CACGACTTTACCATGCTCACTGAATACTTGCTCTAGACGACCGTTGTCCACATCCCACGG
CAGGTTTCCCACATAGACTCTGAACGCAGGTTCATACACCCTAGGTTGGCGTTCTGGACG
TGATCCTCTCGGTGCTGCCTTGTTTACTGTCAGAAGCCGTCCGTT

QA 1 345 1 345
DS 

RD RS1AC41JQ 274 0 0
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ACCGTTGTCCACATCCCACGGCAGGTTTCCCACATAGACCCTGAACGCAGGTTCATACAC
CCTAGGTTGGCGTTCTGGACGTGATCCTCTCGGTGCTGCCTTGTTTACTGTCAAAAGCCG
TCCGTTCAGAT*ATAACGGTTGAACTTCTCAACAGCAGTCTCAGCTTCTTCCACGGTACT
CATCGTCACAAATCCAAACCCACGACTCTGGTCT

QA 1 274 1 274
DS 

RD RS1CY08JQ 545 0 0
CAACA
AAAAATCATCAAAGAGTGTAAAAATCTCGTCTAAACAAAATGCAAAGCGATAGATAGAGA
GAGGGAGAGGAAACTGGCAAAAAAAATAATCTCAATCCTTTTAAAACCCACGCCTCGGAC
GCTCCTCCGCTACGTTCACTCTGATTGCTCTACCCTCCATGTTCTGTCCATCAAGAGCAG
CAATAGCGTCGTTGAGTTCAGTCTCGTTAGACATTGTGACAAAACCGAACCCACGTGAGC
GACCCGTCTCACGGTCATAAACCACTCGAGCTTCCACGACTTTACCATGCTCACTGAAAA
CTTGTTCTAAACGACCGTTGTCCACATCCCACGGTAGGTTTCCCACATAAACTCTGAACG
CAGGTTCATATACCCTAGGTTGGCGTTCTGGACGTGATCCTCTTGGTGCTGCCTTGTTTA
CTGTCAGAAGCCGTCCGTTCAGATCATAACGGTTGAACTTCTCAACAGCAGTCTCAGCTT
CTTCCACGGTACTCATCGTCACAAATCCAAACCCACGACTCTGGTCTGTCTCCCTATTGT

QA 6 545 6 545
DS 

RD RS1AC41TF 582 0 0
CGGACACAACA
AAAAATCATCAAAGAGTGTAAGAATCTCGTCTAAACAAAATGCAAAGCGATAGGAAGAGA
GAGAGAGAGGAAACTGGCAGAAGAGATAATCTCAATCCTTTTAAAACCCACGCCTCGGAC
GCTCCTCAGCTACGTTCACTCTGATTGCTCTACCCTCCATGTTCTGTCCATCAAGAGCAG
CGATAGCGTCGTTGAGTTCAGTCTCGTTAGACATTGTGACAAAACCGAACCCACGTGAAC
GACCCGTCTCACGGTCATAAACCACACGAGCTTCCACGACTTTACCATGCTCACTGAATA
CTTGCTCTAGACGACCGTTGTCCACATCCCACGGCAGGTTTCCCACATAGACCCTGAACG
CAGGTTCATACACCCTAGGTTGGCGTTCTGGACGTGATCCTCTCGGTGCTGCCTTGTTTA
CTGTCAGAAGCCGTCCGTTCAGAT*ATAACGGTTGAACTTCTCAACAGCAGTCTCAGCTT
CTTCCACGGTACTCATCGTCACAAATCCAAACCCACGACTCTGGTCTGTCTCCCTATTGT
AGATAACCTCAGCGATTTCAACAGCACCGGC

QA 12 582 12 582
DS 

RD RS1CY08TF 803 0 0
GCTATATAGTAAAGCATTAGTCAGACAACAAAAAAATCATCAAAGGGGTCAGACACACAA
AAATCATCAAAGAGTGTAAGAATCTCGTCTAAACAAAATGCAAAGCGATAGATAGAGAGA
GGGAGAGGAAACTGGCAGAAGAGATAATCTCAATCCTTTTAAAACCCACGCCTCGGACGC
TCCTCCGCTACGTTCACTCTGATTGCTCTACCCTCCATGTTCTGTCCATCAAGAGCAGCA
ATAGCGTCGTTGAGTTCAGTCTCGTTAGACATTGTGACAAAACCGAACCCACGTGAGCGA
CCCGTCTCACGGTCATAAACCACTCGAGCTTCCACGACTTTACCATGCTCACTGAAAACT
TGTTCTAGACGACCGTTGTCCACATCCCACGGTAGGTTTCCCACATAGACTCTGAACGCA
GGTTCATATACCCTAGGTTGGCGTTCTGGACGTGATCCTCTTGGTGCTGCCTTGTTTACT
GTCAGAAGCCGTCCGTTCAGATCATAACGGTTGAACTTCTCAACAGCAGTCTCAGCTTCT
TCCACGGTACTCATCGTCACAAATCCAAACCCACGACTCTGGTCTGTCTCCCTATTGTAG
ATAACCTCAGCGATTTCAACAGTACCGGCTTGCTCAAAGAGCATAGCCAAGGCTTGACTG
TCAACATCGTAAGCCAAGTTTCCGACGAAGAGTGAAGGGTGGATAGTGGAGAGTGAAGGG
TGGGGGAAGATGGTGGAAAAGGAAGAGGAAGAGTCCGCCATGGCTAAAGGCTTGAAGCTT
GAGGTTACTATTGATGAAGCCCC

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 6

CO CL1118Contig1 794 6 10 U
GGAAGAGAATCGACCAATAAGATCAGGAGAAAGGTCCACGTGTCTTTATACGAAATCTTG
TCTAGTAAAAAGCGCAGCAGAAAAAAATCGAGTAAAGAAGAAGAAGACGAGAGTAGTAGC
AGAAGAAGAAGAAGA***ACCAGTTCGATGGCGATGACAGTAGCAGCTTCGTCCTCTGTG
GCAGTGATGATTCCACGTGTCCCCGCCGTCTCCGCTCGCTTATCCGCCGTTCCTTACCTT
CCTCCGCTGCCTCCTCGCTCTTTAGGCCGATCTTCTTTCACTGTTCCCCTGAAGCTAGTT
TCAGGGACCGGTTTACAGAAGGTTGAATTGATGAAGACGAGAGCTTCTTCATCAGACGAG
ACCTCAACGTCCATTGACACCAACGAACTCTTTACAGACTTGAAGGAAAAGTGGGATGGT
CTTGAGAACAAAACAACCGTGGTTATCTATGGAGGAGGAGCCATTGTAGCTGTTTGGTTA
TCTTCCATTCTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTCTGCTTCCTAAAGCTATGGAGCTT
GTCGGTCTCGGGTACACAGGATGGTTTGTCTACAGATACCTTCTCTTCAAGTCAAGCAGA
AAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGAAGATCGCAGGGACCGAATAGATT
CTTTCATAAAAATAATAAACTTTCTTTCTTTCTGGAGTTTTTCTGTAATGTGATTATTAT
TATACAATGTCTCTGTTTTCAACAATGTACCTTCTTCAGTGTGAAAATACTATCTTTGAT
CCATGGGCAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 10 40 40 40 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FY55TF U 1
AF RS1FY55JQ C 252
AF RS1CT11JQ C 92
AF RS1CT11TF U 92
AF RS1EN62TF U 96
AF RS1EN62JQ C 295
BS 1 197 RS1FY55TF
BS 198 198 RS1CT11TF
BS 199 202 RS1FY55TF
BS 203 203 RS1CT11TF
BS 204 266 RS1FY55TF
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BS 599 603 RS1FY55TF
BS 604 794 RS1CT11TF

RD RS1FY55TF 610 0 0
GGAAGAGAATCGACCAATAAGATCAGGAGAAAGGTCCACGTGTCTTTATACGAAATCTTG
TCTAGTAAAAAGCGCAGCAGAAAAAAATCGAGTAAAGAAGAAGAAGACGAGAGTAGTAGC
AGAAGAAGAAGAAGA***ACCAGTTCGATGGCGATGACAGTAGCAGCTTCGTCCTCTGTG
GCAGTGATGATTCCACGCGTCCTCGCCGTCTCCGCTCGCTTATCCGCCGTTCCTTACCTT
CCTCCGCTGCCTCCTCGCTCTTTAGGTCGATCTTCTTTCACTGTTCCCCTGAAGCTAGTT
TCAGGGACCGGTTTACAGAAGGTTGAATTGATGAAGACGAGAGCTTCTTCATCAGACGAG
ACCTCAACGTCCATTGACACCAACGAACTCTTTACAGACTTGAAGGAAAAGTGGGATGGT
CTTGAGAACAAAACAACCGTGGTTATCTATGGAGGAGGAGCCATTGTAGCTGTTTGGTTA
TCTTCCATTCTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTCTGCTTCCTAAAGCTATGGAGCTT
GTCGGTCTCGGGTACACAGGATGGTTTGTCTACAGATACCTTCTCTTCAAGTCAAGCGGA
AAG
AGTTGGC

QA 1 603 1 603
DS 

RD RS1FY55JQ 530 0 0
TCCTCGCTCTTTAGGTCGATCTTCTTTCACTGTTCCCCTGAAGCTAGTTTCAGGGACCGG
TTTACAGAAGGTTGAATTGATGAAGACGAGAGCTTCTTCATCAGACGAGACCTCAACGTC
CATTGACACCAACGAACTCTTTACAGACTTGAAGGAAAAGTGGGATGGTCTTGAGAACAA
AACAACCGTGGTTATCTATGGAGGAGGAGCCATTGTAGCTGTTTGGTTATCTTCCATTCT
TGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTCTGCTTCCTAAAGCTATGGAGCTTGTCGGTCTCGG
GTACACAGGATGGTTTGTCTACAGATACCTTCTCTTCAAGTCAAGCGGAAAGGAGTTGGC
TGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGAAGATCGCAGGGACCGAATAGATTCTTTCATAAAA
ATAATAAACTTTCTTTCTTTCTGGAGTTTTTCTGTAATGTGATTATTATTATACAATGTC
TCTGTTTTCAACAATGTACCTTCTTCAGTGTGAAAATACTATCTTTGA
CC

QA 1 528 1 528
DS 

RD RS1CT11JQ 697 0 0
GGAAA
GAAGAAGAAGACGAGAGTAGTAGCAGAAGAAGAAGAAGA***ACCAGTTCGATGGCGATG
ACAGTAGCAGCTTCGTCCTCTGTGGCAGTGATGATTCCACGTGTCCCCGCCGTCTCCGCT
CGCTTATCCGCCGTTCCTTACCTTCCTCCGCTGCCTCCTCGCTCTTTAGGCCGATCTTCT
TTCACTGTTCCCCTGAAGCTAGTTTCAGGGACCGGTTTACAGAAGGTTGAATTGATGAAG
ACGAGAGCTTCTTCATCAGACGAGACCTCAACGTCCATTGACACCAACGAACTCTTTACA
GACTTGAAGGAAAAGTGGGATGGTCTTGAGAACAAAACAACCGTGGTTATCTATGGAGGA
GGAGCCATTGTAGCTGTTTGGTTATCTTCCATTCTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCT
CTGCTTCCTAAAGCTATGGAGCTTGTCGGTCTCGGGTACACAGGATGGTTTGTCTACAGA
TACCTTCTCTTCAAGTCAAGCAGTAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAG
AAGATCGCAGGGACCGAATAGATTCTTTCATAAAAATAATAAACTTTCTTTCTTTCTGGA
GTTTTTCTGTAATGTGATTATTATTATACAATGTCTCTGTTTTCAACAATGTACCTTCTT
CAGTGTGAAAATACTATCTTTGATCC
ATGGGC

QA 6 691 6 691
DS 

RD RS1CT11TF 703 0 0
GGAAA
GAAGAAGAAGACGAGAGTAGTAGCAGAAGAAGAAGAAGA***ACCAGTTCGATGGCGATG
ACAGTAGCAGCTTCGTCCTCTGTGGCAGTGATGATTCCACGTGTCCCCGCCGTCTCCGCT
CGCTTATCCGCCGTTCCTTACCTTCCTCCGCTGCCTCCTCGCTCTTTAGGCCGATCTTCT
TTCACTGTTCCCCTGAAGCTAGTTTCAGGGACCGGTTTACAGAAGGTTGAATTGATGAAG
ACGAGAGCTTCTTCATCAGACGAGACCTCAACGTCCATTGACACCAACGAACTCTTTACA
GACTTGAAGGAAAAGTGGGATGGTCTTGAGAACAAAACAACCGTGGTTATCTATGGAGGA
GGAGCCATTGTAGCTGTTTGGTTATCTTCCATTCTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCT
CTGCTTCCTAAAGCTATGGAGCTTGTCGGTCTCGGGTACACAGGATGGTTTGTCTACAGA
TACCTTCTCTTCAAGTCAAGCAGTAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAG
AAGATCGCAGGGACCGAATAGATTCTTTCATAAAAATAATAAACTTTCTTTCTTTCTGGA
GTTTTTCTGTAATGTGATTATTATTATACAATGTCTCTGTTTTCAACAATGTACCTTCTT
CAGTGTGAAAATACTATCTTTGATCCATGGGCAAAAAA

QA 6 703 6 703
DS 

RD RS1EN62TF 696 0 0
G
GAAGAAGAAGACGAGAGTAGTAGCAGAAGAAGAAGAAGAAGAACCAGTTCGATGGCGATG
ACAGTAGCAGCTTCGTCCTCTGTGGCAGTGATGATTCCCCGTGTCCCGGCCGTCTCCGCT
CGCTTATCCGCCGTTCCTTACCTTCCTCCGCTGCCTCCTCGCTCTTTAGGCCGATCTTCT
TTCACTGTTCCCCTGAAGCT**TTTCAGGGAACGGTTTACAGAATGTTGAATTGACGAAG
A*GAGAGCTTCTTCATCAGACGAGACCTCAACGTCCATTGACACCAACGAACTCTTTACA
GACTTGAAGGAAAAGTGGGATGGTCTTGAGAATAAAACAACTGTGGTTATCTATGGAGGA
GGAGCCATTGTAGCTGTTTGGTTATCTTCCATTCTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCC
CTGCTTCCTAAAGTTATGGAGCTTGTTGGTCTCGGGTACACAGGATGGTTTGTCTACAGA
TACCTTCTCTTCAAGTCAAGCAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAG
AAGATCGCAGGGACCGAATAGATTCTTTCATAAAAATAATAAACTTTCTTTCTTTCTGGA
GCTTTTCTGTAATGTGATTATTAT***ACAATGTCTCTGTTTTCA*CAGTGTACCTTCTT
CAGTGTGAAAATATTATCTTTGATCCA
AAAAAAAA

QA 2 688 2 688
DS 

RD RS1EN62JQ 488 0 0
AGCT
TTTCAGGGAACGGTTTACAGAATGTTGAATTGACGAAGA*GAGAGCTTTTTCATCAGACG
AGACCTCAACGTCCATTGACACCAACGAACTCTTTACAGACTTGAAGGAAAAGTGGGATG
GTCTTGAGAATAAAACAACTGTGGTTATCTATGGAGGAGGAGCCATTGTAGCTGTTTGGT
TATCTTCCATTCTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCCCTGCTTCCTAAAGTTATGGAGC
TTGTTGGTCTCGGGTACACAGGATGGTTTGTCTACAGATACCTTCTCTTCAAGTCAAGCA
GAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGAAGATCGCAGGGACCGAATAGA
TTCTTTCATAAAAATAATAAACTTTCTTTCTTTCTGGAGCTTTTCTGTAATGTGATTATT
AT***ACAATGTCTCTGTTTTCAACAGTGTACCTTCTTCAGTGTGAAAATATTATCTTTG
ATCC

QA 5 488 5 488
DS 



AS 2 6

CO CL1119Contig1 821 4 8 U
GGTAGAGTCAATTTACACCAATAGAGTGATTTACAGTGACTTTAGACATCTAGCTTTATT
GCGTTAGCATAACGAAAAGCATACAGTGTTACATTTTATTTCAAATGGTGGATGTATCTC
TTAATTAGTTTTTTGGCTACAATTTTATTGAATCTTTGGGTAGGATGGAAACTATCCCAA
AACAAGTGAGCAGATACATTGGAGCACACATCTGTTGTGAATCGATTGCAGAGTATACCT
GCTTCCAAAAGTCCAGTTCCACAACATCCTTTCTTTATTTCCTCAAACCCATAATCTTGT
GAGTTTTCTATGATGTCACTGAAAGGAGAGTAGATGTCAATGTAGAAGATATTTGAATTT
GGTAGGGCATGAGTCAATTGATCCAACGTGATGAAGAGTTTGGCATTGAAAAGCTGAGAT
GCATAGTTTAGTTCTTGAGCGCAGTCTCTATGAGGACCTCCCTTTATGCTTCTTTGCGCT
GGTATACATCCAAGTGGTGGTGTTCCTATCACTGCTATTTGTCTTGCTCCATATCCATGT
AATTGCATAACGAAACTTGCGGCAGACTTAGCCATCATTGATGTAAAGTTGTGAATGTTG
TATATGAGCGATTGAGCACCTTGACCATAGTATGTAATAAGCAGATCGTTGTTACCTGCG
ACCACAATGGCTAAGCCCTTGGCTAATAAGTGATTAGTCTTATCTTTCCCTAGTAACCTC
GTTGCCCTCGCTATGTATTGTTCAAAATATGTCAACTGCTCCAACAGTGACCTCACCCTT
GATATTTTGGATGTTAAATAGTGATAGCCACTACCACCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BD02JQ U 69
AF RS1G533JQ U 38
AF RS1B468JQ U 1
AF RS1BD02TF C 149
BS 1 277 RS1B468JQ
BS 278 278 RS1G533JQ
BS 279 336 RS1B468JQ
BS 337 337 RS1G533JQ
BS 338 670 RS1B468JQ
BS 671 671 RS1G533JQ
BS 672 741 RS1B468JQ
BS 742 821 RS1BD02TF

RD RS1BD02JQ 123 0 0
ATAACGAAAAGCATACAGTGTTACATTTTATTTCAAATGGGGGAAGTATCTCTTAATTAA
TTTTTTGGCTACAATTTTATTGAATCTTTGGGTAGGAAGGAAACTATCCCAAAACAAGTG
AGC

QA 1 123 1 123
DS 

RD RS1G533JQ 665 0 0
GACTTTAGACATCTAGCTTTATTGCGTTAGCATAACGAAAAGCATACAGTGTTACATTTT
ATTTCAAATGGTGGATGTATCTCTTAATTAGTTTTTTGGCTACAATTTTATTGAATCTTT
GGGTAGGATGGAAACTATCCCAAAACAAGTGAGCAGATACATTGGAGCACACATCTGTTG
TGAATCGATTGCAGAGTATACCTGCTTCCAAAAGTCCAGTTCCACAACATCCTTTCTTTA
TTTCCTCAAACCCATAATCTTGTGAGTTTTCTATGATGTCACTGAAAGGAGAGTAGATGT
CAATGTAGAAGATATTTGAATTTGGTAGGGCATGAGTCAATTGATCCAACGTGATGAAGA
GTTTGGCATTGAAAAGCTGAGATGCATAGTTTAGTTCTTGAGCGCAGTCTCTATGAGGAC
CTCCCTTTATGCTTCTTTGCGCTGGTATACATCCAAGTGGTGGTGTTCCTATCACTGCTA
TTTGTCTTGCTCCATATCCATGTAATTGCATAACGAAACTTGCGGCAGACTTAGCCATCA
TTGATGTAAAGTTGTGAATGTTGTATATGAGCGATTGAGCACCTTGACCATAGTATGTAA
TAAGCAGATCGTTGTTACCTGCGACCACAATGGCTAAGCCCTTGGCTAATAAGTGATTAG
TCTTA

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1B468JQ 741 0 0
GGTAGAGTCAATTTACACCAATAGAGTGATTTACAGTGACTTTAGACATCTAGCTTTATT
GCGTTAGCATAACGAAAAGCATACAGTGTTACATTTTATTTCAAATGGTGGATGTATCTC
TTAATTAGTTTTTTGGCTACAATTTTATTGAATCTTTGGGTAGGATGGAAACTATCCCAA
AACAAGTGAGCAGATACATTGGAGCACACATCTGTTGTGAATCGATTGCAGAGTATACCT
GCTTCCAAAAGTCCAGTTCCACAACATCCTTTCTTTAGTTCCTCAAACCCATAATCTTGT
GAGTTTTCTATGATGTCACTGAAAGGAGAGTAGATGCCAATGTAGAAGATATTTGAATTT
GGTAGGGCATGAGTCAATTGATCCAACGTGATGAAGAGTTTGGCATTGAAAAGCTGAGAT
GCATAGTTTAGTTCTTGAGCGCAGTCTCTATGAGGACCTCCCTTTATGCTTCTTTGCGCT
GGTATACATCCAAGTGGTGGTGTTCCTATCACTGCTATTTGTCTTGCTCCATATCCATGT
AATTGCATAACGAAACTTGCGGCAGACTTAGCCATCATTGATGTAAAGTTGTGAATGTTG
TATATGAGCGATTGAGCACCTTGACCATAGTATGTAATAAGCAGATCGTTGTTACCTGCG
ACCACAATGGTTAAGCCCTTGGCTAATAAGTGATTAGTCTTATCTTTCCCTAGTAACCTC
GTTGCCCTCGCTATGTATTGT

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1BD02TF 673 0 0
TGAATCTTTGGGTAGGATGGAAACTATCCCAAAACAAGTGAGCAGATACATTGGAGCACA
CATCTGTTGTGAATCGATTGCAGAGTATACCTGCTTCCAAAAGTCCAGTTCCACAACATC
CTTTCTTTATTTCCTCAAACCCATAATCTTGTGAGTTTTCTATGATGTCACTGAAAGGAG
AGTAGATGTCAATGTAGAAGATATTTGAATTTGGTAGGGCATGAGTCAATTGATCCAAAG
TGATGAAGAGTTTGGCATTGAAAAGCTGAGATGCATAGTTTAGTTCTTGAGCGCAGTCTC
TATGAGGACCTCCCTTTATGCTTCTTTGCGCTGGTATACATCCAAGTGGTGGTGTTCCTA
TCACTGCTATTTGTCTTGCTCCATATCCATGTAATTGCATAACGAAACTTGCGGCAGACT
TAGCCATCATTGATGTAAAGTTGTGAATGTTGTATATGAGCGATTGAGCACCTTGACCAT
AGTATGTAATAAGCAGATCGTTGTTACCTGCGACCACAATGGCTAAGCCCTTGGCTAATA
AGTGATTAGTCTTATCTTTCCCTAGTAACCTCGTTGCCCTCGCTATGTATTGTTCAAAAT
ATGTCAACTGCTCCAACAGTGACCTCACCCTTGATATTTTGGATGTTAAATAGTGATAGC
CACTACCACCCCC

QA 1 673 1 673
DS 



CO CL1119Contig2 833 2 2 U
GGGTATAAACACACATGCAAAATAGTATCATTAGTAAAATTCCATCTTTGTTTTTCCTTG
TTAGAGAAGCCTTTCCTTTTTTCAGAGATTGATAGTTGTAGAACTATGAAACAATATAAG
CTGCTTCGATTTGTTTTCTTTCTCTTATCATCATTTTGTATCTTTTTCGTGACGACGACC
CATTCCCAAGCGATCCACCACAGACGACTGTTGCCATGGCTAACACAAGAATCTGGTCCA
GGCCCACCACGTGATCCATCACCACATAACCCAGCTACACCGGCAGTGTTTTACTTTGGT
GATTCGATCATCGACACGGGAAATAATAATAATCTAACAACAGAAATGAAATGTAATTTT
CGTCCCTACGGCATGAATTTTCCTACGGGAGTTGCCACCGGGAGATTCAGCGATGGAAAG
GTCGCTACTGATTATATATCCGAATATTTAGGACTAAAGCCGATTGTACCGGCATATTTA
GAACCCAACGTACAACTAGAAGAACTTCTCACTGGCGTATCATTTGCTTCGGGTGGTAGT
GGCTATCACTATTTAACATCCAAAATATCAAGGGTGAGGTCACTGTTGGAGCAGTTGACA
TATTTTGAACAATACATAGCGAGGGCAACGAGGTTACTAGGGAAAGATAAGACTAATCAC
TTATTAGCCAAGGGCTTAACCATTGTGGTCGCAGTAACAACGATCTGCTTATTACATACT
ATGGTCAAGTGCTCATCGCTCATATACACATTCACACTTTACATCATGATGGCTAGTCTG
CCGCAGTTTCGTTATGCATTACATGGATATGGAGCAGACAATAGCAGTGATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1G533TF U 1
AF RS1B468TF U 56
BS 1 567 RS1G533TF
BS 568 833 RS1B468TF

RD RS1G533TF 567 0 0
GGGTATAAACACACATGCAAAATAGTATCATTAGTAAAATTCCATCTTTGTTTTTCCTTG
TTAGAGAAGCCTTTCCTTTTTTCAGAGATTGATAGTTGTAGAACTATGAAACAATATAAG
CTGCTTCGATTTGTTTTCTTTCTCTTATCATCATTTTGTATCTTTTTCGTGACGACGACC
CATTCCCAAGCGATCCACCACAGACGACTGTTGCCATGGCTAACACAAGAATCTGGTCCA
GGCCCACCACGTGATCCATCACCACATAACCCAGCTACACCGGCAGTGTTTTACTTTGGT
GATTCGATCATCGACACGGGAAATAATAATAATCTAACAACAGAAATGAAATGTAATTTT
CGTCCCTACGGCATGAATTTTCCTACGGGAGTTGCCACCGGGAGATTCAGCGATGGAAAG
GTCGCTACTGATTATATATCCGAATATTTAGGACTAAAGCCGATTGTACCGGCATATTTA
GAACCCAACGTACAACTAGAAGAACTTCTCACTGGCGTATCATTTGCTTCGGGTGGTAGT
GGCTATCACTATTTAACATCCAAAATA

QA 1 567 1 567
DS 

RD RS1B468TF 778 0 0
CCTTGTTAGAGAAGCCTTTCCTTTTTTCAGAGATTGATAGTTGTAGAACTATGAAACAAT
ATAAGCTGCTTCGATTTGTTTTCTTTCTCTTATCATCATTTTGTATCTTTTTCGTGACGA
CGACCCATTCCCAAGCGATCCACCACAGACGACTGTTGCCATGGCTAACACAAGAATCTG
GTCCAGGCCCACCACGTGATCCATCACCACATAACCCAGCTACACCGGCAGTGTTTTACT
TTGGTGATTCGATCATCGACACGGGAAATAATAATAATCTAACAACAGAAATGAAATGTA
ATTTTCGTCCCTATGGCATGAATTTTCCTACGGGAGTTGCCACCGGGAGATTCAGCGATG
GAAAGGTCGCTACTGATTATATATCCGAATATTTAGGACTAAAGCCGATTGTACCGGCAT
ATTTAGAACCCAACGTACAACTAGAAGAACTTCTCACTGGCGTATCATTTGCTTCGGGTG
GTAGTGGCTATCACTATTTAACATCCAAAATATCAAGGGTGAGGTCACTGTTGGAGCAGT
TGACATATTTTGAACAATACATAGCGAGGGCAACGAGGTTACTAGGGAAAGATAAGACTA
ATCACTTATTAGCCAAGGGCTTAACCATTGTGGTCGCAGTAACAACGATCTGCTTATTAC
ATACTATGGTCAAGTGCTCATCGCTCATATACACATTCACACTTTACATCATGATGGCTA
GTCTGCCGCAGTTTCGTTATGCATTACATGGATATGGAGCAGACAATAGCAGTGATAG

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 6

CO CL1120Contig1 1377 6 23 U
GCGATCCAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGATAATAATCTCATCTTCATTTCTCT
TCTTCAAAAATAAAAAATGGCAAAAAATTCATTAGCCATATATCTAATGTTACTAATTGC
ATTGAGCACTGTTTATGAAACACAGGGGACATTCTCATTACCTCTTTACTTGAAGAACTT
TCCCAAAGTAGGCCAAGATTTTGAGTCTTTCGCTTACAAAGGTATGATGGATTTCATGGG
TGACTTGGAAGGCAAATGTCCTCAGACCACAGAGTTTAAGGATTTTTTTGTAAAGCTGAA
GGATTACATGGCATGTTACAGTTCAACATCACCCGGGTCAAAAGATCTCCAAGTTGAGCT
GTCAATAAAATCTGAGACACTCTTCAGGGCTATGTCTGATTTTAGTGGAACTAAAGGCGG
AACATCAGAGGATACATGGACGCTAGTGGATGGCTTATTGTCAATGGGAAAGAGTTTGGT
TGATATGAAGAAGAGTGGTTCTAAGGAAATAACTTTTGAACAAAGAAAAGAAATTATTCA
ATCCATGGTGAAATGGACTCGAGGAATCGGTCTATTCGTAAAGAAGGTCTCCGAGAATAA
AGGAAAATCTATCGATTTATCATCATTTGGAATTGACTATGACACCAATGTGTCTTCTCC
ATCTGAGAGAGCTCTTTACGAAACACAAGGAACGTTCTCATTGCCCCACTACTTGAAGGA
TTTTCCAAAAATGAGCAAAGACTTTGAGCCTTTTGCTTACAAAGGTATGTCGGCTTTCTT
GGGGGCTTTGGAGAGTAAGTGTCCTGCCACAGCAGAGTTCAAAGATCTCTTTGTAAAGGT
AGCGGACTGCATGGCCTGCTTCGAGTCGGGGATCAAGGTTGAGATGCCAGAAAAATCCGA
GAAACTCTTTAGGGCTATTTCTGCATTGGATGGTACTAACGGTGGAGCATCGGTGGATAC
TTGGAGGATGGTCGACGGTATGTTGTCAATGGGAAAAATTGTGATTGAGATGAAGAAGAG
TGCTTCAGAGGAGATAACTTTTGAACAAAGAAAGGAACTGATAGGGGGTATGGCGAAATG
GGCTCGAGGTATCGGTCTACTTGTTAAGACAGCATCCGAGAAAAAAGGAAAATCTATTGA
TCTAGCATCTTTTGGAGTTGATTATAGCCCCCATGTTAGTTCTCCTTTCAAAGGAGCTAG
CGGTGAGCTATAAAGATTTTCCCTGCAGTTGCAACTTTTAACTAATTCCAATAAGGGAAC
CCTTCCAATAATGTAAAAAAGTAAATTATTATTTCAACAAGAAATCTTTTATCAGTTGTA
AAAGATTTAGCTATTGTAAATATCTATCTATTCTATTAAAATAAAAGTTTCAACTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
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5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RS1BE65TF U 1
AF RS1BN22TF U 6
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AF RS1GH09JQ C 924
AF RS1DR82TF U 781
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BS 1376 1377 RS1DR82JQ

RD RS1BE65TF 719 0 0
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TCTTCAAAAATAAAAA*TGGCAAAAAATTCATTAGCCATATATCTAATGTTACTAATTGC
ATTGAGCACTGTTTATGAAACACAGGGGACATTCTCATTACCTCTTTACTTGAAGAACTT
TCCCAAAGTAGGCCAAGATTTTGAGTCTTTCGCTTACAAAGGTATGATGGATTTCATGGG
TGACTTGGAAGGCAAATGTCCTCAGACCACAGAGTTTAAGGATTTTTTTGTAAAGCTGAA
GGATTACATGGCATGTTATAGTTCAACATCACCCGGGTCAAAAGATCTCCAAGTTGAGCT
GTCAATAAAATCTGAGACACTCTTCAGGGCTATGTCTGATTTTAGTGGAACTAAAGGCGG
AACATCAGAGGATACATGGACGCTAGTGGATGGCTTATTGTCAATGGGAAAGAGTTTGGT
TGATATGAAGAAGAGTGGTTCTAAGGAAATAACTTTTGAACAAAGAAAAGAAATTATTCA
ATCCATGGTGAAATGGACTCGAGGAATCGGTCTATTCGTAATGAAGGTCTCGGAGAATAA
AGGAAAATCTATCGATTTATCATCATTTGGAATTGACTATGACACCAATGTGTCTTCTCC
TTCTGAGAGAGCTCTTTACGAA*CACAAGGAACGTTCTCATTGCCC*ACTACTTGAAGG

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DS 

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GATCCAAAAC
AAAAAAAAACAAAAAAAAAGATAATAATCTCATCTTCATTTCTCTTCTTCAAAAATAAAA
AATGGCAAAAAATTCATTAGCCATATATCTAATGTTACTAATTGCATTGAGCACTGTTTA
TGAAACACAGGGGACATTCTCATTACCTCTTTACTTGAAGAACTTTCCCAAAGTAGGCCA
AGATTTTGAGTCTTTCGCTTACAAAGGTATGATGGATTTCATGGGTGACTTGGAAGGCAA
ATGTCCTCAGACCACAGAGTTTAAGGATTTTTTTGTAAAGCTGAAGGATTACATGGCATG
TTACAGTTCAACATCACCCGGGTCAAAAGATCTCCAAGTTGAGCTGTCAATAAAATCTGA
GACACTCTTCAGGGCTATGTCTGATTTTAGTGGAACTAAAGGCGGAACATCAGAGGATAC
ATGGACGCTAGTGGATGGCTTATTGTCGATGGGAAAGAGTTTGGTTGATATGAAGAAGAG
TGGTTCTAAGGAAATAACTTTTGAACAAAGAAAAGAAATTATTCAATCCATGGTGAAATG
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TTTATCATCATTTGGAATTGACTATGACACCAATGTGTCTTCTCCATCTGAGAGAGCTCT
TTACGAAACACAAAGAACGTTCTCATTGCCCCACTACTTGAAGGATTTTCCAAAAATGAG
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QA 11 764 11 764
DS 

RD RS1GH09TF 575 0 0
G
CATGGCATGTTACAGTTCAACATCACCCGGGTCAAAAGATCTCCAAGTTGAGCTGTCAAT
AAAATCTGAGACACTCTTCAGGGCTATGTCTGATTTTAGTGGAACTAAAGGCGGAACATC
AGAGGATACATGGACGCTAGTGGATGGCTTATTGTCAATGGGAAAGAGTTTGGTTGATAT
GAAGAAGAGTGGTTCTAAGGAAATAACTTTTGAACAAAGAAAAGAAATTATTCAATCCAT
GGTGAAATGGACTCGAGGAATCGGTCTATTCGTAAAGAAGGTCTCCGAGAATAAAGGAAA
ATCTACCGATTTATCATCATTTGGAATTGACTATGACACCAATGTGTCTTCTCCATCTGA
GAGAGCTCTTTACGAAACACAAGGAACGTTCTCATTGCCCCACTACTTGAAGGATTTTCC
AAAAATGAGCAAAGACTTTGAGCCTTTTGCTTACAAAGGTATGTCGGCTTTCTTGGGGGC
TTTGGAGAGTAAGTGTCCTGCCACAGCAGAGTTCAAAGATCTCTTTGTAAAGGTAGCGGA
CTACATGGCCTGCTTCGAGTCGGGGATCAAGGTT

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DS 

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TTGGAGGATGGTCGACGGTATGTTGTCAATGGGAAAAATTGTGATTGAGATGAAGAAGAG
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AAAGATTTAGCTATTGTAAATATCTATCTATTCTATTAAAATAAAAGTTTCAACTTC

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DS 

RD RS1GH09JQ 454 0 0
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ATAGCCCCCATGTTAGTTCTCCTTTCAAAGGAGCTAGCGGTGAGCTATAAAGATTTTCCC
TGCAGTTGCAACTTTTAACTAATTCCAATAAGGGAACCCTTCCAATAATGTAAAAAAGTA
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CTATCTATTCTATTAAAATAAAAGTTTCAACT
CC

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DS 

RD RS1DR82TF 597 0 0
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AGCGGACTGCATGGCCTGCTTCGAGTCGGGGATCAAGGTTGAGATGCCAGAAAAATCCGA
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TTGGAGGATGGTCGACGGTATGTTGTCAATGGGAAAAATTGTGATTGAGATGAAGAAGAG
TGCTTCAGAGGAGATAACTTTTGAACAAAGAAAGGAACTGATAGGGGGTATGGCGAAATG
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AAAGATTTAGCTATTGTAAATATCTATCTATTCTATTAAAATAAAAGTTTCAACT
TC

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 6

CO CL1121Contig1 627 6 7 U
GGAAACTACACATACATACATCAAAAATCATGGCTAAGTTTGCTTCTATCGTCGCCCTTC
TCTTCGCTGCTCTTGTTGTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACAGTGGTGGAAGCAAAGT
TGTGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCATGCAAGA
ATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGCTC
ACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCACAATCGTTGGTGCTTGTATGTTTA
CTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGTGACCTC
ATGCAATGTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTATGTTGGT
TTGTTTTAATAAAATATAAACATT*TGTCTTG*GGTAACAATTATTTCCATTCCTTCTTG
AAAGGACCTGGTTTAGCTAGCTTCCGATATTTAATTATAGAAATTTAATACTTAGAAAAA
TATGGATGATGCTCCCTGTACTATGTAAACTATATAATATTTTATCCAAAATGTAAAATT
ATTATCATATGTTAAACTTTTATATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 10 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EH50JQ C 1
AF RS1EH50TF U 1
AF RS1GS02TF U 53
AF RS1BN90TF U 57
AF RS1C818JQ C 6
AF RS1C818TF U 6
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BS 253 254 RS1GS02TF
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BS 391 456 RS1EH50TF
BS 457 627 RS1C818TF

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TTGTTTTAATAAAATATAAACATT*TGTCTTG*GGT

QA 1 456 1 456
DS 

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TTTCTTGTGTGCTTATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGTGACCTCATGCAAT
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AATAAAATATAAACATT*TGTCTTG*GGT

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DS 

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G
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GCAAAGTTGGGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGTCTGTGGAAACAATAACGCA
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CCTGCTCACAAGTGTATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCACAATCGTTGGTGCTTGT
ATGTTTACTTACCGTTTCTTGTGTGCTTATTTGTATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAG
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TGTTGGTTTGTTTTAATAAAATATAAACATT*TGTCTTG*GGT
ATCT

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AAGTTGGGCGAGAGGTCAAGTGGAACATGGTCAGGAGCCTGTGGAAACAATAACGCATGC
AAGAATCAGTGCATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCT
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TGGTTTGTTTTAATAAAATATAAACATT*TGTCTTG*GGT

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TATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCACAATCGTTGGTGCTTGTATGTTTACTTACCG
TTTCTTGTGTGCTTATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGTGACCTCATGACAT
GTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTATGTTGGTTTGTTTT
AATAAAATATAAAAATAATGTAATGTGGTAACAATTATTTCCATTCCTTCTTGAAAGGAC
CTGGTTTAGCTAGCTTCCGATATTTAATTATAGAAATTTAATACTTAGAAAAATATGGAT
GATGCTCCCTGTACTATGTAAACTATATAATATTTTATCCAAAATGTAAAATTATTATCA
TATGTTAAACTTT

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GG
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CATTCGACTTGAAGGAGCACAACATGGATCTTGCAACTATGTGTTCCCTGCTCACAAGTG
TATCTGCTATTTCCCATGTTAATCTACCACAATCGTTGGTGCTTGTATGTTTACTTACCG
TTTCTTGTGTGCTTATTTGCATTAAATAAGTCTGTGTCACTATGAGTGACCTCATGACAT
GTAGCAGATATGTTATGTTGGCTTTTCTTTTGTCACGAATATTCTATGTTGGTTTGTTTT
AATAAAATATAAAAATAATGTAATGTGGTAACAATTATTTCCATTCCTTCTTGAAAGGAC
CTGGTTTAGCTAGCTTCCGATATTTAATTATAGAAATTTAATACTTAGAAAAATATGGAT
GATGCTCCCTGTACTATGTAAACTATATAATATTTTATCCAAAATGTAAAATTATTATCA
TATGTTAAACTTTTATATCT

QA 3 622 3 622
DS 



AS 1 5

CO CL1122Contig1 968 5 22 U
GGATTCCTTGCAGAACCACCACACACGCAGAACACGAGTTGGAGAACACAAAAAAAGTGG
AATAAAGAAGAAGACACTTCTGTTCTGTAATAATCAATCAAGCTGCTGGGGAGGTGGCTG
AACAAAACCCTAATCTCAATTTCCCCCGAATATGCCATTTCTGAGGATTGTGAGACTTCT
GCTGCCTGGGATTAGGATCTTGATTAGAAGGTCGCTACTTTGGTTGCTGTAAATGCATAT
CCGTGAATATATTCCTTCTTGGATCTACCAGTTATTTGGTTGCATGGGTACAGAGGTTGT
TTTGGGAGCTGTAATAAACCACCACCGCTTATAGTTGCAGTGGATGAGCCGTCTAAAGGG
TTAAGGATTCAAGGTCGTTTAGTGAAGAAGCCAAGCGTATCAGACGACTTCTGGAGCACG
AGCACCTGCGATATGGATAACAACAGCACGATGCAGTCACAGAGAAGCGTCTCTTCTATT
AGCTTCACTAACAACACTGCTGCTTCTGCAAGTAGTAGCAACCCCAATGAATTTGTAAAC
ACCGGATTGAACCTGTGGAACCAGACTAGACAACAGTGGCTTGCAAGCGGGTCTTCTCAA
ACAAAGGCCAAAGTTCGAGAACCCACAATAAGCTGGAATGCAACATATGAAAGCTTGTTG
GGTGTGAACAAGCGGTTCTCACGTCCAATACCTCTCCCTGAAATGGTGGATTTTCTGGTG
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TTCTTTCTTTCTTATATATGTGTGTAATATCTGAATTATAGCATCTTTTGAGTCTTATTA
TGTACGTATAAATGATTAATGGTGTGTACTGATTTTGAAGAAAAATCCTACCAAAATCAG
TTATTGCCGAGAAAGTAATTTATCTTTCAAGTTGTACATGTCTGACCATTGTCAAAATGA
CTTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DI95TF U 1
AF RS1AW71TF U 5
AF RS1E408TF U 16
AF RS1AW71JQ C 134
AF RS1E408JQ C 472
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RD RS1DI95TF 701 0 0
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AACAAAACCCTAATCTCAATTTCCCCCGAATATGCCATTTCTGAGGATTGTGAGACTTCT
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AGCTTCAATAACAACGCTGCTGCTTCTGCAAGTAGTAGCAACCCCAATGAATTTGTAAAC
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ACAAAGGCCAAAGTTCGAGAACCCACAATAAGCTGGAATGCAACATATGAAAGCTTGTTG
GGTGTGAACAAGCGGTTCTCACGTCCAATACCTCTCCCTGA

QA 1 701 1 701
DS 

RD RS1AW71TF 748 0 0
GG
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TGGGATTAGGATCTTGATTAGAAGGTCGCTACTTTGGTTGCTGTAAATGCATATCCGTGA
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TGCGATATGGATAACAACAGCACGATGCAGTCACAGAGAAGCGTCTCTTCTATTAGCTTC
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TTGAAC*TGTGGAACCAGACTAGACAACAGTGGCTTGCAAGCGGGTCTTCTCAAACAAAG
GCCAAAGTTCGAGAACCCACAATAAGCTGGA*TGCA*CATATGAAAGCTTGTTGGGTGTG
AACAAGCGGT*CTCACGTC*AATAC*TCTCCCTGAAATGGTGGATTTTCTGGTGGATGTG
TGGGAGCA
GAGGGCTGTATGATGACT

QA 3 730 3 730
DS 

RD RS1E408TF 718 0 0
GG
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TTCTGTTCTGTAATAATCAATCAAGCTGCTGGGGAGGTGGCTGAACAAAACCCTAATCTC
AATTTCCCCCGAATATGCCATTTCTGAGGATTGTGAGACTTCTGCTGCCTGGGATTAGGA
TCTTGATTAGAAGGTCGCTACTTTGGTTGCTGTAAATGCATATCCGTGAATATATTCCTT
CTTGGATCTACCAGTTATTTGGTTGCATGGGTACAGAGGTTGTTTTGGGAGCTGTAATAA
ACCACCACCGCTTATAGTTGCAGTGGATGAGCCGTCTAAAGGGTTAAGGATTCAAGGTCG
TTTAGTGAAGAAGCCAAGCGTATCAGACGACTTCTGGAGCACGAGCACCTGCGATATGGA
TAACAACAGCACGATGCAGTCACAGAGAAGCGTCTCTTCTATTAGCTTCACTAACAACAC
TGCTGCTTCTGCAAGTAGTAGCAACCCCAATGAATTTGTAAACACCGGATTGAACCTGTG
GAACCAGACTAGACAACAGTGGCTTGCAAGCGGGTCTTCTCAA*CAAAGGCCAAAGTTCG
AGAACCCACAATAAGCTGGAATGCAACATATGAAAGCTTGTTGGGTGTGA*CAAGCGGTT
CTCACGTCCAATACCTCTCCCTGAAATGGTGGATTTTCTGGTGGATGTGTGGGAGC

QA 3 718 3 718
DS 

RD RS1AW71JQ 759 0 0
TCTCAATTTCCCCCGAATATGCCATTTCTGAGGATTGTGAGACTTCTGCTGCCTGGGATT
AGGATCTTGATTAGAAGGTCGCTACTTTGGTTGCTGTAAATGCATATCCGTGAATATATT
CCTTCTTGGATCTACCAGTTATTTGGTTGCATGGGTACAGAGGTTGTTTTGGGAGCTGTA
ATAAACCACCACCGCTTATAGTTGCAGTGGATGAGCCGTCTAAAGGGTTAAGGATTCAAG
GTCGTTTAGTGAAGAAGCCAAGCGTATCAGACGACTTCTGGAGCACGAGCACCTGCGATA
TGGATAACAACAGCACGATGCAGTCACAGAGAAGCGTCTCTTCTATTAGCTTCACTAACA
ACACTGCTGCTTCTGCAAGTAGTAGCAACCCCAATGAATTTGTAAACACCGGATTGAAC*
TGTGGAACCAGACTAGACAACAGTGGCTTGCAAGCGGGTCTTCTCAAACAAAGGCCAAAG
TTCGAGAACCCACAATAAGCTGGAATGCAACATATGAAAGCTTGTTGGGTGTGAACAAGC
GGTTCTCACGTCCAATACCTCTCCCTGAAATGGTGGATTTTCTGGTGGATGTGTGGGAGC
AAGAGGGCTTGTATGATTGACTTTGAAACTTACTTTTCCTCTTTTCTTTCTTTCTTTCTT
ATATATGTGTGTAATATCTGAATTATAGCATCTTTTGAGTCTTATTATGTACGTATAAAT
GATTAATGGTGTGTACTGATTTTGAAGAAAAATCCTACC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RS1E408JQ 497 0 0
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TTTGTAAACACCGGATTGAACCTGTGGAACCAGACTAGACAACAGTGGCTTGCAAGCGGG
TCTTCTCAAACAAAGGCCAAAGTTCGAGAACCCACAATAAGCTGGAATGCAACATATGAA
AGCTTGTTGGGTGTGAACAAGCGGTTCTCACGTCCAATACCTCTCCCTGAAATGGTGGAT
TTTCTGGTGGATGTGTGGGAGCAAGAGGGCTTGTATGATTGACTTTGAAACTTACTTTTC
CTCTTTTCTTTCTTTCTTTCTTATATATGTGTGTAATATCTGAATTATAGCATCTTTTGA
GTCTTATTATGTACGTATAAATGATTAATGGTGTGTACTGATTTTGAAGAAAAATCCTAC
CAAAATCAGTTATTGCCGAGAAAGTAATTTATCTTTCAAGTTGTACATGTCTGACCATTG
TCAAAATGACTTTCTCC

QA 1 497 1 497
DS 



AS 1 6

CO CL1123Contig1 728 6 34 U
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TCAGACCAAGTCTTGCAAGGCTAGAAGATCCGATCTTAGGGTTCACCTCAAGAACACTCG
TGAAACAGCGCACGCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCCAAGAGGTACCTTGAGGA
TGTGATAGCTCACAAGCAGGCTATTCCTTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGAC
TGCTCAAGCTAAGAACAGGCACTCCAATGGTCAAGGACGTTGGCCTGCTAAATCTGCTCA
GTTTGTTCTCGATTTGCTCAAGAACGCTGAGAGCAATGCTGAGGTGAAAGGTCTGGATGT
TGATGCGCTTTTCATTTCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCGAAACAGAGGAGAAGGAC
TTACCGTGCTCATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGCTGAT
TTTGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACCCAGTTGGCAGCCAAGTC
GAAGAAATCAAGTGCTTAAGCTTTCTTTGTTTTCTAGTTTCTACTTTTTGTGTTCGTGAA
AGAGATTTTGCTCCCTTTTCCCTCCCATCTTTGCAAGACAATGGATAGATTTTCGTGGAT
TATTATTGTTGGTGTTATGAAAATTAAACTATTACTCTTTGCGTTTGTAGTATTTAATTC
TATCTTAC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1G546JQ C 115
AF RS1G546TF U 115
AF RS1H066JQB C 1
AF RS1H066TF U 1
AF RS1C376JQ C 1
AF RS1C376TF U 1
BS 1 115 RS1H066TF
BS 116 120 RS1G546TF
BS 121 121 RS1H066TF
BS 122 131 RS1G546TF
BS 132 132 RS1H066TF
BS 133 163 RS1G546TF
BS 164 164 RS1H066TF
BS 165 267 RS1G546TF
BS 268 268 RS1H066TF
BS 269 269 RS1G546TF
BS 270 270 RS1H066TF
BS 271 303 RS1G546TF
BS 304 304 RS1H066TF
BS 305 309 RS1G546TF
BS 310 310 RS1H066TF
BS 311 352 RS1G546TF
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BS 367 367 RS1H066TF
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BS 370 370 RS1H066TF
BS 371 390 RS1G546TF
BS 391 391 RS1H066TF
BS 392 475 RS1G546TF
BS 476 476 RS1H066TF
BS 477 573 RS1G546TF
BS 574 574 RS1H066TF
BS 575 620 RS1G546TF
BS 621 621 RS1H066TF
BS 622 643 RS1G546TF
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BS 661 679 RS1H066TF
BS 680 728 RS1C376TF

RD RS1G546JQ 546 0 0
G
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TGGAT

QA 2 546 2 546
DS 

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G
ACTCGGGAAACAGCGCGCGCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCCGAGAGGTACCTT
GAGGATGTGATAGCTCACAAGCAGGCTATTCCTTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGA
AGGACTGCTCAAGCTAAGAACAGGCACTCCAACGTTCAAGGACGTTGGCCTGCTAAATCT
GCTCAGTTCGTTCTTGATTTGCTCAAGAACGCTGAGAGCAATGCTGAGGTGAAAGGTTTG
GATGTTGATGCCCTCTTCATTTCGCACATCCAAGTCAACCAGGCTGCGAAACAGAGGAGA
AGGACTTACCGTGCTCATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAG
TTGATTTTGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACCCAGTTGGCAGCC
AAGTCGAAGAAATCAAGTGCTTAAGCTTTCTTTGTTTTTTAGTTTCTACTTTTTGTGTTC
GTGAAAGAGATTTTGCTCCCTTTTCTCTCCCATCTTTGCAAGACAATGAATAGATTTTCG
TGGAT

QA 2 546 2 546
DS 

RD RS1H066JQB 679 0 0
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TTACCGTGCTCATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGCTGAT
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QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1H066TF 679 0 0
GGGCCGCCGATCTCTTCCGTTAGCCGCAGCCATGGTGAAGTACTCACAAGAACCTGACAA
TCAGACCAAGTCTTGCAAGGCTAGAAGATCCGATCTTAGGGTTCACCTCAAGAACACTCG
TGAAACAGCGCACGCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCCAAGAGGTACCTTGAGGA
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TGCTCAAGCTAAGAACAGGCACTCCAATGGTCAAGGACGTTGGCCTGCTAAATCTGCTCA
GTTTGTTCTCGATTTGCTCAAGAACGCTGAGAGCAATGCTGAGGTGAAAGGTCTGGATGT
TGATGCGCTTTTCATTTCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCGAAACAGAGGAGAAGGAC
TTACCGTGCTCATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGCTGAT
TTTGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACCCAGTTGGCAGCCAAGTC
GAAGAAATCAAGTGCTTAAGCTTTCTTTGTTTTCTAGTTTCTACTTTTTGTGTTCGTGAA
AGAGATTTTGCTCCCTTTTCCCTCCCATCTTTGCAAGACAATGGATAGATTTTCGTGGAT
TATTATTGTTGGTGTTATG

QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1C376JQ 728 0 0
GGGCCGCCGATCTCTTCCGTTAGCCGCAGCCATGGTGAAGTACTCACAAGAACCTGACAA
TCAGACCAAGTCTTGCAAGGCTAGAGGATCCGATCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACTCG
TGAAACAGCGCACGCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCCAAGAGGTACCTTGAGGA
TGTGATAGCTCACAAGCAGGCTATTCCTTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGAC
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GTTTGTTCTCGATTTGCTCAAGAACGCTGAGAGCAATGCTGAGGTGAAAGGTCTGGATGT
TGATGCGCTTTTCATTTCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCGAAACAGAGGAGAAGGAC
TTACCGTGCTCATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGCTGAT
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TATTATTGTTGGTGTTATGAAAATTAAACTATTACTCTTTGCGTTTGTAGTATTTAATTC
TATCTTAC

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1C376TF 728 0 0
GGGCCGCCGATCTCTTCCGTTAGCCGCAGCCATGGTGAAGTACTCACAAGAACCTGACAA
TCAGACCAAGTCTTGCAAGGCTAGAGGATCCGATCTTAGGGTTCACTTCAAGAACACTCG
TGAAACAGCGCACGCCATCAGGAAGCTACCATTGCTCAAGGCCAAGAGGTACCTTGAGGA
TGTGATAGCTCACAAGCAGGCTATTCCTTTCACCCGTTTCTGCAGAGGTGTTGGAAGGAC
TGCTCAAGCTAAGAACAGGCACTCCAATGGTCAAGGACGTTGGCCTGCTAAATCTGCTCA
GTTTGTTCTCGATTTGCTCAAGAACGCTGAGAGCAATGCTGAGGTGAAAGGTCTGGATGT
TGATGCGCTTTTCATTTCGCACATCCAAGTTAACCAGGCTGCGAAACAGAGGAGAAGGAC
TTACCGTGCTCATGGAAGAATCAACCCTTACATGTCCAACCCATGCCACATTGAGCTGAT
TTTGTCTGAGAAGGAAGAGTCTGTCAAGAAAGAGCCGGAGACCCAGTTGGCAGCCAAGTC
GAAGAAATCAAGTGCTTAAGCTTTCTTTGTTTTCTAGTTTCTACTTTTTGTGTTCGTGAA
AGAGATTTTGCTCCCTTTTCCCTCCCATCTTTGCAAGACAATGGATAGATTTTCGTGGAT
TATTATTGTTGGTGTTATGAAAATTAAACTATTACTCTTTGCGTTTGTAGTATTTAATTC
TATCTTAC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 6

CO CL1124Contig1 640 6 4 U
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AACATACTATAGTCGTTCGAAATAAACCAGAAACAAGAGGAACTTGGGTGTGTTTTGAAA
ACAGTAGTGATAACAGTAGAGTAGAATAAAGCAAGCTCAGAAACCATGGATCTTGATGTT
GTCCTTCTTCACAAGCCCAGCCTGGACTAAGAACGTGGAGACGTTCTTCCTCTGGTCACC
TTGAAGCTGAATAACCTGACCCAGTTCGGAGTCTTGAACGACAGTTCCGTTGCAACAAAA
CTCTTTCTTGAGATCCTTAAGAATCTTGGTGTAGCTGTACTCTTTCTTCAGCCCCTGGAC
GGTTGTCAAGCTTTTCCTACCATTACGCTGCTGCACACGAATGTGGACGTACTCCTTTGT
TCCCGCACCTGAGTCCTCAGCATCCACATCAGCAAACGGGTCGAAGGCAGTTGGGACCTG
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GCTGAGACCTGATTCGACGAGTAGGGTTTCGAGGATCTGATAATCAAGAGAAGAGAGGAA
ACCCTAAATTTGGATATAAAGTCTGCAACTTCTGATTCCC


BQ
10 10 10 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F121TF C 1
AF RS1B638JQ U 3
AF RS1AO69JQ U 4
AF RS1AO69TFB C 4
AF RS1F121JQ U 3
AF RS1B638TF C 3
BS 1 3 RS1F121TF
BS 4 307 RS1B638JQ
BS 308 308 RS1AO69JQ
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ACAGTAGTGATAACAGTAGAGTAGAATAAAGCAAGCTCAGAAACCATGGATCTTGATGTT
GTCCTTCTTCACAAGCCCAGCCTGGACTAAGAACGTGGAGACGTTCTTCCTCTGGTCACC
TTGAAGCTGAATAACCTGACCCAGTTCGGAGTCTTGAACGACAGTTCCGTTGCAACAAAA
CTCTTTCTTGAGATCCTTAAGAATCTTGGTGTAGCTGTACTCTTTCTTCAGCCCCTGGAC
GGTTGTCAAGCTTTTCCTACCATTACGCTGCTGCACACGAATGTGGACGTACTCCTTTGT
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CC

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DS 

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A
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DS 

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A
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TTCTTGAGATCCTTAAAAATCTTGGTGTAGCTGTACTCTTTCTTCAGCCCCTGGACGGTT
GTCAAGCTTTTCCTACCATTGCGCTGCTGCACACGAATGTGGACGTACTCCTTTGTTCCC
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TCAAGTTCAAACATGAAACTTTGTTGAACTGTTGGGCAGAAAAAAAGGACAGAGAAGCTG
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TAAATTTGGATATAAAGTCTGCAACT
CC

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DS 

RD RS1AO69TFB 629 0 0
A
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TACTATAGTCGTTCGAAATAAACCAGAAACAAGAGGAACTTGGGTGTGTTTTGAAAACAG
TAGTGATAACAGTAGAGTAGAATAAAGCAAGCTCAGAAACCATGGATCTTGATGTTGTCC
TTCTTCACAAGCCCAGCCTGGACTAAGAACGTGGAGACGTTCTTCCTCTGGTCACCTTGA
AGCTGAATAACCTGACCCAGTTCGGAGTCTTGAACGACAGTTCCGTTGCAACAAAACTCT
TTCTTGAGATCCTTAAGAATCTTGGTGTAGCTGTACTCTTTCTTCAGCCCCTGGACGGTT
GTCAAGCTTTTCCTACCATTGCGCTGCTGCACACGAATGTGGACGTACTCCTTTGTTCCC
GCACCTGAGTCCTCAGCATCCACATCAGCAAACGGGTCGAAGGCAGTTGGGACCTGGGAA
TCAAGTTCAGACATGAAACTTTGTTGAACTGTTGGGCAGAAAAAAAGGACAGAGAAGCTG
AGACCTGATTCGACGAGTAGGGTTTCGAGGATCTGATAATCAAGAGAAGAGAGGAAACCC
TAAATTTGGATATAAAGTCTGCAACT
CC

QA 2 627 2 627
DS 

RD RS1F121JQ 633 0 0
G
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ATACTATAGTCGTTCGAAATAAACCAGAAACAAGAGGAACTTGGGTGTGTTTTGAAAACA
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CTTCTTCACAAGCCCAGCCTGGACTAAGAACGTGGAGACGTTCTTCCTCTGGTCACCTTG
AAGCTGAATAACCTGACCCAGTTCGGAGTCTTGAACGACAGTTCCGTTGCAACAAAACTC
TTTCTTGAGATCCTTAAGAATCTTGGTGTAGCTGTACTCTTTCTTCAGCCCCTGGACGGT
TGTCAAGCTTTTCCTACCATTACGCTGCTGCACACGAATGTGGACGTACTCCTTTGTTCC
CGCACCTGAGTCCTCAGCATCCACATCAGCAAACGGGTCGAAGGCAGTTGGGACCTGGGA
ATCAAGTTCAGACATGAAACTTTGTTGAACTGTTGGGCAGAAAAAAAGGACAGAGAAGCT
GAAACCTGATTCGACGAGTAGGGTTTCGAGGATCTGATAATCAAGAGAAGAGAGGAAACC
CTAAATTTGGATATAAAGTCTGCAACTTCT
CC

QA 2 631 2 631
DS 

RD RS1B638TF 638 0 0
A
GCGAAGAGTTCTTAACGATCTCATATCACACAAGTAGCAAGATGTTGTAACACAAAGAAC
ATACTATAGTCGTTCGAAATAAACCAGAAACAAGAGGAACTTGGGTGTGTTTTGAAAACA
GTAGTGATAACAGTAGAGTAGAATAAAGCAAGCTCAGAAACCATGGATCTTGATGTTGTC
CTTCTTCACAAGCCCAGCCTGGACTAAGAACGTGGAGACGTTCTTCCTCTGGTCACCTTG
AAGCTGAATAACCTGACCCAGTTCGGAGTCTTGAACGACAGTTCCGTTGCAACAAAACTC
TTTCCTGAGATCCTTAAGAATCTTGGTGTAGCTGTACTCTTTCTTCAGCCCCTGGACGGT
TGTCAAGCTTTTCCTACCATTACGCTGCTGCACACGAATGTGGACGTACTCCTTTGTTCC
CGCACCTGAGTCCTCAGCATCCACATCAGCAAACGGGTCGAAGGCAGTTGGGACCTGGGA
ATCAAGTTCAGACATGAAACTTTGTTGAACTGTTGGGCAGAAAAAAAGGACAGAGAAGCT
GAGACCTGATTCGACGAGTAGGGTTTCGAGGATCTGATAATCAAGAGAAGAGAGGAAACC
CTAAATTTGGATATAAAGTCTGCAACTTCT
GATTCCC

QA 2 631 2 631
DS 



AS 1 2

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GGCCGTGACTCTCTCTCTCTCACTGAGACGGTCGCTAATCTCCGTCACACTCATCCCTCT
CAAATTCCTCCACAATGTCTTTCTACAATCAACTAAGCCGTCTCGTCAACCAACAACGCC
CTCTCACCAAACACTCTTTCCGATCTCTCTCCTCGGAAGCGACTCACCACAGGTCCCACC
AGGAGACGCACAGTTTCCTCGAGCCGGAGAGCTACATAGGAAGCTGGGAGGCTCCCAAAG
ATCCTAAAGACGCGGAGAGATTGCTCGCGCGGCTCAGGAGAGAGTACGAGAAGAAAGTGA
GCCTGTATCGCAGAGACTACGTTCACGAGGTCGAGATGCTTAGGGTGGAGAAGCAGCGTA
AGGACGAGGCGAGGCTGCTCGCTGAGCGTGCTGCTAATGAGGAGAGACGGCGTTTGAAAG
CTGAGGCTGCTAAGGTTAGAGCTGAGGAGCGTAAGGTTTTCGAGGAAGAGTTCAGGAGGA
CTTTGATGAAAGAAAGAGAGGAAAAGCTGGAGTTCTGGAGAATGACGGGACTAAAAAGGG
AAGATAAGAAGAAAGCGAGAAAGAAGCTGTTGCATGAGCAAAGCTCACTGTGGATCGAGC
CGAAAGAACTGGAGAAGAAGATTACGGAAGCCCTTGTTGATTCCACTACTCTCTAAACCA
AACAAAGCCCATTCTCCTGAGTCCTTGTTTGAGAAAACAACCACCTTGGTCTTATTGTTG
CAGACATACTCTCTTTACTTCTTCATGTTAGAGAAAGAAAGCGAAGGCGTTTTTGGCCTT
TTTGTGTTAAGCACATAAAGAGTGTTGGTGGATAAAGTTAAAAAACTGGTCAATAATAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B904TF U 1
AF RS1B904JQ C 85
BS 1 622 RS1B904TF
BS 623 840 RS1B904JQ

RD RS1B904TF 622 0 0
GGCCGTGACTCTCTCTCTCTCACTGAGACGGTCGCTAATCTCCGTCACACTCATCCCTCT
CAAATTCCTCCACAATGTCTTTCTACAATCAACTAAGCCGTCTCGTCAACCAACAACGCC
CTCTCACCAAACACTCTTTCCGATCTCTCTCCTCGGAAGCGACTCACCACAGGTCCCACC
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CGAAAGAACTGGAGAAGAAGAT

QA 1 622 1 622
DS 

RD RS1B904JQ 756 0 0
A
CAATCAACTAAGCGGTCTCGTCAACCAACAACGCCCTCTCACCAAACACTCTTTCCGATC
TCTCTCCTCGGAAGCGACTCACCACAGGTCCCACCAGGAGACGCACAGTTTCCTCGAGCC
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GCTGTTGCATGAGCAAAGCTCACTGTGGATCGAGCCGAAGGAACTGGAGAAGAAGATTAC
GGAAGCCCTTGTTGATTCCACTACTCTCTAAACCAAACAAAGCCCATTCTCCTGAGTCCT
TGTTTGAGAAAACAACCACCTTGGTCTTATTGTTGCAGACATACTCTCTTTACTTCTTCA
TGTTAGAGAAAGAAAGCGAAGGCGTTTTTGGCCTTTTTGTGTTAAGCACATAAAGAGTGT
TGGTGGATAAAGTTAAAAAACTGGTCAATAATAAG

QA 2 756 2 756
DS 



AS 1 6

CO CL1126Contig1 1123 6 12 U
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ACGTTTTAACAATCCAGAACGAATTTGGGTTTCACGAACAAAGCACACAAACTGAAAAA*
GCAAAACAAAAGGAGAGAGTCTTAAGCTTTATGAATCAGACGAAGCCACTGACGACATCT
CAAGCCTCATCGTACTCCTCTTCTTCCTCCTCATACTCCTCCTCACCGGCTGTCGCATCC
TGGTACTGCTGATACTCTGCAACAAGATCATTCATGTTACTCTCCGCCTCGGTGAACTCC
ATCTCGTCCATGCCTTCTCCCGTGTACCAATGAAGGAAAGCCTTCCTCCTGAACATAGCC
GTGAACTGCTCACTCACACGCCTGAACATCTCCTGGATCGAAGTAGAGTTCCCGATGAAA
GTCGACGCCATTTTCAAACCCGTTGGCGCAATGTCACAGACGCTGGACTTGACGTTGTTC
GGGATCCACTCCACAAAGTAGGACGAGTTCTTGTTCTGGATGTTCATCATCTGCTCATCA
ACCTCCTTAGTGCTCAGCTTCCCACGGAACACAGCGGATGCGGTTAAGTAACGTCCGTGG
CGAGGGTCAGCAGCGCACATCATGTTCTTCGCGTCCCACATCTGCTGTGTCAGCTCAGGG
ACACTCAAGGCACTGTACTGCTGCGAACCTCTCGACGTCAATGGAGCGAAACCAACCATG
AAGAAGTGGAGCCTCGGGAAAGGGATCAAGTTCACAGCAAGCTTCCTAAGGTCAGAGTTT
AGCTGACCAGGGAAACGAAGACAGCATGTAACACCACTCATCGTAGCCGAGATGAGGTGG
TTAAGATCACCAAAGGTGGGATTAGCGAGCTTGAGGGTACGGAAACAGATATCGTAGAGA
GCCTCATTGTCCAAAACCATACACTCGTCAGCGTTCTCAACGAGCTGATGCACAGAGAGA
GTTGCATTGTAGGGCTCAACGACGGTGTCAGAGACCTTGGGAGAAGGAAACACAGAGAAG
GTCATCATCATACGGTCAGGATACTCCTCTCTTATCTTAGAGATCAAAAGCGTTCCCATC
CCAGATCCAGTTCCTCCACCCAATGAATGACAAACCTGGAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1FN77TF C 21
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BS 812 836 RS1B786JQ
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C

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C

QA 8 700 8 700
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CATGTTCTTCGCGTCCCACATCTGCTGTGTCAGCTCAGGGACACTCAAGGCACTGTACTG
CTGCGAACCTCTCGACGTCA
C

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CATCGTACTCCTCTTCTTCCTCCTCATACTCCTCCTCACCGGCTGTCGCATCCTGGTACT
GCTGATACTCTGCAACAAGATCATTCATGTTACTCTCCGCTTCGGTGAACTCCATCTCGT
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GCGTTCCCATCCCAGATCCAGTTCCTCCACCCAATGAATGACAAACCTGGAAAC

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DS 



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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1GZ77JQ C 453
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GGGTTT
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AAAGCCTCTTATATAAACATCTCCACTCCTCAAAGATCACAAACAATGCCTTTAATTTTT
GGATCGGTCCCTATCTTGGCTGCGGTGGCCATTCAACTCCTTATATCCAGTGTTTCGTCC
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ATATGGTACGACCAATGCACTCTGGATATTGCTACATACAATTCCGGTGACACCAGAATC
CTTTACGATAATTA

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DS 

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AAAATTCTCATCAAAGCCTCTTATATAAACATCTCCACTCCTCAAAGATCACAAACAATG
CCTTTAATTTTTGGATCGGTCCCTATCTTGGCTGCGGTGGCCATTCAACTCCTTATATCC
AGTGTTTCGTCCCTCAACATTACCAATGAGTATCTCCACCACGCATGCAACAACACCCAA
GGGAAATACGTGCCAGGGGGTGTGTTCGAAAAAAATCTCAACATTGTCCTCAAAAACATA
TCCACCTTTGATCTGCGCAACGGTTACGCCCTTGAGTCCAATATGGATAGACCCTACAAA
TTTATACCTCCTGCCGCCGTCTTCGTCATGCTCCAGTGTCGTGGCGACTCCTACGGGCCT
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GACACCAGAATCCTTTACGATAATTATTTATGTATGGAGAACCCAAAGGACCTGAGCGGA
GATACGGAGATGTTCGATAAGAAGAAGAGCGCTTTCACCAAAAA

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DS 

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GG
AAGGTAAACAAAGTACAAGAAAAAAGGAATCATAATCACTTCAAATCTAAAATTCTCATC
AAAGCCTCTTATATAAACATCTCCACTCCTCAAAGATCACAAACAATGCCTTTAATTTTT
GGATCGGTCCCTATCTTGGCTGCGGTGGCCATTCAACTCCTTATATCCAGTGTTTCGTCC
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CCAGGGGGTGTGTTCGAAAAAAATCTCAACATTGTCCTCAAAAACATATCCACCTTTGAT
CTGCGCAACGGTTACGCCCTTGAGTCCAATATGGATAGACCCTACAAATTTATACCTCCT
GCCGCCGTCTTCGTCATGCTCCAGTGTCGTGGCGACTCCTACGGGCCTAAGTGTCACTCT
TGCCTCGCCAAAGCCCTCTCTGGGCTTCGCAAGAAATGTCCGAGAAACAGAGCAGCAACA
ATATGGTACGACCAATGCACTCTGGATATTGCTACATACAATTCCGGTGACACCAGAATC
CTTTACGATAATTATTTATGTATGGAGAATCCAAAGGACCTGAGCGGAGATACGGAGATG
TTCGATAAGAAGAAGAGCGCTTTCACCAAAAA

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DS 

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TCTGGATATTGCTACATACAATTCCGGTGACACCAGAATCCTTTACGATAATTATTTATG
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GGACGAGTTATTTGGGAACGGTTGCTTTGTGTGTTTAGATTGGCTTATCAATGAGCGTCC
ATTTTGCGGCCATGAAAAACAAGGAGTTAGATATTTGTGTAGAAGCTGTAATGCAAGATT
TGAGCTTTACCCTTTTTTTAGAACTTAAGACTGTTTGTGGGAGCCCTTTGTTTGATGTTT
GAATAGGTGCTATATCA
GG

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DS 

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G
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AATTCCGGTGACACCAGAATCCTTTACGATAATTATTTATGTATGGAGAACCCAAAGGAC
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TCTGAAGTCAAAAAGTTGGGCAAAGACGGGAAGAGGCCAGTGTACGCAACGGGGGAGATG
ATGATCGAGAGAAAGAAGCTTTATGGAATGATGCAATGTACGGACGAGTTATCTGGGAAC
GGTTGCTTTGTGTGTCTAGATTGGCTTATCAATGAGCGTCCATTCTGCGGCCATGAAAAA
CAAGGAGTTAGATATTTGTGTAGAAGCTGTAATGCAAGATTTGAGCTTTACCCTTTTCTT
AGAACTTAAGACTGTTTGTGGGAGCCCTTTGTTTGATGTTTGAATAAGTGCTATATCA
CGA

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DS 

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TGGGAACGGTTGCTTTGTGTGTCTAGATTGGCTTATCAATGAGCGTCCATTCTGCGGCCA
TGAAAAACAAGGAGTTAGATATTTGTGTAGAAGCTGTAATGCAAGATTTGAGCTTTACCC
TTTTCTTAGAACTTAAGACTGTTTGTGGGAGCCCTTTGTTTGATGTTTGAATAAGTGCTA
TATCAGGAAATAAAAAGTGTTCTCCTC

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DS 



AS 2 5

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ATGTTTAAAACATATCTATAACATATTCGATAACTTTATTACAAAGATGATACGATACAT
CAAATGGAAACTTAAATTATACACATTTTTCAAATGCTTAACATAAACAATAAGCTTTAT
ACACCAGTTTTCTTGTGTTCATCGGTCGGTTATCACTTATCAATCATCATCAATACGTAG
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CGACCACAGAGATCACTAGACAAGAAACACTAAGCATCTGCAAACAAACCCACCTCGTGC
TCCATTTCTCCACCTTCCTCTGCTTTATATACATCTCAATCGGGAAGTAAACCGTCAAGG
GCCAAAACCCTAAGGCTCCCAAGATCCCAACCACGTCGTTGAAGAACGGCATTAGCATCG
ATATCACTGTGGTTAGAACGACGAAAGAACACCGGAAAACTACCCTGAAAACGTTTGTTT
TGTATGGAGACCTAAACCCTGGGATTTTGAATTCGAGTTCCTTGGTGAGCAAGTCATTGT
CTGGAAACCTCTCTGAGACGGATTTTTCAGCGAAGGAGAAGATGGGCTGAGAAAAGACTT
GGTAAGCTCCTATGAGATGGATGACGATGGCGGCGTTGGCTATATCGATAAGCCAAAACG
GGTTGTAGAAACCGAAACCCGTGAGGAGGTTTCCTGGTACTGCATCTCCAAAGGCAGCGT
AACCCATTGAGCCACATAGCATGTAGAAGACGGTGGTAACTGCTATGCTGAGTTTTGTAG
CTTTCTTCATTGTTTTCGATTCGATGGTGGAGATCTTACAGTATCCTGAATCTCGATAAG
GACAACAGAGTATGAGTAGGCAAAGGCAATGTCTCCAAGTGCTTGAAAGGTTCTCCATAT
CTTCTGTGTTTGAGTCACTGTTCCTATACTTATTCCTGTGAGGCTTCCTTTGAATACTCC
ATTTGCAGCAACTTGAACAATGCCGAGAGCTAGACCAATAGCAGAGTAAGTGAAGGACAT
GACAGCTGCTACAATGGAGATCCACCAGATCTGGTCGAAGTCAGGAACCTGAGAGAGCAA
GATCTCTGTCACGCCAAATATGATCATGTAAAGGTTGCTCGACATGCGACACGGGTCTTT
TCCTCCGCTCTTGTGGAAACAGTTCGATCTCTTAATCGCCATCATGCTTATAGATGCTGC
GATTGTGTAACCGACGGCTACACCAAACAGATTCAAGTATTGAATCAGCCCACAAATCTT
GAACTGGAACCCACCGAGAATGGATCGAACTGCGTCCATGTAAGTGTAGTTTCTTTTGCC
GGAGACTGCATCGCCGGTTCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FK01JQ U 1
AF RS1GV76JQ U 59
AF RS1GV76TF C 701
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RD RS1FK01JQ 687 0 0
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ATGTTTGAAACATATCTATAACATATTCGATAACTTTATTACAAAGATGATACGATACAT
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ACACCAGTTTTCTTGTGTTCATTGGTCGGTTATCACTTATCAGTCATCATCAATACGTAG
ACTGGAAAGGCTTATAGACTTTAAGATCAAGCATTACTCCAGCAATTGAACCAACTCCAG
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TCCATTTCTCCACCTTCCTCTGCTTTATATACATCTCAATCGGGAAGTAAACCGTCAAGG
GCCAAAACCCTAAGGCTCCCAAGATCCCAACCACGTCGTTGAAGAACGGCATTAGCATCG
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GGTAAGCTCCTATGAGATGGATGACGA

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1GV76JQ 833 0 0
GCATGTTTAAAACATATCTATAACATATTCGATAACTTTATTACAAAGATGATACGATAC
ATCAAATGGAAACTTAAATTATACACATTTT*CAAATGCTTAACATAAACAATAAGCTTT
ATACACCAGTTTTCTTGTGTTCATCGGTCGGTTATCACTTATCAATCATCATCAATACGT
AGACTGGAAATGCTTATAGACTTTAAGATCAAGCATTACTCCAGCAATCGAACCAACTCC
AGCGACCACAGAGATCACTAGACAAGAAACACTAAGCATCTGCAAACAAACCCACCTCGT
GCTCCATTTCTCCACCTTCCTCTGCTTTATATACATCTCAATCGGGAAGTAAACCGTCAA
GGGCCAAAACCCTAAGGCTCCCAAGATCCCAACCACGTCGTTGAAGAACGGCATTAGCAT
CGATATCACTGTGGTTAGGACGACGAAAGAACACCGGAAAACTACCCTGAAAACGTTTGT
TTTGTATGGAGACCTAAACCCTGGGATTTTGAATTCGAGTTCCTTGGTGAGCAAGTCATT
GTCTGGAAACCTCTCTGAGACGGATTTTTCAGCGAAGGAGAAGATGGGCTGAGAAAAGAC
TTGGTAAGCTCCTATGAGGTGGATGACGATGGCGGCGTTGGCTATATCGATAAGCCAAAA
CGGGTTGTAGAAACCGAAACCCGTGAGGAGGTTTCCTGGTACTGCATCTCCAAAGGCAGC
GTAACCCATTGAGCCACATAGCATGTAGAAGACGGTGGTAACTGCTATGCTGAGTTTTGT
AGCTTTCTTCATTGTTTTCGATTCGATGGTGGAGATCTTACAGTATCCTGAAT

QA 1 833 1 833
DS 

RD RS1GV76TF 703 0 0
TATATCGATAAGCCAAAACGGGTTGTAGAA*CCGAAACCCGTGAGGAGGTTTCCTGGTAC
TGCATCTCCAAAGGCAGCGTAACCCATTGAGCCACATAGCATGTAGAAGACGGTGGTAAC
TGCTATGCTGAGTTTTGTAGCTTTCTTCATTGTTTTCGATTCGATGGTGGAGATCTTACA
GTATCCTGAATCTCGATAAGGACAACAGAGTATGAGTAGGCAAAGGCAATGTCTCCAAGT
GCTTGAAAGGTTCTCCATATCTTCTGTGTTTGAGTCACTGTTCCTATACTTATTCCTGTG
AGGCTTCCTTTGAATACTCCATTTGCAGCAACTTGAACAATGCCGAGAGCTAGACCAATA
GCAGAGTAAGTGAAGGACATGACAGCTGCTACAATGGAGATCCACCAGATCTGGTCGAAG
TCAGGAACCTGAGAGAGCAAGATCTCTGTCACGCCAAATATGATCATGTAAAGGTTGCTC
GACATGCGACACGGGTCTTTTCCTCCGCTCTTGTGGAAACAGTTCGATCTCTTAATCGCC
ATCATGCTTATAGATGCTGCGATTGTGTAACCGACGGCTACACCAAACAGATTCAAGTAT
TGAATCAGCCCACAAATCTTGAACTGGAACCCACCGAGAATGGATCGAACTGCGTCCATG
TAAGTGTAGTTTCTTTTGCCGGAGACTGCATCGCCGGTTCTGC

QA 1 703 1 703
DS 



CO CL1128Contig2 888 2 4 U
GATTGTTCAAGTTGCTGCAAATGGAGTGTTCAAAGGAAGCCTCACAGGAATAAGCATAGG
AACAGTGACTCAAACACAGAAGATATGGAGAACCTTTCAAGCGCTTGGAGACATTGCCTT
TGCTTACTCTTACTCCGTTGTCCTCATCGAGATTCAGGATACTGTAAGATCACCACCATC
CGAATCGAAAACAATGAAGAAAGCTACAAAACTCAGTATAGCAGTTACCACCATCTTCTA
CATGCTATGTGGCTCAATGGGTTACGCTGCCTTTGGAGATGCAGCACCAGAAAACCTCCT
CACTGGTTTTGGATTCTACAACCCGTTTTGGCTCATCGATATAGCCAACGCCGCCATCGT
CATCCATCTCATAGGAGCTTACCAAGTCTTCTCTCAGCCCATCTTCTCCTTCGCTGAAAA
ATCCGTCTCAGAGAGGTTTCCAAACAATGACTTGCTCACCAAGGAACTCGAATTCAAAAT
CCCAGGGTTTAGGTCTCCATACAAAACAAACGTTTTCAGGGTAGTATTCAGGTGTTCTTT
CGTCGTTCTAACCACAGTGATATCGATGCTAATGCCGTTCTTCAACGACGTGGTTGGGAT
CTTGGGAGCCTTAGGGTTTTGGCCCTTGACGGTTTACTTCCCGATTGAGATGTATATAAA
GCAGAGGAAGGTGGAGAAATGGAGCACGAGGTGGGTTTGTTTGCAGATGCTTAGTGTTTC
TTGTCTAGTGATCTCTGTGGTCGCTGGAGTTGGTTCAATTGCTGGAGTAATGCTTGATCT
TAAAGTCTATAAGCCTTTCCAGTCTACGTATTGATGATGACTGATAAGTGATAACCGACC
AATGAACACAAGAAAACTGGTGTATAAAGCTTATTGTTTATGTTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FK01TF U 1
AF RS1BZ67JQ C 185
BS 1 290 RS1FK01TF
BS 291 291 RS1BZ67JQ
BS 292 662 RS1FK01TF
BS 663 888 RS1BZ67JQ

RD RS1FK01TF 662 0 0
GATTGTTCAAGTTGCTGCAAATGGAGTGTTCAAAGGAAGCCTCACAGGAATAAGCATAGG
AACAGTGACTCAAACACAGAAGATATGGAGAACCTTTCAAGCGCTTGGAGACATTGCCTT
TGCTTACTCTTACTCCGTTGTCCTCATCGAGATTCAGGATACTGTAAGATCACCACCATC
CGAATCGAAAACAATGAAGAAAGCTACAAAACTCAGTATAGCAGTTACCACCATCTTCTA
CATGCTATGTGGCTCAATGGGTTACGCTGCCTTTGGAGATGCAGCACCAGGAAACCTCCT
CACTGGTTTTGGATTCTACAACCCGTTTTGGCTCATCGATATAGCCAACGCCGCCATCGT
CATCCATCTCATAGGAGCTTACCAAGTCTTCTCTCAGCCCATCTTCTCCTTCGCTGAAAA
ATCCGTCTCAGAGAGGTTTCCAAACAATGACTTGCTCACCAAGGAACTCGAATTCAAAAT
CCCAGGGTTTAGGTCTCCATACAAAACAAACGTTTTCAGGGTAGTATTCAGGTGTTCTTT
CGTCGTTCTAACCACAGTGATATCGATGCTAATGCCGTTCTTCAACGACGTGGTTGGGAT
CTTGGGAGCCTTAGGGTTTTGGCCCTTGACGGTTTACTTCCCGATTGAGATGTATATAAA
GC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RS1BZ67JQ 704 0 0
TCGAAAACAATGAAGAAAGCTACAAAACTCAGTATAGCAGTTACCACCATCTTCTACATG
CTATGTGGCTCAATGGGTTACGCTGCCTTTGGAGATGCAGCACCAGAAAACCTCCTCACT
GGTTTTGGATTCTACAACCCGTTTTGGCTCATCGATATAGCCAACGCCGCCATCGTCATC
CATCTCATAGGAGCTTACCAAGTCTTCTCTCAGCCCATCTTCTCCTTCGCTGAAAAATCC
GTCTCAGAGAGGTTTCCAAACAATGACTTGCTCACCAAGGAACTCGAATTCAAAATCCCA
GGGTTTAGGTCTCCATGCAAAACAAACGTTTTCAGGGTAGTATTCGGGTGTTCTTTCGTC
GTTCTAACCACAGTGATATCGATGCTAATGCCGTTCTTCAACGACGTGGTTGGGATCTTG
GGAGCCTTAGGGTTTTGGCCCTTGACGGTTTACTTCCCGATTGAGATGTATATAAAGCAG
AGGAAGGTGGAGAAATGGAGCACGAGGTGGGTTTGTTTGCAGATGCTTAGTGTTTCTTGT
CTAGTGATCTCTGTGGTCGCTGGAGTTGGTTCAATTGCTGGAGTAATGCTTGATCTTAAA
GTCTATAAGCCTTTCCAGTCTACGTATTGATGATGACTGATAAGTGATAACCGACCAATG
AACACAAGAAAACTGGTGTATAAAGCTTATTGTTTATGTTAAGC

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 6

CO CL1129Contig1 1218 6 17 U
GGACACAAAAGAGATAATCAAAAGGACATTATACAGTTTCTCCGTTCTCTAATTAATGTT
TTCTCAGTCTTTTAATCATACGAACAAAATCTAAAAAATCGATCTTTAAAAATACAGTAC
AGAAGGAACGTGATGTACTCTGAAAATCTAACGCTCTTTCCTCCAAATAATACACAGTGC
CTCACATCTAGCGCCTAGGAGGAAACGTGGGCATGAAATCTTGTGATTTTGGGAGAGGCA
CTTCATGAAACCAACTATGGTTGAGAGCTTCCTCCACTGTTAGACGTTTCTCAGGATCCA
AAGTTAGTAAACCATTCAGCAAATCAAATCCACGTTCTGAAAGTATCTGACCACCTACAA
ATGATATCGCTGGAAACTTCTTACGCAACAAATTATACGATTGTATAGGAAACTTGGCTT
TGGCATTGGGTAACGATGAGAATCCAGGCCAGATTGACTCGTTTGGTGTTCCAAGGACCG
CAAAGATCTTTTGAAGTTGGTCAAGTTCAGTCTTGCCCGGGAACAAAGGCTTTTGAGACA
AGAGCTCCGCCATAATGCAACCTATTGACCACATATCAACAGCCGTAGAGTACTGCTTCG
CTCCTAGAAGAAGTTCTGGTGGTCTGTACCACTGAGTGATGACCATCTGTGTGTAAGGCT
TGATAGGGCTCCCGTACTGTCTCGCCATACCAAAATCACAAATTTTCAACTCCCCAGTGT
TGTTCATCAGGAGGTTAGATGGCTTCAGATCCCTGTGGATGATCCAGTTCGTGTGGAGGT
AGTGCACACCCTCCAGTAGCTGCAGCATCAAGCACTTGACCTCGCTGGTGCTAAAAGGCT
GTTTCTTTCTTTCCATTAAGCACTTCAGGTCGTGTTCCAAGTGTTCCATGACCATGTAAA
CGTCGCTGTCGTTCTTCCCTCCGACCACAACCTCCTTTACATTCACTATTGAAGGGTGAT
TGCATGACAGAAGTATGTTGATTTCCCTCAGAGACGTCAAAGGGAATCCGTACCCTTCTT
CGTACTTGTCTTCCTTCATCTTGATCTTCTTGAGCGCCACAATCTCCTTTGTTTTCTCAT
CCCTCGCTCTGTAAACAATACCGTATGTACCTTCGTTAATCTTGTTTAGCTTCTGAAACC
CATTCACAGACCTGCTACCAAGTAGCATGTTCATCACTCCCTGAGCTGGAGAAGCCGGTT
CTTCAGCTTCTAACTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AD40JQ U 144
AF RS1BH74JQ U 13
AF RS1EV69JQ U 1
AF RS1BH74TF C 13
AF RS1B512JQ U 12
AF RS1EV69TF C 586
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BS 239 239 RS1BH74JQ
BS 240 264 RS1EV69JQ
BS 265 265 RS1BH74JQ
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BS 341 341 RS1BH74JQ
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RD RS1AD40JQ 457 0 0
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AGAGCTTCCTCCACTGTTAGACGTTTCTCAGGATCCAAAGTTAGTAAACCATTCAGCAAA
TCAAATCCACGTTCTGAGAGTATCTGACCACCTACAAATGATATCGCTGGAAACTTCTTA
CGCAACAAATTGTACGATTGTGTAGGAAACTTGGCTTTGGCATTGGGTAACGATGAGAAT
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AGTTCAGTCTTGCCCGGGAACAAAGGCTTTTGAGACAAGAGCTCCGCCATAATGCAACCT
ATTGACCACATACCAACAGCCGTAGAGTACTGCTTCG

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DS 

RD RS1BH74JQ 593 0 0
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TAATCATACGAACAAAATCTAAAAAATCGATCTTTAAAAATACAGTACAGAAGGAACGTG
ATGTACTCTGAAAATCTAACGCTCTTTCCTCCAAATAATACACAGTGCCTCACATCTAGC
GCCTAGGAGGAAACGTGGGCATGAAATCTTGTGATTTTGGGAGGGGCACTTCATGAAACC
AACTATGGTTGAGAGCTTCCTCCACTGTTAGACGTTTCTCAGGATCCAAAGTTAGTAAAC
CATTCAGCAAATCGAATCCACGTTCTGAAAGTATCTGACCACCTACAAATGATATCGCTG
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GAAGTTGGTCAAGTTCAGTCTTGCCCGGGAACAAAGGCTTTTGAGACAAGAGCTCCGCCA
TAATGCAACCTATTGACCACATATCAACAGCCGTAGAGTACTGCTTCGCTCCT

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DS 

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AGAAGGAACGTGATGTACTCTGAAAATCTAACGCTCTTTCCTCCAAATGATACACAGTGC
CTCACATCTAGCGCCTAGGAGGAAACGTGGGCATGAAATCTTGTGATTTTGGGAGAGGGA
CTTCATGAAACCAACTATGGTTGAAAGCTTCCTCCACTGTTAGACGTTTCTCAGGATCCA
AAGTTAGTAAACCATTCAGCAAATCAAATCCACGTTCTGAGAGTATCTGACCACCTACAA
ATGATATCGCTGGAAACTTCTTACGCAACAAATTGTACGATTGTGTAGGAAACTTGGCTT
TGGCATTGGGTAACGATGAGAATCCAGGCCAGATTGACTCGTTTGGTGTTCCAAGGACCG
CAAAGATCTTTTGAAGTTGGTCAAGTTCAGTCTTGCCCGGGAACAAAGGCTTTTGAGACA
AGAGCTCCGCCATAATGCAACCTATTGACCACATATCAACAGCCGTAGAGTACTGCTTCG
CTCCTAGAAGAAGTTCTGGTGGTCTGTACCACTGAGTGATGACCATCTGTGTGTAAGGCT
TGATAGGGCTCCCGTACTGTCTCGCCATACCAAAATCACAAATTTTCAACT

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DS 

RD RS1BH74TF 673 0 0
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TAATCATACGAACAAAATCTAAAAAATCGATCTTTAAAAATACAGTACAGAAGGAACGTG
ATGTACTCTGAAAATCTAACGCTCTTTCCTCCAAATAATACACAGTGCCTCACATCTAGC
GCCTAGGAGGAAACGTGGGCATGAAATCTTGTGATTTTGGGAGGGGCACTTCATGAAACC
AACTATGGTTGAGAGCTTCCTCCACTGTTAGACGTTTCTCAGGATCCAAAGTTAGTAAAC
CATTCAGCAAATCGAATCCACGTTCTGAAAGTATCTGACCACCTACAAATGATATCGCTG
GAAACTTTTTACGCAGCAAATTATACGATTGTATAGGAAACTTGGCTTTGGCATTGGGTA
ACGATGAGAATCCAGGCCAGATTGACTCGTTTGGTGTTCCAAGGACCGCAAAGATCTTTT
GAAGTTGGTCAAGTTCAGTCTTGCCCGGGAACAAAGGCTTTTGAGACAAGAGCTCCGCCA
TAATGCAACCTATTGACCACATATCAACAGCCGTAGAGTACTGCTTCGCTCCTAGAAGAA
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CGTACTGTCTCGC

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DS 

RD RS1B512JQ 716 0 0
A
GATAATCAAAAGGACATTATACAGTTTCTCAGTTCTCTAATTAATGTTTTCTCAGTCTTT
TAATCATACGAACAAAATCTAAAAAATCGATCTTTAAAAATACAGTACAGAAGGAACGTG
ATGTACTCTGAAAATCTAACGCTCTTTCCTCCAAATGATACACAGTGCCTCACATCTAGC
GCCTAGGAGGAAACGTGGGCATGAAATCTTGTGATTTTGGGAGAGGGACTTCATGAAACC
AACTATGGTTGAGAGCTTCCTCCACTGTTAGACGTTTCTCAGGATCCAAAGTTAGTAAAC
CATTCAGCAAATCAAATCCACGTTCTGAGAGTATCTGACCACCTACAAATGATATCGCTG
GAAACTTCTTACGCAACAAATTGTACGATTGTGTAGGAAACTTGGCTTTGGCATTGGGTA
ACGATGAGAATCCAGGCCAGATTGACTCGTTTGGTGTTTCAAGGACCGCAAAGATCTTTT
GAAGTTGGTCAAGTTCAGTCTTGCCCGGGAACAAAGGCTTTTGAGACAAGAGCTCCGCCA
TAATGCAACCTATTGACCACATACCAACAGCCGTAGAGTACTGCTTCGCTCCTAGAAGAA
GTTCTGGTGGTCTGTACCACTGAGTGATGACCATCTGTGTGTAAGGCTTGATAGGGCTCC
CGTACTGTCTCGCCATACCAAAATCACAAATTTTCAACTCCCCAGTGTTGTTCAT

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DS 

RD RS1EV69TF 633 0 0
TAGAGTACTGCTTCGCTC*TAGAAGAAGTTCTGGTGGTCTGTACCACTGAGTGATGACCA
TCTGTGTGTAAGGCTTGATAGGGCTCCCGTACTGTCTCGCCATACCAAAATCACAAATTT
TCAACTCCCCAGTGTTGTTCATCAGGAGGTTAGATGGCTTCAGATCCCTGTGGATGATCC
AGTTCGTGTGGAGGTAGTGCACACCCTCCAGTAGCTGCAGCATCAAGCACTTGACCTCGC
TGGTGCTAAAAGGCTGTTTCTTTCTTTCCATTAAGCACTTCAGGTCGTGTTCCAAGTGTT
CCATGACCATGTAAACGTCGCTGTCGTTCTTCCCTCCGACCACAACCTCCTTTACATTCA
CTATTGAAGGGTGATTGCATGACAGAAGTATGTTGATTTCCCTCAGAGACGTCAAAGGGA
ATCCGTACCCTTCTTCGTACTTGTCTTCCTTCATCTTGATCTTCTTGAGCGCCACAATCT
CCTTTGTTTTCTCATCCCTCGCTCTGTAAACAATACCGTATGTACCTTCGTTAATCTTGT
TTAGCTTCTGAAACCCATTCACAGACCTGCTACCAAGTAGCATGTTCATCACTCCCTGAG
CTGGAGAAGCCGGTTCTTCAGCTTCTAACTCGC

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 6

CO CL1130Contig1 1014 6 11 U
GGATCGGATCTGAGATCTTTGGATCCAAACATCGTTTTTTAATTCGAAATCAAGGTAATA
AGGAAAGCTTTGAGGTATCTTAGTCATCATGTCAAGAAGGCAAGTAGGAGGTTCCACGAG
GCGTGGAGGGGATAGTGGAAGCTTTCCATTTGTAGGAGCTTTGCACTCTAAATCACGTTC
CTCTCCTCTGCTTTCTATTTGCCTTGTTCTCGTGGGAGCATGCCTTCTCATTGGTTATGC
TTTCAGTGGTCCAGGTTTGTTTAAAACCATCAGAGAAGTCAGCAAGATCACAGGTGACTA
TTCATGCACATCAGAAGTTCAAAGAGCCGTTCCTGTTCTCAAGAATGCTTACGGAGATAG
CATGCGGAAAGTCTTGCACGTGGGTCCTGAAACATGCTCAGTGGTCTCTACCCTGTTGAG
GGAAGAAGAGACTGAAGCATGGGGTGTTGAGCCATATGATGTAGAGGATGCAGACTCCAA
CTGCAAAAGTCTTTTGCGTAAAGGCCTTGTGCGTGTGGCTGACATCAAGTTCCCTCTGCC
TTACCGGTCTAAGTCATTTTCTGTTGTGATCGTCTCGGATGCTCTGGATTACCTCTCACC
AAAGTATCTGAACAAAACCGTTCCTGAACTTGCGCGGGTTGCTTCAGATGGTGTCGTTCT
CTTCGCAGGTAATCCTGGTAAGCAAAAGGCTAAAGCTGCAGAGTTGTCAAAAGTGGGACG
ACCGGCTAAAATGCGTAGCTCGTCCTGGTGGACCCGTTTCTTCTCACAGACGAACTTAGA
GGAAAACGAAGCAGGAAGCAAGAAATTCGAAAAAGCAGCGTCCAAGATGTCATACAAACC
AGCTTGTCAAGTCTTCCACCTCAAGCCATTACATTAGAACATTATTTAGTATTATTACTA
CTGGTCTTCAAACCAAATATATCTTGCACTCTCTGTTATATGCCTTATTTGCTCTATAGA
AAGAAACAGATGTTCAAAAAAAAATTGTATTCCATTCTCAACGTTTTGATTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1CV32TF U 1
AF RS1F628TF U 35
AF RS1BK37TF U 35
AF RS1F628JQ C 207
AF RS1BK37JQ C 227
AF RS1CV32JQ C 238
BS 1 191 RS1CV32TF
BS 192 192 RS1BK37TF
BS 193 290 RS1CV32TF
BS 291 291 RS1BK37TF
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RD RS1CV32TF 645 0 0
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AGGAAAGCTTTGAGGTATCTTAGTCATCATGTCAAGAAGGCAAGTAGGAGGTTCCACGAG
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TTCATGCACATCAGAAGTTCAAAGAGCCGTTCCTGTTCTCAAGAATGCTTACGGAGATAG
CATGCGGAAAGTCTTGCACGTGGGTCCTGAAACATGCTCAGTGGTCTCTACCCTGTTGAG
GGAAGAAGAGACTGAAGCATGGGGCGTTGAGCCATATGATGTAGAGGATGCAGACTCCAA
CTGCAAAAGTCTTTTGCGTAAAGGCCTTGTGCGTGTGGCTGACATCAAGTTCTCTCTGCC
TTACCGGTCTAAGTCATTTTCTGTTGTGATCGTCTCGGATGCTCTGGATTACCTCTCACC
AAAGTATCTGAACAAAACCGTTCCTGAACTTGCGCGGGTTGCTTC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1F628TF 590 0 0
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GGAGCTTTGCACTCTAAATCACGTTCCTCTCCTCTGCTTTCTATTTGCCTTGTTCTCGTG
GGAGCATGCCTTCTCATTGGTTATGCTTTCAGTGGTCCAGGTTTGTTTAAAACCATCAGA
GAAGTCAGCAAGATCACAGGTGACTATTCATGCACATCAGAAGTTCAAAGAGCCGTTCCT
GTTCTCAAGAATGCTTACGGAGATAGCATGCGGAAAGTCTTGCACGTGGGTCCTGAAACA
TGCTCAGTGGTCTCTACCCTGTTGAGGGAAGAAGAGACTGAAGCATGGGGTGTTGAGCCA
TATGATGTAGAGGATGCAGGCTCCAACTGCAAAAGTCTTTTGCGTAAAGGCCTTGTGCGT
GTGGCTGACATCAAGTTCCCTCTGCCTTACCGGTCTAAGTCATTTTCTGTTGTGATCGTC
TCGGATGCTCTGGATTACCTCTCACCAAAGTATCTGAACAAAACCGTTCC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RS1BK37TF 630 0 0
TTTTTTAATTCGAAATCAAGGTAATAAGGAAAGCTTTGAGGTATCTTAGTCATCATGTCA
AGAAGGCAAGTAGGAGGTTCCACGAGGCGTGGAGGGGATAGTGGAAGCTTTCCATTTGTA
GGAGCTTTGCACTCTAAATCACGTTCCTCTCCTCTGCTTTCTATTTGCCTTGTTCTCGTG
GGAGCATGCCTTCTCATTGGTTATGCTTTCAGTGGTCCAGGTTTGTTTAAAACCATCAGA
GAAGTCAGCAAGATCACAGGTGACTATTCATGCACATCAGAAGTTCAAAGAGCCGTTCCT
GTTCTCAAGAATGCTTACGGAGATAGCATGCGGAAAGTCTTGCACGTGGGTCCTGAAACA
TGCTCAGTGGTCTCTACCCTGTTGAGGGAAGAAGAGACTGAAGCATGGGGTGTTGAGCCA
TATGATGTAGAGGATGCAGACTCCAACTGCAAAAGTCTTTTGCGTAAAGGCCTTGTGCGT
GTGGCTGACATCAAGTTCCCTCTGCCTTACCG*TCTAAGTCATTTTCTGTTGTGATCGTC
TCGGATGCTCTGGATTACCTCTCACCAAAGTATCTGAACAAAACCGTTCCTGAACTTGCG
CGGGTTGCTTCAGATGGTGTCGTTCTCTTC

QA 1 630 1 630
DS 

RD RS1F628JQ 808 0 0
G
TCTCGTGGGAGCATGC*TTCTCATGGGT*ATGCTTTCAGTGGTCCAGGTTTGTTTAAAAC
CATCAGAGAAGTCAGCAAGATCACAGGTGACTATTCATGCACATCAGAAGTTCAAAGAGC
CGTTCCTGTTCTCAAGAATGCTTACGGAGATAGCATGCGGAAAGTCTTGCACGTGGGTCC
TGAAACATGCTCAGTGGTCTCTACCCTGTTGAGGGAAGAAGAGACTGAAGCATGGGGTGT
TGAGCCATATGATGTAGAGGATGCAGGCTCCAACTGCAAAAGTCTTTTGCGTAAAGGCCT
TGTGCGTGTGGCTGACATCAAGTTCCCTCTGCCTTACCGGTTTAAGTCATTTTCTGTTGT
GATCGTCTCGGATGCTCTGGATTACCTCTCACCAAAGTATTTGAACAAAACCGTTCCTGA
ACTTGCGCGGGTTGCTTCAGATGGTGTCGTTCTCTTCGCAGGTAATCCTGGTAAGCAAAA
GGCTAAAGCTGCAGAGTTGTCAAAAGTGGGACGACCGGCTAAAATGCGTAGCTCGTCCTG
GTGGACCCGTTTCTTCTCACAGACGAACTTAGAGGAAAACGAAGCAGGAAGCAAGAAATT
CGAAAAAGCAGCGTCCAAGATGTCATACAAACCAGCTTGTCAAGTCTTCCACCTCAAGCC
ATTACATTAGAACATTATTTAGTATTATTACTACTGGTCTTCAAACCAAATATATCTTGC
ACTCTCTGTTATATGCCTTATTTGCTCTATAGAAAGAAACAGATGTTCAAAAAAAAATTG
TATTCCATTCTCAACGTTTTGATTCAT

QA 2 808 2 808
DS 

RD RS1BK37JQ 773 0 0
CTCATTGGTTATGCTTTCAGTGGTCCAGGTTTGTTTAAAACCATCAGAGAAGTCAGCAAG
ATCACAGGTGACTATTCATGCACATCAGAAGTTCAAAGAGCCGTTCCTGTTCTCAAGAAT
GCTTACGGAGATAGCATGCGGAAAGTCTTGCACGTGGGTCCTGAAACATGCTCAGTGGTC
TCTACCCTGTTGAGGGAAGAAGAGACTGAAGCATGGGGTGTTGAGCCATATGATGTAGAG
GATGCAGACTCCAACTGCAAAAGTCTTTTGCGTAAAGGCCTTGTGCGTGTGGCTGACATC
AAGTTCCCTCTGCCTTACCG*TCTAAGTCATTTTCTGTTGTGATCGTCTCGGATGCTCTG
GATTACCTCTCACCAAAGTATCTGAACAAAACCGTTCCTGAACTTGCGCGGGTTGCTTCA
GATGGTGTCGTTCTCTTCGCAGGTAATCCTGGTAAGCAAAAGGCTAAAGCTGCAGAGTTG
TCAAAAGTGGGACGACCGGCTAAAATGCGTAGCTCGTCCTGGTGGACCCGTTTCTTCTCA
CAGACGAACTTAGAGGAAAACGAAGCAGGAAGCAAGAAATTCGAAAAAGCAGCGTCCAAG
ATGTCATACAAACCAGCTTGTCAAGTCTTCCACCTCAAGCCATTACATTAGAACATTATT
TAGTATTATTACTACTGGTCTTCAAACCAAATATATCTTGCACTCTCTGTTATATGCCTT
ATTTGCTCTATAGAAAGAAACAGATGTTCAAAAAAAAATTGTATTCCATTCTC

QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1CV32JQ 777 0 0
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CTATTCATGCACATCAGAAGTTCAAAGAGCCGTTCCTGTTCTCAAGAATGCTTACGGAGA
TAGCATGCGGAAAGTCTTGCACGTGGGTCCTGAAACATGCTCAGTGGTCTCTACCCTGTT
GAGGGAAGAAGAGACTGAAGCATGGGGCGTTGAGCCATATGATGTAGAGGATGCAGACTC
CAACTGCAAAAGTCTTTTGCGTAAAGGCCTTGTGCGTGTGGCTGACATCAAGTTCCCTCT
GCCTTACCGGTCTAAGTCATTTTCTGTTGTGATCGTCTCGGATGCTCTGGATTACCTCTC
ACCAAAGTATCTGAACAAAACCGTTCCTGAACTTGCGCGGGTTGCTTCAGATGGTGTCGT
TCTCTTCGCAGGTAATCCTGGTAAGCAAAAGGCTAAAGCTGCAGAGTTGTCAAAAGTGGG
ACGACCGGCTAAAATGCGTAGCTCGTCCTGGTGGACCCGTTTCTTCTCACAGACGAACTT
AGAGGAAAACGAAGCAGGAAGCAAGAAATTCGAAAAAGCAGCGTCCAAGATGTCATACAA
ACCAGCTTGTCAAGTCTTCCACCTCAAGCCATTACATTAGAACATTATTTAGTATTATTA
CTACTGGTCTTCAAACCAAATATATCTTGCACTCTCTGTTATATGCCTTATTTGCTCTAT
AGAAAGAAACAGATGTTCAAAAAAAAATTGTATTCCATTCTCAACGTTTTGATTCAT

QA 1 777 1 777
DS 



AS 2 5

CO CL1131Contig1 563 3 4 U
CACAATGCTTTTAAAATAATATATAAGGGATAAATCAACTTATGAATTTTTTTATGATAT
CATTTAAGCTGACAACACCTAGTTAACACATAAATCTCCGGTCCCGAAATTTTACGATTG
CTCGCTCGTCGCAAAACAAGCAAAAATATATACGGTATTTTACGGTTACAAAGTATGTAT
AAGGGAGAGGAACAGGAAGAAGCTGTTTTAGTAGCTAAAGGCTCTCATCTTTGCAGCGGC
TTCTTTGATCTGCTCAATAGTGAAAATGCCAAAGATGTCGTCATCTTTAACGGCGTTAAT
CACAGCAAGTGCTAGATCATCAACTTTAACCGGTGGAGCCAAGATGAGATCAGACGCAGG
GAGAGACCTCAAAGGCCTAATGAACCTCTCTGCAGCATCGTAAATCTTGTCTAGTGGCTC
CCCGACCAGATCAAGCGGGAACTCGAATCCGTTCACTTTTCGTTTCCAGTATATGAAACC
TGGTCTCCGCACAACTCCGGAGTTGGGATATTTGGAGAGGAGTTCTGCCTCTGCGCTACG
TTTTCCGGTGAAGTAACCGCTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 10 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CV80JQ U 1
AF RS1CV80TF C 263
AF RS1FT87JQ U 26
BS 1 196 RS1CV80JQ
BS 197 197 RS1FT87JQ
BS 198 476 RS1CV80JQ
BS 477 563 RS1FT87JQ

RD RS1CV80JQ 477 0 0
CACAATGCTTTTAAAATAATATATAAGGGATAAATCAACTTATGAATTTTTTTATGATAT
CATTTAAGCTGACAACACCTAGTTAACACATAAATCTCCGGTCCCGAAATTTTACGATTG
CTCGCTCGTCGCAAAACAAGCAAAAATATATACGGTATTTTACGGTTACAAAGTATGTAT
AAGGGAGAGGAACAGGGAGAAGCTGTTTTAGTAGCTAAAGGCTCTCATCTTTGCAGCGGC
TTCTTTGATCTGCTCAATAGTGAAAATGCCAAAGATGTCGTCATCTTTAACGGCGTTAAT
CACAGCAAGTGCTAGATCATCAACTTTAACCGGTGGAGCCAAGATGAGATCAGACGCAGG
GAGAGACCTCAAAGGCCTAATGAACCTCTCTGCAGCATCGTAAATCTTGTCTAGTGGCTC
CCCGACCAGATCAAGCGGGAACTCGAATCCGTTCACTTTTCGTTTCCAGTATATGA
C

QA 1 476 1 476
DS 

RD RS1CV80TF 215 0 0
AAAATGC
CAAAGAGGTCGTCATCTTTAACGGCGTTAATCACAGCAAGTGCTAGATCATCAACTTTAA
CCGGTGGAGCCAAGATGAGATCAGACGCAGGGAGAGACCTCAAAGGCCTAATGAACCTCT
CTGCAGCATCGTAGATCTTGTCTAGTGGCTCCCCGACCAGATCAAGCGGGAACTCGAATC
CGTTCACTTTTCGTTTCCAGTATATGA
C

QA 8 214 8 214
DS 

RD RS1FT87JQ 538 0 0
AGGGATAAATCAACTTATGAATTTTTTTATGATATCATTTAAGCTGACAACACCTAGTTA
ACACATAAATCTCCGGTCCCGAAATTTTACGATTGCTCGCTCGTCGCAAAACAAGCAAAA
ATATATACGGTATTTTACGGTTACGAAGTATGTATAAGGGAGAGGAACAGGAAGAAGCTG
TTTTAGTAGCTAAAGGCTCTCATCTTTGCAGCGGCTTCTTTGATCTGCTCAATAGTGAAA
ATGCCAAAAATGTCGTCATCTTTAACGGCGTTAATCACAGCAAGTGCTAAATCATCGACT
TTAACCGGTGGAGCCAAGATGAAATCAGACGCAGGGAGAGACCTCAAAGGCCTAATGAAC
CTCTCTGCAGCATCGTAAATCTTGTCTAGTGGCTCCCCGACCAAATCAAGCGGGAACTCG
AATCCGTTCACTTTTCGTTTCCCGTATATGAAACCTGGTCTCCGCACAACTCCGGAGTTG
GGATATTTGGAGAGGAGTTCTGCCTCTGCGCTACGTTTTCCGGTGAAGTAACCGCTGG

QA 1 538 1 538
DS 



CO CL1131Contig2 977 2 18 U
GGGCGCCAGTTGTTGTAACCACACTTTTCTCGCTTTTTGTTTGTCTCCTCCGCCGATTTT
CAGACACTAGTTTCTGTCCGAAAAGAGTTTCAGTTGTTAAAATTTAAATCACCTTTTTCC
CGTACAAAATCGAAAAAAATGTCATCGTTTCTCAGTTTTCCGGCCATTTCACCTCGTCCA
TCTGCTTTTCCCGGCGCTTCATTTCGTCCTCGCTTTTCATCTCCACGATTGTTCAAGTCT
TGTGTTAAGTGCAGTTATGCTGAAGAAGCTACAATTGACATTGTGGCAGATGTCAGATCT
GAAAGGGTTGTAGTTCTGGGAGGCAATGGTTTCGTTGGCTCAGCTATCTGCAAGGAAGCA
ATCTCCAACGGAATCGAAGTTGTAAGCGTCAGCAGGTCTGGTCGTCCTAGCTTGCAAGAT
TCATGGTTGGATCAGGTTACATGGGTTACTGGTGACGTTTTCTATTTGAACTGGGATGAA
GTACTTCTCGGTGCCACTGCTGTAGTTTCGACCATTGGTGGTGTTGGTAATGAAGAACAG
ATGAAAAGAATCAACGGCGAAGCTAACGTTATCGCTGTGAATGCTGCCAAAGATTTCGGG
GTTCCTAAGTTTGTCTTGATCACTGTTCACGACTACAATCTTCCACCATTTGTTCTATCC
AGCGGTTACTTCACCGGAAAACGTAGCGCAGAGGCAGAACTCCTCTCCAAATATCCCAAC
TCCGGAGTTGTGCGGAGACCAGGTTTCATATACGGGAAACGAAAAGTGAACGGATTCGAG
GTCCCGCTTGATCTGGTCGGGGAGCCACTAGACAAGATCTACGATGCTGCAGAGAGGTTC
ATTAGACCGTTGAGTCTCTCCCTGCGTCTGATCTCATCTTGGCTCCACCGGTTAAAGTCG
ATGATCTAGCACTTGCTGTGATTAACGCCGTTAAAGATGACGACATCTTTGCATTTTCAC
TATTGAGCAGATCAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FT87TF U 1
AF RS1AB38TF U 139
BS 1 145 RS1FT87TF
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BS 718 739 RS1FT87TF
BS 740 977 RS1AB38TF

RD RS1FT87TF 756 0 0
GGGCGCCAGTTGTTGTAACCACACTTTTCTCGCTTTTTGTTTGTCTCCTCCGCCGATTTT
CAGACACTAGTTTCTGTCCGAAAAGAGTTTCAGTTGTTAAAATTTAAATCACCTTTTTCC
CGTACAAAATCGAAAAAAATGTCATTGTTTCTCAGTTTTCCGGCCATTTCACCTCGTCCA
TCTGCTTTTCCCGGCGCTTCATTTCGTCCTCGCTTTTCATCTCCACGATTGTTCAAGTCT
TGTGTTAAGTGCAGTTATGCTGAAGAAGCTACAATTGACATTGTGGCAGATGTCAGATCT
GAAAGGGTTGTAGTTCTTGGAGGCAATGGTTTCGTTGGCTCAGCTATCTGCAAGGAAGCA
ATCTCCAACGGAATTGAAGTTGTAAGCGTCAGCAGGTCTGGTCGTCCTAGCTTGCAAGAT
TCATGGTTGGATCAGGTTACATGGGTTACTGGTGATGTTTTCTATTTGAACTGGGATGAA
GTACTTCTCGGTGCCACTGCTGTAGTTTCGACCATTGGTGGTTTTGGTAATGAAGAACAG
ATGAAAAGAATCAACGGCGAAGCTAACGTTATCGCTGTGAATGCTGCTAAAGATTTCGGT
GTTCCTAAGTTTGTCTTGATCACTGTTCACGACTACAATCTTCCACCATTTGTTCTATCC
AGCGGTTACTTCACCGGAAAACGTAGCGCAGAGGCAGAACTCCTCTCCAAATATCC*AAC
TCCGGAGTTGTGCGGAGAC
AGTTTCATATACGGAAA

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1AB38TF 839 0 0
ATGTCATCGTTTCTCAGTTTTCCGGCCATTTCACCTCGTCCATCTGCTTTTCCCGGCGCT
TCATTTCGTCCTCGCTTTTCATCTCCACGATTGTTCAAGTCTTGTGTTAAGTGCAGTTAT
GCTGAAG***CTACAATTGACATTGTGGCAGATGTCAGATCTGAAAGGGTTGTAGTTCTG
GGAGGCAATGGTTTCGTTGGCTCAGCTATCTGCAAGGAAGCAATCTCCAACGGAATCGAG
GTTGTAAGTGTCAGCAGGTCTGGTCGTCCTAGCTTGCAAGATTCATGGTTGGATCAGGTT
ACATGGGTTACTGGTGACGTTTTCTATTTGAACTGGGATGAAGTACTTCTCGGTGCCACT
GCTGTAGTTTCGACCATTGGTGGTGTTGGTAATGAAGAACAGATGAAAAGAATCAACGGT
GAAGCTAACGTTATCGCTGTGAATGCTGCCAAGGATTTCGGGGTTCCTAAGTTTGTCTTG
ATCACTGTTCACGACTACAATCTTCCACCATTTGTTCTATCCAGCGGTTACTTCACCGGA
AAGCGTAGCGCTGAGGCAGAACTCCTCTCCAAATATCCCAACTCCGGAGTTGTGCTGAGA
CCAGGTTTCATATACGGGAAACGAAAAGTGAACGGATTCGAGGTCCCGCTTGATCTGGTC
GGGGAGCCACTAGACAAGATCTACGATGCTGCAGAGAGGTTCATTAGACCGTTGAGTCTC
TCCCTGCGTCTGATCTCATCTTGGCTCCACCGGTTAAAGTCGATGATCTAGCACTTGCTG
TGATTAACGCCGTTAAAGATGACGACATCTTTGCATTTTCACTATTGAGCAGATCAAAG

QA 1 839 1 839
DS 



AS 1 6

CO CL1132Contig1 1418 6 12 U
TTTTTAAAAATTGTTCTTTATACATAAAAACCCTAATTTTGATACATAAGCTTTAAGAAC
CTTCTCGAGAGATCCTTTGGTGTACACTTTACTGTTTTTTTGGATTTGATTTGATTTGAT
TTGAAGAAGAAGAAATGCCTCCAAAGCAACAACCAAAGGCAGATTTGGCGAAAAAGCAGA
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AGTATGTCCAGAGTCTCAAGCAATCTGTTCAACCCAAACCCGACGCTTCTAAAGTTGCAG
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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G
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TAAAAAAA

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AS 1 5

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GATGTGACAAACAGTGGATCAGAGAAGACTAACAACACCATTCTCCAGATCAACAGGTTC
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AAGAACCCTATGTACACTTACCGCGAGAAGATTGTTCTTGGGAAGACGGATTGCACCATC
TTCACGGTTAATCAGATATTGCGTGAGCTCAGCAGGGAATGGCCTGGTCACACGTATGAT
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AAACTCCCAGGTTGGGTGAATCGGTTTGCTCATGCCGGCGACACGGCCTTGG*AAGTTGC
AGGAAACACAGCAATGCGGATAAAGCAAGCCAAAACTGAACTAGTATCAGCTAGTAAAGT
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AGAAGATGAAGATGCAAATCACGCAGTCCCTAATCATCAAAGAAAACAGAGCCGTGACTC
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ACACGTACTGTTCTCCATCATCTGTATCCATTACTTCTGTAACTGTCATTTGAACGCCAT
TTATTTCTCAGCAGAAACCTGTGATTTTGATATGAAGATACTATTCGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1G152TF U 1
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GGCTTATCGTTTCCTTTCGA
TGT

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GG
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TTCAAAGACGGCATCGGTCTTGGCGGCATCTTCCACAGCGCCATTCAGGTGTATGGGGAT
GATGAATGGTCATTTGGGTATTGTGAACAAGGAACTGGTGTCTTTAGCTGTCCTAGTACC
AAGAATCCTATGTACACTTATCGCGAGAAGATTGTTCTTGGGAAGACGGATTGCACCATT
TTCACGGTTAATCAGATATTGCGTGAGCTCAGCAGGGAATGGCCTGGACACACTTATGAT
TTGTTGTCTAAAAATTGTAACCACTTCTGCGATGTACTCTGCGACAGGCTTGGTGTCCCT
AAACTCCCAGGTTGGGTGAATCGGTTTGCTCATGCCGGCGACACGGCGTTGG*AAGTTGC
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AGGGGGGCCTGGAACACTGGGCAGTTCAGATAATGGGGGGAACATGAGATTG

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GATTGTTCTTGGGAAGACGGATTGCACCATCTTCACGGTTAATCAGATATTGCGTGAGCT
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A

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GAGAATGGGGGGAACATGAGATTGCAAGGTAGTTGGTTCAAAGGGTTACTTAACACTTCC
AAACCCTCCACAAGTACGGAGATGGAAAGCAAAGAAGATGAAGATGCAAATCACGCAGTC
CCTAATCATCAAAGAAAACAGAGCCGTGACTCTGTACCCATCCACCCTACTGCATTTGGG
TAAAATTGTATATCTCCATTGGCCGAGCAGTTACACGTACTGTTCTCCATCATCTGTATC
CATTACTTCTGTAACTGTCATTTGAACGCCATTTATTTCTCAGCAGAAACCTGTGATTTT
GATATGAAGATACTATTCG
AC

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DS 



AS 1 6

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ATCCGCCTCCTCAAACTCAAACATCATCATCATCTGAGATTGATTGATTGAAAGGGAGAG
AGAGAGAAATGGAGAACAATACTAAGAGCGGAGGATCGGCGATGGAAGCGTTCGAGAAGC
TAGAGAAAGTAGGAGAAGGGACATACGGGAAAGTGTACAGAGCAAGAGAGAAGGCAACTG
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AGTACGTTGACACGGATCTCAAGAAGTTCATCAGGAGCTTCAAGCAAGCTGGCCAAAACA
TTCCCCACAACACTGTCAAGTGTTTGATGTACCAACTATGCAAAGGCATGGCTTTCTGCC
ACGGCCATGGAGTGTTGCACAGGGATCTTAAGCCTCACAATCTCTTGATGGACCGTCAGA
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AGTATACACATGAGATACTAACTCTATGGTATAGAGCTCCAGAAGTCCTTCTCGGTGCAA
CCCATTACTCAACCGCTGTTGATATGTGGTCTGTTGGCTGCATTTTTGCTGAACTTGTGA
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AGGCTATGGAGCATCCTTACTTCGATGATCTACCTGACAAATCCCTTCTCTGAAGATCTC
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ACCTTATCTTGCTATCTTAGTAGGATGATCAACTTTTTCAAATTTCCCTTGGCATTGGGG
TCTATGTTCCCAGTTGTATAACCCTCTACTTCATTAACATTGATAGAACACAATTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EC47TF U 1
AF RS1AP06TFB U 71
AF RS1DK38TF U 71
AF RS1EC47JQ C 607
AF RS1AP06JQ C 460
AF RS1DK38JQ C 811
BS 1 124 RS1EC47TF
BS 125 125 RS1AP06TFB
BS 126 574 RS1EC47TF
BS 575 575 RS1AP06TFB
BS 576 696 RS1EC47TF
BS 697 700 RS1AP06TFB
BS 701 766 RS1DK38TF
BS 767 767 RS1AP06JQ
BS 768 772 RS1DK38TF
BS 773 773 RS1AP06JQ
BS 774 780 RS1DK38TF
BS 781 781 RS1AP06JQ
BS 782 796 RS1DK38TF
BS 797 797 RS1AP06JQ
BS 798 817 RS1DK38TF
BS 818 1167 RS1AP06JQ
BS 1168 1168 RS1DK38JQ
BS 1169 1222 RS1AP06JQ
BS 1223 1258 RS1DK38JQ

RD RS1EC47TF 696 0 0
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ATCCGCCTCCTCAAACTCAAACATCATCATCATCTGAGATTGATTGATTGAAAGGGAGAG
AGAGGGAAATGGAGAACAATACTAAGAGCGGAGGATCGGCGATGGAAGCGTTCGAGAAGC
TAGAGAAAGTAGGAGAAGGGACATACGGGAAAGTGTACAGAGCAAGAGAGAAGGCAACTG
GTCTCATCGTCGCTTTGAAGAAGACTCGTCTCCATGAGGACGAAGAAGGCGTTCCTCCCA
CCACTCTCCGCGAGATCTCCATCCTCCGCATGCTCGCTCGCGATCCCCACATCGTCAGGT
TGATGGATGTTAAGCAAGGATTGAACAAAGAAGGCAAGACTGTGCTCTACCTTGTGTTCG
AGTACGTTGACACGGATCTCAAGAAGTTCATCAGGAGCTTCAAGCAAGCTGGCCAAAACA
TTCCCCACAACACTGTCAAGTGTTTGATGTACCAACTATGCAAAGGCATGGCTTTCTGCC
ACGGCCATGGAGTGTTGCACAGGGATCTTAAGCCACACAATCTCTTGATGGACCGTCAGA
AAATGACCCTCAAAATAGCTGATCTTGGATTAGCCAGAGCCTTCACTCTCCCTATGAAAA
AGTATACACATGAGATACTAACTCTATGGTATAGAG

QA 1 696 1 696
DS 

RD RS1AP06TFB 630 0 0
GG
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GAGAAGGGACATACGGGAAAGTGTACAGAGCAAGAGAGAAGGCAACTGGTCTCATCGTCG
CTTTGAAGAAGACTCGTCTCCATGAGGACGAAGAAGGCGTTCCTCCCACCACTCTCCGCG
AGATCTCCATCCTCCGCATGCTCGCTCGCGATCCCCACATCGTCAGGTTGATGGATGTTA
AGCAAGGATTGAACAAAGAAGGCAAGACTGTGCTCTACCTTGTGTTCGAGTACGTTGACA
CGGATCTCAAGAAGTTCATCAGGAGCTTCAAGCAAGCTGGCCAAAACATTCCCCACAACA
CTGTCAAGTGTTTGATGTACCAACTATGCAAAGGCATGGCTTTCTGCCACGGCCATGGAG
TGTTGCACAGGGATCTTAAGCCTCACAATCTCTTGATGGACCGTCAGAAAATGACCCTCA
AAATAGCTGATCTTGGATTAGCCAGAGCCTTCACTCTCCCTATGAAAAAGTATACACATG
AGATACTAACTCTATGGTATAGAGCTCC

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DS 

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GG
AAACTCAAACATCATCATCATCTGAGATTGATTGATTGAAAGGGAGAGAGAGAGAAATGG
AGAACAATACTAAGAGCGGAGGATCGGCGATGGAAGCGTTCGAGAAGCTAGAGAAAGTAG
GAGAAGGGACATACGGGAAAGTGTACAGAGCAAGAGAGAAGGCAACTGGTCTCATCGTCG
CTTTGAAGAAGACTCGTCTCCATGAGGACGAAGAAGGCGTTCCTCCCACCACTCTCCGCG
AGATCTCCATCCTCCGCATGCTCGCTCGCGATCCCCACATCGTCAGGTTGATGGATGTTA
AGCAAGGATTGAACAAAGAAGGCAAGACTGTGCTCTACCTTGTGTTCGAGTACGTTGACA
CGGATCTCAAGAAGTTCATCAGGAGCTTCAAGCAAGCTGGCCAAAACATTCCCCACAACA
CTGTCAAGTGTTTGATGTACCAACTATGCAAAGGCATGGCTTTCTGCCACGGCCATGGAG
TGTTGCACAGGGATCTTAAGCCTCACAATCTCTTGATGGACCGTCAGAAAATGACCCTCA
AAATAGCTGATCTTGGATTAGCCAGAGCCTTCACTCTCCCTATGAAAAAGTATACACATG
AGATACTAACTCTATGGTATAGAGCTCCAGAAGTCCTTCTCGGTGCAACCCATTACTCAA
CCGCTGTTGATATGTGGTCTGTTGGCTGCATTTT*GCTGA*CTTGTGA*CAAGCAAGCAA
TTTT*GCTGGAGACTCTGAGCTCCA
CACTCCTCAGTATTT

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DS 

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CACATGAGATACTAACTCTATGGTATAGAGCTCCAGAAGTCCTTCTCGGTGCAACCCATT
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AAGCAATTTTTGCTGGAGACTTTGAGCTCCAACAACTCCTCAGTATTTTCAGGTTGCTGG
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CACAGTGGAAACCTTTGAGCCTCTCAACAGCTGTCCCAAACCTCGATGAGTCCGGACCTG
ATTTTTTATCAAAAATGCTGGAGTATGAGCCAGTTAAACGAATTTCAGCTAAGAAGGCTA
TGGAGCATCCTTACTTCGATGATCTACCTGACAAATCCCTT
TTTTGA

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DS 

RD RS1AP06JQ 763 0 0
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GCAAAGGCATGGCTTTCTGCCACGGCCATGGAGTGTTGCACAGGGATCTTAAGCCTCACA
ATCTCTTGATGGACCGTCAGAAAATGACCCTCAAAATAGCTGATCTTGGATTAGCCAGAG
CCTTCACTCTCCCTATGAAAAAGTATACACATGAGATACTAACTCTATGGTATAGAGCTC
CAGAAGTCCTTCTCGGTGCAACCCATTACTCAACCGCTGTTGATATGTGGTCTGTTGGCT
GCATTTTTGCTGAACTTGTGAACAAGCAAGCAATTTTTGCTGGAGACTCTGAGCTCCAAC
AACTCCTCAGTATTTTCAGGTTGCTGGGAACACCAAACGAACAAGTGTGGCCTGGAGTGA
GCAAACTCAAGGACTGGCATGAATACCCACAGTGGAAACCTTTGAGCCTCTCAACAGCTG
TCCCAAACCTCGATGAGTCCGGACTTGATCTCTTATCAAAAATGCTGGAGTATGAGCCAG
TTAAACGAATTTCAGCTAAGAAGGCTATGGAGCATCCTTACTTCGATGATCTACCTGACA
AATCCCTTCTCTGAAGATCTCTTTATGTACGAACTCTCTGTAGTCTTGTTTGTTCCAACT
TTGTCATTGCTTGTCTCAAGCACCTTATCTTGCTATCTTAGTAGGATGTTCAACTTTTTC
AAATTTCCCTTGGCATTGGGGTCTATGTTCCCAGTTGTATAAC

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DS 

RD RS1DK38JQ 448 0 0
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CTGGAGTGAGCAAACTCAAGGACTGGCATGAATACCCACGGTGGAAACCTTTGAGCCTCT
CAACAGCTGTCCCAAACCTCGATGAGTCCGGACTTGATCTCTTATCAAAAATGCTGGAGT
ATGAGCCAGTTAAACGAATCTCAGCTAAGAAGGCTATGGAGCATCCTTACTTCGATGATC
TACCTGACAAATCCCTTCTCTGAAGATCTCTTTATGTACGAACTCTCTGTAGTCTTGTTT
GTTCCAACTTTGTCATTGCTTGTCTCAAGCACCTTATCTTGCTATCTTAGTAGGATGATC
AACTTTTTCAAATTTCCCTTGGCATTGGGGTCTATGTTCCCAGTTGTATAACCCTCTACT
TCATTAACATTGATAGAACACAATTTGC

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DS 



AS 1 6

CO CL1135Contig1 1317 6 7 U
AGCTCAACAAGAAGATTCTTGCTTTTATGTATACACATTCATAATTAAACACGGCATAAA
TAACACACATGTACATTTCAAATCATAAGTTAAAATAAATAAAAAACACAAACCATCCCA
AACATTCTCACAACAGAAACAACACAACTCTCATTTCCTTGTCACCAAAAGACTGTTTAG
CAAGCAAAAGCAGTCTCCAGTTCTGGTTTCAAATTTCGGTTCACTTCCTCTGCAACAAAC
CGGTTTATCTGCTCAGTTTTCTGTGTGGTTTCATCATCATTGTCTTCTTTAGAGATCACT
ATTAAAGTCTTTGGAGTTCGACGCCTAGAGACTCCTTTCGCTCTGTTCCCTTCTTTTGTG
TTCCTACGCCCTAGTTTCGGTGACTTTGCTCGAGTTGGAGGAGGCTTCTTAAGTTCAACC
TTTGGAGGAGGCACTTCATGGTAGAAGTTAGGCATTGGGTTTGCTTTGAAAATCAAACTC
TTTCTTAATTGCCTCAATGCTGCATCGTTCTCTTCCTTGTTCCTTGCTTCGCTCTGCGTT
TTTTCTGCCTCCATGGCTTGGTGTTTCTCCTCCAGTTTTGTATAGACCTCCTTCCTTTTC
TCTGCACGCTCGGTGGAACGAAATGAAGGAGCTGCAATGACAATAGTTCTTGATTTAGCA
GACTTTGCAGCCGACGTGGCATAAGAAGCAACAGAGCAAGAATCTTCCTCATCAGAAAGC
TTTTTGTTCTTTGGCTGCAACGGTTTCCTTGCCACCTTTGTAGCCTGCTTTGGTACTTTA
CTGTACTCATCCGGAAATATTTTGGACACTACTTCATGAGACTCACGTGTAGCAGATGAA
GCACGCTTCTCAGTAGCTAAAGCAACTGGCTGAGGAACAGTGTTCCTTATTTTATTACTT
ACACGACCTGGTTTAGAAGCATGTTTTGCATTCAAAAGAGACTTCTTCACAGATTTTGCG
TCTTTTCCCAAGGTAGCTATCTCCAGATTACCATCTTCCAGTGGCTTAGCCACTGGAATT
TCATTAGTACACTCCTTAACATCGTACTCTTTTACTTCTGTGCTCTCTTCTGTAGATAGA
AGCTCTGTATTTCCATTGGCTTCATCGCTTGATACTGTATCTAAGGGAGGCAGTACAGAA
ACATTTTCTTGGATTGGGTTACATGAATCGCCATTAGCATAGACCACCACACCATCTGGC
TCCTTGTCCATACAGATATCCATTGTTCTCGTGTCAGGCGAGAGAATCTTGTAACTGCTC
TTTATCTCTCTCTTGTGTGTGTTTGTTTGTGACTTCTGAGAATGATGAATACTATCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EO63TF C 1
AF RS1EO63JQ U 11
AF RS1FN20JQ U 11
AF RS1FN20TF C 76
AF RS1DM45JQ U 72
AF RS1DM45TF C 613
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RD RS1EO63TF 694 0 0
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CAAGCAAAAGCAGTCTCCAGTTCTGGTTTCAAATTTCGGTTCACTTCCTCTGCAACAAAC
CGGTTTATCTGCTCAGTTTTCTGTGTGGTTTCATCATCATTGTCTTCTTTAGAGATCACT
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TTCCTACGCCCTAGTTTCGGTGACTTTGCTCGAGTTGGAGGAGGCTTCTTAAGTTCAACC
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TTTCTTAATTGCCTCAATGCTGCATCGTTCTCTTCCTTGTTCCTTGCTTCGCTCTGCGTT
TTTTCTGCCTCCATGGCTTGGTGTTTCTCCTCCAGTTTTGTATAGACCTCCTTCCTTTTC
TCTGCACGCTCGGTGGAACGAAATGAAGGAGCTGCAATGACAATAGTTCTTGATTTAGCA
GACTTTGCAGCCGACGTGGCATAAGAAGCAACAG

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DS 

RD RS1EO63JQ 734 0 0
GAAA
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ATTTCAAATCATAAGTTAAAATAAATAAAAAACACAAACCATCCCAAACATTCTCACAAC
AGAAACAACACAACTCTCATTTCCTTGTCACCAAAAGACTGTTTAGCAAGCAAAAGCAGT
CTCCAGTTCTGGTTTCAAATTTCGGTTCACTTCCTCTGCAACAAACCGGTTTATCTGCTC
AGTTTTCTGTGTGGTTTCATCATCATTGTCTTCTTTAGAGATCACTATTAAAGTCTTTGG
AGTTCGACGCCTAAAGACTCCTTTCGCTCTGTTCCCTTCTTTTGTGTTCCTACGCCCTAG
TTTCGGTGACTTTGCTCGAGTTGGAGGAGGCTTCTTAAGTTCAACCTTTGGAGGAGGCAC
TTCATGGTAGAAGTTAGGCATTGGGTTTGCTTTGAAAATCAAACTCTTTCTTAATTGCCT
CAATGCTGCATCGTTCTCTTCCTTGTTCCTTGCTTCGCTCTGCGTTTTTTCTGCCTCCAT
GGCTTGGTGTTTCTCCTCCAGTTTTGTATAGACCTCCTTCCTTTTCTCTGCACGCTCGGT
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CTGCAACGGT

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DS 

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AGAAACAACACAACTCTCATTTCCTTGTCACCAAAAGACTGTTTAGCAAGCAAAAGCAGT
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AGTTTTCTGTGTGGTTTCATCATCATTGTCTTCTTTAGAGATCACTATTAAAGTCTTTGG
AGTTCGACGCCTAGAGACTCCTTTCGCTCTGTTCCCTTCTTTTGTGTTCCTACGCCCTAG
TTTCGGTGACTTTGCTCGAGTTGGAGGAGGCTTCTTAAGTTCAACCTTTGGAGGAGGCAC
TTCATGGTAGAAGTTAGGCATTGGGTTTGCTTTGAAAATCAAACTCTTTCTTAATTGCCT
CAATGCTGCATCGTTCTCTTCCTTGTTCCTTGCTTCGCTCTGCGTTTTTTCTGCCTCCAT
GGCTTGGTGTTTCTCCTCCAGTTTTGTATAGACCTCCTTCCTTTTCTCTGCACGCTCGGT
GGAACGAAATGAAGGAGCTGCAATGACAATAGTTCTTGATTTAGCAGACTTTGCAGCCGA
CGTGGCATAAGAAGCAACAGAGCAAGAATCTTCCTCATCAGAAAGCTTTTTGTTCTTTGG
CTGCAACGGTTTCCTTGCCACCTTTGTAGC

QA 5 754 5 754
DS 

RD RS1FN20TF 691 0 0
A
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TTCGACGCCTAGAGACTCCTTTCGCTCTGTTCCCTTCTTTTGTGTTCCTACGCCCTAGTT
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CATGGTAGAAGTTAGGCATTGGGTTTGCTTTGAAAATCAAACTCTTTCTTAATTGCCTCA
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CTTGGTGTTTCTCCTCCAGTTTTGTATAGACCTCCTTCCTTTTCTCTGCACGCTCGGTGG
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TGGCATAAGAAGCAACAGAGCAAGAATCTTCCTCATCAGAAAGCTTTTTGTTCTTTGGCT
GCAACGGTTTCCTTGCCACCTTTGTAGC
CC

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DS 

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CGCAC
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AAACAACACAACTCTCATTTCCTTGTCACCAAAAGACTGTTTAGCAAGCAAAAGCAGTCT
CCAGTTCTGGTTTCAAATTTCGGTTCACTTCCTCTGCAACAAACCGGTTTATCTGCTCAG
TTTTCTGTGTGGTTTCATCATCATTGTCTTCTTTAGAGATCACTATTAAAGTCTTTGGAG
TTCGACGCCTAGAGACTCCTTTCGCTCTGTTCCCTTCTTTTGTGTTCCTACGCCCTAGTT
TCGGTGACTCTGCTCGAGTTGGAGGAGGCTTCTTAAGTTCAACCTTTGGAGGAGGCCCTT
CATGGTAGAAGTTAGGCATTGGGTTTGCTTTGAACATCAAACTCTTTCTTAATTGCCTCA
ATGCTGCATCGTTCTCTTCCTTGTTCCTTGCTTCGCTCTGCGTTTTCTCTGCCTCCATGG
CTTGGTGTTTCTCCTCCAGTTTTGTATAGAACTCCTTCCTTTTCTCTGCACGCTCGGTGG
AACGAAATGAAGGAGCTGCAATGACAATAGTTCTTGATTTAGCAGACTTTGCAGCCGACG
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GCAACGGTTTCCTTGCCACCTTTGTAGCCTGCTTTGGTACTTTACTGTACTCATCCG

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DS 

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GGTGG
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TATTTTGGACACTACTTCATGAGACTCACGTGTAGCAGATGAAGCACGCTTCTCAGTAGC
TAAAGCAACTGGCTGAGGAACAGTGTTCCTTATTTTATTACTTACACGACCTGGTTTAGA
AGCATGTTTTGCATTCAAAAGAGACTTCTTCACAGATTTTGCGTCTTTTCCCAAGGTAGC
TATCTCCAGATTACCATCTTCCAGTGGCTTAGCCACTGGAATTTCATTAGTACACTCCTT
AACATCGTACTCTTTTACTTCTGTGCTCTCTTCTGTAGATAGAAGCTCTGTATTTCCATT
GGCTTCATCGCTTGATACTGTATCTAAGGGAGGCAGTACAGAAACATTTTCTTGGATTGG
GTTACATGAATCGCCATTAGCATAGACCACCACACCATCTGGCTCCTTGTCCATACAGAT
ATCCATTGTTCTCGTGTCAGGCGAGAGAATCTTGTAACTGCTCTTTATCTCTCTCTTGTG
TGTGTTTGTTTGTGACTTCTGAGAATGATGAATACTATCC

QA 6 705 6 705
DS 



AS 1 5

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AAGTTCTGGTTCCCTTTCCCTAAACTCAAACATCTCGAGCTTGTCTTGATCCTTTTCTTC
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AAGCCAGACAACCTAGAACATGCTTCCATGTTCCTACACCTCATTATCTTCGCATGTTTC
GCTCTCTTTTGCGAGCTAACCCTTTGCTCAGATCTCTTCTCCGGTATAATAGGGATCCTC
TCTGCTTCTGTCTTTGCACAAGAACTCTTCCTCCTTCATTTCCACTCCACTGATCACTTA
GGTCTTGAAGGTCACTACCATTTCCTTCTCCAGCTCATCGCTTTTGTCTCCTTCTCCTCG
GCTCTAGCTTCTGCTTCTATTCCGAAGTCATTTTCTGCAGCACTAGTCCTCTCGGTTTCT
GTTATGTTTCAAGGATGCTGGTTCTTGAACATGGGTTTCATGCTTTGGGTCCCAAAGTAT
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TCAGTTTAGTTGGATTTTGTCAGCTGTATTGATCACTACTTGTGCCTTATGCTTCAAGTT
TTCTGGCAAAGTTGTGTTGCCTAAGAATAGGTCGTCCTCGGAGTACGAGCGTCTTTGTCG
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ATAGATTTTCCTTACTTTGTTATATTAATATGATAATATGATGTATAATGCATGTAGATA
CACAAACAAGTAAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BM62TF U 9
AF RS1EQ01TF U 1
AF RS1AD32TF U 116
AF RS1EQ01JQ C 629
AF RS1AD32JQ C 168
BS 1 17 RS1EQ01TF
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RD RS1BM62TF 381 0 0
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AACGTTTCTAGGACACTTTGTGCCTGGTCTCTCACTTGCACTTCTTGGTCTTTGGCATCT
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GTTCCCTTTCCCTAAACTCAAACATCTCGAGCTTGTCTTGATCCTTTTCTTCTCCTTCTT
CGCCATCATTCTCTTAACTATAGACTTCCCTGATTTCAATTTCTCCTCTTTCAAGCCAGA
CAACCTAGAACATGCTTCCATGTTCCTACACCTCATTATCTTCGCATGTTTCGCTCTCTT
TTGCGAGCTAACCCTTTGCTC

QA 1 381 1 381
DS 

RD RS1EQ01TF 635 0 0
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AGAATGGGAACGTTTCTAGGACACTTTGTGCCTGGTCTCTCACTTGCACTTCTTGGTCTT
TGGCATCTCTTCAACACCATAAGATCTTACTGTCTTAAAGGCCCTGAAACTTTCTCTGCC
AAGTTCTGGTTCCCTTTCCCTAAACTGAAACATCTCGAGCTTGTCTTGATCCTTTTCTTC
TCCTTCTTCGCCATCATTCTCTTAACTATAGACTTCCCTGATTTCAATTTCTCCTCTTTC
AAGCCAGACAACCTAGAACATGCTTCCATGTTCCTACACCTCATTATCTTCGCATGTTTC
GCTCTCTTTTGCGAGCTAACCCTTTGCTCAGATCTCTTCTCCGGTATAATAGGGATCCTC
TCTGCTTCTGTCTTTGCACAAGAACTCTTCCTCCTTCATTTCCACTCCACTGATCACTTA
GGTCTTGAAGGTCACTACCATTTCCTTCTCCAGCTCATCGCTTTTGTCTCCTTCTCCTCG
GCTCTAGCTTCTGCTTCTATTCCGAAGTCATTTTCTGCAGCACTAGTCCTCTCGGTTTCT
GTTATGTTTCAAGGATGCTGGTTCTTGAACATGGG

QA 1 635 1 635
DS 

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CTGCCAAGTTCTGGTTCCCTTTCCCTAAACTCAAACATCTCGAGCTTGTCTTGATCCTTT
TCTTCTCCTTCTTCGCCATCATTCTCTTAACTATAGACTTCCCTGATTTCAATTTCTCCT
CTTTCAAGCCAGACAACCTAGAACATGCTTCCATGTTCCTACACCTCATTATCTTCGCAT
GTTTCGCTCTCTTTTGCGAGCTAACCCTTTGCTCAGATCTCTTCTCCGGTATAATAGGGA
TCCTCTCTGCTTCTGTCTTTGCACAAGAACTCTTCCTCCTTCATTTCCACTCCACTGATC
ACTTAGGTCTTGAAGGTCACTACCATTTCCTTCTCCAGCTCATCGCTTTTGTCTCCTTCT
CCTCGGCTCTAGCTTCTGCTTCTATTCCGAAGTCATTTTCTGCAGCACTAGTCCTCTCGG
TTTCTGTTATGTTTCAAGGATGCTGGTTCTTGAACATGGGTTTCATGCTTTGGGTCCCAA
AGTATGTTCCCTAGAG*TTGCGTAAGCAACACGACAGCATCTGATAACAGAAGCGTTGTT
CATGGTAGTGCGGTAGCTTGTGAGTCTCCTGGCGC

QA 1 635 1 635
DS 

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ACAGCATTTGATAACAGAAGCGTTGTTCATGGTAGTGCGGTAGCTTGTGAGTCTCCTGGC
GCTGAGGTTCGAGCAAAGGCC
CTA

QA 1 141 1 141
DS 

RD RS1AD32JQ 870 0 0
AACTTTCTCTGCCAAGTTCTGGTTCCCTTTCCCTAAACTCAAACATCTCGAGCTTGTCTT
GATCCTTTTCTTCTCCTTCTTCGCCATCATTCTCTTAACTATAGACTTCCCTGATTTCAA
TTTCTCCTCTTTCAAGCCAGACAACCTAGAACATGCTTCCATGTTCCTACACCTCATTAT
CTTCGCATGTTTCGCTCTCTTTTGCGAGCTAACCCTTTGCTCAGATCTCTTCTCCGGTAT
AATAGGGATCCTCTCTGCTTCTGTCTTTGCACAAGAACTCTTCCTCCTTCATTTCCACTC
CACTGATCACTTAGGTCTTGAAGGTCACTACCATTTCCTTCTCCAGCTCATCGCTTTTGT
CTCCTTCTCCTCGGCTCTAGCTTCTGCTTCTATTCCGAAGTCATTTTCTGCAGCACTAGT
CCTCTCGGTTTCTGTTATGTTTCAAGGATGCTGGTTCTTGAACATGGGTTTCATGCTTTG
GGTCCCAAAGTATGTTCC*TAGAGGTTGCGTAAGCAACACGACAGCATCTGATAACAGAA
GCGTTGTTCATGGTAGTGCGGTAGCTTGTGAGTCTCCTGGCGCTGAGGTTCGAGCAAAGG
CCTTAGCGAATCTTCAGTTTAGTTGGATTTTGTCAGCTGTATTGATCACTACTTGTGCCT
TATGCTTCAAGTTTTCTGGCAAAGTTGTGTTGCCTAAGAATAGGTCGTCCTCGGAGTACG
AGCGTCTTTGTCGACAAGGAAGTGATCGCTCTCCAGCCCTGAAGGTGGAAGTACCGGCTA
GTTCCGATCAACAATAGATTTTCCTTACTTTGTTATATTAATATGATAATATGATGTATA
ATGCATGTAGATACACAAACAAGTAAGACC

QA 1 870 1 870
DS 



AS 2 6

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CTTGTAAGCCAAAAAAAAAAAGATAAACTGGAAGGGATCATTCTCTTCTGCAACTATTAG
TTATATCACAAAAGCTAAATACGTATTCATTTGGCTTCTGCAGCTTTCTCACTGATACGC
AAACTTTCAGCTTTACGCACAACCTCCTCTGCCACAAGCTTCACGTTACCGCTCTGATCG
CTCTCCTTCTCCTCCTGGTTCACTGAACCAACAACCTCCCATATTCTGACCGTCCCGTCT
TCTGATCCTGACGTGTATGACTCCCCACCTGGCGAATACCTCACGCAGTGCACTGGTCCG
TGGTGACCCTTGTTACACCCAATCTCTTCTCCAGTCTGGAAATCAAACCTATGGACCCAC
ATGTCTTCTCCTCCAGCAATGAAAGTGTTCCCTTGTTTCGGTTCCAAGGATGCTGATTCA
ACGTTGCAAGGCATCTCATAGCTCTTGACCAATCCAAAATTAGTGGCGTCCCAAAACTTA
ACACTAGATCCATCAGCAGTAGTTATGTATCGCCCATCCTGGCTTACTTCAGCACTAGTG
ACTGGGAACTTGGTTTCTAGTGTTTGAACAATCTTGTCACTTCTTATGTCCCATAACCTA
ATGTCACCGGTATCTGTGCAAGAGCTCAGGATAGTATTATCACTGTGAAGCCATTCTACG
GTTCTGATTGAACCAGGAGAATTTCCAACTTCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G087JQ U 30
AF RS1EO80JQ U 1
AF RS1EK21TF C 211
BS 1 79 RS1EO80JQ
BS 80 81 RS1G087JQ
BS 82 181 RS1EO80JQ
BS 182 182 RS1G087JQ
BS 183 267 RS1EO80JQ
BS 268 268 RS1G087JQ
BS 269 755 RS1EO80JQ

RD RS1G087JQ 520 0 0
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QA 1 520 1 520
DS 

RD RS1EO80JQ 755 0 0
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QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1EK21TF 537 0 0
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CCAGTCTGGAAATCAAACCTATGGACCCACATGTCTTCTCCTCCAGCAATGAAAGTGTTC
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AATCCAAAATTAGTGGCGTCCCAAAACTTAACACTAGATCCATCAGCAGTAGTTATGTAT
CGCCCATCCTGGCTTACTTCAGCACTAGTGACTGGGAACTTGGTTTCTAGTGTTTGAACA
ATCTTGTCACTTCTTATGTCCCATAACCTAATGTCACCGGTATCTGTGCAAGAGCTCAGG
ATAGTATTATCACTGTGAAGCCATTCTACGGTTCTGATTGAACCAGGAGAATTTCC
C

QA 1 536 1 536
DS 



CO CL1137Contig2 924 3 4 U
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TAATTAAAAAAGTCGTTCCTTTTATCATTCCTTCTTCTCTCACACTTTGTCTTTCCAAAT
TAAAAAAAAATCCAAGGTGTGATCCTCTTCAAGGGGGAGCAGGTTCAATACATTCTTACC
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AAATATGGAATGCATTGACTGGAGATGAATTGCACTCCTTTGAACACAAGCACATCGTTC
GCGCATGTGCCTTCTCCGAGGATACTCATCTTTTGCTCACTGGTGGAATGGAGAAGATTC
TTCGGATATTCGATATGAATAGGCCAGACGCACCTCCCAAAGAAGTTGGAAATTCTCCTG
GTTCAATCAGAACCGTAGAATGGCTTCACAGTGATAATACTATCCTGAGCTCTTGCACAG
ATACCGGTGACATTAGGTTATGGGACATAAGAAGTGACAAGATTGTTCAAACACTAGAAA
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ATGGATCTAGTGTTAAGTTTGGGACGCCACTAATTTGGATGGTCAGAGCTATGAGATGCC
TTGCACGTTGAATCAGCATCCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EO80TF U 1
AF RS1BV34TF U 48
AF RS1G087TF U 107
BS 1 209 RS1EO80TF
BS 210 216 RS1BV34TF
BS 217 738 RS1EO80TF
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TAATTAAAAAAGTCGTTCCTTTTATCATTCCTTCTTCTCTCACACTTTGTCTTTCCAAAT
TAAAAAAAAATCCAAGGTGTGATCCTCTTCAAGGGGGAGCAGGTTCAATACATTCTTACC
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TGGGGGTTCCGTTAGTATGCCACGGGCATTCTCGTCCCGTCGTCGACGTTTCTTACAGTC
CGGTGACTCCAGATGGATTCTTCCTCATCAGCGCCAGCAAAGATTCGAACCCAATGTTGA
GGAATGGGGAGACTGGTGATTGGATAGGGACTTTTGAAGGACACAAAGGAGCTGTTTGGA
GTTGCAGCCTTGATAAACATGCTATGCGTGCTGCCTCTGCTTCTGCTGATTTCACTGCGA
AAATATGGAATGCATTGACTGGAGATGAATTGCACTCCTTTGAACACAAGCACATCGTTC
GCGCATGTGCCTTCTCCGAGGATACTCATCTTTTGCTCACTGGTGGAATGGAGAAGATTC
TTCGGATATTCGATATGAATAGGCCAGACGCACCTCCCAAAGAAGTTGGAAATTCTCCTG
GTTCAATCAGAACCGTAGAATGGCTTCACAGTGATAATACTATCCTGAGCTCTTGCACAG
ATACCGGTGACATTAGGT
ATGGGACA

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1BV34TF 685 0 0
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TGTCTTTCCAAATTAAAAAAAAATCCAAGGTGTGATCCTCTTCAAGGGGGAGCAGGTTCA
ATACATTCTTACCGATCTAAAGCACTGGGGCACTCTTGTCGGTGAATAGAGACAGACAAA
AAGGAAGAGATAATGGGGGTTCCGTTAGTATGCCACGGGCATTCTCGTCCCGTCGTCGAC
GTTTCTTGCAGTCCGGTGACTCCAGATGGATTCTTCCTCATCAGCGCCAGCAAAGATTCG
AACCCAATGTTGAGGAATGGGGAGACTGGTGATTGGATAGGGACTTTTGAAGGACACAAA
GGAGCTGTTTGGAGTTGCAGCCTTGATAAACATGCTATGCGTGCTGCCTCTGCTTCTGCT
GATTTCACTGCGAAAATATGGAATGCATTGACTGGAGATGAATTGCACTCCTTTGAACAC
AAGCACATCGTTCGCGCATGTGCCTTCTCCGAGGATACTCATCTTTTGCTCACTGGTGGA
ATGGAGAAGATTCTTCGGATATTCGATATGAATAGGCCAGACGCACCTCCCAAAGAAGTT
GGAAATTCTCCTGGT*CAATCAGAACCGTAGA*TGGCTTCACAGTGATAATACTATCCTG
AGCTCTTGCACAGATACCGGTGACA

QA 1 685 1 685
DS 

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GG
GTCTTTCCAAATTAAAAAAAAATCCAAGGTGTGATCCTCTTCAAGGGGGAGCAGGTTCAA
TACATTCTTACCGATCTAAAGCACTGGGGCACTCTTGTCGGTGAATAGAGACAGACAAAA
AGGAAGAGATAATGGGGGTTCCGTTAGTATGCCACGGGCATTCTCGTCCCGTCGTCGACG
TTTCTTACAGTCCGGTGACTCCAGATGGATTCTTCCTCATCAGCGCCAGCAAAGATTCGA
ACCCAATGTTGAGGAATGGGGAGACTGGTGATTGGATAGGGACTTTTGAAGGACACAAAG
GAGCTGTTTGGAGTTGCAGCCTTGATAAACATGCTATGCGTGCTGCCTCTGCTTCTGCTG
ATTTCACTGCGAAAATATGGAATGCATTGACTGGAGATGAATTGCACTCCTTTGAACACA
AGCACATCGTTCGCGCATGTGCCTTCTCCGAGGATACTCATCTTTTGCTCACTGGTGGAA
TGGAGAAGATTCTTCGGATATTCGATATGAATAGGCCAGACGCACCTCCCAAAGAAGTTG
GAAATTCTCCTGGTTCAATCAGAACCGTAGAATGGCTTCACAGTGATAATACTATCCTGA
GCTCTTGCACAGATACCGGTGACATTAGGTTATGGGACATAAGAAGTGACAAGATTGTTC
AAACACTAGAAACCAAGTTCCCAGTCACTAGTGCTGAAGTAAGCCAGGATGGGCGATACA
TAACTACTGCTGATGGATCTAGTGTTAAGTTTGGGACGCCACTAATTTGGATGGTCAGAG
CTATGAGATGCCTTGCACGTTGAATCAGCATCCTTG

QA 3 818 3 818
DS 



AS 1 5

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GAAGAAGAAGAAGAGAATGGCGGCGAATGAAGAAGAAGCGGTGAAGTATGTATGGGAAGG
AGCAATTCCGCTGCAGATCCATCTCCACAAATCCGAAGTCGCTTCTCACCCTGCTCCTCC
TCCTGCTCTCGTATTAGCACCTAGGATAGGGTACTTGCCTCTGTTAGTTCCTCTTATAAA
GCCTTACTTCAAGGATTCACTTCCTCCTGGTGAAGATTCCATCTGGTTCGATTACAAAGG
CTTTCCTCTTAAATGGTATATACCAACAGGTGTTCTTTTTGATCTCATATGCGCAGAACC
TGAAAGACCTTGGAATCTCACCATACACTTTAGGGGATATCCTAGCAACGTGCTGATTCC
ATGTGAAGGAGAAGATTCTGTCAAGTGGAACTTTGTTAATTCTTTGAAAGAGGCGGCGTA
TATCATCAATGGAAACTGCAAGAATGTTATGAATATGTCTCAGAGTGATCAAGAGGATCT
ATGGACCTCTGTCATGAACGGTGATCTTGAGTCCTACACAAGATTATTACCCAAGCTTAA
AATGGGAAATATCGAAGATGAGTTTTCAAGAAAAGCAAATTTGTCATCTCCACAATCTCG
ACAAGGTGGGACTGAGACAGATGTGGCTGGACAAGTTAAGACAGCGAGGATTCCTGTTCG
GCTGTATGTTCGAAGTGTCAATAAAGATTTCGAGAATCTTGAAGATGTACCTGAGATCGA
TACATGGGATGAGATCTCGTACTTGAATCGCCCTGTTGAGTTCCTCAGAGAAGAAGGGAA
ATGCTTTACTCTACGTGACGCCATTGAAAGTCTCCTCCCGGAGTACAGTGGAGACAGAGC
TCAAACGAGTGGAGAAGAGGAAGCAGATGGGTCGCAGGAGACGAGGGGAGAAGTCAAACT
GGTAAGGATCCAAGGGATAGAAGTGAGACTAGAGATACCGTTTTCATGGGTGGTAAATAA
CTTGATGAACCCAGAATTCTATCTCCACATCTCTGTTCTTGTGAAAGCTCCTCAAAGGTA
AAACTAGCAAGACGCTGCATCTACACTCCCATCTGTGAATCAATCAAATTGCTTTCTAGT
TTTTTTCTCAGAAGCCTAAAGAATCAACTTGTTTTATATGCAACCACTACTATTACTCTG
ATGGAAGCAGAACTCAGATATACATTTGAAATCATATTAATGATTCATTCATAGCGTTTA
CTTGTTAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AX06TF U 1
AF RS1DH35TF U 150
AF RS1B768TF U 504
AF RS1AX06JQ C 406
AF RS1B768JQ C 615
BS 1 665 RS1AX06TF
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RD RS1AX06TF 715 0 0
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GAAGAAGAAGAAGAGAATGGCGGCGAATGAAGAAGAAGCGGTGAAGTATGTATGGGAAGG
AGCAATTCCGCTGCAGATCCATCTCCACAAATCCGAAGTCGCTTCTCACCCTGCTCCTCC
TCCTGCTCTCGTATTAGCACCTAGGATAGGGTACTTGCCTCTGTTAGTTCCTCTTATAAA
GCCTTACTTCAAGGATTCACTTCCTCCTGGTGAAGATTCCATCTGGTTCGATTACAAAGG
CTTTCCTCTTAAATGGTATATACCAACAGGTGTTCTTTTTGATCTCATATGCGCAGAACC
TGAAAGACCTTGGAATCTCACCATACACTTTAGGGGATATCCTAGCAACGTGCTGATTCC
ATGTGAAGGAGAAGATTCTGTCAAGTGGAACTTTGTTAATTCTTTGAAAGAGGCGGCGTA
TATCATCAATGGAAACTGCAAGAATGTTATGAATATGTCTCAGAGTGATCAAGAGGATCT
ATGGACCTCTGTCATGAACGGTGATCTTGAGTCCTACACAAGATTATTACCCAAGCTTAA
AATGGGAAATATCGAAGATGAGTTTTCAAGAAAAGCAAATTTGTCATCTCCACAATCTCG
ACAAG*TGGGACTGAGACAGATGTGGCTGGACAAGT*AAGACAGCGAGGAT
CCTG

QA 1 711 1 711
DS 

RD RS1DH35TF 615 0 0
G
ATCCGAAGTCGCTTCTCACCCTGCTCCTCCTCCTGCTCTCGTATTAGCACCTAGGATAGG
GTACTTGCCTCTGTTAGTTCCTCTTATAAAGCCTTACTTCAAGGATTCACTTCCTCCTGG
TGAAGATTCCATCTGGTTCGATTACAAAGGCTTTCCTCTTAAATGGTATATACCAACAGG
TGTTCTTTTTGATCTCATATGCGCAGAACCTGAAAGACCTTGGAATCTCACCATACACTT
TAGGGGATATCCTAGCAACGTGCTGATTCCATGTGAAGGAGAAGATTCTGTCAAGTGGAA
CTTTGTTAATTCTTTGAAAGAGGCGGCGTATATCATCAATGGAACCTGCAAGAATGTTAT
GAATATGTCTCAGAGTGATCAAGAGGATCTATGGACCTCTGTCATGAACGGTGATCTTGA
GTCCTACACAAGATTATTACCCAAGCTTAAAATGGGAAATATCGAAGATGGGTTTTCAA*
**AAGCAAATTTGTCATCTCCACAATCTCGACAAGGTGGGACTGAGACAGATGTGGCTGG
ACAAGTTAAGACAGCGAGGATTCCTGTTCGGCTGTATGTTCGAAGTGTCAATAAAGATTT
CGAGAATCTTGAAG

QA 2 615 2 615
DS 

RD RS1B768TF 646 0 0
ATGTTATGAATATGTCTCAGAGTGATCAAGAGGATCTATGGACCTCTGTCATGAACGGTG
ATCTTGAGTCCTACACAAGATTATTACCCAAGCTTAAAATGGGAAATATCGAAGATGAGT
TTTCAAGAAAAGCAAATTTGTCATCTCCACAATCTCGACAAGGTGGGACTGAGACAGATG
TGGCTGGACAAGTTAAGACAGCGAGGATTCCTGTTCGGCTGTATGTTCGAAGTGTCAATA
AAGATTTCGAGAATCTTGAAGATGTACCTGAGATCGATACATGGGATGAGATCTCGTACT
TGAATCGCCCTGTTGAGTTCCTCAGAGAAGAAGGGAAATGCTTTACTCTACGTGACGCCA
TTGAAAGTCTCCTCCCGGAGTACAGTGGAGACAGAGCTCAAACGAGTGGAGAAGAGGAAG
CAGATGGGTCGCAGGAGACGAGGGGAGAAGTCAAACTGGTAAGGATCCAAGGGATAGAAG
TGAGACTAGAGATACCGTTTTCATGGGTGGTAAATAACTTGATGAACCCAGAATTCTATC
TCCACATCTCTGTTCTTGTGAAAGCTCCTCAAAGGTAAAACTAGCAAGACGCTGCATCTA
CACTCCCATCTGTGAATCAATCAAATTGCTTTCTAGTTTTTT
CTCA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RS1AX06JQ 845 0 0
CAACGTGCTGATTCCATGTGAAGGAGAAGATTCTGTCAAGTGGA*CTTTGTTAATTCTT*
GAAAGAGGCGGCGTATATCATCAATGGAAACTGCAAGAATGTTATGAATATGTCTCAGAG
TGATCAAGAGGATCTATGGACCTCTGTCATGAACGGTGATCTTGAGTCCTACACAAGATT
ATTACCCAAGCTTAAAATGGGAAATATCGAAGATGAGTTTTCAAGAAAAGCAAATTTGTC
ATCTCCACAATCTCGACAAGGTGGGACTGAGACAGATGTGGCTGGACAAGTTAAGACAGC
GAGGATTCCTGTTCGGCTGTATGTTCGAAGTGTCAATAAAGATTTCGAGAATCTTGAAGA
TGTACCTGAGATCGATACATGGGATGAGATCTCGTACTTGAATCGCCCTGTTGAGTTCCT
CAGAGAAGAAGGGAAATGCTTTACTCTACGTGACGCCATTGAAAGTCTCCTCCCGGAGTA
CAGTTGAGACAGAGCTCAAACGAGTGGAGAAGAGGAAGCAGATGGGTCGCAGGAGACGAG
GGGAGGAGTCAAACTGGTAAGGATCCAAGGGATAGAAGTGAGACTAGAGATACCGTTTTC
ATGGGTGGTAAATAACTTGATGAACCCAGAATTCTATCTCCACATCTCTGTTCTTGTGAA
AGCTCCTCAAAGGTAAAACTAGCAAGACGCTGCATCTACACTCCCATCTGTGAATCGATC
AAATTGCTTTCTAGTTTTTTTCTCAGAAGCCTAAAGAATCAACTTGTTTTATATGCAACC
ACTACTATTACTCTGATGGAAGCAGAACTCAGATATACATTTGAAATCATATTAATGATT
CAT
CC

QA 1 843 1 843
DS 

RD RS1B768JQ 656 0 0
AAGATGAGTTTTCAAGAAAAGCAAATTTGTCATCTCCACAATCTCGACAAGGTGGGACTG
AGACAGATGTGGCTGGACAAGTTAAGACAGCGAGGATTCCTGTTCGGCTGTATGTTCGAA
GTGTCAATAAAGATTTCGAGAATCTTGAAGATGTACCTGAGATCGATACATGGGATGAGA
TCTCGTACTTGAATCGCCCTGTTGAGTTCCTCAGAGAAGAAGGGAAATGCTTTACTCTAC
GTGACGCCATTGAAAGTCTCCTCCCGGAGTACAGTGGAGACAGAGCTCAAACGAGTGGAG
AAGAGGAAGCAGATGGGTCGCAGGAGACGAGGGGAGAAGTCAAACTGGTAAGGATCCAAG
GGATAGAAGTGAGACTAGAGATACCGTTTTCATGGGTGGTAAATAACTTGATGAACCCAG
AATTCTATCTCCACATCTCTGTTCTTGTGAAAGCTCCTCAAAGGTAAAACTAGCAAGACG
CTGCATCTACACTCCCATCTGTGAATCAATCAAATTGCTTTCTAGTTTTTTTCTCAGAAG
CCTAAAGAATCAACTTGTTTTATATGCAACCACTACTATTACTCTGATGGAAGCAGAACT
CAGATATACATTTGAAATCATATTAATGATTCATTCATAGCGTTTACTTGTTAAGT

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 5

CO CL1139Contig1 947 5 6 U
GCTATTATCTTATTTGCATATAAATATCTTATATCCGTTTAACACTACATAAATATCGTT
AACCTATCAAGAGAGAGAAACAGAGATGATCAAATCAAGTGAAAGCAACACGCATCAATC
ACAACCAATACATAGAGAGTTCATAAGAAAGCAGGATAGAGAGTTTATATGTGGCTCGAG
ATTGGAAGGACACACAATTATAAAGACAAATTAAAGAACCACACGACATAGAGATTGGCC
ATGAGATTGCTAATCTCAAATATGATCAATCGATGACCAATGACATAATCTTTTCCTGAA
GATTTGGCTGAATGGGTTGAACTCTATACCCGAATTGCGCATCATGATCTTTCATCATCA
TTCCTCTTGCGTTGCTAGCTATCGCCATCTCCTGCTGTTGCAGCTGGAAACTGAGCTGCC
GATTCTCCTCCACCATCATTTTCTCGTTTCTCCTCTTTGTCATAAGGAACTCCATCTGGT
GGTCTCGGACTTTGTCGAGGCCATGTTCAACGCCGTGCTCTACGGCCATCAAGTTTTTTA
AGTTGAGAGACTGTATATCTTCCCCTTTCAAATGCCTGAGCTCCAGTTGTAAGCTATCAT
TCTCCTTTTTGATCATATCAATCTCATTGTTGAGGTTCTCATGCTTAGCATCCCATAGTT
TCTTGCCAGATAGCTTCTGGTATTGGTCCAACATAGCACCAAGATCCATGGAAGGACAAC
AATAATCAGTCATCTTACCATTACTTGCAAAGACTATGAGAGCAACTTTTGCATCACAGA
GAACTGTGATCTCTTTCGCCTTCTTAACCAACCCATTCCTCCTCTTTGAGAACGTCACCA
CTCTGTTGTTTACGTTCTCTATCCTCTTTATCTCTATCTTCCCCCTTCCCATCTTTCTCT
CTCTAGCTCTCTTTTCTCAGTTTTAGGGTTCGATGAGAAATTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RS1DO31JQ U 1
AF RS1B132JQ U 87
AF RS1GE83JQ U 96
AF RS1DO31TF C 300
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RD RS1DO31JQ 710 0 0
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AACCTATCAAGAGAGAGAAACAGAGATGATCAAATCAAGTGAAAGCAACACGCATCAATC
ACAACCAATACATAGAGAGTTCATAAGAAAGCAGGATAGAGAGTTTATATGTGGCTCGAG
ATTGGAAGGACACACAATTATAAAGACAAATTAAAGAACCACACGACATAGAGATTGGCC
ATGAGATTGCTAATCTCAAATATGATCAATCGATGACCAATGACATAATCTTTTCCTGAA
GATTTGGCTGAATGGGTTGAACTCTATACCCGAATTGCGCATCATGATCTTTCATCATCA
TTCCTCTTGCGTTGCTAGCTATCGCCATCTCCTGCTGTTGCAGCTGGAAACTGAGCTGCC
GATTCTCCTCCACCATCATTTTCTCGTTTCTCCTCTTTGTCATAAGGAACTCCATCTGGT
GGTCTCGGACTTTGTCGAGGCCATGTTCAACGCCGTGCTCTACGGCCATCAAGTTTTTTA
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TCTTGCCAGATAGCTTCTGGTATTGGTCCAACATAGCACCAAGATCCATG

QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1B132JQ 720 0 0
A
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AAAGCAGGATAGAGAGTTTATATGTGGCTCGAGATTGGAAGGACACACAATTATAAAGAC
AAATTAAAGAACCACACGACATAGAGATTGGCCATGAGATTGCTAATCTCAAATATGATC
AATCGATGACCAATGACATAATCTTTTCCTGAAGATTTGGCTGAATGGGTTGAACTCTAT
ACCCGAATTGCGCATCATGATCTTTCATCATCATTCCTCTTGCGTTGCTAGCTATCGCCA
TCTCCTGCTGTTGCAGCTGGAAACTGAGCTGCCGATTCTCCTCCACCATCATTTTCTCGT
TTCTCCTCTTTGTCATAAGGAACTCCATCTGGTGGTCTCGGACTTTGTCGAGGCCATGTT
CAACGCCGTGCTCTACGGCCATCAAGTTTTTTAAGTTGAGAGACTGTATATCTTCCCCTT
TCAAATGCCTGAGCTCCAGTTGTAAGCCATCATTCTCCTTTTTGATCATATCAATCTCAT
TGTTGAGGTTCTCATGCTTAGCATCCCATAGTTTCTTGCCAGA**GCTTCTGGTATTGGT
CCAACATAGCACCAAGATCCATGGAAGGACAACAATAATCAGTCATCTTACCATTACTTG
CAAAGACTATGAGAGCAACTTTTGCATCACAGAGAACTGTGATCTCTTTCGCCTTCTTA

QA 2 720 2 720
DS 

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ATAGAGAGTTTATATGTGGCTCGAGATTGGAAGGACACACAATTATAAAGACAAATTAAA
GAACCACACGACATAGAGATTGGCCATGAGATTGCTAATCTCAAATATGATCAATCGATG
ACCAATGACATAATCTTTTCCTGAAGATTTGGCTGAATGGGTTGAACTCTATACCCGAAT
TGCGCATCATGATCTTTCATCATCATTCCTCTTGCGTTGCTAGCTATCGCCATCTCCTGC
TGTTGCAGCTGGAAACTGAGCTGCCGATTCTCCTCCACCATCATTTTCTCGTTTCTCCTC
TTTGTCATAAGGAACTCCATCTGGTGGTCTCGGACTTTGTCGAGGCCATGTTCAACGCCG
TGCTCTACGGCCATCAAGTTTTTTAAGTTGAGAGACTGTATATCTTCCCCTTTCAAATGC
CTGAGCTCCAGTTGTAAGTTATCATTCT***TTTTGATCATATCAATCTCATTGTTGAGG
TTCTCATGCTTAGCATCCCATAGTTTCTTGCCAGATAGCTTCTGGTATTGGTCCAACATA
GCACCAAGATCCATGGAAGGACAACAATAATCAGTCATCTTACCATTACTTGCAAAGACT
ATGAGAGCAACTTTTGCATCACAGAGAACTGTGATCTCTTTCGCCTTCTTAACCAACCC

QA 1 719 1 719
DS 

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AGATTTGGCTGAATGGGTTGAACTCTATACCCGAATTGCGCATCATGATCTTTCATCATC
ATTCCTCTTGCGTTGCTAGCTATCGCCATCTCCTGCTGTTGCAGCTGGAAACTGAGCTGC
CGATTCTCCTCCACCATCATTTTCTCGTTTCTCCTCTTTGTCATAAGGAACTCCATCTGG
TGGTCTCGGACTTTGTCGAGGCCATGTTCAACGCCGTGCTCTACGGCCATCAAGTTTTTT
AAGTTGAGAGACTGTATATCTTCCCCTTTCAAATGCCTGAGCTCCAGTTGTAAGCTATCA
TTCTCCTTTTTGATCATATCAATCTCATTGTTGAGGTTCTCATGCTTAGCATCCCATAGT
TTCTTGCCAGATAGCTTCTGGTATTGGTCCAACATAGCACCAAGATCCATGGAAGGACAA
CAATAATCAGTCATCTTACCATTACTTGCAAAGACTATGAGAGCAACTTTTGCATCACAG
AGAACTGTGATCTCTTTCGCCTTCTTAACCAACCCATTCCTCCTCTTTGAGAACGTCACC
ACTCTGTTGTTTACGTTCTCTATCCTCTTTATCTCTATCTTCCCCCTTCCCATCTTTCTC
TCTCTAGCTCTCTTTTCTCAGTTT*AGGGTTCGATGAGAAATTGTTCC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1GE83TF 645 0 0
AGATTTGGCTGAATGGGTTGAACTCTATACCCGAATTGCGCATCATGATCTTTCATCATC
ATTCCTCTTGCGTTGCTAGCTATCGCCATCTCCTGCTGTTGCAGCTGGAAACTGAGCTGC
CGATTCTCCTCCACCATCATTTTCTCGTTTCTCCTCTTTGTCATAAGGAACTCCATCTGG
TGGTCTCGGACTTTGTCGAGGCCATGTTCAACGCCGTGCTCTACGGCCATCAAGTTTTTT
AAGTTGAGAGACTGTATATCTTCCCCTTTCAAATGCCTGAGCTCCAGTTGTAAGTTATCA
TTCT***TTTTGATCATATCAATCTCATTGTTGAGGTTCTCATGCTTAGCATCCCATAGT
TTCTTGCCAGATAGCTTCTGGTATTGGTCCAACATAGCACCAAGATCCATGGAAGGACAA
CAATAATCAGTCATCTTACCATTACTTGCAAAGACTATGAGAGCAACTTTTGCATCACAG
AGAACTGTGATCTCTTTCGCCTTCTTAACCAACCCATTCCTCCTCTTTGAGAACGTCACC
ACTCTGTTGTTTACGTTCTCTATCCTCTTTATCTCTATCTTCCCCCTTCCCATCTTTCTC
TCTCTAGCTCTCTTTTCTCAGTTTTAGGGTTCTATGAGAAATT
CC

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 6

CO CL1140Contig1 1237 6 21 U
GTGCATTGTTTATTTTGATTGTCCTTCAGCAGTTCAAACACACAAACCATTTTATTACGG
ACGTTACGCAGCTCTTATTATTGAGTAAAGATGATCTAAAGACGTCTGAGTATGTGTGTT
TGCGGGATGTTGTAACACTTGTAACACACGGAGACAGGAACATAACCAGAAGAAGAAGAA
CTCTCTTTTGCTCTTGTTTCCAAGTTTTCAGTCCAGAATCTTAGCTTTCCTGTAGCTCTC
CACCGAATCCACAAGTGTTTCCTCCAACGGCCTGAAAGTCCAACCCAACTTCTGCAGTTT
CTCCGAACTCATCGTAGTCCTTTCTTCCACTTCGACGAAGCTCTTAGGGTAGTTGTAATT
AGGGTAAAGACTCTTGAGCTTCTCAACCACATCCTTTTCTTTAGCCTTGTGGGCAGTACA
TATGTACCTTCCTTCAGCTTCTGGTTTCTCATAAACCAAAAGTAACGCTTGAGCCACATC
ACGCACATCTACAATAAGTCTCACTTGGTTCTCCCGTGACTCAAAACCCTCTTTAAGAAG
CTTGGCAAGGGCAAGGGTACTAGCGTTAACGGTGTGTTGCTGCAGTACAGGACCAAATAC
CATGGTAGGGCAAATGCTGACGAGATCAATCCC*GGTTCGTTTTGCGAACTCGAAA*GCT
TCACTTTCTGCCTGTGTCTTTGACGCACAATACCAATTCTCAGTTCTTTTGCAAAA*CTC
CAGGTCAGACCAACATGACTCATCTATGACTCGATCCTTAGACCAATTAGGGTTCATCAT
AAGCGCAGCTGCAGAGGAAACGTACACAACACGCTTAACGTTCGCTTCCACGCACGCCTT
AAGCACATTCAACGTCCCATCCACAGCTGGTGCCATCACTTCCACCTCAGGATTTGGGAC
TGAAGATGATGGAACAGGGCTTGCGACATGGAAGACGCCAACGCAACCTGCAATAGCGGA
TTGAAGAGAGCCGTAGTCCAGCAAATCAGCCTTGACGAGCTTGAGATTGTCACCGGCTTT
CTCCAGCTTCTTCAAATGAGAATACTTTTCGTTATCAGGGTCTCTGACAGTGCCGTGAAC
GAAGTAATCCTTAGAGAGAAGGAGATCAACGACCCACGAAGCAAGAAACCCTCCGGCACC
GGTAACGCAAACCTTTCCTTTCGTCACCACCGACATTTTTTTCAATCTTCCAGAGAATCG
AGATACTTCTCCTTCTATTCTAACCTTGTCTGAATCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GZ12JQ U 1
AF RS1CP50JQ U 58
AF RS1BT49JQ U 57
AF RS1CP50TF C 466
AF RS1GZ12TF C 547
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TGCGGGATGTTGTAACACTTGTAACACACGGAGACAGGAACATAACCAGAAGAAGAAGAA
CTCTCTTTTGCTCTTGTTTCCAAGTTTTCAGTCCAGAATCTTAGCTTTCCTGTAGCTCTC
CACCGAATCCACAAGTGTTTCCTCCAACGGCCTGAAAGTCCAACCCAACTTCTGCAGTTT
CTCCGAACTCATCTTAGTCCTTTCTTCCACTTC

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DS 

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CGGACGT
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GGATGTTGTAACACTTGTAACACACGGAGACAGGAACATAACCAGAAGAAGAAGAACTCT
CTTTTGCTCTTGTTTCCAAGTTTTCAGTCCAGAATCTTAGCTTTCCTGTAGCTCTCCACC
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GAACTCATCGTAGTCCTTTCTTCCACTTCTACGAAGCTCTTAGGGTAGTTGTAATTAGGG
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TATCTTCCTTCAGCTTCTGGTTTCTCATAAACCAAAAGTAACGCTTGAGCCACATCACGC
ACATCTACAATAAGTCTCACTTGGTTCTCCCGTGACTCAAAACCCTCTTTAAGAAGCTTG
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GTAGGGCAAATGCTGACGAGATCAATCCC*GGTTCGTTTTGCGAACTCGAAA*GCTTCAC
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TCAGACCAACATGACTCATCTATGACTCGATCCTTAGACCAA

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DS 

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ACAGACAA
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GGATGTTGTAACACTTGTAACACACGGAGACAGGAACATAACCAGAAAAAAAAAAACTCT
CTTTTGCTCTTGTTTCCAAGTTTTCAGTCCAGAATCTTAGCTTTCCTGTAGCTCTCCACC
GAATCCACAAGTGTTTCCTCCAACGGCCTGAAAGTCCAACCCAACTTCTGCAGTTTCTCC
GAACTCATCGTACTCCTCTCTTCCACTTCGACGTAGCTCTTAGGGTAGTTGTAATTAGGG
TAAAGACTCTTGAGCTTCTCAACCACATCCTTTTCTTTAGCCTTGTGGGCTGTACATATG
TACCTTCCTTCAGCTTCTGGTTTCTCATAAACCAAAAGTAACGCTTGAGCCACATCACGC
ACATCTACAATAAGTCTCACTTGGTTCTCCCGTGACTCAAAACCCTCTTTAAAAAGCTTG
GCAAGGGCAAGGGTACTAGCGTTAACGGTGTGTTGCTGCAGTACAGGACCAAATACCATG
GTAGGGCAAATGCTGACGAGATCAATCCC*GGTTCGTTTTGCGAACTCGAAA*GCTTCAC
TTTCTGCCTGTGTCTTTGACGCACAATACCAATTCTCAGTTCTTTTGCAAAA*TTCCAG*
TCAGACCAACATGACTCATCTATGACTCGATCCTTAGACCAATTAGGGTTCATCATAAGC
GCAGCTGCAGA

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DS 

RD RS1CP50TF 636 0 0
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ACCCTCTTTAAGAAGCTTGGCAAGGGCAAGGGTACTAGCGTTAACGGTGTGTTGCTGCAG
TACAGGACCAAATACCATGGTAGGGCAAATGCTGACGAGATCAATCCCCGGTTCGTTTTG
CGAACTCGAAAAGCTTCACTTTCTGCCTGTGTCTTTGACGCACAATACCAATTCTCAGTT
CTTTTGCAAAAACTCCAGGTCAGACCAACATGACTCATCTATGACTCGATCCTTAGACCA
ATTAGGGTTCATCATAAGCGCAGCTGCAGAGGAAACGTACACAACACGCTTAACGTTCGC
TTCCACGCACGCCTTAAGCACATTCAACGTCCCATCCACAGCTGGTGCCATCACTTCCAC
CTCAGGATTTGGGACTGAAGATGATGGAACAGGGCTTGCGACATGGAAGACGCCAACGCA
ACCTGCAATAGCGGATTGAAGAGAGCCGTAGTCCAGCAAATCAGCCTTGACGAGCTTGAG
ATTGTCGCCGGCTTTCTCCAGCTTCTTCAAATGAGAATACTTTTCGTTATCAGGGTCTCT
GACAGTGCCGTGAACGAAGTAATCCTTAGAGAGAAG

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DS 

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AGGGCAAATGCTGACGAGATCAATCCC*GGTTCGTTTTGCGAACTCGAAA*GCTTCACTT
TCTGCCTGTGTCTTTGACGCACAATACCAATTCTCAGTTCTTTTGCAAAA*CTCCAGGTC
AGACCAACATGACTCATCTATGACTCGATCCTTAGACCAATTAGGGTTCATCATAAGCGC
AGCTGCAGAGGAAACGTACACAACACGCTTAACGTTCGCTTCCAGGCACGCCTTAAGCAC
ATTCAACGTCCCATCCACAGCTGGTGCCATCACTTCCACCTCAGGATTTGGGACTGAAGA
TGATGGAACAGGGCTTGCGACATGGAAGACGCCAACGCAACCTGCAATAGCGGATTGAAG
AGAGCCGTAGTCCAGCAAATCAGCCTTGACGAGCTTGAGATTGTCACCGGCTTTCTCCAG
CTTCTTCAAATGAGAATACTTTTCGTTATCAGGGTCTCTGACAGTGCCGTGAACGAAGTA
ATCCTTAGAGAGAAGGAGATCAACGACCCACGAAGCAAGAAACCCTCCGGCACCGGTAAC
GCAAACCTTTCCTTTCGTCACCACCGACATTTTTTTCAATCTTCCAGAGAATCGAGATAC
TTCTCCTTCTATTCT
CC

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DS 

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AGGGCAAGGGTACTAGCGTTAACGGTGTGTTGCTGCAGTACAGGACCAAATACCATGGTA
GGGCAAATGCTGACGAGATCAATCCC*GGTTCGTTTTGCGAACTCGAAA*GCTTCACTTT
CTGCCTGTGTCTTTGACGCACAATACCAATTCTCAGTTCTTTTGCAAAA*TTCCAG*TCA
GACCAACATGACTCATCTATGACTCGATCCTTAGACCAATTAGGGTTCATCATAAGCGCA
GCTGCAGAGGAAACGTACACAACACGCTTAACGTTCGCTTCGACACACGCTTTAAGCACA
TTCAACGTCCCATCCACAGCTGGTGCCATCACTTCCACCTCAGGATTTGGGACTGAAGAT
GATGGAACAGGACTTGCGACATGGAAGACGCCGACGCAACCTGCAATAGCAGATTGAAGA
GAGCCGTAGTCCAGCAAATCAGCCTTGACGAGCTTGAGATTGTCACCGGCTTTCTCCAGC
TTCTTCAAATGAGAATACTTTTCGTTATCAGGGTCCCTGACAGTGCCGTGAACGAAGTAA
TCCTTAGAGAGAAGGAGATCAACGACCCACGAAGCAAGAAACCCTCCGGCACCGGTAACG
CAAACCTTTCCTTTCGTCACCACCGACATTTTTTTCAATCTTCCAGAGAATCGAGATACT
TCTCCTTCTATTCTAACCTTGTCTGAATCC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 4

CO CL1141Contig1 995 4 11 U
GAAAAGAATTGTGATTTTTTCTTTAAAAGTAACAAAACTACCACTTGATTGATCCCTTCC
CCCCCAATCAACAATAATTAAATAATAAAATACATAGTTTACAGAGCACATCATCATCTT
TGGAAATGAAATAAAAAAAGGGGTCAGGAGGAGGCGGCAGTAGTGGTGCAAGGCGCCAAG
CTGTTGTGAGGAAGGTTGACTCCCGCGGCTCTCACAAACACCGCCGGTCCTCTAGCTCTG
CTCACAACTAGGCTGGTGTCAAAAAAAACAACTATGACTGTAATGTCATCGTGGAAATGT
CTACGTACTCCTCTGTCTATCTTTTTCAGGTCAGAGTACCTCATCTCTCTCTTCTTAGCT
GCTTCTTTAAGCGCCACTTTCACCAGCCTCTTTGCTATCCCGTTACGCGGATGATTGTGG
ACAATCTCTACAGCTTCTTGGTTGCTCATATGTTCCCAAAGTCCATCGGAGGCACATATT
ATAAACTGGTCATGGGGCTGGAGTGTGTGGACGGTGATGGAGGGCTCTGCACTGAGTAAG
GGCCTGCTGAAGGGTGCCCTCAGTCTGAATTTCGCATACAATGGTTCCCTGTTGAACTCC
GAGCGTTTCAGATATAAATCCCCAATGGATCTTGAAACCTGAATGATTCCTTTAACTCTC
CAAACGTTATGCTTGAGAAGCACGATATCAGGATGGTCGGGATGGAGGCTCTGTAGTTCA
CGTCGAACAGACTCAATAGAAGCATTGTGCTCTTGAGAGAGCTGAGTGGCGTGAACAAGG
CCCCCAGCAGAAGTGAGTTAACCGAGGACGGCACGAGAATCACCAGCATTGGCAACGTAG
AGGATACCATCGCAGACAACGGAAACAAGGCAGCAAGAGCCAACGGTGGCAATTTGAGGC
CTGGCTGGAATTGAGTGGTAACTAAGGAGAGGAAACCTTGTTCAGTAGCTTGGAAGGCTT
TCTTTATCACTTCCGCAGACATACACCCTTCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DX01JQ U 1
AF RS1AI56JQ U 54
AF RS1DX01TF C 227
AF RS1AI56TF C 249
BS 1 88 RS1DX01JQ
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BS 801 904 RS1DX01TF
BS 905 995 RS1AI56TF

RD RS1DX01JQ 570 0 0
GAAAAGAATTGTGATTTTTTCTTTAAAAGTAACAAAACTACCACTTGATTGATCCCTTCC
CCCCCAATCAACAATAATTAAATAATAAGATACATAGTTTACAGAGCACATCATCATCTT
TGGAAATGAAATAAAAAGAGGGGTCAGGAGGAGGCGGCAGTAGTGGTGCAAGGCGCCAAG
CTGTTGTGAGGAAGGTTGACTCCCGCGGCTCTCACAAACACCGCCGGTCCTCTAGCTCTG
CTCACAACTAGGCTGGTGTCAAAAAAAACAACTATGACTGTAATGTCATCGTGGAAATGT
CTACGTACTCCTCTGTCTATCTTTTTCAGGTCAGAGTACCTCATCTCTCTCTTCTTAGCT
GCTTCTTTAAGCGCCACTTTCACCAGCCTCTTTGCTATCCCGTTACGCGGATGATTGTGG
ACAATCTCTACAGCTTCTTGGTTGCTCATATGTTCCCAAAGTCCATCGGAGGCACATATT
ATAAACTGGTCATGGGGCTGGAGTGTGTGGACGGTGATGGAGGGCTCTGCACTGAGTAAG
GGCCTGCTGAAGGGTGCCCTCAGTCTGAAT

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DS 

RD RS1AI56JQ 506 0 0
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TCATCTTTGGAAATGAAATAAAAAAAGGGGTCAGGAGGAGGCGGCAGTAGTGGTGCAAGG
CGCCAAGCTGTTGTGAGGAAGGTTGACTCCCGCGGCTCTCACAAACACCGCCGGTCCTCT
AGCTCTGCTCACAACTAGGCTGGGGTCAAAAAAAACAACTATGACTGTAATGTCATCGTG
GAAATGTCTACGTACTCCTCTGTCTATCTTTTTCAGGTCAAAATACCTCATCTCTCTCTT
CTTAGCTGCTTCTTTAAGCGCCACTTTCACCAGCCTCTTTGCTATCCCGTTACGCGGATG
ATTGTGGACAATCTCTACAGCTTCTTGGTTGCTCATATGTTCCCAAAGTCCATCGGAGGC
ACATATTATAAACTGGTCATGGGGCTGGAGTGTGTGGACGGTGATGGAGGGCTCTGCACT
GAGTAAGGGCCTGCTGAAGGGTGCCC

QA 1 506 1 506
DS 

RD RS1DX01TF 683 0 0
GTCCTCTAGCTCTGCTCACAACTAGGCTGGTGTCAAAGAAGACAACTATGACTGTAATGT
CATCGTGGAAATGTCTACGTACTCCTCTGTCTATCTTTTTCAGGTCAGAGTACCTCATCT
CTCTCTTCTTAGCTGCTTCTTTAAGCGCCACTTTCACCAGCCTCTTTGCTATCCCGTTAC
GCGGATGATTGTGGACAATCTCTACAGCTTCTTGGTTGCTCATATGTTCCCAAAGTCCAT
CGGAGGCACATATTATAAACTGGTCATGGGGCTGGAGTGTGTGGACGGTGATGGAGGGCT
CTGCACTGAGTAAGGGCCTGCTGAAGGGTGCCCTCAGTCTGAATTTCGCATACAATGGTT
CCCTGTTGAACTCCGAGCGTTTCAGATATACATCCCCAATGGATCTTGAAACCTGAATGA
TTCCTTTAACTCTCCAAACGTTATGCTTGAGAAGCACGATATCAGGATGGTCGGGATGGA
GGCTCTGTAGTTCACGTCGAACAGACTCAATAGAAGCATTGTGCTCTTGAGAGAGCTGAG
TGGCGTGAACAAGGCCCCCAGCAGAAGTGAGTTGACCGAGGACGGCACGAGAATCACCAG
CATTGGCAACGTAGAGGATACCATCGCAGACAACGGAAACAAGGCAGCAAGAGCCAACGG
TGGCAATTTGAGGCCTGG
TTTGC

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1AI56TF 747 0 0
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TCCTCTGTCTATCTTTTTCAGGTCAGAGTACCTCATCTCTCTCTTCTTAGCTGCTTCTTT
AAGCGCCACTTTCACCAGCCTCTTTGCTATCCCGTTACGCGGATGATTGTGGACAATCTC
TACAGCTTCTTGGTTGCTCATATGTTCCCAAAGTCCATCGGAGGCACATATTATAAACTG
GTCATGGGGCTGGAGTGTGTGGACGGTGATGGAGGGCTCTGCACTGAGTAAGGGCCTGCT
GAAGGGTGCCCTCAGTCTGAATTTCGCATACAATGGTTCCCTGTTGAACTCCGAGCGTTT
CAGATATAAATCCCCAATGGATCTTGAAACCTGAATGATTCCTTTAACTCTCCAAACGTT
ATGTTTGAGAAGCACGATATCAGGATGGTCGGGATGGAGGCTCTGTAGTTCTCGTCGAAC
AGACTCAATAGAAGCATTGTGCTCTTGAGAGAGCTGAGTGGCGTGAACAAGGCCCCCAGC
AGAAGTGAGTTAACCGAGGACGGCACGAGAATCACCAGCATTGGCAACGTAGAGGATACC
ATCGCAGACAACGGAAACAAGGCAGCAAGAGCCAACGGTGGCAATTTGAGGCCTGGCTGG
AATTGAGTGGTAACTAAGGAGAGGAAACCTTGTTCAGTAGCTTGGAAGGCTTTCTTTATC
ACTTCCGCAGACATACACCCTTCCTCC

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 3

CO CL1142Contig1 739 3 21 U
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TGAAACCTACATTGAATACAAGTAAGGCCCAAATAGTTTTTTCTTATTCAATTTGACTAT
TTGAGGTAAGACGTAG*****TAGG**TGTGAAAGCATAATACATAAAGCTGAAACTAAT
TAAAACCAACATCTCTAATCATCGTTTTAGTCCTTTATTTTTCAAACTTCTCCAAGACAA
GAGAGAAAGTTTCTACTTCAACCACAATTACATTGCCGACTGGAAGATCATCTCAGCGAG
TTCCTGTTTAGCAAAAGGAACCTTTGGTTCTCCAAACTCTTTAGCCTTCTTCTCAAGATA
CTCAAAATCAACTTTGCCTTCTTCTATTTGCCTCCCAAGTTCAGAGTTCCAGCTTGAGTA
TCTCTTTCCTACCAATTCACTTAAACGTCCATCCTCCAAGATCTTGGCTGCATTTCTCAG
TCCACGAGCGACTGTGTCCATTCCACTAATATGAGCAATGAACAAGTCTTCAACATCTGT
ACTCTCTCTTCGCAGTTTGGCGTCGAAGTTGAAGCCTCCTGGAGCAATCCCACCGTTTTT
GATGACACTCATCATAACCATGGTTGCTTCTCCAACATCTGTAAGAAACTGATCTGTATC
CCATCCAGTTTGAGCATCGCCAGTGTTTGCATCAATGTTACCAAGTAAACCGTTAATTCT
TGCAGTTTCAAGCTCGTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AY14JQ U 103
AF RS1BI66TF C 56
AF RS1EU56JQ U 1
BS 1 101 RS1EU56JQ
BS 102 102 RS1BI66TF
BS 103 126 RS1EU56JQ
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BS 128 136 RS1EU56JQ
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BS 148 167 RS1EU56JQ
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BS 169 220 RS1EU56JQ
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BS 267 273 RS1EU56JQ
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BS 371 371 RS1BI66TF
BS 372 739 RS1EU56JQ

RD RS1AY14JQ 204 0 0
CTTATTCAATTTGACTATTTGAGGTAAGACGTA******TAGG**TGTGAAAGCATAATA
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GAAGATCATCTCAGCGAGTTCCTG

QA 1 204 1 204
DS 

RD RS1BI66TF 543 0 0
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ACTATTTGAGGTAAGACGTAG******AGG**TGTGAAAGCATAATACATAAAGCTGAAA
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GCGAGTTCCTGTTTAGCAGAAGGAACCTTTGGTTCTCCAAACTCTTTAGCCTTCTTCTCA
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CTCAGTCCACGAGCGACTGTGTCCATTCCACTAATATGAGCAATGAACAAGTCTTCAACA
TCTGTACTCTCTCTTCGCAGTTTGGCGTCGAAGTTGAAGCCTCCTGGAGCAATCCCACC
ATCC

QA 1 539 1 539
DS 

RD RS1EU56JQ 739 0 0
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TGAAACCTACATTGAATACAAGTAAGGCCCAAATAGTTTTT*CTTATTCAATTTGACTAT
TTGAGGCAAGACGTAGGACGGTAGGAGTGTGAAAGCATAATACATAA*GCTGAAACTAAT
TAAAACCAACATCTCTAATCATCGTTTTAGTCCTTTATTTCTCAAACTTCTCCAAGACAA
GAGAGAAAGTTTCTACTTCAACCACCATTACATCGCCGACCGGAAGATCATCTCAGCGAG
TTCCTGTTTAGCAAAAGGAACCTTTGGTTCTCCAAACTCTTTAGCCTTCTTCTCAAGATA
CTCAAAATCAGCTTTGCCTTCTTCTATTTGCCTCCCAAGTTCAGAGTTCCAGCTTGAGTA
TCTCTTTCCTACCAATTCACTTAAACGTCCATCCTCCAAGATCTTGGCTGCATTTCTCAG
TCCACGAGCGACTGTGTCCATTCCACTAATATGAGCAATGAACAAGTCTTCAACATCTGT
ACTCTCTCTTCGCAGTTTGGCGTCGAAGTTGAAGCCTCCTGGAGCAATCCCACCGTTTTT
GATGACACTCATCATAACCATGGTTGCTTCTCCAACATCTGTAAGAAACTGATCTGTATC
CCATCCAGTTTGAGCATCGCCAGTGTTTGCATCAATGTTACCAAGTAAACCGTTAATTCT
TGCAGTTTCAAGCTCGTGA

QA 1 739 1 739
DS 



AS 2 6

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TCTTCTCCAGTAGATTTGATTTCCCCACTTTACACTTTCTCCACCGCTCCTGCGACATTG
TCGGCTGCTTTCATTCCTTTAGATCATCAATCTCACCACAACATCCTCATGGATTCCCAG
CCTACTACTACTACTACTACTTCCCCTGTGAAAACAGTGAAGATTAGCAATGTCTCACTC
AACGTTTCCAAGAAAGATCTCAATGAGTTCTTTTCTTTCTCTGGTGACATTCACTACATC
GAGATGCGAAGCGAGACGCAAGAAACTCAGCTTGCTTATGTTACTTTTAAAGATCCACAA
GGCGCAGAAACTGCTATGCTCTTAACGGGAGCTGTCATTGCTGATCATCGTGTCAGTATT
ACACCTGCTGTGAACTACGAGCTACCACCAGAAGCCCTTGCACTTGACTCGCAGGAATAT
TCATTCAATGGCTTCACTGTCAAGAAAGCCGAACACGTGGTAACCATCATGATGGAAAGA
GGTTACGCTGTCGGCAAAGACGCGATGGAGAAAGCCAAAGCCTTTGACGACAAACACAAC
TTGGTCTCAAACGCCTCGGCAACCATCGCCTCCCTCGACAACAAGATTGGTCTGAGCGAG
AAGCTAAGCATGGGAACAACCGTGGTCAACGAGAAGCTGAGAGAGGTGGACGAGCGGTAT
CAAGTGAGGGAGATCACGAAGTCCGCTCTAGCAGCTGCTGAGGAGAGAGCGATCAGCGCA
GGGACAGCTCTGATGGCCAACCCTTACGTGTCGAGCGGAGCTTCTTGGTTAAAACGCCTT
TGGTGCAGCGACAAAGGCGGTTAGAGCTGAGGAGAATGGAGGAGAGGTGAGGAAGGAGAT
TATTATTCAGCTTGATGACACTTCACCTAAAGCTCCTGCTGTTGTTCCCGTTAGCTCGGT
GGACACAGACTTCATCAACAAACCAAGTTTCTAAAAGATTGCATTGTCTCAAACTCTCAT
TCTTTGTGCATATATATGTTTTTACATATTCATTTGTCTTCTTTTCATTGCACAAACATA
AACCTTATTGTTGTTTTGTTTGTTTTACTTTTTGCCTTGAAAATTTAATAATATAATTCA
GGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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ATTTAATAATATAATTCAGGGC

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TTCCC


BQ
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CC

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TTTTCTTTCTCTGGTGACATTCACTACATCGAGATGCGAAGCGAGACGCAAGAAACTCAG
CTTGCTTATGTTACTTTTAAAGATCCACAAGGCGCAGAAACTGCTATGCTCTTAACGGGA
GCTGTCATTGCTGATCATCGCGTCAGTATTACACCTGCTGTGAACTACGAGCTACCACCA
GAAGCCCTTGCACTTGACTCGGAATATTCATTCAATGGCTTCACTGTCAAGAAAGCCGAA
CACAACAAGATTGGTCTGAGCGAGAAGCTAAGCATGGGAACAACCGTGGTCAACGAGAAG
CTGAGAGAGGTGGAGGAGAGGTGAGGAAGGAGATTATTATTCAGCTTGATGACACTTCAC
CTAAAGCTCCTGCTGTTGTTCCCGTTAGCTCGGTGGACACAGACTTCATCAACAAACCAA
GTTTCCAAAAGATTGCATTGTCTCAAACTCTCATTCTTTGTGCATATATATGCTTTTACA
TATTCATTTGTCTTCTTTTCATTGCACAAACATAAACCTTATTGTTGTTTTGTTTGTTTT
ACTTTTTGCCTTGAAAATTTAATAATATAATTCAG
CC

QA 1 635 1 635
DS 

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TTTACTTTTTGCCTTGAAAATTTAATAATATAATTCAGCGGAAAAAAATAATATAAACCT
TATTGTTACATTCAGACAACATTTGTCATATTCTTAAGAACTGAGTTGAAGAAACCTCCT
AGCCATAGGATGCGTAGCTTGAGAAAGCTCATCAGGTTTAAGAACTTCGACGATCTCTCC
ATCAACGACGAGGCAGACCATATCCGCAACTCGCTGGATCTGCTTGATACTGTGAGAGAC
GATCACAGTCGTGATCCCTCTCTGCTTCTTCAGCTTCACTATAACATCCTCGACGTTCTC
CGTCGATATGGGATCCAAAGCGCTCGTTGGCTCGTCGAGAAGCAGCACCTCGGGGTCGTT
GGCTAGAGTCCTCGCAAGTGCTACTCGCTGCGCTTGACCAACGGATAACTCTGAACCAGT
CTTCTTTGCAAAAGAAGCATCGAGATCCGCGAGAGTTAGCAGCTTGTAGACGTCTTGGTC
ACTTAGCTTATGCCCTCTCAGGTTCGGACCATATCTCACATTGTCCGCAACAGTCCCTTC
AAAGAGAACGGGAAGCTGGAAAAGCATGCCGACTCTACGGCGGAGAGCGATAACGT

QA 1 656 1 656
DS 

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CTCGTCGAGAAGCAGCACCTCGGGGTCGTTGGCTAGAGTCCTCGCAAGTGCTACTCGCTG
CGCTTGACCAACGGATAACTCTGAACCAGTCTTCTTTGCAAAAGAAGCATCGAGATCCGC
GAGAGTTAGCAGCTTGTAGACGTCTTGGTCACTTAGCTTATGCCCTCTCAGGTTCGGACC
ATATCTCACATTGTCCGCAACAGTCCCTTCAAAGAGAACGGGAAGCTGGAAAAGCATGCC
GACTCTACGGCGGAGAGCGATAACGTCGATGCTCGCGATGTCTACGCCGTCCAAGAAAAC
AGTCGTCGCCGGAGGCTCCCAGAGACGGTTGAGAGATCTCAGAAACGTTGACTTTCCGCT
GCCACTTGGACCGATCACGCCAACGATCATCCCCTTGGGTATGTCCATGGATACTCCTTT
CAGAATCAGAGATCCGTCATCGGAGACTCGGGTCAGGTCTCTTACCAGTATCTTTGGTTC
TTGACCAGACAGAGCCTCCACGTCCAGTAGATGCTCTCGCAACGCGCCATTGGATTCACC
AGACAAGAGTGATGGCATCGTCTTTGAATTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTCGTGCGTCTTT
CAGTTTTGATGATTCCC

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 3

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TGCCTATCAATGAGACATTGATTGATGCTAACAACTATTAACACTAATACAATCTTTTAT
ACTACAAAGAAACAAAAGCTGATTGAGAAACTTCTCTCTTGCACATCACAAACACAGACA
AACCATCTCATCTTCTTCACCCCTGCGGAGCAAAACTCCAATTCAAGAACGGTTTCTGCT
CAAGCGGATCCTGGAACGAAGTGAAGCAATCAGTAGGCTGATACATGAACTGAGGAACAA
AAGCATCGCTCTGCAACAAGTCCATGGAACAACCACCAACACCCCCAAACATGGAAGAAT
CAAAAGCCTCCAAAGCATCCTCAAGCTCTCTCCATTTAGGCTCGCTCTGAACCTCCTCCT
TCGCATCAGGTGACACCACGTGTCCTCCCGAGCTGCTACAATCCTCCTCTTGCAACGTCG
ACACCGATGTGTCAAAAGGCGACGATGCGGTCCTCGGTTTCTCATCAGCAGGGTAGTACT
TCTCCATGGTTCCTTTCTTGTTGTGGATTCGACATAACACCCAATCATCAAGTCGTAGGT
TGTTCTTTTTGTTAACAGAAGCTGATCTATCGACATTAGCGAGACGATACTCGTGCATGA
TCCAATTCGTTTTAATCCCTTTGGGAGCTTTCCCGGCGTAGAAGACGAGCGCTTTCTTTA
TCCCCAACGTCTTCGGTTTACCGATGGGTTTATCAGCTCCGGTGGCTTTCCAATAACCGG
TACCTGCTGCCCGGTTAGGACGCGAACCGTTTGGGTATTTCCGGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CK39JQ U 6
AF RS1CK39TF C 1
AF RS1EE43JQ U 62
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RD RS1CK39JQ 639 0 0
GAAA
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CCTGGAACGAAGTGAAGCAATCAGTAGGCTGATACATGAACTGAGGAACAAAAGCATCGC
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TGTTAACAGAAGCTGATCTATCGACATTAGCGAGA

QA 5 639 5 639
DS 

RD RS1CK39TF 706 0 0
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TGCCTATCAATGAGACATTGATTGATGCTAACAACTATTAACACTAATACAATCTTTTAT
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AACCATCTCATCTTCTTCACCCCTGCGGAGCAAAACTCCAATTCAAGAACGGTTTCTGCT
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AAGCATCGCTCTGCAACAAGTCCATGGAACAACCACCAACACCCCCAAACATGGAAGAAT
CAAAAGCCTCCAAAGCATCCTCAAGCTCTCTCCATTTAGGCTCGCTCTGAACCTCCTCCT
TCGCATCAGGTGACACCACGTGTCCTCCCGAGCTGCTACAATCCTCCTCTTGCAACGTCG
ACACCGATGTGTCAAAAGGCGACGATGCGGTCCTCGGTTTCTCATCAGCAGGGTAGTACT
TCTCCATGGTTCCTTTCTTGTTGTGGATTCGACATAACACCCAATCATCAAGTCGTAGGT
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TCCAATTCGTTTTAATCCCTTTGGGAGCTTTCC
CGGCGTAGAAGAC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RS1EE43JQ 766 0 0
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AAGCGGATCCTGGAACGAAGTGAAGCAATCAGTAGGCTGATACATGAACTGAGGAACAAA
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AAAAGCCTCCAAAGCATCCTCAAGCTCTCTCCATTTAGGCTCGCTCTGAACCTCCTCCTT
CGCATCAGGTGACACCACGTGTCCTCCCGAGCTGCTACAATCCTCCTCTTGCAACGTCGA
CACCGATGTGTCAAAAGGCGACGATGCGGTCCTCGGTTTCTCATCAGCAGGGTAGTACTT
CTCCATGGTTCCTTTCTTGTTGTAGATTCGACATAACACCCAATCATCAAGTCGTAGGTT
GTTCTTTTTGTTAACAGAAGCTGATCTATCGACATTAGCGAGACGATACTCGTGCATGAT
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CCCCAACGTCTTCGGTTTACCGATGGGTTTATCAGCTCCGGTGGCTTTCCAATAACCGGT
ACCTGCTGCCCGGTTAGGACGCGAACCGTTTGGGTATTTCCGGTCT

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 6

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ATAGAGAGAGACAACAATGGCGTCGAACTCGCTCATGAGCTGCGGTATCGCCGCCGTCTA
CCCTTCTCTTCTTTCTTCTTCAAAATCTAAATTCGTCTCGGCCGGAGTTGCTCTCCCCAA
CGCCGGGAATGTTGGCCGTGTCAGAATGGCTGCTCACTGGATGCCCGGCGAACCACGACC
AGCTTACCTCGACGGTTCTGCTCCTGGTGACTTTGGGTTTGACCCACTCGGACTTGGAGA
GGTTCCAGAGAACCTTGAGAGGTACAAAGAATCAGAGCTCATCCACTGTAGATGGGCTAT
GCTTGCTGTTCCAGGGATATTGGTACCAGAGGCTTTGGGATATGGAAACTGGGTAAAGGC
TCAAGAATGGGCAGCAGTACCTGGAGGACAAGCCACTTACTTGGGGAACCCAGTCCCTTG
GGGTACTTTGCCCACAATCTTGGCTATAGAGTTTTTAGCTATTGCATTTGTTGAGCACCA
GAGGAGTATGGAGAAAGACCCTGAGAAAAAGAAGTACCCGGGAGGTGCATTTGACCCTCT
TGGATACTCCAAAGACCCAAAGAAGTTCGAGGAGTTGAAAGTTAAAGAGATCAAGAACGG
GAGGCTTGCGTTGTTGGCGTTTGTAGGCTTCTGTGTGCAACAATCTGCCTACCCAGGCAC
AGGACCATTGGAGAACCTGGCTACTCACTTGGCGGATCCATGGCACAAAAACATTGGCGA
TGTTGTTATCCCTTTCAACTAGTGACTTGTAAAAAAAGATAGTAATGTATCCTATGAGCT
TTATGTGTATCAAAACTCTGTCTAGTGAAAGACAGATTGTGAAACCTATGTTTTGTCTCG
GTGATCGATTGCTCCTGTGAGCTTGTTGAAGTCTATGTTATTAAACCTTTTGAATCGAAA
CAAACATGCATCAGAGAGATTTTCGAAATGCAAAAAAAGAAAACATTGAAGTCGGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RS1GQ40TF U 40
AF RS1CQ75TF U 1
AF RS1DS85TF U 17
AF RS1DS85JQ C 188
AF RS1CQ75JQ C 267
AF RS1GQ40JQ C 668
BS 1 262 RS1CQ75TF
BS 263 263 RS1GQ40TF
BS 264 718 RS1CQ75TF
BS 719 808 RS1DS85TF
BS 809 911 RS1DS85JQ
BS 912 912 RS1CQ75JQ
BS 913 957 RS1DS85JQ
BS 958 993 RS1CQ75JQ
BS 994 994 RS1GQ40JQ
BS 995 1017 RS1CQ75JQ

RD RS1GQ40TF 616 0 0
GGGTGG
TAAACAGAAAGGGAGATAGAGAGAGACAACAATGGCGTCGAACTCGCTCATGAGCCGCGG
TATCGCCGCCGTCTACCCTTCTCTTCTTTCTTCTTCAAAATCTAAATTCGTCTCGGCCGG
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CGGCGAACCACGACCAGCTTACCTCGACGGTTCTGCTCCTGGTGACTTTGGGTTTGACCC
ACTCGGACTTGGAGAGGTTCCAGAGAACCTTGAGAGGTACAAAGAATCAGAGCTCATCCA
CTGTAGATGGGCTATGCTTGCTGTTCCAGGGATATTGGTACCAGAGGCTTTGGGATATGG
AAACTGGGTAAAGGCTCAAGAATGGGCAGCAGTACCTGGAGGACAAGCCACTTACTTGGG
GAACCCAGTCCCTTGGGGTACTTTGCCCACAATCTTGGCTATAGAGTTTTTAGCTATTGC
ATTTGTTGAGCACCAGAGGAGTATGGAGAAAGACCCTGAGAAAAAGAAGTACCCGGGAGG
TGCATTTGACCCTCTCGGATACTCCAAAGACCCAAAGAAGTTCGAGGAGTTGAAAGTTAA
AGAGATCAAG

QA 7 616 7 616
DS 

RD RS1CQ75TF 718 0 0
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ATAGAGAGAGACAACAATGGCGTCGAACTCGCTCATGAGCTGCGGTATCGCCGCCGTCTA
CCCTTCTCTTCTTTCTTCTTCAAAATCTAAATTCGTCTCGGCCGGAGTTGCTCTCCCCAA
CGCCGGGAATGTTGGCCGTGTCAGAATGGCTGCTCACTGGATGCCCGGCGAACCACGACC
AGCTTACCTCGACGGTTCTGCTTCTGGTGACTTTGGGTTTGACCCACTCGGACTTGGAGA
GGTTCCAGAGAACCTTGAGAGGTACAAAGAATCAGAGCTCATCCACTGTAGATGGGCTAT
GCTTGCTGTTCCAGGGATATTGGTACCAGAGGCTTTGGGATATGGAAACTGGGTAAAGGC
TCAAGAATGGGCAGCAGTACCTGGAGGACAAGCCACTTACTTGGGGAACCCAGTCCCTTG
GGGTACTTTGCCCACAATCTTGGCTATAGAGTTTTTAGCTATTGCATTTGTTGAGCACCA
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TGGATACTCCAAAGACCCAAAGAAGTTCGAGGAGTTGAAAGTTAAAGAGATCAAGAACGG
GAGGCTTGCGTTGTTGGCGTTTGTAGGCTTCTGTGTGCAACAATCTGCCTACCCAGGC

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DS 

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GG
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GGCGTCGAACTCGCTCATGAGCTGCGGTATCGCCGCCGTCTACCCTTCTCTTCTTTCTTC
TTCAAAATCTAAATTCGTCTCGGCCGGAGTTGCTCTCCCCAACGCCGGGAATGTTGGCCG
TGTCAGAATGGCTGCTCACTGGATGCCCGGCGAACCACGACCAGCTTACCTCGACGGTTC
TGCTCCTG*TGACTTTGGGTTTGACCCACTCGGACTTGGAGAGGTTCCAGAGAACCTTGA
GAGGTACAAAGAATCAGAGCTCATCCACTGTAGATGGGCTATGCTTGCTGTTCCAGGGAT
ATTGGTACCAGAGGCTTTGGGATATGGAAACTGGGTAAAGGCTCAAGAATGGGCAGCAGT
ACCTGGAGGACAAGCCACTTACTTGGGGAACCCAGTCCCTTGGGGTACTTTGCCCACAAT
CTTGGCTATAGAGTTTTTAGCTATTGCATTTGTTGAGCACCAGAGGAGTATGGAGAAAGA
CCCTGAGAAAAAGAAGTACCCGGGAGGTGCATTTGACCCTCTTGGATACTCCAAAGACCC
AAAGAAGTTCGAGGAGTTGAAAGTTAAAGAGCTCAAGAACGGGAGGCTTGCGTTGTTGGC
GTTTGTAG*CTTCTGTGTGCAACAATCTGCCTACCCAGGCACAGGACCATTGGAGAACCT
GGCTACTCACTTGGCGGATCCATGGCACAAAAACATTGGCGATGTTGTTATCCCTTTCAA
CTAGTGACTT

QA 3 792 3 792
DS 

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CTCGACGGTTCTGCTCCTG*TGACTTTGGGTTTGACCCACTCGGACTTGGAGAGGTTCCA
GAGAACCTTGAGAGGTACAAAGAATCAGAGCTCATCCACTGTAGATGGGCTATGCTTGCT
GTTCCAGGGATATTGGTACCAGAGGCTTTGGGATATGGAAACTGGGTAAAGGCTCAAGAA
TGGGCAGCAGTACCTGGAGGACAAGCCACTTACTTGGGGAACCCAGTCCCTTGGGGTACT
TTGCCCACAATCTTGGCTATAGAGTTTTTAGCTATTGCATTTGTTGAGCACCAGAGGAGT
ATGGAGAAAGACCCTGAGAAAAAGAAGTACCCGGGAGGTGCATTTGACCCTCTTGGATAC
TCCAAAGACCCAAAGAAGTTCGAGGAGTTGAAAGTTAAAGAGCTCAAGAACGGGAGGCTT
GCGTTGTTGGCGTTTGTAGGCTTCTGTGTGCAACAATCTGCCTACCCAGGCACAGGACCA
TTGGAGAACCTGGCTACTCACTTGGCGGATCCATGGCACAAAAACATTGGCGATGTTGTT
ATCCCTTTCAACTAGTGACTTGTAAAAAAAGATAGTAATGTATCCTATGAGCTTTATGTG
TATCAAAACTCTGTCTAGTGAAAGACAGATTGTGAAACCTATGTTTTGTCTCGGTGATCG
ATTGTTCCTGTGAGCTTGTTGAAGTCTATGTTATTAAACCTTTTGAATCG

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DS 

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AAGAATCAGAGCTCATCCACTGTAGATGGGCTATGCTTGCTGTTCCAGGGATATTGGTAC
CAGAGGCTTTGGGATATGGAAACTGGGTAAAGGCTCAAGAATGGGCAGCAGTACCTGGAG
GACAAGCCACTTACTTGGGGAACCCAGTCCCTTGGGGTACTTTGCCCACAATCTTGGCTA
TAGAGTTTTTAGCTATTGCATTTGTTGAGCACCAGAGGAGTATGGAGAAAGACCCTGAGA
AAAAGAAGTACCCGGGAGGTGCATTTGACCCTCTTGGATACTCCAAAGACCCAAAGAAGT
TCGAGGAGTTGAAAGTTAAAGAGATCAAGAACGGGAGGCTTGCGTTGTTGGCGTTTGTAG
GCTTCTGTGTGCAACAATCTGCCTACCCAGGCACAGGACCATTGGAGAACCTGGCTACTC
ACTTGGCGGATCCATGGCACAAAAACATTGGCGATGTTGTTATCCCTTTCAACTAGTGAC
TTGTAAAAAAAGATAGTAATGTATCCTATGAGCTTTATGTGTATCAAAACTCTGTCTAGT
GAAAGACAGATTGTGAAACCTATGTTTTGTCTCGGTGATCGATTGCTCCTGTGAGCTTGT
TGAAGTCTATGTTATTAAACCTTTTGAATCGAAACAAACATGCATCAGAGAGATTTTCGA
AATGCAATAAAAGAAAACATTGAAGTCGGCG

QA 1 751 1 751
DS 

RD RS1GQ40JQ 350 0 0
GCGTTGTTGGCGTTTGTAGGCTTCTGTGTGCAACAATTTGCCTACCCAGGCACAGGACCA
TTGGAGAACCTGGCTACTCACTTGGGGGATCCATGGGGCAAAAACATTGGGGATGTTGTT
ATCCCTTTCAACTAGTGACTTGTAAAAAAAGATAGTAATGTATCCTATGAGCTTTATGTG
TATCAAAACTTTGTTTAGTGAAAGACAGATTGTGAAACCTATGTTTTGTTTCGGTGATCG
ATTGCTCCTGTGAGCTTGTTGAAGTTTATGTTATTAAACCTTTTGAATCGAAACAAACAT
GCATCAGAGAGATTTTGGAAGTGCAAAAAAAGGAAACATTGAAGT
GGGCT

QA 1 345 1 345
DS 



AS 1 4

CO CL1146Contig1 1096 4 10 U
TACGGCCGGGGGAGGAAGCGGGTTTAAAGACATCCTCAGAGATGGCGGCGATGGCGATTA
TCCGGTGTTGCTCCTCCTTCTCCCATACTTCCGGCGTCCGTACTCTGCCGCACGAAAATT
CACGAAGTTCAGAGACTGGGAACAAGTTAGCTAAATCTATTGGCTACTCCTCACATCATC
TTATCTCCAAGATTAAACTTTTGTCTACCAAGAAGCCCAATGAGCCTGAAAGCAAGGGAC
TCTTCTTACAAACACCATCTCCAACCCTGCAAAGTTTTGACAAGTTATCAGCTTTTGAGG
GATTTGGGAGGCTCAAGTTACCTGTGATGGCAGTGTTGTTTACAAACTCCCTTCTCATTG
GTACACCTCTCCAAGCCTTGTCTGCTGACATATGCGAGCCTCCTGAGAGTTCCGTCTTCA
ACATGCCTCTTTTGTTGCTTGTCGCACTTGTTGGCGCCACTGTTGGAGGGTTACTTGCTC
GGCAGAGGAAAGGGGAGTTACAGAGGCTGAACGAACAGCTACGACAGATCAACACAGCCC
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TTAGAATCCCACCAGAGAGTGAGATCATTGTGGACCCAAAGAAACAAGAGTTGATCTCCA
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TCAAGATTGCTCTGGAGCTTGCCCAGAGTCTAGGAGACCCCATCGAAGAGAAGAAAGCTG
CCAGAGGCTTAGGCGCTTCGCTGCAACTTCAAGGGAAGTATAGAGATGCTATACAGTATC
ACAACATGGTTCTTGCCATCTCGAATAGGGAAGGAGAAGATTCTGGAAGCACTGAAGCTT
ATGGAGCTATTGCAGATTGTTACACTGAGCTCGGAGATCTTGAGAAAGCTGGGAGTTACT
ATGACACCTGCATTGCTCGGTTAGAGACAGACTGATTCATTCATCTGTATTGTCTTTTTG
TCTGTTTGTTGTGTTTATGTCATATCACATAATATGGATATCAGATTCCCTTTTTTTAAA
TGTAATTTTGTTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AM11TF U 1
AF RS1EC09TF U 8
AF RS1AU86TF U 96
AF RS1AU86JQ C 381
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RD RS1AM11TF 756 0 0
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TCCGGTGTTGCTCCTCCTTCTCCCATACTTCCGGCGTCCGTACTCTGCCGCACGAAAATT
CACGAAGTTCAGAGACTGGGAACAAGTTAGCTAAATCTATTGGCTACTCCTCACATCATC
TTATCTCCAAGATTAAACTTTTGTCTACCAAGAAGCCCAATGAGCCTGAAAGCAAGGGAC
TCTTCTTACAAACACCATCTCCAACCCTGCAAAGTTTTGACAAGTTATCAGCTTTTGAGG
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GTACACCTCTCCAAGCCTTGTCTGCTGACATATGCGAGCCTCCTGAGAGTTCCGTCTTCA
ACATGCCTCTTTTGTTGCTTGTCGCACTTGTTGGAGCCACTGTTGGAGGGTTACTTGCTC
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TTAGGAGACAAGCCAAAATCGAGTCTTACGCCCCAGGGTTAAGTTACGCACCGGTAGGAG
CTAGAATCCCACCAGAGAGTGAGATCATTGTGGACCCAAAGAAACAAGAGTTGATCTCCA
AGCTGAAGACGGGCAAGACCTTTCTGAGGAATCAAGAGCTAGAGAAAGCTTTTTCGGAGT
TCAAGATTGCTCTGGAGCTTGCCCAGAGTCTAGGAG

QA 1 756 1 756
DS 

RD RS1EC09TF 764 0 0
GGGAGCT
GAAGCGGGTTTAAAGACATCCTCAGATATGGCGGCGATGGCGATTATCCGGTGTTGCTCC
TCCTTCTCCCATACTTCCGGCGTCCGTACTCTGCCGCACGAAAATTCACGAAGTTCAGAG
ACTGGGAACAAGTTAGCTAAATCTATTGGCTACCCCTCACATCATCTTATCTCCAAGATT
AAACTTTTGTCTACCAAGAAGCCCAATGAGCCTGAAAGCAAGGGACCCTTCTTACAAACA
CCATCTCCAACCCTGCAAAGTTTTGACAAGTTATCAGCTTTTGAGGGATTTGGGAGGCTC
AAGTTACCTGTGATGGCAGTGTTGTTTACAAACTCCCTTCTCATTGGTACACCTCTCCAA
GCCTTGTCTGCTGACATATGCGAGCCTCCTGAGAGTTCCGTCTTCAACATGCCTCTTTTG
TTGCTTGTCGCACTTGTTGGCGCCACTGTTGGAGGGTTACTTGCTCGGCAGAGGAAAGGG
GAGTTACAGAGGCTGAACGA*CAGCTACGACAGATCAACACAGCCCTTAGTAGACAAGCC
AAAATCGAGTCTTACGCCCCAGGGTTAAGTTACGCACCGGTAGGAGCTAGAATCCCACCA
GAGAGTGAGATCATTGTGGACCCAAAGAAACAAGAGTTGATCTCCAAGCTGAAGACGGGC
AAGACCTTTCTGAGGAATCAAGAGCTAGAGAAAGCTTTTTCGGAGTTCA*GATTGCTCTG
GAGCTTGCCCAGAGTCTAGGAGACCCCATCGAA
AGAG

QA 8 760 8 760
DS 

RD RS1AU86TF 709 0 0
GG
CCGTACTCTGCCGCACGAAAATTCACGAAGTTCAGAGACTGGGAACAAGTTAGCTAAATC
TATTGGCTACTCCTCACATCATCTT**CTCCAAGATTAAACTTTTGTCTACCAAGAAGCC
CAATGAGCCTGAAAGCAAGGGACTCTTCTTACAAACACCATCTCCAACCCTGCAAAGTTT
TGACAAGTTATCAGCTTTTGAGGGATTTGGGAGGCTCAAGTTACCTGTGATGGCAGTGTT
GTTTACAAACTCCCTTCTCATTGGTACACCTCTCCAAGCCTTGTCTGCTGACATATGCGA
GCCTCCTGAGAGTTCCGTCTTCAACATGCCTCTTTTGTTGCTTGTCGCACTTGTTGGCGC
CACTGTTGGAGGGTTACTTGCTCGGCAGAGGAAAGGGGAGTTACAGAGGCTGAACGAACA
GCTACGACAGATCAACACAGCCCTTAGGAGACAAGCCAAAATCGAGTCTTACGCCCCAGG
GTTAAGTTACGCACCGGTAGGAGTTAGAATCCCACCAGAGAGTGAGATCATTGTGGACCC
AAAGAAACAAGAGTTGATCTCCAAGCTGAAGACGGGCAAGACCTTTCTGAGGAATCAAGA
GCTAGAGAAAGCTTTTTCGGAGTTCAAGATTGCTCTGGAGCTTGCCCAGAGTCTAGGAGA
CCCCATCGAAGAGAAGAAAGCTGCCAGAGGCTTAG
CGCTTCGCTGCA

QA 3 697 3 697
DS 

RD RS1AU86JQ 716 0 0
TCTGCTGACATATGCGAGCCTCCTGAGAGTTCCGTCTTCAACATGCCTCTTTTGTTGCTT
GTCGCACTTGTTGGCGCCACTGTTGGAGGGTTACTTGCTCGGCAGAGGAAAGGGGAGTTA
CAGAGGCTGAACGAACAGCTACGACAGATCAACACAGCCCTTAGGAGACAAGCCAAAATC
GAGTCTTACGCCCCAGGGTTAAGTTACGCACCGGTAGGAGTTAGAATCCCACCAGAGAGT
GAGATCATTGTGGACCCAAAGAAACAAGAGTTGATCTCCAAGCTGAAGACGGGCAAGACC
TTTTTGAGGAATCAAGAGCTAGAGAAAGCTTTTTCGGAGTTCAAGATTGCTCTGGAGCTT
GCCCAGAGTCTAGGAGACCCCATCGAAGAGAAGAAAGCTGCCAGAGGCTTAGGCGCTTCG
CTGCAACTTCAAGGGAAGTATAGAGATGCTATACAGTATCACAACATGGTTCTTGCCATC
TCGAATAGGGAAGGAGAAGATTCTGGAAGCACTGAAGCTTATGGAGCTATTGCAGATTGT
TACACTGAGCTCGGAGATCTTGAGAAAGCTGGGAGTTACTATGACACCTGCATTGCTCGG
TTAGAGACAGACTGATTCATTCATCTGTATTGTCTTTTTGTCTGTTTGTTGTGTTTATGT
CATATCACATAATATGGATATCAGATTCCCTTTTTTTAAATGTAATTTTGTTTGTC

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 6

CO CL1147Contig1 1010 6 11 U
GAGGAAGAGTTGTGATTATTGCATTGAGAAGAACGAATGAATATAACAAAGCAGTTACAA
TCAATCAAGCTAAAAAAACTAATTCACTCCATGAGGAATCTTGAGTACAGTCCTTTATGT
GTATATAATTACTATCTTATTTGTGTGTTTGCTTGCCGATGGTTTATAATCCAAAGTTGC
GGATGTCACCTCCATCAATAAGCTTACTTAACCCCGAGTTGAGAATGTCCTAAAGATGGA
TAAGGAGATAACGGAGGCACAGAGAATAGTCCCATCCCTATACCGTCTACTCCGTCCCAA
AACCCCATCCAACTTGACGGTGTCAACGGACAAGCCTCACCCTGAGCTTCCGTCTCTTCC
CTTTTCACAGCTTTATGGCAGATCAGGTTTATCCCACGGTCTTCATCCTCTGTTTCTGGT
CGCTTCCTCTTAGCTTTCAAAGCCACAGTCTTCTTGTTGTTGTCGTCATCTCCAGAGTCC
TCGTGCTTACCTGCTTCGAGTGGGAAGTTAAGAATGGCTTT*GCTTCCTCTTAGTTTAAA
AGCAGCTCTGTCGTAACCTCTTGCAGCTTCCACGGCCGTGTCAAAAGTACCTAGCCAGAC
ACGAACACCTTTCTTGTTTGGGTCTCTGATCTCAGCCGCGTACTTACCCCACGGTCTACG
CCTCACGCCTCTGTAATGCCTATGATCATCCTCTTTAACCACCGGTGCAGTAGTAGGAAC
TAAAATGGTGGCAAGAGATGGCTTGCGTTGGCTAAGAGTGGAGGTGGTGCTCTGATGGAT
GCTAGAAACGAAAGTCTCCAAGGAAGGGGAATCGGTAAGGAGGTGTTGAGTTATGAGGTC
CAAAGCTGATTGGTCTTGTGAAGAAGCCATAAATGAAACTTTGGAGTCGTTGGTTTGTGG
TTTTGATTGTGTTGTGTTGTGGACTTTTTGATTTGAGATTGGGGGAGATTATATAGAAGA
AGGAAGTGAGACTGAGAAGTTTCGTAGTTAGCTTCTTCTTGGGTTTGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EW50TF C 162
AF RS1EW50JQ U 15
AF RS1AR31JQ U 388
AF RS1C408JQ U 1
AF RS1C408TF C 144
AF RS1AR31TFB C 288
BS 1 432 RS1C408JQ
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BS 434 473 RS1C408JQ
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BS 513 701 RS1C408JQ
BS 702 870 RS1C408TF
BS 871 871 RS1AR31TFB
BS 872 922 RS1C408TF
BS 923 1010 RS1AR31TFB

RD RS1EW50TF 117 0 0
GTTTATAATCCAAAGTTGCGGATGTCACCTCCATCAATAAGCTTACTTAACCCCGAGTTG
AGAATGTCCTAGAGATGGATAAGGAGATAACGGAGGCACAGAGAATAGTCCCATCCC

QA 1 117 1 117
DS 

RD RS1EW50JQ 264 0 0
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AAAACTAATTCACTCCATGAGGAATCTTGAGTACAGTCCTTTATGTGTATATAATTACTA
TCTTATTTGTGTGTTTGCTTGCCGATGGTTTATAATCCAAAGTTGCGGATGTCACCTCCA
TCAATAAGCTTACTTAACCCCGAGTTGAGAATGTCCTAAAGATGGATAAGGAGATAACGG
AGGCACAGAGAATAGTCCCATCCC

QA 1 264 1 264
DS 

RD RS1AR31JQ 240 0 0
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GTCTTCTTGTTGTTGTCGTCATCTCCAGAGTCCTCGTGCTTACCTGCTTCGAGTGGGAAG
TTAAGAATGGCTTTTGCTTCCTCTTAGTTTAAAAGCAGCTCTGTCGTAACCTCTTGCAGC
TTCCACGGCCGTGTCAAAAGTACCTAGCCAGACACGAACACCTTTCTTGTTTGGGTCTCT

QA 1 240 1 240
DS 

RD RS1C408JQ 701 0 0
GAGGAAGAGTTGTGATTATTGCATTGAGAAGAACGAATGAATATAACAAAGCAGTTACAA
TCAATCAAGCTAAAAAAACTAATTCACTCCATGAGGAATCTTGAGTACAGTCCTTTATGT
GTATATAATTACTATCTTATTTGTGTGTTTGCTTGCCGATGGTTTATAATCCAAAGTTGC
GGATGTCACCTCCATCAATAAGCTTACTTAACCCCGAGTTGAGAATGTCCTAAAGATGGA
TAAGGAGATAACGGAGGCACAGAGAATAGTCCCATCCCTATACCGTCTACTCCGTCCCAA
AACCCCATCCAACTTGACGGTGTCAACGGACAAGCCTCACCCTGAGCTTCCGTCTCTTCC
CTTTTCACAGCTTTATGGCAGATCAGGTTTATCCCACGGTCTTCATCCTCTGTTTCTGGT
CGCTTCCTCTTAACTTTCAAAGCCACAGTCTTCTTGTTGTTGTCGTCATCTCCGGAGTCC
TCGTGCTTACCTGCTTCGAGTGGGAAGTTAAAAATGGCTTT*GCTTCCTCTTAGTTTAAA
AGCAGCTCTGTCGTAACCTCTTGCAGCTTCCACGGCCGTGTCAAAAGTACCTAGCCAGAC
ACGAACACCTTTCTTGTTTGGGTCTCTGATCTCAGCCGCGTACTTACCCCACGGTCTACG
CCTCACGCCTCTGTAATGCCTATGATCATCCTCTTTAACCA

QA 1 701 1 701
DS 

RD RS1C408TF 781 0 0
GTGT
TTTGCTTGCCGATGGTTTATAATCCAAAGTTGCGGATGTCAC*TCCATCAATAAGCTTAC
TTAACCCCGAGTTGAGAATGTCCTAGAGATGGATAAGGAGATAACGGAGGCACAGAGAAT
AGTCCCATCCCTATACCGTCTACTCCGTCCCAAAACCCCATCCAACTTGACGGTGTCAAC
GGACAAGCCTCACCCTGAGCTTCCGTCTCTTCCCTTTTCACAGCTTTATGGCAGATCAGG
TTTATCCCACGGTCTTCATCCTCTGTTTCTGGTCGCTTCCTCTTAGCTTTCAAAGCCACA
GTCTTCTTGTTGTTGTCGTCATCTCCGGAGTCCTCGTGCTTACCTGCTTCGAGTGGGAAG
TTAAGAATGGCTTT*GCTTCCTCTTAGTTTAAAAGCAGCTCTGTCGTAACCTCTTGCAGC
TTCCACGGCCGTGTCAAAAGTACCTAGCCAGACACGAACACCTTTCTTGTTTGGGTCTCT
GATCTCAGCCGCGTACTTACCCCACGGTCTACGCCTCACGCCTCTGTAATGCCTATGATC
ATCCTCTTTAACCACCGGTGCAGTAGTAGGAACTAAAATGGTGGCAAGAGATGGCTTGCG
TTGGCTAAGAGTGGAGGTGGTGCTCTGATGGATGCTAGAAACGAAAGTCTCCAAGGAAGG
GGAATCGGTAAGGAGGTGTTGAGTTATGAGGTCCAAAGCTGATTGGTCTTGTGAAGAAGC
CATGAATGAAACTTTGGAGTCGTTGGTTTGTGGTTTTGATTGTGTTGTGTTGTGG
CC

QA 5 779 5 779
DS 

RD RS1AR31TFB 723 0 0
TACTCCGTCCCAAAACCCCATCCAACTTGACGGTGTCAACGGACAAGCCTCACCCTGAGC
TTCCGTCTCTTCCCTTTTCACAGCTTTATGGCAGATCAGGTTTATCCCACGGTCTTCATC
CTCTGTTTCTGGTCGCTTCCTCTTAGCTTTCAAAGCCACAGTCTTCTTGTTGTTGTCGTC
ATCTCCAGAGTCCTCGTGCTTACCTGCTTCGAGTGGGAAGTTAAGAATGGCTTT*GCTTC
CTCTTAGTTTAAAAGCAGCTCTGTCGTAACCTCTTGCAGCTTCCACGGCCGTGTCAAAAG
TACCTAGCCAGACACGAACACCTTTCTTGTTTGGGTCTCTGATCTCAGCCGCGTACTTAC
CCCACGGTCTACGCCTCACGCCTCTGTAATGCCTATGATCATCCTCTTTAACCACCGGTG
CAGTAGTAGGAACTAAAATGGTGGCAAGAGATGGCTTGCGTTGGCTAAGAGTGGAGGTGG
TGCTCTGATGGATGCTAGAAACGAAAGTCTCCAAGGAAGGGGAATCGGTAAGGAGGTGTT
GAGTTATGAGGTCCAAAGCTGATTGGTCTTGTGAAGAAGCCATAAATGAAACTTTGGAGT
CGTTGGTTTGTGGTTTTGATTGTGTTGTGTTGTGGACTTTTTGATTTGAGATTGGGGGAG
ATTATATAGAAGAAGGAAGTGAGACTGAGAAGTTTCGTAGTTAGCTTCTTCTTGGGTTTG
GCC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 4

CO CL1148Contig1 763 4 7 U
GGAAGCTATAACTGATTTGGTTTTGGAGTTTAGACAGAGTCTGTCGGTGAATATCGGGGG
GAAGATGGTGAAGTCTTCAGAGATCGTGAAGAAGCTGAATCTCAGGTCACACCAAGAAGG
TGGTTTCTTCTATGAAACGTTCAGAGATTCTTCTGTCATCCTCTCCACCTCTCATCTCCC
ACCCACCTTCAAGGTGGACAGAGCTGTGAGCACAAGCATCTACTTCTTGCTTCCATCTGG
TAACGTTTCACGTCTTCATCGCATTCCAATGGCTGAAACCTGGCACTTCTATTTGGGTGA
ACCCCTCACTGTAGTGGAGATCCACGACGATGGGAAGCTGAAATTCACGTGTCTTGGTCC
TGACCTGATTGAAGGCAACCAGAAGCCTCAGTACACTGTCCCTCCAAACATCTGGTTCGG
TTCGTTTCCGACAAAGGACTTTCATTTCCCTCATGAGGGGACTCTGCTTAGAACCGAGCC
TAGAGACTCTGAGAACCATTTCTCTCTTGTTGGATGCACCTGTGCTCCTGGTTTCCAGTT
TGAGGACTTCGAGCTTGCGAAACGCTCTCACCTCTTATCGCTGTTTCCTCAGCACGAGTC
GCTTATCACAATGCTCTCTTATCCTGAGTGAAGGAGGTAATGATAATAAAAAGAATGACA
CTCACTTCACTATGTTGTTTTGTTTCTTCAACACGTTACTTATGAATCATGCGAGGTTGT
AATTGTACTCTTTGATTTTACTTTTGAACTACCTTTCTTTGTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1B180TF U 1
AF RS1C657TF U 1
AF RS1C657JQ C 148
AF RS1B180JQ C 175
BS 1 688 RS1B180TF
BS 689 705 RS1C657TF
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RD RS1B180TF 688 0 0
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GAAGATGGTGAAGTCTTCAGAGATCGTGAAGAAGCTGAATCTCAGGTCACACCAAGAAGG
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ACCCCTCACTGTAGTGGAGATCCACGACGATGGGAAGCTGAAATTCACGTGTCTTGGTCC
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TTCGTTTCCGACAAAGGACTTTCATTTCCCTCATGAGGGGACTCTGCTTAGAACCGAGCC
TAGAGACTCTGAGAACCATTTCTCTCTTGTTGGATGCACCTGTGCTCCTGGTTTCCAGTT
TGAGGACTTCGAGCTTGCGAAACGCTCTCACCTCTTATCGCTGTTTCCTCAGCACGAGTC
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CTCACTTCACTATGTTGTTTTGTTTCTT

QA 1 688 1 688
DS 

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GGAAGCTATAACTGATTTGGTTTTGGAGTTTAGACAGAGTCTGTCGGTGAATATCGGGGG
GAAGATGGTGAAGTCTTCAGAGATCGTGAAGAAGCTGAATCTCAGGTCACACCAAGAAGG
TGGTTTCTTCTATGAAACGTTCAGAGATTCTTCTGTCATCCTCTCCACCTCTCATCTCCC
ACCCACCTTCAAGGTGGACAGAGCTGTGAGCACAAGCATCTACTTCTTGCTTCCATCTGG
TAACGTTTCACGTCTTCATCGCATTCCAATGGCTGAAACCTGGCACTTCTATTTGGGTGA
ACCCCTCACTGTAGTGGAGATCCACGACGATGGGAAGCTGAAATTCACGTGTCTTGGTCC
TGACCTGATTGAAGGCAACCAGAAGCCTCAGTACACTGTCCCTCCAAACATCTGGTTCGG
TTCGTTTCCGACAAAGGACTTTCATTTCCCTCATGAGGGGACTCTGCTTAGAACCGAGCC
TAGAGACTCTGAGAACCATTTCTCTCTTGTTGGATGCACCTGTGCTCCTGGTTTCCAGTT
TGAGGACTTCGAGCTTGCGAAACGCTCTCACCTCTTATCGCTGTTTCCTCAGCACGAGTC
GCTTATCACAATGCTCTCTTATCCTGAGTGAAGGAGGTAATGATAATAAAAAGA*TGACA
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AATTGTACTCTTT

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DS 

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GAGCACAAGCATCTACTTCTTGCTTCCATCTGGTAACGTTTCACGTCTTCATCGCATTCC
AATGGCTGAAACCTGGCACTTCTATTTGGGTGAACCCCTCACTGTAGTGGAGATCCACGA
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CCCTCATGAGGGGACTCTGCTTAGAACCGAGCCTAGAGACTTTGAGAACCATTTCTCTCT
TGTTGGATGCACCTGTGCTCCTGGTTTCCAGTTTGAGGACTTCGAGCTTGCGAAACGCTC
TCACCTCTTATCGCTGTTTCCTCAGCACGAGTCGCTTATCACAATGCTCTCTTATCCTGA
GTGAAGGAGGTAATGATAATAAAAAGAATGACACTCACTTCACTATGTTGTTTTGTTTCT
TCAACACGTTACTTATGAATCATGCGAGGTTGTAATTGTACTCTTTGATTTTACTTTTGA
ACTACCTTTCTTTGTT

QA 1 616 1 616
DS 

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TCTCCCACCCACCTTCAAGGTGGACAGAGCTGTGAGCACAAGCATCTACTTCTTGCTTCC
ATCTGGTAACGTTTCACGTCTTCATCGCATTCCAATGGCTGAAACCTGGCACTTCTATTT
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TGGTCCTGACCTGATTGAAGGCAACCAGAAGCCTCAGTACACTGTCCCTCCAAACATCTG
GTTCGGTTCGTTTCCGACAAAGGACTTTCATTTCCCTCATGAGGGGACTCTGCTTAGAAC
CGAGCCTAGAGACTCTGAGAACCATTTCTCTCTTGTTGGATGCACCTGTGCTCCTGGTTT
CCAGTTTGAGGACTTCGAGCTTGCGAAACGCTCTCACCTCTTATCGCTGTTTCCTCAGCA
CGAGTCGCTTATCACAATGCTCTCTTATCCTGAGTGAAGGAGGTAATGATAATAAAAAGA
ATGACACTCACTTCACTATGTTGTTTTGTTTCTTCAACACGTTACTTATGAATCATGCGA
GGTTGTAATTGTACTCTTTGATTTTACTTTTGAACTACCTTTCTTTGTT

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 6

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GTGAGTGAACTACTTACTGGTATCAAATGAAAGCTTGCGAGCTATTTCAGATTACAAAGA
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AAGTCTTTTCCATCACAACCTGGAAGTGCTATGGGAAGCTCGTTGTGCAGAACCTGCACA
AAGTACTTGGGAGAGGAAGGTGCAGGACAACTGTAGAGTACAAGCATGTTGTTCCCACCA
AAGGGGGCCATGGTGCTGCCTTTAAAGTCCCTGGTCTTAGGAGGCTGGGGAGGGAGTTCC
AATGGTTTCTCCTTCTGTATCTTCTCATACTCAGATCCACCTAGGAAGAGCCCAAGAAGA
CAAGAGAAGGGAACTATTGTTTCCGCATGTGCAAACCTAAGCCTTGCTTTTTCGTAGCTT
CCAGGTGGGAGCTTGTCTTCTCTGGCCTTGATAGCTTCTTCCATCGAATGCAAAACATCG
TCTAACAACGGAACTCCCATTTTGTAGTTCAAGGAGTTTCCATAACCTTCGAGGATAAAC
ACTTCCAAGTCATCTGCCCATTCCAGCAAAGCAACCTCAGATGGCGTGAAAAGTTCACAA
CTTTGATTCGTTACATTAAGCAATGATGCTTCCTGCTTGCAAAGAAACCAGAGAGAAGAA
ATGTCCTGTTTAGTGAAATTCAAATCATGTCTCTTTGCAACGGAAGCTGTAATCTTATCG
AGAACAGGCTCCTTGAGCTTATCCACAGCAGGCCCTTTAGCTTTCCTATAGCTCTTATAG
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GCGAACGCTCTATTACGACCAGGTCCAAGATCTCCTTTCTCACTGAACAACCCCATCCCA
AACGCCACAGCACTTGCAGACGCCCGAGGAATCTGAGTAGCTCTTATGGTGTAAACATCA
GGGTGATAATCCTCTTTGAACAAAGTCGGAAACCGTTCCCTGACTCTGATTCCAAGCTGG
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TCCTTTAACCTACCGGATAAATTCTCCAGTTCACGTAACCTTTTCTTGGTTGGAGAACGA
GTTCCATGCCTAGCCACAAGGTTAAGGTGGATAGGTGTACACTCACTGGGGATAGTTGAC
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TGATGACGAACATCAAAACCAACATGATCTGCCTCTGCGATAACGAATAAACAGAGCAGT
GTGATCCAAACAATCTTCTTCATCGCAATCGAATTTCGCGCTTTGTTGGGGGGGGTCAAA
GTTTCTGTCTTGTTTATAAAAA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E347JQ U 1
AF RS1D846JQ U 85
AF RS1AD02JQ U 84
AF RS1E347TF C 525
AF RS1AD02TF C 813
AF RS1D846TF C 1043
BS 1 283 RS1E347JQ
BS 284 284 RS1AD02JQ
BS 285 311 RS1E347JQ
BS 312 545 RS1AD02JQ
BS 546 546 RS1D846JQ
BS 547 849 RS1AD02JQ
BS 850 851 RS1AD02TF
BS 852 1258 RS1E347TF
BS 1259 1592 RS1AD02TF
BS 1593 1702 RS1D846TF

RD RS1E347JQ 311 0 0
GTAGAAAGGAACCAACAAAATGTTTTATCTTAGCAAGAATCAACATATGAGTTCTGACTA
GTGAGTGAACTACTTACTGGTATCAAATGAAAGCTTGCGAGCTATTTCAGATTACAAAGA
ACTGTGGCAAAGGGAGGACAAACAAAAGACCGACAACATTGCTCTATGTGATTTAAGGAA
AAGTTGTCAAGTAAATAAATAGTTATTTAGAGCTCGGCCTTTTGGCTCGACCCCAACAGC
CAACTCCACAAAGATTGATGCTTCTGTTTAGGGTCATCTAGATCAGCATTGCAGAGGTTG
TCAAAAGCATG

QA 1 311 1 311
DS 

RD RS1D846JQ 624 0 0
A
AATGAAAGCTTGCGAGCTATTTCAGATTACAAAGAACTGTGGCAAAGGGAGGACAAACAA
AAGACCGACAACATTGCTCTATGTGATTTAAGGAAAAGTTGTCAAGTAAATAAATAGTTA
TTTAGAGCTCGGCCTTTTGGCTCGACCCCAACAGCCAACTCCACAAAGATTGATGCTTCT
GTTTAGGGTCATCTAGATTAGCATTGCAGAGGTTGTCAAAAGCATGCTTGAGATGAGGGG
TCACCACTTTGGCCTTGAAATCTTCAAGAGGACAGAAGTCTTTTCCATCACAACCTGGAA
GTGCTATGGGAAGCTCGTTGTGCAGAACCTGCACAAAGTACTTGGGAGAGGAAGGTGCAG
GACAACTGTAGAGTACAAGCATGTTGTTCCCACCAAAGGGGGCCATGGTGCTGCCTTTAA
CGTCCCTGGTCTTAGGAGGCTGGGGAGGGAGTTCCAATGGTTTCTCCTTCCGTATCTTCT
CATACTCAGATCCACCTAGGAAGAGCCCAAGAAGACAAGAGAAGGGAACTATTGTTTCCG
CGTGTGCAAACCTAAGCCTTGCTTTTTCGTAGCTTCCAGGTGGGAGCTTATCTTCTCTGG
CCTTGATAGCTTCTTCCATCGAA

QA 2 624 2 624
DS 

RD RS1AD02JQ 776 0 0
CC
AATGTAAGCTTGCGAGCTATTTCAGATTACAAAGAACTGTGGCAAAGGGAGGACAAACAA
AAGACCGACAACATTGCTCTATGTGATTTGAGGAAAAGTTGTCAAGTAAATAAATAGTTA
TTTAGAGCTCGGCCTTTTGGCTCGACCCCAACAGCCAACTCCACAAAGATTGATGCTTCT
GTTTAGGGTCATCTAGATTAGCATTGCAGAGGTTGTCAAAAGCATGCTTGAGATGAGGGG
TCACCACTTTGGCCTTGAAATCTTCAAGAGGACAGAAGTCTTTTCCATCACAACCTGGAA
GTGCTATGGGAAGCTCGTTGTGCAGAACCTGCACAAAGTACTTGGGAGAGGAAGGTGCAG
GACAACTGTAGAGTACAAGCATGTTGTTCCCACCAAAGGGGGCCATGGTGCTGCCTTTAA
AGTCCCTGGTCTTAGGAGGCTGGGGAGGGAGTTCCAATGGCTTCTCCTTCTGTATCTTCT
CATACTCAGATCCACCTAGGAAGAGCCCAAGAAGACAAGAGAAGGGAACTATTGTTTCCG
CATGTGCAAACCTAAGCCTTGCTTTTTCGTAGCTTCCAGGTGGGAGCTTGTCTTCTCTGG
CCTTGATAGCTTCTTCCATCGAATGCAAAACATCGTCTAACAACGGAACTCCCATTTTGT
AGTTCAAGGAGTTTCCATAACCTTCGAGGATAAACACTTCCAAGTCATCTGCCCATTCCA
GCAAAGCAACCTCAGATGGCGTGAAAAGTTCACAACTTTGATTC
GTTACATTAA

QA 3 766 3 766
DS 

RD RS1E347TF 735 0 0
CTGGGGAGGGAGTTCCAATGGTTTCTC*TTCTGTATCTTCTCATACTCAGATCCAC*TAG
GAAGAGCCCAAGAAGACAAGAGAAGGGAACTATTGTTTCCGCATGTGCAAACCTAAGCCT
TGCTTTTTCGTAGCTTCCAGGTGGGAGCTTGTCTTCTCTGGCCTTGATAGCTTCTTCCAT
CGAATGCAAAACATCGTCTAACAACGGAACTCCCATTTTGTAGTTCAAGGAGTTTCCATA
ACCTTTGAGGATAAACACTTCCAAGTCATCTGCCCATTCCAGCAAAGCAACCTCAGATGG
CGTGAAAAGTTCACAACTTTGATTC**TACATTAAGCAATGATGCTTCCTGCTTGCAAAG
AAACCAGAGAGAAGAAATGTCCTGTTTAGTGAAATTCAAATCATGTCTCTTTGCAACGGA
AGCTGTAATCTTATCGAGAACAGGCTCCTTGAGCTTATCCACAGCAGGCCCTTTAGCTTT
CCTATAGCTCTTATAGTTTTGACAACACTCAAAAAACCTCAGCTTGGTATCACTAGCACG
GTTCTCACTAGTGACAGCGAACGCTCTATTACGACCAGGTCCAAGATCTCCTTTCTCACT
GAACAACCCCATCCCAAACGCCACAGCACTTGCAGACGCCCGAGGAATCTGAGTAGCTCT
TATGGTGTAAACATCAGGGTGATAATCCTCTTTGAACAAAGTCGGAAACCGTTCCCTGAC
TCTGATTCCAAGCT
C

QA 1 734 1 734
DS 

RD RS1AD02TF 780 0 0
CAA
CTCAGATGGCGTGAAAAGTTCACAACTTTGATTCGTTACATTAAGCAATGATGCTTC*TG
CTTGCAAAGAAACCAGAGAGAAGAAATGTCCTGTTTAGTGAAATTCAAATCATGTCTCTT
TGCAACGGAAGCTGTAATCTTATCGAGAACAGGCTCCTTGAGCTTATCCACAGCAGGCCC
TTTAGCTTTCCTATAGCTCTTATAGTTTTGACAACACTCAAAAAACCTCAGCTTGGTATC
ACTAGCACGGTTCTCACTAGCGACAGCGAACGCTCTATTACGACCAGGTCCAAGATCTCC
TTTCTCACTGAACAACCCCATCCCAAACGCCACAGCACTTGCAGACGCCCGAGGAATCTG
AGTAGCTCTTATGGTGTAAACATCAGGGTGATAATCCTCTTTGAACAAAGTCGGAAACCG
TTCCCTGACTCTGATTCCAAGCTGGTACAGCTCCTCCTCTCCTTGTTTGATCAGCTCCCC
GCCTTTCACTTTCCCTTGCCATGGAGATACCCATTTCCCTAACCATCCAGGGACTTTGTC
TGAAGCTTTTGCATCTCTTACAAGCTCCTTTAACCTACCGGATAAATTCTCCAGTTCACG
TAACCTTTTCTTGGTTGGAGAACGAGTTCCATGCCTAGCCACAAGGTTAAGGTGGATAGG
TGTACACTCACTGGGGATAGTTGACCCTACAATCAAATTTTGAGAGACTTCTTTTGAAAC
AGAGTATCTGGTGACGGTGGATAAGTGATGACGAACATCAAAACCAACATGATCTGC

QA 4 780 4 780
DS 

RD RS1D846TF 660 0 0
TCAGCTTGGTATCACTAGCACGGTTCTCACTAGTGACAGCGAACGCTCTATTACGACCAG
GTCCAAAATCTCCTTTCTCACTGAACAACCCCATCCCAAACGCCACAGCACTTGCAGACG
CCCGAGGAATCTGAGTAGCTCTTATGGTGTAAACATCAGGGTGATAATCCTCTTTGAACA
AAGTCGGAAACCGTTCCCTGACTCTGATTCCAAGCTGGTACAGCTCCTCCTCTCCTTGTT
TGATCAGCTCCCCGCCTTTCACTTTCCCTTGCCATGGAGATACCCATTTCCCTAACCATC
CAGGGACTTTGTCTGAAGCTTTTGCATCTCTTACAAGCTCCTTTAACCTACCGGATAAAT
TCTCCAGTTCACGTAACCTTTTCTTGGTTGGAGAACGAGTTCCATGCCTAGCCACAAGGT
TAAGGTGGATAGGTGTACACTCACTGGGGATAGTTGACCCTTCAATCAAATTTTGAGAGA
CTTCTTTTGAAACAGAGTATCTGGTGACGGTGGATAAGTGATGACGAACATCGAAACCAA
CATGATCTGCCTCTGCGATAACGAATAAACAGAGCAGTGTGATCCAAACAATCTTCTTCA
TCGCAATCGAATTTCGCGCTTTGTTGGGGGGGGTCAAAGTTTCTGTCTTGTTTATAAAAA

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 6

CO CL1150Contig1 853 6 17 U
GGAAGACAAGTAAAGCACAACAGAATCGCAAACACAACTGTCAAAGAGTTAAAGCTAAGC
AACCATTTTCACGCTCTCTTTTATATCATATCAATAAATAAATAAAAGCTATTCATCACC
CCGAAAGGAAAAGAAAAAATATCAAAAGAGAGTTCTCGAATCTGTTTCAATGGCGATTAA
CAACAAGCTTCCTCTTCTCCTTCTCTCTGTCATCATTCTCATCCTCAGTCGCCCTGTGGT
CAGTGACACTGATGAAGAGGACGTTCTTTTCACAGGCATCAACAGCTACAGAACATCACA
GAATCTCACAACCTTAAACAAGAACAAAAACGCAGAGTGTCTAGCCGACGAACTCGCCGA
TCAATTCAAGAACAAACCATGCACCAACGACACCGGCTCAGCCACAGTGCCTGGAACCGA
ACCACAGTTCTCAGATTACCCTAACATTCTAGCTAAATGCCACTTAAACGTCTCAGACAC
AAGAGACGGCTCTATTATGCCCGCATGTGTTCCTCGTCTAGAGTCAAGCCTCGTCCTCAC
AAACTTCACCAAGTCGCAATACTCCATGAGTTTGAACGATTCCAAGTTTACAGGGATGGG
CATCGGTAAGGAAGATGATTGGATCGTTGTGGTTCTCACCACCAGCACACCTGAAGGAAA
CTATTCTCCAGCTACAAAACAGGATTCCAATGGCTTCACCTTTAGTATTGGCCTCTTTAA
TTACTTGCTTGCTTTCACGTTGTCCTTCTGTTTCTTCCTCTGTTGATGAGAGTGACACCT
ACCACACATGTCATGAGTTTTTTTTT***GTCTCAAGAATAATTTTTGCTTATGTTATTT
ACTAAATTTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 15 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FW57TF U 1
AF RS1BT84JQ C 522
AF RS1E324TF U 116
AF RS1FW57JQ C 209
AF RS1BT84TF U 130
AF RS1E324JQ C 132
BS 1 138 RS1FW57TF
BS 139 139 RS1E324TF
BS 140 141 RS1FW57TF
BS 142 142 RS1E324TF
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BS 846 853 RS1E324JQ

RD RS1FW57TF 607 0 0
GGAAGACAAGTAAAGCACAACAGAATCGCAAACACAACTGTCAAAGAGTTAAAGCTAAGC
AACCATTTTCACGCTCTCTTTTATATCATATCAATAAATAAATAAAAGCTATTCATCACC
CCGAAAGGAAAAGAAAAA*TAACGAAAGAGAGTTCTCGAATCTGTTTCAATGGCGATTAA
CAACAAGCTTCCTCTTCTCCTTCTCTCTGTCATCATTCTCATCCTCAGTCGCCCTGTGGT
CAGTGACACTGATGAAGAGGACGTTCTTTTCACAGGCATCAACAGCTACAGAACATCACA
GAATCTCACAACCTTAAACAAGAACAAAAACGCAGAGTGTCTAGCCGACGAACTCGCCGA
TCAATTCAAGAACAAACCATGCACCAACGACACCGGCTCAGCCACAGTGCCTGGAACCGA
ACCACAGTTCTCAGATTACCCTAACATTCTAGCTAAATGCCACTTAAACGTCTCAGACAC
AAGAGACGGCTCTATTATGCCCGCGTGTGTTCCTCGTCTAGAGTCAAGCCTCGTCCTCAC
AAACTTCACCAAGTCGCAATACTCCATGAGTTTGAACGATTCCAAGTATACAGGGATGGG
GATTGGT

QA 1 600 1 600
DS 

RD RS1BT84JQ 258 0 0
AGTCAAGCCTCGTCCTCACAAACTTCACCAAGTCGCAATACTCCATGAGTTTGAACGATT
CCAAGTTTACAGGGATGGGCATCGGTAAGGAAGATGATTGGATCGTTGTGGTTCTCCCCA
CCAGTACACCTGAAGGAAACTATTCTCCAGCTACAAAACAGGATTCCAATGGCTTCACCT
TTAGTATTGGCCTCTTTAATTACTTGCTTGCTTTCACGTTGTCCTTCTGTTTCTTCCTCT
GTTGATGAGAGTGAC
CCC

QA 1 255 1 255
DS 

RD RS1E324TF 694 0 0
GG
ACCCCGAAAGGAAAAGAAAAAATATCAAAAGAGAGTTCTCGAATCTGTTTCAATGGCGAT
TAACAACAAGCTTCCTCTTCTCCTTCTCTCTGTCATCATTCTCATCCTCAGTCGCCCTGT
GGTCAGTGACACTGATGAAGAGAACGTTCTTTTCACAGGCATCAACAGCTACAGAACATC
ACAGAATCTCACAACCTTAAACAAGAACAAAAACGCAGAGTGTCTAGCCGACGAACTCGC
CGATCAATTCAAGAACAAACCATGCACCAACGACACCGGCTCAGCCACAGTGCCTGGAAC
CGAACCACAGTTCTCAGATTACCCTAACATTCTAGCTAAATGCCACTTAAACGTCTCAGA
CACAAGAGACGGCTCTATTATGCCCGCATGTGTTCCTCGTCTAGAGTCAAGCCTCGTCCT
CACAAACTTCACCAAGTCGCAATACTCCATGGGTTTGAACGATTCCAAGTTTACAGGGAT
GGGCATCGGTAAGGAAGATGATTGGATCGTTGTGGTTCTCACCACCAGCACACCCGAAGG
AAACTATTCTCCAGCTACAAAACAGGATTCCAATGGCTTCACCTTTAGTATTGGCCTCTT
TAATTACTTGCTTGCTTTCACGTTGTCCTTCTGTTTCTTCCTCTGTTGATGAGAGTGACA
CCTACCACACATGTCATGAGTTTTTTTTT
GTC

QA 3 691 3 691
DS 

RD RS1FW57JQ 628 0 0
GTCATCATTCTCATCCTCAGTCGCCCTGTGGTCAGTGACACTGATGAAGAGGACGTTCTT
TTCACAGGCATCAACAGCTACAGAACATCACAGAATCTCACAACCTTAAACAAGAACAAA
AACGCAGAGTGTCTAGCCGACGAACTCGCCGATCAATTCAAGAACAAACCATGCACCAAC
GACACCGGCTCAGCCACAGTGCCTGGAACCGAACCACAGTTCTCAGATTACCCTAACATT
CTAGCTAAATGCCACTTAAACGTCTCAGACACAAGAGACGGCTCTATTATGCCCGCGTGT
GTTCCTCGTCTAGAGTCAAGCCTCGTCCTCACAAACTTCACCAAGTCGCAATACTCCATG
AGTTTGAACGATTCCAAGTATACAGGGATGGGGATTGGTAAGGAAGATGATTGGATCGTT
GTGGTTCTCACCACCAGCACACCTGAAGGAAACTATTCTCCAGCTACAAAACAGGATTCA
AGTGGCTTCATCTTTAGTATTGGCCTCTTTAATTACTTTCTTGCTTTCACGTTGTCCTTC
TGTTTCTTCCTCTGTTGATGAGAGTGACACCTACCACACATGTCATGAGTTTTTTTTT**
*GTCTCAAGAATAATTTTTGCTTATG
CT

QA 1 626 1 626
DS 

RD RS1BT84TF 716 0 0
GGAGA
AAAAATATCAAAAGAGAGTTCTCGAATCTGTTTCAATGGCGATTAACAACAAGCTTCCTC
TTCTCCTTCTCTCTGTCATCATTCTCATCCTCAGTCGCCCTGTGGTCAGTGACACTGATG
AAGAGGACGTTCTTTTCACAGGCATCAACAGCTACAGAACATCACAGAATCTCACAACCT
TAAATAAGAACAAAAACGCAGAGTGTCTAGCCGACGAACTCGCCGATCAATTCAAGAACA
AACCATGCACCAACGACACCGGCTCAGCCACAGTGCCTGGAACCGAACCACAGTTCTCAG
ATTACCCTAACATTCTAGCTAAATGCCACTTAAACGTCTCAGACACAAGAGACGGCTCTA
TTATGCCCGCACGTGTTCCTCGTCTAGAGTCAAGCCTCGTCCTCACAAACTTCACCAAGT
CGCAATACTCCATGAGTTTGAACGATTCCAAGTTTACAGGGATGGGCATCGGTAAGGAAG
ATGATTGGATCGTTGTGGTTCTCACCACCAGTACACCTGAAGGAAACTATTCTCCAGCTA
CAAAACAGGATTCCAATGGCTTCACCTTTAGTATTGGCCTCTTTAATTACTTGCTTGCTT
TCACGTTGTCCTTCTGTTTCTTCCTCTGTTGATGAGAGTGACACCTACCACACATGTCAT
GAGTTTTTTTTTTTTGTCTCAAGAATAATTTTTGCTTATGTTATTTACTAA

QA 6 716 6 716
DS 

RD RS1E324JQ 722 0 0
AGA
AAAAATATCAAAAGAGAGTTCTCGAATCTGTTTCAATGGCGATTAACAACAAGCTTCCTC
TTCTCCTTCTCTCTGTCATCATTCTCATCCTCAGTCGCCCTGTGGTCAGTGACACTGATG
AAGAGAACGTTCTTTTCACAGGCATCAACAGCTACAGAACATCACAGAATCTCACAACCT
TAAACAAGAACAAAAACGCAGAGTGTCTAGCCGACGAACTCGCCGATCAATTCAAGAACA
AACCATGCACCAACGACACCGGCTCAGCCACAGTGCCTGGAACCGAACCACAGTTCTCAG
ATTACCCTAACATTCTAGCTAAATGCCACTTAAACGTCTCAGACACAAGAGACGGCTCTA
TTATGCCCGCATGTGTTCCTCGTCTAGAGTCAAGCCTCGTCCTCACAAACTTCACCAAGT
CGCAATACTCCATGGGTTTGAACGATTCCAAGTTTACAGGGATGGGCATCGGTAAGGAAG
ATGATTGGATCGTTGTGGTTCTCACCACCAGCACACCCGAAGGAAACTATTCTCCAGCTA
CAAAACAGGATTCCAATGGCTTCACCTTTAGTATTGGCCTCTTTAATTACTTGCTTGCTT
TCACGTTGTCCTTCTGTTTCTTCCTCTGTTGATGAGAGTGACACCTACCACACATGTCAT
GAGTTTTTTTTT***GTCTCAAGAATAATTTTTGCTTATGTTATTTACTAAATTTCTTC

QA 4 722 4 722
DS 



AS 2 6

CO CL1151Contig1 1077 4 15 U
GAGAGGGTTTGGTTTTGTTGCTTTCTCCAGTCCTGAAGAAGCTTTGAGAGCTTTGAATGA
AATGAATGGGAAGATGATAGGAAGGAAACCTCTTTACATTGCATTTGCTCAACGCAAGGA
AGAGAGGAGGACTCATCTTCAGACTGTGTTTTCTATGAGACCAAATGTACCAATGGGTGG
GTTTCATCATCACCCAACAGGAGGGCCAGCTGGAGGGCCACACCATCAAATGTACATGGG
CCAGAACGGTCAAGGTATGGTGCCTTCACAGCCTATGGGGTATGGGTACCAACTTCAGTT
CATGCCTGGGGTGCGTCCGGGTGCTGGCCCGGCTAACTACATGATGCCTTACCCTCTTCA
GAGGCAAAACCACCCTGGTCCCCGTGTTGGATTCAGGCGTGGTGCTCCTAACATGCAGCA
CCACTTCCAGCAGCAGCAACAAATTATGCAGCACAATGGAAGATACATGGGAGGTGTGGG
TAATATGATGAATCGTGTGGAAGCATCTGCTCCACAAGGCATCATACCATTGGATGCATC
TGCGATCTCTCACAATGCTTCTCAAAACCAACAGAGGCCAGCTCTCCTCCCCATTTCTAA
GCTCACTTCTGCCTTGGCATTGGCTAGCCCTGCCAATCACTCACAGATTCTTGGAGAGCA
GCTTTACCCACTTGTGGAAAAGCAGGAGCCAGTTCATGTGGCCAAAGTGACAGGGATGTT
GCTGGAGATGGACCAAGCTGAGATCTTGCACCTTCTTGAGTCACCTGAAGCTCTTAAGGC
CAAAGTGGCTATGGCTCTGGATGTACTCAGGCTCTCTGCTAATCCGACAGCTGTTTCTTC
CGTTGATGATCAGTTTGCTCCCTCCTCAACGGAGTGAAATGAGTTATTACCCAAAGAAAA
AGACAATGTTTCTTCTCGATTTTATTAGACTATGCGCTTTGAAATTTTTAGGACTTATTT
AACCAGTTTTTCTTCTCGTTTGCAACTTTTAGTTGCATTGGATTTTCTTTTCTTTTAAGA
CTTGTAGTTCTTTTTTTTTCTTGAGTCTATCTAATGATTCAACTCTTTTGGACCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GA11TF U 70
AF RS1CT70TF U 1
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AF RS1BA40JQ C 437
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GACTCATCTTCAGACTGTGTTTTCTATGAGACCAAATGTACCAATGGGTGGGTTTCATCA
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GGTGCGTCCGGGTGCTGGCCCGGCTAACTAC*TGATGCCTTACCCTCTTCAGAGGCAAAA
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GAATCGTGTGGAAGCATCTGCTCCACAAGGCATCATACCATTGGATGCATCTGCGATCTC
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TGCCTTGGCATTGGCTA

QA 1 557 1 557
DS 

RD RS1CT70TF 681 0 0
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AATGAATGGGAAGATGATAGGAAGGAAACCTCTTTACATTGCATTTGCTCAACGCAAGGA
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GTTTCATCATCACCCAACAGGAGGGCCAGCTGGAGGGCCACACCATCAAATGTACATGGG
CCAGAACGGTCAAGGTATGGTGCCTTCACAGCCTATGGGGTATGGGTACCAACTTCAGTT
CATGCCTGGGGTGCGTCCGGGTGCTGGCCCGGCTAACTACATGATGCCTTACCCTCTTCA
GAGGCAAAACCACCCTGGTCCCCGTGTTGGATTCAGGCGTGGTGCTCCTAACATGCAGCA
CCACTTCCAGCAGCAGCAACAAATTATGCAGCACAATGGAAGATACTTGGGAGGTGTTGG
TAATATGATGAATCGTGTGGAAGCATCTGCTCCACAAGGCATCATACCATTGGATGCATC
TGCGATCTCTCACAATGGTTCTCAAAACCAACAGAGGCCAGCTCTCCTCCCCATTTCTAA
GCTCACTTCTGCCTTGGCATTGGCTAGCCCTGCCAATCACTCGCAGATTCTTGGAGAGCA
GCTTTACCCACTTGTGGAAAA

QA 1 681 1 681
DS 

RD RS1A457JQ 799 0 0
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CCCGGCTAACTACATGATGCCTTACCCTCTTCAGAGGCAAAACCACCCTGGTCCCCGTGT
TGGGTTCAGGCGTGGTGCTCCTAACATGCAGCACCACTTCCAGCAGCAGCCACAAATTAT
GCAGCACAATGGAAGATATATGGGAGGTGTGGGTAATATGATGAATCGTGTGGAAGCATC
TGCTCCACAAGGCATCATACCATTGGATGCATCTGCGATCTCTCACAATGCTTCTCAAAA
CCAACAGAGGCCAGCTCTCCTCCCCATTTTTAAGCTCACTTCTGCCTTGGCATTGGCTAG
CCCTGCCAATCACTCACAGATTCTTGGAGAGCAGCTTTACCCACTTGTGGAAAAGCAGGA
GCCAGTTCATGTGGCCAAAGTGACAGGGATGTTGCTGGAGATGGACCAAGCTGAGATCTT
GCACCTTCTTGAGTCACCTGAAGCTCTTAAGGCCAAAGTGGCTATGGCTCTGGATGTACT
CAGGCTTTCTGCTAATCCGACAGCTGTTTCTTCCGTTGATGATCAGTTTGCTCCCTCCTC
AACGGAGTGAAATGAGTTATTACCCAAAGAAAAAGACAATGTTTCTTCTCGATTTTATTA
GACTATGCGCTTTGAAATTTT*AGGACTTATTTAACCAGTTTTTCTTCTCGTTTGCAACT
TTTAGTTGCATTGGATTTTCTTTTCTTTTAAGACTTGTAGTTCTTTTTTTTTCTTGAGTC
TATCTAATGATTCAACTC
C

QA 1 798 1 798
DS 

RD RS1BA40JQ 641 0 0
CC
ACAAATTATGCAGCACAATGGAAGATATATGGGAGGTGTGGGTAATATGATGAATCGTGT
GGAAGCATTTGCTCCACAAGGCATCATACCATTGGATGCTTCTGCGATCTCTCACAATGC
TTCTCAAAACCAACAGAGGCCAGCTCTCCTCCCCATTTCTAAGCTCACTTCTGCCTTGGC
ATTGGCTAGCCCTGCCAATCACTCACAGATTCTTGGAGAGCAGCTTTACCCACTTGTGGA
AAAGCAGGAGCCAGTTCATGTGGCCAAAGTGACAGGGATGTTGCTGGAGATGGACCAAGC
TGAGATCTTGCACCTTCTTGAGTCACCTGAAGCTCTTAAGGCCAAAGTGGCTATGGCTCT
GGATGTACTCAGGCTCTCTGCTAATCCGACAGCTGTTTCTTCCGTTGATGATCAGTTTGC
TCCCTCCTCAACGGAGTGAAATGAGTTATTACCCAAAGAAAAAGACAATGTTTCTTCTCG
ATTTTATTAGACTATGCGCTTTGAAATTTTTAGGACTTATTTAACCAGTTTTTCTTCTCG
TTTGCAACTTTTAGTTGCATTGGATTTTCTTTTCTTTTAAGACTTGTAGTTCTTTTTTTT
TCTTGAGTCTATCTAATGATTCAACTCTTTTGGACCATC

QA 3 641 3 641
DS 



CO CL1151Contig2 768 2 6 U
GGTTCAAAAGAGTTGAATCATTAGATAGACTCAAGAAAGGAAAAAACTACAAGTCTTAAA
AGAAAAGAAAAATCCAATGAAAACTAAAAGTTGCAAAACGAGAAGAAAAACTAGTTAAAT
AGGTCCTAAAAATTTCAAAGCGCATAGTCTAATAAAAGCCAGAAGAAACATTGTCTTTTT
CTTTGGGGCAATAACTCATTTCACTCCGTTGAGGAGGGAGCAAACTGATCATCAACGGAA
GAAACAGCAGTCGGATTAGCAGAAAGCCTGAGTACATCCAAAACCATAGCCACTTTGGCC
TTAAGAGCTTCAGGTGACTCAAGAAGGTGCAAGATCTCAGCTTGGTCCATCTCCAGCAAC
ATCCCGGTAACTTTGGCCACATGAACTGGCTCCTGCTTTTCCACAAGTGGGTAAAGCTGC
TCTCCAAGAATCTGCGAGTGATTGGCAGGGCTAGCCAATGCCAAGGCAGAAGTGAGCTTA
AAAATGGGGAGGAGAGCTGGCCTCTGTTGGTTTTGAGAACCATTGTGAGAGATCGCAGAT
GCATCCAATGGTATGATGCCTTGTGGAGCAAATGCTTCCACACGATTCATCATATTACCA
ACACCTCCCAAGTATCTTCCATTGTGCTGCATAATTTGTTGCTGCTGCTGGAAGTGGTGC
TGCATGTTAGGAGCACCACGCCTGAATCCAACACGGGGACCAGGGTGGTTTTGCCTCTGA
AGAGGGTAAGGCATCATGTAGTTAGCCGGGCCAGCACCCGGACGCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GA11JQ U 1
AF RS1CT70JQ U 41
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QA 1 536 1 536
DS 

RD RS1CT70JQ 728 0 0
AAAA
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CTGCTGGAAGTGGTGCTGCATGTTAGGAGCACCACGCCTGAATCCAACACGGGGACCAGG
GTGGTTTTGCCTCTGAAGAGGGTAAGGCATCATGTAGTTAGCCGGGCCAGCACCCGGACG
CACC

QA 5 728 5 728
DS 



AS 1 5

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AATTCATTTTCAACGTTGAAGCTTCTAGAGATTCGATTAGGTTTCAAATTTTGTAAGAAT
CTCTGTTCAATTTGTCTCGTGGTGGTCGGATTGAATCGGTAGGGTATGGCTCAAGCTGTA
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ACCACCGTCGGATGTTCCCTCGAGATTATATCTCCTTATAACCTATACCTAAACCCTACT
CTTGTGGTGAAGCAATACCAGTTCTGGCGCCTCGTTACTAACTTCCTTTACTTCCGTAAC
ATGGATTTGGACTTCTTGTTCCATATGTTCTTCCTTGCTAGATACTGCAAACTTCTTGAA
GAAAACTCCTTCAGGGGAAAGACTGCTGATTTCCTTTACATGCTCTTATTCGGAGCAACT
GTTCTCACCGGTATTGTTCTCGTTGGTGGGATGATACCTTACTTGTCCGTCTCTTTCTCC
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AACCCTTACATCCACATGAGTTTCCTTGGCCTTTTCACTTTTACTGCAGCGTATTTACCA
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TAGTTTTGTTTTCTCCTTTGTCTGACATATATGTGTTTACCTCCTTGTGCATATAAGAAC
GTAAACTGTGTACACAGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BH28TF U 93
AF RS1A672TF U 1
AF RS1AL81TF U 155
AF RS1AL81JQ C 768
AF RS1A672JQ C 550
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TTTCACTTTTACTGCAGCGTATTTACCATGGGTGCTTCTTGGGTTCTCTGTCCTTGTTGG
TGCAAGTCCCTGGGGGGATTTACTGGGAATGATAG

QA 1 635 1 635
DS 

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CTCTGTTCAATTTGTCTCGTGGTGGTCGGATTGAATCGGTAGGGTATGGCTCAAGCTGTA
GAAGAATGGTACAAACAGATGCCGATCATAACCCGGTCGTATTTGACGGCGGCTGTTGTC
ACCACCGTCGGATGTTCCCTCGAGATTATATCTCCTTATAACCTATACCTAAACCCTACT
CTTGTGGTGAAGCAATACCAGTTCTGGCGCCTCGTTACTAACTTCCTTTACTTCCGTAAC
ATGGATTTGGACTTCTTGTTCCATATGTTCTTCCTTGCTAGATACTGCAAACTTCTTGAA
GAAAACTCCTTCAGGGGAAAGACTGCTGATTTCCTTTACATGCTCTTATTCGGAGCAACT
GTTTTCACCGGTATTGTTCTCGTTGGTGGGATGATACCTTACTTGTCCGTCTCTTTCTCC
AAAATCATCTTCCTCAGCAACTCTTTGACCTTCATGATGGTCTATGTATGGAGCAAGCAA
AACCCTTACATCCACATGAGTTTCCTTGGCCTTTTCACTTTTACTGCAGCGTATTTACCA
TGGGTGCTTCTTGGGTTCTCTGTCCTTGTTGGTGCAAGTCCCTGGGGGGATTTACTGGGA
ATGATAGCAG*TCACGCGTACTACTTCTTGGCATTTGTGTATCCACGAATGACTGATAGA
CGACCCTTGAAGACTCCATCTTTCC

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DS 

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CTTATAACCTATACCTAAACCCTACCCTTGTGGTGAAGCAATACCAGTTCTGGCGCCTCG
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TACCTTACTTGTCCGTCTCTTTCTCCAAAATCATCTTCCTCAGCAACTCTTTGACTTTCA
TGATGGTCTATGTATGGAGCAAACATAACCCTTACATCCACATGAGTTTCCTTGGCCTTT
TCACTTTTACTGCAGCGTATTTACCATGGGTTCTTCTTGGGTTCTCTGTCCTTGTTGGTG
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CCTTTGATGAAATCCACCAAGACTGAATCTTTATCGTCCACACAAACACAGTTCAAGTCT
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ATC

QA 1 831 1 831
DS 

RD RS1AL81JQ 261 0 0
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TGGAAGTGTTTGTTAGTTTT
T

QA 1 260 1 260
DS 

RD RS1A672JQ 551 0 0
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CTTGGGTTTTCTGTCCTTGTTGGTGCAAGTCCCTGGGGGGATTTACTGGGAATGATAGCA
GGTCACGCGTACTACTTCTTGGCATTTGTGTATCCACGAATGACTGATAGACGACCCTTG
AAGACTCCATCTTTCCTCAAAGCCCTATTCGCTGATGAGCCTGTCGTTGTTGCACGGCCA
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GTCCACAGAAAAACAGTTCAAGTCTGTTCAGATCATGTTAAAAGGGCAAATGATGTAACT
CACTCATTGACTCTTGTTCTACATAGTTGTTGATAATGTGGAAGTTTTTGTTAGTTTTGT
TTTCTCCTTTGTCTGACATATATGTGTTTACCTCCTTGTGCATATAAGAACGTAAACTGT
GTACACAGTCT

QA 1 551 1 551
DS 



AS 1 6

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ATGATAAGCTTCTTGAGAACAATGGTTGAATTCTCAAGATGAATACACTACGAAGGGTAA
TAGAAGAAACAATATTAGCATTAAGGAAACAGTGAGCTTGATGGGATGATTAAATGATAA
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TGTCCTTCTTGTCCCAGCTGTTTTCTCTGCATTTCTTGGTTTTATGCTTTCTTGAATGTC
TATGACACATTCAGAGCCATTACAGTTACCTGTAACTTCAGCTATACTCGACTTGACGCT
GCTCTCACTACTAAAGCTATGTGAGGCTAAAGAAGATCCAGAGAGAAACATGGCCAAGTC
GTCTCGCTCTTCTTCACTGAGATTAACCCAACGGAGAGGTTCTTTTCCATTCTCACTGTA
AGTTTCTTGGACAGAGGTTTCAACGCGATGAATCTGGTTTTCTATAGCGGCAACAAACTG
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TTTCTCAAACTCCTCTAACTGCCATTTAGCAGTACCCAAAGCTGCTTGAAGCTCCTTAAA
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CTTTTGTACTTCTTCAGCTGCAGAGAAGAAAACATCCTTTTGCCATAAATCGAAGCTGTT
AACTACCATCATCGTCGTCACAAAGAAGAAGGTACGAGCAAGATAATCAAAAAGAAGTTT
TTTCTCGGATATGATTTGCAGTGTATCCAAACAGATTCTTCTTCTCTGAAATCTCCTCTC
TTCTTCCCTCTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 
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35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AACC

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TCTTGAATGTCTATGACACATTCAGAGCCATTACAGTTACCTCTAACTTCAGCTATACTC
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C

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TCTCAAACTCCTCTAACTGCCATTTAGCAGTACCCAAAGCTGCTTGAAGCTCCTTAAAGA
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*CTCGGATATGATTTGCAGTGTATCCAAACAGATTCTTCTTCTCTGAAATCTCCTCTCTT
CTTCCCTCTTTCT

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TTCTTGGACAGAGGTTTCAACGCGATGAATCTGGTTTTCTATAGCGGCAACAAACTGTTT
GTGCCGTGTGGTGGATGTAGAATCATCCCCACACTGTCTATGGCTCAATCTTACTGCTTT
CTCAAACTCCTCTAACTGCCATTTAGCAGTACCCAAAGCTGCTTGAAGCTCCTTAAAGAT
GTCATCTTTCTTCTCTCTAATCCACAATCTATAAGCAGATTCCATTATATCTGCAGACTT
TTGTACTTCTTCAGCTGCAGAGAAGAAAACATCCTTTTGCCATAAATCGAAGCTGTTAAC
TACCATCATCGTCGTCACAAAGAAGAAGGTACGAGCAAGATAATCAAAAAGAAGTTTTTT
CTCGGATATGATTTGCAGTGTATCCAGACAGATTCTTCTTCTCTGAAATCTCCTCTCTTC
TTCCCTCT
CC

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DS 



AS 1 4

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GCGTTTTCTTCACACCGTTTCCAGTGATTTCTTCAAGCAGATGATCTGAGCCGATACCAT
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AGTTCAAAGATAAGTCTCTTACCTCTTTCTCAGATTTAGTTTTATTTCTGATTTAATGTA
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GGTACGCCTAGGAAACGTTCCCGACTCATGTAAGGTGAACCAGGGACGGCATGGCTTAAG
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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BE40TF U 1
AF RS1EY19TF U 4
AF RS1EY19JQ C 245
AF RS1BE40JQ C 197
BS 1 61 RS1BE40TF
BS 62 62 RS1EY19TF
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BS 198 652 RS1BE40TF
BS 653 698 RS1EY19TF
BS 699 967 RS1BE40JQ

RD RS1BE40TF 656 0 0
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GTGTTTTCTTCACACCGTTTCCAGTGATTTCTTCAAGCAGATGATCTGAGCCGATACCAT
CCTTTCCCATCCGTCAACAATCTCCATCTTTTCTCCCTTCATCTCGTCACTTCCGTTCCT
CGCATCCTCCTGTC***AGTCTCACGAGGGAGTTCGGCGGTGTTCAAGCTCGAGGGAGAA
GATGGAGTCGCGGGAGAGAAGATAGATTTGGTTCAGAGACGAGGGAGGAGATGGAGTTGG
AGTTCAAAGATAAGTCTCTTACCTCTTTCTCAGATTTAGTTTTATTTCTGATTTAATGTA
TTGATTATGGAGGAAACCACAGTATTTGGTCTATGGGCTGGAAAAGGGACAATTTGTTGC
AGAAATTGTAGCGATTTCGGCAGTTCAACATGGAGCTATGAGGCAACATGGAACTCTCAC
TTGGGAGGCAAGGATGAAGATCCTTATCGGCACTGCACAAGCATATGTAGCGCCAGAATA
TGCTAACTCAGGCCTGTTAAACGAAAAGAGTGATATATACAGCTTTGGTGTTTTGCTTCT
TGAAGCTGTAACTCGACGAGATCCGGTTGATTATGGACGTCCTGCTAATGAG
TTGC

QA 1 652 1 652
DS 

RD RS1EY19TF 695 0 0
GG
GAAACCCTAAGCGCCGTTGTCTCTCTGTCTCTCTCTCGCGGGTGGGCGATTTCTGGCGTT
TTCTTCACACCGTTTCCAGTGATTTCTTCAAGCAGATGATCTGAGCCGATACCATCCTTT
CCCATCCGTCAACAATCTCCATCTTTTCTCCCTTCATCTCGTCACTTCCGTTCCTCGCAT
CCTCCTGTCCAGAGTCTCACGAGGGAGTTCGGCGGTGTTCAAGCTCGAGGGAGAAGATGG
AGTCGCGGGAGAGAAGATAGATTTGGTTCAGAGACGAGGGAGGAGATGGAGTTGGAGTTC
AAAGATAAGTCTCTTACCTCTTTCTCAGATTTAGTTTTATTTCTGATTTAATGTATTGAT
TATGGAGGAAACCACAGTATTTGGTCTATGGGCTGGAAAAGGGACAATTTGTTGCAGAAA
TTGTAGCGATTTCGGTAGTTCAACATGGAGCTATGAGGCAACATGGAACTCTCACTTGGG
AGGCAAGGATGAAGATCCTTATCGGCACTGCACAAGCATATGTAGCGCCAGAATATGCTA
ACTCAGGCCTGTTAAACGAAAAGAGTGATATATACAGCTTTGGTGTTTTGCTTCTTGAAG
CTGTAACTCGACGAGATCCGGTTGATTATGGACGTCCTGCTAATGAGGTTGCACAGGTAC
GCCTCTTGGGTGCCGTCTCGCGTACCGGGTTCG

QA 3 695 3 695
DS 

RD RS1EY19JQ 640 0 0
GAGTCGCGGGAGAGAAGATAGATTTGGTTCAGAGACGAGGGAGGAGATGGAGTTGGAGTT
CAAAGATAAGTCTCTTACCTCTTTTTCAGATTTAGTTTTATTTCTGATTTAATGTATTGA
TTATGGAGGAAACCACAGTATTTGGTCTATGGGCTGGAAAAGGGACAATTTGTTGCAGAA
ATTGTAGCGATTTCGGTAGTTCAACATGGAGCTATGAGGCAACATGGAACTCTCACTTGG
GAGGCAAGGATGAAGATCCTTATCGGCACTGCACAAGCATATGTAGCGCCAGAATATGCT
AACTCAGGCCTGTTAAACGAAAAGAGTGATATATACAGCTTTGGTGTTTTGCTTCTTGAA
GCTGTAACTCGACGAGATCCGGTTGATTATGGACGTCCTGCTAATGAGGTTGCACAGGTA
CGCCTCTTGGGTGCCGTCTCGCGTACCGGGTTCGGCAGGGGGACGGGTACGTCTCGGGTA
CGCCTAGGAAACGTTCCCGACTCATGTAAGGTGAACCAGGGACGGCATGGCTTAAGGGGG
ACGGGTTTGGTCAGAGATGGGAGACGTCTCAGAGACGTATCCGTTGATTTTTGTGTTAAG
AAAAAATTGTTTATCAAATATTAATAGTCTCTTTCACTTC

QA 1 640 1 640
DS 

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C
AGTCTCACGAGGGAGTTCGGCGGTGTTCAAGCTCGAGGGAGAAGATGGAGTCGCGGGAGA
GAAGATAGATTTGGTTCAGAGACGAGGGAGGAGATGGAGTTGGAGTTCAAAGATAAGTCT
CTTACCTCTTTCTCAGATTTAGTTTTATTTCTGATTTAATGTATTGATTATGGAGGAAAC
CACAGTATTTGGTCTATGGGCTGGAAAAGGGACAATTTGTTGCAGAAATTGTAGCGATTT
CGGCAGTTCAACATGGAGCTATGAGGCAACATGGAACTCTCACTTGGGAGGCAAGGATGA
AGATCCTTATCGGCACTGCACAAGCATATGTAGCGCCAGAATATGCTAACTCAGGCCTGT
TAAACGAAAAGAGTGATATATACAGCTTTGGTGTTTTGCTTCTTGAAGCTGTAACTCGAC
GAGATCCGGTTGATTATGGACGTCCTGCTAATGAGGTTGCACAGGTACGCCTCTTGGGTG
CCGTCTCGCGTACCGGGTTCGGCAGGGGGACGGGTACGTCTCGGGTACGCCTAGGAAACG
TTCCCGACTCATGTAAGGTGAACCAGGGACGGCATGGCTTAAGGGGGACGGGTTTGGTCA
GAGATGGGAGACGTCTCAGAGACGTATCCGTTGATTTTTGTGTTAAGAAAAAATTGTTTA
TCAAATATTAATAGTCTCTTTCACTTCCACATTGTTCTCTTCAATTCTCCTACTTATATG
TCTTTCTCTTTTGACTCTCAACTATATCTCACGTAAGCATGTTCCTTCTT

QA 2 771 2 771
DS 



AS 2 6

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CCTAAAAATTTCTAAACTCTGGGAGATGGAAACACATTCATTTCCTTGGACACAGAAACA
AACAAGTCCACAGGGATTTTGTCTTTATGTGAAAGGCAAAAAAAAAAAAACTCTGTGGCA
AATCCTTATTTGCTTCTTCTCTTGGAGGTTTGTTTTTTGTTCTTCTCAGTGGCAGTAGCA
GTAGCAACTGGTGGAGACGTCCCTTGTTGAGGATCATCATCAGGTAAAACGGTATGAAAA
AACTTTTTAAAGGAACCAACTTGGTTGCAAATTAACTTGAGCATCTTCCTCCCTCTCATC
CATTTCAGCATCAGCTTCATATGCGTCTTGCTGTTCAATCCACTCACCCCAGCTTCCTGA
GCGCGGAGCCAAGTGTTGGGAACGGAAAAAGGTCCATGTTTCTTGAAAACGTCGTAAAAA
GAGCTGGAAATGGTGTGAGCTTCTTGGATCGAGACCTTAGGGTTTATCTTCCTCACGTTT
ACAGCTCGCTCTCTCGACATGTATCTCACTGACAACAAAAAGTTATGGCTCATCTCGTTC
TCGAAAACAGTCGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DI67JQ U 1
AF RS1FS47JQ U 8
BS 1 261 RS1DI67JQ
BS 262 262 RS1FS47JQ
BS 263 299 RS1DI67JQ
BS 300 300 RS1FS47JQ
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BS 331 334 RS1DI67JQ
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BS 449 449 RS1FS47JQ
BS 450 472 RS1DI67JQ
BS 473 615 RS1FS47JQ

RD RS1DI67JQ 472 0 0
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CCTAAAAATTTCTAAACTCTGGGAGATGGAAACACATTCATTTCCTTGGACACAGAAACA
AACAAGTCCACAGGGATTTTGTCTTTATGTGAAAGGCAAAAAAAAAAAAACTCTGTGGCA
AATCCTTATTTGCTTCTTCTCTTGGAGGTTTGTTTTTTGTTCTTCTCAGTGGCAGTAGCA
GTAGCAACTGGTGGAGACGTCTCTTGTTGAGGATCATCATCAGGTAAAACGGTATGAAAG
AACTTTTTAGAGGAACCAACTTGGTTGCAGATTATCTTGAGCATCTTCCTCCCTCTCATC
CATTTCAGCATCAGCTTCATATGCGTCTTGCTGTTCAATCCACTCACCCCAGCTTCCTGA
GCGCGGAGCCAAGTGTTGGGAACGGAAAGAGGTCCATGTTTCTTGAAAACGT

QA 1 472 1 472
DS 

RD RS1FS47JQ 608 0 0
AAATTGATGTTTCTC
TTATTCATAGGGAACAGAGCAAAAGGATGGAAACAAACCCTAAAAATTTCTAAACTCTGG
GAGATGGAAACACATTCATTTCCTTGGACACAGAAACAAACAAGTCCACAGGGATTTTGT
CTTTATGTGAAAGGCAAAAAAAAAAA**CTCTGTGGCAAATCCTTATTTGCTTCTTCTCT
TGGAGGTTTGTTTTTTGTTCTTCTCAGTGGCAGTAGCAGTAGCAACTGGTGGAGACGTCC
CTTGTTGAGGATCATCATCAGGTAAAACGGTATGAAAAAACTTTTTAAAGGAACCAACTT
GGTTGCAAATTAACTTGAGCATCTTCCTCCCTCTCATCCATTTCAGCATCAGCTTCATAT
GCGTCTTGCTGTTCAATCCACTCACCCCAGCTTCCTGAGCGCGGAGCCAAGTGTTGGGAA
CGGAAAAAGGTCCATGTTTCTTGAAAACGTCGTAAAAAGAGCTGGAAATGGTGTGAGCTT
CTTGGATCGAGACCTTAGGGTTTATCTTCCTCACGTTTACAGCTCGCTCTCTCGACATGT
ATCTCACTGACAACAAAAAGTTATGGCTCATCTCGTTCTCGAAAACAGTCGCC

QA 16 608 16 608
DS 



CO CL1155Contig2 740 4 13 U
GGGAGGAGTCAACGAGAGAGAGAGAGGCCTAACTTAGTTCCTCGGCCAAACGAAATCGAG
AGATAGTTGACGGCGAGGGAAGAGAGAATGTGGTTCACCGGCGGCGGCGGAGGAGGACTG
AGGAAGCTCTGTAGAGCCTCGGCGACTGTTTTCGAGAACGAGATGAGCCATAACTCTCTG
TTGTCAGTGAGATACATGTCGAGAGAGCGAGCTGTAAACGTGAGGAAGATAAACCCTAAG
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GAACCTCTCTCCGTTCCCAACACTTGGCTCCGCGCTCAGGAAGCTGGGGTGAGTGGATTG
AACAGCAAGACGCATATGAAGCTGATGCTGAAATGGATGAGAGGGAGGAAGATGCTCAAG
TTAATCTGCAACCAAGTTGGTTCCTCTAAAAAGTTCTTTCATACCGTTTTACCTGATGAT
GATCCTCAACAAGAGACGTCTCCACCAGTTGCTACTGCTACTGCCACCGAGAAGAACAAA
AAACAAACCTCCAAGAGAAGAAGCAAATAAGGATTTGCCACAGAGTTTTTTTTTT**TGC
CTTTCACATAAAGACAAAATCCCTGTGGACTTGTTTGTTTCTGTGTCCAAGAAATGAATG
TGTTTCCATCTCCCAGAGTTTAGAAATTTTTAGGTTTGTTTCCATCCTTGCTCTGTTCCC
TATGAATAAAGAAAATCAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FS47TF U 1
AF RS1DI67TF U -3
AF RS1BT57JQ C 12
AF RS1BT57TF U 3
BS 1 26 RS1FS47TF
BS 27 27 RS1BT57TF
BS 28 252 RS1FS47TF
BS 253 253 RS1BT57TF
BS 254 301 RS1FS47TF
BS 302 302 RS1BT57TF
BS 303 493 RS1FS47TF
BS 494 494 RS1DI67TF
BS 495 527 RS1FS47TF
BS 528 528 RS1BT57TF
BS 529 646 RS1FS47TF
BS 647 647 RS1DI67TF
BS 648 740 RS1BT57TF

RD RS1FS47TF 646 0 0
GGGAGGAGTCAACGAGAGAGAGAGAGACCTAACTTAGTTCCTCGGCCAAACGAAATCGAG
AGATAGTTGACGGCGAGGGAAGAGAGAATGTGGTTCACCGGCGGCGGCGGAGGAGGACTG
AGGAAGCTCTGTAGAGCCTCGGCGACTGTTTTCGAGAACGAGATGAGCCATAACTCTCTG
TTGTCAGTGAGATACATGTCGAGAGAGCGAGCTGTAAACGTGAGGAAGATAAACCCTAAG
GTCTCGATCCAAGAAGCTCACACCATTTCCAGCTCTCTCTACGACGTCTTCAAGAAACAT
GGACCTCTCTCCGTTCCCAACACTTGGCTCCGCGCTCAGGAAGCTGGGGTGAGTGGATTG
AACAGCAAGACGCATATGAAGCTGATGCTGAAATGGATGAGAGGGAGGAAGATGCTCAAG
TTAATCTGCAACCAAGTTGGTTCCTCTAAAAAGTTCTTTCATACCGTTTTACCTGATGAT
GATCCTCAACAAGGGACGTCTCCACCAGTTGCTACTGCTACTGCCACTGAGAAGAACAAA
AAACAAACCTCCAAGAGAAGAAGCAAATAAGGATTTGCCACAGAGTTTTTTTTTT**TGC
CTTTCACATAAAGACAAAATCCCTGTGGACTTGTTTGTTTCTGTGT

QA 1 646 1 646
DS 

RD RS1DI67TF 651 0 0
GGATACGAGGAGTCAACGA
GAGAGAGAGAGACCTAACTTAGTTCCTCGGCCAAACGAAATCGAGAGATAGTTGACGGCG
AGGGAAGAGAGAATGTGGTTCACCGGCGGCGGCGGAGGAGGACTGAGGAAGCTCTGTAGA
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ATGTCGAGAGAGCGAGCTGTAAACGTGAGGAAGATAAACCCTAAGGTCTCGATCCAAGAA
GCTCACACCATTTCCAGCTCTCTCTACGACGTCTTCAAGAAACATGGACCTCTCTCCGTT
CCCAACACTTGGCTCCGCGCTCAGGAAGCTGGGGTGAGTGGATTGAACAGCAAGACGCAT
ATGAAGCTGATGCTGAAATGGATGAGAGGGAGGAAGATGCTCAAGATAATCTGCAACCAA
GTTGGTTCCTCTAAAAAGTTCTTTCATACCGTTTTACCTGATGATGATCCTCAACAAGAG
ACGTCTCCACCAGTTGCTACTGCTACTGCCACTGAGAAGAACAAAAAACAAACCTCCAAG
AGAAGAAGCAAATAAGGATTTGCCACAGAGTTTTTTTTTTTTTGCCTTTCACATAAAGAC
AAAATCCCTGTGGACTTGTTTGTTTCTGTGTC

QA 20 651 20 651
DS 

RD RS1BT57JQ 639 0 0
CAAC
GAGAGAGAGAGGCCTAACTTAGTTCCTCGGCCAAACGAAATCGAGAGATAGTTGACGGCG
AGGGAAGAGAGAATGTGGTTCACCGGCGGCGGCGGAGGAGGACTGAGGAAGCTCTGTAGA
GCCTCGGCGACTGTTTTCGAGAACGAGATGAGCCATAACTCTCTGTTGTCAGTGAGATAC
ATGTCGAGAGAGCGAGCTGTAAACGTGAGGAAGATAAACCCTAAGGTCTCGATCCAATAA
GCTCACACCATTTCCAGCTCTCTTTACGACGTCTTCAAGAAACATGAACCTCTCTCCGTT
CCCAACACTTGGCTCCGCGCTCAGGAAGCTGGGGTGAGTGGATTGAACAGCAAGACGCAT
ATGAAGCTGATGCTGAAATGGATGAGAGGGAGGAAGATGCTCAAGTTAATCTGCAACCAA
GTTGGTTCCTCTAAAAAGTTCTTTCATACCGTTTTACCTGATGATGATCCTCAACAAGAG
ACGTCTCCACCAGTTGCTACTGCTACTGCCACCGAGAAGAACAAAAAACAAACCTCCAAG
AGAAGAAGCAAATAAGGATTTGCCACAGAGTTTTTTTTTT**TGCCTTTCACATAAAGAC
AAAATCCCTGTGGACTTGTTTGTTTCTGTGTCCAA

QA 5 639 5 639
DS 

RD RS1BT57TF 738 0 0
GGGAGGAGTCAAC
GAGAGAGAGAGGCCTAACTTAGTTCCTCGGCCAAACGAAATCGAGAGATAGTTGACGGCG
AGGGAAGAGAGAATGTGGTTCACCGGCGGCGGCGGAGGAGGACTGAGGAAGCTCTGTAGA
GCCTCGGCGACTGTTTTCGAGAACGAGATGAGCCATAACTCTCTGTTGTCAGTGAGATAC
ATGTCGAGAGAGCGAGCTGTAAACGTGAGGAAGATAAACCCTAAGGTCTCGATCCAATAA
GCTCACACCATTTCCAGCTCTCTCTACGACGTCTTCAAGAAACATGAACCTCTCTCCGTT
CCCAACACTTGGCTCCGCGCTCAGGAAGCTGGGGTGAGTGGATTGAACAGCAAGACGCAT
ATGAAGCTGATGCTGAAATGGATGAGAGGGAGGAAGATGCTCAAGTTAATCTGCAACCAA
GTTGGTTCCTCTAAAAAGTTCTTTCATACCGTTTTACCTGATGATGATCCTCAACAAGAG
ACGTCTCCACCAGTTGCTACTGCTACTGCCACCGAGAAGAACAAAAAACAAACCTCCAAG
AGAAGAAGCAAATAAGGATTTGCCACAGAGTTTTTTTTTT**TGCCTTTCACATAAAGAC
AAAATCCCTGTGGACTTGTTTGTTTCTGTGTCCAAGAAATGAATGTGTTTCCATCTCCCA
GAGTTTAGAAATTTTTAGGTTTGTTTCCATCCTTGCTCTGTTCCCTATGAATAAAGAAAA
TCAAT

QA 14 738 14 738
DS 



AS 1 6

CO CL1156Contig1 844 6 21 U
GGGAACATTGATCATCTATAGACTTTGGTGGCCATTATGGCAGTCTCTTCACTCTCAATC
CGCTTTTGTGTTTCACCAACAATCTCGCACAAGACAGATATTCTCTGTCCAAACCCATCA
CTCAGAGCTTGTTGTTCACTTTCATCCGGCAGCAGTCTTGACTCCTCGGAGAATAGAAAT
GGAAGCAACTGGAAGAGAAGGCAAGCTCTTGTGGGAGTAGGAACTTTATTGGCAACTTCA
GTTCCAGCAACTTTGCTTCTTGCTGAAGAGGTACCAAAAAGCTACTCTGCTTTTGTGGAT
AGAGAAGATGGTTATTCGTATTATTACCCATCAGACTGGAGGGAATTTGACTTCAGGGCA
CATGATTCAGCCTTCAAGGATAGATATTTGCAGCTGCAGAATGTTCGTGTCAGGTTCATA
CCAACAGAGAAAACAGACATCCGCGAAGTGGGTCCAATGGATGAGGTGGTTTATGATCTA
GTGAAGCATAAGTTTGCAGCACCAAATCAAGTAGCTACCATCTATGATATGAAAGAGAGG
GTGGAGGATGGAAGGAGCTATTACACATTTGAGTATGGACTAAGAACTCCCATCTATGCA
ACCACTTCTTTTGCAACTGTGGCTGTTGGAAACAACAGATACTACACACTCATAGTTGGA
GCAAACGAGAGAAGATGGAGGAAAGTCAAGAAGCAGCTTCAAGTTGTTGCAGACTCTTT*
GAAGATTCTTCAGATTTGACAAGAGACAATAAACAAATCTTCTGTTACTCTTTATCTATA
CTCTCTGTCGGTTACAAAACTGTATGTAGATTTCAGTTGATATTCTTATATTCTCTACAA
CTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 

AF RS1CA56TF U 42
AF RS1B827TF U 1
AF RS1H738TF U 2
AF RS1BW36TF U 144
AF RS1CA56JQ C 65
AF RS1H738JQB C 286
BS 1 56 RS1B827TF
BS 57 57 RS1CA56TF
BS 58 140 RS1B827TF
BS 141 141 RS1CA56TF
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BS 366 366 RS1CA56TF
BS 367 582 RS1B827TF
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BS 711 711 RS1CA56TF
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BS 822 830 RS1BW36TF
BS 831 844 RS1CA56JQ

RD RS1CA56TF 685 0 0
AGTCTCTTCACTCTCAATCCGCTTTTGTGTTTCACCAACAATCTCGCACAAGACAGATAT
TCTCTGTCCAAACCCATCACTCAGAGCTTGTTGTTCACTTTCATCCGGCAGCAGTCTTGA
CTCCTCGGAGAATAGAAATGGAAGCAACTGGAAGAGAAGGCAAGCTCTTGTGGGAGTAGG
AACTTTATTGGCAACTTCAGTTCCAGCAACTTTGCTTCTTGCTGAAGAGGTACCAAAAAG
CTACTCTGCTTTTGTGGATAGAGAAGATGGTTATTCGTATTATTACCCATCAGACTGGAG
GGAATTTGACTTCAGGGCACATGATTCAGCCTTCAAGGATAGATATTTGCAGCTGCAGAA
TGTTCGTGTCAGGTTCATACCAACAGAGAAAACAGACATCCGCGAAGTGGGTCCAATGGA
TGAGGTGGTTTATGATCTAGTGAAGCATAAGTTTGCAGCACCAAATCAAGTAGCTACCAT
CTATGATATGAAAGAGAGGGTGGAGGATGGAAGGAGCTATTACACATTTGAGTATGGACT
AAGAACTCCCATCTATGCAACCACTTCTTTTGCAACTGTTGCTGTTGGAAACAACAGATA
CTACACACTCATAGTTGGAGCAAACGAGAGAAGATGGAGGAAAGTCAAGGAGCAGCTTCA
AGTTGTTGCAGACTCTTT*GAAGAT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RS1B827TF 792 0 0
GGGAACATTGATCATCTATAGACTTTGGTGGCCATTATGGCAGTCTCTTCACTCTCGATC
CGCTTTTGTGTTTCACCAACAATCTCGCACAAGACAGATATTCTCTGTCCAAACCCATCA
CTCAGAGCTTGTTGTTCACTATCATCCGGCAGCAGTCTTGACTCCTCGGAGAATAGAAAT
GGAAGCAACTGGAAGAGAAGGCAAGCTCTTGTGGGAGTAGGAACTTTATTGGCAACTTCA
GTTCCAGCAACTTTGCTTCTTGCTGAAGAGGTACCAAAAAGCTACTCTGCTTTTGTGGAT
AGAGAAGATGGTTATTCGTATTATTACCCATCAGACTGGAGGGAATTTGACTTCAGGGCA
CATGACTCAGCCTTCAAGGATAGATATTTGCAGCTGCAGAATGTTCGTGTCAGGTTCATA
CCAACAGAGAAAACAGACATCCGCGAAGTGGGTCCAATGGATGAGGTGGTTTATGATCTA
GTGAAGCATAAGTTTGCAGCACCAAATCAAGTAGCTACCATCTATGATATGAAAGAGAGG
GTGGAGGATGGAAGGAGCTATTACACATTTGAGTATGGACTAGGAACTCCCATCTATGCA
ACCACTTCTTTTGCAACTGTGGCTGTTGGAAACAACAGATACTACACACTCATAGTTGGA
GCAAACGAGAGAAGATGGAGGAAAGTCAAGAAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCGACTCTTT*
GAAGATTCTTCAGATTTGACAAGAGACA**TAAAAAATCTTCTGT*ACTCTTTATCTATA
CTCTCTGTCGGT

QA 1 792 1 792
DS 

RD RS1H738TF 820 0 0
GGATTGA
TGATCATCTATAGACTTTGGTGGCCATTATGGCAGTCTCTTCACTCTCAATCCGCTTTTG
TGTTTCACCAACAATCTCGCACAAGACAGATATTCTCTGTCCAAACCCATCACTCAGAGC
TTGTTGTTCACTTTCATCCGGCAGCAGTCTTGACTCCTCGGAGAATAGAAATGGAAGCAA
CTGGAAGAGAAGGCAGGCTCTTGTGGGAGTAGGAACTTTATTGGCAACTTCAGTTCCAGC
AACTTTGCTTCTTGCTGAAGAGGTACCAAAAAGCTACTCTGCTTTTGTGGATAGAGAAGA
TGGTTATTCGTATTATTACCCATCAGACTGGAGGGAATTTGACTTCAGGGCACATGATTC
AGCCTTCAAGGATAGATATTTGCAGCCGCAGAATGTTCGTGTCAGGTTCATACCAACAGA
GAAAACAGACATCCGCGAAGTGGGTCCAATGGATGAGGTGGTTTATGATCTAGTGAAGCA
TAAGTTTGCAGCACCGAATCAAGTAGCTACCATCTATGATATGAAAGAGAGGGTGGAGGA
TGGAAGGAGCTATTACACATTTGAGTATGGACTAAGAACTCCCATCTATGCAACCACTTC
TTTTGCAACTGTGGCTGTTGGAAACAACAGATACTACACACTCATAGTTGGAGCAAACGA
GAGAAGATGGAGGAAAGTCAAGAAGCAGCTTCAAGTTGTTGCAGACTCTTT*GA*GATTC
TTCAGATTTGACAAGAGACA**TAACAAATCTTCTGTTACTCTT*ATCTATACTCTCTGT
CGGT*ACAAAACTGTATGTAGATTTCAGTTGAT

QA 8 820 8 820
DS 

RD RS1BW36TF 687 0 0
ATCCGGCGGCAGTCTTGACTCCTCGGAGAATAGAAATGGAAGCAACTGGAAGAGAAGGCA
AGCTCTTGTGGGAGTAGGAACTTTATTGGCAACTTCAGTTCCAGCAACTTTGCTTCTTGC
TGAAGAGGTACCAAAAAGCTACTCTGCTTTTGTGGATAGAGAAGATGGTTATTCGTATTA
TTACCCATCAGACTGGAGGGAATTTGACTTCAGGGCACATGATTCAGCCTTCAAGGATAG
ATATTTGCAGCTGCAGAATGTTCGTGTCAGGTTCATACCAACAGAGAAAACAGACATCCG
CGAAGTGGGTCCAATGGATGAGGTGGTTTATGATCTAGTGAAGCATAAGTTTGCAGCACC
AAATCAAGTAGCTACCATCTATGATATGAAGGAGAGGATGGAGGATGGAAGGAGCTATTA
CACATTTGAGTATGGACTAAGAACTCCCATCTATGCAACCACTTCTTTTGCAACTGTGGC
TGTTGGAAACAACAGATACTACACACTCATAGTTGGAGCAAACGAGAGAAGATGGAGGAA
AGTCAAGAAGCAGCTTCAAGTTGTTGCAGACTCTTTTGAAGATTCTTCAGATTTGACAAG
AGACAATAAACAAATCTTCTGTTACTCTTTATCTATACTCTCTGTCGGTTACAAAACTGT
ATGTAGATTTCAGTTGATATTCTTATA

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1CA56JQ 780 0 0
TTTTGTG
TTCACCAACAATCTCGCACAAGACAGATATTCTCTGTCCAAACCCATCACTCAGAGCTTG
TTGTTCACTTTCATCCGGCAGCAGTCTTGACTCCTCGGAGAATAGAAATGGAAGCAACTG
GAAGAGAAGGCAAGCTCTTGTGGGAGTAGGAACTTTATTGGCAACTTCAGTTCCAGCAAC
TTTGCTTCTTGCTGAAGAGGTACCAAAAAGCTACTCTGCTTTTGTGGATAGAGAAGATGG
TTATTCGTATTATTACCCATCAGACTGGAGGGAATTTGACTTCAGGGCACATGATTCAGC
CTTCAAGGATAGATATTTGCAGCTGCAGAATGTTCGTGTCAGGTTCATACCAACAGAGAA
AACAGACATCCGCGAAGTGGGTCCAATGGATGAGGTGGTTTATGATCTAGTGAAGCATAA
GTTTGCAGCACCAAATCAAGTAGCTACCATCTATGATATGAAAGAGAGGGTGGAGGATGG
AAGGAGCTATTACACATTTGAGTATGGACTAAGAACTCCCATCTATGCAACCACTTCTTT
TGCAACTGTTGCTGTTGGAAACAACAGATACTACACACTCATAGTTGGAGCAAACGAGAG
AAGATGGAGGAAAGTCAAGGAGCAGCTTCAAGTTGTTGCAGACTCTTT*GAAGATTCTTC
AGATTTGACAAGAGACAATAAACAAATCTTCTGTTACTCTTTATCTATACTCTCTGTCGG
TTACAAAACTGTATGTAGATTTCAGTTGATATTCTTATATTCTCTACAACTCC

QA 8 780 8 780
DS 

RD RS1H738JQB 559 0 0
TCTGCTTTTGTGGATAGAGAAGATGGTTATTCGTATTATTACCCATCAGACTGGAGGGAA
TTTGACTTCAGGGCACATGATTCAGCCTTCAAGGATAGATATTTGCAGCCGCAGAATGTT
CGTGTCAGGTTCATACCAACAGAGAAAACAGACATCCGCGAAGTGGGTCCAATGGATGAG
GTGGTTTATGATCTAGTGAAGCATAAGTTTGCAGCACCGAATCAAGTAGCTACCATCTAT
GATATGAAAGAGAGGGTGGAGGATGGAAGGAGCTATTACACATTTGAGTATGGACTAAGA
ACTCCCATCTATGCAACCACTTCTTTTGCAACTGTGGCTGTTGGAAACAACAGATACTAC
ACACTCATAGTTGGAGCAAACGAGAGAAGATGGAGGAAAGTCAAGAAGCAGCTTCAAGTT
GTTGCAGACTCTTT*GAAGATTCTTCAGATTTGACAAGAGACAATAAACAAATCTTCTGT
TACTCTTTATCTATACTCTCTGTCGGTTACAAAACTGTATGTAGATTTCAGTTGATATTC
TTATATTCTCTACAACTCC

QA 1 559 1 559
DS 



AS 1 6

CO CL1157Contig1 939 6 33 U
GGGATTCAATCCAAAGCCGAAGACAAAGTCGTTGAGCGATCTCCAATGGCGGAAGAAGAT
TCCGTTAAAGAGGGTTACGCTGAGATCGTTGTTGTACGTCATGGAGAAACATCTTGGAAT
GCCGAGAGAAAGATCCAGGGTCATTTGGATGTTGAACTAAACGATGCAGGAAGACAACAA
GCAGAAAAAGTTGCTGAGCGGTTATCAAAGGAGCCTAAGGTATCTTATGTTTACTCTTCT
GACTTGAAGAGAGCCTTTGAGACTGCTCAGATCATTGCAGCTAAATGCGGCAAGGTTGAG
GTACTTACTGATCCTGATTTGCGGGAGAGGCATTTAGGAGATATGCAAGGTCTTGTGTAC
CAAGAAGCTTCCAAACTTCGCCCTGAAGCTTACAAGGCCTTCTCATCTAACCGCACAGAC
GTTGACATTCCAGGTGGAGGAGAAAGTCTTGACAAACTCTACGACAGATGTACATCTGCA
TTACAGAGAATCGGCGACAAACATCAAGGTGAAAGAGTGGTGGTAGTGACTCATGGAGGT
GTCATTCGATCTCTCTACGAGAGAGCTCGTCCAAGTGCACGAAAAGTTGAAAAGATTCTC
AACACATCGGTCAATGTGTTCCGTTTATTCGACGGAGACAAATGGACAATCCAAGTTTGG
GG*AGATGTGTCTCATTTGGACCAGACCGGTTTCTTGCAATCCGGTTTTGGTGGTGACAG
AACCTCTGGTTAAGATTCAGTGACTCTTTCCACTGAGGTTTTCTGTAATTTAAATTTGAC
TCTGTTACTTTCTTCTTTTGCAATTTGACCTCATAACTTTGAGGCTATCCCGATTTAGCC
TGTAATTGGGAGGATTAATAAAGTAACTGCTATAAATTGAACGTGATGCATAAAATATAT
CATCATTTTCTAGTTAAGAAATCATTTTAGTTTTCAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 0 15 0 0 15 0 0 15 0 15 15 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CU34JQ C 365
AF RS1BM22TF U 1
AF RS1DT85TF U 12
AF RS1CU34TF U 18
AF RS1DT85JQ C 229
AF RS1BM22JQ C 235
BS 1 19 RS1BM22TF
BS 20 20 RS1DT85TF
BS 21 24 RS1BM22TF
BS 25 26 RS1DT85TF
BS 27 27 RS1BM22TF
BS 28 28 RS1DT85TF
BS 29 30 RS1BM22TF
BS 31 32 RS1DT85TF
BS 33 48 RS1BM22TF
BS 49 49 RS1DT85TF
BS 50 294 RS1BM22TF
BS 295 295 RS1DT85TF
BS 296 300 RS1BM22TF
BS 301 301 RS1DT85TF
BS 302 329 RS1BM22TF
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BS 686 757 RS1BM22TF
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BS 780 824 RS1DT85JQ
BS 825 825 RS1BM22JQ
BS 826 866 RS1DT85JQ
BS 867 867 RS1BM22JQ
BS 868 893 RS1DT85JQ
BS 894 939 RS1BM22JQ

RD RS1CU34JQ 353 0 0
AAGCTTCCAAACTTCGCCCTGAAGCTTACAAGGCCTTTTCATCTAACCGCACAGACGTTG
ACATTCCAGGTGGAGGAGAAAGTCTTGACAAACTTTACGACAGATGTACATCTGCATTAC
AGAGAATCGGCGACAAACATCAAGGTGAAAGAGTGGTGGTAGTGACTCATGGAGGTGTCA
TTCGATCTCTCTACGAGAGAGCTCGTCCAAGTGCACGAAAAGTTGAAAAGATTCTCAACA
CATCGGTCAATGTGTTCCGTTTATTCGACGGAGACAAATGGACAATCCAAGTTTGGGG*A
GATGTGTCTCATTTGGACCAGACCGGTTTCTTGCAATCCGGTTTTGGTGGTGA

QA 1 353 1 353
DS 

RD RS1BM22TF 757 0 0
GGGATTCAATCCAAAGCCGTAGACCGATTC**TGAGCGATCTCCAATGACGGAAGAAGAT
TCCGTTAAAGAGGGTTACGCTGAGATCGTTGTTGTACGTCATGGAGAAACATCTTGGAAT
GCCGAGAGAAAGATCCAGGGTCATTTGGATGTTGAACTAAACGATGCAGGAAGACAACAA
GCAGAAAAAGTTGCTGAGCGGTTATCAAAGGAGCCTAAGGTATCTTATGTTTACTCTTCT
GACTTGAAGAGAGCCTTTGAGACTGCTCAGATCATTGCAGCTAAATGCGGCAAGATTGAG
TTACTTACTGATCCTGATTTGCGGGAGAGACATTTAGGAGATATGCAAGGTCTTGTGTAC
CAAGAAGCTTCCAAACTTCGCCCTGAAGCTTACAAGGCCTTCTCATCTAACCGCACAGAC
GTTGACATTCCAGGTGGAGGAGAAAGTCTTGACAAACTCTACGACAGATGTACATCTGCA
TTACAGAGAATCGGCGACAAACATCAAGGTGAAAGAGTGGTGGTAGTGACTCATGGAGGT
GTCATTCGATCTCTCTACGAGAGAGGTCGTCCAAGTGCACGAAAAGTTGAAAAGATTCTC
AACACATCGTTCAATGTGTTCCGTTTATTCGATGGAGACAAATGGACAATCCAAGTTTGG
GG*AGATGTGTCTCATTTGGACCAAACCGGTTTCTTGCAATCCGGTTTTGGTGGTGACAG
AACCTCTGGTTAAGATTCAGTGACTCTTTCCACTGAG

QA 1 757 1 757
DS 

RD RS1DT85TF 710 0 0
GGGGATTC
AATCCAAAGTCGTTGAGCGATCTCCAATGGCGGAAGAAGATTCCGTTAAAGAGGGTTACG
CTGAGATCGTTGTTGTACGTCATGGAGAAACATCTTGGAATGCCGAGAGAAAGATCCAGG
GTCATTTGGATGTTGAACTAAACGATGCAGGAAGACAACAAGCAGAAAAAGTTGCTGAGC
GGTTATCAAAGGAGCCTAAGGTATCTTATGTTTACTCTTCTGACTTGAAGAGAGCCTTTG
AGACTGCTCAGATCATTGCAGCTAAATGCGGCAAGGTTGAGGTACTTACTGATCCTGATT
TGCGGGAGAGGCATTTAGG*GATATGCAAGGTCTTGTGTACCAAGAAGCTTCCAAACTTC
GCCCTGAAGCTTACAAGGCCTTCTCATCTAACCGCACAGACGTTGACATTCCAGGTGGAG
GAGAAAGTCTTGACAAACTCTACGACAGATGTACATCTGCATTACAGAGAATCGGCGACA
AACATCAAGGTGAAAGAGTGGTGGTAGTGACTCATGGAGGTGTCATTCGATCTCTCTACG
AGAGAGCTCGTCCAAGTGCACGAAAAGTTGAAAAGATTCTCAACACATCGGTCAATGTGT
TCCGTTTATTCGACGGAGACAAATGGACAATCCAAGTTTGGGG*AGATGTGTCTCATTTG
GACCAGACCGGTTTCTTGCAATCCGGTTTTGGTGGTGACAGA

QA 9 710 9 710
DS 

RD RS1CU34TF 731 0 0
GGAATCCAAAGTCGT
TGAGCGATCTCCAATGGCGGAAGAAGATTCCGTTAAAGAGGGTTACGCTGAGATCGTTGT
TGTACGTCATGGAGAAACATCTTGGAATGCCGAGAGAAAGATCCAGGGTCATTTGGATGT
TGAACTAAACGATGCAGGAAGACAACAAGCAGAAAAAGTTGCTGAGCGGTTATCAAAGGA
GCCTAAGGTATCTTATGTTTACTCTTCTGACTTGAAGAGAGCCTTTGAGACTGCTCAGAT
CATTGCAGCTAAATGCGGCAAGGTTGAGGTACTTACTGATCCTGATTTGCGGGAGAGGCA
TTTAGGGGATATGCAAGGTCTTGTGTGCCAAGAAGCTTCCAAACTTCGCCCTGAAGCTTA
CAAGGCCTTCTCATCTAACCGCACAGACGTTGACATTCCAGGTGGAGGAGAAAGTCTTGA
CAAACTCTACGACAGATGTACATCTGCATTACAGAGAATCGGCGACAAACATCAAGGTGA
AAGAGTGGTGGTAGTGACTCATGGAGGTGTCATTCGATCTCTCTACGAGAGAGCTCGTCC
AAGTGCACGAAAAGTTGAAAAGATTCTCAACACATCGGTCAATGTGTTCCGTTTATTCGA
CGGAGACAAATGGACAATCCAAGTTTGGGGGAGATGTGTCTCATTTGGACCAGACCGGTT
TCTTGCAATCCGGTTTTGGTGGTGACAGAACCTCTGGTTAAGATTCAGTGACTCTT

QA 16 731 16 731
DS 

RD RS1DT85JQ 665 0 0
GTTTACTCTTCTGACTTGAAGAGAGCCTTTGAGACTGCTCAGATCATTGCAGCTAAATGC
GGCAAGGTTGAGGTACTTACTGATCCTGATTTGCGGGAGAGGCATTTAGG*GATATGCAA
GGTCTTGTGTACCAAGAAGCTTCCAAACTTCGCCCTGAAGCTTACAAGGCCTTCTCATCT
AACCGCACAGACGTTGACATTCCAGGTGGAGGAGAAAGTCTTGACAAACTCTACGACAGA
TGTACATCTGCATTACAGAGAATCGGCGACAAACATCAAGGTGAAAGAGTGGTGGTAGTG
ACTCATGGAGGTGTCATTCGATCTCTCTACGAGAGAGCTCGTCCAAGTGCACGAAAAGTT
GAAAAGATTCTCAACACATCGGTCAATGTGTTCCGTTTATTCGACGGAGACAAATGGACA
ATCCAAGTTTGGGG*AGATGTGTCTCATTTGGACCAGACCGGTTTCTTGCAATCCGGTTT
TGGTGGTGACAGAACCTCTGGTTAAGATTCAGTGACTCTTTCCACTGAGGTTTTCTGTAA
TTTAAATTTGTCTCTGTTACTTTCTTCTTTTGCAATTTGACCTCATAACTTTGAGGTTAT
CCCGATTTAGCCTGTAATTGGGAGGATTAATAAAGTAATTGCTATAAATTGAACGTGATG
CATAA

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1BM22JQ 705 0 0
TCTTCTGACTTGAAGAGAGCCTTTGAGACTGCTCAGATCATTGCAGCTAAATGCGGCAAG
ATTGAGTTACTTACTGATCCTGATTTGCGGGAGAGACATTTAGGAGATATGCAAGGTCTT
GTGTACCAAGAAGCTTCCAAACTTCGCCCTGAAGCTTACAAGGCCTTTTCATCTAACCGC
ACAGACGTTGACATTCCAGGTGGAGGAGAAAGTCTTGACAAACTTTACGACAGATGTACA
TCTGCATTACAGAGAATCGGCGACAAACATCAAGGTGAAAGAGTGGTGGTAGTGACTCAT
GGAGGTGTCATTCGATCTCTCTACGAGAGAGGTCGTCCAAGTGCACGAAAAGTTGAAAAG
ATTCTCAACACATCGTTCAATGTGTTCCGTTTATTCGATGGAGACAAATGGACAATCCAA
GTTTGGGG*AGATGTGTCTCATTTGGACCAAACCGGTTTCTTGCAATCCGGTTTTGGTGG
TGACAGAACCTCTGGTTAAGATTCAGTGACTCTTTCCACTGAGGTTTTCTGTAATTTAAA
TTTGACTCTGTTACTTTCTTCTTTTGCAATTTGACCTCATAACTTTGAGGCTATCCCGAT
TTAGCCTGTAATTGGGAGGATTAATAAAGTAACTGCTATAAATTGAACGTGATGCATAAA
ATATATCATCATTTTCTAGTTAAGAAATCATTTTAGTTTTCAATC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 2 6

CO CL1158Contig1 594 2 2 U
GGATCCACTTGGAGCCGAGCCTCGACCATGGCATCTCCTTCACTTCTGCACTCCTCAGCT
TCGTCGTTTCACTGCCGTTTCCCATCGCTAGCAATTCGCACCTCCGCACCTCCTCCGCCT
CAGAGAAACTTGTTGAAAGTGTCGGCGTCGGGAACAGTGCTGGTGGAGAAATCAGAGGCG
GAGAAAGTGCAGCGCCTCAAAACCGCTTACCTCGAGAGAATCATCCCCGCCCTCAAAGAT
GAGTTCAAATACATCAACATTCACCAGGTTCCAAAGGTTCAGAAGATTGTGGTGAATTGT
GGAATAGGAGATGCAGCGCAGAACGACAAAGGATTGGAGGCAGCAATGAAAGACATAGCG
CTTATAACAGGGCAGAAGCCTGTCAAGACAAGAGCTAGAGCTTCCATTGCTACTTTCAAG
ATTAGGGAAGATCAACCTCTTGGGATCGCCGTCACTCTCAGAGGAGACGTGATGTACTCG
TTCCTGGACCGTCTGATCAATTTAGCACTTCCAAGAACAAGAGATTTCCAAGGTGTGAGT
CCCAGTAGCTTTGATGGCAACGGAAACTACAGCATTGGTGTCAAAGACCAAAGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CC13TF U 1
AF RS1FS95TF U 1
BS 1 586 RS1CC13TF
BS 587 594 RS1FS95TF

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QA 1 586 1 586
DS 

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CAGAGAAACTTGTTGAAAGTGTCGGCGTCGGGAACAGTGCTGGTGGAGAAATCAGAGGCG
GAGAAAGTGCAGCGCCTCAAAACCGCTTACCTCGAGAGAATCATCCCCGCCCTCAAAGAT
GAGTTCAAATACATCAATATTCACCAGGTTCCAAAGGTTCAGAAGATTGTGGTGAATTGT
GGAATAGGAGATGCAGCGCAGAACGACAAAGGATTGGAGGCAGCAATGAAAGACATAGCG
CTTATAACAGGGCAGAAGCCTGTCAAGACAAGAGCTAGAGCTTCCATTGCTACTTTCAAG
ATTAGGGAAGATCAACCTCTTGGGATCGCCGTCACTCTCAGAGGAGACGTGATGTACTCG
TTCCTGGACCGTCTGATCAATTTAGCACTTCCAAGAACAAGAGATTTCCAAGGTGTGAGT
CCCAGTAGCTTTGATGGCAACGGAAACTACAGCATTGGTGTCAAAGACCAAAGC

QA 1 594 1 594
DS 



CO CL1158Contig2 965 4 16 U
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TCGTCGTTTCACTGCCGTTTCCCATCGCTAGCAATTGGCACCTCCGCACCTCCGCCGCTG
AGGAACGTGGTGAAAGTCTCGGCGTCGGGAACAGTGCTGGTGGAAAAATCTGAGGCGGAG
AAAGTGCAGCGCCTCAAAACCGCTTACCTCGAGAGAATCATCCCCGCCCTCAAAGATGAG
TTCAAATACATCAACATTCACCAGGTTCCAAAGGTTCAGAAGATAGTGGTGAATTGTGGA
ATAGGAGATGCAGCGCAGAACGACAAAGGATTGGAGGCAGCAATGAAAGACATAGCGCTT
ATAACAGGGCAGAAGCCTGTCAAGACAAGAGCCAGAGCTTCCATTGCTACTTTCAAGATT
AGGGAAGATCAACCTCTTGGGATCGCCGTCACTCTCAGAGGAGACGTGATGTACTCGTTC
CTGGACCGTCTGATCAATTTAGCACTGCCAAGAACAAGAGATTTCCAAGGTGTGAGTCCC
AGTAGCTTTGATGGCAACGGAAACTACAGCATTGGTGTCAAAGACCAAAGCGCTTTCCCT
GAAATCAGGTTTGATGCGATAGGGAAAGCAAGAGGAATGGATGTATGCATAAGCACAACG
GCTAAAACAGATGACGAAGGACAGAGACTGTTGGCTCTGATGGGAATGCCTTTCAGGGAA
GGAAGCAGCGCCAACACAGGAGGGGCGCCAGTGAGGAAGAAGAAACTTAAGCCTCATCAT
TTTGATGCTAAAAGCAAAGGCAAGGGAAAGAGATGAAGAAATAAGATTTTCATTTGTATT
TGTCTTCATGTATGTTGATGGATTAATCTAATGATTTTGTTTCTCCGCCATGTTATATTA
CTCCTCCCTTGTGATAGTGTTTGTTAATCCTCCTGATAAAACAAAACAATCCAATTTGGA
AGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1EO55TF U 1
AF RS1CN32TF U 11
AF RS1EO55JQ C 168
AF RS1CN32JQ C 491
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CTGGACCGTCTGATCAATTTAGCACTGCCAAGAACAAGAGATTTCCAAGGTGTGAGTCCC
AGTAGCTTTGATGGCAACGGAAACTACAGCATTGGTGTCAAAGACCAAAGCGTTTTCCCT
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QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1CN32TF 719 0 0
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AACCTCTTGGGATCGCCGTCACTCTCAGAGGAGACGTGATGTACTCGTTCCTGGACCGTC
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ATGACGAAG*ACAGAGACTGTTGGCTCTGATGGGAATGCCTTTCAGG
AAGGAGCAGCGC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1EO55JQ 750 0 0
ATCT
GAGGCGGAGAAAGTGCAGCGCCTCAAAACCGCTTACCTCGAGAGAATCATCCCCGCCCTC
AAAGATGAGTTCAAATACATCAACATTCACCAGGTTCCAAAGGTTCAGAAGATAGTGGTG
AATTGTGGAATAGGAGATGCAGCGCAGAACGACAAAGGATTGGAGGCAGCAATGAAAGAC
ATAGCGCTTATAACAGGGCAGAAGCCTGTCAAGACAAGAGCCAGAGCTTCCATTGCTACT
TTCAAGATTAGGGAAGATCAACCTCTTGGGATCGCCGTCACTCTCAGAGGAGACGTGATG
TACTCGTTCCTGGACCGTCTGATCAATTTAGCACTGCCAAGAACAAGAGATTTCCAAGGT
GTGAGTCCCAGTAGCTTTGATGGCAACGGAAACTACAGCATTGGTGTCAAAGACCAAAGC
GTTTTCCCTGAAATCAGGTTTGATGCGATAGGGAAAGCAAGAGGAATGGATGTATGCATA
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TTCAGGGAAGGAAGCAGCGCCAACACAGGAGGGGCGCCAGTGAGGAAGAAGAAACTTAAG
TCTCATCATTTTGATGCTAAAAGCAAAGGCGAGGGAAAGAGATGAAGAAATAAGATTTTC
ATTTGTATTTGTCTTCATGTATGTTGATGGATTAATCTAATGATTTTGTTTTTCCGCCAT
GTTATATTACTCCTCCCTTGTGATAG

QA 5 750 5 750
DS 

RD RS1CN32JQ 475 0 0
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ATGGCAACGGAAACTACAGCATTGGTGTCAAAGACCAAAGCGCTTTCCCTGAAATCAGGT
TTGATGCGATAGGGAAAGCAAGAGGAATGGATGTATGCATAAGCACAACGGCTAAAACAG
ATGACGAAGGACAGAGACTGTTGGCTCTGATGGGAATGCCTTTCAGGGAAGGAAGCAGCG
CCAACACAGGAGGGGCGCCAGTGAGGAAGAAGAAACTTAAGCCTCATCATTTTGATGCTA
AAAGCAAAGGCAAGGGAAAGAGATGAAGAAATAAGATTTTCATTTGTATTTGTCTTCATG
TATGTTGATGGATTAATCTAATGATTTTGTTTCTCCGCCATGTTATATTACTCCTCCCTT
GTGATAGTGTTTGTTAATCCTCCTGATAAAACAAAACAATCCAATTTGGAAGAGT

QA 1 475 1 475
DS 



AS 1 6

CO CL1159Contig1 1055 6 8 U
GGCAGGGAAGGTAACAAGTCGTAACCAAGTATAGAGGAAGTTAGCACAAGATAACGTGAA
CAAAGAGTAAAAAGAAAATGTGAAGAAACATTCAAAATAAAAATAAATAAAAGCTTATAA
GTTATATAAGTCGAATTGTATATAAAATAATGTATCCGATCAATTTGACTCGGATACTTT
AATATACATAACAATCTTCGTTTCTGTATTTTTTTTTTTCAAATAATGCACACTCAAACC
CCATCTTCCAACACCACCTTCCGCTGCAGTAAAAATAGAACCCGCTGTTTGTGTGTTTAA
AGGTAACCTTATAGTGCCATCTCAGCC*TGTAGTGCAGCGAGTTCATCTTCATCAGCGTT
CTGTTTCTTCTGAGGTAGAGGACGAGCAGGTAGCTTTCCTTCAGGAAGTGGTCTTGCTGG
CTGAAGAAGTTGGTCCTCTAGCTCTAAGCCTTCAAGTTCGTCAAGTTCTGCTTCCAATTC
ATCCTCATCGAAATCAGCAGCAGAGCCAAATGGAGCGGACAATGCGTCCTGGATCTGTTT
CATGTTATCGGTCTGCTCATTGATCTCATCCATGGTCTTGTCAACATCGTCAATGTTTGT
AGCTTTCTGCATAGCTTTCATAGCAGCAGCACCAGTCCTCAAAGCATCTACAGTCTCTGT
TGTTGCTTTGGCACCTTCTAACATAATCATTTGATCATGAATACGGAGCTGGAAGTTGCC
AAGCTGTTCAACTTGTTGCTCGTATAACCCCTTCCTTTTCAAACATTGTATAGCCGCGCG
TTTGTTCTTGACCTTGGAGAATTCTTTGGCTCTCTCAACCTCTCCAGCAGCTTTCTTGAG
AAGAACAGATTCCTTCTTCTCCAGCATCTCAAGTGTCTCATTAAGCTTGCCTAATGTGTG
GAGAGTATTAGTCTCCTCCTTGGGTTTCCCGAATAGCCGTGTAAACATTCTTCTTGATTA
AACACCTTGGGAGATTTGATGCCCGAAGGTTGCTTGATTGCTTGCGATGATGATGAAGAG
GAGGAGAAGAAGGAGAAACGGCGTTGAAGTGCTTA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BJ35JQ U 1
AF RS1BJ35TF C 1
AF RS1AK65JQ U 86
AF RS1B344JQ U 220
AF RS1AK65TF C 284
AF RS1B344TF C 469
BS 1 558 RS1BJ35JQ
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BS 951 1005 RS1AK65TF
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RD RS1BJ35JQ 694 0 0
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CATGTTATCGGTCTGCTC****ATCTCATCCATGGTCTTGTCAACATCGTCAATGTTTGT
AGCTTTCTGCATAGCTTTCATAGCAGCAGCACCAGTCCTCAAAGCATCTACAGTCTCTGT
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C

QA 1 693 1 693
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RD RS1BJ35TF 694 0 0
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AATATACATAACAATCTTCGTTTCTGTATTTTTTTTTTTCAAATAATGCACACTCAAACC
CCATCTTCCAACACCACCTTCCGCTGCAGTAAAAATAGAACCCGCTGTTTGTGTGTTTAA
AGGTAACCTTATAGTGCCATCTCAGCC*TGTAGTGCAGCGAGTTCATCTTCATCAGCGTT
CTGTTTCTTCTGAGGTAGAGGACGAGCAGGTAGCTTTCCTTCAGGAAGTGGTCTTGCTGG
CTGAAGAAGTTGGTCCTCTAGCTCTAAGCCTTCAAGTTCGTCAAGTTCTGCTTCCAATTC
ATCCTCATCGAAATCAGCAGCAGAGCCAAATGGAGCGGACAATGCGTCCTGGATCTGTTT
CATGTTATCGGTCTGCTC****ATCTCATCCATGGTCTTGTCAACATCGTCAATGTTTGT
AGCTTTCTGCATAGCTTTCATAGCAGCAGCACCAGTCCTCAAAGCATCTACAGTCTCTGT
TGTTGCTTTGGCACCTTCTAACATAATCATTTG
C

QA 1 693 1 693
DS 

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CCAAATGGAGCGGACAATGCGTCCTGGATCTGTTTCATGTTATCGGTCTGCTCTTTGATC
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AATACGGAGCTGGAAGTTGCCAAGCTGTTCAACTTGTTGCTCGTATAACCTCTTCCTTTT
CAAACATTGTATAGCCGCGCGTTTGTTCTTGACCTTGGAGAATTCTTTGGCTCTCTCAAC
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ATTAAGCTTGCCTAATGTGTGGAGAGTATTAGTCTCCTCCTTGGGTTTCCCGAATAGCCG
TGTAAACATTC

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DS 

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CGGAGCTGGAAGTTGCCAAGCTGTTCAACTTGTTGCTCGTATAACCCCTTCCTTTTCAAA
CATTGTATAGCCGCGCGTTTGTTCTTGACCTTGGAGAATTCTTTGGCTCTCTCAACCTCT
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AGCTTGCCTAATGTGTGGAGAGTATTAGTCTCCTCCTTGGGTTTCCCGAATAGCCGTGTA
AACATTCTTCTTGATTAAACACCTTGGGAGATTTGATGCCCGAAGGTTGCTTGATTGCTT
GC

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DS 

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CTGGATCTGTTTCATGTTATCGGTCTGCTCATTGATCTCATCCATGGTCTTGTCAACATC
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TACAGTCTCTGTTGTTGCTTTGGCACCTTCTAACATAATCATTTGATCATGAATACGGAG
CTGGAAGTTGCCAAGCTGTTCAACTTGTTGCTCGTATAACCTCTTCCTTTTCAAACATTG
TATAGCCGCGCGTTTGTTCTTGACCTTGGAGAATTCTTTGGCTCTCTCAACCTCTCCAGC
AGCTTTCTTGAGAAGAACAGATTCCTTCTTCTCCAGCATCTCAAGTGTCTCATTAAGCTT
GCCTAATGTGTGGAGAGTATTAGTCTCCTCCTTGGGTTTCCCGAATAGCCGTGTAAACAT
TCTTCTTGATTAAACACCTTGGGAGATTTGATGCCCGAAGGTTGCTTGATTGCTTGCGAT
GATGATGAAGAGGAGGAGAAGAAGGAGAAACGGCGTTGAAGTGCTTA

QA 1 587 1 587
DS 



AS 3 6

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1A481TF U 1
AF RS1BN03TF U 69
BS 1 171 RS1A481TF
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CCCTAACCTCTACGAGTTTGAGGTACTTCAACATCGCTGAGAACGAGGGAGAGGAAGAAG
ACTAGAAGAGCTATTACTTCTGTTTCCGGTTTTTGTTTTATGTTCGTTGTTGCTCAATAC
AATTTATCATCGCCCTTGTGTTCTTCTTTATCGACACCTTATTTTAGTTTTGTTGAAGTT
ACCTCTTGGTTCAGACTATTGTTTAAGAA
TATTTTGGT

QA 1 389 1 389
DS 

RD RS1BN03TF 324 0 0
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TGAAGAAGCACAACGTGAGGGATTGGCTCAGAGTGATTGCAGCCAACAAGGACCCTAACC
TCTACGAGTT*GAGGTACTTCAACATCGCTGAGAACGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAG
AGCTATTACTTCTGTTTCCGGTTTTTGTTTTATGTTCGTTGTTGCTCAATACAATTTATC
ATCGCCCTTGTGTTCTTCTTTATCGACACCTTATTTTAGTTTTGTGGAAGTTACCTCTTG
GTTCAGACTATTGTTTAAGAAAAA

QA 1 324 1 324
DS 



CO CL1160Contig2 627 2 3 U
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TTTCCAGGATTTGCTCAAGAGAAAAAAAAATGAGTAGAGGAAGTGCAGCCGTTGCCAAGG
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GTGCACTCGGTGATTCCGTCACTATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACCGTCACTTCCG
ATGGTCAATTCTCCAAGAGGTATCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACA
ACGTGAGGGATTGGCTCAGAGTGATTGCTGCCAACAAGGACCGTAACCTCTACGAGTTGA
GGTACTTCAACATCGCTGAGAACGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAGTTATTACATCT
GTTTCCGGTTTTTGTTTTGTGTTCGTTGTTGCTCAATACTATTTATCATCTTCTTTATCG
ACACCTTATTTTAGTTTTGTTGAATTTACCTCTTGGTTCAGACTATTGTTTAAGAAAAAT
ATTTTGGTAATGATTCAAGAATCTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AAAAAAAAAAGAACGCCGCTCGTCTCTTCAGAGAGTGTTCCACTTTCCAGGATTTGCTCA
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AGAATCTTT
C

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BQ
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AF RS1EA63TF C 1
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A
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AS 1 4

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B253TF U 10
AF RS1D088TF U 2
AF RS1AV28TF U 1
AF RS1AV28JQ C 436
BS 1 653 RS1AV28TF
BS 654 654 RS1AV28JQ
BS 655 684 RS1AV28TF
BS 685 685 RS1AV28JQ
BS 686 710 RS1AV28TF
BS 711 1183 RS1AV28JQ

RD RS1B253TF 593 0 0
GG
GTTTTCGATTTAGGGTACCCAATCTCTGCGATCAAAATCTCGGCTTTTTGCCGCACCATC
AATCTTGTTCCGATTCTCCAATCCATTCCTTCGATTCATCTCCACTGTTCACGAATCCAG
CAGTGCTATCCTCCCCCTTCTCCTTTTGTACTGATTTAAAGATGGCAGCTAAAGCTAATA
ATCTTCCCGACAGTGAGGTTGTGCCATCAGCTGTTCGGGAGGTTACATCGATTCTTCGCG
CGGCTCATGATATACATCCCACCCATCCTCGGATTGCTTACCTATGTGTGTGTGGTGCCG
CTGAGGAGTGTTTAAGCGCTGACCCCTTCCTACGTGGGAACGGTGTTCTCTTGTTTGCGT
TTCGTCTTAAACGCTGGACTGAAACCAATGATGAAACACTTGGGGATGGAAAATTGCGGC
CTAGTGATGTACGTGACATCCAGAGTTTCTATCTAGAATATTACCAGAAAAATATCCATG
CTTTGTTCAAGTTTATCGAAGACTACAGACATTTTGAAGGATGGGGCCCAGCGCCCATGC
CTCTCTGGCCTACTCCTATGGACG*TTTCAAAGCTCTTAGAACTCTCAGTG

QA 3 593 3 593
DS 

RD RS1D088TF 635 0 0
GGGTATACCCGTTTTCGATTTAGGGTACCCAATCTCTTCGATCAAAATCTCGGCTTTTTG
CCGCACCATAAATCTTGTTCCGATTCTCCAATCCATTCCTTCGATTCATCTCCACTGTTC
ACGAATCCAGCAGTGCTATCCTCCCCCTTCTCCTTTTGTACTGATTTAAAGATGGCAGCT
AAAGCTAATAATCTTCCCGACAGTGAGGTTGTGCCATCAGCTGTTCGGGAGGTTACATCG
ATTCTTCGCGCGGCTCATGATATACATCCCACCCATCCTCGGATTGCTTACCTATGTGTG
TGTGGTGCCGCTGAGGAGTGTTTAAGCGCTGACCCCTTCCTACGTGGGAACGGTGTTCTC
TTGCTTGCGTTTCGTCTTAAACGCTGGACTGAAACCAATGATGAAACACTTGGGGATGGA
AAATTGCGGTCTAGTGATGTACGTGACATCCAGAGTTTCTATCTAGGATATTACCAGAAA
AATATCCATGCTTTGTTCAAGTTTATCGAAGACTACAGACATTTTGAAGGATGGGGCCCA
GCGCCCATGCCTCTCTGGCCTACTCCTATGGACGGTTTCAAAGCTCTTAGAACCCTCAGT
GTCAGGGCTGACAGGGCTGAACTTCTCACATATGC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1AV28TF 729 0 0
GGGGTATACCCGTTTTCGATTTAGGGTACCCAATCTCTGCGATCAAAATCTCGGCTTTTT
GCCGCACCATAAATCTTGTTCCGATTCTCCAATCCATTCCTTCGATTCATCTCCACTGTT
CACGAATCCAGCAGTGCTATCCTCCCCCTTCTCCTTTTGTACTGATTTAAAGATGGCAGC
TAAAGCTAATAATCTTCCCGACAGTGAGGTTGTGCCATCAGCTGTTCGGGAGGTTACATC
GATTCTTCGCGCGGCTCATGATATACATCCCACCCATCCTCGGATTGCTTACCTATGTGT
GTGTGGTGCCGCTGAGGAGTGTTTAAGCGCTGACCCCTTCCTACGTGGGAACGGTGTTCT
CTTGTTTGCGTTTCGTCTTAAACGCTGGACTGAAACCAATGATGAAACACTTGGGGATGG
AAAATTGCGGCCTAGTGATGTACGTGACATCCAGAGTTTCTATCTAGAATATTACCAGAA
AAATATCCATGCTTTGTTCAAGTTTATCGAAGACTACAGACATTTTGAAGGATGGGGCCC
AGCGCCCATGCCTCTCTGGCCTACTCCTATGGACGGTTTCAAAGCTCTTAGAACTCTCAG
TGTCAGGGCTGACAGGGCTGAACTTCTCACATATGCATGTGGAATTGCTCTTC*TCTCTA
CAAAGTCGTGGAGCATCTTTCTAA*GATGAGCAACTGCCTCCTGAGATTT
GGAGCCCACATGAGTGAAC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1AV28JQ 748 0 0
TGATGTACGTGACATCCAGAGTTTCTATCTAGAATATTACCAGAAAAATATCCATGCTTT
GTTCAAGTTTATCGAAGACTACAGACATTTTGAAGGATGGGGCCCAGCGCCCATGCCTCT
CTGGCCTACTCCTATGGACGGTTTCAAAGCTCTTAGAACTCTCAGTGTCAGGGCTGACAG
GGCTGAACTTCTCACATATGCATGTGGAATTGCTCTTCCTCTCTACAAAGTCGTGGAGCA
TCTTTCTAAAGATGAGCAACTGCCTCCTGAGATTTTGGAAGCCCACAATGAAGTGAAACG
GCTAGCCGAAATCTTTAGGCCATACATGATTTATCCCAGCGATCCTTATAGTGATGATCA
TTTTATTTGGAGAGTTCCTCAGATCAGGGCTGTCAAAAACGCACTTCGTGGAAAATTCTA
CCCTAGTAGTAATACTCAAGGCGATAACAATTCCGAAAACACAGAGATTATTGGCAATAA
TCCTGCGGACACGCCTGTGGGGATTAATTGGAGACCGATGATAGAGATAATTAGTCTTCT
ATTGATTAGCTTTTTTGTGATATGTTTGTTTCAACTACTAATGTTTTAACTTTTTTTAAT
AGATTATGTGGAATCATCATAATTTCGATCGTTGATTTAAGTTTTTTGCATGTTTTTTGG
ATTGAGTTAATCTACTCCATGTCACATTAGTCAAAATTGTTTTGATTATCTTTTAATAAT
CGAAATAAGATAATTTGTGTTTTAACTT

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 6

CO CL1162Contig1 695 6 6 U
GGAGCGACATTACCACTGACTGCACCTTCGTCGGAGATATTCATTAGCGAGAGACTGAGA
CAGAGATGGCTGAAACAGCGAGAAGACAAGGCGGTGGGCGGCCATTGCCGCCTCCTCCGA
GAGGCGTCAATCAACCTCCTCGCGTTAAATCCGAACCTGTCGATCGTGAGAAGACATGTC
CCCTGCTTCTTCGCGTTTTTACAAAGAGCGGTGGTCATCATACGAAGGAAGATTATGCTG
TGAGAGGCAAAGAACCAAAGGATGAAGTTCAAATTTACACTTGGAAAGATGCTAATCTTC
GCGAGTTAACTGATTTGGTCAAAGAAGTCTCTGTAGCAGCTAGGAGAAGAGACGCAAGGT
TGTCTTTTGCGTTTGTTTATCCAGACAAGAATGGCCGTTTCATTGTGAGACAGGTTGGTC
AGACGATGTCTTATCCAAACAGAAAACAACCAGACGACAGTAAAACACTCGCTGACCTTC
ATTTCGAGATTGGAGATTATCTGGATGTAGCAATTTACTAGGAGGAGGTTTCTGTTTCTC
GTCAAATGAGATTTTAGGTGTATGTGTGGACAAAGGAAAAAACACATTCATGGTTTTTCC
CGTTTCAAAACTTAGTTCAGACGACATTTTATGTCTAATATATGTGGTGTAATGAGTTTA
AACGAGATTTAAACAATTCAAATGATGTTTTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 30 30 10 

AF RS1H146TF U 1
AF RS1CY87TF U 46
AF RS1BL27TF U 91
AF RS1C714TF U 392
AF RS1H146JQB C 125
AF RS1BL27JQ C 187
BS 1 312 RS1H146TF
BS 313 313 RS1CY87TF
BS 314 687 RS1H146TF
BS 688 692 RS1CY87TF
BS 693 694 RS1BL27TF
BS 695 695 RS1BL27JQ

RD RS1H146TF 687 0 0
GGAGCGACATTACCACTGACTGCACCTTCGTCGGAGATATTCATTAGCGAGAGACTGAGA
CAGAGATGGCTGAAACAGCGAGAAGACAAGGCGGTGGGCGGCCATTGCCGCCTCCTCCGA
GAGGCGTCAATCAACCTCCTCGCGTTAAATCCGAACCTGTCGATCGTGAGAAGACATGTC
CCCTGCTTCTTCGCGTTTTTACAAAGAGCGGTGGTCATCATACGAAGGAAGATTATGCTG
TGAGAGGCAAAGAACCAAAGGATGAAGTTCAAATTTACACTTGGAAAGATGCTAATCTTC
GCGAGTTAACTGGTTTGGTCAAAGAAGTCTCTGTAGCAGCTAGGAGAAGAGACGCAAGGT
TGTCTTTTGCGTTTGTTTATCCAGACAAGAATGGCCGTTTCATTGTGAGACAGGTTGGTC
AGACGATGTCTTATCCAAACAGAAAACAACCAGACGACAGTAAAACACTCGCTGACCTTC
ATTTCGAGATTGGAGATTATCTGGATGTAGCAATTTACTAGGAGGAGGTTTCTGTTTCTC
GTCAAATGAGATTTTAGGTGTATGTGTGGACAAAGGAAAAAACACATTCATGGTTTTTCC
CGTTTCAAAACTTAGTTCAGACGACATTTTATGTCTAATATATGTGGTGTAATGAGTTTA
AACGAGATTTAAACAATTCAAATGATG

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1CY87TF 647 0 0
GGA
GAGAGACTGAGACAGAGATGGCTGAAACAGCGAGAAGACAAGGCGGTGGGCGGCCATTGC
CGCCTCCTCCGAGAGGCGTCAATCAACCTCCTCGCGTTAAATCCGAACCTGTCGATCGTG
AGAAGACATGTCCCCTGCTTCTTCGCGTTTTTACAAAGAGCGGTGGTCATCATACGAAGG
AAGATTATGCTGTGAGAGGCAAAGAACCAAAGGATGAAGTTCAAATTTACACTTGGAAAG
ATGCTAATCTTCGCGAGCTAACTGATTTGGTCAAAGAAGTCTCTGTAGCAGCTAGGAGAA
GAGACGCAAGGTTGTCTTTTGCGTTTGTTTATCCAGACAAGAATGGCCGTTTCATTGTGA
GACAGGTTGGTCAGACGATGTCTTATCCAAACAGAAAACAACCAGACGACAGTAAAACAC
TCGCTGACCTTCATTTCGAGATTGGAGATTATCTGGATGTAGCAATTTACTAGGAGGAGG
TTTCTGTTTCTCGTCAAATGAGATTTTAGGTGTATGTGTGGACAAAGGAAAAAACACATT
CATGGTTTTTCCCGTTTCAAAACTTAGTTCAGACGACATTTTATGTCTAATATATGTGGT
GTAATGAGTTTAAACGAGATTTAAACAATTCAACTGATGTTTTG

QA 4 647 4 647
DS 

RD RS1BL27TF 605 0 0
GCGGTGGGCGGCCATTGCCGCCTCCTCCGAGAGGCGTCAATCAACCTCCTCGCGTTAAAT
CCGAACCTGTCTATCGTGAGAAGACATGTCCCCTGCTTCTTCGCGTTTTTACAAAGAGCG
GTGGTCATCATACGAAGGAAGATTATGCTGTGAGTGGCAAAGAACCAAAGGATGAAGTTC
AAATTTACACTTGGAAAGATGCTAATCTTCGCGAGTTAACTGATTTGGTCAAAGAAGTCT
CTGTAGCAGCTAGGAGAAGAGACGCAAGGTTGTCTTTTGCGTTTGTTTATCCAGACAAGA
ATGGCCGTTTCATTGTGAGACAGGTTGGTCAGACGATGTCTTATCCAAACAGAAAACAAC
CAGACGACAGTAAAACACTCGCTGACCTTCATTTCGAGATTGGAGATTATCTGGATGTAG
CAATTTACTAGGAGGAGGTTTCTGTTTCTCGTCAAATGAGATTTTAGGTGTATGTGTGGA
CAAAGGAAAAAACACATTCATGGTTTTTCCCGTTTCAAAACTTAGTTCAGACGACATTTT
ATGTCTAATATATGTGGTGTAATGAGTTTAAACGAGATTTAAACAATTCAAATGATGTTT
TGTT
T

QA 1 604 1 604
DS 

RD RS1C714TF 304 0 0
G
GGCCGTTTCATTGTGAGACAGGTTGGTCAGACGATGTCTTATCCAAACAGAAAACAACCA
GACGACAGTAAAACACTCGCTGACCTTCATTTCGAGATTGGAGATTATCTGGATGTAGCA
ATTTACTAGGAGGAGGTTTCTGTTTCTCGTCAAATGAGATTTTAGGTGTATGTGTGGACA
AAGGAAAAAACACATTCATGGTTTTTCCCGTTTCAAAACTTAGTTCAGACGACATTTTAT
GTCTAATATATGTGGTGTAATGAGTTTAAACGAGATTTAAACAATTCAAATGATGTTTTG
TT
T

QA 2 303 2 303
DS 

RD RS1H146JQB 570 0 0
CGTCAATCAACCTCCTCGCGTTAAATCCGAACCTGTCGATCGTGAGAAGACATGTCCCCT
GCTTCTTCGCGTTTTTACAAAGAGCGGTGGTCATCATACGAAGGAAGATTATGCTGTGAG
AGGCAAAGAACCAAAGGATGAAGTTCAAATTTACACTTGGAAAGATGCTAATCTTCGCGA
GTTAACTGGTTTGGTCAAAGAAGTCTCTGTAGCAGCTAGGAGAAGAGACGCAAGGTTGTC
TTTTGCGTTTGTTTATCCAGACAAGAATGGCCGTTTCATTGTGAGACAGGTTGGTCAGAC
GATGTCTTATCCAAACAGAAAACAACCAGACGACAGTAAAACACTCGCTGACCTTCATTT
CGAGATTGGAGATTATCTGGATGTAGCAATTTACTAGGAGGAGGTTTCTGTTTCTCGTCA
AATGAGATTTTAGGTGTATGTGTGGACAAAGGAAAAAACACATTCATGGTTTTTCCCGTT
TCAAAACTTAGTTCAGACGACATTTTATGTCTAATATATGTGGTGTAATGAGTTTAAACG
AGATTTAAACAATTCAAATGATGTTTTGTT

QA 1 570 1 570
DS 

RD RS1BL27JQ 509 0 0
TTT
TTCGCGTTTTTACAAAGAGCGGTGGTCATCATACGAAGGAAGATTATGCTGTGAGTGGCA
AAGAACCAAAGGATGAAGTTCAAATTTACACTTGGAAAGATGCTAATTTTCGCGAGTTAA
CTGATTTGGTCAAAGAAGTTTCTGTAGCAGCTAGGAGAAGAGACGCAAGGTTGTTTTTTG
CGTTTGTTTATCCAGACAAGAATGGCCGTTTCATTGTGAGACAGGTTGGTCAGACGATGT
TTTATCCAAACAGAAAACAACCAGACGACAGTAAAACACTCGCTGACCTTCATTTCGAGA
TTGGAGATTATCTGGATGTAGCAATTTACTAGGAGGAGGTTTCTGTTTTTCGTCAAATGA
GATTTTAGGTGTATGTGTGGACAAAGGAAAAAACACATTCATGGTTTTTCCCGTTTCAAA
ACTTAGTTCAGACGACATTTTATGTTTAATATATGTGGTGTAATGAGTTTAAACGAGATT
TAAACAATTCAAATGATGTTTTGTTT

QA 4 509 4 509
DS 



AS 1 6

CO CL1163Contig1 945 6 8 U
GGACTCATAAACAGAATATCACTCTTTACAGCCATAATTTCCTAGAATGGCGGAGGTTGC
TACCGAAATTGCAAAGAACATGGAGGAAAAGGCGGAGACGCCAGTGACTGTGCCACCAAC
TAAAGCGGTGGAGGCTGCAAGGGCGGAAGAAGCTGAGACCAAGGTGACGGTGACACTTCC
TAAAACGGTCGAGGCTACAAACAAACCGGCGGAACAGGAGGTGAAGCCAACAGAGACGTC
TAGCTTGGTGGGGAAGCTTGAGACAGACGTGGAGATCAAAGCTTCTGCTGAGCAGTTCCA
TCACATGTTCACCGGCAAACCACACCATGTTTCCAAAGCATCCCCAGGCAACATTCAGGG
CTGTGATCTGCACGAAGGCGATTGGGGCAAACCTGGCTCTATCATTTTCTGGAACTACGT
TCATGATGGAGAGGCAAAGGTGGCAAAGGAGAGGATCGAGGCGGTCGAGCCGGAGAAGAA
CTTGATCACGTTCAGGGTTATTGAAGGTGATCTGATGAAAGAGTACAAAAGCTTCTTGCT
CACAATCCAGGTGACCCCTAAGCACGGTGGGGCAGGAAGTATTGTGCACTGGCACCTTGA
GTTCGAGAAGATTAGCGAAGAGGTTGCTCATCCCGAGACTCTCCTCCAGTTCTGTGTCGA
AGTCTCCAAAGAGATCGACGAACATCTCTTGGCCGATGAATAAATCAAAAGGAATATGTG
TTGTGCCTTAAGTTACGTACTTTTACTAAGACAAAATAAAGGACTATGGAGCCCTGTCCG
AGTTTGTGAGAGAGAAATTATGAGTGTGCCATGATTATGTGTGTGTATGGTAAGATCGTT
TTACGTTGTGAGTTGTAACTCTGAGAAGCGACGTGTACTAGCTATGATGAGCAGTGCCGT
CCCAAAATTATTTATGAGAAAAAAGTATAAAAAATGGTTGTGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GJ03TF U 1
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TAAAACGGTCGAGGCTACAAACAAACCGGCGGAACAGGAGGTGAAGCCAACAGAGACGTC
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CTA

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DS 



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ATCACAGCTCTCTCAAAGTCGCTGGAGAGCTCTTTGTCTAAGGCCTTGAGGAGATCCTCA
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GTAATGACC


BQ
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15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RS1D629JQ U 1
AF RS1BX41JQ U 1
AF RS1GG28JQ U 59
AF RS1D629TF C 345
AF RS1BX41TF C 415
BS 1 853 RS1BX41JQ
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BS 1036 1149 RS1D629TF

RD RS1D629JQ 756 0 0
AA
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AGTTTCACACAACTCTTTATTATTCAAAACAAACCAAAAGGGAAACAGAATCAGTACTAT
TCAGACATCTCCATGTCCGAGAAGAGCAACAAGCATGTCCTCATAATCACCAGAAGTGTC
TTTGGCGACGGCACGGTCCAAAGGAACGCTGTTCCTACGCTGATACTCCTCTTTGATGCG
TTCCATGTCAACCTCAGTTCTCGTTGTCACGACTCTGGTCAGTCCCCACTCGTCAGTTCC
CATTTTGTTGATGGCTAGACGCAGAACCTTCTCAAAATGCTTCTCAGGGTACGTCAAACA
AGTGATTGCAGCTCTCAGTAGTTTCAGGTAATCATCATCCGAACCCTCCTTCAAGTTCTT
GTTGATGGAGTTACCATGTTCATTGTTGTAGTGGTTGAGAGTAGCACCGAGCTGAGCTTT
GCTTCTAGTAGTCAAGATTCTGATGAAGTCATCGTCGTTGAAAGCTTTCTCGGAGACTTT
CTCGTGAAGCAGCTTGGCTTCGGATCTCGCGAGCATCATGTTGACGTCGTCTCCTTCGTA
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CTCGACGGCGGACCTCGTGCAAGCGATCTCGACG

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DS 

RD RS1BX41JQ 853 0 0
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ATTCAGACATCTCCATGTCCGAGAAGAGCAACAAGCATGTCCTCATAATCACCAGAAGTG
TCTTTGGCGACGGCACGGTCCAAAGGAACGCTGTTCCTACGCTGATACTCCTCTTTGATG
CGTTCCATGTCAACCTCAGTTCTCGTTGTCACGACTCTGGTCAGTCCCCACTCGTCAGTT
CCCATTTTGTTGATGGCTAGACGCAGAACCTTCTCAAAATGCTTCTCAGGGTACGTCAAA
CAAGTGATTGCAGCTCTCAGTAGTTTCAGGTAATCATCATCCGAACCTTCCTTCAAGTTC
TTGTTGATGGAGTTACCATGTTCATTGTTGTAGTGGTTGAGAGTAGCACCGAGCTGAGCT
TTGCTTCTAGTAGTCAAGATTCTGATGAAGTCATCGTCGTTGAAAGCTTTCTCGGAGACT
TTCTCGTGAAGCAGCTTGGCTTCGGATCTCGCGAGCATCATGTTGACGTCGTCTCCTTCG
TACCTGAAGGTGCTGACCAGAGGAAGCAGGAGCTTGCGGAGGTCACCGGATGTGTGCTGA
GCGACGTCTTCCTCGAGGGATTTTTTGTAACGAGCTTGGTAAGCTTGCTTTACCTTGAAA
AGCTCGACGGCGGACCTCGTGCAAGCGATCTCGACGAGAACCCAGTTGTTCTTGGTGAAC
ATTTTGGTGGATTCTTTGGCCAAGTAAGCGTCTCTCTCCGCTGGATCAAGCGTCCACAAC
ATCACAGCTCTCT

QA 1 853 1 853
DS 

RD RS1GG28JQ 845 0 0
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CTATTCAGACATCTCCATGTCCGAAAAGAGCAACAAGCATGTCCTCATAATCACCAGAAG
TGTCTTTGGCGACGGCACGGTCCAAAGGAACGCTGTTCCTACGCTGATACTCCTCTTTGA
TGCGTTCCATGTCAACCTCAGTTCTCGTTGTCACGACTCTTGTCAGTCCCCACTCGTCAG
TTCCCATTTTGTTGATGGCTAGACGCAGAACCTTCTCAAAATGCTTCTCAGGGTACGTCA
AACAAGTGATTGCAGCTCTCAGTAGTTTCAGGTAATCATCATCCGAACCTTCCTTCAAGT
TCTTGTTGATGGAGTTACCATGTTCATTGTTGTAGTGGTTGAGAGTAGCACCGAGCTGAG
CTTTGCTTCTAGTAGTCAAGATTCTGATGAAGTCATCGTCGTTGAAAGCTTTCTCGGAAA
CTTTCTCGTGAAGCAGCTTGGCTTCGGATCTCGCGAGCATCATGTTGACGTCGTCTCCTT
CGTACCTGAAGGTGCTGACCAGAGGAAGCAGGAGCTTGCGGAGGTCACCGGATGTGTGCT
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ACATCACAGCTCTCTCAA*GTCGCTGGAGAGCTCTTTGTCTAAG*CCTTGAGGAGATCCT
CATTG

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DS 

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CTCTCAGGTACGTC
AACAAGTGAT*GCAGCTCTCAGTAGTTTCAGGTA*TCATCATCCGACCCT**CTTCAAGT
*CTG**TGATGGAGTTACCATGTTCATTGTTGTAGTGGTTGAGAGTAGCACCGAGCTGAG
CTTTGCTTCTAGTAGTCAAGATTCTGATGAAGTCATCGTCGTTGAAAGCTTTCTCGGAGA
CTTTCTCGTGAAGCAGCTTGGCTTCGGATCTCGCGAGCATCATGTTGACGTCGTCTCCTT
CGTACCTGAAGGTGCTGACCAGAGGAAGCAGGAGCTTGCGGAGGTCACCGGATGTGTGCT
GAGCGACGTCTTCCTCGAGGGATTTTTTGTAACGAGCTTGGTAAGCTTGCTTTACCTTGA
AAAGCTCGACGGCGGACCTCGTGCAAGCGATCTCGACGAGAACCCAGTTGTTCTTGGTGA
ACATTTTGGTGGATTCTTTGGCCAAGTAAGCGTCTCTCTCCGCTGGATCAAGCGTCCACA
ACGTCACAGCTCTCTCAAAGTCGCTGGAGAGCTCTTTGTCTAAGGCCTTGAGGAGATCCT
CATTGTAAGTAGCGGCGTAAACGCTGCGGATCATGCTGCGTTGTGCTGCGTTCCTGTGTG
CTAGAATTGATATGATCAGCTTCTCGTTCGTACCCCATCCTGAGAAAGCCTTGTGGAGTT
GCTCGGCGTCATCTTCGGGGAGAGGGACATTGCTCGGGACTTTGAGAGAGGCCATTGTTG
TTTTTGGGATCAGACTTCTAGCTTTGAGATCTCTCTCTGTGTTGTGTTTTTTTTCTCTCG
TTGTAATGACC

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DS 

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TGAGCTTTGCTTCTAGTAGTCAAGATTCTGATGAAGTCATCGTCGTTGAAAGCTTTCTCG
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TGCTGAGCGACGTCTTCCTCGAGGGATTTTTTGTAACGAGCTTGGTAAGCTTGCTTTACC
TTGAAAAGCTCGACGGCGGACCTCGTGCAAGCGATCTCGACGAGAACCCAGTTGTTCTTG
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CACAACATCACAGCTCTCTCAAAGTCGCTGGAGAGCTCTTTGTCTAAGGCCTTGAGGAGG
TCCTCATTGTAAGCAGCGGCGTAAACGCTGCGGATCATGCTGCGTTGTGCTGCGTTCCTG
TGTGCTAGAATTGATATGATCAGCTTCTCGTTCGTACCCCATCCTGAGAAAGCCTTGTGG
AGTTGCTCGGCGTCATCTTCAGGGAGAGGGACATTGCTCGGGACTTTGAGAGAGGCCATT
GTTGTTTTTGGGATCAGACTTCTAGCTTTGAGATCTCTCTCTGTGTTGTGTTTTTTTTCT
CTCGTTGTAAT
CC

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DS 



AS 2 6

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CA49TF U 1
AF RS1CA49JQ C 1
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GG
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TCTGT

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DS 

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GGTTGAAGAGGAAGCGCAGAAAGATGAGACAGCGATCTAAGTAGTCTGTTTCATCGTATG
CCTTATCAATAAATCTCTGTGTTGCCTCCCTTTCTTGTTTCTCGAACCAGTTATGTTTTT
TTAATTATCACATTTTAAGTTTCAAACTATTTTCTGTAGAACATGTTTTGCTCACTCGTT
TTATTATCTACTACAAGCAGAGATTTATTT

QA 1 270 1 270
DS 



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TTACTAGTTTACTGATT


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CD67JQ C 1
AF RS1GI36TF U 1
AF RS1CD67TF U 1
AF RS1CD69TF U 3
BS 1 4 RS1CD67JQ
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GAGGTTGAAGAGGAAGCGCAGAAAGATGAGACAGAGATCTAAGTAGAGTCTGTTGTCATC
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TTTAATATCTACTACAAGCAGAGATTTAT
CC

QA 1 269 1 269
DS 

RD RS1GI36TF 253 0 0
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TGCCTTATCTATAAATCTCTGTGTTTCCCTTTCTTGTTTCTTGAACCAGTTATGTTTTTA
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ATATCTACT

QA 5 253 5 253
DS 

RD RS1CD67TF 271 0 0
GGGC
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TTGAAGAGGAAGCGCAGAAAGATGAGACAGAGATCTAAGTAGAGTCTGTTGTCATCGTAT
TGCCTTATCTATAAATCTCTGTGTTTCCCTTTCTTGTTTCTTGAACCAGTTATGTTTTTA
ATTTTTTACGTTTAAGTTGCAAACAATCTTCTGTAGAACATGTCTTGCTCACTCGTTTTA
ATATCTACTACAAGCAGAGATTTAT
CC

QA 5 269 5 269
DS 

RD RS1CD69TF 315 0 0
GG
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TTGAAGAGGAAGCGCAGAAAGATGAGACAGAGATCTAAGTAGAGTCTGTTGTCATCGTAT
TGCCTTATCTATAAATCTCTGTGTTTCCCTTTCTTGTTTCTTGAACCAGTTATGTTTTTA
ATTTTTTACGTTTAAGTTGCAAACAATCTTCTGTAGAACATGTCTTGCTCACTCGTTTTA
ATATCTACTACAAGCAGAGATTTATCTTAATAATTTTCTGGATATGTTAATGTTTATTAC
TAGTTTACTGATT

QA 3 315 3 315
DS 



AS 1 5

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AGGCTTTTCCTGGAAACCCCATGGATTCTTATTTGCCCAGTTCCATTGATCTCTGCACAT
CTCATCCACTCCATATTGTGCCTTCCATTTGAGTTCTTTCTCAGCTCTCTCAGTTGAAGC
ATAAACAGCTGTTGCATCTCCAGCTCTTCTTGGACATAGCTTCATTGGGATTTTCTTGCC
AGAAGCTTTTTCGAAAGCAGAAACCATTTCCAAGACAGAAGTTCCTTGACCAGTCCCAAG
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TCCATCTGCTAAATCCATTACATGGATATAGTCTCTGACCGCGCTACCATCCGGTGTAGG
ATAGTCATGTCCAAATACATTGAGCTCAGGTAACCTTCCAACCGCAACTTGCTGGATATA
AGGCATGAGATTGTTCGGTATGCCCTTTGGATCTTCTCCGATCCTCCCGCTCTCGTGAGC
TCCAACTGGATTGAAGTACCTCAGAAGAATTATCCTCCACTCTGGCTCTGCCGCGTGGAT
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TAAGTTGTTGTCAAAGTAACGACGAGGGTTTGCAACACTTTCACCCACAGCTTTAAGACC
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GTTTCTCAAATCACCCAGATGGAATTCAAGCTTGGAAGAGAGATCAGGACCAACAAGCTC
ACGAACCCTATGGACAGCTTCAAGGACAGAGTTATCAAGATTGTCGATGATGGAAACCTT
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AACGTAGCCGTGAACGGAATAAAGGAAGAGGTTAAGATGGAGAAATCTCCTTTTTGATGG
TTTCTTTTATGTTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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CTC

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CC

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DS 



AS 2 6

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BQ
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20 20 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F984TF U 1
AF RS1E905TF U 1
AF RS1EY67TF U 186
BS 1 255 RS1E905TF
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RD RS1F984TF 662 0 0
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CCTCGTCCTCCCAGATGGGTGAGCTTGTAGCTGACAAGCATGTACGTTACATTCTTATGG
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CCTACTGGGGACTCACCACTCTAGACTTACTCGACAAGCTTCCCTCTGTTTCCGTTGATG
AAGTCGTTTCATGGCTCATCACCTGCCAGCACGAATCTGGTGGCTTTGCCGGAAATACTG
GACATGACCCCCATGTTTTATATACACTGAGTGCTGTACAAATCTTGGCCCTCTTTGACA
AACTAGACATTCTTGACGTTGCAAAAGTATCAAGCTATATTGCTGGTTTGCAGAACGAAG
ATGGATCCTTCTCTGGAGATATGTGGGGCGAAGTAGACACGAGGTTTTCCTACATTGCCA
TATGCTGTCTCTCAATTTTGAAATGTCTTGACAAAATCAATGTAGAGAAGGCCGTTGATT
ACATTGTTAGCTGCAAAAACCTTGATGGTGGTTTTGGGTGCACACCCGGAGCAGAATCAC
ATGCAGGACGGATTTTCTGTTGCGTGGGTGCTCTTGCTATCACCGGGAGTCTCCATCATG
TC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RS1E905TF 778 0 0
GGGCCTCCAATCGCGCGACTCGTCTTCCGTCTCCAATCAAGCTGATGAGCTCTTCGTCTT
CCTCGTCCTCCCAGATGGGTGAGCTTGTAGCTGACAAGCATGTACGTTACATTCTTATGG
CAGAAAAGAAGAAAGAGAGTTTTGAGTCGGTGGTGATGGATCATCTAAGAATGAATGGTG
CCTACTGGGGACTCACCACTCTAGACTTACTCGACAAGCTTCCCTCTGTTTCCGTTGATG
AAGTCGTTTCATGGCGCATCACCTGCCAGCACGAATCTGGTGGCTTTGCCGGAAATACTG
GACATGACCCCCATGTTTTATATACACTGGGTGCTGTACAAATCTTGACCCTCTTTGACA
AACTAGACATTCTTGACGTTGCAAAAGTATCAAGCTATATTGCTGGTTTGCAGAACTAAG
ATGGATCCTTCTCTGGAGATATGTGGGGCGAAGTAGACACGAGGTTTTCCTACATTGCCA
TATGCTGTCTCTCAATTTTGAAATGTCTTGACAAAATCAATGTAGAGAAGGCCGTTGATT
ACATTGTTAGCTGCAAAAACCTTGATGGTGGTTTTGGGTACACACCCGGAGCAGAATCAC
ATGCAGGACAGATTTTCTGTTGCGTGGGTGCTCTTGCTATCACCGGGAGTCTCCATCATG
TCGATAAG*ACTTACTCGGGTGGTGGTTATGTGAAAGACA*GTCAAGTCAGGGG**TTAA
ATGGACGACCCGAGAAACTTCCTGATGTTTGCTATTCTTGGTGGGTC*TATCTAGCCT

QA 1 778 1 778
DS 

RD RS1EY67TF 809 0 0
G
GGGGACTCACCACTCTAGACTTACTCGACAAGCTTCCCTCTGTTTCCGTTGATGAAGTCG
TTTCATGGCTCATCACCTGCCAGCACGAATCTGGTGGCTTTGCCGGAAATACTGGACATG
ACCCCCATGTTTTATATACACTGAGTGCTGTACAAATCTTGGCCCTCTTTGACAAACTAG
ACATTCTTGACGTTGCAAAAGTATCAAGCTATATTGCTGGTTTGCAGAACGAAGATGGAT
CCTTCTCTGGAGATATGTGGGGCGAAGTAGACATGAGGTTTTCCTACATTGCCATATGCT
GTCTCTCAATTTTGAAATGTCTTGACAAAATCAATGTAGAGAAGGCCGTTGATTACATTG
TTAGCTGCAAAAACCTTGATGGTGGTTTTGGGTGCACACCCGGAGCAGAATCACATGCAG
GACAGATTTTCTGTTGCGTGGGTGCTCTTGCTATCACCGGGAGTCTCCATCATGTCGATA
AGGACTTACTCGGGTGGTGGTTATGTGAAAGACAAGTCAAGTCAGGGGGTTTAAATGGAC
GACCCGAGAAACTTCCTGATGTTTGCTATTCTTGGTGGGTCCTATCTAGCCTAATCATGA
TAGATAGAGTTCACTGGATCAACAAAGCAAAGCTTGTCAAGTTCATCTTGGATTGTCAGA
TTTGGAGAACGGAGGTATCTCAGACAGACCTGACGATGCTGTTGATATCTTCACACTACT
TTGGAGTGCAGGCTTTCCCTCCTCGAGTATCTGGAGTCAAACCAATTGATCCAGCCTACG
CTTTGCCTGTTGATGTCATCAATCGAAT

QA 2 809 2 809
DS 



CO CL1167Contig2 679 3 2 U
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ACCAAGAGTTGCAATCATCACATCTTCCATTAGTAGATCACTTGAATCCACATGGTTCGT
TTAATATTCCCAAATTACAATTTCCTCGTTGATCATGCATTCAAATGAACTTCTAAAACC
GTCTAAGTAAAACCAACCAATGAACAACGCAAAGAACTGCCATTGCCTTTATTTGGTTAG
GAGAATTCGATTGATGACATCAACAGGCAAAGCGTAGGCTGGATCAATTGGTTTGACTCC
AGGATACTCGAGGAGGGAAAGCCCTGCAACTCCAAAGTAGGTGTGGAAAATATCAACAGC
ATCGTCAGGTCTGTCTGAAATACCTCCGTTCTCCAAATCCTGACAATCCAAGATGAACTT
GACAAGCTTTGCTTTGTTGATCCAGTGAACTCTATCTATCATGATTAGGCTAGATAGGAC
CCACCAAGAATAGCAAACATCAGGAAGTTTCTCGGGTCGTCCATTTAAACCCCCTGACTT
GACTTGTCTTTCACATAACCACCACCCGAGTAAGTCCTTATCGACATGATGGAGACTCCC
GGTGATAGCAAGAGCACCCACGCAACAGAAAATCCGTCCTGCATGTGATTCTGCTCCGGG
TGTGCACCCAAAACCACCA


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EY67JQ U 1
AF RS1E905JQ U 2
AF RS1F984JQ U 1
BS 1 623 RS1EY67JQ
BS 624 679 RS1F984JQ

RD RS1EY67JQ 623 0 0
GGAGAAAGAAAACACTAATGTGATTTATAATAAGAGTTCTGCAAATTTCTCAAGGAATGG
ACCAAGAGTTGCAATCATCACATCTTCCATTAGTAGATCACTTGAATCCACATGGTTCGT
TTAATATTCCCAAATTACAATTTCCTCGTTGATCATGCATTCAAATGAACTTCTAAAACC
GTCTAAGTAAAACCAACCAATGAACAACGCAAAGAACTGCCATTGCCTTTATTTGGTTAG
GAGAATTCGATTGATGACATCAACAGGCAAAGCGTAGGCTGGATCAATTGGTTTGACTCC
AGGATACTCGAGGAGGGAAAGCCCTGCAACTCCAAAGTAGGTGTGGAAAATATCAACAGC
ATCGTCAGGTCTGTCTGAAATACCTCCGTTCTCCAAATCCTGACAATCCAAGATGAACTT
GACAAGCTTTGCTTTGTTGATCCAGTGAACTCTATCTATCATGATTAGGCTAGATAGGAC
CCACCAAGAATAGCAAACATCAGGAAGTTTCTCGGGTCGTCCATTTAAACCCCCTGACTT
GACTTGTCTTTCACATAACCACCACCCGAGTAAGTCCTTATCGACATGATGGAGACTCCC
GGTGATAGCAAGAGCACCCACGC

QA 1 623 1 623
DS 

RD RS1E905JQ 644 0 0
GAGAAAGAAAACACTAATGTGATTTATAATAAGAGTTCTGAAAATTTCTCAAGGAATGGA
CCAAGAGTTGCAATCATCACATCTTCCATTAGTAGATCACTTGAATCCACATGGTTCGTT
TAATATTCCCAAATTACAATTTCCTCGTTGATCATGCATTCAAATGAACTTCTAAAACCG
TCTAAGTAAAACCAACCAATGAACAACGCAAAGAACTGCCATTGCCTTTATTTGGTTAGG
AGAATTCGATTGATGACATCAACAGGCAAAGCGTAGGCTGGATCAATTGGTTTGACTCCA
GGATACTCGAGGAGGGAAAGCCCTGCAACTCCAAAGTAGGTGTGGAAGATATCAACAGCA
TCGTCAGGTCTGTCTGAAATACCTCCGTTCTCCAAATCCTGACAATCCAAGATGAACTTG
ACAAGCTTTGCTTTGTTGATCCAGTGAACTCTATCTATCATGATTAGGCTAGATAGGACC
CACCAAGAATAGCAAACATCAGGAAGTTTCTCGGGTCGTCCATTTAAACCCCCTGACTTG
ACTTGTCTTTCACATAACCACCACCCGAGTAAGTCCTTATCGACATGATGGAGACTCCCG
GTGATAGCAAGAGCACCCACGCAACAGAAAATCTGTCCTGCATG

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1F984JQ 679 0 0
A
GAGAAAGAAAACACTAATGTGATTTATAATAAGAGTTCTGCAAATTTCTCAGGGAATGGA
CCAAGAGTTGCAATCATCACATCTTCCATTAGTAAATCACTTGAATCCACATGGTTCGTT
TAATATTCCCAAATTACAATTTCCTCGTTGATCATGCATTCAAATGAACTTCTAAAACCG
TCTAAGTAAAACCAACCAATGAACAACGCAAAGAACTGCCATTGCCTTTATTTGGTTAGG
AGAATTCGATTGATGACATCAACAGGCAAAGCGTAGGCTGGATCAATTGGTTTGACTCCA
GGATACTCGAGGAGGGAAAGCCCTGCAACTCCAAAGTAGGTGTGGAAAATATCAACAGCA
TCGTCAGGTCTGTCTGAAATACCTCCCTTCTCCAAATCCTGACAATCCAAGATGAACTTG
ACAAGCTTTGCTTTGTTGATCCAGTGAACTCTATCTATCATGAT*AGGCTAGATAGGACC
CACCAAGAATAGCAAACATCAGGAAGTTTCTCGGGTCGTCCATTTAAACCTCCTGACTTG
ACTTGTCTTTCACATAACCACCACCCGAGTAAGTCCTTATCGACATGATGGAGACTCCCG
GTGATAGCAAGAGCACCCACGCAACAGAAAATCCGTCCTGCATGTGATTCTGCTCCGGGT
GTGCACCCAAAACCACCA

QA 2 679 2 679
DS 



AS 1 6

CO CL1168Contig1 728 6 7 U
GCTAAAGAAATCAAAAATAAAATTATACTGCAGAAGGAACATAAAGAAAGTCGAAAGGAT
TTGATTTTTAAGATCAAGGTCACATAATAACGCATAGAAGTAGTATCTGTCTCTCCTCAT
AAAACAACAACAAAAACGGATGGAACACATTCCACGAGTATAACAAGCTCTTCCCTCACT
TGAGAGGAATGAAACGAGAGGAGTGGGTAGCACCAACACCAGGCCTACCGTGCTTAACCG
GCTTGTATGAGATGGAGAACTCAGCCAGGTAGTGACCAATCATCTCAGGCTTGATCTCGA
CCTGGTTAAACGTCTTTCCATTGTACACACCAATGATGCTTCCGATCATCTCAGGGACAA
TGATCATGTTCCTCAGGTGGGTTCTCACTGGTTCTGGTTTCTCACCTTGTGGTGCCTCCC
TTTTCGCCTTGCGAAGCTTCTTAATCAGAGCCATTGGCTTCCTGGTCAAACCTCTAGAGA
ACCTTCTACGAATACGAGAAGGGAAGAGCTTGACAAGGTCATCAGTAGACATATCGAGAA
GAGCATCGAGATCTACTCCTTTGAAGGCAAACTTCTTGAACGTCCTCTTCTTCGGGACTC
CAGCCGCAGCAACCTCTGGTTCCACATCCGCCATGCTTAGATCTCGGTGAAAGTATAAAA
CCCTACGCAGCTACAGACTTGACTTGAGAGACTGGTTGTCTTTGCGTGAGGTTAACAGAG
AGAGAGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1H439JQB U 1
AF RS1GQ62JQ U 46
AF RS1H439TF C 1
AF RS1GQ62TF C 70
AF RS1CK83JQ U 46
AF RS1CK83TF C 46
BS 1 281 RS1H439JQB
BS 282 282 RS1GQ62JQ
BS 283 476 RS1H439JQB
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BS 511 511 RS1CK83JQ
BS 512 656 RS1GQ62JQ
BS 657 728 RS1CK83JQ

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GCTTGTATGAGATGGAGAACTCAGCCAGGTAGTGACCAATCCTCTCAGGCTTGATCTCGA
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GA
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CCGTGCTTAACCGGCTTGTATGAGATGGAGAACTCAGCCAGGTAGTGACCAATCATCTCA
GGCTTGATCTCGACCTGGTTAAACGTCTTTCCATTGTACACACCAATGATGCTTCCGATC
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TTCTTCGGGACTCCAGCCGCAGCAACCTCTGGTTCCACATCCGCCATGCTTAGATCTCGG
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QA 3 611 3 611
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AAAACAACAACAAAAACGGATGGAACACATTCCACGAGTATAACAAGCTCTTCCCTCACT
TGAGAGGAATGAAACGAGAGGAGTGGGTAGCACCAACACCAGGCCTACCGTGCTTAACCG
GCTTGTATGAGATGGAGAACTCAGCCAGGTAGTGACCAATCCTCTCAGGCTTGATCTCGA
CCTGGTTAAACGTCTTTCCATTGTACACACCAATGATGCTTCCGATCATCTCAGGGACAA
TGATCATGTTCCTCAGGTGGGTTCTCACTGGTTCTGGTTTCTCACCTTGTGGTGCCTCCC
TTTTCGCCTTGCGAAGCTTCTTAATCAGAGCCATTGGCTTCCTGGTCAAACCTCTAGAGA
ACCTTCTACGAATACGAGAAGGGAAGAGCTTGACAAGGTCATCAGTAGACATATCGAGAA
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CC

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DS 

RD RS1GQ62TF 640 0 0
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ACGTCTTTCCATTGTACACACCAATGATGCTTCCGATCATCTCAGGGACAATGATCATGT
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TGCGAAGCTTCTTAATCAGAGCCATTGGCTTCCTGGTCAAACCTCTAGAGAACCTTCTAC
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CAACCTCTGGTTCCACATCCGCCATGCTTAGATCTCGGTGAAAGTATAAAACCCTACGCA
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CC

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CCGTGCTTAACCGGCTTGTATGAGATGGAGAACTCAGCCAGGTAGTGACCAATCATCTCA
GGCTTGATCTCGACCTGGTTAAACGTCTTTCCATTGTACACACCAATGATGCTTCCGATC
ATCTCAGGGACAATGATCATGTTCCTAAGGTGGGTTCTCACTGGTTCTGGTTTCTCACCT
TGTGGTGCCTCCCTTTTCGCCTTGCGAAGCTTCTTAATCAGAGCCATTGGCTTCCTGGTC
AAACCTCTAGAGAACCTTCTACGAATACGAGAAGGGAAGAGCTTGACAAGGTCATCAGTA
GACATATCGAGAAGAGCATCGAGATCTACTCCTTTGAAGGCAAACTTCTTGAACGTCCTC
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GG
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TGTCTCTCCTCATAAAACAACAACAAAAACGGATGGAACACATTCCACGAGTATAACAAG
CTCTTCCCTCACTTGAGAGGAATGAAACGAGAGGAGTGGGTAGCACCAACACCAGGCCTA
CCGTGCTTAACCGGCTTGTATGAGATGGAGAACTCAGCCAGGTAGTGACCAATCATCTCA
GGCTTGATCTCGACCTGGTTAAACGTCTTTCCATTGTACACACCAATGATGCTTCCGATC
ATCTCAGGGACAATGATCATGTTCCTAAGGTGGGTTCTCACTGGTTCTGGTTTCTCACCT
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AAACCTCTAGAGAACCTTCTACGAATACGAGAAGGGAAGAGCTTGACAAGGTCATCAGTA
GACATATCGAGAAGAGCATCGAGATCTACTCCTTTGAAGGCAAACTTCTTGAACGTCCTC
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TGAAAGTATAAAACCCTACGCAGCTACAGACTTGACTTGAGAGACTGGTTGTCTTTGCGT
GAGGTTAACAGAGAGAGAGCC

QA 3 683 3 683
DS 



AS 2 6

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BQ
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15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C906TF U 1
AF RS1EK96TF U 1
BS 1 336 RS1C906TF
BS 337 337 RS1EK96TF
BS 338 491 RS1C906TF
BS 492 492 RS1EK96TF
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BS 569 671 RS1C906TF
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QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1EK96TF 717 0 0
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CTTCTTCGCTTTAGCTCCTGAGGAGAAACTGAAGTTCGACATGTCCGGTGGTAAAAAGGG
AGGATTCATTGTCTCTAGTCATCTTCAGGGAGAGTCTGTTCAAGATTGGAGAGAGATCGT
GACGTATTTCTCGTACCCGGTGAGAAACAGAGACTACTTACGGTGGCCGACTAAGCCGGA
AGGGTGGGTGAAAGTGACGGAGGAGTACAGCGAGAAGCTGATGAGTTTGGCTTGTAAACT
TCTTGAGGTTTTGTCTGAAGCTATGGGACTTGAGAAAGAGGCACTTACCAATGCATGCGT
CGATATGGACCAGAAAATAGTTGTTAACTATTACCCAAAATGCCCTCAGCCTGATCTAAC
CCTCGTACTCAAGCGTCACACCGACCCCGGAACCATCACTTTGCTGCTCCAGGACCA

QA 1 717 1 717
DS 



CO CL1169Contig2 893 4 7 U
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TACTCATCTTTCTCTTATACATCTCCGCAAACGTAATAGGCTCCTCCAGGATCGGCTTCT
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CTATTGATAATCTGCTCGAGTTGGAGTTCACCACGGCCTGGTGGTCAGCGTTCTTGAATC
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CAGGCTGAGGGCATTTTGGGTAATAGTTAACAACTATTTTCTGGCCCATATCGACGCATG
CATTGGTAAGTGCCTCTTTCTCAAGCCCCATAGCTTCAGACAAAACCTCAAGAAGTTTAC
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TAGTCGGCCACCGTGAGTAGTCTCTGTTTCTCACCGGGTACGAGAAATACGTCACGATCT
CTCTCCAATCTTGAACAGACTCTCCCTGAAGATGACTAGAGACAATGAATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 5 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1C906JQ U 8
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GC
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C*AACATGACATAACTTAATTTCAGTACCAACTTACACAACCGAACCAACACAATAGCAA
GGGCCCAACA*CAATGAGTCTAAGCGATGATTTGGTCGAGAGGCTTGGCAGCTTCCTTGT
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GGCATTTTGGG

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DS 

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GT
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GGGGCCAACAACAAGGAGTCTAAGCGATGATTTGGTCGAGAGGCTTGGCAGCTTCCTTGT
GGTCATGTTCTTCTTTCGCCAGCTTCTTGAGGCGAGCCAGCTCAAGATCTCTACTCATCT
TTCTCTTATACATCTCCGCAAACGTAATAGGCTCCTCCAGGATCGGCTTCTCTCCTTCTC
TCACTTTAAGCGGATACACGGTGGCTTCCGGCGCCGGATTCTGGAACGTGGCTATTGATA
ATCTGCTCGAGTTGGAGTTCACCACGGCCTGGTGGTCAGCGTTCTTGAATCTCCCGTTGC
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ACCGTGAGTAGTCTCTG

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CAGACAAAACCTCAAGAAGTTTACAAGCCAAACTCATCAGCTTCTCGCTGTACTCCTCCG
TCACTTTCACCCACCCTTCCGGCTTAGTCGGCCACCGTGAGTAGTCTCTGTTTCTCACCG
GGTACGAGAAATACGTCACGATCTCTCTCCAATCTTGAACAGACTCTCCCTGAAGATGAC
TAGAGACAATGAATCCC

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DS 



AS 1 4

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TCGAATTAAACATACAAACCAGCCACAGGTTCATTACTGGTAATAAGAAGTGAAATCTAA
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ATGAACTCCAGTTTCAGATACTCAGCAATATCATAATTCTTTATTATACGGAAAAGCGTT
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TCGTCGAACTTACTTTCCAACACATTTCGAACCATGTTCTTGACATGAAGCGGGTGAGGC
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TGCAAGTTGTTCAGCGCTTGCCTCATATCACCATCAGCTGTGAAGATTATCGCCTCAAGG
CCTTCAGGTACATAAGGAACATTCTCAGCTTGAACGACGACCATGAGACGGCCAAGTATG
TCCTGATCAGATAACCTAGAGAATCGAACAAAAGCGCATCTACTCTGGATAGGCTCAATA
ATCTTGCCAGAGGTGTTACAAGCAAGTGCAAAGCGGGTAGAGTTTGAGTAGATCTCAATC
GTTCTCCTCAAGGCTTGCTGTGCTCCAGATGTCATGCTGTCAGCTTCATCAAGAATGACA
ACCTTATGACGGCCAGGAGGAAGTGTGACTTTCTTCTGAGCAAACATCTTAATCTTGTTC
CTAACAACATCGATACCCCTATCATCAGAAGCATTCAACTCGAGAACAGCCTCTCTATAA
TTAGGGCCGAGAAGCTCGTGTGCAAGAGCCAAAATGCTTGTGGTTTTACCCGTTCCAGGA
GGTCCGGCGAGGATAAGATTGGGCATGTTGCCATCGCGAGCGATGACTTGAAGCCTTGAG
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GGGATCTCGTAACCGCCTCCCGAACTGTTCGAAGACGATGACGCCATTGTTATTGTTCAC
AAGATAGAATCTCCCGACGGATTTTAGATTTGGGGATTTTTCTTTTCTGGTTTGGCC


BQ
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AF RS1D526TF C 93
AF RS1E540TF C 606
BS 1 23 RS1E573JQ
BS 24 24 RS1D526JQ
BS 25 82 RS1E573JQ
BS 83 83 RS1D526JQ
BS 84 101 RS1E573JQ
BS 102 103 RS1D526JQ
BS 104 104 RS1E573JQ
BS 105 105 RS1D526JQ
BS 106 106 RS1E573JQ
BS 107 107 RS1D526JQ
BS 108 133 RS1E573JQ
BS 134 134 RS1D526JQ
BS 135 170 RS1E573JQ
BS 171 171 RS1D526JQ
BS 172 233 RS1E573JQ
BS 234 234 RS1D526JQ
BS 235 248 RS1E573JQ
BS 249 249 RS1D526JQ
BS 250 256 RS1E573JQ
BS 257 257 RS1D526JQ
BS 258 266 RS1E573JQ
BS 267 267 RS1D526JQ
BS 268 278 RS1E573JQ
BS 279 279 RS1D526JQ
BS 280 328 RS1E573JQ
BS 329 329 RS1D526JQ
BS 330 334 RS1E573JQ
BS 335 335 RS1D526JQ
BS 336 365 RS1E573JQ
BS 366 366 RS1D526JQ
BS 367 437 RS1E573JQ
BS 438 438 RS1D526JQ
BS 439 467 RS1E573JQ
BS 468 468 RS1D526JQ
BS 469 617 RS1E573JQ
BS 618 618 RS1D526JQ
BS 619 630 RS1E573JQ
BS 631 632 RS1D526JQ
BS 633 751 RS1E573JQ
BS 752 791 RS1D526JQ
BS 792 872 RS1D526TF
BS 873 1197 RS1E540TF

RD RS1E573JQ 751 0 0
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TCGAATTAAACATACAAACCAGTCACAGGTTCATTACTGGTGGTGATAAGTGAAATCTAA
CTGGCCTAAGCTGATTTCGCTGTTTCACGAACAACGGCCAACTTAGCAAGAAGACCACAT
AGCTGGAGGTATGATCCAACTCCATCACAGATTCTCATATGAGCAAACCCAGTCTCCTTC
ATGAACTCAAGTTTCAAATACTCAGCCATATCATAATTTTTTATTATACGGAAAAGCGTT
GTGATAATGTCGGTGGGAGAGTAGCCTAAATCGTATAGCTGCTTCATGCCGTGACAAGCA
TCGTCAAACTTACTTTCCAACACATTTCGAACCATGTTCTTGACATGAAGCGGGTGAGGC
TGGTCACAGACCTTGAAAACGTTTTCTTGATTGACAAAGCGGAACCCGCTGAATGTGGCT
TGCAAGTTGTTCAGCGCTTGCCTCATATCACCATCAGCTGTGAAGATTATCGCCTCAAGG
CCTTCAGGTACATAAGGAACATTCTCAGCTTGAACGACGACCATGAGACGGCCAAGTATG
TCCTGATCAGATAACCTGGAGAATCGAACAGGAGCGCATCTACTCTGGATAGGCTCAATA
ATCTTGCCAGAGGTGTTACAAGCAAGTGCAAAGCGGGTAGAGTTTGAGTAGATCTCAATC
GTTCTCCTCAAGGCTTGCTGTGCTCCAGATG

QA 1 751 1 751
DS 

RD RS1D526JQ 794 0 0
GAA
AAGCTTTGCATTGCAAGATCTTATCCAAACTGTCAAACAACCGAGAGTTAACCAACTCGA
ATTAAACATACAAACCAGCTACAGGTTCATTACTGGTAATAAGTGG*GAAATCTAACTGG
CCTAAGCTGCTTTCGCTGTTTCACGAACAACGGCCAACTTAGCAAGCAGACCACATAGCT
GGAGGTATGATCCAACTCCATCACAGATTCTCATATGAGCAAACCCAGTTTCCTTCATGA
ACTCCAGTTTCAGATACTCAGCAATATCATAATTCTTTATTATACGGAAAAGCGTTGTGA
TAATGTCGGTGGGAGAGTAGCCTAGATCGTGTAGCTGCTTCATGCCGTGACAAGCATCGT
CGAACTTACTTTCCAACACATTTCGAACCATGTTCTTGACATGAAGCGGGTGAGGCTGGT
CACAGACCTTGAAGACGTTTTCTTGATTGACAAAGCGGAACCCACTGAATGTGGCTTGCA
AGTTGTTCAGCGCTTGCCTCATATCACCATCAGCTGTGAAGATTATCGCCTCAAGGCCTT
CAGGTACATAAGGAACATTCTCAGCTTGAACGACGACCATGAGACGGCCAAGTATGTCCT
GATCAGATAACCTAGAGAATCGAACTAAAGCGCATCTACTCTGGATAGGCTCAATAATCT
TGCCGGAGGTGTTACAAGCAAGTGCAAAGCGGGTAGAGTTTGAGTAGATCTCAATCGTTC
TCCTCAAGGCTTGCTGTGCTCCAGATGTCATGCTGTCAGCTTCATCAAGAATGACAACCT
TATGACG
CCAG

QA 4 790 4 790
DS 

RD RS1D526TF 781 0 0
GTCATACTGTAATAAGTGG
GAAATCTAACTGGC*TAAGCTGCTTTCGCTGTTTCACGAACAACGGCCAACTTAGCAAGC
AGACCACATAGCTGGAGGTATGATCCAACTCCATCACAGATTCTCATATGAGCAAACCCA
GTTTCTTTCATGAACTCCAGTTTCAGATACTCAGCAATATCATAATTCTTTATTATACGG
AAAAGCGTTGTGATAATGTCGGTGGGAGAGTAGCCTAGATCGTGTAGCTGCTTCATGCCG
TGACAAGCATCGTCGAACTTACTTTCCAACACATTTCGAACCATGTTCTTGACATGAAGC
GGGTGAGGCTGGTCACAGACCTTGAAGACGTTTTCTTGATTGACAAAGCGGAACCCACTG
AATGTGGCTTGCAAGTTGTTCAGCGCTTGCCTCATATCACCATCAGCTGTGAAGATTATC
GCCTCAAGGCCTTCAGGTACATAAGGAACATTCTCAGCTTGAACGACGACCATGAGACGG
CCAAGTATGTCCTGATCAGATAACCTAGAGAATCGAACTAAAGCGCATCTACTCTGGATA
GGCTCAATAATCTTGCCGGAGGTGTTACAAGCAAGTGCAAAGCGGGTAGAGTTTGAGTAG
ATCTCAATCGTTCTCCTCAAGGCTTGCTGTGCTCCAGATGTCATGCTGTCAGCTTCATCA
AGAATGACAACCTTATGACGGCCAGGAGGAAGTGTGACTTTCTTCTGAGCAAACATCTTA
ATCTTGTTCCTAACAACATCGATACCCCTATCATCAGAAGC
C

QA 20 780 20 780
DS 

RD RS1E540TF 592 0 0
ATCAGATAACCTGGAGAATCGAACAAGAGCGCATCTACTCTGGATAGGCTCAATAATCTT
GCCAGAGGTGTTACAAGCAAGTGCAAAGCGGGTAGAGTTTGAGTAGATCTCAATCGTTCT
CCTCAAGGCTTGCTGTGCTCCAGATGTCATGCTGTCAGCTTCATCAAGAATGACAACCTT
ATGACGGCCAGGAGGAGGTGTGACTTTCTTCTGAGCAAACATCTTAATCTTGTTCCTAAC
AATATCGATACCCCTATCATCAGAAGCATTCAACTCGAGAACAGCCTCTCTATAATTAGG
GCCGAGAAGCTCGTGTGCAAGAGCCAAAATGCTTGTGGTTTTACCCGTTCCAGGAGGTCC
GGCGAGGATAAGATTGGGCATGTTGCCATCGCGAGCGATGACTTGAAGCCTTGAGACAGC
ATCTTCGTTCCCGACGATATCAACCACCTTGCTCGGCCTGTATTTCTCCACCCACGGGAT
CTCGTAACCGCCTCCCGAACTGTTCGAAGACGATGACGCCATTGTTATTGTTCACAAGAT
AGAATCTCCCGACGGATTTTAGATTTGGGGATTTTTCTTTTCTGGTTTGGCC

QA 1 592 1 592
DS 



AS 2 5

CO CL1171Contig1 750 2 4 U
GGGTTGCTCTAGAAACACAAACACTAGAAACAAAAATCTCAGATTGAAGAGAGTTTGTAC
TTGTGTTGGAGCAAAAGAAAATGGCTAGCTTCACTGCCTCTGCTTCCACCGTGTCTGTCG
CTCGTCCTGCTCTCCTTCTCAAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAG
GCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATACCGGGC
TCTTTGAGTCTGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAATCCCTTAACGAGGATCCATTGGA
GGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCTGTTCTTGGTTTGCCTCCAA
TGAGTAAGAGGAAGGGAGGAGTGAAATGCTCAATGGAGTCAAAGCAAGGAAACGTCTCAG
CCGTTGGAGCAGGAGTTTCCGCTGCTGCGACTGCAGCTTTGACGGCTGTGATGAGCAACC
CGGCCATGGCGTTGGTGGATGACAGGATGTCCACGGAAGGAACAGGATCACCATTTGGGC
TGAGCAACAACCTATTGGGTTGGATTCTTTTGGGAGTGTTTGGTTTGATCTGGACTTTAC
TTTACCTACACTTCATCTCTCGACGAGGATGAAGAGTCTGGTCTTTCTCTCTGAATATGT
ACTACTACTATATGTCTCTTTTAGCCTTCATCAGTGTTCATCTCTCTCATTTTCATCCTC
ATGTCAGGACATGAATCAACAATATGATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FH58TF U 1
AF RS1FH58JQ C 243
BS 1 727 RS1FH58TF
BS 728 728 RS1FH58JQ
BS 729 741 RS1FH58TF
BS 742 750 RS1FH58JQ

RD RS1FH58TF 746 0 0
GGGTTGCTCTAGAAACACAAACACTAGAAACAAAAATCTCAGATTGAAGAGAGTTTGTAC
TTGTGTTGGAGCAAAAGAAAATGGCTAGCTTCACTGCCTCTGCTTCCACCGTGTCTGTCG
CTCGTCCTGCTCTCCTTCTCAAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAG
GCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATACCGGGC
TCTTTGAGTCTGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAATCCCTTAACGAGGATCCATTGGA
GGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCTGTTCTTGGTTTGCCTCCAA
TGAGTAAGAGGAAGGGAGGAGTGAAATGCTCAATGGAGTCAAAGCAAGGAAACGTCTCAG
CCGTTGGAGCAGGAGTTTCCGCTGCTGCGACTGCAGCTTTGACGGCTGTGATGAGCAACC
CGGCCATGGCGTTGGTGGATGACAGGATGTCCACGGAAGGAACAGGATCACCATTTGGGC
TGAGCAACAACCTATTGGGTTGGATTCTTTTGGGAGTGTTTGGTTTGATCTGGACTTTAC
TTTACCTACACTTCATCTCTCGACGAGGATGAAGAGTCTGGTCTTTCTCTCTGAATATGT
ACTACTACTATATGTCTCTTTTAGCCTTCATCAGTGTTCATCTCTCTCATTTTCATCCTC
ATGTCAG*ACATGAATCAACA
TATGA

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1FH58JQ 508 0 0
TTTGAGTCTGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAATCCCTTAACGAGGATCCATTGGAGG
GCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCTGTTCTTGGTTTGCCTCCAATG
AGTAAGAGGAAGGGAGGAGTGAAATGCTCAATGGAGTCAAAGCAAGGAAACGTTTCAGCC
GTTGGAGCAGGAGTTTCCGCTGCTGCGACTGCAGCTTTGACGGCTGTGATGAGCAACCCG
GCCATGGCGTTGGTGGATGACAGGATGTCCACGGAAGGAACAGGATCACCATTTGGGCTG
AGCAACAACCTATTGGGTTGGATTTTTTTGGGAGTGTTTGGTTTGATTTGGACTTTACTT
TACCTACACTTCATCTCTCGACGAGGATGAAGAGTCTGGTCTTTCTCTCTGAATATGTAC
TACTACTATATGTCTCTTTTAGCCTTCATCAGTGTTCATCTCTCTCATTTTCATCCTCAT
GTCAGGACATGAATCAACAATATGATTT

QA 1 508 1 508
DS 



CO CL1171Contig2 580 3 3 U
GAAGATCATATTGTTGATTCATGTCCTGACATGAGGATGAAAATGAGAGAGATGAACACT
GATGAAGGCTAAAAGAGACATATAGTAGTAGTACATATTCAGAGAGAAAGACCAGACTCT
TCATCCTCGTCGAGAGATGAAGTGTAGGTAAAGTAGAAAGTCCAGATCAAACCAAACACT
CCCAAAAGAATCCAACCCAAGAGGTTGTTGCTCAGCCCAAATGGTAATCCTGTTCCTTCC
GTGGACATCCTGTCATCCACCAACGCCATGGCCGGGTTGCTCATCACAGCCGTCAAAGCT
GCAGTCGCAGCAGCGGAAACTCCTGCTCCAACGGCTGAAACGTTTCCTTGCTTTGACTCC
ATTGAGCATTTCACTCCTCCCTTCCTCTTACTCATTGGAGGCAAACCAAGAACAGGAGCA
GAAAGGGAGACGGTGGGCTTGAGAAGGAGAGCAGGACGAGCGACAGACACGGTGGAAGCA
GAGGCAGTGAAGCTAGCCATTTTCTTTTGCTTCAACACAAGTACAAACTCTCTTCAATCT
GAGATTTTTGTTTCTAGTGTTTGTGTTTCTAGAGCAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G044JQ U 1
AF RS1EO89JQ U 16
AF RS1G044TF C 1
BS 1 398 RS1G044JQ
BS 399 472 RS1EO89JQ
BS 473 580 RS1G044TF

RD RS1G044JQ 398 0 0
GAAGATCATATTGTTGATTCATGTCCTGACATGAGGATGAAAATGAGAGAGATGAACACT
GATGAAGGCTAAAAGAGACATATAGTAGTAGTACATATTCAGAGAGAAAGACCAGACTCT
TCATCCTCGTCGAGAGATGAAGTGTAGGTAAAGTAGAAAGTCCAGATCAAACCAAACACT
CCCAAAAGAATCCAACCCAAGAGGTTGTTGCTCAGCCCAAATGGTAATCCTGTTCCTTCC
GTGGACATCCTGTCATCCACCAACGCCATGGCCGGGTTGCTCATCACAGCCGTCAAAGCT
GCAGTCGCAGCAGCGGAAACTCCTGCTCCAACGGCTGAAACGTTTCCTTGCTTTGACTCC
ATTGAGCATTTCACTCCTCCCTTCCTCTTACTCATTGG

QA 1 398 1 398
DS 

RD RS1EO89JQ 457 0 0
GATTCATGTCCTGACATGAGAATGAAAACGAGAGAGATGAA**********GGCTAAAAG
AGACATATAGTAGTAGTACATATTCAGAGAGAAAGACCAGACTCTTCATCCTCGTCGAGA
GATGAAGTGTAGGTAAAGTAGAAAGTCCAGATCAAACCAAACACTCCCAAAAGAATCCAA
CCCAAGAGGTTGTTGCTCAGCCCAAATGGTAATCCTGTTCCTTCCGTGGACATCCTGTCA
TCCACCAACGCCATGGCCGGGTTGCTCATCACAGCCGTCAAAGCTGCAGTCGCAGCAGCG
GAAACTCCTGCTCCAACGGCTGAAACGTTTCCTTGCTTTGACTCCATTGAGCATTTCACT
CCCCCCTTCCTCTTACTCATTGGAGGCAAACCAAGAACAGGAGCAGAAAGGGAGACGGTG
GGCTTGAGAAGGAGAGCAGGACGAGCGACAGACACGG

QA 1 457 1 457
DS 

RD RS1G044TF 580 0 0
GAAGATCATAT
TGTTGATTCATGTCCTGACATGAGGATGAAAATGAGAGAGATGAACACTGATGAAGGCTA
AAAGAGACATATAGTAGTAGTACATATTCAGAGAGAAAGACCAGACTCTTCATCCTCGTC
GAGAGATGAAGTGTAGGTAAAGTAGAAAGTCCAGATCAAACCAAACACTCCCAAAAGAAT
CCAACCCAAGAGGTTGTTGCTCAGCCCAAATGGTAATCCTGTTCCTTCCGTGGACATCCT
GTCATCCACCAACGCCATGGCCGGGTTGCTCATCACAGCCGTCAAAGCTGCAGTCGCAGC
AGCGGAAACTCCTGCTCCAACGGCTGAGACGTTTCCTTGCTTTGACTCCATTGAGCATTT
CACTCCTCCCTTCCTCTTACTCATTGGAGGCAAACCAAGAACAGGAGCAGAGAGGGAGAC
GGTGGGCTTGAGAAGGAGAGCAGGACGAGCGACAGACACGGTGGAAGCAGAGGCAGTGAA
GCTAGCCATTTTCTTTTGCTTCAACACAAGTACAAACTCTCTTCAATCTGAGATTTTTGT
TTCTAGTGTTTGTGTTTCTAGAGCAACCC

QA 12 580 12 580
DS 



AS 1 5

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TGACAGAAGAGAAGAGTCTAAGCAACAGAGCAAAAAATGGCAGCACAAGCGCTTGTGTCT
TCTTCACTAACCTCCTCTGTTCAGACCGCTAGACAGATATTCGGCACAAAACCAGCTGTG
TCGGTATCACAAAGGAAGGCTTCCTTGGTTGTTAAGGCTGCCTCAACTCCACCTGCCAAG
CAAGGAGCAAACAGGCAATTGTGGTTTGCATCATCACAGAGTCTCTCTTACTTGGATGGC
AGCTTACCTGGCGACTTTGGATTCGACCCGCTTGGTCTTTCAGACCCAGAGGGTACTGGA
GGGTTCATAGAGCCGAGATGGCTAGCCTACGGAGAGATCATCAACGGCCGCTTCGCTATG
TTGGGTGCAGCTGGAGCTATTGCACCTGAGATTCTAGGAAAGGCCGGTCTGATTCCAGCA
GACACTGCTCTTCCCTGGTTCCAAACCGGTGTGATTCCACCTGCAGGGACGTACAGCTAC
TGGGCAGACCCTTACACACTCTTTGTTCTCGAGATGGCTTTGATGGGTTTTGCTGAGCAC
AGGAGGTTGCAGGACTGGTACAACCCAGGATCTATGGGTAAACAATACTTCTTGGGTCTA
GAGAAAGGTTTCGCCGGTTCAGGTAACCCGGCTTACCCCGGTGGACCTTTCTTCAACCCT
CTAGGGTTTGGAAAAGACGAGAAGTCGATGAAGGAGTTGAAACTCAAGGAGGTCAAGAAC
GGTAGACTGGCAATGCTCGCCATCCTTGGCTATTTTATCCAGGGACTAGTGACCGGTGTG
GGACCTTACCAGAACCTTCTTGATCATTTGGCGGATCCCGTCAACAACAATGTCTTGACC
AGCCTCAAGTTCCACTGAGGTGATCATATCATATCATATCATCCCATGGTGTTGTCTGTT
GGTCTCCCATTCTCTTGTATCCTACAGTCTTGTTTCTTTCTCTTTGGTACCATCAGTTTC
TTTGTGTTGTAACACCATGTGTAAACATATTCGTCTTTTGTAAGAAATGACATTATCAGT
GGCCATAATGAAACAACTTCTAGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 10 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CY11TF U 9
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AF RS1CY11JQ C 620
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G
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GAGCCGAGATGGCTAGCCTACGGAGAGATCATCAACGGCCGTTTCGCTATGTTGGGTGCA
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CTTCCCTGGTTCCAAACCGGTGTGATTCCACCTGCAGGGACGTACAGCTACTGGGCAGAC
CCTTACACACTCTTTGTTCTCGAGATGGCTTTGATGGGTTTTGCTGAGCACAGGAGGTTG
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T*CGCCCGTTCA
G

QA 2 673 2 673
DS 

RD RS1CH92TF 745 0 0
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AGCTTACCTGGCGACTTTGGATTCGACCCGCTTGGTCTTTCAGGCCCAGAGGGTACTGGA
GGGCTCATAGAGCCGAGATGGCTAGCCTACGGAGAGATCATCAACGGCCGCTTCGCTATG
TTGGGTGCAGCTGGAGCTATTGCACCTGAGATTCTAGGAAAGGCCGGTCTGATTCCAGCA
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TGGGCAGACCCTTACACACTCTTTGTTCTCGAGATGGCTTTGATGGGTTTTGCTGAGCAC
AGGAGGTTGCAGGACTGGTACAACCCAGGATCTATGGGTAAACAATACTTCTTGGGTCTA
GAGAAAGGTT*CGCCGGTTCA*GTAACCCGGCTTACCC*GGTGGACCTTTCTTCA*CCCT
CTAGGGTT
GGAAAGACGAGAGTCGA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1AI59TF 765 0 0
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TGTGTCTTCTTCACTAACCTCCTCTGTTCAGACCGCTAGACAGATATTCGGCACAAAACC
AGCTGTGTCGGTATCACAAAGGAAGGCTTCCTTGGTTGTTAAGGCTGCCTCAACTCCACC
TGCCAAGCAAGGAGCAAACAGGCAATTGTGGTTTGCATCATCACAGAGTCTCTCTTACTT
GGATGGCAGCTTACCTGGCGACTTTGGATTCGACCCGCTTGGTCTTTCAGACCCAGAGGG
TACTGGAGGGTTCAT*GAGCCGAGATGGCTAGCCTACGGAGAGATCATCAACGGCCGTTT
CGCTATGTTGGGTGCAGCTGGAGCTATTGCACCTGAGATTCTAGGAAAGGCCGGTCTGAT
TCCAGCAGACACTGCTCTTCCCTGGTTCCAAACCGGTGTGATTCCACCTGCAGGGACGTA
CAGCTACTGGGCAGACCCTTACACACTCTTTGTTCTCGAGATGGCTTTGATGGGTTTTGC
TGAGCACAGGAGGTTGCAGGACTGGTACAACCCAGGATCTATGGGTAAACAATACTTCTT
GGGTCTAGAGAAAGGTTTCGCCGGTTCATGTAACCCGGCTTACCCCGGTGGACCTTTCTT
CAACCCTCTAGGGTTTGGAAAAGACGAGAAGTCGATGAAGGAGTTGAAACTCAAGGAGGT
CAAGAACGGTAGACTGGCAATGCTCGCCATCCTTGGCTATTT
ATC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1CH92JQ 700 0 0
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GTCTGATTCCAGCAGACACTGCTCTTCCCTGGTTCCAAACCGGTGTGATTCCACCTGCAG
GGACGTACAGCTACTGGGCAGACCCTTACACACTCTTTGTTCTCGAGATGGCTTTGATGG
GTTTTGCTGAGCACAGGAGGTTGCAGGACTGGTACAACCCAGGATCTATGGGTAAACAAT
ACTTCTTGGGTCTAGAGAAAGGTTTCGCCGGTTCAGGTAACCCGGCTTACCCCGGTGGAC
CTTTCTTCAACCCTCTAGGGTTTGGAAAAGACGAGAAGTCGATGAAGGAGTTGAAACTCA
AGGAGGTCAAGAACGGTAGACTGGCAATGCTCGCCATCCTTGGCTATTTTATCCAGGGAC
TAGTGACCGGTGTGGGACCTTACCAGAACCTTCTTGATCATTTGGCGGATCCCGTCAACA
ACAATGTCTTGACCAGCCTCAAGTTCCACTGAGGTGATCATATCATATCATATCATCCCA
TGGTGTTGTCTGTTGGTCTCCCATTCTCTTGTATCCTACAGTCTTGTTTCTTTCTCTTTG
GTACCATCAGTTTCTTTGTGTTGTAACACCATGTGTAAACATATTCGTCTTTTGTAAGAA
ATGACATTATCAGTGGCCATAATGAAACAACTTCTAGGAC

QA 1 700 1 700
DS 

RD RS1CY11JQ 465 0 0
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CAGGTAACCCGGCTTACCCCGGTGGACCTTTTTTCAACCCTCTAGGGTTTGGAAAAGACG
AGAAGTCGTTGAAGGAGTTGAAACTCAAGGAGGTCAAGAACGGTAGACTGGCAATGCTCG
CCATCCTTGGCTATTTTATCCAGGGACTAGTGACCGGTGTGGGACCTTCCCAGAACCTTC
TTGATCATTTGGCGGATCCCGTCAACAACAATGTCTTGACCGGCCTCAAGTTCCACTGAG
GTGATCATATCATATCATATCATCCCATGGTGTTGTCTGTTGGTCTCCCATTCTCTTGTA
TCCTACAGTCTTGTTTCTTTTTCTTTGGTACCATCAGTTTCTTTGTGTTGTAACACCATG
TGTAAACATATTCGTCTTTTGTAAGAAATGACATTATCAGTGGCC

QA 1 465 1 465
DS 



AS 1 6

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CAAGCAATGGCATCGATGACAATGACAGCAACATTCCTCCCCGCCGTCGCTAAGCTTCCG
TCAGCCACTTCCGGACGAAGGATGTCCGTGGTTAGAGCCTCAACGAGCGAGAACACACCC
AGCTTAGAAGTCAAGGCCATGGAGGAACAGAGAAGCACCACAATGAGGAGGGATCTCATG
TTCACGGCTGCAGCTTCTGCCGTTTGTGCCTTGGCTAAGGTAGCCATGGCGGACGAGGAG
GAGCCCAAGCGAGGGACAGAGGCGGCTAAGAAGAAATACGCTCAGGTCTGCGTCACAATG
CCTACGGCCAAGATCTGCCGCTACTGATTCAACCATCCCACCTTTCATGTCCCTCTCTCT
ATCTCTTTAAATTTTCTCAAATTTGGTATGTAATCATATATTTGGATCAAAATCTTATAA
TCTTCGACTAGACTTCCTTTTCATTAATGAAAACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1BC59JQ C 10
AF RS1BC59TF U 10
AF RS1FN23TF U 1
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TCAGCCACTTCCGGACGAAGGATGTCCGTGGTTAGAGCCTCAACGAGCGAGAACACACCC
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ATCTCTTTAAATTTTCTCAAATTTGGTATGTAATCATATATTTGGATCAAAATCTTATAA
TTTTCGACTAGACTTCCTTTTCATTAATGAAAACTT

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DS 

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GG
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AAGATCTGCCGCTACTGATTCAACCATCCCACCTTTCATGTCCCTCTCTCTATCTCTTTA
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QA 3 481 3 481
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RD RS1BC59TF 505 0 0
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TTCATTA
TAATGAAA

QA 11 497 11 497
DS 

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GCATCGATGACAATGACAGCAACATTCCTCCCCGCCGTCGCTAAGCTTCCGTCAGCCACT
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AAGATCTGCCGCTACTGATTCAACCATCCCACCTTTCATGTCCCTCTCTCTATCTCTTTA
AATTTTCTCAAATTTGGTATGTAATCATATATTTGGATCAAAATCTTATAATCTTCGACT
AGACTTCCTTTTCATTA
ATGAAAACTT

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DS 



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CGTTGTCGTCCAAACAGTGGGGATGTGTGTCGATGGTGTTTGGTGGTTTGTCTTACCAAA
TTTACTTGAAATGGAGGAAGCTGCAGAGAACGAAGAAGAAGAAAAAGACTTGATTGAAGC
TGAGAATGGGGGCGCAGCAGAATCTATAATTCTTGTTTTTGATTTGGGAAACGTTTTACT
TTCACCATATAATGTCTGAAACGTAGATGGAAGAAAAGCTTAGCAAAAATGTAGACTAAT
GCACTTAGAAGAAACTTATATATATCAAGCCAAAGTCAAATCATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1DM34TF U 6
AF RS1E177TF U 1
AF RS1H185TF U 334
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AF RS1E177JQ C 595
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RD RS1DM34TF 591 0 0
GG
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GAATGTGGTCTGTTTGGTTTGGTCTTTTATAATGATTAAGCTGTGGTCCAATGGAGGTAG
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QA 3 591 3 591
DS 

RD RS1E177TF 743 0 0
GGAAATTGATCTCCAAAAACTACTTCAAAACTCACATTCGAATCCTCGCCGGTGTAATAG
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CGTTCTGCGTCGCCGGGATCTGGGCTGCCTACATTTACCAAGGCGTTCTTCAGGAAACCC
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TGGCTCAGAATGTGGTCTGTTTGGTTTGGTCTTTTATAATGATTAAGCTGT***CCAATG
GAGGTAGTGGTGGAGCTCCATGGTGGACGTACTGGAGTGCTGGCATTACTAATACCATTG
GTCCTGCCATGGGTACTGAAGCTCTCAAGTATATTAGTTACCCAGCTCAGGTCCTGGCAA
AGTCTTCTAAAATGATTCCAGTCATGTTGATGGGGTCCTTAGTTTATGGCATAAGATACA
CTTTGCCTGAGTATCTTTGCACCTTTCTTGTTGCCGGAGGAGTGTCCATGTTTGCCCTTC
TTAAGACTAGCTCAAAGACCATCAGCAAGCTAGCAAATCCAAATGCTCCTCTTGGTTACG
GCCTCTGCTTCTTGAACCTCGCCTTTGACGGGTTCACAAACGCCACCCAAGATTCCATTA
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CCATATACA*CATGGTCTACATG

QA 1 743 1 743
DS 

RD RS1H185TF 715 0 0
GGAGTGCTGGCATTACTAATACCATTGGTCCTGCCATGGGTATTGAAGCTCTCAAGTATA
TTAGTTACCCAGCTCAGGTCCTGGCAAAGTCTTCTAAAATGATTCCAGTCATGTTGATGG
GGTCCTTAGTTTATGGCATAAGATACACTTTGCCTGAGTATCTTTGCACCTTTCTTGTTG
CCGGAGGAGTGTCCATGTTTGCCCTTCTTAAGACTAGCTCAAAGACCATCAGCAAGCTAG
CAAATCCAAATGCTCCTCTTGGTTACGGCCTCTGCTTCTTGAACCTCGCCTTTGACGGGT
TCACAAACGCCACCCAAGATTCCATTACCGCAAGGTACCCGAAAACCAGCGCGTGGGACA
TAATGCTGGGAATGAACTTATGGGGAACCATATACAACATGGTCTACATGTTTGGTCTGC
CACACGGGAGCGGATTCGAAGCTGTGCAGTTCTGCAAGCAACACCCTGAGGCAGCATGGG
ACATTCTCATGTACTGTCTGTGCGGTGCGGTGGGACAAAACTTCATCTTCTTGACGATAA
GCAGATTCGGGTCTCTAGCTAACACGACCATAACCACAACGAGGAAGTTTGTAAGCATCG
TGGTGTCTTCAGTTCTGAGCGGGAATCCGTTGTCGTCCAAACAGTGGGGATGTGTGTCGA
TGGTGTTTGGTGGTTTGTCTTACCAA*TTTACTTGAA
TGGAGAGCTGCAGAGACG

QA 1 697 1 697
DS 

RD RS1DM34JQ 777 0 0
GGT
CTTAGTTTATGGCATAAGATACACTTTGCCTGAGTATCTTTGCACCTTTCTTGTTGCCGG
AGGAGTGTCCATGTTTGCCCTTCTTAAGACTAGCTCAAAGACCATCAGCAAGCTAGCAAA
TCCAAATGCTCCTCTTGGTTACGGCCTCTGCTTCTTGAACCTCGCCCTTGACGGGTTCAC
AAACGCCACCCAAGATTCCATTACCGCAAGGTACCCGAAAACCAGCGCGTGGGACATAAT
GCTGGGAATGAACTTATGGGGAACCATATACAACATGGTCTACATGTTTGGTCTGCCACA
CGGGAGCGGATTCGAAGCTGTGCAGTTCTGCAAGCAACACCCTGAGGCAGCATGGGACAT
TCTCATGTACTGTCTGTGCGGTGCGGTGGGACAAAACTTCATCTTCTTGACGATAAGCAG
ATTCGGGTCTCTAGCTAACACGACCATAACCACAACGAGGAAGTTTGTAAGCATCGTGGT
GTCTTCAGTTCTGAGCGGGAATCCGTTGTCGTCCAAACAGTGGGGATGTGTGTCGATGGT
GTTTGGTGGTTTGTCTTACCAAATTTACTTGAAATGGAGGAAGCTGCAGAGAACGAAGAA
GAAGAAAAAGACTTGATTGAAGCTGAGAATGGGGGCGCAGCAGAATCTATAATTCTTGTT
TTTGATTTGGGAAACGTTTTACTATCACCATATAATGTCTGAAACGTAGATGGAAGAAAA
GCTTAGCAAAAATGTAGACTAATGCACTTAGAAGAAACTTATATATATCAAGC
T

QA 4 776 4 776
DS 

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GGCCTCTGCTTCTTGAACCTCGCCTTTGACGGGTTCACAAACGCCACCCAAGATTCCATT
ACCGCAAGGTACCCGAAAACCAGCGCGTGGGACATAATGCTGGGAATGAACTTATGGGGA
ACCATATACAACATGGTCTACATGTTTGGTCTGCCACACGGGAGCGGATTCGAAGCTGTG
CAGTTCTGCAAGCAACACCCTGAGGCAGCATGGGACATTCTCATGTACTGTCTGTGCGGT
GCGGTGGGACAAAACTTCATCTTCTTGACGATAAGCAGATTCGGGTCTCTAGCTAACACG
ACCATAACCACAACGAGGAAGTTTGTAAGCATCGTGGTGTCTTCAGTTCTGAGCGGGAAT
CCGTTGTCGTCCAAACAGTGGGGATGTGTGTCGATGGTGTTTGGTGGTTTGTCTTACCAA
ATTTACTTGAAATGGAGGAAGCTGCAGAGAACGAAGAAGAAGAAAAAGACTTGATTGAAG
CTGAGAATGGGGGCGCAGCAGAATCTATAATTCTTGTTTTTGATTTGGGAAACGTTTTAC
TTTCACCATATAATGTCTGAAACGTAGATGGAAGAAAAGCTTAGCAAAAATGTAGACTAA
TGCACTTAGAAGAAACTTATATATATCAAGCCAAAGTCAAATCATA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RS1E177JQ 651 0 0
GTTACGGCCTCTGCTTCTTGAACCTCGCCTTTGACGGGTTCACAAACGCCACCCAAGATT
CCATTACCTCAAGGTACCCGAAAACCAGCGCGTGGGACATAATGCTGGGAATGAACTTAT
GGGGAACCATATACAACATGGTCTACATGTTTGGTCTGCCACACGGGAGCGGATTCGAAG
CTGTGCAGTTCTGCAAGCAACACCCTGAGGCAGCATGGGACATTCTCATGTACTGTCTGT
GCGGTGCGGTGGGACAAAACTTCATCTTCTTGACGATAAGCAGATTCGGGTCTCTAGCTA
ACACGACCATAACCACAACGAGGAAGTTTGTAAGCATCGTGGTGTCTTCAGTTCTGAGCG
GGAATCCGTTGTCGTCCAAACAGTGGGGATGTGTGTCGATGGTGTTTGGTGGTTTGTCTT
ACCAAATTTACTTGAAATGGAGGAAGCTGCAGAGAACGAAGAAGAAGAAAAAGACTTGAT
TGAAGCTGAGAATGGGGGCGCAGCAGAATCTATAATTCTTGTTTTTGATTTGGGAAACGT
TTTACTTTCACCATATAATGTTTGAAACGTAGATGGAAGAAAAGCTTAGCAAAAATGTAG
ACTAATGCACTTAGAAGAAACTTATATATATCAAGCCAAAGTCAAATCATA

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 6

CO CL1175Contig1 966 6 14 U
GGGGCGAGAGAGAAGAGGAGCAAACAACAGTTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATGAGTAGC
ATTGGAACTGGATACGATCTCTCAGTCACGACCTTCTCTCCCGATGGCCGTGTTTTCCAG
ATCGAGTACGCCGCCAAAGCTGTCGACAACAGTGGAACTGTAGTTGGAATCAAGTGCAAG
GACGGGATTGTAATGGGTGTGGAGAAGCTCATTGCATCTAAGATGATGCTACCGGGTTCC
AACCGGAGGATCCATTCTGTTCATCGTCATGCTGGCATGGCTGTTGCCGGGCTTGCTGCT
GATGGGAGGCAAATTGTTGCACGTGCTAAATCTGAAGCCAGAAGCTATGAGAGTGTTTAT
GGCGACGCTGTACCTGTGAAGGAACTTTCGGAGCGTGTTGCAAGTTATGTTCATTTGTGT
ACTCTCTATTGGTGGCTTAGGCCTTTTGGTTGTGGAGTCATTCTTGGAGGTTATGATAAA
GATGGACCCCAATTGTACATGATTGAGCCATCCGGTATTTCATATAGATACTTTGGTGCT
GCAATTGGCAAAGGAAAACAAGCTGCTAAAACGGAAATTGAGAAATTGAAGTTATCTGAG
ATGACATGCAAAGAAGGCGTT*ATTGAAGTTGCAAAAATAATTTACAAGCTACACGATGA
AGCCAAGGACAAGGCTTTTGAATTGGAGATGAGCTGGATTTGCGAGGAGTCAAAAAGAGA
GCACCAGAAGGTCCCTGATGAGCTTCTAGAAGAAGCAAAGACGGCAGCCAAAACTGCGCT
TGAGGAGATGGATGCTGACTAAACTGATAAAAATGGGTCAAAATTAGATATTGTGTAATG
ATGCATCGTTTGATGTTTCTGTTGTAAAACTTTAAAATTTGCCTCGAGGGGCAAATCGCT
GCATTTTCTCATGAACCGTTTGGACTCCTTCGTCTTGTTTCTATCGACAGTTTCTTTGAA
CTCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1AN61TF U 1
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AF RS1CX81TF U 20
AF RS1CX81JQ C 189
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AF RS1AN61JQ C 263
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AACCGGAGGATCCATTCTGTTCATCGTCATGCTGTCATGGCTGTTGCCGGGCTTGTTGCT
GATGGGAGGCAAATTGTTGCACGTGCTAAATCTGAAGCCAGAAGCTATGAGAGTGTTTAT
GGCGACGCTGTACCTGTGAAGGAACTTTCGGAGCGTGTTGCAAGTTATGTTCATTTGTGT
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GATGGACCCCAATTGTACATGATTGAGCCATCCGGTATTTCATATAGATACTTTGGTGCT
GCAATTGGCAAAGGAAAACAAGCTGCTAAAACGGAAATTGAGAAATTGAAGTTATCTGAG
ATGACATGCAAAGAAGGCGTT*ATTGAAGTTGC

QA 1 633 1 633
DS 

RD RS1C003TF 421 0 0
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TTGAGAAATTGAAGTTATCTGAGATGACATGCAAAGAAGGCGTTTATTGAAGTTGCAAAA
A

QA 1 421 1 421
DS 

RD RS1CX81TF 702 0 0
GG
AAACAACAGTTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATGAGTAGCATTGGAACTGGATACGATCTC
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GTCGACAACAGTGGAACTGTAGTTGGAATCAAGTGCAAGGACGGGATTGTAATGGGTGTG
GAGAAGCTCATTGCATCTAAGATGATGCTACCGGGTTCCAACCGGAGGATCCATTCTGTT
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ATTGAGCCATCCGGTATTTCATATAGATACTTTGGTGCTGCAATTGGCAAAGGAAAACAA
GCTGCTAAAACGGAAATTGAGAAATTGAAGTTATCTGAGATGACATGCAAAGAAGGCGTT
*ATTGAAGTTGCAAAAATAATTTACAAGCTACACGATGAAGCCA*GGACAAGGCTTTTGA
ATTGGAGATGAGCTGGATTTGCGAGGAGTCAAAA
GAGAGC

QA 3 696 3 696
DS 

RD RS1CX81JQ 774 0 0
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GATCCATTCTGTTCATCGTCATGCTGGCATGGCTGTTGCCGGGCTTGCTGCTGATGGGAG
GCAAATTGTTGCACGTGCTAAATCTGAAGCCAGAAGCTATGAGAGTGTTTATGGCGACGC
TGTACCTGTGAAGGAACTTTCGGAGCGTGTTGCAAGTTATGTTCATTTGTGTACTCTCTA
TTGGTGGCTTAGGCCTTTTGGTTGTGGAGTCATTCTTGGAGGTTATGATAAAGATGTACC
CCAATTGTACATGATTGAGCCATCCGGTATTTCATATAGATACTTTGGTGCTGCAATTGG
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CAAAGAAGGCGTT*ATTGAAGTTGCAAAAATAATTTACAAGCTACACGATGAAGCCAAGG
ACAAGGCTTTTGAATTGGAGATGAGCTGGATTTGCGAGGAGTCAAAAAGAGAGCACCAGA
AGGTCCCTGATGAGCTTCTAGAAGAAGCAAAGACGGCAGCCAAAACTGCGCTTGAGGAGA
TGGATGCTGACTAAACTGATAAAAATGGGTCAAAATTAGATATTGTGTAATGATGCATCG
TTTGATGTTTCTGTTGTAAAACTTTAAAATTTGCCTCGAGGGGCAAATCGCTGCATTTTC
TCATGAACCGTTTGGACTCCTTCGTCTTGTTTCTATCGACAGTTTCTTTG
AACC

QA 1 770 1 770
DS 

RD RS1C860JQ 700 0 0
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GCACGTGCTAAATCTGAAGCCAGAAGCTATGAGAGTGTTTATGGCGACGCTGTACCTGTG
AAGGAACTTTCGGAGCGTGTTGCAAGTTATGTTCATTTGTGTACTCTCTATTGGTGGCTT
AGGCCTTTTGGTTGTGGAGTCATTCTTGGAGGTTATGATAAAGATGGACCCCAATTGTAC
ATGATTGAGCCATCCGGTATTTCATATAGATACTTTGGTGCTGCAATTGGCAAAGGAAAA
CAAGCTGCTAAAACGGAAATTGAGAAATTGAAGTTATCTGAGATGACATGCAAAGAAGGC
GTT*ATTGAAGTTGCAAAAATAATTTACAAGCTACACGATGAAGCCAAGGACAAGGCTTT
TGAATTGGAGATGAGCTGGATTTGCGAGGAGTCAAAAAGAGAGCACCAGAAGGTCCCTGA
TGAGCTTTTAGAAGAAGCAAAGACGGCAGCCAAAACTGCGCTTGAGGAGATGGATGCTGA
CTAAACTGATAAAAATGGGTCAAAATTAGATATTGTGTAATGATGTATCGTTTGATGTTT
CTGTTGTAAAACTTTAAAATTTGCCTCGAGGGGCAAATCGCTGCATTTTTTCATGAACCG
TTTGGACTCCTTCGTCTTGTTTCTATCGACAGTTTCTTTG

QA 1 700 1 700
DS 

RD RS1AN61JQ 704 0 0
ATCGTCATGCTGTCATGGCTGTTGCCGGGCTTGTTGCTGATGGGAGGCAAATTGTTGCAC
GTGCTAAATCTGAAGCCAGAAGCTATGAGAGTGTTTATGGCGACGCTGTACCTGTGAAGG
AACTTTCGGAGCGTGTTGCAAGTTATGTTCATTTGTGTACTCTCTATTGGTGGCTTAGGC
CTTTTGGTTGTGGAGTCATTCTTGGAGGTTATGATAAAGATGGACCCCAATTGTACATGA
TTGAGCCATCCGGTATTTCATATAGATACTTTGGTGCTGCAATTGGCAAAGGAAAACAAG
CTGCTAAAACGGAAATTGAGAAATTGAAGTTATTTGAGATGACATGCAAAGAAGGCGTT*
ATTGAAGTTGCAAAAATAATTTACAAGCTACACGATGAAGCCAAGGACAAGGCTTTTGAA
TTGGAGATGAGCTGGATTTGCGAGGAGTCAAAAAGAGAGCACCAGAAGGTCCCTGATGAG
CTTCTAGAAGAAGCAAAGATGGCAGCCAAAACTGCGCTTGAGGAGATGGATGCTGACTAA
ACTGATAAAAATGGGTCAAAATTAGATATTGTGTAATGATGCATCGTTTGATGTTTCTGT
TGTAAAACTTTAAAATTTGCCTCGAGGGGCAAATCGCTGCATTTTCTCATGAACCGTTTG
GACTCCTTCGTCTTGTTTCTATCGACAGTTTCTTTGAACTCTTG

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 6

CO CL1176Contig1 1518 6 24 U
AAGCAAATTTTCACTTATTTAAAACTTTACATTTCGGTAACATTGGATTATTCAAAGCCA
AAATAGTGATATATATCCTTATGAGTGATTTTTATTAAACTGTGTTTCCATGGAAAAGCT
TAAACGTTCATGTCGTTCGAAGTGGGAGCAAGAGCTTCTTCGGTCATGGTTCCTTTGTCT
GACATGTGCTTGTCTTGTCCTGAAGTGAAAGGTTGACAATGGGTACAGCTTGGTGGTTGT
TGGTATATAGGTGGGCGGTAATATGGTACGGTTGGAGTGCAACCACCGGTTTGGCATCCC
CCAGAACCATATCCAGGATTAACCCTGGCTCCTGGAATCACAAAACCGGGAATCTGTGTG
CCTGGAACCGTTATGGGAGGGATTGATATGCTTGGGACAACTACACTTGGCACACTACCA
CTAGAGCCACCTCCTATACCGATACCAATCCCTTCGCCTGAGCCACTACCCTCTCCAATG
CCTTCACCATATCCGCTACCTGGAGCTCCAGTGATAGGACCGCAGTTCGGTTGGCCATAC
CCGGATCCTCTTCCTTCTCCATAGCCACTGCCTCCACTAGAGCCGATGCCTTCTCCATAT
CCACTACCTCCACTAGAGCCAATGCCTTCTCCATATCCACTGCCTCCACTAGAGCCAATG
CCTTCTCCATATCCACTGCCACTTCCATAGCCCCTACCTACACCATACCCCATTGGCTTA
ACTGTGTGGTCAGGATCTTCTGGTTCACCCGGTTCGCCCGGCATGGACTGTTTTACATTG
TGATCGAGCATTTTTTTAGGATCAGGTTCTTCTAGCTCACCCCACATGGATTGCAGTTTA
TGATCAGGCATGAACTTGGCCTCAGGCTCCTCTGGTTCACCCTGCATGGATTGCATTTTA
TGATCAGGCATGATCTTGTCCTCAGGCTCCTCTGGTTCACCAGGCATGGACTGCAGCTTA
CGGTCAGGCTTGACCTTGTCCTCAGGCTCTTCTGGTTCACCCGGCATGGACTGCAGCTTA
TGGTCAGGCATGACCTTGTCCTCAGGCTCTTCCGGTTCACCCGGCATGGACTGCAGCTCA
TGGTCAGGTTCTTCAGGCTCTTCTGGTATACCCGGCATGGACTGCAGCGTATGCAGCTTA
TGGTCAGGTTCTTCAGGCTCTTCTGGTACACCCGGCATGGACTGCAGCGTATGCAGCTTA
TGGTCAGGTTCTTCAGGCTCTTCTGGTACACCCGGCATGGACTGCAGCGTATGGCCAGGC
TTGACTTTGTTCTCAGTTTCTACATTGAAAAACGCATGATCTTGCTCCCTCAAACTAACC
ATCCCAGGCTTCACTAAATGGTTCAGCTCTAGCTTGCTCGCCTCCATCATGGAGAGATCC
TTAAGAACCCTGCGTGCAAAAGTTGAACTGAAGAAGCATAGTAATAGGACGAATCCAAAG
CATCTGCCTTGGTGTCCCTTTGCCATATTATTATTTTTTGGTGTGTTTATCGTATGAAAT
AAACTGATCCTGCAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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GACATGTGCTTGTCTTGTCCTGAAGTGAAAGGTTGACAATGGGTACAGCTTGGTGGTTGT
TGGTATATAGGTGGGCGGTAATATGGTACGGTTGGAGTGCAACCACCGGTTTGGCATCCC
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CCTGGAACCGTTATGGGAGGGATTGATATGCTTGGGACAACTACACTTGGCACACTACCA
CTAGAGCCACCTCCTATACCGATACCAATCCCTTCGCCTGAGCCACTACCCTCTCCAATG
CCTTCACCATATCCGCTACCTGGAGCTCCAGTGATAGGACCGCAGTTCGGTTGGCCATAC
CCGGATCCTCTTCCTTCTCCGTAGCCACTGCCTCCACTAGAGCCGATGCCTTCTCCATAT
CCACTACCTCCACTAGAGCCAATGCCTTCTCCATATCCACTGCCTCCACTAGAGCCAATG
CCTTCTCCATATCCACTGCCACTTCCATAGCCCCTACCTACACCATACCCCATTGGCTTA
ACTGTGTGGTCAGGATCTTCTGGTTCACCCGGTTCGCC

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AAACTGTGTTTCCATGGAAAAGCTTAAACGTTCATGTCGTTCGAAGTGGGAGCAAGAGCT
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GTGCAACCACCGGTTTGGCATCCCCCAGAACCATATCCAGGATTAACCCTGACTCCTGGA
ATCACAAAACCGGGAATCTGTGTGCCTGGAACCGTTATGGGAGGGATTGATATGCTTGGG
ACAACTACACTTGGCACACTACCACTAGAGCCACCTCCTATACCGATACCAATCCCTTCG
CCTGAGCCAATACCCTCTCCAATGCCTTCACCATATCCGCTACCTGGAGCTCCAGTGATA
GGACCGCAGTTCGGTTGGCCATACCCGGATCCTCTTCCTTCTCCATAGCCACTGCCTCCA
CTAGAGCCGATGCCTTCTCCATATCCACTACCTCCACTAGAGCCAATGCCTTCTCCATAT
CCACTGCCTCCACTAGAGCCAATGCCTTCTCCATATCCACTGCCACTTCCATAGCCCCTA
CCTACACCATACCCCATTGGCTTAACTGTGTGGTCAGGATCTTCTGGTTCACCCGGTTCG
CCCGGCATGGACTGTTTTA

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G
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TATCCTTATGAGTGATTTTTATTAAACTGTGTTTCCATGGAAAAGCTTAAACGTTCATGT
CGTTCGAAGTGGGAGCAAGAGCTTCTTCGGTCATGGTTCCTTTGTCTGACATGTGCTTGT
CTTGTCCTGAAGTGAAAGGTTGACAATGGGTACAGCTTGGTGGTTGTTGGTATATAGGTG
GGCGGTAATATGGTACGGTTGGAGTGCAACCACCGGTTTGGCATCCCCCAGAACCATATC
CAGGATTAACCCTGACTCCTGGAATCACAAAACCGGGAATCTGTGTGCCTGGAACCGTTA
TGGGAGGGATTGATATGCTTGGGACAACTACACTTGGCACACTACCACTAGAGCCACCTC
CTATACCGATACCAATCCCTTCGCCTGAGCCACTACCCTCTCCAATGCCTTCACCATATC
CGCTACCTGGAGCTCCAGTGATAGGACCGCAGTTCGGTTGGCCATAACCGGATCCTCTTC
CTTCTCCATAGCCACTGCCTCCACTAGAGCCGATGCCTTCTCCATATCCACTACCTCCAC
TAGAGCCAATGCCTTCTCCATATCCACTGCCTCCACTAGAGCCAATGCCTTCTCCATATC
CACTGCCACTTCCATAGCCCCTACCTACACCATACCCCATTGGCTTAACTGTGTGGTCAG
GATCTTCTGGTTCACCCGGTTCGCCCGGCATGGACTGTTTTACATTGTGATCGAGCATTT
TTT*AGGATCAGGTTCTTCTAGCTCACCC*ACATGGATTGCAGTTTATGATCAG*CATGA
*CTTGGCCTCAG*CTCCTCTGGT
CACCTGCAT

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ATGGTACGGTTGGAGTGCAACCACCGGTTTGGCATCCCCCAGAACCATATCCAGGATTAA
CCCTGGCTCCTGGAATCACAAAACCGGGAATCTGTGTGCCTGGAACCGTTATGGGAGGGA
TTGATATGCTTGGGACAACTACACTTGGCACACTACCACTAGAGCCACCTCCTATACCGA
TACCAATCCCTTCGCCTGAGCCACTACCCTCTCCAATGCCTTCACCATATCCGCTACCTG
GAGCTCCAGTGATAGGACCGCAGTTCGGTTGGCCATACCCGGATCCTCTTCCTTCTCCGT
AGCCACTGCCTCCACTAGAGCCGATGCCTTCTCCATATCCACTACCTCCACTAGAGCCAA
TGCCTTCTCCATATCCACTGCCTCCACTAGAGCCAATGCCTTCTCCATATCCACTGCCAC
TTCCATAGCCCCTACCTACACCATACCCCATTGGCTTAACTGTGTGGTCAGGATCTTCTG
GTTCACCCGGTTCGCCCGGCATGGACTGTTTTACATTGTGATCGAGCATTTTTTTAGGAT
CAGGTTCTTCTAGCTCACCCCACATGGATTGCAGTTTATGATCAGGCATGAACTTGGCCT
CAGGCTCC
C

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DS 

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ACAATCCTTCG
CTGAGCCACTACCCTCTCCAATGC*TTCACCATATCCGCTACCTGGAGCTCCAGTGATAG
GACCGCAGTTCGGTTGGCCATAACCGGATCCTCTTCCTTCTCCATAGCCACTGCCTCCAC
TAGAGCCGATGCCTTCTCCATATCCACTACCTCCACTAGAGCCAATGCCTTCTCCATATC
CACTGCCTCCACTAGAGCCAATGCCTTCTCCATATCCACTGCCACTTCCATAGCCCCTAC
CTACACCATACCCCATTGGCTTAACTGTGTGGTCAGGATCTTCTGGTTCACCCGGTTCGC
CCGGCATGGACTGTTTTACATTGTGATCGAGCATTTTTTTAGGATCAGGTTCTTCTAGCT
CACCCCACATGGATTGCAGTTTATGATCAGGCATGAACTTGGCCTCAGGCTCCTCTGGTT
CACCCTGCATGGATTGCATTTTATGATCAGGCATGATCTTGTCCTCAGGCTCCTCTGGTT
CACCAGGCATGGACTGCAGCTTACGGTCAGGCTTGACCTTGTC*TCAGGCTCTTCTGGTT
CACCCGGCATGGACTGCGGCTTATGGTCAGGCATGACCTTGTCCTCAGGCTCTTCCGGTT
CACCCGGCATGGACTGCAGCTCATGGTCAGGTTCTTCAGGCTCTTCTGGTATACCCGGCA
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TGGACTGC

QA 12 739 12 739
DS 

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GGCCTCAGGCTCCTCTGGTTCACCCTGCATGGATTGCATTTTATGATCAGGCATGATCTT
GTCCTCAGGCTCCTCTGGTTCACCAGGCATGGACTGCAGCTTACGGTCAGGCTTGACCTT
GTCCTCAGGCTCTTCTGGTTCACCCGGCATGGACTGCAGCTTATGGTCAGGCATGACCTT
GTCCTCAGGCTCTTCCGGTTCACCCGGCATGGACTGCAGCTCATGGTCAGGTTCTTCAGG
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CTCTTCTGGTACACCCGGCATGGACTGCAGCGTATGCAGCTTATGGTCAGGTTCTTCAGG
CTCTTCTGGTACACCCGGCATGGACTGCAGCGTATGGCCAGGCTTGACTTTGTTCTCAGT
TTCTACATTGAAAAACGCATGATCTTGCTCCCTCAAACTAACCATCCCAGGCTTCACTAA
ATGGTTCAGCTCTAGCTTGCTCGCCTCCATCATGGAGAGATCCTTAAGAACCCTGCGTGC
AAAAGTTGAACTGAAGAAGCATAGTAATAGGACGAATCCAAAGCATCTGCCTTGGTGTCC
CTTTGCCATATTATTATTTTTTGGTGTGTTTATCGTATGAAATAAACTGATCCTGCAGTC
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 6

CO CL1177Contig1 787 6 11 U
TTTTTTTGCACGAAAAGAACAAAAAGCCATACTAATTATAAGTAGGTTCCTTGGACACTT
GATCAAACTGAACAGAGAAAGCACTCTTCGTTATTAGTAAACAATGGGTGAAGAAAGCTA
TGGCCGTCTTTCAAAGTTTTACACATCATCTCAAAGAACTGTGATACTGTCTTTGATTTT
ACATAATGAGCAAGAAATGTAATTCTGTAAAGAGAAAAAAACATTTAAAGATAAAAAAGT
CTTTAACTAGGTGTACCGTTGGCTTTGCTCCTGTACACCTCTTCAAGACATTCTTTGGCT
CGATGAACTTTCGATTGAAGGTAAAAGCTCCCAGCTTTGGCGTTGTTCTCAAACAGCTTA
TCGTATTTCTGTACTATCTCTTCCCAAGAGGTCTGCTCGGTGACACCGAGAATCTGCCTA
GCCTCTTGCTCAGTAATGGATTTTCCTGCTTTACGTACTGCGTTCTGCATTGCTTCCTGC
GCTACGCCAGTTTTAGAAGCATTAGCAAGAGCCTGACGATAGGCTTGAAAGAAAGCACGA
CCCAATATCCCAGAACCCATCACAATGAGCTGCGCAATGATTCTCCCTGCCATTGAAGCT
GATTAATTGCTCGATTGAGAGATTCGGAAAGATGCTTCTTTCGTTTGCGAGATTCGGATT
CGTTTTTCGCGGGCGGGGAGAAAGAGAGAGGTAAACCTGGACAGGAAGGCGATAGAACAA
TCTAGGGTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTTTTCTTTTGGTTCGTGTTCGT
GTAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 
35 35 35 35 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1FV59TF C 1
AF RS1AS73JQ U 118
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CC

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CC

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C
CC

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ATGG
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ATTTCTGTACTATCTCTTCCCAAGAGGTCTGCTCGGTGACACCGAGAATCTGCCTAGCCT
CTTGCTCAGTAATGGATTTTCCTGCTTTACGTAATGCGTTCTGCATTGCTTCCTGCGCTA
CGCCAGTTTTAGAAGCATTAGCAAGAGCCTGACGATAGGCTTGAAAGAAAGCACGACCCA
ATATCCCAGAACCCATCACAATGAGCTGCGCAATGATTCTCCCTGCCATTGAAGCTGATT
AATTGCTCGATTGAGAGATTCGGAAAGATGCTTCTTTCGTTTGCGAGATTCGGATTCGTT
TTTCGCGGGCGGGGAGAAAGAGAGAGGTAAACCTGGACAGGAAGGCGATAGAACAATCTA
GGGTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTTTTCTTTTGGTTCGTGTTCGTGTAA
TCC

QA 5 667 5 667
DS 



AS 2 5

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AAAAAGAAGCAAAAAAAAATATTATTTCTCGTTCATCTCTCTCATTGAACATCAACATCT
TCATTGTTCATTCTGCAATTCGAATTTTAGGGTTTCTTTTTTCTTCTAGAGTTAGTAGAA
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TTTTTTTTTTGTTTTTTCGAATAAGCGGCGGAGAATGAGTGCTTCGAGGTTCATAAAGTG
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C443TF U 1
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AF RS1FG44JQ C 388
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TCATTGTTCATTCTGCAATTCGAATTTTAGGGTTTCTTTTTTCTTCTAGAGTTAGTAGAA
AAGTTCGCGACTTTATTGTTGGGTAATGGTTTGAGGAGAGAAAAGTCAAGAAGAAGTTTT
TTTTTTTTTTGTTTTTTCGAATAAGCGGCGGAGAATGAGTGCTTCGAGGTTCATAAAGTG
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CACTTTCCCTACGGACTATGTTCCAACAGTGTTCGACAACTTCAGTGCCAACGTGGTTGT
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DS 

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GGA
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CTTTAAAAAAAA

QA 4 782 4 782
DS 

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AGTA
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GATACAGCTGGTCAAGAAGACTATAACAGGTTAAGACCATTGAGTTACCGTGGTGCAGAT
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TGGATTCCTGAGCTTAGGCATTACGCCCCTGGAGTTCCTATCATCCTCGTTGGAACTAAA
CTCGATTTTCGAGATGACAAGCAGTTCTTCATAGACCATCCCGGTGCAGTACCAATCACT
ACAAACCAGGGAGAGGAACTAAAGAAGCTGATAGGATCTCCCGTTTACATTGAATGTAGT
TCAAAGACGCAGCAGAACGTGAAAGCAGTCTTTGACGCAGCTATAAAAGTGGTGCTTCAG
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QA 5 708 5 708
DS 



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BQ
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1E081TF C 1
AF RS1C443JQ U 27
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QA 1 532 1 532
DS 



AS 1 6

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BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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CTCAGATCTAAGGCGGGAGTATCAAATCGAACTCTACCGACTTCGATCTTAACAGATCCG
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GCTTTCAGGCTTTGCTGTGTTGTGGTGGCGCCTAGGAGGCGCGTGGCGAGCCCGTCCAAG
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DS 

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GTTGTTTGTGTTTGTTTAGACTCCGGGGTGTTTCTTTAGCAACCGCCGGCTTGTGGCTTC
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DS 

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DS 

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AAAAAAAAGCGAGAGCGAGAGAGAAAAAAGAGAGAACTTGTTGTCCTCAC*TTCTCCGGT
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GTTGTTTGTGTTTGTTTAGACTCCGGGGTGTTTCTTTAGCAACCGCCGGCTTGTGGCTTC
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ATGTTTCAGACTTGTAACCACTCATGTTTGGGTTTGTAATGTGTTCGATTAATAAAATAT
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TGGCGCCTAGGAGGCGCGTGGCGAGCCCGTCCAAGGTCCGATGGCGAGTTTAGTTGGAGT
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DS 

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TTTTCTTCTCCTAGATGGTACTTTAAATCTGATATTAAGCTTCAGATCTCAGACCTAAGG
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GCTGTGTTGTGGTGGCGCCTAGGAGGCGCGTGGCGAGCCCGTCCAAGGTCCGATGGCGAG
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TTTCAGACTTGTAACCACTCATGTTTGGGTTTGTAATGTGTTCGATTA
ATAAAATATCAGATGAC

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DS 



AS 1 4

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TATTGATGATC**GCAGCTGCTATAAAGCTCGCGATTTGCGACGACATTGGAGAGAAAGC
TTATGACTTCACAGATGTTGCTGGAATCCTTGTGCAGATGCTAGCACGGATTCCAGAAGT
AGGCTCGAGGGCGCTTTACAACCGGTACAAAATTCAGCTTGACGGAGGCTGCGGTAAAAA
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TTGTTTGAATTTCAACACAATTGCATTAAGATGTTTATGATATGGTAGTCCAATGAATAG
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FQ84TF U 1
AF RS1CH88TF U 463
AF RS1CH88JQ C 549
AF RS1AJ43JQ C 742
BS 1 759 RS1FQ84TF
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BS 1268 1399 RS1AJ43JQ

RD RS1FQ84TF 763 0 0
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AAACGAAGAGGAAATTGATTGGATGAATCTTGAATCTGATATTCGTCTATGGACTAGAGC
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ACAGCTTAAGCTGATGGATGTTGTGATTGAAGTCAGAGATGCTAGGATTCCCTTATCCAC
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AGAAGATATGATCTCTAATGATGATCGAAATGATTGGGCTAGATACTTTGCAAAGCAAGG
AATAAAAGTCATTTTCACTAATGGCAAACTTGGGACGGGAGCTATGAAGCTAGGTAGGTT
AGCAAAAAGCTTAGCTGGTGATGTAAATGGAAAGCGGCGAGAGAAGGGTCTTCTCCCTAG
ATCAGTTAGAGCTGGAATCATCGGATACCCAAATGTTGGAAAATCATCTTTGATCAATCG
TCTATTGAAGCGCAAGATCTGCGCAGCAGCTCCAAGACC
GGGT

QA 1 759 1 759
DS 

RD RS1CH88TF 726 0 0
G
ATATTGGTGTTGAACAGAGAAGATATGATCTCTAATGATGATCGAAATGATTGGGCTAGA
TACTTTGCAAAGCAAGGAATAAAAGTCATTTTCACTAATGGCAAACTTGGGACGGGAGCT
ATGAAGCTAGGTAGGTTAGCAAAAAGCTTAGCTGGTGATGTAAATGGAAAGCGGCGAGAG
AAGGGTCTTCTCCCTAGATCAGTTAGAGCTGGAATCATCGGATACCCAAATGTTGGAAAA
TCATCTTTGATCAATCGTCTATTGAAGCGCAAGATCTGCGCAGCAGCTCCAAGACCAGGT
GTAACTAGAGAGATGAAATGGGTGA*GCTCGGGGATGGTCTTGATCTGTTAGATTCACCA
GGAATGCTTCCTATGCGTATTGATGATC**GCAGCTGCTATAAAGCTCGCGATTTGCGAC
GACATTGGAGAGAAAGCTTATGACTTCACAGATGTTGCTGGAATCCTTGTGCAGATGCTA
GCACGGATTCCAGAAGTAGGCTCGAGGGCGCTTTACAACCGGTACAAAATTCAGCTTGAC
GGAGGCTGCGGTAAAAAATTTGTGAAGACGCTTGGTCTAGACTTGTTTGGTGGAGATAGT
CATCAAGCTGCATTTAGAATACTTTCGGATTTTCGCAAAGGCAAATTTGGTTATATCTCG
TTGGAGAGACCTCCACTGTGATCAGGACTCTGTGTATAGAGTTTAATCCTTAAACTTATG
AAGTA

QA 2 726 2 726
DS 

RD RS1CH88JQ 719 0 0
TCATTTTCACTAATGGCAAACTTGGGACGGGAGCTATGAAGCTAGGTAGGTTAGCAAAAA
GCTTAGCTGGTGATGTAAATGGAAAGCGGCGAGAGAAGGGTCTTCTCCCTAGATCAGTTA
GAGCTGGAATCATCGGATACCCAAATGTTGGAAAATCATCTTTGATCAATCGTCTATTGA
AGCGCAAGATCTGCGCAGCAGCTCCAAGACCAGGTGTAACTAGAGAGATGAAATGGGTGA
*GCTCGGGGATGGTCTTGATCTGTTAGATTCACCAGGAATGCTTCCTATGCGTATTGATG
ATC**GCAGCTGCTATAAAGCTCGCGATTTGCGACGACATTGGAGAGAAAGCTTATGACT
TCACAGATGTTGCTGGAATCCTTGTGCAGATGCTAGCACGGATTCCAGAAGTAGGCTCGA
GGGCGCTTTACAACCGGTACAAAATTCAGCTTGACGGAGGCTGCGGTAAAAAATTTGTGA
AGACGCTTGGTCTAGACTTGTTTGGTGGAGATAGTCATCAAGCTGCATTTAGAATACTTT
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GACTCTGTGTATAGAGTTTAATCCTTAAACTTATGAAGTATAAATGCCTAAATATGATGC
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DS 

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ATGCATTGTTTAATGTAAAATTAGGAAGTTGCATAATACTTGTTTGAATTTCAACACAAT
TGCATTAAGATGTTTATGATATGGTAGTCCAATGAATAGAAAATTCTTCTTTCAAACC

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DS 



AS 1 6

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CTCTTCAGCTGAGTCAGAATCCTAACTCGTCAATATCCAACAATCTCCCTAGATTTCCAT
GGAACCAAACATTCGCTTCTTCATCAGATCTTGGCAAAATAGACGTGAACAGTATTCCAA
CAACGGTGGATTGCGAGGAGGAAGCAGGAGTGTCGTCTCCTAACAGTACGATCTCGAGCA
CCATAAGCGGCGGGAAGAGGAGTGAGAGAGAAGGAATCTCCGACCACCACGATGATATCA
CTCCGGATAGAGGTTACTCGCGTGGAACCTCCGACGAAGAAGAAGACGGCGGTGAAACCT
CGAGGAAGAAGCTCCGATTATCTAAAGATCAGTCTGCTTTTCTTGAAGAGACTTTCAAAG
AACACAACACTCTCAATCCCAAACAGAAGCTAGCTTTGGCCAAAAAGTTGAGCTTGACAG
CAAGACAAGTGGAAGTCTGGTTTCAGAACAGAAGAGCTAGAACCAAATTTAAGCAAACGG
AGGTGGATTGTGAATACTTGAAACGATGCGTAGAGAAACTAACGGAGGAGAATAGGCGAC
TTCAGAAAGAGGCTATGGAGCTTCGAACTCTCAAGCTGTCTCCACAGTTCTATGGCCAAA
TGACTCCACCGACTACACTCATCATGTGTCCTTCGTGTGAGCGTGTGGCTGGGCCATCGT
CAAACCATCAACACAATCAGCGACCCGTTCCAATTAACCCGTGGGTTGCTTGTGCTGGTC
AAGTGGCTCATGGGCTGAATTTTGAAGCCTTGCGTCCACGATCGTGAGAGGAAGGGTGTT
CTGTTAATTTTGGTTGCTGTGTTGGTTTGGTGTTAAGTTGGCTGTGTGGGGGTTTATTGC
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TAGTTTGATGTAAATACAAAATTGATCTTTCTAGACACCTTGGAC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 35 35 35 35 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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RD RS1CF06TF 770 0 0
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AGA

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GG
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GG
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GAAAAGAAAAATACCATTTCTCATCTGTATCTTTCTTCTTGATTTCTTTCTCTCCACATA
AAGATCAAATCCTCTCTGTTCTCATCTAGATTCATAAGAACAGAATAAGTCATGATGATG
AGAAAAGAAGATCTGGGTTTGAGCCTGAGCTTAGGACTTTCACAAGATCACACACCTCTT
CAGCTGAGTCAGAATCCTAACTCGTCAATATCCAACAATCTCCCTAGATTTCCATGGAAC
CAAACATTCGCTTCTTCATCAGATCTTGGCAAAATAGACGTGAACAGTATTCCAACAACG
GTGGATTGCGAGGAGGAAGCAGGAGTGTCGTCTCCTAACAGTACGATCTCGAGCACCATA
AGCGGCGGGAAGAGGAGTGAGAGAGAAGGAATCTCCGACCACCACGATGATATCACTCCG
GATAGAGGTTACTCGCGTGGAACCTCCGACGAAGAAGAAGACGGCGGTGAAACCTCGAGG
AAGAAGCTCCGATTATCTAAAGATCAGTCTGCTTTTCTTGAAGAGACTTTCAAAGAACAC
AACACTCTCAATCCCAAACAGAAGCTAGCTTTGGCCAAAAAGTTGAGCTTGACAGCAAGA
CAAGTGGAAGTCTGGTTTCAGAACAGAAGAGCTAGAACCAAATTTAAGCAAACGGAG*TG
GATTGTGA*TACTTGAAACGATGCGTAGAGAAAC

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TTTTCTTGAAGAGACTTTCAAAGAACACAACACTCTCAATCCCAAACAGAAGCTAGCTTT
GGCCAAAAAGTTGAGCTTGACAGCAAGACAAGTGGAAGTCTGGTTTCAGAACAGAAGAGC
TAGAACCAAATTTAAGCAAACGGAGGTGGATTGTGAATACTTGAAACGATGCGTAGAGAA
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GTCTCCACAGTTCTATGGCCAAATGACTCCACCGACTACACTCATCATGTGTCCTTCGTG
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ACGATCGTGAGAGGAAGGGTGTTCTGTTAATTTTGGTTGCTGTGTTGGTTTGGTGTTAAG
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TATGTATGATGTAACCCTCATATGTAATATAAAATTAGCAAAAATTAGTTACAATAGT

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DS 

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G
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AAGTTGAGCTTGACAGCAAGACAAGTGGAAGTCTGGTTTCAGAACAGAAGAGCTAGAACC
AAATTTAAGCAAACGGAGGTGGATTGTGAATACTTGAAACGATGCGTAGAGAAACTAACG
GAGGAGAATAGGCGACTTCAGAAAGAGGCTATGGAGCTTCGAACTCTCAAGCTGTCTCCA
CAGTTCTATGGCCAAATGACTCCACCGACTACACTCATCATGTGTCCTTCGTGTGAGCGT
GTGGCTGGGCCATCGTCAAACCATCAACACAATCAGCGACCCGTTCCAATTAACCCGTGG
GTTGCTTGTGCTGGTCAAGTGGCTCATGGGCTGAATTTTGAAGCCTTGCGTCCACGATCG
TGAGAGGAAGGGTGTTCTGTTAATTTTGGTTGCTGTGTTGGTTTGGTGTTAAGTTGGCTG
TGTGGGGGTTTATTGCAGTATTGGATGATTGGCCTTATTAAGTTTAAGTGCTATATGTAT
GATGTAACCCTCATATGTAATATAAAATTAGCAAAAA

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DS 

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TGAGCTTGACAGCAAGACAAGTGGAAGTCTGGTTTCAGAACAGAAGAGCTAGAACCAAAT
TTAAGCAAACGGAGGTGGATTGTGAATACTTGAAACGATGCGTAGAGAAACTAACGGAGG
AGAATAGGCGACTTCAGAAAGAGGCTATGGAGCTTCGAACTCTCAAGCTGTCTCCACAGT
TCTATGGCCAAATGACTCCACCGACTACACTCATCATGTGTCCTTCGTGTGAGCGTGTGG
CTGGGCCATCGTCAAACCATCAACACAATCAGCGACCCGTTCCAATTAACCCGTGGGTTG
CTTGTGCTGGTCAAGTGGCTCATGGGCTGAATTTTGGAGCCTTGCGTCCACGATCGTGAG
AGGAAGGGTGTTCTGTTAATTTTGGTTGCTGTGTTGGTTTGGTGTTAAGTTGGCTGTGTG
GGGGTTTATTGCAGTATTGGATGATTGGCCTTATTAAGTTTAAGTGCTATATGTATGATG
TAACCCTCATATGTAATATAAAATTAGCAAAAATTAGTTACAATAGTAACCAAATTGTGA
AGCTATCTAAACTAGTTTGATGTAAATACAAAATTGATCTTTCTAGACACCTTGGAC

QA 1 717 1 717
DS 



AS 2 6

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TACAAGAAACTCAAGATAGTATTACATATTCGTTGTTTCTAATACATGATACACTGAATT
TATTCAAATAATAAGACAACAACATGTGGATAAACTACAAGTCGGAAGAGTTTTTTTACT
TTTTCTTTGTGCAAAGGGAAGGCTGTAGAACTAAGAAGGAAGGGTTTTGTGTGACTTTGA
TTCTAAACATGTTCATGAGGAGGATCTATGAGAGGTTCATTGGGTTCCTCACCAGTTTCC
GGAGATTTTGAGGATTTCTTCTCAGGGTACAAGACATAATGTTGAAACATGAAGAGGATA
TCGAAAAATATTGAGATGAGTGAGAGAAGAGTCTTTCCAATGTTCCCATAAAAATTTACC
CATGAATTTTGGTCAATAGATTGAATAACCATCTGCAGATAGTTAGCGAGTCCTCCACCA
AAATCGAGAAGAATGTTCCCAATGCTCCACCCGACTGTGCTCTTCCTAGTAAAGTTCATC
TTAGCCTGTGGAATGTACTTGACGCATGTCATGCCAACCTGAATCGAGTTGAGGATGGTA
ATGAGCCAGAGCCAAGAGTGTGAAGGTAAAGCAATAAAGAAACAGATAGCTGCAAAGCCC
CAGACAAGAACGACAAGAACAGTAGCAAATCTTGATACTTTCTGAGGTCCACGTTCATAG
ATAAAGATCTGGAAGAGGGTAAGAGCTGTGAGAACAACAGCATGGATTGAGAAGGCAACA
TCATTGGCAGCCACAGGTATCATCTCTTGATCGCCGTAAGTGTCAAAGTACTGTTTTTGA
ATGAAGGGGCTGAAGTAGAGGCAGAAGTTGTAGATCATATACGACGAGTGCTTCGTCAAA
TTCAACAGCACGAAGTCGAAGTTCAATCCAACCACACTTTTCCTGCGGAAATTGAGAATC
AGCTGAGGGTAGAAGCTAATGGACCAAGACGCAAACGCGATCCATCCCACGACCTCGTAC
GAGATTTCTAGCGGAATCGAATTCCACGATGCCATAGATCGGTTTCGACTTTTTTTTTTT
TTTTTTTTGCTTCTAAATTTGTTGTGAGGAGGAGGAGAGAGGGAGATTGATGATTGAGAA
AAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AGATTGAATAACCATCTGCAGATAGTTAGCGAGTCCTCCACCAAAATCGAGAAGAATGTT
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TTTTTTTTTTTTTTGCTTCTAAATTTGTTGTGAGGAGGAGGAGAGAGGGAGATTGATGAT
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DS 



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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ES33TF U 1
AF RS1ES33JQ C 416
BS 1 569 RS1ES33TF
BS 570 1124 RS1ES33JQ

RD RS1ES33TF 569 0 0
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AAAAAGAAGTCAAAACGATCGATTCGAAACCGATCTATGGCATCGTGGAATTCGATTCCG
CTAGAAATCTCGTATGAGGTCGTCGGATGGATCGCTTTTGCGTCGTGGTCGATTAGCTTC
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GTGCTGTTGAATTTAACGAAGCACTCGTCGTATATGATCTACAACGTCTGCCTCTACTTC
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GCTGCCAATGATGTTGCCTTCTCAATCCATGCTGTTGTTCTCACAGCTCTTACCCTCTTC
CAGATCTTTATCTATGAGCGTGGACCTCAAAAAGTATCAAGATTTGCTACTGTTCTTGTC
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CTCTGGCTCATTACCATCTTCAACTCGAT

QA 1 569 1 569
DS 

RD RS1ES33JQ 709 0 0
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TTGTCGTTCTTGTCTGGGGCTTTGCAGCTATCTGTTTCTTTATTGCTTTACCTACCCACT
CTTGGCTCTGGCTCATTACCATCTTCAACTCGATTCAGGTTGGCATGACTGCGTCAAGTA
CATTCCACAGGCTAAGATGAACTTCACTAGGAAGGGCACAGTCGGTTGGAGCATTGGGAA
CATTCTTCTCGATTTTGGTGGTGGTCTCGCTAACTATCTGCAGATGGTTATTCAATCTAT
TGACCAAAATTCATGGGTAAATTTTTATGGGAACATTGGAAAGACTCTTCTCTCACTCAT
CTCAATATTTTTCGATATCCTCTTCATGTTTCAACACTATGTCTTGTACCCTGAGAAGAA
ATCCTCTAAATCTCCGGAAACTGGTGAGGAATCCAGTGAACCTCTCATTGATCCTCCTCA
TGAACATGTTTAGAATCAAAGTCTCACAAAACACACACAAAACTTTTCCTTTTTAGTTCT
ACAGCCTTCCCTTTGTACAAAAAAGTAAAAAAACTCTTCGGACTTTGTAGTTTATCCACA
TGTTGTTGTCCTATTATTTGAATAATTTCAGTGTATCATGTATTAGAAACAACGAATATG
TAATACTATCTTGAGCTTCTTGTAAGAATATTAATGTCCATCAAACATT

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 6

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GACCTATTCGGCTATTCCACAAAACAACGGTTACAAAATATACAAACAGCGAAAATGAAT
AACAAAGCGATATTCCTTCTCTTCCTCTCTCTCGTTCTCCTTCCTCTCTACGCTTCTGCG
TCGCCGTTTGTCGGTGGATGGCGTCCCCTCAGAAACGTTAGTGACCCTCACGTCGTAGAG
ATCGGCGAATTCGCGGTCTCCGAGTACAACAAGCAGAGCAAGTCGGGACTCAAGTTCGTG
TCGGTTGTTAGCGGCTACTCTCAGGTAGTTGCCGGTACAAATTACCGGCTTATCGTGGCG
GTTAATGATGGCGTAAAGATAGCCAATGCTGGTGCGAGCAAGAACTACGAAGCGATTGTA
TGGGAGCAGCCTTGGTTACATTCAAAGAATCTCACCTCTTTCAAGCCAGCCATGAACTAA
TGGCTGTTTCCTCTTAAGTTCTCCATATGTAATGATCTGATAAAATACAGTAAAAAAAGT
TAAATAAACAAAGAAGGAATTGAATTAATGTTGATTCCTGTATTTCTTTCTGATTTTCAA
AATTTATGTTGTTGGGCGTAAACCCTAGATCTGATGCAAATGATTGAACAAGTGGTGACA
AATCCGCTAATTACGCCGGCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1B230JQ C 27
AF RS1CO42JQ C 27
AF RS1CO42TF U 27
AF RS1B230TF U 27
AF RS1AN54JQ C 1
AF RS1AN54TF U 1
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AATGTTGATTCCTGTATTTCTTTCTGATTT
CC

QA 1 510 1 510
DS 

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GG

QA 1 504 1 504
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AATCTTGATTCCTGTATTTCTTTC
GG

QA 1 504 1 504
DS 

RD RS1B230TF 512 0 0
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AATGTTGATTCCTGTATTTCTTTCTGATTT
CC

QA 1 510 1 510
DS 

RD RS1AN54JQ 621 0 0
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QA 1 621 1 621
DS 

RD RS1AN54TF 621 0 0
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ATCGGCGAATTCGCGGTCTCCGAGTACAACAAGCAGAACAAGTCGGGACTCAAGTTCGTG
TCGGTTGTTAGCGGCTACTCTCAGGTAGTTGCCGGTACAAATTACCGGCTTATCGTGGCG
GTTAATGATGGCGTAAAGATAGCCAATGCTGGTGCGAGCAAGAACTACGAAGCGATTGTA
TGGGAGCAGCCTTGGTTACATTCAAAGAATCTCACCTCTTTCAAGCCAACCATGAACTAA
TGGCTGTTTCCTCTTAAGTTCTCCATATGTAATGATCTGATAAAATACAGTAAAAAAAGT
TAAATAAACAAAGAAGGAATTGAATTAATGTCGATTCCTGTATTTCTTTCTGATTTTCAA
AATTTATGTTGTTGGGCGTAAACCCTAGATCTGATGCAAATGATTGAACAAGTGGTGACA
AATCCGCTAATTACGCCGGCT

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 2

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AAACAAGTTTTAGTTTGTTTTGATGAGACGCCGAGAAGGAAGGGGAATAATAAAATCGGT
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AATGGAAAAGCATATGTGATCTAAAAGAGCCTAGCAAGAGTGTGCATCTCTTTTCTTGCT
ATTCAAATGTCCGCAAACCAAATTTTGTTCCTACGTTAGAAAGCAAAGATGTACCCGTTT
CTTTGTTTTCTGGGGAGAGAGAGGCTTTGGAATATAATTTTTGAAGATAGCGTGTGAGGT
TATGTTTCCATCGATTGTCTATCCCTAAAACTTGAGAGACTAATTCCAGGGCTGTGACAA
AGACACCGTGGAAGTTGATGCTCCTATTCCTCTTCCCTGATTGATTGCAGAGTTTAGAGT
CTTGTATTGTTCATTGACCGACTTGTACATAGCTTGGCTGTATGCTTCTTTCGCCTCGTT
AGGGTTGTTGCAGTCTACCGTGACATCCGAGAAACTGATCTCAGGACCTATTGATAGTCC
GGTACCATGAAACCCAACTAATCTTTTCTCTCCAATTTCTTTCTCAACTTTGGGTGGAGG
AGGCATGATGCCATAGCAAAGCAAAGACATTGGATAGATGTGTCCAGGAGCACCAGAACG
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CCAGACCTTAGCAGTGTAGCCATCTCCTTTAAGCTTCGTGCGTTTGCTTTTCTTTTCATA
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GAAGAG


BQ
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BQ
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TTTGTCCATCAGAAACCATAGTGGCACATATGAATACAGCTTTTGAGATTTTTTCAGGAA
ACCGCTCTAATGCATATGAAACACATGCACCTCCTGTACTGTGACCTACGACAATCACCT
TTTCTTCCTCTGGAAGATTTTGAAG
A

QA 14 698 14 698
DS 

RD RS1CF70JQ 727 0 0
CACATAATT
AACTATCTTGTTTGGTATCGACGTAAGACGAATTATACAGAAGTTTATAAGTTGAAAAAT
GTAAAGTATTATACATGGTCGAGTGAATTAAAGATTTAACTCTCTTTTAAGGAATCTGAG
CGATCTCAAGAAGGATCTTGTGAAGAGACTGAGGTTTAGAGAAGAAAGGACAATGATCAC
TTCCTTTGATCTTATAAACTCCTTCCGGACTACTATCTCTCACAAGTTTCTCCTGAACGT
CTGGTGAGAGAGCCAAGTCATCAAGCGTCTGAACATAGAATCTCCGACCTTTCCCATATC
TTTCTGCGCTCAGCGACAGTTTCTCCATCATTGGACCCAATGGTACTGCTCGCATTGAGA
TCATCGACAATGCTATGTCCTTATTGGGTGACTGATTGAAGTACAAGCTTTTCATGTGTT
GCTTCTCAAAAATGAACCCCGTTGCGGGCTTGTCCTTTCCATTTCCATGGATCAAGAACT
GCGATTCTTTCATGAACCTTTCTGCAGAACCAAGCTGATCAGCAAAGACATCGAAGGGTC
TTTGTCCATCAGAAACCATAGTGGCACATATGAATACAGCTTTTGAGATTTTTTCAGGAA
ACCGCTCTAACGCAAATGAAACACATGCACCTCCTGTACTGTGACCTACGACAATCACCT
TTTCTTCCTCTGGGAGATTTTGAAGGAGCTCGATCAATGGTTTTGAATATTCTTCTAA

QA 10 727 10 727
DS 

RD RS1FW77TF 769 0 0
TGCGCTCAGCGACAGTTTCTCCATCATTGGACCCAATGGTACTGCTCGCATTGAGATCAT
CGACAATGCTATGTC*TTATTGGGTGACTGATTGAAGTACAAGCTTTTCATGTGTTGCTT
CTCAAAAATGAACCCCGTTGCGGGCTTGTCCTTTCCATTTCCATGGATCAAGAACTGCGA
TTCTTTCATGAACCTTTCTGCAGAACCAAGCTGATCAGCAAAGACATCGAAGGGTCTTTG
TCCATCAGAAACCATAGTGGCACATATGAATACAGCTTTTGAGATTTTTTCAGGAAACCG
CTCTAACGCAAATGAAACACATGCACCTCCTGTACTGTGACCTACGACAATCACCTTTTC
TTCCTCTGGGAGATTTTGAAGGAGCTCGATCAATGGTTTTGAATATTCTTCTAAAGTGGA
AACACTATTTGGGTCAGCCATACTAAATCCAGACTCTTCCAATGAAGCAACAGTTTTGTA
CCAACACCAAGCCCCAAACCCTTCACCATGTACAAGAACGAGTTTTTTAACCGCCAAGCT
CTCCACAAGATCAGGTACCTGCTTGTTGTTTGAAAAAGGGTCAGAGAGAGTTTGTCTTCT
GGAGCTAGTAGACCCGACACGTCTAGAAATGGACCCATCGAATCTCTGAGAAAGCTGAGC
TTGATGAATAGCCATGGACAAAGCTCGTCGATGCAACATCTCTTCATCACCAAGCAGTTT
CCTTTGAGAACGACTTACCCTCTTGCTTCTAGACCCATCTCCTCCTCCC

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 6

CO CL1186Contig1 578 6 16 U
GGAACGGAAGCACCAAACTCAAACACAGAAGAATCAAATCGGAGAGAGATAAAAGTCAAT
TTCGGAAGAAAGAAAATGGGAGAGAAGAAGGAGATGGTGGCACCGGAATACGACGTGAAC
GCTAAGTGGGATGCGTGCATCGATCTCACGACGCGCCGTTTCGTCTACTCCTCCCTCGGC
GGCGCCTTCGCCGGTCTTCTCTTCTTCAGGAGTCCTGTTACAAGATGGGCGTCTATTGCC
TTTGGTGCTGGAATCGGTATTGGCTCTGCATACACTGATTGCTCTCGTGCTTTTGATGCA
GACACTTCTGTATCTCAGGCGGCAGAAGAGTAGAGAAGGATGATAAAGCAGTAAGTGAAC
CCATGCGAAGATCAGCAGGGTATTCAGAAAACACTCATATGATTTTGAATTGTTTCCTTT
TTTTT*GGTCAAATGGACAAGTACTTTGAGGTTAATGCCCAAATGTAAAACCTTCTCTTC
TGTCTTTCTTTCTTATGTTAATCGTTTTGAACAAA*TTAACCTCTAAAATGTTATATCAG
CGCATTCTAGTTGCAATAAAAAAAGCCAACAAATCCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 5 5 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 20 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EJ78JQ C 1
AF RS1EJ78TF U 1
AF RS1CD16TF U 14
AF RS1AG47JQ C 39
AF RS1AG47TF U 39
AF RS1CD16JQ C 197
BS 1 52 RS1EJ78TF
BS 53 54 RS1CD16TF
BS 55 67 RS1EJ78TF
BS 68 68 RS1CD16TF
BS 69 71 RS1EJ78TF
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BS 75 75 RS1CD16TF
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BS 100 100 RS1CD16TF
BS 101 103 RS1EJ78TF
BS 104 104 RS1CD16TF
BS 105 425 RS1EJ78TF
BS 426 426 RS1CD16TF
BS 427 554 RS1EJ78TF
BS 555 578 RS1CD16TF

RD RS1EJ78JQ 554 0 0
GGAACGGAAGCACCAAACTCAAACACAGAAGAATCAAATCGGAGAGAGATAA**GTCAAT
TTCGGAAAAAA*AATATGGGAGAGAAGAAGGAGATGGTGCCACGGGAATACGACGTGAAC
GCTAAGTGGGATGCGTGCATCGATCTCACGACGCGCCGTTTCGTTTACTCCTCCCTCGGC
GGCGCCTTCGCCGGTTTTTTTTTTTTCAGGAGTCCTGTTACAAGATGGGCGTCTATTGCC
TTTGGTGCTGGAATCGGTATTGGCTCTGCATACACTGATTGCTCTCGTGCTTTTGATGCA
GACACTTCTGTATCTCAGGCGGCAGAAGAGTAGAGAAGGATGATAAAGCAGTAAGTGAAC
CCATGCGAAGATCAGCAGGGTATTCAGAAAACACTCATATGATTTTGAATTGTTTCCTTT
TTTTTTGGTCAAATGGACAAGTACTTTGAGGTTAATGCCCAAATGTAAAACCTTCTCTTC
TGTCTTTCTTTCTTATGTTAATCGTTTTGAACAAA*TTAACCTCTAAAATGTTATATCAG
CGCATTCTAGTTGC

QA 1 554 1 554
DS 

RD RS1EJ78TF 554 0 0
GGAACGGAAGCACCAAACTCAAACACAGAAGAATCAAATCGGAGAGAGATAA**GTCAAT
TTCGGAAAAAA*AATATGGGAGAGAAGAAGGAGATGGTGCCACGGGAATACGACGTGAAC
GCTAAGTGGGATGCGTGCATCGATCTCACGACGCGCCGTTTCGTCTACTCCTCCCTCGGC
GGCGCCTTCGCCGGTCTTCTCTTCTTCAGGAGTCCTGTTACAAGATGGGCGTCTATTGCC
TTTGGTGCTGGAATCGGTATTGGCTCTGCATACACTGATTGCTCTCGTGCTTTTGATGCA
GACACTTCTGTATCTCAGGCGGCAGAAGAGTAGAGAAGGATGATAAAGCAGTAAGTGAAC
CCATGCGAAGATCAGCAGGGTATTCAGAAAACACTCATATGATTTTGAATTGTTTCCTTT
TTTTTTGGTCAAATGGACAAGTACTTTGAGGTTAATGCCCAAATGTAAAACCTTCTCTTC
TGTCTTTCTTTCTTATGTTAATCGTTTTGAACAAA*TTAACCTCTAAAATGTTATATCAG
CGCATTCTAGTTGC

QA 1 554 1 554
DS 

RD RS1CD16TF 565 0 0
GGAAACTCAACT
CAGAAGAATCAAATCGGAGAGAGGTAAAAGTCAATTTCGGAAGAAAGAAAATGGGAGAGA
AGAAGGAGATGGTGGCACCGGAATACGACGTGAACGCTAAGTGGGATGCGTGCATCGATC
TCACGACGCGCCGTTTCGTCTACTCCTCCCTCGGCGGCGCCTTCGCCGGTCTTCTCTTCT
TCAGGAGTCCTGTTACAAGATGGGCGTCTATTGCCTTTGGTGCTGGAATCGGTATTGGCT
CTGCATACACTGATTGCTCTCGTGCTTTTGATGCAGACACTTCTGTATCTCAGGCGGCAG
AAGAGTAGAGAAGGATGATAAAGCAGTAAGTGAACCCATGCGAAGATCAGCAGGGTATTC
AGAAAACACTCATATGATTTTGAATTGTTTCCTTTTTTTT*GGTCAAATGGACAAGTACT
TTGAGGTTAATGCCCAAATGTAAAACCTTCTCTTCTGTCTTTCTTTCTTATGTTAATCGT
TTTGAACAAA*TTAACCTCTAAAATGTTATATCAGCGCATTCTAGTTGCAATAAAAAAAG
CCAACAAATCCCC

QA 13 565 13 565
DS 

RD RS1AG47JQ 516 0 0
GGGGAGAAAGGTAA
AAGTCAATTTCGGAAGAAAGAAAATGGGAGAGAAGAAGGAGATGGTGGCACCGGAATACG
ACGTGAACGCTAAGTGGGATGCGTGCATCGATCTCACGACGCGCCGTTTCGTCTACTCCT
CCCTCGGCGGCGCCTTCGCCGGTCTTCTCTTCTTCAGGAGTCCTGTTACAAGATGGGCGT
CTATTGCCTTTGGTGCTGGAATCGGTATTGGCTCTGCATACACTGATTGCTCTCGTGCTT
TTGATGCAGACACTTCTGTATCTCAGGCGGCAGAAGAGTAGAGAAGGATGATAAAGCAGT
AAGTGAACCCATGCGAAGATCAGCAGGGTATTCAGAAAACACTCATATGATTTTGAATTG
TTTCCCTTTTTTT*GGTCAAATGGACAAGTACTTTGAGGTTAATGCCCAAATGTAAAACC
TTCTCTTCTGTCTTTCTTTCTTATGTTAATCGTTTTGAACAAAATTAACCTCTAAAATGT
TATATCAGCGCATTCTAGTTGC

QA 15 516 15 516
DS 

RD RS1AG47TF 516 0 0
GGGGAGAAAGGTAA
AAGTCAATTTCGGAAGAAAGAAAATGGGAGAGAAGAAGGAGATGGTGGCACCGGAATACG
ACGTGAACGCTAAGTGGGATGCGTGCATCGATCTCACGACGCGCCGTTTCGTCTACTCCT
CCCTCGGCGGCGCCTTCGCCGGTCTTCTCTTCTTCAGGAGTCCTGTTACAAGATGGGCGT
CTATTGCCTTTGGTGCTGGAATCGGTATTGGCTCTGCATACACTGATTGCTCTCGTGCTT
TTGATGCAGACACTTCTGTATCTCAGGCGGCAGAAGAGTAGAGAAGGATGATAAAGCAGT
AAGTGAACCCATGCGAAGATCAGCAGGGTATTCAGAAAACACTCATATGATTTTGAATTG
TTTCCCTTTTTTT*GGTCAAATGGACAAGTACTTTGAGGTTAATGCCCAAATGTAAAACC
TTCTCTTCTGTCTTTCTTTCTTATGTTAATCGTTTTGAACAAA*TTAACCTCTAAAATGT
TATATCAGCGCATTCTAGTTGC

QA 15 516 15 516
DS 

RD RS1CD16JQ 382 0 0
TTTTT
TTCTTCAGGAGTCCTGTTACAAGATGGGCGTCTATTGCCTTTGGTGCTGGAATCGGTATT
GGCTCTGCATACACTGATTGCTCTCGTGCTTTTGATGCAGACACTTCTGTATCTCAGGCG
GCAGAAGAGTAGAGAAGGATGATAAAGCAGTAAGTGAACCCATGCGAAGATCAGCAGGGT
ATTCAGAAAACACTCATATGATTTTGAATTGTTTCCTTTTTTTT*GGTCAAATGGACAAG
TACTTTGAGGTTAATGCCCAAATGTAAAACCTTCTCTTCTGTCTTTCTTTCTTATGTTAA
TCGTTTTGAACAAA*TTAACCTCTAAAATGTTATATCAGCGCATTCTAGTTGCAATAAAA
AAAGCCAACAAATCCCC

QA 6 382 6 382
DS 



AS 1 6

CO CL1187Contig1 961 6 12 U
GGTAGAGAAAATAAATAATCGATACAACACCGCAGGATAATGTAATTTGAAGCTTTTCAG
AACGAGATTTAGATGTCATAAGATCCAAAAGGTAAAACAGTCTTACACATTTTTTATTAT
TTGATTGAGTTTGGTTCTTCCAACTTAAAGCTATATATACGACTCTCATAAAACCCTGAA
AAAATCTTCACCGAGAAAGAAGTGCAGCTTCATTGCCTTTAGTCCTCCTTTGCAGCATCA
CCATTTGCAACATCCTTCTTCTCCGTGGTTTCTTCCGTTTTCTCTTCTATGCTTGTAGAA
GTCTCACCGTGGGCAACCGCGGAAGCTTCTTCTGCTTCTTCTCCGGTGTTTGTAGCAGGT
TCCGAGTCTGCTGCACTTTCTTTGCCTTCTCCATCACTCTTCTGAATGGTCCCGACTTTG
ACATACTTGCTCATGAACTTGTACTCCCAGTCTTGTAACGCATCTAGCTCAAATGGACCT
AGACCCGAAATGTCTCCGGTCAAATCGGATTCCTCAAAGGACATCTTAGCAAGAGCTCGG
CTTGCATCTTTCCCTGCAAACAGAGCGTATGGTCCACCTGGTCCATAGAACATCCTGCTC
TGGGAAACATCGTAGATCTGGCCTTTGATGGCCATGAGAAGGGGGTTTTTGGGATCGGAG
CCGTCGTACTTCTTAAGCTCCTCCTCCGTGATTTCTCCGAGCTGAACCGGAGGCGGTAGG
GGCTCAGGCTGAGGGTAATCCTCCGTTGAACGAGGACGGTGTTCCTCGGGGGAGACGAAG
AAACCGGAGACGACTTGGTAGACGGCGAAAGCGAGAGCCAAGACGGTGAAAAAGGCAGCC
GGAGAGAGTCCGGTGTAAGCTGTGATTGTTTCCTTGACCGTCTCCCATAGTTCAACCACC
ATGATTAAAGGAGAGAAGAGATAGAGAGAGAGAGAGATAATCGGTGACTGGTTAGAGAGC
C


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 

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AF RS1CI22JQ U 1
AF RS1AH66TF C 231
AF RS1BY51TF C 261
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TTGAGTTTGGTTCTTCCAACTTAAAGCTATATATACGACTCTCATAAAACCCTGAAAAAA
TCTTCACCGAGAAAGAAGTGCAGCTTCATTGCCTTTAGTCCTCCTTTGCAGCATCACCAT
TTGCAACATCCTTCTTCTCCGTGGTTTCTTCCGTTTTCTCTTCTATGCTTGTAGAAGTCT
CACCGTGGGCAACCGCGGAAGCTTCTTCTGCTTCTTCTCCGGTGTTTGTAGCAGGTTCCG
AGTCTGCTGCACTTTCTTTGCCTTCTCCATCACTCTTCTGAATGGTCCCGACTTTGACAT
ACTTGCTCATGAACTTGTACTCCCAGTCTTGTAACGCATCTAGCTCAAATGGACCTAGAC
CCGAAATGTCTCCGGTCAAATCGGATTCCTCAAAGGACATCTTAGCAAGAGCTCGGCTTG
CATCTTTCCCTGCAAACAGAGCGTATGGTCCACCTGGTCCATAGAACATCCTGCTCTGGG
AAACATCGTAGATCTGGCCTTTGATGGCCATGAGAAGGGGGTTTTTGGGATCGGAGCCGT
CGTACTTCTTAAGCTCCTCCTCCGTGATTTCTCCGAGCTGAACC

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DS 

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TTGATTGAGTTTGGTTCTTCCAACTTAAAGCTATATATACGACTCTCATAAAACCCTGAA
AAAATCTTCACCGAGAAAGAAGTGCAGCTTCATTGCCTTTAGTCCTCCTTTGCAGCATCA
CCATTTGCAACATCCTTCTTCTCCGTGATTTCTTCCGTTTTCTCTTCTATGCTTGTAGAA
GTCTCACCGTGGGCAACCGCGGAAGCTTCTTCTGCTTCTTCTCCGGTGTTTGTAGCAGGT
TCCGAGTCTGCTGCACTTTCTTTGCCTTCTCCATCACTCTTCTGAATGGTCCCGACTTTG
ACATACTTGCTCATGAACTTGTACTCCCAGTCTTGTAACGCATCTAGCTCAAATGGACCT
AGACCCGAAATGTCTCCGGTCAAATCGGATTCCTCAAAGGACATCTTAGCAAGAGCTCGG
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TGGGAAACATCGTAGATCTGGCCTTTGATGGCCATGAGAAGGGGGTTTTTGGGATCGGAG
CCGTCGTACTTCTTAAGCTCCTCCTCCGTGATTTCTCCGAGCTGAACCGGAGGCGGTAGG
GGC

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DS 

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GCTTGTAGAAGTCTCACCGTGGGCAACCGCGGAAGCTTCTTCTGCTTCTTCTCCGGTGTT
TGTAGCAGGTTCCGAGTCTGCTGCACTTTCTTTGCCTTCTCCATCACTCTTCTGAATGGT
CCCGACTTTGACATACTTGCTCATGAACTTGTACTCCCAGTCTTGTAACGCATCTAGCTC
AAATGGACCTAGACCCGAAATGTCTCCGGTCAAATCGGATTCCTCAAAGGACATCTTAGC
AAGAGCTCGGCTTGCATCTTTCCCTGCAAACAGAGCGTATGGTCCACCTGGTCCATAGAA
CATCCTGCTCTGGGAAACATCGTAGATCTGGCCTTTGATGGCCATGAGAAGGGGGTTTTT
GGGATCGGAGCCGTCGTACTTCTTAAGCTCCTCCTCCGTGATTTCTCCGAGCTGAACCGG
AGGCGGTAGGGGCTCAGGCTGAGGGTAATCCTCCGTTGAACGAGGACGGTGTTCCTCGGG
GGAGACGAAGAAACCGGAGACGACTTGGTAGACGGCGAAAGCGAGAGCCGAGACGGTGAA
AAAGGCAGCCGGAGAGAGTCCGGTGTAAGCTGTGATTGTTTCCTTGACCGTCTCCCATAG
TTCAACCAC

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DS 

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GGAAGCTTCTTCTGCTTCTTCTCCGGTGTTTGTAGCAGGTTCCGAGTCTGCTGCACTTTC
TTTGCCTTCTCCATCACTCTTCTGAATGGTCCCGACTTTGACATACTTGCTCATGAACTT
GTACTCCCAGTCTTGTAACGCATCTAGCTCAAATGGACCTAGACCCGAAATGTCTCCGGT
CAAATCGGATTCCTCAAAGGACATCTTAGCAAGAGCTCGGCTTGCATCTTTCCCTGCAAA
CAGAGCGTATGGTCCACCTGGTCCATAGAACATCCTGCTCTGGGAAACATCGTAGATCTG
GCCTTTGATGGCCATGAGAAGGGGGTTTTTGGGATCGGAGCCGTCGTACTTCTTAAGCTC
CTCCTCCGTGATTTCTCCGAGCTGAACCGGAGGCGGTAGGGGCTCAGGCTGAGGGTAATC
CTCCGTTGAACGAGGACGGTATTCCTCGGGGGAGACGAAGAAACCGGAGACGACTTGGTA
GACGGCGAAAGCGAGAGCCAAGACGGTGAAAAAGGCAGCCGGAGAGAGTCCGGTGTAAGC
TGTGATTGTTTCCTTGACCGTCTCCCATAGTTCAACCACCATGATTAAAGGAGAGAAGAG
ATAGATAGAGAGAGAGATAATCGGTGACTGGTT
CC

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DS 

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GCAGCATCACCATTTGCAACATC*TTCTTCTCCGTGATTTCTTCCGTTTTCTCTTCTATG
CTTGTAGAAGTCTCACCGTGGGCAACCGCGGAAGCTTCTTCTGCTTCTTCTCCGGTGTTT
GTAGCAGGTTCCGAGTCTGCTGCACTTTCTTTGCCTTCTCCATCACTCTTCTGAATGGTC
CCGACTTTGACATACTTGCTCATGAACTTGTACTCCCAGTCTTGTAACGCATCTAGCTCA
AATGGACCTAGACCCGAAATGTCTCCGGTCAAATCGGATTCCTCAAAGGACATCTTAGCA
AGAGCTCGGCTTGCATCTTTCCCTGCAAACAGAGCGTATGGTCCACCTGGTCCATAGAAC
ATCCTGCTCTGGGAAACATCGTAGATCTGGCCTTTGATGGCCATGAGAAGGGGGTTTTTG
GGATCGGAGCCGTCGTACTTCTTAAGCTCCTCCTCCGTGATTTCTCCGAGCTGAACCGGA
GGCGGTAGGGGCTCAGGCTGAGGGTAATCCTCCGTTGAACGAGGACGGTGTTCCTCGGGG
GAGACGAAGAAGCCGGAGACGACTTGGTAGACGGCGAAAGCGAGAGCCAAGACGGTGAAA
AAGGCAGCCGGAGAGAGTCCGGTGTAAGCTGTGATTGTTTCCTTGACCGTCTCCCATAGT
TCAACCACCATGATTAAAGGAGAGAAGAGATAGAGAGAGAGAGAGATAATCG
GTCC

QA 1 712 1 712
DS 

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GT
AACGAGATTTAGATGTCATAAGATCCAAAAGGTAAAACAGTCTTACACATTTTTTATTAT
TTGATTGAGTTTGGTTCTTCCAACTTAAAGCTATATATACGACTCTCATAAAACCCTGAA
AAAATCTTCACCGAGAAAGAAGTGCAGCTTCATTGCCTTTAGTCCTCCTTTGCAGCATCA
CCATTTGCAACATCCTTCTTCTCCGTGGTTTCTTCCGTTTTCTCTTCTATGCTTGTAGAA
GTCTCACCGTGGGCAACCGCGGAAGCTTCTTCTGCTTCTTCTCCGGTGTTTGTAGCAGGT
TCCGAGTCTGCTGCACTTTCTTTGCCTTCTCCATCACTCTTCTGAATGGTCCCGACTTTG
ACATACTTGCTCATGAACTTGTACTCCCAGTCTTGTAACGCATCTAGCTCAAATGGACCT
AGACCCGAAATGTCTCCGGTCAAATCGGATTCCTCAAAGGACATCTTAGCAAGAGCTCGG
CTTGCATCTTTCCCTGCAAACAGAGCGTATGGTCCACCTGGTCCATAGAACATCCTGCTC
TGGGAAACATCGTAGATCTGGCCTTTGATGGCCATGAGAAGGGGGTTTTTGGGATCGGAG
CCGTCGTACTTCTTAAGCTCCTCCTCCGTGATTTCTCCGAGCTGAACCGGAGGCGGTAGG
GGCTCAGGCTGAGGGTAATCCTCCGTTGAACGAGGACGGTGTTCCTCGGGGGAGACGAAG
AAACCGGAGACGACTTGGTAGACGGCGAAAGCGAGAGCCAAGACGGTGAAAAAG*CAGCC
GGAGAGAGTCCG*TGTAAGCTGTGATTGTTTCCTTGACCGTCTCCCATAGTTCAACCACC
ATGATTAAAGGAGAGA*GAGATAGAGAGAGAGAGAGATAATCG*TGACTGGTTAGAGAGC
C

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DS 



AS 1 6

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GTGACTGTGAGAACAATCCTACCATCGGTGGCTCTACTGATTCTCATCACCGTATCGACG
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GAAGTAGAGCAATCCGTTGTCGAGATCTTAGGACAAACACGCCACGCTCTCTCCTTCGCT
CGGTTCACTCACCGGTACGGGAAAAGGTACGAGAACACGGAGGAGATGAAGCTCAGGTTC
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AAACTCGGTGTCAATCAGTTTGCTGATATGACGTGGCAAGAGTTTCAAAGGACCAGGCTT
GGTGCTGCTCAAAACTGCTCTGCCGCTTTAAAGGGAACCCACAAACTCACGGAAGCAGCT
CTTCCAGAAACCAAAGACTGGAGAGAGGATGGTATTGTCAGCCCAGTCAAAGACCAGGGA
GGTTGTGGTTCTTGCTGGACATTCAGCACGACTGGAGCGCTTGAGGCAGCTTACCATCAA
GCATTTGGAAAAGGAATATCTCTCTCTGAGCAACAGCTTGTGGATTGTGCCGGAGCTTTC
AACAACTATGGCTGTAATGGTGGCCTTCCTTCCCAAGCCTTTGAATACATCAAATCCAAC
GGTGGCCTGGACACTGAGGAAGCTTATCCTTACACCGGTGAAGATGGAACCTGCAAATAT
TCAGCTGAGAACGTCGGTGTACAAGTCCTTGACTCTGTCAACATTACTCTGGGTGCTGAA
GATGAACTGAAGCATGCGGTTGGATTGGTACGACCAGTAAGCATAGGATTCGAGGTTATA
CACTCGTTCCGGCTTTACAAGAGCGGAGTTTACAGCGATAGTCACTGTGGAAAGACTCCA
ATGGACGTGAACCATGCTGTTTTGGCGGTTGGTTATGGAATTGAAGACGGTGTTCCATAT
TGGCTTATCAAAAACTCATGGGGAGCAGATTGGGGTGACAAAGGTTACTTCAAGATGGAA
ATGGGGAAGAACATGTGTGGTATTGCGGCATGTGCATCGTACCCGGTTGTGGCCTAAGAT
GATCAGCGAATGTCGTCTCTCAGTGATCTGATTACAATCATGTTCCCCATATATATTGGA
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ATAAAGGTCTGCTCATATGTACAAAATGATGCATAAACTACAGACGATCAACTTTATAAT
GTATCCATGTTAAATTTAAGGACACAAATTTATTCGGACCTTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RS1H718TF U 1
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AF RS1FG76TF U 282
AF RS1DA27JQ C 508
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BS 741 741 RS1FG76TF
BS 742 750 RS1H718TF
BS 751 751 RS1DA27TF
BS 752 767 RS1H718TF
BS 768 768 RS1DA27TF
BS 769 769 RS1FG76TF
BS 770 776 RS1DA27TF
BS 777 777 RS1FG76TF
BS 778 790 RS1DA27TF
BS 791 791 RS1FG76TF
BS 792 796 RS1DA27TF
BS 797 797 RS1FG76TF
BS 798 803 RS1DA27TF
BS 804 804 RS1FG76TF
BS 805 820 RS1DA27TF
BS 821 821 RS1FG76TF
BS 822 839 RS1DA27TF
BS 840 1009 RS1FG76TF
BS 1010 1010 RS1DA27JQ
BS 1011 1033 RS1FG76TF
BS 1034 1034 RS1DA27JQ
BS 1035 1050 RS1FG76TF
BS 1051 1051 RS1DA27JQ
BS 1052 1063 RS1FG76TF
BS 1064 1064 RS1DA27JQ
BS 1065 1075 RS1FG76TF
BS 1076 1360 RS1DA27JQ
BS 1361 1365 RS1FG76JQ

RD RS1H718TF 767 0 0
GGAAACCACTGAAGCAAAAGCAGACGCGTTGGTCGAGGAAAAAAAAAGACAATGATGTCT
GTGACTGTGAGAACAATCCTACCATCGGTGGCTCTACTGATTCTCATCACCGTATCGACG
GCGGAGAGTATCGGATTCGACGAGTCAAACCCGATCCGTATGGTCTCCGACCGTCTACGA
GAAGTAGAGCAATCCGTTGTCGTGATCTTAGGACAAACACGCCACGCTCTCTCCTTCGCT
CGGTTCACTCACCGGTACGGGAAAAGGTACGAGAACACGGAGGAGATGAAGCTCAGGTTC
TCGATATTCAAGGAGAGTCTGGATTTGATCAGATCCACTAATAAGAAAGGCTTGTCTTAC
AAACTCGGCGTCAATCAGTTTGCTGATATGACGTGGCAAGAGTTTCAAAGGACCAGGCTT
GGTGCTGCTCAAAACTGCTCTGCCGCTTTAAAGGGAACCCACAAACTCACGGAAGCAGCT
CTTCCAGAAACCAAAGACTGGAGAGAGGATGGTATTGTCAGCCCAGTCAAAGACCAGGGA
GGTTGTGGTTCTTGCTGGACATTCAGCACGACTGGAGCGCTTGAGGCAGCTTACCATCAA
GCATTTGGAAAAGGAATATCTCTCTCTGAGCAACAGCTTGTGGATTGTGCCGGAGCTTTC
AACAACTATGGCTGTAATGGTGGCCTTCCTTCCCAAGCCTTTGA*TACATCAAATCCAAC
GGTGGCTTGGACACTGAGGA*GCTTATCCT*ACACCGGTGAAGATGG

QA 1 767 1 767
DS 

RD RS1DA27TF 843 0 0
GG
ACTGAAGCAAAAGCAGACGCGTTGGTCGAGAAAAAAAAAAGACAATGATGTCTGTGACTG
TGAGAACAATCCTACCATCGGTGGCTCTACTGATTCTCATCACCGTATCGACGGCGGAGA
GTATCGGATTCGACGAGTCAAACCCGATCCGTATGGTCTCCGACCGTCTACGAGAAGTAG
AGCAATCCGTTGTCGAGATCTTAGGACAAACACGCCACGCTCTCTCCTTCGCTCGGTTCA
CTCACCGGTACGGGAAAAGGTACGAGAACACGGAGGAGATGAAGCTCAGGTTCTCGATAT
TCAAGGAGAGTCTGGATTTGATCAGATCCACTAATAAGAAAGGCTTGTCTTACAAACTCG
GTGTCAATCAGTTTGCTGATATGACGTGGCAAGAGTTTCAAAGGACCAGGCTTGGTGCTG
CTCAAAACTGCTCTGCCGCTTTAAAGGGAACCCACAAACTCACGGAAGCAGCTCTTCCAG
AAACCAAAGACTGGAGAGAGGATGGTATTGTCAGCCCAGTCAAAGACCAGGGAGGTTGTG
GTTCTTGCTGGACATTCAGCACGACTGGAGCGCTTGAGGCAGCTTACCATCAAGCATTTG
GAAAAG*AATATCTCTCTCTGAGCAACAGCTTGTGGATTGTGCCGGAGCTTTCAACAACT
ATGGCTGTAATGGTGGCCTTCCTTCCCAAGCCTTTGAATACATCAAATCCAACGGTGGCC
TGGACACTGAGGA*GCTTATCCTTACACCGGTGAAGATGGA*CCTGCAA*TATTCAGCTG
AGA*CGTCG*TGTACA*GTCCTTGACTCTGTCA*CATTACTCTGGGTGCTGA
GATGACTGA

QA 3 834 3 834
DS 

RD RS1FG76TF 794 0 0
GGAGATGAAGCTCAGGTTCTCGATATTCAAGGAGAGTCTGGATTTGATCAGATCCACTAA
TAAGAAAGGCTTGTCTTACAAACTCGGTGTCAATCAGTTTGCTGATATGACGTGGCAAGA
GTTTCAAAGGACCAGGCTTGGTGCTGCTCAAAACTGCTCTGCCGCTTTAAAGGGAACCCA
CAAACTCACGGAAGCAGCTCTTCCAGAAACCAAAGACTGGAGAGAGGATGGTATTGTCGG
CCCAGTCAAAGACCAGGGAGGTTGTGGTTCTTGCTGGACATTCAGCACGACTGGAGCGCT
TGAGGCAGCTTACCATCAAGCATTTGGAAAAGGAATATCTCTCTCTGAGCAACAGCTTGT
GGATTGTGCCGGAGCTTTCAACAACTATGGCTGTAATGGTGGCCTTCCTTCCCAAGCCTT
TGAATACATCAAATCCAACGGTGGCCTGGACACTGAGGAAGCTTATCCTTACACCGGTGA
AGATGGAACCTGCAAATATTCAGCTGAGAACGTCGGTGTACAAGTCCTTGACTCTGTCAA
CATTACTCTGGGTGCTGAAGATGAACTGAAGCATGCGGTTGGATTGGTACGACCAGTAAG
CATAGGATTCGAGGTTATACACTCGTTCCGGCTTTACAAGAGCGGAGTTTACAGCGATAG
TCACTGTGGAAAGACTCCAATGGACGTGAACCATGCTGTTTTGGCGGTTGGTTATGGAAT
TGAAGACG*TGTTCCATATTGGCTTATCAAAA*CTCATGGGGAGCAGAT*GGGGTGACAA
AG*TTACTTCAAGA

QA 1 794 1 794
DS 

RD RS1DA27JQ 853 0 0
AGAT
GTATTGTCAGCCCAGTCAAAGACCAGGGAGGTTGTGGTC**TGCTGGACATTCAGCACGA
CTGGAGCGCTTGAGGCAGCTTACCATCAAGCATTTGGAAAAGGAATATCTCTCTCTGAGC
AACAGCTTGTGGATTGTGCCGGAGCTTTCAACAACTATGGCTGTAATGGTGGCCTTCCTT
CCCAAGCCTTTGAATACATCAAATCCAACGGTGGCCTGGACACTGAGGAAGCTTATCCTT
ACACCGGTGAAGATGGAACCTGCAAATATTCAGCTGAGAACGTCGGTGTACAAGTCCTTG
ACTCTGTCAACATTACTCTGGGTGCTGAAGATGAACTGAAGCATGCGGTTGGATTGGTAC
GACCAGTAAGCATAGGATTCGAGGTTATACACTCGTTCCGGCTTTACAAGAGCGGAGTTT
ACAGCGATAGTTACTGTGGAAAGACTCCAATGGACGTGAACCATGCTGTTTTGGCGGTTG
GTTATGGAATTGAAGACGGTGTTCCATATTGGCTTATCAAAAACTCATGGGGAGCAGATT
GGGGTGACAAAGGTTACTTCAAGATGGAAATGGGGAAGAACATGTGTGGTATTGCGGCAT
GTGCATCGTACCCGGTTGTGGCCTAAGATGATCAGCGAATGTCGTCTCTCAGTGATCTGA
TTACAATCATGTTCCCCATATATATTGGATTAAGACATTACTTGAAAGTCACTTGGGAGT
GCATAGTGTTTGTTTATGCTTGTTGTAACATAAAGGTCTGCTCATATGTACAAAATGATG
CATAAACTACAGACGATCAACTTTATAATGTATCCATGTTAAATTTAAGGACACAAATTT
ATTCGGACC

QA 5 853 5 853
DS 

RD RS1FG76JQ 812 0 0
CTGCTGACA
TCAGCACGACTG*AGCGCT*GAGGCAGCTTACCATCA*GCATTTGGAAAAGGAATATCTC
TCTCTGAGCAACAGCTTGTGGATTGTGCCGGAGCTTTCAACAACTATGGCTGTAATGGTG
GCCTTCCTTCCCAAGCCTTTGAATACATCAAATCCAACGGTGGCCTGGACACTGAGGAAG
CTTATCCTTACACCGGTGAAGATGGAACCTGCAAATATTCAGCTGAGAACGTCGGTGTAC
AAGTCCTTGACTCTGTCAACATTACTCTGGGTGCTGAAGATGAACTGAAGCATGCGGTTG
GATTGGTACGACCAGTAAGCATAGGATTCGAGGTTATACACTCGTTCCGGCTTTACAAGA
GCGGAGTTTACAGCGATAGTCACTGTGGAAAGACTCCAATGGACGTGAACCATGCTGTTT
TGGCGGTTGGTTATGGAATTGAAGACGGTGTTCCATATTGGCTTATCAAAAACTCATGGG
GAGCAGATTGGGGTGACAAAGGTTACTTCAAGATGGAAATGGGGAAGAACATGTGTGGTA
TTGCGGCATGTGCATCGTACCCGGTTGTGGCCTAAGATGATCAGCGAATGTCGTCTCTCA
GTGATCTGATTACAATCATGTTCCCCATATATATTGGATTAAGACATTACTTGAAAGTCA
CTTGGGAGTGCATAGTGTTTGTTTATGCTTGTTGTAACATAAAGGTCTGCTCATATGTAC
AAAATGATGCATAAACTACAGACGATCAACTTTATAATGTATCCATGTTAAATTTAAGGA
CACAAATTTATTCGGACCTTTGT

QA 10 812 10 812
DS 

RD RS1H718JQB 610 0 0
ACACCGGTGAAGATGGAACCTGCAAATATTCAGCTGAGAACGTCGGTGTACAAGTCCTTG
ACTCTGTCAACATTACTCTGGGTGCTGAAGATGAACTGAAGCATGCGGTTGGATTGGTAC
GACCAGTAAGCATAGGATTCGAGGTTATACACTCGTTCCGGCTTTACAAGAGCGGAGTTT
ACAGCGATAGTCACTGTGGAAAGACTCCAATGGACGTGAACCATGCTGTTTTGGCGGTTG
GTTATGGAATTGAAGACGGTGTTCCATATTGGCTTATCAAAAACTCATGGGGAGCAGATT
GGGGTGACAAAGGTTACTTCAAGATGGAAATGGGGAAGAACATGTGTGGTATTGCGGCAT
GTGCATCGTACCCGGTTGTGGCCTAAGATGATCAGCGAATGTCGTCTCTCAGTGATCTGA
TTACAATCATGTTCCCCATATATATTGGATTAAGACATTACTTGAAAGTCACTTGGGAGT
GCATAGTGTTTGTTTATGCTTGTTGTAACATAAAGGTCTGCTCATATGTACAAAATGATG
CATAAACTACAGACGATCAACTTTATAATGTATCCATGTTAAATTTAAGGACACAAATTT
ATTCGGACC
C

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 6

CO CL1189Contig1 866 6 8 U
GGGTGTACATATATAGATTCACACTAACTAATTACTTTTCAGACTCCAGCTAACAAAATT
AATTCTACCTGTTCTTTGGATCAGATTTAGAAAGGAAAAAATATGCACCATTCGGAGACG
ACAACGAAGCAACCTCTTTGTCCTAAGCCACGTCGTGTGTGTCCTTCTCTTCCCGAGTTC
CTCAGACCTCTCTCACATTCCATACACCCTTCCAACTGCCAACAAAGTTCGGAGGAAAAA
AGCGACGTTATTGGCATCGATAAGCCAATAGAAGGTGGAACAATAGAGTCAATGTGGTAC
GCAGGGTCTCCACCTAGGAGAACCGGGAATCCTCTTGTAAACGATCTTCATTTCATTCAC
TGCCTCGATCTTCTCCCCAGTTTCTCAAGCACCAAGGCTTGATCTTCACATCTTCTTAAA
CGAAAAATGCATACACAGCCGCACACAACAACAACAAACAGCAACAACAACGAAACAGAA
GAAAAAAAAACTGTAGTATCAATTGATCTCGGCGTGAAGAACAGTTACCTTATTACACTA
GACATGCATATGTTACTCAAAAAGTTTGGATTTCATTCTTGAAGAAATGTATTTGGATAT
TGTTGATCACCAAGAGTCTACACTTAGGTCAGCACAATATACTGCTTACTAAATCAGCAC
CCACTTGGTACAGAATGAACGCAGATACTTTCTTCTTGGTAATCTGAACGCAGAGACTAT
ATATGGTTAACTAGATATATGTATTAGGGATTAGATGTTTTTTTACAATATAGAACTCGT
TCTCTCTTTTTGTTTGTTTGTTATGTCTCGTTTAATTTGTATTTGAGATTCCTATAATTT
TATATAGACTTGTGTTTCCTTTGTAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 15 30 10 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GN95TF U 1
AF RS1GK33TF U 1
AF RS1E261TF U 1
AF RS1E261JQ C 147
AF RS1GN95JQ C 273
AF RS1GK33JQ C 168
BS 1 701 RS1E261TF
BS 702 702 RS1E261JQ
BS 703 707 RS1E261TF
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BS 743 866 RS1E261JQ

RD RS1GN95TF 688 0 0
GGGTGTACATATATAGATTCACAGTAACTAATTACTTTTCAGACTCCAGCTAACAAAATT
AATTCTACCTGTTCTTTGGATCAGATTTAGAAAGGAAAAAATATGCACCATTCGGAGACG
ACAACGAAGCAACCTCTTTGTCCTAAGCCACGTCGTGTGTGTCCTTCTCTTCCCTAGTTC
CTCAGACCTCTCTCACATTCCATACACCCTTCCAACTGCCAACAAAGTTCGG*GGAAAAA
AGCGACGTTATTGGCATCGATAAGCCAATAGAAGGTGGAACAATAGAGTCAATGTGGTAC
GCAGGGTCTCCACCTAGGAGAACCGGGAATCCTCTTGTAAACGATCTTCATTTCATTCAC
TGCCTCGATCTTCTCCCCAGTTTCTCAAGCACCAAGGCTTGATCTTCACATCTTCTTAAA
CGAAAAATGCATACACAGCCGCACACAACAACAACAAACAGCAACAACAACGAAACAGAA
GAAAAAAAAACTGTAGTATCAATTGATCTCGGCGTGAAGAACAGTTACCTTATTACACTA
GACATGCATATGTTACTCAAAAAGTTTGGATTTCATTCTTGAAGAAATGTATTTGGATAT
TGTTGATCACCATGAGTCTACACTTAG*TCAGCACAATATACTGCTTACTAAATCAGCAC
CCACTTGGTACAGAATGAACGCAGATAC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RS1GK33TF 698 0 0
GGGTGTACATATATAGATTCACACTAACTAATTACTTTTCAGACTCCAGCTAACAAAATT
AATTCTACCTGTTCTTTGGATCAGATTTAGAAAGGAAAAAATATGTACCATTCGGAGACG
ACAACGAAGCAACCTCTTTGTCCTAAGCCACGTCGTGTGTGTCCTTCTCTTCCCGAGTTC
CTCAGACCTCTCTCACATTCCATACACCCTTCCAACTGCCAACAAAGTTCGGAGGAAAAA
AGCGACGTTATTGGCATCGATAAGCCAATAGAAGGTGGAACAATAGAGTCAATGTGGTAC
GCAGGGTCTCCACCTAGGAGAACCGGGAATCCTCTTGTAAACGATCTTCATTTCATTCAC
TGCCTCGATCTTCTCCCCAGTTTCTCAAGCACCAAGGCTTGATCTTCACATCTTCTTAAA
CGAAAAATGCATACACAGCCGCACACAACAACAACAAACAGCAACAACAACGAAACAGAA
GAAAAAAAAACTGTAGTATCAATTGATCTCGGCGTGAAGAACAGTTACCTTATTACACTA
CACATGCATATGTTACTCAAAAAGTTTGGATTTCATTCTTGAAGAAATGTATTTGGATAT
TGTTGATCACCAAGAGTCTACACTTAG*TCAGCACAATATACTGCTTACTAAATCAGCAC
CCACTTGGTACAGAATGAACGCAGATACTTTCTTCTTG

QA 1 698 1 698
DS 

RD RS1E261TF 742 0 0
GGGTGTACATATATAGATTCACACTAACTAATTACTTTTCAGACTCCAGCTAACAAAATT
AATTCTACCTGTTCTTTGGATCAGATTTAGAAAGGAAAAAATATGCACCATTCGGAGACG
ACAACGAAGCAACCTCTTTGTCCTAAGCCACGTCGTGTGTGTCCTTCTCTTCCCGAGTTC
CTCAGACCTCTCTCACATTCCATACACCCTTCCAACTGCCAACAAAGTTCGGAGGAAAAA
AGCGACGTTATTGGCATCGATAAGCCAATAGAAGGTGGAACAATAGAGTCAATGTGGTAC
GCAGGGTCTCCACCTAGGAGAACCGGGAATCCTCTTGTAAACGATCTTCATTTCATTCAC
TGCCTCGATCTTCTCCCCAGTTTCTCAAGCACCAAGGCTTGATCTTCACATCTTCTTAAA
CGAAAAATGCATACACAGCCGCACACAACAACAACAAACAGCAACAACAACGAAACAGAA
GAAAAAAAAACTGTAGTATCAATTGATCTCGGCGTGAAGAACAGTTACCTTATTACACTA
GACATGCATATGTTACTCAAAAAGTTTGGATTTCATTCTTGAAGAAATGTATTTGGATAT
TGTTGATCACCAAGAGTCTACACTTAGGTCAGCACAATATACTGCTTACTAAATCAGCAC
CCACTTGGTACAGAATGAACGCAGATACTTTCTTCTTGGTA*TCTGA*CGCAGAGACTAT
ATATGGTTA*CTAGATATATGT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RS1E261JQ 720 0 0
GCCACGTCGTGTGTGTCCTTCTCTTCCCGAGTTCCTCAGACCTCTCTCACATTCCATACA
CCCTTCCAACTGCCAACAAAGTTCGGAGGAAAAAAGCGACGTTATTGGCATCGATAAGCC
AATAGAAGGTGGAACAATAGAGTCAATGTGGTACGCAGGGTCTCCACCTAGGAGAACCGG
GAATCCTCTTGTAAACGATCTTCATTTCATTCACTGCCTCGATCTTCTCCCCAGTTTCTC
AAGCACCAAGGCTTGATCTTCACATCTTCTTAAACGAAAAATGCATACACAGCCGCACAC
AACAACAACAAACAGCAACAACAACGAAACAGAAGAAAAAAAAACTGTAGTATCAATTGA
TCTCGGCGTGAAGAACAGTTACCTTATTACACTAGACATGCATATGTTACTCAAAAAGTT
TGGATTTCATTCTTGAAGAAATGTATTTGGATATTGTTGATCACCAAGAGTCTACACTTA
GGTCAGCACAATATACTGCTTACTAAATCAGCACCCACTTGGTACAGAATGAACGCAGAT
ACTTTCTTCTTGGTAATCTGAACGCAGAGACTATATATGGTTAACTAGATATATGTATTA
GGGATTAGATGTTTTTTTACAATATAGAACTCGTTCTCTCTTTTTGTTTGTTTGTTATGT
CTCGTTTAATTTGTATTTGAGATTCCTATAATTTTATATAGACTTGTGTTTCCTTTGTAC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RS1GN95JQ 587 0 0
AGGTGGAACAATAGAGTCAATGTGGTACGCAGGGTCTCCACCTAGGAGAACCGGGAATCC
TCTTGTAAACGATCTTCATTTCATTCACTGCCTCGATCTTCTCCCCAGTTTCTCAAGCAC
CAAGGCTTGATCTTCACATCTTCTTAAACGAAAAATGCATACACAGCCGCACACAACAAC
AACAAACAGCAACAACAACGAAACAGAAGAAAAAAAAACTGTAGTATCAATTGATCTCGG
CGTGAAGAACAGTTACCTTATTACACTAGACATGCATATGTTACTCAAAAAGTTTGGATT
TCATTCTTGAAGAAATGTATTTGGATATTGTTGATCACCATGAGTCTACACTTAGGTCAG
CACAATATACTGCTTACTAAATCAGCACCCACTTGGTACAGAATGAACGCAGATACTTTC
TTCTTGGTAATCTGAACGCAGAGACTATATATGGTTAACTAGATATATGTATTAGGGATT
AGATGTTTTTTTACAATATAGAACTCGTTCTCTCTTTTTGTTTGTTTGTTATGTCTCGTT
TAATTTGTATTTGAGATTCCTATAATTTTATATAGACTTGTGTTTCC

QA 1 587 1 587
DS 

RD RS1GK33JQ 676 0 0
TCTTCCCGAGTTCCTCAGACCTCTCTCACATTCCATACACCCTTCCAACTGCCAACAAAG
TTCGGAGGAAAAAAGCGACGTTATTGGCATCGATAAGCCAATAGAAGGTGGAACAATAGA
GTCAATGTGGTACGCAGGGTCTCCACCTAGGAGAACCGGGAATCCTCTTGTAAACGATCT
TCATTTCATTCACTGCCTCGATCTTCTCCCCAGTTTCTCAAGCACCAAGGCTTGATCTTC
ACATCTTTTTAAACGAAAAATGCATACACAGCCGCACACAACAACAACAAACAGCAACAA
CAACGAAACAGAAGAAAAAAAAACTGTAGTATCAATTGATCTCGGCGTGAAGAACAGTTA
CCTTATTACACTACACATGCATATGTTACTCAAAAAGTTTGGATTTCATTCTTGAAGAAA
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ACGCAGAGACTATATATGGTTAACTAGATATATGTATTAGGGATTAGATGTTTTTTTACA
ATATAGAACTCGTTCTCTCTTTTTGTTTGTTTGTTATGTCTCGTTTAATTTGTATTTGAG
ATTCCTATAATTTTAT

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 5

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ATGTCCTTTACGAAGGAGATAACGTCTCTGGAAACTTCGTCGTCGTCGACCATGATATCT
TCTGGGGATCTGATCATCCCGGTTTGGATTTCACGGTGACGTCTCCTGCTGGGAACATAG
TACACACGTTGAAGGGAACATCAGGAGATAAGTTTGAGTTCAAGGCTCCAAAAAGTGGAA
TGTACAAGTTCTGTTTCCACAACCCTTACTCTACTCCTGAAACCGTCTCCTTCTACATCC
ATGTTGGTCATATCCCCAACGAGCATGACTTAGCTAAAGACGAACATTTGGACCCGGTGA
ATGTTAAGATAGCTGAGCTGAGAGAGGCTTTGGAGTCTGTTGTTGCTGAGCAAAAGTATT
TGAAAGCACGTGATACCCGTCACCGTCATACCAATGAGAGCACGAGAAAGCGAGTGATAT
TCTACACAGTAGGAGAGTACATATTCCTAGCAGCAGCAAGTGGTCTTCAGGTTCTCTACA
TCCGCAAGCTCTTCAGCAAGTCGGTTGCATACAACAGGGTTTGAACATAATTTCAAGGTT
CTGTGTCCTTTTTCTATTATGTTTGAATTTGGTGAACACAATTATAAACAAGTGTTAGTT
AATTAAGACTTTAATATAATAGCTAAGATCCTTTTTTTTTGTTTTCAGTGGCTACAATTT
TTATTGACTTAAGTTTACTTATGTTTTTTAATATGAAGAACTTGATAAGCTTACTATACT
GTGTACCTGATGGTAACAATGAACGGGCTAGTAATAAAGAATTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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QA 1 584 1 584
DS 

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CGATCGAGCGAATCTCAGCACTATCGGTTACGGTTAGCGACGATGAATGCGTCCAAGAGT
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TACACACGTTGAAGGGAACATCAGGAGATAAGTTTGAGTTCAAGGCTCCAAAAAGTGGAA
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TCTGGGGATCTGATCATCCCGGTTTGGATTTCACGGTGACGTCTCCTGCTGGGAACATAG
TACACACGTTGAAGGGAACATCAGGAGATAAGTTTGAGTTCAAGGCTCCAAAAAGTGGAA
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QA 1 698 1 698
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RD RS1GA69JQ 581 0 0
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DS 

RD RS1CD78JQ 725 0 0
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GTTTTCAGTGGCTACCATTTTTATTGACTTAAGTTTACTTATGTTTTTTAATATGAAGAA
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ATTGC

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 6

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CTGAGGTTCTCTTCGTCCTCGACGGCTCAATCACCGCCGGGTTCATCTCCTCCGCCAACT
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CCCTTTGATGGATTCTTCTTGTCTTTGTCTGTTTTGTAATTCTTCAAAAAAACCTGTCAA
CATGGTTACATTGTAATGTGAGCTTTTCATTTCATATCCTTAAAGTTGGTCAGACCTTTT
ATATTATT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1FT13TF U 1
AF RS1GR04TF U 1
AF RS1EV83TF U 69
AF RS1EV83JQ C 115
AF RS1FT13JQ C 139
AF RS1GR04JQ C 208
BS 1 130 RS1FT13TF
BS 131 131 RS1EV83TF
BS 132 436 RS1FT13TF
BS 437 437 RS1GR04TF
BS 438 669 RS1FT13TF
BS 670 677 RS1GR04TF
BS 678 771 RS1EV83TF
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BS 773 808 RS1EV83TF
BS 809 848 RS1FT13JQ

RD RS1FT13TF 669 0 0
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TCTTCCTCTTATCTCTCCTCTTTGCTCTATCCAATGCCTCAGTTCAAGACTTCTGCGTAG
CCAACCTGAAACGCGCTGAGACCCCAGCTGGCTACCCTTGCATTCGCCCCATCCATGTCA
AAGCCTCGGACTTCGTCTTCAGCCTAGGCACTCCCGGTAACACCACCAACATCATCAGCG
CTGCGGTCACGCCGGGCTTCGTCGCTCAGTTCCCGGCTCTCAACGGTCTAGGCATCTCCA
CGGCTAGGCTTGACCTAGCACCCAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCT
CTGAGGTTCTCTTCGTCCTCGACGGCTCAATCACCGCCGGGTTCATCTCCTCCGCCAACT
CTGTCTACGTGCAGACTCTGAAACCGGGACAGGTCATGGTGTTCCCGCAGGGCTTGCTTC
ATTTCCAGATCAATGCCGGCAAAACAGCTGCTGCAGCGTTTGTCACTTTCAGCAGCGCTA
GTCCTGGTCTCCAGATTCTTGACTTTGCCCTATTCGCCAACAGTCTTTCCACTGAACTCG
TCTCGGCTACTACTTTCCTTGAGCCTAAAGTAATCAAGACGCTTAAGGGTGTTCTTGGTG
GAACTGGCT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RS1GR04TF 677 0 0
GGAGAGCAGCAAAAACTTAAGACCAACCAATCAATCAATCAATAAAAATGTTGCGCATTA
TCTTCCTCTTATCTCTCCTCTTTGCTCTATCCAATGCCTCAGTTCAAGACTTCTGCGTAG
CCAACCTGAAACGCGCTGAGACCCCAGCTGGCTACCCTTGCATTCGCCCCATCCATGTCA
AAGCCTCGGACTTCGTCTTCAGCCTAGGCACTCCCGGTAACACCACCAACATCATCAGCG
CTGCGGTCACGCCGGGCTTCGTCGCTCAGTTCCCGGCTCTCAACGGTCTAGGCATCTCCA
CGGCTAGGCTTGACCTAGCACCCAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCT
CTGAGGTTCTCTTCGTCCTCGACGGCTCAATCACCGCCGGGTTCATCTCCTCCGCCAACT
CTGTCTACGTGCAGACGCTGAAACCGGGACAGGTCATGGTGTTCCCGCAGGGCTTGCTTC
ATTTCCAGATCAATGCCGGCAAAACAGCTGCTGCAGCGTTTGTCACTTTCAGCAGCGCTA
GTCCTGGTCTCCAGATTCTGGACTTTGCCCTATTCGCCAACAGTCTTTCCACTGAACTCG
TCTCGGCTACTACTTTCCTTGAGCCTAAAGTAATCAAGACGCTTAAGGGTGTTCTTGGTG
GAACTGGCTAAAGAATA

QA 1 677 1 677
DS 

RD RS1EV83TF 741 0 0
GG
ATCTCTCCTCTTTGCTCTATCCAATGCCTCAGTTCAAGACTTCTGCGTAGCCAACCTGAA
GCGCGCTGAGACCCCAGCTGGCTACCCTTGCATTCGCCCCATCCATGTCAAAGCCTCGGA
CTTCGTCTTCAGCCTAGGCACTCCCGGTAACACCACCAACATCATCAGCGCTGCGGTCAC
GCCGGGCTTCGTCGCTCAGTTCCCGGCTCTCAACGGTCTAGGCATCTCCACGGCTAGGCT
TGACCTAGCACCCAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTCTGAGGTTCT
CTTCGTCCTCGACGGCTCAATCACCGCCGGGTTCATCTCCTCCGCCAACTCTGTCTACGT
GCAGACGCTGAAACCGGGACAGGTCATGGTGTTCCCGCAGGGCTTGCTTCATTTCCAGAT
CAATGCCGGCAAAACAGCTGCTGCAGCGTTTGTCACTTTCAGCAGCGCTAGTCCTGGTCT
CCAGATTCTTGACTTTGCCCTATTCGCCAACAGTCTTTCCACTGAACTCGTCTCGGCTAC
TACTTTCCTTGAGCCTAAAGTAATCAAGACGCTTAAGGGTGTTCTTGGTGGAACTGGCTA
AAGAATAAAAAAGGACTTAGGAACAACAATGCCTGTTTGTTTTTTCTTTTCCCTTTGATG
GATTCTTCTTGTCTTTGTCTGTTTTGTAATTCTTCAAAAAA*CCTGTCAACATGGTTACA
TTGTAATGTGAGCTTTTC
A

QA 3 740 3 740
DS 

RD RS1EV83JQ 694 0 0
GCGTAGCCAACCTGAAGCGCGCTGAGACCCCAGCTGGCTACCCTTGCATTCGCCCCATCC
ATGTCAAAGCCTCGGACTTCGTCTTCAGCCTAGGCACTCCCGGTAACACCACCAACATCA
TCAGCGCTGCGGTCACGCCGGGCTTCGTCGCTCAGTTCCCGGCTCTCAACGGTCTAGGCA
TCTCCACGGCTAGGCTTGACCTAGCACCCAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTG
GTGCCTCTGAGGTTCTCTTCGTCCTCGACGGCTCAATCACCGCCGGGTTCATCTCCTCCG
CCAACTCTGTTTACGTGCAGACGCTGAAACCGGGACAGGTCATGGTGTTCCCGCAGGGCT
TGCTTCATTTCCAGATCAATGCCGGCAAAACAGCTGCTGCAGCGTTTGTCACTTTCAGCA
GCGCTAGTCCTGGTCTCCAGATTCTTGACTTTGCCCTATTCGCCAACAGTCTTTCCACTG
AACTCGTCTCGGCTACTACTTTCCTTGAGCCTAAAGTAATCAAGACGCTTAAGGGTGTTC
TTGGTGGAACTGGCTAAAGAATAAAAAAGGACTTAGGAACAACAATGCCTGTTTGTTTTT
TCTTTTCCCTTTGATGGATTCTTCTTGTCTTTGTCTGTTTTGTAATTCTTCAAAAAAACC
TGTCAACATGGTTACATTGTAATGTGAGCTTTTC

QA 1 694 1 694
DS 

RD RS1FT13JQ 710 0 0
AGACCCCAGCTGGCTACCCTTGCATTCGCCCCATCCATGTCAAAGCCTCGGACTTCGTCT
TCAGCCTAGGCACTCCCGGTAACACCACCAACATCATCAGCGCTGCGGTCACGCCGGGCT
TCGTCGCTCAGTTCCCGGCTCTCAACGGTCTAGGCATCTCCACGGCTAGGCTTGACCTAG
CACCCAAAGGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTCTGAGGTTCTCTTCGTCC
TCGACGGCTCAATCACCGCCGGGTTCATCTCCTCCGCCAACTCTGTCTACGTGCAGACTC
TGAAACCGGGACAGGTCATGGTGTTCCCGCAGGGCTTGCTTCATTTCCAGATCAATGCCG
GCAAAACAGCTGCTGCAGCGTTTGTCACTTTCAGCAGCGCTAGTCCTGGTCTCCAGATTC
TTGACTTTGCCCTATTCGCCAACAGTCTTTCCACTGAACTCGTCTCGGCTACTACTTTCC
TTGAGCCTAAAGTAATCAAGACGCTTAAGGGTGTTCTTGGTGGAACTGGCTAAAGAATAA
AAAAGGACTTAGGAACAACAATGCCTGTTTGTTTTTTCTTTTCCCTTTGATGGATTCTTC
TTGTCTTTGTCTGTTTTGTAATTCTTCAAAAAAACCTGTCAACATGGTTACATTGTAATG
TGAGCTTTTCATTTCATATCCTTAAAGTTGGTCAGACCTTTTATATTATT

QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1GR04JQ 641 0 0
GCACTCCCGGTAACACCACCAACATCATCAGCGCTGCGGTCACGCCGGGCTTCGTCGCTC
AGTTCCCGGCTCTCAACGGTCTAGGCATCTCCACGGCTAGGCTTGACCTAGCACCCAAAG
GTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTCTGAGGTTCTCTTCGTCCTCGACGGCT
CAATCACCGCCGGGTTCATCTCCTCCGCCAACTCTGTCTACGTGCAGACGCTGAAACCGG
GACAGGTCATGGTGTTCCCGCAGGGCTTGCTTCATTTCCAGATCAATGCCGGCAAAACAG
CTGCTGCAGCGTTTGTCACTTTCAGCAGCGCTAGTCCTGGTCTCCAGATTCTGGACTTTG
CCCTATTCGCCAACAGTCTTTCCACTGAACTCGTCTCGGCTACTACTTTCCTTGAGCCTA
AAGTAATCAAGACGCTTAAGGGTGTTCTTGGTGGAACTGGCTAAAGAATAAAAAAGGACT
TAGGAACAACAATGCCTGTTTGTTTTTTCTTTTCCCTTTGATGGATTCTTCTTGTCTTTG
TCTGTTTTGTAATTCTTCAAAAAAACCTGTCAACATGGTTACATTGTAATGTGAGCTTTT
CATTTCATATCCTTAAAGTTGGTCAGACCTTTTATATTATT

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 4

CO CL1192Contig1 718 4 7 U
ATAATTTTATAACTAAGAAATTCCAACATGGAGAGCTGCAGAAGCTTCAAGATAAGTAAA
GATCTAAAGTCGTCTTGAATGGTTCCTTCTAAAAGATATAATTATCTCTATGAGTTATAA
ATATATAGGTTGTCTTACATACAACTTACAACACATATTTCTGAATGGTCATTTAGGCTT
AGTATATATGTTTGTCGCTTGATGTCTTTACCACGTCATTATCTTGAGAACTCAAGACAA
CTCTCGTAAGGTCGCAGTCGAAAGTTGAATCATCTGGAGCAGAGTTTTTGTGGTCCTGAT
GGTGATCCC*ATGAATGTACCAAGAAAACGGTGGCAGATTAAACGGAGGAGAGGGTTGAA
AGTATTGGTCCATTATCACTCTCGATGCAAGTTTTCCTTGTCCACCACTACATTTTTTGT
ATTCATCTCGGGTTTTCGGCGACCTATGCTTGCACAATCGTTCTGAATCTACGAATATTG
GTTCTACTTTGTAGCTACCCTCAAACACTTTCATGAACATCATTTTCTCCTTTTTATATT
TTGCCGTAAGATCTTTAATGTTTTCATCGACAATAAGCTTTATGGGGAAAGCTCCAGACC
ACCACAGGAAGTCGAAGGCCACAGTATTATCTGTCTCTAAAATCTGTCTTGGACCATCCT
TCTTCAAAACCTTTCTTGATTGATTTTTCAGAAGTTGGCGGGCGGACATGTCTATTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BW56TF C 168
AF RS1FH63JQ U 1
AF RS1BW56JQ U 43
AF RS1FG25JQ U 98
BS 1 279 RS1FH63JQ
BS 280 280 RS1BW56JQ
BS 281 350 RS1FH63JQ
BS 351 351 RS1BW56JQ
BS 352 440 RS1FH63JQ
BS 441 441 RS1BW56JQ
BS 442 718 RS1FH63JQ

RD RS1BW56TF 380 0 0
GTCATTTAGGCTTAGTATATATGTTTGTCGCTTGATGTCTTTACCACGTCATTATCT*GA
GAACTCAAGACAACTCTCGTAAG*TCGCAGTCGAAAGTTGAATCATCTGGAGCAGAGTTT
TTGTGGTC*TGATGGTGATCCCCATGAATGTACCAAGAAAACGGTGGCAGATTAAACGGA
GGAGAGGGTTGAAAGTATTGGTCCATTATCACTCTCGATGCAAGTTTTCCTTGTCCACCA
CTACATTTTTTGTATTCATCTCGGGTTTTCGGCGACCTATGCTTGCACAATCGTTCTGAA
TCTACGAATATTGGTTCTACTTTGTAGCTACCCTCAAACACTTTCATGAACATCATTTTC
TCCTTTTTATATTTTGCCGT

QA 1 380 1 380
DS 

RD RS1FH63JQ 718 0 0
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GATCTAAAGTCGTCTTGAATGGTTCCTTCTAAAAGATATAATTATCTCTATGAGTTATAA
ATATATAGGTTGTCTTACATACAACTTACAACACATATTTCTGAATGGTCATTTAGGCTT
AGTATATATGTTTGTCGCTTGATGTCTTTACCACGTCATTATCTTGAGAACTCAAGACAA
CTCTCGTAAGGTCGCAGTCGAAAGTTGAATCATCTGGAG*AGAGTTTTTGTGGTCCTGAT
GGTGATCCC*ATGAATGTACCAAGAAAACGGTGGCAGATTAAACGGAGGAAAGGGTTGAA
AGTATTGGTCCATTATCACTCTCGATGCAAGTTTTCCTTGTCCACCACTACATTTTTTGT
ATTCATCTCGGGTTTTCGGCAACCTATGCTTGCACAATCGTTCTGAATCTACGAATATTG
GTTCTACTTTGTAGCTACCCTCAAACACTTTCATGAACATCATTTTCTCCTTTTTATATT
TTGCCGTAAGATCTTTAATGTTTTCATCGACAATAAGCTTTATGGGGAAAGCTCCAGACC
ACCACAGGAAGTCGAAGGCCACAGTATTATCTGTCTCTAAAATCTGTCTTGGACCATCCT
TCTTCAAAACCTTTCTTGATTGATTTTTCAGAAGTTGGCGGGCGGACATGTCTATTGA

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1BW56JQ 655 0 0
G
GCTTCAAGATAAGTAAAGATCTAAAGTCGTCTTGAATGGTTCCTTCTAAAAGATATAATT
ATCTCTATGAGTTATAAATATATAGGTTGTCTTACATACAACTTACAACACATATTTCTG
AATGGTCATTTAGGCTTAGTATATATGTTTGTCGCTTGATGTCTTTACCACGTCATTATC
TTGAGAACTCAAGACAACTCTCGTAAGGTCGCAGTCGAAAGTTGAATCATCTGGAGCAGA
GTTTTTGTGGTCCTGATGGTGATCCC*ATGAATGTACCAAGAAAACGGTGGCAGATTAAA
CGGAGGAGAGGGTTGAAAGTATTGGTCCATTATCACTCTCGATGCAAGTTTTCCTTGTCC
ACCACTACATTTTTTGTATTCATCTCGGGTTTTCGGCGACCTATGCTTGCACAATCGTTC
TGAATCTACGAATATTGGTTCTACTTTGTAGCTACCCTCAAACACTTTCATGAACATCAT
TTTCTCCTTTTTATATTTTGCCGTAAGATCTTTAATGTTTTCATCGACAATAAGCTTTAT
GGGGAAAGCTCCAGACCACCACAGGAAGTCGAAGGCCACAGTATTATCTGTCTCTAAAAT
CTGTCTTGGACCATCCTTCTTCAAAACCTTTCTTGATTGATTTTT
AATGATAAG

QA 2 646 2 646
DS 

RD RS1FG25JQ 596 0 0
ATAATTATCTCTATGAGTTATAAATATATAGGTTGTCTTACATACAACTTACAACACATA
TTTCTGAATGGTCATTTAGGCTTAGTATATATGTTTGTCGCTTGATGTCTTTACCACGTC
ATTATCTTGGGAACTCAAGACAACTCTCGTAAGGTCGCAGTCGAAAGTTGAATCATCTGG
AGCAAAGTTTTTGTGGTCCTGATGGTGATCCC*ATGAATGTACCAAGAAAACGGTGGCAG
ATTAAACGGAGGAAAGGGTTGAAAGTATTGGTCCATTATCACTCTCGATGCAAGTTTTCC
TTGTCCACCACTACATTTTTTGTATTCATCTCGGGTTTTCGGCAACCTATGCTTGCACAA
TCGTTCTGAATCTACGAATATTGGTTCTACTTTGTAGCTACCCTCAAACACTTTCATGAA
CATCATTTTCTCCTTTTTATATTTTGCCGTAAGATCTTTAATGTTTTCATCGACAATAAG
CTTTATGGGGAAAGCTCCAGACCACCACAGGAAGTCGAAGGCCACAGTATTATCTGTCTC
TAAAATCTGTCTTGGACCATCCTTCTTCAAAACCTTTCTTGATTGATTTTT
AATGA

QA 1 591 1 591
DS 



AS 2 5

CO CL1193Contig1 825 2 2 U
CATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATCAGTCGACGGTACCGGACATATGCC
CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGAAATCAACCGTCCCGTCCCCGTCTTTATAGAA
GCGAAATAGATTCTCTTCTCTTCTCTGCCTATCAATCATCGGCGGGGATCAGGGATCTCG
ATTTCAATGTCTTACGCTTACCTCTTCAAGTACATCATCATCGGCGATACAGGAGCAGGG
AAATCATGCCTTCTGCTACAGTTCACGGACAAGAGGTTTCAGCCGGTGCATGATCTCACC
ATTGGTGTTGAATTTGGGGCTAGGATGATCACCATCGACAACAAGCCCCTCAAACTCCAG
ATCTGGGATACGGCTGGTCAAGAATCTTTTAGGTCTATTACAAGGTCTTACTACAGAGGT
GCTGCAGGTGCATTGCTTGTCTATGATATCACAAGGAGGGAGACGTTTAACCATCTAGCT
AGCTGGTTAGAGGATGCGAGGCAGCATGCAAACGCAAATATGACGATAATGCTCATTGGG
AATAAGTCTGATCTTGACCACAGGAGGGCAGTTACCACGGAGGAAGGAGAGCACTTTGCA
AAGGAGCACGGTCTTATTTTCATGGAAGCCTCCGCCAAGACTGCTCAGAATGTCGAAGAG
GCATTCATAAAGACAGCGGCAACTATATACAAAAAGATTGAAGATGGTGTTTGATGTGTC
AAATGAGTCGTATGGAATAAAGGTTGGATATGGAGGAATCCCGGGACCATCAGGTGGTAG
AGACGGATCCACATCGCAAGGAGGAGGTTGCTGCGGCTAAGATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1A284TF U 1
AF RS1A284TV U 53
BS 1 603 RS1A284TF
BS 604 825 RS1A284TV

RD RS1A284TF 603 0 0
CATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATCAGTCGACGGTACCGGACATATGCC
CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGAAATCAACCGTCCCGTCCCCGTCTTTATAGAA
GCGAAATAGATTCTCTTCTCTTCTCTGCCTATCAATCATCGGCGGGGATCAGGGATCTCG
ATTTCAATGTCTTACGCTTACCTCTTCAAGTACATCATCATCGGCGATACAGGAGCAGGG
AAATCATGCCTTCTGCTACAGTTCACGGACAAGAGGTTTCAGCCGGTGCATGATCTCACC
ATTGGTGTTGAATTTGGGGCTAGGATGATCACCATCGACAACAAGCCCCTCAAACTCCAG
ATCTGGGATACGGCTGGTCAAGAATCTTTTAGGTCTATTACAAGGTCTTACTACAGAGGT
GCTGCAGGTGCATTGCTTGTCTATGATATCACAAGGAGGGAGACGTTTAACCATCTAGCT
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AATAAGTCTGATCTTGACCACAGGAGGGCAGTTACCACGGAGGAAGGAGAGCACTTTGCA
AAG

QA 1 603 1 603
DS 

RD RS1A284TV 773 0 0
CATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGAAATCAACCGTCCCGTCCCCGTCT
TTATAGAAGCGAAATAGATTCTCTTCTCTTCTCTGCCTATCAATCATCGGCGGGGATCAG
GGATCTCGATTTCAATGTCTTACGCTTACCTCTTCAAGTACATCATCATCGGCGATACAG
GAGCAGGGAAATCATGCCTTCTGCTACAGTTCACGGACAAGAGGTTTCAGCCGGTGCATG
ATCTCACCATTGGTGTTGAATTTGGGGCTAGGATGATCACCATCGACAACAAGCCCCTCA
AACTCCAGATCTGGGATACGGCTGGTCAAGAATCTTTTAGGTCTATTACAAGGTCTTACT
ACAGAGGTGCTGCAGGTGCATTGCTTGTCTATGATATCACAAGGAGGGAGACGTTTAACC
ATCTAGCTAGCTGGTTAGAGGATGCGAGGCAGCATGCAAACGCAAATATGACGATAATGC
TCATTGGGAATAAGTCTGATCTTGACCACAGGAGGGCAGTTACCACGGAGGAAGGAGAGC
AGTTTGCAAAGGAGCACGGTCTTATTTTCATGGAAGCCTCCGCCAAGACTGCTCAGAATG
TCGAAGAGGCATTCATAAAGACAGCGGCAACTATATACAAAAAGATTGAAGATGGTGTTT
GATGTGTCAAATGAGTCGTATGGAATAAAGGTTGGATATGGAGGAATCCCGGGACCATCA
GGTGGTAGAGACGGATCCACATCGCAAGGAGGAGGTTGCTGCGGCTAAGATGG

QA 1 773 1 773
DS 



CO CL1193Contig2 845 3 31 U
TTCTCTTCTCTTCTCCTCTCTGCCTATCAATCATAGGTGGGGATCAGGGATCTCGATTTT
AATGTCTTACGCTTATCTCTTCAAGTACATCATCATCGGCGATACAGGAGTAGGGAAATC
ATGCCTTCTGCTACAGTTCACGGACAAGAGGTTTCAGCCGGTGCATGATCTCACCATTGG
TGTTGAATTTGGGGCTAGGATGATCACCATCGACAACAAGCCCCTCAAACTCCAGATCTG
GGATACGGCTGGTCAAGAATCTTTTAGGTCTATTACAAGGTCTTACTACAGAGGTGCTGC
AGGTGCATTGCTTGTCTATGATATCACAAGGAGGGAGACGTTTAACCATCTAGCTAGCTG
GTTAGAGGATGCGAGGCAGCATGCAAACGCAAATATGACGATAATGCTCATTGGGAATAA
GTCTGATCTTGACCACAGGAGGGCAGTGACCACGGAGGAAGGAGAGCAGTTTGCAAAGGA
GCACGGTCTTATTTTCATGGAAGCCTCTGCCAAGACTGCTCAGAATGTCGAAGAGGCATT
CATAAAGACAGCGGCAACTATATACAAAAAGATTGAAGATGGTGTGTTTGATGTGTCAAA
TGAGTCGTATGGAATAAAAGTTGGATATGGAGGAATCCCGGGGCCATCAGGTGGTAGAGA
CGGATCCACATCGCAAGGAGGAGGTTGCTGCGGCTAAGATGGGGGAATAGTGTCTTTATC
ATATAAACAAAATCTCTTCTGTTTGAATTATATAATAGTTGTAAATCGTTTGGTTTTCGA
TTTGGTGACTTGTCTTGTGGTGGATTCCGGAACGGATTATTTCATTTATCTATAATGCGT
TTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 10 10 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RS1C291TF U 28
AF RS1GD53TF U 7
AF RS1BS09JQ C 1
BS 1 9 RS1BS09JQ
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RD RS1C291TF 621 0 0
GGATCATCGTC
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GCGATACAGGAGTAGGGAAATCATGCCTTCTGCTACAGTTCACGGACAAGAGGTTTCAGC
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AGCCCCTCAAACTCCAGATCTGGGATACGGCTGGTCAAGAATCGTTTAGGTCTATTACAA
GGTCTTACTACAGAGGTGCTGCAGGTGCATTGCTTGTCTATGATATCACAAGGAGGGAGA
CGTTTAACCATCTAGCTAGCTGGCTAGAGGATGCGAGGCAGCATGCAAATGCAAATATGA
CGATAATGCTCATTGGGAATAAGTCTGATCTTGACCACAGGAGGGCAGTCACCACGGAGG
AAGGAGAGCAGTTTGCAAAGGAGCACGGTCTTATTTTCATGGAAGCCTCTGCTAATACTG
CTCAGAATGTCGAAGAGGCGTTCATAAAGACAGCGGCAACAATATACAAAAAGATCGAAG
ATGGTGTGTTTGATGTGTCAAATGAGTCGTATGGAATTAAAGTTGGATATGGAGTAATCC
CGGGGCCATC

QA 12 621 12 621
DS 

RD RS1GD53TF 652 0 0
GGG
CTTCTCCTCTCTGCCTATCAATCATAGGTGGGGATCAGGGATCTCGATTTTAATGTCTTA
CGCTTATCTCTTCAAGTACATCATCATCGGCGATACAGGAGTAGGGAAATCATGCCTTCT
GCTACAGTTCACGGACAAGAGGTTTCAGCCGGTGCATGATCTCACCATTGGTGTTGAATT
TGGGGCTAGGATGATCACCATCGACAACAAGCCCCTCAAACTCCAGATCTGGGATACGGC
TGGTCAAGAATCTTTTAGGTCTATTACAAGGTCTTACTACAGAGGTGCTGCAGGTGCATT
GCTTGTCTATGATATCACAAGGAGGGAGACGTTTAACCATCTAGCTAGCTGGTTAGAGGA
TGCGAGGCAGCATGCAAACGCAAATATGACGATAATGCTCATTGGGAATAAGTCTGATCT
TGACCACAGGAGGGCAGTGACCACGGAGGAAGGAGAGCAGTTTGCAAAGGAGCACGGTCT
TATTTTCATGGAAGCCTCTGCCAAGACTGCTCAGAATGTCGAAGAGGCATTCATAAAGAC
AGCGGCAACTATACACAAAAAGATTGAAGATGGTGTGTTTGATGTGTCAAATGAGTCGTA
TGGAATAAAAGTTGGATATGGAGGGATCCCGGGGCCATCAG
TGGAAGAG

QA 4 644 4 644
DS 

RD RS1BS09JQ 845 0 0
TTCTCTTCTCTTCTCCTCTCTGCCTATCAATCATAGGTGGGGATCAGGGATCTCGATTTT
AATGTCTTACGCTTATCTCTTCAAGTACATCATCATCGGCGATACAGGAGTAGGGAAATC
ATGCCTTCTGCTACAGTTCACGGACAAGAGGTTTCAGCCGGTGCATGATCTCACCATTGG
TGTTGAATTTGGGGCTAGGATGATCACCATCGACAACAAGCCCCTCAAACTCCAGATCTG
GGATACGGCTGGTCAAGAATCTTTTAGGTCTATTACAAGGTCTTACTACAGAGGTGCTGC
AGGTGCATTGCTTGTCTATGATATCACAAGGAGGGAGACGTTTAACCATCTAGCTAGCTG
GTTAGAGGATGCGAGGCAGCATGCAAACGCAAATATGACGATAATGCTCATTGGGAATAA
GTCTGATCTTGACCACAGGAGGGCAGTGACCACGGAGGAAGGAGAGCAGTTTGCAAAGGA
GCACGGTCTTATTTTCATGGAAGCCTCTGCCAAGACTGCTCAGAATGTCGAAGAGGCATT
CATAAAGACAGCGGCAACTATATACAAAAAGATTGAAGATGGTGTGTTTGATGTGTCAAA
TGAGTCGTATGGAATAAAAGTCGGATACGGAGGAATACCGGGGCCATCAGGTGGTAGAGA
CGGATCCACATCGCAAGGAGGAGGTTGCTGCGGCTAAGATGGGGGAATAGTGTCTTTATC
ATATAAACAAAATCTCTTCTGTTTGAATTATATAATAGTTGTAAATCGTTTGGTTTTCGA
TTTGGTGACTTGTCTTGTGGTGGATTCCGGAACGGATTATTTCATTTATCTATAATGCGT
TTTAC

QA 1 845 1 845
DS 



AS 1 5

CO CL1194Contig1 1024 5 14 U
TAAACGGCAAAACGCGATTCAGTCTCATAGCAGCTCTGTTTTATACTACTAGAACAAAGT
TACATTACACGATAGAGATGATGATGACAAAGGAGAAAATGATTTCTAAGAGGAGAAGGT
ATCGATGATGGTGGTGTGAAGCGGATCACTGAGGTGAGTAGCCCAATTGTTGAGCGGACC
TTTACCAGTCGCAGCGGCTTGAACAGCGAAGCCCAAGAAGGCGACCATGGCAAGACGTGC
GTGCTTGATCTCAGCTAACTGAAGCTGAGCCATCTTCTCAGGGTCAGACGCTAAACCAAG
CGGGTCGAAGAATTTGCCTCCAGGGTACAAACGCTTCTCAGAGTCAAGTTCGGCGTTGCG
CTGGAACTCAATGTAGCCGATCACTAACACCTCGATCCATATCAACGTCGAGATGGAGAA
GGGTAGTGGCTGCCCCAAGTAGGACGATCCATCCACAAGCTCCACCTTTCCGGCGTCTTG
CCAGGTGACGCCGGTAAGCCATTCGACGGAGAGAGCGCCGAGAGTGGCGAGCATCGCCCA
CCGTCCGTGGATCAGCTCGCATTCTCTGAACCTCTGGATTCCGAAGACCTCACTGTACGG
CTGAAACGGCGTCGATTTGGGGG*CCGCCTCTTCGGTGCGTGTTCCGATCACGTCTCCGG
CTAAGTTCTTAGCCAGATTCTGGTCTAGCGAATCTATATCGAACTGGAGATACTCGGCCG
GTTTACCTAAACCGAAAGGATCAAAGCCGTAATCTCCAACAAGGGAACCGTCAAGCCACT
CGGGAGATTTGGCGCCTGGGTACCAGAGAGGCCTGTCCGTAGTCACGGTCTTGGTCTTTT
TGGGAGCCGCCTTCTTCTTTCCGAACCCAAACCTGGCTGTGAACCGACCCGAACCGGAGT
GGATATCGGGAACCACGCGAGTACCCATGATGGACGAAGCAGCGGCGGCGGTAGGAGTAG
CGGCCATCTTCGGCGGTGTTGCGTTTTGGTGATTTCAGGAGGTAGAAGGAACTCTCTGTC
TTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

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GTTTACCTAAACCG

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GAAGCCCAAGAAGGCGACCATGGCAAGACGTGCGTGCTTGATCTCAGCTAACTGAAGCTG
AGCCATCTTCTCAGGGTCAGACGCTAAACCAAGCGGGTCGAAAAATTTGCCTCCAGGGTA
CAAACGCTTCTCAAAGTCAAGTTCGGCGTTGCGCTGGAACTCAATGTAGCCGATCACTAA
CACCTCGATCCATATCAACGTCGAGATGGAGAAGGGTAGTGGCTGCCCCAAGTAGGACGA
TCCATCCACAAGCTCCACCTTTCCGGCGTCTTGCCAGGTGACGCCGGTAAGCCATTCGAC
GGAGGGAGCGCCGAGAGTGGCGAGCATCGCCCACCGTCCGTGGATCAGCTCGCATTCTCT
GAACCTCTGGATTCCGAAGACCTCACTGTACGGCTGAAACGGCGTCGATTTGGGGG*CCG
CCTCTTCGGTGCGTGTTCCGATCACGTCTCCGGCTAAGTTCTTAGCCAGATTCTGGTCTA
GCGAATCTATATCGAACTGGAGATACTCGGCCGGTTTACCTAAACCGAAAGGATCAAAGC
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TGGAACTCAATGTAGCCGATCACTAACACCTCGATCCATATCAACGTCGAGATGGAGAAG
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TAAGTTCTTAGCCAGATTCTGGTCTAGCGAATCTATATCGAACTGGAGATACTCGGCCGG
TTTACCTAAACCGAAAGGATCAAAGCCGTAATCTCCAACAAGGGAACCGTCAAGCCACTC
GGGAGATTTGGCGCCTGGGTACCAGAGAGGCCTGTCCGTAGTCACGGTCTTGGTCTTTTT
GGGAGCCGCCTTCTTCTTTCCGAACCCAAACCTGGCTGTGAACCGACCCGAACCGGAGTG
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GGCCATCTT
CGGCGGTGTTGCG

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DS 

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TGGCTGCCCCAAGTAGGACGATCCATCCACAAGCTCCACCTTTCCGGCGTCTTGCCAGGT
GACGCCGGTAAGCCATTCGACGGAGAGAGCGCCGAGAGTGGAGAGCATCGCCCACCGTCC
GTGGATCAGCTCGCATTCTCTGAACCTCTGGATTCCGAAGACCTCACTGTACGGCTGAAA
CGGCGTCGATTTGGGGG*CCGCCTCTTCGGTGCGTGTTCCGATCACGTCTCCGGCTAAGT
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CTAAACCGAAAGGATCAAAGCCGTAATCTCCAACAAGGGAACCGTCAAGCCACTCGGGAG
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CCGCCTTCTTCTTTCCGAACCCAAACCTGGCTGTGAACCGACCCGAACCGGAGTGGATAT
CGGGAACCACGCGAGTACCCATGATGGACGAAGCAGCGGCGGCGGTAGGAGTAGCGGCCA
TCTTCGGCGGTGTTGCGTTTTGGTGATTTCAGGAGGTAGAAGGAACTCTCTGTCTTCC

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 6

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TCTGTTGAAGGTGTTGAAGTCAAACTATGGCAGGTACCAGAGACGCTTCCAGAAGAAGCA
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ACGGCTATAACTCAGCTGGTTCACCACGGGATGATATTTGTCCCGATCGGTTACACATTT
GGTGCTGGAATGTTCGAGATGGAGAAAGTTAAAGGTGGGAGTCCTTATGGAGCTGGAACA
TTCGCAGGAGATGGTTCTAGGCAGCCAACACAGCTGGAGCTAGAGCAAGCCTTTCACCAA
GGCAAATACGTTGCAACCATCACCAAGAAGCTTAAGGGATCTACTGCTTAATGCTTTCTA
ATGATTTGGTATCTATAAGAACAAAAAACATTACCGGTTTTGTTCTGCTTTATTAATAAT
AATATATAAGTTCTTTCGCTTTAATATAATTTCACAGCAATAATTATTTTTTTGGTTTTA
CGTATAGATATGTAATGATTTGTGCTTGTGTTTCCCTTCGAACATGAATGAGGTTTTTTA
TTGTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1H265TF U 1
AF RS1CE05TF U 1
AF RS1B073TF U 56
AF RS1B073JQ C 61
AF RS1H265JQB C 172
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TACTACTCAATGTACGGTCATGTGCAGAAACTGGCTGAAGAAATAAGGAAAGGAGCTGCT
TCTGTTGAAGGTGTTGAAGTCAAACTATGGCAGGTACCAGAGACGCGTCCAGAAGAAGCA
CTCCTTAAGATGAGCGCACCACCAAAGAGTGGATCACCAATCATCACCCCCAACGACCTA
ACTGAAGCTGATGGCTTTGTCTTTGGTTTCCCAACGAGGTTCGGTATGATGGCTGCTCAG
TTCAAAGCCTTCTTGGACGCAATCGGTGGACTCTGGAGGACTCAGGCACTCGCCGGTAAA
CCAGCTGGGATCTTCTACAGTACTGGCTCTCAAGGTGGTGGCCAAGAAACTACCGCATTG
ACGGCTATAACTCAGCTGGTTCACCACGGGATGATATTTGTCCCGATCGGTTACATATTT
GGTGCTGGAATGTTCGAGATGGAGAAAGTTAAAGGTGGGAGCCCTTATGGAGCTGGAACA
TTCGCAGGAGATGGTTCTAGGCAGCCAACACAGCTGGAGCTAGAGCAAGCCTTTCACCAA
AGCAAATACGTTGCAACCATCACCAAGAAGCTTAAGG*ATCTACTGCTTAAT

QA 1 712 1 712
DS 

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GTAGTTAAGCTTCAGAAAAACTAAGAAACGATCCCCATGGCGACCAAAGTATATATCGTG
TACTACTCAATGTACGGTCATGTGCAGAAACTGGCTGAAGAAATAAGGAAAGGAGCTGCT
TCTGTTGAAGGTGTTGAAGTCAAACTATGGCAGGTACCAGAGACGCTTCCAGAAGAAGCA
CTCCTTAAGATGGGCGCACCACCAAAGAGTGGATCACCAATCATCACCCCCAACGACCTA
ACTGAAGCTGATGGCTTTGTCTTTGGTTTCCCAACGAGGTTCGGTATGATGGCTGCTCAG
TTCAAAGCCTTCTTGGACGCAACCGGTGGACTCTGGAGGACTCAGGCACTCGCCGGTAAA
CCAGCTGGGATCTTCTACAGTACTGGCTCTCAAGGTGGTGGCCAAGAAACTACCGCATTG
ACGGCTATAACTCAGCTGGTTCACCACGGGATGATATTTGTCCCGATCGGTTACACATTT
GGTGCTGGAATGTTCGAGATGGAGAAAGTTAAAGGTGGGAGTCCTTATGGAGCTGGAACA
TTCGCAGGAGATGGTTCTAGGCAGCCAACACAGCTGGAGCTAGAGCAAGCCTTTCACCAA
G*CAAATACGTTGCAACCATCACCAAGAAGCTTAAGG*ATCTACTGCTTAATGCTTTCTA
ATGATTTGGTATCTATAAGAACAAAAA

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DS 

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GGAAA
GTAGTTAAGCTTCAGAAAAACTAAGAAACGATCCCCATGGCGACCAAAGTATATATCGTG
TACTACTCAATGTACGGTCATGTGCAGAAACTGGCTGAAGAAATAAGGAAAGGAGCTGCT
TCTGTTGAAGGTGTTGAAGTCAAACTATGGCAGGTACCAGAGACGCTTCCAGAAGAAGCA
CTCCTTAAGATGAGCGCACCACCAAAGAGTGGATCACCAATCATCACCCCCAACGACCTA
ACTGAAGCTGATGGCTTTGTCTTTGGTTTCCCAACGAGGTTCGGTATGATGGCTGCTCAG
TTCAAAGCCTTCTTGGACGCAACCGGTGGACTCTGGAGGACTCAGGCACTCGCCGGTAAA
CCAGCTGGGATCTTCTACAGTACTGGCTCTCAAGGTGGTGGCCAAGAAACTACCGCATTG
ACGGCTATAACTCAGCTGGTTCACCACGGGATGATATTTGTCCCGATCGGTTACACATTT
GGTGCTGGAATGTTCGAGATGGAGAAAGTTAAAGGTGGGAGTCCTTATGGAGCTGGAACA
TTCGCAGGAGATGGTTCTAGGCAGCCAACACAGCTGGAGCTAGAGCAAGCCTTTCACCAA
GGCAAATACGTTGCAACCATCACCAAGAAGCTTAAGGGATCTACTGCTTAATGCTTTCTA
ATGATTTGGTATCTATA

QA 6 682 6 682
DS 

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GTAGTTAAGCTTCAGAAAAACTAAGAAACGATCCCCATGGCGACCAAAGTATATATCGTG
TACTACTCAATGTACGGTCATGTGCAGAAACTGGCTGAAGAAATAAGGAAAGGAGCTGCT
TCTGTTGAAGGTGTTGAAGTCAAACTATGGCAGGTACCAGAGACGCTTCCAGAAGAAGCA
CTCCTTAAGATGAGCGCACCACCAAAGAGTGGATCACCAATCATCACCCCCAACGACCTA
ACTGAAGCTGATGGCTTTGTCTTTGGTTTCCCAACGAGGTTCGGTATGATGGCTGCTCAG
TTCAAAGCCTTCTTGGACGCAACCGGTGGACTCTGGAGGACTCAGGCACTCGCCGGTAAA
CCAGCTGGGATCTTCTACAGTACTGGCTCTCAAGGTGGTGGCCAAGAAACTACCGCATTG
ACGGCTATAACTCAGCTGGTTCACCACGGGATGATATTTGTCCCGATCGGTTACACATTT
GGTGCTGGAATGTTCGAGATGGAGAAAGTTAAAGGTGGGAGTCCTTATGGAGCTGGAACA
TTCGCAGGAGATGGTTCTAGGCAGCCAACACAGCTGGAGCTAGAGCAAGCCTTTCACCAA
GGCAAATACGTTGCAACCATCACCAAGAAGCTTAAGGGATCTACTGCTTAATGCTTTCTA
ATGATTTGGTATCTATAAGAACAAAAAACATTACCGGTTTTGTTCTGCTTTATTAATAAT
AATATATAAGTTCTTTCGCTTT

QA 1 742 1 742
DS 

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AACGACCTAACTGAAGCTGATGGCTTTGTCTTTGGTTTCCCAACGAGGTTCGGTATGATG
GCTGCTCAGTTCAAAGCCTTCTTGGACGCAATCGGTGGACTCTGGAGGACTCAGGCACTC
GCCGGTAAACCAGCTGGGATTTTCTACAGTACTGGCTCTCAAGGTGGTGGCCAAGAAACT
ACCGCATTGACGGCTATAACTCAGCTGGTTCACCACGGGATGATATTTGTCCCGATCGGT
TACATATTTGGTGCTGGAATGTTCGAGATGGAGAAAGTTAAAGGTGGGAGCCCTTATGGA
GCTGGAACATTCGCAGGAGATGGTTTTAGGCAGCCAACACAGCTGGAGCTAGAGCAAGCC
TTTCACCAAGGCAAATACGTTGCAACCATCACCAAGAAGCTTAAGGGATCTACTGCTTAA
TGCTTTCTAATGATTTGGTATCTATAAGAACAAAAAACATTACCGGTTTTGTTCTGCTTT
ATTAATAATAATATATAAGTTCTTTCGCTTTAATATAATTTCACAGCAATAATT

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DS 

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AGAGCAAGCCTTTCACCAAGGCAAATACGTTGCAACCATCACCAAGAAGCTTAAGGGATT
TACTGCTTAATGCTTTTTAATGATTTGGTATTTATAAGAACAAAAAACATTACCGGTTTT
GTTTTGCTTTATTAATAATAATATATAAGTTCTTTCGCTTTAATATAATTTCACAGCAAT
AATTATTTTTTTGGTTTTACGTATAGATATGTAATGATTTGTGCTTGTGTTTCCCTTCGA
ACATGAATGAGGTTTTTTATTGTC

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DS 



AS 1 6

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GGAACATAATGGGTTTAGGTACAATACAAACCAGCAACCCAAGGAGATTAATTTCCTTTT
TCTCTTTATGTAGGATTTGCACAATAACACTACTGTTTTATGAGAGTTACATAGCCACTC
AAACACTGCTAAAACTTAATGAAATCCCATAGCCCCAGTCTTGAAAGCTGGAGCATCCGG
TGGCGGCGAAGGCAACACCGTTAAAGCCAATATGCCACTCACTGCGGCCGCAATTGCTCC
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TGATACCACCATCTGTGGGACAACAATAGCCAGATTCAGAACACCTAGGGACAGCCCTTG
GCCGGCACCAGAATTGGTTGAAAATATGGAAGCTAGCGCAAAAGGAATACTGAACGTAAT
CGCTTGGGGAATACCGAGAACAGCAAAGAGAGTTAAAGCACCAGCGGTGACACTACCAGG
CGGTCCTGTTTTAGCACCACCGTGATCTCGCCGGTGATCCTCCGCCTGTTTAGTCACCAC
AACAGTCATGGCCAAGCAAATAGCAAGGATGAAGTTAACAGCTCCCC*AAAGCCGTTTAG
CTCCACCCATTTTCCTACCGACCCATTCAACACCAAGAGACATGAACCCAAGAACAATCG
CGTTAAGCATAAGCCCCAACGCGCCAGCTCTAACTCCGTCGTTGTAAAGCTTTTTAGAGG
CGGTACTTGCGGTTGCGTCTGAGTTTCCTCCGTACACCTCACGGCCCATCCAGTCAGTGT
CGAAGAGGAGGAAAGGGAACCAAGCGATCCAGTTCAGTGCAGTGACTATAAGAAGCATCC
ACATCGGTCTTTTCAGCTCATTGAAAGCTCCGAAGATCTCTCCGAAGAAAGGAACGCCCG
AGCCTTTCCCGTCTGCGGTTGGCTCAGGGGTCCATGGCTTCTCCGTCACGTAACATAGAG
ACATGAACGTGACCAAGAGGAGAAGCGTTATGGAGATGAAAAAACACGTTTTGAGGTTCG
CGCAGTAGAGATCGCAAGACTTGGTCATCGTGAAAGGGACAACTTTGTAGAGGTTCTTGT
AAGAGCCCGCCGCGTAACCCAAAACGTTTCCCACCGCCATGAAGAACGAGAAAAACGCGT
TTGCGGTCCGCGTTTTCTTCGCGTTTCCCGCGGACAGATCAGCCAAGAATGCACGGCATG
GTCCTTGGAGAGTGTTGTTCGCCACGTCGAGAATCCAGAACCCGAGGGCGAAAATCGCGA
TAGCCCGCGTTCTCGGCGGTTTGTCGAGCTGATCACCCATGCTATGACCTATATCGGCGG
CGTAACCGATAAGGAACACGGCGACGGTGACTAGACCGGCTCCGGCGACGATGAAAGGAC
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GCATACCGGAGATTGGGCCGCAGAGCCAGATGAGAGAGGCCCATTTATGTGGGATTCCGA
GTAGCTGCACGTAAGGAGTCAGCAGAGAAAGCTGTAAAGCCCAACCGAACTGTACACCGG
CGGCGATGGAAGACACCGATATGATCTTACGGAGAGCCGCCGGCTGATCAAGCTCAGACG
TATGCATCTCCAACGCGGAGGAACCGTTGGAAGCTTTCTCCATTAAGTAGAAAAAGAAGA
AACTAAAACTTTGTTTTAAAGGGTTTTGTGTTTTGTTTTTTTTCGGTGGTGTCTCCGATG
GTTGTGGTGGTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C656JQ U 13
AF RS1AY64JQ U 1
AF RS1AG36JQ U 13
AF RS1AY64TF C 296
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GA
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TTAGGTACAATACAAACCAGCAACCCAAGGAGATTAATTTCCTTTTTCTCTTTATGTAGG
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CTTAATAAAATCCCATAGCCCCAGTCTTGAAAGCTGGAGCATCCGGTGGCGGCGAAGGCA
ACACCGTTAAAGCCAATATGCCACTCACTGCGGCCGCAATTGCTCCTAGCACAAACGCCG
GAATGTTTCCACCATGGAATAGTTCATCGAATGGTCCACCACCCACTGATACCACCATCT
GTGGGACAACAATAGCCAGATTCAGAACACCTAGGGACAGCCCTTGGCCGGCACCAGAAT
TGGTTGAAAATATGGAAGCTAGCGCAAAAGGAATACTGAACGTAATCGCTTGGGGAATAC
CGAGAACAGCAAAGAGAGTTAAAGCGCCAGCGGTGACACTACCAGGCGGTCCTGTTTTAG
CACCACCG

QA 3 550 3 550
DS 

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GGAACATAATGGGTTTAGGTACAATACAAACCAGCAACCCAAGGAGATTAATTTCCTTTT
TCTCTTTATGTAGGATTTGCACAATAACACTACTGTTTTATGAGAGTTACATAGCCACTC
AAACACTGCTAAAACTTAATGAAATCCCATAGCCCCAGTCTTGAAAGCTGGAGCATCCGG
TGGCGGCGAAGGCAACACCGTTAAAGCCAATACGCCACTCACTGCGGCCGCAATTGCTCC
TAGCACAAACGCCGGAATGTTTCCACCATGGAATAGTTCATCGAATGGTCCACCACCCAC
TGATACCACCATCTGTGGGACAACAATAGCCAGATTCAGAACACCTAGGGACAGCCCTTG
GCCGGCACCAGAATTGGTTGAAAATATGGAAGCTAGCGCAAAAGGAATACTGAACGTAAT
CGCTTGGGGAATACCGAGAACAGCAAAGAGAGTTAAAGCACCAGCGGTGACACTACCAGG
CGGTCCTGTTTTAGCACCACCGTGATCTCGCCGGTGATCCTCCGCCTGTTTAGTCACCAC
AACAGTCATGGCCAAGCAAATAGCAAGGATGAAGTTAACAGCTCCCC*AAAGCCGTTTAG
CTCCACCCATTTTCCTACCGACCCATTCAACACCAAGAGACATGAACCCAAGAACAATCG
CGTTAAGCATAAGCCCCAACGCGCCAGCTCTAACTCCGTCGTTGTAAAGCTTTTTAGAG*
CGGTACTTGCGGT*GCGTCTGAGTTTCCTCCGTACAC
T

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DS 

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GG
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TTAGGTACAATACAAACCAGCAACCCAAGGAGATTAATTTCCTTTTTCTCTTTATGTAGG
ATTTGCACAATAACACTACTGTTTTATGAGAGTTACATAGCCACTCAAACACTGCTAAAA
CTTAATGAAATCCCGTAGCCCCAGTCTTGAAAGCTGGAGCATCCGGTGGCGGCGAAGGCA
ACACCGTTAAAGCCAATATGCCACTCACTGCGGCCGCAATTGCTCCTAGCACAAACGCCG
GAATGTTTCCACCATGGAATAGTTCATCGAATGGTCCACCACCCACTGATACCACCATCT
GTGGGACAACAATAGCCAGATTCAGAACACCTAGGGACAGCCCTTGGCCGGCACCAGAAT
TGGTTGAAAATATGGAAGCTAGCGCAAAAGGAATACTGAACGTAATCGCTTGGGGAATAC
CGAGAACAGCAAAGAGAGTTAAAGCACCAGCGGTGACACTACCAGGCGGTCCTGTTTTAG
CACCACCGTGATCTCGCCGGTGATCCTCCGCCTGTTTAGTCACCACAACAGTAATGGCCA
AGCAAATAGCAAGGATGAAGTTAACAGCTCCCC*AAAGCCGTTTAGCTCCACCCATTTTC
CTACCGACCCATTCAACACCAAGAGACATGAACCCAAGAACAATCGCGTTAAGCATAAGC
CCCAACGCGCCAGCTCTAACTCCGTCGTTGTAAAGCTTTTTAGAGGCGGTACTTGCGGTT
GCGTCTGAGTTTCCACCGTACACCTCACGGCCCATCCAGTCAGTGTCGAA

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DS 

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ATGCTCTAGCAC
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ACCATCTGTGGGACAACAATAGCCAGATTCAGAACACCTAGGGACAGCCCTTGGCCGGCA
CCAGAATTGGTTGAAAATATGGAAGCTAGCGCAAAAGGAATACTGAACGTAATCGCTTGG
GGAATACCGAGAACAGCAAAGAGAGTTAAAGCACCAGCGGTGACACTACCAGGCGGTCCT
GTTTTAGCACCACCGTGATCTCGCCGGTGATCCTCCGCCTGTTTAGTCACCACAACAGTC
ATGGCCAAGCAAATAGCAAGGATGAAGTTAACAGCTCCCC*AAAGCCGTTTAGCTCCACC
CATTTTCCTACCGACCCATTCAACACCAAGAGACATGAACCCAAGAACAATCGCGTTAAG
CATAAGCCCCAACGCGCCAGCTCTAACTCCGTCGTTGTAAAGCTTTTTAGAGGCGGTACT
TGCGGTTGCGTCTGAGTTTCCTCCGTACACCTCACGGCCCATCCAGTCAGTGTCGAAGAG
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TCTTTTCAGCTCTTTGAAAGCTCCGAAGATCTCTCCGAAGAAAGGAACGCTCGAGCCTTT
CCCGTCTGCGGTTGGCTCAGGGGTCCATGGC
CT

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DS 

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AAGCAAATAGCAAGGATGAAGTTAACAGCTCCCCCAAAGCCGTTTAGCTCCACCCATTTT
CCTACCGACCCATTCAACACCAAGAGACATGAACCCGAGGACAATCGCGTTAAGCATAAG
CCCCAACGCGCCAGCTCTAACTCCGTCGTTGTAAAGCTTTTTAGAGGCGGTACTTGCTGT
TGCGTCTGAGTTTCCTCCGTACACCTCACGGCCCATCCAGTCAGTGTCGAAGAGGAGGAA
AGGGAACCAAGCGATCCAGTTCAGTGCAGTGACTATAAGAAGCATCCACATCGGTCTTTT
CAGCTCATTGAAAGCTCCGAAGATCTCTCCGAAGAACGGAACGCCCGAGGCTTTCCCGTC
TGCGGTTGGCTCAGGGGTCCATGGCTTCTCCGTCACGTAACATAGAGACATGAACGTGAC
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GCAAGACTTGGTCATCGTGAAAGGGACAACTTTGTAGAGGTTCTTGTAAGAGCCCGCCGC
GTAACCCAAAACGTTTCCCACCGCCATGAAGAACGAGAAAAA

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DS 

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AAACACGTTTTGAGGTTCGCGCAGTAGAGATCGCAAGATTTGGTCATCGTGAATGGGACA
ACTTTGTAGAGGTTCTTGTAAGAGCCCGCCGCGTAACCCAAAACGTTTCCCACCGCCATG
AAGAACGAGAAAAACGCGTTTGCGGTCCGCGTTTTCTTCGCGTTTCCCGCGGACAGATCA
GCCAAGAATGCACGGCATGGTCCTTGGAGAGTGTTGTTCGCCACGTCGAGAATCCAGAAC
CCGAGGGCGAAAATCGCGATAGCCCGCGTTCTCGGCGGTTTGTCGAGCTGATCACCCATG
CTATGACCTATATCGGCGGCGTAACCGATAAGGAACACGGCGACGGTGACTAGACCGGCT
CCGGCGACGATGAAAGGACGACGGCGGCCGAATCTTGAGGTGCAACGGTCACTGTGGTAA
CCGACGATGGGCTGAACAAGCATACCGGAGATTGGGCCGCAGAGCCAGATGAGAGAGGCC
CATTTATGTGGGATTCCGAGTAGCTGCACGTAAGGAGTCAGCAGAGAAAGCTGTAAAGCC
CAACCGAACTGTACACCGGCGGCGATGGAAGACACCGATATGATCTTACGGAGAGCCGCC
GGCTGATCAAGCTCAGACGTATGCATCTCCAACGCGGAGGAACCGTTGGAAGCTTTCTCC
ATTAAGTAGAAAAAGAAGAAACTAAAACTTTGTTTTAAAGGGTTTTGTGTTTTGTTTTTT
TTCGGTGGTGTCTCCGATGGTTGTGGTGGTCC

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DS 



AS 1 6

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TACTCATAACAGTAACACAAAATGTCCTTACAAAATTAAACATAAGAGAGAGACACCGTT
TATTGGTTTCTTCGTCACCGTTTCTTGGACTTAACCGCCACAACGTCTTTATAGAGCTTA
ACGCGATCCTTCAACGCATCTCTTCGAGGCCGAGCCACCTTGTTGTTCGGATCAAACAAC
AAAACCTCTTCAAACGCTTTCAACGCCAAAG**AGCTCCTTCTTCTTCTCGTAAGCATCT
CCAAGGTTGTTCCAAGCCGTTACATAACCAGGCTGAATCTTCACCGCCATTTCAAACTGA
GCGATTCCTTTGTCCAGTTTGTCCTCTCGGACGTAACTCACTCCGAGAGCGTTGTAGACC
TGAGCAAGATCTTGATCGTCACCGTCCCATTTCTGGATGGCTTGAAGCAAGAACTTGTTG
GCTGCCGGATAAAATTTGCGTCTCAGCATCACTGCACCGAGCTCAAAGAGTTCTGTTGCA
CTTGCATCCCCGCTCCTAACTTGTTCCTGTAGTTCTTTGGCAGAGAGGTCAAGTTCTCTG
CGGACAAGTACTTGGCGAATCACATAGAAAGTACCAACTCCGAGCAAACCCAGTAGCAAC
AGCAAGTAAGAAAGCTGAATCCCTAGCTCAAACAACTCTCCAACTTCGTAAATCGGTTCA
GGCTTCACGATCTCTGACGCTGCTGCCAGCTGTGGATAAGCAGAGACCATCAACAAGCTA
TGCCCCAGCAGAAAGGTAGATCCTTTGCTCGGTAGCTTCCTCAAGGAAGCTTTTTTCAAA
ACCGGTAAGCCTCTAGCAGCAAATTCTGCTTTGGTCCTTCCATGTATCTGTAAAGATATC
GTTTTGGGATGGAGCTTGAGCGATACGGGAGAAGAAGGGAGAATCTGAGAGTGATGGAGA
TAGAGGCGGTGAATGGGAGGAGACGATGGAGATAACGTATGGAGTAGCATGCTCGATGAG
ATTACTCTGAATGTCTGAAAATCCACGAGTGTGCGTGTTTCC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 20 35 35 
35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FR21JQ U 1
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TACTCATAACAGTAACACAAAATGTCCTTACAAAATTAAACATAAGAGAGAGACACCGTT
TATTGGTTTCTTCGTCACCGTTTCTTGGACTTAACCGCCACAACGTCTTTATAGAGCTTA
ACGCGATCCTTCAACGCATCTCTTCGAGGCCGAGCCACCTTGTTGTTCGGATCAAACAAC
AAAACCTCTTCAAACGCTTTCAACGCCAAAGGCAGCTCCTTCTTCTTCTCGTAAGCATCT
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GCGATTCCTTTGTCCAGTTTGTCCTCTCGGACGTAACTCACTCCGAGAGCGTTGTAGACC
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GCTGCCGGATAAAATTTGCGTCTCAGCATCACTGCACCGAGCTCAAAGAGTTCTGTTGCA
CTTGCATCCACGCTCCTAACTTGTTCCTGTAGTTCTTTGGCAGAGAGGTCAAGTTCTCTG
CGGACAAGTACTTGGCGAATCACATAGAAAGTACCAACTCCGAGCAAACCCAGTAGCAAC
AGCAAGTAAGAAAGCTGAATCCCTAGCTCAAACAACTCTCCAACTTCGTAAATCGGTTCA
G*CTTCACGATCTCTGACGCTGCTGCCAGCTGTGGATAAGCAGAGACCATCAACAAGCTA
TGCCCCAGCAG

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DS 

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AAACAA
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TAAGAGAGAGACACCGTTTATTGGTTTCTTCGTCACAGTTTCTTGGACTTAACCGCCACA
ACGTCTTTATAGAGCTTAACGCGATCCTTCAACGCATCTCTTCGAGGCCGAGCCACCTTG
TTGTTCGGATCAAACAACAAAACCTCTTCAAACGCTTTCAACGCCAAAGGCAGCTCCTTC
TTCTTCTCGTAAGCATCTCCAAGGTTGTTCCAAGCCGTTACATAACCAGGCTGAATCTTC
ACCGCCATTTCAAACTGAGCGATTCCTTTGTCCAGTTTGTCCTCTCGGACGTAACTCACT
CCGAGAGCGTTGTAGACCTGAGCAAGATCTTGATCGTCACCGTCCCATTTCTGGATGGCT
TGAAGCAAGAACTTGTTGGCTGCCGGATAAAATTTGCGTCTCAGCATCACTGCACCGAGC
TCAAAGAGTTCTGTTGCACTTGCATCCCCGCTCCTAACTTGTTCCTGTAGTTCTTTGGCA
GAAAGGTCAAGTTCTCTGCGGACAAGTACTTGGCGAATCACATAGAAAGTACCAACTCCG
AGCAAACCCAGTAGCAACAGCAAGTAAGAAAGCTGAATCCCTAGCTCAAACAACTCTCCA
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QA 7 786 7 786
DS 

RD RS1BZ66JQ 767 0 0
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TAAGAGGGAGACACCGTTTATTGGTTTCTTCGTCACCGTTTCTTGGACTTAACCGCCACA
ACGTCTTTATAGAGCTTAACGCGATCCTTCAACGCATCTCTTCGAGGCCGAGCCACCTTG
TTGTTCGGATCAAACAACAAAACCTCTTCAAACGCTTTCAACGCCAAAG**AGCTCCTTC
TTCTTCTCGTAAGCATCTCCAAGGTTGTTCCAAGCCGTTACATAACCAGGCTGAATCTTC
ACCGCCATTTCAAACTGAGCGATTCCTTTGTCCAGTTTGTCCTCTCGGACGTAACTCACT
CCGAGAGCGTTGCAGACCTGAGCAAGATCTTGATCGTCACCGTCCCATTTCTGGATGGCT
TGAAGCAAGAACTTGTTGGCTGCCGGATAAAATTTGCGTCTCAGCATCACTGCACCGAGC
TCAAAGAGTTCTGTTGCACTTGCATCCCCGCTCCTAACTTGTTCCTGTAGTTCTTTGGCA
GAGAGGTCAAGTTCTCTGCGGACAAGTACTTGGCGAATCACATAGAAAGTACCAACTCCG
AGCAAACCCAGTAGCAACAGCAAGTAAGAAAGCTGAATCCCTAGCTCAAACAACTCTCCA
ACTTCGTAAATCGGTTCAGGCTTCACGATCTCTGACGCTGCTGCCAGCTGTGGATAAGCA
GAGACCATCAACAAGCTATGCCCAAGCAGAAAGGTAGATCCTTTGCT

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DS 

RD RS1BZ66TF 785 0 0
TCAAACGCTTTCAACGCCAAAG**AGCTC*TTCTTCTTCTCGTAAGCATCTCCAAGGTTG
TTCCAAGCCGTTACATAACCAGGCTGAATCTTCACCGCCATTTCAAACTGAGCGATTCCT
TTGTCCAGTTTGTCCTCTCGGACGTAACTCACTCCGAGAGCGTTGCAGACCTGAGCAAGA
TCTTGATCGTCACCGTCCCATTTCTGGATGGCTTGAAGCAAGAACTTGTTGGCTGCCGGA
TAAAATTTGCGTCTCAGCATCACTGCACCGAGCTCAAAGAGTTCTGTTGCACTTGCATCC
CCGCTCCTAACTTGTTCCTGTAGTTCTTTGGCAGAGAGGTCAAGTTCTCTGCGGACAAGT
ACTTGGCGAATCACATAGAAAGTACCAACTCCGAGCAAACCCAGTAGCAACAGCAAGTAA
GAAAGCTGAATCCCTAGCTCAAACAACTCTCCAACTTCGTAAATCGGTTCAGGCTTCACG
ATCTCTGACGCTGCTGCCAGCTGTGGATAAGCAGAGACCATCAACAAGCTATGCCCAAGC
AGAAAGGTAGATCCTTTGCTCGGTAGCTTCCTCAAGGAAGCTTTTTTCAAAACCGGTAAG
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TGGAGCTTGAGCGATACGGGAGAAGAAGGGAGAATCTGAGAGTGATGGAGATAGAGGCGG
TGAATGGGAGGAGACGATGGAGATAACGTATGGAGTAGCATGCTCGATGAGATTACTCT
AAATGT

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DS 

RD RS1AV47TF 715 0 0
CCA
TTCAAACTGAGCGAT*CCTTTGTCCAGTTTGTCCTCTCGGACGTAACTCACTCCGAGAGC
GTTGTAGAC*TGAGCAAGATCTTGATCGTCACCGTCCCATTTCTGGATGGCTTGAAGCAA
GAACTTGTTGGCTGCCGGATAAAATTTGCGTCTCAGCATCACTGCACCGAGCTCAAAGAG
TTCTGTTGCACTTGCATCCCCGCTCCTAACTTGTTCCTGTAGTTCTTTGGCAGAGAGGTC
AAGTTCTCTGCGGACAAGTACTTGGCGAATCACATAGAAAGTACCAACTCCGAGCAAACC
CAGTAGCAACAGCAAGTAAGAAAGCTGAATCCCTAGCTCAAACAACTCTCCAACTTCGTA
AATCGGTTCAGGCTTCACGATCTCTGACGCTGCTGCCAGCTGTGGATAAGCAGAGACCAT
CAACAAGCTATGCCCCAGCAGAAAGGTAGATCCTTTGCTCGGTAGCTTCCTCAAGGAAGC
TTTTTTCAAAACCGGTAAGCCTCTAGCAGCAAATTCTGCTTTGGTCCTTCCATGTATCTG
TAAAGATATCGTTTTGGGATGGAGCTTGAGCGATACGGGAGAAGAAGGGAGAATCTGAGA
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GCTCGATGAGATTACTCTGAATGTCTGAAAATCCACGAGTGTGCGTGTTTCC

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DS 

RD RS1FR21TF 611 0 0
GCAAGATCTTGATCGTCACCGTCCCATTTCTGGATGGCTTGAAGCAAGAACTTGTTGGCT
GCCGGATAAAATTTGCGTCTCAGCATCACTGCACCGAGCTCAAAGAGTTCTGTTGCACTT
GCATCCACGCTCCTAACTTGTTCCTGTAGTTCTTTGGCAGAGAGGTCAAGTTCTCTGCGG
ACAAGTACTTGGCGAATCACATAGAAAGTACCAACTCCGAGCAAACCCAGTAGCAACAGC
AAGTAAGAAAGCTGAATCCCTAGCTCAAACAACTCTCCAACTTCGTAAATCGGTTCAGGC
TTCACGATCTCTGACGCTGCTGCCAGCTGTGGATAAGCAGAGACCATCAACAAGCTATGC
CCCAGCAGAAAGGTAGATCCTTTGCTCGGTAGCTTCCTCAAGGAAGCTTTTTTCAAAACC
GGTAAGCCTCTAGCAGCAAATTCTGCTTTGGTCCTTCCATGTATCTGTAAAGATATCGTT
TTGGGATGGAGCTTGAGCGATACGGGAGAAGAAGGGAGAATCTGAGAGTGATGGAGATAG
AGGCGGTGAATGGGAGGAGACGATGGAGATAACGTATGGAGTAGCATGCTCGATGAGATT
ACTCT
GAATCC

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 5

CO CL1198Contig1 874 5 13 U
GGGACCTTTAACTTGTTCCTATTTCTTTAGTCATCTTCTTCTTCTTTTCAGATTCGTTTT
GGTCACAAACTCAAAAGCATGGAACGACTTCGTCAGCTCATCATCATCTTCTTCTTCCTC
GTGACCGTTCTTGAACATGCTTCATCTGCTCGGATTCTTACAATCTCTAAGCCCGACAGG
CATGATGTTGCAGCAAGTGCTCGTTGGCTTGTCTCTCAGAACATCTGGGGTGTCCTCAGC
ACATTGTCTATTGAGCATGATGGAGCACCTTTCGGGAATGTTGTGTCATATAGTGATGGT
CTGCCGGGGAAAGGCAAGGGTATACCATACTTTTACTTGACAATTCTTGATCCAACCACA
AGAAACGCATTGAAAGACTCGAGGGCTTCATTCGCAATCAGTGAATCTCCCATTGGAACT
TGCAAGAGAGATCCTATGGACCCTACTTGCTCTAAACTAACCCTCACCGGAAAGTTGTTG
CAACTGAATGAAGGATCTGAGGAAGAGAACGTAGCCAAAAAAGCTCTATTCACTAAGCAT
CCAGAGATGATGGATTGGCCTGAGGGACATGAGTTCAGTGTCTTCAAACTGGAGATTATG
AATATATTTCTGATCAATTGGTATGGTGGAGCTAAATCCATCACCGTAGATGAGTATCTT
CGTTACAAGGAGACCAAAGTCGCTTCCTTTTTATGAAAAATCACAGCTGGAAATGAGCAA
AAGGTGAAGAATAAGCATATCATGAAACTTGTATATATTGGTAACACAATAAAAATGTAT
TCAGCTCTTCTGTAAATGACTGTTGTTAATAGCCTTTCGATTACATTTATGTGGACATGA
TGAATATAGAACTATTCATAAATTACCACAATCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1BO25TF U 1
AF RS1DW96TF U 1
AF RS1G352TF U 59
AF RS1DW96JQ C 171
AF RS1G352JQ C 306
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RD RS1BO25TF 696 0 0
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GGTCACAAACTCAAAAGCATGGAACGACTTCGTCAGCTCATCATCATCTTCTTCTTCCTC
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AATATATTTCTGATCAATTGGTATGGTGGAGCTAAATCCATCACCGTAGATGAGTATCTT
CGTTACAAGGAGACCAAAGTCGCTTCCTTTT
ATGAA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1DW96TF 733 0 0
GGGACCTTTAACTTGTTCCTATTTCTTTAGTCATCTTCTTCTTCTTTTCAGATTCGTTTT
GGTCACAAACTCAAAAGTATGGAACGACTTCGTCAGCTCATCATCATCTTCTTCTTCCTC
GTGACCGTTCTTGAACATGCTTCATCCGCTCGGATTCTTACAATCTCTAAGCCCGACAGG
CATGATGTTGCAGCAAGTGCTCGTTGGCTTGTCTCTCAGAACATCTGGGGTGTCCTCAGC
ACATTGTCTATTGAGCATGATGGAGCACCTTTCGGGAATGTTGTGTCATATAGTGATGGT
CTGCCGGGGAAAGGCAAGGGTATACCATACTTTTACTTGACAATTCTTGATCCAACCACA
AGAAACGCATTGAAAGACTCGAGGGCTTCATTCGCAATCAGTGAATCTCCCATTGGAACT
TGCAAGAGAGATCCTATGGACCCTACTTGCACTAAACTAACCCTCACCGGAAAGTTGTTG
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AGTATATTTCTGATCAATTGGTATGGTGGAGCTAAATCCATCACCGTAGATGAGTATCTT
CGTTACAAGGAGACCAAAGTCGCTTCCTTTTTATGAAAA*TCACAGCTGGAAATGAGCAA
AAG
TGAAGATAGC

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1G352TF 739 0 0
GG
GGTCACAAACTCAAAAGCATGGAACGACTTCGTCAGCTCATCATCATCTTCTTCTTCCTC
GTGACCGTTCTTGAACATGCTTCATCTGCTCGGATTCTTACAATCTCTAGGCCCGACAGG
CATGATGTTGCAGCAAGTGCTCGTTGGCTTGTCTCTCAGAACATCTGGGGTGTCCTCAGC
ACATTGTCTATTGAGCATGATGGAGCACCTTTCGGGAATGTTGTGTCATATAGTGATGGT
CTGCCGGGGAAAGGCAAGGGTATACCATACTTTTACTTGACAATTCTTGATCCAACCACA
AGAAACGCATTGAAAGACTCGAGGGCTTCATTCGCAATCAGTGAATCTCCCATTGGAACT
TGCAAGAGAGATCCTATGGACCCTACTTGCTCTAAACTAACCCTCACCGGAAAGTTGTTG
CAACTGAATGAAGGATCTGAGGAAGAGAACGTAGCCAAAAAAGCTCTATTCACTAAGCAT
CCAGAGATGATGGATTGGCCTGAGGGACATGAGTTCAGTGTCTTCAAACTGGAGATTATG
AATATATTTCTGATCAATTGGTATGGTGGAGCTAAATCCATCACCGTAGATGAGTATCTT
CGTTACAAGGAGACCAAAGTCGCTTCCTTTTTATGAAAAATCACAGCTGGAAATGAGCAA
AAG*TGAAGAATAAGCATATCATGAAACTTGTATATATTGGTA*CACAATAAAA*TGTAT
TCAGCTCT
CTGTAATGA

QA 3 730 3 730
DS 

RD RS1DW96JQ 704 0 0
GCCCGACAGGCATGATGTTGCAGCAAGTGCTCGTTGGCTTGTCTCTCAGAACATCTGGGG
TGTCCTCAGCACATTGTCTATTGAGCATGATGGAGCACCTTTCGGGAATGTTGTGTCATA
TAGTGATGGTCTGCCGGGGAAAGGCAAGGGTATACCATACTTTTACTTGACAATTCTTGA
TCCAACCACAAGAAACGCATTGAAAGACTCGAGGGCTTCATTCGCAATCAGTGAATCTCC
CATTGGAACTTGCAAGAGAGATCCTATGGACCCTACTTGCACTAAACTAACCCTCACCGG
AAAGTTGTTGCAGCTGAATGAAGGATCTGAGGAAGAGAACGTAGCCAAAAAAGCTCTATT
CACTAAGCATCCAGAGATGATGGATTGGCCTGAGGGACATGAGTTCAGTGTCTTCAAACT
GGAGATTATGAGTATATTTCTGATCAATTGGTATGGTGGAGCTAAATCCATCACCGTAGA
TGAGTATCTTCGTTACAAGGAGACCAAAGTCGCTTCCTTTTTATGAAAAATCACAGCTGG
AAATGAGCAAAAGGTGAAGAATAAGCATATCATGAAACTTGTATATATTGGTAACACAAT
AAAAATGTATTCAGCTCTTCTGTAAATGACTGTTGTTAATAGCCTTTCGATTACATTTAT
GTGGACATGATGAATATAGAACTATTCATAAATTACCACAATCC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1G352JQ 569 0 0
GGGGAAAGGCAAGGGTATACCATACTTTTACTTGACAATTCTTGATCCAACCACAAGAAA
CGCATTGAAAGACTCGAGGGCTTCATTCGCAATCAGTGAATCTCCCATTGGAACTTGCAG
GAGAGATCCTATGGACCCTACTTGCTCTAAACTAACCCTCACCGGAAAGTTGTTGCAACT
GAATGAAGGATCTGAGGAAGAGAACGTAGCCAAAAAAGCTCTATTCACTAAGCATCCAGA
GATGATGGATTGGCCTGAGGGACATGAGTTCAGTGTCTTCAAACTGGAGATTATGAATAT
ATTTCTGATCAATTGGTATGGTGGAGCTAAATCCATCACCGTAGATGAGTATTTTCGTTA
CAAGGAGACCAAAGTCGCTTCCTTTTTATGAAAAATCACAGCTGGAAATGAGCAAAAGGT
GAAGAATAAGCATATCATGAAACTTGTATATATTGGTAACACAATAAAAATGTATTCAGC
TCTTCTGTAAATGACTGTTGTTAATAGCCTTTCGATTACATTTATGTGGACATGATGAAT
ATAGAACTATTCATAAATTACCACAATCC

QA 1 569 1 569
DS 



AS 2 4

CO CL1199Contig1 957 2 2 U
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GGAAGTCCTCCTAAGCCTTGGGAACAAGAAGGGAACAACAACGCATCTGCTGGGCCTAAG
CCTTTCAGGCCTCCTTCCAATACCAGCACTGCTGATTCCGTTGAGGCTTCTGGCACGGCG
AATCCTGGTGAGCTGGTTTCGTCTGTTAACAGGACTAACACAGCTGCTGGTACAATGAAT
GGACTGAGTAGGCCTGTGCCGAGTAGGCCTTGGGACCAGCAACAAACCTATGGAAGCACT
TATGGTGGTGGTTATGGTTCAAACCTAGGTATGACCTCTGGGTATGGGTCTGGTACATAT
GGTTCAGGACTAGGTGGGTATGGTTCGTCATATGGGGGTGGAATGTATGGTGGTAGCAGC
ATGTATAATAGAGGAGGTTGTGGCGGTGGTGGTCTCTATGGGAGTTCAGGTATGTATGGT
GGTGGTGGGTGGGATGTACGGCAGTAGTTTTGGTGGGGGTTATGGTATGGGTATGGGGAC
AGGGATGGGTATGGGTATGGGGATGGGAATGGGGATGAGTCCTTATGGTGGTCAAGATCC
AAATGATCCTGCACCAGGTGGTGGCGGTGGTGGTTGGGATAATGTATGGGGTAACTAAGT
TGCTTCGTTTCTTTAAGCCAAGTCCTTCAACGTTGCTCTGAATACACAAATGGTAATCAG
TTTGGATATGAGTAGATTGTGCAGCGGCCTCCTAAGCAGATTGGGTTGTTGTTGTACTAA
AGCCTGATGTTTGTTTACAAATCGAGTCTCTTCTTCCTCAGTGTTCTGGTTATTTGATAA
AACAAGTTGCAGATATTTATGTCGAACTCAATAAAATGGTAAGTTAAGTTGTAAAAGAGT
TTCTAAAAGACATATCTGTTGTGTATTCATTTAATATTATTGGATTCTCTTCTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DA90TF U 1
AF RS1DA90JQ C 273
BS 1 537 RS1DA90TF
BS 538 957 RS1DA90JQ

RD RS1DA90TF 537 0 0
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GGAAGTCCTCCTAAGCCTTGGGAACAAGAAGGGAACAACAACGCATCTGCTGGGCCTAAG
CCTTTCAGGCCTCCTTCCAATACCAGCACTGCTGATTCCGTTGAGGCTTCTGGCACGGCG
AATCCTGGTGAGCTGGTTTCGTCTGTTAACAGGACTAACACAGCTGCTGGTACAATGAAT
GGACTGAGTAGGCCTGTGCCGAGTAGGCCTTGGGACCAGCAACAAACCTATGGAAGCACT
TATGGTGGTGGTTATGGTTCAAACCTAGGTATGACCTCTGGGTATGGGTCTGGTACATAT
GGTTCAGGACTAGGTGGGTATGGTTCGTCATATGGGGGTGGAATGTATGGTGGTAGCAGC
ATGTATAATAGAGGAGGTTGTGGCGGTGGTGGTCTCTATGGGAGTTCAGGTATGTATGGT
GGTGGTGGGTGGGATGTACGGCAGTAGTTTTGGTGGGGGTTATGGTATGGGTATGGG

QA 1 537 1 537
DS 

RD RS1DA90JQ 685 0 0
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GACCTCTGGGTATGGGTCTGGTACATATGGTTCAGGACTAGGTGGGTATGGTTCGTCATA
TGGGGGTGGAATGTATGGTGGTAGCAGCATGTATAATAGAGGAGGTTGTGGCGGTGGTGG
TCTCTATGGGAGTTCAGGTATGTATGGTGGTGGTGG*TGGGATGTACGGCAGTAGTTTTG
GTGGGGGTTATGGTATGGGTATGGGGACAGGGATGGGTATGGGTATGGGGATGGGAATGG
GGATGAGTCCTTATGGTGGTCAAGATCCAAATGATCCTGCACCAGGTGGTGGCGGTGGTG
GTTGGGATAATGTATGGGGTAACTAAGTTGCTTCGTTTCTTTAAGCCAAGTCCTTCAACG
TTGCTCTGAATACACAAATGGTAATCAGTTTGGATATGAGTAGATTGTGCAGCGGCCTCC
TAAGCAGATTGGGTTGTTGTTGTACTAAAGCCTGATGTTTGTTTACAAATCGAGTCTCTT
CTTCCTCAGTGTTCTGGTTATTTGATAAAACAAGTTGCAGATATTTATGTCGAACTCAAT
AAAATGGTAAGTTAAGTTGTAAAAGAGTTTCTAAAAGACATATCTGTTGTGTATTCATTT
AATATTATTGGATTCTCTTCTTCTT

QA 1 685 1 685
DS 



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TATTCATTTAATATTATTGGATTCTCTTCTTCTTTTTT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AA29TF U 47
AF RS1GY51JQ C 1
BS 1 46 RS1GY51JQ
BS 47 68 RS1AA29TF
BS 69 69 RS1GY51JQ
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RD RS1AA29TF 283 0 0
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TTCACTAAACCAAATCCTTCAACGTTACTCTGAATACACAAATGGTAATCAGTTGGTTAT
GAGTAGATTGTGCAGCGGCCTCCTAAGCAGATTGGGTTGTTGTTGTACTAAAGCCTGATG
TTTGTTTACAAATCGAGTCTCTTCTTCCTCAGTGTTCTGGTTATGTGATAAAACAAGTTG
CAGATATTTATGTCGAACTCAATAAAATGGTAAGTTAAGTTGT

QA 1 283 1 283
DS 

RD RS1GY51JQ 398 0 0
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TGGCGGTGGTGGTTGGGATAATGTATGGGGTAACTAATTTGCTTCTTTCACTAAACCAGA
TCCTTCAACGTTACTCTGAATACACAAATGGTAATCAGTTGGTTATGAGTAGATTGTGCA
GCGGCCTCCTAAGCAGATTGGGTTGTTGTTGTACTAAAGCCTGATGTTTGTTTACAAATC
GAGTCTCTTCTTCCTCAGTGTTCTGGTTATGTGATAAAACAAGTTGCAGATATTTATGTC
GAACTCAATAAAATGGTAAGTTAAGTTGTAAAAGAGTTTTTAAAAGACATATCTGTTGTG
TATTCATTTAATATTATTGGATTCTCTTCTTCTTTTTT

QA 1 398 1 398
DS 



AS 1 6

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AGAAACAGTGAGAAGACGAAAAAAAACCACTATAAATCTCCCCGGAAGAAACAAACAGAA
AGAGAGAAGTATCAGATCCGAGAAAAAAATGTGTCTGGTGTGTTTATGCGATGATGAAGA
GACAGAGTTAGGAAGACAACAAGCACCTGGGTCATGTCCGTATTGTGGAGGTAAAGTTCA
AATGCTTGATGTCGAAAGAAAATGGATGTTTTGTTTCGTTCCCCTCTGTTTCAAGATCAA
GAGGAAGTATTTGTGTTCTTCTTGCGATCGTCGTCTCGTTTTGTATTATTAAAATAATAA
TATTGTTATAGTTAAAGTAGATTTATACTTTTAAAAAGTAGATTAATTAGCGTTTTAATC
AAGGGAAATAATTTTAGTCGGTGGCTTTTGGTACGATTTAGTATTATCCGTGTCGTGTAA
AACCGACATTGATCATTTAGAATTTAGAAGTCTCTCGATATGATGTTCAAATATGATGTA
CTTTCTCTTTTGTCAGGCATTCTCTTCTTAAGTCGGTCCAAAATTAATATTATATATAAT
GGTTCTTTTAAATGTAATGATAAATCTCTAGTTTGGTATACTTAATTCTGGCGATTTCCT
GTTCTGTATCATTACAATAGCATGTTCGAACCGTCAGTGTATATGATCTATTGTCTCTAT
CTTGCAA


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 

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GT

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TGTTATAGTTAAAGTAGATTTATACTTTTAAAAAGTAGATTAATTAGCGTTTTAATCAAG
GGAAATAATTTTAGTCGGTGGCTTTTGGTACGATTTAGTATTATCCGTGTCGTGTAAAAC
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TCTTTTAAATGTAATGATAAATCTCTAGTTTG
AC

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AAATAATCTTAGTCGGTGGCTTTTGGTACGATTTAGTATTATCCGTGTCGTGTAAAACCG
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TCTTTTGTCAGGCATTCTCTTCTTAAGTCGGTCCAAAATTAGTATTATATATAATGGTTC
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AA

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DS 



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GTTTCAACTACAACTCCAGCCGTACCTCCTGCTATAAATCCCTCAAAGAGAGTGCGGAAG
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GTATAGAGTAGAGGGAGGAACAGGTAGAGATAGCACAGAGTTCACTTTCTTCGGCTTTTT
CGATCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 

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AF RS1C733JQ U 1
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AF RS1C733TF C 521
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RD RS1A857JQ 429 0 0
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CAATAGGAA

QA 1 429 1 429
DS 

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ATCAACATAGAACTCACACAAAGGGGATCGGTTGAATGTCCAACAGTATCACCTTTCAAC
CATTTTTATAGTCCTCAAGAATAATGTGCAAGAAAACTCAATCCTCTTTCGATTCTTTAA
CCGTCTTGGGACGTCTCTCTGCAAGTGTTCTCTTCGTGCTCTCAAGGACACCAAAGAAGA
TTGAACCACCAATACCTATCCACAACACTCTTGGCCCTATACCCTTTAAGAGAGCAGAAG
CTCCTTCCTCTCTTACAATTGTTTGAACACAGTCAACTATTCCTTGATATTGTTTAGCTG
ATCCCTGAACCATTAATCTTGTCTTAATAACATCAAGCGGAGTGGTGACAGCTCCTGTCA
GAGCACCAGCAAATGCACCAATGAGAGCGTTCTCAGGATCATTAAGCTCTCTACGCGCTG
CTTTTTTATACCCCAAGCATAGCTGCTCATAAATGCAGAACTGAATAGCATCAAACGGCA
AATCTCTCAATAGGAAGGATCGGTATCCTGCATAGAGACCCCTAAAGCCC*TCTTGTGAT
GCAATAACTCGAACAGCGTTGGGAGCTGATGCAAACTGTCCAGTCTGCATTCTC*GCTTC
ACAACCTCT
GTAGGCACTCGAA

QA 1 669 1 669
DS 

RD RS1C733JQ 752 0 0
ACGCTATCAACATTTAATAACATCGAATTTGATATTTTGCCACTTTATTTTATCTGGGGA
AAGAAAGTTGAAATGATCATGATTCACAGTCTGATCA*CATAGAACTCACACAAAGGGGC
TCGGTTGAATGTCCAACAGTATCACCTTTCAACCATTTTTATAGTCCTCAAGAATAGTGT
GCAAGAAA*CTCGATCCTCTTTCGATTCTTTAACCGTCTTGGGACGTCTCTCTGCAAGTG
TTCTCTTCGTGCTCTCAAGGACACCAAAGAAGATTGAACCACCAATACCTATCCACAACA
CTCTTGGCCCTATACCCTTTAAGAGAGCAGAAGCTCCTTCCTCTCTTACAATTGTTTGAA
CACAGTCTACTATTCCTTGATATTGTTTAGCTGATCCCTGAACCATTAATCTTGTCTTAA
TAACATCAAGCGGAGTGGTGACAGCTCCTGTCAGAGCACCAGCAAATGCACCAATGAGAG
CGTTCTCAGGATCATTAAGCTCTCTACGCGCTGTTTTTTTATACCCCAAGCATAGCTGCT
CATAAATGCAGAACTGAATAGCATCAAACGGCAAATCTCTCAATAGGAAGGATCGGTATC
CTGCATAGAGACCCCTGAAGCCC*TCTTGTGATGCAATAACTCGAACAGCGTTGGGAGCT
GATGCAAACTGTCCAGTCTGCATTCTCTGCTTCACAACCTCT**AGGCACTCGAATCAGA
GAGGCAGCAAGTCCACCGATAGCCCCTGCAGT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RS1A857TF 652 0 0
ATAGAGACCCCTGAAGCCCCTCTTGTGGTGCAATAACTCGAACAGCGTTGGGAGCTGATG
CAAACTGTCCAGTCTGCATTCTCTGCTTCACAACCTCTGTAGGCACTCGAATCAGAGAGG
CAGCAAGTCCACCGATAGCCCCTGCAGTCAAGTGAGCAACTGCGCTTAAATGATCAGGAA
AGGTCTTAAGCAGTTTCTGCTTTGTGGGTTCATAAACTCCCACAAATAAAGCCGAAGCCG
GTAAGACACCAGCGATATTTCCAGCTAATCCTGAATAGAGACCCTTCAACACAATCTTCC
CACCTCCACGAGCTGCCTGAAGTCTAGTCTTTATAGTATCAATAGGGTATAAAGCTGTTT
CAACTACAACTCCAGCCGTACCTCCTGCTATAAATCCCTCAAAGAGAGTGCGGAAGAAAT
CAAAAGGGTTTTCGTTTTGCGTACTGACTGAAGCAAAGCCTTTGCTCTTTTTGATCTGTG
GAATCTGCACTACCCTACTCGAAACGTCGGGAGCAGTGGATGAAGAGCTCTTCACATCAA
CAGAGAGTGTAAGGGGAGCCATCAGAAGCTTCTCTAACCTAACGGAGGAGGAGTAGGTAT
AGAGTAGAGGGAGGAACAGGTAGAGATAGCACAGAGTTCACTTTCTTCGGC
C

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1C733TF 746 0 0
ATACCCCAAGCATAGCTGCTCATAAATGCAGAACTGAATAGCATCAAACGGCAAATCTCT
CAATAGGAAGGATCGGTATC*TGCATAGAGACCCCTGAAGCCC*TCTTGTGATGCAATAA
CTCGAACAGCGTTGGGAGCTGATGCAAACTGTCCAGTCTGCATTCTCTGCTTCACAACCT
CT**AGGCACTCGAATCAGAGAGGCAGCAAGTCCACCGATAGCCCCTGCAGTCAAGTGAG
CAACTGCGCTTAAATGATCAGGAAAGGTCTTAAGCAGTTTCTGCTTTGTGGGTTCATAAA
CTCCCACAAATAAAGCCGAAGCCGGTAAGACACCAGCGATATTTCCAGCTAATCCTGAAT
AGAGGCCCTTCAACACAATCTTCCCACCTCCACGAGCTGCCTGAAGTCTAGTCTTTATAG
TATCAATAGGGTATAAAGCTGTTTCAACTACAACTCCAGCCGTACCTCCTGCTATAAATC
CCTCAAAGAGAGTGCGGAAGAAATCAAAAGGGTTTTCGTTTTGCGTACTGACTGAAGCAA
AGCCTTTGCTCTTTTTGATCTGTGGAATCTGCACTACCCTACTCGAAACATCGGGAGCAG
TGGATGAAGAGCTCTTCACATCAACAGAGAGTGTAAGGGGAGCCATCAGAAGCTTCTCTA
ACC****GGAGGAGGAGTAGGTATAGAGTAGAGGGAGGAACAGGTAGAGATAGCACAGAG
TTCACTTTCTTCGGCTTTTTCGATCC

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 5

CO CL1202Contig1 1075 5 18 U
TATAAACTAGTGGAAATTCGTGTACGTCTGTCTTTTTGGAGAAGCTCCAGATTAATACAC
CGACCAATCAAATGGAAATGTCTCCAAGTTTTATTACATCTTAGGGCTAGGCTCCAAGTT
CATCTCTTGAAGGTTAAGCAAGAGATCGTTGGAGCTCAGGTAAACCTTGTTAGCCGATTG
AGCAATGGTCTGGGCAATCTCTCTCGCAGCTTCAATCTTTCTCAGAGTTATGAATGCCTG
ATTGTTTGCAATTGCTTGTCCGATAAGTTGAGCACTCTTAGCTTCTCCCTGTGCACGGAT
AACCGCACTTCTCTTGTCTTGCTCTGCTTTCTCCACAATGAACTTAGCACGCTCAGCTTC
CTGTGCAGCCACTTGTTTAGCTTCGATTGCTGCGGTGAACTCTTTGCCAAATGTGAGAGT
CGTGATGGAGACATCATCGAGAGCAATGTCGAAGTTGGAAGCTCTCTCAGTCAAAATCTT
GCGTATCTCTCTGCTCACAGCTTCTCTCTGAGTGATGAGCTGGCTTGCATTGTACTGAGC
AACAATAGCTTTTAGAGTTTCATGGATGATGGAAGGAAGAACCCTTTCACTGTAATTCTC
GCCCAGGGTTCGGTAAATATGAGGCAAACGGTCACCCATGGGACGTGTCAGAACCCTAAG
TCCAATTTTCACCATCTGAAGGTCATGACTACC*GGTGGTGCTCTCCACAAGATAGGGTC
GTGCACGGACGTCATAGATGATTGGCCTTTCAAACCATGGCAACATGAAATGCGTGCCTT
CCGGGTACACCTTTTCCTTGATACCAGTTAAGCGGTTGAACATGACAGCACGGTGTCCAC
CCTCGACATTGTAGAGGCTATTACTAATAGCGTAGACACCGAGCCCACCAATGACGCTGA
CCTTAAGAAGCGCAGAGAGAGCTGGTGATCCAGGGACGTTGGGCACTTTGTTGAAACTCA
TTTCTGTAAGACCTTAGCTCAGGCTCTTAATCACCGGCGATGTTAGGGGATCACGATCAG
AGGCAGTCGGCAAAGCTTAGGGTTTTAGAACTGAGAATTGACTAATGAACTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D820JQ U 1
AF RS1A978JQ U 75
AF RS1AQ28JQ U 39
AF RS1A978TF C 242
AF RS1AQ28TFB C 242
BS 1 42 RS1D820JQ
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BS 1047 1075 RS1AQ28TFB

RD RS1D820JQ 647 0 0
TATAAACTAGTGGAAATTCGTGTACGTCTGTCTTTTTGGAGATGCTCCAGATTAATACAC
CGACCAATCAAATGGAAATGTCTCCAAGTTTTATTACATCTTAGGGCTAGGCTCCAAGTT
CATCTCTTGAAGGTTAAGCAAGAAATCGTTGGAGCTCAGGTAAACCTTGTTAGCCGATTG
AGCAATGGTCTGGGCAATCTCTCTCGCAGCTTCAATCTTTCTCAAAGTTATGAATGCCTG
ATTGTTTGCAATTGCTTGTCCGATAAGTTGAGCACTCTTAGCTTCTCCCTGTGCACGGAT
AACCGCACTTCTCTTGTCTTGCTCTGCTTTCTCCACAATGAACTTAGCACGCTCAGCTTC
CT*TGCAGCCACTTGTTTAGCTTCGATTGCTGCGGTGAACTCTTTGCCAAATGTGAGAGT
CGTGATGGAGACATCATCGAGAGCAATGTCGAAGTTGGAAGCTCTCTCAATCAAAATCTT
GCGTATCTCTCTGCTCACAGCTTCTCTCTGAGTGATGAGCTGGCTTGCATTGTACTGAGC
AACAATAGCTTTTAGAGTTTCATGGATGATGGAAGGAAGAACCCTTTCACTGTAATTCTC
GCCCAGGGTTCGGTAAATATGAGGCAAACGGTCACCCATGGGACGTG

QA 1 647 1 647
DS 

RD RS1A978JQ 644 0 0
GAAAAGTCTCCAAGTTTTATTACATCTTAGGGCTAGGCTCCAAGTTCATCTCTTGAAGGT
TAAGCAAGAGATCGTTGGAGCTCAGGTAAACCTTGTTAGCCGATTGAGCAATGGTCTGGG
CAATCTCTCTCGCAGCTTCAATCTTTCTCAGAGTTATGAATGCCTGATTGTTTGCAATTG
CTTGTCCGATAAGTTGAGCACTCTTAGCTTCTCCCTGTGCACGGATAACCGCACTTCTCT
TGTCTTGCTCTGCTTTCTCCACAATGAACTTAGCACGCTCAGCTTCCTGTGCAGCCACTT
GTTTAGCTTCGATTGCTGCGGTGAACTCTTTGCCAAATGTGAGAGTCGTGATGGAGACAT
CATCGAGAGCAATGTCGAAGTTGGAAGCTCTCTCAGTCAAAATCTTGCGTATCTCTCTGC
TCACAGCTTCTCACTGAGTGATGAGCTGGCTTGCATTGTACTGAGCAACAATAGCTTTTA
AAGTTTCATGGATGATGGAAGGAAGAACCCTTTCACTGTAATTCTCGCCCAGGGTTCGGT
AAATATGAGGCAAACGGTCACCCATGGGACGTGTCAGAACCCTAAGTCCAATTTTCACCA
TCTGAAGGTCATGACTGCC*GGTGGTGCTCTCCACAAGATAGGG

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1AQ28JQ 846 0 0
GAGAAGCTCGAGATTAATACATCGACCAATCAAATGGAAATGTCTCCAAGTTTTATTACA
TCTTAGGACTAGGCTCCAAGTTCATCTCTTGAAGGTTAAGCAAGAGATCGTTGGAGCTCA
GGTAAACCTTGTTAGCCGATTGTGCAATGGTCTGGGCAATCTCTCTCGCAGCTTCAATCT
TTCTCAGAGTTATGAATGCCTGATTGTTTGCAATTGCTTGTCCGATAAGTTGAGCACTCT
TAGCTTCTCCCTGTGCACGGATAACCGCACTTCTCTTGTCTTGCTCTGCTTTCTCCACAA
TGAACTTAGCACGCTCAGCTTCCTGTGCAGCCACTTGTTTAGCTTCGATTGCAGCGGTGA
ACTCTTTGCCAAATGTGAGAGTCGTGATGGAGACATCATCGAGAGCAATGTCGAAGTTAG
AAGCTCTCTCAGTCAAAATCTTGCGTATCTCTCTGCTCACAGCTTCTCTCTGAGTGATGA
GCTGGCTTGCATTGTACTGAGCTACAATAGCTTTTAGAGTTTCATGGATGATGGAAGGAA
GAATCCTTTCACTGTAATTCTCGCCCAGGGTTCGGTAAATATGAGACAAACGGTCACCCA
TGGGACGTGTCAGAACCCTAAGTCCAATTTTCACCATCTGAAGGTCATGACTACCCGGTG
GTGCTCTCCACAAGATAGGGTCGTGCACGGACGTCATAGATGATTGGCCTTTCAAACCAT
GGCAACATGAAATGCGTGCCTTCCGGGTACACCTTTTCCTTGATACCAGTTAAGCGGTTG
AACATGACAGCACGGTGTCCACCCTCGACATTGTAGAGGCTATTACTAATAGCGTAGACA
CCGAGC

QA 1 846 1 846
DS 

RD RS1A978TF 807 0 0
TTGTTTGCAATTGCTTGTCCGATAAGTTGAGCACTCTTAGCTTCTCCCTGTGCACGGATA
ACCGCACTTCTCTTGTCTTGCTCTGCTTTCTCCACAATGAACTTAGCACGCTCAGCTTCC
TGTGCAGCCACTTGTTTAGCTTCGATTGCTGCGGTGAACTCTTTGCCAAATGTGAGAGTC
GTGATGGAGACATCATCGAGAGCAATGTCGAAGTTGGAAGCTCTCTCAGTCAAAATCTTG
CGTATCTCTCTGCTCACAGCTTCTCACTGAGTGATGAGCTGGCTTGCATTGTACTGAGCA
ACAATAGCTTTTAGAGTTTCATGGATGATGGAAGGAAGAACCCTTTCACTGTAATTCTCG
CCCAGGGTTCGGTAAATATGAGGCAAACGGTCACCCATGGGACGTGTCAGAACCCTAAGT
CCAATTTTCACCATCTGAAGGTCATGACTGCC*GGTGGTGCTCTCCACAAGATAGGGTCG
TGCACGGACGTCATAGATGATTGGCCTTTCAAACCACGGCAACATGAAATGCGTGCCTTC
CGGGTACACCTTTTCCTTGATACCAGTTAAGCGGTTGAACATGACAGCACGGTGTCCACC
CTCGACATTGTAGAGGCTATTACTAATAGCGTAGACACCGAGCCCACCAATGACGCTGAC
CTTAAGAAGCGCAGAGAGAGCTGGTGATCCAGGGACGTTGGGCACTTTGTTGAAACTCAT
TTCTGTAAGATCTTAGCTCAGGCTCTTAATCACCGGCGATGTTAGGGGATCACGATCAGA
GGCAGTCGGCAAAGCTTAGGGTTTT
CC

QA 1 805 1 805
DS 

RD RS1AQ28TFB 834 0 0
TTGTTTGCAATTGCTTGTCCGATAAGTTGAGCACTCTTAGCTTCTCCCTGTGCACGGATA
ACCGCACTTCTCTTGTCTTGCTCTGCTTTCTCCACAATGAACTTAGCACGCTCAGCTTCC
TGTGCAGCCACTTGTTTAGCTTCGATTGCAGCGGTGAACTCTTTGCCAAATGTGAGAGTC
GTGATGGAGACATCATCGAGAGCAATGTCGAAGTTAGAAGCTCTCTCAGTCAAAATCTTG
CGTATCTCTCTGCTCACAGCTTCTCTCTGAGTGATGAGCTGGCTTGCATTGTACTGAGCT
ACAATAGCTTTTAGAGTTTCATGGATGATGGAAGGAAGAATCCTTTCACTGTAATTCTCG
CCCAGGGTTCGGTAAATATGAGACAAACGGTCACCCATGGGACGTGTCAGAACCCTAAGT
CCAATTTTCACCATCTGAAGGTCATGACTACC*GGTGGTGCTCTCCACAAGATAGGGTCG
TGCACGGACGTCATAGATGATTGGCCTTTCAAACCATGGCAACATGAAATGCGTGCCTTC
CGGGTACACCTTTTCCTTGATACCAGTTAAGCGGTTGAACATGACAGCACGGTGTCCACC
CTCGACATTGTAGAGGCTATTACTAATAGCGTAGACACCGAGCCCACCAATTACGCTGAC
CTTAAGAAGCGCAGAGAGAGCTGGTGATCCAGGGACGTTGGGCACTTTGTTGAAACTCAT
TTCTTTAAGACCTTAGCTCAGGCTCTTAATCACCGGCGATGTTAGGGGATCACGGTCAGA
GGTAGTCGGCAAAGCTTAGGGTTTTAGAACTGAGAATTGACTAATGAACTTCCC

QA 1 834 1 834
DS 



AS 1 6

CO CL1203Contig1 895 6 20 U
AACAATCTCTAGAGCTACAATACCAAAGCTGTACACATCAACTTTATCTGTCAAATGGCC
ACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGGGATCTTTCTTTCTCTAGTCGAAGAC
GACGAATCGATATTTCTCTCGCAAATCTAGATTGTTCGCGTG***GAGAGAGGAAGACGG
CGATGGGAAGTGGGCGAGAAGTCAGCGTGTCGCTAGATGGAGTCAGAGACAAAAACATGA
TGCAGCTTAAGAAACTCAACACTGTGCTCTTCCCGGTTCGCTACAACGACAAGTACTACG
CTGATGCGATTGCATCCGGCGAGTTCACTAAGCTTGCTTATTACAGTGATATATGTGTTG
GAGCTATTGCTTGTCGGCTGGAGAAGAAAGAAGGCGGGGCCATGAGAGTGTATATAATGA
CACTTGGTGTTCTTGCACCATACCGCGGCATTGGCATTGGTTCAAAGCTACTGAATCATG
TTCTTGAGATGTGCTCCAAGCAGAACATGTCGGAAATATACTTGCATGTTCAGACAAACA
ACGAAGATGCGATCAAGTTCTACAAGAAATTTGGTTTTGAGATCACAGATACCATACAAG
ACTATTACGTCAACATCGAGCCTAGAGATTGCTATGTTGTCACCAAGTCCTTTGCTCAAT
CTGAAGCCAGCAAATGATGACAATACGTTACTTCGGGAAGCCATTCTTTCCCGCCAGTTT
*GTTTGTTTCACTGAAGATTCCATT*CTTGAAGTTCTGATGTTTTGGTTTCGTGAGTTTT
ACTTGTTTTGATGACCCCAAAGTTATAGATACATGGTTGTCTAGTGACCCCTTGGTTTTG
GACCTCTTAGTTGGGGAGGTGTTAACTTTGCAGCTCTCAACCATTATTACAACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1C877TF U 94
AF RS1AE79TF U 94
AF RS1FB56JQ C 94
AF RS1FB56TF U 94
AF RS1AJ52JQ C 1
AF RS1C877JQ C 116
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RD RS1C877TF 692 0 0
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ATGTTGTCACCAAGTCCTTTGCTCAATCTGAAGCCAGCAAATGATGACAATACGTTACTT
CGGGAAGCCATTCTTTCC*GCCAGTTG***TTGTTTCACTGAAGATTC*ATT*CTTGAAG
T*CTGATGTTT*GGTTTCGTGAGTTT
ACTGTT

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GCGGGGCCATGAGAGTGTATATAATGACACTTGTTGTTCTTGCACCATACCGCGGCATTG
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ATGTTGTCACCAAGTCCTTTGCTCAATCTGAAGCCAGCAAATGATGACAATACGTTACTT
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GGACTCTAGTTGG

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TGGACCTC

QA 1 745 1 745
DS 

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GTTCGCGTG***GAGAGAGGAAGACGGCGATGGGAAGTGGGCGAGAAGTCAGCGTGTCGC
TAGATGGAGTCAGAGACAAAAACATGATGCAGCTTAAGAAACTCAACACTGTGCTCTTCC
CGGTTCGCTACAACGACAAGTACTACGCTGATGCGATTGCATCCGGCGAGTTCACTAAGC
TTGCTTATTACAGTGATATATGTGTTGGAGCTATTGCTTGTCGGCTGGAGAAGAAAGAAG
GCGGGGCCATGAGAGTGTATATAATGACACTTGGTGTTCTTGCACCATACCGCGGCATTG
GCATTGGTTCAAAGCTACTGAATCATGTTCTTGAGATGTGCTCCAAGCAGAACATGTCGG
AAATATACTTGCATGTTCAGACAAACAACGAAGATGCGATCAAGTTCTACAAGAAATTTG
GTTTTGAGATCACAGATACCATACAAGACTATTACGTCAACATCGAGCCTAGAGATTGCT
ATGTTGTCACCAAGTCCTTTGCTCAATCTGAAGCCAGCAAATGATGACAATACGTTACTT
CGGGAAGCCATTCTTTCCCGCCAGTTT*GTTTGTTTCACTGAAGATTCCATT*CTTGAAG
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TGGTTGTCTAGTGACCCCT

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DS 

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CGATGGGAAGTGGGCGAGAAGTCAGCGTGTCGCTAGATGGAGTCAGAGACAAAAACATGA
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CTGAAGCCAGCAAATGATGACAATACGTTACTTCGGGAAGCCATTCTTTCCCGCCAGTTT
*GTTTGTTTCACTGAAGATTCCATT*CTTGAAGTTCTGATGTTTTGGTTTCGTGAGTTTT
ACTTGTTTTGATGACCCCAAAGTTATAGATACATGGTTGTCTAGTGACCCCTTGGTTTTG
GACCTCTTAGTTGGGGAGGTGTTAACTTTGCAGCTCTCAACCATTATTACAACTC

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DS 

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AATGACACTTGGTGTTCTTGCACCATACCGCGGCATTGGCATTGGTTCAAAGCTACTGAA
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GTTTTACTTGTTTTGATGACCCCAAAGTTATAGATACATGGTTGTCTAGTGACCCCTTGG
TTTTGGACCTCTTAGTTGGGGAGGTGTTAACTTTGCAGCTCTCAATCATTATTACAAC
AC

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 6

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TCTTGAAGGTTTGTTTCTTGTTCTCAGTCGCAGCAGCAGCAGCAACTTGTGGTGTTTCTT
GTTGAGGATCTTCAGGTAAAATGGTGTGAAAAAACTTTTTAGAGGAACCAACTTGGTTGC
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TGCTGTTTATTCCACTAACCCCAGCTTCCTGAGCGCGGAGCCAAGTGTTGGGAACGGAGA
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TTCTCAGATTTCGTTCGGCCGCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EZ28JQ U 1
AF RS1B290TF C 5
AF RS1AZ35TF C 281
AF RS1CW15JQ U 5
AF RS1AZ35JQ U 6
AF RS1CW15TF C 15
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BS 646 657 RS1AZ35JQ
BS 658 683 RS1CW15TF

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AACCAGATCAAAACAAGACAGAAACCCCTATGTAGACAGTACAGAAAAAAAAACACACAC
AGCAGACTGTGGCCCCCACAGAGATTATGTGAAAGACCATATCCATTTATTTGCTTCTTC
TCTTGAAGGTTTGTTTCTTGTTCTCAGTCGCAGTAGCAGCAGCAACTTGTGGTGTTTCTT
GTTGAGGATCTTCAGGTAAAATGGTGTGAAAAAACTTTTTAGAGGAACCAACTTGGTTGC
AGATTAACTTGAGCATCTTCCTCCCCCTCATCCATTTCAGCAACAGCTTCATATGAGTTT
TGCTGTTTATTCCACTAACCCCAGCTTCCTGAGCGCGGAGCCAAGTGTTGGGAACGGAGA
GAGGACCATGTTTCTTGAAAACATCGTAAAGAGAAGTGGAAATGATGTGAGCTTCTTGGA
TCGAAACCTTTGGGTTTATCTTTCGGACGTTAACAGCTCGTTCTCTCGACATGTATCTCA
CAAACAGAGAGTTATAGCTCATCTCAGTCTCTAAAACAGCTGCGGAGGCTCTACACAGCT
TCCTTAGTCCTCCTCCTCCTCCGCCGGTGAACCACATTCTCTC

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DS 

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CA
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ATCAAAACAAGACAGAAACCCCTATGTAGACAGTACAGAAAAAAAAACACACACAGCAGA
CTGTGGCCCCCACAGAGATTATGTGAAAGACCATATCCACTTATTTGCTTCTTCTCTTGA
AGGTTTGTTTCTTGTTCTCAGTCGCAGCAGCAGCAGCAACTTGTGGTGTTTCTTGTTGAG
GATCTTCAGGTAAAATGGTGTGAAAAAACTTTTTAGAGGAACCAACTTGGTTGCAGATTA
ACTTGAGCATCTTCCTCCCTCTCATCCATTTCAGCAACAGCTTCATATGAGTTTTGCTGT
TTATTCCACTAACCCCAGCTTCCTGAGCGCGGAGCCAAGTGTTGGGAACGGAGAGAGGAC
CATGTTTCTTGAAGACATCGTAGAGAGAAGTGGAGATGATGTGAGCTTCTTGGATCGAAA
CCTTTGGGTTTATCTTTCGGACGTTAACAGCTCGTTCTCTCGACATGTATCTCACAAACA
GAGAGTTATAGCTCATCTCAGTCTCTAAAACAGCTGCGGAGGCTCTACACAGCTTCCTTA
GTCCTCCTCCTCCTCCGCCGGTGAACCACATTCTCTCTCTTCCTCGCCGTC
ACC

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DS 

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CCAAGTGTTGGGAACGGAGAGAGGACCATGTTTCTTGAAGACATCGTAGAGAGAAGTGGA
GATGATGTGAGCTTCTTGGATCGAAACCTTTGGGTTTATCTTTCGGACGTTAACAGCTCG
TTCTCTCGACATGTATCTCACAAACAGAGAGTTATAGCTCATCTCAGTCTCTAAAACAGC
TGCGGAGGCTCTACACAGCTTCCTTAGTCCTCCTCCTCCTCCGCCGGT

QA 1 348 1 348
DS 

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CA
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ATCAAAACAAGAAAGAAACCCCTATGTAGGCAGTACAGAAAAAAAA*CACACACAGCAAA
CTGTGGCCCCCACAGAGATTATGTGAAAGACCATATCCATTTATTTGCTTCTTCTCTTGA
AGGTTTGTTTCTTGTTCTCAGTCGCAGCAGCAGCAGCAACTTGTGGTGTTTCTTGTTGAG
GATCTTCAGGTAAAATGGTGTGAAAAAACTTTTTAGAGGAACCAACTTGGTTGCAGATTA
ACTTGAGCATCTTCCTCCCTCTCATCCATTTCAGCAACAGCTCCATATGAGTTTTGCTGT
TTATTCCACTAACCCCAGCTTCCTGAGCGCGGAGCCAAGTGTTGGGAACGGAAAGAGGAC
CATGTTTCTTGAAAACATCGTAAAAAGAAGTGGAAATGATGTGAGCTTCTTGGATCGAAA
CCTTTGGGTTTATCTTTCGGACGTTAACAGCTCGTTCTCTCGACATGTATCTCACAAACA
GAGAGTTATAGCTCATCTCAGTCTCTAAAACAGCTGCGGAGGCTCTACACAGCTTCCTTA
GTCCTCCTCCTCCTCCGCCGGTGAACCACATTCTCTCTC

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DS 

RD RS1AZ35JQ 654 0 0
C
AAAGGAGCTTAGCAAGAATTATACCAGAAACTATAATGTTTTCCCTGGGACTAAAACCAG
ATCAAAACAAGACAGAAACCCCTATGTAGACAGTACAGAAAAAAAAACACACACAGCAGA
CTGTGGCCCCCACAGAGATTATGTGAAAGACCATATCCATCTATTTGCTTCTTCTCTTGA
AGGTTTGTTTCTTGTTCTCAGTCGCAGCAGCAGCAGCAACTTGTGGTGTTTCTTGTTGAG
GATCTTCAGGTAAAATGGTGTGAAAAAACTTTTTAGAGGAACCAACTTGGTTGCAGATTA
ACTTGAGCATCTTCCTCCCTCTCATCCATTTCAGCAACAGCTTCATATGAGTTTTGCTGT
TTATTCCACTAACCCCAGCTTCCTGAGCGCGGAGCCAAGTGTTGGGAACGGAGAGAGGAC
CATGTTTCTTGAAGACATCGTAAAGAGAAGTGGAGATGATGTGAGCTTCTTGGATCGAAA
CCTTTGGGTTTATCTTTCGGACGTTAACAGCTCGTTCTCTCGACATGTATCTCACAAACA
GAGAGTTATAGCTCATCTCAGTCTCTAAAACAGCTGCGGAGGCTCTACACAGCTTCCTTA
GTCCTCCTCCTCCTCCGCCGGTGAACCACATTCTCTCTCTTCCTCGCCGTC
CC

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DS 

RD RS1CW15TF 669 0 0
TTAGCAAGAATTATACCAGAAACTATAATGTTTTCCCTGGGACTAAAACCAGATCAAAAC
AAGAAAGAAACCCCTATGTAGGCAGTACAGAAAAAAAA*CACACACAGCAGACTGTGGCC
CCCACAGAGATTATGTGAAAGACCATATCCATTTATTTGCTTCTTCTCTTGAAGGTTTGT
TTCTTGTTCTCAGTCGCAGCAGCAGCAGCAACTTGTGGTGTTTCTTGTTGAGGATCTTCA
GGTAAAATGGTGTGAAAAAACTTTTTAGAGGAACCAACTTGGTTGCAGATTAACTTGAGC
ATCTTCCTCCCTCTCATCCATTTCAGCAACAGCTCCATATGAGTTTTGCTGTTTATTCCA
CTAACCCCAGCTTCCTGAGCGCGGAGCCAAGTGTTGGGAACGGAGAGAGGACCATGTTTC
TTGAAGACATCGTAGAGAGAAGTGGAGATGATGTGAGCTTCTTGGATCGAAACCTTTGGG
TTTATCTTTCGGACGTTAACAGCTCGTTCTCTCGACATGTATCTCACAAACAGAGAGTTA
TAGCTCATCTCAGTCTCTAAAACAGCTGCGGAGGCTCTACACAGCTTCCTTAGTCCTCCT
CCTCCTCCGCCGGTGAACCACATTCTCTCTCTTCCTCGCCGTCACTTTCTCAGATTTCGT
TCGGCCGCC

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 4

CO CL1205Contig1 1237 4 9 U
GAGTAAAGGCATCTCTCTTATAAAATTACAATAATTGAACCCTCTCTCTTCATCTTCTCC
GATTGCAACTTGAATCACTCACTACTCGTAGAGAAGAAAGGGATCGCCTTTCATCAACTC
TCTGTGTCGTTATCTCGATTTCGTGACAAAGTTTTGCCTCAGGGTTGATTGCATTTGAGT
CTTGAAAAGGAATTGGCTCGTCTTCCTGTTTATCTGAGCCTGAGGAGAAGAACTTTCTGC
GGAGTGTCCTTTTGCACTTATTATTCTCCATGGGAAGTAATGAGAATCTACCACCCAATG
TTATCAGGCAGCTCGCCAAGGAACTCAAGAGTCTTGACGAGTCTCCTCCAGAAGGCATCA
AGGTTGTTGTCAATGACGAGGATTTCTCTCAGATTTGTGCTGACATTGAAGGACCAGTTG
GGACTCCTTATGAGAATGGACTTTTCCGTATGAAGTTAGCACTGTCTCATGATTTTCCAC
ATTCCCCACCTAAAGGCTACTTCATGACAAAGATATTCCATCCCAATATTGCTTCTAATG
GAGAGATCTGCGTTAACACGCTTAAGAAAGATTGGAATCCTAGTCTTGGATTAAGACATG
TCCTCTCTGTTGTGAGGTGCTTACTGATCGAGCCGTTTCCAGAATCTGCATTAAACGAAC
AGGCTGGGAAGATGCTACTTGAGAACTATGAAGAGTATGCTAGGCATGCTCGGCTTTACA
CGGGTATCCATGCTAAACCGAAACCTAAGTTCAAGACAGGAGCTATCTCAGAGTCAACGA
CGGCTCTAAACGTTGGCCAGACTAACAACGAGACGCCTGGTGCTACTGCTTCTGCAGTAC
CCTCTTCAGTGGCAGACATCAACAGAGTAACAACAACAACGAGTGGCCAAGACCAACAAG
AAGTGGCTAACAATTCTGTAGCAGCAGCAGGTTCTGCGAGTGTGGTCACTACGACACAGA
AAAGGGAAGCCGGTTTGGCCAAGGTTCAGGCAGACAAGAAGAAGGTAGACGCCAGAAAGA
AGAGCTTGAGGAGACTGTGATGGTGCTACTTTTCAAGAGCTATTATAGGCTTTTATGTAA
TCAGGATGTCTGGTTATGTTGATTTGTTGGTCTATATAATCACTCTTTTGTAATCGGTTT
ACAGTAACCAGGCTTGAGATATTCCTTGGTATAATTTACTGCGACCAATAAACTGGTTAT
TACTTTTAAATTGTACCAAATCTATGGGTTAACTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G857TF U 1
AF RS1EK73TF U 50
AF RS1G857JQ C 650
AF RS1EK73JQ C 553
BS 1 238 RS1G857TF
BS 239 239 RS1EK73TF
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BS 935 1237 RS1EK73JQ

RD RS1G857TF 576 0 0
GAGTAAAGGCATCTCTCTTATAAAATTACAATAATTGAACCCTCTCTCTTCATCTTCTCC
GATTGCAACTTGAATCACTCACTACTCGTAGAGAAGAAAGGGATCGCCTTTCATCAACTC
TCTGTGTCGTTATCTCGATTTCGTGACAAAGTTTTGCCTCAGGGTTGATTGCATTTGAGT
CTTGAAAAGGAATTGGCTCGTCTTCCTGTTTATCTGAGCCTGAGGAGAAGAACTTTCT*C
GGAGTGTCCTTTTGCACTTATTATTCTCCATGGGAAGTAATGAGAATCTACCACCCAATG
TTATCAGGCAGCTCGCCAAGGAACTCAAGAGTCTTGACGAGTCTCCTCCAGAAGGCATCA
AGGTTGTTGTCAATGACGAGGATTTCTCTCAGATTTGTGCTGACATTGAAGGACCAGTTG
GGACTCCTTATGAGAATGGACTTTTCCGTATGAAGTTAGCACTGTCTCATGATTTTCCAC
ATTCCCCACCTAAAGGCTACTTCATGACAAAGATATTCCATCCCAATATTGCTTCTAATG
GAGAGATCTGCGTTAACACGCTTAAGAAAGATTGGA

QA 1 576 1 576
DS 

RD RS1EK73TF 686 0 0
GG
ATCTTCTCCGATTGCAACTTGAATCACTCACTACTCGTAGAGAAGAAAGGGATCGCCTTT
CATCAACTCTCTGTGTCGTTATCTCGATTTCGTGACAAAGTTTTGCCTCAGGGTTGATTG
CATTTGAGTCTTGAAAAGGAATTGGCTCGTCTTCCTGTTTATCTGAGCCTGAGGAGAAGA
ACTTTCTGCGGAGTGTCCTTTTGCACTTATTATTCTCCATGGGAAGTAATGAGAATCTAC
CACCCAATGTTATCAGGCAGCTCGCCAAGGAACTCAAGAGTCTTGACGAGTCTCCTCCAG
AAGGCATCAAGGTTGTTGTCAATGACGAGGATTTCTCTCAGATTTGTGCTGACATTGAAG
GACCAGTTGGGACTCCTTATGAGAATGGACTTTTCCGTATGAAGTTAGCACTGTCTCATG
ATTTTCCACATTCCCCACCTAAAGGCTACTTCATGACAAAGATATTCCATCCCAATATTG
CTTCTAATGGAGAGATCTGCGTTAACACGCTTAAGAAAGATTGGAATCCTAGTCTTGGAT
TAAGACATGTCCTCTCTGTTGTGAGGTGCTTACTGATCGAGCCGTTTCCAGAATCTGCAT
TAAACGAACAGGCTGGGAAGATGCTACTTGAGAACTATGAAGAGTATGCTAGGCATGCTC
GGCTTTACACGGGTATCCATGCTA

QA 3 686 3 686
DS 

RD RS1G857JQ 516 0 0
ATTAAACGAACAGGCTGGGAAGATGCTACTTGAGAACTATGAAGAGTATGCTAGGCATGC
TCGGCTTTACACGGGTATCCATGCTAAACCGAAACCTAAGTTCAAGACAGGAGCTATCTC
AGAGTCAACGACGGCTCTAAACGTTGGCCAGACTAACAACGAGACGCCTGGTGCTACTGC
TTCTGCAGTACCCTCTTCAGTGGCAGACATCAACAGAGTAACAACAACAACGAGTGGCCA
AGACCAACAAGAAGTGGCTAACAATTCTGTAGCAGCAGCAGGTTCTGCGAGTGTGGTCAC
TACGACACAGAAAAGGGAAGCCGGTTTGGCCAAGGTTCAGGCAGACAAGAAGAAGGTAGA
CGCCAGAAAGAAGAGCTTGAGGAGACTGTGATGGTGCTACTTTTCAAGAGCTATTATAGG
CTTTTATGTAATCAGGATGTCTGGTTATGTTGATTTGTTGGTCTATATAATCACTCTTTT
GTAATCGGTTTACAGTAACC
GAACCAGGCTTGAGAT

QA 1 500 1 500
DS 

RD RS1EK73JQ 685 0 0
TTAACACGCTTAAGAAAGATTGGAATCCTAGTCTTGGATTAAGACATGTCCTCTCTGTTG
TGAGGTGCTTACTGATCGAGCCGTTTCCAGAATCTGCATTAAACGAACAGGCTGGGAAGA
TGCTACTTGAGAACTATGAAGAGTATGCTAGGCATGCTCGGCTTTACACGGGTATCCATG
CTAAACCGAAACCTAAGTTCAAGACAGGAGCTATCTCAGAGTCAACGACGGCTCTAAACG
TTGGCCAGACTAACAACGAGACGCCTGGTGCTACTGCTTTTGCAGTACCCTCTTCAGTGG
CAGACATCAACAGAGTAACAACAACAACGAGTGGCCAAGACCAACAAGAAGTGGCTAACA
ATTCTGTAGCAGCAGCAGGTTTTGCGAGTGTGGTCACTACGACACAGAAAAGGGAAGCCG
GTTTGGCCAAGGTTCAGGCAGACAAGAAGAAGGTAGACGCCAGAAAGAAGAGCTTGAGGA
GACTGTGATGGTGCTACTTTTCAAGAGCTATTATAGGCTTTTATGTAATCAGGATGTCTG
GTTATGTTGATTTGTTGGTCTATATAATCACTCTTTTGTAATCGGTTTACAGTAACCAGG
CTTGAGATATTCCTTGGTATAATTTACTGCGACCAATAAACTGGTTATTACTTTTAAATT
GTACCAAATCTATGGGTTAACTTTC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 2 5

CO CL1206Contig1 684 3 2 U
GAAGAATGGCTCTCGAGGCATGGTTAATGGATGATAGCAATGAAGATCAGAGACTTCCTC
ATCATCCTAACCCCAAAGAGCTCCTCCCTATGGATTACTTGGCAGAACTGGGAGTATTGT
ACTGGAAGTTGAACCCTGAGAACTACGAGAATGATTCCGAGCTAGCCAAGATTAGAGATG
AAAGGGGTTACGATTACATGGATTTGCTGGATCTGTGTCCCGAGAAAGTCAGCAACTACG
AGGAGAAGCTGAAGAACTTTTTCACAGAACACATTCACCAGGACGAAGAGATTCGCTACT
GCCTAGCAGGAAGTGGCTATTTTGATGTTAGGGACAAGGATGACCGTTGGATCCGAATTT
GGATGAAACCGGGCGATCTAATTGTTCTTCCTGCTGGGATCTACCACCGGTTCACACTCG
ACACCAGCAACTACATCAAGCTGATGAGGCTGTTTGTGGGAGAACCGGTTTGGACACCAT
ATAACCGGCCTCAGGAAGATCACCCGGTTAGGAAGGAGTATATAAAGAGCTTAACCCACA
AGTTTGGAGAAAGCATTCAAGCTCATTAAGCAGATAGCACTGTGGTGCATTTCTATGTAT
TGTTTACTCAGTTTTAACATATTTGTGCTTTTGTTCAAATAAAAAGATGATATTCGTCAC
CTAAATAGTGAAAGTTGTTAAACT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AGTTTGGAGAAAGCATTCAAGCTCATTAAGCAGATAGCACTGTGGTGCATTTCTATGTAT
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G
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DS 



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ACTTGGCAGGTTCCTCTCTCGCTCCAACTTACTCTTACTTTTTTAAATAAATTTTGAGCT
GTGTTGCTTTTATTGTATTGGATATGTGATTAAAAAAGATAAATCATATGAGCTCACCTG
AAAGAAACTTAAACTGTAAGGGAATATCAAATAAATAAATATACACAATAGCAGAGTATA
CAACTTTTACAAATGTCTCTCACAGTAGCTGTGAATTGTGATGTGATTTTCAGAACTGGG
AGTATTGTACTGGAAGTTTAACCCTGAGAACTACGAGAATGATTCCGAGCTAGCCAAGAT
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AATTAGTCTTCTTTGTAGGATTTGCTGGATCTGTGTCCCGAGAAAGTCAGCAACTACGAG
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CTTGCAGGAAGTGGCTATTTTGATGTTAGGGACAAGGATGACCGTTGGATCCGAATTTGG
ATGAAACCGGGCGATCTCATTGTCCTTCCTGCCGGGATCTACCACCGGTTCACACTCGAC
ACCAGCAACTACATCAAGGTATTATACAGCCTCTCTACTAAAACGCTAGCTGATGAAACT
ATTACATCTGCTATTGAAAAGATTTAATTATTGGATTTTGAGGAATTGGTTGTTTTTGGT
TTTGCAGCTAATGAGGCTGTTTGTGGGAGAACCGGTGTGGACACCATATAACCGTCCGCA
GGAAGATCACCCGGTTAGGAAGGAGTATATAAAGAGCTTAACCCACAAGTTTGGAGAAAG
CATTCAAGCTCATTAAGAAGATAGCATTGTGGTGCATTTCTATGTATTGTTTACTTAGTT
GTTCTTGGAACATATTTGTGCCTTTGTTCAATTAAAAATATAATATTCGTCACCT


BQ
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AF RS1GE46TF U 1
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BS 807 1255 RS1GE46JQ

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CTTGCAG**AGTGGCTATTTTGATGT
AGGAC

QA 1 806 1 806
DS 

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TTTATATTAATATCCAAATTGATACGTAATAAAATTAGTCTTCTTTGTAGGATTTGCTGG
ATCTGTGTCCCGAGAAAGTCAGCAACTACGAGGAGAAGCTGAAGAACTTTTTCACAGAAC
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QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 6

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BQ
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1DW72TF U 1
AF RS1CJ43TF U 1
AF RS1C035JQ C 1
AF RS1C035TF U 1
AF RS1CJ43JQ C 1
AF RS1EK42TF U 1
BS 1 9 RS1DW72TF
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QA 1 444 1 444
DS 

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QA 1 496 1 496
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QA 1 692 1 692
DS 

RD RS1C035TF 692 0 0
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QA 1 692 1 692
DS 

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QA 1 692 1 692
DS 

RD RS1EK42TF 692 0 0
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TACTTGTATAATATCTTAATAAAAGTGTTTTC

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 4

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BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CZ25JQ U 16
AF RS1AO72JQ U 7
AF RS1AE39JQ U 1
AF RS1AE39TF C 387
BS 1 163 RS1AE39JQ
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BS 662 783 RS1AE39JQ
BS 784 1183 RS1AE39TF

RD RS1CZ25JQ 483 0 0
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ACCCTAACTACCCATTCATACAGAGTTTTTCACTCAATCTTCGAATACTTAATCACATTG
AAAGCACAGTAACCTGAAATTTCACTCAAAACAAACAGATAAAAGACCCTACATGAAATT
TTTGAACTTTGGGAACGAAAACCGCTCCTGAAAAGTCTCACACGTACTGATTGACGCGGA
AGGCAGTGACTTTAAAAACGAAGTCCCGAGTACTGAAAAGCTCAAACACACAAACATCTC
CTTCACCTATATTGTTCTCAAGCGTGAACTCATACCATCCTTGGCTGAATTTAGCTCTCC
CTGCCTTGTAAAGACACCTCACTGGCCATTGTTTCTCCCCTAGCTGGATCTTGATGAAGC
CAGATATCCCGCTTAAGTACTTCTCAGCAAACCCAGAAGGCAAGTACATGATGCAGCCTC
TGT

QA 1 483 1 483
DS 

RD RS1AO72JQ 606 0 0
CGGAGCCAAAACCCTTAAACCACATCATAGTCAACATTCACATAAAAGTAATAACATCTT
CTACTTTTGACCCTAACTACCCATTCATACAGAGTTTTTCACTCAATCTTCGAATACTTA
ATCACATTGAAAGCACGGTTACCTGAAATTTCACTCAAAACAAACAGATAAAAGACCCTA
CATGAAATTTTTGAACTTTGGGAACGAAGACCGCTCATGAAGAGTC**ACACGTACTGGT
TGACGCGGAAGGCAGTGACTTTCAAAACGAAGTCCCGAGTACTGAGAAGCTCAAACACAC
AAAAATCCCCTTCACCTATATTGTTCTCAAGCGTGAACTCATACCATCCTTGGCTGAGTT
TAGCTCTCCCTGCCTTGTAAGGACACCTCACTGGCCATTGTTTCTCCCCTAGCTGGATCT
TGATGAAGCCAGATATCCCGCTTAAGTACTTCTCAGCAAACCCAGAAGGCAAGTACATGA
TGCAGCCTCTGTAGAGATAAGATGGTCGCAGAACAACTCTAAAGAATGGATTGGTTGGTT
CGTAGGTTTTGGCTGCAGTGATGGCTCTCTCTCTTTCCTCTGCAGTTGCAGTTCTCATTC
TAGCAG

QA 1 606 1 606
DS 

RD RS1AE39JQ 794 0 0
TTTGTTCGGAGCCAAAACCCTTAAACCACATCATAGTCAACATTCACATAAAAGTAATAA
CATCTTCTACTTTTGACCCTAACTACCCATTCATACAGAGTTTTTCACTCAATCTTCGAA
TACTTAATCACATTGAAAGCACGGTTACCTGAAATTTCACTCAGAACAAACAGATAAAAG
ACCCTACATGAAATTTTTGAACTTTGGGAACGAAGACCGCTCATGAAGAGTC**ACACGT
ACTGGTTGACGCGGAAGGCAGTGACTTTCAGAACGAAGTCCCGAGTACTGAGAAGCTCAA
ACACACAAACATCCCCTTCACCTATATTGCTCTCAAGCGTGAACTCATACCATCCTTGGC
TGAACTTAGCTCTCCCTGCCTTGTAAAGACACCTCACTGGCCATTGTTTCTCCCCTAGCT
GGATCTTGATGAAGCCAGATATCCCGCTTAAGTACTTCTCAGCAAACCCAGAAGGCAAGT
ACATGATGCAGCCTCTGTAGAGATAAGATGGTCGCAGAACAACTCTAAAGAATGGATTGG
TTGGTTCGTAGGTTTTGGCTGTAGTGATGGCTCTCTCTCTTTCCTCTGCAGTTGCAGTTC
TCATTCTAGCAGAAGCACTTTCGTAGAACTTTGAGCGGTTCTCTGAGTCCTCTCCACCTG
GAGTTGACGAGTTTGTTTCCTCGGGGTTAGGATTCTTCTTCTTCCTTCCTCTCTTCTTAA
GGACTTTTGGCGTCGTAGCTTCAGGTTTTGATTCAACGAACAAGTTTTGAGTGGTTGTAG
AAG
CGTCATACCCT

QA 1 783 1 783
DS 

RD RS1AE39TF 797 0 0
AAGACA
CTCACTGGCCATTGTT*CTCCC*TAGCTGGATCTTGATGAAGCCAGATATCCCGCTTAAG
TACTTCTCAGCAAACCCAGAAGGCAAGTACATGATGCAGCCTCTGTAGAGATAAGATGGT
CGCAGAACAACTCTAAAGAATGGATTGGTTGGTTCGTAGGTTTTGGCTGTAGTGATGGCT
CTCTCTCTTTCCTCTGCAGTTGCAGTTCTCATTCTAGCAGAAGCACTTTCGTAGAACTTT
GAGCGGTTCTCTGAGTCCTCTCCACCTGAAGTTGACGAGTTTGTTTCCTCGGGGTTAGGA
TTCTTCTTCTTCCTTCCTCTCTTCTTAAGGACTTTTGGCGTCGTAGCTTCAGGTTTTGAT
TCAACGAACAAGTTTTGAGTGGTTGTAGAAGCGTCATACCCTTTGTTCAGGGGTGTGGTA
GATTCAGGGATCATTGAATGAATCACCTTGGAGCCTTTGTTTTCATGGTCCTCAAACAAT
CTAGCCCGTTTGTTGAACTCACTGTTTGCTGAATCCATGTTCACAAGAGCACTTGAAATG
GTCTTTGTGAGTGAAAACTAAAAGGAACCGTCTTCAAACCAGATTGTGTTGTCAGCTTTG
CTTAGTCTTGGCCTGGCAGGCATGTTAAGATAGTCAGCAACAGTTACCTAAGTAAAGAGA
TAACGAAGAAGAAGGGAGTCAGATCATGAAACGACGCCGGAGAGTTCGATGAAGCCCTTT
TCAGATCTGAAACCAAGTTTAAGAAGTTTTGACTTTGGTCAGAGGGTCTTTCTCACTCTC
TCTGGTTTTCC

QA 7 797 7 797
DS 



AS 1 6

CO CL1209Contig1 701 6 4 U
GGAGGGTTCACATGAACCAACACCAAAACCGAGTAGCGATTCTCTCTTCTCATATATCAC
CACCCGTCATGGCTTCAGAGAAAGAGGCTGCTTTAGCCGCCACTCCTTCCGATGATTCCC
CCACCATATTTGACAAGATCATCAGTAAAGACATTCCATCCACCGTTGTTTTTGAGGATG
ACAAGGTCTTGGCTTTTAGGGACATAACTCCCCAGGGTCCTGTTCACATCCTCCTCATTC
CAAAAGTGAGGGATGGCTTAACTGGCCTCTCTAAGGCTGAGGAGAGGCACATCGACATCT
TGGGCCGCCTTCTATACACTGCCAAGCTTGTAGCAAAACAAGAAGGCCTAGATGAGGGTT
TCAGAATTGTGATCAATGATGGTCCTCAAGGCTGTCAGTCGGTGTATCACATTCATGTTC
ATCTCATCGGAGGACGCCAAATGAACTGGCCTCCTGGCTAAAAAGATATCATCATCTACT
AGTGATTCTTGTCCTGGTTATAAGAGGAACCCTACCCTGAGTTGCTATTGTCTTCTTCTG
TCTTTATGAATAAAAGGCTTGGGACATAACTTTTTATGATTGAAATCTAAACCTTAGTCT
ATGGTATGAAGAGAATATTCGACTGTTCTCTTTTGTAGAATCCTCTTTTTTATTGTTGAC
TTTGTAAAACATTTCAATGGTAAAAAAGCTTTGAATAAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B380JQ C 49
AF RS1B380TF U 97
AF RS1EM73TF U 20
AF RS1G521TF U 8
AF RS1GF03TF U 1
AF RS1G521JQ C 8
BS 1 668 RS1GF03TF
BS 669 669 RS1G521JQ
BS 670 686 RS1GF03TF
BS 687 701 RS1G521JQ

RD RS1B380JQ 545 0 0
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CCGATGATTCCCCCACCATATTTGACAAGATCATCAGTAAAGACATTCCATCCACCGTTG
TTTTTGAGGATGACAAGGTCTTGGCTTTTAGGGACATAACTCCCCAGGGTCCTGTTCACA
TCCTCCTCATTCCAAAAGTGAGGGATGGCTTAACTGGCCTCTCTAAGGCTGAGGAGAGGC
ACATCGACATCTTGGGCCGCCTTCTATACACT*CCAAGCTTGTAGCAAAACAAGAAGGCC
TAGATGAGGGTTTCAGAATTGTGATCAATGATGGTCCTCAAGGCTGTCAGTCGGTGTATC
ACATTCATGTTCATCTCATCGGAGGACGCCAAATGAACTGGCCTCCTGGCTAAAAAGATA
TCATCATCTACTAGTGATTCTTGTCCTGGTTATAAGAGGAACCCTACCCTGAGTTGCTAT
TGTCTTCTTCTGTCTTTATGAATAAAAGGCTTGGGACATAACTTTTTATGATTGAAATCT
AAACC

QA 1 545 1 545
DS 

RD RS1B380TF 456 0 0
CCGCCTCTCCTTCCGATGATTCCCCCACCATATTTGACAAGATCATCAGTAAAGACATTC
CATCCACCGTTGTTTTTGAGGATGACAAGGTCTTGGCTTTTAGGGACATAACTCCCCAGG
GTCCTGTTCACATCCTCCTCATTCCAAAAGTGAGGGATGGCTTAACTGGCCTCTCTAAGG
CTGAGGAGAGGCACATCGACATCTTGGGCCGCCTTCTATACACT*CCAAGCTTGTAGCAA
AACAAGAAGGCCTAAATGAGGGTTTCAGAATTGTGATCAATGATGGTCCTCAAGGCTGTC
AGTCGGTGTATCACATTCATGTTCATCTCATCGGAGGACGCCAAATGAACTGGCCTCCTG
GCTAAAAAGATATCATCATCTACTAGTGATTCTTGTCCTGGTTATAAGAGGAACCCTACC
CTGAGTTGCTATTGTCTTCTTCTGTCTTTATGAATA

QA 1 456 1 456
DS 

RD RS1EM73TF 566 0 0
GG
ACCAAAACCGAGTAGCGATTCTCTCTTCTCATATATCACCACCCGTCATGGCTTCAGAGA
AAGAGGCTGCTTTAGCCGCCACTCCTTCCGATGATTCCCCCACCATATTTGACAAGATCA
TCAGTAAAGACATTCCATCCACCGTTGTTTTTGAGGATGACAAGGTCTTGGCTTTTAGGG
ACATAACTCCCCAGGGTCCTGTTCACATCCTCCTCATTCCAAAAGTGAGGGATGGCTTAA
CTGGCCTCTCTAAGGCTGAGGAGAGGCACATCGACATCTTGGGCCGCCTTCTATACACTG
CCAAGCTTGTAGCAAAGCAAGAAGGCCTAGATGAGGGTTTCAGAATTGTGATCAATGATG
GTCCTCAAGGCTGTCAGTCGGTGTATCACATTCATGTTCATCTCATCGGAGGACGCCAAA
TGAACTGGCCTCCTGGCTAAAAAGATATCATCATCTACTAGTGATTCTTGTCCTGGTTAT
AAGAGGAACCCTACCCTGAGTTGCTATTGTCTTCTTCTGTCTTTATGAATAAAAGGCTTG
GGACATAACTTTTTATGATTGAAA

QA 3 566 3 566
DS 

RD RS1G521TF 628 0 0
GG
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TGGCTTCAGAGAAAGAGGCTGCTTTAGCCGCCACTCCTTCCGATGATTCCCCCACCGTAT
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TGGCTTTTAGGGACATAACTCCCCAGGGTCCTGTTCACATCCTCCTCATTCCAAAAGTGA
GGGATGGCTTAACTGGCCTCTCTAAGGCTGAGGAGAGGCACATCGACATCTTGGGCCGCC
TTCTATACACTGCCAAGCTTGTAGCAAAACAAGAAGGCCTAGATGAGGGTTTCAGAATTG
TGGTCAATGATGGTCCTCAAGGCTGTCAGTCGGTGTATCACATTCATGTTCATCTCATCG
GAGGACGCCAAATGAACTGGCCTCCTGGCTAAAAAGATATCATCATCTACTAGTGATTCT
TGTCCTGGTTATAAGAGGAACCCTACCCTGAGTTGCTATTGTCTTCTTCTGTCTTTATGA
ATAAAAGGCTTGGGACATAACTTTTTATGATTGAAATCTAAACCTTAGTCTATGGTATGA
AGAGAATATTCGACTGTTCTCTTTTG

QA 3 628 3 628
DS 

RD RS1GF03TF 686 0 0
GGAGGGTTCACATGAACCAACACCAAAACCGAGTAGCGATTCTCTCTTCTCATATATCAC
CACCCGTCATGGCTTCAGAGAAAGAGGCTGCTTTAGCCGCCACTCCTTCCGATGATTCCC
CCACCATATTTGACAAGATCATCAGTAAAGACATTCCATCCACCGTTGTTTTTGAGGATG
ACAAGGTCTTGGCTTTTAGGGACATAACTCCCCAGGGTCCTGTTCACATCCTCCTCATTC
CAAAAGTGAGGGATGGCTTAACTGGCCTCTCTAAGGCTGAGGAGAGGCACATCGACATCT
TGGGCCGCCTTCTATACACTGCCAAGCTTGTAGCAAAACAAGAAGGCCTAGATGAGGGTT
TCAGAATTGTGATCAATGATGGTCCTCAAGGCTGTCAGTCGGTGTATCACATTCATGTTC
ATCTCATCGGAGGACGCCAAATGAACTGGCCTCCTGGCTAAAAAGATATCATCATCTACT
AGTGATTCTTGTCCTGGTTATAAGAGGAACCCTACCCTGAGTTGCTATTGTCTTCTTCTG
TCTTTATGAATAAAAGGCTTGGGACATAACTTTTTATGATTGAAATCTAAACCTTAGTCT
ATGGTATGAAGAGAATATTCGACTGTTCTCTTTTGTAGAATCCTCTTTTTTATTGTTGAC
TTTGTAAA*CATTTCAATGGTAAAAA

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1G521JQ 694 0 0
GG
ACATGAACCAACACCAAAACCGAGTAGCGATTCTCTCTTCTCATATATCACCACCCGTCA
TGGCTTCAGAGAAAGAGGCTGCTTTAGCCGCCACTCCTTCCGATGATTCCCCCACCGTAT
TTGACAAGATCATCAGTAAAGACATTCCATCCACCGTTGTTTTTGAGGATGACAAGGTCT
TGGCTTTTAGGGACATAACTCCCCAGGGTCCTGTTCACATCCTCCTCATTCCAAAAGTGA
GGGATGGCTTAACTGGCCTCTCTAAGGCTGAGGAGAGGCACATCGACATCTTGGGCCGCC
TTCTATACACTGCCAAGCTTGTAGCAAAACAAGAAGGCCTAGATGAGGGTTTCAGAATTG
TGGTCAATGATGGTCCTCAAGGCTGTCAGTCGGTGTATCACATTCATGTTCATCTCATCG
GAGGACGCCAAATGAACTGGCCTCCTGGCTAAAAAGATATCATCATCTACTAGTGATTCT
TGTCCTGGTTATAAGAGGAACCCTACCCTGAGTTGCTATTGTCTTCTTCTGTCTTTATGA
ATAAAAGGCTTGGGACATAACTTTTTATGATTGAAATCTAAACCTTAGTCTATGGTATGA
AGAGAATATTCGACTGTTCTCTTTTGTAGAATCCTCTTTTTTATTGTTGACTTTGTAAAA
CATTTCAATGGTAAAAAAGCTTTGAATAAATG

QA 3 694 3 694
DS 



AS 1 4

CO CL1210Contig1 1217 4 17 U
GTGTGGAACTGACGGATTGCAAATTTATTAATAAACACAGCAACTTTCTTTTCTTCATCA
ATGAAAAAGCTACGAACATAAGGCATAAAATTATATGGTACATCTTTGATTAGTCTCATA
TCCAGCCTCAAAAAAAGCGCTCCAAGATATCTCATTAGGCTCAATCTTGGTCGTAATCCA
TATCTCTAACGTGCACTCTGCGTTGATACCACTGCTTATGGCCGGGGGGTCCCCGTCTGT
ACTCTCTCCCGGTGAGGTGACTATAGTCTCGTAGCCGTCGCCGTTGGCTTTATCCTCTCA
GGTGAACTAAGATTCAGGTTTCCCGTTTCGTCCCCATGGCTTCGCCACCAGAGGAGATGG
ATGATGATGAAATTCAATCCCCGCCAAAGAGCACTTACAAGGATCCCGACGATGGAAGGC
AACGATTCTTACTTGAACTTGAATTCATTCAGTGTCTCGCCAATCCTACTTACATCCACT
ACCTGGCGCAGAATCGGTATTTTGAAGATGAAGCATTTATTGAGTACCTCAAGTATCTTC
AATACTGGCAGCGACCAGAGTACATCAAGTTCATTATGTATCCACATTGCCTATATTTCC
TCGAACTTCTTCAAAACCCCAACTTCAGGAGTGCCATGGCCCATCCTGCAAACAAGGAAT
TGGCACATAGGCAACAGTTTTACTATTGGAAGAACTACAGAAACAACAGACTGAAGCACA
TTCTACCTCGTCCTCTTCCAGAGCCTGTAGCTCCACAACCGCCACCTGTGCCTTCATCTT
CTCTTCCTCCTGCCCCATCTGCACCTCCTGCTGCTCCCTCTCCAGCTATTTCTCCGATGC
AGTACAACAATAATATGCTTCCTAAGAACGAGTCGCGGAATATGGTTTCTGCTGGAATTG
ACCGTAGGAAGAGAAAGAAAGGTCCATAAGCATATCTCGCCCTGAAGCAAACACCATGGT
GTCCGGGGATATCTTTCCTACGTATTCTAGAGAGGGAAACATGCTTGACTCAGGTTACAG
AAATGTTGAAGACTCTGGGCATAGAGATTGATGATATTAAGCCTGTCGGCTTTATAGTAA
ATGGTAGTTGTGAGATTGATTCTGTTTCCTATTTTTCGTCGCTCTAGGCTCCAACAGAAG
CCTTACTCATACTTTTACCATATTTGTTTCGTTATTCCAATGAATGTTCTTTCTTATGCA
CATGATATAATTGATCC


BQ
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AGTACAACAATAATAT

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G
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ACTTGAACTTGAATTCATTCAGTGTCTCGCCAATCCTACTTACATCCATTACCTGGCGCA
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GCGACCTGAGTACATCAAGTTCATTATGTATCCACATTGCCTATATTTCCTCGAACTTCT
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TTT
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ATGATATAATTGATCC

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DS 

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TACTCATACTTTTACCATATTTGTTTCGTTATTCCAATGAATGTTCTTTCTTATGCACAT
GATATAATTGATCC

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DS 



AS 1 6

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CGGAGCTTCCAGAGCCAGCTCTAGGCATTAACTTTGCAAGAGATGGACTCTCTGAGAAGG
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ACTACCCTCATCTTTATTTGGCTAGTTCTTAGCTCTTTCTATCCCACCATAACAACTTAG
CCCCTATTTCTCATTTGAATTTGCTGTATAATTAATTGGTTTGTTTCCAGAAACATA


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AATCGAAATGGCAATCTATCCAAGTCGGATTCCAAAGTGAGATCTTCAGATGGCAAAAGC
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GG
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GCCTGTAGTAAGAAACTCTTACTACCCTCATCTTTATTTGGCTAGTTCTTAGCTCTTTCT
ATCCCACCATAACAACTTAGCCCCTATTTCTCATTTGAATTTGCTGTATAATT
AAT

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GCTTTCTCTTGTTGCTATCCACAGTGACACTTGTTTGCTCTCCGTCTCTTTTTACTTCGG
CTCCAGATTCGCTTTCGACAAATATGAGA**AAACGCTTGTTTGATATGATCAATGGGGT
TCCTACCATATTTGAAGTAGTCACTGGAAATATGAAAAAGCAAACTAAGGATAAGTCCTC
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CAAAAGCTCAAAGGCCATGCAGGCAAACAATGAGGAAGATGGATCAGAGGAAGAGGATGA
GGATGAACACGGGGAAACCCTTTGTGGTGCATGTGGAGACGGTGATGGTACTGGTACTGA
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AACTCCAGCTAGAGCTGAGCATATCAAACAGTACAAGTGCCCCGCATGTAGCAACAAAAG
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TATGAGAGGAAACGCTTGTTTGATATGATCAATGGGGTTCCTACCATATTTGAAGTAGTC
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CTATTCAAGTCGGATTCCAAAGTGAGATCTTCAGATGGCAAAAGCTCAAAGGCCATGCAG
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GTTTGTGAGGTGTGGTTCCACGGGAAGTGTGTGAAGATAACTCCAGCTAGAGCTGAGCAT
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TCTTAGCTCTTTCTATCCCCCCATAACAACTTAGCCCCTATTTCTCATTTGAATTTGCTG
TATAATTAATTGGTTTGTTTCCAGAAACATA

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DS 



AS 1 6

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ATTTTCCAGCTGCGTTTCGCGGCTGTCGTGGCATCCGCCGCCGTATTGATCTTCCTTGTA
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ATTTCAATGATATGATAACTTTCCGAAATTTCATTTATCCGTAGCATTATACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AACTATATTTATCTTATGTAATTAATTGCTATTAGA
TTATTTT

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RD RS1EY52JQ 580 0 0
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CCAAGAGATCACGACATGTTATGAAACGCTTACCGACGCGCTTTATAATTTGGCAAGCGC
GAGGAAGAGTATAAGGAAACGTGATGTGATGGCGATGAACATGTTTTTAACTGCGGCTGT
GTCTGATTACGGTGTATGCGTTGAAGGGTTCATTGACAAGGGTCAGGTTAATACGGTTCA
AAATTCAGCGGTTGATTTGAGGAAAACTGGCAGCAATTGCTTGACGTTATCTACATTGAT
TAGATGATAAACCAACAAACATTTGTTATTTTTTCCAAAAAATACTAATTAATTTTTTCA
AAATGAAAAAAGAGAACAAAAAAA*TTGAACTAATGAAAAACGGGTTTTTTTTTTGTTGT
TTTTATTTCGGGGAGCTGTTTGTTGATCATCATTCGTCGTGTAAACGCCACTGGGTATAA
TTAACTATATTTATCTTATGTAATTAATTGCTATTAGA
GC

QA 1 578 1 578
DS 

RD RS1H250JQB 805 0 0
TAAATCAAATAAATAAAATGGCGG*TCGCGACATTT*CCAGCTGCGTTTCGCGGCTGTCG
TGGCATCCGCCGCCGTATTGATCTTCCTTGTATCCAGCCAAGTCGCGGAGGCATCGCGTA
TGATGAACATATGCTCTCACACTCCGTATCCATCTCTGTGCCAGCCTTTGGTGAAGCGTG
AAACGAACCCAAGAAGAGCCACGCACAAAACCATACAGGCTTTGGAGGCTAAGACAAGAC
TAGCTCTAACTGAAGCGGCCAGGTACAAAAGCGGTAACCAAGAGATCACGACATGTTATG
AAACGCTTACCGACGCGCTTTATAATTTGGCAAGCGCGAGGAAGAGTATAAGGAAACGTG
ATGTGATGGCGATGAACATGTTTTTAACTGCGGTTGTGTCTGATTACGGTGTATGCGTTG
AAGGGTTCATTGACAAGGGTCAGGTTAATACGGTTCAAAATTCAGCGGTTGATTTGAGGA
AAACTGGCAGCAATTGCTTGACGTTATCTACATTGATTAGATGATAAACCAACAAACATT
TGTTATTTTCTCCAAAAAATACTAATTAATTTCTTCAAAATGAAAAAAGAGAACAAAAAA
A*TTGAACTAATGAAAAACGGGTTTTTTCTTTGTTGTTTTTATTTCGGGGAGCTGTTTGT
TGATCATCATTCGTCGTGTAAACGCCACTGGGTATAATTAACTATATTTATCTTATGTAA
TTAATTGCTATTAGATTATTTTTTCTTGTGTAATTTCAATGATATGATAACTTTCCGAAA
TTTCATTTATCCGTAGCATTATACT

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 6

CO CL1213Contig1 734 6 7 U
GGAAAAAGAGTCATATTCGAAGAAAACATAATATATTCACCCTCTCTGCGTCTCCTTTCA
GCAGTAATCTCGTCTTGATTCAGCCATGGCTAATGCGGCGTCGGGAATGGCAGTCCATGA
TGACTGCAAGCTAAGGTTTCTGGAACTGAAGGCGAAGAGGACACACCGTTTCATTGTTTA
CAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTCGAGAAGGTTGGTGAACCTATTCAAAC
CTACGAGGAGTTTGCTGCTAGCCTTCCTGCTGAAGAGTGCCGATATGCCATTTATGATTT
TGATTTTGTCACTGCGGAGAATTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATTGCATGGTGTCC
TGACGTAGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATATATGCGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCG
TGAACTTGATGGAATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTTGA
TGTTTTCAAAAGCCGTGTCAATTAAAAAAACAAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGAA
TAAGCTTCTTTGGCTCTTACAGTTTCCTGCGACTGTTATAAAAACATAACGCCCTTTATT
CTATCTATCTGGTCTTGCTTTCTATGTCTTTGTTACCCAACAGTGTTTCGTCTATTTGAA
AATTATCTCAAGTTTGTGCTGTGTGTTTGCATCCTTTGTGTAAAGATGATTTCTTTGAGC
GTCCTTTGTTCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 15 15 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A622TF U 1
AF RS1CU40TF U 226
AF RS1DB16TF U 64
AF RS1ER72TF U 366
AF RS1CL08JQ C 394
AF RS1CL08TF U 394
BS 1 528 RS1A622TF
BS 529 532 RS1DB16TF
BS 533 639 RS1A622TF
BS 640 644 RS1DB16TF
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BS 646 688 RS1DB16TF
BS 689 734 RS1ER72TF

RD RS1A622TF 640 0 0
GGAAAAAGAGTCATATTCGAAGAAAACATAATATATTCACCCTCTCTGCGTCTCCTTTCA
GCAGTAATCTCGTCTTGATTCAGCCATGGCTAATGCGGCGTCGGGAATGGCAGTCCATGA
TGACTGCAAGCTAAGGTTTCTGGAACTGAAGGCGAAGAGGACACACCGTTTCATTGTTTA
CAAGATCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTCGAGAAGGTTGGTGAACCTATTCAAAC
CTACGAGGAGTTTGCTGCTAGCCTTCCTGCTGAAGAGTGCCGATATGCCATTTATGATTT
TGATTTTGTCACTGCGGAGAATTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATTGCATGGTGTCC
TGACGTAGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATATATGCGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCG
TGAACTTGATGGAATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTTGA
TGTTTTCAAAAGCCGTGTCAATTAAAAAAACAAATCTCTCTCTCTCTC****TCTTTGAA
TAAGCTTCTTTGGCTCTTACAGTTTCCTGCGACTGTTATAAAAACATAACGCCCTTTATT
CTATCTATCTGGTCTTGCTTTCTATGTCTTTGTTACCCA
C

QA 1 639 1 639
DS 

RD RS1CU40TF 377 0 0
G
GAACCTATTCAAACCTACGAGGAGTTTGCTGCTAGCCTTCCTGCTGAAGAGTGCCGATAT
GCCATTTATGATTTTGATTTTGTCACTGCGGAGAATTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTC
ATTGTATGATGTCCTGACGTAGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATATATGCGAGCTCCAAG
GACAGGTTCAAGCGTGAACTTGATGGAATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACCGATCCAACT
GAGATGGATCTTGATGTTTTCAAAAGCCGTGTCAATTAAAAAAACAAATCTCTCTCTCTC
TCTCTCTCTTTGAATAAGCTTCTTTGGCTCTTACAGTTTCCTGCGACTGTTATAAAAACA
TAACGCCCTTTATTC
C

QA 2 376 2 376
DS 

RD RS1DB16TF 625 0 0
GG
AATCTCGTCTTGATTCAGCCATGGCTAATGCGGCGTCGGGAATGGCAGTCCATGATGACT
GCAAGCTAAGGTTTCTGGAACTGAAGGCGAAGAGGACACACCGTTTCATTGTTTACAAGA
TCGAGGAGAAGCAGAAGCAAGTGGTTGTCGAGAAGGTTGGTGAACCTATTCAAACCTACG
AGGAGTTTGCTGCTAGCCTTCCTGCTGAAGAGTGCCGATATGCCATTTATGATTTTGATT
TTGTCACTGCGGAGAATTGCCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATTGCATGGTGTCCTGACG
TAGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATATATGCGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAAC
TTGATGGAATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTTGATGTTT
TCAAAAGCCGTGTCAATTAAAAAAACAAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGAATAAGC
TTCTTTGGCTCTTACAGTTTCCTGCGACTGTTATAAAAACATAACGCCCTTTATTCTATC
TATCTGGTCTTGCTTTCTATGTCTTTGTTACCCAACAGTATTTCGTCTATTTGAAAATTA
TCTCAAGTTTGTGCTGTGTGTTT

QA 3 625 3 625
DS 

RD RS1ER72TF 369 0 0
G
AGCAAAGGTGAGAAGCAAGATGATATATGCGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAACT
TGATGGAATTCAAGTGGAGCTTCAGGCAACCGATCCAACTGAGATGGATCTTGATGTTTT
CAAAAGCCGTGTCAATTAAAAAAACAAATCTCTCTCTCTCTCTC**TCTTTGAATAAGCT
TCTTTGGCTCTTACAGTTTCCTGCGACTGTTATAAAAACATAACGCCCTTTATTCTATCT
ATCTGGTCTTGCTTTCTATGTCTTTGTTACCCAACAGTGTTTCGTCTATTTGAAAATTAT
CTCAAGTTTGTGCTGTGTGTTTGCATCCTTTGTGTAAAGATGATTTCTTTGAGCGTCCTT
TGTTCTGC

QA 2 369 2 369
DS 

RD RS1CL08JQ 329 0 0
G
GCGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAACTTGATGGAATTCAAGTGGAGCTTCAGGCA
ACCGATCCAACTGAGATGGATCTTGATGTTTTCAAAAGCCGTGTCAATTAAAAAAACAAA
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGAATAAGCTTCTTTGGCTCTTACAGTTTCCTGCGACT
GTTATAAAAACATAACGCCCTTTATTCTATCTATCTGGTCTTGCTTTCTATGTCTTTGTT
ACCCAACAGTGTTTCGTCTATTTGAAAATTATCTCAAGTTTGTGCTGTGTGTTTGCATCC
TTTGTGTAAAGATGATTTCTTTGAGCG
C

QA 2 328 2 328
DS 

RD RS1CL08TF 329 0 0
G
GCGAGCTCCAAGGACAGGTTCAAGCGTGAACTTGATGGAATTCAAGTGGAGCTTCAGGCA
ACCGATCCAACTGAGATGGATCTTGATGTTTTCAAAAGCCGTGTCAATTAAAAAAACAAA
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGAATAAGCTTCTTTGGCTCTTACAGTTTCCTGCGACT
GTTATAAAAACATAACGCCCTTTATTCTATCTATCTGGTCTTGCTTTCTATGTCTTTGTT
ACCCAACAGTGTTTCGTCTATTTGAAAATTATCTCAAGTTTGTGCTGTGTGTTTGCATCC
TTTGTGTAAAGATGATTTCTTTGAGCG
C

QA 2 328 2 328
DS 



AS 1 5

CO CL1214Contig1 693 5 11 U
GGTAAAAAAGTAACAGAGATGTATATATTTTACATTAACACATAACATATAAGCATATAT
ACTTACTTTTAAGGAGTTTACACACAACACAAAAAACATGTCACCGGACTATACACACAT
ATGCAAGCATCATTGGACATGTAACATCATGTTCTTAAACTCTTCAATATCAATAACACC
ATCAAGATTCTTGTCATGAGCTCGAATCATCCTCCC*ACAATCCCAACTCTTTGTCTCCT
CCTCAAATCCGAGCCGTTCCAACACCGTTCGAAGCTCCTCCGACGAAATATAACCGTCTC
CGTTCACATCGAACACATTAAACGCACTCACAATAGCATCATCATTATCAATAACACTAT
TGCTCTTTGTTTCCTTCCTATTCGAAACGGCGTCGTCGTAAAACCGAAGGAATTCTTCTA
AGTCGAGGCTCTTTTTCCCAACGAACAGTTCGAGTTCTTCGGGAGTGTGTTCGGACCAGC
CGAGTCTCTCTAGAATCCAATGAAGCTCGTCGACGGTCACGAGACCGTCTTGGTTCTTGT
CGAGCATTTGGAACATTCTTTGGAGATCGGTTATGCTTATGAATGAACAATCCATATCTC
TCGGTGGTTCTGTTTCTGATAGTTTTA**GACCTTTTGTTTAGGAATTGGGTACTCTGTA
TCTGAATAAATTTTCAAGATTTATCGTCTATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RS1BJ11JQ U 1
AF RS1C424TF C 35
AF RS1B415JQ U 1
AF RS1D886JQ U 1
AF RS1B415TF C 9
BS 1 168 RS1B415JQ
BS 169 169 RS1BJ11JQ
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BS 645 693 RS1B415JQ

RD RS1BJ11JQ 430 0 0
GGTAAAAAAGTAACAGAGATGTATATATTTTACATTAACACATAACATATAAGCATATAT
ACTTACTTTTAAGGAGTTTACACACAACACAAAAAACATGTCACCGGACTATACACACAT
ATGCAAGAATCATTGGACATGTAACATCATGTTCTTAAACTCTTCAATATCAATAACACC
ATCAAGATTCTTATCATGAGCTCGAATCATCCTCCC*ACAATCCCAACTCTTTGTCCCCT
CCTCAAATCCGAGCCGTTCCAACACCGTTCGAAGCTCCTCCGACGAAATATAACCGTCTC
CGTTCACATCGAACACATTAAACGCACTCACAATAGCATCATCATTATCAATAACACTAT
TGCTCTTTGTTTCCTTCCTATTCGAAACGGCGTCGTCGTAAAACCGAAGGAATTCTTCTA
AGTCGAG
ACT

QA 1 427 1 427
DS 

RD RS1C424TF 589 0 0
TTAACACATAACATATAAGCATATATACTTACTTTTAAGGAGTTTACACACAACACAAAA
AACATGTCACCGGACTATACACACATATGCAAGCATCATTGGACATGTAACATCATGTTC
TTAAACTCTTCAATATCAATAACACCATCAAGATTCTTGTCATGAGCTCGAATCATCCTC
CC*ACAATCCCAACTCTTTGTCTCCTCCTCAAATCCGAGCCGTTCCAACACCGTTCGAAG
CTCCTCCGACGAAATATAACCGTCTCCGTTCACATCGAACACATTAAAAGCACTCACAAT
AGCATCATCATTATCAATAGCACTATTGCTCTTTGTTTCCTTCCTATTCGAAACGGCGTC
GTCGTAAAACCGAAGGAATTCTTCTAAGTCGAGGCTCTTTTTCCCAACGAACAGTTCGAG
TTCTTCGGGAGTGTGTTCGGACCAGCCGAGTCTCTCTAGAATCCAATGAAGCTCGTCGAC
GGTCACGAGACCGTCTTGGTTCTTGTCGAGCATTTGGAACATTCTTTGGAGATCGGTTAT
GCTTATGAATGAACAATCCATATCTCTCGGTGGTTCTGTTTCTGATAGT

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1B415JQ 693 0 0
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ACTTACTTTTAAGGAGTTTACACACAACACAAAAAACATGTCACCGGACTATACACACAT
ATGCAAGCATCATTGGACATGTAACATCATGTTCTTAAACTCTTCAATGTCAATAACACC
ATCAAGATTCTTGTCATGAGCTCGAATCATCCTCCC*ACAATCCCAACTCTTTGTCTCCT
CCTCAAATCCGAGCCGTTCCAACACCGTTCGAAGCTCCTCCGACGAAATATAACCGTCTC
CGTTCACATCGAACACATTAAACGCACTCACAATAGCATCATCATTATCAATAACACTAT
TGCTCTTTGTTTCCTTCCTATTCGAAACGACGTTGTCGTAAAACCGAAGGAATTCTTCTA
AGTCGAGGCTCTTTTTCCCAACGAACAGTTCGAGTTCTTCGGGAGTGTGTTCGGACCAGC
CGAGTCTCTCTAGAATCCAATGAAGCTCGTCGAGGGTCACGAGACCGTCTTGGTTCTTGT
CGAGCATTTGGAACATTCTTTGGAGATCGGTTATGCTTATGAATGAACAATCCATATCTC
TCGGTGGTTCTGTTTCTGATAGTTTTA**GACCTTTTGTTTAG*AATTGGGTACTCTGTA
TCTGAATAAATTTTCAAGATTTATCGTCTATCC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RS1D886JQ 693 0 0
GGTAAAAAAGTAACAGAGATGTATATATTTTACATTAACACATAACATATAAGCATATAT
ACTTACTTTTAAGGAGTTTACACACAACACAAAAAACATGTCACCGGACTATACACACAT
ATGCAAGCATCATTGGACATGTAACATCATGTTCTTAAACTCTTCAATATCAATAACACC
ATCAAGATTCTTGTCATGAGCTCGAATCATCCTCCC*ACAATCCCAACTCTTTGTCTCCT
CCTCAAATCCGAGCCGTTCCAACACCGTTCGAAGCTCCTCCGACGAAATATAACCGTCTC
CGTTCACATCGAACACATTAAACGCACTCACAATAGCATCATCATTATCAATAACACTAT
TGCTCTTTGTTTCCTTCCTATTCGAAACGGCGTCGTCGTAAAACCGAAGGAATTCTTCTA
AGTCGAGGCTCTTTTTCCCAACGAACAGTTCGAGTTCTTCGGGAGTGTGTTCGGACCAGC
CGAGTCTCTCTAGAATCCAATGAAGCTCGTCGACGGTCACGAGACCGTCTTGGTTCTTGT
CGAGCATTTGGAACATTCTTTGGAGATCGGTTATGCTTATGAATGAACAATCCATATCTC
TCGGTGGTTCTGTTTCTGATAGTTTTAAGGACCTTTTGTTTAGGAATTGGGTACTCTGTA
TCTGAATAAATTTTCAAGATTTATCGTCT
ATCC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1B415TF 685 0 0
AGTAACAGAGATGTATATATTT*ACATTAACACATAACATATAAGCATATATACTTACTT
TTAAGGAGTTTACACACAACACAAAAAACATGTCACCGGACTATACACACATATGCAAGC
ATCATTGGACATGTAACATCATGTTCTTAAACTCTTCAATGTCAATAACACCATCAAGAT
TCTTGTCATGAGCTCGAATCATCCTCCCCACAATCCCAACTCTTTGTCTCCTCCTCAAAT
CCGAGCCGTTCCAACACCGTTCGAAGCTCCTCCGACGAAATATAACCGTCTCCGTTCACA
TCGAACACATTAAACGCACTCACAATAGCATCATCATTATCAATAACACTATTGCTCTTT
GTTTCCTTCCTATTCGAAACGACGTTGTCGTAAAACCGAAGGAATTCTTCTAAGTCGAGG
CTCTTTTTCCCAACGAACAGTTCGAGTTCTTCGGGAGTGTGTTCGGACCAGCCGAGTCTC
TCTAGAATCCAATGAAGCTCGTCGAGGGTCACGAGACCGTCTTGGTTCTTGTCGAGCATT
TGGAACATTCTTTGGAGATCGGTTATGCTTATGAATGAACAATCCATATCTCTCGGTGGT
TCTGTTTCTGATAGTTTTA**GACCTTTTGTTTAGGAATTGGGTACTCTGTATCTGAATA
AATTTTCAAGATTTATCGTCT
ATCC

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 6

CO CL1215Contig1 1366 6 5 U
GGATCTTCTCAACCTTCTCTCTATCCACTTCCCTTTTTGTTTCACTGAAACTGTTAACAT
CTTTCACTCTTTTAAAGCTATCGATCTTTTTCTTTCTTGTCTTCTCCACAAACTAAAGAA
AATAAAAAAAAGAGTCAAATCTCTCGAGATGGAACTCATCCCTAATCTTCCCTACGACGT
AGCTCGCGAGTGTCTCCTGCGCTCTTCCTACAAACAGTTCCCTGTCATCGCCTCCGTTTG
CAGAGGCTGGAACCGTGAAGGTCTCTCTCTGAGTTTTTCCAGCAACGACAAGCTTCAGGA
CATAGCCAAGAGCTTCTTATCATGTCGCAGGCTCGTATCGATGCAGACAGAGAACCCGGA
TCCGGAAAGAATTTCGCATCGCCCGAATACAGAGTCGCTGTTCTTGAATCCGGGTCGGGT
CTCTGGACGGAGCTTCCTCCGATTCCGGGTCAATCCAACGGACTGCCTCTGTTCTGTAAA
ATGGTTTCTATCGGGTCGGATCTTATTGTATTGGGTGGGCTTGATCCGGTTACATGGCAG
GCCTCTGATTCGGTCTTCGTCTTCAGTTTTCTCAACTCTAAATGGCGCGCGGGGGCTAAC
ATGCCAGGTGTCAAGAGATCATTCTTCGGATGCGCTTCGGATTCGGATCGGACGGTGTTG
GTTGCCGGAGGACACGACGAGGAGAAGCAAGCGCTGACGTCAGCGATGGTGTATGATCTA
GCAGAAGACAAGTGGACGTTTTTGTCGGATATTTCGCGGGAACGAGACGAGTGCAAGGCC
ATATTCCACGCTGGCAAATTCCACGTCATCGGTGGATACGCCACGGAGGAACAGGGGCAG
TTCAGTAAATCTGCTGAATCCTTCGATGTGTCCATGTGGCTATGGGGTCCAGTGAAAGAG
GAGTT*CTCGACGGCGGGGAAACCGTAAGCACTCCGATATACGCTACCACCGCCGAAGAC
GGAGATCTGTTTGCGTGCTGGCGTGGAGATGTGATGGTTCTGAAAAATGACACGTGGCA*
AAAGTAAGCCAGATCCCTGCTGACATGTACAGTGTGGCCTACGTGGTAACGAGGTCGGGG
AAGTTGATTGTGATCGGCAACGGCAAGACTTTGGCTGGTTATAGTGGCTCCACCGTAGGG
TACATATGTGATTTAAGTAGCTTTCGATGGGTAAAATTAGAAACACATGTTGGTCATGTG
CAAGCTGGTTGCTTCTTGGAGGTCTAATATGAAATCCTTCAATCTCTGGAGTTTAGTCAA
AACCGGTAGGTTTTCTTGGATGTTAGTGCATAAATCTCTCTTTCAAAGGAGTAAAGAAAT
GTAGTTGTGTGAATACATATAAAAATTATATGATTGTATGTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BT36TF U 1
AF RS1BO12TF U 428
AF RS1BP82TF U 428
AF RS1BP82JQ C 588
AF RS1BT36JQ C 597
AF RS1BO12JQ C 640
BS 1 650 RS1BT36TF
BS 651 1073 RS1BO12TF
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BS 1099 1334 RS1BP82JQ
BS 1335 1366 RS1BT36JQ

RD RS1BT36TF 650 0 0
GGATCTTCTCAACCTTCTCTCTATCCACTTCCCTTTTTGTTTCACTGAAACTGTTAACAT
CTTTCACTCTTTTAAAGCTATCGATCTTTTTCTTTCTTGTCTTCTCCACAAACTAAAGAA
AATAAAAAAAAGAGTCAAATCTCTCGAGATGGAACTCATCCCTAATCTTCCCTACGACGT
AGCTCGCGAGTGTCTCCTGCGCTCTTCCTACAAACAGTTCCCTGTCATCGCCTCCGTTTG
CAGAGGCTGGAACCGTGAAGGTCTCTCTCTGAGTTTTTCCAGCAACGACAAGCTTCAGGA
CATAGCCAAGAGCTTCTTATCATGTCGCAGGCTCGTATCGATGCAGACAGAGAACCCGGA
TCCGGAAAGAATTTCGCATCGCCCGAATACAGAGTCGCTGTTCTTGAATCCGGGTCGGGT
CTCTGGACGGAGCTTCCTCCGATTCCGGGTCAATCCAACGGACTGCCTCTGTTCTGTAAA
ATGGTTTCTATCGGGTCGGATCTTATTGTATTGGGTGGGCTTGATCCGGTTACATGGCAG
GCCTCTGATTCGGTCTTCGTCTTCAGTTTTCTCAACTCTAAATGGCGCGCGGGGGCTAAC
ATGCCAGGTGTCAAGAGATCATTCTTCGGATGCGCTTCGGATTCGGATCG

QA 1 650 1 650
DS 

RD RS1BO12TF 647 0 0
G
GGAGCTTCCTCCGATTCCGGGTCAATCCAACGGACTGCCTCTGTTCTGTAAAATGGTTTC
TATCGGGTCGGATCTTATTGTATTGGGTGGGCTTGATCCGGTTACATGGCAGGCCTCTGA
TTCGGTCTTCGTCTTCAGTTTTCTCAACTCTAAATGGCGCGCGGGGGCTAACATGCCAGG
TGTCAAGAGATCATTCTTCGGATGCGCTTCGGATTCGGATCGGACGGTGTTGGTTGCCGG
AGGACACGACGAGGAGAAGCAAGCGCTGACGTCAGCGATGGTGTATGATCTAGCAGAAGA
CAAGTGGACGTTTTTGTCGGATATTTCGCGGGAACGAGACGAGTGCAAGGCCATATTCCA
CGCTGGCAAATTCCACGTCATCGGTGGATACGCCACGGAGGAACAGGGGCAGTTCAGTAA
ATCTGCTGAATCCTTCGATGTGTCCATGTGGCTATGGGGTCCAGTGAAAGAGGAGTT*CT
CGACGGCGGGGAAACCGTAAGCACTCCGATATACGCTACCACCGCCGAAGACGGAGATCT
GTTTGCGTGCTGGCGTGGAGATGTGATGGTTCTGAAAAATGACACGTGGCA*AAAGTAAG
CCAGATCCCTGCTGACATGTACAGTGTGGCCTACGTGGTAACGAG
T

QA 2 646 2 646
DS 

RD RS1BP82TF 671 0 0
G
GGAGCTTCCTCCGATTCCGGGTCAATCCAACGGACTGCCTCTGTTCTGTAAAATGGTTTC
TATCGGGTCGGATCTTATTGTATTGGGTGGGCTTGATCCGGTTACATGGCAGGCCTCTGA
TTCGGTCTTCGTCTTCAGTTTTCTCAACTCTAAATGGCGCGCGGGGGCTAACATGCCAGG
TGTCAAGAGATCATTCTTCGGATGCGCTTCGGATTCGGATCGGACGGTGTTGGTTGCCGG
AGGACACGACGAGGAGAAGCAAGCGCTGACGTCAGCGATGGTGTATGATCTAGCAGAAGA
CAAGTGGACGTTTTTGTCGGATATTTCGCGGGAACGAGACGAGTGCAAGGCCATATTCCA
CGCTGGCAAATTCCACGTCATCGGTGGATACGCCACGGAGGAACAGGGGCAGTTCAGTAA
ATCTGCTGAATCCTTCGATGTGTCCATGTGGCTATGGGGTCCAGTGAAAGAGGAGTT*CT
CGACGGCGGGGAAACCGTAAGCACTCCGATATACGCTATCACCGCCGAAGACGGAGATCT
GTTTGCGTGCTGGCGTGGAGATGTGATGGTTCTGAAAAATGACACGTGGCA*AAAGTAAG
CCAGATCCCTGCTGACATGTACAGTGTGGCCTACGTGGTAACGAGGTCGGGGAAGTTGAT
TGTGATCGGC

QA 2 671 2 671
DS 

RD RS1BP82JQ 747 0 0
CGCGGGGGCTAACATGCCAGGTGTCAAGAGATCATTCTTCGGATGCGCTTCGGATTCGGA
TCGGACGGTGTTGGTTGCCGGAGGACACGACGAGGAGAAGCAAGCGCTGACGTCAGCGAT
GGTGTATGATCTAGCAGAAGACAAGTGGACGTTTTTGTCGGATATTTCGCGGGAACGAGA
CGAGTGCAAGGCCATATTCCACGCTGGCAAATTCCACGTCATCGGTGGATACGCCACGGA
GGAACAGGGGCAGTTCAGTAAATCTGCTGAATCCTTCGATGTGTCCATGTGGCTATGGGG
TCCAGTGAAAGAGGAGTT*CTCGACGGCGGGGAAACCGTAAGCACTCCGATATACGCTAC
CACCGCCGAAGACGGAGATCTGTTTGCGTGCTGGCGTGGAGATGTGATGGTTTTGAAAAA
TGACACGTGGCA*AAAGTAAGCCAGATCCCTGCTGACATGTACAGTGTGGCCTACGTGGT
AACGAGGTCGGGGAAGTTGATTGTGATCGGCAACGGCAAGACTTTGGCTGGTTATAGTGG
CTCCACCGTAGGGTACATATGTGATTTAAGTAGCTTTCGATGGGTAAAATTAGAAACACA
TGTTGGTCATGTGCAAGCTGGTTGCTTCTTGGAGGTCTAATATGAAATCCTTCAATCTCT
GGAGTTTAGTCAAAACCGGTAGGTTTTCTTGGATGTTAGTGCATAAATCTCTCTTTCAAA
GGAGTAAAGAAATGTAGTTGTGTGAAT

QA 1 747 1 747
DS 

RD RS1BT36JQ 770 0 0
TAACATGCCAGGTGTCAAGAGATCATTCTTCGGATGCGCTTCGGATTCGGATCGGACGGT
GTTGGTTGCCGGAGGACACGACGAGGAGAAGCAAGCGCTGACGTCAGCGATGGTGTATGA
TCTAGCAGAAGACAAGTGGACGTTTTTGCCGGATATGTCGCGGGAACGAGACGAGTGCAA
GGCCATATTCCACGCTGGCAAATTCCACGTCATCGGTGGATACGCCACGGAGGAACAGGG
GCAGTTCAGTAAATCTGCTGAATCCTTCGATGTGTCCATGTGGCTATGGGGTCCAGTGAA
AGAGGAGTTTCTCGACGGCGGGGAAACCGTAAGCACTCCGATATACGCTACCACCGCCGA
AGACGGAGATCTGTTTGCGTGCTGGCGTGGAGATGTGATGGTTCTGAAAAATGACACGTG
GCAGAAAGTAAGCCAGATCCCTGCTGACATGTACAGTGTGGCCTACGTGGTAACGAGGTC
GGGGAAGTTGATTGTGATCGGCAACGGCAAGACTTTGGCTGGTTATAGTGGCTCCACCGT
AGGGTACATATGTGATTTAAGTAGCTTTCGATGGGTAAAATTAGAAACACATGTTGGTCA
TGTGCAAGCTGGTTGCTTCTTGGAGGTCTAATATGAAATCCTTCAATCTCTGGAGTTTAG
TCAAAACCGGTAGGTTTTCTTGGATGTTAGTGCATAAATCTCTCTTTCAAAGGAGTAAAG
AAATGTAGTTGTGTGAATACATATAAAAATTATATGATTGTATGTTTTCC

QA 1 770 1 770
DS 

RD RS1BO12JQ 695 0 0
GATTCGGATCGGACGGTGTTGGTTGCCGGAGGACACGACGAGGAGAAGCAAGCGCTGACG
TCAGCGATGGTGTATGATCTAGCAGAAGACAAGTGGACGTTTTTGTCGGATATTTCGCGG
GAACGAGACGAGTGCAAGGCCATATTCCACGCTGGCAAATTCCACGTCATCGGTGGATAC
GCCACGGAGGAACAGGGGCAGTTCAGTAAATCTGCTGAATCCTTCGATGTGTCCATGTGG
CTATGGGGTCCAGTGAAAGAGGAGTT*CTCGACGGCGGGGAAACCGTAAGCACTCCGATA
TACGCTACCACCGCCGAAGACGGAGATCTGTTTGCGTGCTGGCGTGGAGATGTGATGGTT
TTGAAAAATGACACGTGGCA*AAAGTAAGCCAGATCCCTGCTGACATGTACAGTGTGGCC
TACGTGGTAACGAGGTCGGGGAAGTTGATTGTGATCGGCAACGGCAAGACTTTGGCTGGT
TATAGTGGCTCCACCGTAGGGTACATATGTGATTTAAGTAGCTTTCGATGGGTAAAATTA
GAAACACATGTTGGTCATGTGCAAGCTGGTTGCTTCTTGGAGGTCTAATATGAAATCCTT
CAATCTCTGGAGTTTAGTCAAAACCGGTAGGTTTTCTTGGATGTTAGTGCATAAATCTCT
CTTTCAAAGGAGTAAAGAAATGTAGTTGTGTGAAT

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 6

CO CL1216Contig1 726 6 8 U
AGCTGTCTCAATCATTTTACATAAGCTACTAACATAATGAGGTACTTATATACATAACCA
ACTGTAGAGTTATCTCAGTTTCAAATCTTACGAGGTTCTTTTGACACTGATCAACTAAAC
AGAGCAAAGCCCATTCGTTATTATTGCTAAGTAAGAGGTGACCAAAACTATGGCAAATAG
GCAAGAACTGTGACATCGTCTTGGGTTTTACATAAAAGAGCATCAAAAAAG*AGAATCTA
ACTAATTGGCTTTGGTCCTGTACACAACTTCGAGGCATTCTTTGGCTCGAACAACTTTAG
ACTGAAGGTAAAAGCTCCCAGCTTTCGCGTTGTTCTCAAAGAGCTTGTCGTATTTCTGTA
AAATCTCTACCCAAGAGGTCTGCTCGGTTACACCGAGAATCTGCCTAGCCTCTTGCGCAT
TAATGGCTTTTCCTGCTTTACGTACTGCATTCTGCATTGCTTCCTGTGCAACACCAGTTT
TAGATGCATTTGCAATGGCTTGACGATAGGCTTGAAAGACAGCACGACCCAATATCCCAG
AACCCATCACAATGAACTGCGCAATTATTCTACTAGCCATGGAAGCAGATTAGTTGTGAC
CCGTTTGAATTGGAGAAGATGCCTTCTTTCGTTAACGAGATTAGGATTCGCTTTTCGGCG
AGGAAGGCAATTTAACAACAATCTAGGGTTCTCTTTTGTTTAGCTCGTGTTCGTGTGATT
AAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 
25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1F113JQ U 1
AF RS1H664JQB U 122
AF RS1H664TF C 122
AF RS1F113TF C 151
AF RS1BY88TF C 82
AF RS1BY88JQ U 82
BS 1 115 RS1F113JQ
BS 116 116 RS1BY88JQ
BS 117 119 RS1F113JQ
BS 120 120 RS1BY88JQ
BS 121 550 RS1F113JQ
BS 551 551 RS1BY88JQ
BS 552 586 RS1F113JQ
BS 587 726 RS1BY88JQ

RD RS1F113JQ 586 0 0
AGCTGTCTCAATCATTTTACATAAGCTACTAACATAATGAGGTACTTATATACATAACCA
ACTGTAGAGTTATCTCAGTTTCAAATCTTACGAGGTTCTTTTGACACTGATCAACAAAAT
AGAGCAAAGCCCATTCGTTATTATTGCTAAGTAAGAGGTGACCAAAACTATGGCAAATAG
GCAAGAACTGTGACATCGTCTTGGGTTTTACATAAAAGAGCATCAAAAAAG*AGAATCTA
ACTAATTGGCTTTGGTCCTGTACACAACTTCGAGGCATTCTTTGGCTCGAACAACTTTAG
ACTGAAGGTAAAAGCTCCCAGCTTTCGCGTTGTTCTCAAAGAGCTTGTCGTATTTCTGTA
AAATCTCTACCCAAGAGGTCTGCTCGGTTACACCGAGAATCTGCCTAGCCTCTTGCGCAT
TAATGGCTTTTCCTGCTTTACGTACTGCATTCTGCATTGCTTCCTGTGCAACACCAGTTT
TAGATGCATTTGCAATGGCTTGACGATAGGCTTGAAAGACAGCACGACCCAATATCCCAG
AACCCATCACGATGAACTGCGCAATTATTCTACTAGCCATGGAAGC

QA 1 586 1 586
DS 

RD RS1H664JQB 463 0 0
GAGCAAAGCCCATTCGTTATTATTGCTAAGTAAGAGGTGACCAAA*CTATGGCAAATAGG
CAAGAACTGTGACATCGTCTTGGGTTTTACATAAAAGAGCATCAAAAAAG*AGAATCTAA
CTAATTGGCTTTGGTCCTGTACACAACTTCGAGGCATTCTTTGGCTCGAACAACTTTAGA
CTGAAGGTAAAAGCTCCCAGCTTTCGCGTTGTTCTCAAAGAGCTTGTCGTATTTCTGTAA
AATCTCTACCCAAGAGGTCTGCTCGGTTACACCGAGAATCTGCCTAGCCTCTTGCGCATT
AATGGCTTTTCCTGCTTTACGTACTGCATTCTGCATTGCTTCCTGTGCAACACCAGTTTT
AGATGCATTTGCAATGGCTTGACGATAGGCTTGAAAGACAGCACGACCCAATATCCCAGA
ACCCATCACAATGAACTGCGCAATTATTCTACTAGCCATGGAA

QA 1 463 1 463
DS 

RD RS1H664TF 598 0 0
GAGCAAAGCCCATTCGTTATTATTGCTAAGTAAGAGGTGACCAAA*CTATGGCAAATAGG
CAAGAACTGTGACATCGTCTTGGGTTTTACATAAAAGAGCATCAAAAAAG*AGAATCTAA
CTAATTGGCTTTGGTCCTGTACACAACTTCGAGGCATTCTTTGGCTCGAACAACTTTAGA
CTGAAGGTAAAAGCTCCCAGCTTTCGCGTTGTTCTCAAAGAGCTTGTCGTATTTCTGTAA
AATCTCTACCCAAGAGGTCTGCTCGGTTACACCGAGAATCTGCCTAGCCTCTTGCGCATT
AATGGCTTTTCCTGCTTTACGTACTGCATTCTGCATTGCTTCCTGTGCAACACCAGTTTT
AGATGCATTTGCAATGGCTTGACGATAGGCTTGAAAGACAGCACGACCCAATATCCCAGA
ACCCATCACAATGAACTGCGCAATTATTCTACTAGCCATGGAAGCAGATTAGTTGTGACC
CGTTTGAATTGGAGAAGATGCCTTCTTTCGTTAACGAGATTAGGATTCGCTTTTCGGCGA
GGAAGGCAATTTAACAACAATCTAGGGTTCTCTTTTGTTTAGCTCGTGTTCGTGTG
TC

QA 1 596 1 596
DS 

RD RS1F113TF 536 0 0
GTAAGAGGTGACCAAAACTATGGCAAATAGGCAAGAACTGTGACATCGTCTTGGGTTTGA
CATAAAAGAGCATCAAAAAAG*AGAATCTAACTAATTGGCTTTGGTCCTGTACACAACTT
CGAGGCATTCTTTGGCTCGAACAACTTTAGACTGAAGGTAAAAGCTCCCAGCTTTCGCGT
TGTTCTCAAAGAGCTTGTCGTATTTCTGTAAAATCTCTACCCAAGAGGTCTGCTCGGTTA
CACCGAGAATCTGCCTAGCCTCTTGCGCATTAATGGCTTTTCCTGCTTTACGTACTGCAT
TATGCATTGCTTCCTGTGCAACACCAGTTTTAGATGCATTTGCAATGGCTTGACGATAGG
CTTGAAAGACAGCACGACCCAATATCCCAGAACCCATCACGATGAACTGCGCAATTATTC
TACTAGCCATGGAAGCAGATTAGTTGTGACCCGTTTGAATTGGAGAAGATGCCTTCTTTC
GTTAACGAGATTAGGATTCGCTTTTCGGCGAGGAAGGCAATTTAACAACAATCT
CC

QA 1 534 1 534
DS 

RD RS1BY88TF 645 0 0
CG
AATCTTACGAGGTTCTTTTGACACTGATCAACTAAACAGAGCAAAGCCCATTCGTTATTA
TTGCTAAGTAAGAGGTGAACAAAACTATGGCAAATAGGCAAGAACTGTGACATCGTCTTG
GGTTTTACATAAAAGAGCATCAAAAAAGGAGAATCTAACTAATTGGCTTTGGTCCTGTAC
ACAACTTCGAGACATTCTTTGGCTCGAACAACTTTAGACTGAAGGTAAAAGCTCCCAGCT
TTCGCGTTGTTCTCAAAGAGCTTGTCGTATTTCTGTAAAATCTCTACCCAAGAGGTCTGC
TCGGTTACACCGAGAATCTGCCTAGCCTCTTGCGCATTAATTGCTTTTCCTGCTTTACGT
ACTGCATTCTGCATCGCTTCCTGCGCAACACCAGTTTTAGATGCATTTGCAATGGCTTGA
CGATAGGCTTGAAAGACAGCACGACCCAATATCTCAGAACCCATCACAATGAACTGCGCA
ATTATTCTACTAGCCATGGAAGCAGATTAGTTGTGACCCGTTTGAATTGGAGAAGATGCC
TTCTTTCGTTAACGAGATTAGGATTCGCTTTTCGGCGAGGAAGGCAATTTAACAACAATC
TAGGGTTCTCTTTTGTTTAGCTCGTGTTCGTGTG
ATTAAAAAA

QA 3 636 3 636
DS 

RD RS1BY88JQ 645 0 0
CG
AATCTTACGAGGTTCTTTTGACACTGATCAACTAAACAGAGCAAAGCCCATTCGTTATTA
TTGCTAAGTAAGAGGTGAACAAAACTATGGCAAATAGGCAAGAACTGTGACATCGTCTTG
GGTTTTACATAAAAGAGCATCAAAAAAGGAGAATCTAACTAATTGGCTTTGGTCCTGTAC
ACAACTTCGAGACATTCTTTGGCTCGAACAACTTTAGACTGAAGGTAAAAGCTCCCAGCT
TTCGCGTTGTTCTCAAAGAGCTTGTCGTATTTCTGTAAAATCTCTACCCAAGAGGTCTGC
TCGGTTACACCGAGAATCTGCCTAGCCTCTTGCGCATTAATTGCTTTTCCTGCTTTACGT
ACTGCATTCTGCATCGCTTCCTGCGCAACACCAGTTTTAGATGCATTTGCAATGGCTTGA
CGATAGGCTTGAAAGACAGCACGACCCAATATCTCAGAACCCATCACAATGAACTGCGCA
ATTATTCTACTAGCCATGGAAGCAGATTAGTTGTGACCCGTTTGAATTGGAGAAGATGCC
TTCTTTCGTTAACGAGATTAGGATTCGCTTTTCGGCGAGGAAGGCAATTTAACAACAATC
TAGGGTTCTCTTTTGTTTAGCTCGTGTTCGTGTGATTAAAAAA

QA 3 645 3 645
DS 



AS 1 6

CO CL1217Contig1 816 6 4 U
GTTCAAACAAATACACAATGTTATCGACTTACCTCGCTGTATTCGTTCTTCTCTTCAGTG
GTTTCACGGCCAATAAAGAGGCAGATTCTCTGATTCAAAGAAATTGCAAGCGTATATCAG
TCATTCCAAGCGTGATGGATTCAGAAAATATCCTTAAGCTTTGCATCACATCTCTTAAAG
AGAATCCAGAGACCAAGAAAGTGAGAAATAAGATTGAATTGGTCGTGGTAGGTACGAATA
ACGCGATGTCTAACATAACAAACATGAAAAGAACTGTGGAGAAGTTTATAAAAGAGAAGA
GATATAAGAGTAGGCTTATTAAAAAGAAGTTGGAGGTTTGTCTTAACCATTACCAAGATG
GCTATGAGTGGCTAACCTCAGGTTTGAATTACGTCAAAGAGAAGGATCTTGAGTTGGCTT
CAGATGATTTGGGGATGGCAAATAAGGCAGTAACCGATTGCGGAGAGAGATTCAGAAAAG
GCGAAATAAATCCCTTTGAAAAAGAGAATATCGTCCTCTACGTAATGACCAATATTCCTT
ACATGATTAGTGCGATGGATGATTGTGAGACGAGCAAAGGCGGTTGCACGTAGAGACTTA
CGGGGGG*CACGTGCCCCGATCTCTGTTTTATTTTCCTTTCCTAGTTTACATTGACTTTG
TGAAAGGCTCTCAATTCAAAAGTTAAACATCATGAGAAAATACAATGTGCCCTGACTCAA
TAATGTTCTACGTCCGCCCCTGGAGACGAGTGCAGTGAGGTGTTAAGTGAGTTCTATTAA
AAGAAAAGTTAAGAATAAATACAGTTAGTTCTCAGT


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RS1AW70TF U 3
AF RS1D847TF U 3
AF RS1GA29TF U 1
AF RS1AW70JQ C 4
AF RS1GA29JQ C 225
AF RS1D847JQ C 156
BS 1 607 RS1GA29TF
BS 608 608 RS1AW70JQ
BS 609 662 RS1GA29TF
BS 663 816 RS1AW70JQ

RD RS1AW70TF 590 0 0
GGA
AACAAATACACAATGTTATCGACTTACCTCGCTGTATTCGTTCTTCTCTTCAGTGGTTTC
ACGGCCAATAAAGAGGCAGATTCTCTGATTCAAAGAAATTGCAAGCGTATATCAGTCATT
CCAAGCGTGATGGATTCAGAAAATATCCTTAAGCTTTGCATCACATCTCTTAAAGAGAAT
CCAGAGACCAAGAAAGTGAGAAATAAGGTTGAATTGGTCGTGGTAGGTACGAATAACGCG
ATGTCTAACATAACAAACATGAAAAGAACTGTGGAGAAGTTTATAAAAGAGAAGAGATAT
AAGAGTAGGCTTATTAAAAAGAAGTTGGAGGTTTGTCTTAACCATTACCAAGATGGCTAT
GAGTGGCTAACCTCAGGTTTGAATTACGTCAAAGAGAAGGATCTTGAGTTGGCTTCAGAT
GATTTGGGGATGGCAAATAAGGCAGTAACCGATTGCGGAGAGAGATTCAGAAAAGGCGAA
ATAAATCCCTTTGAAAAAGAGAATATCGTCCTCTACGTAATGACCAATATTCCTTACATG
ATTAGTGCGATGGATGATTGTGAGACGAGCAAAGGCGGTTGCACGTA

QA 4 590 4 590
DS 

RD RS1D847TF 604 0 0
GGA
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ACGGCCAATAAAGAGGCAGATTCTCTGATTCAAAGAAATTGCAAGCGTATATCAGTCATT
CCAAGCGTGATGGATTCAGAAAATATCCTTAAGCTTTGCATCACATCTCTTAAAGAGAAT
CCAGAGACCAAGAAAGTGAGAAATAAGATTGAATTGGTCGTGGTAGGTACGAATAACGCG
ATGTCTAACGTAACAAACATGAAAAGAACTGTGGAGAAGTTTATAAAAGAGAAGAGATAT
AAGAGTAGGCTTATTAAAAAGAAGTTGGAGGTTTGTCTTAACCATTACCAAGATGGCTAT
GAGTGGCTAACCTCAGGTTTGAATTACGTCAAAGAGAAGGATCTTGAGTTGGCTTCAGAT
GATTTGGGGATGGCAAATAAGGCAGTAACCGATTGCGGAGAGAGATTCAGAAAAGGCGAA
ATAAATCCCTTTGAAAAAGAGAATATCGTCCTCTACGTAATGACCAATATTCCTTACATG
ATTAGTGCGATGGATGATTGTGAGACGAGCAAAGGCGGTTGCACGTAGAGACTTACGGGG
G

QA 4 604 4 604
DS 

RD RS1GA29TF 662 0 0
GTTCAAACAAATACACAATGTTATCGACTTACCTCGCTGTATTCGTTCTTCTCTTCAGTG
GTTTCACGGCCAATAAAGAGGCAGATTCTCTGATTCAAAGAAATTGCAAGCGTATATCAG
TCATTCCAAGCGTGATGGATTCAGAAAATATCCTTAAGCTTTGCATCACATCTCTTAAAG
AGAATCCAGAGACCAAGAAAGTGAGAAATAAGATTGAATTGGTCGTGGTAGGTACGAATA
ACGCGATGTCTAACATAACAAACATGAAAAGAACTGTGGAGAAGTTTATAAAAGAGAAGA
GATATAAGAGTAGGCTTATTAAAAAGAAGTTGGAGGTTTGTCTTAACCATTACCAAGATG
GCTATGAGTGGCTAACCTCAGGTTTGAATTACGTCAAAGAGAAGGATCTTGAGTTGGCTT
CAGATGATTTGGGGATGGCAAATAAGGCAGTAACCGATTGCGGAGAGAGATTCAGAAAAG
GCGAAATAAATCCCTTTGAAAAAGAGAATATCGTCCTCTACGTAATGACCAATATTCCTT
ACATGATTAGTGCGATGGATGATTGTGAGACGAGCAAAGGCGGTTGCACGTAGAGACTTA
CGGGGGGGCACGTGCCCCGATCTCTGTTTTATTTTCCTTTCCTAGTTTACATTGACTTTG
TG

QA 1 662 1 662
DS 

RD RS1AW70JQ 813 0 0
GG
AACAAATACACAATGTTATCGACTTACCTCGCTGTAT*CGT*CTTCTCTTCAGTGGTTTC
ACGGCCAATAAAGAGGCAGATTCTCTGATTCAAAGAAATTGCAAGCGTATATCAGTCATT
CCAAGCGTGATGGATTCAGAAAATATCCTTAAGCTTTGCATCACATCTCTTAAAGAGAAT
CCAGAGACCAAGAAAGTGAGAAATAAGGTTGAATTGGTCGTGGTAGGTACGAATAACGCG
ATGTCTAACATAACAAACATGAAAAGAACTGTGGAGAAGTTTATAAAAGAGAAGAGATAT
AAGAGTAGGCTTATTAAAAAGAAGTTGGAGGTTTGTCTTAACCATTACCAAGATGGCTAT
GAGTGGCTAACCTCAGGTTTGAATTACGTCAAAGAGAAGGATCTTGAGTTGGCTTCAGAT
GATTTGGGGATGGCAAATAAGGCAGTAACCGATTGCGGAGAGAGATTCAGAAAAGGCGAA
ATAAATCCCTTTGAAAAAGAGAATATCGTCCTCTACGTAATGACCAATATTCCTTACATG
ATTAGTGCGATGGATGATTGTGAGACGAGCAAAGGCGGTTGCACGTAGAGACTTACGGGG
GG*CACGTGCCCCGATCTCTGTTTTATTTTCCTTTCCTAGTTTACATTGACTTTGTGAAA
GGCTCTCAATTCAAAAGTTAAACATCATGAGAAAATACAATGTGCCCTGACTCAATAATG
TTCTACGTCCGCCCCTGGAGACGAGTGCAGTGAGGTGTTAAGTGAGTTCTATTAAAAGAA
AAGTTAAGAATAAATACAGTTAGTTCTCAGT

QA 3 813 3 813
DS 

RD RS1GA29JQ 589 0 0
GTGGTAGGTACGAATAACGCGATGTCTAACATAACAAACATGAAAAGAACTGTGGAGAAG
TTTATAAAAGAGAAGAGATATAAGAGTAGGCTTATTAAAAAGAAGTTGGAGGTTTGTCTT
AACCATTACCAAGATGGCTATGAGTGGCTAACCTCAGGTTTGAATTACGTCAAAGAGAAG
GATCTTGAGTTGGCTTCAGATGATTTGGGGATGGCAAATAAGGCAGTAACCGATTGCGGA
GAGAGATTCAGAAAAGGCGAAATAAATCCCTTTGAAAAAGAGAATATCGTCCTCTACGTA
ATGACCAATATTCCTTACATGATTAGTGCGATGGATGATTGTGAGACGAGCAAAGGCGGT
TGCACGTAGAGACTTACGGGGGG*CACGTGCCCCGATCTCTGTTTTATTTTCCTTTCCTA
GTTTACATTGACTTTGTGAAAGGCTCTCAATTCAAAAGTTAAACATCATGAGAAAATACA
ATGTGCCCTGACTCAATAATGTTCTACGTCCGCCCCTGGAGACGAGTGCAGTGAGGTGTT
AAGTGAGTTCTATTAAAAGAAAAGTTAAGAATAAATACAGTTAGTTCTC

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1D847JQ 658 0 0
AAGCTTTGCATCACATCTCTTAAAGAGAATCCAGAGACCAAGAAAGTGAGAAATAAGATT
GAATTGGTCGTGGTAGGTACGAATAACGCGATGTCTAACGTAACAAACATGAAAAGAACT
GTGGAGAAGTTTATAAAAGAGAAGAGATATAAGAGTAGGCTTATTAAAAAGAAGTTGGAG
GTTTGTCTTAACCATTACCAAGATGGCTATGAGTGGCTAACCTCAGGTTTGAATTACGTC
AAAGAGAAGGATCTTGAGTTGGCTTCAGATGATTTGGGGATGGCAAATAAGGCAGTAACC
GATTGCGGAGAGAGATTCAGAAAAGGCGAAATAAATCCCTTTGAAAAAGAGAATATCGTC
CTCTACGTAATGACCAATATTCCTTACATGATTAGTGCGATGGATGATTGTGAGACGAGC
AAAGGCGGTTGCACGTAGAGACTTACGGGGGG*CACGTGCCCCGATCTCTGTTTTATTTT
CCTTTCCTAGTTTACATTGACTTTGTGAAAGGCTCTCAATTCAAAAGTTAAACATCGTGA
GAAAATACAATGTGCCCTGACTCAATAATGTTCTACGTCCGCCCCTGGAGACGAGTGCAG
TGAGGTGTTAAGTGAGTTCTATTAAAAGAAAAGTTAAGAATAAATACAGTTAGTTCTC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 2 5

CO CL1218Contig1 791 3 26 U
TTTTTTTTTGCGAAACAATTTATTTTCTAAAACATCTATCTTTAAAAAAGATAGGGAGAT
AGGGAGTACATAATTTCCAAAAGAAAAGTAAAGCAAATGAAAAACTGAGAAAAAGACAAC
TCTGTTTTTTACTAATTTGTATTGCTTCAATAGATAATTAAGAAAACACCTATGATTTAA
GGTAATATAAGCTCTTCTTATGGATTAGAAGTGCAATCTCCAAGCCATATTCTTTTACAT
GAAATCATCGTCGTCCATGGCGCCATAAGGACCCGAAACAAGATCATCGTCAGGCTTATC
CACATGCAGCTGTTTCTTCTTACCTGTCTTCTTTTTGCCGGCAGCAGCTTCTTTCTCTGC
CTTGAGTTTTTCGTTACCTATTGCCGAAACTGAGGAAGCAACGCCTTTAACATCAGCTGC
TTTCATATTTGCCACAGAAAGTCTCATCACTGCTTTGAGTAGCCCAATATAGTGAAAGCT
TTTCTCATAAGGTACAAGTTTACGAGATATCATCTCAGCATACTCCAAGAAATCGCTTTC
AGACTTGGGAATGAAAACATCAACGCTTTTCTCATCAGTCTTTGCTCCAAAGAGTTCAGC
AGTTGCCTCGTAATCAGCTTCCTCCACTAGCCTCTGCATGCGAAGTTTGTCAGCAATAGG
ATCAAAAGGTTCATCCTTTGATGATGGTTCTTTTGGAGGAGCTTCAACAGATTTACCCTT
CTTTTCAACGCCTTTCTTTGGAGCAGGCTTTACTACAGCTGCCGGAGTAGGTTCATCATC
CTCCTCCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AH52JQ U 113
AF RS1BK53JQ U 24
AF RS1BK53TF C 1
BS 1 23 RS1BK53TF
BS 24 114 RS1BK53JQ
BS 115 244 RS1AH52JQ
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BS 684 686 RS1BK53JQ
BS 687 691 RS1AH52JQ
BS 692 692 RS1BK53JQ
BS 693 729 RS1AH52JQ
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BS 732 779 RS1AH52JQ
BS 780 791 RS1BK53TF

RD RS1AH52JQ 667 0 0
AG
GACAACTCTGTTTTTTACTAATTTGTATTGCTTCAATAGATAATTAAGAAAACACCTATG
ATTTAAGGTAATATAAGCTCTTCTTATGGATTAGAAGTGCAATCTCCAAGCCATATTCTT
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CTTATCCACATGCAGTTGTTTCTTCTTACCTGTCTTCTTTTTGCCGGCAGCAGCTTCTTT
CTCTGCCTTGAGTTTTTCGTTACCTATTGCCGAAACAGAGGAAGCAACGTCTTTAACATC
AGCTGCTTTCATATTTGCCACAGAAAGTCTCATCACTGCTTTGAGTAGCCCAATATAGTG
AAAGCTTTTCTCATAAGGTACAAGTTTACGAGATATCATCTCAGCATACTCCAAGAAATC
GCTTTCGGACTTGGGAATGAAAACATCAACGGCTTTTTCATCAGTCTTTGCTCCAAACAG
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AATAGGATCAAAAGGTTCATCCTTTGATG***GTTCTCTTGGAGGAGCTTCAACAGATTT
ACCCTTCTTTTCAACAGCTTTCTTTGGAGCAGGCTTTACTACAGCTGCCGGAGTAGGTTC
ATCAT

QA 3 667 3 667
DS 

RD RS1BK53JQ 717 0 0
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AAAAGTAAAGCAAATGAAAAACTGAGAAAAAGACAACTCTGTTTTTTACTAATTTGTATT
GCTTCAATAGATAATTAAGAAAACACCTATGATTTAAGGTAATATAAGCTCTTCTTATGG
ATTAGAAGTGCAATCTCCAAGCCATATTCTTTTACATGAAATCATCGTCGTCCATGGCGC
CATAAGGACCCGAAACAAGATCATCGTCAGGCTTATCCACATGCAGCTGTTTCTTCTTAC
CTGTCTTCTTTTTGCCGGCAGCAGCTTCTTTCTCTGCCTTGAGTTTTTCGTTACCTATTG
CCGAAACTGAGGAAGCAACGCCTTTAACATCAGCTGCTTTCATATTTGCCACAGAAAGTC
TCATCACTGCTTTGAGTAGCCCAATATAGTGAAAGCTTTTCTCATAAGGTACAAGTTTAC
GAGATATCATCTCAGCATACTCCAAGAAATCGCTTTCAGACTTGGGAATGAAAACATCAA
CGCTTTTCTCATCAGTCTTTGCTCCAAAGAGTTCAGCAGTTGCCTCGTAATCAGCTTCCT
CCACTAGCCTCTGCATGCGAAGTTTGTCAGCAATAGGATCAAAAGGTTCATCCTTTGATG
ATGGTTCTTTTGGAGGAGCTTCAACAGATTTACCCTTCTTTTCAACGCCTTTCTTTG

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1BK53TF 791 0 0
TTTTTTTTTGCGAAACAATTTATTTTCTAAAACATCTATCTTTAAAAAAGATAGGGAGAT
AGGGAGTACATAATTTCCAAAAGAAAAGTAAAGCAAATGAAAAACTGAGAAAAAGACAAC
TCTGTTTTTTACTAATTTGTATTGCTTCAATAGATAATTAAGAAAACACCTATGATTTAA
GGTAATATAAGCTCTTCTTATGGATTAGAAGTGCAATCTCCAAGCCATATTCTTTTACAT
GAAATCATCGTCGTCCATGGCGCCATAAGGACCCGAAACAAGATCATCGTCAGGCTTATC
CACATGCAGCTGTTTCTTCTTACCTGTCTTCTTTTTGCCGGCAGCAGCTTCTTTCTCTGC
CTTGAGTTTTTCGTTACCTATTGCCGAAACTGAGGAAGCAACGCCTTTAACATCAGCTGC
TTTCATATTTGCCACAGAAAGTCTCATCACTGCTTTGAGTAGCCCAATATAGTGAAAGCT
TTTCTCATAAGGTACAAGTTTACGAGATATCATCTCAGCATACTCCAAGAAATCGCTTTC
AGACTTGGGAATGAAAACATCAACGCTTTTCTCATCAGTCTTTGCTCCAAAGAGTTCAGC
AGTTGCCTCGTAATCAGCTTCCTCCACTAGCCTCTGCATGCGAAGTTTGTCAGCAATAGG
ATCAAAAGGTTCATCCTTTGATGATGGTTCTTTTGGAGGAGCTTCAACAGATTTACCCTT
CTTTTCAACGCCTTTCTTTGGAGCAGGCTTTACTACAGCTGCCGGAGTAGGTTCATCATC
CTCCTCCTCCC

QA 1 791 1 791
DS 



CO CL1218Contig2 804 2 6 U
GGGTAGAAAAAAAGTGAGAGAGAGAGAGAAAGCCCTAAAGACACCAAATAGTTTTTGGCA
GTCGTATCGTCTTCTCCTTCTTCCTTTGAACATCGGAGTTTTCACCGACGAATCGAACTG
TTTTTCTATTTCTCTCTACGATTCAGGTTTTTCACTTGGATTCAGAACAGCAAATTGTAC
TTTTGTTCTTATAGATAATTAGAAGACAAAGATGGATGATTGGGAGACTGAAGACTTTCA
ACCAACTCCTGCAAAAGTCGAACTTAAAAGCAATTGGGATGATGAGGATGTTGAGGAGGA
TGTTGATGAGAATGACATCAAGGACTCTTGGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGATGA
TGATGAACCTACTCCGGCAGCTGTAGTAAAGCCTGCTCCAAAGAAAGCTGTTGAAAAGAA
GGGTAAATCTGTTGAAGCTCCTCCAAGAGAACCATCAAAGGATGAACCTTTTGATCCTAT
TGCTGACAAACTTCGCATGCAGAGGCTAGTGGAGGAAGCTGATTACGAGGCAACTGCTGA
ACTGTTTGGAGCAAAGACTGATGAAAAAGCCGTTGATGTTTTCATTCCCAAGTCCGAAAG
CGATTTCTTGGAGTATGCTGAGATGATATCTCGTAAACTTGTACCTTATGAGAAAAGCTT
TCACTATATTGGGCTACTCAAAGCAGTGATGAGACTTTCTGTGGCAAATATGAAAGCAGC
TGATGTTAAAGACGTTGCTTCCTCTGTTTCGGCAATAGGTAACGAAAAACTCAAGGCAGA
GAAAGAAGCTGCTGCCGGCAAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GP51TF U 1
AF RS1AH52TF U 57
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BS 584 584 RS1AH52TF
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TA

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1AH52TF 748 0 0
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QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 6

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CCCAATCGCGCGTTCTGAGAAACGTCGATCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 5 5 5 35 35 35 35 35 20 20 35 35 25 40 40 40 40 25 25 0 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
0 15 15 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DS57JQ U 1
AF RS1GS77JQ U 1
AF RS1D289JQ U 122
AF RS1D289TF C 132
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GAAACTCGCATTCACCATCCGAGTGTTCTTCGAATGCCCAGCTCTAGGTT*CGTACCCTC
TT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RS1GS77JQ 779 0 0
GC
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TCTTGGGTTAGTAGCTGCGACATACCCTTTCTGGCGACTTCACTGACCGTCTCCTTTCCA
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CAAAAACGACGTAGTTGCGGATTGGATCGTAAGCCATGACGATCCCTCGGA
CTCATC

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TTCTTGGGTTAGTAGCTGCGACATACCCTTTTCGGCGACTTCACTGACCGTCTCCTTTCC
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TCTGCTTCCGCTTGCCTGATAGCAAGTGCTTCTTTAGCTCGGAGCGAGTCGAGATTAACA
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DS 

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CAGAATGTCTGAGTTTTCCCACTGCACAGGAAGCGTCTTAGACAACGCATCGAAGATGCT
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AGCAAGTGCTTCTTTAGCTCGGAGCGAGTCGAGATTAACACAACAGCTGTCAGTAAGAAG
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CGTTGCTCCTCCTCCTGCTGGATCCATGGCGGCCGGCTTCCCAATCGCGCGTTCT
GA

QA 9 783 9 783
DS 

RD RS1GS77TF 761 0 0
TGA
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TGCCGATCAGATCTAA*CGCTTTCTTGGGT*AGTAGCTGCGACATACCCTTTCTGGCGAC
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TCGGAAAGATACGGGCTACGAACACGTACTTCTTTCATCACCAGAATGTCTGAGTTTTCC
CACTGCACAGGAAGCGTCTTAGACAACGCATCGAAGATGCTCTGCGCCTCAGCGGTAACA
CCAACACCCATTCTCTCAGCTTCTGCTTCCGCTTGCCTGATAGCAAGTGCTTCTTTAGCT
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AAATAAGACAGCCCAGTTATGAAACTCGCATTCACCATCCGAGTGTTCTTCGAATGCCCA
GCTCTAGGTTTCGTACCCTCTTCAAAAACGACGTAGTTGCGGATTGGATCGTAAGCCATG
ACGATCCCTCGGAACTCATCTCCGGTGATCACTTTCACCGAATAAATATTCCCCACCGCG
AATTTCTCGCCTTCTCCTCCTCCGATGTCGTTGGCCACCACCGTTGCTCCTCCTCCTGCT
GGATCCATGGCGGCCGGCTTCCCAATCGCGCGTTCT
CC

QA 4 759 4 759
DS 



AS 2 6

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TAGTAGCTTCTCTATCTCAGAATCATATCTTTAGCAACAAAACCAAACTTAGTCACCCCA
AGTCGTCCTACTTGCGCTCAAAACACAATGCCACCAGAGCCAAAACTATCCGGGCCATAA
GCACCGCACCAGCAAGCCAGCCTCCAGTCGCAGATGAACTGAATGATGAACCTCCTGCTG
TCGATTTTGCATTCGTCCATTCCGTGTTGCTACCGGACGGGACACCGGACGTGCATTGGA
GAAGAGCGTGCGGTGGACAGAAACTTAGAGACGTAATGTTGGATTCTAACATCGAACTCT
ATGGTCCTTATAGTAAGCCCTTGTCAAACTGCGCAGGAGTAGGAACCTGCGCTACATGCA
TGGTCGAGATTGTAAATGGAAAGGAGCTTCTCAACCCACGAACTGACATTGAAAAGGAGA
AACTCAAAAGGAAACCAAAAAATTGGAGACTAGCTTGTCAAACCAACGTGGGAAATCCAG
ATTCGACCGGATTGGTCGTTATACAACAATTGCCAGAGTGGAAAGCTCATGAATGGAACA
TCCCTAAGAATTTACCTATTGATGATCCCGAAAGTTCTACGTGAAAATACGATCCATTTG
TTATTGTCTAGATCATGAAACAATAACGATCGAGTTCTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CQ39TF U 1
AF RS1CQ39JQ C 25
BS 1 702 RS1CQ39TF

RD RS1CQ39TF 702 0 0
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TAGTAGCTTCTCTATCTCAGAATCATATCTTTAGCAACAAAACCAAACTTAGTCACCCCA
AGTCGTCCTACTTGCGCTCAAAACACAATGCCACCAGAGCCAAAACTATCCGGGCCATAA
GCACCGCACCAGCAAGCCAGCCTCCAGTCGCAGATGAACTGAATGATGAACCTCCTGCTG
TCGATTTTGCATTCGTCCATTCCGTGTTGCTACCGGACGGGACACCGGACGTGCATTGGA
GAAGAGCGTGCGGTGGACAGAAACTTAGAGACGTAATGTTGGATTCTAACATCGAACTCT
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TGGTCGAGATTGTAAATGGAAAGGAGCTTCTCAACCCACGAACTGACATTGAAAAGGAGA
AACTCAAAAGGAAACCAAAAAATTGGAGACTAGCTTGTCAAACCAACGTGGGAAATCCAG
ATTCGACCGGATTGGTCGTTATACAACAATTGCCAGAGTGGAAAGCTCATGAATGGAACA
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TTATTGTCTAGATCATGAAACAATAACGATCGAGTTCTTTTT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RS1CQ39JQ 678 0 0
AGAC
TATGGGAAGTCTACAGTTGAATGGTTCAGGCTTAGTAGCTTCTCTATCTCAGAATCATAT
CTTTAGCAACAAAACCAAACTTAGTCACCCCAAGTCGTCCTACTTGCGCTCAAAACACAA
TGCCACCAGAGCCAAAACTATCCGGGCCATAAGCACCGCACCAGCAAGCCAGCCTCCAGT
CGCAGATGAACTGAATGATGAACCTCCTGCTGTCGATTTTGCATTCGTCCATTCCGTGTT
GCTACCGGACGGGACACCGGACGTGCATTGGAGAAGAGCGTGCGGTGGACAGAAACTTAG
AGACGTAATGTTGGATTCTAACATCGAACTCTATGGTCCTTATAGTAAGCCCTTGTCAAA
CTGCGCAGGAGTAGGAACCTGCGCTACATGCATGGTCGAGATTGTAAATGGAAAGGAGCT
TCTCAACCCACGAACTGACATTGAAAAGGAGAAACTCAAAAGGAAACCAAAAAATTGGAG
ACTAGCTTGTCAAACCAACGTGGGAAATCCAGATTCGACCGGATTGGTCGTTATACAACA
ATTGCCAGAGTGGAAAGCTCATGAATGGAACATCCCTAAGAATTTACCTATTGATGATCC
CGAAAGTTTTACGTGAAAATACGATCCATTTGTTATTGTTTAGATCATGAAACAATAACG
ATCGAGTTCTTTTT

QA 5 678 5 678
DS 



CO CL1220Contig2 793 4 2 U
ACATTATTAATAACCTTCATATATAATCATTTAGGTTTATCTAAATAGCTAGTTGTATAT
ATGGTTAATATCGACAACGATTAAAATGAACTCGATCGTTATTGTTTCATGATGTAGACA
ATAACAACTGGATCGTAATTTCACGTAGAACTTTCGGGATCATCAATAGGTAAATTCTTA
GGGATGTTCCATTCATGAGCTTTCCACTCTGGCAATTGTTGTATGACGACCAATCCGGTT
GAATCTGGATTTCCCACGTTGGTTTGACAAGCTAGTCTCCAGTTTTTTGGTTTCCTTTTG
AGTTTCTCCTTTTCAATGTCAGTTCGTGGGTTGAGAAGCTCCTTTCCATTTACAATCTCG
ACCATGCAAGTAGCGCAGGTTCCTACTCCTGCGCAGTTTGACAAGGGCTTACTATAAGGA
CCATAGAGTTCGATGTTAGAATCCAACATTATGTCTCTAAGTTTCTGTCCACCGCACGCT
CTTCTCCAATGCACGTCCGGTGTTCCGTCCGGTAGCAACACCGAATGGACGAATGCAAAA
TCGACAGCAGGAGGTTCATCACTCGGCTCATCTACGACTGGAGGCTGGCTTGCTGGTGCG
GTGCTTATGGCTCGGATAGTTTTGGCTCTGGTGGCATTGTGTTTTGAGCGTAAGAAGGAC
GACTTGGGGTTACTAAGTTTGGTTTTGTGGCTAAAGATATGATTTTGAGATAGAGAAGCT
ACTAAGCCTGAACCATTCAACTGTACACTTCCCATATTCTTGCTCTCTTTCTTAAAAGTA
ATCAAAAGAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1E586JQ U 1
AF RS1E586TF C 20
AF RS1CU51JQ U 92
AF RS1CU51TF C 109
BS 1 643 RS1E586JQ
BS 644 793 RS1CU51JQ

RD RS1E586JQ 643 0 0
ACATTATTAATAACCTTCATATATAATCATTTAGGTTTATCTAAATAGCTAGTTGTATAT
ATGGTTAATATCGACAACGATTAAAATGAACTCGATCGTTATTGTTTCATGATGTAGACA
ATAACAACTGGATCGTAATTTCACGTAGAACTTTCGGGATCATCAATAGGTAAATTCTTA
GGGATGTTCCATTCATGAGCTTTCCACTCTGGCAATTGTTGTATGACGACCAATCCGGTT
GAATCTGGATTTCCCACGTTGGTTTGACAAGCTAGTCTCCAGTTTTTTGGTTTCCTTTTG
AGTTTCTCCTTTTCAATGTCAGTTCGTGGGTTGAGAAGCTCCTTTCCATTTACAATCTCG
ACCATGCAAGTAGCGCAGGTTCCTACTCCTGCGCAGTTTGACAAGGGCTTACTATAAGGA
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CTTCTCCAATGCACGTCCGGTGTTCCGTCCGGTAGCAACACCGAATGGACGAATGCAAAA
TCGACAGCAGGAGGTTCATCACTCGGCTCATCTACGACTGGAGGCTGGCTTGCTGGTGCG
GTGCTTATGGCTCGGATAGTTTTGGCTCTGGTGGCATTGTGTT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RS1E586TF 731 0 0
ATATAT
ATCATTTAGGTTTATCTAAATAGCTAGT*GTATATATGGTTAATATCGACAACGATTAAA
ATGAACTCGATCGTTATTGTTTCATGATGTAGACAATAACAACTGGATCGTAATTTCACG
TAGAACTTTCGGGATCATCAATAGGTAAATTCTTAGGGATGTTCCATTCATGAGCTTTCC
ACTCTGGCAATTGTTGTATGACGACCAATCCGGTTGAATCTGGATTTCCCACGTTGGTTT
GACAAGCTAGTCTCCAGTTTTTTGGTTTCCTTTTGAGTTTCTCCTTTTCAATGTCAGTTC
GTGGGTTGAGAAGCTCCTTTCCATTTACAATCTCGACCATGCAAGTAGCGCAGGTTCCTA
CTCCTGCGCAGTTTGACAAGGGCTTACTATAAGGACCATAGAGTTCGATGTTAGAATCCA
ACATTATGTCTCTAAGTTTCTGTCCACCGCACGCTCTTCTCCAATGCACGTCCGGTGTTC
CGTCCGGTAGCAACACCGAATGGACGAATGCAAAATCGACAGCAGGAGGTTCATCACTCG
GCTCATCTACGACTGGAGGCTGGCTTGCTGGTGCGGTGCTTATGGCTCGGATAGTTTTGG
CTCTGGTGGCATTGTGTTTTGAGCGTAAGAAGGACGACTTGGGGTTACTAAGTTTGGTTT
TGTGGCTAAAGATATGATTTTGAGATAGAGAAGCTACTAAGCCTGAACCATTCAACTGTA
CCCCT

QA 7 726 7 726
DS 

RD RS1CU51JQ 702 0 0
TCGATCGTTATTGTTTCATGATGTAGACAATAACAACTGGATCGTACTTTCACGTAGAAC
TTTCGGGAACATCAATAGGTAAATTCTTAGGGATGTTCCATTCATGAGCTTTCCACTCTG
GCAATTGTTGTATGACGACCAATCCGGTTGAATCTGGATTTCCCACGTTGGTTTGACAAG
CTAGTCTCCAGTTTTTTGGTTTCCTTTTGAGTTTCTCCTTTTCAATGTCAGTTCGTGGGT
TGAGAAGCTCCTTTCCATTTACAATCTCGACCATGCAAGTAGCGCAGGTTCCTACTCCTG
CGCAGTTTGACAAGGGCTTACTATAAGGACCATAGAGTTCGATGTTAGAATCCAACATTA
TGTCTCTAAGTTTCTGTCCACCGCACGCTCTTCTCCAATGCACGTCCGGTGTTCCGTCCG
GTAGCAACACCGAATGGACGAATGCAAAATCGACAGCAGGAGGTTCATCACTCGGCTCAT
CTACGACTGGAGGCTGGCTTGCTGGTGCGGTGCTTATGGCTCGGATAGTTTTGGCTCTGG
TGGCATTGTGTTTTGAGCGTAAGAAGGACGACTTGGGGTTACTAAGTTTGGTTTTGTGGC
TAAAGATATGATTTTGAGATAGAGAAGCTACTAAGCCTGAACCATTCAACTGTACACTTC
CCATATTCTTGCTCTCTTTCTTAAAAGTAATCAAAAGAATCC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RS1CU51TF 685 0 0
ATGATGTAGACAATAACAACTG*ATCGTACTTTCACGTAGAACTTTCGGGATCATCAATA
GGTAAATTCTTAGGGATGTTCCATTCATGAGCTTTCCACTCTGGCAATTGTTGTATGACG
ACCAATCCGGTTGAATCTGGATTTCCCACGTTGGTTTGACAAGCTAGTCTCCAGTTTTTT
GGTTTCCTTTTGAGTTTCTCCTTTTCAATGTCAGTTCGTGGGTTGAGAAGCTCCTTTCCA
TTTACAATCTCGACCATGCAAGTAGCGCAGGTTCCTACTCCTGCGCAGTTTGACAAGGGC
TTACTATAAGGACCATAGAGTTCGATGTTAGAATCCAACATTATGTCTCTAAGTTTCTGT
CCACCGCACGCTCTTCTCCAATGCACGTCCGGTGTTCCGTCCGGTAGCAACACCGAATGG
ACGAATGCAAAATCGACAGCAGGAGGTTCATCACTCGGCTCATCTACGACTGGAGGCTGG
CTTGCTGGTGCGGTGCTTATGGCTCGGATAGTTTTGGCTCTGGTGGCATTGTGTTTTGAG
CGTAAGAAGGACGACTTGGGGTTACTAAGTTTGGTTTTGTGGCTAAAGATATGATTTTGA
GATAGAGAAGCTACTAAGCCTGAACCATTCAACTGTACACTTCCCATATTCTTGCTCTCT
TTCTTAAAAGTAATCAAAAGAATCC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 6

CO CL1221Contig1 969 6 10 U
GGCCGGCTTTATATTGGGAAACTGCTTGGACGTATTCTCAGATCCGTCAAGTGTAGTTTG
ATAGATCTTGGAGGAATCAATGGCTCCGGTATCGGCACTCGCAAAGTATAAGCTGGTGTT
TCTGGGAGATCAATCCGTGGGGAAGACGAGTATCATCACTCGATTCATGTACGACAAATT
CGACAACACTTACCAGGCCACAATTGGTATTGATTTTCTATCCAAGACTATGTACCTTGA
AGATCGAACTGTCAGACTGCAGTTATGGGATACCGCTGGGCAAGAGAGGTTTAGGAGTCT
TATTCCGAGCTATATCAGGGACTCTTCTGTTGCTGTTATCGTGTATGATGTTGCAAGCAG
GCAATCGTTTCTAAACACTGCTAAGTGGATCGATGAGGTTAGGACAGAGCGTGGTAGCGA
TGTCATAGTTGTGCTCGTGGGGAATAAAACCGACCTTGTAGACAAAAGGCAAGTGTCAAT
AGAGGAAGCAGAAGCCAAGGCTCGTGAGCTTAATGTAATGTTCATCGAAACCAGTGCCAA
AGCGGGCTTCAACATAAAGGCTCTTTTCCGCAAGATAGCAGCAGCTTTGCCCGGGATGGA
AACACTGTCTTCAACAAAGCAAGAGGACATGGTTGATGTTAATCTCAAGTCGTCCAACGC
CAATGCATCTTCGGCTCAGCAGCAATCAGGAGGATGCTCTTGTTAAAACCAAAATTTGGT
AACAAAACATTATAGAGAACAAAAGAACATACTCAGAGAAAAAGCAGCCCTCGCATCATC
TGATCCGCTATTATCTTCTTATGTGTAAAATTTTTGCCTCTCTCCTTCATCAGATTGTTT
TTAAAAAAGAGTCTACTTGCAAAGTTTATGGTTTGCCCCTAACTCTGAACTGTTTTCGTC
TTTGGAGTTTTAAATACTGTGATTTTGTGTGTCGCCAAAATTGAATTATATAACATTGAG
CTATTATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EP95TF U 38
AF RS1EP83TF U 1
AF RS1C816TF U 38
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BS 813 969 RS1EP83JQ

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GG
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ATCCAAGACTATGTACCTTGAAGATCGAACTGTCAGACTGCAGTTATGGGATACCGCTGG
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CGTGTATGATGTTGCAAGCAGGCAATCGTTTCTAAACACTGCTAAGTGGATCGATGAGGT
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TAATCTCAAGTCGTCCAACGCCAATGCATCTTCGGCTCAGCAGCAA

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DS 

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ATAGATCTTGGAGGAATCAATGGCTCCGGTATCGGCACTCGCAAAGTATAAGCTGGTGTT
TCTGGGAGATCAATCCGTGGGGAAGACGAGTATCATCACTCGATTCATGTACGACAAATT
CGACAACACTTACCAGGCCACAATTGGTATTGATTTTCTATCCAAGACTATGTACCTTGA
AGATCGAACTGTCAGGCTGCAGTTATGGGATACCGCTGGGCAAGAGAGGTTTAGGAGTCT
TATTCCGAGCTATATCAGGGACTCTTCTGTTGCTGTTATCGTGTATGATGTTGCAAGCAG
GCAATCGTTTCTAAACACTGCTAAGTGGATCGATGAGGTTAGGACAGAGCGTGGTAGCGA
TGTCATAGTTGTGCTCGTGGGGAATAAAACCGACCTTGTAGACAAAAGGCAAGTGTCAAT
AGAGGAAGCAGAAGCCAAGGCTCGTGAGCTTAATGTAATGTTCATCGAAACCAGTGCCAA
AGCGGGCTTCAACATAAAGGCTCTTTTCCGCAAGATAGCAGCAGCTTTGCCCGGGATGGA
AACACTGTCTTCAACAAAGCAAGAGGACATGGTTGATGTTAATCTCAAGTCGTCCAACGC
CAATGCATCTTCGGCTCAGCAGCAATCAG*AGGATGCTCTTGTTAAAACCAAAATTTGGT
AACAAA*CATTATAGAGAACAAAAGAACATACTCAGAGAAAA*GCAGCCCTCGCATCATC
TGATCCGCTATTATCTTCTTATGTGTAAAATT

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DS 

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GG
AGATTCGTCAAGTGTAGTTTGATAGATCTTGGAGGAATCAATGGCTCCGGTATCGGCACT
CGCAAAGTATAAGCTGGTGTTTCTGGGAGATCAATCCGTGGGGAAGACGAGTATCATCAC
TCGATTCATGTACGACAAATTCGACAACACTTACCAGGCCACAATTGGTATTGATTTTCT
ATCCAAGACTATGTACCTTGAAGATCGAACTGTCAGACTGCAGTTATGGGATACCGCTGG
GCAAGAGAGGTTTAGGAGTCTTATTCCGAGCTATATCAGGGACTCTTCTGTTGCTGTTAT
CGTGTATGATGTTGCAAGCAGGCAATCGTTTCTAAACACTGCTAAGTGGATCGATGAGGT
TAGGACAGAGCGTGGTAGCGATGTCATAGTTGTGCTCGTGGGGAATAAAACCGACCTTGT
AGACAAAAGGCAAGTGTCAATAGAGGAAGCAGAAGCCAAGGCTCGTGAGCTTAATGTAAT
GTTCATCGAAACCAGTGCCAAAGCGGGCTTCAACATAAAGGCTCTTTTCCGCAAGATAGC
AGCAGCTTTGCCCGGGATGGAAACACTGTCTTCAACAAAGCAAGAGGACATGGTTGATGT
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TTGTTAAA*CCAAAATTTGGTAACAAA*CATTATAGAGAC**AAAGAACATACTCAGAGA
AAA*GCAGCCCTCGCATCATCTG

QA 3 745 3 745
DS 

RD RS1C816JQ 615 0 0
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GGCAAGAGAGGTTTAGGAGTCTTATTCCGAGCTATATCAGGGACTCTTCTGTTGCTGTTA
TCGTGTATGATGTTGCAAGCAGGCAATCGTTTCTAAACACTGCTAAGTGGATCGATGAGG
TTAGGACAGAGCGTGGTAGCGATGTCATAGTTGTGCTCGTGGGGAATAAAACCGACCTTG
TAGACAAAAGGCAAGTGTCAATAGAGGAAGCAGAAGCCAAGGCTCGTGAGCTTAATGTAA
TGTTCATCGAAACCAGTGCCAAAGCGGGCTTCAACATAAAGGCTCTTTTCCGCAAGATAG
CAGCAGCTTTGCCCGGGATGGAAACACTGTCTTCAACAAAGCAAGAGGACATGGTTGATG
TTAATCTCAAGTCGTCCAACGCCAATGCATCTTCGGCTCAGCAGCAATCAGGAGGATGCT
CTTGTTAAAACCAAAATTTGGTAACAAAACATTATAGAGAACAAAAGAACATACTCAGAG
AAAAAGCAGCCCTCGCATCATCTGATCCGCTATTATCTTCTTATGTGTAAAATTTTTGCC
TCTCTCCTTCATCAG

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DS 

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CTGCAGTTATGGGATACCGCTGGGCAAGAGAGGTTTAGGAGTCTTATTCCGAGCTATATC
AGGGACTCTGCTGTTGCTGTTATCGTGTATGATGTTGCAAGCAGGCAATCGTTTCTAAAC
ACTGCTAAGTGGATCGATGAGGTTAGGACAGAGCGTGGTAGCGATGTCATAGTTGTGCTC
GTGGGGAATAAAACCGACCTTGTAGACAAAAGGCAAGTGTCAATAGAGGAAGCAGAAGCC
AAGGCTCGTGAGCTTAATGTAATGTTCATCGAAACCAGTGCCAAAGCGGGCTTCAACATA
AAGGCTCTTTTCCGCAAGATAGCAGCAGCTTTGCCCGGGATGGAAACACTGTCTTCAACA
AAGCAAGAGGACATGGTTGATGTTAATCTCAAGTCGTCCAACGCCAATGCATTTTCGGCT
CAGCAGCAATCAGGAGGATGCTCTTGTTAAAACCAAAATTTGGTAACAAAACATTATAGA
GAACAAAAGAACATACTCAGAGAAAAAGCAGCCCTCGCATCATCTGATCCGCTATTATCT
TCTTATGTGTAAAATTTTTGCCTCTCTCCTTCATCAGATTGTTTTTAAAAAAGAGTCTAC
TTGCAAAGTTTATGGTTTGCCCCTAACTCTGAACTGTTTTCGTCTTTGGAGTTTTAAATA
CTGTGATTTTGTGTGTCGCC

QA 1 740 1 740
DS 

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GCTCTTTTCCGCAAGATAGCAGCAGCTTTGCCCGGGATGGAAACACTGTCTTCAACAAAG
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CAGCAATCAGGAGGATGCTCTTGTTAAAACCAAAATTTGGTAACAAAACATTATAGAGAA
CAAAAGAACATACTCAGAGAAAAAGCAGCCCTCGCATCATCTGATCCGCTATTATCTTCT
TATGTGTAAAATTTTTGCCTCTCTCCTTCATCAGATTGTTTTTAAAAAAGAGTCTACTTG
CAAAGTTTATGGTTTGCCCCTAACTCTGAACTGTTTTCGTCTTTGGAGTTTTAAATACTG
TGATTTTGTGTGTCGCCAAAATTGAATTATATAACATTGAGCTATTATAT

QA 1 830 1 830
DS 



AS 1 5

CO CL1222Contig1 1196 5 8 U
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AATAAGCCAAATGATTCACAAGACACACCAAACTAAACTATTGAAAACTAACAAAGTGGG
TTTTTCTTTTAAACGAAAACAATAAAGGAAAGAAAGAAAGCATAGACTCATTTCATAATT
AACATCATCCATCCACCAACTTAAATTCTTTCTCATAACACACAAAAGCAACAAATAAAG
TAACATTTAATACTCCACTAAGTGGGTAAATTCACGCTTCATCATCAGTTTGTAGCACTG
CTTCTGAATGAGGCCAAGGCCTTAAATGCTGCAGCTCTCAAAATGTATTGATGGTAAGCT
GCTGCTGCTAGTGCCCCCACGAACGGACCAACCCAGAAGATCCAATGGTCATCCCATGCC
TTCTCGTTGTTGTAGATAACAGCAGCACCAAAGCTTCTAGCTGGGTTGATTCCAGTTCCA
GTAATGGGGATAGTAGCCAAATGCACCATGAACACAGCGAATCCAATTGGAAGTGGAGCC
AAAACAGGGATGTGAGAGTCACGAGCGCTTCTCTTAGGGTCAGTGGCAGAGAAGACGGTG
TAAACGAGGACGAAAGTTCCAATGATCTCAGCTCCGAGAGCAGTTCCTTTGTTGTAAG*A
GGGGCCACAGTGTTAGCTCCGCCTCCAAGAGTGTTGTAAGGAGTCTTCATGAAAGCCTTC
ACGAAACCCACACCACAAATAGCTCCAAGACACTGAGCTATCATGTACCCAACAGCTCTC
ACCAGAGACACCTTACGTGCCAAGAACAGACCGAAAGTCACAGCTGGGTTGATGTGACCA
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ATACCGAGTAGACCAACGCCGTCGCAAGGACCGGTTTGCTTCTTGTGTCCGATGACGGTG
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TCTTTTCCATGGCTTTGAGTGTGTCCCTCTTCGCTCACTTCTTTCGACATCTCTCTCTGA
GTTTCTCTCTCTAGATAGGTATGGAGTTTTTGCTAGAATTGAGTGGTGGTGAGTCC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EK80JQ U 1
AF RS1B651JQ U 147
AF RS1EK80TF C 127
AF RS1H071JQB U 148
AF RS1H071TF C 461
BS 1 398 RS1EK80JQ
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BS 594 924 RS1H071JQB
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TAACATTTAATACTCCACTAAGTGGGTAAATTCACGCTTCATCATCAGTTTGTAGCACTG
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GCTGCTGCTAGTGCCCCCACGAACGGACCAACCCAGAAAATCCAATGGTCATCCCATGCC
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AAAACAGGGATGTGAGAGTCACGAGCGCTTCTCTTAGGGTCAGTGGCAGA
AAA

QA 1 590 1 590
DS 

RD RS1B651JQ 447 0 0
G
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CTTTCTCATAACACACAAAAGCAACAAATAAAGTAACATTTAATACTCCACTAAGTGGGT
AAATTCACACTTCATCATCAGTTTGTAGCACTGCTTCTGAATGAGGCCAAGGCCTTAACT
GCTGCAGCTCTCAAAATGTATTGATGGTAAGCTGCTGCTGCTAGTGCTCCCACGAACGGA
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CCAAAGCTTCTAGCTGGGTTGATTCCAGTTCCAGTAATGGGGATAGTAGCCAAATGCACC
ATGAACACAGCGAATCCAATTGGAAGTGGAGCCAAAACAGGGATGTGAGAGTCACGAGCG
CTTCTCTTAGGGTCAGTGGCAGAGAA

QA 2 447 2 447
DS 

RD RS1EK80TF 708 0 0
C
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TCCATCCACCAACTTAAATTCTTTCTCATAACACACAAAAGCAACAAATAAAGTAACATT
TAATACTCCACTAAGTGGGTAAATTCACGCTTCATCATCAGTTTGTAGCACTGCTTCTGA
ATGAGGCCAAGGCCTTAAATGCTGCAGCTCTCAAAATGTATTGATGGTAAGCTGCTGCTG
CTAGTGCCCCCACGAACGGACCAACCCAGAAGATCCAATGGTCATCCCATGCCTTCTCGT
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CCACACCACAAATAGCTCCAAGACACTGAGCTATCATGTACCCAACAGCTCTCACCAAAG
ACACCTTGCGTGCCAGGAACAGACCGAAAGTCACAGCTGGGTTGAT
C

QA 2 707 2 707
DS 

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GAAAGAAAGAAAGCATAGACCCATTTCATAATTAACATCATCCATCCACCGACTTAAATT
CTTTCTCATAACACACAAAAGCAACAAATAAAGTAACATTTAATCCTCCACTAAGTGGGT
AAATTCACACTTCATCATCAGTTTGTAGCACTGCTTCTGAATGAGGCCAAGGCCTTAACT
GCTGCTGCTCTCAAAATGTATTGATGGTAAGCTGCTGCTGCTAGTGCTCCCAAGAACGGA
CCAACCCAGAAGATCCAATGGTCATCCCATGCCTTCTCGTTGTTGTAAATAACAGCAGCA
CCAAAGCTTCTAGCTGGGTTAATTCCAGTTCCAGTAATGGGGATAGTAGCCAAATGCACC
ATGAACACAGCGAATCCAATTGGAAGTGGAGCCAAAACAGGGATGTGAGAGTCACGAGCG
CTTCTCTTAGGGTCAGTGGCAGAAAAGACGGTGTAAACGAGGACGAAAGTTCCAATGATC
TCAGCTCCGAGAGCAGTTCCTTTGTTGTAAG*AGGGGCCACAGTGTTAGCTCCGCCTCCA
AGAGTGTTGTAAGGAGTCTTCATGAAAGCCTTCACGAAACCCACACCACAAATAGCTCCA
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AGGACGAAGATCATACCACCGAAAGCCCAAGCGATACCGAGTAGACCAACGCCGTCG

QA 1 777 1 777
DS 

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CTGGGTTAATTCCAGTTCCAGTAATGGGGATAGTAGCCAAATGCACCATGAACACAGCGA
ATCCAATTGGAAGTGGAGCCAAAACAGGGATGTGAGAGTCACGAGCGCTTCTCTTAGGGT
CAGTGGCAGAGAAGACGGTGTAAACGAGGACGAAAGTTCCAATGATCTCAGCTCCGAGAG
CAGTTCCTTTGTTGTAAG*AGGGGCCACAGTGTTAGCTCCGCCTCCAAGAGTGTTGTAAG
GAGTCTTCATGAAAGCCTTCACGAAACCCACACCACAAATAGCTCCAAGACACTGAGCTA
TCATGTACCCAACAGCTCTCACCAGAGACACCTTACGTGCCAAGAACAGACCGAAAGTCA
CAGCTGGGTTGATGTGACCACCAGAGATACCGGCGGTGCAGTAAACGAGGACGAAGATCA
TACCACCGAAAGCCCAAGCGATACCGAGTAGACCAACGCCGTCGCAAGGACCGGTTTGCT
TCTTGTGTCCGATGACGGTGGCTATGGTGACGTAGAGGAAGAGGAGCGTGGCGACGAACT
CGGCGATGAGGGCTCTGTAGAAAGACCAAGACTTGAGCTCACCCATGTCGAGAAAGGGAG
CTGGTGGAGGATCGACGTAGTCTTTTCCATGGCTTTGAGTGTGTCCCTCTTCGCTCACTT
CTTTCGACATCTCTCTCTGAGTTTCTCTCTCTAGATAGGTATGGAGTTTTTGCTAGAATT
GAGTGGTGGTGAGTCC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 6

CO CL1223Contig1 656 6 8 U
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GAGCTTTTCTCTTCTGGCAGCTCCACAAACACAACTTCTCCTAAATGATCCTGGGCATGG
TCAGTGATGCCTATGGTAGCCACTGAGCCATCATGTTTCACCCACTCATGTGAATTTGCA
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TGAGATTTGGAGGCAGAAGAAGAGAGCTTGAGAGCGTTTGCTGTAGAGGAAGCCCACATT
CTCAGTGCCATTTTGCTTTCTTTTATCAAAGGAAAGTGGGGAAATGGCAAAGAGAC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GS07JQ U 2
AF RS1GS07TF C 1
AF RS1DJ85JQ U 12
AF RS1DJ85TF C 12
AF RS1G221JQ U 12
AF RS1G221TF C 12
BS 1 1 RS1GS07TF
BS 2 61 RS1GS07JQ
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CGTCTTCCTCTTCGCAGAACTTGGTGTATTCCTTTGAACCCATCAAGGTTTCCAACTCTG
CAGGGTTACTTGGTTTCACCTTTATCATCCAACCATCTTCATAAGGGCTTGAGTTGATCA
AACCAGGCGAATCGGTGAGCTTTGTGTTAACCTCAACGACTTCACC

QA 1 286 1 286
DS 

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GCAGGGTTACTTGGTTTCACCTTTATCATCCAACCATCTTCATAAGGGCTTGAGTTGATC
AAACCAGGCGAATCGGTGAGCTTTGTGTTAACCTCAACGACTTCACCAGAGATTGGAGAT
AGAATCTCACTTGTGGCCTTGACACTCTCCACAGCTCCAAAGTTCTTTTCTTTGCTCACT
GAGCTTTTCTCTTCTGGCAGCTCCACAAACACAACTTCTCCTAAATGATCCTGGGCATGG
TAAGTGATGCCTATGGTAGCCACTGAGCCATCATGTTTCACCCACTCGTGTGAATTTGCA
TATTTAAGTCCTTCCAACACTGAGGAGAAGCATCTAGAGATGGAGAAAGCCGGAAGGAGA
TGAGATTTGGAGGCAGAAGAAGAGAGCTTGAGAGCGTTTGCTGTAGAGGAAGCCCACATT
CTCAGTGCCATTTTGCTTTCTTTTCTCAAAGGAAAGTGGGGAAATGGCAAAGAGAC

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DS 

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CC

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DS 

RD RS1DJ85TF 632 0 0
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GTAAGGAACATTGACAAGTGAAGT***********CCCTCTAGTGAGCAGCGTCTTCCTC
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TTTGCTTTCTTTTATCAAAGGAAAGTGGGG
CC

QA 1 630 1 630
DS 

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TTTGCTTTCTTTT
CTCCC

QA 1 613 1 613
DS 

RD RS1G221TF 618 0 0
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GGCAGAAGAAGAGAGCTTGAGAGCGTTTGCTGTAGAGGAAGCCCACATTCTCAGTGCCAT
TTTGCTTTCTTTT
CTCCC

QA 1 613 1 613
DS 



AS 2 6

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ACGATAACAATGGAGGAACATGTGTGGCCATCGCTGGATCGGATTACTGCGTGATCGCCG
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AACTAGCAGACAAAGCTGTACTCTCTTCCTCTGGCTTCCAAGCTGATGTGAAGGCACTTC
AGAAAGTACTTACATCAAGGCACTTGGTTTATCAGCATCAGCATAACAAGCAGATGAGCT
GTCCCGCTATGGCTCAGCTTCTCTCCAACACGCTTTACTTCAAGCGCTTTTTCCCTTACT
ACGCCTTTAATGCTCTCGGAGGGCTTGACGAGAATGGTAAAGGGTGTGTGTTCACCTATG
ACGCTGTTGGTTCGTATGAGAAGTTTGGATACAGTGCTCAAGGCTCTGGATCGACTCTAA
TTATGCCGTTTCTTGATAATCAGCTCAAGAGTCCCAGCCCTCTTCTGCTTCCTGCCCAGG
ATGCTATCACGCCCCTTTCGGAACCTGAAGCCGTTGACTTGGTGAAGACTGTTTTCGCAT
CTGCCACTGAGAGGGATATCTACACTGGAGACAAGCTTGAGATCATGATTCTCAAGGCCG
ATGGCATCAAGACCGAAGTCATGGACTTAAGGAAAGACTAAGCTGACTTTCCGCGCATAT
GAGTGTTGTGTTGGGAACACACACCTTTGTTACTTTGTCGTTGGTCATCATATCAACTGT
CTTTGAAGTTTAAAACTGTTTCCTTATCTTGTTAACAGTAACAAATTCTCGTTGTCTCAT
TTATGAACACACAACCCTCTTGAGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 5 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 5 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 5 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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QA 1 699 1 699
DS 

RD RS1AJ84TF 727 0 0
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ACGATAACAATGGAGGAACATGTGTGGCCATCGCTGGATCGGATTACTGCGTGATCGCCG
CAGATACTCGAATGTCTACCGGTTACAGCATTCTCACTCGCGATTACTCCAAAATCCATA
AACTAGCAGACAAAGCTGTGCTCTCTTCCTCTGGGTTCCAAGCTGATGTGAAAGCACTGC
AGAAAGTACTTACATCA*GGCACTTGGTTTATCAGCATCAGCATAACAAGCAGATGAGCT
GTCCTGCTATGGCTCAGCTTCTTTCCAACACGCTTTACTTCAAGCGCTTTTTCCCTTACT
ACGCCTTTAATGTCCTCGGAGGGCTCGACGAGAATGGTAAAGGGTGTGTTTTCACGTACG
ACGCTGTTGGTTCGTATGAGAAGGTTGGATACAGTGCTCAAGGCTCTGGACCGACTCTGA
TTATGCCGTTTCTTGATAATCAGCTCAAGAGTCCCAGCCCTCTTCTCCTTCCTGCACAGG
ATGCTATCACGCCCCTTTCGGAACCTGAAGCCGTTGACTTGGTGAAGACTGTTTTCGCAT
CTGCCAC

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1CJ67TF 775 0 0
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TAACAAAATAATCCTTTTTTCC******GAAGACAGTTAACGCTCCATGACGAAGCAGCA
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TCTGCTTCCTGCCCAGGATGCTATCACGCCCCTTTCGGAACCTGAAGCCGTTGACTTGGT
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CATGATTCTCAAG*CCGATGGCATCAAGACCGAAGTCATGGACT

QA 12 775 12 775
DS 

RD RS1CJ67JQ 720 0 0
CAGT
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TCTGGCTTCCAAGCTGATGTGAAGGCACTTCAGAAAGTACTTACATCAAGGCACTTGGTT
TATCAGCATCAGCATAACAAGCAGATGAGCTGTCCCGCTATGGCTCAGCTTCTCTCCAAC
ACGCTTTACTTCAAGCGCTTTTTCCCTTACTACGCCTTTAATGCTCTCGGAGGGCTTGAC
GAGAATGGTAAAGGGTGTGTGTTCACCTATGACGCTGTTGGTTCGTATGAGAAGTTTGGA
TACAGTGCTCAAGGCTCTGGATCGACTCTAATTATGCCGTTTCTTGATAATCAGCTCAAG
AGTCCCAGCCCTCTTCTGCTTCCTGCCCAGGATGCTATCACGCCCCTTTCGGAACCTGAA
GCCGTTGACTTGGTGAAGACTGTTTTCGCATCTGCCACTGAGAGGGATATCTACACTGGA
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AGGAAAGACTAAGCTGACTTTCCGCGCATATGAGTGTTGTGTTGGGAACACACACCTTTG
TTACTTTGTCGTTGGTCATCATATCAACTGTCTTTGAAGTTTAAAACTGTTTCCTTATCT
TGTTAACAGTAACAAATTCTCGTTGTCTCATTTATGAACACACAACCCTCTTGAGT

QA 5 720 5 720
DS 



CO CL1224Contig2 705 2 4 U
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AGATAAGGAAACAGTTTTAAACGTCAAACACAGTTGATATGGATGACCAACGACAAAGTA
ACAAAGGTGTGTGTTCTCAACACTCATATGCGCGGAAAGTCAGCTTAGTCTTTCCTTAAG
TCCATGACTTCGGTCTTGATGCCATCGGCCTTGAGAATCATGATCTCAAGCTTGTCTCCA
GTGTAAATATCCCTCTCAGTGGCAGATGCGAAAACAGTCTTCACCAAGTCAACGGCTTCA
GGTTCCGAAAGGGGCGTGATAGCATCCTGTGCAGGAAGGAGAAGAGGGCTGGGACTCTTG
AGCTGATTATCAAGAAACGGCATAATCAGAGTCGGTCCAGAGCCTTGAGCACTGTATCCA
ACCTTCTCATACGAACCAACAGCGTCGTACGTGAAAACACACCCTTTACCATTCTCGTCG
AGCCCTCCGAGGACATTAAAGGCGTAGTAAGGGAAAAAGCGCTTGAAGTAAAGCGTGTTG
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AAGTGCCTGATGTAAGTACTTTCTGCAGTGCTTTCACATCAGCTTGGAACCCAGAGGAAG
AGAGCACAGCTTTGTCTGCTAGTTTATGGATTTTGGAGTAATCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DU61JQ U 1
AF RS1AJ84JQ U 242
BS 1 245 RS1DU61JQ
BS 246 246 RS1AJ84JQ
BS 247 558 RS1DU61JQ
BS 559 705 RS1AJ84JQ

RD RS1DU61JQ 558 0 0
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AGATAAGGAAACAGTTTTAAACGTCAAACACAGTTGATATGGATGACCAACGACAAAGTA
ACAAAGGTGTGTGTTCTCAACACTCATATGCGCGGAAAGTCAGCTTAGTCTTTCCTTAAG
TCCATGACTTCGGTCTTGATGCCATCGGCCTTGAGAATCATGATCTCAAGCTTGTCTCCA
GTGTAGATATCCCTCTCAGTGGCAGATGCGAAAACAGTCTTCACCAAGTCAACGGCTTCA
GGTTCCGAAAGGGGCGTGATAGCATCCTGTGCAGGAAGGAGAAGAGGGCTGGGACTCTTG
AGCTGATTATCAAGAAACGGCATAATCAGAGTCGGTCCAGAGCCTTGAGCACTGTATCCA
ACCTTCTCATACGAACCAACAGCGTCGTACGTGAAAACACACCCTTTACCATTCTCGTCG
AGCCCTCCGAGGACATTAAAGGCGTAGTAAGGGAAAAAGCGCTTGAAGTAAAGCGTGTTG
GAAAGAAGCTGAACCATA

QA 1 558 1 558
DS 

RD RS1AJ84JQ 464 0 0
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GTTCCGAAAGGGGCGTGATAGCATCCTGTGCAGGAAGGAGAAGAGGGCTGGGACTCTTGA
GCTGATTATCAAGAAACGGCATAATCAGAGTCGGTCCAGAGCCTTGAGCACTGTATCCAA
CCTTCTCATACGAACCAACAGCGTCGTACGTGAAAACACACCCTTTACCATTCTCGTCGA
GCCCTCCGAGGACATTAAAGGCGTAGTAAGGGAAAAAGCGCTTGAAGTAAAGCGTGTTGG
AAAGAAGCTGAACCATAGCAGGACAGCTCATCTGCTTGTTATGCTGATGCTGATAAACCA
AGTGCCTGATGTAAGTACTTTCTGCAGTGCTTTCACATCAGCTTGGAACCCAGAGGAAGA
GAGCACAGCTTTGTCTGCTAGTTTATGGATTTTGGAGTAATCGC

QA 1 464 1 464
DS 



AS 2 6

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AAATGATGCTGTTACAGGCCACATCATTTCTACTACAATTGGAGGCAAAAACGGTGAACC
TAAACAGACCATTAGTTACATGGCAGAACGGGTTGTTGGACAGGGATCATTCGGAATTGT
ATTCCAGGCCAAGTGCTTGGAAACTGGGGAATCTGTAGCCATTAAGAAGGTTTTGCAAGA
CCGGCGCTACAAGAATCGTGAGCTGCAACTAATGCGATTAATGGACCACCCAAATGTGGT
TTCCTTGAAGCATTGTTTCTTCTCTACAACGAGTAGAGATGAGCTCTTCCTCAATCTCGT
AATGGAGTATGTACCCGAGACTTTGTACCGGGTTTTGAAGCACTATACTAGTTCAAGCCA
AAGAATGCCAATTTTCTATGTCAAACTCTACACATACCAAATCTTCAGAGGCTTGGCTTA
TATCCATACTGTTCCTGGTGTCTGTCACAGAGATGTGAAACCACAAAATCTTCTGGTTGA
TCCCCTCACTCATCAGTGTAAGCTGTGTGATTTTGGAAGTGCAAAAGTACTGGTGAAAGG
TGAAGCAAACATATCATACATCTGCTCTCGGTATTACCGAGCTCCAGAGCTGATCTTTGG
GGCCACAGAGTATACATCCTCCATAGACATATGGTCTGCTGGTTGTGTTTTGGCAGAGCT
CCTTCTTGGCCAGCCCTTGTTCCCCGGAGAAAATTCAGTGGACCAGCTGGTGGAGATAAT
CAAAGGTTCTTGGTACTCCAACTCGAGAGAATCCGATGCATGAATCCAAACTACACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
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AF RS1CJ53TF U 59
AF RS1AP92TFB U 1
BS 1 262 RS1AP92TFB
BS 263 263 RS1CJ53TF
BS 264 589 RS1AP92TFB
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RD RS1CJ53TF 660 0 0
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CCTAAACAGACCATTAGTTACATGGCAGAACGGGTTGTTGGACAGGGATCATTCGGAATT
GTATTCCAGGCCAAGTGCTTGGAAACTGGGGAATCTGTAGCCATTAAGAAGGTTTTGCAA
GACCGGCGCTACAAGAATCGTGAGCTGCAACTAATGCGATTAATGGACCACCCAAATGTG
GTTTCCTTGAAGCATTGTTTCTTCTCTACAACGAGTAGAGATGAGCTCTTCCTCAATCTC
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CAAAGAATGCCAATTTTCTATGTCAAACTCTACGCATACCAAATCTTCAGAGGCTTGGCT
TATATCCATACTGTTCCTGGTGTCTGTCACAGAGATGTGAAACCACAAAATCTTCTGGTT
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GGGGCCACAGAGTATACATCCTCCATAGACATATGGTCTGCTGGTTGTGTTTTGGCAGAG

QA 1 660 1 660
DS 

RD RS1AP92TFB 837 0 0
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AAATGATGCTGTTACAGGCCACATCATTTCTACTACAATTGGAGGCAAAAACGGTGAACC
TAAACAGACCATTAGTTACATGGCAGAACGGGTTGTTGGACAGGGATCATTCGGAATTGT
ATTCCAGGCCAAGTGCTTGGAAACTGGGGAATCTGTAGCCATTAAGAAGGTTTTGCAAGA
CCGGCGCTACAAGAATCGTGAGTTGCAACTAATGCGATTAATGGACCACCCAAATGTGGT
TTCCTTGAAGCATTGTTTCTTCTCTACAACGAGTAGAGATGAGCTCTTCCTCAATCTCGT
AATGGAGTATGTACCCGAGACTTTGTACCGGGTTTTGAAGCACTATACTAGTTCAAGCCA
AAGAATGCCAATTTTCTATGTCAAACTCTACACATACCAAATCTTCAGAGGCTTGGCTTA
TATCCATACTGTTCCTGGTGTCTGTCACAGAGATGTGAAACCACAAAATCTTCTGGTTGA
TCCCCTCACTCATCAGTGTAAGCTGTGTGATTTTGGAAGTGCAAAAGTATTGGTGAAAGG
TGAAGCAAACATATCATACATCTGCTCTCGGTATTACCGAGCTCCAGAGCTGATCTTTGG
GGCCACAGAGTATACATCCTCCATAGACATATGGTCTGCTGGTTGTGTTTTGGCAGAGCT
CCTTCTTGGCCAGCCCTTGTTCCCCGGAGAAAATTCAGTGGACCAGCTGGTGGAGATAAT
CAAAGGTTCTTGGTACTCCAACTCGAGAGAATCCGATGCATGAATCCAAACTACACA

QA 1 837 1 837
DS 



CO CL1225Contig2 799 4 7 U
GATGGTCTGCTGGTTGTGTTTTGGCAGAGCTCCTTCTTGGCCAGCCCTTGTTCCCCGGAG
AAAATTCAGTGGACCAGCTGGTGGAGATAATCAAGGTTCTTGGTACTCCAACTCGAGAAG
AAATCCGATGCATGAATCCAAACTACAC*AGACTTCAGATTCCCCCAAATCAAAGCTCAC
CCGTGGCATAAGGTTTTCCATAAGAGGATGCCTCCAGAAGCCATTGACCTCGCATCTCGG
CTTCTTCAATACTCACCGAGCCTGCGTTACACTGCGCTTGAAGCATGTGCACATCCTTTT
TTCAATGAACTCCGTGAGCCGAATGCTCGTCTCCCAAACGGCAGACCTCTACCACCGTTG
TTCAACTTCAAACAAGAGTTAGCTGGGGCTTCACCAGAGCTTATAAACAGGCTCATACCT
GAGCACATAAGGCGACAGATGAGTGGAGGCTTTCCAGTACAAGCTGGCCATTAGAAAAGG
TAACTGAGATGCTTTTGCAGAGCCTGATGGAAACGAGGAGAGAGGGTTTTACTTATCTCT
GATTTTCAGAGGGTTTTAACTAAAATATCAGCTTATGAATAGAGAGATGATTGGCCAATT
AAGCTTTTTGAGAAATCAGGAGGTGATGATGATTGTGTCTAATATACATTCTCTCTCTCT
CTTTTTATGTTATAATTCGCTTTTGACTTGTAGAGAGATACCTTTTCTCGTTGTATTATT
TGTATATGTTTTTGTCCGTAAGACAGCAAACCGCTATGATGGAAGAATGGCATGAATGAA
TGAATGATGTTGAAAACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AP92JQ C 59
AF RS1GS57TF U 1
AF RS1CJ53JQ C 68
AF RS1DE69TF U 518
BS 1 567 RS1GS57TF
BS 568 568 RS1DE69TF
BS 569 615 RS1GS57TF
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BS 770 792 RS1DE69TF
BS 793 799 RS1CJ53JQ

RD RS1AP92JQ 441 0 0
AGAAAATTCAGTGGACCAGCTGGTGGAGATAATCAAGGTTCTTGGTACTCCAACTCGAGA
AGAAATCCGATGCATGAATCCAAACTACACCAGACTTCAGATTCCCCCAAATCAAAGCTC
ACCCGTGGCATAAGGTTTTCCATAAGAGGATGCCTCCAGAAGCCATTGACCTCGCATCTC
GGCTTCTTCAATACTCACCGAGCCTGCGTTACACTGCGCTTGAAGCATGTGCACATCCTT
TTTTCAATGAACTCCGTGAGCCGAATGCTCGTCTCCCAAACGGCAGACCTCTACCACCGT
TGTTCAACTTCAAACAAGAGTTAGCTGGGGCTTCACCAGAGCTTATAAACAGGCTCATAC
CTGAGCACATAAGGCGACAGATGAGTGGAGGCTTTCCAGTACAAGCTGGCCATTAGAAAA
GGTAACTGAGATGCTTTTGCA

QA 1 441 1 441
DS 

RD RS1GS57TF 615 0 0
GATGGTCTGCTGGTTGTGTTTTGGCAGAGCTCCTTCTTGGCCAGCCCTTGTTCCCCGGAG
AAAATTCAGTGGACCAGCTGGTGGAGATAATCAAGGTTCTTGGTACTCCAACTCGAGAAG
AAATCCGATGCATGAATCCAAACTACAC*AGACTTCAGATTCCCCCAAATCAAAGCTCAC
CCGTGGCATAAGGTTTTCCATAAGAGGATGCCTCCAGAAGCCATTGACCTCGCATCTCGG
CTTCTTCAATACTCACCGAGCCTGCGTTACACTGCGCTTGAAGCATGTGCACATCCTTTT
TTCAATGAACTCCGTGAGCCGAATGCTCGTCTCCCAAACGGCAGACCTCTACCACCGTTG
TTCAACTTCAAACAAGAGTTAGCTGGGGCTTCACCAGAGCTTATAAACAGGCTCATACCT
GAGCACATAAGGCGACAGATGAGTGGAGGCTTTCCAGTACAAGCTGGCCATTAGAAAAGG
TAACTGAGATGCTTTTGCAGAGCCTGATGGAAACGAGGAGAGAGGGTTTTACTTATCTCT
GATTTTCAGAGGGTTTTAACTAAAATA*CAGCTTATGAATAGAGAGATGATTGGCCAATT
AAGCTTTTTGAGAAA

QA 1 615 1 615
DS 

RD RS1CJ53JQ 732 0 0
AGTGGACCAGCTGGTGGAGATAGTCAAGGTTCTTGGTACTCCAACTCGAGAAGAAATCCG
ATGCATGAATCCAAACTACAC*AGACTTCAGATTCCCCCAAATCAAAGCTCACCCGTGGC
ATAAGGTTTTCCATAAGAGGATGCCTCCAGAAGCCATTGACCTCGCATCTCGGCTTCTTC
AATACTCACCGAGCCTGCGTTACACTGCGCTTGAAGCATGTGCACATCCTTTTTTCAATG
AACTCCGTGAGCCGAATGCTCGTCTCCCAAACGGCAGACCTCTACCACCGTTGTTCAACT
TCAAACAAGAGTTAGCTGGGGCTTCACCAGAGCTTATAAACAGGCTCATACCTGAGCACA
TAAGGCGACAGATGAGTGGAGGCTTTCCAGTACAAGCTGGCCATTAGAAAAGGTAACTGA
GATGCTTTTGCAGAGCCTGATGGAAACGAGGAGAGAGGGTTTTACTTATCTCTGATTTTC
AGAGGGTTTTAACTAAAATATCAGCTTATGAATAGAGAGATGATTGGCCAATTAAGCTTT
TTGAGAAATCAGGAGGTGATGATGATTGTGTCTAATATACATTCTCTCTCTCTCTTTTTA
TGTTATAATTCGCTTTTGACTTGTAGAGAGATACCTTTTCTCGTTGTATTATTTGTATAT
GTTTTTGTCCGTAAGACAGCAAACCGCTATGATGGAAGAATGGCATGAATGAATGAATGA
TGTTGAAAACTT

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1DE69TF 275 0 0
GAGAGAGGGTTTTACTTATCTCTGATTTTCAGAGGGTTTTAACTAAAATATCAGCTTATG
AATAGAGAGATGATTGGCAAATTAAGCTTTTTGAGAAATCAGGAGGTGATGATGATTGTG
TCTAATATACATTCTCTCTCTCTCTTTTTATGTTATAATTCGCTTTTGACTTGTAGAGAG
ATACCTTTTCTCGTTGTATTATTTGTATATGTTTTTGTCCGTAAGACAGCAAACCGCTAT
GATGGAAGAATTGCATGAATGAATGAATGATGTTG

QA 1 275 1 275
DS 



AS 1 5

CO CL1226Contig1 621 5 4 U
GGCTATATATTACAAGTGTCATAGACAACAAAAAGTTGTAATACATTCCTCCATTTACAT
AGAGACACCAAATTTTGAAATCATGAGGTGTACTACTTTGTTTATGGTTTCTTGTGTTTT
CATATTTTACATTCTGAGTCATGGTAAAGAGGGAGACGCTAGAGACACTGACTGTTGGGA
TAATGTCAATTTCTCTGATGGAGTCTGCGGATGGCACGGAAATAAGAAATGCTTCAAAGA
AATGCGTTCAAACAACGAAACAAAAACAATACGCTATCGTCAGTGCAAATGTACCGTCGT
AGGATTCTTTGGCAACGAACATTCATGCTTTTGCCGACGAGCTGATCCCTCTAATTGCTT
ATAGAAATCTATAGAAATTTCAGCCAATTAATACCAAAATCTATGCACCGATGATAACTC
AAAAAGAAATTGCGTAAGAGAGTTTTTGGTGTTTACAAATAATAAACAATGGTGGTAATC
TGATGTTACCTTTTTTAGTTATGTTACGTTGTGTCATAGTAAATCTAATAAGATTAAATA
TGACGGAGTGTTCTTATCTCGTTCAGTTTGTTTGTTTGTGTTCAACATTTCCAAATAAGA
ATACTTGATGTGTTTATATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CG21TF U 1
AF RS1GE91JQ C 25
AF RS1GE91TF U 25
AF RS1CK06TF U 25
AF RS1GF62JQ C 210
BS 1 312 RS1CG21TF
BS 313 313 RS1CK06TF
BS 314 525 RS1CG21TF
BS 526 621 RS1CK06TF

RD RS1CG21TF 525 0 0
GGCTATATATTACAAGTGTCATAGACAACAAAAAGTTGTAATACATTCCTCCATTTACAT
AGAGACACCAAATTTTGAAATCATGAGGTGTACTACTTTGTTTATGGTTTCTTGTGTTTT
CATATTTTACATTCTGAGTCATGGTAAAGAGGGAGACGCTAGAGACACTGACTGTTGGGA
TAATGTCAATTTCTCTGATGGAGTCTGCGGATGGCACGGAAATAAGAAATGCTTCAAAGA
AATGCGTTCAAACAACGAAACAAAAACAATACGCTATCGTCAGTGCAAATGTACCGTCGT
AGGATTCTTTGGTAACGAACATTCATGCTTTTGCCGACGAGCTGATCCCTCTAATTGCTT
ATAGAAATCTATAGAAATTTCAGCCAATTAATACCAAAATCTATGCACCGATGATAACTC
AAAAAGAAATTGCGTAAGAGAGTTTTTGGTGTTTACAAATAATAAACAATGGTGGTAATC
TGATGTTACCTTTTTTAGTTATGTTACGTTGTGTCATAGTAAATC

QA 1 525 1 525
DS 

RD RS1GE91JQ 534 0 0
GG
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GGTGTACTACTTTGTTTATGGTTTCTTGTGTTTTCATATTTTACATTCTGAGTCATGGTA
AAGAGGGAGACGCTAGAGACACTGACTGTTGGGATAATGTCAATTTCTCTGATGGAGTCT
GCGGATGGCACGGAAATAAGAAATGCTTCAAAGAAATGCGTTCAAACAACGAAACAAAAA
CAATACGCTATCGTCAGTGCAAATGTACCGTCGTAGGATTCTTTGGCAACGAACATTCAT
GCTTTTGCCGACGAGCTGATCCCTCTAATTGCTTATAGAAATCTATAGAAATTTCAGCCA
ATTAATACCAAAATCTATGCACCGATGATAACTCAAAAAGAAATTGCGTAAGAGAGTTTT
TGGTGTTTACAAATAATAAACAATGGTGGTAATCTGATGTTACCTTTTTTAGTTATGTTA
CGTTGTGTCATAGTAAATCTAATAAGATTAAATATGACGGAGTGTTCTTATC

QA 3 534 3 534
DS 

RD RS1GE91TF 534 0 0
GG
AACAAAAAGTTGTAATACATTCCTCCATTTACATAGAGACACCAAATTTTGAAATCATGA
GGTGTACTACTTTGTTTATGGTTTCTTGTGTTTTCATATTTTACATTCTGAGTCATGGTA
AAGAGGGAGACGCTAGAGACACTGACTGTTGGGATAATGTCAATTTCTCTGATGGAGTCT
GCGGATGGCACGGAAATAAGAAATGCTTCAAAGAAATGCGTTCAAACAACGAAACAAAAA
CAATACGCTATCGTCAGTGCAAATGTACCGTCGTAGGATTCTTTGGCAACGAACATTCAT
GCTTTTGCCGACGAGCTGATCCCTCTAATTGCTTATAGAAATCTATAGAAATTTCAGCCA
ATTAATACCAAAATCTATGCACCGATGATAACTCAAAAAGAAATTGCGTAAGAGAGTTTT
TGGTGTTTACAAATAATAAACAATGGTGGTAATCTGATGTTACCTTTTTTAGTTATGTTA
CGTTGTGTCATAGTAAATCTAATAAGATTAAATATGACGGAGTGTTCTTATC

QA 3 534 3 534
DS 

RD RS1CK06TF 597 0 0
GG
AACAAAAAGTTGTAATACATTCCTCCATTTACATAGAGACACCAAATTTTGAAATCATGA
GGTGTACTACTTTGTTTATGGTTTCTTGTGTTTTCATATTTTACATTCTGAGTCATGGTA
AAGAGGGAGACGCTAGAGACACTGACTGTTGGGATAATGTCAATTTCTCTGATGGAGTCT
GCGGATGGCACGGAAATAAGAAATGCTTCAAAGAAATGCGTTCAAACAACGAAACAAAAA
CAATACGCTATCGTCAGTGCAAATGTACCGTCGTAGGATTCTTTGGCAACGAACATTCAT
GCTTTTGCCGACGAGCTGATCCCTCTAATTGCTTATAGAAATCTATAGAAATTTCAGCCA
ATTAATACCAAAATCTATGCACCGATGATAACTCAAAAAGAAATTGCGTAAGAGAGTTTT
TGGTGTTTACAAATAATAAACAATGGTGGTAATCTGATGTTACCTTTTTTAGTTATGTTA
CGTTGTGTCATAGTAAATCTAATAAGATTAAATATGACGGAGTGTTCTTATCTCGTTCAG
TTTGTTTGTTTGTGTTCAACATTTCCAAATAAGAATACTTGATGTGTTTATATAT

QA 3 597 3 597
DS 

RD RS1GF62JQ 401 0 0
GATGGCACGGAAATAAGAAATGCTTCAAAGAAATGGGTTCAAACAACGAAACAAAAACAA
TACGCTATCGTCAGTGCAAATGTACCGTCGTAGGATTTTTTGGCAACGAACATTCATGCT
TTTGCCGACGAACTGATCCCTTTAATTGCTTATAGAAATCTATAGAAATTTCAGCCAATT
AATACCAAATT*TATGCACCGATGATAACTCAAAAAGAAATTGGGTAAGAGAGTTTTTGG
TGTTTACAAATAATAAACAATGGTGGTAATTTGATGTTACCTTTTTTAGTTATGTTACGT
TGTGTCATAGTAAATTTAATAAGATTAAATATGACGGAGTGTTTTTATTTCGTTCAGTTT
GTTTGTTTGTGTTCAACATTTCCAAATAAGAA
ATACTTGAT

QA 1 392 1 392
DS 



AS 1 6

CO CL1227Contig1 389 6 4 U
GGAGGGTTTTCAAGAATCTGTGAGTGTTTATAACGCCGCTCGTCCTCGTCTTTTAGCTCC
GGACGCCAGAGCAATCGAAAAATCATGGGTTTCGCTGCGATCTGGAACTCTCATCCTAAG
AAGTACGGCCCTGGCTCCCGCACCTGCCGTGTGTGCGGAAACTCGCATGGGCTAATCAGG
AAGTATGGACTTAACTGTTGCAGACAGTGCTTCCGCAGCAACGCCAAGGAAATCGGATTC
ATCAAGTACCGTTAAGAGATCCGGTGTTTATGGCAGGGCAGCTGTTTGGTTTTTAAGCTT
TTGAAACTTTCATTTTATATTGTAATGGATCTTATAAATGTTCTATGATTTCTATAAGAC
AATTGATTTGTTGAGCATTTTTAGCTTCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1H035JQB C 1
AF RS1H035TF U 1
AF RS1AD86JQ C 61
AF RS1AD86TF U 61
AF RS1GP44JQ C 61
AF RS1GP44TF U 61
BS 1 60 RS1H035TF
BS 61 62 RS1AD86TF
BS 63 376 RS1H035TF
BS 377 389 RS1GP44TF

RD RS1H035JQB 376 0 0
GGAGGGTTTTCAAGAATCTGTGAGTGTTTATAACGCCGCTCGTCCTCGTCTTTTAGCTCC
TCACGCCAGAGCAATCGAAAAATCATGGGTTTCGCTGCGATCTGGAACTCTCATCCTAAG
AAGTACGGCCCTGGCTCCCGCACCTGCCGTGTGTGCGGAAACTCGCATGGGCTAATCAGG
AAGTATGGACTTAACTGTTGCAGACAGTGCTTCCGCAGCAACGCCAAGGAAATCGGATTC
ATCAAGTACCGTTAAGAGATCCGGTGTTTATGGCAGGGCAGCTGTTTGGTTTTTAAGCTT
TTGAAACTTTCATTTTATATTGTAATGGATCTTATAAATGTTCTATGATTTCTATAAGAC
AATTGATTTGTTGAGC

QA 1 376 1 376
DS 

RD RS1H035TF 376 0 0
GGAGGGTTTTCAAGAATCTGTGAGTGTTTATAACGCCGCTCGTCCTCGTCTTTTAGCTCC
TCACGCCAGAGCAATCGAAAAATCATGGGTTTCGCTGCGATCTGGAACTCTCATCCTAAG
AAGTACGGCCCTGGCTCCCGCACCTGCCGTGTGTGCGGAAACTCGCATGGGCTAATCAGG
AAGTATGGACTTAACTGTTGCAGACAGTGCTTCCGCAGCAACGCCAAGGAAATCGGATTC
ATCAAGTACCGTTAAGAGATCCGGTGTTTATGGCAGGGCAGCTGTTTGGTTTTTAAGCTT
TTGAAACTTTCATTTTATATTGTAATGGATCTTATAAATGTTCTATGATTTCTATAAGAC
AATTGATTTGTTGAGC

QA 1 376 1 376
DS 

RD RS1AD86JQ 317 0 0
GGACGCCAGAGCAATCGAAAAATCATGGGTTTCGCTGCGATCTGGAACTCTCATCCTAAG
AAGTACGGCCCTGGCTCCCGCACCTGCCGTGTGTGCGGAAACTCGCATGGGCTAATCAGG
AAGTATGGACTTAACTGTTGCAGACAGTGCTTCCGCAGCAACGCCAAGGAAATCGGATTC
ATCAAGTACCGTTAAGAGATCCGGTGTTTATGGCAGGGCAGCTGTTTGGTTTTTAAGCTT
TTGAAACTTTCATTTTATATTGTAATGGATCTTATAAATGTTCTATGATTTCTATAAGAC
AATTGATTTGTTGAGC
G

QA 1 316 1 316
DS 

RD RS1AD86TF 317 0 0
GGACGCCAGAGCAATCGAAAAATCATGGGTTTCGCTGCGATCTGGAACTCTCATCCTAAG
AAGTACGGCCCTGGCTCCCGCACCTGCCGTGTGTGCGGAAACTCGCATGGGCTAATCAGG
AAGTATGGACTTAACTGTTGCAGACAGTGCTTCCGCAGCAACGCCAAGGAAATCGGATTC
ATCAAGTACCGTTAAGAGATCCGGTGTTTATGGCAGGGCAGCTGTTTGGTTTTTAAGCTT
TTGAAACTTTCATTTTATATTGTAATGGATCTTATAAATGTTCTATGATTTCTATAAGAC
AATTGATTTGTTGAGC
G

QA 1 316 1 316
DS 

RD RS1GP44JQ 329 0 0
GGACGCCAGAGCAATCGAAAAATCATGGGTTTCGCTGCGATCTGGAACTCTCATCCTAAG
AAGTACGGCCCTGGCTCCCGCACCTGCCGTGTGTGCGGAAACTCGCATGGGCTAATCAGG
AAGTATGGACTTAACTGTTGCAGACAGTGCTTCCGCAGCAACGCCAAGGAAATCGGATTC
ATCAAGTACCGTTAAGAGATCCGGTGTTTATGGCAGGGCAGCTGTTTGGTTTTTAAGCTT
TTGAAACTTTCATTTTATATTGTAATGGATCTTATAAATGTTCTATGATTTCTATAAGAC
AATTGATTTGTTGAGCATTTTTAGCTTCT

QA 1 329 1 329
DS 

RD RS1GP44TF 329 0 0
GGACGCCAGAGCAATCGAAAAATCATGGGTTTCGCTGCGATCTGGAACTCTCATCCTAAG
AAGTACGGCCCTGGCTCCCGCACCTGCCGTGTGTGCGGAAACTCGCATGGGCTAATCAGG
AAGTATGGACTTAACTGTTGCAGACAGTGCTTCCGCAGCAACGCCAAGGAAATCGGATTC
ATCAAGTACCGTTAAGAGATCCGGTGTTTATGGCAGGGCAGCTGTTTGGTTTTTAAGCTT
TTGAAACTTTCATTTTATATTGTAATGGATCTTATAAATGTTCTATGATTTCTATAAGAC
AATTGATTTGTTGAGCATTTTTAGCTTCT

QA 1 329 1 329
DS 



AS 1 4

CO CL1228Contig1 919 4 11 U
GGATCTCATCGTCTATCTATCTATCAATCAACAATGGCGATTCGTTCCGTAGCCAGCAGA
AGAACCCTAGCCGGCCTCAAGGAGACATCTTCGAGGCTTCTTGGTTCCCGATCTATCCAG
ACTTTCACGCTTCCTGATCTCCCCTATGATTACAGCGCGTTGGAGCCGGCGATAAGCGGC
GAGATCATGCAGATCCATCACCAGAAGCACCACCAGGCTTACGTCACTAATTACAACAAT
GCCCTCGAGCAGCTGGATCAGGCCGTCAACAAGGGAGACGCTTCCGCTGTCGTTAAGCTG
CAGAGCGCCATCAAGTTCAACGGCGGAGGTCGTGTGAACCATTCTATTTTCTGGAAGAAC
CTTGCTCCTGTAAAGGAAGGTGGTGGAGAGCCACCGAAGGGATCTCTTGGAGGAGCTATT
GATACTCATTTTGGTTCTCTCGAAGGTTTGGTGAAGAAGATGAGTGCGGAAGGTGCTGCT
GTGCAAGGCTCAGGATGGGTGTGGCTCGGTTTAGACAAAGAGCTTAAGAAGCTTGTGGTT
GACACAACCGCAAATCAGGATCCACTTGTGACGAAAGGAGGAAGCTTGGTTCCTCTGGTG
GGTATAGATGTTTGGGAGCACGCCTACTACTTGCAGTACAAGAATGTGAGGCCGGATTAT
CTGAAGAACGTGTGGAAAGTCATCAACTGGAAATATGCAAGCGAAGTTTATGAGAAGGAA
TGCAAGTGATGAGGTCTTTACATGATAACAAACATATAGAGAGGAACCAGTTCCCAGCTC
GGCTTTGTTTTTATAAAGTTTGTCTGAAACAAACGTACAATGTCTCTTTGGTCTTTGAGT
TACCTCAAAATGACCATGTATGGCTGCAATAATACACGTTTTACAAAACATTTTCCAATA
ATAAAATTTTGTTACATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1EG27TF U 6
AF RS1EF19JQ C 276
AF RS1EG27JQ C 444
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AGAACCCTAGCCGGCCTCAAGGAGACATCTTCGAGGCTTCTTGGTTCCCGATCTATCCAG
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GACACAACCGCAAA

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CCATCACCAGAAGCACCACCAGGCTTACGTCACTAATTACAACAATGCCCTCGAGCAGCT
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GTTCAACGGCGGAGGTCATGTGAACCATTCTATTTTCTGGAAGAACCTTGCTCCTGTAAA
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ATGGGTGTGGCTCGGTTTAGACAAAGAGCTTAAGAAGCTTGTGGTTGACACAACCGCAAA
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TCTTTACATGATAACAA
CATATAGAGA

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TACAATGTCTCTTTGGTCTTTGAGTTACCTCAAAATGACCATGTATGGCTGCAATAATAC
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ACTTGTGACGAAAGGAGGAAGCTTGGTTCCTTTGGTGGGTATAGATGTTTGGGAGCACGC
CTACTACTTGCAGTACAAGAATGTGAGGCCGGATTATTTGAAGAACGTGTGGAAAGTCAT
CAACTGGAAATATGCAAGCGAAGTTTATGAGAAGGAATGCAAGTGATGAGGTCTTTACAT
GATAACAAACATATAGAGAGGAACCAGTTCCCAGCTCGGCTTTGTTTTTATAAAGTTTGT
TTGAAACAAACGTACGATGTCTCTTTGGTCTTTGAGTTACCTCAAAATGACCATGTATGG
CTGCAATAATACACGTTTTACAAAACATTTTCCAATAATAAAATTTTGTTACAT
T

QA 1 474 1 474
DS 



AS 1 6

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TCTCGCAGCCGCTATGAACGCCAAGATCATCGGTTCTGGTGAGAGGTCAATGGTATTGGC
ACACGGGTTTGGAGGCGACCAGTCGGTTTGGGACAAGATAATACCGGTTCTGTCCCAATC
TTTTAAGGTTTTAGTCTTTGACTGGCTTTTCTCTGGAGCCATCAAAGACCAAACTCTATA
CGACCCTTCGAAGTATAACTCCTTCGACCCCTTCGCTGAAGATCTTATTGCTCTTATGGA
GGAGTTGAAGTTTGGCCCCGTTGTGTTCGTAGGCCATTCCATGTCGGGCATGATCGGTTG
TGCTGCTTCTATTAAAAGGCCCGATTTGTTTACAAATCTTATCCCTATTGCTGCTTCTCC
CAGGTATATAAACAGTGAGGATTACAAAGGAGGGTTTGAATCAAAAGACATTGACACGAT
CATCACCAACGTTGGCTCCAACTACGAGGCTTGGGCGGTTGCTTTCGCCTCCACAGTGGT
TGACTCAAGAGACTCTCTGTCCGTCCAAAGGTTCGAAAAATGCCTTAAAAAGATGAAGCC
CGAGACGGCTCTTGCTTTAGCTAAGATTGTATTTGGAAGCGACGAGAGAGGACTCCTGGA
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CGTAGCTTACTTCATGCAGAAGAAGATCAAAGGGGAGTCGACGGTGGACATTATTGAGGA
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CCTCCTCGAGTTTTAAAGCTTGAATATAATAAATGATTTGCGTCGATATTCTTCTTATCT
ATATAATATGTAATTTGAGTGTGTATTTACTAGTACAACAAGGTAATTTCCAGTATAAGT
TAAAAGATCAAGAGATGATCATAGTGAGAGC


BQ
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5 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BE56TF U 56
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AF RS1DJ23TF U 5
AF RS1CU03TF U 1
AF RS1CU03JQ C 270
AF RS1DJ23JQ C 308
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TCCGGTCTCGCAGCCGCTATGAACGCCAAGATCATCGGTTCTGGTGAGAGGTCAATGGTA
TTGGCACACGGGTTTGGAGGCGACCAGTCGGTTTGGGACAAGATAATACCGGTTCTGTCC
CAATCTTGTAAGGTTTTAGTCTTTGACTGGCTTTTCTCTGGAGCCATCAAAGACCAAACT
CTATAAGACCC

QA 1 191 1 191
DS 

RD RS1BE56JQ 174 0 0
GCTTCTCCCAGGTATATAAACAGTGAGGATTACAAAGGAGGGTTTGAATCAAAAGACATT
GACACGATCATCACCAACGTTGGCTCCAACTACGAGGCTTGGGCGGTTGCTTTCGCCTCC
ACAGTGGTTGACTCAAGAGACTCTCTGTCCGTCCAAAGGTTCGAAAAATGCCTT

QA 1 174 1 174
DS 

RD RS1DJ23TF 604 0 0
GG
ATCTCTTAAAGCACACTTATAGTTAAGCATGGTGGTTAACCAGAAGACATCCGGTCTCGC
AGCCGCTATGAACGCCAAGATCATCGGTTCTGGTGAGAGGTCAATGGTATTGGCACACGG
GTTTGGAGGCGACCAGTCGGTTTGGGACAAGATAATACCGGTTCTGTCCCAATCTTTTAA
GGTTTTAGTCTTTGACTGGCTTTTCTCTGGAGCCATCAAAGACCAAACTCTATACGACCC
TTCGAAGTATAACTCCTTCGACCCCTTCGCTGAAGATCTTATTGCTCTTATGGAGGAGTT
GAAGTTTGGCCCCGTTGTGTTCGTAGGCCATTCCATGTCGGGCATGATCGGTTGTGCTGC
TTCTATTAAAAGGCCCGATTTGTTTACAAATCTTATCCCTATTGCTGCTTCTCCCAGGTA
TATAAACAGTGAGGATTACAAAGGAGGGTTTGAATCAAAAGACATTGACACGATCATCAC
CAACGTTGGCTCCAACTACGAGGCTTGGGCGGTTGCTTTCGCCTCCACAGTGGTTGACTC
AAGAGACTCTCTGTCCGTCCAAAGGTTCGAAAAATGCCTTAAAAAGATGAAGCCCGAGAC
GG

QA 3 604 3 604
DS 

RD RS1CU03TF 776 0 0
GGTCTCATCTCTTAAAGCACACTTATAGTTAAGCATGGTAGTTAACCAGAAGACATCCGG
TCTCGCAGCCGCTATGAACGCCAAGACCATCGGTTCTGGTGAGAGGTCAATGGTATTGGC
ACACGGGTTTGGAGGCGACCAGTCGGTTTGGGACAAGATAATACCGGTTCTGTCCCAATC
TTTTAAGGTTTTAGTCTTTGACTGGCTTTTCTCTGGAGCCACCAAAGACCAAACTCTATA
CGACCCTTCGAAGTATAACTCCTTCGACCCCTTCGCTGAAGATCTTATTGCTCTTATGGA
GGAGTTGAAGTTTGGCCCCGTTG**TTTGTAGGCCATTCCATGTCGGGCATGATCGGTTG
TGCTGCTTCTATTAAAAGGCCCGATTTGTTTACAAATCTTATCCCTATTGCTGCTTCTCC
CAGGTATATAAACAGTGAGGATTACAAAGGAGGGTTTGAATCAAAAGACATTGACACGAT
CATCACCAACATTGGCTCCAACTACGAGGCTTGGGCGGTTGCTTTCGCCTCCACAGTGGT
TGACTCAAGAGACTCTCTGTCCGTCCAAAGGTTCGAAAAATGCCTTAAAAAGATGAAGCC
CGAGACGGCTCTTGCTTTAGCTAAGATTGTATTTGGAAGCGACGAGAGAGGACTCCTGGA
CCAAGTGTCAGTGCCTTGCCACGTCATACAACCACGAAACGACGTCGTTGTACCTGTCTC
CGTAGCTTACTTCATGCAGAAGAAGATCAAAGGGGAGTCGACGG*GGACATTATT
A

QA 1 775 1 775
DS 

RD RS1CU03JQ 722 0 0
CCTTCGCTGAAGATCTTATTGCTCTTATGGAGGAGTTGAAGTTTGGCCCCGTTG**TTTG
TAGGCCATTCCATGTCGGGCATGATCGGTTGTGCTGCTTCTATTAAAAGGCCCGATTTGT
TTACAAATCTTATCCCTATTGCTGCTTCTCCCAGGTATATAAACAGTGAGGATTACAAAG
GAGGGTTTGAATCAAAAGACATTGACACGATCATCACCAACATTGGCTCCAACTACGAGG
CTTGGGCGGTTGCTTTCGCCTCCACAGTGGTTGACTCAAGAGACTCTCTGTCCGTCCAAA
GGTTCGAAAAATGCCTTAAAAAGATGAAGCCCGAGACGGCTCTTGCTTTAGCTAAGATTG
TATTTGGAAGCGACGAGAGAGGACTCCTGGACCAAGTGTCAGTGCCTTGCCACGTCATAC
AACCACGAAACGACGTCGTTGTACCTGTCTCCGTAGCTTACTTCATGCAGAAGAAGATCA
AAGGGGAGTCGACGGTGGACATTATTGAGGATGCGATGGGTCACTTTCCACAAATGACGT
CACATATTGAGCTGATTGGCGTCATGAAGCGCCTCCTCGAGTTTTAAAGCTTGAATATAA
TAAATGATTTGCGTCGATATTCTTCTTATCTATATATTATGTAATTTGAGTGTGTATTTA
CTAGTACAACAAGGTAATTTCCAGTATAAGTTAAAAGATCAAGAGATGATCATAGTGAGA
GC

QA 1 722 1 722
DS 

RD RS1DJ23JQ 662 0 0
AAGTTTGGCCCCGTTGTGTTCGTAGGCCATTCCATGTCGGGCATGATCGGTTGTGCTGCT
TCTATTAAAAGGCCCGATTTGTTTACAAATCTTATCCCTATTGCTGCTTCTCCCAGGTAT
ATAAACAGTGAGGATTACAAAGGAGGGTTTGAATCAAAAGACATTGACACGATCATCACC
AACGTTGGCTCCAACTACGAGGCTTGGGCGGTTGCTTTCGCCTCCACAGTGGTTGACTCA
AGAGACTCTCTGTCCGTCCAAAGGTTCGAAAAATGCCTTAAAAAGATGAAGCCCGAGACG
GCTCCTGCTTTAGCTAAGATTGTATTTGGAAGCGACGAGAGAGGACTCCTGGACCAAGTG
TCAGTGCCTTGCCACGTCATACAACCACGAAACGACGTCGTTGTACCTGTCTCCGTAGCT
TACTTCATGCAGGAGAAGATCAAAGGGGAGTCGACGGTGGACATTATTGAGGATGCGATG
GGTCACTTTCCACAAATGACGTCACATATTGAGCTGATTGGCGTCATGAAGCGCCTCCTC
GAGTTTTAAAGCTTGAATATAATAAATGATTTGCGTCGATATTCTTCTTATCTATATAAT
ATGTAATTTGAGTGTGTATTTACTAGTACAACAAGGTAATTTCCAGTATAAGTTAAAAGA
TC

QA 1 662 1 662
DS 



AS 2 6

CO CL1230Contig1 986 3 4 U
GGCCCTATCTTACTCACTAAATCGAGCCCACCGTGATCGCCTCCGATCTCGCCGGGAGTC
TCTGCACTTTCTAAACCATCAGATTCAGTAGAATATGAGAGAGATCCTTCACATCCAAGA
AGGTCAATGTGGGAACCAGATCGGTTCCAAGTTCTGGGAAGTTGTTTGCGACGAGCACGG
GATCGATCCCACTGGTCGTTACACTGGCAACTCCGATCTGCAGTTGGAGAGGGTGAATGT
TTACTATAACGAGGCCTCGTGCGGAAGATATGTTCCCCGTGCTATCCTCATGGATCTTGA
GCCTGGTACTATGGACAGTGTCAGAACTGGACCTTACGGTCAGATCTTCAGGCCTGACAA
CTTCGTTTTCGGGCAGTCTGGTGCTGGAAACAACTGGGCTAAAGGGCATTACACTGAAGG
AGCCGAGCTTATTGATGCTGTACTTGATGTTGTACGTAAGGAGGCTGAGAATTGTGACTG
TCTTCAGGGTTTCCAAGTGTGTCACTCGCTTGGTGGAGGCACTGGGTCTGGAATGGGAAC
TCTGCTGATATCTAAGATCAGGGAAGAGTATCCTGATCGAATGATGCTTACTTTCTCTGT
CTTCCCATCACCCAAGGTCTCAGACACAGTGGTTGAACCGTATAATGCGACACTTTCAGT
TCATCAGCTGGTTGAAAACGCTGATGAGTGTATGGTTCTGGACAATGAAGCTCTTTATGA
CATCTGTTTTAGAACTCTCAAGCTTACCACTCCTAGCTTTGGTGATCTGAATCATCTGAT
CTCTGCAACCATGAGTGGAGTTACATGCTGTCTTAGGTTCCCTGGTCAGCTCAACTCTGA
TCTGAGGAAGCTTGCAGTGAACCTCATACCTTTCCCTCGTCTCCACTTTTTCATGGTCGG
TTTTGCTCCTCTCACCTCCCGTGGCTCCCAGCAGTACCGCGCACTCACCGTCCCAGAGCT
CACCCAACAGATGTGGGATTCAAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D465TF U 1
AF RS1DY37TF U 5
AF RS1H322TF U 351
BS 1 119 RS1D465TF
BS 120 120 RS1DY37TF
BS 121 613 RS1D465TF
BS 614 986 RS1H322TF

RD RS1D465TF 613 0 0
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TCTGCACTTTCTAAACCATCAGATTCAGTAGAATATGAGAGAGATCCTTCACATCCAAGG
AGGTCAATGTGGGAACCAGATCGGTTCCAAGTTCTGGGAAGTTGTTTGCGACGAGCACGG
GATCGATCCCACTGGTCGTTACACTGGCAACTCCGATCTGCAGTTGGAGAGGGTGAATGT
TTACTATAACGAGGCCTCGTGCGGAAGATATGTTCCCCGTGCTATCCTCATGGATCTTGA
GCCTGGTACTATGGACAGTGTCAGAACTGGACCTTACGGTCAGATCTTCAGGCCTGACAA
CTTCGTTTTCGGGCAGTCTGGTGCTGGAAACAACTGGGCTAAAGGGCATTACACTGAAGG
AGCCGAGCTTATTGATGCTGTACTTGATGTTGTACGTAAGGAGGCTGAGAATTGTGACTG
TCTTCAGGGTTTCCAAGTGTGTCACTCGCTTGGTGGAGGCACTGGGTCTGGAATGGGAAC
TCTGCTGATATCTAAGATCAGGGAAGAGTATCCTGATCGAATGATGCTTACTTTCTCTGT
CTTCCCATCACCC

QA 1 613 1 613
DS 

RD RS1DY37TF 598 0 0
GG
ATCTTACTCACTAAATCGAGCCCACCGTGATCGCCTCCGATCTCGCCGGGAGTCTCTGCA
CTTTCTAAACCATCAGATTCAGTAGAATATGAGAGAGATCCTTCACATCCAAGAAGGTCA
ATGTGGGAACCAGATCGGTTCCAAGTTCTGGGAAGTTGTTTGCGACGAGCACGGGATCGA
TCCCACTGGTCGTTACACTGGCAACTCCGATCTGCAGTTGGAGAGGGTGAATGTTTACTA
TAACGAGGCCTCGTGCGGAAGATATGTTCCCCGTGCTATCCTCATGGATCTTGAGCCTGG
TACTATGGACAGTGTCAGAACTGGACCTTACGGTCAGATCTTCAGGCCTGACAACTTCGT
TTTCGGGCAGTCTGGTGCTGGAAACAACTGGGCTAAAGGGCATTACACTGAAGGAGCCGA
GCTTATTGATGCTGTACTTGATGTTGTACGTAAGGAGGCTGAGAATTGTGACTGTCTTCA
GGGTTTCCAAGTGTGTCACTCGCTTGGTGGAGACACTGGGTCTGGAATGGGAACTCTGCT
GATATCTAAGATCAGGGAAGAGTATCCTGATCGAATGATGCTTACTTTCTCTGTCT

QA 3 598 3 598
DS 

RD RS1H322TF 636 0 0
GGCCTGACAACTTCGTTTTCGGGCAGTCTGGTGCTGGAAACAACTGGGCTAAAGGGCATT
ACACTGAAGGAGCCGAGCTTATTGATGCTGTACTTGATGTTGTACGTAAGGAGGCTGAGA
ATTGTGACTGTCTTCAGGGTTTCCAAGTGTGTCACTCGCTTGGTGGAGGCACTGGGTCTG
GAATGGGAACTCTGCTGATATCTAAGATCAGGGAAGAGTATCCTGATCGAATGATGCTTA
CTTTCTCTGTCTTCCCATCACCCAAGGTCTCAGACACAGTGGTTGAACCGTATAATGCGA
CACTTTCAGTTCATCAGCTGGTTGAAAACGCTGATGAGTGTATGGTTCTGGACAATGAAG
CTCTTTATGACATCTGTTTTAGAACTCTCAAGCTTACCACTCCTAGCTTTGGTGATCTGA
ATCATCTGATCTCTGCAACCATGAGTGGAGTTACATGCTGTCTTAGGTTCCCTGGTCAGC
TCAACTCTGATCTGAGGAAGCTTGCAGTGAACCTCATACCTTTCCCTCGTCTCCACTTTT
TCATGGTCGGTTTTGCTCCTCTCACCTCCCGTGGCTCCCAGCAGTACCGCGCACTCACCG
TCCCAGAGCTCACCCAACAGATGTGGGATTCAAAGA

QA 1 636 1 636
DS 



CO CL1230Contig2 802 3 13 U
AACTATAATCCGGGGACTAATTATTTGAAGCAGCAAGAGCATAAAACACACACACAACAG
ACTTCATTTATAACAACACCACGACAAATTAAAAAAATACTGAGCTCCAACCTCACTTTT
ACACACAAGACAATCACAAAACAAGTACATAAGAAACTCAACGAAATCTAAAGGGCAGAG
ATAAAGAACACATGAGATGGTGATACGGTGGTATTCTCAGCAAAAGCCTTTTCAGTCTTG
ATACTCCGCTTCTTCTTCCTCCTCTTCTTCATACTCGCCTTCTTCATCTGCCGTTGCGTC
TTGGTATTGCTGATACTCAGACACCAGATCGTTCATGTTGCTCTCAGCTTCAGTGAACTC
CATCTCGTCCATTCCTTCACCTGTGTACCAATGCAAGAAAGCTTTCCTCCTGAACATGGC
TGTGAACTGCTCACTCACCCTCCTAAACATCTCTTGGATCGATGTCGAATTCCCTATAAA
GGTCGACGCCATGGAGAGGCCTCGAGGCGCTATGTCACAGACGCTTGACTTCACGTTGTT
GGGTATCCATTCCACGAAGTAGGATGAGTTTTTGTTCTGCACGTTTATCATCTGCTCGTC
CACTTCTTTTGTGCTCATTTTGCCACGGAACATTGCCGACGCTGTCAGGTACCGTCCGTG
GCGCGGGTCTGCGGCACACATCATGTTCTTTGAATCCCACATCTGTTGGGTGAGCTCTGG
GACGGTGAGTGCGCGGTACTGCTGGGAGCCACGGGAGGTGAGAGGAGCAAACCGACCATG
AAAAGTGGAGGCGAGGGAAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H322JQB U 1
AF RS1DY37JQ U 48
AF RS1D465JQ U 88
BS 1 177 RS1H322JQB
BS 178 178 RS1DY37JQ
BS 179 179 RS1H322JQB
BS 180 180 RS1DY37JQ
BS 181 319 RS1H322JQB
BS 320 320 RS1DY37JQ
BS 321 427 RS1H322JQB
BS 428 428 RS1DY37JQ
BS 429 574 RS1H322JQB
BS 575 575 RS1DY37JQ
BS 576 620 RS1H322JQB
BS 621 656 RS1DY37JQ
BS 657 802 RS1D465JQ

RD RS1H322JQB 620 0 0
AACTATAATCCGGGGACTAATTATTTGAAGCAGCAAGAGCATAAAACACACACACAACAG
ACTTCATTTATAACAACACCACGACAAATTAAAAAAATACTGAGCTCCAACCTCACTTTT
ACACACAAGACAATCACAAAACAAGTACATAAGAAACTCAACGAAATCTAAAGGGCAAAA
ATAAAGAACACATGAGATGGTGATACGGTGGTATTCTCAGCAAAAGCCTTTTCAGTCTTG
ATACTCCGCTTCTTCTTCCTCCTCTTCTTCATACTCGCCTTCTTCATCTGCCGTTGCGTC
TTGGTATTGCTGATACTCAAACACCAGATCGTTCATGTTGCTCTCAGCTTCAGTGAACTC
CATCTCGTCCATTCCTTCACCTGTGTACCAATGCAAGAAAGCTTTCCTCCTGAACATGGC
TGTGAACCGCTCACTCACCCTCCTAAACATCTCTTGGATCGATGTCGAATTCCCTATAAA
GGTCGACGCCATGGAGAGGCCTCGAGGCGCTATGTCACAGACGCTTGACTTCACGTTGTT
GGGTATCCATTCCACGAAGTAGGATGAGTTTTTGATCTGCACGTTTATCATCTGCTCGTC
CACTTCTTTTGTGCTCATTT

QA 1 620 1 620
DS 

RD RS1DY37JQ 609 0 0
C
CACACACAACAGACTTCATTTATAACAACACCACGACAAATTAAAAAAATACTGAGCTCC
AACCTCACTTTTACACACAAGACAATCACAAAACAAGTACATAAGAAACTCAACGAAATC
TAAAGGGCAGAGATAAAGAACACATGAGATGGTGATACGGTGGTATTCTCAGCAAAAGCC
TTTTCAGTCTTGATACTCCGCTTCTTCTTCCTCCTCTTCTTCATACTCGCCTTCTTCATC
TGCCGTTGCGTCTTGGTATTGCTGATACTCAGACACCAGATCGTTCATGTTGCTCTCAGC
TTCAGTGAACTCCATCTCGTCCATTCCTTCACCTGTGTACCAATGCAAGAAAGCTTTCCT
CCTGAACATGGCTGTGAACTGCTCACTCACCCTCCTAAACATCTCTTGGATCGATGTCGA
ATTCCCTATAAAGGTCGACGCCATGGAGAGGCCTCGAGGCGCTATGTCACAGACGCTTGA
CTTCACGTTGTTGGGTATCCATTCCACGAAGTAGGATGAGTTTTTGTTCTGCACGTTTAT
CATCTGCTCGTCCACTTCTTTTGTGCTCATTTTGCCACGGAACATTGCCGACGCTGTCAG
GTACCGTC

QA 2 609 2 609
DS 

RD RS1D465JQ 715 0 0
ATTAAAAAAATACTGAGCTCCAACCTCACTTTTACACACAAGACAATCACAAAACAAGTA
CATAAGAAACTCAACGAAATCTAAAGGGCAGAGATAAAGAACACATGAGATGGTGATACG
GTGGTATTCTCAGCAGAAGCCTTTTCAGTCTTGATACTCCGCTTCTTCTTCCTCCTCTTC
TTCATACTCGCCTTCTTCATCTGCCGTTGCGTCTTGGTACTGCTGATACTCAGACACCAG
ATCGTTCATGTTGCTCTCAGCTTCAGTGAACTCCATCTCGTCCATTCCTTCACCTGTGTA
CCAATGCAAGAAAGCTTTCCTCCTGAACATGGCTGTGAACTGCTCACTCACCCTCCTAAA
CATCTCTTGGATCGATGTCGAATTCCCTATAAAGGTCGACGCCATGGAGAGGCCTCGAGG
CGCTATGTCACAGACGCTTGACTTCACGTTGTTGGGTATCCATTCCACGAAGTAGGATGA
GTTTTTGTTCTGCACGTTTATCATCTGCTCGTCCACTTCTTTTGTGCTCATTTTGCCACG
GAACATTGCCGACGCTGTCAGGTACCGTCCGTGGCGCGGGTCTGCGGCACACATCATGTT
CTTTGAATCCCACATCTGTTGGGTGAGCTCTGGGACGGTGAGTGCGCGGTACTGCTGGGA
GCCACGGGAGGTGAGAGGAGCAAACCGACCATGAAAAGTGGAGGCGAGGGAAAGT

QA 1 715 1 715
DS 



AS 2 6

CO CL1231Contig1 774 2 2 U
GGATTGTTAGCTAGCTACACATCCACTCTGTTTCCCACTCGATCGATCGAAAGCTTTGGT
GTTCCACGCAGGGAGCGATCGATGGCGCGTCGTTCGGGAGACTGTATGAAATGCCTGGTG
ATCTTCGCGGTTGTATCTGCTTTAGTAGTGTGTGGACCTGCTCTCTATTGGAAATTCAAC
AAGGGTTTCGTTGGATCTACGAGTAGAAACTCTGTTTGTCCTCCTTGCTCCTGTGATTGC
CCACCTCCTGTCTCTCTCCTCGAGATGCTCCTGGGCTTGCAAATCTCTCTGTTACAGATT
GTGGAGGTGATGATCCGGAGCTCAAACAAGAAATGGAGAAGCAGTTTGTGGACCTTCTGA
CCGAGGAGCTGAAGCTTCAAGAAGCTGCTGCGGATGAGCATAGCCGTCATATGAATGTCA
CCCTCGGAGAAGCTAAAAGAGTTGCATCTCAGTACCAAAAGGAAGCTGAGAAATGCAACG
CCGCCACCGAGATTTGTGAATCAGCTAGGGAGAGAGCTGAAGCTTTGTTGATCAAGGAGA
GGAAAATCACTGCTTTGTGGGAGAAGAGAGCTCGGCTATCAGGCTGGGAAGGTGAGTAAA
CTGATTGCATTTCTCATGTCAGAGAAACCAAACTTTCACAACTTAGCTCAAGAAAAGGAA
GCTGTTGAATTGTCAAGGAAGACAATCCTATCTTCCATGTTTCCTCCATATATTGTAGTC
TTTTGTTTTGCCTCTGGATCAGAATGTAGCTAAAGACATGGCTTTGTATTGACT


BQ
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AF RS1DB62TF U 1
AF RS1DB62JQ C 447
BS 1 532 RS1DB62TF
BS 533 774 RS1DB62JQ

RD RS1DB62TF 532 0 0
GGATTGTTAGCTAGCTACACATCCACTCTGTTTCCCACTCGATCGATCGAAAGCTTTGGT
GTTCCACGCAGGGAGCGATCGATGGCGCGTCGTTCGGGAGACTGTATGAAATGCCTGGTG
ATCTTCGCGGTTGTATCTGCTTTAGTAGTGTGTGGACCTGCTCTCTATTGGAAATTCAAC
AAGGGTTTCGTTGGATCTACGAGTAGAAACTCTGTTTGTCCTCCTTGCTCCTGTGATTGC
CCACCTCCTGTCTCTCTCCTCGAGATGCTCCTGGGCTTGCAAATCTCTCTGTTACAGATT
GTGGAGGTGATGATCCGGAGCTCAAACAAGAAATGGAGAAGCAGTTTGTGGACCTTCTGA
CCGAGGAGCTGAAGCTTCAAGAAGCTGCTGCGGATGAGCATAGCCGTCATATGAATGTCA
CCCTCGGAGAAGCTAAAAGAGTTGCATCTCAGTACCAAAAGGAAGCTGAGAAATGCAACG
CCGCCACCGAGATTTGTGAATCAGCTAGGGAGAGAGCTGAAGCTTTGTTGAT

QA 1 532 1 532
DS 

RD RS1DB62JQ 328 0 0
TCTCAGTACCAAAAGGAAGCTGAGAAATGCAACGCCGCCACCGAGATTTGTGAATCAGCT
AGGGAGAGAGCTGAAGCTTTGTTGATCAAGGAGAGGAAAATCACTGCTTTGTGGGAGAAG
AGAGCTCGGCTATCAGGCTGGGAAGGTGAGTAAACTGATTGCATTTCTCATGTCAGAGAA
ACCAAACTTTCACAACTTAGCTCAAGAAAAGGAAGCTGTTGAATTGTCAAGGAAGACAAT
CCTATCTTCCATGTTTCCTCCATATATTGTAGTCTTTTGTTTTGCCTCTGGATCAGAATG
TAGCTAAAGACATGGCTTTGTATTGACT

QA 1 328 1 328
DS 



CO CL1231Contig2 821 4 9 U
GGAGCTACACATCCACTCTGTTACCTACTCGATCGAAAGCTTTCGTGTTCCACGCAGCGA
TCGATGGCGCGTCGTTCCGGAGACTGTATGAAATGCCTGGTGATCTTCGCGGTTGTATCT
GCTTTAGTAGTGTGTGGACCTGCTCTCTATTGGAAATTCAACAAAGGTTTCGTTGGATCG
GCTCGTAAGAACTCTGTTTGTCCTCCTTGCTCCTGTGACTGCCCACCTCCTGTCTCCCTC
CTCGAGATTGCTCCTGGGCTTGCAAATCTCTCTGTTACAGATTGTGGAGGTGATGATCCA
GAGCTCAAACAGGAAATGGAGAAGCAGTTTGTGGACCTTCTGACCGAGGAACTGAAGCTG
CAAGAAGCAGTTGCGGATGAGCACAGCCGTCATATGAATGTCACCCTCGCAGAAGCTAAA
AGAGTTGCATCTCAGTACCAAAAGGAAGCTGAGAAATGCAACGCCGCCACCGAGATTTGT
GAATCAGCTAGGGAGAGAGCTGAAGCTTTGTTGATCAAGGAGAGGAAAATCACTGCTTTG
TGGGAGAAGAGAGCTCGGCAATCAGGTTGGGAAGGTGAGTAAAACTGATTGCACTTCTCA
TATCTACCCTGAAGTGTTTCTGTCTCTGCGAGAAACCGAACTTTCACAACTTAGCTCAAG
AAAAGGAAACTGTTGAATTGTCAAGGAAGACAATCGTATCTTCCATGTTTCCTCCATATA
TTGTAGTCTTTTGTTTTGCCTCTGGATCAGA*TGTAGCTAAAGACATGGCCTTGTTATTG
ACTTTCCTTTTATACATAATTATGATTGTCCATTTCACTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FN22TF U 1
AF RS1F987TF U 5
AF RS1F987JQ C 30
AF RS1FN22JQ C 274
BS 1 40 RS1FN22TF
BS 41 41 RS1F987TF
BS 42 747 RS1FN22TF
BS 748 748 RS1FN22JQ
BS 749 775 RS1F987TF
BS 776 776 RS1F987JQ
BS 777 788 RS1F987TF
BS 789 811 RS1F987JQ
BS 812 821 RS1FN22JQ

RD RS1FN22TF 756 0 0
GGAGCTACACATCCACTCTGTTACCTACTCGATCGAAAGCCTTCGTGTTCCACGCAGCGA
TCGATGGCGCGTCGTTCCGGAGACTGTATGAAATGCCTGGTGATCTTCGCGGTTGTATCT
GCTTTAGTAGTGTGTGGACCTGCTCTCTATTGGAAATTCAACAAAGGTTTCGTTGGATCG
GCTCGTAAGAACTCTGTTTGTCCTCCTTGCTCCTGTGACTGCCCACCTCCTGTCTCCCTC
CTCGAGATTGCTCCTGGGCTTGCAAATCTCTCTGTTACAGATTGTGGAGGTGATGATCCA
GAGCTCAAACAGGAAATGGAGAAGCAGTTTGTGGACCTTCTGACCGAGGAACTGAAGCTG
CAAGAAGCAGTTGCGGATGAGCACAGCCGTCATATGAATGTCACCCTCGCAGAAGCTAAA
AGAGTTGCATCTCAGTACCAAAAGGAAGCTGAGAAATGCAACGCCGCCACCGAGATTTGT
GAATCAGCTAGGGAGAGAGCTGAAGCTTTGTTGATCAAGGAGAGGAAAATCACTGCTTTG
TGGGAGAAGAGAGCTCGGCAATCAGGTTGGGAAGGTGAGTAAAACTGATTGCACTTCTCA
TATCTACCCTGAAGTGTTTCTGTCTCTGCGAGAAACCGAACTTTCACAACTTAGCTCAAG
AAAAGGAAACTGTTGAATTGTCAAGGAAGACAATCGTATCTTCCATGTTTCCTCCATATA
TTGTAGTCTTTTGTTTTGCCTCTGGAT
CAGATGTAG

QA 1 747 1 747
DS 

RD RS1F987TF 784 0 0
GG
ACACATCCACTCTGTTACCTACTCGATCGAAAGCTTTCGTGTTCCACGCAGCGATCGATG
GCGCGTCGTTCCGGAGACTGTATGAAATGCCTGGTGATCTTCGCGGTTGTATCTGCTTTA
GTAGTGTGTGGACCTGCTCTCTATTGGAAATTCAACAAAGGTTTCGTTGGATCGGCTCGT
AAGAACTCTGTTTGTCCTCCTTGCTCCTGTGACTGCCCACCTCCTGTCTCCCTCCTCGAG
ATTGCTCCTGGGCTTGCAAATCTCTCTGTTACAGATTGTGGAGGTGATGATCCAGAGCTC
AAACAGGAAATGGAGAAGCAGTTTGTGGACCTTCTGACCGAGGAACTGAAGCTGCAAGAA
GCAGTTGCGGATGAGCACAGCCGTCATATGAATGTCACCCTCGCAGAAGCTAAAAGAGTT
GCATCTCAGTACCAAAAGGAAGCTGAGAAATGCAACGTCGCCACCGAGATTTGTGAATCA
GCTAGGGAGAGAGCTGAAGCTTTGTTGATCAAGGAGAGGAAAATCACTGCTTTGTGGGAG
AAGAGAGCTCGGCAATCAGGTTGGGAAGGTGAGTAAAGCTGATTGCACTTCTCATATCTA
CCCTGAAGTGTTTCTGTCTCTGCGAGAAACCGAACTTTCACAACTTAGCTCAAGAAAAGG
AAACTGTTGAATTGTCAAGGAAGACA*TCGTATCTTCCATGTTTCCTCCATATATTGTAG
TCTTT*GTTTG**CTCTGGAT*AGA*TGTAGCTAAAGACATGGCCTTGT*ATTGACTTTC
CT

QA 3 784 3 784
DS 

RD RS1F987JQ 782 0 0
CGATCGAAAGCTTTCGTGTTCCACGCAGCGATCGATGGCGCGTCGTTCCGGAGACTGTAT
GAAATGCCTGGTGATCTTCGCGGTTGTATCTGCTTTAGTAGTGTGTGGACCTGCTCTCTA
TTGGAAATTCAACAAAGGTTTCGTTGGATCGGCTCGTAAGAACTCTGTTTGTCCTCCTTG
CTCCTGTGACTGCCCACCTCCTGTCTCCCTCCTCGAGATTGCTCCTGGGCTTGCAAATCT
TTCTGTTACAGATTGTGGAGGTGATGATCCAGAGCTCAAACAGGAAATGGAGAAGCAGTT
TGTGGACCTTCTGACCGAGGAACTGAAGCTGCAAGAAGCAGTTGCGGATGAGCACAGCCG
TCATATGAATGTCACCCTCGCAGAAGCTAAAAGAGTTGCATCTCAGTACCAAAAGGAAGC
TGAGAAATGCAACGTCGCCACCGAGATTTGTGAATCAGCTAGGGAGAGAGCTGAAGCTTT
GTTGATCAAGGAGAGGAAAATCACTGCTTTGTGGGAGAAGAGAGCTCGGCAATCAGGTTG
GGAAGGTGAGTAAAGCTGATTGCACTTCTCATATCTACCCTGAAGTGTTTCTGTCTTTGC
GAGAAACCGAACTTTCACAACTTAGCTCAAGAAAAGGAAACTGTTGAATTGTCAAGGAAG
ACAATCGTATCTTCCATGTTTCCTCCATATATTGTAGTCTTTTGTTTTGCCTCTGGATTA
GAATGTAGCTAAAGACATGGCCTTGTTATTGACTTTCCTTTTATACATAATTATGATTGT
CC

QA 1 782 1 782
DS 

RD RS1FN22JQ 548 0 0
GTTACAGATTGTGGAGGTGATGATCCAGAGCTCAAACAGGAAATGGAGAAGCAGTTTGTG
GACCTTCTGACCGAGGAACTGAAGCTGCAAGAAGCAGTTGCGGATGAGCACAGCCGTCAT
ATGAATGTCACCCTCGCAGAAGCTAAAAGAGTTGCATCTCAGTACCAAAAGGAAGCTGAG
AAATGCAACGCCGCCACCGAGATTTGTGAATCAGCTAGGGAGAGAGCTGAAGCTTTGTTG
ATCAAGGAGAGGAAAATCACTGCTTTGTGGGAGAAGAGAGCTCGGCAATCAGGTTGGGAA
GGTGAGTAAAACTGATTGCACTTCTCATATCTACCCTGAAGTGTTTCTGTTTTTGCGAGA
AACCGAACTTTCACAACTTAGCTCAAGAAAAGGAAACTGTTGAATTGTCAAGGAAGACAA
TCGTATCTTCCATGTTTCCTCCATATATTGTAGTCTTTTGTTTTGCCTCTGGATCAGA*T
GTAGCTAAAGACATGGCCTTGTTATTGACTTTCCTTTTATACATAATTATGATTGTCCAT
TTCACTGC

QA 1 548 1 548
DS 



AS 1 6

CO CL1232Contig1 515 6 4 U
GGAAGCAGCGTCAAAAAAAGTGAGATGGGAGGAGGAGAGTCAGTAACGAAAAGAAGACGG
CGTCCCGGTCAACTTCACCGTAAACGCAGGCGCTTTCCTAAGATCCCGATTCCGAAGCAG
CCCTGTTTTAATACTCAACCTTTGACAGTGGAAAAGTTTCTGGAAAGTCTTGCTATTACC
ACCATGACTCCGTCGCCATCATCAAGCATACCTAAGCAAGAAGAAGAAGAAGAAGCTCGC
GATGATCAACCCACGAAGCCTAATCCCACTCATTGAGTCCTTTTTCTAATGTTTTGTAAT
CGCATTATCGTGACTTGAAATTAAAAATAAAACTTTATGTTATGTGTGATTTTGAGAAAT
CTTCTGTCATGATTATGTAGTTGTGATGTCCAGAACACTAGGTTTCTTTTGTTATATATA
CAATCGGTAAGGGTCTAAGTTGTTGTTACCAGCGACATTCTCTTCTGTTGTCTGGAGAAT
CATTAGCATTTTATTATTATTATTAATTTGCCGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RS1EG25TF U 57
AF RS1C635TF U 1
AF RS1G357JQ C 1
AF RS1EQ10JQ C 5
AF RS1EQ10TF U 5
AF RS1G357TF U 1
BS 1 421 RS1C635TF
BS 422 422 RS1EQ10TF
BS 423 512 RS1C635TF
BS 513 515 RS1G357JQ

RD RS1EG25TF 263 0 0
G
CGGCGTCCCGGTCAACTTCACCGTAAACGCAGGCGCTTTCCTAAGATCCCGATTCCGAAG
CAGCCCTGTTTTAATACTCAACCTTTGACAGTGGAAAAGTTTCTGGAAAGTCTTGCTATT
ACCACCATGACTCCGTCGCCATCATCAAGCATACCTAAGCAAGAAGAAGAAGAAG***CT
CGCGATGATCAACCCACGAAGCCTAATCCCACTCATTGAGTCCTTTTTCTAATGTTTTGT
AATCGCATTATCGTGACTTGAA

QA 2 263 2 263
DS 

RD RS1C635TF 512 0 0
GGAAGCAGCGTCAAAAAAAGTGAGATGGGAGGAGGAGAGTCAGTAACGAAAAGAAGACGG
CGTCCCGGTCAACTTCACCGTAAACGCAGGCGCTTTCCTAAGATCCCGATTCCGAAGCAG
CCCTGTTTTAATACTCAACCTTTGACAGTGGAAAAGTTTCTGGAAAGTCTTGCTATTACC
ACCATGACTCCGTCGCCATCATCAAGCATACCTAAGCAAGAAGAAGAAGAAGAAGCTCGC
GATGATCAACCCACGAAGCCTAATCCCACTCATTGAGTCCTTTTTCTAATGTTTTGTAAT
CGCATTATCGTGACTTGAAATTAAAAATAAAACTTTATGTTATGTGTGATTTTGAGAAAT
CTTCTGTCATGATTATGTAGTTGTGATGTCCAGAACACTAGGTTTCTTTTGTTATATATA
CTATCGGTAAGGGTCTAAGTTGTTGTTACCAGCGACATTCTCTTCTGTTGTCTGGAGAAT
CATTAGCATTTTATTATTATTATTAATTTGCC

QA 1 512 1 512
DS 

RD RS1G357JQ 515 0 0
GGAAGC
AGCGTCAAAAAAAGTGAGATGGGAGGAGGAGAGTCAGTAACGAAAAGAAGACGGCGTCCC
GGTCAACTTCACCGTAAACGCAGGCGCTTTCCTAAGATCCCGATTCCGAAGCAGCCCTGT
TTTAATACTCAACCTTTGACAGTGGAAAAGTTTCTGGAAAGTCTTGCTATTACCACCATG
ACTCCGTCGCCATCATCAAGCATACCTAAGCAAGAAGAAGAAGAAGAAGCTCGCGATGAT
CAACCCACGAAGCCTAATCCCACTCATTGAGTCCTTTTTCTAATGTTTTGTAATCGCATT
ATCGTGACTTGAAATTAAAAATAAAACTTTATGTTATGTGTGATTTTGAGAAATCTTCTG
TCATGATTATGTAGTTGTGATGTCCAGAACACTAGGTTTCTTTTGTTATATATACAATCG
GTAAGGGTCTAAGTTGTTGTTACCAGCGACATTCTCTTCTGTTGTCTGGAGAATCATTAG
CATTTTATTATTATTATTAATTTGCCGAT

QA 7 515 7 515
DS 

RD RS1EQ10JQ 494 0 0
GG
AGCGTCAAAAAAAGTGAGATGGGAGGAGGAGAGTCAGTAACGAAAAGAAGACGGCGTCCC
GGTCAACTTCACCGTAAACGCAGGCGCTTTCCTAAGATCCCGATTCCGAAGCAGCCCTGT
TTTAATACTCAACCTTTGACAGTGGAAAAGTTTTTGGAAAGTCTTGCTATTACCACCATG
ACTCCGTCGCCATCATCAAGCATACCTAAGCAAGAAGAAGAAGAAGAAGCTCGCGATGAT
CAACCCACGAAGCCTAATCCCACTCATTGAGTCCTTTTTTTAATGTTTTGTAATCGCATT
ATCGTGACTTGAAATTAAAAATAAAACTTTATGTTATGTGTGATTTTGAGAAATTTTCTG
TCATGATTATGTAGTTGTGATGTCCAGAACACTAGGTTTTTTTTGTTATATATACAATCG
GTAAGGGTTTAAGTTGTTGTTACCAGGGACATTTTTTTTTGTTGTTTGGAGAATCATTAG
CATTTTATTATT

QA 3 494 3 494
DS 

RD RS1EQ10TF 494 0 0
GG
AGCGTCAAAAAAAGTGAGATGGGAGGAGGAGAGTCAGTAACGAAAAGAAGACGGCGTCCC
GGTCAACTTCACCGTAAACGCAGGCGCTTTCCTAAGATCCCGATTCCGAAGCAGCCCTGT
TTTAATACTCAACCTTTGACAGTGGAAAAGTTTCTGGAAAGTCTTGCTATTACCACCATG
ACTCCGTCGCCATCATCAAGCATACCTAAGCAAGAAGAAGAAGAAGAAGCTCGCGATGAT
CAACCCACGAAGCCTAATCCCACTCATTGAGTCCTTTTTCTAATGTTTTGTAATCGCATT
ATCGTGACTTGAAATTAAAAATAAAACTTTATGTTATGTGTGATTTTGAGAAATCTTCTG
TCATGATTATGTAGTTGTGATGTCCAGAACACTAGGTTTCTTTTGTTATATATACAATCG
GTAAGGGTCTAAGTTGTTGTTACCAGCGACATTCTCTTCTGTTGTCTGGAGAATCATTAG
CATTTTATTATT

QA 3 494 3 494
DS 

RD RS1G357TF 515 0 0
GGAAGC
AGCGTCAAAAAAAGTGAGATGGGAGGAGGAGAGTCAGTAACGAAAAGAAGACGGCGTCCC
GGTCAACTTCACCGTAAACGCAGGCGCTTTCCTAAGATCCCGATTCCGAAGCAGCCCTGT
TTTAATACTCAACCTTTGACAGTGGAAAAGTTTCTGGAAAGTCTTGCTATTACCACCATG
ACTCCGTCGCCATCATCAAGCATACCTAAGCAAGAAGAAGAAGAAGAAGCTCGCGATGAT
CAACCCACGAAGCCTAATCCCACTCATTGAGTCCTTTTTCTAATGTTTTGTAATCGCATT
ATCGTGACTTGAAATTAAAAATAAAACTTTATGTTATGTGTGATTTTGAGAAATCTTCTG
TCATGATTATGTAGTTGTGATGTCCAGAACACTAGGTTTCTTTTGTTATATATACAATCG
GTAAGGGTCTAAGTTGTTGTTACCAGCGACATTCTCTTCTGTTGTCTGGAGAATCATTAG
CATTTTATTATTATTATTAATTTGCC
GAT

QA 7 512 7 512
DS 



AS 1 5

CO CL1233Contig1 1160 5 26 U
AAAACAAAGATTAGAAGAAGTTAATGGAGGAGAGAGAACGAACACACTGAAAAAATGTCT
TCTTGATTACAAAAGGATGGAAATTCTAAGTCTTATGATAAACCGTAATTAACAATTCTC
TAACGCAACTAAAGTTCAAGATTCAACCAAAGGTGAACTGACGACGACAAGACAAGAGAG
AAGACTGAATGTCCTTTCCGACACAATTTGATTTTTCTTTTTTTTTCAAGTCTTTTTGGT
TTGTCCGAGCTACTTTTGAGACTTTGTGGGGGTGGGTTTGTTTTATCAATTCAACGTGAT
CATGTCCTCTTCATGATGTATCCCAAGATTAGACCGATTAATCCCACCAGAAGAACGTAC
ATGAACGGGATTCCACCACCACTCTGACTCCTCTTGCTTTCACGCTTCAACTGCTCCAAT
TCTTGTTGAAGTTTCTTGTTTAGTTGAAGCGCAGAGTTCTTTTCCTCGGTGAGCCTTGTG
ATGAGAGCTCTCGCCTCAGATGAGTTTTCCTGAGGTTCAAGCCTGTCCACGCTAAATCTT
GGAGCAGCAGTAAAATCAGGAACGTTGGCACTGTCAGAGATAGAAGCTCTAGGAGAAGAG
CCCTCTTCGGATCCTTCACGAACGGGTGATGGTGGCCGTGGTGGATCAACATAGACAACT
CTCAATTTAGTCTCCTCAACTCGATGCCCTGCCTCTTTGCTAAACATCTCAGGAGTAACT
TCCTTGGCAGTGGCTCCGGGACTGGCCACAACACACTGAAGCAAGAACTTGTCCTTGCAC
TGCATATCAGCAGGAGCTTCCTTTTGCGCTTGCATCGTCACTAGAACTTCAGAAGAGGAT
CTCGGAAGAACAACACCAGTGTTAGGCCTAACACAATACTTCTTCGGATTCGTCGTTTTA
ACCTTGAAGGCGACATAATTGTCGGTTTTGTTAGCCAGATAGAGAGACGAAGAGATCTGC
TTCTTCAATTCAAAAGGGAATTGAAGGTCGATAGGATCGATGTCGAGAAGATCGTTACTC
ATCCTGATAAGATCTACGACGGAATTTGGTTCTCCGGAGGAGCTAGAGCGTTGCTCGTCG
TCGTCGTTGTCGATCGAGGACAGAGATTCCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCA
TATGTCCGGTACCGTCGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A275TR U 355
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AF RS1A275JQ U 30
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AF RS1A275TF C 508
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TCCAATTCTTGTTGAAGTTTCTTGTTTAGTTGAAGCGCAAAGTTCTTTTCCTCGGTGAGC
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AATCTTGGAGCAGC

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ATGAACGGGATTCCACCACCACTCTGACTCCTCTTGCTTTCACGCTTCAACTGCTCCAAT
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TCCTTGGCAGTGGCTCCGGGACTGGCGATAACACACTGAAGCAAGAACTTGTCCTTGCAC
TGCATATC

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GTCTTATGATAAACCGTAATTAACAATTCTCTAATGCAACTAGAGTTCAAGATTCAACCA
AAGGTGAACTGACGACGAGAAGACAAGAGAGAAGACTGAATGTCCTTTCCGACACAATTT
GATTTTTCTTTTTTT**CATGTCTTTTTGGTTTGTCCGAGCTACTTTTGAGACTTTGTGG
GGGTGGGTTTGTTTTATCAATTCAACGTGATCATGTCCTCTTCATGATGTATCCCAAGAT
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CCTCTTGCTTTCACGCTTCAACTGCTCCAATTCTTGTTGAAGTTTCTTGTTTAGTTGAAG
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DS 

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TTTA
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TCAACATAGACAACTCTCAATTTAGTCTCCTCAACTCGATGCCCTGCCTCTTTGCTAAAC
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AACTTGTCCTTGCACTGCATATCAGCAGGAGCTTCCTTTTGCGCTTGCATCGTCACTAGA
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CCCCCGGCCGTAAT

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DS 

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TCA
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GGTGGCCGTGGTGGATCAACATAGACAACTCTCAATTTAGTCTCCTCAACTCGATGCCCT
GCCTCTTTGCTAAACATCTCAGGAGTAACTTCCTTGGCAGTGGCTCCGGGACTGGCCACA
ACACACTGAAGCAAGAACTTGTCCTTGCACTGCATATCAGCAGGAGCTTCCTTTTGCGCT
TGCATCGTCACTAGAACTTCAGAAGAGGATCTCGGAAGAACAACACCAGTGTTAGGCCTA
ACACAATACTTCTTCGGATTCGTCGTTTTAACCTTGAAGGCGACATAATTGTCGGTTTTG
TTAGCCAGATAGAGAGACGAAGAGATCTGCTTCTTCAATTCAAAAGGGAATTGAAGGTCG
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TCTCCGGAGGAGCTAGAGCGTTGCTCGTCGTCGTCGTTGTCGATCGAGGACAGAGATTCC
CCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 4 653 4 653
DS 



AS 1 6

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TTCTGCCTCTTTGTTTCACTCTCAAATTACCAAAAAGCCCTTCCTTCTCCCAGCCGCGGC
TGCGACGATCAGTGTTCATGGTTTCTCGCCACGGAGGCCAAAGTCTCTCTCT**TTATCC
CATCGTTCTTCAGTCTCGGCTTTGTCTGCTTCCTCCGCAGTCGAAGTCAACGAACCGGTG
AAGAAATCAACGAGAACGCTTCCGTTTCGAGTAGGTCACGGGTTCGATCTGCACCGGCTA
GAGCCAGGGTACCCTCTGATAATAGGCGGGATTGATATCCCTCACGATAGAGGCTGCGAA
GCTCACTCCGATGGGGATGTGTTGCTTCATTGTGTAGTGGATGCTATCTTGGGAGCGTTA
GGACTTCCTGATATAGGCCAGATTTTCCCTGATTCTGATCCCAAGTGGAAAGGAGCTGCA
TCCTCTGTCTTCATCAAAGAAGCTGTGAGACTTATGGACGAGGCAGGGTACGAGATAGGA
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CGATCCAATCTGTCCAAGCTTCTTGGTGCAGACCCTTCTGTGGTGAACTTGAAAGCTAAA
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ATCCATATATGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
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25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E639TF U 3
AF RS1E908TF U 6
AF RS1EQ52TF U 1
AF RS1AR45TFB U 122
AF RS1EQ52JQ C 107
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RD RS1E639TF 545 0 0
GGTG
GGGGAGAGAGATCAGAAAAGTGATGTCTATGGCTACTTCGACTCACCTACCTTCTTCTGC
CTCTTTGTTTCACTCTCAAATTACCAAAAAGCCCTTCCTTCTCCCAGCCGCGGCTGCGAC
GATCAGTGTTCATGGTTTCTCGCCACGGAGGCCAAAGTCTCTCTCT**TTATCCCATCGT
TCTTCAGTCTCGGCTTTGTCTGCTTCCTCCGCAGTCGAAGTCAACGAACCGGTGAAGAAA
TCAACGAGAACGCTTCCGTTTCGAGTAGGTCACGGGTTCGATCTGCACCGGCTAGAGCCA
GGGTACCCTCTGATAATAGGCGGGATTGATATCCCTCACGATAGAGGCTGCGAAGCTCAC
TCCGATGGGGATGTGTTGCTTCATTGTGTAGTGGATGCTATCTTGGGAGCGTTAGGACTT
CCTGATATAGGCCAGATTTTCCCTGATTCTGATCCCAAGTGGAAAGGAGCTGCATCCTCT
GTCTTCATCAAAGAAGCTGTGAGACTTATGGACGAGGCAGGGTACGAGATAGGAAACCTA
G

QA 5 545 5 545
DS 

RD RS1E908TF 676 0 0
G
GGGGAGAGAGATCAGAAAAGTGATGTCTATGGCTACTTCGACTCACCTATCTTCTTCTGC
CTCTTTGTTTCACTCTCAAATTGCCAAAAAGCCCTTCCTTCTCCCAGCCGCGGCTGCGAC
GATCAGTGTTCATGGTTTCTCGCCACGGAGGCCAAATTCTCTCTCTCTTTATCCCATCGT
TCTTCAGTCTCGGCTTTGTCTGCTTCCTCCGCAGTCGAAGTCAACGGACCGGTGAAGAAA
TCAACGAGAACGCTTCCGTTTCGAGTAGGTCACGGGTTCGATCTGCACCGGCTAGAGCCA
GGGTACCCTCTGATAATAGGCGGGATTGATATCCCTCACGATAGAGGCTGCGAAGCTCAC
TCCGATGGGGATGTGTTGCTTCATTGTGTAGTGGATGCTATCTTGGGAGCGTTAGGACTT
CCTGATATAGGCCAGATTTTCCCTGATTCTGATCCCAAGTGAAAAGGAGCTGCATCCTCT
GTCTTCATCAAAGAAGCTGTGAGACTTATGGACGAGGCAGGGTACGAGATAGGAAACCTA
GACGCCACACTGATTCTACAGAGACCAAAGATAAGTCCACACAAGGAGACTATCCGATCC
AATCTGTCCAAGCTTCTTGGTGCAGACCCTTCTGTGGTGAACTTGAAAGCTAAAACACAT
GAGAAAGTTGATAGC

QA 2 676 2 676
DS 

RD RS1EQ52TF 746 0 0
GGGACTGGGGAGAGAGATCAGAAAAGTGATGTCTATGGCTACTTCGACTCACCTATCTTC
TTCTGCCTCTTTGTTTCACTCTCAAATTACCAAAAAGCCCTTCCTTCTCCCAGCCGCGGC
TGCGACGATCAGTGTTCATGGTTTCTCGCCACGGAGGCCAAAGTCTCTCTCT**TTATCC
CATCGTTCTTCAGTCTCGGCTTTGTCTGCTTCCTCCGCAGTCGAAGTCAACGAACCGGTG
AAGAAATCAACGAGAACGCTTCCGTTTCGAGTAGGTCACGGGTTCGATCTGCACCGGCTA
GAGCCAGGGTACCCTCTGATAATAGGCGGGATTGATATCCCTCACGATAGAGGCTGCGAA
GCTCACTCCGATGGGGATGTGTTGCTTCATTGTGTAGTGGATGCTATCTTGGGAGCGTTA
GGACTTCCTGATATAGGCCAGACTTTCCCTGATTCTGATCCCAAGTGGAAAGGAGCTGCA
TCCTCTGTCTTCATCAAAGAAGCTGTGAGACTTATGGACGAGGCAGGGTACGAGATAGGA
AACCTAGACGCCACACTGATTCTACAGAGACCAAAGATAAGTCCACACAAGGAGACTATC
CGATCCAATCTGTCCAAGCTTCTTGGTGCAGACCCTTCTGTGGTGAACTTGAAAGCTAAA
ACACATGAGAAAGTTGATAGCCTCGGAGAAA*CAGAAGCATTGCAGCTCATACTGTTATT
CTCCTCATGAAGAAGTGAGTCGGTTT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1AR45TFB 701 0 0
GCGACGATCAGCGTTCATGGATTCTCTACACGGAGGCCAAAGTCTCTCTCT**TTATCCC
AACGTTCTTCCGTCTCGGCTTTATCTGCTTCCTCCGCCGTCGAAGTCAATGAACCGGTGA
AGAAATCAACGAGAACGCTTCCGTTTCGAGTGGGTCACGGGTTCGATCTGCACCGGCTAG
AGCCAGGGTACCCTCTGATAATAGGCGGGATTGATATCCCTCACGACAGAGGCTGTGAAG
CTCACTCCGATGGGGATGTGTTGCTTCGTTGTGTGGTGGATGCAATCTTGGGAGCGTTAG
GGCTTCCTGATATAGGCCAGATTTTCCCTGATTCTGATCCTAAGTGGAAAGGAGCTGCTT
CCTCTGTCTTCATCAAAGAAGCTGTGAGACTTATGGACGAGGCGGGGTACGAGATAGGAA
ACCTAGACGCCACACTGATTCTACAGAGACCAAAGATAAGTCCACACAAGGAGACTATCC
GATCCAATCTGTCCAAGCTTCTTGGTGCAGACCCTTCTGTGGTGAACTTGAAAGCTAAAA
CACATGAGAAAGTTGATAGCCTCGGAGAAAACAGAAGCATTGCAGCTCATACTGTTATTC
TCCTCATGAAGA*GTGAGTCGGTTTTTATTATCTTCTTTATGTATCAGTTTCATAAAAAA
AATGCTTTATATGTAAATGTTAAACTCGGTGTAATCACCCT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RS1EQ52JQ 742 0 0
CTCCCAGCCGCGGCTGCGACGATCAGTGTTCATGGTTTCTCGCCACGGAGGCCAAAGTCT
CTCTCT**TTATCCCATCGTTCTTCAGTCTCGGCTTTGTCTGCTTCCTCCGCAGTCGAAG
TCAACGAACCGGTGAAGAAATCAACGAGAACGCTTCCGTTTCGAGTAGGTCACGGGTTCG
ATCTGCACCGGCTAGAGCCAGGGTACCCTCTGATAATAGGCGGGATTGATATCCCTCACG
ATAGAGGCTGCGAAGCTCACTCCGATGGGGATGTGTTGCTTCATTGTGTAGTGGATGCTA
TCTTGGGAGCGTTAGGACTTCCTGATATAGGCCAGACTTTCCCTGATTCTGATCCCAAGT
GGAAAGGAGCTGCATCCTCTGTCTTCATCAAAGAAGCTGTGAGACTTATGGACGAGGCAG
GGTACGAGATAGGAAACCTAGACGCCACACTGATTCTACAGAGACCAAAGATAAGTCCAC
ACAAGGAGACTATCCGATCCAATCTGTCCAAGCTTCTTGGTGCAGACCCTTCTGTGGTGA
ACTTGAAAGCTAAAACACATGAGAAAGTTGATAGCCTCGGAGAAAACAGAAGCATTGCAG
CTCATACTGTTATTCTCCTCATGAAGAAGTGAGTCGGTTTTTATTATCTTCTTTATGTAT
CAGTCTCATAAAAAAAATGCTTTATATGTAAATGTTAAACTCGGTGTAATCACCCTTTTG
ACTTTAGATAAACCATCCATA
C

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1E908JQ 637 0 0
CAGTCGAAGTCAACGGACCGGTGAAGAAATCAACGAGAACGCTTCCGTTTCGAGTAGGTC
ACGGGTTCGATCTGCACCGGCTAGAGCCAGGGTACCCTCTGATAATAGGCGGGATTGATA
TCCCTCACGATAGAGGCTGCGAAGCTCACTCCGATGGGGATGTGTTGCTTCATTGTGTAG
TGGATGCTATCTTGGGAGCGTTAGGACTTCCTGATATAGGCCAGATTTTCCCTGATTCTG
ATCCCAAGTGAAAAGGAGCTGCATCCTCTGTCTTCATCAAAGAAGCTGTGAGACTTATGG
ACGAGGCAGGGTACGAGATAGGAAACCTAGACGCCACACTGATTCTACAGAGACCAAAGA
TAAGTCCACACAAGGAGACTATCCGATCCAATCTGTCCAAGCTTCTTGGTGCAGACCCTT
CTGTGGTGAACTTGAAAGCTAAAACACATGAGAAAGTTGATAGCCTCGGAGAAAACAGAA
GCATTGCAGCTCATACTGTTATTCTCCTCATGAAGAAGTGAGTCGGTTTTTATTATCTTC
TTTATGTATCAGTCTCATAAAAAAAATGCTTTATATGTAAATGTTAAACTCGGTGTAATC
CCCCTTTTGACTTTAGATAAACCATCCATATATGACC

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 6

CO CL1235Contig1 726 6 1 U
CGCAGTGAAATCTTAGTTTCTCATTGCTATATTAGAAATTTTTTTTACAGGAATGATGCA
TCTTATACAATCAATAAAGCTAGCAAAAATGCAAAATTTTAGG*GGCCAAAACGGCAAAA
AGAAAACAGATTTTTTTT**TACAAAGATTCAAAGGAAATAACATACACTAGGGTGTACA
TTTTAGTATTGCGTACGGGTATATATTATATACACTCCGAGTTTCTAGTGCCCTGGTGCC
TTCGTCAGTGGGCTGCTACATGCTTTAGGACACTGTTTCCCCACGAGCTTCGGGGATATG
TTACAGCACTGGAACGTTGCTGGACCGTCTTTACCAGTATATTTAATATCAATGTCGCCG
ATCTCCACGTTCTTACACGGAAATGCCTTGCTGCACAATAGCTTAACAGCGTCTTTGTTC
CCTGAGGTTCCTCTGATATTCTTGAACTTTATGTCGACCAGCTTGATAGTTGATGGTTTA
TTCTTGTTGCATCGGTTCCATGGGCAGTACTCTTGGTCGATGAGGATAGGGTTGCTAACG
TTGTGGAGCATAATATTCTCGAAACTGATACCAGAGGCGGTCGTGGAGCAAGCTGCAGAG
GGCCATGTCTTGATCCTCACACCATTGTCAGTATTTCTGAGGGTGCGGTTCACGACCCTG
ATGCCAGTGACGTCTTCCTCGTGCCCGTATAATCCAAGGCTTCCAATACTGATCCCGTGT
CCCGGA


BQ
10 30 35 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1D389JQ U 1
AF RS1D389TF C 1
AF RS1DE81JQ U 2
AF RS1F251JQ U 2
AF RS1D630JQ U 2
AF RS1BM84JQ U 1
BS 1 726 RS1BM84JQ

RD RS1D389JQ 341 0 0
G
GCAGTGAAATCTTAGTTTCTCATTGCTATATTAGAAATTTTTTTTACAGGAATGATGCAT
CTTATACAATCAATAAAGCTAGCAAAAATGCAAAATTTTAGG*GGCCAAAACGGCAAAAA
GAAAACAGATTTTTTTT**TACAAAGATTCAAAGGAAATAACATACACTAGGGTGTACAT
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TCGTCAGTGGGCTGTTACATGCTTTAGGACACTGTTTCCCCACGAGCTTCGGGGATATGT
TACAGCACTGGAACGTTGCTGGACCGTCTTTACCAGTAT
C

QA 2 340 2 340
DS 

RD RS1D389TF 341 0 0
G
GCAGTGAAATCTTAGTTTCTCATTGCTATATTAGAAATTTTTTTTACAGGAATGATGCAT
CTTATACAATCAATAAAGCTAGCAAAAATGCAAAATTTTAGG*GGCCAAAACGGCAAAAA
GAAAACAGATTTTTTTT**TACAAAGATTCAAAGGAAATAACATACACTAGGGTGTACAT
TTTAGTATTGCGTACGGGTATATATTATATACACTCCGAGTTTCTAGTGCCCTGGTGCCT
TCGTCAGTGGGCTGTTACATGCTTTAGGACACTGTTTCCCCACGAGCTTCGGGGATATGT
TACAGCACTGGAACGTTGCTGGACCGTCTTTACCAGTAT
C

QA 2 340 2 340
DS 

RD RS1DE81JQ 375 0 0
GCAGCGAAATCTTAGTTTCTCATTGCTATATTAGAAATTTTTTTTACAGGAATGATGCAT
CTTATACAATCAATAAAGCTAGCAAAAATGCAAAATTTTAGG*GGCCAAAACGGCAAAAA
GAAAACAGATTTTTTTT***ACAAAGATTCAAAGGAAATAATATACACTAGGGTGTACAT
TTTAGTATTGCGTACGGGTATATATTATATACGCTCCGAGTTTCTAGTGCCCTGGTGCCT
TCGTCAGTGGGCTGCTACATGCTTTAGGACACTGTTTCCCCACGAGCTTCGGGGATATGT
TACAGCACTGGAACGTTGCTGGACCGTCTTTACCAGTATATTTAATATCAATGTCGCCGA
TCTCCACGTTCTTAC

QA 1 375 1 375
DS 

RD RS1F251JQ 577 0 0
GT
AGTGAAATCTTAGTTTCTCATTGCTATATTAGAAATTTTTTTTACAGGAATGATGCATCT
TATACAATCAATAAAGCTAGCAAAAATGCAAAATTTTAGG*GGCCAAAACGGCAAAAAGA
AAACAGATTTTTTTT**TACAAAGATTCAAAGGAAATAACATACACTAGGGTGTACATTT
TAGTATTGCGTACGGGTATATATTACATACACTCCGAGTTTCTAGTGCCCTGGTGCCTTC
GTCAGTGGGCTGCTACATGCTTTAGGACACTGTTTCCCCACGAGCTTCGGGGATATGTTA
CAGCACTGGAACGTTGCTGGACCGTCTTTACCAGTATATTTAATATCAATGTCGCCGATC
TCCACGTTCTTACACGGAAATGCCTTGCTGCACAATAGCTTAACAGCGTCTTTGTTCCCT
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TGGAGCATAATATTCTCGAAACTGATACCAGAGGC

QA 3 577 3 577
DS 

RD RS1D630JQ 636 0 0
A
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TTATACAATCAATAAAGCTAGCAAAAATGCAAAATTTTAGGAGGCCAAAACGGCAAAAAG
AAAACAGATTTTTTTTTTTACAAAGATTCAAAGGAAATAACATACACTAGGGTGTACATT
TTAGTATTGCGTACGGGTATATATTATATACACTCCGAGTTTCTAGTGCCCTGGTGCCTT
CGTCAGTGGGCTGCTACATGCTTTAGGACACTGTTTCCCCACGAGCTTCGGGGATATGTT
ACAGCACTGGAACGTTGCTGGACCGTCTTTACCAGTATATTTAATATCAATGTCGCCGAT
CTCCACGTTCTTACACGGAAATGCCTTGCTACACAATAGCTTAACAGCGTCTTTGTTCCC
TGAGGTTCCTCTGATATTCTTGAACTTTATGTCGACCAGCTTGATAGTTGATGGTTTATT
CTTGTTGCATCGGTTCCATGGGCAGTACTCTTGGTCGATGAGGATAGGGTTGCTAACGTT
GTGGAGCATAATATTCTCGAAACTGATACAAGAGGCGGTCGTGGAGCAAGCTGCAGAGGG
CCATGTCTTGATCCTCACACCATTGTCAGTATTTC

QA 2 636 2 636
DS 

RD RS1BM84JQ 726 0 0
CGCAGTGAAATCTTAGTTTCTCATTGCTATATTAGAAATTTTTTTTACAGGAATGATGCA
TCTTATACAATCAATAAAGCTAGCAAAAATGCAAAATTTTAGG*GGCCAAAACGGCAAAA
AGAAAACAGATTTTTTTT**TACAAAGATTCAAAGGAAATAACATACACTAGGGTGTACA
TTTTAGTATTGCGTACGGGTATATATTATATACACTCCGAGTTTCTAGTGCCCTGGTGCC
TTCGTCAGTGGGCTGCTACATGCTTTAGGACACTGTTTCCCCACGAGCTTCGGGGATATG
TTACAGCACTGGAACGTTGCTGGACCGTCTTTACCAGTATATTTAATATCAATGTCGCCG
ATCTCCACGTTCTTACACGGAAATGCCTTGCTGCACAATAGCTTAACAGCGTCTTTGTTC
CCTGAGGTTCCTCTGATATTCTTGAACTTTATGTCGACCAGCTTGATAGTTGATGGTTTA
TTCTTGTTGCATCGGTTCCATGGGCAGTACTCTTGGTCGATGAGGATAGGGTTGCTAACG
TTGTGGAGCATAATATTCTCGAAACTGATACCAGAGGCGGTCGTGGAGCAAGCTGCAGAG
GGCCATGTCTTGATCCTCACACCATTGTCAGTATTTCTGAGGGTGCGGTTCACGACCCTG
ATGCCAGTGACGTCTTCCTCGTGCCCGTATAATCCAAGGCTTCCAATACTGATCCCGTGT
CCCGGA

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 6

CO CL1236Contig1 1148 6 18 U
GAGCGAGTGAAACGAAAGGCCATCATCAACTACTCTCTCTTTTCAATCTCTCTCCACAGA
AATGGCAGCCACAAGAGTGATCACTGCAGCCACTACACAACCCGCCTCCTGTTTCCTCTC
CAAACAAGCTTTCCTTCTCCCTGCCAAGACATCATCATGCGGCGCTCTCTCCTTCAACAG
AAGAAGAGCATCTTTGGTGTTGAAATCAAAGAAGCAGCGACCCTTCTCTTGCACTGCCAT
TTACAATCCTCAGGTTAAGGTTCAAGAAGATGGCCAATCCGAAACCCTTGATTATCGTGT
TTTCTTCCTCGATGGCTCCGGAAAGAAGGTTTCTCCATGGCATGATATACCGTTGACCTT
AGGAGATGGAGTTTTCAACTTTATAGTTGAGATCCCTAAAGAGTCTAAAGCAAAGATGGA
AGTTGCTACTGATGAAGACTTCACTCCTATTAAGCAAGACACTAAGAAGGGCAAGCTCAG
ATACTATCCGTACAACATCAACTGGAACTATGGGTTGCTTCCACAGACATGGGAAGATCC
ATCTCAGGCTAACTCTGAAGTTGAAGGAGCTTTTGGTGATAATGATCCAGTTGATGTTGT
TGAGATTGGCGAGGCTCAAAGGAAGATAGGCGAGGTCCTAAAGATCAAGCCTTTGGCTGC
TTTAGCTATGATTGATGAAGGAGAGCTAGACTGGAAGATTGTTGCCATTTCTTTGGATGA
CCCAAAAGCTCATCTTGTCAATGATGTTGATGATGTTGAGAAACATTTCCCGGGTACATT
AACAGCCATTAGAGACTGGTTTAGAGACTACAAGATCCCAGATGGAAAGCCTGCTAACAG
GTTTGGTCTTGGAGACAAACCAGCAAACAAAGACTATGCTTTGAAGATCATCCATGAAAC
AAATGAATCATGGGCTAAGCTTGTCAAGAGATCCGTTGATGCTGGAGAGCTTTCACTATT
CTGAACAGTTTAACAATCATATCTTGCAAATGCAATGTGTCCAGTTATGAGCTTGAATAA
TTTGATTTTGATCAGACTCATGAGTCCTACATCATTCTTGTTATTCTCTCTCTCTAAAGA
GATCTAAACATCGAGACTTTAGTTTTCACAATTGATGGACTGAGTGAAATAATAGAGACA
TTATTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GK83TF U 38
AF RS1CP32TF U 1
AF RS1BQ74TF U 167
AF RS1GK83JQ C 853
AF RS1CP32JQ C 369
AF RS1BQ74JQ C 400
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BS 438 438 RS1GK83TF
BS 439 679 RS1CP32TF
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BS 681 702 RS1CP32TF
BS 703 809 RS1BQ74TF
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BS 1111 1148 RS1BQ74JQ

RD RS1GK83TF 588 0 0
TT
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ACCCGCCTCCTGTTTCCTCTCCAAACAAGCTTTCCTTCTCCCTGCCAAGACATCATCATG
CGGCGCTCTCTCCTTCAACAGAAGAAGAGCATCTTTGGTGTTGAAATCAAAGAAGCAGCG
ACCCTTCTCTTGCACTGCCATTTACAATCCTCAGGTTAAGGTTCAAGAAGATGGCCAATC
CGAAACCCTTGATTATCGTGTTTTCTTCCTCGATGGCTCCGGAAAGAAGGTTTCTCCATG
GCATGATATACCGTTGACCTTAGGAGATGGAGTTTTCAACTTTATAGTTGAGATCCCTAA
AGAGTCTAAAGCAAAGATGGAATTTGCTACTGATGAAGACTTCACTCCTATTAAGCAAGA
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TCTACAGACATGGGAAGATCCATCTCAGGCTAACTCTGAAGTTGAAGGAGCTTTTGGTGA
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GA

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DS 

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AATGGCAGCCACAAGAGTGATCACTGCAGCCACTACACAACCCGCCTCCTGTTTCCTCTC
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AAGAAGAGCATCTTTGGTGTTGAAATCAAAGAAGCAGCGACCCTTCTCTTGCACTGCCAT
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AGTTGCTACTGATGAAGGCTTCACTCCTATTAAGCAAGACACTAAGAAGGGCAAGCTCAG
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DS 

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G
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AAGCAAAGATGGAAGTTGCTACTGATGAAGACTTCACTCCTATTAAGCAAGACACTAAGA
AGGGCAAGCTCAGATGCTATCCGTACAACATCAACTGGAACTATGGGTTGCTTCCACAGA
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AGCCTTTGGCTGCTTTAGCTATGATTGATGAAGGAGAGCTAGACTGGAAGATTGTTGCCA
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TCCCGGGTACATTAACAGCCATTAGAGACTGGTTTAGAGACT

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AGA
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TAAGCTTGTCAAGAGATCCGTTGATGCTGGAGAGCTTTCACTATTCTGAACAGTTTAACA
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ACTCATGAGTCCTACATCATTCTTG
GC

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DS 

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CGTACAACATCAACTGGAACTATGGGTTGCTTCCACAGACATGGGAAGATCCATCTCAGG
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TTAGAGACTGGTTTAGAGACTACAAGATCCCAGATGGAAAGCCTGCTAACAGGTTTGGTC
TTGGAGGCAAACCAGCAAACAAAGACTATGCTTTGAAGATCATCCA**AAACAAATGAAT
CATGGGCTAAGCTTGTCAAGAGATCCGTTGATGCTGGAGAGCTTTCACTATTTTGAACAG
TTTAACAATCATATCTTGCAAATGCAATGTGTCCAGTTATGAGCTTGAATAATTTGATTT
TGATCAGACTCATGAGTCCTACATCATTCTTGTTATTCTCTCTCTCTAAAGAGATCTAAA
CATCGAGACTTTAGTTTTCACA
G

QA 1 742 1 742
DS 

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CACTAAGAAGGGCAAGCTCAGATGCTATCCGTACAACATCAACTGGAACTATGGGTTGCT
TCCACAGACATGGGAAGATCCATCTCAGGCTAACTCTGAAGTTGAAGGAGCTTTTGGTGA
TAATGATCCAGTTGATGTGGTTGAGATTGGCGAGGCTCAAAGGAAGATAGGCGAGGTCCT
AAAGATCAAGCCTTTGGCTGCTTTAGCTATGATTGATGAAGGAGAGCTAGACTGGAAGAT
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GAAACATTTCCCGGGTACATTAACAGCCATTAGAGACTGGTTTAGAGACTACAAGATCCC
AGATGGAAAGCCTGCTAACAGTTTTGGTCTTGGAGACAAACCAGCAAACAAAGACTATGC
TTTAAAGATCATCCATGAAACAAATGAATCATGGGCTAAGCTTGTCAAGAGATCCGTTGA
TGCTGGAGAGCTTTCACTATTCTGAACAGTTTAACAATCATATCTTGCAAACGCAATGGG
TCCAGTTATGAGCTTGAATAATTTGATTTTGATCAGACTCATGAGTCCTACATCATTCTT
GTTTTTCTCTCTCTCTAAAGAGATCTAAACATTGAGACTTTAGTTTTCACAATTGATGGA
CTGAGTGAAATAATAGAGACATTATTATC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 6

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AAATCTCAGCTGTTATATGAACAATACACGGATCTCCCACCATAAAGTAATAAACACAAA
AAAAAGTAAGATACAGACATACAGTCATCTCTGCACTTGACATCTTCTCTACAGAAACAA
TCTCTTAGGACTCTTTAAAATCCCTCACGACGTGTGAAGAAAACAGATACTTCAAACAAT
CTTTTACGTCCTAAACCGTCTAAACCCGAACCAGATCTCGTAGTGATTAAACAGCAAGCT
ATCATGCGTCTGTTTGCCAAGATACTCAAGTCCCAAACTCGCTAGCCTCTTCGCACACTC
GTCCCCACCTAACCTCGAGCAAAACTTCACGTTATGCGACACGAAGATCCTCCCATCGTA
AGGCTTCAACTTCTCAACCAGCCTCTCGAGTCCCGTCCACACGAGCTTATCAGGCATGTG
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CTCGTACCTCAAGGCAGCCATCAGAGAGAGCTCGTCCTTTTCGAGGCAGTGGAAGTGGCT
TGGATTGAGATAGCGTATGAAATGCAGACCCACGCGTAAGGTCCCGCACCCGATTTCGAG
GACGCGAGAGTTTGGTCTGAGATTGGAGGATTCGGCTAAGAACTCGAATACGTCGCGTCC
ACCTGCCCATGGCTCGCCGTAGTTGCTGTGGTGCTGCTCAACTAGTAACTCACCAGGGCA
TGGGAGAGCTGTGTGGTTGTTGTCTCCTTCGTAATGAGATATACCCTTGTACTGTTTGAG
ATCTGCGAGTTGTTGACCTCTAGTGCGAGGATTAATCCCCTTCCTGAGCTCGTTCTTGTG
CATATGCAAACCATTGGATCTAATCAGATCTCTGACCCACTCTATATCATCTCGCGTCGG
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GAATGAGAGCGAGAGGACAAGTATAGGCACGCTCACGAAAACTCCTTTCTGCATCGCTGG
CGACGGTGAAGAAGAAGAAGAACAGAGAAATGCCATCGAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BT77JQ U 32
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AF RS1G486JQ U 96
AF RS1B309JQ U 96
AF RS1G486TF C 455
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BS 32 405 RS1BT77JQ
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ATC
C

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DS 



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ATTACCTCACGCTCATTCTATGTTTTCTCCTTGGTTGATGGTAGTCGGTACAATCCAAAT
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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AF RS1DY30JQ U 1
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RD RS1DE86JQ 773 0 0
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CAC

QA 1 770 1 770
DS 

RD RS1DY30JQ 755 0 0
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TAAATGGATCAATTTTTTTGATTTTTATTGGAGACTGGGAATAGATGGACTTTCTATAGG
AACGATTTTACTTACGGGATTTATTACTACTTTAGCTACTTTAGCGGCTTTTCCAGTTAC
TCGGGATTCCCGATTATTCTATTTTCTGATGTTAGCAATGTACAGCGGCCAAATAGGATC
ATTTTCTTCTCGGGATATTTTACTTTTTTTCATCATGTGGGAATTAGAATTAATTCCCGT
TTATCTCCTTTTATCCATGTGGGGTGGAAAGAAACGTTTGTATTCAGCTACAAAATTTAT
TTTATACACTGCAGGAAGTTCTATTTTTTTATTAATAGGAGTTTTAGGTATAAGTTTATA
TGGTTCGAACGAACCAACATTAAATTTAGAACTATTAGCGAATCAAGTCTATCCTGTCAC
ACTCGAAATACTATTTTATATTGGATTTCTTATTG

QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1DY30TF 663 0 0
GTTAACAATAATTGTTGTTTT*CCAATATCTGCCGGTTCATTAATGTTATTTCTCCCGCA
TAGGGGAAATAAAGTTAATAAGTGGTATACTATATGCATTTGTATCTTAGAACTTCTTCT
AACGACTTACGCTTTTTGTTATAATTTTAAACTGGACGATCCACTAATTCAACTGTCCGA
AGATTATAAATGGATCAATTTTTTTGATTTTTATTGGAGACTGGGAATAGATGGACTTTC
TATAGGAACGATTTTACTTACGGGATTTATTACTACTTTAGCTACTTTAGCGGCTTTTCC
AGTTACTCGGGATTCCCGATTATTCTATTTTCTGATGTTAGCAATGTACAGCGGCCAAAT
AGGATCATTTTCTTCTCGGGATATTTTACTTTTTTTCATCATGTGGGAATTAGAATTAAT
TCCCGTTTATCTCCTTTTATCCATGTGGGGTGGAAAGAAACGTTTGTATTCAGCTACAAA
ATTTATTTTATACACTGCAGGAAGTTCTATTTTTTTATTAATAGGAGTTTTAGGTATAAG
TTTATATGGTTCGAACGAACCAACATTAAATTTAGAACTATTAGCGAATCAAGTCTATCC
TGTCACACTCGAAATACTATTTTATATTGGATTTCTTATTGCTTTTGCCGTCAAATCAC
CGAC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RS1H582TF 738 0 0
GGACGATCCACTAATTCAACTGTCCGAAGATTATAAATGGATCAATTTTTTTGATTTTTA
TTGGAGACTGGGAATAGATGGACTTTCTATAGGAACGATTTTACTTACGGGATTTATTAC
TACTTTAGCTACTTTATCGGCTTTTCCAGTTACTCGGGATTCCCGATTATTCTATTTTCT
GATGTTAGCAATGTACAGCGGCCAAATAGGATTATTTTCTTCTCGGGATATTTTACTTTT
TTTCATCATGTGGGAATTAGAATTAATTCCCGTTTATCTCCTTTTATCCATGTGGGGTGG
AAAGAAACGTTTGTATTCAGCTACAAAATTTATTTTATACACTGCAGGAAGTTCTATTTT
TTTATTAATAGGAGTTTTAGGTATAAGTTTATATGGTTCGAACGAACCAACATTAAATTT
AGAACTATTAGCGAATCAAGTCTATCCTGTCACACTCGAAATACTATTTTATATTGGATT
TCTTATTGCTTTTGCCGTCAAATTACCGATTATACCTTTACATACTTGGTTACCTGACAC
CCACGGCGAGGCACATTACAGTACCTGTATGCTTCTCGCTGGAATCTTATTAAAAATGGG
AGCATATGGATTGGTTCGAATCAATATGGAATTATTACCTCACGCTCATTCTATGTTTTC
TCCTTGGTTGATGGTAGTCGGTACAATCCAAA*AATTTATGCAGCTTTAACATCTCTCGG
TCAACGTAATTTAAAAAA

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1DE86TF 690 0 0
TTTTTGA
TTTTATTGGAGACTGGGAATAGATGGACTTTCTATAGGAACGATTTTACTTGCGGGATTT
ATTACTACTTTAGCTACTTTAGCGGCTTTTCCAGTTACTCGGGATTCCCGATTATTCTAT
TTTCTGATGTTAGCAATGTACAGCGGCCAAATAGGATCATTTTCTTCTCGGGATATTTTA
CTTTTTTTCATCATGTGGGAATTAGAATTAATTCCCGTTTATCTCCTTTTATCCATGTGG
GGTGGAAAGAAACGTTTGTATTCAGCTACAAAATTTATTTTATACACTGCAGGAAGTTCT
ATTTTTTTATTAATAGGAGTTTTAGGTATAAGTTTATATGGTTCGAACGAACCAACATTA
AATTTAGAACTATTAGCGAATCAAGTCTATCCTGTCACACTCGAAATACTATTTTATATT
GGATTTCTTATTGCTTTTGCCGTCAAATCACCGATTATACCTTTACATACTTGGTTACCT
GACACCCACGGCGAGGCACATTACAGTACCTGTATGCTTCTCGCTGGAATCTTATTAAAA
ATGGGAGCATATGGATTGGTTCGAATCAATATGGAATTATTACCTCACGCTCATTCTATG
TTTTCTCCTTGGTTGATGGTAGTCGGTACAATCCAAATAATTTATGCAGCTTCAACATCT
CCCGGTCAACGTAATTTAAAAAA

QA 8 690 8 690
DS 



AS 1 6

CO CL1239Contig1 820 6 12 U
TTTTTTGGAGAAACTTCAAAACTGTTATATAAATCTGATAAAATCATATATTATACTCCT
TTCATTTCTATTACTAATCATATAAACTAGCAAAAAAACATAACAAAATGGCGTCAGTTA
CATCAGCTACCGTCGCATTCCCATGTTTTACCGGCCTCAAGCTCGTCGTCAACTCCAAAC
CCACGACTGTATCCACCGCCGCCTTCAAATCCTCCTCCACATCGGCGCCTAAGCTCTCCG
TGAAGTCTTCTCTTAAAGATTTCAGCGTCATGGCCGTCGCAGCTGCAGCTTCCATCGCTT
TGGCCGGGAATGCGATGGCCATTGAGATTCTCTTAGGATCTGACGATGGTGGTCTTGTTT
TCGTGCCAAGCGAATTCACGGTGGCTAAAGGAGAGAAGATCGTGTTCAAGAACAACGCAG
GGTACCCACACAACGTGGTGTTCGACGAAGACGAGATCCCTAGTGGCGTGGACGCGAGCA
AGATCTCTATGGACGAGCAAGCTCTTCTCAATGGTGCTGGAGAGATATACGAGGTTACAC
TGACGGAGCCTGGCTCTTACGGCTTCTATTGTGTGCCGCACCAGGGAGCTGGTATGGTCG
GGAAACTTACTGTCAATTGAATTGTGACTAGATGATGATTATTCATGAACCATAAATAAT
TGTAATCTGGAAGAGTGTCTTGAATTATAAAACAGGATTATGTAATACTCCATTTACGTA
CTGGTTTAGTGGTAATAGCATTGGTTCTTCGGTACTTTTAAGCTGCTGCCATTGATTTAG
ATCAATTGTGTTTGTCACGTGAAAATAAAGTTTCTTTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 5 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G035TF U 1
AF RS1EZ64TF U 57
AF RS1EZ64JQ C 184
AF RS1G035JQ C 374
AF RS1BL24JQ C 11
AF RS1BL24TF U 27
BS 1 46 RS1G035TF
BS 47 47 RS1BL24TF
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BS 688 692 RS1EZ64TF
BS 693 801 RS1BL24TF
BS 802 820 RS1BL24JQ

RD RS1G035TF 687 0 0
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CCACGACTGTATCCACCGCCGCCTTCAAATCCTCCTCCACATCGGCGCCTAAGCTCTCCG
TGAAGTCTTCTCTTAAAGATTTCAGCGTCATGGCCGTCGCAGCTGCAGCTTCCATCGCTT
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TCGTGCCAAGCGAATTCACGGTGGCTAAAGGAGAGAAGATCGTGTTCAAGAACAACGCAG
GGTACCCACACAACGTGGTGTTCGACGAAGACGAGATCCCTAGTGGCGTGGACGCGAGCA
AGATCTCTATGGACGAGCAAGCTCTTCTCAATGGTGCTGGAGAGATATACGAGGTTACAC
TGACGGAGCCTGGCTCTTACGGCTTCTATTGTGTGCCGCACCAGGGAGCTGGTATGGTCG
GGAAACTTACTGTCAATTGAATTGTGACTAGATGATGATTATTCATGAACCATAAATAAT
TGTAATCTGGGAGAGTGTCTTGAATTA

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1EZ64TF 636 0 0
GGA
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CCCACGACTGTATCCACCGCCGCCTTCAAATCCTCCTCCACATCGGCGCCTAAGCTCTCC
GTGAAGTCTTCTCTTAAAGATTTCAGCGTCATGGCCGTCGCAGCCGCAGCTTCCATCGCT
TTGGCCGGGAATGCGATGGCCATTGAGATTCTCTTAGGAT*TGACGATGGTGGTCTTGTT
TTCGTGCCAAGCGAATTCACGGTGGCTAAAGGAGAGAAGATCGTGTTCAAGAACAACGCA
GGGTACCCACACAACGTGGTGTTCGACGAAGACGAGATCCCTAGTGGCGTGGACGCGAGC
AAGATCTCTATGGACGAGCAAGCTCTTCTCAATGGTGCTGGAGAGATATACGAGGTTACA
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GGGAAACTTACTGTCAATTGAATTGTGACTAGATGATGATTATTCATGAACCATAAATAA
TTGTAATCTGGAAGAGTGTCTTGAATTATAAAA

QA 4 636 4 636
DS 

RD RS1EZ64JQ 595 0 0
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AGTCTTCTCTTAAAGATTTCAGCGTCATGGCCGTCGCAGCCGCAGCTTCCATCGCTTTGG
CCGGGAATGCGATGGCCATTGAGATTCTCTTAGGAT*TGACGATGGTGGTCTTGTTTTCG
TGCCAAGCGAATTCACGGTGGCTAAAGGAGAGAAGATCGTGTTCAAGAACAACGCAGGGT
ACCCACACAACGTGGTGTTCGACGAAGACGAGATCCCTAGTGGCGTGGACGCGAGCAAGA
TCTCTATGGACGAGCAAGCTCTTCTCAATGGTGCTGGAGAGATATACGAGGTTACACTGA
CGGAGCCTGGCTCTTACGGCTTCTATTGTGTGCCGCACCAGGGAGCTGGTATGGTCGGGA
AACTTACTGTCAATTGAATTGTGACTAGATGATGATTATTCATGAACCATAAATAATTGT
AATCTGGAAGAGTGTCTTGAATTATAAAACAGGATTATGTAATACTCCATTTACGTACTG
GTTTAATGGTAATAGCATTGGTTCTTCGGTACTTTTAAGCTGCTGCCATTGATTT

QA 1 595 1 595
DS 

RD RS1G035JQ 383 0 0
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CGTGGTGTTCGACGAAGACGAGATCCCTAGTGGCGTGGACGCGAGCAAGATCTCTATGGA
CGAGCAAGCTCTTCTCAATGGTGCTGGAGAGATATACGAGGTTACACTGACGGAGCCTGG
CTCTTACGGCTTCTATTGTGTGCCGCACCAGGGAGCTGGTATGGTCGGGAAACTTACTGT
CAATTGAATTGTGACTAGATGATGATTATTCATGAACCATAAATAATTGTAATCTGGGAG
AGTGTCTTGAATTATAAAACAGGATTATGTAATACTCCATTTACGTACTGGTTTAATGGT
AATAGCATTGGTTCTTCGGTAC
C

QA 1 382 1 382
DS 

RD RS1BL24JQ 810 0 0
AAACTTCAAAACTGTTATATAAATCTGATAAAATCATATATTATACTCCTTTCATTTCTA
TTACTAATCATATAAACTAGCAAAAAAACATAACAAAATGGCGTCAGTTACATCAGCTAC
CGTCGCATTCCCATGTTTTACCGGCCTCAAGCTCGTCGTCAACTCCAAACCCACGACTGT
ATCCACCGCCGCCTTCAAATCCTCCTCCACATCGGCGCCTAAGCTCTCCGTGAAGTCTTC
TCTTAAAGATTTCAGCGTCATGGCCGTCGCAGCTGCAGCTTCCATCGCTTTGGCCGGGAA
TGCGATGGCCATTGAGATTCTCTTAGGATCTGACGATGGTGGTCTTGTTTTCGTGCCGAT
CGAATTCACGGTGGCTAAAGGAGAGAAGATCGTGTTCAAGAACAACGCAGGGTACCCACA
CAACGTGGTGTTCGACGAAGACGAGATACCTAGTGGCGTGGACGCGAGCAAGATCTCTAT
GGACGAGCAAGCTCTTCTCAATGGTGCTGGAGAGACATACGAGGTTACACTGACGGAGCC
TGGCTCTTACGGCTTCTATTGTGTGCCGCACCAGGGAGCTGGTATGGTCGGGAAACTTAC
TGTCAATTGAATTGTGACTAGATGATGATTATTCATGAACCATAAATAATTGTAATCTGA
AAGAGTGTCTTGAATTATAAAACAGGATTATGTAATACTCCATTTACGTACTGGTTTAGT
GGTAATAGCATTGGTTCTTCGGTACTTTTAAGCTGCTGCCATTGATTTAGATCAATTGTG
TTTGTCACGTGAAAATAAAGTTTCTTTGAG

QA 1 810 1 810
DS 

RD RS1BL24TF 775 0 0
ATATAAATCTGATAAAATCATATATTATACTCCTTTCATTTCTATTACTAATCATATAAA
CTAGCAAAAAAACATAACAAAATGGCGTCAGTTACATCAGCTACCGTCGCATTCCCATGT
TTTACCGGCCTCAAGCTCGTCGTCAACTCCAAACCCACGACTGTATCCACCGCCGCCTTC
AAATCCTCCTCCACATCGGCGCCTAAGCTCTCCGTGAAGTCTTCTCTTAAAGATTTCAGC
GTCATGGCCGTCGCAGCTGCAGCTTCCATCGCTTTGGCCGGGAATGCGATGGCCATTGAG
ATTCTCTTAGGATCTGACGATGGTGGTCTTGTTTTCGTGCCGATCGAATTCACGGTGGCT
AAAGGAGAGAAGATCGTGTTCAAGAACAACGCAGGGTACCCACACAACGTGGTGTTCGAC
GAAGACGAGATACCTAGTGGCGTGGACGCGAGCAAGATCTCTATGGACGAGCAAGCTCTT
CTCAATGGTGCTGGAGAGACATACGAGGTTACACTGACGGAGCCTGGCTCTTACGGCTTC
TATTGTGTGCCGCACCAGGGAGCTGGTATGGTCGGGAAACTTACTGTCAATTGAATTGTG
ACTAGATGATGATTATTCATGAACCATAAATAATTGTAATCTGAAAGAGTGTCTTGAATT
ATAAAACAGGATTATGTAATACTCCATTTACGTACTGGTTTAGTGGTAATAGCATTGGTT
CTTCGGTACTTTTAAGCTGCTGCCATTGATTTAGATCAATTGTGTTTGTCACGTG

QA 1 775 1 775
DS 



AS 2 6

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CGCAAAAATACATCAATCTTTATAAAAGCGTCATGAATGTAATGATTGACATGTTACCCC
TCAACGGGTAACTATTTGGATGTTTTCTTCTTTTAAAAGCAAAATATACTCTCAGACTGG
TTGGTAGAACAAATAGAAAGAAAATTAGTTGTAAAACAGGCAAATCCTACTCAATGATTC
CGGCGCCACAGTCGATATCAACGTCGCCCATCCCTGTGTCCTCTTCCTCTTCTCCACTTT
CTTCATCGCCGCTAATTTCTTCATTGTCCATTCTCAGCTTCGCCATGTGTTCTGTCAGCA
ACTTATCATCCCGTTCACTCACAGCTCTAGGTGCCTCTTTAACGACGAGCTTGCCTTTGT
GTTTCTCAATTGTCTCAGTGCAAGCTACTATAGCCTCGTCTAGAATTTTAATCCCTTGGT
CCTTGTCAAGTGTGTGAGTAGTAAGGACATACAGAGGTGGAGCAACCAGTTTAATCTTAA
CAGGACAAGCATCGTTTCCAGCAGCTTCAGCCTTTCTCATGGCCTCCTTGATGTGAACAA
CTCCGTCAAACTGAAAACATTTCAACTCGATATCAGCACGGATTTTCATTGGTTGTGGAG
TCATTCTCCTCCTAATGTTCTTCACAAGTGCTTCTTTCACTTCTTCCGTAACAGCAGGTA
CAACTTTAGTCACCTACAAACAGAAACCTCCAAAGATTAGCACCCAAAAAAGTTTGTAAA
CCAAACAACTAAAACGAAACAAAAGAACCAAACTTTACCTCCTGCCCATCAGAACCAACT
TCTTTGATCTCACGGGTGAGTGAACCCAACACAGAATCAGGATCAGTAACCAAGACCTTG
AAGGCCTCAAAAGCATGACCATACTTTCGGTACAAAGGCCAACCAATGTTCACATACAAG
TCCTCCAAATCGAGAGAAAGGGTCTCAGCAACGTGACGCATGATAGAATGAACGAGCTTG
CTCTTGTTGTACCTCTCTTCACAAGTCTGAATATCCTCCTCGCTAACCCTTCGTTTGCTC
AGATCAATGTACCCCCTCTCCTTGTCCACACGCAGGACCATGACGGGCTCGATCTTCCCG
ACCTTGATCAGGCTGCTGACGCTCCGGATCCGACGGCGGGAGAGCTCCGAAAAGAGGATC
ATCCCTTCCGTGTTGTTGTACTCGAGGAGCGACACGTAGGCTCCCATGTCGGCGATGCCT
TTGACCTGGATCATCACCGCCATGTCTACTTCCGGGTACTTGGCTTCGTACATCCGGCAC
TCTAGATTCGGCGTCGCCATGGTTTGGGAGATTGTGATGGAAAGCTGATGC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EX04JQ U 1
AF RS1FJ20JQ U 2
AF RS1D104JQ U 20
AF RS1D104TF C 679
BS 1 60 RS1EX04JQ
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BS 62 114 RS1EX04JQ
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BS 757 1311 RS1D104TF

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TTGGTAGAACAAATAGAAAGAAAATTAGTTGTAAAACAGGCAAATCCTACTCAATGATTC
CGGCGCCACAGTCGATATCAACGTCGCCCATCCCTGTGTCCTCTTCCTCTTCTCCACTTT
CTTCATCGCCGCTAATTTCTTCATTGTCCATTCTCAGCTTCCCCATGTGTTCTGTCAGCA
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GTTTCTCAATTGTCTCAGTGCAAGCTACTATAGCCTCGTCT

QA 1 401 1 401
DS 

RD RS1FJ20JQ 641 0 0
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CAACGGGTAACTATTTGGATGTTTTCTTCTTTTAAAAGCAAAATATACTCTCAGACTGGT
TGGTAGAACAAATAGAAAGAAAATTAGTTGTAAAACAGGCAAATCCTACTCAATGATTCC
GGCGCCACAGTCGATATCAACGTCGCCCATCCCTGTGTCCTCTTCCTCTTCTCCACTTTC
TTCATCGCCACTAATTTCTTCATTGTCCATTCTCAGCTTCGCCATGTGTTCTGTCAGCAA
CTTATCATCCCGTTCACTCACAGCTCTAGGTGCCTCTTTAACGACGAGCTTGCCTTTGTG
TTTCTCAATTGTCTCAGTGCAAGCTACTATAGCCTCGTCTAGAATTTTAATCCCTTGGTC
CTTGTCAAGTGTGTGAGTAGTAAGGACATACAGAGGTGGAGCAACCAGTTTAATCTTAAC
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CATTCTCCTCCTAATGTTCTTCACAAGTGCTTCTTTCACTT

QA 1 641 1 641
DS 

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ATGTTTTCTTTT****AAAGCAAAATATACTCTCAGATTGGTTGGCAGAACAAATAGAAA
GAAAATTAGTTGTAAAACAGGCAAATCCTACTCAATGATTCCGGCGCCACCGTCGATATC
AACGTCGCCCATCCCTGTGTCCTCTTCTTCTTCTCCACTTTCTTCATCGCCGCTAATTTC
TTCATTGTCCATTCTCAGCTTCGTG*TGTGTTCTGTCAGCAACTTATCATCTCGTTCACT
CACAGCTCTAGGCGCCTCTTTAACGACGAGCTTGCCTTTGTGTTTCTCAATTGTCTCAGT
GCAAGCTACTATAGCCTCGTCTAGAATTTTAATCCCTTGGTCCTTGTCAAGTGTGTGAGT
AGTAAGGACATACAGAGGTGGAGCAACCAGTTTAATCTTAACAGGACAAGCATCGTTTCC
AGCAGCTTCAGCCTTTCTCATGGCCTCCTTGATGTGAACAACTCCGTCAAACTGAAAACA
TTTCAACTCGATATCAGCACGGATTTTCATTGGTTGTGGAGTCATTCTCCTCCTAATGTT
CTTCACAAGTGCTTCTTTCACTTCTTCCGTAACAGCAGGTACAACTTTAGTCACCTACAA
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CAAAAGAACCAAACTTT

QA 1 737 1 737
DS 

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ACAAAAGAACCAAACTTTACCTCCTGCCCATCAGAACCAACTTCTTTGATCTCACGGGTG
AGTGAACCCAACACAGAATCAGGATCAGTAACCAAGACCTTGAAGGCCTCAAAAGCATGA
CCATACTTTCGGTACAAAGGCCAACCAATGTTCACATACAAGTCCTCCAAATCGAGAGAA
AGGGTCTCAGCAACGTGACGCATGATAGAATGAACGAGCTTGCTCTTGTTGTACCTCTCT
TCACAAGTCTGAATATCCTCCTCGCTAACCCTTCGTTTGCTCAGATCAATGTACCCCCTC
TCCTTGTCCACACGCAGGACCATGACGGGCTCGATCTTCCCGACCTTGATCAGGCTGCTG
ACGCTCCGGATCCGACGGCGGGAGAGCTCCGAAAAGAGGATCATCCCTTCCGTGTTGTTG
TACTCGAGGAGCGACACGTAGGCTCCCATGTCGGCGATGCCTTTGACCTGGATCATCACC
GCCATGTCTACTTCCGGGTACTTGGCTTCGTACATCCGGCACTCTAGATTCGGCGTCGCC
ATGGTTTGGGAGATTGTGATGGAAAGCTGATGC

QA 1 633 1 633
DS 



CO CL1240Contig2 775 2 2 U
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TCTCCGCCGTCCAATCCAATCCACCTCGCCTCACCATCAGCTTTCCATCACAATCTCCCG
AACCATGGCGACGCCGAATCTAGAGTGCCGCATGTACGAAGCCAAGTACCCGGAAGTAGA
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TACCTGCTGTTACGGAAGAAGTGAAAGAAGCACTTGTGAAGAACATTAGGAGGAGAATGA
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BQ
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AF RS1FJ20TF U 1
AF RS1EX04TF U 112
BS 1 641 RS1FJ20TF
BS 642 775 RS1EX04TF

RD RS1FJ20TF 641 0 0
GGGTACTAATAATCCCAAAGAATCCACCAGACTACTCCGTCGCTTTAAAACCCTAAAATC
TCTCCGCCGTCCAATCCAATCCACCTCGCCTCACCATCAGCTTTCCATCACAATCTCCCG
AACCATGGCGACGCCGAATCTAGAGTGCCGCATGTACGAAGCCAAGTACCCGGAAGTAGA
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CGAGTACAACAACACGGAAGGGATGATCCTCTTCTCCGAGCTCTCCCGCCGTCGGATCCG
GAGCGTCAGCAGCCTGATCAAGGTCGGGAAGATCGAGCCCGTCATGGTCCTGCGTGTGGA
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GTTCACTCACCCGTGAGATCAAAGAAGTTGGTCCTGATGGG

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1EX04TF 664 0 0
G
ATCTCCCGAACCATGGCGACGCCGAATCTAGAGTGCCGCATGTACGAAGCCAAGTACCCG
GAAGTAGACATGGCGGTGATGATCCAGGTCAAAAGCATCGCCGACATGGGAGCCTACGTC
TCCCTCCTCGAGTACAACAACACGGAAGGGATGATCCTCTTCTCCGAGCTCTCCCGCCGT
CGGATCCGGAGCGTCAGCAGCCTGATCAAGGTCGGGAAGATCGAGCCCGTCATGGTCCTG
CGTGTGGACAAGGAGAGGGGGTACATTGATCTGAGCAAACGAAGGGTTAGCGAGGAGGAT
ATT*CAGACTTGTGAAGAGAGGTATAACAAGAGCAAGCTCGTTCACTCTATCATGCGCCA
CGTTGCTGAGACCCTTTCTCTCGATTTGGAGGACTTGTATGTGAACATTGGTTGGCCTTT
GTACCGAAAGTATGGTCATGCTTTTGAGGCCTTCAAGGTCCTGGTGACTGATCCTGATTC
TGTGTTGGGTTCACTCACCCGTGAGATCAAAGAAGTTGGTCCTGATGGGCAGGAGGTGAC
TAGAGTTGTACCTGCTGTTACGGAAGAAGTGAAAGAAGCACTTGTGAAGAACATTAGGAG
GAGAATGACTCCACAACCAATGAAAATCCGTGCTGATATCGAGTTGAAATGTTTTCAGTT
TGA

QA 2 664 2 664
DS 



AS 1 5

CO CL1241Contig1 1098 5 41 U
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AAGGAGGGAGGGAGAGCAAGATGATGACCGGCGGGAGCTACACGACTATTGACAGCCAGA
AAGTCTCTGGATCTGTACCTTCCGTTCCAGATCCAGGCCATACCACCGTCAAATTCGCAG
AGTCAAATCTTCAAACCTTTCCTCCGTCTGCTACTCAGGGCAAGATCTCTGGCGGTAGTA
ATCCTCCTCGTGATGCTGACGATACATTTTCTGGGAATGGTAA*GGTGGTACAGACGAAC
CTCAGTCTGGTGGCTGGCTCCATAAGTTCACTGTTGGTGCTTACAAGCCTTTCTTTGATG
TCGACACTTCTGATGTTGTGGACAGGCTCAAAGAATCTCTCTTCCCGTTCCGTGGAACCT
TTACAGAAAAAACTGCCGATAAGCCTGACTTGTATGGTCCATTTTGGATATGCACGACTT
TGATATTCGTGGCGGCATCTATTGGCACATTTGTCACCTACGTAGCACACAAATGGAAGA
AACAAGAATGGAACTACGATATCAATCTTGTGACTTGGTCAGCAGGAGTGTTCTATGGCT
ATGTCGCGCTTGTTCCTCTCGCGTTATATGTCGTTCTCAAATACTTCTCTGCACCTTCAG
GACTAGTCCAGCTCTTCTGTCTCTACGGCTATTCCCTCTTCATCTTTATCCCCGCATTGT
GCCTCTCGGTCGTGCCAGTGGAGATCTTCAGATGGGTCATCGCGGGTGTAGCAGGGTTCA
TGTCTGCAACATTTGTGGCTTTGAACCTCAAAGCACATATCAATTCCGCTGGAGAGAGAT
CGATCCTGATAATAGCAAGCATCTTTCTTTTGCAGCTAGGGCTTGCGGTTGTTTTGAAGC
TCTATCTGTTCACTGTCACCGTATGATTCACAAAAGGGTGTATTGAAAAGGTTTTGTGTA
GATCTATCCATTAACGTTTTCTCCTCATATCTTATACAATTTTTTGGTACTGCTTGGAAA
CTGAACTCCATGATTCCATTTCATTTAGTTACTTGAACCTTCCATGGTTTTACTTGTAGA
AAATAGTGTCATAATAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1GI19TF U 29
AF RS1DT51TF U 1
AF RS1FT67TF U 29
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GG
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CTGGGAATGGTAA*GGTGGTACAGACGAACCTCAGTCTGGTGGCTGGCTCCATAAGTTCA
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TGTATGGTCCATTTTGGATATGCACGACTTTGATATTCGTGGCGGCATCTATTGGCACAT
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TGACTTGGTCA

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DS 

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AAGGAGGGAGGGAGAGCAAGATGATGACCGGCGGGAGCTACACGACTATTGACAGCGAGA
AAGTCTCTGGATCTGTACCTTCCGATCCAGATCCAGGCCATACCACCGTCAAATTCGCAG
AGTCAAATCTTCAAACCTTTCCTCCTTCTGCTACTCAGGGCAAGATCTCTGGTGGTAGTA
ATCCTCCTCGAGATGCTGACGATACATTTTCTGGGAATGGTAATGGTGGTACAGACGAAC
CTCAGTCTGGTGGCTGGCTCCATAAGTTCACTGTTGGTGCATACAAGCCTTTCTTTGATG
TCGACACTTCTGATGTTGTGGACAGGCTCAAAGAATCTCTCTTCCCGTTCCGTGGAACCT
TTACAGAAAAAACTGCCGATAAGCCTGACTTGTATGGTCCATTTTGGATATGCACGACTT
TGATATTCGTGGCGGCATCTATTGGCACATTTGTCACCTACGTAGCACACAAACGGAAGA
AACAAGAGTGGAACTACGATATCAATCTTGTGACTTGGTCAGCAGGAGTGTTCTATGGCT
ATGTCACGCTTGTTCCTCTCGCACTATATGTCGTTCTCAAATACTTCTCTGCACCTTCAG
GCCTAGTCCAACTCTTCTGTCTCTACGGCTATTCCCTCTTCATCTTTA

QA 1 708 1 708
DS 

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GG
GAGTTATACGGAGACGGAAGGAAGATCGGAAAGGAGGGAGGGAGAGCAAGATGATGACCG
GCGGGAGCTACACGACTATTGACAGCCAGAAAGTCTCTGGATCTGTACCTTCCGTTCCAG
ATCCAGGCCATACCACCGTCAAATTCGCAGAGTCAAATCTTCAAACCTTTCCTCCGTCTG
CTACTCAGGGCAAGATCTCTGGCGGTAGTAATCCTCCTCGTGATGCTGACGATACATTTT
CTGGGAATGGTAA*GGTGGTACAGACGAACCTCAGTCTGGTGGCTGGCTCCATAAGTTCA
CTGTTGGTGCTTACAAGCCTTTCTTTGATGTCGACACTTCTGATGTTGTGGACAGGCTCA
AAGAATCTCTCTTCCCGTTCCGTGGAACCTTTACAGAAAAAACTGCCGATAAGCCTGACT
TGTATGGTCCATTTTGGATATGCACGACTTTGATATTCGTGGCGGCATCTATTGGCACAT
TTGTCACCTACGTAGCACACAAATGGAAGAAACAAGAATGGAACTACGATATCAATCTTG
TGACTTGGTCAGCAGGAGTGTTCTATGGCTATGTCGCGCTTGTTCCTCTCGCGTTATATG
TCGTTCTCAAATACTTCTCTGCACCTTCAGGACTAGTCCAGCTCTTCTGTCTCTACGGCT
ATTCCCTCTTCATCTTTATCCCCGCATTGTGCCTCTCGGTCGTGCCAGTGGAGATCTTCA
GATGGGTCATCGCGGGTGTAGCAGG*TTCATGTCTGCA*CATTTGTGGCTTTGA*CCTCA
AAGCACATATCA*TTCCGCTGGAGAGAGATCGATC
TGATA

QA 3 817 3 817
DS 

RD RS1FT67JQ 744 0 0
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GAACCTTTACAGAAAAAACTGCCGATAAGCCTGACTTGTATGGTCCATTTTGGATATGCA
CGACTTTGATATTCGTGGCGGCATCTATTGGCACATTTGTCACCTACGTAGCACACAAAT
GGAAGAAACAAGAATGGAACTACGATATCAATCTTGTGACTTGGTCAGCAGGAGTGTTCT
ATGGCTATGTCGCGCTTGTTCCTCTCGCGTTATATGTCGTTCTCAAATACTTCTCTGCAC
CTTCAGGACTAGTCCAGCTCTTCTGTCTCTACGGCTATTCCCTCTTCATCTTTATCCCCG
CATTGTGCCTCTCGGTCGTGCCAGTGGAGATCTTCAGATGGGTCATCGCGGGTGTAGCAG
GGTTCATGTCTGCAACATTTGTGGCTTTGAACCTCAAAGCACATATCAATTCCGCTGGAG
AGAGATCGATCCTGATAATAGCAAGCATCTTTCTTTTGCAGCTAGGGCTTGCGGTTGTTT
TGAAGCTCTATCTGTTCACTGTCACCGTATGATTCACAAAAGGGTGTATTGAAAAGGTTT
TGTGTAGATCTATCCATTAACGTTTTCTCCTCATATCTTATACAATTTTTTGGTACTGCT
TGGAAACTGAACTCCATGATTCCATTTCATTTAGTTACTTGAACCTTCCATGGTTTTACT
TGTAGAAAATAGTGTCATAATAAT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1GI19JQ 676 0 0
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ATATTCGTGGCGGCATCTATTGGCACATTTGTCACCTACGTAGCACACAAATGGAAGAAA
CAAGAATGGAACTACGATATCAATCTTGTGACTTGGTCAGCAGGAGTGTTCTATGGCTAT
GTCGCGCTTGTTCCTCTCGCGTTATATGTCGTTCTCAAATACTTCTCTGCACCTTCAGGA
CTAGTCCAGCTCTTCTGTCTCTACGGCTATTCCCTCTTCATCTTTATCCCCGCATTGTGC
CTCTCGGTCGTGCCAGTGGAGATCTTCAGATGGGTCATCGCGGGTGTAGCAGGGTTCATG
TCTGCAACATTTGTGGCTTTGAACCTCAAAGCACATATCAATTCCGCTGGAGAGAGATCG
ATCCTGATAATAGCAAGCATCTTTCTTTTGCAGCTAGGGCTTGCGGTTGTTTTGAAGCTC
TATCTGTTCACTGTCACCGTATGATTCACAAAAGGGTGTATTGAAAAGGTTTTGTGTAGA
TCTATCCATTAACGTTTTCTCCTCATATCTTATACAATTTTTTGGTACTGCTTGGAAACT
GAACTCCATGATTCCATTTCATTTAGTTACTTGAACCTTCCATGGTTTTACTTGTAGAAA
ATAGTGTCATAATAAT

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 6

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AATCAGAGCCTCAAGTCTCCGTTTGTTCATATATATTTTATAGTCAGAACATGATATGAA
ACACACAAAAAAACACCACCATAGATTGAACTCAAGAAATTATTACAAAAACCATCATCT
TAACACACAAAAGCTTACTACTATTACTACTACAATCCTATTTTTGCTCCAAATAATAAC
TTCCACTCTAGAAACTTTTACAGAATCTTCTTCGGTTTCATTCTCTTTTAATAATCTCCC
ACAGAGCATAAAGTGAGGTCCCAGTCTAGTTCGGAAGCATCTGGTCGAAGTGCCACACTC
CGTGTCCTTTGCCAACCATCCTTAGCTGGGTGATGAAGTCTGAGATCTTCTTGATTGCTT
CAATCTGCTCTCCAAGAAACTCACTCTCAACGAAATCAGCTAACTGGGGATCATTGTTCT
CTGATGCCACTCTGTGAAGGTTTAGAAGCTTCCCGTTGGTAAGTTTCTCCAGAGAAAGGG
CCAACTCCATTGCATATAAAGCATCTCCTTTTTCAGCATGTTCGAAATCAGAGACAGGGG
AGACGATCGGGTGGAGTTTCACTCTTCCTCCTCTTTTGTTCTGGTACTCCATAAACTTCT
CTGCGTGCTCTCTTTCTTCATCACTTGATTCCTTGAAAAATTTGGCAAGACCCTTGAGAG
CAACGTCGTCTCTGTCGAAGTAGGCGTACATTGAATGGTACACATACGACACGTTGTATT
CCACATTGATTTGCTCGTTAATGGCAGCCTCGCTAGCGTCGGCATACCTCCGGCGAGCGA
GGGAGGCGTGAGATGTGATTGGAATGGCCAGATCCGCTTTCTTCACCTCCTCGAACGGCT
GGAACACCACTCCCGTCATCGGCATATTGTTTGTATCTACCGTCGAGGACGCAACCACCA
CTCCCCTGCCCCCACTATTATGCCTCGAGAAGCCGATAGACATAACAGACCGAGAGGCAG
CAGAGGAGGTGACGCCATGGGGGAGTAGCGACACACCGGGCTTAGCGCTGAAAGAAGAGA
GTGCCTTGGAGGCCATCAGGGAGAGAGAGAGATAAGGAGGGGAAAGGTGTTTGTTTAGGT
TATGGCTGCTGCTGCTGCTAGTGATTGTTGATGATGGATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 
25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G875JQ U 1
AF RS1G875TF C 1
AF RS1EN01JQ U 66
AF RS1FY89JQ U 58
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AF RS1FY89TF C 524
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BS 772 1083 RS1EN01TF
BS 1084 1121 RS1FY89TF

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CAATCTGCTCTCC

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ACACACAAAAAAACACCACCATAGATTGAACTCAAGAAATTATTACAAAAACCATCATCT
TAACACACAAAAGCTTACTACTATTACTACTACAATCCTATTTTTGCTCCAAATAATAAC
TTCCACTCTAGAAACTTTTACAGAATCTTCTTCGGTTTCATTCTCTTTTAATAATCTCCC
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CGTGTCCTTTGCCAACCATCCTTAGCTGGGTGATGAAGTCTGAGATCTTCTTGATTGCTT
CAATCTGCTCTCC

QA 1 373 1 373
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GCCACTCTGTGAAGGTTTAAAAGCTTCCCGTTGGTAAGTTTCTCC

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GCTTTCTTCACCTCCTCGAACGGCTGGAACACCACTCCCGTCATCGGCATATTGTTTGTA
TCTACCGTCGAGGACGCAACCACCACTCCCCTGCCCCCACTATTATGCCTCGAGAAGCCG
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GGAGGGGAAAGGTGTTTGTTTAGGTTAT
CC

QA 1 748 1 748
DS 

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GTACTCCATAAACTTCTCTGCGTGCTCTCTTTCTTCATCACTTGATTCCTTGAAAAATTT
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ATACGACACGTTGTATTCCACATTGATTTGCTCGTTAATGGCAGCCTCGCTAGCGTCGGC
ATACCTCCGGCGAGCGAGGGAGGCGTGAGATGTGATTGGAATGGCCAGATCCGCTTTCTT
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AAGGTGTTTGTTTAGGTTATGGCTGCTGCTGCTGCTAGTGATTGTTGATGATGGATCC

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 6

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CCAACCACCTCGGCTTCCTCTGTTCAAA***GGTAAGCTTTCACAATCAAAGTCACTATT
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GGAGGAGCTTCTAGCTGCTCGTGGGGATGAATTCAAGAAAGGATCCATGGATTCTCTTAG
CCTTACTGTTGATGATTTGGCTGGGAAAAA*GTTGTCCGATGAATAGAGCAAGAAGCTCT
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TATTAATTTTCGTAACAATATTTGGTATTATAGGTGTAATGTGAATCCACTAAGCTTTGA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DC94TF U 1
AF RS1AP38TFB U 1
AF RS1DC94JQ C 153
AF RS1AP38JQ C 39
AF RS1AL16TF U 6
AF RS1DV43TF U 27
BS 1 674 RS1AP38TFB
BS 675 678 RS1AL16TF
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BS 680 817 RS1AL16TF

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TTGATGATTTGGCT

QA 9 622 9 622
DS 

RD RS1AP38TFB 674 0 0
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CTCGTCGATGGCCGCTAGGTTTCTTAGTCTGAGACGCGCCTTATCTCTCTACCTCACTAA
CCAACCACCTCGGCTTCCTCTGTTCAAA***GGTAAGCTTTCACAATCAAAGTCACTATT
GAGCAGAGATCATGCGTATTTGGGATTACTTCATAGGCAGTTCTGTGGATCCCGTGAGGC
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TTCCACTCCCCCTGCAACGGCCTCCGAGGAACTGATTGTGAAATACAAGTCCCAGTTGAA
AATAAACCCGAGGCATGACTTCATGATGGTGTTCACCTGCAAGGTATGCGAGACGAGGTC
CATGAAGATGGCGAGCCGAGAATCATACGAGAAGGGCGTTGTGGTGGTGCGATGCGAGGG
GTGTGATAATCTGCATCTGATTGCAGACCGTCTTGGCTGGTTTGGAGAACCGGGGAGCGT
GGAGGAGCTTCTAGCTGCTCGTGGGGATGAATTCAAGAAAGGATCCATGGATTCTCTTAG
CCTTACTGTTGATGATTTGGCTGGGAAAAA*GTTGTCCGATGAATAGAGCAAGAAGCTCT
TCGTTGCTCCACTA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1DC94JQ 568 0 0
GTAAGCTTTCACAATCAAAGTCACTATTGAGCAGAGATCATGCGTATTTGGGATTACTTC
ATAGGCAGTTTTGTGGATCCCGTGAGGCTAGTGAAGCTGCTGCAGTAACCAAGTCTTCAA
ACTCCGTTGCTGAACTCTCCAAAGCTCCTTCCACTCCCCCTGCAACGGCCTCCGAGGAAC
TGATTGTGAAATACAAGTCCCAGTTGAAAATAAACCCGAGGCATGACTTCATGATGGTGT
TCACCTGCAAGGTATGCGAGACGAGGTCCATGAAGATGGCGAGCCGAGAATCATACGAGA
AGGGCGTTGTGGTGGTGCGATGCGAGGGGTGTGATAATCTGCATCTGATTGCAGACCGTC
TTGGCTGGTTTGGAGAACCGGGGAGCGTGGAGGAGCTTCTAGCTGCTCGTGGGGATGAAT
TCAAGAAAGGATTCATGGATTCTTTTAGCCTTACTGTTGATGATTTGGCTGGGAAAAA*G
TTGTCCGATGAATAGAGCAAGAAGCTTTTCGTTGCTCCACTACTAGGACTTGAACCCTGC
GGAAAACATATAATATTTTGTCTTTTAA

QA 1 568 1 568
DS 

RD RS1AP38JQ 708 0 0
TCGCCGAAGATTACCACCAGGTCTCGTCGATGGCCGCTAGGTTTCTTAGTCTGAGACGCG
CCTTATCTCTCTACCTCACTAACCAACCACCTCGGCTTCCTCTGTTCAAA***GGTAAGC
TTTCACAATCAAAGTCACTATTGAGCAGAGATCATGCGTATTTGGGATTACTTCATAGGC
AGTTCTGTGGATCCCGTGAGGCTAGTGAAGCTGCTGCAGTAACCAAGTCTTCAAACTCCG
TTGCTGAACTCTCCAAAGCTCCTTCCACTCCCCCTGCAACGGCCTCCGAGGAACTGATTG
TGAAATACAAGTCCCAGTTGAAAATAAACCCGAGGCATGACTTCATGATGGTGTTCACCT
GCAAGGTATGCGAGACGAGGTCCATGAAGATGGCGAGCCGAGAATCATACGAGAAGGGCG
TTGTGGTGGTGCGATGCGAGGGGTGTGATAATCTGCATCTGATTGCAGACCGTCTTGGCT
GGTTTGGAGAACCGGGGAGCGTGGAGGAGCTTCTAGCTGCTCGTGGGGATGAATTCAAGA
AAGGATCCATGGATTCTCTTAGCCTTACTGTTGATGATTTGGCTGGGAAAAA*GTTGTCC
GATGAATAGAGCAAGAAGCTTTTCGTTGCTCCACTACTAGGACTTGAACCCTGCGGAAAA
CATATAATATTTTGTCTTTTAATATTAATTTTCGTAACAATATTTGG
C

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1AL16TF 812 0 0
GGG
GTCCACAACGAAAAACTAGAAGCTTCGTCGTCGCCGAAGATTACCACCAGGTCTCGTCGA
TGGCCGCTAGGTTTCTTAGTCTGAGACGCGCCTTATCTCTCTACCTCACTAACCAACCAC
CTCGGCTTCCTCTGTTCAAA***GGTAAGCTTTCACAATCAAAGTCACTATTGAGCAGAG
ATCATGCGTATTTGGGATTACTTCATAGGCAGTTCTGTGGATCCCGTGAGGCTAGTGAAG
CTGCTGCAGTAACCAAGTCTTCAAACTCCGTTGCTGAACTCTCCAAAGCTCCTTCCACTC
CCCCTGCAACGGCCTCCGAGGAACTGATTGTGAAATACAAGTCCCAGTTGAAGATAAACC
CGAGGCATGACTTCATGATGGTGTTCACCTGCAAGGTATGCGAGACGAGGTCCATGAAGA
TGGCGAGCCGAGAATCATACGAGAAGGGCGTTGTGGTGGTGCGATGCGAGGGGTGTGATA
ATCTGCATCTGATTGCAGACCGTCTTGGCTGGTTTGGAGAACCGGGGAGCGTGGAGGAGC
TTCTAGCTGCTCGTGGGGATGAATTCAAGAAAGGATCCATGGATTCTCTTAGCCTTACTG
TTGATGATTTGGCTGGGAAAAAAGTTGTCCGATGAATAGAGCAAGAAGCTCTTCGTTGCT
CCACTACTAG*ACTTGAACCCTGCGGAAAACATATAATATTTTGTCTTTTAATATTAATT
TTCGTAACAATATTTGGTATTATAGGTGTAATGTGAATCCACTAAGCTTTGATCTTTTAA
GCATTGTAAAATGAGCACAGAGATAACAA

QA 4 812 4 812
DS 

RD RS1DV43TF 755 0 0
GG
AGCTTCGTCGTCGCCGAAGATTACCACCAGGTCTCGTCGATGGCCGCTAGGTTTCTTAGT
CTGAGACGCGCCTTATCTCTCTACCTCACTAACCAACCACCTCGGCTTCCTCTGTTCAAA
***GGTAAGCTTTCACAATCAAAGTCACTATTGAGCAGAGATCATGCGTATTTGGGATTA
CTTCATAGGCAGTTCTGTGGATCCCGTGAGGCTAGTGAAGCTGCTGCAGTAACCAAGTCT
TCAAACTCCGTTGCTGAACTCTCCAAAGCTCCTTCCACTCCCCCTGCAACGGCCTCCGAG
GAACTGATTGTGAAATACAAGTCCCAGTTGAAAATAAACCCGAGGCATGACTTCATGATG
GTGTTCACCTGCAAGGTATGCGAGACGAGGTCCATGAAGATGGCGAGCCGAGTATCATAC
GAGAAGGGCGTTGTGGTGGTGCGATGCGAGGGGTGTGATAATCTGCATCTGATTGCAGAC
CGTCTTGGCTGGTTTGGAGAACCGGGGAGCGTGGAGGAGCTTCTAGCTGCTCGTGGGGAT
GAATTCAAGAAAGGATCCATGGATTCTCTTAGCCTTACTGTTGATGATTTGGCTGGGAAA
AA*GTTGTCCGATGAATAGAGCAAGAAGCTCTTCGTTGCTCCACTACTAG*ACTTGAACC
CTGCGGAAA*CATATAATATTTTGTCTTTTAATATTAATTTTCGTAACAATATTTGGTAT
TATAG*TGTA*TGTGA*TCCACTAAGCTTTGAT

QA 3 755 3 755
DS 



AS 1 6

CO CL1244Contig1 1112 6 10 U
CATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGATCATCTCCGCCGGCAAAACCAGCG
AGGAGAGAGAGAGAAGAGAGAGAATGGATAGCGAAACCCTAATTGAATCGGCGATAAGGG
TTCTGAACACAGCTGACCCGTACGAAAAAGCGCGGCTTGGAGATTCGATTGCCGTCATAT
GGCTCCAAGGAGCTATCTCCGAACCCTACGATCCCGCCGTCGATCTCTCCGTCATGGACA
GGCCAGCTCGTCTCACCAACGTGAAACTGGTGTCTCCGAGTTTGATGCCGAAGCTGGGAA
AAGCTGGTAGCTTGCAGAGCAGGCAAGCGATTGTTCACAGTCTTGTTCATATTGAAAGCT
GGGCAGTTGACTTATCATGGGATATAATTGCTCGTTTCGGCAAGCAAGAGAAGATGCCGA
GAGAGTTCTTTACGGACTTTGTTCGTGTAGCTCAGGACGAAGGCCGTCACTTCTCGCTGC
TTGCAGCTCGGCTTGAGGAAATTGGTTCTCGTTACGGTGCGTTCCCTGCCCATGACGGTC
TTTGGGACTCTGCAACCGCTACTTCTCAGGATCTTTTGGCTCGTTTGGCTATAGAGCATT
GCGTTCACGAGGCTAGGGGGCTAGATGTATTGCCCACGACGATATCCGGGTTTAGGAATG
GAGGGGATAACGAGACGGCAGATTTGCTGGAGAAAGTTGTGTACCCTGAAGAAAACACTC
ACTGTGCAGCTGGAGTAAAATGGTTCAAGTATCTATGTGCAAGGTCCAAGAATCCTGAAG
TTACCATCAACAGCATAGAAGCAGATGATATCAGTGAAGAGATAATCCACAAGTTTCATT
CGGTAGTAAGAGAGCATTTCAGGGGACCGTTGAAGCCGCCTTTTAATGCCGAAGCAAGAA
AAGCTGCTGGTTTTGGCCCTCGATGGTATGAACCTCTTGCTGTCAAGGAGACCAATGCCT
AGAAAAATCAAACATGTCTTCTTTTTTCTTTCGAGTAGTTGGATTGTTTTGTTATCTGCC
ACTTTAATTTTTGGTATACATTTGTTTGACCTATTTGAAGAGAATGTTTCTTCCATTTAG
ACTATGATAAGGGTTTAGACTCTAGGCCAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RS1A030TF U 42
AF RS1FA43TF U 81
AF RS1A030TV U 1
AF RS1FA43JQ C 238
AF RS1A030JQ C 202
AF RS1A030TR C 222
BS 1 864 RS1A030TV
BS 865 865 RS1A030JQ
BS 866 873 RS1A030TV
BS 874 874 RS1A030JQ
BS 875 901 RS1A030TV
BS 902 902 RS1A030JQ
BS 903 913 RS1A030TV
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BS 915 946 RS1A030TV
BS 947 1112 RS1A030JQ

RD RS1A030TF 717 0 0
TCCGCCGGCAAAACCAGCGAGGAGAGAGAGAGAAGAGAGAGAATGGATAGCGAAACCCTA
ATTGAATCGGCGATAAGGGTTCTGAACACAGCTGACCCGTACGAAAAAGCGCGGCTTGGA
GATTCGATTGCCGTCATATGGCTCCAAGGAGCTATCTCCGAACCCTACGATCCCGCCGTC
GATCTCTCCGTCATGGACAGGCCAGCTCGTCTCACCAACGTGAAACTGGTGTCTCCGAGT
TTGATGCCGAAGCTGGGAAAAGCTGGTAGCTTGCAGAGCAGGCAAGCGATTGTTCACAGT
CTTGTTCATATTGAAAGCTGGGCAGTTGACTTATCATGGGATATAATTGCTCGTTTCGGC
AAGCAAGAGAAGATGCCGAGAGAGTTCTTTACGGACTTTGTTCGTGTAGCTCAGGACGAA
GGCCGTCACTTCTCGCTGCTTGCAGCTCGGCTTGAGGAAATTGGTTCTCGTTACGGTGCG
TTCCCTGCCCATGACGGTCTTTGGGACTCTGCAACCGCTACTTCTCAGGATCTTTTGGCT
CGTTTGGCTATAGAGCATTGCGTTCACGAGGCTAGGGGGCTAGATGTATTGCCCACGACG
ATATCCGGGTTTAGGAATGGAGGGGATAACGAGACGGCAGATTTGCTGGAGAAAGTTGTG
TACCCTGAAGAAA*CACTCACTGTGCAGCTGGAGTAAAATGGTTCAAGTATCTATGT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1FA43TF 755 0 0
G
GAATGGATAGCGAAACCCTAATTGAATCGGCGATAAGGGTTCTGAACACAGCTGACCCGT
ACGAAAAAGCGCGGCTTGGAGATTCGATTGCCGTCATATGGCTCCAAGGAGCTATCTCCG
AACCCTACGATCCCACCGTCGATCTCTCCGTCATGGACAGGCCAGCTCGTCTCACCAACG
TGAAACTGGTGTCTCCGAGTTTGATGCCGAAGCTGGGGAAAGCTGGTAGCTTGCAGAGCA
GGCAAGCGATTGTTCGCAGTCTTGTTCATATTGAAAGCTGGGCAGTTGACTTATCATGGG
ATATAATTGCTCGTTTCGGCAAGCAAGAGAAGATGCCGAGAGAGTTCTTTACGGACTTTG
TTCGTGTAGCTCAGGACGAAGGCCGTCACTTCTCGCTGCTTGCAGCTCGGCTTGAGGAAA
TTGGTTCTCGTTACGGTGCGTTCCCTGCCCATGACGGTCTTTGGGACTCTGCAACCGCTA
CTTCTCAGGATCTTTTGGCTCGTTTGGCTATAGAGCATTGCGTTCACGAGGCTAGGGGGC
TAGATGTATTGCCCACGACGATATCCAGGTTTAGGAATGGAGGGGATAACGAGACGGCAG
ATTTGCTGGAGAAAGTTGTGTACCCTGAAGAAATCACTCACTGTGCAGCTGGAGTAAAAT
GGTTCAAGTATCTATGTGCAAG*TCCAAGAATCCTGA*GTTACCATCAACAGCATAGA*G
CAGATGATATCAGTGA
GAGATATCCACAGTTTCA

QA 2 737 2 737
DS 

RD RS1A030TV 948 0 0
CATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGATCATCTCCGCCGGCAAAACCAGCG
AGGAGAGAGAGAGAAGAGAGAGAATGGATAGCGAAACCCTAATTGAATCGGCGATAAGGG
TTCTGAACACAGCTGACCCGTACGAAAAAGCGCGGCTTGGAGATTCGATTGCCGTCATAT
GGCTCCAAGGAGCTATCTCCGAACCCTACGATCCCGCCGTCGATCTCTCCGTCATGGACA
GGCCAGCTCGTCTCACCAACGTGAAACTGGTGTCTCCGAGTTTGATGCCGAAGCTGGGAA
AAGCTGGTAGCTTGCAGAGCAGGCAAGCGATTGTTCACAGTCTTGTTCATATTGAAAGCT
GGGCAGTTGACTTATCATGGGATATAATTGCTCGTTTCGGCAAGCAAGAGAAGATGCCGA
GAGAGTTCTTTACGGACTTTGTTCGTGTAGCTCAGGACGAAGGCCGTCACTTCTCGCTGC
TTGCAGCTCGGCTTGAGGAAATTGGTTCTCGTTACGGTGCGTTCCCTGCCCATGACGGTC
TTTGGGACTCTGCAACCGCTACTTCTCAGGATCTTTTGGCTCGTTTGGCTATAGAGCATT
GCGTTCACGAGGCTAGGGGGCTAGATGTATTGCCCACGACGATATCCGGGTTTAGGAATG
GAGGGGATAACGAGACGGCAGATTTGCTGGAGAAAGTTGTGTACCCTGAAGAAAACACTC
ACTGTGCAGCTGGAGTAAAATGGTTCAAGTATCTATGTGCAAGGTCCAAGAATCCTGAAG
TTACCATCAACAGCATAGAAGCAGATGATATCAGTGAAGAGATAATCCACAAGTTTCATT
CGGTAGTAAGAGAGCATTTCAGGG*ACCGTTGA*GCCGCCTTTTAATGCCGAAGCAAGAA
A*GCTGCTGGTTT*GGCCCTCGATGGTATGAACCTCTTGCTGTCAA
GG

QA 1 946 1 946
DS 

RD RS1FA43JQ 814 0 0
ACAGGCCAGCTCGTCTCACCAACGTGAAACTGGTGTCTCCGAGTTTGATGC*GAAGCTGG
GGAAAGCTGGTAGCTTGCAGAGCAGGCAAGCGATTGTTCGCAGTCTTGTTCATATTGAAA
GCTGGGCAGTTGACTTATCATGGGATATAATTGCTCGTTTCGGCAAGCAAGAGAAGATGC
CGAGAGAGTTCTTTACGGACTTTGTTCGTGTAGCTCAGGACGAAGGCCGTCACTTCTCGC
TGCTTGCAGCTCGGCTTGAGGAAATTGGTTCTCGTTACGGTGCGTTCCCTGCCCATGACG
GTCTTTGGGACTCTGCAACCGCTACTTCTCAGGATCTTTTGGCTCGTTTGGCTATAGAGC
ATTGCGTTCACGAGGCTAGGGGGCTAGATGTATTGCCCACGACGATATCCAGGTTTAGGA
ATGGAGGGGATAACGAGACGGCAGATTTGCTGGAGAAAGTTGTGTACCCTGAAGAAATCA
CTCACTGTGCAGCTGGAGTAAAATGGTTCAAGTATCTATGTGCAAGGTCCAAGAATCCTG
AAGTTACCATCAACAGCATAGAAGCAGATGATATCAGTGAAGAGATAATCCACAAGTTTC
ATTCGGTAGTAAGAGAGCATTTCAGGGGACCGTTGAAGCCGCCTTTTAATGCCGAAGCAA
GAAAAGCTGCTGGTTTTGGCCCTCGATGGTATGAACCTCTTGCTGTCAAAGAGACCAATG
CCTAGAAAAATCAAACATGTCTTCTTTTTTCTTTCGAGTAGTTGGATTGTTTTGTTATCT
GCAACTTTAATTTTTGGTATACATTTGTTTGACC

QA 1 814 1 814
DS 

RD RS1A030JQ 911 0 0
CGAACCTACGATCCCG
CGTCGATCTCTC*GTCATGGACAGGCCAGCTCGTCTCACCAACGTGAAACTGGTGTCTCC
GAGTTTGATGCCGAAGCTGGGAAAAGCTGGTAGCTTGCAGAGCAGGCAAGCGATTGTTCA
CAGTCTTGTTCATATTGAAAGCTGGGCAGTTGACTTATCATGGGATATAATTGCTCGTTT
CGGCAAGCAAGAGAAGATGCCGAGAGAGTTCTTTACGGACTTTGTTCGTGTAGCTCAGGA
CGAAGGCCGTCACTTCTCGCTGCTTGCAGCTCGGCTTGAGGAAATTGGTTCTCGTTACGG
TGCGTTCCCTGCCCATGACGGTCTTTGGGACTCTGCAACCGCTACTTCTCAGGATCTTTT
GGCTCGTTTGGCTATAGAGCATTGCGTTCACGAGGCTAGGGGGCTAGATGTATTGCCCAC
GACGATATCCGGGTTTAGGAATGGAGGGGATAACGAGACGGCAGATTTGCTGGAGAAAGT
TGTGTACCCTGAAGAAAACACTCACTGTGCAGCTGGAGTAAAATGGTTCAAGTATCTATG
TGCAAGGTCCAAGAATCCTGAAGTTACCATCAACAGCATAGAAGCAGATGATATCAGTGA
AGAGATAATCCACAAGTTTCATTCGGTAGTAAGAGAGCATTTCAGGGGACCGTTGAAGCC
GCCTTTTAATGCCGAAGCAAGAAAAGCTGCTGGTTTTGGCCCTCGATGGTATGAACCTCT
TGCTGTCAAGGAGACCAATGCCTAGAAAAATCAAACATGTCTTCTTTTTTCTTTCGAGTA
GTTGGATTGTTTTGTTATCTGCCACTTTAATTTTTGGTATACATTTGTTTGACCTATTTG
AAGAGAATGTTTCTTCCATTTAGACTATGATAAGGGTTTAGACTCTAGGCCAAAC

QA 17 911 17 911
DS 

RD RS1A030TR 886 0 0
GATCTCTCTGTCATGGACAGGCCAGCTCGTCTCACCAACGTGAAACTGGTGTCTCCGAGT
TTGATGCCGAAGCTGGGAAAAGCTGGTAGCTTGCAGAGCAGGCAAGCGATTGTTCACAGT
CTTGTTCATATTGAAAGCTGGGCAGTTGACTTATCATGGGATATAATTGCTCGTTTCGGC
AAGCAAGAGAAGATGCCGAGAGAGTTCTTTACGGACTTTGTTCGTGTAGCTCAGGACGAA
GGCCGTCACTTCTCGCTGCTTGCAGCTCGGCTTGAGGAAATTGGTTCTCGTTACGGTGCG
TTCCCTGCCCATGACGGTCTTTGGGACTCTGCAACCGCTACTTCTCAGGATCTTTTGGCT
CGTTTGGCTATAGAGCATTGCGTTCACGAGGCTAGGGGGCTAGATGTATTGCCCACGACG
ATATCCGGGTTTAGGAATGGAGGGGATAACGAGACGGCAGATTTGCTGGAGAAAGTTGTG
TACCCTGAAGAAAACACTCACTGTGCAGCTGGAGTAAAATGGTTCAAGTATCTATGTGCA
AGGTCCAAGAATCCTGAAGTTACCATCAACAGCATAGAAGCAGATGATATCAGTGAAGAG
ATAATCCACAAGTTTCATTCGGTAGTAAGAGAGCATTTCAGGGGACCGTTGAAGCCGCCT
TTTAATGCCGAAGCAAGAAAAGCTGCTGGTTTTGGCCCTCGATGGTATGAACCTCTTGCT
GTCAAGGAGACCAATGCCTAGAAAAATCAAACATGTCTTCTTTTTTCTTTCGAGTAGTTG
GATTGTTTTGTTATCTGCCACTTTAATTTTTGGTATACATTTGTTTGACCTATTTGAAGA
GAATGTTTCTTCCATTTAGACTATGATAAGGGTTTAGACTCTAGGC

QA 1 886 1 886
DS 



AS 1 5

CO CL1245Contig1 984 5 5 U
AGAAATAAACATTTTTATCATCATATAATCTCATCGTTCACATCAAATAACCCCAAAAAT
GCTCACGCCAAATGATAGAAATGAACACAAGTAAAAACAGAGTAACAGATTCTTATCGAG
TCTTGTGTAGAAATATAAATAAACAGAAATGCCCCAAAAGACCAAAGCAAAACGTCAAAG
GGGATATAGAGAGATAGTTACTTCATTATAAAGTGTCTAACCCAACTTTGCTTTCAGGGA
AGCAAGAGGGATCTTAGAAAGAACTTTCTCATCGAAAACCATGTAATGTTTCTTCAGTTC
ATTTATCGTCTTCTCCGCCACTGGATCCACCTTGTCCTCATGTTTCTCATACAGCATTGG
TACTGTATGCAACACCACAAAACATATGTAGACAAGGGTCAAGAAGTTGAACCAGTTGCC
CACAACCGAGATTATCCACAGCCCAACAACCACCATGAGAAACTTCTTCAAGTCCCTTCC
TAATGCAATGCTCCTTATGATAACGAAGGCCTGGTTCAGCTCGTTTCTCAGTGCAGAAGC
AATCAAAATGAAATGTTCCTCTTTAACATGGATCTCAGGAATTTTAGGTGGAGGCTTTTT
CATAAAGGCATGAGCATTAGACCACAAAAACATGGCAGCGAGGGAGAATATCAAAATGTG
ACACGCAAGACTCAACAAATGATACTCAACCAACTCGAACAGGACCCAAATGGCAGTCGC
TACACCAAGAACAGCGGCTGAGAGCTTCTTGTCCCTCCACAAGAACACATCAGCAGGCAA
GCCACCGCCGAGGACCTTGTGAACAGGCTTCTCTACCAAACAAACGTATATCTTCGCCTT
CAAAGCCGACGGAGACTCCGGTTTCTCGTGCTCCGAGTCCGACGACGATGATGAATCGTG
ATCGTGGATCTTCTCAGCTATCTTCTCCATCAGAGACTCTTCCGTGTGCACAGGTTTCTC
CGATTCTTCCGCCATTTTTTTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GV88JQ U 132
AF RS1DG48TF C 95
AF RS1H420JQB U 1
AF RS1GY06JQ U 73
AF RS1H420TF C 275
BS 1 545 RS1H420JQB
BS 546 546 RS1GY06JQ
BS 547 696 RS1H420JQB
BS 697 725 RS1GY06JQ
BS 726 984 RS1H420TF

RD RS1GV88JQ 383 0 0
AATATAAATAA
ACAGAAATGCCCCAAAAGACCAAAGCAAAACGTCAAAGGGGATATAGAGAGATAGTTACT
TCATTATAAAGTGTCTAACCCAACTTTGCTTTCAGGGAAGCAAGAGGGATCTTAGAAAGA
ACTTTCTCATCGAAAACCATGTAATGTTTCTTCAGTTCATTTATCGTCTTCTCCGCCGGT
GGATCCACCTTGTCCTCATGTTTCTCATACAGCATTGGTACTGTATGCAACACCACAAAA
CATATGTAGACAAGGGTCAAGAAGTTGAACCGGTTGCCCACAACCGAAATTATCCACAGC
CCAACAACCACCATGAGAAACTTCTTCAAGTCCCTTCCTAATGCAATGCTCCTTATGA
CCAAGGCCTGGTTC

QA 12 369 12 369
DS 

RD RS1DG48TF 536 0 0
AAACAGAGTAACAGATTCTTATCGAGTCTTGTGTAGAAATATAAATA**CAGAAATGCCC
CAAAAGACCAAAGCAAAACGTCAAAGGGGATATAGAGAGATAGTTACTTCATTATAAAGT
GTCTAACCCAACTTTGCTTTCAGGGAAGCAAGAGGGATCTTAGAAAGAACTTTCTCATCG
AAAACCATGTAATGTTTCTTCAGTTCATTTATCGTCTTCTCCGCCACTGGATCCACCTTG
TCCTCATGTTTCTCATACAGCATTGGTACTGTATGCAACACCACAAAACATATGTAGACA
AGGGTCAAGAAGTTGAACCAGTTGCCCACAACCGAGATTATCCACAGCCCAACAACCACC
ATGAGAAACTTCTTCAAGTCCCTTCCTAATGCAATGCTCCTTATGATAACGAAGGCCTGG
TTCAGCTCGTTTCTCAGTGCAGAAGCAATCAAAATGAAATGTTCCTCTTTAACATGGATC
TCAGGAATTTTAGGTGGAGGCTTTTTCATAAAGGCATGAGCATTAGACCACAAAAA

QA 1 536 1 536
DS 

RD RS1H420JQB 696 0 0
AGAAATAAACATTTTTATCATCATATAATCTCATCGTTCACATCAAATAACCCCAAAAAT
GCTCACGCCAAATGATAGAAATGAACACAAGTAAAAACAGAGTAACAGATTCTTATCGAG
TCTTGTGTAGAAATATAAATAAACAGAAATGCCCCAAAAGACCAAAGCAAAACGTCAAAG
GGGATATAGAGAGATAGTTACTTCATTATAAAGTGTCTAACCCAACTTTGCTTTCAGGGA
AGCAAGAGGGATCTTAGAAAGAACTTTCTCATCGAAAACCATGTAATGTTTCTTCAGTTC
ATTTATCGTCTTCTCCGCCACTGGATCCACCTTGTCCTCATGTTTCTCATACAGCATTGG
TACTGTATGCAACACCACAAAACATATGTAGACAAGGGTCAAGAAGTTGAACCAGTTGCC
CACAACCGAGATTATCCACAGCCCAACAACCACCATGAGAAACTTCTTCAAGTCCCTTCC
TAATGCAATGCTCCTTATGATAACGAAGGCCTGGTTCAGCTCGTTTCTCAGTGCAGAAGC
AATCAGAATGAAATGTTCCTCTTTAACATGGATCTCAGGAATTTTAGGTGGAGGCTTTTT
CATAAAGGCATGAGCATTAGACCACAAAAACATGGCAGCGAGGGAGAATATCAAAATGTG
ACACGCAAGACTCAACAAATGATACTCAACCAACTC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RS1GY06JQ 672 0 0
A
GATAGAAATGAACACAAGTAAAAACAGAGTAACAGATTCTTATCGAGTCTTGTGTAGAAA
TATAAATAAACAGAAATGCCCCAAAAGACCAAAACAAAACGTCAAAGGGGATACAGAGAG
ATAGTTACTTCATTATAAAGTGTCTAACCCAACTTTGCTTTCAGGGAAGCAAGAGGGATC
TTAAAAAGAACTTTCTCATCGAAAACCATGTAATGTTTCTTCAGTTCCTTCATCGTCTTC
TCTGCCACTGGATCCACCTTGTCCTCATGTTTCTCATACAGCATCGGTACTGTATGCAAC
ACCACAAAACATATGTAGACAAGGGTCAAGAAGTTGAACCAGTTGCCCACAACAGAGATT
ATCCACAGCCCAACAACCACCATCAGAAACTTCTTCAAGTCCCTTCCTAATGCAATGCTC
CTTAGGATAACGAAGGCCTGGTTCAGCTCGTTTCTCAGTGCAGAAGCAATCAAAATGAAA
TGTTCCTCTTTAACATGGATTTCAGGAATTTTAGGTGGAGGCTTTTTCATAAAGGCATGA
GCATTAGACCACAAAAACATGGCAGCGAGGGAGAATATCAAAATGTGACACGCAAGACTC
AACAAATGATACTCAACCAACTCGAACAGGACCCAAATGGCAGTCGCTACAC
AAAGGCTTCTCTCTACCAA

QA 2 653 2 653
DS 

RD RS1H420TF 710 0 0
AAAACCATGTAATGTTTCTTCAGTTCATTTATCGTCTTCTCCGCCACTGGATCCAC*TTG
TCCTCATGTTTCTCATACAGCATTGGTACTGTATGCAACACCACAAAACATATGTAGACA
AGGGTCAAGAAGTTGAACCAGTTGCCCACAACCGAGATTATCCACAGCCCAACAACCACC
ATGAGAAACTTCTTCAAGTCCCTTCCTAATGCAATGCTCCTTATGATAACGAAGGCCTGG
TTCAGCTCGTTTCTCAGTGCAGAAGCAATCAGAATGAAATGTTCCTCTTTAACATGGATC
TCAGGAATTTTAGGTGGAGGCTTTTTCATAAAGGCATGAGCATTAGACCACAAAAACATG
GCAGCGAGGGAGAATATCAAAATGTGACACGCAAGACTCAACAAATGATACTCAACCAAC
TCGAACAGGACCCAAATGGCAGTCGCTACACCAAGAACAGCGGCTGAGAGCTTCTTGTCC
CTCCACAAGAACACATCAGCAGGCAAGCCACCGCCGAGGACCTTGTGAACAGGCTTCTCT
ACCAAACAAACGTATATCTTCGCCTTCAAAGCCGACGGAGACTCCGGTTTCTCGTGCTCC
GAGTCCGACGACGATGATGAATCGTGATCGTGGATCTTCTCAGCTATCTTCTCCATCAGA
GACTCTTCCGTGTGCACAGGTTTCTCCGATTCTTCCGCCATTTTTTTCGC

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 6

CO CL1246Contig1 561 6 4 U
GGATAAGAATTTGGATATTATTAGATAAACGTTATATTTATTTTGAACCATAACCAATCT
AACTTGGAAAATTATTAATAAGACATGAGCTGTTTTTCCTGCTAGATCTACGCAAAAAGA
TCTCTATTACATTGATTTCATGTCTTTATTAGTAAAGAGATTATGCATATATGTATTTTA
AAATTTAGCAATCATATCGACATTCACATTGATGCATGCGAATATAACCTGGCTTGGGAG
GATCATCAATACATTTGGTACATTGTACTCCCCATCCTTTTGGCACAGGTTTTCCAGTAT
TTGTTACACTCATCTTTTTCATGTCCTCTACACATAAATTAATTCCATTTTTTCCGCATG
CTCCAGCATGATTGCTTGGTAATGATTTGCAGAAAAGCTTTTTCATGCCGGCTTCCACCT
CTACTTTAAAATTATTTAAAATGAGAAATGTGAGAACACAAGAAACCATTAACATAACAC
TCTGTCTCATGGCTGAAAATGAGGAAATTCTTTTACAAAAAGGAATTATTGTTTCTTGTA
CACTCCTATGAAATACAATCC


BQ
10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 

AF RS1H128JQB U 1
AF RS1H128TF C 1
AF RS1EV06JQ U 2
AF RS1EV06TF C 2
AF RS1AX33JQ U 42
AF RS1AX33TF C 42
BS 1 512 RS1H128JQB
BS 513 513 RS1EV06JQ
BS 514 556 RS1H128JQB
BS 557 561 RS1EV06JQ

RD RS1H128JQB 558 0 0
GGATAAGAATTTGGATATTATTAGATAAACGTTATATTTATTTTGAACCATAACCAATCT
AACTTGGAAAATTATTAATAAGACATGAGCTGTTTTTCCTGCTAGATCTACGCAAAAAGA
TCTCTATTACATTGATTTCATGTCTTTATTAGTAAAGAGATTATGCATATATGTATTTTA
AAATTTAGCAATCATATCGACATTCACATTGATGCATGCGAATATAACCTGGCTTGGGAG
GATCATCAATACATTTGGTACATTGTACTCCCCATCCTTTTGGCACAGGTTTTCCAGTAT
TTGTTACACTCATCTTTTTCATGTCCTCTACACATAAATTAATTCCATTTTTTCCGCATG
CTCCAGCATGATTGCTTGGTAATGATTTGCAGAAAAGCTTTTTCATGCCGGCTTCCACCT
CTACTTTAAAATTATTTAAAATGAGAAATGTGAGAACACAAGAAACCATTAACATAACAC
TCTGTCTCATGGCTGAAAATGAGGAAATTCTTCTACAAAAAGGAATTATTGTTTCTTGTA
CACTCCTATGAAATAC
CC

QA 1 556 1 556
DS 

RD RS1H128TF 558 0 0
GG
ATAAGAATTTGGATATTATTAGATAAACGTTATATTTATTTTGAACCATAACCAATCTAA
CTTGGAAAATTATTAATAAGACATGAGCTGTTTTTCCTGCTAGATCTACGCAAAAAGATC
TCTATTACATTGATTTCATGTCTTTATTAGTAAAGAGATTATGCATATATGTATTTTAAA
ATTTAGCAATCATATCGACATTCACATTGATGCATGCGAATATAACCTGGCTTGGGAGGA
TCATCAATACATTTGGTACATTGTACTCCCCATCCTTTTGGCACAGGTTTTCCAGTATTT
GTTACACTCATCTTTTTCATGTCCTCTACACATAAATTAATTCCATTTTTTCCGCATGCT
CCAGCATGATTGCTTGGTAATGATTTGCAGAAAAGCTTTTTCATGCCGGCTTCCACCTCT
ACTTTAAAATTATTTAAAATGAGAAATGTGAGAACACAAGAAACCATTAACATAACACTC
TGTCTCATGGCTGAAAATGAGGAAATTCTTCTACAAAAAGGAATTATTGTTTCTTGTACA
CTCCTATGAAATAC
CC

QA 3 556 3 556
DS 

RD RS1EV06JQ 560 0 0
A
ATAAGAATTTGGATATTATTAGATAAACGTTATATTTATTTTGAACCATAACCAATCTAA
CTTGGAAAATTATTAATAAGACATGAGCTGTTTTTCCTGCTAGATCTACGCAAGAAGATC
TCTATTACATTGATTTCATGTCTTTATTAGTAAAGAGATTATGCATATATGTATTTTAAA
ATTTAGCAATCATATCGACATTCACATTGATGCATGCGAATATAACCTGGCTTGGGAGGA
TCATCAATACATTTGGTACATTGTACTCCCCATCCTTTTGGCACAGGTTTTCCAGTATTT
GTTACACTCATCTTTTTCATGTCCTCTACACATAAATTAATTCCATTTTTTCCGCATGCT
CCAGCATGATTGCTTGGTAATGATTTGCAAAAAAGCTTTTTCATGCCGGCTTCCACCTCT
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CTCCTATGAAATACAATCC

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DS 

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A
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ATTTAGCAATCATATCGACATTCACATTGATGCATGCGAATATAACCTGGCTTGGGAGGA
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GTTACACTCATCTTTTTCATGTCCTCTACACATAAATTAATTCCATTTTTTCCGCATGCT
CCAGCATGATTGCTTGGTAATGATTTGCAGAAAAGCTTTTTCATGCCGGCTTCCACCTCT
ACTTTAAAATTATTTAAAATGAGAAATGTGAGAACACAAGAAACCATTAACATAACACTC
TGTCTCATGGCTGAAAATGAGGAAATTCTTTTACAAAAAGGAATTATTGTTTCTTGTACA
CTCCTATGAAATACAATCC

QA 2 560 2 560
DS 

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TATGCATATATGTATTTTAAAATTTAGCAATCATATCGACATTCACATTGATGCATGCGA
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QA 1 520 1 520
DS 

RD RS1AX33TF 520 0 0
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CTAGATCTACGCAAAAAGATCTCTATTACATTGATTTCATGTCTTTATTAGTAAAGAGAT
TATGCATATATGTATTTTAAAATTTAGCAATCATATCGACATTCACATTGATGCATGCGA
ATATAACCTGGCTTGGGAGGATCATCAATACATTTGGTACATTGTACTCCCCATCCTTTT
GGCACAGGTTTTCCAGTATTTGTTACACTCATCTTTTTCATGTCCTCTACACATAAATTA
ATTCCATTTTTTCCGCATGCTCCAGCATGATTGCTTGGTAATGATTTGCAGAAAAGCTTT
TTCATGCCGGCTTCCACCTCTACTTTAAAATTATTTAAAATGAGAAATGTGAGAACACAA
GAAACCATTAACATAACACTCTGTCTCATGGCTGAAAATGAGGAAATTCTTTTACAAAAA
GGAATTATTGTTTCTTGTACACTCCTATGAAATACAATCC

QA 1 520 1 520
DS 



AS 1 5

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ATAATAGAGTACGATTATTGAGAAATAACCAAAACAAACTACAGAAAATCTGATATTTAG
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ACAAAAGAAAAAAGTGAGAGAGTAGAGAGCAACGAAACCAATTCGGTTATCAGGTAAGGT
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GACCTGAATCTTGTACCGTCCCATCCTGTCGATGGTTAAAATGGTAGCAATGTAACCAGG
AACGGTACCGCAAAGAGCGATATAAAATTGTGACTTAGAGATCATGAAGAGCTCTTGGAT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1H388TF C 1
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AF RS1B495JQ U 52
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RD RS1H388TF 627 0 0
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GACCTGAATCTTGTACCGTCCCATCC
C

QA 1 626 1 626
DS 

RD RS1BJ28JQ 602 0 0
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ATGGTAGCAATGTAACCAGGAACGGTACCGCAAAGAGCGATATAAAATTGTGACTTAAAG
AT

QA 1 602 1 602
DS 

RD RS1E027JQ 761 0 0
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QA 6 761 6 761
DS 

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C
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TTTTCTCCGGTCCAGTTTCCCCGGAAAGATTCTCAAGCGATTTCCCCTTAGGCTCCGGAA
CAAGAACCAACGACAACAACATGCCAACAAAACTGATTCCTGCCAAGGTCAGTAACGTAT
ACCGCATCCCCAGAGCTTTCGTCAAAGCAGCAAAACCAAAAGAACCAACCATCGCACCGG
CTTTACCGGAAGCGGCCGAAATACCATGACAAGTCGACCTAAGCCTCGCCGGAAAAATCT
CAGCAGGGACAATGAAAGTGGTTGCGTTAGGTCCGAAGTTACAAAAGAAAAAAGTGAGGG
AGTAGAGAGCAACGAAACCAATTCGGTTATCAGGTAAGGTCCAATGGTGGTACGGTATGG
CTAGACCAATCAAGCTACACGTCATCATGAAGAATCCAAGGACCTGAATCTTGTACCGTC
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GGGGTAACCAACCAATGGTGGTGAAGATATCTTTCTGG

QA 2 759 2 759
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AG
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TATTTAGAAGAAAAAAACAAAAAGAAAAGTTCCTAACAAACCCTGATAATTAAGGGAAAA
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CAAGCGATTTCCCCTTAGGCTCCGGAACAAGAACCAACGACAACAACATGCCAACAAAAC
TGATTCCTGCCAAGGTCAGTAACGTATACCGCATCCCCAGAGCTTTCGTCAAAGCAGCAA
AACCAAAAGAACCAACCATCGCACCGGCTTTACCGGAAGCGGCCGAAATACCATGACA*G
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GTAAGGTCCAATGGTGGTACGGTATGGCTAGACCAATCAAGCTACACGTCATCATGAAGA
ATCCAAGGACCTGAATCTTGTACCGTCCCATCCTGTCGATGGTTAAAATGGTAGCAATGT
AACCAGGAACGGTACCGCAAAGAGCGATATAAAATTGTGACTTAGAGATCATGAAGAGCT
CTTGGATAGCGTTCATGGTTTTTGGTGGGGGTAA

QA 3 696 3 696
DS 



AS 2 5

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GCTGCTATTCGAGACGCAAACGCTGCTCTGGAGATAAACCCTGATTCTGCTAAGGGATAC
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ATGCTCATAAGCTTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AAACGCTGCTA

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DS 

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GG
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TTCTTCCGCGACTATCTCCAGAGTCTCGGTGCTAAGATTCCTACTGCTGCTAATGAAGAA
CACAAAGACTCCAAATCGAGTTTCGTAGTGGAAGAAGAGAGTGATGAAGATATGGAAGAA
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GAATCTGATGTGGAGCTTGAAGGAGAGACTGTCGAACCTGATAATGATCCTCCTCAGAAG
ATGGGAGATGCATCAGTGGAAGTGACCGATGAGAATCGCGAAGCTGCTCAAGAAGCCAAG
GGAAAAGCCATGGAGGCTCTCTCTGAAGGAAATTTCGATGAAGCTATTGAGCATTTGACT
CAGGCCATAACGTTGAATCCCACATCAGCTATTATGTATGGAAACAGAGCTAGTGTCTAC
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CCTGATTCTGCTAAGGGATACAAG*CAAGAGGCATGGCTCGTGCCATGCTTGGAGAATGG
GCAGGGACTGCAAAAGACCTTCACCTTGCGTCTACGATAGACTACGA

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DS 

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AAGTCTGACCCTTCACTGCTCTCTACACCTTCCCTCTCCTTCTTCCGCGACTATCTCCAG
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TTCGTAGTGGAAGAAGAGAGTGATGAAGATATGGAAGAAACTGAAGAGCCAAAACCTAAA
GTTGAGGAGGAAGAGGAAGAAGAAGAGGAAGAGATTGTTGAATCTGATGTGGAGCTTGAA
GGAGAGACTGTCGAACCTGATAATGATCCTCCTCAGAAGATGGGAGATGCATCAGTGGAA
GTGACCGATGAGAATCGCGAAGCTGCTCAAGAAGCCAAGGGAAAAGCCATGGAGGCTCTC
TCTGAAGGAAATTACGATGAAGCTATTGAGCATTTGACTCAGGCCATAACGTTGAATCCC
ACATCAGCTATTATGTATGGAAACAGAGCTAGTGTCTACATTAAGCTGAAGAAGCCAAAC
GCTGCTATTCGAGACGCAAACGCTGCTCTGGAGATAAACCCTGATTCTGCTAAGG*ATAC
AAGGCAAGAG*CATGGCTCGTGCCATGCTTGGAGA*TGGGCAGAG*CTGCAAA*GAC*TT
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ATGCTCATAAGCTTGA

QA 1 796 1 796
DS 



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CTCTTCATCGTAGTCTATCGTAGACGCA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FW53JQ U 1
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CTCTTCATC

QA 1 729 1 729
DS 

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CCAGGCTTTCCTTCCGGAAATCCGCCTGGCATACCTCCAGGGAAACCGCCTGCACCGGGC
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CGTTGTCTATCACGTGCAGCCTTTTTGTCATCTCTTTCCTTCCGTAGTCTGTCATACTTC
CTACGGTGCTCCTCAAGCTTATGAGCATTTGGCTCAACCTTTTTGAGCACAGCACTAATC
TCTTCATCGTAGTCTATCGTAGACGCA

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 6

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GCCTCCGAGACTCTAATCTGTCTTCCATCCAAATCAGCTCCATTCAAAGAATTGATGGCT
CTTGTGACCTCTTGAGGAGAACCGAGTGTGACAAACCCAAAACCCTTGGATCGACCAGTG
TCCCTGTCGTAAATGACCCTGGCCTCGACAACCTTTCCTTGCTCACTAAACAAGCTCTCA
AGAGCCATGTCATCCACACCCCACGAAAGGTTACCCACATAAACACGGTCTGATGAGCCC
GAGCCCGACCCAGAACCGTAGCTAGAACGCTCAGAACCGTAACCAGAACGTCCTGAACGT
TGAGACCCGTAACCGGAACGTTCAGAACCGTAACCACCACTCCTCGGTCCTCTGGAGAAT
GATTCCTCCCTCTTAGGTGGAGGAGGGCCAGCGTTAACCCTCAAGGGTCTACCTTCAAAT
TCATAGCCATTAAACTGTTGAGCTGCAGCCTCAGCTTCAGCTGCAGAGGACATAGTGACA
AACCCAAAACCTCTGCTTCGGCCAGTCACTTTGTCATAGATAACCTCAACCATCTCAACG
TTACCGGTGCTCTCAAACAATTGAGCGAGCTGGGCGCTATCGACATCGAAGGAAAGGTTA
CCGACGAAGAGTTTGAGGTCAGCAGAGAAGGAGCTGCGCTCCTGCGGCGGCGGAGAATCG
TCGTCAGCGAACATGTCGTCTTCCTCCACCTCGAAATCAGAGGATACGGCGACGTGTCTG
ACGAAGAGAGATGGGTACTGGGCGGGTGAGGAGGAGGAAGCGAAGAGAGAGAGGGAGTGG
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TCTCTCGGGATGGGATAAGGTTTAAGGGTTCTGCTAGAGATTTGAGAGCGGAGTTAATGG
GATGGTCCGAGTTCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
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20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CI25JQ U 1
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AF RS1C542JQ U 12
AF RS1GF04TF C 349
AF RS1C542TF C 463
AF RS1CI25TF C 557
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RD RS1CI25JQ 567 0 0
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DS 

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AGCCATGTCATCCACACCCCACGAAAGGTTACCCACATAAACACGGTCTGATGAGCCCGA
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TTCCTCCCTCTTAGGTGGAGGAGGGCCAGCGTTAACCC

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TCTAATCTGTCTTCCATCCAAATCAGCTCCATTCAAAGAATTGATGGCTCTTGTGACCTC
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AATGACCCTGACCTCGACAACCTTTCCTTGCTCACTAAACAAGCTCTCAAGAGCCATGTC
ATCCACACCCCACGAAAGGTTACCCACATAAACACGGTCTGATGAGCCCGAGCCCGACCC
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ACCGGAACGTTCAGAACCGTAACCACCACTCCTCGGTCCTCTGGAGAATGATTCCTCCCT
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GACATGGCTCTCTCTCTCGGGAT
CC

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DS 

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GCAGAGGACATAGTGACAAACCCAAAACCTCTGCTTCGGCCAGTCACTTTGTCATAGATA
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ACATCGAAGGAAAGGTTACCGACGAAGAGTTTGAGGTCAGCAGAGAAGGAGCTGCGCTCC
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DS 

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GTTGAGCTGCAGCCTCAGCTTCAGCTGCAGAGGACATAGTGACAAACCCAAAACCTCTGC
TTCGGCCAGTCACTTTGTCATAGATAACCTCAACCATCTCAACGTTACCGGTGCTCTCAA
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AAGGTTTAAGGGTTCTGCTAGAGATTTGAGAGCGGAGTTAATGGGATGGTCCG
C

QA 1 653 1 653
DS 



AS 2 5

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

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TAGGGTTTTGCGTGAGATTAGGGAAAACAGAAAGCAAGATTTGGCGTTTTCCTTCAACTT
GGTTACTAGCGGCGGCGGCGGCGGCTTATCTCCGGGGAAGTTAAGGAGTATGCTTCTCGG
TGTTGATAGAAAGAAGAAACAAGATATGCTTGAAACTGGGTCAAACCAAATCCATGACCT
TGCTGC***TAGTGGATCAGATGATTGCAAAGACGTTGATGTTGTTGTGACTGAGATCAC
TGATTCTTCTACTTCTGGTACGGCTGGAGATCTTCAAGTTCAAGATGAGTACCCTGGTCT
TGATTACGGCAATGTGAACGAGATCAAGAGCCTTTCTTCTACTGCATCATCCCTCTTTGA
GTTTCAAAAGACAGACAAGGAGAAGACCACTCCAAGAATGTCCGTCAGATCATTCTCTAA
ACCGGCTCCATCTAAATGGGACGACGCTCAGAAATGGATCGCTAGTCCGACAGCTAACCG
TCCCAAGACAGGACAGGTTCACGCTCCTGCGTCGAAGAAAGGGCATAGCTTCGGTCGGCA
G*CTTCTATGAAGATCGTTGAT

QA 1 622 1 622
DS 

RD RS1EW11TF 732 0 0
GTG
GCGGCGGTGGCGGCGGCTTATCTCCGGGGAAGTTAAGGAGTATGCTTCTCGGTGTTGATA
GAAAGAAGAAACAAGATATGCTTGAAACTGGGTCAAACCAAATCCATGACCTTGCAGCTA
CTAGTGGATCAGATGATTGCAAAGACGTTGATGTTGTTGTGACCGAGATCACTGATTCTT
CTACTTCTGGTACGGCTGGAGATCTTCAAGTTCAAGATGAGTACCCTGGTCTTGATTACG
ACAATGTGAACGAGATCAAGAGCCTTTCTTCTACTGCATCATCCCTCTTTGAGTTTCAAA
AGACAGACAAGGAGAAGACCACTCCAAGAATGTCCGTTAGATCATTCTCTAAACCGGCTC
CATCTAAATGGGATGACGCTCAGAAATGGATCGCTAGTCCGACAGCTAACCGTCCCAAGA
CAGGACAGGTTCAGGCTCCTGTGTCGAAGAAAGGGACTAGCTTCGGTCGGCAGTCTTCTA
TGAAGATTGTTGATGAAGAGCCTGATACAAAGCGAGTAGATGTAAGCCAAGTGAAGAAGA
AGGAGACAGGACACAAGTTTGTTAGCTGGGAAGTTGATTCGTATCTTAAACCTGTTCTTA
TGGTTGGGAACTCAGCAACTGAAGTGAATCTCAGTCGACATGACTCGTCAATGGCAACTG
CGTTTGCTCAACCACCGCCCTCAACAGCGAGATCTGTCTCGATGAGAGACATGGGAACCG
AGATGACTC

QA 4 732 4 732
DS 

RD RS1FT96TF 738 0 0
GTG
GCGGCGGTGGCGGCGGCTTATCTCCGGGGAAGTTAAGGAGTATGCTTCTCGGTGTTGATA
GAAAGAAGAAACAAGATATGCTTGAAACTGGGTCAAACCAAATCCATGACCTTGCAGCTA
CTAGTGGATCAGATGATTGCAAAGACGTTGATGTTGTTGTGACCGAGATCACTGATTCTT
CTACTTCTGGTACGGCTGGAGATCTTCAAGTTCAAGATGAGTACCCTGGTCTTGATTACG
ACAATGTGAACGAGATCAAGAGCCTTTCTTCTACTGCATCATCCCTCTTTGAGTTTCAAA
AGACAGACAAGGAGAAGACCACTCCAAGAATGTCCGTTAGATCATTCTCTAAACCGGCTC
CATCTAAATGGGATGACGCTCAGAAATGGATCGCTAGTCCGACAGCTAACCGTCCCAAGA
CAGGACAGGTTCAGGCTCCTGTGTCGAAGAAAGGGACTAGCTTCGGTCGGCAGTCTTCTA
TGAAGATTGTTGATGAAGAGCCTGATACAAAGCGAGTAGATGTAAGCCAAGTGAAGAAGA
AGGAGACAGGACACAAGTTTGTTAGCTGGGAAGTTGATTCGTATCTTAAACCTGTTCTTA
TGGTTGGGAACTCAGCAACTGAAGTGAATCTCAGTCGACATGACTCGTCAATGGCAACTG
CGTTTGCTCAACCACCGCCTTCAACAGCGAGATCTGTCTCGATGAGAGACATGGGAACCG
AGATGACTCCTATAG

QA 4 738 4 738
DS 



CO CL1250Contig2 764 2 2 U
GAGTAAACTTTGACCGTAGGTGAATATAGATGACAATAAAAAGGTACTTTTACAAAAGAT
TTTATTGTACAAACTGACAGAAATACATGAATGGTTCTCGGTGGATTACTAAGAACAAAA
GCTAGAACAAGAGAATAACAATGAAGGTACTTTGCCTGTTCTTCGGATTTGTTCAGCTTG
TTTCTCTGTTTTAGCTGCTTCACGATTCTTCTTTGCTTCAGCCGCTGCTCGTTTCTCCTC
TGCTTTCCGCTCAATCTCAGCCAGTTTGTTCATCAAACGGTCTTGCGCTCGTCCCTTTAT
CCTCTCAACTTCCACCTCTGTTTTCCTCATCTCGGCTTCAGATTTCGCCTTCTGATGATT
CTCCCACGCTTGTATCTTCATCTCTTCGCGTCTAAACCTAGCCATGTGCTTAGCCTTTTC
AGCTTCCTCCCACGCGGACGCACGAGCTTCAGAAACACTCTTAGAAGTTTGGAGAGAAGC
GTCTTTGTCTTCATCCTCTTTGCTAGCCCAAGCAGCAATGTTCAACTTCCCAAGCTGTGT
TCCCAACACCATTATCTCTCTCCTAGTTTTCATCTGAATCTCTTTCTCAGACAACTCCTT
GCTACTACTCAACCCTCGTCTCCCTGGACTCGAAGGTGCAGAAGTCACAGGGCTTCGGAT
CGGCGTCGTTGCCCTGATCGGTGTCCCGTTTCTAGAAGGCTCTTGGCTCGCTATAGGAGT
CATCTCGGTTCCCATGTCTCTCATCGAGACAGATCTCGCTGTTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EW11JQ U 1
AF RS1FT96JQ U 1
BS 1 694 RS1EW11JQ
BS 695 764 RS1FT96JQ

RD RS1EW11JQ 694 0 0
GAGTAAACTTTGACCGTAGGTGAATATAGATGACAATAAAAAGGTACTTTTACAAAAGAT
TTTATTGTACAAACTGACAGAAATACATGAATGGTTCTCGGTGGATTACTAAGAACAAAA
GCTAGAACAAGAGAATAACAATGAAGGTACTTTGCCTGTTCTTCGGATTTGTTCAGCTTG
TTTCTCTGTTTTAGCTGCTTCACGATTCTTCTTTGCTTCAGCCGCTGCTCGTTTCTCCTC
TGCTTTCCGCTCAATCTCAGCCAGTTTGTTCATCAAACGGTCTTGCGCTCGTCCCTTTAT
CCTCTCAACTTCCACCTCTGTTTTCCTCATCTCGGCTTCAGATTTCGCCTTCTGATGATT
CTCCCACGCTTGTATCTTCATCTCTTCGCGTCTAAACCTAGCCATGTGCTTAGCCTTTTC
AGCTTCCTCCCACGCGGACGCACGAGCTTCAGAAACACTCTTAGAAGTTTGGAGAGAAGC
GTCTTTGTCTTCATCCTCTTTGCTAGCCCAAGCAGCAATGTTCAACTTCCCAAGCTGTGT
TCCCAACACCATTATCTCTCTCCTAGTTTTCATCTGAATCTCTTTCTCAGACAACTCCTT
GCTACTACTCAACCCTCGTCTCCCTGGACTCGAAGGTGCAGAAGTCACAGGGCTTCGGAT
CGGCGTCGTTGCCCTGATCGGTGTCCCGTTTCTA

QA 1 694 1 694
DS 

RD RS1FT96JQ 764 0 0
GAGTAAACTTTGACCGTAGGTGAATATAGATGACAATAAAAAGGTACTTTTACAAAAGAT
TTTATTGTACAAACTGACAGAAATACATGAATGGTTCTCGGTGGATTACTAAGAACAAAA
GCTAGAACAAGAGAATAACAATGAAGGTACTTTGCCTGTTCTTCGGATTTGTTCAGCTTG
TTTCTCTGTTTTAGCTGCTTCACGATTCTTCTTTGCTTCAGCCGCTGCTCGTTTCTCCTC
TGCTTTCCGCTCAATCTCAGCCAGTTTGTTCATCAAACGGTCTTGCGCTCGTCCCTTTAT
CCTCTCAACTTCCACCTCTGTTTTCCTCATCTCGGCTTCAGATTTCGCCTTCTGATGATT
CTCCCACGCTTGTATCTTCATCTCTTCGCGTCTAAACCTAGCCATGTGCTTAGCCTTTTC
AGCTTCCTCCCACGCGGACGCACGAGCTTCAGAAACACTCTTAGAAGTTTGGAGAGAAGC
GTCTTTGTCTTCATCCTCTTTGCTAGCCCAAGCAGCAATGTTCAACTTCCCAAGCTGTGT
TCCCAACACCATTATCTCTCTCCTAGTTTTCATCTGAATCTCTTTCTCAGACAACTCCTT
GCTACTACTCAACCCTCGTCTCCCTGGACTCGAAGGTGCAGAAGTCACAGGGCTTCGGAT
CGGCGTCGTTGCCCTGATCGGTGTCCCGTTTCTAGAAGGCTCTTGGCTCGCTATAGGAGT
CATCTCGGTTCCCATGTCTCTCATCGAGACAGATCTCGCTGTTG

QA 1 764 1 764
DS 



AS 2 6

CO CL1251Contig1 1336 4 11 U
GACATGAAGTATATATATATTGGATATTCAATTATTTCGAAATATACATTTATTATTTGT
TTGCCACTGAATTCGTTTAACATCATGTTGAAATGAGATTCTAGGCATACATTAGAATAC
AACAGAGAGACCAAGTGCAGTTGACAATGCATACACAAAGGCAGACAGATCAGAAGTTGT
TGCTGCTGTGACCAGCTTGTCATCTGTCACGCACCTCTCTGATTCCACGATCTGACCACC
AGCAACCTTCACAGCCACCTTTGTCCCATAACCACTTGCACATCTCTTATTCTTAAGAGC
GCCAGTAGCGGCAAGTAGCCAGTTTCCCATTCCAATGGCAGCAACAAACTTGCCCTTCTC
GACAAACTTCTTGACTAATCCGACGGCTTTGTCGTTCATCACCAAGAGCTCCGGCGACCT
TCCTCCGGGAACCACAATGCAGTCATAATCATCCACAGAGACATCTTCCCAGGCGACAGT
CACATAGAAGTTGTGGCTGGACTTCTCGGTTGGAAGTTGCCTTCCGTCCTCGAGGTCGTG
AACGATGGTTGCACATTTATCACCTTTTTTCTTGTTTGGTGACACTGCGTCCACTTTACA
TCCGAGAGCTTGAAACGCTTTAAATGGTACGTTGACACTGTAATCTTCAACACAATCCCC
AATCAAGAATAGCAAAGAAGACTGCTTCTCCATGGAGCAAGTAATCATGGAGCCAAGTGA
TTCTAACAGAACCTTGAGAGTGTTTCCAAGCGTTGGCCACCCCAAAGTGGAAATAAATTT
TCCGTCCATGACACAATCAGTAATGTCGAAAACGGTTTGGACACCTGGCTGTTGCCACCA
CGCACCGCCTGAGAGCTCGATAAAAGGCTTCATGCTTTCAAACGCCGTGCACTTCATTCC
ACGGGCGAGTAGACCCGCCGCCGCCAAAAGCAGCTGGCTGTGGCAGCTCGTAAGAATAAT
TTTCTCAAGCTCAGCGAATCGAGCCACCATGCTGACGCATTTCTCGTCAGTGCTCAAAAG
TTCCGTGAAACGTCCACCGGGAATGATGATGGCATCGTATTGCTCTGGGATGACTTCATC
GAAGTTTGCGTTTAGTGTTAGATGATCGACCACCAACTCGGAGTATATCTCGAGGCCGAG
GAGATCGTGAGCCGCCATGACGCACTTGTCGCCAGTTCTGCGACCAGGAGAAACGCTAAC
GCTAAACGCTTGGAGGAAGTAGAGAGGTACTATGGTCTCATATGCTTCCATGAACTCTCC
GCATAACATCAAAACCGACTTCTGAGCCATTGATCCCATAATGATCGATCTCTTACGACA
AGCGCACACACATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B611JQ U 34
AF RS1AZ10JQ U 1
AF RS1AZ69JQ U 22
AF RS1AZ10TF C 663
BS 1 52 RS1AZ10JQ
BS 53 53 RS1AZ69JQ
BS 54 204 RS1AZ10JQ
BS 205 205 RS1AZ69JQ
BS 206 369 RS1AZ10JQ
BS 370 370 RS1AZ69JQ
BS 371 691 RS1AZ10JQ
BS 692 692 RS1AZ69JQ
BS 693 740 RS1AZ10JQ
BS 741 797 RS1AZ69JQ
BS 798 1336 RS1AZ10TF

RD RS1B611JQ 678 0 0
G
TTTCGAAATATACATTTATTATTTGTTTGCCACTGAATTCGTTTAACATCATGTTGAAAT
GAGATTCTAGGCATACATTAGAATACAACAGAAAGACCAAGTGCAGTTGACAATGCATAC
ACAAAGGCAGACAGATCAGAAGTTGTTGCTGCTGTGACCAGCTTGTCATCTGTCACGCAC
CTCTCTGATTCCACGATCTGACCACCTGCAACCTTCACAGCCACCTTTGTCCCATAACCA
CTTGCACATCTCTTATTCTTAAGAGCGCCAGTAGCGGCAAGTAGCCAGTTTCCCATTCCA
ATGGCAGCAACAAACTTGCCCTTCTCGACAAACTTCTTGACTAATCCGACGGCTTTGTCG
TTCATCACCAAGAGCTCCGGCGACCTTCCTCCGGGAACCACAATGCAGTCATAATCATCC
ACAGAGACATCTTCCCAGGCGACAGTCACATAGAAGTTGTGGCTGGACTTCTCGGTTGGA
AGTTGCCTTCCGTCCTCGAGGTCGTGAACGATGGTTGCACATTTATCACCTTTTTTCTTG
TTTGGTGACACTGCGTCCACTTTACATCAGAGAGCTTGAAACGCTTTAAATGGTACGTTG
ACACTGTAATCTTCAACACAATCCCCAATCAAGAATAGCAAAGAAGACTGCTTCTCCATG
GAGCAAGTAATCTTGGA

QA 2 678 2 678
DS 

RD RS1AZ10JQ 740 0 0
GACATGAAGTATATATATATTGGATATTCAATTATTTCGAAATATACATTTAGTATTTGT
TTGCCACTGAATTCGTTTAACATCATGTTGAAATGAGATTCTAGGCATACATTAGAATAC
AACAGAGAGACCAAGTGCAGTTGACAATGCATACACAAAGGCAGACAGATCAGAAGTTGT
TGCTGCTGTGACCAGCTTGTCATCCGTCACGCACCTCTCTGATTCCACGATCTGACCACC
AGCAACCTTCACAGCCACCTTTGTCCCATAACCACTTGCACATCTCTTATTCTTAAGAGC
GCCAGTAGCGGCAAGTAGCCAGTTTCCCATTCCAATGGCAGCAACAAACTTGCCCTTCTC
GACAAACTTGTTGACTAATCCGACGGCTTTGTCGTTCATCACCAAGAGCTCCGGCGACCT
TCCTCCGGGAACCACAATGCAGTCATAATCATCCACAGAGACATCTTCCCAGGCGACAGT
CACATAGAAGTTGTGGCTGGACTTCTCGGTTGGAAGTTGCCTTCCGTCCTCGAGGTCGTG
AACGATGGTTGCACATTTATCACCTTTTTTCTTGTTTGGTGACACTGCGTCCACTTTACA
TCCGAGAGCTTGAAACGCTTTAAATGGTACGTTGACACTGTAATCTTCAACACAATCCCC
AATCAAGAATAGCAAAGAAGACTGCTTCTCCTTGGAGCAAGTAATCATGGAGCCAAGTGA
TTCTAACAGAACCTTGAGAG

QA 1 740 1 740
DS 

RD RS1AZ69JQ 788 0 0
GGATATTCAATTATTTCGAAATATACATTTATTATTTGTTTGCCACTGAATTCGTTTAAC
ATCATGTTGAAATGAGATTCTAGGCATACATTAGAATACAACAGAGAGACCAAGTGCAGT
TGACAATGCATACACAAAGGCAGACAGATCAGAAGTTGTTGCTGCTGTGACCAGCTTGTC
ATCTGTCACGCACCTCTCTGATTCCACGATCTGACCACCAGCAACCTTCACAGCCACCTT
TGTCCCATAACCACTTGCACATCTCTTATTCTTAAGAGCGCCAGTAGCGGCAAGTAGCCA
GTTTCCCATTCCAATGGCAGCAACAAACTTGCCCTTCTCGACGAACTTCTTGACTAATCC
GACGGCTTTGTCGTTCATCACCAAGAGCTCCGGCGACCTTCCTCCGGGAACCTCAATGCA
GTCATAATCATCCACAGAGACATCTTCCCAGGCGACAGTCACATAGAAGTTGTGGCTGGA
CTTCTCGGTTGGAAGTTGCCTTCCGTCCTCGAGGTCGCGAACGATGGTTGCACATTTATC
ACCTTTTTTCTTGTTTGGTGACACTGCGTCCACTTTACATCCGAGAGCTTGAAACGCTTT
AAATGGTACGTTGACACTGTAATCTTCAACACAATCCCCAATCAAGAATAGCAAAGAAGA
CTGCTTCTCCATGGAGCAAGTAATCTTGGAGCCAAGTGATTCTAACAGAACCTTGAGAGT
GTTTCCAAGCGTTGGCCACCCCAAAGTGGAAATAAATTTTCCGTCCATGACACAAT
TGGTAAGTCGAA

QA 1 776 1 776
DS 

RD RS1AZ10TF 674 0 0
ATC
AGAATAGCAAAGAAGACTGCTTCTCC*TGGAGCAAGTAATCATGGAGCCAAGTGATTCTA
ACAGAACCTTGAGAGTGTTTCCAAGCGTTGGCCACCCCAAAGTGGAAATAAATTTTCCGT
CCATGACACAATCAGTAATGTCGAAAACGGTTTGGACACCTGGCTGTTGCCACCACGCAC
CGCCTGAGAGCTCGATAAAAGGCTTCATGCTTTCAAACGCCGTGCACTTCATTCCACGGG
CGAGTAGACCCGCCGCCGCCAAAAGCAGCTGGCTGTGGCAGCTCGTAAGAATAATTTTCT
CAAGCTCAGCGAATCGAGCCACCATGCTGACGCATTTCTCGTCAGTGCTCAAAAGTTCCG
TGAAACGTCCACCGGGAATGATGATGGCATCGTATTGCTCTGGGATGACTTCATCGAAGT
TTGCGTTTAGTGTTAGATGATCGACCACCAACTCGGAGTATATCTCGAGGCCGAGGAGAT
CGTGAGCCGCCATGACGCACTTGTCGCCAGTTCTGCGACCAGGAGAAACGCTAACGCTAA
ACGCTTGGAGGAAGTAGAGAGGTACTATGGTCTCATATGCTTCCATGAACTCTCCGCATA
ACATCAAAACCGACTTCTGAGCCATTGATCCCATAATGATCGATCTCTTACGACAAGCGC
ACACACATACC

QA 4 674 4 674
DS 



CO CL1251Contig2 779 2 5 U
GGGTGTGTGTTGAGCACTGTATGTGTGTGCGCTTGTCGTAAGAGATCGATCATTATGGGA
TCAATGGCTCAGAAGTCGGTTTTGATGTTATGCGGAGAGTTCATGGAAGCATATGAGACC
ATAGTACCTCTCTACTTCCTCCAAGCTTTTAGCGTTAGCGTCCACTGCGTTTCTCCTGGT
CGCAGAACTGGCGACAAGTGTGTCATGGCGGCTCACGATCTCCTCGGCCTCGAGATATAC
TCCGAGTTGGTGGTCGATCATCTAACACTAAACGCAAACTTCGATGAAGTCATCCCAGAG
CAATACGATGCCATCATCATTCCCGGTGGACGTTTCACGGAACTTTTGAGCACTGACGAG
AAATGCGTCAGCATGGTGGCTCGATTCGCTGAGCTTGAGAAAATTATTCTCACGAGCTGC
CACAGCCAGCTGCTTTTGGCGGCGGCGGGTCTACTCGCCCGTGGAATGAAGTGCACGGCG
TTTGAAAGCATGAAGCCTTTTATCGAGCTCTCAGGCGGTGCGTGGTGGCAACAGCCAGGT
GTCCAAACCGTTTTCGACATTACCAATTGTGTCATGGACGGAAAATTTATTTCCACTTTG
GGGTGGCCAACGCTTGGAAACACTCTCAAGGTTCTGTTAGAATCACTTGGCTCCAAGATT
ACTTGCTCCATGGAGAAGCAGTCTTCTTTGCTATTCTTGATTGGGGATTGTGTTGAAGAT
ACAGTGTCACGTACCATTTAAAGCGTTTCAGCTCTCGGATGTAAGTGGACGCAGTGTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AZ69TF U 1
AF RS1B611TF U 21
BS 1 558 RS1AZ69TF
BS 559 559 RS1B611TF
BS 560 734 RS1AZ69TF
BS 735 735 RS1B611TF
BS 736 779 RS1AZ69TF

RD RS1AZ69TF 779 0 0
GGGTGTGTGTTGAGCACTGTATGTGTGTGCGCTTGTCGTAAGAGATCGATCATTATGGGA
TCAATGGCTCAGAAGTCGGTTTTGATGTTATGCGGAGAGTTCATGGAAGCATATGAGACC
ATAGTACCTCTCTACTTCCTCCAAGCTTTTAGCGTTAGCGTCCACTGCGTTTCTCCTGGT
CGCAGAACTGGCGACAAGTGTGTCATGGCGGCTCACGATCTCCTCGGCCTCGAGATATAC
TCCGAGTTGGTGGTCGATCATCTAACACTAAACGCAAACTTCGATGAAGTCATCCCAGAG
CAATACGATGCCATCATCATTCCCGGTGGACGTTTCACGGAACTTTTGAGCACTGACGAG
AAATGCGTCAGCATGGTGGCTCGATTCGCTGAGCTTGAGAAAATTATTCTCACGAGCTGC
CACAGCCAGCTGCTTTTGGCGGCGGCGGGTCTACTCGCCCGTGGAATGAAGTGCACGGCG
TTTGAAAGCATGAAGCCTTTTATCGAGCTCTCAGGCGGTGCGTGGTGGCAACAGCCAGGT
GTCCAAACCGTTTTCGAC*TTACCAATTGTGTCATGGACGGAAAATTTATTTCCACTTTG
GGGTGGCCAACGCTTGGAAACACTCTCAAGGTTCTGTTAGAATCACTTGGCTCCAAGATT
ACTTGCTCCATGGAGAAGCAGTCTTCTTTGCTATTCTTGATTGGGGATTGTGTTGAAGAT
ACAGTGTCACGTAC*ATTTAAAGCGTTTCAGCTCTCGGATGTAAGTGGACGCAGTGTCA

QA 1 779 1 779
DS 

RD RS1B611TF 743 0 0
GG
GTGTGTGCGCTTGTCGTAAGAGATCGATCATTATGGGATCAATGGCTCAGAAGTCGGTTT
TGATGTTATGCGGAGAGTTCATGGAAGCATATGAGACCATAGTACCTCTCTACTTCCTCC
AAGCTTTTAGCGTTAGCGTCCACTGCGTTTCTCCTGGTCGCAGAACTGGCGACAAGTGTG
TCATGGCGGCTCACGATCTCCTCGGCCTCGAGATATACTCCGAGTTGGTGGTCGATCATC
TAACACTAAACGCAAACTTCGATGAAGTCATCCCAGAGCAATACGATGCCATCATCATTC
CCGGTGGACGTTTCACGGAACTTTTGAGCACTGACGAGAAATGCGTCAGCATGGTGGCTC
GATTCGCTGAGCTTGAGAAAATTATTCTCACGAGCTGCCACAGCCAGCTGCTTTTGGCGG
CGGCGGGTCTACTCGCCCGTGGAATGAAGTGCACGGCGTTTGAAAGCATGAAGCCTTTTA
TCGAGCTCTCAGGCGGTGCGTGGTGGCAACAGCCAGGTGTCCAAACCGTTTTCGACATTA
CCAATTGTGTCATGGACGGAAAATTTATTTCCACTTTGGGGTGGCCAACGCTTGGAAACA
CTCTCAAGGTTCTGTTAGAATCACTTGGCTCCAAGATTACTTGCTCCATGGAGAAGCAGT
CTTCTTTGCTATTCTTGATTGGGGATTGTGTTGAAGATACAGTGTCACGTACCATTTAAA
GCGTTTCAGCTCTCTGATGTA

QA 3 743 3 743
DS 



AS 1 5

CO CL1252Contig1 1079 5 7 U
AGAATGCAAACAACTGTCAAAACGAACTTCTCTTCAACGTTATTTATTCGTACAACAACA
ATCAAACTTAAGGACTATAAATTAAAAAGTAACGATACAAAACTGTTAAAGCCTATCAAT
ACAAAGTCAATCAGCAAGAAAAAGAAAATGTAAGCCACATCTACACATAAAGGTCTGTAT
ATATTATGCATAGGATCACAGCCGTTCATGGAAATTGGCTGATCTTGACAACGCAGCTGG
ATTCGCACATAAAACTAAAGAAGTCTCGGTTTCTTCTTTGTCAATCGTAACCTCTTTTTT
*AGAATCAAACCCTTTAAACATAACTTCGTTCTTGATCCCGAGTGTTGTCCATATAGAAC
TCTTTGCAGCTTCGTTAGGATCATCAACTCTTAAAGTCTTAGGGACCAATACTGACACAT
TCCTCTGTTTTTGCTTGACCGTCTCATCTTCGTCTCTAGAATGCTTACCAATAGTAGATT
TAGGACTTGAATTAGGCGACGGAGACAACATTGGCACGTTCCAATAAGGATAAACCGGGT
AAAAACCGGGATTCCACATGTATGGCCACGAATGCGTTATCCTATTATTTGAGACATTTT
GATCATCCCCATGGGTGAAACTAAGGACCGGGTTACGTGTTTCAGAGAAGGTGGCGTGGT
GGTAATTGTGTGAACAAGATGAGGAGTAGTTCCTGTTCTTGCGTCTTCCGGCTCCGACAG
GGACACTTCTCATGGTCCCACCAGAGGTCCAGTACCTTTGACAAGCTTTGCAGAAATGGC
GAGGTTGGTTTACGTTGTAGTTGTTGTAGTAACAGAACTTTGTTTCCATACTATTGCATC
TTGGACAGGGAATAATCTTGATTGGTTTCTTTAATGTTTTGTCTTTCTCCACTTGATCAT
TTAATGTCTCGTTTTGGTTCTTCTCTTTCGATATTCCGTCTTCTTCAGCCTCAAGAACCG
TTGGAAGAGGAATTTTCATGCCGAATAGCTTAATCGCTTGATCTTTTCTTTCCAGCATTA
TTCTCTTCTTTTTGCTTGGTTTTTCTTTTTTCCAGCTGAGTGTCTCGTTGTTTCGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1C565JQ U 218
AF RS1ET31JQ U 1
AF RS1CL72JQ U 84
AF RS1CL72TF C 452
AF RS1ET31TF C 474
BS 1 687 RS1ET31JQ
BS 688 688 RS1CL72JQ
BS 689 742 RS1ET31JQ
BS 743 822 RS1CL72JQ
BS 823 948 RS1CL72TF
BS 949 949 RS1ET31TF
BS 950 1079 RS1CL72TF

RD RS1C565JQ 382 0 0
GCTGAACTTGACAACGCAGCTGGATTCGCACATAAAACTAAAGAAGTCTCGGTTTCTTCT
TTGTCAATCGTAACCTCTTTTTT*AGAATCAAACCCTTTAAACATAACTTCGTTCTTGAT
CCCGAGTGTTGTCCATATAGAACTCTTTGCAGCTTCGTTAGGATCATCAACTCTTAAAGT
CTTAGGGACCAATACTGACACATTCCTCTGTTTTTGCTTGACCGTCTCATCTTCGTCTCT
AGAATGCTTACCAATAGTAGATTTAGGACTTGAATTAGGCGACGGAGACAACATTGGCAC
GTTCCAATAAGGATAAACCGGGTAAAAACCGGGATTCCACATGTATGGCCACGAATGCGT
TATCCTATTATTTGAGACATTT

QA 1 382 1 382
DS 

RD RS1ET31JQ 742 0 0
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ATCAAACTTAAGGACTATAAATTAAAAAGTAACGATACAAAACTGTTAAAGCCTATCAAT
ACAAAGTCAATCAGCAAGAAAAAGAAAATGTAAGCCACATCTACACATAAAGGTCTGTAT
ATATTATGCATAGGATCACAGCCGTTCATGGAAATTGGCTGATCTTGACAACGCAGCTGG
ATTCGCACATAAAACTAAAGAAGTCTCGGTTTCTTCTTTGTCAATCGTAACCTCTTTTTT
*AGAATCAAACCCTTTAAACATAACTTCGTTCTTGATCCCGAGTGTTGTCCATATAGAAC
TCTTTGCAGCTTCGTTAGGATCATCAACTCTTAAAGTCTTAGGGACCAATACTGACACAT
TCCTCTGTTTTTGCTTGACCGTCTCATCTTCGTCTCTAGAATGCTTACCAATAGTAGATT
TAGGACTTGAATTAGGCGACGGAGACAACATTGGCACGTTCCAATAAGGATAAACCGGGT
AAAAACCGGGATTCCACATGTATGGCCACGAATGCGTTATCCTATTATTTGAGACATTTT
GATCATCCCCATGGGTGAAACTAAGGACCGGGTTACGTGTTTCAGAGAAGGTGGCGTGGT
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GGACACTTCTCATGGTCCCACC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RS1CL72JQ 739 0 0
AAAAAGTAACGATACAAAACTGTTAAGGCCTATCAATACAAAGTCAATCAGCAAGAAAAA
GAAAATGTAAGCCACATCTACACATAAAGGTCTGTATATATTATGCATAGGATCACAGCC
GTTCATGGAAATTGGCTGATCTTGACAACGCAGCTGGATTCGCACATAAAGCTAAAGAAG
TCTCGGTTTCTCCTTTGTCAATCGTAACCTCTTTTTTTAGAATCAAACCCTTTAAACATA
ACTTCGTTCTTGATCCCGAGTGTTGTCCATATAGAACTCTTTGCAGCTTCGTTAGGATCA
TCAACTCTTAAAGTCTTAGGGACCAATACTGACACATTCCTCTGTTTTTGCTTGACCGTC
TCATCTTCGTCTCTAGAATGCTTACCAATAGTAGATTTAGGACTTGAATTAGGCGACGGA
GACAACATTGGCACGTTCCAATAAGGATAAACCGGGTAAAAACCGGGATTCCACATGTAT
GGCCACGAATGCGTTATCCTATTATTTGAGACATTTTGATCATCCCCATGGGTGAAACTA
AGGACCGGGTTACGTGTTTCAGAGATGGTGGCGTGGTGGTAATTGTGTGAACAAGATGAG
GAGTAGTTCTTGTTCTTGCGTCTTCCGGCTCCGACAGGGACACTTCTCATGGTCCCACCA
GAGGTCCAGTACCTTTGACAAGCTTTGCAGAAATGGCGAGGTTGGTTTACGTTGTAGTTG
TTGTAGTAACAGAACTTTG

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1CL72TF 628 0 0
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TGGCACGTTCCAATAAGGATAAACCGGGTAAAAACCGGGATTCCACATGTATGGCCACGA
ATGCGTTATCCTATTATTTGAGACATTTTGATCATCCCCATGGGTGAAACTAAGGACCGG
GTTACGTGTTTCAGAGATGGTGGCGTGGTGGTAATTGTGTGAACAAGATGAGGAGTAGTT
CTTGTTCTTGCGTCTTCCGGCTCCGACAGGGACACTTCTCATGGTCCCACCAGAGGTCCA
GTACCTTTGACAAGCTTTGCAGAAATGGCGAGGTTGGTTTACGTTGTAGTTGTTGTAGTA
ACAGAACTTTGTTTCCATACTATTGCATCTTGGACAGGGAATAATCTTGATTGGTTTCTT
TAATGTTTTGTCTTTCTCCACTTGATCATTTAATGTCTCGTTTTGGTTCTTCTCTTTCGA
TATTCCGTCTTCTTCAGTCTCAAGAACCGTTGGAAGAGGAATTTTCATGCCGAATAGCTT
AATCGCTTGATCTTTTCTTTCCAGCATTATTCTCTTCTTTTTGCTTGGTTTTTCTTTTTT
CCAGCTGAGTGTCTCGTTGTTTCGGTCC

QA 1 628 1 628
DS 

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ACCGGGTAAAAACCGGGATTCCACATGTATGGCCACGAATGCGTTATCCTATTATTTGAG
ACATTTTGATCATCCCCATGGGTGAAACTAAGGACCGGGTTACGTGTTTCAGAGAAGGTG
GCGTGGTGGTAATTGTGTGAACAAGATGAGGAGTTGTTCCTGTTCTTGCGTCTTCCGGCT
CCGACAGGGACACTTCTCATGGTCCCACCAGAGGTCCAGTACCTTTGACAAGCTTTGCAG
AAATGGCGAGGTTGGTTTACGTTGTAGTTGTTGTAGTAACAGAACTTTGTTTCCATACTA
TTGCATCTTGGACAGGGAATAATCTTGATTGGTTTCTTTAATGTTTTGTCTTTCTCCACT
TGATCATTTAATGTCTCGTTTTGGTTCTTCTCTTTCGATATTCCGTCTTCTTCAGCCTCA
AGAACCGTTGGAAGAGGAATTTTCATGCCGAATAGCTTAATCGCTTGATCTTTTCTTTCC
AGCATTATTCTCTTCTTTTTGCTTGGTTTTTCTTTTTTCCAGCTGAGTGTCTCGTTGTTT
CGGTCC

QA 1 606 1 606
DS 



AS 2 6

CO CL1253Contig1 714 4 9 U
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GTCGTCATCATCGGCGAGAGGAGAGCTGGAGAAGATGGGGATCGATCAGCTGAAAGCGCT
GAAGGAGCAAGCGGATCTGGAAGTGAATCTCCTCCAGGACAGTCTCAACAACATCCGCAC
AGCCAACGCACGCCTCGAATCCGCCGCGGGAGCTCTCAACGATCTATCGCTTAGACCTCA
AGGTAAGAAGATGCTTGTACCACTCACCGCGCCTCTGTACGTGCCTGGGACGCTTGACGA
AGCTGATAAGGTTCTTGTTGATATCGGCACTGGTTACTTCATCGAGAAAACAATGGAGGA
TGGAAAAGACTATTGTCAGAGGAAGATCAACTTGTTGAAATCAAACTATGAACAACTCTT
TGAGGTGTTGGCCAAGAAGAAAAGTGTGGCGGATGAAGCCGGGATGGTCTTGCAGGGTAA
AGTTAGACAGTTACAAGCTGCAACCACGTCGTGAAAAAATCCTTCATTTTCTTGTGGCTT
TTACTATTTTGGTGTTTTGAGATTTCCACATTGTTTTGTCTGATCAGTTTTTGTTACAAA
CTCTTATGATCTCAATCAGGTAGTGTTTTTCTGCGCTATGAGAACTTTGTGCTGTAATAT
CAAAGTGAACAAATGTTGCTTGGTTATTCCCCATAAAGCAAAGAGTAAAGAGAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1D637TF U 28
AF RS1D637JQ C 28
AF RS1AI03JQ C 1
AF RS1AI03TF U 1
BS 1 39 RS1AI03TF
BS 40 46 RS1D637TF
BS 47 47 RS1AI03TF
BS 48 289 RS1D637TF
BS 290 290 RS1AI03TF
BS 291 378 RS1D637TF
BS 379 379 RS1AI03TF
BS 380 471 RS1D637TF
BS 472 714 RS1AI03TF

RD RS1D637TF 444 0 0
GGGACTGAGAGT
GAGAGAGGGAGAGAGAATGGCGTCGTCATCATCGGCGAGAGGAGAGCTGGAGAAGATGGG
GATCGATCAGCTGAAAGCGCTGAAGGAGCAAGCGGATCTGGAAGTGAATCTCCTCCAGGA
CAGTCTCAACAACATCCGCACAGCCAACGCACGCCTCGAATCCGCCGCGGGAGCTCTCAA
CGATCTATCGCTTAGACCTCAAGGTAAGAAGATGCTTGTACCACTCACCGCGCCTCTGTA
CGTGCCTGGGGCGCTTGACGAAGCTGATAAGGTTCTTGTTGATATCGGCACTGGTTACTT
CATCGAGAAAACAATGGAGGATGGAAAAGACTATTGTCACAGGAAGATCAACTTGTTGAA
ATCAAACTATGAACAACTCTTTGAGGTGTTGGCCAAGAAGAAAAGTGTGGCGGATGAAGC
CGGGATGGTCTT

QA 13 444 13 444
DS 

RD RS1D637JQ 609 0 0
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GATCGATCAGCTGAAAGCGCTGAAGGAGCAAGCGGATCTGGAAGTGAATCTCCTCCAGGA
CAGTCTCAACAACATCCGCACAGCCAACGCACGCCTCGAATCCGCCGCGGGAGCTCTCAA
CGATCTATCGCTTAGACCTCAAGGTAAGAAGATGCTTGTACCACTCACCGCGCCTCTGTA
CGTGCCTGGGGCGCTTGACGAAGCTGATAAGGTTCTTGTTGATATCGGCACTGGTTACTT
CATCGAGAAAACAATGGAGGATGGAAAAGACTATTGTCAGAGGAAGATCAACTTGTTGAA
ATCAAACTATGAACAACTCTTTGAGGTGTTGGCCAAGAAGAAAAGTGTGGCGGATGAAGC
CGGGATGGTCTTGCAGGGTAAAGTTAGACAGTTACAAGCTGCAACCACGTCGTGAAAAGA
TCCTTCATTTTCTTGTGGCTTTTACTATTTTGGTGTTTTGAGATTTGCACATTGTTTTGT
CTGATCAGTTTTTGTTACACACTCTTATGATCTCAATCAGGTAGTGTTTTTCTGC
AC

QA 13 607 13 607
DS 

RD RS1AI03JQ 714 0 0
CGCCGCAGAGTTTCAGCTGACTCGGGAGGACGCGACTGAGAGAGAGAGAGAGAGAATGGC
GTCGTCATCATTGGCGAGAGGAGAGCTGGAGAAGATGGGGATCGATCAGCTGAAAGCGCT
GAAGGAGCAAGCGGATCTGGAAGTGAATCTCCTCCAGGACAGTCTCAACAACATCCGCAC
AGCCAACGCACGCCTCGAATCCGCCGCGGGAGCTCTCAACGATC**TCGCTTAGACCTCA
AGGTAAGAAGATGCTTGTACCACTCACCGCGTCTCTGTACGTGCCTGGGACGCTTGACGA
AGCTGATAAGGTTCTTGTTGATATCGGCACTGGTTACTTCATCGAGAAAACAATGGAGTA
TGGAAAAGACTATTGTCAGAGGAAGATCAACTTGTTGAAATCAAACTATGAACAACTCTT
TGAGGTGTTGGCCAAGAAGAAAAGTGTGGCGGATGAAGCCGGGATGGTCTTGCAGGGTAA
AGTTAGACAGTTACAAGCTGCAACCACGTCGTGAAAAAATCCTTCATTTTCTTGTGGCTT
TTACTATTTTGGTGTTTTGAGATTTCCACATTGTTTTGTCTGATCAGTTTTTGTTACAAA
CTCTTATGATCTCAATCAGGTAGTGTTTTTCTGCGCTATGAGAACTTTGTGCTGTAATAT
CAAAGTGAACAAATGTTGCTTGGTTATTCCCCATAAAGCAAAGAGTAAAGAGAC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RS1AI03TF 714 0 0
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GTCGTCATCATTGGCGAGAGGAGAGCTGGAGAAGATGGGGATCGATCAGCTGAAAGCGCT
GAAGGAGCAAGCGGATCTGGAAGTGAATCTCCTCCAGGACAGTCTCAACAACATCCGCAC
AGCCAACGCACGCCTCGAATCCGCCGCGGGAGCTCTCAACGATC**TCGCTTAGACCTCA
AGGTAAGAAGATGCTTGTACCACTCACCGCGTCTCTGTACGTGCCTGGGACGCTTGACGA
AGCTGATAAGGTTCTTGTTGATATCGGCACTGGTTACTTCATCGAGAAAACAATGGAGTA
TGGAAAAGACTATTGTCAGAGGAAGATCAACTTGTTGAAATCAAACTATGAACAACTCTT
TGAGGTGTTGGCCAAGAAGAAAAGTGTGGCGGATGAAGCCGGGATGGTCTTGCAGGGTAA
AGTTAGACAGTTACAAGCTGCAACCACGTCGTGAAAAAATCCTTCATTTTCTTGTGGCTT
TTACTATTTTGGTGTTTTGAGATTTCCACATTGTTTTGTCTGATCAGTTTTTGTTACAAA
CTCTTATGATCTCAATCAGGTAGTGTTTTTCTGCGCTATGAGAACTTTGTGCTGTAATAT
CAAAGTGAACAAATGTTGCTTGGTTATTCCCCATAAAGCAAAGAGTAAAGAGAC

QA 1 714 1 714
DS 



CO CL1253Contig2 422 2 1 U
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TAAAAGCCACAAGAGAATGAAATCACGACGAGGCCGCAGCTTGTAGCTGTCTAACTTTAC
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GTTGTTCATAGTTGGATTTCAACAAGTTGATCTTCCTCTGACAATAGTCTTTTCCATCCT
CCATTGTTTTCTCGATGAAGTAACCAGTGCCGATATCAACAAGAACCTTATCAGCTTCAT
CAAGCGTCCCAGGCACGTACAGAGACGCGGTGAGCGGTACAAGCATCTTCTTGCCTTGTG
GTCTCAGCGATAGATCGTTGAGAGCTCCCGCGGCGGACTCGAGGCGAGCGTTGGCTGTGC
GG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1AC58JQ U 215
AF RS1BS43JQ U 1
BS 1 422 RS1BS43JQ

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DS 

RD RS1BS43JQ 422 0 0
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GTTGTTCATAGTTGGATTTCAACAAGTTGATCTTCCTCTGACAATAGTCTTTTCCATCCT
CCATTGTTTTCTCGATGAAGTAACCAGTGCCGATATCAACAAGAACCTTATCAGCTTCAT
CAAGCGTCCCAGGCACGTACAGAGACGCGGTGAGCGGTACAAGCATCTTCTTGCCTTGTG
GTCTCAGCGATAGATCGTTGAGAGCTCCCGCGGCGGACTCGAGGCGAGCGTTGGCTGTGC
GG

QA 1 422 1 422
DS 



AS 1 6

CO CL1254Contig1 1098 6 21 U
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TATCCGAAGCTTTCAGTCAAGTCGACATCACTCTGTCTGGGCTTCAGCTGTCGTCCCTCT
GTTCAAAAAATGGATTTTTCGAAAAGGGCTAGCAGAAGAGAACAGTCAGTCAAATGTTCT
TCATCGTCTGAGTTTGATAATAGTAAAACAGTTGTGAAGGAGAAGAGTGTCTCAGTGATT
CTCTTAGCTGGTGGTCAAGGGAAGAGAATGAAAATGACCATTCCAAAACAGTATATACCA
CTCCTTGGTCAGCCCATTGCTCTCTACAGCTTTTTCACGTTTTCACGTATGCCTGAAATG
AAGGAGATTATAGTTGTGTGCGATCCATTTTTCCGAGATATTTTTGAAGAATATGAAGAA
TCAATAGATGTTGATCTTAAATTCGCTCTTCCTGGTAAAGAAAGGCAAGACTCTGTTCTC
AGTGGACTTCAGGAAATAGATGCGAACGCTGAACTTGTTTGCATCCACGACTCAGCCAGA
CCGTTGGTGGACACTGAAGATGTCGAGAAGGTACTTAAAGATGGTTGGGCGGTTGGAGCA
GCCGTTCTTGGTGTTCCAGCGAAAGCTACTATCAAAGAGGTCAATTCAGATTCACTCGTG
GTGAAAACTCTTGACAGGAAAACCCTTTGGGAAATGCAGACACCACAGGTGATCAAACCC
GAGCTGTTGAAGAGAGGTTTCGAGCTTGTGAAAAGAGAAGGTCTAGAGGTAACAGATGAT
GTTTCAATTGTTGAATACCTCAAGCACCCTGTTTATGTCACTCAAGGATCTTACACAAAC
ATCAAGGTTACAACACCTGATGATTTACTGCTTGCTGAGAGAATCTTGAGCATGGACTCA
TGAGGATGTAGTACGACTTGGTACTTTGATTTATTTTTCAGCCTTGCTGTATTGGTAGAC
AATAATGTTCTAAGATTTTACAAAAAAGTGTTGAAACATTTGGAAAAGAAGAATCAAAAG
AATCATCTACATTTATCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1CE80TF U 1
AF RS1D286TF U 1
AF RS1F952TF U 14
AF RS1F952JQ C 259
AF RS1CE80JQ C 268
AF RS1D286JQ C 391
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GTTCAAAAAATGGATTTTTCGAAAAGGGCTAGCAGAAGAGAACAGTCAGTCAAATGTTCT
TCATCGTCTGAGTTTGATAATAGTAAAACAGTTGTGAAGGAGAAGAGTGTCTCAGTGATT
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CTCCTTGGTCAGCCCATTGCTCTCTACAGCTTTTTCACGTTTTCACGTATGCCTGAAATG
AAGGAGATTATAGTTGTGTGCGATCCATTTTTCCGAGATATTTTCGAAGAATATGAAGAA
TCAATAGATGTTGATCTTAAATTCGCTCTTCCTGGTAAAGAAAGGCAAGACTCTGTTCTC
AGTGGACTTCAGGAAATAGATGCGAACGCTGAACTTGTTTGCATCCACGACTCAGCCAGA
CCGTTGGTGGACACTGAAGATGTCGAGAAG*TACTTAAAGATGGTTGGGCGGTTGGAGCA
GTCGTTCTTGGTGTTCCAGCGAAAGCTACTATCAAAGAG*TCAATTCAGATTCACTCGTG
GTGAAA*CTCTTGACAGGAA

QA 1 740 1 740
DS 

RD RS1D286TF 732 0 0
GGATCTATCTATCTATCTCTCTCACTAGTTAATTTTATCTCCGGCGAGAGAATGGCGATG
ATGCAAGCGAATCTTGGTTTCCTTAAATCTCCGACATTTCCGTTTCCTTCGTCGAATTTG
TATCCGAAGCTTTCAGTCAAGTCGACATCACTCTGTCTGGGCTTCAGCTGTCGTCCCTCT
GTTCAAAAAATGGATTTTTCGAAAAGGGCTAGCAGAAGAGAACAGTCAGTCAAATGTTCT
TCATCGTCTGAGTTTGATAATAGTAAAACAGTTGTGAAGGAGAAGAGTGTCTCAGTGATT
CTCTTAGCTGGTGGTCAAGGGAAGAGAATGAAAATGACCATTCCAAAACAGTATATACCA
CTCCTTGGTCAGCCCATTGCTCTCTACAGCTTTTTCACGTTTTCACGTATGCCTGAAATG
AAGGAGATTATAGTTGTGTGCGATCCATTTTTCCGAGATATTTTTGAAGAATATGAAGAA
TCAATAGATGTTGATCTTAAATTCGCTCTTCCTGGTAAAGAAAGGCAAGACTCTGTTCTC
AGTGGACTTCAGGAAATAGATGCGAACGCTGAACTTGTTTGCATCCACGACTCAGCCAGA
CCGTTGGTGGACACTGAAGATGTCGAGAAGGTACTTAAAGATGGTTGGGCGGTTGGAGCA
GCCGTTCTTGGTGTTCCAGCGAAAGCTACTATCAAAGAGGTCAATTCAGATTCACTCGTG
GTGAAA
CTCTTG

QA 1 726 1 726
DS 

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CTAT
TCTCTCACTAGTTAATTTTATCTCCGGCGAGAGAATGGCGATGATGCAAGCGAATCTTGG
TTTCCTTAAATCTCCGACATTTCCGTTTCCTTCGTCGAATTTGTATCCGAAGCTTTCAGT
CAAGTCGACATCACTCTGTCTGGGCTTCAGCTGTCGTCCCTCTGTTCAAAAAATGGATTT
TTCGAAAAGGGCTAGCAGAAGAGAACAGTCAGTCAAATGTTCTTCATCGTCTGAGTTTGA
TAATAGTAAAACAGTTGTGAAGGAGAAGAGTGTCTCAGTGATTCTCTTAGCTGGTGGTCA
AGGGAAGAGAATGAAAATGACCATTCCAAAACAGTATATACCACTCCTTGGTCAGCCCAT
*GCTCTCTACAGCTTTTTCACGTTTTCACGTATGCCTGAAATGAAGGAGATTATAGTTGT
GTGCGATCCATTTTTCCGAGATATTTTTGAAGAATATGAAGAATCAATAGATGTTGATCT
TAAATTCGCTCTTCCTGGTAAAGAAAGGCAAGACTCTGTTCTCAGTGGACTTCAGGAAAT
AGATGCGAACGCTGAACTTGTTTGCATCCACGACTCAGCCAGACCGTTGGTGGACACTGA
AGATGTCGAGAAGGTACTTAAAGATGGTTGGGCGGTTGGAGCAGCCGTTCTTGGTGTTCC
AGCGAAAGCTACTATCAAAGAG*TCAATTCAGATTCACTCGTGGTGAAA
CTCTTG

QA 5 713 5 713
DS 

RD RS1F952JQ 759 0 0
AATAGTAAAACAGTTGTGAAGGAGAAGAGTGTCTCAGTGATTCTCTTAGCTGGTGGTCAA
GGGAAGAGAATGAAAATGACCATTCCAAAACAGTATATACCACTCCTTGGTCAGCCCAT*
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TGCGATCCATTTTTCCGAGATATTTTTGAAGAATATGAAGAATCAATAGATGTTGATCTT
AAATTCGCTCTTCCTGGTAAAGAAAGGCAAGACTCTGTTCTCAGTGGACTTCAGGAAATA
GATGCGAACGCTGAACTTGTTTGCATCCACGATTCAGCCAGACCGTTGGTGGACACTGAA
GATGTCGAGAAGGTACTTAAAGATGGTTGGGCGGTTGGAGCAGCCGTTCTTGGTGTTCCA
GCGAAAGCTACTATCAAAGAGGTCAATTCAGATTCACTCGTGGTGAAAACTCTTGACAGG
AAAACCCTTTGGGAAATGCAGACACCACAGGTGATCAAACCCGAGCTGTTGAAGAGAGGT
TTCGAGCTTGTGAAAAGAGAAGGTCTAGAGGTAACAGATGATGTTTCGATTGTTGAATAC
CTCAAGCACCCTGTTTATGTCACTCAAGGTTCTTACACAAACATCAAGGTTACAACCCCT
GATGATTTACTGCTTGCTGAGAGAATCTTGAGCATGGACTCATGAGGATGTAGTACGACT
TGGTACTTTGATTTATTTTTCAGCCTTGCTGTATTGGTA

QA 1 759 1 759
DS 

RD RS1CE80JQ 831 0 0
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ATGAAAATGACCATTCCAAAACAGTATATACCACTCCTTGGTCAGCCCATTGCTCTCTAC
AGCTTTTTCACGTTTTCACGTATGCCTGAAATGAAGGAGATTATAGTTGTGTGCGATCCA
TTTTTCCGAGATATTTTCGAAGAATATGAAGAATCAATAGATGTTGATCTTAAATTCGCT
CTTCCTGGTAAAGAAAGGCAAGACTCTGTTCTCAGTGGACTTCAGGAAATAGATGCGAAC
GCTGAACTTGTTTGCATCCACGACTCAGCCAGACCGTTGGTGGACACTGAAGATGTCGAG
AAGGTACTTAAAGATGGTTGGGCGGTTGGAGCAGTCGTTCTTGGTGTTCCAGCGAAAGCT
ACTATCAAAGAGGTCAATTCAGATTCACTCGTGGTGAAAACTCTTGACAGGAAAACCCTT
TGGGAAATGCAGACACCACAGGTGATCAAACCCGAGCTGTTGAAGAGAGGTTTCGAGCTT
GTGAAAAGAGAAGGTCTAGAGGTAACAGATGATGTTTCAATTGTTGAATACCTCAAGCAC
CCTGTTTATGTCACTCAAGGATCTTACACAAACATCAAGGTTACAACACCTGATGATTTA
CTGCTTGCTGAGAGAATCTTGAGCATGGACTCATGAGGATGTAGTACGACTTGGTACTTT
GATTTATTTTTCAGCCTTGCTGTATTGGTAGACAATAATGTTCTAAGATTTTACAAAAAA
GTGTTGAAACATTTGGAAAAGAGGAATCAAAAGAATCATCTACATTTATCG

QA 1 831 1 831
DS 

RD RS1D286JQ 707 0 0
TTTTTCACGTTTTCACGTATGCCTGAAATGAAGGAGATTATAGTTGTGTGCGATCCATTT
TTCCGAGATATTTTTGAAGAATATGAAGAATCAATAGATGTTGATCTTAAATTCGCTCTT
CCTGGTAAAGAAAGGCAAGACTCTGTTCTCAGTGGACTTCAGGAAATAGATGCGAACGCT
GAACTTGTTTGCATCCACGACTCAGCCAGACCGTTGGTGGACACTGAAGATGTCGAGAAG
GTACTTAAAGATGGTTGGGCGGTTGGAGCAGCCGTTCTTGGTGTTCCAGCGAAAGCTACT
ATCAAAGAGGTCAATTCAGATTCACTCGTGGTGAAAACTCTTGACAGGAAAACCCTTTGG
GAAATGCAGACACCACAGGTGATCAAACCCGAGCTGTTGAAGAGAGGTTTCGAGCTTGTG
AAAAGAGAAGGTCTAGAGGTAACAGATGATGTTTCAATTGTTGAATACCTCAAGCACCCT
GTTTATGTCACTCAAGGATCTTACACAAACATCAAGGTTACAACACCTGATGATTTACTG
CTTGCTGAGAGAATCTTGAGCATGGACTCATGAGGATGTAGTACGACTTGGTACTTTGAT
TTATTTTTCAGCCTTGCTGTATTGGTAGACAATAATGTTCTAAGATTTTACAAAAAAGTG
TTGAAACATTTGGAAAAGAAGAATCAAAAGAATCATCTACATTTATC

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 5

CO CL1255Contig1 1150 5 19 U
GGAGACGAGAGAGAGAGGATCAAAGATGGATCACGAAGCAGATGCATACCGTACGGATTT
GATGACCATAACGAGGTTCGTGCTGAATGAGCAATCAAAGTACCCAGAGTCTCATGGTGA
TTTCACCATTTTGCTCAGTAACATCGTTTTGGGATGCAAATTCGTCTGCAGTGCTGTCAA
CAAGGCTGGTTTGGCCAAGCTAATTGGGCTTGCTGGGGAAACAAATATCCAGGGTGAAGA
GCAAAAGAAACTCGATGTGCTCTCTAATGATGTCTTTGTCAAAGCTTTGGTTAGCAGTGG
CAGAACTTCTGTTCTTGTCTCAGAAGAAGATGAGGAAGCAACGTTCGTGGAGTCATCCAA
GCGTGGAAAGTACTGTGTTGTTTTTGATCCACTTGATGGATCCTCAAACATCGACTGTGG
TGTTTCCATTGGAACCATCTTTGGGATTTACACAATGAGCCACAATGATGAGCCAACTAC
TGAAGATGTCTTGAAACCTGGGAATGAAATGGTTGCTGCGGGTTACTGTATGTACGGAAG
CTCCTGCATGCTTGTGTTGAGCACTGGAACTGGTGTCAATGGATTTACCCTGGACCCATC
TCTAGGAGAGTTCATATTAACTCACCCGGACATTAAGATTCCGAAAAAGGGGAACATATA
TTCAGTGAATGAAGGCAATGCTCAGAACTGGGATGGTCCAACCACAAAGTATGTAGAGAA
ATGCAAGTTTCCTAAAGATGGTTCTCCCGCTAAGTCTCTGAGATATGTGGGAAGTATGGT
AGCTGATGTTCATCGCACACTGCTTTATGGAGGAATCTTCTTGTACCCGGCTGACAAGAA
AAGCCCCAATGGGAAACTGCGTGTTCTGTATGAAGTCTTCCCGATGTCGTTCTTGATGGA
GCAAGCCGG*AGGTCAGGCCTTCACTGGCAAGAAAAGGGCGCTAGACCTTGTGCCCGAGA
AGATCCATGAGCGTTCTCCAATATTTCTTGGTAGCTACGAAGATGTAGAGG*AGATTAAG
GCTCTGTATGCTGCAGAGGACTAAGATTCTCATTCTTCTTATTTTATTACTTGTCTCTCC
CTTATTTCTATATCTTCTTCTATTGAGACAAACAAACGACTCATTTATACAAGGGAGACT
TTTCTCACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 5 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RS1F673TF U 1
AF RS1FR29TF U 3
AF RS1AC69TF U 317
AF RS1E953JQ C 347
AF RS1FR29JQ C 760
BS 1 266 RS1F673TF
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BS 1021 1120 RS1AC69TF
BS 1121 1150 RS1E953JQ

RD RS1F673TF 645 0 0
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GATGACCATAACGAGGTTCGTGCTGAATGAGCAATCAAAGTACCCAGAGTCTCATGGTGA
TTTCACCATTTTGCTCAGTAACATCGTTTTGGGATGCAAATTCGTCTGCAGTGCTGTCAA
CAAGGCTGGTTTGGCCAAGCTAATTGGGCTTGCTGGGGAAACAAATATCCAGGGTGAAGA
GCAAAAGAAACTCGATGTGCTCTCTAGTGATGTCTTTGTCAAAGCTTTGGTTAGCAGTGG
CAGAACTTCTGTTCTTGTCTCAGAAGAAGATGAGGAAGCAACGTTCGTGGAGTCATCCAA
GCGTGGAAAGTACTGTGTTGTTTTTGATCCACTTGATGGATCCTCAAACATCGACTGTGG
TGTTTCCATTGGAACCATCTTTGGGATTTACACAATGAGCCACAATGATGAGCCAACTAC
TGAAGATGTCTTGAAACCTGGGAATGAAACGGTTGCTGCGGGTTACTGTATGTACGGAAG
CTCCTGCATGCTTGTGTTGAGCACTGGAACTGGTGTCAATGGATTTACCCTGGACCCATC
TCTAGGAGAGTTCATATTAACTCACCCGGACATTAAGATTCC
GAA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RS1FR29TF 803 0 0
GGAGAC
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TAACGAGGTTCGTGCTGAATGAGCAATCAAAGTACCCAGAGTCTCGTGGTGATTTCACCA
TTTTGCTCAGTAACATCGTTTTGGGATGCAAATTCGTCTGCAGTGCTGTCAACAAGGCTG
GTTTGGCCAAGCTAATTGGGCTTGCTGGGGAAACAAATATCCAGGGTGAAGAGCAAAAGA
AACTCGATGTGCTCTCTAATGATGTCTTTGTCAAAGCTTTGGTTAGCAGTGGCAGAACTT
CTGTTCTTGTCTCAGAAGAAGATGAGGAAGCAACGTTCGTGGAGTCATCCAAGCGTGGAA
AGTACTGTGTTGTTTTTGATCCACTTGATGGATCCTCAAACATCGACTGTGGTGTTTCCA
TTGGAACCATCTTTGGGATTTACACAATGAGCCACAATGATGAGCCAACTACTGAAGATG
TCTTGAAACCTGGGAATGAAATGGTTGCTGCGGGTTACTGTATGTACGGAAGCTCCTGCA
TGCTTGTGTTGAGCACTGGAACTGGTGTCAATGGATTTACCCTGGACCCATCTCTAGGAG
AGTTCATATTAACTCACCCGGACATTAAGATTCCTAAAAAGGGGAACATCTATTCAGTGA
ATGAAGGCAATGCTCAGAACTGGGATGGTCCAACCACAAAGTATGTAGAGAAATGCAAGT
TTCCTAAAGATGGTTCTCCCGCTA*GTCTCTGAGATATGTGGGAAGTATGGTAGCTGATG
TTCATCGCACACTGCTT

QA 7 803 7 803
DS 

RD RS1AC69TF 804 0 0
GGGAGGATCA
AAGATGAGGAAGCAACGTTCGTGGAGTCATCCAAGCGTGGAAAGTACTGTGTTGTTTTTG
ATCCACTTGGTGGATCCTCAAACATCGACTGTGGTGTTTCCATTGGAACCATCTTTGGGA
TTTACACAATGAGCCACAATGATGAGCCAACTACTGAAGATGTCTTGAAACCTGGGAATG
AAATGGTTGCTGCGGGTTACTGTATGTACGGAAGCTCCTGCATGCTTGTGTTGAGCACTG
GAACTGGTGTCAATGGATTTACCCTGGACCCATCTCTAGGAGAGTTCATATTAACTCACC
CGGACATTAAGATTCCGAAAAAGGGGAACATATATTCAGTGAATGAAGGCAATGCTCAGA
ACTGGGATGGTCCAACCACAAAGTATGTAGAGAAATGCGAGTTTCCTAAAGATGGTTCTC
CCGCTAAGTCTCTGAGATATGTGGGAAGTATGGTAGCTGATGTTCATCGCACACTGCTTT
ATGGAGGAATCTTCTTGTACCCGGCTGACAAGAAAAGCCCCAATGGGAAACTGCGTGTTC
TGTATGAAGTCTTCCCGATGTCGTTCTTGATGGAGCAAGCCGGGAGGTCAGGCCTTCACT
GGCAAGAAAAGGGCGCTAGACCTTGTGCCCGAGAAGATCCATGAGCGTTCTCCAATATTT
CTTGGTAGCTACGAAGATGTAGAGGGAGATTAAAGCTCTGTATGCTGCAGAGGACTAAGA
TTCTCATTCTTCTTATTTTATTACTTGTCTCTCCCTTATTTCTATATCTTCTTCTATTGA
GACAAACAAACGAC

QA 11 804 11 804
DS 

RD RS1E953JQ 804 0 0
GTGGAGTCATCCAAGCGTGGAAAGTACTGTGTTGTTTTTGATCCACTTGATGGATCCTCA
AACATCGACTGTGGTGTTTCCATTGGAACCATCTTTGGGATTTACACAATGAGCCACAAT
GATGAGCCAACTACTGAAGATGTCTTGAAACCTGGGAATGAAATGGTTGCTGCGGGTTAC
TGTATGTACGGAAGCTCCTGCATGCTTGTGTTGAGCACTGGAACTGGTGTCAATGGATTT
ACCCTGGACCCATCTCTAGGAGAGTTCATATTAACTCACCCGGACATTAAGATTCCGAAA
AAGGGGAACATATATTCAGTGAATGAAGGCAATGCTCAGAACTGGGATGGTCCAACCACA
AAGTATGTAGAGAAATGCAAGTTTCCTAAAGATGGTTCTCCCGCTAAGTCTTTGAGATAT
GTGGGAAGTATGGTAGCTGATGTTCATCGCACACTGCTTTATGGAGGAATCTTCTTGTAC
CCGGCTGACAAGAAAAGCCCCAATGGGAAACTGCGTGTTCTGTATGAAGTCTTCCCGATG
TCGTTCTTGATGGAGCAAGCCGG*AGGTCAGGCCTTCACTGGCAAGAAAAGGGCGCTAGA
CCTTGTGCCCGAGAAGATCCATGAGCGTTCTCCAATATTTCTTGGTAGCTACGAAGATGT
AGAGG*AGATTAAGGCTCTGTATGCTGCAGAGGACTAAGACTCTCATTCTTCTTATTTTA
TTACTTGTCTCTCCCTTATTTCTATATCTTCTTCTATTGAGACAAACAAACGACTCATTT
ATACAAGGGAGACTTTTCTCACCG

QA 1 804 1 804
DS 

RD RS1FR29JQ 387 0 0
GAGATATGTGGGAAGTATGGTAGCTGATGTTCATCGCACACTGCTTTATGGAGGAATCTT
CTTGTACCCGGCTGACAAGAAAAGCCCCAATGGGAAACTACGTGTTCTGTATGAAGTCTT
CCCGATGTCGTTCTTGATGGAGCAAGCCGG*AGGTCAGGCCTTCACTGGCAAGAAAAGGG
CGCTAGAGCTTGTGCCCGAGAAGATCCATGAGCGTTCTCCAATATTTCTTGGTAGCTACG
AAGATGTAGAGG*AGATTAAGGCTCTGTATGCTGCAGAGGACTAAGATTCTCATTCTTCT
TATTTTATTACTTGTCTCTCCCTTATTTCTATATCTTCTTCTATTGAGACAAACAAACGA
CTCATTTATACAAGGGAGACTTTTCTC

QA 1 387 1 387
DS 



AS 2 6

CO CL1256Contig1 810 3 40 U
GGACATGAATGCCTCATATTATAAAGAAAAATAGCCTTAAAATAGTGGAAAAACACAAAC
AATGTTCGAGAAACGAAAAGTGAATTAAGAAACGAGAAGTGAACTAAGAAACGAGAACCA
TTGCGAGCTTCTGCAACTCAACCTATGTAGTGAGCTCCATAATGGCAAAAACGATATCTC
CATCATTGGCTTTAAAAGCCTCAGTGGCTTTGGCCTTGGAGACACCAGCTTGAGTCATCA
CGAGCTCAACATCCTTGGCTTCAACACCAGTCTCATCAACATCTTCATCTTCCTCCTCCT
CTTGTGCAGCAGTGGCTGCTTCAGAGGCATCAGCGTTAGGGATCATAGATGCAACGTCTG
ACATCTTGAACCTCTGAGCAGCTTGAGCTTGTAGCTGAAAGCTCATATCGTCAATCTTGG
CCTCACCGAATATCACATAGGTGTCCGAGTTTGGGCTCTTGAACACATCCGGCTTCGAGA
TGACAAACAAAACATTCTTGGATCTCTTGATTGTGACTCTGCTAACATCAGTAACAGGTT
TCATTCCAAGTTTGAGCATTGCTTTGCGGCTTTTCTTCTAGCTTCTACTTTGCTTAGAGC
TCTCATTCACACCAGCTCCATCGACGTTGTCATCGTCGTCGTCGTCATCAACATCGTCTT
CCTCATCTCCGTCTTTGACATCTTCAACGACAACATCATCTTCCTTCTCGAGCTTCGTTT
GCTCTTTGACGGCGTCCTTCAACAGCTCTTC****TTC**TTCGA**ACGAAACGAAACC
CTTTCTAGAACAGCGCAGCGAAAATGGTCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AA12JQ U 1
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DS 

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A
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CTCACCGAATATCACATAGGTGTCCGAGTTTGGGCTCTTGAACACATCCGGCTTCGAAAT
GACAAACAAAACATTCTTGGATCTCTTGATTGTGACTCTGCTAACATCAGTAACAGGTTT
CATTCCAAGTTTGAGCATTGCTTTGCGGCTTTTCTTCTAGCTTCTACTTTGCTTAGAGCT
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TTGAACACATCCGGCTTCGAGATGACAAACAAAACATTCTTGGATCTCTTGATTGTGACT
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TCTTCCTTCTCGAGCTTCGTTTGCTCTTTGACGGCGTCCTTCAACAGCTCTTC****TTC
**TTCGA**ACGAAACGAAACCCTTTCTAGAACAGCGCAGCGAAAATGGTCC

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DS 



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TTCGGTTATTATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DT88TF U 1
AF RS1AA12TF U 47
AF RS1DT88JQ C 191
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TGAAGATGTTGATGAGACTGGTGTTGAA

QA 1 628 1 628
DS 

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GG
ACCATTTTAGCTGCGCTGTTCTAGAAAGGGTTTCGTTTCGTT*CGAA*GAAGAAGATGCC
AGGCCCCGTCGTCGACGAAGTGAAGGTTGAGGAGCTGTTGAAGGACGCCGTCAAAGAGCA
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GATGACTCAAGCTGGTGTCTCAAAGGCCAAAGCCACTAAGGCTTTTAAAGCCAATGATGG
AGATATCGTTTCTGCCATTATGGAGCTCAC
CACA

QA 3 692 3 692
DS 

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GATGAGACTGGTGTTGAAGCCAAGGATGTTGAGCTCGTGATGACTCAAGCTGGTGTCTCG
AAGGCCAAAGCCACTAAGGCTCTTAAAGCCAATGATGGAGATATCGTTTCTGCCATTATG
GAGCTCACCACATAGGTTGAGTTGCAGAAGCTCGCAATGGTTCTCGTTTCTCAATTCACT
TTTCGTTTCTCGAACATTGTTTGTGTTTCTCCACTATTTTAAGGCTATTTTGCTTTATAA
TATGAGGCATTCATGTCTAATGTTGTAAGACAGTTTAGTAAGGTGGACATTTCGGTTATT
ATTTT

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 6

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TGCTGTTCTTGTAACCGCTGACCAAGCGGCTAAGAACTACTACATGGTTGCATCCACCAG
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ATCCTTCAGGTGGAACTTAACCGCAAGCGCGGTCAGACCTAACCCTCAAGGATCTTACCA
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CGGAAAGGTTAGGTTTGGGTTTAACGGTGTATCACACGTTGACACCGAGACTCCCTTGAA
GCTTGCTGAGTACTTTGAGATGTCTGAGAAGGTCTTCAAGTACAATGTCATCAAGGACGA
GCCAGAAGCCAAGATCACAACACTAACTGTTGAGCCTAATGTCCTCAACATTACTTTCCG
TACCTTTGTCGAAATCGTCTTCGAGAACCACGAGAAGAGCATGCAGTCCTTCCATTTGGA
TGGTCACTCCTTCTTCGCAGTCGCTTCTGAGCCAGGAAGATGGACACCAGAGAAGAGAAA
CAACTACAACTTGCTCGATGCTGTCAGCAGACACACCGTGCAAGTGTATCCCAAGTCGTG
GTCAGCCATTCTCTTGACATTCGACAACGCCGGTATGTGGAACATCAGATCAGAGAACTG
GGAGAAAAGATACTTGGGACAGCAACTGTACGTCAGCGTTCTATCACCTGAAAAATCACT
AAGAGACGAGTACAACATCCCACTCAACACCAACCTTTGCGGCATCGTCAAGGGCTTGCC
CTTACCTACACCCTACACTATTTAATTAAACTCGCTTCCACAAAGTTTTATGTATTTATA
ATTGAATATGTAAAATTCTAAACTTACCACAAGTGAGTGTATTATGTTACTAATTAACCC
TTTCCTAATTTCATTAAACATACTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 
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30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 5 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G013TF U 1
AF RS1AI75JQ C 612
AF RS1AI75TF U 612
AF RS1CG64TF U 402
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TGCTGTTCTTGTAACCGCTGACCAAGCGGCTAAGAACTACTACATGGTTGCATCCACCAG
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G
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DS 

RD RS1AI75TF 400 0 0
G
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AAATTCTAAACTTACCACAAGTGAGTGTATTATGTTACT

QA 2 400 2 400
DS 

RD RS1CG64TF 634 0 0
G
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TATGTTACTAATTAACCCTTTCCTAATTTCATT

QA 2 634 2 634
DS 

RD RS1F611TF 629 0 0
G
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QA 2 629 2 629
DS 

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GAGCCAGAAGCCAAGATCACAACACTAACTGTTGAGCCTAATGTCCTCAACATTACTTTC
CGTACCTTTGTCGAAATCGTCTTCGAGAACCACGAGAAGAGCATGCAGTCCTTCCATTTG
GATGGTCACTCCTTCTTCGCAGTCGCTTCTGAGCCAGGAAGATGGACACCAGAGAAGAGA
AACAACTACAACTTGCTCGATGCTGTCAGCAGACACACCGTGCAAGTGTATCCCAAGTCG
TGGTCAGCCATTCTCTTGACATTCGACAACGCCGGTATGTGGAACATCAGATCAGAGAAC
TGGGAGAAAAGATACTTGGGACAGCAACTGTACGTCAGCGTTCTATCACCTGAAAAATCA
CTAAGAGACGAGTACAACATCCCACTCAACACCAACCTTTGCGGCATCGTCAAGGGCCTG
CCCTTACCTACACCCTACACTATTTAATTAAACTCGCTTCCACAAAGTTTTATGTATTTA
TAATTGAATATGTAAAATTCTAAACTTACCACAAGTGAGTGTATTATGTTACTAATTAAC
CCTTTCCTAATTTCATT

QA 1 617 1 617
DS 



AS 2 6

CO CL1258Contig1 759 3 2 U
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AAATAAACAATGGCAATGAGAGAAAAGAATCATTCCTCCAAAATTCTCACATGCATACAA
AAACAAAACTCCAAAAAAATTGAGACCATTTCAGTTTATCGTATAAGCACCAAAATCTTC
ATCACTCCCCCCCAAACTCAGAAGCCAACACCAAACCTTTATGATTTTGGGGGAACCATT
CCCCAGTTGACACTCTTTTCACTAACAATCTCTCCTTCCTCCTAATATACATCTCAGTTC
ATAATGTATGAAGGATAGATAAGACCCATTCATCCCTCCCAAAAAAAAACAAATGTTGAA
AATGTAAAAGAAATGTAGTAAACACATAAAATGCAAAACTGACGACGCTCACAAGACTGA
GACCCCATTTTTGGAATGAATTTTAGGAGGAAAGCATGGACTGGAGAGCGACCAGCTGCT
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GCCTTATTATATTAACCATACGACCTGCCGTCTCTTCTGTCACCACATCTTTCCTTGTAA
GCACCTCAGCAAATACTGTTAAGATTTTTGGCAGATACTGGTTATTGGGGCCTAAAAGGT
CCACATCTTGCCTCTCAACCATTGAGCAGAGCTGATCATGAACAACTTTGGCTTCCATGA
CGTCATTACTTATAGGCAAACAGTTCAACCACGCAGGAA


BQ
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CC

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BQ
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GGCAGTCTGAAAATGCCATGGCATATGATAATGCTGTATCCGCTGTGGGAAAGATCTGCC
AATTTCACCGTGATAGTATCGATTCTTCTCAG*TACTTCCTGCGTGGTTGA*CTGTTTGC
CTATAAGTAATGACGTCATG

QA 1 800 1 800
DS 

RD RS1EF42TF 728 0 0
G
GCAATATGCATCTTTGATGATGTTGCTGAACAGTGCCGTGACGCTGCCTTTAAATACTAT
GATACTTATCTTCCATTCGTACTGGAAGCTTGCAATGACGAGAGCGCAGATGTTCGACAG
GCTGCCGTTTATGGGCTTGGTGTTTGTGCTGAGTTTGGCGGATCTGTATTCAAGCCTCTT
GTCGGAGAGGCCCTGTCAAGATTGAATGTTGTGATACAGCATCCAAATGCTCGGCAGTCT
GAAAATGCCATGGCATATGATAATGCTGTATCCGCTGTGGGAAAGATCTGCCAATTTCAC
CGTGATAGTATCGATTCTTCTCAGGTACTTCCTGCGTGGTTGAACTGTTTGCCTATAAGT
AATGATGTCATGGAAGCCAAAGTTGTTCATGATCAGCTCTGCTCAATGGTTGAGAGGCAA
GATGTGGACCTTTTAGGCCCCAATAACCAGTATCTGCCAAAAATCTTAACAGTATTTGCT
GAGGTGCTTACAAGGAAAGATGTGGTGACAGAAGAGACGGCAGGTCGTATGGTTAATATA
ATAAGGCAACTTCAGCAAACACTGCCACAATCGGCATTGGCCTCAGTATGGTCAACATTG
AAACCAGAGCATCAGGTCGTTCTCCAGTCCATGCTTTCCTCCTAAAATTCATTCCAAAAA
TGGGGTCTCAGTCTTGTGAGCGTCGTCAGTTT*GCATTTTATGTGTTTACTACATTTCTT
TTGCATT

QA 2 728 2 728
DS 

RD RS1EF42JQ 645 0 0
T
GTCATGGAAGCCAAAGTTGTTCATGATCAGCTCTGCTCAATGGTTGAGAGGCAAGATGTG
GACCTTTTAGGCCCCAATAACCAGTATCTGCCAAAAATCTTAACAGTATTTGCTGAGGTG
CTTACAAGGAAAGATGTGGTGACAGAAGAGACGGCAGGTCGTATGGTTAATATAATAAGG
CAACTTCAGCAAACACTGCCACAATCGGCATTGGCCTCAGTATGGTCAACATTGAAACCA
GAGCATCAGGTCGTTCTCCAGTCCATGCTTTCCTCCTAAAATTCATTCCAAAAATGGGGT
CTCAGTCTTGTGAGCGTCGTCAGTTTTGCATTTTATGTGTTTACTACATTTCTTTTGCAT
TTTCAACATTTGTTTTTTTGGGAGGGATGATGAATGGGTTTTATCTTATCCTTATACATT
ATGAACTGAAATGTATATTAGGAGGAAGGAGAGATTGTTAGTGAAAAGAGTGTCAACTGG
GGAATGGTTCCCCCAAAATCATAAAGGGTTTGGTGTTGGCTTCTGAGTTTGGGGGAGTGA
TGAAGATTTTGGTTCTTATACGATAAACTGAAATGGTCTCGATTTTTTTGGAGTTTTGTT
TTTGTATGCATGTGAGAATTTTGGAGGAATGATTCTTTTCTCTC

QA 2 645 2 645
DS 



AS 2 6

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GCGACGGCGATCGAAGATTCTTCCGCCGTGGGAATCTGGGATGGGAAGAGGTTCGTCTTC
AAGACTTTCGGCTCGAGTATACCGTTTGTGGATAAGATCGTCTCTTGGTTGAATGATGTG
TACATGTTTTTGCGTTACGGATTCTCACTATTGAGGATGAGTAACTTCGTTGAGAATATG
ATTGATAACTTCTTGAAGTACTATGAAAGCCTAGAGTCAAGACCTGTCTTCGACAGTGTT
GAAGGGATGCTTAAATGGTCAGGCTTGTACAATCTCACTAAAGTCACTCTACAGGAGAAG
TTATCCGAAGCTCAGCTATCTCCTTTGTTAGTCAACGAGCTTGTTACCGTTATTACAAGG
ATTAACTATGGGCAGAGTGTACCTATCAGTGGACTAGCAGGTGCAGTCTCTTTGGCTGGT
TCAGGTGGAGGTTTATGGTCTGTTGAAGGTGGGAACTGGCAGATGGCTGAGAAGCTGATT
AAGCACTCGGATGTTACCTTACACCTGGAGGAGCAAATCGAATCCGTTTCACACCTCGGT
AACTACTACGAGCTGAAGTCCACAAAAGGGAACAGCTTTGAGTGTGACGTCACTGTAGTT
TCCACACCATTAGACGAGGTGGATATTCAGTTCTCACCCGCCATCTCGATTCCCAAGAGG
GAGTTGCAGCACACGCACGCGACATTCGTGAGGGGGCTTTTGAACCCTGGATATTTTGGG
ATGAAATCGGTTTCGGATGTTCCAGCTTTGGTGGGAACTCTTGAAGATCCTCTAATCCCA
TTCTCATCCATCTCGATACTTAGGAAGTATAGTGCAACAGATATGACATACAAGATATTT
ACACGACAAGAAGCATCAGATTCATTGCTTAATGAGCTCTTCAGTCAGAGAACCGAAACT
GTTCGCATAGACTGGGGTGCATATCCAAAGTACCACGCGCCTGAAGTTTTTGCACCGTTC
ATATTAGATGATCATCATTTGTACTATGTGAATGCTTTTGAAAACGCGGCTAGCACGATG
GAGACAAGTGCAGTGGCTGGTGAGAATATGGCGAGGCTCATAATTTCCAGATTCAGGACA
AAAGAATCATCATCACCACCTTCGTCCGACACAAGAAGCTGTGGTTCTGGTCTTCACTCA
GACTTGTGAACAAACTTATCAGCTACGCGTGAACAAGGTTTTTGACTGTGCTCTTTGAAG
AATATTATGCTTTGATGTATATATAAAGAAACCATAAAGCTGTAAAAACTGTAAACTGTG
CGTTGTTTGTTTTCAGTTATTGATTGAGACCATTATCATGAAGTTTATAAAAAGTTGTGA
AAACAGAAAAGATGACGGGTGGGAAACAAGGACTTACATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FX54TF U 1
AF RS1FX54JQ C 544
BS 1 688 RS1FX54TF
BS 689 1361 RS1FX54JQ

RD RS1FX54TF 688 0 0
GCGACGGCGATCGAAGATTCTTCCGCCGTGGGAATCTGGGATGGGAAGAGGTTCGTCTTC
AAGACTTTCGGCTCGAGTATACCGTTTGTGGATAAGATCGTCTCTTGGTTGAATGATGTG
TACATGTTTTTGCGTTACGGATTCTCACTATTGAGGATGAGTAACTTCGTTGAGAATATG
ATTGATAACTTCTTGAAGTACTATGAAAGCCTAGAGTCAAGACCTGTCTTCGACAGTGTT
GAAGGGATGCTTAAATGGTCAGGCTTGTACAATCTCACTAAAGTCACTCTACAGGAGAAG
TTATCCGAAGCTCAGCTATCTCCTTTGTTAGTCAACGAGCTTGTTACCGTTATTACAAGG
ATTAACTATGGGCAGAGTGTACCTATCAGTGGACTAGCAGGTGCAGTCTCTTTGGCTGGT
TCAGGTGGAGGTTTATGGTCTGTTGAAGGTGGGAACTGGCAGATGGCTGAGAAGCTGATT
AAGCACTCGGATGTTACCTTACACCTGGAGGAGCAAATCGAATCCGTTTCACACCTCGGT
AACTACTACGAGCTGAAGTCCACAAAAGGGAACAGCTTTGAGTGTGACGTCACTGTAGTT
TCCACACCATTAGACGAGGTGGATATTCAGTTCTCACCCGCCATCTCGATTCCCAAGAGG
GAGTTGCAGCACACGCACGCGACATTCG

QA 1 688 1 688
DS 

RD RS1FX54JQ 818 0 0
TACTACGAGCTGAAGTCCACAAAAGGGAACAGCTTTGAGTGTGACGTCACTGTAGTTTCC
ACACCATTAGACGAGGTGGATATTCAGTTCTCACCCGCCATCTCGATTCCCAAGAGGGAG
TTGCAGCACACGCACGCGACATTCGTGAGGGGGCTTTTGAACCCTGGATATTTTGGGATG
AAATCGGTTTCGGATGTTCCAGCTTTGGTGGGAACTCTTGAAGATCCTCTAATCCCATTC
TCATCCATCTCGATACTTAGGAAGTATAGTGCAACAGATATGACATACAAGATATTTACA
CGACAAGAAGCATCAGATTCATTGCTTAATGAGCTCTTCAGTCAGAGAACCGAAACTGTT
CGCATAGACTGGGGTGCATATCCAAAGTACCACGCGCCTGAAGTTTTTGCACCGTTCATA
TTAGATGATCATCATTTGTACTATGTGAATGCTTTTGAAAACGCGGCTAGCACGATGGAG
ACAAGTGCAGTGGCTGGTGAGAATATGGCGAGGCTCATAATTTCCAGATTCAGGACAAAA
GAATCATCATCACCACCTTCGTCCGACACAAGAAGCTGTGGTTCTGGTCTTCACTCAGAC
TTGTGAACAAACTTATCAGCTACGCGTGAACAAGGTTTTTGACTGTGCTCTTTGAAGAAT
ATTATGCTTTGATGTATATATAAAGAAACCATAAAGCTGTAAAAACTGTAAACTGTGCGT
TGTTTGTTTTCAGTTATTGATTGAGACCATTATCATGAAGTTTATAAAAAGTTGTGAAAA
CAGAAAAGATGACGGGTGGGAAACAAGGACTTACATTT

QA 1 818 1 818
DS 



CO CL1259Contig2 724 4 3 U
TTTTTTTTGGAATAACAAAACATGACTTGTATATCTTTGAACTTTAATCAAATTGTTTCC
CACCCATCATCTTTTCTGTTTTCACAACTTTTTATAAACTTCATGATAATGGTCTCTCAA
TCAATAACCGAAAACAAACCTCGCATAGTTTACAGTTTTTACAGCTTTATGGTTTCTTTA
TATATACATCAAAGCGTAATATTCTTCAAAGAGCACAGTCAAAAACCTTGTTCGCGCGTA
GCTGATAAGTTTGTTCACACGTCTGAGTGAAGACCAGAAGTACAGCTTCTTGTGTCGGAC
GAAGGTGATGATGATGATTCTTTTGTCCTGAATCAGGAAATTATGAGCCTCGCCATATTC
TCACCAGCCACTGCACTTGTCTCCATCGTGCTAGCCGCGTTTTCAAAAGCATTTACATAG
TACAAATGGTGGTCATCTAATACAAACGGTGCAAATACTTCAGGCGCGTAGTACTTTGGA
TACGCACCCCAGTCTATGCGAACAGTTTCTGTTCTTGCACTGAAGAGCTCATCAAGCAAT
GAATCTGATGCTGCTTGTCGTGTAAATATCTTGTATGTCATATCTGTTGCACTATACTTC
CTAAGTATCGAGATGGATGAGAATGGGATTAGAGGATCTTCAAGAGTTCCCACCAAAGCT
GGAACATCCGAAACCGATTTCATCCCAAAATATCCAGGGTTCAAAAGCCCCCTCACGAAT
GTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 

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AF RS1F566TF C 11
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GG
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GTC
C

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DS 

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GG
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AAACCGATTTCATCCCAAAATATCCAGGGTTCAAAAGCCCCCTCACGAATGTC
C

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 6

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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D418JQ U 1
AF RS1D418TF C 1
AF RS1A032JQ U 28
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C

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C
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CC

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DS 

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CGGTGAGGTTGATTCCAGCGCTGGTGAGGTCGACGGTGGTGGCTTTGAATCCGGCGGAGA
GAAGAAGAGTGGTGAGTTTATA

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1A032TR 924 0 0
A
ATAATCTCAATTCTCAAATCATTCCTACCACTCAAACAACAAGAAGATCGATAGTGTAGT
GAGGGCGGGACATGTTCAAACCAAAAATGAGTTTTAAATTATAGTTGAAGAGAAAATATA
GCACGGAGGAGACAAGTGAACAAGGTAGTTGGGACAGAGAAGAAAGCAGAATGGTCACTC
TCCTCC*AGTGTATACAACTGAGATGGTGGCCACTTCTCCACC*ATACGGTCCTGGAGTA
TAGGGTCACATAGGTTATCTTTACCAGTCTTGATGTAAACTCGAGGAACTTTCTCAGCTT
CAGGGTTTGGAGGCAGCTGATCAATACCTCGCAAAGCCCTTACTGGACAAGGTCGCAACA
GCTTAAATGCCAAAACTACATCCTCAAGAGGGCTTTGGCTATAGAAATAATGCCGTCTAT
ATTCCTCTTTCATTTGCGCACTAGCGGGTGGCTTATCAGCGCCTTCACCGTATGTAAACT
CCCATATGTCTTCTTCTTCTCCCACAGACATGATTGAACGAGGAGAAGACGTGGATCCGG
GTTGAACCATGTCAGCTACGAGGTAAACGGTCATGGAGATTTTGTCTGTGAACTTGCAGA
GAGCTTCGGTGACACTTGCTCCGCCTATGCTATGTCCCACAAGTATGATCTTGTGGTGAT
GAGGTATATCGGAGAGGAGAGAGAAGAGAGGACGGTTATAGTGGTCGAAGTCGAAGACGG
TGTTAGCGTCGGTGAGGTTGATTCCAGCGCTGGTGAGGTCGACGGTGGTGGCTTTGAATC
CGGCGGAGAGAAGAAGAGTGGTGAGTTTATACCAACACCAAGCACCGTGGCTGGCTCCGT
GAACGAGTACAAAGTGAATTATGGGCTCATCATCACCAGCGTCTCCTCCCATAGCAGTCT
CTCACACACTCTCTCTCTATACC

QA 2 924 2 924
DS 



AS 1 6

CO CL1261Contig1 1037 6 14 U
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ATTTTGGGCAGGAGCAGATGCAGTGGTAATAGAAGCTGATGCTTTCAAAGAATCTGATGT
GATATACAGAGCTCTTAGCTCCAGAGGCCATGCTGATATGATCAAGACTGCTGAATTCGT
TCACCAATCATCAACAGATGCAGCATCATCGCTGCTAGTTACAGCTCTAAACGAAGGGAG
GGACGTGATAATAGATGGAACACTCTCGTGGGTACCATTTGTGGTGCAGACGATAACAAT
GACAAGGAATGTGCATCGCCACCGTTACAGAATGGGGGCTGGCTACAAGGTTGGCGAAAA
CGGAGATGTCATAGAGAACTACTGGGAACGCATAGGGGAAAGACAGCAGCTGCAAGAGGA
TGGGAAGGAGAGAAAGCCATACAGGATAGAGTTAGTTGGAGTTGTCTGCGATGCTTACTT
AGCAGTGATTCGAGGCATTAGGAGAGCAATAATGTGTAGAAGAGCGGTGAGGGTTAGATC
TCAGCTGACATCACACAAGAGGTTTGCAGATGCGTTTCTTACCTACTGCAACTTAGTTGA
CAATGCGAGGCTTTACAGCACCAATGCTCTTGAAGGTTCCCCAAAGATGATAGCGTGGAA
AGAGAAGGAGAAGACATTGCTAGTGGATCCAGAGGAGATAGACTGTTTGAAGAACGTAGG
GAGGCTAAACGAGAATGCAGAGTCTATCTACGAGCTATACAGAAGACCAAACCCTGCTTG
TGAAGCTGGATCGATATGGAAAGACATAGTTCTGTCTCCTTCCAGGTTCAACATTCAGCA
GGAGCTCAAATACTCGATTCAGAAAGTGGAAAGATTCAAACAATGTCTCCAAGATACACC
AAAGTCGGAAACAGAGCAAAAAGATGTACTTTCCTAGCTTTGTTTTCTAGCTATGTTTAC
CATCTGTTACACTGCAAGAGATGTGTTAAAGGGTACCAAATGCATCATATGTTTCAGACA
AAAAGGTACTAATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 10 30 30 
30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

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AF RS1D444TF U 236
AF RS1BC96TF U 236
AF RS1D444JQ C 340
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CGGAGATGTCATAGAGAACT**TGGGAACGCATAGGGGAAAGACAGCAGCTGCAAGAGGA
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TCAGCTGACATCACACAAGAGGTTTGCAGATGCGTTTCTTACCTACTGCAACTTAGTTGA
CAATGCGAGGCTTTACAGCACCAATGCTCT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RS1D444TF 576 0 0
G
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TAGGGAGGCTAAACGAGAATGCAGAGTCTATCTACGAGCTATACAGAAGACCAAACCCTG
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QA 2 576 2 576
DS 

RD RS1BC96TF 777 0 0
G
GGAGGGACGTGATAATAGATGGAACACTCTCGTGGGTACCATTTGTGGTGCAGACGATAA
CAATGACAAGGAATGTGCATCGCCACCGTTACAGAATGGGGGCTGGCTACAAGGTTGGCG
AAAACGGAGATGTCATAGAGAACTACTGGGAACGCATAGGGGAAAGACAGCAGCTGCAAG
AGGATGGGAAGGAGAGAAAGCCATACAGGATAGAGTTAGTTGGAGTTGTCTGCGATGCTT
ACTTAGCAGTGATTCGAGGCATTAGGAGAGCAATAATGTGTAGAAGAGCGGTGAGGGTTA
GATCTCAGCTGACATCACACAAGAGGTTTGCAGATGCGTTTCTTACCTACTGCAACTTAG
TTGACAATGCGAGGCTTTACAGCACCAATGCTCTTGAAGGTTCCCCAAAGATGATAGCGT
GGAAAGAGAAGGAGAAGACATTGCTAGTGGATCCAGAGGAGATAGACTGTTTGAAGAACG
TAGGGAGGCTAAACGAGAATGCAGAGTCTATCTACGAGCTATACAGAAGACCAAACCCTG
CTTGTGAAGCTGGATCGATATGGAAAGACATAGTTCTGTCTCCTTCCAGGTTCAACATTC
AGCAGGAGCTCAAATACTCGATTCAGAAAGTGGAAAGATTCAAACAATGTCTCCAAGATA
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TTAC*ATCTGTTACACTGCAAGAGATGTGTTAAAGG*TACCAAATGCATCAT
GTGT

QA 2 773 2 773
DS 

RD RS1D444JQ 663 0 0
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AAGAGCGGTGAGGGTTAGATCTCAGCTGACATCACACAAGAGGTTTGCAGATGCGTTTCT
TACCTACTGCAACTTAGTTGACAATGCGAGGCTTTACAGCACCAATGCTCTTGAAGGTTC
CCCAAAGATGATAGCGTGGAAAGAGAAGGAGAAGACATTGCTAGTGGATCCAGAGGAGAT
AGACTGTTTGAAGAACGTAGGGAGGCTAAACGAGAATGCAGAGTCTATCTACGAGCTATA
CAGAAGACCAAACCCTGCTTGTGAAGCTGGATCGATATGGAAAGACATAGTTCTGTCTCC
TTCCAGGTTCAACATTCAGCAGGAGCTCAAATACTCGATTCAGAAAGTGGAAAGATTCAA
ACAATGTCTCCAAGATACACCAAAGTCGGAAACAGAGCAAAAAGATGTACTTTCCTAGCT
TTGTTTTCTAGCTATGTTTACCATCTGTTACACTGCAAGAGATGTGTTAAAGGGTACCAA
ATG

QA 1 663 1 663
DS 

RD RS1GA54JQ 847 0 0
TCAACAGATGCAGCATCATCGCTGCTAGT*ACAGCTCTAAACGAAGG*AGGGACGTGATA
ATGGATGGAACACTCTCGTGGGTACCATTTGTGGTGCAGACGATAACAATGACAAGGAAT
GTGCATCGCCACCGTTACAGAATGGGGGCTGGCTACAAGGTTGGCGAAAACGGAGATGTC
ATAGAGAACT**TGGGAACGCATAGGGGAAAGACAGCAGCTGCAAGAGGATGGGAAGGAG
AGAAAGCCATACAGGATAGAGTTAGTTGGAGTTGTCTGCGATGCTTACTTAGCAGTGATT
CGAGGCATTAGGAGAGCAATAATGTGTAGAAGAGCGGTGAGGGTTAGATCTCAGCTGACA
TCACACAAGAGGTTTGCAGATGCGTTTCTTACCTACTGCAACTTAGTTGACAATGCGAGG
CTTTACAGCACCAATGCTCTTGAAGGTTCCCCAAAGATGATAGCGTGGAAAGAGAAGGAG
AAGACATTGCTAGTGGATCCAGAGGAGATAGACTGTTTGAAGAACGTAGGGAGGCTAAAC
GAGAATGCAGAGTCTATCTACGAGCTATACAGAAGACCAAACCCTGCTTATGAAGCTGGA
TCGATATGGAAAGACATAGTTCTGTCTCCTTCCAGGTTCAACATTCAGCAGGAGCTCAAA
TACTCGATTCAGAAAGTGGAAAGATTCAAACAATGTCTCCAAGATACACCAAGGTCGGAA
ACAGAGCAAAAAGATGTACTTTCCTAGCTTTGTTTTCTAGCTATGTTTACCATCTGTTAC
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AATCTC
A

QA 1 846 1 846
DS 

RD RS1BC96JQ 796 0 0
GACGTGATAATAGATGGAACACTCTCGTGGGTACCATTTGTGGTGCAGACGATAACAATG
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GGAGATGTCATAGAGAACTACTGGGAACGCATAGGGGAAAGACAGCAGCTGCAAGAGGAT
GGGAAGGAGAGAAAGCCATACAGGATAGAGTTAGTTGGAGTTGTCTGCGATGCTTACTTA
GCAGTGATTCGAGGCATTAGGAGAGCAATAATGTGTAGAAGAGCGGTGAGGGTTAGATCT
CAGCTGACATCACACAAGAGGTTTGCAGATGCGTTTCTTACCTACTGCAACTTAGTTGAC
AATGCGAGGCTTTACAGCACCAATGCTCTTGAAGGTTCCCCAAAGATGATAGCGTGGAAA
GAGAAGGAGAAGACATTGCTAGTGGATCCAGAGGAGATAGACTGTTTGAAGAACGTAGGG
AGGCTAAACGAGAATGCAGAGTCTATCTACGAGCTATACAGAAGACCAAACCCTGCTTGT
GAAGCTGGATCGATATGGAAAGACATAGTTCTGTCTCCTTCCAGGTTCAACATTCAGCAG
GAGCTCAAATACTCGATTCAGAAAGTGGAAAGATTCAAACAATGTCTCCAAGATACACCA
AAGTCGGAAACAGAGCAAAAAGATGTACTTTCCTAGCTTTGTTTTCTAGCTATGTTTACC
ATCTGTTACACTGCAAGAGATGTGTTAAAGGGTACCAAATGCATCATGTGTTTCAGACAA
AAAGGTACTAATCTCC

QA 1 796 1 796
DS 



AS 2 6

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GTATCAATAAGGTAAACTACAATAAAAATGGTGGGCATGCGTAGACCAAAGGCGTTGTTT
GTTGTACTACTAGTGGCTTTGGCCATCTCAGTAGCAAAGGCTGCCAAGGATCTCAAAGAA
AAAGATGCTGGAGTCCCAAGAAACTTAAGTGAAGACGATAATCCTAAAAAAGATGGAAAA
GATGGGAAAGATGCAAAAGAAGAAGAGTACATATTCTGTTGTGTCTAAACAACAGCAAGG
AGAAGAAGAAAGAGGACTTAAACAAAAGATAAGCGAGAAAGATGAAGCTGCAACCATGTC
TGAACTCACTGTATGTCTTCTCATGGACCGTTTTGTTCCATGGTGATACTCCGATATACT
ATTTTGAGATCTCCCATTTGGCGATGATGTGTATGCATATCTAGATTTATAACATGTATT
ATCTATGTCTATAGAAGTTGTCATGTTCCTACATTTCCTTGTAAATTTATGAAAGCGATG
TGTTTAAGAGCACCAAT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1C251JQ C 1
AF RS1C251TF U 1
BS 1 557 RS1C251TF

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TGTTTAAGAGCACCAAT

QA 1 557 1 557
DS 

RD RS1C251TF 557 0 0
GGAGAAAACAAAAACAAAAAGAGGATAAACATAAAAAGAAGCTACAAAAAAAGATTATAA
GTATCAATAAGGTAAACTACAATAAAAATGGTGGGCATGCGTAGACCAAAGGCGTTGTTT
GTTGTACTACTAGTGGCTTTGGCCATCTCAGTAGCAAAGGCTGCCAAGGATCTCAAAGAA
AAAGATGCTGGAGTCCCAAGAAACTTAAGTGAAGACGATAATCCTAAAAAAGATGGAAAA
GATGGGAAAGATGCAAAAGAAGAAGAGTACATATTCTGTTGTGTCTAAACAACAGCAAGG
AGAAGAAGAAAGAGGACTTAAACAAAAGATAAGCGAGAAAGATGAAGCTGCAACCATGTC
TGAACTCACTGTATGTCTTCTCATGGACCGTTTTGTTCCATGGTGATACTCCGATATACT
ATTTTGAGATCTCCCATTTGGCGATGATGTGTATGCATATCTAGATTTATAACATGTATT
ATCTATGTCTATAGAAGTTGTCATGTTCCTACATTTCCTTGTAAATTTATGAAAGCGATG
TGTTTAAGAGCACCAAT

QA 1 557 1 557
DS 



CO CL1262Contig2 503 4 5 U
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GGAGGTCTGGGTGGGAGAGATGAAAAAGATGGGTGAGAAGATAAACCCTAGAAACCCATT
GATGCAAAAGAAGAAGAGTACATATTCTGTTGTGTCTAAACAACAGCAAGGAGAAGAAGA
AAGAGGACTTAAACAAAAGATAAGCGAGAAAGATGAAGCTGCAACCATGTCTGAACTCAC
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GAGATGGATATTTCCATTCACTC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EC33TF U 1
AF RS1FV77TF U 1
AF RS1E271TF U 2
AF RS1CP36TF U 196
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BS 137 137 RS1FV77TF
BS 138 381 RS1EC33TF
BS 382 440 RS1FV77TF
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DS 

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G
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CACCAATCATCTATTTTGT

QA 2 440 2 440
DS 

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CA

QA 1 422 1 422
DS 

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G
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TTCACTC

QA 2 308 2 308
DS 



AS 1 6

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GAGGCATCACTCTTCTCGGGACCGTGACTATCGTGAGACCTCGCACTCATCGAAAGACCG
TCGTAGGCACCATTAAGTCAATCTTCTTGTCACCAACTCTTTCCTCATCCGGTGGGACAA
ACCCGTTTAAGTCTACCTGAGTGTACCTCAATTTTTAGCATTCCGTAAACTCTCGCATTC
CTCTAAGATCATCACCATATGTTATGCTGACCGCTAGTTACCAAGTTATGTGAAAAGAGT
TCATAAAACAGTTTGCTTGTTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1A685TF U 1
AF RS1AF57TF U 1
AF RS1B871TF U 408
AF RS1B871JQ C 634
AF RS1AF57JQ C 393
AF RS1A685JQ C 492
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AGTTTGCAAGGATGGGAAGTCGTTTACATTTTCCAGTAGATCCGGGAACGCTCAAGCTCA
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TAATAACGAGTC

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DS 

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GTGCCGCAGGGAGAACTTGCCTTTACATCATCTTGATTTGTTCTCCAAGAAGTACTCTGA
GTTGAAAGTTGAGTTAAGCAGAACTGAGAGACATATACTGAAAGAGATGGGTTTCGTTTG
TCATGTTGAACATCCTCACAAGTTCATTTCAAGTTACCTTGCCACGCTTGAAACACCTCC
TGAACTGAGACAAGAAGCTTGGAACTTGGCTAATGATAGTCTGCGTACAAACCTTTGTGT
AAGGTTCAGAAGTGAAGTTGTGGCTTGTGGGGTCGTGTATGCTGCTGCCCGCAGGTTTCA
AGTACCTCTCCCAGAGAGTCCACCCTGGTGGAAAGCATTTGATGCAGATAAATCTGGTAT
TGACCAAGTGTGCAGAGTTCTTGCTCATCTATACAGTCTTCCAAAGGCTCAGTACATCTC
AGTTTGCAAGGATGGGAAGTCGTTTACATTTTCCAGTAGATCCGGGAACGCTCAAGCTCA
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TAATAACGAG

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DS 

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G
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CCGCAGGTTTCAAGTACCTCTCCCAGAGAGTCCACCCTGGTGGAAAGCATTTGATGCAGA
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TCAGTACATCTCAGTTTGCATGGATGGGAAGTCATTTACATTTTCCAGTAGATCCGGGAA
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GAGGGACATGGCTAGGTCTTCTCACAGAGACAGAGGCAGAGATTCTGACAAGGACAGAGA
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GGAACGAGTTAGAGAGAGGGACATGGCTAGGTCTTCTCACAGAGACAGAGGCAGAGATTC
TGACAAGGACAGAGACATACCAAATGATCGAGGTCACCATCGGTCAAGTGATAGAATGAA
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TGAGACCTCGCACTCATCGAAAGACCGTCGTAGGCACCATTAAGTCAATCTTCTTGTCAC
CAACTCTTTCCTCATCCGGTGGGACAAACCCGTTTAAGTCTACCTGAGTGTACCTCAATT
TTTAGCATTCCGTAAACTCTCGCATTCCTCTAAGATCATCACC

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DS 

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TCGTGTATGCTGCTGCCCGCAGGTTTCAAGTACCTCTCCCAGAGAGTCCACCCTGGTGGA
AAGCATTTGATGCAGATAAATCTGGTATTGACCAAGTGTGCAGAGTTCTTGCTCATCTAT
ACAGTCTTCCAAAGGCTCAGTACATCTCAGTTTGCAAGGATGGGAAGTCGTTTACATTTT
CCAGTAGATCCGGGAACGCTCAAGCTCAATCAACTACAAAGGATGCTTTACCGGTAGTTG
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CAATTGTCAGAGACTCGAGGGAGGATAGGAGTAAAGTAAGAGGAGAGAGTGATAGGGAGA
AGGAACGAGGTAGAGAGAGGGACATGGCTAGGTCTTCTCACAGAGACAGAGGCAGAGATT
TTGACAAGGACAGAGACAGACCAAATGATCGAGGTCACCATCGGTCAAGTGATAGACTGA
ACGTCTCAGGTGGAGCGTCAGATAGATCGAGGCATCACTCTTCTCGGGACCGTGACTATC
GTGAGACCTCGCACTCATCGAAAGACCGTCGTAGGCACCATTAAGTCAATCTTCTTGTCA
CCAACTCTTTCCTCATCCGGTGGGACAAACCCGTTTAAGTCTACCTGAGTGTACCTCAAT
TTTTAGCATTCCGTAAACTCTCGCATTCCTCTAAGATCATCACCATATGTTATGCTGACC
GCTAGTTACCAAGTTATGTGAAAAGAGTTCATAAAACAGTTTGCTTGT
G

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DS 

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GCAGAGTTCTTGCTCATCTATACAGTCTTCCAAAGGCTCAGTACATCTCAGTTTGCAAGG
ATGGGAAGTCGTTTACATTTTCCAGTAGATCCGGGAACGCTCAAGCTCAATCAACTACAA
AGGATGCTTTACCGGTAGTTGGCGATGCTGTTGAAACCAAGTGTTCAACTAATAACGAGT
CTAAGGATGGTGGAATGATTGCTACGCCTCATGAAAAGGCTACGGATTCGAAGAAGAGCG
ATGCTGAGTCAAACAGTCTACCAATTGTCAGAGACTCGAGGGAGGATAGGAGTAAAGTAA
GAGGAGAGAGTGATAGGGAGAAGGAACGAGGTAGAGAGAGGGACATGGCTAGGTCTTCTC
ACAGAGACAGAGGCAGAGATTCTGACAAGGACAGAGACAGACCAAATGATCGAGGTCACC
ATCGGTCAAGTGATAGACTGAACGTCTCAGGTGGAGCGTCAGATAGATCGAGGCATCACT
CTTCTCGGGACCGTGACTATCGTGAGACCTCGCACTCATCGAAAGACCGTCGTAGGCACC
ATTAAGTCAATCTTCTTGTCACCAACTCTTTCCTCATCCGGTGGGACAAACCCGTTTAAG
TCTACCTGAGTGTACCTCAATTTTTAGCATTCCGTAAACTCTCGCATTCCTCTAAGATCA
TCACCATATGTTATGCTGACCGCTAGTTACCAAGTTATGTGAAAAGAGTTCATAAAACAG
TTTGCTTGTTG

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DS 



AS 1 6

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AAGCATTCACAAGTTTCACCTTCACAAACCTTCATATTCCTTCTTCCTCAAGTTATTCGC
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GGCCGGAAAAGAATCTGATGAGAGGAAGCTTGGGTGTGAGAAGGGCTCTGCCACATGATA
TGCCACTAATGGCTGTGATGGTTCAACAAATAGAGGGGATGCGTGATATCATTACAGAGA
AACACGTGTGGCATCTAAGTGATAAAGCCATCAAGAATGTCTATTTGTTCTATATCATGT
TCACTTGTTGGGGATGTCTGTACTTCGGTTCCGCAAAAGATCCATTCTATGATTCGGAGG
AGTACCGTGGAGATGGAGGTGATGGAACTGGATACTGGGTCTATGAAACTCAAGAAGACA
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AAGTTGGTGGTTTAAGAGAGCTCGAAGAAGCTGTTAATAAGTAGACAACTAACATGTAAA
TCATACACAAATTATAAATATGTATAATATTGTTTTCTGATAATGGTCATAAACCACTCT
TCGTTTATATAATACTATATGTTATCTGTTTTGTGTTCTGTATCATGGAATGAGCATGTT
GAGTAATCGTCTCCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EZ95TF U 1
AF RS1CW71JQ C 21
AF RS1CW71TF U 21
AF RS1FD27JQ C 231
AF RS1B826TF U 77
AF RS1B826JQ C 231
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DS 

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GGGG
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AAATATTGTTTTCTGATAA

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DS 

RD RS1CW71TF 674 0 0
GGGG
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CAAACCTTCATATTCCTTCTTCCTCAAGTTATTCGCCTAAGCAGATTTCAGGGCCAAATC
ATGGATGCTGGCTCTCTATGAAAAAGAATGAGAAGAGGCCGGAAAAGAATCTGATGAGAG
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AAGCCATCAAGAATGTCTATTTGTTCTATATCATGTTCACTTGTTGGGGATGTCTGTACT
TCGGTTCCGCAAAAGATCCATTCTATGATTCGGAGGAGTACCGTGGAGATGGAGGTGATG
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TATGGCGTGAAGAGCTTATCGAAGAAATTGAACAGAAAGTTGGTGGTTTAAGAGAGCTCG
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AAATATTGTTTTCTGATAATGGTCATAAACCACTCTTCATTTATATAATACTATATGTTA
TCT
GTTCAAA

QA 5 667 5 667
DS 

RD RS1FD27JQ 458 0 0
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TATATCATGTTCACTTGTTGGGGATGTCTGTACTTCGGTTCCGCAAAAGATCCATTTTAT
GATTCGGAGGAGTACCGTGGAGATGGAGGTGATGGAACTGGATACTGGGTCTATGAAACT
CAAGAAGACATAGAAGAGAAGGCAAGAGCAGAGCTATGGCGTGAAGAGCTTATCGAAGAA
ATTGAACAGAAAGTTGGTGGTTTAAGAGAGCTCGAAGAAGCTGTTAATAAGTAGACAACT
AACATGTAAATCATACACAAATTATAAATATGTATAATATTGTTTTCTGATAATGGTCAT
AAACCACTCTTCGTTTATATAATACTATATGTTATCT
C

QA 1 457 1 457
DS 

RD RS1B826TF 661 0 0
G
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CCAAATCATGGATGCTGGCTCTCTATGAAAAAAAATGAGAAGAGGCCGGAAAAGAATCTG
ATGAGAGGAAGCTTGTGTGTGAGAAAGGCTCTGCCACATGATATGCCACTAATGGCTGTG
ATGGTTCAACAAATAGAGGGGATGCGTGATATCATTACAGAGAAACACGTGTGGCATCTA
AGTGATAAAGCCATCAAGAATGTCTATTTGTTCTATATCATGTTCACTTGTTGGGGATGT
CTGTACTTCGGTTCCGCAAAAGATCCATTCTATGATTCGGAGGAGTACCGTGGAGATGGA
GGTGATGGAACTGGATACTGGGTCTATGAAACTCAAGAAGACATAGAAGAGAAGGCAAGA
GCAGAGCTATGGCGTGAAGAGCTTATCGAAGAAATTGAACAGAAAGTTGGTGGTTTAAGA
GAGCTCGAAGAAGCTGTTAATAAGTAGACAACTAACATGTAAATCATACACAAATTATAA
ATATGTATAATATTGTTTTCTGATAATGGTCATAAACCACTCTTCGTTTATATAATACTA
TATGTTATCTGTTTTGTGTTCTGTATCATGGAATGAGCATGTTGAGTAATCGTCTCCTTC

QA 2 661 2 661
DS 

RD RS1B826JQ 496 0 0
CCACATGATATGCCACTAATGGCTGTGATGGTTCAACAAATAGAGGGGATGCGTGATATC
ATTACAGAGAAACACGTGTGGCATTTAAGTGATAAAGCCATCAAGAATGTCTATTTGTTT
TATATCATGTTCACTTGTTGGGGATGTCTGTACTTCGGTTCCGCAAAAGATCCATTTTAT
GATTCGGAGGAGTACCGTGGAGATGGAGGTGATGGAACTGGATACTGGGTTTATGAAACT
CAAGAAGACATAGAAGAGAAGGCAAGAGCAGAGCTATGGCGTGAAGAGCTTATCGAAGAA
ATTGAACAGAAAGTTGGTGGTTTAAGAGAGCTCGAAGAAGCTGTTAATAAGTAGACAACT
AACATGTAAATCATACACAAATTATAAATATGTATAATATTGTTTTTTGATAATGGTCAT
AAACCACTCTTCGTTTATATAATACTATATGTTATCTGTTTTGTGTTCTGTATCATGGAA
TGAGCATGTTGAGTAA

QA 1 496 1 496
DS 



AS 1 6

CO CL1265Contig1 944 6 9 U
GGGATCACAATTCCTCTTTTCTAAAATCCTCCTCCTAGGCTAACTTCTTCTTCTTCCTCC
TCCTAAAAGAGACCAAATACATCAAAGATGGTTTTGTGGGTTTTCGGATATGGATCTTTG
ATATGGAACCCAGGTTTCGATTTTGATGAGAAACTCATTGGCTATATCAAAGACTACAAA
CGTGTCTTCGATCTCGCGTGCATTGATCACAGAGGCACGCCTGAGCATCCTGCAAGAACT
TGCACGTTGGAGCAATCCACGGGAGCAAAATGCTGGGGTGCAGCTTATTGTGTTCGTGGA
GGACCAGAGAAGGAGAAGCTAGCGATGGAGTATTTGGAAGGAAGAGAATGCGAATACGAC
TCAAAAACCCTTGTTGAGTTTTACTCGGAAACTGACACCACCAAACCAATCTTGACCGGA
GTTATAGTATTCACGTCAACCCCAGACAAAGTATCAAACAAATACTACCTGGGCCCTGCT
CCATTGGAGGAGATGGCGGTGCAAATCGCTACAGCTTCTGGACCTTGTGGAAACAACCGG
GAGTATCTTTTCAAGCTGGAGAAAGCAATGCACGACATAGAGCACGAGGATGAGTATGTG
ATTGAACTGGCAAATGAGGTTAGGAAACATCTCGACTTAACAAAGGAAGTCAAGGCATTG
TTGAACCCTGTGGTTTCTCCTGTATCCATCAAACCTCAGTCCCAAGCTCATGTTTCCACT
CTCCAACGGGTCTTTGCATCATGAGAGATAAGCAAAGTCATTGAGCCAACTAACACGTTG
ATGAATAACTTTTACGGATGTGACTCTTATGGTTCCACTTCTATTTTTTTGTCACATTTT
AGCTTTCAAAAGTTTGAATTCAGAATACAGACCTTTAGATATTTTTACTCTTGTCGCCAG
TGAGCATTTGTAACACCATGATATTTAATTTTGAGAATAACTCG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1BG94TF U 1
AF RS1BG94JQ C 634
AF RS1B802TF U 2
AF RS1AJ47JQ C 159
AF RS1B802JQ C 207
AF RS1AJ47TF U 159
BS 1 615 RS1BG94TF
BS 616 692 RS1B802TF
BS 693 693 RS1AJ47TF
BS 694 750 RS1B802TF
BS 751 751 RS1AJ47TF
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BS 770 784 RS1B802TF
BS 785 944 RS1AJ47TF

RD RS1BG94TF 615 0 0
GGGATCACAATTCCTCTTTTCTAAAATCCTCCTCCTAGGCTAACTTCTTCTTCTTCCTCC
TCCTAAAAGAGACCAAATACATCAAAGATGGTTTTGTGGGTTTTCGGATATGGATCTTTG
ATATGGAACCCAGGTTTCGATTTTGATGAGAAACTCATTGGCTATATCAAAGACTACAAA
CGTGTCTTCGATCTCGCGTGCATTGATCACAGAGGCACGCCTGAGCATCCTGCAAGAACT
TGCACGTTGGAGCAATCCACGGGAGCAAAATGCTGGGGTGCAGCTTATTGTGTTCGTGGA
GGACCAGAGAAGGAGAAGCTAGCGATGGAGTATTTGGAAGGAAGAGAATGCGAATACGAC
TCAAAAACCCTTGTTGAGTTTTACTCGGAAACTGACACCACCAAACCAATCTTGACCGGA
GTTATAGTATTCACGTCAACCCCAGACAAAGTATCAAACAAATACTACCTGGGCCCTGCT
CCATTGGAGGAGATGGCGGTGCAAATCGCTACAGCTTCTGGACCTTGTGGAAACAACCGG
GAGTATCTTTTCAAGCTGGAGAAAGCAATGCACGACATAGAGCACGAGGATGAGTATGTG
ATTGAACTGGCAAAT

QA 1 615 1 615
DS 

RD RS1BG94JQ 103 0 0
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CCTCAGTCCCAAGCTCATGTTTCCACTTTCCAACGGGTTTTTG

QA 1 103 1 103
DS 

RD RS1B802TF 783 0 0
GGATCACAATTCCTCTTTTCTAAAATCCTCCTCCTAGGCTAACTTCTTCTTCTTCCTCCT
CCTAAAAGAGACCAAATACATCAAAGATGGTTTTGTGGGTTTTCGGATATGGATCTTTGA
TATGGAACCCAGGTTTCGATTTTGATGAGAAACTCATTGGCTATATCAAAGACTACAAAC
GTGTCTTCGATCTCGCGTGCATTGATCACAGAGGCACGCCTGAGCATCCTGCAAGAATTT
GCACGTTGGAGCAATCCACGGGAGCAAAATGCTGGGGTGCAGCTTATTGTGTTCGTGGAG
GACCAGAGAAGGAGAAGCTAGCGATGGAGTATTTGGAAGGAAGAGAATGCGAATACGACT
CAAAAACCCTTGTTGAGTTTTACTCGGAAACTGACACCACCAAACCAATCTTGACCGGAG
TTATAGTATTCACGTCAACCCCAGACAAAGTATCAAACAAATACTACCTGGGCCCTGCTC
CATTGGAGGAGATGGCGGTGCAAATCGCTACAGCTTCTGGACCTTGTGGAAACAACCGGG
AGTATCTTTTCAAGCTGGAGAAAGCAATGCACGACATAGAGCACGAGGATGAGTATGTGA
TTGAACTGGCAAATGAGGTTAGGAAACATCTCGACTTAACAAAGGAAGTCAAGGCATTGT
TGAACCCTGTGGTTTCTCCTGTATCCATCAAGCCTCAGTCCCAAGCTCATGTTTCCACTC
TCCAACGGGTCTTTGCATCATGAGAGATA*GCAAAGTCATTGAGCCA*CTAACACGTTGA
TGA

QA 1 783 1 783
DS 

RD RS1AJ47JQ 786 0 0
G
GGCTATATCAAAGACTACAAACGTGTCTTCGATCTCGCGTGCATTGATCACAGAGGCACG
CCTGAGCATCCTGCAAGAACTTGCACGTTGGAGCAATCCACGGGAGCAAAATGCTGGGGT
GCAGCTTATTGTGTTCGTGGAGGACCAGAGAAGGAGAAGCTAGCGATGGAGTATTTGGAA
GGAAGAGAATGCGAATACGACTCAAAAACT*TTGTTGAGTTTTACTCGGAAACTGACACC
ACCAAACCAATCTTGACCGGAGTTATAGTATTCACGTCAACCCCAGACAAAGTATCAAAC
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GGACCTTGTGGAAACAACCGGGAGTATCTTTTCAAGCTGGAGAAAGCAATGCACGACATA
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ACAAAGGAAGTCAAGGTATTGTTGAACCCTGTGGTTTCTCCTGTATCCATCAAACCTCAG
TCCTAAGCTCATGTTTCCACTCTCCAACGGGTCTTTGCATCATGAGAGATAAGCAAAGTC
ATTGAGCCAACTAACACGTTGATGAATAACTTTTACGGATGTGACTCTTATGGTTCCACT
TCTATTTTTTTGTCACATTTTAGCTTTCAAAAGTTTGAATTCAGAATACAGACCTTTAGA
TATTTTTACTCTTGTCGCCAGTGAGCATTTGTAACACCATGATATTTAATTTTGAGAATA
ACTCG

QA 2 786 2 786
DS 

RD RS1B802JQ 738 0 0
TCACAGAGGCACGCCTGAGCATCCTGCAAGAATTTGCACGTTGGAGCAATCCACGGGAGC
AAAATGCTGGGGTGCAGCTTATTGTGTTCGTGGAGGACCAGAGAAGGAGAAGCTAGCGAT
GGAGTATTTGGAAGGAAGAGAATGCGAATACGACTCAAAAACCCTTGTTGAGTTTTACTC
GGAAACTGACACCACCAAACCAATCTTGACCGGAGTTATAGTATTCACGTCAACCCCAGA
CAAAGTATCAAACAAATACTACCTGGGCCCTGCTCCATTGGAGGAGATGGCGGTGCAAAT
CGCTACAGCTTCTGGACCTTGTGGAAACAACCGGGAGTATCTTTTCAAGCTGGAGAAAGC
AATGCACGACATAGAGCACGAGGATGAGTATGTGATTGAACTGGCAAATGAGGTTAGGAA
ACATCTCGACTTAACAAAGGAAGTCAAGGCATTGTTGAACCCTGTGGTTTCTCCTGTATC
CATCAAGCCTCAGTCCCAAGCTCATGTTTCCACTCTCCAACGGGTCTTTGCATCATGAGA
GATAAGCAAAGTCATTGAGCCAACTAACACGTTGATGAATAACTTTTACGGATGTGACTC
TTATGGTTCCACTTCTATTTTTTTGTCACATTTTAGCTTTCAAAAGTTTGAATTCAGAAT
ACAGACCTTTAGATATTTTTACTCTTGTCGCCAGTGAGCATTTGTAACACCATGATATTT
AATTTTGAGAATAACTCG

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1AJ47TF 786 0 0
G
GGCTATATCAAAGACTACAAACGTGTCTTCGATCTCGCGTGCATTGATCACAGAGGCACG
CCTGAGCATCCTGCAAGAACTTGCACGTTGGAGCAATCCACGGGAGCAAAATGCTGGGGT
GCAGCTTATTGTGTTCGTGGAGGACCAGAGAAGGAGAAGCTAGCGATGGAGTATTTGGAA
GGAAGAGAATGCGAATACGACTCAAAAACT*TTGTTGAGTTTTACTCGGAAACTGACACC
ACCAAACCAATCTTGACCGGAGTTATAGTATTCACGTCAACCCCAGACAAAGTATCAAAC
AAATACTACCTGGGCCCTGCTCCATTGGAGGAGATGGCGGTGCAAATCGCTACAGCTTCT
GGACCTTGTGGAAACAACCGGGAGTATCTTTTCAAGCTGGAGAAAGCAATGCACGACATA
GAGCACGAGGATGAGTATGTGATTGAACTGGCAAATGAGGTTAGGGAACATCTCGACTTA
ACAAAGGAAGTCAAGGTATTGTTGAACCCTGTGGTTTCTCCTGTATCCATCAAACCTCAG
TCCTAAGCTCATGTTTCCACTCTCCAACGGGTCTTTGCATCATGAGAGATAAGCAAAGTC
ATTGAGCCAACTAACACGTTGATGAATAACTTTTACGGATGTGACTCTTATGGTTCCACT
TCTATTTTTTTGTCACATTTTAGCTTTCAAAAGTTTGAATTCAGAATACAGACCTTTAGA
TATTTTTACTCTTGTCGCCAGTGAGCATTTGTAACACCATGATATTTAATTTTGAGAATA
ACTCG

QA 2 786 2 786
DS 



AS 1 6

CO CL1266Contig1 1083 6 11 U
GGGTAAATGGTTAAGTAGCAGACAAATCAGATGCAACTGGGCGACAAAAGGTGCTACTTT
TGGGGAGGACAAACATAGCTCTGATGGAAAAAGTGTCGTTGAACTCACAAACGGCTCGTC
AGAGGATGGTAGAGAGATCTCAATCTCAAACGAAGAAGCTCCTGAAAACAATCCTCAGTA
TACCACTGTGTATGTAGGAAACCTCGCTCCTGAAGTAACTCAGCTTGATCTACACCGCCT
GTTCCATACACTTGGCGCTGGAGTGATTGAAGAGGTCCGTGTCCAGCGAGACAAAGGCTT
TGGTTTTGTGAGATACAACACTCATGATGAGGCTGCTCTTGCTATTCAAATGGGCAACTC
TCAGCCTTTCCTCTTTAACAGACAGATAAAGTGTTCATGGGGAAACAAGCCAACTCCAAT
AGGGACAGCCTCAAACCCGCTTCCGCCACCAGTGCCAGTGGCAGTCCCTGGTCTGTCCCC
AATGGACCTTTTAGCCTATGAGAGGCAACTGGCTTTAGCCAAGATGCACCCTCAGGCTCA
GCATTCTCTAAGGCATGTCAATGCAGCTGGGGCAAGTGCAGCGGCTATGTACGATGGTGG
TTTTCAGAATGTAGCTGCGGCGCATCAGCAGCTCATGTACTATCAGTAATAAACTCTTGG
TGTCTTAGCGCTAAGATACCTTTTCTCCTTCTTCTTTTTTCCTTCTTAATTTTATCACTT
TCTTGTTTTCTTTTTCTAGACCTTGTTCAGAGTCTCTTATGTATGTGTGTCTCTCATTTG
AAGTCGTTGATTCTATATGTATGCTTCTTGGTTTGTAACCTATGAGTCTTCCTTGGCTTG
TATGCCAAGCAATAAAATAACGTTGAAATAAAAGGGGGTTGGGTTTGGGTTCCAAATTTC
CTGGGGTCTAGACATGTTTGTCTGAGAGGGAGGTAGTAGCAGTGCCTTGTGTTGTGGTTT
TGTAATGGTCAACTTGGTCCAAGTATTTGTCTTTTCATTTATGTAATAGTTGATGTAATA
ATTTTATGGTTTGTTATATAATACTAAACTAGAACATGACCCGCTCGACCGAGCGGGAGT
TTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1EP09JQ C 287
AF RS1ES88TF U 1
AF RS1BK79TF U 97
AF RS1EP09TF U 287
AF RS1AZ55JQ C 106
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ATGTACGATGGTGGTTTTCAGAATGT

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TACCACTGTGTATGTAGGAAACCTCGCTCCTGAAGTAACTCAGCTTGATCTACACCGCCT
GTTCCATACACTTGGCGCTGGAGTGATTGAAGAGGTCCGTGTCCAGCGAGACAAAGGCTT
TGGTTTTGTGAGATACAACACTCATGATGAGGCTGCTCTTGCTATTCAAATGGGCAACTC
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AGGGACAGCCTCAAACCCGCTTCCGCCACCAGTGCCAGTGGCAGTCCCTGGTCTGTCCCC
AATGGACCTTTTAGCCTATGAGAGGCAACTGGCTTTAGCCAAGATGCACCCTCAGGCTCA
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TCT
GTTTCTTTTC

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ATGGGGAAACAAGCCAACTCCAATAGGGACAGCCTCAAACCCGCTTCCGCCACCAGTGCC
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AGCCAAGATGCACCCTCAGGCTCAGCATTCTCTAAGGCATGTCAATGCAGCTGGGGCAAG
TGCAGCGGCTATGTACGATGGTGGTTTTCAGAATGTAGCTGCGGCGCATCAGCAGCTCAT
GTACTATCAGTAATAAACTCTTGGTGTCTTAGCGCTAAGATACCTTTTCTCCTTCTTCTT
TTT*CCTTCTTAATTTTATCACTTTCTTGTTTTCTTTTTCTA

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CAAATGGGCAACTCTCAGCCTTTCCTCTTTAACAGACAGATAAAGTGTTCATGGGGAAAC
AAGCCAACTCCAATAGGGACAGCCTCAAACCCGCTTCC***ACCAGTGCCAGTGGCAGTC
CCTGGTCTGTCCCCAATGGACCTTTTAGCCTATGAGAGGCAACTGGCTTTAGCCAAGATG
CACCCTCAGGCTCAGCATTCTCTAAGGCATGTCAATGCAGCTGGGGCAAGTGCAGCGGCT
ATGTACGATGGTGGTTTTCAGAATGTAGCTGCGGCGCATCAACAGCTCATGTACTATCAA
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GTGTCTCTCATTTGAA

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DS 

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CCCTGGTCTGTCCCCAATGGACCTTTTAGCCTATGAGAGGCAACTGGCTTTAGCCAAGAT
GCACCCTCAGGCTCAGCATTCTTTAAGGCATGTCAATGCAGCTGGGGCAAGTGCAGCGGC
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TGTGTCTCTCATTTGAAGTCGTTGATTCTATATGTATGCTTCTTGGTTTGTAACCTATGA
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DS 

RD RS1ES88JQ 799 0 0
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TTCAAATGGGCAACTCTCAGCCTTCCCTCTTTAACAGACAGATAAAGTGTTCATGGGGAA
ACAAGCCAACTCCAATAGGGACAGCCTCAAACCCGCTTCCGCCACCAGTGCCAGTGGCAG
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TGCACCCTCAGGCTCAGCATTCTCTAAGGCATGTCAATGCAGCTGGGGCAAGTGCAGCGG
CTATGTACGATGGTGGTTTTCAGAATGTAGCTGCGGCGCATCAGCAGCTCATGTACTATC
AGTAATAAACTCTTGGTGTCTTAGCGCTAAGATACCTTTTCTCCTTCTTCTTTTTTCCTT
CTTAATTTTATCACTTTCTTGTTTTCTTTTTCTAGACCTTGTTCAGAGTCTCTTATGTAT
GTGTGTCTCTCATTTGAAGTCGTTGATTCTATATGTATGCTTCTTGGTTTGTAACCTATG
AGTCTTCCTTGGCTTGTATGCCAAGCAATAAAATAACGTTGAAATAAAAGGGGGTTGGGT
TTGGGTTCCAAATTTCCTGGGGTCTAGACATGTTTGTCTGAGAGGGAGGTAGTAGCAGTG
CCTTGTGTTGTGGTTTTGTAATGGTCAACTTGGTCCAAGTATTTGTCTTTTCATTTATGT
AATAGTTGATGTAATAATTTTATGGTTTGTTATATAATACTAAACTAGAACATGACCCGC
TCGACCGAGCGGGAGTTTT

QA 1 799 1 799
DS 



AS 2 6

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GTTGCAAAGGCTTGCCGCTGAAGCGCAAGCTAGTCAGGGACAAGCTGTTTCTGTTGGAGT
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TCTATTAGGGTGCCATTTCCGTTTGTTATGAGCCATGGATTATCATTTGGAGGCCTGGAT
ATGGTGAAAGCTTGCAGAGTTTTTGGTTGAAGAATGATGATGTCTGTTTTTAAAAACTTG
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TGTATGTTGGACCAAACTCAGAAAAAGAAACATCGTTTGGCTTGTAGCTGATACGACAAC
TGAAAGGCTTTATTTCTTTCAATGGTTTAGGTGGTTGCTGTCCCACTTCATTGTAAAACC
AGCCATTTAAAGCCTTGTTAGACCTCTACTATGACCTTTTTTGGCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1A174TV U 1
AF RS1A174TF U 76
AF RS1A174TR C 264
AF RS1A174JQ C 283
BS 1 818 RS1A174TV
BS 819 832 RS1A174TF
BS 833 1067 RS1A174TR

RD RS1A174TV 818 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAGATCAATC
GGAAGAGATGGGTGGCGCGAATCTGAAAGCGGAGACGATGGCTCTGATGGATAAGAGAAC
GGCCATGGAGACTGAAATGAACTCGATTGTAGAACGTCTATGCAATCCCGGTGGTCCTGG
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GGTTAGAGCTCAGCGCCGTCGTCTTGCTGAGTTACGGAATGAGCACAGCGAGATAACTGA
CAAGATCAATGTAAACATTCAGATTCTTCATTCAGTGAGGCCTACATCGTCCAGAGTTTC
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TGCCTCCATGGAGACATCTGGAATCAGTGTTACTTCCCGTGCCATGGATGTGGATGTGGT
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TGGGTTGCAGCTTGGAGATCAGGTTGTCAAATTTGGCAACGTGGAAGGTGGTGATAATCT
GTTGCAAAGGCTTGCCGCTGAAGCGCAAGCTAGTCAGGGACAAGCTGTTTCTGTTGGAGT
TATAAGGCAAGGTGCGAAACTAGATTTAGCTGTGACCCCGAGGGTATGGCAAGGCAGAGG
TCTATTAGGGTGCCATTTCCGTTTGTTATGAGCCATGGATTATCATTTGGAGGCCTGGAT
ATGGTGAAAGCTTGCAGAGTTTTTGGTTGAAGAATGAT

QA 1 818 1 818
DS 

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AATGAACTCGATTGTAGAACGTCTATGCAATCCCGGTGGTCCTGGTCTCTCCGGCAATCT
CGTCGACTCGGAGGGATTCCCTCGGACAGATATTGACATTCCGGCGGTTAGAGCTCAGCG
CCGTCGTCTTGCTGAGTTACGGAATGAGCACAGCGAGATAACTGACAAGATCAATGTAAA
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AGGTCCAGAAGAAAGAAGCTTGTCAGGTGAAGTGACTTCCTTATCTGCCTCCATGGAGAC
ATCTGGAATCAGTGTTACTTCCCGTGCCATGGATGTGGATGTGGTCACTAGTATTCCCTT
TGCCATGGTTGATGAGATAACCGAGTCATCTCCAGCAGCAGAGGATGGGTTGCAGCTTGG
AGATCAGGTTGTCAAATTTGGCAACGTGGAAGGTGGTGATAATCTGTTGCAAAGGCTTGC
CGCTGAAGCGCAAGCTAGTCAGGGACAAGCTGTTTCTGTTGGAGTTATAAGGCAAGGTGC
GAAACTAGATTTAGCTGTGACCCCGAGGGTATGGCAAGGCAGAG*TCTATTAGGGTGCCA
TTTCCGTTTGTTATGAGCCATGGATTATCATTTGGAGGCCTGGATATGGTGAAAGCTTGC
AGAGTTTTTGGTTGAAGAATGATGATGTCTGTTTTTA

QA 1 757 1 757
DS 

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TTGCTGAGTTACGGAATGAGCACAGCGAGATAACTGACAAGATCAATGTAAACATTCAGA
TTCTTCATTCAGTGAGGCCTACATCGTCCAGAGTTTCATCTACCAAAGATTCAGGTCCAG
AAGAAAGAAGCTTGTCAGGTGAAGTGACTTCCTTATCTGCCTCCATGGAGACATCTGGAA
TCAGTGTTACTTCCCGTGCCATGGATGTGGATGTGGTCACTAGTATTCCCTTTGCCATGG
TTGATGAGATAACCGAGTCATCTCCAGCAGCAGAGGATGGGTTGCAGCTTGGAGATCAGG
TTGTCAAATTTGGCAACGTGGAAGGTGGTGATAATCTGTTGCAAAGGCTTGCCGCTGAAG
CGCAAGCTAGTCAGGGACAAGCTGTTTCTGTTGGAGTTATAAGGCAAGGTGCGAAACTAG
ATTTAGCTGTGACCCCGAGGGTATGGCAAGGCAGAGGTCTATTAGGGTGCCATTTCCGTT
TGTTATGAGCCATGGATTATCATTTGGAGGCCTGGATATGGTGAAAGCTTGCAGAGTTTT
TGGTTGAAGAATGATGATGTCTGTTTTTAAAAACTTGAATTTAGTAATGCGTGCAAGTGT
TTGCCCAGTTTGGTTGTTGAAAGTAGACTTTCTTCTTTGTATGTTGGACCAAACTCAGAA
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GGTTTAGGTGGTTGCTGTCCCACTTCATTGTAAAACCAGCCATTTAAAGCCTTGTTAGAC
CTCTACTATGACCTTTTTTGGCGC

QA 1 804 1 804
DS 

RD RS1A174JQ 785 0 0
GCACAGCGAGATAACTGACAAGATCAATGTAAACATTCAGATTCTTCATTCAGTGAGGCC
TACATCGTCCAGAGTTTCATCTACCAAAGATTCAGGTCCAGAAGAAAGAAGCTTGTCAGG
TGAAGTGACTTCCTTATCTGCCTCCATGGAGACATCTGGAATCAGTGTTACTTCCCGTGC
CATGGATGTGGATGTGGTCACTAGTATTCCCTTTGCCATGGTTGATGAGATAACCGAGTC
ATCTCCAGCAGCAGAGGATGGGTTGCAGCTTGGAGATCAGGTTGTCAAATTTGGCAACGT
GGAAGGTGGTGATAATCTGTTGCAAAGGCTTGCCGCTGAAGCGCAAGCTAGTCAGGGACA
AGCTGTTTCTGTTGGAGTTATAAGGCAAGGTGCGAAACTAGATTTAGCTGTGACCCCGAG
GGTATGGCAAGGCAGAGGTCTATTAGGGTGCCATTTCCGTTTGTTATGAGCCATGGATTA
TCATTTGGAGGCCTGGATATGGTGAAAGCTTGCAGAGTTTTTGGTTGAAGAATGATGATG
TCTGTTTTTAAAAACTTGAATTTAGTAATGCGTGCAAGTGTTTGCCCAGTTTGGTTGTTG
AAAGTAGACTTTCTTCTTTGTATGTTGGACCAAACTCAGAAAAAGAAACATCGTTTGGCT
TGTAGCTGATACGACAACTGAAAGGCTTTATTTCTTTCAATGGTTTAGGTGGTTGCTGTC
CCACTTCATTGTAAAACCAGCCATTTAAAGCCTTGTTAGACCTCTACTATGACCTTTTTT
GGCGC

QA 1 785 1 785
DS 



CO CL1267Contig2 963 2 4 U
GGAGATCAATCGGAAGAGATGGGTGGCGCGAATCTGAAAGCGGAGACGATGGCTCTGATG
GATAAGAGAGCTGCCATGGAGACTGAAATGAACTCGATCGTTGAACGTCTATGCAATCCC
GGTGGTCCTGGTCTCTCCGGCAATCTCGTCGACTCGGAGGGATTCCCTCGGGGAGATATT
GATGTTCCGGCGGTTAGAGTTCAGCGCCGTCGTCTTGCTGAGTTACGGAATGAACACAGC
GAGATAACGGACAAGATCGATGTGAACATTCAGATTCTTCATTCAGTGAGGCCTACTACA
TCCAGAGCTTCAATTTCCAAAGATTCAGGTCCAGAATAAAGAAGCTTGTCAGGTGAAGTG
ACTTCTTTATCTGCCTCCATGCAGACATCTGGCATCAGTGTCACTTCCCGTGCCATGGAT
GTGGATGTGGTCACTAGTATTCCCTTTGCCATGGTTGATGAGATAACCGAGTCATCTCCA
GCAGCGGAGGATGGGTTACAGCTTGGAGATCAGGTTGTGAAATTCGGCAGCGTGGAAGGT
GGTGACAACCTGTTGCAAAGGCTTTCCGCTGAAGCTCAAGCTAGCCAGGGACAAGCTGTT
TCTGTTGGAGTTATAAGGCAAGGTGCGAAACTAGATTTAGCTGTGACCCCGAGGGTATGG
CAAGGCAGAGGTCTATTAGGGTGCCATTTCCGTTTGTTATGAGCCATGGATTATCATTTG
GAGGCCTGGATATGGTGAAAGCTTGCAGAGTTTTTGGTTGAAGAATGAGATGTCTGTTTT
TAAAAACTTGAATTTAGTAATGCGTGCCAAGTGTTCCCAGTTTGGTTGTTGAAAGTAGAC
TTTCTTCTTTGTATGTTGGACCAAACTCAGAAAAAGAAACATCGTTTGGCTTGTGGCTGA
TACGACAACTGAAAGGCTTCATTTCTTACAATGGTTTAGGTGGTTGCTATCCCACTTCAC
TGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1CW66TF U 1
AF RS1CW66JQ C 192
BS 1 670 RS1CW66TF
BS 671 671 RS1CW66JQ
BS 672 711 RS1CW66TF
BS 712 963 RS1CW66JQ

RD RS1CW66TF 719 0 0
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GATGTTCCGGCGGTTAGAGTTCAGCGCCGTCGTCTTGCTGAGTTACGGAATGAACACAGC
GAGATAACGGACAAGATCGATGTGAACATTCAGATTCTTCATTCAGTGAGGCCTACTACA
TCCAGAGCTTCAATTTCCAAAGATTCAGGTCCAGAATAAAGAAGCTTGTCAGGTGAAGTG
ACTTCTTTATCTGCCTCCATGCAGACATCTGGCATCAGTGTCACTTCCCGTGCCATGGAT
GTGGATGTGGTCACTAGTATTCCCTTTGCCATGGTTGATGAGATAACCGAGTCATCTCCA
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GGTGACAACCTGTTGCAAAGGCTTTCCGCTGAAGCTCAAGCTAGCCAGGGACAAGCTGTT
TCTGTTGGAGTTATAAGGCAAGGTGCGAAACTAGATTTAGCTGTGACCCCGAGGGTATGG
CAAGGCAGAG*TCTATTAGGGTGCCATTTCCGTTTGTTATGAGCCATGGAT
ATCATTTG

QA 1 711 1 711
DS 

RD RS1CW66JQ 772 0 0
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CAAGATCGATGTGAACATTCAGATTCTTCATTCAGTGAGGCCTACTACATCCAGAGCTTC
AATTTCCAAAGATTCAGGTCCAGAATAAAGAAGCTTGTCAGGTGAAGTGACTTCTTTATC
TGCCTCCATGCAGACATCTGGCATCAGTGTCACTTCCCGTGCCATGGATGTGGATGTGGT
CACTAGTATTCCCTTTGCCATGGTTGATGAGATAACCGAGTCATCTCCAGCAGCGGAGGA
TGGGTTACAGCTTGGAGATCAGGTTGTGAAATTCGGCAGCGTGGAAGGTGGTGACAACCT
GTTGCAAAGGCTTTCCGCTGAAGCTCAAGCTAGCCAGGGACAAGCTGTTTCTGTTGGAGT
TATAAGGCAAGGTGCGAAACTAGATTTAGCTGTGACCCCGAGGGTATGGCAAGGCAGAGG
TCTATTAGGGTGCCATTTCCGTTTGTTATGAGCCATGGATTATCATTTGGAGGCCTGGAT
ATGGTGAAAGCTTGCAGAGTTTTTGGTTGAAGAATGAGATGTCTGTTTTTAAAAACTTGA
ATTTAGTAATGCGTGCCAAGTGTTCCCAGTTTGGTTGTTGAAAGTAGACTTTCTTCTTTG
TATGTTGGACCAAACTCAGAAAAAGAAACATCGTTTGGCTTGTGGCTGATACGACAACTG
AAAGGCTTCATTTCTTACAATGGTTTAGGTGGTTGCTATCCCACTTCACTGC

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 6

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TTTTTTTCTCTAAGTTGTTTCATGATGAAGAGTTTCCAGCGATCTGCTCTCCTAGTGAGG
ACCTTGTCCATCATCTTCTTCTTCATCCCGGTTACAATCTCTGTTCCATTCATCCTTTTA
CACGGGATTCGAGATCAATGCTCCAACGGTGGAATCAGTAGCTTCACACAGCTCCTTAGC
AACCTCTCCAACTCCCATGGCTCTTGCTTAGAAATAGGAAATGGG*AACAAGATTCTGTG
TCCATGCCGCTTATGCAACAAGCGAGTATAGCGTGTGAGAAAGTGAAACAGATGAAAGAG
TTGAGTCAAGGTTACAACATTGCTGCACAGTCTCAAGGTAGCTTAGTCGCTAGAGGCCTA
ATCCAGTTCTGCGACAATGCTCCTCCTGTCTTCAACTATGTCTCCTTAGGAGGTCCTCAC
GCCGGCATAGCTGACATACCCAAGTGTACTTCTCCAGTGTGCCAGCTACTGAGAACAGAT
GTCTACAGCGACTATGTTCAGGATCATATTGCTCCAAGTGGTTATATCAAGATCCCTAAT
GAGATGTCAAAGTACTTGGAACACTCCAAGTATCTGCCAAAACTCAACAACGAGAGACCT
AACCAGAGGAACTCCATTTATAAAGAACGTTTCACCAGCTTGCACAACTTGATCCTAGTC
ATGTTCCAGGGGGATAGAGTAGTGATGCCTAAAGAAAGTTGTTGGTTCGGATATTACCCT
GATGGAGCTACAACACCACTTTTGCCTCCTCAACAGACGAAGCTCTATACTGAGGATTGG
ATTGGTCTGAAAACATTGGATGCTGCTGGAAAAGTGAAGTTTGTCAGTGTCCATGGAGAG
CACCTTCAGATGGCGCATGATGACGTTGTGAAGCACGTCGTGCCTTACCTCCAGAACCAT
CCTACGTTTCTTTCTTGATGCAGTCCAGAGGCGGACCCATGTGTTGGGAAGGGGTGCCAC
CTGACACAGGTTAAATACAAAACTCCCAAAGTTTAGTCTTTGGACATGAAGAAATTGTTG
CCTCGTTGGCTAAAAGCTCCTTCTTTTGACCCACCATTCCCGAGTTCAAATCCATTATAG
ACCATCTTTTTACTAATTTTTATAAAAAATGTTTTATAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RS1BT32TF U 33
AF RS1CT87TF U 1
AF RS1BV54TF U 1
AF RS1BT32JQ C 340
AF RS1CT87JQ C 387
AF RS1BV54JQ C 434
BS 1 672 RS1BV54TF
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RD RS1BT32TF 375 0 0
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TACAATCTCTGTTCCATTCATCCTTTTACACGGGATTCGAGATCAATGCTCCAACGGTGG
AATCAGTAGCTTCACACAGCTCCTTAGCAACCTCTCCAACTCCCATGGCTCTTGCTTAGA
AATAGGAAATGGGGAACAAGATTCTGTGTCCATGCCGCTTATGCAACAAGCGAGTATAGC
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CAACTATGTCTCCTT

QA 1 375 1 375
DS 

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ACCTTGTCCATCATCTTCTTCTTCATCCCGGTTACAATCTCTGTTCCATTCATCCTTTTA
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AACCTCTCCAACTCCCATGGCTCTTGCTTAGAAATAGGAAATGGG*AACAAGATTCTGTG
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ATCCAGTTCTGCGACAATGCTCCTCCTGTCTTCAACTATGTCTCCTTAGGAGGTCCTCAC
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GAGATGTCAAAGTACTTGGAACACTCCAAGTATCTGCCAAAACTCAACAACGAGAGACCT
AACCAGAGGAACTCCATTTATAAAGAACGTTTCACCAGCTTGCACAACTTGA

QA 1 652 1 652
DS 

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ACCTTGTCCATCATCTTCTTCTTCATCCCGGTTACAATCTCTGTTCCATTCATCCTTTTA
CACGGGATTCGAGATCAATGCTCCAACGGTGGAATCAGTAGCTTCACACAGCTCCTTAGC
AACCTCTCCAACTCCCATGGCTCTTGCTTAGAAATAGGAAATGGG*AACAAGATTCTGTG
TCCATGCCGCTTATGCAACAAGCGAGTATAGCGTGTGAGAAAGTGAAACAGATGAAAGAG
TTGAGTCAAGGTTACAACATTGCTGCACAGTCTCAAGGTAGCTTAGTCGCTAGAGGCCTA
ATCCAGTTCTGCGACAATGCTCCTCCTGTCTTCAACTATGTCTCCTTAGGAGGTCCTCAC
GCCGGCATAGCTGACATACCCAAGTGTACTTCTCCAGTGTGCCAGCTACTGAGAACAGAT
GTCTACAGCGACTATGTTCAGGATCATATTGCTCCAAGTGGTTATATCAAGATCCCTAAT
GAGATGTCAAAGTACTTGGAACACTCCAAGTATCTGCCAAAACTCAACAACGAGAGACCT
AACCAGAGGAACTCCATTTATAAAGAACGTTTCACCAGCTTGCACAACTTGATCCTAGTC
ATGTTCCAGGGG*ATAGAGTAGTGATGCCTAAAGAAAGTTGTGGGT*CGGATAT*ACCCT
GATGGAGCTACAACACCACTTT
GCTCTCACAGAC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RS1BT32JQ 775 0 0
AA
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CTCCTTAGGAGGTCCTCACGCTGGCATAGCTGACATACCCAAGTGTACTTCTCCAGTGTG
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TTATATCAAGATCCCTAATGAGATGTCAAAGTACTTGGAACACTCCAAGTATCTGCCAAA
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GCCTTACCTCCAGAACCATCCTACGTTTCTTTCTTGATGCAGTCCAGAGGCGGACCCATG
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GGACATGAAGAAATTGTTGCCTCGTTGGCTAAAAGCTCCTTCTTTTGACCCACCATTCCC
GAGTTCAAATCCATTATAGACCATCTTTTTACTAATTTTTATAAAAAATGTTT

QA 3 775 3 775
DS 

RD RS1CT87JQ 733 0 0
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TATTGCTCCAAGTGGTTATATCAAGATCCCTAATGAGATGTCAAAGTACTTGGAACACTC
CAAGTATCTGCCAAAACTCAACAACGAGAGACCTAACCAGAGGAACTCCATTTATAAAGA
ACGTTTCACCAGCTTGCACAACTTGATCCTAGTCATGTTCCAGGGGGATAGAGTAGTGAT
GCCTAAAGAAAGTTGTTGGTTCGGATATTACCCTGATGGAGCTACAACACCACTTTTGCC
TCCTCAACAGACGAAGCTCTATACTGAGGATTGGATTGGTCTGAAAACATTGGATGCTGC
TGGAAAAGTGAAGTTTGTCAGTGTCCATGGAGAGCACCTTCAGATGGCGCATGATGACGT
TGTGAAGCACGTCGTGCCTTACCTCCAGAACCATCCTACGTTTCTTTCTTGATGCAGTCC
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CAAAGTTTAGTCTTTGGACATGAAGAAATTGTTGCCTCGTTGGCTAAAAGCTCCTTCTTT
TGACCCACCATTCCCGAGTTCAAATCCATTATAGACCATCTTTTTACTAATTTTTATAAA
AAATGTTT
TATAC

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1BV54JQ 686 0 0
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ATGTTCAGGATCATATTGCTCCAAGTGGTTATATCAAGATCCCTAATGAGATGTCAAAGT
ACTTGGAACACTCCAAGTATCTGCCAAAACTCAACAACGAGAGACCTAACCAGAGGAACT
CCATTTATAAAGAACGTTTCACCAGCTTGCACAACTTGATCCTAGTCATGTTCCAGGGGG
ATAGAGTAGTGATGCCTAAAGAAAGTTGTTGGTTCGGATATTACCCTGATGGAGCTACAA
CACCACTTTTGCCTCCTCAACAGACGAAGCTCTATACTGAGGATTGGATTGGTCTGAAAA
CATTGGATGCTGCTGGAAAAGTGAAGTTTGTCAGTGTCCATGGAGAGCACCTTCAGATGG
CGCATGATGACGTTGTGAAGCACGTCGTGCCTTACCTCCAGAACCATCCTACGTTTCTTT
CTTGATGCAGTCCAGAGGCGGACCCATGTGTTGGGAAGGGGTGCCACCTGACACAGGTTA
AATACAAAACTCCCAAAGTTTAGTCTTTGGACATGAAGAAATTGTTGCCTCGTTGGCTAA
AAGCTCCTTCTTTTGACCCACCATTCCCGAGTTCAAATCCATTATAGACCATCTTTTTAT
TAATTTTTATAAAAAATGTTTTATAC

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 6

CO CL1269Contig1 626 6 38 U
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AGAAGAAGAAGATGGAGTCATCTATGTCTCAGAAGTTCACTCTTGTTTATGCTTCTCTCC
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ACTTAAGGACGAGGAAAGTAGTCCCGGCGGGAGTTGTATCGATGGTGTCACTCGTGATGA
CTGGGGCTTACTTGCACGGCCTTATTCGCTCAAGTTAAAGCCTCTCTGTTACGTTCGGTT
GGACCTATTCCCAATAGGGTTTGGGATAGCATTTCATATTCTGAAAGTTGTTGAACAGTG
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TATGACTAATGGAATAACTGTAATTGAAGAGTCCGGATCATATATA**CATGGACTTGTG
*TGATGAAAATTTTACTTTCTTTGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 30 30 30 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1A649JQ C 1
AF RS1CO70JQ C 128
AF RS1CO70TF U 25
AF RS1E880JQ C 83
AF RS1E880TF U 11
AF RS1A649TF U 1
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RD RS1A649JQ 626 0 0
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TATGACTAATGGAATAACTGTAATTGAAGAGTCCGGATCATATATA**CATGGACTTGTG
*TGATGAAAATTTTACTTTCTTTGTT

QA 1 626 1 626
DS 

RD RS1CO70JQ 481 0 0
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GACGAGGAAAGTAGTCCCGGCGGGAGTTGTATCGATGGTGTCACTCGTGATGACTGGGGC
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TTCCCTATAGGGTTTGGGATAGCATTTCATATTCTGAAAGTTGTTGAACAGTGTGCTTTG
TGGTGATGTTTATCTACCTTCTTTCGTATCCATATATAGACTCTCAGAAGGAATATGACT
AATGGAATAACTTTAATTGAAGAGTCCGGATCATATATATACATGGATTTGTGGTGATGA
C

QA 1 481 1 481
DS 

RD RS1CO70TF 584 0 0
TTTGCTTTTCCAATCCAGAGAACACAGAGA****GAAGAAGAAGAAGATGGAGTCATCGA
TGTCTCAGAAGTTCACTCTTGTTTATGCTTCTCTCCTTGGAGTTGGTGGGTTGATGGGTT
ACCTGAAACGCGGAAGCAAAATCTCAGTAGTCGCAGGAGGAGGATCAGCTGCATTGTTCT
ATTATGTTTACAAGGAGCTTCCAGAAAATCCTATATTGGCTTCCTCTATCGGTATAGTGG
GGTCGGCAGCGTTGACAGGAATGATGGGATCGCGTTACTTAAGGACGAGGAAAGTAGTCC
CGGCGGGAGTTGTATCGATGGTGTCACTCGTGATGACTGGGGCTTACTTGCACGGCCTTA
TTCGCTCAAGTTAAAGCCTCTCTGCTACGTTCGGTTGGACCTATTCCCTATAGGGTTTGG
GATAGCATTTCATATTCTGAAAGTTGTTGAACAGTGTGCTTTGTGGTGATGTTTATCTAC
CTTCTTTCGTATCCATATATAGACTCTCAGAAGGAATATGACTAATGGAATAACTTTAAT
TGAAGAGTCCGGATCATATATATACATGGATTTGTGGTGATGAC

QA 1 584 1 584
DS 

RD RS1E880JQ 524 0 0
TATGTTTCAGAAGTTCACTCTTGTTTATGCTTCTCTCCTCGGAGTTGGTGGGTTGATGGG
TTACCTGAAACGCGGAAGCAAAATTTCAGTAGTCGCCGGAGGAGGATCAGCTGCATTGTT
TTATTATGTTTACAAGGAGCTTCCAGAAAATCCTGTATTGGCATCCTCCATTGGTATAGT
GGGGTCGGCAGCGTTGACAGGAATGATGGGATCGCGTTACTTAAGGATGAGGAAAGTAGT
CCCGGCGGGAGTTGTATCGATGGTGTCACTCGTGATGACTGGGGCTTACTTGCACGGCCT
TATTCGCTCAAGTTAAAGCCTCTCTGTTACGTTCGGTTGGACCTATTCCCAATAGGGTTT
GGGATAGCATTTCATATTTTGAAAGTTGTTGAACAGTGTGCTTTGTGGTGATGTTTATCT
ACCTTCTTCCGTATCCATATATAGACTCTCAGAAGGAATATGACTAATGGAATAACTGTA
ATTGAAGAGTCCGGATCATATATA**CATGGACTTGTG*TGA
CG

QA 1 522 1 522
DS 

RD RS1E880TF 596 0 0
GG
AGCTCATCTCCATTTGCTTTTCTAATCCAGAGAACACAGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA
TGGAGTCATCTATGTCTCAGAAGTTCACTCTTGTTTATGCTTCTCTCCTCGGAGTTGGTG
GGTTGATGGGTTACCTGAAACGCGGAAGCAAAATCTCAGTAGTCGCCGGAGGAGGATCAG
CTGCATTGTTCTATTATGTTTACAAGGAGCTTCCAGAAAATCCTGTATTGGCATCCTCCA
TTGGTATAGTGGGGTCGGCAGCGTTGACAGGAATGATGGGATCGCGTTACTTAAGGATGA
GGAAAGTAGTCCCGGCGGGAGTTGTATCGATGGTGTCACTCGTGATGACTGGGGCTTACT
TGCACGGCCTTATTCGCTCAAGTTAAAGCCTCTCTGTTACGTTCGGTTGGACCTATTCCC
AATAGGGTTTGGGATAGCATTTCATATTCTGAAAGTTGTTGAACAGTGTGCTTTGTGGTG
ATGTTTATCTACCTTCTTCCGTATCCATATATAGACTCTCAGAAAGAATATGACTAATGG
AATAACTGTAATTGAAGAGTCCCGATCATATATA**CATGGACTTGTG*TGA
CG

QA 3 594 3 594
DS 

RD RS1A649TF 626 0 0
GGGACTCTTATTAGCTCACCTCCATTTGCTTTTCTAATCCAGAGAACACAGAGAAGAAGA
AGAAGAAGAAGATGGAGTCATCTATGTCTCAGAAGTTCACTCTTGTTTATGCTTCTCTCC
TCGGAGTTGGTGTGTTGATGGGTTACCTGAAACGCGGAAGCAAAATCTCAGTAGTCGCCG
GAGGAGGATCAGCTGCATTGTTCTATTATGTTTACAAGGAGCTTCCAGAAAATCCTGTAT
TGGCATCCTCCATTGGTATAGTGGGGTCGGCAGCGTTGACAGGAATGATGGGATCGCGTT
ACTTAAGGACGAGGAAAGTAGTCCCGGCGGGAGTTGTATCGATGGTGTCACTCGTGATGA
CTGGGGCTTACTTGCACGGCCTTATTCGCTCAAGTCAAAGCCTCTCTGTTACGTTCGGTT
GGACCTATTCCCAATAGGGTTTGGGATAGCATTTCATATTCTGAAAGTTGTTGAACAGTG
TGCTTTGTGGTGATGTTTATCTACCTTCTTCCGTATCCATATATAGACTCTCAGAAGGAA
TATGACTAATGGAATAACTGTAATTGAAGAGTCCGGATCATATATA**CATGGACTTGTG
*TGATGAAAATTTTACTTTCTTTGTT

QA 1 626 1 626
DS 



AS 2 5

CO CL1270Contig1 941 2 2 U
AGTTACACGGGTCATTAATATTTAACACAAAAACAATATTCGTTACACATAAAAGTAGCA
ACAAAAACAAAAACAGCAAAAAGAGTGATGGAAACAAAACATTAAAAGCATTCAAAGTAC
CACATAACAAAAGATTTAAACCTTAAAGAGTTTTAAATCCTAAAATCTACCAGTTCCTCT
CCTTCACGACCTTAGCACTGGGTCTATGGGCTACCAGTTTCTCTCCTTCATGACCTTCAG
TACTGTGTCTATGGGTATTGCAAACCCAACACCCACTCCGTCCCCAAATGCGCAGTTAAC
GCCAATGACCTCGCCGTCTAGGTTAACAACCGGACCTCCAGAGTTACCCTCATTCAAAGC
ACAATCAGTTTGGAAATAGAATCGGCAATTGCCTTCTAAGCCAATTTCCTTGTTTGTGCG
TTTAACACAACTGATTATCCCTGCTGAGAAACTGTTTGCAAACTCAAGAGGATTGCCGAT
GGACAGCACCATATCCCCAACAGAAACATCCTTGGAGATTCCAAACTTTGCAGGAGAGAA
TGAAGCTTTCGTTGGTGCCTCAATCTTGACTAGTGCGACATCATAATCTGCATCATAATC
AGCAACAACTCCTCGAAACGTTTGACCATAGTTCAATGTGATCTTTACCTCCATTCGCTT
CGAACGATAGACAGGACTCGTTCTAAACTTGTGGGGGTTGAGGACGAAATGACCACAAGT
TATTATTTTGCCTTCTTCCCCAAACAAAATCCCAGAGCCATAACAGTCGTTAGGTCCATC
AATATTGACAACCGAAGGAGCGATGGTTTTAGCAACCCTTCTGAAAGTGCTTCTTCCAAC
AAACTCAGAAGATTGATTTCCAGCGGACGAAGAACAGACTTATTCACCATAAGTCTACCC
TTCACTCATAAAGGATGGATCTCAAAATATTTTTTTCTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AD50JQ U 1
AF RS1D737JQ U 90
BS 1 236 RS1AD50JQ
BS 237 941 RS1D737JQ

RD RS1AD50JQ 236 0 0
AGTTACACGGGTCATTAATATTTAACACAAAAACAATATTCGTTACACATAAAAGTAGCA
ACAAAAACAAAAACAGCAAAAAGAGTGATGGAAACAAAACATTAAAAGCATTCAAAGTAC
CACATAACAAAAGATTTAAACCTTAAAGAGTTTTAAATCCTAAAATCTACCAGTTCCTCT
CCTTCACGACCTTAGCACTGGGTCTATGGGCTACCAGTTTCTCTCCTTCATGACCT

QA 1 236 1 236
DS 

RD RS1D737JQ 852 0 0
GGAAACAAAACATTAAGAGCATTCAAAGTACCACATAACAAAAGATTTAAACCTTAAAGA
GTTTTAAATCCTAGAATCTACCAGTTCCTCTCCTTCACGACCTTAGCACTGTGTCTATGG
GCTACCAGTTTCTCTCCTTCATGACCTTCAGTACTGTGTCTATGGGTATTGCAAACCCAA
CACCCACTCCGTCCCCAAATGCGCAGTTAACGCCAATGACCTCGCCGTCTAGGTTAACAA
CCGGACCTCCAGAGTTACCCTCATTCAAAGCACAATCAGTTTGGAAATAGAATCGGCAAT
TGCCTTCTAAGCCAATTTCCTTGTTTGTGCGTTTAACACAACTGATTATCCCTGCTGAGA
AACTGTTTGCAAACTCAAGAGGATTGCCGATGGACAGCACCATATCCCCAACAGAAACAT
CCTTGGAGATTCCAAACTTTGCAGGAGAGAATGAAGCTTTCGTTGGTGCCTCAATCTTGA
CTAGTGCGACATCATAATCTGCATCATAATCAGCAACAACTCCTCGAAACGTTTGACCAT
AGTTCAATGTGATCTTTACCTCCATTCGCTTCGAACGATAGACAGGACTCGTTCTAAACT
TGTGGGGGTTGAGGACGAAATGACCACAAGTTATTATTTTGCCTTCTTCCCCAAACAAAA
TCCCAGAGCCATAACAGTCGTTAGGTCCATCAATATTGACAACCGAAGGAGCGATGGTTT
TAGCAACCCTTCTGAAAGTGCTTCTTCCAACAAACTCAGAAGATTGATTTCCAGCGGACG
AAGAACAGACTTATTCACCATAAGTCTACCCTTCACTCATAAAGGATGGATCTCAAAATA
TTTTTTTCTTGG

QA 1 852 1 852
DS 



CO CL1270Contig2 810 3 10 U
GGACATTGATCATGTTTATAAAATACATGAGAGCGAGAAATTAGGGTTTTGGTTACAGAA
GTTTCTCCAATGTTTCTCCGACGTTTCTTGAAAACTCCTCAGATCTCCTCCTCTGTGGGG
ACGATCAGAACCATCTCTAGCTCCCTTCACCCTACTCCTTCGAGTCCTGTTCTAAAACGG
AAGCTTTTTGCCAATCTTAAATCATCCGAGAAACCATGTGACGACGTTCTGAGAGATATG
GAAGAGCAAGGATTTCAGATATATCAAGCCGATCTGATTCGCTGGGCAGATCTATTGGAA
AAGCAAGGCCAAGAAAAAAAATATTTTGAGATCCATTCCTTTATGGAGTGGAAAGGTAGA
CTTATGGTGAATAAGTCTGTTCTTCGTCCTGCTGGAAATCAATCTTCTGAGTTTGTTGGA
AGAAGCACTTTCAGAAGGGTTGCTAAAACCATCGCTCCTTCGGTTGTCAATATTGATGGA
CCTAACGACTGTTATGGCTCTGGGATTTTGTTTGGGGAAGAAGGCAAAATAATAACTTGT
GGTCATTTCGTCCTCAACCCCCACAAGTTTAGAACGAGTCCTGTCTATCGTTCGAAGCGA
ATGGAGGTAAAGATCACATTGAACTGTGGTCAAACGTTTCGAGGAGTTGTTGCTGATTAT
GATGCAGATTATGATGTCGCACTAGTCAAGATTGAGGCACCAACGAAAGCTTCATTCTCT
CCTGCAAAGTTTGGAATCTCCAAGGATGTTTCTGTTGGGGATATGGTGCTGTCCGTCGGC
AATCCTCTTGAGTTTGCAAACAGTTTCTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D737TF U 53
AF RS1F117TF U 1
AF RS1AD50TF U 121
BS 1 316 RS1F117TF
BS 317 317 RS1D737TF
BS 318 539 RS1F117TF
BS 540 540 RS1D737TF
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BS 714 810 RS1AD50TF

RD RS1D737TF 602 0 0
GG
ACAGAAGTTTCTCCAATGTTTCTCCGACGTTTCTTGAAAACTCCTCAGATCTCCTCCTCT
GTGGGGACGATCAGAACCATCTCTAGCTCCCTTCACCCTACTCCTTCGAGTCCTGTTCTA
AAACGGAAGCTTTTTGCCAATCTTAAATCATCCGAGAAACCATGTGACGACGTTCTGAGA
GATATGGAAGAGCAAGGATTTCAGATATATCAAGCCGATCTGATTCGCTGGGCAGATCTA
TTGGAAAAGCAAGGCCAAGAAAAAAAATATTTTGAGATCCATTCCTTTATGGAGTGGAAG
GGTAGACTTATGGTGAATAAGTCTGTTCTTCGTCCTGCTGGAAATCAATCTTCTGAGTTT
GTTGGAAGAAGCACTTTCAGAAGGGTTGCTAAAACCATCGCTCCTTCGGTTGTCAATATT
GATGGACCTAACGACTGTTATGGCTCTGGGATTTTGTTTGGGGAAGAAGGCAAAATAATA
ACTTGTGGTCATTTCGTCCTCAACCCCCACAAGTTTAGAACGAGTCCTGTCTATCGTTCG
AAGCGAATGGAGGTAAAGATCACATTGAACTATGGTCAAACGTTTCGAGGAGTTGTTGCT

QA 3 602 3 602
DS 

RD RS1F117TF 713 0 0
GGACATTGATCATGTTTATAAAATACATGAGAGCGAGAAATTAGGGTTTTGGTTACAGAA
GTTTCTCCAATGTTTCTCCGACGTTTCTTGAAAACTCCTCAGATCTCCTCCTCTGTGGGG
ACGATCAGAACCATCTCTAGCTCCCTTCACCCTACTCCTTCGAGTCCTGTTCTAAAACGG
AAGCTTTTTGCCAATCTTAAATCATCCGAGAAACCATGTGACGACGTTCTGAGAGATATG
GAAGAGCAAGGATTTCAGATATATCAAGCCGATCTGATTCGCTGGGCAGATCTATTGGAA
AAGCAAGGCCAAGAAAGAAAATATTTTGAGATCCATTCCTTTATGGAGTGGAAAGGTAGA
CTTATGGTGAATAAGTCTGTTCTTCGTCCTGCTGGAAATCAATCTTCTGAGTTTGTTGGA
AGAAGCACTTTCAGAAGGGTTGCTAAAACCATCGCTCCTTCGGTTGTCAATATTGATGGA
CCTAACGACTGTTATGGCTCTGGGATTTTGTTTGGGGAAGAAGGCAAAATAATAACTTGC
GGTCATTTCGTCCTCAACCCCCACAAGTTTAGAACGAGTCCTGTCTATCGTTCGAAGCGA
ATGGAGGTAAAGATCACATTGAACTGTGGTCAAACGTTTCGAGGAGTTGTTGCTGATTAT
GATGCAGATTATGATGTCGCACTAGTCA*GATTGAG*CACCAACGAAAGCTTC

QA 1 713 1 713
DS 

RD RS1AD50TF 690 0 0
GG
GATCAGAACCATCTCTAGCTCCCTTCACCCTACTCCTTCGAGTCCTGTTCTAAAACGGAA
GCTTTTTGCCAATCTTAAATCATCCGAGAAACCATGTGACGACGTTCTGAGAGATATGGA
AGAGCAAGGATTTCAGATATATCAAGCCGATCTGATTCGCTGGGCAGATCTATTGGAAAA
GCAAGGCCAAGAAAAAAAATATTTTGAGATCCATTCCTTTATGGAGTGGAAAGGTAGACT
TATGGTGAATAAGTCTGTTCTTCGTCCTGCTGGAAATCAATCT***GAGTTTGTTGGAAG
AAGCACTTTCAGAAGGGTTGCTAAAACCATCGCTCCTTCGGTTGTCAATATTGATGGACC
TAACGACTGTTATGGCTCTGGGATTTTGTTTGGGGAAGAAGGCAAAATAATAACTTGTGG
TCATTTCGTCCTCAACCCCCACAAGTTTAGAACGAGTCCTGTCTATCGTTCGAAGCGAAT
GGAGGTAAAGATCACATTGAACTGTGGTCAAACGTTTCGAGGAGTTGTTGCTGATTATGA
TGCAGATTATGATGTCGCACTAGTCAAGATTGAGGCACCAACGAAAGCTTCATTCTCTCC
TGCAAAGTTTGGAATCTCCAAGGATGTTTCTGTTGGGGATATGGTGCTGTCCGTCGGCAA
TCCTCTTGAGTTTGCAAACAGTTTCTCA

QA 3 690 3 690
DS 



AS 1 6

CO CL1271Contig1 989 6 31 U
GGAACTCATCCAAGACTATCTATCCATCACAAAACAACACAAACTCAAGAACAACATCTT
CATCACTTGATCATTACCACATTTCCCAGTCAATTTACACAGCAACATTACGTACCATGG
TGAAACAAGAACCCAAGACTCAAACCAGTAGCAAGAAAGAAAATTCTCTGTCTTCACCAT
CTCATTCTTCTTCATCATCTTCAACTTCCCTTAAGATCAAGAACAAGAAGAATAAGATCA
AGAAGTACAAAGGAGTGAGGATGAGAACTTGGGGATCATGGGTTTCTGAGATCAGGGCAC
CAAATCAAAAGACAAGGATTTGGTTAGGCTCTTACTCAACAGCTGAGGCAGCAGCTAGGG
CTTACGATGTTGCACTATTGTGTCTTAAAGGCCCTAGAGCCAATCTCAACTTCCCTGCAT
CTTCTTATTCTCTTTCTCAACATCTTCTTGATGAAAAGACCCTTTTGTCCCCCAAATCCA
TCCAAAGAGTCGCCGCTCAAGCTGCTAACAGCTCATTTGACCTTTTATCCCCTTCTTCCT
CAACTTCTTCTTCACCGTCGGATCAAGAACAGCATCACGATGATAATGATGATGATGGGA
TGCAATCTTTGATAGGGTCTTTCATGGATAACCATGTGTCTTTGATGGATCCATCATCGT
CATGGTATGGTGATGAACATAATGGGATATTCTCCTTCGATGATGTAGCTCCGTTCAATT
ACTCTCCTCAGTTGAACTCGATGATGGTCGAGGAGTACTATTACGAAGATGCTTATATTC
CTCTTTGGAATTTCAGTTAATCCGAGTCTAGAATACATACTTTATATATTTGTATCATTT
TAAAAATTCTTTTAATATGTTTATTAATTTACCTTGTCGTAATATTTTTTTCCAAGTTTT
TTGTTGCTTGGAGAGAATTAACGACGGGTATAACTGACTGTAATATTATTCAAGGTTTTA
TATAATGTATTGGGACCTATGAAGTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 5 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GD71TF U 6
AF RS1D579TF U 1
AF RS1DH16TF U 1
AF RS1D579JQ C 214
AF RS1DH16JQ C 423
AF RS1GD71JQ C 246
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BS 818 989 RS1D579JQ

RD RS1GD71TF 613 0 0
GG
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AAAGACAAGGATTTGGTTAGACTCTTACTCAACAGCTGAGGCAGCAGCTAGGGCTTACGA
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TTCTCTTTCTCAACATCTTCTTGATGAAAAGACCCTTTTGTCCCCCAAATCCATCCAAAG
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TTCTTCACCGTCGGATCAAGAACAGCATCATGATGATAATGATGATGATGGGATGCAATC
TTTGATAGGGT

QA 3 613 3 613
DS 

RD RS1D579TF 772 0 0
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TGAAACAAGAACCCAAGACTCAAACCAGTAGCAAGAAAGAAAATTCCCTGTCTTCACCAT
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CTTCTTATTCTCTTTCTCAACATCTTCTTGATGAAAAGACCCTTTTGTCCCCCAAATCCA
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CATGGTATGGTGATGA*CATAATGGGATATTCTC*TTCGATGATGTAGCTC*GTTCA*T*
ACTCTC*TCAGTTGA*CTCGATGATGGTCGAG*AGTACTATTACGA
GATGCT

QA 1 766 1 766
DS 

RD RS1DH16TF 817 0 0
GGAACTC
ATCCAAGACTATCTATCCATCACAAAACAACACAAACTCAAGAACAACATCTTCATCACT
TGATCATTACCACATTTCCCAGTCAATTTACACAGCAACATTACGTACCATGGTGAAACA
AGAACCCAAGACTCAAACCAGTAGCAAGAAAGAAAATTCTCTGTCTTCACCATCTCATTC
TTCTTCATCATCTTCAACTTCCCTTAAGATCAAGAACAAGAAGAATAAGATCAAGAAGTA
CAAAGGAGTGAGGATGAGAACTTGGGGATCATGGGTTTCTGAGATCAGGGCACCAAATCA
AAAGACAAGGATTTGGTTAGGCTCTTACTCAACAGCTGAGGCAGCAGCTAGGGCTTACGA
TGTTGCACTATTGTGTCTTAAAGGCCCTAGAGCCAATCTCAACTTCCCTGCATCTTCTTA
TTCTCTTTCTCAACATCTTCTTGATGAAAAGACCCTTTTGTCCCCCAAATCCATCCAAAG
AGTCGCCGCTCAAGCTGCTAACAGCTCATTTGACCTTTTATCCCCTTCTTCCTCAACTTC
TTCTTCACCGTCGGATCAAGAACAGCATCACGATGATAATGATGATGATGGGATGCAATC
TTTGATAGGGTCTTTCATGGATTACCGTGTGTCTTTGATGGATCCATCATCGTCATGGTA
TGGTGATGAACATAATGGGATATCTCC*TTCGATGATGTAGCTCCGTTCAAT*ACTCTCC
TCAGTTGAACTCGATGATGGTCGAGGAGTACTATTACGAAGATGCTTATAT*CCTCTTTG
GA*TTTCAGTTA*TCCGAGTCTAGAATACA

QA 8 817 8 817
DS 

RD RS1D579JQ 776 0 0
AGATCAAGAACAAGAAGAATAAGATCAAGAAGTACAAAGGAGTGAGGATGAGAACTTGGG
GATCATGGGTTTCTGAGATCAGGGCACCAAATCAAAAGACAAGGATTTGGTTAGGCTCTT
ACTCAACAGCTGAGGCAGCAGCTAGGGCTTACGATGTTGCACTATTGTGTCTTAAAGGCC
CTAGAGCCAATCTCAACTTCCCTGCATCTTCTTATTCTCTTTCTCAACATCTTCTTGATG
AAAAGACCCTTTTGTCCCCCAAATCCATCCAAAGAGTCGCCGCTCAAGCTGCTAACAGCT
CATTTGACCTTTTATCCCCTTCTTCCTCAACTTCTTCTTCACCGTCGGATCAAGAACAGC
ATCACGATGATAATGATGATGATGGGATGCAATCTTTGATAGGGTCTTTCATGGATAACC
ATGTGTCTTTGATGGATCCATCATCGTCATGGTATGGTGATGAACATAATGGGATATTCT
CCTTCGATGATGTAGCTCCGTTCAATTACTCTCCTCAGTTGAACTCGATGATGGTCGAGG
AGTACTATTACGAAGATGCTTATATTCCTCTTTGGAATTTCAGTTAATCCGAGTCTAGAA
TACATACTTTATATATTTGTATCATTTTAAAAATTCTTTTAATATGTTTATTAATTTACC
TTGTCGTAATATTTTTTTCCAAGTTTTTTGTTGCTTGGAGAGAATTAACGACGGGTATAA
CTGACTGTAATATTATTCAAGGTTTTATATAATGTATTGGGACCTATGAAGTTTTT

QA 1 776 1 776
DS 

RD RS1DH16JQ 555 0 0
TCTTATTCTCTTTCTCAACATCTTCTTGATGAAAAGACCCTTTTGTCCCCCAAATCCATC
CAAAGAGTCGCCGCTCAAGCTGCTAACAGCTCATTTGACCTTTTATCCCCTTCTTCCTCA
ACTTCTTCTTCACCGTCGGATCAAGAACAGCATCACGATGATAATGATGATGATGGGATG
CAATCTTTGATAGGGTCTTTCATGGATTACCGTGTGTCTTTGATGGATCCATCATCGTCA
TGGTATGGTGATGAACATAATGGGATATTCTCCTTCGATGATGTAGCTCCGTTCAATTAC
TCTCCTCAGTTGAACTCGATGATGGTCGAGGAGTACTATTACGAAGATGCTTATATTCCT
CTTTGGAATTTCAGTTAATCCGAGTCTAGAATACATACTTTATATATTTGTATCATTTTA
AAAATTCTTTTAATATGTTTATTAATTTACCTTGTCGTAATATTTTTTTCCAAGTTTTTT
GTTGCTTGGAGAGAATTAACGACGGGTATAACTGACTGTAATATTATTCAAGGTTTTATA
TAATGTATTGGGACC

QA 1 555 1 555
DS 

RD RS1GD71JQ 732 0 0
TACAAAGGAGTGAGGATGAGAACTTAGGGATCATGGGTTTCTGAGATCAGGGCACCAAAT
CAAAAGACAAGGATTTGGTTAGACTCTTACTCAACAGCTGAGGCAGCAGCTAGGGCTTAC
GATGTTGCACTATTGTGTCTTAAAGGCCCTAGAGCCAATCTCAACTTCCCTGCATCTTCT
TATTCTCTTTCTCAACATCTTCTTGATGAAAAGACCCTTTTGTCCCCCAAATCCATCCAA
AGAGTCGCCGCTCAAGCTGCTAACAGCTCATTTGACCTTTTATCCCCTTCTTCCTCAACT
TCTTCTTCACCGTCGGATCAAGAACAGCATCATGATGATAATGATGATGATGGGATGCAA
TCTTTGATAGGGTCTTTCATGGATAACCATGTGTCTTTGATGGATCCATCATCGTCATGG
TATGGTGATGAACATAATGGGATATTCTCCTTCGATGATGTAGCTCCGTTCAATTACTCT
CCTCAGTTGAACTCGATGATGGTCGAGGAGTACTATTACGAAGATGCTTATATTCCTCTT
TGGAATTTCAGTTAATCCGAGTCTAGAATACATACTTTATATATTTGTATCATTTTAAAA
ATTCTTTTAATATGTTTATTAATTTACCTTGTCGTAATATTTTTTTCCAAGTTTTTTGTT
GCTTGGAGAGAATTAACGACGGGTATAACTGACTGTAATATTATTCAAGGTTTTATATAA
TGTATTGGGACC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 6

CO CL1272Contig1 647 6 12 U
GGAATCCTCGGGTCGACAATAATAAATCGCAAAGCAAAATAATTTTTTACACTCCACAGC
CTAAACCCAACCCTAAACTACAAAAACAATAAATAAATAATGGGTGGCTGTGCGAGTAGA
CCCAAGGAGTCAGACATGAACAACGAAGGCTCTGTTCCTAAGCCTGTGTCTGAAGACGTA
GTAGCCAAGGAGATCAACACAGAAGAAACCGGTGAGAAGCAGACCCAGACGGAGACCACT
GAAACAACTCCTGAGGAAACTAAGGAGACATCTGAGGTCGAACCGACCAAGGAAACAGCT
CCTACTGCTGAAGCAGAGGTTGCAGCAGCCGTGGAAGAGTCATCTTCTGCTGGTGAGGTT
GCAGCAGCAACTGAGAAAGTTGAGGACGTCGTGGCTGCAACAGAAAACGTTGAGGCGGTT
GCGGTGAAAGAGGCTGAGGCCGAACCAGTGAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCACCGTT
TGATTGGATTAAAAATGTGAAAATATTTTGAACGTTGCTGTAAAACCACCTTGATTTGAT
TTGCTACTACATGATTTAATTAATTGGCTTTGGTTGTTCTTTGTGTGTCATAACGATTCT
TCTTTTATTAATTTAAATATAAATCAGTTTTGCTTCATGCGAATTTC


BQ
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BW46TF U 113
AF RS1BF25JQ C 1
AF RS1BF25TF U 1
AF RS1EF77TF U 1
AF RS1F754JQ C 1
AF RS1F754TF U 1
BS 1 28 RS1BF25TF
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BS 30 167 RS1BF25TF
BS 168 168 RS1EF77TF
BS 169 175 RS1BF25TF
BS 176 176 RS1EF77TF
BS 177 258 RS1BF25TF
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BS 260 322 RS1BF25TF
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BS 324 635 RS1BF25TF
BS 636 647 RS1EF77TF

RD RS1BW46TF 456 0 0
CGG
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CGGTTGCGGTGAAAGAGGCTGAGGCCGAACCAGTGAAGGAAGAGAAAGAAGTTGTTGTCA
CCGTTTGATTGGATTAAAAATGTGAAAATATTTTGAACGTTGCTGTAAAACCACCTTGAT
TTGATTTGCTACTACATGATTTAATTAATTGGC

QA 4 456 4 456
DS 

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C

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DS 

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CA

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DS 

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DS 

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DS 

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TGATTGGATTAAAAATGTGAAAATATTTTGAACGTTGCTGTAAAACCACCTTGATTTGAT
TTGCTACTACATGATTTAATTAATTGGCTTTGGTTGTTCTTTGTGTGTCATAACGATTCT
TCTTTTATTAATTTAAATATAAA

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 5

CO CL1273Contig1 1309 5 8 U
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TTAAACCGGATGTGATCGCACCCGATTTGAACATCCTCGCTGCTTGGCCTGACAAGATCG
GTCCGTCGGGTGTTTCTTCTGATAACAGGAGGACGGAGTTCAATATTTTATCGGGTACTT
CGATGGCGTGTCCGCACGTGTCGGGTCTTGCTGCTTTGCTCAAGGCGGCTCATCCTGATT
GGAGCCCCGCGGCGATAAGGTCAGCGTTGATGACTACGGCTTACACGGTGGATAACCGAG
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ATTACATCCATTTCTTGTGTAACTCCAACTACACAGGAACCAACATTGTGACTATAACAC
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GGACAGTGACAAATGTTGGCGGTTCAGACTCTGTTTATGAGGTTAAGATTAGGCCACCGA
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GTAGAAGCCCACAAGTCCCTTGGTGGTTACTCTTCAACAACCTTTGTGAAGGGTTTTAGG
ATTTGAAGACCGGAAAACTTCTGGTCTCTTTGTTCTTATAACATGTGTAAGATCATAAGC
TGTTGTTGTTGTCTAATATTTATGCTCTTTGTTGTCTGTTCCTGTAATGTAAAATGTATA
TTTGGTGATGTGGGCTTCTAGTGGTGATGCTTGTAAAGCTTCAAGTTCTAAGCCCATATA
TATCGCTTTATATTTGTTTTCTACTTGAAATATGTTATGATTTCCTTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1C741TF U 1
AF RS1FX20TF U 41
AF RS1C741JQ C 270
AF RS1BG69JQ C 635
AF RS1BG69TF U 645
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TTAAACCGGATGTGATCGCACCCGATTTGAACATCCTCGCTGCTTGGCCTGACAAGATCG
GTCCGTCGGGTGTTTCTTCTGATAAGAGGAGGACGGAGTTCAATATTTTATCGGGTACTT
CGATGGCGTGTCCGCACGTGTCGGGTCTTGCTGCTTTGCTCAAGGCGGCTCATCCTGATT
GGAGCCCCGCGGCGATAAGGTCAGCGTTGATGACTACGGCTTACACGGTGGATAACCGAG
ATGAGAAAATGCTGGATGAGTCAACGGGGAATGCATCTTCGGTTATGGATTACGGGTCGG
GTCATGTTCACCCGACCAAAGCTATGGATCCAGGATTAGTCTACGATATAACGTCTTACG
ATTACATCCATTTCTTGTGTAACTCCAACTACACAGGAACCAACATTGTGACTATAACAC
GGCGTAAAGCTGACTGCGACGGTGCTAGACGAGCGGGACACGTCGGGAATTTGAACTATC
CCTCGTTCTCTGTCGTGTTTCAGCAGTATGGTGAGAGTAAATTGTCGACACATTTCATTA
GGACAGTGACAAATGTTGGCGGTTCAGACTCTGTTTATGAGGTTAAGATTAG*CCACCGA
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DS 

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G
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GCTTGGCCTGACAAGATCGGTCCGTCGGGTGTTTCTTCTGATAACAGGAGGACGGAGTTC
AATATTTTATCGGGTACTTCGATGGCGTGTCCGCACGTGTCGGGTCTTGCTGCTTTGCTC
AAGGCGGCTCATCCTGATTGGAGCCCCGCGGCGATAAGGTCAGCGTTGATGACTACGGCT
TACACGGTGGATAACCGAGATGAGAAAATGCTGGATGAGTCAACGGGGAATGCATCTTCG
GTTATGGATTACGGGTCGGGTCATGTTCACCCGACCAAAGCTATGGATCCAGGATTAGTC
TACGATATAACGTCTTACGATTACATCAATTTCTTGTGTAACTCCAACTACACAGGAACC
AACATTGTGACTATAACACGGCGTAAAGCTGACTGCGACGGTGCTAGACGAGCGGGACAC
GTCGGGAATTTGAACTATCCCTCGTTCTCTGTCGTGTTTCAGCAGTATGGTGAGAGTAAA
TTGTCGACACATTTCATTAGGACAGTGACAAATGTTGGCGGTTCAGACTCTGTTTATGAG
GTTAAGATTAGGCCACCGAGAGGGACGACGGTGGCGGTTAAG

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DS 

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AATGCATCTTCGGTTATGGATTACGGGTCGGGTCATGTTCACCCGACCAAAGCTATGGAT
CCAGGATTAGTCTACGATATAACGTCTTACGATTACATCCATTTCTTGTGTAACTCCAAC
TACACAGGAACCAACATTGTGACTATAACACGGCGTAAAGCTGACTGCGACGGTGCTAGA
CGAGCGGGACACGTCGGGAATTTGAACTATCCCTCGTTCTCTGTCGTGTTTCAGCAGTAT
GGTGAGAGTAAATTGTCGACACATTTCATTAGGACAGTGACAAATGTTGGCGGTTCAGAC
TCTGTTTATGAGGTTAAGATTAGGCCACCGAGAGGGACGACGGTGACGGTTAAGCCGGAG
AAGCTATCGTTCCGACGGGTGGGGCAGAAACTGAGTTTTGTGGTTAGGGTTAAGACTACG
GAGGTGAAACTGTCACCAGGAGCGACAAGTGTTGAGACTGGTCATATAGTTTGGTCGGAT
GGGAAACGAAATGTGACAAGTCCCTTGGTGGTTACTCTTCAACAACCTTTGTGAAGGGGT
TTTAGGACTTGGAGACCGGAAAGATTCTGGTCTCTTTGTTTTTATAACATGTGTAAGATC
ATAAGCTGTTGTTGTTGTCTAATCTCTATGATCTTTGTTGGCTGTTCCTGTAATGTAAAA
TGTATCTTTTGCTGTTTAAGGTACATAATCCGTA
TAAAAA

QA 1 754 1 754
DS 

RD RS1BG69JQ 673 0 0
GG
ATGAGGTTAAGATTAGGCCACCGAGAGGGACGACGGTGACGGTTAAGCCGGAGAAGCTAT
CGTTCCGACGGGTGGGGCAGAAACTGAGTTTTGTGGTTAGGGTTAAGACTACGGAGGTGA
AACTGTCACCAGGAGCGACAAGTGTTGAGACTGGTCATATAGTTTGGTCGGATGGGAAAC
GAAATGTGACAAGTCCCTTGGTGGTTACTTTTCAACAACCTTTGTGAAGGGGTTTTAGGA
CTTGGAGACCGGAAAGATTCTGGTCTCTTTGTTTTTATAACACGTGTAAGATCATAAGCT
GTTGTTGTTGTCTAATCTCTATGATCTTTGTTGGCTGTTCCTGTAATGTAAAATGTATCT
TTTGCTGTTTAAGATACATAATCCGTAGAAGCCCACAAGTCCCTTGGTGGTTACTCTTCA
ACAACCTTTGTGAAGGGTTTTAGGATTTGAAGACCGGAAAACTTCTGGTCTCTTTGTTCT
TATAACATGTGTAAGATCATAAGCTGTTGTTGTTGTCTAATATTTATGCTCTTTGTTGTC
TGTTCCTGTAATGTAAAATGTATATTTGGTGATGTGGGCTTCTAGTGGTGATGCTTGTAA
AGCTTCAAGTTCTAAGCCCATATATATCGCTTTATATTTGTTTTCTACTTGAAATATGTT
ATGATTTCCTT

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DS 

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CGGGTGGGGCAGAAACTGAGTTTTGTGGTTAGGGTTAAGACTACGGAGGTGAAACTGTCA
CCAGGAGCGACAAGTGTTGAGACTGGTCATATAGTTTGGTCGGATGGGAAACGAAATGTG
ACAAGTCCCTTGGTGGTTACTCTTCAACAACCTTTGTGAAGGGGTTTTAGGACTTGGAGA
CCGGAAAGATTCTGGTCTCTTTGTTTTTATAACACGTGTAAGATCATAAGCTGTTGTTGT
TGTCTAATCTCTATGATCTTTGTTGGCTGTTCCTGTAATGTAAAATGTATCTTTTGCTGT
TTAAGATACATAATCCGTAGAAGCCCACAAGTCCCTTGGTGGTTACTCTTCAACAACCTT
TGTGAAGGGTTTTAGGATTTGAAGACCGGAAAACTTCTGGTCTCTTTGTTCTTATAACAT
GTGTAAGATCATAAGCTGTTGTTGTTGTCTAATATTTATGCTCTTTGTTGTCTGTTCCTG
TAATGTAAAATGTATATTTGGTGATGTGGGCTTCTAGTGGTGATGCTTGTAAAGCTTCAA
GTTCTAAGCCCATATATATCGCTTTATATTTGTTTTCTACTTGAAATATGTTATGATTTC
CTTAA

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 6

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ATCGCTTCTTACATCATCAAATCACTCCTCGAACTCGGACACACCGTTCGAACCACTGTC
CGAAACCCTCAGGATGAAGAGAAAGTAGGTTTCCTATGGGAACTGAGAGGAGCGAAAGAG
AGGCTGAAGATGTTCAAAGCTGATTTAACGGTTGATGGAAGCTTTGACGAAGCAGTAAAC
GGCGTAGATGGAGTATTCCACACGGCTTCTCCTGTTATTGTTCCACAGGATCAGAACATT
CAAGAAACACTGGTCGATCCTATCATAAAGGGTACAACCAACGTGATGAACTCTTGTGCC
AAGTCCAAAACCACTCTCAAAAGGATCGTTCTTACATCTTCTTGCTCCTCCATACGGTAC
CGCTTCGACGCCACCAAAGCCTCTCCGCTCAACGAGTCGCATTGGAGCGACACTGAATAC
TGCAAACGCTTCAACCTTTGGTACGCATATGCAAAGACTCTTGGTGAGAAAGAGGCTTGG
AGGATAGCTGAAGAGAAAGGGTTGAACTTAGTGGTTGTGAATCCTTCCTTTGTGGTTGGT
CCATTGCTTGGACCTAAACCAACAAGCACTCTTCTTTATATCCTCTCCGTTGTCAAAGGT
CTTGCTGTAGAGTACCGGAATTTTACGGTCGGGTTTGTCCACATAGACGATGTAGTTGGT
GCACATGTGTTAGCCATGGAAGAGCCTAAAGCATCAGGGAGAATCGTATGTTCGAGTTCG
GTTGCTCATTGGTCTGAGATCATTGAGTTGCTAAGAAACAAGTATCCTAATTACCCACTT
GAGAACAAGTGCAGTGACAAAGAAGGGGACAACAATCCACATAGTATGGATACAAGAAAG
ATACATGAGTTAGGATTTGCATCGTTCAAGTCATTGCCTGAAATGTTTGATGATTGTATC
CGCAGCTTTCAGGAGAAGGGTCTGCTCTGATGATAGTACCAAATCCATGTCGTTTTTGGA
TCGTGTTTTGTTACCGGTTGAAACACCTCTTTAGTTTGTGGTTCCAGTATATAATAATAA
AACTTAATAAGCTGGATTGATTAATCGCTTGCTCTAATCTTCTTGTATTAAAGAAAATTA
CCATGTCTTGTTTTTTTTAAACGAGACACCTCACACCTTGAAGCCTGAAGGGTTCAAATT
AAACCGAGCTCAAGCTAATGGGCCGAGAATCAAAACTTTCTTCTTGCCCAAACTCCATAC
AACCTCAATAGAAAATGTTATGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 
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35 35 0 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AA94TF U 2
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ACAGAGAAAGAGATGTCAGAGTATCTGGTCACTGGAGGAACTGGTTTTATCGCTTCTTAC
ATCATCAAATCACTCCTCGAACTCGGACACACCGTTCGAACCACTGTCCGAAACCCTCAG
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TTCAAAGCTGATTTAACGGTTGATGGAAGCTTTGACGAAGCAGTAAACGGCGTAGATGGA
GTATTCCACACGGCTTCTCCTGTTATTGTTCCACAGGATCAGAACATTCAAGAAACATTG
GTTGATCCTATCATAAAGGGTACAACCAACGTGATGAACTCTTGTGCCAAGTCCAAAACC
ACTCTCA***GGATTGTTCTTACATCTTCTTGCTCCTCCATACGGTACCGTTTCGATGCC
ACCAAAGCCTCTCCGCTCAACGAGTCGCATTGGAGCGACACTGAATACTGCAAACGCTTC
AACCTTTGGTACGCATATGCAAAGACTCTTGGTGAGAAAG

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DS 

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GGCACGGCAGGC
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ATCATCAAATCACTCCTCGAACTCGGACACACCGTTCGAACCACCGTCCGAAACCCTCAG
GATGAAGAGAAAATAGGTTTCCTATGGGATCTGAGAGGAGCGAAAGAGAGGCTGAAGATG
TTCAAAGCTGATTTAACGGTTGATGGAAGCTTTGACGAAGCAGTAAACGGCGTAGATGGA
GTCTTCCACACGGCTTCTCCTGTTCTCGTTCCACAGGATCACAATATTCAAGAAACACTG
GTCGATCCTATCATAAAGGGTACAACCAATGTGATGAACTCTTGTGCCAAGTCCAAAACC
ACTCTCAAAAGGATCGTTCTTACATCTTCTTGCTCCTCCATACGGTACCGCTTCGACGCC
ACCAAAGCCTCTCCGCTCAACGAGTCGCATTGGAGCGACACTGAATACTGCAAACGCTTC
AACCTTTGGTACGCATATGCAAAGACTCTTGGTGAGAAAGAGGCTTGGAGGATAGCTGAA
GAGAAAGGGTTGAACTTAGTGGTTGTGAATCCTTCCTTTGTGGTTGGTCCATTGCTTGGA
CCTAAACCAACAAGCACTCTTCTTTATATCCTCTCCGTTGTCAAAGGTCTTGCTGTAGAG
TACCGGAATTT

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DS 

RD RS1FC08TF 786 0 0
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ATCGCTTCTTACATCATCAAATCACTCCTCGAACTCGGACACACCGTTCGAACCACTGTC
CGAAACCCTCAGGATGAAGAGAAAGTAGGTTTCCTATGGGAACTGAGAGGAGCGAAAGAG
AGGCTGAAGATGTTCAAAGCTGATTTAACGGTTGATGGAAGCTTTGACGAAGCAGTAAAC
GGCGTAGATGGAGTATTCCACGCGGCTTCTCCTGTTATTGTTCCACAGGATCAGAACATT
CAAGAAACATTGGTTGATCCTATCATAAAGGGTACAACCAACGTGATGAACTCTTGTGCC
AAGTCCAAAACCACTCTCAAAAGGATTGTTCTTACATCTTCTTGCTCCTCCATACGGTAC
CGTTTCGATGCCACCAAAGCCTCTCCGCTCAACGAGTCGCATTGGAGCGACACTGAATAC
TGCAAACGCTTCAACCTTTGGTACGCATATGCAAAGACTCTTGGTGAGAAAGAGGCTTGG
AGGATAGCTGAAGAGAAAGGGTTGAACTTAGTGGTTGTGAATCCTTCCTTTGTGGTTGGT
CCATTGCTTGGACCTAAACCAACAAGCACTCTTCTTTATATCCTCTCCGTTGTCAAAGGT
CTTGCTGGAGAGTACCGGAATTTTACGGTCGGGTTTGTCCACATAGACGATGTAGTTGGT
GCACATGTGTTAGCCATGGAAGAGCCTAAAGCATCAGG*AGAATCGTATGTTCGAGTTCG
GT
GCTC

QA 1 782 1 782
DS 

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G
GAGAGGCTGAAGATGTTCAAAGCTGATTTAACGGTTGATGGAAGCTTTGACGAAGCAGTA
AACGGCGTAGATGGAGTATTCCACACGGCTTCTCCTGTTATTGTTCCACAGGATCAGAAC
ATTCAAGAAACATTGGTTGATCCTATCATAAAGGGTGCAACCAACGTGATGAACTCTTGT
GCCAAGTCCAAAACCACTCTCAAAAGGATTGTTCTTACATCTTCTTGCTCCTCCATACGG
TACCGTTTCGATGCCACCAAAGCCTCTCCGCTCAACGAGTCGCATTGGAGCGACACTGAA
TACTGCAAACGCTTCAACCTTTGGTACGCATATGCAAAGACTCTTGGTGAGAAAGAGGCT
TGGAGGATAGCTGAAGAGAAAGGGTTGAACTTAGTGGTTGTGAATCCTTCCTTTGTGGTT
GGTCCATTGCTTG*ACCTAAACCAACAAGCACTCTTCTTTATATCCTCTCCGTTGTCAAA
GGTCTTGCTGGAGAGTACCGGAATTTTACGGTCGGGTTTGTCCACATAGACGATGTAGTT
GGTGCACATGTGTTAGCCATGGAAGAGCCTAAAGCATCAGGGAGAATCGTATGTTCGAGT
TCGGTTGCTCATTGGTCTGAGATCATTGAGTTGCTAAGAAACAAGTATCCTAATTACCCA
CTTGAGAACAAGTGCAGTGACAAAGAAGGG*ACAACAATCCACATAGTATGGA

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DS 

RD RS1EO23JQ 815 0 0
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TCAAGAAACACTGGTCGATCCTATCATAAAGGGTACAACCAATGTGATGAACTCTTGTGC
CAAGTCCAAAACCACTCTCAAAAGGATCGTTCTTACATCTTCTTGCTCCTCCATACGGTA
CCGCTTCGACGCCACCAAAGCCTCTCCGCTCAACGAGTCGCATTGGAGCGACACTGAATA
CTGCAAACGCTTCAACCTTTGGTACGCATATGCAAAGACTCTTGGTGAGAAAGAGGCTTG
GAGGATAGCTGAAGAGAAAGGGTTGAACTTAGTGGTTGTGAATCCTTCCTTTGTGGTTGG
TCCATTGCTTGGACCTAAACCAACAAGCACTCTTCTTTATATCCTCTCCGTTGTCAAAGG
TCTTGCTGTAGAGTACCGGAATTTTACGGTCGGGTTTGTGCACATAGACGATGTAGTTGA
TGCACATGTGTTAGCCATGGAAGAGCCTAAAGCATCAGGGAGAACCGTGTGTTCGAGTTC
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GATACATGAGTTAGGATTTGCATCGTTCAAGTCATTGCCTGAAATGTTTGATGATTGTAT
CCGCAGTTTTCAGGAGAAGGGTTTGCTCTGATGATATTACCAAATCCATGTCGTTTTTGG
ATTGTGTTTTGTTACTGGTTGAAACACCTCTTTAGTTTGTGGTTCCAGTATATAATAATA
AAACTTAATAAGCTGGAT
CG

QA 16 813 16 813
DS 

RD RS1FB01JQ 612 0 0
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TCTGAGATCATTGAGTTGCTAAGAAACAAGTATCCTAATTACCCACTTGAGAACAAGTGC
AGTGACAAAGAAGGGGACAACAATCCACATAGTATGGATACAAGGAAGATACATGAGTTA
GGATTTGCATCGTTCAAGTCATTGCCTGAGATGTTTGATGATTGTATCCGCAGCTTTCAG
GAGAAGGGTCTGCTCTGATGATAGTACCAAATCCATGTCGTTTTTGGATCGTGTTTTGTT
ACCGGTTGAAACACCTCTTTAGTTTGTGGTTCCAGTATA**ATAATAAAACTTAATAAGC
TGGATTGATTAATCGCTTGCTCTAATCTTCTTGTATTAAAGAAAATTACCATGTCTTGTT
TTTTTTAAACGAGACACCTCACACCTTGAAGCCTGAAGGGTTCAAATTAAACCGAGCTCA
AGCTAATGGGCCGAGAATCAAAACTTTCTTCTTGCCCAAACTCCATACAACCTCAATAGA
AAATGTTATGTC

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 5

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TATTGAAATTGTAAAATGACACTTATTTTGAAAACAAAATAAAAAATCTAAAGTGACATT
TTTCTTGAAACAAATGAAGTACGTTTTTTTTATTCCATTAACTTATGTGGAAGGATCACA
GCCAATTCTTGCGAATGTCGAAGGTGTAGTTGTTCTCCAGGTAGCACTTATTGTCGTCGT
CCACGAACTTAGATTTAACGGAATAGGAGCCTCTAACAAGCATACCAGACGGTGCCGATT
CTTCAAACATGACATGGTTATACGGTTCCGCCTGTGGACTAAACGTTCCTAGCATCTCCT
TTCTACTATACACCTTGAGTCCGGTCTTCCAAACCGAATTACTGTACCGGAGGCCAGACA
CAATGTTGTTGGTCACACGGAAAGTAAATACAAGAGTGTACTTAGAGCCTTCTTTGAGAG
TAAACCATGGTTCTTTCGATGTCGGGTTTCCGTTTTCAGGCACCGTCAATACCATGTCTT
CTCTATCCGGTGACCTAATTGTTAAGTACATTATCTTTACCACCGGATCCGTAGTCTCTC
CAACCTCCTCCATATCCACACTGCCTAGAAGTTGTTCTTTCCATCTCCTCAAGCTTTCAT
CATCCTTGTCTTTCTCGAGCTGTTCTTTGAGGGCGATCATGGG*ACCAAGTTCAAGCTTC
TTCTCTACGTCTTCGTCGTCATCATCTGTCGGACAAAAAGAGCTGTGGCTGTTCTTTCTG
CTTAACGCCCCTTGTCCCTTTTGGTCTTCTGAAGTTTCTTCAGCTCTCTTCTCCTCCTCT
TTCAAAACCATCTTTGTTTTCTTGATATATATTGTTCTGATTTAATTTGGTTACTAGAAA
ATCCCCACTATTGGATTTGATTCAATACGATTTCCTGGAGATGAGGAGACAACCATTTAG
TCTTCCCCACAAAACAAAAGAATAAAGAGAGTTTAATTAAAGGGTTTGTTATTTTTTTTT
TGTACAAAGAATGAGAAGAAGGTAACAGGAAGAAAAACAAAGACAGTTAAATGATGTATC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 5 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GP75JQ U 40
AF RS1FA48JQ U 1
AF RS1BV28JQ U 192
AF RS1FA48TF C 275
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TAT
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AAAATCTAAAGTGACATTTTTCTTGAAACAGATGAAGTATGTTTTTTT*ATTCCATTAAC
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TACCAGACGGTGTCGATTCTTCAAACATGACATGGTTATACGGTTCCGCCTGTGGACTAA
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TAGAGCCTTCTTTGAGAGTAAACCATGGTTCTTTCGATGTCGGGTTTCCGTTTTCAGGCA
CCGT

QA 4 487 4 487
DS 

RD RS1FA48JQ 578 0 0
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TTTCTTGAAACAAATGAAGTACGTTTTTTTTATTCCATTAACTTATGTGGAAGGATCACA
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CCACGAACTTAAATTTAACGGAATAGGAGCCTCTAACAAGCATACCAAACGGTGCCGATT
CTTCAAACATGACATGGTTATACGGTTCCGCCTGTGGACTAAACGTTCCTAGCATCTCCT
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CTCTATCCGGTGACCTAATTGTTAAGTACATTATCTTT

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DS 

RD RS1BV28JQ 529 0 0
CGAAC
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GTTATACGGTTCCGCCTGTGGACTAAACGTTCCTAGCATCTCCTTTCTACTATACACCTT
GAGTCCGGTCTTCCAAACCGAATTACTGTACCGGAGGCCAGACACAATGTTGTTGGTCAC
ACGGAAAGTAAATACAAGAGTGTACTTAGAGCCTTCTTTGAGAGTAAACCATGGTTCTTT
CGATGTCGGGTTTCCGGTTTCAGGCACCGTCAATACCATGTCTTCTCTATCCGGTGACCT
AACTGTTAAGTACATTATCTTTACCACCGGATCCGTAGTCTCTCCAACCTCCTCCATATC
CACACTGCCTAGAAGTTGTTCTTTCCATCTCCTCAAGCTTTCATCATCCTTGTCTTTCTC
GAGCTGTTCTTTGAGGGCGATCATGGGGACCAAGTTCAAGCTTC

QA 6 529 6 529
DS 

RD RS1FA48TF 722 0 0
AACAAGCATACCAGACGGTGCCGATTCTTCAAACATGACATGGTTATACGGTTCCGC*TG
TGGACTAAACGTTCCTAGCATCTCCTTTCTACTATACACCTTGAGTCCGGTCTTCCAAAC
CGAATTACTGTACCGGAGGCCAGACACAATGTTGTTGGTCACACGGAAAGTAAATACAAG
AGTGTACTTAGAGCCTTCTTTGAGAGTAAACCATGGTTCTTTCGATGTCGGGTTTCCGTT
TTCAGGCACCGTCAATACCATGTCTTCTCTATCCGGTGACCTAATTGTTAAGTACATTAT
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TTCTTTCCATCTCCTCAAGCTTTCATCATCCTTGTCTTTCTCGAGCTGTTCTTTGAGGGT
GATCATGGG*ACCAAGTTCAAGCTTCTTCTCTACGTCTTCGTCGTCATCATCTGTCGGAC
AAAAAGAGCTGTGGCTGTTCTTTCTGCTTAACGCCCCTTGTCCCTTTTGGTCTTCTGAAG
TTTCTTCAGCTTTCTTCTCCTCCTCTTTCAAAACCATCTTTGTTTTCTTGATATATATTG
TTCTGATTTAATTTGGTTACTAGAAAATCCCCACTATTGGATTTGATTCAATACGATTTC
CTGGAGATGAGGAGACAACCATTTAGTCTTCCCCACAAAACAAAAGAATAAAGAGAGTTT
CC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RS1GP75TF 757 0 0
GT
GACTAAACGT*CCTAGCATCTCCTTTCTACTATACAC*TTGAGTCCGGTCTTCCAA*CCG
AATTACTGTACCGGAGGCCAGACACAATGTTGTTGGTCACACGGAAAGTAAATACAAGAG
TGTACTTAGAGCCTTCTTTGAGAGTAAACCATGGTTCTTTCGATGTCGGGTTTCCGTTTT
CAGGCACCGTCAATACCATGTCTTCTCTATCCGGTGACCTAATTGTTAAGTACATTATCT
TTACCACCGGATCCGTAGTCTCTCCAACCTCCTCCATATCCACACTGCCTAGAAGTTGTT
CTTTCCATCTCCTCAAGCTTTCATCATCCTTGTCTTTCTCGAGCTGTTCTTTGAGGGCGA
TCATGGG*ACCAAGTTCAAGCTTCTTCTCTTCGTCTTCGTCGTCATCATCTGTCGGACAA
AAAGAGCTGTGGCTGTTCTTTCTGCTTAACGCCCCTTGTCCCTTTTGGTCTTCTGAGGTT
TCTTCAGCTCTCTTCTCCTCCTCTTTCACAACCATCTTTGTTTTCTTGATATATATTGTT
CTGATTTAATTTGGTTACTAGAAAATCCCCACTATTGGATTTGATTCAATACGATTTCCT
GGAGATGAGGAGACAACCATTTAGTCTTCCCCACAAAACAAAAGAATAAAGAGAGTTTAA
TTAAAGGGTTTGTTATTTTTTTTTTGTACAAAGAATGAGAAGAAGGTAACAGGAAGAAAA
ACAAAGACAGTTAAATGATGTATCATGAGAGAGCC

QA 3 757 3 757
DS 



AS 1 2

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GAACAAGATCAATAGGCAAGTGACGTTTGCAAAGAGAAGGAATGGTCTTTTGAAGAAAGC
ATACGAGCTTTCCGTTCTATGTGATGCAGAGGTTGCTCTCATCATCTTCTCTAGTAGAGG
AAAACAGTACGAGTTTTGCAGCAGTTCGAGCATGCTTCGGACACTAGACAGGTACCAAAA
GTGCAACTATGGAGCTCCAGAGCCCAATGTGCCTTCAAGGGAAGCCTTAGCAGTTGTACC
TCCTCCCTTTATTTCTTAATTTTTTTCCTTACTTTTTTTTTGCTAAATTTTTTTTTCCTT
ACTTTCATTTGTTTCTGCTTAATTAAATAATTTTAATTGCTTTTATTATTTGAAAATCTT
GTAATGTTAACATATTTGGCAAGCAGGAACTTAATAGCCAGCATGAGTATCTCAAGCTTA
AGGAGCGTTACGACGCTTTACAGAGAACTCAAAGGAATCTATTGGGGGAAGATCTTGGAC
CTCTTAGTACAAAAGAGCTCGAGTCACTTGAGAGACAGCTTGACTCTTCTTTGAAGCAGA
TCAGAGCTCTCCGAACACAATTCATGCTCGACCAACTCAATGATCTTCAGAGTAAGGAAC
GCATGTTGGCTGAGACAAATAAAACTCTGAGGCTAAGGTTAGCTGATGGATATCAGATGC
CTCTCCAACTTAACCCGAACCCAGAAGATCATCACCATGTTGAGTACGGTCGTCATCAAC
AAGTACATGAACACTTTCAGCAAGCTTTCTTCCAGCCTTTGGAATGCGAACCCATTCTTC
AAATGGGGTATCAGGGGCAGCAAGATCATGGAATGGGAGCAGGACCAAGTGTGAACAATT
ACATGTTGGGTTGGCTACCTTATGACACCAACTCCATTTGAAACTTTCTTCCTTTTTCTG
TTCACTTTTTGACATTTTTATTTTAAAACTTTCTTTTGCTCTTTTAGGCTTCCATTATGA
TTTCCCCTCTCTATAGTCTCTTGTGTGCATGTGTGTGTGATGTTCTTTTTATGTTCGTCT
ACTATTCAATAATAAATTCAACATGATTTGCTACCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ES56TF U 1
AF RS1DC88JQ C 438
BS 1 621 RS1ES56TF
BS 622 1117 RS1DC88JQ

RD RS1ES56TF 621 0 0
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AAAACAGTACGAGTTTTGCAGCAGTTCGAGCATGCTTCGGACACTAGACAGGTACCAAAA
GTGCAACTATGGAGCTCCAGAGCCCAATGTGCCTTCAAGGGAAGCCTTAGCAGTTGTACC
TCCTCCCTTTATTTCTTAATTTTTTTCCTTACTTTTTTTTTGCTAAATTTTTTTTTCCTT
ACTTTCATTTGTTTCTGCTTAATTAAATAATTTTAATTGCTTTTATTATTTGAAAATCTT
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AGGAGCGTTACGACGCTTTACAGAGAACTCAAAGGAATCTATTGGGGGAAGATCTTGGAC
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DS 

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TTAGCAGTT
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CTTGAGAGACAGCTTGACTCTTCTTTGAAGCAGATCAGAGCTCTCCGAACACAATTCATG
CTCGACCAACTCAATGATCTTCAGAGTAAGGAACGCATGTTGGCTGAGACAAATAAAACT
CTGAGGCTAAGGTTAGCTGATGGATATCAGATGCCTCTCCAACTTAACCCGAACCCAGAA
GATCATCACCATGTTGAGTACGGTCGTCATCAACAAGTACATGAACACTTTCAGCAAGCT
TTCTTCCAGCCTTTGGAATGCGAACCCATTCTTCAAATGGGGTATCAGGGGCAGCAAGAT
CATGGAATGGGAGCAGGACCAAGTGTGAACAATTACATGTTGGGTTGGCTACCTTATGAC
ACCAACTCCATTTGAAACTTTCTTCCTTTTTCTGTTCACTTTTTGACATTTTTATTTTAA
AACTTTCTTTTGCTCTTTTAGGCTTCCATTATGATTTCCCCTCTCTATAGTCTCTTGTGT
GCATGTGTGTGTGATGTTCTTTTTATGTTCGTCTACTATTCAATAATAAATTCAACATGA
TTTGCTACCTC

QA 10 680 10 680
DS 



AS 1 6

CO CL1277Contig1 672 6 6 U
GGGATCCATCAACATTCTTTCGAACAGGAACCGCCTCTCTCTCTCTGTCTCTATTCATCC
TTGTTCATTGGAACATCCGAGACGACTTCTTCATCTTCAAGGTATCGGAAGCTAATATTT
TTGAGCCATGAGCACAGTGACCAGGCCTTCTTCTTCAGCGACAACCTCTGTCATCTTAGA
AACCCCTGTTTCTCAGTCACAGCCTACAGAAAGACTAGTGCTTCGGCTGAACAGGAAGAA
GAAGAAAGTCTCCTGGAAAGACGGCACAGTTGATAACGAGTTCATGCAGAAGAAGAGTTC
CAAGAAATGTTGCATCTTTCACAAACAGAAGCCCTTTGATGAGGATGACAGCGAAGAAGA
TGATGATGATAACCACCACGATCATGATCATGATCATGACCATGAACACTGCGAATCTGG
TGAGGCCTCTTCTTCTAACGGTTCCAAAGCAGCTAATTAATCAATTGAGAGTTTTTTTCA
CATCATAATATAGAGATATTTGAAGCTTTATAATATGTCATGGAAGAACACTTATTCGTC
TGAGGTTTTGGGTTCTCATGATTTTCTCTTCTTCTACTTGACACAGCAAC*ACTGGTTGG
GCTTTATTAGTATATGTAC*ATGTAATTTGCATATTGCACTGTAATGATATTATTCATTG
CAATGCTGATTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1F319JQ C 1
AF RS1F319TF U 1
AF RS1A429JQ C 27
AF RS1A429TF U 27
AF RS1A441JQ C 27
AF RS1A441TF U 27
BS 1 27 RS1F319TF
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BS 29 251 RS1F319TF
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BS 253 587 RS1F319TF
BS 588 672 RS1A429TF

RD RS1F319JQ 587 0 0
GGGATCCATCAACATTCTTTCGAACAGCAACCGCCTCTCTCTCTCTGTCTCTATTCATCC
TTGTTCATTGGAACATCCGAGACGACTTCTTCATCTTCAAGGTATCGGAAGCTAATATTT
TTGAGCCATGAGCACAGTGACCAGGCCTTCTTCTTCAGCGACAACCTCTGTCATCTTAGA
AACCCCTGTTTTTCAGTCACAGCCTACAGAAAGACTAGTGCTTCGGCTGAACAGGAAGAA
GAAGAAAGTCTTCTGGAAAGACGGCACAGTTGATAACGAGTTCATGCAGAAGAAGAGTTC
CAAGAAATGTTGCATCTTTCACAAACAGAAGCCCTTTGATGAGGATGACAGCGAAGAAGA
TGATGATGATAACCACCACGATCATGATCATGATCATGACCATGAACACTGCGAATCTGG
TGAGGCCTCTTCTTCTAACGGTTCCAAAGCAGCTAATTAATCAATTGAGAGTTTTTTTCA
CATCATAATATAGAGATATTTGAAGCTTTATAATATGTCATGGAAGAACACTTATTCGTC
TGAGGTTTTGGGTTCTCATGATTTTCTCTTCTTCTACTTGACACAGC

QA 1 587 1 587
DS 

RD RS1F319TF 587 0 0
GGGATCCATCAACATTCTTTCGAACAGCAACCGCCTCTCTCTCTCTGTCTCTATTCATCC
TTGTTCATTGGAACATCCGAGACGACTTCTTCATCTTCAAGGTATCGGAAGCTAATATTT
TTGAGCCATGAGCACAGTGACCAGGCCTTCTTCTTCAGCGACAACCTCTGTCATCTTAGA
AACCCCTGTTTCTCAGTCACAGCCTACAGAAAGACTAGTGCTTCGGCTGAACAGGAAGAA
GAAGAAAGTCTTCTGGAAAGACGGCACAGTTGATAACGAGTTCATGCAGAAGAAGAGTTC
CAAGAAATGTTGCATCTTTCACAAACAGAAGCCCTTTGATGAGGATGACAGCGAAGAAGA
TGATGATGATAACCACCACGATCATGATCATGATCATGACCATGAACACTGCGAATCTGG
TGAGGCCTCTTCTTCTAACGGTTCCAAAGCAGCTAATTAATCAATTGAGAGTTTTTTTCA
CATCATAATATAGAGATATTTGAAGCTTTATAATATGTCATGGAAGAACACTTATTCGTC
TGAGGTTTTGGGTTCTCATGATTTTCTCTTCTTCTACTTGACACAGC

QA 1 587 1 587
DS 

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GGAACCGCCTCTCTCTCTCTGTCTCTATTCATCCTTGTTCATTGGAACATCCGAGACGAC
TTCTTCATCTTCAAGGTATCGGAAGCTAATATTTTTGAGCCATGAGCACAGTGACCAGGC
CTTCTTCTTCAGCGACAACCTCTGTCATCTTAGAAACCCCTGTTTCTCAGTCACAGCCTA
CAGAAAGACTAGTGCTTCGGCTGAACAGGAAGAAGAAGAAAGTCTCCTGGAAAGACGGCA
CAGTTGATAACGAGTTCATGCAGAAGAAGAGTTCCAAGAAATGTTGCATCTTTCACAAAC
AGAAGCCCTTTGATGAGGATGACAGCGAAGAAGATGATGATGATAACCACCACGATCATG
ATCATGATCATGACCATGAACACTGCGAATCTGGTGAGGCCTCTTCTTCTAACGGTTCCA
AAGCAGCTAATTAATCAATTGAGAGTTTTTTTCACATCATAATATAGAGATATTTGAAGC
TTTATAATATGTCATGGAAGAACACTTATTCGTCTGAGGTTTTGGGTTCTCATGATTTTC
TCTTCTTCTACTTGACACAGCAACTACTGGTTGGGCTTTATTAGTATATGTACTATGTAA
TTTGCATATTGCACTGTAATGATATTATTCATTGCAATGCTGATTT

QA 1 646 1 646
DS 

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GGAACCGCCTCTCTCTCTCTGTCTCTATTCATCCTTGTTCATTGGAACATCCGAGACGAC
TTCTTCATCTTCAAGGTATCGGAAGCTAATATTTTTGAGCCATGAGCACAGTGACCAGGC
CTTCTTCTTCAGCGACAACCTCTGTCATCTTAGAAACCCCTGTTTCTCAGTCACAGCCTA
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CAGTTGATAACGAGTTCATGCAGAAGAAGAGTTCCAAGAAATGTTGCATCTTTCACAAAC
AGAAGCCCTTTGATGAGGATGACAGCGAAGAAGATGATGATGATAACCACCACGATCATG
ATCATGATCATGACCATGAACACTGCGAATCTGGTGAGGCCTCTTCTTCTAACGGTTCCA
AAGCAGCTAATTAATCAATTGAGAGTTTTTTTCACATCATAATATAGAGATATTTGAAGC
TTTATAATATGTCATGGAAGAACACTTATTCGTCTGAGGTTTTGGGTTCTCATGATTTTC
TCTTCTTCTACTTGACACAGCAAC*ACTGGTTGGGCTTTATTAGTATATGTAC*ATGTAA
TTTGCATATTGCACTGTAATGATATTATTCATTGCAATGCTGATTT

QA 1 646 1 646
DS 

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TTCTTCATCTTCAAGGTATCGGAAGCTAATATTTTTGAGCCATGAGCACAGTGACCAGGC
CTTCTTCTTCAGCGACAACCTCTGTCATCTTAGAAACCCCTGTTTCTCAGTCACAGCCTA
CAGAAAGACTAGTGCTTCGGCTGAACAGGAAGAAGAAGAAAGTCTCCTGGAAAGACGGCA
CAGTTGATAACGAGTTCATGCAGAAGAAGAGTTCCAAGAAATGTTGCATCTTTCACAAAC
AGAAGCCCTTTGATGAGGATGACAGCGAAGAAGATGATGATGATAACCACCACGATCATG
ATCATGATCATGACCATGAACACTGCGAATCTGGTGAGGCCTCTTCTTCTAACGGTTCCA
AAGCAGCTAATTAATCAATTGAGAGTTTTTTTCACATCATAATATAGAGATATTTGAAGC
TTTATAATATGTCATGGAAGAACACTTATTCGTCTGAGGTTTTGGGTTCTCATGATTTTC
TCTTCTTCTACTTGACACAGCAAC*ACTGGTTGGGCTTTATTAGTATATGTAC*ATGTAA
TTTGCATATTGCACTGTAATGATATTATTCATTGCAATGCTGATTT

QA 1 646 1 646
DS 

RD RS1A441TF 646 0 0
GGAACCGCCTCTCTCTCTCTGTCTCTATTCATCCTTGTTCATTGGAACATCCGAGACGAC
TTCTTCATCTTCAAGGTATCGGAAGCTAATATTTTTGAGCCATGAGCACAGTGACCAGGC
CTTCTTCTTCAGCGACAACCTCTGTCATCTTAGAAACCCCTGTTTCTCAGTCACAGCCTA
CAGAAAGACTAGTGCTTCGGCTGAACAGGAAGAAGAAGAAAGTCTCCTGGAAAGACGGCA
CAGTTGATAACGAGTTCATGCAGAAGAAGAGTTCCAAGAAATGTTGCATCTTTCACAAAC
AGAAGCCCTTTGATGAGGATGACAGCGAAGAAGATGATGATGATAACCACCACGATCATG
ATCATGATCATGACCATGAACACTGCGAATCTGGTGAGGCCTCTTCTTCTAACGGTTCCA
AAGCAGCTAATTAATCAATTGAGAGTTTTTTTCACATCATAATATAGAGATATTTGAAGC
TTTATAATATGTCATGGAAGAACACTTATTCGTCTGAGGTTTTGGGTTCTCATGATTTTC
TCTTCTTCTACTTGACACAGCAAC*ACTGGTTGGGCTTTATTAGTATATGTAC*ATGTAA
TTTGCATATTGCACTGTAATGATATTATTCATTGCAATGCTGATTT

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 5

CO CL1278Contig1 1159 5 25 U
GGGCGTCTCAAGACTTCGAACTCGACAATCCCTAATTCCCAAAACTCCCCTCTCGGATCT
CCAACAAGAGTGTGATTACGAAACGATGTCGTCTACAAGGGAAGAGAACGTGTACTTAGC
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CAAGACCGTTGACTCCGAGGAGCTCACCGTGGAAGAGAGGAACCTCTTGTCCGTCGCTTA
CAAGAACGTGATCGGTGCTAGGAGAGCTTCCTGGAGGATCATCTCTTCCATCGAGCAGAA
GGAAGAGAGCAGAGGGAACGAAGACCACGTGTCCATCATCAAGGACTACAGAGGGAAGAT
CGAGACCGAGCTCAGCAAGATCTGCGATGGGATCTTGAACCTTCTTGATTCTCACCTTGT
CCCCGCTGCGTCTTTGGCTGAGTCTAAAGTGCTTTATCTTAAGATGAAGGGAGATTACCA
TAGGTACCTTGCTGAGTTTAAGACTGGTGCTGAGAGGAAGGATGCTGCTGAGAACACTCT
CGTTGCTTACAAGTCTGCTCAGGATATTGCCCTTGCTGATTTACCTCCAACTCATCCGAT
TAGATTGGGACTTGCTCTTAACTTCTCTGTCTTCTACTATGAGATTCTCAACTCACCTGA
TCGTGCTTGCAATCTTGCCAAACAGGCTTTTGATGAAGCAATCTCTGAGCTGGACACATT
AGGAGAAGAATCATACAAGGACAGCACGCTCATAATGCAACTTCTCCGTGACAATCTGAC
CCTCTGGACTTCTGACATCAATGACGAGGCGGGTGG*TGATGAGATCAAGGAGGCGTCAA
AAGACGAGCCTGAAGAAGGGAAACAAGCCTAAAACCTTGAAACGACCAAAGCGAGCGAGG
GCATTACTTATGGGATTTGGCTGTAGTTTCTTAAAAACATATGATATGGGGTTTGTTGTT
TGTAGAAGCAGAGAGAAGATCATCATTTGATTTTCTCCTTTGCAAACTCTGAAACTCTGT
TTGGTCTTTCTTGTTTGGTTTTTTCTTCTAGTGTTTTTGAGTCTTTGGTTTTACTCCGTC
GCTTGTTATTATTTTGATTTCTTAGGAAGCGAAGAAACAAAACTTTCAATTATTGCTTTG
GATTCAACTCTTTTTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FW19TF U 7
AF RS1ES04TF U 5
AF RS1AI54TF U 1
AF RS1FW19JQ C 420
AF RS1AI54JQ C 707
BS 1 260 RS1AI54TF
BS 261 261 RS1FW19TF
BS 262 451 RS1AI54TF
BS 452 452 RS1FW19TF
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BS 686 686 RS1FW19JQ
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BS 801 801 RS1FW19JQ
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BS 1152 1159 RS1AI54JQ

RD RS1FW19TF 627 0 0
GG
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CGTCTTTGGCTGAGTCTAAAGTGCTTTATCTTAAGATGAAGGGAGATTACCATAGGTACC
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ACAAGTCTGCTCAGGATATTGCCCTTGCTGATTTACCTCCAACTCATCCGATTAGATTGG
GACTTGCTCTTAACTTCTCTGTCTT

QA 3 627 3 627
DS 

RD RS1ES04TF 677 0 0
GGCT
CAAGACTTCGAACTCGACAATCCCTAATTCCCAAAACTCCCCTCTCGGATCTCTAACAAG
AGTGTGATTAGGAAACGATGTCGTCTACACGAGAAGAGAACGTATACTTAGCCAAGTTAG
CGGAGCAAGCCGAGCGTTACGAGGAGATGGTTGAGTTCATGGAGAAAGTCGCCAAGACCG
TTGACTCCGAGGAGCTCACCGTGGAAGAGAGGAACCTCCTGTCCGTCGCTTACAAGAACG
TGATCGGCGCTAGGAGAGCTTCCTGGAGGATCATCTCTTCCATCGAGCAGAAGGAAGAGA
GCAGAGGGAACGAAGACCACGTGTCCATTATCAAGGACTACAGAGGGAAGATCGAGACAG
AGCTCAGCAAGATCTGCGATGGGATCTTGAACCTTCTTGATTCGCACCTTGTCCCCGCTG
CGTCTTTGGCTGAGTCCAAAGTGTTTTATCTTAAGATGAAGGGTGATTACCATAGGTACC
TTGCTGAGTTTAAGACTGGTGCTGAGAGGAAGGATGCTGCTGAGAACACTCTCGTTGCTT
ACAAGTCTGCTCAGGATATTGCACTTGCTGATTTACCTCCAACTCATCCGATTAGATTGG
GACTTGCTCTTAACTTCTCTGTCTTCTACTATGAGATTCTCAACTCACCTGATCGTGCTT
GCAATCTTGCCAA

QA 5 677 5 677
DS 

RD RS1AI54TF 838 0 0
GGGCGTCTCAAGACTTCGAACTCGACAATCCCTAATTCCCAAAACTCCCCTCTCGGATCT
CCAACAAGAGTGTGATTACGAAACGATGTCGTCTACAAGGGAAGAGAACGTGTACTTAGC
CAAGTTAGCGGAGCAAGCCGAGCGTTACGAGGAGATGGTTGAGTTCATGGAGAAAGTCGC
CAAGACCGTTGACTCCGAGGAGCTCACCGTGGAAGAGAGGAACCTCTTGTCCGTCGCTTA
CAAGAACGTGATCGGTGCTAAGAGAGCTTCCTGGAGGATCATCTCTTCCATCGAGCAGAA
GGAAGAGAGCAGAGGGAACGAAGACCACGTGTCCATCATCAAGGACTACAGAGGGAAGAT
CGAGACCGAGCTCAGCAAGATCTGCGATGGGATCTTGAACCTTCTTGATTCTCACCTTGT
CCCCGCTGCGTCTTTGGCTGAGTCTAAAGTGTTTTATCTTAAGATGAAGGGAGATTACCA
TAGGTACCTTGCTGAGTTTAAGACTGGTGCTGAGAGGAAGGATGCTGCTGAGAACACTCT
CGTTGCTTACAAGTCTGCTCAGGATATTGCCCTTGCTGATTTACCTCCAACTCATCCGAT
TAGATTGGGACTTGCTCTTAACTTCTCTGTCTTCTACTATGAGATTCTCAACTCACCTGA
TCGTGCTTGCAATCTTGCCAAACAG*CTTTTGATGAAGCAATCTCTGAGCTGGACACATT
AG*AGAAGAATCATACAAG*ACAGCACGCTCATAATGCAACTTCTCCGTGACA*TCTGAC
CCTCTGGACTTCTGACATCA*TGACGAGGCGGGTGGGTGATGAGATCAA
AGAGCGTCA

QA 1 829 1 829
DS 

RD RS1FW19JQ 732 0 0
TCCCCGCTGCGTCTTTGGCTGAGTCTAAAGTGCTTTATCTTAAGATGAAGGGAGATTACC
ATAGGTACCTTGCTGAGTTTAAGACTGGTGCTGAGAGGAAGGATGCTGCTGAGAACACTC
TCGTTGCTTACAAGTCTGCTCAGGATATTGCCCTTGCTGATTTACCTCCAACTCATCCGA
TTAGATTGGGACTTGCTCTTAACTTCTCTGTCTTCTACTATGAGATTCTCAACTCACCTG
ATCGTGCTTGCAATCTTGCCAAACAGGCTTTTGATGAAGCAATCTCTGAGCTGGACACAT
TAGGAGAAGAATCATACAAGGACAGCACGCTCATAATGCAACTTCTCCGTGACAATCTGA
CCCTCTGGACTTCTGACATCAATGACGAGGCGGGTGG*TGATGAGATCAAGGAGGCGTCA
AAAGACGAGCCTGAAGAAGGGAAACAAGCTTAAAACCTTGAAATGACCAAAGCGGGCGAG
GGCATTACTTATGGGATTTGGCTGTAGTTTCTTAAAAACATATGATATGGGGTTTGTTGT
TTGTAGAAGCAGAGAGAAGATCATCATTTGATTTTCTCCTTTGCAAACTCTGAAACTCTG
TTTGGTCTTTCTTGTTTGGTTTTTTCTTCTAGTGTTTTTGAGTCTTTGGTTTTACTCCGT
CGCTTGTTATTATTTTGATTTCTTAGGAAGCGAAGAAACAAAACTTTCAATTATTGCTTT
GGATTCAACTCT

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1AI54JQ 453 0 0
GAGCTGGACACATTAGGAGAAGAATCATACAAGGACAGCACGCTCATAATGCAACTTCTC
CGTGACAATCTGACCCTCTGGACTTCTGACATCAATGACGAGGCGGGTGG*TGATGAGAT
CAAGGAGGCGTCAAAAGACGAGCCTGAAGAAGGGAAACAAGCCTAAAACCTTGAAACGAC
CAAAGCGAGCGAGGGCATTACTTATGGGATTTGGCTGTAGTTTCTTAAAAACATATGATA
TGGGGTTTGTTGTTTGTAGAAGCAGAGAGAAGATCATCATTTGATTTTCTCCTTTGCAAA
CTCTGAAACTCTGTTTGGTCTTTCTTGTTTGGTTTTTTCTTCTAGTGTTTTTGAGTCTTT
GGTTTTACTCCGTCGCTTGTTATTATTTTGATTTCTTAGGAAGCGGAGAAACAAAACTTT
CAATTATTGCTTTGGATTCAACTCTTTTTTTAT

QA 1 453 1 453
DS 



AS 1 6

CO CL1279Contig1 1216 6 19 U
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AACACACAAATTCTTGATATTCCCTCAGGATCATCACACAACCAGTACCAAAGTATAAAT
ATAAAGAAATAAAACAAAAGGCAAAGGAAAAGGAAACAAATATGTTTTTT*ATCTGACTA
CACAACAGCAAATACAATGCAAAAGCATTTTTCTCTTGTGTTTTCTACTTTGATCATCTC
TCCTCTACTTGTTGCGCTTTTATTGTCCGCATCTTCTCCCTCCCAACTTGCCCTACTTGT
TTCTCTTTTGACACCTTTAGAAGACATCCGGATTGAATCTTTGCGGCATCATAGAGCTGC
CGTGTTCCATTTGCTCCAGTTGCAATTTCAATGCGTAATTATTCACCTCCAGATTTCTGA
CCTTCTCCTGGTACTGAGGAATCAGTTGCTTAAAAAATTCTAGCTGCTGGTTAGCATCTT
CTAAGGTCTTCTGCCGATCATGCTGGATAGCAACAGCACGTTTCAGCAATGTGTTGTCCT
TGACCAAGACCTCCACTTGTTGCTGCGCTACCACACTCTCCTCTTGGAATTTTTTGGCAG
CTTCATCGTGAGCACGTGCGCTTAACGTCTTCTCTAAAGCCTCAAGGACTCTTCCAGTAC
GGAGTTTCGCATCATCCGTGCCAGTAGACTGCGTGACTTCCCTCACTATCAATGAGACCC
AGTCATCAGCACTCGCTGGTGAAGCAGTCTCCTTATTAGCGGCAGCTCTTTCCTCCTCAG
CAGATACCAAAGCGTATAAGCTCTTCATAGCAGCATTTACGTCACTCCCATGTCCTTCCA
ACGCCTCCACAAGAACGGTGAGTTCAAGATGAGGAAAGGCAGTGCGAAGCTGATCGATCG
ATGAGGAAGGAGAGGAGGAGGACCAGCTTGGAGGATTGGAAGGGGAATAACATCGGAACC
TCTTCGAAGACGGAGGAGGAGAAGGAGTTTCTTCGAAGTAAGATCTCTTACTTCCGCAAT
ATACGGCAGACATGGCTGTGATGATAATCGACGGATGATGATTCGATCCGAATGAGCCCT
AAAATCTGAATTAAGTTAGGGTTTGGAGGAGGAAGGAGATGATTAGAGGCAAAGGTAACC
CCTCAGATCCGAGATTCGTGAGGAGCGTCCAAGTTTATCTATCAGGTTTTAGGTTTTTTG
ATGGGTTTTCTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CQ62JQ U 1
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ATAAAGAAATAAAACAAAAGGCAAAGGAAAAGGAAACAAATATGTTTTTT*ATCTGACTA
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TCCTCTACTTGTTGCGCTTTTATTGTCCGCATCTTCTCCCTCCCAACTTGCCCTACTTGT
TTCTCTTTTGACACCTTTAGAAGACATCCGGATTGAATCTTTGCGGCATCATAGAGCTGC
CGTGTTCCATTTGCTCCTGTTGCAATTTCAATGCGTAATTATTCACCTCCAGATTTCTGA
CCTTCTCCTGGTACTGAGGAATCAGTTGCTTAAAAAATTCTAGCTGCTGGTTAGCATCTT
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TGACCAAGACCTCCACTTGTTGCTGCGCTACCACACTCTCCTCTTGGAATTTTTTGGCAG
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GGAGTTTCGCATCATCCGTGCCAGTAGACTGCGTGACTTCCCTCACTATCAATGAGACCC
AGTCATCAGCACTCGCTGGTGAA

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CAC
CACACAACCAGTACCAAAGTATAAATATAAAGAAATAAAACAAAAGGCAAAGGAAAAGGA
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CTTGTGTTTTCTACTTTGGTCATCTCTCCTCTACTTGTTGCGCTTTTATTGTCCGCATCT
TCTCCCTCCCAACTTGCCCTACTTGTTTCTCTTTTGACACCTTTAGAAGACATCCGGATT
GAATCTTTGCGGCATCATAGAGCTGCCGTGTTCCATTTGCTCCAGTTGCAATTTCAATGC
GTAATTATTCACCTCCAGATTTCTGACCTTCTCCTGGTACTGAGGAATCAGTTGCTTAAA
AAATTCTAGCTGCTGGTTAGCATCTTCTAAGGTCTTCTGCCGATCATGCTGGATAGCAAC
AGCACGTTTCAGCAATGTGTTGTCCTTGACCAAGACCTCCACTTGTTGCTGCGCTACCAC
ACTCTCCTCTTGGAATTTTTTGGCAGCTTCATCGTGAGCACGTGCGCTTAACGTCTTCTC
TAAAGCCTCAAGGACTCTTCCAGTACGGAGTTTCGCATCATCCGTGCCAGTAGACTGCGT
GACTTCCCTCACTATCAATGAGACCCAGTCATCAGCACTCGCTGGTGAAGCAGTCTCCTT
ATTAGCGGCAGCTCTTTCCTCCTCAGCAGATA

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GGCAAAGGAAAAGGAAACAAATATGTTTTTT*ATCTGACTACACAACAGCAAATACAATG
CAAAAGCATTTTTCTCTTGTGTTTTCTACTTTGATCATCTCTCCTCTACTTGTTGCGCTT
TTATTGTCCGCATCTTCTCCCTCCCAACTTGCCCTACTTGTTTCTCTTTTGACACCTTTA
GAAGACATCCGGATTGAATCTTTGCGGCATCATAGAGCTGCCGTGTTCCATTTGCTCCAG
TTGCAATTTCAATGCGTAATTATTCACCTCCAGATTTCTGACCTTCTCCTGGTACTGAGG
AATCAGTTGCTTAAAAAATTCTAGCTGCTGGTTAGCATCTTCTAAGGTCTTCTGCCGATC
ATGCTGGATAGCAACAGCACGTTTCAGCAATGTGTTGTCCTTGACCAAGACCTCCACTTG
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GCTTTTCATAGCAGCATTTACGTCACTCCCATGTCCTTCCAACGCC

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TCACACAACCAGTACCAAAGTATAAATATAAAGAAATAAAACAAAAGGCAAAGGAAAAGG
AAACAAATATGTTTTTT*ATCTGACTACACAACAGCAAATACAATGCAAAAGCATTTTTC
TCTTGTGTTTTCTACTTTGATCATCTCTCCTCTACTTGTTGCGCTTTTATTGTCCGCATC
TTCTCCCTCCCAACTTGCCCTACTTGTTTCTCTTTTGACACCTTTAGAAGACATCCGGAT
TGAATCTTTGCGGCATCATAGAGCTGCCGTGTTCCATTTGCTCCAGTTGCAATTTCAATG
CGTAATTATTCACCTCCAGATTTCTGACCTTCTCCTGGTACTGAGGAATCAGTTGCTTAA
AAAATTCTAGCTGCTGGTTAGCATCTTCTAAGGTCTTCTGCCGATCATGCTGGATAGCAA
CAGCACGTTTCAGCAATGTGTTGTCCTTGACCAAGACCTCCACTTGTTGCTGCGCTACCA
CACTCTCCTCTTGGAATTTTTTGGCAGCTTCATCGTGAGCACGTGCGCTTAACGTCTTCT
CTAAAGCCTCAAGGACTCTTCCAGTACGGAGTTTCGCATCATCCGTGCCAGTAGACTGCG
TGACTTCCCTCACTATAAATGAGACCCAGTCATCAGCACTCGCTGGTGAAGCAGTCTCCT
TATTAGCGGCAGCTCTTTCCTCCTCAGCAGATACCAAAGCGTATAAGCTTTTCATAGCAG
CATTTACGTCACTCCCATGTCCTTCCAACGCCTCCACAAGAACGGTGAGTTCAAGAT

QA 1 837 1 837
DS 

RD RS1CQ62TF 840 0 0
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GCGTAATTATTCAC*TCCAGATTTCTGAC*TTCTCCTGGTACTGAGGAATCAGTTGCTTA
AAAAATTCTAGCTGCTGGTTAGCATCTTCTAAGGTCTTCTGCCGATCATGCTGGATAGCA
ACAGCACGTTTCAGCAATGTGTTGTCCTTGACCAAGACCTCCACTTGTTGCTGCGCTACC
ACACTCTCCTCTTGGAATTTTTTGGCAGCTTCATCGTGAGCACGTGCGCTTAACGTCTTC
TCTAAAGCCTCAAGGACTCTTCCAGTACGGAGTTTCGCATCATCCGTGCCAGTAGACTGC
GTGACTTCCCTCACTATCAATGAGACCCAGTCATCAGCACTCGCTGGTGAAGCAGTCTCC
TTATTAGCGGCAGCTCTTTCCTCCTCAGCAGATACCAAAGCGTATAAGCTCTTCATAGCA
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GGAAAGGCAGTGCGAAGCTGATCGATCGATGAGGAAGGAGAGGAGGAGGACCAGCTTGGA
GGATTGGAAGGGGAATAACATCGGAACCTCTTCGAAGACGGAGGAGGAGAAGGAGTTTCT
TCGAAGTAAGATCTCTTACTTCCGCAATATACGGCAGACATGGCTGTGATGATAATCGAC
GGATGATGATTCGATCCGAATGAGCCCTAAAATCTGAATTAAGTTAGGGTTTGGAGGAGG
AAGGAGATGATTAGGGGCAAAGGTAGCCCCTCAGATCCGAGATTCGTGAGGAGCGTCC
CC

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DS 

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ACTTGTTGCTGCGCTACCACACTCTCCTCTTGGAATTTTTTGGCAGCTTCATCGTGAGCA
CGTGCGCTTAACGTCTTCTCTAAAGCCTCAAGGACTCTTCCAGTACGGAGTTTCGCATCA
TCCGTGCCAGTAGACTGCGTGACTTCCCTCACTATCAATGAGACCCAGTCATCAGCACTC
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TATAAGCTCTTCATAGCAGCATTTACGTCACTCCCATGTCCTTCCAACGCCTCCACAAGA
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GAGGAGGACCAGCTTGGAGGATTGGAAGGGGAATAACATCGGAACCTCTTCGAAGACGGA
GGAGGAGAAGGAGTTTCTTCGAAGTAAGATCTCTTACTTCCGCAATATACGGCAGACATG
GCTGTGATGATAATCGACGGATGATGATTCGATCCGAATGAGCCCTAAAATCTGAATTAA
GTTAGGGTTTGGAGGAGGAAGGAGATGATTAGAGGCAAAGGTAACCCCTCAGATCCGAGA
TTCGTGAGGAGCGTCCAAGTTTATCTATCAGGTTTTAGGTTTTTTGATGGGTTTTCTTTT
CC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 5

CO CL1280Contig1 918 5 7 U
GCAAGACGAGTCATCCTTTTGTCCTTTTTAAAATCAAAACCCAACAAGTCATTCAATGAA
GATGTTTCATTGTACAATGAATAGACAGGTTTTGACCAAGTCACCAAGTATATATACAGT
GCATATATAGTCAGATGACACAGCACTTTTTATTTTTACATGATTTGAATGCGAAAACAG
GTAAAAAGCACTTGGGATGATCAGATGAAATGGAATAAGATCATCTTGAATCTCTGGCTA
CCTTTCTACCTTGTGTGGTTGAACCAGAGAATCAATAATCTTTTTCCATCCTCTAAAATC
CGAAGGAGAATCATCATCTGCCAACTTGAACCCGTTCACGTAGAAGGTTGGTGTTCCATA
AACACCTCTTGAAGCGCTATACTTGAATGAAACTCTGGTTGCACGTTCCGACTTGGTGTC
GTTGAATCCAGATTTGAGAAGATGATGATACGAGTTTCCCAACGTGGATGTTCCAAGATT
GACAATTCTTCCCACAACTTGAGGTCTTGTCAGGAGTTGTGTTTTTGCACCGTAAAACAT
TGCCTGATGCTTAAAGAACCCTTCAAGCAAACCGAAGGTAGCGCTGGCGTTAAAAGTATT
CACAATGTGTAAAGCACGAGAGGTTACATACGCATTGTCATGGTACGGTAACGGAAGGAG
GTGGAGGAGAAGGGACACGCGAGATCCATAGTGTTTAAGCGCTTGCTTCAGCGGCGGCCA
AGAGTCTCTACTGTACGGGCAAACCGGGTCATAAAACGCCTCGATCAGTATAGTATCCGG
GCCAACACGATGACGACCCGGTGGGTAAGCGAAACCATCGGGCCTCGCCGGCGGAATTAG
TTGCGTGTTGACTTGCGTTCCGATGAAGAAGACAAGGAAGAGGAAAATGGTTCTGATCAT
TATTTTCTAGCTCTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G039JQ U 21
AF RS1DJ15JQ U 160
AF RS1BM50JQ U 1
AF RS1BM50TF C 67
AF RS1DJ15TF C 246
BS 1 467 RS1BM50JQ
BS 468 468 RS1DJ15JQ
BS 469 755 RS1BM50JQ
BS 756 763 RS1BM50TF
BS 764 764 RS1DJ15TF
BS 765 867 RS1BM50TF
BS 868 918 RS1DJ15TF

RD RS1G039JQ 412 0 0
GC
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AGACAGGTTTTGACCAAGTCACCAAGTATATATACAGTGCATACATAGTCAGATGACACA
GCACTTTTTATTTTTACATGATTTGAATGCGAAAACAGGTAAAGAGCACTTGGGATGATC
AGATGAAATGGAATAAGATCATCTTGAATCTCTGGCTACCTTTCTACCTTGTGTGGTTGA
ACCAGAAAATCAATAATCTTTTTCCATCCTCTAAAATCCGAAGGAGAATCATCATCTGCC
AACTTGAACCCGTTAACGTAGAAGGTTGGTGTTCCATAAACACCTCTTGAAGCGCTATAC
TTGAATGAAACCCTGGTAGCACGCTCCGACTTGGTGTCGTTGAATCCAGA

QA 3 412 3 412
DS 

RD RS1DJ15JQ 471 0 0
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ATCATCTTGAATCTCTGGCTACCTTTCTACCTTGTGTGGTTGAACCAAAAAATCAATAAT
CTTTTTCCATCCTCTAAAATCCGAAGGAAAATCATCATCTGCCAACTTGAACCCGTTCAC
GTAAAAGGTTGGTGTTCCATAAACACCTCTTGAAGCGCTATACTTGAATGAAACTCTGGT
TGCACGTTCCGACTTGGTGTCGTTGAATCCAGATTTGAAAAAATGATGATACGAGTTTCC
CAACGTGGATGTTCCAAGATTGACAATTCTTCCCACAACTTGAGGTCTTGTCAGGAGTTG
TGTTTTTGCACCGTAAAACATTGCCTGATGCTTAAAGAACCCTTCAAGCAAACCGAAGGT
AGCGCTGGCGTTAAAAGTATTCACAATGTGTAAAGCACGAGAGGTTACATA

QA 1 471 1 471
DS 

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GATGTTTCATTGTACAATGAATAGACAGGTTTTGACCAAGTCACCAAGTATATATACAGT
GCATATATAGTCAGATGACACAGCACTTTTTATTTTTACATGATTTGAATGCGAAAACAG
GTAAAAAGCACTTGGGATGATCAGATGAAATGGAATAAGATCATCTTGAATCTCTGGCTA
CCTTTCTACCTTGTGTGGTTGAACCAGAGAATCAATAATCTTTTTCCATCCTCTAAAATC
CGAAGGAGAATCATCATCTGCCAACTTGAACCCGTTCACGTAGAAGGTTGGTGTTCCATA
AACACCTCTTGAAGCGCTATACTTGAATGAAACTCTGGTTGCACGTTCCGACTTGGTGTC
GTTGAATCCAGATTTGAGAAGATGATGATACGAGTTTCCCAACGTGGCTGTTCCAAGATT
GACAATTCTTCCCACAACTTGAGGTCTTGTCAGGAGTTGTGTTTTTGCACCGTAAAACAT
TGCCTGATGCTTAAAGAACCCTTCAAGCAAACCGAAGGTAGCGCTGGCGTTAAAAGTATT
CACAATGTGTAAAGCACGAGAGGTTACATACGCATTGTCATGGTACGGTAACGGAAGGAG
GTGGAGGAGAAGGGACACGCGAGATCCATAGTGTTTAAGCGCTTGCTTCAGCGGCGGCCA
AGAGTCTCTACTGTACGGGCAAACCGGGTCATAAA

QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1BM50TF 801 0 0
TCATTGTACAATGAATAGACAGGTTT*GACCAAGTCACCAAGTATATATACAGTGCATAT
ATAGTCAGATGACACAGCACTTTTTATTTTTACATGATTTGAATGCGAAAACAGGTAAAA
AGCACTTGGGATGATCAGATGAAATGGAATAAGATCATCTTGAATCTCTGGCTACCTTTC
TACCTTGTGTGGTTGAACCAGAGAATCAATAATCTTTTTCCATCCTCTAAAATCCGAAGG
AGAATCATCATCTGCCAACTTGAACCCGTTCACGTAGAAGGTTGGTGTTCCATAAACACC
TCTTGAAGCGCTATACTTGAATGAAACTCTGGTTGCACGTTCCGACTTGGTGTCGTTGAA
TCCAGATTTGAGAAGATGATGATACGAGTTTCCCAACGTGGCTGTTCCAAGATTGACAAT
TCTTCCCACAACTTGAGGTCTTGTCAGGAGTTGTGTTTTTGCACCGTAGAACATTGCCTG
ATGCTTAAAGAACCCTTCAAGCAAACCGAAGGTAGCGCTGGCGTTAAAAGTATTCACAAT
GTGTAAAGCACGAGAGGTTACATACGCATTGTCATGGTACGGTAACGGAAGGAGGTGGAG
GAGAAGGGACACGCGAGGTCCATAGTGTTTAAGCGCTTGCTTCAGCGGCGGCCAAGAGTC
TCTACTGTACGGGCAAACCGGGTCATAAAACGCCTCGGTCAGTATAGTATCCGGGCCAAC
ACGATGACGACCCGGTGGGTAAGCGAAACCATCGGGCCTCGCCGGCGGAATTAGTTGCGT
GTTGACTTGCGTTCCGATGAA

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DS 

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TCTA
CTTGTGTGGT*GAACCAGAGAATCAATAATCTTTTTCCATCCTCTAAAATCCGAAGGAGA
ATCATCATCTGCCAACTTGAACCCGTTCACGTAGAAGGTTGGTGTTCCATAAACACCTCT
TGAAGCGCTATACTTGAATGAAACTCTGGTTGCACGTTCCGACTTGGTGTCGTTGAATCC
AGATTTGAGAAGATGATGATACGAGTTTCCCAACGTGGATGTTCCAAGATTGACAATTCT
TCCCACAACTTGAGGTCTTGTCAGGAGTTGTGTTTTTGCACCGTAGAACATTGCCTGATG
CTTAAAGAACCCTTCAAGCAAACCGAAGGTAGCGCTGGCGTTAAAAGTATTCACAATGTG
TAAAGCACGAGAGGTTACATACGCATTGTCATGGTACGGTAACGGAAGGAGGTGGAGGAG
AAGGGACACGCGAGATCCATAGTGTTTAAGCGCTTGCTTCAGCGGCGGCCAAGAGTCTCT
ACTGTACGGGCAAACCGGGTCATAAAACGCCTCGATCAGTATAGTATCCGGGCCGACACG
ATGACGACCCGGTGGGTAAGCGAAACCATCGGGCCTCGCCGGCGGAATTAGTTGCGTGTT
GACTTGCGTTCCGATGAAGAAGACAAGGAAGAGGAAAATGGTTCTGATCATTATTTTCTA
GCTCTTTCC

QA 5 673 5 673
DS 



AS 1 6

CO CL1281Contig1 698 6 10 U
GTCATCATCTAAGACAAATAATATTATATCAAGAAAATACAAATATATCTCTCCCATAAC
CAAATAGAAAAAA*CAACAGACCATCATGACACTGATTAAAGATGGGTCTCTCTAAACCT
CATCTTCATCAACCTGATACTTCTTAATCAACTCAGAGCAAAACACATCAGAAACATCTT
TCTCAAACCCCATGTTGTTAGCGTGCCTGATCTGCGAGGCAATGCCATTGTAATGGTTCA
ATATCACACGCGACTGTTCACGCCCCCTCGAGATTTTAGAACAACCCTTGTCTGAGCTTT
TGACAAGCATAACGTCGCACATCTCGTCTTTATGGTCCTCGTGGACAACGAACATGTACT
TTCCCTTCCTGTTTGATACAGCTACGTCTGTGTATAACTCTTTCATTGTCTTCCTGTCTC
TGCACGAAAGCTTCACCGTCGCACCGGGGACGGGGTAGGAGGATTCAGCAGTCTCGAAGC
CGAACTTGCAAGTGTCACAGTAAGTGATACCTTGAACCACCAACGTGTTCTTACCGATAC
GTGGCACCTTCGCCGCCATGGCTATCGCCGGCAAGATACAGAGAACCATCAGCATCGCTA
GTTTCGCCATTTTTGCCAAAGAGAAGACGTACAAGTGAGGGAGAGATGAGAGGAGGACGC
ACAGAGATATTAGTGAAATTTTAAGACAGCGAATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 20 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1FR20JQ U 1
AF RS1GX17JQ U 5
AF RS1E538JQ U 5
AF RS1GX17TF C 323
AF RS1E538TF C 138
AF RS1FR20TF C 8
BS 1 169 RS1FR20JQ
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BS 171 217 RS1FR20JQ
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BS 513 574 RS1FR20JQ
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RD RS1FR20JQ 574 0 0
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CAAATAGAAAAAA*CAACAGACCATCATGACACTGATTAAAGATGGGTCTCTCTAAACCT
CATCTTCATCAACCTGATACTTCTTAATCAACTCAGAGCAAAACACATCTGAAACATCTT
TCTCAAACCCCATGTTGTTAGCGTGCCTGATCTGCGACGCAATGCCATTGTAGTGGTTCA
ATATCACACGCGACTGTTCACGCCCCCTCGAGATTTTAGAACAACCCTTGTCTGAGCTTT
TGACAAGCATAACGTCGCACATCTCGTCTTTATGGTCCTCGTGGACAACGAACATGTACT
TTCCCTTCCTGTTTGATACAGCTACGTCTGTGTATAACTCTTTCATTGTCTTCCTGTCTC
TGCACGAAAGCTTCACCGTCGCACCGGGGACGGGGTAGGAGGATTCAGCAGTCTCGAAGC
CGAACTTGCAAGTGTCACAGTAAGTGATACCCTGAACCACCAACGTGTTCTTACCGATAC
GTGGCACCTTCGCCGCCATGGCTATCGCCGGCAA

QA 1 574 1 574
DS 

RD RS1GX17JQ 578 0 0
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ATGGCTATCGCCGGCAAGATACAGA

QA 14 578 14 578
DS 

RD RS1E538JQ 694 0 0
CATCTAATTTCTC
ATAATATTATATCAAGAAAATACAAATATATATCTCCCATAACCAAATAGAAAAAAACAA
CAGACCGTCATGACACTGATTAAAGATGGGTCTCTCTAAACCTCATCTTCATCAACCTGA
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QA 14 694 14 694
DS 

RD RS1GX17TF 376 0 0
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TATCGCCGGCAAGATACAGAGAACCATCAGCATCGCTAGTTTCGCCATTTTTGCCAAAGA
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AAGACAGCGAATCTCC

QA 1 376 1 376
DS 

RD RS1E538TF 561 0 0
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ATTTTAAGACAGCGAATCTCC

QA 1 561 1 561
DS 

RD RS1FR20TF 691 0 0
TCTAAGACAA
ATAATATTATATCAAGAAAATACAAATATATCTCTCCCATAACCAAATAGAAAAAA*CAA
CAGACCATCATGACACTGATTAAAGATGGGTCTCTCTAAACCTCATCTTCATCAACCTGA
TACTTCTTAATCAACTCAGAGCAAAACACATCTGAAACATCTTTCTCAAACCCCATGTTG
TTAGCGTGCCTGATCTGCGACGCAATGCCATTGTAGTGGTTCAATATCACACGCGACTGT
TCACGCCCCCTCGAGATTTTAGAACAACCCTTGTCTGAGCTTTTGACAAGCATAACGTCG
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ACAGCTACGTCTGTGTATAACTCTTTCATTGTCTTCCTGTCTCTGCACGAAAGCTTCACC
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CAGTAAGTGATACCCTGAACCACCAACGTGTTCTTACCGATACGTGGCACCTTCGCCGCC
ATGGCTATCGCCGGCAAGATTCAGAGAACCATCAGCATCGCTAGTTTCGCCATTTTTGCC
GAAGAGAAGACGTACAAGTGAGGGAGAGATGAGAGGAGGACGCACAGAGATATTAGTGAA
ATTTTAAGACAGCGAATCTCC

QA 11 691 11 691
DS 



AS 1 6

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CAATAAAACTCGCCTTTCTAATTCTATGCATCGCCCTAACCGCAACTGGATTTATAATCC
CAGCCAAACGTGACGCCGTCACACCGCAACACCTGAAAACCGTCGCAGGGATCTGCGGCG
TTGTCCAAGACAAACGTCTCTGTAGCATAACCCTGAACACTGTACCAAGCAATGACCCCG
ACGTTTTGGTCCGTCACTTAGCGACGGCTGCAGAAACCTCGGTTAAAAAGGGCTTGAAGT
TCCTCTCTGGAATCAAACCCAAGTACAAGGGAGACAAATTTGCCACAACTTGCATCACCA
GTTGCGAGAAACAGCTAAACAACGCCTTGGAAGACTTTTCAGATTTCTGGAAAGCCGCTG
GAAAAGACATCAAGAGCATGGCCGATAATTACTTCACATGCAAGAAGAAGATGACATCGA
TCTTCAACTACCAATCGACTTGTCTCGATGACATTTATGACAAAACGTTGTTGAAAGAGG
TTCAAGGAGGGATTGGGCTCGGGAAAAGAATGAGTGGCGAGTCTGTGGATGTGTTCGCTG
GAATGGGCAAAGTCTTTAACACTCTTAACATTAAGACCAAACTTAACCAGAAAGATACCG
ATTCGTTGCTCCCACCACCTTTGTCATTTTACTACTACTGATCTATTTATTGAAGAAAAA
GCATGGCATCGTCTATGGTGATGAATAATCTGCATCTTTCGGGTTTTTTTTTTCAGTTAT
GTTAGGAATCTTGTAAAGAAAGGTTCCTTCTAATGTATGTTTGTGATTAATACGTTATGG
GTGATAATCATGTATGGACCTCGTGGTTGGAAAGGATATGGACAAATGTGATTATATAAT
ATTAATAACATATTTGGTATAATGCCTTTTATGTATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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AF RS1B133TF U 420
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QA 1 472 1 472
DS 

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G
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ATTCTATGCATCGCCCTAACTGCAACTGGATTTATAATCCCAGCCAAACGTGACGCCGTC
ACACCGCAACACCTGAAAACCGTCGCAGGGATCTGCGGCGTTGTCCAAGACAAACGTCTC
TGTAGCATAACCCTGAACACTGTACCAAGCAATGACCCCGACGTTTTGGTCCGTCACTTA
GCGACGGCTGCAGAAACCTCGGTTAAAAAGGGCTTGAAGTTCCTCTCTGGAATCAAACCC
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TGTCTCGATGACATCTATGACAAAACGTTGTTGAAAGAAGTTCAAGGAGGGATTGGGCTT
GGGAAAAGAATGAGTGGCGAGTCTGTAGATGTGTTCGCTGGAATGGGCAAAGTATTTAAC
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ATGAATAATCTGCATCTTT

QA 2 740 2 740
DS 

RD RS1A595JQ 742 0 0
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AATTTGCCACAACTTGCATCACCAGTTGCGAGAAACAGCTAAACAACGCCTTGGAAGACT
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ATGACAAAACGTTGTTGAAAGAAGTTCAAGGAGGGATTGGGCTTGGGAAAAGAATGAGTG
GCGAGTCTGTAGATGTGTTCGCTGGAATGGGCAAAGTATTTAACACTTTTAACATTAAGA
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TTTTGGGTTTTTTTTT*CAGTTATGTTAGGAATCTTGTAAAGAAAGGTTCCTTTTAATGT
ATGTTTGTGATTAATACGTTATGGGTGATAATCATGTATGGACCTCGTGGTTGGAAAGGA
TATGGACAAATGTGATTATAT
G

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1DX15JQ 701 0 0
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ATTTGCCACAACTTGCATCACCAGTTGCGAGAAACAGCTAAACAACGCCTTGGAAGACTT
TTCAGATTTCTGGAAAGCCGCTGGAAAAGACATCAAGAGCATGGCCGATAATTACTTCAC
ATGCAAGAAGAAGATGACATCGATCTTCAACTACCAATCGACTTGTCTCGATGACATTTA
TGACAAAACGTTGTTGAAAGAGGTTCAAGGAGGGATTGGGCTCGGGAAAAGAATGAGTGG
CGAGTCTGTGGATGTGTTCGCTGGAATGGGCAAAGTCTTTAACACTCTTAACATTAAGAT
CAAACTTAACCAGAAAGATACCGATTCGTTGCTCCCACCACCTTTGTCATTTTACTACTA
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TTTGGGTTTTTTTTTTCAGTTATGTTAGGAATCTTGTAAAGAAAGGTTCCTTCTAATGTA
TGTTTGTGATTAATACGTTATGGGTGATAATCATGTATGGACCTCGTGGTTGGAAAGGAT
ATGGACAAATGTGATTATATAATATTAATAATATATTTGG
C

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DS 

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DS 

RD RS1B133TF 519 0 0
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ATCTTCAACTACCAATCGACTTGTCTCGATGACATCTATGACAAAACGTTGTTGAAAGAG
GTTCAAGGAGGGATTGGGCTCGGGAAAAGAA*GAGTGGCGAGTCTGTGGATGTGTTCGCT
GGAATGGTCAAAGTCTTTAACACTCTTAACATTAAGACCAAACTTAACCAGAAAGATACC
GATTCGTTGCTCCCACCACCTTTGTCATTTTACTACTACTGATCTATTTATTGAAGAAAA
AGCATGGCATCGTCTATGGTGATGAATAATCTGCATCTTTCGGGTTTTTTTTTTCAGTTA
TGTTAGGAATCTTGTAAAGAAAGGTTCCTTCTAATGTATGTTTGTGATTAATACGTTATG
GGTGATAATCATGTATGGACCTCGTGGTTGGAAAGGATATGGACAAATGTGATTATATAA
TATTAATAACATATTTGGTATAATGCCTTTTATGTATAC

QA 1 519 1 519
DS 



AS 1 6

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GTTCCAAAAAGAACTAAAACCCTAGAAGCAGAACAATCTTTAGTCTCCAATTCGTTTTCT
GGTTACCTAATATAGTACGTGTTGCTAATCCTTATTAAGTAAGATGATTAACTTTGAGGC
AACGGAGCTGAGGTTAGGGCTGCCGGGTGAGAATCACGGAGGAGCCATGACTGTGAAGAA
TAATGGGAAAAGAGGATTTTCTGAGACTGTTGATCTCAAGTTGAACCTTTCATCGACGGC
TGTGGATTCAGTTTCCGAAGTTGATTTAGAGAATATGAAGGAGAAGGTCTTAAAACCACC
GGCCAAGGCACAAGTTGTGGGATGGCCGCCGGTACGATCTTTCCGGAAGAACGTGATGTC
ATGCCAAAAGCCAACCACCGGAGATACCATCCAAGCAGAGGAAAAGACTTCCGGAAGCAG
CGGAGTTACCTCCTCTGCCTCCGCTTGTGCTACCGCAGCTTACGTGAAGGTTAGCATGGA
CGGTGCACCGTACCTAAGAAAAATTGATTTGAAACTCTACAAAACTTACCAAGATCTCTC
CGACGCCTTAAGCAAAATGTTCAGCTCTTTTACCATAGGCAATTACGGACCACAGGGAAT
GAAAGATTTTATGAATGAGAGTAAATTAATCGATCTTTTGAACGGATCAGATTACGTTCC
AACTTATGAAGATAAAGATGGAGACTGGATGCTTGTAGGAGATGTACCATGGGAGATGTT
TGTTGATTCATGCAAACGCATAAGAATTATGAAGGGGTCAGAAGCAAAAGGACTTGCTCC
AAGGGCTTTAGAAAAATGCAAGAACAGAAGCTGAGTGATTGCCCCAAAAAGGCAACAAAG
ACCGGTTAGATCCGGTTGGATATCTCAAACAGAGAAAAACCAAACCGGCTCGAGTTACCG
TTCCGAGCAGAGAGTTTGCGTATAAAATAATATTTTGATGAACTACATTTTTAAATTTAA
CCCTTTTTTGTTATGTATCATCTTATATAATACATATATAAATATGTATATTTTATTAGG
TTGCATCTATATATTTCCGTTTTTGGACAACTTTTGTTTTTGTGCATTATTGTATTGTCT
ATATGGTATATAAACCCTAAGACATCGAATGTGTTATATTTACGTGATACTAAGATATCA
TATACCCTAGTGTATTTCATTATTTGTTTTTTTTTGCAATATATGCTTTATTTC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H478TF U 2
AF RS1EG68TF U 1
AF RS1BW06TF U 2
AF RS1H478JQB C 600
AF RS1BW06JQ C 443
AF RS1EG68JQ C 558
BS 1 112 RS1EG68TF
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BS 252 252 RS1BW06TF
BS 253 787 RS1EG68TF
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BS 789 795 RS1EG68TF
BS 796 796 RS1BW06JQ
BS 797 803 RS1EG68TF
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BS 805 816 RS1EG68TF
BS 817 1213 RS1BW06JQ
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RD RS1H478TF 643 0 0
GGG
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CAAAAAGAACTAAAACCCTAGAAGCAGAACAATCTTTAGTCTCCAATTCGTTTTCTGGTT
ACCTAATATAGTACGTGTTGCTAATCCTTATTAAGTAAGATGATTAACTTTGAGGCAACG
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GGGAAAAGAGGATTTTCTGAGACTGTTGATCTCAAGTTGAACCTTTCATCGACGGCTGTG
GATTCAGTTTCCGAAGTTGATTTAGAGAATATGAAGGAGAAGGTCTTAAAACCACCGGCC
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CAAAAGCCAACCACCGGAGATACCATCCAAGCAGAGGAAAAGACTTCCGGAAGCAGCGGA
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GCACCGTACCTAAGAGAAATTGATTTGAAACTCTACAAAACTTACCAAGATCTCTCCGAC
GCCTTAAGCAAAATGTTCAGCTCTTTTACCATAGGCAATT

QA 4 643 4 643
DS 

RD RS1EG68TF 822 0 0
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GTTCCAAAAAGAACTAAAACCCTAGAAGCAGAACAATCTTTAGTCTCCAATTTGTTTTCT
GGTTACCTAATATAGTACGTGTTGCTAATCCTTATTAAGTAAGATGATTAACTTTGAGGC
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TAATGGGAAAATAGGATTTTCTGAGACTGTTGATCTCAAGTTGAACCTTTCATCGACGGC
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GGCCAAGGCACAAGTTGTGGGATGGCCGCCGGTACGATCTTTCCGGAAGAACGTGATGTC
ATGCCAAAAGCCAACCACCGGAGATACCATCCAAGCAGAGGAAAAGACTTCCGGAAGCAG
CGGAGTTACCTCCTCTGCCTCCGCTTGTGCTACCGCAGCTTACGTGAAGGTTAGCATGGA
CGGTGCACCGTACCTAAGAAAAATTGATTTGAAACTCTACAAAACTTACCAAGATCTCTC
CGACGCCTTAAGCAAAATGTTCAGCTCTTTTACCATAGGCAATTACGGACCACAGGGAAT
GAAAGATTTTATGAATGAGAGTAAATTAATCGATCTTTTGAACGGATCAGATTACGTTCC
AACTTATGAAGATAAAGATGGAGACTGGATGCTTGTAGGAGATGTACCATGGGAGATGTT
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TCAGAA

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DS 

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GGT
ATCCCCTCGTAGTTTCAACACATTTCATAATCTTCTCTCTCCCTTCAAACGTTTTAGTTC
CAAAAAGAACTAAAACCCTAGAAGCAGAACAATCTTTAGTCTCCAATTCGTTTTCTGGTT
ACCTAATATAGTACGTGTTGCTAATCCTTATTAAGTAAGATGATTAACTTTGAGGCAACG
GAGCTGAGGTTAGGGCTGCCGGATGAGAATCACGGAGGAGCCATGACTGTGAAGAATAAT
GGGAAAAGAGGATTTTCTGAGACTGTTGATCTCAAGTTGAACCTTTCATCGACGGCTGTG
GATTCAGTTTCCGAAGTTGATTTAGAGAATATGAAGGAGAAGGTCTTAAAACCACCGGCC
AAGGCACAAGTTGTGGGATGGCCGCCGGTACGATCTTTCCGGAAGAACGTGATGTCATGC
CAAAAGCCAACCACCGGAGATACCATCCAAGCAGAGGAAAAGACTTCCGGAAGCAGCGGA
GTTACCTCCTCTGCCTCCGCTTGTGCTACCGCAGCTTACGTGAAGGTTAGCATGGACGGT
GCACCGTACCTAAGAAAAATTGATTTGAAACTCTACAAAACTTACCAAGATCTCTCCGAC
GCCTTAAGCAAAATGTTCAGCTCTTTTACCATAGGCAATTACGGACCACAGGGAATGAAA
GATTTTATGAATGAGAGTAAATTAATCGATCTTTTGAACGGATCAGATTACGTTCCAACT
TATGAAGATAAAGATGGAGACTGGATGCTTGTAGGAGATGTACCATGGGAGATGTTTGTT
GATTCAT

QA 4 790 4 790
DS 

RD RS1H478JQB 542 0 0
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TGAAAGATTTTATGAATGAGAGTAAATTAATCGATCTTTTGAACGGATCAGATTACGTTC
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TTGTTGATTCATGCAAACGCATAAGAATTATGAAGGGGTCAGAAGCAAAAGGACTTGCTC
CAAGGGCTTTAGAAAAATGCAAGAACAGAAGCTGAGTGATTGCCCCAAAAAGGCAACAAA
GACCGGTTAGATCCGGTTGGATATCTCAAACAGAGAAAAACCAAACCGGCTCGAGTTACC
GTTCCGAGCAGAGAGTTTGCGTATAAAATAATATTTTGATGAACTACATTTTTAAATTTA
ACCCTTTTTTGTTATGTATCATCTTATATAATACATATATAAATATGTATATTTTATTAG
GTTGCATCTATATATTTCCGTTTTTGGACAACTTTTGTTTTTGTGCATTATTGTATTGTC
TA

QA 1 542 1 542
DS 

RD RS1BW06JQ 771 0 0
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GCTTGTGCTACCGCAGCTTACGTGAAGGTTAGCATGGACGGTGCACCGTACCTAAGAAAA
ATTGATTTGAAACTCTACAAAACTTACCAAGATCTCTCCGACGCCTTAAGCAAAATGTTC
AGCTCTTTTACCATAGGCAATTACGGACCACAGGGAATGAAAGATTTTATGAATGAGAGT
AAATTAATCGATCTTTTGAACGGATCAGATTACGTTCCAACTTATGAAGATAAAGATGGA
GACTGGATGCTTGTAGGAGATGTACCATGGGAGATGTTTGTTGATTCATGCAAACGCATA
AGAATTATGAAGGGGTCAGAAGCAAAAGGACTTGCTCCAAGGGCTTTAGAAAAATGCAAG
AACAGAAGCTGAGTGATTGCCCCAAAAAGGCAACAAAGACCGGTTAGATCCGGTTGGATA
TCTCAAACAGAGAAAAACCAAACCGGCTCGAGTTACCGTTCCGAGCAGAGAGTTTGCGTA
TAAAATAATATTTTGATGAACTACATTTTTAAATTTAACCCTTTTTTGTTATGTATCATC
TTATATAATACATATATAAATATGTATATTTTATTAGGTTGCATCTATATATTTCCGTTT
TTGGACAACTTTTGTTTTTGTGCATTATTGTATTGTCTATATGGTATATAAACCCTAAGA
CATCGAATGTGTTATATTTACGTGATACTAAGATATCATATACCCTAGTGT

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DS 

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GAAAAATTGATTTGAAACTCTACAAAACTTACCAAGATCTCTCCGACGCCTTAAGCAAAA
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AGAGTAAATTAATCGATCTTTTGAACGGATCAGATTACGTTCCAACTTATGAAGATAAAG
ATGGAGACTGGATGCTTGTAGGAGATGTACCATGGGAGATGTTTGTTGATTCATGCAAAC
GCATAAGAATTATGAAGGGGTCAGAAGCGAAAGGACTTGCTCCAAGGGCTTTAGAAAAAT
GCAAGAACAGAGGCTGAGTGATTGCCCCAAAAAGGCAACAAAGACCGGTTAGATCCGGTT
GGATATTTCAAACAGAGAAAAACCAAACCGGCTCGAGTTACCGTTCCGAGCAGAGAGTTT
GCGTATAAAATAATATTTTGATGAACTACATTTTTAAATTTAACCCTTTTTTGTTATGTA
TCATCTTATATAATACATATATAAATATGTATATTTTATTAGGTTGCATCTATATATTTC
CGTTTTTGGACAACTTTTGTTTTTGTGCATTATTGTATTGTCTATATGGTATATAAACCC
TAAGACATCGAATGTGTTATATTTACGTGATACTAAGATATCATATACCCTAGTGTATTT
CATTATTTGTTTTTTTTTGCAATATATGCTTTATTTC

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 6

CO CL1284Contig1 674 6 5 U
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CTCTCCCCGACAATGATTGCAGATACGCTGTTTACGACTTTGATTTCGTCACCTCTGAGA
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CGAAGATGCTATACGCGACATCTAAAGAGAGGTTTAGGAGAGAGCTTCAAGGGATTCACT
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ACTGAGGGATATATTTGTTCTCTGTTTAAGAAAAAAATACTTTTATGGTGTTATGTAATG
AAAATAATCATTCGGATTTCTCGTATTTCTCGTGGGTGCATTTGTGTAACCACAGTTTCT
TGTTCTATGGACAAGTGTATTATTAAACTCCAGTTGATGTTTCAGATTACTCATCTATAA
ACAAGCCTCTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RS1F257TF U 1
AF RS1E309JQ C 154
AF RS1E309TF U 16
AF RS1D183TF U 6
AF RS1F257JQ C 27
AF RS1D183JQ C 325
BS 1 365 RS1F257TF
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BS 641 673 RS1D183TF
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RD RS1F257TF 640 0 0
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AAAATAATCATTCGGATTTCTCGTATTTCTCGTGGGTGCATTTGTGTAACCACAGTTTCT
TGTTCTATGGACAAGTGTATTATTAAACTCCAGTTGATGT

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1E309JQ 490 0 0
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ACGACTTTGATTTCGTCACCTCTGAGAATTGCCAGAAGAGCAAAATCTTCTTCGTCGCAT
GGTCTCCATCGACTTCTAGAATAAGGGCGAAGATGCTATACGCGACATCTAAAGAGAGGT
TTAGGAGAGAGCTTCAAGGGATTCACTACGAGATTCAAGCTACTGATCCTACTGAGGTTG
ATCTTGATGTCCTTCGCGAACGAGCCAACTGAGGGATATATTTGTTCTCTGTTTAAGAAA
AAAATACTTTTATGGTGTTATGTAATGAAAATAATCATTCGGATTTCTCGTATTTCTCGT
GGGTGCATTTGTGTAACCACAGTTTCTTGTTCTATGGACAAGTGTATTATTAAACTCCAG
TTGATGTT
CC

QA 1 488 1 488
DS 

RD RS1E309TF 628 0 0
GG
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TTCTCGTATTTCTCGTGGGTGCATTTGTGTAACCACAGTTTCTTGTTCTATGGACAAGTG
TATTATTAAACTCCAGTTGATGTT
CC

QA 3 626 3 626
DS 

RD RS1D183TF 668 0 0
GG
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GCCAAATGCAACATCCGGAATGGGAGTTGCGGATCAGAGCAAGACCACATACCACGAGCT
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GCTATACGCGACATCTAAAGAGAGGTTTAGGAGAGAGCTTCAAGGGATTCACTACGAGAT
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TGGACAAGTGTATTATTAAACTCCAGTTGATGTTTCAGATTACTCATCTATAAACAAGCC
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QA 3 668 3 668
DS 

RD RS1F257JQ 648 0 0
AGAAAGCAGAATCAATCCATGTCTTTCCGAGGACTTAGCAAGCCAAATGCAT*ATCCGGA
ATGGGAGTTGCGGATCAGAGCAAGACCACATACCACGAGCTCCAGGGGAAGAAGACTCAC
CGCTACGTCGTCTTCAAGATCGATGAGCTCAAAAACCAAGTGGTGGTTGAGAAAACAGGA
AACCCGGCAGAGAGCTACGACGACTTCTTGGCTTCTCTCCCCGACAATGATTGCAGATAC
GCTGTTTACGACTTTGATTTCGTCACCTCTGAGAATTGCCAGAAGAGCAAAATTTTTTTC
GTCGCATGGTCTCCATCGACTTCTAGAATAAGGGCGAAG*TGCTATACGCGACATCTAAA
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GAGGTTGATCTTGATGTCCTTCGCGAACGAGCCAACTGAGGGATATATTTGTTCTCTGTT
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TTCTCGTGGGTGCATTTGTGTAACCACAGTTTCTTGTTCTATGGACAAGTGTATTATTAA
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C

QA 1 647 1 647
DS 

RD RS1D183JQ 350 0 0
TCGTCGCATGGTCTCCATCGACTTCTAGAATAAGGGGGAAGATGCTATACGCGACATCTA
AAGAGAGGTTTAGGAGAGAGCTTCAAGGGATTCACTACGAGATTCAAGCTACTGATCCTA
CTGAGGTTGATCTTGATGTCCTTCGCGAACGAGCCAACTGAGGGATATATTTGTTCTCTG
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ATTTTTCGTGGGTGCATTTGTGTAACCACAGTTTCTTGTTCTATGGACAAGTGTATTATT
AAACTCCAGTTGATGTTTCAGATTACTCATCTATAAACAAGCCTCTTTGC

QA 1 350 1 350
DS 



AS 2 5

CO CL1285Contig1 1205 2 4 U
GGACCAACTTAAAATTCTTTCTCCCCATTCGTTATCCAAACCGCATCTCTTCCCACAACT
ATGGAAACTAATTATTCTCCATTAGGGTTTCTAATTTCACTCTTCATCGTTGTTACTTTT
CTTGCACCACAAGTCAAATCTAGGGCTTTCTACGTATTTGGTGACTCTCTCGTCGACAAT
GGAAACAACGATTACTTAGTCACCACTGCTCGTGCCGACAACTACCCATATGGTATCGAT
TACCCGACCCGTCGACCCACCGGACGTTTCTCAAATGGCCTCAACATCCCCGACATTATC
AGTGAGGCTATAGGCATGCCGTCGACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGAG
AAGGCTAGAGCCAGACCCATATATGTAGATGTTACTTTTATGCTCTGCCTTCTCTTCAGA
GGAACTAAACTGAACTGAGTCAGAGAAACAAAAGAAGGTACAACAAAGAGAGAGAGACAT
GGATGTTTCTTTTCTTACCTCAAGATCAATCTCTGGTGTCAAAGAGCTTGTCCCCCCATT
CATCAAAACCAAAATCTTTTCTTGTTACCCAAGGAGAAACTCCTGCCAGTTTCTCACCAG
GAAGGTTGCTTCTCCAATCTCTGTGAATTGTTCTCTTTCGGATTCATGGAAGCCACTGGA
GGATGATGCTGATCTCTTCAAGGACAGTGTTAACAACAGTTCTACATCAGATGCTGCTGA
CTGGAGAGAGTTCAGGGCAAGGCTCGTAGCTGGTGAGCAAGCTGCAACCCCTGAGAAGGA
CTCGTCACTATCATCATCACTGATCACAACTGGGAATAAATGGGCACACAAGATACTAGA
GCCAGAGACAGGATGTCTCCTAATAGCAACAGAGAAGCTAGACGGAGTCCACATCTTCGA
AAAGACGGTGATCCTACTCCTCTCAGTTGGACCCTCAGGTCCTATAGGAGTCATCCTCAA
CCGTCCCTCGCTCATGTCAATCAAGGAGACCACAAAATCAACGGTCCTAGACATGGCGGG
GACGTTTTCAGACAAGAGCCTCTTCTTCGTGGACCTTTGGAAGAAGGGTTGTTCCTGGTG
AGTCCAAGAGCGGCGACGAGTTGAGAAGAGCGGAGCAGCGTTCAACAAGTAATGAAAGAT
TGTACTACGGACGAGAGAGAGTGTAGGTTGGCTGCAGAGATGTGAAGAGAAGCTGGTGGG
GAGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1AU80TF U 1
AF RS1E902TF U 416
BS 1 537 RS1AU80TF
BS 538 538 RS1E902TF
BS 539 678 RS1AU80TF
BS 679 1205 RS1E902TF

RD RS1AU80TF 678 0 0
GGACCAACTTAAAATTCTTTCTCCCCATTCGTTATCCAAACCGCATCTCTTCCCACAACT
ATGGAAACTAATTATTCTCCATTAGGGTTTCTAATTTCACTCTTCATCGTTGTTACTTTT
CTTGCACCACAAGTCAAATCTAGGGCTTTCTACGTATTTGGTGACTCTCTCGTCGACAAT
GGAAACAACGATTACTTAGTCACCACTGCTCGTGCCGACAACTACCCATATGGTATCGAT
TACCCGACCCGTCGACCCACCGGACGTTTCTCAAATGGCCTCAACATCCCCGACATTATC
AGTGAGGCTATAGGCATGCCGTCGACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGAG
AAGGCTAGAGCCAGACCCATATATGTAGATGTTACTTTTATGCTCTGCCTTCTCTTCAGA
GGAACTAAACTGAACTGAGTCAGAGAAACAAAAGAAGGTACAACAAAGAGAGAGAGACAT
GGATGTTTCTTTTCTTACCTCAAGATCAATCTCTGGTGTCAAAGAGCTTGTCCCCCC*TT
CATCAAAACCAAAATCTTTTCTTGTTACCCAAGGAGAAACTCCTGCCAGTTTCTCACCAG
GAAGGTTGCTTCTCCAATCTCTGTGAATTGTTCTCTTTCGGATTCATGGAAGCCACTGGA
GGATGATGCTGATCTCTT

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1E902TF 790 0 0
GG
AGAGGAACTAAACTGAACTGAGTCAGAGAAACAAAAGAAGGTACAACAAAGAGAGAGAGA
CATGGATGTTTCTTTTCTTACCTCAAGATCAATCTCTGGTGTCAAAGAGCTTGTCCCCCC
ATTCATCAAAACCAGAATCTTTTCTTGTTACCCAAGGAGAAACTCCTGCCAGTTTCTCAC
CAGGAAGGTTGCTTCTCCAATCTCTGTGAATTGTTCTCTTTCGGATTCATGGAAGCCACT
GGAGGATGATGCTGATCTCTTCAAGGACAGTGTTAACAACAGTTCTACATCAGATGCTGC
TGACTGGAGAGAGTTCAGGGCAAGGCTCGTAGCTGGTGAGCAAGCTGCAACCCCTGAGAA
GGACTCGTCACTATCATCATCACTGATCACAACTGGGAATAAATGGGCACACAAGATACT
AGAGCCAGAGACAGGATGTCTCCTAATAGCAACAGAGAAGCTAGACGGAGTCCACATCTT
CGAAAAGACGGTGATCCTACTCCTCTCAGTTGGACCCTCAGGTCCTATAGGAGTCATCCT
CAACCGTCCCTCGCTCATGTCAATCAAGGAGACCACAAAATCAACGGTCCTAGACATGGC
GGGGACGTTTTCAGACAAGAGCCTCTTCTTCGTGGACCTTTGGAAGAAGGGTTGTTCCTG
GTGAGTCCAAGAGCGGCGACGAGTTGAGAAGAGCGGAGCAGCGTTCAACAAGTAATGAAA
GATTGTACTACGGACGAGAGAGAGTGTAGGTTGGCTGCAGAGATGTGAAGAGAAGCTGGT
GGGGAGAA

QA 3 790 3 790
DS 



CO CL1285Contig2 1034 3 6 U
GATAAAGCTACTTTTTCATTTGTCAATCAAAAGATCTTTTAATAAGTTTAGATAACAGAG
CCAGTTTGAGGTCCAATAAGACCAACAACCTCATCCCAAAGACCTTGACTTTGTACAACC
GAACCAAGCTCAACAACACTCAAGCTACAAGCAGCTACAGTCCAGTACCCACCCAACACC
TCTGCTTTCAACTGCTCTTTCTCCCAACCACAATACCCATCAAAGAATCTCATCTCACTT
CTCCCCACCAGCTTCCTCTTCACCATCTCTGCAGCCAACCCTACACTCTCTCTCGTCCCG
TAGTACAATCCTTTCATTACTTGTTTGAACGCTGCTCCGCTCTTCTCAACCTCGTCGCCG
CTCCTTGGACTCACCAGGAACAACCCTTCTTCCAAAGGTCCACCAAAGAAGAGACTCTTG
TCTGAAAACGTTCCCGCCATGTCTAGGACCGTTGATTTGGTGGTCTCTTTGATTGACATG
AGCGAGGGACGGTTGAGGATGACTCCTATAGGACCTGAGGGTCCAACTGAGAGGAGTAGG
ATCACCGTCTTTTCGAAGATGTGGACTCCTTCTAGCTTCTCTGTTGCTATCAGGAGACAT
CCTGTCTCTGGCTCTAGTATCTTGTGTGCCCATTTGTTCCCAGTTGTGATCAGTGATGAT
GATAGTGACGAGTCCTTCTCAGGGGTTGCAGCTTGCTCTCCAGCTACGAGCCTTGCCCTG
AACTCTCTCCAGTCAGCAGCATCTGATGTAGAACTGTTGTTAACACTATCCTTGAAGAGA
TCAGCATCATCCTCCAATGGCTTCCATGAATCCGAAAGAGAACAATTCACAGAGATTGGA
GAAGCAACCTTCCTGGTGAGAAACTGGCAGGAGTTTCTCCTTGGGTAACAAGAAAAGATT
CTGGTTTTGATGAATGGGGGGACAAGCTCTTTGACACCAGAGACTGATCTTGAGGTAAGA
AAAGAAACATCCATATCCTCTCTTTGTTGTACCTTCTTTTGTTTCTCTGACTCAGTTCAG
TTTAGTTCCTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AU80JQ U 26
AF RS1D178JQ U 1
AF RS1D178TF C 362
BS 1 39 RS1D178JQ
BS 40 40 RS1AU80JQ
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BS 357 819 RS1D178JQ
BS 820 1034 RS1D178TF

RD RS1AU80JQ 684 0 0
G
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AACCTCATCCCAAAGACCTTGACTTTGTACAACCGAACCAAGCTCAACAACACTCAAGCT
ACAAGCAGCTACAGTCCAGTACCCACCCAACACCTCTGCTTTCAACTGCTCTTTCTCCCA
ACCACAATACCCATCAAAGAATCTCATCTCACTTCTCCCCACCAGCTTCCTCTTCACCAT
CTCTGCAGCCAACCCTACACTCTCTCTCGTCCCGTAGTACAATCCTTTCATTACTTGTTT
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TGCAGCTTGCTCACCAGCTACGA

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DS 

RD RS1D178JQ 833 0 0
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CCAGTTTGAGGTCCAATAAGACCAACAACCTCATCCCAAAGACCTTGACTTTGTACAACC
GAACCAAGCTCAACAACACTCAAGCTACAAGCAGCTACAGTCCAGTACCCACCCAACACC
TCTGCTTTCAACTGCTCTTTCTCCCAACCACAATACCCATCAAAGAATCTCATCTCACTT
CTCCCCACCAGCTTCCTCTTCACCATCTCTGCAGCCAACCCTACACTCTCTCTCGTCCCG
TAGTACAATCCTTTCATTACTTGTTTGAACGCTGCTCCGCTCTTCTCAACCTCGTTGCCG
CTCCTTGGACTCACCAGGAACAACCCTTCTTCCAAAGGTCCACCAAAGAAGAGACTCTTG
TCTGAAAACGTTCCCGCCATGTCTAGGACCGTTGATTTGGTGGTCTCTTTGATTGACATG
AGCGAGGGACGGTTGAGGATGACTCCTATAGGACCTGAGGGTCCAACTGAGAGGAGTAGG
ATCACCGTCTTTTCGAAGATGTGGACTCCTTCTAGCTTCTCTGTTGCTATCAGGAGACAT
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TCAGCATCATCCTCCAATGGCTTCCATGAATCCGAAAGA
AACATTCACAGAGA

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GCTC
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TGACGAGTCCTTCTCAGGGGTTGCAGCTTGCTCTCCAGCTACGAGCCTTGCCCTGAACTC
TCTCCAGTCAGCAGCATCTGATGTAGAACTGTTGTTAACACTATCCTTGAAGAGATCAGC
ATCATCCTCCAATGGCTTCCATGAATCCGAAAGAGAACAATTCACAGAGATTGGAGAAGC
AACCTTCCTGGTGAGAAACTGGCAGGAGTTTCTCCTTGGGTAACAAGAAAAGATTCTGGT
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AACATCCATATCCTCTCTTTGTTGTACCTTCTTTTGTTTCTCTGACTCAGTTCAGTTTAG
TTCCTCTCC

QA 5 673 5 673
DS 



AS 1 6

CO CL1286Contig1 885 6 19 U
GCTAAAACCAACCATATAAGATAAGAGTCTATTCAACCAAACCACTTAAAATGAAAGCAC
TTGACCACGAAAAGTCTTAAAGAGTTGTTTGTAGAGAAGCAGGCGTACTAACAAATATTT
ATCTCTCGACAACGATTCAACACACATTGAAGAGTAAAATGAGAATCAGTCAGGCATACA
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TCTTCACAACTCCCTCAAGAACACCATCTGCACCAAAATTACCGCTGAAATCTTCGTTGC
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ATAGCATCTTGAACACCTGATTGTGTTTGCACACTGTCTTCTCTCCCGTGGTTGTTACTC
CTTTGATCAGAATCTTGCCGTCTGGTTCTATTTCGCAGCTGAACTCCTTTTCATCTCTTG
AAACACCAGGGAGTGAAACACGAAAATAGTAAGAGTCATCGGATTCAGCAATATCAACCA
AACCAATAGTTGGTCCGACCTTCCCCATGGCTGCACTTCCCGTGAGGGCAACTCCGGTTT
TTGATTGAGAGATTAGGCTATAAAGCTCTGGAGTTGATTCGGAAGGTAGAAATATCATTG
CTGGAGGTCCTGTTTTCTCTGCAGTCTCGTTGGCCTTGTTACCAGACATGGATGAATTAC
CATTTAATGGACCGACGTAAGGCAAACTGTTCAACGGAGCAACTTCGAGGACTTGTGGAA
AACCGTTGCTCTCTCTCATCTCGTTTTGACCACTTGAAGAC*AAACCTTGGATGCTACTC
AGAGATGGAGATAAGGCAAAGAGATGGACAAACGGCGGAGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1E667JQ U 25
AF RS1G621JQ U 1
AF RS1G621TF C 129
AF RS1GJ66JQ U 49
AF RS1GJ66TF C 292
AF RS1E667TF C 381
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RD RS1E667JQ 620 0 0
GG
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TATCTGGATGTTGTTCAGTCTTCGTAGTAGAGCTTCTTCACAACTCCCTCAAGAACACCA
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TCTGGAGTTGATTCGGAA

QA 3 620 3 620
DS 

RD RS1G621JQ 698 0 0
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ATAGCATCTTGAACACCTGATTGTGTTTGCACACTGTCTTCTCTCCCGTGGTTGTTACTC
CTCTGATCAGAATCTTACCGTCTGGTTCTATTTCGCAGCTGAACTCCTTTTCATCTCTTG
AAACACCAGGGAGTGAAACACGAAAATAGTAAGAGTCATCGGATTCAGCAATATCAACCA
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CTGGAGGTCCTGTTTTCTCCGCAGTCTCGTTGGCCTTG

QA 1 698 1 698
DS 

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ACAAAC
ATTCAACACACATTGAAGAGTAAAATGAGAATCAGTCAGGCATACACTAATGAACCATCT
TC*TAATAGCAATATCTGGATGTTGTTCAGTCTTCGTAGTAGAGCTTCTTCACAACTCCC
TCAAGAACACCATCTGCACCAAAATTACCGCTGAAATCTTCGTTGCTGACAGGACCGGGA
AGCTGGAAAGAGATGGTGAAGTGGCCTGGAGGGCATAAGTTTTGCGATAGCATCTTGAAC
ACCTGATTGTGTTTGCACACTGTCTTCTCTCCCGTGGTTGTTACTCCTCTGATCAGAATC
TTACCGTCTGGTTCTATTTCGCAGCTGAACTCCTTTTCATCTCTTGAAACACCAGGGAGT
GAAACACGAAAATAGTAAGAGTCATCGGATTCAGCAATATCAACCAAACCAATAGTTGGT
CCGACCTTCCCCATGGCTGCACTTCCCGTGAGGGCAACTCCGGTTTTTGATTGAGAGATT
AGGCTATAAAGCTCTGGAGTTGATTCAGAAGGTAGAAATATCATTGCTGGAGGTCCTGTT
TTCTCCGCAGTCTCGTTGGCCTTGTTACCAGACATGGATGAATTACCATTTAATGGACCG
ACGTAAGGCAAACTGTTCAACGGAGCAACTTCAAGGACTTGTGGAAAACCGTTGCTCCCT
CTC
C

QA 7 669 7 669
DS 

RD RS1GJ66JQ 801 0 0
G
AATGAAAGCACTTGACCACGAAAAGTCTTAAAGAGTTGTTTGTAGAGAAGCAGGCGTACT
AACAAATATTTATCTCTCGACAACGATTCAACACACAATGAAGAGTAAAATGAGAATCAG
TCAGGCATACACTAATGAACCATCTTCCTAATAGCAATATCTGGATGTTGTTCAGTCTTC
GTAGTAGAGCTTCTTCACAACTCCCTCAAGAACACCATCTGCACCAAAATTACCGCTGAA
ATCTTCGTTGCTGACAGGACCGGGAAGCTGGAAAGAGATGGTGAAGTGGCCTGGAGGGCA
TAAGTTTTGCGATAGCATCTTGAACACCTGATTGTGTTTGCACACTGTCTTCTCTCCCGT
GGTTGTTACTCCTTTGATCAGAATCTTGCCGTCTGGTTCTATTTCGCAGCTGAACTCCTT
TTCATCTCTTGAAACACCAGGGAGTGAAACACGAAA*TAGTAAGAGTCATCGGATTCAGC
AATATCAACCAAACCAATAGTTGGTCCGACCTTCCCCATGGCTGCACTTCCCGTGAGGGC
AACTCCGGTTTTTGATTGAGAGAT*AGGCTATAAAGCTCTGGAGTTGATTCGGAAGGTAG
AAATATCATTGCTGGGGGTCCTGTTTTCTCTGCAGTCTCGTTGGCCTTGTTACCAGACAT
GGATGAATTACCATTTAATGGACCGACGTAAGGCAAACTGTTCAACGGAGCAACTTCGAG
GACTTGTGGAAAACCGTTGCTCTCTCTCATCTCGTTTTGACCACTTGAAGAC*AAACCTT
GGATGCTACTCAGAGATGGA

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DS 

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TTGTTACTCCTTTGATCAGAATCTTGCCGTCTGGTTCTATTTCGCAGCTGAACTCCTTTT
CATCTCTTGAAACACCAGGGAGTGAAACACGAAA*TAGTAAGAGTCATCGGATTCAGCAA
TATCAACCAAACCAATAGTTGGTCCGACCTTCCCCATGGCTGCACTTCCCGTGAGGGCAA
CTCCGGTTTTTGATTGAGAGAT*AGGCTATAAAGCTCTGGAGTTGATTCGGAAGGTAGAA
ATATCATTGCTGGGGGTCCTGTTTTCTCTGCAGTCTCGTTGGCCTTGTTACCAGACATGG
ATGAATTACCATTTAATGGACCGACGTAAGGCAAACTGTTCAACGGAGCAACTTCGAGGA
CTTGTGGAAAACCGTTGCTCTCTCTCATCTCGTTTTGACCACTTGAAGACCAAACCTTGG
ATGCTACTCAGAGATGGAGATAAGGCAAAGAGATGGACAAACGGCGGAGAAAAA

QA 1 594 1 594
DS 

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TCTGGTTCTATTTCGCAGCTGAACTCCTTTTCATCTCTTGAAACACCAGGGAGTGAAACA
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TTCCCCATGGCTGCACTTCCCGTGAGGGCAACTCCGGTTTTTGATTGAGAGATTAGGCTA
TAAAGCTCTGGAGTTGATTCGGAAGGTAGAAATATCATTGCTGGAGGTCCTGTTTTCTCT
GCAGTCTCGTTGGCCTTGTTACCAGACATGGATGAATTACCATTTAATGGACCGACGTAA
GGCAAACTGTTCAACGGAGCAACTTCGAGGACTTGTGGAAAACCGTTGCTCTCTCTCATC
TCGTTTTGACCACTTGAAGAC*****CTTGGATGCTACTCAGAGATGGAGATAAGGCAAA
GAGATGGACAAGCGGCGGAGAAAAA

QA 1 505 1 505
DS 



AS 1 6

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TCAACGTCGTCGTATCACTCCTCCTCCTCCTAGCCTCAACCGCAACATGTTGTCCCCCTT
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TCAACTCATGGACCGGCCAAGACTGCTGCCACAACTGGTACGGCGTCAGCTGCGACTCGC
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GAGCTCACCGAACCGGCTACATGACGGGACACATCTCTCCGGCAATCTGCGACCTCACGC
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TCACGCGTCTCCCTTTCCTCCGCACGCTCGACCTCATCGGAAACCAAATCTCCGGCCCGA
TACCAAACGACATCGGTAGATTACACCGGTTAGCTGTTTTAAACGTAGCAGATAACCGGA
TTTCCGGTTCAATTCCAAAATCGTTAACCAGCCTCTCTAGCTTAATGCATTTGGACCTCC
GTAACAACTTAATATCCGGTTTAATCCCTTCAGACTTCGGCCGGTTAACGATGCTTAGCC
GCGCGTTACTAAGCGGTAACCGGATAACCGGTCGAATTCCCGAATCACTAACCAAGATTT
ATCGGTTAGCTGACGTGGATCTCTCAGGTAACCAACTATACGGCCCAATCCCACCATCTT
TAGGCCGTATGGCGGTTCTCGCGACGCTTAACCTAGACGGAAACAAATTCTCCGGGGAGA
TTCCACAAACTCTGATGACGTCATCGGTGATGAACTTGAACTTGAGCAGGAACTTGTTGC
AAGGGAAGATTCCGGAAGGGTTCGGACCAAGGTCTTACTTCACTGTGCTTGATTTGTCTT
ATAACAATCTCAAGGGACCAATACCGAGATCGATCTCCGGTGCGTCGTTTATTGGTCATT
TGGATCTTAGCCATAACCATCTCTGCGGTAGGATTCCGGTGGGGTCACCGTTCAGTCACC
TTGAAGCGGCGTCGTTTATGTATAACGACTGTCTTTGCGGCAAACCTTTGAGGGCTTGTT
TAAAAAA*CTGAGTTTTATGTAATTTTCTTTTATTAGACCTTACTATATTTTATGATTAT
GTATTGAAAAACATAAATGTGTGCTACGCCTGTCTTCTGGTACTTTATGATTAATTATTA
TCACTACCGGATCTACTTACCAGTTACCATATACTCCCTCCGTTTCAATATAGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1G064TF U 1
AF RS1EF01TF U 1
AF RS1EF01JQ C 520
AF RS1G064JQ C 785
AF RS1AP42JQ C 838
AF RS1AP42TFB U 838
BS 1 93 RS1EF01TF
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RD RS1G064TF 535 0 0
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TCAACTCATGGACTGGCCAAGACTGCTGCCACAACTGGTACGGCGTCAGCTGCGACTCGC
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TCACGCGTCTCCCTTTCCTCCGCACGCTCGACCTCATCGGAAACCAAATCTCCGGCCCGA
TACCAAACGACATCGGTAGATTACACCGGTTAGCTGTTTTAAACGT
TGCTGATAA

QA 1 526 1 526
DS 

RD RS1EF01TF 781 0 0
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TCAACGTCGTCGTATCACTCCTCCTCCTCCTAGTCTCAACCGCAACATGTTGTCCCCCTT
CAGACCACCGCGCACTCCTAGCTTTCCGAGCAGCACTCCACGAGCCATACCTCGGCATTT
TCAACTCATGGACCGGCCAAGACTGCTGCCACAACTGGTACGGCGTCAGCTGCGACTCGC
TCACTCACCGAGTCGCCGACATTAACCTCCGTGGCGAGTCAGAAGACCCCATCTTCGAGC
GAGCTCACCGAACCGGTTACATGACGGGACACATCTCTCCGGCAATCTGCGACCTCACGC
GTCTCTCCGCCATCACAATCGCCGACTGGAAAGGTATCTCCGGCGAGATCCCCACCTGCA
TCACGCGTCTCCCTT*CCTCCGTACGCTCGACCTCATCGGGAACCAAATCTCCGGCCCGA
TACCAAACGGCATCGGTAGATTACACCGGTTAGCTGTTTTAAACGTAGCAGATAACCGGA
TTTCCGGTTCAATTCCAAAATCGTTAACCAGCCTCTCTAGCTTAATGCATTTGGACCTCC
GTAACAACTTAATATCCGGTTTAATCCCTTCAGACTTCGGCCGGTTAACGATGCTTAGCC
GCGCGTTACTAAGCGGTAACCGGATAACCGGTCGAATTCCCGAATCACTAACCAAGATTT
ATCGGTTAGCTGACGTGGATCTCTCAG*TAACCAACTATACG*CCCAATCCCACCATCT
CT

QA 1 779 1 779
DS 

RD RS1EF01JQ 706 0 0
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GCTTAATGCATTTGGACCTCCGTAACAACTTAATATCCGGTTTAATCCCTTCAGACTTCG
GCCGGTTAACGATGCTTAGCCGCGCGTTACTAAGCGGTAACCGGATAACCGGTCGAATTC
CCGAATCACTAACCAAGATTTATCGGTTAGCTGACGTGGATCTCTCAGGTAACCAACTAT
ACGGCCCAATCCCACCATCTTTAGGCCGTATGGCGGTTCTCGCGACGCTTAACCTCGACG
GAAACAAATTCTCCGGGGAGATTCCACAAACTTTGATGACGTCATCGGTGATGAACTTGA
ACTTGAGCAGGAACTTGTTGCAAGGGAAGATTCCGGAAGGGTTCGGACCAAGGTCTTACT
TCACTGTACTTGATTTGTCTTATAACAATCTCAAGGGACCAATACCGAGATCGATCTCCG
GTGCGTCGTTTATTGGTCATTTGGATCTTAGCCATAACCATCTCTGCGGTAGGATTCCGG
TGGGGTCACCGTTCAGTCACCTCGAAGCGGCGTCGTTTATGTATAACGACTGTCTTTGCG
GCAAACCTTTGAGGGCTTGTTTAAAAAA*CTGAGTTTTATGTAATTTTCTTTTATTAGAC
CTTACTATATTTTATGATTATGTATTGAAAAACATAAATGTGTGCT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RS1G064JQ 490 0 0
CCGTATGGCGGTTCTCGCGACGCTTAACCTAGACGGAAACAAATTCTCCGGGGAGATTCC
ACAAACTCTGATGACGTCATCGGTGATGAACTTGAACTTGAGCAGGAACTTGTTGCAAGG
GAAGATTCCGGAAGGGTTCGGACCAAGGTCTTACTTCACTGTGCTTGATTTGTCTTACAA
CAATCTCAAGGGACCAATACCGAGATCGATCTCCGGTGCGTCGTTTATTGGTCATTTGGA
TCTTAGCCATAACCATCTCTGCGGTAGGATTCCGGTGGGGTCACCGTTCAGTCACCTTGA
AGCGGCGTCGTTTATGTATAACGACTGTCTTTGCGGCAAACCTTTGAGGGCTTGTTTAAA
AAAACTGAGTTTTATGTAATTTTCTTTTATTAGACCTTACTATATTTTATGATTATGTAT
TGAAAAACATAAATGTGTGCTACGTCTGTCTTCTGGTACTTTATGATTAATTATTATCAC
TACCGGATC
C

QA 1 489 1 489
DS 

RD RS1AP42JQ 477 0 0
GGATACCT
CAAACTTTGATGACGTCATCGGTGATGAACTTGAACTTGAGCAGGAACTTGTTGCAAGGG
AAGATTCCGGAAGGGTTCGGACCAAGGTCTTACTTCACTGTGCTTGATTTGTCTTATAAC
AATCTCAAGGGACCAATACCGAGATCGATCTCCGGTGCGTCGTTTATTGGTCATTTGGAT
TTTAGCCATAACCATCTTTGCGGTAGGATTCCGGTGGGGTCACCGTTCAGTCACCTTGAA
GCGGCGTCGTTTATGTATAACGACTGTCTTTGCGGCAAACCTTTGAGGGCTTGTTTAAAA
AA*CTGAGTTTTATGTAATTTTCTTTTATTAGACCTTACTATATTTTATGATTATGTATT
GAAAAACATAAATGTGTGCTACGCCTGTCTTCTGGTACTTTATGATTAATTATTATCACT
ACCGGATCTACTTACCAGTTACCATATACTCCCTCCGTTTCAATATAGT

QA 9 477 9 477
DS 

RD RS1AP42TFB 477 0 0
GGATACCT
CAAACTCTGATGACGTCATCGGTGATGAACTTGAACTTGAGCAGGAACTTGTTGCAAGGG
AAGATTCCGGAAGGGTTCGGACCAAGGTCTTACTTCACTGTGCTTGATTTGTCTTATAAC
AATCTCAAGGGACCAATACCGAGATCGATCTCCGGTGCGTCGTTTATTGGTCATTTGGAT
CTTAGCCATAACCATCTCTGCGGTAGGATTCCGGTGGGGTCACCGTTCAGTCACCTTGAA
GCGGCGTCGTTTATGTATAACGACTGTCTTTGCGGCAAACCTTTGAGGGCTTGTTTAAAA
AA*CTGAGTTTTATGTAATTTTCTTTTATTAGACCTTACTATATTTTATGATTATGTATT
GAAAAACATAAATGTGTGCTACGCCTGTCTTCTGGTACTTTATGATTAATTATTATCACT
ACCGGATCTACTTACCAGTTACCATATACTCCCTCCGTTTCAATATAGT

QA 9 477 9 477
DS 



AS 1 5

CO CL1288Contig1 982 5 11 U
GGGTATTATATTACCTTTGATTCCAAAATCATTGAGAACTTTTCAATTCCTCTCATCCAA
TCGCACGGTGAGATCGAGAGCCTAGAACTCGACCCATCTGTTCCTCTGGTCATCATCGCG
ACACAGATGTTCGCTTGACGGGACCTTTTTCTCGCCGCGCGATCTTTGCCTCTTTCCTGT
AATTCGCCGTCTTTTGCTCAAATAAACGAGATCTGCTTTTCCACGACTTTGAAGGAGTAT
GTCGACTCCAGCAAGGAAGAGGTTGATGAGGGATTTCAAGAGGTTGCAGCAAGACCCACC
TGCAGGAATCAGCGGTGCTCCCCAGGACAACAATATCATGCTCTGGAATGCTGTCATATT
CGGGCCTGATGACACCCCGTGGGATGGAGGTACTTTCAAACTCTCACTGCAGTTCTCTGA
GGATTATCCGAATAAACCACCAACAGTTCGCTTTGTGTCTCGGATGTTCCATCCGAATAT
TTATGCAGATGGGAGTATTTGCTTGGACATTCTACAAAACCAGTGGAGTCCTATTTATGA
TGTTGCTGCTATACTTACCTCCATCCAGTCATTGCTCTGTGACCCTAATCCGAATTCTCC
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ACGTGATGTTGTCGAGCAAAGCTGGACTGCTGACTAAGTATTAGTTACTTGTAAGCTCTG
CTGCAACTCATCACTCAATGTCCACCCATTAAGCAACAGCTTTCTTATCTTTTCCATTCA
TTTCCTTTTGTGTGTTTCAAAACTCTAAATGATTGGATGCTGTAATGGTTTCTATGAAAG
CCTAACATCCTTGTAAAATACCTTGTACCAAACCTTCTGAATTATTCACTTTTTCTTTCT
TGTATTTATGTATTATCGGTTTCTTGCTAGGTGCCAAAACAACGTTGTACCAAAATGATA
AAAACTTGTAATATATTAAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TGCAAA

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GG
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GAGTATTTGCTTGGACATTCTACAAAACCAGTGGAGTCCTATTTATGATGTTGCTGCTAT
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CGCGATCTTTGCCTCTTTCCTGTAATTCGCCGTCTTTTGCTCAAATAAACGAGATCTGCT
TTTCCACGACTTTGAAGGAGTATGTCGACTCCAGCAAGGAAGAGGTTGATGAGGGATTTC
AAGAGGTTGCAGCAAGACCCACCTGCAGGAATCAGCGGTGCTCCCCAGGACAACAATATC
ATGCTCTGGAATGCTGTCATATTCGGGCCTGATGACACCCCGTGGGATGGAGGTACTTTC
AAACTCTCACTGCAGTTCTCTGAGGATTATCCGAATAAACCACCAACAGTTCGCTTTGTG
TCTCGGATGTTCCATCCGAATATTTATGCAGATGGGAGTATTTGCTTGGACATTCTACAA
AACCAGTGGAGTCCTATTTATGATGTTGCTGCTATACTTACCTCCATCCAGTCATTGCTC
TGTGACCCTAATCCGAATTCTCCTGCAAATTCGGAAGCCGCTCGGATGTACAGCGAAAAC
AAGCGTGAGTACAACAGAAAAGTACGTGATGTTGTCGAGCAAAGCTGGACTGCTGACTAA
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AGCTTTCTTATCTTTTCCATTCATTTCCTTTTGTGTGTTTCAAAACTCTAAATGATTGGA
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DS 

RD RS1BL71JQ 757 0 0
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CGAGATCTGCTTTTCCACGACTTTGAAGGAGTATGTCGACTCCAGCAAGGAAGAGGTTGA
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AGTCATTGCTCTGTGACCCTAATCCGAATTCTCCTGCAAATTCGGAAGCCGCTCGGATGT
ACAGCGAAAACAAGCGTGAGTACAACAGAAAAGTACGTGATGTTGTCGAGCAAAGCTGGA
CTGCTGACTAAGTATTAGTTACTTGTAAGCTCTGCTGCAACTCATCACTCAATGTCCACC
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AAATGATTGGATGCTGTAATGGTTTCTATGAAAGCCTAACATCCTTGTAAAATACCTTGT
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C

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DS 

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ATTTATGCAGATGGGAGTATTTGCTTGGACATTCTACAAAACCAGTGGAGTCCTATTTAT
GATGTTGCTGCTATACTTACCTCCATCCAGTCATTGCTCTGTGACCCTAATCCGAATTCT
CCTGCAAATTCGGAAGCCGCTCGGATGTACAGCGAAAACAAGCGTGAGTACAACAGAAAA
GTGCGTGATGTTGTCGAGCAAAGCTGGACTGCTGACTAAGTATTAGTTACTTGTAAGCTC
TGCTGCAACTCATCACTCAATGTCCACCCATTAAGCAACAGCTTTCTTATCTTTTCCATT
CATTTCCTTTTGTGTGTTTCAAAACTCTAAATGATTGGATGCTGTAATGGTTTCTATGAA
AGCCTAACATCCTTGTAAAATACCTTGTACCAAACCTTTTGAATTATTCACTTTTTCTTT
CTTGTATTTATGTATTATCGGTTTCTTGCTAGGTGCCAAAACAACGTTGTACCAAAATGA
TAAAAACTTGTAATATATTAAAGG

QA 1 564 1 564
DS 



AS 1 2

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GGGAACACCCATTTTCTCTCGTTTCTCTCTATTTCTTCTTCGTTCCTCGATCCTCTCCGT
CGCCGATCTCGCCACTTCATTTCCCGCGAGTTGATTTGGTACAAAGCGTTGAGAACAAAA
ATGGTAGGAGGAGGAGTTATCCAGCAGATTCTCAGGAGGAAGCTTCACTCCCAATCCCTC
GCAACTCCGGTCCGGTCGTGGTTTTCTTCGAAGACTTCTCATGTGGAGGCTGGGTCTTCT
GGTGTGAGAGCATTTGCGCTCTTGGGTGCTGGTGTTACTGGGCTGTTGAGTTTTTCTACA
GTAGCATCTGCTGATGAGGCCGAACACGGGTTGGCTTGCCCAGATTACCCTTGGCCTCAT
GATGGCATTCTCAGCTCATACGACCATGCCTCGATCCGTCGTGGGCATCAAGTTTATCAG
CAGGTGTGTGCATCTTGCCACTCAATGTCTCTGATCTCATACCGAGATTTGGTGGGTGTC
GCCTACACTGAGGAAGAGGCAAAGGCAATGGCAGCTGAAATCGAGGTGGTTGATGGACCT
AATGATGAGGGTGAGATGTTCACCCGTCCTGGTAAACTCAGTGACCGCTTGCCTCAACCT
TATGCCAATGAATCAGCTGCAAGGTTTGCTAATGGTGGAGCGTATCCTCCTGATCTCAGT
CTTATCACTAAAGCACGTCACAACGGTCAAAACTACGTCTTTGCTCTCCTGACGGGTTAC
CGTGATCCTCCTGCTGGCATTTCAATTAGAGAGGGATTACACTACAATCCTTACTTCCCA
GGGGGAGCAATTGCTATGCCGAAAATGCTCAATGATGAAGCTGTTGAGTATGAAGATGGT
GTCCCCGCCACAGAGGCACAGATGGGTAAAGATGTTGTGTCATTCTTGTCTTGGGCAGCT
GAACCAGAAATGGAAGAGAGGAAGTTGATGGGTTTCAAATGGATATTCCTACTATCTCTC
GCTCTCCTCCAAGCAGCGTACTACGGGCGACTGAAATGGTCAGTTCTCAAGTCTCGCAAG
CTGGTTCTTGACGTGGTGAACTAAAATCACTACGTAGTAAGCTTTTGCAGTTGGCTACTA
CACTGTCCTCTTTTCAGCAAAAATCTCCATTTTATGTCATAAAAATCTTTGATGGGACCA
TCCGTTCTCGCCGGAAAGGTGGAAAATCTCATCTTTTCTTAATTTTTTTTACTTATGAGT
ATCTCTAGGGA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DP79TF U 1
AF RS1G970TF U 568
BS 1 623 RS1DP79TF
BS 624 624 RS1G970TF
BS 625 628 RS1DP79TF
BS 629 629 RS1G970TF
BS 630 691 RS1DP79TF
BS 692 692 RS1G970TF
BS 693 741 RS1DP79TF
BS 742 742 RS1G970TF
BS 743 752 RS1DP79TF
BS 753 1211 RS1G970TF

RD RS1DP79TF 752 0 0
GGGAACACCCATTTTCTCTCGTTTCTCTCTATTTCTTCTTCGTTCCTCGATCCTCTCCGT
CGCCGATCTCGCCACTTCATTTCCCGCGAGTTGATTTGGTACAAAGCGTTGAGAACAAAA
ATGGTAGGAGGAGGAGTTATCCAGCAGATTCTCAGGAGGAAGCTTCACTCCCAATCCCTC
GCAACTCCGGTCCGGTCGTGGTTTTCTTCGAAGACTTCTCATGTGGAGGCTGGGTCTTCT
GGTGTGAGAGCATTTGCGCTCTTGGGTGCTGGTGTTACTGGGCTGTTGAGTTTTTCTACA
GTAGCATCTGCTGATGAGGCCGAACACGGGTTGGCTTGCCCAGATTACCCTTGGCCTCAT
GATGGCATTCTCAGCTCATACGACCATGCCTCGATCCGTCGTGGGCATCAAGTTTATCAG
CAGGTGTGTGCATCTTGCCACTCAATGTCTCTGATCTCATACCGAGATTTGGTGGGTGTC
GCCTACACTGAGGAAGAGGCAAAGGCAATGGCAGCTGAAATCGAGGTGGTTGATGGACCT
AATGATGAGGGTGAGATGTTCACCCGTCCTGGTAAACTCAGTGACCGCTTGCCTCAACCT
TATGCCAATGAATCAGCTGCAAG*TTTGTTAATGGTGGAGCGTATCCTCCTGATCTCAGT
CTTATCACTAAAGCACGTCACAACGGTCAAA*CTACGTCTTTGCTCTCCTGACGGGTTAC
CGTGATCCTCCTGCTGGCATT*CAATTAGAGA

QA 1 752 1 752
DS 

RD RS1G970TF 644 0 0
G
CTGGTAAACTCAGTGACCGCTTGCCTCAACCTTATGCCAATGAATCAGCTGCAAGGTTTG
CTAATGGTGGAGCGTATCCTCCTGATCTCAGTCTTATCACTAAGGCACGTCACAACGGTC
AAAACTACGTCTTTGCTCTCCTGACGGGTTACCGTGATCCTCCTGCTGGCATTTCAATTA
GAGAGGGATTACACTACAATCCTTACTTCCCAGGGGGAGCAATTGCTATGCCGAAAATGC
TCAATGATGAAGCTGTTGAGTATGAAGATGGTGTCCCCGCCACAGAGGCACAGATGGGTA
AAGATGTTGTGTCATTCTTGTCTTGGGCAGCTGAACCAGAAATGGAAGAGAGGAAGTTGA
TGGGTTTCAAATGGATATTCCTACTATCTCTCGCTCTCCTCCAAGCAGCGTACTACGGGC
GACTGAAATGGTCAGTTCTCAAGTCTCGCAAGCTGGTTCTTGACGTGGTGAACTAAAATC
ACTACGTAGTAAGCTTTTGCAGTTGGCTACTACACTGTCCTCTTTTCAGCAAAAATCTCC
ATTTTATGTCATAAAAATCTTTGATGGGACCATCCGTTCTCGCCGGAAAGGTGGAAAATC
TCATCTTTTCTTAATTTTTTTTACTTATGAGTATCTCTAGGGA

QA 2 644 2 644
DS 



AS 1 6

CO CL1290Contig1 870 6 20 U
GGACTCGACCTAAAGCTTAAACCCTAGCAACCGCGTAGAAAGAAGAGAAAAGGCGAAAGC
TTCTCACAAGGTTAATAACAATGGCTGAGCAACAAGAGATCCTCGATTCAGTGTCGGCAG
CCGAAGTGAAACCAGATCCAATAACGGACACTGAAGTCGAAGAAGCTGCAGAGAAACGCG
GGAGAGAGGAGACGACGGAGGAAACAGAGGATGGAGGCGAATCCAAGAAGCAGAAAGTGG
GAGAGGAAGAGAAACCCAACGGGTCGGATCCGGTCAAGCTGGGTCCGAAGGAGTTCGTCA
CCTCTGTGGCGATGTTTGATTACTTCACCAAGTTCATGCATTTCTGGCCGACAGATCTCG
ATGTCAACAAGTATGAACACATGGTGCTGTTAGATCTGATCAAGAAGGGCCATACTGAGC
CTGACAATAAGATTGGGGGAGGGATCAAAGGCTTCCAAGTGAGAACCCACCCGATGTGGA
AAAGCAGGTGCTTCTTTCTGGTTAGGGAAGACGACACTGCTGACGATTTCAGCTACAGGA
AGTGCGTTGATCACATCCTACCTTTGCCTGAAAACATGAAGACTCCTGGGTCTAACGGTA
ATGGACATGGTGGTGGTAGAA*GAGGTGGCCGCGGTGGTGGCAGGGGTGGGAGATTCAGA
AGATGAATTGACCCTTTTGTTGCTTTGTCGAAATTTTGGAGCTTTTAATGTTAACTTCTG
TTTGCTAAAAAACTTATTTAAGTTATGATCTTGTTGAATGCTGTTGTTATTTTCCGGAGA
ATGTTTGTCACCTTATTGTTCAAGAACCGGAAGCTACAGCTCGTCTCTATGTTCACAACT
TGAGAGTATACTTGAATTTGGGCCTTTTGC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DU87TF U 1
AF RS1GO65TF U 1
AF RS1A546JQ C 1
AF RS1A546TF U 397
AF RS1C434TF U 417
AF RS1DU87JQ C 129
BS 1 43 RS1DU87TF
BS 44 46 RS1GO65TF
BS 47 122 RS1DU87TF
BS 123 124 RS1GO65TF
BS 125 186 RS1DU87TF
BS 187 187 RS1GO65TF
BS 188 189 RS1DU87TF
BS 190 190 RS1GO65TF
BS 191 192 RS1DU87TF
BS 193 195 RS1GO65TF
BS 196 493 RS1DU87TF
BS 494 494 RS1GO65TF
BS 495 625 RS1DU87TF
BS 626 731 RS1A546TF
BS 732 732 RS1C434TF
BS 733 775 RS1A546TF
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BS 792 792 RS1DU87JQ
BS 793 810 RS1C434TF
BS 811 870 RS1DU87JQ

RD RS1DU87TF 625 0 0
GGACTCGACCTAAAGCTTAAACCCTAGCAACCGCGTAGAAAGA***GAAAAGGCGAAAGC
TTCTCACAAGGTTAATAACAATGGCTGAGCAACAAGAGATCCTCGATTCAGTGTCGGCAG
CC**AGTGAAACCAGATCCAATAACGGACACTGAAGTCGAAGAAGCTGCAGAGAAACGCG
GGAGAGGGG*GAG**CGGAGGAAACAGAGGATGGAGGCGAATCCAAGAAGCAGAAAGTGG
GAGAGGAAGAGAAACCCAACGGGTCGGATCCGGTCAAGCTGGGTCCGAAGGAGTTCGTCA
CCTCTGTGGCGATGTTTGATTACTTCACCAAGTTCATGCATTTCTGGCCGACAGATCTCG
ATGTCAACAAGTATGAACACATGGTGCTGTTAGATCTGATCAAGAAGGGCCATACTGAGC
CTGACAATAAGATTGGGGGAGGGATCAAAGGCTTCCAAGTGAGAACCCACCCGATGTGGA
AAAGCAGGTGCTTTTTTCTGGTTAGGGAAGACGACACTGCTGACGATTTCAGCTACAGGA
AGTGCGTTGATCACATCCTACCTTTGCCTGAAAACATGAAGACTCCTGGGTCTAACGGTA
ATGGACATGGTGGTGGTAGAA*GAG

QA 1 625 1 625
DS 

RD RS1GO65TF 625 0 0
GGACTCGACCTAAAGCTTAAACCCTAGCAACCGCGTAGAAAGAAGAGAAAAGGCGAAAGT
TTCTCACAAGGTTAATAACAATGGCTGAGCAACAAGAGATCCTCGATTCAGTGTCGGCAG
CCGAAGTGAAACCAGATCCAATAACGGACACTGAAGTCGAAGAAGCTGCAGAGAAACGCG
GGAGAGAGGAGACGACGGAGGAAACAGAGGATGGAGGCGAATCCAAGAAGCAGAAAGTGG
GAGAGGAAGAGAAACCCAACGGGTCGGATCCGGTCAAGCTGGGTCCGAAGGAGTTCGTCA
CCTCTGTGGCGATGTTTGATTACTTCACCAAGTTCATGCATTTCTGGCCGACAGATCTCG
ATGTCAACAAGTATGAACACATGGTGCTGTTAGATCTGATCAAGAAGGGCCATACTGAGC
CTGACAATAAGATTGGGGGAGGGATCAAAGGCTTCCAAGTGAGAACCCACCCGATGTGGA
AAAGCAGGTGCTTCTTTCTGGTTAGGGAAGACGACACTGCTGACGATTTCAGCTACAGGA
AGTGCGTTGATCACATCCTACCTTTGCCTGAAAACATGAAGACTCCTGGGTCTAACGGTA
ATGGACATGGTGGTGGTAGAA*GAG

QA 1 625 1 625
DS 

RD RS1A546JQ 775 0 0
GGACTCGACCTAAAGCTTAAACCCTAGCAACCGCGTAGAAAGAAGAGAAAAGGCGAAAGC
TTCTCACAAGGTTAATAACAATGGCTGAGCAACAAGAGATCCTCGATTCAGTGTCGGCAG
CCGAAGTGAAACCAGATCCAATAACGGACACTGAAGTCGAAGAAGCTGCAGAGAAACGCG
GGAGAGAGGAGACGACGGAGGAAACAGAGGATGGAGGCGAATCCAAGAAGCAGAAAGTGG
GAGAGGAAGAGAAACCCAACGGGTCGGATCCGGTCAAGCTGGGTCCGAAGAAGTTCGTCA
CCTCTGTGGCGATGTTTGATTACTTCACCAAGTTCATGCATTTCTGGCCGACAGATCTCG
ATGTCAACAAGTATGAACACATGGTGCTGTTAGATCTGATCAAGAAGGGCCATACTGAGC
CTGACAATAAGATTGGGGGAGGGATCAAAGGCTTCCAAGTGAGAACCCACCCGATGTGGA
AAAGCAGGTGCTTCTTTCTGGTTAGGGAAGACGACACTGCTGACGATTTCAGCTACAGGA
AGTGCGTTGATCACATCCTACCTTTGCCTGAAAACATGAAGACTCCTGGGTCTAACGGTA
ATGGACATGGTGGTGGTAGAA*GAGGTGGCCGCGGTGGTGGCAGGGGTGGGAGATTCAGA
AGATGAATTGACCCTTTTGTTGCTTTGTCGAAATTTTGGAGCTTTTAATGTTAACTTCTG
TTTGCTAAAAAACTTATTTAAGTTATGATCTTGTTGAATGCTGTTGTTATTTTCC

QA 1 775 1 775
DS 

RD RS1A546TF 384 0 0
TGATCAAGAAGGGCCATACTGAGCCTGACAATAAGATTGGGGGAGGGATCAAAGGCTTCC
AAGTGAGAACCCACCCGATGTGGAAAAGCAGGTGCTTCTTTCTGGTTAGGGAAGACGACA
CTGCTGACGATTTCAGCTACAGGAAGTGCGTTGATCACATCCTACCTTTGCCTGAAAACA
TGAAGACTCCTGGGTCTAACGGTAATGGACATGGTGGTGGTAGAAAGAGGTGGCCGCGGT
GGTGGCAGGGGTGGGAGATTCAGAAGATGAATTGACCCTTTTGTTGCTTTGTCGAAATTT
TGGAGCTTTTAATGTTAACTTCTGTTTGCTAAAAA*CTTATTTAAGTTATGATCTTGTTG
AATGCTGTTGTTATTTTCC
CGGAG

QA 1 379 1 379
DS 

RD RS1C434TF 394 0 0
GAGCCTGACAATAAGATTGGGGGAGGGATCAAAGGCTTCCAAGTGAGAACCCACCCGATG
TGGAAAAGCAGGTGCTTCTTTCTGGTTAGGGAAGACGACACTGCTGACGATTTCAGCTAC
AGGAAGTGCGTTGATCACATCCTACCTTTGCCTGAAAACATGAAGACTCCTGGGTCTAAC
GGTAATGGACATGGTGGTGGTAGAA*GAGGTGGCCGCGGTGGTGGCAGGGGTGGGAGATT
CAGAAGATGAATTGACCCTTTTGTTGCTTTGCCGAAATTTTGGAGCTTTTAATGTTAACT
TCTGTTTGCTAAAAAACTTATTTAAGTTATGATCTTGTTGAATGCTGTTGTTATTTTCCG
GAGAATGTTTGTCACTTTATTGTTCAAGAACCGG

QA 1 394 1 394
DS 

RD RS1DU87JQ 742 0 0
AAACCAGATCCAATAACGGACACTGAAGTCGAAGAAGCTGCAGAGAAACGCGGGAGAGGG
G*GAG**CGGAGGAAACAGAGGATGGAGGCGAATCCAAGAAGCAGAAAGTGGGAGAGGAA
GAGAAACCCAACGGGTCGGATCCGGTCAAGCTGGGTCCGAAGGAGTTCGTCACCTCTGTG
GCGATGTTTGATTACTTCACCAAGTTCATGCATTTCTGGCCGACAGATCTCGATGTCAAC
AAGTATGAACACATGGTGCTGTTAGATCTGATCAAGAAGGGCCATACTGAGCCTGACAAT
AAGATTGGGGGAGGGATCAAAGGCTTCCAAGTGAGAACCCACCCGATGTGGAAAAGCAGG
TGCTTTTTTCTGGTTAGGGAAGACGACACTGCTGACGATTTCAGCTACAGGAAGTGCGTT
GATCACATCCTACCTTTGCCTGAAAACATGAAGACTCCTGGGTCTAACGGTAATGGACAT
GGTGGTGGTAGAA*GAGGTGGCCGCGGTGGTGGCAGGGGTGGGAGATTCAGAAGATGAAT
TGACCCTTTTGTTGCTTTGTCGAAATTTTGGAGCTTTTAATGTTAACTTCTGTTTGCTAA
AAAACTTATTTAAGTTATGATCTTGTTGAATGCTGTTGTTATTTTCCGGAGAATGTTTGT
CACCTTATTGTTCAAGAACCGGAAGCTACAGCTCGTCTCTATGTTCACAACTTGAGAGTA
TACTTGAATTTGGGCCTTTTGC

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 6

CO CL1291Contig1 876 6 2 U
AAAATTAAAAGGTGAAGAGTAAATATAATATGCAAAAGGCAAGAATGATTCTGATTCAAG
AATTCTTACAAAAGTAAAACAACGGTGGTGAGAGTTTTGGCATTTCCGATAACGAAGTGC
TGTTCCCAAGGGATCAAAAACAATTTCAACTGTGTTTCACCAGCAGCAATATGTTTTTTA
TTCCAGTCAAAAAATACTAAAAACAAAAAGCAAAACTCAGCCGCAAGGGAGAAGCCGGAA
TCAGTGGTGGTGCTCATCGTCTTCATCACCGTGACCATCAGGAGGCCCACCTGGACCAAC
CACTTCCAGCTCAAAGTACTGAGTGCAGACCGGGCATTCAAAAGACTTTCCTTTCTCCAG
CCAGAACCACACAACGTCGTGCTCATCCTCGCCTTCACCACCAGGGCATCCCACAATACG
CTTGTCATAGTAAGACTTCACGATAGCAGGAGATTCCTTAGTTCCAAAAGGACCTTCAGG
GAAGTCAATGTCGAGCAGCCTCCTCCCCTCAAGTTCAGCTTGAAGCTCCTCCTTTTCATG
ACCAGTTGCGATGGGCATAACATCCTCCACCTTCTTCTTCGCAACAACGGTCTCAACTGA
TTCGGAGCTGAAATGGCGAGGGATAAGGGAAGAGGAAGCGGGATTGGCTGATCGGTAGAA
GCCAACGGGTCTCACGGTGGTGGCTATAGATCGGCGAGGAGAAGCGGCGGCGACATCGGA
AGCTAGGGTTTTGAGACCAGAGGAGACGATTCTTCTCCACATGATGATGATTGTGTGTTT
GTGTCGTGAATCTCAGGTCACCCCTCCAACTCCAAGGATTAGCGAATCTCGAATCTCTTC
TCACCGATGCTCTTTTTCTCAGTTGACCTCTGGGCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D372JQ U 51
AF RS1GB10JQ U 2
AF RS1EJ68JQ U 1
AF RS1EJ68TF C 54
AF RS1GB10TF C 265
AF RS1D372TF C 256
BS 1 780 RS1EJ68JQ
BS 781 876 RS1D372TF

RD RS1D372JQ 559 0 0
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GGAGCT

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DS 

RD RS1GB10JQ 605 0 0
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GTTCCCAAGGGATCAAAAACAATTTCAACTGTGTTTCACCAGCAGCAATATGTTTTTTAT
TCCAGTCAAAAAATACTAAAAACAAAAAGCAAAACTCAGCCGCAAGGGAGAAGCCGGAAT
CAGTGGTGGTGCTCATCGTCTTCATCACCGTGACCATCAGGAGGCCCACCTGGACCAACC
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CAGAACCACACAACGTCGTGCTCATCCTCGCCTTCACCACCAGGGCATCCCACAATACGC
TTGTCATAGTAAGACTTCACGATAGCAGGAGATTCCTTAGTTCCAAAAGGACCTTCAGGG
AAGTCAATGTCGAGCAGCCTCCTCCCCTCAAGTTCAGCTTGAAGCTCCTCCTTTTCATGA
CCAGTTGCGATGGGCATAACATCCTCCACCTTCTTCTTCGCAACAACGGTCTCAACTGAT
TCGGA

QA 1 605 1 605
DS 

RD RS1EJ68JQ 782 0 0
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AATTCTTACAAAAGTAAAACAACGGTGGTGAGAGTTTTGGCATTTCCGATAACGAAGTGC
TGTTCCCAAGGGATCAAAAACAATTTCAACTGTGTTTCACCAGCAGCAATATGTTTTTTA
TTCCAGTCAAAAAATACTAAAAACAAAAAGCAAAACTCAGCCGCAAGGGAGAAGCCGGAA
TCAGTGGTGGTGCTCATCGTCTTCATCACCGTGACCATCAGGAGGCCCACCTGGACCAAC
CACTTCCAGCTCAAAGTACTGAGTGCAGACCGGGCATTCAAAAGACTTTCCTTTCTCCAG
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CTTGTCATAGTAAGACTTCACGATAGCAGGAGATTCCTTAGTTCCAAAAGGACCTTCAGG
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TTCGGAGCTGAAATGGCGAGGGATAAGGGAAGAGGAAGCGGGATTGGCTGATCGGTAGAA
GCCAACGGGTCTCACGGTGGTGGCTATAGATCGGCGAGGAGAAGCGGCGGCGACATCGGA
AGCTAGGGTTTTGAGACCAGAGGAGACGATTCTTCTCCACATGATGATGATTGTGTGTTT
CC

QA 1 780 1 780
DS 

RD RS1EJ68TF 729 0 0
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TCCCAAGGGATCAAAAACAATTTCAACTGTGTTTCACCAGCAGCAATATGTTTTTTATTC
CAGTCAAAAAATACTAAAAACAAAAAGCAAAACTCAGCCGCAAGGGAGAAGCCGGAATCA
GTGGTGGTGCTCATCGTCTTCATCACCGTGACCATCAGGAGGCCCACCTGGACCAACCAC
TTCCAGCTCAAAGTACTGAGTGCAGACCGGGCATTCAAAAGACTTTCCTTTCTCCAGCCA
GAACCACACAACGTCGTGCTCATCCTCGCCTTCACCACCAGGGCATCCCACAATACGCTT
GTCATAGTAAGACTTCACGATAGCAGGAGATTCCTTAGTTCCAAAAGGACCTTCAGGGAA
GTCAATGTCGAGCAGCCTCCTCCCCTCAAGTTCAGCTTGAAGCTCCTCCTTTTCATGACC
AGTTGCGATGGGCATAACATCCTCCACCTTCTTCTTCGCAACAACGGTCTCAACTGATTC
GGAGCTGAAATGGCGAGGGATAAGGGAAGAGGAAGCGGGATTGGCTGATCGGTAGAAGCC
AACGGGTCTCACGGTGGTGGCTATAGATCGGCGAGGAGAAGCGGCGGCGACATCGGAAGC
TAGGGTTTTGAGACCAGAGGAGACGATTCTTCTCCACATGATGATGATTGTGTGTTT
CC

QA 11 727 11 727
DS 

RD RS1GB10TF 544 0 0
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GCAGACCGGGCATTCAAAAGACTTTCCTTTCTCCAGCCAGAACCACACAACGTCGTGCTC
ATCCTCGCCTTCACCACCAGGGCATCCCACAATACGCTTGTCATAGTAAGACTTCACGAT
AGCAGGAGATTCCTTAGTTCCAAAAGGACCTTCAGGGAAGTCAATGTCGAGCAGCCTCCT
CCCCTCAAGTTCAGCTTGAAGCTCCTCCTTTTCATGACCAGTTGCGATGGGCATAACATC
CTCCACCTTCTTCTTCGCAACAACGGTCTCAACTGATTCGGAGCTGAAATGGCGAGGGAT
AAGGGAAGAAGAAGCGGGATTGGCTGATCGGTAGAAGCCAACGGGTCTCACGGTGGTGGC
TATAGATCGGCGAGGAGAAGCGGCGGCGACATCGGAAGCTAGGGTTTTGAGACCAGGGGA
GACGATTCTTCTCCACATGATGATGATTGTGTGTTTGTGTCGTGAATCTCAGGTTACCCC
TCC
C

QA 1 543 1 543
DS 

RD RS1D372TF 621 0 0
ATCGTCTTCATCACCGTGACCATCAGGAGGCCCACCTGGACCAACCACTTCCAGCTCAAA
GTACTGAGTGCAGACCGGGCATTCAAAAGACTTTCCTTTCTCCAGCCAGAACCACACAAC
GTCGTGCTCATCCTCGCCTTCACCACCAGGGCATCCCACAATACGCTTGTCATAGTAAGA
CTTCACGATAGCAGGAGATTCCTTAGTTCCAAAAGGACCTTCAGGGAAGTCAATGTCGAG
CAGCCTCCTCCCCTCAAGTTCAGCTTGAAGCTCCTCCTTTTCATGACCAGTTGCGATGGG
CATAACATCCTCCACCTTCTTCTTCGCAACAACGGTCTCAACTGATTCGGAGCTGAAATG
GCGAGGGATAAGGGAAGAAGAAGCGGGATTGGCTGATCGGTAGAAGCCAACGGGTCTCAC
GGTGGTGGCTATAGATCGGCGAGGAGAAGCGGCGGCGACATTGGAAGCTAGGGTTTTGAG
ACCAGAGGAGACGATTCTTCTCCACATGATGATGATTGTGTGTTTGTGTCGTGAATCTCA
GGTCACCCCTCCAACTCCAAGGATTAGCGAATCTCGAATCTCTTCTCACCGATGCTCTTT
TTCTCAGTTGACCTCTGGGCC

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 6

CO CL1292Contig1 710 6 10 U
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TTAAATTGGTTTACAAAAATAAACCACATCAAAAGAAAAATCTAAAAAAAAAAAAAAAAT
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TCCACATCTTGATTCTCTTAAGCATGTCTCATTGTCTCAGGTCAAAAAGATTCTCTTGAG
CCGAGCCGGATGCAGAGCAGGCCATGAAGGTCAACAAACACCACAAATCCAGATGGCTTG
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CATCTTTTTCTGCCTCATCCACCTTTCTTTACCAAGAAAAAAAAA*TATCATAATCAAAT
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BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 25 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 
30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F271JQ U 1
AF RS1E006JQ U 2
AF RS1H112JQB U 34
AF RS1E006TF C 33
AF RS1H112TF C 113
AF RS1F271TF C 57
BS 1 314 RS1F271JQ
BS 315 315 RS1H112JQB
BS 316 387 RS1F271JQ
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BS 659 710 RS1E006TF

RD RS1F271JQ 574 0 0
GCCAATGAAATTTTTGTTTTATAAATTAAATTTGGTTTACAAACTAAATTGGTTTACAAA
TTAAATTGGTTTACAAAAATAAACCACATCAAAAGAAAAATCTAAAAAAAAAAAAAAAAT
AAACCACATCTTCACCGCCGCCTCTTCAATTGGACTTACAGCGACCACCACCACAACCCT
GTGACTTGGGAGCACCACTACTGCACTGCGACTGGCGGAAAGAAGTCCGATAGTAACGCT
TCCACATCTTGATTCTCTTAAGCATGTCTCATTGTCTCAGGTCAAAAAGATTCTCTTGAG
CCGAGCCGGATGCAAAGCAGGCCATGAAGGTCAACAAACACCACAAATCCAGATGGCTTG
AAGCTGAAAGGCATCACGAGACCAGGAAAGATAGCAAGGTTCCTCTTCACAACCAAACAT
CATCTTTTTCTGCCTCATCCACCTTTCTTTACCAAGAAAAAAAAA*TATCATAATCAAAT
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CAGTACACCGCAGTCTCTCGGAAAGGATTCCACT

QA 1 574 1 574
DS 

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TAAATTGGTTTACAAAAATAAACCACATCAAAAGAAAAATCTAAAAAAAAAAAAAAAATA
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AGTACACCGCAGTCTCTCGGAAAGGATTCCACTGCAGATGTGATGACATCTCTAAAA

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DS 

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AATTTGATTCTGTAAAGAAAAAAAA

QA 1 625 1 625
DS 

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T
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GGCGGAGAGAAGTCCGATAGTAACGCTTCCACATCTTGATTCTCTTAAGCATGTCTCATT
GTCTCAGGTCAGAAAGATTCTCTTGAGCCGAGCCGGATGCAGAGCAGGCCATGAAGGTCA
ACAAACACCACAAATCCAGATGGCTTGAAGCTGAGAGGCATCACGAGACCAGGAGAGATA
GCAAGGTTCCTCTTCACAACCAAACATCATCTTTTTCTGCCTCATCCACCTTTCTTTACC
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TGCAGATGTGATGACATCTCTAAAAGATGAGATGGGAAGCTTTGCATATACAAATAAAGA
AATTTGATTCTGTAAAGAAAAAAAAGAAACAATGGTTACTAGTTAGGATAAGATGACATA
GGAAAGACAGAGAATCC

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DS 

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ACAACCCTGTGACTTGGGAGCACCACTACTGCACTGCGACTGGCGGAGAGAAGTCCGATA
GTAACGCTTCCACATCTTGATTCTCTTAAGCATGTCTCATTGTCTCAGGTCAGAAAGATT
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AAAAAAGAAACAATGGTTACTAGTTAGGATAAGAT
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QA 1 575 1 575
DS 

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CCCTGTGACTTGGGAGCACCACTACTGCACTGCGACTGGCGGAGAGAAGTCCGATAGTAA
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TGAGCCGAGCCGGATGCAGAGCAGGCCATGAAGGTCAACAAACACCACAAATCCAGATGG
CTTGAAGCTGAGAGGCATCACGAGACCAGGAGAGATAGCAAGGTTCCTCTTCACAACCAA
ACATCATCTTTTTCTGCCTCATCCACCTTTCTTTACCAAGAAAAAAAAA*TATCATAATC
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AAGATGAGATGGGAAGCTTTGCATATACAAATAAAGAAATTTGATTCTGTAAAGAAAAAA
AAGAAACAATGGTTACTAGTTAGGATAAGAT
CC

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 4

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CGGATTTTTTAAATGGAGCAATATGAAGATGATGGATATGACTATGGAAGAGGCACCAAC
GACGATATATGTGATGCCGAGGAAGTCGTCTCTTCCTCCTAACCAACTTGACGTGGAGAG
AATAAGCTTCTTCTGCCCACTAAAGCTATAAGTGTTGTAGTTGTTGAACAAATTCACCAC
AACAACGCTCCCTGGTTCCAAGTCCTCTTCGATTCTTCCGTATAGTTTCCTGAAGCTTAG
TAGAGCAGCTGCTCGCATCCACACAATAAAGTCCTCTTGGTCACTTAGAGGAACTTTAGG
ATCCAACTTAGCTCCACCAACCAAAGAACCGTTCTGGAAATTGAAAGGATAAACATCCTT
TCCAAACTTGTGCTCACGGTCACTCTTCCAGGCAATGTTGTTCCGGCTCACCTTCAGCTG
AGCAAAGGTAAACGTATCATTGAACATACTCCAAGCGATTAACCCGCAGGGGACAATGGG
GAGACCATCATTAGATGACTCCTCGGGTTCACAAGCACTCGTGTGGCTATACTCACGTCC
GTGTAACAGTTGCTGATCACTTCTACTCTTTACATACCGGCGGTGGTTCTGATAGTAGTT
ATCAAGCTGGTAGTAGATAAAAATGGGAGCTTTCATATGCTTTTGTACCTTTAAGTAACG
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TTCAGGAATACACTCAACATCATACCGGTCAACAATTTCAATAGCATGACGAGAAGCACG
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CGAGGTTGGAGTTAAGACTGGCCTACAAGCTGGTAGTTTCTGCTGCTTAAACTGATACAA
TACTTTGGATCGGCTGGAACGTAAGGAGGATGATTGAGGAGGAGCACGATTCATCAAAGT
GTTGGATCCATCCACTTCCATCATTTTTATCTTCTCTCCACTTCAACTAATACATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AA35JQ U 1
AF RS1A231JQ U 22
AF RS1A231TR U 22
AF RS1A231TF C 403
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RD RS1AA35JQ 775 0 0
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CAGGCTCTTGAGTAATGTATATATGAACCTGGAATCGGAATATGTTAGAGAAAGAATGGT
AA***CAGTTTCTCAACTCGAAAGGCTTTTCTTGTTCCAAGAATTGTCTCCATAAGGCCT
CGGATTTTTTAAATGGAGCAATATGAAGATGATGGATATAACTATGGAAGAGGCACCAAC
GACGATATATGTGATACCGAGAAAATCATTTCTTCCTCCTAACCAACTTGACGTGGAGAG
AATAAGCTTCTTCTGCCCACTAAAGCTATAAGTGTTGTAGTTGTTGAACAAATTCACCAC
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ATCCAACTTAGCTCCACCAACCAAAGAACCGTTCTGGAAATTGAAAGGATAAACATCCTT
TCCAAACTTGTGCTCACGGTCACTCTTCCAGGCAATGTTGTTCCGGCTCACCTTCAGCTG
AGCAAAGGTAAAGGTATCATTGAACATACTCCAAGCGATTAACCCGCAGGGGACAATGGG
GAGACCATCATTAGATGACTCCTCGGGTTCACAAGCACTCGTGTGGCTATACTCCCGTCC
GTGTAACAGTTGCTGATCACTTCTACTCTTTACATACCGGCGGTGGTTCTGATAG

QA 1 775 1 775
DS 

RD RS1A231JQ 776 0 0
GGTTCTATACT
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AATCGGAATATGTTAGAGAAAGAATGGTAACAACAGTTTCTTAACTCGAAAGGCTTTTCT
TGTTCCAAGAATTGTCTCCATAAGGCCTCGGATTTTTTAAATGGAGCAATATGAAGATGA
TGGATATGACTATGGAAGAGGCACCAACGACGATATATGTGATGCCGAGGAAGTCGTCTC
TTCCTCCTAACCAACTTGACGTGGAGAGAATAAGCTTCTTCTGCCCACTAAAGCTATAAG
TGTTGTAGTTGTTGAACAAATTCACCACAACAACGCTCCCTGGTTCCAAGTCCTCTTCGA
TTCTTCCGTATAGTTTCCTGAAGCTTAGTAGAGCAGCTGCTCGCATCCACACAATAAAGT
CCTCTTGGTCACTTAGAGGAACTTTAGGATCCAACTTAGCTCCACCAACCAAAGAACCGT
TCTGGAAATTGAAAGGATAAACATCCTTTCCAAACTTGTGCTCACGGTCACTCTTCCAGG
CAATGTTGTTCCGGCTCACCTTCAGCTGAGCAAAGGTAAACGTATCATTGAACATACTCC
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AAGCACTCGTGTGGCTATACTCACGTCCGTGTAACAGTTGCTGATCACTTCTACTCTTTA
CATACCGGCGGTGGTTCTGATAGTAGTTATCAAGCTGGTAGTAGA

QA 12 776 12 776
DS 

RD RS1A231TR 863 0 0
GGTTCTATACT
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AATCGGAATATGTTAGAGAAAGAATGGTAACAACAGTTTCTTAACTCGAAAGGCTTTTCT
TGTTCCAAGAATTGTCTCCATAAGGCCTCGGATTTTTTAAATGGAGCAATATGAAGATGA
TGGATATGACTATGGAAGAGGCACCAACGACGATATATGTGATGCCGAGGAAGTCGTCTC
TTCCTCCTAACCAACTTGACGTGGAGAGAATAAGCTTCTTCTGCCCACTAAAGCTATAAG
TGTTGTAGTTGTTGAACAAATTCACCACAACAACGCTCCCTGGTTCCAAGTCCTCTTCGA
TTCTTCCGTATAGTTTCCTGAAGCTTAGTAGAGCAGCTGCTCGCATCCACACAATAAAGT
CCTCTTGGTCACTTAGAGGAACTTTAGGATCCAACTTAGCTCCACCAACCAAAGAACCGT
TCTGGAAATTGAAAGGATAAACATCCTTTCCAAACTTGTGCTCACGGTCACTCTTCCAGG
CAATGTTGTTCCGGCTCACCTTCAGCTGAGCAAAGGTAAACGTATCATTGAACATACTCC
AAGCGATTAACCCGCAGGGGACAATGGGGAGACCATCATTAGATGACTCCTCGGGTTCAC
AAGCACTCGTGTGGCTATACTCACGTCCGTGTAACAGTTGCTGATCACTTCTACTCTTTA
CATACCGGCGGTGGTTCTGATAGTAGTTATCAAGCTGGTAGTAGATAAAAATGGGAGCTT
TCATATGCTTTTGTACCTTTAAGTAACGAGTACAGTTCTTAGAGATGGATGAGTCTGTAA
TGTAAGAGAGTT

QA 12 863 12 863
DS 

RD RS1A231TF 795 0 0
ATAGTTT
CTGAAGCTTAGTAGAGCAGCTGCTCGCATCCACACAATAAAGTCCTCTTGGTCACTTAGA
GGAACTTTAGGATCCAACTTAGCTCCACCAACCAAAGAACCGTTCTGGAAAT*GAAAGGA
TAAACATCCTTTCCAAACTTGTGCTCACGGTCACTCTTCCAGGCAATGTTGTTCCGGCTC
ACCTTCAGCTGAGCAAAGGTAAACGTATCATTGAACATACTCCAAGCGATTAACCCGCAG
GGGACAATGGGGAGACCATCATTAGATGACTCCTCGGGTTCACAAGCACTCGTGTGGCTA
TACTCACGTCCGTGTAACAGTTGCTGATCACTTCTACTCTTTACATACCGGCGGTGGTTC
TGATAGTAGTTATCAAGCTGGTAGTAGATAAAAATGGGAGCTTTCATATGCTTTTGTACC
TTTAAGTAACGAGTACAGTTCTTAGAGATGGATGAGTCTGTAATGTAAGAGAGTTTGTTG
GTTCTATATTCTTCAGGAATACACTCAACATCATACCGGTCAACAATTTCAATAGCATGA
CGAGAAGCACGGAGAGTAACGAAGCCAATGGGGATGAAAACAAAACCCATCAACATAAAC
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AACTGATACAATACTTTGGATCGGCTGGAACGTAAGGAGGATGATTGAGGAGGAGCACGA
TTCATCAAAGTGTTGGATCCATCCACTTCCATCATTTTTATCTTCTCTCCACTTCAACTA
ATACATAT

QA 8 795 8 795
DS 



AS 1 5

CO CL1294Contig1 790 5 15 U
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TTCACTAGTAACTATTCTCAAATACTCTGTTTGTGCATAAATGGCTTCTTTTTCATCCCT
TGTGGCTATCATCTTCTTCTTATGCTCTCTCGCCGCTGCAAATGAAGTCACCGTCGGTGG
AAAATCCGGCGACTGGAAGATCCCTCCTTCCTCTTCTAACTCATTCACGGAATGGGCCCA
AAAAGCTCGCTTCAAAGTCGGCGACTTTATCGTTTTCCGGTATGAAGCGGGTAAAGACTC
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CTACACAGATGGAGAGACCAAGGTGAAGTTGGACAGGTCCGGTCCATTTTACTTCATCAG
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TCTTGTTCTTGGTCTATGGTCTTGGTTCTAATTTGGAACCATGTGTGTTTTGTTTTATGG
ATGAGCTTTTCGTTTCAGAAAAGCTCTTTCTTTTAGTTTCTGTTTTTATGGATTACATCT
TGTTAGTTTAGAGATCTTTGTTGGTCTCGGTTCCTCACTACTATTTTATAGTTAAATTAA
ATTTATTGTT


BQ
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30 15 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 

AF RS1FE03TF U 6
AF RS1GL43TF U 1
AF RS1GL43JQ C 1
AF RS1BX29JQ C 56
AF RS1BX29TF U 64
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CAT
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ATCC

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DS 

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TTCACTAGTAACTATTCTCAAATACTCTGTTTGTGCATAAATGGCTTCTTTTTCATCCCT
TGTGGCTATCATCTTCTTCTTATGCTCTCTCGCCGCTGCGAATGAAGTCACCGTCGGTGG
AAAATCCGGCGACTGGAAGATCCCTCCTTCCTCTTCTAACTCATTCACGGAATGGGCCCA
AAAAGCTCGCTTCAAAGTCGGCGACTTTATCGTTTTCCGGTATGAAGCGGGTAAAGACTC
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ATGAGCTTTTCGTTTCAGAAAAGCTCTTTCTTTTAGTTTCTGTTTTTATGGATTACATCT
TGTTAGTTTAGAGATCTTTGTTGGTCTCGGTTCCTCACTACTATTTTATAGTTAAATTAA

QA 1 780 1 780
DS 

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TTC
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CTTGTGGCTATCATCTTCTTCTTATGCTCTCTCGCCGCTGCAAATGAAGTCACCGTCGGT
GGAAAATCCGGCGACTGGAAGATCCCTCCTTCCTCTTCTAACTCATTCACGGAATGGGCC
CAAAAAGCTCGCTTCAAAGTCGGCGACTTTATCGTTTTCCGGTATGAAGCGGGTAAAGAC
TCTGTTTTGCAAGTAACACGAGAAGCATACAAGAGCTGCAACACCACGAACCCTTTAGCT
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AGTGGAGTCGATGGTCACTGTGAGAAAGGTCAG*AAGGTGAGCCTCGTCGTGGTTAGTCC
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GGTCTTGTTCTTGGTCTATGGTCTTGGTTCTAATTTGGAACCATGTGTGTTTTGTTTTAT
GGATGAGCTTTTCGTTTCAGAAAAGCTCTTTCTTTTAGTTTCTGTTTTTATGGATTACAT
CTTGTTAGTTTAGAGATCTTTGTTGGTCTCGGTTCCTCACTACTATTTTATAGTTAAATT
AAATTTATTGTT

QA 4 735 4 735
DS 

RD RS1BX29TF 727 0 0
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GGCTATCATCTTCTTCTTATGCTCTCTCGCCGCTGCAAATGAAGTCACCGTCGGTGGAAA
ATCCGGCGACTGGAAGATCCCTCCTTCCTCTTCTAACTCATTCACGGAATGGGCCCAAAA
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TTTGCAAGTAACACGAGAAGCATACAAGAGCTGCAACACCACGAACCCTTTAGCTAACTA
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AGTCGATGGTCACTGTGAGAAAGGTCAGTAAGGTGAGCCTCGTCGTGGTTAGTCCGCGTC
ACAAAGCTATTTCTCCCGGCTCTCTTCTCCGGTTGAGTTCGAAGATGGTCCATCCGTGGC
TCCAGCTCCGACTAGTGGCTCAGCTAGGCTTGGTGGTGGGTTTGTTGCTGTGTTAGGTCT
TGTTCTTGGTCTATGGTCTTGGTTCTAATTTGGAACCATGTGTGTTTTGTTTTATGGATG
AGCTTTTCGTTTCAGAAAAGCTCTTTCTTTTAGTTTCTGTTTTTATGGATTACATCTTGT
TAGTTTAGAGATCTTTGTTGGTCTCGGTTCCTCACTACTATTTTATAGTTAAATTAAATT
TATT
GTT

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 4

CO CL1295Contig1 1030 4 15 U
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TCAAGAAGAGCTTCTCATCAGATCGGTTTCCCATGGCTGCAGTCGCTAACACCGCCGCTA
TTTTCGCCTCTCCTTCCCAGCCTTTATCTTCTAAACGCAGTCTATTGTACAGTTCAACGA
TTAGTCCACAACAAAGGAGATTTCCAACGAGGAAGCTTGATCTCCAAGTAAAAGCTGCTG
CCACGACTCTTGCCCCCCTCGAAGAGATCAAAGAATATAAGCTTCCTTCATGGGCAATGT
TCGAGATGGGGAGAGCTCCAGTGTACTGGAAAACCATGAATGGTCTTCCTCCAACCGCAG
GTGAAAAGTTGAAACTTTTCTATAACCCAGCTGCTACTGAACTCACTCCTAACGAGGACT
ATGGGGTTGCTTTCAACGGAGGTTTTAACCAACCAATCATGTGTGGTGGGGAACCAAGAG
CAATGCTTAAAAAAGATCGAGGCAAAGCCGATTCTCCCATATACACTATGCAGATTTGCA
TTCCTAAGCACGCTGTGAATTTGATATTCTCATTCACCAATGGTGTCGACTGGGACGGTC
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ATAGATGCAATCTAGATCTCGTTCCTGGGTGTATGGATACAAATTCAGAACATTTCAACC
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AACACAGATATGTTTATACCAGTGTGAGTTTGAATATGTATACATGTGGATGTGGTAATT
GATATACGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1GI51TF U 1
AF RS1EN29TF U 21
AF RS1H591TF U 366
AF RS1H591JQB C 432
BS 1 127 RS1GI51TF
BS 128 128 RS1EN29TF
BS 129 163 RS1GI51TF
BS 164 164 RS1EN29TF
BS 165 189 RS1GI51TF
BS 190 190 RS1EN29TF
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RD RS1GI51TF 442 0 0
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TCAAGAAGAGCTTCTCATCAGATCGGTTTCCCATGGCTGCAGTCGCTAACACCGCCGCTA
TTTTCGCGTCTCCTTCCCAGCCTTTATCTTCTAAACGCAGTCTCTTGTACAGTTCAACGA
TTAGTCCACTACAAAGGAGATTTCCAACGAGGAAGCTTGATCTCCAAGTAAAAGCTGCTG
CCACGACTCTTGCCCCCCTCGAAGAGATCAAAGAATATAAGCTTCCTTCATGGGCAATGT
TCGAGATGGGGAGATCTCCAGTGTACTGGAAAACCATGAATGGTCTTCCTCCAACCGCAG
GTGAAAAGTTGAAACTTTTCTATAACCCAGCTGCTACTGAACCCACTCCTAACGAGGACT
ATGGGGTTGCTTTCAACGGAGG

QA 1 442 1 442
DS 

RD RS1EN29TF 573 0 0
GG
ATCTTGAAACCATATATCAACTACTCTTCCTTCTACCATCCAGAAGAGCTTCTCATCAGA
TCGGTTTCCCATGGCTGCAGTCGCTAACACCGCCGCTATTTTCGCCTCTCCTTCCCAGCC
TTTATCTTCTAAACGCAGTCTATTGTACAGTTCAACGATTAGTCCACAACAAAGGAGATT
TCCAACGAGGAAGCTTGATCTCCAAGTAAAAGCTGCTGCCACGACTCTTGCCCCCCTCGA
AGAGATCAAAGAATATAAGCTTCCTTCATGGGCAATGTTCGAGATGGGGAGAGCTCCAGT
GTACTGGAAAACCATGAATGGTCTTCCTCCAACCGCAGGTGAAAAGTTGAAACTTTTCTA
TAACCCAGCTGCTACTGAACTCACTCCTAACGAGGACTATGGGGTTGCTTTCAACGGAGG
TTTTAACCAACCAATCATGTGTGGTGGGGAACCAAGAGCAATGCTTAAAAAAGATCGAGG
CAAAGCCGATTCTCCCATATACACTATGCAGATTTGCATTCCTAAGCACGCTGTGAATTT
GATATTCTCGCTCACCAATGGTGTCGACTGG

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DS 

RD RS1H591TF 665 0 0
G
AGTTGAAACTTTTCTATAACCCAGCTGCTACTGAACTCACTCCTAACGAGGACTATGGGG
TTGCTTTCAACGGAGGTTTTAACCAACCAATCATGTGTGGTGGGGAACCAAGAGCAATGC
TTAAAAAAGATCGAGGCAAAGCCGATTCTCCCATATACACTATGCAGATTTGCATTCCTA
AGCACGCTGTGAATTTGATATTCTCATTCACCAATGGTGTCGACTGGGACGGTCCATACA
GGCTTCAGTTCCAAGTCCCTAAGAGATGGCAAAACAAACCTATTGAGTTCTTCAATGAGG
GTCTAGCGAATGAGTTGAGTCAAGATGGAGCCTGCGAGATAGCAATATTTCCTGACTCCA
ACATTGTTGCGACACGGTGCACAATGATTGCCAACTTGACGGTCGAAGGAGGTGATAGAT
GCAATCTAGATCTCGTTCCTGGGTGTATGGATACAAATTCAGAACATTTCAACCCGTTGG
CTAATGTTGATGATGGTTTGCCCTCTCGAGTTATCCGATTCTGATGAATAGAACTGATAC
ATATTCATGTAAATATATAAACACAGATGATTTGTGCACAAAAAAATATATATAAACACA
GATATGTTTATACCAGTGTGAGTTTGAATATGTATACATGTGGATGTGGTAATTGATATA
CGAT

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DS 

RD RS1H591JQB 599 0 0
TTCAACGGAGGTTTTAACCAACCAATCATGTGTGGTGGGGAACCAAGAGCAATGCTTAAA
AAAGATCGAGGCAAAGCCGATTCTCCCATATACACTATGCAGATTTGCATTCCTAAGCAC
GCTGTGAATTTGATATTCTCATTCACCAATGGTGTCGACTGGGACGGTCCATACAGGCTT
CAGTTCCAAGTCCCTAAGAGATGGCAAAACAAACCTATTGAGTTCTTCAATGAGGGTCTA
GCGAATGAGTTGAGTCAAGATGGAGCCTGCGAGATAGCAATATTTCCTGACTCCAACATT
GTTGCGACACGGTGCACAATGATTGCCAACTTGACGGTCGAAGGAGGTGATAGATGCAAT
CTAGATCTCGTTCCTGGGTGTATGGATACAAATTCAGAACATTTCAACCCGTTGGCTAAT
GTTGATGATGGTTTGCCCTCTCGAGTTATCCGATTCTGATGAATAGAACTGATACATATT
CATGTAAATATATAAACACAGATGATTTGTGCACAAAAAAATATATATAAACACAGATAT
GTTTATACCAGTGTGAGTTTGAATATGTATACATGTGGATGTGGTAATTGATATACGAT

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 6

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GGAAGCGAACGTATTAGGGTTTGCTCTTGTACCCTAAACTCCACACCGAAACCCGCCGCC
GTCGCTTTCAAGAAAGATGAAGACGATCTTGTCATCCGAGACGATGGACATCCCCGAAGG
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TCGTGATTTCAAGCATCTCAACCTCGATTTCCAGCTCATCACAGACGCCGTCACCGGCAA
GCGACAGCTCAAGATCGATTCTTGGTTCGGATCCCGCAAAGCCAGTGCTTCCATCAGGAC
CGCTCTGAGCCACGTCAGCAACCTCATCGCCGGTGTCACACAGGGTTTCCTTTACAAGAT
GAGGTTTGTGTATGCTCATTTCCCCATCAATGCTTCCATCTCCGGTGACAACAAGTCTAT
TGAGATCCGTAACTTCCTTGGGGAGAAGAAGGTCAGGAAGGTTGATATGTTGGATGGTGT
TACCATTGTTCGGTCTGAGAAGGTTAAGGATGAGATTACTCTTGAGGGAAATGATATCGA
GCTTGTTTCACGCTCATGCGCTTTGATCAACCAGAAATGCCATGTGAAGAAGAAGGATAT
CAGAAAGTTTCTTGATGGTATTTACGTGAGCGAGAAGGGAAAGATCGCTGTTGAAGAATG
AAGAGAGTATGGTGTGGAAGAGTGATATAGTCGTAGCTTTCTGTTCACTTCTCATATGGG
TTTGTAGTTTTGATTTCTTTGGACCAATTGATAATGCAAACTCATTATTATCCTTTATGT
TTGGGTTTTTATTTACCCTTTTCTATTTAAAGTTTTTGAGACTATTTTATTCTCTACTTA
TTCTTGGAATTGGTTTTGAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 
10 40 25 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RS1DN91TF U 1
AF RS1BI56TF U 29
AF RS1EP86TF U 43
AF RS1DN91JQ C 95
AF RS1BI56JQ C 78
AF RS1EP86JQ C 140
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RD RS1DN91TF 592 0 0
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GTCGCTTTCAAGAAAGATGAAGACGATCTTGTCATCCGAGACGATGGACATCCCCGAAGG
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GCGACAGCTCAAGATCGATTCTTGGTTCGGATCTCGCAAAGCCAGTGCTTCCATCAGAAC
CGCTCTGAGCCACGTCAGCAACCTCATCGCCGGTGTCACTCAGGGTTTCCTTTACAAGAT
GAGGTTTGTGTATGCTCATTTCCCCATCAATGCTTCCATCTCCGGTGACAACAAGTCTAT
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TACCATTGTTCGGTCTGAGAAGGTTAAGGATGAGATTACTCTTGAGGGAAATGATATCGA
GCTTGTTTCACGCTCATGCGCTTTGATCAACCAGAAATGCCATGTGAAGAAG

QA 1 592 1 592
DS 

RD RS1BI56TF 761 0 0
GG
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GTCATCCGAGACGATGGACATCCCCGAAGGCGTCGTGATCAAGGTCCACGCCAAGGTGAT
CGAAGTAGAAGGCCCACGCGGGAAACTCACTCGTGATTTCAAGCATCTCAACCTCGATTT
CCAGCTCATCACAGATGCCGTCGCCGGCAAGCGACAGCTCAAGATCGATTCTTGGTTCGG
ATCCCGCAAAGCCAGTGCTTCCATCAGGACTGCTCTGAGCCACGTCAGCAACCTCATCGC
CGGTGTCACACAGGGTTTCCTTTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTCATTTCCCCATCAA
TGCTTCAATCTCCGGTGACAACAAGTCTATTGAGATCCGTAACTTCCTTGGGGAGAAGAA
GGTCAGGAAGGTTGATATGTTGGATGGTGTTACCATTGTTCGGTCTGAG**GGTTAAGGA
TGAGATTACTCTTGAGGGTAATGATATCGAGCTTGTTTCACGTTCATGCGCTTTGATCAA
CCAGAAATGCCATGTGAAGAAGAAGGATATCAGAAAGTTTCTTGATGGTATTTACGTGAG
CGA**AGGGAAAGATCGCTGTTGAAGAATGAAGAGAGTATGGTGTGGAAGAGTGATATAG
TCGTAGCTTTCTGTTCACTTCTCATATGGGTTTGTAGTTTTGATTTCTTTGGACCAATTG
ATAATGCAAACTCATTATTATCCTTTATGTTTGGGTTTT

QA 3 761 3 761
DS 

RD RS1EP86TF 766 0 0
GG
ACCGAAACCCGCCGCCGTCGCTTTCGAGAAAGATGAAGTCGATCTTGTCATCCGAGACGA
TGGACATCCCCGAAGGCGTCGTGATCAAGGTCCACGCCAAGGTGATCGAAGTAGAAGGCC
CACGCGGGAAACTCACTCGTGATTTCAAGCATCTCAACCTCGATTTTCAGCTCATCACAG
ACGCCGTCACCGGCAAGCGACAGCTCAAGATCGATTCTTGGTTCGGATCCCGCAAAGCCA
GTGCTTCCATCAGGACCGCTCTGAGCCACGTCAGCAACCTCATCGCCGGTGTCACACAGG
GTTTCCTTTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTCATTTCCCCATCAATGCTTCCATCTCCG
GTGACAACAAGTCTATTGAGATCCGTAACTTCCTTGGGGAGAAGAAGGTCAGGAAGGTTG
ATATGTTGGATGGTGTTACCATTGTTCGGTCTGAGAAGGTTAAGGATGAGATTACTCTTG
AGGGAAATGATATCGAGCTAGTTTCACGCTCATGCGCTTTGATCAACCAGAAATGCCATG
TGAAGAAGAAGGATATCAGAAAGTTTCTTGATGGTATTTACGTGAGCGAGAAGGGAAAGA
CCGCTGTTGAAGAATGAAGAGAGTATGGTGTGGAAGAGTGATATAGTCGTGGCTTTCTGT
TCACTTCTCATATGGGTTTGTAGTTTTGATTTCTTTGGACCAATTGATAATGCAAACTCA
TTATTATCCTTTATGTT*GGGTTTT*ATTTACCCTTTTCTATTT

QA 3 766 3 766
DS 

RD RS1DN91JQ 730 0 0
TCCGAGACGATGGACATCCCCGAAGGCGTCGTGATCAAGGTCCACGCCAAGGTGATCGAA
GTAGAAGGTCCACGCGGGAAACTCACTCGTGATTTCAAGCATCTCAACCTCGATTTCCAG
CTCATCACAGACGCCGTCACCGGCAAGCGACAGCTCAAGATCGATTCTTGGTTCGGATCT
CGCAAAGCCAGTGCTTCCATCAGAACCGTTTTGAGCCACGTCAGCAACCTCATCGCCGGT
GTCACTCAGGGTTTCCTTTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTCATTTCCCCATCAATGCT
TCCATCTCCGGTGACAACAAGTCTATTGAGGTCCGTAACTTCCTTGGGGAGAAGAAGGTC
AGGAAGGTTGATATGTTGGATGGTGTTACCATTGTTCGGTCTGAGAAGGTTAAGGATGAG
ATTACTCTTGAGGGAAATGATATCGAGCTTGTTTCACGCTCATGCGCTTTGATCAACCAG
AAATGCCATGTGAAGAAGAAGGATATCAGAAAGTTTCTTGATGGTATTTACGTGAGCGAG
AAGGGAAAGATCGCTGTTGAAGAATGAAGAGAGCATGGTGTGGAAGAGTGATATAGTCGT
AGCTTTCTGTTCACTTCTCATATGGGTTTGTAGTTTTGATTTCTTTGGACCAATTGATAA
TGCAAACTCATTATTATCCTTTATGTTTGGGTTTTTATTTACCCTTTTCTATTTAAAGTT
TTTGAGACTA

QA 1 730 1 730
DS 

RD RS1BI56JQ 785 0 0
TGAAGACGATCTTGTCATCCGAGACGATGGACATCCCCGAAGGCGTCGTGATCAAGGTCC
ACGCCAAGGTGATCGAAGTAGAAGGCCCACGCGGGAAACTCACTCGTGATTTCAAGCATC
TCAACCTCGATTTCCAGCTCATCACAGATGCCGTCGCCGGCAAGCGACAGCTCAAGATCG
ATTCTTGGTTCGGATCCCGCAAAGCCAGTGCTTCCATCAGGACTGCTTTGAGCCACGTCA
GCAACCTCATCGCCGGTGTCACACAGGGTTTCCTTTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTC
ATTTCCCCATCAATGCTTCAATCTCCGGTGACAACAAGTCTATTGAGATCCGTAACTTCC
TTGGGGAGAAGAAGGTCAGGAAGGTTGATATGTTGGATGGTGTTACCATTGTTCGGTCTG
AG**GGTTAAGGATGAGATTACTCTTGAGGGTAATGATATCGAGCTTGTTTCACGTTCAT
GCGCTTTGATCAACCAGAAATGCCATGTGAAGAAGAAGGATATCAGAAAGTTTCTTGATG
GTATTTACGTGAGCGA**AGGGAAAGATCGCTGTTGAAGAATGAAGAGAGTATGGTGTGG
AAGAGTGATATAGTCGTAGCTTTCTGTTCACTTCTCATATGGGTTTGTAGTTTTGATTTC
TTTGGACCAATTGATAATGCAAACTCATTATTATCCTTTATGTTTGGGTTTTTATTTACC
CTTTTCTATTTAAAGTTTTTGAGACTATTTTATTCTCTATTTATTCTTGGAATTGGTTTT
GAGTT

QA 1 785 1 785
DS 

RD RS1EP86JQ 718 0 0
GCCAAGGTGATCGAAGTAGAAGGCCCACGCGGGAAACTCACTCGTGATTTCAAGCATCTC
AACCTCGATTTTCAGCTCATCACAGACGCCGTCACCGGCAAGCGACAGCTCAAGATCGAT
TCTTGGTTCGGATCCCGCAAAGCCAGTGCTTCCATCAGGACCGCTTTGAGCCACGTCAGC
AACCTCATCGCCGGTGTCACACAGGGTTTCCTTTACAAGATGAGGTTTGTGTATGCTCAT
TTCCCCATCAATGCTTCCATCTCCGGTGACAACAAGTCTATTGAGATCCGTAACTTCCTT
GGGGAGAAGAAGGTCAGGAAGGTTGATATGTTGGATGGTGTTACCATTGTTCGGTCTGAG
AAGGTTAAGGATGAGATTACTCTTGAGGGAAATGATATCGAGCTAGTTTCACGCTCATGC
GCTTTGATCAACCAGAAATGCCATGTGAAGAAGAAGGATATCAGAAAGTTTCTTGATGGT
ATTTACGTGAGCGAGAAGGGAAAGACCGCTGTTGAAGAATGAAGAGAGTATGGTGTGGAA
GAGTGATATAGTCGTGGCTTTCTGTTCACTTCTCATATGGGTTTGTAGTTTTGATTTCTT
TGGACCAATTGATAATGCAAACTCATTATTATCCTTTATGTTTGGGTTTTTATTTACCCT
TTTCTATTTAAAGTTTTTGAGACTATTTTATTCTCTGCTTATTCTTGGAATTGGTTTT

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 6

CO CL1297Contig1 701 6 3 U
GGAAGACGAAAAAGGTAAACGTAATATCTGCGACGGGGAGAAGCATAACGATGAAGCCTT
CTATGATGGATAGTCTATTAGGTCTTCTTCGTATTCGTGTCAAGCGCGGTGTGAATCTCG
CCGTCCGCGATCTCAACAGTAGTGATCCTTACGTCGTCGTCAAAATGGGTAAACAGAAAT
TGAAGACTCGAGTTATTTACAATGATGTGAATCCTGAGTGGAATGAAGATTTGACTCTCT
CAGTAACCGATCCCAATCTCAAAGTCTTCTTGACGGTGTATGATCACGATACATTCACCA
AAGACGACAAAATGGGAGATGCAGAATTTGAGATTAAGCCGTACATCAATGCATTGACTA
TGCACTTGCAAGATCTCCCATATGGGACAATAGTGACCACAGTCCAGCCTAGCCGAGACA
ATTGCTTAGCGGAGGGTTCTCGGATCATTTGGTCTGATGGTAAGCTTGTTCAGGAAATAG
TCCTTAGACTGAAACATGTAGAGTGCGGTGAGGTTGAGGTTCAACTTCAATGGATAGATC
TTCCTGGCTCCAAGGGTCTATGATTTGTTTATTTTTTTT*ATTTGTAATATCCGTCATGT
TATGGACACTATATAGACTTTAAGTTAAACCTCACAAACTGATGTTGTATATATGTTATT
GAACATGATGAGCAAATATTATTCACTTTACTCTTCAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DC86TF U 1
AF RS1AS77TF U 4
AF RS1DC86JQ C 32
AF RS1E405JQ C 6
AF RS1E405TF U 6
AF RS1E115TF U 7
BS 1 635 RS1DC86TF
BS 636 660 RS1AS77TF
BS 661 701 RS1E405TF

RD RS1DC86TF 635 0 0
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TGAAGACTCGAGTTATTTACAATGATGTGAATCCTGAGTGGAATGAAGATTTGACTCTCT
CAGTAACCGATCCCAATCTCAAAGTCTTCTTGACGGTGTATGATCACGATACATTCACCA
AAGACGACAAAATGGGAGATGCAGAATTTGAGATTAAGCCGTACATCAATGCATTGACTA
TGCACTTGCAAGATCTCCCATATGGGACAATAGTGACCACAGTCCAGCCTAGCCGAGACA
ATTGCTTAGCGGAGGGTTCTCGGATCATTTGGTCTGATGGTAAGCTTGTTCAGGAAATAG
TCCTTAGACTGAAACATGTAGAGTGCGGTGAGGTTGAGGTTCAACTTCAATGGATAGATC
TTCCTGGCTCCAAGGGTCTATGATTTGTTTATTTTTTTT*ATTTGTAATATCCGTCATGT
TATGGACACTATATAGACTTTAAGTTAAACCTCAC

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DS 

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GGAC
GAAAAAGGTAAACGTAATATCTGCGACGGGGAGAAGCATAACGATGAAGCCTTCTATGAT
GGATAGTCTATTAGGTCTTCTTCGTATTCGTGTCAAGCGCGGTGTGAATCTCGCCGTCCG
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DS 

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CGTCGTCGTCAAAATGGGTAAACAGAAATTGAAGACTCGAGTTATTTACAATGATGTGAA
TCCTGAGTGGAATGAAGATTTGACTCTCTCAGTAACCGATCCCAATCTCAAAGTCTTCTT
GACGGTGTATGATCACGATACATTCACCAAAGACGACAAAATGGGAGATGCAGAATTTGA
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AGTGACCACAGTCCAGCCTAGCCGAGACAATTGCTTAGCGGAGGGTTCTCGGATCATTTG
GTCTGATGGTAAGCTTGTTCAGGAAATAGTCCTTAGACTGAAACATGTAGAGTGCGGTGA
GGTTGAGGTTCAACTTCAATGGATAGATCTTCCTGGCTCCAAGGGTCTATGATTTGTTTA
TTTTTTTT*ATTTGTAATATCCGTCATGTTATGGACACTATATAGACTTTAAGTTAAACC
TCAC

QA 1 604 1 604
DS 

RD RS1E405JQ 655 0 0
GG
GAAAAAGGTAAACGTAATATCTGCGACGGGGAGAAGCATAACGATGAAGCCTTCTATGAT
GGATAGTCTATTAGGTCTTCTTCGCATTCGTATCAAGCGCGGTGTGAATCTCGCCGTCCG
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CAAAATGGGAGATGCAGAATTTGAGATTAAGCCGTACATCAATGCATTGACTATGCACTT
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AGCGGAGGGTTCTCGGATCATTTGGTCTGATGGTAAGCTTGTTCAGGAAATAGTCCTTAG
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ACTATATAGACTTTAAGTTAAACCTCACAAACTGATGTTGTATATATGTTATT

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DS 

RD RS1E405TF 696 0 0
GG
GAAAAAGGTAAACGTAATATCTGCGACGGGGAGAAGCATAACGATGAAGCCTTCTATGAT
GGATAGTCTATTAGGTCTTCTTCGCATTCGTATCAAGCGCGGTGTGAATCTCGCCGTCCG
CGATCTCAACAGTAGTGATCCTTACGTCGTCGTCAAAATGGGTAAACAGAAATTGAAGAC
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CAAAATGGGAGATGCAGAATTTGAGATTAAGCCGTACATCAATGCATTGACTATGCACTT
GCAAGATCTCCCATATGGGACAATAGTGACCACAGTCCAGCCTAGCCGAGACGATTGCTT
AGCGGAGGGTTCTCGGATCATTTGGTCTGATGGTAAGCTTGTTCAGGAAATAGTCCTTAG
ACTGAAACATGTAGAGTGCGGTGAGGTTGAGGTTCAACTTCAATGGATAGATCTTCCTGG
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ATGAGCAAATATTATTCACTTTACTCTTCAAAAA

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DS 

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G
GAAAAAGGTAAACGTAATATCTGCGACGGGGAGAAGCATAACGATGAAGCCTTCTATGAT
GGATAGTCTATTAGGTCTTCTTCGTATTCGTGTCAAGCGCGGTGTGAATCTCGCCGTCCG
CGATCTCAACAGTAGTGATCCTTACGTCGTCGTCAAAATGGGTAAACAGAAATTGAAGAC
TCGAGTTATTTACAATGATGTGAATCCTGAGTGGAATGAAGATTTGACTCTCTCAGTAAC
CGATCCCAATCTCAAAGTCTTCTTGACGGTGTATGATCACGATACATTCACCAAAGACGA
CAAAATGGGAGATGCAGAATTTGAGATTAAGCCGTACATCAATGCATTGACTATGCACTT
GCAAGATCTCCCATATGGGACAATAGTGACCACAGTCCAGCCTAGCCGAGACAATTGCTT
AGCGGAGGGTTCTCGGATCATTTGGTCTGATGGTAAGCTTGTTCAGGAAATAGTCCTTAG
ACTGAAACATGTAGAGTGCGGTGAGGTTGAGGTTCAACTTCAATGGATAGATCTTCCTGG
CTCCAAGGGTCTATGATTTGTTTATTTTTTTT*ATTTGTAATATCCGTCATGTTATGGAC
ACTATATAGACTTTAAGTTAAACCTCACAAACTGATGTTGTATATATGTTATTGA*CATG
ATGAGCAAATATTATTCA

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DS 



AS 2 6

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TTGAACATGAGAGTAAAAGACAGAAGAAAACAGAAGTAGAGATAACTAAGCAATTCACAA
GGGTTAAAAAGAGACATCTTTACATACACATATTATGTCTCGTTATCTCTCTCTCTTGTG
ACAATATGTTACAGAACAAGTTCCTTTTATTCACAAGCTTACTGATCCCCAACGCTGCGA
ATACGTTTCTGCAGATGTTCCAAACTAGCAACTCTACGCATGGACTCTGTTCTGTTCATT
TTGCACCCAGTCAAGGCCTTGCTTTTGTTGCCTGAGCTGATCTCCGGTGTGGTCACTTGG
ACGTTTGTGTCTAGAGAATCTGACGTCGTCTCTGAAGGATTAAAGACGGTTGAAACCTGA
GGCATGGTGTGGAACATTGGGTTCAACCCTGTGAGTCTCTTCACTGTCTCCTCAGCCATT
TTCACTTTTGCTCGTAGTGTCTCAATATTTGCTTTGAGAACTCTGTTCTCTACAGCTGCG
TCATTGAATGTCTGAGTTACGTCAGTGAGACCTTTCATGAGGTTTGAATTCTCCACACGC
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CTAGCTGATTCCCTGTTAGAGAGCATCCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GZ67JQ U 104
AF RS1DS47JQ U 40
AF RS1CO54JQ U 1
BS 1 87 RS1CO54JQ
BS 88 88 RS1DS47JQ
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RD RS1GZ67JQ 428 0 0
G
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GTTCTCT

QA 2 428 2 428
DS 

RD RS1DS47JQ 556 0 0
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TCGTTATCTCTCTCTCTTGTGACAATATGTTACAAAACAAGTTCCTTTTATTCACAAGCT
TACTGATCCCCAACGCTGCGAATACGTTTCTGCAGATGTTCCAAACTAGCAACTCTACGC
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AGGTTTGAATTCTCCA

QA 1 556 1 556
DS 

RD RS1CO54JQ 691 0 0
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TTGAACATGAGAGTAAAAGACAGAAGAGAACAGAAGTAGAGATAACTAAGCAATTCACAA
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ACAATATGTTACAGAACAAGTTCCTTTTATTCACAAGCTTACTGATCCCCAACGCTGCGA
ATACGTTTCTGCAGATGTTCCAAACTAGCAACTCTACGCATGGACTCTGTTCTGTTCATT
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TCATTGAATGTCTGAGTTACGTCAGTGAGACCTTTCATGAGGTTTGAATTCTCCACACGC
AGCTGTGAAACTTGTGTCTCAAGCTCACTCAGGTGTGCTTGCTTTCTTCTCCTGGATCGT
CTAGCTGATTCCCTGTTAGAGAGCATCCTTT

QA 1 691 1 691
DS 



CO CL1298Contig2 869 3 1 U
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AGTGGTGAGCAGTGCCATAACAAGTGGTTCTGAGCTCTCTGGTGATGAAGAAGAAGCTGA
TGGTGAAACTAATATGAACCCCACCAATGTTAAGCGCGTCAAAAGGATGCTCTCTAACAG
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AGTTTCACAGCTGCGTGTGGAGAATTCAAACCTCATGAAAGGTCTCACTGACGTAACTCA
GACATTCAATGACGCAGCTGTAGAGAACAGAGTTCTCAAAGCAAATATTGAGACACTACG
AGCAAAAGTGAAAATGGCTGAGAGACAGTGAAGAGACTCACAGGTTGAACCCAATGTTCC
ACACCATGCCTCAGTCTCAACCGTCTCTATCCTTCAGAGACGACGTCAGATCTCTAGACA
CAAACGTCCAGTGACACACGGAGATCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GZ67TF U 57
AF RS1DS47TF U 57
AF RS1CO54TF U 1
BS 1 869 RS1CO54TF

RD RS1GZ67TF 481 0 0
GG
GAACAAAAGTTTGAAACCAAGAAAATGTCTGGTAACCATCTCTGGTCGGAGCTGGCCTCG
AAAGAGAGAAATGGGATGAACCGTAGTGACTCCGAGTGGGCATTGCAACGCTTCATACAA
GAGTCAGAAGCGTATGGCGTTTCCGTCTCTGGACCTCCTTCTCCTCCTCCGAGTGTTCCT
GTTGATTCCGAGGAATACAGAGAGTTTCTTAAGAGTAAACTCAACTTAGCTTGTGCTGCT
GTCGCCATGAAAAGGGGAGCTTTCATCAAACCTCAAGATACCTCTGGTAGATCTGAGAAT
GGTGGAGCTTATACATCCACTGCTTCAGAACAAGGCTCTCTACCTTCTTCCAAAGCAACA
CCAGTGGTGAGCAGTGCCATAACAAGTGGTTCTGAGCTCTCTGGTGATGAAGAAGAAGCT
GATGGTGAAACTAATATGAACCCCACCAATGTTAAGCGCGTCAAAAGGATGCTCTCTAA

QA 3 481 3 481
DS 

RD RS1DS47TF 710 0 0
GG
GAACAAAAGTTTGAAACCAAGAAAATGTCTGGTAACCATCTCTGGTCGGAGCTGGCCTCG
AAAGAGAGAAATGGGATGAACCGTAGTGACTCCGAGTGGGCATTGCAACGCTTCATACAA
GAGTCAGAAGCGTATGGCGTTTCCGTCTCTGGACCTCCTTCTCCTCCTCCGAGTGTTCCT
GTTGATTCCGAGGAATACAGAGAGTTTCTTAAGAGTAAACTCAACTTAGCTTGTGCTGCT
GTCGCCATGAAAAGGGGAGCTTTCATCAAACCTCAAGATACCTCTGGTAGATCTGAGAAT
GGTGGAGCTTATACATCCACTGCTTCAGAACAAGGCTCTCTACCTTCTTCCAAAGCAACA
CCAGTGGTGAGCAGTGCCATAACAAGTGGTTCTGAGCTCTCTGGTGATGAAGAAGAAGCT
GATGGTGAAACTAATATGAACCCCACCAATGTTAAGCGCGTCAAAAGGATGCTCTCTAAC
AGGGAATCAGCTAGACGATCCAGGAGAAGAAAGCAAGCACACCTGAGTGAGCTTGAGACA
CAAGTTTCACAGCTGCGTGTGGAGAATTCAAACCTCATGAAAGGTCTCACTGACGTAACT
CAGACATTCAATGACGCAGCTGTAGAGAACAGAGTTCTCAAAGCAAATATTGAGACACTA
CGAGCAAAAGTGAAAATGGCTGAGAGACTGTGAAGAGACTCACAGG
TT

QA 3 708 3 708
DS 

RD RS1CO54TF 869 0 0
GGAATGCAAAAGACTGACCAATCGGATAAGAAGAAAACTTTTGCAGAGAGAAGAAGAAGA
ACAAAAGTTTGAAACCAAGAAAATGTCTGGTAACCATCTCTGGTCGGAGCTGGCCTCGAA
AGAGAGAAATGGGATGAACCGTAGTGACTCCGAGTGGGCATTGCAACGCTTCATACAAGA
GTCAGAAGCGTATGGCGTTTCCGTCTCTGGACCTCCTTCTCCTCCTCCGAGTGTTCCTGT
TGATTCCGAGGAATACAGAGAGTTTCTTAAGAGTAAACTCAACTTAGCTTGTGCTGCTGT
CGCCATGAAAAGGGGAGCTTTCATCAAACCTCAAGATACCTCTGGTAGATCTGAGAATGG
TGGAGCTTATACATCCACTGCTTCAGAACAAGGCTCTCTACCTTCTTCCAAAGCAACACC
AGTGGTGAGCAGTGCCATAACAAGTGGTTCTGAGCTCTCTGGTGATGAAGAAGAAGCTGA
TGGTGAAACTAATATGAACCCCACCAATGTTAAGCGCGTCAAAAGGATGCTCTCTAACAG
GGAATCAGCTAGACGATCCAGGAGAAGAAAGCAAGCACACCTGAGTGAGCTTGAGACACA
AGTTTCACAGCTGCGTGTGGAGAATTCAAACCTCATGAAAGGTCTCACTGACGTAACTCA
GACATTCAATGACGCAGCTGTAGAGAACAGAGTTCTCAAAGCAAATATTGAGACACTACG
AGCAAAAGTGAAAATGGCTGAGAGACAGTGAAGAGACTCACAGGTTGAACCCAATGTTCC
ACACCATGCCTCAGTCTCAACCGTCTCTATCCTTCAGAGACGACGTCAGATCTCTAGACA
CAAACGTCCAGTGACACACGGAGATCAGC

QA 1 869 1 869
DS 



AS 3 6

CO CL1299Contig1 793 2 7 U
CGAACGAAGACTGACGAAGTCGATAATTAAAGCGTAGCTTACATGGTTACAAGTTATACA
CCAACCAAAGAACACATACAAACGAAAAACACCCTAAACAAACCCTAAAATCACACACAA
CAACAATAAAAGCTTCTAAAAGAAAAAAAAAAAACAAATCTGTGAGATAATAATAATTCA
AGATAAATGATTTCAAATCTCTAAGCGGCTGATATCGCAGCATAGTCTTGATAACGAGAC
ATGGCACCTTTAAACTTGTGATCGTCTCCTTTGTGAGTGCTCAAGCTATGCGGGATGTAC
GCTCTGAAAACCTCCTCGAGATCCGGTCTCGTCTTCAGCTCACGGCAAGCCACCTCTAGA
GCCGTGTGTTCGAACCCTTTGTAGAATTTCTGGCGGCACACGTAACCGAATAAGAGAGAG
ATGAAGATGAGAGGAACCAGGAGAGTCGCCCAAACGAATAGCTTGACTCCCAAGTAACCA
AACATAACCAGTTGGAACAAAAACAATGCCGCTAGAATGCGAGTGTGAATGTGCGGCCAC
ATCCTCCCGTAGCTCTCGTATGCTGGAACGTACACTTTCAAAGCCTGGTTTCTAAGGATG
AGCCACCCTAGACCGAAGTAGATAACGCCGAATACGAGGATAAGAGGAGCGATCACGGAG
TAGCAGAAGGTGATAGTGAGGATGAGCATGTCGCTAGGAACCCTAGTCGCGTAGCTTAAG
TCTCCTGGATACCAAGCTTCTTTGACCTCTGCTTCGGTTTGCATAGATACTTCTTTTTTA
AATGGATATTATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FT79JQ U 8
AF RS1AZ59JQ U 1
BS 1 73 RS1AZ59JQ
BS 74 74 RS1FT79JQ
BS 75 153 RS1AZ59JQ
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BS 500 500 RS1FT79JQ
BS 501 793 RS1AZ59JQ

RD RS1FT79JQ 636 0 0
CGC
CTGACGAAGTTGATAATTAAAGCGTAGCTTACATGGTTACAAGTTATACACCAACCAAAG
AACACATACAAACGAAAAACACCCTAAACAAACCCTAAAATCACACACAACAACAATAAA
AGCTTCTAAAAGAAAAAAAAAAAACAAATCTGTGAGATAATAATAATTCAAGATAAATGA
TTTCAAATCTCTAAGCGGCTGATATCGCAGCATAGTCTTGATAACGAGACATGGCACCTT
TAAACTTGTGATCGTCTCCTTTGTGAGTGCTCAAGCTATGCGGGATGTACGCTCTGAAAA
CCTCCTCGAGATCCGGTCTCGTCTTCAGCTCACGGCAAGCCACCTCTAGAGCCGTGTGTT
CGAACCCTTTGTAGAATTTCTGGCGGCACACGTAACCGAATAAGAGAGAGATGAAGATGA
GAGGAACCAGGAGAGTCGCCCAAACGAATAGCTTGACTCCCAAGTAACCAAACATAACCA
GTTGGAACAAAAACAATGCCGCTAGAATGCGAGTGTGAATGTGCGGCCACATCCTCCCGT
AGCTCTCGTATGCTGGAACGTACACTTTCAAAGCCTGGTTTCTAAGGATGAGCCACCCTA
GACCGAAGTAGATAACGCCGAATACGAGGATAA

QA 4 636 4 636
DS 

RD RS1AZ59JQ 793 0 0
CGAACGAAGACTGACGAAGTCGATAATTAAAGCGTAGCTTACATGGTTACAAGTTATACA
CCAACCAAAGAACGCATACAAACGAAAAACACCCTAAACAAACCCTAAAATCACACACAA
CAACAATAAAAGCTTCTAAAAGAAAAAAAAAAA*CAAATCTGTGAGATAATAATAATTCA
AGATAAATGATTTCAAATCTCTAAGCGGCTGATATCGCAGCATAGTCTTGATAACGAGAC
ATGGCACCTTTAAACTTGTGATCGTCTCCTTTGTGAGTGCTCAAGCTATGCGGGATGTAC
GCTCTGAAAACCTCCTCGAGATCCGGTCTCGTCTTCAGCTCACGGCAAGCCACCTCTAGA
GCCGTGTGTTCGAACCCTTTGTAGAATTTCTGGCGGCACACGTAACCGAATAAGAGAGAG
ATGAAGATGAGAGGAACCAGGAGAGTCGCCCAAACGAATAGCTTGACTCCCAAGTAACCA
AACATAACCAGTTGGAACAGAAACAATGCCGCTAGAATGCGAGTGTGAATGTGCGGCCAC
ATCCTCCCGTAGCTCTCGTATGCTGGAACGTACACTTTCAAAGCCTGGTTTCTAAGGATG
AGCCACCCTAGACCGAAGTAGATAACGCCGAATACGAGGATAAGAGGAGCGATCACGGAG
TAGCAGAAGGTGATAGTGAGGATGAGCATGTCGCTAGGAACCCTAGTCGCGTAGCTTAAG
TCTCCTGGATACCAAGCTTCTTTGACCTCTGCTTCGGTTTGCATAGATACTTCTTTTTTA
AATGGATATTATA

QA 1 793 1 793
DS 



CO CL1299Contig2 1189 2 2 U
GCACTCTTGATAATCTCCAGAAGACTCTTCCCTTCTTGAAGCCGATCGTGGAGATAGGTT
TCATTAAAACCATCTTGGAGTCTTACCTTCCTCAGATAGCGCTCATCGTCTTCTTGGCTA
TGCTGCCTAAGTTCCTCATGTTCCTATCAAAATCAGAGGGGATCCCTTCGCAGAGCCACG
CCGTTAGAGCTACCTCCGGGAAGTACTTTTACTTCTCGGTCTTGAACGTCTTCATCGGTG
TTACCCTCGCAGGGTCTTTGTTCCAGAATTTGAAGGCTCTTGAGAAGAAACCAAACTCTA
TTATCACCGTTTTGGCTACTAGTCTCCCTAAGAACGCTACTTTCTTCTTGACCTACGTTG
CTCTCAAGTTCTTTGTTGGTTATGGTCTCGAGCTGTCTAGGATCATACCTTTGATAATAT
TCCATCTGAAAAAGAAGTATCTATGCAAAACCGAAGCAGAGGTCAAAGAAGCTTGGTATC
CAGGAGACTTGAGCTACGCGACTAGGGTTCCAAGCGACATGCTCATCCTCACCATCACCT
TCTGCTACTCCGTGATCGCTCCTCTTATCCTCGTATTCGGCGTTATCTACTTCGGTCTAG
GCTGGCTCATCCTTAGGAACCAGGCTTTGAAAGTGTACGTTCCAGCATACGAGAGCTACG
GGGGGATGTGGCCGCACATTCACACTCGCATTCTAGCGGCATTGTTTCTGTTCCAACTGG
TTATGTTTGGTTACTTGGGAGTCAAGCTATTCGTTTGGGCGACTCTCTTGGCTCCTCTCA
TCTTCATCTCTCTCGTATTCGGTTACGTTTGCCGCCAGAAATTCTACAGAGGGTTCGAAC
ACACGGCTCTGGAGGTGGCGTGCCGTGAGCTGAAGACGAGACCGGATCTCGAGGAGGTTT
TCAGGGCGTACATCCCGCATAGCTTGAGCACTCACAAAGGAGACGATCACAAGTTTAAAG
GCGCTATGTCTCGTTATCAAGACTATGCTGCGATATCAGCCGCTTAAACATTTGAATCCT
TATTATTATCTCACAGATTTGTTTTTTTTCTTTTAGAAGCTTTTATTGTTGTTGTGTGTG
ATTTTAGGGTTTGTTTAGGGTTTTTTCGTTTGTATGTGTTCTTTGGTTGTTGTATAACTT
GTAACCATGTAAGCTACGCTTTAATTATCAACTTCGTCAGTCTTCGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FR12TF U 1
AF RS1FR12JQ C 375
BS 1 610 RS1FR12TF
BS 611 1189 RS1FR12JQ

RD RS1FR12TF 610 0 0
GCACTCTTGATAATCTCCAGAAGACTCTTCCCTTCTTGAAGCCGATCGTGGAGATAGGTT
TCATTAAAACCATCTTGGAGTCTTACCTTCCTCAGATAGCGCTCATCGTCTTCTTGGCTA
TGCTGCCTAAGTTCCTCATGTTCCTATCAAAATCAGAGGGGATCCCTTCGCAGAGCCACG
CCGTTAGAGCTACCTCCGGGAAGTACTTTTACTTCTCGGTCTTGAACGTCTTCATCGGTG
TTACCCTCGCAGGGTCTTTGTTCCAGAATTTGAAGGCTCTTGAGAAGAAACCAAACTCTA
TTATCACCGTTTTGGCTACTAGTCTCCCTAAGAACGCTACTTTCTTCTTGACCTACGTTG
CTCTCAAGTTCTTTGTTGGTTATGGTCTCGAGCTGTCTAGGATCATACCTTTGATAATAT
TCCATCTGAAAAAGAAGTATCTATGCAAAACCGAAGCAGAGGTCAAAGAAGCTTGGTATC
CAGGAGACTTGAGCTACGCGACTAGGGTTCCAAGCGACATGCTCATCCTCACCATCACCT
TCTGCTACTCCGTGATCGCTCCTCTTATCCTCGTATTCGGCGTTATCTACTTCGGTCTAG
GCTGGCTCAT

QA 1 610 1 610
DS 

RD RS1FR12JQ 815 0 0
GTTGGTTATGGTCTCGAGCTGTCTAGGATCATACCTTTGATAATATTCCATCTGAAAAAG
AAGTATCTATGCAAAACCGAAGCAGAGGTCAAAGAAGCTTGGTATCCAGGAGACTTGAGC
TACGCGACTAGGGTTCCAAGCGACATGCTCATCCTCACCATCACCTTCTGCTACTCCGTG
ATCGCTCCTCTTATCCTCGTATTCGGCGTTATCTACTTCGGTCTAGGCTGGCTCATCCTT
AGGAACCAGGCTTTGAAAGTGTACGTTCCAGCATACGAGAGCTACGGGGGGATGTGGCCG
CACATTCACACTCGCATTCTAGCGGCATTGTTTCTGTTCCAACTGGTTATGTTTGGTTAC
TTGGGAGTCAAGCTATTCGTTTGGGCGACTCTCTTGGCTCCTCTCATCTTCATCTCTCTC
GTATTCGGTTACGTTTGCCGCCAGAAATTCTACAGAGGGTTCGAACACACGGCTCTGGAG
GTGGCGTGCCGTGAGCTGAAGACGAGACCGGATCTCGAGGAGGTTTTCAGGGCGTACATC
CCGCATAGCTTGAGCACTCACAAAGGAGACGATCACAAGTTTAAAGGCGCTATGTCTCGT
TATCAAGACTATGCTGCGATATCAGCCGCTTAAACATTTGAATCCTTATTATTATCTCAC
AGATTTGTTTTTTTTCTTTTAGAAGCTTTTATTGTTGTTGTGTGTGATTTTAGGGTTTGT
TTAGGGTTTTTTCGTTTGTATGTGTTCTTTGGTTGTTGTATAACTTGTAACCATGTAAGC
TACGCTTTAATTATCAACTTCGTCAGTCTTCGTTC

QA 1 815 1 815
DS 



CO CL1299Contig3 811 2 3 U
ACGGTTCTCGCTGAGAAGCAGCAAACCGCAGCGGTTGTGTTCTTCACAGACAGAGTCACT
GCAGCTCTAGCCGCTCAGTCTCTCCACTGCCAGATGGTTGACAAATGGACGGTGACCGAA
GCTCCGGAGCCTCGCCAGCTCATCTGGGAGAATCTCAAGATCAAGTTCTTCAGCAGAATA
GTCAGACAGTACTTGATCTACTTCATCGTTGCTATAACCATATTGTTCTACATGACCCCT
ATAGCTTTCGTCTCTGCCATCACCACTCTTGATAATCTCCAGAAGACTCTTCCCTTCTTG
AAGCCGATCGTGGAGATAGGCTTCATCAAAACCATCTTGGAGTCTTACCTTCCTCAGATA
GCGCTCATCGTCTTCTTGGCTATGCTGCCTAAGTTCCTCATGTTCCTATCAAAGTCAGAG
GGGATTCCTTCGCAGAGCCACGCCGTTAGAGCTACCTCCGGGAAGTACTTTTACTTCTCG
GTCTTGAACGTCTTCATCGGTGTAACCCTTGCAGGGTCTTTGTTTGACAACTTGAAGGCC
CTTGAGAAGAAACCAAACTCTATTATCACCGTTTTGGCTACTAGTCTCCCTAAGAACGCT
ACTTTCTTCTTGACCTACGTTGCTCTCAAGTTCTTTGTTGGTTATGGTCTCGAGCCGTCT
AGGATCATACCTTTGATAATATTCCATTTAAAAAGAAGTATCTATGCAAACCGAAGCAGA
GTCAAAGAGCTGGTATCCAGGAGACTAAGCTACGCGACTAGGGTCCTAGCGACATGCTCA
TCCTCACTATCACTTCTGCTACTCCGTGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AZ59TF U 20
AF RS1FT79TF U 1
BS 1 52 RS1FT79TF
BS 53 53 RS1AZ59TF
BS 54 811 RS1FT79TF

RD RS1AZ59TF 738 0 0
G
GCAAACCGCAGCGGTTGTGTTCTTCACAGACAGAGTCACTGCAGCTCTAGCCGCTCAGTC
TCTCCACTGCCAGATGGTTGACAAATGGACGGTGACCGAAGCTCCGGAGCCTCGCCAGCT
CATCTGGGAGAATCTCAAGATCAAGTTCTTCAGCAGAATAGTCAGACAGTACTTGATCTA
CTTCATCGTTGC*ATAACCATATTGTTCTACATGATCCCTATAGCTTTCGTCTCTGCCAT
CACCACTCTTGATAATCTCCAGAAGACTCTTCCCTTCTTGAAGCCGATCGTGGAGATAGG
CTTCATCAAAACCATCTTGGAGTCTTACCTTCCTCAGATAGCGCTCATCGTCTTCTTGGC
TATGCTGCCTAAGTTCCTCATGTTCCTATCAAAGTCAGAGGGGATTCCTTCGCAGAGCCA
CGCCGTTAGAGCTACCTCCGGGAAGTACTTTTACTTCTCGGTCTTGAACGTCTTCATCGG
TGTAACCCTTGCAGGGTCTTTGTTTGACAACTTGAAGGCTCTTGAGAAGAAACCAAACTC
TATTATCACCGTTTTGGCTACTAGTCTCCCTAAGAACGCTACTTTCTTCTTGACCTACGT
TGCTCTCAAGTTCTTTGTTGGTTATGGTCTCGAGCTGTCTAGGATCATACCTTTTATAAT
ATTCCATTTAAAAAGAAGTATCTATGCAAACCGAAGCAGAGTCAA*GAGCTGGTATCCAG
GAGACTTAGCTACGCGA

QA 2 738 2 738
DS 

RD RS1FT79TF 811 0 0
ACGGTTCTCGCTGAGAAGCAGCAAACCGCAGCGGTTGTGTTCTTCACAGACATAGTCACT
GCAGCTCTAGCCGCTCAGTCTCTCCACTGCCAGATGGTTGACAAATGGACGGTGACCGAA
GCTCCGGAGCCTCGCCAGCTCATCTGGGAGAATCTCAAGATCAAGTTCTTCAGCAGAATA
GTCAGACAGTACTTGATCTACTTCATCGTTGCTATAACCATATTGTTCTACATGACCCCT
ATAGCTTTCGTCTCTGCCATCACCACTCTTGATAATCTCCAGAAGACTCTTCCCTTCTTG
AAGCCGATCGTGGAGATAGGCTTCATCAAAACCATCTTGGAGTCTTACCTTCCTCAGATA
GCGCTCATCGTCTTCTTGGCTATGCTGCCTAAGTTCCTCATGTTCCTATCAAAGTCAGAG
GGGATTCCTTCGCAGAGCCACGCCGTTAGAGCTACCTCCGGGAAGTACTTTTACTTCTCG
GTCTTGAACGTCTTCATCGGTGTAACCCTTGCAGGGTCTTTGTTTGACAACTTGAAGGCC
CTTGAGAAGAAACCAAACTCTATTATCACCGTTTTGGCTACTAGTCTCCCTAAGAACGCT
ACTTTCTTCTTGACCTACGTTGCTCTCAAGTTCTTTGTTGGTTATGGTCTCGAGCCGTCT
AGGATCATACCTTTGATAATATTCCATTTAAAAAGAAGTATCTATGCAAACCGAAGCAGA
GTCAAAGAGCTGGTATCCAGGAGACTAAGCTACGCGACTAGGGTCCTAGCGACATGCTCA
TCCTCACTATCACTTCTGCTACTCCGTGATC

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 4

CO CL1300Contig1 555 4 7 U
GGAAACTACAACTGAGAATCTTCTTTATTTTCTCAAAGGAAAAAAAATGTCGGGTCGTGG
AAAGGGAGGAAAGGGTTTGGGCAAAGGAGGAGCCAAGCGTCACAGGAAGGTTCTGAGAGA
CAACATCCAGGGAATCACCAAGCCTGCTATTCGGAGGTTGGCTCGTAGAGGTGGAGTCAA
ACGTATCAGTGGTCTGATCTACGAGGAGACACGTGGAGTCCTCAAGATCTTTTTGGAGAA
CGTCATCCGTGACGCCGTGACCTACACCGAGCACGCCAGGAGGAAGACGGTGACGGCCAT
GGATGTCGTCTATGCGTTGAAGAGGCAAGGGAGGACGCTTTACGGGTTTGGGGGTTAAGG
GTCTTTTGAGATTCGCGCTTGCGTTTCTGGGTTTCTTTTAGGTGTTGTTCTTCTGGAAAT
TTCTAATCAAATCGTGTTATCCAGTGTGTGCGTTTTTAATTCTGTTTGGGTACGGTCTTT
TGTGTGTCGCGGTAGCGTTTCGTTCTATATAATGTAATTACGCATTTTATCAATGAAGCT
GTTCGAGTTTAAAAG


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 

AF RS1E835JQ C 1
AF RS1E835TF U 1
AF RS1AC44JQ C 2
AF RS1AC44TF U 2
BS 1 1 RS1E835JQ
BS 2 261 RS1E835TF
BS 262 262 RS1AC44TF
BS 263 377 RS1E835TF
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BS 379 551 RS1E835TF
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GGATGTCGTCTATGCGTTGAAGAGGCAAGGGAGGACGCTTTACGGGTTTGGGGGTTAAGG
GTCTTTTGAGATTCGCGTTTGCGTTTCTGGGTTTCTTTTAGGTGTTGTTCTTCTGGAAAT
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TGTGTGTCGCGGTAGCGTTTCGTTCTATATAATGTAATTACGCATTTTATCAATGAAGCT
GTTCGAGTTTA
TG

QA 1 551 1 551
DS 

RD RS1E835TF 553 0 0
G
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GTCATCCGTGACGCCGTGACTTACACCGAGCACGCCAGGAGGAAGACGGTGACGGCCATG
GATGTCGTCTATGCGTTGAAGAGGCAAGGGAGGACGCTTTACGGGTTTGGGGGTTAAGGG
TCTTTTGAGATTCGCGTTTGCGTTTCTGGGTTTCTTTTAGGTGTTGTTCTTCTGGAAATT
TCTAATCAAATCGTGTTATCCAGTGTGTGCGTTTTTAATTCTGTTTGGGTACGGTCTTTT
GTGTGTCGCGGTAGCGTTTCGTTCTATATAATGTAATTACGCATTTTATCAATGAAGCTG
TTCGAGTTTA
TG

QA 2 551 2 551
DS 

RD RS1AC44JQ 554 0 0
GAAACTACAACTGAGAATCTTCTTTATTTTCTCAAAGGAAAAAAAATGTCGGGTCGTGGA
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GATGTCGTCTATGCGTTGAAGAGGCAAGGGAGGACGCTTTACGGGTTTGGGGGTTAAGGG
TCTTTTGAGATTCGCGCTTGCGTTTCTGGGTTTCTTTTAGGTGTTGTTCTTCTGGAAATT
TCTAATCAAATCGTGTTATCCAGTGTGTGCGTTTTTAATTCTGTTTGGGTACGGTCTTTT
GTGTGTCGCGGTAGCGTTTCGTTCTATGTAATGTAATTACGCATTTTATCAATGAAGCTG
TTCGAGTTTAAAAG

QA 1 554 1 554
DS 

RD RS1AC44TF 554 0 0
GAAACTACAACTGAGAATCTTCTTTATTTTCTCAAAGGAAAAAAAATGTCGGGTCGTGGA
AAGGGAGGAAAGGGTTTGGGCAAAGGAGGAGCCAAGCGTCACAGGAAGGTTCTGAGAGAC
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GATGTCGTCTATGCGTTGAAGAGGCAAGGGAGGACGCTTTACGGGTTTGGGGGTTAAGGG
TCTTTTGAGATTCGCGCTTGCGTTTCTGGGTTTCTTTTAGGTGTTGTTCTTCTGGAAATT
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GTGTGTCGCGGTAGCGTTTCGTTCTATGTAATGTAATTACGCATTTTATCAATGAAGCTG
TTCGAGTTTA
AAAG

QA 1 550 1 550
DS 



AS 1 5

CO CL1301Contig1 895 5 12 U
CACAAAAACATCATTTATTCCACGCTTAAGATGCATACAAACAAGAACATACAATTCTCT
CCACATCCATCATCCATAGCTCTGG*CATTATTTAAGAAGACATGATCATCAAACTAAAG
TAAAACAGAACACAACTGAACATAGATAGGAACCAAAGCGACAAACAAACGGATCTACTC
AACCCCAAACTTCTTCCTGAGCATACCCATAAACTCAGTAACCTTCTCAAAATCAGGCAA
GGACTTGGCCACACTCTCCCTCTGCATACACCTCTTAGCCCAAGCAATAAGCTTCGGACA
CTCTGCTTCGAAGTTGAGGTTACCAAACTTCTCATACCCAGGGAACCAGGAGTAGAATCC
AATCAATCCAATGTCCACGTAGCCAAAGTCATCCCCACCAAAGTAAGGCTTGTCTCCGAG
CTCGGATTCAAGAGTCTTGAGTATCTCAATGAACTCCTTCTTGCCTGCCTCTTGTTCCTC
ACTCTTGGAAGCATACACCTTCCTCTGTGCCTCGTACATCTTCTTGTCGATGAAATCAAC
CCAGAACCTAGCCTGAGCTCTCTGGTAAGGATCAGAAGGGAGGATAGGGTTCTTGTGAGA
CCAGACCTCGTCGATGTACTGAACCTGGATTGCTGATTCACAGACCGGTTTACCGTTGTG
GATGAGAACCGGAATCTTCTTGTGGACCGGGTTCATCTGGAGAAGCAGAGGGCTCTTTTC
CCTCAGATCCTCGTCCCTGTACTCGAACTCGACACCTTTCTCCCTCAAAGCGATCCTTGT
CCTCATGCCGTACATGCTAGGCCAGAAATCAAGAAGGATCACCTCGTTCGCCATTAGTTG
TATTTAGCGATCACTCAAAGCTCACAGAAGAGAGAGATTTGTTTTACTGTTGTCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 0 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1EB94JQ U 1
AF RS1EV72JQ U 1
AF RS1DB14JQ U 2
AF RS1EV72TF C 152
AF RS1EB94TF C 193
BS 1 145 RS1EB94JQ
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BS 836 836 RS1EB94TF
BS 837 895 RS1EV72TF

RD RS1EB94JQ 727 0 0
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CCACATCCATCATCCATAGCTCTGG*CATTATTTAAGAAGACATGATCATCAAACTAAAG
TAAAACAGAACACAACTGAACATAGGTAGGAACCAAAGCGACAAACAAACGGATCTACTC
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GGACTTGGCCACACTCTCCCTCTGCATACACCTCTTAGCCCAAGCAATAAGCTTCGGACA
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AATCAATCCAATGTCCACGTAGCCAAAGTCATCCCCACCAAAGTAAGGCTTGTCTCCGAG
CTCGGATTCAAGAGTCTTGAGTATCTCAATGAACTCCTTCTTGCCTGCCTCTTGTTCCTC
GCTCTTGGAAGCATACACCTTCCTCTGTGCCTCGTACATCTTCTTGTCGATGAAATCAAC
CCAGAACCTAGCCTGAGCTCTCTGGTAAGGATCAGAAGGGAGGATAGGGTTCTTGTGAGA
CCAGACCTCGTCGATGTACTGAACCTGGATTGCTGATTCACAGACCGGTTTACCGTTGTG
GATGAGAACCGGAATCTTCTTGTGGACCGGGTTCATCTGGAGAAGCAGAGGGCTCTTTTC
CCTCAGA

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1EV72JQ 763 0 0
AC
CAAAAACATCATTTATTCCACGCTTAAGATGCATACAAACAAGAACATACAATTCTCTCC
ACATCCATCATCCATAGCTCTGG*CATTATTTAAGAAGACATGATCATCAAACTAAAGTA
AAACAGAACACAACTGAACATAGATAGGAACCAAAGCGACAAACAAACGGATCTACTCAA
CCCCAAACTTCTTCCTGAGCATACCCATAAACTCAGTAACCTTCTCAAAATCAGGTAAGG
ACTTGGCCACACTCTCCCTCTGCATACACCTCTTAGCCCAAGCAATAAGCTTCGGACACT
CTGCTTCGAAGTTGAGGTTACCAAACTTCTCATACCCAGGGAACCAGGAGTAGAATCCAA
TCAATCCAATGTCCACGTAGCCAAAGTCATCCCCACCAAAGTAAGGCTTGTCTCCGAGCT
CGGATTCAAGAGTCTTGAGTATCTCAATGAACTCCTTCTTGCCTGCCTCTTGTTCCTCAC
TCTTGGAAGCATACACCTTCCTCTGTGCCTCGTACATCTTCTTGTCGATGAAATCAACCC
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AGACCTCGTCGATGTACTGAACCTGGATTGCTGATTCACAGACCGGTTTACCGTTGTGGA
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TCAGATCCTCGTCCCTGTACTCGAACTCGACACCTTTCTCC

QA 3 763 3 763
DS 

RD RS1DB14JQ 808 0 0
A
CAAAAACATCATTTATTCCACGCTTAAGATGCAAACAAACAAGAACATACAATTCTCTCC
ACATCCATCATCCATAGCTCTGGGCATTATTTAAGAAGACATGATCATCAAACTAAAGTA
AAACAGAACGAAACTGAACATAGATAGGAACCAAA*CGACAAACAAACGGATCTACTCAA
CCCCAAACTTCTTCCTGAGCATACCCATAAACTCAGTAACCTTCTCAAAATCAGGCAAGG
ACTTGGCCACACTCTCCCTCTGCATACACCTCTTAGCCCAAGCAATCAGTTTCGGACACT
CTGCTTCGAAGTTGAGGTTACCAAACTTCTCATACCCAGGGAACCAGGAGTAGAATCCAA
TCAATCCAATGTCCACATAGCCGAAGTCATCCCCACCAAAGTAAGGCTTGTCTCCAAGCT
CGGATTCAAGAGTCTTGAGTATCTCAATGAACTCCTTCTTGCCTGCCTCTTGTTCCTCAC
CCTTGGAAGCATACACCTTCCTCTGTGCCTCGTACATCTTCTTGTCAATGAAATCAACCC
AGAACCTAGCCTGAGCTCTCTGGTAAGGATCAGAAGGGAGGATAGGGTTCTTGTGAGACC
AGACCTCGTCGATGTACTGAACCTGGATGGCTGATTCGCAGACCGGTTTATCGTTGTGGA
TGAGAACCGGAATCTTCTTGTGGACCGGGTTCATCTGGAGAAGCAGAGGGCTCTTGTCCC
TCAGATCCTCGTCCCTGTACTCGAACTCGACACCTTTCTCCCTCAAAGCGATCCTTGTCC
TCATGCCGTACATGCTAGGC
AGAAATC

QA 2 801 2 801
DS 

RD RS1EV72TF 744 0 0
ACCAAAG
CGACAAACAAACGGATCTACTCAACCCCAAACTTCTTC*TGAGCATACCCATAAACTCAG
TAACCTTCTCAAAATCAGGTAAGGACTTGGCCACACTCTCCCTCTGCATACACCTCTTAG
CCCAAGCAATAAGCTTCGGACACTCTGCTTCGAAGTTGAGGTTACCAAACTTCTCATACC
CAGGGAACCAGGAGTAGAATCCAATCAATCCAATGTCCACGTAGCCAAAGTCATCCCCAC
CAAAGTAAGGCTTGTCTCCGAGCTCGGATTCAAGAGTCTTGAGTATCTCAATGAACTCCT
TCTTGCCTGCCTCTTGTTCCTCACTCTTGGAAGCATACACCTTCCTCTGTGCCTCGTACA
TCTTCTTGTCGATGAAATCAACCCAGAACCTAGCCTGAGCTCTCTGGTAAGGATCAGAAG
GGAGGATAGGGTTCTTGTGAGACCAGACCTCGTCGATGTACTGAACCTGGATTGCTGATT
CACAGACCGGTTTACCGTTGTGGATGAGAACCGGAATCTTCTTGTGGACCGGGTTCATAT
GGAGAAGCAGAGGGCTCTTTTCCCTCAGATCCTCGTCCCTGTACTCGAACTCGACACCTT
TCTCCCTCAAAGCGATCCTTGTCCTCATGCCGTACATGCTAGGCCAGAAATCAAGAAGGA
TCACCTCGTTCGCCATTTGTTGTATTTAGCGATCACTCAAAGCTCACAGAAGAGAGAGAT
TTGTTTTACTGTTGTCC

QA 8 744 8 744
DS 

RD RS1EB94TF 703 0 0
TCTCCC
GAGCATACCCATAAACTCAGTAAC*TTCTCAAAATCAGGCAAGGACTTGGCCACACTCTC
CCTCTGCATACACCTCTTAGCCCAAGCAATAAGCTTCGGACACTCTGCTTCGAAGTTGAG
GTTACCAAACTTCTCATACCCAGGGAACCAGGAGTAGAATCCAATCAATCCAATGTCCAC
GTAGCCAAAGTCATCCCCACCAAAGTAAGGCTTGTCTCCGAGCTCGGATTCAAGAGTCTT
GAGTATCTCAATGAACTCCTTCTTGCCTGCCTCTTGTTCCTCGCTCTTGGAAGCATACAC
CTTCCTCTGTGCCTCGTACATCTTCTTGTCGATGAAATCAACCCAGAACCTAGCCTGAGC
TCTCTGGTAAGGATCAGAAGGGAGGATAGGGTTCTTGTGAGACCAGACCTCGTCGATGTA
CTGAACCTGGATTGCTGATTCACAGACCGGTTTACCGTTGTGGATGAGAACCGGAATCTT
CTTGTGGACCGGGTTCATCTGGAGAAGCAGAGGGCTCTTTTCCCTCAGATCCTCGTCCCT
GTACTCGAACTCGACACCTTTCTCCCTCAAAGCGATCCTTGTCCTCATGCCGTACATGCT
AGGCCAGAAATCAAGAAGGATCACCTCGTTCGCCATTAGT***ATTTAGCGATCACTCAA
AGCTCACAGAAGAGAGAGATTTGTTTTACTGTTGTCC

QA 7 703 7 703
DS 



AS 1 6

CO CL1302Contig1 942 6 19 U
GGAAACAAGGGTTAAATAAATTTCTCTCGGTCTTTCTTCGATCGGATTGTGGACTTACCG
ACTCTGTCATTCCGTCGGAGATTGATAATAATTCGCCATGGGCAGATCACAATTGCTGTT
GATAGGTTTACCGATTTTCTTGTTCTGTTCGGATCTCTTCAACCTTTTCACTCCTCCGCC
TCCCAAACCTCCGAGTCACCGTCCCAATCATCCACCGCACATCCCTCACCAGCAGCCTCC
GCCTGTTGTCGTTCCTGATTTTCCTTCACAGAAGCAGGCAAGTGGCTTAGGAGGAGCAGT
TGGATATGGAAACACTGTGGAGATCAACTTCTGCGTCTCCTGTTCTTTCAAGGGAACTGC
AGTGAATATGAAGAAGATGTTAGAGACGGCTTTTCCCGGTTTAGATGTGGTTCTTGCGAA
CTACCCACCACCACCACCAAAGCGTCTTCTAGCTAAGGTTGTCCCCGTTGCTCAGATGGG
AGTTATTGGGATGATAGTTGCGGGTGATCGTGTCTTTCCCATGATTGGTATTGCGCATCC
ACCCGCATGGTTCAACTCCTTGAGGGCCAATAGGTTTGGATCCATGGCTTCCACTTGGCT
TATCGGTAACTTTCTCCAGTCTTACCTTCAAAGCTCAGGCGCCTTTGAAGTTCTCTGCAA
CGGGGAACTGGTGTTCTCTAAGTTGAAAGAGGGTAGATTCCCGGGAGAGATCGAGCTGAG
AGATCTCATCAGTAAAACTTTGACAAAACCTAGCATGGTTGCAGGTAGCTTACTGAAGTA
GTTTCATCAGAAGAAGATGGGTGTTTCGATCTCTTGTGCCGAAAAAAAGCAAACGTTGTG
TTTTTAGTTAACATCATGCTTTGAACATTCCTGGTTTGTCTGATGATGATGA***TGTAG
CAGTCATACTTTGGTTTAGTTTAAAACTATACGCTTTGATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CP40TF U 1
AF RS1GN72TF U 47
AF RS1FS57TF U 67
AF RS1FS57JQ C 259
AF RS1GN72JQ C 259
AF RS1AY37JQ C 357
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BS 278 357 RS1CP40TF
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RD RS1CP40TF 634 0 0
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TCCCAAACCTCCGAGTCACCGTCCCAATCATCCACCGCACATCCCTCACCAGCAGCCTCC
GCCTGTTGTCGTTCCTGATTTTCCTTCACAG******GCAAGTGGCTTAGGAGGAGCAGT
TGGATATGGAAACACTGTGGAGATCAACTTCTGCGTCTCCTGTTCTTTCAAGGGAACCGC
AGTGAATATGAAGAAGATGTTAGAGACGGCTTTTCCCGGTTTAGATGTGGTTCTTGCGAA
CTACCCACCACCACCACCAAAGCGTCTTCTGGCTAAGGTTGTCCCCGTTGCTCAGATGGG
AGTTATTGGGATGATAGTTGCGGGTGATCGTGTCTTTCCCATGATTGGTATTGCGCATCC
ACCCGCATGGTTCAACTCCTTGAGGGCCAATAGGTTTGGATCCATGGCTTCCACTTGGCT
TATCGGTAACTTTCTCCAGTCTTACCTTCAAAGC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1GN72TF 628 0 0
GG
GTGGACTTACCGACTCTGTCATTCCGTCGGAGATTGATAATAATTCGCCATGGGCAGATC
ACAACTGCTGTTGATAGGTTTACCGATTTTCTTGTTCTGTTCGGATCTCTTCAACCTTTT
CACTCCTCCGCCTCCCTAACCTCCGAGTCACCGTCCCAATCATCCACCGCACATCCCTCA
CCAGCAGCCTCCGCCTGTTGTCGTTCCTGATTTTCCTTCACAGAAGCAGGCAAGTGGCTT
AGGAGGAGCAGTTGGATATGGAAACACTGTGGAGATCAACTTCTGCGTCTCCTGTTCTTT
CAAGGGAACTGCAGTGAATATGAAGAAGATGTTAGAGACGGCTTTTCCCGGTTTAGATGT
GGTTCTTGCGAACTACCCACCACCACCACCAAAGCGTCTTCTAGCTAAGGTTGTCCCCGT
TGCTCAGATGGGAGTTATTGGGATGATAGTTGCGGGTGATCGTGTCTTTCCCATGATTGG
TATTGCGCATCCACCCGCATGGTTCAACTCCTTGAGGGCCAATAGGTTTGGATCCATGGC
TTCCACTTGGCTTATCGGTAACTTTCTCCAGTCTTACCTTCAAAGCTCAG*CGCCTTTGA
AGTTCTCTGCAACGGGGAACTGGTGT

QA 3 628 3 628
DS 

RD RS1FS57TF 692 0 0
GG
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TACCGATTTTCTTGTTCTGTTCGGATCTCTTCAACCTTTTCACTCCTCCGCCTCCCAAAC
CTCCGAGTCACCGTCCCAATCATCCACCGCATATCCCTCACCAGCAGCCTCCGCCTGTTG
TCGTTCCTGATTTTCCTTCACAGAAGCAGGCAAGTGGCTTAGGAGGAGCAGTTGGATATG
GAAACACTGTGGAGATCAACTTCTGCGTCTCCTGTTCTTTCAAGGGAACTGCAGTGAATA
TGAAGAAGATGTTAGAGACGGCTTTTCCCGGTTTAGATGTGGTTCTTGCGAACTACCCAC
CACCACCACCAAAGCGTCTTCTAGCTAAGGTTGTCCCCGTTGCTCAGATGGGAGTTATTG
GGATGATAGTTGCGGGTGATCGTGTCTTTCCCATGATTGGTATTGCGCATCCACCCGCAT
GGTTCAACTCCTTGAGGGCCAATAGGTTTGGATCCATGGCTTCCACTTGGCTTATCGGTA
ACTTTCTCCAGTCTTACCTTCAAAGCTCAGGCGCCTTTGAAGTTCTCTGCAACGGGGAAC
TGGTGTTCTCTAAGTTGAAAGAGGGTAGATTCCCGGGAGAGATCGAGCTGAGAGATCTCA
TCAGTAAAACTTTGACAAA*CCTAGCATGG

QA 3 692 3 692
DS 

RD RS1FS57JQ 684 0 0
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GGAGATCAACTTCTGCGTCTCCTGTTCTTTCAAGGGAACTGCAGTGAATATGAAGAAGAT
GTTAGAGACGGCTTTTCCCGGTTTAGATGTGGTTCTTGCGAACTACCCACCACCACCACC
AAAGCGTCTTCTAGCTAAGGTTGTCCCCGTTGCTCAGATGGGAGTTATTGGGATGATAGT
TGCGGGTGATCGTGTCTTTCCCATGATTGGTATTGCGCATCCACCCGCATGGTTCAACTC
CTTGAGGGCCAATAGGTTTGGATCCATGGCTTCCACTTGGCTTATCGGTAACTTTCTCCA
GTCTTACCTTCAAAGCTCAGGCGCCTTTGAAGTTCTCTGCAACGGGGAACTGGTGTTCTC
TAAGTTGAAAGAGGGTAGATTCCCGGGAGAGATCGAGCTGAGAGATCTCATCAGTAAAAC
TTTGACAAAACCTAGCATGGTTGCAGGTAGCTTACTGAAGTAGTTTCATCAGAAGAAGAT
GGGTGTTTCGATCTCTTGTGCCGAAAAAAAGCAAACGTTGTGTTTTTAGTTAACATCATG
CTTTGAACATTCCTGGTTTGTCTGATGATGATG******TAGCAGTCATACTTTGGTTTA
GTTTAAAACTATACGCTT
TGATTC

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1GN72JQ 680 0 0
TTTTCCTTCACAGAAGCAGGCAAGTGGCTTAGGAGGAGCAGTTGGATATGGAAACACTGT
GGAGATCAACTTCTGCGTCTCCTGTTCTTTCAAGGGAACTGCAGTGAATATGAAGAAGAT
GTTAGAGACGGCTTTTCCCGGTTTAGATGTGGTTCTTGCGAACTACCCACCACCACCACC
AAAGCGTCTTCTAGCTAAGGTTGTCCCCGTTGCTCAGATGGGAGTTATTGGGATGATAGT
TGCGGGTGATCGTGTCTTTCCCATGATTGGTATTGCGCATCCACCCGCATGGTTCAACTC
CTTGAGGGCCAATAGGTTTGGATCCATGGCTTCCACTTGGCTTATCGGTAACTTTCTCCA
GTCTTACCTTCAAAGCTCAGGCGCCTTTGAAGTTCTCTGCAACGGGGAACTGGTGTTCTC
TAAGTTGAAAGAGGGTAGATTCCCGGGAGAGATCGAGCTGAGAGATCTCATCAGTAAAAC
TTTGACAAAACCTAGCATGGTTGCAGGTAGCTTACTGAAGTAGTTTCATCAGAAGAAGAT
GGGTGTTTCGATCTCTTGTGCCGAAAAAAAGCAAACGTTGTGTTTTTAGTTAACATCATG
CTTTGAACATTCCTGGTTTGTCTGATGATGATGA***TGTAGCAGTCATACTTTGGTTTA
GTTTAAAACTATACGCTT
CG

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1AY37JQ 586 0 0
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CGAACTACCCACCACCACCACCAAAGCGTCTTCTAGCTAAGGTTGTCCCCGTTGCTCAGA
TGGGAGTTATTGGGATGATAGTTGCGGGTGATCGTGTCTTTCCCATGATTGGTATTGCGC
ATCCACCCGCATGGTTCAACTCCTTGAGGGCCAATAGGTTTGGATCCATGGCTTCCACTT
GGCTTATCGGTAACTTTCTCCAGTCTTACCTTCAAAGCTCAGGCGCCTTTGAAGTTTTCT
GTAACGGGGAACTGGTGTTCTTTAAGTTGAAAGAGGGTAGATTCCCGGGAGAGATCGAGC
TGAGAGATCTCATCAGTAAAACTTTGACAAAACCTAGCATGGTTGCAGGTAGCTTACTGA
AGTAGTTTCATCAGAAGAAGATGGGTGTTTCGATTTCTTGTGCCGAAAAAAAGCAAACGT
TGTGTTTTTAGTTAACATCATGCTTTGAACATTCCTGGTTTGTCTGATGATGATGATGAT
GTAGCAGTCATACTTTGGTTTAGTTTAAAACTATACGCTTTGATTC

QA 1 586 1 586
DS 



AS 1 6

CO CL1303Contig1 1121 6 9 U
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CTTTCTGAACAAGCAAAATATGAGATACAAAGGCAAGCAATGTCTGTCAACTTAAAGCCT
GATGAAGTTGTCAAGCTTTTTCCACTGAACTTACAACTCTCAGTCGCATTGGAAGATCCC
TGGTTCTAGATGAAGCTTGTCTTTTAGTAAATCTCATCATCAGGTATCTCAGGAGTCAAG
AACTTCATCGGATCTTTGCTAATCTCCTCATAATTCACCCTCGGTTTCACCCTATCAGGA
ACAGGCTCCAGAGGAATGATGCTGTCCCCATCAATAACCCCATCAATCAAACCATACTCA
ACCGCTTCAATCGGAGACATGTACCGGTCCCTGTCGATATCCTTCAGGACCTGCTCAAAG
GAACGGCCAGTACACCCAGCGATAATGCTGGTGACATTGTTCTTGTTGTGCATAACTTCT
TTCGCTTGGATCTCAACATCTATAGCTTGACCGCTCGCACCTCCAAGAGGCTGATGCATC
ATTATCCTCGTGTTGGGCATCGCAAAGCGCTTGCCTTTAGTTCCCGCACCGAGAATGATC
GACGCTGTTGATGCAGCGATGCCGAGAACAATCGTGGAAACATCGGCTCTCACAAGTTGA
ACCACATCGTATATAGCCATGGTTGCACTGAGGGAGCCACCAGAGGAGTTGATGAAGAGT
TTGATGTCTTTCTTAGGATCTTTGGCATCTAAGAGCAGCAACTGACTCATTATGGCGTCG
GCGACGAAATCGTCGATACTGCTGCCGAGGAAGACGATTCGTTCCCTGGGGAGGAGACCC
ATGACGTCGGATTCGGCGCCGCGAATAGCTGACTCCTGGGTCTGCGACATCTCGATTGAA
GCGTTCGCGAATCTCAGTGGGGACGGAGAGGTTCTCAAGGGAGGTGAAATGAGTTTGGTG
GGTTTGAGGGAGAGGTTGTTGGGTTTTGGGAAAGAAGAAGAGGATGCGGAGGAAGAGGAG
CTGAGTCTTGACGAAACGAGGAGTGAAGGTTTGAGGGAGGATGAGAGAGATAGGGTTCCC
ATGGCTGAAGAAGCGAAGAAGAAGTAAAGAGTTTGGGATCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 40 40 15 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1CN87JQ U 22
AF RS1EZ54JQ U 1
AF RS1G224JQ U 1
AF RS1F073JQ U 11
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TTTTAGTAAATCTCATCATCAGGTATCTCAGGAGTCAAGAACTTCATCGGATCTTTGCTA
ATCTCCTCATAGTTCACTCTCGGTTTCACCCTATCAGGAACAGGCTCCAGAGGAATGATG
CTGTCCCCATCAATAACCCCATCAATCAAACCATACTCAACCGCTTCAATCGGAGACATG
TACCGGTCCCTGTCGATATCCTTCAGGACCTGCTCAAACGAACGGCCAGTACACCCAGCG
ATAATGCTGGTGACATTGTTCTTGTTGTGCATAACTTCTTTAGCTTGGATCTCAACATCT
ATAGCTTGACCGCTCGCACCTCCAAGAGGCTGATGCATCATTATCCTCGTGTTGGGCATC
GCAAAGCGCTTGCCTTTAGTTCCCGCACCGAGAATGATCGATGCTGTTGATGCAGCGATG
CCGAGAGCAATCGTGGAAACATC
C

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DS 

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TGGTTCTAGATGAAGCTTGTGTTTTAGTAAATCTCATCATCAGGTATCTCAGGAGTCAAG
AACTTCATCGGATCTTTGCTAATCTCCTCATAATTCACCCTCGGTTTCACCCTATCAGGA
ACAGGCTCCAGAGGAATGATGCTGTCCCCATCAATAACCCCATCAATCAAACCATACTCA
ACCGCTTCAATCGGAGACATGTACCGGTCCCTGTCGATATCCTTCAGGACCTGCTCAAAG
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TGGTTCTAGATGAAGCTTGTGTTTTAGTAAATCTCATCATCAGGTATCTCAGGAGTCAAG
AACTTCATCGGATCTTTGCTAATCTCCTCATAATTCACCCTCGGTTTCACCCTATCAGGA
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ACCGCTTCAATCGGAGACATGTACCGGTCCCTGTCGATATCCTTCAGGACCTGCTCAAAG
GAACGGCCAGTACACCCAGCGATAATGCTGGTGACATTGTTCTTGTTGTGCATAACTTCT
TTCGCTTGGATCTCAACATCTATAGCTTGACCGCTCGCACCTCCAAGAGGCTGATGCATC
ATTATCCTCGTGTTGGGCATCGCAAAGCGCTTGCCTTTAGTTCCCGCACCGAGAATGATC
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G
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GAAGCTTGTCTTTTAGTAAATCTCATCATCAGGTATCTCAGGAGTCAAGAACTTCATCGG
ATCTTTGCTAATCTCCTCATAGTTCACTCTCGGTTTCACCCTATCAGGAACAGGCTCCAG
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CGGAGACATGTACCGGTCCCTGTCGATATCCTTCAGGACCTGCTCAAACGAACGGCCAGT
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TGCAGCGATGCCGAGAGCAATCGTGGAAACATCGGCTCTCACAAGTTGAACCACATCGTA
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QA 2 743 2 743
DS 

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GTTCCCATGGCTGAAGAAGCGAAGAAGAAGTAAAGAGTTTGGGATCC

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DS 

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AAGGAACGGCCAGTACACCCAGCGATAATGCTGGTGACATTGTTCTTGTTGTGCATAACT
TCTTTCGCTTGGATCTCAACATCTATAGCTTGACCGCTCGCACCTCCAAGAGGCTGATGC
ATCATTATCCTCGTGTTGGGCATCGCAAAGCGCTTGCCTTTAGTTCCCGCACCGAGAATG
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TGAACCACATCGTATATAGCCATGGTTGCACTGAGGGAGCCACCAGAGGAGTTGATGAAG
AGTTTGATGTCTTTCTTAGGATCTTTGGCATCTAAGAGCAGCAACTGACTCATTATGGCG
TCGGCGACGAAATCGTCGATACTGCTGCCGAGGAAGACGATTCGTTCCCTGGGGAGGAGA
CCCATGACGTCGGATTCGGCGCCGCGAATAGCTGACTCCTGGGTCTGCGACATCTCGATT
GAAGCGTTCGCGAATCTCAGTGGGGACGGAGAGGTTCTCAAGGGAGGTGAAATGAGTTTG
GTGGGTTTGAGGGAGAGGTTGTTGGGTTTTGGGAAAGAAGAAGAGGATGCGGAGGAAGAG
GAGCTGAGTCTTGACGAAACGAGGAGTGAAGGTTTGAGGGAGGATGAGAGAGATAGGGTT
CCCATGGCTGAAGAAGCGAAGAAGAAGTAAAGAGTTTGGGATCC

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 4

CO CL1304Contig1 809 4 3 U
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GTTCACATTGCATTTACCCAAAACTTCAAAAGTAAAACAATAAACTCTTTTCTAGGACTA
GATATTCTAATTTTACATAGAATAAATCCTTCTTTTCTTCAACGGACAATAGCCATCCTA
CGTCTTTGAGATTCCGTCGGGAGTTTCACATCATATGCTAACCCAACAATCTCAAGTGAC
CGAACAATGTACCAAGAGATGTCTATTTGCCACCATTCAAGTCCTTGCCTCGCCGACGAC
TCGAACGCATGGTGGTTGTTGTGCCAACTTTCTCCAAATGAAAACACAGATAGCCACCAA
ACATTACGAGAAGTGTCATTGGTTTTCCATGTCCGAGTGCCCCAAATGTGGCAGATGGAG
TTGATGAAGCAAGTCACGTGCACCTCCAATGCTGCTCCTACACCCATTCCCCAAGTAACG
AAGGACATGCCACCAAGATAGTAGAGAATGAGACCAAGTCCTAGAATATGAAACATCACC
GTTTTTTGAAGGAACCTATAGAACCATTGCTTCTTCAAATCCTCCACGTTTGTTCTTCTT
CCACACTTTGAAACAAGATATGCAGAATCATAAATCCATAGAAGATGACTAAACCAAAAG
CCTTCTTTAGGACTATGTGGATCTCTTTCTGAATCTGTAAACTGGTGATGATATCGATGA
GTACTCACCCAATCGATCGGATCTCCCTGAATGGCGAGAAGGGCACAATAGGCTAAGAGA
TACTCAAGCCATTTAGGGACTTTGAAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C640JQ U 163
AF RS1CV37JQ U 51
AF RS1FO01JQ U 12
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BS 1 30 RS1GT08JQ
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BS 32 809 RS1GT08JQ

RD RS1C640JQ 366 0 0
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CCAACAATCTCAAGTGACCGAACAATGTACCAAGAGATGTCTATTTGCCACCATTCAAGT
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AACACAGATAGCCACCAAACATTACGAGAAGTGTCATTGGTTTTCCATGTCCGAGTGCCC
CAAATGTGGCAGATGGAGTTGATGAAGCAAGTCACGTGTACCTCCAATGCTGCTCCTACA
CCCATTCCCCAAGTAACGAAGGACATGCCACCAAGATAGTAGAGAATGAGACCAAGTCCT
AGAATA

QA 1 366 1 366
DS 

RD RS1CV37JQ 458 0 0
G
ATCGAAAACGTTCACATTGCATTTACCCAAAACTTCAAAAGTAAAACAATAAACTCTTTT
CTAGGACTAGATATTCTAATTTTACATAGAATAAATCCTTCTTTTCTTCAACGGACAATA
GCCATCCTACGTCTTTGAGATTCCGTCGGGAGTTTCACATCATATGCTAACCCAACAATC
TCAAGTGACCGAACAATGTACCAAGAGATGTCTATTTGCCACCATTCAAGTCCTTGCCTC
GCCGACGACTCGAACGCATGGTGGTTGTTGTGCCAACTTTCTCCAAATGAAAACACAGAT
AGCCACCAAACATTACGAGAAGTGTCATTGGTTTTCCATGTCCGAGTGCCCCAAATGTGG
CAGATGGAGTTGATGAAGCAAGTCACGTGCACCTCCAATGCTGCTCCTACACCCATTCCC
CAAGTAACGAAGGACATGCCACCAAGATAGTAAAGAA

QA 2 458 2 458
DS 

RD RS1FO01JQ 676 0 0
ACCACAAATATCTTAAATAAATTTAGTCCAACATCAATACATCGAAAACGTTCACATTGC
ATTTACCCAAAACTTCAAAAGTAAAACAATAAACTCTTTTCTAGGACTAGATATTCTAAT
TTTACATAGAATAAATCCTTCTTTTCTTCAACGGACAATAGCCATCCTACGTCTTTGAGA
TTCCGTCGGGAGTTTCACATCATATGCTAACCCAACAATCTCAAGTGACCGAACAATGTA
CCAAGAGATGTCTATTTGCCACCATTCAAGTCCTTGCCTCGCCGACGACTCGAACGCATG
GTGGTTGTTGTGCCAACTTTCTCCAAATGAAAACACAGATAGCCACCAAACATTACGAGA
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AGTCACGTGCACCTCCAATGCTGCTCCTACACCCATTCCCCAAGTAACGAAGGACATGCC
AC*AAGATAGTAGAGAATGAGACCAAGTCCTAGAATATGAAACATCACCGTTTTTTGAAG
GAACCTATAGAACCATTGCTTCTTCAAATCCTCCACGTTTGTTCTTCTTCCACACTTTGA
AACAAGATATGCAGAATCATAAATCCATAGAAGATGACTAAACCAAAAGCCTTCTTTAGG
ACTATGTGGATCTCTT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1GT08JQ 809 0 0
CAGCACCGATTACCACAAATATCTTAAATAGATTTAGTCCAACATCAATACATCGAAAAC
GTTCACATTGCATTTACCCAAAACTTCAAAAGTAAAACAATAAACTCTTTTCTAGGACTA
GATATTCTAATTTTACATAGAATAAATCCTTCTTTTCTTCAACGGACAATAGCCATCCTA
CGTCTTTGAGATTCCGTCGGGAGTTTCACATCATATGCTAACCCAACAATCTCAAGTGAC
CGAACAATGTACCAAGAGATGTCTATTTGCCACCATTCAAGTCCTTGCCTCGCCGACGAC
TCGAACGCATGGTGGTTGTTGTGCCAACTTTCTCCAAATGAAAACACAGATAGCCACCAA
ACATTACGAGAAGTGTCATTGGTTTTCCATGTCCGAGTGCCCCAAATGTGGCAGATGGAG
TTGATGAAGCAAGTCACGTGCACCTCCAATGCTGCTCCTACACCCATTCCCCAAGTAACG
AAGGACATGCCACCAAGATAGTAGAGAATGAGACCAAGTCCTAGAATATGAAACATCACC
GTTTTTTGAAGGAACCTATAGAACCATTGCTTCTTCAAATCCTCCACGTTTGTTCTTCTT
CCACACTTTGAAACAAGATATGCAGAATCATAAATCCATAGAAGATGACTAAACCAAAAG
CCTTCTTTAGGACTATGTGGATCTCTTTCTGAATCTGTAAACTGGTGATGATATCGATGA
GTACTCACCCAATCGATCGGATCTCCCTGAATGGCGAGAAGGGCACAATAGGCTAAGAGA
TACTCAAGCCATTTAGGGACTTTGAAACT

QA 1 809 1 809
DS 



AS 2 6

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ATCTTGATGGTCCTCTGCATCTTGCCGGCGATAGCCATGGCGGCGAGGAAGCAGCCACGC
ATCGGAAAGAACACTCTTGTCGTTCAAGGCATCACTTACTGCGACGCATGCAAGTTCGGT
TTCGAGACTGCCGAATCCTCCTACGTCCTTCCCGGCGCGACGGTGAAGCTTTCTTGCAAA
GACAGGAAGACGATGGAAGAGATCTACAGTGACGTGGCCGTGTCGAACCGTCACGGGAAG
TACATGTTCGTCGTCCACGAAGACCACAAAGACGAGATGTGCGATGTGATGCTCGTGAAA
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AACCATTACAATGGTATCGCTGAGCAGATTAGGCATGCGAACAACATGGGGTTCGAGAAG
GATGTTAGCGATGTGTTTTGCTCTGAGTTGATTAAGAAGTATCAGGTTGATGAAGATGAG
ACTTGAGATTAGTAGATCTGTTTTCTTGTCAATGTTGTGATCTGATGTTTTTTTTTTTAA
TATATTTATTTGTCTTGGATGATGATCGGAACTCTGGTTGTGTAAGCTTTCTTTATATTT
GATGATGTGTTACTTCCCTGCTTGGGAAGTGTCTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BZ60JQ C 1
AF RS1BZ60TF U 1
BS 1 679 RS1BZ60TF
BS 680 696 RS1BZ60JQ

RD RS1BZ60JQ 696 0 0
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TTCGAGACTGCCGAATCCTCCTACGTCCTTCCCGGCGCGACGGTGAAGCTTTCTTGCAAA
GACAGGAAGACGATGGAAGAGATCTACAGTGACGTGGCCGTGTCGAACCGTCACGGGAAG
TACATGTTCGTCGTCCACGAAGACCACAAAGACGAGATGTGCGATGTGATGCTCGTGAAA
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AACCATTACAATGGTATCGCTGAGCAGATTAGGCATGCGAACAACATGGGGTTCGAGAAG
GATGTTAGCGATGTGTTTTGCTCTGAGTTGATTAAGAAGTATCAGGTTGATGAAGATGAG
ACTTGAGATTAGTAGATCTGTTTTCTTGTCAATGTTGTGATCTGATGTTTTTTTTTT*AA
TATATTTATTTGTCTTGGATGATGATCGGAACTCTGGTTGTGTAAGCTTTCTTTATATTT
GATGATGTGTTACTTCCCTGCTTGGGAAGTGTCTTT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RS1BZ60TF 679 0 0
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ATCTTGATGGTCCTCTGCATCTTGCCGGCGATAGCCATGGCGGCGAGGAAGCAGCCACGC
ATCGGAAAGAACACTCTTGTCGTTCAAGGCATCACTTACTGCGACGCATGCAAGTTCGGT
TTCGAGACTGCCGAATCCTCCTACGTCCTTCCCGGCGCGACGGTGAAGCTTTCTTGCAAA
GACAGGAAGACGATGGAAGAGATCTACAGTGACGTGGCCGTGTCGAACCGTCACGGGAAG
TACATGTTCGTCGTCCACGAAGACCACAAAGACGAGATGTGCGATGTGATGCTCGTGAAA
AGCTCGGACAAGGGTTGTTCGAAAATCTCAAAGGGGCGTGAGCAGTCGCGCGTGATATTG
AACCATTACAATGGTATCGCTGAGCAGATTAGGCATGCGAACAACATGGGGTTCGAGAAG
GATGTTAGCGATGTGTTTTGCTCTGAGTTGATTAAGAAGTATCAGGTTGATGAAGATGAG
ACTTGAGATTAGTAGATCTGTTTTCTTGTCAATGTTGTGATCTGATGTTTTTTTTTTTAA
TATATTTATTTGTCTTGGATGATGATCGGAACTCTGGTTGTGTAAGCTTTCTTTATATTT
GATGATGTGTTACTTCCCT

QA 1 679 1 679
DS 



CO CL1305Contig2 683 4 5 U
AAAGACACTTCCCAAGCAGGGAAGTAACACGTCATCAAATATAAAGAAAGCTTACACAAC
CAGAGTTCCGATCATCATCCAAAGACAAATAAATATTAAAAAAAAAAACATCAGAGACAA
AGAAACAGATCTACTAATCTCAAATCTCATCTTCATCAACCTGATACTTCTTAATCAACT
CAGAGCAAAACACATCGCTAACATCCTTCTCGAACCCCATGTTGTCAGCATGCCTAATCT
GCTCAGCGATACCATTGTAATGGTTCAATATCACGCGCGACTGCTCACGCCCCTTTGAGA
TTTTAGAACAACTCTTGTCGGAGCTTTTCACGAGCATCACATCGCACATCTCGTCTTTGT
GGTCCTCGTGGACGACGAACATGTACTTCCCGTGACGGTTCGACACGGCCACGTCACTGT
AGATCTCTTCCATCGTCTTCCTGTCTTTGCAAGAAAGCTTCACCGTCGCGCCGGGGAGTA
CGTAGGAGGATTCAGCAGTCTCGAAACCGAACTTGCATGTGTCGCAGTAAGTGATGCCTT
GAACGACCAGAGTGTTCTTTCCGATGCGTGGCTGCTTCCTCGCCGCCATGGCTATCGCGG
GCAAGATGCAGAGAACCATCAAGATCACTAGTTTCGCCATTTTCGAGAAGAGAGAGCTAG
AGAGAGAGTATGGATCGAAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BM04JQ U 117
AF RS1BM04TF C 77
AF RS1DP37JQ U 38
AF RS1DP37TF C 1
BS 1 37 RS1DP37TF
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RD RS1BM04JQ 163 0 0
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AACTCAAAGCAAAACACATCGCTAACATCCTTCTCGAACCCCATGTTGTCAGCATGCCTA
ATCTGCTCAGCGATACCATTGTAATGGTTCAATATC
CCGCCCG

QA 1 156 1 156
DS 

RD RS1BM04TF 522 0 0
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ATCTCAAATCTCATCTTCATCAACCTGATACTTCTTAATCAACTCAGAGCAAAACACATC
GCTAACATCCTTCTCGAACCCCATGTTGTCAGCATGCCTAATCTGCTCAGCGATACCATT
GTAATGGTTCAATATCACGCGCGACTGCTCACGCCCCTTTGAGATTTTAGAACAACTCTT
GTCGGAGCTTTTCACGAGCATCACATCGCACATCTCGTCTTTGTGGTCCTCGTGGACGAC
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QA 1 522 1 522
DS 

RD RS1DP37JQ 570 0 0
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AAAAAAAAAAACATCAGAGACAAAGAAACAGATCTACTAATCTCAAATCTCATCTTCATC
AACCTGATACTTCTTAATCAACTCAGAGCAAAACACATCGCTAACATCCTTCTCGAACCC
CATGTTGTTAGCATGCCTAATCTGCTCAGCGATACCATTGTAATGGTTCAATATCACGCG
CGACTGCTCACGCCCCTTTGAGATTTTAGAACAACTCTTGTCGGAGCTTTTCACGAGCAT
CACATCGCACATCTCGTCTTTGTGGTCCTCGTGGACGACGAACATGTACTTCCCGTGACG
GTTCGACACGGCCACGTCACTGTAGATCTCTTCCATCGTCTTCCTGTCTTTGCAAGAAAG
CTTCACCGTCGCGCCGGGGAGTACGTAGGAGGATTCAGCAGTCTCGAAACCGAACTTGCA
TGTGTCGCAGTAAGTGATGCCTTGAACGACCAGAGTGTTCTTTCCGATGCGTGGCTGCTT
CCTCGCCGCCATGGCTATCGCGGGCAAGAT

QA 1 570 1 570
DS 

RD RS1DP37TF 683 0 0
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CAGAGTTCCGATCATCATCCAAAGACAAATAAATATTAAAAAAAAAAACATCAGAGACAA
AGAAACAGATCTACTAATCTCAAATCTCATCTTCATCAACCTGATACTTCTTAATCAACT
CAGAGCAAAACACATCGCTAACATCCTTCTCGAACCCCATGTTGTTAGCATGCCTAATCT
GCTCAGCGATACCATTGTAATGGTTCAATATCACGCGCGACTGCTCACGCCCCTTTGAGA
TTTTAGAACAACTCTTGTCGGAGCTTTTCACGAGCATCACATCGCACATCTCGTCTTTGT
GGTCCTCGTGGACGACGAACATGTACTTCCCGTGACGGTTCGACACGGCCACGTCACTGT
AGATCTCTTCCATCGTCTTCCTGTCTTTGCAAGAAAGCTTCACCGTCGCGCCGGGGAGTA
CGTAGGAGGATTCAGCAGTCTCGAAACCGAACTTGCATGTGTCGCAGTAAGTGATGCCTT
GAACGACCAGAGTGTTCTTTCCGATGCGTGGCTGCTTCCTCGCCGCCATGGCTATCGCGG
GCAAGATGCAGAGAACCATCAAGATCACTAGTTTCGCCATTTTCGAGAAGAGAGAGCTAG
AGAGAGAGTATGGATCGAAGTCC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 6

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CATAGATAAGGGCTAAAGAGTCAAACTCATAATCCAAATTGAAATGAAACGTACTCATGT
CCGACAAAACAAAATTTAAAACACAAAAGTACTTGCTTATGATTTAAACTTAAAAGACAA
AACACCTTACTCAAATCAACTCTTTGTTTTAATCAACGTTCTGCATAACATCCTCAGCAG
TGAACTTAGTACCCTTGTCCTTATCCGCGGCAGCACGTCCCTTGGCCTTCCTCTCCAAAA
GCGACTTCCTGTCCTTATCGAGACGGAGCTTCGTAATCACCACTTTCGACGGCTGAACTC
CGACATTCACGGTGGTTCCGTTCACCTTCTCCCTCGTGATCCTCTCGATGTGAATCACCC
ACTTGCGACGGTACACCTGGACAACCTTTCCCTCACGTCCCTTGTAGGTACCGCGAACGA
TCTGAACCTCGTCGTCCTTGCGGATAGGCATGGATCTGACGTTGTACTTGGCGCGGAGGT
CGGTGGAGAGAGGTGAGCTCATGATGACGCGCCTCTCGCTCGATGATGCGGTGAAATGAG
CCTTACGGTTCTTCCTGCGGGAGGAGGTGACTCTTGGGTTGTACTTCATCTTCGCCGCCG
GGTTT*GGGGAATGGAGAAGCTCTCTTTCTAGGGTTTTATGGGGGCGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 

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AF RS1EB37JQ U 138
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AF RS1AU70TF C 45
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TGAACTTAGTACCCTTGTCCTTATCCGCGGCAGCACGTCCCTTGGCCTTCCTCTCCAAAA
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CGACATTCACGGTGGTTCCGTTCACCTTCTCCCTCGTGATCCTCTCGATGTGAATCACCC
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TCTGAACCTCGTCGTCCTTGCGGATAGGCATGGATCTGACGTTGTACTTGGCGC

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CTTCGCCGCCGGGTTT*GGGGAATGGAGAAGCTCTCTTTCTAGGGTTTTATGGGGGCGAG
CC

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DS 

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T
TTACTCAAATCAACTCTTTGTTTTAATCAACGTTCTGCATAACATCCTCAGCAGTGAACT
TAGTACCCTTGTCCTTATCCGCGGCAGCACGTCCCTTGGCCTTCCTCTCCAAAAGCGACT
TCCTGTCCTTATCGAGACGGAGCTTCGTAATCACCACTTTCGACGGCTGAACTCCGACAT
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GACGGTACACCTGGACAACCTTTCCCTCACGTCCCTTGTAGGTACCGCGAACGATCTGAA
CCTCGTCGTCCTTGCGGATAGGCATGGATCTGACGTTGTACTTGGCGCGGAGGTCGGTGG
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GGGGAATGGAGAAGCTCTCTTTCTAGGGTTTTATGGGGGC
CC

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DS 

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CC

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DS 

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TCGAGACGAAGCTTGGTAATCACCACTTTCGACGGCTGAACTCCGACATTCACGGTGGTT
CCGTTCACCTTCTCCCTCGTGATCCTCTCGATGTGAATCACCCACTTGCGACGGTACACC
TGGACAACCTTTCCCTCACGTCCCTTGTAGGTACCGCGAACGATCTGAACCTCGTCGTCC
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AAGCTCTCTTTCTAGGGTTTTATGGGGGC
CC

QA 1 569 1 569
DS 

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CATAT
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CCTCTCCAAAAGCGACTTCCTGTCCTTATCGAGACGGAGCTTCGTAATCACCACTTTCGA
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GGCGCGGAGGTCGGTGGAGAGAGGTGAGCTCATGATGACGCGCCTCTCGCTCGATGATGC
GGTGAAATGAGCCTTACGGTTCTTCCTGCGGGAGGAGGTGACTCTTGGGTTGTACTTCAT
CTTCGCCGCCGGGTTT*GGGGAATGGAGAAGCTCTCTTTCTAGGGTTTTATGGGGGC
GAGCC

QA 6 662 6 662
DS 



AS 1 6

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TTTAATAGGAGAAAAGTTCAAGATAATAAGCCAAACAAGTGAGCAAGTCGAAATTTCATT
TTCAAAAACATGGGATACCTCTAAACGCGGCTCGACAATTCCACTAAACGTAGATAAAAG
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AAATCTTACCGATGGTAGTGCAGCTCCATTGGAATACAAAGAAGCGGTTCGGATGGT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CW92TF U 1
AF RS1DZ21TF U 8
AF RS1CI76TF U 36
AF RS1DZ21JQ C 75
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AA

QA 1 662 1 662
DS 

RD RS1DZ21TF 805 0 0
GG
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GTGATACAAATTTCTTCAGTGGAGAAAGCTCATCATAAGAATAAAGCTGAAAAGGAACTC
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GGTCATAACTCAGGGTTTTGTTCTGATATTCCTTCTTCAAGGTGTTCATTCCCGAACGTT
GCGAAGCGAATCAAATACTGCAGAATCGGGACAAAAGGTTACGGTTAACACAGCTGGCGA
ACAAGTGGTTGTTGATAATGGTATCATCCAACTCACCTTCTCGAATCCAGCCGGCTTAGT
AACTGCAATCAAGTATAAGGGCTTTGACAATGTGTTGAACGAAAGAACTAAGAATCGTGT
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AGAAAAGTTCAAGATAATAAGCCAAACAAGTGAGCAAGTCGAAATTTCATTTTCAAAAAC
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TATGGCTGTAGACGATCATCGACAGAATCTAATGCCTTTAGAGGCAGATCGAA*TCTTAC
CGATGGTAGTGCAGCTC
ATTGGA

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DS 

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GG
GGTAAATCAAAAACAAAAAAAAAATTGTATAAGTGATACAAATTTCTTCAGTGGAGAAGG
CTCATCATAAGAATAAAGCTGAAAAGGAACTCAATAAATAGACAAATAGGGAAATCATAC
AAGAAAATTGAATTAGTCAAGGAGATGGATCGGGTCATAACTCAGGGTTTTGTTCTGATA
TTCCTTCTTCAAGGTGTTCATTCCCGAACGTTGCGAAGCGAATCAAATACTGCAGAATCG
GGACAAAAGGTTACGGTTAACACAGCTGGCGAACAAGTGGTTGTTGATAATGGTATCATC
CAACTCACCTTCTCGAATCCAGCCGGCTTAGTAACTGCAATCAAGTATAAGGGCTTTGAC
AATGTGTTGAACGAAAGAACTAAGAATCGTGTGTATTGGGATATAGTATGGTATGAACCA
GGACAAGTATCGCAAACAGATTTTTTAATAGGAGAAAAGTTCAAGATAATAAGCCAAACA
AGTGAGCAAGTCGAAATTTCATTTTCAAAAACATGGGATACCTCTAAACGCGGCTCGACA
ATTCCACTAAACGTAGATAAAAGATATATTACTCGACGCGGTGTAAGTGGAGTGTATATG
TACGGTGTGGTAGAGAGGTTAAAAAGTTGGCCGACGGTAACAATGGACCAAACCAGAATA
GTCTACAAGCTTAACGCTACAAAGTTCGATTATATGGCTGTAGACGATCATCGACAGAAT
CTAATGCCTTTAGAG*CAGATCGAA*TCTTACCGATGGTAGTGCAGCTC
ATGGA

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DS 

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ATAGACAAATAGGGAAATCATACAAGAAAACTGAATTAGTCAAGGAGATGGATCGGGTCA
TAACTCAGGGTTTTGTTCTGATATTCCTTCTTCAAGGTGTTCATTCCCGAACGTTGCGAA
GCGAATCAAATACTGCAGAATCGGGACAAAAGGTTACGGTTAACACAGCTGGCGAACAAG
TGGTTGTTGATAATGGTATCATCCAACTCACCTTCTCGAATCCAGCCGGCTTAGTAACTG
CAATCAAGTATAAGGGCTTTGACAATGTGTTGAACGAAAGAACTAAGAATCGTGTGTATT
GGGATATAGTATGGTATGAACCAGGACAAGTATCGCAAACAGATTTTTTAATAGGAGAAA
AGTTCAAGATAATAAGCCAAACAAGTGAGCAAGTCGAAATTTCATTTTCAAAAACATGGG
ATACCTCTAAACGCGGCTCGACAATTCCACTAAACATAGATAAAAGATATATTATTCGAC
GCGGTGTAAGTGGAGTGTATATGTACGGTGTGGTAGAGAGGTTAAAAAGTTGGCCGACGG
TAACAATGGACCAAACCAGAATAGTCTACAAGCTTAACGCTACAAAGTTCGATTATATGG
CTGTAGACGATCATCGACAGAATCTAATGCCTTTAGAGGCAGATCGAAATCTTACCGATG
GTAGTGCAGCTCCATTGGAATACAAAGAAGCGGTTCGGATGGT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RS1CI76JQ 725 0 0
AAGCTGAAAAGGAACTCAATAAATAGACAAATAGGGAAATCATACAAGAAAATTGAATTA
GTCAAGGAGATGGATCGGGTCATAACTCAGGGTTTTGTTCTGATATTCCTTCTTCAAGGT
GTTCATTCCCGAACGTTGCGAAGCGAATCAAATACTGCAGAATCGGGACAAAAGGTTACG
GTTAACACAGCTGGCGAACAAGTGGTTGTTGATAATGGTATCATCCAACTCACCTTCTCG
AATCCAGCCGGCTTAGTAACTGCAATCAAGTATAAGGGCTTTGACAATGTGTTGAACGAA
AGAACTAAGAATCGTGTGTATTGGGATATAGTATGGTATGAACCAGGACAAGTATCGCAA
ACAGATTTTTTAATAGGAGAAAAGTTCAAGATAATAAGCCAAACAAGTGAGCAAGTCGAA
ATTTCATTTTCAAAAACATGGGATACCTCTAAACGCGGCTCGACAATTCCACTAAACGTA
GATAAAAGATATATTACTCGACGCGGTGTAAGTGGAGTGTATATGTACGGTGTGGTAGAG
AGGTTAAAAAGTTGGCCGACGGTAACAATGGACCAAACCAGAATAGTCTACAAGCTTAAC
GCTACAAAGTTCGATTATATGGCTGTAGACGATCATCGACAGAATCTAATGCCTTTAGAG
GCAGATCGAAATCTTACCGATGGTAGTGCAGCTCCATTGGAATACAAAGAAGCGGTTCGG
ATGGT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1CW92JQ 585 0 0
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AGTGGTTGTTGATAATGGTATCATCCAACTCACCTTCTCGAATCCAGCCGGCTTAGTAGC
TGCAATCAAGTATAAGGGCTTTGACAATGTGTTGAACGAAAGAACTAAGAATCGTGTGTA
TTGGGATATAGTATGGTATGAACCAGGACAAGTATCGCAAACAGATTTTTTAATAGGAGA
AAAGTTCAAGATAATAAGCCAAACAAGTGAGCAAGTCGAAATTTCATTTTCAAAAACATG
GGATACCTCTAAACGCTGCTCGACAATTCCACTAAACGTAGATAAAAGATATATTATTCG
ACGCGGTGTAAGTGGAGTGTATATGTACGGTGTG*TAGAGAGGTTAAAAAGTTGGCCGAC
GGTAACAATGGACCAAACCAGAATAGTCTACAAGCTTAACGCTACAAAGTTCGATTATAT
GGCTGTAGACGATCATCGACAGAATCTAATGCCTTTAGAGGCAGATCGAAATCTTACCGA
TGGTAGTGCAGCTCCATTGGAATACAAAGAAGCGGTTCGGATGGT

QA 1 585 1 585
DS 



AS 2 6

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TTCCTTGTAATCAAACTCAATCGTGTTGACATGCCCCGAGATGATTCCCCATAAGCCCCA
AAAGATATGATTTGCCAAAGTGTATCTCCCTGCATCAGTCATTAACCTATCCACTTCTTC
TTGGCTTAGTGCATTCCCTGTAGAGCCAAGGTATGTGCTAATGAACCTTCTCCGTTCTTC
TTCTCCTGGATATAGAGTGTAATCAAGAACATGAGGAGTGTCTGAATGGTAATTAGCAGC
CATTTCACAGAAGTGGTTAGCAATGTCATAAGCGATAGGGTTGAAACTCGAATACTCATA
GTCTATGATGGTAATAGCGTTGGTTTCCTCATCGATCATGACGTTACCATACTGAAGATC
ATTGTGACAGAAACCAATCTCCTGATCCTCCCGAGTCAGCCTCTCTTTCAACAAGTTGAT
TTCACCGTCCATAGCTTCCAAACGAAACTCATCGATCTCTGTCGGCGAACACAGGTTCTT
AGCTTCCTTGAGCCAAGTCCTGAGCCTTTCCCAGAGGAGTACGTTCTTTGGACAGGCATA
TCTAGCTTGTGAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BH42JQ U 1
AF RS1BH42TF C 1
AF RS1EO32JQ U 12
AF RS1EO54JQ U 12
BS 1 454 RS1BH42JQ
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BS 720 793 RS1EO54JQ

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C

QA 1 454 1 454
DS 

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TTCCTTGTAATCAAACTCAATCGTGTTGACATGCCCCGAGATGATTCCCCATAAGCCCCA
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TTCTCCTGGATATAGAGTGTAATCAAGAACATGA
C

QA 1 454 1 454
DS 

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QA 1 708 1 708
DS 

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GGAGCATTTGTTTTCTAAGCCAGTACTGTTCAAATCTCTGCCTTGCATATTCCTTGTAAT
CAAACTCAATCGTGTTGACATGCCCCGAGATGATTCCCCATAAGCCCCAAAAGATATGAT
TTGCCAAAGTGTATCTCTCTGCATCAGTCATTAACCTATCCACTTCTTCTTGGCTTGGTG
CATTCCCTGTAAAGCCAAGGTATGTGCTAATGAACCTTCTCCGTTCTTCTTCTCCTGGAT
ATAGAGTGTAATCAAGAACATGAGGAGTGTCTGAATGGTAATTAGCAGCCATTTCACAGA
AGTGGTTAGCAATGTCATAAGCGATAGGGTTGAAACTCGAATACTCATAGTCTATGATGG
TAATAGCGTTGGTTTCCTCATCGATCATGACGTTACCATACTGAAGATCATTGTGACAGA
AACCAATCTCCTGATCCTCCCGAGTCAGCCTCTCTTTCAACAAGTTGATTTCACCGTCCA
TAGCTTCCAAACGAAACTCATCGATCTCTGTCGGCGAACACAGGTTCTTAGCTTCCTTGA
GCCAAGTCCTGAGCCTTTCCCAGAGGAGTACGTTCTTTGGACAGGCATATCTAGCTTGTG
AA

QA 1 782 1 782
DS 



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CACAAGTAAAAAAAGATTCTTGTTGATAATCTTATCTCTCTCTCTCTCAAAGAATCTCAT
ACCCCTCCCTCCCTCGAATCTTCTTCTAGCGTTTAATCTACGTTTTCATCATCATTTCCC
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TGAGGTTGTTCCGTTGAAAGGAGCCATGACCAACGAGGTCTACCAGATCAACTGGCCTAC
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BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EO32TF U 1
AF RS1EO54TF U 1
BS 1 659 RS1EO32TF
BS 660 807 RS1EO54TF

RD RS1EO32TF 659 0 0
GGACCCAGAAACGTAGTTTCGTTTGTGTTTCAAAGTTCAGTTCCCAATATCATTTCTTTC
CACAAGTAAAAAAAGATTCTTGTTGATAATCTTATCTCTCTCTCTCTCAAAGAATCTCAT
ACCCCTCCCTCCCTCGAATCTTCTTCTAGCGTTTAATCTACGTTTTCATCATCATTTCCC
CATGGCGATCAAGAAGATGAACAGTTTGATCCCTACCTGCTCTTCCCCGGACGATCTGAA
ACGCGTTCTCCAGACGCTAGGCTCGACCTGGGGAGACGTGGTCGAAGACCTCGAGAGCCT
TGAGGTTGTTCCGTTGAAAGGAGCCATGACCAACGAGGTCTACCAGATCAACTGGCCTAC
CTTAAACGGAGGAGAAGATGCTCTTCACCGCAGAGTTCTTGTTCGGATCTACGGAGACGG
CGTTGACCTTTTCTTCAACAGAGACGACGAGATCAAAACCTTCGAGTGTATGTCTCATCA
CGGTTATGGACCTAAGCTTCTTGGCCGCTTCTCCGATGGTCGTCTCGAAGAGTTCATCCA
CGCAAGAACTCTTTCTGCAGGTGATCTCCGTGTGACCGAAACATCTGATTTAATCGCGGC
GAAACTAAGAGAGTTTCACAAGCTAGATATGCCTGGTCCAAAGAACGTACTCCTCTGGG

QA 1 659 1 659
DS 

RD RS1EO54TF 807 0 0
GGACCCAGAAACGTAGTTTCGTTTGTGTTTCAAAGTTCAGTTCCCAATATCATTTCTTTC
CACAAGTAAAAAAAGATTCTTGTTGATAATCTTATCTCTCTCTCTCTCAAAGAATCTCAT
ACCCCTCCCTCCCTCGAATCTTCTTCTAGCGTTTAATCTACGTTTTCATCATCATTTCCC
CATGGCGATCAAGAAGATGAACAGTTTGATCCCTACCTGCTCTTCCCCGGACGATCTGAA
ACGCGTTCTCCAGACGCTAGGCTCGACCTGGGGAGACGTGGTCGAAGACCTCGAGAGCCT
TGAGGTTGTTCCGTTGAAAGGAGCCATGACCAACGAGGTCTACCAGATCAACTGGCCTAC
CTTAAACGGAGGAGAAGATGCTCTTCACCGCAGAGTTCTTGTTCGGATCTACGGAGACGG
CGTTGACCTTTTCTTCAACAGAGACGACGAGATCAAAACCTTCGAGTGTATGTCTCATCA
CGGTTATGGACCTAAGCTTCTTGGCCGCTTCTCCGATGGTCGTCTCGAAGAGTTCATCCA
CGCAAGAACTCTTTCTGCAGGTGATCTCCGTGTGACCGAAACATCTGATTTAATCGCGGC
GAAACTAAGAGAGTTTCACAAGCTAGATATGCCTGGTCCAAAGAACGTACTCCTCTGGGA
AAGGCTCACGACTTGGCTCAAGGAAGCTAAGAACCTGTGTTCGCCGACAGAGATCGATGA
GTTTCGTTTGGAAGCTATGGACGTGAAATCAACTTGTTGAAAGAGAGCTGACTCGGGAGG
ATCAGAGATGGTTTCTGTCACAATGAT

QA 1 807 1 807
DS 



AS 1 6

CO CL1309Contig1 503 6 5 U
GGGTCTCTTTCCTGTATAAATCTGATTCGCTGCTGTGATTGAAACATTTACTTTTGTAAG
AAGAGAGAGGAGAGAAGATGTCTCAGACTGTGGTTCTAAAGGTGGCTATGCCGTGTGAGG
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TGAATCTGAAAGAACAGAAAGTAACGGTGAAAGGAAACGTGGAGCCAGAAGCTGTACTGC
AGACAGTCTCAAAGACGGGAAAGAAAACCAGTTTCTGGGGAGCCGACGAGGCTGAAACTG
CCAAGGCCTAAAACTGGAAGAATCAACAAAGCATCTCTGTTTTTAGCAGAGATTCCTACC
CCAAAATAATATAATATCATATGTAATGGAAACTCTCAAATAAATATATAATCTCTGAAG
GTCCCTTTTGTTTTTCAAGGAAGAAACGTTCGGTCTTGTAATCATCTTCTGTTGTCTTTA
CTTTCGTGTGTTTTTTTTGTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RS1DY79TF U 1
AF RS1DT49JQ C 23
AF RS1DT49TF U 23
AF RS1CH50JQ C 24
AF RS1CH50TF U 24
AF RS1GC95TF U 54
BS 1 23 RS1DY79TF
BS 24 24 RS1DT49TF
BS 25 459 RS1DY79TF
BS 460 501 RS1CH50TF
BS 502 503 RS1GC95TF

RD RS1DY79TF 459 0 0
GGGTCTCTTTCCTGTATAAATCTTATTCGCTGCTGTGATTGAAACATTTACTTTTGTAAG
AAGAGAGAGGAGAGAAGATGTCTCAGACTGTGGTTCTAAAGGTGGCTATGCCGTGTGAGG
GATGCGTGGGAGCTGTGAAAAGAGTCCTAGGCAAAATGCAAGGTGTGGAGTCATTTGATG
TGAATCTGAAAGAACAGAAAGTAACGGTGAAAGGAAACGTGGAGCCAGAAGCTGTACTGC
AGACAGTCTCAAAGACGGGAAAGAAAACCAGTTTCTGGGGAGCCGACGAGGCTGAAACTG
CCAAGGCCTAAAACTGGAAGAATCAACAAAGCATCTCTGTTTTTAGCAGAGATTCCTACC
CCAAAATAATATAATATCATATGTAATGGAAACTCTCAAATAAATATATAATCTCTGAAG
GTCCCTTTTGTTTTTCAAGGAAGAAACGTTCGGTCTTGT

QA 1 459 1 459
DS 

RD RS1DT49JQ 414 0 0
G
GATTCGCTGCTGTGATTGAAACATTTACTTTTGTAAGAAGAGAGAGGAGAGAAGATGTCT
CAGACTGTGGTTTTAAAGGTGGCTATGCCGTGTGAGGGATGCGTGGGAGCTGTGAAAAGA
GTCCTAGGCAAAATGCAAGGTGTGGAGTCATTTGATGTGAATTTGAAAGAACAGAAAGTA
ACGGTGAAAGGAAACGTGGAGCCAGAAGCTGTACTGCAGACAGTTTCAAAGACGGGAAAG
AAAACCAGTTTTTGGGGAGCCGACGAGGCTGAAACTGCCAAGGCCTAAAACTGGAAGAAT
CAACAAAGCATCTCTGTTTTTAGCAGAGATTCCTACCCCAAAATAATATAATATCATATG
TAATGGAAACTCTCAAATAAATATATAATCTCTGAAGGTCCCTTTTGTTTTTC

QA 2 414 2 414
DS 

RD RS1DT49TF 414 0 0
G
GATTCGCTGCTGTGATTGAAACATTTACTTTTGTAAGAAGAGAGAGGAGAGAAGATGTCT
CAGACTGTGGTTCTAAAGGTGGCTATGCCGTGTGAGGGATGCGTGGGAGCTGTGAAAAGA
GTCCTAGGCAAAATGCAAGGTGTGGAGTCATTTGATGTGAATCTGAAAGAACAGAAAGTA
ACGGTGAAAGGAAACGTGGAGCCAGAAGCTGTACTGCAGACAGTCTCAAAGACGGGAAAG
AAAACCAGTTTCTGGGGAGCCGACGAGGCTGAAACTGCCAAGGCCTAAAACTGGAAGAAT
CAACAAAGCATCTCTGTTTTTAGCAGAGATTCCTACCCCAAAATAATATAATATCATATG
TAATGGAAACTCTCAAATAAATATATAATCTCTGAAGGTCCCTTTTGTTTTTC

QA 2 414 2 414
DS 

RD RS1CH50JQ 479 0 0
GATTCGCTGCTGTGATTGAAACATTTACTTTTGTAAGAAGAGAGAGGAGAGAAGATGTCT
CAGACTGTGGTTCTAAAGGTGGCTATGCCGTGTGAGGGATGCGTGGGAGCTGTGAAAAGA
GTCCTAGGCAAAATGCAAGGTGTGGAGTCATTTGATGTGAATCTGAAAGGACAGAAAGTA
ACGGTGAAAGGAAACGTGGAGCCAGAAGCTGTACTGCAGACAGTCTCAAAGACGGGAAAG
AAAACCATTTTCTGGGGAGCCGACGAGGCTGAAACTGCCAAGGCCTAAAACTGGAAGAAT
CAACAAAGCATCTCTGTTTTTAGTAGAGATTCCTACCCCAAAATAATATAATATCATATG
TAATGGAAACTCTCAAATAAATATATAATCTCTGAAGGTCCCTTTTGTTTTTCAAGGAAG
AAACGTTCGGTCTTGTAATCATCTTCTGTTGTCTTTACTTTCGTGTGTTTTTTTTGTC
C

QA 1 478 1 478
DS 

RD RS1CH50TF 479 0 0
GATTCGCTGCTGTGATTGAAACATTTACTTTTGTAAGAAGAGAGAGGAGAGAAGATGTCT
CAGACTGTGGTTCTAAAGGTGGCTATGCCGTGTGAGGGATGCGTGGGAGCTGTGAAAAGA
GTCCTAGGCAAAATGCAAGGTGTGGAGTCATTTGATGTGAATCTGAAAGGACAGAAAGTA
ACGGTGAAAGGAAACGTGGAGCCAGAAGCTGTACTGCAGACAGTCTCAAAGACGGGAAAG
AAAACCATTTTCTGGGGAGCCGACGAGGCTGAAACTGCCAAGGCCTAAAACTGGAAGAAT
CAACAAAGCATCTCTGTTTTTAGTAGAGATTCCTACCCCAAAATAATATAATATCATATG
TAATGGAAACTCTCAAATAAATATATAATCTCTGAAGGTCCCTTTTGTTTTTCAAGGAAG
AAACGTTCGGTCTTGTAATCATCTTCTGTTGTCTTTACTTTCGTGTGTTTTTTTTGTC
C

QA 1 478 1 478
DS 

RD RS1GC95TF 450 0 0
GG
GTAAGAAGAGAGAGGAGAGAAGATGTCTCAGACTGTGGTTCTAAAGGTGGCTATGCCGTG
TGAGGGATGCGTGGGAGCTGTGAAAAGAGTCCTAGGCAAAATGCAAGGTGTGGAGTCATT
TGATGTGAATCTGAAAGAACAGAAAGTAACGGTGAAAGGAAACGTGGAGCCAGAAGCTGT
ACTGCAGACAGTCTCAAAGACGGGAAAGAAAACCAGTTTCTGGGGAGCCGACGAGGCTGA
AACTGCCAAGGCCTAAAACTGGAAGAATCAACAAAGCATCTCTGTTTTTAGCAGAGATTC
CTACCCCAAAATAATATAATATCATATGTAATGGAAACTCTCAAATAAATATATAATCTC
TGAAGGTCCCTTTTGTTTTTCAAGGAAGAAACGTTCGGTCTTGTAATCATCTTCTGCTGT
CTTTACTTTCGTGTGTTTTTTTTGTCTT

QA 3 450 3 450
DS 



AS 2 5

CO CL1310Contig1 752 2 6 U
GGAACCTTGGCTACTACAAGCAGCTTCTCTGATCTTATTTTGAATGAAATACAATCGTGT
CTTTTAGCTCTTGCAGACAAACTTAAAGCTTCTTCCTTTCTTGTTCTTTACATTTCAATA
AGGCTTTAACAAGCCATTCTTTTTATGTTCTAATAAAGCTCTTTGAGCATTGTCTATAAA
TGTCATCATGGTATCAGAGCCCACGGCGATTCATGGGGTTTATCTTACCGCTTCTACAGT
TTCAGCTCAAGCTAACAAGTTCATCAACCTTTTGCTGCTCAATCTCACACGCTGAGTCAC
TCCATGGAACAAGAGATGAAATCATCAGCTACTGAAACACGCCACTTCATGGAACTGGAG
GACGAAATCATCCAGTCTTTTCATCATTGCAACAAGACAGTGTCTTCAAGCTTCAAAAGA
AAATGAAAGCAGTTAGCCGAAGCAATGTGTTTTCTGGGTTAAGACAGAAGCAGTGAAACA
ATGATGCCTTGCTGTAAAGAGCTCAGAATGGTCAAAGAAGAAAGGCGACTTCCTCTTCAC
TTTATAGATGGTATTGTCTGTTTCTTCCTCTCTAGACAGAACAAAGGATTTAAAAAAAAA
AGGTTGTGTTGGATCGGGTTGGTCGTTGGCTTAGATCCTTGGGTTAAGATAGGTTTGGAA
CAGAAGCTATATATGAAATAGTTGGTTTGGGTTTGTTGCGTGTGGTGTTCTCTGGCTTTA
AAGCTATGCACACAAGTGCTCGCTGAATGCTA


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A573TF U 1
AF RS1B756TF U 1
BS 1 84 RS1A573TF
BS 85 85 RS1B756TF
BS 86 637 RS1A573TF
BS 638 638 RS1B756TF
BS 639 678 RS1A573TF
BS 679 752 RS1B756TF

RD RS1A573TF 678 0 0
GGAACCTTGGCTACTACAAGCAGCTTCTCTGATCTTATTTTGAATGAAATACAATCGTGT
CTTTTAGCTCTTGCAGACAAACTTGAAGCTTCTTCCTTTCTTGTTCTTTACATTTCAATA
AGGCTTTAACAAGCCATTCTTTTTATGTTCTAATAAAGCTCTTTGAGCATTGTCTATAAA
TGTCATCATGGTATCAGAGCCCACGGCGATTCATGGGGTTTATCTTACCGCTTCTACAGT
TTCAGCTCAAGCTAACAAGTTCATCAACCTTTTGCTGCTCAATCTCACACGCTGAGTCAC
TCCATGGAACAAGAGATGAAATCATCAGCTACTGAAACACGCCACTTCATGGAACTGGAG
GACGAAATCATCCAGTCTTTTCATCATTGCAACAAGACAGTGTCTTCAAGCTTCAAAAGA
AAATGAAAGCAGTTAGCCGAAGCAATGTGTTTTCTGGGTTAAGACAGAAGCAGTGAAACA
ATGATGCCTTGCTGTAAAGAGCTCAGAATGGTCAAAGAAGAAAGGCGACTTCCTCTTCAC
TTTATAGATGGTATTGTCTGTTTCTTCCTCTCTAGACAGAACAAAGGATTTAAAAAAAAA
AGGTTGTGTTGGATCGGGTTGGTCGTTGGCTTAGATCTTTGGGTTAAGATAGGTTTGGAA
CAGAAGCTATATATGAAA

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1B756TF 752 0 0
GG
AACCTTGGCTGCTACAAGCAGCTTCTCTGATCTTATTTTGAATGAAATACAATCGTGTCT
TTTAGCTCTTGCAGACAAACTTAAAGCTTCTTCCTTTCTTGTTCTTTACATTTCAATAAG
GCTTTAACAAGCCATTCTTTTTATGTTCTAATAAAGCTCTTTGAGCATTGTCTATAAATG
TCATCATGGTATCAGAGCCCACGGCGATTCATGGGGTTTATCTTACCGCTTCTACAGTTT
CAGCTCAAGCTAACAAGTTCATCAACCTTTTGCTGCTCAATCTCACACGCTGAGTCACTC
CATGGAACAAGAGATGAAATCATCAGCTACTGAAACACGCCACTTCATGGAACTGGAGGA
CGAAATCATCCAGTCTTTTCATCATTGCAACAAGACAGTGTCTTCAAGCTTCAAAAGAAA
ATGAAAGCAGTTAGCCGAAGCAATGTGTTTTCTGGGTTAAGACAGAAGCAGTGAAACAAT
GATGCCTTGCTGTAAAGAGCTCAGAATGGTCAAAGAAGAAAGGCGACTTCCTCTTCACTT
TATAGATGGTATTGTCTGTTTCTTCCTCTCTAGACAGAACAAAGGATTTAAAAAAAAAAG
GTTGTGTTGGATCGGGTTGGTCGTTGGCTTAGATCCTTGGGTTAAGATAG*TTTGGAACA
GAAGCTATATATGAAATAGTTGGTTTGGGTTTGTTGCGTGTGGTGTTCTCTGGCTTTAAA
GCTATGCACACAAGTGCTCGCTGAATGCTA

QA 3 752 3 752
DS 



CO CL1310Contig2 748 3 4 U
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TAGCAGCCAAGGTTACCATTACACAAAGCTAATACAGTTCTATTTATATGAAACCAACAT
ATGTTGAGAACCCTAGTTACATGGGCTTTGGGTTGAACTTGATTGGCTTGGGCTTGAGCC
TTAATACTCCCCCGCAAACTGAGCATCGGGTGAAAACCAAGAGGCTGAGTTTGAACCGGA
AATGAAGATGACATTGAATGAGCATAACTATGTGTAGTAGGATGCTTGAGATGTTGGTAA
ATGGCTGTACTCACCATTTGTAGACAGACATTAGTGTGAGATCTATTCAGGCCTATACTT
GGAGAGTATCACATGGCTTCACTCAGAGGTTTCTTTTGAACTTGGAGAGCTTAGTTGATC
TCACTCAGAGGTATAATTATGACATCTTTGTCTCACTATGAATATAGGTTTCCTTTACCT
ATTTCATTCTTCTAATGTGTCTTATGAAGAACACTCTTTTCGCACCTACCAAAATACAGT
TACTCACTCTCTGCTTCCCATCAATACACTAC*AAAACTCTGCCTCTAAACAATTGACCT
TCTTGTTAGCATTTCAGCGAGCACCTTGTGTGCATTAGCTTTAAAGCCAGAGAACACCAC
ACGCAACAAACCCAAACCAACCTATTTCATATATAGCTTCTGTTCCAAACCTATCTTAAC
CCAAAGATCTAAGCCAACGACCAACCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BG92JQ U 1
AF RS1BG92TF C 5
AF RS1A573JQ U 9
BS 1 49 RS1BG92JQ
BS 50 50 RS1A573JQ
BS 51 694 RS1BG92JQ
BS 695 748 RS1A573JQ

RD RS1BG92JQ 695 0 0
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ATGGCTGTACTCACCATTTGTAGACAGACATTAGTGTGAGATCTATTCAGGCCTATACTT
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TCTTGTTAGCATTTCAGCGAGCACCTTGTGTGCATTAGCTTTAAAGCCAGAGAACACCAC
ACGCAACAAACCCAAACCAACCTATTTCATATAT
C

QA 1 694 1 694
DS 

RD RS1BG92TF 691 0 0
TTGG
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AACCCTAGTTACATGGGCTTTGGGTTGAACTTGATTGGCTTGGGCTTGAGCCTTAATACT
CCCCCGCAAACTGAGCATCGGGTGAAAACCAAGAGGCTGAGTTTGAACCGGAAATGAAGA
TGACATTGAATGAGCATAACTATGTGTAGTAGGATGCTTGAGATGTTGGTAAATGGCTGT
ACTCACCATTTGTAGACAGACATTAGTGTGAGATCTATTCAGGCCTATACTTGGAGAGTA
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AGGTATAATTATGACATCTTTGTCTCACTATGAATATAGGTTTCCTTTACCTATTTCATT
CTTCTAATGTGTCTTATGAAGAACACTCTTTTCGCACCTACCAAAATACAGTTACTCACT
CTCTGCTTCCCATCAATACACTAC*AAAACTCTGCCTCTAAACAATTGACCTTCTTGTTA
GCATTTCAGCGAGCACCTTGTGTGCATTAGCTTTAAAGCCAGAGAACACCACACGCAACA
AACCCAAACCAACCTATTTCATATAT
C

QA 5 690 5 690
DS 

RD RS1A573JQ 740 0 0
GCTAAAAGACACGATTGTATTTCATTCAAAATAAGATCAGAGAAGCTGCTTGTAGCAGCC
AAGGTTACCATTACACAAAGCTAATACAGTTCTATTTATATGAAACCAACATATGTTGAG
AACCCTAGTTACATGGGCTTTGGGTTGAACTTGATTGGCTTGGGCTTGAGCCTTAATACT
CCCCCGCAAACTGAGCATCGGGTGAAAACCAAGAGGCTGAGTTTGAACCGGAAATGAAGA
TGACATTGAATGAGCATAACTATGTGTAGTAGGATGCTTGAGATGTTGGTAAGTGGCTGT
ACTCACCATTTGTAGACAGACATTAGTGTGAGATCTATTCAGGCCTATACTTGGAGAGTA
TCACATGGCTTCACTCAGAGGTTTCTTTTGAACTTGGAGAGCTTAGTTGATCTCACTCAG
AGGTATAATTATGACATCTTTGTCTCACTATGAATATAGGTTTCCTTTACCTATTTCATT
CTTCTAATGTGTCTTATGAAGAACACTCTTTTCACACCTACCAAAATACAGTTACTCACT
CTCTGCTTCCCATCAATACACTACCAAAACTCTGCCTCTAAACAATTGACCTTCTTGTTA
GCATTTCAGCGAGCACCTTGTGTGCATTAGCTTTAAAGCCAGAGAACAC*ACACGCAACA
AACCCAAACCAACCTATTTCATATATAGCTTCTGTTCCAAACCTATCTTAACCCAAAGAT
CTAAGCCAACGACCAACCCG

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 6

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GGCAAAGAAGAAGATGTTAGAGTCGGAGCCAACAAGTTTCCGGAGAGACAACCGATCGGA
ACATCGGCTCAGAGCGACAAGGACTACAAGGAGCCACCTCCTGCGCCCTTGTTCGAGCCC
GGCGAGCTTGCTTCGTGGTCCTTCTGGAGAGCCGGGATCGCTGAGTTCATCGCCACGTTC
TTGTTCCTTTACATCACTGTTTTGACCGTCATGGGAGTCAAGAGGTCACCGAACATGTGT
GCTTCTGTCGGAATCCAAGGGATCGCTTGGGCTTTCGGTGGTATGATCTTCGCTCTCGTC
TACTGCACCGCTGGTATCTCCGGTGGACACATCAACCCAGCTGTCACGTTCGGTCTGTTC
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GGCGGAGCCAACACTGTAGCTCCTGGTTACACTAAAGGAAGTGGTCTCGGAGCTGAGATT
ATTGGAACTTTTGTCCTTGTTTACACCGTCTTCTCCGCCACTGACGCCAAGAGGAACGCT
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CACTTAGCAACCATCCCCATCACTGGTACTGGAATCAACCCAGCGAGGAGTCTTGGAGCT
GCAATCATCTTCAACAAGGACAACGCTTGGGACGACCATTGGGTGTTTTGGGTTGGACCA
TTCATCGGTGCTGCACTTGCTGCTCTTTACCACGTGATTGTCATCAGAGCCATCCCATTC
AAGTCCAGAAGCTGATTGAGTTACTCTTAGTTTACTTCTCTTTTGTGAATGTACTACTAC
TACT******TGTGTGAAACATCGTCTGTATGTGTTTGTTCCTCTGCTTTGCCTAATGCA
GACTCTATTTGTAATACAGAGTCAGAGACATTCCCCTGAAAAAATATTGTGATCTTAGCA
AAAAAAA


BQ
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15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 
35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 15 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1FO95TF U 3
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AF RS1B408TF U 180
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AF RS1E227JQ C 488
AF RS1E227TF U 377
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BS 10 10 RS1FO95TF
BS 11 16 RS1AJ87TF
BS 17 17 RS1FO95TF
BS 18 65 RS1AJ87TF
BS 66 66 RS1FO95TF
BS 67 479 RS1AJ87TF
BS 480 480 RS1FO95TF
BS 481 542 RS1AJ87TF
BS 543 543 RS1FO95TF
BS 544 545 RS1AJ87TF
BS 546 546 RS1FO95TF
BS 547 794 RS1AJ87TF
BS 795 921 RS1B408TF
BS 922 922 RS1E227TF
BS 923 936 RS1B408TF
BS 937 937 RS1E227TF
BS 938 948 RS1B408TF
BS 949 949 RS1E227TF
BS 950 963 RS1B408TF
BS 964 1063 RS1E227TF
BS 1064 1064 RS1E227JQ
BS 1065 1087 RS1E227TF

RD RS1FO95TF 591 0 0
GAA
CACAATATTATCACACACTCATCTAGAGAGAGAAAAGAGACGTCTGGAGATGGAAGGCAA
AGAAGAAGATGTTAGAGTCGGAGCCAACAAGTTTCCGGAGAGACAACCGATCGGAACATC
GGCTCAGAGCGACAAGGACTACAAGGAGCCACCTCCTGCGCCCTTGTTCGAGCCCGGCGA
GCTTGCTTCGTGGTCCTTCTGGAGAGCCGGGATCGCTGAGTTCATCGCCACGTTCTTGTT
CCTTTACATCACTGTTTTAACCGTCATGGGAGTCAAGAGGTCACCGAACATGTGTGCTTC
TGTCGGAATCCAAGGGATCGCTTGGGCTTTCGGTGGTATGATCTTCGCTCTCGTCTACTG
CACCGCTGGTATCTCCGGTGGACACATCAACCCAGCAGTCACGTTCGGTCTGTTCTTGGC
CAGGAAGCTTTCGCTCACACGAGCTGTGTACTACATAGTGATGCAGTGCTTAGGAGCCAT
CTGTGGAGCTGGTGTGGTCAAGGGATTCCAACCAAAGCAGTACCAAGCTCTAGGAGGCGG
AGCCAACACTGTAGCTCCTGGTTACACTAAAGGAAGTGGTCTCGGAGC

QA 4 591 4 591
DS 

RD RS1AJ87TF 794 0 0
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GGCAAGGAAGAAGATGTTAGAGTCGGAGCCAACAAGTTTCCGGAGAGACAACCGATCGGA
ACATCGGCTCAGAGCGACAAGGACTACAAGGAGCCACCTCCTGCGCCCTTGTTCGAGCCC
GGCGAGCTTGCTTCGTGGTCCTTCTGGAGAGCCGGGATCGCTGAGTTCATCGCCACGTTC
TTGTTCCTTTACATCACTGTTTTGACCGTCATGGGAGTCAAGAGGTCACCGAACATGTGT
GCTTCTGTCGGAATCCAAGGGATCGCTTGGGCTTTCGGTGGTATGATCTTCGCTCTCGTC
TACTGCACCGCTGGTATCTCCGGTGGACACATCAACCCAGCTGTCACGTTCGGTCTGTTC
TTGGCCAGAAAGCTTTCGCTCACACGAGCTGTATACTACATAGTGATGCAGTGCTTAGGG
GCCATCTGTGGAGCTGGTGTGGTCAAGGGATTCCAACCAAAGCAGTACCAAGCTCTAGGA
GGTGGGGCCAACACTGTAGCTCCTGGTTACACTAAAGGAAGTGGTCTCGGAGCTGAGATT
ATTGGAACTTTTGTCCTTGTTTACACCGTCTTCTCCGCCACTGACGCCAAGAGGAACGCT
CGTGACTCTCATGTTCCCATTCTTGCACCTCTTCCTATCGGATTCGCTGTGTTCTTGGTC
CACTTAGCAACCATCCCCATCACTGGTACTGGAATCAACCCAGCGAGGAGTCTTGGAGCT
GCAATCATCTTCAA

QA 1 794 1 794
DS 

RD RS1B408TF 784 0 0
G
GGCGAGCTTGCTTCGTGGTCCTTCTGGAGAGCCGGGATCGCTGAGTTCATCGCCACGTTC
TTGTTCCTTTACATCACTGTTTTGACCGTCATGGGAGTCAAGAGGTCACCGAACATGTGT
GCTTCTGTCGGAATCCAAGGGATCGCTTGGGCTTTCGGTGGTATGATCTTCGCTCTCGTC
TACTGCACCGCTGGTATCTCCGGTGGACACATCAACCCAGCTGTCACGTTCGGTCTGTTC
TTGGCCAGAAAGCTTTCGCTCACACGAGCTGTATACTACATAGTGATGCAGTGCTTAGGA
GCCATCTGTGGAGCTGGTGTGGTCAAGGGATTCCAACCAAAGCAGTACCAAGCTCTAGGA
GGTGGGGCCAACACTGTAGCTCCTGGTTACACTAAAGGAAGTGGTCTCGGAGCTGAGATT
ATTGGAACTTTTGTCCTTGTTTACACCGTCTTCTCCGCCACTGACGCCAAGAGGAACGCT
CGTGACTCTCATGTTCCCATTCTTGCACCTCTTCCTATCGGATTCGCTGTGTTCTTGGTC
CACTTAGCAACCATCCCCATCACTGGTACTGGAATCAACCCAGCGAGGAGTCTTGGAGCT
GCAATCATCTTCAACAAGGACAACGCTTGGGACGACCATTGGGTGTTTTGGGTTGGACCA
TTCATCGGTGCTGCACTTGCTGCTCTTTACCACGTGATTGTCATCAGAGCCATCCCATTC
AAGTCCAGAAGCTGATTGAGT*ACTCTTAGTTTACT*CTCTTTTGTGA*TGTACTACTAC
TAC

QA 2 784 2 784
DS 

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AGTCAAGAGGTCACCGAACATGTGTGCTTCTGTCGGAATCCAAGGGATCGCTTGGGCTTT
CGGTGGTATGATCTTCGCTCTCGTCTACTGCACCGCTGGTATCTCCGGTGGACACATCAA
CCCAGCTGTCACGTTCGGTCTGTTCTTGGCCAGAAAGCTTTCGCTCACACGAGCTGTATA
CTACATAGTGATGCAGTGCTTAGGGGCCATCTGTGGAGCTGGTGTGGTCAAGGGATTCCA
ACCAAAGCAGTACCAAGCTCTAGGAGGTGGGGCCAACACTGTAGCTCCTGGTTACACTAA
AGGAAGTGGTCTCGGAGCTGAGATTATTGGAACTTTTGTCCTTGTTTACACCGTCTTCTC
CGCCACTGACGCCAAGAGGAACGCTCGTGACTCTCATGTTCCCATTCTTGCACCTCTTCC
TATCGGATTCGCTGTGTTCTTGGTCCACTTAGCAACCATCCCCATCACTGGTACTGGAAT
CAACCCAGCGAGGAGTCTTGGAGCTGCAATCATCTTCAACAAGGACAACGCTTGGGACGA
CCATTGGGTGTTTTGGGTTGGACCATTCATCGGTGCTGCACTTGCTGCTCTTTACCACGT
GATTGTCATCAGAGCCATCCCATTCAAGTCCAGAAGCTGATTGAGTTACTCTTAGTTTAC
TTCTCTTTTGTGAATGTACTACTACTACTACTACTTGTGTGAAACATCGTGTGTATGTGT
TTGTTCCTCTGCTTTGCCTAATGCAGACTCTATTTGTAATAC
G

QA 1 822 1 822
DS 

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CCAACACTGTAGCTCCTGGTTACACTAAAGGAAGTGGTCTCGGAGCTGAGATTATTGGAA
CTTTTGTCCTTGTTTACACCGTTTTTTCCGCTACTGACGCCAAGAGGAACGCTCGTGACT
TTCATGTTCCCATTCTTGCACCTCTTCCTATCGGATTCGCTGTGTTCTTGGTCCACTTAG
CAACCATCCCCATCACTGGTACTGGAATCAACCCAGCAAGGAGTCTTGGAGCTGCAATCA
TCTTCAACAAGGACAACGCTTGGGACGACCATTGGGTGTTTTGGGTTGGACCATTCATCG
GTGCTGCACTTGCTGCTCTTTACCACGTGATTGTCATCAGAGCCATCCCATTCAAGTCCA
GAAGCTGATTGAGTTACTCTTAGTTTGCTTTTCTTTTGTGAATGTACTACTACTACT***
***TGTGTGAAACATCGTCTGTATGTGTTTGTTCCTCTGCTTTGCCTAATGCAGACTCTA
TTTGTAATACAGAGTCAGAGACATTCCCCTGAAAAAATATTGTGATCTTAGC

QA 1 592 1 592
DS 

RD RS1E227TF 711 0 0
G
CTCCGGTGGACACATCAACCCAGCAGTCACGTTCGGTCTGTTCTTGGCCAGGAAGCTTTC
GCTCACACGAGCTGTGTACTACATAGTGATGCAGTGCTTAGGAGCCATCTGTGGAGCTGG
TGTGGTCAAGGGATTCCAACCAAAGCAGTACCAAGCTCTAGGAGGCGGAGCCAACACTGT
AGCTCCTGGTTACACTAAAGGAAGTGGTCTCGGAGCTGAGATTATTGGAACTTTTGTCCT
TGTTTACACCGTCTTCTCCGCTACTGACGCCAAGAGGAACGCTCGTGACTCTCATGTTCC
CATTCTTGCACCTCTTCCTATCGGATTCGCTGTGTTCTTGGTCCACTTAGCAACCATCCC
CATCACTGGTACTGGAATCAACCCAGCAAGGAGTCTTGGAGCTGCAATCATCTTCAACAA
GGACAACGCTTGGGACGACCATTGGGTGTTTTGGGTTGGACCATTCATCGGTGCTGCACT
TGCTGCTCTTTACCACGTGATTGTCATCAGAGCCATCCCATTCAAGTCCAGAAGCTGATT
GAGTTACTCTTAGTTTGCTTTTCTTTTGTGAATGTACTACTACTACT******TGTGTGA
AACATCGTCTGTATGTGTTTGTTCCTCTGCTTTGCCTAATGCAGACTCTATTTGTAATAC
AGAGTCAGAGACATTCCCCTGAAAAA*TATTGTGATCTTAGCAAAAAAAA

QA 2 711 2 711
DS 



AS 1 5

CO CL1312Contig1 1033 5 19 U
GCCATTCAAACTGTTGGAAACCTTTATTAACCAAACAAAATTCTAAATCAATGGAAAGAT
AACAAGGAATATTCTGCATTGCCAAACTTTATTACAGGGAGATACACTAATCGTACACAT
CAAATTTGTCTGAATTGAGGAAAGCCCCTAAGTCAACACAACTTCTCAGCCTCCTTTTTC
TCTACAAGTTTGATGAAATTGCGAACAATTGTCTTGCCTTCAGTTGTTATAATACTCTCC
GGATGAAACTGAACTCCCTGTATATGCTTGTACTTCCTGTGTCGGGCCGCCATAACCAAA
CCATCTTCTGTCCATGCTGTAACCTCGAGTTCATCACTGGGAAATGTATCCTTTTCGATC
ACGAGGCTGTGATATCTACCTACTAGGAAAGGGTTAGATAATCCAGAGAACAAGCCATCT
TCTCCTTTCTCATCATAGTGAACCATGGAGCTTTTCCCATGCATTACACCATATGGTGAC
CTTACAATCTTCCCTCCAAATGCTTCTCCTATACACTGCAAACCCATACATACTCCAAAC
AAAGGAACACGTGGTCCGAGTTCCACAACAGTTTGTAAGGAGATCCCAGAGTCTTGTGGG
GTACCAGGACCAGGAGAAATCAGCACCCCTCTTGGATTTTTACTTTTGAGTTCCTCCACA
GTAAGTTCATCATTGCGGTAAACTTCAAAATGGCATCCTAGCTCTCCCATATACTGGCAG
AGATTGTAGGTGAAGCTGTCGTAATTATCAATCACGATGATGGGACCCTTGTGCTTATTC
GAGGAGTTGACAACAGCGGAAGGCGTCGAGTTCGAATGCGCCATTTCGATCGAAGCTCTC
GTAACGACATGTCCGCGACTCTTCCCCGAAAACGAAACTCTGGTCGGATTCGGACAGGGC
TTGAAGACAGAAGAAGGGTTTAGGCGAGTGGTGGAGCTGGACTTTGGTTGGAGAAGACAA
GAGGAGTTGGACAATGTAGTAGCCGCCATTGATTTGTGGGAAAACTAAAAGATCGTTCCT
TTCTTTGGTTCCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EC88JQ U 1
AF RS1FO08JQ U 1
AF RS1H542JQB U 30
AF RS1EC88TF C 364
AF RS1FO08TF C 214
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BS 679 1033 RS1FO08TF

RD RS1EC88JQ 620 0 0
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TCTCCTTTCTCATCATAGTGAACCATGGAGCTTTTCCCATGCATTACACCATATGGTGAC
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GTACCAGGACCAGGAGAAAT

QA 1 620 1 620
DS 

RD RS1FO08JQ 619 0 0
C
CCATTCAAACTGTTGGAAACCTTTATTAACCAAACAAAATTCTAAATCAATGGAAAGATA
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AAATTTGTCTGAATTGAGGAAAGCCCCTAAGTCAACACAACTTCTCACCCTCCTTTTTCT
CTACAAGTTTGATGAAATTGCGAACAATTGTCTTGCCTTCAGTTGTTATAATACTCTCCG
GATGAAACTGAACTCCCTGTATATGCTTGTACTTCCTGTGTCGGGCCGCCATAACCAAAC
CATCTTCTGTCCATGCTGTAACCTCGAGTTCATCACTGGGAAATGTATCCTTTTCGATCA
CGAGGCTGTGATATCTACCTACAAGGAAAGGGTTAAATAATCCAAAAAACAAGCCATCTT
CTCCTTTCTCATCATAGTGAACCATGGAGCTTTTCCCATGCATTACACCATATGGTGACC
TTACAATCTTCCCTCCAAATGCTTCTCCTATACACTGCAAACCCATACATACTCCAAACA
AAGGAACACGTGGTCCGAGTTCCACAACAGTTTGTAAGGAGATCCCAAAGTCTTGTGGGG
TACCAGGACCAGGAGAAA

QA 2 619 2 619
DS 

RD RS1H542JQB 649 0 0
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TATTACAGGGAGATACACTAATCGTACACATCAGATTTGTCTGAATTGAGGAAAGCCCCT
AAGTCAACACAACTTCTCAGCCTCCTTTTTCTCTACAAGTTTGATGAAATTGCGAACAAT
TGTCTTGCCTTCAGTTGTTATAATACTCTCCGGATGAAACTGAACTCCCTGTATATGCTT
GTACTTCCTGTGTCGGGCCGCCATAACCAAACCATCTTCTGTCCATGCTGTAACCTCGAG
TTCATCACTCGGAAATGTATCTTTTTCGATCACGAGGCTGTGATATCTACCTACTAGGAA
AGGGTTAGATAATCCAGAGAACAAGCCATCTTCTCCTTTCTCATCATAGTGAACCATGGA
GCTTTTCCCATGCATTACACCATATGGTGACCTTACAATCTTCCCTCCAAATGCTTCTCC
TATACACTGCAAACCCATACATACTCCAAACAAAGGAACACGTGGTCCGAGTTCCACAAC
AGTTTGTAAGGAGATCCCAGAGTCTTGTGGGGTACCAGGACCAGGAGAAATCAGCACCCC
TCTTGGATTTTTACTTTTGAGTTCCTCCACAGTAAGTTCATCATTGCGG

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1EC88TF 396 0 0
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CCTTTCTCATCATAGTGAACCATGGAGCTTTTCCCATGCATTACACCATATGGTGACCTT
ACAATCTTCCCTCCAAATGCTTCTCCTATACGCTGCAAACCCATACATACTCCAAACAAA
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AGTTCATCATTGCGGTAAACTTCAAAATGGCATCCTAGCTCTCCCATATACTGGCAGAGA
TTGTAGGTGAAGCTGTCGTAATTATCAATCACGATG

QA 1 396 1 396
DS 

RD RS1FO08TF 820 0 0
TCTG
CTTCAGTTGTTATAATACTCTCCGGATGAAACTGA*CTCCCTGTATATGCTTGTACTTC*
TGTGTCGG*CCGCCATAACCAAACCATCTTCTGTCCATGCTGTAACCTCGAGTTCATCAC
TGGGAAATGTATCCTTTTCGATCACGAGGCTGTGATATCTACCTACAAGGAAAGGGTTAG
ATAATCCAGAGAACAAGCCATCTTCTCCTTTCTCATCATAGTGAACCATGGAGCTTTTCC
CATGCATTACACCATATGGTGACCTTACAATCTTCCCTCCAAATGCTTCTCCTATACACT
GCAAACCCATACATACTCCAAACAAAGGAACACGTGGTCCGAGTTCCACAACAGTTTGTA
AGGAGATCCCAGAGTCTTGTGGGGTACCAGGACCAGGAGAAATCAGCACCCCTCTTGGAT
TTTTACTTTTGAGTTCCTCCACAGTAAGTTCATCATTGCGGTAAACTTCAAAATGGCATC
CTAGCTCTCCCATATACTGGCAGAGATTGTAGGTGAAGCTGTCGTAATTATCAATCACGA
TGATGGGACCCTTGTGCTTATTCGAGGAGTTGACAACAGCGGAAGGCGTCGAGTTCGAAT
GCGCCATTTCGATCGAAGCTCTCGTAACGACATGTCCGCGACTCTTCCCCGAAAACGAAA
CTCTGGTCGGATTCGGACAGGGCTTGAAGACAGAAGAAGGGTTTAGGCGAGTGGTGGAGC
TGGACTTTGGTTGGAGAAGACAAGAGGAGTTGGACAATGTAGTAGCCGCCATTGATTTGT
GGGAAAACTAAAAGATCGTTCCTTTCTTTGGTTCCC

QA 5 820 5 820
DS 



AS 1 6

CO CL1313Contig1 1439 6 13 U
CGGGCGAGGAGCGACGAAGAAGAGCGACAACACAAAGTTCTACGAGATCTTAGGCGTACC
CAAGACAGCATCTCCCGAAGATCTCAAGAAGGCTTACAAAAAAGCAGCCATCAAGAACCA
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GACCTGGGATGATCCAGCAGATGCAGCATGCTTGTAACGACTGCAAAGGCACCATCAACG
ATCGTGACAGGTGTCCGCAGTGCAAAGGAGACAAAGTCGTCCCTGAGAAGAAAGTTCTTG
AAGTGAATGTTGAGAAAGGGATGCAGCACAGTCAGAAGATCACATTCGAAG*ACAAGCAG
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CAAAGTTCAAGAGAAAAGGAGAAGACCTCTTTGTAGAACACACACTCTCTCTCACCGAAG
CTCTTTGTGGCTTCTCCTTCGTCCTTACCCACTTGGATGGCAGGAATCTTCTCATCAAAT
CTCATCCCGGGGACGTCGTTAAACCTGATTCATACAAGGCAATAAGCGATGAAGGGATGC
CGATATACCAGAGGCCATTCATGAAGGGTAAGCTCTACATCCACTTCACAGCGGATTTCC
CGGACTCGCTAACCCCTGACCAGACCAAAGCATTTGAAGCTATTCTGCCCAAACCTTCGA
CTACTCAGCTGACCGACATGGAGATAGATGAGTGCGAGGAGACAACGCTGCACGATGTCG
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GAAAACCAACTTGTTTCGTTCTCTCACTCTTTAAATTAATGACGTATTGAAATTTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1A188TF U 263
AF RS1A188TV U 1
AF RS1D241TF U 613
AF RS1D241JQ C 858
AF RS1F690JQ C 958
AF RS1F690TF U 958
BS 1 499 RS1A188TV
BS 500 500 RS1A188TF
BS 501 772 RS1A188TV
BS 773 773 RS1A188TF
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BS 791 802 RS1A188TV
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BS 1279 1439 RS1F690TF

RD RS1A188TF 530 0 0
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GGTAGCAGCAGAGGAAGGAGGCAGGGGCGTGGTGAAGATGTTGTTCATCCTTTGAAAGTT
TCCCTTGAGGATCTCTACCTTGGTACCACCAAGAAGCTCTCTCTTTCTAGAAACGCTCTC
TGCTCTAAGTGCAACGGAAAGGGTTCGAAATCCGGAGCCTCGATGAAGTGTGGTGGGGTG
TCAGGGGACGGGTATGAAGGTGACAATCAGGCAGCTTGGACCTGGGATGATCCAGCAGAT
GCAGCATGCTTGTAACGACTGCAAAGGCACCATCAACGATCGTGACAGGTGTCCGCAGTG
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GCAGCACAGTCAGAAGATCACATTCGAAG*ACAAGCAGATGAAGCGCCTGACACAGTCAC
TGGAGATATAGTGTTTGTAATTCAGCAGAAAGAGCACCCAAAGTTCA
GAG

QA 1 527 1 527
DS 

RD RS1A188TV 847 0 0
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CAAGACAGCATCTCCCGAAGATCTCAAGAAGGCTTACAAAAAAGCAGCCATCAAGAACCA
TCCCGACAAGGGTGGAGATCCAGAAAAGTTCAAAGAGCTAGCACAGGCGTATGAAGTTCT
GAGTGACCCAGAGAAGAGAGAGATATACGATGAGTACGGAGAGGATGCACTCAAGGAAGG
AATGGGTGGTGGAGGAGGCGGGCATGACCCTTTTGATATCTTCTCATCCTTCTTTGGAGG
TGGCAGCCCCTTTGGAGGTGGTGGTAGCAGCAGAGGAAGGAGGCAGGGGCGTGGTGAAGA
TGTTGTTCATCCTTTGAAAGTTTCCCTTGAGGATCTCTACCTTGGTACCACCAAGAAGCT
CTCTCTTTCTAGAAACGCTCTCTGCTCTAAGTGCAACGGAAAGGGTTCGAAATCCGGAGC
CTCGATGAAGTGTGGTGGG*TGTCAGGGGACGGGTATGAAGGTGACAATCAGGCAGCTTG
GACCTGGGATGATCCAGCAGATGCAGCATGCTTGTAACGACTGCAAAGGCACCATCAACG
ATCGTGACAGGTGTCCGCAGTGCAAAGGAGACAAAGTCGTCCCTGAGAAGAAAGTTCTTG
AAGTGAATGTTGAGAAAGGGATGCAGCACAGTCAGAAGATCACATTCGAAG*ACAAGCAG
ATGAAGCGCCTGACACAGTCACTGGAGATATAGTGTTTGTAATTCAGCAGAA*GAGCACC
CAAAGTTCA*GAGAAAAGGAGA*GACCTCTTTGTAGAACACACACTCTCTCTCACCGAAG
CTCTT
GT

QA 1 845 1 845
DS 

RD RS1D241TF 671 0 0
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AGAAAGGGATGCAGCACAGTCAGAAGATCACATTCGAAGGACAAGCAGATGAAGCGCCTG
ACACAGTCACTGGAGATATAGTGTTTGTAATTCAGCAGAAAGAGCACCCAAAGTTCAAGA
GAAAAGGAGAAGACCTCTTTGTAGAACACACACTCTCTCTCACCGAAGCTCTTTGTGGCT
TCTCCTTCGTCCTTACCCACTTGGATGGCAGGAATCTTCTCATCAAATCTCATCCCGGGG
ACGTCGTTAAACCTGATTCATACAAGGCAATAAGCGATGAAGGGATGCCGATATACCAGA
GGCCATTCATGAAGGGTAAGCTCTACATCCACTTCACAGTGGATTTCCCGGACTCGCTAA
CCCCTGACCAGACCAAAGCATTTGAAGCTATTCTGCCCAAACCTTCGACTACTCAGCTGA
CCGACATGGAGATAGATGAGTGCGAGGAGACAACGCTGCACGATGTCGACATTGAGGATG
AGATGAGAAGGAAAGCACAAGCTCAGAGAGAGGCTTATGATGATGACGAAGGCGATGATG
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AGAAAG
ACGTG

QA 1 666 1 666
DS 

RD RS1D241JQ 582 0 0
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GTTAAACCTGATTCATACAAGGCAATAAGCGATGAAGGGATGCCGATATACCAGAGGCCA
TTCATGAAGGGTAAGCTCTACATCCACTTCACAGTGGATTTCCCGGACTCGCTAACCCCT
GACCAGACCAAAGCATTTGAAGCTATTCTGCCCAAACCTTCGACTATTCAGCTGACCGAC
ATGGAGATAGATGAGTGCGAGGAGACAACGCTGCACGATGTCGACATTGAGGATGAGATG
AGAAGGAAAGCACAAGCTCAGAGAGAGGCTTATGATGATGACGAAGGCGATGATGACCAT
CCTGGAGGTGCGCAGAGGGTGCAATGTGCCCAGCAGTAACTAAGTAACCCTTTAGAGAAA
GGACGTGATGAGGGGGTTTGGCTCCAACGTTTGCCTCTTCCTTTTCTTTATTTTCAGTGT
ATTTGGAAGTCTTATGGAGTTTGCTATGGTTTAGACTTTGGCGGAAAACCAACTTGTTTC
GTTCTCTCACTCTTTAAATTAATGACGTATTGAAATTTTGTC

QA 1 582 1 582
DS 

RD RS1F690JQ 482 0 0
GGG
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CGGACTCGCTAACCCCTGACCAGACCAAAGCATTTGAAGCTATTCTGCCCAAACCTTCGA
CTACTCAGCTGACCGACATGGAGATAGATGAGTGCGAGGAGACAACGCTGCACGATGTTG
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QA 4 482 4 482
DS 

RD RS1F690TF 482 0 0
GGG
CGATATACCAGAGGCCATTCATGAAGGGTAAGCTCTACATCCACTTCACAGCGGATTTCC
CGGACTCGCTAACCCCTGACCAGACCAAAGCATTTGAAGCTATTCTGCCCAAACCTTCGA
CTACTCAGCTGACCGACATGGAGATAGATGAGTGCGAGGAGACAACGCTGCACGATGTTG
ACATTGAGGATGAGATGAGAAGGAAAGCACAAGCTCAGAGAGAGGCTTATGATGATGACG
AGGGCGATGATGACCATCCTGGAGGTGCGCAGAGGGTGCAATGTGCCCAGCAGTAACTAA
GTAACCCTTTAGAGAAAGGACGTGATGAGGGGGTTTGGCTCCAACGTTTGCCTCTTCCTT
TTCTTTATTTTCAGTGTATTTGGAAGTCTTATGGAGTTTGCTATGGTTTAGACTTTGGTG
GAAAACCAACTTGTTTCGTTCTCTCACTCTTTAAATTAATGACGTATTGAAATTTTGTC

QA 4 482 4 482
DS 



AS 1 5

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CTTACTGATACAACTTTCTTTCATTTATGTACATTATTCAAACGATAAGATTAAGCATAC
AGAGAGATACATTTACCAGTATGTCAGGGATGATACATTACATACTGGCTACAACGGAAG
GAATCTCTGCATCCACCTCGATTTCTCCTTCTGATCCCTCCTTGGTCGTCTGAGGAGAAT
CCTTGGATTTGGTGGTTTCAGAGAGATACACAGCCAAAGCTCCTTTGCCACGGAGAATCT
TAGCACCAGAGCCTCTACGCCCTTCTCCTTCAACTGCTTCATCATCCACCACAACCGCCT
CTATCATAACCTTCCCTGTACCCTCGTCCGGTATCTCGTACATAGAATCCATGAGGATGC
TTTCTAAAAGAGCTCTTAAGCCACGAGCACCTGTGTTCTTCGTTATTGCTTTTCTAGCTA
TTAGCCGCAGCGCCGTTTCCGTGAAATGCAGCTTTACACTATTCATCTGGTACATCTTTT
TGTATTGCTTTCCAAGAGCGTTCTTGGGCTCGGTAAGAACCTCCATGAGTTGGTTCTCAG
TCAAAGCAGATAAGCTGACGAGAACAGGAAACAT*CCAACAAATTCAGGTATTAAACCAT
AAGCAATCAGATCACTGCTTTCCACAGTTTCCATCAGGTTTGATGCAACAGCGGCGTTTG
TAACACCACCCACCCTCATGTTAGCACGTACAGGAGCCCCAAACCCTATTGAAGAATCAT
GGCGCCTCTCAGAGATCGTCTTTTCGATGTCTACAAAAGCACCACCACATATGAAAAGTA
TATCTTTTGTGTCTATCTGGATATTGTCACCTCAAAGCGGCGGCCATGGCTCGGTGGGTG
GGGATGATCAGAAGATGGTATCAGCAATTGACTAACATAAGCCGATCGAAGATCAAATGA
ATAATAAGCCCTCCTTTTGAGATGGGTATGTAAGAAATTAAGGAAAGAGAAGAGAGACGA
TGATTACGGTGAAAGTTGTGAAGCACACGGAAAGGATGAAGAAACGCAATTTCGAAAGGG
AGAGAAAACGTATCGGAGAGAATTATCTTTCTTTTCTTTTTTTGAGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1CB74JQ U 155
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CCTTGGATTTGGTGGTTTCAGAGAGATACACAGCCAAAGCTCCTTTGCCACGGAGAATCT
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CTATCATATCCTTCCCTGTACCCTCGTCCGGTATCTCGTACATAGAATCCATGAGGATGC
TTTCTAAAAGAGCTCTTAAGCCACGAGCACCTGTGTTCTTCGTTATTGCTTTTCTAGCTA
TTAGCCGCAGCGCCGTTTCCGTGAAATGCAGCTTTACACTATTCATCTGGTACATCTTTT
TGTATTGCTTTCCAAGAGCGTTCTTGGGCTCGGTAAGAGCCTCCATGAGTTGGTTCTCAG
TCAAAGCAGATAAGCTGACGAGAACAGGAAACCTTCCAACAAATTCAGGTATTAAACCAT
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TAACACCACCCACCCTCATGTTAGCACGTACAGGAGCCCCAAACCCTATTGAA*AATCAT
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CTGATCCCTCCTTGGTCGTCTGAGGAGAATCCTTGGATTTGGTGGTTTCAGAGAGATACA
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CAACTGCTTCATCATCCACCACAACCGCCTCTATCATAACCTTCCCTGTACCCTCGTCCG
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CTGTGTTCTTCGTTATTGCTTTTCTAGCTATTAGCCGCAGCGCCGTTTCCGTGAAATGCA
GCTTTACACTATTCATCTGGTACATCTTTTTGTATTGCTTTCCAAGAGCGTTCTTGGGCT
CGGTAAGAACCTCCATGAGTTGGTTCTCAGTCAAAGCAGATAAGCTGACGAGAACATGAA
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CAAAGCTCCTTTGCCACGGAGAATCTTAGCACCAGAGCCTCTACGCCCTTCTCCTTCAAC
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CTCGTACATAGAATCCATGAGGATGCTTTCTAAAAGAGCTCTTAAGCCACGAGCACCTGT
GTTCTTCGTTATTGCTTTTCTAGCTATTAGCCGCAGCGCCGTTTCCGTGAAATGCAGCTT
TACACTATTCATCTGGTACATCTTTTTGTATTGCTTTCCAAGAGCGTTCTTGGGCTCGGT
AAGAACCTCCATGAGTTGGTTCTCAGTCAAAGCAGATAAGCTGACGAGAACAGGAAACAT
*CCAACAAATTCAGGTATTAAACCATAAGCAATCAGATCACTGCTTTCCACAGTTTCCAT
CAGGTTTGATGCAACAGCGGCGTTTGTAACACCACCCACCCTCATGTTAGCACGTACAGG
AGCCCCAAACCCTATTGAAGAATCATGGCGCCTCTCAGAGATCGTCTTTTCGATGTCTAC
A

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CTTTTCGATGTCTACAAAAGCACCACCACATATGAAAAGTATATCTTTTGTGTCTATCTG
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GAATTATCTTTCTTTTCTTTTTTTGAGCCC

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CGAGCACCTGTGTTCTTCGTTATTGCTTTTCTAGCTATTAGCCGCAGCGCCGTTTCCGTG
AAATGCAGCTTTACACTATTCATCTGGTACATCTTTTTGTATTGCTTTCCAAGAGCGTTC
TTGGGCTCGGTAAGAACCTCCATGAGTTGGTTCTCAGTCAAAGCAGATAAGCTGACGAGA
ACAGGAAACAT*CCAACAAATTCAGGTATTAAACCATAAGCAATCAGATCACTGCTTTCC
ACAGTTTCCATCAGGTTTGATGCAACAGCGGCGTTTGTAACACCACCCACCCTCATGTTA
GCACGTACAGGAGCCCCAAACCCTATTGAAGAATCATGGCGCCTCTCAGAGATCGTCTTT
TCGATGTCTACAAAAGCACCACCACATATGAAAAGTATATCTTTTGTGTCTATCTGGATA
TTGTCACCTCAAAGCGGCGGCCATGGCTCGGTGGGTGGGGATGATCAGAAGATGGTATCA
GCAATTGACTAACATAAGCCGATCGAAGATCAAATGAATAATAAGCCCTCCTTTTGAGAT
GGGTATGTAAGAAATTAAGGAAAGAGAAGAGAGACGATGATTACGGTGAAAGTTGTGAAG
CACACGGAAAGGATGAAGAAACGCAATTTCGAAAGGGAGAGAAAACGTATCGGAGAGAAT
TATCTTTCTTTTCTTTTTTTGAGCCC

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 6

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CTCTTAAGTTTCTATTCCGAAACCGTCAAGTCGCAGAACTGCGGCTGTTCCCCGGACCTA
TGCTGTAGTCAGTACGGTTTTTGCGGTACGGGTAATGACTTCTGTGGTCTCGGTTGCCAA
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GCTTTCATCAACGCTGCGAATTCTTCCCCCAATTTTGCCAATTCCGTTACTAGGCTTGAA
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ATAGACGGAGCGTCACAAAACTACTGCAACGACAAGGAATACCCACAATACCCATGTGCA
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CCAACTGTAGCTTTCAGGACAGCTTTGTGGTTTTGGGTGAATAACGTAAGGCCGGTACTG
AGCCAAGGATTCGGAGCCACCATAAGAGCAATCAATGGAAGAGTAGAATGTGACGGTGCG
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BQ
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

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AF RS1E645JQ C 444
AF RS1E645TF U 444
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G
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G

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G
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TAATTCAAATTTATAAATGTCCTGAGTTAC

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AATGGCCATTGGAATCGTCGGAGATGCTGGAGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCT
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BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

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QA 5 729 5 729
DS 

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GG
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CCATTGGAATCGTCGGAGATGCTGGAGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTTTTCG
TGGGGATGATTCTTATCCTCATCTTTGCGGAAGCACTTGCTCTCTATGGTCTCATTGTAG
GCATTATCTTGTCCTCTCGAGCTGGTCAGTCCAGAGCAGAATGAGAAACAAAACAAACGT
CAGGTGATGATTAATTTTTTTTCCGTGTGTGTAATGTCTCACTTACTCTCATCTGTTTGT
TTGGGGTTGTCACCTTCCTTCCGATGGGTGCTTGAGTGTAG*ATGTTGTTATTTGTTTGG
TTGGCTAA

QA 3 730 3 730
DS 

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TCCTGTATGGGAGCTGCTTATGGAACTGCGAAGAGTGGTGTTGGTGTGGCTTCCATGGGA
GTGATGAGACCTGAGTTGGTGATGAAGTCCATTGTCCCC*GTGGTTATGGCTGGTGTGTT
GGGTATTTATGGACTCATCATCGCTGTTATCATCAGTACCGGTATCAACCCAAAGGCTAA
GTCTTACTACCTCTTTGATGGATACGCGCACCTCTCCTCTGGTCTTGCTTGTGGTCTCGC
TGGTCTCTCAGCTGGAATGGCCATTGGAATCGTCGGAGATGCTGGAGTCAGGGCAAATGC
TCAGCAGCCTAAGCTTTTCGTGGGGATGATTCTTATCCTCATCTTTGCGGAAGCACTTGC
TCTCTATGGTCTCATTGTAGGCATTATCTTGTCCTCTCGAGCTGGTCAGTCCAGAGCAGA
ATGAGAAACAAAACAAACGTCAGGTGATGATTAATTTTTTTTCCGTGTGTGTAATGTCTC
ACTTACTCTCATCTGTTTGTTTGGGGTTGTCACCTTCCTTCCGATGGGTGCTTGAGTGTA
GGATGTTGTTATTTGTTTGGTTGGCTAATAAAAAGACAAGTGTGCATGTTTTGTATTCTT
TGTATTTGTCTTGAGGAACTTGATGATATTTTGTTTGTAAAGAAGTTTGCTTCTGAAACC
GTCTTCGAGTGTTGTTATGAT

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DS 

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GCTGTTATCATCAGTACCGGTATCAACCCAAAGGCTAAGTCTTACTACCTCTTTGATGGA
TACGCGCACCTCTCCTCTGGTCTTGCTTGTGGTCTCGCTGGTCTCTCAGCTGGAATGGCC
ATTGGAATCGTCGGAGATGCTGGAGTCAGGGCAAATGCTCAGCAGCCTAAGCTTTTCGTG
GGGATGATTCTTATCCTCATCTTTGCGGAAGCACTTGCTCTCTATGGTCTCATTGTAGGC
ATTATCTTGTCCTCTCGAGCTGGTCAGTCCAGAGCAGAATGAGAAACAAAACAAACGTCA
GGTGATGATTAATTTTTTTTCCGTGTGTGTAATGTCTCACTTACTCTCATCTGTTTGTTT
GGGGTTGTCACCTTCCTTCCGATGGGTGCTTGAGTGTAGGATGTTGTTATTTGTTTGGTT
GGCTAATAAAAAGACAAGTGTGCATGTTTTGTATTCTTTGTATTTGTCTTGAGGAACTTG
ATGATATTTTGTTTGTAAAGAAGTTTGCTTCTGAAACCGTCTTCGAGTGTTGTTATGATG
TTCAT
AC

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DS 

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CTAAGCTTTTCGTGGGGATGATTCTTATCCTCATCTTTGCGGAAGCACTTGCTCTTTATG
GTCTCATTGTAGGCATTATCCTGTCCTCTCGAGCTGGTCAGTCCAGAGCAGAATGAGAAA
CAAAACAAACGTCAGGTGATGATTAATTTTTTTTCCGTGTGTGTAATGTCTCACTTACTC
TCATCTGTTTGTTTGGGGTTGTCACCTTCCTTCCGATGGGTGCTTGAGTGTAGGATGTTG
TTATTTGTTTGGTTGGCTAATAAAAAGACAAGTGTGCATGTTTTGTATTCTTTGTATTTG
TCTTGAGGAACTTGATGATATTTTGTTTGTAGAGAAGTTTGCTTCTGAAACCGTCTTCGA
GTGTTGTTATGATATTCATCTAT

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DS 



AS 1 5

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GTTTTGAAGAGTGACTTCGAAGATAATACAAACCAAACCATACATCTTTTCTCATGTCTG
TTTCATGTGTCTGGGTCCTAAAGTTAGAGATGCAGATCTTCAATGTCTCTAAGTGGTTCC
GGAGTTCTCTTGTTGTCAGGTTGGTTCACAACTAGCTGACCACAAGCACCACTAATATCC
TGACCCATTTCTTTGCGAACCGTGGTTCGTATATTGTAGGTTTCCCTCAGGATCTTCTGG
AAGCTTGAGACGCTTTGTTTAGTACTGGTTTTGAACTGGCTCGTTGACCCAATTGGGTTG
AATGGTATCAAATTTATCACCACTTGAAATGTCTTTAGCAACTCGCCAAGTTGATGAGCG
TTCTCCCCTTGATCATTTACTCCATCAAGCATGATGTACTCAATGAAGATCTTCTGCTGA
CTGCTTTTCTGGAAAGCTTGAAGTGCATCCATAAGCTTTTGAAGAGGAAAGGCTCTAGCT
GCTGGCATGATTTGGCAGCGGATTTCTTGAACTGGTGCATGAAGAGATACCGCTAAACTT
ATGCCTGGTAGATCATTGTGAAGCTTGTTTATCGCATGAACAACTCCAACAGTTGAAATG
GTAATTCTCTTGGGTGAGAGCTGAAAAGGCTGTTTTAACATGGCACGGACAGCTTCAACA
ACAGCATTGTAGTTATTCAAAGGTTCTCCCATTCCCATGAAGACAATGTTGCGTATATCA
GCTAAGCGAGAGGCGTGCACAAGCTGCTCCACAATTTCTCCCGATGTTAAATTGCTTTTG
AATCCCATGCTACCAGTTGCACAGAACGTGCAACCCATTTTGCAACCAACCTGTGATGAA
ATGCATAATGTAGATCTCACACCACCTGGACGTGGCTTCCCTCCACACATCCCCAACCGA
GTATCGTATCTCATTATCACAGCCTCCACAAAAGCTCCATTCTGGAGCTCGATGAGGAGT
TTAGAGGTGGTGCCATCAGAGGAGTGGAAGAGGGAGTGGAGAGAGGAAGTGAAAGTCTTG
AACTTTGAATGGAGGAGAGTGTATGCGGCGGTGGGCAACGAAGGGATCTCGTCCCAAACG
CAATCGGGATTCTGAATTATGTACTTCCAGATCGGGATCATGAAATTAGGGTTTATTCCC
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AGTTTCGTCTCGCCGATGATTTTAAAAGCCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CD09JQ U 1
AF RS1C431JQ U 87
AF RS1FN96JQ U 66
AF RS1FN96TF C 400
AF RS1C431TF C 610
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RD RS1CD09JQ 685 0 0
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GTTTTGAAGAGTGACTTCGAAGATAATACAAACCAAACCATACATCTTTTCTCATGTCTG
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GGAGTTCTCTTGTTGTCAGGTTGGTTCACAACTAGCTGACCACAAGCACCACTAATATCC
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AAGCTTGAGACGCTTTGTTTAGTACTGGTTTTGAACTGGCTCGTTGACCCAATTGGGTTG
AATGGTATCAAATTTATCACCACTTGAAATGTCTTTAGCAACTCGCCAAGTTGATGAGCG
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CTGCTTTTCTGGAAAGCTTGAAGTGCATCCATAAGCTTTTGAAGAGGAAAGGCTCTAGCT
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ATGCCTGGTAGATCATTGTGAAGCTTGTTTATCGCATGAACAACTCCAACAGTTGAAATG
GTAATTCTCTTGGGTGAGAGCTGAA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RS1C431JQ 634 0 0
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GAGATGCAGATCTTCAATGTCTCTAAGTGGTTCCGGAGTTCTCTTGTTGTCAGGTTGGTT
CACAACTAGCTGACCACAAGCACCACTAATATCCTGACCCATTTCTTTGCGAACCGTGGT
TCGTATATTGTAGGTTTCCCTCAGGATCTTCTGGAAGCTTGAGACGCTTTGTTTAGTACT
GGTTTTGAACTGGCTCGTTGACCCAATTGGGTTGAATGGTATCAAATTTATCACCACTTG
AAATGTCTTTAGCAACTCGCCAAGTTGATGAGCGTTCTCCTCTTGATCATTTACTCCATC
AAGCATGATGTACTCAATGAAGATCTTCTGCTGACTGCTTTTCTGGAAAGCTTGAAGTGC
ATCCATAAGCTTTTGAAGAGGAAAGGCTCTAGCTGCTGGCATGATTTGGAAGCGGATTTC
TTGAACTGGTGCATGAAGAGATACCGCTAAACTTATGCCTGGTAGATCATTGTGAAGCTT
GTTTATCGCATGAACAACTCCAACAGTTGAAATGGTAATTCTCTTGGGTGAGAGCTGAAA
AGGCTGTTTTAACATGGCACGGACAGCTTCAACA

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1FN96JQ 682 0 0
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TGTGTCTGGGTCCTAAAGTTAGAGATGCAGATCTTCAATGTCTCTAAGTGGTTCCGGAGT
TCTCTTGTTGTCAGGTTGGTTCACAACTAGCTGACCACAAGCACCACTAATATCCTGACC
CATTTCTTTGCGAACCGTGGTTCGTATATTGTAGGTTTCCCTCAGGATCTTCTGGAAGCT
TGAGACGCTTTGTTTAGTACTGGTTTTGAACTGGCTCGTTGACCCAATTGGGTTGAATGG
TATCAAATTTATCACCACTTGAAATGTCTTTAGCAACTCGCCAAGTTGATGAGCGTTCTC
CCCTTGATCATTTACTCCATCAAGCATGATGTACTCAATGAAGATCTTCTGCTGACTGCT
TTTCTGGAAAGCTTGAAGTGCATCCATAAGCTTTTGAAGAGGAAAGGCTCTAGCTGCTGG
CATGATTTGGCAGCGGATTTCTTGAACTGGTGCATGAAGAGATACCGCTAAACTTATGCC
TGGTAGATCATTGTGAAGCTTGTTTATCGCATGAACAACTCCAACAGTTGAAATAGTAAT
TCTCTTGGGTGAGAGCTGAAAAGGCTGTTTTAACATGGCACGGACAGCTTCAACAACAGC
ATTGTAGTTATTCAAAGGTTCT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1FN96TF 625 0 0
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TCAATGAAGATCTTCTGCTGACTGCTTTTCTGGAAAGCTTGAAGTGCATCCATAAGCTTT
TGAAGAGGAAAGGCTCTAGCTGCTGGCATGATTTGGCAGCGGATTTCTTGAACTGGTGCA
TGAAGAGATACCGCTAAACTTATGCCTGGTAGATCATTGTGAAGCTTGTTTATCGCATGA
ACAACTCCAACAGTTGAAATAGTAATTCTCTTGGGTGAGAGCTGAAAAGGCTGTTTTAAC
ATGGCACGGACAGCTTCAACAACAGCATTGTAGTTATTCAAAGGTTCTCCCATTCCCATG
AAGACAATGTTGCGTATATCAGCTAAGCGAGAGGCGTGCACAAGCTGCTCCACAATTTCT
CCCGATGTTAAATTGCTTTTGAATCCCATGCTACCAGTTGCACAGAACGTGCAACCCATT
TTGCAACCAACCTGTGATGAAATGCATAATGTAGATCTCACACCACCTGGACGTGGCTTC
CCTCCACACATCCCCAACCGAGTATCGTATCTCATTATCACAGCCTCCACAAAAGCTCCA
TTCTGGAGCTCGATGAGGAGTTTAG

QA 1 625 1 625
DS 

RD RS1C431TF 745 0 0
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TTGGGTGAGAGCTGAAAAGGCTGTTTTAACATGGCACGGACAGCTTCAACAACAGCATTG
TAGTTATTCAAAGGTTCTCCCATTCCCATGAAGACAATGTTGCGTATATCAGCTAAGCGA
GAGGCGTGCACAAGCTGCTCCACAATTTCTCCCGATGTTAAATTGCTTTTGAATCCCATG
CTACCAGTTGCACAGAACGTGCAACCCATTTTGCAACCAACCTGTGATGAAATGCATAAT
GTAGATCTCACACCACCTGGACGTGGCTTCCCTCCACACATCCCCAACCGAGTATCGTAT
CTCATTATCACAGCCTCCACAAAAGCTCCATTCTGGAGCTTGATGAGGAGTTTAGAGGTG
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TGGAGGAGAGTGTATGCGGCGGTGGGCAACGAAGGGATCTCGTCCCAAACGCAATCGGGA
TTCTGAATTATGTACTTCCAGATCGGGATCATGAAATTAGGGTTTATTCCCGCTGACTCG
AACTCCGATTTGATCTCCGGCGCATCGAATACTGATTTCATCTTCATCGGTCTTCCTTCA
AACTCTCACCTCGCCGCCGCCGCCGCCGTCTCTAAGTTTCGCCGGTTTAAAAGTTTCGTC
TCGCCGATGATTTTAAAAGCCCTCC

QA 1 745 1 745
DS 



AS 2 5

CO CL1318Contig1 838 3 7 U
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AAAAGAAAACTCTTAGATTCCAAAATAAAATAAAAGCCAGAAGAAAAATTACAAAATGTG
GCTAACTCTAGAATCCCACAGTAAAAAAAGAAGCAAAAGTTGTAAGGGAAGAAAAAAACA
GAAGGCAGAGCTTTTGAAGACATCAGAAGCTGTTGTTCTAAAAGCCTCAACACATTTGTG
CGGAAGAGACCAGAAGAAGAGCTCTAAGCAGCTTTAGGCTTGGGTATCCTCTTCTTCAGG
TTCCTCTGGGAGGAGGAGGAGGAGG***TTGTCGTTGCATTCTTCATTCCGATAAAAAAC
AGCAATGCCCCAAGAAGCGCAACGCTCTGCAAGAACTCAGTAAAGAGAAGAGAGAACTCG
CGGTCCTGAGGTCCATAGTTGTAGAAATCATATAAGATGGGGCTAACGACCACCAAGTAG
AAAGCCAGAAGATAGGCACCAAAGACGTTGCCAACAACAAAGAGTAAGCCTCCGAGTCCT
TTCAGAGCAACAATTGCCCATACGACTTGTTTCACCTCAATGTCGGGAAATGCTACTCCT
AATCTGGAAGAGAGATGTGCTTTGGTCAGGTGAAGCTTTGGAGCCAACTCTTTAGCTGCT
GGACCACCGTCAGATCCAAAGTCACTGAACATTTGCCAAGCGGAGAGGATGAATAGAGAA
GCGAAGAGAACTCTTCCGAGAAACGAGAAGAAACCCATTTTTCTCTCCCTCTGTCTGTCG
CACGTAGGTCTGGTTTGTCGTCGGAGACAGGAACAATCTTTCTCGGTGGAAGCTATCC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GX24JQ U 1
AF RS1D014JQ U 3
AF RS1GX24TF C 160
BS 1 205 RS1GX24JQ
BS 206 206 RS1D014JQ
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BS 249 403 RS1GX24JQ
BS 404 757 RS1D014JQ
BS 758 838 RS1GX24TF

RD RS1GX24JQ 403 0 0
ATCAAAACAGATGAACCAAAATTAATATTAAAAAAAGAGAGAATTGTATGATCCTCTAAC
AAAAGAAAACTCTTAGATTCCAAAATAAAATAAAAGCCAGAAGAAAAATTACAAAATGTG
GCTAACTCTAGAATCCCACAGTAAAAAAAGAAGCAAAAGTTGTAAGGGAAGAAAAAAACA
GAAGGCAGAGCTTTTGAAGACATCAAAAGCTGTTGTTCTAAAAGCCTCAACACATTTGTG
CGGAAGAAACCAGAAGAAGAGCTCTAAGCAGCTTTAGGCTTGGGTATCCTCTTCTTCAGG
TTCCTCTGGGAGGAGGAGGAGGAGG***TTGTCGTTGCATTCTTCATTCCGATAAAAAAC
AGCAATGCCCCAAGAAGCGCAACGCTCTGCAAGAACTCAGTAA

QA 1 403 1 403
DS 

RD RS1D014JQ 755 0 0
CA
AAACAGATGAACCAAAATTAATATTAAAAAA*GAGAGAATTGTATGATCCTCTAACAAAA
GAAAACTCTTAGATTCCAAAATAAAATAAAAGCCAGAAGAGAAATTACAAAATGTGGCTA
ACTCTAGAATCCCACAGTAGAAAAAGAAGCAAAAGTTGTAAGGGTAGAAAAAAACAGAAG
GCAGAGCTTTTGAAGACATCAGAAGCTGTTGTTCTAAAAGCCTCAACACATTTGTGCGGA
AGAGACCAGAAGAAGAGCTCTAAGCAGCTTTAGGCTTGGGTATCCTCTTCTTCAGGTTCC
TCTGGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGTTGTCGTTGCATTCTTCATTCCGATAAAAAACAGCA
ATGCCCCAAGAAGCGCAACGCTCTGCAAGAACTCAGTAAAGAGAAGAGAGAACTCGCGGT
CCTGAGGTCCATAGTTGTAGAAATCATATAAGATGGGGCTAACGACCACCAAGTAGAAAG
CCAGAAGATAGGCACCAAAGACGTTGCCAACAACAAAGAGTAAGCCTCCGAGTCCTTTCA
GAGCAACAATTGCCCATACGACTTGTTTCACCTCAATGTCGGGAAATGCTACTCCTAATC
TGGAAGAGAGATGTGCTTTGGTCAGGTGAAGCTTTGGAGCCAACTCTTTAGCTGCTGGAC
CACCGTCAGATCCAAAGTCACTGAACATTTGCCAAGCGGAGAGGATGAATAGAGAAGCGA
AGAGAACTCTTCCGAGAAACGAGAAGAAACCCA

QA 3 755 3 755
DS 

RD RS1GX24TF 679 0 0
TTGTAAGGGAAG
AAAAAAACAGAAGGCAGAGCTTT*GAAGACATCAGAAGCTGTTGTTCTAAAAGCCTCAAC
ACATTTGTGCGGAAGAGACCAGAAGAAGAGCTCTAAGCAGCTTTAGGCTTGGGTATCCTC
TTCTTCAGGTTCCTCTGGGAGGAGGAGGAGGAGG***TTGTCGTTGCATTCTTCATTCCG
ATAAAAAACAGCAATGCCCCAAGAAGCGCAACGCTCTGCAAGAACTCAGTAAAGAGAAGA
GAGAACTCGCGGTCCTGAGGTCCATAGTTGTAGAAATCATATAAGATGGGGCTAACGACC
ACCAAGTAGAAAGCCAGAAGAT*GGCACCAAAGACGTTGCCAACAACAAAGAGTAAGCCT
CCGAGTCCTTTCAGAGCAACAATTGCCCATACGACTTGTTTCACCTCAATGTCGGGAAAT
GCTACTCCTAATCTGGAAGAGAGATGTGCTTTGGTCAGGTGAAGCTTTGGAGCCAACTCT
TTAGCTGCTGGACCACCGTCAGATCCAAAGTCACTGAACATTTGCCAAGCGGAGAGGATG
AATAGAGAAGCGAAGAGAACTCTTCCGAGAAACGAGAAGAAACCCATTTTTCTCTCCCTC
TGTCTGTCGCACGTAGGTCTGGTTTGTCGTCGGAGACAGGAACAATCTTTCTCGGTGGAA
GCTATCC

QA 13 679 13 679
DS 



CO CL1318Contig2 710 2 3 U
TTTTTTATCAAACAGATGAACCAAAATTAATATTAAAAAACGAGAAAGAATTGTATGATC
CTCCAACAAAAGAAAACTCTTAGATTCCAAAATAAAATAAAAACCAGAAGAGAAATTACA
AAATGTGGCTAACTCTAGAATCCCACAGTAAAAAAAGAAGCAAAGGTTGTAAGGAAGAAA
AAAAAGCAGAAGGTAGAGCTTTTGAAGACATCAGAAGCTGTTGTTCTAAAAGCCTCAACA
CATTTGTGCGGAAGAGACCAGAAGAAGAACTCTAAGCAGCTTTAGGCTTGGGTATCCTCT
TCTTCAGGTTCCTCTGGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGTTGTCGTTGCATTCTTCATTCCGA
TAAAAAACAGCAATGCCCCAAGAAGTGCAACGCTCTGCAAAAACTCAGTAAAGAGAAGAG
AGAACTCGCGGTCCTGAGGTCCATAGTTGTAGAAATCATATAAGATGGGGCTAACGATCA
CCAAGTAGAAAGCCAGAAGATAAGCACCAAAGACGTTCCCAACAACAAAGAGTAAGCCTC
CGAGTCCTTTCAGAGCAACAATTGCCCATACGACTTGTTTCACCTCAATGTCCGGCAATG
CTACTCCTAATCTGGAAGAGACCTGTGCTTTGGTCAGGTGAAGCTTTGGAGCCAACTCTT
TAGCTGCTGGACCACCGTCAGATCCAAAGTCACTGAACATTTGCCAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GZ78JQ U 6
AF RS1GZ78TF C 1
BS 1 9 RS1GZ78TF
BS 10 642 RS1GZ78JQ
BS 643 710 RS1GZ78TF

RD RS1GZ78JQ 637 0 0
ATCA
AAACAGATGAACCAAAATTAATATTAAAAAACGAGAAAGAATTGTATGATCCTCCAACAA
AAGAAAACTCTTAGATTCCAAAATAAAATAAAAACCAGAAGAGAAATTACAAAATGTGGC
TAACTCTAGAATCCCACAGTAAAAAAAGAAGCAAAGGTTGTAAGGAAGAAAAAAAAGCAG
AAGGTAGAGCTTTTGAAGACATCAGAAGCTGTTGTTCTAAAAGCCTCAACACATTTGTGC
GGAAGAGACCAGAAGAAGAACTCTAAGCAGCTTTAGGCTTGGGTATCCTCTTCTTCAGGT
TCCTCTGGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGTTGTCGTTGCATTCTTCATTCCGATAAAAAACA
GCAATGCCCCAAGAAGTGCAACGCTCTGCAAAAACTCAGTAAAGAGAAGAGAGAACTCGC
GGTCCTGAGGTCCATAGTTGTAGAAATCATATAAGATGGGGCTAACGATCACCAAGTAGA
AAGCCAGAAGATAAGCACCAAAGACGTTCCCAACAACAAAGAGTAAGCCTCCGAGTCCTT
TCAGAGCAACAATTGCCCATACGACTTGTTTCACCTCAATGTCCGGCAATGCTACTCCTA
ATCTGGAAGAGACCTGTGCTTTGGTCAGGTGAA

QA 5 637 5 637
DS 

RD RS1GZ78TF 710 0 0
TTTTTTATCAAACAGATGAACCAAAATTAATAT**AAAAACGAGAAAGAATTGTATGATC
*TCCAACAAAAGAAAACTCTTAGATTCCAAAATAAAATAAAAACCAGAAGAGAAATTACA
AAATGTGGCTAACTCTAGAATCCCACAGTAGAAAAAGAAGCAAAGGTTGTAAGGAAGAAA
AAAAAGCAGAAGGTAGAGCTTTTGAAGACATCAGAAGCTGTTGTTCTAAAAGCCTCAACA
CATTTGTGCGGAAGAGACCAGAAGAAGAACTCTAAGCAGCTTTAGGCTTGGGTATCCTCT
TCTTCAGGTTCCTCTGGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGTTGTCGTTGCATTCTTCATTCCGA
TAAAAAACAGCAATGCCCCAAGAAGTGCAACGCTCTGCAAAAACTCAGTAAAGAGAAGAG
AGAACTCGCGGTCCTGAGGTCCATAGTTGTAGAAATCATATAAGATGGGGCTAACGATCA
CCAAGTAGAAAGCCAGAAGATAAGCACCAAAGACGTTCCCAACAACAAAGAGTAAGCCTC
CGAGTCCTTTCAGAGCAACAATTGCCCATACGACTTGTTTCACCTCAATGTCCGGCAATG
CTACTCCTAATCTGGAAGAGACCTGTGCTTTGGTCAGGTGAAGCTTTGGAGCCAACTCTT
TAGCTGCTGGACCACCGTCAGATCCAAAGTCACTGAACATTTGCCAAGCC

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL1319Contig1 763 2 5 U
GTAAGAACTTCGAAAAAATAAAACTGGTATGGTAAATGAATTGTCTCAGCAAAAAGAGAA
CCATTAACAAACACAAGAATAAAAGATAAAAGTATACTTAGACCGCAGCCTTGTCTTTAA
AACTCGATTAGAAAAACGGACTAAGCGACCCATAGGATCATCAAAACACAAGTCACCGAA
GCAAAACTCATATGAGAGAGCGTATCAAACCAAAACCAATAATCTTTTTCACTTGAAGCA
CTTGGCGTCCAAGAGAGCTTCACCTTCAAACGGCTCTGCGTCCTCGATCATCTGGCTAAC
ACGCTCCTTCTGGGCTTCATCGGAGATGTCAACCTTAGTCCACTCGTACAGCTCCATGTC
GTACACCTCATCCATAACGAACTTGGGGATCTCTGGTCCACGGAACAGCCACAAACCCTT
CACCTTGAACGGACCTTCTGCCCCGCAAATCAGCATCTTTCCAAAGGCGTACTTGCGCGC
CAAATCCATTCTCTGCAGGAATCCACCAACCTTGTTGAGGGTGACGAATGACACTGTGTT
CTCGTCATTGTATTTGTAGTCGCAGAACCACAGTGAGTATCCCTCTGGGTCATACATGTC
TCAGAATCCTTTGATAGCAACATCACGGAAGTTCGACTTGGTGTTTGAGTACAGCCTCTT
CCACTCATCGAGAACCATTGGGCTTGGTGGTAGCAAGTCAAGAGGGTTCTTTGCTTTGGG
CTTTGGAGCCTCTTCCTCTTCAACAGGCTTAGGCGCCTCTGCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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BQ
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TGACTCGCAATGAGTGCACTTCCTGACAACTGTCCCATCTGCGCTGAATGGTTCAGGACT
GTGAGAGACGTTGCTGTTCTTCTTCTTGCGTCTCCTCTTGGCAGAACTCTCAGAAGAGAG
GTAAGTGTCTTCAGAGTCTGAATCATCATCCAGAGCAAACTTCCTCTCCAGCATTTCAGA
TAAGAAG*AGTGGCGGGATAAGAATGTTGGGATTGAGGGGCGCTTGCGCTTGCTTCTGAT
GCCTTT

QA 5 730 5 730
DS 

RD RS1AL95TF 675 0 0
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CTGAATGGTTCAGGACTGTGAGAGACGTTGCTGTTCTTCTTCTTGCGTCTCCTCTTGGCG
GAACTCTCAGAAGAGAGGTAAGTGTCTTCAGAGTCTGAATCATCATCCAGAGCAAACTTC
CTCTCCAGCATTTCAGATAAGAAGGAGTGGCGGGATAAGAATGTTGGGATTGAGGGGCGC
TTGCGCTTGCTTCTGATGCCTTTGACGGGGAAGGCCAGTCTCTGAGCTCTGTTTTGGTTC
TGGAACGAGGCTGCAGAACCATTGGCTGCGTTGTTTTCGAGCACTGAGACTGGGCTTGAG
GACTGAAACAGCTTTGAGACTTTCACATCAGGAAGGGAAGTATCAACGGTAGAAGAGATT
CCTCC*AACTGCTTCAAAGTGGGCACAGGCTTCTTGTGGGCTCCTTCCACAAGCTGCCCA
TTGGTGCCAGCACGAGTGAACTCAGAGGACAAACTTGTGAGCACATCCGATGGTGGAGGT
ATGAGGTTCTTAAAGTCGGCACCCCAGTCTGCCTCTTCGTTGGTGGTTTCGATGTCCTCA
AGAGGGAAATCGATATGATTGATGAGATCATCAAAGAAGTTATCCGTGAGACCCTTGAAG
TCCTCTTCCGGTAAC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1EL70TF 675 0 0
CTC
TCTTGCGTCTCCTCTTGGCAGAACTCTCAGAAGAGAGGTAAGTGTCTTCAGAGTCTGAAT
CATCATCCAGAGCAAACTTCCTCTCCAGCATTTCAGATAAGAAGGAGTGGCGGGATAAGA
ATGTTGGGATTGAGGGGCGCTTGCGCTTGCTTCTGATGCCTTTGACGGGGAAGGCCAGTC
TCTGAGCTCTGTTTTGGTTCTGGAACGAGGCTGCAGAACCATTGGCTGCGTTGTTTTCGA
GCACTGAGACTGGGCTTGAGGACTGAAACAGCTTTGAGACTTTCACATCAGGAAGGGAAG
TATCAACGGTAGAAGAGATTCCTCCCAACTGCTTCAAAGTGGGCACAGGCTTCTTGTGGG
CTCCTTCCACAAGCTGCCCATTGGTGCCAGCACGAGTGAACTCAGAGGACAAACTTGTGA
GCACATCCGATGGTGGAGGTATGAGGTTCTTAAAGTCGGCACCCCAGTCTGCCTCTTCGT
TGGTGGTTTCGATGTCCTCAAGAGGGAAATCGATATGGTTGATGAGATCATCAAAGAAGT
TATCCGTGAGACCCTTGAAGTCCTCTTCCGGTAACCACGGACCACCGTTATTCATTTTTT
CCACCCCACTTTTGAACGTATTCCACAAGCGCGAGCCAAAGGAGAGAGAGAGAGAATCTA
AACTTGTCT
CAC

QA 4 672 4 672
DS 

RD RS1DQ35TF 672 0 0
TCTTGCGTCTCCTCTTGGCAGAACTCTCAGAAGAGAGGTAAGTGTCTTCAGAGTCTGAAT
CATCATCCAGAGCAAACTTCCTCTCCAGCATTTCAGATAAGAAG*AGTGGCGGGATAAGA
ATGTTGGGATTGAGGGGCGCTTGCGCTTGCTTCTGATGCCTTTGACGGGGAAGGCCAGTC
TCTGAGCTCTGTTTTGGTTCTGGAACGAGGCTGCAGAACCATTGGCTGCGTTGTTTTCGA
GCACTGAGACTGGGCTTGAGGACTGAAACAGCTTTGAGACTTTCACATCAGGAAGGGAAG
TATCAACGGTAGAAGAGATTCCTCCCAACTGCTTCAAAGTGGGCACAGGCTTCTTGTGGG
CTCCTTCCACAAGCTGCCCATTGGTGCCAGCACGAGTGAGCTCAGAGGACAAACTTGTGA
GCACATCCGATGGTGGAGGTATGAGGTTCTTAAAGTCGGCACCCCAGTCTGCCTCTTCGT
TGGTGGTTTCGATGTCCTCAAGAGGGAAATCGATATGATTGATGAGATCATCAAAGAAGT
TATCCGTGAGACCCTTGAAGTCCTCTTCCGGTAACCACGGACCACCGTTATTCATTTTTT
CCACCCCACTTTTGAACGTATTCCACAAGCGCGAGCCAAAGGAGAGAGAGAGAGAATCTA
AACTTGTCTGAA

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 6

CO CL1321Contig1 764 6 3 U
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TAACAAAACGGTTGATAAAGATCACAACTCAAAGAGAACGTGTTTACAAGACAAACAGTG
TGGTTGAGGAATGAGGAATGAGAAAATACCAGTGGATAGAGACAATTAAGCAACAGAAAT
AGAGGACAAGAGACCATCAATGTACTCCTCAAGCTTGGCCTTTGTAATAGCACCTTCCCT
TCTGCTACCTGGCACTTCCTTACCATCCTTGAACAGTATAAAATGCGGTAAACCATAAAC
CTTGTACTCTGCTATCAAATTAGGATTCGCGTCGTGATCAATCTTCACAATCGTCAACCT
CTCATCATACTCCTGAGATAAAGCTTCCGTAACTGGATAGACCAACTTGCAGGGACCGCA
CCACGTGGCGACGAAATTAACCAGAACCGGCCGGTCCGATTCGAGAACCGTGCTGGTGAA
CTCACTCTCTCCGATCTCCTTGATTCACCCGCCGCATCTTATCACGGTAGTGGAGAGTGA
TCTTGTTCTTTTGAGACCGGACTTGAACGAGAGTATGTGGCGGTTAGCCGCGGAGGATGC
GACCTGTGCTGAGCTCAGAGGTTTGGCGGACACGGAGGAAGCTGAACGAATTGGAGTGAG
ATGTGATCGGATAAGAACCGTCGAGCTGGAGACGATACAGTCCATTGCTTCCCCCT**CC
TCAGTGGACGATGATGATGTTCACTTGATTCAGCCCCGTCGACT


BQ
10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 30 30 5 30 30 5 5 
30 5 30 30 30 5 30 30 30 5 5 5 30 5 5 5 30 5 5 30 30 5 5 30 30 5 30 5 30 5 30 5 5 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A388TR U 1
AF RS1A388JQ U 4
AF RS1A388TF C 4
AF RS1DE41TF C 57
AF RS1DE41JQ U 62
AF RS1A388TV C 4
BS 1 713 RS1A388TR
BS 714 755 RS1DE41JQ
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RD RS1A388TR 713 0 0
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TCTGCTACCTGGCACTTCCTTACCATCCTTGAACAGTATAAAATGCGGTAAACCATAAAC
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GACCTGTGCTGAGCTCAGAGGTTTGGCGGACACGGAGGAAGCTGAACGAATTGGAGTGAG
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QA 1 713 1 713
DS 

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GCTACCTGGCACTTCCTTACCATCCTTGAACAGTATAAAATGCGGTAAACCATAAACCTT
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QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1A388TF 761 0 0
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GCTACCTGGCACTTCCTTACCATCCTTGAACAGTATAAAATGCGGTAAACCATAAACCTT
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ATCATACTCCTGAGATAAAGCTTCCGTAACTGGATAGACCAACTTGCAGGGACCGCACCA
CGTGGCGACGAAATTAACCAGAACCGGCCGGTCCGATTCGAGAACCGTGCTGGTGAACTC
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QA 1 761 1 761
DS 

RD RS1DE41TF 699 0 0
TTTTTG
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ACGTGGCGACGAAATTAACCAGAACCGGCCGGTCCGATTCGAGAACCGTGCTGGTGAACT
CACTCTCTCCGATCTCCTTGATTCCTCCGCCGCATCTTATCACGGTAGTGGAGAGTGATC
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QA 7 699 7 699
DS 

RD RS1DE41JQ 694 0 0
G
ACAAAACGGTTGATAAAGATCACAACTCAAAGAGAACGTGTTTACAAGACAAACAGTGTG
GTTGAGGAATGAGGAATGAGAAAATACCAGTGGATAGAGACAATTAAGCAACAGAAATAG
AGGGCAAGAGACCATCAATGCACTCCTTAAGCTTGGCCTTTGTAATAGCACCTTCCCTTC
TGCTACCTGGCACTTCCTTACCATCCTTGAACAGTATAAAATGCGGTAAACCATAAACCT
TGTACTCTGCTATCAAATTAGGATTCGCGTCGTGATCAATCTTCACAATCGTCAACCTCT
CATCATACTCCTGAGATAAAGCTTCCGTAGCTGGATAGACTAACTTGCAGGGACCGCACC
ACGTGGCGACGAAATTAACCAGAACCGGCCGGTCCGATTCGAGAACCGTGCTGGTGAACT
CACTCTCTCCGATCTCCTTGATTCCTCCGCCGCATCTTATCACGGTAGTGGAGAGTGATC
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CCTGTGCTGAGCTCAGAGGTTTGGCGGACACGGAGGAAGCTGAACGAATTGGAGTGAGAT
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AGTGGACGATGATGATGTTCACTTGATTCAGCC

QA 2 694 2 694
DS 

RD RS1A388TV 761 0 0
GCACAAAGCTCAGAGTCTTGTATTAATAAAAATCTGTTGCTGGATTTACACATTTGGTAA
CAAAACGGTTGATAAAGATCACAACTCAAAGAGAACGTGTTTACAAGACAAACAGTGTGG
TTGAGGAATGAGGAATGAGAAAATACCAGTGGATAGAGACAATTAAGCAACAGAAATAGA
GGACAAGAGACCATCAATGTACTCCTCAAGCTTGGCCTTTGTAATAGCACCTTCCCTTCT
GCTACCTGGCACTTCCTTACCATCCTTGAACAGTATAAAATGCGGTAAACCATAAACCTT
GTACTCTGCTATCAAATTAGGATTCGCGTCGTGATCAATCTTCACAATCGTCAACCTCTC
ATCATACTCCTGAGATAAAGCTTCCGTAACTGGATAGACCAACTTGCAGGGACCGCACCA
CGTGGCGACGAAATTAACCAGAACCGGCCGGTCCGATTCGAGAACCGTGCTGGTGAACTC
ACTCTCTCCGATCTCCTTGATTCACCCGCCGCATCTTATCACGGTAGTGGAGAGTGATCT
TGTTCTTTTGAGACCGGACTTGAACGAGAGTATGTGGCGGTTAGCCGCGGAGGATGCGAC
CTGTGCTGAGCTCAGAGGTTTGGCGGACACGGAGGAAGCTGAACGAATTGGAGTGAGATG
TGATCGGATAAGAACCGTCGAGCTGGAGACGATACAGTCCATTGCTTCCCCCCGGCCGTA
ATGGCCGAAT*TCCCGGGCATATG*TCCGGTACCGTCGACT

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 6

CO CL1322Contig1 859 6 5 U
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AACCACAACAAACAACAACCATATATTTGTCTTATTTGTATCATTTGTCCCCTTGTGTTC
TTTATCTTAAGGAAAGTAAAATCTTGATTAATCTGAATAATGATGGGAGCAAATGATGGG
AGAAGAACGCCTTTAATGAATCTTGGGGTTCAAGTATCGATGAGAGTATTAGCCATTGGC
ACTGCATTGGCCTCCATGGGGCTCACGATCACTAACCATGAAGTCGCCTCTGTTTATGGC
ATTAATTTTGAGGCTAAATACGACTACTCATCTGCCTTTAGGTATTTGGTGTACGCAGAA
ATAGCTATCGCCGGCATGACATTGTTTACGCTCGTATGGGCTTGTTTAGCTGTCCGTAGA
AGAGGACTTGTTTTTGCACTCTTCTTCTTTGATTTGCTCACGACATTGACGGCTATATCG
TCTTTCTCTGCGGCCATGTCGGATGGTTACATCGGCAAGTATGGTAATACACACGCCGGT
TGGCTACCGATATGCGGCTACGTCCATAATTACTGTAACCGTGTTACTCTCTCACTCGCT
TTGTCCTTCGCATCTTTTCTCCTCTTGTTCATCCTTACAGTCTTAACTGCCTCAGCTGCT
CGTCATTTCTGATTAACTTTCTTTACGTTTTCATATTATACATTTGCTTAAATTCTCATG
ATTTTTCAAGCTTTCTTATACTACTTACTATTATAAGATGAAAAATCAAAAGAAAGAAAT
TGTATCCTTCCGTGAAATGTTTGTCCTTGAGACTCTTGTTATTTGTTATGTTCAAGTCTC
GTCTTCATTTGGGACTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1DB45TF U 19
AF RS1DR40TF U 19
AF RS1DG63TF U 1
AF RS1C348TF U 267
AF RS1DB45JQ C 43
AF RS1DR40JQ C 82
BS 1 212 RS1DG63TF
BS 213 213 RS1DB45TF
BS 214 765 RS1DG63TF
BS 766 856 RS1DB45JQ
BS 857 859 RS1DR40JQ

RD RS1DB45TF 622 0 0
TTTCTCTTGTCTTGGCAAAGTTTTGGGATCTTACACAACAACAACCACAACAAACAACAA
CCATATATTTGTCTTATTTGTATCATTTGTCCCCCTGTGTTCTTTATCTTAAGGAAAGTA
AAATCTTGATTAATCTGAATAATGATGGGAGCAAATGATGGGAGAAGAACGCCTTTAATG
AATCTTGGGGTTCAAGTATCGATGAGAGTATTAGCCATTGGCACTGCATTGGCCTCCATG
GGGCTCACGATCATTAACCATGAAGTCGCCTCTGTTTATGGCATTAATTTTGAGGCTAAA
TACGACTACTCATCTGCCTTTAGGTATTTGGTGTACGCAGAAATAGCTATCGCCGGCATG
ACATTGTTTACGCTCGTATGGGCTTGCTTAGCTGTCCGTAGAAGAGGACTTGTTTTTGCA
CTCTTCTTCTTTGATTTGCTCACGACATTGACGGCTATATCGTCTTTCTCTGCGGCCATG
TCGGATGGTTACATCGGCAAGTATGGTAATACACACGCCGGTTGGCTACCGATATGCGGC
TACGTCCATAATTACTGTAACCGTGTTACTCTCTCACTCGCTTTGTCCTTCGCATCTTTT
CTCCTCTTGTTCATCCTTACAG

QA 1 622 1 622
DS 

RD RS1DR40TF 665 0 0
TTTCTCTTGTCTTGGCAAAGTTTTGGGATCTTACACAACAACAACCACAACAAACAACAA
CCATATATTTGTCTTATTTGTATCATTTGTCCCCTTGTGTTCTTTATCTTAAGGAAAGTA
AAATCTTGATTAATCTGAATAATGATGGGAGCAAATGATGGGAGAAGAACGCCTTTAATG
AATCTTGGGGTTCAAGTATCGATGAGAGTATTAGCCATTGGCACTGCATTGGCCTCCATG
GGGCTCACGATCACTAACCATGAAGTCGCCTCTGTTTATGGCATTAATTTTGAGGCTAAA
TACGACTACTCATCTGCCTTTAGGTATTTGGTGTACTCAGAAATAGCTATCGCCGGCATG
ACATTGTTTACGCTCGTATGGGCTTGTTTAGCTGTCCGTAGAAGAGGACTTGTTTTTGCA
CTCTTCTTCTTTGATTTGCTCACGACATTGACGGCTATATCGTCTTTCTCTGCGGCCATG
TCGGATGGTTACATCGGCAAGTATGGTAATACACACGCCGGTTGGCTACCGATATGCGGC
TACGTCCATAATTACTGTAACCGTGTTACTCTCTCACTCGCTTTGTCCTTCGCATCTTTT
CTCCTCTTGTTCATCCTTACAGTCTTAACTGCCTCAGCTGCTCGTCATTTCTGATTAACT
TTCTT

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1DG63TF 765 0 0
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AACCACAACAAACAACAACCATATATTTGTCTTATTTGTATCATTTGTCCCCTTGTGTTC
TTTATCTTAAGGAAAGTAAAATCTTGATTAATCTGAATAATGATGGGAGCAAATGATGGG
AGAAGAACGCCTTTAATGAATCTTGGGGTTCAGGTATCGATGAGAGTATTAGCCATTGGC
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ATAGCTATCGCCGGCATGACATTGTTTACGCTCGTATGGGCTTGTTTAGCTGTCCGTAGA
AGAGGACTTGTTTTTGCACTCTTCTTCTTTGATTTGCTCACGACATTGACGGCTATATCG
TCTTTCTCTGCGGCCATGTCGGATGGTTACATCGGCAAGTATGGTAATACACACGCCGGT
TGGCTACCGATATGCGGCTACGTCCATAATTACTGTAACCGTGTTACTCTCTCACTCGCT
TTGTCCTTCGCATCTTTTCTCCTCTTGTTCATCCTTACAGTCTTAACTGCCTCAGCTGCT
CGTCATTTCTGATTAACTTTCTTTACGTTTTCATATTATACATTTGCTTAAATTCTCATG
ATTTTTCAAGCTTTCTTATACTACTTACTATTATAAGATGAAAAA

QA 1 765 1 765
DS 

RD RS1C348TF 499 0 0
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CTCATCTGCCTTTAGGTATTTGGTGTACGCAGAAATAACTATCGCCGGCATGACATTGTT
TACGCTCGTATGGGCTTGTTTAGCTGTCCGTAGAAGAGGACTTGTTTTTGCACTCTTCTT
CTTTGATTTGCTCACGACATTGACGGCTATATCGTCTTTCTCTGCGGCCATGTCGGATGG
TTACATCGGCAAGTATGGTAATACACACGCCGGTTGGCTACCGATATGCGGCTACGTCCA
TAATTACTGTAACCGTGTTACTCTCTCACTCGCTTTGTCCTTCGCATCTTTTCTCCTCTT
GTTCATCCTTACAGTCTTAACTGCCTCAGCTGCTCGTCATTTCTGATTAACTTTCTTTAC
GTTTTCATATTATACATTTGCTTAAATTCTCATGATTTTTCAAGCTTTCTTATACTACTT
ACTATTATAAGATGAAAAA

QA 1 499 1 499
DS 

RD RS1DB45JQ 814 0 0
GGGATCTTACACAACAACAACCACAACAAACAACAACCATATATTTGTCTTATTTGTATC
ATTTGTCCCCCTGTGTTCTTTATCTTAAGGAAAGTAAAATCTTGATTAATCTGAATAATG
ATGGGAGCAAATGATGGGAGAAGAACGCCTTTAATGAATCTTGGGGTTCAAGTATCGATG
AGAGTATTAGCCATTGGCACTGCATTGGCCTCCATGGGGCTCACGATCATTAACCATGAA
GTCGCCTCTGTTTATGGCATTAATTTTGAGGCTAAATACGACTACTCATCTGCCTTTAGG
TATTTGGTGTACGCAGAAATAGCTATCGCCGGCATGACATTGTTTACGCTCGTATGGGCT
TGCTTAGCTGTCCGTAGAAGAGGACTTGTTTTTGCACTCTTCTTCTTTGATTTGCTCACG
ACATTGACGGCTATATCGTCTTTCTCTGCGGCCATGTCGGATGGTTACATCGGCAAGTAT
GGTAATACACACGCCGGTTGGCTACCGATATGCGGCTACGTCCATAATTACTGTAACCGT
GTTACTCTCTCACTCGCTTTGTCCTTCGCATCTTTTCTCCTCTTGTTCATCCTTACAGTC
TTAACTGCCTCAGCTGCTCGTCATTTCTGATTAACTTTCTTTACGTTTTCATATTATACA
TTTGCTTAAATTCTCATGATTTTTCAAGCTTTCTTATACTACTTACTATTATAAGATGAA
AAATCAAAAGAAAGAAATTGTATCCTTCCGTGAAATGTTTGTCCTTGAGACTCTTGTTAT
TTGTTATGTTCAAGTCTCGTCTTCATTTGGGACT

QA 1 814 1 814
DS 

RD RS1DR40JQ 778 0 0
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TCTTGATTAATCTGAATAATGATGGGAGCAAATGATGGGAGAAGAACGCCTTTAATGAAT
CTTGGGGTTCAAGTATCGATGAGAGTATTAGCCATTGGCACTGCATTGGCCTCCATGGGG
CTCACGATCACTAACCATGAAGTCGCCTCTGTTTATGGCATTAATTTTGAGGCTAAATAC
GACTACTCATCTGCCTTTAGGTATTTGGTGTACTCAGAAATAGCTATCGCCGGCATGACA
TTGTTTACGCTCGTATGGGCTTGTTTAGCTGTCCGTAGAAGAGGACTTGTTTTTGCACTC
TTCTTCTTTGATTTGCTCACGACATTGACGGCTATATCGTCTTTCTCTGCGGCCATGTCG
GATGGTTACATCGGCAAGTATGGTAATACACACGCCGGTTGGCTACCGATATGCGGCTAC
GTCCATAATTACTGTAACCGTGTTACTCTCTCACTCGCTTTGTCCTTCGCATCTTTTCTC
CTCTTGTTCATCCTTACAGTCTTAACTGCCTCAGCTGCTCGTCATTTCTGATTAACTTTC
TTTACGTTTTCATATTATACATTTGCTTAAATTCTCATGATTTTTCAAGCTTTCTTATAC
TACTTACTATTATAAGATGAAAAATCAAAAGAAAGAAATTGTATCCTTCCGTGAAATGTT
TGTCCTTGAGACTCTTGTTATTTGTTATGTTCAAGTCTCGTCTTCATTTGGGACTCTT

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 5

CO CL1323Contig1 625 5 10 U
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ACCGCCAAATATGATAATTAGTAGCTAAGTAGATGTTTTTTGTTTGGTTTTCAATAAAAC
TAAGATCGGTGTAGGCAATAGATGTCTACCTTTAGACCGACGTATGCAAATAATAACTTT
GTAAGCAATAAAGATAGACTGTATGCTCGCTTTTTATGTTTTACATAGAGAAGTAAGCA*
GACCCATTAAAGGGATTTTGAATAATTTTCTTCTTGTTTCTATATTAAATTAAATAAAAA
AATTATTCTTTATGATCAGAGTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1G944TF U 66
AF RS1B731TF U 457
AF RS1DM63TF U 1
AF RS1C383JQ C 57
AF RS1C383TF U 57
BS 1 186 RS1DM63TF
BS 187 189 RS1G944TF
BS 190 261 RS1DM63TF
BS 262 262 RS1C383TF
BS 263 333 RS1DM63TF
BS 334 335 RS1G944TF
BS 336 539 RS1DM63TF
BS 540 540 RS1C383TF
BS 541 601 RS1DM63TF
BS 602 625 RS1C383TF

RD RS1G944TF 339 0 0
G
GTAAAGGCCAGACAGTGTCCTCCACACAACAGTCAGAACTTAAGCAGACGCTCACTAAAT
GGGAACAAGTCACCACCCAGTTTGTGGAGACTGCTGTTTCTTCTAGTTCAGCTTCAGCTT
CATCTTCCACTCAGTCTCAGAAATCTCAGCAGTCTCAACAGTCCCTTCAGTCCCAACAGT
CTCAGCAGTCTCTGCAGTCAGTGCAGACACAGCAGGGCAGTACCCTGAAGGCTCAGACTC
AGACCAATTGAGATACACTAATGCGCCGCAAATCATCAAGAGAGACAAACTAGTACCGCC
AAATATGATAATTAGTAGCTAAGTAGATGTTTTTTGTT

QA 2 339 2 339
DS 

RD RS1B731TF 135 0 0
G
CGACGTATGCAAATAATAACTTTGTAAGCAATAAAGATAGACTGTATGCTCGCTTTTTAT
GTTTTACATAGAGAAGTAAGCAAGACCCATTAAAGGGATTTTGAATAATTTTCTTCTTGT
TTCTATATTAAATT

QA 2 135 2 135
DS 

RD RS1DM63TF 601 0 0
CCCAACAACAGTTGATGCAGACATTCGAAGAGCTAAAAGAAGTCAACAGTAAAATAGTGA
GTGAGAGTAAAGGCCAGACAGTGTCCTCCACACAACAGTCAGAACTTAAGCAGACGCTCA
CTAAATGGGAACAAGTCACCACCCAGTTTGTGGAGACTGCTGTTTCTTCTAGTTCAGCTT
CAGCTT***CTTCCACTCAGTCTCAGAAATCTCAGCAGTCTCAACAGTCCCTTCAGTCCC
AACAGTCTCAGCAGTCTCTGCAGTCAGTGCAGACACAGCAGGGCAGTACCCTGAAGGCTC
AGACTCAGACCAATTGAGATACACTAATGCGCC**AAATCATCAAGAGAGACAAACTAGT
ACCGCCAAATATGATAATTAGTAGCTAAGTAGATGTTTTTTGTTTGGTTTTCAATAAAAC
TAAGATCGGTGTAGGCAATAGATGTCTACCTTTAGACCGACGTATGCAAATAATAACTTT
GTAAGCAATAAAGATAGACTGTATGCTCGCTTTTTATGTTTTACATAGAGAAGTAAGCAA
GACCCATTAAAGGGATTTTGAATAATTTTCTTCTTGTTTCTATATTAAATTAAATAAAAA
A

QA 1 601 1 601
DS 

RD RS1C383JQ 569 0 0
GTGAGTGAGAGTAAAGGCCAGACAGTGTCCTCCACACAACAGTCAGAACTTAAGCAGACG
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GCA*GACCCATTAAAGGGATTTTGAATAATTTTCTTCTTGTTTCTATATTAAATTAAATA
AAAAAATTATTCTTTATGATCAGAGTTGT

QA 1 569 1 569
DS 

RD RS1C383TF 569 0 0
GTGAGTGAGAGTAAAGGCCAGACAGTGTCCTCCACACAACAGTCAGAACTTAAGCAGACG
CTCACTAAATGGGAACAAGTCACCACCCAGTTTGTGGAGACTGCTGTTTCTTCTAGTTCA
GCTTCAGCTTCATCTTCCACTCAGTCTCAGAAATCTCAGCAGTCTCAACAGTCCCTTCAG
TCCCAACAGTCTCAGCAGTCTCTGCGGTCAGTGCAGACACAGCAGGGCAGTACCCTGAAG
GCTCAGACTCAGACCAATTGAGATACACTAATGCGCCGCAAATCATCAAGAGAGACAAAC
TAGTACCGCCAAATATGATAATTAGTAGCTAAGTAGATGTTTTTTGTTTGGTTTTCAATA
AAACTAAGATCGGTGTAGGCAATAGATGTCTACCTTTAGACCGACGTATGCAAATAATAA
CTTTGTAAGCAATAAAGATAGACTGTATGCTCGCTTTTTATGTTTTACATAGAGAAGTAA
GCA*GACCCATTAAAGGGATTTTGAATAATTTTCTTCTTGTTTCTATATTAAATTAAATA
AAAAAATTATTCTTTATGATCAGAGTTGT

QA 1 569 1 569
DS 



AS 1 6

CO CL1324Contig1 694 6 3 U
GGACATCTCTTCTCGCCTCTTTTCCTTTAACAAACTATTTGAAATCTAATTTCAAATTCA
ACTATTTGAAATCTAATTTCAAATTGGTTGTTGAGGTAAAGTTGAGCTCTAGTTATGGCC
AAGATCGCCTTGTTGCTTTTCGTCATGGCCATTCTGGTCTCTCTCCACGCTAATGAAGCT
CACCACCGTAAGGGAGATCCAGCGCGTGAAAAAGACTTAACAGCCAAGAAAAAGAGCATT
CAAGGTTTGACATCTGAAGTGAAATCGTTGAGCAAATCTGAACAGGTGGTGAATAACATT
GAAAAAGATCACAATAAGAACAAAATGCTTTCAAAGAAAGATCACAAGAAGAAACTGGAC
TCAATGGCTTATGCACAGAAACTCAAAAAATTCCGCAGGGTTACCAAAATCAAGAGAGTA
CCTGCGAGAAAGAGGAAATCTGCATCCATAATCCAATCGATCTTGAAAGATTTTGGATTA
AACGGAGGGAGAAACTAACAAAAATAACAATTAGGGTTTGATTCATATTGATGACTTTAT
AAAGGAGGTTTGAACCTGGCCATGGATTTTAGCTTTACAAGTGAGTGGAGAAAATAATTT
CCCCATATTATGTTATTTACATCATATTGTAATTGATATAAGTTAATGAAATATTACTAC
TTATGATATCATAATATGTTTCTATGCAAAAAAA


BQ
10 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

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G
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TTTCTATGC

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TATGA
CAAAAAAAA

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CTGCGAGAAGGAGGAAATCTGCATCCATAATCCAATCGATCTTGAAAGATTTTGGATTAA
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AAGGAGGTTTGAACCTGGCCATGGATTTTAGCTTTACAAGTGAGTGGAGAAAATAATTTC
CCCATATTATGTTATTTACATCATATTGTAATTGATATAAGTTAATGAAATATTACTACT
TATGA
C

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CCATATTATGTTATTTACATCATATTGTAATTGATATAAGTTAATGAAATATTACTACTT
ATGA
TATC

QA 6 669 6 669
DS 



AS 1 4

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BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D537TF U 4
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AF RS1H788TF U 1
AF RS1D023JQ C 479
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BS 240 240 RS1H788TF
BS 241 254 RS1D023TF
BS 255 255 RS1H788TF
BS 256 326 RS1D023TF
BS 327 327 RS1H788TF
BS 328 329 RS1D023TF
BS 330 330 RS1H788TF
BS 331 332 RS1D023TF
BS 333 334 RS1H788TF
BS 335 341 RS1D023TF
BS 342 342 RS1H788TF
BS 343 359 RS1D023TF
BS 360 360 RS1H788TF
BS 361 389 RS1D023TF
BS 390 390 RS1H788TF
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BS 455 455 RS1H788TF
BS 456 643 RS1D023TF
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BS 658 1050 RS1D023JQ

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GG
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TTTTGTCGGAAAAATGGCTGACAAGAACAACATCGTCATCGTATTCGATTTCGACAAGAC
GATCATCGACGTGGATAGTGATAACTGGGTCGTCGATGAGCTTGGCTTCACCGAGTTGTT
CGAACAGCTTCTCCCCACAATGCCTTGGAACTCTCTCATGGATCGTATGATGAAAGAGCT
TCATGATCACGGTAAAACCATTGAAGAAATCAAACAAGTCTTGAGAAGTATCCCTATTCA
TCCTCGCGTCATCCCTGCCATTAAGTCTTCTCATGCCTTAGGGTGCGAGCTGAGAATAGT
GAGTGATGCCAACACGTTCTTCATCGAAACGATCGTTGAACATCTCGGGATTAGTGAGTA
TTTCTCAGAGATTAACACAAACCCTGGACATGTAGATGAACAAGGAAGGTTAAGAATCTC
TCCTTACCATGACTTCACCAAATCTTCACATGGTTGCTCTCGTTGCCCTCCTAACATGTG
CGAGAGTTTAATAATTGAGAGGATTCAAGCTTC
TTTT

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DS 

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AAGACGATCATCGACGTGGACAGTGATAACTGGGTCGTCGATGAGCTTGGCTTCACCGAG
TTGTTCGAACAGCTTCTCCCCACAATGCCTTGGAACTCTCTCATGGATCGGATGATGAAG
GAGCTTCATGATCATGGTAAAACCATTGAAGAAATCAAACAAGTCTTGAGAAGAATCCCT
ATTCATCCTCGTGTCATCCCTGCCATCAAATCCGCTCATGCTTTAGGGTGCGAGCTGAGG
ATAGTGAGTGATGCCAACACGTTCTTCATTGAAACGATCGTTGAACATCTCGGGATTAGT
GAGTATTTCTCAGAGATTAACACAAACCCTGGACTTGTAGATGAACAAGGAAGGTTAAGA
ATCTCTCCTTACCATGACTTCACCAAATCTTCACATGGTTGCTCTCGTTGCCCTCCTAAC
ATGTGCAAGAGTTTAATAATTGAGAGGATTCAAGCTTCCTTTACTAAAGAAGGAAAGAAG
ATGAAGATGGTCTATCTAGGAGATGGTGCTGGTGATTACTGTC

QA 1 643 1 643
DS 

RD RS1H788TF 657 0 0
GGAAT
ATAATAATCATACAGATACCTAACAAAGTTTAAGGTTTCTCACAAGAGTGTCTTTCTCTG
TTTTGTCGGAAAAATGGCTGACAAGAACAACATTGTCATCGTATTCGATTTCGACAAGAC
GATCATCGACGTGGATAGTGATAACTGGGTCGTCGATGAGCTTGGCTTCACCGAGTTGTT
CGAACAGCTTCTCCCCACAATGCCTTGGAACTCTCTCATGGATCGTATGATGAAAGAGCT
TCATGATCACGGTAAAACCATTGAAGAAATCAAACAAGTCTTGAGAAGGATCCCTATTCA
TCCTCGTGTCATCCCTGCCATTAAGTCTTCTCATGCCTTAGGGTGCGAGCTGAGAATAGT
GAGTGATGCCAACACGTTCTTCATCGAAACGATCGTTGAACATCTCGGGATTAGTGAGTA
TTTCTCAGAGATTAACACAAACCCTGGACATGTAGATGAACAAGGAAGGTTAAGAATCCC
TCCTTACCATGACTTCACCAAATCTTCACATGGTTGCTCTCGTTGCCCTCCTAACATGTG
CAAGAGTTTAATAATTGAGAGGATTCAAGCTTCTTTTACTAAAGAAGGAAAGAAGATGAA
GATGGTATATCTAGGAGATGGTGCTGGTGATTACTGTCCGAGTCTTCGACTC

QA 6 657 6 657
DS 

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ACATGTGCAAGAGTTTAATAATTGAGAGGATTCAAGCTTCCTTTACTAAAGAAGGAAAGA
AGATGAAGATGGTCTATCTAGGAGATGGTGCTGGTGATTACTGTCCTAGTCTTAGACTCA
AAGGTGAAGATTACATGATGCCAAGGAAGAACTTCCCGGTTTGGGATTTGATTAGTCAAA
ATCCCACCTTGGTTAAGGCCTCGGTTAGAGATTGGACCGATGGTGAAGCTATGGAGAGGA
TATTAATGGGAATTATCAACGAGATTATATCATCAGAAGTGGAAGAGAAAGAAAAGATGT
TGAGCTCTGACCAATATAAGATATCTGTTGGGATTGTTCATGAACCTTTGTTGCCTCTTT
CTCTTCCGGTTCCTCTACGTCTCGTGAAGTGATTGATGAAGAGAACAAAGAATCTAATAC
TTTGTTTTGAAATATATAATATTATTCTTCATGCAATCGAGAAAAAATGTATGAGAAGAT
ACCTAGAGTTGATTATAGTAATTCATGCACGT

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 6

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GGAACACAGCTTTGGGGCATTGGAAGCATCGAATCTTTACATGCACTTCAGAGAAAACTA
AAATCTTGTTCCTCAAAAAAAGACGACGAACATGGCGAAAAGCGGTGTAGATATGGAAGA
CATTAAGACAGTCGATCTCATGTCTGAGCTCCTCCGTCGCATGAAGTGTGCCTCTAAACC
TGACAAACGTCTCGTTTTCATCGGTCCACCTGGCTCAGGAAAAGGTACGCAGTCTCCGGT
CATAAAGGATGAGTTCTGCTTGTGTCATTTGTCCACTGGTGACATGCTTAGAGCTGCTGT
TGCTGCTAAGTCCCCTCTTGGTGTCAAGGCAAAGGAAGCTATGGACAAGGGAGAGCTTGT
TTCTGATGACTTGGTTGTTGGTATCATGGATGAAGCAATGAACAGACCCAAATGTCAGAA
AGGTTTCATTCTTGATGGCTTCCCTAGGACCGTAACACAAGCTGAGAAGCTTGATGAGAT
GCTTAATAGAAGAGGAGCTCAGATTGACAAAGTGCTTAATTTTGCAATCGATGATTCGGT
TCTTGAAGAAAGAATTACTGGAAGGTGGATTCACCCTTCAAGTGGAAGGAGCTATCATAC
CAAATTCGCACCTCCTAAAGTTCCTGGAGTCGATGATGTGACTGGAGAGCCATTGATTCA
ACGTAAAGATGACAATGCGGATGTTCTTAGGTCAAGGCTGGATGCATTCCACAAGCAGAC
GCAACCGGTAATTGACTACTACGCGAAGAAGGGGAATTTGGTGAACATACCAGCAGAGAA
GGCTCCTGAAGAGGTTACCAAAGTGGTGAAGAAGGTTGTGTTTACATGAAAACTGTAATA
AATTTGGCATGAAAATTGAGTTCTAAAATCTCTCTTTATACCTTCTTTTGTTTTCTTTTT
GAATAAATCTCCTGAGGCTTTTGTTATCCTGGAATGTCTGTGCTTGAGAGCAAACATTTT
GCTGCAGCTTTTGTTGCAGTGTTTTCACTAAGGCCAATGTTTGTTACTGTTTAATGAGTA
AAACGAAAAAAAAATGTAAAATGATATGAGTTTTGTAATTGTGAGATACCCCAAAGCGTC
TTTCG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1GY13TF U 1
AF RS1FQ45TF U 4
AF RS1EZ21TF U 39
AF RS1FF56JQ C 257
AF RS1GY13JQ C 503
AF RS1EZ21JQ C 352
BS 1 139 RS1GY13TF
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BS 1006 1085 RS1EZ21JQ

RD RS1GY13TF 686 0 0
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AAATCTTGTTCCTCAAAAAAAGACGACGAACATGGCGAAAAGCGGTGTAGATATGGAAGA
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TGACAAACGTCTCGTTTTCATCGGTCCACCTGGCTCAGGAAAAGGTACGCAGTCTCCGGT
CATAAAGGATGAGTTCTGCTTGTGTCATTTGTCCACTGGTGACATGCTTAGAGCTGCTGT
TGCTGCTAAGTCCCCTCTTGGTGTCAAGGCAAAGGAAGCTATGGACAAGGGAGAGCTTGT
TTCTGATGACTTGGTTGTTGGTATCATGGATGAAGCAATGAACAGACCCAAATGTCAGAA
AGGTTTCATTCTTGATGGCTTCCCTAGGACCGTAACACAAGCTGAGAAGCTTGATGAGAT
GCTTAATAGAAGAGGAGCTCAGATTGACAAAGTGCTTAATTTTGCAATCGATGATTCGGT
TCTTGAAGAAAGAATTACTGGAAGGTGGATTCACCCTTCAAGTGGAAAGAGCTATCATAC
CAAATTCGCACCTCCTAAAGTTCCTGGAGTCGATGATGTGACTGGAGAGCCATTGATTCA
ACGTAAAGATGACAATGCGGATGTTC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1FQ45TF 683 0 0
GG
ACAGCTTTGGGGCATTGGAAGCATCGAATCTTTACATGCACTTCAGAGAAAACTAAAATC
TTGTTCCTCAAAAAAAGACGACGAACATGGCGAAAAGCGGTGTAGATATGGAAGACATTA
AGACAGTCGATCTCATGTCTGAGCTCCTCCGTCGCATGAAGTGTGCCTCTAAACCTGACA
AACGTTTCGTTTTCATCGGTCCACCTGGCTCAGGAAAAGGTACGCAGTCTCCGGTCATAA
AGGATGAGTTCTGCTTGTGTCATTTGTCCACTGGTGACATGCTTAGAGCTGCTGTTGCTG
CTAAGTCCCCTCTTGGTGTCAAGGCAAAGGAAGCTATGGACAAGGGAGAGCTTGTTTCTG
ATGACTTGGTTGTTGGTATCATGGATGAAGCAATGAACAGACCCAAATGTCAGAAAGGTT
TCATTCTTGATGGCTTCCCTAGGACCGTAACACAAGCTGAGAAGCTTGATGAGATGCTTA
ATAGAAGAGGAGCTCAGATTGACAAAGTGCTTAATTTTGCAATCGATGATTCGGTTCTTG
AAGAAAGAATTACTGGAAGGTGGATTCACCCTTCAAGTGGAGGGAGCTATCATACCAAAT
TCGCACCTCCTAAAGTTCCTGGAGTCGATGATGTGACTGGAGAGCCATTGATTCAACGTA
AAGATGACAATGCGAATGTTC

QA 3 683 3 683
DS 

RD RS1EZ21TF 648 0 0
GG
ATGCACTTCAGAGAAAACTAAAATCTTGTTCCTCAAAAAAAGACGACGAACATGGCGAAA
AGCGGTGTAGATATGGAAGACATTAAGACAGTCGATCTCATGTCTGAGCTCCTCCGTCGC
ATGAAGTGTGCCTCTAAACCTGACAAACTTCTCGTTTTCATCGGTCCACCTGGCTCAGGA
AAAGGTACGCAGTCTCCGGTCATAAAGGATGAGTTCTGCTTGTGTCATTTGTCCACTGGT
GACATGCTTAGAGCTGCTGTTGCTGCTAAGTCCCCTCTTGGTGTCAAGGCAAAGGAAGCT
ATGGACAAGGGAGAGCTTGTTTCTGATGACTTGGTTGTTGGTATCATGGATGAAGCATTG
AACAGACCCAAATGTCAGAAAGGTTTCATTCTTGATGGCTTCCCTAGGACCGTAACACAA
GCTGAGAAGCTTGATGAGATGCTTAATAGAAGAGGAGCTCAGATTGACAAAGTGCTTAAT
TTTGCAATCGATGATTCGGTTCTTGAAGAAAGAATTACTGGAAGGTGGATTCACCCTTCA
AGTGGAAGGAGCTATCATACCAAATTCGCACCTCCTAAAGTTCCTGGAGTCGATGATGTG
ACTGGAGAGCCATTGATTCAACGTAAAGATGACAATGCGGATGTTC

QA 3 648 3 648
DS 

RD RS1FF56JQ 756 0 0
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CTTGGTGTCAAGGCAAAGGAAGCTATGGACAAGGGAGAGCTTGTTTCTGATGACTTGGTT
GTTGGTATCATGGATGAAGCAATGAACAGACCCAAATGTCAGAAAGGTTTCATTCTTGAT
GGCTTCCCTAGGACCGTAACACAAGCTGAGAATCTTGATGAGATGCTTAATAGAAGAGGA
GCTCAGATTGACAAAGTGCTTAATTTTGCAATCGATGATTCGGTTCTTGAAGAAAGAATT
ACTGGAAGGTGGATTCACCCTTCAAGTGGAAGGAGCTATCATACCAAATTCGCACCTCCT
AAAGTTCCTGGAGTCGATGATGTGACTGGAGAGCCATTGATTCAACGTAAAGATGACAAT
GCGGATGTTTTTAGGTCAAGGCTGGATGCATTCCACAAGCAGACGCAACCGGTAATTGAC
TACTACGCGAAGAAGGGGAATTTGGTGAACATACCAGCAGAGAAGGCTCCTGAAGAGGTT
ACCAAAGTGGTGAAGAAGGTTGTGTTTACATGAAAACTGTAATAAATTTGGCATGAAAAT
TGAGTTTTAAAATCTCTCTTTATACCTTCTTTTGTTTTCTTTTTGAATAAATCTCCTGAG
GCTTTTGTTACCCTGGAATGTCTGTGCTTGAGAGCAAACATTTTGCTGCAGCTTTTGTTG
CAGTGTTTTCACTAAGGCCAATGTTTGTT
ACTGTTT

QA 1 749 1 749
DS 

RD RS1GY13JQ 503 0 0
ATTGACAAAGTGCTTAATTTTGCAATCGATGATTCGGTTCTTGAAGAAAGAATTACTGGA
AGGTGGATTCACCCTTCAAGTGGAAGGAGCTATCATACCAAATTCGCACCTCCTAAAGTT
CCTGGAGTCGATGATGTGACTGGAGAGCCATTGATTCAACGTAAAGATGACAATGCGGAT
GTTCTTAGGTCAAGGCTGGATGCATTCCACAAGCAGACGCAACCGGTAATTGACTACTAC
GCGAAGAAGGGGAATCTGGTGAACATACCAGCAGAGAAGGCTCCTGAAGAGGTTACCAAA
GTGGTGAAGAAGGTTGTGTTTACATGAAAACTGTAATAAATTTGGCATGAAAATTGAGTT
CTAAAATCTCTCTTTATACCTTCTTTTGTTTTCTTTTTGAATAAATCTCCTGAGGCTTTT
GTTATCCTGGAATGTCTGTGCTTGAGAGCAAACATTTTGCTGCAGCTTTTGTTGCAGTGT
TTTCACTAAGGCCAATGTTTGTT

QA 1 503 1 503
DS 

RD RS1EZ21JQ 734 0 0
AGAGCTTGTTTCTGATGACTTGGTTGTTGGTATCATGGATGAAGCATTGAACAGACCCAA
ATGTCAGAAAGGTTTCATTCTTGATGGCTTCCCTAGGACCGTAACACAAGCTGAGAAGCT
TGATGAGATGCTTAATAGAAGAGGAGCTCAGATTGACAAAGTGCTTAATTTTGCAATCGA
TGATTCGGTTCTTGAAGAAAGAATTACTGGAAGGTGGATTCACCCTTCAAGTGGAAGGAG
CTATCATACCAAATTCGCACCTCCTAAAGTTCCTGGAGTCGATGATGTGACTGGAGAGCC
ATTGATTCAACGTAAAGATGACAATGCGGATGTTTTTAGGTCAAGGCTGGATGCATTCCA
CAAGCAGACGCAACCGGTAATTTACTACTACGCGAAGAAGGGGAATTTGGTGAACATACC
AGCAGAGAAGGCTCCTGAAGAGGTTACCAAAGTGGTGAAGAAGGTTGTGTTTACATGAAA
ACTGTAATAAATTTGGCATGAAAATTGAGTTCTAAAATCTCTCTTTATACCTTCTTTTGT
TTTCTTTTTGAATAAATCTCCTGAGGCTTTTGTTATCCTGGAATGTCTGTGCTTGAGAGC
AAACATTTTGCTGCAGCTTTTGTTGCAGTGTTTTCACTAAGGCCAATGTTTGTTACTGTT
TAATGAGTAAAACGAAAAAAAAATGTAAAATGATATGAGTTTTGTAATTGTGAGATACCC
CAAAGCGTCTTTCG

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 6

CO CL1327Contig1 812 6 17 U
GATCGTGGAACGTGGAGCTCACATAACTAAACAAGATCCGATCTAACCCCCGGTTCTCGT
CGGAATCTCTTCACGGTTAACCGGCGTTCCTCATCCACCTTTCGTTGTCATGGAAGACGT
CAAGGGAAAGGAGCTTGTTGATGATACTCCACCTCCTGTTGACCAAAATGATAACAAGAA
TGAAACTGAGATTCATAAACAGCCATCATCTGAGTCCGAGGAAAATGCGATCAAGAAAAA
GTATGGAGGATTGTTGCCAAAGAAGATTCCTTTGATATCCAAGGATCATGAGCGCGCGTT
TTTTGACTCTGCTGATTGGGCATTAGGCAAGCAAAAAGGACAAAAGCCTAAAGGGCCTTT
GGAAGCTCTCCGACCAAAACTGCAGCCAACCCCGCACCAGCAGCCTAGAGCTAGACGGAT
GGCTTTATCTTCAGGCGACAACACTGAAGACGCTGAGGCTGACACCAACGAACCCCTCGA
TGACCAAGCTAGCGCATCAGCTGCTGACAACGCCAAGGATGTTGGAGGAGGCATCGATGC
TGCTGACGCCGCGAAAGACAACGTCAAGTCATGAACAAAAACATATCACAAGTCAATTTT
ACAGAAGAATAAGCGACCAGGTTTGCTGCTATGCAAACGGTCGTAGTAATATCGAGTCTC
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT**TTACATTATATTCCATACATACTTGGGCACC
AGCAAATCTGTATCACCACCATACAAGACCTAGTAATTGTTTGAAACTTCTATTTGACGA
TTTGCAAAATGGTTTGCTTTTAATGATCCATT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 10 10 10 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DV15TF U 1
AF RS1CH46TF U 3
AF RS1DV15JQ C 103
AF RS1FO74JQ C 155
AF RS1FO74TF U 155
AF RS1CH46JQ C 67
BS 1 83 RS1DV15TF
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BS 771 778 RS1CH46TF
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RD RS1DV15TF 771 0 0
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TGCTGACGCCGCGAAAGATAACGTCAAGTCATGAACAAAAACATATCACAAGTCAATTTT
ACAGAAGAATAAGCGACCAGGTTTGCTGCTATGCAAACGGTCGTAGTAATATCGAGTCTC
TCTCTCTCTCTCTCTCTC******TCT**TTACATTATAT*CCATACATACTTGGGCACC
AGCAAATCTGTATCACC*CCATACA*GACCTAGTAATTGTTTGAAACTTC
C

QA 1 770 1 770
DS 

RD RS1CH46TF 776 0 0
GG
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GGAGGATTGTCGCCAAAGAAGATTCCTTTGATATCCAAGGATCATGAGCGCGCGTTTTTT
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GACGCCGCGAAAGACAACGTCAAGTCATGAACAAAAACATATCACAAGTCAATTTTACAG
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TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT**TTACATTATATTCCATACATACTTGGGCACCAGCA
AATCTGTATCACCACCATACAAGACCTAGTAATTGTTTGAA*CTTCTATTTGAC

QA 3 776 3 776
DS 

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GAAACTTC
C

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G
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CAAAAACATATCACAAGTCAATTTTACAGAAGAATAAGCGACCAGGTTTGCTGCTATGCA
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TATATTCCATACATACTTGGGCACCAGCAAATCTGTATCACCACCATACAAGACCTAGTA
ATTGTTTGAAACTTCTATTTGAC
G

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DS 

RD RS1FO74TF 625 0 0
G
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CCGAGGAAAATGCGATCAAGAAAAAGTATGGAGGATTGTTGCCAAAGAAGATTCCTTTGA
TATCCAAGGATCATGAGCGCGCGTTTTTTGACTCTGCTGATTGGGCATTAGGCAAGCAAA
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AGGCTGACACCAACGAACCCCTCGATGACCAAGCTAGCGCATCAGCTGCTGACAACGCCA
AGGATGTTGGAGGAGGCATCGATGCTGCTGACGCCGCGAAAGACAACGTCAAGTCATGAA
CAAAAACATATCACAAGTCAATTTTACAGAAGAATAAGCGACCAGGTTTGCTGCTATGCA
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TATATTCCATACATACTTGGGCACCAGCAAATCTGTATCACCACCATACAAGACCTAGTA
ATTGTTTGAAACTTCTATTTGAC
G

QA 2 624 2 624
DS 

RD RS1CH46JQ 746 0 0
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AAAGGAGCTTGTTGATGATACTCCACCTCCTGTTGACCAAAATGATAACAAGAATGAAAC
TGAGATTCATAAACAGCCATCATCTGAGTCCGAGGAAAATGCGATCAAGAAAAAGTATGG
AGGATTGTCGCCAAAGAAGATTCCTTTGATATCCAAGGATCATGAGCGCGCGTTTTTTGA
CTCTGCTGATTGGGCATTAGGCAAGCAAAAAGGACAAAAGCCTAAAGGGCCTTTGGAAGC
TCTCCGACCAAAACTGCAGCCAACCCCGCACCAGCAGCCTAGAGCTAGACGGATGGCTTT
ATCTTCAGGCGACAACACTGAAGACGCTGAGGCTGACACCAACGAACCCCTCGATGACCA
AGCTAGCGCATCAGCTGCTGACAACGCCAAGGATGTTGGAGGAGGCATCGATGCTGCTGA
CGCCGCGAAAGACAACGTCAAGTCATGAACAAAAACATATCACAAGTCAATTTTACAGAA
GAATAAGCGACCAGGTTTGCTGCTATGCAAACGGTCGTAGTAATATCGAGTCTCTCTCTC
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT**TTACATTATATTCCATACATACTTGGGCACCAGCAAA
TCTGTATCACCACCATACAAGACCTAGTAATTGTTTGAAACTTCTATTTGACGATTTGCA
AAATGGTTTGCTTTTAATGATCCATT

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 6

CO CL1328Contig1 780 6 16 U
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ATTACTTTCTTTTAATATTTTATTATAATAATTTAAGTGTCATCTTACCAACACTATAAT
TTAATCAGTGCAAACACATGATGATTGTTCAGAATTAAGATCTACGTGGTAACATGTTAG
AGATAACAAGAGCAATACCACAAAGCTTCTTGATTCCCTTACTGTTATTCACAACAGAAG
TATCTACAGATCTCAATCTCTTCACATTATCTAGACATGTATCAGCTCCATCCAATGCAG
CTGAAACTTTGATGTTCATCCCGAAGCCATCCCCGGAAGCCAAATTCTCAAAAGCTTCAT
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AATTGAGGAATTTAAGACAGAAAGCTCGGTCCAAAGTTTTGTCACAGATTGTTCTCATCT
CTGAGCTTGTGATTGCGTAGGAGGAACCAATCAAGAGAAGCAACATGAGAGAAGACAAGA
AAGCATTGTTCCTGAGATTCGCAGCCATTCTTGTTTCTCTACTTTCTATTTTTTTTCCTA
GTTTATGATCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1DD91TF C 1
AF RS1DD91JQ U 7
AF RS1A293JQ U 80
AF RS1A293TF C 80
AF RS1A293TR U 80
AF RS1A293TV C 80
BS 1 9 RS1DD91TF
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BS 158 158 RS1A293JQ
BS 159 178 RS1DD91JQ
BS 179 179 RS1A293JQ
BS 180 467 RS1DD91JQ
BS 468 468 RS1A293JQ
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BS 513 513 RS1A293JQ
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BS 620 620 RS1A293JQ
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ATTACTTTCTTTTAATATTTTATTATAATAATTTAAGTGTCATCTTACCAACACTATAAT
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TATCTACAGATCTCAATCTCTTCACATTATCTAGACATGTATCAGCTCCATCCAATGCAG
CTGAAACTTTGATGTTCATCCCGAAGCCATCCCCGGAAGCCAAATTCTCAAAAGCTTCAT
CGAGGTTTTCCATGGTGTTCTCGTATTCATCCATGCATGATCTGTAAGCTAATTTGGATC
GTGGGTCAACTCCTCCATCGATAATAGATTGAAGTCTTTTGAATGTTTGTGTTGCTCTTG
CTTGTGTGGCATCAAGTGTGGTTTTTGCCAAGGCTTGAATATTAGGAGATGCGGATTTCG
AATTGAGGAATTTAAGACAGAAAGCTCGGTCCAAAGTTTTGTCACAGATTGTTCTCATCT
CTGAGCTTGTGATTGCGTATGAGGAACCAATCAAGAGAAGCAACATGAGAGAAGACAAGA
AAGCATTGTTCCTGAGATTCGCAGCCATTCTTGTTTCTCTACTTTCTATTTCTTTTCCTA
GTTTATGAT
AGGATCC

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DS 

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GGG
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TTTTAATATTTTATTATAATAATTTAAGTGTCATCTTACCAACACTATAATTTAATCAGT
GCAAACACATGATGATTGTTCAGAATTAGGATCTACGTGGTAACATGTTCGAGATAACAA
GAGCAATACCACAAAGCTTCTTGATTCCCTTACTGTTATTCACAACAGAAGTATCTACAG
ATCTCAATCTCTTCACATTATCTAGACATGTATCAGCTCCATCCAATGCAGCTGAAACTT
TGATGTTCATCCCGAAGCCATCCCCGGAAGCCAAATTCTCAAAAGCTTCATCGAGGTTTT
CCATGGTGTTCTCGTATTCATCCATGCATGATCTGTAAGCTAATTTGGATCGTGGGTCAA
CTCCTCCATCGATAATAGATTGAAGTCTTTTGAATGTTTGTGTTGCTCTTGCTTGTGTGG
CATCAAGTGTGGTTTTTGCCAAGGCTTGAATATTAGGAGATGCGGATTTCGAATTGAGGA
ATTTAAGACAGAAAGCTCGGTCCAAAGTTTTGTCACAGATTGTTCTCATCTCTGAGCTTG
TGATTGCGTATGAGGAACCAATCAAGAGAAGCAACATGAGAGAAGACAAGAAAGCATTGT
TCCTGAGATTCGCAGCCATTCTTGTTTCTCTACTTTCTATTTCTTTTCCTAGTTTATGAT
AGGATCC

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CCCGAAGCCATCCCCGGAAGCCAAATTCTCAAAAGCTTCATCGAGGTTTTCCATGGTGTT
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GAAAGCTCGGTCCAAAGTTTTGTCACAGATTGTTCTCATCTCTGAGCTTGTGATTGCGTA
GGAGGAACCAATCAAGAGAAGCAACATGAGAGAAGACAAGAAAGCATTGTTCCTGAGATT
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GGTTTTTGCCAAGACTTGAATATTAGGAGATGCGGATTTCGAATTGAGGAATTTAAGACA
GAAAGCTCGGTCCAAAGTTTTGTCACAGATTGTTCTCATCTCTGAGCTTGTGATTGCGTA
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CCCGAAGCCATCCCCGGAAGCCAAATTCTCAAAAGCTTCATCGAGGTTTTCCATGGTGTT
CTCGTATTCATCCATGCATGATCTGTAAGCTAATTTGGATCGTGGGTCAACTCCTCCATC
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GGTTTTTGCCAAGACTTGAATATTAGGAGATGCGGATTTCGAATTGAGGAATTTAAGACA
GAAAGCTCGGTCCAAAGTTTTGTCACAGATTGTTCTCATCTCTGAGCTTGTGATTGCGTA
GGAGGAACCAATCAAGAGAAGCAACATGAGAGAAGACAAGAAAGCATTGTTCCTGAGATT
CGCAGCCATTCTTGTTTCTCTACTTTCTATTTTTTTTCCTAGTTTATGATCC

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DS 

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GATGATTGTTCAGAATTAAGATCTACGTGGTAACATGTTAGAGATAACAAGAGCAATACC
ACAAAGCTTCTTGATTCCCTTACTGTTATTCACAACAGAAGTATCTACAGATCTCAATCT
CTTCACATTATCTAGACATGTATCAGCTCCATCCAATGCAGCTGAAACTTTGATGTTCAT
CCCGAAGCCATCCCCGGAAGCCAAATTCTCAAAAGCTTCATCGAGGTTTTCCATGGTGTT
CTCGTATTCATCCATGCATGATCTGTAAGCTAATTTGGATCGTGGGTCAACTCCTCCATC
GATAATAGATTGAAGTCTTTTGAATGTTCGTGTTGCTCTTGCTTGTGTGGCATCAAGTGT
GGTTTTTGCCAAGACTTGAATATTAGGAGATGCGGATTTCGAATTGAGGAATTTAAGACA
GAAAGCTCGGTCCAAAGTTTTGTCACAGATTGTTCTCATCTCTGAGCTTGTGATTGCGTA
GGAGGAACCAATCAAGAGAAGCAACATGAGAGAAGACAAGAAAGCATTGTTCCTGAGATT
CGCAGCCATTCTTGTTTCTCTACTTTCTATTTTTTTTCCTAGTTTATGATCCCCCGGCCG
TAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 6

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CACCAAATCTTAATATGATTATGAAAGACAATTTTTTAATTACATTTTGTGTGCATCATG
AATACAAGAAATTACATAATATGTAGTATCGTCAGTAGGCTACAAACCTGATCGATATAT
TTACAAACAGATTAAAAACTGTTAAGAGTTTTCGATTATATTAACAAATATATATACGAG
GAAAGCTAACAGTTGAATTTATAGCGGTACTAGCAGTTCCCTGGTCGACTATACTTTGGA
GGCAGAGATGGACACTGTTCATTCATATGCGTATAAGGTTCCATAGTGTTGTAACCAGGA
AGTTCCATTCTATATTTCCCTAGTATCTGACAGTAAGGAAGCTTCACATTGTCATTGTCA
TTGCACCATTTTGGAAGACGACTTGCATTGTTCTCGAAGAAGTTTAGCATGTAAGCATCT
TTGAGCGTGAACTCTGTGACTTGAATAGAACTAGCCAATGAGCCGAATAGGCCAGCTTCT
TTGTACATTTCAAGGATGAAAGCAATGCACGAGGTTGATTTGCCATCGCTGTAGATCCAG
TCGTCTTGTTCGGGTACAGTCAGTAACTTGTCAAAAGAAGATCCACGCTTCTCTACTTCT
ACCAGTACATCTGAAAGACCAAGACCCTCTGTTCCAAGCCGCTTGTTCAAGGCTTCATTC
CACATATTAGCTGCATACTCAGGCTGCAATTTGTTCCAAACAGTCATGAAAGAAGCAACA
AGATGAGCATCTATAGGAGGAGGGTAGTTTGCAGTAACGGTATCGATCCAGGCAAAAATC
AAGTTGTGATAACCATATGGTTTATTCTCCATGCTCCGAGCATATTCCCACGCAGCAGTA
ACGTTGAACTTAGCACGAACATCAGGATGCAAAGGTAAGAATGCAATCTGAGGATTCGAG
TCATCTTTCTTTTGTTCAAACTCCCACCACTCCTCCCATGGTAAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FM79JQ U 251
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AF RS1FM79TF C 323
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BS 862 949 RS1B887TF

RD RS1FM79JQ 282 0 0
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TATATTTCCCTAGTATCTGACAGTAAGGAAGCTTCACATTGTCATTGTCATTGCACCATT
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ACTCTGTGACTTGAATAGAACTAGCCAATGAGCCGAATAGGCCAGCTTCTTTGTACGTTT
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QA 1 282 1 282
DS 

RD RS1CW89JQ 764 0 0
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AGATGAGCATCTATAGGAGGAGGGTAGTTTGCAGTAACGGTATC

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1B887JQ 760 0 0
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TACATAATATGTAGTATCGTCAGTAGGCTACAAACCTGATCGATATATTTACAAACAGAT
TAAAAACTGTTAAGAGTTTTCGATTATATTAACAAATATATATACGAGGAAAGCTAACAG
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CACTGTTCATTCATATGCGTATAAGGTTCCATAGTGTTGTAACCAGGAAGTTCCATTCTA
TATTTCCCTAGTATCTGGCAGTAAGGAAGCTTCACATTGTCATTGTCATTGCACCATTTT
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TCTGTGACTTGAATAGAACTAGCCAATGAGCCGAATAGGGCAGCTTCTTTGTACATTTCA
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GGTACAGTCAGTAACTTGTCAAAAGAAGATCCACGCTTCTCTACTTCTACCAGTACATCT
GAAAGACCAAGACCCTCTGTTCCAAGCCGCTTGTTCAAGGCTTCATTCCACATATTAGCT
GCATACTCAGGCTGCAATTTGTTCCAAACAGTCATGAAAGAAGCAACAAGATGAGCATCT
ATAGGAGGAGGGTAGTTTGCAGTAACGGTATCGATCCAG
C

QA 1 759 1 759
DS 

RD RS1CV73JQ 838 0 0
GGAAGAAATC
TTTTAATTACATTTTGGGGGCATCATGAATACAAGAAATTACATAATATGTAGTATCGTC
AGTAGGCTACAAACCTGATCGATATATTTACAAACAGATTAAAAACTGTTAAGAGTTTTC
GATTATATTAACAAATATATATACGAGGAAAGCTAACAGTTGAATTTATAGCGGTACTAG
AAGTTCCCTGGTCGGTTATACTTTGGAGGCAGAGATGGACACTGTTCATTCATATGAGTA
TAAGGTTCCATAGTGTTGTAACCAGGAAGTTCCATTCTATATTTCCCTAGTATCTGACAG
TAAGGAAGCTTCACATTGTCATTGTCATTGCACCATTTTGGAAGATGGCTTGCATTGTTC
TCGAAGAAGTTTAGCATGTAAGCATCTTTCAGCGTGAACTCTGTGACTTGAATAGAATTA
GCCAATGAGCCGAATAGGCCAGCTTCTTTGTACATTTCGAGTATGAAAGCGATGCACGAG
GTTGATTTACCATCGCTGTAGATCCAGTCGTCTTGTTCGGGTACAGTCAGTAACTTGTCA
AAAGAAGATCCACGTTTCTCTACTTCTACCAGTACATCTGAAAGACCAAGACCCTCTGTT
CCGAGACGCTTGTTCAAGGCTTCATTCCACATATTAGCAGCATACTCAGGCTGCAATTTG
TTCCAAACAGTCATGAAAGAGGCAACAAGATGAGCATCTATAGGAGGAGGGTAGTTTGCA
GTAACGGTATCGATCCAGGCAAAAATCAAGTTGTGATAACCATATGGTTTATTCTCCATG
CTGCGAGTATATTCCCACGCAGCAGTAACGTTGAACTTAACACGAACA

QA 11 838 11 838
DS 

RD RS1B887TF 756 0 0
TGAATTTATAGCGGTACTAGCAGTTCCCTGGTCGACTATACTTTGGAGGCAGAGATGGAC
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ATTTCCCTAGTATCTGGCAGTAAGGAAGCTTCACATTGTCATTGTCATTGCACCATTTTG
GAAGACGACTTGCATTGTTCTCGAAGAAGTTTAGCATGTAAGCATCTTTGAGCGTGAACT
CTGTGACTTGAATAGAACTAGCCAATGAGCCGAATAGGCCAGCTTCTTTGTACATTTCAA
GGATGAAAGCAATGCACGAGGTTGATTTGCCATCGCTGTAGATCCAGTCGTCTTGTTCGG
GTACAGTCAGTAACTTGTCAAAAGAAGATCCACGCTTCTCTACTTCTACCAGTACATCTG
AAAGACCAAGACCCTCTGTTCCAAGCCGCTTGTTCAAGGCTTCATTCCACATATTAGCTG
CATACTCAGGCTGCAATTTGTTCCAAACAGTCATGAAAGAAGCAACAAGATGAGCATCTA
TAGGAGGAGGGTAGTTTGCAGTAACGGTATCGATCCAGGCAAAAATCAAGTTGTGATAAC
CATATGGTTTATTCTCCATGCTCCGAGCATATTCCCACGCAGCAGTAACGTTGAACTTAG
CACGAACATCAGGATGCAAAGGTAAGAATGCAATCTGAGGATTCGAGTCATCTTTCTTTT
GTTCAAACTCCCACCACTCCTCCCATGGTAAGATCC

QA 1 756 1 756
DS 

RD RS1FM79TF 581 0 0
GTATCTGACAGTAAGGAAGCTTCACATTGTCATTGTCATTGCACCATTTTGGAAGACGAC
TTGCATTGTTCTCGAAGAAGTTTAGCATGTAAGCATCTTTGAGCGTGAACTCTGTGACTT
GAATAGAACTAGCCAATGAGCCGAATAGGCCAGCTTCTTTGTACGTTTCAAGGATGAAAG
CAATGCACGAGGTTGATTTGCCATCGCTGTAGATCCAGTCGTCTTGTTCGGGTACAGTCA
GTAACTTGTCAAAAGAAGATCCACGCTTCTCTACTTCTACCAGTACATCTGAAAGACCAA
GACCCTCTGTTCCAAGCCGCTTGTTCAAGGCTTCATTCCACATATTAGCTGCATACTCAG
GCTGCAATTTGTTCCAAACAGTCATGAAAGAAGCAACAAGATGAGCATCTATAGGAGGAG
GGTAGTTTGCAGTAACGGTATCGATCCAGGCAAAAATCAAGTTGTGGTAACCATATGGTT
TATTCTCCATGCTCCGAGCATATTCCTACGCAGCAGTAACGTTGAACTTAGCACGAACAT
CAGGATGCAAAGGTAAGAATGCAATCTGAGGATTCGAGTC
C

QA 1 580 1 580
DS 



AS 1 5

CO CL1330Contig1 790 5 11 U
GGACGGCCGTCGAAAAAAAAAA*GTCGATCGCTCTCTCTCTCTC**AAGGTTTAGGGTTT
TTGCTTCTAACTGCCATTCTCCATGGAAGAGAAAAAA*CGTAAGAGGAAGAAACGCAAAG
ATGCTAGAGCTGGAACGACCTCAGAGCCAGTGGGATCTGAAGATCCAGCGGAATCTGTAA
ACCGCAAGAAGAAAAAGGCACGTTATTCATCTCGTAAGTGGCTTACCAGCAGTTCCGAAT
CCGAATACGAAGCTGTATCTCATCCCACGCAAGTTGCTGTTCGAAATCTTCCTCAAAATC
TCCCCGAAGATGAGTTGATAGATGAGTTGGCTAATTTTTTT*GATGTCGAGCCTGAGCAA
GTTCATCCTCGTAAATTCAAAACGGAGCCCGGTGTCTATGAAAAACAAAGCGTGGTCGCT
TTTGCTTCTGAGGCAGAAGCAAAAGAGGCTCTTAAATTGTGTGGAAAACCATTTGGCGGA
AAAGCAATTTACATTAAGCCGAATGGAAACAGTCGAGCGATAGTGCGCGTGAGTGGGTTC
AGCAACCAATTGACTGTAGAAGATACCGAGACACAACTTCGCATGAATTTCGAGACACGT
GGAGAAGTACTTCATGTATTTGTTCCAGGAAATAGTGTAACTGGCTGTTGTCTAGGATTT
GGATATGTTTACATTGACCTTAAAGGTCCGGACGGAAAACACCTCAACCTCAAGTAAACC
TGCTGGATCAGCTGGGATTGGTGGTGTTTCATGTTATGTTGAAGAGGCTAAACCAAATCA
TGCTTCGAAC


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 20 20 20 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1EB33TF U 2
AF RS1FG09TF U 1
AF RS1EI23TF U 2
AF RS1CZ82TF U 1
AF RS1BB55TF U 1
BS 1 44 RS1BB55TF
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ACGGAAAAA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1FG09TF 685 0 0
G
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QA 2 685 2 685
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QA 1 681 1 681
DS 

RD RS1CZ82TF 681 0 0
G
GACGGCCGTCGAAAAAAAAAA*GTCGATCGCTCTCTCTCTCTC**AAGGTTTAGGGTTTT
TGCTTCTAACTGCCATTCTCCATGGAAGAGAAAAAA*CGTAAGAGGAAGAAACGCAAAGA
TGCTAGAGCTGGAACGACCTCAGAGCCAGTGGGATCTGAAGATCCAGCGGAATCTGTAAA
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QA 2 681 2 681
DS 

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GGATATGTTTACATTGACCTTAAAGGTCCGGACGGAAAACACCTCAACCTCAAGTAAACC
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TGCTTCGAAC

QA 1 790 1 790
DS 



AS 2 6

CO CL1331Contig1 830 4 19 U
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AGCTTTAAGAAACACAGGGCTTTCAACTTTGCTTAGGAGATGTTTTGATCTCTAATCTTC
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CATGACAATGTCCTCTTCGTCGTCTCCAGGCATTGGTTGACCTGCATGATGAACGTTCCA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F347JQ U 1
AF RS1BO80JQ U 50
AF RS1BO80TF C 50
AF RS1G349JQ U 74
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RD RS1F347JQ 370 0 0
AATGAAAACCGAACTAATTAAACTCTAACCATAACCAAACCAAACAATTAAGCATCAAAC
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AACTTAGCCAACACAAAGCAGTTGAACCAAAGAGCAACACTGCCTATTTACATCCAAAAG
TGGAAAACATATTGGTAGCAAACTTGAAACATTAAATTAAAATATAGTTAGAAAGTTGCG
AGCTTTAAAAAACACAGGGCTTTCAACTTTGCTTAGGAAATGTTTTGATCTCTAATCTTC
ATCGTCTGCATTTGTGAAGTCTTCAATCACTTCATCCCTATTAAATTGTTTGTTCATCGT
GCGCAGCTCC

QA 1 370 1 370
DS 

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AAGT
ATCAAACCAAACCGATTAATAGTCACATAAACCGAAATGAAATAAGCTCCCTCAAAGAAC
GAACTCAAACTTAGCCAACACAAAGCAGTTGAACCAAAGAGCAACACTGCCTATTTACAT
CCAAAAGTGGAGAACATATTGGTAGCAGACTTGAAACATTAGATTAAAATATAGTTAGAA
AGTTGCTAGCTTTAAGAAACACAGGGCTTTCAACTTTGCTTAGGAGATGTTTTGATCTCT
AATCTTCATCGTCTGCATTTGTGAAGTCTTCAATCACTTCATCCCTATTAGATTGTTTGT
TCATCGTACGCAGCTCCTCGATTTCAAACTTGAGCATTGGATCACAAACCACTTTGTTGC
TCTTCAGTTTACCTCGGCAGCCAGCTATAGGACATTTCGCATTTGGATTGGTGGCTATGT
AATGCATGATTGAGGCTTTGTCGTAGACGTGCTTGCAATCCATACTGCGAACTGGATCTG
CTAGTTCAGTGAGAGGCTTCCCGCTTACAGGGCATTTCACGTTTAGGAAAGGGCACTGAG
TACTGGTCATGACAATGTCCTCTTCGTCGTCTCCAGGCATTGGTTGACCTGCATGATGAA
CGTTCCAAACAGCTTCCCGGAACTGTCGCATCAAATGATGATTTTC
GGGCACTGC

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DS 

RD RS1BO80TF 659 0 0
AAGT
ATCAAACCAAACCGATTAATAGTCACATAAACCGAAATGAAATAAGCTCCCTCAAAGAAC
GAACTCAAACTTAGCCAACACAAAGCAGTTGAACCAAAGAGCAACACTGCCTATTTACAT
CCAAAAGTGGAGAACATATTGGTAGCAGACTTGAAACATTAGATTAAAATATAGTTAGAA
AGTTGCTAGCTTTAAGAAACACAGGGCTTTCAACTTTGCTTAGGAGATGTTTTGATCTCT
AATCTTCATCGTCTGCATTTGTGAAGTCTTCAATCACTTCATCCCTATTAGATTGTTTGT
TCATCGTACGCAGCTCCTCGATTTCAAACTTGAGCATTGGATCACAAACCACTTTGTTGC
TCTTCAGTTTACCTCGGCAGCCAGCTATAGGACATTTCGCATTTGGATTGGTGGCTATGT
AATGCATGATTGAGGCTTTGTCGTAGACGTGCTTGCAATCCATACTGCGAACTGGATCTG
CTAGTTCAGTGAGAGGCTTCCCGCTTACAGGGCATTTCACGTTTAGGAAAGGGCACTGAG
TACTGGTCATGACAATGTCCTCTTCGTCGTCTCCAGGCATTGGTTGACCTGCATGATGAA
CGTTCCAAACAGCTTCCCGGAACTGTCGCATCAAATGATGATTTTC
GGGCACTGC

QA 5 650 5 650
DS 

RD RS1G349JQ 757 0 0
GGC
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AGCAGACTTGAAACGTTAGATTAAAATATAGTTAGAAAGCTGCGAGCTTTAAGAAACACA
GGGCTTTCAACTTTGCTTAGGAGATGTTTTGATCTCTAATCTTCATCGTCTGCATTTGTG
AAGTCTTCAATCACTTCATCCCTATTAGATTGTTTGTTCATCGTGCGCAGCTCCTCGATT
TCAAACTTGAGCATTGGATCACAAACCACTTTGTTGCTCTTCAGTTTACCTCGGCAGCCA
GCTATAGGACATTTCGCATTTGGATTGGTGGCTATGTAATGCATGATTGAGGCTTTGTCG
TAAACGTGCTTGCAATCCATACTGCGAACTGGATCGGCTAGTTCAGTGAGAGGCTTCCCG
CTTACAGGGCATTTCACGTTTAGGAAAGGGCACTGAGTACTGGTCATGACAATGTCCTCT
TCGTCGTCTCCAGGCATTGGTTGACCTGCATGATGAACGTTCCAAACTGCTTCCCTGAAC
TGTCGCATCAAATTATGATTTTCTGTCACTGAAGGAGTTGTAGTCTTGAGCTTTGTAAAC
TCATCGTCAAGCAACTTTTTGAAGTCAGTTAACTGTTCCCCAGGCTGGTACCCATTAGCA
ACAGAATGAATAGCTGAGGAACGATGAGCACAAT

QA 4 757 4 757
DS 



CO CL1331Contig2 836 2 18 U
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CCCTCCAAAACTATGGCGTCGGCGTCCTCTTCAAACGCAGTCGCCGGAAGGCTTCGAAAC
GCATCGTTGGTTCTCGTATCCGATAACGATTCCACAATCTCTGACATACGTAAAGCTGTG
ACTCTGATGAAGAACATTGCTGTTCAGTTGGAGAAAGATAACCAAACTGAGAAGGTTAAA
GACCTTGAAAACTCTGTGGCTGAGCTGTTGGAATTGTATGGTGATTGTGCTCATCGTTCC
TCAGCAATTCATTCTGTTGCTAATGGGTACCAGCCTGGAGAACAGTTAACTGACTTCAAA
AAGTTGCTTGACGATGAATTCACAAAGCTCAAGACTACAACTCCTTCAGTGACAGAAAAT
CATAATTTGATGCGACAGTTCAGGGAAGCAGTTTGGAACGTTCATCATGCAGGTCAACCA
ATGCCTGGAGACGACGAAGAGGACATTGTCATGACCAGTACTCAGTGCCCTTTCCTAAAC
GTGAAATGCCCTGTAAGCGGGAAGCCTCTCACTGAACTAGCAGATCCAGTTCGCAGTATG
GATTGCAAGCACGTCTACGACAAAGCCTCAATCATGCATTACATAGCCACCAATCCAAAT
GCGAAATGTCCTATAGCTGGCTGCCGAGGTAAACTGAAGAGCAACAAAGTGGTTTGTGAT
CCAATGCTCAAGTTTGAAATCGAGGAGCTGCGCACGATGAACAAACAATCTAATAGGGAT
GAAGTGATTGAAGACTTCACAAATGCAGACGATGAAGATTAGAGATCAAAACATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G349TF U 1
AF RS1F347TF U 66
BS 1 164 RS1G349TF
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BS 806 836 RS1F347TF

RD RS1G349TF 805 0 0
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GTGAAATGCCCTGTAAGCGGGAAGCCTCTCACTGAACTAGCCGATCCAGTTCGCAGTATG
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CCAATGCTCAAGTTTGAAATCGAGGAGCTGCGCACGATGAACAAACAATCTAATAGGGAT
GAAGTGATTGA*GACTTCACAAATG

QA 1 805 1 805
DS 

RD RS1F347TF 771 0 0
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AATTCATTCTGTTGCTAATGGGTACCAGCCTGGAGAACAGTTAACTGACTTTAAAAAGTT
GCTTGACGATGAATTCACAAAGCTCAAGGCTACAGCTCCTTCAGTGCCCGAAAATCATCA
TTTGATGCGACAGTTCCGGGAAGCTGTTTGGAACGTTCATCATGCAGGTCAACCAATGCC
TGGAGACGACGAAGAGGACATTGTCATGACCAGTACTCAGTGCCCTTTCCTAAACGTGAA
GTGCCCTGTAAGCGGGAAGCCTCTCACTGAACTAGCAGATCCAGTTCGCAGTATGGATTG
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ATGTCCTATAGCTGGCTGCCGAGGTAAACTGAAGAGCAACAAAGTGGTTTGTGATCCAAT
GCTCAAGTTTGAAATCGAGGAGCTGCGCACGATGAACAAACAATCTAATAGGGATGAAGT
GATTGAAGACTTCACAAATGCAGACGATGAAGATTAGAGATCAAAACATCT

QA 1 771 1 771
DS 



AS 2 6

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ACTGAGTAAACAGACAAAAGGGGAAGCTGTTTACCAATCGAAAATGATCAAAGTAAAGAC
AAACCGCATCTGAGGAGTTTTCTTTCATTTGCGAGCATCGACTTTCTTCGCGTCTCTTGC
TGCTTTTTCCTCTTCACGCTTCTTGGCAGCTTCTTCTCTCTGTTGGCGAATCAAAGCCAA
ACGATCCAAATCCTTTCTTGCTTGTTCGGTTTTGCCTTGCTCCTGTAATCTCATGTATCG
CTCATGAGCTCGCCGCTTCTATAGCTCCTCCCTTTCACGCCTCGAGAGTTCAGTGGTTTT
ACTTGCATCAAGGTCTCTTGCTTTCAAAGTCTTTGGTTTTGCTCTGTTAGGGTTATCAAC
TTGGATCAAAGCCTCATGTCCTTTCTTCTTCACATCAAAATCATCTTCGGATTCTTCTTC
AGATTCCTCCTCAGACTCCTCCTCTTCCACATCTTCTTCGTACTCCGATTCTTTTGCTTG
AATGAACGAGGACGTGCAGCAAAAGTGCCAGCAAGTATCTCAGCTGCGCTTGAGAATCGT
CGCTGGCCTGTGGGTTTCCCTTTGAACTTGCCTCTTCCCATCGTTTTCTCGAAAGAGATT
TTGAAATCGGATAAACTGGAGTTCGATTCCTGACGCAGAGAATATGAATCGGTTCGAAAG
AGGAGGAGGAGGATCTCTCGTCTTCTCTTTGAGGTCGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F959JQ U 18
AF RS1F959TF C 1
BS 1 17 RS1F959TF
BS 18 597 RS1F959JQ
BS 598 761 RS1F959TF

RD RS1F959JQ 580 0 0
CCGGATTGCTAATAACTTTCAAATGTATAAAGATCCACACAATACTGAGTAAACAGACAA
AAGGGGAAGCTGTTTACCAATCGAAAATGATCAAAGTAAAGACAAACCGCATCTGAGGAG
TTTTCTTTCATTTGCGAGCATCGACTTTCTTCGCGTCTCTTGCTGCTTTTTCCTCTTCAC
GCTTCTTGGCAGCTTCTTCTCTCTGTTGGCGAATCAAAGCCAAACGATCCAAATCCTTTC
TTGCTTGTTCGGTTTTGCCTTGCTCCTGTAATCTCATGTATCGCTCATGAGCTCGCCGCT
TCTATAGCTCCTCCCTTTCACGCCTCGAGAGTTCAGTGGTTTTACTTGCATCAAGGTCTC
TTGCTTTCAAAGTCTTTGGTTTTGCTCTGTTAGGGTTATCAACTTGGATCAAAGCCTCAT
GTCCTTTCTTCTTCACATCAAAATCATCTTCGGATTCTTCTTCAGATTCCTCCTCAGACT
CCTCCTCTTCCACATCTTCTTCGTACTCCGATTCTTTTGCTTGAATGAACGAGGACGTGC
AGCAAAAGTGCCAGCAAGTATCTCAGCTGCGCTTGAGAAT

QA 1 580 1 580
DS 

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ACTGAGTAAACAGACAAAAGGTGAAGCTGTTTACCAATCGAAAATGATCAAAGTAAAGAC
AAACCGCATCTGAGGAGTTTTCTTTCATTTGCGAGCATCGACTTTCTTCGCGTCTCTTGC
TGCTTTTTCCTCTTCACGCTTCTTGGCAGCTTCTTCTCTCTGTTGGCGAATCAGAGCCAA
ACGATCCAAATCCTTTCTTGCTTGTTCGGTTTTGCCTTGCTCCTGTAATCTCATGTATCG
CTCATGAGCTCGCCGCTTCTATAGCTCCTCCCTTTCACGCCTCGAGAGTTCAGTGGTTTT
ACTTGCATCAAGGTCTCTTGCTTTCAAAGTCTTTGGTTTTGCTCTGTTAGGGTTATCAAC
TTGGATCAGAGCCTCATGTCCTTTCTTCTTCACATCAGAATCATCTTCGGATTCTTCTTC
AGATTCCTCCTCAGACTCCTCCTCTTCCACATCTTCTTCGTACTCCGATTCTTTTGCTTG
AATGAACGAGGACGTGCAGCAGAAGTGCCAGCAAGTATCTCAGCTGCGCTTGAGAATCGT
CGCTGGCCTGTGGGTTTCCCTTTGAACTTGCCTCTTCCCATCGTTTTCTCGAAAGAGATT
TTGAAATCGGATAAACTGGAGTTCGATTCCTGACGCAGAGAATATGAATCGGTTCGAAAG
AGGAGGAGGAGGATCTCTCGTCTTCTCTTTGAGGTCGGTCC

QA 1 761 1 761
DS 



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GCGTTCAGGAATCGAACTCCAGTTTTTCCGATTTCAAAATCTCTTTCGAGAAAAGGATGG
GAAGAGGCAAGTTCAAAGGGAAACCCACAGGCCAGCGACGATTCTCAAGCGCAGCTGAGA
TTCTTGCTGGCACTTCTGCTGCGCGTCCTCGTTCATTCAAGCAGAAAGAAGCGGAGTACG
AAGAAGATGTGGAAGAGGAGGAGTCTGAGGAGGAATCTGAAGAAGAATCCGAAGATGATT
CTGATGTGAAGAAGAAAGGACATGAGGCTCTGATCCAAGTTGATAACCCTAACAGAGCAA
AACCAAAGACTTTGAAAGCAAGAGACCTTGATGCAAGTAAAACCACTGAACTCTCGAGGC
GTGAAAGGGAGGAGCTAGAGAAGCAGCGAGCTCATGAGCGATACATGAGATTACAGGAGC
AAGGCAAAACCGAACAAGCAAGAAAGGATTTGGATCGTTTGGCTCTGAGTCGCCAACAGA
GAGAAGAAGCTGCCAAGAAGCGTGAAGAGGAAAAAGCAGCAAGAGACGCGAAGAAAGTCG
ATGCTCGCAAATGAAAGAAAACTCCTCAGATGCGTTTGTCTTTACTTTGGTCGTTTTCGA
TTGGTAAACAGGAAGACCTTTTGTCTGTTTACTCAGTATTGTGTGGATCTTTATACATTT
GAAAGTTATTAGCAATCCGGTTGAGAAAGCCATAAACAACATCAGCTTGACTTTCTTACA
TTTATGTTAGATAACACAAGAGTTTATAAGAAGT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FV96TF U 1
AF RS1E559TF U 4
AF RS1E559JQ C 103
AF RS1FV96JQ C 212
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QA 1 646 1 646
DS 

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GG
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CAGGAATCGAACTCCAGTTTTTCCGATTTCAAAATCTCTTTCGAGAAAAGGATGGGAAGA
GGCAAGTTCAAAGGGAAACCCACAGGCCAGCGACGATTCTCAAGCGCAGCTGAGATTCTT
GCTGGCACTTCTGCTGCGCGTCCTCGTTCATTCAAGCAGAAAGAAGCGGAGTACGAAGAA
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GTGAAGAAGAAAGGACATGAGGCTCTGATCCAAGTTGATAACCCTAACAGAGCAAAACCA
AAGACTTTGAAAGCAAGAGACCTTGATGCAAGTAAAACCACTGAACTCTCGAGGCGTGAA
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T

QA 3 747 3 747
DS 

RD RS1E559JQ 649 0 0
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ACATGAGATTACAGGAGCAAGGCAAAACCGAACAAGCAAGAAAGGATTTGGATCGTTTGG
CTTTGAGTCGCCAACAGAGAGAAGAAGCTGCCAAGAAGCGTGAAGAGGAAAAAGCAGCAA
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TACTTTGGTCGTTTTCGATTGGTAAACAGGAAGACCTTTTGTCTGTTTACTCAGTATTGT
GTGGATCTTTATACATTTGAAAGTTATTAGCAATCCGGTTGAGAAAGC
T

QA 1 648 1 648
DS 

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TGCAAGTAAAACCACTGAACTCTCGAGGCGTGAAAGGGAGGAGCTAGAGAAGCAGCGAGC
TCATGAGCGATACATGAGATTACAGGAGCAAGGCAAAACCGAACAAGCAAGAAGGGATTT
GGATCGTTTGGCTTTGAGTCGCCAACAGAGAGAAGAAGCTGCCAAGAAGCGTGAAGAGGA
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GCGTTTGTCTTTACTTTGGTCGTTTTCGATTGGTAAACAGGAAGACCTTTTGTCTGTTTA
CTCAGTATTGTGTGGATCTTTATACATTTGAAAGTTATTAGCAATCCGGTTGAGAAAGCC
ATAAACAACATCAGCTTGACTTTCTTACATTTATGTTAGATAACACAAGAGTTTATAAGA
AGT

QA 1 603 1 603
DS 



AS 1 6

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TACTACAACAAGAAATTCTTTAACATCCAGAAATCATAAAAGATAAAAGAACACGAAACA
AAGCTAAAATCAACAAGATTTTTTTTTAACCGGTGATGTTCTGTGACTTGTTGAGGATAA
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TGCCAACACGGGCCTTGCATCTACGTCTACGTGCCACACGGTATCCTGGACGTTCAAGAA
CAACATAAAAATCCATTCCGTAAATACCAGTAGATGGATCATACTTGATTCCGAGATCAA
TGTGCTCTTGGATACCGAATCCAAAGCAACCAGTGTCACTAAAGTTCCTCCTAAGAAGCT
CATACTCCTTAACTTTCAAGCCACTCTCGAGAAGCTGCATTGCCTTGTCACCTCTAACAG
TGACGTAGCACGCAATCTTTTCGTTACGCCTGATACCAAAAGACCTCACAGTGTACCTCG
CCTTTGAGAAAACAGGGGTTTGTCCACTGAGCTGTTCCAAAACCTTTGAGGCACGGGTGA
GACGATCACCACTTTCACCAACGGAGATGTTGAGAACAAGCTTCTGGACCTTAATGTCCC
TCATGGGGTTCGACAGCTTCTTCTCTGACGCCATTTCAAGGAGCTATAAGAGAGTTGCGG
AGACAAGACTGCGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CU56JQ U 1
AF RS1BE17JQ U 18
AF RS1EV49JQ U 21
AF RS1BE17TF C 21
AF RS1EV49TF C 141
AF RS1CU56TF C 54
BS 1 153 RS1CU56JQ
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BS 155 597 RS1CU56JQ
BS 598 674 RS1EV49JQ
BS 675 737 RS1BE17TF

RD RS1CU56JQ 597 0 0
AACAAAAAAATCAGGTTCTTGGAAGATTTTAGATTCTACCACATGTCAAAAAAAGGTTTT
TACTACAACAAGAAATTCTTTAACATCCAGAAATCATAAAAGATAAAAGAACACGAAACA
AAGCTAAAATCAACAAGATTTTTTTTTAACCGGGGATGTTCTGTGACTTGTTGAGGATAA
CTCCTTCATACTTGACTTGGAACCATTTCATTGCATCATCCTTAGTCACTCTGTGTTGGA
TGCCAACACGGGCCTTGCATCTACGTCTACGTGCCACACGGTATCCTGGACGTTCAAGAA
CAACATAAAAATCCATTCCGTAAATACCAGTAGATGGATCATACTTGATTCCGAGATCAA
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TGACGTAGCACGCAATCTTTTCGTTACGCCTGATACCAAAAGACCTCACAGTGTACCTCG
CCTTTGAGAAAACAGGGGTTTGTCCACTGAGCTGTTCCAAAACCTTTGAGGCACGGG

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DS 

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CTTGGAAAATTTTAAAT
TCTACCACATGTCAAAAAAAGGTTTTTACTACAACAAGAAATTCTTTAACATCCAAAAAT
CATAAAAGATAAAAGAACACGAAACAAAGCTAAAATCAACAAGATTTTTTTTTAACCGGT
GATGTTCTGTGACTTGTTGAGGATAACTCCTTCATACTTGACTTGGAACCATTTCATTGC
ATCATCCTTAGTCACTCTGTGTTGGATACCAACACGGGCCTTGCATCTACGTCTACGTGC
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CTGCATTGCCTTGTCACCTCTAACAGTGACGTAGCACGCAATCTTTTCGTTACGCCTGAT
ACCAAAAGACCTCACAGTGTACCTCGCCTTTGAGAAAACAGGGGTTTGTCCACTGAGCTG
TTCCAAAACCTTTGAGGCACGGG

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DS 

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GGAAGATTTTAGAT
TCTACCACATGTCAAAAAAAGGTTTTTACTACAACAAGAAATTCTTTAACATCCAGAAAT
CATAAAAGATAAAAGAACACGAAACAAAGCTAAAATCAACAAGATTTTTTTTTAACCGGT
GATGTTCTGTGACTTGTTGAGGATAACTCCTTCATACTTGACTTGGAACCATTTCATCGC
ATCATCCTTAGTCACTCTGTGTTGGATGCCAACACGGGCCTTGCATCTACGTCTACGTGC
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GTCACTAAAGTTCCTCCTAAAAAGCTCATACTCCTTAACTTTCAAGCCACTCTCGAGAAG
CTGCACTGCCTTGTCACCTCTAACAGTGACGTAGCACGCAATCTTTTCGTTACGCCTGAT
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TTCCAAAACCTTTGAGGCACGGGTGAGACGATCACCACTTTCACCAACGGAGATGTTGAG
AACAAGCTTCTGGACCTTAATGTCCCTCATGGGGTTCGAC

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DS 

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CTGGAAGATTTAGA
TCTACCACATGTCAAAAAAAGGTTTT*ACTACAACAAGAAATTCTTTAACATCCAGAAAT
CATAAAAGATAAAAGAACACGAAACAAAGCTAAAATCAACAAGATTTTTTTTTAACCGGT
GATGTTCTGTGACTTGTTGAGGATAACTCCTTCATACTTGACTTGGAACCATTTCATTGC
ATCATCCTTAGTCACTCTGTGTTGGATACCAACACGGGCCTTGCATCTACGTCTACGTGC
CACACGGTATCCTGGACGTTCAAGAACAACATAGAAATCCATTCCGTAGATACCAGTAGA
TGGATCATACTTGATTCCGAGATCAATGTGCTCTTGGATACCGAATCCAAAGCAACCAGT
GTCACTAAAGTTCCTCCTAAGAAGCTCATACTCCTTAACTTTCAAGCCACTCTCGAGAAG
CTGCATTGCCTTGTCACCTCTAACAGTGACGTAGCACGCAATCTTTTCGTTACGCCTGAT
ACCAAAAGACCTCACAGTGTACCTCGCCTTTGAGAAAACAGGGGTTTGTCCACTGAGCTG
TTCCAAAACCTTTGAGGCACGGGTGAGACGATCACCACTTTCACCAACGGAGATGTTGAG
AACAAGCTTCTGGACCTTAATGTCCCTCATGGGGTTCGACAGCTTCTTCTCTGACGCCAT
TTCAAGGAGCTATAAGAGAGTTGCGGAGACAAGACTGCGTCCC

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DS 

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AACCATTTCATCGCATCATCCTTAGTCACTCTGTGTTGGATGCCAACACGGGCCTTGCAT
CTACGTCTACGTGCCACACGGTATCCTGGACGTTCAAGAACAACATAGAAATCCATTCCG
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CCAAAGCAACCAGTGTCACTAAAGTTCCTCCTAAGAAGCTCATACTCCTTAACTTTCAAG
CCACTCTCGAGAAGCTGCACTGCCTTGTCACCTCTAACAGTGACGTAGCACGCAATCTTT
TCGTTACGCCTGATACCAAAAGACCTCACAGTGTACCTCGCCTTTGAGAAAACAGGGGTT
TGTCCACTGAGCTGTTCCAAAACCTTTGAGGCACGGGTGAGACGATCACCACTTTCACCA
ACGGAGATGTTGAGAACAAGCTTCTGGACCTTAATGTCCCTCATGGGGTTCGACAGCTTC
TTCTCTGACGCCATTTCAAGGAGCTATAAGAGAGTTGCGGAGACAAGACT
GCGTCCC

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DS 

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AAGG
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ACAAAGCTAAAATCAACAAGATTTTTTTT*AACCGGTGATGTTCTGTGACTTGTTGAGGA
TAACTCCTTCATACTTGACTTGGAACCATTTCATTGCATCATCCTTAGTCACTCTGTGTT
GGATGCCAACACGGGCCTTGCATCTACGTCTACGTGCCACACGGTATCCTGGACGTTCAA
GAACAACATAGAAATCCATTCCGTAGATACCAGTAGATGGATCATACTTGATTCCGAGAT
CAATGTGCTCTTGGATACCGAATCCAAAGCAACCAGTGTCACTAAAGTTCCTCCTAAGAA
GCTCATACTCCTTAACTTTCAAGCCACTCTCGAGAAGCTGCATTGCCTTGTCACCTCTAA
CAGTGACGTAGCACGCAATCTTTTCGTTACGCCTGATACCAAAAGACCTCACAGTGTACC
TCGCCTTTGAGAAAACAGGGGTTTGTCCACTGAGCTGTTCCAAAACCTTTGAGGCACGGG
TGAGACGATCACCACTTTCACCAACGGAGATGTTGAGAACAAGCTTCTGGACCTTAATGT
CCCTCATGGGGTTCGACAGCTTCTTCTCTGACGCCATTTCAAGGAGCTATAAGAGAGTTG
CGGAGACAAGACT
CC

QA 5 677 5 677
DS 



AS 1 6

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CTGACAAAGTCGACGATTTCAACAACATCATGGAGCAGAGAGTTGGAGTTCACCACCCTA
CAGTTTCGTCTGATCTGTCCTTGAGATCCTGTGAGAGGGGTAATGTTTCCCATTCTATCC
ATCGCCTTTATAAACGCATTGAAGAACTTTTGTGTGCCATCAGCGTATTCTCTCACCAAG
GGGATAGTATCAGTGGCATTGGGGCTTGAGAACAGCTCTTGATCGGTTTGGATAAGTCCT
TTGAGCTCTTTCAGATTCACATAATATTTGTTGTCAAAAACTGTCGGTGTACGTAGATCA
AAATCCACTAGAACGCTCTGGTTACCATTACGAGGGCATAGTCCACGAAGCGTCTGGAGA
TAAGTAGTGTTGAGGGTAGGGTCGGGTAAACCAGTGTTGGTGAAGTTGTATAGCCTGTCC
ATAATAAACTGGCATTGGTTTTTTACCAAAAGTGTGACCTCCGGAGAGGGCAACGAGATC
AGAAGGAAGGTTAAGCCCGACATTGCTGAAACTGGCTTTAAGTTGGGGCAGCGTGAAGAA
TGGAGCAGGAAGATTGTTATTAGAAAGATTAAAGAAAGCTTGTAAGCTATCTCGTCTCCC
CAAAGGAACCCTCCATGAAGGACCTCCTGCCAGATTGACTGATTGTTGAGCTGCGATAGT
TAGAATATCTGCACATGAAACAATCCCCGGACATTGTGCCTCCACTGCTGTTTTCATTCT
GTCAACCACTGGAAATCCTCGAGCCGAGTTTGCATTTGGCGCAGCATCTTTTTCCGTTCG
AAACGATGTTGTGTTGTCTAACAAGATCGATGCATCGCAACCATTCACGAAGCAGTCGTG
GAAGTGAAGACGAAGGAGGCTCGCAGCAATACGAGGATCCGATCTTAGCTCGTTGACGAT
GATTCCCCGGACGATGGTAGACACGTCAGGGCATGTATTGTCGTAGAAAGTAGGAGTTAG
TACTTGAGCACTAGAGAAAGATGAATGAAGCATAAGGCATCCCACTGTTATAAGGGTTGT
CCAAGTTGACAACGAAGACAACGAAGACAAAGAAGAGGAATGCATTTATTCTCCGAAGAA
AATTATCTGATTGGTTTTACTGGAGAAAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BS55JQ U 113
AF RS1AM67JQ U 19
AF RS1DF06JQ U 1
AF RS1AM67TF C 303
AF RS1BS55TF C 504
AF RS1DF06TF C 527
BS 1 503 RS1DF06JQ
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RD RS1BS55JQ 422 0 0
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GTAGAACAAAATCCACTAAAACGCTCTGGTTACCATTACGAGGGCATAGTCCACGAAGCG
TCTGGAGATAAGTAGTGTTGAGGGTAGGGTCGGGTAAACCAGTGTTGGTGAAGTTGTATA
GCCTGTCCATAATAAACTGGCATTGGTTTTTTACCAAAAGTGTGACCTCCGGAGAGGGCA
AC

QA 1 422 1 422
DS 

RD RS1AM67JQ 481 0 0
TTAGT
TTGCCACATATATTGAGCCAACTATTATTACATAGAGCTGACAAAGTCGACGATTTCAAC
AACATCATGGAGCAGAGAGTTGGAGTTCACCACCCTACAGTTTCGTCTGATCTGTCCTTG
AGATCCTGTGAGAGGGGTAATGTTTCCCATTCTATCCATCGCCTTTATAAACGCATTGAA
GAACTTTTGTGTGCCATCAGCGTATTCTCTCACCAAGGGGATAGTATCAGTGGCATTGGG
GCTTGAGAACAGCTCTTGATCGGTTTGGATAAGTCCTTTGAGCTCTTTCAGATTCACATA
ATATTTGTTGTCAAAAACTGTCGGTGTACGTAGATCAAAATCCACTAGAACGCTCTGGTT
ACCATTACGAGGGCATAGTCCACGAAGCGTCTGGAGATAAGTAGTGTTGAGGGTAGGGTC
GGGTAAACCAGTGTTGGTGAAGTTGTATAGCCTGTCCATAATAAACTGGCATT
TGG

QA 6 478 6 478
DS 

RD RS1DF06JQ 639 0 0
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CTGACAAAGTCGACGATTTCAACAACATCATGGAGCAGAGAGTTGGAGTTCACCACCCTA
CAGTTTCGTCTGATCTGTCCTTGAGATCCTGTGAGAGGGGTAATGTTTCCCATTCTATCC
ATCGCCTTTATAAACGCATTGAAGAACTTTTGTGTGCCATCAGCGTATTCTCTCACCAAG
GGGATAGTATCAGTGGCATTGGGGCTTGAGAACAGCTCTTGATCGGTTTGGATAAGTCCT
TTGAGCTCTTTCAGATTCACATAATATTTGTTGTCAAAAACTGTCGGTGTACGTAGATCA
AAATCCACTAGAACGCTCTGGTTACCATTACGAGGGCATAGTCCACGAAGCGTCTGGAGA
TAAGTAGTGTTGAGGGTAGGGTCGGGTAAACCAGTGTTGGTGAAGTTGTATAGCCTGTCC
ATAATAAACTGGCATTGGTTTTT*ACCAAAAGTGTGACCTCCGGAGAGGGCAACGAGATC
AGAAGGAAGGTTAAGCCCGACATTGCTGAAACTGGCTTTAAGTTGGGGCAGCGTGAAGAA
TGGAGCAGGAAGATTGTTATTAGAAAGATTAAAGAAAGC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RS1AM67TF 871 0 0
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ATCCACTAGAACGCTCTGGTTACCATTACGAGGGCATAGTCCACGAAGCGTCTGGAGATA
AGTAGTGTTGAGGGTAGGGTCGGGTAAACCAGTGTTGGTGAAGTTGTATAGCCTGTCCAT
AATAAACTGGCATTGGTTTTT*ACCAAAAGTGTGACCTCCGGAGAGGGCAACGAGATCAG
AAGGAAGGTTAAGCCCGACATTGCTGAAACTGGCTTTAAGTTGGGGCAGCGTGAAGAATG
GAGCAGGAAGATTGTTATTAGAAAGATTAAAGAAAGCTTGTAAGCTATCTCGTCTCCCCC
AAGGAACCCTCCATGAAGGACCTCCTGCCAGATTGACTGATTGTTGAGCTGCGATAGTTA
GAATATCTGCACATGAAACAATCCCCGGACATTGTGCCTCCACTGCTGTTTTCATTCTGT
CAACCACTGGAAATCCTCGAGCCGAGTTTGCATTTGGCGCAGCATCTTTTTCCGTTCGAA
ACGATGTTGTGTTGTCTAACAAGATCGATGCATCGCAACCATTCACGAAGCAGTCGTGGA
AGTGAAGACGAAGGAGGCTCGCAGCAATACGAGGATCCGATCTTAGCTCGTTGACGATGA
TTCCCCGGACGATGGTAGACACGTCAGGGCATGTATTGTCGTAGAAAGCAGGAGTTAGTA
CTTGAGCACTAGAGAAAGATGAATGAAGCATAAGGCATCCCACTGTTATAAGGGTTGTCC
AAGTTGACAACGAAGACAACGAAGACAAAGAAGAGGAATGCATTTATTCTCCGAAGAAAA
TTATCTGATTGGTTTTACTGGAGAAAGATCC

QA 1 871 1 871
DS 

RD RS1BS55TF 670 0 0
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TGCTGAAACTGGCTTTAAGTTGGGGCAGCGTGAAGAATGGAGCAGGAAGATTGTTATTAG
AAAGATTAAAGAAAGCTTGTAAGCTATCTCGTCTCCCCAAAGGAACCCTCCATGAAGGAC
CTCCTGCCAGATTGACTGATTGTTGAGCTGCGATAGTTAGAATATCTGCACATGAAACAA
TCCCCGGACATTGTGCCTCCACTGCTGTTTTCATTCTGTCAACCACTGGAAATCCTCGAG
CCGAGTTTGCATTTGGCGCAGCATCTTTTTCCGTTCGAAACGATGTTGTGTTGTCTAACA
AGATCGATGCATCGCAACCATTCACGAAGCAGTCGTGGAAGTGAAGACGAAGGAGGCTCG
CAGCAATACGAGGATCCGATCTTAGCTCGTTGACGATGATTCCCCGGACGATGGTAGACA
CGTCAGGGCATGTATTGTCGTAGAAAGTAGGAGTTAGTACTTGAGCACTAGAGAAAGATG
AATGAAGCATAAGGCATCCCACAGTTATAAGGGTTGTCCAAGTTGACAACGAAGACAACG
AAGACAAAGAAGAGGAATGCATTTATTCTCCGAAGAAAATTATCTGATTGGTTTTACTGG
AGAAAGATCC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RS1DF06TF 647 0 0
AGGGCAACGAGATCAGAAGGAAGGTTAAGCCCGACATTGCTGAAACTGGCTTTAAGTTGG
GGCAGCGTGAAGAATGGAGCAGGAAGATTGTTATTAGAAAGATTAAAGAAAGCTTGTAAG
CTATCTCGTCTCCCCAAAGGAACCCTCCATGAAGGACCTCCTGCCAGATTGACTGATTGT
TGAGCTGCGATAGTTAGAATATCTGCACATGAAACAATCCCCGGACATTGTGCCTCCACT
GCTGTTT*CATTCTGCCAACCACTGGAAATCCTCGAGCCGAGTTTGCATTTGGCGCAGCA
TCTTTTTCCGTTCGAAACGATGTTGTGTTGTCTAACAAGATCGATGCATCGCAACCATTC
ACGAAGCAGTCGTGGAAGTGAAGACGAAGGAGGCTCGCAGCAATACGAGGATCCGATCTT
AGCTCGTTGACGATGATTCCCCGGACGATGGTAGACACGTCAGGGCATGTATTGTCGTAG
AAAGTAGGAGTTAGTACTTGAGCACTAGAGAAAGATGAATGAAGCATAAGGCATCCCACT
GTTATAAGGGTTGTCCAAGTTGACAACGAAGACAACGAAGACAAAGAAGAGGAATGCATT
TATTCTCCGAAGAAAATTATCTGATTGGTTTTACTGGAGAAAGATCC

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 4

CO CL1335Contig1 1125 4 9 U
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TTTGCAAAGCAGATGGGTTTGACTGACAATGACATCGTGGCTTTATCTGGTGCCCACACT
CTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGCTTTTTCTTTGATTCAGAATCTGTTCTTT
AGATTACAGTTCTTCAAGAACTGAATTGGTGGAAAGCTAAAACTGATCTTCTTCGGCAGC
AAACGCGTATAGATATAGAGTATCAAGACAACTCCAGTGTCGGCATGGCAAACACTTGGG
GTGACGACAAGATCCTCAGCTACAACGATGTTGTTCAGGAGATCAGATCTTGACATCCTT
AACGGTCCCAATTTTCTAAACGACCGTGTAATCGAGTTCTACCTAAGCTACTTATCCACA
CTCCACACTTCCCCTACCATCTCGCTAATCCCTCCCTCCATCGCCTTCTGGATCTCAGAC
TGTCCCGACGCTGAATCACTCAAAGACTTCATGAAACCCCTTAGGCTACTCGACAGCGAG
CTCGTGATATTACCTGTAAACGACAACCTCAATGTCGAGATAGCAGAAGGCGGGTTACAC
TGGAGCTTACTCGTGTACTACAAAGAAGCCAACTCGTTTTTCCATCACGATAGCTTTATG
GGATCGAATCGATGGAATGCGAGACAGCTCTACAAGGCGGTTTCTCCATTTGTGTCTGAT
GGAGATGCTGCGTATAGAGAATGCAGTGATTCACCGCAGCAGAAGAATGGGTACGACTGT
GGTGTGTACCTTCTTGCAAACGCTCAGGTTATATGCAAGTGGTTTAGCTCTGGTGGAGTG
AAGAACCGGGATGAGCTTTGGTTAGGTGATGTGAAGGAGACTGTACCGGATGTGGTTAAC
CATTTGCGAGAAGAGATATTGGGGTTGATCAAAAGGTTGATGTCTGAGAAGAGTGCGAGT
AAATGAGAGATGCTTGTTGAAGATTTTTTTTTTTTAACGTTTTACCGGATTTAATACATT
TGATATTTTCACCGGTTATTGTTGTACTTTTAAGTTTAACCTTAAACCGATAACGAGTGC
TTTGTGTATGTGATCAATTGGTAAATAAAATAAAATAATTGCCGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1FE36TF U 1
AF RS1H722TF U 1
AF RS1FE36JQ C 637
AF RS1H722JQB C 637
BS 1 740 RS1FE36TF
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RD RS1FE36TF 740 0 0
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GGATCGAATCGATGGAATGCGAGACAGCTCTACAAGGCGGTTTCTCCATTTGTGTCTGAT
GGAGATGCTGCGTATAGAGA

QA 1 740 1 740
DS 

RD RS1H722TF 778 0 0
GCACCTCCAGAGGGTCGTCTTCCTGATGCTACAAAGGGTTGTAACCACTTGAGAGAAGTC
TTTGCAAAGCAGATGGGTTTGACTGACAATGACATCGTGGCTTTATCTGGTGCCCACACT
CTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGCTTTTTCTTTGATTCAGAATCTGTTCTTT
AGATTACAGTTCTTCAAGAACTGAATTGGTGGAAAGCTAAAACTGATCTTCTTCGGCAGC
AAACGCGTATAGATATAGAGTATCAAGACAACTCCAGTGTCGGCATGGCAAACACTTGGG
GTGACGACAAGATCCTCAGCTACAACGATGTTGTTCAGGAGATCAGATCTTGACATCCTT
AACGGTCCCAATTTTCTAAACGACCGTGTAATCGAGTTCTACCTAAGCTACTTATCCACA
CTCCACACTTCCCCTACCATCTCGCTAATCCCTCCCTCCATCGCCTTCTGGATCTCAGAC
TGTCCCGACGCTGAATCACTCAAAGACTTCATGAAACCCCTTAGGCTACTCGACAGCGAG
CTCGTGATATTACCTGTAAACGACAACCTCAATGTCGAGATAGCAGAAGGCGGGTTACAC
TGGAGCTTACTCGTGTACTACAAAGAAGCCAACTCGTTTTTCCATCACGATAGCTTTATG
GGATCGAATCGATGGAATGCGAGACAGCTCTACAAG*CGGTTTCTCCATTTGTGTCTGAT
GGAGATGCTGCGTATAGAGAATGCAGTGATTCACCGCAGCAGA*GAATGGGTACGACT

QA 1 778 1 778
DS 

RD RS1FE36JQ 489 0 0
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TAACCTTAAACCGATAACGAGTGCTTTGTGTATGTGATCAATTGGTAAATAAAATAAAAT
AATTGCCGC

QA 1 489 1 489
DS 

RD RS1H722JQB 489 0 0
TTTTTCCATCACGATAGCTTTATGGGATCGAATCGATGGAATGCGAGACAGCTCTACAAG
GCGGTTTCTCCATTTGTGTCTGATGGAGATGCTGCGTATAGAGAATGCAGTGATTCACCG
CAGCAGAAGAATGGGTACGACTGTGGTGTGTACCTTCTTGCAAACGCTCAGGTTATATGC
AAGTGGTTTAGCTCTGGTGGAGTGAAGAACCGGGATGAGCTTTGGTTAGGTGATGTGAAG
GAGACTGTACCGGATGTGGTTAACCATTTGCGAGAAGAGATATTGGGGTTGATCAAAAGG
TTGATGTCTGAGAAGAGTGCGAGTAAATGAGAGATGCTTGTTGAAGATTTTTTTTTTTTA
ACGTTTTACCGGATTTAATACATTTGATATTTTCACCGGTTATTGTTGTACTTTTAAGTT
TAACCTTAAACCGATAACGAGTGCTTTGTGTATGTGATCAATTGGTAAATAAAATAAAA
TAATTGCCGC

QA 1 479 1 479
DS 



AS 2 6

CO CL1336Contig1 886 4 12 U
GTAAAACAAGCCTTTGTATTTCATTATTTCGTTACATTACTTTAATTTTGAATGATCTGC
TACATGCTGATCATATACATTCATTTTGAAGTAATAAAATCAGAAGTTACAGAAAAAAAA
TA*TCAATATAATACACTTTCGTAACACACCAATGAAACATAAGATCATATAACCG*ACA
ACCTTTAACAATTACTCCTCTAGCGGTTGGACACCTAGCTAGATCACAATGCTCACCTTG
TGTTCCCCACCAATCCAAACTCTTATCCTCCATCCCCACCGAGAAGTACAACAAGACAGC
CATGAACGCTACACCAGCGTCCATCGCAGCTGAGAGCACGTAGCTATACCTTTGCCACCA
ACTTTTCCTGTACCGGAACACAAAAAAGTTGAATATCGTCCCGACCAAGATCCATGAGTT
GTAGTTCACCGCGGTCGCTGGTGGCATCATCGCGGTTGCACCTAGAAGAACAGGTAGATT
CACTAGTGGAATCCAAGAATGTTTTGGAAACGCTTTGTGGCACAACCATACTATCACCGG
TCCTATCGCACCACCGAGGAAAAGCCAGTTCATAGCTGCGTAGTTTCCTTGAGAGCCAAA
GATCCGTTTTGGCCCGACCAATCCCCAAATGACCGATGCGTCGAAGAAAACACGGTCGCC
CGGACATGTCCATGGACTGTTGGGAGGTAGAAGTTCTTCTTGACATATGTTGGTTATAGA
GTTTAGTTGCCACCATGCAACCGTTATGTTAATTGTTCCAGCAAGGATTGTACCGATGAA
TTGAACCAAGAACATGGATCTTGGAGGGATCTTCATGTAGTGACCAAGTTTGAAGTCGTT
TAAGAAAGAGACGGCTTGTGCCATGCTCATGTATCCATATACTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GR35JQ U 4
AF RS1GX37JQ U 1
AF RS1EV22JQ U 1
AF RS1GR35TF C 239
BS 1 333 RS1EV22JQ
BS 334 334 RS1GX37JQ
BS 335 343 RS1EV22JQ
BS 344 344 RS1GR35JQ
BS 345 356 RS1EV22JQ
BS 357 357 RS1GR35JQ
BS 358 542 RS1EV22JQ
BS 543 543 RS1GR35JQ
BS 544 563 RS1EV22JQ
BS 564 564 RS1GR35JQ
BS 565 728 RS1EV22JQ
BS 729 886 RS1GR35TF

RD RS1GR35JQ 612 0 0
AGACAGA
CCTTTGTATTTCATTATTTCGTTACATTACTTTAATTTTGAATGATCTGCTACATGCTGA
TCATATACATTCATTTTGAAGTAATAAAATCAGAAGTTACAGAAAAAAAAAAATCAATAT
AATACACTTTCGTAACACACCAATGAAACATAAGATCATATAACCGGACAACCTTTAACA
ATTACTCCTCTAGCGGTTGGACACCTAGCTAGATCACAATGCTCACCTTGTGTTCCCCAC
CAATCCAAACTCTTATCCTCCATCCCCACCGAGAAGTACAACAAGACAGCCATGAACGCT
ACACCAGCGTCCATCGCAGCTGAGAGCACGTAGCTATACCTTTGCCACCAACTTTTCCTG
TACCGGAACACAAAAAAGTTGAATATCGTCCCGACCAAGATCCATGAGTTGTAGTTCACC
GCGGTCGCTGGTGGCATCATCGCGGTTGCACCTAGAAGAACAGGTAGATTCACTAGTGGA
ATCCAAGAATGTTTTGGAAACGCTTTGTGGCACAACCATACTATCACCGGTCCTATCGCA
CCACCGAGGAAAAGCCAGTTCATAGCTGCGTAGTTTCCTTGAGAGCCAAAGATCCGTTTT
GG
TCC

QA 8 609 8 609
DS 

RD RS1GX37JQ 706 0 0
GTAAAACAAG
CCTTTGTATTTCATTATTTCGTTACATTACTTTAATTTTGAATGATCTGCTACATGCTGA
TCATATACATTCATTTTGAAGTAATAAAATCAGAAGTTACAGAAAAAAAATA*TCAATAT
AATACACTTTCGTAACACACCAATGAAACATAAGATCATATAACCG*ACAACCTTTAACA
ATTACTCCTCTAGCGGTTGGACACCTAGCTAGATCACAATGCTCACCTTGTGTTCCCCAC
CAATCCAAACTCTTATCCTCCATCCCCACCGAGAAGTACAACAAGACAGCCATGAACGCT
ACACCAGCGTCCATCGCAGCTGAGAGCACGTAGTTATACCTTTGCCGCCAACTTTTCCTG
TACCGGAACACAAAAAAGTTGAATATCGTCCCGACCAAGATCCATGAGTTGTAGTTCACC
GCGGTCGCTGGTGGCATCATCGCGGTTGCACCTAGAAGAACAGGTAGATTCACTAGTGGA
ATCCAAGAATGTTTTGGAAACGCTTTGTGGCACAACCATACTATCACCGGTCTTATCGCA
CCACCGAGGAAAAACCAGTTCATAGCTGCGTAGTTTCCTTGAGAGCCAAAGATCCGTTTT
GGCCCGACCAATCCCCAAATGACCGATGCGTCGAAGAAAACACGGTCGCCCGGACATGTC
CATGGACTGTTGGGAGGTAGAAGTTCTTCTTG
ACAT

QA 11 702 11 702
DS 

RD RS1EV22JQ 728 0 0
GTAAAACAAGCCTTTGTATTTCATTATTTCGTTACATTACTTTAATTTTGAATGATCTGC
TACATGCTGATCATATACATTCATTTTGAAGTAATAAAATCAGAAGTTACAGAAAAAAAA
TA*TCAATATAATACACTTTCGTAACACACCAATGAAACATAAGATCATATAACCG*ACA
ACCTTTAACAATTACTCCTCTAGCGGTTGGACACCTAGCTAGATCACAATGCTCACCTTG
TGTTCCCCACCAATCCAAACTCTTATCCTCCATCCCCACCGAGAAGTACAACAAGACAGC
CATGAACGCTACACCAGCGTCCATCGCAGCTGAAAGCACGTAGTTATACCTTTGCCGCCA
ACTTTTCCTGTACCGGAACACAAAAAAGTTGAATATCGTCCCGACCAAGATCCATGAGTT
GTAGTTCACCGCGGTCGCTGGTGGCATCATCGCGGTTGCACCTAGAAGAACAGGTAGATT
CACTAGTGGAATCCAAGAATGTTTTGGAAACGCTTTGTGGCACAACCATACTATCACCGG
TCTTATCGCACCACCGAGGAAAAACCAGTTCATAGCTGCGTAGTTTCCTTGAGAGCCAAA
GATCCGTTTTGGCCCGACCAATCCCCAAATGACCGATGCGTCGAAGAAAACACGGTCGCC
CGGACATGTCCATGGACTGTTGGGAGGTAGAAGTTCTTCTTGACATATGTTGGTTATAGA
GTTTAGTT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1GR35TF 648 0 0
TGTGTTCCCCACCAATCCAAACTCTTATCCTCCATCCCCACCGAGAAGTACAACAAGACA
GCCATGAACGCTACACCAGCGTCCATCGCAGCTGAGAGCACGTAGCTATACCTTTGCCAC
CAACTTTTCCTGTACCGGAACACAAAAAAGTTGAATATCGTCCCGACCAAGATCCATGAG
TTGTAGTTCACCGCGGTCGCTGGTGGCATCATCGCGGTTGCACCTAGAAGAACAGGTAGA
TTCACTAGTGGAATCCAAGAATGTTTTGGAAACGCTTTGTGGCACAACCATACTATCACC
GGTCCTATCGCACCACCGAGGAAAAGCCAGTTCATAGCTGCGTAGTTTCCTTGAGAGCCA
AAGATCCGTTTTGGTCCGACCAATCCCCAAATGACCGATGCATCGAAGAAAACACGGTCG
CCCGGACATGTTCATGGACTGTTGGGAGGTAGAAGTTCTTCTTGGCATATGTTGGTTATG
GAGTTTAGTTGCCACCATGCAACCGTTATGTTAATTGTTCCAGCAAGGATTGTACCGATG
AATTGAACCAAGAACATGGATCTTGGAGGGATCTTCATGTAGTGACCAAGTTTGAAGTCG
TTTAAGAAAGAGACGGCTTGTGCCATGCTCATGTATCCATATACTTTC

QA 1 648 1 648
DS 



CO CL1336Contig2 766 2 1 U
GGTAGCTCTCTTTTACGGCAGGGAAATTACCGAGAGGTTTCGAGTTTCGTACAAAGGCAA
AGAGGATGTACATACTAGGTTAATGAAGAGATATAAAGACATACCTTCATGGTGGTTCTA
CTCAATGCTGGGTGCAACACTTCTTATCTCTCTTGCGTTATGTGTTTTCTTGAACGATCA
GGTTCAAATGCCTTGGTGGGGACTCGTGTTCGCCAGTGCCATGGCTTTCATCTTCACACT
TCCCATCAGCATCATTACCGCAACAACTAACCAAACACCGGGGTTGAATATAATAACGGA
GTACGCAATGGGAATCATTTACCCGGGAAGGCCTATTGCAAACGTATGCTTCAAAGTGTA
TGGATACATGAGTATGGCACAAGCTGTCTCTTTCTTAAATGACTTCAAACTTGGTCACTA
CATGAAGATCCCTCCGAGATCCATGTTCTTGGTTCAATTCATCGGTACAATCCTTGCTGG
AACAATTAACATAACGGTTGCATGGTGGCAACTAAACTCTATAACCAACATATGTCAAGA
AGAACTTCTACCTCCCAACAGTCCATGGACATGTCCGGGCGACCGTGTTTTCTTCGACGC
ATCGGTCATTTGGGGATTGGTCGGGCCAAAACGGATCTTTGGCTCTCAAGGAAACTACGC
AGCTATGAACTGGTTTTTCCTCGGTGGTGCGATAAGACCGGTGATAGTATGGTTGTGCCA
CAAAGCGTTCCAAACATTCTTGGATTCACTAGTGAATCTACCTGTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GX37TF U 1
AF RS1EV22TF U 1
BS 1 766 RS1EV22TF

RD RS1GX37TF 561 0 0
GGTAGCTCTCTTTTACGGCAGGGAAATTACCGAGAGGTTTCGAGTTTCGTACAAAGGCAA
AGAGGATGTACATACTAGGTTAATGAAGAGATATAAAGACATACCTTCATGGTGGTTCTA
CTCAATGCTGGGTGCAACACTTCTTATCTCTCTTGCGTTATGTGTTTTCTTGAACGATCA
GGTTCAAATGCCTTGGTGGGGACTCGTGTTCGCCAGTGCCATGGCTTTCATCTTCACACT
TCCCATCAGCATCATTACCGCAACAACTAACCAAACACCGGGGTTGAATATAATAACGGA
GTACGCAATGGGAATCATTTACCCGGGAAGGCCTATTGCAAACGTATGCTTCAAAGTGTA
TGGATACATGAGTATGGCACAAGCTGTCTCTTTCTTAAATGACTTCAAACTTGGTCACTA
CATGAAGATCCCTCCGAGATCCATGTTCTTGGTTCAATTCATCGGTACAATCCTTGCTGG
AACAATTAACATAACGGTTGCATGGTGGCAACTAAACTCTATAACCAACATATGTCAAGA
AGAACTTCTACCTCCCAACAG

QA 1 561 1 561
DS 

RD RS1EV22TF 766 0 0
GGTAGCTCTCTTTTACGGCAGGGAAATTACCGAGAGGTTTCGAGTTTCGTACAAAGGCAA
AGAGGATGTACATACTAGGTTAATGAAGAGATATAAAGACATACCTTCATGGTGGTTCTA
CTCAATGCTGGGTGCAACACTTCTTATCTCTCTTGCGTTATGTGTTTTCTTGAACGATCA
GGTTCAAATGCCTTGGTGGGGACTCGTGTTCGCCAGTGCCATGGCTTTCATCTTCACACT
TCCCATCAGCATCATTACCGCAACAACTAACCAAACACCGGGGTTGAATATAATAACGGA
GTACGCAATGGGAATCATTTACCCGGGAAGGCCTATTGCAAACGTATGCTTCAAAGTGTA
TGGATACATGAGTATGGCACAAGCTGTCTCTTTCTTAAATGACTTCAAACTTGGTCACTA
CATGAAGATCCCTCCGAGATCCATGTTCTTGGTTCAATTCATCGGTACAATCCTTGCTGG
AACAATTAACATAACGGTTGCATGGTGGCAACTAAACTCTATAACCAACATATGTCAAGA
AGAACTTCTACCTCCCAACAGTCCATGGACATGTCCGGGCGACCGTGTTTTCTTCGACGC
ATCGGTCATTTGGGGATTGGTCGGGCCAAAACGGATCTTTGGCTCTCAAGGAAACTACGC
AGCTATGAACTGGTTTTTCCTCGGTGGTGCGATAAGACCGGTGATAGTATGGTTGTGCCA
CAAAGCGTTCCAAACATTCTTGGATTCACTAGTGAATCTACCTGTT

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 6

CO CL1337Contig1 741 6 39 U
GGAAGAGTAAGGGTAGTATCGTCGTTTTACAGGGGAAAGCCCAAAACCC*TTTCTTCCGT
CTTCTCTC*****ACCTGCATCGCTTTCTTCTGCATTTTCCCTTTAAGCGATTCTCGCCG
GAGAGCTCCCGTCGACCTGTGTTTGAGAAGAGGATGTTGAAGTTCCTATCAAAAGTAAAG
ATTGAGTTCAACACATTAGATCC*AGGACTCGCCTCTTGCGTCGAGTTCTTGGCTCAGTG
CAACGCGAGGAAGGCCAAAGAGTCGAACCCTAACTGCCAGGTTCTGGTGAAACGCAGAAC
AGACGATCAGCCACCGCAGATCAGCGTCACGTTCGTTAACGGTGTTGAGGAAGCTTTCGA
TGCGGCGGCCACGTCAGCTCAGTCCATCAGGAAGATGATTCTTGACAAAGGGCAGTATCT
TGAGACAGAGCAGATGTTCCGTGAAGCCGGGGAGCAGTGGCCTGTCATCATCCCTGAGGA
AGAGATTCACCAAGAAGCTCCTGGTGTCAAGCCGAGGAAAGCAGAAGACAAGAAGCAATG
ATGCTCTCGCTTGATTTGGGTTTACTCTTGTTGTTCTGTTGGCATGTCTAGCTTTGGGAA
TGTATAACTCTTGATTGGGATAGATACATCTGTATTGTTTCTTTCTTTATGTGAACCTGA
AATGTATGAACTTTTTGATCAGAAGTCATGAAGTTTAATTCATGTCTTTCTTTTCTCAAT
AAGAGGCTGGTGAGGCTTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 
40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 10 35 35 35 
35 35 35 35 35 10 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1BK11TF U 33
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DS 

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ATGCTCTCGCTTGATTTGGGTTTACTCTTGTTGTTCTGTTGGCATGTCTAGCTTTGGGAA
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A*TTTATGAACTCTT*GATCAGAAGCCATGA
GT

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DS 

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TAAAT

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GTTTA
T

QA 1 665 1 665
DS 

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CCTCTTGCGTCGAGTTCTTGGCTCAGTGCAACGCGAGGAAGGCCAAAGAGTCGAACCCTA
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GTTCTGTTGGCATGTCTAGCTTTGGGAATGTATAACTCTTGATTGGGATAGATACATCTG
TATTGTTTCTTTCTTTATGTGAACCTGAAATGTATGAACTTTTTGATCAGAAGTCATGAA
GTTTA

QA 1 665 1 665
DS 

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GG
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TCTGTTGGCATGTCTAGCTTTGGGAATGTATAACTCTTTATTGGGATAGATACATTTGTA
TTGTTTCTTTCTTTATGTGAACCTGAAATTTATGAACTCTT*GATCAGAAGCCATGAAGT
TTAATTCATGTCTTTCTTTTCTCAATAAGAGGCTGGTGAGGCTTTGT

QA 3 649 3 649
DS 



AS 1 2

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CGAGATGTTCGTCGTCGTCTTCTTCTTCTTCTCTCAGAGCTTCTCTCTCGAACGGCTTAC
TCTCGTCGTACATCGGAGGAAGCATCTCTAGTGACTTCTGCGGCGCCAAGCTTCGTTCCG
AATCGCTTAATCCGTTGAATATCTCCAGGTCGAAGCCTAAGCGCGGAGTTGTCACTATGG
TTATACCTTTTTCAAAAGGGAGTGCACACGAACAGCCTCCTCCTGATTTGGCATCGTATT
TGTTCAAAAACAGAATTGTATATTTGGGAATGTCTCTTGTGCCTTCAGTCACTGAGTTGA
TACTCGCCGAGTTTCTTTACCTTCAGTATGAAGACTAGGACAAGCCTATTTACCTCTACA
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GTCTTCCAAAATCCCCCATGATTAACAGGTTGTTGGTTTGACCGCGGTTCAAAGGAGGAA
TCGTTGATCATTAGCACAGAACCGAGGTGAACTCTTGAAAGATGTGAAAAAATGTTACTA
CTAATGCTGAATTTTTAGGGTTATTCGTTCATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AA03TF U 1
AF RS1AA03JQ C 321
BS 1 607 RS1AA03TF
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RD RS1AA03TF 839 0 0
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CGAGATGTTCGTCGTCGTCTTCTTCTTCTTCTCTCAGAGCTTCTCTCTCGAACGGCTTAC
TCTCGTCGTACATCGGAGGAAGCATCTCTAGTGACTTCTGCGGCGCCAAGCTTCGTTCCG
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GCTTGGG*TGAAGCTGCTTTGCTTCTGACTGCTGGTGCGAAAGGAAACCGTTCTGCATTG
CCCTCATCAACTATAATGATAAAACAGCCCATTGCTCGATTTCAAGGCCAAGCAACCGAT
GTTGAAATCGCAAGGAAAGAAATCAATCACATAAAGACAGAAATGGTCAAGCTGTATTCA
AAGCATATTGGTAATCCCCGGGAGTAGATTGAAGCTGACATGAAACGCCCAAA
TATTTT

QA 1 833 1 833
DS 

RD RS1AA03JQ 793 0 0
AGTGCACACGAACAGCCTCCTC*TGATTTGGCATCGTATTTGTTCAAAAACAGAATTGTA
TATTTGGGAATGTCTCTTGTGCCTTCAGTCACTGAGTTGATACTCGCCGAGTTTCTTTAC
CTTCAGTATGAAGACTAGGACAAGCCTATTTACCTCTACATAAACTCCACGGGGACGACC
AAGAATGGTGAGAAGTTGGGCTATGATACCGAGGCTTTTGCAATTTATGATGTCATGGGG
*TATGTCAAACCACCAATCTTTACTCTTTGCGTTGGGAATGCTTGGGGTGAAGCTGCTTT
GCTTCTGACTGCTGGTGCGAAAGGAAACCGTTCTGCATTGCCCTCATCAACTATAATGAT
AAAACAGCCCATTGCTCGATTTCAAGGCCAAGCAACCGATGTTGAAATCGCAAGGAAAGA
AATCAATCACATAAAGACAGAAATGGTCAAGCTGTATTCAAAGCATATTGGTAAATCCCC
GGAGTAGATTGAAGCTGACATGAAACGCCCAAAATATTTTAGTCCCAGTGAGGCTGTTGA
ATACGGAATCATTGATAAGTTGTTTACAACGAGAGGAGCAGCCAAGACAGAGGAGTTGTG
TCCGACTTAAAAAAGGCACAACTCATCTAATGTCAGAATTGTCTTCCAAAATCCCCCATG
ATTAACAGGTTGTTGGTTTGACCGCGGTTCAAAGGAGGAATCGTTGATCATTAGCACAGA
ACCGAGGTGAACTCTTGAAAGATGTGAAAAAATGTTACTACTAATGCTGAATTTTTAGGG
TTATTCGTTCATA

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 5

CO CL1339Contig1 1060 5 11 U
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TTGTAGATCATTATTTACACAAATGCAAAGAAACGTTTATGGAATGAGTGTGTGCGCGTG
TGTCTAAATCCATACATTTAGACAGTTCAGAAAGTCTGCAAAGATTCGTACGAATAATAC
ACAAGCAGTTGTGTTCCGGCAACCATCTTTTTTATTAACATTCAAGAATCAGCCGAACCG
GGCTGCCTTTGAACCATTTCCTCTGCCGCTGGACATGCGCGTAAGAGTGTGCAGACGTCA
TTTTTAACAAGGAAATCGTTTGCATTAACCAGGATCAGAGGTCCATACTCGAACACCAAC
TTCTTGCACTTCTTCTCGTAGTTCTTGAACGATTTGCATCCCTTGAGAAGTAGCTCAACT
ATATCCAACTGAGTGTCAGGATCTTGGAGTTTGATGAGAATATCTGAAACAGTCTTGTGG
CATACAGCGCAGCTATCCTGACGGGCTTCTTCCACAAGAGCTGCCACTTTGTCACAAAGA
TTCATCCTCTTGCAGAAATCTTCAGGTTGAAACGACTCGAGTTGTATGAAGAAAAGAGGG
ACGTAGTAGTCAACCAAAGTTACGCACTGCTGTGCAAAACCGCGCATATGGGAGCACCGC
TCATGAAGGTCCTCGATAACCTGTGCTTGTGTTTCGTTTTTCTCAAGGTAGGTTATAGCA
ACGTTAACATACTCCTCACACAGAGTGCAAACCTTTTCGTTCTTTGATACTTCCTCTGAG
TCTAGGGAAGAGTGAAGGAAAGACCTAGCGTCAGAAAGCAAGGTCAAACCCAGCAGCAAG
ATAATAACCAACGTTCCAGCTTTTGGTCCCATTTGATTCCTATTTCTAAGAACAATAGAG
CAACTTAATGAATCGCAGGCTCTGGCTTGGAGGAGAAGAAGAAGGTATCAATCACAAGCA
GATCCGTTCGAATTGGTCGTTTGCGTATGAATGTTCGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RS1GG17JQ U 1
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AF RS1G431JQ U 129
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AF RS1G431TF C 465
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TTCATCCTCTTGC

QA 1 613 1 613
DS 

RD RS1B543JQ 710 0 0
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TCCGGCAACCATCTTTTTTATTAACATTCAAGAATCAGCCGAACCGGGCTGCCTTTGAAC
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CTCGTAGTTCTTGAACGATTTGCATCCCTTGAGAAGTAGCTCAACTATATCCAACTGAGT
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QA 1 710 1 710
DS 

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TTGTGTTCCGGCAACCATCTTTTTTATTAACATTCAAGAATCAGCCGAACCGGGCTGCCT
TTGAACCATTTCCTCTGCCGCTGGACATGCGCGTAAGAGTGTGCAGACGTCATTTTTAAC
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CTTGCAGAAATCTTCAGGTTGAAACGACTCGAGTTGTATGAAGAAAAGAGGGACGTAGTA
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GTCCTCGATAACCTGTGCTTGTGTT

QA 1 625 1 625
DS 

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GAAAGACCTAGCGTCAGAAAGCAAGGTCAAACCCAGCAGCAAGATAATAACCAACGTTCC
AGCTTTTGGTCCCATTTGATTCCTATTTCTAAGAACAATAGAGCAACTTAATGAATCGCA
GGCTCTGGCTTGGAGGAGAAGAAGAAGGTATCAATCACAAGCAGATCCGTTCGAATTGGT
CGTTTGCGTATGAATGTT
CCC

QA 16 753 16 753
DS 

RD RS1G431TF 596 0 0
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CACTTTGTCACAAAGATTCATCCTCTTGCAGAAATCTTCAGGTTGAAACGACTCGAGTTG
TATGAAGAAAAGAGGGACGTAGTAGTCAACCAAAGTTACGCACTGCTGTGCAAAACCGCG
CATATGGGAGCACCGCTCATGAAGGTCCTCGATAACCTGTGCTTGTGTTTCGTTTTTCTC
AAGGTAGGTTATAGCAACGTTAACATACTCCTCACACAGAGTGCAAACCTTTTCGTTCTT
TGATACTTCCTCTGAGTCTAGGGAAGAGTGAAGGAAAGACCTAGCGTCAGAAAGCAAGGT
CAAACCCAGCAGCAAGATAATAACCAACGTTCCAGCTTTTGGTCCCATTTGATTCCTATT
TCTAAGAACAATAGAGCAACTTAATGAATCGCAGGCTCTGGCTTGGAGGAGAAGAAGAAG
GTATCAATCACAAGCAGATCCGTTCGAATTGGTCGTTTGCGTATGAATGTTCGTCC

QA 1 596 1 596
DS 



AS 2 6

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TCACAACACTTGTTCTTCTCTCCACTCAAATCAATGCAAGAGAGAGCTACTTCTTTGGCA
AATTCCACCGAGAATCCCCCAAAGACCAAAACCCTAAGAATGTCCTCCCTCTCGAGACCA
GCGAGAAAACCACAGTAGAAGAATCCTTCCCAAACAAGAAAGAGCAAGAACAAGACCCTA
CCTTCGTCCCCGAGTCCGAGAACGGCTATGTCCTATATGGTCACGAGACCACCTACAACA
ACAAAGAAGAGTTCAACAACAAGGACAACAAGTACGATGAAAAATTCAACGGTGAGACTT
TCTCAACTCCAAGCCTGAGCGAGACCGAAGAGTCTTACAACAACTACGAGAAGAACATGA
TGAACAAACAGCCTGAAGAGTTTGTTGAGGAGCAAGGAGATCAGTTCAAGCCTTGATGAA
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CAACTAAGTTATTTTACTTCTAGTTGATTAGTCAAACTAAGTCGTTGTTATCATTGCAAG
TGAAAAAGGGAAAAGGGGAGGGGTCTGTGTTTTCTTTTAGTTGAAATGGGTTTGCTTTTT
ATGGGATTTTGAACTTTGATGTTTGCGTTTGCATATAATATTCGAAGAAAAGATAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CK45TF U 42
AF RS1CK45JQ C 1
BS 1 41 RS1CK45JQ
BS 42 397 RS1CK45TF
BS 398 717 RS1CK45JQ

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GAGAGCTACTTCTTTGGCAAATTCCACCGAGAATCCCCCAAAGACCAAAACCCTAAGAAT
GTCCTCCCTCTCGAGACCAGCGAGAAAACCACAGTAGAAGAATCCTTCCCAAACAAGAAA
GAGCAAGAACAAGACCCTACCTTCGTCCCCGAGTCCGAGAACGGCTATGTCCTATATGGT
CACGAGACCACCTACAACAACAAAGAAGAGTTCAACAACAAGGACAACAAGTACGATGAA
AAATTCAACGGTGAGACTTTCTCAACTCCAAGCCTGAGCGAGACCGAAGAGTCTTA

QA 1 356 1 356
DS 

RD RS1CK45JQ 717 0 0
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TCACAACACTTGTTCTTCTCTCCACTCAAATCAATGCAAGAGAGAGCTACTTCTTTGGCA
AATTCCACCGAGAATCCCCCAAAGACCAAAACCCTAAGAATGTCCTCCCTCTCGAGACCA
GCGAGAAAACCACAGTAGAAGAATCCTTCCCAAACAAGAAAGAGCAAGAACAAGACCCTA
CCTTCGTCCCCGAGTCCGAGAACGGCTATGTCCTATATGGTCACGAGACCACCTACAACA
ACAAAGAAGAGTTCAACAACAAGGACAACAAGTACGATGAAAAATTCAACGGTGAGACTT
TCTCAACTCCAAGCCTGAGCGAGACCGAAGAGTCTTACAACAACTACGAGAAGAACATGA
TGAACAAACAGCCTGAAGAGTTTGTTGAGGAGCAAGGAGATCAGTTCAAGCCTTGATGAA
GATTTGATGTTTGATTTCCTCTCAAGATCATTACAATCTTAAAAGTGTTTTCTTTTATTT
CAACTAAGTTATTTTACTTCTAGTTGATTAGTCAAACTAAGTCGTTGTTATCATTGCAAG
TGAAAAAGGGAAAAGGGGAGGGGTCTGTGTTTTCTTTTAGTTGAAATGGGTTTGCTTTTT
ATGGGATTTTGAACTTTGATGTTTGCGTTTGCATATAATATTCGAAGAAAAGATAGC

QA 1 717 1 717
DS 



CO CL1340Contig2 1184 4 9 U
GGACACTATCACATTGTCTCTTCTCTCCTCCCAATCACACTACACTAAACATCATGACTT
TCGCCACTAGAAGCTCTCTCTTCGTCTGCTTCACAACACTTGTTCTTCTCTCCACTCAAA
TCAATGCAAGAGAGAGCTACTTCTTTGGCAAATTCCACAGAGAATCCCCCAAAGACCAAA
ACCCTAACAATGTCCTCCCTCTCGAGACCAGCGAGAAAACCACAGTAGAAGAATCCTTCC
CAAACAAGAAAGAGCAAGAACAAGATCCTACCTTCGTCCCCGAGTCCGAGAACGGCTATG
GCTTATATGGTCACGAGACCACCTACAACAACAAAGAAGAGTTCAACAACAAGGACAACA
AGTACGATGAAAAATTCAACGGTGAGACTTTCTCAACTCCAAGCCTGAGCGAGACCGAAG
AGTCTTACAACAACTACGAGGAGAACTACCCGAAGAAGACCGAGAGCTACGACAACAACC
GTTACAACAACGAAGAGTTCAACAACAACAAGTACGATGAAAACGTCAAGGAAGAGTTCA
ACAACAACAACAAGTACGATGAAAACTTCAAGGAAGAGTTCAGCAACAACAACAAGTACG
ACGAAAACTTCAAGGAAGAGTCATTCTCTGAGAACAATGAAGACAAGAGAGGTATCTACA
ACTCCAACGCTTACGGAACTGAGTTAGAGCGTGAAACGCCTTACAAAGGTTACAGCCACA
ACTTGGAGAGACAAGGCATGAGTGACACAAGGTTCATGGAAAAGGGTAACTACTACTATG
ATCTTTACAACGACAGAAACCACGGCCATTTCTACCGGAAGCCTCATCAGAAAAGCCCTG
CCGGTTATTATTCTTCTCAGGCGACCGAGAATAACTACGACCAGTCGTACAACACCTACA
ACAATGAGGAGGAGAAGAGCTTCAAGGATCAGTACAATTCCAAGTGGGAGAAGAACATGA
TGAACAAACAGCCTGAAGAGTTTGTTGAGGAGCAAGGAGATCAGTTCAAGCCTTGATGAA
GATTTGATGTTTGATTTCCTCTCAAGATCACTACAATCTTAAAAGTGTTTTCTTTTATTT
CAACTAAGTTATTTTACTTCTGGTTGATTAGTCAAACTAAGTCGTTGTTATCATTGCAAG
TGAAAAAGGGAAAAGGGGAGGGGTCTGTGTTTTCTTTTAGTTGA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EF70TF U 1
AF RS1CS27TF U 3
AF RS1BI11TF U 113
AF RS1CS27JQ C 525
BS 1 126 RS1EF70TF
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BS 128 136 RS1EF70TF
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BS 148 665 RS1CS27TF
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BS 667 704 RS1CS27TF
BS 705 1184 RS1CS27JQ

RD RS1EF70TF 147 0 0
GGACACTATCACATTGTCTCTTCTCTCCTCCCAATCACACTACACTAAACATCATGACTT
TCGCCACTAGAAGCTCTCTCTTCGTCTGCTTCACAACACTTGTTCTTCTCTCCACTCAAA
TCAATG*AAGAGAGAG*TACTTCTTTG

QA 1 147 1 147
DS 

RD RS1CS27TF 702 0 0
GG
ACTATCACATTGTCTCTTCTCTCCTCCCAATCACACTACACTAAACATCATGGCTTTCGC
CACTAGAAGCTCTCTCTTCGTCTGCTTCACAACACTTGTTCTTCTCTCCACTCAAATCAA
TGCAAGAGAGAGCTACTTCTTTGGCAAATTCCACAGAGAATCCCCCAAAGACCAAAACCC
TAACAATGTCCTCCCTCTCGAGACCAGCGAGAAAACCACAGTAGAAGAATCCTTCCCAAA
CAAGAAAGAGCAAGAACAAGATCCTACCTTCGTCCCCGAGTCCGAGAACGGCTATGGCTT
ATATGGTCACGAGACCACCTACAACAACAAAGAAGAGTTCAACAACAAGGACAACAAGTA
CGATGAAAAATTCAACGGTGAGACTTTCTCAACTCCAAGCCTGAGCGAGACCGAAGAGTC
TTACAACAACTACGAGGAGAACTACCCGAAGAAGACCGAGAGCTACGACAACAACCGTTA
CAACAACGAAGAGTTCAACAACAACAAGTACGATGAAAACGTCAAGGAAGAGTTCAACAA
CAACAACAAGTACGATGAAAACTTCAAGGAAGAGTTCAGCAACAACAACAAGTACGACGA
AAACTTCAAGGAAGAGTCATTCTCTGAGAACAATGAAGACAAGAGAGGTATCTACAACTC
CCACGCTTACGGAACTGAGTTAGAGCGTGAAACGCCTTAC

QA 3 702 3 702
DS 

RD RS1BI11TF 560 0 0
G
ACTCAAATCAATGCAAGAGAGAGCTACTTCTTTGGCAAATTCCACAGAGAATCCCCCAAA
GACCAAAACCCTAACAATGTCCTCCCTCTCGAGACCAGCGAGAAAACCACAGTAGAAGAA
TCCTTCCCAAACAAGAAAGAGCAAGAACAAGATCCTACCTTCGTCCCCGAGTCCGAGAAC
GGCTATGGCTTATATGGTCACGAGACCACCTACAACAACAAAGAAGAGTTCAACAACAAG
GACAACAAGTGCGATGAAAAATTCAACGGTGAGACTTTCTCAACTCCAAGCCTGAGCGAG
ACCGAAGAGTCTTACAACAACTACGAGGAGAACTACCCGAAGAAGACCGAGAGCTACGAC
AACAACCGTTACAACAACGAAGAGTTCAACAACAACAAGTACGATGAAAACGTCAAGGAA
GAGTTCAACAACAACAACAAGTACGATGAAAACTTCAAGGAAGAGTTCAACAACAACAAC
AAGTACGACGAAAACTTCAAGGAAGAGTCATTCTCTGAGAACAATGAAGACAAGAGAGGT
ATCTACAACTCCAACGCTT

QA 2 560 2 560
DS 

RD RS1CS27JQ 660 0 0
GTCAAGGAAGAGTTCAACAACAACAACAAGTACGATGAAAACTTCAAGGAAGAGTTCAGC
AACAACAACAAGTACGACGAAAACTTCAAGGAAGAGTCATTCTCTGAGAACAATGAAGAC
AAGAGAGGTATCTACAACTCCAACGCTTACGGAACTGAGTTAGAGCGTGAAACGCCTTAC
AAAGGTTACAGCCACAACTTGGAGAGACAAGGCATGAGTGACACAAGGTTCATGGAAAAG
GGTAACTACTACTATGATCTTTACAACGACAGAAACCACGGCCATTTCTACCGGAAGCCT
CATCAGAAAAGCCCTGCCGGTTATTATTCTTCTCAGGCGACCGAGAATAACTACGACCAG
TCGTACAACACCTACAACAATGAGGAGGAGAAGAGCTTCAAGGATCAGTACAATTCCAAG
TGGGAGAAGAACATGATGAACAAACAGCCTGAAGAGTTTGTTGAGGAGCAAGGAGATCAG
TTCAAGCCTTGATGAAGATTTGATGTTTGATTTCCTCTCAAGATCACTACAATCTTAAAA
GTGTTTTCTTTTATTTCAACTAAGTTATTTTACTTCTGGTTGATTAGTCAAACTAAGTCG
TTGTTATCATTGCAAGTGAAAAAGGGAAAAGGGGAGGGGTCTGTGTTTTCTTTTAGTTGA

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 5

CO CL1341Contig1 1403 5 6 U
GCCTGTTTGTAAAACTTTCAATGTGATCAAATATGTCCCGCTAGTAACATACCATCAGAT
ATTGTGGCTTATGAAACTGGTACTCTCTTTGCGTACAAACACTTATTCAAAGTTATACAG
ATAGTTAAACAGAAGTATGAACATGGGAGTCCACTACTGACTTCAGAACCTCCTCTCCCA
TCTCCTTGCAACCCACCAGTTTAGTTCCTGCGGAGTAGATGTCTCCTGTTCTGAATCCTT
TGTTCAGAGCACCCAACACCGCGTCTTCAATTCTCTTAGCTGCCTTTTCTTCTCCAAGTC
CGTATTTGAGAAGCATTGCAGCGCTGAGGATCGTTGCCAGCGGGTTTGCTTTATCCTGTC
CAGCAATATCAGGTGCAGAACCATGTATTGGTTCAAAGAGTCCAGGTCCCGAATCGCTGA
GACTAGCAGAGGGAAGCATGCCGATGCTCCCTGTGATCATTGAAGCTTCATCGGATAATA
TATCACCAAAAATGTTGTTTGTGACAATGGTGTCAAACTGTTTAGGGTCACGAACAAGCT
GCATGGCAGCATTGTCAACATACATATGTGACAGCTCAACATCAGGATATTCAGAGGCTA
ATGTTGTTACTCGTCTCCTCCACAAAATCGAGGCCTCCAAAACATTAGCTTTGTCAACAG
AACACAGCTTGCCACGCCGTTTCCTAGCAGTTTCGAAGGCAACACGAGCAATTCTATCAA
TCTCGTGAGCAGCATAGACCTCGGTATTAAACCCAACTTCCTCGCCATTTTCATTAGTCT
TAATGCCCCTTGGCACTCCAAAGTAAATACCCCCGGTAAGCTCCCTAACAACCATTAGAT
CAACACCTTCTGCAACCTCTCTCTTCAAGGTCGAAGCATCCACTAACTGTGGAAGAACAG
TAGCAGGTCTGAGATTAGCAAAGACTTTAAGAGCGGCACGAAGTTGAAGTAACCCAGTCT
CAGGCTTCATATGTTTATCATTCATATCCCATTTGTACCCTCCAATGGCTCCAAGAAGCA
CAGCATCTGATTCTTTAGCAGCGGAGACGGTCTCCTCAGGCAAAGGCACTCCGACCAAAT
CCAAAGCAGCGCCTCCTACAGGCATCTCCCGGAAGCTAAATTCCACTCCTTCCAAGGATC
CAGCTTGGTGAAGCACATTCTTAGCAATGGAGACGACCTCCGGACCAATGCCGTCGCCGG
GAAGGAGAGTGATGTTGTAACTCTTTTTCCCGGGGGAAGCAGCAGCACATCTTACTCTAA
AGGGTGCGGGAGAAGATCGTTTGGTTAAAGCTCTGAACGTAACCGGAAACTTGACTGGAC
GGATATTCTTCTGCAGAGCCGCCGCCATTTCAGGTGATAAACACAAGGATTCGTCGTTTC
GGATTTTTTTGAAACTGTGGTCC


BQ
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25 25 25 25 5 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TGTTCAGAGCACCCAACACCGCGTCTTCAATTCTCTTAGCTGCCTTTTCTTCTCCAAGTC
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CATTTTCATTAGTCTTAATGCCCCTTGGCACTCCAAAGTAAATACCCCCGGTAAGCTCCC
TAACAACCATTAGATCAACACCTTCTGCAAC
TCTCT

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CCTGTTCTGAATCCTTTGTTCAGAGCACCCAACACCGCGTCTTCAATTCTCTTAGCTGCC
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GGGTCACGAACAAGCTGCATGGCAGCATTGTCAACATACATATGTGACAGCTCAACATCA
GGATATTCAGAGGCTAATGTTGTTACTCGTCTCCTCCACAAAATCGAGGCCTCCAAAACA
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AGCAG
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CCCAACTTCCTCGCCATTTTCATTAGTCTTAATGCCCCTTGGCACTCCAAAGTAAATACC
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CGAAGCATCCACTAACTGTGGAAGAACAGTAGCAGGTCTGAGATTAGCAAAGACTTTAAG
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TTTGTACCCTCCAATGGCTCCAAGAAGCACAGCATCTGATTCTTTAGCAGCGGAGACGGT
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QA 6 717 6 717
DS 



AS 1 4

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GAGAATGACCATTGATAAGGTGGAAGACGAGCCACGAGCTCCCGTCGAAGGTGGATGCGG
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TGCTGAGAAACCAGTTCAGGAAGCTAGGTGCATGGAAGTCCCTTCCTCTGAGCCAGAAGC
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ATCCATTGAGACAAAGAACTCTACGAACACAAGTCCTGTCGCTTCTCCAGCACTGAACAG
AGCTCTTTCTCTCTCAAGCACCTCCAATGCAGCTTCCCCAGCTGCTCAATCATTCCCCGT
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CCAACGATTCCTTGAGAAGAGACGGGACAGATTGGTCAGCAAGAATCCTTACCCTGCTTC
AGACAAGAAGACAGATGTCCCAAGAGACAATGCTTCTGTTAAGGAGGAGGAGTATCCGAC
TGCTTAGCAGAAGATCAACCAACCATCAAGGCTGTAATAAAGTTTAACGAATATATCATT
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AAGGATTATTGCAGTGTCCTAAGAGTCTGTCTTAACTAATGTCTCATGATGTTATGTTAT
TGAACTTGTTATATCTTCCAGAT


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G055TF U 1
AF RS1CY07TF U 36
AF RS1BA68TF U 7
AF RS1BA68JQ C 127
BS 1 30 RS1G055TF
BS 31 31 RS1BA68TF
BS 32 193 RS1G055TF
BS 194 194 RS1BA68TF
BS 195 442 RS1G055TF
BS 443 443 RS1BA68TF
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BS 498 638 RS1BA68TF
BS 639 923 RS1BA68JQ

RD RS1G055TF 497 0 0
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GAGAATGACCATTGATAAGGTGGAAGACGAGCCACGAGCTCCCGTCGAAGGTGGATGCGG
TTTTGGCGGCGATAATGTCACTGTACATGGTTCCATCGCCGGATCTGTCGCCGGAGAAGG
TGCTGAGAAACCAATTCAGGAAGCTAGGTGCATGGAAGTCCCTTCCTCTGAGCCAGAAGC
TCCAACCATCCGTCCTAATCAACTTACTATCTTCTTTGGTGGGAAAGTTCGCGTCTTTGA
TGGGATTCCAGCAGACAAGATTCAAGAAATCATCCGTATTGCTGCTGCTACTGCTGCTAA
ATCCATTGAGACAAAGAACTCTACGAACACAAGTCCTGTCGCTTCTCCAGCACTGAACAG
AGCTCTTTCTCTCTCAAGCACCCCCAATGCAGCTTCCCCAGCTGCTCAATCATTCCCCGT
TCACCCTATTTCCTTCT

QA 1 497 1 497
DS 

RD RS1CY07TF 526 0 0
GG
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GCTCCCGTCGAAGGTGGATGCGGTTTTGGCGGCGATAATGTCACTGTACATGGTTCCATC
GCCGGATCTGTCGCCGGAGAAGGTGCTGAGAAACCAATTCAGGAAGCTAGGTGCATGGAA
GTCCCTTCCTCTGAGCCAGAAGCTCCAACCATCCGTCCTAATCAACTTACTATCTTCTTT
GGTGGGAAAGTTCGCGTCTTTGATGGGATTCCAGCAGACAAGATTCAAGAAATCATCCGT
ATTGCTGCTGCTACTGCTGCTAAATCCATTGAGACAAAGAACTCTACGAACACAAGTCCT
GTCGCTTCTCCAGCACTGAACAGAGCTCTTTCTCTCTCAAGCACCTCCAATGCAGCTTCC
CCAGCTGCTCAATCATTCCCCGTTCACCCTATTTCCTTCTGCAGATCTGCTGCTGATCTA
CCAATTGCAAGGAGTCATTCGCTTCAACGATTCCTTGAGAAGAG

QA 3 526 3 526
DS 

RD RS1BA68TF 632 0 0
GG
AAAGACGAATAAAGCAAATCGAAACTGGAGAAGACATATCGACGAGTTCCAAGAGAATGA
CCATTGATAAGGTGGTAGACGAGCCACGAGCTCCCGTCGAAGGTGGATGCGGTTTTGGCG
GCGATAATGTCACTGTACATGGTTCCATCGCCGGATCTGTCGCCGGAGAAGGTGCTGAGA
AACCAGTTCAGGAAGCTAGGTGCATGGAAGTCCCTTCCTCTGAGCCAGAAGCTCCAACCA
TCCGTCCTAATCAACTTACTATCTTCTTTGGTGGGAAAGTTCGCGTCTTTGATGGGATTC
CAGCAGACAAGATTCAAGAAATCATCCGTATTGCTGCTGCTACTGCTGCTAAATCCATTG
AGACAAAGAACTCTACGAACACAAGTCCTGTCGCTTCTCCAGCACTGAACAGAGCTCTTT
CTCTCTCAAGCACCTCCAATGCAGCTTCCCCAGCTGCTCAATCATTCCCCGTTCACCCTA
TTTCCTTCTACAGATCTGCTGCTGATCTACCAATTGCAAGGAGGCATTCGCTCCAACGAT
TCCTTGAGAAGAGACGGGACAGATTGGTCAGCAAGAATCCTTACCCTGCTTCAGACAAGA
AGACAGATGTCCCAAGAGACAATGCTTCTG

QA 3 632 3 632
DS 

RD RS1BA68JQ 797 0 0
CGGCGATAATGTCACTGTACATGGT*CCATCGCCGGATCTGTCGCCGGAGAAGGTGCTGA
GAAACCAGTTCAGGAAGCTAGGTGCATGGAAGTCCCTTCCTCTGAGCCAGAAGCTCCAAC
CATCCGTCCTAATCAACTTACTATCTTCTTTGGTGGGAAAGTTCGCGTCTTTGATGGGAT
TCCAGCAGACAAGATTCAAGAAATCATCCGTATTGCTGCTGCTACTGCTGCTAAATCCAT
TGAGACAAAGAACTCTACGAACACAAGTCCTGTCGCTTCTCCAGCACTGAACAGAGCTCT
TTCTCTCTCAAGCACCTCCAATGCAGCTTCCCCAGCTGCTCAATCATTCCCCGTTCACCC
TATTTCCTTCTACAGATCTGCTGCTGATCTACCAATTGCAAGGAGGCATTCGCTCCAACG
ATTCCTTGAGAAGAGACGGGACAGATTGGTCAGCAAGAATCCTTACCCTGCTTCAGACAA
GAAGACAGATGTCCCAAGAGACAATGCTTCTGTTAAGGAGGAGGAGTATCCGACTGCTTA
GCAGAAGATCAACCAACCATCAAGGCTGTAATAAAGTTTAACGAATATATCATTCCTACT
AAGTGAAACGTTATGAACTTATGATAATGTAATCGTCTATGCTGCTTCTGTGTTGTATGA
TAGTGTCTGCACAGGTTTGGTAGACCTGTTTTTATCGTTTTAACGTTTTTCTCCAAGGAT
TATTGCAGTGTCCTAAGAGTCTGTCTTAACTAATGTCTCATGATGTTATGTTATTGAACT
TGTTATATCTTCCAGAT

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 5

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GGATCCATACCAAGAGAGTGACACGTCTTGATTTCCAAAGCCTTCGATATAAATCAAATC
GCATTATTACTTAGTTTTTAAATCGGGAATCATGGCGATGGCACCGGCAATGCAGACGAC
GTTCGTGTCATCGACGAACTTTCTGAAACAATCGAGACCTTCTTCATCACCTAGCAATGT
GACTCTTCCCAAAAACAAGAGATCGTCCTCCGTAGTTGTTGCCGCTGTCGGTGATGTCTC
TTCTGACGGAACCGTATATTTGATAGCCGGAGCCGCTGCCGTTGCTCTTGTCGGAACAGC
TTTTCCGATCCTCTTCAAACGCACCGACACGTGTCCGGAATGTGACGGGGCAGGATTTGT
GAGGAAGGGAGGAGCCACTTTGAGGGCCAACGCGGCAAGGAAGGATCAAGCTCAGATCGT
TTGCGCCAACTGCAATGGCCTCGGCAAGCTTAACCAGATTGATAAATAAAATAATTAACT
CTCTTCTTCTTCATTATTATTACAAACCGCTATTTCACATTCATCTTCTTCTCTGTGTAA
TATATACTCTGTAAGTTTTCCCGAAACCGTAAGAGTGTGTTCGATTCGCGATAGCTTGTT
TCGAGATACAATTGTTTTGAGCTGTTCAACTTATATGCTCTGCAACTGCAAGAGATAGTC
TCTGTTAAGTCTGCACACTGTATTTGCTCTGCAACTGCGTTAATCACATTCACCCGAACT
GTGTGTTGTTGTTCAGGTGATTTTGTATAAAAAACGTCATGTGCAGAATTTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1C960TF U 1
AF RS1GE92TF U 78
AF RS1FH36TF U 78
AF RS1BF22JQ C 166
AF RS1BF22TF U 166
BS 1 225 RS1C960TF
BS 226 226 RS1FH36TF
BS 227 271 RS1C960TF
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BS 642 774 RS1BF22TF

RD RS1C960TF 583 0 0
GGATCCATACCAAGAGAGTGACACGTCTTGATTTCCAAAGCCTTCGATATAAATCAAATC
GCATTATTACTTAGTTTTTAAATCGGGAATCATGGCGATGGCACCGGCAATGCAGACGAC
GTTCGTGTCATCGACGAACTTTCTGAAACAATCGAGACCTTCTTCATCACCTAGCAATGT
GACTCTTCCCAAAAACAAGAGATCGTCCTCCGTAGTTGTTGCCGCCGTCGGTGATGTCTC
TTCTGACGGAACCGTATATTTGATAGCCGGATCCGCTGCCGTTGCTCTTGTCGGAACAGC
TTTTCCGATCCTCTTCAAACGCACCGACACGTGTCCGGAATGTGACGGGGCAGGATTTGT
GAGGAAGGGAGGAGCCACTTTGAGGGCCAACGCGGCAAGGAAGGATCAAGCTCAGATCGT
TTGCGCCAACTGCAATGGCCTCGGCAAGCTTAACCAGATTGATAAATAAAATAATTAACT
CTCTTCTTCTTCATTATTATTACAAACCGCTATTTCACATTCATCTTCTTCTCTGTGTAA
TATATACTCTGTAAGTTTTCCCGAAACCGTAAGAGTGTGTTCG

QA 1 583 1 583
DS 

RD RS1GE92TF 513 0 0
GG
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TTGATAGCCGGATCCGCTGCCGTTGCTCTTGTCGGAACAGCTTTTCCGATCCTCTTCAAA
CGCACCGACACGTGTCCGGAATGTGACGGGGCAGGATTTGTGAGGAAGGGAGGAGCCACT
TTGAGGGCCAACGCGGCAAGGAAGGATCAAGCTCAGATCGTTTGCGCCAACTGCAATGGC
CTCGGCAAGCTTAACCAGATTGATAAATAAAATAATTAACTCTCTTCTTC***ATTATTA
TTACAAACCGCTATTTCACATTCATCTTCTTCTCTGTGTAATATATACTCTGTAAGTTTT
CCCGAAACCGTAAGAGTGTGTTCGATTCGCG

QA 3 513 3 513
DS 

RD RS1FH36TF 564 0 0
GG
AAATCGGGAATCATGGCGATGGCACCGGCAATGCAGACGACGTTCGTGTCATCGACGAAC
TTTCTGAAACAATCGAGACCTTCTTCATCACCTAGCAATGTGACTCTTCCCAAAAACAAG
AGATCGTCCTCCGTAGTTGTTGCCGCTGTCGGTGATGTCTCTTCTGACGGAACCGTATAT
TTGATAGCCGGAGCCGCTGCCGTTGCTCTTGTCGGAACAGCTTTTCCGATCCTCTTCAAA
CGCACCGACACGTGTCCGGAATGTGACGGGGCAGGATTTGTGAGGAAGGGAGGAGCCACT
TTGAGGGCCAACGCGGCAAGGAAGGATCAAGCTCAGATCGTTTGCGCCAACTGCAATGGC
CTCGGCAAGCTTAACCAGATTGATAAATAAAATAATTAACTCTCTTCTTC***ATTATTA
TTACAAACCGCTATTTCACATTCATCTTCTTCTCTGTGTAATATATACTCTGTAAGTTTT
CCCGAAACCGTAAGAGTGTGTTCGATTCGCGATAGCTTGTTTCGAGATACAATTGTTTTG
AGCTGTTCAACTTATATGCTCT

QA 3 564 3 564
DS 

RD RS1BF22JQ 609 0 0
G
TCACCTAGCAATGTGACTCTTCCCAAAAACAAGAGATCGTCCTCCGTAGTTGTTGCCGCT
GTCGGTGATGTCTCTTCTGACGGAACCGTATATTTGATAGCCGGAGCCGCTGCCGTTGCT
CTTGTCGGAACAGCTTTTCCGATCCTCTTCAAACGCACCGACACGTGTCCGGAATGTGAC
GGGGCAGGATTTGTGAGGAAGGGAGGAGCCACTTTGAGGGCCAACGCGGCAAGGAAGGAT
CAAGCTCAGATCGTTTGCGCCAACTGCAATGGCCTCGGCAAGCTTAACCAGATTGATAAA
TAAAATAATTAACTCTCTTCTTCTTCATTATTATTACAAACCGCTATTTCACATTCATCT
TCTTCTCTGTGTAATATATACTCTGTAAGTTTTCCCGAAACCGTAAGAGTGTGTTCGATT
CGCGATAGCTTGTTTCGAGATACAATTGTTTTGAGCTGTTCAACTTATATGCTCTGCAAC
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CATTCACCCGAACTGTGTGTTGTTGTTCAGGTGATTTTGTATAAAAAACGTCATGTGCAG
AATTTAGC

QA 2 609 2 609
DS 

RD RS1BF22TF 609 0 0
G
TCACCTAGCAATGTGACTCTTCCCAAAAACAAGAGATCGTCCTCCGTAGTTGTTGCCGCT
GTCGGTGATGTCTCTTCTGACGGAACCGTATATTTGATAGCCGGAGCCGCTGCCGTTGCT
CTTGTCGGAACAGCTTTTCCGATCCTCTTCAAACGCACCGACACGTGTCCGGAATGTGAC
GGGGCAGGATTTGTGAGGAAGGGAGGAGCCACTTTGAGGGCCAACGCGGCAAGGAAGGAT
CAAGCTCAGATCGTTTGCGCCAACTGCAATGGCCTCGGCAAGCTTAACCAGATTGATAAA
TAAAATAATTAACTCTCTTCTTCTTCATTATTATTACAAACCGCTATTTCACATTCATCT
TCTTCTCTGTGTAATATATACTCTGTAAGTTTTCCCGAAACCGTAAGAGTGTGTTCGATT
CGCGATAGCTTGTTTCGAGATACAATTGTTTTGAGCTGTTCAACTTATATGCTCTGCAAC
TGCAAGAGATAGTCTCTGTTAAGTCTGCACACTGTATTTGCTCTGCAACTGCGTTAATCA
CATTCACCCGAACTGTGTGTTGTTGTTCAGGTGATTTTGTATAAAAAACGTCATGTGCAG
AATTTAGC

QA 2 609 2 609
DS 



AS 1 4

CO CL1344Contig1 842 4 27 U
GAATAAACTGGTACCAATCGATTAGAAATTCGAGAAATGGATTGTAGCAAACATGTAATA
CCTAAATGAGTCCACACTTTCCTCTCTTAACGGTGGAGAATGTCTGGTTCATTAATTGTC
TGCACAGGTTAAAAGAGTACTTACCGAACATAAGAGATTACACAAAACCACCATCACATG
AAAAAAACAGACAGATCATTCTTCAAAGATCGGTCCAAGGTAGTCCCCTTCAAGGCTAGC
CAACGCCTGAAACTCCTTCTCAACCTCCATCCACTTGGTCCCAATCACCACAAATCTGAC
CAAAGTATCAACCTGAATCCTAGACATCTTCTCGTTCATGAAGATGGGGTTCTCTCCAGG
GAGGTACTTGTAATCAGGCATCTTCAGGTGAGAGAGGTAGACGTTCTCGACAGGACCACA
CCTCATGAAGACACCGTGCCTCAGCACCTTGTGCACCACACCTTCAAGTATCTCTCCTTT
GAAGATCTTGAAGGTCATCCCGCTGAAAACGACAGGGAACATAACTTCACCGGTGTGCTC
CCTGATTTTGCCCTCTCCGATCTTGTCTAGAGATGTGACTGTTAAGTAGTAGCCAAGCTC
CTTGGTTGCTCTCTTCGACGCAAAAGCCTCTAGCAACTGAACCAGAATAGTCCTCTTCAG
CATAAGACCTTTCGCATCCATGTTTTCAGCAGGGATCATCACGTTCCATGGCAACTCGAC
TTTGAGAAACATGTTTCAAACCTTTGCTTTAGAGTTTCGAAGGTGGGGAAAGAAACGAGA
ATCGACAAGAGAGAGCTTCCGAGAATCGACAAGAGAGAGCTTCGGAGAATCAACGTCGTC
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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10 10 

AF RS1FN74JQ U 1
AF RS1DQ07JQ U 211
AF RS1E269TF C 250
AF RS1DQ07TF C 250
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AAAAAAACAGACAGATCATTCTTCAAAGATCGGTCCAAGGTAGTCCCCTTCAAGGCTAGC
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CCTGATTTTGCCTTCTCCAATCTTGTCTAGAGACGTGACTGTTAAGTAGTAGCCAAGCTC
CTTGGTTGCTCTCTTAGACGCAAAAGCCTCTAGCAACTGAACCAGAATAGTCCTCTTCAG
CATAAGACCTTTCGCATCCATGTTTTCA

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CCACTTGGTCCCAATCACCACAAATCTGACCAAAGTATCAACCTGAATCCTAGACATCTT
CTCGTTCATGAAGATGGGGTTCTCTCCAGGGAGGTACTTGTAATCAGGCATCTTCAGGTG
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TAGCAACTGAACCAGAATAGTCCTCTTCAGCATAAGACCTTTCGCATCCATGTTTTCAGC
AGGGATCATCACGTTCCATGGCAAC

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GCCCTCTCCGATCTTGTCTAGAGATGTGACTGTTAAGTAGTAGCCAAGCTCCTTGGTTGC
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CC

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DS 

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AACCTGAATCCTAGACATCTTCTCGTTCATGAAGATGGGGTTCTCTCCAGGGAGGTACTT
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GACACCGTGCCTCAGCACCTTGTGCACCACACCTTCAAGTATCTCTCCTTTGAAGATCTT
GAAGGTCATCCCGCTGAAAACGACAGGGAACATAACTTCACCGGTGTGCTCCCTGATTTT
GCCCTCTCCGATCTTGTCTAGAGATGTGACTGTTAAGTAG*AGCCAAGCTCCTTGGTTGC
TCTCTTCGACGCAAAAGCCTCTAGCAACTGAACCAGAATAGTCCTCTTCAGCATAAGACC
TTTCGCATCCATGTTTTCAGCAGGGATCATCACGTTCCATGGCAACTCGACTTTGAGAAA
CATGTTTCAAACCTTTGCTTTAGAGTTTCGAAGGTGGGGAAAGAAACGAGAATCGATAAG
AGAGAGCTTCCGAGAATCGACAAGAGAGAGCTTCGGAGAATCAACGTCGTCCC

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DS 



AS 1 5

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AGCAGCTGTCAAGTTTGAATACACAAATGGTTCTCAAGTGGTCATTGGAGCAGAACGTGG
GACGCCAACATTGCTTGGATACGAAGAGTTTGAGCTTGAATCAGATGAATACATAACCAT
CATGGAAGGCACCTACGACAAAATCTTAGGGAGTGATGGGCTGACGATGCTCACTTTCAA
GACTAACAAGAACAAAACATATGGACCGTATGGTCTCGAAGGTAGCACACACTTTGATTT
CAAGGAGGAAGGTCACAAGATTACAGGGTTCCATGGACGAGCTGGTTCAGCTATTAGTGC
TATTGGAGTTTACTTAGCTCCAGTAGGCACCATCCCCTTGACTCCTGCCCAACCAACCAA
GAAGCTAGAAGCCAAGGGTGGTGAGGGAGGAACATCATGGGATGATGGTGCTTTCGACGG
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CGAAGAGTTTGAGCTTGACTATCCAAGTGAATACATCACGGAAGTAAATGGCACATTCGA
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AGCAACATATGGTCCCTTTGGGCTTACCGCTGGTGAGGCCTTCCATCTCAGAGAGGAAGG
CCACAAGATCGTGGGTTTCCATGGAAGTGCTGGTGATTTGCTTCATAAATTTGGAGTTTA
TGTCCTTCCCATCACCAACTGATCGTGGATCACATGAATTTGTCACAGCTTTTGTGGTCT
CTCTCTCTCATAATGGTCTTTGAACTTTAAATAAGTTGTTTCTACCCTTTACTAGTTTAT
ATTTGTTTCAAGTTCTTCTCTTTTGTGTTGTTGTTGTTCTGTCTAAGATGGATTTGTGAT
CCCTCTTAATGAATAAATTTTATTTGAATTATTTGTCT


BQ
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GACGCCAACATTGCTTGGATACGAAGAGTTTGAGCTTGAATCAGATGAATACATAACCAT
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TATTGGAGTTTACTTAGCTCCAGTAGGCACCATCCCCTTGACTCCTGCCCAACCAACCAA
GAAGCTAGAAGCCAAGGGTGGTGAGGGAGGAACATCATGGGATGATGGTGCTTTCGACGG
C

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DS 

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GCAGCTGTCAAGTTTGAATACACAAATGGTTCTCAAGTGGTCATTGGAGCAGAACGTGGG
ACGCCAACATTGCTTGGATACGAGGAGTTTGAGCTTGAATCAGATGAATACATAACCATC
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ATTGGAGTTTACTTAGCTCCAGTAGGCACCATCCCCTTGACTCCTGCCCAACCAACCAAG
AAGCTAGAAGCCAAGGGTGGTGAGGGAGGAACATCATGGGATGATGGTGCTTTCGACGGC
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AACAAAGGTTCTTCTGAAATCATAGGAGATGAACATGGTAAGAGTACTCTACTTGGATTC
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G

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GGAAAGAGTACTCTACTTGGATTCGAAGAGTTTGAGCTTGACTATCCAAGTGAATACATC
ACGGAAGTAAATGGCACATTCGATATAATCTTTGGGAGTGACTCCGCGGTCCTTACCATG
CTTACGTTCAAGACTAATAAGCCAGCAACATATGGTCCCTTTGGGCTTACCGCTGGTGAG
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TTGCTTCATAAATTTGGAGTTTATGTCCTTCCCATCACCAACTGATCGTGGATCACATGA
ATTTGTCACAGCTTTTGTGGTCTCTCTCTCT

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DS 

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GC
CGAGCTGGTTCAGCTATTAGTGCTATTGGAGTTTACTTAGCTCCAGTAGGCACCATCCCC
TTGACTCCTGCCCAACCAACCAAGAAGCTAGAAGCCAAGGGTGGTGAGGGAGGAACATCA
TGGGATGATGGTGCTTTCGACGGCGTAAGAAAAGTCTCTGTAGGACAAGCCCAAGATGGT
ATATCAGCGGTTAAGTTTGTGTACAACAAAGGTTCTTCTGAAATCATAGGAGATGAACAT
GGAAAGAGTACTCTACTTGGATTCGAAGAGTTTGAGCTTGACTATCCAAGTGAATACATC
ACGGAAGTAAATGGCACATTCGATATAATCTTTGGGAGTGACTCCGCGGTCCTTACCATG
CTTACGTTCAAGACTAATAAGCCAGCAACATATGGTCCCTTTGGGCTTACCGCTGGTGAG
GCCTTCCATCTCAGAGAGGAAGGCCACAAGATCGTGGGTTTCCATGGAAGTGCTGGTGAT
TTGCTTCATAAATTTGGAGTTTATGTCCTTCCCATCACCAACTGATCGTGGATCACATGA
ATTTGTCACAGCTTTTGTGGTCTCTCTCTCTCATAATGGTCTTTGAACTTTAAATAAGTT
GTTTCTACCCTTTACTAGTTTATATTTGTTTCAAGTTCTTCTCTTTTGTGTTGTTGTTGT
TCTGTCTAAGATGGATTTGTGATCCCTCTTAATGAATAAATTTTATTTGAA
CC

QA 3 713 3 713
DS 

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G
AGACTAATAAGCCAGCAACATATGGTCCCTTTGGGCTTACCGCTGGTGAGGCCTTCCATC
TCAGAGAGGAAGGCCACAAGATCGTGGGTTTCCATGGAAGTGCTGGTGATTTGCTTCATA
AATTTGGAGTTTATGTCCTTCCCATCACCAACTGATCGTGGATCACATGAATTTGTCACA
GCTTTTGTGGTCTCTCTCTCTCATAATGGTCTTTGAACTTTAAATAAGTTGTTTCTACCT
TTTACTAGTTTATATTTGTTTCAAGTTCTTCTCTTTTGTGTTGTTGTTGTTCTGTCTAAG
ATGGATTTGTGATCCCTCTTAATGAATAAATTTTATTTGAATTATTTGTCT

QA 2 352 2 352
DS 



AS 1 6

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AAAAATAAACTTATGTCTCCGCAGAATACATTTTTTTCATCCATCCTAGTACAACAACAA
GCAAAGACAATAAATAAAGCAAGAATCCAAATTCAAACTTGGTTTGTTTGTACCTTAACA
GCCTTGAACGCTGGATGAAGCAATCCAAGCTCGTCTTTCATCTCAAGTGGATTGCTAGTC
TCGTTCCTCACTCTCTTGACTTTGCGACTAGCCAAAGATTTGTGAGTGAAACCATATATT
TGCAGAATCTGGTTATCCCCAAAGTTAAAGGCTCTGTCCATTTGCTTTAGACACCGTTCC
ACGGGGTAATCCCCAAACTTCCCGCATGGTTTGCAACCCACAAAGTGAGTCACCAAGGGC
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AGTACTCCCCAGTAGCCGTGAAGATAGTATCCATTTTCTAGGAATACCTTATTACCCCAA
GTGTCACGCTGAGTAGCCAAGAGATAAACCATAGCAGACTGATCATCAGCCTCGAAAACA
GGCCTACCCTTGAGCTCACGGGTCAAAACCTTACCGGCTTCCTCACGGATCTTCCCTTTA
GGACCCATAGGAGCCCAAGTATCAAGCAAATCGAGCCCCATTGATTGTTCCTAAGCAAGA
AACTCCCAGTGTTCAACCCAATCCAATTCTTCTCATCGTAAACCATCTCATTCCACCCGT
GCATCACCAAGTTGTAATCTTTATACCTCTCCCACGGAAGCTCAAACGCCATGTCCGTAA
ACATCGCATCACTATCCATCCACCACAGAAACTCAATCTCGGGGTGAGATAGCAATAGCT
TCCTGATCAAAGGAAGCTTCGCCCAGAAACCAGCCATCTCGGCATCTAGTAAAGCCATGT
TGTAGAAGATCTCGATCCCGTGAAGCCTACAGTAATCGATCTTGTTCTTGATCGACTTCA
GCAGGTAATGGTCTCCGGCGGGATTCTCACACGGTTTCGGAGCAGAACCAGTCACCAAGA
GGACACGTGGCTTGCTCGGTCCGATGAAGTTGGGGAAGCTAGGGTTCTTAGCTAACCAGT
CGGATCTCTGTTCGTCCCAATCGGATATCTTGGGTCCGAGAGTATACGGTTTATTCGGGT
CGGGTTTCTCTTCTTCTCCTTCGTCAACGAATATCTTGTTGATGTCAAACGTCTCATAGT
TATTGCTCCCGCCGGAGTTTGCATCGCCGGAGGAAGAAGAATCGCCGCCGGTCTGTATCT
CTTCGAGCACACGGTGAGGCTCGGCTCGTTTACGAGATGCGTAGATATGCTGACGGATCT
CGTCGAGATCTTGCTCCAGAGTTCCGAACTTCCCGGCGCCGATTGTGCCACGTAGGACGA
CTACGGTGAGAACGAGACATAGAACCGTTACCTTCAAGTGACGTAATGCTCTCTGGATTC
TCCGGCACCGGTGAGCTCCCAAACACCTCTCCATCATCCTCTCCAATCTTCTTTCTAGTA
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CCCGGCCGTAATGGCCGAATT


BQ
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15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FH11JQ U 1
AF RS1FH11TF C 1
AF RS1A104JQ U 46
AF RS1A104TR U 46
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AAAAATAAACTTATGTCTCCGCAGAATACATTTTTTTCATCCATCCTAGTACAACAACAA
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TCGTTCCTCACTCTCTTGACTTTGCGACTAGCCAAAGATTTGTGAGTGAAACCATATATT
TGCAGAATCTGGTTATCCCCAAAGTTAAAGGCTCTGTCCATTTGCTTTAGACACCGTTCC
ACGGGGTAATCCCCAAACTTCCCGCATGGTTTGCAACCCACAAAGTGAGTCACCAAGGGC
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AGTACTCCCCAGTAGCCGTGAAGATAGTATCCATTTTCTAGGAATACCTTATTACCCC
CCCCGGCCGTAATC

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DS 

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AAAAATAAACTTATGTCTCCGCAGAATACATTTTTTTCATCCATCCTAGTACAACAACAA
GCAAAGACAATAAATAAAGCAAGAATCCAAATTCAAACTTGGTTTGTTTGTACCTTAACA
GCCTTGAACGCTGGATGAAGCAATCCAAGCTCGTCTTTCATCTCAAGTGGATTGCTAGTC
TCGTTCCTCACTCTCTTGACTTTGCGACTAGCCAAAGATTTGTGAGTGAAACCATATATT
TGCAGAATCTGGTTATCCCCAAAGTTAAAGGCTCTGTCCATTTGCTTTAGACACCGTTCC
ACGGGGTAATCCCCAAACTTCCCGCATGGTTTGCAACCCACAAAGTGAGTCACCAAGGGC
CATCTGTGATCGCCTAGACACGGGTGGTAGTTCTCTATCATTTCTTCGTATTTGTCGACA
AGTACTCCCCAGTAGCCGTGAAGATAGTATCCATTTTCTAGGAATACCTTATTACCCC
CCCCGGCCGTAATC

QA 1 538 1 538
DS 

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GACGAAACAAAACCAAAAAATAAACTTATGTCTCCGCAGAATACATTTTTTTCATCCATC
TTAGTACAACAACAAGCAAAGACAATAAATAAAGCAAGAATCCAAATTCAAACTTGGTTT
GTTTGTACCTTAACAGCCTTGAACGCTGGATGAAGCAATCCAAGCTCGTCTTTCATCTCA
AGTGGATTGCTAGTCTCGTTCCTCACTCTCTTGACTTTACGACTAGCCAAAGATTTGTGA
GTGAAACCATATATTTGCAGAATCTGGTTATCCCCAAAGTTAAAGGCTCTGTCCATTTGC
TTTAGACACCGTTCCACGGGGTAATCCCCAAACTTCCCGCATGGTTTGCAACCCACAAAG
TGAGTCACCAAGGGCCATCTGTGATCGCCTAGACCCGGGTGGTAGTTCTCTATCATTTCT
TCGTATTTGTCGACAAGTATTCCCCAGTAGCCGTGAAGATAGTATCCATTTTCTAGGAAT
ACCTTATTACCCCAAGTGTCACGCTGAGTAGCCAAGAGATAAACCATAGCAGACTGATCA
TCAGCTTCGAAAACAGGCCTACCCTTGAGCTCACGGGTCAAAACCTTACCGGCTTCCTCA
CGGATCTTCCCTTTAGGACCCATAGGAGCCCAAGTATCAAGCAAATCGAGCCCCATTGAT
TGTTCCTAAGCAAGAAACTCCCAGTGTTCAACCCAATCCAATTCTTCTCATCGTAAACCA
TCTCAT

QA 1 726 1 726
DS 

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GACGAAACAAAACCAAAAAATAAACTTATGTCTCCGCAGAATACATTTTTTTCATCCATC
TTAGTACAACAACAAGCAAAGACAATAAATAAAGCAAGAATCCAAATTCAAACTTGGTTT
GTTTGTACCTTAACAGCCTTGAACGCTGGATGAAGCAATCCAAGCTCGTCTTTCATCTCA
AGTGGATTGCTAGTCTCGTTCCTCACTCTCTTGACTTTACGACTAGCCAAAGATTTGTGA
GTGAAACCATATATTTGCAGAATCTGGTTATCCCCAAAGTTAAAGGCTCTGTCCATTTGC
TTTAGACACCGTTCCACGGGGTAATCCCCAAACTTCCCGCATGGTTTGCAACCCACAAAG
TGAGTCACCAAGGGCCATCTGTGATCGCCTAGACCCGGGTGGTAGTTCTCTATCATTTCT
TCGTATTTGTCGACAAGTATTCCCCAGTAGCCGTGAAGATAGTATCCATTTTCTAGGAAT
ACCTTATTACCCCAAGTGTCACGCTGAGTAGCCAAGAGATAAACCATAGCAGACTGATCA
TCAGCCTCGAAAACAGGCCTACCCTTGAGCTCACGGGTCAAAACCTTACCGGCTTCCTCA
CGGATCTTCCCTTTAGGACCCATAGGAGCCCAAGTATCAAGCAAATCGAGCCCCATTGAT
TGTTCCTAAGCAAGAAACTCCCAGTGTTCAACCCAATCCAATTCTTCTCATCGTAAACCA
TCTCATTCCACCCGTGCATCACCAAGTTGTAATCTTTATACCTCTCCCACGGAAGCTCAA
ACGCCATGTCCGTAAACATCGCATCACTATCCATCCACCACAGAAACTCAATCTCGGGGT
GAGATAGCAATAGCTTC
CTG

QA 1 857 1 857
DS 

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AACATCGCATCACTATCCATCCACCACAGAAACTCAATCTCGGGGTGAGATAGCAATAGC
TTC*TGATCAAAGGAAGCTTCGCCCAGAAACCAGCCATCTCGGCATCTAGTAAAGCCATG
TTGTAGAAGATCTCGATCCCGTGAAGCCTACAGTAATCGATCTTGTTCTTGATCGACTTC
AGCAGGTAATGGTCTCCGGCGGGATTCTCACACGGTTTCGGAGCAGAACCAGTCACCAAG
AGGACACGTGGCTTGCTCGGTCCGATGAAGTTGGGGAAGCTAGGGTTCTTAGCTAACCAG
TCGGATCTCTGTTCGTCCCAATCGGATATCTTGGGTCCGAGAGTATACGGTTTATTCGGG
TCGGGTTTCTCTTCTTCTCCTTCGTCAACGAATATCTTGTTGATGTCAAACGTCTCATAG
TTATTGCTCCCGCCGGAGTTTGCATCGCCGGAGGAAGAAGAATCGCCGCCGGTCTGTATC
TCTTCGAGCACACGGTGAGGCTCGGCTCGTTTACGAGATGCGTAGATATGCTGACGGATC
TCGTCGAGATCTTGCTCCAGAGTTCCGAACTTCCCGGCGCCGATTGTGCCACGTAGGACG
ACTACGGTGAGAACGAGACATAGAACCGTTACCTTCAAGTGACGTAATGCTCTCTGGATT
CTCCGGCACCGGTGAGCTCCCAAACACCTCTCCATCATCCTCTCCAATCTTCTTTCTAGT
AGT

QA 1 723 1 723
DS 

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TCAATCTCGGGGTGAGATAGCAATAGCTTCCTGATCAAAGGAAGCTTCGCCCAGAAACCA
GCCATCTCGGCATCTAGTAAAGCCATGTTGTAGAAGATCTCGATCCCGTGAAGCCTACAG
TAATCGATCTTGTTCTTGATCGACTTCAGCAGGTAATGGTCTCCGGCGGGATTCTCACAC
GGTTTCGGAGCAGAACCAGTCACCAAGAGGACACGTGGCTTGCTCGGTCCGATGAAGTTG
GGGAAGCTAGGGTTCTTAGCTAACCAGTCGGATCTCTGTTCGTCCCAATCGGATATCTTG
GGTCCGAGAGTATACGGTTTATTCGGGTCGGGTTTCTCTTCTTCTCCTTCGTCAACGAAT
ATCTTGTTGATGTCAAACGTCTCATAGTTATTGCTCCCGCCGGAGTTTGCATCGCCGGAG
GAAGAAGAATCGCCGCCGGTCTGTATCTCTTCGAGCACACGGTGAGGCTCGGCTCGTTTA
CGAGATGCGTAGATATGCTGACGGATCTCGTCGAGATCTTGCTCCAGAGTTCCGAACTTC
CCGGCGCCGATTGTGCCACGTAGGACGACTACGGTGAGAACGAGACATAGAACCGTTACC
TTCAAGTGACGTAATGCTCTCTGGATTCTCCGGCACCGGTGAGCTCCCAAACACCTCTCC
ATCATCCTCTCCAATCTTCTTTCTAGTAGTCCAGATCCTCTCTGTTGTGATAAAGATCTA
AATCGAGGTATTTTAAGACGAGATCTCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATT

QA 1 829 1 829
DS 



AS 2 5

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TTTTCATCAAATATCATCATCATTTTTTTGGTAAGAATCAACATCTTATCTTGGGGCGAT
ATCATTCTTCTCGACCGTGAAATCCCAAATATCACCATACTTGTCATTAAAGTCCCAAAT
GCTCATAGTGTTGTAGTCATTAATGAGCTTGTCACGAGCTCCTCTCTCCATTTTGTAAAT
CTGAGGTTCGAAGTTGTGGGGCATGTCTGGTTTATCCATCTCTATTATACAAAACACTAT
GGTAAACAAACCCCCACCTATGAACAAGTACTCACCCGGAGCATCAAAATACATCCCAGC
CGCAATAGCAGGAAGAAACAACCAAGAAATTAAACCTTGAAACCCAAATGGAGGATCCAC
AGCAGCAATATCATCTGCAATTGCTCCCCAAAACGTTCCCTTTTCAACTTCTCCTTCGTA
ATAAGTGTGAGCTCCATCGTAATAACCATACTTGAAATCCTCCATTTCAATACTGTTAAG
CTCGAACTGACCAATGGGATCTTCGTTGATATCTGGTTCGATCTGCGACAGTCCAGCCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GY01JQ U 23
AF RS1E418JQ U 1
BS 1 333 RS1E418JQ
BS 334 334 RS1GY01JQ
BS 335 373 RS1E418JQ
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BS 375 384 RS1E418JQ
BS 385 385 RS1GY01JQ
BS 386 600 RS1E418JQ

RD RS1GY01JQ 398 0 0
ACACATGGTAACACGT
TTCATTCATCATTTATAAACAGTTTTCATCAAATATCATCATCATTTTTTTGGTAAGAAT
CAACATCTTATCTTGTGGCGATATCATTCTTCTCGACCGTGAAATCCCAGATATCACCAT
ACTTGTCATTAAAGTCCCAAATGCTCATAGTGTTGTAGTCATTAATGAGCTTGTCACGAG
CTCCTCTCTCCATTTTGTAAATCTGAGGTTCGAAGTTGTGGGGCATGTCTGGTTTATCCA
TCTCTATTATACAGAACACTATGGTAAACAAACCCGCACCTATGAACAAGTACTCACCCG
GAGCATCAAAATACATCCCAGCCGCAATAGCAGGAAGAAACAACCAAGAAATTAAACCTT
GAAACCCAGATGGAGGATCCAC

QA 17 398 17 398
DS 

RD RS1E418JQ 600 0 0
AAGCACATGAAAAATACGTTATACACATGGTAACACGCTTCATTCATCATTTATAAACAG
TTTTCATCAAATATCATCATCATTTTTTTGGTAAGAATCAACATCTTATCTTGGGGCGAT
ATCATTCTTCTCGACCGTGAAATCCCAAATATCACCATACTTGTCATTAAAGTCCCAAAT
GCTCATAGTGTTGTAGTCATTAATGAGCTTGTCACGAGCTCCTCTCTCCATTTTGTAAAT
CTGAGGTTCGAAGTTGTGGGGCATGTCTGGTTTATCCATCTCTATTATACAAAACACTAT
GGTAAACAAACCCCCACCTATGAACAAGTACTCCCCCGGAGCATCAAAATACATCCCAGC
CGCAATAGCAGGAGGAAACAACCAGGAAATTAAACCTTGAAACCCAAATGGAGGATCCAC
AGCAGCAATATCATCTGCAATTGCTCCCCAAAACGTTCCCTTTTCAACTTCTCCTTCGTA
ATAAGTGTGAGCTCCATCGTAATAACCATACTTGAAATCCTCCATTTCAATACTGTTAAG
CTCGAACTGACCAATGGGATCTTCGTTGATATCTGGTTCGATCTGCGACAGTCCAGCCGC

QA 1 600 1 600
DS 



CO CL1347Contig2 810 3 9 U
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ACCATTAATTCAACGGTCACGATTCTCTCTCCCAACTCGATCCCAAAGATCATCAACTCG
AAACTCGGAGTTAGTGTTTCTGATCAGACCGCCGGTTTCTCTCCCAACGTTGTGAAATGT
GTGAGTTCCTCCTCTTGCCGGAGATTGAAGCTAGCGAAGCTGGTCTCTGCGGCTGGACTG
TCGCAGATCGAACCAGATATCAACGAAGATCCCATTGGTCAGTTCGAGCTTAACAGTATT
GAAATGGAGGATTTCAAGTATGGTTATTACGATGGAGCTCACACTTATTACGAAGGAGAA
GTTGAAAAGGGAACGTTTTGGGGAGCAATTGCAGATGATATTGCTGCTGTGGATCCTCCA
TCTGGGTTTCAAGGTTTAATCTCTTGGTTGTTTCTTCCTGCTATTGCGGCTGGGATGTAT
TTTGATGCTCCGGGTGAGTACTTGTTCATAGGTGCGGGTTTGTTTACCATAGTGTTCTGT
ATAATAGAGATGGATAAACCAGACATGCCCCACAACTTCGAACCTCAGATTTACAAAATG
GAGAGAGGAGCTCGTGACAAGCTCATTAATGACTACAACACTATGAGCATTTGGGACTTT
AATGACAAGTATGGTGATATCTGGGATTTCACGGTCGAGAAG*ATGATATCGCCACAAGA
TAAGATGTTGATTCTTAC*AAAAAATGATGATGATATTTGATGAAA*CTGTTTATAAATG
ATGAATGAACGTGTTACATGTGTAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GY01TF U 1
AF RS1GC27TF U 46
AF RS1E229TF U 46
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AAACTCGGAGTTAGTGTTTCTGATCAGACCGCCGGTTTCTCTCCCAACGTTGTGAAATGT
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TCTGGGTTTCAAGGTTTAATCTCTTGGTTGTTTCTTCCTGCTATTGCGGCTGGGATGTAT
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AATGACAAGTATGGTGATATCTGGGATT*CACGGTCGAGAG**ATGATATCGC*ACAAGA
TAAGATGTTGATTCTTAC*AAAAAATGATGATGATATTTGATGAAA*CTGTTTATAAATG
ATGA*TGAACGTGTTACATGTGTAAAAAAA

QA 1 810 1 810
DS 

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GCTGTGGATCCTCCATCTGGGTTTCAAGGTTTAATCTCTTGGTTGTTTCTTCCTGCTATT
GCGGCTGGGATGTATTTTGATGCTCCGGGTGAGTACTTGTTCATAGGTGCGGGTTTGTTT
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A*CTGTTTATAAATGATGAATGAA
CGTGTTACATGTGTA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1E229TF 745 0 0
AAAAAAACAATGGCAACCATTAATTCAACGGTCACGATTCTCTCTCCCAACTCGATCCCA
AAGATCATCAACTCGAAACTCGGAGTTAGTGTTTCTGATCAGACCGCCGGTTTCTCTCCC
AACGTTGTGAAATGTGTGAGTTCCTCCTCTTGCCGGAGATTGAAGCTAGCGAAGCTGGTC
TCTGCGGCTGGACTGTCGCAGATCGAACCAGATATCAACGAAGATCCCATTTGTCAGTTC
GAGCTTAACAGTATTGAAATGGAGGATTTCAAGTATGGTTATTACGATGGAGCTCACACT
TATTACGAAGGAGAAGTTGAAAAGGGAACGTTTTGGGGAGCAATTGCAGATGATATTGCT
GCTGTGGATCCTCCATCTGGGTTTCAAGGTTTAATCTCTTGGTTGTTTCTTCCTGCTATT
GCGGCTGGGATGTATTTTGATGCTCCGGGTGAGTACTTGTTCATAGGTGCGGGTTTGTTT
ACCATAGTGTTCTGTATAATAGAGATGGATAAACCAGACATGCCCCACAACTTCGAACCT
CAGATTTACAAAATGGAGAGAGGAGCTCGTGACAAGCTCATTAATGACTACAACACTATG
AGCATTTGGGACTTTAATGACAAGTATGGTGATATCTGGGATTTCACGGTCGAGAAG*AT
GATATCGCCACAAGATAAGATGTTGATTCTTACCAAAAAATGATGATGATATTTGATGAA
AACTGTTTATAGATGATGAATGAA
A

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 4

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TCTTTCCAGAGTTTCAGACACGGTTGTATGCTCTCTATTTGGTCGGCCATGTAGCTTGTG
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TAACAAGAATCTTCACAAACAGTGTGGAGTTCTGAGCATCTGACAATGCGCAACTGCTTC
CAATGATTCCTACACATAACCCGCATACAAGGTTGGCGAATCCAACAATGATTCCAGAAG
CGAAGATTGCATATCCAGCTCTAAGAGACTCGGCGTCATACATCTTTGATGATGGGACAC
TCTCCAACTTCGTCTGCAGAATGATTGCAACAATAACGCCATATATAGCTACAGCTTCGC
AAAAGATTACACTGATGAGATTCTTTGAAGTGATACGAGGAGCTTCAATGGCCACACCGA
TCAAACTACTTCCGGTGATGTAAATCCCCCAGGCGGCGCCGAGGACGGAGACGCCGATCG
AGATGGCGATTCCGATTGCGGAGAAAGTGTACGGCGAGATCCTTACCAACGCTGCTCCCC
ACGAGCTCGCATCTACTATTCCAGACATTCTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTT
TCTCTCGCTCGCTTATTGGCAATGGATACGATCTGTCTCTCTGTCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1AI79JQ U 2
AF RS1B355JQ U 1
AF RS1AI79TF C 52
AF RS1B355TF C 83
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RD RS1AI79JQ 644 0 0
A
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TTTTTTCTCTAGACATGAAAGTATCCATATAACAATGAAGATAATCAAGAAACCATCTTC
TTTCCAGAGTTTCAGACACGGTTGTATGCTCTCTATTTGGTCGGCCATGTAGCTTGTGCG
GACATAATGATCCCAACAATAACTCCAAACAACCCGAGAGCGCTTCCGAAGATCTCAATA
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AAGATTACACTGATGAGATTCTTTGAAGTGATACGAGGAGCTTCAATGGCCACACCGATC
AAACTACTTCCGGTGATGTAAATCCCCCAGGCGGCGCCGAGGA

QA 2 644 2 644
DS 

RD RS1B355JQ 798 0 0
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CGGACATAATGATCCCAACAATAACTCCAAACAACCCGAGAGCGCTTCCGAAGATCTCAA
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CGAAGATTGCATATCCAGCTCTAAGAGACTCGGCGTCATACATCTTTGATGATGGGACAC
TCTCCAACTTCGTCTGCAGAATGATTGCAACAATAACGCCATATATAGCTACAGCTTCGC
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TCTCTCGCTCGCTTATTG

QA 1 798 1 798
DS 

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CCACACCGATCAAACTACTTCCGGTGATGTAAATCCCCCAGGCGGCGCCGAGGACGGAGA
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CCGCTCCCCACGAGCTCGCATCTACCATTCCAGACATTCTATCTCTCTCTCTCTCTCTCT
********TTCTCTCGCTCGCTTATTGGCAATGGATACGATCTGTCTCTCTGTCC

QA 1 775 1 775
DS 

RD RS1B355TF 744 0 0
AAAAATCA
GGATACAAAGAAGT*CTCAGTTCTTACACTGGTTTTT*CTCTAGACATGAAAGTATCCAT
ATAACAATGAAGATAATCAAGAAACCATCTTCTTTCCAGAGTTTCAGACACGGTTGTATG
CTCTCTATTTGGTCGGCCATGTAGCTTGTGCGGACATAATGATCCCAACAATAACTCCAA
ACAACCCGAGAGCGCTTCCGAAGATCTCAATCACAAGAATCTTCACAAACAGTGTGGAGT
TCTGAGCATCTGACAATGCGCAACTGCTTCCAATGATTCCTACACATAACCCGCATACAA
GGTTGGCGAATCCAACAATGATTCCAGAAGCGAAGATTGCATATCCAGCTCTAAGAGACT
CGGCGTCATACATCTTTGATGATGGGACACTCTCCAACTTCGTCTGCAGAATGATTGCAA
CAATAACGCCATATATAGCTACAGCTTCGCAAAAGATTACACTGATGAGATTCTTTGAAG
TGATACGAGGAGCTTCAATGGCCGCACCGATCAAACTACTTCCGGTGATGTAAATCCCCC
AGGCGGCGCCGAGGACGGAGACGCCGATCGAGATGGCGATTCCGATTGCGGAGAAAGTGT
ACGGCGAGATCCTTACCAACGCTGCTCCCCACGAGCTCGCATCTACTATTCCAGACATTC
TATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCGCTCGCTTATTGGCAATGGATACG
ATCTGTCTCTCTGTCC

QA 9 744 9 744
DS 



AS 1 6

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ACAGAC


BQ
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 

AF RS1GD61JQ C 1
AF RS1H404JQB C 1
AF RS1GD85TF U 1
AF RS1GD85JQ C 1
AF RS1GD61TF U 1
AF RS1H404TF U 1
BS 1 306 RS1GD85TF

RD RS1GD61JQ 306 0 0
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TGTTGTTATTATTATTATTAACAAACTACTAGATAAGCTAGTAAACAGAAATTCAATTCG
ACAGAC

QA 1 306 1 306
DS 

RD RS1H404JQB 306 0 0
GAACCGCGCAACACATGTTTTAAAATGGTTCCATATATATAGTCATAAAAAAGCAGCAAA
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AAGCCTTTTGGCAGCCTCCTCCAGGTATTTTCTCTCCAGATTTTTATTGTACTCAAGGGC
CTTGAGGTCAAGAGATTGAACGATAGAGATCAACAGAAAAAAAAAACAAAAACAAATTGT
TGTTGTTATTATTATTATTAACAAACTACTAGATAAGCTAGTAAACAGAAATTCAATTCG
ACAGAC

QA 1 306 1 306
DS 

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GAACCGCGCAACACATGTTTTAAAATGGTTCCATATATATAGTCATAAAAAAGCAGCAAA
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AAGCCTTTTGGCAGCCTCCTCCAGGTATTTTCTCTCCAGATTTTTATTGTACTCAAGGGC
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ACAGAC

QA 1 306 1 306
DS 

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AAGCCTTTTGGCAGCCTCCTCCAGGTATTTTCTCTCCAGATTTTTATTGTACTCAAGGGC
CTTGAGGTCAAGAGATTGAACGATAGAGATCAACAGAAAAAAAAAACAAAAACAAATTGT
TGTTGTTATTATTATTATTAACAAACTACTAGATAAGCTAGTAAACAGAAATTCAATTCG
ACAGAC

QA 1 306 1 306
DS 

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AAGCCTTTTGGCAGCCTCCTCCAGGTATTTTCTCTCCAGATTTTTATTGTACTCAAGGGC
CTTGAGGTCAAGAGATTGAACGATAGAGATCAACAGAAAAAAAAAACAAAAACAAATTGT
TGTTGTTATTATTATTATTAACAAACTACTAGATAAGCTAGTAAACAGAAATTCAATTCG
ACAGAC

QA 1 306 1 306
DS 

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GAACCGCGCAACACATGTTTTAAAATGGTTCCATATATATAGTCATAAAAAAGCAGCAAA
AGATATTTGATTGTATGTACCCTCTCTATCATTGGCCCGGTGCTTTACTTTTGCTTCCTC
AAGCCTTTTGGCAGCCTCCTCCAGGTATTTTCTCTCCAGATTTTTATTGTACTCAAGGGC
CTTGAGGTCAAGAGATTGAACGATAGAGATCAACAGAAAAAAAAAACAAAAACAAATTGT
TGTTGTTATTATTATTATTAACAAACTACTAGATAAGCTAGTAAACAGAAATTCAATTCG
ACAGAC

QA 1 306 1 306
DS 



AS 2 6

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GGCCAAGAAAGTATTGCTTTCTCGGTTTCGCGGAGTCTCATCATTCCCTCTTTTTTTCTA
ACGCTTTCTTCATCCACACGCAAACTCAAATCCAAACCTAACCCTAAAAATGGATACCAC
CGAGCTAAAACGCGTGTTCCAAATGTTCGACAAGGACGGAGACGGTCGGATCACTAAGAA
GGAGCTAAACGATTCATTGAAAAACCTAGGGATCATTATACCAGAAAAGGAGCTATGGCA
GATGATCGACAAGATCGATGTGAATGGCGATGGTTGCGTTGACATTGAAGAGTTCGGAGA
GCTTTACAAGACGATAATGGTGGAAGACGAGGACGAGATAGGAGAAGAAGATATGAAGGA
AGCGTTCAACGTTTTCGATAGGAATGGAGATGGGTTTATCACAGTGGATGAATTGAAAGA
GGTGTTGTCTTCCCTGGGACTCAAGCAAGGTAAGACCTTGGAGGAATGTAGGAAGATGAT
CATACAAGTGGATGTTGATGGTGATGGTAGAGTTGATTACAAGGAGTTTAGGCAAATGAT
GAAAAAGGGTCGGTTTTTTTAGCTCTTTGAGCTAATAATTAACGATCTTTTTTTCTCACT
TTTGTTTTTTTTTAAAACCATTTATCTATCTCCCGCATTCTAGAATGAAAAATTAAACGA
TTGGTAAATGAATTGTTTAATAGTCTACTTTGCGAGTGCACATTGTAAAAATGTAGAACT
GTTTGTCTATTAATTAATGGGATTTGTGATGCTT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DN62TF U 1
AF RS1AJ71TF U 1
AF RS1DN62JQ C 143
BS 1 383 RS1AJ71TF
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BS 791 814 RS1DN62JQ

RD RS1DN62TF 783 0 0
GATC
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CTAAACGATTCATTGAAAAACCTAGGGATCATTATACCAGAAAAGGAGCTATGGCAGATG
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TACAAGACGATAATGGTGGAAGACGAGGACGAGATAGGAGAAGAAGATATGAAGGAAGCG
TTCAACGTTTTCGATAGGAATGGAGATGGGTTTATCACAGTGGATGAATTGAAAGAGGTG
TTGTCTTCCCTGGGACTCAAGCAAGGTAAGACCTTGGAGGAATGTAGGAAGATGATCATA
CAAGTGGATGTTGATGGTGATGGTAGAGTTGATTACAAGGAGTTTAGGCAAATGATGAAA
AAGGGTCGGTTTTTTTAGCTCTTTGAGCTAATAATTAACGATCTTTTTT*CTCACTTTTG
TTTTTTTT*AAAACCATTTATCTATCTCCCGCATTCTAGA*TGAAAA*TTAAACGAT*GG
TAAATGA*TTGTT*AATAGTCTACTTTGCGAGTGCACATTGTAAAA
TGTAGACTGTTGT

QA 5 770 5 770
DS 

RD RS1AJ71TF 795 0 0
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GGCCAAGAAAGTATTGCTTTCTCGGTTTCGCGGAGTCTCATCATTCCCTCTTTTTTTCTA
ACGCTTTCTTCATCCACACGCAAACTCAAATCCAAACCTAACCCTAAAAATGGATACCAC
CGAGCTAAAACGCGTGTTCCAAATGTTCGACAAGGACGGAGACGGTCGGATCACTAAGAA
GGAGCTAAACGATTCATTGAAAAACCTAGGGATCATTATACCAGAAAAGGAGCTATGGCA
GATGATCGACAAGATCGATGTGAATGGCGATGGTTGCGTTGACATTGAAGAGTTCGGAGA
GCTTTACAAGACGATAATGGTGGTAGACGAGGACGAGATAGGAGAAGAAGATATGAAGGA
AGCGTTCAACGTTTTCGATAGGAATGGAGATGGGTTTATCACAGTGGATGAATTGAAAGA
GGTGTTGTCTTCCTTGGGACTCAAGCAAGGTAAGACCTTGGAGGAATGTAGGAAGATGAT
CATACAAGTGGATGTTGATGGTGATGGTAGAGTTGATTACAAGGAGTTTAGACAAATGAT
GAAAAAGGGTCGGTTTTTTTAGCTCTTTGAGCTAATAATTAACGATCTTTTTTTCTCACT
TTTGTTTTTTTTTAAAACCATTTATCTATCTCCCGCATTCTAGAATGAAAAATTAAACGA
TTGGTAAATGAATTGTTTAATAGTCTACTTTGCGAGTGCACATTGTAAAA*TGTAGAACT
GTTTGTCTAT
ATTAA

QA 1 790 1 790
DS 

RD RS1DN62JQ 672 0 0
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ATGTTCGACAAGGACGGAGACGGTCGGATCACTAAGAAGGAGCTAAACGATTCATTGAAA
AACCTAGGGATCATTATACCAGAAAAGGAGCTATGGCAGATGATCGACAAGATCGATGTG
AATGGCGATGGTTGCGTTGACATTGAAGAGTTCGGAGAGCTTTACAAGACGATAATGGTG
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AATGGAGATGGGTTTATCACAGTGGATGAATTGAAAGAGGTGTTGTCTTCCCTGGGACTC
AAGCAAGGTAAGACCTTGGAGGAATGTAGGAAGATGATCATACAAGTGGATGTTGATGGT
GATGGTAGAGTTGATTACAAGGAGTTTAGGCAAATGATGAAAAAGGGTCGGTTTTTTTAG
CTCTTTGAGCTAATAATTAACGATCTTTTTTTCTCACTTTTGTTTTTTTTTAAAACCATT
TATCTATCTCCCGCATTCTAGAATGAAAAATTAAACGATTGGTAAATGAATTGTTTAATA
GTCTACTTTGCGAGTGCACATTGTAAAAATGTAGAACTGTTTGTCTATTAATTAATGGGA
TTTGTGATGCTT

QA 1 672 1 672
DS 



CO CL1350Contig2 833 3 5 U
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TCTCCAAGGGGCCAAGAAAGTACTGCTTTCTCGGTTTCGCGGAGTCTCATCATTCCCTCT
TTTTTTAACGCTTTCTTCATCCACACGCAAACTCAAATCCAAAACCTAACCCTAAAAATG
GATACCACCGAGCTAAAACGTGTGTTCCAAATGTTCGACAAGGACGGAGACGGTCGGATC
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CTATGGCAGATGATCGACAAGATCGATGTAAATGGTGATGGTTGCGCTGACATTGAAGAG
TTTGGAGAGCTTTACAAGACGATAATGGTGGAAGACGAGGACGAGATAGGAGAAGAAGAT
ATGAAGGAAGCGTTCAACGTTTTCGATAGGAATGGAGATGGGTTTATCACGGTGGATGAG
TTGAAAGCGGTGTTGTCTTCCTTGGGACTCAAGCAAGGTAAGACCTTGGAGGAATGTAGG
AAGATGATCATACAAGTGGATGTTGATGGTGATGGTAGAGTTGATTACAAGGAGTTTAGA
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TTTCTTTCACTTTTGTTTTATCTTTTTTTTTTACTATTTATCTCTCGCATTCTAGAAAGG
AAAAATTAAACGATTGGTAAATGAATTGTTTAATAGTCTAATTTGCGAGAGCATATTGTA
AAAATTGTAGAACTGTTTGTCTATTAATTAATGGGATTTGTGATGATTGTAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AP02TFB U 1
AF RS1AP02JQ C 58
AF RS1GZ32TF U 321
BS 1 662 RS1AP02TFB
BS 663 691 RS1GZ32TF
BS 692 692 RS1AP02JQ
BS 693 825 RS1GZ32TF
BS 826 833 RS1AP02JQ

RD RS1AP02TFB 665 0 0
GGGATTTTCAATCACATTTCTGTAACATTCTCCTTAGTTTCTGAAACTCCCCTTACCGGG
TCTCCAAGGGGCCAAGAAAGTACTGCTTTCTCGGTTTCGCGGAGTCTCATCATTCCCTCT
TTTTTTAACGCTTTCTTCATCCACACGCAAACTCAAATCCAAAACCTAACCCTAAAAATG
GATACCACCGAGCTAAAACGTGTGTTCCAAATGTTCGACAAGGACGGAGACGGTCGGATC
ACTAAGAAGGAGCTAAACGATTCATTGAAAAACCTAGGGATCATAATACCAGAAAAAGAG
CTATGGCAGATGATCGACAAGATCGATGTAAATGGTGATGGTTGCGCTGACATTGAAGAG
TTTGGAGAGCTTTACAAGACGATAATGGTGGAAGACGAGGACGAGATAGGAGAAGAAGAT
ATGAAGGAAGCGTTCAACGTTTTCGATAGGAATGGAGATGGGTTTATCACGGTGGATGAG
TTGAAAGCGGTGTTGTCTTCCTTGGGACTCAAGCAAGGTAAGACCTTGGAGGAATGTAGG
AAGATGATCATACAAGTGGATGTTGATGGTGATGGTAGAGTTGATTACAAGGAGTTTAGA
CAAATGATGAAAAAGGGTCGGTTTTTTTAGCTCTTTGAGCTGATAATTAACTATCTTTTT
TT
TCT

QA 1 662 1 662
DS 

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TCTTTTTTTAACGCTTTCTTCATCCACACGCAAACTCAAATCCAAAACCTAACCCTAAAA
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ATCACTAAGAAGGAGCTAAACGATTCATTGAAAAACCTAGGGATCATAATACCAGAAAAA
GAGCTATGGCAGATGATCGACAAGATCGATGTAAATGGTGATGGTTGCGCTGACATTGAA
GAGTTTGGAGAGCTTTACAAGACGATAATGGTGGAAGACGAGGACGAGATAGGAGAAGAA
GATATGAAGGAAGCGTTCAACGTTTTCGATAGGAATGGAGATGGGTTTATCACGGTGGAT
GAGTTGAAAGCGGTGTTGTCTTCCTTGGGACTCAAGCAAGGTAAGACCTTGGAGGAATGT
AGGAAGATGATCATACAAGTGGATGTTGATGGTGATGGTAGAGTTGATTACAAGGAGTTT
AGACAAATGATGAAAAAGGGTCGGTTTTTTTAGCTCTTTGAGCTGATAATTAACTATCTT
TTTTTTCTTTCACTTTTGTTTTATCTTTTTTTTTTACTATTTATCTCTCGCATTCTAGAA
AGGAAAAATTAAACGATTGGTAAATGAATTGTTTAATAGTCTAATTTGCGAGAGCATATT
GTAAAAATTGTAGAACTGTTTGTCTATTAATTAATGGGATTTGTGATGATTGTAAT

QA 1 776 1 776
DS 

RD RS1GZ32TF 510 0 0
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GATAATGGTGGAAGACGAGGACGAGATAGGAGAAGAAGATATGAAGGAAGCGTTCAACGT
TTTCGATAGGAATGGAGATGGGTTTATCACGGTGGATGAGTTGAAAGCGGTGTTGTCTTC
CTTGGGACTCAAGCAAGGTAAGACCTTGGAGGAATGTAGGAAGATGATCATACAAGTGGA
TGTTGATGGTGATGGTAGAGTTGATTACAAGGAGTTTAGACAAATGATGAAAAAGGGTCG
GTTTTTTTAGCTCTTTGAGCTGATAATTAACTATCTTTTTTTTCTTTCACTTTTGTTTTA
TCTTTTTTTTT*ACTATTTATCTCTCGCATTCTAGAAAGGAAAAATTAAACGATTGGTAA
ATGAATTGTTTAATAGTCTAATTTGCGAGAGCATATTGTAAAAATTGTAGAACTGTTTGT
CTATTAATTAATGGGATTTGTGATG
ATTGT

QA 1 505 1 505
DS 



AS 1 5

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TATATTAAAAACATCCAGGTGAGAAGGTGACATTAGTAAAAGGCTTGAGCCTTGAGCTCA
TCACTGTTCAAGCGATGCAAGAAGAAAACACTTAAAAACAGAGCACTGAATCAAGAATGA
GACATGTCTGGCCAAAGTCATGGGAATCAAACGAATGTCAAACTGCAAGACATCAGAGAC
GAAGAACCCTGAGGTTCCACTTCCATCCCATACTGAAACGTGTAAGCTCAAAGGCTGCTC
TGAACAGAACAGCTTGAATTAGATGACTGAACACCCAAGCTGCATCTTTGGTCAGAACAT
GAGATTGGTGTTGTTGTTACTGCGCTCCCTGGATCAAAGTAAGTCAACTGAATCTCCTGT
GTTTTGAGGGTAGCCAATGCAAGAAGCACATTAATCTCAAATCAGAGAATTTACTTGGAG
TTCACTGGTTTGAGGGCAGCCATCGCAAGAAGCATAACTAACACACGAAACATCACCTCC
TGTGTCAATCTGTACTTGAAAGGCTCTTGGCAGAGATCAAAGCCGCAATTTTCTGTAGTA
TGACATTGACATCCACCAACAGAAGATCAGCCCACATGAGCTCCCCACCACGTTTGACGT
TTCTGGTTTCCCAGAATCGCAACAGTCGCGCCTCCACGACGGCGGAGCACTGGGCGGACT
TCAGATCGGAGAAGAACACCCTAGTCATAGCCATTAAGAGAGATGAAGTTAAAGGTTGGA
ATTTGCGTGACCAAGATTGCAGAGAGATTAAGAGGTCAAGAAAAAATATAAAAGAGTGAG
CTATGAACCTTCTTATAACACATACAGATATGAACAGCGCAACCGAAGAGACCGCATTAG
AGGCACGAATTAAAGACATCCGGAGTAATTACGATGACCACGCAACGCAGCCTTGCAGCA
TCCGTTTCGTCAAGATCGGCGCCGATGGAGGCAGCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCC
GGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1FG37JQ U 1
AF RS1A306JQ U 41
AF RS1A306TR U 41
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RD RS1FG37JQ 729 0 0
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TTCTGGTTTCCCAGAATCGCAACAGTCGCGCCTCCACGACGGCGGAGCACTGGGCGGACT
TCAGATCGG

QA 1 729 1 729
DS 

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TGCATCTTTGGTCAGAACATGAGATTGGTGTTGTTGTTACTGCGCTCCCTGGATCAAAGT
AAGTCAACTGAATCTCCTGTGTTTTGAGGGTAGCCAATGCAAGAAGCACATTAATCTCAA
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CTCCCCACCACGTTTGACGTTTCTGGTTTCCCAGAATCGCAACAGTCGCGCCTCCACGAC
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AAAAAATATAAAAGAGTGAGCTATGAACCTTCTTATAACACATACAGATATGA

QA 1 833 1 833
DS 

RD RS1A306TR 933 0 0
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AGGCTTGAGCCTTGAGCTCATCACTGTTCAAGCGATGCAAGAAGAAAACACTTAAAAACA
GAGCACTGAATCAAGAATGAGACATGTCTGGCCAAAGTCATGGGAATCAAACGAATGTCA
AACTGCAAGACATCAGAGACGAAGAACCCTGAGGTTCCACTTCCATCCCATACTGAAACG
TGTAAGCTCAAAGGCTGCTCTGAACAGAACAGCTTGAATTAGATGACTGAACACCCAAGC
TGCATCTTTGGTCAGAACATGAGATTGGTGTTGTTGTTACTGCGCTCCCTGGATCAAAGT
AAGTCAACTGAATCTCCTGTGTTTTGAGGGTAGCCAATGCAAGAAGCACATTAATCTCAA
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CTCCCCACCACGTTTGACGTTTCTGGTTTCCCAGAATCGCAACAGTCGCGCCTCCACGAC
GGCGGAGCACTGGGCGGACTTCAGATCGGAGAAGAACACCCTAGTCATAGCCATTAAGAG
AGATGAAGTTAAAGGTTGGAATTTGCGTGACCAAGATTGCAGAGAGATTAAGAGGTCAAG
AAAAAATATAAAAGAGTGAGCTATGAACCTTCTTATAACACATACAGATATGAACAGCGC
AACCGAAGAGACCGCATTAGAGGCACGAATTAAAGACATCCGGAGTAATTACGATGACCA
CGCAACGCAGCCTTGCAGCATCCGTTTCGTCAA

QA 1 933 1 933
DS 

RD RS1A306TV 906 0 0
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ATGGGAATCAAACGAATGTCAAACTGCAAGACATCAGAGACGAAGAACCCTGAGGTTCCA
CTTCCATCCCATACTGAAACGTGTAAGCTCAAAGGCTGCTCTGAACAGAACAGCTTGAAT
TAGATGACTGAACACCCAAGCTGCATCTTTGGTCAGAACATGAGATTGGTGTTGTTGTTA
CTGCGCTCCCTGGATCAAAGTAAGTCAACTGAATCTCCTGTGTTTTGAGGGTAGCCAATG
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CCATCGCAAGAAGCATAACTAACACACGAAACATCACCTCCTGTGTCAATCTGTACTTGA
AAGGCTCTTGGCAGAGATCAAAGCCGCAATTTTCTGTAGTATGACATTGACATCCACCAA
CAGAAGATCAGCCCACATGAGCTCCCCACCACGTTTGACGTTTCTGGTTTCCCAGAATCG
CAACAGTCGCGCCTCCACGACGGCGGAGCACTGGGCGGACTTCAGATCGGAGAAGAACAC
CCTAGTCATAGCCATTAAGAGAGATGAAGTTAAAGGTTGGAATTTGCGTGACCAAGATTG
CAGAGAGATTAAGAGGTCAAGAAAAAATATAAAAGAGTGAGCTATGAACCTTCTTATAAC
ACATACAGATATGAACAGCGCAACCGAAGAGACCGCATTAGAGGCACGAATTAAAGACAT
CCGGAGTAATTACGATGACCACGCAACGCAGCCTTGCAGCATCCGTTTCGTCAAGATCGG
CGCCGATGGAGGCAGCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCG
TCGACT

QA 1 906 1 906
DS 

RD RS1A306TF 874 0 0
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AGGCTGCTCTGAACAGAACAGCTTGAATTAGATGACTGAACACCCAAGCTGCATCTTTGG
TCAGAACATGAGATTGGTGTTGTTGTTACTGCGCTCCCTGGATCAAAGTAAGTCAACTGA
ATCTCCTGTGTTTTGAGGGTAGCCAATGCAAGAAGCACATTAATCTCAAATCAGAGAATT
TACTTGGAGTTCACTGGTTTGAGGGCAGCCATCGCAAGAAGCATAACTAACACACGAAAC
ATCACCTCCTGTGTCAATCTGTACTTGAAAGGCTCTTGGCAGAGATCAAAGCCGCAATTT
TCTGTAGTATGACATTGACATCCACCAACAGAAGATCAGCCCACATGAGCTCCCCACCAC
GTTTGACGTTTCTGGTTTCCCAGAATCGCAACAGTCGCGCCTCCACGACGGCGGAGCACT
GGGCGGACTTCAGATCGGAGAAGAACACCCTAGTCATAGCCATTAAGAGAGATGAAGTTA
AAGGTTGGAATTTGCGTGACCAAGATTGCAGAGAGATTAAGAGGTCAAGAAAAAATATAA
AAGAGTGAGCTATGAACCTTCTTATAACACATACAGATATGAACAGCGCAACCGAAGAGA
CCGCATTAGAGGCACGAATTAAAGACATCCGGAGTAATTACGATGACCACGCAACGCAGC
CTTGCAGCATCCGTTTCGTCAAGATCGGCGCCGATGGAGGCAGCCCCCGGCCGTAATGGC
CGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 874 1 874
DS 



AS 2 6

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ATGAAAACAAATTCTACAGTTTTAAGCACTAAAGGAAAGACACACTTCAATCTGTATCTC
AGAAGAAGCCAATGGGAACAATCCACACAGTTTCTTTGTCTAAAACCCGAATATGAAGAA
AAGAAAGATAGAAAAAGAACCCAATCAATCACTCATTCAGGCCATGATTTTGGCAGACCG
GACATAAAGGCTGTCAACGACTTTCCCCATGTTAGCAATGGTGTCAAGAGTAGCCGAGTA
GATAGCATCCGCCTTTGGATCTTCGAATATGATGAGGCATCCAGCTCCTTGATCCAACGT
ACCTGCGAACTTCTTGTCAAGTATCATCTGAGACAGCTTCTTCTCCACATGGTCGATAGG
CAACCCAATCAGATCAGCAACGTGGGCGATCTCAACTCGTGAGAAAGGCTCGATCAAACG
ACACAGGTTCTGCTCCAGAAGCGTGTCGTAAAGAGAAGAAAGATGCCTGTGGACAATCGG
GTCATCCTCCAGCTGAGCTTTGTAGTCACGGAGAGCGTTCTCAAACAGTTTCAACGACCT
CTTGGAGTGAGCGTCAGCGACCGCCTTCATGGCATCTAGATCAGGGCCAACGTACTGGAG
TCCAGCCTTTGAGGAGATGATTCCGGCAACGTCATCAGCCTGGCTAACCATGATCTTGCA
CAACAACATGTACTTCAAACTGAAAACGGCTCTTGGATCTCCCAGAGCGTTGAAAGACTC
AAAGGCTTCAAAGAAGTAGCTGTATCCGGTTTTGTAGTCCTTCTCTTCAGCGTGAAGATC
CCACTCTGCAGATCAATAGTACTTGCTGGGCCGTGGGACATATATAGCATTTGCAGCTGT
CCTGGCAGCAGTGAGTGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AA01JQ U 1
AF RS1BC23JQ U 1
AF RS1E656JQ U 63
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AAGAAAGATAGAAAAAGAACCCAATCAATCACTCATTCAGGCCATGATTTTGGCAGACCG
GACATAAAGGCTGTCAACGACTTTCCCCATGTTAGCAATGGTGTCAAGAGTAGCCGAGTA
GATAGCATCCGCCTTTGGATCTTCGAATATGATGAGGCATCCAGCTCCTTGATCCAACGT
ACCTGCGAACTTCTTGTCAAGTATCATCTGAGACAGCTTCTTCTCCACATGGTCGATAGG
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GG
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AAGATAGAAGAAGAACCCAATCAATCACTCATTCAGGCCATGATTTTGGCAGACCGGACA
TAAAGGCTGTCAACGACCTTCCCCATGTTAGCAAGGGTGTCAAGAGTAGCCGAGTAGATA
GCATCCGCCTTTGGATCTTCGAATATGATGAGGCATCCAGCTCCTTGATCCAACGTACCT
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QA 3 856 3 856
DS 



CO CL1352Contig2 1016 3 25 U
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AGCTGGACTCCAGTACGTTGGCCCTGATCTAGATGCATGAAGCGGTCGCTGACGCG


BQ
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AF RS1BC23TF U 200
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GGCGGTTTTGAGTTTGTTACATACAACCCAACCACAATGGTTTCGTTTCCCGCTACAACC
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GTCTTGGAAGACCCTTCTTCCTCTCCAGAGTCTCTCCGGATCAAGGAGCAAGCCATCAGC
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ATTATCGATGCTGTCGCCAAGATCCCTGGAACCACTCATCTCCAGATCACTCTCTGCAAA
GAGATGGTGGAGTGGACGCGCGCCGAGAAGCGTACTTTCCTCAGACAGAGAGTTGAGGCC
AGGCTAGCTTCGCTTCTGATGGAGAACAAGGAGTACGTTGAAGCGTTGGCGCTGTTGAGT
ACTTTGGTTAAAGAGG

QA 1 616 1 616
DS 

RD RS1AA01TF 672 0 0
G
AGAAGCCAACAGCTCGGAGGCTATTCAGATACTCTACCAGGTCTTGGAAGACCCTTCTTC
CTCTCCAGAGTCTCTCCGGATCAAGGAGCAAGCCATCAGCAACCTCTGCGAACGTCTCAC
CGAAGAGAAGAGAGGCGAGGATCTCCGGACACTCTTGACCAAGTTGAGACCTTTCTTCTC
CCTCATCCCCAAGGCCAAGACCGCCAAAATCGTCAGAGGGATTATCGATGCTGTCGCCAA
GATCCC*GGAACCACTCATCTCCAGATCACTCTCTGCAAAGAGATGGTGGAGTGGACGCG
CGCCGAGAAGCGTACTTTCCTCAGGCAGAGAGTTGAGGCGAGGCTAGCTTCGCTTCTGAT
GGAGAACAAGGAGTACGTTGAAGCTTTGGCGCTGCTGAGTACTTTGGTTAAAGAGGTTAG
GAGGTTAGATGATAAGCTCCTTTTGGTTGACATTGACTTGTTGGAGAGCAAGCTTCACTT
CTCCTTGAGGAACTTACCCAAGGCCAAAGCTGCACTCACTGCTGCCAGGACAGCTGCAAA
TGCTATTTATGTCCCACCGGCACAGCAAGGTACTATTGATCTCCAGAGTGGGATCCTTCA
CGCTGAAGAGAAGGACTACAAAACCGGATACAGCTACTTCTTTGAAGCCTTTGAGTCTTT
CAACGCTCT
CG

QA 2 670 2 670
DS 

RD RS1BC23TF 817 0 0
G
AGAAGCCAACAGCTCGGAGGCTATTCAGATACTCTACCAGGTCTTGGAAGACCCTTCTTC
CTCTCCAGAGTCTCTCCGGATCAAGGAGCAAGCCATCAGCAACCTCTGCGAACGTCTCAC
CGAAGAGAAGAGAGGCGAGGATCTCCGGACACTCTTGACCAAGTTGAGACCTTTCTTCTC
CCTCATCCCCAAGGCCAAGACCGCCAAAATCGTCAGAGGGATTATCGATGCTGTCGCCAA
GATCCC*GGAACCACTCATCTCCAGATCACTCTCTGCAAAGAGATGGTGGAGTGGACGCG
CGCCGAGAAGCGTACTTTCCTCAGGCAGAGAGTTGAGGCGAGGCTAGCTTCGCTTCTGAT
GGAGAACAAGGAGTACGTTGAAGCTTTGGCGCTGCTGAGTACTTTGGTTAAAGAGGTTAG
GAGGTTAGATGATAAGCTCCTTTTGGTTGACATTGACTTGTTGGAGAGCAAGCTTCACTT
CTCCTTGAGGAACTTACCCAAGGCCAAAGCTGCACTCACTGCTGCCAGGACAGCTGCAAA
TGCTATTTATGTCCCACCGGCACAGCAAGGTACTATTGATCTCCAGAGTGGGATCCTTCA
CGCTGAAGAGAAGGACTACAAAACCGGATACAGCTACTTCTTTGAAGCCTTTGAGTCTTT
CAACGCTCTCGGAGATCCAAGAGCCGTTTTCAGTTTGAAGTACATGTTGTTGTGCAAGAT
CATGGTTAGCCAGGCTGATGACGTTGCAGATATCTCCTCAAGCTGGACTCCAGTACGTTG
GCCCTGATCTAGATGCATGAAGCGGTCGCTGACGCG

QA 2 817 2 817
DS 



AS 1 5

CO CL1353Contig1 747 5 11 U
GGAGGGTTGAGACTTGAGCGAGAGATGAGCAGCTTCGCGGTTCCACTTTCTTCCTCGTCC
TCTCTCTCCAATGCCTATCATCAACCTTCTCGTGTTCGCTTCGATTTCCGCAATCCTCGT
TCCATGTTTGAGATTCGCGGGATACGACTAAGTGGGAGGGTTCGAAGAACATCTTTAAAG
TGCAATTGCTGCAGCAAAGGGAACGGAGGTGAAAACGAAAACAGAAATGTGTTAGATGCT
TTCTTTCTGGGAAAGGCACTAGCTGAGGTTATGAACGAGCGAATTGAGTCCGCAGTTGGC
GAAGTTTTGGGTAATATTGGAAGGTTTCAGGCTGAGCAACAGAAGCAAGTTCAAGAGATT
CAGGGAGAGGTGCTAGAAAGAGCCAAGAAAGCTAAAGAAAGAGCAGCTAGGGAAACCGTG
GAGGCACAAGGACTCGTACCGGAATCCACAAACCCAAAACCAGCTGCTGGTGCTGTTGCC
TCTGTTGTAAACCCTACCTCGATCGTTGAAAGCAAGGCTATAAGAAATGATGAGAAGCTG
CCGGGTTTCTCCGGATCTTCAGAGCCCGACATTATGGATAGCTCGAGTTCTATCGACGAA
GACAGTGACTAAGGGATTGTTCCTTGGGCCAATTTCAAGGTTTGGTTATAGTATCGGACT
TTTTTGAAACGGTTGATAACATCTTCGTTGATATATGTGCTTATAACGATGGAAGTTGAG
AATAAATAACCTTGATATTATTTGTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 5 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GD25TF U 1
AF RS1DX69TF U 14
AF RS1EE69TF U 14
AF RS1AQ34TFB U 14
AF RS1DX69JQ C 93
BS 1 184 RS1GD25TF
BS 185 185 RS1AQ34TFB
BS 186 203 RS1GD25TF
BS 204 204 RS1AQ34TFB
BS 205 472 RS1GD25TF
BS 473 473 RS1DX69TF
BS 474 634 RS1GD25TF
BS 635 661 RS1AQ34TFB
BS 662 662 RS1DX69TF
BS 663 721 RS1AQ34TFB
BS 722 747 RS1DX69JQ

RD RS1GD25TF 634 0 0
GGAGGGTTGAGACTTGAGCGAGAGATGAGCAGCTTCGCGGTTCCACTTTCTTCCTCGTCC
TCTCTCTCCAATGCCTATCATCAACCTTCTCGTGTTCGCTTCGATTTCCGCAATCCTCGT
TCCATGTTTGAGATTCGCGGGATACGACTAAGTGGGAGGGTTCGAAGAACATCTTTAAAG
TGCAGTTGCTGCAGCAAAGGGAATGGAGGTGAAAACGAAAACAGAAATGTGTTAGATGCT
TTCTTTCTGGGAAAGGCACTAGCTGAGGTTATGAACGAGCGAATTGAGTCCGCAGTTGGC
GAAGTTTTGGGTAATATTGGAAGGTTTCAGGCTGAGCAACAGAAGCAAGTTCAAGAGATT
CAGGGAGAGGTGCTAGAAAGAGCCAAGAAAGCTAAAGAAAGAGCAGCTAGGGAAACCGTG
GAGGCACAAGGACTCGTACCGGAATCCACAAACCCAAAACCAGCTGCTGGTGTTGTTGCC
TCTGTTGTAAACCCTACCTCGATCGTTGAAAGCAAGGCTATAAGAAATGATGAGAAGCTG
CCGGGTTTCTCCGGATCTTCAGAGCCCGACATTATGGATAGCTCGAGTTCTATCGACGAA
GACAGTGACTAAGGGATTGTTCCTTGGGCCAATT

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1DX69TF 654 0 0
GG
GAGCGAGAGATGAGCAGCTTCGCGGTTCCACTTTCTTCCTCGTCCTCTCTCTCCAATGCC
TATCATCAACCTTCTCGTGTTCGCTTCGATTTCCGCAATCCTCGTTCCATGTTTGAGATT
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AAAGGGAACGGAGGTGAAAACGAAAACAGAAATGTGTTAGATGCTTTCTTTCTGGGAAAG
GCACTAGCTGAGGTTATGAACGAGCGAATTGAGTCCGCAGTTGGCGAAGTTTTGGGTAAT
ATTGGAAGGTTTCAGGCTGAGCAACAGAAGCAAGTTCAAGAGATTCAGGGAGAGGTGCTG
GAAAGAGCCAAGAAAGCTAAAGAAAGAGCAGCTAGGGAAACCGTGGAGGCACAAGGACTC
GTGCCGGAATCCACAAACCCAAAACCAGCTGCTGGTGCTGTTGCCTCTGTTGTAAACCCT
ACCTCGATCGTTGAAAGCAAGGCTATAAGAAATGATGAGAAGCTGCCGGGTTTCTCCGGA
TCTTCAGAGCCCGACATTATGGATAGCTCGAGTTCTATCGACGAAGACAGTGACTAAGGG
ATTGTTCCTTGGGCCAATTTCAAG*TTTGGTTATAGTATCGGACTTTTTTGA

QA 3 654 3 654
DS 

RD RS1EE69TF 708 0 0
TT
GAGCGAGAGATGAGCAGCTTCGCGGTTCCACTTTCTTCCTCGTCCTCTCTCTCCAATGCC
TATCATCAACCTTCTCGTGTTCGCTTCGATTTCCGCAATCCTCGTTCCATGTTTGAGATT
CGCGGGATACGACTAAGTGGGAGGGTTCGAAGAACATCTTTAAAGTGCAATTGCTGCAGC
AAAGGGAACGGAGGTGAAAACGAAAACAGAAATGTGTTAGATGCTTTCTTTCTGGGAAAG
GCACTAGCTGAGGTTATGAACGAGCGAATTGAGTCCGCAGTTGGCGAAGTTTTGGGTAAT
ATTGGAAGGTTTCAGGCTGAGCAACAGAAGCAAGTTCAAGAGATTCAGGGAGAGGTGCTA
GAAAGAGCCAAGAAAGCTAAAGAAAGAGCAGCTAGGGAAACCGTGGAGGCACAAGGACTC
GTACCGGAATCCACAAACCCAAAACCAGCTGCTGGTGTTGTTGCCTCTGTTGTAAACCCT
ACCTCGATCGTTGAAAGCAAGGCTATAAGAAATGATGAGAAGCTGCCGGGTTTCTCCGGA
TCTTCAGAGCCCGACATTATGGATAGCTCGAGTTCTATCGACGAAGACAGTGACTAAGGG
ATTGTTCCTTGGGCCAATTTCAAGGTTTGGTTATAGTATCGGACTTGTTTGAAACGGTTG
ATAACATCTTCGTTGATATATGTGCTTATAACGATGGAAG
CTGAGA

QA 3 702 3 702
DS 

RD RS1AQ34TFB 710 0 0
GG
GAGCGAGAGATGAGCAGCTTCGCGGTTCCACTTTCTTCCTCGTCCTCTCTCTCCAATGCC
TATCATCAACCTTCTCGTGTTCGCTTCGATTTCCGCAATCCTCGTTCCATGTTTGAGATT
CGCGGGATACGACTAAGTGGGAGGGTTCGAAGAACATCTTTAAAGTGCAATTGCTGCAGC
AAAGGGAACGGAGGTGAAAACGAAAACAGAAATGTGTTAGATGCTTTCTTTCTGGGAAAG
GCACTAGCTGAGGTTATGAACGAGCGAATTGAGTCCGCAGTTGGCGAAGTTTTGGGTAAT
ATTGGAAGGTTTCAGGCTGAGCAACAGAAGCAAGTTCAAGAGATTCAGGGAGAGGTGCTA
GAAAGAGCCAAGAAAGCTAAAGAAAGAGCAGCTAGGGAAACCGTGGAGGCACAAGGACTC
GTACCGGAATCCACAAACCCAAAACCAGCTGCTGGTGTTGTTGCCTCTGTTGTAAACCCT
ACCTCGATCGTTGAAAGCAAGGCTATAAGAAATGATGAGAAGCTGCCGGGTTTCTCCGGA
TCTTCAGAGCCCGACATTATGGATAGCTCGAGTTCTATCGACGAAGACAGTGACTAAGGG
ATTGTTCCTTGGGCCAATTTCAAGGTTTGGTTATAGTATCGGACTTGTTTGAAACGGTTG
ATAACATCTTCGTTGATATATGTGCTTATAACGATGGAAGTTGAGA
AT

QA 3 708 3 708
DS 

RD RS1DX69JQ 655 0 0
TGTTCGCTTCGATTTCCGCAATCCTCGTTCCATGTTTGAGATTCGCGGGATACGACTAAG
TGGGAGGGTTCGAAGAACATCTTTAAAGTGCAATTGCTGCAGCAAAGGGAACGGAGGTGA
AAACGAAAACAGAAATGTGTTAGATGCTTTCTTTCTGGGAAAGGCACTAGCTGAGGTTAT
GAACGAGCGAATTGAGTCCGCAGTTGGCGAAGTTTTGGGTAATATTGGAAGGTTTCAGGC
TGAGCAACAGAAGCAAGTTCAAGAGATTCAGGGAGAGGTGCTGGAAAGAGCCAAGAAAGC
TAAAGAAAGAGCAGCTAGGGAAACCGTGGAGGCACAAGGACTCGTGCCGGAATCCACAAA
CCCAAAACCAGCTGCTGGTGCTGTTGCCTCTGTTGTAAACCCTACCTCGATCGTTGAAAG
CAAGGCTATAAGAAATGATGAGAAGCTGCCGGGTTTTTCCGGATCTTCAGAGCCCGACAT
TATGGATAGCTCGAGTTCTATCGACGAAGACAGTGACTAAGGGATTGTTCCTTGGGCCAA
TTTCAAGGTTTGGTTATAGTATCGGACTTTTTTGAAACGGTTGATAACATCTTCGTTGAT
ATATGTGCTTATAACGATGGAAGTTGAGAATAAATAACCTTGATATTATTTGTGT

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 5

CO CL1354Contig1 473 5 3 U
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TAAAAGGGAGAAAGCATTAATTCAAACACTAACAACAACAGCAAGAACTACGATGAAGAT
GAGAATCAATTAGAACACCCAATTTTTATTTAAAACCACAACGATTAATTTTTTTAAAAG
GGATACTATAACTCCCAGTTTTATGCTCGAATGGGCTACTTCTTCATGCCGGTCTTCTCC
TTCACAAGATTAACAGCGCCTCCTGCAGCCTCTGTTATCTTCTGCCCCGCGGTTTGCGCA
GAAGCTCCAGCTGAGGTAGCAGCAACCTTGATCTTGTCCACCAGCACATTAGTCTTCTCC
TCAGCACGACCAGCGGCTTGACCGGCTTGGAAGCTCTGCTTGTTGTCTGCCATTTTTTTT
TAAAAACGATATATTTATTTATTATTGAATGTTTTTTGTTTTTGATTGATCCC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 
10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 

AF RS1DK71TF C 1
AF RS1C652JQ U 26
AF RS1C652TF C 26
AF RS1FE21JQ U 1
AF RS1G766JQ U 1
BS 1 25 RS1FE21JQ
BS 26 471 RS1C652JQ
BS 472 473 RS1DK71TF

RD RS1DK71TF 473 0 0
GAGCTTAAATCAGATGTTCATTAACGGGAAACTAAATACATAAACAGCCAAACTTACACC
TAAAAGGGAGAAAGCATCAATTCAAACACTAACAACAACA*CAAGAACTACGATGAAGAT
GAGAATCAATTAGAACACCCAATTTTTATTTAAAACCACAACGATTAATTTTTTTAAAAG
GGATACTATAACTCCCAGTTTTATGCTCGAATGGGCTACTTCTTCATGCCGGTCTTCTCC
TTCACAAGATTAACAGCGCCTCCTGCAGCCTCTGTTATCTTCTGCCCCGCGGTTTGCGCA
GAAGCTCCAGCTGAGGTAGCAGCAACCTTGATCTTGTCCACCAGCACATTAGTCTTCTCC
TCAGCACGACCAGCGGCTTGACCGGCTTGGAAGCTCTGCTTGTTGTCTGCCATTTTTTTT
TAAAAACGATATATTTATTTATTATTGAATGTTTTTTGTTTTTGATTGATCCC

QA 1 473 1 473
DS 

RD RS1C652JQ 447 0 0
GGGAAACTAAATACATAAACAGCCAAACTTACACCTAAAAGGGAGAAAGCATTAATTCAA
ACACTAACAACAACAGCAAGAACTACGATGAAGATGAGAATCAATTAGAACACCCAATTT
TTATTTAAAACCACAACGATTAATTTTTTTAAAAGGGATACTATAACTCCCAGTTTTATG
CTCGAATGGGCTACTTCTTCATGCCGGTCTTCTCCTTCACAAGATTAACAGCGCCTCCTG
CAGCCTCTGTTATCTTCTGCCCCGCGGTTTGCGCAGAAGCTCCAGCTGAGGTAGCAGCAA
CCTTGATCTTGTCCACCAGCACATTAGTCTTCTCCTCAGCACGACCAGCGGCTTGACCGG
CTTGGAAGCTCTGCTTGTTGTCTGCCATTTTTTTTTAAAAACGATATATTTATTTATTAT
TGAATGTTTTTTGTTTTTGATTGATC
C

QA 1 446 1 446
DS 

RD RS1C652TF 447 0 0
GGGAAACTAAATACATAAACAGCCAAACTTACACCTAAAAGGGAGAAAGCATTAATTCAA
ACACTAACAACAACAGCAAGAACTACGATGAAGATGAGAATCAATTAGAACACCCAATTT
TTATTTAAAACCACAACGATTAATTTTTTTAAAAGGGATACTATAACTCCCAGTTTTATG
CTCGAATGGGCTACTTCTTCATGCCGGTCTTCTCCTTCACAAGATTAACAGCGCCTCCTG
CAGCCTCTGTTATCTTCTGCCCCGCGGTTTGCGCAGAAGCTCCAGCTGAGGTAGCAGCAA
CCTTGATCTTGTCCACCAGCACATTAGTCTTCTCCTCAGCACGACCAGCGGCTTGACCGG
CTTGGAAGCTCTGCTTGTTGTCTGCCATTTTTTTTTAAAAACGATATATTTATTTATTAT
TGAATGTTTTTTGTTTTTGATTGATC
C

QA 1 446 1 446
DS 

RD RS1FE21JQ 473 0 0
GAGCTTAAATCAGATGTTCATTAACGGGAAACTAAATACATAAACAGCCAAACTTACACC
TAAAAGGGAGAAAGCATTAATTCAAACACTAACAACAACAACAAGAACTACGATGAAGAT
GAGAATCAATTAGAACACCCAATTTTTATTTAAAACCACAACGATTAATTTTTTTAAAAG
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AS 1 6

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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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G
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C

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CAGTATTCAGCCGGGTCGTCAATGTTAGTAGAAATCCCCAAATAATCGTTGGCTTTGACC
ATGGCATCTACTATCATAAGCTCTATTGCCTTTACTTTCGGATGTGTGTAGACAGTTCGA
TAGAGATCAGCTCGAGTTGCAAATAACTTGTGAACATTACGGTACTCCTTAGCGCGATAG
CAGATTTCGTTGGCCATGACTCTCATCGTCTCTGTCAGTCTTTGAAACTGAAAGTTGCAT
CCCAGTCCACAAGCTCGAGAATCACGAACAAGGTAGTCAAACTTGTCCACATCAATTCCA
TTTCGACCATTCGCAACAATGTCATACAAGAAACGTTTTTCCGCGTTGCTTTTCAGCTGC
GAAAATTCAGTACTCGCTAGGATCATATCCTTCACTCTTTTCAGCATTTGAGCATCAATA
TCAATGTTATGCGTATCAACAATATGGTCAATCATCTTTACCGACATTAACTCATGAGAC
CACTCAGAGCCACTCATGACCTTTGGCAGGAATTCACGCTCAAACATATGGCTAAAAGGC
CCATGGCCAATATCATGGAGAAGTCCCGCAAGTCTCACAGTCTGAAGATCATGTTTGTCA
ATGTCGAGCTCCATTCCCTGAAAAGTTTTTAGCTTCTGTGCAGTTT

QA 1 766 1 766
DS 

RD RS1FL60TF 764 0 0
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AGGTAGTCAAACTTGTCTACATCAATCCCATTTCGACCATTCGCAACAATGTCATACAAG
AAACGTTTT*CAGCGTTGCTTTTCAGCTGCGAAAATTCAGTACCCGCTAGGATCATATCC
TTCACTCTTTTCAGCATTTGAGCATCAATATCAATGTTATGCGTATCAACAATATGGTCA
ATCATCTTTACAGACATTAACTCATGAGACCACTCACAGCCACTCATGACCTTTGGCAGG
AATTCACGCTCAAACATATGGCTAAAAGGCCCATGGCCAATATCATGGAGAAGTCCGGCA
AGTCTCACAGTCTGAAGATCATGTTTGTCAATGTCGAGCTCCATTCCCTGAAAAGTTTTT
AGCTTCTGTGCAGTTTCGCCTGCAAGCCAATACACACCTAGAGAATGCTCAAACCTAGAA
TGCACAGCTCCCGGGTATACCATGTTTGTCACTCCAAGCTGCTTTAGTTCACGAAGCCTC
TGAAACTGCTCCGTGTCAATGAATTTCAAGCAAAGAGGATCGAGGTAGATGTTGCCATGA
ACGTTGTCGTAGACGTGCTTGCTGAATCGGAGCTCGTTCGTCGGAGCGCCGGCGGAGTAA
ACCGGCATGTTTAGGTCGTCGTTGCAATACGCTCCCATCAGTTTTGATTTCACGTCGCTC
GCTC****GCTATATCTCCGGAGGCTGCAGAGAAAGTGAAAAAA

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1CX25TF 801 0 0
AAAG
TGCATCCCAGTCCACAAGCTCGAGA*TCACGAACAAGGTAGTCAAACT*GTCCACATCAA
TTCCATTTCGACCATTCGCAACAATGTCATACAAGAAACGTTTT*CCGCGTTGCTTTTCA
GCTGCGAAAATTCAGTACTCGCTAGGATCATATCCTTCACTCTTTTCAGCATTTGAGCAT
CAATATCAATGTTATGCGTATCAACAATATGGTCAATCATCTTTACCGACATTAACTCAT
GAGACCACTCAGAGCCACTCATGACCTTTGGCAGGAATTCACGCTCAAACATATGGCTAA
AAGGCCCATGGCCAATATCATGGAGAAGTCCCGCAAGTCTCACAGTCTGAAGATCATGTT
TGTCAATGTCGAGCTCCATTCCCTGAAAAGTTTTTAGCTTCTGTGCAGTTTCGCCTGCAA
GCCAATACACACCTAGAGAATGCTCGAACCTAGGATGCACAGCTCCCGGGTATACCATGT
TTGTCACTCCAAGCTGCTTTAGTTCACGAAGCCTCTGAAACTGCTCCGTGTCAATGAATT
TCAAGCAAAGAGGATCGAGGTAGATGTTGCCATGAACGTTGTCGTAGACGTGCTTGCTGA
ATCGGAGCTCGTTCGTCGGAGCGCCGGCGGAGTAAACCGGCATGTTTAGGTCGTCGTTGC
AATACGCTCCCATCAGTTTGGATTTCACGTCGCTCGCTCGCTCGCTATATCTCCGGAGGT
TGCAGAGAAAGTGAAAAAATGGTAACCGTAAATTGAGAAAGCGATTTGAACTTTATGCTG
CTGCAGGAAGTTAGCCT

QA 5 801 5 801
DS 



AS 2 4

CO CL1356Contig1 868 2 8 U
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AAAACAGAGCTAAGAGGAGGAGAGAAAACAAACAATTAAACTTTTCATCACGTGGAAAGC
TTGATATAAGATCGTGGAGAGAGAGCAATATATACAAAATTAATCAAAAGGTAAATGAGC
ACGACGGGTCCGGCAAGGAAAAGCTCACTAATGGAAACTCTCTTGGGACTCCTTAGAATC
CGCATCAAACGTGGCGTCAATCTCGCCGTCCGTGACATTAATAGCAGTGATCCTTACGTC
GTCGTTAAAATGGGCAAACAGAAATTGAAAACTCGTGTCATCAACAAAGACGTAAATCCA
GAATGGAACGAAGATCTGACTCTCTCCGTCACGGACCCCAGTCTTACCGTTCTCTTGACG
GTGTACGACCACGACATGTTTAGCAAGGACGACAAGATGGGTGATGCAGAGTTCGAGATA
AAGCCCTATATCGAGGCTTTAAAGATGCAACTTGACGGTCTTCCTAGTGGTACCATCGTC
ACCACGGTTCAGCCATGTCGTCGCAACTGTCTAGCTGAGGAGTCTAAAATAACTTGGGGT
CGACGGTAAGCTCGTCCAGGATCTCGTTCTCAGTTTACGACATGTTGAGTGGTGGAGAGG
TCGAGGCTCAGCTTCAGTGGATTGACCTCCCTGGCTCCAAGGGTCTATAAAACGTGTCTT
CTATTTATAATTACCGTTACTATTTGAGGGTTTTCTTTTGAATTTGAATTAAACCTCAGA
AAACAAAACAAGAACTGAACCATGTTGAAGTACAAAACGCGTATTAATCCATGCATGAGA
GAGTATGAGATTAGACGTTTGAGGATGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A102TF U 1
AF RS1A102TV U 1
BS 1 37 RS1A102TF
BS 38 38 RS1A102TV
BS 39 711 RS1A102TF
BS 712 712 RS1A102TV
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BS 774 785 RS1A102TF
BS 786 868 RS1A102TV

RD RS1A102TF 785 0 0
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AAACA

QA 1 785 1 785
DS 

RD RS1A102TV 868 0 0
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AAAACAGAGCTAAGAGGAGGAGAGAAAACAAACAATTAAACTTTTCATCACGTGGAAAGC
TTGATATAAGATCGTGGAGAGAGAGCAATATATACAAAATTAATCAAAAGGTAAATGAGC
ACGACGGGTCCGGCAAGGAAAAGCTCACTAATGGAAACTCTCTTGGGACTCCTTAGAATC
CGCATCAAACGTGGCGTCAATCTCGCCGTCCGTGACATTAATAGCAGTGATCCTTACGTC
GTCGTTAAAATGGGCAAACAGAAATTGAAAACTCGTGTCATCAACAAAGACGTAAATCCA
GAATGGAACGAAGATCTGACTCTCTCCGTCACGGACCCCAGTCTTACCGTTCTCTTGACG
GTGTACGACCACGACATGTTTAGCAAGGACGACAAGATGGGTGATGCAGAGTTCGAGATA
AAGCCCTATATCGAGGCTTTAAAGATGCAACTTGACGGTCTTCCTAGTGGTACCATCGTC
ACCACGGTTCAGCCATGTCGTCGCAACTGTCTAGCTGAGGAGTCTAAAATAACTTGGG*T
CGACGGTAAGCTCGTCCAGGATCTCGTTCTCAGTTTACGACATGTTGAGTG*TGGAGAGG
TCGAGGCTCAGCTTCAGTGGATTGACCTCCCTGGCTCCAAGGGTCTATAAAACGTGTCTT
CTATTTATAATTACCGTTACTATTTGAGGGTTTTCTTTTGAATTTGAATTAAACCTCAGA
AAACAAAACAAGAACTGAACCATGTTGAAGTACAAAACGCGTATTAATCCATGCATGAGA
GAGTATGAGATTAGACGTTTGAGGATGT

QA 1 868 1 868
DS 



CO CL1356Contig2 297 2 1 U
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A102TR U 79
AF RS1FR90JQ U 1
BS 1 297 RS1FR90JQ

RD RS1A102TR 129 0 0
CATATGGGAAACAAAACATCCCTCAAACGTTCCTAATCCTCATACTCTTCTCATGCATGG
ATTAATACCCGTTTTGTACTTCAACATGGTTCATTTCTTGTTTTGTTTTCTGAGGTTTAA
TTCAAATTC

QA 1 129 1 129
DS 

RD RS1FR90JQ 297 0 0
CGGGGTAATCAAAGCTTTTATTCTAGGCACATAGCTAATCCAAATATACAAGGACAATAA
TATATACGACTCGATCACCATATGGGAAACAAAACATCCCTCAAACGTTCCTAATCCTCA
TACTCTTCTCATGCAGGGATTAATACCCGTTTTGTACTTCAACATGGTTCATTTCTTGTT
TTGTTTTCTGAGGTTTAATTCAAATTCAAAAAAAAACCCTCAAATAGTAACGGTAATTAT
AAATAAAGGAAACTTTTTATAAACCCTTGGAGCCAGGGAGGTCAATCCACTGAAGCT

QA 1 297 1 297
DS 



AS 1 6

CO CL1357Contig1 1141 6 3 U
CACTAAAACGACGTAGTTTCATTGTCCAGTCATCATTAGAAAAAATCTCTTCAATATCCT
ACTAACAAAATACAAAAAAGACATGTAACGAACCAATTTAATGTAAAGTAAACAAAAAAT
AATTGTAAATCTTCTTTAATGTTGGGATTCCGGTACAAGTGATTGACCAGAGAGTTCACC
AAACCGGCCTTCTCTGTTTCTCATAAGCTCACCAAAAGAAATACAACTCTCTGTTTGGTT
ATTATTATGCCTCCTCGTAACTTTAATCTTAACATGATCCGGTAATCTCAACGTATACCG
ATCTTCTTCCTCCGGTTTATTCCTCACTATCGAATGACCCGTCGTCTTCGATCTCGAGAA
TTTATCCGGTAAAGGCTCGGTCTTACCACTACTACTGCTCTCTCTCGACAACGAAACCTC
GTTTGACGTTGAAGGTTGCTCGTGGTTTCCGTTGCTGTTTTCGTGTATCACTTCTATGAT
CAACTCTTTGATGTTTTCAGGCGCGTTTGGATCTAAGTTCCGACGACAAACAGGGCATGT
TTTGTTAGATTCGAGCCATCTATCGATGCATTCTTGATGAAAAACATGGTAGCATGTTGT
CAGAAGCCGAAGGAGGATTTGTTCTTCTTCGAATTCTAGAAGACAGATCGCGCATTCGAG
TCCTTGGTTATCTTCTCTAAGATCTTTTACCGAGGAGAATGGGAATAATGGGAAGGATTG
GATGATATGTGGCTCTAAACCGGGGTTAACCGGTGGTTGACCGGCGTTTTCTTGTTGTGA
TTGGATTTGATCTTCGGGTGATCTGTTGTGGTAATGGCGATCCCAGGCCTGTGAGAGAGT
GTGGAAGAAACACCTGAAGAAATAGAGAGCGCAGAAACCGATGAAGAAGACGACGAGGAG
GATCACAGGAGGATTACAAAGAGCGGTGGTTGACTGTACTGATGTGGTGGCTGAGATCGA
AGAGTTGTGTTTGATCCGAGCGGTTTCGTTATCGGCATTGAAGGAATTAAGTGTCGGAGA
TTACGTATCTCCGATTCAATTATTGGAATGTTTTCTTTTTGGTTTCTTGATTTATATTTT
GTTTTTGGTTTTTGTTTTGAAGAAAGATGGTAGTGTGTTGAGTTTTTTTTGTGTATGGTC
C


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 

AF RS1GM27JQ U 1
AF RS1GM27TF C 68
AF RS1BY35JQ U 5
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AF RS1BY35TF C 524
AF RS1DZ19TF C 525
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ATTATTATGCCTCCTCGTAACTTTAATCTTAACATGATCCGGTAATCTCAACGTATACCG
ATCTTCTTCCTCCGGTTTATTCCTCACTATCGAATGACCC
CC

QA 1 340 1 340
DS 

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AAAAT
CAAAAAAGACATGTAACGAACCAATTTAATGTAAAGTAAACAAAAAATAATTGTAAATCT
TCTTTAATGTTGGGATTCCGGTACAAGTGATTGACCAGAGAGTTCACCAAACCGGCCTTC
TCTGTTTCTCATAAGCTCACCAAAAGAAATACAACTCTCTGTTTGGTTATTATTATGCCT
CCTCGTAACTTTAATCTTAACATGATCCGGTAATCTCAACGTATACCGATCTTCTTCCTC
CGGTTTATTCCTCACTATCGAATGACCC
CC

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DS 

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GTAAATCTTCTTTAATGTTGGGATTCCGGTACAAGTGATTGACCAGAGAGTTCACCAAAC
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TTATGCCTCCCCGTAACTTTAATCTTAACATGATCCGGTAATCTCAACGTATACCGATCT
TCTTCCTCCGGTTTATTCCTCACTATCGAATGACCCGTCGTCTTCGATCTCGAGAATTTA
TCCGGTAAAGGCTCGGTCTTACCACTACTACTGCTCTCTCTCGACAACGAAACCTCGTTT
GACGTTGAAGGTTGCTCGTGGTTTCCGTTGCTGTTTTCGTGTATCACTTCTATGATCAAC
TCTTTGATGTTTTCAGGCGCGTTTGGATCTAAGTTCCGACGACAAACAGGGCATGTTTTG
TTAGATTCGAGCCATCTATCGATGCATTCTTGATGAAAAACATGGTAGCATGTTGTCAGA
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ATATGTGGCTCTAAACCGGGGTTAA

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C
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TTTTTTGTGTATGGTCC

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CGTTTTCTTGTTGTGATTGGATTTGATCTTCGGGTGATCTGTTGTGGTAATGGCGATCCC
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AGAAGACGACGAGGAGGATCACAGGAGGATTACAAAGAGCGGTGGTTGACTGTACTGATG
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AATTAAGTGTCGGAGATTACGTATCTCCGATTCAATTATTGGAATGTTTTCTTTTTGGTT
TCTTGATTTATATTTTGTTTTTGGTTTTTGTTTTGAAGAAAGATGGTAGTGTGTTGAGTT
TTTTTTGTGTATGGTCC

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DS 



AS 1 6

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TTTCCATCTTCTTTGCATTTTTCTCTCTGTCTCTCTTTTTGTTCCATCAGATCACTCATA
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AGAAGACAATGAGTGTTGAGGTACGGTCAAGAGTCTTTGACCAAGAAGCTGGCTCAACTC
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AATTAGATCTCAATCCCCTACGCATTGTAGTAGCGGAATTGGTGGGGACATTCATTCTAA
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TAGAGTACGCCGCTACGGCTGGTCTATCGGTGGTTGTCGTAGTTTACTCCATCGGACACA
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TAGCTGGGGTGTCAGTCTACGGAGTAAACCCTGACCTAATGATAACAAAACCTGCGTTAA
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TGAATTCTAATGTTTGCTTGGATATTCATATTTTATAAGAATCCATTTTAAGTTCTTACT


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BT80TF U 1
AF RS1C319TF U 59
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RD RS1BT80TF 757 0 0
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TTTCCATCTTCTTTGCATTTTTCTCTCTGTCTCTCTTTTTGTTCCATCAGATCATTCATA
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AGAAGACAATGAGTGTTGAGGTACGGTCAAGAGTCTTTGACCAAGAAGCTGGCTCAACTC
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AATTAGATCTCAATCCCCTACGCATTGTAGTAGCGGAATTGGTGGGGACATTCATTCTAA
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TAGAGTACGCCGCGACGGCTGGTCTATCGGTGGTTGTCGTAGTTTACTCCATCGGACACA
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CATGGTCTCAGGTTCCGTTATATATAACGGCGCAGACGATGGGGGCAACGGCGGCAACAT
TAGCTGGGGTGTCAGTCTACGGAGTAAACCCTGACCTAATGATAACAAAACCTGCGTTAA
GCTGCGTTTCTGCATTTT*CGTTGAACTCGTTGCTACGAGCATCGCCGTCTTTCTAGCCT
CCGCGTTACATTGTGGTC
TCATCAAATTTGAGTATTT

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DS 

RD RS1C319TF 792 0 0
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TAAAGCCAATCCAGCCACTTGGTGACTGTCCTCAATCGATTCCTTGTTCACCATCTTGAG
GGAGAAGACAATGAGTGTTGAGGTACGGTCAAGAGTCTTTGACCAAGAAGCTGGCTCAAC
TCTAGCTTCGTTGAGAGATGGTGATCCGTCGACACAAAGGGGTTTTCGATGTATCCCTTA
TGAATTAGATCTCAATCCCCTACGCATTGTAGTAGCGGAATTGGTGGGGACATTCATTCT
AATGTTCAGCGTGTGTGGGGTCATAAGCAGTACTCAGTTGTCCGGTGGTCATGTCGGATT
GCTAGAGTACGCCGCTACGGCTGGTCTATCGGTGGTTGTCGTAGTTTACTCCATCGGACA
CATCTCCGGCGCCCATCTCAACCCTTCTATCACCATTGCTTTCGCCCTCTTTGGCGGATT
CCCATGGTCTCAGGTTCCGTTATATATAACGGCGCAGACGATGGGGGCAACGGCGGCAAC
GTTAGCTGGG*TGTCAGTCTACGGAGTAAACCCTGACCTAATGATAACAAAACCTGCGTT
AAGCTGCGTTTCTGCATTTTTCGTTGAACTCGTTGCTACGAGCATCGTCGTCTTTCTAGC
CTCCGCGTTACATTGTGGTCCTCATCAAA*TTTGAGTAATTTGACGGG*TTGGTGATTGG
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AGCTCGATCACT

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DS 

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GGG
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AAGAGTCTTTGACCAAGAAGCTGGCTCAACTCTAGCTTCGTTGAGAGATGGTGATCCGTC
GACACAAAGGGGTTTTCGATGTATCCCTTATGAATTAGATCTCAATCCCCTACGCATTGT
AGTAGCGGAATTGGTGGGGACATTCATTCTAATGTTCAGCGTGTGTGGGGTCATAAGCAG
TACTCAGTTGTCCGGTGGTCATGTCGGATTGCTAGAGTACGCCGCTACGGCTGGTCTATC
GGTGGTTGTCGTAGTTTACTCCATCGGACACATCTCCGGCGCCCATCTCAACCCCTCCAT
CACCATTGCTTTCGCCCTCTTTGGCGGATTCCCATGGTCTCAGGTTCCGTTATATATAAC
GGCGCAGACGATGGGGGCAACGGCGGCAACGTTAGCTGGGGTGTCAGTCTACGGAGTAAA
CCCTGACCTAATGATAACAAAACCTGCGTTAAGCTGCGTTTCTGCATTTTTCGTTGAACT
CGTTGCTACGAGCATCGTCGTCTTTCTAGCCTCCGCGTTACATTGTGGTCCTCATCAAAA
TTTGAGTAATTTGACGGGGTTGGTGATTGGAGCAGTCATATCCCTTGGAGTGCTTATTAC
CGGACCGATTTCGGGAGGATCGATGA*CCCAGCTCGATCACTAG*ACCGGCGGTGGTGGC
ATGGGATTTG*AGTATATATGGGTT*ACATGACTGC

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DS 

RD RS1C319JQ 876 0 0
A
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ATCGGTGGTTGTCGTAGTTTACTCCATCGGACACATCTCCGGCGCCCATCTCAACCCTTC
TATCACCATTGCTTTCGCCCTCTTTGGCGGATTCCCATGGTCTCAGGTTCCGTTATATAT
AACGGCGCAGACGATGGGGGCAACGGCGGCAACGTTAGCTGGG*TGTCAGTCTACGGAGT
AAACCCTGACCTAATGATAACAAAACCTGCGTTAAGCTGCGTTTCTGCATTTTTCGTTGA
ACTCGTTGCTACGAGCATCGTCGTCTTTCTAGCCTCCGCGTTACATTGTGGTCCTCATCA
AAATTTGAGTAATTTGACGGGGTTGGTGATTGGAGCAGTCATATCCCTAGGAGTGCTTAT
TACCGGACCGATTTCGGGAGGATCGATGAACCCAGCTCGATCACTAGGACCGGCGGTGGT
GGCATGGGATTTTTAGTATATATGGGTTTACATGACTGCTCCGGTGATCGGAGCCCTTAT
CGGTGTTTTGACATACAGAACTATTAGCCTCCAGAGCAGGCCTTCTCCACATTCCCCTCC
AGTCTCTTCGCTTTTACGCTGACCGACCATTCAGCTCAAATCCTAGTATGATATCTAATT
AAGTTATAACCTTAATTACTCCCCAAATAAACCTTATTACTCTACTCTTAATGTAGCCCG
TTATGCCTATATGGAGCCTCGATTGATACTACTAGTGAATTCTAATGTTTGCTTGGATAT
TCATATTTTATAAGAATCCATTTTAAGTT
CTTATT

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DS 

RD RS1BT80JQ 757 0 0
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TCCATCACCATTGCTTTCGCCCTCTTTGGCGGATTCCCATGGTCTCAGGTTCCGTTATAT
ATAACGGCGCAGACGATGGGGGCAACGGCGGCAACATTAGCTGGGGTGTCAGTTTACGGA
GTAAACCCTGACCTAATGATAACAAAACCTGCGTTAAGCTGCGTTTCTGCATTTTTCGTT
GAACTCGTTGCTACGAGCATCGCCGTCTTTCTAGCCTCCGCGTTACATTGTGGTCCTCAT
CAAAATTTGAGTAATTTGACGGGGTTGGTGATTGGAGCAGTCATATCCCTTGGAGTGCTT
ATTACCGGACCGATTTCGGGAGGATCGATGAACCCAGCTCGATCACTAGGACCGGCGGTG
GTGGCATGGGATTTTGAGTATATATGGGTTTACATGACTGCTCCGGTGATCGGAGCCATT
ATCGGTGTTTTGACATACAGAACTATTAGCCTCCAAAGCAGGCCTTCTCCACATTCCCCT
CCAGTCTCTTCGCTTTTACGCTGACCGACCATTCAGCTCAAATCCTAGTATGATATCTAA
TTAAGTTATAACCTTAATTACTCCCCAAATAAACCTTATTACTCTACTCTTAATGTAGCC
CGTTATGCCTATATGGAGCCTCGATTGATACTACTAGTGAATTCTAATGTTTGCTTGGAT
ATTCATATTTTACAAGAATCCATTTTAAGTTCTTACT

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DS 

RD RS1BH16JQ 750 0 0
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CCATCACCATTGCTTTCGCCCTCTTTGGCGGATTCCCATGGTCTCAGGTTCCGTTATATA
TAACGGCGCAGACGATGGGGGCAACGGCGGCAACGTTAGCTGGGGTGTCAGTCTACGGAG
TAAACCCTGACCTAATGATAACAAAACCTGCGTTAAGCTGCGTTTCTGCATTTTTCGTTG
AACTCGTTGCTACGAGCATCGTCGTCTTTCTAGCCTCCGCGTTACATTGTGGTCCTCATC
AAAATTTGAGTAATTTGACGGGGTTGGTGATTGGAGCAGTCATATCCCTTGGAGTGCTTA
TTACCGGACCGATTTCGGGAGGATCGATGAACCCAGCTCGATCACTAGGACCGGCGGTGG
TGGCATGGGATTTTGAGTATATATGGGTTTACATGACTGCTCCGGTGATCGGAGCCATTA
TCGGTGTTTTGACATACAGAACTATTAGCCTCCAGAGCAGGCCTTCTCCACATTCCCCTC
CAGTCTCTTCGCTTTTACGCTGACCGACCATTCAGCTCAAATCCTAGTATGATATCTAAT
TAAGTTATAACCTTAATTACTCCCCAAATAAACCTTATTACTCTACTCTTAATGTAGCCC
GTTATGCCTATATGGAGCCTCGATTGATACTACTAGTGAATTCTAATGTTTGCTTGGATA
TTCATATTTTATAAGAATCCATTTTAAGTT

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 5

CO CL1359Contig1 1004 5 7 U
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TTTCCTCAAAAATCCTTCTCATGTGGCTCCTGCAACCACAGGAAGGGTGGAAAACACTCC
ACTAAACCCCCGGTGACCGTTCCGAAGTTACCTGTTCCTCCAGTGACCGTACCTAAGCTT
CCAGTTCCTCCGGTGACAGTTCCTAAGCTACCTGTTCCTCCAGTCACCGTCCCAAAGCTA
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CCTCCGGTTGGAGGGCTACCCATACCTCCGGTTGGAGGGTTACCCATACCTCCGGTTGGA
GGGCTACCCACATTGCCACTGCCACCGTTGCCGATTGTGGGTCCTCTTCTTCCTCCAGGG
ACAAACCCTCCTAGTTCAGGAGGAAAAGATTGCCCTCCACCCCCCGGGTAGCCATAAGTC
CCCACCAGGCACTGGGAAGGCGACATGTCCAATAGACACGCTGAAGTTGGGGGCGTGTGT
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TCCGATACTTAAAGGCCTCGCTGAAGTTGAAGCAGCAGCTTGTCTCTGCACTACACTTAA
GCTTAAAGCTCTTAACCTTAAGCTGTACGTTCCAGTTGCTCTTCAGCTTCTTCTTACCTG
TGGCAAAAACCCACCTCCGGGCTACACTTGCTCCATCTGAGAAATTTAGTCCAGTTAAAG
GATAACTTGGAGAAAAAAAAGTGAGAAGACAATGGCAGAGCTCTGGTTTTTCCTTTCACG
TGTATTAATCATGTCCAATCCTTTCCCTTTGATTCTTTCACATATCTACCCCTTCTGCTT
GTATCGTTGTGGTTCTAGATTTATGATTCTTCTCTTGTATGAAAGTACGATTTGAAATTA
TTTATTTTTAACGAATGAATTGAGGTGTGTGAAAATATTATTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1H663TF U 1
AF RS1H663JQB C 414
AF RS1A873TF U 505
AF RS1FR17JQ C 647
AF RS1FR17TF U 647
BS 1 464 RS1H663TF
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BS 611 888 RS1A873TF
BS 889 889 RS1FR17TF
BS 890 977 RS1A873TF
BS 978 1004 RS1FR17TF

RD RS1H663TF 610 0 0
ATGGAGTCATCCAAACTCTCATCTATTTCTCTCTGTTTCATTCTCATTTGCATTATCTTC
TTTCCTCAAAAATCCTTCTCATGTGGCTCCTGCAACCACAGGAAGGGTGGAAAACACTCC
ACTAAACCCCCGGTGACCGTTCCGAAGTTACCTGTTCCTCCAGTGACCGTACCTAAGCTT
CCAGTTCCTCCGGTGACAGTTCCTAAGCTACCTGTTCCTCCAGTCACCGTCCCAAAGCTA
CCTGTACCTCCCGTGACCGTCCCAGAACTACCACTTCCCCCGGTTGGAGGGCTACCCATT
CCTCCGGTTGGAGGGCTACCCATACCTCCGGTTGGAGGGTTACCCATACCTCCGGTTGGA
GGGCTACCCACATTGCCACTGCCACCGTTGCCGATTGTGGGTCCTCTTCTTCCTCCAGGG
ACAAACCCTCCTAGTTCAGGAGGAAAAGATTGCCCTCCACCCCC*GGGTAGCCATAAGTC
CCCACCAGGCACTGGGAAGGCGACATGTCCAATAGACACGCTGAAGTTGGGGGCGTGTGT
TGACTTGTTGGGAGGTTTAGTAAAGATAGGGTTAGGAGACCCAGCCGTTAACAAATGCTG
TCCGATACTT

QA 1 610 1 610
DS 

RD RS1H663JQB 579 0 0
TCCAGGGACAAACCCTCCTAGTTCAGGAGGAAAAGATTGCCCTCCACCCCCCGGGTAGCC
ATAAGTCCCCACCAGGCACTGGGAAGGCGACATGTCCAATAGACACGCTGAAGTTGGGGG
CGTGTGTTGACTTGTTGGGAGGTTTAGTAAAGATAGGGTTAGGAGACCCAGCCGTTAACA
AATGCTGTCCGATACTTAAAGGCCTCGTTGAAGTTGAAGCAGCAGCTTGTCTCTGCACTA
CACTTAAGCTTAAAGCTCTTAACCTTAAGCTGTACGTTCCAGTTGCTTTTCAGCTTCTTT
TTACCTGTGGCAAAAACCCACCTCCGGGCTACACTTGCTCCATTTGAGAAATTTAGTCCA
GTTAAAGGATAACTTGGAGAAAAAAA*GTGAGAAGACAATGGCAGAGCTCTGGTTTTTCC
TTTCACGTGCATTAATCATGTCCAATCCTTTCCCTTTGACTCTTTCACATATCTATCCCT
TCTGCTTGTATCGTTGTGGTTCTAGATTTATGATTCTTCTCTTGTATGAAAGTACGATTT
GAAATTATTTATTTTTAACGAATGAATTGAGGTGTGTG
T

QA 1 578 1 578
DS 

RD RS1A873TF 473 0 0
G
TGTCCAATAGACACGCTGAAGTTGGGGGCGTGTGTTGACTTGTTGGGAGGTTTAGTAAAG
ATAGGGTTAGGAGACCCAGCCGTTAACAAATGCTGTCCGATACTTAAAGGCCTCGCTGAA
GTTGAAGCAGCAGCTTGTCTCTGCACTACACTTAAGCTTAAAGCTCTTAACCTTAAGCTG
TACGTTCCAGTTGCTCTTCAGCTTCTTCTTACCTGTGGCAAAAACCCACCTCCGGGCTAC
ACTTGCTCCATCTGAGAAATTTAGTCCAGTTAAAGGATAACTTGGAGAAAAAAAAGTGAG
AAGACAATGGCAGAGCTCTGGTTTTTCCTTTCACGTGTATTAATCATGTCCAATCCTTTC
CCTTTGATTCTTTCACATATCTATCCCTTCTGCTTGTATCGTTGTGGTTCTAGATTTATG
ATTCTTCTCTTGTATGAAAGTACGATTTGAAATTATTTATTTTTAACGAATG

QA 2 473 2 473
DS 

RD RS1FR17JQ 358 0 0
G
GCACTACACTTAAGCTTAAAGCTTTTAACCTTAAGCTGTACGTTCCAGTTGCTCTTCAGC
TTCTTTTTACCTGTGGCAAAAACCCACCTCCGGGCTACACTTGCTCCATTTGAGAAATTT
AGTCCAGTTAAAGGATAACTTGGAGAAAAAAAAGTGAGAAGACAATGGCAGAGCTTTGGT
TTTTCCTTTCACGTGTATTAATCATGTCCAATCCTTTCCCTTTGATTCTTTCACATATCT
ACCCCTTCTGCTTGTATCGTTGTGGTTCTAGATTTATGATTCTTCTCTTGTATGAAAGTA
CGATTTGAAATTATTTATTTTTAACGAATGAATTGAGGTGTGTGAAAATATTATTGT

QA 2 358 2 358
DS 

RD RS1FR17TF 358 0 0
G
GCACTACACTTAAGCTTAAAGCTCTTAACCTTAAGCTGTACGTTCCAGTTGCTCTTCAGC
TTCTTCTTACCTGTGGCAAAAACCCACCTCCGGGCTACACTTGCTCCATCTGAGAAATTT
AGTCCAGTTAAAGGATAACTTGGAGAAAAAAAAGTGAGAAGACAATGGCAGAGCTCTGGT
TTTTCCTTTCACGTGTATTAATCATGTCCAATCCTTTCCCTTTGATTCTTTCACATATCT
ACCCCTTCTGCTTGTATCGTTGTGGTTCTAGATTTATGATTCTTCTCTTGTATGAAAGTA
CGATTTGAAATTATTTATTTTTAACGAATGAATTGAGGTGTGTGAAAATATTATTGT

QA 2 358 2 358
DS 



AS 2 5

CO CL1360Contig1 602 3 2 U
GGGATACCTTATACGTATGTTGTCACAGGTTGCTTTGCTGGCTTTTTCGTTCCTAGTTTG
GGTCAATGCCACTTGCGACTCAGAACTCCTCCTACCGACAAAGTTTCCATCTACGACAGT
GGCGATGCCAAAGCTATTATCAACACCGAAGAGGACATTGTTGCGTATACAATGAAAGCT
GTTGATGACCCGAGAACACTTAACAAGATTCTCTACGTCCATCCACCCAAGAACATTGTC
TCGCAGAACGATATGGTCAGTTTGTGGGAGAGAAAGATCGGTAAGACTCTGGAGAAGATT
TATGTTTCAGAGGAAGAACTTCTCAAAAGCATCCAAGAGGCTCAGCCTCCAATGGATTTT
GTGATGGGTTTGATCCATACAGTACTAGTGCAGGGTGATCTTACCTCCTTCACTATAGAC
CCTTCCGTTGGAGTGGAGGCTTCCGAGCTTTACCCTGATGTCAAGTACACCAGTGTCGAT
GAGTTTCTCAACCAGTTTGTTTGAGACACAAACAAACCTCCTTCTATGTTGCATTTTAAT
AATCTGAGATCGATTACATTCGATTTTTTAGACGCTAATCTTTTAATTCGAAACGAGGCT
TA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1AR10JQ C 1
AF RS1AR10TFB U 1
AF RS1CG84TF U 87
BS 1 580 RS1AR10TFB
BS 581 602 RS1CG84TF

RD RS1AR10JQ 404 0 0
GGGATACCTTATACGTATGTTGTCACAGGTTGCTTTGCTGGCTTTTTCGTTCCTAGTTTG
GGTCAATGCCACTTGGGATTCAGAACTCCTCCTACCGACAAAGTTTCCATTTACGACAGT
GGGGATGCCAAAGTTATTATCAACACCGAAGAGGACATTGTTGGGTATACAATGAAAGCT
GTTGATGACCCGAGAACACTTAACAAGATTTTTTACGTCCATCCACCCAAGAACATTGTC
TCGCAGAACGATATGGTCAGTTTGTGGGAGAGAAAGATCGGTAAGATTCTGGAGAAGATT
TATGTTTCAGAGGAAGAACTTTTCAAAAGCATCCAAGAGGTTCAGCCTCCAATGGATTTT
GTGATGGGTTTGATCCATACAGTATTAGTGCAGGGTGATTTTAC

QA 1 404 1 404
DS 

RD RS1AR10TFB 580 0 0
GGGATACCTTATACGTATGTTGTCACAGGTTGCTTTGCTGGCTTTTTCGTTCCTAGTTTG
GGTCAATGCCACTTGCGACTCAGAACTCCTCCTACCGACAAAGTTTCCATCTACGACAGT
GGCGATGCCAAAGCTATTATCAACACCGAAGAGGACATTGTTGCGTATACAATGAAAGCT
GTTGATGACCCGAGAACACTTAACAAGATTCTCTACGTCCATCCACCCAAGAACATTGTC
TCGCAGAACGATATGGTCAGTTTGTGGGAGAGAAAGATCGGTAAGACTCTGGAGAAGATT
TATGTTTCAGAGGAAGAACTTCTCAAAAGCATCCAAGAGGCTCAGCCTCCAATGGATTTT
GTGATGGGTTTGATCCATACAGTACTAGTGCAGGGTGATCTTACCTCCTTCACTATAGAC
CCTTCCGTTGGAGTGGAGGCTTCCGAGCTTTACCCTGATGTCAAGTACACCAGTGTCGAT
GAGTTTCTCAACCAGTTTGTTTGAGACACAAACAAACCTCCTTCTATGTTGCATTTTAAT
AATCTGAGATCGATTACATTCGATTTTTTAGACGCTAATC

QA 1 580 1 580
DS 

RD RS1CG84TF 516 0 0
G
CCTCCTACCGACAAAGTTTCCATCTACGACAGTGGCGATGCCAAAGCTGTTATCAACACC
GAAGAGGACATTGTTGCGTATACAATGAAAGCTGTTGATGACCCGAGAACACTTAACAAG
ATTCTCTACGTCCATCCACCCAAGAACATTGTCTCGCAGAACGATATGGTCAGTTTGTGG
GAGAGAAAGATCGGTAAGACTCTGGAGAAGATTTATGTTTCAGAGGAAGAACTTCTCAAA
AGCATCCAAGAGGCTCAGCCTCCAATGGATTTTGTGATGGGTTTGATCCATACAGTACTA
GTGCAGGGTGATCTTACCTCCTTCACTATAGACCCTTCCGTTGGAGTGGAGGCTTCCGAG
CTTTACCCTGATGTCAAGTACACCAGTGTCGATGAGTTTCTCAACCAGTTTGTTTGAGAC
ACAAACAAACCTCCTTCTATGTTGCATTTTAATAATCTGAGATCGATTACATTCGATTTT
TTAGACGCTAATCTTTTAATTCGAAACGAGGCTTA

QA 2 516 2 516
DS 



CO CL1360Contig2 1021 2 8 U
AGAAGAAAGAAGTAGGAAGAGAGAAAGAGATGACGAGCAAGACTCTGGTGATCGGGGCGA
CGGGTTACATAGGAAAAGTCTTCGTCGAGGGAAGCGTCAAGTCCGGCCACGCCACTTTCG
CTCTGGTCAGAGAATCCTCTCTCTCCGATCCCGTTAAGGCCAAACTCGTCCAGAGTTTCA
AAGATCTTGGCGTCACCATACTCTACGGAAGCTTAAATGAGAAAGAGAGCTTGGTGAAAG
CGATCAGACAAGTAGATGTCGTGATTTCTGCTCTAGGTCGAACCCAGATTCTAGATCAGG
TCAACTTCATCGACGCCATCAAAGAAGCTGGAAATGTCAAGAGATTCTTACCTTCGGAAT
TTGGCAATGACGTGGACCGTACGGTGGCCATCGAGCCGGCGTTATCGGAATTCATCATGA
AAGCTCAAATACTTCGTGCCATAGAAGCCGCGGGGATACCTTATACGTATGTTGTCACAG
GTTGCTTTGCTGGCTTTTTCGTACCTAGTTTGGGTCAATGCCACTTGCGACTCAGAACTC
CTCCTACTGACAAGGTTCCCATCTACGACAGTGGCGATGCCAAAGCTATTATCAACACAA
AGAAGACATTGTTGCGTATACAATGAAAGCTGTTGATGACTCGAGAACCCTCGACAAGAT
TCTCTACGTCCATCTACCCAAGAACATTGTCTCGCAGAACGATATGGTCAGTTTGTGGGA
GAGAAAGATCGGTAAGACTCTGGAGAAGATTTATGTTTCAGAGGAAGAACTTCTCAAAAG
CATCCAAGAGGCTCAGCCTCCAATGGATTTTGTGATGGGTTTGATCCATACAGTACTAGT
GAAAGGTGATCTTACCTCCTTCACTATAGACCCTTCCGTTGGAGTGGAGGCTTCCGAGCT
TTACCTTGATGTCAAGTACACCAGTTCGATGAGTTTCTCAACCAGTTTGTTTGAGACACA
AACAAACAAACCTCCTTTTATGTTGCATTTTAATAATCTGAGATCGATTACATTCGAGAG
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1B367TF U 1
AF RS1B367JQ C 321
BS 1 656 RS1B367TF
BS 657 657 RS1B367JQ
BS 658 678 RS1B367TF
BS 679 679 RS1B367JQ
BS 680 683 RS1B367TF
BS 684 684 RS1B367JQ
BS 685 698 RS1B367TF
BS 699 1021 RS1B367JQ

RD RS1B367TF 702 0 0
AGAAGAAAGAAGTAGGAAGAGAGAAAGAGATGACGAGCAAGACTCTGGTGATCGGGGCGA
CGGGTTACATAGGAAAAGTCTTCGTCGAGGGAAGCGTCAAGTCCGGCCACGCCACTTTCG
CTCTGGTCAGAGAATCCTCTCTCTCCGATCCCGTTAAGGCCAAACTCGTCCAGAGTTTCA
AAGATCTTGGCGTCACCATACTCTACGGAAGCTTAAATGAGAAAGAGAGCTTGGTGAAAG
CGATCAGACAAGTAGATGTCGTGATTTCTGCTCTAGGTCGAACCCAGATTCTAGATCAGG
TCAACTTCATCGACGCCATCAAAGAAGCTGGAAATGTCAAGAGATTCTTACCTTCGGAAT
TTGGCAATGACGTGGACCGTACGGTGGCCATCGAGCCGGCGTTATCGGAATTCATCATGA
AAGCTCAAATACTTCGTGCCATAGAAGCCGCGGGGATACCTTATACGTATGTTGTCACAG
GTTGCTTTGCTGGCTTTTTCGTACCTAGTTTGGGTCAATGCCACTTGCGACTCAGAACTC
CTCCTACTGACAAGGTTCCCATCTACGACAGTGGCGATGCCAAAGCTATTATCAACACAA
AGAAGACATTGTTGCGTATACAATGAAAGCTGTTGATGACTCGAGAACCCTCGACA*GAT
TCTCTACGTCCATCTACC*AAGA*CATTGTCTCGCAGA
CGAT

QA 1 698 1 698
DS 

RD RS1B367JQ 701 0 0
AAAGAAGCTGGAAATGTCAAGAGATTCTTACCTTCGGAATTTGGCAATGACGTGGACCGT
ACGGTGGCCATCGAGCCGGCGTTATCGGAATTCATCATGAAAGCTCAAATACTTCGTGCC
ATAGAAGCCGCGGGGATACCTTATACGTATGTTGTCACAGGTTGCTTTGCTGGCTTTTTC
GTACCTAGTTTGGGTCAATGCCACTTGCGACTCAGAACTCCTCCTACTGACAAGGTTCCC
ATCTACGACAGTGGCGATGCCAAAGCTATTATCAACACAAAGAAGACATTGTTGCGTATA
CAATGAAAGCTGTTGATGACTCGAGAACCCTCGACAAGATTCTCTACGTCCATCTACCCA
AGAACATTGTCTCGCAGAACGATATGGTCAGTTTGTGGGAGAGAAAGATCGGTAAGACTC
TGGAGAAGATTTATGTTTCAGAGGAAGAACTTCTCAAAAGCATCCAAGAGGCTCAGCCTC
CAATGGATTTTGTGATGGGTTTGATCCATACAGTACTAGTGAAAGGTGATCTTACCTCCT
TCACTATAGACCCTTCCGTTGGAGTGGAGGCTTCCGAGCTTTACCTTGATGTCAAGTACA
CCAGTTCGATGAGTTTCTCAACCAGTTTGTTTGAGACACAAACAAACAAACCTCCTTTTA
TGTTGCATTTTAATAATCTGAGATCGATTACATTCGAGAGT

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 6

CO CL1361Contig1 529 6 3 U
GGGAGTCGATAATAAACACATAGAGAGAAGAAGGGAGAGAAGAAAATGGAGAAGTATTTT
GGAAATGCGTACAGGGGAGATCCAGGAGTGCCACACGCAGATGCTGATAGGTTCGTGAAC
ATATGGATTGGTTCGGCTGCCTTCTCTGCTCTCACCTGGGTCAATCCTTACATGTGGCAG
CTCTCCAACCAATTCAATTATCATGATAAGTGGATGCTCTTTGAGCAGTACCACTGGAAA
AAAGCAAGGGCAAAGAAGCAGCCTTACGAATTCAAGTGGAATAAGATACCGAAAGAAGTC
AGGGACTCGTATTATTACAACTGGCCTGTCTACTTCCCTTAGAAGAAACCTCTGCCTTGG
AATCTTTTCAGCTTGCCTTGTCGAACTTATTAAGAATGTAACTCTGTTTGCTTCTCGTTC
TGTTCCTTTTCTGTTGGATTTTAAGTTTGGTCTGTACTTGATCACTCAACTATCCTCTTC
TAGATGAAACTCTTATGGCAAGATTGAAACACTCTTCTTTTACGTACAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 
40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BO33JQ C 1
AF RS1AR03JQ C 11
AF RS1BO33TF U 7
AF RS1AR03TFB U 11
AF RS1AG02TF U 9
AF RS1B140TF U 47
BS 1 13 RS1BO33JQ
BS 14 499 RS1BO33TF
BS 500 529 RS1AG02TF

RD RS1BO33JQ 499 0 0
GGGAGTCGATAATAAACACATAGAGAGAAGAAGGGAGAGAAGAAAATGGAGAAGTATTTT
GGAAATGCGTACAGGGGAGATCCAGGAGTGCCACACGCAGATGCTGATAGGTTCGTGAAC
ATATGGATTGGTTCGGCTGCCTTTTCTGCTCTCACCTGGGTCAATCCTTACATGTGGCAG
CTCTCCAACCAATTCAATTATCATGATAAGTGGATGCTCTTTGAGCAGTACCACTGGAAA
AAAGCAAGGGCAAAGAAGCAGCCTTACGAATTCAAGTGGAATAAGATACCGAAAGAAGTC
AGGGACTCGTATTATTACAACTGGCCTGTCTACTTCCCTTAGAAGAAACCTCTGCCTTGG
AATCTTTTCAGCTTGCCTTGTCGAACTTATTAAGAATGTAACTCTGTTTGCTTCTCGTTC
TGTTCCTTTTCTGTTGGATTTTAAGTTTGGTCTGTACTTGATCACTCAACTATCCTCTTC
TAGATGAAACTCTTATGGC

QA 1 499 1 499
DS 

RD RS1AR03JQ 472 0 0
GGA
AAACACATAGAGAGAAGAAGGGAGAGAAGAAAATGGGGAAGTATTTTGGAAATGCGTACA
GGGGAGATCCAGGAGTGCCACACGCAGATGCTGATAGGTTCGTGAACATATGGATTGGTT
CGGCTGCCTTCTCTGCTCTCACCTGGGTCAATCCTTACATGTGGCAGCTCTCCAACCAAT
TCAATTATCATGATAAGTGGATGCTCTTTGAGCAGTACCACTGGAAAAAAGCAAGGGCAA
AGAAGCAGCCTTACGAATTCAAGTGGAATAAGATACCGAAAGAAGTCAGGGACTCGTATT
ATTACAACTGGCCTGCCTACTTCCCTTAGAAGAAACCTCTGCCTTGGAATCTTTTCAGCT
TGCCTTGTCGAACTTATTAAGAATGTAACTCTGCTTGCTTCTCGTTCTGTTCCTTTTCTG
TTGGATTTTAAGTTTGGTCTGTACTTGATCACTCAACTATCCTCCTCTA

QA 4 472 4 472
DS 

RD RS1BO33TF 493 0 0
CGATAAT
AAACACATAGAGAGAAGAAGGGAGAGAAGAAAATGGAGAAGTATTTTGGAAATGCGTACA
GGGGAGATCCAGGAGTGCCACACGCAGATGCTGATAGGTTCGTGAACATATGGATTGGTT
CGGCTGCCTTCTCTGCTCTCACCTGGGTCAATCCTTACATGTGGCAGCTCTCCAACCAAT
TCAATTATCATGATAAGTGGATGCTCTTTGAGCAGTACCACTGGAAAAAAGCAAGGGCAA
AGAAGCAGCCTTACGAATTCAAGTGGAATAAGATACCGAAAGAAGTCAGGGACTCGTATT
ATTACAACTGGCCTGTCTACTTCCCTTAGAAGAAACCTCTGCCTTGGAATCTTTTCAGCT
TGCCTTGTCGAACTTATTAAGAATGTAACTCTGTTTGCTTCTCGTTCTGTTCCTTTTCTG
TTGGATTTTAAGTTTGGTCTGTACTTGATCACTCAACTATCCTCTTCTAGATGAAACTCT
TATGGC

QA 8 493 8 493
DS 

RD RS1AR03TFB 489 0 0
GGA
AAACACATAGAGAGAAGAAGGGAGAGAAGAAAATGGGGAAGTATTTTGGAAATGCGTACA
GGGGAGATCCAGGAGTGCCACACGCAGATGCTGATAGGTTCGTGAACATATGGATTGGTT
CGGCTGCCTTCTCTGCTCTCACCTGGGTCAATCCTTACATGTGGCAGCTCTCCAACCAAT
TCAATTATCATGATAAGTGGATGCTCTTTGAGCAGTACCACTGGAAAAAAGCAAGGGCAA
AGAAGCAGCCTTACGAATTCAAGTGGAATAAGATACCGAAAGAAGTCAGGGACTCGTATT
ATTACAACTGGCCTGCCTACTTCCCTTAGAAGAAACCTCTGCCTTGGAATCTTTTCAGCT
TGCCTTGTCGAACTTATTAAGAATGTAACTCTGCTTGCTTCTCGTTCTGTTCCTTTTCTG
TTGGATTTTAAGTTTGGTCTGTACTTGATCACTCAACTATCCTCCTCTAGATGAAACTCT
TATG
AC

QA 4 487 4 487
DS 

RD RS1AG02TF 521 0 0
GGAAT
AAACACATAGAGAGAAGAAGGGAGAGAAGAAAATGGAGAAGTATTTTGGAAATGCGTACA
GGGGAGATCCAGGAGTGCCACACGCAGATGCTGATAGGTTCGTGAACATATGGATTGGTT
CGGCTGCCTTCTCTGCTCTCACCTGGGTCAATCCTTACATGTGGCGGCTCTCCAACCAAT
TCAATCATCATGATAAGTGGATGCTCTTTGAGCAGTACCACTGGAAAAAAGCAAGGGCAA
AGAAGCAGCCTTACGAATTCAAGTGGAATAAGATACCGAAAGAAGTCAGGGACTCGTATT
ATTACAACTGGCCTGTCTACTTCCCTTAGAAGAAACCTCTGCCTTGGAATCTTTTCAGCT
TGCCTTGTCGAACTTATTAAGAATGTAACTCTGTTTGCTTCTCGTTCTGTTCCTTTTCTG
TTGGATTTTAAGTTTGGTCTGTACTTGATCACTCAACTATCCTCTTCTAGATGAAACTCT
TATGGCAAGATTGAAACACTCTTCTTTTACGTACAG

QA 6 521 6 521
DS 

RD RS1B140TF 476 0 0
G
GGAGAAGTATTTTGGAAATGCGTACAGGGGAGATCCAGGAGTGCCACACGCAGATGCTGA
TAGGTTCGTGAACATATGGATTGGTTCGGCTGCCTTCTCTGCTCTCACCTGGGTCAATCC
TTACATGTGGCAGCTCTCCAACCAATTCAATTATCATGATAAGTGGATGCTCTTTGAGCA
GTACCACTGGAAAAAAGCAAGGGCAAAGAAGCAGCCTTACGAATTCAAGTGGAATAAGAT
ACCGAAAGAAGTCAGGGACTCGTATTATTACAACTGGCCTGTCTACTTCCCTTAGAAGAA
ACCTCTGCCTTGGAATCTTTTCAGCTTGCCTTGTCGAACTTATTAAGAATGTAACTCTGT
TTGCTTCTCGTTCTGTTCCTTTTCTGTTGGATTTTAAGTTTGGTCTGTACTTGATCACTC
AACTATCCTCTTCTAGATGAAACTCTTATGGCAAGATTGAAACACTCTTCTTTTA

QA 2 476 2 476
DS 



AS 1 6

CO CL1362Contig1 496 6 6 U
TTTTTTAGCGTAACCCTTGAAGCAAAGTAGGCAACCAATAATAATGATACAAGTCTCAGT
ACACAAATGAAAACTGTAAAAAGTAAGACTGTTTTGGTAAATAGAAGACAACAAGACAAA
AGAGAAGAAGACCCGAAGTGAGAGCACTCACGCTTTGTGTCAAAGCTTTTGCATCACCCA
AGGCCAAAGTCATAAAATGAATCTCTATCTGTGTGCTGTGACCAGTGTCTCTATAAACCT
CAGCCCATCAAACCTCGGCTCCAGTTTCTCCGTCTTCCTCGATTCCCAGCCCTTTGGGGA
GACGGGAGGAATAGCGGAGGAGGAAGAAGAGAGAGCAGCGGTGGAGAAGGCAATGACTGA
AGCGACAACACCGCTCGGAATCTTCATCATCATCATTACTGGAGGAGGAGGAGGAGACCC
GTCGGCGCCGGATCTCGACCACCACCAACTCTGCGTCTTCTTCTTGTCTTGGGCCTTTTT
ATTTTCTGGACCAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 

AF RS1CV10JQ U 1
AF RS1AW91JQ U 7
AF RS1AW91TF C 7
AF RS1CV10TF C 7
AF RS1BG78JQ U 7
AF RS1BG78TF C 7
BS 1 328 RS1CV10JQ
BS 329 329 RS1AW91JQ
BS 330 330 RS1CV10JQ
BS 331 331 RS1AW91JQ
BS 332 495 RS1CV10JQ
BS 496 496 RS1BG78JQ

RD RS1CV10JQ 495 0 0
TTTTTTAGCGTAACCCTTGAAGCAAAGTAGGCAACCAATAATAATGATACAAGTCTCAGT
ACACAAATGAAAACTGTAAAAAGTAAGACTGTTTTGGTAAATAGAAGACAACAAGACAAA
AGAGAAGAAGACCCGAAGTGAGAGCACTCACGCTTTGTGTCAAAGCTTTTGCATCACCCA
AGGCCAAAGTCATAAAATGAATCTCTATCTGTGTGCTGTGACCAGTGTCTCTATAAACCT
CAGCCCATCAAACCTCGGCTCCAGTTTCTCCGTCTTCCTCGATTCCCAGCCCTTTGGGGA
GACGGGAGGAATAGCGGAGGAGGAAGAAAAAAGAGCAGCGGTGGAGAAGGCAATGACTGA
AGCGACAACACCGCTCGGAATCTTCATCATCATCATTACTGGAGGAGGAGGAGGAGACCC
GTCGGCGCCGGATCTCGACCACCACCAACTCTGCGTCTTCTTCTTGTCTTGGGCCTTTTT
ATTTTCTGGACCAGC

QA 1 495 1 495
DS 

RD RS1AW91JQ 489 0 0
AGCGTAACCCTTGAAGCAAAGTAGGCAACCAATAATAATGATACAAGTCTCAGTACACAA
ATGAAAACTGTAAAAAGTAAGACTGTTTTGGTAAATAGAAGACAACAAGACAAAAGAGAA
GAAGACCCGAAGTGAGAGCACTCACGCTTTGTGTCAAAGCTTTTGCATCACCCAAGGCCA
AAGTCATAAAATGAATCTCTATCTGTGTGCTGTGACCAGTGTCTCTATAAACCTCAGCCC
ATCAAACCTCGGCTCCAGTTTCTCCGTCTTCCTCGATTCCCAGCCCTTTGGGGAGACGGG
AGGAATAGCGGAGGAGGAAGAAGAGAGAGCAGCGGTGGAGAAGGCAATGACTGAAGCGAC
AACACCGCTCGGAATCTTCATCATCATCATTACTGGAGGAGGAGGAGGAGACCCGTCGGC
GCCGGATCTCGACCACCACCAACTCTGCGTCTTCTTCTTGTCTTGGGCCTTTTTATTTTC
TGGACCAGC

QA 1 489 1 489
DS 

RD RS1AW91TF 489 0 0
AGCGTAACCCTTGAAGCAAAGTAGGCAACCAATAATAATGATACAAGTCTCAGTACACAA
ATGAAAACTGTAAAAAGTAAGACTGTTTTGGTAAATAGAAGACAACAAGACAAAAGAGAA
GAAGACCCGAAGTGAGAGCACTCACGCTTTGTGTCAAAGCTTTTGCATCACCCAAGGCCA
AAGTCATAAAATGAATCTCTATCTGTGTGCTGTGACCAGTGTCTCTATAAACCTCAGCCC
ATCAAACCTCGGCTCCAGTTTCTCCGTCTTCCTCGATTCCCAGCCCTTTGGGGAGACGGG
AGGAATAGCGGAGGAGGAAGAAGAGAGAGCAGCGGTGGAGAAGGCAATGACTGAAGCGAC
AACACCGCTCGGAATCTTCATCATCATCATTACTGGAGGAGGAGGAGGAGACCCGTCGGC
GCCGGATCTCGACCACCACCAACTCTGCGTCTTCTTCTTGTCTTGGGCCTTTTTATTTTC
TGGACCAGC

QA 1 489 1 489
DS 

RD RS1CV10TF 489 0 0
AGCGTAACCCTTGAAGCAAAGTAGGCAACCAATAATAATGATACAAGTCTCAGTACACAA
ATGAAAACTGTAAAAAGTAAGACTGTTTTGGTAAATAGAAGACAACAAGACAAAAGAGAA
GAAGACCCGAAGTGAGAGCACTCACGCTTTGTGTCAAAGCTTTTGCATCACCCAAGGCCA
AAGTCATAAAATGAATCTCTATCTGTGTGCTGTGACCAGTGTCTCTATAAACCTCAGCCC
ATCAAACCTCGGCTCCAGTTTCTCCGTCTTCCTCGATTCCCAGCCCTTTGGGGAGACGGG
AGGAATAGCGGAGGAGGAAGAAGAGAGAGCAGCGGTGGAGAAGGCAATGACTGAAGCGAC
AACACCGCTCGGAATCTTCATCATCATCATTACTGGAGGAGGAGGAGGAGACCCGTCGGC
GCCGGATCTCGACCACCACCAACTCTGCGTCTTCTTCTTGTCTTGGGCCTTTTTATTTTC
TGGACCAGC

QA 1 489 1 489
DS 

RD RS1BG78JQ 490 0 0
G
GCGTAACCCTTGAAGCAAAGTAGGCAACCAATAATAATGATACGAGTCTCAGTACACAAA
TGAAAACTGTAAAAAGTAAGACTGTTTTGGTAGATAGAAGACAACAAGACAAAAGAGAAG
AAGACCCGAAGTGAGAGCACTCACGCTTTGTGTCAAAGCTTTTGCATCACCCAAGGCCAA
AGTCATAAAATGAATCTCTATCTGTGTGCTGTGACCAGTGTCTCTATAAACCTCAGCCCA
TCAAACCTCGGCTCCAGTTTCTCCGTCTTCCTCGATTCCCAGCCCTTTGGGGAGACGGGA
GGAATAGCGGAGGAGGAAGAAGAGAGAGCAGCGGTGGAGAAGGCAATGACTGAAGCGACA
ACACCGCTCGGAATCTTCATCATCATCATTACTGGAGGAGGAGGAGGAGACCCGTCGGCG
CCGGATCTCGACCACCACCAACTCTGCGTCTTCTTCTTGTCTTGGGCCTTTTTATTTTCT
GGACCAGCC

QA 2 490 2 490
DS 

RD RS1BG78TF 490 0 0
G
GCGTAACCCTTGAAGCAAAGTAGGCAACCAATAATAATGATACGAGTCTCAGTACACAAA
TGAAAACTGTAAAAAGTAAGACTGTTTTGGTAGATAGAAGACAACAAGACAAAAGAGAAG
AAGACCCGAAGTGAGAGCACTCACGCTTTGTGTCAAAGCTTTTGCATCACCCAAGGCCAA
AGTCATAAAATGAATCTCTATCTGTGTGCTGTGACCAGTGTCTCTATAAACCTCAGCCCA
TCAAACCTCGGCTCCAGTTTCTCCGTCTTCCTCGATTCCCAGCCCTTTGGGGAGACGGGA
GGAATAGCGGAGGAGGAAGAAGAGAGAGCAGCGGTGGAGAAGGCAATGACTGAAGCGACA
ACACCGCTCGGAATCTTCATCATCATCATTACTGGAGGAGGAGGAGGAGACCCGTCGGCG
CCGGATCTCGACCACCACCAACTCTGCGTCTTCTTCTTGTCTTGGGCCTTTTTATTTTCT
GGACCAGC
C

QA 2 489 2 489
DS 



AS 2 6

CO CL1363Contig1 799 2 16 U
GTAAGTAAGGGTTTCATTCTGCATCACTCTCCCCGTCGTTCTCGACCTCGCAAGGTTTTT
GAAGCGGCCGAAGCGGGAAGTGACAATACCGCTTTTCTTCAGCACATTTTGGATGATTTG
AGCGAAAACGGAGTACAAAGTTCAGCCTTTAAGGAGGCTATGAATCAAATAGGGCTGGTG
GCGCAGTCCCCACTTGACCAATTTGAGATTGTCCCATTGATTCCTATGAATATCGGAAAC
TTCTATTTCTCATTCACAAATTCATCTTTGTTCATGCTGCTAACTCTGAGTTTTTTCCTA
CTTCTGATTCATTTTATTACTAAAAAGGGAGGAGGAAACTTAGTCCCAAATGCTTGGCAA
TCCTTGGTAGAGCTTCTTTATGATTTCGTGCTGAACCTGGTAAAGGAACAAATAGGTGGT
CTTTCCGGAAATGTGAAACAAACGTTTTTCCCTTGCATCTTGGTCACTTTTCTCTTTTTG
TTATTTTGTAATCTTCAGGGTATGATACCTTATAGCTTCACAGTGACAAGTCATTTTCTC
ATTACTTTGGCTCTCTCATTTTCTATTTTTATTGGCATTACTATAGTGGGATTTCAAAGA
CATGGGCTTCATTTTTTCAGCTTTTTATTACCCGCAGGAGTCCCACTGCCGTTAGCACCT
TTTTTAGTACTCCTTGAACTAATTTCTTATTGTTTTCGCGCATAAACTTAGAATACGTTT
ATTTGCTATATGATGCCCGTCATAGTTAGTAAAGATTTAGTGGTTCGCTTGACTATGCTA
TGTATGATGAGATTTCTAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B222TF U 1
AF RS1CM29TF U 1
BS 1 225 RS1B222TF
BS 226 226 RS1CM29TF
BS 227 342 RS1B222TF
BS 343 343 RS1CM29TF
BS 344 448 RS1B222TF
BS 449 449 RS1CM29TF
BS 450 473 RS1B222TF
BS 474 474 RS1CM29TF
BS 475 677 RS1B222TF
BS 678 678 RS1CM29TF
BS 679 681 RS1B222TF
BS 682 682 RS1CM29TF
BS 683 703 RS1B222TF
BS 704 704 RS1CM29TF
BS 705 706 RS1B222TF
BS 707 799 RS1CM29TF

RD RS1B222TF 706 0 0
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GAAGCGGCCGAAGCGGGAAGTGACAATACCGCTTTTCTTCAGCACATTTTGGATGATTTG
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CTTCTGATTCATTTTATTACTAAAAAGGGAGGAGGAAACTTATTCCCAAATGCTTGGCAA
TCCTTGGTAGAGCTTCTTTATGATTTCGTGCTGAACCTGGTAAAGGAACAAATAGGTGGT
CTTTCCGGAAATGTGAAACAAACGTTTT*CCCTTGCATCTTGGTCACTTTTCTTTTTTTG
TTATTTTGTAATCTTCAGGGTATGATACCTTATAGCTTCACAGTGACAAGTCATTTTCTC
ATTACTTTGGCTCTCTCATTTTCTATTTTTATTGGCATTACTATAGTGGGATTTCAAAGA
CATGGGCTTCATTTTTTCAGCTTTTTATTACCCGCAGGAGTCCCACTGCCGTTAGCACCT
TTTTTAGTACTCCTTGAGCTA*TTTCTTATTGTTTTCGCGCATTAA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RS1CM29TF 799 0 0
GTAAGTAAGGGTTTCATTCTGCATCACTCTCCCCGTCGTTCTCGACCTCGCAAGGTTTTT
GAAGCGGCCGAAGCGGGAAGTGACAATACCGCTTTTCTTCAGCACATTTTGGATGATTTG
AGCGAAAACGGAGTACAAAGTTCAGCCTTTAAGGAGGCTATGAATCAAATAGGGCTGGTG
GCGCAGTCCCCACTTGACCAATTTGAGATTGTCCCATTGATTCCTATGAATATCGGAAAC
TTCTATTTCTCATTCACAAATTCATCTTTGTTCATGCTGCTAACTCTGAGTTTTTTCCTA
CTTCTGATTCATTTTATTACTAAAAAGGGAGGAGGAAACTTAGTCCCAAATGCTTGGCAA
TCCTTGGTAGAGCTTCTTTATGATTTCGTGCTGAACCTGGTAAAGGAACAAATAGGTGGT
CTTTCCGGAAATGTGAAACAAATGTTTTTCCCTTGCATCTTGGTCACTTTTCTCTTTTTG
TTATTTTGTAATCTTCAGGGTATGATACCTTATAGCTTCACAGTGACAAGTCATTTTCTC
ATTACTTTGGCTCTCTCATTTTCTATTTTTATTGGCATTACTATAGTGGGATTTCAAAGA
CATGGGCTTCATTTTTTCAGCTTTTTATTACCCGCAG*AGTCCCACTGCCGTTAGCACCT
TTTTTAGTACTCCTTGAACTAATTTCTTATTGTTTTCGCGCATAAGCTTAGAATACGTTT
ATTTGCTATATGATGCCCGTCATAGTTAGTAAAGATTTAGTGGTTCGCTTGACTATGCTA
TGTATGATGAGATTTCTAT

QA 1 799 1 799
DS 



CO CL1363Contig2 729 4 18 U
CCTTATCAGAGAGGGGCCCCCTAGGGGGTGTTTAGTAACTCGAGCATTCCTTGTTTACTC
GAACAGCAAAGGAGAGGTGCTTTAGCAACTCGACTGCAAGGAGAGGGGCTGTGTAACTGC
TCTTTATAACACTACTCTCATCCCTCGCTTTTGTTCAATTATAAATCTAAATAAAAGAAA
GAAGAAATTTAATGGAGATTTATAGCATCATTCAAGTAAATACAGATTAAGATCGTAAAA
ACATAAGCTTGTAATATAGCTACACCTAATTCCAGACCGGTTAATGCAAGAACTATAAAT
AAAGGACCAAGAGCCCCTATAAAATAGAAAATCTCATTCATACATAGCATAGTCCAAGCG
AACCCACTTAAAATCTTTACTAAACTATGACCGGCCATCATATTAGCAAATAAACGTATT
CCTAAGCTTAATGCGCGAAAACAATAAGAAATTAGCTCAAGGAGTACTAAAAAAGGTGCT
AACGGCAGTGGGACTCCTGCGGGTAATAAAAAGCTGAAAAAATGAAGCCCATGTCTT*GA
AATCCCACTATAGTAATGCCAATAAAAATAGAAAATGAGAGAGCCAAAGTAATGAGAAAA
TGACTTGTCACTGTGAAGCTATAAGGTATCATACCCTGAAGATTACAAAATAACAAAAAA
AGAAAAGTGACCAAGATGCAAGGGAAAAACATTTGTTTCACATTTCCGGAAAGACCACCT
ATTTGTTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CM29JQ U 1
AF RS1DC56JQ U 1
AF RS1B222JQ U 356
AF RS1DC56TF C 104
BS 1 48 RS1CM29JQ
BS 49 49 RS1DC56JQ
BS 50 123 RS1CM29JQ
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BS 692 706 RS1B222JQ
BS 707 729 RS1DC56TF

RD RS1CM29JQ 689 0 0
CCTTATCAGAGAGGGGCCCCCTAGGGGGTGTTTAGTAACTCGAGCATTTCTTGTTTACTC
GAACAGCAAAGGAGAGGTGCTTTAGCAACTCGACTGCAAGGAGAGGGGCTGTGTAACTGC
TCTAAATAACACTACTCTCATCCCTCGCTTTTGTTCAATTATAAATCTAAATAAAAGAAA
GAAGAACTTTAATGGAGATTTATAGCATCATTCAAGTAAATACAGATTAAGATCGTAAAA
ACATAAGCTTGTAATATAGCTACACCTAATTCCAGACCGGTTAATGCAAGAACTATAAAT
AAAGGACCAAGAGCCCCTATAAAATAGAAAATCTCATTCATACATAGCATAGTCCAAGCG
AACCCACTTAAAATCTTTACTAAACTATGACCGGCCATCATATTAGCAAATAAACGTATT
CCTAAGCTTAATGCGCGAAAACAATAAGAAATTAGTTCAAGGAGTACTAAAAAAGGTGCT
AACGGCAGTGGGACTCCTGCGGGTAATAAAAAGCTGAAAAAATGAAGCCCATGTCTTTGA
AATCCCACTATAGTAATGCCAATAAAAATAGAAAATGAGAGAGCCAAAGTAATGAGAAAA
TGACTTGTCACTGTGAAGCTATAAGGTATCATACCCTGAAGATTACAAAATAACAAAAAG
AGAAAAGTGACCAAGATGCAAGGGAAAA
A

QA 1 688 1 688
DS 

RD RS1DC56JQ 661 0 0
CCTTATCAGAGAGGGGCCCCCTAGGGGGTGTTTAGTAACTCGAGCATTCCTTGTTTACTC
GAACAGCAAAGGAGAGGTGCTTTAGCAACTCGACTGCAAGGAGAGGGGCTGTGTAACTGC
TCTTTATAACACTACTCTCATCCCTCGCTTTTGTTCAATTATAAATCTAAATAAAAGAAA
GAAGAAATTTAATGGAGATTTATAGCATCATTCAAGTAAATACAGATTAAGATCGTAAAA
ACATAAGCTTGTAATATAGCTACACCTAATTCCAGACCGGTTAATGCAAGAACTATAAAT
AAAGGACCAAGAGCCCCTATAAAATAGAAAATCTCATTCATACATAGCATAGTCCAAGCG
AACCCACTTAAAATCTTTACTAAACTATGACCGGCCATCATATTAGCAAATAAACGTATT
CCTAAGCTTAATGCGCGAAAACAATAAGAAATTAGCTCAAGGAGTACTAAAAAAGGTGCT
AACGGCAGTGGGACTCCTGCGGGTAATAAAAAGCTGAAAAAATGAAGCCCATGTCTT*GA
AATCCCACTATAGTAATGCCAATAAAAATAGAAAATGAGAGAGCCAAAGTAATGAGAAAA
TGACTTGTCACTGTGAAGCTATAAGGTATCATACCCTGAAGATTACAAAATAACAAAAAA
A

QA 1 661 1 661
DS 

RD RS1B222JQ 351 0 0
AAGCGAACCCACTTAAAATCTTTACTAAACTATGACCGGCCATCATATTAGCGAATAAAC
GTATTCCTAAGCTTAATGCGCGAAAACAATAAAAAATTACCTCAAGGAGTACTAAAAAAG
GTGCTAACGGCAGTGGGACTCCTGCGGGTAATAAAAAGCTGAAAAAATGAAGCCCATGTC
TTTGAAATCCCACTATAGTAATGCCAATAAAAATAGAAAATGAGAGAGCCAAAGTAATGA
GAAAATGACTTGTCACTGTGAAGCTATAAGGTATCATACCCTGAAGATTACAAAATAACA
AAAAAAGAAAAGTGACCAAGATGCAAGGGAAAA*CGTTTGTTTCACATTTC

QA 1 351 1 351
DS 

RD RS1DC56TF 626 0 0
AGGGGCTGTGTAACTGCTCTTTATAACACTACTCTCATCCCTCGCTTTTGTTCAATTATA
AATCTAAATAAAAGAAAGAAGAAATTTAATGGAGATTTATAGCATCATTCAAGTAAATAC
AGATTAAGATCGTAAAAACATAAGCTTGTAATATAGCTACACCTAATTCCAGACCGGTTA
ATGCAAGAACTATAAATAAAGGACCAAGAGCCCCTATAAAATAGAAAATCTCATTCATAC
ATAGCATAGTCCAAGCGAACCCACTTAAAATCTTTACTAAACTATGACCGGCCATCATAT
TAGCAAATAAACGTATTCCTAAGCTTAATGCGCGAAAACAATAAGAAATTAGCTCAAGGA
GTACTAAAAAAGGTGCTAACGGCAGTGGGACTCCTGCGGGTAATAAAAAGCTGAAAAAAT
GAAGCCCATGTCTT*GAAATCCCACTATAGTAATGCCAATAAAAATAGAAAATGAGAGAG
CCAAAGTAATGAGAAAATGACTTGTCACTGTGAAGCTATAAGGTATCATACCCTGAAGAT
TACAAAATAACAAAAAAAGAAAAGTGACCAAGATGCAAGGGAAAAACATTTGTTTCACAT
TTCCGGAAAGACCACCTATTTGTTCC

QA 1 626 1 626
DS 



AS 2 5

CO CL1364Contig1 789 2 5 U
AGCGCAATCATTTACTTATACAGATGGAGTGCGAATAACGTGACAAAAGCAGTGAAATGA
AAATGATCCTCGTCGAAGACGATTAACTTCAATGTTTACCAAACTAAGCTTTCTTTTTTT
CATCCCTTTTTTCTCTAATCTACAAAGTGATTCATAAAACATAAAGAGGGTTTACATGCT
TTAAACGAGACAGCAGGAACCAACAAGATCCGTGAGGGTTTTAACAAGTTTCTCCACCAG
TTCTGTCTATAAAACAAGCCCTTCAGTCTCTCTGACATTTCAAAACTGACACGAAGTTCC
CAGCCTCTGCCTCAAATCCTGTCCTAAAGTTAAGGCCTTGCGCTTTGTCTCACTAGGCTC
CTCGTCTCCAGCACGAACCTCTCTAGTCATCATCTCACCAGTTTCAGCCAAACATAAACC
ATAATCAGTAGAATCGTGCAGAGAACTAAAACAAGGAGACTAGCCTCCGCTCCCTTCTCA
ACATCTCACAATCTTCAAAAGGGTCTCGACTTGCTATGTACTTCATCTCCTCTTAAGAGA
ACGGGATCGACGCCTGTGGCCAATGAATCCACTCAAAGTAAAGATCCTCAAGATTCTCCG
GCAAGCAAAGACCGTGATCGATCGGAATTAGCTCCACTTGACCAAACATCCCCACACCAT
CCAGCTTCTTAACCAGAAGGTTCCGGTTCCCTGAGTGTCTGTCCGTATTCTTCAAGATTC
TAATATCAAGAATCCCTATACGGTGCAAAGCTGAAACAGGGAAGCTGGACGTCCCATGCG
CGTTATCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FN18JQ U 133
AF RS1A924JQ U 1
BS 1 314 RS1A924JQ
BS 315 315 RS1FN18JQ
BS 316 317 RS1A924JQ
BS 318 318 RS1FN18JQ
BS 319 789 RS1A924JQ

RD RS1FN18JQ 212 0 0
CT
CTAATCTACAAAGTGATTCATAAAACATAAAGAGGGTTTACATGCTTTAAACGAGACAGC
AGGAACCAACAAGATCCGTGAGGGTTTTAACAAGTTTCTCCACCAGTTCTGTCTATAAAA
CAAGCCCTTCAGTCTCTCTGACATTTCAAAACTGACACGAAGTTCCCAGCCTCTGCCTCA
AATCCTGTCCTAAAGTTAAGGCCTTGCGCT

QA 3 212 3 212
DS 

RD RS1A924JQ 789 0 0
AGCGCAATCATTTACTTATACAGATGGAGTGCGAATAACGTGACAAAAGCAGTGAAATGA
AAATGATCCTCGTCGAAGACGATTAACTTCAATGTTTACCAAACTAAGCTTTCTTTTTTT
CATCCCTTTTTTCTCTAATCTACAAAGTGATTCATAAAACATAAAGAGGGTTTACATGCT
TTAAACGAGACAGCAGGAACCAACAAGATCCGTGAGGGTTTTAACAAGTTTCTCCACCAG
TTCTGTCTATAAAACAAGCCCTTCAGTCTCTCTGACATTTCAAAACTGACACGAAGTTCC
CAGCCTCTGCCTCAGATTCTGTCCTAAAGTTAAGGCCTTGCGCTTTGTCTCACTAGGCTC
CTCGTCTCCAGCACGAACCTCTCTAGTCATCATCTCACCAGTTTCAGCCAAACATAAACC
ATAATCAGTAGAATCGTGCAGAGAACTAAAACAAGGAGACTAGCCTCCGCTCCCTTCTCA
ACATCTCACAATCTTCAAAAGGGTCTCGACTTGCTATGTACTTCATCTCCTCTTAAGAGA
ACGGGATCGACGCCTGTGGCCAATGAATCCACTCAAAGTAAAGATCCTCAAGATTCTCCG
GCAAGCAAAGACCGTGATCGATCGGAATTAGCTCCACTTGACCAAACATCCCCACACCAT
CCAGCTTCTTAACCAGAAGGTTCCGGTTCCCTGAGTGTCTGTCCGTATTCTTCAAGATTC
TAATATCAAGAATCCCTATACGGTGCAAAGCTGAAACAGGGAAGCTGGACGTCCCATGCG
CGTTATCAC

QA 1 789 1 789
DS 



CO CL1364Contig2 802 3 1 U
GATAGGAACAAGACTAGAAAAGAGAGAAGAGCTTCAAAGCGAGAGACCTTCCTGAGTCGA
CTCGGAACGAGTTGGCTATTCTCTCATAATCTCTCCTCTACTGTATTCGGTTTTCGAGCT
CCCTCCCTCCCTCTCCGTTGCTGTCATTTTCGTTTGTTGCAGATTGTTGTGTTATCTGGA
TTTTAACTATGGAAGCTCGTCTTGTGGATTTCGTTTGGTTTCATTGGTCTTGGATTTAAG
CAACCTGTCTTAGGAGGAAGAAGAAAGGGGCTGACTTTCGCATTAGAGCGAGGCTGTGAC
TTCTCTGGTTTGATCTCCACAATTCATGTCACGTAAACTCGACAACAGTCCTGTTCAGAC
ACAAAATGGCAGTTTCGCTTCTAAAGAGCAGCCCCTTGACCGGAGATTTTAACAAGATGG
GGATGTAGCCTAGGCGTGTTTTAGTCCAAACTGAGACTCGTTGTGTACTGGGGTTGGAGC
TGGATCGCAGCAGTGATAACGCGCATGGGACGTCCAGCTTCCCTGTTTCAGCTTTGCACC
GTATAGGGATTCTTGATATTAGAATCTTGAAGAATACGGACAGACACTCAGGGAACCGGA
ACCTTCTGGTTAAGAAGCTGGATGGTGTGGGGGATGTTTGGTCAAGTGGAGCTGATTCCG
ATCGATCACGGTCTTTGCTTGCCGGAGAATCTTGAGGATCTTTACTTTGAGTGGATTCAT
TGGCCACAGGCGTCGATCCCGCTCTCCGAAGAGGAGATGAAGTACATAGCAAGTCGAGAC
CCTTTTGAGATTGTGAGATGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A924TF U 24
AF RS1FN18TF U 159
AF RS1BX59TF U 1
BS 1 802 RS1BX59TF

RD RS1A924TF 465 0 0
GG
GAAGAGCTTCAAAGCGAGAGACCTTCCTGAGTCGACTCGGAACGAGTTGGCTATTCTCTC
ATAATCTCTCCTCTACTGTATTCGGTTTTCGAGCTCCCTCCCTCCCTCTCCGTTGCTGTC
ATTTTCGTTTGTTGCAGATTGTTGTGTTATCTGGATTTTAACTATGGAAGCTCGTCTTGT
GGATTTCGTTTGGTTTCATTGGTCTTGGATTTAAGCAACCTGTCTTAGGAGGAAGAAGAA
AGGGGCTGACTTTCGCATTAGAGCGAGGCTGTGACTTCTCTGGTTTGATCTCCACAATTC
ATGTCACGTAAACTCGACAACAGTCCTGTTCAGACACAAAATGGCAGTTTCGCTTCTAAA
GAGCAGCCCCTTGACCGGAGATTTTAACAAGATGGGGATGTAGCCTAGGCGTGTTTTAGT
CCAAACTGAAACTCGTTGTGTACTGGGGTTGGAGCTGGATCGC

QA 3 465 3 465
DS 

RD RS1FN18TF 568 0 0
GCAGATTGTTGTGTTATCTGGATTTTAACTATGGAAGCTCGTCTTGTGGATTTCGTTTGT
TTTCATTGGTCTTGGATTTAAGCAACCTGTCTTAGGAGGAAGAAGAAAGGGGCTGACTTT
CGCATTAGAGCGAGGCTGTGACTTCTCTGGTTTGATCTCCACAATTCATGTCACGTAAAC
TCGACAACAGTCCTGTTCAGACACAAAATGGCAGTTTCGCTTCTAAAGAGCAGCCCCTTG
ACCGGAGATTTTAACAAGATGGGGACGTAGCCTAGGCGTGTTTTAGTCCAAACTGAGACT
CGTTGTGTACTGGGGTTGGAGCTGGATCGCAGCAGTGATAACGCGCATGGGACGTCCAGC
TTCCCTGTTTCAGCTTTGCACCGTATAGGGATTCTTGATATTAGAATCTTGAAGAATACG
GACAGACACTCAGGGAACCGGAACCTTCTGGTTAAGAAGCTGGATGGTGTGGGG*ATGTT
TGGTCAAGTGGAGCTGATTCCGATCGATCACGGTCTTTGCTTGCCGGAGAATCTTGAGGA
TCTTTACTTTGAGTGGATTCATTGGCCA

QA 1 568 1 568
DS 

RD RS1BX59TF 802 0 0
GATAGGAACAAGACTAGAAAAGAGAGAAGAGCTTCAAAGCGAGAGACCTTCCTGAGTCGA
CTCGGAACGAGTTGGCTATTCTCTCATAATCTCTCCTCTACTGTATTCGGTTTTCGAGCT
CCCTCCCTCCCTCTCCGTTGCTGTCATTTTCGTTTGTTGCAGATTGTTGTGTTATCTGGA
TTTTAACTATGGAAGCTCGTCTTGTGGATTTCGTTTGGTTTCATTGGTCTTGGATTTAAG
CAACCTGTCTTAGGAGGAAGAAGAAAGGGGCTGACTTTCGCATTAGAGCGAGGCTGTGAC
TTCTCTGGTTTGATCTCCACAATTCATGTCACGTAAACTCGACAACAGTCCTGTTCAGAC
ACAAAATGGCAGTTTCGCTTCTAAAGAGCAGCCCCTTGACCGGAGATTTTAACAAGATGG
GGATGTAGCCTAGGCGTGTTTTAGTCCAAACTGAGACTCGTTGTGTACTGGGGTTGGAGC
TGGATCGCAGCAGTGATAACGCGCATGGGACGTCCAGCTTCCCTGTTTCAGCTTTGCACC
GTATAGGGATTCTTGATATTAGAATCTTGAAGAATACGGACAGACACTCAGGGAACCGGA
ACCTTCTGGTTAAGAAGCTGGATGGTGTGGGGGATGTTTGGTCAAGTGGAGCTGATTCCG
ATCGATCACGGTCTTTGCTTGCCGGAGAATCTTGAGGATCTTTACTTTGAGTGGATTCAT
TGGCCACAGGCGTCGATCCCGCTCTCCGAAGAGGAGATGAAGTACATAGCAAGTCGAGAC
CCTTTTGAGATTGTGAGATGTG

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 6

CO CL1365Contig1 840 6 7 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATACGGCCATTACGGCCGGGGCACGGCGACG
TGTTCGAGGTTCTGAGGCCGTGGATCGAGCTCGGGAGGGTGACGGTGCATGATATCAGGG
ATCAGGAGCGGTTCGATGGGTACTATCATTACCAGTTCATGGTCGTGAACGATTGCTTGC
ATAGGTATAGGTTCAAGACGAAGTGGATGTTCTTCTTCGATGTTGATGAGTTTATGTACG
TTCCGGAGGAGAAGGGGACGGTCTCGGAGGTTATGGAATCTTTGGAGGAATATTCTCAGT
TTACTATTGAGCAGATGCCGATGAGTAGTAGGATTTGTTACTCCGGCGATGGTCCGGCGA
GAACTTACAGGAAATGGGGATTTGAGAAAATGGCATATAGAGACGTGAAGAAGGTTCCAA
GACGAGACCGGAAATACGCGGTCCAGCCGCAAAACGTATTTGCAACGGGAGTCCACATGT
CTCAGAATCTACAAGGGAAAACATACCACAAGGCTGAGAGTAAAATCCGTTATTTCCACT
ACCACGGTTCAATTTCTCAGCGTCGCGAGCCTTGCCGTCACCTTTTCAATTACTCGAGAG
TTGTCTTTGAGAATAATCCTTATGTGCTCGACACTACGATCCGCGACGTTGGTCTTGCTG
TGAAGACGTTTGAGATGAGAACGATTGGTGACCGGCTGATTAGGACACGCCAGTGAAAAT
GATTTTTTTTTTTTTTT*ATATAAATGAATAGTGAATGTAATCGTCTTTAGAAAGAATTA
GAAGTTATGAAGATGTTTTTTTTTGGGCTATTCTTTTGTTGTATCATAATTTGGCTATGA


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RS1D323TF U 50
AF RS1A347TF U 1
AF RS1A347TR C 216
AF RS1A347TV U 5
AF RS1A347JQ C 87
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CGATTGCTTGCATAGGTATAGGTTCAAGACGAAGTGGATGTTCTTCTTCGATGTTGATGA
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TTACTCGAGAGTTGTCTTTGAGAATAATCCTTATGTGCTCGACACTACG

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TGTTCGAGGTTCTGAGGCCGTGGATCGAGCTCGGGAGGGTGACGGTGCATGATATCAGGG
ATCAGGAGCGGTTCGATGGGTACTATCATTACCAGTTCATGGTCGTGAACGATTGCTTGC
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TTCCGGAGGAGAAGGGGACGGTCTCGGAGGTTATGGAATCTTTGGAGGAATATTCTCAGT
TTACTATTGAGCAGATGCCGATGAGTAGTAGGATTTGTTACTCCGGCGATGGTCCGGCGA
GAACTTACAGGAAATGGGGATTTGAGAAAATGGCATATAGAGACGTGAAGAAGGTTCCAA
GACGAGACCGGAAATACGCGGTCCAGCCGCAAAACGTATTTGCAACGGGAGTCCACATGT
CTCAGAATCTACAAGGGAAAACATACCACAAGGCTGAGAGTAAAATCCGTTATTTCCACT
ACCACGGTTCAATTTCTCAGCGTCGCGAGCCTTGCCGTCACCTTTTCAATTACTCGAGAG
TTGTCTTTGAGAATAATCCTTATGTGCTCGACACTACGATCCGCGACGTTGGTCTTGCTG
TGAAGACGTTTGAGATGAGAACGATTGGTGACCGGCTGA

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GAATCTTTGGAGGAATATTCTCAGTTTACTATTGAGCAGATGCCGATGAGTAGTAGGATT
TGTTACTCCGGGGATGGTCCGGCGAGAACTTACAGGAAATGGGGATTTGAGAAAATGGCA
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GTATTTGCAACGGGAGTCCACATGTTTCAGAATCTACAAGGGAAAACATACCACAAGGCT
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CGTCCCCTTTTCAATTACTCGAGAGTTGTCTTTGAGAATAATCCTTATGTGCTCGACACT
ACGTTCCGCGACGTTGGTCTTGCTGTGAAGACGTTTGAGATGAGAACGATTGGTGACCGG
CTGATTAG

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CGAGGTTCTGAGGCCGTGGATCGAGCTCGGGAGGGTGACGGTGCATGATATCAGGGATCA
GGAGCGGTTCGATGGGTACTATCATTACCAGTTCATGGTCGTGAACGATTGCTTGCATAG
GTATAGGTTCAAGACGAAGTGGATGTTCTTCTTCGATGTTGATGAGTTTATGTACGTTCC
GGAGGAGAAGGGGACGGTCTCGGAGGTTATGGAATCTTTGGAGGAATATTCTCAGTTTAC
TATTGAGCAGATGCCGATGAGTAGTAGGATTTGTTACTCCGGCGATGGTCCGGCGAGAAC
TTACAGGAAATGGGGATTTGAGAAAATGGCATATAGAGACGTGAAGAAGGTTCCAAGACG
AGACCGGAAATACGCGGTCCAGCCGCAAAACGTATTTGCAACGGGAGTCCACATGTCTCA
GAATCTACAAGGGAAAACATACCACAAGGCTGAGAGTAAAATCCGTTATTTCCACTACCA
CGGTTCAATTTCTCAGCGTCGCGAGCCTTGCCGTCACCTTTTCAATTACTCGAGAGTTGT
CTTTGAGAATAATCCTTATGTGCTCGACACTACGATCCGCGACGTTGGTCTTGCTGTGAA
GACGTTTGAGATGAGAACGATTGGTGACCGGCTGATTAGGACACGCCAGTGAAAATGATT
TTTTTTTTTTTTTTATATAAATGAATAGTGAATGTAATCGTCTTTAGAAAGAATTAGAAG
TTATGAAGATGTTTTTTTTTGGGCTATTCTTTTGTTGTATCATAATTTGGCT

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CATTACCAGTTCATGGTCGTGAACGATTGCTTGCATAGGTATAGGTTCAAGACGAAGTGG
ATGTTCTTCTTCGATGTTGATGAGTTTATGTACGTTCCGGAGGAGAAGGGGACGGTCTCG
GAGGTTATGGAATCTTTGGAGGAATATTCTCAGTTTACTATTGAGCAGATGCCGATGAGT
AGTAGGATTTGTTACTCCGGCGATGGTCCGGCGAGAACTTACAGGAAATGGGGATTTGAG
AAAATGGCATATAGAGACGTGAAGAAGGTTCCAAGACGAGACCGGAAATACGCGGTCCAG
CCGCAAAACGTATTTGCAACGGGAGTCCACATGTCTCAGAATCTACAAGGGAAAACATAC
CACAAGGCTGAGAGTAAAATCCGTTATTTCCACTACCACGGTTCAATTTTTCAGCGTCGC
GAGCCTTGCCGTCACCTTTTCAATTACTCGAGAGTTGTCTTTGAGAATAATCCTTATGTG
CTCGACACTACGATCCGCGACGTTGGTCTTGCTGTGAAGACGTTTGAGATGAGAACGATT
GGTGACCGGCTGATTAGGACACGCCAGTGAAAATGATTTTTTTTTTTTTTT*ATATAAAT
GAATAGTGAATGTAATCGTCTTTAGAAAGAATTAGAAGTTATGAAGATGTTTTTTTTTGG
GCTATTCTTTTGTTGTATCATAATTTGGCTATGA

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DS 

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AGCAGATGCCGATGAGTAGTAGGATTTGTTACTCCGGCGATGGTCCGGCGAGAACTTACA
GGAAATGGGGATTTGAGAAAATGGCATATAGAGACGTGAAGAAGGTTCCAAGACGAGACC
GGAAATACGCGGTCCAGCCGCAAAACGTATTTGCAACGGGAGTCCACATGTCTCAGAATC
TACAAGGGAAAACATACCACAAGGCTGAGAGTAAAATCCGTTATTTCCACTACCACGGTT
CAATTTTTCAGCGTCGCGAGCCTTGCCGTCACCTTTTCAATTACTCGAGAGTTGTCTTTG
AGAATAATCCTTATGTGCTCGACACTACGATCCGCGACGTTGGTCTTGCTGTGAAGACGT
TTGAGATGAGAACGATTGGTGACCGGCTGATTAGGACACGCCAGTGAAAATGATTTTTTT
TTTTTTTT*ATATAAATGAATAGTGAATGTAATCGTCTTTAGAAAGAATTAGAAGTTATG
AAGATGTTTTTTTTTGGGCTATTCTTTTGTTGTATCATAATTTGGCT
ATGA

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DS 



AS 1 6

CO CL1366Contig1 1231 6 3 U
CAAAACCACTACTGGACAAGATACTTGGCGTCCTGATCGAAGGTCTAGTCGACACTTTTC
TCAGTCTTGTAGAAGAAAACAGAACAGATGATCTGAGTTCAATTGATGCAAATGGTTTCT
GCCAACTCATGTTTGAGCTTGAATACTTTGAGACAGTACTTAATCTATATTTCACAAGCG
ATGCAACCGCGTCTCTGAAAACGCTACAAGGAACCGTGTTGGAGATTGCCATAGAGAGCA
TCAGTGAAGCAGTAGAGACTCCGGGGGCATAACCGCAGACCAACTCGTGGCAGCGAAGAC
ACAGTTTCAGATGACAGACAAGGATCATCTGTTTCAGCAGAATGACCTCCTCGCTCTAAC
GAAACAGTACTCAAGCGAATTGCTACAGTTAGAAATGGAGAGAACTCGTCTGAACACCGC
ATGCTTTGCAGAGTCAGTCCCGGTAGAGCCAACGCCTACATTACCCAAAACTGCGTACAG
AGTGTCGATGGATTCTCCAAGTAGAAACTACAGAGGCTCACAATCATCAGGTTCTCCGGT
TCATAGCCGACCCAGACGAAGATAAAAAGACAACTCTTTGTTTTTTTTTCTTTTTAAGTA
ACACCTTTTTGCACGTTAACGATTAACAATTCTTTGCGAGTGTTTGGTATGTTTGTGCTT
CTTAAGAACTTGTCTTTACTTATAAAACTCAGATGGTTTGGGTTGTAATCAAGAATGGTC
CCACGATGAAAAGTAAAACCAAAGAAGTTGAGAGGGAGAAACATTCCAAAGAAAACACAT
CTTCTTAAAGCATTTCGAGTTTTGGACGACACATAGTCACGAAGACATTTGTTTAAAGAG
TTGATTAACTTAGGCTTCGGATTTGATTTTTAGCTCAAGTTGTCCTCAGTGGTGGAGACA
CCAATATTACTCCATCTCCTCTCACAAATAGATACTGAATATTGCGCTTTGTCGTCCGGA
CAATCTCTTCGTATGTCTCGTCATCTATTTCCACAGTAGTGATAACTTCTTCAACATCAC
CCAGAATCATATTCAAATGCTGATCAAACGCGTGAAGCTTGCCGCGGAGTTGGCGGTCTG
AGCGGAGCTTAACATAGATTCTCTCGTCTAGACTCAGACGAATCAGATCTAGTGGCTCCC
TTACAGTGGCATCTTCCTCGCCGGACATTGTGTAAGAAGTTCACAGGTGGGTATAACTAA
CCTTCTCCGAGGGTTTCGATTATTTGACCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1D466TF U 1
AF RS1D466JQ C 217
AF RS1AK88TF C 657
AF RS1AK88JQ U 725
AF RS1AV91JQ U 681
AF RS1AV91TF C 681
BS 1 528 RS1D466TF
BS 529 682 RS1D466JQ
BS 683 1231 RS1AV91JQ

RD RS1D466TF 528 0 0
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TCAGTCTTGTAGAAGAAAACAGAACAGATGATCTGAGTTCAATTGATGCAAATGGTTTCT
GCCAACTCATGTTTGAGCTTGAATACTTTGAGACAGTACTTAATCTATATTTCACAAGCG
ATGCAACCGCGTCTCTGAAAACGCTACAAGGAACCGTGTTGGAGATTGCCATAGAGAGCA
TCAGTGAAGCAGTAGAGACTCCGGGGGCATAACCGCAGACCAACTCGTGGCAGCGAAGAC
ACAGTTTCAGATGACAGACAAGGATCATCTGTTTCAGCAGAATGACCTCCTCGCTCTAAC
GAAACAGTACTCAAGCGAATTGCTACAGTTAGAAATGGAGAGAACTCGTCTGAACACCGC
ATGCTTTGCAGAGTCAGTCCCGGTAGAGCCAACGCCTACATTACCCAAAACTGCGTACAG
AGTGTCGATGGATTCTCCAAGTAGAAACTACAGAGGCTCACAATCATC

QA 1 528 1 528
DS 

RD RS1D466JQ 540 0 0
TGTTGGAGATTGCCATAGAGAGCATCAGTGAAGCAGTAGAGACTCCGGGG*CATAACCGC
AGACCAACTCGTGGCAGGGAAGACACAGTTTCAGATGACAGACAAGGATCATCTGTTTCA
GCAGA*TGACCTCCTCGCTCTAACGAAACAGTACTCAAGCGAATTGCTACAGTTAGAAAT
GGAGAGAACTCGTCTGAACACCGCATGCTTTGCAGAGTCAGTCCCGGTAGAGCCAACGCC
TACATTACCCAAAACTGCGTACAGAGTGTCGATGGATTCTCCAAGTAGAAACTACAGAGG
CTCACAATCATCAGGTTCTCCGGTTCATAGCCGACCCAGACGAAGATAAAAAGACAACTC
TTTGTTTTTTTTTCTTTTTAAGTAACACCTTTTTGCACGTTAACGATTAACAATTCTTTG
CGAGTGTTTGGTATGTTTGTGCTTCTTAAGAACTTGTCTTTACTTATAAAACTCAGATGG
TTTGGGTTGTAATCAAGAATGGTCCCACGATGAAAAGTAAAACCAAAGAAGTTGAGAGG
C

QA 1 539 1 539
DS 

RD RS1AK88TF 493 0 0
GCTTCTTAAGAACTTGTCTTTACTTATAAAACTCAGATGGTTTGGGTTGTAATCAAGAAT
GGTCCCACGATGAAAAGTAAAACCAAAGAAGTTGAGAGGGAGAAACATTCCAAAGAAAAC
ACATCTTCTTAAAGCATTTCGAGTTTTGGACGACACATAGTCACGAAGACATTTGTTTAA
AGAGTTGATTAACTTAGGCTTCGGATTTGATTTTTAGCTCAAGTTGTCCTCAGTGGTGGA
GACACCAATATTACTCCATCTCCTCTCACAAATAGATACTGAATATTGCGCTTTGTCGTC
CGGACAATCTCTTCGTATGTCTCGTCATCTATTTCCACAGTAGTGATAACTTCTTCAACA
TCACCCAGAATCATATTCAAATGCTGATCAAACGCGTGAAGCTTGCCGCGGAGTTGGCGG
TCTGAGCGGAGCTTAACATAGATTCTCTCGTCTAGACTCAGACGAATCAGATCTAGTGGC
TCCCTTACAGTGG

QA 1 493 1 493
DS 

RD RS1AK88JQ 439 0 0
GATGAAAAGTAAAACCAAAGAAGTTGAGAGGGAGAAACATTTCAAAGAAAACACATCTTC
TTAAAGCATTTCGAGTTTTGGACGACACATAGTCACGAAGACATTTGTTTAAAGAGTTGA
TTAACTTAGGCTTCGGATTTGATTTTTAGCTCAAGTTGTCCTCAGTGGTGGAGACACCAA
TATTACTCCATCTCCTCTCACAAATAGATACTGAATATTGCGCTTTGTCGTCCGGACAAT
CTCTTCGTATGTCTCGTCATCTATTTCCACAGTAGTGATAACTTCTTCAACATCACCCAG
AATCATATTCAAATGCTGATCAAACGCGTGAAGCTTGCCGCGGAGTTGGCGGTCTGAGCG
GAGCTTAACATAGATTCTCTCGTCTAGACTCAGACGAATCAGATCTAGTGGCTCCCTTAC
AGTGGCATCTTCCTCGCCG

QA 1 439 1 439
DS 

RD RS1AV91JQ 551 0 0
CT
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AGAAGTTGAGAGGGAGAAACATTCCAAAGAAAACACATCTTCTTAAAGCATTTCGAGTTT
TGGACGACACATAGTCACGAAGACATTTGTTTAAAGAGTTGATTAACTTAGGCTTCGGAT
TTGATTTTTAGCTCAAGTTGTCCTCAGTGGTGGAGACACCAATATTACTCCATCTCCTCT
CACAAATAGATACTGAATATTGCGCTTTGTCGTCCGGACAATCTCTTCGTATGTCTCGTC
ATCTATTTCCACAGTAGTGATAACTTCTTCAACATCACCCAGAATCATATTCAAATGCTG
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CTCGTCTAGACTCAGACGAATCAGATCTAGTGGCTCCCTTACAGTGGCATCTTCCTCGCC
GGACATTGTGTAAGAAGTTCACAGGTGGGTATAACTAACCTTCTCCGAGGGTTTCGATTA
TTTGACCCC

QA 3 551 3 551
DS 

RD RS1AV91TF 551 0 0
CT
TAAAACTCAGATGGTTTGGGTTGTAATCAAGAATGGTCCCACGATGAAAAGTAAAACCAA
AGAAGTTGAGAGGGAGAAACATTCCAAAGAAAACACATCTTCTTAAAGCATTTCGAGTTT
TGGACGACACATAGTCACGAAGACATTTGTTTAAAGAGTTGATTAACTTAGGCTTCGGAT
TTGATTTTTAGCTCAAGTTGTCCTCAGTGGTGGAGACACCAATATTACTCCATCTCCTCT
CACAAATAGATACTGAATATTGCGCTTTGTCGTCCGGACAATCTCTTCGTATGTCTCGTC
ATCTATTTCCACAGTAGTGATAACTTCTTCAACATCACCCAGAATCATATTCAAATGCTG
ATCAAACGCGTGAAGCTTGCCGCGGAGTTGGCGGTCTGAGCGGAGCTTAACATAGATTCT
CTCGTCTAGACTCAGACGAATCAGATCTAGTGGCTCCCTTACAGTGGCATCTTCCTCGCC
GGACATTGTGTAAGAAGTTCACAGGTGGGTATAACTAACCTTCTCCGAGGGTTTCGATTA
TTTGACCCC

QA 3 551 3 551
DS 



AS 1 5

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AACATCGAAAGGGATCTTGGAGATAGCTAAGTTCGGTTTCTACGTAGCTGTACCTATCGG
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GTATGTTGTCTACCCTGAAGAGGCACCTCGACCTCCTTCACCCGAGGAGATGCGAGAGAT
GGCGCGAGAGCTTGCCCGTAAGAAGAACATTTCCTGAATTGAATTGAGGAACAAGTTAAT
ATTGCAATTGCTCGGGGTAAGGTAATAATGTATCTTTGTTGATTCCTGTACTGTAAGAAT
AGAAATGGGATGTGTAACTCAAATAATGAGGAAGAACATGCGTGTGTTTTGTTCGCTAAA
GGAACCTTTTTGTTACATATCTTGTACTTTACTATACGCATCAATAATTTGAGAGACACG
GGTGATAACAAACAATAGTGCTTCTTCTTCATCTCTTGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CX32JQ C 1
AF RS1CX32TF U 1
AF RS1G929TF U 39
AF RS1DN26TF U 87
AF RS1DN26JQ C 94
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RD RS1CX32JQ 494 0 0
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TCTTATGTATACATTCGCCAACAACAGCACCAATATCAAGAAATTCATGGGCGATCGTTC
GTATGTTGTCTACCCTGAAGAGGCACCTCGACCTCCTTCACCCGAGGAGATGCGAGAAAT
GGCGCGAGAGCTTGCCCGTAAGAAGAACATTTCCTGAATTGAATTGAGGAACAAGTTAAT
ATTGCAATTGCTCGGGGTAAGGTAATAATGTATCTTTGTTGATTCCTGTACTGTAAGAAT
AGAAATGGGATGTGTAACTCAAATAATGAGGAAGAACATGCGTGTGTTTTGTTCGCTAAA
GGAACCTTTTTGTT

QA 1 494 1 494
DS 

RD RS1CX32TF 494 0 0
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TAAAAAGCTCGTCGTTGAATCACATCTCTGATCTCTGGAATACAAAATGTCGGCGGTAGG
AACATCGAAAGGGATCTTGGAGATAGCTAAGTTCGGTTTCTACGTAGCTGTACCTATCGG
TCTTATGTATACATTCGCCAACAACAGCACCAATATCAAGAAATTCATGGGCGATCGTTC
GTATGTTGTCTACCCTGAAGAGGCACCTCGACCTCCTTCACCCGAGGAGATGCGAGAAAT
GGCGCGAGAGCTTGCCCGTAAGAAGAACATTTCCTGAATTGAATTGAGGAACAAGTTAAT
ATTGCAATTGCTCGGGGTAAGGTAATAATGTATCTTTGTTGATTCCTGTACTGTAAGAAT
AGAAATGGGATGTGTAACTCAAATAATGAGGAAGAACATGCGTGTGTTTTGTTCGCTAAA
GGAACCTTTTTGTT

QA 1 494 1 494
DS 

RD RS1G929TF 458 0 0
G
AATTTCTCCATCGATAAACCCTAAAAAGCTCGTCGTTGAATCACATCTCTGATCTCTGGA
ATACAAAATGTCGGCGGTAGGAACATCGAAAGGGATCTTGGAGATAGCTAAGTTCGGTTT
CTACGTAGCTGTACCTATCGGTCTTATGTATACATTCGCCAACAACAGCACCAATATCAA
GAAATTCATGGGCGATCGTTCGTATGTTGTCTACCCTGAAGAGGCACCTCGACCTCCTTC
ACCCGAGGAGATGCGAGAGATGGCGCGAGAGCTTGCCCGTAAGAAGAACATTTCCTGAAT
TGAATTGAGGAACAAGTTAATATTGCAATTGCTCGGGGTAAGGTAATAATGTATCTTTGT
TGATTCCTGTACTGTAAGAATAGAAATGGGATGTGTAACTCAAATAATGAGGAAGAACAT
GCGTGTGTTTTGTTCGCTAAAGGAACCTTTTTGTT
AC

QA 2 456 2 456
DS 

RD RS1DN26TF 494 0 0
TCTGATCTCTGGAATACAAAATGTCGGCGGTAGGAACATCGAAAGGGATCTTGGAGATAG
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GCACCAATATCAAGAAATTCATGGGCGATCGTTCGTATGTTGTCTACCCTGAAGAGGCAC
CTCGACCTCCTTCACCCGAGGAGATGCGAGAGATGGCGCGAGAGCTTGCCCGTAAGAAGA
ACATTTCCTGAATTGAATTGAGGAACAAGTTAATATTGCAATTGCTCGGGGTAAGGTAAT
AATGTATCTTTGTTGATTCCTGTACTGTAAGAATAGAAATGGGATGTGTAACTCAAATAA
TGAGGAAGAACATGCGTGTGTTTTGTTCGCTAAAGGAACCTTTTTGTTACATATCTTGTA
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CTTCATCTCTTGTT

QA 1 494 1 494
DS 

RD RS1DN26JQ 487 0 0
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CGGTTTCTACGTAGCTGTACCTATCGGTCTTATGTATACATTCGCCAACAACAGCACCAA
TATCAAGAAATTCATGGGCGATCGTTCGTATGTTGTCTACCCTGAAGAGGCACCTCGACC
TCCTTCACCCGAGGAGATGCGAGAGATGGCGCGAGAGCTTGCCCGTAAGAAGAACATTTC
CTGAATTGAATTGAGGAACAAGTTAATATTGCAATTGCTCGGGGTAAGGTAATAATGTAT
CTTTGTTGATTCCTGTACTGTAAGAATAGAAATGGGATGTGTAACTCAAATAATGAGGAA
GAACATGCGTGTGTTTTGTTCGCTAAAGGAACCTTTTTGTTACATATCTTGTACTTTACT
ATACGCATCAATAATTTGAGAGACACGGGTGATAACAAACAATAGTGCTTCTTCTTCATC
TCTTGTT

QA 1 487 1 487
DS 



AS 2 6

CO CL1368Contig1 655 4 24 U
AACCTAACATACGAGAATTGATTGACCATTCAGTAGTTGTCTCAACAGACTTCAAACTTG
GGTCAAGGACTCAAGAGAGAGTACAAGTAGAAAGAAGTTTATAAAATGATCTCACTTGAT
TCATCATTCAAAAGCTAAAAAGACATAACATGCAATAAAAACCGACCCATGATGGGGGGC
CTTACATGAAACTAGGAGCAACCGGCCCCTTTGACATGCCAAGACGAACTTCCATCCCGT
GGTGGAAGTCTACCGGCTTGAATGTCTCCGAGTCACGAGGGTCATTCAAGTAATCCTCAA
AACCAAAGTCATCAATGGCTCCTGTGTAGACTTCTAAACCGAGCATTGACGAAGGAATTG
GCCCAGAAGGTCTCTGAAACCTAGAGAGGATTTGCCTGTCCATATCCATCTTCAACGGAA
GTGAAGTCCCGTAGGTATGCCCAATGATCGTCCTCTTCATCGCCTCGTGCGATCTCTTTC
CAGATTCGTAAGATGATTCGAGTGGGTGAGATCCCACGATGTCGCTCTTAACGCCGTTGA
GACCAAATCGAAGAGCGTCTCTCTTCACGCCACCGATCTCATGAGCTATCTTCTTCGGTG
ACTCCATTGTTTCTCTTCCTTTCGCTCTGCTTCCTCTTCCTCTTTAGTTTAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
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30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EX39JQ U 116
AF RS1EX39TF C 1
AF RS1CP05JQ U 104
AF RS1CP05TF C 104
BS 1 107 RS1EX39TF
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BS 174 221 RS1EX39JQ
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BS 385 424 RS1EX39JQ
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RD RS1EX39JQ 309 0 0
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GGGGCCTTACATGAAACTAGGAGCAACCGGCCCCTTTGACATGCCAGGACAAACTTCCAT
CCCGGGGGGGAAGTCTACCGGCTTGAATGTCTCCGAGTCACGAGGGTCATTCAAGTAATC
CTCAAAACCAAAGTCATCAATGGCTCCGGTGTAAACTTCTAAACCGAGCATTGACAAAGG
AATTGGCCCAAAAGGTCTCTGAAACCTAAAGAGGATTTGCCTGTCCATATCCATCTTCAA
CGGAAGTGA

QA 1 309 1 309
DS 

RD RS1EX39TF 620 0 0
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GGTCAAGGACTCAAGAGAGAGTACAAGTAGAAAGAAGTTTATAAAATGATCTCACTTGAT
TCATCATTCAAAAGCTAAAAAGACATAACATGCAATAAAAACCGACCCATGATGGGGGGC
CTTACATGAAACTAGGAGCAACCGGCCCCTTTGACATGCCAGGACGAACTTCCATCCCGT
GGTGGAAGTCTACCGGCTTGAATGTCTCCGAGTCACGAGGGTCATTCAAGTAATCCTCAA
AACCAAAGTCATCAATGGCTCCTGTGTAGACTTCTAAACCGAGCATTGACGAAGGAATTG
GCCCAGAAGGTCTCTGAAACCTAGAGAGGATTTGCCTGTCCATATCCATCTTCAACGGAA
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GACCAAATCGAAGAGCGTCTCTCTTCACGCCACCGATCTCATGAGCTATCTTCTTCGGTG
ACTCCATTGTTTCTCTT
CCC

QA 1 617 1 617
DS 

RD RS1CP05JQ 552 0 0
AAAT
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ACTTCCATCCCGTGGTGGAAGTCTACCGGCTTGAATGTCTCCGAGTCACGAGGGTCATTC
AAGTAATCCTCAAAACCAAAGTCATCAATGGCTCCTGTGTAGACTTCTAAACCGAGCATT
GACGAAGGAATTGGCCCAGAAGGTCTCTGAAACCTAGAGAGGATTTGCCTGTCCATATCC
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TGCGATCTCTTTCCAGATTCGTAAGATGATTCGAGTGGGTGAGATCCCACGATGTCGCTC
TTAACGCCGTTGAGACCAAATCGAAGAGCGTCTCTCTTCACGCCACCGATCTCATGAGCT
ATCTTCTTCGGTGACTCCATTGTTTCTCTTCCTTTCGCTCTGCTTCCTCTTCCTCTTTAG
TTTAGTCC

QA 5 552 5 552
DS 

RD RS1CP05TF 552 0 0
AAAT
GATCTCACTTGATTCATCATTCAAAAGCTAAAAAGACATAACATGCAATAAAAACCGACC
CATGATGGGGGGCCTTACATGAAACTAGGAGCAACCGGCCCCTTTGACATGCCAAGACGA
ACTTCCATCCCGTGGTGGAAGTCTACCGGCTTGAATGTCTCCGAGTCACGAGGGTCATTC
AAGTAATCCTCAAAACCAAAGTCATCAATGGCTCCTGTGTAGACTTCTAAACCGAGCATT
GACGAAGGAATTGGCCCAGAAGGTCTCTGAAACCTAGAGAGGATTTGCCTGTCCATATCC
ATCTTCAACGGAAGTGAAGTCCCGTAGGTATGCCCAATGATCGTCCTCTTCATCGCCTCG
TGCGATCTCTTTCCAGATTCGTAAGATGATTCGAGTGGGTGAGATCCCACGATGTCGCTC
TTAACGCCGTTGAGACCAAATCGAAGAGCGTCTCTCTTCACGCCACCGATCTCATGAGCT
ATCTTCTTCGGTGACTCCATTGTTTCTCTTCCTTTCGCTCTGCTTCCTCTTCCTCTT
TAGTTTAGTCC

QA 5 541 5 541
DS 



CO CL1368Contig2 565 2 1 U
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AAGAGATCGCACGAGGCGATGAAGAGGACGATCATTGGGCATACCTACGGGACTGCACTT
CCTTTGAAGATGGATATGGACAGGCAAATCCTCTCTAGGTTTCAGAGACCTTCTGGGCCA
ATTCCTTCGTCAATGCTCGGTTTAGAAGTGTACACTGGAGCCATTAATGACTTTGGTTTT
GAGGATTACTTGAATGACCCTCGTGACTCGGAGACTTTCAAGCCCGTAGACTTCCACCAC
GGGATGGAAGTTCGTCTTGGCATGTCAAAGGGCCCGGTCGCCCCAAGTTTCATGTAAGGC
CCCATATCATGGGTTCGGTTTTTATTGAATGTTATGTCCTTTTAGCTTTTGAATGATGAA
TCAAGTGGGATCGTTTTATAAACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FL13TF U 1
AF RS1FL13JQ C 169
BS 1 565 RS1FL13TF

RD RS1FL13TF 565 0 0
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AACGGTGTTAAGAGCGACATCGTCGGATCTCACCCACTCGAATCATCTTACGAATCTGGA
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CCTTTGAAGATGGATATGGACAGGCAAATCCTCTCTAGGTTTCAGAGACCTTCTGGGCCA
ATTCCTTCGTCAATGCTCGGTTTAGAAGTGTACACTGGAGCCATTAATGACTTTGGTTTT
GAGGATTACTTGAATGACCCTCGTGACTCGGAGACTTTCAAGCCCGTAGACTTCCACCAC
GGGATGGAAGTTCGTCTTGGCATGTCAAAGGGCCCGGTCGCCCCAAGTTTCATGTAAGGC
CCCATATCATGGGTTCGGTTTTTATTGAATGTTATGTCCTTTTAGCTTTTGAATGATGAA
TCAAGTGGGATCGTTTTATAAACTT

QA 1 565 1 565
DS 

RD RS1FL13JQ 397 0 0
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GGGACTGCACTTCCTTTGAAGATGGATATGGACAGGCAAATCCTCTTTAGGTTTCAGAGA
CCTTTTGGGCCAATTCCTTCGTCAATGCTCGGTTTAGAAGTGTACACTGGAGCCATTAAT
GACTTTGGTTTTGAGGATTACTTGAATGACCCTCGTGACTCGGAGACTTTCAAGCCCGTA
GACTTCCACCACGGGATGGAAGTTCGTCTTGGCATGTCAAAGGGCCCGGTCGCCCCAAGT
TTCATGTAAGGCCCCATATCATGGGTTCGGTTTTTATTGAATGTTATGTCCTTTTAGCTT
TTGAATGATGAATCAAGTGGGATCGTTTTATAAACTT

QA 1 397 1 397
DS 



AS 1 6

CO CL1369Contig1 705 6 3 U
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CCCACAGGGTTATTTCTAGCTGGAGCCAAGTACATGGTCATCCAAGGCGAGCCTGGCGCT
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TCTCTCTAAGAAGCTGGAGGCTTATTAAAGTTATGTTTATTTAAAGCATATTGTTTTCCT
CTTTCTTTTTCTTGGTTTCATACGATTCAATTTTTCGTAAACCATGTTTAATTAATTTGC
CTATTTGTTATTCTTTTTTTTTTTGCTTAAAACCTATTTGTTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 5 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ET37TF U 1
AF RS1ET37JQ C 207
AF RS1C362JQ C 18
AF RS1C362TF U 8
AF RS1CA15JQ C 9
AF RS1CA15TF U 9
BS 1 573 RS1ET37TF
BS 574 698 RS1C362TF
BS 699 705 RS1CA15TF

RD RS1ET37TF 573 0 0
GGACGCTGTAAGATAACGCATACAGAAAACCAAGGAAAGACGAAGAAGATGTCGTGGCAA
ACTTACGTTGATGAGCATTTGATGTGTGATGTCGGAGACGGCCAGGGCCATCACCTTACT
GCCGCCGCAATCGTTGGCCATGACGGTAGCGTTTGGGCACAGAGCGCTAACTTCCCTCAG
TTCAAAGCACAAGAGTTCACTGGTATAATGAAAGATTTTGATGAACCGGGTCACTTAGCT
CCCACAGGGTTATTTCTAGCTGGAGCCAAGTACATGGTCATCCAAGGCGAGCCTGGCGCT
GTAATCCGTGGCAAGAAGGGAGCAGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACAATCATGT
GTGTTTGGGCTCTATGAAGAGCCCGTAACACCAGGACAGTGCAACATGGTCGTCGAGAGG
TTGGGTGATTACCTCCTCGAACAGGATCTCTAGGCCTCCATCTCATCAACCCTTCTAGAA
GATTCCAACTTCCACATTATTTTCTTCTACAAACTAATATATTTGATTTGGTTTCTGGAT
TCTCTCTAAGAAGCTGGAGGCTTATTAAAGTTA

QA 1 573 1 573
DS 

RD RS1ET37JQ 344 0 0
AATGAAAGATTTTGATGAACCGGGTCACTTAGCTCCCACAGGGTTATTTCTAGCTGGAGC
CAAGTACATGGTCATCCAAGGCGAGCCTGGCGCTGTAATCCGTGGCAAGAAGGGAGCAGG
AGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACAATCATGTGTGTTTGGGCTTTATGAAGAGCCCGT
AACACCAGGACAGTGCAACATGGTTGTCGAGAGGTTGGGTGATTACCTCCTCGAACAGGA
TCTCTAGGCCTCCATTTCATCAACCCTTTTAGAAGATTCCAACTTCCACATTATTTTTTT
TTACAAACTAATATATTTGATTTGGTTTTTGGATTCT
TTTTAAG

QA 1 337 1 337
DS 

RD RS1C362JQ 635 0 0
GCATACAGAAAACGAAAGAAAGA***AGAAGATGTCGTGGCAAACTTACGTTGATGAGCA
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TCATACGATTCAATTTTTCGTAAACCATGTTTAAT

QA 1 635 1 635
DS 

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GG
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QA 3 691 3 691
DS 

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G
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GATGAGCATTTGATGTGTGATGTCGGAGACGGCCAGGGCCATCACCTTACTGCCGCCGCA
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GGCAAGAAGGGAGCAGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACAATCATGTGTGTTTGGG
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TCTTGGTTTCATACGATTCAATTTTTCGTAAACCATGTTTAATTAATTTGCCTATTTGTT
ATTTTTTTTTTTTT
TGCT

QA 2 675 2 675
DS 

RD RS1CA15TF 697 0 0
G
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GATGAGCATTTGATGTGTGATGTCGGAGACGGCCAGGGCCATCACCTTACTGCCGCCGCA
ATCGTTGGCCATGACGGTAGCGTTTGGGCACAGAGCGCTAACTTCCCTCAGTTCAAAGCA
CAAGAGTTCACTGGTATAATGAAAGATTTTGATGAACCGGGTCACTTAGCTCCCACAGGG
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GGCAAGAAGGGAGCAGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACAATC*TGTGTGTTTGGG
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TACCTCCTCGAACAGGATCTCTAGGCCTCCATCTCATCAACCCTTCTAGAAGATTCCAAC
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TCTTGGTTTCATACGATTCAATTTTTCGTAAACCATGTTTAATTAATTTGCCTATTTGTT
ATT*TTTTTTTTTTTGCTTAAAACCTATTTGTTATG

QA 2 697 2 697
DS 



AS 1 6

CO CL1370Contig1 936 6 11 U
TTTTTAAACCAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAAATACAAAACATAAAAACACA
AAACATAAAATAATGGCAAGAGTTCAGTTATTATTATGTTTCACCTTTCTCCTTGCATCA
GTGACCTTTATGGAACATGTTTCAAGTGCCACCACCGCCAGCTCTAGCTCAACCACTACA
GTGGCACAACTTGAGACTGAGACATCCAAAGAAGTCATGGAATTCATAATGAAGCTGGAG
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GTGGCCTCCACAAAGGTTACTACCGAAAAGAAGAAAGGTTTCTTCTCTGCTGCAGCTGGC
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GCAGAGCAAAAAACAGAGATCAAACAAACAATCACCAGATGGGAAACAGTGACGACTCAG
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GTCAAGCTACCTTGAGCTCTCTCTCAGAGGCTGCTTTATCTACTACATTCATTTTGCCAC
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AGCTCTGATAGCATAAGATGAGAAGATTTGTCTAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1CR57TF U 6
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AF RS1CJ80JQ C 161
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QA 10 421 10 421
DS 

RD RS1CJ80TF 776 0 0
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GTGGCCTCCACAAAGGTTACTACCGAAAAGAAGAAAGGTTTCTTCTCTGCTGCAGCTGGC
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TACACATATATAAAATATTATTCAAG*CTAGCTAA*AATAATTTAGAGATTTTTTT

QA 1 776 1 776
DS 

RD RS1CJ09TF 762 0 0
TTTTTAAAC
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ACATGTTTCAAGTGCCACCACCGCCAGCTCTAGCTCAACCACTACAGTGGCACAACTTGA
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QA 10 762 10 762
DS 

RD RS1AM38TF 732 0 0
AAAC
CAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAAATACAAAACATAAAAACACAAAACATAAAATAAT
GGCAAGAGTTCAGTTATTATTATGTTTCACCTTTCTCCTTGCATCAGTGACCTTTATGGA
ACATGTTTCAAGTGCCACCACCGCCAGCTCTAGCTCAACCACTACAGTGGCACAACTTGA
GACTGAGACATCCAAAGAAGTCATGGAATTCATAATGAAGCTGGAGAAGAAGTGTCCACC
AAAGGAGGAATACAAGTCTTTCTTCGAGAAACTAAAGAGTACCATGGTGGCCTCCACAAA
GGTTACTACCGAAAAGAAGAAAGGTTTCTTCTCTGCTGCAGCTGGCAAAATATCTGATGC
GGTGTCTTTCATTGGTTCAAAATTTACTGGCAAGTCAGCAGAGGTTAAAAAATCCATGGA
GACCTACCAACAAGAGGTGGCCAAGGCACTGCAGGAGTTAGAAGCCATCCACAAGAAAAT
CATTGAAGCAAACCAAGGCAAGGTAGAGGGGTCAGTGGCAGTGACAGCAGAGCAAAAAAC
AGAGATCAAACAAACAATCACCAGATGGGAAACAGTGACGACTCAGTTCGTGGAGACTGC
TATCCAGACCGAAGCTGCTTCAAATACTACAGTTGGTGTAGACAAAGTCAAGCTACCTTG
AGCTCTCTCTCAGAGGCTGCTTTATCTACTACATTCATTTTGCCACTACACATATATAAA
ATATTATT

QA 5 732 5 732
DS 

RD RS1CJ80JQ 773 0 0
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AATTCATAATGAAGCTGGAGAAGAAGTGTCCACCAAAGGAGGAATACAAGTCTTTCTTCG
AGAAACTAAAGAGTACCATGGTGGCCTCCACAAAGGTTACTACCGAAAAGAAGAAAGGTT
TCTTCTCTGCTGCAGCTGGCAAAATATCTGATGCGGTGTCTTTCATTGGTTCAAAATTTA
CTGGCAAGTCAGCAGAGGTTAAAAAATCCATGGAGACCTACCAACAAGAGGTGGCCAAGG
CACTGCAGGAGTTAGAAGTCATCCACAAGAAAATCATTGAAGCAAACCAAGGCAAGGTAG
AGGGGTCAGTGGCAGTGACAGCAGAGCAAAAAACAGAGATCAAACAAACAATCACCAGAT
GGGAAACAGTGACGACTCAGTTCGTGGAGACTGCTATCCAGACCGAAGCTGCTTCAAATA
CTACAGTTGGTGTAGACAAAGTCAAGCTACCTTGAGCTCTCTCTCAGAGGCTGCTTTATC
TACTACATTCATTTTGCCACTACACATATATAAAATATTATTCAAGGCTAGCTAATAATA
ATTTAGAGATTTTTTTTTTTGTTGGGTTGAAATAAAACCAAGGTTGGTATAGGCCAATCA
TATAGATCTATGGATCGACCTATTAAGTAAGTAAAGATAGACTGTAACCGCTCTGTATGT
GTTGAAATAATTTTAAAATAAGCTCTGATAGCATAAGATGAGAAGATTTGTCT

QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1AM38JQ 591 0 0
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CAGGAGTTAGAAGCCATCCACAAGAAAATCATTGAAGCAAACCAAGGCAAGGTAGAGGGG
TCAGTGGCAGTGACAGCAGAGCAAAAAACAGAGATCAAACAAACAATCACCAGATGGGAA
ACAGTGACGACTCAGTTCGTGGAGACTGCTATCCAGACCGAAGCTGCTTCAAATACTACA
GTTGGTGTAGACAAAGTCAAGCTACCTTGAGCTCTCTCTCAGAGGCTGCTTTATCTACTA
CATTCATTTTGCCACTACACATATATAAAATATTATTCAAGGCTAGCTAATAATAATTTA
GAGATTTTTTTTTT*GTTGGGTTGAAATAAAACCAAGGTTGGTATAGGCCAATCATATAG
ATCTATGGATCGACCTATTAAGTAAGTAAAGATAGACTGTAACCGCTCTGTATGTGTTGA
AATAATTTTAAAATAAGCTCTGATAGCATAAGATGAGAAGATTTGTCTAAA

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 6

CO CL1371Contig1 1442 6 6 U
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CACGCGACGAGTCTCATCCTCTCATCCTCCTCCAGGTTCTCTCGTCTCGGCTGTACCAGC
ACCAGATTTCTCAGACACAACACAAACCCTCTTCCCGTTCCTCGATTCCGATGCTACTGC
TCTTCCTCCGACGACACTTCTCCTTCTGTAAAGAAACGTGTGGTCTCTGGAGTCCAGCCC
ACTGGTTCGATTCACCTCGGAAACTATCTCGGCGCTATCAAAAACTGGGTCACTCTTCAG
GATACTTACGAAACACTCTTTTTTATCGTTGACCTTCATGCGATAACACTACCTTATGAC
GTGCAAGAACTGAGAAAGGCGACTAGGGATACCGCAGCGCTCTATCTAGCATGTGGTGTA
GACATTTCTAAGGCTTCGGTGTTTGTGCAATCTCACGTCCGTGCTCATGTGGAGTTAATG
TGGCTTTTGAGTTCATCCACACCTATTGGTTGGTTACAGAAAATGACTCAGTTCAAAGAG
AAATCACGCAAGGAGGGGGGTGAGAATGCTTCTGTGTCTTTGTTAACTTATCCAGTTCTG
ATGGCTGCTGACATCCTCTTGTATAAGTCAGATTTTGTGCCTGTGGGTGAGGACCAGAAG
CAGCACCTAGAACTTGCACGCGACCTGGCACAGCGTGTGAATAATTTATACGGTGGAAGG
AAGTGGAAGAAGCTTGGAGGGCGTGGTGGTTCCATCTTTAAGATACCAGAACCACTTATA
CCGCAAGTTGGAGCCAGAGTTATGTCTCTTACAGATGGTCTTTCCAAGATGTCCAAGTCT
GCACCTTCTGATCAGTCCCGGATCAATCTCCTTGACTCTAAAGATTTGATTGCGGATAAG
ATCAAACGGTGCAGGACAGATTCATTTGCAGGCCTTGAGTTTGACAATGCCGAGAGACCT
GAATGCAACAATCTCCTCTCCGTATATCAGATTGTTTCAGGCAAGACAAAAGAGGAAGTG
ATGGAGGAATGCAAAGATATGAGCTGGGGCACATTTAAGCCTCTCCTTGCTGATGCTGTC
ATCGAGCATCTCAGTCCAATCCAGGTCCGTTATGAGGAGATAACAGCAGAGTCGGCTTAT
TTGGACAAAGTATTGTCAGAAGGTGCGGACAGAGCCACGGAGATAGCCGAATCCACTATT
CACAATTTGAAACAAGCGATGGGTTTCTATATATGAGTAGGATCAGTGCCTACTACGGTG
TTTAAAACCTTTTGCTTTTCTTTTTTTTTGGGTGGAGAGAAAGAGTTGAGAGTTAAAATT
TGCAAACGATTCTTGATTCTTGAAATGCAGTCAAAGGCTGCTCAATATTCTTTGCTGTAA
CTGTGATGTATCGACATTCTTTGCGGTAAGTTATTTTAAAGATTTTTTCAAAAAAGAGAG
GC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1AZ93TF U 8
AF RS1EZ20TF U 1
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AF RS1AZ93JQ C 1046
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CGATTCACCTCGGAAACTATCTCGGCGCTATCAAAAACTGGGTCACTCTTCAGGATACTT
ACGAAACACTCTTTTTTATCGTTGACCTTCATGCGATAACACTACCTTATGACGTGCAAG
AACTGAGAAAGGCGACTAGGGATACCGCAGCGCTCTATCTAGCATGTGGTGTAGACATTT
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ACCAGATTTCTCAGACACAACACAAACCCTCTTCCCGTTCCTCGATTCCGATGCTACTGC
TCTTCCTCCGACGACACTTCTCCTTCTGTAAAGAAACGTGTGGTCTCTGGAGTCCAGCCC
ACTGGTTCGATTCACCTCGGAAACTATCTCGGCGCTATCAAAAACTGGGTCACTCTTCAG
GATACTTACGAAACACTCTTTTTTATCGTTGACCTTCATGCGATAACACTACCTTATGAC
GTGCAAGAACTGAGAAAGGCGACTAGGGATACCGCAGCGCTCTATCTAGCATGTGGTGTA
GACATTTCTAAGGCTTCGGTGTTTGTGCAATCTCACGTCCGTGCTCATGTGGAGTTAATG
TGGCTTTTGAGTTCATCCACACCTATTGGTTGGTTACAGAAAATGACTCAGTTCAAAGAG
AAATCACGCAAGGAGGGGGGTGAGAATGCTTCTGTGTCTTTGTTAACTTATCCAGTTCTG
ATGGCTGCTGACATCCTCTTGTATAAGTCAGATTTTGTGCCTGTGGGTGAGGACCAGAAG
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G
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AACTTATCCAGTTCTGATGGCTGCTGACATCCTCTTGTATAAGTCAGATTTTGTGCCTGT
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TTTATACGGTGGAAGGAAGTGGAAGAAGCTTGGAGGGCGTGGTGGTTCCATCTTTAAGAT
ACCAGAACCACTTATACCGCAAGTTGGAGCCAGAGTTATGTCTCTTACAGATGGTCTTTC
CAAGATGTCCAAGTCTGCACCTTCTGATCAGTCCCGGATCAATCTCCTTGACTCTAAAGA
TTTGATTGCGGATAAGATCAAACGGTGCAGGACAGATTCATTTGCAGGCCTTGAGTTTGA
CAATGCCGAGAGACCTGAATGCAACAATCTCCTCTCCGTATATCAGATTGTTTCAGGCAA
GACAAAAGAGGAAGTGATGGAGGAATGCAAAGATATGAGCTGGGGCACATTTAAGCCTCT
CCTTGCTGATGCTGTCATCGAGCATCTCAGTCCAATCCAGGTCCGTTATGAGGAGATAAC
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TGTCTA

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GGG
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GTTATGAGGAGATAACAGCAGAGTCGGCTTATTTGGACAAAGTATTGTCAGAAGGTGCGG
ACAGAGCCACGGAGATAGCCGAATCCACTATTCACAATTTGAAACAAGCGATGGGTTTTT
ATATATGAGTAGGATCAGTGCCT

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DS 

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GGAGGGCGTGGTGGTTCCATCTTTAAGATACCAGAACCACTTATACCGCAAGTTGGAGCC
AGAGTTATGTCTCTTACAGATGGTCTTTCCAAGATGTCCAAGTCTGCACCTTCTGATCAG
TCCCGGATCAATCTCCTTGACTCTAAAGATTTGATTGCGGATAAGATCAAACGGTGCAGG
ACAGATTCATTTGCAGGCCTTGAGTTTGACAATGCCGAGAGACCTGAATGCAACAATCTC
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GATATGAGCTGGGGCACATTTAAGCCTCTCCTTGCTGATGCTGTCATCGAGCATCTCAGT
CCAATCCAGGTCCGTTATGAGGAGATAACAGCAGAGTCGGCTTATTTGGACAAAGTATTG
TCAGAAGGTGCGGACAGAGCCACGGAGATAGCCGAATCCACTATTCACAATTTGAAACAA
GCGATGGGTTTCTATATATGAGTAGGATCAGTGCCTACTACGGTGTTTAAAACCTTTTGC
TTTTCTTTTTTTTTGGGTGGAGAGAAAGAGTTGAGAGTTAAAATTTGCAAACGATTCTTG
ATTCTTGAAATGCAGTCAAAGGCTGCTCAATATTCTTTGCTGTAACTGTGATGTATCGAC
ATTCTTTGCGGTAAGTTATTTTAAAGATTTTT
CC

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DS 

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ACGGTGCAAGACAGATTCATTTGCAGGCCTTGAGTTTGACAATGCCGAGAGACCTGAATG
CAACAATTTCCTCTCCGTATATCAGATTGTTTCAGGCAAGACAAAAGAGGAAGTGATGGA
GGAATGCAAAGATATGAGCTGGAGCACATTTAAGCCTCTCCTTGCTGATGCTGTCATCGA
GCATCTCAGTCCAATCCAGGTCCGTTATGAGGAGATAACAGCAGAGTCGGCTTATTTGGA
CAAAGTATTGTCAGAAGGTGCGGACAGAGCCACGGAGATAGCCGAATCCACTATTCACAA
TTTGAAACAAGCGATGGGTTTCTATATATGAGTAGGATCAGTGCCTACTACGGTGTTTAA
AACCTTTTGCTT**CTTTTTTTTTGGGTGGAGAGAAAGAGTTGAGAGTTAAAATTTGCAA
ACGATTCTTGATTCTTGAAATGCAGTTAAAGGCTGCTCAATATTCTTTGCTGTAACTGTG
ATGTATCGACATTCTTTGCGGTAAGTTATTTTAAAGATTTTTTCAAAAAAGAGAGGC

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DS 



AS 1 4

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GGATCGTGCAGAAGCTTGGTGCTTGACTCCTCCTAGCTCTTAGCTCTCCGGAGAAGAAGA
AGATGGTGAGGAAACAGTTTCAACAGGCTAAAACGGGAGTAGAGGCTTTGAAGTCAATGG
ATGCAAACAAGTATCTGAAGAAGGTTGGATTAGGGCGTGACGATATGTTCTTTTGGAAAC
AAGTGGGGAAAGCATTGCTGTGCACCTACACGATCTTCGGCATGGCGTGGCTATACAACG
AGACTTCTCCTTTAGGGTGGTGGACGCTGAAGCCGAGACCAAAGGAGGAGAGAGAATTGG
CGCATTTGTATGAGCGGCGTGAGTTTCCTTATCCAGGTGATACGGAGGCTATGGAGGATT
TTGTTGCAAAGGGAGGAATGACCGGGACGGCTATTGGGCCTAAAGGGGTTGTTGAGTCAG
AAGGTGAAGGTGATAATTACCAGAAAGAGATGGAGAAGAAGAAGTTTGACAAAGAGGCTC
AGAAACTGTGGCTGAGGATGAGGAATGAGGTTATGACTGAGCTTCAAGAGAAAGGGTATG
ATCTTGAATAAGTTAACTGCAAAAGAGTTGTGATACAATAAACTTGTGTAATTTAAGCTG
CGTGTAGGTTTCAACCATTGGTACAAGTATCTCTACCTCCTATTTGATTGTAGAGGAAGT
ACAAAACTTTATATGCTCACTGTGTGTGTTTGAAACTATTTTTTTTAGTCCAGGGATTGT
TGTATTGATCAG


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CZ01TF U 1
AF RS1G627TF U 1
AF RS1G627JQ C 44
AF RS1CZ01JQ C 220
BS 1 272 RS1CZ01TF
BS 273 495 RS1G627TF
BS 496 496 RS1G627JQ
BS 497 600 RS1G627TF
BS 601 691 RS1G627JQ
BS 692 732 RS1CZ01JQ

RD RS1CZ01TF 272 0 0
GGATCGTGCAGAAGCTTGGTGCTTGACTCCTCCTAGCTCTTAGCTCTCCGGAGAAGAAGA
AGATGGTGAGGAAACAGTTTCAACAGGCTAAAACGGGAGTAGAGGCTTTGAAGTCAATGG
ATGCAAACAAGTATCTGAAGAAGGTTGGATTAGGGCGTGACGATATGTTCTTTTGGAAAC
AAGTGGGGAAAGCATTGCTGTGCACCTACACGATCTTCGGCATGGCGTGGCTATACAACG
AGACTTCTCCTTTAGGGTGGTGGACGCTGAAG

QA 1 272 1 272
DS 

RD RS1G627TF 604 0 0
GG
ATCGTGCAGAAGCTTGGTGCTTGACTCCTCCTAGCTCTTAGCTCTCCGGAGAAGAAGAAG
ATGGTGAGGAAACAGTTTCAACAGGCTAAAACGGGAGTAGAGGCTTTGAAGTCAATGGAT
GCAAACAAGTATCTGAAGAAGGTTGGATTAGGGCGTGACGATATGTTCTTTTGGAAACAA
GTGGGGAAAGCATTGCTGTGCACCTACACGATCTTCGGCATGGCGTGGCTATACAACGAG
ACTTCTCCTTTAGGGTGGTGGACGCTGAAGCCGAGACCAAAGGAGGAGAGAGAATTGGCG
CATTTGTATGAGCGGCGTGAGTTTCCTTATCCAGGTGATACGGAGGCTATGGAGGATTTT
GTTGCAAAGGGAGGAATGACCGGGACGGCTATTGGGCCTAAAGGGGTTGTTGAGTCAGAA
GGTGAAGGTGATAATTACCAGAAAGAGATGGAGAAGAAGAAGTTTGACAAAGAGGCTCAG
AAACTGTGGCTGACGATGAGGAATGAGGTTATGACTGAGCTTCAAGAGAAAGGGTATGAT
CTTGAATAAGTTAACTGCAAAAGAGTTGTGATACAATAAACTTGTGTAATTTAAGCTG
CGTG

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DS 

RD RS1G627JQ 667 0 0
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GGCTTTGAAGTCAATGGATGCAAACAAGTATCTGAAGAAGGTTGGATTAGGGCGTGACGA
TATGTTCTTTTGGAAACAAGTGGGGAAAGCATTGCTGTGCACCTACACGATCTTCGGCAT
GGCGTGGCTATACAACGAGACTTCTCCTTTAGGGTGGTGGACGCTGAAGCCGAGACCAAA
GGAGGAGAGAGAATTGGCGCATTTGTATGAGCGGCGTGAGTTTCCTTATCCAGGTGATAC
GGAGGCTATGGAGGATTTTGTTGCAAAGGGAGGAATGACCGGGACGGCTATTGGGCCTAA
AGGGGTTGTTGAGTCAGAAGGTGAAGGTGATAATTACCAGAAAGAGATGGAGAAGAAGAA
GTTTGACAAAGAGGCTCAGAAACTGTGGCTGAGGATGAGGAATGAGGTTATGACTGAGCT
TCAAGAGAAAGGGTATGATCTTGAATAAGTTAACTGCAAAAGAGTTGTGATACAATAAAC
TTGTGTAATTTAAGCTGCGTGTAGGTTTCAACCATTGGTACAAGTATCTCTACCTCCTAT
TTGATTGTAGAGGAAGTACAAAACTTTATATGCTCACTGTGTGTGTTT
GAAACTATTTTTCTTAGTC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1CZ01JQ 513 0 0
GCATGGCGTGGCTATACAACGAGATTTCTCCTTTAGGGTGGTGGACGCTGAAGCCGAGAC
CAAAGGAGGAGAGAGAATTGGCGCATTTGTATGAGCGGCGTGAGTTTCCTTATCCAGGCG
ATACGGAGGCTATGGAGGATTTTGTTGCAAAGGGAGGAATGATCGGGACGGCTATTGGGC
CTAAAGGGGTTGTTGAGTCAGAAGGTGAAGGTGATAATTACCAGAAAGAGATGGAGAAGA
AGAAGTTTGACAAAGAGGCTCAGAAACTGTGGCTGAGGATGAG*AATGAGGTTATGACTG
AGCTTCAAGAGAAAGGGTATGATCTTGAATAAGTTAACTGCAAAAGAGTTGTGATACAAT
AAACTTGTGTAATTTAAGCTGTGTGTAGGTTTCAACCATTGGTACAAGTATCTCTACCTC
CTATTTGATTGTAGAGGAAGTACAAAACTTTATATGCTCACTGTGTGTGTTTGAAACTAT
TTTTTTTAGTCCAGGGATTGTTGTATTGATCAG

QA 1 513 1 513
DS 



AS 1 5

CO CL1373Contig1 717 5 2 U
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TGGATGAGGTGCTGGCATCTGTCGCAGAGACGATAAAGAACTTTGCGGTGATATACCTGG
TGGACATCACTGAGGTTCCGGACTTCAACACCATGTACGAGCTCTACGATCCATCCACGG
TCATGTTCTTCTTTAGGAACAAGCACATTATGATCGATCTTGGGACTGGTAACAACAACA
AGATCAACTGGGCTATGAAGGACAAGCAGGAGTTCATTGATATCATTGAAACCGTCTTCC
GTGGTGCAAGGAAAGGTCGTGGTCTGGTGATTGCTCCTAAAGATTACTCCACCAAATACC
GCTACTAACCAACCGGGTCTTGCCACAACATTTGATCGAAACTCTTTATGTCATGAGTGA
TTCTGATCATTTGAAATATATATCCTATGAACTTGTGATTTGTTATTCCGGATTTTGCTT
GCTCTCTCTATCGGCTGTTTGCCATTTATGTGTGTGTGT**AAGTGCTTCAGACTTACTT
CAGTGAAATGATGATTACTTAGAAGCCAAATATTGTGTTTATTTAGTATTAAGTACA


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GC23TF U 5
AF RS1H694TF U 1
AF RS1AT67JQ C 286
AF RS1H694JQB C 22
AF RS1ED36TF U 5
BS 1 687 RS1H694TF
BS 688 717 RS1ED36TF

RD RS1GC23TF 588 0 0
GG
AGATCAGAGTTTTCGAGAAAGCGCGAGAGGAAGGGAGAGAGGGAGACGAGACGATGTCGT
ATCTTCTACCGCATCTGCACTCCGGTTGGGCTGTAGATCAGGCGATTCTGGCGGAGGAAG
AGCGTCTCGTCGTCATACGTTTCGGCCATGATTGGGATGAGACTTGTATGCAGATGGATG
AGGTGCTGGCATCTGTCGCAGAGACGATAAAGAACTTTGCGGTGATATACCTGGTGGACA
TCACTGAGGTTCCAGACTTCAACACCATGTACGAGCTCTACGATCCATCCACGGTCATGT
TCTTCTTTAGGAACAAGCACATTATGATCGATCTTGGGACTGGTAACAACAACAAGATCA
ACTGGGCTATGAGGGACAAGCAGGAGTTCATTGATATCATTGAAACCGTCT*CCGTGGTG
CAAGGAAAGGTCGTGGTCTGGTGATTGCTCCTAAAGATTACTCCACCAAATACCGCTACT
AACCAACCGGGTCTTGCCACAACATTTGATCGAAACTCTTTATGTCATGAGTGATTCTGA
TCATTTGAAATATATATCCTATGAACTTGTGATTTGTTATTCCGGA

QA 3 588 3 588
DS 

RD RS1H694TF 690 0 0
GGAAACAGATCAGAGTTTTCGAGAAAGCGCGAGAGGAAGGGGGAGAGGGAGACGAGACGA
TGTCGTATCTTCTACCGCATCTGCACTCCGGTTGGGCTGTAGATCAGGCGATTCTGGCGG
AGGAAGAGCGTCTCGTCGTCATACGTTTCGGCCATGATTGGGATGAGACTTGTATGCAGA
TGGATGAGGTGCTGGCATCTGTCGCAGAGACGATAAAGAACTTTGCGGTGATATACCTGG
TGGACATCACTGAGGTTCCGGACTTCAACACCATGTACGAGCTCTACGATCCATCCACGG
TCATGTTCTTCTTTAGGAACAAGCACATTATGATCGATCTTGGGACTGGTAACAACAACA
AGATCAACTGGGCTATGAAGGACAAGCAGGAGTTCATTGATATCATTGAAACCGTCTTCC
GTGGTGCAAGGAAAGGTCGTGGTCTGGTGATTGCTCCTAAAGATTACTCCACCAAATACC
GCTACTAACCAACCGGGTCTTGCCACAACATTTGATCGAAACTCTTTATGTCATGAGTGA
TTCTGATCATTTGAAATATATATCCTATGAACTTGTGATTTGTTATTCCGGATTTTGCTT
GCTCTCTCTATCGGCTGTTTGCCATTTATGTGTGTGTGT**AAGTGCTTCAGACTTACTT
CAGTGAAATGATGATTACTTAGAAGCC
AAA

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1AT67JQ 402 0 0
ACGATCCTTCGACTGTCATGTTCTTCTTTAGGAACAAGCACATTATGATCGATCTTGGGA
CTGGTAACAACAACAAGATCAACTGGGCTATGAAGGACAAGCAGGAGTTCATTGATATCA
TTGAAACCGTCTTCCGTGGTGCAAGGAAAGGTCGTGGTCTGGTGATTGCTCCTAAAGATT
ACTCCACCAAATACCGCTACTAACCAACCGGGTCTTGCCACAACATTTGATCGAAACT*T
TTATGTCATGAGTGATTCTGATCATTTGAAATATATATCCTATGAACTTGTGATTTGTTA
TTCCGGATTTTGCTTGCTCTCTCTATCGGCTGTTTGCCATTTATGTGTGTGTGTGTAGGT
GCTTCAAACTTACTTCAGTGAAATGATGATTACTTAGAAGCC

QA 1 402 1 402
DS 

RD RS1H694JQB 666 0 0
AGAAAGCGCGAGAGGAAGGGGGAGAGGGAGACGAGACGATGTCGTATCTTCTACCGCATC
TGCACTCCGGTTGGGCTGTAGATCAGGCGATTCTGGCGGAGGAAGAGCGTCTCGTCGTCA
TACGTTTCGGCCATGATTGGGATGAGACTTGTATGCAGATGGATGAGGTGCTGGCATCTG
TCGCAGAGACGATAAAGAACTTTGCGGTGATATACCTGGTGGACATCACTGAGGTTCCGG
ACTTCAACACCATGTACGAGCTCTACGATCCATCCACGGTCATGTTCTTCTTTAGGAACA
AGCACATTATGATCGATCTTGGGACTGGTAACAACAACAAGATCAACTGGGCTATGAAGG
ACAAGCAGGAGTTCATTGATATCATTGAAACCGTCTTCCGTGGTGCAAGGAAAGGTCGTG
GTCTGGTGATTGCTCCTAAAGATTACTCCACCAAATACCGCTACTAACCAACCGGGTCTT
GCCACAACATTTGATCGAAACTCTTTATGTCATGAGTGATTCTGATCATTTGAAATATAT
ATCCTATGAACTTGTGATTTGTTATTCCGGATTTTGCTTGCTCTCTCTATCGGCTGTTTG
CCATTTATGTGTGTGTGT**AAGTGCTTCAGACTTACTTCAGTGAAATGATGATTACTTA
GAAGCC

QA 1 666 1 666
DS 

RD RS1ED36TF 713 0 0
GG
AGATCAGAGTTTTCGAGAAAGCGCGAGAGGAAGGGAGAGAGGGAGACGAGACGATGTCGT
ATCTTCTACCGCATCTGCACTCCGGTTGGGCTGTAGATCAGGCGATTCTGGCGGAGGAAG
AGCGTCTCGTCGTCATACGTTTCGGCCATGATTGGGATGAGACTTGTATGCAGATGGATG
AGGTGCTGGCATCTGTCGCAGAGACGATAAAGAACTTTGCGGTGATATACCTGGTGGACA
TCACTGAGGTTCCGGACTTCAACATCATGTACGAGCTCTACGATCCATCCACGGTCATGT
TCTTCTTTAGGAACAAGCACATTATGATCGATCTTGGGACTGGTAACAACAACAAGATCA
ACTGGGCTATGAAGGACAAGCAGGAGTTCATTGATATCATTGAAACCGTCTTCCGTGGTG
CAAGGAAAGGTCGTGGTCTGGTGATTGCTCCTAAAGATTACTCCACCAAATACCGCTACT
AACCAACCGGGTCTTGCCACAACATT*GATCGAAACTCTTTATGTCATGAGTGATTCTGA
TCATTTGAAATATATATCCTATGAACTTGTGATTTGTTATTCCGGATTTTGTTTGCTCTC
TCTATCGGCTGTTTGCCATTTATGTGTGTGTGT**AAGTGCTTCAGACTTACTTCAGTGA
AATGATGATTACTTAGAAGCCAAATATTGTGTTTATTTAGTATTAAGTACA

QA 3 713 3 713
DS 



AS 1 6

CO CL1374Contig1 871 6 12 U
GGGCGCTGTTCCAAGGGTTTCGTTGGTTACGAAGGAAGAAGAGTAGTAGATAAGAAAGAG
GGTGAAGAAGATGCCAGGCCCAGTCGTTGAAGAAGTTAACACTGAAGAGCAGTTGATGGA
TGCCATCAAAGAGCAAATGAAGCTCCAG***GAAAATGATGTTGTCGTTGAGGATGTGAA
AGACGGAGATGAAGACGACGAAGATGAGGACGACGACGATGACAACGTCGATGGAGCTGG
TGAGAATGAGAGCTCCAAGCAAAGCCGAAGCGAGAAGAAAAGCCGCAAAGCAATGCTCAA
ACTTGGAATGAAACCTGTCACTGATGTTAGCAGAGTCACAATCAAGAGATCAAAGAATGT
TCTGTTTGTCATCTCGAAGCCTGATGTGTTCAAGAGTCCCAACTCTGACACCTATGTGAT
ATTCGGCGAGGCCAAGATTGATGACATGAGCTCTCAGCTACAAGCCCAAGCTGCTCAGAG
GTTCAAGATGCCTGATGTTGCGTCTATGATCCCCAGCAACGCTGATGCCTCTCAAGCAGC
CACTGTTGCACAAGAGGAGGAAGATGATGATGATGTTGATGAGACTGGTGTTGAAGCTAA
GGACATTGATCTTGTGATGACTCAAGCTGGTGTCTCTAAGGCCAAAGCCGTTAAGGCTCT
CAAGACTAATGATGGAGATATCGTTTCTGCCATTATGGAACTCACTACATAGGTTGAGTT
GCAGAGACTCCCCGTTGGTCCTCTTTTGTAGTTCACTTGCATTTCTTAATCATTTTCATT
TGTGTTTCCCCAATTCTAAGGCTTGTTTTTTCCTTCTATGAGCCATAAACATATTTGCTT
CAAAGTCTATAATATGAGACATGTTATGCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 15 40 40 40 40 10 40 40 40 
40 40 40 15 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 25 15 20 5 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CT34TF U 1
AF RS1FO43TF U 2
AF RS1D381TF U 239
AF RS1CT34JQ C 7
AF RS1BG44TF U 354
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TCTGTTTGTCATCTCGAAGCCTGATGTGTTCAAGAGTCCCAACTCTGACACCTATGTGAT
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GGCGC
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AGATGAAGACGACGAAGATGAGGACGAAGACGAGGACGACGTCGATGGAGCTGGTGAGAA
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AATGAAACCTGTCACTGATGTTAGCAGAGTCACAATCAAGAGATCAAAGAATGTTCTGTT
TGTCATCTCGAAGCCTGATGTGTTCAAGAGTCCCAACTCTGACACCTATGTGATATTCGG
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GATGCCTGATGTTGCGTCTATGATCCCCAGCAACGCTGATGCCTCTCAAGCAGCCACTGT
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TGATCTTGTGATGACTCAAGCTGGTGTCTCTAAGGCCAAAGTCGTTAAGGCTCTCAAGAC
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GCTTCCCGTTGGTC*TCTTT*GTAGT*CACTTGCATTTCTTACC**GTTTCATTTGTGTT
TCCCC
ACTC

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DS 

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AGG
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CTTGGAATGAAACCTGTCACTGATGTTAGCAGAGTCACAATCAAGAGATCAAAGAATGTT
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TTCAAGATGCCTGATGTTGCGTCTATGATCCCCAGCAACGCTGATGCCTCTCAAGCAGCC
ACTGTTGCACAAGAGGAGGAAGATGATGATGATGTTGATGAGACTGGTGTTGAAGCTAAG
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AAGACTAATGATGGAGATATCGTTTCTGCCATTATGGAACTCACTACATAGGTCGAGTTG
CAGAGGCTTCCCGTTGGTCCTCTTTTGTAGTTCACTTGCATTTCTTAACCGTTTTCATTT
GTGTTTCCCC

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DS 

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AGATGAAGACGACGAAGATGAGGACGACGACGATGACAACGTCGATGGAGCTGGTGAGAA
TGAGAGCTCCAAGCAAAGCCGAAGCGAGAAGAAAAGCCGCAAAGCAATGCTCAAACTTGG
AATGAAACCTGTCACTGATGTTAGCAGAGTCACAATCAGGAGATCAAAGAATGTTCTGTT
TGTCATCTCGAAGCCTGATGTGTTCAAGAGTCCCAACTCTGACACCTATGTGATATTCGG
CGAGGCCAAGATTGATGACATGAGCTTTCAGCTACAAGCCCAAGCTGCTCAGAGGTTCAA
GATGCCTGATGTTGCGTCTATGATCCCCAGCAACGCTGATGCCTCTCAAGCAGCCACTGT
TGCACAAGAGGAGGAAGATGATGATGATGTTGATGAGACTGGTGTTGAAGCTAAGGACAT
TGATCTTGTGATGACTCAAGCTGGTGTCTCTAAGGCCAAAGCCGTTAAGGCTCTCAAGAC
TAATGATGGAGATATCGTTTCTGCCATTATGGAACTCACTACATAGGTTGAGTCGCAGAG
ACTCCCCGTTGGTCCTCTTTTGTAGTTCACTTGCATTTCTTAATCATTTTCATTTGTGTT
TCCCCAATTCTAAGGCTTGTTTTTTCCTTCTATGAGCCATAAACATATTTGCTTC

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G
GAATGTTCTGTTTGTCATCTCGAAGCCTGATGTGTTCAAGAGTCCCAACTCTGACACCTA
TGTGATATTCGGCGAGGCCAAGATTGATGACATGAGCTCTCAGCTACAAGCCCAAGCTGC
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AGCAGCCACTGTTGCACAAGAGGAGGAAGATGATGATGATGTTGATGAGACTGGTGTTGA
AGCTAAGGACATTGATCTTGTGATGACTCAAGCTGGTGTCTCTAAGGCCAAAGCCGTTAA
GGCTCTCAAGACTAATGATGGAGATATCGTTTCTGCCATTATGGAACTCACTACATAGGT
TGAGTTGCAGAGACTCCCCGTTGGTCCTCTTTTGTAGTTCACTTGCATTTCTTAATCATT
TTCATTTGTGTTTCCCCAATTCTAAGGCTTGTTTTTTCCTTCTATGAGCCATAAACATAT
TTGCTTCAAAGTCTATAATATGAGACATGTTATGCCT

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DS 

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CAAGCTGCTCAGAGGTTCAAGATGCCTGATGTTGCGTCTATGATCCCCAGCAACGCCGAT
GCCTCTCAAGCAGCCACTGTTGCACAAGAGGAGGAAGATGATGATGATGTTGATGAGACT
GGTGTTGAAGCTAAGGACATTGATCTTGTGATGACTCAAGCTGGTGTCTTTAAGGCCAAA
GCCGTTAAGGCTCTCAAGACTAATGATGGAGATATCGTTTCTGCCATTATGGAACTCACT
ACATAGGTTGAGTTGCAGAGACTCCCCGTTGGTCCTCTTTTGTAGTTCACTTGCATTTTT
TAATCATTTTCATTTGTGTTTCCCCAATTTTAAGGCTTGTTTTTTCCTTTTATGAGCCAT
AAACATATTTGCTTCAAAGTCTATAATATGAGACATGTTATGCCT

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DS 



AS 1 6

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CACACAGAAAATAAAAGTACCTTCGGGGGAAAATCTTGTGGTGGGTTACATTCTCATTCA
GCTCTAGACTGGCCAGCTCTAGAAGAGAGGATGATTCCCACAATAAGGCCGTAAAGAGCA
AGCGCCTCTGCGAAGATAAGGATAAGAATCATCCCGACAAAGAGCTTAGGCTGCTGAGCA
TTTGCCCTGACACCGGCATCTCCGACAATACCAATGGCCATACCAGCAGAGAGACCAGCA
AGACCACAAGCAAGACCGGAGGAGAGATGTGCGTATCCATCGAAGAGGTAGTAAGACTTG
GCCTTGGGGTTAATCCCGGTACTGATGATAACAGCAATAATCAAACCGTAAATACCCAAG
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GTAGACATGTCGAAGGCTTGTGATTTGGATCTGAGATCAGGTCGATGATTCAAATCTGGC
GAGACAGAGAGAGATGGAGAGAGAGGTGTGGATCCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 35 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 10 10 10 40 40 40 40 40 40 10 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DE91JQ U 1
AF RS1EW38JQ U 1
AF RS1BM91JQ U 4
AF RS1EW38TF C 102
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BS 792 840 RS1EW38TF
BS 841 876 RS1BM91TF

RD RS1DE91JQ 710 0 0
TTTACAAATAAATGTATTTAACTTCCTCAGGACAATACAAGAATACAAAAACATACCAAG
CTCCATCAGAGCTCTCTTTATTACAGAACCAAATAATAAAAAAAATCCCTACATCGGAGA
TCAACCACCGAGAGAGAGA**AATAGGAGAGCTTCCGAAACAAAGTTCCCAAGTGTCCAA
TAATTTTTTTCTTCAGTTCCCGATGATACATATGCTAAAGAACGATAGAACAACAAAACA
CACACAGAAAATAAAAGTACCTTCGGGGGAAAATCTTGTGGTGGGTTACATTCTCATTCA
GCTCTAGACTGGCCAGCTCTAGAAGAGAGGATGATTCCCACAATAAGGCCGTAAAGAGCA
AGCGCCTCTGCGAAGATAAGGATAAGAAT***CCCGACAAAGAGCTTAGGCTGCTGAGCA
TTTGCCCTGACACCGGCATCTCCGACAATACCAATGGCCATACCAGCAGAGAGACCAGCA
AGACCACAAGCAAGACCGGAGGAGAGATGTGCGTATCCATCGAAGAGGTAGTAAGACTTG
GCCTTGGGGTTAATCCCGGTACTGATGATAACAGCAATAATCAAACCGTAAATACCCAAG
ACACCAGCCATGACAACGGGGACGATAGACTTCATGACCAACTCTGGCCTCATGACTCCC
ATAGAAGCCACACCAACTCCACTCTTTGCTGTTCCATAAGCAGCTCCCAT

QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1EW38JQ 776 0 0
TTT
ACAAATAAATGTATTTAACTTCCTCAGGACAATACAAGAATACAAAAACATACCAAGCTC
CATCAGAGCTCTCTTTATTACAGAACCAAATAATAAAAAAAATCCCTACATCGGAGATCA
ACCACCGAGAGAGAGAGAAATAGGAGAGCTTCCGAAACAAAGTTCCCAAGTGTCCAATAA
TTTTTTTCTTCAGTTCCCGATGATACATATGCTAAAGAACGATAGAACAACAAAACACAC
ACAGAAAATAAAAGTACCTTCGGGGGAAAATCTTGTGGTGGGTTACATTCTCATTCAGCT
CTAGACTGGCCAGCTCTAGAAGAGAGGATGATTCCCACAATAAGGCCGTAAAGAGCAAGC
GCCTCTGCGAAGATAAGGATAAAAATCATCCCGACGAAAAGCTTAGGCTGCTGAGCATTT
GCCCTGACACCGGCATCTCCGACAATACCAATGGCCATACCAGCAGAGAGACCAGCAAGA
CCACAAGCAAGACCGGAGGAGAGATGTGCGTATCCATCGAAGAGGTAGTAAGACTTGGCC
TTGGGGTTAATCCCGGTACTGATGATAACAGCAATAATCAAACCGTAAATACCCAAGACA
CCAGCCATGACAACGGGGACGATGGACTTCATGACCAACTCTGGCCTCATGACTCCCATA
GAAGCCACACCAACTCCACTCTTTGCTGTTCCATAAGCAGCTCCCATACAGGAGAAGACG
AGTGCGGCTGCAGCGCCGAGGAAGCCGAAGAAAGGAGCTGTTTCATCGCCGCT

QA 4 776 4 776
DS 

RD RS1BM91JQ 788 0 0
ACAAATAAATGTATTTAACTTCCTCAGGACAATACAAGAATACAAAAACATACCAAGCTC
CATCAGAGCTCTCTTTATTACAGAACCAAATAATAAAAAAAATCCCTACATCGGAGATCA
ACCACCGAGAGAGAGAGAAATAGGAGAGCTTCCGAAACAAAGTTCCCAAGTGTCCAATAA
TTTTTTTCTTCAGTTCCCGATGATACATATGCTAAAGAACGATAGAACAACAAAACACAC
ACAGAAAATAAAAGTACCTTCGGGGGAAAATCTTGTGGTGGGTTACATTCTCATTCAGCT
CTAGACTGGCCAGCTCTAGAAGAGAGGATGATTCCCACAATAAGGCCGTAAAGAGCAAGC
GCCTCTGCGAAGATAAGGATAAGAATCATCCCGACAAAGAGCTTAGGCTGCTGAGCATTT
GCCCTGACACCGGCATCTCCGACAATACCAATGGCCATACCAGCAGAGAGACCAGCAAGA
CCACAAGCAAGACCGGAGGAGAGATGTGCGTATCCATCGAAGAGGTAGTAAGACTTGGCC
TTGGGGTTAATCCCGGTACTGATGATAACAGCAATAATCAAACCGTAAATACCCAAGACA
CCAGCCATGACAACGGGGACGATGGACTTCATGACCAACTCTGGCCTCATGACTCCCATA
GAAGCCACACCAACTCCACTCTTTGCTGTTCCATAAGCAGCTCCCATACAGGAGAAGACG
AGTGCGGCTGCAGCGCCGAGGAAGCCGAAGAAAGGAGCTGTTTCATCGCCGCTGAAG*TA
GACATGTC

QA 1 788 1 788
DS 

RD RS1EW38TF 741 0 0
AAAAAT
CCTACATCGGAGATCA*CCACCGAGAGAGAGAGAAATAGGAGAGCT*CCGAAACAAAGTT
CCCAAGTGTCCAATAATTTTTT*CTTCAGTTCCCGATGATACATATGCTAAAGAACGATA
GAACAACAAAACACACACAGAAAATAAAAGTACCTTCGGGGGAAAATCTTGTGGTGGGTT
ACATTCTCATTCAGCTCTAGACTGGCCAGCTCTAGAAGAGAGGATGATTCCCACAATAAG
GCCGTAAAGAGCAAGCGCCTCTGCGAAGATAAGGATAAGAATCATCCCGACGAAGAGCTT
AGGCTGCTGAGCATTTGCCCTGACACCGGCATCTCCGACAATACCAATGGCCATACCAGC
AGAGAGACCAGCAAGACCACAAGCAAGACCGGAGGAGAGATGTGCGTATCCATCGAAGAG
GTAGTAAGACTTGGCCTTGGGGTTAATCCCGGTACTGATGATAACAGCAATAATCAAACC
GTAAATACCCAAGACACCAGCCATGACAACGGGGACGATGGACTTCATGACCAACTCTGG
CCTCATGACTCCCATAGAAGCCACACCAACTCCACTCTTTGCTGTTCCATAAGCAGCTCC
CATACAGGAGAAGACGAGTGCGGCTGCAGCGCCGAGGAAGCCGAAGAAAGGAGCTGTTTC
ATCGCCGCTGAAGGTAGACATGTCGAAGGCTTGTGATTTGGATCTGAGATCAGGTCGATG
ATTCAAATCTGGC
CC

QA 7 739 7 739
DS 

RD RS1BM91TF 693 0 0
TTTTTTTCTTCAGTTCCCGATGATACATATGCTAAAGAACGATAGAACAACAAAACACAC
ACAGAAAATAAAAGTACCTTCGGGGGAAAATCTTGTGGTGGGTTACATTCTCATTCAGCT
CTAGACTGGCCAGCTCTAGAAGAGAGGATGATTCCCACAATAAGGCCGTAAAGAGCAAGC
GCCTCTGCGAAGATAAGGATAAGAATCATCCCGACAAAGAGCTTAGGCTGCTGAGCATTT
GCCCTGACACCGGCATCTCCGACAATACCAATGGCCATACCAGCAGAGAGACCAGCAAGA
CCACAAGCAAGACCGGAGGAGAGATGTGCGTATCCATCGAAGAGGTAGTAAGACTTGGCC
TTGGGGTTAATCCCGGTACTGATGATAACAGCAATAATCAAACCGTAAATACCCAAGACA
CCAGCCATGACAACGGGGACGATGGACTTCATGACCAACTCTGGCCTCATGACTCCCATA
GAAGCCACACCAACTCCACTCTTTGCTGTTCCATAAGCAGCTCCCATACAGGAGAAGACG
AGTGCGGCTGCAGCGCCGAGGAAGCCGAAGAAAGGAGCTGTTTCATCGCCGCTGAAGGTA
GACATGTCGAAGGCTTGTGACTTGGATCTGAGATCAGGTCGATGATTCAAATCTGGCGAG
ACAGAGAGAGATGGAGAGAGAGGTGTGGATCCC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RS1DE91TF 669 0 0
TTTTTTCTTCAGTTCCCGATGATACATATGCTAAAGAACGATAGAACAACAAAACACACA
CAGAAAATAAAAGTAC*TTCGGGGGAAAATCTTGTGGTGGGTTACATTCTCATTCAGCTC
TAGACTGGCCAGCTCTAGAAGAGAGGATGATTCCCACAATAAGGCCGTAAAGAGCAAGCG
CCTCTGCGAAGATAAGGATAAGAAT***CCCGACAAAGAGCTTAGGCTGCTGAGCATTTG
CCCTGACACCGGCATCTCCGACAATACCAATGGCCATACCAGCAGAGAGACCAGCAAGAC
CACAAGCAAGACCGGAGGAGAGATGTGCGTATCCATCGAAGAGGTAGTAAGACTTGGCCT
TGGGGTTAATCCCGGTACTGATGATAACAGCAATAATCAAACCGTAAATACCCAAGACAC
CAGCCATGACAACGGGGACGATAGACTTCATGACCAACTCTGGCCTCATGACTCCCATAG
AAGCCACACCAACTCCACTCTTTGCTGTTCCATAAGCAGCTCCCATACAGGAGAAGACGA
GTGCGGCTGCAGCGCCGAGGAAGCCGAAGAAAGGAGCTGTTTCATCGCCGCTGAAGGTAG
ACATGTCGAAGGCTTGTGATTTGGATCTGAGATCAGGTCGATGATTCAAATCTGGCGAGA
CAGAGAG
CC

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 6

CO CL1376Contig1 645 6 8 U
TTTTTTTTGTAAACAGAGTCTCAAATTAACTGAAGATATATTTTTCAAATCCATTGAGAA
AGGGAGTTCTCAGAAGATAAAACCACAAAGTAAAAGACATTATTAAGGTCGACCAATCAG
AAGAAAAGAAGCTAGAGGGGGAAAACGAATGTACAATCTTCATCACCAAGAAGATCAAAC
TATCAAATCAGAGCATATTAGCAGGAAGATCCAAACGTGTTCTCACCACTGTATGTCATG
TAGAGAAACCCATCTTCGTCTTTGTGTTCTTCATAGATTGCAGACATCAATGCAGCAGTT
GGGGGTAACGTGTTCTTGACAAAGACAAAGATTGCTTTCTCGGCTCCGAGCTTAATTCTT
TTGCGCACAACGTACACAAATTGTCCAGCGGTTAGATCAGCTGGCACAAGGTACTTCTTC
TTGTCAATGTCAGGAACATCACTTTGTGCAGCTTTCTCCACAATCACAGGAACTCTGTCT
TGGTACTTCTCTCTGATACGAGTAGATTCAGCCATTCTCACCTCAAGAGGATTAGAAAGC
TTGAAGGAGTTTTTGGCCATGTCGATTCGATCAGTATCTAAAGAAGAAGAAGCGAATCGA
TGATCGAGAGAAACTAGGGTTCGGTGATCAAAGCCTGAGAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G106JQ U 9
AF RS1G106TF C 1
AF RS1CO88JQ U 2
AF RS1G740JQ U 4
AF RS1G740TF C 120
AF RS1CO88TF C 2
BS 1 7 RS1G106TF
BS 8 8 RS1CO88JQ
BS 9 50 RS1G106JQ
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BS 141 531 RS1G106JQ
BS 532 645 RS1CO88JQ

RD RS1G106JQ 523 0 0
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CTCAGAAGATAAAACCACAAAGTAAAAGACATTATTAAGGTCGACCAATCAGAAGAAAAG
AAGCTAGAGGGAGAAAACGAATGTACAATCTTCATCACCAAGAAGATCAAACTATCAAAT
CAGAGCATATTAGCAGGAAGATCCAAACGTGTTCTCACCACTGTATGTCATGTAGAGAAA
CCCATCTTCGTCTTTGTGTTCTTCATAGATTGCAGACATCAATGCAGCAGTTGGGGGTAA
CGTGTTCTTGACAAAGACAAAGATTGCTTTCTCGGCTCCGAGCTTAATTCTTTTGCGCAC
AACGTACACAAATTGTCCAGCGGTTAGATCAGCTGGCACAAGGTACTTCTTCTTGTCAAT
GTCAGGAACATCACTTTGTGCAGCTTTCTCCACAATCACAGGAACTCTGTCTTGGTACTT
CTCTCTGATACGAGTAGATTCAGCCATTCTCACCTCAAGAGGA

QA 1 523 1 523
DS 

RD RS1G106TF 638 0 0
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AGGGAGTTCTCAGAAGATAAAACCACAAAGTAAAAGACATTATTAAGGTCGACCAATCAG
AAGAAAAGAAGCTAGAGGGAGAAAACGAATGTACAATCTTCATCACCAAGAAGATCAAAC
TATCAAATCAGAGCATATTAGCAGGAAGATCCAAACGTGTTCTCACCACTGTATGTCATG
TAGAGAAACCCATCTTCGTCTTTGTGTTCTTCATAGATTGCAGACATCAATGCAGCAGTT
GGGGGTAACGTGTTCTTGACAAAGACAAAGATTGCTTTCTCGGCTCCGAGCTTAATTCTT
TTGCGCACAACGTACACAAATTGTCCAGCGGTTAGATCAGCTGGCACAAGGTACTTCTTC
TTGTCAATGTCAGGAACATCACTTTGTGCAGCTTTCTCCACAATCACAGGAACTCTGTCT
TGGTACTTCTCTCTGATACGAGTAGATTCAGCCATTCTCACCTCAAGAGGATTAGAAAGC
TTGAAGGAGTTTTTGGCCATGTCGATTCGATCAGTATCTAAAGAAGAAGAAGCGAATCGA
TGATCGAGAGAAACTAGGGTTCGGTGATCAAAGCCT
CC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RS1CO88JQ 644 0 0
CAGAAA
TGTAAACAGAGTCTCAAATTAACTGAAGATATATTTTTCAAATCCATTGAGAAAGGGAGT
TCTCAGAAGATAAAACCACAAAGTAAAAGACATTATTAAGGTCGACCAATCAGAAGAAAA
GAAGCTAGAGGGGGAAAACGAATGTACAATCTTCATCACCAAGAAGATCAAACTATCAAA
TCAGAGCATATTAGCAGGAAGATCCAAACGTGTTCTCACCACTGTATGTCATGTAGAGAA
ACCCATCTTCGTCTTTGTGCTCTTCATAGATTGCAGACATCAATGCAGCAGTTGGGGGTA
ACGTGTTCTTGACAAAGACAAAGATTGCTTTCTCGGCTCCGAGCTTAATTCTTTTGCGCA
CAACGTACACAAATTGTCCAGCGGTTAGATCAGCTGGCACAAGGTACTTCTTCTTGTCAA
TGTCAGGAACATCACTTTGTGCAGCTTTCTCCACAATCACAGGAACTCTGTCTTGGTACT
TCTCTCTGATACGAGTAGATTCAGCCATTCTCACCTCAAGAGGATTAGAAAGCTTGAAGG
AGTTTTTGGCCATGTCGATTCGATCAGTATCTAAAGAAGAAGAAGCGAATCGATGATCGA
GAGAAACTAGGGTTCGGTGATCAAAGCCTGAGAAAAAA

QA 7 644 7 644
DS 

RD RS1G740JQ 635 0 0
GAAA
TGTAAACAGAGTCTCAAATTAACTGAAGATATATTTTTCAAATCCATTGAGAAAGGGAGT
TCTCAGAAGATAAAACCACAAAGTAAAAGACATTATTAAGGTCGACCAATCAGAAGAGAA
GAAGCTAGAGGGGGAAAACGAATGTACAATCTTCATCACCAAGAAGATCAAACTATCAAA
TCAGAGCATATTAGCAGGAAGATCCAAACGTGTTCTCACCACTGTATGTCATGTAGAGAA
ACCCATCTTCGTCTTTGTGTTCTTCATAGATTGCAGAAATCAATGCAGCAGTTGGGGATA
ACGTGTTCTTGACAAAGACAAAGATTGCTTTCTCGGCTCCGAGCTTAATTCTTTTGCGCA
CAACGTACACGAATTGTCCAGCGGTTAGATCAGCTGGCACAAGGTACTTCTTCTTGTCAA
TGTCAGGAACATCACTTTGTGCAGCTTTCTCCACAATCACAGGAACTCTGTCTTGGTACT
TCTCTCTGATACGAGTAGATTCAGCCATTCTCACCTCAAGAGGATTAGAAAGCTTGAAGG
AGTTTTTGGCCATGTCGATTCGATCAGTATCTAAAGAAGAAGAAGCGAATCGATGATCGA
GAGAAACTAGGGTTCGGTGATCAAAGCCT
CC

QA 5 633 5 633
DS 

RD RS1G740TF 519 0 0
GAAGAGAAGAAGCTAGAGGGGGAAAACGAATGTACAATCTTCATCACCAAGAAGATCAAA
CTATCAAATCAGAGCATATTAGCAGGAAGATCCAAACGTGTTCTCACCACTGTATGTCAT
GTAGAGAAACCCATCTTCGTCTTTGTGTTCTTCATAGATTGCAGAAATCAATGCAGCAGT
TGGGGATAACGTGTTCTTGACAAAGACAAAGATTGCTTTCTCGGCTCCGAGCTTAATTCT
TTTGCGCACAACGTACACGAATTGTCCAGCGGTTAGATCAGCTGGCACAAGGTACTTCTT
CTTGTCAATGTCAGGAACATCACTTTGTGCAGCTTTCTCCACAATCACAGGAACTCTGTC
TTGGTACTTCTCTCTGATACGAGTAGATTCAGCCATTCTCACCTCAAGAGGATTAGAAAG
CTTGAAGGAGTTTTTGGCCATGTCGATTCGATCAGTATCTAAAGAAGAAGAAGCGAATCG
ATGATCGAGAGAAACTAGGGTTCGGTGATCAAAGCCT
CC

QA 1 517 1 517
DS 

RD RS1CO88TF 644 0 0
CAGAAA
TGTAAACAGAGTCTCAAATTAACTGAAGATATATTTTTCAAATCCATTGAGAAAGGGAGT
TCTCAGAAGATAAAACCACAAAGTAAAAGACATTATTAAGGTCGACCAATCAGAAGAAAA
GAAGCTAGAGGGGGAAAACGAATGTACAATCTTCATCACCAAGAAGATCAAACTATCAAA
TCAGAGCATATTAGCAGGAAGATCCAAACGTGTTCTCACCACTGTATGTCATGTAGAGAA
ACCCATCTTCGTCTTTGTGCTCTTCATAGATTGCAGACATCAATGCAGCAGTTGGGGGTA
ACGTGTTCTTGACAAAGACAAAGATTGCTTTCTCGGCTCCGAGCTTAATTCTTTTGCGCA
CAACGTACACAAATTGTCCAGCGGTTAGATCAGCTGGCACAAGGTACTTCTTCTTGTCAA
TGTCAGGAACATCACTTTGTGCAGCTTTCTCCACAATCACAGGAACTCTGTCTTGGTACT
TCTCTCTGATACGAGTAGATTCAGCCATTCTCACCTCAAGAGGATTAGAAAGCTTGAAGG
AGTTTTTGGCCATGTCGATTCGATCAGTATCTAAAGAAGAAGAAGCGAATCGATGATCGA
GAGAAACTAGGGTTCGGTGATCAAAGCCT
GAGAAAAAA

QA 7 635 7 635
DS 



AS 2 6

CO CL1377Contig1 770 2 6 U
GGAAGGATTAGGAAGATCTCTCGTCGCTTCTCTCTCCATCTCTCACTCATAGCCATGGCT
GCTTTCACTTGTACCTCTCGTCCTCCCGTCTCCCTCCGTTCGGAGGCAAGAATCGCATCC
TCACCATCCGCTTCACTCTCTGCTCGGCGAATCTTCACCGCGTCACCCGACTCAGCAGGA
TTGAGAATCCGTCTTTCCCAGTCTCCAGCTTCCTTGACCTCGAAGGTTCCTCGACCACGA
AGAAGAGGTGTCGTCTGTGAAGCTCAGGAAACCACTACAGACATAGTTACAATAGTCAAC
GACACCACATGGGACTCTCTAGTTCTCAAGGCGGACGGGCCTGTATTGGTTGACTTTTGG
GCTCCATGGTGTGGACCTTGCAAAATGATTGACCCTCTAGTGAACGAGCTAGCAAGAGAG
TACACCGGGAAGGTCAAGTTCTACAAACTGAACACGGACGACTCCCCGTCAACCCCAAGC
AAGTACAATGTCAGAAGCATCCCAACGATCATGATCTTTGTCAATGGCGAGAAGAAAGAT
GCTATCATTGGTGCAGTGCCTAGATCCACACTCACATCTAGCATTGACAAGTTCTTGCAA
TGAGACTACACTGTGAGTCTGTGAGATCTGTGTCTTGTCCCCCCCCCCCCTCTTGTCTTG
TGTTCTCATTCTCTCTGTAATTTGTAGCTATCTGCTTCTTCCATTGTATCTTTTCTTTAT
CACTGAACATCTAGACATGGATAAATAATATGATGTCATGTTTTTGTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1B618TF U 1
AF RS1B618JQ C 151
BS 1 649 RS1B618TF
BS 650 650 RS1B618JQ
BS 651 745 RS1B618TF
BS 746 746 RS1B618JQ
BS 747 764 RS1B618TF
BS 765 770 RS1B618JQ

RD RS1B618TF 769 0 0
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GCTTTCACTTGTACCTCTCGTCCTCCCGTCTCCCTCCGTTCGGAGGCAAGAATCGCATCC
TCACCATCCGCTTCACTCTCTGCTCGGCGAATCTTCACCGCGTCACCCGACTCAGCAGGA
TTGAGAATCCGTCTTTCCCAGTCTCCAGCTTCCTTGACCTCGAAGGTTCCTCGACCACGA
AGAAGAGGTGTCGTCTGTGAAGCTCAGGAAACCACTACAGACATAGTTACAATAGTCAAC
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GCTCCATGGTGTGGACCTTGCAAAATGATTGACCCTCTAGTGAACGAGCTAGCAAGAGAG
TACACCGGGAAGGTCAAGTTCTACAAACTGAACACGGACGACTCCCCGTCAACCCCAAGC
AAGTACAATGTCAGAAGCATCCCAACGATCATGATCTTTGTCAATGGCGAGAAGAAAGAT
GCTATCATTGGTGCAGTGCCTAGATCCACACTCACATCTAGCATTGACAAGTTCTTGCAA
TGAGACTACACTGTGAGTCTGTGAGATCTGTGTCTTGTCCCCCCCCCCC*TCTTGTCTTG
TGTTCTCATTCTCTCTGTAATTTGTAGCTATCTGCTTCTTCCATTGTATCTTTTCTTTAT
CACTGAACATCTAGACATGGATAAA*AATATGATGTCATGTTTT
TGTTT

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1B618JQ 620 0 0
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TCCTTGACCTCGAAGGTTCCTCGACCACGAAGAAGAGGTGTCGTCTGTGAAGCTCAGGAA
ACCACTACAGACATAGTTACAATAGTCAACGACACCACATGGGACTCTCTAGTTCTCAAG
GCGGACGGGCCTGTATTGGTTGACTTTTGGGCTCCATGGTGTGGACCTTGCAAAATGATT
GACCCTCTAGTGAACGAGCTAGCAAGAGAGTACACCGGGAAGGTCAAGTTTTACAAACTG
AACACGGACGACTCCCCGTCAACCCCAAGCAAGTACAATGTCAGAAGCATCCCAACGATC
ATGATCTTTGTCAATGGCGAGAAGAAAGATGCTATCATTGGTGCAGTGCCTAGATCCACA
CTCACATCTAGCATTGACAAGTTCTTGCAATGAGACTACACTGTGAGTCTGTGAGATCTG
TGTCTTGTCCCCCCCCCCCCTCTTGTCTTGTGTTCTCATTCTCTCTGTAATTTGTAGCTA
TCTGCTTCTTCCATTGTATCTTTTCTTTATCACTGAACATCTAGACATGGATAAATAATA
TGATGTCATGTTTTTGTGTT

QA 1 620 1 620
DS 



CO CL1377Contig2 820 4 5 U
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GGAAAGATCTCTCGTTGCTTCTCTCTCCATCTCACATACCCATGGCTGCTTTCACTTGTA
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CACTCTCCGCTCGGCGAATCTTCACCGTGTCGCCCGACTCAGCAGGATTGAGAATCCGTC
TTTCCCAGTCTCCAGCTTCGTTGACCTCTAAGGTTCCTCGACCACGAAGAAGAGGTGTCG
TCTGTGAAGCTCAGGAAACCACTACAGACATAGTTACAATAGTCAACGACACCACATGGG
ACTCTCTAGTTCTCAAGGCGGACGGGCCTGTATTGGTTGACTTTTGGGCTCCATGGTGTG
GACCTTGCAAAATGATTGACCCACTCGTGAACGAGCTAGCAAGAGAGTACACCGGGAAGG
TCAAGTTCTACAAACTGAACACGGACGACTCTCCTTCAACCCCAAGCAAGTACAATGTTA
GAAGCATCCCAACGATCATGATCTTTGTCAATGGCGAGAAGAAAGATGCTATCATTGGTG
CAGTGCCTAGATCCACACTCACATCTAGCATTGACAAGTTCTTGCAATGAGACTACACTG
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CTAGACATGGATAAATAATATGATGTCATGTTTTTATGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1G917TF U 1
AF RS1BG31TF U 65
AF RS1BG31JQ C 67
AF RS1G917JQ C 304
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RD RS1G917TF 573 0 0
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TCAAGTTCTACAAACTGAACACGGACGACTCTCCTTCAACCCCAAGCAAGTACAATGTTA
GAAGCATCCCAACGATCATGATCTTTGTCAATG

QA 1 573 1 573
DS 

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GG
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TCTACAAACTGAACACGGACGACTCTCCTTCAGCCCCAAGCAAGTACAATGTTAGAAGCA
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CTAGATCCACACTCACATCTAGCATTGACAAGTTCTTGCAATGAGACTACACTGTGAGTC
TGTGAGATCTGTGTCTTGTCTCCCCCCCCCC*TCTCTTGTCTTGTGTTCTCATTCTCTCT
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AA

QA 3 750 3 750
DS 

RD RS1BG31JQ 748 0 0
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AGTCTCCAGCTTCGTTGACCTCTAAGGTTCCTCGACCACGAAGAAGAGGTGTCGTCTGTG
AAGCTCAGGAAACCACTACAGACATAGTTACAATAGTCAACGACACCACATGGGACTCTC
TAGTTCTCAAGGCGGACGGGCCTGTATTGGTTGACTTTTGGGCTCCATGGTGTGGACCTT
GCAAAATGATTGACCCACTCGTGAACGAGCTAGCAAGAGAGTACACCGGGAAGGTCAAGT
TCTACAAACTGAACACGGACGACTCTCCTTCAGCCCCAAGCAAGTACAATGTTAGAAGCA
TCCCAACGATCATGATCTTTGTCAATGGCGAGAAGAAAGATGCTATCATTGGTGCAGTGC
CTAGATCCACACTCACATCTAGCATTGACAAGTTCTTGCAATGAGACTACACTGTGAGTC
TGTGAGATCTGTGTCTTGTCTCCCCCCCCCCCTCTCTTGTCTTGTGTTCTCATTCTCTCT
GTAATTTGTAGCTATTTGCTTCTTCCATTGTATCTTTTCTTCATCACTGAACATCTAGAC
ATGGATAAATAATATGATGTCATGTTTT

QA 1 748 1 748
DS 

RD RS1G917JQ 517 0 0
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CTTGCAAAATGATTGACCCACTCGTGAACGAGCTAGCAAGAGAGTATACCGGGAAGGTCA
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TGCCTAGATCCACACTCACATCTAGCATTGACAAGTTCTTGCAATGAGACTACACTGTGA
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GACATGGATAAATAATATGATGTCATGTTTTTATGTT

QA 1 517 1 517
DS 



AS 2 6

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CTAGGAACAACATCATGTAAGAAACAATTTGAAGCCTAAAGTTACAACTCATCCTCTTAC
TCAAAAAATCAGCAGCTATGAGATCCACTAAAGCCATGTACACAAGTATCCCTGCTGACA
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ATACTCCAAGTGATATACCGATGATAATGGAGTGTGACACGATCCCAAGCTCCAAAACCT
AACAATGTTAAGTAAAATGAAACTAATCTTGAGCTTACATTTGAGACTATACAAGAATCA
AGAATCAAGAATCAAGAATCAAGAATCAAGAATCAAGAATCAAGAATCAAGAAACAAAGA
TTTGTACCTGAGAGACAACGACATGCCTTGCTCCACTTCCGAGCTCCAAACCTCCGTGGG
AGTGTCCATGTCCATGTCCATGACCAATCTTCTGGCGTCCATCACAAGAACCATGACTAT
GTGTGTGGTGAGCAGCATGAGCATGAATGCCAACAATGTGAATCCCGCCACTATCTTCTT
CTCCAAACACTTTATCATCATCGCTCCCTCCTTCCGCAACCACCACGGGAACAACAATAC
TCCCTGGAGACGACTGT


BQ
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BQ
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GCGGAAGGAGGGAGCGATGATGATAAAGTGTTTGG*AGAAGAAGATAGTGGCGGGATTCA
CATTGTTGGCATTCATGCTCATGCTGCTCACCACACACATAGTCATGGTTCTTGTGATGG
ACGCCAGAAGATTGGTCATGGACATGGACATGGACACTCC

QA 1 880 1 880
DS 

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TCTTCATCGATGTTCTTTGGAGTTTGTTTCCTCTTTACTTTTTCAGATCAGAAAGAGATT
CTCTCTCAGAAACAGAGTCCATCTTGCAGGTAGTTCCTGTGACAATGGCTGCTTCTTCAT
CCACCATTCTTTGCAATGCCGCCGAGTCCGACCTTTGTCGTGACGATTCGGCTGCGTTTC
TCCTCAAGTTAGTAGCCATTGCTTCCATTCTCTTAGCTGGTGCTGCTGGTGTAGCTATAC
CACTCATTGGGAGAAACCGTCGGTTCCTTCAAACAGACAGTAATCTCTTTGTAACTGCTA
AAGTCTTTGCAGCCGGTGTGATCCTCGCCACGGGGTTTTTTTTCACATGTTAGCCGGTGG
CACTGAAGCCTTGAACAACCCGTGCTTACCGGAGTACCCTTGGTCTAAGTTTCCTTTCCC
GGGGTTCTTCGCCATGGTTGCTGCTTTGATCACTCTGCTTGTTGATTTCATGGGGACTCA
GTACTATGAGAGGAAGCAAGAGAGGGAAGCTGCTGACCTGTCTGATGGACAGCTTGGTCC
TGAACAGTCGTCTCCAGGGAGTATTGTTGTTCCCGTGGTGGTTGCGGAAGGAGGGAGCGA
TGATGATAAAGTGTTTGGGAGAAGAAGATAGTGGCGGGATTCACATTGTTGGCATTCATG
CTCATGCTGCTCACCACACACATAGTCATGGTTCTTGTGATGGAC
GCC

QA 1 765 1 765
DS 

RD RS1D009TF 649 0 0
G
ATGGTTGCTGCTTTTATCACTCTGCTTGTTGATTTCATGGGGACTCAGTACTATGAGAGG
AAGCAAGAGAGGGAAGCTGCTGACCTGTCTGATGGACAGCTTGGTCCTGAACAGTCGTCT
CCAGGGAGTATTGTTGTTCCCGTGGTGGTTGCGGAAGGAGGGAGCGATGATGATAAAGTG
TTTGG*AGAAGAAGATAGTGGCGGGATTCACATTGTTGGCATTCATGCTCATGCTGCTCA
CCACACACATAGTCATGGTTCTTGTGATGGACACCAGAAGATTGGTCATGGACATGGACA
TGGACACTCCCACGGAGGTTTGGAGCTCGGAAGTGGAGCAAGGCATGTCGTTGTCTCTCA
GGTTTTGGAGCTTGGGATCGTGTCACACTCCATTATCATCGGTATATCACTTGGAGTATC
TCAATCTCCATGCACAATCCGGCCTCTAATAGCAGCACTATCATTCCACCAATTCTTTGA
AGGGTTTGCACTCGGTGGATGCACCTCTCAAGCGCAGTTCAGGAACAAGTCAGCGACCAT
AATGGCTTGCTTTTTCGCCCTCACAACACCGATAGGGATCGGTATCGGAACCGCAGTGGC
GTCGTCTTTTAACTCTCACAGCGTTGGAGCGTTGGTGGCGGAAG
TATC

QA 2 645 2 645
DS 

RD RS1D009JQ 750 0 0
CGGAAGGAGGGAGCGATGATGATAAAGTGTTTGG*AGAAGAAGATAGTGGCGGGATTCAC
ATTGTTGGCATTCATGCTCATGCTGCTCACCACACACATAGTCATGGTTCTTGTGATGGA
CACCAGAAGATTGGTCATGGACATGGACATGGACACTCCCACGGAGGTTTGGAGCTCGGA
AGTGGAGCAAGGCATGTCGTTGTCTCTCAGGTTTTGGAGCTTGGGATCGTGTCACACTCC
ATTATCATCGGTATATCACTTGGAGTATCTCAATCTCCATGCACAATCCGGCCTCTAATA
GCAGCACTATCATTCCACCAATTCTTTGAAGGGTTTGCACTCGGTGGATGCACCTCTCAA
GCGCAGTTCAGGAACAAGTCAGCGACCATAATGGCTTGCTTTTTCGCCCTCACAACACCG
ATAGGGATCGGTATCGGAACCGCAGTGGCGTCGTCTTTTAACTCTCACAGCGTTGGAGCG
TTGGTGGCGGAAGGTATCTTGGATTCTCTGTCAGCAGGGATACTTGTGTACATGGCTTTA
GTGGATCTCATAGCTGCTGATTTTTTGAGTAAGAGGATGAGTTGTAACTTTAGGCTTCAA
ATTGTTTCTTACATGATGTTGTTCCTAGGAGCTGGACTCATGTCTTCTCTTGCTATTTGG
GCTTAGATTGTGAGATTCTTTCTTCTGTTATAGCTGCTAGCTACAAATAATATGTATAGT
TCTAGAATAATCATATCTCGAATGTATTTT

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 5

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TTTTTTTCCTCTCCTCTCTAACCTCTCCTCTCAGCTTGTGCTGGATCTCTCCAGCAGAGA
CGAACCAATCCTTCTTCGGAGAGATTCGCACGGGACTGATTGATCGATCAAGGCTTCTCG
GGCTATCAGAAATGGACCACGACAAGACAGGATGCCAAAGCCCACCTGAAGGTCCCAAGC
TTTGCATCAACAACTGCGGTTTCTTCGGAAGCGCTGCCACAATGAACATGTGTTCCAAGT
GTCACAAGACTATCCTGTTTCAACAGGAACAGGGGG*CTAAGTTTGCATCTGCAGTGTCT
GGTTCTTCATCATCATCATCCAGCAACATCTTGAAGGAAACCTTTGCTGCTGCGCTGGTT
GATGCTGAAACCAAATCCGTTGAGCCGGTGGTTGTATCTGTGCAGCCATCCTCGGTTCAA
GTTGCCGCAGAGGTAGCAGCTCCAGAAGCAGCAGCTGCAGCGAAACCAAAGGAAGGACCA
AGCCGATGTACTACATGCAATAAACGGGTTGGTCTGACTGGATTCAAATGTCGCTGTGGT
GACCTCTTCTGCGGGACGCACCGCTATGCAGACATACATAACTGCTCCTTCAATTACCAT
GCCGCTGCGCAAGAAGCTATCGCTAAAGCAAACCCGGTTGTGAAGGCAGAGAAGCTTGAC
AAAATCTGAAACTCAAACACCAAAGTTTCCTTCGTCCTGTCTGCGTCTGGTTCAAGGTGT
GTCGCATGTTAAAAAGGCTTTTTATATATATATATATATATGGTCGAAGAACCAAAGCGT
GTGTTTATCTTTAGTTTCTCTCTGCAATATTTGTGGTGTGGAACATTCTATTATCTGTGG
TTTGAAGCAGAGAAGTGTGCTCTTAAAGAATATGCTTTGATGTGTTTCTCTTTCTTATGA
TTTATGAGCACTATGTTTGTTTATGTTTCATCATTTGGGTCTGTATCATATTGAGATTGT
ATCTTTAGCTATTTGTTTTATTTAAAAGCTTATGATTGTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B002TF U 7
AF RS1CY24TF U 1
AF RS1DE58TF U 1
AF RS1CY24JQ C 397
AF RS1DE58JQ C 338
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BS 642 1004 RS1DE58JQ

RD RS1B002TF 295 0 0
GG
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TCCTTCTTCGGAGAGATTCGTACGGGACTGATTGATCGATCAAGGCTTCTCGGGCTACCA
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AACAACTGCGGTTTCTTCGGAAGCGCTGCCACAATGAACATGTGTTCCAAGTGTCACAAG
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CG

QA 3 293 3 293
DS 

RD RS1CY24TF 551 0 0
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GGCTATCAGAAATGGACCACGACAAGACAGGATGCCAAAGCCCACCTGAAGGTCCCAAGC
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GGTTCTTCATCATCATCATCCAGCAACATCTTGAAGGAAACCTTTGCTGCTGCGCTGGTT
GATGCTGAAACCAAATCCGTTGAGCCGGTGGTTGTATCTGTGCAGCCATCCTCGGTTCAA
GTTGCCGCAGAGGTAGCAGCTCCAGAAGCAGCAGCTGCAGCGAAACCAAAGGAAGGACCA
AGCCGATGTACTACATGCAATAAACGGGTTGGTCTGACTGGATTCAAATGTCGCTGTGGT
GACCTCTT
CTG

QA 1 548 1 548
DS 

RD RS1DE58TF 641 0 0
TTTTTTTC
CTCTCCTCTCTAACCTCTCCTCTCAGCTTGTGCTGGATCTCTCCAGCAGAGACGAACCAA
TCCTTCTTCGGAGAGATTCGCACGGGACTGATTGATCGATCAAGGCTTCTCGGGCTATCA
GAAATGGACCACGACAAGACAGGATGCCAAAGCCCACCTGAAGGTCCCAAGCTTTGCATC
AACAACTGCGGTTTCTTCGGAAGCGCTGCCACAATGAACATGTGTTCCAAGTGTCACAAG
ACTATCCTGTTTCAGCAGGAACAGGGGG*CTAAGTCTGCATCTGCAGTGTCTGGTTCTTC
ATCATCATCATCCAGCAACATCTTGAAGGAAACCTTTGCTGCTGCGCTGGTTGATGCTGA
AACCAAATCCGTTGAGCCGGTGGTTGTATCTGTGCAGCCATCCTCGGTTCAAGTTGCCGC
AGAGGTAGCAGCTCCAGAAGCAGCAGCTGCAGCGAAACCAAAGGAAGGACCAAGCCGATG
TACTACATGCAATAAACGGGTTGGTCTGACTGGATTCAAATGTCGCTGTGGTGACCTCTT
CTGCGGGACGCACCGCTATGCAGACATACATAACTGCTCCTTCAATTACCATGCCGCTGC
GCAAGAAGCTATCGCTAAAGCAAACCCGGTTGT

QA 9 641 9 641
DS 

RD RS1CY24JQ 435 0 0
TCTGTGCAGCCATCCTCGGTTCAAGTTGCCGCAGAGGTAGCAGCTCCAGAAGCAGCAGCT
GCAGCGAAACCAAAGGAAGGACCAAGCCGATGTACTACATGCAATAAACGGGTTGGTCTG
ACTGGATTCAAATGTCGCTGTGGTGACCTTTTTTGCGGGACGCACCGCTATGCAGACATA
CATAACTGCTCCTTCAATTACCATGCCGCTGCGCAAGAAGCTATCGCTAAAGCAAACCCG
GTTGTGAAGGCAGAGAAGCTTGACAAAATTTGAAACTCAAACACCAAAGTTTCCTTCGTC
CTGTTTGCGTTTGGTTCAAGGTGTGTCGCATGTTAAAAAGGCTTTTTATATATATATATA
TAT**GGTCGAAGAACCAAAGCGTGTGTTTATCTTTAGTTTCTTTTTGCAATATTTGTGG
TGTGGAACATT
TTAT

QA 1 431 1 431
DS 

RD RS1DE58JQ 667 0 0
AAACCTTTGCTGCTGCGCTGGTTGATGCTGAAACCAAATCCGTTGAGCCGGTGGTTGTAT
CTGTGCAGCCATCCTCGGTTCAAGTTGCCGCAGAGGTAGCAGCTCCAGAAGCAGCAGCTG
CAGCGAAACCAAAGGAAGGACCAAGCCGATGTACTACATGCAATAAACGGGTTGGTCTGA
CTGGATTCAAATGTCGCTGTGGTGACCTCTTCTGCGGGACGCACCGCTATGCAGACATAC
ATAACTGCTCCTTCAATTACCATGCCGCTGCGCAAGAAGCTATCGCTAAAGCAAACCCGG
TTGTGAAGGCAGAGAAGCTTGACAAAATCTGAAACTCAAACACCAAAGTTTCCTTCGTCC
TGTCTGCGTCTGGTTCAAGGTGTGTCGCATGTTAAAAAGGCTTTTTATATATATATATAT
ATATGGTCGAAGAACCAAAGCGTGTGTTTATCTTTAGTTTCTCTCTGCAATATTTGTGGT
GTGGAACATTCTATTATCTGTGGTTTGAAGCAGAGAAGTGTGCTCTTAAAGAATATGCTT
TGATGTGTTTCTCTTTCTTATGATTTATGAGCACTATGTTTGTTTATGTTTCATCATTTG
GGTCTGTATCATATTGAGATTGTATCTTTAGCTATTTGTTTTATTTAAAAGCTTATGATT
GTTCTCC

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 6

CO CL1380Contig1 941 6 8 U
GGACAGTATATTCCTATGTGGCCAGGAGAGGGACACGGTAGTACCACTTCTGTTGTTCGC
CTTTCATTACAAAATATAAACTTCGCCGTCCTCTCACATTCGCCGCGACCCGAAAGAACA
AAAAATGGCCAGCCGAAAAAGTCTGATTAACGTCCGCCGGATCATCCGCTCCACCGCGGT
GGTTAGCCGGAGATCCGTCACTCCTGCCACCGCAACACGAGCCCATCCCATTTTCCGAAA
TCGAGTTGATTTGGGGGCGAGGTTCTTCTCCGGGAACACGACGAGTCCACAAAACTTTGA
GATTGATCTCTCTAACGAAGAGAAGAAGAGGATAACGATCAACAGATTGTTGTATAGGAG
CAAGCAACGTGGTTTTCTGGAACTTGATCTGGTTTTGGGTAACTGGGTTGAGGAGAATGT
TGATTCCATGGACGAAACCACTGTCAAATCCTTAATTCATGTCCTCGATTTGGAGAACCC
TGATCTGTGGAAATGGCTAACTGCTCAGGAACAGCCTCCGGAGATAGTGAGCTCAAATCC
GGTATTCTTGGCGTTGCACAAGAAAGTCATGACGAATCTGAACAAGCATGCAGCACCAGA
GACGCGTGCAGCAGCTGGACAGCCCTGGGTCAAAGGTTGGGATGATTTCAAAAGAGGCCG
TGACGCTCCCATCTCAGGGAACCAGTGAAAGAAAAAACTCATTCTCTTCACTTACAAAAG
TCACAAACTGCAAAAACACGGTTATATAAATGTATCTTATAAAAATATAATAATGTGTGG
CAGGCCGTGAAGAAGGCCGGAGCTATAAATGTGTCTCGGTAGTGACACGATGAGACAGAT
AAATACAGTCTTGTTTGTGGAAGTTCTTGATATGTTAGTTATGTGTTTGTTGAAATTGAT
GTGTTTTTATTTCAGGCAATAAGTCCTTTTGCCTCTGGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 
35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GH31TF U 105
AF RS1C060TF U 1
AF RS1CQ37TF U 103
AF RS1H301TF U 103
AF RS1H301JQB C 238
AF RS1CQ37JQ C 244
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BS 651 765 RS1CQ37TF
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RD RS1GH31TF 474 0 0
GG
GACCCGAAGGAACAAAAAATGGCCAGCCGAAAAAGTCTGATTAACGTCCGCCGGATCATC
CGCTCCACCGCGGTGGTTAGCCGGAGATCCGTCACTCCTGCCACCGCAACACGAGCCCAT
CCCATTTTCCGAAATCGAGTTGATTTGGGGGCGAGGTTCTTCTCCGGGAACACGACGAGT
CCACAAAACTTTGAGATTGATCTCTCTAACGAAGAGAAGAAGAGGATAACGATCAACAGA
TTGTTGTATAGGAGCAAGCAACGTGGTTTTCTGGAACTTGATCTGGTTTTGGGTAACTGG
GTTGAGGAGAATGTTGATTCCATGGACGAAACCACTGTCAAATCCTTAATTCATGTCCTC
GATTTGGAGAACCCTGATCTGTGGAAATGGCTAACTGCTCAGGAACAGCCTCCGGAGATA
GTGAGCTCAAATCCGGTATTCTTGGCGTTGCACAAGAAAGTCATGACGAATC

QA 3 474 3 474
DS 

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CTTTCATTACAAAATATAAACTTCGCCGTCCTCTCACATTCGCCGCGACCCGAAAGAACA
AAAAATGGCCAGCCGAAAAAGTCTGATTAACGTCCGCCGGATCATCCGCTCCACCGCGGT
GGTTAGCCGGAGATCCGTCACTCCTGCCACCGCAACACGAGCCCATCCCATTTTCCGAAA
TCGAGTTGATTTGGGGGCGAGGTTCTTCTCCGGGAACACGACGAGTCCACAAAACTTTGA
GATTGATCTCTCTAACGAAGAGAAGAAGAGGATAACGATCAACAGATTGTTGTATAGGAG
CAAGCAACGTGGTTTTCTGGAACTTGATCTGGTTTTGGGTAACTGGGTTGAGGAGAATGT
TGATTCCATGGACGAAACCACTGTCAAATCCTTAATTCATGTCCTCGATTTGGAGAACCC
TGATCTGTGGAAATGGCTAACTGCTCAGGAACAGCCTCCGGAGATAGTGAGCTCAAATCC
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GACGCGTGCAGCAGCTGGACAGCCCTGGGTCAAAG*TTGGGATGATTTCA

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DS 

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GGGC
GACCCGAAAGAACAAAAAATGGCCAGCCGAAAAAGTCTGATTAACGTCCGCCGGATCATC
CGCTCCACCGCGGTGGTTAGCCGGAGATCCGTCACTCCTGCCACCGCAACACGAGCCCAT
CCCATTTTCCGAAATCGAGTTGATTTGGGGGCGAGGTTCTTCTCCGGGAACACGACGAGT
CCACAAAACTTTGAGATTGATCTCTCTAACGAAGAGAAGAAGAGGATAACGATCAACAGA
TTGTTGTATAGGAGCAAGCAACGTGGTTTTCTGGAACTTGATCTGGTTTTGGGTAACTGG
GTTGAGGAGAATGTTGATTCCATGGACGAAACCACTGTCAAATCCTTAATTCATGTCCTC
GATTTGGAGAACCCTGATCTGTGGAAATGGCTAACTGCTCAGGAACAGCCTCCGGAGATA
GTGAGCTCAAATCCGGTATTCTTGGCGCTGCACAAGAAGGTCATGACGAATCTGAACAAG
CATGCAGCACCAGAGACGCGTGCAGCAGCTGGACAGCCCTGGGTCAAAGGTTGGGATGAT
TTCAAAAGAGGCCGTGACGCTCCCATCTCAGGGAACCAGTGAAAGAAAAAACTCATTCTC
TTCACTTACAAAAGTCACAAACTGCAAAAACACGGTTATATAAATGTATCTTATAAAAA

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DS 

RD RS1H301TF 663 0 0
GGGC
GACCCGAAAGAACAAAAAATGGCCAGCCGAAAAAGTCTGATTAACGTCCGCCGGATCATC
CGCTCCACCGCGGTGGTTAGCCGGAGATCCGTCACTCCTGCCACCTTAACACGAGCCCAT
CCCATTTTCCGAAATCGAGTTGATTTGGGGGCGAGGTTCTTCTCCGGGAACACGACGAGT
CCACAAAACTTTGAGATTGATCTCTCTAACGAAGAGAAGAAGAGGATAACGATCAACAGA
TTGTTGTATAGGAGCAAGCAACGTGGTTTTCTGGAACTTGATCTGGTTTTGGGTAACTGG
GTTGAGGAGAATGTTGATTCCATGGACGAAACCACTGTCGAATCCTTAATTCATGTCCTC
GATTTGGAGAACCCTGATCTGTGGAAATGGCTAACTGCTCAGGAACAGCCTCCGGAGATA
GTGAGCTCAAATCCGGTATTCTTGGCGTTGCACAAGAAAGTCATGACGAATCTGAACAAG
CATGCAGCACCAGAGACGCGTGCAGCAGCTGGACAGCCCTGGGTCAAAGGTTGGGATGAT
TTCAAAAGAGGCCGTGACGCTCCCATCTCAGGGAACCAGTGAAAGAAAAAACTCATTCTC
TTCACTTACAAAAGTCACAAACTGCAAAAACACGGTTATATAAATGTATCTTATAAAAA

QA 5 663 5 663
DS 

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AAATCGAGTTGATTTGGGGGCGAGGTTCTTCTCCGGGAACACGACGAGTCCACAAAACTT
TGAGATTGATCTCTCTAACGAAGAGAAGAAGAGGATAACGATCAACAGATTGTTGTATAG
GAGCAAGCAACGTGGTTTTCTGGAACTTGATCTGGTTTTGGGTAACTGGGTTGAGGAGAA
TGTTGATTCCATGGACGAAACCACTGTCGAATCCTTAATTCATGTCCTCGATTTGGAGAA
CCCTGATCTGTGGAAATGGCTAACTGCTCAGGAACAGCCTCCGGAGATAGTGAGCTCAAA
TCCGGTATTCTTGGCGTTGCACAAGAAAGTCATGACGAATCTGAACAAGCATGCAGCACC
AGAGACGCGTGCAGCAGCTGGACAGCCCTGGGTCAAAGGTTGGGATGATTTCAAAAGAGG
CCGTGACGCTCCCATCTCAGGGAACCAGTGAAAGAAAAAACTCATTCTCTTCACTTACAA
AAGTCACAAACTGCAAAAACACGGTTATATAAATGTATCTTATAAAAATATAATAATGTG
TGGCAGGCCGTGAAGAAGGCCGGAGCTATAAATGTGTCTCGGTAGTGACACGATGAGATA
GATAAATACAGTCTTGTTTGTGGAAGTTCTTGATATGTTAGTTATGTGTTTG
C

QA 1 652 1 652
DS 

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TGATCTCTCTAACGAAGAGAAGAAGAGGATAACGATCAACAGATTGTTGTATAGGAGCAA
GCAACGTGGTTTTCTGGAACTTGATCTGGTTTTGGGTAACTGGGTTGAGGAGAATGTTGA
TTCCATGGACGAAACCACTGTCAAATCCTTAATTCATGTCCTCGATTTGGAGAACCCTGA
TCTGTGGAAATGGCTAACTGCTCAGGAACAGCCTCCGGAGATAGTGAGCTCAAATCCGGT
ATTCTTGGCGCTGCACAAGAAGGTCATGACGAATCTGAACAAGCATGCAGCACCAGAGAC
GCGTGCAGCAGCTGGACAGCCCTGGGTCAAAGGTTGGGATGATTTCAAAAGAGGCCGTGA
CGCTCCCATCTCAGGGAACCAGTGAAAGAAAAAACTCATTCTCTTCACTTACAAAAGTCA
CAAACTGCAAAAACACGGTTATATAAATGTATCTTATAAAAATATAATAATGTGTGGCAG
GCCGTGAAGAAGGCCTGAGCTATAAATGTGTCTCGGTAGTGACACGATGAGACAGATAAA
TACAGTCTTGTTTGTGGAAGTTCTTGATATGTTGGTTATGTGTTTGTTGAAATTGATGTG
TTTTTATTTCAGGCAATAAGTCCTTTTGCCTCTGGCTC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 3

CO CL1381Contig1 1347 3 9 U
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TAAACAAAATTAAACAGTTTGATTATTTTCAACACAACATAACATAAACACTCCAAACAA
ATGTTAAACCTCTTGTCCTGACCAGATTTTTCAAAGTAGTAGTAACATTAGAGTACTAAA
GCTGTAAAAATCATTTATGATCTTGCAATCCAAAAACTCACGCAGATTCCACAACGATTT
CCTCTTCTTTAGTCTTTTTTTTTTTTGCCCCCAACTGATTCTTTACTCTCTCTTGAAACA
TCATCAGACTCACCGTGTGATAGACTTCAAACAAAAGCCTACTGGATGGGATGGTATTGA
GCTGATACTCTCTTTGGAGGTAGCTTACGCAAAATGAAAAGGACTAGTGCCGATGGAAGT
ACTTCAACCACCATATAGTAAATTAAGTTCAAAACGGGATGATCAAGAACATCCAGCGTT
AAATCCCTGTCAAAAGCTGATACACCCACCACAATGCATCTAATGAGGAAGCAGGTGAAG
CATATGGCTGTCACGGATCCAACCTCATGGAGCTTCTCCCTTCTTCCTTTTGACTCAATA
GGGAACCTTCTTAGCATAATAAACAATCTTCCTCCGTAGAGCAAGAAGCCTAACGCCGCG
ATGAAAGACACAACTGACATAAATATCTTTCCAACTAACTCCACAGTGCTGTTATCATTG
ACCCAGATGCATACCCATATAACAACCTGAGCCAAATATACAGCCACATTGACTGAGATA
TACGTTATCCGAAGCTTATCCGTTGGTAAGCTTCTTGCCTGGTGATATATCTCTGCCCAG
AACAGCACGAGCAGTGTGTAAGCCGAGAAGAAGAGGAGCCCCGGAAGATCCAATAGTATC
CAGCAAAGAGCCTTGGGATGGACGAGAAACACTTGATGGTGAAATCCAAATAGAACAGCG
CGAACTCCATTGACGACAAAGTTCATTAGATGAAAGACCTTCTGAGTGGTCCAGCCATAC
TCAGGCACTCTCATTTGGATCCTTACCAACTGGACAAGAGCGATGGCGGAGACAAGAGCA
TAAGCACCAGAGAGAGCGAAGAAGATCCCGTCTTGCCACTGAGTTGACTCGTTAACCTCC
TCCCACCAATTCGTCATCTCCGTCGCCAAGATTTGTGCCATCATCACCAGGCTCGAATCC
GTCATCCTCCTCCTCGTTTATCTGTTATATTCGGTGAGGTACGGTTTGAATCAAATCGAG
AAATCCTAATGAGTTCTTTCGAATCCAGACAGACTCCAGAGAGAGGCGAACGAAGGGAAA
TGGATGAGTTGTTTGAATATCTGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EQ17JQ U 1
AF RS1AG86JQ U 24
AF RS1FB18TF C 654
BS 1 113 RS1EQ17JQ
BS 114 114 RS1AG86JQ
BS 115 532 RS1EQ17JQ
BS 533 533 RS1AG86JQ
BS 534 577 RS1EQ17JQ
BS 578 578 RS1AG86JQ
BS 579 635 RS1EQ17JQ
BS 636 850 RS1AG86JQ
BS 851 1347 RS1FB18TF

RD RS1EQ17JQ 635 0 0
AGCAAAATGTAAAAGATCTGTTTTTATTCAAACCTTATTAGAATGACAGGATTTTAACAA
TAAACAAAATTAAACAGTTTGATTATTTTCAACACAACATAACATAAACACTCGAAACAA
ATGTTAAACCTCTTGTCCTGACCAGATTTTTCAAAGTAGTAGTAACATTAGAGTACTAAA
GCTGTAAAAATCATTTATGATCTTGCAATCCAAAAACTCACGCAGATTCCACAACGATTT
CCTCTTCTTTAGTCTTTTTTTTTTTTGCCCCCAACTGATTCTTTACTCTCTCTTGAAACA
TCATCAGACTCACCGTGTGATAGACTTCAAACAAAAGCCTACTGGATGGGATGGTATTGA
GCTGATACTCTCTTTGGAGGTAGCTTACGCAAAATGAAAAGGACTAGTGCCGATGGAAGT
ACTTCAACCACCATATAGTAAATTAAGTTCAAAACGGGATGATCAAGAACATCCAGCGTT
AAATCCCTGTCAAAAGCTGATACACCCACCACAATGCATCTAATGAGGAAGCGGGTGAAG
CATATGGCTGTCACGGATCCAACCTCATGGAGCTTCTTCCTTCTTCCTTTTGACTCAATA
GGGAACCTTCTTAGCATAATAAACAATCTTCCTCC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1AG86JQ 827 0 0
TTATTCAAACCTTATTAGAATGGCAGGATTTTAACAATAAACAAAATTAAACAGTTTGTT
TATTTTCAACCCAACATAACATGAACACTCCAAACAAATGTTAAACCTCTTGTCCTGACC
AGATTTTTCAAAGTAGTAGTAACATTAGAGTACTAAAGCTGTAAAAATCATTTATGATCT
TGCAATCCAAAAACTCACGCAGATTCCACAACGATTTCTTCTTCTTTAGTCTTTTTTTTT
TT*GCCCCCAACTGATTCTTTACTCTCTCTTGAAACATCATCAGACTCACCGTGTGATAG
ACTTCAGACAAAAGCCTACTGGATGGGATGGTATTGAGCTGATACTCTCTTTGGAGGTAG
CTTACGCAGAATGAAGAGGACTAGTGCCGATGGAAGTACTTCAACCACCATATAGTAAAT
TAAGTTCAGAACGGGATGATCAAGAACATCCAGCGTTAAATCCCTGTCAAATGCTGATAC
ACCCACCACAATGCATCTAATGAGGAAGCAGGTGAAGCATATGGCTGTCACGGATCCAAC
CTCATGGGGCTTCTCCCTTCTTCCTTTTGACTCAATAGGGAACCTTCTTAGCATAATAAA
CAATCTTCCTCCGTAGAGCAAGAAGCCTAACGCCGCGATGAAAGACACAACTGACATAAA
TATCTTTCCAACTAACTCCACAGTGCTGTTATCATTGACCCAGATGCATACCCATATAAC
AACCTGAGCCAAATATACAGCCACATTGACTGAGATATACGTTATCCGAAGCTTATCCGT
TGGTAAGCTTCTTGCCTGGTGATATATCTCTGCCCAGAACAGCACGA

QA 1 827 1 827
DS 

RD RS1FB18TF 694 0 0
CGCCGCGATGAAAGACACAACTGACATAAATATCTTTCCAACTAACTCCACAGTGCTGTT
ATCATTGACCCAGATGCATACCCATATAACAACCTGAGCCAAATATACAGCCACATTGAC
TGAGATATACGTTATCCGAAGCTTATCCGTTGGTAAGCTTCTTGCCTGGTGATATATCTC
TGCCCAGAACAGCACGAGCAGTGTGTAAGCCGAGAAGAAGAGGAGCCCCGGAAGATCCAA
TAGTATCCAGCAAAGAGCCTTGGGATGGACGAGAAACACTTGATGGTGAAATCCAAATAG
AACAGCGCGAACTCCATTGACGACAAAGTTCATTAGATGAAAGACCTTCTGAGTGGTCCA
GCCATACTCAGGCACTCTCATTTGGATCCTTACCAACTGGACAAGAGCGATGGCGGAGAC
AAGAGCATAAGCACCAGAGAGAGCGAAGAAGATCCCGTCTTGCCACTGAGTTGACTCGTT
AACCTCCTCCCACCAATTCGTCATCTCCGTCGCCAAGATTTGTGCCATCATCACCAGGCT
CGAATCCGTCATCCTCCTCCTCGTTTATCTGTTATATTCGGTGAGGTACGGTTTGAATCA
AATCGAGAAATCCTAATGAGTTCTTTCGAATCCAGACAGACTCCAGAGAGAGGCGAACGA
AGGGAAATGGATGAGTTGTTTGAATATCTGTCCC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 6

CO CL1382Contig1 598 6 12 U
GGATATACATATATATTAGGTTAAAACAAGCCAGCCTCCTCAGCGTGTGAGCGAAGAAGA
AGCGGAGAAAAAAA*TGGTTCAGCGTCTTGTATACCGTTCGCGTCACAGCTACGCCACCA
AATCTAACCAGCACAGGATCCTCAAAACCCCAGGTGGTAAATTGACATTCCAGACCACTA
AGAAGCGTGCAAGTGGACCCAAATGTCCTGTCACCGGCAAGCGTATTCAGGGTATCCCTC
ACTTGAGGCCTGCTGAGTACAAGAGGTCTAGATTGTCTAGAAACAGGAGGACCGTGAACC
GTGCTTATGGTGGTGTTTTATCTGCTTTGGCTGTTAGAGAAAGAATCGTTCGTGCTTTCC
TTGTGGAGGAGCAGAAGATTGTGAAGAAGGTTTTGAAGCTCCAAAAGGCCAAGGAAAAGG
TTGCTCCCAGGAGCTAGATTATCATATAAGCTTCTTTTGGAAAAAAA*TGTTTAATGGAT
CTGTTCTAGCAATAGTACTCTGGTTGCAGAAGTTTGAGAGAAATACTTTTTTTTTCGTTA
TCCATTGAGTTTTGATTCTGTCGACATTTCTCAAATATTGCGTTTTGTTTTCTCGTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 10 10 10 

AF RS1C746JQ C 1
AF RS1FE59JQ C 51
AF RS1FE59TF U 379
AF RS1H096TF U 33
AF RS1H096JQB C 33
AF RS1C746TF U 1
BS 1 35 RS1C746TF
BS 36 59 RS1H096TF
BS 60 60 RS1C746TF
BS 61 378 RS1H096TF
BS 379 404 RS1FE59TF
BS 405 405 RS1H096TF
BS 406 460 RS1FE59TF
BS 461 461 RS1H096TF
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BS 536 536 RS1H096TF
BS 537 594 RS1FE59TF
BS 595 598 RS1C746JQ

RD RS1C746JQ 598 0 0
GGATATACATATATATTAGGTTAAAACAAGCCAGCCTCCTCAGCGTGTGAGCGAAGAAGA
AGCGGAGAAAAAAA*TGGTTCAGCGTCTTGTATACCGTTCGCGTCACAGCTACGCCACCA
AATCTAACCAGCACAGGATCCTCAAAACCCCAGGTGGTAAATTGACATTCCAGACAACTA
AGAAGCGTGCAAGTGGACCCAAATGTCCTGTCACCGGCAAGCGTATTCAGGGTATCCCTC
ACTTGAGGCCTGCTGAGTACAAGAGGTCTAGATTGTCTAGAAACAGGAGGACCGTGAACC
GTGCTTATGGTGGTGTTTTATCTGCTTTGGCTGTTAGAGAAAGAATCGTTCGTGCTTTCC
TTGTGGAGGAGCAGAAGATTGTGAAGAAGGTTTTGAAGCTCCAAAAGGCCAAGGAAAAGG
TTGCTCCCAGGAGCTAGATTATCATATAAGCTTCTTTTGGAAAAAAA*TGTTTAATGGAT
CTGTTCTAGCAATAGTACTCTGGTTGCAGAAGTTTGAGAGAAATACTTTTTTTTTTGTTA
TCCATTGAGTTTTGATTCTGTCGACATTTCTCAAATATTGCGTTTTGTTTTCTCGTCC

QA 1 598 1 598
DS 

RD RS1FE59JQ 544 0 0
GG
GAAGAAGAAGCGGAGAAAAAAAATGGTTCAGCGTCTTGTATACCGCTCGCGTCACAGCTA
CGCTACCAAATCTAACCAGCACAGGATCCTCAAAACCCCAGGTGGTAAATTGACATTCCA
GACCACTAAGAAGCGTGCAAGTGGACCCAAATGTCCTGTCACTGGCAAGCGTATTCAGGG
TACCCCTCACTTGAGGCCTGCTGAGTACAAGAGGTTTAGATTGTCTAGAAACAGGAGGAC
CGTGAACCGTGCTTATGGTGGTGTTTTATCTGCTTTGGCTGTTAGAGAAAGAATCGTTCG
TGCTTTCCTTGTGGAGGAGCAGAAGATTGTGAAGAAGGTTTTGAAGCTCCAAGAGGCCAA
GGAAAAGGTTGCTCCCAGGAGCTAGATTATCATATAAGCTTCTTTTGGGAAAAAA*TGTT
TAATGGATCTGTTCTAGCAATAGTACTCTGGTTGCAGAAGTTTGAGAGAAATACTTTTTT
TTT*GTTATCCATTGAGTTTTGATTCTGTCGACATTTCTCAAATATTGCGTTTTGTTTTC
TC

QA 3 544 3 544
DS 

RD RS1FE59TF 216 0 0
TTGTGAAGAAGGTTTTGAAGCTCCAAGAGGCCAAGGAAAAGGTTGCTCCCAGGAGCTAGA
TTATCATATAAGCTTCTTTTGGGAAAAAA*TGTTTAATGGATCTGTTCTAGCAATAGTAC
TCTGGTTGCAGAAGTTTGAGAGAAATACTTTTTTTTT*GTTATCCATTGAGTTTTGATTC
TGTCGACATTTCTCAAATATTGCGTTTTGTTTTCTC

QA 1 216 1 216
DS 

RD RS1H096TF 566 0 0
GGG
CTCCTCAGCGTGTGAGCGAAGAAGCAGCGGAGAAAAAAA*TGGTTCAGCGTCTTGTATAC
CGTTCGCGTCACAGCTACGCCACCAAATCTAACCAGCACAGGATCCTCAAAACCCCAGGT
GGTAAATTGACATTCCAGACCACTAAGAAGCGTGCAAGTGGACCCAAATGTCCTGTCACC
GGCAAGCGTATTCAGGGTATCCCTCACTTGAGGCCTGCTGAGTACAAGAGGTCTAGATTG
TCTAGAAACAGGAGGACCGTGAACCGTGCTTATGGTGGTGTTTTATCTGCTTTGGCTGTT
AGAGAAAGAATCGTTCGTGCTTTCCTTGTGGAGGAGCAGAAGATTGTGAAGAAGGTTTTG
AAGCTCCAAAAGGCCAAGGAGAAGGTTGCTCCCAGGAGCTAGATTATCATATTAGCTTCT
TTTGGAAAAAAAATGTTTGATGGATCTGTTCTAGCAATAGTACTCTGGTTGCAGAAGTTT
GAGAGAAATACTTTTTTTTTCGTTATCCATTGAGTTTTTATTCTGTCGACATTTCTCAAA
TATTGCGTTTTGTTTTCTC
GTCC

QA 4 562 4 562
DS 

RD RS1H096JQB 553 0 0
GGG
CTCCTCAGCGTGTGAGCGAAGAAGCAGCGGAGAAAAAAA*TGGTTCAGCGTCTTGTATAC
CGTTCGCGTCACAGCTACGCCACCAAATCTAACCAGCACAGGATCCTCAAAACCCCAGGT
GGTAAATTGACATTCCAGACCACTAAGAAGCGTGCAAGTGGACCCAAATGTCCTGTCACC
GGCAAGCGTATTCAGGGTATCCCTCACTTGAGGCCTGCTGAGTACAAGAGGTCTAGATTG
TCTAGAAACAGGAGGACCGTGAACCGTGCTTATGGTGGTGTTTTATCTGCTTTGGCTGTT
AGAGAAAGAATCGTTCGTGCTTTCCTTGTGGAGGAGCAGAAGATTGTGAAGAAGGTTTTG
AAGCTCCAAAAGGCCAAGGAGAAGGTTGCTCCCAGGAGCTAGATTATCATATTAGCTTCT
TTTGGAAAAAAAATGTTTGATGGATCTGTTCTAGCAATAGTACTCTGGTTGCAGAAGTTT
GAGAGAAATACTTTTTTTTTCGTTATCCATTGAGTTTTTATTCTGTCGACATTTCTCAAA
TATTGCGTTT

QA 4 553 4 553
DS 

RD RS1C746TF 598 0 0
GGATATACATATATATTAGGTTAAAACAAGCCAGCCTCCTCAGCGTGTGAGCGAAGAAGA
AGCGGAGAAAAAAA*TGGTTCAGCGTCTTGTATACCGTTCGCGTCACAGCTACGCCACCA
AATCTAACCAGCACAGGATCCTCAAAACCCCAGGTGGTAAATTGACATTCCAGACAACTA
AGAAGCGTGCAAGTGGACCCAAATGTCCTGTCACCGGCAAGCGTATTCAGGGTATCCCTC
ACTTGAGGCCTGCTGAGTACAAGAGGTCTAGATTGTCTAGAAACAGGAGGACCGTGAACC
GTGCTTATGGTGGTGTTTTATCTGCTTTGGCTGTTAGAGAAAGAATCGTTCGTGCTTTCC
TTGTGGAGGAGCAGAAGATTGTGAAGAAGGTTTTGAAGCTCCAAAAGGCCAAGGAAAAGG
TTGCTCCCAGGAGCTAGATTATCATATAAGCTTCTTTTGGAAAAAAA*TGTTTAATGGAT
CTGTTCTAGCAATAGTACTCTGGTTGCAGAAGTTTGAGAGAAATACTTTTTTTTTTGTTA
TCCATTGAGTTTTGATTCTGTCGACATTTCTCAAATATTGCGTTTTGTTTTCTC
GTCC

QA 1 594 1 594
DS 



AS 1 6

CO CL1383Contig1 1045 6 15 U
AAAAATCGGTTTAAAAGTATTACGTTAACGAATTAATACAATGCAAACGAATCAATAAAA
TTTAACGTGATCTACAATAAAATGAACATATTTTGTAGCAATAAAAAAAGTACTGCTCTG
CTCTCAACTCTTTACTCTCTATGCGGCTAAGCACTCTTTTGGAAGACCTTGAGGGAATCT
CTTTGAATCCGTGCAATAGTTGTATATCATATAGTTTTTCTGCACCCATCTCATCCTTTC
TTGAGCAGTTGAGTCAAGCTCCTGAGACAACCACGAGCCAGTGGTCCCTTGTTTCGAGAC
ATCAGGGCAAGACGACTTGCCGTTCGACCAAACACAAGCTTCTTGGTTGAAGCCACGGTA
CGAAGCGGTGAAAGGAGCTTTAGACCAATCGGTTTTGACCAAACCGCCTCTCGTGGCCCA
GTCATCAGCGTTCCAAAGACTAGAGTACATT*CTCATTGGTCTGTTCTTGGGAAAGAGAG
TGCCAATAGATTCCATGTTCTTGAATTCTCTAATTGGAGTTCCATCGACGGTGAAAATGA
TTCGTTGTGGGTTCCACAGAATGGTGTAAGTGTGGAAATCAGCTGTTGGATCGAACCAGA
GTTTAAACTGCTGTTCTTTGTCTCCTTTGCCTTGTGTGTAGACATTTGTGTGTAGTGTGT
AAGGATCTCCACCTACGTTTCCCAAAAACTCGAAATCAATCTCGTCCCATGTTGTTCCAG
GTGATTTCAAGTAGAGGGTTGTGACTGTTCCGGCTGAGTTTCCAGGGACGAGTTTCATTT
GCATGTCGATTTTACCGAACAAGTACTCGTTCTTGGATTGAAAGCCAGAGCCAGAGGATT
TGTCTAGAGATAAAGTGAGAAGCTCTCCATTGTTCGTGATCTGTCCACGTCCATCTCCCC
ATGTGATCTCTACGTCTCTTTGGAAGTTAGCTGAAACAGAGGAGATGACGATAAGAGAAA
GAAACAGAGGAAGTAAGTAACTGTTTGCCATTTTCAGAGATTTATGAGTTTCTTCTTTTT
TTCCTATTGGGGTTTTGATCTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 20 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 

AF RS1EH29JQ U 1
AF RS1CS55JQ U 295
AF RS1CS55TF C 60
AF RS1EF61JQ U 7
AF RS1EF61TF C 263
AF RS1EH29TF C 293
BS 1 54 RS1EH29JQ
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BS 267 439 RS1EH29JQ
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BS 478 478 RS1CS55JQ
BS 479 827 RS1EF61JQ
BS 828 1021 RS1EF61TF
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BS 1040 1040 RS1EH29TF
BS 1041 1045 RS1EF61TF

RD RS1EH29JQ 439 0 0
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TTTAACGTGATCTACAATAAAATGAACATATTTTGTAGCAATAAAAAAAGTACTGCTCTG
CTCTCAACTCTTTACTCTCTATGCGGCTAAGCACTCTTTTGGAAGACCTTGAGGGAATCT
CTTTGAATCCGTGCAATAGTTGTATATCATATAGTTTTTCTGCACCCATCTCATCCTTTC
TTGAGCAGTTGAGTCAAGCTCCTGAAACAACCACGAGCCAGTGGTCCCTTGTTTCGAGAC
ATCAGGGCAAGACGACTTGCCGTTCGACCAAACACAAGCTTCTTGGTTGAAGCCACGGTA
CGAAGCGGTGAAAGGAGCTTTAGACCAATCGGTTTTGACCAAACCGCCTCTCGTGGCCCA
GTCATCAGCGTTCCAAAGA

QA 1 439 1 439
DS 

RD RS1CS55JQ 302 0 0
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ACGGTACGAAGCGGTGAAAGGAGCTTTAAACCAATCGGTTTTGACCAAACCGCCTCTCGT
GGCCCAGTCATCAGCGTTCCAAAGACTAAAGTACATTTCTCATTGGTCTGTTCTTGGGAA
AGAGAGTGCCAATAGATTCCATGTTCTTGAATTCTCTAATTGGAGTTCCATCGACGGTGA
AAATGATTCGTTGTGGGTTCCACAGAATGGTGTAAGTGTGGAAATCAGCTGTTGGATCGA
AC

QA 1 302 1 302
DS 

RD RS1CS55TF 664 0 0
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GCTCTCAACTCTTTACTCTCTATGCGGCTAAGCACTCTTTTGGAAGACCTTGAGGGAATC
TCTTTGAATCCGTGCAATAGTTGTATATCATATAGTTTTTCTGCACCCATCTCATCCTTT
CTTGAGCAGTTGAGTCAAGCTCCTGAGACAACCACGAGCCAGTGGTCCCTTGTTTCGAGA
CATCAGGGCAAGACGACTTGCCGTTCGACCAAACACAAGCTTCTTGGTTGAAGCCACGGT
ACGAAGCGGTGAAAGGAGCTTTAGACCAATCGGTTTTGACCAAACCGCCTCTCGTGGCCC
AGTCATCAGCGTTCCAAAGACTAGAGTACATT*CTCATTGGTCTGTTCTTGGGAAAGAGA
GTGCCAATAGATTCCATGTTCTTGAATTCTCTAATTGGAGTTCCATCGACGGTGAAAATG
ATTCGTTGTGGGTTCCACAGAATGGTGTAAGTGTGGAAATCAGCTGTTGGATCGAACCAG
AGTTTAAACTGCTGTTCTTTGTCTCCTTTGCCTTGTGTGTAGACATTTGTGTGTAGTGTG
TAAGGATCTCCACTTACGTTTCCCAAAAACTCGAAATCAATCTCGTCCCATGTTGTTCCA
GGT
C

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DS 

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GTGATCTACAATAAAATGAACATATTTTGTAGCGATAAAAAAAGTACTGCTCTGCTCTCA
ACTCTTTACTCTCTATGCGGCTAAGCACTCTTTTGGAAGACCTTGAGGGAATCTCTTTGA
ATCCGTGCAATAGTTGTATATCATATAGTTTTTCTGCACCCATCTCATCCTTTCTTGAGC
AGTTGAGTCAAGCTCCTGAGACAACCACGAGCCAGTGGTCCCTTGTTTCGAGACATCAGG
GCAAGACGACTTGCCGTTCGACCAAACACAAGCTTCTTGGTTGAAGCCACGGTACGAAGC
GGTGAAAGGAGCTTTAAACCAATCGGTTTTGACCAAACCGCCTCTCGTGGCCCAGTCATC
AGCGTTCCAAAGACTAGAGTACATT*CTCATTGGTCTGTTCATGGGAAAGAAAGTGCCAA
TAGATTCCATGTTCTTGAATTCTCTAATTGGAGTTCCATCGACGGTGAAAATGATTCGTT
GTGGGTTCCACAGAATGGTGTAAGTGTGGAAATCAGCTGTTGGATCGAACCAGAGTTTAA
ACTGCTGTTCTTTGTCTCCTTTGCCTTGTGTGTAGACATTTGTGTGTAGTGTGTAAGGAT
CTCCACCTACGTTTCCCAAAAACTCGAAATCAATCTCGTCCCATGTTGTTCCAGGTGATT
TCAAGTAGAGGGTTGTGACTGTTCCGGCTGAGTTTCCAGGGACGAGTTTCATTTGCATGT
CGATTTTACCGAACAAGTACTCGTTCTTGGATTGAAAGCCA

QA 1 821 1 821
DS 

RD RS1EF61TF 783 0 0
CTGAGAC
ACCACGAGCCAGTGGTCCCTTGTT*CGAGACATCAGGGCAAGACGACTTGCCGTTCGACC
AAACACAAGCTTCTTGGT*GAAGCCACGGTACGAAGCGGTGAAAGGAGCTTTAGACCAAT
CGGTTTTGACCAAACCGCCTCTCGTGGCCCAGTCATCAGCGTTCCAAAGACTAGAGTACA
TT*CTCATTGGTCTGTTCATGGGAAAGAGAGTGCCAATAGATTCCATGTTCTTGAATTCT
CTAATTGGAGTTCCATCGACGGTGAAAATGATTCGTTGTGGGTTCCACAGAATGGTGTAA
GTGTGGAAATCAGCTGTTGGATCGAACCAGAGTTTAAACTGCTGTTCTTTGTCTCCTTTG
CCTTGTGTGTAGACATTTGTGTGTAGTGTGTAAGGATCTCCACCTACGTTTCCCAAAAAC
TCGAAATCAATCTCGTCCCATGTTGTTCCAGGTGATTTCAAGTAGAGGGTTGTGACTGTT
CCGGCTGAGTTTCCAGGGACGAGTTTCATTTGCATGTCGATTTTACCGAACAAGTACTCG
TTCTTGGATTGAAAGCCAGAGCCAGAGGATTTGTCTAGAGATAAAGTGAGAAGCTCTCCA
TTGTTCGTGATCTGTCCACGTCCATCTCCCCATGTGATCTCTACGTCTCTTTGGAAGTTA
GCTGAAACAGAGGAGATGACGATAAGAGAAAGAAACAGAGGAAGTAAGTAACTGTTTGCC
ATTTTCAGAGATTTATGAGTTTCTTCTTTTTT*CCTATTGGGGTTTTGATTTGTCC

QA 8 783 8 783
DS 

RD RS1EH29TF 753 0 0
TTCGAGACATCAGGGCAAGACGACTTGCCGTTCGACCAAACACAAGCTTCTTG*TTGAAG
CCACGGTACGAAGCGGTGAAAGGAGCTTTAGACCAATCGGTTTTGACCAAACCGCCTCTC
GTGGCCCAGTCATCAGCGTTCCAAAGACTAGAGTACATT*CTCATTGGTCTGTTCTTGGG
AAAGAGAGTGCCAATAGATTCCATGTTCTTGAATTCTCTAATTGGAGTTCCATCGACGGT
GAAAATGATTCGTTGTGGGTTCCACAGAATGGTGTAAGTGTGGAAATCAGCTGTTGGATC
GAACCAGAGTTTAAACTGCTGTTCTTTGTCTCCTTTGCCTTGTGTGTAGACATTTGTGTG
TAGTGTGTAAGGATCTCCACTTACGTTTCCCAAAAACTCGAAATCAATCTCGTCCCATGT
TGTTCCAGGTGATTTCAAGTAGAGGGTTGTGACTGTTCCGGCTGAGTTTCCAGGGACGAG
TTTCATTTGCATGTCGATTTTACCGAACAAGTACTCGTTCTTGGATTGAAAGCCAGAGCC
AGAGGATTTGTCTAGAGATAAAGTGAGAAGCTCTCCATTGTTCGTGATCTGTCCACGTCC
ATCTCCCCATGTGATCTCTACGTCTCTTTGGAAGTTAGCTGAAACAGAGGAGATGACGAT
AAGAGAAAGAAACAGAGGAAGTAAGTAACTGTTTGCCATTTTCAGAGATTTATGAGTTTC
TTCTTTTTTTCCTATTGGGGTTTTGATCTGTCC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 6

CO CL1384Contig1 856 6 15 U
GGGACGAGCACTTAACCAAAAAATGGGGTCCGGAGAGAGCGCATGACCAAAGATTAGGGT
TTCAAGAGGAGCGATGGTGCGTATGGAAGGAGCGTTGATGGGTGAAGAATGTGATGCTTG
GTGTTGGTATCTGGAAGATGTATTTTTGCTGCATACACCTGATGAGCCTGACTGGGTGAG
ACCGAATCATGTCATTCAGAACGAGAAAAACAAGGCGCTTCAGCTCACACCCAAACAAGA
ATGTGACTTGATTAATGAACAGATAAAAGCCAGCGAGGGCTTCGATGTTGATTGGACCAA
GGCCCGCTGCCTTTACAATTACCATCCTGTTGTGTTCGATGATGATGTATTTGTCGACGA
GCCCGAAACCAATCTTGATCTACTCAACAGGCTCTGTGAAAAATCCATTGGTCACTACAA
TCAGGAAAACAAGACAGCATATGAATTTGTCAAGCCTCTTTATGCCAATTGTCACGGGTG
TACTGGGATCATGTTTCTCATAACTTTCCAAGTCAAGGATCCTGTTGAAAACCTCACAAA
AGACTTCCAAGCTAGGATTCATTACTCTTATTGTAGCAAGAGCCAGTTCATCATGTGCAG
ACCAAAACACCACCAAGCAGATAGCCTTGGAGTTGCCGAGAATGACCCCAAGAAGCCAAG
ACTGGAGTAAGATGCTCCCTCTACTCGTGACAGAACTTACTATCGACTCTTGGTTATGTT
TCTATTACTATTTGTAGACTGTTGTTGTTGTCTTCTTGTAAGCAAAGATACCTGTAGCGA
ACCTTCTATCTCTCTACATTGTAAGTGGCTATTTTCTTTTAGACTCTTTGTTATATTTTA
TTTAATTACCATCTCG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 0 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 
10 30 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1DZ23TF U 23
AF RS1FR14TF U 1
AF RS1FO44TF U 1
AF RS1FO44JQ C 3
AF RS1FR14JQ C 5
AF RS1DZ23JQ C 163
BS 1 22 RS1FO44TF
BS 23 23 RS1FO44JQ
BS 24 29 RS1FO44TF
BS 30 30 RS1FO44JQ
BS 31 760 RS1FO44TF
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BS 762 771 RS1FO44TF
BS 772 772 RS1FO44JQ
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BS 781 781 RS1FO44JQ
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BS 855 856 RS1DZ23JQ

RD RS1DZ23TF 576 0 0
GGGGGGTTCG
GAGAGAGCGCATGACCAAAGATTAGGGTTTCAAGAGGAGCGATGGTGCGTATGGAAGGAG
CGTTGATGGGTGAAGAATGTGATGCTTGGTGTTGGTATCTGGAAGATGTATTTTTGCTGC
ATACACCTGATGAGCCTGACTGGGTGAGACCGAATCATGTCATTCAGAACGAGAAAAACA
AGGCGCTTCAGCTCACACCCAAACAAGAATGTGACTTGATTAATGAACAGATAAAAGCCA
GCGAGGGCTTCGATGTTGATTGGACCAAGGCCCGCTGCCTTTACAATTACCATCCTGTTG
TGTTCGATGATGACGTATTTGTCGACGAGCCCGAAACCAATCTTGATCTACTCAACAGGC
TCTGTGAAAAATCCATTGGTCACTACAATCAGGAAAACAAGACAGCATATGAATTTGTCA
AGCCTCTTTATGCCAATTGTCACGGGTGTACTGGGATCATGTTTCTCATAACTTTCCAAG
TCAAGGATCCTGTTGAAAACCTCACAAAAGACTTCCGAGCTAGGATTCATTACTCTTACT
GTAGCAAGAGCCAGTTCATCATGTGC

QA 11 576 11 576
DS 

RD RS1FR14TF 762 0 0
G
GGACGAGCACTTAACCAAAAATTGGGGTTCGGAGAGAGCGCATGACCAAAGATTAGGGTT
TCAAGAGGAGCGATGGTGCGTATGGAAGGAGCGTTGATGGGTGAAGAATGTGATGCTTGG
TGTTGGTATCTGGAAGATGTATTTTTGCTGCATACACCTGATGAGCCTGACTGGGTGAGA
CCGAATCATGTCATTCAGAACGAGAAAAACAAGGCGCTTCAGCTCACACCCAAACAAGAA
TGTGACTTGATTAATGAACAGATAAAAGCCAGCGAGGGCTTCGATGTTGATTGGACCAAG
GCCCGCTGCCTTTACAATTACCATCCTGTTGTGTTCGATGATGATGTATTTGTCGACGAG
CCCGAAACCAATCTTGATCTACTCAACAGGCTCTGTGAAAAATCCATTGGTCACTACAAT
CAGGAAAACAAGACAACATATGAATTTGTCAAGCCTCTTTATGCCAATTGTCACGGGTGT
ACTGGGATCATGTTTCTCATAACTTTCCAAGTCAAGGATCCTGTTGAAAACCTCACAAAA
GACTTCCAAGCTAGGATTCATTACTCTTATTGTAGCAAGAGCCAGTTCATCATGTGCAGA
CCAAAACACCACCAAGCAGATAGCCTTGGAGTTGCCGAGAATGACCCCAAGAAGCCAAGA
CTGGAGTAAGATGCTCCCTCTACTCGTGACAGAACTTACTATCGACTCTTGGTTATGTTT
CTATTACTATTTGTAGACTGTTGTTGTTGTCT
CTGTAAGCA

QA 2 753 2 753
DS 

RD RS1FO44TF 801 0 0
GGGACGAGCACTTAACCAAAAATTGGGGTTCGGAGAGAGCGCATGACCAAAGATTAGGGT
TTCAAGAGGAGCGATGGTGCGTATGGAAGGAGCGTTGATGGGTGAAGAATGTGATGCTTG
GTGTTGGTATCTGGAAGATGTATTTTTGCTGCATACACCTGATGAGCCTGACTGGGTGAG
ACCGAATCATGTCATTCAGAACGAGAAAAACAAGGCGCTTCAGCTCACACCCAAACAAGA
ATGTGACTTGATTAATGAACAGATAAAAGCCAGCGAGGGCTTCGATGTTGATTGGACCAA
GGCCCGCTGCCTTTACAATTACCATCCTGTTGTGTTCGATGATGATGTATTTGTCGACGA
GCCCGAAACCAATCTTGATCTACTCAACAGGCTCTGTGAAAAATCCATTGGTCACTACAA
TCAGGAAAACAAGACAGCATATGAATTTGTCAAGCCTCTTTATGCCAATTGTCACGGGTG
TACTGGGATCATGTTTCTCATAACTTTCCAAGTCAAGGATCCTGTTGAAAACCTCACAAA
AGACTTCCAAGCTAGGATTCATTACTCTTATTGTAGCAAGAGCCAGTTCATCATGTGCAG
ACCAAAACACCACCAAGCAGATAGCCTTGGAGTTGCCGAGAATGACCCCAAGAAGCCAAG
ACTGGAGTAAGATGCTCCCTCTACTCGTGACAGAACTTACTATCGACTCTTGGTTATGTT
TCTATTACTATTTGTAGACTGTTGTTGTTGTCTTCTTGTA*GCAAAGATAC*TGTAGCGA
CC**TCTATCTCTCTACATTG

QA 1 801 1 801
DS 

RD RS1FO44JQ 852 0 0
GGACGAGCACTTAACCA
AAAATGGGGTC**GAGAGAGCGCATGACCAAAGATTAGGGTTTCAAGAGGAGCGATGGTG
CGTATGGAAGGAGCGTTGATGGGTGAAGAATGTGATGCTTGGTGTTGGTATCTGGAAGAT
GTATTTTTGCTGCATACACCTGATGAGCCTGACTGGGTGAGACCGAATCATGTCATTCAG
AACGAGAAAAACAAGGCGCTTCAGCTCACACCCAAACAAGAATGTGACTTGATTAATGAA
CAGATAAAAGCCAGCGAGGGCTTCGATGTTGATTGGACCAAGGCCCGCTGCCTTTACAAT
TACCATCCTGTTGTGTTCGATGATGATGTATTTGTCGACGAGCCCGAAACCAATCTTGAT
CTACTCAACAGGCTCTGTGAAAAATCCATTGGTCACTACAATCAGGAAAACAAGACAGCA
TATGAATTTGTCAAGCCTCTTTATGCCAATTGTCACGGGTGTACTGGGATCATGTTTTTC
ATAACTTTCCAAGTCAAGGATCCTGTTGAAAACCTCACAAAAGACTTCCAAGCTAGGATT
CATTACTCTTATTGTAGCAAGAGCCAGTTCATCATGTGCAGACCAAAACACCACCAAGCA
GATAGCCTTGGAGTTGCCGAGAATGACCCCAAGAAGCCAAGACTGGAGTAAGATGCTCCC
TCTACTCGTGACAGAACTTACTATCGACTCTTGGTTATGTTTCTATTACTATTTGTAGAC
TGTTGTTGTTGTCTTCTTGTAAGCAAAGATACCTGTAGCGAACCTTCTATCTCTCTACAT
TGTAAGTGGCTATTTTCTTTTAGACTCTTTGTTATATTTTATTTAATTACCATCT

QA 18 852 18 852
DS 

RD RS1FR14JQ 850 0 0
GGACGAGCACTAACC
AAAATGGGGTC**GAGAGAGCGCATGACCAAAGATTAGGGTTTCAAGAGGAGCGATGGTG
CGTATGGAAGGAGCGTTGATGGGTGAAGAATGTGATGCTTGGTGTTGGTATCTGGAAGAT
GTATTTTTGCTGCATACACCTGATGAGCCTGACTGGGTGAGACCGAATCATGTCATTCAG
AACGAGAAAAACAAGGCGCTTCAGCTCACACCCAAACAAGAATGTGACTTGATTAATGAA
CAGATAAAAGCCAGCGAGGGCTTCGATGTTGATTGGACCAAGGCCCGCTGCCTTTACAAT
TACCATCCTGTTGTGTTCGATGATGATGTATTTGTCGACGAGCCCGAAACCAATCTTGAT
CTACTCAACAGGCTCTGTGAAAAATCCATTGGTCACTACAATCAGGAAAACAAGACAACA
TATGAATTTGTCAAGCCTCTTTATGCCAATTGTCACGGGTGTACTGGGATCATGTTTTTC
ATAACTTTCCAAGTCAAGGATCCTGTTGAAAACCTCACAAAAGACTTCCAAGCTAGGATT
CATTACTCTTATTGTAGCAAGAGCCAGTTCATCATGTGCAGACCAAAACACCACCAAGCA
GATAGCCTTGGAGTTGCCGAGAATGACCCCAAGAAGCCAAGACTGGAGTAAGATGCTCCC
TCTACTCGTGACAGAACTTACTATCGACTCTTGGTTATGTTTCTATTACTATTTGTAGAC
TGTTGTTGTTGTCTTCTTGTAAGCAAAGATACCTGTAGCGAACCTTCTATCTCTCTACAT
TGTAAGTGGCTATTTTCTTTTAGACTCTTTGTTATATTTTATTTAATTACCATCT

QA 16 850 16 850
DS 

RD RS1DZ23JQ 694 0 0
TGAGCCTGACTGGGTGAGACCGAATCATGTCATTCAGAACGAGAAAAACAAGGCGCTTCA
GCTCACACCCAAACAAGAATGTGACTTGATTAATGAACAGATAAAAGCCAGCGAGGGCTT
CGATGTTGATTGGACCAAGGCCCGCTGCCTTTACAATTACCATCCTGTTGTGTTCGATGA
TGACGTATTTGTCGACGAGCCCGAAACCAATCTTGATCTACTCAACAGGCTCTGTGAAAA
ATCCATTGGTCACTACAATCAGGAAAACAAGACAGCATATGAATTTGTCAAGCCTCTTTA
TGCCAATTGTCACGGGTGTACTGGGATCATGTTTCTCATAACTTTCCAAGTCAAGGATCC
TGTTGAAAACCTCACAAAAGACTTCCGAGCTAGGATTCATTACTCTTACTGTAGCAAGAG
CCAGTTCATCATGTGCAGACCAAAACACCACCAAGCAGATAGCCTTGGAGTTGCCGAGAA
TGACCCCAAGAAGCCAAGACTGGAGTAGGATGCTCCCTCTACTCGTGACAGAACTTACTA
TCGACTCTTGGTTATGTTTCTATTACTATTTGTAGACTGTTGTTGTTGTCTTCTTGTAAG
CAAAGATACCTGTAGCGAACCTTCTATCTCTCTACATTGTAAGTGGCTATTTTCTTTTAG
ACTCTTTGTTATATTTTATTTAATTACCATCTCG

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 5

CO CL1385Contig1 1032 5 7 U
TTTTGGAATCAGTATTTTGGGGCTCCTTTCAAAGATGATGGTTAAAAAGAAATCAAGAAG
TTTTGGTTACATTTAGTTAAATGAAGCAAAAGAAGAGTGAAAAGGAGAGGATCTGTCTGT
ATGGTATCTTCATGGTTAAGACTCAAGGGTGTGTGTGGTCAGAGAGCTGCCATCATTGCT
CGTCTTGTTGCCTCCTGCTTCATCTCTGCTGCTTTACCGCTCCCTCTGAAGTACATGTAT
ACTTGCTGAATAACCCAGATGCTCACGAGTGACTCCAGGCAAAAGAATCCAAACCCAATG
AAGTAGAATATCCCAACTAATATGTTCCCGCTCAACACGTCAATCGCCGGTAATATTCCC
GTCAGCGACTTCCCCTTGAAGATAATTGGAGGAGCCACCGCCGCGAATACACAAAACCCT
ATGTGAAACAGATATGTTAAGAAAAACCACCCAAACTTGAGAGCACTATCAGTCCTCATG
GCACGATAAAGAGGTCTATACCACATAACATACGCTCCAGGAACCCCCGATATGAAATAG
ATAATAGCTAGAAACCATATGGTTGGACCTTCTCCCTTAATCCACGCGGTGGTGACTGCA
ACAATGTTCCATAACAGGCACACCACAAGACCCAGAAACGATGTGAATGCAACATATTGG
ATTCTCTGGAGATGGATGGGAATCTCATTCGAAATGTCATGATGGATGAGAGGAAGAAAC
GGTGGCCAGTTTTTGTCTTCTATCACAATCCCGGCCTGTGCTATAACATCCTCTTTCCGC
TTGAGTTCCTGCTCTCGCCTCTTCAAATCAGCTTCTTTTGCCTGGAGTTCCTTCTCCTTA
GCTTTCAGATCCTTCCAAGAGTCTAGAGGAATATCAGTGGTGTGCTCATACGCAGCAGGA
ACAGTTGAAGGATTCGCAAAAGGATTAACCTCCCCGCCGTCGTCAAAGGAAGGAGACTGG
TAGCTAGACATTGCACCACCGTACTCGGCAGATCCAATCTAAAGAAGAAGAAAGGGTGAT
CTGATGCGTTCC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GN48JQ U 19
AF RS1A301TR U 1
AF RS1A301JQ U 5
AF RS1A301TF C 196
AF RS1GN48TF C 518
BS 1 305 RS1A301TR
BS 306 306 RS1GN48JQ
BS 307 674 RS1A301TR
BS 675 857 RS1A301TF
BS 858 858 RS1GN48TF
BS 859 936 RS1A301TF
BS 937 1032 RS1GN48TF

RD RS1GN48JQ 600 0 0
GGGGCTCCTTTCAAAGATGATGGTTAAAAAGAAATCAAGAAGTTTTGGTTACATTTAGTT
AAATGAAGCAAAAGAAGAGTGAAAAGGAGAGGATCTGTCTGTATGGTATCTTCATGGTTA
AGACTCAAGGGAGTGTGTGGTCAGAGAGCTGCCATCATTGCTCGTCTTGTTGCCTCCTGA
TTCATCTCTGCTGCTTTACCGCTCCCTCTGAAGTACATGTATACTTGCTGAATAACCCAG
ATGCTCACGAGTGACTCCAGGCAAAAGAATCCAAACCCAATGAAGTAGAATATCCCAACT
AATATGTTCCCGCTCAACACGTCAATCGCCGGTAATATTCCCGTCAGCGACTTCCCCTTG
AAGATAATTGGAGGAGCCACCGCCGCGAATACACAAAACCCTATGTGAAACAGATATGTT
AAGAAAAACTACCCAAACTTGAGAGCACTATCAGTCCTCATGGCACGATAAAGAGGTCTA
TACCACATAACATACGCTCCAGGAACCCCCGATATGAAATAGATAATAGCTAGAAACCAT
ATGGTTGGACCTTCTCCCTTAATCCACGCGGTGGTGACTGCAACAATGTTCCATAACAGG

QA 1 600 1 600
DS 

RD RS1A301TR 674 0 0
TTTTGGAATCAGTATTTTGGGGCTCCTTTCAAAGATGATGGTTAAAAAGAAATCAAGAAG
TTTTGGTTACATTTAGTTAAATGAAGCAAAAGAAGAGTGAAAAGGAGAGGATCTGTCTGT
ATGGTATCTTCATGGTTAAGACTCAAGGGTGTGTGTGGTCAGAGAGCTGCCATCATTGCT
CGTCTTGTTGCCTCCTGCTTCATCTCTGCTGCTTTACCGCTCCCTCTGAAGTACATGTAT
ACTTGCTGAATAACCCAGATGCTCACGAGTGACTCCAGGCAAAAGAATCCAAACCCAATG
AAGTAAAATATCCCAACTAATATGTTCCCGCTCAACACGTCAATCGCCGGTAATATTCCC
GTCAGCGACTTCCCCTTGAAGATAATTGGAGGAGCCACCGCCGCGAATACACAAAACCCT
ATGTGAAACAGATATGTTAAGAAAAACCACCCAAACTTGAGAGCACTATCAGTCCTCATG
GCACGATAAAGAGGTCTATACCACATAACATACGCTCCAGGAACCCCCGATATGAAATAG
ATAATAGCTAGAAACCATATGGTTGGACCTTCTCCCTTAATCCACGCGGTGGTGACTGCA
ACAATGTTCCATAACAGGCACACCACAAGACCCAGAAACGATGTGAATGCAACATATTGG
ATTCTCTGGAGATG

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1A301JQ 664 0 0
GGAATCAGTATTTTGGGGCTCCTTTCAAAGATGATGGTTAAAAAGAAATCAAGAAGTTTT
GGTTACATTTAGTTAAATGAAGCAAAAGAAGAGTGAAAAGGAGAGGATCTGTCTGTATGG
TATCTTCATGGTTAAGACTCAAGGGTGTGTGTGGTCAGAGAGCTGCCATCATTGCTCGTC
TTGTTGCCTCCTGCTTCATCTCTGCTGCTTTACCGCTCCCTCTGAAGTACATGTATACTT
GCTGAATAACCCAGATGCTCACGAGTGACTCCAGGCAAAAGAATCCAAACCCAATGAAGT
AAAATATCCCAACTAATATGTTCCCGCTCAACACGTCAATCGCCGGTAATATTCCCGTCA
GCGACTTCCCCTTGAAGATAATTGGAGGAGCCACCGCCGCGAATACACAAAACCCTATGT
GAAACAGATATGTTAAGAAAAACCACCCAAACTTGAGAGCACTATCAGTCCTCATGGCAC
GATAAAGAGGTCTATACCACATAACATACGCTCCAGGAACCCCCGATATGAAATAGATAA
TAGCTAGAAACCATATGGTTGGACCTTCTCCCTTAATCCACGCGGTGGTGACTGCAACAA
TGTTCCATAACAGGCACACCACAAGACCCAGAAACGATGTGAATGCAACATATTGGATTC
TCTG

QA 1 664 1 664
DS 

RD RS1A301TF 759 0 0
TGC
TTCATCTCTGCTGCTTTACCGCTCCCTCTGAAGTACATGTATACTTGCTGAATAACCCAG
ATGCTCACGAGTGACTCCAGGCAAAAGAATCCAAACCCAATGAAGTAGAATATCCCAACT
AATATGTTCCCGCTCAACACGTCAATCGCCGGTAATATTCCCGTCAGCGACTTCCCCTTG
AAGATAATTGGAGGAGCCACCGCCGCGAATACACAAAACCCTATGTGAAACAGATATGTT
AAGAAAAACCACCCAAACTTGAGAGCACTATCAGTCCTCATGGCACGATAAAGAGGTCTA
TACCACATAACATACGCTCCAGGAACCCCCGATATGAAATAGATAATAGCTAGAAACCAT
ATGGTTGGACCTTCTCCCTTAATCCACGCGGTGGTGACTGCAACAATGTTCCATAACAGG
CACACCACAAGACCCAGAAACGATGTGAATGCAACATATTGGATTCTCTGGAGATGGATG
GGAATCTCATTCGAAATGTCATGATGGATGAGAGGAAGAAACGGTGGCCAGTTTTTGTCT
TCTATCACAATCCCGGCCTGTGCTATAACATCCTCTTTCCGCTTGAGTTCCTGCTCTCGC
CTCTTCAAATCAGCTTCTTTTGCCTGGAGTTCCTTCTCCTTAGCTTTCAGATCCTTCCAG
GAGTCTAGAGGAATATCAGTGGTGTGCTCATACGCAGCAGGAACAGTTGAAGGATTCGCA
AAAGGATTAACCTCCCCG
GCCGTAATGGCCGAATTC

QA 4 741 4 741
DS 

RD RS1GN48TF 515 0 0
CAGGACCCCCCGATATGAAATAGATAATAGCTAGAAACCATATGGTTGGACCTTCTCCCT
TAATCCACGCGGTGGTGACTGCAACAATGTTCCATAACAGGCACACCACAAGACCCAGAA
ACGATGTGAATGCAACAAATTGGATTCTCTGGAGATGGATGGGAATCTCATTCGAAATGT
CATGATGGATGAGAGGAAGAAACGGTGGCCAGTTTTTGTCTTCTATCACAATCCCGGCCT
GTGCTATAGCATCCTCTTTCCGCTTGAGTTCCTGCTCTCGCCTCTTCAAATCAGCTTCTT
TTGCCTGGAGTTCCTTCTCCTTAGCTTTCAGATCCTTCCGAGAGTCTAGAGGAATATCAG
TGGTGTGCTCATACGCAGCAGGAACAGTTGAAGGATTCGCAAAAGGATTAACCTCCCCGC
CGTCGTCAAAGGAAGGAGACTGGTAGCTAGACATTGCACCACCGTACTCGGCAGATCCAA
TCTAAAGAAGAAGAAAGGGTGATCTGATGCGTTCC

QA 1 515 1 515
DS 



AS 1 6

CO CL1386Contig1 827 6 9 U
TTAAAACAAATGCTTAATTGTACTAAGAACACCATATGATGTATATAATAGACAAACGGA
ACTTAAATATATGAACGAAACGAAACACAAGGACAACAACAACAAAGGAAAAAA*GGCGA
TATATAAATGAATCAAAAGCTTATATGCATCATGATGAAATAAAGAAACAAAAAAGAACA
AAAGTAAATATAAAATGAATCAAACGTATAACATATGGTACGTTAAGAAAGAAAATTATT
AGCGATCAAGAATGAGGAATGAATGAAGATCGAACCGTGTTGAATCAAATCCTCCTCTCT
ATCATTCTGTTTCTTATTTCGCGTACCTATAGCAATGCGTGATCGCACTGCATCCACGCC
TGTAAGGATTGTTCCTTCTCCTCTTCTTGCAATCATAGTAAGATCGGCCACGTCTATTGC
AAGGCACATTGTTCTTTTTGAGAGCATCGTATCCAATGTAACGACGTCCTCTAGCAAGCT
GACGACGGTTTGTCTCTGAATCCATTAGAGACTCGAGTTCATCGTCGTCTCCGATGCAAC
CTTGCCCGTTGATGCAAGATTTAGTTAATGGATAGGTTGCATTTACAGATTTAGCTACCA
TAGCTAAAACCAAGAGGCCAAAGATGAATAACAATTTGACACCACCCATTTTGTATTTTT
TT*CTTTGTATAGATGAGTTATATTATTACTCTTGTGCTTGAGTTTTTTGGTATCTTCTA
CGCCCTTCCTTGTGAAAGGAGAGGGAGAAATAGAAGTATGAGAGATTGTGCAGAAGAACA
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BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1B985JQ U 48
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AF RS1D856TF C 1
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RD RS1CK19JQ 749 0 0
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GCTACCATAGCTAAAACCAAGAGGCCAAAGATGAATAACAATTTGACACCACCCATTTTG
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TCTTCTACGCCCTTCCTTGTGAAAGGAGAGGGAGAAATAGAAGTATGAGAGATTGTGCAG
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ATATATAAATGAATCAAAAGCTTATATGCATCATGATGAAATAAAGAAACAAAAAAGAAC
AAAAGTAAATATAAAATGAATCAAACGTATAACATATGGTACGTTAAGAAAGAAAATTAT
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TATCATTCTGTTTCTTATTTCGCGTACCTATAGCAATGCGTGATCGCACTGCATCCACGC
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RD RS1CK19TF 720 0 0
AGG
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AAAAAGAACAAAAGTAAATATAAAATGAATCAAACGTATAACATATGGTACGTTAAGAAA
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CCTCCTCTCTATCATTCTGTTTCTTATTTCGCGTACCTATAGCAATGCGTGATCGCACTG
CATCCACGCCTGTAAGGATTGTTCCTTCTCCTCTTCTTGCAATCATAGTAAGATCGGCCA
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TTAGCTACCATAGCTAAAACCAAGAGGCCAAAGATGAATAACAATTTGACACCACCCATT
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DS 



AS 1 6

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ATAAGTACTCCTGGAGGGAGGATACGAATGAAATTGAATTCCATTTCTGAGC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GK56TF U 116
AF RS1H063TF U 1
AF RS1H328TF U 1
AF RS1CK71TF U 13
AF RS1CK71JQ C 85
AF RS1GK56JQ C 282
BS 1 590 RS1H063TF
BS 591 591 RS1CK71TF
BS 592 668 RS1H063TF
BS 669 669 RS1CK71TF
BS 670 678 RS1H063TF
BS 679 679 RS1H328TF
BS 680 740 RS1H063TF
BS 741 746 RS1CK71TF
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BS 748 800 RS1CK71TF
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RD RS1GK56TF 549 0 0
GG
GGTTGGTTTTGATGGGAGATGAGGCTTCTCTAAGGAGCACTGTACACCACATACGAGTCT
CCATAGAGGGTGCCTTCCCAGTGGAACTCATTGGAGCCGACATGGAAGCTGATAGTGAGG
AAGCTTTCCATGTTGCTGTCCAAAAGGCATGGAATCGTTTGGGATCTTTGGATGCTTTTG
TCAACTGCTGTACCTACCAAGGGAAGATGCAGGACATTCTCCAAGTCTCTGAAGATGAGT
TCAAGAAGATCACAAAGATCAATCTCACGGCTCCATGGTTTATCTTGAAGGCTGTGGCGA
GTATGATGAAGGAGCATGGATCAGGAGGTTCCGTTGTCTTTATGGCTACAATCGCTAGTG
GGGAGAGAGGGCTTTACCCTGGAGCTGATGCCTATGCTACAGCCGCTGCTGGGATTCACC
AGCTGGTTCGGGCATCAGCCATGAGTCTAGGGAAGCACAAGATAAGGGTCAACATGATCT
CTAGAGGTCTGCATCTTGGAGATGAATATCCAGTTGCAGTAGGGATAGATCGAGCGGAGA
AGCTTGT

QA 3 549 3 549
DS 

RD RS1H063TF 740 0 0
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TGGTTTTGATGGGAGATGAGGCTTCTCTAAGGAGCACTGTACACCACATACGAGTCTCCA
TAGAGGGTGCCTTCCCAGTGGAACTCATTGGAGCCGACATGGAAGCTGATAGTGAGGAAG
CTTTCCATGTTGCTGTCCAAAAGGCATGGAATCGTTTGGGATCTTTGGATGCTTTTGTCA
ACTGCTGTACCTACCAAGGGAAGATGCAGGACATTCTCCAAGTCTCTGAAGATGAGTTCA
AGAAGATCACAAAGATCAATCTCACGGCTCCATGGTTTATCTTGAAGGCTGTGGCGAGTA
TGATGAAGGAGCATGGATCAGGAGGTTCCGTTGTCTTTATGGCTACAATCGCTAGTGGGG
AGAGAGGGCTTTACCCTGGAGCTGATGCCTATGCTACAGCCGCTGCTGGGATTCACCAGC
TGGTTCGGGCATCAGCCATGAGTCTAGGGAAGCACAAGATAAGGGTCAACGTGATCTCTA
GAGGTCTGCATCTTGGAGATGAATATCCAGTTGCAGTAGGGATAGATCGAGCGGAGAAGC
TTGTGAAG*ACGCTGCTC*TCTGGGACAGTGGCTGA*CCCGGAGAAAGATATCTACTCGA
CTGTGATTTATTTGATCAGT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RS1H328TF 740 0 0
GGACCAATGGAGGAGAGAGGCATACTCTGAATCAAATGGCGAAGAAAGTGTTGATGACAT
CTAACGGCGACGAGGTTTCCCGGAACATCGCTATCCAGCTAGCCAAACATGGTTGTCGGT
TGGTTTTGATGGGAGATGAGGCTTCTCTAAGGAGCACTGTACACCACATACGAGTCTCCA
TAGAGGGTGCCTTCCCAGTGGAACTCATTGGAGCCGACATGGAAGCTGATAGTGAGGAAG
CTTTCCATGTTGCTGTCCAAAAGGCATGGAATCGTTTGGGATCTTTGGATGCTTTTGTCA
ACTGCTGTACCTACCAAGGGAAGATGCAGGACATTCTCCAAGTCTCTGAAGATGAGTTCA
AGAAGATCACAAAGATCAATCTCACGGCTCCATGGTTTATCTTGAAGGCTGTGGCGAGTA
TGATGAAGGAGCATGGATCAGGAGGTTCCGTTGTCTTTATGGCTACAATCGCTAGTGGGG
AGAGAGGGCTTTACCCTGGAGCTGATGCCTATGCTACAGCCGCTGCTGGGATTCACCAGC
TGGTTCGGGCATCAGCCATGAGTCTAGGGAAGCACAAGATAAGGGTCAACGTGATCTCTA
GAGGTCTGCATCTTGGAGATGAATATCCAGTTGCAGTAGGGATAGATCGAGCGGAGAAGC
TTGTGAAG*ACGCTGCTCCTCTGGGACAGTGGCTGA*CCCGGAGAAAGATATCTACTCGA
CTGTGATTTATTTGATCAGT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RS1CK71TF 788 0 0
GG
GAGAGGCATACTCTGAATCAAATGGCGAAGAAAGTGTTGATGACATCTAACGGCGACGAG
GTTTCCCGGAACATCGCTATCCAGCTAGCCAAACATGGTTGTCGGTTGGTTTTGATGGGA
GATGAGGCTTCTCTAAGGAGCACTGTACACCACATACGAGTCTCCATAGAGGGTGCCTTC
CCAGTGGAACTCATTGGAGCCGACATGGAAGCTGATAGTGAGGAAGCTTTCCATGTTGCT
GTCCAAAAGGCATGGAATCGTTTGGGATCTTTGGATGCTTTTGTCAACTGCTGTACCTAC
CAAGGGAAGATGCAGGACATTCTCCAAGTCTCTTAAGATGAGTTCAAGAAGATCACAAAG
ATCAATCTCACGGCTCCATGGTTTATCTTGAAGGCTGTGGCGAGTATGATGAAGGAGCAT
GGATCAGGAGGTTCCGTTGTCTTTATGGCTACAATCGCTAGTGGGGAGAGAGGGCTTTAC
CCTGGAGCTGATGCCTATGCTACAGCCGCTGCTGGGATTCACCAGCTGGTTCGGGCATCA
GCCATGAGTCTAGGGAAGCACAAGATAAGGGTCAACATGATCTCTAGAGGTCTGCATCTT
GGAGATGAATATCCAGTTGCAGTAGGGATAGATCGAGCGGAGAAGCTTGTGAAGGACGCT
GCTCCTCTGGGACAGTGGCTGA*CCCGGAGAAAGATATCTACTCGACTGTGATTTATTTG
ATCAGTGACGGT*CATGCTTCATGACAGGTACAACTGTGATGGTCGATGGAGCACAGTCT
CTTATG

QA 3 788 3 788
DS 

RD RS1CK71JQ 847 0 0
ACATCGCTATCCAGCTAGCCAAACATGGTTGTCGGTTGGTTTTGATGGGAGATGAGGCTT
CTCTAAGGAGCACTGTACACCACATACGAGTCTCCATAGAGGGTGCCTTCCCAGTGGAAC
TCATTGGAGCCGACATGGAAGCTGATAGTGAGGAAGCTTTCCATGTTGCTGTCCAAAAGG
CATGGAATCGTTTGGGATCTTTGGATGCTTTTGTCAACTGCTGTACCTACCAAGGGAAGA
TGCAGGACATTCTCCAAGTCTCTTAAGATGAGTTCAAGAAGATCACAAAGATCAATCTCA
CGGCTCCATGGTTTATCTTGAAGGCTGTGGCGAGTATGATGAAGGAGCATGGATCAGGAG
GTTCCGTTGTCTTTATGGCTACAATCGCTAGTGGGGAGAGAGGGCTTTACCCTGGAGCTG
ATGCCTATGCTACAGCCGCTGCTGGGATTCACCAGCTGGTTCGGGCATCAGCCATGAGTC
TAGGGAAGCACAAGATAAGGGTCAACATGATCTCTAGAGGTCTGCATCTTGGAGATGAAT
ATCCAGTTGCAGTAGGGATAGATCGAGCGGAGAAGCTTGTGAAGGACGCTGCTCCTCTGG
GACAGTGGCTGAACCCGGAGAAAGATATCTACTCGACTGTGATTTATTTGATCAGTGACG
GTTCATGCTTCATGACAGGTACAACTGTGATGGTCGATGGAGCACAGTCTCTTATGAGAC
CACGTCTCAAATCCTACATGTGATTTGTTTTTTTTTTATAAAAATGCTTGTAACTGTATT
ATTACTTTCTTGAAAATTGAATTTGATCAAGCTTGAATAAGTACTCCTGGAGGGAGGCTA
CGAATG
G

QA 1 846 1 846
DS 

RD RS1GK56JQ 671 0 0
TCTTTGGATGCTTTTGTCAACTGCTGTACCTACCAAGGGAAGATGCAGGACATTCTCCAA
GTCTCTGAAGATGAGTTCAAGAAGATCACAAAGATCAATCTCACGGCTCCATGGTTTATC
TTGAAGGCTGTGGCGAGTATGATGAAGGAGCATGGATCAGGAGGTTCCGTTGTCTTTATG
GCTACAATCGCTAGTGGGGAGAGAGGGCTTTACCCTGGAGCTGATGCCTATGCTACAGCC
GCTGCTGGGATTCACCAGCTGGTTCGGGCATCAGCCATGAGTCTAGGGAAGCACAAGATA
AGGGTCAACATGATCTCTAGAGGTCTGCATCTTGGAGATGAATATCCAGTTGCAGTAGGG
ATAGATCGAGCGGAGAAGCTTGTGAAGGACGCTGCTCCTCTGGGACAGTGGCTGAACCCG
GAGAAAGATATCTACTCGACTGTGATTTATTTGATCAGTGACGGTTCATGCTTCATGACA
GGTACAACTGTGATGGTCGATGGAGCACAGTCTCTTATGAGACCACGTCTCAAATCCTAC
ATGTGATTTGTTTTTTTTT*ATAAAAATGCTTGTAACTGTATTATTACTTTCTTGAAAAT
TGAATTTGATCAAGCTTGAATAAGTACTCCTGGAGGGAGGATACGAATGAAATTGAATTC
CATTTCTGAGC

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 6

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AAAGAAACAAAAAGAAAACTAAAGAATCAAACCAAAGTCAAGTCACTTGAAACACACAAC
AATGTCTCTAGTCCCAAGCCTTTTCGGACGCAGGTCAAACGTTTTTGATCCCTTCTCGCT
AGATGCATGGGATCCATTCGAAGGATTCTTCACTCCTTCCGCGTTAGCAAACGCATCCGG
TTCAACCGCTCGTGACATTGCAGCGTTTACAAACGCAATAGTGGACTGGAAGGAGACGCC
GGAGGCGCACGTATTCAAAGCGGATCTGCCGGGGCTGAAGAAAGAAGAAGTGAAGGTGGA
GGTTGAAGACAAGAACATACTTCAGATAAGTGGAGAGAGGAGAAAGGAGAACGAAGAGAA
GGACGACAAGTGGCACCGTGTGGAGAGGGCAAGCGGGAAGTTTACGAGGAGGTTTAAGTT
GCCTGAGAATGCCAAGATGGAAGAAGTGAAGGCGACGATGGAGAACGGTGTGCTCACGGT
TACGGTGCCGAAAGCTCCTGAGAAGAAGCCTGAAATCAAGTCTATTGATATCTCTGGCTA
AGTTGTTGTCTCGATGAAAATGAAGAATGGATATTTGGTCTGTGGAATAAAAGGCGTGTT
TTTTTTTTTTT***TTTTTTTTTATAAAAGGCGTGTTTGCTTAAATGTTTGTCTGGTGTT
TTGGTTTGTTGTGTTTTGAAGTTGTTCCTTTCCCTGAAATCATGAATGTGGGATGTCGTT
AC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A386TF U 306
AF RS1B573TF U 52
AF RS1DY01TF U 51
AF RS1F610TF U 51
AF RS1B573JQ C 52
AF RS1A386TV U 1
BS 1 338 RS1A386TV
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BS 671 782 RS1A386TV

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TGCCGAAAGCTCCTGAGAAGAAGCCTGAAATCAAGTCTATTGATATCTCTGGCTAAGTTG
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QA 1 346 1 346
DS 

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GGCG
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QA 5 598 5 598
DS 

RD RS1DY01TF 642 0 0
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TCGCTAGATGCATGGGATCCATTCGAAGGATTCTTCACTCCTTCCGCGTTAGCAAACGCA
TCCGGTTCAACCGCTCGTGACATTGCAGCGTTTACAAACGCAATAGTGGACTGGAAGGAG
ACGCCGGAGGCGCACGTATCCAAAGCGGATCTGCCGGGGCTGAAGAAAGAAGAAGTGAAG
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GAGAAGGACAACAAGTGGCACCGTGTGGAGAGGGCAAGCGGGAAGTTTACGAGGAGGTTT
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GGCTAAGTTGTTGTCTCGATGAAAATGAAGAATGGATATTTGGTCTGTGGAATAAAAGGC
GTGTTTTTTTTTTTTT***TTTCTTTTT
TTTTTTTAT

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DS 

RD RS1F610TF 614 0 0
GGATC
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AAGTTGCCTGAGAATGCCAAGATGGAAGAAGTGAAGGCGACGATGGAGAACGGTGTGCTC
ACGGTTACGGTGCCGAAAGCTCCTGAGAAGAAGCCTGAAATCAAGTCTATTGATATCTCT
GGCTAAGTTGTTGTCTCGATGAAAATGAAGAATGGATATTTGGTCTGTGGAATAAAAGGC
GTGTTTTTT

QA 6 614 6 614
DS 

RD RS1B573JQ 705 0 0
GGCG
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TCGCTAGATGCATGGGATCCATTCGAAGGATTCTTCACTCCTTCCGCGTTAGCAAACGCA
TCCGGTTCAACCGCTCGTGACATTGCAGCGTTTACAAACGCAATAGTGGACTGGAAGGAG
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GAGAAGGACGACAAGTGGCACCGTGTGGAGAGGGCAAGCGGGAAGTTTACGAGGAGGTTT
AAGTTGCCTGAGAATGCCAAGATGGAAGAAGTGAAGGCGACGATGGAGAACGGTGTGCTC
ACGGTTACGGTGCCGAAAGCTCCTGAGAAGAAGCCTGAAATCAAGTCTATTGATATCTCT
GGCTAAGTTGTTGTCTCGATGAAAATGAAGAATGGATATTTGGTCTGTGGAATAAAAGGC
GTGTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTATAAAAGGCGTGTTTGCTTAAATGTTTGTCTG
GTGTTTTGGTTTGTTGTGTTTTGAAGTTGTTCCTTTCCC
CG

QA 5 703 5 703
DS 

RD RS1A386TV 782 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGCATCAGATC
AAAGAAACAAAAAGAAAACTAAAGAATCAAACCAAAGTCAAGTCACTTGAAACACACAAC
AATGTCTCTAGTCCCAAGCCTTTTCGGACGCAGGTCAAACGTTTTTGATCCCTTCTCGCT
AGATGCATGGGATCCATTCGAAGGATTCTTCACTCCTTCCGCGTTAGCAAACGCATCCGG
TTCAACCGCTCGTGACATTGCAGCGTTTACAAACGCAATAGTGGACTGGAAGGAGACGCC
GGAGGCGCACGTATTCAAAGCGGATCTGCCGGGGCTGAGGAAAGAAGAAGTGAAGGTGGA
GGTTGAAGACAAGAACATACTTCAGATAAGTGGAGAGAGGAGAAAGGAGAACGAAGAGAA
GGACGACAAGTGGCACCGTGTGGAGAGGGCAAGCGGGAAGTTTACGAGGAGGTTTAAGTT
GCCTGAGAATGCCAAGATGGAAGAAGTGAAGGCGACGATGGAGAACGGTGTGCTCACGGT
TACGGTGCCGAAAGCTCCTGAGAAGAAGCCTGAAATCAAGTCTATTGATATCTCTGGCTA
AGTTGTTGTCTCGATGAAAATGAAGAATGGATATTTGGTCTGTGGAATAAAAGGCGTGTT
TTTTTTTTTCT***TTTTTTTTTATAAAAGGCGTGTTTGCTTAAATGTTTGTCTGGTGTT
TTGGTTTGTTGTGTTTTGAAGTTGTTCCTTTCCCTGAAATCATGAATGTGGGATGTCGTT
AC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 5

CO CL1389Contig1 1336 5 15 U
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GACCAGATCACATGCTCTCTCAAGGAAAAAGATCCTGCATGTCGATGATGTCTGCAAAAA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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TGTAGCAACGACTACGTATCTCTACTATATTGTCACTGCCTCTTAGTCGTCCCAATGGCG
AATCTTTTGGAACTTCTCTAATGCCTACTTGGACGCTTGAGCCCTCAATCACACAAACAT
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GTTTTGCTATTCCATTTTGGAGGAAATCATCCACAGTCATGACTCCAGGTCTCATCTCTT
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CAGTATACCCCAGTGTTTTAGCAGCTCGAACAACTAGACTTAGAGGCCTTCCATCTTCAA
GCTCACTCATTACATATCCCAAGGTACCGCTCAAACTACCGACAATGCTATGAACAGGAT
CTCCGGATGAAATTATACGGTTCATGGATGCAATGACAAGAAGCCCAGCACCAACAGTGG
ATTCATG

QA 1 787 1 787
DS 

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AACAATCCTTGAAAATAAGGTTTTATTATTACTGTGATATGATGACCAGATCACATGCTC
TCTCAAGGAAAAAGATCCTGCATGTCGATGATGTCTGCAAAAACACCGGCTGCAGTTGTG
TCGTTCCCGGCTCCGGCACCTTGAATCACCAAAGGCTGCTCCTTGTAGCAACGACTACGT
ATCTCTACTATATTGTCACTGCCTCTTAGTCGTCCCAATGGCGAATCTTTTGGAACTTCT
CTAATGCCTACTTGAACGCTTGAGCCCTCAATCACACAAACATAACGAAGCACATACCCG
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TGGAGGAAATCATCCACAGTCATGACTCCAGGTCTCATCTCTTCAGGGTACAAGCTCTCT
ATCTTAATGCTATCCATAATTATCCTCTTCCCAAGAAGTCGAGCAAGAATCAAACCCTTT
CTAGCAACATCCATGCCACTAAGGTCATCACGTGGATCTGGTTCAGTATACCCCAGTGTT
TTAGCAGCTCGAACAACTAGACTTAGAGGCCTTCCATCTTCAAGCTCACTCATTACATAT
CCCAAGGTACCGCTCAAACTACCGACAATGCTATGAACAGGATCTCCGGATGAAATTATA
CGGTTCATGGATGCAATGACAGGAAGCCCAGCACCAACAGTGGAT

QA 1 765 1 765
DS 

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AGAATCAAACCCTTTCTAGCAACATCCATGCCACTAAGGTCATCACGTGGATCTGGTTCA
GTATACCCCAGTGTTTTAGCAGCTCGAACAACTAGACTTAGAGGC*TTCCATCTTCAAGC
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CCGGATGAAATTATACGGTTCATGGATGCAATGACAAGAAGCCCAGCACCAACAGTGGAT
TCATGGCGGATACGTCGAGGATCCAAAACCAATTTGTCATAATGTTCCAGTGTGGAAGTA
AGAGGCTTCTTATTTGCTAGGACAACACAGCAACCAAAGTCAACTGCCTTCATCAATATC
TCAACCGTTTCACTGCTGGCTGAGCAATCCACAACAACTAAGCCTGCAGATTTACCCAGA
AGTTGTGCAACTGCTTCTGTTTCTCTTCTTGACTCAGAACCACTGAACACACGATATTCA
CCTTTACCTAAAGCACCAAGCGTGGATAACGGAGAACCAGCAGATTTGAGACGGCAAACA
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AAAGAGACAATGTGTTGCAGAAGTTGTCGGCCAACGCCTCCACAGCCCATGAGAACCACC
GATATCTTCTTCATCCTTCCTTCCTTCCTTCTTTCTC
C

QA 1 817 1 817
DS 

RD RS1BU36TF 777 0 0
AGCAACATCCATGCCACTAAGGTCATCACGTGGATCTGGTTCAGTATACCCCAGTGTTT*
AGCAGCTCGAACAACTAGACTTAGAGGC*TTCCATCTTCAAGCTCACTCATTACATATCC
CAAGGTACCGCTCAAACTACCGACAATGCTATGAACAGGATCTCCGGATGAAATTATACG
GTTCATGGATGCAATGACAGGAAGCCCAGCACCAACAGTGGATTCATGGCGGATACGTCG
AGGATCCAAAACCAATTTGTCATAATGTTCCAGTGTGGAAGTAAGAGGCTTCTTATTTGC
TAGGACAACACAGCAACCAAAGTCAACTGCCTTCATCAATATCTCAACCGTTTCACTGCT
GGCTGAGCAATCCACAACAACTAAGCCTGCAGATTTACCCAGAAGTTGTGCAACTGCTTC
TGTTTCTCTTCTTGACTCAGAACCACTGAACACACGATATTCACCTTTACCTAAAGCACC
AAGCGTGGATAACGGAGAACCAGCAGATTTGAGACGGCAAACAACTGACAAGAGATCATC
ATCAAGTTCCTCTTTGACCACATCCACTGGAACAAGTAAGGATTTACTGTCACTGACTCC
AATCACCCGTATATGAACTCCCATTTTGGCGTGTAGGGATCGGAAAGAGACAATGTGTTG
CAGAAGTTGTCGGCCAACGCCTCCACAGCCCATGAGAACCACCGATATCTTCTTCATCCT
TCCTTCCTTCCTTCTTTCTCAGATTTCCTCAGCTTCGCTAGTATTGACTATGGCTCC

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 6

CO CL1390Contig1 725 6 2 U
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ATTCAAACTCCGTTTACATTAAAAGATATAGTTGAAGTCTCTTAACACTCATATAACTCT
GATTTAAGTTGGACAAAAAAGAAAGATGTTCTTTTGTTCACTGAAACTAGAGGGGGATAG
TATTGAGCAAAGAGGGATGATCAGACATAAACACCACTAGCAAGTAGCAAAAACAACGAT
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TTTTTCCTGGATGATGTAGCTTCATAGATGAAGAAGATAGCGGCGATGATGAGGCCGATC
GCAAGAGTGAACACCGACAGAGTCGGGTACATAGCCACCGGAATCGGACTCGTAATCGGA
ATTGCCGCCATTGTGTCGCTTAGCTTAGCTTATCTTCTTCGCTTCGATCTGAGAGGAACA
ATGAGCAGCAGCACTTTCGTTCGGGTCGGAACTTACCCGACAAGGAATTTCGCTACCTTA
GGACCGTTATCGTTACGGCCGCCGTTCACCGGGGCTTCGGTCGCCGGCTCCCCTGTCATC
AGGTCACCAACTTCCTTGACCTTCCGGCACTGGGCAGGCGTAAGCCCCCATACATGGTCT
TACGACTTTGCGGAGACCTGTGTTTTTGGTAAACAGTCGCCCGGGCCTGGTCACTGCGAC
CCCCC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 

AF RS1GE87JQ U 1
AF RS1FZ64JQ U 1
AF RS1FZ64TF C 1
AF RS1GE87TF C 1
AF RS1DI21JQ U 37
AF RS1DI21TF C 37
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BS 493 725 RS1DI21JQ

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CC

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ATGAGCAGCAGC
CC

QA 1 492 1 492
DS 

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TATTGAGCAAAGAGGGATGATCAGACATAAACACCACTAGCAAGTAGCAAAAACAACGAT
CCAAAACCCAAGAAAACAGATGCTACTGCTGCAGTCGCGAGCTCCTTCCCGAGGCTACGG
TTTTTCCTGGATGATGTAGCTTCATAGATGAAGAAGATAGCGGCGATGATGAGGCCGATC
GCAAGAGTGAACACCGACAGAGTCGGGTACATAGCCACCGGAATCGGACTCGTAATCGGA
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ATGAGCAGCAGC
CC

QA 1 492 1 492
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TCGCCCGGGCCTGGTCACTGCGACCCCCC

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DS 

RD RS1DI21TF 689 0 0
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TTCACTGAAACTAGAGGGGGATAGTATTGAGCAAAGAGGGATGATCAGACATAAACACCA
CTAGCAAGTAGCAAAAACAACGATCCAAAACCCAAGAAAACAGATGCTACTGCTGCAGTC
GCGAGCTCCTTCCCGAGGCTACGGTTTTTCCTGGATGATGTAGCTTCATAGATGAAGAAG
ATAGCGGTGATGATGAGGCCGATCGCAAGAGTGAACACCGACAGAGTCGGGTACATAGCC
ACCGGAATCGGACTCGTAATCGGACTTGCCGCCATTGTGTCGCTTAGCTTAGATTATCTT
CTTCGCTTCGATCTGAGAGGAACAATGAGCAGCAGCACTTTCGTTCGGGTCGGAACTTAC
CCGACAAGGAATTTCGCTACCTTAGGACCGTTATCGTTACGGCCGCCGTTCACCGGGGCT
TCGGTCGCCGGCTCCCCTGTCATCAGGTCACCAACTTCCTTGACCTTCCGGCACTGGGCA
GGCGTAAGCCCCCATACATGGTCTTACGACTTTGCGGAGACCTGTGTTTTTGGTAAACAG
TCGCCCGGGCCTGGTCACTGCGACCCCCC

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 6

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CCATCACAACCGCCATCGCCAGAACCAAGCTACACTCCCTCCAGTACTTGTCAACCTTCT
CCTTCATGGTTTTAGCTATGCCAGCTACATAAGGATCCTCTCCCGCTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 25 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 
40 25 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C552JQ U 42
AF RS1C552TF C 19
AF RS1FV63JQ U 61
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AF RS1BR22TF C 256
BS 1 62 RS1BR22JQ
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CCTGTTGTCTCCAATATGTAGTTGTCGAAATCAGACAGCCCGTCTGCCTCGGATGCTGGT
TTTAGCGGTGCGGGGAGTGCCATGTAC

QA 1 627 1 627
DS 

RD RS1C552TF 650 0 0
TTTTTTTTCG
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GGCGCAAATCAGAGCCTCCACAGTCTCAGGCCTCAGAGACGTCTTGTACTCATCCATCTC
CCTCGGTTCCATGTCAAACACATAGTCGAAGGCTGCAGCTGAGACCGGGATGGAGAGGAT
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QA 11 650 11 650
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GGA
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QA 4 661 4 661
DS 

RD RS1BR22JQ 833 0 0
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GGATTAAGACTAACCACACAAC***GTAGTAGAATAATACAACAAGGATTAGAGATAAAA
CGACGCAAAGTCCCAATGCTTAAGTAGTAGTAGGAAATAGCAAGGATTAGAGATAAACAA
AGCAACGTCCAAATGCTTTTAAGTAGTAGAAAACAACACGGATTATAGATACACAAACCA
AAGTCTCTCACCCCTAGGCTTCAGCGTTGACAACAGCACTCGACATTTGCTGAGAAGATG
CTGCTTCACTCTCAAGAAGCCACTCCCTGGCGCAAATCAGAGCCTCCACAGTCTCAGGCC
TCAGAGACGTCTTGTACTCATCCATCTCCCTCGGTTCCATGTCAAACACATAGTCGAAGG
CTGCAGCTGAAACCGGGATGGAGAGGATGTCTCTAGCCATCTTGCACAGTGTCGGGTACT
TGAGCTTGTTCTGTTTCCACCAGTCTAAAACATCAAACTCCTGAACACGAGGAAGCAGCG
TTTCGTCAAGGTACTGGTCCAGCTCTGACTTGAGGTTCTGCCCTGTTGTCTCCAGTATGT
AGTTGTCGAAATCAGACAGCCCGTCTGCCTCGGATGCTGGTTTTAGCGGTGCAGGGAGTG
CCATGTACTCGTTGAAGAGCTCGTGGATCCCATCATCAACGGTCTTGATGTTCTTCCCAG
CGTCTTCTCCGAATATCTTGGAGAAGCTGAACTCCACCAGCTTCATCTTGAACCGAGGAT
CCATCACAACCGCCATCGCCAGAACCAAGCTACACTCCCTCCAGTACTTGTCA

QA 1 833 1 833
DS 

RD RS1C560JQ 752 0 0
G
GTAGAATAATACAACAAGGATTAGAGATAAAACGACGCAAAGTCCCAATGCTTAAGTAGT
AGTAGGAAATAGCAAGGATTAGAGATAAACAAAGCAACGTCCAAATGCTTTTAAGTAGTA
GAAAACAACACGGATTATAGATACACAAACCAAAGTCTCTCACCCCTAGGCTTCAGCGTT
GACAACAGCACTCGACATTTGCTGAGAAGATGCTGCTTCACTCTCAAGAAGCCACTCCCT
GGCGCAAATCAGAGCCTCCACAGTCTCAGGCCTCAGAGACGTCTTGTACTCATCCATCTC
CCTCGGTTCCATGTCAAACACATAGTCGAAGGCTGCAGCTGAAACGGGGATGGAGAGGAT
GTCTCTAGCCATCTTGCACAGTGTCGGGTACTTGAGCTTGTTCTGTTTCCACCAGTCTAA
AACATCAAACTCCTGAACACGAGGAAGCAGCGTTTCGTCAAGGTACTGGTCCAGCTCTGA
CTTGAGGTTCTGCCCTGTTGTCTCCAGTATGTAGTTGTCGAAATCAGACAGCCCGTCTGC
CTCGGATGCTGGTTTTAGCGGTGCAGGGAGTGCCATGTACTCGTTGAAGAGCTCGTGGAT
CCCATCATCAACGGTCTTGATGTTCTTCCCAGCGTCTTCTCCGAATATCTTGGAGAAGCT
GAACTCCACCAGCTTCATCTTGAACCGAGGATCCATCACAACCGCCATCGCCAGAACCAA
GCTACACTCCCTCCAGTACTTGTCA
ACCTTC

QA 2 746 2 746
DS 

RD RS1BR22TF 635 0 0
AGGCTTCAGCGTTGACAACAGCACTCGACATTTGCTGAGAAGATGCTGCTTCACTCTCAA
GAAGCCACTCCCTGGCGCAAATCAGAGCCTCCACAGTCTCAGGCCTCAGAGACGTCTTGT
ACTCATCCATCTCCCTCGGTTCCATGTCAAACACATAGTCGAAGGCTGCAGCTGAGACCG
GGATGGAGAGGATGTCTCTAGCCATCTTGCACAGTGTCGGGTACTTGAGCTTGTTCTGTT
TCCACCAGTCTAAAACATCAAACTCCTGAACACGAGGAAGCAGCGTTTCGTCAAGGTACT
GGTCCAGCTCTGACTTGAGGTTCTGCCCTGTTGTCTCCAGTATGTAGTTGTCGAAATCAG
ACAGCCCGTCTGCCTCGGATGCTGGTTTTAGCGGTGCAGGGAGTGCCATGTACTCGTTGA
AGAGCTCGTGGATCCCATCATCAACGGTCTTGATGTTCTTCCCAGCGTCTTCTCCGAATA
TCTTGGAGAAGCTGAACTCCACCAGCTTCATCTTGAACCGAGGATCCATCACAACCGCCA
TCGCCAGAACCAAGCTACACTCCCTCCAGTACTTGTCAACCTTCTCCTTCATGGTTTTAG
CTATGCCAGCTACATAAGGATCCTCTCCCGCTATC

QA 1 635 1 635
DS 



AS 2 6

CO CL1392Contig1 869 4 9 U
GGAGGGGTTGTTTGGTTTACTTCCGTCGTCACTAAGAGGTTGTTGTTGTAACAGAGAGAA
AGAGAATCAAGACAAAGATGCCGGCGGCGAAGCAAAGGACCCCGAAAGTGAGCCGAAACC
CTGATCTGATAAGGGGTGTTGGCAAATACTCTCGTTCCCAAATGTACCACAAGAGAGGCT
TGTGGGCAATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCCAAACACGACGCTAAGTCCAAGG
TCCAAGCTTCCGTTGAGAAGCCACCCAAGTTTTACCCCGCTGAAGACGTTAAGAAGCCTC
TCGCCAACAGACGCAAGCCTAAGCCTACCAAGCTCAAGTCAAGCATTACTCCAGGAACTG
TGTTGATCATTCTTGCCGGTAGATTCAAGGGCAAGAGAGTTGTATTCCTCAAGCAGCTCT
CTTCTGGTTTGCTTTTGGTGACTGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTTCCACTGAGACGTG
TTAACCAGTCCTATGTGATTGGAACCTCCACAAAGGTTGACATTTCTGGAGTCAACGTTG
AGAAGTTCGATGACAAGTACTTCGGAAAGGTTGCTGAGAAGAAGAGCAAGAAAGGAGAAG
GCGAGTTCTTTGAAGCTGACAAAGAGGTGAAGAAAGAGATCCCACAGGAGAAGAAAGAAG
GCCAGAAAACCGTGGATGCAGCACTTATCAAAGC*ATTGAAGCGGTGCCAGAGCTCA*GA
CTTACCTCGGCGCCAGGTTCTCATTGTCTCAAGGAATGAAACCCCATGAGCTTGTTTTCT
AGATTTCATATCCCTTTTGTTTCAACAATATCTGTGTTTCCCCCTGAGAGATTTTGGTCA
TCTTTTATAAAAAACGTTATTTCTCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 5 5 20 20 20 20 5 20 20 20 5 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
5 30 30 15 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EO95TF U 2
AF RS1CL73TF U 1
AF RS1EL38TF U 5
AF RS1CL73JQ C 336
BS 1 691 RS1CL73TF
BS 692 693 RS1EL38TF
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BS 733 755 RS1EL38TF
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BS 766 774 RS1EL38TF
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AAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCCAAACACGACGCTAAGTCCAAGGTCCAAGCTTCC
GTCGAGAAGCCACCCAAGTTTTACCCCGCTGAAGACGTTAAGAAGCCTCTCGCCAACAGA
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CTTTTGGTGACTGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTTCCACTGAGACGTGTTAACCAGTCC
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GTGGATGCAGCACTTATC

QA 11 688 11 688
DS 

RD RS1CL73TF 732 0 0
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AGAGAATCAAGACAAAGATGCCGGCGGCGAAGCAAAGGACCCCGAAAGTGAGCCGAAACC
CTGATCTGATAAGGGGTGTTGGCAAATACTCTCGTTCCCAAATGTACCACAAGAGAGGCT
TGTGGGCAATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCCAAACACGACGCTAAGTCCAAGG
TCCAAGCTTCCGTTGAGAAGCCACCCAAGTTTTACCCCGCTGAAGACGTTAAGAAGCCTC
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TGTTGATCATTCTTGCCGGTAGATTCAAGGGCAAGAGAGTTGTATTCCTCAAGCAGCTCT
CTTCTGGTTTGCTTTTGGTGACTGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTTCCACTGAGACGTG
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GCGAGTTCTTTGAAGCTGACAAAGAGGTGAAGAAAGAGATCCCACAGGAGAAGAAAGAAG
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CTTACCTCGGCG

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1EL38TF 770 0 0
GGGTTGT
TTGGTTTACTTCCGTCGTCACTAAGAGGTTGTTGTTGTAACATAGAGAAAGAGAATCAAG
ACAAAGATGCCGGCGGCGAAGCAAAGGACCCCGAAAGTGAGCCGAAACCCTGATCTGATA
AGGGGTGTTGGCAAATACTCTCGTTCCCAAATGTACCACAAGAGAGGCTTGTGGGCAATC
AAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCCAAACACGACGCTAAGTCCAAGGTCCAAGCTTCC
GTTGAGAAGCCACCCAAGTTTTACCCCGCTGAAGACGTTAAGAAGCCTCTCGCCAACAGA
CGCAAGCCTAAGCCTACCAAGCTCAAGTCAAGCATTACTCCAGGAACTGTGTTGATCATT
CTTGCCGGTAGATTCAAGGGCAAGAGAGTTGTATTCCTCAAGCAGCTCTCTTCTGGTTTG
CTTTTGGTGACTGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTTCCACTGAGACGTGTTAACCAGTCC
TATGTGATTGGAACCTCCACAAAGGTTGACATTTCTGGAGTCAACGTTGAGAAGTTCGAT
GACAAGTACTTCGGAAAGGTTGCTGAGAAGAAGAGCAAGAAAGGAGAAGGCGAGTTCTTT
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GTGGATGCAGCACTTATCAAAGC*ATTGAAGCAGTGCCAGAGCTCA*GACTTACCTCGGC
GCCAGGTTCTCATTGTCTCAAGGA*TGAAACCC*ATGAGCTTG

QA 8 770 8 770
DS 

RD RS1CL73JQ 534 0 0
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AGAGTTGTATTCCTCAAGCAGCTCTCTTCTGGTTTGCTTTTGGTGACTGGACCGTTCAAG
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GAGAAGAAGAGCAAGAAAGGAGAAGGCGAGTTCTTTGAAGCTGACAAAGAGGTGAAGAAA
GAGATCCCACAGGAGAAGAAAGAAGGCCAGAAAACCGTGGATGCAGCACTTATCAAAGCC
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ATGAAACCCCATGAGCTTGTTTTCTAGATTTCATATCCCTTTTGTTTCAACAATATCTGT
GTTTCCCCCTGAGAGATTTTGGTCATCTTTTATAAAAAACGTTATTTCTCTTTT

QA 1 534 1 534
DS 



CO CL1392Contig2 746 2 3 U
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TATTGCTGAAACAAAAGGGATATGAAATCTAAAAAACAAGCTCATGGGGTTTCATTCCTT
GAGACAATGAAAACCTAGCGCCGAGGTAAGTCTTTAGCTCTGGCACTGCTTCAATGGCTT
TGATAAGTGCTGCATCCACCGTCTTCCGGTCTTCTTTCTTTTCCTGTGGGATCTCTTTCT
TCACCTCTTTGTCAGCTTCAAAGAACTCGCCTTCTCCTTTCTTGCTCTTCTTCTCAGCAA
CCTTTCCGAAGTACTTGTCATCGAACTTCTCAACGTTGACTCCAGAAATGTCAACCTTTG
TGGAGGTTCCAATCACATAGGACTGGTTAACACGTCTCAGTGGAACACCATTGATCTTGA
ACGGTCCAGTCACCAAAAGCAAACCAAAAAAGAGCTGCTTGAGGAAGACAACTCTCTTGC
CCTTGAATCTACCGGCAAGAATGATCAACACAGTTCCTGGAGCAATGCTTGACTTGAGCT
TGGTAGGCTTAGGCTTGCGTCTGTTGGCGAGAGGCTTCTTAACGTCTTCAGCGGGGTAAA
ACTTGGGTGGCTTCTCGACGGAAGCTTGGACCTTGGACTTAGCGTCGTGTTTGGGGAAAA
CGCCGCCGTTTTTGGCCTTGATTGCCCACAAGCCTCTCTTGTGGTACATTTGGGAACGAG
AGTATTTGCCAACACCCCTTATCAGA


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FC57JQ U 4
AF RS1EO95JQ U 1
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CCTCTTTGTCAGCTTCAAAGAACTCGCCTTCTCCTTTCTTGCTCTTCTTCTCAGCAACCT
TTCCGAAGTACTTGTCATCGAACTTCTCAACGTTGACTTCAGAAATGTCAACCTTTGTGG
AGGTTCCAATCACATAGGACTGGTTAACACGTCTCAGTGGAACACCATTGATCTTGAACG
GTCCAGTCACCAAAAGCAAACCA
AAA

QA 1 443 1 443
DS 

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GAGACAATGAAAACCTAGCGCCGAGGTAAGTCTTTAGCTCTGGCACTGCTTCAATGGCTT
TGATAAGTGCTGCATCCACCGTCTTCCGGTCTTCTTTCTTTTCCTGTGGGATCTCTTTCT
TCACCTCTTTGTCAGCTTCAAAGAACTCGCCTTCTCCTTTCTTGCTCTTCTTCTCAGCAA
CCTTTCCGAAGTACTTGTCATCGAACTTCTCAACGTTGACTCCAGAAATGTCAACCTTTG
TGGAGGTTCCAATCACATAGGACTGGTTAACACGTCTCAGTGGAACACCATTGATCTTGA
ACGGTCCAGTCACCAAAAGCAAACCAAAAAAGAGCTGCTTGAGGAAGACAACTCTCTTGC
CCTTGAATCTACCGGCAAGAATGATCAACACAGTTCCTGGAGCAATGCTTGACTTGAGCT
TGGTAGGCTTAGGCTTGCGTCTGTTGGCGAGAGGCTTCTTAACGTCTTCAGCGGGGTAAA
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CGCCGCCGTTTTTGGCCTTGATTGCCCACAAGCCTCTCTTGTGGTACATTTGGGAACGAG
AGTATTTGCCAACACCCCTTATCAGA

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 6

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AAATCGTCGCCCCCCCCATCCTCTCGAGGATATAGGACGGAAGCTGGTCTCCCGTGTGTT
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GTGAATTAAATTCCTCGTCATATCGTCGGTCGTTCCGGTCTAAAAGCTCTCGATGACCCA
AAGTCCTCAACGCGACCCCAGGTCAGGCGGGATCACCCGCTGAGTTTAAGCATATCAATA
AGCGGAGG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FO05JQ C 77
AF RS1FQ20JQ C 77
AF RS1FO05TF U 77
AF RS1FQ20TF U 77
AF RS1AM47JQ C 1
AF RS1AM47TF U 1
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DS 

RD RS1FQ20JQ 175 0 0
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QA 1 175 1 175
DS 

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QA 1 175 1 175
DS 

RD RS1FQ20TF 175 0 0
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QA 1 175 1 175
DS 

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AAATCGTCGTCCCCCCCATCCTCTCGAGGATATAGGACGGAAGCTGGTCTCCCGTGTGTT
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AGCGGAGG

QA 1 488 1 488
DS 

RD RS1AM47TF 488 0 0
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TTCTGAAATGTAAAGTCTATAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGAT
GAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGT
CTTTGAACGCAAGTTGCGCCCCAAGCCTTCTGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGTGTCAC
AAATCGTCGTCCCCCCCATCCTCTCGAGGATATAGGACGGAAGCTGGTCTCCCGTGTGTT
ACCGCACGCGGTTGGCCAAAATCCGAGCTAAGGATGCCAGGAGCGTCTTGACATGCGGTG
GTGAATTAAATTCCTCGTCATATCGTCGGTCGTTCCGGTCTAAAAGCTCTCGATGACCCA
AAGTCCTCAACGCGACCCCAGGTCAGGCGGGATCACCCGCTGAGTTTAAGCATATCAATA
AGCGGAGG

QA 1 488 1 488
DS 



AS 1 6

CO CL1394Contig1 1180 6 12 U
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TCCTCTGTTTCCTTCATGCTCCCAATGAAACTCCCCGTTATCACTTTCCTCCCAAGCATA
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ATATAATCCATTGAATCCGCCAATCCGTTCATCTTCGTTTGGTCGGATCCGATCACGTAA
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BQ
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AF RS1EG80JQ U 69
AF RS1EM47TF C 1
AF RS1EM47JQ U 10
AF RS1DB30JQ U 8
AF RS1EG80TF C 51
AF RS1DB30TF C 664
BS 1 10 RS1EM47TF
BS 11 504 RS1DB30JQ
BS 505 505 RS1EM47JQ
BS 506 642 RS1DB30JQ
BS 643 643 RS1EG80TF
BS 644 807 RS1DB30JQ
BS 808 808 RS1EG80TF
BS 809 821 RS1DB30JQ
BS 822 822 RS1EG80TF
BS 823 835 RS1DB30JQ
BS 836 861 RS1EG80TF
BS 862 1180 RS1DB30TF

RD RS1EG80JQ 245 0 0
T
TTTTATGCTCACAAACAAACATAAAATATTATCATCAGGTTTTGTAAAAAAGGACAAAAA
ATGTTTTATTTTCAAGTAACTCAAGCCTCAAGTTTGCTTCCTTCGACATCAACCACAAAC
CTATAACGCACATCGTTCTTCTCGAGTCTCTCAAACGCAGTGTTCACATAATCCATCTTC
ACAACTTCAATGATTGAACTCAAACCCTTCTCCTTACAAAACTCAAGCATCCCCTCTGTT
TCCT

QA 2 245 2 245
DS 

RD RS1EM47TF 577 0 0
TTTTTTTTTGCATACAAAGACGTTTTCATATAAGTATATGCTTTCACATGAAAAGCAGCG
ACAAATCAGTTTTATGCTCACAAACAAACATAAAATATTATCATCAGGTTTTGTAAAGAA
GGACAAAAGATGTTTTAGTTTCAAGTAACTCAAGCCTCAAGTTTGCTTCCTTCGACATCA
ACCACGAACCTATAACGCACATCGTTCTTCTCGAGTCTCTCAAACGCAGTGTTCACATAA
TCCATCTTCACAACTTCGATGATTGAACTCAAACCCTTCTCCTTACAGAACTCAAGCATC
TCCTCTGTTTCCTTCATGCTCCCAATGAAACTCCCCGTTATCACTTTCCTCCCAAGCATA
ACCATAGGAGTGAGAAACTGCAACGGATTGCTGATAACTCCCATGAGTATGAGTTTCCCA
TCAAGCCTAAGCAGAGACAAGTAAGGCTCAAGTGCATGATGGACAGGGACCGTATCGATT
ATATAATCCATTGAATCCGCCAATCCGTTCATCTTCGTTTGGTCGGATCCGATCACGTAA
TCATCGGCTCCAAGATCTTTCAAAGCCTCTTCTCTC
C

QA 1 576 1 576
DS 

RD RS1EM47JQ 568 0 0
G
CATACAAAGACGTTTTCATATAAGTATATGCTTTCACATGAAAAGCAGCGACAAATCAGT
TTTATGCTCACAAACAAACATAAAATATTATCATCAGGTTTTGTAAAGAAGGACAAAAGA
TGTTTTAGTTTCAAGTAACTCAAGCCTCAAGTTTGCTTCCTTCGACATCAACCACGAACC
TATAACGCACATCGTTCTTCTCGAGTCTCTCAAACGCAGTGTTCACATAATCCATCTTCA
CAACTTCGATGATTGAACTCAAACCCTTCTCCTTACAGAACTCAAGCATCTCCTCTGTTT
CCTTCATGCTCCCAATGAAACTCCCCGTTATCACTTTCCTCCCAAGCATAACCATAGGAG
TGAGAAACTGCAACGGATTGCTGATAACTCCCATGAGTATGAGTTTCCCATCAAGCCTAA
GCAGAAACAAGTAAGGCTCAAGTGCATGATGGACAGGGACCGTATCGATTATATAATCCA
TTGAATCCGCCAATCCGTTCATCTTCGTTTGGTCGGATCCGATCACGTAATCATCGGCTC
CAAGATCTTTCAAAGCCTCTTCTCTC
C

QA 2 567 2 567
DS 

RD RS1DB30JQ 832 0 0
GCT
CATACAAAGACGTTTTCATATAAGTATATGCTTTCACATGAAAAGCAGCGACAAATCAGT
TTTATGCTCACAAACAAACATAAAATATTATCATCAGGTTTTGTAAAGAAGGACAAAAGA
TGTTTTAGTTTCAAGTAACTCAAGCCTCAAGTTTGCTTCCTTCGACATCAACCACGAACC
TATAACGCACATCGTTCTTCTCGAGTCTCTCAAACGCAGTGTTCACATAATCCATCTTCA
CAACTTCGATGATTGAACTCAAACCCTTCTCCTTACAGAACTCAAGCATCTCCTCTGTTT
CCTTCATGCTCCCAATGAAACTCCCCGTTATCACTTTCCTCCCAAGCATAACCATAGGAG
TGAGAAACTGCAACGGATTGCTGATAACTCCCATGAGTATGAGTTTCCCATCAAGCCTAA
GCAGAGACAAGTAAGGCTCAAGTGCATGATGGACAGGGACCGTATCGATTATATAATCCA
TTGAATCCGCCAATTCGTTCATCTTCGTTTGGTCGGATCCGATCACGTAATCATCGGCTC
CAAGATCTTTCAAAGCCTCTTCTCTCTTCTTGTTTGATGAGCTTATGACAGTCACATGGT
GACCCATTGCTTTGGCTATTTTCACACCCATGTGACCAACTCCACCTAACCCTAGTATGC
CTCCTCTTAGGCCTGGTCGCTTCAGCCCGAAGTGAGCCAGTGGACTGTACACAGTCACAC
CGGCACACAGTAGTGGTGCCGCCTGCTCAACAGCCATTCCTTCTGGAATCTTCACCACAA
ACTTTTGGTGAACGACG*TGGCTCTAGCGAA*CCGCCTTGTGTAG
TTGA

QA 4 828 4 828
DS 

RD RS1EG80TF 812 0 0
AAAAGCAGCGACAAATCAGTTTTATGCTCACAAACAAACATAAAATATTATCATCAGGTT
TTGTAAAGAAGGACAAAAGATGTTTTAGTTTCAAGTAACTCAAGC*TCAAGTTTGCTTC*
TTCGACATCAACCACGAACCTATAACGCACATCGTTCTTCTCGAGTCTCTCAAACGCAGT
GTTCACATAATCCATCTTCACAACTTCGATGATTGAACTCAAACCCTTCTCCTTACAGAA
CTCAAGCATCTCCTCTGTTTCCTTCATGCTCCCAATGAAACTCCCCGTTATCACTTTCCT
CCCAAGCATAACCATAGGAGTGAGAAACTGCAACGGATTGCTGATAACTCCCATGAGTAT
GAGTTTCCCATCAAGCCTAAGCAGAGACAAGTAAGGCTCAAGTGCATGATGGACAGGGAC
CGTATCGATTATATAATCCATTGAATCCGCCAATTCGTTCATCTTCGTTTGGTCGGATCC
GATCACGTAATCATCGGCTCCAAGATCTTTCAAAGCCTCTTCTCTCTTCTTGTTTGATGA
GCTTATGACAGTCACATGGTGACCCATTGCTTTGGCTATTTTCACACCCATGCGACCAAC
TCCACCTAACCCTAGTATGCCTCCCCTTAGGCCTGGTCGCTTCAGCCCGAAGTGAGCCAG
TGGACTGTACACAGTCACACCGGCACACAGTAGTGGTGACGCCAGCTCAACAGCCATTCC
TTCTGGAATCTTCACCACAAACTTTTGGTGAACGACGGTGGCTCTAGCGAAACCGCCTTG
TGTAGGTTGACCATTGATGTAAACATCGTTG
C

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DS 

RD RS1DB30TF 517 0 0
AGTATGCCTCCTCTTAGGCCTGGTCGCTTCAGCCCGAAGTGAGCCAGTGGACTGTACACA
GTCACACCGGCACACAGTAGTGGTGCCGCCTGCTCAACAGCCATTCCTTCTGGAATCTTC
ACCACAAACTTTTGGTGAACGACGGTGGCTCTAGCGAAACCGCCTTGTGTAGGTTGACCA
TTGATGTAAACATCGTTGTAGCTCCAGATCTTCTTGGGACAATACTGTTCCAGATCTCTC
TCGCAGGGGCTACAACCTCCACAGCATCCAACGAGACAACCAACTCCAACTATATCCCCT
GCGGTGAACTTGCTCACACCTGATCCCACCTCCACCACTTCCCCAACAACCTCGTGCCCA
GGAACCATGGGGTAGTTTGACATGCCAAGATCGTTTTTGGTTTGATGAAGATCGGTGTGG
CAGATTCCACAGCATATGATTCTGATGTGCACATCCTCTGGTCCTGTCTCTCTGAGAGTG
TAAGTGTAAGGAGAGAGTAACCCAGATGGGTCTCTCG

QA 1 517 1 517
DS 



AS 1 6

CO CL1395Contig1 1406 6 13 U
GGGGGTGTCACAAGAGAGACAAGAGACAGAAAAGAGAGTTAAACAAGCATTCCCCGTTTG
ATCCAAGAAACTGTCATGATTCTTACAAAATGCTTGCCATTGATATGGCTATCTCTAGTA
AGTCTGTGTGCTGGTGGGAGAACATTATACCAACTCCCTGGTAAAGGAGTCAAAGATGCT
ACTAAGCAGCCGATTCAGACTTCACGTCCTTTTAACATCGCACACAGAGGTTCCAACGGA
GAGCTCCCAGAAGAAACTAAAGCTGCATACTTGAGAGCAATTGAAGAAGGTGCAGACTTC
ATAGAAACAGATATCTTATCATCCAAAGATGGTGTGCTTATCTGTTTCCATGATGTCGGC
CTTGACTTAACAACCGATGTTGCGAGTCACAAGGAGTTCGCTGATCGTAAGAGGACATAT
CAGGTCCAAGGTTTCAACATCACTGGCTTTTTCACCTTTGATTTTACTCTCAAGGAACTA
AAGACTCTACGGACAAAGCAGAGATATGCTTTTCGAGACCAGCAATACAACGGAAAGTAC
CCTATCATCACATTTGAAGAATTCCTTGCCATTGCTCAGGATGCTCCAAGAGTTGTCGGG
ATCTATCCTGAGATTAAAAATCCAGTTTTAATGAACCAACATGTCAAATGGCCTGGTGGT
AAGAGATTTGAGGATAAAGTTGTGGAGACTCTTAAGAAGCATGGGTACGGAGGCGCGTAT
TTGTCCAAGAAGTGGTTGAACAAACCCTTGTTTATTCAGTCATTTGCACCATCTTCACTC
GTGTACATATCAAACTTGACAGACTCACCGAAACTCTTGTTAATAGATGATGTTACCAGG
CCAACTCAAGATACTAACCAGACATACGCAGAGATCACCTCAGATGCCTATTTCACCTAC
ATTAAGGATTATGTGGTTGGGATTGGACCGTGGAAGGATACAGTAGTTCCAGTAACTAAC
AACTACATGCTAACCCCCACAGATTTGGTCAAAAGAGCTCACGCGCATAAGCTACAGGTG
CATCCATACACGTACAGAAATGAAAACCAGTTCCTACACTTTAACTTCAGCCAAGATCCA
TATCAAGAATACGAGTACTGGATCAAAGAGATTGGAGTTGATGGTCTCTTTACCGATTTC
ACCGGTAGCCTCCATAAATATCAAGAATGGGCGTCTCCGTTACCTGA***TGACACCACC
AAGTCTCGTCGTCAGCTCTTGAGTCATATTGCTTCTTTGGTCCGCCCTTATGCAAAGGCT
TGAAGCACCACGCTTCTATATAGTCTTTAATCTAACAGAAGAGTCTTTGAAGATTTAAAT
AAAAA*GTGAAAGACACAGATTTTATCCAAATTGTTATCTGTTTTACTTCACAAGATTTA
TACATTATAAGTCAAACGAAGTTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EJ62TF U 1
AF RS1FV04TF U 44
AF RS1FV04JQ C 636
AF RS1DK34JQ C 633
AF RS1DK34TF U 633
AF RS1EJ62JQ C 636
BS 1 119 RS1EJ62TF
BS 120 120 RS1FV04TF
BS 121 275 RS1EJ62TF
BS 276 276 RS1FV04TF
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BS 535 577 RS1EJ62TF
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BS 579 705 RS1EJ62TF
BS 706 1324 RS1DK34TF
BS 1325 1325 RS1DK34JQ
BS 1326 1345 RS1DK34TF
BS 1346 1406 RS1EJ62JQ

RD RS1EJ62TF 705 0 0
GGGGGTGTCACAAGAGAGACAAGAGACAGAAAAGAGAGTTAAACAAGCATTCCCCGTTTG
ATCCAAGAAACTGTCATGATTCTTACAAAATGCTTGCCATTGATATGGCTATCTCTAGTT
AGTCTGTGTGCTGGTGGGAGAACATTATACCAACTCCCTGGTAAAGGAGTCAAAGATGCT
ACTAAGCAGCCGATTCAGACTTCACGTCCTTTTAACATCGCACACAGAGGTTCCAACGGA
GAGCTCCCAGAAGAAACTAAAGCTGCATACTTGAGGGCAATTGAAGAAGGTGCAGACTTC
ATAGAAACAGATATCTTATCATCCAAAGATGGTGTGCTTATCTGTTTCCATGATGTCGGC
CTTGACTTAACAACCGATGTTGCGAGTCACAAGGAGTTCGCTGATCGTAAGAGGACATAT
CAGGTCCAAGGTTTCAACATCACTGGCTTTTTCACCTTTGATTTTACTCTCAAGGAACTA
AAGACTCTACGGACAAAGCAGAGATATGCTTTTCGAGACCAGCAATACAACGGGAAGTAC
CCTATCATCACATTTGAAGAATTCCTTGCCATTGCTCGGGATGCTCCAAGAGTTGTCGGG
ATCTATCCTGAGATTAAAAATCCAGTTTTAATGAACCAACATGTCAAATGGCCTGGTGGT
AAGAGATTTGAGGATAAAGTTGTGGAGACTCTTAAGAAGCATGGG

QA 1 705 1 705
DS 

RD RS1FV04TF 662 0 0
GGAAGCATT
CCCGTTTGATCCAAGAAACTGTCATGATTCTTACAAAATGCTTGCCATTGATATGGCTAT
CTCTAGTAAGTCTGTGTGCTGGTGGGAGAACATTATACCAACTCCCTGGTAAAGGAGTCA
AAGATGCTACTAAGCAGCCGATTCAGACTTCACGTCCTTTTAACATCGCACACAGAGGTT
CCAACGGAGAGTTCCCAGAAGAAACTAAAGTTGCATACTTGAGAGCAATTGAAGAAGGTG
CAGACTTCATAGAAACAGATATTTTATCATCCAAAGATGGTGTGCTTATCTGTTTCCATG
ATGTCGGCCTTGACTTAACAACCGATGTTGCGAGTCACAAGGAGTTCGCTGATCTTAAGA
GGACATATCAGGTCCAAGGTTTCAACATCACTGGCTTTTTCACCTTTGATTTTACTCTCA
AGGAACTAAAGACTCTACGGACAAAGCAGAGATATGCTTTTCGAGACCAGCAATACAACG
GAAAGTACCCTATCATCACATTTGAAGAATTCCTTGCCATTGCTCAGGATGCTCCAAGAG
TTGTCGGGATCTATCCTGAGATTAAAAATCCAGTTTTAATGAACCAACATGTCAAATGGC
CTGGTGGTAAGAGATTTGAGGATAAAGTTGTGGAGACTCTTAAGAAGCATGGG

QA 10 662 10 662
DS 

RD RS1FV04JQ 565 0 0
CCAACATGTCAAATGGCCTGGTGGTAAGAGATTTGAGGATAAAGTTGTGGAGACTCTTAA
GAAGCATGGGTACGGAGGCGCGTATTTGTCCAAGAAGTGGTTGAACAAACCCTTGTTTAT
TCAGTCATTTGCACCATCTTCACTCGTGTACATATCAAACTTGACAGACTCACCGAAACT
CTTGTTAATAGATGATGTTACCAGGCCAACTCAAGATACTAACCAGACATACGCAGAGAT
CACCTCAGATGCCTATTTCACCTACATTAAGGATTATGTGGTTGGGATTGGACCGTGGAA
GGATACAATAGTTCCAGTAACTAACAACTACATGCTAACCCCCACAGATTTGGTCAAAAG
AGCTCACGCGCATAAGCTACAGGTGCATCCATACACGTACAGAAATGAAAACCAGTTCCT
ACACTTTAACTTCAGCCAAGATCCATATCAAGAATACGAGTACTGGATCAAAGAGATTGG
AGTTGATGGTCTCTTTACCGATTTCACCGGTAGCCTCCATAAATATCAAGAATGGGCGTT
TCCGTTACCTGA
TGACACCACCAAG

QA 1 552 1 552
DS 

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TAAGAAGCATGGGTACGGAGGCGCGTATTTGTCCAAGAAGTGGTTGAACAAACCCTTGTT
TATTCAGTCATTTGCACCATCTTCACTCGTGTACATATCAAACTTGACAGACTCACCGAA
ACTCTTGTTAATAGATGATGTTACCAGGCCAACTCAAGATACTAACCAGACATACGCAGA
GATCACCTCAGATGCCTATTTCACCTACATTAAGGATTATGTGGTTGGGATTGGACCGTG
GAAGGATACAGTAGTTCCAGTAACTAACAACTACATGCTAACCCCCACAGATTTGGTCAA
AAGAGCTCACGCGCATAAGCTACAGGTGCATCCATACACGTACAGAAATGAAAACCAGTT
CCTACACTTTAACTTCAGCCAAGATCCATATCAAGAATACGAGTACTGGATCAAAGAGAT
TGGAGTTGATGGTCTCTTTACCGATTTCACCGGTAGCCTCCATAAATATCAAGAATGGGC
GTCTCCGTTACCTGA***TGACACCACCAAGTCTCGTCGTCAGCTCTTGAGTCATATTGC
TTCTTTGGTCCGCCCTTATGCAAAGGCTTGAAGCACCACGCTTCTATATAGTCTTTAATC
TAACAGAAGAGTCTTTGAAGATTTAAATAAAAA*GTGAAAGACACAGATTTTA
CC

QA 1 713 1 713
DS 

RD RS1DK34TF 716 0 0
GAACCAACATGTCAAATGGCCTGGTGGTAAGAGATTTGAGGATAAAGTTGTGGAGACTCT
TAAGAAGCATGGGTACGGAGGCGCGTATTTGTCCAAGAAGTGGTTGAACAAACCCTTGTT
TATTCAGTCATTTGCACCATCTTCACTCGTGTACATATCAAACTTGACAGACTCACCGAA
ACTCTTGTTAATAGATGATGTTACCAGGCCAACTCAAGATACTAACCAGACATACGCAGA
GATCACCTCAGATGCCTATTTCACCTACATTAAGGATTATGTGGTTGGGATTGGACCGTG
GAAGGATACAGTAGTTCCAGTAACTAACAACTACATGCTAACCCCCACAGATTTGGTCAA
AAGAGCTCACGCGCATAAGCTACAGGTGCATCCATACACGTACAGAAATGAAAACCAGTT
CCTACACTTTAACTTCAGCCAAGATCCATATCAAGAATACGAGTACTGGATCAAAGAGAT
TGGAGTTGATGGTCTCTTTACCGATTTCACCGGTAGCCTCCATAAATATCAAGAATGGGC
GTCTCCGTTACCTGA***TGACACCACCAAGTCTCGTCGTCAGCTCTTGAGTCATATTGC
TTCTTTGGTCCGCCCTTATGCAAAGGCTTGAAGCACCACGCTTCTATATAGTCTTTAATC
TAACAGAAGAGTCTTTGAAGATTTAAATAAAA**GTGAAAGACACAGATTTTA
CCA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RS1EJ62JQ 771 0 0
CCAACATGTCAAATGGCCTGGTGGTAAGAGATTTGAGGATAAAGTTGTGGAGACTCTTAA
GAAGCATGGGTACGGAGGCGCGTATTTGTCCAAGAAGTGGTTGAACAAACCCTTGTTTAT
TCAGTCGTTTGCACCATCTTCGCTCGTGTACATATCAAACTTGACAGACTCACCGAAACT
CTTGTTAATAGATGATGTTACCAGGCCAACTCAAGATACTAACCAGACATACGCAGAGAT
CACCTCAGATGCCTATTTCACCTACATTAAGGAGTATGTGGTTGGGATTGGACCGTGGAA
GGATACAATAGTTCCAGTAACTAACAACTACATGCTAACCCCCACAGATTTGGTCAAAAG
AGCTCACGCGCATAAGCTACAGGTGCATCCATACACGTACAGAAATGAAAACCAGTTCCT
ACACTTTAACTTCAGCCGAGATCCATATCAAGAATACGAGTACTGGATCAAAGAGATTGG
AGTTGATGGACTCTTTACCGATTTCACCGGTAGCCTCCATAAATATCAAGAATGGGCGTC
TCCGTTACCTGACAGTGACACCACCAAGTCTCGTCGTCAGCTCTTGAGTCATATTGCTTC
TTTGGTCCGCCCTTATGCAAAGGCTTGAAGCGCCACGCTTCTATATAGTCTTTAATCTAA
CAGAAGAGTCTTTGAAGATTTAAATAAAAAAGTGAAAGACACAGCTTTTATCCAAATTGT
TATCTGTTTTACTTCACAAGATTTATACATTATAAGTCAAACGAAGTTTGT

QA 1 771 1 771
DS 



AS 2 6

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GGTAAAATGTTAAATTTTATACCAATTTTAGTTTTTTGACAGCAATTACAGAGAAAACAA
AGAAAGCAGAGTAACCAAAACCTAAAACAAAGTAACAACAGGAAACAAAATGGTCACAAT
CAACAAGAACACATCTAAGCAATCTGGAAGATCCAACATGTAGAAACACCGATTCCAAAC
TAAAAGCTTGGACATTTGTGTTGTTGCCACAGATTCTAAGATCTTGAGTTTTCATCCTTG
TTGCCACGAGCACCACCACTCGAGGCCGCCCTCAAAACCTCGAACGCGGGTAGAGCCTAC
AGCTTCTCTAAAGACTAACACAAAAACGAAACAACTTCAAACAACAAGTTACAGCTAGCG
GCACATGAGTTTCTACGGGCAGTCAGAGCAGCCGCCTCCGACCACATCCTCAAGCTAAAG
TAGCCTCGAGAATCATCTCCCACAGATGCAACAAAGTCGCCAAAGCCTAATCGCCGCCTC
TATTCTACACTGTCCCCACCAGCGCTTCAATGGAACAAATCAAAGCTGAAGATGAACCAC
TTCAGGACCTGTGAAACCAAGCTAACAAAACACATACAACGCAAGAAACGGAGGAGCCAC
ACCGGAACCTACAGATCTGAGAAATCCAGAGAGTAAACACCAAAGACGGATCTCTGAAAT
CAAACCCTGTTGAAGCACCACCACCAGCCGTCGCCAGGGAGACCTCTCGCTGGAAGAACC
CAAACCCAACACTTCCGTCCTAGCCGCACCCGCGAAGGAGAAGCAACACGCATCAGAGGC
AGATGCCACCTAACCG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1FU48JQ U 15
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RD RS1CM60JQ 646 0 0
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TATTCTACACTGTCCCCACCAGCGCTTTAATGGAACAAATCAAAGCTGAAGATGAACCAC
TTCAGGACCTGTGAAACCAAGCTAACAAAACACATACAACGCAAGAAACGGAGGAGCCAC
ACCGGAACCTACAGATCTGAGAAATCCAGAGAGTAAACACCAAAGA

QA 1 646 1 646
DS 

RD RS1E421JQ 773 0 0
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GAAAGCAGAGTAACCAAAACCTAAAACAAAGTAACAACAGGAAACAAAATGGTCACAATC
AACAAGAACACATCTAAGCAATCTGGAAGATCCAACATGTAGAAACACCGATTCCAAACT
AAAAGCTTGGACATTTGTGTTGTTGCCACAGATTCTAAGATCTTGAGTTTTCATCCTTGT
TGCCACGAGCACCACCACTCGAGGCCGCCCTCAAAACCTCGAACGCGGGTAGAGCCTACA
GCTTCTCTAAAGACTAACACAAAAACGAAACAACTTCAAACAACAAGTTACAGCTAGCGG
CACATGAGTTTCTACGGGCAGTCAGAGCAGCCGCCTCCGACCACATCCTCAAGCTAAAGT
AGCCTCGAGAATCATCTCCCACAGATGCAACAAAGTCGCCAAAGCCTAATCGCCGCCTCT
ATTCTACACTGTCCCCACCAGCGCTTCAATGGAACAAATCAAAGCTGAAGATGAACCACT
TCAGGACCTGTGAAACCAAGCTAACAAAACACATACAACGCAAGAAACGGAGGAGCCACA
CCGGAACCTACAGATCTGAGAAATCCAGAGAGTAAACACCAAAGACGGATCTCTGAAATC
AAACCCTGTTGAAGCACCACCACCGGCCGTCGCCAGGGAGACCTCTCGCTGGAAGAACCC
AAACCCAACACTTCCGTCCTAGCCGCACCCGCGAAGGAGAAGCAACACGCATC

QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1FU48JQ 782 0 0
TTTTATACCAATTTTAGTTTTTTGACAGCAATTACAGAGAAAACAAAGAAAGCAGAGTAA
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CTAAGCAATCTGGAAGATCCAACATGTAGAAACACCGATTCCAAACTAAAAGCTTGGACA
TTTGTGTTGTTGCCACAGATTCTAAGATCTTGAGTTTTCATCCTTGTTGCCACGAGCACC
ACCACTCGAGGCCGCCCTCAAAACCTCGAACGCGGGTAGAGCCTACAGCTTCTCTAAAGA
CTAACACAAAAACGAAACAACTTCAAACAACAAGTTACAGCTAGCGGCACATGAGTTTCT
ACGGGCAGTCAGAGCAGCCGCCTCCGACCACATCCTCAAGCTAAAGTAGCCTCGAGAATC
ATCTCCCACAGATGCAACAAAGTCGCCAAAGCCTAATCGACGCCTCTATTCTACACTGTC
CCCACCAGCGCTCCAATGGAACAAATCAAAGCTGAAGATGAACCACTTCAGGACCTGTGA
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ATCTGAGAAATCCAGAGAGTAAACACCAAAGACGGATCTCTGAAATCCAACCCTGTTGAA
GCACCACCACCAGCCGTCGCCAGGGAGACCTCTCGCTGGAAGAACCCAAACCCAACACTT
CCGTCCTAGCCGCACCCGCGAAGGAGAAGCAACACGCATCAGAGGCAGATGCCACCTAAC
CG

QA 1 782 1 782
DS 



CO CL1396Contig2 680 3 5 U
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GAGAGGTCTCCCTGGCGACGGCTGGTGGTGGTGCTTCAACAGGGTTGGATTTCAGAGATC
CGTCTTTGGTGTTTACTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E421TF U 1
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CGAGTTATTTCTAAACTTTTGTATCTGTAGAGTTCGCCCTATTTCTTATTCTCTCCTAAC
CAGCCGCCTACTAAAAGTTTCGAACTTTTAAAGATTTGCTTCTTCGGTGGTTGGCCTCTG
TGCCTCCGTCCGGAGAGGCCTCCTCTCCTTTCTCTTTTTTTTACTTCATCGGCTTTCTTC
TCTGCTTATTCAGTTTTAGTAGAGAATACGAGAGGTCACGGGTTTGAAGCAGACTTTCCG
GTGATAGTTGCGGCAGATCTATCTGGTGTGGACGTGTGACATCTTTTGCGTCTCTCCGGC
GGGTTTTGCTGCTCCTATTAGTCTCATCTTTTTCCTTGTCCAAGATGAGATGGTGACATC
CATAGCCCCTCTGCTCTTTCATGGTGGTTGAGAGTTTGAGGACTGCTCTCTGATCCAGTC
AGATGCGGTGGATAAAGCTTTCGGTTTCACCTCGGTTAGGTGGCATCTGCCTCTGATGCG
TGTTGCTTCTCCTTCGCGGGTGCGGC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RS1FU48TF 601 0 0
GG
ATTTCTAAACTTTTGTATCTGTAGAGTTCGCCCTATTTCTTATTCTCTCCTAACCAGCCG
CCGACTAAAAGTTTCGAACTTTTAAAGATTTGCTTCTTCGGTGGTTGGCCTCTGTGCCTC
CGTCCGGAGAGGCCTCCTCTCCTTTCTCTTTTTTTTACTTCATCGGCTTTCTTCTCTGCT
TATTCAGTTTTAGTAGAGAATACGAGAGGTCACGGGTTTGAAGCAGACTTTCCGGTGATA
GTTGCGGCAGATCTATCTGGTGTGGACGTGTGACATCTTTTGCGTCTCTCCGGCGGGTTT
TGCTGCTCCTATTAGTCTCATCTTTTTCCTTGTCCAAGATGGGATGGTGACATCCATAGC
CCCTCTGCTCTTTCATGGTGGTTGAGAGTTTGAGGACTGCTCTCTGATCCAGTCAGATGC
GGTGGATAAAGCTTTCGGTTTCACCTCGGTTAGGTGGCATCTGCCTCTGATGCGTGTTGC
TTCTCCTTCGCGGGTGCGGCTAGGACGGAAGTGTTGGGTTTGGGTTCTTCCAGCGAGAGG
TCTCCCTGGCGACGGCTGGTGGTGGTGCTTCAACAGGGTTGGATTTCAGAGATCCGTCT

QA 3 601 3 601
DS 

RD RS1CM60TF 602 0 0
GG
GTATCTGTAGAGTTCGCCCTATTTCTTATTCTCTCCTAACCAGCCGCCGACTAAAAGTTT
CGAACTTTTAAAGATTTGCTTCTTCGGTGGTTGGCCTCTGTGCCTCCGTCCAGAGAGGCC
TCCTCTCCTTTCTCTTTTTTTTACTTCATCGGCTTTCTTCTCTGCTTATTCAGTTTTAGT
AGAGAATACGAGAGGTCACGGGTTTGAAGCAGACTTTCCGGTGATAGTTGCGGCAGATCT
ATCTGGTGTGGACGTGTGACATCTTTTGCGTCTCTCCGGCGGGTTTTGCTGCTCCTATTA
GTCTCATCTTTTTCCTTGTCCAAGATGAGATGGTGACATCCATAGCCCCTTTGCTCTTTC
ATGGTGGTTGAGAGTTTGAGGACTGCTCTCTGATCCAGTCAGATGCGGTGGATAAAGCTT
TCGGTTTCACCTCGGTTAGGTGGCAT*TGCCTCTGATGCGTGTTGTTTCTCCTTCGCGGG
TGCGGCTAGGACGGAAGTGTTGGGTTTGGGTTCTTCCAGCGAGAGGTCTCCCTGGCGACG
GCTGGTGGTGGTGCTTCAACAGGGTTGGATTTCAGAGATCCGTCTTTGGTGTTTACTCTC

QA 3 602 3 602
DS 



AS 1 5

CO CL1397Contig1 1257 5 17 U
GGCCATAGCTGAGCTCGACATCTACAAGTTCGAACCACCTGATTTACCCGAGAAGTCATG
CTTAAGGACTGGAGATCTTAAGTGGTACTTCTTCTGTCCGAGGCTTAAGAAGTATCCCAA
CGGCGATAAGGCAAACCGTTCTACTGAATCTGGTTACTGGAAGACCACAGGGAAAGATAG
AGATGTTACTTACAATGATGAGGTCGTTGGGAAAATCAGAACTCTGATTTTTCACTACGG
GAAGACGCCTCGTGGGGAACGTACCGACTGGGTTATACACGAGTACAGACTTGAAGACAG
AGCACTGGTACAGAGGAATATTCCTCAGGATACTTATGTGATTTGTAAACTCTTTAAGAA
GAAAGGACTTGGACCAAGGCATGGATCTGAATATGGAGCTCCATTTAAGGATGAGGATTG
GAGTGATGAGGAAGATATAGAGAGTCTTGTAGCTATTCCTGATCCTGGTCCTAACAAAGT
AACCAGTGTAGTTGCTTCGGCATCACGCTCGCATCCTCCAGAGGATTGTATCACTAGAGT
GATATCAGAATCTTGTGTCTCTGATGTACCGCAACTGACTGCCGCAGTGCTTCCACCTCT
AGCGAGTGATGTTGTAGCTCACACTCCCTTGTCTTCTTCTTCTTCTCCTCTTCTTGAGGT
TCCTCACGCAGTACAAGATGACGATGACTTTTATTCTATGCTGGATCTCTTTGTTGTTGA
TAGCGACGAGTCTTTACGTCTGGACGGATTCAACAACCAGTATGAGGTGAGACATGAGAC
TGGAGTTCCTGTTGTGGATGAAGCTCCTGTTTGCTTAGAAGATGTCGATATGAGCTGGAT
GCAAGGCGATGAGCTATTCATAGGCATAGAGGAACTGATTGAGCCATCCACTCCTCCCGC
TGCTCAGGCTGGTCATCCCGGTGCTTCATGAGTCTATACAGTCAGACTTAAAACCACTCT
GGTATTCATTGCTGTTTTGAGGATCCGTGTTGCTTTGATGCCATGGAAACAGAGACAAAA
AATTGTGAAGCTTTAACCAGAATGTTTTCTCTATCGCAAACTCTAGTGTGCACAAAAAGA
CAGACAATGTCATGACTCAGTAGTAGTAGCTTCTTTTTTTTAAGCAAACACAGTAGTAGT
AGCTTAACACCATGAGATGTTGAGCTAGCTTCTATGTTGTGTTTGCCTTAACTAGCATTC
ATCATCATCATCATCATCATCATCTATGTATCAGAAAAAATCATTTGAACTTGTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BS69TF U 60
AF RS1AL25TF U 1
AF RS1GA85TF U 315
AF RS1BS69JQ C 708
AF RS1AL25JQ C 735
BS 1 125 RS1AL25TF
BS 126 126 RS1BS69TF
BS 127 276 RS1AL25TF
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BS 735 735 RS1GA85TF
BS 736 765 RS1AL25TF
BS 766 766 RS1GA85TF
BS 767 819 RS1AL25TF
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BS 821 845 RS1AL25TF
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BS 1122 1257 RS1BS69JQ

RD RS1BS69TF 683 0 0
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GAGCACTGGTACAGAGGAATATTCCTCAGGATACTTATGTGATTTGTAAACTCTTTAAGA
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GGAGTGATGAGGAAGATATAGAGAGTCTTGTAGCTATTCCTGATCCTGGTCCTAACAAAG
TAACCAGTGTAGTTGCTTCGGCATCACGCTCGCATCCTCCAGAGGATTGTATCACTAGAG
TGATATCAGAATCTTGTGTCTCTGAGGTACCGCAACTGACTGCCGCAGTGCTTCCACCTC
TAGCGAGTGATGTTGTAGCTCACACTCCCTTGTCTTCTTCTTCTTCTCCTCTTCTTGAGG
TTCCTCACGCAGTACAAGATGACGATGACTTTTATTCTATGCTGGATCTCTTTGTTGTTG
ATAGCGACGAGTCTT
TACGTCTG

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1AL25TF 866 0 0
GGCCATAGCTGAGCTCGACATCTACAAGTTCGAACCACCTGATTTACCCGAGAAGTCATG
CTTAAGGACTGGAGATCTTAAGTGGTACTTCTTCTGTCCGAGGCTTAAGAAGTATCCCAA
CGGCGGTAAGGCAAACCGTTCTACTGAATCTGGTTACTGGAAGACCACAGGGAAAGATAG
AGATGTTACTTACAATGATGAGGTCGTTGGGAAAATCAGAACTCTGATTTTTCACTACGG
GAAGACGCCTCGTGGGGAACGTACCGACTGGGTTATGCACGAGTACAGACTTGAAGACAG
AGCACTGGTACAGAGGAATATTCCTCAGGATACTTATGTGATTTGTAAACTCTTTAAGAA
GAAAGGACTTGGACCAAGGCATGGATCTGAATATGGAGCTCCATTTAAGGATGAGGATTG
GAGTGATGAGGAAGATATAGAGAGTCTTGTAGCTATTCCTGATCCTGGTCCTAACAAAGT
AACCAGTGTAGTTGCTTCGGCATCACGCTCGCATCCTCCAGAGGATTGTATCACTAGAGT
GATATCAGAATCTTGTGTCTCTGATGTACCGCAACTGACTGCCGCAGTGCTTCCACCTCT
AGCGAGTGATGTTGTAGCTCACACTCCCTTGTCTTCTTCTTCTTCTCCTCTTCTTGAGGT
TCCTCACGCAGTACAAGATGACGATGACTTTTATTCTATGCTGGATCTCTTTGTTGTTGA
TAGCGACGAGTCTT*ACGTCTGGACGGATTCAACAACCAGTATGACGTGAGACATGAGAC
TGGAGTTCCTGTTGTGGATGAAGCTCCTGTTTGCTTAGA*GATGTCGATATGAGCTGGAT
GCAAG*CGATGAGCTATTCATAGGCA

QA 1 866 1 866
DS 

RD RS1GA85TF 589 0 0
TGTGACCTCTG
CAGGATACTTATGTGATTTGTAAACTCTTTAAGAAGAAAGGACTTGGACCAAGGCATGGA
TCTGAATATGGAGCTCCATTTAAGGATGAGGATTGGAGTGATGAGGAAGATATAGAGAGT
CTTGTAGCTATTCCTGATCCTGGTCCTAACAAAGTAACCAGTGTAGTTGCTTCGGCATCA
CGCTCGCATCCTCCAGAGGATTGTATCACTAGAGTGATATCAGAATCTTGTGTCTCTGAT
GTACCGCAACTGACTGCCGCAGTGCTTCCACCTCTAGCGAGTGATGTTGTAGCTCACACT
CCCTTGTCTTCTTCTTCTTCTCCTCTTCTTGAGGTTCCTCACGCAGTACAAGATGACGAT
GACTTTTATTCTATGCTGGATCTCTTTGTTGTTGATAGCGACGAGTCTTTACGTCTGGAC
GGATTCAACAACCAGTATGAGGTGAGACATGAGACTGGAGTTCCTGTTGTGGATGAAGCT
CCTGTTTGCTTAGAAGATGTCGATATGAGCTGGATGCAAGGCGATGAGCTATTCATAGGC
ATAGAGGAACTGATTGAGCCATCCACTCCTCCCGCTGC

QA 12 589 12 589
DS 

RD RS1BS69JQ 550 0 0
TCTTTGTTGTTGATAGCGACGAGTCTTTACGTCTGGACGGATTCAACAACCAGTATGAGG
TGAGACATGAGACTGGAGTTCCTGTTGTGGATGAAGCTCCTGTTTGCTTAGAAGATGTCG
ATATGAGCTGGATGCAAGGCGATGAGCTATTCATAGGCATAGAGGAACTGATTGAGCCAT
CCACTCCTCCCGCTGCTCAGGCTGGTCATCCCGGTGCTTCATGAGTCTATACAGTCAGAC
TTAAAACCACTCTGGTATTCATTGCTGTTTTGAGGATCCGTGTTGCTTTGATGCCATGGA
AACAGAGACAAAAAATTGTGAAGCTTTAACCAGAATGTTTTCTCTATCGCAAACTCTAGT
GTGCACAAAAAGACAGACAATGTCATGACTCAGTAGTAGTAGCTTCTTTTTTT*AAGCAA
ACACAGTAGTAGTAGCTTAACACCATGAGATGTTGAGCTAGCTTCTATGTTGTGTTTGCC
TTAACTAGCATTCATCATCATCATCATCATCATCATCTATGTATCAGAAAAAATCATTTG
AACTTGTGCT

QA 1 550 1 550
DS 

RD RS1AL25JQ 504 0 0
TACGTCTGGACGGATTCAACAACCAGTATGAGGTGAGACATGAGACTGGAGTTCCTGTTG
TGGATGAAGCTCCTGTTTGCTTAGAAGATGTCGATATGAGCTGGATGCAAGGCGATGAGC
TATTCATAGGCATAGAGGAACTGATTGAGCCATCCACTCCTCCCGCTGCTCAGGCTGGTC
ATCCCGGTGCTTCATGAGTTTATACAGTCAGACTTAAAACCACTTTGGTATTCATTGCTG
TTTTGAGGATCCGTGTTGCTTTGATGCCATGGAAACAGAGACAAAAAATTGTGAGGCTTT
AACCAGAATGTTTTTTTTATCGCAAACTTTAGTGTGCACAAAAAGACAGACAATGTCATG
ACTCAGTAGTAGTAGCTTTTTTTTTTTAAGCAAACACAGTAGTAGTAGCTTAACACCATG
AGATGTTGAGCTAGCTTTTATGTTGTGTTTGCCTTAACTAGCATTCATCATCATCATCAT
CATCATCATCTATGTATCAGAAAA

QA 1 504 1 504
DS 



AS 1 5

CO CL1398Contig1 707 5 28 U
GGACCTGCTGCTTGCATCTACCGTCGTCAAGCTGCTGGTAAACCATGGCGATGGCGGTGT
CTATCCTCCAAGCTTCTCCGCTTTCGGTGAATATCAACAAAAACGTGCGGATTCGTAGCT
CAGGGTTGGTCGGAGGAGGAATCAAAAGTCGAGATAGAGTCTCCTCGTTAAGTGCGGTGG
GGGTGGGATTGGGATTAGGATTGGATAGTCGAAAGCGATCTCTTTTGATATGCAACTCCG
CCGCTAACGCGAAGTGCAGTGAAAGTCAAGGTCAAACACAAACCGTTATTCGGGAGTCTC
CGACAATAACACAAGCTCCTGTCCACTCTAAGGAGAAATCACCAAGCTTGGATGATGGAG
GAGACGGGTTCCCACCGCGAGATGATGGAGATGGAGGTGGAGGTGGAGGGGG*TGGAGGC
AACTGGTCTGGTGGCTTCTTCTTCTTTGGTTTTCTCGCTTTCTTGGGTTTATTGAAGGAC
AAAGAGGGTGAGGAGGATTATCGAGGGAGCAGAAGACGATGATCATGTGTATACTTCATT
GGATTAGTGTGTTTCTTTTTTGAGAATCATATTTGCTTATCTTAGACCTGAAACATACAT
TGTCTCGTTTTGTATCTGTTTCGTTGAGCGGATCACTCCATATGATATGTACTGTATGTT
TCTTGTACCAAAGAGATGGTCGATTTTTAAGCTTTTTTTACTTATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 
30 30 30 30 30 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RS1EF60TF U 8
AF RS1GC15JQ C 1
AF RS1AR91JQ C 494
AF RS1GC15TF U 1
AF RS1AR91TFB U 494
BS 1 9 RS1GC15JQ
BS 10 18 RS1EF60TF
BS 19 19 RS1GC15TF
BS 20 36 RS1EF60TF
BS 37 39 RS1GC15TF
BS 40 57 RS1EF60TF
BS 58 58 RS1GC15TF
BS 59 79 RS1EF60TF
BS 80 80 RS1GC15TF
BS 81 148 RS1EF60TF
BS 149 149 RS1GC15TF
BS 150 150 RS1EF60TF
BS 151 151 RS1GC15TF
BS 152 182 RS1EF60TF
BS 183 183 RS1GC15TF
BS 184 250 RS1EF60TF
BS 251 251 RS1GC15TF
BS 252 412 RS1EF60TF
BS 413 413 RS1GC15TF
BS 414 422 RS1EF60TF
BS 423 423 RS1GC15TF
BS 424 482 RS1EF60TF
BS 483 483 RS1GC15TF
BS 484 523 RS1EF60TF
BS 524 524 RS1GC15TF
BS 525 660 RS1EF60TF
BS 661 667 RS1GC15TF
BS 668 707 RS1AR91TFB

RD RS1EF60TF 665 0 0
GG
GCTTGCATCCACCGTCGTCAAGCTGCT***AAACCATGGCGATGGCGGCGTCTATCCTCC
AAGCTTCTCCTCTTTCGGTGAATATCAACAAAAACGTGCGGATTCGTAGCTCAGGGTTGG
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TGGGATTAGGATTGGATAGTCGAAAGCGATCTCTTTTGATATGCAACTCCGCCGCTAACG
CCAAGTGCAGTGAAAGTCAAGGTCAAACACAAACCGTTATTCGGGAGTCTCCGACAATAA
CACAAGCTCCTGTCCACTCTAAGGAGAAATCACCAAGCTTGGATGATGGAGGAGACGGGT
TCCCACCGCGAGATGATGGAGATGGAGGTGGAGGTGGAGGGGGGTGGAGGCAATTGGTCT
GGTGGCTTCTTCTTCTTTGGTTTTCTCGCTTTCTTGGGTTTATTGAAGGACAAGGAGGGT
GAGGAGGATTATCGAGGGAGCAGAAGACGATGATGATGTGTATACTTCATTGGATTAGTG
TGTTTCTTTTTTGAGAATCATATTTGCTTATCTTAGACCTGAAACATACATTGTCTCGTT
TTGTATCTGTTTCGTTGAGCGGATCACTCCATATGATATGTACTGTATGTT
CTTGTACCCAAG

QA 3 653 3 653
DS 

RD RS1GC15JQ 703 0 0
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CTATCCTCCAAGCTTCTCCGCTTTCGGTGAATATCAACAAAAACGTGCGGATTCGTAGCT
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GGGTGGGATTGGGATTAGGATTGGATAGTCGAAAGCGATCTCTTTTGATATGCAACTCCG
CCGCTAACGCGAAGTGCAGTGAAAGTCAAGGTCAAACACAAACCGTTATTCGGGAGTCTC
CGACAATAACACAAGCTCCTGTCCACTCTAAGGAGAAATCACCAAGCTTGGATGATGGAG
GAGACGGGTTCCCACCGCGAGATGATGGAGATGGAGGTGGAGGTGGAGGGGG*TGGAGGC
AACTGGTCTGGTGGCTTCTTCTTCTTTGGTTTTCTCGCTTTCTTGGGTTTATTGAAGGAC
AAAGAGGGTGAGGAGGATTATCGAGGGAGCAGAAGACGATGATCATGTGTATACTTCATT
GGATTAGTGTGTTTCTTTTTTGAGAATCATATTTGCGTATCTTAGACCTGAAACATACAT
TGTCTCGTTTTGTATCTGTTTCGTTGAGCGGATCACTCCATATGATATGTACTGTATGTT
TCTTGTACCAAAGAGATGGTCGATTTTTAAGCTTTTTTTACTT

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1AR91JQ 173 0 0
G
GGATTATCGAGGGAGCAGAAGACGATGATCATGTGTATACTTCATTGGATTAGTGTGTTT
CTTTTTTGAGAATCATATTTGCTTATCTTAGACCTGAAACATACATTGTCTCGTTTTGTA
TCTGTTTCGTTGAGCGGATCACTCCATATGATATGTACTGTATGTTTCTTGT

QA 2 173 2 173
DS 

RD RS1GC15TF 667 0 0
GGACCTGCT
GCTTGCATCTACCGTCGTCAAGCTGCTGGTAAACCATGGCGATGGCGGTGTCTATCCTCC
AAGCTTCTCCGCTTTCGGTGAATATCAACAAAAACGTGCGGATTCGTAGCTCAGGGTTGG
TCGGAGGAGGAATCAAAAGTCGAGATAGAGTCTCCTCGTTAAGTGCGGTGGGGGTGGGAT
TGGGATTAGGATTGGATAGTCGAAAGCGATCTCTTTTGATATGCAACTCCGCCGCTAACG
CGAAGTGCAGTGAAAGTCAAGGTCAAACACAAACCGTTATTCGGGAGTCTCCGACAATAA
CACAAGCTCCTGTCCACTCTAAGGAGAAATCACCAAGCTTGGATGATGGAGGAGACGGGT
TCCCACCGCGAGATGATGGAGATGGAGGTGGAGGTGGAGGGGG*TGGAGGCAACTGGTCT
GGTGGCTTCTTCTTCTTTGGTTTTCTCGCTTTCTTGGGTTTATTGAAGGACAAAGAGGGT
GAGGAGGATTATCGAGGGAGCAGAAGACGATGATCATGTGTATACTTCATTGGATTAGTG
TGTTTCTTTTTTGAGAATCATATTTGCGTATCTTAGACCTGAAACATACATTGTCTCGTT
TTGTATCTGTTTCGTTGAGCGGATCACTCCATATGATATGTACTGTATGTTTCTTGTA

QA 10 667 10 667
DS 

RD RS1AR91TFB 214 0 0
G
GGATTATCGAGGGAGCAGAAGACGATGATCATGTGTATACTTCATTGGATTAGTGTGTTT
CTTTTTTGAGAATCATATTTGCTTATCTTAGACCTGAAACATACATTGTCTCGTTTTGTA
TCTGTTTCGTTGAGCGGATCACTCCATATGATATGTACTGTATGTTTCTTGTACCAAAGA
GATGGTCGATTTTTAAGCTTTTTTTACTTATAC

QA 2 214 2 214
DS 



AS 1 6

CO CL1399Contig1 664 6 6 U
GGGCGCAGACACTGTTTTCAGGTTCACTGGATTTCTAGGGTTTTCAACAATCTGAACAAA
TGGCGGATGAGGCTGCTAAGGCCGGGATCGTGAAAAAGAGAACGTTCAAGAAATTCGCCT
TCAAAGGAGTCGATCTCGATGCTCTTCTCGACATGTCTACTGATGATCTTGTCAAGCTCT
TCAGTTCCCGTATTCGCAGAAGGTTCTCTAGAGGGTTGACCAGGAAGCCTATGGCTTTGA
TCAAGAAATTGCGAAAAGCGAAAAGGGATGCGCCAGCTGGTGAGAAGCCAGAAGCAGTGA
GAACCCACCTAAGGAACATGATCATCGTGCCTGAAATGATTGGAAGCATCATTGGTGTAT
ACAACGGGAAGACATTTAACCAAGTCGAGATCAAACCAGAGATGATTGGTCATTACTTGG
CTGAGTTTTCAATCTCATATAAGCCTGTTAAGCATGGTAGGCCTGGTGTTGGTGCCACCA
ATTCCTCCAGGTTTATCCCTCTCAAGTGAATGATCTACTCTTATTATAGCCATGTGTTAA
TGCTCCAAAATAAGACTTTCGTTGTTTTTTTCTTTATAACGTTTTGTCTTTGTTTCTCTG
CTCTCCTTCAGATTTTGTTTAAATTCTTCATGCGTTTCAATAATACTTAGCATTTTTGAG
TATC


BQ
10 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 

AF RS1GA36TF U 1
AF RS1EG86JQ C 1
AF RS1EG86TF U 1
AF RS1BP52JQ C 2
AF RS1GA36JQ C 17
AF RS1BP52TF U 2
BS 1 1 RS1EG86JQ
BS 2 562 RS1GA36TF
BS 563 563 RS1EG86TF
BS 564 588 RS1GA36TF
BS 589 645 RS1EG86TF
BS 646 664 RS1BP52TF

RD RS1GA36TF 588 0 0
G
GGCGCAGACACTGTTTTCAGGTTCACTGGATTTCTAGGGTTTTCAACAATCTGAACAAAT
GGCGGATGAGGCTGCTAAGGCCGGGATCGTGAAAAAGAGAACGTTCAAGAAATTCGCCTT
CAAAGGAGTCGATCTCGATGCTCTTCTCGACATGTCTACTGATGATCTTGTCAAGCTCTT
CAGTTCCCGTATTCGCAGAAGGTTCTCTAGAGGGTTGACCAGGAAGCCTATGGCTTTGAT
CAAGAAATTGCGAAAAGCGAAAAGGGATGCGCCAGCTGGTGAGAAGCCAGAAGCAGTGAG
AACCCACCTAAGGAACATGATCATCGTGCCTGAAATGATTGGAAGCATCATTGGTGTATA
CAACGGGAAGACATTTAACCAAGTCGAGATCAAACCAGAGATGATTGGTCATTACTTGGC
TGAGTTTTCAATCTCATATAAGCCTGTTAAGCATGGTAGGCCTGGTGTTGGTGCCACCAA
TTCCTCCAGGTTTATCCCTCTCAAGTGAATGATCTACTCTTATTATAGCCATGTGTTAAT
GCTCCAAAATAAGACTTTCGTCGTTTTTTTCTTTATAACGTTTTGTC

QA 2 588 2 588
DS 

RD RS1EG86JQ 645 0 0
GGGCGCAGACACTGTTTTCAGGTTCACTGGATTTCTAGGGTTTTCAACAATCTGAACAAA
TGGCGGATGGGGCTGCTAAGGCCGGGATCGTGAAAAAGAGAACGTTCAAGAAATTCGCCT
TCAAAGGAGTCGATCTCGATGCTCTTCTCGACATGTCTACTGATGATCTTGTCAAGCTCT
TCAGTTCCCGTATTCGCAGAAGGTTCTCTAGAGGGTTGACCAGGAAGCCTATGGCTTTGA
TCAAGAAATTGCGAAAAGCGAAAAGGGATGCGCCAGCTGGTGAGAAGCCAGAAGCAGTGA
GAACCCACCTAAGGAACATGATCATCGTGCCTGAAATGATTGGAAGCATCATTGGTGTAT
ACAACGGGAAGACATTTAACCAAGTCGAGATCAAACCAGAGATGATTGGTCATTACTTGG
CTGAGTTTTCAATCTCATATAAGCCTGTTAAGCATGGTAGGCCTGGTGTTGGTGCCACCA
ATTCCTCCAGGTTTATCCCTCTCAAGTGAATGATCTACTCTTATTATAGCCATGTGTTAA
TGCTCCAAAATAAGACTTTCGTTGTTTTTTTCTTTATAACGTTTTGTCTTTGTTTCTCTG
CTCTCCTTCAGATTTTGTTTAAATTCTTCATGCGTTTCAATAATA

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1EG86TF 645 0 0
G
GGCGCAGACACTGTTTTCAGGTTCACTGGATTTCTAGGGTTTTCAACAATCTGAACAAAT
GGCGGATGGGGCTGCTAAGGCCGGGATCGTGAAAAAGAGAACGTTCAAGAAATTCGCCTT
CAAAGGAGTCGATCTCGATGCTCTTCTCGACATGTCTACTGATGATCTTGTCAAGCTCTT
CAGTTCCCGTATTCGCAGAAGGTTCTCTAGAGGGTTGACCAGGAAGCCTATGGCTTTGAT
CAAGAAATTGCGAAAAGCGAAAAGGGATGCGCCAGCTGGTGAGAAGCCAGAAGCAGTGAG
AACCCACCTAAGGAACATGATCATCGTGCCTGAAATGATTGGAAGCATCATTGGTGTATA
CAACGGGAAGACATTTAACCAAGTCGAGATCAAACCAGAGATGATTGGTCATTACTTGGC
TGAGTTTTCAATCTCATATAAGCCTGTTAAGCATGGTAGGCCTGGTGTTGGTGCCACCAA
TTCCTCCAGGTTTATCCCTCTCAAGTGAATGATCTACTCTTATTATAGCCATGTGTTAAT
GCTCCAAAATAAGACTTTCGTTGTTTTTTTCTTTATAACGTTTTGTCTTTGTTTCTCTGC
TCTCCTTCAGATTTTGTTTAAATTCTTCATGCGTTTCAATAATA

QA 2 645 2 645
DS 

RD RS1BP52JQ 663 0 0
GGCGCATACACTGTTTTCAGGTTCACTGGATTTCTAGGGTTTTCAACAATCTGAACAAAT
GGCGGATGAGGCTGCTAAGGCCGGGATCGTGAAAAAGAGAACGTTCAAGAAATTCGCCTT
CAAAGGAGTCGATCTCGATGCTCTTCTCGACATGTCTACTGATGATCTTGTCAAGCTCTT
CAGTTCCCGTATTCGCAGAAGGTTCTCTAGAGGGTTGACCAGGAAGCCTATGGCTTTGAT
CAAGAAATTGCGAAAAGCGAAAAGGGATGCGCCAGCTGGTGAGAAGCCAGAAGCAGTGAG
AACCCACCTAAGGAACATGATCATCGTGCCTGAAATGATTGGAAGCATCATTGGTGTATA
CAACGGGAAGACATTTAACCAAGTCGAGATCAAACCAGAGATGATTGGTCATTACTTGGC
TGAGTTTTCAATCTCATATAAGCCTGTTAAGCATGGTAGGCCTGGTGTTGGTGCCACCAA
TTCCTCCAGGTTTATCCCTCTCAATTGAATGATCTACTCTTATTATAGCCATGTGTTAAT
GCTCCAAAATAAGACTTTCGTTGTTTTTTTCTTTATAACGTTTTGTCTTTGTTTCTCTGC
TCTCCTTCAGATTTTGTTTAAATTCTTCATGCGTTTCAATAATACTTAGCATTTTTGAGT
ATC

QA 1 663 1 663
DS 

RD RS1GA36JQ 648 0 0
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TAAGGCCGGGATCGTGAAAAAGAGAACGTTCAAGAAATTCGCCTTCAAAGGAGTCGATCT
CGATGCTCTTCTCGACATGTCTACTGATGATCTTGTCAAGCTCTTCAGTTCCCGTATTCG
CAGAAGGTTCTCTAGAGGGTTGACCAGGAAGCCTATGGCTTTGATCAAGAAATTGCGAAA
AGCGAAAAGGGATGCGCCAGCTGGTGAGAAGCCAGAAGCAGTGAGAACCCACCTAAGGAA
CATGATCATCGTGCCTGAAATGATTGGAAGCATCATTGGTGTATACAACGGGAAGACATT
TAACCAAGTCGAGATCAAACCAGAGATGATTGGTCATTACTTGGCTGAGTTTTCAATCTC
ATATAAGCCTGTTAAGCATGGTAGGCCTGGTGTTGGTGCCACCAATTCCTCCAGGTTTAT
CCCTCTCAAGTGAATGATCTACTCTTATTATAGCCATGTGTTAATGCTCCAAAATAAGAC
TTTCGTCGTTTTTTTCTTTATAACGTTTTGTCTTTGTTTCTCTGCACTCCTTCAGATTTC
GTTTAAATTCTTCATGCGTTTCAATAATACTTAGCATTTTTGAGTATC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1BP52TF 663 0 0
GGCGCATACACTGTTTTCAGGTTCACTGGATTTCTAGGGTTTTCAACAATCTGAACAAAT
GGCGGATGAGGCTGCTAAGGCCGGGATCGTGAAAAAGAGAACGTTCAAGAAATTCGCCTT
CAAAGGAGTCGATCTCGATGCTCTTCTCGACATGTCTACTGATGATCTTGTCAAGCTCTT
CAGTTCCCGTATTCGCAGAAGGTTCTCTAGAGGGTTGACCAGGAAGCCTATGGCTTTGAT
CAAGAAATTGCGAAAAGCGAAAAGGGATGCGCCAGCTGGTGAGAAGCCAGAAGCAGTGAG
AACCCACCTAAGGAACATGATCATCGTGCCTGAAATGATTGGAAGCATCATTGGTGTATA
CAACGGGAAGACATTTAACCAAGTCGAGATCAAACCAGAGATGATTGGTCATTACTTGGC
TGAGTTTTCAATCTCATATAAGCCTGTTAAGCATGGTAGGCCTGGTGTTGGTGCCACCAA
TTCCTCCAGGTTTATCCCTCTCAATTGAATGATCTACTCTTATTATAGCCATGTGTTAAT
GCTCCAAAATAAGACTTTCGTTGTTTTTTTCTTTATAACGTTTTGTCTTTGTTTCTCTGC
TCTCCTTCAGATTTTGTTTAAATTCTTCATGCGTTTCAATAATACTTAGCATTTTTGAGT
ATC

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 6

CO CL1400Contig1 885 6 3 U
GAAGGAAAGAATAACATGAAATTAAGCCAAAATAATATCTCACAGGAAATAGATTCGGAT
GCAGAAGATACTGAATAATTTCAGCCAAAACACAAATATTCATAAGGTTTTTTTTTATAT
AGTTCATTGACCTCATTGCCTATATTACACTATTCCAAGGGAGAAGGCTAAAGCGATTTT
AAGGAGATGCAACCTCGAACACAATGCATTGCCAAAATGGAATAAGCAGAGACCTTCAAA
AACCAGCAACCGGATTTTGCATCTGAGAGGAGGTGACCTTTGTTTAAAGGAAGTAGTCAG
GTGTCCTTCGGGTCACATCTGGTTCTCCTCTCCTTGGGGCTGGTTCAAACTGAATGAAGG
TGTGGTTCCTGCAGTCATCGATCTCAAGAATAGAGGCCATGTTTCCACAGCGATAGCAAT
AGTTCGGTGCACTGAAGATAGTAACCACCTTTTGCTCGTGTGCCCAGTTGTATCCATCCA
TAACCAGCTGATGCGCTCGAGCGATAAGTTTTAAGCTGTTGCTGTGGTTGAATTGTTCGG
AAATGTCCTGACCAAATGTATATCCGGCACCACGAGGAGAGATTCCCCAGCCACATCTGT
CATCAGGATCAGACCATAGTAAGTCACACATGGGTCCTTCATGTGGAACTTCTTGAACTC
GGCCAAAGTTCCTAATGTTGTCAAGGGTCTCAATAGACGGTGACAATCCACCGTGCAGGC
AGAATATTTCCGACTCCACCAAGGCTGTCAGTGGGAAATAGTCAAAGAGGTCTGTAAATA
TCTTCCAAACATTGGCATTGCCATACTTTCGCAGGCATTCATCATAAAATCCATAAACCT
GAGTGATCAGACGACTTTCATGGTTTCCTCTAAGAATAGCCCCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A346JQ U 435
AF RS1A346TR U 443
AF RS1CJ40JQ U 1
AF RS1A346TV C 676
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AF RS1A346TF C 674
BS 1 681 RS1CJ40JQ
BS 682 846 RS1CJ40TF
BS 847 885 RS1A346TF

RD RS1A346JQ 144 0 0
AAGATAGTAACCACCTTTTGCTCGTGTGCCCAGTTGTATCCATCCATAACCAGCTGATGC
GCTCGAGCGATAAGTTTTAAGCTGTTGCTGTGGTTGAATTGTTCGGAAATGTCCTGACCA
AATGTATATCCGGCACCACGAGGA

QA 1 144 1 144
DS 

RD RS1A346TR 108 0 0
AACCACCTTTTGCTCGTGTGCCCAGTTGTATCCATCCATAACCAGCTGATGCGCTCGAGC
GATAAGTTTTAAGCTGTTGCTGTGGTTGAATTGTTCGGAAATGTCCTG

QA 1 108 1 108
DS 

RD RS1CJ40JQ 681 0 0
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GCAGAAGATACTGAATAATTTCAGCCAAAACACAAATATTCATAAGGTTTTTTTTTATAT
AGTTCATTGACCTCATTGCCTATATTACACTATTCCAAGGGAGAAGGCTAAAGCGATTTT
AAGGAGATGCAACCTCGAACACAATGCATTGCCAAAATGGAATAAGCAGAGACCTTCAAA
AACCAGCAACCGGATTTTGCATCTGAGAGGAGGTGACCTTTGTTTAAAGGAAGTAGTCAG
GTGTCCTTCGGGTCACATCTGGTTCTCCTCTCCTTGGGGCTGGTTCAAACTGAATGAAGG
TGTGGTTCCTGCAGTCATCGATCTCAAGAATAGAGGCCATGTTTCCACAGCGATAGCAAT
AGTTCGGTGCACTGAAGATAGTAACCACCTTTTGCTCGTGTGCCCAGTTGTATCCATCCA
TAACCAGCTGATGCGCTCGAGCGATAAGTTTTAAGCTGTTGCTGTGGTTGAATTGTTCGG
AAATGTCCTGACCAAATGTATATCCGGCACCACGAGGAGAGATTCCCCAGCCACATCTGT
CATCAGGATCAGACCATAGTAAGTCACACATGGGTCCTTCATGTGGAACTTCTTGAACTC
GGCCAAAGTTCCTAATGTTGT

QA 1 681 1 681
DS 

RD RS1A346TV 105 0 0
TGTTGTCAAGGGTCTCAATAGACGGTGACAATCCACCGTGCAGGCAGAATATTTCTGACT
CCACCAAGGCTGTCAGTGGGAAATAGTCAAAGAGGTCTGTAAATA

QA 1 105 1 105
DS 

RD RS1CJ40TF 739 0 0
TTTTTTTTATATAGT*CAT*GACCTCATTGCCTATAT*ACACTATTCCAAGGGAGAAGGC
TAAAGCGATTT*AAGGAGATGCAAC*TCGAACACAATGCATTGCCAAAATGGAATAAGCA
GAGACCTTCAAAAACCAGCAACCGGATTTTGCATCTGAGAGGAGGTGACCTTTGTTTAAA
GGAAGTAGTCAGGTGTCCTTCGGGTCACATCTGGTTCTCCTCTCCTTGGGGCTGGTTCAA
ACTGAATGAAGGTGTGGTTCCTGCAGTCATCGATCTCAAGAATAGAGGCCATGTTTCCAC
AGCGATAGCAATAGTTCGGTGCACTGAAGATAGTAACCACCTTTTGCTCGTGTGCCCAGT
TGTATCCATCCATAACCAGCTGATGCGCTCGAGCGATAAGTTTTAAGCTGTTGCTGTGGT
TGAATTGTTCGGAAATGTCCTGACCAAATGTATATCCGGCACCACGAGGAGAGATTCCCC
AGCCACATCTGTCATCAGGATCAGACCATAGTAAGTCACACATGGGTCCTTCATGTGGAA
CTTCTTGAACTCGGCCAAAGTTCCTAATGTTGTCAAGGGTCTCAATAGACGGTGACAATC
CACCGTGCAGGCAGAATATTTCCGACTCCACCAAGGCTGTCAGTGGGAAATAGTCAAAGA
GGTCTGTAAATATCTTCCAAACATTGGCATTGCCATACTTTCGCAGGCATTCATCATAAA
ATCCATAAACCTGAGTGA
C

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1A346TF 212 0 0
AA
TGTTGTCAAGGGTCTCAATAGACGGTGACAATCCACCGTGCAGGCAGAATATTTCCGACT
CCACCAAGGCTGTCAGTGGGAAATAGTCAAAGAGGTCTGTAAATATCTTCCAAACATTGG
CATTGCCATACTTTCGCAGGCATTCATCATAAAATCCATAAACTTGAGTGATCAGACGAC
TTTCATGGTTTCCTCTAAGAATAGCCCCGG

QA 3 212 3 212
DS 



AS 1 6

CO CL1401Contig1 1239 6 27 U
TTTTTTAGTTTTCCCCTCTCTGCGAAACCATATTATTAAAACCCTTCACAACCTCCCATT
ACTTCTTCCACCACCATCTTTCACGTTTCTAAAGGCTCCCTTCTGAATCGCCCATTTAAT
AGAGGTTTGAACCAGTTTCGATGGCAGTTGAAGCACACCATCTTAACCCTTTATTTTCTT
CTAACAGAGAAATGATGCAACCCGTTGAAGCAAACAGTTTATTCTATAACAACAACCAGA
TCCGATACAACACTCTTCCAGCGACTGCGATGCCATTTAACCCTACCATGGAATGTCAAA
CTTCTACGTTTAATCCCATTTACAACATCTCACCTGTTGACGGTTTGGTTCATCAGTCCA
TGAAGCCAACGATCCATTCCGTTGATAGCTCAGTTACATTCAACAGTGACAATAATAATG
GCAACAACGTTAATTATCTTCCTCCTGTGTCGTCTTTGAGAAAACGCCCCAGAGAAGAAT
CGGTTGTTGAAAACCCTATGCCAAGCCAGAAACGTTGCACTGATCCTCTCATGTTCCTAG
GACAAGACTTGTCTTCTAACATCCAACATCACAACTTAGATATCGATCGCTTGATCTCTA
ATCATGTAGAGATAATGAGAATGGGGATTGAAGAGAAGAGAAAACAGCAAGGTAGGAAGA
TAATGGAAGCGATTGAACAAGGGTTGATGAAGACACTTAGAGCCAAAGACGAAGAGATAA
ATCACATAGGCAAACTAAACCTCTTTCTTGAAGAGAAGGTTAAGTCTCTTAGTGTAGAGA
ATCAGTTATGGCGTGACATGGCACAGTCTAACGAAGCCACTGTAAACTCCCTAAGGTCCA
ATCTCCAACAAGTCCTCGCCGCTGTGGAACGTAACCGGTGGGAGGAGCCTACGACTGCTG
ATGACGCGCAGTCTTGTTGCGGAAGCAACGACAAGGGTGACAGTACTACGATGATGCGCA
CGGTTTCAAGTACGATGTGTAGAAGCTGTGGGAAAGGAGAAGCGAGTGTGTTACTGTTAC
CATGCAGACACATGTGCTTATGCAGTGTGTGTGGTTCTTCGATTAACACATGTCCAATCT
GTAAATCTCCAAAGAACGCTAGTCTCCATGTTAATCTTTCCTAACAATACTCGGTAAATT
GTAAATGTCCTAAAATAGTAAATAGTTGAAAACAGTATCAAAAATCCTGGTTTCTAAAAC
TGTACCAATAGTGTTGATGATGGAACACGAATCTTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FK32TF U 1
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AF RS1C559TF U 227
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TCCGATACAACACTCTTTCAGCGACTGCGATGCCATTTAACCCTACCATGGAATGTCAAA
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GCAACAACGTTAATTATCTTCCTCCTGTGTCGTCTTTGAGAAAACGCCCCAGAGAAGAAT
CGGTTGTTGAAAACCCTATGCCAAGCCAGAAACGTTGCACTGATCCTCTCATGTTCCTAG
GACAAGACTTGTCTTCTAACATCCAACATCACAACTTAGATATCGATCGCTTGATCTCTA
ATCATGTAGAGATAATGAGAATGG

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DS 

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GG
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TGAACCAGTTTCGATGGCAGTTGAAGCACACCATCTTAATCCTTTATTTTCTTCTAACAG
AGAAATGATGCAACCCGTTGAAGCAAACAGTTTATTCTATAACAACAACCAGATCCGATA
CAACACTCTTCCAGCGACTGCGATGCCATTTAACCCTACCATGGAATGTCAAACTTCTAC
GTTTAATCCCATTTACAACATCTCACCTGTTGACGGTTTGGTTCATCAGTCCATTAAGCC
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CGTTAATTATCTTCCTCCTGTGTCGTCTTTGAGAAAACGCCCCAGAGAAGAATCGGTTGT
TGAAAACCCTATGCCAAGCCAGAAACGTTGCACTGATCCTCTCATGTTCCTAGGACAAGA
CTTGTCTTCTAACATCCAACATCACAACTTAGATATCGATCGCTTGATCTCTAATCATGT
AGAGATAATGAGAATGGGGATTGAAGAGAAGAGAAAACAGTAAGGTAGGAAGATAATGGA
AGCGATTGAACAAGGGTTGATGAAGACACTTAGAGCCAAAGACGAAGAGATAAATCACAT
AG*CAAACTAAACCTCTTTCTTGAAGAGAAG*TTAAGTCTCTTAGTGTAGAGA*TCAGTT
ATGGCGTGACATGGCACAGTCTA
CGAGCCACTGTAACTC

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DS 

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G
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GTTCATCAGTCCATGAAGCCAACGATCCATTCCGTTGATAGCTCAGTTACATTCAACAGT
GACAATAATAATGGCAACAACGTTAATTATCTTCCTCCTGTGTCGTCTTTGAGAAAACGC
CCCAGAGAAGAATCGGTTGTTGAAAACCCTATGCCAAGCCAGAAACGTTGCACTGATCCT
CTCATGTTCCTAGGACAAGACTTGTCTTCTAACATCCAACATCACAACTTAGATATCGAT
CGCTTGATCTCTAATCATGTAGAGATAATGAGAATGTGGATTGAAGAGAAGAGAAAACAG
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CTTAGTGTAGAGAATCAGTTATGGCGTGACATGGCACAGTCTAACGAAGCCACTGTAAAC
TCCCTAATGTCCAATCTCCAACAAGTCCTCGCCGCTGTGGA*CGTAACCGGTGGGAGGAG
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DS 

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TCTTGAAGAGAAGGTTAAGTCTCTTAGTGTAGAGAATCAGTTATGGCGTGACATGGCACA
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CAACGACAAGGGTGACAGTACTACGATGATGCGCACGGTTTCAAGTACGATGTGTAGAAG
CTGTGGGAAAGGAGAAGCGAGTGTGTTACTGTTACCATGCAGACACATGTGCTTATGCAG
TGTGTGTGGTTCTTCGATTAACACGTGTCCAATCTGTAAATCTCCAAAGAACGCTAGTCT
CCATGTTAATCTTTCCTAACAATACTCGGTAAATTGTAAATGTCCTAAAATAGTAAATAG
TTGAAAACAGTATC

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DS 

RD RS1FK32JQ 649 0 0
CATGTT
CTAGGACAAGACTTGTCTTCTAACATCCAACATCACAACTTAGATATCGATCGCTTGATC
TCTAATCATGTAGAGATAATGAGAATGGGGATTGAAGAGAAGAGAAAACAGCAAGGTAGG
AAGATAATGGAAGCGATTGAACAAGGGTTGATGAAGACACTTAGAGCCAAAGACGAAGAG
ATCAATCACATAGGCAAAGTAAACCTCTTTCTTGAGGAGAAGGTTAAGTCTCTTAGTGTA
GAGAATCAGTTATGGCGTGACATGGCACAGTCTAACGAAGCCACAGTAAACTCCCTACGG
TCCAATCTCCAACAAGTCCTCGCAGCCGTGGAACGTAACCGGTGGGAGGAGCCTACGACT
GCTGATGACGCGCAGTCTTGTTGCGGAAGCAACGACGAGGGTGACAGTACTACGATGATG
CGCACGGTTACAAGTACGATGAGTAGAAGCTGTGGAAAAGGAGAAGCAAGTGTGTTACTG
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ATCTGTAAATCTCCAAAGAACGCCAGTCTCCATGTTAATCTTTCCTAACAATACTCAGTA
AATTGTAAATGTCCTAAAATAGTAAATAGTTGAAAACAGTATC

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DS 

RD RS1C559JQ 742 0 0
ATGCCAAGCCAGAAACGTTGCACTGATCCTCTCATGTTCTTAGGACAAGACTTGTCTTCT
AACATCCAACATCACAACTTAGATATCGATCGCTTGATCTCTAATCATGTAGAGATAATG
AGAATGTGGATTGAAGAGAAGAGAAAACAGCAAGGTAGGAAGATAATGGAAGCGATTGAA
CAAGGGTTGATGAAGACACTTAGAGCCAAAGACGAAGAGATAAATCACATAGGCAAACTA
AACCTCTTTCTTGAAGAGAAGGTTAAGTCTCTTAGTGTAGAGAATCAGTTATGGCGTGAC
ATGGCACAGTCTAACGAAGCCACTGTAAACTCCCTAAGGTCCAATCTCCAACAAGTCCTC
GCCGCTGTGGAACGTAACCGGTGGGAGGAGCCTACGACTGCTGATGACGCGCAGTCTTGT
TGCGGAAGCAACGACAAGGGTGACAGTACTACGATGATGCGCACGGTTTCAAGTACGATG
TGTAGAAGCTGTGGGAAAGGAGAAGCGAGTGTGTTACTGTTACCATGCAGACACATGTGC
TTATGCAGTGTGTGTGGTTCTTCGATTAACACATGTCCAATCTGTAAATCTCCAAAGAAC
GCTAGTCTCCATGTTAATCTTTCCTAACAATACTCGGTAAATTGTAAATGTCCTAAAATA
GTAAATAGTTGAAAACAGTATCAAAAATCCTGGTTTCTAAAACTGTACCAATAGTGTTGA
TGATGGAACACGAATCTTTGAC

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 6

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TTCTCCGCCTATGTCGATCTCTCTCCCCGATCAATTCCCCGATTCCGTTCATCCAATCCG
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AGGGATATCCTTGGCTCTTATGCTGTGTGGATCCGTGACCTTCTTCATTGGTTTCCTCTT
GTTGCCTTGGGTGCTTGCTCTGATCACCGTTTTCTACGTTGCTGGGATCGTTTCAGCCAT
TTCCTTGGCGGGGAGGTCGGTGCTCTTTTACGTCTTCACGCCACCTTCCTCCTCCAGGAA
GGAGATTTCTGATTGGAAGCTTTTGTGATGTGACGATGGGGACTTGCAAAACGCCCTATT
ATATCATCTGGCCTTCTGGTGAAGCAGGACAACAAAAGATGGATTGATTATAAGACGCAA
CAGTCCAATTAGAGTTTTTATTTCTTCTTTTTATATAGTACTACTATGTATTCTCGGAGG
GTTGGATAAAAAGCATGTGGATATTTGGG*AGTTTTTATAATCTTTTAGAGTTATAGAAA
CCTTTCTGATATTTTCGTGACAAAAAAAAAAAAAGAAACCTTTCTGATATGTACTTTTAT
TTCCATGGATGGTTTTATTATGTTACATGATTTTCTTAAAATATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E391TF U 1
AF RS1GF70TF U 22
AF RS1GF70JQ C 95
AF RS1A534TF U 242
AF RS1E391JQ C 399
AF RS1A534JQ C 317
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RD RS1E391TF 448 0 0
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AGGGATATCCTTGGCTCTTATGCTGTGTAGATCCGTGACCTTCTTCATTGGTTTCCTCTT
GTTGCCTTGGGTGCTTGCTCTGATCACC

QA 1 448 1 448
DS 

RD RS1GF70TF 653 0 0
G
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CTCCCCGATCAATTCCCCGATTCCGTTCATCCAATCCGGCCTCGTTATTCGTCGGCGGCG
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ATCACCGTTTTCTACGTTGCTGGGATCGTTTCAGCCATTTCCTTGGCGGGGAGGTCGGTG
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T*GTGATGTGACGATGGGGACTTGCAAAACGCCCTATTATATCATCTGGCCTTCTGGTGA
AGCAG*ACAACAAAAGATGGATTGATTATAAGACGCAACAGTCCAATTAGAG

QA 2 653 2 653
DS 

RD RS1GF70JQ 729 0 0
AGCAAATCGCCATTAATTTACCCGAAATAGTAAGTGTTTCGAAATTACAACAGTGGGATT
TTTTTTT*GGTGATGATGAGAAGACAACGAGATGAAGAGTCCAGGGCTTTCCACGACCTA
TCGGCTCTTGTCCTGAGTCTCCTCCGTTCTCCGCCTATGTCGATCTCTCTCCCCGATCAA
TTCCCCGATTCCGTTCATCCAATCCGGCCTCGTTATTCGTCGGCGGCGACGCAGATATCT
CCGTCGGGATTCGCGTCGCTGCTTCTAGGGATATCCTTGGCTCTTATGCTGTGTGGATCC
GTGACCTTCTTCATTGGTTTCCTCTTGTTGCCTTGGGTGCTTGCTCTGATCACCGTTTTT
TACGTTGCTGGGATCGTTTCAGCCATTTCCTTGGCGGGGAGGTCGGTGCTCTTTTACGTC
TTCACGCCACCTTCCTCCTCCAGGAAGGAGATTTCTGATTGGAAGCTTT*GTGATGTGAC
GATGGGGACTTGCAAAACGCCCTATTATATCATCTGGCCTTCTGGTGAAGCAGGACAACA
AAAGATGGATTGATTATAAGACGCAACAGTCCAATTAGAGTTTTTATTTCTTCTTTTTAT
ATAGTACTACTATGTATTCTCGGAGGGTTGGATAAAAAGCATGTGGATATTTGGG*AGTT
TTTATAATCTTTCAGAGTTATAGAAACCTTTCTGATATTTTCGTGACAAAAAAAAAA
GAAACCTTTCCG

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1A534TF 644 0 0
TCTCCGCCTATGTCGAACTCTCTCCCCGATCAATTCCCCGATTCCGTTCATCCAATCCGG
CCTCGTTATTCGTCGGCGGCGACGCAGATATCTCCGTCGGGATTCGCGTCGCTGCTTCTA
GGGATATCCTTGGCTCTTATGCTGTGTGGATCCGTGACCTTCTTCATTGGTTTCCTCTTG
TTGCCTTGGGTGCTTGCTCTGATCACCGTTTTCTACGTTGCTGGGATCGTTTCAGCCATT
TCCTTGGCGGGGAGGTCGGTGCTCTTTTACGTCTTCACGCCACCTTCCTCCTCCAGGAAG
GAGATTTCTGATTGGAAGCTTTTGTGATGTGACGATGGGGACTTGCAAAACGCCCTATTA
TATCATCTGGCCTTCTGGTGAAGCAGGACAACAAAAGATGGATTGATTATAAGACGCAAC
AGTCCAATTAGAGTTTTTATTTCTTCTTTTTATATAGTACTACTATGTATTCTCGGAGGG
TTGGATAAAAAGCATGTGGATATTTGGGGAGTTTTTATAATCTTTTAGAGTTATAGAAAC
CTTTCTGATATTTTCGTGACAAAAAAAAAAAAAGAAACCTTTCTGATATGTACTTTTATT
TCCATGGATGGTTTTATTATGTTACATGATTTTCTTAAAATATG

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1E391JQ 479 0 0
CCTTCTTCATTGGTTTCCTCTTGTTGCCTTGGGTGCTTGCTCTGATCACCGTTTTCTACG
TTGCTGGGATCGTTTCAGCCATTTCCTTGGCGGGGAGGTCGGTGCCCTTTTACGTCTTCA
CGCCACCTTCCTCCTCCAGGAAGGAGATTTCTGATTGGAAGCTTTTGTGATGTGACGATG
GGGACTTGCAAAACGCCCTATTATATCATCTGGCCTTCTGGTGAAGCAGGACAACAAAAG
ATGGATTGATTATAAGACGCAACAGTCCAATTAGAGTTTTTATTTCTTCTTTT*ATATAG
TACTACTATGTATTCTCGGAGGGTTGGATAAAAAGCATGTGGATATTTGGG*AGTTTTTA
TAATCTTTTAGAGTTATAGAAACCTTTCTGATATTTTCGTGACAAAAAAAAAAA**GAAA
CCTTTCTGATTTGTACTTTTATTTCCATGGATGGTTTTATTATGTTACATGATTTTCTT

QA 1 479 1 479
DS 

RD RS1A534JQ 561 0 0
GCGGCGACGCAGATATTTCCGTCGGGATTCGCGTCGCTGCTTCTAGGGATATCCTTGGCT
CTTATGCTGTGTGGATCCGTGACCTTTTTCATTGGTTTCCTCTTGTTGCCTTGGGTGCTT
GCTTTGATCACCGTTTTTTACGTTGCTGGGATCGTTTCAGCCATTTCCTTGGCGGGGAGG
TCGGTGCTTTTTTACGTCTTCACGCCACCTTCCTCCTCCAGGAAGGAGATTTTTGATTGG
AAGCTTTTGTGATGTGACGATGGGGACTTGCAAAACGCCCTATTATATCATCTGGCCTTC
TGGTGAAGCAGGACAACAAAAGATGGATTGATTATAAGACGCAACAGTCCAATTAGAGTT
TTTATTTTTTCTTTTTATATAGTACTACTATGTATTCTCGGAGGGTTGGATAAAAAGCAT
GTGGATATTTGGG*AGTTTTTATAATCTTTTAGAGTTATAGAAACCTTTTTGATATTTTC
GTGACAAAAAAAAAAAAAGAAACCTTTCTGATATGTACTTTTATTTCCTTGGATGGTTTT
ATTATGTTACATGATTTTCTT

QA 1 561 1 561
DS 



AS 1 6

CO CL1403Contig1 921 6 11 U
GGACACAGACACAAAAAAAAAAAGAGAAAGAGATCACGATATAAACATCTTCTCTTTCAT
TTCGTGTCTGTTTCAGTTGTGTGTGTTCGGAAGAATATTATGATGGATAGAGTTGAATCA
TATGTGTTCAATATCTCCGGTGATAATCTATATCACTCTTCTTCTTCAGAGTCTTCTTCC
ATCGGGAGGAACAGCGACGACGAAGAAGACGAAGAGTGTCACGGCGGTGACGCGGAAGAG
AACGAAGCAGAGTCTCCGTACAAAGGCCCTCTTGATCTGATGGAATCACTAGAAGAAGTC
TTACCCGTTAGGAAAGGGATATCGAGTTTTTACAACGGAAAGTCAAAGTCTTTCACGAAC
CTAGCGGCTGCGTCGGCGTTGACTTCTTCATCGTCGATGAAGGACTTGGCAAAGCCGGAG
AATCCTTACAGCCGGAGGAGGAGGAATCTCCTCTGCCATCAGATTTGGGAGAACAATAAA
TCGGCTCCACGTGGCGGGATCTCGAAGAAACACGTCATGAGCTCGAGCAGGAGCGCGTTG
ACGCTCGCCGTGGCGGTTGCAGCCGGAGAAGGATCTTCATCCGGTGAAGACTCGTCGTCG
GGGTCAAGTCCGACGAACTCTGGATCTCCTCCTCCGAGGCAGAGACATCATCATCAGATT
ATGACGATGCTTCCTCCGTTGTATCCTAGTAGTAGGAGTCATCAAGGGTCTTTTGGTAAT
TTGAAGTCGTCTCAATCGTCGTTGGAGTTTTGTGCCTTGAGATCGTCTTCGGTTGCTGAT
ATTTCGAGGTGTCTTGGGTCCAATTGAATCGTAGTGGACGATAGATAGCATTTGTTTACT
TGAAACTTTGTTTTTTAACCCTGTTAACATCCGGAGAATGTATAGACGAGTTTCAAACTT
TTAAATGGATCTACAACTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C931TF U 1
AF RS1E250TF U 6
AF RS1E250JQ C 53
AF RS1DE03JQ C 228
AF RS1DE03TF U 77
AF RS1C931JQ C 276
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BS 75 75 RS1E250TF
BS 76 530 RS1C931TF
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BS 851 898 RS1E250JQ
BS 899 921 RS1C931JQ

RD RS1C931TF 546 0 0
GGACACAGACACAAAAAAAAAAAGAGAAAGAGATCACGATATAAACATCTTCTCTTTCAT
TTCGTGTCTGTTTCTGTTGTGTGTGTTCGGAAGAATATTATGATGGATAGAGTTGAATCA
TATGTGTTCAATATCTCCGGTGATAATCTATATCACTCTTCTTCTTCAGAGTCTTCTTCC
ATCGGGAGGAACAGCGACGACGAAGAAGACGAAGAGTGTCACGGCGGTGACGCGGAAGAG
AACGAAGCAGAGTCTCCGTACAAAGGCCCTCTTGATCTGATGGAATCACTAGAAGAAGTC
TTACCCGTTAGGAAAGGGATATCGAGTTTTTACAACGGAAAGTCAAAGTCTTTCACGAAC
CTAGCGGCTGCGTCGGCGTTGACTTCTTCATCGTCGATGAAGGACTTGGCAAAGCCGGAG
AATCCTTACAGCCGGAGGAGGAGGAATCTCCTCTGCCATCAGATTTGGGAGAACAATAAA
TCGGCTCCACGTGGCGGGATCTCGAAGAAACACGTCATGAGCTCGAGCAG
AGCGCGTGACGCTCGC

QA 1 530 1 530
DS 

RD RS1E250TF 705 0 0
GGAGACAC
AAAAAAAAAAG*GAAAGAGATCACGATATAAACATCTTCTCTTTCATTTCGTGTCTGTTT
CAGTTGTGTGTGTTCGGAAGAATATTATGATGGATAGAGTTGAATCATATGTGTTCAATA
TCTCCGGTGATAATCTATATCACTCTTCTTCTTCAGAGTCTTCTTCCATCGGGAGGAACA
GCGACGACGAAGAAGACGAAGAGTGTCACGGCGGTGACGCGGAAGAGAACGAAGCAGAGT
CTCCGTACAAAGGCCTTCTTGATCTGATGGAATCACTAGAAGAAGTCTTACCCGTTAGGA
AAGGGATATCGAGTTTTTACAACGGAAAGTCAAAGTCTTTCACGAACCTAGCGGCTGCGT
CGGCGTTGACTTCTTCATCGTCGATGAAGGACTTGGCAAAGCCGGAGAATCCTTACAGCC
GGAGGAGGAGGAATCTCCTCTACCATCAGATTTGGGAGAACAATAAATCGGCTCCACGTG
GCGGGATCTCGAAGAAACACGTCATGAGCTCGAGCAGGAGCGCGTTGACGCTCGCCGTGG
CGGTTGCAGCCGGAGAAGGATCTTCATCCGGTGAAGACTCGTCGTCGGGGTCAAGTCCGA
CGAACTCTGGATCTCCTCCTCCGAGGCAGAGACATCATCATCAGATTATGACGATGCTTC
CTCCGTTGTATCCTAGTAGTAG*AGTCATCAAGGGTC

QA 9 705 9 705
DS 

RD RS1E250JQ 850 0 0
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TTGAATCATATGTGTTCAATATCTCCGGTGATAATCTATATCACTCTTCTTCTTCAGAGT
CTTCTTCCATCGGGAGGAACAGCGACGACGAAGAAGACGAAGAGTGTCACGGCGGTGACG
CGGAAGAGAACGAAGCAGAGTCTCCGTACAAAGGCCTTCTTGATCTGATGGAATCACTAG
AAGAAGTCTTACCCGTTAGGAAAGGGATATCGAGTTTTTACAACGGAAAGTCAAAGTCTT
TCACGAACCTAGCGGCTGCGTCGGCGTTGACTTCTTCATCGTCGATGAAGGACTTGGCAA
AGCCGGAGAATCCTTACAGCCGGAGGAGGAGGAATCTCCTCTACCATCAGATTTGGGAGA
ACAATAAATCGGCTCCACGTGGCGGGATCTCGAAGAAACACGTCATGAGCTCGAGCAGGA
GCGCGTTGACGCTCGCCGTGGCGGTTGCAGCCGGAGAAGGATCTTCATCCGGTGAAGACT
CGTCGTCGGGGTCAAGTCCGACGAACTCTGGATCTCCTCCTCCGAGGCAGAGACATCATC
ATCAGATTATGACGATGCTTCCTCCGTTGTATCCTAGTAGTAGGAGTCATCAAGGGTCTT
TTGGTAATTTGAAGTCGTCTCAATCGTCGTTGGAGTTTTGTGCCTTGAGATCGTCTTCGG
TTGCTGATATTTCGAGGTGTCTTGGGTCCAATTGAATCGTAGTGGACGATAGATAGCATT
TGTTTACTTGAAACTTTGTTTTTTAACCCTGTTAACATCCGGAGAATGTATAGACGAGTT
TCAAAC
TTTT

QA 1 846 1 846
DS 

RD RS1DE03JQ 672 0 0
TGACGCGGAAGAGAACGAAGCAGAGTCTCCGTACAAAGGCCCTCTTGATCTGATGGAATC
ACTAGAAGAAGTCTTACCCGTTAGGAAAGGGATATCGAGTTTTTACAACGGAAAGTCAAA
GTCTTTCACGAACCTAGCGGCTGCGTCGGCGTTGACTTCTTCATCGTCGATGAAGGACTT
GGCAAAGCCGGAGAATCCTTACAGCCGGAGGAGGAGGAATCTCCTCTGCCATCAGATTTG
GGAGAACAATAAATCGGCTCCACGTGGCGGGATCTCGAAGAAACACGTCATGAGCTCGAG
CAGGAGCGCGTTGACGCTCGCCGTGGCGGTTGCAGCCGGAGAAGGATCTTCATCCGGTGA
AGACTCGTCGTCGGGGTCAAGTCCGACGAACTCTGGATCTCCTCCTCCGAGGCAGAGACA
TCATCATCAGATTATGACGATGCTTCCTCCGTTGTATCCTAGTAGTAGGAGTCATCAAGG
GTCTTTTGGTAATTTGAAGTCGTCTCAATCGTCGTTGGAGTTTTGTGCCTTGAGATCGTC
TTCGGTTGCTGATATTTCGAGGTGTCTTGGGTCCAATTGAATCGTAGTGGACGATAGATA
GCATTTGTTTACTTGAAACTTTGTTTTTTAACCCTGTTAACATCCGGAGAATGTATAGAC
GAGTTTCAAAC
C

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1DE03TF 774 0 0
GG
GTGTGTGTTCGGAAGAATATTATGATGGATAGAGTTGAATCATATGTGTTCAATATCTCC
GGTGATAATCTATATCACTCTTCTTCTTCAGAGTCTTCTTCCATCGGGAGGAACAGCGAC
GACGAAGAAGACGAAGAGTGTCACGGCGGTGACGCGGAAGAGAACGAAGCAGAGTCTCCG
TACAAAGGCCCTCTTGATCTGATGGAATCACTAGAAGAAGTCTTACCCGTTAGGAAAGGG
ATATCGAGTTTTTACAACGGAAAGTCAAAGTCTTTCACGAACCTAGCGGCTGCGTCGGCG
TTGACTTCTTCATCGTCGATGAAGGACTTGGCAAAGCCGGAGAATCCTTACAGCCGGAGG
AGGAGGAATCTCCTCTGCCATCAGATTTGGGAGAACAATAAATCGGCTCCACGTGGCGGG
ATCTCGAAGAAACACGTCATGAGCTCGAGCAGGAGCGCGTTGACGCTCGCCGTGGCGGTT
GCAGCCGGAGAAGGATCTTCATCCGGTGAAGACTCGTCGTCGGGGTCAAGTCCGACGAAC
TCTGGATCTCCTCCTCCGAGGCAGAGACATCATCATCAGATTATGACGATGCTTCCTCCG
TTGTATCCTAGTAGTAGGAGTCATCAAGGGTCTTTTGGTAATTTGAAGTCGTCTCAATCG
TCGTTGGAGTTTTGTGCCTTGAGATCGTCTTCG*TTGCTGATATTTCGAGGTGTCTTGGG
TCCAATTGAATCGTAGTGGACGATAGATAGCATTTGTTTACTTGAAACTTTG

QA 3 774 3 774
DS 

RD RS1C931JQ 646 0 0
TCTGATGGAATCACTAGAAGAAGTCTTACCCGTTAGGAAAGGGATATCGAGTTTTTACAA
CGGAAAGTCAAAGTCTTTCACGAACCTAGCGGCTGCGTCGGCGTTGACTTCTTCATCGTC
GATGAAGGACTTGGCAAAGCCGGAGAATCCTTACAGCCGGAGGAGGAGGAATCTCCTCTG
CCATCAGATTTGGGAGAACAATAAATCGGCTCCACGTGGCGGGATCTCGAAGAAACACGT
CATGAGCTCGAGCAGGAGCGCGTTGACGCTCGCCGTGGCGGTTGCAGCCGGAGAAGGATC
TTCATCCGGTGAAGACTCGTCGTCGGGGTCAAGTCCGACGAACTCTGGATCTCCTCCTCC
GAGGCAGAGACATCATCATCAGATTATGACGATGCTTCCTCCGTTGTATCCTAGTAGTAG
GAGTCATCAAGGGTCTTTTGGTAATTTGAAGTCGTCTCAATCGTCGTTGGAGTTTTGTCC
CTTGAGATCGTCTTCGGTTGCTGATATTTCGAGGTGTCTTGGGTCCAATTGAATCGTAGT
GGACGATAGATAGCATTTGTTTACTTGAAACTTTGTTTTTTAACCCTGTTAACATCCGGA
GAATGTATAGACGAGTTTCAAACTTTTAAATGGATCTACAACTTTT

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 4

CO CL1404Contig1 1178 4 20 U
GGAACGGCGAATTTGACGACGGAACCCCAAAAGAAAAAAAAAAGATGGTGGCGATATCCA
TGTACAGAGGCAACCTTCACAAAGTTCCCGACGTGCCTCGCCGGTGGACTATGCCGGATC
GCAACCTCTCTTTCAAGGAATTCAAATCTCTCCTTCACCGCCGCAAGCAAGCTCTCTCGC
GTCTCTTCCCCGGTTCCAACCCTAACCCGACCCATAACGTCAAGCCTGAGTCGGTTACGG
ATCGGAGGGATGCGATTCCATCCGAACGGCCCGGTTCGGCCGGGAAGCAGAAGCTTGTTG
AGGTGAAGAGAGAGGAGGAGAATGTCAGAACTGAAGGAACTCGAGTAGGAGGATCGGACG
GTGGAGATCGAGTGATGGAATTGCTGTCGAATAATGAAACCGATCACGAGGAAGCTGCGA
AGGATAAGGCGGAGGAGGCAAAGGAAACAGCGGAAGAAGAAGTAGTACCAAGCGAAATAG
AGAAAGAAGAGAAACAAGTGGAGGAGAGATTACAAGTGTTGAATGCAAAGAAACACAATC
TCGTCCAAGTGCTTAAGCTGATTTTGAATGCTGAGGAAGAATTGAAAAGGCGCAGCAGCA
TCACGCAGCAATCAGGAACAACAGCGTCTCGTCCTTCTCTTCCTCCACTCCATGTAGATG
TCTCTAATGATGCTCACATGGAAGGCGGGGAGACGGATGGTGCAGCAAATCATAATAATG
CTCAAACTCCCAGTGTTGTTCGACTATGCGGTGCTTCTTCTTCGTCTGAATCTCCTCTCA
GAAGAGCAGCTGCCGCCTTTTCACAACACAATATGGCTCCGCATCCTTCTAGATGGAGCC
CACGCGTGGGTCCAACACAACCTGGGAATACAAGTGCTGCAGGAGTCACTGTGTCTGCGT
CTGGAACAAACTACATAGCTTCGTCACCTTCACCAGCTGGTTCTGGTGGCACTTCTGTTT
TCAGAGAAACACGGCTACAGAGTCCAGGGAACTAGCAGCTTCTCCTCTTAGCGCTGCACT
AACTTCTTCCTTTTTTGTAGCTGTTAAGATAAAAGTAATGTGATGTGAGAGGATCAGAGA
CGTGTTCAAGCGATTGATCTATAAGTATGATGTTTTAGATTTGTGAGAAACGTGTTCCAA
GTACGTAATTAATACGGCCAGGTTAATAATTTAGAACG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AT

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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D467JQ U 64
AF RS1CZ37JQ U 1
AF RS1CO05JQ U 41
AF RS1CZ37TF C 368
AF RS1CO05TF C 385
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DS 

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TGTTTATTAGCC

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DS 

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GCAT

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DS 

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AAACAAGCTCTCTTTTTTATTTGTCTTAAATAAGGCCAGTTGAAACTCTTCCTTGTTTAT
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GGTGAAACACGCCCCC

QA 1 736 1 736
DS 

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CTGATTTTTTTAAACAGCTCATAGAGAGCTTCTATTTCACTCACGCCAAAAACAGTGTCT
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AA

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DS 



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GGAGCTTGC


BQ
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EK16JQ U 1
AF RS1EK16TF C 1
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AF RS1EO34TF C 1
AF RS1EJ91JQ U 30
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QA 1 484 1 484
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CTCC

QA 1 484 1 484
DS 

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DS 

RD RS1EJ91TF 640 0 0
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TCGATGATGAAGACGAGATCAGCCGGAATCACTCCGGGATGTTCGTTGCCTTTCTCGGGG
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GTTCCTTTGTAGAGATCTTCAAGGCTACAAGGGAGCTTGC

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 6

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TTGACGCTGAAATAATGAAAATCTGATATTGATATTTTTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 40 25 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 10 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C838TF U 1
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AF RS1DQ17TF U 42
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AF RS1DB43JQ C 8
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T
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G

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T
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G

QA 2 531 2 531
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G
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G
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C

QA 2 565 2 565
DS 

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GG
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QA 3 565 3 565
DS 



AS 1 4

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CTCGATCATATGTTTCAGTCTATGAATTCAGTTTCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EL33TF U 1
AF RS1G794TF U 1
AF RS1G794JQ C 142
AF RS1DO04JQ C 164
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ATC

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GCATCGACGAGTATGAGTTTTGGAAATAATCTTAACAACTGGGATAACTCATCTTCTCAA
ATAAGTTTCACCATTGATGAACCCGGAAAACGGTCCAAGACCACCGACTTTTTCACCTTA
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GGGGCATGC

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DS 

RD RS1G794JQ 564 0 0
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GGAAATAATCTTAACAACTGGGATAACTCATCTTCTCAAATAAGTTTCACCATTGATGAA
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ACGAGCTACGCAGACATGTTGGATTTAGCTGTTGAGCATATCAAAGGTCTTCAACACCAT
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CGAATGATATGATATGTTTCCAAACATGAACCAAGACATTATGTAAGAAAAAGAGACTAA
GTGAATCAATTTTTTTT**TGAGC

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DS 

RD RS1DO04JQ 773 0 0
C
GGCTATAAACGGTGTAGCATCGACGAATATGAGTTTTGGAAATAATCTTAACAACTGGGA
TAACTCATCTTCTCAAATAAGTTTCACCATTGATGAACCCGGAAAACGGTCCAAGACCAC
CGACTTTTTCACCTTAGAAACTCAGTTTAGCATGCCACAAACGTCACTGGAGATGGAGAG
TTTGATAAACATCCCAGAGGATTCGGCGCCTTGGAAGGTCAGGGCCAAGCGTGGATGTGC
TACTCACCCGCGCAGCATCGCTGAAAGGGAGAGAAGAACGAGAATAAGTGGGAAGCTGAA
GAAGCTACAAGAACTTGTGCCCAATATGGACGAGTAAACGAGCTATGCAGACATGTTGGA
TTTAGCTGTTGAGCATATCAAAGGTCTTCAACACCATATAGAGTCGCTGGAAAAGGGGAT
GGAGAGATGCACTTGCGGGGCATGCAAGAAGCGATGACGAATGATATGATATGTTTCCCA
ACATGATCCAAGACA********GAAAAGGAGACTAAGTGAATCAATTTTTTTTTTTGAG
CAACGACTAAGTGAATCAATTCAAAGACAGAAAAGGAACACAACAACAGAAAAAAATAAT
GAAGTCTGTTTTTGGTACATTCTCGAAGTCTTCACCACAATTCGTTGATCAATTAGAATG
TGTAGCATCTTATGTTTACCAATGAAATTTGACTTTAGAACCTACTACTTGAGATTTGGT
ACGTGTGTGTATAGTACTCGATCATATGTTTCAGTCTATGAATTCAGTTTCT

QA 2 773 2 773
DS 



AS 1 3

CO CL1409Contig1 842 3 3 U
GGGAATCTGAAGGAGCTCTATCGCAGAAATGGAAAGAACGCTTCTTGTGACCTTGTCTGT
GTTACTCTTTTCTTCTGTTGCGGCAGATGATTACGTCCGACCAAAACCTCGTCAAGCTTT
ACAGTTTCCATGGAAACAAAAGTCCACTTCTCAACCCGAGCAGGTGCATATCTCATTGGC
TGGAGAAAAACATATGCGAGTGGGTTGGGTCACCAACGACAAATCTTCGCCTTCCTTTGT
TGAATACGGAACATCTCCAGGGAAATACTCCTTTCTTGGTCAAGGAGAGAGCACCTCTTA
CAGCTACATATTCTACAGATCAGGGAAGATACACCACGCCGTCATCGGCCCATTGGAACC
GAACACGGTTTACTATTACCGTTGCGGTGGAGGAGGACCTGAGTTTCATCTGAAAACACC
ACCGGCTCAGTTCCCGATCACTTTCGCAGTGGCTGGTGATCTTGGTCAAACCGGTTGGAC
CAAGTCGACGCTAGATCACATCGATCAGTGCAGATACGAAGTGCATCTGCTCCCCGGTGA
TCTTTCTTATGCTGACTATATGCAGCACAAGTGGGACACGTTCGGAGAGCTTGTTCAGCC
TCTGGCGAGTGTGAGGCCCTGGATGGTGACTCAAGGAAACCATGAGAAAGAGAATATTCC
GTTTGTGGTGGATGAGTTTGTGTCGTATAACTCGAGGTGGAAGATGCCTTATGCAGAGAG
TGGATCAAATTCGAATTTGTATTACTCTTTTGAGTTTTCTGGTGTCCATGTGATCATGCT
TGGCTCATACACTGATTACGACCGGTACTCAGATCAATACAATTGGTTAAAGGTGATCTC
TC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1F153TF U 10
AF RS1BB03TF U 7
AF RS1CP45TF U 1
BS 1 59 RS1CP45TF
BS 60 60 RS1F153TF
BS 61 842 RS1CP45TF

RD RS1F153TF 584 0 0
GG
GGAGCTCTATCGCAGAAATGGAAAGAAAGCTTCTTGTGACCTTGTCTGTGATACTCTTTT
CTTCTGTTGCGGCAGATGATTACGTCCGACCAGAACCTCGTCAAGCTTTACAGTTTCCAT
GGAAACAAAAGTCCACTTCTCAACCCGAGCAGGTGCATATCTCATTGGCTGGAGACAAAC
ACATGCGAGTGAGTTGGGTCACCAACGACAAATCTTCCCCTTCCTTTGTTGAATACGGAA
CATCTCCAGGGAAATACTCTTTCCTTGGTCAAGGAGAGAGCACCTCGTACAGCTACATAT
TCTACAGGTCAGGGAAGATACACCACGCCGTCATCGGCCCATTGGAACCGGACACGGTTT
ACTATTACCGTTGCGATGGAGGAGGACCGGAGTTTCATCTTAAAACACCACCAGCTCAGT
TCCCGATCACTTTCGCAGTGGCTGGTGATCTTGGTCAAACCGGTTGGACCAAGTCGACGC
TAGATCATATCGACCAGTGCAAATACGAAGTGCATCTGCTCCCCGGTGATCTTTCTTATG
CTGACTATATGCAGCACAAGTGGGACACGTTCGGAGAGCTTG

QA 3 584 3 584
DS 

RD RS1BB03TF 718 0 0
GGGAA
GGAGCTCTATCGCAGAAATGGAAAGAACGCTTCTTGTGACCTTGTCTGTGTTACTCTTTT
CTTCTGTTGCGGCAGATGATTACGTCCGACCAAAACCTCGTCAAGCTTTACAGTTTCCAT
GGAAACAAAAGTCCACTTCTCAACCCGAGCAGGTGCATATCTCATTGGCTGGAGAAAAAC
ATATGCGAGTGGGTTGGGTCACCAACGACAAATCTTCGCCTTCCTTTGTTGAATACGGAA
CATCTCCGGGGAAATACTCCTTTCTTGGTCAAGGAGAGAGCACCTCTTACAGCTACATAT
TCTACAGATCAGGGAAGATACACCACGCCGTCATTGGCCCATTGGAACCGAACACGGTTT
ACTATTACCGTTGCGGTGGAGGAGGACCTGAGTTTCATCTGAAAACACCACCGGCTCAGT
TCCCGATCACTTTCGCAGTGGCAGGTGATCTTGGTCAAACCGGTTGGACCAAGTCGACGC
TAGATCACATCGATCAGTGCAGATACGAAGTGCATCTGCTCCCCGGTGATCTTTCTTATG
CTGACTATATGCAGCACAAGTGGGACACGTTCGGAGAGCTTGTTCAGCCTCTGGCGAGTG
TGAGGCCCTGGATGGTGACTCAAGGAAACCATGAGAAAGAGAATATTCCGTTTGTGGTGG
ATGAGTTTGTGTCGTATAACTCGAGGTGGAAGATGC*TTATGCAGAGAGTGGA

QA 6 718 6 718
DS 

RD RS1CP45TF 842 0 0
GGGAATCTGAAGGAGCTCTATCGCAGAAATGGAAAGAACGCTTCTTGTGACCTTGTCTGC
GTTACTCTTTTCTTCTGTTGCGGCAGATGATTACGTCCGACCAAAACCTCGTCAAGCTTT
ACAGTTTCCATGGAAACAAAAGTCCACTTCTCAACCCGAGCAGGTGCATATCTCATTGGC
TGGAGAAAAACATATGCGAGTGGGTTGGGTCACCAACGACAAATCTTCGCCTTCCTTTGT
TGAATACGGAACATCTCCAGGGAAATACTCCTTTCTTGGTCAAGGAGAGAGCACCTCTTA
CAGCTACATATTCTACAGATCAGGGAAGATACACCACGCCGTCATCGGCCCATTGGAACC
GAACACGGTTTACTATTACCGTTGCGGTGGAGGAGGACCTGAGTTTCATCTGAAAACACC
ACCGGCTCAGTTCCCGATCACTTTCGCAGTGGCTGGTGATCTTGGTCAAACCGGTTGGAC
CAAGTCGACGCTAGATCACATCGATCAGTGCAGATACGAAGTGCATCTGCTCCCCGGTGA
TCTTTCTTATGCTGACTATATGCAGCACAAGTGGGACACGTTCGGAGAGCTTGTTCAGCC
TCTGGCGAGTGTGAGGCCCTGGATGGTGACTCAAGGAAACCATGAGAAAGAGAATATTCC
GTTTGTGGTGGATGAGTTTGTGTCGTATAACTCGAGGTGGAAGATGCCTTATGCAGAGAG
TGGATCAAATTCGAATTTGTATTACTCTTTTGAGTTTTCTGGTGTCCATGTGATCATGCT
TGGCTCATACACTGATTACGACCGGTACTCAGATCAATACAATTGGTTAAAGGTGATCTC
TC

QA 1 842 1 842
DS 



AS 1 5

CO CL1410Contig1 547 5 28 U
GGACCAACAAAAACAAAAGATAAACAACAGAAAGTAACATGAGATTTATCTTACTAGCCT
TGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGTCTTGCAACGCAGTGGTTG
GAGATCTCTACCCTTGCCTCTCCTACGTTGTGCAAGGCGGAAACGTCCCAACGAACTGCT
GCAACGGTATCAGAACGCTCAACAGTCAGGCCCAAACCCCTGTGGACCGTCAGGGCGTCT
GCCGTTGCATCAAGAATGCTATCGGAGGAGTCTCTTTCTCTTCTAACAACCTCAACAATG
CTCAGTCTCTGCCTGCTAAATGTGGTGTGAATCTCCCTTACAGTATCAGCCCTTCCACCA
ATTGCGACAGTATCAACTGAGAGAAGCAGACAAGGAAGCTACTACTATTACTACAAGAAC
TAAATAAGAAGTCATTAATAAATTAGAACG**TATGGTTTGCTACTAGCTACGTTAATTT
GTGATGTAATCGTCACTCCTATGTTCTTTGAAAGTTATAATAAATTATCAACATGCATTT
TCTATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1GX11TF U 1
AF RS1C651JQ C 4
AF RS1EJ45JQ C 209
AF RS1EJ45TF U 209
AF RS1C651TF U 4
BS 1 22 RS1GX11TF
BS 23 23 RS1C651TF
BS 24 45 RS1GX11TF
BS 46 46 RS1C651TF
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RD RS1GX11TF 522 0 0
GGACCAACAAAAACAAAAGATAGACAACAGAAAGTAACATGAGATCTATCTTACTAGCCT
TGTTCCTAGTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGTCTTGCAACGCAGTGGTTG
GAGATCTTTACCCTTGCCTCTCCTACGTTGTTCAAGGCGGAAACGTACCAGCGAACTGCT
GCAACGGTATCAGGACGCTCAACAGTCAGGCCCAAACCCCTGTGGACCGTCAGGGCGTCT
GCCGTTGCATCAAAAATGCTATCGGAGGAGTCTCTTTCTCTTCTAACAACCTCAACAATG
CTCAGTCTCTGCCTGCTAAATGTGGTGTGAATCTCCCTTACAGTATCAGCCCTTCCACCA
ATTGCGACAGTATCAACTGAGAGAAGCAGACAAGGAAGCTACTACTATTACTACAAGAAC
TAAATAATAAGTCATTAATAAATTAGAACGAGTATGGTTTGCTACTAGCTACGTTAATTT
GTGATGTA*TCGTCACTCCTATGTTTTTTGAAAGTTCTAATA

QA 1 522 1 522
DS 

RD RS1C651JQ 488 0 0
GGACCAAC
AACAAAAGATAAACAACAGAAAGTAACATGAGATTTATCTTACTAGCCTTGTTCCTAGTT
CTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGTCTTGCAACGCAGTGGTTGGAGATCTCTAC
CCTTGCCTCTCCTACGTTGTGCAAGGCGGAAACGTCCCAACGAACTGCTGCAACGGTATC
AGAACGCTCAACAGTCAGGCCCAAACCCCTGTGGACCGTCAGGGCGTCTGCCGTTGCATC
AAGAATGCTATCGGAGGAGTCTCTTTCTCTTCTAACAACCTCAACAATGCTCAGTCTCTG
CCTGCTAAATGTGGTGTGAATCTCCCTTACAGTATCAGCCCTTCCACCAATTGCGACAGT
ATCAACTGAGAGAAGCAGACAAGGAAGCTACTACTATTACTACAAGAACTAAATAAGAAG
TCATTAATAAATTAGAACG**TATGGTTTGCTACTAGCTACGTTAATTTGTGATGTAATC

QA 9 488 9 488
DS 

RD RS1EJ45JQ 338 0 0
GGCCCAAACCCCTGTGGACCGTCAGGGCGTCTGCCGTTGCATCAAGAATGCTATCGGAGG
AGTCTCTTTTTTTTCTAACAACCTCAACAATGCTCAGTCTTTGCCTGCTAAATGTGGTGT
GAATCTCCCTTACAGTATCAGCCCTTCCACCAATTGCGACAGTATCAACTGAGAGAAGCA
GACAAGGAAGCTACTACTATTACTACAAGAACTAAATAAGAAGTCATTAATAAATTAGAA
CG**TATGGTTTGCTACTAGCTACGTTAATTTGTGATGTAATCGTCACTCCTATGTTCTT
TGAAAGTTATAATAAATTATCAACATGCA
TTTTCTATG

QA 1 329 1 329
DS 

RD RS1EJ45TF 338 0 0
GGCCCAAACCCCTGTGGACCGTCAGGGCGTCTGCCGTTGCATCAAGAATGCTATCGGAGG
AGTCTCTTTCTCTTCTAACAACCTCAACAATGCTCAGTCTCTGCCTGCTAAATGTGGTGT
GAATCTCCCTTACAGTATCAGCCCTTCCACCAATTGCGACAGTATCAACTGAGAGAAGCA
GACAAGGAAGCTACTACTATTACTACAAGAACTAAATAAGAAGTCATTAATAAATTAGAA
CG**TATGGTTTGCTACTAGCTACGTTAATTTGTGATGTAATCGTCACTCCTATGTTCTT
TGAAAGTTATAATAAATTATCAACATGCA
TTTTCTATG

QA 1 329 1 329
DS 

RD RS1C651TF 544 0 0
GGACCAAC
AACAAAAGATAAACAACAGAAAGTAACATGAGATTTATCTTACTAGCCTTGTTCCTAGTT
CTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGTCTTGCAACGCAGTGGTTGGAGATCTCTAC
CCTTGCCTCTCCTACGTTGTGCAAGGCGGAAACGTCCCAACGAACTGCTGCAACGGTATC
AGAACGCTCAACAGTCAGGCCCAAACCCCTGTGGACCGTCAGGGCGTCTGCCGTTGCATC
AAGAATGCTATCGGAGGAGTCTCTTTCTCTTCTAACAACCTCAACAATGCTCAGTCTCTG
CCTGCTAAATGTGGTGTGAATCTCCCTTACAGTATCAGCCCTTCCACCAATTGCGACAGT
ATCAACTGAGAGAAGCAGACAAGGAAGCTACTACTATTACTACAAGAACTAAATAAGAAG
TCATTAATAAATTAGAACG**TATGGTTTGCTACTAGCTACGTTAATTTGTGATGTAATC
GTCACTCCTATGTTTTTTGAAAGTTATAATAAATTATCAACATGCATTTTCTATGC

QA 9 544 9 544
DS 



AS 1 5

CO CL1411Contig1 866 5 2 U
CGGGGGATACCAACTCTACATCTAAGATCCACCTCACAGTTAATAGCCTTTATTTCATAC
TTTCTCCTGTATTTCATTCAAACACCAAAGTTTTAGAAATGGCAACAGCATCGGTTAACA
TGCAGTCAGTCTTCGCCAGTGGGTTGGCCACTCGCAAGATCAACACAAACAAGCTCTTCT
TCGCCGCAAACTTCCCAAATCTCAAGAGGAATTATCCGGTTGGAGTGAGGTGCATGGCTG
AGGGAGAACCCATGAAAGATGAGTCTGCACCTTCCACCTCCGCTGCTCAGCCTTTGTCTA
GTTCATCACCTCCTCCACCTCCTCCACGTCCTACTAAACCAAAGGTGAGCACGAAGTTTA
GCGACTTGCTAGCATTTAGCGGTCCAGCACCAGAAAGAATAAACGGGCGTTTAGCGATGG
TTGGGTTCGTGGCGGCCTTGGCGGTTGAACTTTCCAAGGGTGAAAACGTTTTGGCTCAGA
TCTCTGACGGTGGCGTCTCGTGGTTCCTCGGTACGACCGCGATCTTGACACTTGCGTCCC
TTGTACCCCTTTTCAAAGGTATCACCGCCGAGTCTAAGTCCAAAGGTTTCATGACGTCCG
ACGCTGAGCTCTGGAACGGGCGTTTCGCGATGCTTGGTTTGGTCGCGTTGGCGTTTACCG
AGTTTGTCAAGGGTGGGACCCTTGTCTGAGGAATGGAACTTTCTTATTGGGGGAGAATGC
TATATTACAGTTTTGCCCCTGAATTCTGTGAAGTAATCTTGCTTGATATGTGTGGTTAAG
CCTATGGTGTGTTTCTTTACATATGTATTAGTCACATGAGACTTTGGGTTACAACACTAT
ATCAGTAAAATCAGTGATGTTTCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1CQ44TF U 70
AF RS1EL60TF U 7
AF RS1C760TF U 1
AF RS1C760JQ C 52
AF RS1EL60JQ C 300
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BS 693 866 RS1C760JQ

RD RS1CQ44TF 407 0 0
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TCTTCGCCAGTGGGTTGGCCACTCGCAAGATCAACACAAACAAGCTCTTCTTCGCCGCAA
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TAGCATTTAGCGGTCCAGCACCAGAAAGAATAAACGGGCGTTTAGCGATGGTTGGGTTCG
TGGCGGCCTTGGCGGTTGAACTTTCCAAGGGTGAAAACGTTTTGGCT

QA 1 407 1 407
DS 

RD RS1EL60TF 512 0 0
GG
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GTATTTCATTCAAACACCAAAGTTT*AGAAATGGCAACAGCATCGGTTAACATGCAGTCA
GTCTTCGCCAGTGGGTTGGCCACTCGCAAGATCAACACAAACAAGCTCTTCTTCGCCGCA
AACTTCCCAAATCTCAAGAGGAATTATCCGGTTGGAGTGAGGTGCATGGCTGAGGGAGAA
CCCATGAAAGATGAGTCTGCACCTTCCACCTCCGCTGCTCAGCCTTTGTCTAGTTCATCA
CCTCCTCCACCTCCTCCACGTCCTACTAAACCAAAGGTGAGCACGAAGTTTAGCGACTTG
CTAGCATTTAGCGGTCCAGCACCAGAAAGAATAAACGGGCGTTTAGCGATGGTTGGGTTC
GTGGCGGCCTTGGCGGTTGAACTTTCCAAGGGTGAAAACGTTTTGGCTCAGATCTCTGAC
GGTGGCGTCTCGTGGTTCCTCGGTACGAC
T

QA 3 511 3 511
DS 

RD RS1C760TF 696 0 0
CGGGGGATACCAACTCTACATCTAAGATCCACCTCACAGTTAATAGCCTTTATTTCATAC
TTTCTCCTGTATTTCATTCAAACACCAAAGTTTTAGAAATGGCAACAGCATCGGTTAACA
TGCAGTCAGTCTTCGCCAGTGGGTTGGCCACTCGCAAGATCAACACAAACAAGCTCTTCT
TCGCCGCAAACTTCCCAAATCTCAAGAGGAATTATCCGGTTGGAGTGAGGTGCATGGCTG
AGGGAGAACCCATGAAAGATGAGTCTGCACCTTCCACCTCCGCTGCTCAGCCTTTGTCTA
GTTCATCACCTCCTCCACCTCCTCCACGTCCTACTAAACCAAAGGTGAGCACGAAGTTTA
GCGACTTGCTAGCATTTAGCGGTCCAGCACCAGAAAGAATAAACGGGCGTTTAGCGATGG
TTGGGTTCGTGGCGGCCTTGGCGGTTGAACTTTCCAAGGGTGAAAACGTTTTGGCTCAGA
TCTCTGACGGTGGCGTCTCGTGGTTCCTCGGTACGACCGCGATCTTGACACTTGCGTCCC
TTGTACCCCTTTTCAAAGGTATCACCGCCGAGTCTAAGTCCAAAGGTTTCATGACGTCCG
ACGCTGAGCTCTGGAACGGGCGTTTCGCGATGCTTGGTTTGGTCGCGTTGGCGTTTACCG
AGTTTGTCAAGGGTGGGACCCTTGTCTGAGGA
TGGA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RS1C760JQ 815 0 0
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CGGTTAACATGCAGTCAGTCTTCGCCAGTGGGTTGGCCACTCGCAAGATCAACACAAACA
AGCTCTTCTTCGCCGCAAACTTCCCAAATCTCAAGAGGAATTATCCGGTTGGAGTGAGGT
GCATGGCTGAGGGAGAACCCATGAAAGATGAGTCTGCACCTTCCACCTCCGCTGCTCAGC
CTTTGTCTAGTTCATCACCTCCTCCACCTCCTCCACGTCCTACTAAACCAAAGGTGAGCA
CGAAGTTTAGCGACTTGCTAGCATTTAGCGGTCCAGCACCAGAAAGAATAAACGGGCGTT
TAGCGATGGTTGGGTTCGTGGCGGCCTTGGCGGTTGAACTTTCCAAGGGTGAAAACGTTT
TGGCTCAGATCTCTGACGGTGGCGTCTCGTGGTTCCTCGGTACGACCGCGATCTTGACAC
TTGCGTCCCTTGTACCCCTTTTCAAAGGTATCACCGCCGAGTCTAAGTCCAAAGGTTTCA
TGACGTCCGACGCTGAGCTCTGGAACGGGCGTTTCGCGATGCTTGGTTTGGTCGCGTTGG
CGTTTACCGAGTTTGTCAAGGGTGGGACCCTTGTCTGAGGAATGGAACTTTCTTATTGGG
GGAGAATGCTATATTACAGTTTTGCCCCTGAATTCTGTGAAGTAATCTTGCTTGATATGT
GTGGTTAAGCCTATGGTGTGTTTCTTTACATATGTATTAGTCACATGAGACTTTGGGTTA
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QA 1 815 1 815
DS 

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AGTTCATCACCTCCTCCACCTCCTCCACGTCCTACTAAACCAAAGGTGAGCACGAAGTTT
AGCGACTTGCTAGCATTTAGCGGTCCAGCACCAGAAAGAATAAACGGGCGTTTAGCGATG
GTTGGGTTCGTGGCGGCCTTGGCGGTTGAACTTTCCAAGGGTGAAAACGTTTTGGCTCAG
ATTTCTGACGGTGGCGTCTCGTGGTTCCTCGGTACGACTGCGATCTTGACACTTGCGTCC
CTTGTACCCCTTTTCAAAGGTATCACCGCCGAGTTTAAGTCCAAAGGTTTCATGACGTCC
GACGCTGAGCTCTGGAACGGGCGTTTCGCGATGCTTGGTTTGGTCGCGTTGGCGTTTACC
GAGTTTGTCAAGGGTGGGACCCTTGTTTGAGGAATGGAACTTTTTTATTGGGGGAGAATG
CTATATTACAGTTTTGCCCCTGAATTCTGTGAAGTAATCTTGCTTGATATGTGTGGTTAA
GCCTATGGTGTGTTTCTTTACATATGTATTAGTCACATGAGACTTTGGGTTACAACACTA
TATCAGTAAAATCAGTGATGTTTCTC

QA 1 566 1 566
DS 



AS 1 4

CO CL1412Contig1 1070 4 5 U
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AGAATAACCGAAAACACAGAGAAGACAGGTAAACAATGATGGAAACTGGCTTTAGGATGA
AAAAAAATGATTAATCACTTTGGTGAATTTGATCAGAAGCACTTTCTGTGGACAATCGAC
GGTCCAGATTCGTCATACTCAGCCTTTGCAATCCACATCTGCTGGAAAGTACTGAGGGAA
GCCAAGATAGAGCCACCGATCCAGACACTGTACTTCCTTTCCGGTGGAGCCACCACTTTG
ATCTTCATACTGCTTGGAGCCAAAGCAGTGATCTCTTTACTCATCCTATCACCAATCCCA
CCGAACATCGAGGTTCCACCACTGAGCACAATGTTCCCATAAAGATCCTTCCTGATATCC
ACGTCACATTTCATGATTGAGTTGTAAGTAGTTTCATGGATCCCTGGATTTTCCATTCCG
ATCATCGATGGCTGGAACAGGACTTCGGGACATCGGAAACGCTCTGCCCCGATGGTAATC
ACCTGACCGTCTGGCAGCTCGAAGCTCTTTTCGACAGATGAGCTGGTGTTGGAAGTCTCG
AGCTCTTGCTCGTAGTCCAAGGCAATGTAAGAGAGCTTCTCCTTCATGTCTCTAACGATT
TCACGCTCAGCAGTTGTGGTGAAGGAGTAACCACGCTCTGTTAAGATTTTCATGAGGTAG
TCCGTCAGATCACGACCTGCAAGGTCGAGACGCAAGATTGCGTGTGGAAGAGCATAACCC
TCGTAGATTGGAACCGTGTGGCTCACACCATCTCCAGAGTCCAACACAATACCAGTAGTA
CGGCCACTGGCATATAGGGAGAGAAACAGCTTGAATGGCGACATACATAGCAGGGGGTGT
TGAAGGTTTCAAACATGAATCTGTGTCATCTTCTCACGATTAGCCTTTGGATTGAGAGGC
GCTTCGGTTAGCAGAACCGGGTGTTCTTCAGGGGGCAACACGCAGCTCGTTGTAGAATGT
GTGATGCCAAATCTTCTCCATGTCATCCCAATTGTTGACGATTCCATGCT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F128JQ U 1
AF RS1F128TF C 8
AF RS1BZ64JQ U 8
AF RS1BZ64TF C 549
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BS 789 1070 RS1BZ64TF

RD RS1F128JQ 495 0 0
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AGAATAACCGAAAACACAGAGAAGACAGGTAAACAATGATGGAAACTGGCTTTAGGATGA
AAAAAAATGATTAATCACTTTGGTGAATTTGATCAGAAGCACTTTCTGTGGACAATCGAC
GGTCCAGATTCGTCATACTCAGCCTTTGCAATCCACATCTGCTGGAAAGTACTGAGGGAA
GCCAAGATAGAGCCACCGATCCAGACACTGTACTTCCTTTCCGGTGGAGCCACCACTTTG
ATCTTCATACTGCTTGGAGCCAAAGCAGTGATCTCTTTACTCATCCTATCACCAATCCCA
CCGAACATCGAGGTTCCACCACTGAGCACAATGTTCCCATAAAGATCCTTCCTGATATCC
ACGTCACATTTCATGATTGAGTTGTAAGTAGTTTCATGGATCCCTGGATTTTCCATTCCG
ATCATCGATGGCTG
C

QA 1 494 1 494
DS 

RD RS1F128TF 488 0 0
AA
CTTGATTTACTTCAAAAGCAAGATTATATAATAGTAAACAAATGAAGAAGAAGAATAACC
GAAAACACAGAGAAGACAGGTAAACAATGATGGAAACTGGCTTTAGGATGAAAAAAAATG
ATTAATCACTTTGGTGAATTTGATCAGAAGCACTTTCTGTGGACAATCGACGGTCCAGAT
TCGTCATACTCAGCCTTTGCAATCCACATCTGCTGGAAAGTACTGAGGGAAGCCAAGATA
GAGCCACCGATCCAGACACTGTACTTCCTTTCCGGTGGAGCCACCACTTTGATCTTCATA
CTGCTTGGAGCCAAAGCAGTGATCTCTTTACTCATCCTATCACCAATCCCACCGAACATC
GAGGTTCCACCACTGAGCACAATGTTCCCATAAAGATCCTTCCTGATATCCACGTCACAT
TTCATGATTGAGTTGTAAGTAGTTTCATGGATCCCTGGATTTTCCATTCCGATCATCGAT
GGCTG
C

QA 3 487 3 487
DS 

RD RS1BZ64JQ 784 0 0
AG
CTTGATTTACTTCAAAAGCAAGATTATATAATAGTAAACAAATGAAGAAGAAGAATAACC
GAAAACACAGAGAAGACAGGTAAACAATGATGGAAACTGGCTTTAGGATGAAAAAAAATG
ATTAATCACTTTGGTGAATTTGATCAGAAGCACTTTCTGTGGACAATCGACGGTCCAGAT
TCGTCATACTCAGCCTTTGCAATCCACATCTGCTGGAAAGTACTGAGGGAAGCCAAGATA
GAGCCACCGATCCAGACACTGTACTTCCCTTCCGGTGGAGCCACCACTTTGATCTTCATA
CTGCTTGGAGCCAAAGCAGTGATCTCTTTACTCATCCTATCACCAATCCCACCGAACATC
GTGGTTCCACCACTGAGCACAATGTTCCCATAAAGATCCTTCCTGATATCCACGTCACAT
TTCATGATTGAGTTGTAAGTAGTTTCATGGATCCCTGGATTTTCCATTCCGATCATCGAT
GGCTGGAACAGGACTTCGGGACATCGGAAACGCTCTGCCCCGATGGTAATCACCTGACCG
TCTGGCAGCTCGAAGCTCTTTTCGACAGATGAGCTGGTGTTGGAAGTCTCGAGCTCTTGC
TCGTAGTCCAAGGCAATGTAAGAGAGCTTCTCCTTCATGTCTCTAACGATTTCACGCTCA
GCAGTTGTGGTGAAGGAGTAACCACGCTCTGTTAAGATTTTCATGAGGTAGTCCGTCAGA
TCACGACCTGCAAG*TCGAGACGCAAGATTGCGTGTGGAAGAGCATAACCCTCGTAGAT
GGG

QA 3 781 3 781
DS 

RD RS1BZ64TF 522 0 0
GTCTGGCAGCTCGAAGCTCTTTTCGACAGATGAGCTGGTGTTGGAAGTCTCGAGCTCTTG
CTCGTAGTCCAAGGCAATGTAAGAGAGCTTCTCCTTCATGTCTCTAACGATTTCACGCTC
AGCAGTTGTGGTGAAGGAGTAACCACGCTCTGTTAAGATTTTCATGAGGTAGTCCGTCAG
ATCACGACCTGCAAGGTCGAGACGCAAGATTGCGTGTGGAAGAGCATAACCCTCGTAGAT
TGGAACCGTGTGGCTCACACCATCTCCAGAGTCCAACACAATACCAGTAGTACGGCCACT
GGCATATAGGGAGAGAAACAGCTTGAATGGCGACATACATAGCAGGGGGTGTTGAAGGTT
TCAAACATGAATCTGTGTCATCTTCTCACGATTAGCCTTTGGATTGAGAGGCGCTTCGGT
TAGCAGAACCGGGTGTTCTTCAGGGGGCAACACGCAGCTCGTTGTAGAATGTGTGATGCC
AAATCTTCTCCATGTCATCCCAATTGTTGACGATTCCATGCT

QA 1 522 1 522
DS 



AS 1 5

CO CL1413Contig1 850 5 9 U
GGTGGGGCTCTTGGTGGTAAGATTAATGAAGTTATGATTGTTATATGATCCAATGTAATA
TATAAGCAGAGGCCATTACACAACAACATATAATAGTTTTTAAACCTAACGCGACAGTAG
AGTCTTCCCGAGATCAATCAGCAGTTATCTTCAACAGTCCATGTTCTTCACACTCCTCCT
GCACAAAGCTCTCATCCCAACGTGGAGTATGTGAGAAACTCCGTCGAAGTAAACTGAAAT
GGTTGGCGCGGAATAGGGTTCGGTCTAGGGCCATAAACTTTGATCTGACGGATATGAGTA
TCTCTCCCGTTGAGGTGATTTGACAACATGGCTATTTGCAACATGAATGTATTCACAAAT
GTTTCCCTTGGATCGGTCCCAGACAGAGATACGGAAACCCAACCAGATGGCTTTACAAGC
TCAACACTTTTTACCTCCTTTAAGTTATGAAAGCCATCACCAGCACGAACAGAGATCTTA
CTAGGCGTATAGCTCTCATCAAGCTTAAAGTCAACGTACAAAGCCACTAACTGTAATCTC
ACTTTCTTCTGGAACTGAATGTTGATCAAATGTGGTTGCAAACCATCCGATTGCCAATAG
GTCTCGAGATTGTCGTCGCGGAGAGTGTTGACGCCGTTGCCGGGCTTGCAAGAGCTAACG
CTCCAAGCTGCGTTTTTGCCCATCTCTCTCAGATCCTCGTCCACGATTAGCTTCTCGTTT
CCTCCGCTGATCTTCCCTTCTTCCTCCGATTCCGATGACTCCGTCGCCATATCTAATCTC
CGATGTCAAACACTTTTTTTTGTTGCTAAAACCCTCTAGACGAGGGTTTGAATTCGTCTT
TATGGATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CW74JQ U 1
AF RS1C828JQ U 72
AF RS1D281JQ U 44
AF RS1D281TF C 132
AF RS1CW74TF C 227
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RD RS1CW74JQ 662 0 0
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TATAAGCAGAGGCCATTACACAACAACATATAATAGTTTTTAAACCTAACGCGACAGTAG
AGTCTTCCCGAGATCAATCAGCAGTTATCTTCAACAGTCCATGTTCTTCACACTCCTCCT
GCACAAAGCTCTCATCTCAACGTGGAGTATGTGAGAAACTCCGTCGAAGTAAACTGAAAT
GGTTGGCGCGGAATAGGGTTCGGTCTAGGGCCATAAACTTTGATCTGACGGATATGAGTA
TCTCTCCCGTTGAGGTGATTTGACAACATGGCTATTTGCAGCATGAATGTATTCACAAAT
GTTTCCCTTGGATCGGTCCCAGACAGAGATACGGAAACCCAACCAGATGGCTTTACAAGC
TCAACACTTTTTACCTCCTTTAAGTTATGAAAGCCATCACCAGCACGAACAGAGATCTTA
CTAGGCGTATAGCTCTCATCAAGCTTAAAGTCAACGTACAAAGCCACTAACTGTAATCTC
ACTTTCTTCTGGAACTGAATGTTGATCAAATGTGGTTGCAAACCATCCGATTGCCAATAG
GTCTCGAGATTGTCGTCGCGGAGAGTGTTGACGCCGTTGCCGGGCTTGCAAGAGC
TAACGCT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1C828JQ 585 0 0
GCCATTACACAACAACATATAATAGTTTTTAAACCTAATGCGACAGTAGAGGCTTCCCGA
GATCAAATAGCAGTTATCTTCAACAGTCCATGTTCTTCACACTCCTCCTGCACAAAGCTC
TCATCTCAACGTGGAGTATGCGAGAAACTCCGTTGAAGTAAACTGAAATGGTTGGCGCGG
AATAGGATTCGGTCTAGGGCCATAAACTTTGATCTGACGGATATGAGTATCTCTCCCGTT
GAGGTGATTTGACAACATGGCTATTTGCAACATGAATGTATTCACAAATGTTTCCCTCGG
ATCGGTCCCAGACAAAGATACGGAAACCCAACCAGATGGCTTTACAAGCTCAACACTTTT
TACCTCCTTTAAGTTATGAAAGCCATCACCAGCACGAACAGAGATCTTACTAGGCGTATA
GCTCTCATCAAGCTTAAAGTCAACGTACAAAGCCACTAACTGTAATCTCACTTTCTTCTG
GAACTGAATGTTGATCAAATGTGGTTGCAAACCATCCGATTGCCAATAGGTCTCGAGATT
GTCGTCCCGGAGAGTGTTGACGCCGTTGCCGGGCTTGCAAGAGC
C

QA 1 584 1 584
DS 

RD RS1D281JQ 569 0 0
TATGATCCAATGTAATATATAAGCAGAGGCCATTACACAACAACATATAATAGTTTTTAA
ACCTAACGCGACAGTAGAGTCTTCCCGAGATCAATCAGCAGTTATCTTCAACAGTCCATG
TTCTTCACACTCCTCCTGCACAAAGCTCTCATCCCAACGTGGAGTATGTGAGAAACTCCG
TCGAAGTAAACTGAAATGGTTGGCGCGGAATAGGGTTCGGTCTAGGGCCATAAACTTTGA
TCTGACGGATATGAGTATCTCTCCCGTTGAGGTGATTTGACAACATGGCTATTTGCAACA
TGAATGTATTCACAAATGTTTCCCTTGGATCGGTCCCAGACAGAGATACGGAAACCCAAC
CAGATGGCTTTACAAGCTCAACACTTTTTACCTCCTTTAAGTTATGAAAGCCATCACCAG
CACGAACAGAGATCTTACTAGGCGTATAGCTCTCATCAAGCTTAAAGTCAACGTACAAAG
CCACTAACTGTAATCTCACTTTCTTCTGGAACTGAATGTTGATCAAATGTGGTTGCAAAC
CATCCGATTGCCAATAGGTCTCGAGA
ATG

QA 1 566 1 566
DS 

RD RS1D281TF 675 0 0
GAGATCATCAGCAG
TATCTTCAACAGTCCATGTTCTTCACACTCCTC*TGCACAAAGCTCTCATCCCAACGTGG
AGTATGTGAGAAACTCCGTCGAAGTAAACTGAAATGGTTGGCGCGGAATAGGGTTCGGTC
TAGGGCCATAAACTTTGATCTGACGGATATGAGTATCTCTCCCGTTGAGGTGATTTGACA
ACATGGCTATTTGCAACATGAATGTATTCACAAATGTTTCCCTTGGATCGGTCCCAGACA
GAGATACGGAAACCCAACCAGATGGCTTTACAAGCTCAACACTTTTTACCTCCTTTAAGT
TATGAAAGCCATCACCAGCACGAACAGAGATCTTACTAGGCGTATAGCTCTCATCAAGCT
TAAAGTCAACGTACAAAGCCACTAACTGTAATCTCACTTTCTTCTGGAACTGAATGTTGA
TCAAATGTGGTTGCAAACCATCCGATTGCCAATAGGTCTCGAGATTGTCGTCGCGGAGAG
TGTTGACGCCGTTGCCGGGCTTGCAAGAGCTAACGCTCCAAGCTGCGTTTTTGCCCATCT
CTCTCAGATCCTCGTCCACGATTAGCTTCTCGTTTCCTCCGCTGATCTTCCCTTCTTCC*
*CGATTCCGATGACTCCGTCGCCATATCTAATCTCCGATGTCAAACACTTTTTTTTGTT
CC

QA 15 673 15 673
DS 

RD RS1CW74TF 624 0 0
AAGTAAACTGAAATGGTTGGCGCGGAATAGGGTTCGGTCTAGGGCCATAAACTTTGATCT
GACGGATATGAGTATCTCTCCCGTTGAGGTGATTTGACAACATGGCTATTTGCAGCATGA
ATGTATTCACAAATGTTTCCCTTGGATCGGTCCCAGACAGAGATACGGAAACCCAACCAG
ATGGCTTTACAAGCTCAACACTTTTTACCTCCTTTAAGTTATGAAAGCCATCACCAGCAC
GAACAGAGATCTTACTAGGCGTATAGCTCTCATCAAGCTTAAAGTCAACGTACAAAGCCA
CTAACTGTAATCTCACTTTCTTCTGGAACTGAATGTTGATCAAATGTGGTTGCAAACCAT
CCGATTGCCAATAGGTCTCGAGATTGTCGTCGCGGAGAGTGTTGACGCCGTTGCCGGGCT
TGCAAGAGCTAACGCTCCAAGCTGCGTTTTTGCCCATCTCTCTCAGATCCTCGTCCACGA
TTAGCTTCTCGTTTCCTCCGCTGATCTTCCCTTCTTCCTCCGATTCCGATGACTCCGTCG
CCATATCTAATCTCCGATGTCAAACACTTTTTTTTGTTGCTAAAACCCTCTAGACGAGGG
TTTGAATTCGTCTTTATGGATCCC

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 6

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GGCTCAACAACAACTTTTCATTAACCAATTGTGAATACAAGATTACAACCTCAAGAGATT
TTAACCCGACATACAACCGACGAGATCTAGTACACCCTAGGAACACTGAGTCGAAACTGG
AAAGGATCCTAGACTACCAAATCTAATTCATCGGTGTATTTTTCACCACAATGACACGAG
TTCCTCTCACGACTCGAAGGAAACCGTATCTTAAACCACTAAATTCTACCACTAATTACG
GAACATATCCTTCGCAAACAGACACCAATAGTAAGAAATCTAAGGAAACCACAAGCAAAT
GGATCTATTATTTGACTGTGAAGCTCAGCCATTGCTTCATCACCAGAAGGCGCTTCTTCC
CACTATTGAGAGAAGATTCCATTTGAAGAACATTGTAACTGAATTAGACATTGAAAGAAT
TAGACCGGACAGTCACTTCATCGCCAAACACGCATACTCTTCTCCGTATATCTGAGTGTT
ACATGACATGTTCCACCCTAAAAACCACAAACCGCAACCAGAACCAAGTAGAGCTTAAGC
TAATAGGAGCTCGATTCAAGAACAACTGTTAGTACCAAATGATAGGATTTCAGCCCGTGA
ACTAACAGTACCCACACCCAAAGCGCATAGCAAACTTAGCTTAAGACCACCGACGGTTGA
TATCACGTTTCGTAGCCAAAACCGATCACAAGAACCGGACTGAAAAACGGACCTTGGCAC
CAGCTCACGCGTCCAGTATACCGAAT


BQ
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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CTCCATCTCCCATGACTTGATTGCGTTTTGAACCGTC

QA 7 703 7 703
DS 

RD RS1C207JQ 742 0 0
G
CATGCATCCAAGTGACTATTACAATATATTTTATAAAGAGTCTACACACTTCTGCTTTCC
TTATTTTTCCAGTATGGCCCAATGATACAGTAAATCAACAGTTATAGTTCCTTAAGTTTT
CTTAATGTGTGAAGGGACAGCTCTGTTTCTCTGCAGTGTTGTCTCCACTGTCTGTGGTTT
TGGTCTCTGATATAGGTGGTCCCTTGAGCAGTCCCCCGAACAGCTCTCCTGGATCATAGT
AAATCTCAATCTCCTCTGCTCTAAGCAGTTCATCAACCTTTAGAACTCCCAGACCGAGGA
ACTGAACCATTTCTCCAGTAGGAGCATGGCCTTTGAAGTTTCCTTCAAAGTATCCCCAGT
GTCTAAACTTGAAGGCTATATTAGGCGGCCCTGAGTACACGGAAAGTATCTCAAAAGCAA
ACCCACGCGGTAAAGCAGATCTAAAGGCATCATGTGATGACTCGAAGCTCTCTTCTTCTG
GTTTATAGTACTGAAACTCTCCAGGTAAAGAGGTCTTGAGCAAAGCATTGTAGCTCCCAA
GCCTAAGCGTTTCTTCAGCTGATAATCCTTCTCTCCCATTGACAAAGAGCTTAAACTTAT
CAGGGTTTATAGTCTTGAAGTCTTGTAAACGGATCTTGTGTGAGAGCTCCATCTCCCATG
ACTTGATTGCGTTTTGAACCGTCTCTTCCAAGGATCCTTCTGGCCATACCTTGGTCTGGC
CTTCTTCAAAGAGCTGGTTCA

QA 2 742 2 742
DS 

RD RS1CP71TF 793 0 0
TTTTTCCAGTATGGCCCAATGATACAGTAAATCAACAGTCGTAGTTCTTTAAGTTTTCTT
AATGTGTGAAGGGACAGCTCTGTTTCTCTGCAGTGCTGTCTCCACTGTCTGTGGTTTTGG
TCTCTGATATAGGTGGTCCCTTGAGCAGTCCCCCGAACAGCTCTCCTGGATCATAATAAA
TCTCAATCTCCTCTGCTCTAAGCAGTTCATCAACCTTTAGAACTCCTAGGCCGAGGACCT
GAACCATTTCTCCAGTAGGAGCATGGCCTTTGAAGTTTCCTTCAAAGTATCCCCAGTGTC
TAAACTTGAAGGCTATATTAGGCGGCCCTGAGTACACGGAAAGTATCTCAAAAGCAAACT
CACGCGGTAAAGCAGATCTAAAGGCATCATGTGATGACTCGAAGCTCTCTTCTTCTGGTT
TATAGTACTGAAACTCTCCAGGTAAAGAGGTCTTGAGCAAAGCACTGTAGCTCCCAAGCC
TAAGCGTTTCTTCAGCTGATAATCCTTCTCTCCCATTGACAAAGAGCTTAAACTTATCAG
GGTTTATAGTCTTGAAGTCTTGTAAACGGATCTTGTGTGAGAGCTCCATCTCCCATGACT
TGATTGCGTTTTGAACCGTCTCTTCCAAGGATCCTTCTGGCCATACCTTGGCCTGGCCTT
CTTCAAAGAGCTGGTTCACAAGGTCAAAAGCTGGAGGGTGACCATACCTCCATTGGACAT
CTCCTACATCGTTAAGGACAGATCTATACTTATCTCTCTCTTCCCTAGTAGCCATTATTA
ACTTTTGATGTCC

QA 1 793 1 793
DS 

RD RS1C207TF 699 0 0
GT
TGTCTCCACTGTCTGTGGTTTTGGTCTCTGATATAGGTGGTCCCTTGAGCAGTCCCCCGA
ACAGCTCTCCTGGATCATAGTAAATCTCAATCTCCTCTGCTCTAAGCAGTTCATCAACCT
TTAGAACTCCCAGACCGAGGAACTGAACCATTTCTCCAGTAGGAGCATGGCCTTTGAAGT
TTCCTTCAAAGTATCCCCAGTGTCTAAACTTGAAGGCTATATTAGGCGGCCCTGAGTACA
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ACTCGAAGCTCTCTTCTTCTGGTTTATAGTACTGAAACTCTCCAGGTAAAGAGGTCTTGA
GCAAAGCATTGTAGCTCCCAAGCCTAAGCGTTTCTTCAGCTGATAATCCTTCTCTCCCAT
TGACAAAGAGCTTAAACTTATCAGGGTTTATAGTCTTGAAGTCTTGTAAACGGATCTTGT
GTGAGAGCTCCATCTCCCATGACTTGATTGCGTTTTGAACCGTCTCTTCCAAGGATCCTT
CTGGCCATACCTTGGTCTGGCCTTCTTCAAAGAGCTGGTTCACAAGGTCAAAAGCTGGAG
GGTGACCATACCTCCATTGGACATCTCCTACATCGTTAAGAACAGATCTATACTTATCTC
TCTCTTCCCTAGTAGCCATTATTAACTTTTGATGTCC

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DS 

RD RS1DH96TF 650 0 0
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AGTTCATCAACCTTTAGAACTCCCAGACCGAGGAACTAAACCATTTCTCCAGTAGGAGCA
TGGCCTTTGAAGTTTCCTTCAAAGTATCCCCAGTGTCTAAACTTGAAGGCTATATTAGGC
GGCCCTGAGTACACGGAAAGTATCTCAAAAGCAGACCCACGCGGTAAAGCAGATCTAAAG
GCATCATGTGATGACTCGAAGCTCTCTTCTTCTGGTTTATAGTACTGAAACTCTCCAGGT
AAAGAGGTCTTGAGCAAAGCATTGTAGCTCCCAAGCCTAAGCGTTTCTTCAGCTGATAAT
CCTTCTCTCCCATTGACAAAGAGCTTAAACTTATCAGGGTTTATAGTCTTGAAGTCTTGT
AAACGGATCTTGTGTGAGAGCTCCATCTCCCATGACTTGATTGCGTTTTGAACCGTCTCT
TCCAAGGATCCTTCTGGCCATACCTTGGTCTGGCCTTCTTCAAAGAGCTGGTTCACAAGG
TCAAAAGCTGGAGGGTGACCATACCTCCATTGGACATCTCCTACATCGTTAAGGACAGAT
CTATACTTATCTCTCTCTTCCCTAGTAGCCATTATTAACTTTTGATGTCC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 5

CO CL1416Contig1 982 5 24 U
GGAAGTCTTTTGTGTGTCCGTTTCTAGTCTATCTATCTATCTATCTCTTTGTGCAACTTT
TTAGGGTTTTATCTTCCAAAGTCACAGTGCCCCCCTCCCCTTCTTCTCTTATCCTCAAGA
CAGCAGAAATGGCGGCGACTCAACTCGCAGCATCACCAGTGACTGTGTCAGCTAGGAGCT
TAGCCTCACTCAGAGCTTCGAGTGCCATCAAGTTTGGAACTTTGAAACCAGGCACCCTTA
AGCAGACTCAGTTCCGTTCTTTGGTTGTCAGAGCTGCTTCCGTCGTTGCTCCCAAGTATA
CTTCAATTAAGCCATTGGGAGATCGAGTTCTGGTTAAGACCAAGGAGGCAGAGGAGAAGA
CAATGGGAGGTATTTTACTTCCATCCACAGCTCAATCAAAACCTCAGGGAGGTGAAGTCA
TTGCTGTGGGTGAAGGAAGAACTATTGGGAAGAACAAAATCAATATCGATGTCCCTACTG
GAGCACAGATCATCTACTCCAAATACGCAGGAACCGAGGTGGAGTTCAACGATGTGAAGC
ATCTCATTCTCAAGGAAGATGATATCGTTGGCCTTCTTGAGACGGAGGACATCAAAGATC
TCAAGCCATTGAACGACCGAGTCTTCATTAAGGTTGCTGAGGCTGAGGAGAAAACAGCTG
GAGGGTTGTTGCTTACCGAGACTACCAAAGAGAAGCCTTCTATTGGCACGGTGATAGCAG
TTGGACCAGGTTCTCTAGATGAGGAAGGTAAGCGTCAGCCACTATCGATATCGACTGGAA
GCACAGTTCTTTACTCCAAGTATGCTGGCAATGACTTCAAGGGCAAAGATGGTTCCAACT
ACATCGCCCTGAGAGCTTCGGATGTGATGGCTATCCTTTCTTAGTTTGTATCTTTGTGAC
CCTGCAATTTGTATCCCAAATGTGGAAATTTTTCATAAACGGCTTCTGCACAATCTGAAA
TAAAAGACTTTGAGAGCTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 
30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1G751TF U 1
AF RS1F177TF U 58
AF RS1BC19TF U 113
AF RS1BC19JQ C 189
AF RS1F177JQ C 244
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RD RS1G751TF 550 0 0
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TTAGGGTTTTATCTTCCAAAGTCACAGTGCCCCCCTCCCCTTCTTCTCTTATCCTCAAGA
CAGCAGAAATGGCGGCGACTCAACTCACAGCATCACCAGTGACTGTGTCAGCTAGGAGCT
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CTATGGGAGGTATCTTACTTCCTTCCACAGCTCAATCAAAACCTCAAGGAGGTGAAGTCA
TTGCTGTGGGTGAAGGAAGAACTATTGGGAAGAACAAAATCGATATCGATGTCCCTACTG
GAGCACAGATCATCTACTCCAAATACGCAG*AACCGAAGTGGAGTTCAACGATGTGAAGC
ATCTCATTCT

QA 1 550 1 550
DS 

RD RS1F177TF 681 0 0
TTTTTAGGGTTTTATCTTCCAAAGTCACAGTGCCCCCCT*****TCTTCTCTTATCCTCA
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GCTTAGCCTCACTCAGAGCTTCGAGTGCCATCAAGTTTGGAACTTTGAAACCAGGCACCC
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CTGGAGGGTTGTTGCTTACCGAGACTACCAAAGAGAAGCCTTCTATTGGCACGGTGATAG
CAGTTGGACCAGGT
CTCTAGA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1BC19TF 743 0 0
GGATCCTCA
AGCAGAAATGGCGGCGACTCAACTCGCAGCATCACCAGTGACTGTGTCAGCTAGGAGCTT
AGCCTCACTCAGAGCTTCGAGTGCCATCAAGTTTGGAACTTTGAAACCAGGCACCCTTAA
GCAGACTCAGTTCCGTTCTTTGGTTGTCAGAGCTGCTTCCGTCGTTGCTCCCAAGTATAC
TTCAATTAAGCCATTGGGAGATCGAGTTCTGGTTAAGACCAAGGAGGCAGAGGAGAAGAC
AATGGGAGGTATTTTACTTCCATCCACAGCTCAATCAAAACCTCAGGGAGGTGAAGTCAT
TGCTGTGGGTGAAGGAAGAACTATTGGGAAGAACAAAATCAATATCGATGTCCCTACTGG
AGCACAGATCATCTACTCCAAATACGCAGGAACCGAGGTGGAGTTCAACGATGTGAAGCA
TCTCATTCTCAAGGAAGATGATATCGTTGGCCTTCTTGAGACGGAGGACATCAAAGATCT
CAAGCCATTGAACGACCGAGTCTTCATTAAGGTTGCTGAGGCTGAGGAGAAAACAGCTGG
AGGGTTGTTGCTTACCGAGACTACCAAAGAGAAGCCTTCTATTGGCACGGTGATAGCAGT
TGGACCAGGTTCTCTAGATGAGGAAGGTAAGCGTCAGCCACTATCGATATCGACTGGAAG
CACAGTTCTTTACTCCAAGTATGCTGGCAATGACTTCAAGGGCAAAGATGGTTCCAACTA
CATCGC
CTGAGAGC

QA 10 735 10 735
DS 

RD RS1BC19JQ 794 0 0
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CAGTTCCGTTCTTTGGTTGTCAGAGCTGCTTCCGTCGTTGCTCCCAAGTATACTTCAATT
AAGCCATTGGGAGATCGAGTTCTGGTTAAGACCAAGGAGGCAGAGGAGAAGACAATGGGA
GGTATTTTACTTCCATCCACAGCTCAATCAAAACCTCAGGGAGGTGAAGTCATTGCTGTG
GGTGAAGGAAGAACTATTGGGAAGAACAAAATCAATATCGATGTCCCTACTGGAGCACAG
ATCATCTACTCCAAATACGCAGGAACCGAGGTGGAGTTCAACGATGTGAAGCATCTCATT
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TTGAACGACCGAGTCTTCATTAAGGTTGCTGAGGCTGAGGAGAAAACAGCTGGAGGGTTG
TTGCTTACCGAGACTACCAAAGAGAAGCCTTCTATTGGCACGGTGATAGCAGTTGGACCA
GGTTCTCTAGATGAGGAAGGTAAGCGTCAGCCACTATCGATATCGACTGGAAGCACAGTT
CTTTACTCCAAGTATGCTGGCAATGACTTCAAGGGCAAAGATGGTTCCAACTACATCGCC
CTGAGAGCTTCGGATGTGATGGCTATCCTTTCTTAGTTTGTATCTTTGTGACCCTGCAAT
TTGTATCCCAAATGTGGAAATTTTTCATAAACGGCTTCTGCACAATCTGAAATAAAAGAC
TTTGAGAGCTTATT

QA 1 794 1 794
DS 

RD RS1F177JQ 738 0 0
AGACTCAGTTCCGTTCTTTGGTTGTCAGAGCTGCTTCCGTCGTTGCTCCCAAGTATACTT
CAATTAAGCCATTGGGAGATCGAGTTCTGGTTAAGACCAAGGAGGCAGAGGAGAAGACAA
TGGGAGGTATTTTACTTCCATCCACAGCTCAATCAAAACCTCAGGGAGGTGAAGTCATTG
CTGTGGGTGAAGGAAGAACTATTGGGAAGAACAAAATCAATATCGATGTCCCTACTGGAG
CACAGATCATTTACTCCAAATACGCAGGAACCGAGGTGGAGTTCAACGATGTGAAGCATC
TCATTCTCAAGGAAGATGATATCGTTGGCCTTCTTGAGACGGAGGACATCAAAGATCTCA
AGCCATTGAACGACCGAGTTTTCATTAAGGTTGCTGAGGCTGAGGAGAAAACAGCTGGAG
GGTTGTTGCTTACCGAGACTACCAAAGAGAAGCCTTCTATTGGCACGGTGATAGCAGTTG
GACCAGGTTCTCTAGATGAGGAAGGTAAGCGTCAGCCACTATCGATATCGACTGGAAGCA
CAGTTCTTTACTCCAAGTATGCTGGCAATGACTTCAAGGGCAAAGATGGTTCCAACTACA
TCGCCCTGAGAGCTTCGGATGTGATGGCTATCCTTTCTTAGTTTGTATCTTTGTGACCCT
GCAATTTGTATCCCAAATGTGGAAATTTTTCATAAACGGCTTCTGCACAATCTGAAATAA
AAGACTTTGAGAGCTTA
C

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 6

CO CL1417Contig1 1412 6 20 U
GAAGAAAAATCATGGCTGAAGGAATCTCTCACTCAGAGGTTTTGTCCAGTAACGCTATCG
ATATCTTCCATGCTCTTGTCACCGCTATGTCCCAAATGAAGAACGGGAACCTCGGAGAAG
CCGGACCTGCTCCTGATCGTGATCTTCTAGAAGACATGGACGACAAAGGATTACCTAAAT
GGCATTCTGACAAAGACAGGAAGCTTATGGCTCAGGCCGGACGCCCTGATGCCCCAGCTG
ATGAAGGCATAGGTGAAGGCGGCGGTGGTGGCGGTAAGATCAAGCCGACTCATGTGGTGG
CTAAAGATGGAAGTGGACAGTTTAAGACGATTTCCGAAGCAGTTAAGGCTTGTCCGCAGA
AAAATCCTGGACGTTGCATTATCTATATTAAGGCTGGTGTCTACAAGGAACAGGTCACTA
TCCCTAAGAAGGTAAACAACGTTTTCATGTTTGGTGATGGTGCAACAAAAACAATCATTA
CTTTCGACAGAAGTGTTGGTCTTAGCCCTGGAACCACTACTTCACTCAGTGGCACCGTTC
AGGTGGAATCTGAGGGATTCATGGCGAAATGGATTGGGTTTCAGAACACTGCTGGTCCAT
TAGGACACCAAGCCGTCGCATTCCGTGTGAACGGAGACCGTGCGGTCATATTCAACTGCA
GATTTGATGGTTACCAAGACACACTCTACGTCAACAACGGACGTCAGTTCTACAGGAACA
TTGTTGTGTCCGGTACAGTCGATTTTATCTTCGGAAAATCTGCGACCGTGATCCAAAACT
CTCTAATCCTCTGCCGAAAGGGAAACAAAGGACAAACCAACCACGTTACAGCCGACGGTA
ACATGAAAGGTAAAGCGGTGAAGATTGGTATCGTTCTACATAACTGCCGTATCATGGCGG
ACAAAGAGCTCGAAGCTGACAGGCTAACCGTCAAATCATACCTTGGACGGCCGTGGAAAC
CATTTGCAACCACCGCTGTTATTGGAACTGAGATTGGTGATTTGATTCAACCGGTAGGAT
GGAACGAATGGCAAGGAGAAAAGTTCCATCTGACAGCTACATATGTTGAGTTCAATAACC
GTGGACCAGGAGCTAACACAGCTGCGAGGGCTCCTTGGGCTAAGATGGCTAAGTCTGCCG
CTGAGGTTGAACGTTTCACCGTCGCTAACTGGCTGACTCCGGCTAACTGGATTCAAGAAG
CCAACGTTCCTGTCCAGCTTGGATTGTAAAAGAAACTACCTAACAAAATAATATAGTATG
TGATCATGTAAAAAGGTTACAGTACGACCTCGTCTCTCGGGATCAGGGCTCTTTTTGGTT
ATTATTAGGGTTCTAGGCATTTTGGGATGATGTTTGTATAAAATTGCTTTTGTTTCACAT
GCAAAACATATGTACAAAATACCTTATTTCTT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1GT14TF U 1
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G
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TCAAAGCTTCCTCCGAACCTTCCGACTCAGCCTCAGTCTCTACCACATCCAGCGAACCTG
TACTATTCACCGCTCCTCCAGGTTTCAATCCCCCGGAGCCGCAGCGCTTCGCCGTCAAAC
CCGGAAAGCTCTTCGACGTCTTGGGTGCTTCCATCGGACTACTTTTCCGCTTCGGCACCG
GCGTTTTCGTCTCTGGGTACTCTGCTTCTTTCGTGTCCGAGGACGAGGTTCCATCTGACC
AGTACGCGTTTCGTCTCGGCGGGATCACTGTAAAGGAAAGCTCCAAGCTTGGGCCTCGTC
CCGAGAAACCCATCGAGATTTACGAGTTTGAAGGATGTCCCTTCTGTCGCAAGGTCAGGG
AAATGGTTGGAGTGTTGGATCTTGATATTCTCTACTATCCTTGTCCAAGAGGAAGTCCTA
ATTTCCGCCCCAAGGTTAATCAGATGGGTGGCAAACGACAGTTTCCCTACATGGTTGATC
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ATGGAGATGGAACAGTTCCTTTAAGCTTGACACTTGGTCCGTTAACG*CTATAACAGCTG
GCTTTGCA*TGATTGGTCGTATGGGG
GAG

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CACTTGGTCCGTTAACGGCTATAACAGCTGGCTTTGCAATGATTGGTCGTATGGGGAAGG
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GCTACTTTTCTGTTGC

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CACT
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GCAAACAACAGTTTCCCTACATGGTTTATCCAAATACTGGAGTGTCCATGTATGAATCAG
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CACTTGGTCCGTTAACGGCTATAACAGCTGGCTTTGCAATGATTGGTCGTATGGGGAAGG
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TTCAGGTGCCTTACTTGGAAGATCCGAACACTGGAGTAAATATGTTTTGAGAGTGCAGAG
ATTGTAGAGTATCTGAAGCAAACTTATGCTGCTTAAGTTAATCTTCTTTACTCTTACGAG
CAAATATAGATATAAATTTGAATGTATGTATGTATAAACAAACTTATGCTGCTTAATTTA
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ATCA
G

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DS 

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CCAAGAGGAAGTCCTAATTTCCGCCCCAAGGTTAATCAGATGGGTGGCAAACAACAGTTT
CCCTACATGGTTTATCCAAATACTGGAGTGTCCATGTATGAATCAGATGCAATCATCAAG
TATCTGTCCGAGAAATATGGAGATGGAACAGTTCCTTTAAGCTTGACACTTGGTCCGTTA
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CCAGCAAAACTACCACCTAAGCCACTCGTATTCTGGGCATATGAGGGTTTTCCGTTTTGC
AAGCTTGTACGCGAAGTTCTCGTTGAACTGGAGTTACCACACATTCAACGCAGTTTTGCT
CGTGGTAGCCCCAAACGGCATGAATTGCTCAAGAAAGCAGGTCACTTTCAGGTGCCTTAC
TTGGAAGATCCGAACACTGGAGTAAATATGTTT*GAGAGTGCAGAGATTGTAGAGTATTT
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AATTTGAATGTATGTATGTATAAACAAACTTATGCTGCTTAATTTAGCTACTTTTCTGTT
GCAATATAAACTCAACTTAGTTATGAGTAAGTGTAGGGGTGTAACGATCAAG

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 6

CO CL1419Contig1 1568 6 16 U
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TCTCCACCAATCTCATTTGGCAGAGATGGAGGCTGGCGCTGGTATTGGTTTGTACCCGCT
GCACCGTTGCAAAACAATCTACCTAGTGAGACATGCTCAAGGGATCCACAATGTTGATGG
GGACAAGAACTATAAGGCTTACATGTCTCATGACTACTTTGATGCTGAGTTGACCCAACT
TGGCTGGCAACAGGTAGATAATTTGCGTAAGCATGTTCGTTCCAGTGGACTTCACAAGAA
GATTGAGTTGGTCATCTCGTCTCCACTCATGAGAACAATGCAAACTGCCGTTGGTGTTTT
CGGTGGAGATGGCTACACGGATATGAGCGATGTACTACCTCTAATGGTAGCAAATGCAGG
AAACAGCAACCGTGCAGCTATATCCAGTTCAAACTGCCCACCTATTATCACAGAGGAGTC
TTGCAGAGAACATTTGGGAGTGCATCCATGCGATCAGAGAAGAAGCATCAGCGACTATCA
GTTTCTTTTCCCCGCTGTTGATTTTTCACTGATAGAGAGCGATGAAGATACGTTATGGAA
GGCTGACGTTAGAGAAACAATCGAAGAACTTGCAGCTAGAGGCAAAAAGTTCCTCAACTG
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CATTTCAGTGACTGATTATCCAGGGAAAATTCCAAAGGGGACCGATCTTCCAAGTGATGC
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TTATCTTCTTCACATTTTTCTTCCAACTTTCTATCTCTATCCATATCCAAACAAGCTTCT
TTGTTGTATGCAACTGTCTTTTTATTAGTCTTTCGCATTCAGTTAAAAGATCTTTTAAGA
TGCTTTGTGACAAACTTGATTTAATCATATTTGCTTCTTTTTTTTTTTGCATATATGATC
CTAGGTCATAACTTCCTGAATTTAGTTTGCTCTACATTCAAGACAAATCCGATATTTCAG
GTGTGAACAAATCAAGAAAGAAAGAAAAACATAGAAACAAATGGAATCCGATTGCATAAA
ACATTGAACTGACATGTGACTTCTTGTAACAACAAAACTCTAAATTTTCTCTCTCAAAAC
TCTGTTCCTTGATTCCTAAGTAGTGCCGACGATGATGTTGTTGATGGGAATAAAGATGAG
TTTCACAAAGAAGCCAACGAATCCCATCACTACAAACCCTATCGCTGTGCGAACTGCAAC
TTTCGTGAACTCTTTGCGATCTGGTTTGTGGCGACGCTTAACGAGACGGATGCTATCCTT
GGCGAAGTCTCTGAGAGGATCAACGACGGAATCAATGGCGTCCATGGCGATGAAAGGCGT
TGGAATCC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DN79TF U 36
AF RS1CM87TF U 1
AF RS1EL37TF U 53
AF RS1AA50TF U 3
AF RS1EL37JQ C 424
AF RS1E937TF C 777
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BS 730 756 RS1CM87TF
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BS 884 1114 RS1EL37JQ
BS 1115 1568 RS1E937TF

RD RS1DN79TF 613 0 0
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GCGCTGGTATTGGTTTGTACCCGCTGCACCGTTGCAAAACAATCTACCTAGTGAGACATG
CTCAAGGGATCCACAATGTTGATGGGGACAAGAACTATAAGGCTTACATGTCTCATGACT
ACTTTGATGCTGAGTTGACCCAACTTGGCTGGCAACAGGTAGATAATTTGCGTAAGCATG
TTCGTTCCAGTGGACTTCACAAGAAGATTGAGTTGGTCATCTCGTCTCCACTCATGAGAA
CAATGCAAACTGCCGTTGGTGTTTTCGGTGGAGATGGCTACACGGATATGAGCGATGTAC
TACCTCTAATGGTAGCAAATGCAGGAAACAGCAACCGTGCAGCTATATCCAGTTCAAACT
GCCCACCTATTATCACAGAGGAGTCTTGCAGAGAACATTTGGGAGTGCATCCATGCGATC
AGAGAAGAAGCATCAGCGACTATCAGTTTCTTTTCCCCGCTGTTGATTTTTCACTGATAG
AGAGCGATGAAGATACGTTATGGAAGGCTGACGTTAAAGAAACAATCGAATAACTTGCAG
CTAGAGGCAAAAA

QA 1 613 1 613
DS 

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GGATCGACCATCTCCTACTACTTCATTCCCATCTTCTCTCCTCAGCCTCCTTTCGGTTCA
TCTCCACCAATCTCATTTGGCAGAGATGGAGGCTGGCGCTGGTATTGGTTTGTACCCGCT
GCACCGTTGCAAAACAATCTACCTAGTGAGACATGCTCAAGGGATCCACAATGTTGATGG
GGACAAGAACTATAAGGCTTACATGTCTCATGACTACTTTGATGCTGAGTTGACCCAACT
TGGCTGGCAACAGGTAGATAATTTGCGTAAGCATGTTCGTTCCAGTGGACTTCACAAGAA
GATTGAGTTGGTCATCTCGTCTCCACTCATGAGAACAATGCAAACTGCCGTTGGTGTTTT
CGGTGGAGATGGCTACACGGATATGAGCGATGTACTACCTCTAATGGTAGCAAATGCAGG
AAACAGCAACCGTGCAGCTATATCCAGTTCAAACTGCCCACCTATTATCACAGAGGAGTC
TTGCAGAGAACATTTGGGAGTGCATCCATGCGATCAGAGAAGAAGCATCAGCGACTATCA
GTTTCTTTTCCCCGCTGTTGATTTTTCACTGATAGAGAGCGATGAAGATACGTTATGGAA
GGCTGACGTTAGAGAAACAATCGAAGAACTTGCAGCTAGAGGCAAAAAGTTCCTCAACTG
GCTATGGACAAGAAAGGAA**AGAGATAGCGATTGTGACACACAGTGGTTTCTTGTTTCA
CACGCTGA*CGCTCTACAGAGTGAGTGCCATCCAGA

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DS 

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GG
GGTTCATCTCCACCAATCTCATTTGGCAGAGATGGAGGCTGGCGCTGGTATTGGTTTGTA
CCCGCTGCACCGTTGCAAAACAATCTACCTAGTGAGACATGCTCAAGGGATCCACAATGT
TGATGGGGACAAGAACTATAAGGCTTACATGTCTCATGACTACTTTGATGCTGAGTTGAC
CCAACTTGGCTGGCAACAGGTAGATAATTTGCGTAAGCATGTTCGTTCCAGTGGACTTCA
CAAGAAGATTGAGTTGGTCATCTCGTCTCCACTCATGAGAACAATGCAAACTGCCGTTGG
TGTTTTCGGTGGAGATGGCTACACGGATATGAGCGATGTACTACCTCTAATGGTAGCAAA
TGCAGGAAACAGCAACCGTGCAGCTATATCCAGTTCAAACTGCCCACCTATTATCACAGA
GGAGTCTTGCAGAGAACATTTGGGGGTGCATCCATGCGATCAGAGAAGAAGCATCAGCGA
CTATCAGTTTCTTTTCCCCGCTGTTGATTTTTCACTGATAGAGAGCGATGAAGATACGTT
ATGGAAGGCTGACGTTAGAGAAACAATCGAAGAACTTGCAGCTAGAGGCAAAAAGTTCCT
CAACTGGCTATGGACAAGGAAAGAAAAAGAGATAGCGATTGTGACACACAGTGGTTTCTT
GTTTCACACGCTGAACGCTCTACAGAGTGAGTGCCATCCAGA
TGTTA

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DS 

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GGG
GACCATCTCCTACTACTTCATTCCCATCTTCTCTCCTCAGCCTCCTTTCGGTTCATCTCC
ACCAATCTCATTTGGCAGAGATGGAGGCTGGCGCTGGTATTGGTTTGTACCCGCTGCACC
GTTGCAAAACAATCTACCTAGTGAGACATGCTCAAGGGATCCACAATGTTGATGGGGACA
AGAACTATAAGGCTTACATGTCTCATGACTACTTTGATGCTGAGTTGACCCAACTTGGCT
GGCAACAGGTAGATAATTTGCGTAAGCATGTTCGTTCCAGTGGACTTCACAAGAAGATTG
AGTTGGTCATCTCGTCTCCACTCATGAGAACAATGCAAACTGCCGTTGGTGTTTTCGGTG
GAGATGGCTACACGGATATGAGCGATGTACTACCTCTAATGGTAGCAAATGCAGGAAACA
GCAACCGTGCAGCTATATCCAGTTCAAACTGCCCACCTATTATCACAGAGGAGTCTTGCA
GAGAACATTTGGGAGTGCATCCATGCGATCAGAGAAGAAGCATCAGCGACTATCAGTTTC
TTTTCCCCGCTGTTGATTTTTCACTGATAGAGAGCGATGAAGATACGTTATGGAAGGCTG
ACGTTAGAGAAACAATCGAAGAACTTGCAGCTAGAGGCAAAAAGTTCCTCAACTGGCTAT
GGACAAGGAAAGAAAAAGAGATAGCGATTGTGACACACAGTGTTTTCTTGTTTCACACGC
TGAACGCTCTACAGAGTGAGTGCCATCCAGATGTTAAGAAAGAGATTTGCAGCCACTTTG
CAAATTGCGAGCTACGCTCAATGGTCATCGTTGATAGAAGTATGTTAG*ATCGGACATTT
CAGTGACTGAT
ATCCAGGG

QA 4 854 4 854
DS 

RD RS1EL37JQ 693 0 0
CAGCAACCGTGCAGCTATATCCAGTTCAAACTGCCCACCTATTATCACAGAGGAGTCTTG
CAGAGAACATTTGGGGGTGCATCCATGCGATCAGAGAAGAAGCATCAGCGACTATCAGTT
TCTTTTCCCCGCTGTTGATTTTTCACTGATAGAGAGCGATGAAGATACGTTATGGAAGGC
TGACGTTAGAGAAACAATCGAAGAACTTGCAGCTAGAGGCAAAAAGTTCCTCAACTGGCT
ATGGACAAGGAAAGAAAAAGAGATAGCGATTGTGACACACAGTGGTTTCTTGTTTCACAC
GCTGAACGCTCTACAGAGTGAGTGCCATCCAGATGTTAAGAAGGAGATTTGCAGCCACTT
TGCAAATTGCGAGCTACGCTCAATGGTCATCGTTGATAGAAGTATGTTAGGATCGGACAT
TTCAGTGACTGATTATCCAGGGAAAATTCCAAAGGGGACTGATCTTCCAAGTGATGCTGT
TGTAGAGAATGATAATAACATCAAAGGTGAATGAATGATGATTCTTGTTTAAGCTTATTA
TCTTCTTCACATTTTTCTTCCAACTTTCTATCTCTATCCATATCCAAACAAGCTTCTTTG
TTGTATGCAACTGTCTTTTTATTAGTCTTTCGCATTCAGTTAAAAGATCTTTTAAGATGC
TTTGTGACAAACTTGATTTAATCATATTTGC
CT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1E937TF 792 0 0
GCCACTTTGCAAATTGCGAGCCACGCTCAATGGTCATCGTTGATAGAATTATGTTAGGAT
CGGACATTTCAGTGACTGATTATCCAGGGAAGATTCCAAAGGG*ACCGATCTTCCAAGTG
ATGCTGTTGTAGAGAATGATAATAACATCAAAGGTGAATGAATGATGATTCTTGTTTAAG
CTTATTATCTTCTTCACATTTTTCTTCCAACTTTCTATCTCTATCCATATCCAAACAAGC
TTCTTTGTTGTATGCAACTGTCTTTTTATTAGTCTTTCGCATTCAGTTAAAAGATCTTTT
AAGATGCTTTGTGACAAACTTGATTTAATCATATTTGCTTCTTTTTTTTTTTGCATATAT
GATCCTAGGTCATAACTTCCTGAATTTAGTTTGCTCTACATTCAAGACAAATCCGATATT
TCAGGTGTGAACAAATCAAGAAAGAAAGAAAAACATAGAAACAAATGGAATCCGATTGCA
TAAAACATTGAACTGACATGTGACTTCTTGTAACAACAAAACTCTAAATTTTCTCTCTCA
AAACTCTGTTCCTTGATTCCTAAGTAGTGCCGACGATGATGTTGTTGATGGGAATAAAGA
TGAGTTTCACAAAGAAGCCAACGAATCCCATCACTACAAACCCTATCGCTGTGCGAACTG
CAACTTTCGTGAACTCTTTGCGATCTGGTTTGTGGCGACGCTTAACGAGACGGATGCTAT
CCTTGGCGAAGTCTCTGAGAGGATCAACGACGGAATCAATGGCGTCCATGGCGATGAAAG
GCGTTGGAATCC

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 6

CO CL1420Contig1 657 6 29 U
CGAAGCAAAACCTTCTAACACAATGGTCAGAGTTTTATTAAATTGACATAACCACCTCTT
GTCATTTTGAGGCTTCTTCTTCTATAAACAAGACATGTATATATGAACTAAGAATAAATT
AAATAATAAAAGAGGATGAACAAACAAACAATATGATTGATGGAAAACAATAGAGAAAGA
TTCAATCTCCAGGAATCATGACAGAAGCACAAATCATGAGCAAATTAAATAGCCTTGAGA
GACTCAAAACTCTTTAAGAGAATGTTATCCACAAACTACTAGAAGGATAAAAAAA*GAAA
AATCAGAAGAAGGAGAGGGAAGAAGAAGCATCGAGAGGATGGATAAGGTAAGTGAGGACA
AGCGCCACCACCATTAGCAAATACGCAATCCCTTGATCTATCGATGTCCCGTCACTGGTG
GGAGCTGGAGCGGGAGCTAGGGTTTGAGCGCCGGCGAGAGACGAGATGACGGCGAATACA
AATGTGAATAACGCGAATCCGGCTACGGAGTTTCTCGACGCCATCTCTCTCTCTCTCT**
TAAGATCCGAGGAGTTCAAATAAGATCGCGAGCTCTGCAGGGTGAAAATGAAAAACTCCG
ACGAGAGAGAGAGAGAGAGTATCTGCAGAGACGAGGAAATGAGGATGATGAAGTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
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40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RS1EF66JQ U 1
AF RS1DC95JQ U 101
AF RS1DC95TF C 101
AF RS1EF66TF C 4
AF RS1B144JQ U 100
AF RS1B144TF C 100
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GTCATTTTGAGGCTTCTTCTTCTATAAACAAGACATGTATATACGAACTAAGAATAAATT
AAATAATAAAAGAGGATGAACAAACAAACAATATGATTAATGGAAAACAATAGAGAAAGA
TTCAATCTCCAGGAATCATGACAGAAGCACAAATCATGAGCAAATTAAATAGCCTTGAAA
AACTCAAAACTCTTTAAAAAAATGTTATCCACAAACTACTAGAAGGATAAAAAAA*GAAA
AATCAAAAAAAGGAGAGGGAAGAAAAAGCATCGAGAGGATGGATAAGGTATGTGAGGACA
AGCGCCACCACCAATAGCAAATACGCAATCCCTTGATCTATCGATGTCCCGTCACTGGTG
GGAGCTGGAGCGGGAGCTAGGGTTTGAGCGCCGGCGAGAGACGA

QA 1 464 1 464
DS 

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G
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GGAAAACAATAGAGAAAGATTCAATCTCCAGGAATCATGACAGAAGCACAAATCATGAGC
AAATTAAATAGCC**GAGAGACTCACAACTCTTTAAGAGAATGTTATCCACAAACTACTA
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CGATGTCCCGTCACTGGTGGGAGCTGGAGCGGGAGCTAGGGTTTGAGCGCCGGCGAGAGA
CGAGATGACGGCGAATACAAATGTGAATAACGCGAATCCGGCTACGGAGTTTCTCGACGC
CATCTCTCTCTCTCTCTCTTAAGATCCGAGGAGTTCAAATAAGATCGCGAGCTCTGCAGG
GTGAAAATGAAAAA

QA 2 495 2 495
DS 

RD RS1DC95TF 495 0 0
G
TATGAACTAAGAATAAATTAAATAATAAAAGAGGATGAACAAACAAACAATATGATTGAT
GGAAAACAATAGAGAAAGATTCAATCTCCAGGAATCATGACAGAAGCACAAATCATGAGC
AAATTAAATAGCC**GAGAGACTCACAACTCTTTAAGAGAATGTTATCCACAAACTACTA
GAAGGATAAAAAAA*GAAAAATCAGAAGAAGGAGAGGGAAGAAGAAGCATCGAGAGGATG
GATAAGGTAAGTGAGGACAAGCGCCACCACCATTAGCAAATACGCAATCCCTTGATCTAT
CGATGTCCCGTCACTGGTGGGAGCTGGAGCGGGAGCTAGGGTTTGAGCGCCGGCGAGAGA
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CATCTCTCTCTCTCTCTCTTAAGATCCGAGGAGTTCAAATAAGATCGCGAGCTCTGCAGG
GTGAAAATGAAAAA

QA 2 495 2 495
DS 

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AAGCAGAA
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GCTTCTTCTTCTATAAACAAGACATGTATATACGAACTAAGAATAAATTAAATAATAAAA
GAGGATGAACAAACAAACAATATGATTAATGGAAAACAATAGAGAAAGATTCAATCTCCA
GGAATCATGACAGAAGCACAAATCATGAGCAAATTAAATAGCCTTGAGAAACTCAAAACT
CTTTAAGAGAATGTTATCCACAAACTACTAGAAGGATAAAAAAA*GAAAAATCAGAAGAA
GGAGAGGGAAGAAGAAGCATCGAGAGGATGGATAAGGTATGTGAGGACAAGCGCCACCAC
CAATAGCAAATACGCAATCCCTTGATCTATCGATGTCCCGTCACTGGTGGGAGCTGGAGC
GGGAGCTAGGGTTTGAGCGCCGGCGAGAGACGAGATGACGGCGAATACAAATGTGAATAA
CGCGAATCCGGCTACGGAGTTTCTCGACGCCATCTCTCTCTCTCTCT**TAAGATCCGAG
GAGTTAAAATAAGATCGCGAGCTCTGTAGGGTGAAAATGAAAAACTCCGACGAGAGAGAG
AG****AGTATCTGCAGAGACGAGGAAATGAGGATGATGAAG

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DS 

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CA
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GGAAAACAATAGAGAAAGATTCAATCTCCAGGAATCATGACAGAAGCACAAATCATGAGC
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CGATGTCCCGTCACTGGTGGGAGCTGGAGCGGGAGCTAGGGTTTGAGCGCCGGCGAGAGA
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AGGATGATGAAGTATC

QA 3 558 3 558
DS 

RD RS1B144TF 558 0 0
CA
TATGAACTAAGAATAAATTAAATAATAAAAGAGGATGAACAAACAAACAATATGATTGAT
GGAAAACAATAGAGAAAGATTCAATCTCCAGGAATCATGACAGAAGCACAAATCATGAGC
AAATTAAATAGCCTTGAGAGACTCA***CTCTTTAAGAGAATGTTATCCACAAACTACTA
GAAGGATAAAAAAAAGAAAAATCAGAA***GGAGAGGGAAGAAGAAGCATCGAGAGGATG
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CGATGTCCCGTCACTGGTGGGAGCTGGAGCGGGAGCTAGGGTTTGAGCGCCGGCGAGAGA
CGAGATGACGGCGAATACAAATGTGAATAACGCGAATCCGGCTACGGAGTTTCTCGACGC
CATCTCTCTCCCTCTCT**TAAGATCCGAGGAGTTCAAATAAGATCGCGAGCTCTGCAGG
GTGAAAATGAAAAACTCCGACGAGAGAGAGAGAGAGAGTATCTGCAGAGACGAGGAAATG
AGGATGATGAAG
TATC

QA 3 554 3 554
DS 



AS 1 5

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ACCTCCACACAAACAGGAAAGAGAGAGAGGAAGAAGAGCAAGTACTTTTCGTCTGAGTTC
TTGTCAGATTTTTCATCTAAAGGCAGAAGAAAGACCAAAACTGAACCTGAATCTTGCATT
GTTCCAAGTCAGGGCCAAGTAGGAGGAGGAGAGCTGATGGCCGATGGTGCGAGTAATAGC
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CGGGATCTGATTCGTGTATCTGCTCTTGGTACAGAATATCCAAAAGACAGTAGCTCAAGA
GACATGGTAAGAGAGTTCATGTCCATCTACAGAAGCTTCACATATTGTGAGGGTGTTAAC
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CGGAGAAAACTAAAGACGCAAGCTGATGAAGTAGAAGAAACCCGCAAAGAGGTGACTGAG
ACGACAAAGAAAGAGAGAAAGCGTAGGAAGCCTGAATCTGAGAAGAAAGCTGATGAAGAA
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AAGAAGCCTAAGTTTGAAGAACAGGAAACCCCGAGTGAGTCTGAGAAGAAGGAAAGAGAG
GCAAAAACAAAGAAGCAGGAATCTGAGAAGGAATTTTCAGGAGCTGAGCTGTTTGTTACA
TTTGGTCCTGGTTCAAGTCTACCTAAAAAAGAAGTGCTTATTGGAATCTATGGAAAGTTT
GGAGCTTTGGATGAAGAGAGAAGCTATGTTTCAGAGACCAGCTTCTGTGCCCGTGTTGCC
TTCTTGAACGTGGACGAGGGAGAGACAGCCTTTGAGTCTTCACTTGAGAACTCTCCTTTT
GGTTCTATTTCCGCGGTGAAATTCAGACTCAAGTATCCTAATGAGAGAGCAGGGAAGAAG
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AAGAAGTTTGAGGAGATGATATCATTGGTGGATAAGTCTGAAAGAGGGATGACTGCCGAA
GTTAAAGTGAAACTTGAAGAGGAGATGGTGAATTTGCTTGAGGAAGTAAGAAAGATGCCA
CTGTCTTAGGGTTATGTTTTTATGTTTTATGTTGGTTGAGACGTTTACAGGGGGGATTGT
GAGTTTTCTGGAAAAAGCAAGGTCTTAGGATTATGTTTCTTATGTTTGTTGGTTGAGAAT
TTTCGAGACACTTTTACAGGTTTTTAGGATATTTATGGTCTTCTGCAACAAGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CT36TF U 1
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CGGGATCTGATTCGTGTATCTGCTCTTGGTACAGAATATCCAAAAGACAGTAGCTCAAGA
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ACGACAAAGAAAGAGAGAAAGCGTAG*AAGCCTGAATCTGAGAA

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TCTGCTCTTGGTACAGAATATCCAAAAGACAGTAGCTCAAGAGACATGGTAAGAGAGTTC
ATGTCCATCTACAGAAGCTTCACATATTGTGAGGGTGTTAACAGCAAGTTTCTAGGGAGT
TATAATACTGCAGATTCAGACAAGGAAGAAGTGAATGGGACAGGCAAACCTGAGAAGAAG
ATTGATCAACCTGGAAAAGAAGAGAATGAGACAGCAAAGAGACGGAGAAAACTAAAGACG
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GAAGAAGA
AGAGGTGAGTGGGTC

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AAGAACAGGAAACCCCGAGTGAGTCTGAGAAGAAGGAAAGAGAGGCAAAAACAAAGAAGC
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GCACGG

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CCAGCTTCTGTGCCCGTGTTGCCTTCTTGAACGTGGACGAGGGAGAGACGGCCTTTGAGT
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CTAATGAGAGA

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DS 

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GCTGAGCTGTTTGTTACATTTGGTCCTGGTTCAAGTCTACCTAAAAAAGAAGTGCTTATT
GGAATCTATGGAAAGTTTGGAGCTTTGGATGAAGAGAGAAGCTATGTTTCAGAGACCAGC
TTCTGTGCCCGTGTTGCCTTCTTGAACGTGGACGAGGGAGAGACAGCCTTTGAGTCTTCA
CTTGAGAACTCTCCTTTTGGTTCTATTTCCGCGGTGAAATTCAGACTCAAGTATCCTAAT
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GAGATGGGACATTTGAAGAAGAAGTTTGAGGAGATGATATCATTGGTGGATAAGTCTGAA
AGAGGGATGACTGCCGAAGTTAAAGTGAAACTTGAAGAGGAGATGGTGAATTTGCTTGAG
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GTTTACAGGGGGGATTGTGAGTTTTCTGGAAAAAGCAAGGTCTTAGGATTATGTTTCTTA
TGTTTGTTGGTTGAGAATTTTCGAGACACTTTTACAGGTTTTTAGGATATTTATGGTCTT
CTGCAACAAGAAAAA

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 6

CO CL1422Contig1 1053 6 12 U
GGACGACCTTAAAAATCAGAGATTCCAGTTTTCATACTCTTCTCTCTCTCTCTCTTAATA
CGATTCTGATTCTATTTTTCTCACCAACCATTCTCCAATTTTTCTCAGCCATGGGACACG
GAACAATGGCGACACCACCGACCACCACCACCATCCCCGCCAAGACGACGCTCATCTTCA
CGTACGGAACCCTGAAGAGAGGATTCTCGAACCACGTCCTGATGCAAGATCTGATCCGAT
CAGGCGACTCATCTTTCAAAGGAGTCTACCAAACCCTAGACAAATACCCCCTCGTCTGCG
GACCGTACCGAGTCCCTTTCCTCCTCAACAAGCCTGGATCGGGCCATCGCGTCACGGGAG
AGCTTTACGCCGTTTCTCCTCGCGGTCTCTCGCGTCTCGACGAGCTGGAAGGGATCACTC
GGGGACATTACGTGAGGCAGCCAATCCGCCTCGCTGCTGAGAAACAAGGAGGAGGAGATC
TAGAGTCGTGCGTGGTTGAGGCGTATTATGCGCACAAGAGCTACGATGAGAAGCTGTGGG
AAAGGAGTAGTGGGAGGTCGTTCGGCGCGTACACGGAGAACGAAGCGCGTGGATACGTGA
AGCGTAAGGATCGACCGCAGCATCTTACCTTCTTGGACCATATCCGTATTTTTGTTTCTT
CTCCATGTGATTGATTTTTTTATTTTCCTTGGTCTCTCCCTCTCTATCTCTCACCGCCTT
TTTTAAACCTTTTCTCGGGAAATGAAATAAGAAAGTACAAACGCAAACCACTAGTTTCAT
TCACCAGTGGGACCCCACCGGTTAGTTGTCTCCGTACGACGGTTGTTGGTAGCAATTTGA
TTAGAGGTTCTGTGATTGTTACTTGGATGTTAACTGTTAAGTGTTAAGTGGTAACATAAT
ATAATCAATCTCTCCGTCTTCGATCGCTCGCTGTCTTTAATATCATAAGCTTCGGTCAGT
CGGTGTCTTTACTTCAGGTTCTTTTTTATGTCTCTTATCCGTATCCAATCTTTGTTTTTT
TTCCTATTATAAAGCATAAGTTATTATATAATT


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 25 40 40 25 25 40 15 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GT73TF U 1
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AF RS1EX81TF U 3
AF RS1GT73JQ C 295
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RD RS1GT73TF 679 0 0
GGACGACCTTAAAAATCAGAGATTCCAGTTTTCATACTCTTCTCTCTCTCTCTCTTAATA
CGATTCTGATTCTATTTTTCTCACCAACCATTCTCCAATTTTTCTCAGCCATGGGACACG
GAACAATGGCGACACCACCGACCACCACCACCGTCCCCGCCAAGACGACGCTCATCTTCA
CGTACGGAACCCTGAAGAGAGGATTCTCGAACCACGTCCTGATGCAAGATCTGATCCGAT
CAGGCGACTCACCTTTCAAAGGAGTCTACCAAACCCTAGACAAATACCCCCTCGTCTGCG
GACCGTACCGAGTCCCTTTCCTCCTCAACAAGCCTGGATCGGGCCATCGCGTCACGGGAG
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TAGAGTCGTGCGTGGTTGAGGCGTATTATGCGCACAAGAGCTACGATGAGAAGCTGTGGG
AAAGGAGTAGTGGGAGGTCGTTCGGCGCGTACACGGAGAACGAAGCGCGTGGATACGTGA
AGCGTAAGGATCGACCGCAGCATCTTACCTTCTTGGACCATATCCGTATTTTTGTTTCT*
CTCCATGTGATTGATTTTT

QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1BD57TF 679 0 0
GG
GACCTTAAAAATCAGAGATTCCAGTTTTCATACTCTTCTCTCTCTCTCT**TAATACGAT
TCTGATTCTATTTTTCTCACCAACCATTCTCCAATTTTTCTCAGCCATGGGACACGGAAC
AATGGCGACACCACCGACCACCACCACCATCCCCGCCAAGACGACGCTCATCTTCACGTA
CGGAACCCTGAAGAGAGTATTCTCGAACCACGTCCTGATGCAAGATCTGATCCGATCAGG
CGACTCATCTTTCAAAGGAGTCTACCAAACCCTAGACAAATACCCCCTCGTCTGCGGACC
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TTACGCCGTTTCTCCTCGCGGTCTCTCGCGTCTCGACGAGCTGGAAGGGATCACTCGGGG
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GAGTAGTGGGAGGTCGTTCGGCGCGTACACGGAGAACGAAGCGCGTGGATACGTGAAGCG
TAAGGATCGACCGCAGCATCTTACCTTCTTGGACCATATCCGTATTTTGTTTCTT*CTCC
ATGTGATTGATTTTTT
A

QA 3 678 3 678
DS 

RD RS1EX81TF 721 0 0
GG
GACCTTAAAAATCGGAGATTCC**TTTTCATACTCTTCTCTCTCTCTCTCTTAATACGAT
TCTGATTCTATTTTTCTCACCAACCATTCTCCAATTTTTCTCAGCCATGGGACACGGAAC
AATGGCGACACCACCGACCACCACCACCATCCCCGCCAAGACGACGCTCATCTTCACGTA
CGGAACCCTGAAGAGAGGATTCTCGAACCACGTCCTGATGCAAGATCTGATCCGATCAGG
CGACTCATCTTTCAAAGGAGTCTACCAAACCCTAGACAAATACCCCCTCGTCTGCGGACC
GTACCGAGTCCCTTTCCTCCTCAACAAGCCTGGATCGAGCCATCGCGTCACGGGAGAGCT
TTACGCCGTTTCTCCTCGCGGTCTCTCGCGTCTCGACGAGCTGGAAGGGATCACTCGGGG
ATATTACGTGAGGCAGCCAATCCGCCTCGCTGCTGAGAAACAAGGAGGAGGAGATCTAGA
GTCGTGCGTGGTTGAGGCGTATTATGCGCACAAGAGCTACGATGAGAAGCTGTGGGAAAG
GAGTAGTGGGAGGTCGTTCGGCGCGTACACGGAGAACGAAGCGCGTGGATACGTGAAGCG
TAAGGATCGACCGCAGCATCTTACCTTCTTGGACCATATCCGTATTTTTGTTTCTTCTCC
ATGTGATTGATTTTTT*ATTTTCCTTGGTCTCTCCCTCTCTATCTCTCACCGCCTTTTT

QA 3 721 3 721
DS 

RD RS1GT73JQ 470 0 0
TCTGCGGACCGTACCGAGTCCCTTTCCTCCTCAACAAGCCTGGATCGGGCCATCGCGTCA
CGGGAGAGCTTTACGCCGTTTCTCCTCGCGGTCTCTCGCGTCTGGACGAGCTGGAAGGGA
TCACTCGGGGACATTACGTGAGGCAGCCAATCCGCCTCGCTGCTGAGAAACAAGGAGGAG
GAGATCTAGAGTCGTGCGTGGTTGAGGCGTATTATGCGCACAAGAGCTACGATGAGAAGC
TGTGGGAAAGGAGTAGTGGGAGGTCGTTCGGCGCGTACACGGAGAACGAAGCGCGTGGAT
ACGTGAAGCGTAAGGATCGACCGCAGCATCTTACCTTCTTGGACCATATCCGTATTTTTG
TTTCTTCTCCATGTGATTGATTTTTTTATTTTCCTTGGTCTCTC**TCTCTATCTCTCAC
CGCCTTTTTTAAACCTTTTCTCGGGAAATGAAATAAGAAAGTAC
AAACCC

QA 1 464 1 464
DS 

RD RS1EX81JQ 461 0 0
GCGGACCGTACCGAGTCCCTTTCCTCCTCAACAAGCCTGGATCGAGCCATCGCGTCACGG
GAGAGCTTTACGCCGTTTCTCCTCGCGGTCTCTCGCGTCTCGACGAGCTGGAAGGGATCA
CTCGGGGATATTACGTGAGGCAGCCAATCCGCCTCGCTGCTGAGAAACAAGGAGGAGGAG
ATCTAGAGTCGTGCGTGGTTGAGGCGTATTATGCGCACAAGAGCTACGATGAGAAGCTGT
GGGAAAGGAGTAGTGGGAGGTCGTTCGGCGCGTACACGGAGAACGAAGCGCGTGGATACG
TGAAGCGTAAGGATCGACCGCAGCATCTTACCTTCTTGGACCATATCCGTATTTTTGTTT
CTTCTCCATGTGATTGATTTTTTTATTTTCCTTGGTCTCTCCCTCTCTATCTCTCACCGC
CTTTTTTAAACCTTTTCTCGGGAAATGAAATAAGAAAGTAC

QA 1 461 1 461
DS 

RD RS1B536JQ 702 0 0
TCACGGGAGAGCTTTACGCCGTTTCTCCTCGCGGTCTCTCGCGTCTCGACGAGCTGGAAG
GGATCACTCGGGGACATTACGTGAGGCAGCCAATCCGCCTCGCTGCTGAGAAACAAGGAG
GAGGAGATCTAGAGTCGTGCGTGGTTGAGGCGTATTATGCGCACAAGAGCTACGATGAGA
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GATACGTGAAGCGTAAGGATCGACCGCAGCATCTTACCTTCTTGGACCATATCCGTATTT
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TCGGTCAGTCGGTGTCTTTACTTCAGGTTCTTTTTTATGTCTCTTATCCGTATCCAATCT
TTGTTTTTTTTCCTATTATAAAGCATAAGTTATTATATAATT

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 6

CO CL1423Contig1 949 6 4 U
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CTATCTTCTCTCTAACAGCCTTCTTCATCGGTCTTTGCTTTTCCGGCCGGCGGCGTAGGC
TTTCATAGCTACCGTCGGTCGGGCTTCACTTCTTCTCTCTGTTTTTTTTCTGTTGCTTGC
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GTCTTCCTCCGGTGCTATTTTCCTTCCCTAGGGATTCGCTCGGCTCTCTTTACGAGATCT
CGCCGTCGTCTTCCCCTCTCAGATCTGGCCGGTTGTATGTTGCTGATGCTTGTGTGAGTG
CTTCCGTGGATGGATGGTGTTCTGTTCCTTGCTTATGCTTGCAACGGGATAGATCCTGAT
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CTTGACTCTTTATGCATCTTGCCAGTGGAGATTGATAGGTAAAAGTTATGTCCTTCTTCT
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TATATGGAGGTGCGTCTGCTCCCTAATAATGTCTGGCCATTGATGTGCGCCCATCTTCTC
CTTCCTTCCTTGGTGGTTCTCCGTTCATGGGTTTAATTGTTTGATCTAGATGTTCTTTAT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1BC55TF U 35
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TGT

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TATATGGAGGTGCGTCTGCTCCCTAATAATGTCTGGCCATTGATGTGCGCCCATCTTCTC
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G

QA 1 781 1 781
DS 

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AAAGACGCTCTATCTTCTCTCTAACAGCCTTCTTCATCGGTCTTTGCTTTTCCGGCCGGC
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QA 18 755 18 755
DS 

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AAAGACGCTCTATCTTCTCTCTAACAGCCTTCTTCATCGGTCTTTGCTTTTCCGGCCGGC
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TCGTGGTTTGTCTTCCTCCGGTGCTATTTTCCTTCCCTAGGGATTCGCTCGGCTCTCTTT
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GTGTGAGTGCTTCCGTGGATGGATGGTGTTCTGTTCCTTGCTTATGCTTGCAACGGGATA
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CCTTCTTCTCTATGGGTTGCTATGCGTCGTTCTACGTCATGGTGGCTCGTTGGTGTGTTT
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CATCTTCTCCTTCCTTCCTTGGTGGTTCTCCGTTCATGGGTTTAATTGTTTGATCTAGAT
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QA 15 818 15 818
DS 

RD RS1A320TR 838 0 0
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TCGTGGTTTGTCTTCCTCCGGTGCTATTTTCCTTCCCTAGGGATTCGCTCGGCTCTCTTT
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GTGTGAGTGCTTCCGTGGATGGATGGTGTTCTGTTCCTTGCTTATGCTTGCAACGGGATA
GATCCTGATTTGTTCCTATGTCGGCCTTTGTTAAAAGGTTTTCCGGCTCGTTTCTTAAGG
AACAGGAGCCTTGACTCTTTATGCATCTTGCCAGTGGAGATTGATAGGTAAAAGTTATGT
CCTTCTTCTCTATGGGTTGCTATGCGTCGTTTTACGTCATGGTGGCTCGTTGGTGTGTTT
CCCGAGCAATATATGGAGGTGCGTCTGCTCCCTAATAATGTCTGGCCATTGATGTGCGCC
CATCTTCTCCTTCCTTCCTTGGTGGTTCTCCGTTCATGGGTTTAATTGTTTGATCTAGAT
GTTCTTTATGTTTGATCTGTAAAACCTTGGTTATTTTCTGTTTCTTGTCTCCGGAGAATG
TTGTATTCTGCCGGCTAATGGCTCCGAAGGAAGTTATATCCTGTCGGCTTACGTTCTTTA
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DS 

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GTCGTCTTCCCCTCTCAGATCTGGCCGGTTGTATGTTGCTGATGCTTGTGTGAGTGCTTC
CGTGGATGGATGGTGTTCTGTTCCTTGCTTATGCTTGCAACGGGATAGATCCTGATTTGT
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GGGTTGCTATGCGTCGTTTTACGTCATGGTGGCTCGTTGGTGTGTTTCCCGAGCAATATA
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CTTCCTTGGTGGTTCTCCGTTCATGGGTTTAATTGTTTGATCTAGATGTTCTTTATGTTT
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GCTAATGGCTCCGAAGGAAGTTATATCCTGTCGGCTTACGTTCTTTAAGTTTGTATCCAA
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DS 



AS 2 5

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TCATTGATTGATATGTTTCCGATATCGTCTCGGATCATTGACGGACCAGCATCCTTAAGA
ACTGCTTCAGATAAAGTAGTTTTCACAGCTATGCATCTCATGTTTGCAGCTTGAGCAGCC
TGGACTCCAGCAAGTGCATCCTCAATAACAATACACTCGCTTGTGGGCACACCCAAGATC
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ACAATTGCATCAAACATGGACAAAGACAAACCAGCGGCTGCAAGGTTTGCATCAACTTTG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1A184TR U 140
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AGAGT
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AGAAATTTTTGAAAAAGTACAATGGAGAAATAAATACACCAGAAACGAAGTGTTTTGCAA
CGAATTGTTTGGAGACTACATACTGGTAGAATCAGAGCCACCAGCGAGAATGTCATTGAT
TGATATGTTTCCGATATCGTCTCGGATCATTGACGGACCAGCATCCTTAAGAACTGCTTC
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AGCCAAGAAAATATCTGGAGCTGGTTTCAAGTTCTCAAATGCGTCTGCTGATACAATTGC
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TCCTAAGAACTTAGCTTCACCTGTTCCCATGAAAGGGACGAAGTCATCT

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DS 

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TTTATTCAAGAAATTTTTGAAAAAGTACAATGGAGAAATAAATACACCAGAAACGAAGTG
TTTTGCAACGAATTGTTTGGAGACTACATACTGGTAGAATCAGAGCCACCAGCGAGAATG
TCATTGATTGATATGTTTCCGATATCGTCTCGGATCATTGACGGACCAGCATCCTTAAGA
ACTGCTTCAGATAAAGTAGTTTTCACAGCTATGCATCTCATGTTTGCAGCTTGAGCAGCC
TGGACTCCAGCAAGTGCATCCTCAATAACAATACACTCGCTTGTGGGCACACCCAAGATC
TTGGAAGCAGCCAAGAAAATATCTGGAGCTGGTTTCAAGTTCTCAAATGCGTCTGCTGAT
ACAATTGCATCAAACATGGACAAAGACAAACCAGCGGCTGCAAGGTTTGCATCAACTTTG
ACACGGTCGGCGCTAGAGGCAACAGCGACTTTGAGACCTCTGTTCTTACACTCAGTAACA
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GTGACTTCAACTCCCATCTCGGTGAA

QA 1 746 1 746
DS 

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CGAAATCGTCTCGGAACATTGACGGACCAGCATCCTTAAAAACTGCTTCAGATAAAGTAG
TTTTCACAGCTATGCATCTCATGTTTGCAGCTTGAGCAGCCTGGACTCCAGCAAGTGCAT
CCTCAATAACAATACACTCGCTTGTGGGCACACCCAAGATCTTGGAAGCAGCCAAGAAAA
TATCTGGAGCTGGTTTCAAGTTCTCAAATGCGTCTGCTGATACAATTGCATCAAACATGG
ACAAAGACAAACCAGCGGCTGCAAGGTTTGCATCAACTTTGACACGGTCGGCGCTAGAGG
CAACAGCGACTTTGAAACCTCTGTTCTTACACTCAGTAACAAGCTCAAGTGCTCCAGGAA
ATCCAATTCCAGACTCTGGCTTCGCGTACTTATCGAGATAAATCTCAAAGAAGCGCTTTT
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TAGCTTCACCTGTTCCCATGAAAGGGACGAAGTCATCTACGGTGACTTCAACTCCCATCT
CGGTGAAGACATCCACTGCGC

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DS 



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CTAGATCTTCGTTTCCAGGATTCCGCTGTGTGTCTCCGGCTCCTTTACCGTCGTCCTGGA
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AAGTCTCAGCGGTGCTATTCGATATGGACGGAGTGCTTTGCAACAGCGAGGATCTCTCGA
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TCCCTTTCATGGGAACAGGTGAAGCTAAGTTCCTAGGAGGTGTTGCTTCTGTTAAAGGAG
TAAAAGAGTTTGATCCTGATGCAGCTAAAAAGCGCTTCTTTGAGATTTATCTCGACAAGT
ACGCGAAGCCAGAGTCTGGAATTGGATTTCCAGGAGCACTTGAGCTTGTTACTGAGTGTA
AGAGCAGAGGTCTCAAAGTCGCTGTTGCGTCTAGCGCTGACCGTGTCAAAGTTGATGCAA
ACCTTGCAGCCGCTGGTTTGTCTTTGTCCATGTTTGATGCAATTGTATCAGCAGACGCAT
TTGAGAACTTGAAACCAGCTCCAGATATTTTCTTGGCTGCTTCAAAAATCTTGGGTGTGC
CAACAAGCGAGTGTATTGTTATTGAAGATGCACTTGCTGGAGTCCAGGCTGCTCAAGCTG
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TGGTGTATTTGTTTCTCCATTGTACCTTTTCAAAAAAAAATCTTGAATAAAGTGGCCTTC
CTTGTAATGAGATCACATTTGACATATTGAATCGAATGTTTCGCACTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DZ33TF U 1
AF RS1DZ33JQ C 217
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AAGTCTCAGCGGTGCTATTCGATATGGACGGAGTGCTTTGCAACAGCGAGGATCTCTCGA
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TAAAAGAGTTTGATCCTGATGCAGCTAAAAAGCGCTTCTTTGAGATTTATCTCGACAAGT
ACGCGAAGCCAGAGTCTGGAATTGGATTTCCAGGAGCACTTGAGCTTGTTACTGAGTGTA
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QA 1 763 1 763
DS 

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TCTTTGAGATTTATCTCGACAAGTACGCGAAGCCAGAGTCTGGAATTGGATTTCCAGGAG
CACTTGAGCTTGTTACTGAGTGTAAGAGCAGAGGTCTCAAAGTCGCTGTTGCGTCTAGCG
CTGACCGTGTCAAAGTTGATGCAAACCTTGCAGCCGCTGGTTTGTCTTTGTCCATGTTTG
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CTGCTTCAAAAATCTTGGGTGTGCCAACAAGCGAGTGTATTGTTATTGAAGATGCACTTG
CTGGAGTCCAGGCTGCTCAAGCTGCTAACATGAGATGCATAGCTGTGAAAACTACTTTGT
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AAAATCTTGAATAAAGTGGCCTTCCTTGTAATGAGATCACATTTGACATATTGAATCGAA
TGTTTCGCACTTT

QA 1 853 1 853
DS 



AS 1 5

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AAGACCTGCGAGATGTTACCGTCAGATCAAGGGGAAGCCCTACCCGAAATCCCGCTACTG
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CGACGAGTTCCCTTTCTGCGTCCACCTCGTCTCCTGGGAGAAAGAAAACGTCTCCAGCGA
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TGCCTTCCACTTGAGGATTAGGGTTCACCCTTTCCATGTGTTGCGTATCAACAAGATGCT
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GCTGAGACAGGTTAAGAGGATTGTTCCTGATGGTGTCAATGCTAAGTTTCTGTCGAACCA
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GTTTTTGTTGTAACAGTTGAAAACAAGATCCTTTTCTGGTTTCGTTTTGTTTGGACAATT
GTTTTATGGTCTGTTTCTGTGTTCATTGCTTTAGTTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1DY35TF U 153
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GG
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GAGATGTTACCGTCAGATCAAGGGGAAGCCCTACCCGAAATCCCGCTACTGCCGCGGAGT
CCCCGACCCCAAGATCCGAATCTACGACGTCGGGATGAAGAAGAAAGGAGTCGACGAGTT
CCCTTTCTGCGTCCACCTCGTCTCCTGGGAGAAAGAAAACGTCTCCAGCGAAGCCCTCGA
GGCCGCGCGTATCGCCTGCAACAAGTACATGGTGAAATCCGCAGGGAAAGATGCCTTCCA
CTTGAGGATTAGGGTTCACCCTTTCCATGTGTTGCGTATCAACAAGATGCTTTCGTGCGC
CGGAGCCGATAGGCTTCAGACTGGTATGAGAGGCGCCTTTGGTAAGGCGCTGGGGACTTG
CGCTAGGGTTGCGATTGGGCAGGTGCTTTTGTCTGTGAGGTGTAAGGATAACCATGGGGC
TCATGCTCAGGAGGCGTTGAGGAGGGCGAAGTTTAAGTTCCCTGGG

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DS 

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AAGACCTGCGAGATGTTACCGTCAGATCAAGGGGAAGCCCTACCCGAAATCCCGCTACTG
CCGCGGAGTCCCCGACCCCAATATCCGAATCTACGACGTCGGGATGAAGAAGAAAGGAGT
CGACGAGTTCCCTTTCTGCGTCCACCTCGTCTCCTGGGAGAAAGAAAACGTCTCCAGCGA
AGCCCTCGAGGCCGCGCGTATCGCCTGCAACAAGTACATGGTGAAATCCGCAGGGAAAGA
TGCCTTCCACTTGAGGATTAGGGTTCACCCTTTCCATGTGTTGCGTATCAACAAGATGCT
TTCGTGCGCCGGAGCCGATAGGCTTCAGACTGGTATGAGAGGCGCCTTTGGTAAGGCGCT
GGGGACTTGCGCTAGGGTTGCGATTGGGCAGGTGCTTTTGTCTGTGAGGTGTAAGGATAA
CCATGGGGCGCATGCTCAGGAGGCGCTGAG**GGGCTAAGTTTAAGTTCCCTGGGCGCCA
GAAGATTATTGTTAGCAGGAAATGGGGTTTCACTAAGTTCAACCGTGCTGATTACACTAG
GCTGAGACAGGTTAAGAGGATTGTTCCTGATGGTGTCAATGCTAAGTTTCTGTCGAACCA
TGGTCCTTTGGCTAACCGTCAACCGGGAAGTGCGTTCATATCAGC

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DS 

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GG
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TGGGAGAAAGAAAACGTCTCCAGCGAAGCCCTCGAGGCCGCGCGTATCGCCTGCAACAAG
TACATGGTGAAATCCGCAGGGAAAGATGCCTTCCACTTGAGGATTAGGGTTCACCCTTTC
CATGTGTTGCGTATCAACAAGATGCTTTCGCGCGCCGGAGCCGATAGGCTTCAGACTGGT
ATGAGAGGCGCCTTTGGTAAGGCGCTGGGGACTTGCGCTAGGGTTGCGATTGGGCAGGTG
CTTTTGTCTGTGAGGTGTAAGGATAACCATGGGGCTCATGCTCAGGAGGCGTTGAGGAGG
GCGAAGTTTAAGTTCCCTGGGCGTCAGAAGATTATTGTTAGCAGGAAATGGGGTTTCACT
AAGTTCAACCGTGCTGATTACACTAGGCTGAGACAGGTTAAGAGGATTGTTCCTGATGGT
GTCAATGCTAAGTTTCTGTCGAACCATGGTCCTTTGGCTAACCGTCAACCGGGAAGTGCG
TTCATATCAGCAACCAGCGATAAAGAATGAAGACGATTTGTGGTTGTAGTACCGATAATA
CTCTAGGTTCCGAAGTTATTCGTTTTGTTTTTGTTGTAACAGTTGA

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DS 

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TGAAATCCGCAGGGAAAGATGCCTTCCACTTGAGGATTAGGGTTCACCCTTTCCATGTGT
TGCGTATCAACAAGATGCTTTCGTGCGCCGGAGCCGATAGGCTTCAGACTGGTATGAGAG
GCGCCTTTGGTAAGGCGCTGGGGACTTGCGCTAGGGTTGCGATTGGGCAGGTGCTTTTGT
CTGTGAGGTGTAAGGATAACCATGGGGCTCATGCTCAGGAGGCGTTGAGGAGGGCGAAGT
TTAAGTTCCCTGGGCGTCAGAAGATTATTGTTAGCAGGAAATGGGGTTTCACTAAGTTCA
ACCGTGCTGATTACACTAGGCTGAGACAGGTTAAGAGGATTGTTCCTGATGGTGTCAATG
CTAAGTTTCTGTCGAACCATGGTCCTTTGGCTAACCGCCAACCGGGAAGTGCGTTCATAT
CAGCAACCAGCGATAAAGAATGAAGACGATTTGTGGTTGTAGTACCGATAATACTCTAGG
TTCCGAAGTTATTCGTTTTGTTTTTGTTGTAACAGTTGAAAACAAGATCCTTTTCTGGTT
TCGTTTTGTTTGGACAATTGTTT

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DS 

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GCCGCGCGTATCGCCTGCAACAAGTACATGGTGAAATCCGCAGGGAAAGATGCCTTCCAC
TTGAGGATTAGGGTTCACCCTTTCCATGTGTTGCGTATCAACAAGATGCTTTCGCGCGCC
GGAGCCGATAGGCTTCAGACTGGTATGAGAGGCGCCTTTGGTAAGGCGCTGGGGACTTGC
GCTAGGGTTGCGATTGGGCAGGTGCTTTTGTCTGTGAGGTGTAAGGATAACCATGGGGCT
CATGCTCAGGAGGCGTTGAGGAGGGCGAAGTTTAAGTTCCCTGGGCGTCAGAAGATTATT
GTTAGCAGGAAATGGGGTTTCACTAAGTTCAACCGTGCTGATTACACTAGGCTGAGACAG
GTTAAGAGGATTGTTCCTGATGGTGTCAATGCTAAGTTTCTGTCGAACCATGGTCCTTTG
GCTAACCGTCAACCGGGAAGTGCGTTCATATCAGCAACCAGCGATAAAGAATGAAGACGA
TTTGTGGTTGTAGTACCGATAATACTCTAGGTTCCGAAGTTATTCGTTTTGTTTTTGTTG
TAACAGTTGAAGACAAGATCCTTTTCTGGTTTCGTTTTGTTTGGACAATTGTTTTATGGT
CTGTTTCTGTGTTCATTGCTTTAGTTCCG

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 6

CO CL1426Contig1 1198 6 12 U
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ATCATCATATCTCTCTTAACAAAACCGAAAACCACATTCGT*GGAAAGATAATAATAGTT
TGCAAAGTGTGCATGATTATTCTGAACTGAGGTATGTATAAGAAACAATCTTTTATTTCC
CAACACAAAATTGATTAGGCATATGTCTTCCACATGCAAAAGAATCTAAATACCGGGGAT
GAACTACGCCGCGGCAGATTGCTTCTCCTCGTAATCATCAAGCCTTAGGGCTTCTAATAG
CCTCGGCCATGACTCTGGGATGCCTCCAGGTAAGTCAAACTCCATAAGCTTTCCCTTGCT
ACGGTAGTATTCTTCAAGGGGCTGGCTGGTTTCATTGTATATACGAAGCCTTGCTTTCAC
AACCTCTTCGGTATCATCAGCTCGAGTGATGAGCTTTGACATACACTGAGGTGGAGGGAG
AAGTGGATCCATGCTGATCGCAGGCTTCCCATTCTCACCCTTTAAGTTGATGTGAGCTAC
ATTGAAACCTTTGCCGCATTGATTACAAGTTCTCCTCCCGAGGCACTTGTCAACCAAAAC
TTCCTCGGGTAGTTTCAAATTCACCACTAGGTCGATGCCAGTTACATCTCCCAGTATTTC
AGCTTGTCTCATGGTTCGAGGAAAGCCATCAAGAATGAAACCTGATTCACCTTTGGCTTC
ACCAGCCTCAAGTCTCTTTGACAATAGGTTTACTATGATCTCATCCGAAACAAGCTTCCC
TTGGTTTACAATCTCCGATAGCTGTCGGGAGAGAGGACCTGACGAAGCGAGCTCCTCGCG
GACGAGATCTCCGGTGGCGATGTGAGGAACGCCGAGAA*GGGTCGACAGTCTGCTAGCGT
AGGTGCCTTTTCCGACGCCGGGACATCCTAGAAACACCCACTGCACGTTCCTATCCTTGG
CGAGAACCCTGCTAGCTCCTCCGCCGTGAAGAAACGGGGAAGCGTGGCTAGCTTCTCCGG
CTGAGGTGGAGTAGAATCGGCTTCCGAGGCCAAAGAGGGAGGAGGATCTCGCCACACGCA
GTACTCTCGCCATTGCAGAGAGAGATAGAACGAAGAAGCGGCTTGAAGGTTAATGCTTTA
CCCTAGCCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1AV09JQ U 1
AF RS1AV09TF C 2
AF RS1A094JQ U 45
AF RS1A094TR U 45
AF RS1A094TV C 414
AF RS1A094TF C 416
BS 1 637 RS1AV09JQ
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BS 639 747 RS1AV09JQ
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BS 770 878 RS1A094TR
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BS 880 902 RS1A094TR
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BS 967 981 RS1A094TR
BS 982 1198 RS1A094TV

RD RS1AV09JQ 756 0 0
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ATCATCATATCTCTCTTAACAAAACCGAAAACCACATTCGT*GGAAAGATAATAATAGTT
TGCAAAGTGTGCATGATTATTCTGAACTGAGGTATGTATAAGAAACAATCTTTTATTTCC
CAACACAAAATTGATTAGGCATATGTCTTCCACATGCAAAAGAATCTAAATACCGGGGAT
GAACTACGCCGCGGCAGATTGCTTCTCCTCGTAATCATCAAGCCTTAGGGCTTCTAATAG
CCTCGGCCATGACTCTGGGATGCCTCCAGGTAAGTCAAACTCCATAAGCTTTCCCTTGCT
ACGGTAGTATTCTTCAAGGGGCTGGCTGGTTTCATTGTATATACGAAGCCTTGCTTTCAC
AACCTCTTCGGTATCATCAGCTCGAGTGATGAGCTTTGACATACACTGAGGTGGAGGGAG
AAGTGGATCCATGCTGATCGCAGGCTTCCCATTCTCACCCTTTAAGTTGATGTGAGCTAC
ATTGAAACCTTTGCCGCATTGATTACAAGTTCTCCTCCCGAGGCACTTGTCAACCAAAAC
TTCCTCGGGTAGTTTCAAATTCACCACTAGGTCGATGTCAGTTACATCTCCCAGTATTTC
AGCTTGTCTCATGGTTCGAGGAAAGCCATCAAGAATGAAACCTGATTCACCTTTGGCTTC
ACCAGCCTCAAGTCTCTTTGACAATAG
TTTACTATC

QA 1 747 1 747
DS 

RD RS1AV09TF 756 0 0
GTGTAAATGTATTAATACATTC*TGTAACTAGAGCAAGCTCATAA*CAATCAATGATACA
TCATCATATCTCTCTTA*CAAAACCGAAAACCACATTCGT*GGAAAGATAATAATAGTTT
GCAAAGTGTGCATGATTATTCTGAACTGAGGTATGTATAAGAAACAATCTTTTATTTCCC
AACACAAAATTGATTAGGCATATGTCTTCCACATGCAAAAGAATCTAAATACCGGGGATG
AACTACGCCGCGGCAGATTGCTTCTCCTCGTAATCATCAAGCCTTAGGGCTTCTAATAGC
CTCGGCCATGACTCTGGGATGCCTCCAGGTAAGTCAAACTCCATAAGCTTTCCCTTGCTA
CGGTAGTATTCTTCAAGGGGCTGGCTGGTTTCATTGTATATACGAAGCCTTGCTTTCACA
ACCTCTTCGGTATCATCAGCTCGAGTGATGAGCTTTGACATACACTGAGGTGGAGGGAGA
AGTGGATCCATGCTGATCGCAGGCTTCCCATTCTCACCCTTTAAGTTGATGTGAGCTACA
TTGAAACCTTTGCCGCATTGATTACAAGTTCTCCTCCCGAGGCACTTGTCAACCAAAACT
TCCTCGGGTAGTTTCAAATTCACCACTAGGTCGATGTCAGTTACATCTCCCAGTATTTCA
GCTTGTCTCATGGTTCGAGGAAAGCCATCAAGAATGAAACCTGATTCACCTTTGGCTTCA
CCAGCCTCAAGTCTCTTTGACAATAGGTTTACTAT
C

QA 1 755 1 755
DS 

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A
AACAATCAATGATACATCATCATATCTCTCTTAACAAAACCGAAAACCACATTCGT*GGA
AAGATAATAATAGTTTGCAAAGTGTGCATGATTATTCTGAACTGAGGTATGTATAAGAAA
CAATCTTTTATTTCCCAACACAAAATTGATTAGGCATATGTCTTCCACATGCAAAAGAAT
CTAAATACCGGGGATGAACTACGCCGCGGCAGATTGCCTCTCCTCGTAATCATCAAGCCT
TAGGGCTTCTAATAGCCTCGGCCATGACTCTGGGATGCCTCCAGGTAAGTCAAACTCCAT
AAGCTTTCCCTTGCTACGGTAGTATTCTTCAAGGGGCTGGCTGGTTTCATTGTATATACG
AAGCCTTGCTTTCACAACCTCTTCGGTATCATCAGCTCGAGTGATGAGCTTTGACATACA
CTGAGGTGGAGGGAGAAGTGGATCCATGCTGATCGCAGGCTTCCCATTCTCACCCTTTAA
GTTGATGTGAGCTACATTGAAACCTTTGCCGCATTGATTACAAGTTCTCCTCCCGAGGCA
CTTGTCAACCAAAACTTCCTCGGGTAGTTTCAAATTCACCACTAGGTCGATGCCAGTTAC
ATCTCCCAGTATTTCAGCTTGTCTCATGGTTCGAGGAAAGCCATCAAGAATGAAACCTGA
TTCACCTTTGGCTTCACCAGCCTCAAGTCTCTTTGACAATAGGTTTACTATGATCTCATC
CGAA

QA 2 725 2 725
DS 

RD RS1A094TR 937 0 0
A
AACAATCAATGATACATCATCATATCTCTCTTAACAAAACCGAAAACCACATTCGTAGGA
AAGATAATAATAGTTTGCAAAGTGTGCATGATTATTCTGAACTGAGGTATGTATAAGAAA
CAATCTTTTATTTCCCAACACAAAATTGATTAGGCATATGTCTTCCACATGCAAAAGAAT
CTAAATACCGGGGATGAACTACGCCGCGGCAGATTGCCTCTCCTCGTAATCATCAAGCCT
TAGGGCTTCTAATAGCCTCGGCCATGACTCTGGGATGCCTCCAGGTAAGTCAAACTCCAT
AAGCTTTCCCTTGCTACGGTAGTATTCTTCAAGGGGCTGGCTGGTTTCATTGTATATACG
AAGCCTTGCTTTCACAACCTCTTCGGTATCATCAGCTCGAGTGATGAGCTTTGACATACA
CTGAGGTGGAGGGAGAAGTGGATCCATGCTGATCGCAGGCTTCCCATTCTCACCCTTTAA
GTTGATGTGAGCTACATTGAAACCTTTGCCGCATTGATTACAAGTTCTCCTCCCGAGGCA
CTTGTCAACCAAAACTTCCTCGGGTAGTTTCAAATTCACCACTAGGTCGATGCCAGTTAC
ATCTCCCAGTATTTCAGCTTGTCTCATGGTTCGAGGAAAGCCATCAAGAATGAAACCTGA
TTCACCTTTGGCTTCACCAGCCTCAAGTCTCTTTGACAATAGGTTTACTATGATCTCATC
CGAAACAAGCTTCCCTTGGTTTACAATCTCCGATAGCTGTCGGGAGAGAGGACCTGACGA
AGCGAGCTCCTCGCGGACGAGATCTCCGGTGGCGATGTGAGGAACGCCGAGAAAGGGTCG
ACAGTCTGCTAGCGTAG*TGCCTTTTCCGACGCCGGGACATCCTAGAAACACCCACTGCA
CGTTCCTATCCTTGGCGAGA*CCCTGCTAGCTCCTC

QA 2 937 2 937
DS 

RD RS1A094TV 785 0 0
CTTTCACAACCTCTTCGGTATCATCAGCTCGAGTGATGAGCTTTGACATACACTGAGGTG
GAGGGAGAAGTGGATCCATGCTGATCGCAGGCTTCCCATTCTCACCCTTTAAGTTGATGT
GAGCTACATTGAAACCTTTGCCGCATTGATTACAAGTTCTCCTCCCGAGGCACTTGTCAA
CCAAAACTTCCTCGGGTAGTTTCAAATTCACCACTAGGTCGATGCCAGTTACATCTCCCA
GTATTTCAGCTTGTCTCATGGTTCGAGGAAAGCCATCAAGAATGAAACCTGATTCACCTT
TGGCTTCACCAGCCTCAAGTCTCTTTGACAATAGGTTTACTATGATCTCATCCGAAACAA
GCTTCCCTTGGTTTACAATCTCCGATAGCTGTCGGGAGAGAGGACCTGACGAAGCGAGCT
CCTCGCGGACGAGATCTCCGGTGGCGATGTGAGGAACGCCGAGAA*GGGTCGACAGTCTG
CTAGCGTAGGTGCCTTTTCCGACGCCGGGACATCCTAGAAACACCCACTGCACGTTCCTA
TCCTTGGCGAGAACCCTGCTAGCTCCTCCGCCGTGAAGAAACGGGGAAGCGTGGCTAGCT
TCTCCGGCTGAGGTGGAGTAGAATCGGCTTCCGAGGCCAAAGAGGGAGGAGGATCTCGCC
ACACGCAGTACTCTCGCCATTGCAGAGAGAGATAGAACGAAGAAGCGGCTTGAAGGTTAA
TGCTTTACCCTAGCCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGT
CGACT

QA 1 785 1 785
DS 

RD RS1A094TF 783 0 0
TTCACAACCTCTTCGGTATCATCAGCTCGAGTGATGAGCTTTGACATACACTGAGGTGGA
GGGAGAAGTGGATCCATGCTGATCGCAGGCTTCCCATTCTCACCCTTTAAGTTGATGTGA
GCTACATTGAAACCTTTGCCGCATTGATTACAAGTTCTCCTCCCGAGGCACTTGTCAACC
AAAACTTCCTCGGGTAGTTTCAAATTCACCACTAGGTCGATGCCAGTTACATCTCCCAGT
ATTTCAGCTTGTCTCATGGTTCGAGGAAAGCCATCAAGAATGAAACCTGATTCACCTTTG
GCTTCACCAGCCTCAAGTCTCTTTGACAATAGGTTTACTATGATCTCATCCGAAACAAGC
TTCCCTTGGTTTACAATCTCCGATAGCTGTCGGGAGAGAGGACCTGACGAAGCGAGCTCC
TCGCGGACGAGATCTCCGGTGGCGATGTGAGGAACGCCGAGAA*GGGTCGACAGTCTGCT
AGCGTAGGTGCCTTTTCCGACGCCGGGACATCCTAGAAACACCCACTGCACGTTCCTATC
CTTGGCGAGAACCCTGCTAGCTCCTCCGCCGTGAAGAAACGGGGAAGCGTGGCTAGCTTC
TCCGGCTGAGGTGGAGTAGAATCGGCTTCCGAGGCCAAAGAGGGAGGAGGATCTCGCCAC
ACGCAGTACTCTCGCCATTGCAGAGAGAGATAGAACGAAGAAGCGGCTTGAAGGTTAATG
CTTTACCCTAGCCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCG
ACT

QA 1 783 1 783
DS 



AS 2 6

CO CL1427Contig1 928 4 5 U
GGGAAAAACCTAGCTACGTACTACTCTCTTCGCCGTCTCCTTTGCTCCCTTCGGAACCCT
AGCTTCGCGTATTCCCAGCAGTTTCTCCGGTAACATGGCTGACCGTACGATTCTTCAACC
CATCAATGTTCGCGAGATGTGGGAGAAAGTTGTTGATGATTTGGCTTCCGACGATATCAA
TCCACCTCACGAAGGCATCACCTCTAAAGACATTGCTTTGATGCTTCTCGTCCGTTACCG
TTGGGATCTCGACGCGATAAACAAGGCTCGCGACGACTCTTCTTTCCAGGAGATCTGTGA
TGCGATTGGCGTCTCTCGGACACCATTCAGGATGACATTGTGCTTGCAGTGTATCGACAA
TAATTATGGCCCGAACAATC***ACCTTGCCGCTGAGGAAAATCTGTTCTGTGCCATTCC
AGGTTGTGGCCATTACTGTCCCACACACTACCGTAATGATATGCGTCACAGAATTACCGT
CTATGGGGAGCTTGAGCTAAGGTGCAAGCATCACGGATGCTCCACCAACTATCCAATGAG
CGCTATACCCAGCGACTATGTTCCGCAGTATCACGATAACAATCTTTT*GGAGATCTACA
AGGAGGCAGTTGACAGAAACTTCTTCCACTACCTCGAGGGCCGTGTCTCTTGCAGCGGAT
GCTATGCCAAGTTCTCTGCTCCGACTCCAGGGACTTACACATGTGGCGGGTGCTCCAAAC
CAATCACTCGCAATTAATACCAAACCAATCAAGCGAATCTGCTTCTGCTTCACATTGTCT
CTCTGTTTCCTGTTTTTCAAATAAAAGCTACTTGACTACTATGCTGTATTCATGCTCAAA
CGTATGTTTCCTGTTTTTTCCAGTTTCTGAACCTAATCTTTTAGTCCAGACTTTAATTTA
AAACAGCAATCCATCTACTTTTCCATGC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BT07TF U 177
AF RS1AY79TF U 1
AF RS1H030TF U 1
AF RS1AY79JQ C 55
BS 1 588 RS1AY79TF
BS 589 589 RS1H030TF
BS 590 695 RS1AY79TF
BS 696 732 RS1H030TF
BS 733 928 RS1AY79JQ

RD RS1BT07TF 149 0 0
TCAATCCACCTCACGAAGGCATCACCTCTAAAGACATTGCTTTGATGCTTCTCGTCCGTT
ACCGTTGGGATCTCGACGCGATAAACAAGGCTCGCGACGACTCTTCTTTCCAGGAGATCT
GTGATGCGATTGGCGTCTCTCGGACACCA

QA 1 149 1 149
DS 

RD RS1AY79TF 695 0 0
GGGAAAAACCTAGCTACGTACTACTCTCTTCGCCGTCTCCTTTGCTCCCTTCGGAACCCT
AGCTTCGCGTATTCCCAGCAGTTTCTCCGGTAACATGGCTGACCGTACGATTCTTCAACC
CATCAATGTTCGCGAGATGTGGGAGAAAGTTGTTGATGATTTGGCTTCCGACGATATCAA
TCCACCTCACGAAGGCATCACCTCTAAAGACATTGCTTTGATGCTTCTCGTCCGTTACCG
TTGGGATCTCGACGCGATAAACAAGGCTCGCGACGACTCTTCTTTCCAGGAGATCTGTGA
TGCGATTGGCGTCTCTCGGACACCATTCAGGATGACATTGTGCTTGCAGTGTATCGACAA
TAATTATGGCCCGAACAATC***ACCTTGCCGCTGAGGAAAATCTGTTCTGTGCCATTCC
AGGTTGTGGCCATTACTGTCCCACACACTACCGTAATGATATGCGTCACAGAATTACCGT
CTATGGGGAGCTTGAGCTAAGGTGCAAGCATCACGGATGCTCCACCAACTATCCAATGAG
CGCTATACCCAGCGACTATGTTCCGCAGTATCACGATAACAATCTTTTTGGAGATCTACA
AGGAGGCAGTTGACAGAAACTTCTTCCACTACCTCGAGGGCCGTGTCTCTTGCAGCGGAT
GCTATGCCAAGTTCTCTGCTCCGACTCCAGGGACT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1H030TF 732 0 0
GGGG
AAAACCTAGCTACGTACTACTCTCTTCGCCGTCTCCTTTGCTCCCTTCGGAACCCTAGCT
TCGCGTATTCCCAGCAGTTTCTCCGGTAACATGGCTGACCGTACGATTCTTCAACCCATC
AATGTTCGCGAGATGTGGGAGAAAGTTGTTGATGATTTGGCTTCCGACGATATCAATCCA
CCTCACGAAGGCATCACCTCTAAAGACATTGCTTTGATGCTTCTCGTCCGTTACCGTTGG
GATCTCGACGCGATAAACAAGGCTCGCGACGACTCTTCTTTCCAGGAGATCTGTGATGCG
ATTGGCGTCTCTCGGACACCATTCAGGATGACATTGTGCTTGCAGTGTATCGACAATAAT
TATGGCCCGAACAATCGTCACCTTGCCGCTGAGGAAAATCTGTTCTATGCCATTCCAGGT
TGTGGCCATTACTGTCCCACACACTACCGTAATGATATGCGTCACAGAATTACCGTCTAT
GGGGAGCTTGAGCTAAGGTGCAAGCATCACGGATGCTCCACCAACTATCCAATGAGCGCT
ATACCCAGCGACTATGTTCCGCAGTATCACGATAACAATCTTTT*GGAGATCTACAAGGA
GGCAGTTGACAGAAACTTCTTCCACTACCTCGAGGGCCGTGTCTCTTGCAGCGGATGCTA
TGCCAAGTTCTCTGCTCCGACTCCAGGGACTTACACATGTGGCGGGTGCTCCAAACCAAT
CACTCGCA

QA 5 732 5 732
DS 

RD RS1AY79JQ 874 0 0
G
ACCCTAGCTTCGCGTAT*CCCAGCAGTT*CTCCGGTAACATGGCTGACCGTACGAT*CTT
CAACCCATCAATGTTCGCGAGATGTGGGAGAAAGTTGTTGATGATTTGGCTTCCGACGAT
ATCAATCCACCTCACGAAGGCATCACCTCTAAAGACATTGCTTTGATGCTTCTCGTCCGT
TACCGTTGGGATCTCGACGCGATAAACAAGGCTCGCGACGACTCTTCTTTCCAGGAGATC
TGTGATGCGATTGGCGTCTCTCGGACACCATTCAGGATGACATTGTGCTTGCAGTGTATC
GACAATAATTATGGCCCGAACAATC***ACCTTGCCGCTGAGGAAAATCTGTTCTGTGCC
ATTCCAGGTTGTGGCCATTACTGTCCCACACACTACCGTAATGATATGCGTCACAGAATT
ACCGTCTATGGGGAGCTTGAGCTAAGGTGCAAGCATCACGGATGCTCCACCAACTATCCA
ATGAGCGCTATACCCAGCGACTATGTTCCGCAGTATCACGATAACAATCTTTT*GGAGAT
CTACAAGGAGGCAGTTGACAGAAACTTCTTCCACTACCTCGAGGGCCGTGTCTCTTGCAG
CGGATGCTATGCCAAGTTCTCTGCTCCGACTCCAGGGACTTACACATGTGGCGGGTGCTC
CAAACCAATCACTCGCAATTAATACCAAACCAATCAAGCGAATCTGCTTCTGCTTCACAT
TGTCTCTCTGTTTCCTGTTTTTCAAATAAAAGCTACTTGACTACTATGCTGTATTCATGC
TCAAACGTATGTTTCCTGTTTTTTCCAGTTTCTGAACCTAATCTTTTAGTCCAGACTTTA
ATTTAAAACAGCAATCCATCTACTTTTCCATGC

QA 2 874 2 874
DS 



CO CL1427Contig2 927 2 2 U
GGGAAAAACCTAGCTACGTACTACTCTCTTCGCAGTCTCCTTTGCTCCCTTCGGAACCCT
AGCTTCGCGTATTCCCAGCAGTTTCTCCGGTAACATGGCTGACCGTACGATTCTTCAACC
CATCAATGTTCGCGAGATGTGGGAGAAAGTTGTTGATGATTTGGCTTCCGACGATATCAA
TCCACCTCACGAAGGCATCACCTCTAAAGACATTGCTTTGATGCTTCTCGTCCGTTACCG
TTGGGATCTCGACGCGATAAACAAGGCTCGCGACGACTCTTCTTTTCAGGAGATCTGTGA
TGCGATTGGCGTCTCTCGGACACCACACAGGGTGACATTGTGCTTGGATTGTATCGACGA
TAATTATGGCCCGAACAATCGTCACCTTGCCGCTGAGGAAAATCTGTTCTATGCCATTCC
AGGTTGTGGCCATTACTGTCCTACACACTACCGTTATCATATAAGTAACAGAATTACCGT
CTATGGAGAGCTTGAGCTAACGTGCCAGCATCACGGATGCTCCACCAACTATCCAATGAG
CGCTATACCCAGCGACTATGTTCCTATGTTTCGCGATCACAATCTTTTGGAGCTCTACAA
GCACGCAGTTGACAGAAACTTCTTCCACTACCTCGAGGGCCGTGTCTCTTGCAGCGGATG
CTATGCCAAGTTCTCTGCTCCGACTCCAGGGACTTACACATGTGGCGGGTGCTCCAAACC
AATCACTCGCAATTAATACCAAACCAATCAAGCGAATCTGCTTCTGCTTCACATTGTCTC
TCTGTTTCCTGTTTTTCAAATAAAAGCTACTTGACTACTATGATGTATTCATGCTCAAAC
GTATGTTTCCTGTTTTTTCCAGTTTCTGAACCTAATCTTTTAGTCCAGACTTTAATTTAA
AACAGCAATCCATCTACTTTTCCATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E217TF U 1
AF RS1E217JQ C 486
BS 1 733 RS1E217TF
BS 734 927 RS1E217JQ

RD RS1E217TF 739 0 0
GGGAAAAACCTAGCTACGTACTACTCTCTTCGCAGTCTCCTTTGCTCCCTTCGGAACCCT
AGCTTCGCGTATTCCCAGCAGTTTCTCCGGTAACATGGCTGACCGTACGATTCTTCAACC
CATCAATGTTCGCGAGATGTGGGAGAAAGTTGTTGATGATTTGGCTTCCGACGATATCAA
TCCACCTCACGAAGGCATCACCTCTAAAGACATTGCTTTGATGCTTCTCGTCCGTTACCG
TTGGGATCTCGACGCGATAAACAAGGCTCGCGACGACTCTTCTTTTCAGGAGATCTGTGA
TGCGATTGGCGTCTCTCGGACACCACACAGGGTGACATTGTGCTTGGATTGTATCGACGA
TAATTATGGCCCGAACAATCGTCACCTTGCCGCTGAGGAAAATCTGTTCTATGCCATTCC
AGGTTGTGGCCATTACTGTCCTACACACTACCGTTATCATATAAGTAACAGAATTACCGT
CTATGGAGAGCTTGAGCTAACGTGCCAGCATCACGGATGCTCCACCAACTATCCAATGAG
CGCTATACCCAGCGACTATGTTCCTATGTTTCGCGATCACAATCTTTTGGAGCTCTACAA
GCACGCAGTTGACAGAAACTTCTTCCACTACCTCGAGGGCCGTGTCTCTTGCAGCGGATG
CTATGCCAAGTTCTCTGCTCCGACTCCAGGGACTTACACATGTGGCGGGTGCTCCAAACC
AATCACTCGCAAT
AATACC

QA 1 733 1 733
DS 

RD RS1E217JQ 442 0 0
GA
GAGCTTGAGCTAACGTGCCAGCATCACGGATGCTCCACCAACTATCCAATGAGCGCTATA
CCCAGCGACTATGTTCCTATGTTTCGCGATCACAATCTTTTGGAGCTCTACAAGCACGCA
GTTGACAGAAACTTCTTCCACTACCTCGAGGGCCGTGTTTCTTGCAGCGGATGCTATGCC
AAGTTTTCTGCTCCGACTCCAGGGACTTACACATGTGGCGGGTGCTCCAAACCAATCACT
CGCAATTAATACCAAACCAATCAAGCGAATCTGCTTCTGCTTCACATTGTCTCTCTGTTT
CCTGTTTTTCAAATAAAAGCTACTTGACTACTATGATGTATTCATGCTCAAACGTATGTT
TCCTGTTTTTTCCAGTTTCTGAACCTAATCTTTTAGTCCAGACTTTAATTTAAAACAGCA
ATCCATCTACTTTTCCATGC

QA 3 442 3 442
DS 



AS 2 5

CO CL1428Contig1 770 2 17 U
ATCTTACTAACATTTTATCTTTGTAAACGTTGAGGCAAAAACAAATTTGATTTCAGTAAG
ATTATTTTCCCCCATCACACAAACATTCACTTATATCCCACACTGATGCCACAAATTAGG
AAAGGCAAAAGAAAAAAAACAGAAAGCACAGTTTTAGAACTTGCCAAATTTGTACACACA
CCATAACAACCATTTTGTAATTATTTCCTTAGGCCGCACTTCTGAAGGACCCAAGGGACT
TGGAACCGGAAGCTCTTAAAACGAACTGGTGATAAAATGCAGCGATGGCGGCTCCAATGA
ATGGTCCCACCCAGAATATCCAGTGGTCATCCCACGGCTTGGACTCGTTGAAGATAACCG
CGGCTCCGAAACTCCTGGCCGGGTTAATACCGGTTCCCGTGATCGGAATAGTCGCCAAGT
GAACCATGAACACCGCAAATCCTATCGGAAGTGGCGCCAACACGGGAACGTGGGAGTCAC
GTGCGTTTCTTTTGGGGTCTGTGGCGGAGAAGACAGTGTAGACAAGAACAAAAGTTCCGA
TGATCTCTGCGGCAAGTCCTGTCCCTGTGCTGTATCCGTCGGCCAGAGAGTTGGCTCCTC
CACCGTAACGCACGTAGTAAGCGCTTTGGAAGGCCTTCACGAACCCAACTCCACATACCG
CACCCAAACACTGAGCCACCATGTATAGAACCGCTCTAACCAGCGATACCTTGTGGGCCA
AGAACAAGCCGAACGTCACCGCCCGGGTTTATGTGACCACCTGAGATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AE67JQ U 32
AF RS1E073JQ U 1
BS 1 120 RS1E073JQ
BS 121 121 RS1AE67JQ
BS 122 134 RS1E073JQ
BS 135 135 RS1AE67JQ
BS 136 141 RS1E073JQ
BS 142 142 RS1AE67JQ
BS 143 143 RS1E073JQ
BS 144 144 RS1AE67JQ
BS 145 206 RS1E073JQ
BS 207 207 RS1AE67JQ
BS 208 232 RS1E073JQ
BS 233 233 RS1AE67JQ
BS 234 238 RS1E073JQ
BS 239 239 RS1AE67JQ
BS 240 258 RS1E073JQ
BS 259 259 RS1AE67JQ
BS 260 770 RS1E073JQ

RD RS1AE67JQ 320 0 0
GAGA
CAAAAACAAATTTGATTTCAGTAAGATTATTTTCCCCCATCACACAAGCATTCACTTATA
TCCCACACTGATGCCACAAATTAGGAAAGGCAAAAGAAAAAAAACAGAAAGCACAGTTTT
AGAACTTGCCAAATTTGTACACACACCATAACAACCATTTTGTAATTGTTTCCTTAGGCC
GCACTTCTGAAGGACCCAAGGGACTTGGAACCGGAAGCTCTTAAAACGAACTGGTGATAA
AATGCAGCGATGGCGGCTCCAATGAATGGTCCCACCCAGAATATCCAGTGGTCATCCCAC
GGCTTGGACTC
CTTGT

QA 5 315 5 315
DS 

RD RS1E073JQ 770 0 0
ATCTTACTAACATTTTATCTTTGTAAACGTTGAGGCAAAAACAAATTTGATTTCAGTAAG
ATTATTTTCCCCCATCACACAAACATTCACTTATATCCCACACTGATGCCACAAATTAGG
GAAGGCAAAAGAAAGAAAACATATAGCACAGTTTTAGAACTTGCCAAATTTGTACACACA
CCATAACAACCATTTTGTAATTATTTTCTTAGGCCGCACTTCTGAAGGACCCGAGGGATT
TGGAACCGGAAGCTCTTAGAACGAACTGGTGATAAAATGCAGCGATGGCGGCTCCAATGA
ATGGTCCCACCCAGAATATCCAGTGGTCATCCCACGGCTTGGACTCGTTGAAGATAACCG
CGGCTCCGAAACTCCTGGCCGGGTTAATACCGGTTCCCGTGATCGGAATAGTCGCCAAGT
GAACCATGAACACCGCAAATCCTATCGGAAGTGGCGCCAACACGGGAACGTGGGAGTCAC
GTGCGTTTCTTTTGGGGTCTGTGGCGGAGAAGACAGTGTAGACAAGAACAAAAGTTCCGA
TGATCTCTGCGGCAAGTCCTGTCCCTGTGCTGTATCCGTCGGCCAGAGAGTTGGCTCCTC
CACCGTAACGCACGTAGTAAGCGCTTTGGAAGGCCTTCACGAACCCAACTCCACATACCG
CACCCAAACACTGAGCCACCATGTATAGAACCGCTCTAACCAGCGATACCTTGTGGGCCA
AGAACAAGCCGAACGTCACCGCCCGGGTTTATGTGACCACCTGAGATACC

QA 1 770 1 770
DS 



CO CL1428Contig2 1054 3 15 U
TTTTTCTCTAAAAGAAATAATATTAAATGGCGAAAGATGTGGAAGGAGCAGAGGGAGTCA
CAGCGAGGGACTACGAAGATCCACCGCCTACTCCCTTTTTCGACGCGGAGGAGCTCACGA
AGTGGTCTTTGTACAGAGCCGTCATCGCCGAGTTCGTAGCCACTCTCCTCTTCTTATACG
TCACCGTTTTGACTGTCATCGGCTACAAGATTTCCTCCGACACTAAGGCCGGAGGCGATG
AATGCGGTGGCGTCGGAATCCTCGGCATCGCCTGGGCTTTCGGCGGCATGATTTTCATTC
TTGTCTACTGCACCGCCGGTATCTCAGGTGGTCACATAAACCCGGCGGTGACGTTCGGCT
TGTTCTTGGCCCACAAGGTATCGCTGGTTAGAGCGGTGCTATACATGGTGGCTCAGTGTT
TGGGTGCGATATGTGGAGTTGGGTTCGTGAAGGCCTTCCAAAGCGCTTACTACGTGCGTT
ACGGTGGAGGAGCCGACTCTCTGGCCGACGGATACAGCACGGGGACAGGACTCGCCGCAG
AGATCATCGGAACTTTTGTTCTTGTCTACACTGTCTTCTCCGCCACAGACCCCAAAAGAA
ACGCACGTGACTCCCACGTTCCCGTGTTGGCGCCACTTCCGATAGGATTTGCGGTGTTCA
TGGTTCACTTGGCGACTATTCCGATCACGGGAACCGGTATTAACCCGGCCAGGAGTTTCG
GAGCCGCGGTTATTTTCAACGAGTCCAAGCCGTGGGATGACCACTGGATATTTTGGGTGG
GACCATTCATTGGGGCCGCCATCGCTGCATTTTATCACCAGTTCGTTTTAAGAGCTTCCG
GTTCCAAATCCCTCGGGTCCTTCAGAAGTGCGGCCTAAGAAAATAATTACAAAATGGTTG
TTATGGTGTGTGTACAAATTTGGCAAGTTTTAAAACTGTGCTATATGTTTTCTTTCTTTT
GCCTTCCCTAATTTGTGGCATCAGTGTGGGATATAAGTGAATGTTTGTGTGATGGGGGAA
AATAATCTTACTGAAATCAAATTTGTTTTTGCCT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E073TF U 1
AF RS1GM42TF U 1
AF RS1GM42JQ C 451
BS 1 197 RS1E073TF
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BS 654 686 RS1GM42TF
BS 687 1054 RS1GM42JQ

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TGGGTGCGGTATGTGGAGTTGGGTTCGTGAAGGCCTTCCAAAGCGCTTACTACGTGCGTT
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AGATCATCGGAACTTTTGTTCTTGTCTACACTGTCTTCTCCGCCACAGACCCCAAAAGAA
ACGCACGTGACTCCCACGTTCCCGTGTTGGCGCCACTTCCGATAGGATTTGCG

QA 1 653 1 653
DS 

RD RS1GM42TF 686 0 0
TTTTT
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AGGGACTACGAAGATCCACCGCCTACTCCCTTTTTCGACGCGGAGGAGCTCACGAAGTGG
TCTTTGTACAGAGCCGTCATCGCCGAGTTCGTAGCCACTCTCCTCTTCTTATACGTCACC
GTTTTGACTGTCATCGGCTACAAGATTTCCTCCGACACTAAGGCCGGAGGCGATGAATGC
GGTGGCGTCGGAATCCTCGGCATCGCCTGGGCTTTCGGCGGCATGATTTTCATTCTTGTC
TACTGCACCGCCGGTATCTCAGGTGGTCACATAAACCCGGCGGTGACGTTCGGCTTGTTC
TTGGCCCGCAAGGTATCGCT**TTAGAGCGGTGCTATACATGGTGGCTCAGTGTTTGGGT
GCGATATGTGGAGTTGGGTTCGTGAAGGCCTTCCAAAGCGCTTACTACGTGCGTTACGGT
GGAGGAGCCGACTCTCTGGCCGACGGATACAGCACGGGGACAGGACTCGCCGCAGAGATC
ATCGGAACTTTTGTTCTTGTCTACACTGTCTTCTCCGCCACAGACCCCAAAAGAAACGCA
CGTGACTCCCACGTTCCCGTGTTGGCGCCACTTCCGATAGGATTTGCGGTGTTCATGGTT
CACTTGGCGACTATTCCGATC

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DS 

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GATACAGCACGGGGACAGGACTCGCCGCAGAGATCATCGGAACTTTTGTTTTTGTTTACA
CTGTTTTTTCCGCCACAGACCCCAAAAGAAACGCACGTGACTCCCACGTTCCCGTGTTGG
CGCCACTTCCGATAGGATTTGCGGTGTTCATGGTTCACTTGGGGACTATTCCGATCACGG
GAACCGGTATTAACCCGGCCAGGAGTTTCGGAGCCGCGGTTATTTTCAACGAGTCCAAGC
CGTGGGATGACCACTGGATATTTTGGGTGGGACCATTCATTGGGGCCGCCATCGCTGCAT
TTTATCACCAGTTCGTTTTAAGAGCTTCCGGTTCCAAATCCCTCGGGTCCTTCAGAAGTG
CGGCCTAAGAAAATAATTACAAAATGGTTGTTATGGTGTGTGTACAAATTTGGCAAGTTT
TAAAACTGTGCTATATGTTTTCTTTCTTTTGCCTTCCCTAATTTGTGGCATCAGTGTGGG
ATATAAGTGAATGTTTGTGTGATGGGGGAAAATAATCTTACTGAAATCAAATTTGTTTTT
GCCT

QA 1 604 1 604
DS 



AS 2 5

CO CL1429Contig1 816 2 6 U
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ACACCGTCACTGGAGATATAGCTGCTATTAAAATCCTCGACCGAGATAAGGTTCTACGTC
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ATGTGGTTGAAATCATTGAGGTTATGGCGAGCAAAACGAAGATCTATATAGTTCTTGAGC
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AAGCTAGGAAATATGTTCAGCAGCTAATCAATGCCGTTGATTACTGCCACAGTCGAGGGG
TCTACCACAGAGATCTCAAGCCTGAAAATCTTCTCCTTGATTCAAATGGGGTTTTAAAAG
TCTCTGATTTTGGGTTAAGCGCTTTCTCACTACAAATTCGGGAAGATGGTTTGCTTCACA
CAGCTTGTGGAACGCCCAACTATGTTGCTCCTGAGGTTCTGTCGGACAAAGGCTATGACG
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TGCCCTTTGATGAGCCAAATCTCATGACATTATACAAACGTATATGCAAGGCTGAATTCA
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TCCCTATAACCAGAATAAGTATCGCAGAGTTACTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BI57TF U 1
AF RS1CA96TF U 299
BS 1 481 RS1BI57TF
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GTAGTAAAATGAACGGGAGTAGAAAGAGGACGACGCCGGCGAGCAGGACGAGAGTGGGGA
ACTACGAGATGGGACGAACTCTAGGCGAAGGTAGCTTCGCTAAGGTCAAATACGCAAGGA
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AAGCTAGGAAATATGTTCAGCAGCTAATCAATGCCGTTGATTACTGCCACAGTCGAGGGG
TCTACCACAGAGATCTCAAGCCTGAAAATCTTCTCCTTGATTCAAATGGGGTTTTAAAAG
TTTCTGATTTTGGGTTAAGCGCTTTCTCACTACAAATTCGGGAAGATGGTTTGCTTCACA
CAGCTTGTGGAACGCCCAACTATGTTGCTCCTGAGGTTCTGTCGGACAAAGGCTATGACG
GTGCAGCAGCAGATGTATGGTCATGTGGTGTTATTCTATTTGTTCTCATGGCTGGTTACT
TGCCCTTTGATGAGCCAAATCTCATGACATTATACAAACGTATATGCA*GGCTGAATTCA
ACTGCCCACCATGGTT

QA 1 736 1 736
DS 

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GCTTGTCAATGGAGGTGAACTCTTTGATAAAATCGCTCAACAAGGGAGACTTAAGGAGGA
TGAAGCTAGGAAATATGTTCAGCAGCTAATCAATGCCGTTGATTACTGCCACAGTCGAGG
GGTCTACCACAGAGATCTCAAGCCTGAAAATCTTCTCCTTGATTCAAATGGGGTTTTAAA
AGTCTCTGATTTTGGGTTAAGCGCTTTCTCACTACAAATTCGGGAAGATGGTTTGCTTCA
CACAGCTTGTGGAACGCCCAACTATGTTGCTCCTGAGGTTCTGTCGGACAAAGGCTATGA
CGGTGCAGCAGCAGATGTATGGTCATGTGGTGTTATTCTATTTGTTCTCATGGCTGGTTA
CTTGCCCTTTGATGAGCCAAATCTCATGACATTATACAAACGTATATGCAAGGCTGAATT
CAACTGCC*ACCATGGTTCTCGCCAGGTGCCAAGAGTGTCATTAAGCGTATTCTTGATCC
CATCCCTATAACCAGAATAAGTATCGCAGAGTTACTAG

QA 1 518 1 518
DS 



CO CL1429Contig2 712 3 8 U
GGCAATGTTTTAGTTATCTACCATCTTTGAAGGTTCATTTAAAAGTTTCAACTTGTTCAA
TGCTCTTTCTTTCTTTCTTCATTTAGTTTAATTTGCTTTTAAATAGAAAAATTGCTAATG
AACTTATTAAACTTTATGTTCTTGAGCTGCTCCGTCAGTATTCCAGACTACATCCTTTAA
TCCAGATGAAAAGGTTTTGTAGAACTTGTGAAACTCGAGGGTATCACCGCCGGTTTTCCT
AAGCTCTACCACATGCAATGATGGTGCCACTTCAAACACCTCTGTAGCAACTGAGAGCTG
GCCTTTACGACCACTTTTGTCTCCTTTCATTTTTATCTTGTACTTGTCTTTACGGACATT
GAAACCTAATGGCTTTGCGGTTTCTTCCATCTTGGACATTATTTCGCTCGCAGGTCTGTT
TGAAGTAAACCGGGTCTCTTTTTTCACAAGTTGGGCTTGCTTCTCGAACAAGTTCTCAAG
ACTGAACTCGCTTGAGCTAGAGATAAGTTCAAAAGCGTTCATAGATTCAGGGTTCTCCTT
CTTCTCTGTCACAAGACATTCCTTGGAGTTACTGAAAGCAGCATCAACATCATCAATGGT
TATGTCCTCATCATCTTGCTCAAAAGATGGCGGCTTGTACCCTTGCTTGAACCATTCATC
TTCTAGTAACTCTGCGATACTTATTCTGGTTATAGGGATGGGATCAAGAATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D160JQ U 1
AF RS1CA96JQ U 16
AF RS1BI57JQ U 58
BS 1 216 RS1D160JQ
BS 217 217 RS1CA96JQ
BS 218 294 RS1D160JQ
BS 295 295 RS1CA96JQ
BS 296 444 RS1D160JQ
BS 445 531 RS1CA96JQ
BS 532 532 RS1BI57JQ
BS 533 712 RS1CA96JQ

RD RS1D160JQ 444 0 0
GGCAATGTTTTAGTTATCTACCATCTTTGAAGGTTCATTTAAAAGTTTCAACTTGTTCAA
TGCTCTTTCTTTCTTTCTTCATTTAGTTTAATTTGCTTTTAAATAGAAAAATTGCTAATG
AACTTATTAAACTTTATGTTCTTGAGCTGCTCCGTCAGTATTCCAGACTACATCCTTTAA
TCCAGATGAAAAGGTTTTGTAGAACTTGTGAAACTCCAGGGTATCACCGCCGGTTTTCCT
AAGCTCTACCACATGCAATGATGGTGCCACTTCAAACACCTCTGTAGCAACTGAAAGCTG
GCCTTTACGACCACTTTTGTCTCCTTTCATTTTTATCTTGTACTTGTCTTTACGGACATT
GAAACCTAATGGCTTTGCGGTTTCTTCCATCTTGGACATTATTTCGCTCGCAGGTCTGTT
TGAAGTAAACCGGGTCTCTTTTTT

QA 1 444 1 444
DS 

RD RS1CA96JQ 697 0 0
ATCTACCATCTTTGAAGGTTCATTTAAAAGTTTCAACTTGTTCAATGCTCTTTCTTTCTT
TCTTCATTTAGTTTAATTTGCTTTTAAATAGAAAAATTGCTAATGAACTTATTAAACTTT
ATGTTCTTGAGCTGCTCCGTCAGTATCCCAGACTACATCCTTTAATCCAGATGAGAAGGT
TTTGTAGAACTTGTGAAACTCGAGGGTATCACCGCCGGTTTTCCTAAGCTCTACCACATG
CAATGATGGTGCCACTTCAAACACCTCTGTAGCAACTGAGAGCTGGCCTTTACGACCACT
TTTGTCTCCTTTCATTTTTATCTTGTACTTGTCTTTACGGACATTGAAACCTAATGGCTT
TGCGGTTTCTTCCATCTTGGACATTATTTCGCTCGCAGGTCTGTTTGAAGTAAACCGGGT
CTCTTTTTTCACAAGTTGGGCTTGCTTCTCGAACAAGTTCTCAAGACTGAACTCGCTTGA
GCTAGAGATAAGTTCAAAAGCGTTCATAGATTCAGGTTTCTCCTTCTTCTCTGTCACAAG
ACATTCCTTGGAGTTACTGAAAGCAGCATCAACATCATCAATGGTTATGTCCTCATCATC
TTGCTCAAAAGATGGCGGCTTGTACCCTTGCTTGAACCATTCATCTTCTAGTAACTCTGC
GATACTTATTCTGGTTATAGGGATGGGATCAAGAATA

QA 1 697 1 697
DS 

RD RS1BI57JQ 605 0 0
CAATGCTCTTTCTTTCTTTCTTCATTTAGTTTAATTTGCTTTTAAATAGAAAAATTGCTA
ATGAACTTATTAAACTTTATGTTCTTGAGCTGCTCCGTCAGTATTCCAGACTACATCCTT
TAATCCAGATGAAAAGGTTTTGTAGAACTTGTGAAACTCGAGGGTATCACCGCCGGTTTT
CCTAAGCTCTACCACATGCAATGATGGTGCCACCTCAAACACCTCTGTAGCAATTGAGAG
CTGGCCTTTACGACCACTTTTGTCTCCTTTCATTTTTATCTTGTACTTGTCTTTACGGAC
ATTGAAACCTAATGGCTTTGCGGTTTCTTCCATCTTGGACATTATTTCGCTCGCAGGTCT
GTTTGAAGTAAACCGGGTCTCTTTTTTCACAAGTTGGGCTTGCTTCTCGAACAAGTTCTC
AAGACTGAACTCGCTTGAGCTAGAGATAAGTTCAAAAGCGTTCATAGATTCAGGGTT*TC
CTTCTTCTCTGTCACAAGACATTCCTTGGAGTTACTGAAAGCAGCATCAACATCATCAAT
GGTTATGTCCTCATCATCTTGCTCAAAAGATGGCGGCTTGTACCCTTGCTTGAACCATTC
ATCTT

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 6

CO CL1430Contig1 870 6 7 U
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ACATAATAATTGGAGTAGAAAAGGAGAAAGAAAAACATGAAAGAAATGGGAGTGGTAGTG
TTTCTTCTACTTCATTCGATCTTCTACACTGCCTTTTGCTTCAAAGATGGTAAGCCCTCG
TTATGCAAATATCTTCTTTTTTTTAACTAAAGCAAGCGTAAGAAAAACAGTCGTTTAGCT
ATGAAAAATAATATTACAGTTTTCATTCACATCATGTTTACACCTTGTATATCAAAATAA
TTTCGTCTGTATTGCACCACAAGTCATGAATACTACTACTTGACAACAACTACAAGATGT
TAATTTTCCTTCTTTGTGTATCATTAGATGCTTAACCAATAGACAAGAACAGAATAGCTT
TGTGAATTTAAATACCAAACAGAATTACTTAAAGAGAATATTGGATGAAAGTATTTAACT
GTTACAATCAGACAGATCTGTATACATGCACATGGTATTTGTCAAATGGTTTACAATAAA
TGCATCAGTAAAAAGTAAAAACTCATACCTTCCAATCTGCAACAGTTT*TTATTCTTTTA
GTAATTTGAAAATTTCGCACTTCAACTTTTCTTCAATTATTATATTATATCATAGATTTG
AAACAGCAAAACCATTATTCAGTAAACATTCCCATGTTAAACAAAAGTGAAAATGTACTT
TACTAGAATCATTGTCACCAACTATATACGTACACTAGTTCCATTTGGCTTGAGAAAATT
TTGTTTTTTCATTATTGTTACATCTATAAATTACACTACCCTTCTCAGAAACCATAACAA
ACCTTAAATGTTATTAACTATAACCTTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 25 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 0 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 10 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 
40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 15 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 10 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1BU26TF U 1
AF RS1BU26JQ C 110
AF RS1GG14TF U 197
AF RS1AH37JQ C 204
AF RS1GG14JQ C 338
AF RS1AH37TF U 204
BS 1 497 RS1BU26TF
BS 498 498 RS1GG14TF
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RD RS1BU26TF 658 0 0
AGGGACTCCACTAAACATTCCTTCTCTCGCTCACTATTCTCCATTTTGTATAAGTATATA
ACATAATAATTGGAGTAGAAAAGGAGAAAGAAAAACATGAAAGAAATGGGAGTGGTAGTG
TTTCTTCTACTTCATTCGATCTTCTACACTGCCTTTTGCTTCAAAGATGGTAAGCCCTCG
TTATGCAAATATCTTCTTTTTTTTAACTAAAGCAAGCGTAAGAAAAACAGTCGTTTAGCT
ATGAAAAATAATATTACAGTTTTCATTCACATCATGTTTACACCTTGTATATCAAAATAA
TTTCGTCTGTATTGCACCACAAGTCATGAATACTACTACTTGACAACAACTACAAGATGT
TAATTTTCCTTCTTTGTGTATCATTAGATGCTTAACCAATAGACAAGAACAGAATAGCTT
TGTGAATTTAAATACCAAACAGAATTACTTAAAGAGAATATTGGATGAAAGTATTTAACT
GTTACAATCAGACAGATTTGTATACATGCACATGGTATTTGTCAAATGGTTTACAATAAA
TGCATCAGTAAAAAGTAAAAACTCATACCTTCCAATCTGCAACAGTTT*TCATTCTTTTA
GTAATTTGAAAATTTCGCACTTCAACTTTTCTTCAATTATTATATTATATCATAGAT
C

QA 1 657 1 657
DS 

RD RS1BU26JQ 696 0 0
GAGTGGTAGTGTTTCTTCTACTTCATTCGATCTTCTACACTGCCTTTTGCTTCAAAGATG
GTAAGCCCTCGTTATGCAAATATCTTCTTTTTTTTAACTAAAGCAAGCGTAAGAAAAACA
GTCGTTTAGCTATGAAAAATAATATTACAGTTTTCATTCACATCATGTTTACACCTTGTA
TATCAAAATAATTTCGTCTGTATTGCACCACAAGTCATGAATACTACTACTTGACAACAA
CTACAAGATGTTAATTTTCCTTCTTTGTGTATCATTAGATGCTTAACCAATAGACAAGAA
CAGAATAGCTTTGTGAATTTAAATACCAAACAGAATTACTTAAAGAGAATATTGGATGAA
AGTATTTAACTGTTACAATCAGACAGATCTGTATACATGCACATGGTATTTGTCAAATGG
TTTACAATAAATGCATCAGTAAAAAGTAAAAACTCATACCTTCCAATTTGCAACAGTTT*
TCATTTTTTTAGTAATTTGAAAATTTCGCACTTCAACTTTTTTTCAATTATTATATTATA
TCATAGATTTGAAACAGCAAAACCATTATTCAGTAAACATTCCCATGTTAAACAAAAGTG
AAAATGTACTTTACTAGAATCATTGTCCCCAACTATATACGTACACTGGTTCCATTTG*C
TTGAGAAAATTTTGTTTTTTCATTATTGTTACATCT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RS1GG14TF 674 0 0
TTTTTTTT
AACTAAAGCAAGCGTAAGAAAAACAGTCGTTTAGCTATGAAAAATAATATTACAGTTTTC
ATTCACATCATGTTTACACCTTGTATATCAAAATAATTTCGTCTGTATTGCACCACAAGT
CATGAATACTACTACTTGACAACAACTACAAGATGTTAATTTTCCTTCTTTGTGTATCAT
TAGATGCTTAACCAATAGACAAGAACAGAATAGCTTTGTGAATTTAAATACCAAACAGAA
TTACTTAAAGAGAATATTGGATGAAAGTATTTAACTGTTACAATCAGACAGATCTGTATA
CATGCACATGGTATTTGTCAAATGGTTTACAATAAATGCATCAGTAAAAAGTAAAAACTC
ATACCTTCCAATCTGCAACAGTTTATTATTCTTTTAGTAATTTGAAAATTTCGCACTTCA
ACTTTTCTTCAATTATTATATTATATCATAGATCTGAAACAGCAAAACCATTATTCAGTA
AACATTCCCATGTTAAACAAAAGTGAAAATGTACTTTACTAGAATCATTGTCACCAACTA
TATACGTACACTAGTTCCATTTGGCTTGAGAAAATTTTGTTTTTTCATTATTGTTACATC
TATAAATTACACTACCCTTCTCAGAAACCATAACAAACCTTAAATGTTATTAACTATAAC
CTTTTG

QA 9 674 9 674
DS 

RD RS1AH37JQ 667 0 0
G
AACTAAAGCAAGCGTAAGAAAAGCAGTCGTTTAGCTATGAAAAATAATATTACAGTTTTC
ATTCACATCATGTTTACACCTTGTATATCAAAATAATTTCGTCTGTATTGCACCACAAGT
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DS 

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QA 1 533 1 533
DS 

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G
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ATTCACATCATGTTTACACCTTGTATATCAAAATAATTTCGTCTGTATTGCACCACAAGT
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TATAAATTACACTACCCTTCTCAGAAACCATAACAAACCTTAAATGTTATTAACTATAAC
CTTTTG

QA 2 667 2 667
DS 



AS 1 5

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GTTTCTGAACATTTACACCCTCACGCCATGTGTGGAGGAGCTATAATCTCCGACTTCATC
CCGCCGCCGAGGTCTCGCCGCGTCACCAGCGAGTTTCTCTGGCCGGATCTGAAGAAGAAG
AAGAGCTCGAGGAAACGCTCGAGTTTCTTCGATCTTGACGATGAGTTCGAGGCTGACTTC
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GGGGCTCGTAAACCCGCCGTATCAGCCGCCGCCACTGCCGATTCAGCTTTTGGCAAGAAA
GTTGCTGACGGAGAAGGTGAGAGATCTGCAAAGAGGAAGAGGAAGAGCCAGTACCGAGGT
ATAAGACAACGTCCTTGGGGAAAATGGGCTGCTGAGATTCGTGATCCAAGGGAAGGTTCA
AGAGTCTGGCTTGGAACTTTCAAAACTGCCGAGGAAGCTGCAAGAGCTTACGATGCTGCA
GCTCGTAGAATCCGTGGTTCCAAAGCTAAGGTGAATTTCCCTGAGGAGAACCCACTTGCC
AAGAAGGTGGCTAAACCGAACCCAAACCCAACTCTGGTTCAGAACGTGGACAACTCCTTT
GACAATATGTGTTTCATGGAGGAGAAACAACAAGTTAACAGCAGCAACAACAACA***GT
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TGTTCTGAGTTTGGTTGGAACGATCAAGCTCCTATAACTCCTGAGATCTCTTCGGCGTTT
ATCAACAACAACAACTCTGCTCTATTCGTTGAGGAAGCTGATCCAGCCAAGAAGCTCAAG
GCCATGGATTTCGAGACACCTTACAACAACACTGAATGGGATTCTTCACTTGATTTCTTC
AACGAAGACGCCGTGGCGACTCAGGACAATGGTGCAAACCCTATGGAACTATGGAGCATT
GATGAGATCGATTCCATGATTGGAGGAGTCTTCTAAAGAGATCCATTGTCATTTAAAACA
TTTTGAACTCTTTCTGGTGGTCTCTTGTATTCGCTTGTGTTTTGGTTCTTTCACTTTGTG
CACCCAAGCGTCTCCTTTAAACATTGTCATAACCATAAGTTAATATGTTGAATTAATGTT
CTGTTTTATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G385TF U 1
AF RS1BN96TF U 5
AF RS1D550TF U 164
AF RS1DQ15JQ C 438
AF RS1BN96JQ C 476
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RD RS1G385TF 632 0 0
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GTTTCTGAACATTTACGCCCTCACGCCATGTGTGGAGGAGCTATAATCTCCTACTTCATC
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GCTCGTAGAATCCGTGGTTCCAAAGCTAAGGTGAATTTCCCTGAGGAGAACCCACTTGCC
AAGAAGGTGGCTAAACCGAACCCAAACCCAAC

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1BN96TF 828 0 0
GG
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GAACATTTACACCCTCACGCCATGTGTGGAGGAGCTATAATCTCCGACTTCATCCCGCCG
CCGAGGTCTCGCCGCGTCACCAGCGAGTTTCTCTGGCCGGATCTGAAGAAGAAGAAGAGC
TCGAGGAAACGCTCGAGTTTCTTCGATCTTGACGATGAGTTCGAGGCTGACTTCCAGGGC
TTCAACGACGATTCCTCCATCGACTGCGATGACGAGAAACCGTTCGTTTTCGCCGGGGCT
CGTAAACCCGCCGTATCAGCCGCCGCCACTGCCGATTCAGCTTTTGGCAAGAAAGTTGCT
GACGGAGAAGGTGAGAGATCTGCAAAGAGGAAGAGGAAGAGCCAGTACCGAGGTATAAGA
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AGAATCCGTGGTTCCAAAGCTAAGGTGAATTTCCCTGAGGAGAACCCACTTGCCAAGAAG
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GGTAATGGGTATCATCAGTTATTCAGCTCAGACCAGGGTAGTAACTCATTCGGTTGTTCT
GAGTTTGGTTGGAACGATCAAGCTCCTATAACTCCTGAGATCT
CTT

QA 3 825 3 825
DS 

RD RS1D550TF 792 0 0
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GAAGAAGAGCTCGAGGAAACGCTCGAGTTTCTTCGATCTTGACGATGAGTTCGAGGCTGA
CTTCCAGGGCTTCAACGACGATTCCTCCATCGACTGCGATGACGAGAAACCGTTCGTTTT
CGCCGGGGCTCGTAAACCCGCCGTATCAGCCGCCGCCACTGCCGATTCAGCTTTTGGCAA
GAAAGTTGCTGACGGAGAAGGTGAGAGATCTGCAAAGAGGAAGAGGAAGAGCCAGTACCG
AGGTATAAGACAACGTCCTTGGGGAAAATGGGCTGCTGAGATTCGTGATCCAAGGGAAGG
TTCAAGAGTCTGGCTTGGAACTTTCAAAACTGCCGAGGAAGCTGCAAGAGCTTACGATGC
TGCAGCTCGTAGAATCCGTGGTTCCAAAGCTAAGGTGAATTTCCCTGAGGAGAACCCACT
TGCCAAGAAGGTGGCTAAACCGAACCCAAACCCAACTCTGGTTCAGAACGTGGACAACTC
CTTTGACAATATGTGTTTCATGGAGGAGAAACAGCAAGTTAACAGCAGCAACAACAACA*
**GTCAATTTGGTAATGGGTATCATCAGTTATTCAGCTCAGACCAGGGTAGTAACTCATT
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GTTTATCAACAACAACAACTCTGCTCTATTCGTTGAGGAAGCTGATCCAGCCAAGAAGCT
CAAG*CCATGGATTTCGAGACACCTTACA*CAACACTGAATGGGATTCTTCACTTGATT

QA 14 792 14 792
DS 

RD RS1DQ15JQ 721 0 0
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GAACCCAAACCCAACTCTGGTTCAGAACGTGGACAACTCCTTTGACAATATATGTTTCAT
GGAGGAGAAACAAGAAGTTAACAGCAGCAACAACAACAACAATCAATTTGGTAATGGGTA
TCATCAGTTATTCAGCTCAGACCAGGGTAGTAACTCATTTGGTTGTTCTGAGTTTGGTTG
GAACGATCAAGCTCCTATAACTCCTGAGATCTCTTCGGCGTTTATCAACAACAACAACTC
TGCTCTATTCGCCGAGGAAGCTGATCCAGCTAAGAAGCTCAAGTCCATGGATTTCGAGAC
ACCTTACAACAACACTGAATGGGATTCTTCACTTGATTTCTTCAACGAAGACGCCGTGGC
GACTCAGGACAATGGTGCAAACCCTATGGAACTATGGAGCATTGATGAGATCGATTCCAT
GATTGGGGGAGTCTTCTGAAGAGATCCATTGTCATTTAAAACATTTTGAACTCTTTCTGG
TGGTCTCTTGTATTCGCTTGTGTTTTGGTTCTTTCACTTTGTGCACCCAAGCGTCTCCTT
T

QA 1 721 1 721
DS 

RD RS1BN96JQ 736 0 0
GTTCAAGAGTCTGGCTTGGAACTTTCAAAACTGCCGAGGAAGCTGCAAGAGCTTACGATG
CTGCAGCTCGTAGAATCCGTGGTTCCAAAGCTAAGGTGAATTTCCCTGAGGAGAACCCAC
TTGCCAAGAAGGTGGCTAAACCGAACCCAAACCCAACTCTGGTTCAGAACGTGGACAACT
CCTTTGACAATATGTGTTTCATGGAGGAGAAACAACAAGTTAACAGCAGCAACTACAACA
***GTCAATTTGGTAATGGGTATCATCAGTTATTCAGCTCAGACCAGGGTAGTAACTCAT
TCGGTTGTTCTGAGTTTGGTTGGAACGATCAAGCTCCTATAACTCCTGAGATCTTTTCGG
CGTTTATCAACAACAACAACTTTGCTCTATTCGTTGAGGAAGCTGATCCAGCCAAGAAGC
TCAAGGCCATGGATTTCGAGACACCTTACAACAACACTGAATGGGATTCTTCACTTGATT
TTTTCAACGGAGACGCCGTGGCGACTCAGGACAATGGTGCAAACCCTATGGAACTATGGA
GCATTGGTGAGATCGATTCCATGATTGGAGGAGTCTTCTAAAGAGATCCATTGTCATTTA
AAACATTTTGAACTCTTTCTGGTGGTCTTTTGTATTCGCTTGTGTTTTGGTTCT**CACT
TTGTGCACCCAAGTGTCTTCTTTAAACATTGTCATAACCATAAGTTAATATGTTGAATTA
ATGTTCTGTTTTATGG

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 4

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TCAAAAAGAATATGTGGTTGGTCAGTTCACTCGCTGTCGAGTACCATCTGGTGGGTTGGT
TCATGCAGTTTTAAATAGGATATGGGGTAGGAAATGCAACATTTTTGTCAAGAAGATAAG
TGATTCTTCCCATATCTTTCACATCCCGGATGAAAATACACGAAAATGGGTCCTGGAGCG
TGGTCTGTGGCATGTTGATGACTGTCTAATGTTTGTAGCGGCATGGAATTCTAAGGAATC
TTTATCTCTTCCAGAAATCACTTCTGTTCCTCTGTGGGTAACACTTAAGAACATCCCTGC
TCAGTTATACTCCATCTTTGCTTTAGAATGGATTACCTCAGGTTTAGGAGAACCGATGAT
GTCCCACAAGCCATGGCTAGATCCTACTATGCTAGGAGAGGCAAAAGTTTTGGTGGAGAT
CGAGCTTGATAAGCCTTTTCCTCAAAAAGTAGCAGCATGGGATAAGCAAGGAAACTACTC
AATGATCGATGTTGAGTATAACTGGCTTCCTGCCAAGTGTGAGAAATGTGGTCATATTGG
CCACAAGGCAAAGAGATGTTTGCACATATCGCAGCAAGAGATTCCAGCTAAGGATAATGG
AACGGTGGTGGTCGATGCTTCGGCATCTCCTACAATTGTTGGTGCTTCTTCTCTCAAGGA
AACTCTTACCACTAATCCCTTGGAGGATCAGGTACTGACATTGCAAAACAATAGCACAAG
CCAAGGTGGATCTCTGGAAACTCCTGGTAATGAGGATGAGCTTAATCGCTGCAAAGTAGA
TTCTCATGTTGAACCTGCGGAGACCGAAGATCTAGTTACAGATTCCGACACAACGGTAGT
TTCACCATCTTTCCCGACAATTGACACGCTTGCGTCAATCACGGTACTTGAGAACATGTG
TAACTCTCCTTCTATTATCTGCATCAACAACACGATTGAGACTCCAAATCCGGAGCCTGC
CCAGAAGTTATCAACCGCATCTACTTCTCAGAAAATATATTCAGGTGCCATAGAGGGTGC
TTGTATCATTGAACCTGACTTGGGTTCTAACAAGTTTGCTTCCTTGATCGATGTAGAGGA
GGAAGAAGAAGATTCACCAGAATCTGAAGAAATAGAGCCGATGGATTTCTTGACTCCAGT
TGGGAAAAGAATCCTTCGAGATAGGCCGGTTAAACCAACTACAAAGGCTAGAGAGATGCA
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ATGTGGCTAGATTTTTTTAGTAATTTCTTTCTCAATAGGAATGTGTTCTCCTCTTGTTGC
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ATGGCCAATAAATAATATTTTACGTT


BQ
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AGAACCGATGTTGTCCCACAAGCCATGGCTAGATCCTACTATGCTAGGAGAGGCAAAAGT
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TGGTCATATTGGCCACAAGGCAAAGAGATGTTTGCACATATCGCAGCAAGAGATTCCAGC
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CACAACGGTAGTTTCACCATCTTTCCCGACAATTGACACGCTTGCGTCAATCACGGTACT
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G
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GGTATTGACATTGCAAAACAATAGCACAAGCCAAGGTGGATCTCTGGAAACTCCTGGTAA
TGAGGATGAGCTTAATCGCTGCAAAGTAGATTCTCATGTTGAACCTGCGGAGACCGAAGA
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TGCGTCAATCACGGTACTTGAGAACATGTGTAACTCTCCTTCTATTATCTGCATCAACAA
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CAAGTTTGCTTCCTTGATCGATGTAGAGGATGAAGAAGAAGATTCACCAGAATCTGAAGA
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TGGGTTTTAACAAGTTTGCTTCCTTGATCGATGTAGAGGAGGAAGAAGAAGATTCACCAG
AATTTGAAGAAATAGAGCCGATGGATTTTTTGACTCCGGTTGGGAAAAGAATCCTTCGAG
ATAGGCCGGTTAAACCAACTACAAAGGCTAGAGAGATGCATTCGCAACCCACATGCCGTG
GACGTGGACGGGGTAATCAAGGCCGAGGAAATCGTGGAAGATGTGGCTAGATTTTTTTAG
TAATTTCTTTCTCAATAGGAATGTGTTCTCCTCTTGTTGCTATGGTTCATTTATATGTTC
CATTTTCTTTTGTAATTTTTGAAACTGCATGACTTAGGTCATGGCCAATAAATAATATTT
TACGTT

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DS 



AS 1 6

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AGCCGCCTCTGTCCCTCGCTTGGGCTCCTCCTCGTCCGCCATGGCTACCTTAGCCAAGGC
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GCCTTGC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 

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AF RS1FB35TF C 1
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AF RS1C575TF C 2
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TATTGAACAAAAGAAAGAGATAGAGAGAGAGAGAGGCACATGAAAGGTGGGACGGT
C

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DS 

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A
GTCGAAGATTATAAGATTTTGATCCAAATATATGATTACATACCAAATTTGAGAAAATTT
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TCTTCCTTGGGCTTGACTTCTAAGCTGGTTGTGTTCTCGCTCGTTGAGGCTCTGACCATG
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TCC

QA 2 464 2 464
DS 

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A
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CAAACGGCAGAAGCTGCAGCCGTGAACATGAGATCTCTCCTCATTGTAGTGCTTCTCTGT
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GTCATTGTCATCGATGCCATTGCTTGAATCGTTATCTATCGGT
TCC

QA 2 464 2 464
DS 

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ATCGGT
TCC

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DS 

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TCTTCCTTGGGCTTGACTTCTAAGCTGGTTGTGTTCTCGCTCGTTGAGGCTCTGACCATG
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CCTTGC

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DS 

RD RS1C575TF 486 0 0
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CAAACGGCAGAAGCTGCAGCCGTGAACATGAGATCTCTCCTCATTGTAGTGCTTCTCTGT
TCTTCCTTGGGCTTGACTTCTAAGCTGGTTGTGTTCTCGCTCGTTGAGGCTCTGACCATG
GACATCCTTCTTCCTGCGGTGGGTGACGGAAGCTTAGCGACGGCTGGGAGGAACGTTGCT
GTCATTGTCATCGATGCCATTGCTTGAATCGTTATCTATCGGTCCCTCGCCCATATTTAG
CCTTGC

QA 1 486 1 486
DS 



AS 1 5

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GTACCGATGAGCTGACGATTCCTGACGTTAAGCTGACTCGGTCAAGGGACGGATCTAACG
GAATGGCACTATTCTCTTTCGACCAACCATCGGTTTT*CGACTCGAGCGGTGAGGTCGGT
GAGATAACGGGTTT*GTACATGATTGATGAGGAAGGTGTGATTCAGTCGACGGATGTGAA
CGCTAGATTCGTGAACGGGAAACCGGAAGGCATTGTGGCGAAGCATGTGATGAGGACGCC
GAAAGAATGGGACAGGTTCATGAGGTTTATGGAGAGGTATTCTGACCAGAACGGTTTACA
GTTCGTTAAGAAGCAATGAGGTTGGGGACTATTCTATGAGCAAAATGTGTATGTTACATT
TCAAAAAAAAAAA*CTATTGGTTTATAATTTCTCTCATAGTTTTGATCATTATTTGAGTT
TTCAATTCTTCAATGGTACTTTTATTAGAATGAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BX44JQ C 1
AF RS1BX44TF U 205
AF RS1G268TF U 54
AF RS1DE01TF U 54
AF RS1G268JQ C 54
BS 1 55 RS1BX44JQ
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RD RS1BX44JQ 711 0 0
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CC

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DS 

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CC

QA 1 505 1 505
DS 

RD RS1G268TF 612 0 0
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QA 3 612 3 612
DS 

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GG
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CACTCATTCTCCTCGACATGTTTCACGCACCTCAGGCATTGTCATGTCTTCATGCTCGCC
CTCCTCCTTCACTGGCTCTCCCATTTCCCTCTCTCGACTCCACCCACCATATCCAACAAC
TCTGAGACCAAGAACTCTCGTCCCAATCACGATGATGGTCAAGCCGGCGCTCCAGTTCAT
CCAAGGTACCGATGAGCTGACGATTCCTGACGTTAAGCTGACTCGGTCAAGGGACGGATC
TAACGGAATGGCTCTATTCTCTTTCGACCAACCATCGGTTTT*CGACTCGAGCGGTGAGG
TCGGTGAGATAACGGGTTT*GTACATGATTGATGAGGAAGGTGTGATTCAGTCGACGGAT
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ACGCCGAAAGAATGGGACAGGTTCATGAGGTTTATGGAGAGGTATTCTGACCAGAACGGT
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ACATTTCAAAAAAAAAAA*CTATTGGTTTATAATTTCTCTCATAGTTTTGATCATTATTT
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QA 3 705 3 705
DS 

RD RS1G268JQ 674 0 0
GG
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CCAAGGTACCGATGAGCTGACGATTCCTGACGTTAAGCTGACTCGGTCAAGGGACGGATC
TAACGGAATGGCACTATTTTCTTTCGACCAACCATCGGTTTT*CGACTCGAGCGGTGAGG
TCGGTGAGATAACGGGTTT*GTACATGATTGATGAGGAAGGTGTGATTCAGTCGACGGAT
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ACGCCGAAAGAATGGGACAGGTTCATAAGGTTTATGGAGAGGTATTCTGACCAGAACGGT
TTACAGTTCGTTAAGAAGCAATGAGGTTGGGGACTATTCTATGAGCAAAATGTGTATGTT
ACATTTCAAAAAAAAAAAACTATTGGTTTATAATTTCTCTCATAGTTTTGATCATTATTT
GAGTTTTCAATT

QA 3 674 3 674
DS 



AS 2 5

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CAGAAGCTTCAGTTTCAAGAGGAAGTATATGATGAGTATGTGATAAGATTAATGATGCGG
TACACCATTATTTATATATTAATACATATTTTATCATATGATCAACGAGACATATAATGT
CCAGTATTTTCTTTCCTTTTTTCCATGTACCGACGTACCGTTACGTTTTATATTTTTCGG
TCTGAATCTCTTGGAAGAAGATTCAAATTAAATCTTGTTAATGCCAGTGTCGCCATGCAT
ATGAATATCACTGTCATTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F205JQ C 168
AF RS1BX50TF U 84
AF RS1F205TF U 1
BS 1 561 RS1F205TF

RD RS1F205JQ 297 0 0
AGACCTTCGCCGGAAACCTCGCACCGCAAGCCCCCTTTCATCCCCCATAAAACCTCCACC
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ATTAATGATGCGGTACACCATTATTTATATATTAATACATATTTTATCATATGATCAACG
AGACATATAATGTCCAGTATTTTCTTTCCTTTTTTCCATGTACCGACGTACCGTTAC

QA 1 297 1 297
DS 

RD RS1BX50TF 452 0 0
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AGGGGGCCAGAGACACATAACTCTAGACCTTCGCCGGAAACCTCGCACCGCAAGCCACCT
TTCATCCACCATAAAACCTCCACCGCTGGATCCGCCAGTGCTCATGTTGGAGGGCAGAAC
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AGTATATGATGAGTATGTGATAAGATTAATGATGCGGTACACCATTATTTATATATTAAT
ACATATTTTATCATATGATCAACGAGACATATAATGTCCAGTATTTTCTTTTCTTTTTTC
CATGTACCGACGTACCGTTACGTTTTATATTTTTCGGTCTGAATCTCTTGGAAGAAGATT
CAAATTAAATCTTGTTAAT
ACCAGTGTCGCCA

QA 1 439 1 439
DS 

RD RS1F205TF 561 0 0
ACTCAAAAGTTCATAACTGTTTATAAGTAATTAAAATGAAGTCGACCGTCGTGATTTTTC
TCATGTACCTTCTCCTTGTTGTGCCTTGCTTGGTCGCTGTAGGATCGGAAAATACGGATT
CGGAGGTGTACGAGATCGATTACAGGGGGCCAGAGACACATAACTCTAGACCTTCGCCGG
AAACCTCGCACCGCAAGCCACCTTTCATCCACCATAAAACCTCCACCGCTGGATCCGCCA
GTGCTCATGTTGGAGGGCAGAACTAGAGAGCGACTTTTTCTTAAGGAGAAAGGAGGGTCT
CAGAAGCTTCAGTTTCAAGAGGAAGTATATGATGAGTATGTGATAAGATTAATGATGCGG
TACACCATTATTTATATATTAATACATATTTTATCATATGATCAACGAGACATATAATGT
CCAGTATTTTCTTTCCTTTTTTCCATGTACCGACGTACCGTTACGTTTTATATTTTTCGG
TCTGAATCTCTTGGAAGAAGATTCAAATTAAATCTTGTTAATGCCAGTGTCGCCATGCAT
ATGAATATCACTGTCATTCTC

QA 1 561 1 561
DS 



CO CL1435Contig2 582 2 2 U
GGACCACTCAAAACAAAAACACTCAAAAGTTCATAACTGTTTATAAGTAATTAAAATGAA
GTCGACCGTCGTGATTTTTCTCATGTACCTTCTCCTTGTTGTGCCTTGCTTGGTCGCTAT
AGGATCGGAAAATACGGATTCGGAGGTGTACGAGATCGATTACAGGGGGCCAGAGACACA
TAACTCTAGACCTTCGCCGGAAACCTCGCACCGCAAGCCATCTTTCATCCACCATAAAAC
CTCCACCGCTGGATCCGCCAGTGCTCATATTGGAGGGCATAACTAGAGAGTGACTTTTTC
TTAAGGAGAAAGGAGGGTCTCAGAAGCTTCAGTTTCAATAGGAAGTATATGATGAGTATG
TGATAAGATTAATGATGCGGTACACCATTATTTATATATTAATACATATTTTATCATATG
ATCAACGAGAGTACGAGACATATAATGTCCAGTATTTTCTTTCCTTTTTTCCATGTACCG
ACGTACCGTTACGTTTTTATATTTTTCGGTCTGAATCTCTTGGAAGAAGATTCAAATTAA
ATCTTGTTAATGCGTCAGTGTCGCCATGCATATGAATATCAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1GP30JQ C 1
AF RS1GP30TF U 1
BS 1 581 RS1GP30TF
BS 582 582 RS1GP30JQ

RD RS1GP30JQ 582 0 0
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AGGATCGGAAAATACGGATTCGGAGGTGTACGAGATCGATTACAGGGGGCCAGAGACACA
TAACTCTAGACCTTCGCCGGAAACCTCGCACCGCAAGCCATCTTTCATCCACCATAAAAC
CTCCACCGCTGGATCCGCCAGTGCTCATATTGGAGGGCATAACTAGAGAGTGACTTTTTC
TTAAGGAGAAAGGAGGGTCTCAGAAGCTTCAGTTTCAATAGGAAGTATATGATGAGTATG
TGATAAGATTAATGATGCGGTACACCATTATTTATATATTAATACATATTTTATCATATG
ATCAACGAGAGTACGAGACATATAATGTCCAGTATTTTCTTTCCTTTTTTCCATGTACCG
ACGTACCGTTACGTTTTTATATTTTTCGGTCTGAATCTCTTGGAAGAAGATTCAAATTAA
ATCTTGTTAATGCGTCAGTGTCGCCATGCATATGAATATCAG

QA 1 582 1 582
DS 

RD RS1GP30TF 582 0 0
GGACCACTCAAAACAAAAACACTCAAAAGTTCATAACTGTTTATAAGTAATTAAAATGAA
GTCGACCGTCGTGATTTTTCTCATGTACCTTCTCCTTGTTGTGCCTTGCTTGGTCGCTAT
AGGATCGGAAAATACGGATTCGGAGGTGTACGAGATCGATTACAGGGGGCCAGAGACACA
TAACTCTAGACCTTCGCCGGAAACCTCGCACCGCAAGCCATCTTTCATCCACCATAAAAC
CTCCACCGCTGGATCCGCCAGTGCTCATATTGGAGGGCATAACTAGAGAGTGACTTTTTC
TTAAGGAGAAAGGAGGGTCTCAGAAGCTTCAGTTTCAATAGGAAGTATATGATGAGTATG
TGATAAGATTAATGATGCGGTACACCATTATTTATATATTAATACATATTTTATCATATG
ATCAACGAGAGTACGAGACATATAATGTCCAGTATTTTCTTTCCTTTTTTCCATGTACCG
ACGTACCGTTACGTTTTTATATTTTTCGGTCTGAATCTCTTGGAAGAAGATTCAAATTAA
ATCTTGTTAATGCGTCAGTGTCGCCATGCATATGAATATCA
G

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 3

CO CL1436Contig1 940 3 4 U
AGTTAAGAGCAATATTTCATAAGCACCCATGACTGAACTTGAAAAATAATCATCATACAT
AAAAGGATTACTCTGCTAGCTTCAATTACTAAACACAAAACAGTTACACATAACACATGG
TAACAATATTCGCACACATACAACATTCATGACAAGGAACGTCTCTGTTAATTATAACAT
ATTTTAAAATGTATTTGGCTCACTAAGCAAAGAATTGGAACCTTATTAATTATCTAACTA
AACAGGACATTTTTATTGGCTCTTCTTGGACGAAAATAAACCTTTACTATTCATCTCTTC
TTGTTTCTGTGTGTATATATATAACTCAGCTAGCTGCTGATGCAATAAAAGTGGCTGGCT
CAGGAACAACATCGGCTGGAGAGAAACCGTTTGGTTTCGGATATTGTTTCTCCTCCAATC
CCCAGAACTTTGCTGTTTTGACATCATCTTCACACATTTGTTTTGAAAACTCCTCATGAT
CATACTCCAGTGTTGCTTTTCCTCCAAACTCCTTGGGAAGATTCTCAACATCAAAATGTG
ATGTCATCAGTTCATCACTTGTTTTGTCTTTAGGGTACACAAATTTGACCTTTTGAGCTG
TACATGGGTCCAAGAAATATTTAACAGCCTTGTAGACTGCTTGGAAGAGTCTTGGTGGAT
TGTAGAGAAAGGCGATACCGAGTCTCTCAGGGTAATGATTCTGTAGAATGTAGACAATCT
CTCGTGTTGTTTTCATAGGGACATTAGCAGCCATAGACCAACCAGTGAAATCGATGAGCC
AAGACATTTGTTCTTGTCCCTTGGGAAGATTGAGGATGGCATTTTCAAGAAGATAGACCA
AATGCTTGATATTGCCCTCTGCTGATGTTGAGTTCTGTAATGCTGGTCTCATTATAAGCA
CTACTCTACCTTGTCTATCATGAAAACAGCTCTTGAAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CS06JQ U 82
AF RS1E726JQ U 1
AF RS1D191JQ U 73
BS 1 466 RS1E726JQ
BS 467 467 RS1D191JQ
BS 468 686 RS1E726JQ
BS 687 940 RS1D191JQ

RD RS1CS06JQ 123 0 0
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AACATTCATGACAAGGAACGTCTCTGTTAATTATAACATATTTTAAAATGTATTTGGCTC
ACT

QA 1 123 1 123
DS 

RD RS1E726JQ 686 0 0
AGTTAAGAGCAATATTTCATAAGCACCCATGACTGAACTTGAAAAATAATCATCATACAT
AAAAGGATTACTCTGCTAGCTTCAATTACTAAACACAAAACAGTTACACATAACACATGG
TAACAATATTCGCACACATACAACATTCATGACAAGGAACGTCTCTGTTAATTATAACAT
ATTTTAAAATGTATTTGGCTCACTAAGCAAAGAATTGGAACCTTATTAATTATCTAACTA
AACAGGACATTTTTATTGGCTCTTCTTGGACGAAAATAAACCTTTACTATTCATCTCTTC
TTGTTTCTGTGTGTATATATATAACTCAGCTAGCTGCTGATGCAATAAAAGTGGCTGGCT
CAGGAACAACATCGGCTGGAGAGAAACCGTTTGGTTTCGGATATTGTTTCTCCTCCAATC
CCCAGAACTTTGCTGTTTTGACATCATCTTCACACATTTGTTTTGAGAACTCCTCATGAT
CATACTCCAGTGTTGCTTTTCCTCCAAACTCCTTGGGAAGATTCTCAACATCAAAATGTG
ATGTCATCAGTTCATCACTTGTTTTGTCTTTAGGGTACACAAATTTGACCTTTTGAGCTG
TACATGGGTCCAAGAAATATTTAACAGCCTTGTAGACTGCTTGGAAGAGTCTTGGTGGAT
TGTAGAGAAAGGCGATACCGAGTCTC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1D191JQ 868 0 0
CTGCTAGCTTCAATTGCTAAACACAAAACAGTTACACATAACACATGGTAACAATATTCG
CACACATATAACATTCATGACAAGGAACGTCTCTGTTAATTATAACATATTTTAAAATGT
ATTTGGCTCACTAAGCAAAGACTTGGAACCTTATTAATTATCTAACTAAACAGGACATTT
TTATTGGCTCTTCTTGGACGAAAATAAACCTTTACTATTCATCTCTTCTTGTTTCTGTGT
GTATATATATAACTCAGCTAGCTGCTGATGCAATAGAAGTGGCTGGCTCAGGAACAACAT
CGGCTGGAGAGAAACCGTTTGGTTTCGGATATTGTTTCTCCTCCAATCCCCAGAACTTTG
CTGTTTTGACATCATCTTCACACATTTGTTTTGAAAACTCCTCATGATCATACTCCAGTG
TTGCTTTTCCTCCAAACTCCTTGGGAAGATTCTCAACATCAAAATGTGATGTCATCAGTT
CATCACTTGTTTTGTCTTTAGGGTACACAAATTTGACCTTTTGAGCTGTACATGGGTCCA
AGAAATATTTAACAGCCTTGTAGACTGCTTGGAAGAGTCTTGGTGGATTGTAGAGAAAGG
CGATACCGAGTCTCTCAGGGTAATGATTCTGTAGAATGTAGACAATCTCTCGTGTTGTTT
TCATAGGGACATTAGCAGCCATAGACCAACCAGTGAAATCGATGAGCCAAGACATTTGTT
CTTGTCCCTTGGGAAGATTGAGGATGGCATTTTCAAGAAGATAGACCAAATGCTTGATAT
TGCCCTCTGCTGATGTTGAGTTCTGTAATGCTGGTCTCATTATAAGCACTACTCTACCTT
GTCTATCATGAAAACAGCTCTTGAAACT

QA 1 868 1 868
DS 



AS 1 5

CO CL1437Contig1 1040 5 6 U
GCTAAAAATAAAGTTTATTTTATTCATAATCTCAGAGTACGTACAAATAACATGAAAAAA
TACAATACAGAATAAGCCACAGATTTGGCTTTTTTATTTGTTTAAAGTTGTAAACCTTAA
TTATTCATGGCCAAAACCGGTCTAGTTGTTTTTGGCGGCGTTTTCGAAAGACCAGCTCCA
GATGTCGTGACGCTCAGGGGCACGTCCCATGGAACCGGCAAAACCGACGTAACTGTTCTG
AAGAACAACATCATTGAGCTCTCTGGGACCTTGGATCAAAGGTCTCTTAGGCTTCTTCAT
GTTCTCAGGCGCGAGGGTAATAGTAATCCTATTGTCTTTGTTTCTGAACTCAATCCAAGC
CGTGAACCTCTCTCCGCTACTCAGGTTCACATCTTTAAAAGACCAAACTTTCCTCTTCCC
GACTCTTGTCTGAACCCAGTAACCAGCTTTCTCCGCAACGTTCGAAGTCATGGAGTTGAT
GTTGAGCCCGACGTGGTTGCCACTAATGTCTTGGAACTCTTTGTTCTGGAAAGTGTCGAA
CTCGACGGCGAAGAGGTGGTTTTCCGCATTCCCGTTGTTGGTTTTGTTGAGCATTCCGAG
GAATCCACCGCCTGAGGCGCCGGAGTTATCGGCGGCTGGGACGACGATGAAGGCGAGGCC
TTGGCCGGAGTTTGGTTTGGTACGAGGAGTGATGGAGAAAGTGAAAGAGGTCTCGAATGA
GTAAGGGGCAGAGTCGTTGGAAGGCTTGAAAGGGATGGGGTTGATGTAGAGACCTTTGCC
GTAAGAGAATGGATTCTCGTCACGGGTCATGGACCAGGCTCCGGATCGGTTTATACCGTC
GGAGGCAGGACCAAGCTCTGCGTCTCCGAGGAACATCAAGTTGTCTCCGTCGAAGGTTTT
GAAGTTGAACTTGACGGCAAAGGCTGCTTGAGCTAAGAACAGAGCAATAAAACAGAGTTT
GTGAATCTGCATTGTGTTTGTTTTTTTTTGTATTAGACTGAAGTGGAGAGAAGATTGATT
GATTGATTGATTGATGATCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
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TTCATGGCCAAAACCGGTCTAGTTGTTTTTGGCGGCGTTTTCGAAAGACCAGCTCCAGAT
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TC
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GAGACCTTTGCCGTAAGAGAATGGATTCTCGTCACGGGTCATGGACCAGGCTCCGGATCG
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AAAACAGAGTTTGTGAATCTGCATTGTGTTTGTTTTTTTTTGTATTAGACTGAAGTGGAG
AGAAGATTGATTGATTGATTGATTGAT
GATCC

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DS 



AS 2 6

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AF RS1DA65JQ U 1
AF RS1A696JQ U 88
AF RS1A696TF C 490
AF RS1DA65TF C 612
BS 1 133 RS1DA65JQ
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BS 135 186 RS1DA65JQ
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BS 188 357 RS1DA65JQ
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BS 443 460 RS1DA65JQ
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BS 566 639 RS1A696JQ
BS 640 1280 RS1A696TF

RD RS1DA65JQ 565 0 0
CAGCAATAGTTCTGAAAATTAATCACCAATACGCAAATTTTACAGAAATTGAATAAGTCT
TGATATTTTTTTTTCACACCCACACTGGTTTCTCCACAATCAGCTAAGCTCATTAACGTG
CGTTAAAAAATTCTCCCGTCTTTTTACTTATGCAAAAAAAAAAACCACACGGCAATGTAG
CATTCAGCCTTTATGAACTCGTTCCAGCATTTGTCACCGCGGTTAGATCTTCTAGTTCAT
CAACAATGGCCTTGTAGCAAAACAAGTATTGATCCATGGTTTGAACCATGCCAATGCGTT
GTCTGCGGAATGTTGTCACAGTTTTAGCAAGATCCAAAGCAAACATGTCTCCAACAAGAA
TCCTCTGGATTGTGTTATGTATCGCACAGTATGTTCCGGTTCTTCCTATCCCTGCACTGC
AGTGAACAATGATTGGGCCGAGACTAGGCGGTACTTGATAGAGTCTTTTCAAAATTTCAC
GGGTAGCCACGGTATCTTTGGGAACTCCATGGTCAGGCCACTCCGGATACTGAATGTGCA
AAACGGACATGGGCTGCTGACCCTC

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DS 

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GTTTCTCCACAATCAGCTAAGCTCATTAACGTGCGTTAAAAAATTCCCCCGTCTTTTTAC
TTATGCAAAAAAAAAAACCACACGGCAATGTAGCATTCACCCTTTATGAACTCGTTCCAG
CATTTGTCACCGCGGTTAGATCTTCTAGTTCATCAACAATGGCCTTGTAGCAAAACAAGT
ATTGATCCATGGTTTGAACCATGCCAATGCGTTGTCTGCGGAATGTTGTCACAGTTTTAG
CAAGATCCAAAGCAAACATGTCTCCAACAAAAATCCTCTGGATTGTGTTATGTATCGCAC
AGTATGTTCCGGTTCTTCCTATCCCTGCACTGCAGTGAACAATGATTGGGCCGAAACTAG
GCGGTACTTGATAAAGTCTTTTCAAAATTTCACGGGTAGCCACGGTATCTTTGGGAACTC
CATGGTCAGGCCACTCCGGATACTGAATGTGCAAAACGGACATGGGCTGCTGACCCTCCA
TCTCCTTGTAGTTAACCTCAAAATTCCGCAACAACAGTGAAGTATCATCAGTAGTCTTTA
CCCATTTGGTCA

QA 1 552 1 552
DS 

RD RS1A696TF 791 0 0
CGGTATCTTTGGGAACTCCATGGTCAGGCCACTCCGGATACTGAATGTGCAAAACGGACA
TGGGCTGCTGACCCTCCATCTC*TTGTAGTTAACCTCAAAATTCCGCAACAACAGTGAAG
TATCATCAGTAGTCTTTACCCATTTGGTCAGAACAGATACGTTGCCAAATTCTCTGGGCT
TATTATCTTCGGCTGGAAAGTAGTCACCGCATTTAACAGTCTTGTAGTTATCAACCAAGC
GAGTGAGCATCACTATGACGGGACAGTGCTGCTGAACCACCATCTCCCAAAAGTCCTCCG
TCGTGCGTTGTAGAGGACCTTGCGTAGCAATAAACTCAGAAACACTCTCAGACGACGACG
CCTTAATCAAGCTTGCATTCACATATCCATCTGCATCTTTGCACGGACTCAGAACAACTC
TATTCTCATCAAATGGCAAAACGTCGGTGTATCTGTTCTTATCGAAATTGACATTGTTCA
TAGCCACTGTAGCGTTTAGTAGCATATCCGACGCTCTCATCCTATTAGCCTGCAGATTCG
CGAACTCCCGAGAGATGGAGTCAGGATCTGAGATCTTCTCGCGGAGAATCTTGAGAGCTT
GGTGGCAGTAGCTGAGCTGATCGGGGGAGAGAGAGAGCTTGGGAGGAGGCGAATCAGCGG
AGGAGGAGAAATCGAAACAACAACTCGAGGCGGAAGTAGAGTTTGCGGTAGCCATGATCG
ATCGGCGGCGGGATTTAACGCGGCGGCAGGAAGAAGTGAGATTGCCCGTCGTGTGAGGCG
GAGAGAATCGA

QA 1 791 1 791
DS 

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TCATCAGTAGTCTTTACCCATTTGGTCAGAACAGATACGTTGCCAAATTCTCTGGGCTTA
TTATCTTCGGCTGGAAAGTAGTCACCGCATTTAACAGTCTTGTAGTTATCAACCAAGCGA
GTGAGCATCACTATGACGGGACAGTGCTGCTGAACCACCATCTCCCAAAAGTCCTCCGTC
GTGCGTTGTAGAGGACCTTGCGTAGCAATAAACTCAGAAACACTCTCAGACGACGACGCC
TTAATCAAGCTTGCATTCACATATCCATCTGCATCTTTGCACGGACTCAGAACAACTCTA
TTCTCATCAAATGGCAAAACGTCGGTGTATCTGTTCTTATCGAAATTGACATTGTTCATA
GCCACTGTAGCGTTTAGTAGCATATCCGACGCTCTCATCCTATTAGCCTGCAGATTCGCG
AACTCCCGAGAGATGGAGTCAGGATCTGAGATCTTCTCGCGGAGAATCTTGAGAGCTTGG
TGGCAGTAGCTGAGCTGATCGGGGGAGAGAGAGAGCTTGGGAGGAGGCGAATCAGCGGAG
GAGGAGAAATCGAAACAACAACTCGAGGCGGAAGTAGAGTTTGCGGTAGCCATGATCGAT
CGGCGGCGGGATTTAACGCGGCGGCAGGAAGAAGTGAGATTGCCCGTCGTGTGAGGCGGA
GAGAATCGA

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DS 



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GATAACCTAAGAAAGAAAAGGTCGATTCTCTCCGCCTCACACGACGGGCAACCTCACTTC
TTCCCGCCGCCGCGCTAAATCCCGCCGCCGATCGATCATGGCTACCGCAAACTCCACCGG
CTCGAGTCGTTTCGATTTCTCCTCCTCCGCTGACTCGCCTCCTCCCAAGCTCTCTCTCTC
CCCCGATCAGCTCAGCTACTGCCACCAAGCTCTCAAGATTCTCCGCGAGAAGATCTCAGA
TCCTGACTCCATCTCTCGGGAGTTCGCGAATCTGCAGACTAATAGGATGAGAGCGTCGGA
TATGCTACTAAACGCTACAGTGGCTATGAACAATGTCAATTTCGATAAGAACAGATACAC
CGACGTTTTGCCATTTGATGAGAATAGAGTTGTTCTGAGTCCGTGCAAAGATGCAGATGG
ATATGTGAATGCAAGCTTGATTAAGGCGTCGTCGTCTGAGAGTGTTTCTGAGTTTATTGC
TACGCAAGCTGACGGTCGAGAGAGAGACTTTTCGGACAGCAACTGCTGATTTCTCGCCGA
TCTTGCAGTTCGAGCAAGACCCTGTTCAGATTCTTGATGCTTTGTTGCCTTTGTATCTGA
ACAGTCAGATTCTTAGGGCGTTACAGGAGTCTTTGGCGAGTGAGCTCGCGGCTCGGATGA
GTGCGATGAGTAGTGCTTCGGATAATGCATCGGATCTTAAGAAATCGCTTTCGATGGTTT
ATAATAGAAAACGTCAAGCTAAGATTACTGGTGAGATTCTTGAGATTGTTGCTGGAGCCA
ATGCACAGGCTTGATGATTCGATATGAGCACCTCTTTTTAAATATATATATCATTTTCGG
TCGTATAATGTATAATCGTCTAGACTCCTATGATCTTTATATAATCATGCAATTACAAAC
GT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RS1FH33TF U 1
AF RS1FH33JQ C 187
BS 1 443 RS1FH33TF
BS 444 902 RS1FH33JQ

RD RS1FH33TF 443 0 0
GATAACCTAAGAAAGAAAAGGTCGATTCTCTCCGCCTCACACGACGGGCAACCTCACTTC
TTCCCGCCGCCGCGCTAAATCCCGCCGCCGATCGATCATGGCTACCGCAAACTCCACCGG
CTCGAGTCGTTTCGATTTCTCCTCCTCCGCTGACTCGCCTCCTCCCAAGCTCTCTCTCTC
CCCCGATCAGCTCAGCTACTGCCACCAAGCTCTCAAGATTCTCCGCGAGAAGATCTCAGA
TCCTGACTCCATCTCTCGGGAGTTCGCGAATCTGCAGACTAATAGGATGAGAGCGTCGGA
TATGCTACTAAACGCTACAGTGGCTATGAACAATGTCAATTTCGATAAGAACAGATACAC
CGACGTTTTGCCATTTGATGAGAATAGAGTTGTTCTGAGTCCGTGCAAAGATGCAGATGG
ATATGTGAATGCAAGCTTGATTA

QA 1 443 1 443
DS 

RD RS1FH33JQ 716 0 0
TCAGCTCAGCTACTGCCACCAAGCTCTCAAGATTCTCCGCGAGAAGATCTCAGATCCTGA
CTCCATCTCTCGGGAGTTCGCGAATCTGCAGACTAATAGGATGAGAGCGTCGGATATGCT
ACTAAACGCTACAGTGGCTATGAACAATGTCAATTTCGATAAGAACAGATACACCGACGT
TTTGCCATTTGATGAGAATAGAGTTGTTCTGAGTCCGTGCAAAGATGCAGATGGATATGT
GAATGCAAGCTTGATTAAGGCGTCGTCGTCTGAGAGTGTTTCTGAGTTTATTGCTACGCA
AGCTGACGGTCGAGAGAGAGACTTTTCGGACAGCAACTGCTGATTTCTCGCCGATCTTGC
AGTTCGAGCAAGACCCTGTTCAGATTCTTGATGCTTTGTTGCCTTTGTATCTGAACAGTC
AGATTCTTAGGGCGTTACAGGAGTCTTTGGCGAGTGAGCTCGCGGCTCGGATGAGTGCGA
TGAGTAGTGCTTCGGATAATGCATCGGATCTTAAGAAATCGCTTTCGATGGTTTATAATA
GAAAACGTCAAGCTAAGATTACTGGTGAGATTCTTGAGATTGTTGCTGGAGCCAATGCAC
AGGCTTGATGATTCGATATGAGCACCTCTTTTTAAATATATATATCATTTTCGGTCGTAT
AATGTATAATCGTCTAGACTCCTATGATCTTTATATAATCATGCAATTACAAACGT

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 4

CO CL1439Contig1 867 4 4 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGCGTCTGTG
TCTGTTTAGGTTAAGAGGATCGATGTCGTGGTGGGGGGAGGAAGCGGCGAAGGCTGCTAA
AATAGCTGTGTGGTGGGATATGAAGGACTGTCCGATTCCTGAGGGTTATGATGCTGGTCG
GATCCGGCCGAGTTTAGAAGCGGCGTTCAAGGAACGAGGCTACACCGGTCCAGTTTCCTC
CATCACTGCCTATGGTGACCAAACAGAAACCCCTGTTCACATCCTGAAAGGGCTCTTATC
TACTGGAGTTTCGGTAGCACACACCAGATCCGAAAGCACAAAGTACATCATGTATCGGGA
TATAGTGGAATGGCGAGGTCAGAATCCTCCCCCTGCTACAATGATGATCATATCAAATCC
GGTGAGAGGTGACTTCTGTTGGGATCTGGCCCGGCTACAACAACGGTCGCAATACAATCT
GTTTGTGGCTTATCCGAAGTCGCTTTGCTATATCTCACCCCTGCTAATTTCTGCAGTGTG
GGTATGGGGAAAATTACTAGGGTTTAGGGATAATAATAGAATTATTGAGACCAGAAGCGC
ACCACTTGCCATGCTTTGTTGCAAATCGTGCAATTTCGATTGCCAAATCCCTGAGAAATT
GAGGAAGCATCTCTCGAGTTATAAGCATGCACGCCAAGAGTCTGTATACCCTACGTACGA
AGAAATCACCCGGGTAACGGAGCATTGGGGAAAGAACTACCCGGCAACGCCTGAATATGC
GACAGCTAAAATACTGGTGTGGTGGGACATGTTTTACTGTCCTATCCCCGAGGGATATGA
TGCTCGTCGGGTCCGTCCGAGTTTAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A339TV U 1
AF RS1DF82TF U 50
AF RS1AD61TF U 66
AF RS1A339TF U 76
BS 1 470 RS1A339TV
BS 471 691 RS1DF82TF
BS 692 814 RS1AD61TF
BS 815 867 RS1A339TF

RD RS1A339TV 470 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGCGTCTGTG
TCTGTTTAGGTTAAGAGGATCGATGTCGTGGTGGGGGGAGGAAGCGGCGAAGGCTGCTAA
AATAGCTGTGTGGTGGGATATGAAGGACTGTCCGATTCCTGAGGGTTATGATGCTGGTCG
GATCCGGCCGAGTTTAGAAGCGGCGTTCAAGGAACGAGGCTACACCGGTCCAGTTTCCTC
CATCACTGCCTATGGTGACCAAACAGAAACCCCTGTTCACATCCTGAAAGGGCTCTTATC
TACTGGAGTTTCGGTAGCACACACCAGATCCGAAAGCACAAAGTACATCATGTATCGGGA
TATAGTGGAATGGCGAGGTCAGAATCCTCCCCCTGCTACAATGATGATCATATCAAATCC
GGTGAGAGGTGACTTCTGTTGGGATCTGGCCCGGCTACAACAACGGTCGC

QA 1 470 1 470
DS 

RD RS1DF82TF 642 0 0
GGGCGTCTGTGTCTGTTTAGGTTAAGAGGATCGATGTCGTGGTGGGGGGAGGAAGCGGCG
AAGGCTGCTAAAATAGCTGTGTGGTGGGATATGAAGGACTGTCCGATTCCTGAGGGTTAT
GATGCTGGTCGGATCCGGCCGAGTTTAGAAGCGGCGTTCAAGGAACGAGGCTACACCGGT
CCAGTTTCCTCCATCACTGCCTATGGTGACCAAACAGAAACCCCTGTTCACATCCTGAAA
GGGCTCTTATCTACTGGAGTTTCGGTAGCACACACCAGATCCGAAAGCACAAAGTACATC
ATGTATCGGGATATAGTGGAATGGCGAGGTCAGAATCCTCCCCCTGCTACAATGATGATC
ATATCAAATCCGGTGAGAGGTGACTTCTGTTGGGATCTGGCCCGGCTACAACAACGGTCG
CAATACAATCTGTTTGTGGCTTATCCGAAGTCGCTTTGCTATATCTCACCCCTGCTAATT
TCTGCAGTGTGGGTATGGGGAAAATTACTAGGGTTTAGGGATAATAATAGAATTATTGAG
ACCAGAAGCGCACCACTTGCCATGCTTTGTTGCAAATCGTGCAATTTCGATTGCCAAATC
CCTGAGAAATTGAGGAAGCATCTCTCGAGTTATAAGCATGCA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RS1AD61TF 754 0 0
GG
AGGTTAAGAGGATCGATGTCGTGGTGGGGGGAGGAAGCGGCGAAGGCTGCTAAAATAGCT
GTGTGGTGGGATATGAAGGACTGTCCGATTCCTGAGGGTTATGATGCTGGTCGGATCCGG
CCGAGTTTAGAAGCGGCGTTCAAGGAACGAGGCTACACCGGTCCAGTTTCCTCCATCACT
GCCTATGGTGACCAAACAGAAACCCCTGTTCACATCCTGAAAGGGCTCTTATCTACTGGA
GTTTCGGTAGCACACACCAGATCCGAAAGCACAAAGTACATCATGTATCGGGATATAGTG
GAATGGCGAGGTCAGAATCCTCCCCCTGCTACAATGATGATCATATCAAATCCGGTGAGA
GGTGACTTCTGTTGGGATCTGGCCCGGCTACAACAACGGTCGCAATACAATCTGTTTGTG
GCTTATCCGAAGTCGCTTTGCTATATCTCACCCCTGCTAATTTCTGCAGTGTGGGTAAGG
GGAAAATTACTAGGGTTTAGGGATAATAATAGAATTATTGAGACCAGAAGCGCACCACTT
GCCATGCTTTGTTGCAAATCGTGCAATTTCGATTGCCAAATCCCTGAGAAATTGAGAAAG
CATCTCTCGAGTTATAAGCATGCACGCCAAGAGTCTGTATACCCTACGTACGAAGAAATC
ACCCGGGTAACGGAGCATTGGGGAAAGAACTACCCGGCAACGCCTGAATATGCGACAGCT
AAAATACTGGTGTGGTGGGACATGTTT
TACTG

QA 3 749 3 749
DS 

RD RS1A339TF 792 0 0
AGGATCGATGTCGTGGTGGGGGGAGGAAGCGGCGAAGGCTGCTAAAATAGCTGTGTGGTG
GGATATGAAGGACTGTCCGATTCCTGAGGGTTATGATGCTGGTCGGATCCGGCCGAGTTT
AGAAGCGGCGTTCAAGGAACGAGGCTACACCGGTCCAGTTTCCTCCATCACTGCCTATGG
TGACCAAACAGAAACCCCTGTTCACATCCTGAAAGGGCTCTTATCTACTGGAGTTTCGGT
AGCACACACCAGATCCGAAAGCACAAAGTACATCATGTATCGGGATATAGTGGAATGGCG
AGGTCAGAATCCTCCCCCTGCTACAATGATGATCATATCAAATCCGGTGAGAGGTGACTT
CTGTTGGGATCTGGCCCGGCTACAACAACGGTCGCAATACAATCTGTTTGTGGCTTATCC
GAAGTCGCTTTGCTATATCTCACCCCTGCTAATTTCTGCAGTGTGGGTATGGGGAAAATT
ACTAGGGTTTAGGGATAATAATAGAATTATTGAGACCAGAAGCGCACCACTTGCCATGCT
TTGTTGCAAATCGTGCAATTTCGATTGCCAAATCCCTGAGAAATTGAGGAAGCATCTCTC
GAGTTATAAGCATGCACGCCAAGAGTCTGTATACCCTACGTACGAAGAAATCACCCGGGT
AACGGAGCATTGGGGAAGGAACTACCCGGCAACGCCTGAATATGCGACAGCTAAA*TACT
GGTGTGGTGGGACATGTTTTACTGTCCTATCCCCGAGGGATATGATGCTCGTCGGGTCCG
TCCGAGTTTAGA

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 5

CO CL1440Contig1 813 5 4 U
GGAAATAAAAAAAAATCTTTTAAGCAAAGAAAGAAAAAAAAATGCAGATCTTCGTGAAAA
CCCTGACCGGGAAAACCATAACCCTAGAGGTTGAAAGCAGCGACACCATCGACAATGTCA
AAGCCAAAATCCAGGACAAGGAGGGAATACCACCGGATCAACAGAGGCTGATATTCGCTG
GCAAACAACTTGAAGATGGAAGAACCCTTGCGGACTACAACATCCAGAAAGAGTCAACTC
TTCACTTGGTCTTGAGGCTTAGAGGTGGGACCATGATCAAGGTCAAGACTCTCACTGGCA
AAGAAATTGAGATTGATATCGAACCTACAGACACCATTGATCGGATCAAGGAACGCGTTG
AGGAGAAAGAAGGCATCCCTCCTGTTCAACAAAGGCTCATCTACGCTGGAAAACAGCTAG
CTGATGACAAGACGGCAAAAGACTACAACATCGAGGGAGGCTCTGTTCTGCATCTGGTTC
TTGCTCTTAGGGGTGGTTTTGGTCTTCTCTAGAAAAAA**AGTGAATGCAATATGAATTT
GATGCTTTGCTGTTTCAGTGGGTTTGGAATCAATGTACCAAAAGTCTGTTCAATCTCGGA
TGATGCATAATTACATATGATTTTTTTTTTGGATTTGGCTATTTTTGAGGGATATCTTTC
AACCTATTCGTTTTATAAGTTCCATGCTACCCATGATCATTGTCGTAAGAAATTACATAC
TAAAGGGTCCTACACAAGAAGTGACCGTTGATATTCGAACGTTAAGCTTTACAAGACGTT
AGCGTTTTGGAAAGAATCGTATTCTTCCAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C773TF U 19
AF RS1AE63TF U 266
AF RS1C773JQ C 19
AF RS1DC14TF U 1
AF RS1DC14JQ C 224
BS 1 726 RS1DC14TF
BS 727 727 RS1DC14JQ
BS 728 762 RS1DC14TF
BS 763 813 RS1DC14JQ

RD RS1C773TF 285 0 0
GAAGCAAAGAAAGAA
AAAAAAAAATGCAGATCTTCGTGAAAACCCTGACCGGGAAAACCATAACCCTAGAGGTTG
AAAGCAGCGACACCATCGACAATGTCAAAGCCAAAATCCAGGACAAGGAGGGAATACCAC
CGGATCAACAGAGGCTGATATTCGCTGGCAAACAACTTGAAGATGGAAGAACCCTTGCGG
ACTACAACATCCAGAAAGAGTCAACTCTTCACTTGGTCTTGAGGCTTAGAGGTGGGACCA
TGATCAAGGTCAAGACTCTCACTGGCAAAG

QA 16 285 16 285
DS 

RD RS1AE63TF 247 0 0
TGGGACCATGATCAAGGTCAAGACTCTCACTGGCAAAGAAATTGAAATTGATATCGAACC
TACAGACACCATTGATCGGATCAAGGAACGCGTTGAGGAGAAAAAAGGCATCCCTCCTGT
TCAACAAAGGCTCATCTACGCTGGAAAACAGCTAGCTGATGACAAGACGGCAAAAGACTA
CAACATCGAGGGAGGCTCTGTTCTGCATCTGGTTCTTGCTCTTAGGGGTGGTTTTGGTCT
TCTCTAG

QA 1 247 1 247
DS 

RD RS1C773JQ 613 0 0
GAAGCAAAGAAAGAA
AAAAAAAAATGCAGATTTTCGTGAAAACCCTGACCGGGAAAACCATAACCCTAGAGGTTG
AAAGCAGCGACACCATCGACAATGTCAAAGCCAAAATCCAGGACAAGGAGGGAATACCAC
CGGATCAACAGAGGCTGATATTCGCTGGCAAACAACTTGAAGATGGAAGAACCCTTGCGG
ACTACAACATCCAGAAAGAGTCAACTCTTCACTTGGTCTTGAGGCTTAGAGGTGGGACCA
TGATCAAGGTCAAGACTCTCACTGGCAAAGAAATTGAGATTGATATCGAACCTACAGACA
CCATTGATCGGATCAAGGAACGCGTTGAGGAGAAAGAAGGCATCCCTCCTGTTCAACAAA
GGCTCATTTACGCTGGAAAACAGCTAGCTGATGACAAGACGGCAAAAGACTACAACATCG
AGGGAGGCTCTGTTCTGCATCTGGTTCTTGCTCTTAGGGGTGGTTTTGGTCTTCTCTAGA
AAAAAAAAGTGAATGCAATATGAATTTGATGCTTTGCTGTTTCAGTGGGTTTGGAATCAA
TGTACCAAAAGTCTGTTCAATCTCGGATGATGCATAATTACATATGATTTTTTTTTTG

QA 16 613 16 613
DS 

RD RS1DC14TF 762 0 0
GGAAATAAAAAAAAATCTTTTAAGCAAAGAAAGAAAAAAAAATGCAGATCTTCGTGAAAA
CCCTGACCGGGAAAACCATAACCCTAGAGGTTGAAAGCAGCGACACCATCGACAATGTCA
AAGCCAAAATCCAGGACAAGGAGGGAATACCACCGGATCAACAGAGGCTGATATTCGCTG
GCAAACAACTTGAAGATGGAAGAACCCTTGCGGACTACAACATCCAGAAAGAGTCAACTC
TTCACTTGGTCTTGAGGCTTAGAGGTGGGACCATGATCAAGGTCAAGACTCTCACTGGCA
AAGAAATTGAGATTGATATCGAACCTACAGACACCATTGATCGGATCAAGGAACGCGTTG
AGGAGAAAGAAGGCATCCCTCCTGTTCAACAAAGGCTCATCTACGCTGGAAAACAGCTAG
CTGATGACAAGACGGCAAAAGACTACAACATCGAGGGAGGCTCTGTTCTGCATCTGGTTC
TTGCTCTTAGGGGTGGTTTTGGTCTTCTCTAGAAAAAA**AGTGAATGCAATATGAATTT
GATGCTTTGCTGTTTCAGTGGGTTTGGAATCAATGTACCAAAAGTCTGTTCAATCTCGGA
TGATGCATAATTACATATGATTTTTTTTTTGGATTTGGCTATTTTTGAGGGATATCTTTC
AACCTATTCGTTTTATAAGTTCCATGCTACCCATGATCATTGTCGTAAGAAATTACATAC
TAAAGG*TCCTACACAAGAAGTGACCGTTGATATTCGAACGT

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1DC14JQ 590 0 0
CCAGAAAGAGTCAACTCTTCACTTGGTCTTGAGGCTTAGAGGTGGGACCATGATCAAGGT
CAAGACTCTCACTGGCAAAGAAATTGAGATTGATATCGAACCTACAGACACCATTGATCG
GATCAAGGAACGCGTTGAGGAGAAAGAAGGCATCCCTCCTGTTCAACAAAGGCTCATCTA
CGCTGGAAAACAGCTAGCTGATGACAAGACGGCAAAAGACTACAACATCGAGGGAGGCTC
TGTTCTGCATCTGGTTCTTGCTCTTAGGGGTGGTTTTGGTCTTCTCTAGAAAAAA**AGT
GAATGCAATATGAATTTGATGCTTTGCTGTTTCAGTGGGTTTGGAATCAATGTACCAAAA
GTCTGTTCAATCTCGGATGATGCATAATTACATATGATTTTTTTTTTGGATTTGGCTATT
TTTGAGGGATATCTTTCAACCTATTCGTTTTATAAGTTCCATGCTACCCATGATCATTGT
CGTAAGAAATTACATACTAAAGGGTCCTACACAAGAAGTGACCGTTGATATTCGAACGTT
AAGCTTTACAAGACGTTAGCGTTTTGGAAAGAATCGTATTCTTCCAGACC

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 2

CO CL1441Contig1 780 2 3 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGCACTTATAA
AAAATTAAAAAACTATGGGATCTCATCATCTCATCGCTTCTCTCAAATCTTCTCTTTGCG
TTTTCCCCCCAACAATCATGTCGACGAAGAAGATCGTGTTGAAGAGCTCCGATGGCGAGT
CTTTCAAGGTCGACGAGGCGGTGGCCCTCGAGTCCCAGACCATAGCCCACATGGTCGAAG
ACGACTGCGTCGACAACGGGGTCCCGCTTCCCAACGTCACGAGCAAGATCCTCGCCAAGG
TGATCGAGTACTGCAAGAAGCACGTCGACGCCGCCGCTTCCAAGGCCTGGGATGCTGAGT
TTATGAAGATCGATCAAGCCACCCTCTTCGAACTCATCCTGGCTGCTAATTATTTGAACA
TCAAGAACCTGCTTGACCTTACATGCCAGACAGTGGCTGATATGATCAAGGGAAAGACTC
CGGAAGAGATACGCACGACCTTCAACATCAAGAACGACTTTACACCCGAGGAAGAAGAGG
AGGTGCGCAGGGAGAACCAATGGGCTTTTGAATGATGTGTGAGAGAGAGAGGTCGTTGAA
GCAAACCAACCAGTTTCTTGCTTTTTATGTTGTTGCTTTTTTTTTTTTCTGTGGATGATC
AGTGTGGATGATGACTCTTGCTATTTTCGTTTTGTAATTCATGACCTATGTTCGTCTTGA
AGAACCAATGCTGGATGTTTGCTTTTAATGTCTTAAAAGAGTGATGATGTTGGTTTGCCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A175TF U 1
AF RS1A175TV U 1
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BS 758 758 RS1A175TV
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DS 

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AGAACCAATGCTGGATGTTTGCTTTTAATGTCTTAAAAGAGTGATG
ATGTTGGTTTGCCT

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 5

CO CL1442Contig1 891 5 9 U
GGAATCACTTCTTCCAAACAACATCCCATGGCTGCTCCTCACACCTTCCTCTCCTTCTCA
TCCCCTCCGCGCCTCCTCCTCGTCTCTCCTTCATCCACTCTCCGCTCCTCTTTCGGCGGC
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CTTTGTGAACATGTTTGTTACTTTTGGTTTAAATCTGCATTCGATCGTTTTAGATCATTG
TTTTGCTTTTGCTATTACTTTCCTTTTATCAAGCTAAAGATTCGTGCTTAC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RS1GA19TF U 2
AF RS1AR05TFB U 1
AF RS1BC93JQ C 269
AF RS1BC93TF U 269
AF RS1GA19JQ C 304
BS 1 179 RS1AR05TFB
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BS 260 260 RS1GA19TF
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GAATCACTTCTTCCAAACGACATCCCATGGCTGCTCCTCACACCTTCCTCTCCTTCTCAT
CCCCTCCGCGCCTCCTCCTCGTCTCTCCTTCATCCACTCTCCGCTCCTCTTTCGGCGGCG
TCTCTCTCATCAACCTCCGCCGTCCCCAATCTGCTTCCTTCTCCGCCTCGAAGAAGAAAT
CGCTGACTGTCGTCTCCGCCGCGAAGAAAGCTGTTGCTGTGCTCAAGGGTAACTCCGATG
TCGAAGGAGTTGTTACTTCGACTCAAGACGACTCAGGTCCGACAAAAGTGAATGTTCGTA
TCACCGGTCTCACTCCAGGGCCTCATGGCTTTCACCTCCATGAGTTTGGTGATACAACAA
ATGGTTGCATCTCAACAGGGCCACATTTCAACCCTAACAACATGACACACGGAGCTCCTC
AAGACGAGATCCGTCATGCGGGTGACCTGGGAAACATTATTGCCAACGCCGATGGCGTGG
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TGACCACTGGAAACGCAG*CGGCAGATTGGCATGCG

QA 1 636 1 636
DS 

RD RS1AR05TFB 820 0 0
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TCCCCTCCGCGCCTCCTCCTCGTCTCTCCTTCATCCACTCTCCGCTCCTCTTTCGGCGGC
GTCTCTCTCATCAACCTCCGCCGTCCCCAATCTGCTTCCTTCTCCGCCTCGAAGAAGAAG
TCGCTGACTGTCGTCTCCGCCGCGAAGAAAGCTGTTGCTGTGCTCAAGGGTAACTCCGAT
GTCGAAGGAGTTGTTACTTTGACTCAAGACGACTCAGGTCCGACAAAAGTGAGTGTTCGT
ATCACCGGTCTCACTCCAGGGCCTCATGGCTTTCACCTCCATGAGTTTGGTGATACAACA
AATGGTTGCATCTCAACAGGGCCACATTTCAACCCTAACAACATGACACACGGAGCTCCT
CAAGACGAGATCCGTCATGCGGGTGACCTGGGAAACATTATTGCCAACGCCGATGGCGTG
GCAGAAACAACACTTGTGGACAATCAGATTCCTCTGACTGGTCCTAATTCTGTTGTTGGG
AGAGCCTTTGTGGTTCACGAGCTTAAGGATGACCTCGGAAAGGGCGGGCATGAGCTTAGC
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TAAGTATGGGGCTAAGTAACGTACTTTGGTGTCTACTGTGTTGTTCTTGTCTGTTGAATC
AGATGTCAAATAATGTTGGCTGAGAATAATCTTTTGATGTTTCTCTTGCTGGAGTTGTGC
CTTTGTGAACATGTTTGTTACTTTTGGTTTAA
TCTGCATT

QA 1 812 1 812
DS 

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GA
GACTCAGGTCCGACAAAAGTGAGTGTTCGTATCACCGGTCTCACTCCAGGGCCTCATGGC
TTTCACCTCCATGAGTTTGGTGATACAACAAATGGTTGCATCTCAACAGGGCCACATTTC
AACCCTAACAACATGACACACGGAGCTCCTCAAGACGAGATCCGTCATGCGGGTGACCTG
GGAAACATTATTGCCAACGCCGATGGCGTGGCAGAAACAACACTTGTGGACAATCAGATT
CCTCTGACTGGTCCTAATTCTGTTGTTGGGAGAGCCTTTGTGGTTCACGAGCTTAAGGAT
GACCTCGGAAAGGGCGGGCATGAGCTTAGCGTGACCACTGGAAACGCAGGCGTCAGATTG
GCATGCGGTGTGGTAGGTTTGACGCCGCTCTAAGTATGGGGCTAAGTAACGTACTTTGGT
GTCTACTGTGTTGTTCTTGTCTGTTGAATCAGATGTCAAATAATGTTGGCTGAGAATAAT
CTTTTGATGTTTCTCTTGCTGGAGTTGTGCCTTTGTGAACATGTTTGTTACTTTTGGTTT
AAATCTGCATTCGATCGTTTTAGATCATTGTTTTGCTTTTGCTATTACTTTCCTTTTATC
AAGCTAAAGATTCGTGCT

QA 3 620 3 620
DS 

RD RS1BC93TF 620 0 0
GA
GACTCAGGTCCGACAAAAGTGAGTGTTCGTATCACCGGTCTCACTCCAGGGCCTCATGGC
TTTCACCTCCATGAGTTTGGTGATACAACAAATGGTTGCATCTCAACAGGGCCACATTTC
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GGAAACATTATTGCCAACGCCGATGGCGTGGCAGAAACAACACTTGTGGACAATCAGATT
CCTCTGACTGGTCCTAATTCTGTTGTTGGGAGAGCCTTTGTGGTTCACGAGCTTAAGGAT
GACCTCGGAAAGGGCGGGCATGAGCTTAGCGTGACCACTGGAAACGCAGGCGTCAGATTG
GCATGCGGTGTGGTAGGTTTGACGCCGCTCTAAGTATGGGGCTAAGTAACGTACTTTGGT
GTCTACTGTGTTGTTCTTGTCTGTTGAATCAGATGTCAAATAATGTTGGCTGAGAATAAT
CTTTTGATGTTTCTCTTGCTGGAGTTGTGCCTTTGTGAACATGTTTGTTACTTTTGGTTT
AAATCTGCATTCGATCGTTTTAGATCATTGTTTTGCTTTTGCTATTACTTTCCTTTTATC
AAGCTAAAGATTCGTGCT

QA 3 620 3 620
DS 

RD RS1GA19JQ 588 0 0
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GGTTGCATCTCAACAGGGCCACATTTCAACCCTAACAACATGACACACGGAGCTCCTCAA
GACGAGATCCGTCATGCGGGTGACCTGGGAAACATTATTGCCAACGCCGATGGCGTGGCA
GAAACAACACTTGTGGACAATCAGATTCCTCTGACTGGTCCTAATTCTGTTGTTGGGAGA
GCCTTTGTGGTTCACGAGCTTAAGGATGACCTCGGAAAGGGCGGGCATGAGCTTAGCGTG
ACCACTGGAAACGCAGGCGGCAGATTGGCATGCGGTGTGGTTGGTTTGACGCCGCTCTAA
GTATGGGGCTAAGTAACGTACTTTGGTGTCTACTGTGTTGTTCTTGTCTGTTGAATCAGA
TGTCAAATAATGTTGGCTGAGAATAATCTTTTGATGTTTCTCTTGCTGGAGTTGTGCCCT
TGTGAACATGTTTGTTACTTTTGGTTTAAATCTGCATTCGATCGTTTTAGATCATTGTTT
TGCTTTTGCTATTACTTTCCTTTTATCAAGCTAAAGATTCGTGCTTAC

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 4

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GTATATTCAACCATCCAGTTCCATTGGGGGTACATGGACAACAACCTTAGCAGCAGCAGC
AGCCACAGCCGCAGATGCATTCTGTATATCCAACACTTCAATCTCAATCCATGCCTTCAT
CTCCTCAACAATATGGTTTAGTTTTGTCAAGACCTTCTCTTTTACCTGGTTCGTATCTTC
CAAGTCATTACGGTTCTCCTCCTCCTCCGATGGTTATGCCTCCGGGAATGGTTACATACC
CTAGTTGGAATCCATACCAGGCTTCTATAACTGCAATGCCTTCTCCTGGAACACAACCCT
CTATTGGATCAAGCTCTGTTTATGGAATGGCGTCTTTATCTCCTCCAGGGACTGCTTATA
CAAGAGCATACCAATCTGGTGGGCCTTCTTCCTTGACTACCTCAACAGAACAACAGTCTT
TTCCTCAGCGACCTGATCAACCTGAGTGTCAATACTTCATGAGAACCGGAAACTGTAAGT
TCGGATCTTCGTGTAGATACCATCATCCTCTAGACGCAGCTCAACCTAAAACTGGTGTTG
TCCTCAGCTCCAGTGGCCTTCCACTTCTTCCCGGCGTAGCGCAATGCACTCACTTTGCGC
AACACGGAATTTGCAAGTTTGGACCGGCGTGTAAGTTTGATCACTCGATGAGTTCTTCAC
TTAGCTACAGCCCGTCTGCTTCTTCTCTAACCGAGATACCTGTTGCTCCATACCCAATCG
GATCATCCTCACTCAGCGGCGCATCAGCTCAAGTAAGTTCGAGCAATGAACCCACCACAG
AGGCTGTGACTGCTGTAGTTTCTCCTCCAATAGTCGTCAGTGGCTTGAGCCTTGAAAAGC
CAGCTGACACTAGTGTTGACTCTTCTAGCGTCAATAGCAGCATAGAAGCTAAGACTTCTT
CAAATTAAAACAAAAGAGAGAAGAAAACATACTCTGATTCTTCGTGAACTTAAACAACAT
TAAGAAAAGAGAAGATTATTTTTGGGGTCTGAGATTTGATGGAAGCAGAGAGAAACCAAA
ACCAAAGCTTCTGTCATTTACCATTTGTCCATATATAAATAGATTCTCTCTCATACGGCC
ATCTCTCTTGTTTTTTTCTTTCTTGAACAACGATTACTACTAATAAATGGCCTTATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FM11TF U 1
AF RS1C641JQ C 263
AF RS1GS42TF U 382
AF RS1FM11JQ C 303
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BS 988 1138 RS1FM11JQ

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QA 1 567 1 567
DS 

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GAAAACATACTTTGATTCTTCGTGAACTTAAACAACATTAAGAAAAGAGAAGATTATTTT
TGGGG

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1GS42TF 612 0 0
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CACTTCTTCCCGGCGTAGCGCAATGCACTCACTTTGCGCAACACGGAATTTGCAAGTTTG
GACCGGCGTGTAAGTTTGATCACTCGATGAGTTCTTCACTTAGCTACAGCCCGTCTGCTT
CTTCTCTAACCGAGATACCTGTTGCTCCATACCCAATCGGATCATCCTCACTCAGCGGCG
CATCAGCTCAAGTAAGTTCGAGCAATGAACCCACCACAGAGGCTGTGACTGCTGTAGTTT
CTCCTCCAATAGTCGTCAGTGGCTTGAGCCTTGAAAAGCCAGCTGACACTAGTGTTGACT
CTTCTAGCGTCAATAGCAGCATAGAAGCTAAGACTTCTTCAAATTAAAACAAAAGAGAGA
AGAAAACATACTCTGATTCTTCGTGAACTTAAACAACATTAAGAAAAGAGAAGATTATTT
TTGGGG
TCTGAG

QA 1 606 1 606
DS 

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AGAGCATACCAATCTGGTGGGCCTTCTTCCTTGACTACCTCAACAGAACAACAGTCTTTT
CCTCAGCGACCTGATCAACCTGAGTGTCAATATTTCATGAGAACCGGAAACTGTAAGTTC
GGATCTTCGTGTAGATACCATCATCCTCTAGACGCAGCTCAACCTAAA*CTGGTGTTGTC
CTCAGCTCCAGTGGCCTTCCACTTCTTCCCGGCGTAGCGCAATGCACTCACTTTGCGCAA
CACGGAATCTGCAAGTTTGGACCGGCGTGTAAGTTTGATCACTCGATGAGTTCTTCACTT
AGCTACAGCCCGTCTGCTTCTTCTCTAACCGAGATACCTGTTGCTCCATACCCAATCGGA
TCATCCTCACTCAGCGGCGCATCAGCTCAAGTAAGTTCGAGCAATGAACCCACCACAGAG
GCTGTGACTGCTGTAGTTTCTCCTCCAATAGTCGTCAGTGGCTTGAGCCTTGAAAAGCCA
GCTGACACTAGTGTTGACTCTTCTAGCGTCAATAGCAGCATAGAAGCTAAGACTTCTTCA
AATTAAAACAAAAGAGAGAAGAAAACATACTCTGATTCTTCGTGAACTTAAACAACATTA
AGAAAAGAGAAGATTATTTTTGGGGTCTGAGATTTGATGGAAGCAGAGAGAAACCAAAAC
CAAAGCTTCTGTCATTTACCATTTGTCCATATATAAATAGATTCTCTCTCATACGGCCAT
CTCTCTTGTTTTTTTCTTTCTTGAACAACGATTACTACTAATAAATGGCCTTATTC

QA 1 836 1 836
DS 



AS 2 4

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TATCCCATAAACAAAATATCTCACAGCCACCACCATCATCATCATATCTGTCTCCTCATT
CTCTACCTCCGCCAACAAATCTGTCTCAGCCACCATCACCATAACCTCCATCGCTGCCAC
CATCATCTTAATCTCCACCTCCTCGTTATCTATCTCCGCTAATGAACTCTGTTTCAACCA
TCACCACCAAATCTGTCTCAACCTTTCTTATCTATTCTCTTATCAAAGCTTCTTCTTTTT
CAGATGCAGATTCATGAAGAAGATGGAGTTTTCTCAAGGACCACCATCAATTCAAGATCT
GATGCGAGGAATGAGAGATTGGCTGGAAGAGGAGAAGTCGGAATCATAGAGAGTGGTGAC
AAGGTGAAGCCAGAAGTGGAGACAGCGCTGAGGCTACGGTGGAGGTGGTGGAGACAGCGA
TGAGGCTACAGTGAAGGCGGTGAAGCCGAAGGTGTAGTAACGGAAGCTGGGCTTGGAGAA
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AAGAAGTGGTGGTCGTGGTGGAGAGCGACAGAGATTGGTGGTGGTCATTAGCGGCGGAGA
CATTAGGTTTAGAATTTTTTTTTTTTGGGTTTACTTTTTAACTTTGGTCTATTGTAAACC
GATTCATATTTGTAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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TG
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ACTCTGTTTCAACCATCACCACCAAATCTGTCTCAGCCTTTCTTATCTATTCTCTTATCA
AAGCTTCTTCTTTTTCAGATGCAGATTCATGTAGAAGATGGAGTTTTCTCAAGGACCACC
ATCAATTCAAGATCTGATGCGAGGAATGAGAGATTGGCTGGAAGCGGAGAAGTCGGAATC
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CTCTACCTCCGCCAACAAATCTGTCTCAGCCACCATCACCATAACCTCCATCGCTGCCAC
CATCATCTTAATCTCCACCTCCTTGTTATCTATCTCCGCTAATGAACTCTGTTTCAACCA
TCACCACCAAATCTGTCTCAACCTTTCTTATCTATTCTCTTATCAAAGCTTCTTCTTTTT
CAGATGCAGATTCATGAAGAAGATGGAGTTTTCTCAAGGACCACCATCAATTCAAGATCT
GATGCGAGGAATGAGAGATTGGCTGGAAGAGGAGAAGTCGGAATCATAGAGAGTGGTGAC
AAGGTGAAGCCAGAAGTGGAGACAGCGCTGAGGCTACGGTGGAGGTGGTGGAGACAGCGA
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AAGAAGTGGTGGTCGTGGTGGAGAGCGACAGAGATTGGTGGTGGTCATTAGCGGCGGAGA
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QA 1 736 1 736
DS 



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AAAAGGTTGAGACAGATTTGGTGGTGATGGTTGAAACAGAGTTCATTAGCGGAGATAGAT
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BQ
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BS 9 746 RS1DH30JQ

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TCTCCAAGCCCAGCTTCCGTTACTACACCTTCGGCTTCACCGCCTCCACCGTAGCCTCAG
CGCTGTCTCCACTTCTGGCTTCACCTTGCCACCACTCTCTATGATTCCGACTTCTCCGCT
TCCAGCCAATCTCTCATTCCTCGCATCAGATCTTGAATTGATGGTGGTCCTTGAGAAAAC
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AACGAGGAGGTGGGGATTAAGATGATGGTGGCAGCGATGGAGGTTATGGTGATGGTGGCT
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AAAGAGATAGAGTTGAGT
CTTTTGTC

QA 1 738 1 738
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AGAGTTGAGTCTTTTGTC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 2 5

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ACCGAGCGTCCTCACGTCTCGGCGCTTGTTCGCGAATCGCTGATCAAGCGTGCCAAAGAC
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GAAACTGTGAAGAAATGGTGAAATGCTCTTTGGTTTTCTGATAAACTGTGAAGAAAAAAG
AAGAAACTAGTTGCTGGGCCAAAATGCTCTTTGAATTATATAACACTTGCGTTGTTTGAG
ATCTATCTTATTTTCAATAAATAAACACAAGACTGTCAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D641TF U 1
AF RS1D641JQ C 471
BS 1 633 RS1D641TF
BS 634 634 RS1D641JQ
BS 635 663 RS1D641TF
BS 664 1059 RS1D641JQ

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GCAGCGGTTTCGTTCCTCTCCAACCTAGCGAAGGCGGCTTTCGGCCTTGGAACGGCGGCG
ACGTTGCTGAACACGTCGCTGTACACCGTTGACGGCGGAGAGAGAGCTGTGATCTTCGAT
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CTACAGAAGCCCCACATCTTCGACATCCGCACGAAGCCTCACACGTTCTCTTCCATCTCC
GGTACCAAGGATCTTCAGATGGTTAATCTCACCCTCCGTGTTCTCTCTCGCCCTGAGGTT
GTGCGTCTGCCATACATATTCCAAACATTGGGTCTAGAGTACGACGAGAAGGTTCTTCCT
TCGATTGGAAACGAGGTTTTGAAAGCCGTGGTTGCACAGTTCAACGCTGACCAGCTCCTC
ACCGAGCGTCCTCACGTCTCGGCGCTTGTTCGCGAATCGCTGATCAAGCGTGCCAAAGAC
TTCAACATTGTGCTCGACGATGTCGCCATCACGCACTTGTCGTACGGCTACGAGTTCTCG
AAGGCTGTTGAGCAGAAACAGGTGGCGCAGCAG*AGGCGGAGAGGTCTAAGTTTGTGGTG
ATG

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DS 

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TGCCAAAGACTTCAACATTGTGCTCGACGATGTCGCCATCACGCACTTGTCGTACGGCTA
CGAGTTCTCGAAGGCTGTTGAGCAGAAACAGGTGGCGCAGCAGGAGGCGGAGAGGTCTAA
GTTTGTGGTGATGAAGGCTGATCAGGAGAGGAGGGCTGCGGTTATAAGAACTGAAGGTGA
GAGCGAAGCTGCGCAGCTGATCTCTGACGCTACGGCTAAAGCTGGTATGGGACTTATCGA
GCTTAGGAGGATTGAGGCTTCGAGGGAGGTTGCAGCTACGCTTGCTAGGTCTCCTAATGT
GGCTTACTTGCCCGGTGGCCAGAGCATGCTCTTTTCTCTGAACCGTTGATCAGAACTAAA
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AAGAAAAAAGAAGAAACTAGTTGCTGGGCCAAAATGCTCTTTGAATTATATAACACTTGC
GTTGTTTGAGATCTATCTTATTTTCAATAAATAAACACAAGACTGTCAC

QA 1 589 1 589
DS 



CO CL1445Contig2 1141 3 9 U
GGATCGTCGTCGTCTCAATTTCTTCCTCACTTCGTTCTTCACGTCTCGAGAAAAATGGGA
AGCCAACAAGCAGCGGTTTCGTCCCTCTCCAACCTAGCGAAGGCGGCTTTCGGCCTTGGA
ACGGCGGCGACGGTGCTGAACACGTCGCTGTACACCGTTGACGGCGGAGAGAGAGCTGTG
ATCTTCGATCGATTCAAAGGAGTCATGGATCAAACCGTCGGCGAAGGAACTCATTTCCTG
ATCCCGATTCTGCAGAAGCCCCACATCTTCGACATCCGCACGAAGCCTCACACGTTCTCT
TCCATCTCCGGTACGAAGGATCTTCAGATGGTCAATCTCACCCTCCGTGTTCTCCCCCGC
CCTGAGGTTGTGCGTCTGCCATACATATTCCAAACATTGGGTCTAGAGTACGACGAGAAG
GTTCTTCCTTCGATTGGAAACGAGGTTTTGAAAGCCGTGGTTGCACAGTTCAACGCTGAC
CAGCTCCTCACGGAGCGTCCTCACGTCTCGGCCCTTGTCCGCGAATCGCTAATCAAACGT
GCCAAAGACTTCAACATTGTGCTCGACGATGTTGCAATCACGCACTTGTCTTACGGCTAC
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TTTGTGGTGATGAAGGCTGATCAGGAGAGGAGGGCTGCGGTTATAAGAGCTGAAGGTGAG
AGTGAAGCTGCGCAGCTGATCTCTGACGCTACGGCTAAAGCTGGTATGGGACTTATCGAG
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GCTTACTTGCCCGGTGGTCAGAGCATGCTCTTTTTTCTGAACCGTTGATCAGAACTATAT
GGTTATGGGGAAACTGTGAAGAAATGGTGAAATGCTCTTTGGTTTTCTGATAAACTGTGA
AGAAAAAAGAAGAAACTAGTTGCTGGGCCAAAATGCTCTTTGAATTCTATAACACTTGCG
TTGTTTGAGATCTATCTTATTTTCAATAAATAAACACAAGACTGTCTCAATTCCCAAATA
CTTAGTTGATGTAAGAGTTAGTTTTGAGGATACATAGTGGAGTGAAGCCACATGTTTGAC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1DR79TF U 1
AF RS1FY68TF U 7
AF RS1FY68JQ C 481
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BS 197 197 RS1FY68TF
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BS 225 225 RS1FY68TF
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BS 493 599 RS1DR79TF
BS 600 636 RS1FY68TF
BS 637 1141 RS1FY68JQ

RD RS1DR79TF 599 0 0
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ATCCCGATTCTGCAGAAGCCCCACATCTTCGACATCCGCACGAAGCCTCACACGTTCTCT
TCCATCTCCGGTACGAAGGATCTTCAGATGGTCAATCTCACCCTCCGTGTTCTCCCCCGC
CCTGAGGTTGTGCGTCTGCCATACATATTCCAAACATTGGGTCTAGAGTACGACGAGAAG
GTTCTTCCTTCGATTGGAAACGAGGTTTTGAAAGCCGTGGTTGCACAGTTCAACGCTGAC
CAGCTCCTCACAGAGCGTCCTCACGTCTCGGCCCTTGTCCGCGAATCGCTAATCAAACGT
GCCAAAGACTTCAACATTGTGCTCGACGATGTTGCAATCACGCACTTGTCTTACGGCTA

QA 1 599 1 599
DS 

RD RS1FY68TF 630 0 0
GAGTC
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AGCGGTTTCGTTCCTCTCCAACCTAGCGAAGGCGGCTTTCGGCCTTGGAATGGCGGCGAC
GGTGCTGAACACGTCGCTGTACACCGTTGACGGCGGAGAGAGAGCTGTGATCTTCGATCG
ATTCAAAGGAGTCATGGATCAAACCGTCGGCGAAGGAACTCATTTCCTGATCCCGATTCT
GCAGAAGCCCCACATCTTCGACATCCGCACGAAGCCTCACACGTTCTCTTCCATCTCCGG
TACGAAGGATCTTCAGATGGTCAATCTCACCCTCCGTGTTCTCTCTCGCCCTGAGGTTGT
GCGTCTGCCATACATATTCCAAACATTGGGTCTAGAGTACGACGAGAAGGTTCTTCCTTC
GATTGGAAACGAGGTTTTGAAAGCCGTGGTTGCACAGTTCAACGCTGACCAGCTCCTCAC
GGAGCGTCCTCACGTCTCGGCCCTTGTCCGCGAATCGCTAATCAAACGTGCCAAAGACTT
CAACATTGTGCTCGACGATGTTGCAATCACGCACTTGTCTTACGGCTACGAGTTCTCAAA
GGCTGTTGAGCAGAAACAGGTGGCG

QA 6 630 6 630
DS 

RD RS1FY68JQ 661 0 0
CAGCTCCTCACGGAGCGTCCTCACGTCTCGGCCCTTGTCCGCGAATCGCTAATCAAACGT
GCCAAAGACTTCAACATTGTGCTCGACGATGTTGCAATCACGCACTTGTCTTACGGCTAC
GAGTTCTCAAAGGCTGTTGAGCAGAAACAGGTGGCGCAGCAGGAGGCAGAGAGGTCTAAG
TTTGTGGTGATGAAGGCTGATCAGGAGAGGAGGGCTGCGGTTATAAGAGCTGAAGGTGAG
AGTGAAGCTGCGCAGCTGATCTCTGACGCTACGGCTAAAGCTGGTATGGGACTTATCGAG
CTTAGGAGGATTGAGGCTTCGAGGGAGGTTGCAGCTACGCTTGCTAGGTCTCCTAATGTG
GCTTACTTGCCCGGTGGTCAGAGCATGCTCTTTTTTCTGAACCGTTGATCAGAACTATAT
GGTTATGGGGAAACTGTGAAGAAATGGTGAAATGCTCTTTGGTTTTCTGATAAACTGTGA
AGAAAAAAGAAGAAACTAGTTGCTGGGCCAAAATGCTCTTTGAATTCTATAACACTTGCG
TTGTTTGAGATCTATCTTATTTTCAATAAATAAACACAAGACTGTCTCAATTCCCAAATA
CTTAGTTGATGTAAGAGTTAGTTTTGAGGATACATAGTGGAGTGAAGCCACATGTTTGAC
C

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 5

CO CL1446Contig1 770 5 4 U
GGACATAATTCATTTTACTTTATTATGTGATGTGACTTGAGAATCACTACACCTTTTTTT
ATCATAGTAAACAAACCAAATTCGACATTATTAAACACACAACACTGTAGTCTCACATGA
CTTTCACACACCTCAGAGAACTGACTTCTTGATAGCATTAGGAGCCTTGACATAAGCAAC
CAGCGAAGCATCTCCAGTTCTAATCATTGTCTTGAGCTCATAACCAATCCAACACCTTGA
ACTCTTCCTGTTGTAGAAAAACCCTAAGCACTTACAATCACTCGTACACTTGTCTCCGCA
CGCTTTCTCCGTCGCCGACGAGCCACCGTTATACTTAGTCATGAAACTATCAGCTCCTTC
GATCTTGAAATAATGAAACGTCTTGGGATCGCAACTCGTGAGACTAGGAGTCTTACAAGT
CTCGTCCCAACCAAGAAGTCCTTTATCGCTAGGACAAGCGTTACACTGACCTTTCTTACA
CAAACCAAACTCCAAACAATGCTCAGGGATTCTACACTCGTCGTTACCGTCAATATCGTC
GTTAGTAAAAGCGGTGTATGTCACGTCCCAAGCCGTTGAAGTCGCTAACGTGCTGTAACT
CCAAACTCTAACGTTACCGTCTGATTCTAACCTAATAAAACTCAACGTGGCGTTGTGTTT
GGGACGTGAGAGGAACGTTGAGACATTGAACTGAGAACCAGAGTCGACACCTTCCATGTG
TAGACCCCACGTGGTGTCGGAATCTTCCGCGGCTTGGAACGTCATGGATC


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

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CCAAACTCTAACGTTACCGTCTGATTCTAACCTAATAAAACTCAACGTGGCGTTGTGTTT
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TTTT
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GATCTTGAAATAATGAAACGTCTTGGGATCGCAACTCGTGAGACTAGGAGTCTTACAAGT
CTCGTCCCAACCAAGAAGTCCTTTATCGCTAGGACAAGCGTTACACTGACCTTTCTTACA
CAAACCAAACTCCAAACAATGCTCAGGGATTCTACACTCGTCGTTACCGTCAATATCGTC
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CCAAACTCTAACGTTACCGTCTGATTCTAACCTAATAAAACTCAACGTGGCGTTGTGTTT
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TAGACCCCACGTGGTGTCGGAATCTTCCGCGGCTTGGAACGTCATGGATC

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GACATAAGCAACCAGCGAAGCATCTCCAGTTCTAATCATTGTCTTGAGCTCATAACCAAT
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ACCTTCCATGTGTAGACCCCACGTGGTGTCGGAATCTTCCGCGGCTTGGAACGTCATGGA
TC

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 5

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E253JQ U 35
AF RS1EX68JQ U 1
AF RS1AY96JQ U 35
AF RS1E253TF C 68
AF RS1EX68TF C 306
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GG
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QA 3 569 3 569
DS 

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GTGGTAACCTTTG
TTCGC

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DS 

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GA
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ACATCAACTACTAAGCAATACTATGTAACAACTTAGAAACATCAACTACTAAGCGATACT
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GTTCTTCTATTCTTCAGAAACAGAGTCGTTAACATCCTCCTCCTCCTTGTTGCTCATCAC
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TATCTCGGTGGTAAGATCGCACGACTCGAACTCGTATTTGCACTCGCAAAATCCGGGACC
GTGTAGAGGATTAGCCAAGAAAATGTTGTGACCGGTCTTTTTGAAAGACGCGAGAGCAGA
AGAAAACTCCATACCGTTTCGCGAGATCACCATCAAGTTGGACAATTCACGCTTATTCTC
CAACACTACCCACCTCAAAAAACGTACTATCATCTCCATAAGTCTCGCATGCTTATCTCC
TTTGGGAAATATTTCGATTCCGGCAGATTCGTAGTAACCAGGGATCTGGTTCCTGTCCCC
AAACGCCATGATTCTCACCTCGCCGTGGTAACCTTTG

QA 3 639 3 639
DS 

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ATGAGTC*TTAACATCAACTACTTGGCAAGTTCTTCTATTCTTCAGAAACAGAGTCGTTA
ACATCCTCCTCCTCCTTGTTGCTCATCACTGCATCTCTTTTGGCTTTGAGGAGAGGGTCT
CCTCCGGCAGCTAAGGTCTCCCAAACCCATATCTCGGTGGTAAGATCGCACGACTCGAAC
TCGTATTTGCACTCGCAAAATCCGGGACCGTGTAGAGGATTAGCCAAGAAAATGTTGTGA
CCGGTCTTTTTGAAAGACGCGAGAGCAGAAGCAAACTCCATACCGTTTCGCGAGATCACC
ATCAAGTTGGACAATTCACGCTTATTCTCCAACACTACCCACCTCAAAAAACGTACTATC
ATCTCCATAAGTCCCGCATGCTTATCTCCTTTGGGAAATATTTCGATTCCGGCAGATTCG
TAGTAACCAGGGATCTGGTTCCTGTCCCCAAACGCCATGATTCTCACCTCGCCGTGGTAA
CCTTTGTTCGCCAGAGCCGATCTGATGTTCTGATAAACAGATTCAGGGTCGAGATCTTCA
GGGATCGGACACTCCTCCACGTCCCAGAAGACTCCTGTCTTAGCCTCAGCGAAAGTGGTG
CTTGTCACGGAAGGCATGGTTTCGAGGGAGAGATTTATCAGCGAAGTGGGGCTTCTGTTC
AC
CC

QA 1 782 1 782
DS 

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CGTAATAACCAGGGATCTGGTTCCTGTCCCCAAACGCCATGATTCTCACCTCGCCGTGGT
AACCTTTGTTCGCCAGAGCCGATCTGATGTTCTGATAAACAGATTCAGGGTCGAGATCTT
CAGGGGTCGGACGCTCCTCCACGTCCCAGAAGACTCCTGTCTTAGCCTCAGCGAAAGTGG
TGCTTGTCACGGAAGGCATGGTTTCGAGGGAGAGATTTATCAGCGAAGTGGGGCTTCTGT
TCACGAAAGGAAAAGCCGTGGTTTCGACAGAGATATCC

QA 1 578 1 578
DS 



AS 1 5

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GCTTTAGGGTTTAAAAAACTGACTCTTTAGAAAGTCTTTCTACGTGAAAATCTTCTTCTC
CATATCTTTAGAAAATGGGCATCATGATCAACTACCATTTGCTCGCTATCGTCTTCGGCA
TCTTAGGAAACGCAATATCCTTCCTCGTATTCCTCGCTCCAGTGCCTACGTTTTATAGAA
TATACAAGAAAAAGTCGACAGAAAGTTTCCAGTCTCTACCGTATCAAGTGTCGCTATTTA
GCTGCATGCTATGGCTCAGTTACGCATTGATTAAGCAAGACGCTTTTCTCCTAATTACCA
TCAACTCCTTCGGATGCGTCGTGGAGACTATCTACATCGCCATCTTCTTCACTTACGCTA
CCAGGGAGAAAAGGATCGCGGCTATGAAGTTGTTCTTAACGATAAATGTTGCGTTCTTCT
CGTTGATTATAACGGTTACACATTTCGCCATTAAAAGTCTTAGCCTCCAAGTCTCCGTCC
TCGGCTGGATATGCGTTGCCATTTCAGTATCTGTTTTCGCTGCCCCTCTAATGATCGTGG
CGCGTGTTATAAAGACAAAGAGTGTGGAATTCATGCCTTTCACGCTTTCTTTCTTCCTCA
CCATAAGCGCGGTTATGTGGTTTGCTTATGGCTTGTTCCTTCATGACATATGCATAGCTA
TTCCAAACGTGGTGGGATTCATACTAGGGATGGTACAAATGATTTTATACGGAGTTTACA
GAAATTCAGGGGAGAAATTAGATATTGAGAAAAAAATGAATCCACCAGAACAACAACTTA
AAACTATTGTCCTGATGAGTCCGTTGGGTGTGTCAGAAGTGCACCCCATTGACGTCAAAG
TGACTGAGCCGGTGGTCCCCTTTTTTGATGTAGTTCAACATGAAGATCCATCCAAAGTTA
CTAACGAGGTGACAGGAATCCATGACGTAAAGTGCCTCGTAGAGATTGTCCATCTTGAAA
CTGTTTGAAGTGTCAAATGTATTGCAACAAGAAACGAAATATATATCTCTCCCTCACCCT
TTCTCTTTTTCTTGGGCCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GG
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QA 3 772 3 772
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TTTAGAAAATGGGCATCATGATCAACTACCATTTGCTCGCTATCGTCTTCGGCATCTTAG
GAAACGCAATATCCTTCCTCGTATTCCTCGCTCCAGTGCCTACGTTTTATAGAATATACA
AGAAAAAGTCGACAGAAAGTTTCCAGTCTCTACCGTATCAAGTGTCGCTATTTAGCTGCA
TGCTATGGCTCAGTTACGCATTGATTAAGCAAGACGCTTTTCTCCTAATTACCATCAACT
CCTTCGGATGCGTCGTGGAGACTATCTACATCGCCATCTTCTTCACTTACGCTACCAGGG
AGAAAAGGATCGCGGCTATGAAGTTGTTCTTAACGATAAATGTTGCGTTCTTCTCGTTGA
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GGATATGCGTTGCCATTTCAGTATCTGTTTTCGCTGCCCCTCTAATGATCGTGGCGCGTG
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TATACAAGAAAAAGTCGACAGAAAGTTTCCAGTCTCTACCGTATCAAGTGTCGCTATTTA
GCTGCATGCTATGGCTCAGTTACGCATTGATTAAGCAAGACGCTTTTCTCCTAATTACCA
TCAACTCCTTCGGATGCGTCGTGGAGACTATCTACATCGCCATCTTCTTCACTTACGCTA
CCAGGGAGAAAAGGATCGCGGCTATGAAATTGTTCTTAACGATAAATGTTGCGTTCTTCT
CGTTGATTATAACGGTTACACATTTCGCCATTAAAAGTCTTAGCCTCCAAGTCTCCGTCC
TCGGCTGGATATGCGTTGCCATTTCAGTATCTGTTTTCGCTGCCCCTCTAATGATCGTGG
CGCGTGTTATAAGGACAAAGAGTGTGGAATTCATGCCTTTCACGCTTTCTTTCTTCCTCA
CCATAAGCGCGGTTATGTGGTTTGCTTATGGCGTGTTCCTTCATGACATATGCATAGCTA
TTCCAAACGTGGTGGGAT*CATACTAGGGATGGTACAA*TGATTTTATACGGAGTT*ACA
GAAATTCAGGG
AGAAATAGATATTGAGA

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DS 

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AGAATATACAAGAAAAAGTCGACAGAAAGTTTCCAGTCTCTACCGTATCAAGTGTCGCTA
TTTAGCTGCATGCTATGGCTCAGTTACGCATTGATTAAGCAAGACGCTTTTTTCCTAATT
ACCATCAACTCCTTCGGATGCGTCGTGGAGACTATTTACATCGCCATTTTTTTCACTTAC
GCTACCAGGGAGAAAAGGATCGCGGCTATGAAGTTGTTTTTAACGATAAATGTTGCGTTC
TTCTCGTTGATTATAACGGTTACACATTTCGCCATTAAAAGTTTTAGCCTCCAAGTCTCC
GTCCTCGGCTGGATATGCGTTGCCATTTCAGTATCTGTTTTCGCTGCCCCTCTAATGATC
GTGGCGCGTGTTATAAAGACAAAGAGTGTGGAATTCATGCCTTTCACGCTTTCTTTCTTC
CTCACCATAAGCGCGGTTATGTGGTTTGCTTATGGCTTGTTCCTTCATGACATATGCATA
GCTATTCCAAACGTGGTGGGATTCATACTAGGGATGGTACAAATGATTTTATACGGAGTT
TACAGAAATTCAGGG
GAGAAATTAGATATTGAG

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DS 

RD RS1FA93JQ 542 0 0
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GAGTGTGGAATTCATGCCTTTCACGCTTTCTTTCTTCCTCACCATAAGCGCGGTTATGTG
GTTTGCTTATGGCTTGTTCCTTCATGACATATGCATAGCTATTCCAAACGTGGTGGGATT
CATACTAGGGATGGTACAAATGATTTTATACGGAGTTTACAGAAATTCAGGGGAGAAATT
AGATATTGAGAAAAAAATGAATCCACCAGAACAACAACTTAAAACTATTGTCCTGATGAG
TCCGTTGGGTGTGTCAGAAGTGCACCCCATTGACGTCAAAGTGACTGAGCCGGTGGTCCC
CTTTTTTGATGTAGTTCAACATGAAGATCCATCCAAAGTTACTAACGAGGTGACAGGAAT
CCATGACGTAAAGTGCCTCGTAGAGATTGTCCATCTTGAAACTGTTTGAAGTGTCAAATG
TATTGCAACAAGAAACGAAATATATATCTCTCCCTCACCCTTTCTCTTTTTCTTGGGCCT
TG

QA 1 542 1 542
DS 



AS 1 5

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AAAAAAAAGAAAACCTAAATTCTCTGAGAGATCGATCAAATCGGATAGCACGCAATAATG
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GCTCCCGGGATAAGTGCCTCTCCGTCTGAGGAAAATATGCGCTACTTCAATGTTATGATT
CTTGGTCCTACCCAGTCTCCTTATGAAGGAGGCGTTTTCAAGTTGGAGCTCTTTTTGCCT
GAAGAATATCCGATGGCAGCTCCCAAGGTTAGGTTTCTCACCAAGATATACCATCCTAAC
ATTGACAAGCTTGGAAGAATCTGCCTTGACATACTGAAAGACAAGTGGAGTCCTGCTCTC
CAAATAAGGACCGTGCTCTTGAGTATTCAAGCCCTTCTAAGTGCACCAAACCCAGATGAT
CCCCTCTCTGAGAACATAGCTAAGCACTGGAAAAGCAATGAAGCAGAAGCTGTGGAGACA
GCTAAGGAGTGGACTCGTCTATATGCAAGTGGCGCTTGATATAGAGTGCAAAAAGGAGAA
AGTTCCTTGTCATTTTAAATAACAATCTATCTGGTGAAACACTCTCATCTCAAGGTTTTA
TCTAGAATCCTTTTTTTTCTAAAACAGGAAAGAAAAAGATTTGTACTCTATGTATATGTA
TAACTTGGGTGGGTATTTAAGACTCGTTTGCCCATATTTGCAAACTAACTTATGAGCTTT
GTCTTTGTTGTTCTATTATCATTTGCTCACTGTAGACAATAAGATTTCACTTTTCACAGG
CTGTGGATAAAGGTAAATTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 10 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GC49JQ C 485
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AF RS1GM28TF U 35
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TTT

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DS 

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GG
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CAAATCGGATAGCACGCAATAATGGCCAATAGTAATCTTCCACGAAGGATCATCAAGGAA
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ATGCGCTACTTCAATGTTATGATTCTTGGTCCTACCCAGTCTCCTTATGAAGGAGGCGTT
TTCAAGTTGGAGCTCTTTTTGCCTGAAGAATATCCGATGGCAGCTCCCAAGGTTAGGTTT
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CTAAGTGCACCAAACCCAGATGATCCCCTCTCTGAGAACATAGCTAAGCACTGGAAAAGC
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TTTTTC

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C

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DS 

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GCGCTTGATATAGAGTGCAAAAAGGAGAAAGTTCCTTGTCATTTTAAATAACAATCTATC
TGGTGAAACACTCTCATCTCAAGGTTTTATCTAGAATCCTTTTTTTTCTAAAACAGGAAA
GAAAAAGATTTGTACTCTATGTATATGTATAACTTGGGTGGGTATTTAAGACTCGTTTGC
CCATATTTGCAAACTAACTTATGAGCTTTGTCTTTGTTGTTCTATTATCATTTGCTCACT
GTAGACAATAAGATTTCACTTTTCACAGGCTGTGGATAAAGGTAAATTTGAC

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 5

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AGTTGGTCAACAGCAGGATACTGTAGCAATACTGAACAAGATGGATCATGAAAATGGATA
TGGTGTGGAAGTCACTGGGCTATCTCCAGCCGTTACTGAGAAAGATCTCATCGACTTCTT
CTCCTTCTCTGGTGCAATCGAACATATTGACATCGTCAGGTCGGGCGAGCAAGCGTGCAC
TGCGTATGTGATGTTCAAGGATTCTTACTCTCAGGAAACTGCCGTCTTACTCAGTGGGGC
AACCATATTGGAGCAGCGAGTTTGCATAACTCGTTGGGGACAGCATCACGAGGAGTTTGA
CTTCTGGAACGCGACTCAGCGGGGTTTTGTTGACGACACAAACTCACACGCTCATCCCCA
ACGAGGCGAGTTCAACGCCGGAGAAGCAGTGACAAAAGCTCAAGAAGTGGTGAGGACAAT
GCTAGCCACCGGATTCGTGCTGGGGAAAGACGCTTTAGCCAAAGCTAAAGGCTTCGACGA
ATCCCACGGTGTATCGGCTGCAGCAGCGGCTAGAGTATCTCAACTAGACCAGAGGATCGG
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GGTTTCAGACAAAGCAAAATCAGCCGTTTCTGCTACAGGAAGAACCGCGGCAGCAGCTGC
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AGAGCGTGCGGCTAAGGCTGCATCTGATCTTGGTAGCCGTGGCTCAAGGCAGTGATGTGA
ATAGATACGAACTGATCAGAATCATATACATGCATTTATAAAAAAAACTCCCGACTTCGT
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GCAAAAATGTTATAAGAAGGGTGAATCTCCTGACTTC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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AF RS1BV42TF U 36
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GGGAGGACTGAGAAGCAAATCGCAGCGGACGACGGTTCTCGGCGTGTATAGGCGTCGCGG
TTTACTTTCTGTTAACGATCGGCTTCTCCTCGGTTACCTGATCACTCCCTCTGTCTACTC
TCTCTATCTTCAATCATCAGTCCATCGCTGTCATCTCTCTTTCAAGCTTCTCTGAGTGCG
AGTTGGTCAACAGCAGGATACTGTAGCAATACTGAACAAGATGGATCATGAAAATGGATA
TGGTGTGGAAGTCACTGGGCTATCTCCAGCCGTTACTGAGGAAGATCTCATCGACTTCTT
CTCCTTCTCTGGTGCAATCGAACATATTGACATCGTCAGGTCGGGTGAGCAAGCGTGCAC
TGCGTATGTGATGTTCAAGGATTCTTACTCTCAGGAAACTGCCGTCTTACTCAGTGGGGC
AACCATATTGGAGCAGCGAGTTTGCATAACTCGTTGGGGACAGCATCACGAGGAGTTTGA
CTTCTGGAACGCGACTCAGCGGGGTTTTGTTGACGACACAAACTCACACGCTCATCCCCA
ACGAGGCGAGTTCAACGCCCGAGAAGCAGTGACAAAAGCTCAAGAAGTGGTGAGAACAAT
GCTAGCCACCGGATTCGTGCTGGGGAA

QA 1 627 1 627
DS 

RD RS1BV42TF 675 0 0
TTCTCGGCGTGTATAGGCGTCGCGGTTTACTTTCTGTTAACGATCGGCTTCTCCTCGGTT
ACCTGATCACTCCCTCTGTCTACTCTCTCTATCTTCAATCATCAGTCCATCGCTGTCATC
TCTCTTTCAAGCTTCTCTGAGTGCGAGTTGGTCAACAGCAGGATACTGTAGCAATACTGA
ACAAGATGGATCATGAAAATGGATATGGTGTGGAAGTCGCTGGGCTATCTCCAGCCGTTA
CTGAGAAAGATCTCATCGACTTCTTCTCCTTCTCTGGTGCAATCGAACATATTGACATCG
TCAGGTCGGGCGAGCAAGCGTGCACTGCGTATGTGATGTTCAAGGATTCTTACTCTCAGG
AAACTGCCGTCTTACTCAGTGGGGCAACCATATTGGAGCAGCGAGTTTGCATAACTCGTT
GGGGACAGCATCACGAGGAGTTTGACTTCTGGAACGCGACTCAGCGGGGTTTTGTTGACG
ACACAAACTCACACGCTCATCCCCAACGAGGCGAGTTCAACGCCGGAGAAGCAGTGACAA
AAGCTCAAGAAGTGGTGAGGACAATGCTAGCCACCGGATTCGTGCTGGGGAAAGACGCTT
TAGCCAAAGCTAAAGGCTTCGACGAATCCCACGGTGTATCGGCTGCAGCAGCGGCTAGAG
TATCTCAACTAGACC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1BV42JQ 725 0 0
ATCGTCAGGTCGGGCGAGCAAGCGTGCACTGCGTATGTGATGTTCAAGGATTCTTACTCT
CAGGAAACTGCCGTCTTACTCAGTGGGGCAACCATATTGGAGCAGCGAGTTTGCATAACT
CGTTGGGGACAGCATCACGAGGAGTTTGACTTCTGGAACGCGACTCAGCGGGGTTTTGTT
GACGACACAAACTCACACGCTCATCCCCAACGAGGCGAGTTCAACGCCGGAGAAGCAGTG
ACAAAAGCTCAAGAAGTGGTGAGGACAATGCTAGCCACCGGATTCGTGCTGGGGAAAGAC
GCTTTAGCCAAAGCTAAAGGCTTCGACGAATCCCACGGTGTATCGGCTGCAGCAGCGGCT
AGAGTATCTCAACTAGACCAGAGGATCGGTCTCACTGACAAAATCTTCGCCGGAGTTGAA
GCTGTCAGACTGACCGACCAGAAGTACCAGGTTTCAGACAAAGCAAAATCAGCCGTTTCT
GCTACAGGAAGAACCGCGGCAGCAGCTGCAACTAGTGTTGTCAATAGCAGTTACTTCTCC
AGCGGAGCTCTCTGGCTATCGGGTGCGTTAGAGCGTGCGGCTAAGGCTGCATCTGATCTT
GGTAGCCGTGGCTCAAGGCAGTGATGTGAATAGATACGAACTGATCAGAATCATATACAT
GCATTTATAAAAAAAACTCCCGACTTCGTACTTGTGTGCACCCCCATCCAATAATTAGTT
TACCC

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1G677JQ 496 0 0
GGGGAAAGACGCTTTAGCCAAAGCTAAAGGCTTCGACGAATCCCACGGTGTATCGGCTGC
AGCAGCGGCTAGAGTATCTCAACTAGACCAGAGGATCGGTCTCACTGACAAAATCTTCGC
CGGAGTTGAAGCTGTCAGACTGACCGACCAGAAGTACCAGGTTTCAGACAAAGCAAAATC
AGCCGTTTCTGCTACAGGGAGAACCGCGGCAGCAGCTGCAACTAGTGTTGTCAATAGCAG
TTACTTCTCCAGCGGAGCTCTCTGGCTATCGGGTGCGTTAGAGCGTGCGGCTAAGGCTGC
ATCTGATCTTGGTAGCCGTGGCTCAAGGCAGTGATGTGAATAGATACGAACTGATCAGAA
TCATATACATGCATTTATAAAAAA**CTCCCGACTTCGTACTTGTGTGCACCACCATCCA
ATAATTAGTTTACCCAATGACCCCTGATTTGATTTGTATGCAAAAATGTTATAAGAAGGG
TGAATCTCCTGACTTC

QA 1 496 1 496
DS 

RD RS1F526TF 422 0 0
GG
TCTCAACTAGACCAGAGGATCGGTCTCACTGACAAAATCTTCGCCGGAGTTGAAGCTGTC
AGACTGACCGACCAGAAGTACCAGGTTTCAGACAAAGCAAAATCAGCCGTCTCTGCTACA
GGAAGAACCGCGGCAGCAGCTGCAACTAGTGTTGTCAATAGCAGTTACTTCTCCAGCGGA
GCTCTCTGGCTATCGGGTGCGTTAGAGCGTGCGGCTAAGGCTGCATCTGATCTTGGTAGC
CGTGGCTCAAGGCAGTGATGTGAATAGATACGAACTGATCAGAATCATATACATGCATTT
ATAAAAAAAACTCCCGACTTCGTACTTGTGTGCACCACCATCCAATAATTAGTTTACCCA
ATGACCCCTGATTTGATTTGTATGCAAAAATGTTATAAGAAGGGTGAATCTCCTGACTTC

QA 3 422 3 422
DS 



AS 1 5

CO CL1451Contig1 1179 5 15 U
GGGTGTCTAGCTAGCCATGGCCGTCTGTAACTGTTTCCTCCAAGCTCCACCTCTCTCTCG
CTTCCTATCACCGGTTTTCTCTCGCCGCGCTACGAATCTCTTCGCCGGCTATTGTCAGCT
CAAATCAACCGTCATGTTCTCCTCCTCCTCCTCCTCCGCCGCGAACCGAACCGGACCGTT
GACATCTCCCGTCAGAGCTGAAGTAAAGCGCGTCTCGCGGAAGGACGATCAAGTAGCTTC
TGCTTCTGATCTTCAATTCGAGACGCCGTTGAAGATCGTCGAGTATCCGGATCCTATCTT
ACGCGCTAAGTGCAAGAGGATTGGTGTTTTCGACGAGAATCTGAAGAACTTGGCCGATAA
TATGTTCGATGTTATGTACAAAACGGATGGCATCGGGCTCTCAGCGCCACAAGTGGGGTT
CAATATTCAGCTCATGGTGTTTAATCCAGCTGGGGAGTCTGGTGAAGGAGAAGAGATCGT
TCTTGTGAACCCGAAAATTAATAAATATTCTGATAAATTAGTACCGTTTAACGAAGGATG
CTTATCTTTCCCTGGGATCTATGCTGATGTTGTTCGACCACAATCTGTCAAGATTGACGC
AAGGGACATTACTGGTGCAAAATTTTCAATCAGTCTATCACGTTTACCTGCAAGAATCTT
CCAGCATGAATACGACCACCTTGAGGGAGTTCTCTTTTTCGACAGAATGACGGATGACGT
TCTTGACACCATTCGTGAAGAGTTAGAGGCCTTGGAAAAGAAGTACGAAGAAAAAACTGG
ATTGCCAAGCCCTGAAAAAGTACAAGCACGACAAAAAAAGAAAGCAGGAGTTGGTTTCGG
CAAACGTCGATGAGACATTCTCGCTCGATTCTCATTTCATCTTCGAATAGGATATGGGAT
TTAACAATGGTATGGGAATCAGACGATGACAAGAAACACGTTTGCATTTCTCAATCCAGA
GGAGCACATCACATTGTGTGATGCAAATCTCCCAAACTGGATGTACGGTTGTAACAGATA
TCATTTATTTCAGAATCTTTTTTTGCCAGAGTAATATATTATTCAAGATTGTCTGTTTGC
GCTGTTGTATAATGTTAGCCTTTTAGCTTGAGCTTGTGAACTGCGTATAAAATGTTCTTT
ACCACTAAGCTCTACCATATCATGGTTTATCTTTGTTAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B168TF U 1
AF RS1BE89TF U 1
AF RS1A731TF U 1
AF RS1B168JQ C 229
AF RS1BE89JQ C 477
BS 1 79 RS1A731TF
BS 80 80 RS1B168TF
BS 81 153 RS1A731TF
BS 154 156 RS1B168TF
BS 157 390 RS1A731TF
BS 391 391 RS1B168TF
BS 392 696 RS1A731TF
BS 697 697 RS1B168JQ
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BS 745 837 RS1B168JQ
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BS 839 1043 RS1B168JQ
BS 1044 1044 RS1BE89JQ
BS 1045 1072 RS1B168JQ
BS 1073 1179 RS1BE89JQ

RD RS1B168TF 682 0 0
GGGTGTCTAGCTAGCCATGGCCGTCTGTAACTGTTTCCTCCAAGCTCCACCTCTCTCTCG
CTTCCTATCACCGGTTTTCTCTCGCCGCGCTACGAATCTCTTCGCCGGCTATTGTCAGCT
CAAATCAACCGTCATGTTCTCCTCCTCCTCCTCCTCCGCCGCTAACCGAACCGGACCGTT
GACATCTCCCGTCAGAGCTGAAGTAAAGCGCGTCTCGCGGAAGGACGATCAAGTAGCTTC
TGCTTCTGATCTTCAATTCGAGACGCCGTTGAAGATCGTCGAGTATCCGGATCCTATCTT
ACGCGCTAAGTGCAAGAGGATTGGTGTTTTCGACGAGAATCTGAAGAACTTGGCCGATAA
TATGTTCGATGTTATGTACAAAACGGATGGCATCGGGCTCTCAGCGCCACAAGTGGGGTT
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TCTTGTGAACCCGAAAATTAATAAATATTCTGATAAATTAGTACCGTTTAACGAAGGATG
CTTATCTTTCCCTGGGATCTATGCTGATGTTGTTCGACCACAATCTGTCAAGATTGACGC
AAGGGACATTACTGGTGCAAAATTTTCAATCGGTCTATCACGTTTACCTGCAAGAATCTT
CCAGCATGAATACGACCACCTT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1BE89TF 678 0 0
GGGTGTCTAGCTAGCCATGGCCGTCTGTAACTGTTTCCTCCAAGCTCCACCTCTCTCTCG
CTTCCTATCACCGGTTTTCTCTCGCCGCGCTACGAATCTCTTCGCCGGCTATTGTCAGCT
CAAATCAACCGTCATGTTCTCCTCCTCCTCCTCCTCCGCCGCGAACCGAACCGGACCGTT
GACATCTCCCGTCAGAGCTGAAGTAAAGCGCGTCTCGCGGAAGGACGATCAAGTAGCTTC
TGCTTCTGATCTTCAATTCGAGACGCCGTTGAAGATCGTCGAGTATCCGGATCCTATCTT
ACGCGCTAAGTGCAAGAGGATTGGTGTTTTCGACGAGAATCTGAAGAACTTGGCCGATAA
TATGTTCGATGTTATGTACAAAACGGATGGCATCGGGCTCTCAGCGCCACAAGTGGGGTT
CAATATTCAGCTCATGGTGTTTAATCCAGCTGGGGAGTCTGGTGAAGGAGAAGAGATCGT
TCTTGTGAACCCGAAAATTAATAAATATTCTGATAAATTAGTACCGTTTAACGAAGGATG
CTTATCTTTCCCTGGGATCTATGCTGATGTTGTTCGACCACAATCTGTCAAGATTGACGC
AAGGGACATTACTGGTGCAAAATTTTCAATCAGTCTATCACGTTTACCTGCAAGAATCTT
CCAGCATGAATACGACCA

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1A731TF 744 0 0
GGGTGTCTAGCTAGCCATGGCCGTCTGTAACTGTTTCCTCCAAGCTCCACCTCTCTCTCG
CTTCCTATCACCGGTTTTCCCTCGCCGCGCTACGAATCTCTTCGCCGGCTATTGTCAGCT
CAAATCAACCGTCATGTTCTCCTCCTCCTCCTC***CGCCGCGAACCGAACCGGACCGTT
GACATCTCCCGTCAGAGCTGAAGTAAAGCGCGTCTCGCGGAAGGACGATCAAGTAGCTTC
TGCTTCTGATCTTCAATTCGAGACGCCGTTGAAGATCGTCGAGTATCCGGATCCTATCTT
ACGCGCTAAGTGCAAGAGGATTGGTGTTTTCGACGAGAATCTGAAGAACTTGGCCGATAA
TATGTTCGATGTTATGTACAAAACGGATGGTATCGGGCTCTCAGCGCCACAAGTGGGGTT
CAATATTCAGCTCATGGTGTTTAATCCAGCTGGGGAGTCTGGTGAAGGAGAAGAGATCGT
TCTTGTGAACCCGAAAATTAATAAATATTCTGATAAATTAGTACCGTTTAACGAAGGATG
CTTATCTTTCCCTGGGATCTATGCTGATGTTGTTCGACCACAATCTGTCAAGATTGACGC
AAGGGACATTACTGGTGCAAAATTTTCAATCAGTCTATCACGTTTACCTGCAAGAATCTT
CCAGCATGAATACGACCACCTTGAGGGAGTTCTCTTCTTCGACAGAATGACGGATGACGT
TCTTGACACCATTCGTGAAGAGTT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1B168JQ 847 0 0
GATCAAGTAGCTCTGC
TCTGATCTTCAATTCGAGACGCCGT*GAAGATCGTCGAGTATCCGGATCCTATCTTACGC
GCTAAGTGCAAGAGGATTGGTGTTTTCGACGAGAATCTGAAGAACTTGGCCGATAATATG
TTCGATGTTATGTACAAAACGGATGGCATCGGGCTCTCAGCGCCACAAGTGGGGTTCAAT
ATTCAGCTCATGGTGTTTAATCCAGCTGGGGAGTCTGGTGAAGGAGAAGAGATCGTTCTT
GTGAACCCGAAAATTAATAAATATTCTGATAAATTAGTACCGTTTAACGAAGGATGCTTA
TCTTTCCCTGGGATCTATGCTGATGTTGTTCGACCACAATCTGTCAAGATTGACGCAAGG
GACATTACTGGTGCAAAATTTTCAATCGGTCTATCACGTTTACCTGCAAGAATCTTCCAG
CATGAATACGACCCCCTTGAGGGAGTTCTTTTTTTCGACAGAATGACGGATGACGTTCTT
GACACCATTCGTGAAGAGTTAGAGGCCTTGGAAAAGAAGTACGAAGAAAAAACTGGATTG
CCAAGCCCTGAAAAAGTACAAGCACGACAAAAAAAGAAAGCAGGAGTTGGTTTTGGCAAA
CGTCGATGAGACATTCTCGCTCGATTCTCATTTCATCTTCGAATAGGATATGGGATTTAA
CAATGGTATGGGAATCAGACGATGACAAGAAACACGTTTGCATTTCTCAATCCAGAGGAG
CACATCACATTGTGTGATGCAAATCTCCCAAACTGGATGTACGGTTGTAACAGATATCAT
TTATTTCAGAATCTTTTTT*GCCAGAGTAATATATTATTCAAGATTGT
TTG

QA 17 844 17 844
DS 

RD RS1BE89JQ 703 0 0
TCGTTCTTGTGAACCCGAAAATTAATAAATATTCTGATAAATTAGTACCGTTTAACGAAG
GATGCTTATCTTTCCCTGGGATCTATGCTGATGTTGTTCGACCACAATCTGTCAAGATTG
ACGCAAGGGACATTACTGGTGCAAAATTTTCAATCAGTCTATCACGTTTACCTGCAAGAA
TCTTCCAGCATGAATACGACCACCTTGAGGGAGTTTTCTTTTTCGACAGAATGACGGATG
ACGTTCTTGGCACCATTCGTGAAGAGTTAGAGGCCTTGGAAAAGAAGTACGAAGAAAAAA
CTGGATTGCCAAGCCCTGAAAAAGTACAAGCACGACAAAAAAAGAAAGCAGGAGTTGGTT
TCGGCAAACGTCGATGAGACATTCTCGCTCGATTCTCATTTCATCTTCGAATAGGATATG
GGATTTAACAATGGTATGGGAATCAGACGATGACAAGAAACACGTTTGCATTTCTCAATC
CAGAGGAGCACATCACATTGTGTGATGCAAATCTCCCAAACTGGATGTACGGTTGTAACA
GATATCATTTATTTCAGAATCTTTTTTTGCCAGAGTAATATATTATTCAAGATTGTCTGT
TTGCGCTGTTGTATAATGTTAGCCTTTTAGCTTGAGCTTGTGAACTGCGTATAAAATGTT
CTTTACCACTAAGCTCTACCATATCATGGTTTATCTTTGTTAC

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 4

CO CL1452Contig1 1117 4 11 U
GGGCGAGAGAGAGTGTAACAAAAACAGAGTGACAACAAACTCACACCTAACCAAACCAAG
ACAAGAAGACGATGGCTTCGTTTCGCTTCCCTTTCTCGTTTTCTCAGCCCTCTGTCCCTA
AACCACCGCGTTCCACGTCATCATCATCATCCAGATTCTCCGTTTCCGCAGTCGCCGTGA
CCGTCACGGTTGGCGGAGTAGCTGCGATAGCGGCGTTGCGGAATCCGTGGGTGTTCTCAT
CTCATCGTTCGTCTCAGTTACCATGGGGATCTATAGCTCTAGCCAGTCCTAGCTCCGAAT
CCAACGTGGTTGTTGAGCCTAAGACCGGTCTCTCCTTCCCGGCTACGATCGGAGGAGGTT
CGAGGAGATTACTAGGCGTGGGGCTGAGGAAGAAGAGCCTACTTGGATTGAAGAACATCG
ATGTCTACGCATTCGGCATGTATGCTGACTGTGATGATGTCAAGAAACTTGTTGGTGAGA
AATACGCGAATCTTCCGGCTTCTGAGCTCAGGGGAAACAAGGCATTTGTCGATGATCTTA
TGGATGCCGATATAAAGATGACTATTAGGCTACAGATCGTCTACGGCAAACTCAACATCC
GTTCCGTTCGCACTGCTTTCAAAGATTCTGTCGGTAACAGACTCAAGAAGTTTGGTGGCT
TATTAGACAACGATGACTTGCTCCAAAGCTTCACTAGCCTCTTCAAAGACGAGTATAAAA
TTCCAAGAAATTCCACTATTGATATGACGCGAGAACCAGGGCATGTACTCAACGTAGCAA
TTGGGGGAAACCAAGTTGGGAGTGTGAAGAGCAAACTCTTGTGTAGGTCAATCTTAGACT
TGTACATTGGTGAAGAACCGTTTGATAAGAATGCAAGAGAGGATTTTCTAGACAATGTGG
CTTCTATAGCCGCTGTTGACAACAAGTAGTACCAGGTCATGAGATTTCAGAAGAAAAAAT
GATAAAACAAACCAAGTGTGGTCTTTGCTATCGTATTCTCTATATTATAATACTGTTGAG
GTATTTTTAATGAAAAAAATTGCTACCTTGAGGGATGGTTCAGGGTTTTGTTTAAGTCCA
AATATGTACAGAAAAATTTTATCGGCAAGAAAAACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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CGGTAACAGACTCAAGAAGTTTGGTGGCTTATTAGACAACGATGACTTGCTCCAAAGCTT
CACTAGCCTCTTCAAAGACGAGTATAAAATTCCAAGAAATTCCACTATTGATATGACGCG
AGAACCAGGGCATGTACTCAACGTAGCAATTGGGGGAAACCAAGTTGGGAGTGTGAAGAG
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TGCAAGAGAGGATTTTCTAGACAATGTGGCTTCTATAGCCGCTGTTGACAACAAGTAGTA
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AAACTT

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 5

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TCCGTGTTTCGATTTTCTTAACTTTCATAAACCGACCAAAACTTGTCTAAAAAATTATGG
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TGAAGACGACTCAGCTGCAGCGGCTGCACCGGCTGTTGCTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCA
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GAAGTTTGTTGGCTTCGTTGTGTCTTATTTTTCAGTTTCTCTGTTCTTCTTTTTGTTGTG
TTTTAGGGTATTGTTTCGTGGTATTTTAAAGGTATGAAAATTTTAATTCCTTTTCGTTT


BQ
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25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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TCCG
GCGGAGAA

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CTGCGGCGACTGGGGAGGTAACAGATCGTGGTATGTTCGACTTCTTGAAAAAGAAGAAGG
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TCCG
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TCTTCTAGCTCCTCAAGCGAGGAAG**GTGAAGATGGTGAGAAGAGAAAGAAGAAGAAGG
ATAAGAAGAAGATTGCTACTGAAGGAGAGGGGCAAACAGAGGAGGAGAAGAAAGGGTTTA
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CAGCGGCTGCATCGGCTGTTGCTCCTCCGGTGGAGGAAGCGCATCCGGCTGAGAAGAAGG
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G
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DS 



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CGAAGGAGTCTCCCCTGAACATGGAGTCAAGTGTTACTAACGTGTCAACAATGATTGAGA
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AAGGGGAAAGTTTCTTATGTCACTGGAACTAAGAGAATCAATCTGCTTCTGACCCTTTCT
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BB11JQ U 20
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AF RS1A163TV C 569
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RD RS1BB11JQ 574 0 0
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QA 1 574 1 574
DS 

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GG

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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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CC

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G
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GCATCTCATGGGTATGGGCATGGTGGTCATGGTAAATTCAAGCACGGGAAGCATGGAGGC
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GGCAAATTCAAGAAGTGGAAGTAATCTATAAAGAAACCACCCTTTGATTCTCTCCTCCGG
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ACTATATCGGTCTAGAGATTACTGGTTCGGAGAAAATAAATGGAGAGTGGTAGTATAATG
TAAACCTTATGGCATCTGCAGAAGAGGTTTCTTCAATCTCTTT**GTAGCAGATGCCCTG
AAACTTATCTATAATTTGGTTTTATAATTGACATTTTGTGTTCATTTTGCCTCTTTTTTC
TTATTCTAAATCTTTAATGTTTGATGACTTGATGATGTTGGTGAAGTTTTCAATTATGAT
ATATGTTGTAGATAA

QA 2 556 2 556
DS 



AS 2 4

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CGGCAATATCCTGGGCCGTGGTAGGTGATGCTTAAGCAATCTGATGGTTCATTTGTATGT
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CTAGGACTACAAGAAGAGAAAGGGAGCTCACTTGAGTTTCTGCGCAGGGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AC67TF U 1
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AAGAACTCTCTGTTATAGAGCAGTTTGTGGAAAACTTTGCCACCTCAACCCCGGCTCTTC
TCTTTAATCTTGAGCTAGATACCTTACGTGCAGTGCTGACCTAGGGCTACTTGGCTTTCC
CCCTAAAGATCTGCACTACCGGTTTCTTTCTCAGTTTGTTCCCGTCTTTTATATCCGTAT
CAGAGAGTATTCAAAGTGGCAGTGGCACCATATGTGTTGAACTACA*CGGAGCACTTTT
CGCATATC

QA 1 839 1 839
DS 

RD RS1AC67JQ 655 0 0
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CCGCGTTTGATTCGATTGATGGTATAAGTATACGTTCGCTAGACGATATACCTGGCACTT
CTGTCACCAATTTCTTCAGGGCTATAAGGAGTACCTTGGACTTTGATTTTGAAGATGAAA
ACGAAGGTAGTTGGGAGCCCAAGGAGCCACCGACCCCTTTATATGTTTATCAATTGCAGC
ACTAAAGAACTCTCTGTTATAGAGCAGTTTGTGGAAAACTTTGCCACCTCAACCCCGGCT
CTTCTCTTTAATCTTGAGCTAGATACCTTACGTGCAGTGCTGACCTAGGGCTACTTGGCT
TTCCCCCTAAAGATCTGCACTACCGGTTTCTTTCTCAGTTTGTTCCCGTCTTTTATATCC
GTATCAGAGAGTATTCAAAGTGGCAGTGGCACCATATGTGTTGAACTACAACGGAGCACT
TTTTCGGCAATATCCTGGGCCGTGGTAGGTGATGCTTAAGCAATCTGATGGTTCATTTGT
ATGTGTTGCAGAAAGCCCCACTCGTTTCACCCTGGGTGAAACGAAGGAAGAGCTTTTACA
GGTTCTAGGACTACAAGAAGAGAAAGGGAGCTCACTTGAGTTTCTGCGCAGGGGC

QA 1 655 1 655
DS 



CO CL1457Contig2 650 2 5 U
CCTTATATAGTTTCTCTGTAATTTCCTCTGAGTATTATTCAAAGGGTATTAAACTGAATA
AAACATTTCCAAACTATTGTTTATCATTCTCATCAATGTTGCACATATACAGGTGTAAAT
ATCGCAATCTTGGGAGATTTTGTGAAACTTACTAAAGGTGTGAATCCATGACTTGGCCAC
AGTTTAGCTACGCCAATTAGATGATAACTCAAGATCCACATCTTCTTCCCACCAAGTTGC
TGCCTTGTAGCCCCTGCGCAAAAACTCAAGTGAGCTCCCTTTCTCTTCTTGTAGTCCTAG
AACCTGTAAAAGCTCTTCCTTCGTTTCACCCAGGGTGAAACGAGTGGGGCTTTCTGCAAC
ACATGCAAATGAACCATCAGATTGCTTAAGCATCACCTGCCACGGCCCAGGATATTGCCG
AAAAAGTGCTCCGTTGTAGTTCAACACATATGGTGCCACTGCCACTGTCTTTGAATACTC
TCTGATACGGATATAAAAGACGGGAACAAACTGAGAAAGAAACCGGTAGTGCAGATCTTT
AGGGGGAAAGCCAAGTAGCCCTAGGTCAGCACGTAAGGTATCTAGCTCAAGATTAAAGAG
AAGAGCCGGGGTTGAGGTGGCAAAGTTTTCCACAAACTGCTCTATAACAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G443JQ U 1
AF RS1FZ72JQ U 14
BS 1 104 RS1G443JQ
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BS 261 261 RS1FZ72JQ
BS 262 650 RS1G443JQ

RD RS1G443JQ 650 0 0
CCTTATATAGTTTCTCTGTAATTTCCTCTGAGTATTATTCAAAGGGTATTAAACTGAATA
AAACATTTCCAAACTATTGTTTATCATTCTCATCAATGTTGCACGTATACAGGTGTAAAT
ATCGCAATCTTGGGAGATTTTGTGAAACTTACTAAAGGTGTGAATCCATGACTTGGCCAC
AGTTTAGCTACGCCAATTAGATGATAACTCAAGATCCACATCTTCTTCCCACCAAGTTGC
TGCCTTGTAGCCCCTGCGCAGAAACTCAAGTGAGCTCCCTTTCTCTTCTTGTAGTCCTAG
AACCTGTAAAAGCTCTTCCTTCGTTTCACCCAGGGTGAAACGAGTGGGGCTTTCTGCAAC
ACATGCAAATGAACCATCAGATTGCTTAAGCATCACCTGCCACGGCCCAGGATATTGCCG
AAAAAGTGCTCCGTTGTAGTTCAACACATATGGTGCCACTGCCACTGTCTTTGAATACTC
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AGGGGGAAAGCCAAGTAGCCCTAGGTCAGCACGTAAGGTATCTAGCTCAAGATTAAAGAG
AAGAGCCGGGGTTGAGGTGGCAAAGTTTTCCACAAACTGCTCTATAACAG

QA 1 650 1 650
DS 

RD RS1FZ72JQ 631 0 0
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CTATTGTTTATCATTCTCATCAATGTTGCACATATACAGGTGTAAATATCGCAATCTTGG
GAGATTTTGTGAAACTTACTAAAGGTGTGAATCCATGACTTGGCCACAGTTTAGCTACGC
CAATTAGATGATAACTCAAGATCCACATCTTCTTCCCACCAAGTTGCTGCCTTGTAGCCC
CTGCGCAAAAACTCAAGTGAGCTCCCTTTCTCTTCTTGTAGTCCTAGAACCTGTAAAAGC
TCTTCCTTCGTTTCACCCAGGGTGAAACGAGTGGGGCTTTCTGCAACACATGCAAATGAA
CCATCAGATTGCTTAAGCATCACCTGCCACGGCCCAGGATATTGCCGAAAAAGTGCTCCG
TTGTAGTTCAACACATATGGTGCCACTGCCACTGTCTTTGAATACTCTCTGATACGGATA
TAAAAGACGGGAACAAACTGAGAAAGAAACCGGTAGTGCAGATCTTTAGGGGGAAAGCCA
AGTAGCCCTAGGTCAGCACGTAAGGTATCTAGCTCAAGATTAAAGAGAAGAGCCGGGGTT
GAGGTGGCAAAGTTTTCCACAAACTGCTCTA

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 5

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GGCTGATATTTCTGATACTTCCCCACAAACACAAACTGCCACCTCCTTCGACATCGAAGA
AGGTGGATCAGGAGGTGATTTAGGATCATCGGGGTTTTCCCGTCCTCTTCTATCCGTATC
ATTCGTTCAAAAGTTGCTTGGGGAGTTCGTGGGGACATTCTCTCTCATATTTGCCGGTTG
CGCGGCTATTGTGGTAAATGATACGTACGGTAAAGTGGTGACACTTCCTGGTATAGCTTT
GGTATGGGGACTAACCGTAATGGTTATGATCTACTCAATTGGTCATGTATCCGGTGCACA
TTTCAATCCTGCTGTTTCCATTGCATTTGCCTCTTCGAGAAAGTTCCCATTTAAACAGGT
TCCGGGGTATATAGCTGCACAAGTTCTCGGCTCAACTTTAGCTTCTGAGGCTCTACGACT
TGTGTTCCAGCTGGAGAACAACGTTTGTAGCCTCAAAGGCGATGTTTATGTGGGAACATA
CCCGTCAAGTTCCAACATGGCGTCATTTGTTATGGAGTTCATCACTACTTTCAACTTAAT
GTTCGTTATCTCGGCTGTAGCTACTGATAAACGAGCCAATGGATCATTCGCAGGCATTGC
TATTGGCGCGACAGTTGTACTCGACATCCTGTTCTGCGGGCCAATCTCCGGAGCATCAAT
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ATACATTGTTTCACCGGTTATTGGAGCATTGGCAGGTGCATGGACTTATGATATGTTACG
GTCTACAAACAAATCATATGGTGAGATAATACGTCCAAATTGCAATAAAGTTTCTTCAAG
AGATCGCCAAGAAGCATCTGAAGACGAGATTTGTGTTCTTCAAGTGGTCAACCAAGCTAA
CCGGAAAGAATTCATATGTTCATCGCCCACTGATATCAACGACAAAAGAAATGTCACATG
CAAGTTGCCGTAAGATTATTCACAACATGAATCTGTCGTGCTCTATACTTTCAAAACTTT
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AATACAGAGGTTAAAAATAAGGATTGTACTTTGTAAAATATTTTGTAACATCCCGAGTTG
TGATATGTGAAAAAGCTTAAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1GX79TF U 1
AF RS1EJ18TF U 35
AF RS1GX79JQ C 452
AF RS1EJ18JQ C 516
AF RS1D304TF U 763
BS 1 176 RS1GX79TF
BS 177 177 RS1EJ18TF
BS 178 192 RS1GX79TF
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BS 745 770 RS1EJ18TF
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BS 800 800 RS1D304TF
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BS 823 984 RS1D304TF
BS 985 985 RS1GX79JQ
BS 986 1223 RS1D304TF

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GGCTGATATTTCTGATACTTCCCCACAAACACAAACTGCCACCTCCTTCGACATCGAAGA
AGGTGGATCAGGAGGTGATTTAGGATCATCGGGGTTTTCCCGTCCTCTTCTATCCG*ATC
ATTCGTTCAAAA

QA 1 192 1 192
DS 

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ACTGCCACCTCCTTCGACATCGAAGAAGGTGGATCAGGAGGTGATTTAGGATCATCGGGG
TTTTCCCGTCCTCTTCTATCCGTATCATTCGTTCAAAAGTTGCTTGGGGAGTTCGTGGGG
ACATTCTCTCTCATATTTGCCGGTTGCGCGGCTATTGTGGTAAATGATACGTACGGTAAA
GTGGTGACACTTCCTGGTATAGCTTTGGTATGGGGACTAACCGTAATGGTTATGATCTAC
TCAATTGGTCATGTATCCGGTGCACATTTCAATCCTGCTGTTTCCATTGCATTTGCCTCT
TCGAGAAAGTTCCCATTTAAACAGGTTCCGGGGTATATAGCTGCACAAGTTCTCGGCTCA
ACTTTAGCTTCTGAGGCTCTACGACTTGTGTTCCAGCTGGAGAACAACGTTTGTAGCCTC
AAAGGCGATGTTTATGTGGGAACATACCCGTCAAGTTCCAACATGGCGTCATTTGTTATG
GAGTTCATCACTACTTTCAACTTAATGTTCGTTATCTCGGCTGTAGCTACTGATAAACGA
GCCAATGGATCATTCGCAGGCATTGCTATTGGCGCGACAGTTGTACTCGACATCCTGTTC
TGCGGGCCAATCTCCGGAGCATCAATGAATCCAGCAAGAAGCTTAGGGC*TGCACTTATA
TGGGGATGTTATAAGG*TTTATGGTTATACATTGTTTCACCGGTT*TTGGAGCAT*GGCA
GGTGCATG

QA 1 788 1 788
DS 

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CTCAAAGGCGATGTTTATGTGGGAACATACCCGTCAAGTTCCAACATGGCGTCATTTGTT
ATGGAGTTCATCACTACTTTCAACTTAATGTTCGTTATCTCGGCTGTAGCTACTGATAAA
CGAGCCAATGGATCATTCGCAGGCATTGCTATTGGCGCGACAGTTGTACTCGACATCCTG
TTCTGCGGGCCAATCTCCGGAGCATCAATGAATCCAGCAAGAAGCTTAGGGCCTGCACTT
ATATGGGGATGTTATAAGGATTTATGGTTATACATTGTTTCACCGGTTATTGGAGCATTG
GCAGGTGCATGGACTTATGATATGTTACGGTCTACAAACAAATCATATGGTGAGATAATA
CGTCCAAATTGCAATAAAGTTTCTTCAAGAGATCGCCAAGAAGCATCTGAAGACGAGATT
TGTGTTCTTCAAGTGGT***CCAAGCTAACCGGAAAGAATTCATATGTTCATCGCCCACT
GATATCAACGACAAAAGAAATGTCACATGCAAGTTGCCGTAAGATTATTCACAACATGAA
TCTGTCGTGCTCTATACTTTCAAAACTTTCACACACAAAAAAGCTTTGTTGACAAAAAGA
ATTTCAAAATCTGTTAAATATTTTCTATAAATACAGAGGTT

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DS 

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AGTTCATCACTACTTTCAACTTAATGTTCGTTATCTCGGCTGTAGCTACTGATAAACGAG
CCAATGGATCATTCGCAGGCATTGCTATTGGCGCGACAGTTGTACTCGACATCCTGTTCT
GCGGGCCAATCTCCGGAGCATCAATGAATCCAGCAAGAAGCTTAGGGCCTGCACTTATAT
GGGGATGTTATAAGGATTTATGGTTATACATTGTTTCACCGGTTATTGGAGCATTGGCAG
GTGCATGGACTTATGATATGTTACGGTCTACAAACAAATCATATGGTGAGATAATACGTC
CAAATTGCAATAAAGTTTTTTCAAGAGATCGCCAAGAAGCATCTGAAGACGAGATTTGTG
TTCTTCAAGTGGTCAACCAAGCTAACCGGAAAGAATTCATATGTTCATCGCCCACTGATA
TCAACGACAAAAGAAATGTCACATGCAAGTTGCCGTAAGATTATTCACAACATGAATCTG
TCGTGCTCTATACTTTCAAAACTTTCACACACAAAAAAGCTTTGTTGACAAAAAGAATTT
CAAAATCTGTTAAATATTTTCTATAAATACAGAGGTTAAAAATAAGGATTGTACTTTGTA
AAATATTTTGTAACATCCCGAGTTGTGATATGTGAAAAAGCTTAAGAG

QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1D304TF 461 0 0
G
TATAAGGATTTATGGTTATACATTGTTTCACCGGTTATTGGAGCATTGGCGGGTGCATGG
ACTTATGATATGTTACGGTCTACAAACAAATCATATGGTGAGATAATACGTCCAAATTGC
AATAAAGTTTCTTCAAGAGATCGCCAAGAAGCATCTGAAGACGAGATTTGTGTTCTTCAA
GTGGTCAACCAAGCTAACCGGAAAGAATTCATATGTTCATCTCCCACTGATATCAACGAC
AAAAGAAATGTCACATGCAAGTTGCCGTAAGATTATTCACAACATGAATCTGTCGTGCTC
TATACTTTCAAAACTTTCACACACAAAAAAGCTTTGTTGACAAAAAGAATTTCAAAATCT
GTTAAATATTTTCTATAAATACAGAGGTTAAAAATAAGGATTGTACTTTGTAAAATATTT
TGTAACATCCCGAGTTGTGATATGTGAAAAAGCTTAAGAG

QA 2 461 2 461
DS 



AS 1 5

CO CL1459Contig1 986 5 10 U
GGGAAAGAACTCACCTCTCTTTAAATTAATTCGAACATAAAATGAGATGAAAACGTGTTT
TTGTTTTTTAATGAAACACTTGTTCTTCTGTTCCTCTTCTTTATAAACGAAAATCTACAA
AGGAAGAGAGAAAAAGAGAAGGCAGATAGATGTAGACGCTTCTTCTTTTAAAAACAGAAC
ATGTGCTTCCTCTTCTTCTTCTTCTGGGACTGAGCAAACTCTTGACGATCAATGTAAGCG
AGTAATTCTTCTTGCCTCATCAGAGCTTCATATAGAGCCTTTTTCGTGGCTATGAGTTCG
GCTTCAAGCGCGTCTACGCGGCAAACAGCTGCGTTAAGCAGTTCTTCTTTCTCGGAAGGC
ATCTCATTTGGCTTCGACTGCAGCGCTCCTATTTTCTCCTCAAGTTCCGTTAGTTTCTTC
AGCACTGAATTGAGGAGCTCAGCTTCCTCCTCTCTAGCGGCAGCGGCAGTGTTTCCTTCT
ATTTGCGGCGGAGGAGGCTGCTGCTTGGTCACAACACGGTCTGATAGTGTTCGGAAGAAT
GTGAGAATCGCCATCACAATCGCCATGAAAAATACAAAGACACGAGCACTGAAGCTCTCA
TGCTCCTTTGGTTCATTTGGAGTAACAAGAACTCCTTTGGATTGAACCCTGTTGATGGTG
GTGGGTTTAACCTTCCAGGTGGCATCAACAGCTTTGTCAACCATTGGAACATACTCATCA
TAACCTGCCAAACTACCGGCAAAGCTCGTTTCACCAGAGCCGCCAACCTTTGCCTCTTCA
CGAACAGGGGTCAAGCGAAGATGAGAATAACTCATTACCGCCTTTGGAGACGCAACGACA
TCTTCAGCTTCAGAACCTGATTCTGCTGTCGAAGTATCGCTTCCCTTTATCCATGGATAA
GATGGCTTTGCATACGCAATCACTTTCCCCTCGCTGTTCAGAACTTTCACCACCTGCTTT
GCTCGGTGAGCTCCCCCGTGTAGAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AU89JQ U 1
AF RS1BY60JQ U 44
AF RS1G272JQ U 58
AF RS1AU89TF C 392
AF RS1BY60TF C 199
BS 1 200 RS1AU89JQ
BS 201 203 RS1BY60JQ
BS 204 517 RS1AU89JQ
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BS 519 773 RS1AU89JQ
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BS 791 806 RS1AU89JQ
BS 807 986 RS1BY60TF

RD RS1AU89JQ 817 0 0
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TTGTTTTTTAATGAAACACTTGTTCTTCTGTTCCTCTTCTTTATAAACGAAAATCTACAA
AGGAAGAGAGAAAAAGAGAAGGCAGATAGATGTAGACGCTTCTTCTTTTAAAAACAGAAC
ATGTGCTTCCTCTTCTTCTT***CTGGGACTGAGCAAACTCTTGACGATCAATGTAAGCG
AGTAATTCTTCTTGCCTCATCAGAGCTTCATATAGAGCCTTTTTCGTGGCTATGAGTTCG
GCTTCAAGCGCGTCTACGCGGCAAACAGCTGCGTTAAGCAGTTCTTCTTTCTCGGAAGGC
ATCTCATTTGGCTTCGACTGCAGCGCTCCTATTTTCTCCTCAAGTTCCGTTAGTTTCTTC
AGCACTGAATTGAGGAGCTCAGCTTCCTCCTCTCTAGCGGCAGCGGCAGTGTTTCCTTCT
ATTTGCGGCGGAGGAGGCTGCTGCTTGGTCACAACACAGTCTGATAGTGTTCGGAAGAAT
GTGAGAATCGCCATCACAATCGCCATGAAAAATACAAAGACACGAGCACTGAAGCTCTCA
TGCTCCTTTGGTTCATTTGGAGTAACAAGAACTCCTTTGGATTGAACCCTGTTGATGGTG
GTGGGTTTAACCTTCCAGGTGGCATCAACAGCTTTGTCAACCATTGGAACATACTCATCA
TAACCTGCCAAACTACCGGCAAAGCTCGTTTCACCAGAGCCGCCAACCTTTGC*TCTTCA
CGAACAGGG*TCAAGCGAAGATGAGA
TACTCTTTACC

QA 1 806 1 806
DS 

RD RS1BY60JQ 739 0 0
GG
GATGAAAACGTGTTTTTGTTTTTTAATGAAACACTTGTTCTTCTGTTCCTCTTCTTTATA
AACGAAAATCTACAAAGGAAGAGAGAAAAAGAGAAGGCAGATAGATGTAGACGCTTCTTC
TTTTAAAAACAGAACATGTGCTTCCTCTTCTTCTTCTTCTGGGACTGAGCAAACTCTTGA
CGATCAATGTAAGCGAGTAATTCTTCTTGCCTCATCAGAGCTTCATATAGAGCCTTTTTC
GTGGCTATGAGTTCGGCTTCAAGCGCGTCTACGCGGCAAACAGCTGCGTTAAGCAGTTCT
TCTTTCTCGGAAGGCATCTCATTTGGCTTCGACTGCAGCGCTCCTATTTTCTCCTCAAGT
TCCGTTAGTTTCTTCAGCACTGAATTGAGGAGCTCAGCTTCCTCCTCTCTAGCGGCAGCG
GCAGTGTTTCCTTCTATTTGCGGCGGAGGAGGCTGCTGCTTGGTCACAACACGGTCTGAT
AGTGTTCGGAAGAATGTGAGAATCGCCATCACAATCGCCATGAAAAATACAAAGACACGA
GCACTGAAGCTCTCATGCTCCTTTGGTTCATTTGGAGTAACAAGAACTCCTTTGGATTGA
ACCCTGTTGATGGTGGTGGGTTTAACCTTCCAGGTGGCATCAACAGCTTTGTCAACCATT
GGAACATAATCATCATAACCTGCCAAACTACCGGCAAAGCTCGTTTCACCAGAGCCGCCA
ACCTTTGCCTCTTCACG

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DS 

RD RS1G272JQ 763 0 0
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CAAAGGAAGAGAGAAAAAGAGAAGGCAGATAGATGTAGACGCTTCTTCTTTTAAAAACAG
AACATGTGCTTCCTCTTCTTCTTCTTCTGGGACTGAGCAAACTCTTGACGATCAATGTAA
GCGAGTAATTCTTCTTGCCTCATCAGAGCTTCATATAGAGCCTTTTTCGTGGCTATGAGT
TCGGCTTCAAGCGCGTCTACGCGGCAAACAGCTGCGTTAAGCAGTTCTTCTTTCTCGGAA
GGCATCTCATTTGGCTTCGACTGCAGCGCTCCTATTTTCTCCTCAAGTTCCGTTAGTTTC
TTCAGCACTGAATTGAGGAGCTCAGCTTCCTCCTCTCTAGCGGCAGCGGCAGTGTTTCCT
TCTATTTGCGGCGGAGGAGGCTGCTGCTTGGTCACAACACGGTCTGATAGTGTTCGGAAG
AATGTGAGAATCGCCATCACAATCGCCATGAAAAATACAAAGACACGAGCACTGAAGCTC
TCATGCTCCTTTGGTTCATTTGGAGTAACAAGAACTCCTTTGGATTGAACCCTGTTGATG
GTGGTGGGTTTAACCTTCCAGGTGGCATCAACAGCTTTGTCAACCATTGGAACATACTCA
TCATAACCTGCCAAACTACCGGCAAAGCTCGTTTCACCAGAGCCGCCAACCTTTGCCTCT
TCACGAACAGGGGTCAAGCGAAGATGAGA
ATAACTCTTTACCG

QA 1 749 1 749
DS 

RD RS1AU89TF 552 0 0
TTTTCTCCTCAAGTTCCGTTAGTTTCTTCAGCACTGAATTGAGGAGCTCAGCTTCCTCCT
CTCTAGCGGCAGCGGCAGTGTTTCCTTCTATTTGCGGCGGAGGAGGCTGCTGCTTGGTCA
CAACACAGTCTGATAGTGTTCGGAAGAATGTGAGAATCGCCATCACAATCGCCATGAAAA
ATACAAAGACACGAGCACTGAAGCTCTCATGCTCCTTTGGTTCATTTGGAGTAACAAGAA
CTCCTTTGGATTGAACCCTGTTGATGGTGGTGGGTTTAACCTTCCAGGTGGCATCAACAG
CTTTGTCAACCATTGGAACATACTCATCATAACCTGCCAAACTACCGGCAAAGCTCGTTT
CACCAGAGCCGCCAACCTTTGCCTCTTCACGAACAGGGGTCAAGCGAAGATGAGAATAAC
TCTTTACCGCCTTTGGAGACGCAACGACATCTTCAGCTTCAGAACCTGATTCTGCTGTCG
AAGTGTCGCTTCCCTTTATCCATGGATAAGATGGCTTTGCATACGCAATCACTTTCCCCT
CGCTGTTCAG
CC

QA 1 550 1 550
DS 

RD RS1BY60TF 788 0 0
TCTC
TCTGGGACTGAGCAAACTCT*GACGATCAATGTAAGCGAGTAATTCTTCTTGCCTCATCA
GAGCTTCATATAGAGCCTTTTTCGTGGCTATGAGTTCGGCTTCAAGCGCGTCTACGCGGC
AAACAGCTGCGTTAAGCAGTTCTTCTTTCTCGGAAGGCATCTCATTTGGCTTCGACTGCA
GCGCTCCTATTTTCTCCTCAAGTTCCGTTAGTTTCTTCAGCACTGAATTGAGGAGCTCAG
CTTCCTCCTCTCTAGCGGCAGCGGCAGTGTTTCCTTCTATTTGCGGCGGAGGAGGCTGCT
GCTTGGTCACAACACGGTCTGATAGTGTTCGGAAGAATGTGAGAATCGCCATCACAATCG
CCATGAAAAATACAAAGACACGAGCACTGAAGCTCTCATGCTCCTTTGGTTCATTTGGAG
TAACAAGAACTCCTTTGGATTGAACCCTGTTGATGGTGGTGGGTTTAACCTTCCAGGTGG
CATCAACAGCTTTGTCAACCATTGGAACATAATCATCATAACCTGCCAAACTACCGGCAA
AGCTCGTTTCACCAGAGCCGCCAACCTTTGCCTCTTCACGAACAGGGGTCAAGCGAAGAT
GAGAATAACTCATTACCGCCTTTGGAGACGCAACGACATCTTCAGCTTCAGAACCTGATT
CTGCTGTCGAAGTATCGCTTCCCTTTATCCATGGATAAGATGGCTTTGCATACGCAATCA
CTTTCCCCTCGCTGTTCAGAACTTTCACCACCTGCTTTGCTCGGTGAGCTCCCCCGTGTA
GAAC

QA 5 788 5 788
DS 



AS 1 4

CO CL1460Contig1 832 4 8 U
GTAGAATAAATAAACAAAAAGTTGTAGAGCTCAAAAACAGAGAGCAAACAACAAGTAATA
TAAAGTCGGAACAATTCAAGATAAAGATCAATTCTGTAACAAATAGTTTGCTGACAAACA
GTAAAGTAAAACAACATGCATCATCCAAGACGAAGCATTTCAAGTCCGGAGTTTATTTTA
GTTTCACCTCCAAGTTTGCTTGATTGATCACTTCTTCTGAACTTGAATCCCTCCTTGTTC
CATATCCTTCATCCCCGCCTTTCTGACTCTACTAGCATCTCCATATAAATCTTTTAGCTT
TGCGAGGTTACTGTTAACAGTCGCAGCTGCTGCTTTATCCTTGTTTCCATAGTCTCTTTT
AGGAGTTGGCTCACGCTCAATTTGCACACTCCTGCTTCTGCTTCTATCGTCCTCGTAATC
ACTGCGTCTGCTTCTACTACTTT**TAGTCACGCCTTGATCTCCTATCATTATCATAATC
CCCTCTCCCTTTCCCTTTCCCGGTCTCTCTCCCTCTCCCTGTCTCTGTTCGAATAATAGT
CTGGGCTCTGGTGGAAGCACGGTGAGGTGCAGGCTGCCCAAATGAAACAGAGAGGGATGC
TTTTACTGATGGTGGACGACGGGCAGTGTCTTCAGAGCCACGTGACATGTCTCCGGTTGA
ACCAGGATGGTTTTGTTGGTAAATTCATCTTCTCACAGGAACCACCGGAATACGTGGAAA
CAACAACGTATCAAAGTAATACAGTCTAAGCAGCAGATCACGTACGTAAACACCCCATGG
TCGTCGTCCTTCCATTTGATCACAGAACTCTACAAGATCCAGATATGTATGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CW93JQ U 67
AF RS1CW93TF C 63
AF RS1GS86JQ U 1
AF RS1AT45JQ U 24
BS 1 167 RS1GS86JQ
BS 168 168 RS1CW93JQ
BS 169 443 RS1GS86JQ
BS 444 445 RS1CW93JQ
BS 446 472 RS1GS86JQ
BS 473 473 RS1CW93JQ
BS 474 789 RS1GS86JQ
BS 790 832 RS1AT45JQ

RD RS1CW93JQ 469 0 0
CGGAACAATTCAAGATAAAGATCAATTCTGTAACAAATAGTTTGCTGACAAACAGTAAAG
TAAAACAACATGCATCATCCAAGACGAAGCATTTCAAGTCCGGAGTTTATTTTAGTTTCA
CCTCCAAGTTTGCTTGATTGATCACTTCTTCTGAACTTGAATCCCTCCTTGTTCCATATC
CTTCATCCCCGCCTTTCTGACTCTACTAGCATCTCCATATAAATCTTTTAGCTTTGCGAG
GTTACTGTTAACAGTCGCAACTGCTGCTTTATCCTTGTTTCCATAGTCTCTTTTAGGAGT
TGGCTCACGCTCAATTTGCACACTCCTGCTTCTGCTTCTATCGTCCTCGTAATCACTGCG
TCTGCTTCTACTACTTT**TAGTCACGCCTTGATCTCCTATCATTATCATAATCCCCTCT
CCCTTTCCCTTTCCCGGTCTCTCTCCCTCTCCCTGTCTCTGTTCGAATA

QA 1 469 1 469
DS 

RD RS1CW93TF 488 0 0
AAGT
CGGAACAATTCAAGATAAAGATCAATTCTGTAACAAATAGTTTGCTGACAAACAGTAAAG
TAAAACAACATGCATCATCCAAGACGAAGCATTTCAAGTCCGGAGTTTATTTTAGTTTCA
CCTCCAAGTTTGCTTGATTGATCACTTCTTCTGAACTTGAATCCCTCCTTGTTCCATATC
CTTCATCCCCGCCTTTCTGACTCTACTAGCATCTCCATATAAATCTTTTAGCTTTGCGAG
GTTACTGTTAACAGTCGCAGCTGCTGCTTTATCCTTGTTTCCATAGTCTCTTTTAGGAGT
TGGCTCACGCTCAATTTGCACACTCCTGCTTCTGCTTCTATCGTCCTCGTAATCACTGCG
TCTGCTTCTACTACTTT**TAGTCACGCCTTGATCTCCTATCATTATCATAATCCCCTCT
CCCTTTCCCTTTCCCGGTCTCTCTCCCTCTCCCTGTCTCTGTTCGAATAATAGTCTGGGC
TC
CC

QA 5 486 5 486
DS 

RD RS1GS86JQ 789 0 0
GTAGAATAAATAAACAAAAAGTTGTAGAGCTCAAAAACAGAGAGCAAACAACAAGTAATA
TAAAGTCGGAACAATTCAAGATAAAGATCAATTCTGTAACAAATAGTTTGCTGACAAACA
GTAAAGTAAAACAACATGCATCATCCAAGACGAAGCATTTCAAGTCCAGAGTTTATTTTA
GTTTCACCTCCAAGTTTGCTTGATTGATCACTTCTTCTGAACTTGAATCCCTCCTTGTTC
CATATCCTTCATCCCCGCCTTTCTGACTCTACTAGCATCTCCATATAAATCTTTTAGCTT
TGCGAGGTTACTGTTAACAGTCGCAGCTGCTGCTTTATCCTTGTTTCCATAGTCTCTTTT
AGGAGTTGGCTCACGCTCAATTTGCACACTCCTGCTTCTGCTTCTATCGTCCTCGTAATC
ACTGCGTCTGCTTCTACTACTTTCATAGTCACGCCTTGATCTCCTATCATTACCATAATC
CCCTCTCCCTTTCCCTTTCCCGGTCTCTCTCCCTCTCCCTGTCTCTGTTCGAATAATAGT
CTGGGCTCTGGTGGAAGCACGGTGAGGTGCAGGCTGCCCAAATGAAACAGAGAGGGATGC
TTTTACTGATGGTGGACGACGGGCAGTGTCTTCAGAGCCACGTGACATGTCTCCGGTTGA
ACCAGGATGGTTTTGTTGGTAAATTCATCTTCTCACAGGAACCACCGGAATACGTGGAAA
CAACAACGTATCAAAGTAATACAGTCTAAGCAGCAGATCACGTACGTAAACACCCCATGG
TCGTCGTCC

QA 1 789 1 789
DS 

RD RS1AT45JQ 809 0 0
GTAGAGCTCAAAAACAGAGAGCAAACAACAAGTAATATAAAGTCGGAACAATTCAAGATA
AAGATCAATTCTGTAACAAATAGTTTGCTGACAAACAGTAAAGTAAAACAACATGCATCA
TCCAAGACGAAGCATTTCAAGTCCAGAGTTTATTTTAGTTTCACCTCAAAGTTTGCTTGA
TTGATCACTTCTTCTGAACTTGAATCCCTCCTTGTTCCATATCCTTCATCCCCGCCTTTC
TGACTCTACTAGCATCTCCATATAAATCTTTTAGCTTTGTGAGGTTACTGTTAACAGTCG
CAGCTGCTGCTTTATCCTTGTTTCCATAGTCTCTTTTAGGAGTTGGCTCACGCTCAATTT
GCACACTCCTGCTTCTGCTTCTATCGTCCTCGTAATCACTGCGTCTGCTTCTACTACTTT
CATAGTCACGCCTTGATCTCCTATCATTATCATAATCCCCTCTCCCTTTCCCTTTCCCGG
TCTCTCTCCCTCTCCCTGTCTCTGTTCGAATAATAGTCTGGGCTCTGGTGGAAGCACGGT
GAGGTGCAGGCTGCCCAAATGAAACAGAGAGGGATGCTTTTACTGATGGTGGACGACGGG
CAGTGTCTTCAGAGCCACGTGACATGTCTCCGGTTGAACCAGGATGGTTTTGTTGGTAAA
TTCATCTTCTCACAGGAACCACCGGAATACGTGGAAACAACAACGTATCAAAGTAATACA
GTCTAAGCAGCAGATCACGTACGTAAACACCCCATGGTCGTCGTCCTTCCATTTGATCAC
AGAACTCTACAAGATCCAGATATGTATGA

QA 1 809 1 809
DS 



AS 1 4

CO CL1461Contig1 674 4 1 U
GGAATCACATCCATTCCATACGTTCTTCTTCCTCTTGCTTCGCGAAACCAAAAAGTGCCT
CCTCCTTGTTCGTTTTCGATCTCAAATTTTGTCTCTCTGCGGAATCGTTTGTGAATGGTG
GAAACGAATCGGCTCGGTGGTAAGTCTACGCTCTCCCTTCCAATCGAAAGGGCGAGCCTT
TTACTCCCTCTCTCTGCCTCCTCTGTTTTCGCTTTCGGTTCCTGCAAAGAAGGCTGGTAC
TTCCGCTGCTTCGGCATCGACCCGTGAATCCAATCTCCCCCCCA*AATAGCCCTAATCTC
GCTCTGAGATCTGTTTATTTTTTTTCTTTAAATCACTCTTGAAAATTTCGAAAAAGATGT
TGCTTTACAACAAGCAGAAGAAGAACCAGAACAACGCAAAGGGAAACAGAATCCTAATCA
GCGTTACGGTTCTCGGTAGCGCCGGTCCGATCCGGTTCGTTGCTTACGAGGAAGATCTCG
TCGCCTCGGTTATCGATACTGCCCTTAAATGCTACGCTCGCGAAGGTCGTCTTCCTCTTC
TCGGATCCGATTTCAATGATTTCCTTCTCTATTGCCCCATGGTTGGACCTGAAGCTTTAA
GCGCGTGGAGTGCAATTGGATCGCTTGGTGCAAGGAACTTTACTCTGTGTAGAAACCAGA
GAGAAGAAAGTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 5 20 
20 5 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FE62TF U 141
AF RS1GA46TF U 5
AF RS1GJ16TF U 6
AF RS1D315TF U 1
BS 1 674 RS1D315TF

RD RS1FE62TF 215 0 0
TAAGTCTACGCTCTCCCTTCCAATCGAAAGGGCGAGCCTTTTACTCCCTCTCTCTGCCTC
CTCTGTTTTCGCTTTCGGTTCCTGCAAAGAAGGCTGGTACTTCCGCTGCTTCGGCATCGA
CCCGTGAATCCAATCTCCCCCCCA*AATAGCCCTAATCTCGCTCTTAGATCTGTTTATTT
TTTTTCTTTAAATCACTCTTGAAAATTTCGAAAAA

QA 1 215 1 215
DS 

RD RS1GA46TF 462 0 0
GG
ACATCCATTCCATACGTTCTTCTTCCTCTCGCTTCGCGAAACCAAAAACCGCTTCTTCAT
TGCTCGTTTTCGATCTCAAATTTTCTCTCTCTGCGGAATCGTTTGTGAATGGTGGAAACG
AATCGGCTCGGTGGCAAGTCTACGCTCTCCTTTCCAATCGAAAGGGCGAGCCTTTTACTC
CCTCTCTCTGCCTCCTCTGTTTTCGCTTTCGGTTCCTGCAAAGAAGGCTGGTACTTCCGC
TGCTTCGGCATCGACCCGTGAATCCAATCTCCCCACCACAATAGCCCTAATCTCGATCTG
AGATCTGTTTATTTTTTGTCTTTAAATCACTCGTGAAAATTTGGAAAA*GATGTTGCTTT
ACAACAAGCAGAAGAAGAACCAGAACAACGCAAAGGGAAACAGAATCCTAATCAGCGTTA
CGGTTCTTGGTAGCGCCGGTCCGATCCGGTTCGTTGCTTA

QA 3 462 3 462
DS 

RD RS1GJ16TF 625 0 0
G
ACATCCATTCCATACGTTCTTCTTCCTCTTGCTTCGCGAAACCAAAAAGTGCCTCCTCCT
TGTTCGTTTTCGATCTCAAATTTTGTCTCTCTGCGGAATCGTTTGTGAATGGTGGAAACG
AATCGGCTCGGTGGTAAGTCTACGCTCTCCCTTCCAATCGAAAGGGCGAGCCTTTTACTC
CCTCTCTCTGCCTCCTCTGTTTTCGCTTTCGGTTCCTGCAAAGAAGGCTGGTACTTCCGC
TGCTTCGGCATCGACCCGTGAATCCAATCTCCCCCCCA*AATAGCCCTAATCTCGCTCTT
AGATCTGTTTATTTTTTTTCTTTAAATCACTCTTGAAAATTTCGAAAAAGATGTTGCTTT
ACAACAAGCAGAAGAAGAACCAGAACAACGCAAAGGGAAACAGAATCCTAATCAGCGTTA
CGGTTCTCGGTAGCGCCGGTCCGATCCGGTTCGTTGCTTACGAGGAAGATCTCGTCGCCT
CGGTTATCGATACTGCCCTTAAATGCTACGCTCGCGAAGGTCGTCTTCCTCTTCTCGGAT
CCGATTTCAATGATTTCCTTCTCTATTGCCCCATGGTTGGACCTGAAGCTTTAAGCGCGT
GGAGTGCAATTGGATCGCTTGGTG

QA 2 625 2 625
DS 

RD RS1D315TF 674 0 0
GGAATCACATCCATTCCATACGTTCTTCTTCCTCTTGCTTCGCGAAACCAAAAAGTGCCT
CCTCCTTGTTCGTTTTCGATCTCAAATTTTGTCTCTCTGCGGAATCGTTTGTGAATGGTG
GAAACGAATCGGCTCGGTGGTAAGTCTACGCTCTCCCTTCCAATCGAAAGGGCGAGCCTT
TTACTCCCTCTCTCTGCCTCCTCTGTTTTCGCTTTCGGTTCCTGCAAAGAAGGCTGGTAC
TTCCGCTGCTTCGGCATCGACCCGTGAATCCAATCTCCCCCCCA*AATAGCCCTAATCTC
GCTCTGAGATCTGTTTATTTTTTTTCTTTAAATCACTCTTGAAAATTTCGAAAAAGATGT
TGCTTTACAACAAGCAGAAGAAGAACCAGAACAACGCAAAGGGAAACAGAATCCTAATCA
GCGTTACGGTTCTCGGTAGCGCCGGTCCGATCCGGTTCGTTGCTTACGAGGAAGATCTCG
TCGCCTCGGTTATCGATACTGCCCTTAAATGCTACGCTCGCGAAGGTCGTCTTCCTCTTC
TCGGATCCGATTTCAATGATTTCCTTCTCTATTGCCCCATGGTTGGACCTGAAGCTTTAA
GCGCGTGGAGTGCAATTGGATCGCTTGGTGCAAGGAACTTTACTCTGTGTAGAAACCAGA
GAGAAGAAAGTGGT

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 5

CO CL1462Contig1 755 5 6 U
GAAAGCATTAATTAACAAGGATACATATATTCAACTGATAGACTGAAAATATATGAAACC
TCGAGATTTATCACACGTAATTAACAACATCAAAGCATATCAAAATACCCAAACAGCAAT
ATATTGTAACTGATGAACCATACAAGAGCCCCATTTATTATAACATAATACGAAGGCGCG
CGCACACAAACACACACAAAGGCAGCCATATATAACGGTGGGGGATCTGGTGATGATGGT
TTGAAACGGACTTAGGATTTGATAACGTGGTGATCCATGTCCGCAGCGAGGCTCTTGACG
AACTTCATGTAGTTGATGGGTTCAGGCGAGTCATCGGTTCGCTTCTCCCATATCATAGTG
ACCTTGCAGACTATATCACTAGGCGACTTTTGAATGAACTGAAAGATGACGTCATACACT
TTAAGCTGCTCCATTACGTGACCTTCGAGCCCTTTGAGCGTTACCGCCATATTCTCATCG
TCATTCTCTCTCCTCTCCTTGAACACCTCTTGTTTCCCATCGCATGTGTAGTTCCAAATC
TTGATGGATCCATGAGAGTCCCATTCACCATCGTGGACGGTGACACCTTGAATGAGGTGG
CCAATGGCGTCGGGGAAGAGATGGTTCTCATTCTTCCACCTCTTGTAGTGTTTCTCCGCC
GATCCTTTCAAAGGAACCTCCGTCACATATGTTCCTGACGTCGCCATCTCTGATCTTTCT
TTTTTTTTGTTTTTGTTCTTTTGGCTTTTGAATCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 30 30 30 15 15 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

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AF RS1BJ91TF C 19
AF RS1CU37JQ U 51
AF RS1CU37TF C 51
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TTTTT***GTTTTTGTTCTTTTGGCTTTTGAAT
G

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DS 

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ATATTGTAACTGATGAACCATACAAGAGCCCCATTTATTATAACATAATACGAAGGCGCG
CGCACACAAACACACACAAAGGCAGCCATATATAACGGTGGGGGATCTGGTGATGATGGT
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AACTTCATGTAGTTGATGGGTTCAGGAGAGTCATCGGTTCGCTTCTCCCATATCATAGTG
ACCTTGCAGACTATATCACTAGGCGACTTTTGAATGAACTGAAAGATGACGTCATACACT
TTAAGCTGCTCCATTACGTGACCTTCGAGCCCTTTGAGCGTTACCACCATATTCTCATCG
TCATTCTCTCTCCTCTCCTTGAACACCTCTTGTTTCCCATCGCATGTGTAGTTCCAAATC
TTGATGGATCCATGAGAGTCCCATTCACCATCGTGGACGGTGACACCTTGAATGAGGTGG
CCAATGGCGTCGGGGAAGAGATGGTTCTCATTCTTCCACCTCTTGTAGTGTTTCTCCGCC
GATCCTTTCAAAGGAACCTCCGTCACATATGTTCCTGACGTCGCCATCTCTGATCTTTCT
TT

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CATACAAGAGCCCCATTTATTATAACATAATACGAAGGCGCGCGCACACAAACACACACA
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TTGATAACGTGATGATCCATGTCCGCAGCGAGGCTCTTGACGAACTTCATGTAGTTGATG
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CTAGGCGACTTTTGAATGAACTGAAAGATGACGTCATACACTTTAAGCTGCTCCATTACG
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TTGAACACCTCTTGTTTCCCATCGCATGTGTAGTTCCAAATCTTGATGGATCCATGAGAG
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TTTTGGCTTTTGAATCC

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GTCATACACTTTAAGCTGCTCCATTACGTGACCTTCGAGCCCTTTGAGCGTTACCGCCAT
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CC

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DS 

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CGAAGGCGCGCGCACACAAACACACACAAAGGCAGCCATATATAACGGTGGGGGATCTGG
TGATGATGGTTTGAAACGGACTTAGGATTTGATAACGTGGTGATCCATGTCCGCAGCGAG
GCTCTTGACGAACTTCATGTAGTTGATGGGTTCAGGCGAGTCATCGGTTCGCTTCTCCCA
TATCATAGTGACCTTGCAGACTATATCACTAGGCGACTTTTGAATGAACTGAAAGATGAC
GTCATACACTTTAAGCTGCTCCATTACGTGACCTTCGAGCCCTTTGAGCGTTACCGCCAT
ATTCTCATCGTCATTCTCTCTCCTCTCCTTGAACACCTCTTGTTTCCCATCGCATGTGTA
GTTCCAAATCTTGATGGATCCATGAGAGTCCCATTCACCATCGTGGACGGTGACACCTTG
AATGAGGTGGCCAATGGCGTCGGGGAAGAGATGGTTCTCATTCTTCCACCTCTTGTAGTG
TTTCTCCGCCGATCCTTTCAAAGGAACCTCCGTCACATATGTTCCTGACGTCGCCATCTC
TGATCTTTCTTTTTTTTTGTTTTTGTTCTTTTGGCTTTTGAAT
CC

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 5

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TTGCACATAACCAGCTTCTTGCTCATGCTGCGGCCGTCGATCTTTACAGAACCAAATATA
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GGCTTCCCAACTTCACAGAGGAAGAAGCCGCACTCGTCGCTGGTTCATATGATTTTTTGG
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ACACACTGCCATGATGGACGCAGGCGTAAAGCTCACATATGAGAATTCACGTGGTGAACT
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AAACACTTTTACTCCTCAAGATCATCTCCATGTCTCTCTCTCACTCTTTCTACTTGCTCC
ATAGATAAGGAGCTTCTTCTACCTATAATAATGTAATAAATAAAAAGTCTAAATAAAAAG
ATGAACAACTCATGAAC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RS1FE84TF U 1
AF RS1GS48TF U 464
AF RS1FU49JQ C 560
AF RS1AJ55JQ C 712
AF RS1AJ55TF U 712
BS 1 500 RS1FE84TF
BS 501 501 RS1GS48TF
BS 502 557 RS1FE84TF
BS 558 558 RS1GS48TF
BS 559 567 RS1FE84TF
BS 568 568 RS1GS48TF
BS 569 640 RS1FE84TF
BS 641 641 RS1GS48TF
BS 642 675 RS1FE84TF
BS 676 676 RS1GS48TF
BS 677 693 RS1FE84TF
BS 694 694 RS1GS48TF
BS 695 753 RS1FE84TF
BS 754 889 RS1GS48TF
BS 890 890 RS1AJ55TF
BS 891 1120 RS1GS48TF
BS 1121 1121 RS1AJ55TF
BS 1122 1139 RS1GS48TF
BS 1140 1154 RS1AJ55TF
BS 1155 1157 RS1AJ55JQ

RD RS1FE84TF 768 0 0
GATACACAGTGCCTACAAGAGGCTATTCGATTGGAACAGATGCACCCGGTCGATGTTCTC
CTATGGTTGATACCAAGCACAGGTGTTACGGTGGAAATTCTTCAACAGAACCCTACATCG
TTGCACATAACCAGCTTCTTGCTCATGCTGCGGCCGTCGATCTTTACAGAACCAAATATA
AGTTCCAAAAGGGAAAGATTGGACCTGTGATGATAACAAGATGGTTTCTTCCATATGATG
ATTCTGATCCTGCCTCCATAGAAGCAGCCGAAAGGATGAACCAATTCTTCCATGGATGGT
ACGTGGAGCCGCTAACAAAGGGTAGATATCCAGACATCATGAGACAGATTGTGGGTAGTC
GGCTTCCCAACTTCACAGAGGAAGAAGCCGCACTCGTCGCTGGTTCATATGATTTTTTGG
TCTCAACTATTATGTCGCTCAGTACACCCAGCCGAAACCTAACCCATATCCTTCAGAGAC
ACACACTGCCATGATGGACGGAGGCGTAAAGCTCACATATGAGAATTCACGTGGTGAACT
TATTGGTCCACTGTTCGTTGAAGACAAGGACAACGGCAACAGCTATTACTACCCAAAAGG
GATTTATTACGTAATGGACTACTTTAAAACCAAATACGGCGACCCATTAATCTATGTCAC
CGAGAATGGATTTAGTACCCCCGGTTCAGAAAA*CGTGAGCAAGCTATTGCCGATTACAA
GCGAATTGATTATCTATGCAGCCATCTATGTTT
CTCCGCAACGTCATC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1GS48TF 676 0 0
G
CATATCCTTCAGAGACACACACTGCCATGATGGACGCTGGCGTAAAGCTCACATATGAGA
ATTCACGTGGTGAACTTATTGGTCCACTGTTCGCTGTAGACAAAGACAACGGCAACAGCT
ATTACTACCCAAAAGGGATTTATTACGTAATGGACTACTTTAAAACCAAATACGGCAACC
CATTAATCTATGTCACCGAGAATGGATTTAGCACCCCCGGTTCAGAAAAACGTGAGCAAG
CTATTGCCGATTACAAGCGAATTGATTATCTATGCAGCCATCTATGTTTTCTCCGCAAAG
TCATCAAGGAGAAGGGTGTCAACGTGAGAGGATACTTCGCATGGGCTCTTGGTGATAATT
ATGAATTCTGTAAAGGTTTTACGGTCAGATTTGGACTCAGTTACGTTAATTGGGATGATC
TCGACGACAGAAACCTCAAAGAATCTGGTCAATGGTACCAGAGATTCATTAACGGGACTG
TCAAGAATCCTGCAAAACAAGATTTCCTCCGCTCAAGCCTCTCTTCCCAGAGTCAGAAGA
GGCTTGCTGATGCATGAAACACTTTTACTCCTCAAGATCATCTCCATGTCTCTCTCTCAC
TCTTTCTACTTGCTCCATAGATAAGGAGCTTCTTCTACCTATAATAATGTAATAAA*AAA
AAGTCTAAATAAAAA

QA 2 676 2 676
DS 

RD RS1FU49JQ 595 0 0
GA
AGACAAAGACAACGGCAACAGCTATTACTACCCAAAAGGGATTTATTACGTAATGGAATA
CTTTAAAACCAAATACGGCAACCCATTAATCTATGTCACCGAGAATGGATTTAGCACCCC
CGGTTCAGAAAAACGTGAGCAAGCTATTGCCGATTACAAGCGAATTGATTATCTATGCAG
CCATCTATGTTTTTTCCGCAAAGTCATCAAGGAGAAGGGTGTCAACGTGAGAGGATACTT
CGCATGGGCTCTTGGTGATAATTATGAATTCTGTAAAGGTTTTACGGTCAGATTTGGACT
CAGTTACGTTAATTGGGATGATCTCGACGACAGAAACCTCAAAGAATCTGGTCAATGGTA
CCAGAGATTCATTAACGGGACTGTCAAGAATCCTGCAAAACAAGATTTCCTCCGCTCAAG
CCTCTCTTCCCAGAGTCAGAAGAGGCTTGCTGATGCATGAAACACTTTTACTCCTCAAGA
TCATCTCCATGTCTCTCTCTCACTCTTTCTACTTGCTCCATAGATAAGGAGCTTCTTCTA
CCTATAATAATGTAATAAA*AAAA*GTCTAAATAAAAATATGATCAACTCATG

QA 3 595 3 595
DS 

RD RS1AJ55JQ 446 0 0
G
GATTACAAGCGAATTGATTATCTATGCAGCCATCTATGTTTTCTCCGCAAAGTCATCAAG
GAGAAGGGTGTCAACGTGAGAGGATACTTCGCATGGGCTCTTGGTGATAATTATGAATTC
TGTAAAGGTTTTACGGTCAGATTTGGACTCAGTTACGTTAATTGGGATGATCTCGACAAC
GGAAACCTCAAAGGATCTGGTCAATGGTACCAGAGATTCATTAACGGGACTGTCAAGAAT
CCTGCAAAACAAGATTTCCTCCGCTCAAGCCTTTCTTCCCAGAGTCAGAAGAGGCTTGCT
GATGCATGAAACACTTTTACTCCTCAAGATTATCTCCATGTCTCTCTC**ACTCTTTCTA
CTTGCTCCATAGATAAGGAGCTTCTTCTACCTATAATAATGTAATAAATAAAAAGTCTAA
ATAAAAAGATGAACAACTCATGAAC

QA 2 446 2 446
DS 

RD RS1AJ55TF 446 0 0
G
GATTACAAGCGAATTGATTATCTATGCAGCCATCTATGTTTTCTCCGCAAAGTCATCAAG
GAGAAGGGTGTCAACGTGAGAGGATACTTCGCATGGGCTCTTGGTGATAATTATGAATTC
TGTAAAGGTTTTACGGTCAGATTTGGACTCAGTTACGTTAATTGGGATGATCTCGACAAC
GGAAACCTCAAAGGATCTGGTCAATGGTACCAGAGATTCATTAACGGGACTGTCAAGAAT
CCTGCAAAACAAGATTTCCTCCGCTCAAGCCTTTCTTCCCAGAGTCAGAAGAGGCTTGCT
GATGCATGAAACACTTTTACTCCTCAAGATTATCTCCATGTCTCTCTC**ACTCTTTCTA
CTTGCTCCATAGATAAGGAGCTTCTTCTACCTATAATAATGTAATAAATAAAAAGTCTAA
ATAAAAAGATGAACAACTCATG
AAC

QA 2 443 2 443
DS 



AS 1 5

CO CL1464Contig1 571 5 4 U
GGGCGTTCACCCCGAAAGGCCTCTCTCTACCTATTAACCCGGCGAGATCTGCAACTCTTC
CCGGCGTGGAGAAAAAA*TGGTAGCGGCAAAGAAGACGAAGAAGTCCCATGAAGGAATCA
ACAGCAGATTAGCTCTGGTCATGAAGAGTGGAAAGTACACTCTCGGCTACAAATCTGTTC
TCAAATCCCTTCGCAGCTCCAAAGGTAAGTTGATTCTGATCTCGAGCAACTGCCCTCCGT
TGAGGAGATCAGAGATCGAGTACTACGCTATGCTTGCTAAAGTCGGTGTTCATCATTACA
ATGGCAACAATGTCGATTTGGGTACTGCTTGTGGAAAGTACTTCCGTGTCTCTTGCCTCA
GCATCGTTGATCCTGGTGATTCCGACATCATCAAGTCACTTCCTGGCGACCAGTGATTTT
TGATTTTGTTGGGTTGTTACGGTCTTAGCCATGTTTTGTTTGATTTTATGCAATGTGTTC
TTGGAAAAGACAGAATGTGTTTGGTTTCTTAAACAAACTCCTTAATTACAGTTTCGTCTC
TACTGATGGAACCAGTTGCATGAATGAAACT


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FF62TF U 1
AF RS1GZ25JQ C 3
AF RS1GZ25TF U 3
AF RS1FF62JQ C 67
AF RS1CU59TF U 2
BS 1 77 RS1FF62TF
BS 78 78 RS1GZ25TF
BS 79 514 RS1FF62TF
BS 515 571 RS1CU59TF

RD RS1FF62TF 514 0 0
GGGCGTTCACCCCGAAAGGCCTCTCTCTACCTATTAACCCGGCGAGATCTGCAACTCTTC
CCGGCGTGGAGAAAAAAATGGTAGCGGCAAAGAAGACGAAGAAGTCCCATGAAGGAATCA
ACAGCAGATTAGCTCTGGTCATGAAGAGTGGAAAGTACACTCTCGGCTACAAATCTGTTC
TCAAATCCCTTCGCAGCTCCAAAGGTAAGTTGATTCTGATCTCGAGCAACTGCCCTCCGT
TGAGGAGATCAGAGATCGAGTACTACGCTATGCTTGCTAAAGTCGGTGTTCATCATTACA
ATGGCAACAATGTCGATTTGGGTACTGCTTGTGGAAAGTACTTCCGTGTCTCTTGCCTCA
GCATCGTTGATCCTGGTGATTCCGACATCATCAAGTCACTTCCTGGCGACCAGTGATTTT
TGATTTTGTTGGGTTGTTACGGTCTTAGCCATGTTTTGTTTGATTTTATGCAATGTGTTC
TTGGAAAAGACAGAATGTGTTTGGTTTCTTAAAC

QA 1 514 1 514
DS 

RD RS1GZ25JQ 512 0 0
GG
GTTCACCCCGAAAGGCCTCTCTCTACCTATTAACCCGGCGAGATCTGCAACTCTTCCCGG
CGTGGAGAAAAAA*TGGTAGCGGCAAAGAAGACGAAGAAGTCCCATGAAGGAATCAACAG
CAGATTAGCTCTGGTCATGAAGAGTGGAAAGTACACTCTCGGCTACAAATCTGTTCTCAA
ATCCCTTCGCAGCTCCAAAGGTAAGTTGATTCTGATCTCGAGCAACTGCCCTCCGTTGAG
GAGATCAGAGATCGGGTACTACGCTATGCTTGCTAAAGTCGGTGTTCATCATTACAATGG
CAACAATGTCGATTTGGGTACTGCTTGTGGAAAGTACTTCCGTGTCTCTTGCCTCAGCAT
CGTTGATCCTGGTGATTCCGACATCATCAAGTCACTTCCTGGCGACCAGTGATTTTTGAT
TTTGTTGGGTTGTTACGGTCTTAGCCATGTTTTGTTTGATTTTATGCAATGTGTTCTTGG
AAAAGACAGAATGTGTTTGGTTTCTTAAAC

QA 3 512 3 512
DS 

RD RS1GZ25TF 512 0 0
GG
GTTCACCCCGAAAGGCCTCTCTCTACCTATTAACCCGGCGAGATCTGCAACTCTTCCCGG
CGTGGAGAAAAAA*TGGTAGCGGCAAAGAAGACGAAGAAGTCCCATGAAGGAATCAACAG
CAGATTAGCTCTGGTCATGAAGAGTGGAAAGTACACTCTCGGCTACAAATCTGTTCTCAA
ATCCCTTCGCAGCTCCAAAGGTAAGTTGATTCTGATCTCGAGCAACTGCCCTCCGTTGAG
GAGATCAGAGATCGGGTACTACGCTATGCTTGCTAAAGTCGGTGTTCATCATTACAATGG
CAACAATGTCGATTTGGGTACTGCTTGTGGAAAGTACTTCCGTGTCTCTTGCCTCAGCAT
CGTTGATCCTGGTGATTCCGACATCATCAAGTCACTTCCTGGCGACCAGTGATTTTTGAT
TTTGTTGGGTTGTTACGGTCTTAGCCATGTTTTGTTTGATTTTATGCAATGTGTTCTTGG
AAAAGACAGAATGTGTTTGGTTTCTTAAAC

QA 3 512 3 512
DS 

RD RS1FF62JQ 448 0 0
TGGAGA
AAAAAATGGTAGCGGCAAAGAAGACGAAGAAGTCCCATGAAGGAATCAACAGCAGATTAG
CTCTGGTCATGAAGAGTGGAAAGTACACTTTCGGCTACAAATCTGTTCTCAAATCCCTTC
GCAGCTCCAAAGGTAAGTTGATTCTGATCTCGAGCAACTGCCCTCCGTTGAGGAGATCAG
AGATCGAGTACTACGCTATGCTTGCTAAAGTCGGTGTTCATCATTACAATGGCAACAATG
TCGATTTGGGTACTGCTTGTGGAAAGTACTTCCGTGTCTCTTGCCTCAGCATCGTTGATC
CTGGTGATTCCGACATCATCAAGTCACTTCCTGGCGACCAGTGATTTTTGATTTTGTTGG
GTTGTTACGGTTTTAGCCATGTTTTGTTTGATTTTATGCAATGTGTTCTTGGAAAAGACA
GAATGTGTTTGGTTTCTTAAAC

QA 7 448 7 448
DS 

RD RS1CU59TF 570 0 0
GGC
GTTCACCCCGAAAGGCCTCTCA**ACCTATTAACCCGGCGAGATCTGCAACTCTTCCCGG
CGTGGAGAAAAAA*TGGTAGCGGCAAAGAAGACGAAGAAGTCCCATGAAGGAATCAACAG
CAGATTAGCTCTGGTCATGAAGAGTGGAAAGTACACTCTCGGCTACAAATCTGTTCTCAA
ATCCCTTCGCAGCTCCAAAGGTAAGTTGATTCTGATCTCGAGCAACTGCCCTCCGTTGAG
GAGATCAGAGATCGAGTACTACGCTATGCTTGCTAAAGTCGGTGTTCATCATTACAATGG
CAACAATGTCGATTTGGGTACTGCTTGTGGAAAGTACTTCCGTGTCTCTTGCCTCAGCAT
CGTTGATCCTGGTGATTCCGACATCATCAAGTCACTTCCTGGCGACCAGTGATTTTTGGT
TTTGTTCGGTTGTTACGGTCTTAGCCATGTTTTGTTTGATTTTATGCAATGTATTCTTGG
AAAAGACAGAATGTGTTTGGTTTCTTTCTTAAACTCCTTAATTACAGTTTCGTCTCTACT
GATGGAACCAGTTGCATGAATGAAACT

QA 4 570 4 570
DS 



AS 2 4

CO CL1465Contig1 796 2 19 U
GGGAGGTGAGAAGAGTTTATGGTTTCTAGATTACAGTAAACGCCTTCCTTTCTCTCTCTC
TCGCCGCAAAGACCTCTCCAGTGTCTTCCTCCTCCCAAAGAGCTTAGAGAAAGATGGATC
ATATGTACAAGAGCCAACTGCAGTCATATGCCATGAAACAAAATATGGAGCTTCCCGTCT
ATGCCGCTGAGCGACAAGGACCTGCTCATGCTCCGCGATTCCGCTGTAAGGTCACTGTTT
TCGGACAGACTTTTCAGAGCCTAGAATTATGTCCTACACTAAAAGCGGCTGAACATGCTG
CTGCAAAAGTAGCATTGGCTTCGTTGACTCCACTTAATCCAGAGGGAGTTGTTGATCTTG
CTTACAAGAACCTGTTACAAGAAATTGCACAGAAAGAAAACTCTCTTTTACCAGTTTATG
CTACTTCTACATCTGGTCCCTCGCATTCACCTACGTTCACCTCAACGGTTGAGTTTGCGG
GAAATGTCTACAAAGGAGAAGAAGCAAAAAAAAAAAAAATTGGCTGAAATGAATGCTGCC
AAGATTGCATTCATGTGTATAAAATATGGACAACCAAACCAGACTCCATCGCCTTCTTTG
CCTTGTGAGAAACAAGAAGCTGCAAACTCAAATGTGAAGAGCAGTGAACAAGTGAGCCCT
TCCCTACCTTCCAAGATGGTGACCCCTGATGTCCCATCAAAGTGGATTGAAGTGTACGAA
GATGACTTGCAGACGTTCTTAATGCACCAGTCATAGTGTTAAGACACAAATATTGCTGCC
TCGCCTGTGGCTACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DC07TF U 61
AF RS1CW61TF U 1
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BS 270 373 RS1CW61TF
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BS 520 543 RS1CW61TF
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BS 628 719 RS1CW61TF
BS 720 720 RS1DC07TF
BS 721 796 RS1CW61TF

RD RS1DC07TF 665 0 0
GGA
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CAAAAGTAGCATTGGCTTCGTTGACTCCACTTAATCCAGAGGGAGTTGTTGATCTTGCTT
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TGTGAGAAACAAGAAGCTGCAAACTCAAATGTGAAGAGCAGTGAACAAGTGAGCCCTTCC
CTACCTTCCAAGATGGTGACCCCTGATGTCCCATCAAAGTGGATTGAAGTGTACGAAGAT
GA

QA 4 665 4 665
DS 

RD RS1CW61TF 796 0 0
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ATATGTACAAGAGCCAACTGCAGTCATATGCCATGAAACAAAATATGGAGCTTCCCGTCT
ATGCCGCTGAGCGACAAGGACCTGCTCATGCTCCGCGATTCCGCTGTAAGGTCACTGTTT
TCGGACAGACTTTTCAGAGCCTAGAATTCTGTCCTACACTAAAAGCGGCTGAACATGCTG
CTGCAAAAGTAGCATTGGCTTCGTTGACTCCACTTAATCCAGAGGGAGTTGTTGATCTTG
CTTACAAGAACCTTTTACAAGAAATTGCGCAGAAAGAAAACTCTCTTTTACCAGTTTATG
CTACTTCTACATCTGGTCCCTCGCATTCACCTACGTTCACCTCAACGGTTGAGTTTGCGG
GAAATGTCTACAAAGGAGAAGAAGCAAAAACAAAAAAA*TTGGCTGAAATGAATGCTGCC
AAGGTTGCATTCATGTGTATAAAATATGGACAACCAAACCAGACTCCATCGCTTTCTTTG
CCTTGTGAGAAACAAGAAGCTGCAAATTCAAATGTGAAGAGCAGTGAACAAGTGAGCCCT
TCCCTACCTTCCAAGATGGTGACCCCTGATGTCCCATCAAAGTGGATTGAAGTGTACGA*
GATGACTTGCAGACGTTCTTAATGCACCAGTCATAGTGTTAAGACACAAATATTGCTGCC
TCGCCTGTGGCTACTC

QA 1 796 1 796
DS 



CO CL1465Contig2 870 2 4 U
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AACATTCGCCGTTACTAGGGTCACACACACACATCCGAAAAAACCTGCCTCTGACCTTAG
TTTATTCCATCCATCGCAACAACTCGAAGCACACAGAAAAATAGTAGACTAGTAGGGGAG
GCACGAGCTGTTTTTAGTGCTTCAGGACACGATAAGAAATGAATCTGTCGTCTCTAAACA
TCATCTCCGAATCTTCGGGAAGAGTCATATCTGGGTTCCATGGTCGACATACTACATGTT
GGCCACCTGGAATACTCCGGTACCCACTTCCCATTACCAGCTTCTTCTCACTTGATTCAT
TATCATCATTGTTTGTTGGTTTCTGAGACAAGTCAGCAGCATCAGCGTTCATCTCCATAG
CATTGGTAGCTGGTGCAACTGTAAGATTAGCCACAGGCGACGCAGTAATGTTTGTGTCCT
TAACACTATTGGCTGGTGCATTAAGAACGTCTGGGAGTTCATCTTCGTACACTTCAATAC
ACTTTGATGGGACATCAGGGGTCACCATCTTGGAAGGTAGGGAAGGGCTCACTTGTTCAC
TGCTCTTCACATTTGAGTTTGCAGCTTCTTGTTTCTCACAAGGCAAAGAAGGCGATGGAG
TCTGGTTTGGTTGTCCATATTTTATACACATGAATGCAATCTTGGCAGCATTCATTTCAG
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AGTTTTCTTTCTGCGCAATTTCTTGTAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DC07JQ U 1
AF RS1CU32TF C 253
BS 1 538 RS1DC07JQ
BS 539 539 RS1CU32TF
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BS 732 870 RS1CU32TF

RD RS1DC07JQ 735 0 0
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GCACGAGCTGTTTTTAGTGCTTCAGGACACGATAAGAAATGAATCTGTCGTCTCTAAACA
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GGCCACCTGGAATACTCCGGTACCCACTTCCCATTACCAGCTTCTTCTCACTTGATTCAT
TATCATCATTGTTTGTTGGTTTCTGAGACAAGTCAGCAGCATCAGCGTTCATCTCCATAG
CATTGGTAGCTGGTGCAACTGTAAGATTAGCCACAGGCGACGCAGTAATGTTTGTGTCCT
TAACACTATTGGCTGGTGCATTAAGAACGTCTGGGAGTTCATCTTCGTACACTTCAATCC
ACTTTGATGGGACATCAGGGGTCACCATCTTGGAAGGTAGGGAAGGGCTCACTTGTTCAC
TGCTCTTCACATTTGAGTTTGCAGCTTCTTGTTTCTCACAAGGCAAAGAAGGCGATGGAG
TCTGGTTTGGTTGTCCATATTTTATACACATGAATGCAATCTTGGCAGCATTCATTTCAG
CCAATTTTTTT
TTTT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RS1CU32TF 618 0 0
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GTGCAACTGTAAGATTAGCCACAGGCGACGCAGTAATGTTTGTGTCCTTAACACTATTGG
CTGGTGCATTAAGAACGTCTGGGAGTTCATCTTCGTACACTTCAATACACTTTGATGGGA
CATCAGGGGTCACCATCTTGGAAGGTAGGGAAGGGCTCACTTGTTCACTGCTCTTCACAT
TTGAGTTTGCAGCTTCTTGTTTCTCACAAGGCAAAGAAGGCGATGGAGTCTGGTTTGGTT
GTCCATATTTTATACACATGAATGCAATCTTGGCAGCATTCATTTCAGCCAATTTTTTTG
TTTTTGCTTCTTCTCCTTTGTAGACATTTCCCGCAAACTCAACCGTTGAGGTGAACGTAG
GTGAATGAGAGGGACCAGATGTAGAAGTAGCATAAACTGGTAAAAGAGAGTTTTCTTTCT
GCGCAATTTCTTGTAACC

QA 1 618 1 618
DS 



AS 1 5

CO CL1466Contig1 547 5 8 U
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CG*AATTCTCAAGAGAAAATGTCTTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGCGGAGCTGGCTGC
AAGTGCGTTGGATGCGGAGGTTGCAAAATGTACCCAGACTTGAGCTTCTCCGGCGAGACC
ACCACCACCGAGACTCTTGTCCTCGGCGTTGCTCCGTCGATGAACTCTCAGTTCGAGGCT
ACCGGCGAGACTTTCGTTGCCGAGAACGATGCCTGCAAATGCGGATCTGACTGCAAGTGC
AACCCTTGCACCTGCAAATAGATAACCACATAAACCCCTAAGAGTCTTGCAATAAACCTT
TATGTTATGTGTAATAATAATGGCTGATTTCTCCGGTTGTTTTGCCGGCGACAGTGAGTC
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TCTGACTATTAAATAAGCCAAAAGTATTATGGGTCTGAGTATTAGTTTCATTCAGATATT
TAAAAGC


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 

AF RS1E221JQ C 1
AF RS1GO55TF U 2
AF RS1E221TF U 1
AF RS1AE47JQ C 2
AF RS1AE47TF U 92
BS 1 1 RS1E221JQ
BS 2 147 RS1GO55TF
BS 148 148 RS1E221TF
BS 149 428 RS1GO55TF
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ACCACCACCGAGACTCTTGTCCTCGGCGTTGCTCCGTCGATGAACTCTCAGTTCGAGGCT
ACCGGCGAGACTTTCGTTGCCGAGAACGATGCCTGCAAATGCGGATCTGACTGCAAGTGC
AACCCTTGCACCTGCAAATAGATAACCACATAAACCCCTAAGAGTCTTGCAATAAACCTT
TATGTTATGTGTAATAATAATGGCTGATTTCTCCGGTTGTTTTGCCGGCGACAGTGAGTC
TTGTTCTTCTGTGTCTGTTGTTATGGTTTGGTCATGAGATATCTCTGTAAGTTTTATCTT
TCTGACTATTAAATAAGCCAAAAGTATTATGGGTCTGAGTATT
TAGTTTC

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DS 

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ACCCTTGCACCTGCAAATAGATAACCACATAAACCCCTAAGAGTCTTGCAATAAACCTTT
ATGTTATGTGTAATAATAATGGCTGATTTCTCCGGTTGTTTTGCCGGCGACAGTGAGTCT
TGTTCTTTTGTGTCTGTTGTTATGGTTTGGTCATGAGATATCTCTGTAAGTTTTATCTTT
CTGACTATTAAATAAGCCAAAAGTAT

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DS 

RD RS1E221TF 530 0 0
G
GGATTCGCTAACTGTTTTAAAAATCTTCTTCTTCAAGGCAAATTAATATCTTCTATCTTC
G*AATTCTCAAGAGAAAATGTCTTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGCGGAGCTGGCTGCA
AGTGCGTTGGATGCGGAGGTTGCAAAATGTACCCAGACTTGAGCTTCTCCGGCGAGACCA
CCACCACCGAGACTCTTGTCCTCGGCGTTGCTCCGTCGATGAACTCTCAGTTCGAGGCTA
CCGGCGAGACTTTCGTTGCCGAGAACGATGCCTGCAAATGCGGATCTGACTGCAAGTGCA
ACCCTTGCACCTGCAAATAGATAACCACATAAACCCCTAAGAGTCTTGCAATAAACCTTT
ATGTTATGTGTAATAATAATGGCTGATTTCTCCGGTTGTTTTGCCGGCGACAGTGAGTCT
TGTTCTTCTGTGTCTGTTGTTATGGTTTGGTCATGAGATATCTCTGTAAGTTTTATCTTT
CTGACTATTAAATAAGCCAAAAGTATTATGGGTCTGAGTATT
TAGTTTC

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DS 

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GCAATTCTCAAGAGAAAATGTCTTGCTGTGGAGGAAACTGTGGTTGCGGAGCTGGCTGCA
AGTGCGTTGGATGCGGAGGTTGCAAAATGTACCCAGACCTGAGCTTTTCCGGCGAGACCA
CCACCACCGAGACTTTCGTCCTCGGCGTTGCTCCGTCGATGAACTCTCAGTTCGAGGCTT
CCGGCGAGACTTTCGTTGCCGAGAACGATGCCTGCAAATGCGGATCTGACTGCAAGTGCA
ACCCTTGCCCCTGCAAATAGATAACCACATAAACCCCTAAGAGTCTTGCAATAAACCTTT
ATGTTATGTGTAATAATAATGGCTGATTTCTCCGGTTGTTTTGCCGGCGACAGTGAGTCT
TGTTCTTCTGTGTCTGTTGTTATGGTTTGGTCATGAGATATCTCTGTAAGTTTTATCTTT
GTGACTATTAA*TAAGCCAAAAGTATTATGGGTCTGAGTATTAGTTTCATTCAGATATTT
AAAAG

QA 1 545 1 545
DS 

RD RS1AE47TF 456 0 0
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ACCCAGACCTGAGCTTCTCCGGCGAGACCACCACCACCGAGACTCTCGTCCTCGGCGTTG
CTCCGTCGATGAACTCTCAGTTCGAGGCTTCCGGCGAGACTTTCGTTGCCGAGAACGATG
CCTGCAAATGCGGATCTGACTGCAAGTGCAACCCTTGCACCTGCAAATAGATAACCACAT
AAACCCCTAAGAGTCTTGCAATAAACCTTTATGTTATGTGTAATAATAATGGCTGATTTC
TCCGGTTGTTTTGCCGGCGACAGTGAGTCTTGTTCTTCTGTGTCTGTTGTTATGGTTTGG
TCATGAGATATCTCTGTAAGTTTTATCTTTGTGACTATTAA*TAAGCCAAAAGTATTATG
GGTCTGAGTATTAGTTTCATTCAGATATTTAAAAGC

QA 1 456 1 456
DS 



AS 1 4

CO CL1467Contig1 979 4 18 U
GGCAGAAGAAGAAGAAGCAAGCTTCTTTCACTCATCAGACACAACAATGATCTTACCAAT
GAAACTTCTTCATCCTCTCCATCACTCTCTCTCTTCCTCCATTCCTTTTCAATCAAGAAG
AAGGCAATCCAAATCTTACCGGTGCTCGTTACCCTCTCCCGGCGGCGAAAAGATCATCAG
ACCAGAGACCGTTGTTTCTCCGGCGCCACCGGTGAGCTACGAAGGAAGAAGAGTTTTACT
TGGATGTCTCCTCTCCGCTGCGTCTGGGATTCTGTTAACTGATTCATCCGAGGCCGTAAG
CACCAGTAGAAGAGCTCTACGTGCATCTAAGATACCTGACAGCGAGTTTACTACTCTCCC
CAATGGTCTCAAGTACTATGATATAAAAGTTGGCAATGGAGCAGAGGCTGTGAAAGGATC
TCGGGTCGCAGTCCACTATGTTGCAAAATGGAAAGGGATAACGTTCATGACAAGTCGACA
AGGACTTGGCGTTGGAGGTGGAACGCCTTACGGGTTTGACGTTGGACAATCAGAGAACGG
GAATGTTCTCAAAGGACTTGACCTTGGCGTTGAAGGGATGCATGTAGGCGGTCAGAGACT
GGTGATTGTTCCTCCCGAGCTTGCTTACGGAAAGAAAGGAGTGCAAGAGATTCCTCCTAA
CGCAACAATCGAGCTTGACATTGAGCTATTATCAATCAAGCAGAGTCCTTTCGGGACGCC
AGTGAAGATCGTTGAAGGATAAGATACTAATAAGAAGCGAGAAATGGATCCAGAGCTATG
GAAGCTTCATCTGTATCAGAAGAATCTGTTTAATGATACCGGCTAGTCTGGATTCATACC
CACTTCTCATCTCTTGTTCTTCTATTAGTACATGTTTGTTGTGCTTTGCAAAAACATCAG
ACTCGGTTCAATCCCATAAGCCGATAAGATACTTTACTTATGGTTCGAATATAAAATCTA
GGCTGGAACCTTTTTACAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 10 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1AT09TF U 11
AF RS1CL79TF U 1
AF RS1CL79JQ C 206
AF RS1CD96JQ C 331
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BS 520 520 RS1AT09TF
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RD RS1AT09TF 721 0 0
GG
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TCCTCTCCATCACTCTCTCTCTTCCTCCATTCCTTTTCAATCAAGAAGAAGGCAATCCAA
ATCTTACCGGTGCTCGTTACCCTCTCCCGGCGGCGAAAAGATCATCAGACCAGAGACCGT
TGTTTCTCCGGCGCCACCGGTGAGCTACGAAGGAAGAAGAGTTTTACTTGGATGTCTCCT
CTCCGCTGCGTCTGGGATTCTGTTAACTGATTCATCCGAGGCCGTAAGCACCAGTAGAAG
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CCACTATGTTGCAAAATGGAAAGGGATAACGTTCATGACAAGTCGACAAGGACTTGGCGT
TGGAGGTGGAACGCCTTACGGGTTTGACGTTGGACAATCAGAGAACGGGAATGTTCTCAA
AGGACTTGACCTTGGCGTTGAAGGGATGCATGTAGGCGGTCAGAGACTGGTGATTGTTCC
TCCCGAGCTTGCTTACGGAAAGAAAGGAGTGCAAGAGATTCCTCCTAACGCA*CAATCGA
GCTTGACATTGAGCTATTATCAATCAAGCAGAGTCCTTTCGG*ACGCCAGTGA
GATCGT

QA 3 715 3 715
DS 

RD RS1CL79TF 808 0 0
GGCAGAAGAAGAAGAAGCAAGCTTCTTTCACTCATCAGACACAACAATGATCTTACCAAT
GAAACTTCTTCATCCTCTCCATCACTCTCTCTCTTCCTCCATTCCTTTTCAATCAAGAAG
AAGGCAATCCAAATCTTACCGGTGCTCGTTACCCTCTCCCGGCGGCGAAAAGATCATCAG
ACCAGAGACCGTTGTTTCTCCGGCGCCACCGGTGAGCTACGAAGGAAGAAGAGTTTTACT
TGGATGTCTCCTCTCCGCTGCGTCTGGGATTCTGTTAACTGATTCATCCGAGGCCGTAAG
CACCAGTAGAAGAGCTCTACGTGCATCTAAGATACCTGACAGCGAGTTTACTACTCTCCC
CAATGGTCTCAAGTACTATGATATAAAAGTTGGCAATGGAGCAGAGGCTGTGAAAGGATC
TCGGGTCGCAGTCCACTATGTTGCAAAATGGAAAGGGATAACGTTCATGACAAGTCGACA
AGGACTTGGCGTTGGAGGTGGAACGCCTTACGGGTTTGATGTTGGACAATCAGAGAACGG
GAATGTTCTCAAAGGACTTGACCTTGGCGTTGAAGGGATGCATGTAGGCGGTCAGAGACT
GGTGATTGTTCCTCCCGAGCTTGCTTACGGAAAGAAAGGAGTGCAAGAGATTCCTCCTAA
CGCAACAATCGAGCTTGACATTGAGCTATTATCA*TCAAGCAGAGTCCTTTCGGGACGCC
AGTGAAGATCGTTGAAG*ATA*GATACTAATA*GAAGCGAGAAATGGATC*AGAGCTATG
GA*GCT*CATCTGTATCAGAAGA
TCTGT

QA 1 803 1 803
DS 

RD RS1CL79JQ 774 0 0
CCACCGGTGAGCTACGAAGGAAGAAGAGTTTTACTTGGATGTCTCCTCTCCGCTGCGTCT
GGGATTCTGTTAACTGATTCATCCGAGGCCGTAAGCACCAGTAGAAGAGCTCTACGTGCA
TCTAAGATACCTGACAGCGAGTTTACTACTCTCCCCAATGGTCTCAAGTACTATGATATA
AAAGTTGGCAATGGAGCAGAGGCTGTGAAAGGATCTCGGGTCGCAGTCCACTATGTTGCA
AAATGGAAAGGGATAACGTTCATGACAAGTCGACAAGGACTTGGCGTTGGAGGTGGAACG
CCTTACGGGTTTGATGTTGGACAATCAGAGAACGGGAATGTTCTCAAAGGACTTGACCTT
GGCGTTGAAGGGATGCATGTAGGCGGTCAGAGACTGGTGATTGTTCCTCCCGAGCTTGCT
TACGGAAAGAAAGGAGTGCAAGAGATTCCTCCTAACGCAACAATCGAGCTTGACATTGAG
CTATTATCAATCAAGCAGAGTCCTTTCGGGACGCCAGTGAAGATCGTTGAAGGATAAGAT
ACTAATAAGAAGCGAGAAATGGATCCAGAGCTATGGAAGCTTCATCTGTATCAGAAGAAT
CTGTTTAATGATACCGGCTAGTCTGGATTCATACCCACTTCTCATCTCTTGTTCTTCTAT
TAGTACATGTTTGTTGTGCTTTGCAAAAACATCAGACTCGGTTCAATCCCATAAGCCGAT
AAGATACTTTACTTATGGTTCGAATATAAAATCTAGGCTGGAACCTTTTTACAG

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DS 

RD RS1CD96JQ 649 0 0
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TGGCAATGGAGCAGAGGCTGTGAAAGGATCTCGGGTCGCAGTCCACTATGTTGCAAAATG
GAAAGGGATAACGTTCATGACAAGTCGACAAGGACTTGGCGTTGGAGGTGGAACGCCTTA
CGGGTTTGACATTGGACAATCAGAGAACGGGAATGTTCTCGGAGGACTTGACCTTGGCGT
TGAAGGGATGCATGTAGGCGGTCAGAGACTGGTGATTGTTCCTCCCGAGCTTGCTTACGG
AAAGAAAGGAGTGCAAGAGATTCCTCCTAACGCAACAATCGAGCTTGACACTGAGCTCTT
ATCAATCAAGCAGAGTCCTTTCGGGACGCCAGTGAAGATCGTTGAAGGCTAAGATACTAA
TAAGAAGCGAGAAATGGATCCAGAGCTATGGAAGCTTCATCTGTATCAGAAGAATCTGTT
TAATGATACCGGCTAGTCTGGATTCATACCCACTTCTCATCTCTTGTTCTTCTATTAGTA
CATGTTTGTTGTGCTTTGCAAAAACATCAGACTCGGTTCAATGCCATAAGCCGATAAGAT
ACTTTACTTATGGTTCGAATATAAAATCTAGGCTGGAACCTTTTTACAG

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 5

CO CL1468Contig1 996 5 18 U
GCTAAACTCAAAGTTGAATATATGGCAAAAACAAGTATATATTATATATCCACACTATAA
TCAACTCCAAATTTTAGGGGAAAATACATCCAAAAAATCATACAAACCGGCCTTTTCTTC
ACTTATCCTCCTCAAGCTAGCTACACAGCACTATCACTCGGTAAGGAGGAGGAAGTAAAG
GTTATCAGCTCGATGCTAAAATCTGTTAATCCTCTGTGACAAATCTAGCGTGCTCCATCC
CAGGAGGTGATAAAGGAGGGATAGCTGATTCAGTTCCTAGAAGGGGCCTTGCTGAAACGC
CCTGAGACTCCTTTTCCTTTGAAGGAAGGGAATCAGATGAAGAGTTGCTTTTGTTCATTG
ATGCTAAGAACTGTTTCTTTGAAAGATTTGTTGAAGCTGATGAGACAACCGAGCTGAACA
CACCAGACTCTTTCAATGCTTGTATAACAACCATTGGTGAATAAATGCGAGTCAGAATAC
CCTTCCTAAGGAGTTTCATCTTCACCTCTTTGTCTCCCCACACAACATGTTCACGGTACC
AGCTTATCATTTCATCTTCAGTTGCTGTTGACGCAATTATAAATGCAGATCTATCGAAAT
CCAACATAAAGCATCTTTTCACGTCTTCTTTTGTAGGCTTGCAGCCACATCGGTCACGCC
TGGATGTTAGGTCAGAGAACTTGGCATATGTGTAGTGTAAGACAGCAGCCT*CCTCCAGT
TTTATCTCATTGGGAGTTTTCATGTAATTATGCCATCTGTGTGCTCCATTTGGTCGGAGG
TGGTCTTGAACCCGAGCAACTGATTTGCCGTTTCCATAAGTCAAGAAGTAGTTTGGATTG
TTTCGGGTTGCTTCTTTGTACATTCCAAAATATGTATCTTTTGGAAGATGGTCATAGTTC
TTTTTAAACATTGACACCTCTGTGAAAGGATCCTTGATATCATCTCTTTCTACGCTGCTT
TCATAATTTGGGAAAATAACCATATCCAAATTTGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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G
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CTTCTTTTGTAGGCTTGCAGCCACATCGGTCACGCCTGGATGTTAGGTCAGAGAACTTGG
CATATGTGTAGTGTAAGACAGCAGCCT*CCTCCAGTTTTATCTCATTGGGAGTTTTCATG
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TTGC

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A
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TTTTGTAGGCTTGAAGCCACATCGGTCACGCCTGGATGTTAGGTCAGAGAACTTGGCATA
TGTGTAGTGTAAGACAGCAGCCT*CCTCCAGTTTTATCTCATTGGGAGTTTTCATGTAAT
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C

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T
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DS 



AS 1 5

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TCTGTGGTGGTAGTGCCTACCCTAGGGATTGGGATTACGCTAGATTGAGAGCTGTTGCCG
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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AR95TFB U 1
AF RS1CE82TF U 219
AF RS1CE82JQ C 541
AF RS1AR95JQ C 491
AF RS1ES01TF U 681
BS 1 237 RS1AR95TFB
BS 238 238 RS1CE82TF
BS 239 289 RS1AR95TFB
BS 290 290 RS1CE82TF
BS 291 361 RS1AR95TFB
BS 362 362 RS1CE82TF
BS 363 638 RS1AR95TFB
BS 639 661 RS1AR95JQ
BS 662 662 RS1CE82JQ
BS 663 680 RS1AR95JQ
BS 681 1058 RS1ES01TF
BS 1059 1059 RS1AR95JQ
BS 1060 1076 RS1ES01TF
BS 1077 1077 RS1AR95JQ
BS 1078 1172 RS1ES01TF
BS 1173 1173 RS1AR95JQ
BS 1174 1271 RS1ES01TF

RD RS1AR95TFB 638 0 0
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GTTACATTGATTACGATAAGCTTGAGGAGAAGGCCATGGATTTCAGGCCTAAGCTCCTCA
TCTGTGGTGGTAGTGCCTACCCTAGGGATTGGGATTACGCTAGATTGAGAGCTGTTGCCG
ATAAGGTTGGAGCTCTCTTGCTCTGTGACATGGCTCACATTAGTGGTCTCGTTGCTGTTC
AGGAAGCTGCAAACCCCTTTGAGTACTGTGACGTTGTGACAACAACAACTCACAAGAGTT
TGAGGGGTCCAAGGGCTGGTATGATCTTCTACAGGAAGGGCCCGAAACCACCAAAGAAGG
GGCAAGCCGAGGGTGCAGTCTATGACTTTGAGGACAAAATCAACTTTGCTGTGTTCCCTG
CGCTTCAAGGTGGTCCTCACAACCACCAGATTGGTGCTCTAGCTGTTGCGTTGAAGCAGG
CTAATACTCCTGGTTTCAAGGTCTATGCGAAACAGGTGAAAGCTAATGCTGTTGCCCTTG
CAAACTACCTGATGGGCAAGGGATACAGTATTGTAACCGGTGGAACTGAGAACCATCTTG
TTCTTTGGGATCTTCGCCCTCTTGGATTGACCGGTAAC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1CE82TF 422 0 0
GTC
AGTGGTCTCGTTGCTGCT*AGGAAGCTGCAAACCCCTTTGAGTACTGTGACGTTGTGACA
ACCACAACCCACAAGAGTTTGAGGGGTCCAAGGGCTGGTATGATCTTCTACCGGAAGGGC
CCGAAACCACCAAAGAAGGGACAAGCCGAGGGTGCAGTCTATGACTTTGAGGACAAAATC
AACTTTGCTGTGTTCCCTGCGCTTCAAGGTGGTCCTCACAACCACCAGATTGGTGCTCTA
GCTGTTGCGTTGAAGCAGGCTAATACTCCTGGTTTCAAGGTCTATGCGAAACAGGTGAAA
GCTAATGCTGTTGCCCTTGCAAACTACCTGATGGGCAAGGGATACAGTATTGTAACCGGT
GGAACTGAGAACCATCTTGTTCTTTGGGATCTTCGCCCTCTTGGATTGACCGGTAAC
AA

QA 4 420 4 420
DS 

RD RS1CE82JQ 660 0 0
CAAACTACCTGATGGGCAAGGGATACAGTATTGTAACCGGTGGAACTGAGAACCATCTTG
TTCTTTGGGATCTTCGCCCTCTTGGATTGACCGGTAACAAGGTTGAGAAGCTGTGCGATC
TATGCGACATTACTTTGAACAAGAATGCTGTCTTTGGAGACAGCAGTGCTCTTGCTCCTG
GAGGTGTAAGAATCGGTACTCCTGCGATGACATCAAGGGGATTGGTGGAGAAGGACTTTG
AGATGATAGGAGAGTTCTTGAGCCGATCAGTGACGCTGACATTGAACATCCAGAAGGAGC
ATGGTAAGCTGTTGAAGGACTTCAACAAGGGTTTGGTGAACAACAAAGAGATCGAGGAGC
TCAAGGCTGATGTTGAGAAGTTCGCTGCCTCCTATGAGATGCCTGGATTTCTCATGTTTG
AGATGAAGTACCAGCACTAGAGATTTCCTCTCTCTATCGAAGAGTAATCTTCTGTTATCT
CTCTATATAATATGCTTTTGTAGGGCCGCCTGATTGGAATTCACAAGGCGAAGAGATAAA
GAAACAAACAGTAAAGACAAAAAGGGTTTTCTTGAGTAATTTTTTCTTGAGTGTTTTTAT
TTTCTCTTATTGAAATTGTTGTATTTTGTTGGCTTTTAATAATAATATCAAGCGAGTT
CT

QA 1 658 1 658
DS 

RD RS1AR95JQ 718 0 0
TGGTTTCAAGGTCTATGCGAAACAGGTGAAAGCTAATGCTGTTGCCCTTGCAAACTACCT
GATGGGCAAGGGATACAGTATTGTAACCGGTGGAACTGAGAACCATCTTGTTCTTTGGGA
TCTTCGCCCTCTTGGATTGACCGGTAACAAGGTTGAGAAGCTGTGCGATCTGTGCGACAT
TACTTTGAACAAGAATGCTGTCTTTGGAGACAGCAGTGCTCTTGCTCCTGGAGGTGTAAG
AATCGGCACTCCTGCGATGACATCAAGGGGATTGGTGGAGAAGGACTTTGAGATGATAGG
AGAGTCCTTGAGCCGATCAGTGACGCTGACATTGAACATCCAGAAGGAGCATGGTAAGCT
GTTGAAGGACTTCAACAAGGGTTTGGTGAACAACAAAGAGATCGAGGAGCTCAAGGCTGA
TGTTGAGAAGTTCGCTGCCTCCTATGAGATGCCTGGATTTCTCATGTCTGAGATGAAGTA
CCAGAACTAGAGATTTCCTCTCTCTATCAAAGAGTAATCTTCTGTTATCTCTCTATATAA
TATGCTTTTGTAGGGCCGCCTGATTGGAATTCACAAGGCGAAGAGATAAAGAAACAAACA
GTAAAAACAAAAAGGGTTTTCTTGAGTAATTTCTTCTTGAATGTTTTTATTTTCTCTTAT
TGAAATTGTTGTATTTTGTTGGCTTTTAATAATAATATCAAGCGAGTTTTAAAATT
AG

QA 1 716 1 716
DS 

RD RS1ES01TF 591 0 0
AAGAATGCTGTCTTTGGAGACAGCAGTGCTCTTGCTCCTGGAGGTGTAAGAATCGGTACT
CCTGCGATGACATCAAGGGGATTGGTGGAGAAGGACTTTGAGATGATAGGAGAGTTCTTG
AGCCGATCAGTGACGCTGACATTGAACATCCAGAAGGAGCATGGTAAGCTGTTGAAGGAC
TTCAACAAGGGTTTGGTGAACAACAAAGAGATCGAGGAGCTCAAGGCTGATGTTGAGAAG
TTCGCTGCCTCCTATGAGATGCCTGGATTTCTCATGTCTGAGATGAAGTACCAGCACTAG
AGATTTCCTCTCTCTATCAAAGAGTAATCTTCTGTTATCTCTCTATATAATATGCTTTTG
TAGGGCCGCCTGATTGGAGTTCACAAGGCGAAGAGACAAAGAAACAAACAGTAAAAACAA
AAAGGGTTTTCTTGAGTAATTTCTTCTTGAATGTTTTTATTTTCTCTTATTGAAATTGTT
GTATTTTGTTGGTTTTTAATAATAATATCAAGCGAGTTTTAAAATTGTGTGTGTTTGTCT
GGTTTGCGATTGGTATGTCAAAATGCTTGTAGATTTTTTATCCGAATGTAT

QA 1 591 1 591
DS 



AS 2 4

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GGACACTGAACTGATTCAATCCGACAACACGGAGGCCAAGGATCCCGAGTCATGCAGTAT
CTATCGAACTCTCGTAAAATCGCTCGGGTTCTGAAACCCCTTGCACTCTTCGAAACTGAT
GTGAGATTTGCTTCTCATGTTGCTGACTCTGCCCAATGGCAGAACCATCGATCTACTTCA
GTCTCTGTCTCTCCAGGGCTGATGATGCTGAGATCAAGCTTTTCCTCTGAAGCAAAACTT
GTCGAAGATCCTACAGAGGCTGTCAAGGACCTACATGGTAAGATACTTGACTCTGTGAAT
GTCAAGAGATCGATGCCTCCGAATGCTTTGTTGTGGTCACTGATTGAGAATTGTCGGAAG
GAGGATGACATTAGTTTCCTCTTTGACGCTCTCCAGAATCTCAGGAGATTTAGGTTGTCT
AATCTCCGTATACATGACAACTTTAATTGCAATCTGTGCCGGCAAGTTGCTAAGACTTGT
GTCCGTGTGGGAGCAATTAACCATGGTAAACGGGCTCTTTGGAAACATAATGTTCATGGT
TTGACTCCTAGCGTTGCATCTGCTCACCATTTACTGTCACATGCGTTAGAGCACAAGAAC
GCTAACCTCATGGACGAAGTGATGAAACTCCTGAAAGCGAATGACCTGCCTCTACAACCC
GGTACAGCGGATTTAGTTTTCAGGATCTGTCATGAGACAGATAGCTGGGATCTATTAGCT
AAGTACTCGAAGAAATTCTGCAAAGCTGGAGTCAGTTAAGAGACACATTTGATGTATGGA
TGGATTTGCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FA24TF U 6
AF RS1FW13TF U 1
BS 1 17 RS1FW13TF
BS 18 18 RS1FA24TF
BS 19 244 RS1FW13TF
BS 245 245 RS1FA24TF
BS 246 421 RS1FW13TF
BS 422 422 RS1FA24TF
BS 423 683 RS1FW13TF
BS 684 684 RS1FA24TF
BS 685 791 RS1FW13TF

RD RS1FA24TF 739 0 0
GG
GAACTGATTCAATCCGACAACACGGAGGCCAAGGATCCCGAGTCATGCAGTATCTATCGA
ACTCTCGTAAAATCGCTCGGGTTCTGAAACCCCTTGCACTCTTCGAAACTGATGTGAGAT
TTGCTTCTCATGTTGTTGACTCTGCCCAATGGCAGAACCATCGATCTACTTCAGTCTCTG
TCTCTCCAGGGCTGATGATGCTGAGATCAAGCTTTTCCTCTGAAGCAAAACTTGTCGAAG
ATCCTACAGAGGCTGTCAAGGACCTACATGGTAAGATACTTGACTCTGTGAATGTCAAGA
GATCGATGCCTCCGAATGCTTTGTTGTGGTCACTGATTGAGAATTGTCGGAAGGAGGATG
ACATTAGTTTCCTCTTTGACGCTCTCCAGAATCTCAGGAGATTTAGGTTGTCTAATCTCC
GTATACATGACAACTTTAATTGCAATCTGTGCCGGCAAGTTGCTAAGACTTGTGTCCGTG
TGGGAGCAATTAACCATGGTAAACGGGCTCTTTGGAAACATAATGTTCATGGTTTGACTC
CTAGCGTTGCATCTGCTCACCATTTACTGTCACATGCGTTAGAGCACAAGAACGCTAACC
TCATGGACGAAGTGATGAAACTCCTGAAAGCGAATGACCTGCCTCTACAACCCGGTACAG
CGGATTTAGTTTTCAGGATCTGTCATGAGACAGATAGCTGGGATCTATTAGCTAAGTACT
CGAAGAAATTCTGCAAA

QA 3 739 3 739
DS 

RD RS1FW13TF 791 0 0
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CTATCGAACTCTCGTAAAATCGCTCGGGTTCTGAAACCCCTTGCACTCTTCGAAACTGAT
GTGAGATTTGCTTCTCATGTTGCTGACTCTGCCCAATGGCAGAACCATCGATCTACTTCA
GTCTCTGTCTCTCCAGGGCTGATGATGCTGAGATCAAGCTTTTCCTCTGAAGCAAAACTT
GTCGGAGATCCTACAGAGGCTGTCAAGGACCTACATGGTAAGATACTTGACTCTGTGAAT
GTCAAGAGATCGATGCCTCCGAATGCTTTGTTGTGGTCACTGATTGAGAATTGTCGGAAG
GAGGATGACATTAGTTTCCTCTTTGACGCTCTCCAGAATCTCAGGAGATTTAGGTTGTCT
AGTCTCCGTATACATGACAACTTTAATTGCAATCTGTGCCGGCAAGTTGCTAAGACTTGT
GTCCGTGTGGGAGCAATTAACCATGGTAAACGGGCTCTTTGGAAACATAATGTTCATGGT
TTGACTCCTAGCGTTGCATCTGCTCACCATTTACTGTCACATGCGTTAGAGCACAAGAAC
GCTAACCTCATGGACGAAGTGATGAAACTCCTGAAAGCGAATGACCTGCCTCTACAACCC
GGTACAGCGGATTTAGTTTTCAG*ATCTGTCATGAGACAGATAGCTGGGATCTATTAGCT
AAGTACTCGAAGAAATTCTGCAAAGCTGGAGTCAGTTAAGAGACACATTTGATGTATGGA
TGGATTTGCTG

QA 1 791 1 791
DS 



CO CL1470Contig2 809 2 5 U
GGCGCTGTTCTTCCACACTGAACTGATTCAATCCGACAACACGGAGGCTAAGGGATCCCG
AGTCATGCAGTATCTATCGAACTCTCGTAGAATCGCTCGGGCTCTGAAACCCCTTGCACT
CTTCGAGACTGATGTGAGATTTGCCTCTCATGTTGTTGACTCTGCCCAATTGCAGAACCA
TCGATCTACTTCAGTCTCTGTCTCTCCAGGGCTGATGATGCTGAGATCAAGCTTTTCCTC
TGAAGCAAAACATGTCGAAGATCCTACAGAGGCTGTCAAGGAGCTACACGGTAAGATACT
TGACTCTGTGAATGTCAAGAGATCGATGCCTCCGAATGCTTTGTTGTGGTCTCTGATTGA
GAATTGTCGGAAGGAGGATGACATTAGTTTCCTCTTTGACGCTCTCCAGAATCTCAGGAG
ATTTAGGTTGTCTAATCTCCGTATACATGACAACTTTAATTGCAATCTGTGCCGTGAAGT
TGCTAAGACTTGTGTCCGTGTTGGGGCTATTAACCATGGTAAACGGGCTCTTTGGAAACA
TAATGTTCATGGTTTGACTCCTAGCGTTGCATCTGCTCACCATTTACTGTCACATGCGTT
GGAGCACAAGAACGCTAACCTCATGGACGAAGTGATGAAACTTCTGAAGGCGAATGACCT
GCCTTTACAACCCGGTACAGCGGATTTAGTTTTCAGATCTGTCATGAGACAGATAGCTGG
GATCTATTAGCTAAGTACTCTAAGAAGTTCTGCAAAGCTGGAGTCAAGTAAGGAGACCAC
ATTTGATGTATGGATGGATTTGCTGCCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1G232TF U 16
AF RS1GS28TF U 1
BS 1 649 RS1GS28TF
BS 650 650 RS1G232TF
BS 651 748 RS1GS28TF
BS 749 749 RS1G232TF
BS 750 809 RS1GS28TF

RD RS1G232TF 752 0 0
GACT
GAACTGATTCAATCCGACAACACGGAGGCTAAGGGATCCCGAGTCATGCAGTATCTATCG
AACTCTCGTAGAATCGCTCGGGCTCTGAAACCCCTTGCACTCTTCGAGACTGATGTGAGA
TTTGCCTCTCATGTTGTTGACTCTGCCCAATTGCAGAACCATCGATCTACTTCAGTCTCT
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GATCCTACAGAGGCTGTCAAGGAGCTACACGGTAAGATACTTGACTCTGTGAATGTCAAG
AGATCGATGCCTCCGAATGCTTTGTTGTGGTCTCTGATTGAGAATTGTCGGAAGGAGGAT
GACATTAGTTTCCTCTTTGACGCTCTCCGGAATCTCAGGAGATTTAGGTTGTCTAATCTC
CGTATACATGACGACTTTAATTGCAATCTGTGCCGTGAAGTTGCTAAGACTTGTGTCCGT
GTTGGGGCTATTAACCATGGTAAACGGGCTCTTTGGAAACATAATGTTCATGGTTTGACT
CCTAGCGTTGCATCTGCTCACCATTTACTGTCACATGCGTTGGAGCACAAGAACGCTAAC
CTCATGGACGAAGTGATGAAACTTCTGAAGGCGAATGACCTGCCTTTACAACCCGGTACA
GCGGATTTAGTTTTCAGATCTGTCATGAGACAGATAGCTGGGATCTATTAGCTAAGTACT
CTAAGAAGTTCTGCAAAGCTGGAGTCA
A

QA 5 751 5 751
DS 

RD RS1GS28TF 809 0 0
GGCGCTGTTCTTCCACACTGAACTGATTCAATCCGACAACACGGAGGCTAAGGGATCCCG
AGTCATGCAGTATCTATCGAACTCTCGTAGAATCGCTCGGGCTCTGAAACCCCTTGCACT
CTTCGAGACTGATGTGAGATTTGCCTCTCATGTTGTTGACTCTGCCCAATTGCAGAACCA
TCGATCTACTTCAGTCTCTGTCTCTCCAGGGCTGATGATGCTGAGATCAAGCTTTTCCTC
TGAAGCAAAACATGTCGAAGATCCTACAGAGGCTGTCAAGGAGCTACACGGTAAGATACT
TGACTCTGTGAATGTCAAGAGATCGATGCCTCCGAATGCTTTGTTGTGGTCTCTGATTGA
GAATTGTCGGAAGGAGGATGACATTAGTTTCCTCTTTGACGCTCTCCAGAATCTCAGGAG
ATTTAGGTTGTCTAATCTCCGTATACATGACAACTTTAATTGCAATCTGTGCCGTGAAGT
TGCTAAGACTTGTGTCCGTGTTGGGGCTATTAACCATGGTAAACGGGCTCTTTGGAAACA
TAATGTTCATGGTTTGACTCCTAGCGTTGCATCTGCTCACCATTTACTGTCACATGCGTT
GGAGCACAAGAACGCTAACCTCATGGACGAAGTGATGAAACTTCTGAAG*CGAATGACCT
GCCTTTACAACCCGGTACAGCGGATTTAGTTTTCAGATCTGTCATGAGACAGATAGCTGG
GATCTATTAGCTAAGTACTCTAAGAAGT*CTGCAAAGCTGGAGTCAAGTAAGGAGACCAC
ATTTGATGTATGGATGGATTTGCTGCCAA

QA 1 809 1 809
DS 



AS 1 3

CO CL1471Contig1 815 3 1 U
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TTAAAAGCTCCACAACATTCATATAAAGTCAGAAAACGTCAGCAAAAACATTCTCTTATT
CACATAGAGATGATGTCATTGTTTGAAAAATAAAACATCAATGCAGTTTGTTTCCATTTA
CTTTAAAAAAATATGCTTCACATTGTTTATCTATCGATCGATCCCTTCAATCTTGTCTTC
GACCTGAGAGTACAAGTCCTTGAGCTTCTCGATGTTGTCCTCCGAAGTCTCCCAGTAGCC
ACGACCATTGGCTTCCAAGAACGTCTGGATCATCTTCCTGAAGGAGTTTGGATTAGTGTT
CATGAGACGGTTAAGCATCTCCTCGTCTTTGATGAAAGTCGTGTTGGCCTCTTCGTAGAC
CCAGTTGTCTACTTGACCTGAGGTTGCACTCCATCCCACAGTGTTGGTCAGTCTCTTCTC
TATCTCACGAACACCTTCGTATCCGCTTGACATCATTCCTTCGTACCACTTTGGGTTCAG
CAGCTTTGTTCTTGCGTCCAGCCTCACTGTCTCAGACAGTGACCTCACCTGTGCGTTTGC
GGTTGTTGTATCAGCAATGTAAGCGCTAGGCTTCTTCTTGTCTTTCCTCAAACTCTGAAC
CAAGTTTGTCGGGTCAGAGTCAAAGTAATGGCTCACGTCGGTCAACGAAATCTCGGAAGA
ATCGAGGTTCTGAAACGTGACTTCTGCAGTCATAAGAGCCATCTGAAAGACCTCCTTCTT
CTCAGCCATCCCTGCTCCAGGAGCATCGCTGTCAA


BQ
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AF RS1EI87JQ U 64
AF RS1EI87TF C 64
AF RS1DN67JQ U 1
BS 1 815 RS1DN67JQ

RD RS1EI87JQ 252 0 0
A
AAGCTCCACAACATTCATATAAAGTCAAAAAACGTCAGCAAAAACATTCTCTTATTCACA
TAGAGATGATGTCATTGTTTGAAAAATAAAACATCAATGCAGTTTGTTTCCATTTACTTT
AAAAAAATATGCTTCACATTGTTTATCTATCGATCGATCCCTTCAATCTTGTCTTCGACC
TGAGAGTACAAGTCCTTGAGCTTCTCGATGTTGTCCTCCGAAGTCTCCCAGTAGCCACGA
CCATTGGCTTC

QA 2 252 2 252
DS 

RD RS1EI87TF 252 0 0
A
AAGCTCCACAACATTCATATAAAGTCAGAAAACGTCAGCAAAAACATTCTCTTATTCACA
TAGAGATGATGTCATTGTTTGAAAAATAAAACATCAATGCAGTTTGTTTCCATTTACTTT
AAAAAAATATGCTTCACATTGTTTATCTATCGATCGATCCCTTCAATCTTGTCTTCGACC
TGAGAGTACAAGTCCTTGAGCTTCTCGATGTTGTCCTCCGAAGTCTCCCAGTAGCCACGA
CCATTGGCTTC

QA 2 252 2 252
DS 

RD RS1DN67JQ 815 0 0
AGACTAAAGCTGTTGCTCCAAGTGAAAAAGAACATCATATACTGCCTCTTAGGCTTAGAA
TTAAAAGCTCCACAACATTCATATAAAGTCAGAAAACGTCAGCAAAAACATTCTCTTATT
CACATAGAGATGATGTCATTGTTTGAAAAATAAAACATCAATGCAGTTTGTTTCCATTTA
CTTTAAAAAAATATGCTTCACATTGTTTATCTATCGATCGATCCCTTCAATCTTGTCTTC
GACCTGAGAGTACAAGTCCTTGAGCTTCTCGATGTTGTCCTCCGAAGTCTCCCAGTAGCC
ACGACCATTGGCTTCCAAGAACGTCTGGATCATCTTCCTGAAGGAGTTTGGATTAGTGTT
CATGAGACGGTTAAGCATCTCCTCGTCTTTGATGAAAGTCGTGTTGGCCTCTTCGTAGAC
CCAGTTGTCTACTTGACCTGAGGTTGCACTCCATCCCACAGTGTTGGTCAGTCTCTTCTC
TATCTCACGAACACCTTCGTATCCGCTTGACATCATTCCTTCGTACCACTTTGGGTTCAG
CAGCTTTGTTCTTGCGTCCAGCCTCACTGTCTCAGACAGTGACCTCACCTGTGCGTTTGC
GGTTGTTGTATCAGCAATGTAAGCGCTAGGCTTCTTCTTGTCTTTCCTCAAACTCTGAAC
CAAGTTTGTCGGGTCAGAGTCAAAGTAATGGCTCACGTCGGTCAACGAAATCTCGGAAGA
ATCGAGGTTCTGAAACGTGACTTCTGCAGTCATAAGAGCCATCTGAAAGACCTCCTTCTT
CTCAGCCATCCCTGCTCCAGGAGCATCGCTGTCAA

QA 1 815 1 815
DS 



AS 1 5

CO CL1472Contig1 797 5 13 U
GGAAACCATTTGTTCTTTCTTTGGCTGAGCGGCAATGGCTGAGGAGCAAAAGACAACTAC
GGTTGACGTGGAATCACCGGCGGTTTTAGCTCCGGCAAAGGAACCAGCTCCTACTCCGGT
GGACGCTTCTAAAGACGTTACGGAGGAGAAAGTTCATAATCCACCTCCTCCTGACGAGTC
CAAAGCTCTTGCCGTTGTAGAAAAACCCATTGAAGAGGCTACACCAAAGAAAAGTTCATC
TGGTTCCATGGATAGAGATGTGAAACTTGCAGACTTGGAAAAAGAGAAGAAAACTTCATT
CATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAAGCAGAGAACAAGGCACAAAAGAAGGT
ATCTGATGTGCTTGCTTGGGAGAACAGCCAAAAAGCAGCCATTGAAGCCCAACTAAGGAA
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GGCTGCGATCCACAAGCAAGCAGAAGAGAAAAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAGAGGAGA
GGAGCTTCTTAAAGCCGAAGAAATGGCTGCCAAGCACAGAGCCACTGGTATCGTTCCCAA
GGCAACTTGTGGATGCTTCTAAGTTGTGTTCTCAAGCCATTGGTCATTCATGTCTCTCTT
TTTGGTGTTATTCTGCTACTTTTTCTTTGTCTGTTGTCTTGTTTATATATTGGTGATCTT
GTGTGTAAAAGAAGATCAGGGTTAAAGCATGTGTGACTGCAGTTTCACATATAATCTGTA
AATTTTAACATGTTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1DJ94TF U 5
AF RS1CD04TF U 1
AF RS1CD04JQ C 224
AF RS1DJ94JQ C 26
AF RS1AM81TF U 570
BS 1 123 RS1CD04TF
BS 124 124 RS1DJ94TF
BS 125 142 RS1CD04TF
BS 143 143 RS1DJ94TF
BS 144 704 RS1CD04TF
BS 705 705 RS1AM81TF
BS 706 729 RS1CD04TF
BS 730 730 RS1AM81TF
BS 731 742 RS1CD04TF
BS 743 743 RS1AM81TF
BS 744 766 RS1CD04TF
BS 767 795 RS1AM81TF
BS 796 797 RS1DJ94JQ

RD RS1DJ94TF 589 0 0
TAAACCATTTGTTCT
TTTGGCTGAGCGGCAATGGCTGAGGAGCAAAAGACAACTACGGTTGACGTGGAATCACCG
GCGGTTTTAGCTCCGGCAAAGGAACCAGCTCCTACTCCGGTGGACGCTTCTAAAGACGTT
ACGGAGGAGAAAGTTCATAATCCACCTCCTCCTGACGAGTCCAAAGCTCTTGCCGTTGTA
GAAAAACCCATTGAAGAGGCTACACCAAAGAAAAGTTCATCTGGTTCCATGGATAGAGAT
GTGAAACTTGCAGACTTGGAAAAAGAGAAGAAAACTTCATTCATCAAAGCATGGGAAGAG
AGTGAGAAGTCAAAAGCAGAGAACAAGGCACAAAAGAAGGTATCTGATGTGCTTGCTTGG
GAGAACAGCCAAAAAGCAGCCATTGAAGCCCAACTAAGGAAGATAGAAGAAAAACTAGAG
AAGAAGAAGGCAGAGTATGGTGAGAAAATGAAGAACAAAGTGGCTGCGATCCACAAGCAA
GCAGAAGAGAAAAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAGAGGAGAGGAGCTTCTTAAAGCCGAA
GAAATGGCTGCCAAGCACAGAGCCACTGGTATCG

QA 16 589 16 589
DS 

RD RS1CD04TF 766 0 0
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GGTTGACGTGGAATCACCGGCGGTTTTAGCTCCGGCAAAGGAACCAGCTCCTACTCCGGT
GGAAGCTTCTAAAGACGTTACGAAGGAGAAAGTTCATAATCCACCTCCTCCTGACGAGTC
CAAAGCTCTTGCCGTTGTAGAAAAACCCATTGAAGAGGCTACACCAAAGAAAAGTTCATC
TGGTTCCATGGATAGAGATGTGAAACTTGCAGACTTGGAAAAAGAGAAGAAAACTTCATT
CATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAAGCAGAGAACAAGGCACAAAAGAAGGT
ATCTGATGTGCTTGCTTGGGAGAACAGCCAAAAAGCAGCCATTGAAGCCCAACTAAGGAA
GATAGAAGAAAAACTAGAGAAGAAGAAGGCAGAGTATGGTGAGAAAATGAAGAACAAAGT
GGCTGCGATCCACAAGCAAGCAGAAGAGAAAAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAGAGGAGA
GGAGCTTCTTAAAGCCGAAGAAATGGCTGCCAAGCACAGAGCCACTGGTATCGTTCCCAA
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TTTGGTGTTATTCTGCTACTTTTTCTTTGTCTGTTGTCTTGTTTGTATATTGGTGATCTT
GTGTGTAAA*GAAGATCAGGGT*AAAGCATGTGTGACTGCAGTTTC

QA 1 766 1 766
DS 

RD RS1CD04JQ 545 0 0
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GAGAAGAAAACTTCATTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAGAAGTCAAAAGCAGAGAAC
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GAAGCCCAATTAAGGAAGATAGAAGAAAAACTAGAGAAGAAGAAGGCAGAGTATGGTGAG
AAAATGAAGAACAAAGTGGCTGCGATCCACAAGCAAGCAGAAGAGAAAAGAGCAATGGTT
GAAGCTAAAAGAGGAGAGGAGCTTCTTAAAGCCGAAGAAATGGCTGCCAAGCACAGAGCC
ACTGGTATCGTTCCCAAGGCAACTTGTGGATGCTTTTAAGTTGTGTTCTCAAGCCATTGG
TCATTCATGTCTCTCTTTTTGGTGTTATTCTGCTACTTTTTCTTTGTCTGTTGTCTTGTT
TGTATATTGGTGATCTTGTGTGTAAAAGAAGATCAGGGTTAAAGCATGTGTGACTGCAGT
TTC
AC

QA 1 543 1 543
DS 

RD RS1DJ94JQ 772 0 0
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TTAGCTCCGGCAAAGGAACCAGCTCCTACTCCGGTGGACGCTTCTAAAGACGTTACGGAG
GAGAAAGTTCATAATCCACCTCCTCCTGACGAGTCCAAAGCTCTTGCCGTTGTAGAAAAA
CCCATTGAAGAGGCTACACCAAAGAAAAGTTCATCTGGTTCCATGGATAGAGATGTGAAA
CTTGCAGACTTGGAAAAAGAGAAGAAAACTTCATTCATCAAAGCATGGGAAGAGAGTGAG
AAGTCAAAAGCAGAGAACAAGGCACAAAAGAAGGTATCTGATGTGCTTGCTTGGGAGAAC
AGCCAAAAAGCAGCCATTGAAGCCCAACTAAGGAAGATAGAAGAAAAACTAGAGAAGAAG
AAGGCAGAGTATGGTGAGAAAATGAAGAACAAAGTGGCTGCGATCCACAAGCAAGCAGAA
GAGAAAAGAGCAATGGTTGAAGCTAAAAGAGGAGAGGAGCTTCTTAAAGCCGAAGAAATG
GCTGCCAAGCACAGAGCCACTGGTATCGTTCCCAAGGCAACTTGTGGATGCTTTTAAGTT
GTGTTCTCAAGCCATTGGTCATTCATGTCTCTCTTTTTGGTGTTATTCTGCTACTTTTTC
TTTGTTTGTTGTCTTGTTTATATATTGGTGATCTTGTGTGTAAAAGAAGATCAGGGTTAA
AGCATGTGTGACTGCAGTTTCACATATAATCTTTAAATTTTAACATGTTGAT

QA 1 772 1 772
DS 

RD RS1AM81TF 226 0 0
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TCTCAAGCCATTGGTCATTCATGTCTCTCTTTTTGGTGTTATTCTGCTACTTTTTCTTTG
TTTGTTGTCTTGTTTATATATTGGTGATCTTGTGTGTAAAAGAAGATCAGGGTTAAAGCA
TGTGTGACTGCAGTTTCACATATAATCTGTAAATTTTAACATGTTG

QA 1 226 1 226
DS 



AS 1 5

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GCAATGTGAAGCCGAATGTACCAAAAAGAGGCCAAAAGGGGTTGGTATGTGCCTACCCAT
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BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1FW20JQ C 1
AF RS1FW20TF U 1
AF RS1GO77TF U 1
AF RS1ES61TF U 8
AF RS1G029TF U 4
BS 1 5 RS1FW20JQ
BS 6 429 RS1FW20TF
BS 430 477 RS1GO77TF

RD RS1FW20JQ 429 0 0
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CTTCATTTTGGTCACAATCTTTTTACTAGGAGTAGTGGTGTTTGCTCAGAAGGGAGGACC
AAGCACAGAAAGAACTTGTAATGAAGCATACCCAAACAATACTGGAAAATGTGATACTAA
GCAATGTGAAGCCGAATGTACCAAAAAGAGGCCAAAAGGGGTTGGTATGTGCCTACCCAT
AGGCAAAGGAGATTTTCATTGCAGATGCTATTATAAATGCCGTCGCTGATATTTTTAACC
TACATATCGAAGCTCAATTATATTCCACTTTTAATAAGTCACAACTTCTTTTGATGTGTG
ATATTTAAAAAATAGATCTTCATTAGAAAGTCATGTTTCATTTATTTTTAAATAAAATTT
TGGCATCAT

QA 1 429 1 429
DS 

RD RS1FW20TF 429 0 0
GGAGA
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TTTTGGTCACAATCTTTCTACTAGGAGTAGTGGTGTCTGCTCAGAAGGGAGGACCAAGCA
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GTGAAGCCGAATGTACCAAAAAGAGGCCAAAAGGGGTTGGTATGTGCCTACCCATAGGCA
AAGGAGATTTTCATTGCAGATGCTATTATAAATGCCGTCGCTGATATTTTTAACCTACAT
ATCGAAGCTCAATTATATTCCACTTTTAATAAGTCACAACTTCTTTTGATGTGTGATATT
TAAAAAATAGATCTTCATTAGAAAGTCATGTTTCATTTATTTCTAAATAAAATTTTGGCA
TCAT

QA 6 429 6 429
DS 

RD RS1GO77TF 477 0 0
GGAAA
ACACAATTAGTTCATTATTTAAGATGAAAATATCTTTTCAAACTTCGCTTATTGGCTTCA
TTTTGGTCACAATCTTTCTACTAGGAGTAGTGGTGTCTGCTCAGAAGGGAGGACCAAGCA
CAGAAAGAACTTGTAATGAAGCATACCCAAACAATACTGGAAAATGTGATACTAAGCAAT
GTGAAGCCGAATGTACCAAAAAGAGGCCAAAAGGGGTTGGTATGTGCCTACCCATAGGCA
AAGGAGATTTTCATTGCAGATGCTATTATAAATGCCGTCGCTGATATTTTTAACCTACAT
ATTGAAGCTCAATTATATTCCACTTTTAATAAGTCACAACTTCTTTTGATGTGTGATATT
TAAAAAATAGATCTTCATTAGAAAGTCATGTTTCATTTATTTCTAAATAAAATTTTGGCA
TCATAACTCAATCACCTCATATTTTATCGACTATAATAACTACTTTGCCTAT

QA 6 477 6 477
DS 

RD RS1ES61TF 422 0 0
GG
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AAGAACTTGTAATGAAGCATACCCAAACAATACTGGAAAATGTGATACTAAGCAATGTGA
AGCCGAATGTACCAAAAAGAGGCCAAAAGGGGTTGGTATGTGCCTACCCATAGGCAAAGG
AGATTTTCATTGCAGATGCTATTATAAATGCCGTCGCTGATATTTTTAACCTACATATTG
AAGCTCAATTATATTCCACTTTTAATAAGTCACAACTTCTTTTGATGTGTGATATTTAAA
AAATAGATCTTCATTAGAAAGTCATGTTTCATTTATTTCTAAATAAAATTTTGGCATCAT

QA 3 422 3 422
DS 

RD RS1G029TF 472 0 0
GG
ACACAATTAGTTCATTATTTAAGATGAAAATATCTTTTCAAACTTCGCTTATTGGCTTCA
TTTTGGTCACAATCTTTCTACTAGGAGTAGTGGTGTCTGCTCAGAAGGGAGGACCAAGCA
CAGAAAGAACTTTTAATGAAGCATACCCAAACAATACTGGAAAATGTGATACTAAGCAAT
GTGAAGCCGAATGTACCAAAAAGAGGCCAAAAGGGGTTGGTATGTGCCTACCCATAGGCA
AAGGAGATTTTCATTGCAGATGCTATTATAAATGCCGTCGCTGATATTTTTAACCTACAT
ATTGAAGCTCAATTATATTCCACTTTTAATAAGTCACAACTTCTTTTGATGTGTGATATT
TAAAAAATAGATCTTCATTAGAAAGTCATGTTTCATTTATTTCTAAATAAAATTTTGGCA
TCATAACTCAATCACCTCATATTTTATCGACTATAATAACTACTTTGCCT

QA 3 472 3 472
DS 



AS 1 5

CO CL1474Contig1 573 5 8 U
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ACATATTGTCAGAAAATGAAAATTCTCAAATTTGTTTGAAAGGTAATCAAACGCACACTC
AGACAATGGCATTGGCAGCACTTGCAATCCTAGGCCAAAGATCAGCGCACTCTTTACCAA
TGGGACCAGTGATCGCAGAACCTTTCATTTCTCCCTTGGGGTTCACGATGACTCCAGCAT
TATCTTCGAAGTACATGAAGACACCATCCTTTCGGCGCCAAGGCTTCCTCTGCCTAACGA
TGACAGCTGGCATAACCTTCTTCCTCAGATCAGGCTTCCCCTTCTTCACGGTGGCCATCA
CCATGTCTCCGACGCAGGCGGAAGGCAACCTGTTGAGACGACCCTTGATCCCCTTCACCG
AAATGATGTAGAGGTTCTTGGCGCCGGTGTTGTCGGCACAGTTCACCGTCGCCGCCACGG
GGAGACCAAGCGACATCCTGAACTTGTTACCCGACGTACCTCCACGTCCTCGTTTCGACA
TTTTGGACGGCTTTGAGCTGATCTCTGTTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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C

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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A487JQ U 1
AF RS1DW32JQ U 158
AF RS1AH67TF C 160
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AA
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AAGGAGAGGATGTAGTACAGGAGATTGAGGAGTGGATACAGATGAGCATTCCAGCCGAAT
CGCAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 

AF RS1A487TF U 1
AF RS1DW32TF U 1
BS 1 621 RS1A487TF
BS 622 785 RS1DW32TF

RD RS1A487TF 621 0 0
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QA 1 621 1 621
DS 

RD RS1DW32TF 785 0 0
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TTCCTAAGAGAACAAGTTGTATCAGTTATTTTTCTTGTGAGATAAAAGAAAAGGGGGTGC
AATGGCGAGGATAAAACCTCAGGCTCTGCTAAATCAAAGCAAGAAGAAGAAGGGTCCTAG
TCGGATAAGTATTTCTACAATTGTCGTGTGTAATCTCGTAGTTGCCGTAGTCGTACTCTC
CTTGGTCACTACTTATCGTCATTGGTCCCAGAGGTCAAGAAACACACTTGAAACCCAGAG
TCATACTTTTGAGGACACAAATGCTGTATCACAACAAAAGAATTACGATCGTCCTGGCTA
TGCCGATATAAGCACATCAAAAGGTCTCATAACTGTGGAACTCTTTAAAGATGCTTCCCC
TGAAGCTGTCGACAAGTTTCTAGATCTGTGTAAAAAAGATCACTTCAAGGGAATGCCGTT
TCAACGGGTTATAAAAAACTACTTGGTGCAAGCTGGTCACTCCTCGAGCTCTATACCTGT
AGAAGAATGGACTGCTAAAGGAAAGCTCCGTGGTCGCCTTGACACAAGCCCAAAACATGA
AGCATTCATGTTGGGGACACCAAAAATCAAAGGGAACAACAACAAGGACTTCGAGCTTCT
GATCACAACGGCGCCAATCCCGGATCTGAATGATCAGCTTATAGTGTTCGGAGAGTCCTT
AAGGAGAGGATGTAGTACAGGAGATTGAGGAGTGGATACAGATGAGCATTCCAGCCGAAT
CGCAG

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 3

CO CL1476Contig1 1050 3 6 U
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ACTTACTGTCTTCTGTATCGAAAGTTATCGTATTCTTCAATTTTCTTTTAAAAAGTCATA
TTTTTCATGGAAGCTAGAAGACTCGCGATCCTATGTTCCCATCTCAACCCAGCTGGTCCT
TACCCACCCAGAGACTCGATTCTCAGGGTTTCCGATTGTAGCTCCGGCGAAGACAAGGTC
GAATCATCCAATCTCCAAAACGACTGCGTTTTCTGCAAGATTGTCCGTGGCGAGTCTCCT
TGTCTCAAGTTGTACGAGGATGATATGTGTTTGTGCATTTTGGACACGAGTCCACTTATC
CATGGGTAATCAAACACTCTCATTCTACTCTCTAGTTTTGACTATTTAGTACTAAGACTA
TGCTTAAGGCCTCCATTTTTTTTTTTTTTTGATTAGTGGATTGCATTATGAACATGTTTT
TTTTGCTTAGTGGAATTCCAAAAGCTATCAGCTTTTTTTTTTTAATCTGGTGGGTGTGTT
CAGGCACTCTCTTATCATTCCCAAGTTACATTATCCTACCTTAGAGGAAACACCTCCCTC
AGTAGTTGCTGCCATGTGTTCCAAAGTTCCTCTTATCAGTAATGCCCTCGTCAAAGCTAC
CGACAGTGATTCATTTAACTTGTTGGTTAACAATGGAGCAGCAGCTGGGCAAGTCAGATT
TCACACACACATTCACATTATCCCACGTAAGGAACGTGACTGTTTATGGACTTCCGAGAG
CTTGCATAGACACACACTGAAACTGGACAAGGAAGCATCTCAGCTGGCGTCTCGTGTTCG
AGAACAATTGTGCAGACCTCCTGAAGAACAATTGGTTCAGCCCTCCTCATAAGTCCCCTT
TTCAAGAGACGTTGTTGTGAACTTTACAATTACACTCTGCCAACACAAAAAAGGTCTATT
CTGTATAGTTCATATTCACAGCTTCATCTTCATTTTATATATATATACATTCTTCAGTCT
GTTTGGTTAAGTTTATCAGGATTCAAGTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D977TF U 1
AF RS1G706TF U 584
AF RS1D977JQ C 451
BS 1 645 RS1D977TF
BS 646 646 RS1D977JQ
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BS 841 1007 RS1G706TF
BS 1008 1050 RS1D977JQ

RD RS1D977TF 648 0 0
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ACTTACTGTCTTCTGTATCGAAAGTTATCGTATTCTTCAATTTTCTTTTAAAAAGTCATA
TTTTTCATGGAAGCTAGAAGACTCGCGATCCTATGTTCCCATCTCAACCCAGCTGGTCCT
TACCCACCCAGAGACTCGATTCTCAGGGTTTCCGATTGTAGCTCCGGCGAAGACAAGGTC
GAATCATCCAATCTCCAAAACGACTGCGTTTTCTGCAAGATTGTCCGTGGCGAGTCTCCT
TGTCTCAAGTTGTACGAGGATGATATGTGTTTGTGCATTTTGGACACGAGTCCACTTATC
CATGGGTAATCAAACACTCTCATTCTACTCTCTAGTTTTGACTATTTAGTACTAAGACTA
TGCTTAAGGCCTCCATTTTTTTTTTTTTTTGATTAGTGGATTGCATTATGAACATGTTTT
TTTTGCTTAGTGGAATTCCAAAAGCTATCAGCTTTTTTTTTTTAATCTGGTGGGTGTGTT
CAGGCACTCTCTTATCATTCCCAAGTTACATTATCCTACCTTAGAGGAAACACCTCCCTC
AGTAGTTGCTGCCATGTGTTCCAAAGTTCCTCTTATCAGTAATGC
CCT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1G706TF 429 0 0
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GCTGGGCAAGTCAGATTTCACACACACATTCACATTATCCCACGTAAGGAACGTGACTGT
TTATGGACTTCCGAGAGCTTGCATAGACACACACTGAAACTGGACAAGGAAGCATCTCAG
CTGGCGTCTCGTGTTCTAGAACAATTGTGCAGACCTCCTGAAGAACAATTGGTTCAGCCC
TCCTCATAAGTCCCCTTTTCAAGAGACGTTGTTGTGAACTTTACAATTACACTCTGCCAA
CACAAAAAAGGTCTATTCTGTATAGTTCATATTCACAGCTTCATCTTCATTTTATATATA
TATA
CATTC

QA 1 424 1 424
DS 

RD RS1D977JQ 600 0 0
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GCTTTTTTTTTTTAATCTGGTGGGTGTGTTCAGGCACTCTCTTATCATTCCCAAGTTACA
TTATCCTACCTTAGAGGAAACACCTCCCTCAGTAGTTGCTGCCATGTGTTCCAAAGTTCC
TCTTATCAGTAATGCCCTCGTCAAAGCTACCGACAGTGATTCATTTAACTTGTTGGTTAA
CAATGGAGCAGCAGCTGGGCAAGTCATATTTCACACACACATTCACATTATCCCACGTAA
GGAACGTGACTGTTTATGGACTTCCGAGAGCTTGCATAGACACACACTGAAACTGGACAA
GGAAGCATCTCAGCTGGTGTCTCGTGTTCGAGAACAATTGTGCAGACCTCCTGAAGAACA
ATTGGTTCAGCCCTCCTCATAAGTCCCCTTTTCAAGAGACGTTGTTGTGAACTTTACAAT
TACACTCTGCCAACACAAAAAAGGTCTATTCTGTATAGTTCATATTCACAGCTTCATCTT
CATTTTATATATATATACATTCTTCAGTCTGTTTGGTTAAGTTTATCAGGATTCAAGTAT

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 5

CO CL1477Contig1 1131 5 15 U
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CCAAAGTTAATTTTTCAGTAGCAATCATGGCGGACGAGAATAATGAGTTGAAGGAGGTCA
AGGACGAGCAAGAACTCGCACCCTTTGACCCAACCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAG
TTGTCCTTCAAGATCCCATCGAGGAACCAACTGAGTCACCGGCCGAGCCATCTGATTCTT
TGCCTGCTAATGATGGTGGCCTTGACGGTCCATCTTTCGGAACCAAGAAGAAAAAGAAGA
AGAAGCCTGTTGAATCAAGCTCATTGGATGAAGAAACTGCTGATGCTCCAGAAGATTTGG
AGGAGCATCCCAATGAAGAGGAAGAGGCAGAAGGAATTGATTTGCAGCAGCAGCAGCAAC
GTTATCCCTGGGAGGGAAGTGATAGGGATTATATATATGACGAGCTTCTTGGTAGAGTCT
TTAACATTCTCCGTGAGAACAATCCGGAGCTTGCTGGAGATAGGCGTCGTACTGTTATGA
GGCCTCCCCAAGTTCTTCGTGAAGGGACAAAGAAGACAGTGTTTGTCAACTTTATGGACC
TTTGCAAGACAATGCATCGTCAACCGGACCATGTGATGAATTTCTTGCTTGCTGAGTTGG
GAACCAGTGGTTCGCTTGATGGACAGCAAAGATTGGTTGTCAAGGGAAGATTTGCACCCA
AGAATTTTGAGGGGATTTTGCGTCGTTATGTCACTGAGTACGTCATTTGCCTTGGTTGCA
AGAGCCCGGACACAATTCTCTCAAAGGAGAATCGTCTCTTCTTTCTCAGATGCGAGAAGT
GTGGATCTGGACGATCTGTGGCGCAGATCAAAGCTGGTTTTGTTGCTCGTGTTGGTCGCA
GAAAGACTTGAGGAATTGGACGGTGAACTGAGTGGTCTTTTTGTTTTGGGAAACTACAGA
GCTTGTTATGCAGTTGAAATACCTGTGTTGTTTTTTTTT*GTTTTTTTTTGTTATTGTTT
CTGAATGTGAGCAATAATCTGGAGACTAAGATTTCACATCAAATATGATCAAAACCCTCT
ACTTTGTTAGATCATGTGGGTCACTTGAATTCTTGAAGTTCTTTTGCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RS1CL89TF U 1
AF RS1FS31TF U 6
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AF RS1CL89JQ C 297
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TGCCTGCTAATGATGGTGGCCTTGACGGTCCATCTTTCGGAACCAAGAAGAAAAAGAAGA
AGAAGCCTGTTGAATCAAGCTCATTGGATGAAGAAACTGCTGATGCTCCAGAAGATTTGG
AGGAGCATCCCAATGAAGAGGAAGAGGCAGAAGGAATTGATTTGCAGCAGCAGCAGCAAC
GTTATCCCTGGGAGGGAAGTGATAGGGATTATATATATGACGAGCTTCTTGGTAGAGTCT
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GGCCTCCCCAAGTTCTTCGTGAAGGGACAAAGAAGACAGTGTTTGTCAACTTTATGGACC
TTTGCAAGACAATGCATCGTCAACCGGACCATGTGATGAATTTCTTGCTTGCTGAGTTGG
GAACCAGTGGTTCGCTTGATGGACAGCAAAGATTGGT*GTCAAGGGA*GATTTGCACCCA
AGAATTT
GAGGG

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DS 

RD RS1FS31TF 761 0 0
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TCTCTCTCTCAGATTGATTCCTCCCAAAATCAACCCTTCTCCCCCAAAGTTAATTTTTCA
GTAGCAATCATGGCGGACGAGAATAATGAGTTGAAGGAGGTCAAGGACGAGCAAGAACTC
GCACCCTTTGACCCAACCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA***AGTTGTCCTTCAAGATCCC
ATCGAGGAACCAACTGAGTCACCGGCCGAGCCATCTGATTCTTTGCCTGCTAATGATGGT
GGCCTTGACGGTCCATCTTTCGGAACCAAGAAGAAAAAGAAGAAGAAGCCTGTTGAATCA
AGCTCATTGGATGAAGAAACTGCTGATGCTCCAGAAGATTTGGAGGAGCATCCCAATGAA
GAGGAAGAGGCAGAAGGAATTTATTTGCAGCAGCAGCAGCAACGTTATCCCTGGGAGGGA
AGTGATAGGGATTATATATATGACGAGCTTCTTGGTAGAGTCTTTAACATTCTCCGTGAG
AACAATCCGGAGCTTGCTGGAGATAGGCGTCGTACTGTTATGAGGCCTCCCCAAGTTCTT
CGTGAAGGGACAAAGAAGACAGTGTTTGTCAACTTTATGGACCTTTGCAAGACAATGCAT
CGTCAACCGGACCATGTGATGAATTTCTTGCTTGCTGAGTTGGGAACCAGTGGTTCGCTT
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T*GCGTCGT*ATGTCACTGAGTACGTCAT

QA 13 761 13 761
DS 

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GGCAGAAGGAATTTATTTGCAGCAGCAGCAGCAACGTTATCCCTGGGAGGGAAGTGATAG
GGATTATATATATGACGAGCTTCTTGGTAGAGTCTTTAACATTCTCCGTGAGAACAATCC
GGAGCTTGCTGGAGATAGGCGTCGTACTGTTATGAGGCCTCCCCAAGTTCTTCGTGAAGG
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GGACCATGTGATGAATTTCTTGCTTGCTGAGTTGGGAACCAGTGGTTCGCTTGATGGACA
GCAAAGATTGGTTGTCAAGGGAAGATTTGCACCCAAGAATTTTGAGGGGATTTTGCGTCG
TTATGTCACTGAGTACGTCATTTGCCTTGGTTGCAAGAGCCCGGACACAATTCTCTCAAA
GGAGAATCGTCTCTTCTTTTTCAGATGCGAGAAGTGTAGATCTGGACGATCTGTGGCGCA
GATCAAAGCTGGTTTTGTTGCTCGTGTTGGTCGCAGAAAGACTTGAGGAATTGGACGGTG
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TGTTGTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTGTTATTGTTTCTGAATGTGAGCAATAATCTGGAGA
CTAAGATTTCACATCAAATATGATCAAAACCCTCTACTTTGTT

QA 1 823 1 823
DS 

RD RS1CL89JQ 835 0 0
AAAAGAGAGAAGCTGTG
ATCAAGCTCATTGGATGAAGAAACTGCTGATGCTCCAGAAGATTTGGAGGAGCATCCCAA
TGAAGAGGAAGAGGCAGAAGGAATTGATTTGCAGCAGCAGCAGCAACGTTATCCCTGGGA
GGGAAGTGATAGGGATTATATATATGACGAGCTTCTTGGTAGAGTCTTTAACATTCTCCG
TGAGAACAATCCGGAGCTTGCTGGAGATAGGCGTCGTACTGTTATGAGGCCTCCCCAAGT
TCTTCGTGAAGGGACAAAGAAGACAGTGTTTGTCAACTTTATGGACCTTTGCAAGACAAT
GCATCGTCAACCGGACCATGTGATGAATTTCTTGCTTGCTGAGTTGGGAACCAGTGGTTC
GCTTGATGGACAGCAAAGATTGGTTGTCAAGGGAAGATTTGCACCCAAGAATTTTGAGGG
GATTTTGCGTCGTTATGTCACTGAGTACGTCATTTGCCTTGGTTGCAAGAGCCCGGACAC
AATTCTCTCAAAGGAGAATCGTCTCTTCTTTCTCAGATGCGAGAAGTGTGGATCTGGACG
ATCTGTGGCGCAGATCAAAGCTGGTTTTGTTGCTCGTGCTGGTCGCAGAAAGACTTGAGG
AATTGGACGGTGAACTGAGTGGTCTTTTTGTTTTGGGAAACTGCAGAGCTTGTTATGCAG
TTGAAATACCTGTGTTGTTTTTTTTT*GTTTTTTTTTGTTATTGTTTCTGAATGTGAGCA
ATAATCTGGAGACTAAGATTTCACATCAAATATGATCAAAACCCTCTACTTTGTTAGATC
ATGTGGGTCACTTGAATTCTTGAAGTTCTTTTGCTTCC

QA 18 835 18 835
DS 

RD RS1BN89TF 589 0 0
G
GGCCTCCCCAAGTTCTTCGTGAAGGGACAAAGAAGACAGTGTTTGTCAACTTTATGGACC
TTTGCAAGACAATGCATCGTCAACCGGACCATGTGATGAATTTCTTGCTTGCTGAGTTGG
GAACCAGTGGTTCGCTTGATGGACAGCAAAGATTGGTTGTCAAGGGAAGATTTGCACCCA
AGAATTTTGAGGGGATTTTGCGTCGTTATGTCACTGAGTACGTCATTTGCCTTGGTTGCA
AGAGCCCGGACACAATTCTCTCAAAGGAGAATCGTCTCTTCTTTCTCAGATGCGAGAAGT
GTGGATCTGGACGATCTGTGGCGCAGATCAAAGCTGGTTTTGTTGCTCGTGTTGGTCGCA
GAAAGACTTGAGGAATTGGACGGTGAACTGAGTGGTCTTTTTGTTTTGGGAAACTACAGA
GCTTGTTATGCAGTTGAAATACCTGTGTTGTTTTTTTT**GTTTTTTTTTGTTATTGTTT
CTGAATGTGAGCAATAATCTGGAGACTAAGATTTCACATCAAATATGATCAAAACCCTCT
ACTTTGTTAGATCATGTGGGTCACTTGAATTCTTGAAGTTCTTTTGCT

QA 2 589 2 589
DS 



AS 1 5

CO CL1478Contig1 1013 5 7 U
GGGAGTGACTCAGGGCCACGCAATCATGTGACGTCACCCGAATCTCTCTTAACCCGCCGT
CGAAATGCTTATCCACACGAACGAGCAGCCACTACTATTCGAGCCTCCGCCCGCCGGATT
ACAAATCGCCGATCGTCTAGAGTACAGTTTTACTCGTAGATGTCGTCGTCGCCGCCGTTG
GTGAAGTCTTATCTCTTCGCTCACAATTTTCTCCAAGCTTCGTCATGGACGATTTCGCTT
CTGAGTATCATTAGCAGCGTTTTGTCGAACAAGACGATCAGTGGCGGTTACGCTGCCGCT
GGATATTTGATAAGTGTGATGCAAACTGTTGCAGTTCTTGAAGTTCTTCACGGAGCCATA
GGAATTGTGCCGAGCGGTTTCTTATCTCCTTTGATGCAATGGAGTGGAAGAACACATTTC
ATATTAGCCATTGTTGGACAGATCAATGAGGTCCAGGATTCGCCATGGCTGGCAATGACA
CTTGTAGCTTGGTGTATCGGGGAGATGATCAGATATCCTCACTATGCTTTAACTTGCCTT
GGTAAATGTCCCTATTGGCTAACCTATCTCAGGTACACTGGATTCATCATGATCTATCCA
ACGGGACTAGTGGGTGAATTATTAGTCATGTACAAAGCGCTTCCACATGTTAAAGAAAGG
AACCTTTATGCGAATTTCTTCTCTGTTTTCCCCTTCAGTTACTACGATTTCCTTTGGGCC
GTCCTCTTGGTATACCCGTTCCTTTGGTTGAAGCTTTATCTCCAGCTGTTCAGACAAAGA
AAGTCTAAGCTTGGAAAAGCAGAGAAGCATGAGGGCAAGAGAAAGAGAATGTGAAACTCC
CTTCAAGGCTTCAATCATCTCCTCAGATATGTCTATCTTTATCCTTGTTTATGTTATCGC
TCTATGTGCTTTTAGCTTTTTATTCCTTTTACAAAAAGTTTAAATAATTTAATTGTGGTT
TGTTCGACAATAATTTAGTTATGGTTTGAATAATTTAATCATGCCATATTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B390TF U 105
AF RS1CP24TF U 1
AF RS1DN95TF U 77
AF RS1B390JQ C 187
AF RS1CP24JQ C 222
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GG
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TCATGATCTATCCAACGGGACTAGTGGGTGAATTATTA

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DS 

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CGAAATGCTTATCCACACGAACGAGCAGCCACTACTATTCGAGCCTCCGCCCGCCGGATT
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GTGAAGTCTTATCTCTTCGCTTACAATTTTCTCCAAGCTTCGTCATGGACGATTTCGCTT
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GGATATTTGATAAGTGTGATGCAAACTGTTGCAGTTCTTGAAGTTCTTCACGGAGCCATA
GGAATTGTGCCGAGCGGTTTCTTATCTCCTTTGATGCAATGGAGTGGAAGAACACATTTC
ATATTAGCCATTGTTGGACAGATCAATGAGGTCCAGGATTCGCCATGGCTGGCAATGACA
CTTGTAGCTTGGTGTATCGGGGAGATGATCAGATATCCTCACTATGCTTTAACTTGCCTT
GGTAAATGTCCCTATTGGCTAACCTATCTCAGGTACACTGGATTCATCATGATCTATCCA
ACGGGACTAGTGGGTGAATTATTAGTCATGTACAAAGCGCTTCCACATGTTAAAGAAAGG
AACCTTTATGCGAATTTCTTCTCTGTTTTCCCCT

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DS 

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GG
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AGAGTACAGTTTTACTCGTAGATGTCGTCGTCGCCGCCGTTGGTGAAGTCTTATCTCTTC
GCTTACAATTTTCTCCAAGCTTCGTCATGGACGATTTCGCTTCTGAGTATCATTAGCAGC
GTTTTGTCGAACAAGACGATCAGTGGCGGTTACGCTGCCGCTGGATATTTGATAAGTGTG
ATGCAAACTGTTGCAGTTCTTGAAGTTCTTCACGGAGCCATAGGAATTGTGCCGAGCGGT
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TTCCTTTGGTTGAAGCTTTATCTCCAGCTGTTCAGACAAAGAAAGTCTAAGCTT

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GCGTTTTGTCGAACAAGACGATCAGTGGCGGTTACGCTGCCGCTGGATATTTGATAAGTG
TGATGCAAACTGTTGCAGTTCTTGAAGTTCTTCACGGAGCCATAGGAATTGTGCCGAGCG
GTTTCTTATCTCCTTTGATGCAATGGAGTGGAAGAACACATTTCATATTAGCCATTGTTG
GACAGATCAATGAGGTCCAGGATTCGCCATGGCTGGCAATGACACTTGTAGCTTGGTGTA
TCGGGGAGATGATCAGATATCCTCACTATGCTTTAACTTGCCTTGGTAAATGTCCCTATT
GGCTAACCTATCTCAGGTACACTGGATTCATCATGATCTATCCAACGGGACTAGTGGGTG
AATTATTAGTCATGTACAAAGCGCTTCCACATGTTAAAGAAAGGAACCTTTATGCGAATT
TCTTCTCTGTTTTCCCCTTCAGTTACTACGATTTCCTTTGGGCCGTCCTCTTGGTATACC
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AAGCAGAGAAGCATGAGGGCAAGAGAAAGAGAATGTGAAACTCCCTTCAAGGCTTCAATC
ATCTCCTCAGATATGTCTATCTTTATCCTTGTTTATGTTATCGCTCTATGTGCTTTTAGT
TTTTTATTCCTTTTACAAAAAGTTTAAATAATTTAATTGTGGTTTGTTCGACAATAATTT
AGTTATGGTTTGAATAATTTAATCATGCCATATTATC

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DS 

RD RS1CP24JQ 784 0 0
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GAGTGGAAGAACACATTTCATATTAGCCATTGTTGGACAGATCAATGAGGTCCAGGATTC
GCCATGGCTGGCAATGACACTTGTAGCTTGGTGTATCGGGGAGATGATCAGATATCCTCA
CTATGCTTTAACTTGCCTTGGTAAATGTCCCTATTGGCTAACCTATCTCAGGTACACTGG
ATTCATCATGATCTATCCAACGGGACTAGTGGGTGAATTATTAGTCATGTACAAAGCGCT
TCCACATGTTAAAGAAAGGAACCTTTATGCGAATTTTTTCTCTGTTTTCCCCTTCAGTTA
CTACGATTTCCTTTGGGCCGTCCTCTTGGTATACCCGTTCCTTTGGTTGAAGCTTTATCT
CCAGCTGTTCAGACAAAGAAAGTCTAAGCTTGGAAAAGCAGAGAAGCATGAGGGCAAGAG
AAAGAGAATGTGAAACTCCCTTCAAGGCTTCAATCATCTCCTCAGATATGTCTATCTTTA
TCCTTGTTTATGTTATCGCTCTATGTGCTTTTAGCTTTTTATTCCTTTTACAAAAAGTTT
AAATAATTTAATTGTGGTTTGTTCGACAATAATTTAGTTATGGTTTGAATAATTTAATCA
TGCC

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 5

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AATGGCGACATCGGTTGCGACTCTATCTTCTCCGCCACCAGTCACTCTGCCTCTCTCGTC
ATCTCGCTCTTCCTTATTCTCCAACTGTTTCACAGTGACCACCCAACGAAGACCAAAGAC
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TTTCGGACCTAAGAAGCTTCCTGAGATTGGCAAGAGTATTGGCAAGACCGTCAAAAGCTT
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GAACAGTTTATGAAATGAGTTTAGATCAACTACTC**TTTGTTGATGGAAGCAGACTTGT
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AAGAAAGAAGCCTTTCAAACAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 5 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 
30 30 30 5 30 30 5 5 5 30 30 30 15 30 30 30 30 30 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E548JQ C 88
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AF RS1AM45TF U 43
AF RS1FM08TF U 1
AF RS1FM08JQ C 436
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T

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GGAAAAAACTGAGGTTTCGTCAAGCTCAGAGGACAATGCATGAATGAAGAATGATAAGCT
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GA

QA 1 589 1 589
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GAACAGTTTATGAAATGAGTTTAGATCAACTACTC**TTTGTTGATGGAAGCAGACTTGT
CTTCCTTTGAAATATGGTTCCTTGGTGTTTGGATCTCTCTCTATAGCTGTCCTTCTTAA*
AAGAAAGAAGCCTTTCAAACAAAAAAAA

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DS 

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TCCA
GTAGCAATGAGCAACAAGGAAGAGAAAAAAACTGAGGTTTCGTCAAGCTCAAAGGACAAT
GCATGAATGAAGAATGATAAGCTTTGTTTTCTTTGTAGCTAGAACAGTTTATGAAATGAG
TTTAGATCAACTACTC**TTTGTTGATGGAAGCAGACTTGTCTTCCTTTGAAATATGGTT
CCTTGGTGTTTGGATCTCTCTCTATAGCTGTCCTTCTTAAGAAGAAAGAAG
GCCTTTC

QA 5 235 5 235
DS 



AS 2 5

CO CL1480Contig1 947 3 11 U
CGAGTAAAACAGAAAACCATATAACAATGACTCCAAATATTACATGATAGTTGGCACACA
TACATGAAAAAAATGACTAAACTAAGCTAATCATCAAGGTACAACAAGCAGAAACATCAA
ACCACATCACCAACACGAAAAGTTTTTTAATTATGCTGATCAAAGTTATTAATCAACAAT
GCACACTACAAAAGGAGGCAATGCCTTGACATTTAACTGAAATAAATTCACTTAGATTAG
ATTCTAGAAGAATCCAAGAGCATGACGGTACTGAGGTTCATAGGGTGCATATACTTGGAG
GAACCAGTGAGGATCTGATTAACAATGATCCTATTAGCTTTCTCTGTCGGATGAAACGCA
TCCCAAAACGCATATAAATCTCTGTTTGGACATAAGTTCGAGATTGGTGTGCATAGTCCT
ATGCCATTGTACGGTCCTTGTCCACAACATGCCACCTTTGATGTCACAAACCCGAATTGC
TCTGGATTAGTTAGATAATCCATGTTCATTTGATAGGCATTGGCTGCTACAAAAACGTCC
TGACCGATCTCAGCGTTGACTGATGCGATCAAATTAACTAATTGCGGATTGAACAAAGCG
GCTGCTGTTTGTAGAGCACCATAGCATTCGCCATTTCGACTATGCTGAGCCAGTTCCGCA
GGTGCACATCCCATCGCACCAGTTCCGGTTACTAGAACCCGTCTTGCACCCAACTCATAG
AGTTTCCTAAGGATCTTTCCGTATTCGGAAATGAGATAAACAACGTAGTTCGGTAACGTG
AACTGGCGAGAGCGGGCAGAGAAAGGAATGAGATAATAGTTGTTAACGAAATCGTTTCCA
CCGAGTGTGATTAAGACAAGAGCTTGGTTAACTAGCTGTTGTGTAGCTTCTGGTCCGATC
ATGCGCTCACTCGTTGCTGGTACTGTTGGAAGTATTCGACTGCTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C228JQ U 1
AF RS1EH37JQ U 23
AF RS1BC04JQ U 123
BS 1 249 RS1C228JQ
BS 250 250 RS1EH37JQ
BS 251 528 RS1C228JQ
BS 529 529 RS1EH37JQ
BS 530 655 RS1C228JQ
BS 656 656 RS1EH37JQ
BS 657 755 RS1C228JQ
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BS 844 844 RS1BC04JQ
BS 845 851 RS1EH37JQ
BS 852 947 RS1BC04JQ

RD RS1C228JQ 755 0 0
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TACATGAAAAAAATGACTAAACTAAGCTAATCATCAAGGTACAACAAGCAGAAACATCAA
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GCACACTACAAAAGGAGGCAATGCCTTGACATTTAACTGAAATAAATTCACTTAGATTAG
ATTCTAGAAAAATCCAAGAGCATGACGGTACTGAGGTTCATAGGGTGCATATACTTGGAG
GAACCAGTGAGGATCTGATTAACAATGATCCTATTAGCTTTCTCTGTCGGATGAAACGCA
TCCCAAAACGCATATAAATCTCTGTTTGGACATAAGTTCGAGATTGGTGTGCATAGTCCT
ATGCCATTGTACGGTCCTTGTCCACAACATGCCACCTTTGATGTCACAAACCCGAATTGC
TCTGGATTAGTTAGATAATCCATGTTCATTTGATAGGCATTGGCTGCTGCAAAAACGTCC
TGACCGATCTCAGCGTTGACTGATGCGATCAAATTAACTAATTGCGGATTGAACAAAGCG
GCTGCTGTTTGTAGAGCACCATAGCATTCGCCATTTCGACTATGCTGAGCCAGTTTCGCA
GGTGCACATCCCATCGCACCAGTTCCGGTTACTAGAACCCGTCTTGCACCCAACTCATAG
AGTTTCCTAAGGATCTTTCCGTATTCGGAAATGAG

QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1EH37JQ 829 0 0
GG
CAATGACTCCAAATATTACATGATAGTTGGCACACATACATGAAAAAAATGACTAAACTA
AGCTAATCATCAAGGTACAACAAGCAGAAACATCGAACCACATCACCAACACGAAAAGTT
TTTTAATTATGCTGATCAAAGTTATTAATCAACAATGCACACTACAAAAGGAGGCAATGC
CTTGACATTTAACTGAAATAAATTCACTTAGATTAGATTCTAGAAGAATCCAAGAGCATG
ACGGTACTGAGGTTCATAGGGTGCATATACTTGGAGGAACCAGTGAGGATCTGATTAACA
ATGATCCTATTAGCTTTCTCTGTCGGATGAAACGCATCCCAAAACGAATATAAATCTCTG
TTTGGACATAAGTTCGAGATTGGTGTGCATAGTCCTATGCCATTGTACGGTCCTTGTCCA
CAACATGCCACCTTTGATGTCACAAACCCGAATTGCTCTGGATTAGTTAGATAATCCATG
TTCATTTGATAGGCATTGGCTGCTACAAAAACGTCCTGACCGATCTCAGCGTTGACTGAT
GCGATCAAATTAACTAATTGCGGATTGAACAAAGCGGCTGCTGTTTGTAGAGCACCATAG
CATTCGCCATTTCGACTATGCTGAGCCAGTTCCGCAGGTGCACATCCCATCGCACCAGTT
CCGGTTACTAGAACCCGTCTTGCACCCAACTCATAGAGTTTCCTAAGGATCTTTCCGTAT
TCGGAAATGAGATAAACAACGTAGTTCGGTAACGTGAACTGGCGAGAGCGGGCAGAGAAA
GGAATGAGATAATAGTTGTTAACGAAATCGTTTCCACCGGGTGTGAT

QA 3 829 3 829
DS 

RD RS1BC04JQ 825 0 0
CTTT
TCACCAACACGAAAAGTTTTTTAATTATGCTGATCAAAGTTATTAATCAACAATGCACAC
TACAAAAGGAGGCAATGCCTTGACATTTAACTGAAATAAATTCACTTAGATTAGATTCTA
GAAGAATCCAAGAGCATGACGGTACTGAGGTTCATAGGGTGCATATACTTGGAGGAACCA
GTGAGGATCTGATTAACAATGATCCTATTAGCTTTCTCTGTCGGATGAAACGCATCCCAA
AACGCATATAAATCTCTGTTTGGACATAAGTTCGAGATTGGTGTGCATAGTCCTATGCCA
TTGTACAGTCCTTGTCCACAACATGCCACCTTTGATGTCACAAACCCGAATTGATCTGGA
TTAGTTAGATAATCCATGTTCATTTGATAGGCATTGGATGCTACAAAAACGTCCTGACCG
ATCTCAGCGTTGACTGATGCGATCAAATTAACTAATTGCGGATTGAACAAAGCGGCTGCT
GTTTGTAGAGCACCATAGCATTCGCCATTTCGACTATGCTGAGCCAGTTCCGCAGGTGCA
CATCCCATCGCACCAGTTCCGGTTACTAGAACCCGTCTTGCACCCAACTCATAGAGTTTC
CTAAGGATCTTTCCGTATTCGGAAATGAGATAAACAACGTAGTTCGGTAACGTGAACTGG
CGAGAGCGGGCAGAGAAAGGAATGAGATAATAGTTGTTAACGAAATCGTTTCCACCGAGT
GTGATTAAGACAAGAGCTTGGTTAACTAGCTGTTGTGTAGCTTCTGGTCCGATCATGCGC
TCACTCGTTGCTGGTACTGTTGGAAGTATTCGACTGCTTAG

QA 5 825 5 825
DS 



CO CL1480Contig2 814 2 4 U
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TCCAAACCGCATCTCTTCCCACAACTATGGAAACTAATTATTCTCCATTAGGGTTTCTAA
TTTCACTCTTCATCGTTGTTACTTTTCTTGCACCACAAGTCAAATCTAGGGCTTTCTACG
TATTTGGTGACTCTCTCGTCGACAATGGAAACAACGATTACTTAGTCACCACTGCTCGTG
CCGACAACTACCCATATGGTATCGATTACCCGACCCGTCGACCCACCGGACGTTTCTCAA
ATGGCCTCAACATCCCCGACATTATCAGTGAGGCTATAGGCATGCCGTCGACTCTGCCGT
ACCTTAGCCCGCAGCTCACCGGAGAAAATCTTCTCGTAGGTGCTAACTTCGCCTCCGCCG
GAATTGGAATCCTCAACGACACTGGAATTCAATTTGTAAACATAATTAGAATATCTAAGC
AGTTCGAATACTTCCAACAGTACCAGCAACGAGTGAGCGCATTGATCGGACCAGAAGCTA
CACAACAGCTAGTTAACCAAGCTCTTGTCTTAATCACACTCGGTGGAAACGATTTCGTTA
ACAACTATTATCTCATTCCTTTCTCTGCCCGCTCTCGCCAGTTCACGTTACCGAACTACG
TTGTTTATCTCATTTCCGATACGGAAAGATCCTTAGGAAACTCTATGAGTTGGGTGCAAG
ACGGGTTCTAGTAACCGGACTGGGGCGATGGGATGTGCACCTGCGGACTGGCTCAGCATA
GTCGAAATGCGAATGCTATGGTGCTCTACAACAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C228TF U 1
AF RS1BC04TF U 27
BS 1 346 RS1C228TF
BS 347 347 RS1BC04TF
BS 348 675 RS1C228TF
BS 676 814 RS1BC04TF

RD RS1C228TF 675 0 0
GGACACTCCATATGCTATCATATTATTCACCAACTTAAAATTCTTTCTCCCCATTCGTTA
TCCAAACCGCATCTCTTCCCACAACTATGGAAACTAATTATTCTCCATTAGGGTTTCTAA
TTTCACTCTTCATCGTTGTTACTTTTCTTGCACCACAAGTCAAATCTAGGGCTTTCTACG
TATTTGGTGACTCTCTCGTCGACAATGGAAACAACGATTACTTAGTCACCACTGCTCGTG
CCGACAACTACCCATATGGTATCGATTACCCGACCCGTCGACCCACCGGACGTTTCTCAA
ATGGCCTCAACATCCCCGACATTATCAGTGAGGCTATAGGCATGCCTTCGACTCTGCCGT
ACCTTAGCCCGCAGCTCACCGGAGAAAATCTTCTCGTAGGTGCTAACTTCGCCTCCGCCG
GAATTGGAATCCTCAACGACACTGGAATTCAATTTGTAAACATAATTAGAATATCTAAGC
AGTTCGAATACTTCCAACAGTACCAGCAACGAGTGAGCGCATTGATCGGACCAGAAGCTA
CACAACAGCTAGTTAACCAAGCTCTTGTCTTAATCACACTCGGTGGAAACGATTTCGTTA
ACAACTATTATCTCATTCCTTTCTCTGCCCGCTCTCGCCAGTTCACGTTACCGAACTACG
TTGTTTATCTCATTT

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1BC04TF 788 0 0
GG
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GGAAACTAATTATTCTCCATTAGGGTTTCTAATTTCACTCTTCATCGTTGTTACTTTTCT
TGTACCACAAGTCAAATCTAGGGCTTTCTACGTATTTGGTGACTCTCTCGTCGACAATGG
AAACAACGATTACTTAGTCACCACTGCTCGTGCCGACAACTACCCATATGGTATCGATTA
CCCGACCCGTCGACCCACCGGACGTTTCTCAAATGGCCTCAACATCCCCGACATTATCAG
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TCTTCTCGTAGGTGCTAACTTCGCCTCCGCCGGAATTGGAATCCTCAACGACACTGGAAT
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CTTAATCACACTCGGTGGAAACGATTTCGTTAACAACTATTATCTCATTCCTTTCTCTGC
CCGCTCTCGCCAGTTCACGTTACCGAACTACGTTGTTTATCTCATTTCCGATACGGAAAG
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TGGGATGTGCACCTGCGGACTGGCTCAGCATAGTCGAAATGCGAATGCTATGGTGCTCTA
CAACAG

QA 3 788 3 788
DS 



AS 1 3

CO CL1481Contig1 1082 3 8 U
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TCTCTCGAATCTCTACAGAGAACCAATCCTGTCTTGAAAGGATTTAACACAAGAAAAAAA
AAACAAGCTGAAACAGGGTGAATCAGTAGTGAGTAGTTGGAACCCTGGTGGTAGTTTTCG
CCGGTAAAACATTGTCGGGAAAAATCAACTCGGGTGGAGTTTCACGGACAATCCCAAGCA
TTGAATCATAATCCTCATCCTTGCGTGCATATTTCTTCCTAAGCGCACTCTCAACCTCGA
TCTCATCAAATGACTTTGAATTCTCAGCGGCATGAATGTGTGCAAGATTGATGTAGTTCT
ATGCAGACTTTGAGATATATGCTATCTCTTCATCTGTTAACTTCCTCATAAACTTTGCTG
GATTCCCTCCCC*AAACCTCTCCAGAAGGAATACGGGTGTTCTCTTTGACAAGAGAACCA
ACAGCAACCATGGCATTCTTCTCAACCACCACACCATCAAGTAGTGTAGCTCCCATGCCA
ACAAATGCCTCATCCTCAACAGTACACCCATGTATAACGGCACTATGACCTACAGTGACC
TTGTCCCCAATCGTAGTAGGTAAAACCTTCCCACCAAGATTGGTTTTCGCAACATGTACA
AGAGAATTATCTTGGATATTCGTCCCTGATCCAACACTGATGTTGTTCACATCACCTCGA
AGAACACAGCCATACCAAATAGAGGAGCCTTTCCCGATTTGAACGTCACCAATAACAGAT
GCACTTGGAGCCACGAACGCATCCTTATCCACCAATGGAGATTTATCAAACACATCCATC
AACGTCCGATGCCTCGATAGCTGTTCTTCGAAGCGGTGGCTCCCTTGAAGAAGAGAGCCG
AAACGATCGAGAGCTTTGCCGGAGCCCCGGATCCAGTTACCCACAGTGTAAATAGCTCGT
CCTAGGGTTCCCATTTCCGATTACCACAGAGATACGACGACGACAAGGGAGAGAGAGCAC
CC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1EV45JQ U 1
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AF RS1CN66TF C 328
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RD RS1EV45JQ 534 0 0
G
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AACAAGCTGAAACAGGGTGAATCAGTAGTGAGTAGTTGGAACCCTGGTGGTAGTTTTCGC
CGGTAAAACATTGTCGGGAAAAATCAACTCGGGTGGAGTTTCACGGACAATCCCAAGCAT
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QA 2 534 2 534
DS 

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CCGGTAAGACATTGTCGGGAAGAATCAACTCGGGTGGAGTTTCACGGACAATCCCAAGCA
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TTGTCCCCAATCGTAGTAGGTAAAACCTTCCCACCAAGATTGGTTTTCGCAACATGTACA
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QA 1 778 1 778
DS 

RD RS1CN66TF 755 0 0
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CTAAGCGCACTCTCA*CCTCGATCTCATCAAATGACTTTGAATTCTCAGCGGCATGAATG
TGTGCAAGATTGATGTAGTTCTATGCAGACTT*GAGATATATGCTATCTCTTCATCTGTT
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GTTCTCTTTGACAAGAGAACCAACAGCAACCATGGCATTCTTCTCAACCACCACACCATC
AAGTAGTGTAGCTCCCATGCCAACAAATGCCTCATCCTCAACAGTACACCCATGTATAAC
GGCACTATGACCTACAGTGACCTTGTCCCCAATCGTAGTAGGTAAAACCTTCCCACCAAG
ATTGGTTTTCGCAACATGTACAAGAGAATTATCTTGGATATTCGTCCCTGATCCAACACT
GATGTTGTTCACATCACCTCGAAGAACACAGCCATACCAAATAGAGGAGCCTTTCCCGAT
TTGAACGTCACCAATAACAGATGCACTTGGAGCCACGAACGCATCCTTATCCACCAATGG
AGATTTATCAAACACATCCATCAACGTCCGATGCCTCGATAGCTGTTCTTCGAAGCGGTG
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ACCCACAGTGTAAATAGCTCGTCCTAGGGTTCCCATTTCCGATTACCACAGAGATACGAC
GACGACAAGGGAGAGAGAGCACCC

QA 12 755 12 755
DS 



AS 1 5

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AGTTATTAAACAGAGCATCTAATCTTATCATTGAAGGAAACTATATTTATTTGTATAGTC
GATA*GAGTAAACCAACCAACATATAAAATCCAACCCACTTCTTTCAAAAACCGGTTATA
CCCCGGCCAGTTTCACCGGTTAAGATACAATTTTACAATATCTACCTTTCTTAGTTATTT
ACAATTTATTACCCTCTCATTTCCAATTACATAACAGAACATCCTTCTGGATTCTCATCG
CTGAACATCTGAGGAGCACGCATATGAGCATAAGGATCTGCATACCCTTGGTGGTTCATA
TACGGTTGTGGTGGTGCTTCTTGTCCATACCCTTGGCCGTATCCTTGATTTCTATACGAT
TCATGTACATATCCTTGGTTAGCATACGGTTCTTGTACATACGGTTGAAATGATTGACCT
TGCATCATGTAGTGTTGACCGTACATTTGTCCTGGTGGGTAGTAATACATCGGCTGAGGT
GGATAGCCATAACCGCTATACTCCGATTTCTTCACATCCACCGTAGCACCACCGTCTCCT
ACTCCGGCTGGAGCAACTTCTTTTTTCTTTTCACCACCACCGTCTTTCTTTTCTCCCACA
TCTTTGCTCTCTTTCTTTTCACCACCACCACCATCCTCCTTCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1CZ95TF C 93
AF RS1CZ95JQ U 93
AF RS1FH50JQ U 1
AF RS1DS59JQ U 17
AF RS1FL25JQ U 146
BS 1 52 RS1FH50JQ
BS 53 53 RS1DS59JQ
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GT
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CCCACTTCTTTCAAAAACCGGTTATACCCCGGCCAGTTTCACCGGTTAAGATACGATTTT
ACAATATCTACCTTTCTTAGTTATTTACAATTTATTACCCTCTCATTTCCAATTACATAA
CAGAACATCCTTCTGGATTCTC

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DS 

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GT
AGGAAACTATATTTATTTGTATAGTCGATA*GAGTAAACCAACCAACATATAAAATCCAA
CCCACTTCTTTCAAAAACCGGTTATACCCCGGCCAGTTTCACCGGTTAAGATACGATTTT
ACAATATCTACCTTTCTTAGTTATTTACAATTTATTACCCTCTCATTTCCAATTACATAA
CAGAACATCCTTCTGGATTCTCATCGCTGAACATCTGAGGAGCACGCATATGAGCATAAG
GATCTGC

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DS 

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AGTTATTAAACAGAGCATCTAATCTTATCATTGAAGGAAACTATATTTATTTGTATAGTC
GATAAGAGTAAACCAACCAACATATAAAATCCAACCCACTTCTTTCAAAAACCGGTTATA
CCCCGGCCAGTTTCACCGGTTAAAATACAATTTTACCATATCTACCTTTCTTAGTTATTT
ACAATTTATTACCCTCTCATTTCCACTTACATAACAAAACATCCTTCTGGATTCTCATCG
CTGAACATCTGAGGAGCACGCATATGAGCATAAGGATCTGCATACCCTTGGTGGTTCATA
TACGGTTGTGGTGGTGCTTCTTGTCCATACCCTTGGCCGTATCCTTGATTTCTATACGAT
TCATGTACATATCCTTGGTTAGCATACGGTTCTTGTACATACGGTTGAAATGATTGACCT
TGCATCATGTAGTGTTGACCGTACATTTGTCCTGGTGGGTAGTAATACATCGGCTGAGGT
GGATAGCCATAACCGCTATACTCCGATTTCTTCACATCCACCGTAGCACCACCGTCTCCT
ACTCCGGCTGGAGCAAC

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ATCTAATCTTATCATTGAAGGAAACTATATTTATTTGTATAGTCGATAAGAGTAAACCAA
CCAACATATAAAATCCAACCCACTTCTTTCAAAAACCGGTTATACCCCGGCCAGTTTCAC
CGGTTAAGATACAATTTTACCATATCTACCTTTCTTAGTTATTTACAATTTATTACCCTC
TCATTTCCACTTACATAACAGAACATCCTTCTGGATTCTCATCGCTGAACATCTGAGGAG
CACGCATATGAGCATAAGGATCTGCATACCCTTGGTGGTTCATATACGGTTGTGGTGGTG
CTTCTTGTCCATACCCTTGGCCGTATCCTTGATTTCTATACGATTCATGTACATATCCTT
GGTTAGCATACGGTTCTTGTACATACGGTTGAGATGATTGACCTTGCATCATGTAGTGTT
GACCGTACATTTGTCCTGGTGGGTAGTAATACATCGGCTGAGGTGGATAGCCATAACCGC
TATACTCCGATTTCTTCACATCCACCGTAGCACCACCGTCTCCTACTCCGGCTGGAGCAA
CTTCTTTTTTCTTTTCACCACCACCGTCTTTCTTTTCTCCCACATCTTTGCTCTCTTTCT
TTTCACCACCACCACCATCCTTCTTCT

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TACAATTTTACCATATCTACCTTTCTTAGTTATTTACAATTTATTACCCTCTCATTTCCA
CTTACATAACAAAACATCCTGCTGGATTCTCATCGCTGAACATCTGAGGAGCACGCATAT
GAGCATAAGGATCTGCATACCCTTGGTGGTTCATATACGGTTGTGGTGGTGCTTCTTGTC
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ACGGTTCTTGTACATACGGTTGAAATGATTGACCTTGCATCATGTAGTGTTGACCGTACA
TTTGTCCTGGTGGGTAGTAATACATCGGCTGAGGTGGATAGCCATAACCGCTATACTCCG
ATTTCTTCACATCCACCGTAGCACCACCGTCTCCTACTCCGGCTGGAGCAACTTCTTTTT
TCTTTTCACCACCACCGTCTTTCTTTTCTCCCACATCTTTGCTCTCTTTCTTTTCACCAC
CACCACCATCCTCCTTCTCT

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DS 



AS 1 5

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CTTTTTGTTCATAGCTTGGTAATAAACAGTCTTGCTTCTCGCAAGGCTCAATAAGAGGAG
ATGGGTGAAACCGCTGCCGCCAACAACCACCATCACCACCACCATCACGGCCACCAAGTC
TTTGACGCGTCCGTCCCACAACAACCAGCTTTCAAATGCTTTGACGATGACGGCCGTCTC
AAAAGAACCGGTACTGTTTGGACCGCAAGCGCTCATATAATTACAGCAGTGATCGGTTCA
GGCGTCCTCTCGCTTGCATGGGCCATTGCTCAGCTTGGGTGGATAGCTGGACCTGTGGTG
ATGCTATTGTTCTCTTTTGTTACTCTATATACTTCAACACTTCTCAGTGATTGCCACAGA
ACTGGAGATGCAGTCTCCGGCAAGAGAAACTACACTTACATGGATGCAGTTCGATCCATT
CTCGGTGGGTTCAAGTTCAAGATATGTGGACTGATACAATACTTGAATCTCTTTGGTATC
GCTATCGGTTACACAATAGCAGCATCTATAAGCATGATGGCAATCAAGAGATCGAACTGT
TTCCACAAGAGCGGAGGAAAAGACCCATGTCACATGTCGAGTAACCCTTACATGATCATC
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GTTCAAGTTGCTGCAAATGGAGTATTCAAAGGGAGTCTCACGGGCATAAGCATTGGGACA
GTGACTCAAACACAAAAGATATGGAGAACATTTCAAGCACTTGGAGATATTGCCTTCGCT
TACTCATACTCTGTTGTCCTAATCGAGATTCAGGATACTGTAAGATCTCCACCAGCAGAA
TCAACAACGATGAAGAAAGCTACAAAGATCAGCATTGCAGTCACCACAATCTTCTACATG
CTATGTGGCTCAATGGTTATGCCGCCTTTGGAGACGCAGCACCAGGAAACCTCCTCACGG
GTTTCGGATTCTACAACCCGTTTTGGCTCCTCGACATAGCCAACGCCGCCATTGTAGTCC
ACCTCATAGGAGCTTACCAAGTCTTCTCTCAGCCAATCTTCGCATTCGTTGAAAAATCAT
TCTCAGAAAGGTTTCCAGACAGTGACTTGCTCACCAAGGAACTCCAAATCAAGATCCCAG
GTTTTAGGTCTCCATACAAAACAAACGTTTTCAGGGTAGTTTTCCGGTGCTGCTTCGTAG
TTCTAACCACCGTGATATCGATGCTAATGCCGTTTTTCAACGACGTGGTTGGGATCTTAG
GAGCCTTAGGGTTTTGGCCCTTGACGGTTTACTTCCCGGTGGAGATGTATATAAAGCAGA
GGAAGGTAGAGAAGTGGAGCACGAGGTGGGTTTGTTTACAGATGCTTAGTGCTGCTTGTC
TAGTGATCTCGGTGGTCGCTGGAGTTGGGTCAATAGCCGGAGTGATGCTTGATCTTAAGG
TCTACAAGCCCTTCCAGTCAACGTATTGATTATTGATGATGGACCAAGAACAAAAGAAAA
GTGGTGTATAAAGCTTATTGTTTATAGTAAGCATTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BM19TF U 79
AF RS1FE94TF U 1
AF RS1AP68TFB U 587
AF RS1AP68JQ C 789
AF RS1FE94JQ C 1171
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CAACAACCAGCTTTCAAATGCTTTGACGATGACGGCCGTCTCAAAAGAACCGGTACT***
TGGACCGCAAGCGCTCATATAATTACAGCAGTGATCGGTTCAGGCGTCCTCTCGCTTGCA
TGGGCCATTGCTCAGCTTGGGTGGATAGCTGGACCTGTGGTGATGCTATTGTTCTCTTTT
GTTACTCTATATACTTCAACACTTCTCAGTGATTGCTACAGAACTGGAGATGCAGTCTCC
GGCAAGAGAAACTACACTTACATGGATGCAGTTCGATCCAT

QA 1 401 1 401
DS 

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AAAAGAACCGGTACTGTTTGGACCGCAAGCGCTCATATAATTACAGCAGTGATCGGTTCA
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GCTATCGGTTACACAATAGCAGCATCTATAAGCATGATGGCAATCAAGAGATCGAACTGT
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TTCGGTGTGACAGAGATCTTGCTCTCTCAG*TTCCTGATTTCGACCAGATTTGGTGGATC
TCCATTGTAGCAGCTGTCATGTCCTTCACTTACTCTGCCATTGGTCTAGCTCT

QA 1 773 1 773
DS 

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G
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TTACATGATCATCTTCGGTGTGACAGAGATCTTGCTCTCTCAGGTTCCTGATTTCGACCA
GATTTGGTGGATCTCCATTGTAGCAGCTGTCATGTCCTTCACTTACTCTGCCATTGGTCT
AGCTCTAGGGATCGTTCAAGTTGCTGCAAATGGAGTATTCAAAGGGAGTCTCACGGGCAT
AAGCATTGGGACAGTGACTCAAACACAAAAGATATGGAGAACATTTCAAGCACTTGGAGA
TATTGCCTTCGCTTACTCATACTCTGTTGTCCTAATCGAGATTCAGGATACTGTAAGATC
TCCACCAGCAGAATCAACAACGATGAAGAAAGCTACAAAGATCAGCATTGCAGTCACCAC
AATCTTCTACATGCTATGTGGCTCAATGGTTATGCCGCCTTTGGAGACGCAGCACCAGGA
AACCTCCTCACGGGTTTCGGATTCTACAACCCGTTTTGGCTCCTCGACATAGCCAACGCC
GCCATTGTAGTCCACCTCATAGGAGCTTACCAAGTCTTCTCTCAGCCAATCTTCGCATTC
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ATCAAGATCCCAGGTTT

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CTCTGTTGTCCTAATCGAGATTCAGGATACTGTAAGATCTCCACCAGCAGAATCAACAAC
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CTCAATGGTTATGCCGCCTTTGGAGACGCAGCACCAGGAAACCTCCTCACGGGTTTCGGA
TTCTACAACCCGTTTTGGCTCCTCGACATAGCCAACGCCGCCATTGTAGTCCACCTCATA
GGAGCTTACCAAGTCTTCTTTCAGCCAATCTTCGCATTCGTTGAAAAATCATTCTCAGAA
AGGTTTCCAGACAGTGACTTGCTCACCAAGGAACTCCAAATCAAGATCCCAGGTTTTAGG
TCTCCATACAAAACAAACGTTTTTAGGGTAGTTTTCCGGTGCTGCTTCGTAGTTCTAACC
ACCGTGATATCGATGCTAATGCCGTTTTTCAACGACGTGGTTGGGATCTTAGGAGCCTTA
GGGTTTTGGCCCTTGACGGTTTACTTCCCGGTGGAGATGTATATAAAGCAGAGGAAGGTA
GAGAAGTGGAGCACGAGGTGGGTTTGTTTACAGATGCTTAGTGCTGCTTGTCTAGTGATC
TCGGTGGTCGCTGGAGTTGGGTCAATAGCCGGAGTGATGCTTGATCTTAAGGTCTACAAG
CCCTTCCAGTCAACGTATTGATTATTGATGATGG

QA 1 814 1 814
DS 

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AGCCAATCTTCGCATTCGTTGAAAAATCATTCTCAGAAAGGTTTCCAGACAGTGACTTGT
TCACCAAGGAACTCCAAATCAAGATCCCAGGTTTTAGGTCTCCATACAAAACAAACGTTT
TCAGGGTAGTTTTCCGGTGCTGCTTCGTAGTTCTAACCACCGTGATATCGATGCTAATGC
CGTTTTTCAACGACGTGGTTGGGATTTTAGGAGCCTTAGGGTTTTGGCCCTTGACGGTTT
ACTTCCCGGTGGAGATGTATATAAAGCAGAGGAAGGTAGAGAAGTGGAGCACGAGGTGGG
TTTGTTTACAGATGCTTAGTGCTGCTTGTCTAGTGATCTCGGTGGTCGCTGGAGTTGGGT
CAATAGCCGGAGTGATGCTTGATCTTAAGGTTTACAAGCCCTTCCAGTCAACGTATTGAT
TATTGATGATGGACCAAGAACAAAAGAAAAGTGGTGTATAAAGCTTATTGTTTATAGTAA
GCATTTGG

QA 1 488 1 488
DS 



AS 1 5

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TGAAAATTAAACATCATACAAGAATAGATAAGACAAGAATCCATATTGTGGAACACGAAA
CAAAAGCCATTACAACATCTCTAGAAAGCATAGTGTTCGAAGAACAAAAGCACAACAAAG
GTTCTTTTTATTTTATTACCACCGTAAACAAAATGAAGACACAAACTCAAACCGTGAGGA
CAAGCTTCTTTTTTCTCTCTCTTCAATGGCTGGCTAATTTGAGAGTGTTGGCCTTGTCTT
GTAGTGTACCAAGCAGACTCTCGAAACTCTTTTTGAACGAGTCTACACCTTCTTCTTCCA
ACTGTTCTCCCACTTTGTTCCAGTCTATTCCCAGCTTCTCTAGTGCACTGTATATTCCTT
CTGCTTCCGACACATTTGCATCTATCGTCCTCTTCACGGTTCCATGATCTATGAATGCTT
CCAGGGCTTGATCAGGCATGGTTGACACAGTGTCAGGTCCAATGAGAGGAGCAACATATA
AAGTGTCAGAATAAGCTGGGTTCTTAACACTTGTGGATGCCCAGAGAAGCCTCTGCTTCT
TGGCACCTTTCTTCACCAGAGCCTCCCATCTTGGTCCTGAGAATTTTTTCTGGTACAGCT
TGTATGCTAATGCAGCTTGAGCCACAGCTGCCTTGCCACGGAGGTCTAGGGCTTCTGGGG
TACCAATTTTCTCAAGCATCTTGTCCATGAGAGTATCCACTCTACTGACA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EK40JQ U 62
AF RS1A791JQ U 1
AF RS1A791TF C 1
AF RS1EK40TF C 62
AF RS1BH59JQ U 34
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BS 213 213 RS1BH59JQ
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RD RS1EK40JQ 435 0 0
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QA 1 435 1 435
DS 

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TGGCACCTTTCTTCACCAGAGCCTC

QA 1 625 1 625
DS 

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TGAAAATTAAACATCATACAAGAATAGATAAGACAAGAATCCATATTGTGGAACACGAAA
CAAAAGCCATTACAACATCTCTAGAAAGCATAGTGTTCGAAGAACAAAAGCACAACAAAG
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CAAGCTTCTTTTTTCTCTCTCTTCAATGGCTGGCTAATTTGAGAGTGTTGGCCTTGTCTT
GTAGTGTACCAAGCAGACTCTCGAAACTCTTTTTGAACGAGTCTACACCTTCTTCTTCCA
ACTGTTCTCCCACTTTGTTCCAGTCTATTCCCAGCTTCTCTAGTGCACTGTATATTCCTT
CTGCTTCCGACACATTTGCATCTATCGTCCTCTTCACGGTTCCATGATCTATGAATGCTT
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AAGTGTCAGAGTAAGCTGGGTTCTTAACACTTGTGGATGCCCAGAGAAGCCTCTGCTTCT
TGGCACCTTTCTTCACCAGAGCCTC

QA 1 625 1 625
DS 

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GAAAATTAAACATCATACAAGAATAGATAAGACAAGAATCCATATTGTGGAACACGAAAC
AAAAGCCATTACAACATCTCTAGAAAGCATAGTGTTCGAAGAACAAAAGCACAACAAAGG
TTCTTTTTATTTTATTACCACCGTAAACAAAATGAAGACACAAACTCAAACCGTGAGGAC
AAGCTTCTTTTTTCTCTCTCTTCAATGGCTGGCTAATTTGAGAGTGTTGGCCTTGTCTTG
TAGTGTACCAAGCAGACTCTCGAAACTCTTTTTGAACGAGTCTACACCTTCTTCTTCCAA
CTGTTCTCCCACTTTGTTCCAGTCTATTCCCAGCTTCTCTAGTGCACTGTATATTCCTTC
TGCTTCCGACACATTTGCATCTATCGTCCTCTTCACGGTTCCATGGTCTATGAATGCTTC
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GGCACCTTTCTTCACCAGAGCCTCCCATCTTGGTCCTGAGAATTTTTTCTGGT
C

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DS 

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GG
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AAGACACAAACTCAAACCGTGAGGACAAGCTTCTTTTTTCTCTCTCTTCAATGGCTGGCT
AATTTGAGAGTGTTGGCCTTGTCTTGTAGTGTACCAAGCAGACTCTCGAAACTCTTTTTG
AACGAGTCTACACCTTCTTCTTCCAACTGTTCTCCCACTTTGTTCCAGTCTATTCCCAGC
TTCTCTAGTGCACTGTATATTCCTTCTGCTTCCGACACATTTGCATCTATCGTCCTCTTC
ACGGTTCCATGATCTATGAATGCTTCCAGGGCTCGATCAGGCATGGTTGACACAGTGTCA
GGTCCAATGAGAGGAGCAACATATAAAGTGTCAGAATAAGCTGGGTTCTTAACACTTGTG
GATGCCCAGAGAAGCCTCTGCTTCTTGGCACCTTTCTTCACCAGAGCCTCCCATCTTGGT
CCTGAGAATTTTTTCTGGTACAGCTTGTATGCTAATGCAGCTTGAGCCACAGCTGCCTTG
CCACGGAGGTCTAGGGCTTCTGGGGTACCAATTTTCTCAAGCATCTTGTCCATGAGAGTA
TCCACTCTACTGACA

QA 3 737 3 737
DS 



AS 1 5

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CTTTTATAGAGGCATCTGACTCTTCCATAGCCTTGTGCAAGATAGAGGGATATCAGGTTA
ACTCTTTCTTGACGCCAACACCAACAGTTACGATTTACTTCCTTTATTATTACTGATCAT
CAGTATCTCTAGAGGGAAAACAAATTGGTATTTCGAGTATTTTTTTTCGTCACTCATTCG
ACAGCATTAACAAGCTCATACTCGACAAGTGACATGTTGGTGTCTTCTTTCACTTTGAAG
CTTGCAAGCTCTGTGACTTCAACGCGACCCCACTTGTCCACAGCTAGCCTCATTGATCCT
TTATACATGTCGATTTTTGCATTGCGTAGAGTTACAGTGGTTCCTTCTTTCATTAAGTCC
ACTTGGTCATTTCTTGCGGTGAAGACCACAACTCCGGTCTCGTCTCCGACAATGCATTCA
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TTAGTGAAAGCTGGCTTTCTTAACCCGGGTTTCGTGTCTGCCATTTTTTAAATAAGAAGA
GCCCTTTGGATTATTCGAAGGTAGAGACGACAGGATAGAGATAGATCTGATTCACGTCAC
ATTCAATGAAAATGAATTCCCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGG
TACCGTCGACT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ED59JQ U 25
AF RS1A041JQ U 1
AF RS1A041TR U 1
AF RS1ED59TF C 32
AF RS1A041TV C 305
BS 1 799 RS1A041JQ
BS 800 851 RS1A041TV

RD RS1ED59JQ 681 0 0
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AATTTACTTCCTTTATTATTACTGATCATCAGTATCTCTAGAGGGAAAACAAATTGGTAT
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CACTAGTCCCAGGACGCAAATGATCAACCTTAGTGAAAGCTGGCTTTCTTAACCCGGGTT
TCGTGTCTGCCATT

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CTTTTATAGAGGCATCTGACTCTTCCATAGCCTTGTGCAAGATAGAGGGATATCAGGTTA
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CAGTATCTCTAGAGGGAAAACAAATTGGTATTTCGAGTATTTTTTTTCGTCACTCATTCG
ACAGCATTAACAAGCTCATACTCGACAAGTGACATGTTGGTGTCTTCTTTCACTTTGAAG
CTTGCAAGCTCTGTGACTTCAACGCGACCCCACTTGTCCACAGCTAGCCTCATTGATCCT
TTATACATGTCGATTTTTGCATTGCGTAGAGTTACAGTGGTTCCTTCTTTCATTAAGTCC
ACTTGGTCATTTCTTGCGGTGAAGACCACAACTCCGGTCTCGTCTCCGACAATGCATTCA
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GTGCTAACGATCTTAACGGTGACATTGTGTCCACTAGTCCCAGGACGCAGATGATCAACC
TTAGTGAAAGCTGGCTTTCTTAACCCGGGTTTCGTGTCTGCCATTTTTTAAATAAGAAGA
GCCCTTTGGATTATTCGAAGGTAGAGACGACAGGATAGAGATAGATCTGATTCACGTCAC
ATTCAATGAAAATGAATTC
CCC

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DS 

RD RS1A041TR 802 0 0
AGAGTAATAATAACATTGCACAGAAACCGTAACAATTATGTCGACATTGCAAAACAAAGG
CTGTAACAAAGTCATAATTAACAAATCAAAGAAACTTAACCAAGAAAAACTATGCATTCA
CTTTTATAGAGGCATCTGACTCTTCCATAGCCTTGTGCAAGATAGAGGGATATCAGGTTA
ACTCTTTCTTGACGCCAACACCAACAGTTACGATTTACTTCCTTTATTATTACTGATCAT
CAGTATCTCTAGAGGGAAAACAAATTGGTATTTCGAGTATTTTTTTTCGTCACTCATTCG
ACAGCATTAACAAGCTCATACTCGACAAGTGACATGTTGGTGTCTTCTTTCACTTTGAAG
CTTGCAAGCTCTGTGACTTCAACGCGACCCCACTTGTCCACAGCTAGCCTCATTGATCCT
TTATACATGTCGATTTTTGCATTGCGTAGAGTTACAGTGGTTCCTTCTTTCATTAAGTCC
ACTTGGTCATTTCTTGCGGTGAAGACCACAACTCCGGTCTCGTCTCCGACAATGCATTCA
GAAATGCGCATCTGGCGAGCCTGAGGACCATCTGCACGACCTTTTTGTAACACCATCTTG
GTGCTAACGATCTTAACGGTGACATTGTGTCCACTAGTCCCAGGACGCAGATGATCAACC
TTAGTGAAAGCTGGCTTTCTTAACCCGGGTTTCGTGTCTGCCATTTTTTAAATAAGAAGA
GCCCTTTGGATTATTCGAAGGTAGAGACGACAGGATAGAGATAGATCTGATTCACGTCAC
ATTCAATGAAAATGAATTC
CCC

QA 1 799 1 799
DS 

RD RS1ED59TF 773 0 0
ACAATTATGTCGACATTGCAAAACAAAGGCTGTAACAAAGTCATAATTAACAAATCAAAG
AAACTTAACCAAGAAAAACTATGCATTCACTTTTATAGAGGCATCTGACTCTTCCATAGC
*TTGTGCAAGATAGAGGGATATCAGGTTAACTCTTTCTTGACGCCAACACCAACAGTTAC
GATTTACTTCCTTTATTATTACTGATCATCAGTATCTCTAGAGGGAAAACAAATTGGTAT
TTCGAGTATTTTTTTTCGTCACTCATTCGACAGCATTAACAAGCTCATACTCGACAAGTG
ACATGTTGGTGTCTTCTTTCACTTTGAAGCTTGCAAGCTCTGTGACTTCAACGCGACCCC
ACTTGTCCACAGCTAGCCTCATTGATCCTTTATACATGTCGATTTTTGCATTGCGTAGAG
TTACAGTGGTTCCTTCTTTCATTAAGTCCACTTGGTCATTTCTTGCGGTGAAGACCACAA
CTCCGGTCTCGTCTCCGACAATGCATTCAGAAATGCGCATCTGGCGAGCCTGAGGACCAT
CTGCACGACCTTTTTGTAACACCATCTTGGTGCTAACGATCTTAACGGTGACATTGTGTC
CACTAGTCCCAGGACGCAGATGATCAACCTTAGTGAAAGCTGGCTTTCTTAACCCGGGTT
TCGTGTCTGCCATTTTTTAAATAAGAAGAGCCCTTTGGATTATTCGAAGGTAGAGACGAC
AGGATAGAGATAGATCTGATTCACGTCACATTCAATGAAAATGAATTC
AGGCC

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DS 

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CAAGCTCTGTGACTTCAACGCGACCCCACTTGTCCACAGCTAGCCTCATTGATCCTTTAT
ACATGTCGATTTTTGCATTGCGTAGAGTTACAGTGGTTCCTTCTTTCATTAAGTCCACTT
GGTCATTTCTTGCGGTGAAGACCACAACTCCGGTCTCGTCTCCGACAATGCATTCAGAAA
TGCGCATCTGGCGAGCCTGAGGACCATCTGCACGACCTTTTTGTAACACCATCTTGGTGC
TAACGATCTTAACGGTGACATTGTGTCCACTAGTCCCAGGACGCAGATGATCAACCTTAG
TGAAAGCTGGCTTTCTTAACCCGGGTTTCGTGTCTGCCATTTTTTAAATAAGAAGAGCCC
TTTGGATTATTCGAAGGTAGAGACGACAGGATAGAGATAGATCTGATTCACGTCACATTC
AATGAAAATGAATTCCCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACC
GTCGACT

QA 1 547 1 547
DS 



AS 1 5

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CCTGGTCCTCTTTAAGACAACTCCCGCTTGATGAATAATGAATAAGCCCATCCCATCGTC
CTCTTTTGCTGTCTGCAGAATTTTAATAAAATGTGAGAATTCAACAATTTTTTTTATTAC
CTCAAATTTTTTATTTTTTATTTTTTATGATCAACTCAAGTTTTGAGGATCATCCAGTTC
TTCTGTTATGTTGTTCTTCCTGATCAATATGCTTTTGCACGGCGAGCTTCAATTTTTAGT
ACCGGATACATATTCTTTAATGGTTCATACATAATTAGTATTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1F539TF U 57
AF RS1A372TF U 1
AF RS1A372TR C 50
AF RS1A372TV U 1
AF RS1A372JQ C 50
BS 1 764 RS1A372TF

RD RS1F539TF 544 0 0
GATAG
CAATTATTAGCTCTCGAGTGTTGTGTTTATCATCACCTGAAGATTCTCTGTCTTCTCCTC
CGATCCTCGTCGCTCTCTCGGTCCAAATGGCGGAAGCTGTGTCTGCTAAAACTCCGTCTC
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GTTTCCCGACCACAAACCAAACGAGGCATTGTTTCACACGTTACATTGAGTATCACAGAT
GTGTAGCTGCTAAGGGTGACGATGCTCCAGAATGCGATAAGTTTGCAAAGTTTTATCGAT
CTCTTTGCCCCAGCGAATGGGTTGATAGGTGGAACGAGCAAAGAGAGAATGGAACTTTCC
CTGGTCCTCTTTAAGACAACTCCCGCTTGATGAATGATGAATAAGCCCATCCCATCGTCC
TCTTTTGCTGTCTGCAGAATTTTAATAAAATGTGAGAATTCAACAATTTTTTT
ATTACC

QA 6 538 6 538
DS 

RD RS1A372TF 764 0 0
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CCGATCCTCGTCGCTCTCTCGGTCCAAATGGCGGAAGCTGTGTCTGCTAAAACTCCGTCT
CTCTCCGAGCA*TATCATTTGGAGAATGATGTGAAGCAAGTTAAAGAGGATCCTAGTGAC
GAAAACACTAGTGAGGAGACTCCTGATGATATCACGCTTAAGACAGCTCCTGCTGATTTC
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TCTCTTTGCCCCAGCGAATGGGTTGATAGGTGGAACGAGCAAAGAGAGAATGGAACTTTC
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CTCAAATTTTTTATTTTTTATTTTTTATGATCAACTCAAGTTTTGAGGATCATCCAGTTC
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ACCGGATACATATTCTTTAATGGTTCATACATAATTAGTATTCC

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1A372TR 715 0 0
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*GTCTTCTCCTCCGATCCTCGTCGCTCTCTCGGTCCAAATGGCGGAAGCTGTGTCTGCTA
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CTGCTGATTTCCGTTTCCCGACCACAAACCAAACGAGGCATTGTTTCACACGTTACATTG
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AGTTTTATCGATCTCTTTGCCCCAGCGAATGGGTTGATAGGTGGAACGAGCAAAGAGAGA
ATGGAACTTTCCCTGGTCCTCTTTAAGACAACTCCCGCTTGATGAATAATGAATAAGCCC
ATCCCATCGTCCTCTTTTGCTGTCTGCAGAATTTTAATAAAATGTGAGAATTCAACAATT
TTTTTTATTACCTCAAATTTTTTATTTTTTATTTTTTATGATCAACTCAAGTTTTGAGGA
TCATCCAGTTCTTCTGTTATGTTGTTCTTCCTGATCAATATGCTTTTGCACGGCGAGCTT
CAATTTTTAGTACCGGATACATATTCTTTAATGGTTCATACATAATTAGTATTCC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1A372TV 764 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAAAAACATA
ACAATTATTAGCTCTCGAGTGTTGTGTTTATCATCACCTGAAGATTCT**GTCTTCTCCT
CCGATCCTCGTCGCTCTCTCGGTCCAAATGGCGGAAGCTGTGTCTGCTAAAACTCCGTCT
CTCTCCGAGCA*TATCATTTGGAGAATGATGTGAAGCAAGTTAAAGAGGATCCTAGTGAC
GAAAACACTAGTGAGGAGACTCCTGATGATATCACGCTTAAGACAGCTCCTGCTGATTTC
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CTCAAATTTTTTATTTTTTATTTTTTATGATCAACTCAAGTTTTGAGGATCATCCAGTTC
TTCTGTTATGTTGTTCTTCCTGATCAATATGCTTTTGCACGGCGAGCTTCAATTTTTAGT
ACCGGATACATATTCTTTAATGGTTCATACATAATTAGTATTCC

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1A372JQ 715 0 0
GGAAAAACATAACAATTATTAGCTCTCGAGTGTTGTGTTTATCATCACCTGAAGATTCT*
*GTCTTCTCCTCCGATCCTCGTCGCTCTCTCGGTCCAAATGGCGGAAGCTGTGTCTGCTA
AAACTCCGTCTCTCTCCGAGCA*TATCATTTGGAGAATGATGTGAAGCAAGTTAAAGAGG
ATCCTAGTGACGAAAACACTAGTGAGGAGACTCCTGATGATATCACGCTTAAGACAGCTC
CTGCTGATTTCCGTTTCCCGACCACAAACCAAACGAGGCATTGTTTCACACGTTACATTG
AGTATCACAGATGTGTAGCTGCTAAGGGTGACGATGCTCCAGAATGCGATAAGTTTGCAA
AGTTTTATCGATCTCTTTGCCCCAGCGAATGGGTTGATAGGTGGAACGAGCAAAGAGAGA
ATGGAACTTTCCCTGGTCCTCTTTAAGACAACTCCCGCTTGATGAATAATGAATAAGCCC
ATCCCATCGTCCTCTTTTGCTGTCTGCAGAATTTTAATAAAATGTGAGAATTCAACAATT
TTTTTTATTACCTCAAATTTTTTATTTTTTATTTTTTATGATCAACTCAAGTTTTGAGGA
TCATCCAGTTCTTCTGTTATGTTGTTCTTCCTGATCAATATGCTTTTGCACGGCGAGCTT
CAATTTTTAGTACCGGATACATATTCTTTAATGGTTCATACATAATTAGTATTCC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 2 4

CO CL1487Contig1 690 2 4 U
CAAGGGTAAAAAAACGGGTTGCTCAAGGCACATTTTTAAGACCAGATATCATAGTAATCT
CATAACTAGTGTGAACATTTATTTAGTCGAAATACATATATTGTTCCCCACTCATTTTTA
TATTTTCTTACATATTCATATCCCCAGCATGATCAAATCGAACTCACAACACCATCATCC
TCATTCTCCACACTCCTGATCCTTGAGTTTACAACCCTACAATTCCGTCTTATCTCGCCT
TGAGTTCCAGTCAAAGGTTTGAGATTTCCCATCCGAATCATTGCTTCGGCGAATGCTTGA
AAGAACACGAGCCTGTTGTTGCTGTATTGCTCCACTAGTGGAATCGTAAATGCTCGTGGG
GTTGAAAACAGTTCTTGATCGCTCTGAATCAGCCCTCTCCCGTTACGAAGATTGGTGTAG
TACTGATTATCGAAACCACCTGGAGTCACAGGGTCGAAGTTGACCAAAACAGTGCCGATT
CCGTTTTGAGGGCACAATCCACGGAGTTGGGTGAGGTAAGTTGGGTTGAGACTAGGGTCA
GGTCTATTGGTACCATTGAAGTTGTAGAGACGAGGTGTCACAAATTGACATTGTGCTTTT
CCAAATGTGTGACCACCAGAAAGAGCGACTAGATCGGAGGGGCGGTTTAGACCAACCGCA
GCAAAACTTGCATTAAGTTGAGCAAGTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1CI79JQ U 1
AF RS1BD59JQ U 50
BS 1 392 RS1CI79JQ
BS 393 393 RS1BD59JQ
BS 394 563 RS1CI79JQ
BS 564 690 RS1BD59JQ

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CATAACTAGTGTGAACATTTATTTAGTCGAAATACATATATTGTTCCCCACTCATTTTTA
TATTTTCTTACATATTCATATCCCCAGCATGATCAAATCGAACTCACAACACCATCATCC
TCATTCTCCACACTCCTGATCCTTGAGTTTACAACCCTACAATTCCGTCTTATCTCGCCT
TGAGTTCCAGTCAAAGGTTTGAGATTTCCCATCCGAATCATTGCTTCGGCGAATGCTTGA
AAGAACACGAGCCTGTTGTTGCTGTATTGCTCCACTAGTGGAATCGTAAATGCTCGTGGG
GTTGAAAACAGTTCTTGATCGCTCTGAATCAGTCCTCTCCCGTTACGAAGATTGGTGTAG
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GGTCTATTGGTACCATTGAAGTT

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DS 

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ACTCATTTTTATATTTTCTTACATATTCATATCCCCAGCATGGTCAAATCGAACTCACAA
CACCATCATCCTCATTCTCCACACTCCTGATCCTTGAGTTTACAACCCTACAATTCCGTC
TTATCTCGCCTTGAGTTCCAGTCAAAGGTTTGAGATTTCCCATCCGAATCATTGCTTCGG
CGAATGCTTGAAAGAACACGAGCCTGTTGTTGCTGTATTGCTCCACTAGTGGAATCGTAA
ATGCTCGTGGGGTTGAAAACAGTTCTTGATCGCTCTGAATCAGCCCTCTCCCGTTACGAA
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GACCAACCGCAGCAAAACTTGCATTAAGTTGAGCAAGTGTG

QA 1 641 1 641
DS 



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CTTAATGCAAGTTTTGCTGCGGTTGGTCTAAACCGCCCCTCCGATCTAGTCGCTCTTTCT
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C


BQ
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10 

AF RS1GM34TF U 32
AF RS1CI79TF U 1
BS 1 781 RS1CI79TF

RD RS1GM34TF 269 0 0
GG
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TCTTGCATCATGGGAGCCCTAGTATTGGGTTGCCTTCTCCTTCAAGCATCAAACTCTAAC
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CTTCACTTCCATGACTGTTTTGT
AATG

QA 3 265 3 265
DS 

RD RS1CI79TF 781 0 0
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GGTTGCCTTCTCCTTCAAGCATCAAACTCTAACGCTCAACCACTAAGTCCTGATTTCTAT
TCCAGAACATGCCCGCGTGTGTTCGATATCATTAGGAGGACCATCGTTGCTGAATTACGA
TCCGATCCTCGTATTGCCGCTAGCATCCTTCGTCTTCACTTCCATGACTGTTTTGTTAAT
GGTTGTGATGCATCGATCCTGCTGGACAGTTCCACATCTTTCAGGACCGAGAAAGATGCT
GCTCCAAACGCTAATTCGGCTAGAGGGTTTGACGTCATAGATAGAATGAAAGCCGAGATT
GAGATAGCGTGCCCAAGAACAGTTTCTTGTGCAGATGTTCTTACCATCGCTTCTCAAATA
TCAGTGATTTTGTCGGGAGGTCCAGGGTGGCAGGTTTCATTGGGAAGGAGAGACAGCTTA
CGAGCTTTCTTCGATCTGGCTAATACAGCCCTTCCTTCTCCATTTTTCACACTTGCTCAA
CTTAATGCAAGTTTTGCTGCGGTTGGTCTAAACCGCCCCTCCGATCTAGTCGCTCTTTCT
GGTGGTCACACATTTGGAAAAGCACAATGTCAATTTGTGACACCTCGTCTCTACACTTCA
TGGTACCAATAGACCTGACCCTAGTCTCACCCACTTACCTCACCACTCGTGGATGTGCCT
C

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 5

CO CL1488Contig1 1066 5 14 U
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AACTTTGCGATCTCCACCGGCCGGCGCGTGGTGGCTCCGCTAGCGCCACCGCCGGTACGA
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TTTAGTTCTTGTGTGGTTTGGGATGTGGCTTGTCTTCTTTTGAAGGTTAGTGGTGGGTGA
AGTGCTTTCTCAACGGGTTAGGATATGGGGAGGCTATATGTTCCGGACTTGGTGTCTTTA
TACCGCTCCTCCTTCTTGGTCGTAGCTTTTGGATCAGGTGTGCTCCTGCTTCTCCTCGTT
CTCGTGAGCCATTGGTAATCTGTGTTTGTCAAGGTCTCTTTTGTTGGGTTCGTCTCTTGG
ATGGTAATCTGTTGTGTAGGCATCTACTTGCTTCTTCTCTATGGTGTGAAGTATCAAGAC
GAAGCAATGGGTTCGATCTTCGGCTCTTCTCTTGCGAGGACGTGACCACTCTCTTGCTTT
GTAGATGGTTGAGTTTGGGTACACGAGGGTCCGCGTGCAAGAGCTACTGATCCTTTTAGA
CGTTTTCCCCGCTTGGAGTTTCAAGGTTCGACCTTGTGTCTTTCCTCTCTTGGGTTGCCT
GTGGTCTTAGTGCAGACGCGGTAGTGGTTGTTATTGGCTCCGTTTGCACCTCGGGTTCTT
GCCGATTTGTTTCTCGTGAGGTTGTGGTTGTGACCTGATGGATTGTGGTCTTCTCAAGTC
TCTGTTTCTGAGTTCAACTCGTGCGTCTTCAGGTTCTTGGTTATGATTGGCGACCTGGTG
CTGTTATGGAGTTTGGTTTGAGTTCCTTGATCTTTTAAGTATTTCAAGTCATTTTCTCTT
TTGTGTTAGTCTCTAGAGTAAGGTTTCTTTTATGTTTTTAATTTGGGTCTCTGGGATGTT
CGATATGTGAAATCCCCAGCTATGGTCTTCGGAAGAGTTAAGACTCTTGCCGACCTTTGT
CATGTAAAGTACTTCCGTTTAAGTTGAATGATAATTCATAGATGAC


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1GA33TF U 1
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AF RS1B815TF U 13
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TTTAGTTCTTGTGTGGTTTGGGATGTGGCTTGTCTTCTTTTGAAGGTTAGTGGTGGGTGA
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ATGGTAATCTGTTGTGTAGGCATCTACTTGCTTCTTCTCTATGGTGTGAAGTGTCAAGAC
GAAGCAATGGGTTCGATCTTCGGCTCTTCTCTTGCGAGGACGTGACCACTCTCTTGCTTT
GTAGATGGTTGAGTTTGGGTA

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DS 

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GCTTAGTATTTTGTAGATCTGGTATTTTTTCCGTTAGTGTTATGCTTTTTTAGTTCTTGT
GTGGTTTGGGATGTGGCTTGTCTTCTTTTGAAGGTTAGTGGTGGGTGAAGTGCTTTCTCA
ACGGGTTAGGATATGGGGAGGCTATATGTTCCGGACTTGGTGTCTTTATACCGCTCCTCC
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TGGTAATCTGTGTTTGTCAAGGTCTCTTTTGTTGGGTTCGTCTCTTGGATGGTAATCTGT
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GTTTGGGTACACGAGGGTCCGCGTGCAAGAGCTACTGATCCTTTTAGACGTTTTCCCCGC
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CTCGT

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DS 

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AAAAAAAATCTTATCCTCTCTCCCGATAAACTAGCCTCTCCTCTGTTCAACTTTGCGATC
TCCACCGGCCGGCGCGTGGTGGCTCCGCTAGCGCCACCGCCGGTACGATTTGTTTCTTTT
GCTTAGTATTTTGTAGATCTGGTATTTTTTCCGTTAGTGTTATGCTTTTTTAGTTCTTGT
GTGGTTTGGGATGTGGCTTGTCTTCTTTTGAAGGTTAGTGGTGGGTGAAGTGCTTTCTCA
ACGGGTTAGGATATGGGGAGGCTATATGTTCCGGACTTGGTGTCTTTATACCGCTCCTCC
TTCTTGGTCGTAGCTTTTGGATCAGGTGTGCTCCTGCTTCTCCTCGTTCTCGTGAGCCAT
TGGTAATCTGTGTTTGTCAAGGTCTCTTTTGTTGGGTTCGTCTCTTGGATGGTAATCTGT
TGTGTAGGCATCTACTTGCTTCTTCTCTATGGTGTGAAGTATCAAGACGAAGCAATGGGT
TCGATCTTCGGCTCTTCTCTTGCGAGGACGTGACCACTCTCTTGCTTTGTAGATGGTTGA
GTTTGGGTACACGAGGGTCCGCGTGCAAGAGCTACTGATCCTTTTAGACGTTTTCCCCGC
TTGGAGTTTCAAGGTTCGACCTTGTGTCTTTCCTCTCTTGGGTTGCCTGTGGTCTTAGTG
CAGACGCGGTAGTGGTTGT*ATTGGCTCCGTTTGCACCTCGGGTTCTTGCCGATTTGTTT
CTCGTGAGGTTGTGGT
GTGACT

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TCTTCGGCTCTTCTCTTGCGAGAACGTGACCACTCTCTTGCTTTGTAGATGGTTGAGTTT
GGGTACACGAGGGTCCGCGTGCAAGAGCTACTGACCCTTTTAGACGTTTTCCCCGCTTGG
AGTTTCAAGGTTCGACCTTGTGTCTTTCCTCTCTTGGGTTGCCTGTGGTCTTAGTGCAGA
CGCGGTAGTGGTTGTTATTGGCTCCGTTTGCACCTCGGGTTCTTGCCGATTTGTTTCTCG
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ACTCGTGCGTCTTCAGGTTCTTGGTTATGATTGGCGACCTGGTGCTGTTATGGAGTTTGG
TTTGAGTTCCTTGATCTTTTAAGTATTTCAAGTCATTTTCTCTTTTGTGTTAGTCTCTAG
AGTAAGGTTTCTTTTATGTTTTTAATTTGGGTCTCTGGGATGTTCGATATGTGAAATCGC
CAGCTATGGTCTTCGGAAGAGTTAAGACTCTTGCCGACCTTTGTCATGTAAAGTACTTCC
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QA 1 750 1 750
DS 

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GGATGGTAATCTGTTGTGTAGGCATCTACTTGCTTCTTCTCTATGGTGTGAAGTATCAAG
ACGAAGCAATGGGTTCGATCTTCGGCTCTTCTCTTGCGAGGACGTGACCACTCTCTTGCT
TTGTAGATGGTTGAGTTTGGGTACACGAGGGTCCGCGTGCAAGAGCTACTGATCCTTTTA
GACGTTTTCCCCGCTTGGAGTTTCAAGGTTCGACCTTGTGTCTTTCCTCTCTTGGGTTGC
CTGTGGTCTTAGTGCAGACGCGGTAGTGGTTGTTATTGGCTCCGTTTGCACCTCGGGTTC
TTGCCGATTTGTTTCTCGTGAGGTTGTGGTTGTGACCTGATGGATTGTGGTCTTCTCAAG
TCTCTGTTTCTGAGTTCAACTCGTGCGTCTTCAGGTTCTTGGTTATGATTGGCGACCTGG
TGCTGTTATGGAGTTTGGTTTGAGTTCCTTGATCTTTTAAGTATTTCAAGTCATTTTCTC
TTTTGTGTTAGTCTCTAGAGTAAGGTTTCTTTTATGTTTTTAATTTGGGTCTCTGGGATG
TTCGATATGTGAAATCCCCAGCTATGGTCTTCGGAAGAGTTAAGACTCTTGCCGACCTTT
GTCATGTAAAGTACTTCCGTTTAAGTTGAATGATAATTCATAGATGAC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 2 4

CO CL1489Contig1 1079 2 4 U
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AGATTGTCTATGATAACCACAACCACTAGCGTTACCCACCTGGTGACCCTAGCAAGCGTG
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CTTTTTTTTTCCCATGTTCCGGCAATGTTATGAGCAAGATTGTCTTGTTTTTGCTGAATA
ATTGAAACCGTTTTGTCATATTTATTGAACTGTGTACTCGAGCTCTGTTTTTCGATAAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AO62TFB U 1
AF RS1AO62JQ C 468
BS 1 683 RS1AO62TFB
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BS 685 768 RS1AO62TFB
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RD RS1AO62TFB 768 0 0
GGGCCATCGACCGTCCCTCTAACCATTAGGACAAACTCTGTTCTCGCCAAAGCGAAACCC
TAATCCACCGTTTGAGCAGAGAGATGCTGCGAGTAGCAGGAAGGAGGCTTTTTTCTCTTT
CGCAGAGATCTTCCACCGTCTCCTCCTTCGCGCTTTCCCGAGACCATACCTTATCCAATG
GCGGCGTCGACGACTCATCTTCATCCCCCAGATCTGTCTCCTCTGCCGATCTTTCACGTT
TCGATTCTTACCACCGGAGCCTCATGAGAGGTTTCTCTTCACAAGTCCTTACTCAAGGAA
ATGAGGTAGGTTTTGGTTCGGAGCCTGCCACCGTCGAGGCCGTCAAGACGCCTAACTCGA
AGATTGTCTATGATAACCACAACCACTAGCGTTACCCACCTGGTGACCCTAGCAAGCGTG
CCTTCGCCTATTTCGTCTTGTCCGGTGGGAGATTTGTCTACGCCTCTGTTCTCCGCCTTC
TTGTCCTCAAGCTCATTGTCAGCATGTCCGCGAGTAAAGATGTCCTCGCCCTTGCGTCCC
TCGAGGTCGACCTCGGGAGCATCGAGCCGGGAACTACTGTGACAGTGAAGTGGCGTGGAA
AGCCTGTCTTCATCAGGAGAAGGACTGAAGATGACATCAAGCTGGCGAACAGTGTGGATC
TTGGATCTTTGAGAGACCCGCAG*AGGACTCGGTGAGGGTCAAGAATCCCGGAGTGGTTG
GTGGTTGTTGGGTCTGCACTCACTTGGGGTGTATCCCTTTGCCGAATG

QA 1 768 1 768
DS 

RD RS1AO62JQ 612 0 0
GTTCTCCGCCTTCTTGTCCTCAAGCTCATTGTCAGCATGTCCGCGAGTAAAGATGTCCTC
GCCCTTGCGTCCCTCGAGGTCGACCTCGGGAGCATCGAGCCGGGAACTACTGTGACAGTG
AAGTGGCGTGGAAAGCCTGTTTTCATCAGGAGAAGGACTGAAGATGACATCAAGCTGGCG
AACAGTGTGGATCTTGGATCTTTGAGAGACCCGCAGGAGGACTCGGTGAGGGTCAAGAAT
CC*GGAGTGGTTGGTGGTTGTTGGGTCTGCACTCACTTGGGGTGTATCCCTTTGCCGAAT
GCTGGTGATTACGGTGGTTGGTTTTGCCCGTGTCATGGTTCGCACTACGATATCTCTGGA
AGGATTAGGAAAGGTCCTGCACCGTACAACCTGGAGGTGCCAACCTACAGCTTCTTGGAA
GAGAATAAGTTACTCATTGGTTAATGATGATGAATAAAAAGCACAACAGTCAGAGAACTA
CATCCGTTTGTTTCTTTTTTTTTCCCATGTTCCGGCAATGTTATGAGCAAGATTGTCTTG
TTTTTGCTGAATAATTGAAACCGTTTTGTCATATTTATTGAACTGTGTACTCGAGCTCTG
TTTTTCGATAAG

QA 1 612 1 612
DS 



CO CL1489Contig2 735 2 4 U
GGGTCTGTTGCCATCGGCCGTCCCTCTAACCATTAGGACAACAACTCTTGTTCTCGCCAA
AGCGGAACCCTAATCCACCGTTTGAGCAGAGAGATGCTGCGAGTAGCAGGAAGGAGGCTT
TTTTCTCTTTCGCAGAGATCTTCCACCGTCTCCTCCTTCGCGCTTTCCCGAGACCATACC
TTATCCAATGGCGGCGTCGACGACTCATCTTCATCCCCCAGATCTGTCTCCTCTACCGAT
CTTTCACGTTTCGATTCTTACCACCGGAGCCTCATGAGAGGTTTCTCTTCACAAGTCCTT
ACTCAAGGAAATGAGGTAGGTTTTGGTTCGGAGCCTGCCACCGTCGAGGCCGTCAAGACG
CCTAACTCGAAGATTGTCTATGATGACCACAACCACGAGCGTTACCCACCTGGTGACCCT
AGCAAGCGTGCATTCGCATATTTCGTCCTGTCCGGTGGGAGGTTTGTCTACGCCTCTGTT
CTCCGCCTTCTTGTCCTCAAGCTCATTGTCAGCATGTCCGCGAGTAAAGATGTCCTCGCC
CTTGCGTCCCTCGAGGTCGACCTCGGGAGCATCGAGCCGGGGACTACTGTGACAGTGAAG
TGGCGTGGAAAGCCGGTGTTCATCAGGAGAAGAACAGAAGATGACATCAAGCTGGCGAAC
AGCGTTGATCTTGGATCTTTGAGAGACCCGCAAGAAGACTCGGTGAGGGTCAAGAATCCG
GAGTGGTTGGTGGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DF88TF U 1
AF RS1AE36TF U 57
BS 1 626 RS1DF88TF
BS 627 627 RS1AE36TF
BS 628 684 RS1DF88TF
BS 685 735 RS1AE36TF

RD RS1DF88TF 684 0 0
GGGTCTGTTGCCATCGGCCGTCCCTCTAACCATTAGGACAACAACTCTTGTTCTCGCCAA
AGCGGAACCCTAATCCACCGTTTGAGCAGAGAGATGCTGCGAGTAGCAGGAAGGAGGCTT
TTTTCTCTTTCGCAGAGATCTTCCACCGTCTCCTCCTTCGCGCTTTCCCGAGACCATACC
TTATCCAATGGCGGCGTCGACGACTCATCTTCATCCCCCAGATCTGTCTCCTCTACCGAT
CTTTCACGTTTCGATTCTTACCACCGGAGCCTCATGAGAGGTTTCTCTTCACAAGTCCTT
ACTCAAGGAAATGAGGTAGGTTTTGGTTCGGAGCCTGCCACCGTCGAGGCCGTCAAGACG
CCTAACTCGAAGATTGTCTATGATGACCACAACCACGAGCGTTACCCACCTGGTGACCCT
AGCAAGCGTGCATTCGCATATTTCGTCCTGTCCGGTGGGAGGTTTGTCTACGCCTCTGTT
CTCCGCCTTCTTGTCCTCAAGCTCATTGTCAGCATGTCCGCGAGTAAAGATGTCCTCGCC
CTTGCGTCCCTCGAGGTCGACCTCGGGAGCATCGAGCCGGGGACTACTGTGACAGTGAAG
TGGCGTGGAAAGCCGGTGTTCATCAG*AGAAGAACAGAAGATGACATCAAGCTGGCGAAC
AGCGTTGATCTTGGATCTTTGAGA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1AE36TF 679 0 0
GG
AAAGCGGAACCCTAATCCACCGTTTGAGCAGAGAGATGCTGCGAGTAGCAGGAAGGAGGC
TTTTTTCTCTTTCGCAGAGATCTTCCACCGTCTCCTCCTTCGCGCTTTCCCGAGACCATA
CCTTATCCAATGGCGGCGTCGACGACTCATCTTCATCCCCCAGATCTGTCTCCTCTACCG
ATCTTTCACGTTTCGATTCTTACCACCGGAGCCTCATGAGAGGTTTCTCTTCACAAGTCC
TTACTCAAGGAAATGAGGTAGGTTTTGGTTCGGAGCCTGCCACCGTCGAGGCCGTCAAGA
CGCCTAACTCGAAGATTGTCTATGATGACCACAACCACGAGCGTTACCCACCTGGTGACC
CTAGCAAGCGTGCATTCGCATATTTCGTCCTGTCCGGTGGGAGGTTTGTCTACGCCTCTG
TTCTCCGCCTTCTTGTCCTCAAGCTCATTGTCAGCATGTCCGCGAGTAAAGATGTCCTCG
CCCTTGCGTCCCTCGAGGTCGACCTCGGGAGCATCGAGCCGGGGACTACTGTGACAGTGA
AGTGGCGTGGAAAGCCGGTGTTCATCAGGAGAAGAACAGAAGATGACATCAAGCTGGCGA
ACAGCGTTGATCTTGGATCTTTGAGAGACCCGCAAGAAGACTCGGTGAGGGTCAAGAATC
CGGAGTGGTTGGTGGTG

QA 3 679 3 679
DS 



AS 1 3

CO CL1490Contig1 1335 3 4 U
ACGAGAGAGCCCAAAATTTAAATGACAAATATAAATATTGAAAAAAAAACATAAGAAGCA
ATGATAAATAAACATTCAAAAATTATTAGAAATAAAGGTTCAACGCTTAAACAAGGCGTT
GGGATCAATAATAACTGAAAACACAATTAAGACAAATCAAAATTTGAAGAAGAAAAAGAT
TAGTCCCCATGATCAACATTGAGTATCAATTCACACTCGTGAGACTAAAGCAAGTTGCCG
CCCTCCTTAACTCCTTCTCCCCTATTTCATCTATAGGTTCCTTCGAAGATTCACCAGAGC
TTGAAGCGTACACTTCTTTCGTTTCCGTGAAAGATTGACTCTCATCGATGATTTCGAGGA
ACTGATGGATTTCATCATAGTTATGAACATCAACTTCTTCCTCTTGTTGATTCGATGCCA
TCTGAAGATTAACAAGCTGAGACTGTATAGCCATCACACTGTTATTGTTCTTCGTCTCGC
TACAATGCTCGTTTTGATTGATGAATCCATAGTTATGATGATGATTATAAGGAAATTGAT
TCTGACCCCAAGCCAAAGAAGTGTTATTATTATGATTATTGAGAACTTCCTTACACGTGT
CTGGAGTGGGATTGTAGTCATGGTTGTTATTAACCTCACTACAATAAGACATATGCTGAG
GTTGTTGTAGCTGCTGTGTTTCAGAAACCGGACTGAAAAACGGTATGGTATTGCCTTGGT
TAGTGTTAACCGGAAGTCCCATTCCCAAATCAAGCTGTGACGTGAGATCTTCTTGCTTCT
CACCAATTTCGTGAATCATAATATTATGAGGGTTAGGGTGATTCTGACCGTTACGATAGA
GCTGTAATTGTGAATTCACGGCTTTGAGCTCTTCCTCGGCGACCCATATCATGTATTGAA
GCTGTTGCGTGATCCCAAGGAAACCGTGGACAGGGTTACGATCTCGGACGTAAGACTGAA
ATATAATTGATTTCATCGCTTCTGGTCTCTGAACTTCGTCGAGGTTCTCGAGTATTTTAA
CGATGCTTCTAACGCCGAAAAGCCTATGAACGTTTTGGAAGAGCTTTGGTTGTTCGGCTG
GAAAGTAGGGTGCGAGTGGGCAGTCCGCAGCGCAGCGTCTGCGTTGGTACTTGCACGCAG
CACATGCACCACTCGTGCCGCCTTTAAGTGTCATGTAAACGATGAGAGAGATCAAGAGAA
GATCCAAAAATCTCTCTATTGACCCAATGGGATTGTGGATGGTTTTTATTTGGCTCATTC
GATGGGGGCAAGAAATCAAAAAAAGGAGACTGGAAAAAAAACAATGATTGAAGATTTTGA
ATGAGATGAACGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DA74JQ U 1
AF RS1AC81JQ U 34
AF RS1DA74TF C 682
BS 1 359 RS1DA74JQ
BS 360 360 RS1AC81JQ
BS 361 812 RS1DA74JQ
BS 813 1335 RS1DA74TF

RD RS1DA74JQ 813 0 0
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TCTGACCCCAAGCCAAAGAAGTGTTATTATTATGATTATTGAGAACTTCCTTACACGTGT
CTGGAGTGGGATTGTAGTCATGGTTGTTATTAACCTCACTACAATAAGACATATGCTGAG
GTTGTTGTAGCTGCTGTGTTTCAGAAACCGGACTGAAAAACGGTATGGTATTGCCTTGGT
TAGTGTTAACCGGAAGTCCCATTCCCAAATCAAGCTGTGACGTGAGATCTTCTTGCTTCT
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T

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DS 

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ATATTGA
AAAAAAAAACATAAGAAGCAATGATAAATAAACATTCAAAAATTATTAGAAATAAAGGTT
CAACGCTTAAACAAGGCGTTGGGATCAATAATAACTGAAAACACAATTAAGACAAATCAA
AATTTGAAGAAGAAAAAGATTAGTCCCCATGATCAACATTGAGTATCAATTCACACTCGT
GAGACTAAAGCAAGTTGCCGCCCTCCTTAACTCCTTCTCCCCTATTTCATCTATAGGTTC
CTTCGAAGATTCACCAGAGCTTGAAGCGTACACTTCTTTCGTTTCCGTGAAAGATTGACT
CTCATCGATGATTTCGAGGAACTGATGGATTTCATCATAGTTGTGAACATCAACTTCTTC
CTCTTGTTGATTCGATGCCATCTGAAGATTAACAAGCTGAGACTGTATAGCCATCACACT
GTTATTGTTCTTCGTCTCGCTACAATGCTCGTTTTGATTGATGAATCCATAGTTATGATG
ATGATTATAAGGAAATTGATTCTGACCCCAAGCCAAAGAAGTGTTATTATTATGATTATT
GAGAACTTCCTTACACGTGTCTGGAGTGGGATTGTAGTCATGGTTGTTATTAACCTCACT
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CGGTATGGTATTGCCTTGGTTAGTGTTAACCGGAAGTCCCATTCCCAAATCAAGCTGCGA
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QA 8 779 8 779
DS 

RD RS1DA74TF 654 0 0
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ACCCAATGGGATTGTGGATGGTTTTTATTTGGCTCATTCGATGGGGGCAAGAAATCAAAA
AAAGGAGACTGGAAAAAAAACAATGATTGAAGATTTTGAATGAGATGAACGTCC

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 4

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GGAACTCCAAACTTCCAAGCAAACCAGTGGGCTCAAGGTTTCTATACCTTTCTCTATCTT
TCTCTTCTTCACTCAGATTCTTTCCTATAAGCTTGGCTCTCTCTGTTTATTGTTTTCATC
TCTCTCTCAATTCTCTTATCATATTCTTGCTTGTATCTCTCTCAACTCTCTTATTTGATT
CTTTGATCATGATACTAAGCAAGAGACCTCATCTAATGATCCGAAAACTGTCGGAGATGC
TGGTTCCAAGAAGCCGGTCTGCTATTAAACCGGAAGACTATTCGGCGAGTCCGAGAAGTC
CGTTAGATTTGAAGTTCCCATCGCCAGTTAACTCCAAACGTTACGGTTCCGGTGGTGTCG
GTTTGGGTATCGTGGCTGCGTTGGAGGAAAGTAACACTGGGATCAACCGGTACGATCCGG
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GCGTGACGAGCCGTGATGGGCCGACCAGAGTGTATTACAACGAAGACGGGGTTGAATTGT
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TTTCAAGAAACGTCGACGTTTTGAGTTCTCCTTACGCCACCGGCGAACAAACTTTTTCCG
CCGGGATATTCGTATTTTAGGATAGCATAATAATTTACATTTAGAATTAAAAAAAAGAGT
GATCACCATTCTATTTATAAGAAAAAAATAAGAAAACAAAACAAAATGAATTGATAAAAA
AATGAAAATTTTGGTTAGGTTAAAAGCAACTTGTATAGAAGCTTTGCTTTTGGTTTTGAT
TTTGGAATAAAGATTAATGTTTATATGTTTGGTTTCTATATCAAATAAATCAATAAAAAA
GCTAGAGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CJ35TF U 116
AF RS1ET69TF U 1
AF RS1CJ35JQ C 592
AF RS1ET69JQ C 306
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GGATC
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TTGAAAATGGGTCGG

QA 6 440 6 440
DS 

RD RS1ET69TF 692 0 0
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TCTCTTCTTCACTCAGATTCTTTCCTATAAGCTTGGCTCTCTCTGTTTATTGTTTTCATC
TCTCTCTCAATTCTCTTATCATATTCTTGCTTGTATCTCTCTCAACTCTCTTATTTGATT
CTTTGATCATGATACTAAGCAAGAGACCTCATCTAATGATCCGGAAACTGTCGGAGATGC
TGGTTCCAAGAAGCCGGTCTGCTATTAAACCGGAAGACTATTCGGCGAGTCCGAGAAGTC
CGTTAGATTTGAAGTTCCCATCGCCAGTTAACTCCAAACGTTACGGTTCCGGTGGTGTCG
GTTTGGGTATCGTGGCTGCGTTGGAGGAAAGTAACACTGGGATCAACCGGTACGATCCGG
TTTGTTTCTCCGGGAGATTCCGATGCCCTGAGGTTGATCTGTCGGAGGAGGAATACACTT
GCGTGACGAGCCGTGATGGGCCGACCAGAGTGTATTACAACGAAGACGGGGTTGAATTGT
TTGAAAATGGGTCGGAGTTCGGTGATCGGAGAAAGCAGAAACCGATGGTTGAACCACCGG
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AGAAGAGACTTCAAG*CAAAGACATT
ACATGT

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1CJ35JQ 415 0 0
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GCTTGTGTAAGAAGAGACTTCAAGGCAAAGACATTTACATGTACAAAGGAGAGATGGGAT
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AACCGCAAGTTTCAAGAAACGTGGACGTTTTGAGTTCTCCTTACGCCACCGGGGAACAAA
CTTTTTCCGCCGGGATATTCGTATTTTAGGATAGCATAATAATTTACATTTAGAATTAAA
AAAAAGAGTGATCACCATTCTATTTATAAGAAAAAAATAAGAAAACAAAACAAAATGAAT
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GC

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DS 

RD RS1ET69JQ 785 0 0
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GGTATCGTGGCTGCGTTGGAGGAAAGTAACACTGGGATCAACCGGTACGATCCGGTTTGT
TTCTCCGGGAGATTCCGATGCCCTGAGGTTGATCTGTCGGAGGAGGAATACACTTGCGTG
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AGAAACGTCGACGTTTTGAGTTCTCCTTACGCCACCGGCGAACAAACTTTTTCCGCCGGG
ATATTCGTATTTTAGGATAGCATAATAATTTACATTTAGAATTAAAAAAAAGAGTGATCA
CCATTCTATTTATAAGAAAAAA*TAAGAAAACAAAACAAAATGAATTGATAAAAAAATGA
AAATTTTGGTTAGGTTAAAAGCAACTTGTATAGAAGCTTTGCTTTTGGTTTTGATTTTGG
AATAAAGATTAATGTTTATATGTTTGGTTTCTATATCAAATAAATCAATAAAAAAGCTAG
AGACG

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 4

CO CL1492Contig1 1300 4 7 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGCCACCAAAG
CGAGTTCGGAATCCCTCTTCTTCTTCTTCTTATAGTTGCGCGTTTCTATATCCCCGAGAG
AAAAAAAAAGGAGGAGGATGGCGGAAGAGAAAAAAGTAGCTCCGATTGGTGTGTGGAACA
CTGTGAAGCCCTTCGTCAATGGCGGTACCTCCGGTATGCTCGCAACCTGCGTTATCCAGC
CGATCGACATGATCAAGGTGAGGATTCAACTAGGTCAGGGATCTGCAGCCAGTGTGACCT
CTACCATGTTGAAGAATGAAGGCATCGGTGCTTTCTACAAGGGATTATCTGCTGGTTTGC
TGAGGCAAGCAACTTACACCACTGCCCGTCTTGGATCATTCAAGATGCTGACTGCGAAAG
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CAGCTGGTGCAATCGGTGCTTGCGTCGGTAGTCCAGCTGATTTGGCGCTTATCAGAATGC
AAGCTGATAACACCTTGCCGTTAGCTCAGCGCAGGAACTATACCAATGCGTTCCATGCGC
TTTACCGTATTAGCGCTGATGAAGGAGTCTTGGCACTTTGGAAAGGTTGTGGTCCCACTG
TGGTCAGAGCTATGGCTTTGAACATGGGAATGCTTGCTTCTTATGATCAAAGTGCTGAAT
ACATGAGAGATAACCTTGGTCTTGGGGAGACTTCCACTGTCGTAGGAGCAAGTGCTGTTT
CAGGATTCTGCGCTGCGGCTTGCAGTCTCCCATTTGACTTTGTCAAAACTCAGATCCAGA
AAATGCAACCGGACGCTCAGGGTAAATATCCATACACGGGTTCACTCGACTGTGCCATGC
AAACCTTGAAATCAGGAGGACCTCTGAAATTCTACACAGGTTTCCCTGTTTACTGCGTCA
GGATCGCCCCTCACGTCATGATGACATGGATCTTCCTGAACCAGATTACAAAGTTCCAAA
AGACCATTGGTATGTGATCTTCAAGCAATCCTTGTGAAGTGCGGAGACAATAATAAGATG
GGAAAGAACGAAATCACAATTTTGGAATTGTGTTCATTTACCTTTTAACAATATACATGC
CTTAGATGCATTATTGGAGCTGTTTGAGACCTGAGAGATTTTTTTTTGTCGTCGTTGATT
GGTCCGTGAACTTTAAAATTTTTTATTTGGTATAAGATTTTTGGCCATAAGTAACTTTGA
AACTACTGATGCATCGAAATATATTTTATTACTTGGTTAT


BQ
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CCTTAGATGCATTATTGGAGCTGTTTGAGACCTGAGAGATTTTTTTTTGTCGTCGTTGAT
TGGTCCGTGAACTTTAAAATTTTTTATTTGGTATAAGATTTTTGGCCATAAGTAACTTTG
AAACTACTGATGCATCGAAATATATTTTATTACTTGGTTAT

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DS 



AS 1 3

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CGCAAACACCAAAACCCTCTTTTGGGTTTCTCAACTTCCTTCCATAACCTAAGGATCTCA
TCCAACGGTCCAGCTTTCTCCACACGATCAAGATCCACCACCTACTCATCCACTCCAGCT
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B171TF U 1
AF RS1A542JQ C 226
AF RS1A542TF U 35
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RD RS1B171TF 697 0 0
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CGCAAACACCAAAACCCTCTTTTGGGTTTCTCAACTTCCTTCCATAACCTAAGGATCTCA
TCCAACGGTCCAGCTTTCTCCACACGATCAAGATCCACCACCTACTCATCCACTCCAGCT
TTCTTCAGAACCATGTGCAGCAGCAGCAGCAGCGAGAACTCCAGACCCACTAAGATCCAA
GAACTCAACGTGTACGAGTTCAACGAAGGCGACCGAAACAGCCCAGCGGTTCTAAAACTC
GGCAAGAACCCACAGCAGCTCTGCATTGGCGACCTCGTCCCTTTCACGTACAAACTCTAC
ACCGGAGACCTCAAGAAACGCGTCGGGATCACGGCGGGACTCTGCGTTTTGATCCAGCAC
GTTCCCGAGAAGAAAGGCGACCGCTTCGAAGCTTCTTACAGCTTCTACTTCGGAGAGTAC
GGTCACATTTCCTTTCAGGGACCTTACCTGACTTACGAGGACACGTTCCTCGCCATCACC
GGTGGCTCCGGAGTCTTCGAAGGTGCCTACGGACAGGTCCAGCTTCGTCAGCTTGTGTAT
CCAACCAAGCTGTTCTACACTTTTTACTTGAAAG*TGTTGCCTCTGATTTGCCTGTGGAG
CTCACCGGAAA*CATGTTGAGCCGTCGAAG
ATGTGAA

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1A542JQ 607 0 0
CCCACTAAAATCCAAGAACTCAACGTGTACGAGTTCAACGAAGGCGACCGAAACAGCCCA
GCGGTTCTAAAACTCGGCAAGAACCCACAGCAGCTCTGCATCGGCGACCTCGTCCCTTTC
ACGAACAAACTCTACACCGGAGACCTCAAGAAACGCGTCGGGATCCCGGCG**ACTCTGC
GTTTTGATCCAGCACGTTCCCGAGAAGAAAGGCGACCGCTTCGAAGCTTCTTACAGCTTC
CACTTCGGAGAGTACGGTCACATTTCCGTTCAGGGACCTTACCTGACTTACGAGGACACG
TTCCTCGCCATCACCGGTGGCTCCGGAGTCTTCGAAGGTGCCTACGGACAGGTCCAACTT
CGTCAGCTTGTGTATCCGACCAAGCTGTTCTACACTTTTTACTTGAAAGGTGTTGCCTTT
GATTTGCCTGTGGAGCTCACCGGAAAACATGTTGAGCCGTCGAAGGATGTGAAGCCGGCG
GCGGAAGCTCAGGCGGCTCAGCACGGCGCGACTATCCTTAACTTTACCGAGTAAAAATCA
TTTGCGGCGTTGAGCTTTCTCTGTTTGTTTTCTCTTGGATCTTGATGGGTCTAT
TAATGGGCCTAAA

QA 1 594 1 594
DS 

RD RS1A542TF 807 0 0
CTCTTGT
AACTCTAAGGAACATCTCTCGCAAACACCAAAACCCTCTTTTGGGTTTCTCAACTTCCTT
CCATAACCTAAGGATCTCATCCAACGGTCCAGCTTTCTCCACACGATCAAGATCCACCAC
CTACTCATCCACTCCAGCTTTCTTCAGAACCATGTGCAGCAGCAGCAGCAGCGAGAACTC
CAGACCCACTAAGATCCAAGAACTCAACGTGTACGAGTTCAACGAAGGCGACCGAAACAG
CCCAGCGGTTCTAAAACTCGGCAAGAACCCACAGCAGCTCTGCATCGGCGACCTCGTCCC
TTTCACGAACAAACTCTACACCGGAGACCTCAAGAAACGCGTCGGGATCCCGGCG**ACT
CTGCGTTTTGATCCAGCACGTTCCCGAGAAGAAAGGCGACCGCTTCGAAGCTTCTTACAG
CTTCCACTTCGGAGAGTACGGTCACATTTCCGTTCAGGGACCTTACCTGACTTACGAGGA
CACGTTCCTCGCCATCACCGGTGGCTCCGGAGTCTTCGAAGGTGCCTACGGACAGGTCCA
ACTTCGTCAGCTTGTGTATCCGACCAAGCTGTTCTACACTTTTTACTTGAAAGGTGTTGC
CTCTGATTTGCCTGTGGAGCTCACCGGAAAACATGTTGAGCCGTCGAAG*ATGTGAAGCC
GGCGGCGGAAGCTCAG*CGGCTCAGCACGGCGCGACTATCCTTTACTTTACCGAGTAAAA
*TCATTTGCGGCGTTGAGCTTTCTCTGTT*GTTTTCTCT*GGATCT*GATGGGTCTATAT
GGGCCTAAATAATGGGCTTT

QA 8 807 8 807
DS 



AS 1 4

CO CL1494Contig1 814 4 23 U
GGATCGCAGCTTTCCAAAGTCCAAAAGCACAGTTTCTACCAGAAACCAAC*TTTGCATCT
TGCAATTGACCAAAAAATGGAGAATCTACTGGGTCTTCTGAGAATTCATGTGAAGAGAGG
TGTGAATCTCGCCATTAGAGATACCTCAAGCAGCGATCCTTACATCGTCTTTCGCTCAGG
AAAACAGAAGCTTAAAACCCGTGTAATCAAACATAGTATAAACCCGGAATGGAACGACGA
TTTAACTCTTTCTGTTACAGATCCAAACCTCACTGTTAAACTTACGGTTTACGACAAGGA
CTTGTTCTCGGCGGATGATAAGATGGGAGAAGCAGAGTTTGGCATTGCTCCATATCTTGA
AGCCATTAAACTACGCCATAAGCTTGAAGGTGGACTTCCCAACGGAACCATAATCATGAA
GGTACAACCGACCAGACAAAACTGTTTGTCTGAAGAGAGCCATATTGTGTTGAGCCAAGG
CAAGCTTGTGCAGAATATGTTCCTTAGACTCCAGCACGTGGAGTGTGGAGAGGTCGAGCT
ACAGCTCGAGTGGATCGGGGTTCCCGGTTCAAAGGGTATTTAAAGCCATCGACCCCATCC
TTAGTCCCTTGTGCATGCATACATGGTTAAGAAATTAGAACTAAAGCGTTGTCCAAAACC
GGTCAGTGAAAGGATCTCAAACTGGTCATGTAGTAAACTCTTTTGCGTTTTTCTGTTCTT
ATTTGAGTTCAAAGCGTGCAAGTCCATGAGGAATGTGGGCGTCTTAAAACAAGAATGTGT
AAAAATAATGCATGGGTTTACTTTGTAATAAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B715TF U 1
AF RS1G664TF U 4
AF RS1EO76TF U 1
AF RS1EO76JQ C 2
BS 1 42 RS1B715TF
BS 43 43 RS1EO76TF
BS 44 63 RS1B715TF
BS 64 64 RS1EO76TF
BS 65 71 RS1B715TF
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BS 73 87 RS1B715TF
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BS 124 375 RS1B715TF
BS 376 376 RS1EO76TF
BS 377 390 RS1B715TF
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BS 471 471 RS1EO76TF
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BS 515 652 RS1EO76TF
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RD RS1B715TF 521 0 0
GGATCGCAGCTTTCCAAAGTCCAAAAGCACAGTTTCTACCAGCAACCAAC*TTTGCATCT
TGCTATTGACCCAAAAATGGAGAATCTGCTGGGTCTTCTGAGAATTCATGTGAAGAGAGG
TGCGAATCTCGCCATTAGAGATACCTCAAGCAGCGATCCTTACATCGTCTTTCGCTCAGG
AAAACAGAAGCTTAAAACCCGTGTAATCAAACATAGTATAAACCCGGAATGGAACGACGA
TTTAACTCTTTCTGTTACAGATCCAAACCTCACTGTTAAACTTACGGTTTACGACAAGGA
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AGCCATTAAACTACGTCATAAGCTTGAAGGAGGACTTCCCAACGGAACCATAATCATGAA
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CACGTGG

QA 1 514 1 514
DS 

RD RS1G664TF 567 0 0
GGACAGT
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CCAAAAATGGAGAATCTACTGGGTCTTCTGAGAATTCACGTGAAGAGAGGTGTGAATCTC
GCCATTAGAGATACCTCAAGCAGCGATCCTTACATCGTCTTTCGCTCAGGAAAACAGAAG
CTCAAAACCCGTGTAATCAAACATAGTATAAACCCGGAATGGAACGACGATTTAACTCTT
TCTGTTACAGATCCAAACCTCACTGTTAAACTTACGGTTTACGACAAGGACTTGTTCTCG
GCGGATGATAAGATGGGAGAAGCAGAGTTTGGCATTGCTCCATATCTTGAAGCCATTAAA
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CAGAATATGTTCCTTAGACTCCAGAATGTGGAGTGTGGAGAGGTCGAGCTACAGCTCGAG
TGGATCGAGGTTCCCGGTTC

QA 8 567 8 567
DS 

RD RS1EO76TF 656 0 0
GGATTGCAGC
TTTCCAAAGTCCAAAAGCACAGTTTCTACCAGAAACCAAC*TTTGCATCTTGCAATTGAC
CAAAAAATGGAGAATCTACTGGGTCTTCTGAGAATTCATGTGAAGAGAGGTGTGAATCTC
GCCATTAGAGATACCTCAAGCAGCGATCCTTACATCGTCTTTCGCTCAGGAAAACAGAAG
CTTAAAACCCGTGTAATCAAACATAGTATAAACCCGGAATGGAACGACGATTTAACTCTT
TCTGTTACAGATCCAAACCTCACTGTTAAACTTACGGTTTACGACAAGGACTTGTTCTCG
GCGGATGATAAGATGGGAGAAGCAGAGTTTGGCATTGCTCCATATCTTGAAGCCATTAAA
CTACGCCATAAGCTTGAAGGTGGACTTCCCAACGGAACCATAATCATGAAGGTACAACCG
ACCAGACAAAACTGTTTGTCTGAAGAGAGCCATATTGTGTTGAGCCAAGGCAAGCTTGTG
CAGAATATGTTCCTTAGACTCCAGCACGTGGAGTGTGGAGAGGTCGAGCTACAGCTCGAG
TGGATCGGGGTTCCCGGTTCAAAGGGTATTTAAAGCCATCGACCCCATCCTTAGTCCCTT
GTGCATGCATACATGGTTAAGAAATTAGAACTAAAGCGTTGT
CCAA

QA 11 652 11 652
DS 

RD RS1EO76JQ 813 0 0
GATTGCAGC
TTTCCAAAGTCC*AAAGCACAGTTTCTACCAGAAACCAAC*TTTGCATCTTGCAATTGAC
CAAAAAATGGAGAATCTACTGGGTCTTCTGAGAATTCATGTGAAGAGAGGTGTGAATCTC
GCCATTAGAGATACCTCAAGCAGCGATCCTTACATCGTCTTTCGCTCAGGAAAACAGAAG
CTTAAAACCCGTGTAATCAAACATAGTATAAACCCGGAATGGAACGACGATTTAACTCTT
TCTGTTACAGATCCAAACCTCACTGTTAAACTTACGGTTTACGACAAGGACTTGTTCTCG
GCGGATGATAAGATGGGAGAAGCAGAGTTTGGCATTGCTCCATATCTTGAAGCCATTAAA
CTACGCCATAAGCTTGAAGGTGGACTTCCCAACGGAACCATAATCATGAAGGTACAACCG
ACCAGACAAAACTGTTTGTCTGAAGAGAGCCATATTGTGTTGAGCCAAGGCAAGCTTGTG
CAGAATATGTTCCTTAGACTCCAGCACGTGGAGTGTGGAGAGGTCGAGCTACAGCTCGAG
TGGATCGGGGTTCCCGGTTCAAAGGGTATTTAAGGCCATCGACCCCATCCTTAGTCCCTT
GTGCATGCATACATGGTTAAGAAATTAGAACTAAGGCGTTGTCCAAAACCGGTCAGTGAA
AGGATCTCAAACTGGTCATGTAGTAAACTCTTTTGCGTTTTTCTGTTCTTATTTGAGTTC
AAAGCGTGCAAGTCCATGAGGAATGTGGGCGTCTTAAAACAAGAATGTGTAAAAATAATG
CATGGGTTTACTTTGTAATAAATC

QA 10 813 10 813
DS 



AS 2 5

CO CL1495Contig1 1014 3 2 U
GGGCATTGAAGAACATGCGAGCCTCTGTTTAACTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCT
CTCTCTATACAGATCTCTTCCTCTCTCACTTCAAGATCACCACAACTCTAATCCCGTTTC
CAAGTGTGGGATCGTAAGAGAGATTTGCGTAACATCAGAGTCAAAAAAAAAAATGGGGAA
GAAGGAGAGACCAAGACCAGAGAAGTTGTCTGTTTACCTTTATATACCTAACATTGTTGG
GTACATGAGAGCTCTCTTGAACTGTGTTGCCTTTGCTGTCTGTTTCTCTAACAAAACACT
TTTCTCCCTCCTCTATTTCTTCAGCTTTTGTTGTGATGCTGTGGATGGCTGGTGTGCTCG
TAGATTCAACCAAGTTTCAACGTTTGGGGCTGTTCTCGACATGGTCACAGATAGAGTTAG
CACGGCATGTCTACTCGTGATTCTCTCTCAAGTCTACAGGCCTAGCTTGGTCTTCCTTTC
ATTGCTGGCTTTAGATATTGCTAGTCATTGGCTGCAGATGTACAGTACGTTTCTAGCAGG
GAAGAGCAGCCATAAGGATGTGAAAGACAGCACAAGCTGGCTTTTCAGACTCTACTATGG
AAACCGGATCTTCATGTGCTATTGCTGTGTTTCTTGCGAGGTTCTATATATCATCCTTCT
TCTCATTGCAAAGAACCAAACCGAAAGTCTCCTGAATGTCGTAGTTTCCACATTAACTCA
GATTTCACCACTTTCTCTTCTTCTCGCTTTGACAATATTCGGTTGGTCGATGAAACAAAC
AGTCAATATCATTCAGATGAAAACAGCTGCAGATGTCTGTGTACTGTATGATATAGAGAA
GCAGCAGAAGAGTCTTTGATCTTCCTTCCCTTTTTTTCTGAACTTGCAACTCTATTTATC
TTTTTTTTCTTGTGTAGAAACATGTTCCTCCTGTTATAAACAAGATGAAAGAATATTGAT
TTACCTTTTTGACATAATTTCTGTTTGTAAATATAATCTGATTACAAGTTTTAC


BQ
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AF RS1BL67TF U 1
AF RS1BL67JQ C 315
AF RS1GD03TF U 452
BS 1 735 RS1BL67TF
BS 736 1014 RS1GD03TF

RD RS1BL67TF 735 0 0
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CTCTCTATACAGATCTCTTCCTCTCTCACTTCAAGATCACCACAACTCTAATCCCGTTTC
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GTACATGAGAGCTCTCTTGAACTGTGTTGCCTTTGCTGTCTGTTTCTCTAACAAAACACT
TTTCTCCCTCCTCTATTTCTTCAGCTTTTGTTGTGATGCTGTGGATGGCTGGTGTGCTCG
TAGATTCAACCAAGTTTCAACGTTTGGGGCTGTTCTCGACATGGTCACAGATAGAGTTAG
CACGGCATGTCTACTCGTGATTCTCTCTCAAGTCTACAGGCCTAGCTTGGTCTTCCTTTC
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GAAGAGCAGCCATAAGGATGTGAAAGACAGCACAAGCTGGCTTTTCAGACTCTACTATGG
AAACCGGATCTTCATGTGCTATTGCTGTGTTTCTTGCGAGGTTCTATATATCATCCTTCT
TCTCATTGCAAAGAACCAAACCGAAAGTCTCCTGAATGTCGTAGTTTCCACATTAACTCA
GATTTCACCACTTTC

QA 1 735 1 735
DS 

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ATATTGCTAGTCATTGGCTGCAGATGTACAGTACGTTTCTAGCAGGGAAGAGCAGCCATA
AGGATGTGAAAGACAGCACAAGCTGGCTTTTCAGACTCTACTATGGAAACCGGATCTTCA
TGTGCTATTGCTGTGTTTCTTGCGAGGTTCTATATATCATCCTTCTTCTCATTGCAAAGA
ACCAAACCGAAAGTCTCCTGAATGTCGTAGTTTCCACATTAACTCAGATTTCACCACTTT
CTCTTCTTCTCGCTTTGACAATATTCGGTTGGTCGATGAAACAAACAGTCAATATCATTC
AGATGAAAACAGCTGCAGATGTCTGTGTACTGTATGATATAG

QA 1 522 1 522
DS 

RD RS1GD03TF 563 0 0
GG
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TTGCGAGGTTCTATATATCATCCTTCTTCTCATTGCAAAGAACCAAACCGAAAGTCTCCT
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TAATCTGATTACAAGTTTTAC

QA 3 563 3 563
DS 



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TCCTGCGAGGTTCTGTATATCATCCTTCTTCTCATTGCAAAGAACCAAACCGAAAGTCTC
CTGAATGTCGTACTTTCCACATTAACTCAGATTTCACCACTTTCTTT


BQ
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AF RS1H077TF U 1
AF RS1H077JQB C 157
BS 1 685 RS1H077TF
BS 686 707 RS1H077JQB

RD RS1H077TF 685 0 0
TTTTTGACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCTCTCTCTCTACAGATCTCTTCCTCTCTCTC
ACTTCAAGATCGCCACAACTCTAACCCGTTTCCAAGTGGAGATCGTTAAAGAGATTGTGT
AACAACATCAGAGTCAAAAAAATGGGGAAGAAGGAGAGACCAAGACCAGAGAAGTTGTCT
GTTTACCTTTATATACCTAACATTGTTGGGTACATGAGAGTTCTCTTGAACTGTGTTGCC
TTTGCTGTCTGTTTCTCTAACAAAACACTTTTCTCCCTCCTCTATTTCTTCAGCTTTTGT
TGTGATGCTGTGGATGGCTGGTGCGCTCGTAGATTCAACCAAGTTTCAACGTTTGGGGCT
GTTCTCGACATGGTCACAGATAGAGTTAGCACGGCATGTCTACTCGTGATTCTCTCTCAA
GTCTACAGGCCTAGCTTGGTCTTCCTCTCTTTGCTGGCTTTAGATATTGCTAGTCATTGG
CTGCAGATGTACAGTACGTTTCTAGCAGGGAAGAGCAGCCATAAGGATGTGAAAGACAGC
ACAAGCTGGCTTTTCAGACTCTACTATGGCAACCGGATCTTCATGTGTTATTGCTGTGTT
TCCTGCGAGGTTCTGTATATCATCCTTCTTCTCATTGCAAAGAACCAAACCGAAAGTCTC
CTGAATGTCGTACTTTCCACATTAA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RS1H077JQB 551 0 0
AGACCAAGACCAGAGAAGTTGTCTGTTTACCTTTATATACCTAACATTGTTGGGTACATG
AGAGTTCTCTTGAACTGTGTTGCCTTTGCTGTCTGTTTCTCTAACAAAACACTTTTCTCC
CTCCTCTATTTCTTCAGCTTTTGTTGTGATGCTGTGGATGGCTGGTGCGCTCGTAGATTC
AACCAAGTTTCAACGTTTGGGGCTGTTCTCGACATGGTCACAGATAGAGTTAGCACGGCA
TGTCTACTCGTGATTCTCTCTCAAGTCTACAGGCCTAGCTTGGTCTTCCTCTCTTTGCTG
GCTTTAGATATTGCTAGTCATTGGCTGCAGATGTACAGTACGTTTCTAGCAGGGAAGAGC
AGCCATAAGGATGTGAAAGACAGCACAAGCTGGCTTTTCAGACTTTACTATGGCAACCGG
ATCTTCATGTGTTATTGCTGTGTTTCCTGCGAGGTTCTGTATATCATCCTTCTTCTCATT
GCAAAGAACCAAACCGAAAGTCTCCTGAATGTCGTACTTTCCACATTAACTCAGATTTCA
CCACTTTCTTT

QA 1 551 1 551
DS 



AS 1 4

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AAAGAAAAAAAGTAATACCAACCAATTGATTAAAGTCACATTAACAATTCTGAAAACAAC
AACAGAAGATATGATGTGTAGAAAGTAACTTAGCTACAAAGTACAGATAAA*GAGATTAA
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TCAGCATTGCTCGCTGATTATTTAAATTAAATAAATGAAACTCGTTGCGCATAAAACAAT
AGCTATAAACTGAAATGAAAACAGAAACTTCTCAGTTTCAAACCTGAATTCACAATTGTA
AACCCTGAGGAAGATGGTACCTCCCAAAGATGACCATGACCAAACAACGAATGTTGAAGC
AGACAGAGGATATACTCTTCTTTCTCTTTCGTTACTCCACATAGCTCCCAAGATTTTTCG
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CAATGACTCATCCCAAACCTCAGCACTTCCATTCGATGCATCTTCAACATCTTCTTCCAT
CGAAAGCCTTATGTACTCTCTATGTGCAAAACGATCCCACTCTGTCAATGTAGGGTTCTC
ACGCTCCTGACGAATGAGGAATGGATCCCGTGTCTCAAATGCCATAAATTTATTAAGATT
AAAAAGGATGTTGAAGACGTTTCCAGAGAGTTTGGAGCCCTTCAGGTCATTCAGGGTTAT
ATAGCTTTCATTCTCTGGTCCGATCATATCAATTAGCTGACATAATATATCCTCAAAAAG
AACAGCCTCTTGCGCCATACACTCCATTCGATGTAACTGCTCCTCATAAAAGAATTGCAT
CTCATTTCGCGTCAGTATCCCATTTGCATCCAAGTCAATGCACTTAAACCAATATTCAAG
GCTAGGCTCTGAGGATTTATCTTCTTCCGCAAGTATGAAATAGACAAAATCCTCATACCC
CATTTTCCCTTCAACTTTGCTAGTGAACTTCCTAGCAACCTGGGAGAATATTTGTCGACA
ATGCGGTAAGTAAGAGCATGGTTGCCATATTTCATAAGGTTTTCTTTGTCAATAAGGAAA
TCGTGATCAGTATCGAGCTCCCAGAACTTGCAGTATATGACATAGAAATGCTCATATGAG
AAGTACCGTAACACTTTGTTGATATCTTCTTCTTCATCAGCATGAAGCATAGCATCGATT
AAATTTCCAAGTTTAAGCTCCCTATATGTAAGTCGACCATTTCCAGATCTATTTATGTAG
TAAAAAATTCTGTATGTAACAGTTTCAGCATATCTTTCTTGGAATTCAGGTGTGCCTTGC
AAAAATTCAAGCCCAGGGTGTGTCGCCAAAAGTTCTTTAAGTAGTGGCTTGAAATCATCC
TTCACAAGGAAACTCTGATTTTGCTGCTTTAGTATCTTGAATATTTGGGTAGTTTTATCC
ATTATCAACATGTTCCCGTTTACCCAATAATCAATAAATGCTTCCCTGGTAA


BQ
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AATGAGGAATGGATCCCGTGTCTCAAATGCCATAAATTTATTAAGATTAAAAAGGATGTT
GAAGACGTTTCCAGAGAGTTTGGAGCCCT

QA 1 629 1 629
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AACAAGTGCCAATTGTGTAACATGCAAATCAGCATTGCTCGCTGATTATTTAAATTAAAT
AAATGAAACTCGTTGCGCATAAAACAATAGCTATAAACTGAAATGAAAACAGAAACTTCT
CAGTTTCAAACCTGAATTCACAATTGTAAACCCTGAGGAAGATGGTACCTCCCAAAGATG
ACCATGACCAAACAACGAATGTTGAAGCAGACAGAGGATATACTCTTCTTTCTCTTTCGT
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TTAGCTGACATAATATATCCTCAAAAAGAACAGCCTCTTGCGCCATACACTCCATTCGAT
GTAACTGCTCCTCATAAAAGAATTGCATCTC

QA 1 751 1 751
DS 

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ATACCCCATTTTCCCTTCAACTTTGCTAGTGAACTTCCTAGCAACCTGGGAGAATATTTG
TCGACAATGCGGTAAGTAAGAGCATGGTTGCCATATTTCATAAGGTTTTCTTTGTCAATA
AGGAAATCGTGATCAGTATCGAGCTCCCAGAACTTGCAGTATATGACATAGAAATGCTCA
TATGAGAAGTACCGTAACACTTTGTTGATATCTTCTTCTTCATCAGCATGAAGCATAGCA
TCGATTAAATTTCCAAGTTTAAGCTCCCTATATGTAAGTCGACCATTTCCAGATCTATTT
ATGTAGTAAAAAATTCTGTATGTAACAGTTTCAGCATATCTTTCTTGGAATTCAGGTGTG
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TCATCCTTCACAAGGAAACTCTGATTTTGCTGCTTTAGTATCTTGAATATTTGGGTAGTT
TTATCCATTATCAACATGTTCCCGTTTACCCAATAATCAATAAATGCTTCCCTGGTAA

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DS 



AS 1 4

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CAAATAGAATTATCCAGTCTTGCGATCATTCAGACACCACATGCCACATTGCAACGAATA
AATACATAAACGTGCGTATTCAATTATCAA*TAACAAACTAAAAAGTTTTAAAAGACTAG
GAAGGGCAACAAGAAATGAGAAGCCTCCAAAGACTTTATTTTATGTTTTAGGAAACACTT
GATCTGATGCAGCACCTGACTTGTTTGTGCCATCCTCTTCCATTTTCACACCTGCTTCCT
CAACTCCCACTGAGTTTCCTCCTGTTACCTTGGTGGTGCTTCCACTCTCCTCCATACCCC
CCATCTCAAAACCTTTCATACGCTCCATTACTCCTTTCAGTCCTCCATCCTTGTCCTTTG
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CATCCATGTCAGAATCCGCATCCCATCTTTTATCTCCATCTTCTTGGTCTTCATCTACCT
CAGGAGTCTCTGTATCTGGTGGCCTTTCCTGAAACGGCACACTCGGAGCATGCTGAAGCT
TCGAGAGGTTGTGGAGCAAGTCATTACGAATCACTTCAAGCATCTGCCGAGAGTTCTTGT
TCTCCATGTTACTCGGAGCAACGTGAAGCGTATAGTCTGGACCAAAGTACTCATAGTACT
CATGCTCCGGCATCTTGTCCTCAACTTCGATTCCAAGTGCAACTCCAGTCTCGTAGCACC
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TAAACGATCTCATGAACTTGACACACTCGGCATGACCTTTGATGGAGAGGTTAAAGCATC
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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DB64JQ U 1
AF RS1FY92JQ U 29
AF RS1CS18JQ U 29
AF RS1DB64TF C 575
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TGGTGGTGCTTCCACTCTCCTCCATACCCCCCATCTCAAAACCTTTCATACGCTCCATTA
CTCCTTTCAGTCCTCCATCCTTGTCCTTTGCATCAGATTCAACAGCTTCTCTTTTCACTC
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CAGACACCACATGCCACATTGCAACGAATAAATACATAAACGTGCGTATTCAATTATCAA
ATAACAAACTAAAAAGTTTTAAAAGACTAGGAAGGGCAACAAGAAATGAGAAGCCTCCAA
AGACTTTATTTTATGTTTTAGGAAACACTTGATCTGATGCAGCACCTGACTTGTTTGTGC
CATCCTCTTCCATTTTCACACCTGCTTCCTCAATTCCCACTGAGTTTCCTCCTGTTACCT
TGGTGGTGCTTCCACTCTCCTCCATACCCCCCATCTCAAAACCTTTCATACGCTCCATTA
CTCCTTTCAGTCCTCCATCCTTGTCCTTTGCATCAGATTCAACAGCTTCTCTTTTCACTC
TGCTTGGTATAGGTTTACGATCATCATCTACATCCATGTCAGAATCCGCATCCCATCTTT
TATCTCCATCTTCTTGGTCTTCATCTACCTCAGGAGTCTCTGTATCTGGTGGCCTTTCCT
GAAACGGCACACTCGGAGCATGCTGAAGCTTCGAGAGGTTGTGGAGCAAGTCATTACGAA
TCACTTCAAGCATCTGCCGAGAGTTCTTGTTCTCCATGTTACTCGGAGCAACGTGAAGCG
TATAGTCTGGACCAAAGTACTCATAGTACTCATGCTCCGGCATCTTGTCCTCAACTTCGA
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CACCACCACCCAAGAGAAGTAACGGAACATTAAACGATCTCATGAACTTGACACACTCGG
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AACGCACACTC
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GCCGAGAGTTCTTGTTCTCCATGTTACTCGGAGCAACGTGAAGCGTATAGTCTGGACCAA
AGTACTCATAGTACTCATGCTCCGGCATCTTGTCCTCAACTTCGATCCCAAGTGCAACTC
CAGTCTCGTAGCACCAGCACCGAGCAACGTTACGGATAGTGTAACCACCACCACCCAAGA
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TGTCGATATCAACATACAGAACACGCTCATGCTGCTTAAGCAGCTCAAGGATAGCTAGGA
CGATGTCATTGACATAACAGAAGCCAGAAGCCTCACACTTCC

QA 12 713 12 713
DS 



AS 1 5

CO CL1498Contig1 1325 5 11 U
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ACAACTTGTAACACGTTCGAAGAAGAGTGGACATATATACATTTTACATGTCACTGCTGG
ATCAGAAGAAACACCTTCTTTTTTTTTCTAGAATACAAGCACACACCAAAGGATATATAG
GCGTATTCACACTGGATTCGAGTTTTCTGCAACACGAATACGCCAAGCGAAATAGTGAAG
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ATAGATCGGAGGTAGTCTCACTGTAGAATATAATAGATGAACCAAAATGCCTACAAGCGC
AAACTCAAGCGCTGCGTATGTCCAAATGTATTCTCTGATAGCTAGGACAATGGCAAACAC
AGATGCTAGGAGGCCTAACGTTAATGAGAATGGTCCTGCTATGTAGATAGCTTGCGTGCT
GAGATCCCGAATTAGTAATTGCTCGAGGAAGAAGAAGTAACAGACTGTGCTGATTAGAAC
CAACACCGCAAACTCTTGCCAAGCACTAGCGGTTTGTGACTGCATACTCTGTTGACTGCT
GCGATCACCACCACGTCCGCTGTTCAGTTGATTAGTTGTAGGCACGCGAAGCAATATAAC
CGGTAGGTTCTTGACTTCTCTTCTACAGACGTCACAGGTTCTCGTCCCCTTTGTGCTAAA
CCATTTGATGGCACACGCTTCGTGAACTAGTCTGAGATCGCCTTTGCAGCTGCACTCCAT
CTTAAGAGTGTTGCCTTCTTCGCACACGTCCAGACAGATCCTGCACACCGCTTCTTCTTC
CGGAATCTCTTCTTCTGTTTCTCCAGTGGGAACTGGAGAGATTTGATCTGGGCTTGTTTC
AAGAGCTTTGCGGTTGTCAAAAGAAACGGATCGGACAATGACTTTGTTTCTCCCAGGCAT
GGACAATGACCTTGGAACTGATGGACGTATAGAATCTTTCTTAGGAGGTTCACCGGGAAC
AGAAACTGAGACATGAGCAGGAGGTACCACAGGAGACAGCTTCGCGGGCTGTCTAGATGG
AAGAGACAAGCATCTTTGCCAATAAGGCGAAGTAGCTGCTGAACCGGGAGGGTTATTATT
AGCCTTTTTAGCTGTTTCTTCTTCCATGAGAGCGGGAGATAGCAGAGAGCTTCTCTCGCT
TTCAGGATGAGCTACAGCTTTCTTTTTCAAGCTTAGGTTACGCAAGATTCCTCTTGGCGA
AGATGTGGTGCTGGTGCTGCTTTTGAATGAGCTTGTGGACTTGAGTGAACCCTTTGGGAT
ACGGC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

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AA
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ATAGATCGGAGGTAGTCTCACTGTAGAATATAATAGATGAACCAAAATGCCTACAAGCGC
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CAACACCGCAAACTCTTGCCAAGCACTAGCGGTTTGTGACTGCATACTCTGTTGACTGCT
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CT

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TACGGC

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CTCACCTTCAGCTCTAATAACCGCGGCTCTCCTCTCCTGATCAGCCTTCATCACCACAAA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1D719JQ U 1
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AF RS1AM88TF C 36
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TGCTCTGTCCACTGGGCAAGTAAGCCACGTTCGGAGACCTAGCCAGTGTAGCTGCAACCT
CCCTCGAAGCCTCAATCCTCCTGAGCTCGATCAGTCCCATTCCAGCTTTAGCCGTCGCAT
CAGAAATCAACTGAGCAGCTTCGCTCTCACCTTCAGCTCTAATAACCGCGGCTCTCCTCT
CCTGATCAGCCTTCATCACCACAAACTTGGACCTCTCCGCTTCCTGCTGAGCCACTTGCT
TCGCCTCCACCGCCCTCGAGAACTCCATACCGTACGACAAATGCGTGATAGCCACATCGT
CGAGCTCGATGTTGAAGTCCCTGGCACGCTTGATGAGAGAGTCACGAACAAGTGCCGACA
CTTGAGGTCGCTCAGTGAGGAGCTGGTCAGCGTTGAATTGAGCCACCACAGCCTTCAAGA
CCTCGTTTCCAATCGAGGGAAGAACCTTCTCGTCATACTCCACACCCAATGTTTGGAATA
TTGTAGGGAGACGCGACACCTCGGGGCGAGAGAGAACACGGAGGGTGAGATTAACCATCT
GGAGATCCTTGGTACCGGA
C

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 4

CO CL1500Contig1 899 4 16 U
GGAGGTTCTCAAGCAGCTTGCTCTCTCTCTCACACCTAACTTACTAAAGCAGCTAGCTAC
AATGGCGGTGACCTTTTCAGATCTACACACAGAGCAGGGCCTCAAATCCGTGGAGGAGCA
CCTCGTCGGAAAAACCTACATCTCCGGAGATAAATTGTCTGTAGATGATGTGAAGGTATA
CGCTGCCGTTGTTGAGAAACCAAGCGAGAGTTTCCCTAATGCTAGCAAGTGGTACGCCTG
TGTTACCTCCCACCTTGCTAAAAGTTTCCCTGGTAAAGCCGTAGGAGTTTCAATCGGTGG
CTCTGCTACTGCTCCTGCCCAAGCTGAGACACCTGCAGTAGCTGATGATGATGATGACAT
GGATCTGTTTGGTGACGAGACCGAGGAGGAAAAGAAAGCTGCAGAGGAGAGGGAGGCTGC
TAAGAAGGACACCAAGAAGCCCAAAGAGAGTGGAAAGTCATCTGTGCTCATGGAAGTGAA
ACCATGGGATGACGAGACAGATATGAAGAAACTTGAGGAGTGTGTTCGTGCTGTTGAGAT
GCCTGGTCTTCTATGGGGAGCTTCAAAACTGGTTCCAGTTGGTTACGGGATCAAGAAGCT
CACGATCATGCTCACAATCGTTGATGACCTCGTCTCCCCAGACAACCTCATTGAAGACTA
TCTCACCTCTGAACCTAACAACGAGTACATCCAGAGTGTTGACATTGTCGCATTCAACAA
GATCTAGAGACGCTCTAAAACTTGTCTCCCTACCAAACGATACATTTCATTTCCTTCCGA
GTTTTGTCTGCTTGAGATGTTTGTTTTCTAGTTGCAACTTGCACGACCCCTTTCATGTTT
GCAAGAAACATAAACTATGGATGCTTAATATTCCTTTGCTAAAAACTGAAGTGTTGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BD78TF U 30
AF RS1BE14TF U 1
AF RS1DG30JQ C 329
AF RS1BE14JQ C 140
BS 1 86 RS1BE14TF
BS 87 87 RS1BD78TF
BS 88 492 RS1BE14TF
BS 493 493 RS1BD78TF
BS 494 672 RS1BE14TF
BS 673 673 RS1BE14JQ
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BS 717 717 RS1BE14JQ
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BS 741 753 RS1BE14TF
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BS 755 773 RS1BE14TF
BS 774 899 RS1BE14JQ

RD RS1BD78TF 648 0 0
GG
ACACCTAACTTACTAAAGCAGCTAGCTACAATGGCGGTGACCTTTTCAGATCTACACACA
GAGCAGGGTCTCAAATCCGTGGAGGAGCACCTCGTCGGAAAAACCTACATCTCCGGAGAT
AAATTGTCTGTAGATGATGTGAAGGTATACGCTGCCGTTGTTGAGAAACCAAGCGAGAGT
TTCCCTAATGCTAGCAAGTGGTACGCCTGTGTTACCTCCCACCTTGCTAAAAGTTTCCCT
GGTAAAGCCGTAGGAGTTTCAATCGGTGGCTCTGCTGCTGCTCCTGCCCAAGCTGAGGCA
CCTGCAGTAGCTGATGATGATGATGACATGGATCTGTTTGGTGACGAGACCTAGGAGGAA
AAGAAAGCTGCAGAGGAGAGGGAGGCTGCTAAGAAGGACACCAAGAAGCCCAAAGAGAGT
GGAAAGTCATCTGTGCTCATGGAAGTGAAACCATGGGATGACGAGACAGATATGAAGAAA
CTTGAGGAGTGTGTTCGTGCTGTTGAGATGCCTGGTCTTCTATGGGGAGCTTCAAAACTG
GTTCCAGTTGGTTACGGGATCAAGAAGCTCACGATCATGCTCACAATCGTTGATGACCTC
GTCTCCCCAGACAACCTCATTGAAGACTATCTCACCTCTGA
CCTAA

QA 3 643 3 643
DS 

RD RS1BE14TF 774 0 0
GGAGGTTCTCAAGCAGCTTGCTCTCTCTCTCACACCTAACTTACTAAAGCAGCTAGCTAC
AATGGCGGTGACCTTTTCAGATCTACGCACAGAGCAGGGCCTCAAATCCGTGGAGGAGCA
CCTCGTCGGAAAAACCTACATCTCCGGAGATAAATTGTCTGTAGATGATGTGAAGGTATA
CGCTGCCGTTGTTGAGAAACCAAGCGAGAGTTTCCCTAATGCTAGCAAGTGGTACGCCTG
TGTTACCTCCCACCTTGCTAAAAGTTTCCCTGGTAAAGCCGTAGGAGTTTCAATCGGTGG
CTCTGCTACTGCTCCTGCCCAAGCTGAGACACCTGCAGTAGCTGATGATGATGATGACAT
GGATCTGTTTGGTGACGAGACCGAGGAGGAAAAGAAAGCTGCAGAGGAGAGGGAGGCTGC
TAAGAAGGACACCAAGAAGCCCAAAGAGAGTGGAAAGTCATCTGTGCTCATGGAAGTGAA
ACCATGGGATGATGAGACAGATATGAAGAAACTTGAGGAGTGTGTTCGTGCTGTTGAGAT
GCCTGGTCTTCTATGGGGAGCTTCAAAACTGGTTCCAGTTGGTTACGGGATCAAGAAGCT
CACGATCATGCTCACAATCGTTGATGACCTCGTCTCCCCAGACAACCTCATTGAAGACTA
TCTCACCTCTGA*CCTAACA*CGAGTACATCCAGAGTGTTGACATTGTCGCATTCA*CAA
GATCTAGAGACGCTCTAAA*CTTGTCTCCCTAC*AAACGATACATTTCATTTC
C

QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1DG30JQ 454 0 0
G
CACCTGCAGTAGCTGATGATGATGATGGCATGGATTTGTTTGGTGACGAGACCGAGGAGG
AAAAGAAAGCTGCAGAGGAGAGGGAGGCTGTTAAGAAGGACACCAAGAAGCCCAAAGAGA
GTGGAAAGTCATTTGTGTTCATGGAAGTGAAACCATGGGATGACGAGACAGATATGAAGA
AACTTGAGGAGTGTGTTCGTGCTGTTGAGATGCCTGGTTTTTTATGGGGAGCTTCAAAAC
TGGTTCCAGTTGGTTACGGGATCAAGAAGCTCACGATCATGCTCACAATCGTTGATGACC
TCGTCTCCCCAGACAACCTCATTGAAGACTATTTCACCTTTGAACCTAACAACGAGTACA
TCCAGAGTGTTGACATTGTCGCATTCAACAAGATCTAGAGACGCTTTAAAACTTGTTTCC
CTACCAAACGATACATTTCATTTCCTTCCGAGT

QA 2 454 2 454
DS 

RD RS1BE14JQ 760 0 0
ATCTCCGGAGATAAATTGTCTGTAGATGATGTGAAGGTATACGCTGCCGTTGTTGAGAAA
CCAAGCGAGAGTTTCCCTAATGCTAGCAAGTGGTACGCCTGTGTTACCTCCCACCTTGCT
AAAAGTTTCCCTGGTAAAGCCGTAGGAGTTTCAATCGGTGGCTCTGCTACTGCTCCTGCC
CAAGCTGAGACACCTGCAGTAGCTGATGATGATGATGACATGGATCTGTTTGGTGACGAG
ACCGAGGAGGAAAAGAAAGCTGCAGAGGAGAGGGAGGCTGCTAAGAAGGACACCAAGAAG
CCCAAAGAGAGTGGAAAGTCATCTGTGCTCATGGAAGTGAAACCATGGGATGATGAGACA
GATATGAAGAAACTTGAGGAGTGTGTTCGTGCTGTTGAGATGCCTGGTCTTCTATGGGGA
GCTTCAAAACTGGTTCCAGTTGGTTACGGGATCAAGAAGCTCACGATCATGCTCACAATC
GTTGATGACCTCGTCTCCCCAGACAACCTCATTGAAGACTATCTCACCTCTGAACCTAAC
AACGAGTACATCCAGAGTGTTGACATTGTCGCATTCAACAAGATCTAGAGACGCTCTAAA
ACTTGTCTCCCTACCAAACGATACATTTCATTTCCTTCCGAGTTTTGTCTGCTTGAGATG
TTTGTTTTCTAGTTGCAACTTGCACGACCCCTTTCATGTTTGCAAGAAACATAAACTATG
GATGCTTAATATTCCTTTGCTAAAAACTGAAGTGTTGTGC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 5

CO CL1501Contig1 1051 5 14 U
TTTTTGTTTGTATCCTTCTTCCTCTCTCTCTCTCTCTCCGCCGCATTACGTCTCTCTCTC
TCTCTCTCTCTCAATCTCTCAGCTTAAGCGCAGAACCATGGCAGCGAAACAGGGAGCCGC
AGCTACAACGTATTCACCCAAAATCATGGCGAGAACTCGGCCTCCTATCTTCAAAGGCTC
CGACCTCGATTGGACCCGTCCTGATGGTCGTGGATTCCACCAATGCCGACCTGCCTTACT
TCAAACAGGTGCTGTGAGTGCTGCTTCTGGTTCTGCTTATGCTGAGTTTGGGAACACCAA
AGTCATTGTTTCTGTATTTGGGCCAAGGGAGAGTAAGAAAGCAACGAGTTATAGTGATGT
TGGTAGATTGGATTGCAATGTTAGCTACACTAATTTTGCTTCCCCGACCCTTGGTAGTCA
GGGGACTGATCACAAAGAGTACTCATCAATGCTTCACAAAGCGTTGGAAGGCGTAATCAT
GATGGAGACGTTCCCAAAGACAACTGTTGATGTTTTTGCGCTGGTTCTTGAATCTGGAGG
CAGTGACCTCCCGGTTGTGATATCATGTGCTGGTCTTGCTCTAGCAGACGCCGGGATTAT
GATGTATGACCTTATCACAGCTGTCTCAGTGTCTTGCATAGGGAAAAGCCTTATGATTGA
CCCGGTTACAGAAGAGGAAGGATGCGAAGATGGAAGCTTCATGATGACGTGCATGCCTTC
TCGGAGTGAAATCACTCAGCTGACCATCACTGGTGAATGGACAACGCCTAACATTAACGA
GGCAATGCAGCTTTGCGTGGATGCTTGTTCCAAACTTGGAGAAATCATGCGTGATTGTTT
GAAGCAGGCTGCCTCAGCTTCAGATGAATGAACATACAACTCAAGAAACTATAGCTATGA
TTGTACCTCAGCCATTGGTATGAAACCGGTTAAGCTGTTGGGTTAGGTAAAATTGAATTT
ATACTAAACCGGTGTGATGGAGTTTAAAACAGATGTACTGTGTTACGTCAAAATTTGATG
GAACTAGATCTTTAAAGAGCGTCATTTGCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F170TF U 10
AF RS1BV40JQ C 538
AF RS1BV40TF U 38
AF RS1FY64TF U 1
AF RS1F170JQ C 312
BS 1 218 RS1FY64TF
BS 219 219 RS1F170TF
BS 220 314 RS1FY64TF
BS 315 315 RS1F170TF
BS 316 370 RS1FY64TF
BS 371 371 RS1F170TF
BS 372 493 RS1FY64TF
BS 494 494 RS1F170TF
BS 495 680 RS1FY64TF
BS 681 681 RS1F170JQ
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BS 732 756 RS1FY64TF
BS 757 1051 RS1F170JQ

RD RS1F170TF 646 0 0
GGGTATCCTTCTTC
CTCTCTCTCTCTCTCCGCCGCATTACGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAATCTCTCAGC
TTAAGCGCAGAACCATGGCAGCGAAACAGGGAGCCGCAGCTACAACGTATTCACCCAAAA
TCATGGCGAGAACTCGGCCTCCTATCTTCAAAGGCTCCGACCTCGATCGGACCCGTCCTG
ACGGTCGTGGATTCCACCAATGCCGACCTGCCTTACTTCAAACAGGTGCTGTGAGTGCTA
CTTCTGGTTCTGCTTATGCTGAGTTTGGGAACACCAAAGTCATTGTTTCTGTATTTGGGC
CAAGGGAGAGTAAGAAAGCAACGAGTTATAGTGATGTTGGTAGATTGGATTGCAATGTTA
GCTACACTAATTTTGCTTCCCCGACCCTTGGTAGTCAGGGGACTGATCACAAAGAGTACT
CATCAATGCTTCACAAAGCGTTGGAAGGCGTAATCATGATGGAGACGTTCCCAAAGACAA
CTGTTGATGTTTTTGCGCTGGTTCTTGAATCTGGAGGCAGTGACCTCCCGGTTGTGATAT
CATGTGCTGGTCTTGCTCTAGCAGACGCCGGGATTATGATGTATGACCTTATCACAGCTG
TCTCAGTGTCTTGCATAGGGAAAAGCCTTATG

QA 15 646 15 646
DS 

RD RS1BV40JQ 111 0 0
AGGCAGTGACCTCCCGGTTGTGATATCATGTGCTGGTCTTGCTCTAGCAGACGCCGGGAT
TATGATGTATGACCTTATCACAGCTGTCTCAGTGTCTTGCATAGGGAAAA
A

QA 1 110 1 110
DS 

RD RS1BV40TF 635 0 0
GG
GCCGCATTACGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAATCTCTCAGCTTAAGCGCAGCACCAT
GGCAGCGAAACAGGGAGCCGCAGCTACAACGTATTCACCCAAAATCATGGCGAGAACTCG
GCCTCCTATCTTCAAAGGCCCCGACCTCGATTGGACCCGTCCTGATGGTCGTGGATTCCA
CCAATGCCGACCTGCCTTACTTCAAACAGGTGCTGTGAGTGCTGCTTCTGGTTCTGCTTA
TGCTGAGTTTGGGAACACCAAAGTCATTGTTTCTGTATTTGGGCCAAGGGAGAGTAAGAA
AGCAACGAGTTATAGTGATGTTGGTAGATTGAATTGCAATGTTAGCTACACTAATTTTGC
TTCCCCGACCCTTGGTAGTCAGGGGACTGATCACAAAGAGTACTCATCAATGCTTCACAA
AGCGTTGGAAGGCGTAATCATGATGGAGACGTTCCCAAAGACAACTGTTGATGTTTTTGC
GCTGGTTCTTGAATCTGGAGGCAGTGACCTCCCGGTTGTGATATCATGTGCTGGTCTTGC
TCTAGCAGACGCCGGGATTATGATGTATGACCTTATCACAGCTGTCTCAGTGTCTTGCAT
AGGGAAAAGCCTTATGATTGACCCGGTTACAGA

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DS 

RD RS1FY64TF 757 0 0
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TCTCTCTCTCTCAATCTCTCAGCTTAAGCGCAGAACCATGGCAGCGAAACAGGGAGCCGC
AGCTACAACGTATTCACCCAAAATCATGGCGAGAACTCGGCCTCCTATCTTCAAAGGCTC
CGACCTCGATTGGACCCGTCCTGATGGTCGTGGATTCCGCCAATGCCGACCTGCCTTACT
TCAAACAGGTGCTGTGAGTGCTGCTTCTGGTTCTGCTTATGCTGAGTTTGGGAACACCAA
AGTCATTGTTTCTGCATTTGGGCCAAGGGAGAGTAAGAAAGCAACGAGTTATAGTGATGT
TGGTAGATTGAATTGCAATGTTAGCTACACTAATTTTGCTTCCCCGACCCTTGGTAGTCA
GGGGACTGATCACAAAGAGTACTCATCAATGCTTCACAAAGCGTTGGAAGGCGTAATCAT
GATGGAGACGTTCTCAAAGACAACTGTTGATGTTTTTGCGCTGGTTCTTGAATCTGGAGG
CAGTGACCTCCCGGTTGTGATATCATGTGCTGGTCTTGCTCTAGCAGACGCCGGGATTAT
GATGTATGACCTTATCACAGCTGTCTCAGTGTCTTGCATAGGGAAAAGCCTTATGATTGA
CCCGGTTACAGAAGAGGAAG*ATGCGAAGATGGAAGCTTCATGATGACGTGCATGCCTTC
TCGGAGTGAA*TCACTCAGCTGACCATCACTGGTGA
T

QA 1 756 1 756
DS 

RD RS1F170JQ 740 0 0
CTGT
ATTTGGGCCAAGGGAGAGTAAGAAAGCAACGAGTTATAGTGATGTTGGTAGATTGGATTG
CAATGTTAGCTACACTAATTTTGCTTCCCCGACCCTTGGTAGTCAGGGGACTGATCACAA
AGAGTACTCATCAATGCTTCACAAAGCGTTGGAAGGCGTAATCATGATGGAGACGTTCCC
AAAGACAACTGTTGATGTTTTTGCGCTGGTTCTTGAATCTGGAGGCAGTGACCTCCCGGT
TGTGATATCATGTGCTGGTCTTGCTCTAGCAGACGCCGGGATTATGATGTATGACCTTAT
CACAGCTGTCTCAGTGTCTTGCATAGGGAAAAGCCTTATGATTGACCCGGTTACAGAAGA
GGAAGGATGCGAAGATGGAAGCTTCATGATGACGTGCATGCCTTCTCGGAGTGAAATCAC
TCAGCTGACCATCACTGGTGAATGGACAACGCCTAACATTAACGAGGCAATGCAGCTTTG
CGTGGATGCTTGTTCCAAACTTGGAGAAATCATGCGTGATTGTTTGAAGCAGGCTGCCTC
AGCTTCAGATGAATGAACATACAACTCAAGAAACTATAGCTATGATTGTACCTCAGCCAT
TGGTATGAAACCGGTTAAGCTGTTGGGTTAGGTAAAATTGAATTTATACTAAACCGGTGT
GATGGAGTTTAAAACAGATGTACTGTGTTACGTCAAAATTTGATGGAACTAGATCTTTAA
AGAGCGTCATTTGCTG

QA 5 740 5 740
DS 



AS 1 5

CO CL1502Contig1 647 5 12 U
GGAGTCCTTGCGAGAGTGGCGGAGAGAGTTTATTCATCTGAACCCTCCCTCCTGTTGTTG
AACAATAGCCATGGCGACAGGTAAAACAGTGAAAGATGTCTCTCCTCATGACTTCGTCAA
GGCGTACGCTTCTCATCTCAAGCGATCTGGCAAGATCGAGCTTCCCCCATGGACAGACAT
TGTGAAGACTGGTAAGCTGAAGGAGCTTGCCCCATATGATCCTGATTGGTACTACATCAG
AGCTGCATCTATGGCAAGGAAGGTATACCTGAGGGGAGGTCTTGGCGTTGGTGCTTTCCG
TAGAATCTACGGTGGAAGCAAGAGAAACGGCAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAG
CGGTGGCGTTGCACGTCACATTCTCCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGA
CACCAAAGGAGGAAGAAGAATCACTTCCAGTGGTCAACGGGATTTGGACCAGGTTGCTGG
ACGTATTGCAGCTGAAATTTGAAGATCTCAATCTTGTTTTTTTTAGTTCTTCTACTACTT
TTGAAACCAATGTCCTGTTTTTAGTCCTTTTATCTTTTCTCTCAAGAACCATTATCAATA
TCATTGCTGAAGACTTGCTCTCATAATGTTCAGAGATTGTTCATCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RS1GC21JQ C 1
AF RS1CT66TF U 2
AF RS1GC21TF U 1
AF RS1FZ28JQ C 8
AF RS1FZ28TF U 8
BS 1 9 RS1GC21JQ
BS 10 239 RS1CT66TF
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BS 646 647 RS1FZ28JQ

RD RS1GC21JQ 646 0 0
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AACAATAGCCATGGCGACAGGTAAAACAGTGAAAGATGTCTCTCCTCATGACTTCGTCAA
GGCGTACGCTTCTCATCTCAAGCGATCTGGCAAGATCGAGCTTCCCCCATGGACAGACAT
TGTGAAGACTGGTAAGCTGAAGGAGCTTGCCCCATATGATCCTGATTGGTACTACATCAG
AGCTGCATCTATGGCAAGGAAGGTATACCTGAGGGGAGGTCTTGGCGTTGGTGCTTTCCG
TAGAATCTACGGTGGAAGCAAGAGAAACGGCAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAG
CGTTGGCGTTGCACGTCACATTCTCCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGA
CACCAAAGGAGGAAGAAGAATCACTTCCAGTGGTCAACGGGATTTGGACCAGGTTGCTGG
ACGTATTGCAGCTGAAATTTGAAGATCTCAATCTTGTTTTTTTTAGTTCTTCTACTACTT
TTGAAACCAATGTCCTGTTTTTAGTCCTTTTATCTTTTCTCTCAAGAACCATTATCAATA
TCATTGCTGAAGACTTGCTCTCATAATGTTCAGAGATTGTTCATC
C

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1CT66TF 619 0 0
GGGTCCTT
GCGAGAGTGGCGGAGAGAGTTTATTCATCTGAACCCTCCCTCCTGTTGTTGAACAATAGC
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TTCTCATCTCAAGCGATCTGGCAAGATCGAGCTTCCCCCATGGACAGACATTGTGAAGAC
TGGTAAGCTGAAGGAGCTTGCCCCATATGATCCTGATTGGTACTACATCAAAGCTGCATC
TATGGCAAGGAAGGTATACCTGAGGGGAGGTCTTGGCGTTGGTGCTTTCCGTAGAATCTA
CGGTGGAAGCAAGAGAAACGGCAGCCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAGCGGTGGCGT
TGCACGTCACATTCTCCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGG
AGGAAGAAGAATCACTTCCAGTGGTCAACGGGATTTGGGCCAGGTTGCTGGACGTATTGC
AGCTGAAATTTGAAGATCTCAATCTTGTTTTTTT*AGTTCTTCTACTACTTTTGAAACCA
ATGTCCTGTTTTTAGTCCTTTTATCTTTTCTCTCAAGAACCATTATCAATATCATTGCTG
AAGACTTGCTC

QA 9 619 9 619
DS 

RD RS1GC21TF 646 0 0
GGAGTCCTT
GCGAGAGTGGCGGAGAGAGTTTATTCATCTGAACCCTCCCTCCTGTTGTTGAACAATAGC
CATGGCGACAGGTAAAACAGTGAAAGATGTCTCTCCTCATGACTTCGTCAAGGCGTACGC
TTCTCATCTCAAGCGATCTGGCAAGATCGAGCTTCCCCCATGGACAGACATTGTGAAGAC
TGGTAAGCTGAAGGAGCTTGCCCCATATGATCCTGATTGGTACTACATCAGAGCTGCATC
TATGGCAAGGAAGGTATACCTGAGGGGAGGTCTTGGCGTTGGTGCTTTCCGTAGAATCTA
CGGTGGAAGCAAGAGAAACGGCAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAGCGTTGGCGT
TGCACGTCACATTCTCCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGG
AGGAAGAAGAATCACTTCCAGTGGTCAACGGGATTTGGACCAGGTTGCTGGACGTATTGC
AGCTGAAATTTGAAGATCTCAATCTTGTTTTTTTTAGTTCTTCTACTACTTTTGAAACCA
ATGTCCTGTTTTTAGTCCTTTTATCTTTTCTCTCAAGAACCATTATCAATATCATTGCTG
AAGACTTGCTCTCATAATGTTCAGAGATTGTTCATC
C

QA 10 645 10 645
DS 

RD RS1FZ28JQ 640 0 0
GG
GCGAGAGTGGCGGAGAGAGTTTATTCATCTGAACCCTCCCTCCTGTTGTTGAACAATAGT
CATGGCGACAGGTAAAACAGTGAAAGATGTCTCTCCTCATGACTTCGTCAAGGCGTACGC
TTCTCATCTCAAGCGATCTGGCAAGATCGAGCTTCCCCCATGGACAGACATTGTGAAGAC
TGGTAAGCTGAAGGAGCTTGCCCCATATGATCCTGATTGGTACTACATCAGAGCTGCATC
TATGGCAAGGGAGGTATACCTGAGGGGAGGTCTTGGCGTTGGTGCTTTCCGTAGAATTTA
CGGTGGAAGCAAGAGAAACGGCAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAGCGGTGGCGT
TGCACGTCACATTCTCCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGG
AGGAAGAAGGATCACTTCCAGTGGTCAACGGGATTTGGACCAGGTTGCTGGACGTATTGC
AGCTGAAATTTGAAGATCTCAATCTTGTTTTTTTTAGTTCTTCTACTACTTTTGAAACCA
ATGTCCTGTTTTTAGTCCTTTTATCTTTTCTCTCAAGAACCATTATCAATATCATTGCTG
AAGACTTGCTCTCATAATGTTCAGAGATTGTTCATCGT

QA 3 640 3 640
DS 

RD RS1FZ28TF 640 0 0
GG
GCGAGAGTGGCGGAGAGAGTTTATTCATCTGAACCCTCCCTCCTGTTGTTGAACAATAGT
CATGGCGACAGGTAAAACAGTGAAAGATGTCTCTCCTCATGACTTCGTCAAGGCGTACGC
TTCTCATCTCAAGCGATCTGGCAAGATCGAGCTTCCCCCATGGACAGACATTGTGAAGAC
TGGTAAGCTGAAGGAGCTTGCCCCATATGATCCTGATTGGTACTACATCAGAGCTGCATC
TATGGCAAGGGAGGTATACCTGAGGGGAGGTCTTGGCGTTGGTGCTTTCCGTAGAATCTA
CGGTGGAAGCAAGAGAAACGGCAGTCGCCCACCACATTTCTGCAAAAGCAGCGGTGGCGT
TGCACGTCACATTCTCCAGCAGTTGGAGACTATGAACATTGTTGAGATTGACACCAAAGG
AGGAAGAAGGATCACTTCCAGTGGTCAACGGGATTTGGACCAGGTTGCTGGACGTATTGC
AGCTGAAATTTGAAGATCTCAATCTTGTTTTTTTTAGTTCTTCTACTACTTTTGAAACCA
ATGTCCTGTTTTTAGTCCTTTTATCTTTTCTCTCAAGAACCATTATCAATATCATTGCTG
AAGACTTGCTCTCATAATGTTCAGAGATTGTTCATC
GT

QA 3 638 3 638
DS 



AS 2 5

CO CL1503Contig1 739 2 4 U
ACATTTGTGTATCTGCATTCCCCTCATGGCCGTTCTGTTTCTCTATCTTCTCAGTCTCCT
CATGGCTGGCCATTGTAGCGCCACATGGTGTGTGTGCAAAACAGGGCTGAGTGACTCAGT
GCTCCAAAGGACACTAGACTATGCTTGTGGAAATGGAGCTGACTGTAACCCAACTCACCC
AAAAGGGTCTGCTTTAACCCTGACAATGTTAGAGCTCATTGTAACTATGCTGTCAATAGC
TTCTTTCAGAAGAAAAGTCAAGCTTCTGAGTCTTGTAACTTCACTGGTACTGCCACTCTT
ACCACCACTGATCCCAGCTATTCAGGATGTCCATTCCCTTCTAGTGTTAGTGGCACTGGA
GGTGGTAGCAGCAGCACCGTGACGCCAGGTAAAAGCAGTCCAAAGGGAAACAGCCCTATC
ACGACATTTCCCGGTGGAAACAGTCCATACACTGGCAGTCCATTCACTGGCACACCAACC
GGGTTAAACCCGGATTACTCAAACGAAAGCACCGGTTTCGTGCTGCGTAATTCCAACAAT
TTGTTCCTCTGCTTGTTTTCTGTCTTGATGATGCTCTGAAGACGATGGATGGTCGGGTCT
ATCTTTTGTTCACTATCTAAATATGTTATGTTCTAGCTCGTTTGGGTTCATGCTTATCTA
TTTTAAGGAAAGCAATTAACAATGTAAAACTGAATCGTTTTGGGACGAATTTGGTTTCTA
TTTAATATCTTTAAATCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AV02TF U 1
AF RS1AV02JQ C 27
BS 1 667 RS1AV02TF
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QA 1 716 1 716
DS 

RD RS1AV02JQ 713 0 0
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TATGTTCTAGCTCGTTTGGGTTCATGCTTATCTATTTTAAGGAAAGCAATTAACAATGTA
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QA 1 713 1 713
DS 



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BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GW83TF U 1
AF RS1CO56TF U 1
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BS 1 757 RS1CO56TF
BS 758 830 RS1CO56JQ

RD RS1GW83TF 546 0 0
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CAGCACCGTGACGCCAGGTAAAAGCAGTCCAAAGGGAAACAGCCCTATCACGACATTTCC
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QA 1 529 1 529
DS 

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ACTAGACTATGCTTGTGGAAATGGAGCTGACTGTAACCCAACTCACCCAAAAGGGTCTTG
CTTTAACC*TGACAATGTTAGAGCTCATTGTAACTATGCTGTCAATAGCTTCTTTCAGAA
GAAAAGTCAAGCTTCTGAGTCTTGTAACTTCACTGGTACTGCCACTCTTACCACCACTGA
TCCCAGCTATTCAGGACGTCCATTCCCTTCTAGTGTTAGTGGCACTGGAGGTGGTAGCAG
CAGCACCGTGACGCCAGGTAAAAGCAGTCCAAAGGGAAACAGCCCTATCACGACATTTCC
CGGTGGAAACAGTCCATACACTGGCAGTCCATTCACTGGCACACCAACCACCGGACTGCT
AGGAGGCAATATCACTGATGCTACCGGAACCGGGTTAAACCCGGATTACTCAAACGAAAG
CACCGGTTTCGTGCTGCGTAATTCCAACAATTTGTTCCTCTGCTTGTTTTCTGTCTTGAT
GATGCTCTGAAGACGATGGATGGTCTGGTCTATCTTTTGTTCACTATCTAAATATGTTAT
GTTCTAGCTCGTTTGGGTTCATGCTTATCTATTTTAA

QA 1 757 1 757
DS 

RD RS1CO56JQ 792 0 0
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ACCCGGATTACTCAAACGAAAGCACCGGTTTCGTGCTGCGTAATTCCAACAATTTGTTCC
TCTGCTTGTTTTCTGTCTTGATGATGCTCTGAAGACGATGGATGGTCTGGTCTATCTTTT
GTTCACTATCTAAATATGTTATGTTCTAGCTCGTTTGGGTTCATGCTTATCTATTTTAAG
GAAAGCAATTAACAATGTAAAACTGAATCGTTTTGGGACGAATTTGGTTTCTATTTAATA
TCTTTAAATCTT

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 5

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AGTGTAATGAATGAATGTGATATGCACCTAGTGTTACGGCGTGATCAAGTGCTTCAGATA
TAAATGACAAAAATTCGCAATAACTTATAAAAGTTTTCATGCTATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BM10TF U 14
AF RS1CP55TF U 1
AF RS1BP41TF U 165
AF RS1CN17TF U 20
AF RS1CP55JQ C 12
BS 1 700 RS1CP55TF
BS 701 707 RS1CP55JQ

RD RS1BM10TF 543 0 0
GAACACTT
GTCGTCGCTCTGTTGAGTGTCGTTTGCTTAAGGGATAAATTCGCGTTCGCGAACCGTAGA
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GATTGAGCTATGAATCCTAGAAGGGAGCCTCGTGGTGGAAGAAGTTCTCTCTTTGATGGA
ATCGAAGAGGGAGGAATCAGAGCTGCTTCTTCTTACTCTCATGAAATCAATGAGCATGAG
AATGAGCGTGCCTTGGAAGGATTACAAGACAGAGTCGTTCTCTTAAAACGACTTTCTGGC
GATATCAACGAAGAGGTGGATACTCATAACCGCATGCTTGACAGAATGGGTAATGATATG
GATTCATCAAGGGGAATTCTCTCAGGAACCATGGACCGGTTTAAAACTGTTTTTGAGACC
AAATCAAGCAGAAGAATGCTGACACTCGTCGCAGCATTCGTGGGTTTATTTCTAGTCATT
TACTATCTTACCCGTTGAAATTGGCAAAACCAGAGTACTCTGAAACAATCCATCC

QA 9 543 9 543
DS 

RD RS1CP55TF 707 0 0
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TTCGCGTTCGCGAACCGTAGATCCATCCAGGAGGTGAAATCTGGAAACGTCCGAGGAACT
TTGAAGCCAAATCGAGAATTTGATTGAGCTATGAATCCTAGAAGGGAGCCTCGTGGTGGA
AGAAGTTCTCTCTTTGATGGAATCGAAGAGGGAGGAATCAGAGCTGCTTCTTCTTACTCT
CATGAAATCAATGAGCATGAGAATGAGCGTGCCTTGGAAGGATTACAAGACAGAGTCGTT
CTCTTAAAACGACTTTCTGGCGATATCAACGAAGAGGTGGATACTCATAACCGCATGCTT
GACAGAATGGGTAATGATATGGATTCATCAAGGGGAATTCTCTCAGGAACCATGGACCGG
TTTAAAACTGTTTTTGAGACCAAATCAAGCAGAAGAATGCTGACACTCGTCGCAGCATTC
GTGGGTTTATTTCTAGTCATTTACTATCTTACCCGTTGAAATTGGCAAAACCAGAGTACT
CTGAAACAATCCATCCATATCATATTTTCATGCTCTCTGTTGGCTCCTTCAATCTCTGTC
AGTGTAATGAATGAATGTGATATGCACCTAGTGTTACGGCGTGATCAAGTGCTTCAGATA
TAAATGACAAAAATTCGCAATAACTTATAAAAGTTTTCAT
GCTATGG

QA 1 700 1 700
DS 

RD RS1BP41TF 539 0 0
GGAGCCTCGTGGTGGAAGAAGTTCTCTCTTTGATGGAATCGAAGAGGGAGGAATCAGAGC
TGCTTCTTCTTACTCTCATGAAATCAATGAGCATGAGAATGAGCGTGCCTTGGAAGGATT
ACAAGACAGAGTCGTTCTCTTAAAACGACTTTCTGGCGATATCAACGAAGAGGTGGATAC
TCATAACCGCATGCTTGACAGAATGGGTAATGATATGGATTCATCAAGGGGAATTCTCTC
AGGAACCATGGACCGGTTTAAAACTTTTTTTGAGACCAAATCAAGCAGAAGAATGCTGAC
ACTCGTCGCAGCATTCGTGGGTTTATTTCTAGTCATTTACTATCTTACCCGTTGAAATTG
GCAAAACCAGAGTACTCTGAAACAATCCATCCATATCATATTTTCATGCTCTCTGTTGGC
TCCTTCAATCTCTGTCAGTGTAATGAATGAATGTGATATGCACCTAGTGTTACAGCGTGA
TCAAGTGCTTCAGATATAAATGACAAAAATTCGCAATAACTTATAAAAGTTTTCAT
GCT

QA 1 536 1 536
DS 

RD RS1CN17TF 681 0 0
GG
GTCGTCGCTCTGTTGAGTGTCGTTTGCTTAAGGGATAAATTCGCGTTCGCGAACCGTAGA
TCCATCCAGGAGGTGAAATCTGGAAACGTCCGAGGAACTTTGAAGCCAAATCGAGAATTT
GATTGAGCTATGAATCCTAGAAGGGAGCCTCGTGGTGGAAGAAGTTCTCTCTTTGATGGA
ATCGAAGAGGGAGGAATCAGAGCTGCTTCTTCTTACTCTCATGAAATCAATGAGCATGAG
AATGAGCGTGCCTTGGAAGGATTACAAGACAGAGTCGTTCTCTTAAAACGACTTTCTGGC
GATATCAACGAAGAGGTGGATACTCATAACCGCATGCTTGACAGAATTGGTAATGATATG
GATTCATCAAGGGGAATTCTCTCAGGAACCATGGACCGGTTTAAAACTGTTTTTGAGACC
AAATCAAGCAGAAGAATGCTGACACTCGTCGCAGCATTCGTGGGTTTATTTCTAGTCATT
TACTATCTTACCCGTTGAAATTGGCAAAACCAGAGTACTCTGAAACAATCCATCCATATC
ATATTTTCATGCTCTCTGTTGGCTCCTTCAATCTCTGTCAGTGTAATGAATGAATGTGAT
ATGCACCTAGTGTTACAGCGTGATCAAGTGCTTCAGATATAAATGACAAAA*TTCGCAAT
AACTTATAAAAGTTTTCAT

QA 3 681 3 681
DS 

RD RS1CP55JQ 696 0 0
AGGATACAC
TGTCGTCGCTCTGT*GAGTGTCGTTTGCTTAAGGGATAAATTCGCGTTCGCGA*CCGTAG
ATCCATCCAGGAGGTGAAATCTGGAAACGTCCGAGGAACTTTGAAGCCAAATCGAGAATT
TGATTGAGCTATGAATCCTAGAAGGGAGCCTCGTGGTGGAAGAAGTTCTCTCTTTGATGG
AATCGAAGAGGGAGGAATCAGAGCTGCTTCTTCTTACTCTCATGAAATCAATGAGCATGA
GAATGAGCGTGCCTTGGAAGGATTACAAGACAGAGTCGTTCTCTTAAAACGACTTTCTGG
CGATATCAACGAAGAGGTGGATACTCATAACCGCATGCTTGACAGAATGGGTAATGATAT
GGATTCATCAAGGGGAATTCTCTCAGGAACCATGGACCGGTTTAAAACTGTTTTTGAGAC
CAAATCAAGCAGAAGAATGCTGACACTCGTCGCAGCATTCGTGGGTTTATTTCTAGTCAT
TTACTATCTTACCCGTTGAAATTGGCAAAACCAGAGTACTTTGAAACAATCCATCCATAT
CATATTTTCATGCTCTCTGTTGGCTCCTTCAATCTCTGTCAGTGTAATGAATGAATGTGA
TATGCCCCTAGTGTTACGGCGTGATCAAGTGCTTCAGATATAAATGACAAAAATTCGCAA
TAACTTATAAAAGTTTTCATGCTATGG

QA 10 696 10 696
DS 



AS 1 3

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AGGTGGTGGGAAGGGTAAGGGAAAGCAAGCAAGTGGCAGTGATGAAGCTCCCTCCAAGGG
AAAAGGCAAAGCTGGAAAGGCTGCTGATGGTCTCGGCACCTGCACCTATGTTAAAGCGAG
ACATGTTCTGTGTGAAAAGCAAGGAAAGATCAACGAGGCGTACAAAAAGTTGCAGGATGG
TTGGTTGAGCAACGGTGACAAGGTTCCTCCTGCTGAGTTTGCAAAGATTGCAGCAGAGTA
CTCAGAGTGCCCATCAGG*AAAAAAGGAGGAGATCTTGGATGGTTCCCAAGGGGAAAGAT
GGCAGGTCCCTTCCAAGATGTCGCCTTCAACACACCTGTTGGTGTCACTAGTGCACCTTT
CAAATCTACGCACGGATACCACATCATCTTGTCGGAAGGAAGGAAGAACTGACAGATTTT
ACGTCTCTGTTCTGGCTGACTCTGCTCTTATGGATGGATGTCACTTGCTAGTTATTGATG
TAACCAATATATATAAAAAAAAATACACAGCCTTTGTTGTTTTGGCCAAAATGTTTGCTA
CAAATTGTTTGAAAAAATCTCCTGTCCTTTGAATAATGAATTTCTTAAGGCTGTGATGCA
TTTTGGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EJ04TF U 5
AF RS1EJ04JQ C 5
AF RS1FG48TF U 1
BS 1 58 RS1FG48TF
BS 59 59 RS1EJ04TF
BS 60 318 RS1FG48TF
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BS 320 473 RS1FG48TF
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BS 563 563 RS1EJ04TF
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RD RS1EJ04TF 653 0 0
GG
CTGCTCGATCGTTGAAGCTGAAAGAAGAACCTGAAAGATGGGGAAGGACGGAAAAGGTGG
TGGGAAGGGTAAGGGAAAGCAAGCAAGTGGCAGTGATGAAGCTCCCTCCAAGGGAAAAGG
CAAAGCTGGAAAGGCTGCTGATGGTCTCGGCACCTGCACCTATGTTAAAGCGAGACATGT
TCTGTGTGAAAAGCAAGGAAAGATCAACGAGGCGTACAAAAAGTTGCAGGATGGTTGGTT
GAGCAACGGTGACAAGGTTCCTCCTGCTGAGTTTGCAAAGATTGCAGCAGAGTACTCAGA
GTGCCCATCAGG*AAAAAAGGAGGAGATCTTGGATGGTTCCCAAGGGGAAAGATGGCAGG
TCCCTTCCAAGATGTCGCCTTCAACACACCTGTTGGTGTCACTAGTGCACCTTTCAAATC
TACGCACGGATACCACATCATCTTGTCGGAAGGAAGGAAGAACTGACAGATTTTACGTCT
CTGTTCTGGCTGACTCTGCTCTTATGGATGGATGTCACTTGCTAGTTATTGATGTAACCA
ATATATATAAAAAAAAATACACAGCCTTTGTTGTTTTGGCCAAAATGTTTGCTACAAATT
GTTTGAAAAAATCTCCTGTCCTTTGAATAATGAATTTCTTAAAGCTGTG
AC

QA 3 651 3 651
DS 

RD RS1EJ04JQ 651 0 0
GG
CTGCTCGATCGTTGAAGCTGAAAGAAGAACCTGAAAGATGGGGAAGGACGGAAAAGGTGG
TGGGAAGGGTAAGGGAAAGCAAGCAAGTGGCAGTGATGAAGCTCCCTCCAAGGGAAAAGG
CAAAGCTGGAAAGGCTGCTGATGGTCTCGGCACCTGCACCTATGTTAAAGCGAGACATGT
TCTGTGTGAAAAGCAAGGAAAGATCAACGAGGCGTACAAAAAGTTGCAGGATGGTTGGTT
GAGCAACGGTGACAAGGTTCCTCCTGCTGAGTTTGCAAAGATTGCAGCAGAGTACTCAGA
GTGCCCATCAGG*AAAAAAGGAGGAGATCTTGGATGGTTCCCAAGGGGAAAGATGGCAGG
TCCCTTCCAAGATGTCGCCTTCAACACACCTGTTGGTGTCACTAGTGCACCTTTCAAATC
TACGCACGGATACCACATCATCTTGTCGGAAGGAAGGAAGAACTGACAGATTTTACGTCT
CTGTTCTGGCTGACTCTGCTCTTATGGATGGATGTCACTTGCTAGTTATTGATGTAACCA
ATATATATAAAAAAAAATACACAGCCTTTGTTGTTTTGGCCAAAATGTTTGCTACAAATT
GTTTGAAAAAATCTCCTGTCCTTTGAATAATGAATTTCTTAAGGCTGTG

QA 3 651 3 651
DS 

RD RS1FG48TF 669 0 0
GGCTCTCTGCTCGATCGTTGAAGCTGAAAGAAGAACCTGAAAGATGGGGAAGGACGGATA
AGGTGGTGGGAAGGGTAAGGGAAAGCAAGCAAGTGGCAGTGATGAAGCTCCCTCCAAGGG
AAAAGGCAAAGCTGGAAAGGCTGCTGATGGTCTCGGCACCTGCACCTATGTTAAAGCGAG
ACATGTTCTGTGTGAAAAGCAAGGAAAGATCAACGAGGCGTACAAAAAGTTGCAGGATGG
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CTCAGAGTGCCCATCAGGGAAAAAAGGAGGAGATCTTGGATGGTTCCCAAGGGGAAAGAT
GGCAGGTCCCTTCCAAGATGTCGCCTTCAACACACCTGTTGGTGTCACTAGTGCACCTTT
CAAATCTACGCACGGATACCACATCATCTTGTCGGAAGGAAGGAAGAACTGACGGATTTT
ACGTCTCTGTTCTGGCTGACTCTGCTCTTATGGATGGATGTCACTTGCTAGTTATTGATG
TAACCAATATATATAAAAAAAA*TACACAGCCTTTGTTGTTTTGGCCAAAATGTTTGCTA
CAAATTGTTTGAAAAAATCTCCTGTCCTTTGAATAATGAATTTCTTAAGGCTGTGATGCA
TTTTGGTGC

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 5

CO CL1506Contig1 1079 5 6 U
CGGGGGAATGATTAGTGTGTTTCTCCATTAAATAACTAAACAAAAAGGAATAATTAAATG
ATTCAATTACAAGCAAATCAATCATCTTCTCTCTCACAACCTCAAGAGCTTCTGTCTTCA
ACTAACTCCTAACATCTCCTTGTTATTACAATACAGAAGCTCTCCAATGTTTTATCTAGC
ATTAAAAAAAATCTCATTCTCTAAGGTAACAACTCTTTCTCACTAGTCTCATCAGCATCT
GAGTTGCCCCTCGTCTCTATACCCTCAAGAACTCCCATGCTGGCCAGGATCTCTTCTCTC
GACTCGTCTGGATACTTCACCCTATAGTACTCCAACTCCATCTCGAGATCTTGTATCTCC
TTCTCCCTGTCAGCCAAAACATCGTTCGCCCTCTCGAGCGCGTCCACGTCGTGCTCCGCC
TGCTCGTCCATCATCCTCAGGTACTGCAACGCTTCCATCTGGAGAGCCGCTTTCTCTTCC
TGCAACCTAGTGATCATCGCCATCGCTTCGTCCGTAGCGATGGCCGACGCGTTTCTTTCT
TCCTCTAGCTCTTTGCTCAGCTCTCTAAGGCATGTCCTGTCGTACTCTAGCTGCTGCTTC
AACAGATCGACGAGACTTTCTCCTTCGATGCCGCTGCTGATGCTTGCGAAGGACTCCACT
GAAGCAGAGTGTTTTAGTTCCGGTGGTGGCTCGTTTGAAGTGGAGTGAGTCTCTGCCTCC
TTTGAGGAATCTTTGTCGGTATGTGACATCAAAGGCTCAGTCTCTGCATGCTCTTCTTTA
CCGGAGTGTTCTTCTGTAGCATTGTTTGATGTTGTTAACTGTTCAGTGTCTTCATTGTCC
ACGTCATCATCTCTTGATTGTTCTTCAGCTGAACCTGATACTTGTTTTGATGTGGACGGC
TCAGAATGTTCGTTGATCTCATCTGCTTCTTCTTCATTACTGAAGTATTCTTCTGCAGCA
TTGTTTCCACTAACCTCTTTTTCTTCCTCACTAGACTGTTCATGTGCCTGAGAATCTGAC
GCTGAAGGCTTGCAGTCTCTTTCAGCTCCGTCTTCCTCATCATCTGCAACAGAACCAGC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 
30 30 30 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
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25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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CT

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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GS12JQ U 1
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AF RS1GS12TF C 433
AF RS1AI95TF C 543
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GACGTGGTAAGCTTCCAAGTTTGGGAACTTCTTAGTCACAGTCTCGATCCAAGCCTTATC
TTCCTCAATAAA

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RD RS1AI95JQ 727 0 0
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AGTAAATGCACTGAATCCTTAAAAGTAAACCAAAATCATCAAAGATAAAGCAAAAACACA
CACAGAAAGCCAGCTAAGCAAAGTGACTCTAGGTCCACCATGTAAATCAACGGCGGCGGC
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AATGCCTTAGCCTACCATTTTGCTCCCTCATGTATCCCTTACACAAGAAAGTCGCCGAGA
ACTCATCTTCCACCGGGCGGTTAACGTCGTGAACAAAAACGTCAGTTTCTCCATCTTCAC
GGTTGCGAGCCAAAAGCCCCGCCGTGTAGATAGCGCTCATCCTCCCTAGAGCTTCCTCGT
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CTAAACC

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DS 

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TCCTAGCTCCATCAGCTTGTCTGAATTTTTCACTTTGGTGTTGTAAACGACGTGGTAAGC
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GAATGTCTGTTGTGGAGTGACGTTGCTGGTGACGTAGTGAACCAATGCGTCGGATAAAGA
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TT***GAGAGAGATGTGTTTTGGAAAGGGGCCTTGAGGAGGAAGAAGAGATGTTTGATCT
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AACAGAAGACTGAGATTTGGTCCTCATTTTTCAATCTTTGTTTTGATCGACGAATGC
CC

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DS 

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CGTGGTAAGCTTCCAAGTTTGGGAACTTCTTAGTCACAGTCTCGATCCAAGCCTTATCTT
CCTCAATAAACAAGGTACGTCCACCGTGGTTGAGAGATGCCCACATCAAGCTGTCATGAC
CTAAACCAAAGGCGAGGAAGTTACATGGAGACTTCTTGTCCAACACTCTCTTTGAGACAG
AGACTTCGTCGAATGTCTGTTGTGGAGTGACGTTACTGGTGACGTAGTGAACCAATGCGT
CGGATAAAGATATTGGCATCTTTGTGCATTGTTTTGTTGATGGACAATGCGTCTGATTTT
CTTCTTCTTCTTCTTGAGAGAGATGTGTTTTGGAAAGGGGCCTTGAGGAGGAAGAAGAGA
TGTTTGATCTTGCAAAGAAGATAATGAGAAAGATCAAGATTGAGCAGCATGTGAATATGA
CCTTAAGATTAACAGAAGACTGAGATTTGGTCCTCATTTTTCAATCTTTGTTTTGATCGA
CGAATGCAACAATCC

QA 1 555 1 555
DS 



AS 1 5

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AACAATGGCGACGAGCAACGAACCAGAGTTTGCAACGGCGGTGGCGGTTGCTACAAAGCA
AAGAACGTTCAAGAAGTTCTCATTCAGAGGATTCAACGTCGAAGCTCTTCTCAAAATGTC
CACATATGATCTCTCTAAGCTTTTCAACGCTCGTGTTCGAAGGAGATTCTATAGAGGGCT
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CTTGCTATGTTTTGTGTTTTCTCTACTTTAGAATGTTCTTTCACCTTCTAATAAAACTAA
AAATTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1AJ69TF U 1
AF RS1EM13JQ C 55
AF RS1F126JQ C 155
AF RS1F126TF U 155
AF RS1EM13TF U 55
BS 1 446 RS1AJ69TF
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RD RS1AJ69TF 658 0 0
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AAGAACGTTCAAGAAGTTCTCATTCAGAGGATTCAACGTCGAAGCTCTTCTCAAAATGTC
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AAAGAAGAAGCCTCTGATTCTGATCAAGAAGCTACGCAAGGCGAAGAAAGAAGCAAAAGA
TGGGGACAAGAAGAAGCCTGAAGTGGTGAAAACGCATCTGAGGAACATGATCATTGTCCC
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TAAACCTGAGATGATTGGTCACTATCCTGCGGAGTTTTCGATGACTTGCAAGAAAGTTGA
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TCTGAGGTGATTGAAGGAAAATCTCTTTTATTTTCTGTTATATTGTGCTCAAATTATTTT
CTTGCTATGTTTTGTGTTTTCTCTACTTTAGAATGTTCTTTCACCTTCTAATAAAACT

QA 1 658 1 658
DS 

RD RS1EM13JQ 613 0 0
GG
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AAGATGGGGACAAGAAGAAGCCTGAAGTGGTGAAAACGCATCTGAGGAACATGATCATTG
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TGATTAAACCTGAGATGATTGGTCACTATCTTGCGGAGTTTTCGATGACTTGCAAGAAAG
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TTTTCTTGCTATGTTTTGTGTTTTCTCTACTTTAGAATGTTCTTTCACCTTCTAATAAAA
CTAAAAATTGC

QA 3 613 3 613
DS 

RD RS1F126JQ 513 0 0
G
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TTCTTTCACCTTCTAATAAAACTAAAAATTGC

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DS 

RD RS1F126TF 513 0 0
G
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TGTTATATTGTGCTCAAATTATTTTCTTGCTATGTTTTGTGTTTTCTCTACTTTAGAATG
TTCTTTCACCTTCTAATAAAACTAAAAATTGC

QA 2 513 2 513
DS 

RD RS1EM13TF 613 0 0
GG
AAACAACAATGGCGACGAGCAACGAACCAGAGTTTGCAACGGCGGTGGCGGTTGCTACAA
AGCAAAGAACGTTCAAGAAGTTCTCATTCAGAGGATTCAACGTCGAAGCTCTTCTCAACA
TGTCCACATATGATCTCTCTAAGCTTTTCAACGCTCGTGTTCGAAGGAGATTCTATAGAG
GGCTAAAGAAGAAGCCTCTGATTCTGATCAAGAAGCTACGCGAGGCGAAGAAAGAAGCAA
AAGATGGGGACAAGAAGAAGCCTGAAGTGGTGAAAACGCATCTGAGGAACATGATCATTG
TCCCTGAGATGATTGGAAGTGTTGTCGGAGTGCATAACGGTAAGAAGTTTAACGAGGTCG
TGATTAAACCTGAGATGATTGGTCACTATCTTGCGGAGTTTTCGATGACTTGCAAGAAAG
TTGATCACTATAGACCACGTATATGTGGTTGTGGTTGTTACCGTAATTCCACCAGGTTTA
TTCCTCTGAGGTGATTGAAGGAAAATCTCTTTTATTTTCTGTTATATTGTGCTCAAATTA
TTTTCTTGCTATGTTTTGTGTTTTCTCTACTTTAGAATGTTCTTTCACCTTCTAATAAAA
CTAAAAATTGC

QA 3 613 3 613
DS 



AS 1 5

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AAGAAAAACCTTACATGTTTTATTTTCTTTATTGCTTCCAATTGAAATCTTTCACAGCTT
AGTAAGGATCATATCTAAGCTTCCAAATAAATAAAGAACTTTTGAGTTTTACAACTTTCT
CCATCATTATTGTATCATCAACCACTTTATTTCTTCTTTAGATTTTGTTGCCTTGTTCCA
TAGAACTTGTGAAACTTGAACTCCCTTTTGTGTTTTGAGTGAAAAAGCTTAAAAGCTTTT
TGCTGCCAATCTCCACTTTTTTTTCTGGCTTTCACTGATTTGGTTTATTTAATTCTTGCA
CTCTGTTATTCATCACCAGACCGTAATGAAGAACCAAAAGGATGAGATCACAAACGAAAA
CGCCAAGTTATGAGTATTAATCGCTGAAACTCCACTTGTTGTTGAGTTGGCTTTTGCAGT
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ATCTGAAGGACCACCAGGATTCATGATAGGTATGTAACTGCTAATATGAAGCACGGAGAT
GTTATACGGATGTGTCGCAACAGAGTCTATAAGCTTAGCGTCAAGGATAGATCCGGGAAC
CGCGGGACCGAACATGACGTCGCCGTTGCTCATAACGGTTGCGTTTATGAAACCTTGTTG
GCCTTTGGCTTGACCGCTTGATTGGAAGAGAGTGGTGAGTATTACTGATTTTTTGTTGAG
GTTCTTGAGTTTCTTGATGTCGTAGTAATCTAGAATGACGTGGAGGCTGAGGATTTTCTT
GTTGTCTTCGGTTGATTGGTCGGAGAAAACGGACACTGCGTCGTTGGAGAGGGCGAGGAC
GGTTATGGTTTGACGGGAGTTGATGGTGGAAGCGAGTCCGGTTTGGGAGAGGAGGTTGTT
GAAAGTGGAGAACTCGTTGTTCAGGTTTAAGATGCGTGTGATGTTGAATGCGTGGGCATT
GAGGAATGTAGAAGCAAAGAAGAAGAAGAGTGTAAGTGAAGCAGAAGAAGAAGACATTGT
GTCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1A028TR U 30
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CGCG

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CTAGAATGACGTG

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AGGTTGTGGAGGAAGTGGTGAAGAAGATGAACCATGATCTGAAGGACCACCAGGATTCAT
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GTCTATAAGCTTAGCGTCAAGGATAGATCCGGGAACCGCGGGACCGAACATGACGTCGCC
GTTGCTCATAACGGTTGCGTTTATGAAACCTTGTTGGCCTTTGGCTTGACCGCTTGATTG
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GTAATCTAGAATGACGTGGAGGCTGAGGATTTTCTTGTTGTCTTCGGTTGATTGGTCGGA
GAAAACGGACACTGCGTCGTTGGAGAGGGCGAGGACGGTTATGGTTTGACGGGAGTTGAT
GGTGGAAGCGAGTCCGGTTTGGGAGAGGAGGTTGTTGAAAGTGGAGAACTCGTTGTTCAG
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GAAGAGTGTAAGTGAAGCAGAAGAAGAAGACATTGTGTCCCCCGGCCGTAATGGCCGAAT
TCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

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DS 



AS 1 4

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GGGTTTCATCAAACCCATCTCTTTCCGATTCCTCTTCCTTGTCCTTCCGTTCTGTTCTCA
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GACG


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1FS20TF U 475
AF RS1GQ05TF U 1
AF RS1E479JQ C 416
AF RS1GQ05JQ C 666
BS 1 771 RS1GQ05TF
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BS 773 785 RS1GQ05TF
BS 786 1260 RS1E479JQ
BS 1261 1324 RS1GQ05JQ

RD RS1FS20TF 217 0 0
G
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TAGCGTGGGGAAGAAGGGAAACTCTTATTTTCTCCGCCGTCCTTACATCCCCGTCGACAA
GTACCTCGAGGCCGGAACCTTACCGACGGCGAAGGAAGCTCAAGCCGTTGCCGATGATGT
CTTCTCTCTGTTTATAAGCGAGGAAGTCGACAAAGT

QA 2 217 2 217
DS 

RD RS1GQ05TF 785 0 0
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GGGTTTCATCAAACCCATCTCTTTCCGATTCCTCTTCCTTGTCCTTCCGTTCTGTTCTCA
ATCCACTTCCTCTCCCAAACCACAACTCCTCTCCTTCAAGATCCTCCTTCGTTGCTCCAA
TCCAATCCTCCCTTCGTGAGCTCAGAGACCGAATCGACTCAGTCAAAAACACTCAGAAGA
TCACTGAAGCCATGAAGCTTGTCGCTGCAGTAAAAGTAAGGAGAGCTCAAGAAGCTGTCG
TCAACGGACGACCATTCTCCGAAACCCTAGTCGAAGTTCTTTACAACATCAACGAACAGC
TTCAAACCGATGATATCGATGTGCCCTTAACCAAGATAAGACCGGTTAAGAAGGTTGCAC
TCGTTGTCGTAACGGGAGACCGTGGATTATGCGGTGGGTTTAATAACTTCATTATCAAGA
AAGCAGAGGCGAGGATCAAGGAGCTTCAAGGGTTAGGTCTTGACTACACAGTCATTAGCG
TGGGGAAGAAGGGAAACTCTTACTTCCTCCGCCGTCCCTACATCCCCGTCGACAAGTACC
TCGAGGCCGGAACCTTACCGACGGCGAAGGAAGCTCAAGCTGTTGCCGATGATGTCTTCT
CTCTGTTTATAAGCGAGGAAGTCGACAAAGTGGAGCTCTTGTACACGAAGTTTGTGTCTT
TGGTCAGATCAGAACCCGTGATCCACACGCTACTGCCTCTATCACCCAAAG*AGAGATCT
GTGAC

QA 1 785 1 785
DS 

RD RS1E479JQ 846 0 0
TGCACTCGTTGTCGTAACGGGAGACCGTGGATTATGCGGTGGGTTTAATAACTTCATTAT
CAAGAAAGCAGAGGCGAGGATCAAGGAGCTTCAAGGGTTAGGTCTTGACTACGCAGTCAT
TAGCGTGGGGAAGAAGGGAAACTCTTACTTCCTCCGCCGTCCCTACATCCCCGTCGACAA
GTACCTCGAGGCCGGAACCTTACCGACGGCGAAGGAAGCTCAAGCTGTTGCCGATGATGT
CTTCTCTCTGTTTATAAGCGAGGAAGTCGACAAAGTGGAGCTCTTGTACACGAAGTTTGT
GTCTTTGGTCAGATCAGAACCCGTGATCCACACGCTACTGCCTCTATCACCCAAAGGAGA
GATCTGTGACATCAACGGGAACTGTGTTGACGCTGCTGAAGACGAGTTCCTCAGGTTGAC
GACTAAAGAAGGGAAGCTGACGGTCGAGAGAGAGACTTTTCGGACAGCAACTGCTGATTT
CTCGCCGATCTTGCAGTTCGAGCAAGACCCTGTTCAGATTCTTGATGCTTTGTTGCCTTT
GTATCTGAACAGTCAGATTCTTAGGGCGTTACAGGAGTCTTTGGCGAGTGAGCTCGCAGC
TCGGATGAGTGCGATGAGTAGTGCTTCGGATAATGCATCGGATCTTAAGAAATCGCTTTC
CATGGTTTATAATAGAAAACGTCAAGCTAAGATTACTGGTGAGATTCTTGAGATTGCTGC
TGGAGCTAATGCACAGGCTTGATTCGATATGAGCAGGTTGTTTTTTAAATATATATCATT
TTCGGTCGTATAATGTATAATCGTCTAGACTCCTATGATCTTTATATAATCATGCAATTA
CAAAC
G

QA 1 845 1 845
DS 

RD RS1GQ05JQ 659 0 0
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AGATCAGAACCCGTGATCCACACGCTACTGCCTCTATCACCCAAAGGAGAGATCTGTGAC
ATCAACGGGAACTGTGTTGACGCTGCTGAAGACGAGTTCTTCAGGTTGACGACTAAAGAA
GGGAAGCTGACGGTCGAGAGAGAGACTTTTCGGACAGCAACTGCTGATTTCTCGCCGATC
TTGCAGTTCGAGCAAGACCCTGTTCAGATTCTTGATGCTTTGTTGCCTTTGTATCTGAAC
AGTCAGATTCTTAGGGCGTTACAGGAGTCTTTGGCGAGTGAGCTCGCAGCTCGGATGAGT
GCGATGAGTAGTGCTTCGGATAATGCATCGGATCTTAAGAAATCGCTTTCCATGGTTTAT
AATAGAAAACGTCAAGCTAAGATTACTGGTGAGATTCTTGAGATTGTTGCTGGAGCTAAT
GCACAGGCTTGATTCGATATGAGCAGGTTGTTTTTTAAATATATATCATTTTCGGTCGTA
TAATGTATAATCGTCTAGACTCCTATGATCTTTATATAATCATGCAATTACAAACATAAT
GCGGTTGTATTTATTTTGGTCTTTCATTGGATAAATGATTAAGAAAAAACTTCGTGACG

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

CO CL1511Contig1 830 2 6 U
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TCTCTCTCTCTCTCTCGATCGACGACTGTTCTGTCGGAACCGGAGACGCGCGTCACGAGA
CGAATCTGATTGAGTCTCCGGCGATCTGATCGAGATGAGCAACAGCGAGCTTCTTACCGT
CGAGCCTCTCGACCTTCAGTTCCCTTTTGAATTGAAGAAACAGATCTCATGCTCTCTTTA
CTTGACCAACAAGACCGACAATCATGTCGCCTTTAAGGTTAAGACAACGAATCCGAAGAA
GTATTGCGTTAGGCCTAACACTGGAGTTGTTCTTCCACGGTCCACTTGTGAAGTTCTTGT
GACCATGCAAGCTCAAAAGGAAGCTCCTGCGGATATGCAGTGCAAGGACAAGTTTCTGCT
TCAAGGTGTAACTGCTAGTCCTGGTATCACAGCCAAGGATGTTACTCCTGAGATGTTTAG
TAAAGAGGCTGGGTATTTGGTTGAGGAGACTAAGCTGAGAGTTACTTATGTTGCTCCACC
ACTACCACCATCACCAGTCCGCGAAGGTTCTGAAGAGGGATCTTCACCAAGGGCTTCTGT
TTCTGATAACGGACAGGCTTCTGAATTTTCTTTTCAGAAATTTAGCGCAGACAAGGCTGA
ACCTCAAGAAAACACATCTGAGGCAAGGGCTCTCATCACAAAGCTAACCGAGGAGAAACA
GTCTGCCATTCAACTGAACAACAAACTCCAAAGAGACTGGAGCAGTTGAGCGTGACAGCA
GAGAAGCCAAAGTGGTGGTATCCCTTTGATGTACGTTCTTCTGTGGGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GX10TF U 1
AF RS1BE90TF U 54
BS 1 422 RS1GX10TF
BS 423 423 RS1BE90TF
BS 424 579 RS1GX10TF
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BS 581 588 RS1GX10TF
BS 589 830 RS1BE90TF

RD RS1GX10TF 588 0 0
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TCTCTCTCTCTCTCTCGATCGACGACTGTTCTGTCGGAACCGGAGACGCGCGTCACGAGA
CGAATCTGATTGAGTCTCCGGCGATCTGATCGAGATGAGCAACAGCGAGCTTCTTACCGT
CGAGCCTCTCGACCTTCAGTTCCCTTTTGAATTGAAGAAACAGATCTCATGCTCTCTTTA
CTTGACCAACAAGACCGACAATCATGTCGCCTTTAAGGTTAAGACAACGAATCCGAAGAA
GTATTGCGTTAGGCCTAACACTGGAGTTGTTCTTCCACGGTCCACTTGTGAAGTTCTTGT
GACCATGCAAGCTCAAAAGGAAGCTCCTGCGGATATGCAGTGCAAGGACAAGTTTCTGCT
TCTAGGTGTAACTGCTAGTCCTGGTATCACAGCCAAGGATGTTACTCCTGAGATGTTTAG
TAAAGAGGCTGGGTATTTGGTTGAGGAGACTAAGCTGAGAGTTACTTATGTTGCTCCACC
ACTACCACCATCACCAGTCCGCGAAGGTTCTGAAGAGGGTTCTTCACC

QA 1 588 1 588
DS 

RD RS1BE90TF 777 0 0
GAT
TCTCTTTCTCTCTCTCTTTCGATCGACGACTGTTCTGTCGGAACCGGAGACGCGCGTCAC
GAGACGAATCTGTTTGAGTCTCCGGCGATCTGATCGAGATGAGTAACAGCGAGCTTCTTA
CCGTCGAGCCTCTCGACCTTCAGTTCCCTTTTGAATTGAAGAAACAGATCTCATGCTCTC
TTTACTTGACCAACAAGACCGACAATCATGTCGCCTTTAAGGTTAAGACAACGAATCCGA
AGAAGTATTGCGTTAGGCCTAACACTGGAGTTGTTCTTCCACGGTCCACTTGTGAAGTTC
TTGTGACCATGCAAGCTCAAAAGGAAGCTCCTGCGGATATGCAGTGCAAGGACAAGTTTC
TGCTTCAAGGTGTAACTGCTAGTCCTGGTATCACAGCCAAGGATGTTACTCCTGAGATGT
TTAGTAAAGAGGCTGGGTATTTGGTTGAGGAGACTAAGCTGAGAGTTACTTATGTTGCTC
CACCACTACCACCATCACCAGTCCGCGAAGGTTCTGAAGAGGGATCTTCACCAAGGGCTT
CTGTTTCTGATAACGGACAGGCTTCTGAATTTTCTTTTCAGAAATTTAGCGCAGACAAGG
CTGAACCTCAAGAAAACACATCTGAGGCAAGGGCTCTCATCACAAAGCTAACCGAGGAGA
AACAGTCTGCCATTCAACTGAACAACAAACTCCAAAGAGACTGGAGCAGTTGAGCGTGAC
AGCAGAGAAGCCAAAGTGGTGGTATCCCTTTGATGTACGTTCTTCTGTGGGACT

QA 4 777 4 777
DS 



AS 2 5

CO CL1512Contig1 870 2 15 U
CCATAAATTCCCACCTTCAATTCCCTGGTTAAATCATATATGATCCGATTTAAATCACTG
GACAAACTGGGAAACAGGAAGACCACATAGGGCTCTCAAGTCTCAACAAAACAAAACTAA
CCCCAACAAGTCAAGGTTTAATTCACTGTGAAACATGGCAAAAACAAATACTTTTCCCCT
GATTTTATTTGGACTGGAGAGTCTTGAACTACACTTGCAAGTTGCAGCATTGGTATTATC
ACTTGTAGAGCTGTTCCATGAAATTCTTCAGCTTCGTAACATCTGCCCCCACGATCTCGC
CCTTTTTAGAGCCTTCATTAAACAACTGCAGTGTTGGCACAGCCGTGATACTCAGCTTGC
TGAAAGTGTTTGAAAGTCCAGCCTCATCAATGTCAATCTTATACGTTGTTACATCAGGGT
ACTGTTTACTAACCTCCACGATTACAGGGGCAATAAACTTGCATGGTCCACACCAGGCGG
CAGTGAAGTAGAAGATGGACGGTGAAAATCCACCTTCAGCTTTGCTCATTGCACTGATGA
ACTCTTCCTCTGATTTCACTATAACAACACCCTTTCCACCTCCAGTTGATGATGAACAGA
GGCTTCTCCGGCAGGGGAAAAGTGTTGTGGAGAAGTTAGATTCAATGGACGACGGGAGGA
AGGTGAGGTAGGTAACAACGAGTTTCTAGGGATCTGCGACGGCATCGAGTTTGGAGCCAC
GATAAGCGATCGGGAGGAGCTGGATAACGCGGAGTATCGCGACGAACGGAGTGTGGAGAA
CGGCGTTGGAAAGCTGACGGGCGATCGAGAAGCTTCGTTTCATCTTCTTCTCCGGTTGAT
GATGACGCTCGAGCTTTTTTTGATGATTTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FO71JQ U 1
AF RS1AT86JQ U 1
BS 1 61 RS1AT86JQ
BS 62 62 RS1FO71JQ
BS 63 160 RS1AT86JQ
BS 161 161 RS1FO71JQ
BS 162 261 RS1AT86JQ
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BS 433 433 RS1FO71JQ
BS 434 506 RS1AT86JQ
BS 507 507 RS1FO71JQ
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RD RS1FO71JQ 604 0 0
CCATAAATTCCCACCTTCAATTCCCTGGTTAAATCATATATGATCCGGTTTAAATCACTG
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ACTGTTTACTAACCTCCACGATTACAGGGGCAATAAACTTGCATGGTCCACACCAGGCGG
CAGTGAAGTAGAAGATGGACGGTGAAAATCCACCTTCAGCTTTGCTCATTGCACTGATGA
ACTCTTCCTCTGATTTCACTATAACAACACCCTTTCCACCTCCAGTTGATGATGAACAGA
GGCT

QA 1 604 1 604
DS 

RD RS1AT86JQ 870 0 0
CCATAAATTCCCACCTTCAATTCCCTGGTTAAATCATATATGATCCGATTTAAATCACTG
GGCAAACTGGGAAACAGGAAGACCACATAGGGCTCTCAAGTCTCAACAAAACAAAACTAA
CCCCAACAAGTCAAGGTTTAATTCACTGTGAAACATGGCAGAAACAAATACTTTTCCCCT
GATTTTATTTGGACTGGAGAGTCTTGAACTACACTTGCAAGTTGCAGCATTGGTATTATC
ACTTGTAGAGCTGTTCCATGAGATTCTTCAGCTTCGTAACATCTGCCCCCACGATCTCGC
CCTTTTTAGAGCCTTCATTAAACAACTGCAGTGTTGGCACAGCCGTGATACTCAGCTTGC
TGAGAGTGTTTGAAAGTCCAGCCTCATCAATGTCGATCTTATACGTTGTTACATCAGGGT
ACTGTTTACTAAGCTCCACGATTACAGGGGCAATAAACTTGCATGGTCCACACCAGGCGG
CAGTGAAGTAGAAGATGGACGGTGAAGATCCACCTTCAGCTTTGCTCATTGCACTGATGA
ACTCTTCCTCTGATTTCACTATAACAACACCCTTTCCACCTCCAGTTGATGATGAACAGA
GGCTTCTCCGGCAGGGGAAAAGTGTTGTGGAGAAGTTAGATTCAATGGACGACGGGAGGA
AGGTGAGGTAGGTAACAACGAGTTTCTAGGGATCTGCGACGGCATCGAGTTTGGAGCCAC
GATAAGCGATCGGGAGGAGCTGGATAACGCGGAGTATCGCGACGAACGGAGTGTGGAGAA
CGGCGTTGGAAAGCTGACGGGCGATCGAGAAGCTTCGTTTCATCTTCTTCTCCGGTTGAT
GATGACGCTCGAGCTTTTTTTGATGATTTC

QA 1 870 1 870
DS 



CO CL1512Contig2 786 3 6 U
GGAAATCATCAAAAAAAAGCTCGAGCGTTCATCAATCAACCGGAGAAGAAGATGAAACGA
AGCTTCTCGATCGCCCGTCAGGCTTTCCAACGCCGTTTCTCCACACTCCGTTCGTCGCGA
TACTCCGCGTTATCCAGCTCCTCCCGATCGCTTATCGTGGCTCCAAACTCGATGCCGTCG
CAGATCCCTAGAAACTCGTTGTTACCTACCTCCACCTTCCTCCCGTCGTCCATTGAATCT
AACTTCTCCACAACACTTTTCCCCTGCCGGAGAAGCCTCTGTTCATCATCAACTGGAGGT
GGAAAGGGTGTTGTTATAGTGAAATCAGAGGAAGAGTTCATCAGTGCAATGAGCAAAGCT
GAAGGTGGATCTTCACCGTCCATCTTCTACTTCACTGCCGCCTGGTGTGGACCATGCAAG
TTTATTGCCCCTGTAATCGTGGAGCTTAGTAAACAGTACCCTGATGTAACAACGTATAAG
ATCGACATTGATGAGGCTGGACTTTCAAACACTCTCAGCAAGCTGAGTATCACGGCTGTG
CCAACACTGCAGTTGTTTAATGAAGGCTCTAAAAAGGGCGAGATCGTGGGGGCAGATGTT
ACGAAGCTGAAGAATCTCATGGAACAGCTCTACAAGTGATAATACCAATGCTGCAACTTG
CAAGTGTAGTTCAAGACTCTCCAGTCCAATAAAATCAGGGAAAGTATTTGTTTCTGCATG
TTTCACAGTGAATAAACCTTGACTTGTTGGGGTAGTTTTGTTTGTTGAGACTTGAGAGCC
TATGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1AT86TF U 1
AF RS1G131TF U 6
AF RS1FO71TF U 3
BS 1 212 RS1AT86TF
BS 213 213 RS1FO71TF
BS 214 563 RS1AT86TF
BS 564 673 RS1FO71TF
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RD RS1AT86TF 563 0 0
GGAAATCATCAAAAAAAAGCTCGAGCGTTCATCAATCAACCGGAGAAGAAGATGAAACGA
AGCTTCTCGATCGCCCGTCAGGCTTTCCAACGCCGTTTCTCCACACTCCGTTCGTCGCGA
TACTCCGCGTTATCCAGCTCCTCCCGATCGCTTATCGTGGCTCCAAACTCGATGCCGTCG
CAGATCCCTAGAAACTCGTTGTTACCTACCTC*ACCTTCCTCCCGTCGTCCATTGAATCT
AACTTCTCCACAACACTTTTCCCCTGCCGGAGAAGCCTCTGTTCATCATCAACTGGAGGT
GGAAAGGGTGTTGTTATAGTGAAATCAGAGGAAGAGTTCATCAGTGCAATGAGCAAAGCT
GAAGGTGGATCTTCACCGTCCATCTTCTACTTCACTGCCGCCTGGTGTGGACCATGCAAG
TTTATTGCCCCTGTAATCGTGGAGCTTAGTAAACAGTACCCTGATGTAACAACGTATAAG
ATCGACATTGATGAGGCTGGACTTTCAAACACTCTCAGCAAGCTGAGTATCACGGCTGTG
CCAACACTGCAGTTGTTTAATGA

QA 1 563 1 563
DS 

RD RS1G131TF 687 0 0
GGATCA
AAAAAAAGCTCGAGCGTTCATCAATCAACCGGAGAAGAAGATGAAACGAAGCTTCTCGAT
CGCCCGTCAGGCTTTCCAACGCCGTTTCTCCACACTCCGTTCGTCGCGATACTCCGCGTT
ATCCAGCTCCTCCCGATCGCTTATCGTGGCTCCAAACTCGATGCCGTCGCAGATCCCTAG
AAACTCGTTGTTACCTACCTCCACCTTCCTCCCGTCGTCCATTGAATCTAACTTCTCCAC
AACACTTTTCCCCTGCCGGAGAAGCCTCTGTTCATCATCAACTGGAGGTGGAAAGGGTGT
TGTTATAGTGAAATCAGAGGAAGAGTTCATCAGTGCAATGAGCAAAGCTGAAGGTGGATC
TTCACCGTCCATCTTCTACTTCACTGCCGCCTGGTGTGGACCATGCAAGTTTATTGCCCC
TGTAATCGTGGAGCTTAGTAAACAGTACCCTGACGTAACAACGTATAAGATCGACATTGA
TGAGGCTGGACTTTCAAACACTCTCAGCAAGCTGAGTATCACGGCTGTGCCAACACTGCA
GTTGTTTAATGAAGGCTCTAAAAAGGGCGAGATCGTGGGGGCAGATGTTACGAAGCTGAA
GAATCTCATGGAACAGCTCTACAAGTGATAATACCAATGCTGCAACTTGCAAGTGTAGTT
CAAGACTCTCCAGTCC
GAATA

QA 7 682 7 682
DS 

RD RS1FO71TF 784 0 0
GGATCATCA
AAAAAAAGCTCGAGCGTTCATCAATCAACCGGAGAAGAAGATGAAACGAAGCTTCTCGAT
CGCCCGTCAGGCTTTCCAACGCCGTTTCTCCACACTCCGTTCGTCGCGATACTCCGCGTT
ATCCAGCTCCTCCCGATCGCTTATCGTGGCTCCAAACTCGATGCCGTCGCAGATCCCTAG
AAACTCGTTGTTACCTACCTCCACCTTCCTCCCGTCGTCCATTGAATCTAACTTCTCCAC
AACACTTTTCCCCTGCCGGAGAAGCCTCTGTTCATCATCAACTGGAGGTGGAAAGGGTGT
TGTTATAGTGAAATCAGAGGAAGAGTTCATCAGTGCAATGAGCAAAGCTGAAGGTGGATC
TTCACCGTCCATCTTCTACTTCACTGCCGCCTGGTGTGGACCATGCAAGTTTATTGCCCC
TGTAATCGTGGAGCTTAGTAAACAGTACCCTGATGTAACAACGTATAAGATCGACATTGA
TGAGGCTGGACTTTCAAACACTCTCAGCAAGCTGAGTATCACGGCTGTGCCAACACGGCA
GTTGTTTAATGAAGGCTCTAAAAAGGGCGAGATCGTGGGGGCAGATGTTACGAAGCTGAA
GAATCTCATGGAACAGCTCTACAAGTGATAATACCAATGCTGCAACTTGCAAGTGTAGTT
CA*GACTCTCCAGTCCAATAAAATCAGGGAAAGTATTTGTTTCTGCATGTTTCACAGTGA
ATAAACCTTGACTTGTTGGGGTAGTTTTGTTTGTTGAGACTTGAGAGCCTATGTG

QA 10 784 10 784
DS 



AS 1 5

CO CL1513Contig1 909 5 4 U
TGGGGAACCAAACGCACCAACAAGAACAAGAAGAAGAACAAGGATTCTGCTTTGGAAATC
ACACAAGGACATATAGAGAGAGGTTTCTTGATCTTGAAAAAATGGCTTACGAGAATGTCA
ATGAGCTTAACCTTAAGGACACAGAGCTTCGTCTTGGATTACCCGGAACGGAGCAAGATA
AGGAAGAACAAGAGGTTTCTTGCGTTAGAAGCATCAAACGTCAACTACAAAGCGATAACG
AGGAAGCATCTACACCTCCTACGAAAACTCAAATCGTTGGTTGGCCTCCGGTGAGATCTT
ACCGTAAGAACAACAACAGTGTTAGCTATGTGAAAGTGAGTATGGATGGAGCTCCTTATC
TTAGGAAAATAGATCTCAAAACATACAAAAACTATGCTGAGCTTCTAAAGGCTTTGGAGA
ACATGTTCAAATTCACGATAGGTGAATACTGCGAAAGAGAAGGATACAAAGGATCTGGAG
TTGTACCAACGTACGAGGATAAAGATGGAGACTGGATGTTGGTTGGTGATGTTCCATGGG
ATATGTTCTCTTCCTCTTGTAAGAGACTCCGGATCATGAAAGGATCTGATGCTCTTGCTT
TGGACTCGGCCTTATTATGATGATGATAAAGAAGAAGATATTTCGATGAAAGCTTTTGAT
GGATGAAACCCTTTTTGATTTGATTTGATTCTGATCGGAGTTTGAGTAGTTGACTACACC
AAAAACAGAACATGTCAGGGTTTTGTTCGATGAGATAGATCCATCTTCAAGGGGTTATCT
TTTAGTTTTGTTTGATCCTTGTTTTTAGATTTGGAGTTTGATGTAAAGATAGATGAAATT
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BQ
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20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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DS 



AS 1 5

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10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
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AATGGTAGCTTCATCAACAACTCTACAACAAACAAACCATTTCTTCTCTCGGGTCTATTC
GGGTCATCCGTATCTTCATCTTCCTCTACTCTTCTCCAGTCTCCACACAAGCCCATTAAC
AATGGTGGTGAGATGATGGGACAGTCCCATCTACAAACCCTAGCATCGCTTCAACACGTT
GGAGGTAACAACGACGATATGAACAAAGAAAGGAAGCTTGATCAGATCTCTGGGAACATT
AATGGGTTCATGTCATCATCATCTCTAGATCCTTCAAACTACAACAACATATGGAATAAT
GCAAGTGCTGTCAATGGAGCGTGTCTTGATCAGACAAACA*TGACATTGGATCCTCCCTT
ACCTC*TTGATATAAACCAGA
CTATGGTTATAT

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GGAAGCTTGATCAGATTTCTGGGAACATTAATGGGTTCATGTCATCATCATCTCTAGATC
CTTCAAACTACAACAACATATGGAATAATGCAAGTGCTGTCAATGGAGCGTGTCTTGATC
AGACAAACAATGACATTGGATCCTCCCTTACCTCCTTGATATAAACCAGAACTTATTGGT
TATATAGGATCTATAACTAATTAGGGTTTCATCTTCATCACTTTTTTTTT*TCTTTCTGT
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GATTCAAGGTTTACTCTGTTCGACTGCTAAGTTTACTTAAGGTAAATTATTAGTGTATGT
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GTGGCTTTCATTGGGTATACAAACAGAGGGATGGGTGTGGTTTTGTGTTGTTATAACTTT
GGTTATCCATGTATCATGTATGAGTTATGTTACGAGTTGTGACTGTTCTTCTGGAC

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DS 



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CGATGCCCTTTCTTGAGGAACATCAACGAGCCCACTAACCTCTCCTTCTCTTCCTCCTTC
CCTTTCCCCATCCCTGCACCAGCAGCAGGTCAAGGCCCTATATTCGAGGATGGACCCAAT
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GCGAAATCGTACCGAGCTGTAAGCGGTGTGGCGCCGCTCGTGGCGAAGATCCTGCAACCA
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T


BQ
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35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1E922TF U 1
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AF RS1E922JQ C 495
AF RS1GJ85TF U 709
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CTCCGTCGTCGGCGTCTTCCGTCTCTTATCCATTCTTTCTCCTTTTTTCCAACACAACAA
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CGATGCCCTTTCTTGAGGAACATCAACGAGCCCACTAACCTCTCCTTCTCTTCCTCCTTC
CCTTTCCCCATCCCTGCACCAGCAGCAGGTCAAGGCCCTATATTCGAGGATGGACCCAAT
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GCCACCACCAGTCTCTCTTCTTTTGGACCTGGAGGCCCTTTTGGATTCGATGCCTTTTCT
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AAGGGAGGAAACCACGAATCTATGAGTGACGACTGGCTACAAACAGGAAACTGCCCCATT
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CCTCCAGGGATGCATTACAAGTGCCCTAAAGCAATACTAGCAGCTCGAGCAGCCATATCA
AAAA

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DS 

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CGACGTCGGCGTCTTCCGTCTCTTATCCATTCTT*CTCCTTTTTTCCAACACAACAAAGA
ATGGCTAATTGTTCGGGAGACTCCAACGACATGGCTGCTTCTCAGTTTGACATTCTCCGA
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TTCCCCATCCCTGCACCAGCAGCAGGTCAAGGCCCTATATTCGAGGATGGACCCAATTTT
GATACCGCGTTTAGGCTTTTCCACGGCCAAGATGGTGTTGTCCCACTCTCTGACAGGGCC
AGACCTGAGGCTGAGAAGAAGCCCGTCCCTCTGTTCAATCCACTCGCTGCTAAGGCCGCC
ACCATCAGTCTCTCTTCTTTTGGACCTGGAGGCCCTTTTGGATTCGATGCCTTTTCTCAC
ATGTTTAAAAACCAAAAGAGAAACTCTGACTCTTCCAAAAACAACAAGGATTCTTCCAAG
GGAGGAAACCACGAATCTATGAGTGACGACTGGCTACAAACAGGAAACTGCCCCATTGCG
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CCAGGGATGCATTACAAGTGCCCTAAAGCAATACTAGCAGCTCGAGCAGCCATATCAAAA
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AGATCTCGAATATATATATATAATTGTTTTTCTTCTTGTTTTGGAGAGATTGTATTTGTA
AAAGTTTCTATATGTTTGAGAAAAACTAGAATAAATTCATTTC
C

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CACACCGAAAAGTTCTCTGCATCTTGGTTTATAGCCCTTCACGCAGCCGTTCCTTTCATA
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ATGCAGTTCCCCGGAGTTTCATCATCGGATGGAAGGTGCGGTGACAAAGTGGTGATGAAA
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CTTGTTTTGGAGAGA

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DS 

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CTTTCGCCAAGAACCTCCGCCCGCAGCCTTTATCATCCAAAGTTCTTGTGATAGGGATGC
TCGGCATGGCGCTAAACGTTCCTCTTGGGGTCTGGAGAGAGCACACCGAAAAGTTCTCTG
CATCTTGGTTTATAGCCCTTCACGCAGCCGTTCCTTTCATAGGGATACTGAGGAAGTCGG
TGTTGATGCCTAAGATGGCGATGGTGTTTACCATAGCAGCATCGGTTATGGGACAGGTGA
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TGGCTGTTGTACCAAACCCTTCGTCTGTTGAAGCAACTCCGATGCAGTTCCCCGGAGTTT
CATCATCGGATGGAAGGTGCGGTGACAAAGTGGTGATGAAATGGAACCCCATGTTGCTTG
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TTCAAGAAGATCTCGAATATATATATATAATTGTTTTTCTTCTTGTTTTGGAGAGATTGT
ATTTGTAAAAGTTTCTATATGTTTGAGAAAAACTAGAATAAATTCATTTCTAAAATGTTG
AAACTGTCTCTAAATGTAAAAGACTTGGTTTATTAAATAAATACTTGATTCGCT

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 5

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GAGTAGGCCGGTGTTCGTTGGGAACTTCGAGTATGAGACTCGCCAATCGGATCTGGAACG
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TGGAAAGGCAGCTTCCAATCAGAGGCCTACAAAGACACTCTTTGTCATCAACTTTGACCC
TATCCGCACTAAAGAGCGTGATATTGAGAGGCACTTTGAGCCGTATGGTAAAGTTCTCAA
TGTCCGCATAAGACGCAACTTTGCATTCGTTCAGTTTGCAACTCAGGAAGATGCAACCAA
GGCCCTTGAGTCTACACAAAACAGCAAATTAATGGACAGGGTTGTTTCTATTGAGTACGC
TTTGAGGGATGATGATGAAAGAGATGATCGATATGCTCCTAGTCCCAGAAGGAGATCTCC
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TGACAGGTACAAGGGTCCAGCTCCTTATGAAAGGCGTAGGAGCCCAGATTACGGTCGTCG
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TTTCTATGTTAGTCTGAACCTTAGTTGCTATGCTATTATGCTACGTGGTGTTAGTTTTAG
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TTCAGTTTCTTCATTAGT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1C440TF U 1
AF RS1BZ88TF U 49
AF RS1BZ88JQ C 242
AF RS1E350JQ C 399
AF RS1E350TF U 399
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BS 663 978 RS1E350TF

RD RS1C440TF 635 0 0
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GAGTAGGCCGGTGTTCGTTGGGAACTTCGAGTATGAGACTCGCCAATCGGATCTGGAACG
GTTGTTCGGCAAGTACGGGAGAGTGGAGCGAGTTGACATGAAGTCTGGTTATGCTTTTGT
GTATTTTGAGGATGAGCGTGATGCTGAAGATGCTATCCGTGGGATTGACAATATCCCTTT
TGGCTATGAGAAACGCAAGCTCTCTGTCGAATGGGCTAAGGGTGAACGTGGGAAGCCTCA
TGGAAAGGCAGCTTCCAATCAGAGGCCTACAAAGACACTCTTTGTCATCAACTTTGACCC
TATCCGCACTAAAGAGCGTGATATTGAGAGGCACTTTGAGCCGTATGGTAAAGTTCTCAA
TGTCCGCATAAGACGCAACTTTGCATTCGTTCAGTTTGCAACTCAGGAAGATGCAACCAA
GGCCCTTGATTCTACACAAAACAGCAAATTAATGGACAGGGTTGTTTCTATTGAGTACGC
TTTGAGGGATGATGATGAAAGAGATGATCGATATGCTCCTAGTCCCAGAAGGAGATCTCC
CAGTCCTGTCTACAGGAGGCGTCCCAGTCCTGATT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1BZ88TF 614 0 0
GTCTGGAAGCATGAGTAGGCCGGTGTTCGTTGGGAACTTCGAGTATGAGACTCGCCAATC
GGATCTGGAACGGTTGTTCAGCAAGTACGGGAGAGTGGAGCGAGTTGACATGAAGTCTGG
TTATGCTTTTGTGTATTTTGAGGATGAGCGTGATGCTGAAGATGCTATCCGTGGGATTGA
CAATATCCCTTTTGGCTATGAGAAACGCAAGCTCTCTGTCGAATGGGCTAAGGGTGAACG
TGGGAAGCCTCATGGAAAGGCAGCTTCCAATCAGAGGCCTACAAAGACACTCTTTGTCAT
CAACTTTGACCCTATCCGCACTAAAGAGCGTGATATTGAGAGGCACTTTGAGCCGTATGG
TAAAGTTCTCAATGTCCGCATAAGACGCAACTTTGCATTCGTTCAGTTTGCAACTCAGGA
AGATGCAACCAAGGCCCTTGAGTCTACACAAAACAGCAAATTAATGGACAGGGTTGTTTC
TATTGAGTACGCTTTGAGGGATGATGATGAAAGAGATGATCGATATGCTCCTAGTCCCAG
AAGGAGATCTCCTAGTCCTGTCTACAGGAGGCGTCCCAGTCCTGATTACGGCCGTCCTCG
CAGTCCTGAGTATG

QA 1 614 1 614
DS 

RD RS1BZ88JQ 705 0 0
GGCTATGAGAAACGCAAGCTCTCTGTCGAATGGGCTAAGGGTGAACGTGGGAAGCCTCAT
GGAAAGGCAGCTTCCAATCAGAGGCCTACAAAGACACTCTTTGTCATCAACTTTGACCCT
ATCCGCACTAAAGAGCGTGATATTGAGAGGCACTTTGAGCCGTATGGTAAAGTTCTCAAT
GTCCGCATAAGACGCAACTTTGCATTCGTTCAGTTTGCAACTCAGGAAGATGCAACCAAG
GCCCTTGAGTCTACACAAAACAGCAAATTAATGGACAGGGTTGTTTCTATTGAGTACGCT
TTGAGGGATGATGATGAAAGAGATGATCGATATGCTCCTAGTCCCAGAAGGAGATCTCCT
AGTCCTGTCTACAGGAGGCGTCCCAGTCCTGATTACGGCCGTCCTCGCAGTCCTGAGTAT
GACAGGTACAAGGGTCCAGCTCCTTATGAAAGGCGTAGGAGCCCAGATTACGGTCGTCGC
AGTCCTGAATATGGGAGAGCTATAAGCCCTGGTTATGACAGATACAGAAGCCGGTCTCCT
GTATACAGAGCAAGAGGTTGAAGATGTTGCTACGGAATGTGCTCTACGAGTGGTTGTGTT
TTCTATGTTAGTCTGAACCTTAGTTGCTATGCTATTATGCTACGTGGTGTTAGTTTTAGT
AGCTTGTAATGACATTAATCTTTGTGAAGAATTTGAAGCTTGGAT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RS1E350JQ 580 0 0
G
GCCGTATGGTAAAGTTCTCAATGTCCGCATAAGACGCAACTTTGCATTCGTTCAGTTTGC
AACTCAGGAAGATGCAACCAAGGCCCTTGAGTTTACACAAAACAGCAAATTAATGGACAG
GGTTGTTTCTATTGAGTACGCTTTGAGGGATGATGATGAAAGAGATGATCGATATGCTCC
TAGTCCCAGAAGGAGATCTCCTAGTCCTGTCTACAGGAGGCGTCCCAGTCCTGATTACGG
CCGTCCTCGCAGTCCTGAGTATGACAGGTACAAGGGTCCAGCTCCTTATGAAAGGCGTAG
GAGCCCAGATTACGGTCGTCGCAGTCCTGAATATGGGAGAGCTAGAAGTCCTGGTTATGA
CAGATACAGAAGCCGGTCTCCTGTATACAGAGCAAGAGGTTGAAGATGTTGCTACGGAAT
GTGCTCTACG**TGGTTGTGTTTTCTATGTTAGTCTGAACCTTAGTTGCTATGCTATTAT
GCTACGTGGTGTTAGTTTTAGTAGCTTGTAATGGCATTAATCTTTGTGAAGAATTTGAAG
CTTGGATTCTCTCTTAATCAATTCAGTTTCTTCATTAGT

QA 2 580 2 580
DS 

RD RS1E350TF 580 0 0
G
GCCGTATGGTAAAGTTCTCAATGTCCGCATAAGACGCAACTTTGCATTCGTTCAGTTTGC
AACTCAGGAAGATGCAACCAAGGCCCTTGAGTCTACACAAAACAGCAAATTAATGGACAG
GGTTGTTTCTATTGAGTACGCTTTGAGGGATGATGATGAAAGAGATGATCGATATGCTCC
TAGTCCCAGAAGGAGATCTCCTAGTCCTGTCTACAGGAGGCGTCCCAGTCCTGATTACGG
CCGTCCTCGCAGTCCTGAGTATGACAGGTACAAGGGTCCAGCTCCTTATGAAAGGCGTAG
GAGCCCAGATTACGGTCGTCGCAGTCCTGAATATGGGAGAGCTAGAAGTCCTGGTTATGA
CAGATACAGAAGCCGGTCTCCTGTATACAGAGCAAGAGGTTGAAGATGTTGCTACGGAAT
GTGCTCTACG**TGGTTGTGTTTTCTATGTTAGTCTGAACCTTAGTTGCTATGCTATTAT
GCTACGTGGTGTTAGTTTTAGTAGCTTGTAATGGCATTAATCTTTGTGAAGAATTTGAAG
CTTGGATTCTCTCTTAATCAATTCAGTTTCTTCATTAGT

QA 2 580 2 580
DS 



AS 1 5

CO CL1517Contig1 687 5 6 U
GAAGCAGTGGTGCCATTACGACCGGGGGATCCATTTCCCATTTCGTCGTCATCTTCCTAA
TCACAAAAAATGGGTCGCCGTAGCTCCGGAGGAAGATCTGCACCTCGTCCTCGCCCACGT
GCCCCAGCTCCTCAACCTGTAAACCGTGCGCCTCCTCCAGCTCCAGCTCAGGCGACCAGT
GGCGGTGGTGGCATGTTCTCAGGCATTGGTTCCACCATAGCTCAGGGTATGGCTTTTGGA
ACCGGAAGTGCCGTTGCTCATAGGGCTGTTGATTCCGTCATGGGCCCACGTACCATTCAG
CATGAAACTGTTGAGTCTGCCTCTGCTTCTGCTGCTCCTGTCGGAAGCAACATGTTCAAC
AGCTCCTGTGACATTCACGCTAAGGCTTTCCAAGATTGCATCGGCAGCTATGGAAGCGAT
ATTAGCAAGTGTCAGTTCTACATGGACATGTTGTCTGAGTGCAAGAAGAACTCCGGTTCC
TCTATTGGTGCCTGAATCAAAAGCTTGTTTCATTTCTTATTTTGGCTTTGTCTAAACAAT
TATTCAGCTGTTATATGCTGAGAGTCTGGATATCATCAAATAACAACAGTTCAGATACTG
CATGTTTCAAGTCTTCTGCCTGTTTACTTTATTTGTTATTTTTATGATAAAATGTTTGGA
GCGTTGGTTACTTAATCTGTTTAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FK95TF U 71
AF RS1EI70TF U 1
AF RS1EI70JQ C 344
AF RS1GQ36TF U 185
AF RS1ES95TF U 75
BS 1 134 RS1EI70TF
BS 135 135 RS1FK95TF
BS 136 582 RS1EI70TF
BS 583 583 RS1GQ36TF
BS 584 667 RS1EI70TF
BS 668 687 RS1ES95TF

RD RS1FK95TF 560 0 0
TGGGTC
GCCGTAGCTCCGGAGGAAGATCTGCACCTCGTCCTCTCCCACGTGCCCCAGCTCCTCAAC
CTGTAAACCGTGCGCCTCCTCCAGCTCCAGCTCAGGCGACCAGTGGCGGTGGTGGCATGT
TCTCAGGCATTGGTTCCACCATAGCTCAGGGTATGGCTTTTGGAACCGGAAGTGCCGTTG
CTCATAGGGCTGTTGATTCCGTCAAGGGCCCACGTACCATTCAGCATGAAACTGTTGAGT
CTGCCTCTGCTTCTGCCGCTCCTGTCGGAAGCAACATGTTCAACAGCTCCTGTGACATTC
ACGCTAAGGCTTTCCAAGATTGCATCGGCAGCTATGGAAGCGATATTAGCAAGTGTCAGT
TCTACATGGACATGTTGTCTGAGTGCAAGAAGCACTCCGGTTCCTCTATTGGTGCCTGAA
TCAAAAGCTTGTTTCATTTCTTATTTTGGCTTTGTCTAAACAATTATTCAGCTGTTATAT
GCTGAGAGTCTGGATATCATCAAATAACAACAGTTCAGATACTGCATGTTTCAAGTCTTC
TGCCTGTTTACTTT

QA 7 560 7 560
DS 

RD RS1EI70TF 670 0 0
GAAGCAGTGGTGCCATTACGACCGGGGGATCCATTTCCCATTTCGTCGTCATCTTCCTAA
TCACAAAAAATGGGTCGCCGTAGCTCCGGAGGAAGATCTGCACCTCGTCCTCGCCCACGT
GCCCCAGCTCCTCAGCCTGTAAACCGTGCGCCTCCTCCAGCTCCAGCTCAGGCGACCAGT
GGCGGTGGTGGCATGTTCTCAGGCATTGGTTCCACCATAGCTCAGGGTATGGCTTTTGGA
ACCGGAAGTGCCGTTGCTCATAGGGCTGTTGATTCCGTCATGGGCCCACGTACCATTCAG
CATGAAACTGTTGAGTCTGCCTCTGCTTCTGCTGCTCCTGTCGGAAGCAACATGTTCAAC
AGCTCCTGTGACATTCACGCTAAGGCTTTCCAAGATTGCATCGGCAGCTATGGAAGCGAT
ATTAGCAAGTGTCAGTTCTACATGGACATGTTGTCTGAGTGCAAGAAGAACTCCGGTTCC
TCTATTGGTGCCTGAATCAAAAGCTTGTTTCATTTCTTATTTTGGCTTTGTCTAAACAAT
TATTCAGCTGTTATATGCTGAGAGTCTGGATATCATCAAATAGCAACAGTTCAGATACTG
CATGTTTCAAGTCTTCTGCCTGTTTACTTTATTTGTTATTTTTATGATAAAATGTTTGGA
GCGTTGG
CCA

QA 1 667 1 667
DS 

RD RS1EI70JQ 326 0 0
GAAGCAACATGTTCAACAGCTCCTGTGACATTCACGTTAAGGCTTTCCAAGATTGCATCG
GCAGCTATGGAAGCGATATTAGCAAGTGTCAGTTTTACATGGACATGTTGTTTGAGTGCA
AGAAGAACTCCGGTTCCTTTATTGGTGCCTGAATCAAAAGCTTGTTTCATTTTTTATTTT
GGCTTTGTTTAAACAATTATTCAGCTGTTATATGCTGAGAGTCTGGATATCATCAAATAG
CAACAGTTCAGATACTGCATGTTTCAAGTTTTCTGCCTGTTTACTTTATTTGTTATTTTT
ATGATAAAATGTTTGGAGCGTTGG
CC

QA 1 324 1 324
DS 

RD RS1GQ36TF 485 0 0
GTGGTGGCATGTTCTCAGGCATTGGTTCCACCATAGCTCAGGGTATGGCTTTTGGAACCG
GAAGTGCCGTTGCTCATAGGGCTGTTGATTCCGTCATGGGCCCACGTACCATTCAGCATG
AAACTGTTGAGTCTGCCTCTGCTTCTGCTGCTCCTGTCGGAAGCAACATGTTCAACAGCT
CCTGTGACATTCACGCTAAGGCTTTCCAAGATTGCATCGGCAGCTATGGAAGCGATATTA
GCAAGTGTCAGTTCTACATGGACATGTTGTCTGAGTGCAAGAAGAACTCCGGTTCCTCTA
TTGGTGCCTGAATCAAAAGCTTGTTTCATTTCTTATTTTGGCTTTGTCTAAACAATTATT
CAGCTGTTATATGCTGAGAGTCTGGATATCATCAAATAACAACAGTTCAGATACTGCATG
TTTCAAGTCTTCTGCCTGTTTACTTTATTTGTTATTTTTATGATAAAATGTTTGGAGCGT
TGG
TT

QA 1 483 1 483
DS 

RD RS1ES95TF 613 0 0
GG
GCCGTAGCTCCGGAGGAAGATCTGCACCTCGTCCTCGCCCACGTGCCCCAGCTCCTCAAC
CTGTAAACCGTGCGCCTCCTCCAGCTCCAGCTCAGGCGACCAGTGGCGGTGGTGGCATGT
TCTCAGGCATTGGTTCCACCATAGCTCAGGGTATGGCTTTTGGAACCGGAAGTGCCGTTG
CTCATAGGGCTGTTGATTCCGTCATGGGCCCACGTACCATTCAGCATGAAACTGTTGAGT
CTGCCTCTGCTTCTGCTGCTCCTGTCGGAAGCAACATGTTCAACAGCTCCTGTGACATTC
ACGCTAAG*CTTTCCGAGATTGCATCGGCAGCTATGGAAGCGATATTAGCAAGTGTCAGT
TCTACATGGACATGTTGTCTGAGTGCAAGAAGAACTCCGGTTCCTCTATTGGTGCCTGAA
TCAAAAGCTTGTTTCATTTCTTATTTTGGCTTTGTCTAAACAATTATTCAGCTGTTATAT
GCTGAGAGTCTGGATATCATCAAATAACAACAGTTCAGATACTGCATGTTTCAAGTCTTC
TGCCTGTTTACTTTATTTGTTATTTTTATGATAAAATGTTTGGAGCGTTGGTTACTTAAT
CTGTTTAAAAA

QA 3 613 3 613
DS 



AS 1 4

CO CL1518Contig1 1297 4 7 U
GTGGTTTAGAAGAAGAGGAGACCGTTGGAGGATCAAGACAAGGAGGGAGATGTCGGCAAC
ATTAAAATACAATAGAAGTCACATGTTCCTCTCTCCTTGGAGCCGTTTGAGACCTGTCAC
TATCTCGGCCAGTTCCTTGAGAAGACCAGCTTAGTTTAATCTAATTCTTATTGTCTTGAC
TTGGCCTGATATGGCTTTAAATATATGTTGTATGCAAGCTATTTTTGATTAAGGGAAATA
TTTCCTCTTCTTATTCTCTCTTTGCGCAAACTCTCTCCCCCTCTCTCTCTCTCACTCTGC
GTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGCACGAAAATCTGGGATTGAGAAGGATATTAAAA
AAAAAAGTGTTGCGAATAATAATTATCTTCTCCAAACGTATGCATCTTGCGAAACCCTAA
ATACCCAAATGTCATTCGCCGACGAATTTGAATCTAATCTCGTTTCGTTGGCCCATGTTT
TGCAGAAGAAATATGCACTCCTCCGTGATTTGGATAAAAGTTTGCAAGAAAATCAAAGAC
AGAACGAACAACGGTGTGAAAAGGAGATAGAGGATATAAGAAGAGGAAGAACCGGAAATG
TCACACCCAATACACACTTCTCAGAGGAAGCAATTGATGAACAGAAGCACAGCGTCAGGA
TTGCTGATGAGAAAGTCGCTTTGGCTATGCAAGCTTATGATCTGGTGGATATGCATGTTC
AGCAACTTGACCAGTACATGAAAAAATCCAATGAGGAGATGCGCCGAGAGAAAGAAAATG
CCTCTGCTTCAAACCTCGAGAACAGCGCAGAAGCCGGTAAGGCAGGTGAAGGTAGAAGAG
GAGGGCGAAAGAAGACAAGGCTAGCAACTGCAACGTCAACAGCAGCAGTAGCATCAGCAT
CAACTGGTATGACTTCAACTGGTATGGACTTGGATCTGCCTGTGGATCCAAACGAACCAA
CTTACTGCATCTGCAACCAAGTTAGCTACGGCGAGATGATTGCCTGCGATAACAATGAGT
GTAAGATTGAGTGGTTCCATTTTGGTTGCGTGGGGCTGAAAGATCAACCCAAAGGGAAAT
GGTACTGCCCGGATTGTGCTACAGTCAAGAAGAGCAGGAAAGGCCGATGATTCTGAATCT
AGAAATCTCGTGTGTTTCGTTTAAAACGGTCTAGTAGTTGTATATCTACTTCCATGTAAA
CCACTGACCATTGAATAATGACCACGGGTTGCTCATGCTCTATATATAAGACCTTCCATT
CCCAATAAACAGATAAATAGAGTACTAGTTAAGACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 0 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1H317TF U 1
AF RS1C890TF U 174
AF RS1DM01JQ C 788
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GTTGA

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DS 

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G
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CTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGCACGAAAATCTGGGATTGAGAAGGATA
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CCCTAAATACCCAAATGTCATTCGCCGACGAATTTGAATCTAATCTCGTTTCGTTGGCCC
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GAAATGTCACACCCAATACACACTTCTCAGAGGAAGCAATTGATGAACAGAAGCACAGCG
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AGACCG

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 5

CO CL1519Contig1 979 5 7 U
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AATCAAACGTGAAAAGGGAAGAAGTAACAAACAGGTGTGAAGGCACTCGGAAATAGTGGT
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CTTCACCTTCCCCATCATCATCATCTCTCCTTCCATTAATGTCACGTACTATCCCCAATA
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AAAAATAAAAATATTTCTAGTTTCGTTTTTCTTTTATTTTTGGTGTGTGTGAACAGAATG
CCGGAGAAATGTGTCGAGGGTTTACAAAGTCAAGCAGCGTCATTTTTTTTTTTACTCTTC
TTTTTCTCCACTCTCTGCGATTTTTTTTACTTTTGATTTTGTTTACCGTTTACAAATTTA
CAATAGAAAAGGTAAACTT


BQ
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AF RS1CJ54TF U 1
AF RS1BL91TF U 1
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AF RS1CJ54JQ C 533
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ACCATC
TCT

QA 1 726 1 726
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1FE24TF C 853
AF RS1CE92TF C 704
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CACCAGTCCATTCTCATTGCATTTTGAACATCTCTTGAACCGTTCTTCTTCCTCTTCAAA
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AGGCAAACAAACCGGTTTTGGTTTCTCCGCAGCACCGAGCAAGCTTTGAAGCTCTTTCCT
GTATTTAGAATCCATCGAGATATCACGCTCGTCTACCGCAACTTGAAGGCCTCTCAATAT
CATCCTTACGCAACAGCAATCCTCATATGTCTTCCTAATTCCTCGGAGAGTTGTGAAGTA
TAACACAATCTTGTCTTCTGCTCCTCCTTGTAATCTCGGTTTGGTTTGTGAACTCAGTGG
AGTAGAGCAAACAGATTTTGGC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RS1CE92JQ 744 0 0
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CTTCCTCTTCAAACACCTTAGTGCTACCATCACAGTTAGTACAAGGCACAAACCTTGCAT
CACCACAGCTCCGGCATGTCCCCAAGCATTCACTAGGAGGGAAATCTTTCAACATCTCAG
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DS 

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C

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DS 

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TGGTTGTG
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GGT*GTGAGAGGGTTTT*GTTCTCGACATTGGTTAACTGTTTAGAGGACAAGGCTTTCTT
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CCAAAGAGGTTGCTTTGGTTTATAAGACAACGGGACCCAATCTTCTTCGTCACGTTCGAT
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GGGGGTTTCGAATTCGAATTCGTCGTCCAAGCCGTCCATGAGCTCCCACGTGTTGATAAC
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TGAAGTAGAAGAGCCCATTTTTAACAAACACTTAACTTTGAAAGATTTGGTTTTTAGTTT
TGTTCCTCTTTCTGGTGTTCTTCTGAGATTCCC

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DS 



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TCCTCCGGTCAGTGAAGTTGATAAAAAAGAAGATGGAGGGGATTAGTACTCAACATACAC
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CTCTCACTATCGATATGGTGAAGTTTCACCAAACGTGCGATCCTGAGAAGGAGAACTTGT
CTCTGTATGGACTTCCGAATGAGACATGGGAGGTTAATCTTCCCGCAGAGGAAGTTCCTC
CTGAGCTTCCTGAACCAGCTCTAGGCATCAATTTCGCTAGAGACGGCATGCAAGAAAAGG
ACTGGGTCTCTTTGGTCGCTGTTCACAGTGATTCCTGGCTGCTTTCTGTTGCCTTCTACT
TTGGTGCACGTTTCGGGTTTGGTAAGAATGAGAGGAAGAGACTCTTCCAGATGATAAACG
ATCTCCCAACCATTTTCGAGGTTGTGACGGGCAATGCAAAGCAATCCAAAGATCATTCTG
GTACCAACAACAACAATAGCAAAAGCAAACCTAGCGGCTTGAAGGTTTCGAAGATGTCAT
CTCCATTGCCTAAAGAAGAAGATGAGAGTGAAGACGAGGAAGAACAAGGTGCGGTTTGTG
GCGCTTGTGGAGACAACTACGGTACAGATGAGTTTTGGATATGCTGTGACGCGTGTCAGA
AATGGTTCCATGGAAAATGTGTCCAGATTACACCTGCAAAAGCAGAGCACATCAAGCACT
ACAAGTGCCCAAGTTGCACTAACAAGAGAGCCAGACCTTGATGTTACTTAAACAACCAGA
AGAAAAAGAAAGAAAAGGTTAAAAGTCGGATGAATTTTCTTCTTGTTAATGTCAATACTA
CAAATACTAATGTGCATGTTTGAGGTTATTTTAGTCCTTTTCGTCTACACTAATTGTTGT
TTTTGGTCATATGCTTTTACGTTTTTATTAGTTAACACAGTCTAAAGTTGAAAGATTCTG
GACAACT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AV69TF U 6
AF RS1CC65TF U 1
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AF RS1AV69JQ C 374
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BS 902 1008 RS1CC65JQ
BS 1009 1087 RS1AV69JQ

RD RS1AV69TF 641 0 0
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GTCTCTTTGGTCGCTGTTCACAGTGATTCTTGGCTGCTTTCTGTTGCCTTCTACTTTGGT
GCACGTTTCGGGTTTGGTAAGAATGAGAGGAAGAGACTCTTCCAGATGATAAACGATCTC
CCAACCATTTTCGAGGTTGTGACGGGCAATGCAAAGCAATCCAAAGATCATTCTGGTACC
AACAACAACAATAGCAAAAGCAAACCTAGCGGCTTGA
GGTT

QA 1 637 1 637
DS 

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TCCTCCGGTCGGTGAAGTTGATAAAAAAGAAGATGGAGGGGATTAGTACTCAACATACAC
CACGAACTGTGGAAGAGGTATTTATCGACTTCAGAGGTCGACGAGCTGGTCTCATTAAGG
CTCTCACTATCGATATGGTGAAGTTTCACCAAACGTGCGATCCTGAGAAGGAGAACTTGT
CTCTGTATGGACTTCCGAATGAGACATGGGAGGTTAATCTTCCCGCAGAGGAAGTTCCTC
CTGAGCTTCCTGAACCAGCTCTAGGCATCAATTTCGCTAGAGACGGCATGCAAGAAAAGG
ACTGGGTCTCTTTGGTCGCTGTTCACAGTGATTCCTGGCTGCTTTCTGTTGCCTTCTACT
TTGGTGCACGTTTCGGGTTTGGTAAGAATGAGAGGAAGAGACTCTTCCAGATGATAAACG
ATCTCCCAACCATTTTCGAGGTTGTGACGGGCAATGCAAAGCAATCCAAAGATCATTCTG
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CTCCATTGCCTAAAGA*GAAGATGAGAGTGA
GACGAGAAGA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1CC65JQ 722 0 0
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AGAGGAAGTTCCTCCTGAGCTTCCTGAACCAGCTCTAGGCATCAATTTCGCTAGAGACGG
CATGCAAGAAAAGGACTGGGTCTCTTTGGTCGCTGTTCACAGTGATTCCTGGCTGCTTTC
TGTTGCCTTCTACTTTGGTGCACGTTTCGGGTTTGGTAAGAATGAGAGGAAGAGACTCTT
CCAGATGATAAACGATCTCCCAACCATTTTCGAGGTTGTGACGGGCAATGCAAAGCAATC
CAAAGATCATTCTGGTACCAATAACAACAATAGCAAAAGCAAACCTAGCGGCTTGAAGGT
TTCGAAGATGTCATCTCCATTGCCTAAAGAAGAAGATGAGAGTGAAGACGAGGAAGAACA
AGGTGCGGTTTGTGGCGCTTGTGGAGACAACTACGGTACAGATGAGTTTTGGATATGCTG
TGACGCGTGTCAGAAATGGTTCCATGGAAAATGTGTCCAGATTACACCTGCAAAAGCAGA
GCACATCAAGCACTACGAGTGCCCAAGTTGCACTAACAAGAGAGCCAGACCTTGATGTTA
CTTAAACAACCAGAGGAAAAAGAAAGAAAAGGTTAAAAGTCGGATGAATTTTCTTCTTGT
TAATGTCAATACTACAAATACTAATGTGCATGTTTGAGGTTATTTTAGTCCTTTTCGTCT
AC

QA 1 722 1 722
DS 

RD RS1AV69JQ 714 0 0
ACCAGCTCTAGGCATCAATTTCGCTAGAGACGGCATGCAAGAAAAGGACTGGGTCTCTTT
GGTCGCTGTTCACAGTGATTCTTGGCTGCTTTCTGTTGCCTTCTACTTTGGTGCACGTTT
CGGGTTTGGTAAGAATGAGAGGAAGAGACTCTTCCAGATGATAAACGATCTCCCAACCAT
TTTCGAGGTTGTGACGGGCAATGCAAAGCAATCCAAAGATCATTCTGGTACCAACAACAA
CAATAGCAAAAGCAAACCTAGCGGCTTGAAGGTTTCGAAAATGTCATCTCCATTGCCTAA
AGAAGAGGATGAGAGTGAAGACGAGGAAGAACAAGGTGCGGTTTGTGGCGCTTGTGGAGA
CAACTACGGTACAGATGAGTTTTGGATATGCTGTGACGCGTGTCAGAAATGGTTCCATGG
AAAATGTGTCCAGATTACACCTGCAAAAGCAGAGCACATCAAGCACTACAAGTGCCCAAG
TTGCACTAACAAGAGAGCCAGACCTTGATGTTACTTAAACAACCAGAAGAAAAAGAAAGA
AAAGGTTAAAAGTCGGATGAATTTTCTTCTTGTTAATGTCAATACTACAAATACTAATGT
GCATGTTTGAGGTTATTTTAGTCCTTTTCGTCTACACTAATTGTTGTTTTTGGTCATATG
CTTTTACGTTTTTATTAGTTAACACAGTCTAAAGTTGAAAGATTCTGGACAACT

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 3

CO CL1522Contig1 859 3 2 U
AAGTGTTGAAAGTGATTCTCTTCATTATTTGTACTCTTTGTTTTCGTCTAGTTTCTTGTA
ACACGAGCTATAGAGTTGTTAATTGTTTTATTCATAAAAGCCGACAAGCAAAACAAGTGA
AAACCATACGATGTCCTGACTCAAGTCTTGGGCTGTGAAGGCTTCCACGTTCCTGGTATC
TCAACACCATGAGGTCCGATTCTGTTACGTGATATGAAATTCACTACTAGATTCGCAAAC
TCCTCTGGTACATCTTCCTGTATAGCATGTCCGGTGTGTTTGACCACAATCATTTGAAAC
TTTCCTTGCATTTGACCAATTGTGAGCGTCCGGTCCAATCTGTCAGTTCCAGCTAATAGC
AAGAGTTTTGGAACAGGAGATGACAAGAACTTCTCTGAGAGACCTTCGTACCAGCCTTTC
CAATACTGCTCTGTTTGCTCTAGACGTGTCCGGTAAGTGTAGCAGTGTTTTGAATCATCG
TATATGAGAGTTGTGGGGATGGAGACGCGAGCAGACTCGATGTTCCTTAATGACCCTCCT
CTAACGCTGTACTCAATTGCTTTTTGGATGCTGGGAAAATGTTGCATTCTGTTCGAAAGA
ATTTTCTGCATGTGAATCAAAGAGGCAACAGCAGTACCCTCAACAACATCCACTACGACA
AGCCCAGCCAAGCTAGGCAATGTTTTGTTTGCAGCAACTTGCACAGCGACCGAACCTCCC
ATGCTGTGACCAACTAGCACAATAGCAGGAGGAGAATCTCCATACAATTCCTTAACCACA
GCCACAACATCACTGCTCATTGTCTCGAGGGATAAGTCCAGTTCGTTCTCAGAAACCGAT
TTACCGTGTCCTCTCAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GX76JQ U 8
AF RS1ET17JQ U 1
AF RS1ET17TF C 158
BS 1 744 RS1ET17JQ
BS 745 859 RS1ET17TF

RD RS1GX76JQ 677 0 0
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CTATAGAGTTGTTAATTGTTTTATTCATAAAAGCCGACAAGCAAAACAAGTGAAAACCAT
ACGATGTCCTGATTCAAGTCTTGGGCTGTGAAGGCTTCCACGTTCCTGGTATCTCAACAC
CATGAGGTCCGATTCTGTTACGTGATATGAAATTCACTACTAGATTCGCAAACTCCTCTG
GTACATCTTCCTGTATAGCATGTCCGGCGTGTTTGACCACAATCATTTGAAACTTTCCTT
GCATTTGACCAATTGTGAGCGTCCGGTCCAATCTGTCAGTTCCAGCTAATAGCAAGAGTT
TTGGAACAGGAGATGACAAGAACTTCTCTGAGAGACCTTCGTACCAGCCTTTCCAATACT
GCTCTGTTTGCTCTAGACGTGTCCGGTAAGTGTAGCAGTGTTTTGAATCATCGTATATGA
GAGTTGTGGGGATGGAGACGCGAGCAGACTCGATGTTCCTTAATGACCCTCCTCTAACGC
TGTACTCAATTGCTTTTTGGATGCTGGGAAAATGTTGCATTCTGTTCGAAAGAATTCTCT
GCATGTGAATCAAAGAGGCAACAGCAGCACCCTCAACAACATCCACTACGACAAGCCCAG
CCAAGCTAGGCAATGTT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RS1ET17JQ 744 0 0
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ACACGAGCTATAGAGTTGTTAATTGTTTTATTCATAAAAGCCGACAAGCAAAACAAGTGA
AAACCATACGATGTCCTGACTCAAGTCTTGGGCTGTGAAGGCTTCCACGTTCCTGGTATC
TCAACACCATGAGGTCCGATTCTGTTACGTGATATGAAATTCACTACTAGATTCGCAAAC
TCCTCTGGTACATCTTCCTGTATAGCATGTCCGGTGTGTTTGACCACAATCATTTGAAAC
TTTCCTTGCATTTGACCAATTGTGAGCGTCCGGTCCAATCTGTCAGTTCCAGCTAATAGC
AAGAGTTTTGGAACAGGAGATGACAAGAACTTCTCTGAGAGACCTTCGTACCAGCCTTTC
CAATACTGCTCTGTTTGCTCTAGACGTGTCCGGTAAGTGTAGCAGTGTTTTGAATCATCG
TATATGAGAGTTGTGGGGATGGAGACGCGAGCAGACTCGATGTTCCTTAATGACCCTCCT
CTAACGCTGTACTCAATTGCTTTTTGGATGCTGGGAAAATGTTGCATTCTGTTCGAAAGA
ATTTTCTGCATGTGAATCAAAGAGGCAACAGCAGTACCCTCAACAACATCCACTACGACA
AGCCCAGCCAAGCTAGGCAATGTTTTGTTTGCAGCAACTTGCACAGCGACCGAACCTCCC
ATGCTGTGACCAACTAGCACAATA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1ET17TF 702 0 0
AAGGCTTCCACGTTCCTGGTATCTCAACACCATGAGGTCCGATTCTGTTACGTGATATGA
AATTCACTACTAGATTCGCAAACTCCTCTGGTACATCTTCCTGTATAGCATGTCCGGTGT
GTTTGACCACAATCATTTGAAACTTTCCTTGCATTTGACCAATTGTGAGCGTCCGGTCCA
ATCTGTCAGTTCCAGCTAATAGCAAGAGTTTTGGAACAGGAGATGACAAGAACTTCTCTG
AGAGACCTTCGTACCAGCCTTTCCAATACTGCTCTGTTTGCTCTAGACGTGTCCGGTAAG
TGTAGCAGTGTTTTGAATCATCGTATATGAGAGTTGTGGGGATGGAGACGCGAGCAGACT
CGATGTTCCTTAATGACCCTCCTCTAACGCTGTACTCAATTGCTTTTTGGATGCTGGGAA
AATGTTGCATTCTGTTCGAAAGAATTTTCTGCATGTGAATCAAAGAGGCAACAGCAGTAC
CCTCAACAACATCCACTACGACAAGCCCAGCCAAGCTAGGCAATGTTTTGTTTGCAGCAA
CTTGCACAGCGACCGAACCTCCCATGCTGTGACCAACTAGCACAATAGCAGGAGGAGAAT
CTCCATACAATTCCTTAACCACAGCCACAACATCACTGCTCATTGTCTCGAGGGATAAGT
CCAGTTCGTTCTCAGAAACCGATTTACCGTGTCCTCTCAAGC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 5

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TGGATCGAGCTTGGTCGAAGATGATGATGATGATGGTGGTGATCATGATGCTCACATCGA
CGATCTCAGCAAAAGAGCAGCTGAGCACTAAAGAGTGCGAGGATCTAGGATTCACCGGTC
TTGCTCTCTGCTCTGATTGCCACTCACTCTCTGAATACGTCAAGGACCAAGAGTTGGTAT
CTGACTGCTTGAAATGTTGCGCTGATGATTCTGAGGATTCCATGAGTAAGGTTACCTATT
CAGGAGCTATATTGGAGGTGTGCATGAGAAAGCTGGTTTTCTATCCCGAGATTGTTGGTT
TTATTGAAGAAGAGAAACAAAACTTCCCTACCCTTAAAGTTGAGTACGTTTTCAACTCAC
CACCCAAGTTGATCATGCTCGATGGAGATGATGAACGTAAGGAAACAATCAGAATCGACA
ACTGGAAACGCGAGCATCTACTCCAGTATATGCGGGAGAAGGTCAAGCCTACTTCATCAA
GTTAGTCTAAATCACTATGTAGGAGGGACTGAATTACCTATTCCAAAGCAGCAGCATTGT
GATCTAATAGTTAAATAACACATTGTGATCGATTTTTCTTTAAGCTATTTGGTCCCTCGG
CATGAGTAGTCTGTCTGTTCTGAACTTTTGCAATCTCGGTGTTAATGTCTTCTATTCTAT
CCAATGTTCTTATAAAATGGGAACTTTTGTACTTGGCTGTTTGGCATAATTACAAGCAGA
ATTCATCAC


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EJ49TF U 1
AF RS1G580TF U 1
AF RS1D651TF U 2
AF RS1G580JQ C 2
AF RS1H252TF U 345
BS 1 92 RS1EJ49TF
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RD RS1EJ49TF 610 0 0
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TGGATCGAGCTTGGTCGAAGATGATGATGATG***GTGGTGATCATGATGCTCACATCGA
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TTATTGAAGAAGAGAAACAAAACTTCCCTACCCTTAAAGTTGAGTACGTTTTCAACTCAC
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GTTAGTCTAAATCACTATGTAGGAGGGACTGAATTACCTATTCCAAAGCAGCAGCATTGT
GATCTAATAG

QA 1 610 1 610
DS 

RD RS1G580TF 684 0 0
G
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GGATCGAGCTTGGTCGAAGATGATGATGATGATGGTGGTGATCATGATGCTCACATCGAC
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CTGGAAACGCGAGCATCTACTCCAGTATATGCGGGAGAAGGTCAAGCCTACTTCATCAAG
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ATGAGTAGTCTGTCTGT
CTGACT

QA 2 678 2 678
DS 

RD RS1D651TF 725 0 0
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GGATCGAGCTTGGTCGAAGATGATGATGATGATGGTGGTGATCATGATGCTCACATCGAC
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TGCTCTCTGCTCTGATTGCCACTCACTCTCTGAATATGTCAAGGACCAAGAGTTGGTATC
TGACTGCTTGAAATGTTGCGCTGATGATTCTGAGGATTCCATGAGTAAGGTTACCTATTC
AGGAGCTATATTGGAGGTGTGCATGAGAAAGCTGGTTTTCTATCCCGAGATTGTTGGTTT
TATTGAAGAAGAGAAACAAAACTTCCCTACCCTTAAAGTTGAGTACGTTTTCAACTCACC
ACCCAAGTTGATCATGCTCGATGGAGATGATGAACGTAAGGAAACAATCAGAATCGACAA
CTGGAAACGCGAGCATCTACTCCAGTATATGCGGGAGAAGGTCAAGCCTACTTCATCAAG
TTAGTCTAAATCACTATGTAGGAGGGACTGAATTACCTATTCCAAAGCAGCAGCATTGTG
ATCTAATAGTTAAATAACACATTGTGATCGATTTTTCTTTAAGCTATTTGGTCCCTCGGC
ATGAGTAGTCTGTCTGTTCTGAACTTTTGCAATCTCGGTGTTAATGTCTTCTATTCTATC
CAATG

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1G580JQ 749 0 0
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GGATCGAGCTTGGTCGAAGATGATGATGATGATGGTGGTGATCATGATGCTCACATCGAC
GATCTCAGCAAAAGAGCAGCTGAGCACTAAAGAGTGCGAGGATCTAGGATTCACCGGTCT
TGCTCTCTGCTCTGATTGCCACTCACTCTCTGAATACGTCAAGGACCAAGAGTTGGTATC
TGACTGCTTGAAATGTTGCGCTGATGATTCTGAGGATTCCATGAGTAAGGTTACCTATTC
AGGAGCTATATTGGAGGTGTGCATGAGAAAGCTGGTTTTCTATCCCGAGATTGTTGGTTT
TATTGAAGAAGAGAAACAAAACTTCCCTACCCTTAAAGTTGAGTACGTTTTCAACTCACC
ACCCAAGTTGATCATGCTCGATGGAGATGATGAACGTAAGGAAACAATCAGAATCGACAA
CTGGAAACGCGAGCATCTACTCCAGTATATGCGGGAGAAGGTCAAGCCTACTTCATCAAG
TTAGTCTAAATCACTATGTAGGAGGGACTGAATTACCTATTCCAAAGCAGCAGCATTGTG
ATCTAATAGTTAAATAACACATTGTGATCGATTTTTCTTTAAGCTATTTGGTCCCTCGGC
ATGAGTAGTCTGTCTGTTCTGAACTTTTGCAACCTCGGTGTTAATGTCTTCTATTCTATC
CAATGTTCTTATAAAATGGGAACTTTTGT

QA 1 749 1 749
DS 

RD RS1H252TF 445 0 0
G
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ACGTTTTCAACTCACCACCCAAGTTGATCATGCTCGATGGAGATGATGAACGTAAGGAAA
CAATCAGAATCGACAACTGGAAACGCGAGCATCTACTCCAGTATATGCGGGAGAAGGTCA
AGCCTACTTCATCAAGTTAGTCTAAATCACTATGTAGGAGGGACTGAATTACCTATTCCA
AAGCAGCAGCATTGTGATCTAATAGTTAAATAACACATTGTGATCGATTTTTCTTTAAGC
TATTTGGTCCCTCGGCATGAGTAGTCTGTCTGTTCTGAACTTTTGCAATCTCGGTGTTAA
TGTCTTCTATTCCATCCAATGTTCTTATAAAATGGGAACTTTTGTACTTGGCTGTTTGGC
ATAATTACAAGCAGAATTCATCAC

QA 2 445 2 445
DS 



AS 1 5

CO CL1524Contig1 1084 5 14 U
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TGTTCAATGTAACTTGCACAATCTTTTTTTAGCAAGAAAAATAAAACTTAAAATGATGTT
TATCTAATACGACAAGACCTTATTGGACAAAGAAACAAACTCTCAAGAGTGCATGGGAGA
GAGACATTGGTGTAGAGATTTATAAGTTGGGTTGAGCAGGCAAATCTTGTAATCCACATA
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TGATGGATTTGAATGTTTCTTTATCTTTGGTTAAACGAGGGTTGTGTTGCATCTCTTCTC
CAACTGTACTTACCTCGTAACCTTTGTAGTCATGAGCTGGATAGATCAATGTGTCCTTTG
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AGTCGGTCCTCCCACAACCGCGGATGAGTACAGCATCCCCTGTAAAAGCCATTCTTGGTT
GGGGCTGATCAGCGTCCTCTCCAGTCACATATGTAACACATCCTGCAGTATGTCCAGGTG
TAGCACGGACCTCAAGGTATATATCACCAATGGATACTCTGTCACCTGGCTCAAGAAACA
TGTCTGCTTTGGAACCACTTGCTTTCGAAATGACTGATTTCACACCTGGGACCTTCGTCT
TAAGAAGTCCAGTGCCAGTGACATGATCGGCATGAACATGAGTGTTCATAGCATACACAA
GCTTCAAGCCTAGCTCATTGATCAGCTTCAAGTCTCTATCAACAGTCTTGTCCACCGGAT
CAATCAACAAAGCAGGTTTATCCGGATGCGAAACGTCAGCGAGGAGATAGGTGTAAGTGG
AAGACTCTTTCTCGAAGAGCTGTCGGAAGAGAAGCTTCGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAAG
AACCCATCACCGATCTGATGACTGTTCGAGTTCTGATTAGAGGATGTCGGAGAACAGGAG
ACTGATGAGAAGAGAGGAATCTGGGTTGAAGAAGAAGAAGATGCTGGAATCGTGTCAACA
CTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

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C

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CA
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AGAAGAAGAAGATGCTGGAATCGTGTCAACACTCC

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DS 



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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1C774TF U 2
AF RS1C774JQ C 79
AF RS1F269JQ C 201
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ATTTCCAGATCAATGCGGGGAAATC**CTGCTGCGGCTTTTGTCACTTTCAGCAGCGCTA
GTCCTGGTCTACAGATTCTTGATTTCGCGCTATTTGCTAACGATCTTCCCACTGAACTCG
TCTCGGGTACTACTTTCCTTAAGCCTGCTGTAGTCA

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DS 

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GGAGAGC
AAAAAACACAGAGTTTAGTTACACCAACCAATCAAAATGTTGCGTATTATCTTCCTCTTA
TCCCTCCTTTTTGCTCTATCCACGGCCTCTGTTCAAGACTTCTGTGTGGCCAACCTGAAA
CGCGCTGAAACCCCTGCGGGTTACCCATGCATACGTCCCATTCATGTCAAAGCCAAGGAC
TTCGTCTTCTCCGGCTTAGGCACTCCTGGTAACACTACCAACATCATCAGCGCTGCGGTC
ACACCAGATTTTGTCGCTCAGTTCCCTGGTCTGAACGGTCTAGGACTCTCTACAGCTAGA
CTTGACCTAGCTCCAAAAGGTGTGATCCCAATGCACACACACCCGGGTGCCTCTGAGGTT
CTGTTTGTTCTTGACGGTGCCATTACCGCTGGGTTTGTCTCCTCTGCGAACTCTGTCTAC
GTACAGACACTAAAGCCGGGACAGGTCATGGTCTTCCCGCAGGGCTTGCTTCATTTCCAG
ATCAATGCGGGGAAATCAGCTGCTGCGGCTTTTGTCACTTTCAGCAGCGCTAGTCCTGGT
CTACAGATTCTTGATTTCGCGCTATTTGCTAACGATCTTCCCACTGAACTCGTCTCGGGT
ACTACTTTCCTTAAGCCTGCTGTAGTCAAGAAGCTCAAGGGTGTTCTTGGAGGA*CTGGC
TAAATCAAGACTTGACTATAAA
CAA

QA 8 689 8 689
DS 

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TTGCTCTATCCACGGCCTCTGTTCAAGACTTCTGTGTGGCCAACCTGAAACGCGCTGAAA
CCCCTGCGGGTTACCCATGCATACGTCCCATTCATGTCAAAGCCAAGGACTTCGTCTTCT
CCGGCTTAGGCACTCCTGGTAACACTACCAACATCATCAGCGCTGCGGTCACACCAGATT
TTGTCGCTCAGTTCCCTGGTCTGAACGGTCTAGGACTCTCTACAGCTAGACTTGACCTAG
CTCCAAAAGGTGTGATCCCAATGCACACACACCCGGGTGCCTCTGAGGTTCTGTTTGTTC
TTGACGGTGCCATTACCGCTGGGTTTGTCTCCTCTGCGAACTCTGTCTACGTACAGACAC
TAAAGCCGGGACAGGTCATGGTCTTCCCGCAGGGCTTGCTTCATTTCCAGATCAATGCGG
GGAAATCAGCTGCTGCGGCTTTTGTCACTTTCAGCAGCGCTAGTCCTGGTCTACAGATTC
TTGATTTCGCGCTATTTGCTAACGATCTTCCCACTGAACTCGTCTCGGGTACTACTTTCC
TTAAGCCTGCTGTAGTCAAGAAGCTCAAGGGTGTTCTTGGAGGAACTGGCTAAATCAAGA
CTTGACTATAAAACAACAAGGCCTGTTTTTCTATTCTCTTTTAATGGATTATTTTCTCAT
TTGTTTTGTGTTCCTTGTAGTTCTTCAAAACATGTCAACATTATTACATTGTATGTGAGT
TTTTCAATTAAGATCCTGAGTACGTCAGACCGTTCAT

QA 1 757 1 757
DS 

RD RS1F269JQ 623 0 0
GGCTTAGGCACTCCTGGTAACACTACCAACATCATCAGCGCTGCGGTCACACCAGATTTT
GTCGCTCAGTTCCCTGGTCTGAACGGTCTAGGACTCTCTACAGCTAGACTTGACCTAGCT
CCAAAAGGTGTGATCCCAATGCACACACACCCGGGTGCCTCTGAGGTTCTGTTTGTTCTT
GACGGTGCCATTACCGCTGGGTTTGTCTCCTTTGCGAACTCTGTCTACGTACAGACACTA
AAGCCGGGACAGGTCATGGTCTTCCCGCAGGGCTTGCTTCATTTCCAGATCAATGCGGGG
AAATCAGCTGCTGCGGCTTTTGTCACTTTCAGCAGCGCTAGTCCTGGTCTACAGATTCTT
GATTTCGCGCTATTTGCTAACGATCTTCCCACTGAACTCGTCTCGGGTACTACTTTCCTT
AAGCCTGCTGTAGTCAAGAAGCTCAAGGGTGTTCTTGGAGGAACTGGCTAAATCAAGACT
TGACTATAAAACAACAAGGCCTGTTTTTCTATTCTCTTTTAATGGATTATTTTCTCATTT
GTTTTGTGTTCCTTGTAGTTCTTCAAAACATGTCAACATTATTACATTGTATGTGAGTTT
TTCAATTAAGATCCTGAGTACGT

QA 1 623 1 623
DS 



AS 2 4

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GGGTGAAACTATCATACCGTTCCGATGATGACGAAAACAACGTGAACAGCTCTCCAAAGG
CACAGAACACATCGCTTTCGTATACCTCGGAAGCAGATGATTCAGTCACAGGACAGCCTG
CCATTCACAAGCTATTCAACAAATGGTTAACACTGCTGCGCACACAATCACCTGTTCAGG
TGGTTGACGAGGCTTTGGGAGGAGAAGAGGCTCCACAGACGACAAAGGCAGAAACTGAAA
CTGAGATCAGGAAAACAGAAAGCCTCCAGAGTGCGAAAAGTACATTTTGGACCTTGTTTT
GGAGTCTAGACGCAGCTGTCAAGATTCCTTTGCTGCTATTTGTTCCAGCTTTTCTAGCTG
TTAACGCAATCTATGGAGCCGAAGTTACAAAGGAGCTATCTCCTCTATGGATAGCTGGTC
CTTTGATCGTCGCCCTTTATGTCAAAATGTTCCAAGGACTATGCACCCTTTACGCCTTCT
GCTTCAAGCAAACCACCAAGGTGATAAGAAACCTGCCATCTTATTACCTTATAGCATACC
ATTACATCGCCCACGGCAAGCTCAGAGACGACTTGAGAGGTTTTGTGACTCGACCAGTTG
TGGCCATCAAGAACGCTGACTACAAAGAGCTCACACGCACCAAACTGAAACAGCTCCAAG
TGTGGATCGTTGAGAGGTACTTGGGATTTGGTTGAATCTATATGGCCTTATTACTGCAGA
ACTATCAGATTCCTGAAGAGGGCTAACCTGATTTGAAGCTCTTCAATATGAAAAGGCCCC
CCTACAGGGATGCTCTGTGATTTGTACTTTTCATGTTGACTTTGTTTTTACCTTTTTTGA
TTCTTAAAATCTTAGAAAGCCCTTTCATGTCTTTGATGTTGTCTTCATGTGTACTGATAC
CTTCTTTGAGGTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AE20TF U 1
AF RS1AE20JQ C 395
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BS 849 914 RS1AE20JQ

RD RS1AE20TF 851 0 0
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TTCTTAAA
TCT

QA 1 848 1 848
DS 

RD RS1AE20JQ 520 0 0
GCTATT
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TTATTACCTTATAGCATACCATTACATCGCCCACGGCAAGTTCAGAGACGACTTGAGAGG
TTTTGTGACTCGACCAGTTGTGGCCATCAAGAACGCTGACTACAAAGAGCTCACACGCAC
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TATGGCCTTATTACTGCAGAACTATCAGATTCCTGAAGAGGGCTAACCTGATTTGAAGCT
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GTCTTCATGTGTACTGATACCTTCTTTGAGGTTT

QA 7 520 7 520
DS 



CO CL1526Contig2 847 2 8 U
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AAACAAAAGCATTTACGATTGAAGCAAAGTTGTTGTTTTAGTTTAAGGTCTCCCTGCAGT
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TCGTATACCTCGGAAGCAGATGACTCAGTCACAGGACAGCCTGCTATTCAGAAGCTATTC
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GAAAGCCTCCAGAGTGCGAAAAGTACATTTTGGACCTTGTTTTGGAGTCTAGACGCATCT
ATCAAGATTCCTTTGCTGCTATTTGTTCCAGCTTTTCTAGCTGTTAACGCCATCTATGGA
GCTGAAGTTACAAAGGAGTTATCTCCTTTATGGATAGCTGGTCCTTTGATCGTTGCCCTT
TATGTCAAAATGTTCCAAGGACTATGCACCCTTTACGCCTTCTGCTTCAAGTAAAGCGCC
AAGTTGATAAGAAACCTGCCATCTTATTACCTTATAGCATACCATTACATCGTCCACGCA
GCTCAGAGACGACGTGAGAGGTTAGTGACTCGACAGTTGTGGCCATCAAGAATGCTGACT
ACAAAGA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FT42TF U 1
AF RS1GC33TF U 1
BS 1 729 RS1FT42TF
BS 730 730 RS1GC33TF
BS 731 774 RS1FT42TF
BS 775 775 RS1GC33TF
BS 776 800 RS1FT42TF
BS 801 801 RS1GC33TF
BS 802 828 RS1FT42TF
BS 829 847 RS1GC33TF

RD RS1FT42TF 845 0 0
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GATGCTGACTACAAGAG

QA 1 828 1 828
DS 

RD RS1GC33TF 847 0 0
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AAACAAAAGCATTTACGATTGAAGCAAAGTTGTTGTTTTAGTTTAAGGTCTCCCTGCAGT
GGTGGATTGAAAGCAAAATCTTTCAAGGTCACATCATTCAAAGGCGGAATCCAAAACAGT
GAATCAGGAGGAAGTGAGGGTGGGAAGAGAGTTACTAACAACTCGGTGAAACTATCTTAC
CGTTCAGATGATGACGAAAACAACGTGAACAGCTCTCCAAAGGCACAGAACACATCGATT
TCGTATACCTCGGAAGCAGATGACTCAGTCACAGGACAGCCTGCTATTCAGAAGCTATTC
AAGAAATGGTTAACACTGCTGCGCACACAATCACCTGTCCAGGTGGTTGACGAGGCTTTG
GCAGGAGAAGAGGCTCCACAGACGACAAAGCCAGAAACTGAAACTGAGATCAAGAAAACA
GAAAGCCTCCAGAGTGCGAAAAGTACATTTTGGACCTTGTTTTGGAGTCTAGACGCATCT
ATCAAGATTCCTTTGCTGCTATTTGTTCCAGCTTTTCTAGCTGTTAACGCCATCTATGGA
GCTGAAGTTACAAAGGAGTTATCTCCTTTATGGATAGCTGGTCCTTTGATCGTTGCCCTT
TATGTCAAAATGTTCCAAGGACTATGCACCCTTTACGCCTTCTGCTTCAAGTAAAGCGCC
AAGTTGATAAGAAACCTGCCATCTTATTAC*TTATAGCATACCATTACATCGTCCACGCA
GCTCAGAGACGACGTGAGAGGTTAGTGACTCGACAGTTGTGGCCATCAAGAATGCTGACT
ACAAAGA

QA 1 847 1 847
DS 



AS 1 5

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CCTTATCACTTGATCTTTTTTCCTAATCTTTCGCTCATTTGTCGACAGCAAAACTTCTGA
CAATGGAAGCAATCAGATTCTCTAACGTGTCAGCTCTTCTTATACTGCTGCTGCTACTGT
CACTGTCTCTCCGTGCGACGTCAAAAGACCAAACTGTTTCTTGCACAATGTGTACCTCTT
GCGACAATCCATGTAACCCTGTCCCGTCTTCCTCTCCGCCTCCTACTCCTCCAAGCTCCA
GCGGCGGCGGTGGATCTTATTATTATTCTCCTCCTCCTCCTAATCATCCGAGCTCCGGCG
GCGACGGCTCTTATTATTATCCTCCTCCTTCGAGTTCCGGTGGTGGTAAATACCCTCCTC
CGTATGGAGACGGTGGACAGAGTTACTATTATCCGCCTGCTTCTTACGGTAACTACCCGA
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CGGGAGATTCTGGATCGGATCGTTTAATGAGTTCATTTCTCTTTGTTCTGTTCTCGTTCT
CGATTTGTTTTGGGTGAATGATGAGAAAGATCATGTTTTACTACTACTTTTACCTTTTTA
ACTATGCTACTACTTTTTTACTTTCTGTTGACAATTTGTAATTAACACCG


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CM95TF U 76
AF RS1AU78JQ C 2
AF RS1AU78TF U 2
AF RS1AS40TF U 1
AF RS1AS40JQ C 11
BS 1 299 RS1AS40TF
BS 300 300 RS1AU78TF
BS 301 336 RS1AS40TF
BS 337 339 RS1AU78TF
BS 340 693 RS1AS40TF
BS 694 694 RS1AS40JQ
BS 695 710 RS1AS40TF

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QA 1 163 1 163
DS 

RD RS1AU78JQ 655 0 0
GG
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ACGGCTCTTATTATTATCCTCCTCCTTCGAGTTCCGGTGGTGGTAAATACCCTCCTCCGT
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CGCCTCCGCCGAATCCCATCGTTCCTTATTTTCCGTTTTACTTTCACGTACCTCCTCCGG
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CC

QA 3 653 3 653
DS 

RD RS1AU78TF 655 0 0
GG
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TATC*CTTGATCTTTTTTCCTAATCTTTCGCTCATTTGTCGACAGCAAAACTTCTGACAA
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TGTCTCTCCGTGCGACGTCAAAAGACCAAACTGTTTCTTGCACAATGTGTACCTCTTGCG
ACAATCCATGTAACCCTGTCCCGTCTTCCTCTCCGCCTCCTACTCCTCCAAGCTCCAGCG
GCGGCGGTGGATCTTATTATTATTCTCCTCCTCCTCCTAATCATCCGAGCTCCGGCGGCG
ACGGCTCTTATTATTATCCTCCTCCTTCGAGTTCCGGTGGTGGTAAATACCCTCCTCCGT
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CGCCTCCGCCGAATCCCATCGTTCCTTATTTTCCGTTTTACTTTCACGTACCTCCTCCGG
GAGATTCTGGATCGGATCGTTTAATGAGTTCATTTCTCTTTGTTCTGTTCTCGTTCTTGA
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CC

QA 3 653 3 653
DS 

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CCTTATCACTTGATCTTTTTTCCTAATCTTTCGCTCATTTGTCGACAGCAAAACTTCTGA
CAATGGAAGCAATCAGATTCTCTAACGTGTCAGCTCTTCTTATACTGCTGCTGCTACTGT
CACTGTCTCTCCGTGCGACGTCAAAAGACCAAACTGTTTCTTGCACAATGTGTACCTCTT
GCGACAATCCATGTAACCCTGTCCCGTCTTCCTCTCCGCCTCCTACTCCTCCAAGCTCCG
GCGGCGGCGGTGGATCTTATTATTATTCTCCTCCTC***CTAATCATCCGAGCTCCGGCG
GCGACGGCTCTTATTATTATCCTCCTCCTTCGAGTTCCGGTGGTGGTAAATACCCTCCTC
CGTATGGAGACGGTGGACAGAGTTACTATTATCCGCCTGCTTCTTACGGTAACTACCCGA
CGCCGCCTCCGCCGAATCCCATCGTTCCTTATTTTCCGTTTTACTTTCACGTACCTCCTC
CGGGAGATTCTGGATCGGATCGTTTAATGAGTTCATTTCTCTTTGTTCTGTTCTCGTTCT
CGATTTGTTTTGGGTGAATGATGAGAAAGATCATGTTTTACTACTACTTTTACCTTTTTA
ACTATGCTACTACTTTTTTACTTTCTGTTGACA*TTTGTAATTAACACCG

QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1AS40JQ 700 0 0
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TGATCTTTTTTCCTAATCTTTCGCTCATTTGTCGACAGCAAAACTTCTGACAATGGAAGC
AATCAGATTCTCTAACGTGTCAGCTCTTCTTATACTGCTGCTGCTACTGTCACTGTCTCT
CCGTGCGACGTCAAAAGACCAAACTGTTTCTTGCACAATGTGTACCTCTTGCGACAATCC
ATGTAACCCTGTCCCGTCTTCCTCTCCGCCTCCTACTCCTCCAAGCTCCGGCGGCGGCGG
TGGATCTTATTATTATTCTCCTCCTC***CTAATCATCCGAGCTCCGGCGGCGACGGCTC
TTATTATTATCCTCCTCCTTCGAGTTCCGGTGGTGGTAAATACCCTCCTCCGTATGGAGA
CGGTGGACAGAGTTACTATTATCCGCCTGCTTCTTACGGTAACTACCCGACGCCGCCTCC
GCCGAATCCCATCGTTCCTTATTTTCCGTTTTACTTTCACGTACCTCCTCCGGGAGATTC
TGGATCGGATCGTTTAATGAGTTCATTTCTCTTTGTTCTGTTCTCGTTCTCGATTTGTTT
TGGGTGAATGATGAGAAGGATCATGTTTTACTACTACTTTTACCTTTTTAACTATGCTAC
TACTTTTTTACTTTCTGTTGACAATTTGTAATTAACACCG

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 5

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TGTCTCTAGAACCCTTTAACCCAGTTCCTAAACTAGAGCCTAGTTCACCGGTTCTTGATC
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ACTAATGGGATTAGTCATATGCTTAAGTTTGACTAATGTAGATAAATATCTATGTATGTG
AAGCATCATGTATAGAGCCAAGAAAATATTAGATTAGACATTAGTGTAGTGAATAAGTGT
TGCAAAATATGCGCTATAAGAGTTCTTGTAACAATGGAACTTATGTGTTGTCCCATGTCT
TACAGATAATCAGTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GS85TF U 1
AF RS1FJ04TF U 1
AF RS1F785TF U 4
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AF RS1F785JQ C 106
BS 1 749 RS1FJ04TF
BS 750 858 RS1F785JQ

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AAGCATCATGTATAGAGCCAAGAAAATAT

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GG
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GATGGTTTCATGGAAGATTTTCTCTTTGATGATTCCGCTTTTGTGTCAGGACTCTTGTCT
CTAGAACCCTTTAACCCAGTTCCTAAACTAGAGCCTAGTTCACCGGTTCTTGATCCAGAT
TCCTATGTCCGAGAGTTTCTTCAAATGCGAGCATCATCTTCATCATCAACAACAACAACT
ACAACAACATCACCTGAGGTTGAGACTGTCTCAAACCGGAAAAGACCAAAGAGGGTCGAA
GAGACTAGACACTACCGAGGCGTGAGAAGGAGGCCATGGGGAAAATTTGCAGCAGAGATT
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TCATGTATAGAGC

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AGAACCCTTTAACCCAGTTCCTAAACTAGAGCCTAGTTCACCGGTTCTTGATCCAGATTC
CTATGTCCGGGAGTTTCTTCAAATGCAAGCATCATCTTCATCATCAACAACAACAACTAC
AACAACATCACCTGAGGTTGAGACTGTCTCAAACCGGAAAAGACCAAAGAGGGTCGAAGA
GACTAGACACTACCGAGGCGTGAGAAGGAGGCCATGGGGAAAATTTGCAGCAGAGATTCG
AGATCCTGCCAAGAAAGGATCTAGGCTTTGGCTAGGGACATTTGAGAGTGATATTGATGC
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CGATGTAACGGAGCCTCAAGGAACAACTACGAGTAATTCATCATCTTCATCACACTAATG
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TTGTGTCAGGACTCTTGTCTCTAGAACCCTTTAACCCAGTTCCTAAACTAGAGCCTAGTT
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CATCATCAACAACAACAACTACAACAACATCACCTGAGGTTGAGACTGTCTCAAACCGGA
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CTTGCCGGAAGAGGAGAAGAAACGATGTAACGGAGCCTCAAGGAACAACTACGAGTAATT
CATCATCTTCATCACACTAATGGGATTAGTCATATGCTTAAGTTTGACTAATGTAGATAA
ATATCTATGTATGTGAAGCATCATGTATAGAGCCAAGAAAATATTAGATTAGACATTAGT
GTAGTGAATAAGTGTTGCAAAATATGCGCTATAAGAGTTCTTGTAACAATGGAACTTATG
TGTTGTCCCATGTCTTACAGATAATCAGTTCTC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 4

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AACACTAGAGGTGGTCATTTGTATTACATTTCCTCGACATCAAGACAATGGTTTGATTCT
TTTGTTCTCTTTTTACCTGACCTGCGTTGCTGTCTTATATCTGTACCCAGTCTGGTGAAC
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CTAGATCACTGAATGACACATCTTCTTCGTCTTCACCAAGAGGATGCTTAGTAGTTACTC
CTCCTTCCATGCCGCTCACCGCATCTGAACTCTCTTCGTCGTTCAACCAATCATCTGCGT
CTTCTTCTTCTTCTTCTACGTCCTCAGCTTGCACATTGACAAATCTAGATGAAGAAGAAG
AATCAGTTGATGAGTTTCTTTCTTCAATGACAGATTTGTCAACGACTTGTATCTCCTCCT
TGCTCTCAATTGAATGCTTGTCCGTCTCACTCTCCTGCGGATTCACGGTTTTAGCAACTA
ATGACTCCTGCGAAGGGTTGTAAGGCACGGTAAGAGGTTCAACCACTGCAGCGTTAGCTC
CAGAACTCTCTGCTGCTTCCACAGGTGCTCTGGTTGATTTCTGTAACTCATGAGATAACA
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TTAC*ATCCCATGAAACCTGAGATGCTACTACTACATTACCTGAGGAGTGGAGAGAAGTA
AGGCATCGTGTTGGGTGAGTTTAGGATGCAAAAGCACAAAGTAAATCATCCAGAAGCAAT
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TTTCAACAGCCACAGCATGCTCGTGCTGATCATCACTCATTTCAAACTCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 25 10 25 25 10 25 10 10 25 10 25 25 25 10 25 10 10 10 25 25 25 25 10 0 25 10 25 10 10 10 10 25 10 25 25 
25 25 10 25 25 10 25 10 25 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FE31TF C 1
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AF RS1BF17TF U 121
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TAGAGTTGGTAGATCTCTTAGAACTCACGGGTACGTC
C

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DS 

RD RS1D760JQ 726 0 0
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CACTGAATGACACATCTTCTTCGTCTTCACCAAGAGGATGCTTAGTAGTTACTCCTCCTT
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TTGCTTCGAGTACCTGAGGAGTGGAG*AGAAGTAAGGCATCGTGTTGGGTGAGTTTAGGA
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QA 1 726 1 726
DS 

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CTTTTTACCTGACCTGCGTTGCTGTCTTATATCTGTACCCAGTCTGGTGAACTAGAGTTA
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CTGAATGACACATCTTCTTCGTCTTCACCAAGAGGATGCTTAGTAGTTACTCCTCCTTCC
ATGCCGCTCACCGCATCTGAACTCTCTTCGTCGTTCAACCAATCATCTGCGTCTTCTTCT
TCTTCTTCTACGTCCTCAGCTTGCACATTGACAAATCTAGATGAAGAAGAAGAATCAGTT
GATGAGTTTCTTTCTTCAATGACAGATTTGTCAACGACTTGTATCTCCTCCTTGCTCTCA
ATTGAATGCTTGTCCGTCTCACTCTCCTGCGGATTCACGGTTTTAGCAACTAATGACTCC
TGCGAAGGGTTGTAAGGCACGGTAAGAGGTTCAACCACTGCAGCGTTAGCTCCAGAACTC
TCTGCTGCTTCCACAGGTGCTCTGGTTGATTTCTGTAACTCATGAGATAACATTGCTCTT
GCTTCGAGTACCTTTTTAATGAAACACAAGAATCACATCACGCTAAAA*ACTTTAC*ATC
CCATGAAACCTGAGATGCTACTACTACATTACCTGAG*AGTGGAGAGAA

QA 9 717 9 717
DS 

RD RS1BF17JQ 719 0 0
TCATCTTCTAGATCACTGAATGACACATCTTCTTCGTCTTCACCAAGAGGATGCTTAGTA
GTTACTCCTCCTTCCATGCCGCTCACCGCATCTGAACTCTCTTCGTCGTTCAACCAATCA
TCTGCGTCTTCTTCTTCTTCTTCTACGTCCTCAGCTTGCACATTGACAAATCTAGATGAA
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TCCTCCTTGCTCTCAATTGAATGCTTGTCCGTCTCACTCTCCTGCGGATTCACGGTTTTA
GCAACTAATGACTCCTGCGAAGGGTTGTAAGGCACGGTAAGAGGTTCAACCACTGCAGCG
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DS 



AS 1 4

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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DS 



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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CB01TF C 1
AF RS1GV71JQ U 2
AF RS1AF86JQ U 1
BS 1 312 RS1AF86JQ
BS 313 313 RS1GV71JQ
BS 314 405 RS1AF86JQ
BS 406 406 RS1GV71JQ
BS 407 508 RS1AF86JQ
BS 509 509 RS1GV71JQ
BS 510 591 RS1AF86JQ
BS 592 592 RS1GV71JQ
BS 593 602 RS1AF86JQ
BS 603 603 RS1GV71JQ
BS 604 824 RS1AF86JQ

RD RS1CB01TF 255 0 0
TATTAAAGGGTTC
TAAGCCCAAAGTTTACAAGTGATTTGCACTCATTAAACCCAATACAGAAGCCCAAAATTA
CTCAACAAGTTTAGATAAACACAAAAA*CACGTGTCTTGATCTTCTTATTCAACGCAGAT
GCAACGTGTCATTCTTGGAAATTGTTGAGATGAGCCACCGTTTCTTCATCGGAGATCTTG
CCGTCTACTCCTCCGCCAGATGAAAGAGAATCCAAATCATTAAGGAAAGGCAAGATCTTC
C
C

QA 14 254 14 254
DS 

RD RS1GV71JQ 657 0 0
ATTAAATGGCTA
TAAGCCCAAAGTTTACAAGTGATTTGCACTCATTAAACCCAATACAGAAGCCCAAAATTA
CTCAACAAGTTTAGATAAACACAAAAAACACGTGTCTTGATCTTCTTATTCAACGTAGAG
GCAACGTGTCATTCTTGGAAATTGTTGAGATGAGCCACCGTTTCTTCATCGGAGATCTCG
CCGTCTACTCCTCCGCCAGATGAAAGAGAATCCAAATCATTAAGCAAAGGCAAGATCTTC
CGGATTCAAACCACTTGGATGAGATTGCCTTTCACTAAAGCCGTGACTACATAGGCAGAA
AGGTTTTGGTTCACCGGGAAGTACATCAGTGGAAGCATGAGTCTGGTTGAAGGTAGACTC
TTTGTCGGACCGCTACGAAGGCGCCAACTCTTATGAATCCGCTTCAAATAAAACTCAATA
GATCCATCAAACTTGATCTTCATTCATCCAAGATGCTCTGCCATAACAGCCACTAAAGGC
TTTAA*GAAAGCAGAAACTGATACTTTTAAGAAAGAGATTCAAGTGAACGGTGAAGAAAA
ACATCTGACATATAATTGAACGGGATGAAAATA*AAAACTGAGTGAAAGACTTTGATTTA
AAACTTTATTCATTTCAAACTCAATCGAGAGCAGAAGATGAAAAA

QA 13 657 13 657
DS 

RD RS1AF86JQ 824 0 0
TATTAAAGGGTTCTAAGCCCAAAGTTTACAAGTGATTTGCACTCATTAAACCCAATACAG
AAGCCCAAAATTACTCAACAAGTTTAGATAAACACAAAAA*CACGTGTCTTGATCTTCTT
ATTCAACGTAGATGCAACGTGTCATTCTTGGAAATTGTTGAGATGAGCCACCGTTTCTTC
ATCGGAGATCTTGCCGTCTACTCCTCCGCCAGATGAAAGAGAATCCAAATCATTAAGGAA
AGGCAAGATCTTCCGGATTCAAACCACTTGGATGAGATTGCCTTTCACTAAAGCCGTGAC
TACATAGGCAGAGAGGTTTTGGTTCACCGGGAAGTACATCAGTGGAAGCATGAGTCTGGT
TGAAGGTAGACTCTTTGTCGGACCGCTACGAAGGCGCCAACTCTTCTGAATCCGCTTCAA
ATAAAACTCAATAGATCCATCAAACTTGATCTCCATTCATCCAAGATGCTCTGCCATAAC
AGCCACTAAAGGCTTTAAAGAAAGCAGAGACTGATACTTTTAAGAAAGAGATTCAAGTGA
ACGGTGAAGAAAAACATCTGACATATAATCGAACGGGATCAAAATAGAAAATTGAGTGAA
AGGCTTTGATTTAAAACTTTATTCATTTCAAACTCAATCGAGAACAGAAGATGAAAAACT
CTTGAACACCAACTCGACTGAAGATTGAAAAACACAACAAAAGTCGCCTTGCGAAATTTT
AGTCCAGATCGCCAACGCGAAAGAAAGGATTCGCCAAGCGAAGTATATACATCAAAAAAC
AAAAAGAAAATGGTAACCGGCGGTGATAACCACCGGTCACCGAA

QA 1 824 1 824
DS 



AS 1 4

CO CL1533Contig1 509 4 9 U
GGATCTCTCTCTCAAAGCAAAATTAACATTTTAGATTTCTTCAAAGTTTCTTAGAAACGA
TGTCTTGCTGTGGAGGAAACTGTAGCTGCGGATCTGACTGCAAGTGCGATGGCTGCAAAG
GTTGCAAAATGTACCCAGACTTGGGCTTCTCAGGCGAGACTACCACCACCGAGACTCTTA
TCCTCGGCGTTGCTCCGTCTATGAACTCCCAGTACGAGGCTTCCGGCGAGACTTTCTTCG
CCGAGAATGATGGCTGCAAATGCGGATCTGACTGCAAGTGCGACAATTGCACCTGTAAAT
GAACAACCCCCAAACTCTGCAGTAAACCTAATGTTATGTTATGTCTTGGTTATATGAAAT
AATGGCTCATTTCGCCGGTTGTTTGGCCGGTGCTATTATCCCTGTTTGTTATCTACATGT
TGTATCCGTGTGTGACTATGTATGGTTCCAAATAGTGTTATGGGGTTTGTAACTGAAGTT
TCAGTCGGAACTTTTTATGGTTGTTTTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RS1E927TF U 1
AF RS1GC28TF U 1
AF RS1DK27TF U 11
AF RS1GC28JQ C 320
BS 1 90 RS1E927TF
BS 91 91 RS1GC28TF
BS 92 131 RS1E927TF
BS 132 132 RS1GC28TF
BS 133 427 RS1E927TF
BS 428 428 RS1GC28TF
BS 429 475 RS1E927TF
BS 476 505 RS1GC28TF
BS 506 509 RS1GC28JQ

RD RS1E927TF 475 0 0
GGATCTCTCTCTCAAAGCAAAATTAACATTTTAGATTTCTTCAAAGTTTCTTAGAAACGA
TGTCTTGCTGTGGAGGAAACTGTAGCTGCGTATCTGACTGCAAGTGCGATGGCTGCAAAG
GTTGCAAAATGCACCCAGACTTGGGCTTCTCAGGCGAGACTACCACCACCGAGACTCTTA
TCCTCGGCGTTGCTCCGTCTATGAACTCCCAGTACGAGGCTTCCGGCGAGACTTTCTTCG
CCGAGAATGATGGCTGCAAATGCGGATCTGACTGCAAGTGCGACAATTGCACCTGTAAAT
GAACAACCCCCAAACTCTGCAGTAAACCTAATGTTATGTTATGTCTTGGTTATATGAAAT
AATGGCTCATTTCGCCGGTTGTTTGGCCGGTGCTATTATCCCTGTTTGTTATCTACATGT
TGTATCCATGTGTGACTATGTATGGTTCCAAATAGTGTTATGGGGTTTGTAACTG

QA 1 475 1 475
DS 

RD RS1GC28TF 509 0 0
GGATCTCTCTCTCAAAGCAAAATTAACATTTTAGATTTCTTCAAAGTTTCTTAGAAACGA
TGTCTTGCTGTGGAGGAAACTGTAGCTGCGGATCTGACTGCAAGTGCGATGGCTGCAAAG
GTTGCAAAATGTACCCAGACTTGGGCTTCTCAGGCGAGACTACCACCACCGAGACTCTTA
TCCTCTGCGTTGCTCCGTCTATGAACTCCCAGTACGAGGCTTCCGGCGAGACTTTCTTCG
CCGAGAATGATGGCTGCAAATGCGGATCTGACTGCAAGTGCGACAATTGCACCTGTAAAT
GAACAACCCCCAAACTCTGCAGTAAACCTAATGTTATGTTATGTCTTGGTTATATGAAAT
AATGGCTCATTTCGCCGGTTGTTTGGCCGGTGCTATTATCCCTGTTTGTTATCTACATGT
TGTATCCGTGTGTGACTATGTATGGTTCCAAATAGTGTTATGGGGTTTGTAACTGAAGTT
TCAGTCGGAACTTTTTATGGTTGTT
TCTT

QA 1 505 1 505
DS 

RD RS1DK27TF 495 0 0
GG
CAAAGCAAAATTAACATTTTAGATTTCTTCAAAGTTTCTTAGAAACGATGTCTTGCTGTG
GAGGAAACTGTAGCTGCGGATCTGACTGCAAGTGCGATGGCTGCAAAGGTTGCAAA*TGT
ACCCAGACTTGGGCTTCTCAGGCGAGACTACCACCACCGAGACTCTTATCCTCGGCGTTG
CTCCGTCTATGAACTCCCAGTACGAGGCTTCCGGCGAGACTTTCTTCGCCGAGAATGATG
GCTGCAAATGCGGATCTGACTGCAAGTGCGACAATTGCACCTGTAAATGAACAACCCCCA
AACTCTGCAGTAAACCTAATGTTATGTTATGTCTTGGTTATACGAAATAATGGCTCATTT
CGCCGGTTGTTTGGCCGGTGCTATTATCCCTGTTTGTTATCTACATGTTGTATCCGTGTG
TGACTATGTATGGTTCCAAATAGTGTTATGGGGTTTGTAACTGAAGTTTCAGTCGGAACT
TTTTATGGTTGTT

QA 3 495 3 495
DS 

RD RS1GC28JQ 190 0 0
CAGTAAACCTAATGTTATGTTATGTTTTGGTTATATGAAATAATGGCTCATTTCGCCGGT
TGTTTGGCCGGTGCTATTATCCCTGTTTGTTATTTACATGTTGTATCCGTGTGTGACTAT
GTATGGTTCCAAATAGTGTTATGGGGTTTGTAACTGAAGTTTCAGTCGGAACTTTTTATG
GTTGTTTTTT

QA 1 190 1 190
DS 



AS 1 4

CO CL1534Contig1 1766 4 10 U
AGGGGCTTTGGGCATAGATAATATATTGGGTTTCGATTGGCCTTCACCTCCATCCCCACA
AGCAATGATACGGGCACTTGAAGTACTTTATTCACTTCAAATCCTTGATGATGATGCAAA
ACTCACTTCTCCAACAGGATTCCAAGTAGCAGAACTTCCACTGGACCCAATGATATCGAA
GATGATCTTAGCTTCAAATGAGCTTGGTTGTTCAGATGAGATCATTACAATCGCTGCAGT
ACTCTCTATCCAATCCGTTTGGGTCATTGCCAGGGGAGTACAGAAAGAACAAGATGAAGC
AAAACTGAGATTTGCTGCTGCAGAGGGTGACCATATCACATTCCTGAATGTATACAAAGG
GTTTCTTGAGTCCAAAAAAATCTTCACAATGGTGTTACAAGAACTTCCTCAACTACCAGT
CCATGAAAAAAGTTGTTGAAATCAGGGATCAACTCAAACGGATTGCTCGGAGATTAGGCA
TCACCCTGAAATCATGTGAAGGAGACATTGATGCTGTGAGAAAAGCAGTGACTGCAGGTT
TTTTCGCCAATGCATGCCGCTTAGAACCACACAGCAATGGGGTATTCAAGACTATTAGAG
GCTCTGAAGAAGTTTATATTCACCCATCCTCCGTATTGTTCAGGGTGAATCCGAAATGGG
TGGTTTACCAGTCCATTGTCTCAACAGAGCGTCAATACATGCGGAATGTCGTCACCATCA
ATCCTTTTTGGGTGACAGAAGCTGCTCCACACTTTTACCAGAACCGGCAAAACAATATGT
CCTTGTAATCCCCAAGCTAAAACACTCAGTTGAAGACACCGATAACAGTTGGTCCTGACA
ACATTTCATGATAAGTTCCTAGGATAATACAATGCAAGAATGTTTTGGAAATGCAAAGAA
ACAGTTTTCAATGGAGAAAACCAAATACTGTCTGTTTGAACAGCTATTATCCAATCAACT
TAAAGCAGTAAAACATAGACTGTTTGTTTGAACAATCAATCAACTCAATGTAGAAAGTAT
AGAATCAGATTTGCATGTTTGTTTGTTTCAGGATCTTCTCACCGTTTACAAAAGTTAAGA
AAATGATAACATAAATCTTTTCTCCTTGTTCAACTGAAAACCTCAGCGAACTTCTCAGAA
ACCAACACTCCTGAATCGATAGACTCCAATGGATCCTTCCTGAGACGGTGCCTCAAGCAG
TTAGGGATAACGGTTGCAACATCATCTGCAGTCACTCGGTCTTTTCCTTTGAGAGCTGCA
AGTGCTTTCGCTGCTCTGTTAGTCACAATGTCTCCTCTCAGCCCATCAACATTGAGCTCC
GAACACACCTTAAAGATCTTCACCTTCAACTCCCGGTCAATCTGAACAGAGGAAAGATTG
CTTCTCGCATTTGAAATCTGGTCTTGAAGCTTATCCTGCTCCGTTTTGTAAGTCTCACGG
AAATCCTGTGGGTTACTATCAAACCGAGCTCTCTCTTCAACAATCTTGACACGTAGTTCA
GCATCTCTAACCGTCCCTACTTGCGCATGCATACCAAACCTATCAAGAAGCTGTGGCCTA
AGCTCTCCCTCCTCAGGATTCCCGGAACCAATCAAGATAAACCTCGCCGGGTGAGAAATC
GAGATCCCTTCTCTCTAAACCGTGTTCCAACCGGAAGCAGCTGAATCAAGAAGCACATCA
ACCAAATGATCATCCAAGAGGTTGACTTCATCAACATAGAGTATCCCTCTGTTGGCTTTA
GCCAACAAGCCAGGCTCAAAGCTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TTTCGCCAATGCATGCCGCTTAGAACCACACAGCAATGGGGTATTCAAGACTATTAGAGG
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G

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TCGCATTTGAAATCTGGTCTTGAAGCTTATCCTGCTCCGTTTTGTAAGTCTCACGGAAAT
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TCCCTTCTCTCTAAACCGTGTTCCAACCGGAAGCAGCTGAATCAAGAAGCACATCAACCA
AATGATCATCCAAGAGGTTGACTTCATCAACATAGAGTATCCCTCTGTTGGCTTTAGCCA
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DS 



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ACACAGTATTTTCATTTATACTCTGTTCATACTTCCAAAGAACACAGTATTATCTGATTT
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C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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10 

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1CX46TF U 24
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GCTCTGCTCACGTTCGCTATCACGATACTTGCCTTCATCTGCGCGATCGCGTCCTTCTCT
GATAACTTCAGTAACCAAACACCCTCTGCTCAGATCCAGATATTGAATATCAATTGGTTT
CAGAAGCAACCCCATGGAAATGATGAGGTCAGCTTGACACTGAACATAACAGCAGACTTG
CAGTCACTATTTACTTGGAACACAAAGCAGGTATTCGCTTTCGTAGCAGCAGAGTATAAA
ACTTCAAAGAATTCTCTGAACCATGTTTCTCTATGGGATGCCATAATACCAGAGAAGGAG
CAAGCCAACTTCTGGATTCAAATCTCAAACAAGTACCGTTTCATAGACCAGGGACACAAC
CTGCGAGGGAAAGAGTTCAACTTGACACTGCACTGGCATGTCATGCCCAAGACTGGCAAG
ATGTTTGCTGACAAAATAGTCATGTCTGGTTATCGCCTACCGAATGCATACAGATGATTA
TGAAGAGGAGGAGGAGGCCTCATGCATATCATCTAGTAGTGAAGCGAGTTTATATCTCAG
TTTAAACATTGTTTTGTAATGGAACTTATTATGAGCTAATAACTTGTAGACTAATCCTTT
GGATTCACAAACTATAAACAATCCA

QA 1 745 1 745
DS 

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GG
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TAAAGAAGATGCATTCTTTCGGATACAGAGCGAATGCTCTGCTCACGTTCGCTATCACGA
TACTTGCCTTCATCTGCGCGATCGCGTCCTTCTCTGATAACTTCAGTAACCAAACACCCT
CTGCTCAGATCCAGATATTGAATATCAATTGGTTTCAGAAGCAACCCCATGGAAATGATG
AGGTCAGCTTGACACTGAACATAACAGCAGACTTGCAGTCACTATTTACTTGGAACACAA
AGCAGGTATTCGCTTTCGTAGCAGCAGAGTATAAAACTTCAAAGAATTCTCTGAACCAGG
TTTCTCTATGGGATGCCATAATACCAGAGAAGGAGCAAGCCAACTTCTGGATTCAAATCT
CAAACAAGTACCGTTTCATAGACCAGGGACACAACCTGCGAGGGAAAGAGTTCAACTTGA
CACTGCACTGGCATGTCATGCCCAAGACTGGCAAGATGTTTGCTGACAAAATAGTCATGT
CTGGTTATCGCCTACCGAATGCATACAGATGATTATGAAGAGGAGGAGGAGGCCTCATGC
ATATCATCTAGTAGTGAAGAGAGTTTATATCTCAGTTTAAACATTGTTTTGTAATGGAAC
TTATTATGAGCTAATAACTTGTAGACTAATCCTTTGGATTCACAAACTATAAA
AA

QA 3 715 3 715
DS 

RD RS1EW24TF 705 0 0
GG
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TAAAGAAGATGCATTCTTTCGGATACAGAGCGAATGCTCTGCTCACGTTCGCTATCACGA
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CTGCTCAGATCCAGATATTGAATATCAATTGGTTTCAGAAGCAACCCCATGGAAATGATG
AGGTCAGCTTGACACTGAACATAACAGCAGACTTGCAGTCACTATTTACTTGGAACACAA
AGCAGGTATTCGCTTTCGTAGCAGCAGAGTATAAAACTTCAAAGAATTCTCTGAACCAGG
TTTCTCTATGGGATGCCATAATACCAGAGAAGGAGCAAGCCAACTTCTGGATTCAAATCT
CAAACAAGTACCGTTTCATAGACCAGGGACACAACCTGCGAGGGAAAGAGTTCAACTTGA
CACTGCACTGGCATGTCATGCCCAAGACTGGCAAGATGTTTGCTGACAAAATAGTCATGT
CTGGTTATCGCCTACCGAATGCATACAGATGATTATGAAGAGGAGGAGGAGGCCTCATGC
ATATCATCTAGTAGTGAAGAGAGTTTATATCTCAGTTTAAACATTGTTTTGTAATGGAGC
TTATTATGAGCTAATAACTTGTAGACTAATCCTTTGGATTCAC

QA 3 705 3 705
DS 



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CAGACGAGTGATCTGAAGAAAGATGCATTCTTTCGGCTACAGAGCGAACGCACTGCTCAC
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TAACCAAACACCCTCTGCTCAGATCCAGATATTGAATATCAATTGGTTTCAGAAGCAACC
CCATGGAAATGATGAGGTCAGCTTGACACTGAACATAACAGCGGACTTGCAGTCACTATT
TACTTGGAACACAAAGCAGGTATTCGCTTTCGTAGCAGCAGAGTATAAAACCTCAAAGAA
TTCTCTGAACCAGGTTTCTCTATGGGATGCCATAATACCAGAGAAGGAGCAAGCCAACTT
CTGGATTCAAATCTCAAACAAGTACCGTTTCATAGACCAGGGACACAACCTCCGAGGGAA
AGAGTTCAACTTGACACTGCACTGGCATGTCATGCCCAAGACTGGCAAGATGTTTGCTGA
CAAGATAGTCATGTCTGGTTATCGCCTACCGAATGCATACAGATGATTTTGTGAAGAGTA
GTAGGCCTTCATGCATAATATCATCTAGTTGTGTGTTTTCAGTTGTTCAGTCGTTGAAAC
ATTGTTTTGTAATGGGAACTTATTATGAGGTAATAACTTGTAGACTAATCCTCTGGATTC
ACAAACTATAAAAAAAAATCCATAGAAAAACGAGAATCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GU44TF U 1
AF RS1GU44JQ C 1
BS 1 586 RS1GU44TF
BS 587 759 RS1GU44JQ

RD RS1GU44TF 586 0 0
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QA 1 586 1 586
DS 

RD RS1GU44JQ 759 0 0
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CCATGGAAATGATGAGGTCAGCTTGACACTGAACATAACAGCGGACTTGCAGTCACTATT
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AGAGTTCAACTTGACACTGCACTGGCATGTCATGCCCAAGACTGGCAAGATGTTTGCTGA
CAAGATAGTCATGTCTGGTTATCGCCTACCGAATGCATACAGATGATTTTGTGAAGAGTA
GTAGGCCTTCATGCATAATATCATCTAGTTGTGTGTTTTCAGTTGTTCAGTCGTTGAAAC
ATTGTTTTGTAATGGGAACTTATTATGAGGTAATAACTTGTAGACTAATCCTCTGGATTC
ACAAACTATAAAAAAAAATCCATAGAAAAACGAGAATCG

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 3

CO CL1537Contig1 979 3 7 U
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TCAAGAAAAGGCTTCTCCAAGAAGCGCAATTTGCGGAAAGGATCCCCACTAAACATATCC
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AAAAGCTTAAGACCCAAACCCCACAATTTTTTTCCACCAACTCCAACAATGCTACAGATA
TGCTCTAATTTCTTAGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C126JQ U 1
AF RS1AV92JQ U 19
AF RS1C126TF C 202
BS 1 725 RS1C126JQ
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BS 859 979 RS1C126TF

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ATAAAGGAACAGTGTATAAGCAAAAGCAACATAATTAAAATAATTTGTAGCATTTCTCCT
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GTCGGAAGAGGCCCGGACTCTAACATTTCCTCGGCGAATGGACCATCCAGCATAGGAGGA
ACGACAGACATTCCAAGTCCTTCAAAAGACTTTTGGGCAGTCTTCTCCAACAACGGATCT
TCGGAAAAGTATGTACAACATACCTTATCAACGCGAGCCTTGAACTCAGCCAGAGACGAG
CCTTCTTCTTCTAGAATCTTCTCTCCAGTTTGACAAATATAAGAGCTAAGGGCATCGTTG
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TGTCTATCATCCATTAGCTTCTCGAAACCCTTTTCAAGAATGGCACAAGCATGAACCCCC
AGGAGTTCCCTGTAGACAACTTCAAGCAGCTCATCCTGGAATATAAAGAAAAGGGAGAGG
CTTCTGCATTTTTTCTTCTCCTCACCAACCCTTCGATTGATATGTTTCAAATACAGGGAA
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TCAAG

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DS 

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GG
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CAAAAGCAACATAATTAAAATAATTTGTAGCATTTCTCCTTACTTAATGGGGGACTAGTA
GACATAATAAAAACACCCTTGTTAAAAACAGCGGTGACTTGTCGGAAGAGGCCCGGACTC
TAACATTTCCTCGGCGAATGGACCATCCAGCATAGGAGGAACGACAGACATTCCAAGTCC
TTCAAAAGACTTTTGGGCAGTCTTCTCCAACAACGGATCTTCGGAAAAGTATGTACAACA
TACCTTATCAACGCGAGCCTTGAACTCAGCCAGAGACGAGCCTTCTTCTTCTAGAATCTT
CTCTCCAGTTTGACAAATATAAGAGCTAAGGGCATCGTTGATATGATGCACTAAATCCGC
CTGGGAGAAGAGATCATACATGATACGAAGGGCCTCAAAGTGTCTATCATCCATTAGCTT
CTCGAAACCCTTTTCAAGAATGGCACAAGCATGAACCCCCAGGAGTTCCCTGTAGACAAC
TTCAAGCAGCTCATCCTGGAATATAAAGAAAAGGGAGAGGCTTCTGCATTTTTTCTTCTC
CTCACCAACCCTTCGATTGATATGTTTCAAATACAGGGAAATGTCAGAAGACTGTTCCAG
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CCTTGTC

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DS 

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CTCTACATTTCCTCGCGAT
GACCATCCAGCATAGGAGGAACGACAGACATTCCAAGTCCT*CAAAAGACTTT*GGGCAG
TCT*CTCCAACAACGGATCTTCGGAAAAGTATGTACAACATACCTTATCAACGCGAGC*T
TGAACTCAGCCAGAGACGAGCTTTCTTCTTCTAGAATCTTCTCTCCAGTTTGACAAATAT
AAGAGCTAAGGGCATCGTTGATATGATGCACTAAATCCGCCTGGGAGAAGAGATCATACA
TGATACGAAGGGCCTCAAAGTGTCTATCATCCATTAGCTTCTCGAAACCCTTTTCAAGAA
TGGCACAAGCATGAACCCCCAGGAGTTCCCTGTAGACAACTTCAAGCAGCTCATCCTGGA
ATATAAAGAAAAGGGAGAGGCTTCTGCATTTTTTCTTCTCCTCACCAACCCTTCGATTGA
TATGTTTCAAATACAGGGAAATGTCAGAAGACTGTTCCAGGACTTGTTTTGCTTCTGCGG
CATAAAACTCAGCAGTGGAGTCAAGAAAAGGCTTCTCCAAGAAGCGCAATTTGCGGAAAG
GATCCCCACTAAACATATCCATAAGATTCTTTAGCTGACTCATGTTAACAGGCTTGCCTA
ATCTTTGATCTGTAATGAGATGCAGAATGATGGTTCGAACCTTGTCGCAAATTTGAGGGA
CCAAGAAGAGCTTTGTGGGTAAAAGCTTAAGACCCAAACCCCACAATTTTTTTCCACCAA
CTCCAACAATGCTACAGATATGCTCTAATTTCTTAGGAC

QA 20 778 20 778
DS 



AS 1 3

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GGCTGTTCCGATGGTTAACGATGATCAGGTGCTGATCAAGGTAGTTGCGGCGGCTCTTAA
TCCCGTCGACGGTAAGAGACGGCAAGGAAAGTTCAAAGCCACCGATTCTCCTCTCCCGAC
GGTTCCAGGATACGACGTAGCCGGAGTGGTGGTGAAGGTGGGAAGCGCGGTGAAAGAATT
CAAAGAAGGAGACGAAGTATACGCGAACGTGAGCGAGAAAGCATTAGAAGGACCGAAGCA
ATCCGGTTCTCTGGCGGAGTACACTGCCGTGGAAGAGAAGCTATTAGCCTTAAAGCCTAA
AAACATCGATTTCGCTCAAGCAGCAGGGCTTCCACTGGCTATAGAAACCGCCGACGAAGG
TCTCGTTAGAACGGAGTTCTCCACCGGAAAATCAATTCTCGTCCTCAACGGCGCCGGAGG
AGTAGGAAGCCTTGCGATTTAGCTTGCGAAGCACGGCTATGTAGCTTCGAAGGTTGCTGC
AACAGCGAGCACTGGGAAGCTAGAGCTAGTGAGAAGCTTAGGTGCTGATTTAGCTATTGA
TTACACTAAGGAGAACATTGAAGACTTGACTGGGAAATTCGATGTCGTCTTTGACGCCAT
TGGGATGTGTGATAAGGCGGTGAAAGTGATTAAAGAAGGAGGGAAGGTTGTGGCATTGAC
CGGAGCTGTCACGCCTCCTGGTTTCAGATTCGTTGTGACATCTAACGGCGATGTTTTGAA
GAAACTGAATCCATACATTGAGAGTGGGAAGGTGAAGCCTGTGGTTGACCCTAAAGTACC
TTTCCCATTTTCGCGCGTGGCTGATGCTTTCTCATACATAGAAACGAACCATGCCACAGG
AAAGGTCGTTGTATATCCTATCCCTTGAGTTGCTTAAGTCTATAGCCTTATTTGTATGCA
AGCAAATATCAAAAGTCCTTGTAGAGTGTTTTGAGTTATGAACTCATATGAATATGGAAA
ACTAAAAAATGCTATTTGTGGCTTATTCATTACAGAACATATGAGACTAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E445TF U 78
AF RS1FR91TF U 1
AF RS1FR91JQ C 229
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BS 816 1012 RS1FR91JQ

RD RS1E445TF 533 0 0
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QA 1 533 1 533
DS 

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TCTCGTTAGAACGGAGTTCTCCACCGGAAAATCAATTCTCGTCCTCAACGGCGCCGGAGG
AGTAGGAAGCCTTGCGATTTAGCTTGCGAAGCACGGCTATGTAGCTTCGAAGGTTGCTGC
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CGGAGCTGTCACGCCTCCTGGTTTCAGATTCGTTGTGACATCTAACGGCGATGTTTTGAA
GAA*CTGAATCCATACATTGAGAGTGGGAAG*TGAAGCCTGTGGTTGACC*TAAAGTACC
TTTCCCATTT*CGCGCGTGGCTGATGCTTTCTCAT

QA 1 815 1 815
DS 

RD RS1FR91JQ 784 0 0
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CTTAAAGCCTAAAAACATCGATTTCGCTCAAGCAGCAGGGCTTCCACTGGCTATAGAAAC
CGCCGACGAAGGTCTCGTTAGAACGGAGTTCTCCACCGGAAAATCAATTCTCGTCCTCAA
CGGCGCCGGAGGAGTAGGAAGCCTTGCGATTTAGCTTGCGAAGCACGGCTATGTAGCTTC
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TTTAGCTATTGATTACACTAAGGAGAACATTGAAGACTTGACTGGGAAATTCGATGTCGT
CTTTGACGCCATTGGGATGTGTGATAAGGCGGTGAAAGTGATTAAGGAAGGAGGGAAGGT
TGTGGCATTGACCGGAGCTGTCACGCCTCCTGGTTTCAGATTCGTTGTGACATCTAACGG
CGATGTTTTGAAGAAACTGAATCCATACATTGAGAGTGGGAAGGTGAAGCCTGTGGTTGA
CCCTAAAGTACCTTTCCCATTTTCGCGCGTGGCTGATGCTTTTTCATACATAGAAACGAA
CCATGCCACAGGAAAGGTCGTTGTATATCCTATCCCTTGAGTTGCTTAAGTCTATAGCCT
TATTTGTATGCAAGCAAATATCAAAAGTCCTTGTAGAGTGTTTTGAGTTATGAACTCATA
TGAATATGGAAAACTAAAAAATGCTATTTGTGGCTTATTCATTACAGAACATATGAGACT
AGAG

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 5

CO CL1539Contig1 931 5 2 U
CATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATCAGTCGACGGTACCGGACATATGCC
CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGAGGGAAGAGAGATAGAGAGAGAC***CGGAGAAGATG
AAGGAGGAAACGGCCATGGAAGAGCCAGAGAGGAAGATCCCGAGGAAGATAGCGAGCCTG
GATGATGATAAGCTCTGGGCAGGATTTAAATGGGAGGAAACAGATAAGATCTTGAGTGGT
GAAATCAAACCCAAAACCTTGATCACTACCTACCATATGTCCCCATCTTCTACACGATAT
CCTGAGAGGGGACCATTTCTTGCGAGAGAGATGGAAGCGGTGTTCCCCAATTCTAAATAC
ATGACCAGAGAGCCCAACGAAATGCTTGATTCTATCATAGCATTAGCGAGAAAGAATGAT
TGTACATCTCTCATCCTCGCTCGTTCAAATTCTCCCAGAGAGGATATAATCTATATCCTA
AACTTGCTGAATAATGCCACCGCTGTGTTTAGGGTTATTGATCTCGTCCCACGGGAGGAT
ATTCCGAATCGGTCTGATCCCATTAGTGCCCTCTACCCGAGTATTCAGATGAGAGGTTTT
GAGTCTCCTGCCAGTGTTGGCACTGCCAAAATGATACAAGCTCTCTTCCCCTGTGTCCCT
CCTGTCCGTGGTCGAAGGAGTATTGCATGGTTCGAGAAGCAAAAAAACTATATCTTTTTC
CGACATTCTGGTTACTTCAAAAAGGAAACCGTTGAAGGACAACCTCCTCCTAGTGTTCCC
ATGCTGATAAAGGGAATGTGGACCTCGTTTTGCGCTCCAGTTCACTGGTTTACATTTATT
TGATGCTCACAACCTAGACTTCTATCCCGGTTTGCTTGCCGGATATAACTTGGACGACTC
GATTAAAACCACTTCCTCTGCGCTGAACACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GO13TF U 86
AF RS1A373TF U 1
AF RS1A373TV U 37
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CAGAGAGGAAGATCCCGAGGAAGATAGCGAGCCTGGATGATGATGAGCTCTGGGCAGGAT
TTAAATGGGAGGAAACAGATAAGATCTTGAGTGGTGAAATCAAACCCAAAACCTTGATCA
CTACCTACCATATGTCCCCATCTTCTACACGATATCCTGAGAGGGGACCATTTCTTGCGA
GAGAGATGGAAGCGGTGTTCCCCAATTCTAAATACATGACCAGAGAGCCCAACGAAATGC
TTGATTCTATCATAGCATTAGCGAGAAAGAATGATTGTACATCTCTCATCCTCGCTCGTT
CAAATTCTCCCAGAGAGGATATAATCTATATCCTAAACTTGCTGAATAATGCCACCGCTG
TGTTTAGGGTTATTGATCTCGTCCCACGGGAGGATATTCCGAATCGGTCTGATCCCATTA
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AAACCGTTGAAG*ACAACCTCCTCCTAG

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CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGAGGGAAGAGAGATAGAGAGAGAC***CGGAGAAGATG
AAGGAGGAAACGGCCATGGAAGAGCCAGAGAGGAAGATCCCGAGGAAGATAGCGAGCCTG
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GAAATCAAACCCAAAACCTTGATCACTACCTACCATATGTCCCCATCTTCTACACGATAT
CCTGAGAGGGGACCATTTCTTGCGAGAGAGATGGAAGCGGTGTTCCCCAATTCTAAATAC
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TGTACATCTCTCATCCTCGCTCGTTCAAATTCTCCCAGAGAGGATATAATCTATATCCTA
AACTTGCTGAATAATGCCACCGCTGTGTTTAGGGTTATTGATCTCGTCCCACGGGAGGAT
ATTCCGAATCGGTCTGATCCCATTAGTGCCCTCTACCCGAGTATTCAGATGAGAGGTTTT
GAGTCTCCTGCCAGTGTTGGCACTGCCAAAATGATACAAGCTCTCTTCCCCTGTGTCCCT
CCTGTCCGTGGTCGAAGGAGTATTGCATGGTTCGAGAAGCAAAAAAACTATATCTTTTTC
CGACATTCTGGTTACTTCAAAAAGGAAACCGTTGAAGGACAACCTCCTCCTAGTGTTCCC
ATGCTGATAAAGGGAATGTGGACCTCGTTTTGCGCTCCAGTTCACTGGTTTACATTTATT
TGATGCTCACAACCTAGACTTCTATCCCGGTTTGCTTGCCGGATA

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AGAGAGAGAC***CGGAGAAGATGAAGGAGGAAACGGCCATGGAAGAGCCAGAGAGGAAG
ATCCCGAGGAAGATAGCGAGCCTGGATGATGATAAGCTCTGGGCAGGATTTAAATGGGAG
GAAACAGATAAGATCTTGAGTGGTGAAATCAAACCCAAAACCTTGATCACTACCTACCAT
ATGTCCCCATCTTCTACACGATATCCTGAGAGGGGACCATTTCTTGCGAGAGAGATGGAA
GCGGTGTTCCCCAATTCTAAATACATGACCAGAGAGCCCAACGAAATGCTTGATTCTATC
ATAGCATTAGCGAGAAAGAATGATTGTACATCTCTCATCCTCGCTCGTTCAAATTCTCCC
AGAGAGGATATAATCTATATCCTAAACTTGCTGAATAATGCCACCGCTGTGTTTAGGGTT
ATTGATCTCGTCCCACGGGAGGATATTCCGAATCGGTCTGATCCCATTAGTGCCCTCTAC
CCGAGTATTCAGATGAGAGGTTTTGAGTCTCCTGCCAGTGTTGGCACTGCCAAAATGATA
CAAGCTCTCTTCCCCTGTGTCCCTCCTGTCCGTGGTCGAAGGAGTATTGCATGGTTCGAG
AAGCAAAAAAACTATATCTTTTTCCGACATTCTGGTTACTTCAAAAAGGAAACCGTTGAA
GGACAACCTCCTCCTAGTGTTCCCATGCTGATAAAGGGAATGTGGACCTCGTTTTGCGCT
CCAGTTCACTGGTTTACATTTATTTGATGCTCACAACCTAGACTTCTATCCCGGTTTGCT
TGCCGGATATAACTTGGACGACTCGATTAAAACCACTTCCTCTGCGCTGAACACC

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CCAGAGAGCCCAACGAAATGCTTGATTCTATCATAGCATTAGCGAGAAAGAATGATTGTA
CATCTCTCATCCTCGCTCGTTCAAATTCTCCCAGAGAGGATATAATTTATATCCTAAACT
TGCTGAATAATGCCACCGCTGTGTTTAGGGTTATTGATCTCGTCCCACGGGAGGATATTC
CGAATCGGTCTGATCCCATTAGTGCCCTCTACCCGAGTATTCAGATGAGAGGTTTTGAGT
CTCCTGCCAGTGTTGGCACTGCCAAAATGATACAAGCTTTCTTCCCCTGTGTCCCTCCTG
TCCGTGGTCGAAGGAGTATTGCATGGTTCGAGAAGCAAAAAAACTATATCTTTTTCCGAC
ATTCTGGTTACTTCAAAAAGGAAACCGTTGAAGGACAACCTCCTCCTAGTGTTCCCATGC
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GCTCACAACCTAGACTTCTATCC*GGTTTGCTTGCCGGATATAACTTGGACGACTCGATT

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DS 

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AGAGAGCCCAACGAAATGCTTGATTCTATCATAGCATTAGCGAGAAAGAATGATTGTACA
TCTCTCATCCTCGCTCGTTCAAATTCTCCCAGAGAGGATATAATCTATATCCTAAACTTG
CTGAATAATGCCACCGCTGTGTTTAGGGTTATTGATCTCGTCCCACGGGAGGATATTCCG
AATCGGTCTGATCCCATTAGTGCCCTCTACCCGAGTATTCAGATGAGAGGTTTTGAGTCT
CCTGCCAGTGTTGGCACTGCCAAAATGATACAAGCTTTCTTCCCCTGTGTCCCTCCTGTC
CGTGGTCGAAGGAGTATTGCATGGTTCGAGAAGCAAAAAAACTATATCTTTTTCCGACAT
TCTGGTTACTTCAAAAAGGAAACCGTTGAAGGACAACCTCCTCCTAGTGTTCCCATGCTG
ATAAAGGGAATGTGGACCTCGTTTTGCGCTCCAGTTCACTGGTTTACATTTATTTGATGC
TCACAACCTAGACTTCTATCC*GGTTTGCTTGCCGGATATAACTTGGACGACTCGATTAA
AACCACTT

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DS 



AS 1 5

CO CL1540Contig1 1342 5 25 U
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TAAGAGATGAATTGCCTTCAGAATCTTACTAGATCTTCAGTCTCACCTTTGTTGGGGAGC
TTTGGAGGCAATCACAGAGATCCTTCTTGGTCTTCCTTGAAGATGATGCTACCAATCAAA
GCCAATGATCCTAAATGTCGACTTGTTTTACAGGCTGTATCAGACAGCGCAGAGATGAGT
GGTGTTTCAAAGAAGGAGGAAGTGAAATCTGATGAATATAGCCAAGACATGACTCAAGCT
ATGGGTGCTGTATTAACATACAGGCACGAGCTAGGAATGAACTACAACTTCCTTCGTCCA
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ATAAAGAGCATTCAAGCATATGCTAAGACATTTACTGATATTGAGCATATTCGCTGTGAA
ATAAGAGACTTTGATGCATTTGATTTGAGAATGCGTCTTCCTGCTGTGCTTAGTACACTG
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AGGGCTCCTGCTGTTGCGTTGACATACATGTTCTGGGTGCAAGGCTATAAACTTATGGAT
GCTCATAAAATACTTATGAGCAAACGAACGTGCTTCCCGAAGCTGGATGCTATCAGAAAT
GCAACAATTGATATTCTTACAGGACTCAAGAAGAAGTATGTTACTCTGACACTGAAAGAC
AAGGGTTTCTCCACTGTAGAAATTTCTGGCCTTGACATCGGATGGGGACAGAGGATACCT
CTGACACTGGACAAGGGAACAGGATTCTGGAGCCTGAAGAGAGAATTGCCTGAGGGACAG
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GGACCTAACAAAGATGGCCATACCAATAATTACGCAAAAGTAGTGTATGATC*AACGAGT
GTGGATGGTACAACTCGGGAGAGGTTAACAAAGGAAGACCCTGAGCTTTTGGAGGACGAA
CGCTCGAAGCTAATCCAGTTCTTGGAGACTTCTTCTGAGGCAGAAGTTTGAGGTTGTAAG
TCTGTGAATGTACCCCTTACTAGTAACAATAAAATGCTTTATGTAGGTCATACATAAAGT
TATGTTTATAGGGAAAAAGAAGCATAAAGCTAGTTGTATTGTACCATGTTCAAGTATAAT
AATATTACATAAGACTTTAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1AT10TF U 1
AF RS1A451TF U 24
AF RS1CZ39TF U 512
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AF RS1CZ39JQ C 610
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TAAGAGATGAATTGCCTTCAGAATCTTACTAGATCTTCAGTCTCACCTTTGTTGGGGGGC
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GCCAATGATCCTAAATGTCGACTTGTTTTACAGGCTGTATCAGACAGCGCAGAGATGAGT
GGTGTTTCAAAGAAGGAGGAAGTGAAATCTGATGAATATAGCCAAGACATGACTCAAGCT
ATGGGTGCTGTATTAACATACAGGCACGAGCTAGGAATGAACTACAACTTCCTTCGTCCA
GATTTAATCGTTGGATCTTGCTTACAGACTCCTGAAGATGTTGACAAGCTCCGTGAGATT
GGTGTTAAAACCATATTCTGCTTGCAACAAGATCCTGACTTGGAATATTTTGGAGTAGAT
ATAAAGAGCATTCAAGCATATGCTAAGACATTTACTGATATTGAGCATATTCGCTGTGAA
ATAAGAGACTTTGATGCATTTGATTTGAGAATGCGTCTTCCTGCTGTGCTTAGTACACTG
TACAAAGCTGTTAAGCGAAATGGAGGAGTTACATACGTCCACTGCACTGCTGGTATGGGA
AGGGCTCCTGCTGTTGCGTTGACATACATGTTCTGGGTGCAAG
CTA

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DS 

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TTCTTGGTCTTCCTTGAAGATGATGCTACCAATCAAAGCCAATGATCCTAAATGTCGACT
TGTTTTACAGGCTGTATCAGACAGCGCAGAGATGAGTGGTGTTTCAAAGAAGGAGGAAGT
GAAATCTGATGGATATAGTCAAGACATGACTCAAGCTATGGGTGCTGTATTAACATACAG
GCACGAGCTAGTAATGAACTACAACTTCCTTCGTCCAGATTTAATCGTTGGATCTTGCTT
ACAGACTTCTGAAGATGTTGACAAGCTCCGTAAGATTGGTGTTAAAACCATATTCTGCTT
GCAACAAGATCCTGACTTGGAATATTTTGGAGTAGATATAAAGAGCATTCAAGCATATGC
TAAGACATTTACTGATATTGAGCATATTCGCTGTGAAATAAGAGACTTTGATGCATTTGA
TTTGAGAATGCGTCTTCCTGCTGTGCTTAGTACACTGTACAAAGCTGTTAAGCGAAATGG
AGGAGTTACATACGTCCACTGCACTGCTGGTATGGGAAGGGCTCCTGCTGTTGCGTTGAC
ATACATGTTCTGGGTGCAAG*CTATAAACTTATGGATGCTCATAAAATACTTATGAGCAA
ACGAACGTGCTTCCCGAAGCTGGATGCTATCAGAAATGCAACAATTGATATTCTTACAG*
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TTCTG
CTGAC

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DS 

RD RS1CZ39TF 698 0 0
G
TACTGATATTGAGCATATTCGCTGTGAAATAAGAGACCTTGATGCATTTGATTTGAGAAT
GCGTCTTCCTGCTGTGCTTAGTACACTGTACAAAGCTGTTAAGCGACATGGAGGAGTTAC
ATACGTCCACTGCACTGCTGGTATGGGAAGGGCTCCTGCTGTTGCGTTGACATACATGTT
CTGGGTGCAAGGCTATAAACTTATGGATGCTCATAAAATACTTATGAGCAAACGAACGTG
CTTCCCGAAGCTGGATGCTATCAGAAATGCAACAATTGATATTCTTACAGGACTCAAGAA
GAAGTATGTTACTCTGACACTGAAAGACAAGGGTTTCTCCACTGTAGAAATTTCTGGCCT
TGACATCGGATGGGGACAGAGGATACCTCTGACACTGGACAAGGGAACAGGATTCTGGAG
CCTGAAGAGAGAATTGCCTGAGGGACAGTTTGAATATAAATATATCATAGATGGGGAATG
GAGACACAATGAGCTCGAGCCGTTTACAGGACCTAACAAAGATGGCCATACCAATAATTA
CGCAAAAGTAGTGTATGATC*AACGAGTGTGGATGGTACAACTCGGGAGAGGTTAACAAA
G*AAGACCCTGAGCTTTTGGAGGACGAACGCTCGAAGCTAATCCAGTTCTTGGAGACTTC
TTCTGAG*CAGAAGTTTGAG*TTGTAAGTCTGTGA
TG

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DS 

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TAAAGAGCATTCAAGCATATGCTAAGACATTTACTGATATTGAGCATATTCGCTGTGAAA
TAAGAGACTTTGATGCATTTGATTTGAGAATGCGTCTTCCTGCTGTGCTTAGTACACTGT
ACAAAGCTGTTAAGCGAAATGGAGGAGTTACATACGTCCACTGCACTGCTGGTATGGGAA
GGGCTCCTGCTGTTGCGTTGACATACATGTTCTGGGTGCAAGGCTATAAACTTATGGATG
CTCATAAAATACTTATGAGCAAACGAACGTGCTTCCCGAAGCTGGATGCTATCAGAAATG
CAACAATTGATATTCTTACAGGACTCAAGAAGAAGTATGTTACTCTGACACTGAAAGACA
AGGGTTTCTCCACTGTAGAAATTTCTGGCCTTGACATCGGATGGGGACAGAGGATACCTC
TGACACTGAACAAGGGAACAGGATTCTGGAGCCTGAAGAGAGAATTGCCTGAGGGACAGT
TTGAATATAAATATATCATAGATGGGGAATGGAGACACAATGAGCTCGAGCCGTTTACAG
GACCTAACAAAGATGGCCATACCAATAATTACGCAAAAGTAGTGTATGATCCAACGAGTG
TGGATGGTGCAACTCGGGAGAGGTTAACAAAGGAAGACCCTGAGCTTTTGGAGGACGAAC
GCTCGAAGCTAATCCAGTTCTTGGAGACTTCTTCTGAGGCAGAAGTTTGAGGTTGTAAGT
CTGTGAATGTACCCCTTACTAGTAACAATAAAATGCTTTATGTAGGTCATACATAAAGTT
ATGTTTATAGGGAAAAAGAAGCATAAAGCTAGTTGTATTGTACCATGTTCAAGTATAATA
ATATTACATAAGACTTTAACC

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DS 

RD RS1CZ39JQ 733 0 0
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GCTGTTGCGTTGACATACATGTTCTGGGTGCAAGGCTATAAACTTATGGATGCTCATAAA
ATACTTATGAGCAAACGAACGTGCTTCCCGAAGCTGGATGCTATCAGAAATGCAACAATT
GATATTCTTACAGGACTCAAGAAGAAGTATGTTACTCTGACACTGAAAGACAAGGGTTTC
TCCACTGTAGAAATTTCTGGCCTTGACATCGGATGGGGACAGAGGATACCTCTGACACTG
GACAAGGGAACAGGATTCTGGAGCCTGAAGAGAGAATTGCCTGAGGGACAGTTTGAATAT
AAATATATCATAGATGGGGAATGGAGACACAATGAGCTCGAGCCGTTTACAGGACCTAAC
AAAGATGGCCATACCAATAATTACGCAAAAGTAGTGTATGATC*AACGAGTGTGGATGGT
ACAACTCGGGAGAGGTTAACAAAGGAAGACCCTGAGCTTTTGGAGGACGAACGCTCGAAG
CTAATCCAGTTCTTGGAGACTTCTTCTGAGGCAGAAGTTTGAGGTTGTAAGTCTGTGAAT
GTACCCCTTACTAGTAACAATAAAATGCTTTATGTAGGTCATACATAAAGTTATGTTTAT
AGGGAAAAAGAAGCATAAAGCTAGTTGTATTGTACCATGTTCAAGTATAATAATATTACA
TAAGACTTTAACC

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 5

CO CL1541Contig1 960 5 16 U
GGGCGTGATTTCTCGATAGATTCTAGGGTTTCTATCTGGGAACACTTTCGCTTCCTGGGT
GTTGTTGTTGATCTAGGAGGGTTTAGGATATAAAAAAGTCTGTATCTTTCGTGGAATAAA
AGATGTATGCTGATAGATTGGAGTCTGAGTCTGGAACCAGGAAACTCGTAAAAGATCGAA
TCAATGGCGGTTCTAGCGATAACTCTACTTCCTCCCGAAAATTGACTGGAAAAAGGCAAA
GGCAGGACGACGATAAATGGGAGCATGATCTTTTCAGTAGTGACAAGCCTCAACTCTCAA
ATCGCAGAGTTGATTCTAGAGACCTTCGCGTGAAGCTCCAGAAGAGACATCACGGGTCTC
AAAGCGGCCGAGAAGGTGGCTCAGGCGTGCGGGATTTAAGGGAAAAGCTCTCTGGGACAA
TGAGTATGCAACCAAAATCTAAAGTGGAGACTGCTAAACCAAGCTTGAAGAGTGTAGTGA
CTGAAACTGTAACAGAGACTACTAGAAAAACTTCAAGTCAAGCTACCAGGAAGAAGTCAC
AGCAGGCTGGTGCATCTGTTGATAGCTTTCTGGAATCATTGGGTCTTGAGAAATATTCAA
CAGCTTTTCAAGTGGAAGAAGTTGATATGGATGCTCTCATGCATATGACAGATGATGACC
TTAAGGCTATGCTTATACCAATGGGCCCGAGGAAGAAGATACTTCTTGCTTTGGGATCCA
AACGCTAATAGTTTAGTGTCTTTCGCTTGATGGCTTTCAAGCTCGGCTGAACGGTCTCAG
TCAGGAAGTCGTTATTACATTAAGATATTGTCGAAATGATTCCCGGATATGGCTTTCTTT
TTTTCTCGTATTCTTTCAAGGTGGTCAGAATTTTGGCGGTTGACATCTGTAATGTTAAAT
ATAGTGTGACAAACACTACTAGTTTGCACCACTTTTGATGTGAGAAAAGTTTCTAAGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EW41TF U 74
AF RS1B878TF U 1
AF RS1BP10TF U 99
AF RS1EW41JQ C 71
AF RS1B878JQ C 177
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BS 800 930 RS1EW41JQ
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RD RS1EW41TF 588 0 0
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TAGATTGGAGTCTGAGTCTGGAACCAGGAAACTCGTAAAAGATCGAATCAATGGCGGTTC
TAGCGATAACTCTACTTCCTCCCGAAAATTGACTGGAAAAAGGCAAAGGCAGGACGACGA
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ATCTGTTGATAGCTTTCTGGAATCATTGGGTCTTGAGAAATATTCAACAGCTTTTCAAGT
GGAAGAAGTTGATATGGATGCTCTCATGCATATGACAGATGATGACCT

QA 1 588 1 588
DS 

RD RS1B878TF 753 0 0
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GTTGTTGTTGATCTAGGAGGGTTTAGGATATAAAAA*GTCTGTATCTTTCGTGGAATAAA
AGATGTATGCTGATAGATTGGAGTCTGAGTCTGGAACCAGGAAACTCGTAAAAGATCGAA
TCAATGGCGGTTCTAGCGATAACTCTACTTCCTCCCGAAAATTGACTGGAAAAAGGCAAA
GGCAGGACGACGATAAATGGGAGCATGATCTTTTCAGTAGTGACAAGCCTCAACTCTCAA
ATCGCAGAGTTGATTCTAGAGACCTTCGCGTGAAGCTCCAGAAGAGACATCACGGGTCTC
AAAGCGGCCGAGAAGGTGGCTCAGGCGTGCGGGATTTAAGGGAAAAGCTCTCTGGGACAA
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CTGAAACTGTAACAGAGACTACTAGAAAAACTTCAAGTCAAGCTACCAGGAAGAAGTCAC
AGCAGGCTGGTGCATCTGTTGATAGCTTTCTGGAATCATTGGGTCTTGAGAAATATTCAA
CAGCTTTTCAAGTGGAAGAAGTTGATATGGATGCTCTCATGCATATGACAGATGATGACC
TTAACGCTATGCTTATACCAATGGGCCCGAGGAAGAAGATACTTCTTGCTTTGGGATCCG
A*CGCTAATAGTTTAGTGTCTTTCGCTTGATGG

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1BP10TF 701 0 0
TCTGTA
TCTTTCGTGGAATAAAAGATGTATGCTGATAGATTGGAGTCTGAGTCTGGAACCAGGAAA
CTCGTAAAAGATCGAATCAATGGCGGTTCTAGCGATAACTCTACTTCCTCCCGAAAATTG
ACTGGAAAAAGGCAAAGGCAGGACGACGATAAATGGGAGCATGATCTTTTCAGTAGTGAC
AAGCCTCAACTCTCAAATCGCAGAGTTGATTCTAGAGACCTTCGCGTGAAGCTCCAGAAG
AGACATCACGGGTCTCAAAGCG*CCGAGAAGGTGGCTCAGGCGTGCGGGATTTAAGGGAA
AAGCTCTCTGGGACAATGAGTATGCAACCAAAATCTAAAGTGGAGACTGCTAAACCAAGC
TTGAAGAGTGTAGTGACTGAAACTGTAACAGAGACTACTAGAAAAACTTCAAGTCAAGCT
ACCAGGAAGAAGTCACAGCAGGCTGGTGCATCTGTTGATAGCTTTCTGGAATCATTGGGT
CTTGAGAAATATTCAACAGCTTTTCAAGTGGAAGAAGTTGATATGGATGCTCTCATGCAT
ATGACAGATGATGACCTTAAGGCTATGCTTATACCAATGGGCCCGAGGAAGAAGATACTT
CTTGCTTTGGGATCCAAACGCTAATAGTTTAGTGTCTTTCGCTTGATGGCTTTCAAGCTC
GGCTGA*CGGTCTCAGTCAG*AAGTCGTTATTACA

QA 7 701 7 701
DS 

RD RS1EW41JQ 860 0 0
ATC
TAGGAGGGTTTAGGATATAAAAAAGTCTGT*TCTTTCGTGGAATAAAAGATGTATGCTGA
TAGATTGGAGTCTGAGTCTGGAACCAGGAAACTCGTAAAAGATCGAATCAATGGCGGTTC
TAGCGATAACTCTACTTCCTCCCGAAAATTGACTGGAAAAAGGCAAAGGCAGGACGACGA
TAAATGGGAGCATGATCTTTTCAGTAGTGACAAGCCTCAACTCTCAAATCGCAGAGTTGA
TTCTAGAGACCTTCGCGTGAAGCTCCAGAAGAGACATCACGGGTCTCAAAGCGGCCGAGA
AGGTGGCTCAGGCGTGCGGGATTTAAGGGAAAAGCTCTCTGGGACAATGAGTATGCAACC
AAAATCTAAAGTGGAGACTGCTAAACCAAGCTTGAAGAGTGTAGTGACTGAAACTGTAAC
AGAGACTACTAGAAAAACTTCAAGTCAAGCTACCAGGAAGAAGTCACAGCAGGCTGGTGC
ATCTGTTGATAGCTTTCTGGAATCATTGGGTCTTGAGAAATATTCAACAGCTTTTCAAGT
GGAAGAAGTTGATATGGATGCTCTCATGCATATGACAGATGATGACCTTAAGGCTATGCT
TATACCAATGGGCCCGAGGAAGAAGATACTTCTTGCTTTGGGATCCAAACGCTAATAGTT
TAGTGTCTTTCGCTTGATGGCTTTCAAGCTCGGCTGAACGGTCTCAGTCAGGAAGTCGTT
ATTACATTAAGATATTGTCGAAATGATTCCCGGATATGGCTTTCTTTTTTTCTCGTATTC
TTTCAAGGTGGTCAGAATTTTGGCGGTTGACATCTGTAATGTTAAATATAGTGTGACAAA
CACTACTAGTTTGCACC

QA 4 860 4 860
DS 

RD RS1B878JQ 784 0 0
ATCGAATCAATGCGG
TCTAGCGATAACTCTACTTCCTCCCGAAA*TTGACTGGAAAAAGGCAAAGGCAGGACGAC
GATAAATGGGAGCATGATCTTTTCAGTAGTGACAAGCCTCAACTCTCAAATCGCAGAGTT
GATTCTAGAGACCTTCGCGTGAAGCTCCAGAAGAGACATCACGGGTCTCAAAGCGGCCGA
GAAGGTGGCTCAGGCGTGCGGGATTTAAGGGAAAAGCTCTCTGGGACAATGAGTATGCAA
CCAAAATCTAAAGTGGAGACTGCTAAACCAAGCTTGAAGAGTGTAGTGACTGAAACTGTA
ACAGAGACTACTAGAAAAACTTCAAGTCAAGCTACCAGGAAGAAGTCACAGCAGGCTGGT
GCATCTGTTGATAGCTTTCTGGAATCATTGGGTCTTGAGAAATATTCAACAGCTTTTCAA
GTGGAAGAAGTTGATATGGATGCTCTCATGCATATGACAGATGATGCCCTTAAGGCTATG
CTTATACCAATGGGCCCGAGGAAGAAGATACTTCTTGCTTTGGGATCCGAACGCTAATAG
TTTAGTGTCTTTCGCTTGATGGCTTTCAAGCTCGGCTGAACGGTCTCAGTCAGGAAGTCG
TTATTACATTAAGATATTGTCGAAATGATTCCCGGATATGGCTTTCTTTTTTTCTCGTAT
TCTTTCAAGGTGGTCAGAATTTTGGCGGTTGACATCTGTAATGTTAAATATAGTGTGACA
AACACTACTAGTTTGCACCACTTTTGATGTGAGAAAAGTTTCTAAGTTC

QA 16 784 16 784
DS 



AS 1 4

CO CL1542Contig1 780 4 6 U
GTGGCATTGCCTGGTTGTTCTACCACGCTCTCCTTGCTCGGCACTGGGTTTAGGGAGAAG
AAGTTTGCTATCATTGGCGTCAAAGTCTATGCTGCGGGTTTGTATGTCGATGAATCTATC
TTGAGCGGGCTAATCCCTTGGAAAGGGAAGTCTGCTGATGAGATTCAAAGAGATTCATCA
CTCTTTAGTTCAATCTTTCAAGATCAAGCAGAGAAGTCACTGCAGATTGTTCTTGTGAGA
GATGTTGATGGCAAAACCTT*CTGGGGATGCATTGGACGAAGCCATTTCACCTAGAATCA
AATCTCCTTCATCTGATGATAAAACCGCTCTCTCTACATTCCGAGGGATCTTTCAAAACA
GACCTCTCAACAAAGGAAGTGTCATTCTCTTGACTTGGATCAATCCTTCTAAAATGCTTG
TTTCTGTTTCTTCTGGAGGGTTGCCAAAGGATGTGGATGCAGAGATCGAGTCAGGTAGTG
TTACATCTGCTTTGTTTGATGTGTTCTTTGGAGACTCTCCTGTCTCTCCTACATTGAAAT
CTTCAGTGGCTAACCAATTAGCTATGGTCCTCAAGTAAACACTCTAAATGTAACATATCA
TGTTGTAATATGAATATCTTGAATCGTGTAATGTGTTAGGTCTATGTTTGTATTATCGTT
TATAACCAGATAAAGACACCATGTTTTGAGCTTAAAAATGATGTATCTTTTGAAATTTTC
ATTGATACTAAGCCATTTTATTTTGTATATTGACCTCATTAAGCCTAAATTTTTTATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BL50TF U 1
AF RS1BK64TF U 233
AF RS1BL50JQ C 91
AF RS1BK64JQ C 80
BS 1 309 RS1BL50TF
BS 310 310 RS1BK64TF
BS 311 413 RS1BL50TF
BS 414 414 RS1BK64JQ
BS 415 428 RS1BL50TF
BS 429 780 RS1BK64JQ

RD RS1BL50TF 428 0 0
GTGGCATTGCCTGGTTGTTCTACCACGCTCTCCTTGCTCGGCACTGGGTTTAGGGAGAAG
AAGTTTGCTATCATTGGCGTCAAAGTCTATGCTGCGGGTTTGTATGTCGATGAATCTATC
TTGAGCGGGCTAATCCCTTGGAAAGGGAAGTCTGCTGATGAGATTCAAAGAGATTCATCA
CTCTTTAGTTCAATCTTTCAAGATCAAGCAGAGAAGTCACTGCAGATTGTTCTTGTGAGA
GATGTTGATGGCAAAACCTT*CTGGGGATGCATTGGACGAAGCCATTTCACCTAGAATCA
AATCTCCTTTATCTGATGATAAAACCGCTCTCTCTACATTCCGAGGGATCTTTCAAAACA
GACCTCTCAACAAAGGAAGTGTCATTCTCTTGACTTGGATCAATCCTTCTAAA*TGCTTG
TTTCTGTT

QA 1 428 1 428
DS 

RD RS1BK64TF 192 0 0
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TAGAATCAAATCTCCTTCATCTGATGATAAAACCGCTCTCTCTACATTCCGAGGGATCTT
TCAAAACAGACCTCTCAACAAAGGAAGTGTCATTCTCTTGACTTGGATCAATCCTTCTAA
A*TGCTTGTTTC

QA 1 192 1 192
DS 

RD RS1BL50JQ 608 0 0
GCTGCGGGTTTGTATGTCGATGAATCTATCTTGAGCGGGCTAATCCCTTGGAAAGGGAAG
TCTGCTGATGAGATTCAAAGAGATTCATCACTCTTTAGTTCAATCTTTCAAGATCAGGCA
GAGAAGTCACTGCAGATTGTTCTTGTGAGAGATGTTGATGGCAAAACCTT**TTGGGATG
CATTGGACGAAGCCATTTCACCTAGAATCAAATCTCCTTTATCTGATGATAAAACCGCTC
TCTCTACATTCCGAGGGATCTTTCAAAACAGACCTCTCAACAAAGGAAGTGTCATTCTCT
TGACTTGGATCAATCCTTCTAAAATGCTTGTTTCTGTTTCTTCTGGAGGGTTGCCAAAGG
ATGTGGATGCAGAGATCGAGTCAGGTAGTGTTACATCTGCTTTGTTTGATGTGTTCTTTG
GAGACTCTCCTGTCTCTCCTACATTGAAATCTTCAGTGGCTAACCAATTAGCTATGGTCC
TCAAGTAAACACTCTAAATGTAACGTATCATGTTGTAATATGAATATCTTGAATCGTGTA
ATGTGTTAGGTCTATGTTTGTATTATCGTTTATAACCAGATAAAGACACCATGTTTTGAG
CTTAAAAA

QA 1 608 1 608
DS 

RD RS1BK64JQ 701 0 0
TCAAAGTCTATGCTGCGGGTTTGTATGTCGATGAATCTATCTTGAGCGGGCTAATCCCTT
GGAAAGGGAAGTCTGCTGATGAGATTCAAAGAGATTCATCACTCTTTAGTTCAATCTTTC
AAGATCAAGCAGAGAAGTCACTGCAGATCGTTCTTGTGAGAGATGTTGATGGCAAAACCT
T*CTGGG*ATGCATTGGACGAAGCCATTTCACCTAGAATCAAATCTCCTTCATCTGATGA
TAAAACCGCTCTCTCTACATTCCGAGGGATCTTTCAAAACAGACCTCTCAACAAAGGAAG
TGTCATTCTCTTGACTTGGATCAATCCTTCTAAAATGCTTGTTTCTGTTTCTTCTGGAGG
GTTGCCAAAGGATGTGGATGCAGAGATCGAGTCAGGTAGTGTTACATCTGCTTTGTTTGA
TGTGTTCTTTGGAGACTCTCCTGTCTCTCCTACATTGAAATCTTCAGTGGCTAACCAATT
AGCTATGGTCCTCAAGTAAACACTCTAAATGTAACATATCATGTTGTAATATGAATATCT
TGAATCGTGTAATGTGTTAGGTCTATGTTTGTATTATCGTTTATAACCAGATAAAGACAC
CATGTTTTGAGCTTAAAAATGATGTATCTTTTGAAATTTTCATTGATACTAAGCCATTTT
ATTTTGTATATTGACCTCATTAAGCCTAAATTTTTTATTCC

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 5

CO CL1543Contig1 880 5 14 U
GGAGAATCGAGAGATACCGACTCTTGAACCGAAATTATTTAGGTGATGGATGAGATCCTT
AACCGATACGAGCCATTTCTAAACCCTCGTCGTCGTGGCTCGTGTTACAGATCAAGGCGA
AGAAGCAAAAGGTCAGGTGAAGCAACAATGTCGTGGATGAAAGGAGATTTACTTTCCAAA
ACCAGGAGGCTTGTTGGTGGGCTCGCTACAAGAGAGCCTGTTTGGCTTAAAGCCATGGAA
GCATCACCACCTCCTGTCTTCCCTCGCTCTAATGGGAACCTCAAGAAGATTGTTCTCCCT
GAAGATCCCTACGTTCGCAGATTCGCTCGTAAGCATCCTGAAGCTAAACTCGTCGACCCC
AACAAGGTTTCGGCGTTTATTCCAGATCCAGCACGCTTTTATGGTTGCCGGGTTCTTGAA
CTGACCAAAAATGGCATCAGCGAGGATGACGCCATGTCTGTAGCTAATATGGAGTATCTT
GCGGAGAGAAAGGAAAAGAAGAAAGCATACAAGCGCCTAAAGGAGCTTGCTCTTCTGCAA
GACAAGGCTCCGCCTCCTAAACCCTATCTTAGTACCAAAAAGGAGATGCAAACTCAAGAG
AAGAAAGCACCTGCGGATCCTCCTAGCGTCCGCAGGCTAGTTAACCAGTTGAAACAGCAG
AAAGATGTGTTGCTTCAGGACAAACCTGGAGGTAGTACTAATCAGGATCATTGGATAGAC
GAATAGATTCTCCATCACCCTTTTCTTTTTATGCAAGTTCCAGTCTTTTTATACATGATG
ACAATTGTTGTTATTCCCATTTGATTGTTTACAGATCATTTTCAACAGACAAGTGTTACT
CCCATTTGATTGTAGTTGTAATAACACATATCTTTGGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1DX70TF U 113
AF RS1GL89TF U 1
AF RS1C686TF U 114
AF RS1C686JQ C 120
AF RS1GL89JQ C 154
BS 1 544 RS1GL89TF
BS 545 545 RS1DX70TF
BS 546 678 RS1GL89TF
BS 679 679 RS1C686TF
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BS 747 794 RS1C686TF
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BS 857 878 RS1C686JQ
BS 879 880 RS1GL89JQ

RD RS1DX70TF 562 0 0
GAAGGCG
AAGAAGCAAAAGG*CAGGTGAAGCAACAATGTCGTGGATGAAAGGAGATTTACTTTCCAA
AACCAGGAGGCTTGTTGGTGGGCTCGCTACAAGAGAGCCTGTTTGGCTTAAAGCCATGGA
AGCATCACCACCTCCTGTCTTCCCTCGCTCTAATGGGAACCTCAAGAAGATTGTTCTCCC
TGAAGATCCCTACGTTCGCAGATTCGCTCGTAAGCATCCTGAAGCTAAACTCGTCGACCC
CAACAAGGTTTCGGCGTTTATTCCAGATCCAGCACGCTTTTATGGTTGCCGGGTTCTTGA
ACTGACCAAAAATGGCATCAGCGAGGATGACGCCATGTCTGTAGCTAATATGGAGTATCT
TGCGGAGAGAAAGGAAAAGAAGAAAGCATACAAGCGCCTAAAGGAGCTTGCTCTTCTGCA
AGACAAGGCTCCGCCTCCTAAACCCTATCTTAGTACCAAAAAGGAGATGCAAACTCAAGA
GAAGAAAGCACCTGCGGATCCTCCTAGCGTCCGCAGGCTAGTTAACCAGTTGAAACAGCA
GAAAGATGTGTTGCT

QA 8 562 8 562
DS 

RD RS1GL89TF 746 0 0
GGAGAATCGAGAGATACCGACTCTTGAACCGAAATTATTTAGGTGATGGATGAGATCCTT
AACCGATACGAGCCATTTCTAAACCCTCGTCGTCGTGGCTCGTGTTACAGATCAAGGCGA
AGAAGCAAAAGGTCAGGTGAAGCAACAATGTCGTGGATGAAAGGAGATTTACTTTCCAAA
ACCAGGAGGCTTGTTGGTGGGCTCGCTACAAGAGAGCCTGTTTGGCTTAAAGCCATGGAA
GCATCACCACCTCCTGTCTTCCCTCGCTCTAATGGGAACCTCAAGAAGATTGTTCTCCCT
GAAGATCCCTACGTTCGCAGATTCGCTCGTAAGCATCCTGAAGCTAAACTCGTCGACCCC
AACAAGGTTTCGGCGTTTATTCCAGATCCAGCACGCTTTTATGGTTGCCGGGTTCTTGAA
CTGACCAAAAATGGCATCAGCGAGGATGACGCCATGTCTGTAGCTAATATGGAGTATCTT
GCGGAGAGAAAGGAAAAGAAGAAAGCATACAAGCGCCTAAAGGAGCTTGCTCTTCTGCAA
GACAGGGCTCCGCCTCCTAAACCCTATCTTAGTACCAAAAAGGAGATGCAAACTCAAGAG
AAGAAAGCACCTGCGGATCCTCCTAGCGTCCGCAGGCTAGTTAACCAGTTGAAACAGCAG
AAAGATGTGTTGCTTCAG*ACAA*CCTGGAGGTAGTACTAATCA*GATCATTGGATAGAC
GAATAGATTCTCCATCACCCTTTTCT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1C686TF 744 0 0
AAGGCG
AAGAAGCAAAAGGTCAGGTGAAGCAACAATGTCGTGGATGAAAGGAGATTTACTTTCCAA
AACCAGGAGGCTTGTTGGTGGGCTCGCTACAAGAGAGCCTGTTTGGCTTAAAGCCATGGA
AGCATCACCACCTCCTGTCTTCCCTCGCTCTAATGGGAACCTCAAGAAGATTGTTCTCCC
TGAAGATCCCTACGTTCGCAGATTCGCTCGTAAGCATCCTGAAGCTAAACTCGTCGACCC
CAACAAGGTTTCGGCGTTTATTCCAGATCCAGCATGCTTTTATGGTTGCCGGGTTCTTGA
ACTGACCAAAAATGGCATCAGCGAGGATGACGCCATGTCTGTAGCTAATATGGAGTATCT
TGCGGAGAGAAAGGAAAAGAAGAAAGCATACAAGCGCCTAAAGGAGCTTGCTCTTCTGCA
AGACAAGGCTCCGCCTCCTAAACCCTATCTTAGTACCAAAAAGGAGATGCAAACTCAAGA
GAAGAAAGCACCTGCGGATCCTCCTAGCGTCCGCAGGCTAGTTAACCAGTTGAAACAGCA
GAAAGATGTGTTGCTTCAGGACAAACCTGGAGGTAGTACTAATCACGATCATTGGATAGA
CGAATAGATTCTCCATCACCCTTTTCTTTTTATGCAAGTTCCAGTCTTTTTATACATGAT
GACAATTGTTGTTAT*CCCATTTGATTGTTTACAGATCATTTTCAACAGACAAGTGTTAC
TCCCATTTGATTGTAGT
G

QA 7 743 7 743
DS 

RD RS1C686JQ 760 0 0
AAGAAGCAAAAGGTCAGGTGAAGCAACAATGTCGTGGATGAAAGGAGATTTACTTTCCAA
AACCAGGAGGCTTGTTGGTGGGCTCGCTACAAGAGAGCCTGTTTGGCTTAAAGCCATGGA
AGCATCACCACCTCCTGTCTTCCCTCGCTCTAATGGGAACCTCAAGAAGATTGTTCTCCC
TGAAGATCCCTACGTTCGCAGATTCGCTCGTAAGCATCCTGAAGCTAAACTCGTCGACCC
CAACAAGGTTTCGGCGTTTATTCCAGATCCAGCATGCTTTTATGGTTGCCGGGTTCTTGA
ACTGACCAAAAATGGCATCAGCGAGGATGACGCCATGTCTGTAGCTAATATGGAGTATCT
TGCGGAGAGAAAGGAAAAGAAGAAAGCATACAAGCGCCTAAAGGAGCTTGCTCTTCTGCA
AGACAAGGCTCCGCCTCCTAAACCCTATCTTAGTACCAAAAAGGAGATGCAAACTCAAGA
GAAGAAAGCACCTGCGGATCCTCCTAGCGTCCGCAGGCTAGTTAACCAGTTGAAACAGCA
GAAAGATGTGTTGCTTCAGGACAAACCTGGAGGTAGTACTAATCAGGATCATTGGATAGA
CGAATAGATTCTCCATCACCCTTTTCTTTTTATGCAAGTTCCAGTCTTTTTATACATGAT
GACAATTGTTGTTATTCCCATTTGATTGTTTACAGATCATTTTCAACAGACAAGTGTTAC
TCCCATTTGATTGTAGTTGTAATAACACATATCTTTGGA
G

QA 1 759 1 759
DS 

RD RS1GL89JQ 727 0 0
TGGATGAAAGGAGATTTACTTTCCAAAACCAGGAGGCTTGTTGGTGGGCTCGCTACAAGA
GAGCCTGTTTGGCTTAAAGCCATGGAAGCATCACCACCTCCTGTCTTCCCTCGCTCTAAT
GGGAACCTCAAGAAGATTGTTCTCCCTGAAGATCCCTACGTTCGCAGATTCGCTCGTAAG
CATCCTGAAGCTAAACTCGTCGACCCCAACAAGGTTTCGGCGTTTATTCCAGATCCAGCA
CGCTTTTATGGTTGCCGGGTTCTTGAACTGACCAAAAATGGCATCAGCGAGGATGACGCC
ATGTCTGTAGCTAATATGGAGTATCTTGCGGAGAGAAAGGAAAAGAAGAAAGCATACAAG
CGCCTAAAGGAGCTTGCTTTTTTGCAAGACAGGGCTCCGCCTCCTAAACCCTATTTTAGT
ACCAAAAAGGAGATGCAAACTCAAGAGAAGAAAGCACCTGCGGATCCTCCTAGCGTCCGC
AGGCTAGTTAACCAGTTGAAACAGCAGAAAGATGTGTTGCTTCAGGACAAACCTGGAGGT
AGTACTAATCAGGATCATTGGATAGACGAATAGATTTTCCATCACCCTTTTCTTTTTATG
CAAGTTCCAGTCTTTTTATACATGATGACAATTGTTGTTATTCCCATTCGATTGTTTACA
GATCATTTTCAACAGACAAGTGTTACTCCCATTTGATTGTAGTTGTAATAACACATATCT
TTGGATG

QA 1 727 1 727
DS 



AS 2 4

CO CL1544Contig1 666 2 2 U
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ATAACCCAATATTATTTGAGTGCTCGTGTAGATAAAAAAAATCAGCGAGCGCACGGATAA
TGACATATACATCGCTTTTTTTTGTCTGTTGGATTAGTTGTGCAACTGCCTTGCCCTTCT
TTATGCCTTTTGACACATTCGGCTTGACACACCTGTTGGGGACATGTTCCACTTTTGTTT
CGTAATACCCTATTACATTGGTTGTCACTTTTTCCTTTCTGAGCAATCGCCATTTCACCT
ATTATTATAACAATTAAAACATAATCTTAGTTTTATATTTAAAACAGAAAATCATTGTTT
TGTAAAACATATGTTTGGAGAATTTCCTTCACAAATAGAAAAAACTGAAAGTCTAAAACA
TCTTCTTTCTTATTCATTGATTACTCTTAAAAGATCATTAAACTCGATATTATAGAATTA
GACATATAATTTATATAGGTGTATAAAATAAAGCACATCAATAAAATTTATATTAGAAGG
ATTATATAATATATGAATAAATTTGTAAATCAAAATACAAACCGAATAGAAAAATTGTGA
GTATAAGAAAGCCAATAAGCCAAGGTTTGAAAGCTACTTTCATCTTCGATAGTGAAATAA
TAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1BG56TF C 1
AF RS1BG56JQ U 6
BS 1 5 RS1BG56TF
BS 6 666 RS1BG56JQ

RD RS1BG56TF 660 0 0
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TTATGCCTTTTGACACATTCGGCTTGACACACCTGTTGGGGACATGTTCCACTTTTGTTT
CGTAATACCCTATTACATTGGTTGTCACTTTTTCCTTTCTGAGCAATCGCCATTTCACCT
ATTATTATAACAATTAAAACATAATCTTAGTTTTATATTTAAAACAGAAAATCATTGTTT
TGTAAAACATATGTTTGGAGAATTTCCTTCACAAATAGAAAAAACTGAAAGTCTAAAACA
TCTTCTTTCTTATTCATTGATTACTCTTAAAAGATCATTAAACTCGATATTATAGAATTA
GACATATAATTTATATAGGTGTATAAAATAAAGCACATCAATAAAATTTATATTAGAAGG
ATTATATAATATATGAATAAATTTGTAAATCAAAATACAAACCGAATAGAAAAATTGTGA
GTATAAGAAAGCCAATAAGCCAAGGTTTGAAAGCTACTTTCATCTTCGATAGTGAAATAA

QA 1 660 1 660
DS 

RD RS1BG56JQ 661 0 0
AAACAACAGTTTATTTAAAATTTATTATTTTCTTTGACAAATAAATGATAATATTATAAC
CCAATATTATTTGAGTGCTCGTGTAGATAAAAAAAATCAGCGAGCGCACGGATAATGACA
TATACATCGCTTTTTTTTGTCTGTTGGATTAGTTGTGCAACTGCCTTGCCCTTCTTTATG
CCTTTTGACACATTCGGCTTGACACACCTGTTGGGGACATGTTCCACTTTTGTTTCGTAA
TACCCTATTACATTGGTTGTCACTTTTTCCTTTCTGAGCAATCGCCATTTCACCTATTAT
TATAACAATTAAAACATAATCTTAGTTTTATATTTAAAACAGAAAATCATTGTTTTGTAA
AACATATGTTTGGAGAATTTCCTTCACAAATAGAAAAAACTGAAAGTCTAAAACATCTTC
TTTCTTATTCATTGATTACTCTTAAAAGATCATTAAACTCGATATTATAGAATTAGACAT
ATAATTTATATAGGTGTATAAAATAAAGCACATCAATAAAATTTATATTAGAAGGATTAT
ATAATATATGAATAAATTTGTAAATCAAAATACAAACCGAATAGAAAAATTGTGAGTATA
AGAAAGCCAATAAGCCAAGGTTTGAAAGCTACTTTCATCTTCGATAGTGAAATAATAGTC
C

QA 1 661 1 661
DS 



CO CL1544Contig2 670 2 7 U
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TATTATAACCCAATATTATTTGAGTACTCGTGTAAATAAAAAAAATCAGCGAGCGCACGG
ATAATGACATATACATAGCATTTTTTTGTCTGTTGGATTAGTTGTGCAACTGCCTTGCCC
TTCTTTATGCCTTTTGACACATTCGGCTTGACACACCTGTTGGGGACATGTTCCATTTTC
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GTTTTGTAAACATATGTTTGGAGAATTTCCTTCACAAATAGAAAAAAACTGAAAGTCTAA
AACATCTTCTTTCTTATTCATTGATTACTCTTAAAAGATCATTAAACTCGATATTATAGA
ATTAGACATATAGTTTATATAGGTGTATAAAATAAAACACATCAATAAAATTTATATTAG
AAGGATTATATAATGTATCAATAAATTTGTAAATCAAAATACAAACCGAACAGAAAAATT
GTGAGCATAAGAAAACCAATAAGCCAAGGTTTGAAAGCAACTTTCATCTTCGATAGTGAA
ATAATGGTCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G904JQ U 4
AF RS1DW68TF C 1
BS 1 3 RS1DW68TF
BS 4 85 RS1G904JQ
BS 86 86 RS1DW68TF
BS 87 104 RS1G904JQ
BS 105 105 RS1DW68TF
BS 106 162 RS1G904JQ
BS 163 670 RS1DW68TF

RD RS1G904JQ 159 0 0
CCCAAAAACAACAGTTTATTTAAAATTTTATTATTTTCTTTGACAAATAAATGATAATAT
TATAACCCAATATTATTTGAGTGCTCGTGTAAATAAAAAAA*TCAGCGAGCGCACGGATA
ATGACATATACATAGCATTTTTTTGTCTGTTGGATTAGT

QA 1 159 1 159
DS 

RD RS1DW68TF 670 0 0
TATCCCAAAAACAACAGTTTATTTAAAATTTTATTATTTTCTTTGACAAATAAATGATAA
TATTATAACCCAATATTATTTGAGTACTCGTGTAGATAAAAAAAATCAGCGAGCGCACGG
ATAATGACATATACATAGCATTTTTTTGTCTGTTGGATTAGTTGTGCAACTGCCTTGCCC
TTCTTTATGCCTTTTGACACATTCGGCTTGACACACCTGTTGGGGACATGTTCCATTTTC
GTTTCGTAATACCCTTCTACATTGGTTGCCACTTTTTCCTTTCTGAGCAATCGCCATTTC
ACCTATTATTATAACAATTAAAACATAATCTTAGTTTTATATTTAAAACAGAAAATCATT
GTTTTGTAAACATATGTTTGGAGAATTTCCTTCACAAATAGAAAAAAACTGAAAGTCTAA
AACATCTTCTTTCTTATTCATTGATTACTCTTAAAAGATCATTAAACTCGATATTATAGA
ATTAGACATATAGTTTATATAGGTGTATAAAATAAAACACATCAATAAAATTTATATTAG
AAGGATTATATAATGTATCAATAAATTTGTAAATCAAAATACAAACCGAACAGAAAAATT
GTGAGCATAAGAAAACCAATAAGCCAAGGTTTGAAAGCAACTTTCATCTTCGATAGTGAA
ATAATGGTCC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 5

CO CL1545Contig1 716 5 2 U
GGGCTCCGTAAAGCACCACCACCACGATCAGAAGAAGAAGGAGAATCGTGTGGAGAAGGA
AGATGGTGAACTATGTGCTTAAAATAACGGCAGATCTCGAGAATCTCACTAATCTCCAGC
CTTCCGGTGGCTGCGACGATCCCAACTTCCCTTACCTCTTCAAGTTGAAATGTGAAAGAT
GCGGAGAGGTGACTCAGAAGGAAACATGTGTGACTTTGAATGAGACTTTTACTCCTCCTG
GTGGCAGGGGTTCTTGTCATCTTGTTCAGAAGTGTAAGTTCTGTGGAAGGGAAGGGAATG
TGACAATGATCCCGGGGAAAGGTCGACCTTTAACTCTTGAAGATTCCGAGGCTGGAGAAC
ATGCTCCTCTTATGGTCTTTGACTGTCGAGGCTATGAGCCAATCGATTTCGGGTTTGGCG
GATTTTGGAAAGCTCAAGCTGAATCTGGAACTAAGTTTGATGAGATTGATTTGTCGAGCG
GAGAGGAGTTCACGGAGTACGATGAGAAGGGCGAGTGCCCGGTTATGATATCAAACTTCC
GTGCAAGCTTCACCGTCACCAAGTAAAGTAGCTGAGCGTCTATTGTTCTATCTTCTGATT
CTCTCTGCACACTTAAGTGTATGTAAAAACTATGAGAAGATTGTTACTCAAGTTCTAATA
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CF05TF U 1
AF RS1AF63TF U 16
AF RS1CF05JQ C 25
AF RS1AF63JQ C 737
AF RS1CD42TF U 666
BS 1 713 RS1CF05TF
BS 714 717 RS1AF63TF
BS 718 718 RS1CD42TF
BS 719 800 RS1AF63TF
BS 801 879 RS1CD42TF
BS 880 880 RS1AF63JQ
BS 881 989 RS1CD42TF
BS 990 990 RS1AF63JQ
BS 991 1138 RS1CD42TF
BS 1139 1139 RS1AF63JQ
BS 1140 1293 RS1CD42TF
BS 1294 1294 RS1AF63JQ
BS 1295 1397 RS1CD42TF
BS 1398 1399 RS1AF63JQ
BS 1400 1451 RS1CD42TF

RD RS1CF05TF 713 0 0
GGGTACAGTTTCGAATTCTCCGTCTCTTGAAAACTCTCTCCAGATCTCTCTCTCTCTGCG
CAACGACGAAGATCACTTCTTATGGCGGCGGAGAAATGGGTGCACACGGTGACGGCTCAA
ACTCCGACGAACATCGCGGTGATTAAGTATTGGGGAAAGAGAGACGAGGTCCGGATCCTC
CCCGTAAACGACAGCATCAGCGTAACTCTCGATCCCGATCACCTCTGCACCGTCACCACC
GTCGCCGTCAGTCCCGCTTTCGATCGGGATCGAATGTGGCTCAACGGCAAGGAGATCTCT
CTATCGGGGAGTAGGTACCAGAACTGTTTGAGGGAGATTCGAAGCCGTGGTGGTGATGTC
GAAGACGAGGAGAAAGGTGTGAAGATTGAGAAGAAAGATTGGGAGAGATTGAATCTGCAT
ATTGCTTCTCATAACAACTTCCCTACAGCTGCTGGTTTAACTTCTTCAGCTGCTGGATTT
GCTTGTCTAGTTTTCTCTCTTGCAAAGTTGATGAATGTAGAGGAAGATCTAAGCCAGCTT
TCTGCGATAGCCAGGCAAGGTTCAGGAAGTGCTTGCCGTAGTTTGTTTGGTGGATTTGTC
AAGTGGAAAATGGGAAGCAAAGAAGATGGAAGTGATAGCGTTGCAGTTCAACTTGCAGAT
GAGAAACATTGGGATGATCTTGTTATCATCATTGCTGTGGTAAGTTCACGGCA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RS1AF63TF 785 0 0
GG
CTCCGTCTCTTGAAAACTCTCTCCAGATCTCTCTCTCTCTGCGCAACGACGAAGATCACT
TCTTATGGCGGCGGAGAAATGGGTGCACACGGTGACGGCTCAAACTCCGACGAACATCGC
GGTGATTAAGTATTGGGGAAAGAGAGACGAGGTCCGGATCCTCCCCGTAAACGACAGCAT
CAGCGTAACTCTCGATCCCGATCACCTCTGCACCGTCACCACCGTCGCCGTCAGTCCCGC
TTTCGATCGGGATCGAATGTGGCTCAACGGCAAGGAGATCTCTCTATCGGGGAGTAGGTA
CCAGAACTGTTTGAGGGAGATTCGAAGCCGTGGTGGTGATGTCGAAGACAAGGAGAAAGG
TGTGAAGATTGAGAAGAAAGATTGGGAGAGATTGAATCTGCATATTGCTTCTCATAACAA
CTTCCCTACAGCTGCTGGTTTAGCTTCTTCAGCTGCTGGATTTGCTTGTCTAGTTTTCTC
TCTTGCAAAGTTGATGAATGTAGAGGAAGATCTAAGCCAGCTTTCTGCGATAGCCAGGCA
AGGTTCAGGAAGTGCTTGCCGTAGTTTGTTTGGTGGATTTGTCAAGTGGAAAATGGGAAG
CAAAGAAGATGGAAGTGATAGCGTTGCAGTTCAACTTGCAGATGAGAAGCATTGGGATGA
TCTTGTTATCATCATTGCTGTGGTAAGTTCACGGCAGAAG*AAACGAGCAGCACCTCTGG
AATGCGAGAAAGTGTTGAGACGAGTTTGCTTTTACAGCACAGAGCAAAAGAAGTTGTGCC
GAA

QA 3 785 3 785
DS 

RD RS1CF05JQ 758 0 0
TCTTGAAAACTCTCTCCAGATCTCTCTCTCTCTGCGCAACGACGAAGATCACTTCTTATG
GCGGCGGAGAAATGGGTGCACACGGTGACGGCTCAAACTCCGACGAACATCGCGGTGATT
AAGTATTGGGGAAAGAGAGACGAGGTCCGGATCCTCCCCGTAAACGACAGCATCAGCGTA
ACTCTCGATCCCGATCACCTCTGCACCGTCACCACCGTCGCCGTCAGTCCCGCTTTCGAT
CGGGATCGAATGTGGCTCAACGGCAAGGAGATCTCTCTATCGGGGAGTAGGTACCAGAAC
TGTTTGAGGGAGATTCGAAGCCGTGGTGGTGATGTCGAAGACGAGGAGAAAGGTGTGAAG
ATTGAGAAGAAAGATTGGGAGAGATTGAATCTGCATATTGCTTCTCATAACAACTTCCCT
ACAGCTGCTGGTTTAACTTCTTCAGCTGCTGGATTTGCTTGTCTAGTTTTCTCTCTTGCA
AAGTTGATGAATGTAGAGGAAGATTTAAGCCAGCTTTCTGCGATAGCCAGGCAAGGTTCA
GGAAGTGCTTGCCGTAGTTTGTTTGGTGGATTTGTCAAGTGGAAAATGGGAAGCAAAGAA
GATGGAAGTGATAGCGTTGCAGTTCAACTTGCAGATGAGAAACATTGGGATGATCTTGTT
ATCATCATTGCTGTGGTAAGTTCACGGCAGAAGGAAACGAGCAGCACCTCTGGAATGCGA
GAAAGTGTTGAGACGAGTTTGCTTTTACAGCACAGAGC

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1AF63JQ 681 0 0
GAATGCGAGAAAGTGTTGAGACGAGTTTGCTTTTACAGCACAGAGCAAAAGAAGTTGTGC
CGAAACGGATTGTGCAAATGGAGGAAGCTATTAAAAACCAAGATTTTGCATCGTTTACCC
AACTGAGCTGCACAGACAGTAACCAGTTCCATGCTGTTTGTCTAGATACATCTCCACCCA
TATTTTACATGAATGACACCTCCCACAGGATAATTAGCTTAGTTGAAAAGTGGAACCGTT
CTGAAGGGACTCCACAGGTTGCTTACACATTTGATGCTGGTCCAAATGCTGTACTGATTG
CACGCAACAGAAAGGTAGCTGTTCAACTTCTCCAGGGGCTTCTCTACTATTTCCCTCCTA
AGTCTGACACTGATATGAAGAGTTACGTAGTGGGAGACAATTCGATTCTAAAGGAGGCAG
GATTAGAGGGAGCAAAGAGTGTTGAGAATCTGCAACCTCCACCTGAAATGAAAGACAAGA
TTGGATTTCAGGATCAAAAAGGAGAAGTCAGTTATTTTATATGCACTAGACCTGGAAGAG
GTCCCGTCGTGCTTCCCGACCAGACTCAAGCTCTTCTCGATCCGGTAACCGGCCTTCCCA
AATGAGAGCATTGTTTCTGCTTCAAATGTTATGATTATCACCATCATTTAACTGCAAGTT
TTAAGAAACTGATATT
TGTGC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1CD42TF 786 0 0
G
CATTGGGATGATCTTGTTATCATCATTGCTGTGGTAAGTTCACGGCAGAAGGAAACGAGC
AGCACCTCTGGAATGCGAGAAAGTGTTGAGACGAGTTTGCTTTTACAGCACAGAGCAAAA
GAAGTTGTGCCGAAACGGATTGTGCAAATGGAGGAAGCTATTAAAAACCAAGATTTTGCA
TCGTTTACCCAACTGAGCTGCACAGACAGTAACTAGTTCCATGCTGTTTGTCTAGATACA
TCTCCACCCATATTTTACATGAATGACACCTCCCACAGGATAATTAGCTTAGTTGAAAAG
TGGAACCGTTCTGAAGGGACTCCGCAGGTTGCTTACACATTTGATGCTGGTCCAAATGCT
GTACTGATTGCACGCAACAGAAAGGTAGCTGTTCAACTTCTCCAGGGGCTTCTCTACTAT
TTCCCTCCTAAGTCTGACACTGATATGAAGAGTTACGCAGTGGGAGACAATTTGATTCTA
AAGGAGGCAGGATTAGAGGGAGCAAAGAGTGTTGAGAATCTGCAACCTCCACCTGAAATG
AAAGACAAGATTGGATCTCAGGATCAAAAAGGAGAAGTCAGTTATTTTATATGCACTAGA
CCTGGAAGAGGTCCCGTCGTGCTTCCCTACCAGACTCAAGCTCTTCTCGATCCGGTAACC
GGCCTTCCCAAATGAGAGCATTGTCTCTGCTTCAAATGTTATGATTATCACCATCATTTA
ACTGCAAGTTT**AGAAACTGATATTGTGCCAGATAGTGCAAACTCGTTGTTTCTACTAC
TGCTA

QA 2 786 2 786
DS 



AS 1 5

CO CL1547Contig1 593 5 6 U
GGAGCAGAAGACGGCACACAAGCTTCACCGGAGATAGATCAGAGGAGCGAAAATGGTGAA
CATTCCGAAGACAAAGAAGACATACTGCAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCATACCTTGCA
CAAGGTTACCCAATACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTCGCTGCTCAAGGGAAGCGTCGTTA
TGACCGTAAGCAATCTGGTTACGGTGGTCAGACTAAGCCTGTCTTCCACAAGAAGGCTAA
GACCACGAAGAAGATTGTCTTGAGGCTTCAGTGCCAAACCTGCAAGCACTTTTCTCAGCA
CTCCATCAAGAGGTGCAAGCATTTTGAGATCGGTGGAGACAAGAAGGGCAAGGGAACATC
ACTTTTCTAAGCTGCTCTTGTCTTAAACTTTACAAGTTTTGTACTTCGTTGGATCTTTGA
TTTCATCTGGTTTAGCTCTCGTATAAGATTGTTTCTTATCTTTGCTTGTTAACTCTGTTT
TTGTATCATCAAGATGTGCTTTTCAGTTTTTATCAGTCACTGCAATCTAAGTATGTGTTT
TTACAATCCAATTTTAAATCGACTATATTCATTTCATTATAGAATAATACTTC


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F020JQ C 1
AF RS1F020TF U 1
AF RS1GF84JQ C 2
AF RS1GF84TF U 2
AF RS1CQ82TF U 306
BS 1 5 RS1F020JQ
BS 6 282 RS1F020TF
BS 283 283 RS1GF84TF
BS 284 512 RS1F020TF
BS 513 570 RS1GF84TF
BS 571 593 RS1CQ82TF

RD RS1F020JQ 514 0 0
GGAGCAGAAGACGGCACACAAGCTTCACCGGAGATAGATCAGAGGAGCGAAAATGGTGAA
CATTCCGAAGACAAAGAAGACATACTGCAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCATACCTTGCA
CAAGGTTACCCAATACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTCGCTGCTCAAGGGAAGCGTCGTTA
TGACCGTAAGCAATCTGGTTACGGTGGTCAGACTAAGCCTGTTTTCCACAAGAAGGCTAA
GACCACGAAGAAGATTGTCTTGAGGCTTCAGTGCCAAACCTGTAAGCACTTTTTTCAGCA
CTCCATCAAGAGGTGCAAGCATTTTGAGATCGGTGGAGACAAGAAGGGCAAGGGAACATC
ACTTTTTTAAGCTGCTCTTGTCTTAAACTTTACAAGTTTTGTACTTCGTTGGATCTTTGA
TTTCATCTGGTTTAGCTCTCGTATAAGATTGTTTCTTATCTTTGCTTGTTAACTCTGTTT
TTGTATCATCAAGATGTGCTTTTCAGTTTTTA
CC

QA 1 512 1 512
DS 

RD RS1F020TF 514 0 0
GGAGC
AGAAGACGGCACACAAGCTTCACCGGAGATAGATCAGAGGAGCGAAAATGGTGAACATTC
CGAAGACAAAGAAGACATACTGCAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCATACCTTGCACAAGG
TTACCCAATACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTCGCTGCTCAAGGGAAGCGTCGTTATGACC
GTAAGCAATCTGGTTACGGTGGTCAGACTAAGCCTGTCTTCCACAAGAAGGCTAAGACCA
CGAAGAAGATTGTCTTGAGGCTTCAGTGCCAAACCTGTAAGCACTTTTCTCAGCACTCCA
TCAAGAGGTGCAAGCATTTTGAGATCGGTGGAGACAAGAAGGGCAAGGGAACATCACTTT
TCTAAGCTGCTCTTGTCTTAAACTTTACAAGTTTTGTACTTCGTTGGATCTTTGATTTCA
TCTGGTTTAGCTCTCGTATAAGATTGTTTCTTATCTTTGCTTGTTAACTCTGTTTTTGTA
TCATCAAGATGTGCTTTTCAGTTTTTA
CC

QA 6 512 6 512
DS 

RD RS1GF84JQ 569 0 0
GGGT
AGAAGACGGCACACAAGCTTCACCGGAGATAGATCAGAGGAGCGAAAATGGTGAACATTC
CGAAGACAAAGAAGACATACTGCAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCATACCTTGCACAAGG
TTACCCAATACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTCGCTGCTCAAGGGAAGCGTCGTTATGACC
GTAAGCAATCTGGTTACGGTGGTCAGACTAAGCCTGTCTTCCACAAGAAGGCTAAGACCA
CGAAGAAGATTGTCTTGAGGCTTCAGTGCCAAACCTGCAAGCACTTTTCTCAGCACTCCA
TCAAGAGGTGCAAGCATTTTGAGATCGGTGGAGACAAGAAGGGCAAGGGAACATCACTTT
TTTAAGCTGCTCCTGTCTTAAACTTTACAAGTTTTGTACTTCGTTGGATCTTTGATTTCA
TCTGGTTTAGCTCTCATATAAGATTGTTTCTTATCTTTGCTTGTTAACTCTGTTTTTGTA
TCATCAAGATGTGCTTTTCAGTTTTTATCAGTCACTGCAATCTAAGTATGTGTTTTTACA
ATCCAATTTTAAATCGACTATATTC

QA 5 569 5 569
DS 

RD RS1GF84TF 574 0 0
GGGT
AGAAGACGGCACACAAGCTTCACCGGAGATAGATCAGAGGAGCGAAAATGGTGAACATTC
CGAAGACAAAGAAGACATACTGCAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCATACCTTGCACAAGG
TTACCCAATACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTCGCTGCTCAAGGGAAGCGTCGTTATGACC
GTAAGCAATCTGGTTACGGTGGTCAGACTAAGCCTGTCTTCCACAAGAAGGCTAAGACCA
CGAAGAAGATTGTCTTGAGGCTTCAGTGCCAAACCTGCAAGCACTTTTCTCAGCACTCCA
TCAAGAGGTGCAAGCATTTTGAGATCGGTGGAGACAAGAAGGGCAAGGGAACATCACTTT
TCTAAGCTGCTCCTGTCTTAAACTTTACAAGTTTTGTACTTCGTTGGATCTTTGATTTCA
TCTGGTTTAGCTCTCATATAAGATTGTTTCTTATCTTTGCTTGTTAACTCTGTTTTTGTA
TCATCAAGATGTGCTTTTCAGTTTTTATCAGTCACTGCAATCTAAGTATGTGTTTTTACA
ATCCAATTTTAAATCGACTATATTC
AAAAA

QA 5 569 5 569
DS 

RD RS1CQ82TF 288 0 0
G
CAAGAGGTGCAAGCATTTTGAGATCGGTGGAGACAAGAAGGGCAAGGGAACATCACTTTT
CTAAGCTGCTCTTGTCTTAAACTTTACAAGTTTTGTACTTCGTTGGATCTTTGATTTCAT
CTGGTTTAGCTCTCGTATAAGATTGTTTCTTATCTTTGCTTGTTAACTCTGTTTTTGTAT
CATCAAGATGTGCTTTTCAGTTTTTATCAGTCACTGCAATCTAAGTATGTGTTTTTACAA
TCCAATTTTAAATCGACTATATTCATTTCATTATAGAATAATACTTC

QA 2 288 2 288
DS 



AS 1 4

CO CL1548Contig1 1527 4 18 U
GGGTACAAAACGATTCATCGCCTACCTTTCACTCACTAACAATGGCTACGCTATCAAAGC
TAGAGATGGCCACGACCTTCCTCGCTTTCACGGCTCCTCGTTCCGCCACCGCCCTGAACT
ACCGCTTATCTTCTGCCGGCTTCCCGATTTTCTCTAGGCGCGTTCCCGTTTCCGTTTCCG
TCAGGGCGAAACCGTCCTTACTCTATTCCCCACTCGTAAATTCCAATCGAACTCGAAGAT
TCTCCTCGGTTTCGGCTTCAGCTTCCGCGTCGTCGGCGCCACCGCAAACAGAAGATTCCG
ATGTGACCACTAAGATTCCGCCAGACAACCGGATCCCAGTTACTATAATCACGGGCTTTC
TGGGCTCTGGCAAGACGACATTACTGAACCATATACTGACTAGAGATCATGGGAAGCGCA
TAGCCGTTATCGAGAATGAGTTTGGTGAAGTTGACATTGATGGGTCACTTGTTGCTTCCA
AATCTGTGGGAGCTGAGGATATAGTGATGCTCAACAACGGCTGCCTGTGCTGCACTGTAA
GGGGTGATCTTGTGAGGATGATTTCTGAGTTAGTCAACAAGAAGAAAGGAAAGTTCGACC
ATATTGTCATTGAGACTACAGGGTTGGCTAACCCGGCTCCGATTATCCAAACCTTTTATG
CGGAGGACGAGATTTTCAATGATGTCAAACTGGACGGAGTTGTTACTCTAGTTGACGCTA
AGCATGCTCGTTTGCATCTTGATGAGGTCAAGCCCAAAGGTGTTGTCAACGAGGCTGTTG
AACAGATAGCCTATGCTGACCGTATCATAGTTAACAAGACTGATCTTGTTGGTGAGTCAG
AGTTAGGTTCAGTGGTGCAACGCATAAAGACAATAAACAGCATGGCTCAGATGACGAGGA
CAAATTACGGAAACGTTGACTTGGATTATGTTCTTGGAATTGGAGGTTTTGATCTGGAGA
GAATCGAAAGCTCTGTGACCACCGAAGATGTTAAGGAAGGTCATAATGAGTGTCACGACG
AACATCACCATGATCATCATCATGATCACCATCACCACAATGAACATGAGCATAATCATT
CTCATGATCATGATCACACCCATGATCCCGGTGTTTCTTCAGTCAGTATAGTTTGCGAAG
GGAGCTTAGACCTTGAGAAGGCAAACATGTGGCTAGGGACGTTACTGATGGAACGAAGTG
AGGATATCTACAGGATGAAAGGTCTGCTCTCGGTCCACACCATGGAGGAGAGATTCGTGT
TTCAAGGAGTCCATGACATCTTTCAAGGATCCCCAGACCGGTTATGGGGCAAAGACGAGG
CTAGAGTCAACAAGCTGGTCTTCATTGGCAAGAATCTGAACCGGGAGGAGCTAGAGAAGG
GTTTTAAATCTTGCTTGATTTGAATTCTCGTATCATTTACAATTCAAATCTATCCTATTT
CCGGCAGATGTTGTATCCCCCGTTGTCCTAAAGTACAAACTTTTGTTTTTTTATTTCACT
TAACTCTATTTTACTAAATTTTATTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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G
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GTTTTTTTATTTCACTTAACTCTATTTTACTAAATTTTATTCT

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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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CAAAATCAAGTTCAAGGCCTTTGACTTGGGTGGCCATCAGATTGCCCGTAGGGTCTGGAA
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G

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TGTGGAGTCGAAAAGAGAGCTTGACGCTCTTCTACCTGATGAAGCCTTAGCTAATTTCCC
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TAAAAACAAAAATGTGTTTCTGATTGTGAAGTAGTAATCACTATGAT

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DS 

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TGAAAAGACATAAAACTGTTTTTCTTCTTGTAGTTTCCTCTTTTAAGTTCTAATGTATGT
TAAGTCGATGACTTAC

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DS 



AS 1 5

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CTTCTTAGTTTGTTCGCTTGATTTGATCAAAGCCCTTCCCTCGATCAAGATCATGCTTAG
CAAAAGAACTCATCCCATGATAGGAAAAATATCTGAGCTCCTCGTTGGCGTGAACCGATC
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TTTCCTCAACTCGTGTTACTTATGCAGGAAGAAACTTCACGGCCAGGACATATTTATTTA
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AAGGAAAGAGAGATGTAGATCGAAGTTTTCAACCTCTCCTTACACCGCCGGTCAAATTTT
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GGGGGGAAGGGGTAAATAAAATAGTAACTAGGCATTAATAATATGCGAGAGAAATAAATT
AGCATATATAAAAATATGACATGTATGTCCATATAAATGATATATGTGATATGGTGGAAG
AGAAACAACATGAAAATTTTGGGTGAAGGGGGTTTATGAGAGAGAGCTAGTTCTTGATCG
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1GR86TF U 1
AF RS1GC79TF U 1
AF RS1GC79JQ C 533
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GTTTCACAAACACCACCAATCTTCTTCTTCT***CTCATCATCTTTTTGTTACTTCTTAG
TTTGTTCGCTTGATTTGATCAAAGCCCTTCCCTCGATCAAGATCATGCTTAGCAAAAGAA
CTCATCCCATGATAGGAAAAATATCTGAGCTCCTCGTTGGCGTGGACCGATCTGCAGCCG
CAGGGGCTCCGTTCTTGGACGTCTTGATGACGAGCCCTAGAAGCCCACTAGATTTCAAGA
TTCTCCCTCAGATATCTCAAAGAAACAGTTCAAAGAGATTCTACGATGACAATCTTGGTG
GGTCCGTTGGTCTAGGGATTGTAGCCGCACTCGAGAACTCAACCACTCGCCGGATCACGA
GCGTTTCTAGAAATGAACCGAACCAATCCGGCCGGTCTGAACCGGTTCAGTTCATGAGCC
ATGTCGGAAGCTCGGACGAGGAA

QA 1 443 1 443
DS 

RD RS1GR86TF 648 0 0
GGGTGGAGGTTTCACAAACACCACCAATCTTCTTCTTCTTCTCTCATCATCTTTTTGTTA
CTTCTTAGTTTGTTCGCTTGATTTGATCAAAGCCCTTCCCTCGATCAAGATCATGCTTAG
CAAAAGAACTCATCCCATGATAGGAAAAATATCTGAGCTCCTCGTTGGCGTGAACCGATC
TGCAGCCGCAGCGGCTCCGTTCTTGGACGTCTTGATGACGAGCCCTAGAAGCCCACTAGA
TTTCAAGATTCTCCCTCAGATATCTCAAAGAAACAGTTCAAAGAGATTCTACGATGACAA
TCTTGGTGGGTCCGTTGGTCTAGGGATTGTAGCCGCACTCGAGAACTCAACCACTCGCCG
GATCACGAGCGTTTCTAGAAATGAACCGAACCAATCCGGCCGGTCTGAACCGGTTCAGTT
CATGAGCCATGTCGGAAGCTCGGACGAGGAAGATGAGGAGATGTTCATAATGGACGAGGA
GGACTATACGCTGGTGACGTCTCACCATGGTCCTAGTGGAACTTGTAGCACAAGGGTTTA
TGACAAAGACGGTCTCGAGTGTTTCGCAACTAAGGTTAACGAAGAACGTCGTGAGAGACT
TTTCGTGGTCGATGTCGGTACGGAATCTCCAAAGAATACTCCGGAGTT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1GC79TF 779 0 0
GGGTGGAGGTTTCACAAACACCACCAATCTTCTTCTTCTTCTCTCATCATCTTTTTGTTA
CTTCTTAGTTTGTTCGCTTGATTTGATCAAAGCCCTTCCCTCGATCAAGATCATGCTTAG
CAAAAGAACTCATCCCATGATAGGAAAAATATCTGAGCTCCTCGTTGGCGTGAACCGATC
TGCAGCCGCAGCGGCTCCGTTCTTGGACGTCTTGATGACGAGCCCTAGAAGCCCACTAGA
TTTCAAGATTCTCCCTCAGATATCTCAAAGAAACAGTTTAAAGAGATTCTACGATGACAA
TCTTGGTGGGTCCGTTGGTCTAGGGATTGTAGCCGCACTCGAGAACTCAACCACTCGCCG
GATCACGAGCGTTTCTAGAAATGAACCGAACCAATCCGGCCGGTCTGAACCGGTTCAGTT
CATGAGCCATGTCGGAAGCTCGGACGAGGAAGATGAGGAGATGTTCATAATGGACGAGGA
GGACTATACGCTGGTGACGTCTCACCATGGTCCTAGTGGAACTTGTAGCACAAGGGTTTA
TGACAAAGACGGTCTCGAGTGTTTCGCAACTAAGGTTAACGAAGAACGTCGTGAGAGACT
TTTCGTGGTCGATGTCGGTACGGAATCTCCAAAGAATACTCCGGAGTTTCAGGGTTTGGG
TTTCCTCAACTCGTGTTACTTATGCAG*AAGAAACTTCACGGCCAGGACATATTTATTTA
CAGAGGAGAAAATGCTTTT*GCAGCACAGAGTGTCGATCGAGTCATATAGCAAGTGTTG

QA 1 779 1 779
DS 

RD RS1GC79JQ 654 0 0
AGGGTTTATGACAAAGACGGTCTCGAGTGTTTCGCAACTAAGGTTAACGAAGAACGTCGT
GAGAGACTTTTCGTGGTCGATGTCGGTACGGAATCTCCAAAGAATACTCCGGAGTTTCAG
GGTTTGGGTTTCCTCAACTCGTGTTACTTATGCAGGAAGAAACTTCACGGCCAGGACATA
TTTATTTACAGAGGAGAAAATGCTTTTTGCAGCACAGAGTGTCGATCGAGTCATATAGCA
AGTGTTGAAAGGAAAGAGAGATGTAGATCGAAGTTTTCAACCTCTCCTTACACCGCCGGT
CAAATTTTTTCCGCCGGAGTTTTAGTGACTTAGCTGGAGTTCTTTTACTGAGTATATATA
TGGGGGGGGGGGGGAAGGGGTAAATAAAATAGTAACTAGGCATTAATAATATGCGAGAGA
AATAAATTAGCATATATAAAAATATGACATGTATGTCCATATAAATGATATATGTGATAT
GGTGGAAGAGAAACAACATGAAAATTTTGGGTGAAGGGGGTTTATGAGAGAGAGCTAGTT
CTTGATCGTCAAGATGGCGAAAATGGAATAACGCTCTTGTTTTTTTTT*CTATTGTTATT
GTGTTTTGTATTTGGTGCTTATTAACATGTTGAAATAATTTTAATGTTCAAATT

QA 1 654 1 654
DS 

RD RS1GR86JQ 624 0 0
GTTAACGAAGAACGTCGTGAGAGACTTTTCGTGGTCGATGTCGGTACGGAATCTCCAAAG
AATACTCCGGAGTTTCAGGGTTTGGGTTTCCTCAACTCGTGTTACTTATGCAGGAAGAAA
CTTCACGGCCAGGACATATTTATTTACAGAGGAGAAAAAGCTTTTTGCAGCACAGAGTGT
CGATCGAGTCATATAGCAAGTGTTGAAAGGAAAGAGAGATGTAGATCGAAGTTTTCAACC
TCTCCTTACACCGCCGGTCAAATTTTTTCCGCCGGAGTTTTAGTGACTTAGCTGGAGTTT
TTTTACTGAGTATATATATGGGGGGGGGGGGGAAGGGGTAAATAAAATAGTAACTAGGCA
TTAATAATATGCGAGAGAAATAAATTAGCATATATAAAAATATGACATGTATGTCCATAT
AAATGATATATGTGATATGGTGGAAGAGAAACAACATGAAAATTTTGGGTGAAGGGGGTT
TATGAGAGAGAGCTAGTTCTTGATCGTCAAGATGGCGAAAATGGAATAACGCTCTTGTTT
TTTTTTTCTATTGTTATTGTGTTTTGTATTTGGTGCTTATTAACATGTTGAAATAATTTT
AATGTTCAAATTGGGTTTTCATCG

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 5

CO CL1552Contig1 748 5 6 U
GGACATCAGATCAAAGATAAAAAGAAAGCAAGAATCGAAACCAAGCAAACTAGCTCAAGA
AACGACAACAATGTCTCTGGTTCCAAGCCCTTTCGGAGGACGCAGGTCAAACGTTTTTGA
TCCGTTGTCTCTAGACGCATGGGATCCATTCGAAGGGTTCTTCACTCCTTCCTCGCTGGC
AAACGCATCGGGTGCAACCGCTCGTGACATGGCAGCGTTTACAAACGCGAGAGTGGACTG
GAAGGAGACGCCGGAGGCACACGTGTTCAAAGCGGACTTGCCGGGACTAAAGAAAGAAGA
AGTGAAGGTTGAGGTTGAAGACAAGAACATACTTCAGATCAGCGGAGAGAGGAGCAAGGA
GAACGAGGAGAAGAACGACAAGTGGCACCGCGTGGAGAGGGCAAGCGGGAAGTTTATGAG
GAGGTTTAAGTTGCCGGAGAACGCGAAAATGGAGGAGGTGAAGGCGACGATGGAGAACGG
TGTGCTTACTGTTACGGTGCCGAAAGCGCTTGAGAAGAAGCCTGAAGTCAAGTCCATTGA
TATCTCTGGCTAAGCCACTGGGG*AGGAAGATGAATGTTGAAGATTTGGTGTGTGGGATA
ATAAAGCGTGTTTGATTTAAAAATTTGTGTGCTCTTTGGGTTTGTTATGTTGTACAATTG
TGGCTTTTCTGAAACCGTGAATGTAAAAGATGCTATATTACTATGAATAAACGAACGTTG
CAGTAATCATGGATGATGACATCGTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1GH35TF U 1
AF RS1F342TF U 3
AF RS1F342JQ C 248
AF RS1EH90JQ C 6
AF RS1EH90TF U 6
BS 1 89 RS1GH35TF
BS 90 90 RS1EH90TF
BS 91 91 RS1GH35TF
BS 92 92 RS1F342TF
BS 93 599 RS1GH35TF
BS 600 748 RS1F342TF

RD RS1GH35TF 599 0 0
GGACATCAGATCAAAGATAAAAAGAAAGCAAGAATCGAAACCAAGCAAACTAGCTCAAGA
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TCCGTTGTCTCTAGACGCATGGGATCCATTCGAAGGGTTCTTCACTCCTTCCTCGCTGGC
AAACGCATCGGGTGCAACCGCTCGTGACATGGCAGCGTTTACAAACGCGAGAGTGGACTG
GAAGGAGACGCCGGAGGCACACGTGTTCAAAGCGGACTTGCCGGGACTAAAGAAAGAAGA
AGTGAAGGTTGAGGTTGAAGACAAGAACATACTTCAGATCAGCGGAGAGAGGAGCAAGGA
GAACGAGGAGAAGAACGACAAGTGGCACCGCGTGGAGAGGGCAAGCGGGAAGTTTATGAG
GAGGTTTAAGTTGCCGGAGAACGCGAAAATGGAGGAGGTGAAGGCGACGATGGAGAACGG
TGTGCTTACTGTTACGGTGCCGAAAGCGCTTGAGAAGAAGCCTGAAGTCAAGTCCATTGA
TATCTCTGGCTAAGCCACTGGGG*AGGAAGATGAATGTTGAAGATTTGGTGTGTGGGAT

QA 1 599 1 599
DS 

RD RS1F342TF 746 0 0
GGATC
AGATCAAAGATAAAAAGAAAGCAAGAATCGAAACCAAGCAAACTAGCTCAAGAAACGACA
ACAATGTCTCTGGTTCCAAGCCTTTTCGGAGGACGCAGGTCAAACGTCTTTGATCCGTTG
TCTCTAGACGCATGGGATCCATTCGAAGGGTTCTTCACTCCTTCCTCGCTGGCAAACGCA
TCGGGTGCAACCGCTCGTGACATGGCAGCGTTTACAAACGCGAGAGTGGACTGGAAGGAG
ACGCCGGAGGCACACGTGTTCAAAGCGGACTTGCCGGGACTAAAGAAAGAAGAAGTGAAG
GTTGAGGTTGAAGACAAGAACATACTTCAGATCAGCGGAGAGAGGAGCAAGGAGAACGAG
GAGAAGAACGACAAGTGGCACCGCGTGGAGAGGGCAAGCGGGAAGTTTATGAGGAGGTTT
AAGTTGCCGGAGAACGCGAAAATGGAGGAGGTGAAGGCGACGATGGAGAACGGTGTGCTT
ACTGTTACGGTGCCGAAAGCGCTTGAGAAGAAGCCTGAAGTCAAGTCCATTGATATCTCT
GGCTAAGCCACTGGGGGAGGAAGATGAATGTTGAAGATTTGGTGTGTGGGATAATAAAGC
GTGTTTGATTTAAAAATTTGTGTGCTCTTTGGGTTTGTTATGTTGTACAATTGTGGCTTT
TCTGAAACCGTGAATGTAAAAGATGCTATATTACTATGAATAAACGAACGTTGCAGTAAT
CATGGATGATGACATCGTTAT

QA 6 746 6 746
DS 

RD RS1F342JQ 499 0 0
ACGCCGGAGGCACACGTGTTCAAAGCGGACTTGCCGGGACTAAAGAAAGAAGAAGTGAAG
GTTGAGGTTGAAGACAAGAACATACTTCAGATCAGCGGGGAGAGGGGCAAGGGGAACGAG
GGGAAGAACGACAAGTGGCCCCGCGTGGAGAGGGCAAGCGGGAAGTTTATGAGGAGGTTT
AAGTTGCCGGAGAACGCGAAAATGGAGGAGGTGAAGGGGACGATGGAGAACGGTGTGCTT
ACTGTTACGGTGCCGAAAGCGCTTGAGAAGAAGCCTGAAGTCAAGTCCATTGATATTTCT
GGGTAAGCCACTGGGG*AGGAAGATGAATGTTGAAGATTTGGTGTGTGGGATAATAAAGC
GTGTTTGATTTAAAAATTTGTGTGCTCTTTGGGTTTGTTATGTTGTACAATTGTGGCTTT
TTTGAAACCGTGAATGTAAAAGATGCTATATTACTATGAATAAACGAACGTTGCAGTAAT
CATGGATGATGACATCGTT

QA 1 499 1 499
DS 

RD RS1EH90JQ 720 0 0
GG
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ACAATGTCTCTGGTTCCAAGCCCTTTCGGAGGACGCAGGTCAAACGTTTTTGATCCGTTG
TCTCTAGACGCATGGGATCCATTCGAAGGGTTCTTCACTCCTTCCTCGCTGGCAAACGCA
TCGGGTGCAACCGCTCGTGACATGGCAGCGTTTACAAACGCGAGAGTGGACTGGAAGGAG
ACGCCGGAGGCACACGTGTTCAAAGCGGACTTGCCGGGACTAAAGAAATAAGAAGTGAAG
GTTGAGGTTGAAGACAAGAACATACTTCAGATCAGCGGAGAGAGGAGCAAGGAGAACGAG
GAGAAGAACGACAAGTGGCACCGTGTGGAGAGGGCAAGCGGGAAGTTTATGAGGAGGTTT
AAGTTGCCGGAGAACGCGAAAATGGAGGAGGTGAAGGCGACGATGGAGAACGGTGTGCTT
ACTGTTACGGTGCCGAAAGCGCTTGAGAAGAAGCCTGAAGTCAAGTCCATTGATATCTCT
GGCTAAGCCGCTGGGG*AGGAAGATGAATGTTGAAGATTTGGTGTGTGGGATAATAAAGC
GTGTTTGATTTAAAAATTTGTGTGCTCTTTGGTTTTGTTATGTTGTACAATTGTGGCTTT
TTTGAAACCGTGAATGTAAAAGATGCTATATTACTATGAATAAACGAACGTTGCAGT
G

QA 3 719 3 719
DS 

RD RS1EH90TF 720 0 0
GG
AGATCAAAGATAAAAAGAAAGCAAGAATCGAAACCAAGCAAACTAGCTCAAGAAACGACA
ACAATGTCTCTGGTTCCAAGCCCTTTCGGAGGACGCAGGTCAAACGTTTTTGATCCGTTG
TCTCTAGACGCATGGGATCCATTCGAAGGGTTCTTCACTCCTTCCTCGCTGGCAAACGCA
TCGGGTGCAACCGCTCGTGACATGGCAGCGTTTACAAACGCGAGAGTGGACTGGAAGGAG
ACGCCGGAGGCACACGTGTTCAAAGCGGACTTGCCGGGACTAAAGAAATAAGAAGTGAAG
GTTGAGGTTGAAGACAAGAACATACTTCAGATCAGCGGAGAGAGGAGCAAGGAGAACGAG
GAGAAGAACGACAAGTGGCACCGTGTGGAGAGGGCAAGCGGGAAGTTTATGAGGAGGTTT
AAGTTGCCGGAGAACGCGAAAATGGAGGAGGTGAAGGCGACGATGGAGAACGGTGTGCTT
ACTGTTACGGTGCCGAAAGCGCTTGAGAAGAAGCCTGAAGTCAAGTCCATTGATATCTCT
GGCTAAGCCGCTGGGG*AGGAAGATGAATGTTGAAGATTTGGTGTGTGGGATAATAAAGC
GTGTTTGATTTAAAAATTTGTGTGCTCTTTGGTTTTGTTATGTTGTACAATTGTGGCTTT
TCTGAAACCGTGAATGTAAAAGATGCTATATTACTATGAATAAACGAACGTTGCAGT
G

QA 3 719 3 719
DS 



AS 2 5

CO CL1553Contig1 656 2 2 U
GGGTAGCACCCATGTGCAAATATTGAAACAGATTTTGATTGGTCTAGCTAATGTTCTACC
GAAACACAAGCTTGTTCCCCAAAAGAATTTAGCAGAAGCAAGTTTTAGAGATGTCATGAA
GAGAAAATTGACACCATACAACGTCATTTGTTACAGTGGCAAGCCGCGTCTACGGACCGC
CGTAGAGATGCTTCGAACTACTCAGGAGATCGAGCAACAGTTGGAAAAGGTGTGTTTGCC
GATACTGATACTACACGGAGAGGCTGATAGAGTGACGGACCTATCAGTGAGCAGAGAGCT
TTATGAGAAAGCGAAAAGTTCAGACAAGAAGATAGTTGTGTATAAAGATGCTTATCATTC
TCTGCTCGAAGGCGAGCCAGACAAAATGATCCTCCGTGTCTTGTCTGATGTTATCTCCTG
GCTTGACTACCATAGCCTTGCAAGTTGAGGAGGGATCACAAAGTTACTTCTGTGTAGATT
CTGATCATTTGTTTCCTTCCATTTTGTAGGTGACAAGTATTTTTCAACAAAGAAATTCTT
TTTTTTTGACATTTTGCAAATTTGATGTGATTCTTCGGATGGAAAATAATGTAACACATG
ATCAAGCTTTGTAATCTATAGCTGCCAATCATATATATCATGTTACATATTCAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TCTGCTCGAAGGCGAGC

QA 1 377 1 377
DS 

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GAGAAAATTGACACCATACAACGTCATTTGTTACAGTGGCAAGCCGCGTCTACGGACCGC
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GATACTGATACTACACGGAGAGGCTGATAGAGTGACGGACCTATCAGTGAGCAGAGAGCT
TTATGAGAAAGCGAAAAGTTCAGACAAGAAGATAGTTGTGTATAAAGATGCTTATCATTC
TCTGCTCGAAGGCGAGCCAGACAAAATGATCCTCCGTGTCTTGTCTGATGTTATCTCCTG
GCTTGACTACCATAGCCTTGCAAGTTGAGGAGGGATCACAAAGTTACTTCTGTGTAGATT
CTGATCATTTGTTTCCTTCCATTTTGTAGGTGACAAGTATTTTTCAACAAAGAAATTCTT
TTTTTTTGACATTTTGCAAATTTGATGTGATTCTTCGGATGGAAAATAATGTAACACATG
ATCAAGCTTTGTAATCTATAGCTGCCAATCATATATATCATGTTACATATTCAACC

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DS 



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AGAGAATCCTGAGTTTAGTTCTCTGCCGAGCTTTCTCTTTGGGCAGTCAATGGGTGGTGC
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CCTATCAGTGAGCAGAGAGCTTTATGAGAAAGCGAAAAGTTCAGACAAGAAGATAGTTGT
GTATAAAGATGCTTATCATTCCCTGCTCGAAGGCGAGCCAGACGAAATGATCCTCCGTGT
CTTGTCTGATGTTATCTCCTGGCTTGACGACCATAGCCTTGCAAGTTGAGGAGGGATCAT
TGGTTACTTCTGTGTAGATTCTGATCATTTGTTTCCTTCCATTTTGTAGGTGAAAAGTAT
TTTTCAACAAAGAATTTTTTTTTTTGACGTTTTGCAAATTTGATGTGATCTTATCTTCGG
ATGGAAAATAATGTAACACATGATCAAGCTTTGTAATCTACAGCTGCCAATCATATATAT
ATCATGGTACATATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AB74TF U 41
AF RS1H432TF U 1
AF RS1H432JQB C 569
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RD RS1AB74TF 722 0 0
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TATTTGTTTCTGCCATGGTTATGGAGATACTTGCACTTTTTTCTTCGAAGGGATTGCAAG
GAGATTAGCATTGTCTGGATATGGAGTTTTCGCTATGGATTATCCTGGATTTGGCTTATC
AGAAGGCTTGCACGGCTACATCCCTAGCTTTGATCTTCTTGTTGAAGATGTCATTGAGCA
TTACTCCAACATCAAAGAGAATCCTGAGTTTAGTTCTCTGCCGAGCTTTCTCTTTGGGCA
GTCAATGGGTGGAGCCGTGTCGCTCAAAATACATTTCAAGCAACCAAATGCTTGGACCGG
TGCAGTCTTGGTAGCACCCATGTGCAAAATTGCAGATGATATGGTTCCGCCACCAGTATT
GAAACAGATTTTGATTGGTCTAGCTAATGTTCTACCGAAACACAAGCTTGTTCCCCA

QA 6 722 6 722
DS 

RD RS1H432TF 815 0 0
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TAAGGGAAGAACCGTGTGGCAAAGGAAGAGCTCGATGGCTCCGACGGCGAAGGTAGACAA
CGATGATGAGCTCCGTCGAGTCAAAGATGTTAACAAGGACGAAGCTCCGGCGCGCCGTCA
CGTTCGCGATTCTTTTAAAGATATTCAGCTTAATCTCGATCATATCCTCTTCAAGACACC
AGGCGATGGGATTAAGACAAAGGAGTCTTATGAGGTGAATTCAAGAGGAGTTGAGATCTT
CTCGAAAAGCTGGCTTCCTGAAGCTTCTTCTAGGCCCAGAGCTCTTGTTTGTTTCTGCCA
TGGTTATGGAGATACCTGCACTTTTTTCTTCGAAGGGATTGCAAGGAGACTGGCATTGTC
TGGATACGGAGTTTTCGCTATGGATTATCCTGGATTCGGCTTATCAGAAGGCTTGCACGG
CTACATCCCTAGCTTTGATCTTCTTGTTGAAGATGTCATTGAACACTACTCCAACATCAA
AGAGAATCCTGAGTTTAGTTCTCTGCCGAGCTTTCTCTTTGGGCAGTCAATGGGTGGTGC
CGTGTCTCTCAAAATTCATTTCAAGCAACCAAATGCTTGGACCGGTGCAGTCTTGGTAGC
ACCCATGTGCAAAATTGCAGATGATATGGTTCCGCCACCAGTATTGAAACAGATT**GAT
CGGTCTAGCTAATGTTTTACCGAAACATAAGCTGGTTCCCCAAAAGGACTTGGCAGA*GC
AAGTTTTAGAGATGTCAGGAA
AGAAATTGACACCA

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DS 

RD RS1H432JQB 768 0 0
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CCAAATGCTTGGACCGGTGCAGTCTTGGTAGCACCCATGTGCAAAATTGCAGATGATATG
GTTCCGCCACCAGTATTGAAACAGATT**GATCGGTCTAGCTAATGTTTTACCGAAACAT
AAGCTGGTTCCCCAAAAGGACTTGGCAGAAGCAAGTTTTAGAGATGTCAGGAAGAGAAAA
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ATGCTTAGAACTACTCAGGAGATTGAGCAACAGTTGGAAAAGGTGTGTTTGCCAATTCTG
ATACTACACGGAGAGGCTGATAGAGTGACGGACCTATCAGTGAGCAGAGAGCTTTATGAG
AAAGCGAAAAGTTCAGACAAGAAGATAGTTGTGTATAAAGATGCTTATCATTCCCTGCTC
GAAGGCGAGCCAGACGAAATGATCCTCCGTGTCTTGTCTGATGTTATCTCCTGGCTTGAC
GACCATAGCCTTGCAAGTTGAGGAGGGATCATTGGTTACTTCTGTGTAGATTCTGATCAT
TTGTTTCCTTCCATTTTGTAGGTGAAAAGTATTTTTCAACAAAGAATTTTTTTTTTTGAC
GTTTTGCAAATTTGATGTGATCTTATCTTCGGATGGAAAATAATGTAACACATGATCAAG
CTTTGTAATCTACAGCTGCCAATCATATATATATCATGGTACATATTC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 4

CO CL1554Contig1 1262 4 5 U
GGACAGCGCCTTTTCCGTTCCCTCTTGCCCTGTCAAAATCAACCTCAACGCAAAATCTGG
GAAGATTGATCTCATAATCATAATTAACTGATGGGTTCCAAAATCGTCTTCCGATCCCTC
ACCGAGTTATTCCCACAGATTGATGCGAGGATTCTAAAAGCTGTAGCTATTGAGCACCCT
AAAGATGCTGATCTCGCTGCAGCTATTGTTATCTCTGAGATTGTTCCCAAGTTTTACCCT
GATTTGTCTGATCATCCTTCTTCCCTACCTCACAACAACAAGACACCAATAATAAAGGTC
CCAGACAACAACAATGTAGGGCGTGATATACCAAACGGTGCGTTGACTGGTTCTGAGACG
GGTGCCTCTTCTTCAGGGACTATCCCTCTAGCTCTCCATGGGGAACATGGAACAAGGTCC
CTACTTACTGACTCGCTTTCTTCTGGTGATCTTGAGGATATTCAGAGCAAAGCAGTGGTC
GATGAGTCTAGAGTGGTCTCCTCAGCTCCACCTGCCTCCGTGCAGGCGGGAACCAAACTG
ACTAGTGAGGACAAACCTGCAGTAGACAGTTCGGAATCTACACAGGAGTCATCAAAGCGT
TCAGATGATGTGAGAGAGGCTTCAAGTGGTTCACTCAGTGATGCAGAGTTGAGCGGCTCA
GTTCTTGTGGAAGAGACTTCGGAAGGTTCCTTGGCTGTTGAAAATGGTGAGTCAGAGCTG
CCTGGTGCCTTTAGCTCTAGTGTTAGCCGATCCAGCCAGGGCTGCAAAATTGATCACCTC
GAACAGATCATCGAAGATGCCAAAAGTAACAAGAGAACCTTGTTCATTGTGATGGAATCG
ATTATGAATCTGATGAGAGAAGTCGAGCTTCAAGAGAAGGATGCAGAGAAGGTGAAGGAA
GACGCTACTAGAGGAGGCTTTGATACCCTTAAAAAGGTTGAGGACCTCAAGAAGATTCTG
GCACATGCCAAGGAAGGAAACGACATGGATGCCGGAGAAGTCTATGGGGAGAGGTCAGTT
TTAGCAACTGAAGTAAATGAGCTTGAAAACCGTTTGCTCAACTTATCAGAAGAACGTGAC
AAGTCTCTTTCTGTTCTTGATGAGATGTGTGGAGTCCTCGAAGTGAGACTAGCTGCAGCC
CTGGAGATTAAAAATGCTGCTGAGAAATAGATCCAAGAGAAAGAGGTGCCGCACGCAAGG
AACTTACTGAACAAGAAGCAATCATGGATAAGTTGTCCAAGAATCAAAGCTACAGAAGAG
CA


BQ
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G
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DS 



AS 1 5

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CCCACTGGGTTTAAGCACAAAGTTACCGATAATCTCCAAAAATGGATAATAGAGGTAACA
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CI85JQ C 147
AF RS1CI85TF U 1
AF RS1CJ07TF U 362
AF RS1E109TF U 2
AF RS1E109JQ C 78
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BS 573 738 RS1CI85TF
BS 739 851 RS1E109JQ

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CGATAATCTCCAAAAATGGATAATAGAGGTAACAGGAGCACCAGGTACGCTCTATGCGAA
TGAAACTTACAAGCTTCAGGTTGATTTTCCTGAACATTACCCCATGGAATCTCCTCAGGT
AGTTTTTGTTCCACCGGCACCGCTACATCCCCATATTTACAGCAATGGACATATTTGTTT
AGATATTTTGTATGACTCGTGGTCTCCAGCCATGACGGTTAGTTCAGTATGCATCAGCAT
TCTCTCCATGCTATCGAGTTCACCGGAAAAGCAACGTCCGGCTGATAATGACCGATATGT
AAAGAACTGCAAGAACGGGAGGTTTCCTAAAGATACAAGATGGTGGTTCCATGACGACAA
GGCATTATGGTAATATGACCAAACATCATAAATAAAAATGAGGTTTTATATAATTTCCCC
AGAGACTGATAGTAACTGATATTGGGATTCCTTGTGGCCTCAAACCCTTTTT
TTTTTTT

QA 1 532 1 532
DS 

RD RS1CI85TF 740 0 0
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TCTGATTCTACGCCTGTCTCCACGACCATGACCAGCTCTTCATCTCCTTCACGCAAGGCG
TTAAGCAAGATCGCGTGTAATAGGCTGCAGAAAGAGTTATCAGAGTGGCAAGTCAATCCT
CCCACTGGGTTTAAGCACAAAGTTACCGATAATCTCCAAAAATGGATAATAGAGGTAACA
GGAGCACCAGGTACGCTCTATGCGAATGAAACTTACAAGCTTCAGGTTGATTTTCCTGAA
CATTACCCCATGGAATCTCCTCAGGTAGTTTTTGTTCCACCGGCACCGCTACATCCCCAT
ATCTACAGCAATGGACATATTTGTTTAGATATTCTGTATGACTCGTGGTCTCCAGCCATG
ACGGTTAGTTCAGTATGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCGAGTTCACCGGAAAAGCAA
CGTCCGGCTGATAATGACCGATATGTAAAGAACTGCAAGAACGGGAGGTCTCCTAAAGAT
ACAAGATGGTGGTTCCATGACGACAAGGCATTATGGTAATATGACCAAACATCATAAATA
AAAATGAGGTTTTATATAATTTCCCCAGAGACTGATAGTAACTGATATTGGGATTCCTTG
TGGCCTCAAACCCTTTTTCTTTCTTTCTATCTGTCTTTTGTATGGATGATTATGTAGACA
TCTGAAATGTCTCACACC
TT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1CJ07TF 377 0 0
G
CTACAGCAATGGACATATTTGTTTAGATATTCTGTATGACTCGTGGTCTCCAGCCATGAC
GGTTAGTTCAGTATGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCGAGTTCACCGGAAAAGCAACG
TCCGGCTGATAATGACCGATATGTAAAGAACTGCAAGAACGGGAGGTCTCCTAAAGATAC
AAGATGGTGGTTCCATGACGACAAGGCATGATGGTAATATGACCAAACATCATAAATAAA
AATGAGGTTTTATATAATTTCCCCAGAGACTGATAGTAACTGATATTGGGATTCCTTGTG
GCCTCAAACCCTTTTTCTTTCTTTCTATCTGTCTTTTGTATGGATGATTATGTAGACATC
TGAAATGTCTCACACC

QA 2 377 2 377
DS 

RD RS1E109TF 737 0 0
TTTTTTTTAATTCGAAAAATTCAGACAAAAGCAGAAGAAGCAAAGTTCTTCTGTCTGTGT
CTGATTCTACGCCTGTCTCCACGACCATGACCAGCTCTTCATCTCCTTCACGCAAGGCGT
TAAGCAAGATCGCGTGTAATAGGCTGCAGAAAGAGTTATCAGAGTGGCAAGTCAATCCTC
CCACTGGGTTTAAGCACAAAGTTACCGATAATCTCCAAAAATGGATAATAGAGGTAACAG
GAGCACCAGGTACGCTCTATGCGAATGAAACTTACAAGCTTCAGGTTGATTTTCCTGAAC
ATTACCCCATGGAATCTCCTCAGGTAGTTTTTGTTCCACCGGCACCGCTACATCCCCATA
TCTACAGCAATGGACATATTTGTTTAGATATTCTGTATGACTCGTGGTCTCCAGCCATGA
CGGTTAGTTCAGTATGCATCAGCATTCTCTCCATGCTATCGAGTTCACCGGAAAAGCAAC
GTCCGGCTGATAATGACCGATATGTAAAGAACTGCAAGAACGGGAGGTCTCCTAAAGATA
CAAGATGGTGGTTCCATGACGACAAGGCATGATGGTAATATGACCAAACATCATAAATAA
AAATGAGGTTTTATATAATTTCCCCAGAGACTGATAGTAACTGATATTGGGATTCCTTGT
GGCCTCAAACCCTTTTTCTTTCTTTCTATCTGTCTTTTGTATGGATGATTATGTAGACAT
CTGAAATGTCTCACACC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RS1E109JQ 774 0 0
CTCCACGACCATGACCAGCTCTTCATCTCCTTCACGCAAGGCGTTAAGCAAGATCGCGTG
TAATAGGCTGCAGAAAGAGTTATCAGAGTGGCAAGTCAATCCTCCCACTGGGTTTAAGCA
CAAAGTTACCGATAATCTCCAAAAATGGATAATAGAGGTAACAGGAGCACCAGGTACGCT
CTATGCGAATGAAACTTACAAGCTTCAGGTTGATTTTCCTGAACATTACCCCATGGAATC
TCCTCAGGTAGTTTTTGTTCCACCGGCACCGCTACATCCCCATATCTACAGCAATGGACA
TATTTGTTTAGATATTCTGTATGACTCGTGGTCTCCAGCCATGACGGTTAGTTCAGTATG
CATCAGCATTCTCTCCATGCTATCGAGTTCACCGGAAAAGCAACGTCCGGCTGATAATGA
CCGATATGTAAAGAACTGCAAGAACGGGAGGTCTCCTAAAGATACAAGATGGTGGTTCCA
TGACGACAAGGCATGATGGTAATATGACCAAACATCATAAATAAAAATGAGGTTTTATAT
AATTTCCCCAGAGACTGATAGTAACTGATATTGGGATTCCTTGTGGCCTCAAACCCTTTT
TCTTTCTTTCTATCTGTCTTTTGTATGGATGATTATGTAGACATCTGAAATGTCTCACAC
CTTGAATTAACTGTTTCTGCTTTTGTTCTCTCTAGAGCAACCTTGGAGATTTGATGAAAA
TTGTATTTGGGAACATGGTTTTTCTTTTTTTGCAATATATGTTCTTATTCTAGC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 2 4

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GGGATTAAATCATGAGGTTTGAATAAGAATAAACAGCATAAAGAAGGCTGACAAGTTCAT
GAGAAGACAAAGGTAATGCGCCTCTGGTTTTATTCTTCTTGTGTATACTGAAGAGTTGCT
TCTGTTACTCTACTCCAGGGGCCCAGACGAAGTTCCCTCCTCTTCACCATCAAACTCTTG
CTCAACACCTTTGACCTCGGATATATAATGCATCAGCATATTCTCAATCCCTGACTTCAA
AGTAACAGATGAACTTGGACAACCGCTACAAGCTCCTTGCATTCGAAGCTCAACTATCCC
AGTTTCCGTATCAAACCCACAATACTCAATGTCTCCTCCATCATCTTGGACTGATGGTCG
GATGCGAGTCTCCAAGAGTTCCTTGATCATTGCTACAGTTTCAGAGTCATCGTCGTTAAC
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GAAGTCCATTACCACTGCAAACACTTCAGGCTTGAGGAAGTCCCACGTCACGTCATCTGA
CTTTGTCACAGTGACAAAATCCGATCCGAAGAAAACTCTAACAACACCATCAATGGAGAA
GATGGCTTTTGCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BK89JQ U 219
AF RS1DU79JQ U 1
BS 1 294 RS1DU79JQ
BS 295 295 RS1BK89JQ
BS 296 350 RS1DU79JQ
BS 351 351 RS1BK89JQ
BS 352 673 RS1DU79JQ

RD RS1BK89JQ 244 0 0
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TATTCTCAATCCCTGACTTCAAAGTAACAGATGAACTTGGACAACCGCTACAAGCTCCTT
GCATTCGAAGCTCAACTATGCCAGTTTCCGTATCAAACCCACAATACTCAATGTCTCCTC
CATCATCTTGGACTGATGGTCGGATGCGAGTCTCCAAGAGTTCCTTGATCATTGCTACAG
TTTC

QA 1 244 1 244
DS 

RD RS1DU79JQ 673 0 0
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GGGATTAAATCATGAGGTTTGAATAAGAATAAACAGCATAAAGAAGGCTGACAAGTTCAT
GAGAAGACAAAGGTAATGCGCCTCTGGTTTTATTCTTCTTGTGTATACTGAAGAGTTGCT
TCTGTTACTCTACTCCAGGGGCCCAGACGAAGTTCCCTCCTCTTCACCATCAAACTCTTG
CTCAACACCTTTGACCTCGGATATATAATGCATCAGCATATTCTCAATCCCTGATTTCAA
AGTAACAGATGAACTTGGACAACCGCTACAAGCTCCTTGCATTCGAAGCTTAACTATCCC
AGTTTCCGTATCAAACCCACAATACTCAATGTCTCCTCCATCATCTTGGACTGATGGTCG
GATGCGAGTCTCCAAGAGTTCCTTGATCATTGCTACAGTTTCAGAGTCATCGTCGTTAAC
GGCAGTATCCTTGGCAGCTGCAACTTGTGAGTCTAGAAACAAAGGCTGGCCAGAAGAGTA
GAAGTCCATTACCACTGCAAACACTTCAGGCTTGAGGAAGTCCCACGTCACGTCATCTGA
CTTTGTCACAGTGACAAAATCCGATCCGAAGAAAACTCTAACAACACCATCAATGGAGAA
GATGGCTTTTGCC

QA 1 673 1 673
DS 



CO CL1556Contig2 778 2 16 U
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ATTCTCCGAATAAAGCTTAAATCTTTAGAATCTGGAAAAACGTAGGGAAACGATGAAAGG
GATAACGAGGTTTCTGAATTCTCTTTCGAGACATAGAGCTCGCGAGGTCTTTTCTTCGCC
TTGTCGTCCTCTTCTTCTGATATCACGTCGCCCTCTGTTCATCTCGGCGACAACCCAATT
CGCTACGAGTCACGGGAAGACTTATGCTTCTCGTAACTTTCCGAAAGTTTCTTCCTTTCC
TCTCAAATCGATCTCACTGGGAGTGCAAAGGAGGACCATGTTTATACAAACACAGTCAAC
ACCAAACCCTTCTTCTCTGATGTTTAGTCCTGGTAAACCAGTCATGGAAGTGGGAAGCGC
AGACTTCCCTAATTCTCGTTCAGCTATGACTTCACCTTTGGCAAAAGCCATCTTCTCCAT
TGATGGTGTTGTTAGAGTTTTCTTCGGATCGGATTTTGTCACTGTGACAAAGTCAGACGA
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CGATGACTCTGAAACTGTAGCAATGATCAAGGAACTCTTGGAGACTCGCATCCGACCATC
AGTCCAAGATGATGGAGGAGACATTGAGTATTGTGGGTTTGATACGGAAACTGGCATA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1DU79TF U 1
AF RS1BK89TF U 60
BS 1 211 RS1DU79TF
BS 212 212 RS1BK89TF
BS 213 336 RS1DU79TF
BS 337 337 RS1BK89TF
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BS 401 401 RS1BK89TF
BS 402 537 RS1DU79TF
BS 538 538 RS1BK89TF
BS 539 691 RS1DU79TF
BS 692 692 RS1BK89TF
BS 693 726 RS1DU79TF
BS 727 727 RS1BK89TF
BS 728 737 RS1DU79TF
BS 738 738 RS1BK89TF
BS 739 762 RS1DU79TF
BS 763 778 RS1BK89TF

RD RS1DU79TF 762 0 0
GGGATCACCATTCCCCCGACACGAATTAGCTTGTTTCTTCCTTCGCCTATCCGATTTGCG
ATTCTCCGAATAAAGCTTAAATCTTTAGAATCTGGAAAAACGTAGGGAAACGATGAAAGG
GATAACGAGGTTTCTGAATTCTCTTTCGAGACATAGAGCTCGCGAGGTCTTTTCTTCGCC
TTGTCGTCCTCTTCTTCTGATATCACGTCGCTCTCTGTTCATCTCGGCGACAACCCAATT
CGCTACGAGTCACGGGAAGACTTATGCTTCTCGTAACTTTCCGAAAGTTTCTTCCTTTCC
TCTCAAATCGATCTCACTGGGAGTGCAAAGGAGGACGATGTTTATACAAACACAGTCAAC
ACCAAACCCTTCTTCTCTGATGTTTAGTCCTGGTAAACCATTCATGGAAGTGGGAAGCGC
AGACTTCCCTAATTCTCGTTCAGCTATGACTTCACCTTTGGCAAAAGCCATCTTCTCCAT
TGATGGTGTTGTTAGAGTTTTCTTCGGATCGGATTTTGTCACTGTGACAAAGTCAGATGA
CGTGACGTGGGACTTCCTCAAGCCTGAAGTGTTTGCAGTGGTAATGGACTTCTACTCTTC
TGGCCAGCCTTTGTTTCTAGACTCACAAGTTGCAGCTGCCAAGGATACTGCCGTTAACGA
CGATGACTCTGAAACTGTAGCAATGATCAAG*AACTCTTGGAGACTCGCATCCGACCATC
AGTCCA*GATGATGGAG*AGACATTGAGTATTGTGGGTTTGA

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1BK89TF 719 0 0
GATTCTCCGAATAAAGCTTAAATCTTTAGAATCTGGAAAAACGTAGGGCAACGATGAAAG
GGATAACGAGGTTTCTGAATTCTCTTTCGAGACATAGAGCTCGCGAGGTCTTTTCTTCGC
CTTGTCGTCCTCTTCTTCTGATATCACGTCGCCCTCTGTTCATCTCGGCGACAACTCAAT
TCGCTACGAGTCACGGGAAGACTTATGCTTCTCGTAACTTTCCGAAAGTTTCTTCCTTTC
CTCTCAAATCGATCTCACTGGGAGTGCAAAGGAGGACCATGTTTATACAAACACAGTCAA
CACCAAACCCTTCTTCTCTGATGTTTAGTCCTGGTAAACCAGTCATGGAAGTGGGAAGTG
CAGACTTCCCTAATTCTCGTTCAGCTATGAGTTCACCTTTGGCCAAAGCCTTCTTCTCCA
TTGATGGTGTTGTTCGAGTTTTCTTTGGGTCGGATTTTGTCACTGTGACAAAGTCGGACG
ATGTGACGTGGGACTTCCTCAAGCCTGAAGTGTTTGCAGTGGTAATGGACTTCTACTCTT
CTGGCCAGCCTTTGTTTCTGGACTCACAAGTTGCAGCTGCCAAGGATACTGCCGTTAACG
AGGATGACTCTGAAACTGTAGCAATGATCAAGGAACTCTTGGAGACTCGCATCCGACCAT
CAGTCCAAGATGATGGAGGAGACATTGAGTATTGTGGGTTTGATACGGAAACTGGCATA

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 5

CO CL1557Contig1 813 5 14 U
GGAACCTTTCTCCGAAGAGCAGCGGTGAGAGAGAGAACCAGTCGAATCGAGAGGAAGAAA
AGATGGTGTCCGGGTCAGGGATATGCGCGAAGCGCGTCGTGGTCGACGCGAGGCACCACA
TGCTGGGCCGTCTTGCTTCGATCATCGCCAAGGAGCTGCTCAACGGACAGAGAGTCGTTG
TCGTCAGATGCGAGGAGATATGCCTGTCAGGTGGATTGGTTCGACAGAAGATGAAGTACA
TGAGGTTTATGAGGAAACGCATGAACACTAAGCCTTCTCACGGTCCCATTCACTTCAGGG
CTCCCTCTAAGATCTTCTGGCGTACCGTTCGTGGTATGATTCCACACAAGACCAAGCGTG
GAGCTGCTGCTCTTGCACGCTTGAAGGTCTTTGAAGGAGTCCCACCACCTTACGACAAGG
TCAAGAGAATGGTTATTCCTGATGCTCTCAAGGTTTTGAGGCTCCAGGCTGGTCACAAGT
ACTGCTTGTTGGGCCGTCTGTCTTCTGAGGTTGGCTGGAACCATTACGATACCATTAAGG
AGCTTGAGGTCAAAAGAAAGGAGAGGTCACAGGCTATGTATGAGCGTAAGAAGCAGCTCA
TCAAGCTCAGGACTAAGGCTGAGAAGGTTGCAGAGGAGAAGCTTGGATCCCAGCTTGATG
TTCTTGCACCCATCAAGTACTGAGAATTGGCATCTATTATTTGGTTTAATACTTGCTTTG
GTGCTCGTCTCTATTCTACCTTTTGAATTTTGTTTGTGCTTTTGGTAGCTTGTAAACTTA
AAATATTGGAATGAGACATTTTGGTTTTTGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RS1DG92TF U 1
AF RS1G807TF U 12
AF RS1BD71JQ C 376
AF RS1BD71TF U 10
AF RS1G807JQ C 331
BS 1 234 RS1DG92TF
BS 235 235 RS1G807TF
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BS 428 535 RS1DG92TF
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BS 608 775 RS1BD71TF
BS 776 776 RS1G807JQ
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BS 791 791 RS1G807JQ
BS 792 813 RS1BD71TF

RD RS1DG92TF 607 0 0
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TGAGGTTTATGAGGAAACGCATGAACACTAAGCCTTCTCACGGTCCCATTCACTTCAGGG
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GAGCTGCTGCTCTTGCACGCTTGAAGGTCTTTGAAGGAGTCCCACCACCTTACGACAAGG
TCAAGAAAATGGTTATTCCTGATGCTCTCAAGGTTTTGAGGCTCCAGGCTGGTCACAAGT
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TCAAGCT

QA 1 607 1 607
DS 

RD RS1G807TF 595 0 0
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GTCTTTGAAGGAGTCCTACCACCTTACGACAAGGTCAAGAGAATGGTTATTCCTGATGCT
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GAGGTTGGCTGGAACCATTACGATACCATTAAGGAGCTTGAGGTCAAAAGAAAGGAGAGG
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QA 16 595 16 595
DS 

RD RS1BD71JQ 345 0 0
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AGGCTGAGAAGGTTGCAGAGGAGAAGCTTGGATCCCAGCTTGATGTTCTTGCACCCATCA
AGTACTGAGAATTGGCATTTATTATTTGGTTTAATACTTGCTTTG

QA 1 345 1 345
DS 

RD RS1BD71TF 804 0 0
GGGAAGAGCAGCAGTGA
GAGAGAGAGAACCAGTCGAATCGAGAGGAAGAAAAAATGGTGTCCGGGTCAGGGATATGC
GCGAAGCGCGTCGTGGTCGACGCAAGGCACCACATGCTGGGCCGTCTTGCCTCGATCATC
GCCAAGGAGCTGCTCAACGGGCAGAGAGTCGTTGTCGTCAGATGCGAGGAGATATGCCTG
TCAGGTGGATTGGTTCGACAGAAGATGAAGTACATGAGGTTTATGAGGAAACGCATGAAC
ACTAAACCTTCTCACGGTCCCATTCACTTCAGGGCTCCCTCTAAGATCTTCTGGCGTACC
GTTCGTGGTATGATTCCACACAAGACCAAGCGTGGAGCTACTGCTCTTGCACGCTTGAAG
GTCTTTGAAGGAGTCCCACCACCTTACGACAAGGTCAAGAGAATGGTTATTCCTGATGCT
CTCAAGGTTTTGAGGCTCCAGGCTGGTCACAAGTACTGCTTGTTGGGCCGTCTGTCTTCT
GAGGTTGGCTGGAACCATTACGATACCATTAAGGAGCTTGAGGTCAAAAGAAAGGAGAGG
TCACAGGCTATGTATGAGCGTAAGAAGCAGCTCATCAAGCTCAGGACTAAGGCTGAGAAG
GTTGCAGAGGAGAAGCTTGGATCCCAGCTTGATGTTCTTGCACCCATCAAGTACTGAGAA
TTGGCATCTATTATTTGGTTTAATACTTGCTTTGGTGCTCGTCTCTATTCTACCTTTTGA
ATTTTGTTTGTGCTTTTGGTAGCTTGTAA*CTTAAA*TATTGGA*TGAGACATTTTGGTT
TTTGATG

QA 18 804 18 804
DS 

RD RS1G807JQ 481 0 0
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TTGAAGGAGTCCTACCACCTTACGACAAGGTCAAGAGAATGGTTATTCCTGATGCTCTCA
AGGTTTTGAGGCTCCAGGCTGGTCACAAGTACTGCTTGTTGGGCCGTCTGTCTTCTGAGG
TTGGCTGGAACCATTACGATACCATTAAGGAGCTTGAGGTCAAAAGAAAGGAGAGGTCAC
AGGCTATGTATGAGCGTAAGAAGCAGCTCATCAAGCTCAGGACTAAGGCTGAGAAGGTTG
CAGAGGAGAAGCTTGGATCCCAGCTTGATGTTCTTGCACCCATCAAGTACTGAGAATTGG
CATCTATTATTTGGTTTAATACTTGCTTTGGTGCTCGTCTCTATTCTACCTTTTGAATT*
*GTTTGTGCTTTTGGTAGCTTGTAAACTTAAAATATTGGAATGAGACATTTTGGTTTTT
TT

QA 1 479 1 479
DS 



AS 1 5

CO CL1558Contig1 579 5 22 U
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GAAGAACAGAACCGATCTGAAGGTAGAAGATGCAGGAATTGCTGCATTGTTTGGTCTCGA
ATGCTTTGCCTGGTACTGCGCAGGCGAAATCGCCGGAAGAGGATTCACCTTCACTGGCTA
CTACCCTTGAAAGAGAGGAACAATAACTTGAACAAGATTGTGTAATCTGAATCAAATTTT
TTTT*CTTCAAGTTTTTCCCTGAAACGGAAACAGAGTATTTGGGATCTGAGAAAATTTCC
ATTTTGCTAAACTCTCCTTGATAAGTTTGAGATTAATAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 20 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RS1DM51JQ C 1
AF RS1DM51TF U 1
AF RS1GD08TF U 1
AF RS1DZ91JQ C 7
AF RS1DZ91TF U 7
BS 1 8 RS1DM51JQ
BS 9 58 RS1DM51TF
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RD RS1DM51JQ 548 0 0
GGTCTCTCATCTTCCTCACCGGTGCCGCATCTCTCTATCCCAACGGATTTGGTTTCTGGA
GATGGCATCGAAGTTGGTACAAGTTCAGTCAAAGGCGTGTGAGGCTTCAAAGTTTGTGAC
CAAGCATGGAACTTCTTATTACAGGCAGTTGCTTGAGAAGAACAAGCACTACATCCAGGA
ACCTGCCACTGTGGAGAAGTGCCAAGAGTTGTCTAAGCAGCTGCTCTACACCCGTCTTGC
TAGCATTCCCAAACGCTATGAAACTTTCTGGAAGGAAGTAGACTATGCAAAGAACTTGTG
GAAGAACAGAACCGATCTGAAGGTAGAAGATGCAGGAATCGCTGCTTTGTTTGGTCTCGA
ATGCTTTGCCTGGTACTGCGCAGGCGAAATCGCCGGAAGAGGATTCACCTTCACCGGCTA
CTACCCTTGAAAGAGAGGAACAATAACTTGAACAAGATTGTGTAATCTGAATCAATTTTT
TTTTTCTTCAAGTTTTTCCCTGAAACGGAAACAGAGTATTTGGGATATGAGAAAATTTCC
ATTTTGCT

QA 1 548 1 548
DS 

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GGTCTCTC
ATCTTCCTCACCGGTGCCGCATCTCTCTATCCCAACGGATTTGGTTTCTGGAGATGGCAT
CGAAGTTGGTACAAGTTCAGTCAAAGGCGTGTGAGGCTTCAAAGTTTGTGACCAAGCATG
GAACTTCTTATTACAGGCAGTTGCTTGAGAAGAACAAGCACTACATCCAGGAACCTGCCA
CTGTGGAGAAGTGCCAAGAGTTGTCTAAGCAGCTGCTCTACACCCGTCTTGCTAGCATTC
CCAAACGCTATGAAACTTTCTGGAAGGAAGTAGACTATGCAAAGAACTTGTGGAAGAACA
GAACCGATCTGAAGGTAGAAGATGCAGGAATCGCTGCTTTGTTTGGTCTCGAATGCTTTG
CCTGGTACTGCGCAGGCGAAATCGCCGGAAGAGGATTCACCTTCACCGGCTACTACCCTT
GAAAGAGAGGAACAATAACTTGAACAAGATTGTGTAATCTGAATCAATTTTTTTTTTCTT
CAAGTTTTTCCCTGAAACGGAAACAGAGTATTTGGGATATGAGAAAATTTCCATTTTGCT

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DS 

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GGACTCTC
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CGAAGTTGGTACAAGTTCAGTCAAAGGCGTGTGAGGCTTCAAAGTTTGTGGCCAAGCATG
GAACTTCTTATTACAGGCAGTTGCTTGAGAAGAACAAGCACTACATCCAGGAACCTGCCA
CTGTGGAGAAGTGCCAAGAGTTGTCTAAGCAGCTGCTCTACACCCGTCTTGCTAGCATTC
CCAAACGCTATGAAACTTTCTGGAAGGAAGTAGACTACGCAAAGAACTTGTGGAAGAACA
GAACCGATCTGAAGGTAGAAGATGCAGGAATTGCTGTATTGTTTGGTCTCGAATGCTTTG
CCTGGTACTGCGCAGGCGAAATCGCCGGAAGAGGATTCACCTTCACTGGCTACTACCCTT
GAAAGAGAGGAACAATAACTTGAACAAGATTGTGTAATCTGAATCAAATTTTTTTT*CTT
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CTGTGGAGAAGTGCCAAGAGTTGTCTAAGCAGCTGCTCTACACCCGTCTTGCTAGCATTC
CCAAACGCTATGAAACTTTCTGGAAGGAAGTAGACTACGCAAAGAACTTGTGGAAGAACA
GAACCGATCTGAAGGTAGAAGATGCAGGAATTGCTGCATTGTTTGGTCTCGAATGCTTTG
CCTGGTACTGCGCAGGCGAAATCGCCGGAAGAGGATTCACCTTCACTGGCTACTACCCTT
GAAAGAGAGGAACAATAACTTGAACAAGATTGTGTAATCTGAATCAAATTTTTTTT*CTT
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GG
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CGAAGTTGGTACAAGTTCAGTCAAAGGCGTGTGAGGCTTCAAAGTTTGTGGCCAAGCATG
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CTGTGGAGAAGTGCCAAGAGTTGTCTAAGCAGCTGCTCTACACCCGTCTTGCTAGCATTC
CCAAACGCTATGAAACTTTCTGGAAGGAAGTAGACTACGCAAAGAACTTGTGGAAGAACA
GAACCGATCTGAAGGTAGAAGATGCAGGAATTGCTGCATTGTTTGGTCTCGAATGCTTTG
CCTGGTACTGCGCAGGCGAAATCGCCGGAAGAGGATTCACCTTCACTGGCTACTACCCTT
GAAAGAGAGGAACAATAACTTGAACAAGATTGTGTAATCTGAATCAAATTTTTTTT*CTT
CAAGTTTTTCCCTGAAACGGAAACAGAGTATTTGGGATCTGAGAAAATTTCCATTTTGCT
AAACTCTCCTTGATAAGTTTGAGATTAATAA

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DS 



AS 1 5

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CGATCTTTCGCCGATTCTCTTCAGGTTCCGTAGATCTACAGCTCGCGTTGCATCTGCTTG
TGATCCGAACAGTGTTATTCACTCAACAACAAGTTTCAGACCGAATGGCGCTAGTTGTGA
TTTGCGGGCAGCCTTGTAGCGGGAAGTCAAAAGCTGCAGCAACCTTATCCGAAACACTGA
AAGAATCCGAAACGAAGCAGAACGTTAGAATCATCGACGAAGATTCGTTTCATCTAGACC
GGAACCAGAACTACGCCAACATGCCTGCGGAGAAGAACCTTAGAGGGAAGCTCAGGTCAG
ATGTCGACAGATCGGTTTCGAGAGGAGACATTGTTATTGTAGATTCTTTGAACAGCATCA
AGGGTTACAGATACGAGCTGTGGTGCATCGCACGCGCCGCTGGGATTAGGTACTGTGTTC
TCTTCTGTGATGTGGATGAAGCTCGGTGCAGGGAGTGGAATAAGGAGCGTGGGGATAGAG
GTGAAGCTTCGTATGACGACGGTATCTTCGAGGATCTGGTGAGGAGGTTCGAGAGACCCG
AGAGGAGAAACAGGTGGGATTCACCTCTCTTTGAGCTGTACCCTTCTCGAGATGGGATAG
AGATATCATCTCCTGTGGTCTCAGAGGCTGTGACTTATCTGACCAAGACTGTTGATTCCA
AAACTCAAGACGTGAGGATCCTCCAGCCGAGCATAGCGACGCAGTCTGCTAGATTCTCGG
AAGCGAATTCTCTTTACGAGTTGGACAGAGCGACGCAAGAAGTCATTAACGCGATTGTGG
AGCAACAAGCGCTCGGTGGGGCTATAAGCAGAGTTACTCTTGGCAATGGTCTACCTCCGA
TTGAAATCTGCAGACCAGTTGGACTACCGGAGCTAGGTAGGCTTCGAAGAACGTTTGTTA
AGTTGATGGGTCAGTCGAGTCTGAGCGGACCACCGGTACCAACTGATGCAAACAGTGGAA
AGAGACGGTTTGTGGATTACTTGAACAGAGAGTTTGGAGGTAATAACGCTTGAAATTGGT
GGGTGAAGAAACATTTTACAATTTGTTTTTTTTTCATCTTCTCAACACAAGCCAAGTTTA
CACTTTGTGCTCTTCAGTGAAAAGTTGTGAGCTAATTGATGTATTTGTCTTATTCAAACA
AATATATAGTTTATTATTTATCAAGTTAAACAGTGTTTTGTGTGTAATATCTTTCCAGTT
TTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1C316TF U 1
AF RS1CZ77TF U 13
AF RS1CT05TF U 481
AF RS1C316JQ C 354
AF RS1CZ77JQ C 686
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RD RS1C316TF 717 0 0
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CGATCTTTCGCCGATTCTCTTCAGGTTCCGTAGATCTACAGCTCGCGTTGCATCTGCTTG
TGATCCGAACAGTGTTATTCACTCAACAACAAGTTTCAGACCGAATGGCGCTAGTTGTGA
TTTGCGGGCAGCCTTGTAGCGGGAAGTCAAAAGCTGCAGCAACCTTATCCGAAACACTGA
AAGAATCCGAAACGAAGCAGAACGTTAGAATCATCGACGAAGATTCGTTTCATCTAGACC
GGAACCAGAACTACGCCAACATGCCTGCGGAGAAGAACCTTAGAGGGAAGCTCAGGTCAG
ATGTCGACAGATCGGTTTCGAGAGGAGACATTGTTATTGTAGATTCTTTGAACAGCATCA
AGGGTTACAGATACGAGCTGTGGTGCATCGCACGCGCCGCTGGGATTAGGTACTGTGTTC
TCTTCTGTGATGTGGATGAAGCTCGGTGCAGGGAGTGGAATAAGGAGCGTGGGGATAGAG
GTGAAGCTTCGTATGACGACGGTATCTTCGAGGATCTGGTGAGGAGGTTCGAGAGACCCG
AGAGGAGAAACAGGTGGGATTCACCTCTCTTTGAGCTGTACCCTTCTCGAGATGGGATAG
AGATATCATCTCCTGTGGTCTCAGAGGCTGTGACTTATCTGACCAAGACTGTTGATT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1CZ77TF 762 0 0
GGG
ACGCGACCTTTCTTCAACCTCCCCACAACTTTTTGATTCCGGTGTCGATCTTTCGCCGAT
TCTCTTCAGGTTCCGTAGATCTACAGCTCGCGTTGCATCTGCTTGTGATCCGAACAGTGT
TATTCACTCAACAACAAGTTTCAGACCGAATGGCGCTAGTTGTGATTTGCGGGCAGCCTT
GTAGCGGGAAGTCAAAAGCTGCAGCAACCTTATCCGAAACACTGAAAGAATCCGAAACGA
AGCAGAACGTTAGAATCATCGACGAAGATTCGTTTCATCTAGACCGGAACCAGAACTACG
CCAACATGCCTGCGGAGAAGAACCTTAGAGGGAAGCTCAGGTCAGATGTCGACAGATCGG
TTTCGAGAGGAGACATTGTTATTGTAGATTCTTTGAACAGCATCAAAGGTTACAGATACG
AGCTGTGGTGCATCGCACGCGCCGCTGGGATTAGGTACTGTGTTCTCTTCTGTGATGTGG
ATGAAGCTCGGTGCAGGGAGTGGAATAAGGAGCGTGGGGATAGAGGTGAAGCTTCGTATG
ACGACGGTATCTTCGAGGATCTGGTGAGGAGGTTCGAGAGACCCGAGAGGAGAAACAGGT
GGGATTCACCTCTCTTTGAGCTGTACCCTTCTCGAGATGGGATAGAGATATCATCTCCTG
TGGTCTCAGAGGCTGTGACTTATCTGACCAATACTGTTGATTCCAAA*CTCA*GACGTGA
GGATCCTCCAGCCGAGCATAGCGACGCAGTCTGCTAGAT

QA 4 762 4 762
DS 

RD RS1CT05TF 694 0 0
G
CTTCTGTGATGTGGATGAAGCTCGGTGCAGGGAGTGGAATAAGGAGCGTGGGGATAGAGG
TGAAGCTTCGTATGACGACGGTATCTTCGAGGATCTGGTGAGGAGGTTCGAGAGACCCGA
GAGGAGAAACAGGTGGGATTCACCTCTCTTTGAGCTGTACCCTTCTCGAGATGGGATAGA
GATATCATCTCCTGTGGTCTCAGAGGCTGTGACTTATCTGACCAAGACTGTTGATTCCAA
AACTCAAGACGTGAGGATCCTCCAGCCGAGCATAGCGACGCAGTCTGCTAGATTCTCGGA
AGCGAATTCTCTTTACGAGTTGGACAGAGCGACGCAAGAAGTCATTAACGCGATTGTGGA
GCAACAAGCGCTCGGTGGGGCTATAAGCAGAGTTACTCTTGGCAATGGTCTACCTCCGAT
TGAAATCTGCAGACCAGTTGGACTACCGGAGCTAGGTAGGCTTCGAAGAACGTTTGTTAC
GTTGATGGGTCAGTCGAGTCTGAGCGGACCACCGGTACCAACTGATGCAAACAGTGGAAA
GAGACGGTTTGTGGATTACTTGAACAGAGATTTTGGAGGTAATAACGCTTGAAATTGGTG
GGTGAAGAAACATTTTACAATTTGTTTTTTTTTCATCTTCTCAACACAAGCCAAGCTTAC
ACTTTGTGCTCTTCAGTGAAA*GTTGTGAGCTA

QA 2 694 2 694
DS 

RD RS1C316JQ 892 0 0
CA
GTCAGATGTCGACAGATCGGTT*CGAGAGGAGACATT*TTATTGTAGATT*TTTGAACAG
CATCAAGGGT*ACAGATACGAGCTGTGGTGCATCGCACGCGCCGCTGGGATTAGGTACTG
TGTTCTCTTCTGTGATGTGGATGAAGCTCGGTGCAGGGAGTGGAATAAGGAGCGTGGGGA
TAGAGGTGAAGCTTCGTATGACGACGGTATCTTCGAGGATCTGGTGAGGAGGTTCGAGAG
ACCCGAGAGGAGAAACAGGTGGGATTCACCTCTCTTTGAGCTGTACCCTTCTCGAGATGG
GATAGAGATATCATCTCCTGTGGTCTCAGAGGCTGTGACTTATCTGACCAAGACTGTTGA
TTCCAAAACTCAAGACGTGAGGATCCTCCAGCCGAGCATAGCGACGCAGTCTGCTAGATT
CTCGGAAGCGAATTCTCTTTACGAGTTGGACAGAGCGACGCAAGAAGTCATTAACGCGAT
TGTGGAGCAACAAGCGCTCGGTGGGGCTATAAGCAGAGTTACTCTTGGCAATGGTCTACC
TCCGATTGAAATCTGCAGACCAGTTGGACTACCGGAGCTAGGTAGGCTTCGAAGAACGTT
TGTTAAGTTGATGGGTCAGTCGAGTCTGAGCGGACCACCGGTACCAACTGATGCAAACAG
TGGAAAGAGACGGTTTGTGGATTACTTGAACAGAGAGTTTGGAGGTAATAACGCTTGAAA
TTGGTGGGTGAAGAAACATTTTACAATTTGTTTTTTTTTCATCTTCTCAACACAAGCCAA
GTTTACACTTTGTGCTCTTCAGTGAAAAGTTGTGAGCTAATTGATGTATTTGTCTTATTC
AAACAAATATATAGTTTATTATTTATCAAGTTAAACAGTGTTTTGTGTG
C

QA 3 891 3 891
DS 

RD RS1CZ77JQ 579 0 0
GGCTGTGACTTATTTGACCAATACTGTTGATTCCAAAACTCAAGACGTGAGGATCCTCCA
GCCGAGCATAGCGACGCAGTTTGCTAGATTTTCGGAAGGGAATTCTCTTTACGAGTTGGA
CAGAGCGACGCAAGAAGTCATTAACGCGATTGTGGAGCAACAAGCGCTCGGTGGGGCTAT
AAGCAGAGTTACTTTTGGCAATGGTCTACCTCCGCTTGAAATTTGCAGACCAGTTGGACT
ACCGGAGCTAGGTAGGCTTCGAAGAACGTTTGTTAAGTTGATGGGTCAGTCGAGTTTGAG
CGGACCACCGGTACCAACTGATGCAAACAGTGGAAAGAGACGGTTTGTGGATTACTTGAA
CAGAGAGTTTGGAGGTAATAACGCTTGAAATTGGTGGGTGAAGAAACATTTTACAATTTG
TTTTTTTTTCATTTTTTCAACACAAGCCAAGTTTACACTTTGTGCTTTTCAGTGAAAAGT
TGTGAGCTAATTGATGTATTTGTTTTATTCAAACAAATATATAGTTTATTATTTATCAAG
TTAAACAGTGTTTTGTGTGTAATATCTTTCCAGTTTTTG

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 5

CO CL1560Contig1 688 5 8 U
GGATTCATCACTTCTCCATACAACAAAATATTCTAAACAAGTTGAAAATGGCTTCCAAGG
CATTACTTTTGTTGGGTCTCTTTGCAATTCTTTTCGTCATCTCAGAAGTTGCCGCGACAT
CCGAAGAGTCATTGAAGTCAGAGAGTAAGGATACCTTACAACCTAACCATGACCAATATG
GTGGTGGTGGCCGCGGTGGCAATGGAGGCTACAACGGAGGGGGAGGTTACAACGGAGGGG
GAGGATACAATGGAGGCGGAGGATACAACGGAGGAGGACACAACGGAGGAGGACACAATG
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ATGCCGGAGAAGCTGTTCAGACACAGCCCGGCCACTAAAAGTCGATAACGTATTAACCAC
CACCATATATGCAGTTATGTGTCTTTATGAGTACGAAACGTCGAAAACCATCGTGGTGTG
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AATTATGAGAATAAAGTTTGATTATGTAATGTCTTTGCGTTTGAGCTGTTATCTTTCGTG
GCTGTCATAATAAAATCGTTTGTAGTTG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 

AF RS1E595TF U 5
AF RS1GW93TF U 1
AF RS1B602TF U 5
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AF RS1B602JQ C 159
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GG
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GTGGTGGTGGCCGCGGTGGCAATGGAGGCTACAACGGAGGGGGAGGTTACAACGGAGGGG
GAGGATACAATGGAGGCGGAGGATACAACGTAGGAGGACACAACGGAGGAGGACACAATG
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ATGCCGGAGAAGCTGTTCAGACACAGCCCGGCCACTAAAAGTCGATAACGTATTAACCAC
CACCATATATGCAGTTATGTGTCTTTATGAGTACGAAACGTCGAAAACCATCGTGGTGTG
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AATTATGAGAATAAAGTTTGATTATGTAATGTCTTTGCGTTTGAGCTGTTATCTTTCGTG
GCTGTCATAATAAAATCGTTTGTA

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DS 

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GG
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AGTCATTGAAGTCAGAGAGTAAGGATACCTTACAACCTAACCATGACCAATATGGTGGTG
GTGGCCGCGGTGGCAATGGAGGCTACAACGGAGGGGGAGGTTACAACGGAGGGGGAGGAT
ACAATGGAGGCGGAGGATACAACGGAGGAGGACACAACGGAGGAGGACACAATGGAGGAG
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GCCGCCACGGCTGCTGCTACAGAGGTTACCGTGGCTGCTCAAGGTGTTGCTCATATGCCG
GAGAAGCTGTTCAGACACAGCCCGGCCACTAAAAGTCGATAACGTATTAACCACCACCAT
ATATGCAGTTATGTGTCTTTATGAGTACGAAACGTCGAAAACCATCGTGGTGTGTTTGTA
ATGAATAATGATGTAAGCGACTTTTAGTGAAGGCCAGGATTGATTAAGAGGCCAAATTAT
GAGAATAAAGTTTGATTATGTAATGTCTTTGCGTTTGAGCTGTTATCTTTCGTGGCTGTC
ATAATAAAATCGTTTGTA
GTTG

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GACACAACGGAGGAGGACACAATGGAGGAGGACACAACGGAGGAGTCCGAGGTGGAGGAT
ACAACGGAGGAGGCCGAGGAGGAGGTTACTGCCGCCACGGCTGCTGCTACAGAGGTTACC
GTGGCTGCTCAAGGTGTTGCTCATATGCCGGAGAAGCTGTTCAGACACAGCCCGGCCACT
AAAAGTCGATAACGTATTAACCACCACCATATATGCAGTTATGTGTCTTTATGAGTACGA
AACGTCGAAAACCATCGTGGTGTGTTTGTAATGAATAATGATGTAAGCGACTTTTAGTGA
AGGCCAGGATTGATTAAGAGGCCAAATTATGAGAATAAAGTTTGATTATGTAATGTCTTT
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GTTT

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AACGGAGGAGGCCGAGGAAGAGGTTACTGCCGCCACGGCTGCTGCTACAGAGGTTACCGT
GGCTGCTCAAGGTGTTGCTCATATGCCGGAGAAGCTGTTCAGACACAGCCCGGCCACTAA
AAGTCGATAACGTATTAACCACCACCATATATGCAGTTATGTGTCTTTATGAGTACGAAA
CGTCGAAAACCATCGTGGTGTGTTTGTAATGAATAATGATGTAAGCGACTTTTAGTGAAG
GCCAGGATTGATTAAGAGGCCAAATTATGAGAATAAAGTTTGATTATGTAATGTCTTTGC
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DS 



AS 1 4

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ACATTATTTTCTGCTTATATAGCATTATTCAGTTACAAACACTAGATCATAAACGCTCAG
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CTTCTAAAAGATAGTCTTCTGTATTCCTAGTTAAATGACATCCGTCGGCTACAACTTGTT
GTAATGGATCCAAAACATTCTGCACCATCCTTAGAAATGTTCCATCTTCTGCTGCAACAT
GTTCCACAAAGAGGTAAAGCCCTCCTGGTTTTAGGATCCGCTTTATCTCTTTGAGTGTTT
GAGGGATATCCGAGACAGAACACATCACGAGACTTCCCACAACTGCATCCACTGAGGCAT
CTTCTAATGGCATAGATTCTGCGACCGCGTGAATGAACTTGAAGTTTTCCGATTTCACTC
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CTGAATCTATGGTCACCGGGAACGTTAAGGAAGGTGTGAAATTCAGGATCGCCATTGCTA
TTTCTCAAACTACCCGTTTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AATGTTCCATCTTCTGCTGCAACATGTTCCAC
GA

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DS 

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ACATTATTTTTTGCTTATATAGCATTATTCAGTTACAAACACTAGATCATAAACGCTCAG
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AACGTTGATATTTTCAAACGTGAAAGAAAGCCTTGTGTTCAGTCCAAAGATGAGCTGCTG
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TTAAGTGGTAAAAGGCAGAAAGAGAGACCTTGTTGATATCTACACCACCATTGAACCCAG
CTTCTAAAAGATAGTCTTCTGTATTCCTAGTTAAATGACATCCGTCGGCTACAACTTGTT
GTAATGGATCCAAAACATTCTGCACCATCCTTAGAAATGTTCCATCTTCTGCTGTAACAT
GTTCCACAAAGAGGTAAAGCCCTCCTGGTTTTAGGATCCGCTTTATCTCTTTGAGTGTTT
GAGGGATATCCGAGACAGAACACATCACGAGACTTCCCACAACTGCATCCACTGAGGCAT
CTTCTAATGGCATAGATTCTGCGACCGCGTGAATGAACTTGAAGTTTTC
G

QA 1 649 1 649
DS 

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GCTTATATAGCATTATTCAGTTACAAACACTAGATCATAAACGCTCAGACTCAATCCATT
GAGTCGACAGTTTAGGATCAAAAACAGATATAGAGAAACAGAGTTGAAAACGTTGATATT
TTCAAACGTGAAAGAAAGCCTTGTGTTCAGTCCAAAGATGAGCTGCTGAGTTCAGATACT
TCCCAGCTTTTTTTTT**AATTATATGCAACTCCATAAAGATGAGGGCTTAAGTGGTAAA
AGGCAGAAAGAGAGACCTTGTTGATATCTACACCACCATTGAACCCAGCTTCTAAAAGAT
AGTCTTCTGTATTCCTAGTTAAATGACATCCGTCGGCTACAACTTGTTGTAATGGATCCA
AAACATTCTGCACCATCCTTAGAAATGTTCCATCTTCTGCTGCAACATGTTCCACAAAGA
GGTAAAGCCCTCCTGGTTTTAGGATCCGCTTTATCTCTTTGAGTGTTTGAGGGATATCCG
AGACAGAACACATAACGAGACTTCCCACAACTGCATCCACTGAGGCATCTTCTAATGGCA
TAGATTCTGCGACCGCGTGAATGAACTTGAAGTTTTCGGATTTCACTCCTGCTTCTATAG
CGGATTTGCGTGCGTGACTTTCCATCTTAGGGTTTGGATCAACACCAAGAACAGAGACGT
TTGGAATATTGTTATAGTACTTGATGTTCGGACCAGCTCCAATACCAATCTCCAAAACAG
TTTCTGCTTTTCCCACCAAATTTGCAAAGAGTTTCTTCTTGTAAACAGCAATCTCTTTCT
CATATCT

QA 1 787 1 787
DS 

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GGATCCG
TTTATCTCTTTGAGTGTTTGAGGGATATCCGAGACAGAACACATCACAAGACTTCCCACA
ACTGCATCCACTGATGCATCTTCTAATGGCATAGATTCTGCGACCGCGTGAATAAACTTG
AAATTTTCCGATTTCACTCCTGCTTCTATAGCGGATTTGCGTGCGTGACTTTCCATCTTA
GGGTTTGGATCAACACCAAGAACAGAGACGTTTGGAATATTGTTATAGTACTTGATGTTC
GGACCAGCTCCAATTCCAATCTCCAAAACAGTTTCTGCTTTTCCCACCAAATTTGCAAAG
AGTTTCTTCTTGTAAACGGCAATCTCTTTCTCATATCTTTCCATGCCTGCACTCCTGAAA
TAACCATAGAGCTCAAAATACCAGTCAGGCTTAGGAGGACGCAACTGGTTCAATACTTCC
GTTGAGTTAGTAGCAGTGGATGGAGCTGTGGATGGAGCAGCGTAGGAAGGAGAGATTGGA
AGAAACGGCGTCGTAGCTTCTCCTAGGAAATGCTTTCTTCCGCACGTACATAAGCTGAAA
CCATGTGAGGCTGGAGGATCCGTAGTAATGAGACTCTTCTGCATTTTGATGACAGAACCC
CTAACTCTTGTTCTTCGAGCTGAATCTATGGTCACCGGGAACGTTAAGGAAGGTGTGAAA
TTCAGGATCGCCATTGCTATTTCTCAAACTACCCGTTTCA

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DS 



AS 1 4

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CGGAGAGAAGATGGCAGGCAAGGGAGGGAAAGGGCTCGTAGCTGCAAAGACGATGGCTTC
TAACAAGGACAAAGACAAGGGCAAGATGAAACCCATCTCTCGATCTGCTCGTGCCGGTAT
TCAGTTTCCAGTGGGTCATATCCATAGGCAACTCAAGACCAGGGTTTCAGCACACGGAAG
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CGGAGGTGGTGTGATCCCTCACATCCACAAGTCTCTCATCAACAAAACCACCACTGAGTG
ATTTGTTGTTAGAGTGATCTTGCTAGTTAGTTGCTCATCGTGTGTTGGTGTTTTGTTAAC
GTCTTGAACTGCTT**CCCTTCCTTTATTAGTGTTGCCTTTTATTGGACATCTTCAGGTG
TACATGAGTTAATTTGAACTCTTCTGCTTCTCTGTTTAGCAATTCTTGTCTTTGCATACT
CTTGTGGTTTAGCTTCTTTCAAGTAAATCAGTTTAATTACCGGTGTTAAATAACCGAGG


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 10 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DS96TF U 31
AF RS1DG90TF U 6
AF RS1A771TF U 1
AF RS1A771JQ C 29
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RD RS1DS96TF 640 0 0
GG
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CGATTCTGGAGTACTTGACTGCAGAAGTTCTTGAGTTAGCTGGAAACGCAAGCAAGGATC
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CTCTCATCAACAAAACCACCACTGAGTGATTTGTTGTTAAAGTGATCTTGCTAGTTAGCT
GCTCATCGTGTGTTGGTGTTTTGTTAACGTCTTGAACTGCTTTTCCTTTCCTTTATTAGT
GTTTGCCTTTATTGGACATCTTCAGGTGTACATGAGTTAATTTGAACTCTTCTGCTTCTC
TGTTTAGCAATTCTTGTCTTTGCAT
GCCTCTTGTGGTT

QA 3 627 3 627
DS 

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GG
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AAGATGGCAGGCAAGGGAGGGAAAGGGCTCGTAGCTGCAAAGACGATGGCTTCTAACAAG
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CCAGTGGGTCGTATCCATAGGCAACTCAAGACCAGGGTTTCAGCACACGGAAGAGTTGGT
GCCACTGCTGCTGTTTACACTGCTTCGATTCTGGAGTACTTGACTGCAGAAGTTCTTGAG
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ACTGCTTTTCCTTTCCTTTATTAGTGTTTGCCTTTATTGGACATCTTCAGGTGTACATGA
GTTAATTTGAACTCTTCTGC

QA 3 622 3 622
DS 

RD RS1A771TF 719 0 0
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CGGAGAGAAGATGGCAGGCAAGGGAGGGAAAGGGCTCGTAGCTGCAAAGACGATGGCTTC
TAACAAGGACAAAGACAAGGGCAAGATGAAACCCATCTCTCGATCTGCTCGTGCCGGTAT
TCAGTTTCCAGTGGGTCATATCCATAGGCAACTCAAGACCAGGGTTTCAGCACACGGAAG
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TCTCGAGTTAGCTGGAAACGCAAGCAAGGATCTGAAAGTGAAGAGGATAACTCCAAGGCA
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CGGAGGTGGTGTGATCCCTCACATCCACAAGTCTCTCATCAACAAAACCACCACTGAGTG
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GTCTTGAACTGCTT**CCCTTCCTTTATTAGTGTTGCCTTTTATTGGACATCTTCAGGTG
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CTTGTGGTTTAGCTTCTTTCAAGTAAATCAGTTTAATTACCGGTGTTAAATAACCGAGG

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DS 

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TCTC
CTCGTCGTCTCAGGGATATAGAAGTGAGCGGAGAGAAGATGGCAGGCAAGGGAGGGAAAG
GGCTCGTAGCTGCAAAGACGATGGCTTCTAACAAGGACAAAGACAAGGGCAAGATGAAAC
CCATCTCTCGATCTGCTCGTGCCGGTATTCAGTTTCCAGTGGGTCATATCCATAGGCAAC
TCAAGACCAGGGTTTCAGCACACGGAAGAGTTGGTGCCACTGCTGCTGTTTACACTGCTT
CGATTCTGGAGTACTTGACTGCAGAAGTTCTCGAGTTAGCTGGAAACGCAAGCAAGGATT
TGAAAGTGAAGAGGATAACTCCAAGGCATTTGCAGTTGGCTATCAGAGGAGATGAGGAGC
TTGACACGCTCATCAA*GGAACCATTGCCGGAGGTGGTGTGATCCCTCACATCCACAAGT
CTCTCATCAACAAAACCACCACTGAGTGATTTGTTGTTAGAGTGATCTTGCTAGTTAGTT
GCTCATCGTGTGTTGGTGTTTTGTTAACGTCTTGAACTGCTT**CCCTTCCTTTATTAGT
GTTGCCTTTTATTGGACATCTTCAGGTGTACATGAGTTAATTTGAACTTTTTTGCTTCTC
TGTTTAGCAATTCTTGTCTTTGCATACTCTTGTGGTTTAGCTTCTTTCAAGTAAATCAGT
TTAATTACCGGTGTTAAATAACCGAGG

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DS 



AS 1 5

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AGTCCAGGTGAAACTGCAGCAACGGATCCGGCAAGGGAATGCGAGGGAAAAGGAGCTTGT
GAATTCAAACAGACTCGACTCTCTGATACAATCATGCCTCATATCCTCAACTTGTACGGG
GCATGTGCAAAAGCAAACGATTTTGACATGTACGCACCAAATGCTTCGTTTGAGGACCCT
TTAACACATGCTCAAGGGGTGAAGCAAATCAAATCAGCTTTTTATTCACTCTCCAAGGTG
TTTGGTGAGTCGAAAATAGTTGAATACCAAGTTCAAGAAAGTGATATCGCACCGGGGAAG
AAAGAGATACTAATCGACAACAAACAACACTACAAGATCATGGGAAAGGACATAGATATG
ATCTCCCTCATCAAACTCTCTGTCGAGAATGGGAAGATTGTCCGACACGAAGACTGGTGG
GATAAGAAACCTCTGAGGAACAGAGACACAGTTAGCTTCCCATTAGTCGGTCGGTTTATG
GAGATGGG*TCGAAGAGGCATGATGCTAGCTACTCATGCCATGATGGGTTTTGGTAAAGA
TCCTGACTCACATTGAATAAAGGAGAGATTCATCGGAAACAATGAATATATAATGTCTAA
GCTCTTCAAAACATTCCTTGATTTTGAGTAACTTCCTCTGTCGGTTTGGTTTGGTTTCGA
TTTTAGTTTTATATTTGTAATATATTAACGTGTGGTTGGGTTATCAAATGTTTGTGTATA
CATCTAATTTTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AV32TF U 1
AF RS1CY09TF U 88
AF RS1AV32JQ C 3
AF RS1BA33TF U 169
AF RS1CY09JQ C 88
BS 1 548 RS1AV32TF
BS 549 549 RS1BA33TF
BS 550 641 RS1AV32TF
BS 642 642 RS1BA33TF
BS 643 670 RS1AV32TF
BS 671 671 RS1BA33TF
BS 672 684 RS1AV32TF
BS 685 685 RS1BA33TF
BS 686 690 RS1AV32TF
BS 691 691 RS1BA33TF
BS 692 703 RS1AV32TF
BS 704 704 RS1BA33TF
BS 705 723 RS1AV32TF
BS 724 724 RS1BA33TF
BS 725 729 RS1AV32TF
BS 730 730 RS1BA33TF
BS 731 739 RS1AV32TF
BS 740 740 RS1BA33TF
BS 741 745 RS1AV32TF
BS 746 746 RS1BA33TF
BS 747 756 RS1AV32TF
BS 757 757 RS1BA33TF
BS 758 774 RS1AV32TF
BS 775 782 RS1BA33TF
BS 783 795 RS1CY09JQ

RD RS1AV32TF 774 0 0
GGAATCTAAATCTTTCAACAATCTCTGAACACATCATCAATGGGGAAAGACGATAATCCG
AGTCCAGGTGAAACTGCAGCAACGGATCCGGCAAGGGAATGCGAGGGAAAAGGAGCTTGT
GAATTCAAACAGACTCGACTCTCTGATACAATCATGCCTCATATCCTCAACTTGTACGGG
GCATGTGCAAAAGCAAACGATTTTGACATGTACGCACCAAATGCTTCGTTTGAGGACCCT
TTAACACATGCTCAAGGGGTGAAGCAAATCAAATCAGCTTTTTATTCACTCTCCAAGGTG
TTTGGTGAGTCGAAAATAGTTGAATACCAAGTTCAAGAAAGTGATATCGCACCGGGGAAG
AAAGAGATACTAATCGACAACAAACAACACTACAAGATCATGGGAAAGGACATAGATATG
ATCTCCCTCATCAAACTCTCTGTCGAGAATGGGAAGATTGTCCGACACGAAGACTGGTGG
GATAAGAAACCTCTGAGGAACAGAGACACAGTTAGCTTCCCATTAGTCGGTCGGTTTATG
GAGATGGGGTCGAAGAGGCATGATGCTAGCTACTCATGCCATGATGGGTTTTGGTAAAGA
TCCTGACTCACATTGAATAAAGGAGAGATTCATCGGAAACA*TGAATATATAATGTCTAA
GCTCTTCAAA*CATTCCTTGATTT*GAGTA*CTTCCTCTGTCG*TTTGGTTTGGTTTCGA
TTT*AGTTT*ATATTTGTA*TATAT*AACGTGTGGT*GGGTTATCAAATGTTTG

QA 1 774 1 774
DS 

RD RS1CY09TF 667 0 0
CCGGCAAGGGAATGCGAGGGAAAAGGAGCTTGTGAATTCAAACAGACTCGACTCTCTGAT
ACAATCATGCCTCATATCCTCAACTTGTACGGGGCATGTGCAAAAGCAAACGATTTTGAC
ATGTACGCACCAAATGCTTCGTTTGAGGACCCTTTAACACATGCTCAAGGGGTGAAGCAA
ATCAAATCAGCTTTTTATTCACTCTCCAAGGTGTTTGGTGAGTCGAAAATAGTTGAATAC
CAAGTTCAAGAAAGTGATATCGCACCGGGGAAGAAAGAGATACTAATCGACAACAAACAA
CACTACAAGATCATGGGAAAGGACATAGATATGATCTCCCTCATCAAACTCTCTGTCGAG
AATGGGAAGATTGTCCGACACGAAGACTGGTGGGATAAGAAACCTCCGAGGAACAGAGAC
ACAGTTAGCTTCCCATTAGTCGGTCGGTTTATGGAGATGGG*TCGAAGAGGCATGATGCT
AGCTACTCATGCCATGATGGGTTTTGGTAAAGATCCTGACTCACATTGAATAAAGGAGAG
ATTCATCGGAAACAATGAATATATAATGTCTAAGCTCTTCAAAACATTCCTTGATTTTGA
GTAACTTCCTCTGTCGGTTTGGTTTGGTTTCGATTTTAGTTTTATATTTGTA*TATATTA
ACGTGTG

QA 1 667 1 667
DS 

RD RS1AV32JQ 783 0 0
GGATCT
AATCTTTCAACAATCTCTGAACACATCATCAATGGGGAAAGACGATAATCCGAGTCCAGG
TGAAACTGCAGCAACGGATCCGGCAAGGGAATGCGAGGGAAAAGGAGCTTGTGAATTCAA
ACAGACTCGACTCTCTGATACAATCATGCCTCATATCCTCAACTTGTACGGGGCATGTGC
AAAAGCAAACGATTTTGACATGTACGCACCAAATGCTTCGTTTGAGGACCCTTTAACACA
TGCTCAAGGGGTGAAGCAAATCAAATCAGCTTTTTATTCACTCTCCAAGGTGTTTGGTGA
GTCGAAAATAGTTGAATACCAAGTTCAAGAAAGTGATATCGCACCGGGGAAGAAAGAGAT
ACTAATCGACAACAAACAACACTACAAGATCATGGGAAAGGACATAGATATGATCTCCCT
CATCAAACTCTCTGTCGAGAATGGGAAGATTGTCCGACACGAAGACTGGTGGGATAAGAA
ACCTCTGAGGAACAGAGACACAGTTAGCTTCCCATTAGTCGGTCGGTTTATGGAGATGGG
*TCGAAGAGGCATGATGCTAGCTACTCATGCCATGATGGGTTTTGGTAAAGATCCTGACT
CACATTGAATAAAGGAGAGATTCATCGGAAACAATGAATATATAATGTCTAAGCTCTTCA
AAACATTCCTTGATTTTGAGTAACTTCCTCTGTCGGTTTGGTTTGGTTTCGATTTTAGTT
TTATATTTGTAATATATTAACGTGTGGTTGGGTTATCAAATGTTTGTGTATACA
TCT

QA 7 780 7 780
DS 

RD RS1BA33TF 614 0 0
TGGG
TGTACGGGGCATGTGCAAAAGCAAACGATTTTGACATGCACGCACCAAATGCTTCGTTTG
AGGACCCTTTAACACATGCTCAAGGGGTGAAGCAAATCAAATCAGCTTTTTATTCACTCT
CCAAGGTGTTTGGTGAGTCGAAAATAGTTGAATACCAAGTTCAAGAAAGTGATATCGCAC
CGGGGAAGAAAGAGATACTAATCGACAACAAACAACACTACAAGATCATGGGAAAGGACA
TAGATATGATCTCCCTCATCAAACTCTCTGTCGAGAATGGGAAGATTGTCCGACACGAAG
ACTGGTGGGATAAGAAACCTCTGAGGAACAGAGACACAGTTAGCTTCCCATTAGTCGGTC
GGTTTATGGAGATGGG*TCGAAGAGGCATGATGCTAGCTACTCATGCCATGATGGGTTTT
GGTAAAGATCCTGACTCACATTGAATAAAGGAGAGATTCATCGGAAACAATGAATATATA
ATGTCTAAGCTCTTCAAAACATTCCTTGATTTTGAGTAACTTCCTCTGTCGGTTTGGTTT
GGTTTCGATTTTAGTTTTATATTTGTAATATATTAACGTGTGGTTGGGTTATCAAATGTT
TGTGTATACA

QA 5 614 5 614
DS 

RD RS1CY09JQ 708 0 0
CCGGCAAGGGAATGCGAGGGAAAAGGAGCTTGTGAATTCAAACAGACTCGACTCTCTGAT
ACAATCATGCCTCATATCCTCAACTTGTACGGGGCATGTGCAAAAGCAAACGATTTTGAC
ATGTACGCACCAAATGCTTCGTTTGAGGACCCTTTAACACATGCTCAAGGGGTGAAGCAA
ATCAAATCAGCTTTTTATTCACTCTCCAAGGTGTTTGGTGAGTCGAAAATAGTTGAATAC
CAAGTTCAAGAAAGTGATATCGCACCGGGGAAGAAAGAGATACTAATCGACAACAAACAA
CACTACAAGATCATGGGAAAGGACATAGATATGATCTCCCTCATCAAACTTTCTGTCGAG
AATGGGAAGATTGTCCGACACGAAGACTGGTGGGATAAGAAACCTCCGAGGAACAGAGAC
ACAGTTAGCTTCCCATTAGTCGGTCGGTTTATGGAGATGGG*TCGAAGAGGCATGATGCT
AGCTACTCATGCCATGATGGGTTTTGGTAAAGATCCTGACTCACATTGAATAAAGGAGAG
ATTCATCGGAAACAATGAATATATAATGTTTAAGCTCTTCAAAACATTCCTTGATTTTGA
GTAACTTCCTCTGTCGGTTTGGTTTGGTTTCGATTTTAGTTTTATATTTGTAATATATTA
ACGTGTGGTTGGGTTATCAAATGTTTGTGTATACATCTAATTTTATCC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 3

CO CL1564Contig1 743 3 4 U
GGGACTTGGATCTGTTGATGCGAAGAGAGAGAGAGATGGGTCGAGCGTTGTGGACGAAGA
TGGTGGTGATGATTATTATGTTGACATCGACGATCTCAGGGAAAGAGCAGCTGAGCACTA
AAGAGTGCGAGGATCTAGGGTTCACCGGTCTCGCTCTCTGCTCCGATTGCCACTCACTCT
CTGAATACGTCAAGGATCAAGAGTTGGTATCTGATTGCTTGAAATGTTGCGCTGATGATT
CTGAGGATTCCATGAGTAAGGTTACTTATTCAGGCGCTATATTAGAGGTGTGTATGAGGA
AGCTGGTTTTCTACCCTGAGATTGTTGGATTCATTGAAGAAGAGAAAGAAAAGTTCCCTA
GCGTTAATGTTCAGTACATTTTCAACTCGCCTCCCAAGTTGATTATGTTGGATGAAGATG
GTGAACATAAGGAAACGATCAGAATCGACAACTGGAAACGTGAACATCTTCTGCAGTACA
TGCGGGAGAAGGTCAAGCCTACTTCATCAAGTTAATGAATATGTGGTGCTGAGTACCTTT
GTCAAACAATTCATCTTATGGTTAAACAACACATTGTGGTCGTTACTATCTCCCAGCTAT
TTGCATCAGTAGTCTGTATGTTCTGAACCTTAGCAATCTCATAATTAATGACTTCTATTT
AATGTTGTTATGAAAGGGTAATGAGAATCTTGTACGTAGCTGTTTAGTATAATTAACAAA
TGAATGGAGAGATGACATAGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RS1DZ03TF U 1
AF RS1DZ03JQ C 5
AF RS1CT40TF U 6
BS 1 723 RS1DZ03TF
BS 724 724 RS1DZ03JQ
BS 725 740 RS1DZ03TF
BS 741 743 RS1DZ03JQ

RD RS1DZ03TF 742 0 0
GGGACTTGGATCTGTTGATGCGAAGAGAGAGAGAGATGGGTCGAGCGTTGTGGACGAAGA
TGGTGGTGATGATTATTATGTTGACATCGACGATCTCAGGGAAAGAGCAGCTGAGCACTA
AAGAGTGCGAGGATCTAGGGTTCACCGGTCTCGCTCTCTGCTCCGATTGCCACTCACTCT
CTGAATACGTCAAGGATCAAGAGTTGGTATCTGATTGCTTGAAATGTTGCGCTGATGATT
CTGAGGATTCCATGAGTAAGGTTACTTATTCAGGCGCTATATTAGAGGTGTGTATGAGGA
AGCTGGTTTTCTACCCTGAGATTGTTGGATTCATTGAAGAAGAGAAAGAAAAGTTCCCTA
GCGTTAATGTTCAGTACATTTTCAACTCGCCTCCCAAGTTGATTATGTTGGATGAAGATG
GTGAACATAAGGAAACGATCAGAATCGACAACTGGAAACGTGAACATCTTCTGCAGTACA
TGCGGGAGAAGGTCAAGCCTACTTCATCAAGTTAATGAATATGTGGTGCTGAGTACCTTT
GTCAAACAATTCATCTTATGGTTAAACAACACATTGTGGTCGTTACTATCTCCCAGCTAT
TTGCATCAGTAGTCTGTATGTTCTGAACCTTAGCAATCTCATAATTAATGACTTCTATTT
AATGTTGTTATGAAAGGGTAATGAGAATCTTGTACGTAGCTGTTTAGTATAATTAACAAA
TGA*TGGAGAGATGACATAG
AC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RS1DZ03JQ 739 0 0
CTTGGATCTGTTGATGCGA
AGAGAGAGAGAGATGGGTCGAGCGTTGTGGACGAAGATGGTGGTGATGATTATTATGTTG
ACATCGACGATCTCAGGGAAAGAGCAGCTGAGCACTAAAGAGTGCGAGGATCTAGGGTTC
ACCGGTCTCGCTCTCTGCTCCGATTGCCACTCACTCTCTGAATACGTCAAGGATCAAGAG
TTGGTATCTGATTGCTTGAAATGTTGCGCTGATGATTCTGAGGATTCCATGAGTAAGGTT
ACTTATTCAGGCGCTATATTAGAGGTGTGTATGAGGAAGCTGGTTTTCTACCCTGAGATT
GTTGGATTCATTGAAGAAGAGAAAGAAAAGTTCCCTAGCGTTAATGTTCAGTACATTTTC
AACTCGCCTCCCAAGTTGATTATGTTGGATGAAGATGGTGAACATAAGGAAACGATCAGA
ATCGACAACTGGAAACGTGAACATCTTCTGCAGTACATGCGGGAGAAGGTCAAGCCTACT
TCATCAAGTTAATGAATATGTGGTGCTGAGTACCTTTGTCAAACAATTCATCTTATGGTT
AAACAACACATTGTGGTCGTTACTATCTCCCAGCTATTTGCATCAGTAGTCTGTATGTTC
TGAACCTTAGCAATCTCATAATTAATGACTTCTATTTAATGTTGTTATGAAAGGGTAATG
AGAATCTTGTACGTAGCTGTTTAGTATAATTAACAAATGAATGGAGAGATGACATAGGAC

QA 20 739 20 739
DS 

RD RS1CT40TF 717 0 0
GGGTTGATGCGAAGAGAG
AGAGAGAGAGAGATGGGTCGAGCGTTGTGAACGAAGATGGTGGTGATGATTATGATGTTG
ACATCGACGATCTCAGGGAAAGAGCAGCTGAGCACTAAAGAGTGCGAGGATCTAGGGTTC
ACCGGTCTCGCTCTCTGCTCCGATTGCCACTCACTCTCTGAATACGTCAAGGATCAAGAG
TTGGTATCTGATTGCTTGAAATGTTGCGCTGATGATTCTGAGGATTCCATGAGTAAGGTT
ACTTATTCAGGCGCTATATTAGAGGTGTGTATGAGGAAGCTGGTTTTCTACCCTGAGATT
GTTGGATTCATTGAAGAAGAGAAAGAAAAGTTCCCTAGCGTTAATGTTCAGTACATTTTC
AACTCGCCTCCCAAGTTGATTATGCTGGATGAAGATGGTGAACATAAGGAAACGATCAGA
ATCGACAACTGGAAACGTGAACATCTTCTGCAGTACATACGGGAGAAGGTCAAGCCTACT
TCATCAAGTTAATGAATATGTGGTGCTGAGTACCTTTGTCAAACAATTCATCTTATGGTT
AAACAACACATTGTGGTCGTTACTATCTCCCAGCTATTTGCATCAGTAGTCTGTATGTTC
TGAACCTTAGCAATCTCATAATTAATGACTTCTATTTAATGTTGTTATGAAAGG*TAATG
AGAATCTTGTACGTAGCTGTTTAGTATAATTAACAAATG

QA 19 717 19 717
DS 



AS 2 5

CO CL1565Contig1 814 3 12 U
GGGATTTCGGCACTGCAAAGTTCGCTGAATCAAAGTTTTCTCTCTCTACGTTTTTTGTTT
TCCTCCGAGAAACTCTCTCTCACTCGAATCTCGAAGCTTAAATTTCGGATCTTACTTACT
TACTTACAGCTGTCTCCTCGGATAGGAGACGACGACCATGAGCAGAGATCATCCACCCGA
GCCTCTTGATTTCTTCATCTGGACTGTTGAGGACGTTGGATCCTGGCTTGAGGAGATCAA
CCTGGGGAGCTACCGCCTGATTTTCAAAGAGAATGGTGTCAACGGAGAGTATCTCGAAAG
CATGTCTGTGTTCACAACGGAACAGATCCTTCACTTCATAAGGAGGCACCACATGAAATG
GGGAGACTTCATCACCCTCTGCAAAGAACTCAGGAGGATTAAAGTGGCTTGCTTGAAAGG
TGAACAGAGAGTTCGACGGCCATGGTGGGCACCTTCTTGCCTCTCAGTAGTCTTTGTTAA
GGCGGCTAAGCGCAACCGACAGTCTCGTGTTGTATCTCTAAAGCTTGAGTCTTGACCATT
TTTACACTTTGGATGTTTATGTACCTACGTACTTGTCTCTCTATCTCTTCTCTTCTCTTC
TCTTTTTTTTCTGGTTTGGGGTTTGTCTGTGGAAATCAAAAGCCACACATGCAATGGGAA
GAAACAAACTCAAGCCAAAAATGCTGTTTGGCTTTGGTAAAATCTTGCAAGGTGGGAGGA
AAAACATTATGTTCTTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTGTACTTCGGTGTATACAAAGTT
TGTTCCCAGATGTTTAATATATTATGCGACAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FN27TF U 1
AF RS1FN27JQ C 141
AF RS1EZ45TF U 448
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TCCTCCGAGAAACTCTCTCTCACTCGAATCTCGAAGCTTAAATTTCGGATCTTACTTACT
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GGCGGCTAAGCGCAACCGACAGTCTCGTGTTGTATCTCTAAAGCTTGAGTCTTGACCATT
TTTACACTTTGGATGTTTATGTACCTACGTACTTGTCTCTCTATCTCTTCTCTTCTCTTC
TCTTTTTTTTCTGGTTTGGGGTTTGTCTGTGGAAATCAAAAGCCACACATGCAATGGGAA
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AAA*CATTATGTTCTTTTTT
GTTTTGTTTTGTTTGTAC

QA 1 740 1 740
DS 

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TTTTCAAAGAGAATGGTGTCAACGGAGAGTATCTCGAAAGCATGTCTGTGTTCACAACGG
AACAGATCCTTCACTTCATAAGGAGGCACCACATGAAATGGGGAGACTTCATCACCCTCT
GCAAAGAACTCAGGAGGATTAAAGTGGCTTGCTTGAAAGGTGAACAGAGAGTTCGACGGC
CATGGTGGGCACCTTCTTGCCTCTCAGTAGTCTTTGTTAAGGCGGCTAAGCGCAACCGAC
AGTCTCGTGTTGTATCTCTAAAGCTTGAGTCTTGACCATTTTTACACTTTGGATGTTTAT
GTACCTACGTACTTGTCTCTCTATCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTTTTTTTCTGGTTTGGG
GTTTGTCTGTGGAAATCAAAAGCCACACATGCAATGGGAAGAAACAAACTCAAGCCAAAA
ATGCTGTTTGGCTTTGGTAAAATCTTGCAAGGTGGGAGGAAAAACATTATGTTCTTTTTT
TGTTTTTGTTTTTGTTTTGTACTTCGGTGTATACAAAGTTTGTTCCCAGATGTTTAATAT
ATTATGCGAC

QA 1 670 1 670
DS 

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TGTTGTATCTCTAAAGCTTGAGTCTTGACCATTTTTACACTTTGGATGTTTATGTACCTA
TGTACTTGTCTCTCTATCTCTTCTCTTCTCTT*****TTTTTTCTGGTTTGGGGTTTGTC
TGTGGAAATCAAAAGCCACACATGCAATGGGAAGAAACAAACTCAAGCCAAAAATGCTGT
TTGGCTTTGGTAAAATCTTGCAAGGTGGGAGGAAAAACATTATGTTCTTTTTTTGTTTTT
GT***********ACTTCGGTGTATACAAAGTTTGTTCCCAGATGTTTAATATATTATGC
GACAGAT

QA 1 367 1 367
DS 



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CGACCATGAGCAGAGATCATCCTCCCGAGCCTCTTGATTTCTTCATCTGGACTGTTGAGG
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GGAGGATTAAAGTGGCTTGCTTGAAAGGTGAACAGAGAGTTCGACGGCCATGGTGGGCAC
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TATCTCTAAAGCTTGAGTCTTGACATTTACACTTTGGATGTTTATGTACCTACTTGTCTC
TCTATCTCTTCTCTTCTCTTTCTTTTTTTTTTTCTCTGGTTTGGGGTTTGTCTGTGGAGA
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CTTCGGTGTATACAAAGTTTGTTCCCAGATGTTTAATATATTATGCGACAGAT


BQ
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AF RS1GW22TF U 1
AF RS1GW22JQ C 184
BS 1 682 RS1GW22TF
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CGACCATGAGCAGAGATCATCCTCCCGAGCCTCTTGATTTCTTCATCTGGACTGTTGAGG
ACGTTGGATCTTGGCTTGAGGAGATCAACCTAGGGAGCTACCGCCTGATTTTCAAAGAGA
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ACTTCATAAGGAGGCATCACATGAAATGGGGTGACTTCATCACCCTCTGCAAAGAACTCA
GGAGGATTAAAGTGGCTTGCTTGAAAGGTGAACAGAGAGTTCGACGGCCATGGTGGGCAC
CTTCTTGCCTCTCAGTAGTCTTTGTTAAGGCGGCTAAGCGCAACCGACAATCTCGTGTTG
TATCTCTAAAGCTTGAGTCTTGACATTTACACTTTGGATGTTTATGTACCTACTTGTCTC
TCTATCTCTTCTCTTCTCTTTCTTTTTTTTTTTCTCTGGTTTGGGGTTTGTCTGTGGAGA
TCAAAAGCCGCATATGCAATAG*AAGAAACAAACTCAAGCCAAAA*TGCTGTTTGGCTTT
G

QA 1 721 1 721
DS 

RD RS1GW22JQ 650 0 0
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TCATAAGGAGGCATCACATGAAATGGGGTGACTTCATCACCCTCTGCAAAGAACTCAGGA
GGATTAAAGTGGCTTGCTTGAAAGGTGAACAGAGAGTTCGACGGCCATGGTGGGCACCTT
CTTGCCTCTCAGTAGTCTTTGTTAAGGCGGCTAAGCGCAACCGACAATCTCGTGTTGTAT
CTCTAAAGCTTGAGTCTTGACATTTACACTTTGGATGTTTATGTACCTACTTGTCTCTCT
ATCTCTTCTCTTCTCTTTCTTTTTTTTTTTCTCTGGTTTGGGGTTTGTCTGTGGAGATCA
AAAGCCGCATATGCAATAGGAAGAAACAAACTCAAGCCAAAAATGCTGTTTGGCTTTGGT
AAAATCTTGCAAGGTGGGGGGAAAAACATTATGTTCTTTTTTTGTTTTTGTTTTGTACTT
CGGTGTATACAAAGTTTGTTCCCAGATGTTTAATATATTATGCGACAGAT

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 4

CO CL1566Contig1 1070 4 33 U
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TCTAGAAGCAATCAAGTTCTCCAGAAAGAATCACCGTCTTTGTTTCGCCAGATTCTCTCT
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TGAACACTCTCGTCATGAACTTCCTTGTCACTGAGGGTTATGTTGAAGCTGCTGACAAGT
*CCAAAGGGAGTCTGGCACCAAACCAGAGATAGATCTTGCAACCATCACTGATCGAATGG
CTGTTAAGAAGGCTGTTCAAAACGGCAATGTCGAGGATGCTATTGAAAAAGTTAATGACT
TGAATCCTGAGATACTAGACACAAACCCCGAGCTCTTCTTTCATCTTCAGCAGCAAAGGT
TGATTGAACTTATTCGTCAAGGCAAGACTGAAGAAGCCTTGGAGTTTGCTCAGGAGGAAC
TTGCTCCACGTGGCGAGGAAAATCAAGCGTTTCTGCAAGAACTGGAAAAAACTGTAGCTT
TGCTTGTTTTTGAAGATGCCTCTAACTGTCCTGTTAAAGATCTTCTCGACATCTCCCACC
GTCTTAAGACTGCAAGTGAAGTGAACGCAGCAATTCTTACAAGCCAGAGTCATGAAAAAG
ATCCCAAACTTCCAAGCTTGTTGAAGATGCTGGTTTGGGCTCAGAACCAGCTGGATGAGA
AAGCAGTGTATCCGCACATCAATGATTTGTCTACTGGCCAGCTCCAGGACCCGTCTGAAG
AATTTTGTACCTGCTAAAGGGAACAACAATCAAATGATATGCCCTCTCTCCCATTTCAAT
TTCAATAAGTCAAGGTTCATTATGTTTTAGCGAATGCTTTCTTCTTTCCCTTTTTTTTCT
GCATTGGATGGAATTGTTTAGGATATGTGCAAGGGAACATAAAGCTGTTTCTAGTCAAAT
GTTGTGATTGTCAACATATCCCTTGACTCACCGCATGGTGCCCTTTTGAT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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G
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CTAGTCAAATGTTGTGATTGTCAACATATCCCTTGACTCACCGCATGGTGCCCTTTTGAT

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DS 



AS 2 5

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BQ
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15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1A710TF U 1
AF RS1EM18TF U 475
AF RS1EM18JQ C 667
BS 1 685 RS1A710TF
BS 686 686 RS1EM18TF
BS 687 729 RS1A710TF
BS 730 730 RS1EM18TF
BS 731 792 RS1A710TF
BS 793 864 RS1EM18TF

RD RS1A710TF 792 0 0
GGGAGTAATTTAGAGAGTACCATTCTGCAGATTCTGGACATGGGCGGAGGAGCCTGGGAT
CGGGACACTGTTGTCCGTGCACTCCGTGCTGCATTTAACAACCCTGAAAGAGCTGTGGAA
TATCTTTACTCTGGGATCCCCGAGCAAGCTGAAGTTCCACCAGTTGCTCGTGCCCCAGCA
AGTAGTGGGCAGGCGGCAAATCCTCCAGCACAGACTCAGCAACCTGCAGCGGCACCTGCT
ACTGGTCCTAATGCAAATCCGTTAGATCTCTTCCCACAGGGGTTGCCAAATGTTGGTGCA
AACTCTGGTGGTGGAACACTTGACTTCCTGCGCAACAGCCAACAGTTCCAAGCTCTGCGT
GCAATGGTGCAAGCAAACCCTCAAGTTCTGCAGCCTATGCTTAGGAACTGGGAAAGCAAA
ACCCAAACTTGATGCGATTGATTCAAGAACATCAAGCTGATTTCTTACGTTTAATCAATG
AACCAGTTGAAGGAGGGGCGGAAGGGGCCAACCTCTTCGGCGAAGGAGTGCCACAACCAC
AGGCGATTCAAGTCACACCTGAGGAACGTGACGCAATTGAAAGGCTGGAAGCGATGGGAT
TTGAGAGAGCATTGGTGTTGGAAGCGTTCTTTGCGTGCAACAAGAACGAAGAGTTGGCTG
CAAACTATCTTCTGGATCACATGCATGAGTTTGAGGAATAAGCTTCTTCAATAAAATTGC
CTTTGTTCGGCTCTCTCGTTGTCTCTTGTCTCATTGGTTCATATTTTTACTTATATATTG
TGGGGATGCCAA

QA 1 792 1 792
DS 

RD RS1EM18TF 390 0 0
G
CAATGAACCAGTTGAAGGAGGGGCGGAAGGGGCCAACCTCTTCGGCGAAGGAGTGCCACA
ACCACAGGCGATTCAAGTCACACCTGAGGAACGTGACGCAATTGAAAGGCTGGAAGCGAT
GGGATTTGAGAGAGCATTGGTGTTGGAAGTGTTCTTTGCGTGCAACAAGAACGAAGAGTT
GGCTGCAAACTATCTTCTGGATCACATGCACGAGTTTGAGGAATAAGCTTCTTCAATAAA
ATTGCCTTTGTTCGTCTCTCTCGTTGTCTCTTGTCTCATTGGTTCATATTTTTACTTATA
TATTGTGGGGATGCCAAGTTCGAACTTCGTTACTCGTCCGTGGTCATGGATTCACTCAGT
TGTCAGTTTAAAATGGAGTTTGTCTTCTC

QA 2 390 2 390
DS 

RD RS1EM18JQ 198 0 0
ATCTTTTGGATCACATGCACGAGTTTGAGGAATAAGCTTCTTCAATAAAATTGCCTTTGT
TCGTCTCTCTCGTTGTCTCTTGTCTCATTGGTTCATATTTTTACTTATATATTGTGGGGA
TGCCAAGTTCGAACTTCGTTACTCGTCCGTGGTCATGGATTCACTCAGTTGTCAGTTTAA
AATGGAGTTTGTCTTCTC

QA 1 198 1 198
DS 



CO CL1567Contig2 758 2 3 U
GGCAAGCTGAAGTTCCACCAGTTGCTCGTGCCCCAGCAAGTAGTGGGCAGGCGGCAAATC
CTCCAGCACAGACTCAGCAACCTGCAGCGGCACCTGCTACTGGTCCTAATGCAAATCCGT
TAGATCTCTTCCCACAGGGGTTGCCAAATGTTGGTGCAAACTCTGGTGGTGGAACACTTG
ACTTCCTGCGCAACAGCCAACAGTTCCAAGCTCTGCGTGCAATGGTGCAAGCAAACCCTC
AAGTTCTGCAGCCTATGCTTCAGGAACTGGGAAAGCAAAACCTCTTCGGCGAAGGAGTGC
CACAACCACAGGCGATTCAAGTCACACCTGAGGAACGTGACGCAATTGAAAGGCTGGAAG
CGATGGGATTTGAGAGAGCATTGGTGTTGGAAGTGTTCTTTGCGTGCAACAAGAACGAAG
AGTTGGCTGCAAACTATCTTCTGGATCACATGCACGAGTTTGAGGAATAAGCTTCTTCAA
TAAAATTGCCTTTGTTCGTCTCTCTCGTTGTCTCTTGTCTCATTGGTTCATATTTTTACT
TATATATTGTGGGGATGCCAAGTTCGAACTTCGTTACTCGTCCGTGGTCATGGATTCACT
CAGTTGTCAGTTTAAAATGGAGTTTGTCTTCTCATGTGCTCTTTTTTATTGTCGTGGACC
GTGTGTTGTCGTTTCTGAATCTCTTCATGTTCCTGTTATTTTTTTTTGGTCGAACTGGAG
ACAACATGTATTATACATGTATGTATAATAGTAAACGT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E808TF U 1
AF RS1E808JQ C 1
BS 1 1 RS1E808JQ
BS 2 705 RS1E808TF
BS 706 758 RS1E808JQ

RD RS1E808TF 705 0 0
G
GCAAGCTGAAGTTCCACCAGTTGCTCGTGCCCCAGCAAGTAGTGGGCAGGCGGCAAATCC
TCCAGCACAGACTCAGCAACCTGCAGCGGCACCTGCTACTGGTCCTAATGCAAATCCGTT
AGATCTCTTCCCACAGGGGTTGCCAAATGTTGGTGCAAACTCTGGTGGTGGAACACTTGA
CTTCCTGCGCAACAGCCAACAGTTCCAAGCTCTGCGTGCAATGGTGCAAGCAAACCCTCA
AGTTCTGCAGCCTATGCTTCAGGAACTGGGAAAGCAAAACCTCTTCGGCGAAGGAGTGCC
ACAACCACAGGCGATTCAAGTCACACCTGAGGAACGTGACGCAATTGAAAGGCTGGAAGC
GATGGGATTTGAGAGAGCATTGGTGTTGGAAGTGTTCTTTGCGTGCAACAAGAACGAAGA
GTTGGCTGCAAACTATCTTCTGGATCACATGCACGAGTTTGAGGAATAAGCTTCTTCAAT
AAAATTGCCTTTGTTCGTCTCTCTCGTTGTCTCTTGTCTCATTGGTTCATATTTTTACTT
ATATATTGTGGGGATGCCAAGTTCGAACTTCGTTACTCGTCCGTGGTCATGGATTCACTC
AGTTGTCAGTTTAAAATGGAGTTTGTCTTCTCATGTGCTCTTTTTTATTGTCGTGGACCG
TGTGTTGTCGTTTCTGAATCTCTTCATGTTCCTGTTATTTTTTT

QA 2 705 2 705
DS 

RD RS1E808JQ 758 0 0
GGCAAGCTGAAGTTCCACCAGTTGCTCGTGCCCCAGCAAGTAGTGGGCAGGCGGCAAATC
CTCCAGCACAGACTCAGCAACCTGCAGCGGCACCTGCTACTGGTCCTAATGCAAATCCGT
TAGATCTCTTCCCACAGGGGTTGCCAAATGTTGGTGCAAACTCTGGTGGTGGAACACTTG
ACTTCCTGCGCAACAGCCAACAGTTCCAAGCTCTGCGTGCAATGGTGCAAGCAAACCCTC
AAGTTCTGCAGCCTATGCTTCAGGAACTGGGAAAGCAAAACCTCTTCGGCGAAGGAGTGC
CACAACCACAGGCGATTCAAGTCACACCTGAGGAACGTGACGCAATTGAAAGGCTGGAAG
CGATGGGATTTGAGAGAGCATTGGTGTTGGAAGTGTTCTTTGCGTGCAACAAGAACGAAG
AGTTGGCTGCAAACTATCTTCTGGATCACATGCACGAGTTTGAGGAATAAGCTTCTTCAA
TAAAATTGCCTTTGTTCGTCTCTCTCGTTGTCTCTTGTCTCATTGGTTCATATTTTTACT
TATATATTGTGGGGATGCCAAGTTCGAACTTCGTTACTCGTCCGTGGTCATGGATTCACT
CAGTTGTCAGTTTAAAATGGAGTTTGTCTTCTCATGTGCTCTTTTTTATTGTCGTGGACC
GTGTGTTGTCGTTTCTGAATCTCTTCATGTTCCTGTTATTTTTTTTTGGTCGAACTGGAG
ACAACATGTATTATACATGTATGTATAATAGTAAACGT

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 4

CO CL1568Contig1 591 4 4 U
GACACAGAAATACAAACACACATCGCTCTATCTCCGTCTGTCTCATCGCTGCGCCATAGT
TCTCCGTCACCCGAGCAACCCTAGAAATGGATGGGCATGATTCTGAGGATACTAAGCAGA
GCACTGCTGATATGACTGCTTTTGTCCAAAATCTTCTGCAGCAGATGCAAAGCAGGTTTC
AGACAATGTCGGACTCCATCATCACAAAGATCGATGACATGGGAGGCAGAATCAATGAGC
TGGAGCAAAGCATCAATGATCTAAGAGCTGAGATGGGAGTTGAAGGCACTCCACCTCCTG
CCTCCAAATCTGGCGATGAACCCAAAACACCGGCTAGTTAATTCCACTTGAAAAAAAA*C
CTATGGTCCATGATCTTTCTGCTTGTGTCTGCAACACTGTGAAATTTATTAAGCGCGGTA
CTATGACTTTTTAAAATTTCTGTTTCAAAAGACATGAATATCTTGTTGAGTTCATTCAAT
AGATTGATGATGTGGTGGTACATTGCATTATCCTGCACTTATGATTTGTCGTGTTGGTTT
TGAGATAACTGAAAAGTCTAATGCATGGAAGGCTTTACTCGGTTTGGTTCC


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CW65TF U 1
AF RS1CB49TF U 12
AF RS1A705JQ C 2
AF RS1A705TF U 2
BS 1 358 RS1CW65TF
BS 359 359 RS1A705TF
BS 360 517 RS1CW65TF
BS 518 591 RS1A705TF

RD RS1CW65TF 518 0 0
GACACAGAAATACAAACACACATCGCTCTATCTCCGTCTGTCTCATCGCTGCGCCATAGT
TCTCCGTCACCCGAGCAACCCTAGAAATGGATGGGCATGATTCTGAGGATACTAAGCAGA
GCACTGCTGATATGACTGCTTTTGTCCAAAATCTTCTGCAGCAGATGCAAAGCAGGTTTC
AGACAATGTCGGACTCCATCATCACAAAGATCGATGACATGGGAGGCAGAATCAATGAGC
TGGAGCAAAGCATCAATGATCTAAGAGCTGAGATGGGAGTTGAAGGCACTCCACCTCCTG
CCTCCAAATCTGGCGATGAACCCAAAACACCGGCTAGTTAATTCCACTTGAAAAAAAAAC
CTATGGTCCATGATCTTTCTGCTTGTGTCTGCAACACTGTGAAATTTATTAAGCGCGGTA
CTATGACTTTTTAAAATTTCTGTTTCAAAAGACATGAATATCTTGTTGAGTTCATTCAAT
AGATTGATGATGTGGTGGTACATTGCATTATCCTGCA
C

QA 1 517 1 517
DS 

RD RS1CB49TF 506 0 0
AGGG
ACACACATCGCTCTATCTCCGTCTGTCTCATCGCTGCGCCATAGTTCTCCGTCACCCGAG
CAACCCTAGAAATGGATGGGCATGATTCTGAGGATACTAAGCAGAGCACTGCTGATATGA
CTGCTTTTGTCCAAAATCTTCTGCAGCAGATGCAAAGCAGGTTTCAGACAATGTCGGACT
CCATCATCACAAAGATCGATGACATGGGAGGCAGAATCAATGAGCTGGAGCAAAGCATCA
ATGATCTAAGAGCTGAGATGGGAGTTGAAGGCACTCCACCTCCTGCCTCCAAATCTGGCG
ATGAACCCAAAACACCGGCTAGTTAATTCCACTTGAAAAAAAA*CCTATGGTCCATGATC
TTTCTGCTTGTGTCTGCAACACTGTGAAATTTATTAAGCGCGGTACTATGACTTTTTAAA
ATTTCTGTTTCAAAAGACATGAATATCTTGTTGAGTTCATTCAATAGATTGATGATGTGG
TGGTACATTGCATTATCCTGCA

QA 5 506 5 506
DS 

RD RS1A705JQ 590 0 0
GG
ACAGAAATACAAACACACATCGCTCTATCTCCGTCTGTCTCATCGCTGCGCCATAGTTTT
CCGTCACCCGAGCAACCCTAGAAATGGATGGGCATGATTCTGAGGATACTAAGCAGAGCA
CTGCTGATATGACTGCTTTTGTCCAAAATCTTCTGCAGCAGATGCAAAGCAGGTTTCAGA
CAATGTCGGACTCCATCATCACAAAGATCGATGACATGGGAGGCAGAATCAATGAGCTGG
AGCAAAGCATCAATGATTTAAGAGCTGAGATGGGAGTTGAAGGCACTCCACCTCCTGCCT
CCAAATCTGGCGATGAACCCAAAACACCGGCTAGTTAATTCCACTTGAAAAAAAA*CCTA
TGGTCCATGATCTTTCTGCTTGTGTCTGCAACACTGTGAAATTTATTAAGCGCGGTACTA
TGACTTTTTAAAATTTCTGTTTCAAAAGACATGAATATCTTGTTGAGTTCATTCAATAGA
TTGATGATGTGGTGGTACATTGCATTATCCTGCACTTATGATTTGTCGTGTTGGTTTTGA
GATAACTGAAAAGTTTAATGCATGGAAGGCTTTACTCGGTTTGGTTCC

QA 3 590 3 590
DS 

RD RS1A705TF 590 0 0
GG
ACAGAAATACAAACACACATCGCTCTATCTCCGTCTGTCTCATCGCTGCGCCATAGTTCT
CCGTCACCCGAGCAACCCTAGAAATGGATGGGCATGATTCTGAGGATACTAAGCAGAGCA
CTGCTGATATGACTGCTTTTGTCCAAAATCTTCTGCAGCAGATGCAAAGCAGGTTTCAGA
CAATGTCGGACTCCATCATCACAAAGATCGATGACATGGGAGGCAGAATCAATGAGCTGG
AGCAAAGCATCAATGATCTAAGAGCTGAGATGGGAGTTGAAGGCACTCCACCTCCTGCCT
CCAAATCTGGCGATGAACCCAAAACACCGGCTAGTTAATTCCACTTGAAAAAAAA*CCTA
TGGTCCATGATCTTTCTGCTTGTGTCTGCAACACTGTGAAATTTATTAAGCGCGGTACTA
TGACTTTTTAAAATTTCTGTTTCAAAAGACATGAATATCTTGTTGAGTTCATTCAATAGA
TTGATGATGTGGTGGTACATTGCATTATCCTGCACTTATGATTTGTCGTGTTGGTTTTGA
GATAACTGAAAAGTCTAATGCATGGAAGGCTTTACTCGGTTTGGTTCC

QA 3 590 3 590
DS 



AS 2 5

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ACATGATTTTTTGTTTTTTTTTATCACAGTTTAAGTTTTCACCAACTTACAAATCATAAC
TTTGTTTCCCAGTAAACTTAACTTCAATGGGACTAACATTTTTCCCAATAAATCTCATAT
TCTGACCAACACCTTCTCTTCCCGGATTCCCCTTCTCCGGATAAACTCCATCTTTAGGAT
GAAAATACTGAACCTCACCATTAGGGAACACCCTGTAAAACTGGTAGTTAATCTTGTACT
TGGACCTAAGCCTTGTCCCCAACGCCAAGCACTGTTCTTTCCTCGCCAGCTTCAGCAAGT
TCGGACCTTCCCTCATGATCGCCGCACCTCCCGTCGGCATCTCAAAGATCTGTTCTTTCG
GCGAGTTCCATGTAATAACGTAGAACTCTTCCACCTGGGCTTTGCGGAGAAGCCCACCGG
TGCTTCCCGCGAAGATCGGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GO81JQ U 1
AF RS1C026TF C 75
BS 1 117 RS1GO81JQ
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BS 119 401 RS1GO81JQ
BS 402 562 RS1C026TF

RD RS1GO81JQ 401 0 0
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TAAGAGAATAATTATTCAAATGAACCCCATTAAAAATTAAAACCAAACATAGTCACATCC
ACATGATTTTTTGTTTTTTTTTATCACAGTTTAAGTTTTCACCAACTTACAAATCATAAC
TTTGTTTCCCAGTAAACTTAACTTCAATGGGACTAACATTTTTCCCAATAAATCTCATAT
TCTGACCAACACCTTCTCTTCCCGGATTCCCCTTCTCCGGATAAACTCCATCTTTAGGAT
GAAAATACTGAACCTCACCATTAGGGAACACCCTGTAAAACTGGTAGTTAATCTTGTACT
TGGACCTAAGCCTTGTCCCCAACGCCAAGCACTGTTCTTTC

QA 1 401 1 401
DS 

RD RS1C026TF 488 0 0
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TTTTTTTTATCACAGTTTAAGTTTTCACCAACTTACAAATCATAACTTTGTTTCCCAGTA
AACTTAACTTCAATGGGACTAACATTTTTCCCAATAGATCTCATATTCTGACCAACACCT
TCTCTTCCCGGATTCGCCTTCTCCGGATAAACTCCATCTTTAGGATGAAGATACTGAACC
TCACCATTAGGGAACACCCTGTAAAACTGGTAGTTAATCTTGTACTTGGACCTAAGTCTT
GTCCCCAACGCCAAGCACTGTTCTTTCCTCGCCAGCTTCAGCAAGTTCGGACCTTCCCTC
ATGATCGCCGCACCTCCCGTCGGCATCTCAAAGATCTGTTCTTTCGGCGAGTTCCATGTA
ATAACGTAGAACTCTTCCACCTGGGCTTTGCGGAGAAGCCCACCGGTGCTTCCCGCGAAG
ATCGGTGC

QA 1 488 1 488
DS 



CO CL1569Contig2 742 3 3 U
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CCATAACAACCACAGCAGCCTCCGGTGTGAAAAAACTCCACTTTTTCACAACATCCGCCC
GTCCAAGATCCCTCTCCTTCACCAAAACCGCAATCCGCGCCGAGAAAACGGATTCCGCCG
CCGTCGCCCCAGCCCCTGCCGTGAAAGAAGCTCCGGTGGGATTCACGCCGCCTCAGCTAG
ACCAAAACACACCGTCACCGATCTTCGCGGGGAGCACCGGTGGGCTTCTCCGCAAAGCCC
AGGTGGAAGAGTTCTACGTTATTACATGGAACTCGCCGAAAGAGCAGATCTTTGAGATGC
CGACGGGAGGTGCGGCGATCATGAGGGAAGGTCCGAACTTGCTGAAGCTGGCGAGGAAAG
AACAGTGTTTGGCTTTGGGGACAAGGCTTAGGTCCAAGTACAAGATCAACTACCAGTTTT
ACAGGGTGTTCCCTAATGGTGAGGTTCAGTATCTTCATCCTAAAGATGGAGTTTATCCCG
AGAAGGCGAATCCGGGAAGAGAAGGTGTTGGTCAGAATATGAGATCTATTGGGAAAAATG
TTAGTCCCATTGAAGTTAAGTTTACTGGGAAACAAAGTTATGATTTGTAAGTTGTGAAAA
TTTAAAACAAAAAATCATGTGGATGTGACTATGTTTGGTTTTAATTTTTAATGGGGTTCA
TCTGAATAATTATTCTCTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GQ08TF U 1
AF RS1GQ08JQ C 108
AF RS1FC44TF U 568
BS 1 654 RS1GQ08TF
BS 655 724 RS1FC44TF
BS 725 742 RS1GQ08JQ

RD RS1GQ08TF 673 0 0
GGGACCAAACAGAAAGAAAAAAAAACATGGCAACTCAAGCGTCCGGACTCTTTAGCTCCG
CCATAACAACCACAGCAGCCTCCGGTGTGAAAAAACTCCACTTTTTCACAACATCCGCCC
GTCCAAGATCCCTCTCCTTCACCAAAACCGCAATCCGCGCCGAGAAAACGGATTCCGCCG
CCGTCGCCCCAGCCCCTGCCGTGAAAGAAGCTCCGGTGGGATTCACGCCGCCTCAGCTAG
ACCAAAACACACCGTCACCGATCTTCGCGGGGAGCACCGGTGGGCTTCTCCGCAAAGCCC
AGGTGGAAGAGTTCTACGTTATTACATGGAACTCGCCGAAAGAGCAGATCTTTGAGATGC
CGACGGGAGGTGCGGCGATCATGAGGGAAGGTCCGAACTTGCTGAAGCTGGCGAGGAAAG
AACAGTGTTTGGCTTTGGGGACAAGGCTTAGGTCCAAGTACAAGATCAACTACCAGTTTT
ACAGGGTGTTCCCTAATGGTGAGGTTCAGTATCTTCATCCTAAAGATGGAGTTTATCCCG
AGAAGGCGAATCCGGGAAGAGAAGGTGTTGGTCAGAATATGAGATCTATTGGGAAAAATG
TTAGTCCCATTGAAGTTAAGTTTACTGGGAAACAAAGTTATGATTTGTAAGTTG
TGAAAATTTAAAACAAAAA

QA 1 654 1 654
DS 

RD RS1GQ08JQ 635 0 0
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ACGGATTCCGCCGCCGTCGCCCCAGCCCCTGCCGTGAAAGAAGCTCCGGTGGGATTCACG
CCGCCTCAGCTAGACCAAAACACACCGTCACCGATCTTCGCGGGGAGCACCGGTGGGCTT
CTCCGCAAAGCCCAGGTGGAAGAGTTCTACGTTATTACATGGAACTCGCCGAAAGAGCAG
ATCTTTGAGATGCCGACGGGAGGTGCGGCGATCATGAGGGAAGGTCCGAACTTGCTGAAG
CTGGCGAGGAAAGAACAGTGTTTGGCTTTGGGGACAAGGCTTAGGTCCAAGTACAAGATC
AACTACCAGTTTTACAGGGTGTTCCCTAATGGTGAGGTTCAGTATCTTCATCCTAAAGAT
GGAGTTTATCCCGAGAAGGCGAATCCGGGAAGAGAAGGTGTTGGTCAGAATATGAGATCT
ATTGGGAAAAATGTTAGTCCCATTGAAGTTAAGTTTACTGGGAAACAAAGTTATGATTTG
TAAGTTGTGAAAATTTAAAACAAAAAATCATGTGGATGTGACTATGTTTGGTTTTAATTT
TTAATGGGGTTCATCTGAATAATTATTCTCTTATT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1FC44TF 157 0 0
TTGGTCAGAATATGAGATCTATTGGGAAAAATGTTAGTCCCATTGAAGTTAAGTTTACTG
GGAAACAAAGTTATGATTTGTAAGTTGTGAAAATTTAAAACAAAAAATCATGTGGATGTG
ACTATGTTTGGTTTTAATTTTTAATGGGGTTCATCTG

QA 1 157 1 157
DS 



AS 1 5

CO CL1570Contig1 1004 5 10 U
GGACTACCACCAATATCCTTCACTTTTCTCACACATTGTCTATTTCAGATTCGTCGACCC
TTTTTCGGAAGCAGCCGCCGTGTTTTTGGTTTGGAGTTTGTAGAAATGGTGTTTCCGGAG
AACACCAACTGGCTCAGTGATTACCCTTTGATTGATGGTGTTTTCTCTCATCATCAGAGT
CCCACTTTCCCTTGGCAGATCCATGGCTCAGCAGCTACTACTGTCAGTGTTGAGGAAGTT
GATGGCTTCCTTTGTGATTCAGATGTGATCAAAGAACCTGGCTCAAAGAAAAGAATCAAA
CCGGAAGCTTGCGCTGGTTCTAGCTCGAAAGCCTGTAGGGAGAAACAAAGACGCGACAGG
CTAAATGACAAGTTTACGGAATTGAGTTCCGTATTGGAACCCGGGAGAGCTCCAAAAACA
GACAAGGTTGCTATCATCAATGACGCCATTCGCATGGTGAATCAAGCAAGAGACGAAGCA
CAGAGATTGAAAGACTTGAACTCCAGCCTCCAGGAGAAAATCAAGGAGTTGAAGGATGAG
AAGAACGAGCTGCGTGACGAGAAACAGAAGCTGAAGATTGAGAAAGAGAGAATCGAGCAG
CAACTCAGAGCCACTAACACGTCACAGCCTTGTTTCTTACCAAACCCGCCAACACTCTCT
CAAGCTCAAACTCCTGGAAGCAAGCTTGTCCCTTACACAACTTACCCCGGCTTTGCCATG
TGGCAGTTCATGCCCCCTGCTGCTGTTGATACCTCACAGGACCATGTCCTTCGTCCTCCG
GTTGCGTAGAAAAGCTGCCCTCTTTGTTCACTTTTTTTTCTTCTGATATAATGGTTCTCC
CATTCTGGAGACAATCCTATGCAAACTTGTATTGTGATTTATGATCATCATGCGATTAAT
TTGCATGTAAAATGGAAATAAGCATATGCACTAACCGTGCAAAATGTTGTAAACATTGAA
AATAATTGTTCTACAGATTGTGAATTTTATGATCATAGATGCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1GN05TF U 1
AF RS1EC79TF U 83
AF RS1GN05JQ C 254
AF RS1A270TV U 390
AF RS1A270TF U 413
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BS 734 991 RS1A270TV
BS 992 1004 RS1GN05JQ

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TTTTTCGGAAGCAGCCGCCGTGTTTTTGGTTTGGGGTTTGTAGAAATGGTGTTTCCGGAG
AACACCAACTGGCTCAGTGATTACCCTTTGATTGATGGTGTTTTCTCTCATCATCAGAGT
CCCACTTTCCCTTGGCAGATCCATGGCTCAGCAGCTACTACTGTCAGTGTTGAGGAAGTT
GATGGCTTCCTTTGTGATTCAGATGTGATCAAAGAACCTGGCTCAAAGAAAAGAATCAAA
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DS 

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ACCCTTTGGTTGATGGTGTTTTCTCTCATCATCAGAGTCCCACTTTCCCTTGGCAGATCC
ATGGCTCAGCAGCTACTACTGTCAGTGTTGAGGAAGTTGATGGCTTCCTTTGTGATTCAG
ATGTGATCAAAGAACCTGGCTCAAAGAAAAGAATCAAACCGGAAGCTTGCGCTGGTTCTA
GCTCGAAAGCCTGTAGGGAGAAACAAAGACGCGACAGGCTAAATGACAAGTTTACGGAAT
TGAGTTCCGTATTGGAACCCGGGAGAGCTCCAAAAACAGACAAGGTTGCTATCATCAATG
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AGCTTGTCC*TTACACAACTTACCCCGGCTTTGCCATGTGGCAGTTCATGC
TCCTGCTGCTGTGATACT

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DS 

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CTGGTTCTAGCTCGAAAGCCTGTAGGGAGAAACAAAGACGCGACAGGCTAAATGACAAGT
TTACGGAATTGAGTTCCGTATTGGAACCCGGGAGAGCTCCAAAAACAGACAAGGTTGCTA
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CTAACACGTCACAGCCTTGTTTCTTACCAAACCCGCCAACACTCTCTCAAGCTCAAACTC
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CTCCTGCTGCTGTTGATACCTCACAGGACCATGTCCTTCGTCCTCCGGTTGCTTAGAAAA
GCTGCCCTCTTTGTTCACTTTTTTTTCTTCTGATATAATGGTTCTCCCATTCTGGAGACA
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GGAAATAAGCATATGCACTAACTGTGTAAAATGTTGTAAACATTGAAAATAATTGTTCTA
CAGATTGTGAATTTTATGATCATAGATGCTG

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DS 

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CGGGG
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AGATTGAGAAAGAGAGAATCGAGCAGCAACTCAGAGCCACTAACACGTCACAGCCTTGTT
TCTTACCAAACCCGCCAACACTCTCTCAAGTTCAAACTCCTGGAAGCAAGCTTGTCCCTT
ATACAACTTACCCCGGCTTTGCCATGTGGCAGTTCATGCCCCCTGCTGCTGTTGATACCT
CACAGGACCATGTCCTTCGTCCTCCGGTTGCGTAGAAAAGCTGCCCTCTTTGTTCACTTT
TTTTTCTTCTGATATAATGGTTCTCCCATTCTGGAGACAATCCTATGCAAACTTGTATTG
TGATTTATGATCATCATGCGATTAATTTGCATGTAAAATGGAAATAAGCATATGCACTAA
CCGTGCAAAATGTTGTAAACATTGAAAATAATTGTTCTACAGATTGTGAATTTTATG
ATCG

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DS 

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CAAAAACAGACAAGGTAGCTATCATCAATGACGCCATTCGCATGGTGAATCAAGCAAGAG
ACGAAGCACAGAGATTGAAAGACTTGAACTCCAGCCTCCAGGAGAAAATCAAGGAGTTGA
AGGATGAGAAGAACGAGCTGCGTGACGAGAAACAGAAGCTGAAGATTGAGAAAGAGAGAA
TCGAGCAGCAACTCAGAGCCACTAACACGTCACAGCCTTGTTTCTTACCAAACCCGCCAA
CACTCTCTCAAGTTCAAACTCCTGGAAGCAAGCTTGTCCCTTATACAACTTACCCCGGCT
TTGCCATGTGGCAGTTCATGCCCCCTGCTGCTGTTGATACCTCACAGGACCATGTCCTTC
GTCCTCCGGTTGCGTAGAAAAGCTGCCCTCTTTGTTCACTTTTTTTTCTTCTGATATAAT
GGTTCTCCCATTCTGGAGACAATCCTATGCAAACTTGTATTGTGATTTATGATCATCATG
CGATTAATTTGCATGTAAAATGGAAATAAGCATATGCACTAACCGTGCAAAATGTTGTAA
ACATTGAAAATAATTGTTCTACAGATTGTGAATTTTATG

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DS 



AS 1 5

CO CL1571Contig1 1210 5 22 U
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AATGGCGGATTTCCAGACATCAACTCAAAGGGCCAAGTGGATTTTCACACCCCAGAAACT
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AACCCAAGTTGAAGTAGATGCTAGGGGTTCACTAACTTATCCAACAGAGAAAGGTGATGC
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GAGAGCTTTTTATGAGGCAAAGGTTCAAGAAGTCTGCAGTGCCTTTGAGTTTCCTCACAA
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ACATCATCCCAAAGAAATAATGTTAACCTGCGTGTATGCAGCCTGTAAAATAGAGGAGAA
TCATGTATCTGCTGAGGAGATAGGCAAGGGGATTAAACAAGATCACCATGTAATTCTCAA
GTACGAGATGGCTGTTCTCCAGAGTTTGGAATTTGATCTGATTGTCTATGCACCGTATCG
TGCAATCGAAGGCTTTGTCAGCAACATGGAGGAATTTCTTCAAGCTAGAGATGATGAAAT
CCAAAAGCTGGAGAGTTTGATCAAAGCTGCAACAGCAGAAGCCGATAAAATTATGCTCAC
AGATGCTCCACTCCTCTTTCCTCCTGGCCAGTTGGCGTTGGCTGCTTTGCGTATTGCAAA
TGGGGTTCTTGGAGTGGTTGACTTTTATAGTTACCTAGAGAACATTGTTTCTCAACCGAA
CTCTGAGCACACAACTTCAGAGCTCATAAATTTACTAGATGACGTTGAATATTTGGTAAA
GAACTATAAGTACCCAAGTGAAAAGGACATGAAGCATATCAACAGGAAGCTAAAATCTTG
TCTAGGACATAGCTCTTCACATGACGAGAGTAAGAAACGGGAGAAAAGATCGAAGCACAA
GTCACATAAGAACTCCAGTGATACACCAAAAGGTCCACCGATTGGTTGAGCTTCTCGTTT
TTGTCATTAAGCAAATTTTTTCCTTGGCACTTGGTATCTTTAATCTTATTGCCCTCTTGT
TCTTTCTAAAGTAAATTATCTGAATAATCAAAATCTTAATTCTGGCAGTTTGTGTTAAAC
AGACCAAAAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CB02TF U 1
AF RS1DU22TF U 176
AF RS1CB65JQ C 595
AF RS1CB65TF U 595
AF RS1CB02JQ C 603
BS 1 222 RS1CB02TF
BS 223 223 RS1DU22TF
BS 224 225 RS1CB02TF
BS 226 226 RS1DU22TF
BS 227 261 RS1CB02TF
BS 262 262 RS1DU22TF
BS 263 405 RS1CB02TF
BS 406 406 RS1DU22TF
BS 407 585 RS1CB02TF
BS 586 586 RS1DU22TF
BS 587 665 RS1CB02TF
BS 666 666 RS1DU22TF
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BS 710 710 RS1DU22TF
BS 711 758 RS1CB02TF
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BS 811 811 RS1CB65TF
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BS 1188 1210 RS1CB02JQ

RD RS1CB02TF 758 0 0
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AACCCAAGTTGAAGTAGATGCTAGGGGTTCACTAACTTATCCTACGGAGAAAGGTGATGC
AGGAGGAGATCAAGGTGATAATAAGCTTAAGCCTTTGAGTGTTGATGAAGAACGGTTCAT
GAGAGCTTTTTATGAGGCAAAGGTTCAAGAAGTCTGCAGTGCCTTTGAGTTTCCTCACAA
GATTCAGGCAACAGCTCTGCAATACTTTAAAAGATTTTATCTGCAGTGGTCTGTTATGCA
ACATCATCCCAAAGAAATAATGTTAACCTGCGTGTATGCAGCCTGTAAAATAGAGGAGAA
TCATGTATCTGCTGAGGAGATAGGCAAGGGGATTAAACAAGATCACCATGTAATTCTCAA
GTACGAGATGGCTGTTCTCCAGAGTTTGGAATTTGATCTGATTGTTTATGCACCGTATCG
TGCAATCGAAGGCTTTGTCAGCAACATGGAGGAATTTCTTCAAGCTAGAGATGATGAAAT
CCAAA*GCTGGAGAGTTTGATCAAAGCTGCAACAGCAGAAGCCGATAAA*TTATGCTCAC
AGATGCTCCACTCCTCTTTCCTCCTGGCCAGTTGGCGT

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1DU22TF 695 0 0
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GATGCAGGAGGAGATCAAGGTGATAAGAAGCTTAAGCCTTTGAGTGTTGATGAGGAACGG
TTCATGAGAGCTTTTTATGAGGCGAAGGTTCAAGAAGTCTGTAGTGCCTTTTAGTTTCCT
CACAAGATTCAGGCAACAGCTCTGCAATATTTTAAAAGATTTTATCTGCAATGGTCTGTT
ATGCAACATCATCCCAAAGAAATAATGTTAACCTGCGTGTATGCAGCCTGTAAGATAGAG
GAGAATCATGTATCTGCTGAGGAGATAGGCGAGGGTATTAAACAAGATCACCATGTAATT
CTCAAGTACGAGATGGCTGTTCTCCAGAGTTTGGAATTTGATCTGATTGTCTATGGACCG
TATCGTGCAATCGAAGGCTTTGTCAGCAACATGGAGGAATTTCTTCAAGCTAGAGATGAT
GAAATCCAAAAGCTGGAGAGTTTGCTCAAAGCTGCAACAGCAGAAGCCGATAAAATTATG
CTCACAGATGCTCCACTCCTCTTTCCTCCTGGCCAGTTGGCGTTGGCTGCTTTGCGTATT
GCAAATGGGGTTCTTGGAGTGGTTGACTTTTATAGGTACCTAGAGAACATTGTTTCTCAA
CCGAACTCTGAGCACACGACTTCAGAGCTCATA
GA

QA 1 693 1 693
DS 

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GCTCACAGATGCTCCACTCCTCTTTCCTCCTGGCCAGTTGGCGTTGGCTGCTTTGCGTAT
TGCAAATGGGGTTCTTGGAGTGGTTGACTTTTATAGTTACCTAGAGAACATTGTTTCTCA
ACCGAACTCTGAGCACACAACTTCAGAGCTCATAAATTTACTAGATGACGTTGAATATTT
GGTAAAGAACTATAAGTACCCAAGTGAAAAGGACATGAAGCATATCAACAGGAAGCTAAA
ATCTTGTCTAGGACATAGCTCTTCACATGACGAGAGTAAGAAACGGGAGAAAAGATCGAA
GCACAAGTCACATAAGAACTCCAGTGATACACCAAAAGGTCCACCGATTGGTTGAGCTTC
TCGTTTTTGTCATTAAGCAAATTTTTTCCTTGGCACTTGGTATCTTTAATCTTATTGCCC
TCTTGTTCTTTCTAAAGTAAATTATCTGAATAATC

QA 1 575 1 575
DS 

RD RS1CB65TF 593 0 0
GTATCGTGCAATCGAAGGCTTTGTCAGCAACATGGAGGAATTTCTTCAAGCTAGAGATGA
TGAAATCCAAAAGCTGGAGAGTTTGATCAAAGCTGCAACAGCAGAAGCCGATAAAATTAT
GCTCACAGATGCTCCACTCCTCTTTCCTCCTGGCCAGTTGGCGTTGGCTGCTTTGCGTAT
TGCAAATGGGGTTCTTGGAGTGGTTGACTTTTATAGTTACCTAGAGAACATTGTTTCTCA
ACCGAACTCTGAGCACACAACTTCAGAGCTCATAAATTTACTAGATGACGTTGAATATTT
GGTAAAGAACTATAAGTACCCAAGTGAAAAGGACATGAAGCATATCAACAGGAAGCTAAA
ATCTTGTCTAGGACATAGCTCTTCACATGACGAGAGTAAGAAACGGGAGAAAAGATCGAA
GCACAAGTCACATAAGAACTCCAGTGATACACCAAAAGGTCCACCGATTGGTTGAGCTTC
TCGTTTTTGTCATTAAGCAAATTTTTTCCTTGGCACTTGGTATCTTTAATCTTATTGCCC
TCTTGTTCTTTCTAAAGTAAATTATCTGAATAATCAAAATCTTAATTCTGGCA

QA 1 593 1 593
DS 

RD RS1CB02JQ 608 0 0
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AAAAGCTGGAGAGTTTGATCAAAGCTGCAACAGCAGAAGCCGATAAAATTATGCTCACAG
ATGCTCCACTCCTCTTTCCTCCTGGCCAGTTGGCGTTGGCTGCTTTGCGTATTGCAAATG
GGGTTCTTGGAGTGGTTGACTTTTATAGTTACCTAGAGAACATTGTTTCTCAACCGAACT
CTGAGCACACAACTTCAGAGCTCATAAATTTACTAGATGACGTTGAATATTTGGTAAAGA
ACTATAAGTACCCAAGTGAAAAGGACATGAAGCATATCAACAGGAAGCTAAAATCTTGTT
TAGGACATAGCTCTTCACATGACGAGAGTAAGAAACGGGAGAAAAGATCGAAGCACAAGT
CACATAAGAACTCCAGTGATACACCAAAAGGTCCACCGATTGGTTGAGCTTCTCGTTTTT
GTCATTAAGCAAATTTTTTCCTTGGCACTTGGTATCTTTAATCTTATTGCCCTCTTGTTC
TTTCTAAAGTAAATTATCTGAATAATCAAAATCTTAATTCTGGCAGTTTGTGTTAAACAG
ACCAAAAA

QA 1 608 1 608
DS 



AS 1 5

CO CL1572Contig1 788 5 16 U
GGACAGGTTCTGCTTTAAATCATCACTTTCATATCTCTGAGACTTGAGCACACAAAGACA
GAGTTTCTTATCTTTCAGGAGGTGAGAAGAAAAAAGAATGGCGTTTGTGACAACTGCGGA
AGTTTGTGACGCGAATCAAGATCTGATCCGTAGTGGCCAGCTCAGAGCTATGCAACCCTG
TTT*CCAGATTTACGGTCGTCGTCAAATATTCTCAGGTCCTGTTGTTACTGTCAAAGTGT
TTGAAGACAATGGCTTGATCCGTCAGTTTCTCGAAGAGAAAGGCAATGGAAGAGTTCTTG
TGGTGGATGGTGGAGGGAGTTTACGATGTGCTATACTTGGAGGGAACCCGGTAGTACAAG
CTCAGAACAACGGATGGGCGGGGATCATAGTGAACGGTTGCATAAGAGACGTTGATGAGA
TCAACGGTTGTGACATTGGAGTGAGAGCTTTGGCTTCACATCCCATAAAGGCTAGTAAGA
AAGGACTTGGTGAACAGAGAGTCCCACTCAACATAGCTGGCATTCGGATATGCGATGGTG
AATGGCTTTACGCAGATACTGATGGTATCCTTGTTTCTCAGGTCGAATTATCTGTTTAGA
AAAACAAAGAAATGGTGGAGGAGCTTTGTCTTCTTGTTAAATGGCTATCAAAGCAAAAAT
GTTGATGTCTTTGAAGGGATACGTTTTGGGGTTTGTGGCGTTAATAAGTTAAATGTTTTT
CATTATTTGTTTGTATTATTTTCGTGTCATGGCGTGTAACGTTTCTGAAATAAAATGGTT
CTTTATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 10 10 

AF RS1D858TF U 1
AF RS1AQ76TFB U 44
AF RS1DU40TF U 48
AF RS1DU40JQ C 67
AF RS1D858JQ C 102
BS 1 501 RS1D858TF
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RD RS1D858TF 501 0 0
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GAGTTTCTTATCTTTCAGGAGGTGAGAAGAAAAAAGAATGGCGTTTGTGACAACTGCGGA
AGTTTGTGACGCGAATCAAGATCTGATCCGTAGTGGCCAGCTCAGAGCTATGCAACCCTG
TTT*CCAGATTTACGGTCGTCGTCAAATATTCTCAGGTCCTGTTGTTACTGTCAAAGTGT
TTGAAGACAATGGCTTGATCCGTCAGTTTCTCGAAGAGAAAGGCAATGGAAGAGTTCTTG
TGGTGGATGGTGGAGGGAGTTTACGATGTGCTATACTTGGAGGGAACCCGGTAGTACAAG
CTCAGAACAACGGATGGGCGGGGATCATAGTGAACGGTTGCATAAGAGACGTTGATGAGA
TCAACGGTTGTGACATTGGAGTGAGAGCTTTGGCTTCACATCCCATAAAGGCTAGTAAGA
AAGGACTTGGTGAACAGAGAG

QA 1 501 1 501
DS 

RD RS1AQ76TFB 742 0 0
GGGAGC
ACACAAAGACAGAGTTTCTTATCTTTCAGG***TGAGAAGAAAAAAGAATGGCGTTTGTG
ACCACTGCGGAAGTTTGTGACGCGAATCAAGATCTGATCCGTAGTGGCCAGCTCAGAGCT
CTGCAGCCCTGTTTTCCAGATTTACGGTCGTCGTCAGATATTCTCAGGTCCTGTAGTTAC
TGTCAAAGTGTTTGAAGACAATGGCTTGATCCGTCAGTTTCTCGAAGAGAAAGGCAATGG
AAGAGTTCTTGTGGTGGATGGTGGAGGGAGTTTACGATGTGCTATACTTGGAGGGAACCC
GGTAGTACAAGCTCAGAACAACGGATGGGCGGGGATCATAGTGAACGGTTGCATCAGAGA
CGTTGATGAGATCAACGGTTGCGACATTGGAGTGAGAGCTTTGGCTTCTCATCCCATAAA
GGCTAGTAAGAAAGGACTTGGTGAACAGAGAGCCCCACTCAACATAGCTGGCACTCGGAT
ATGCGATGGTGAATGGCTTTACGCAGATACTGATGGTATCCTTGTTTCTCAGGTCGAATT
ATCTGTTTAGAAAAACAAAGAAATGGTGGAGGAGCTTTGTCTTCTTGTTAAATGGCTATC
AAAGCAAAAATGTTAATGTCTTTGAAGTGGTGCGTTTTGGGGTTTGTGGCGTTAATAAGT
TAAATGTTTTTCATTATCTGTTTGTATTATTTTCGTGTCATGGCGTGTAACGTTTCTGAA
ATAAAATGGTTCTTTA

QA 7 742 7 742
DS 

RD RS1DU40TF 741 0 0
GG
ACACAAAGACAGAGTTTCTTATCTTTCAGGAGGTGAGAAGAAAAAAGAATGGCGTTTGTG
ACAACTGCGGAAGTTTGTGACGCGAATCAAGATCTGATCCGTAGTGGCCAGCTCAGAGCT
ATGCAACCCTGTTT*CCAGATTTACGGTCGTCGTCAAATATTCTCAGGTCCTGTTGTTAC
TGTCAAAGTGTTTGAAGACAATGGCTTGATCCGTCAGTTTCTCGAAGAGAAAGGCAATGG
AAGAGTTCTTGTGGTGGATGGTGGAGGGAGTTTACGATGTGCTATACTTGGAGGGAACCC
GGTAGTACAAGCTCAGAACAACGGATGGGCGGGGATCATAGTGAACGGTTGCATAAGAGA
CGTTGATGAGATCAACGGTTGTGACATTGGAGTGAGAGCTTTGGCTTCACATCCCATAAA
GGCTAGTAAGAAAGGACTTGGTGAACAGAGAGTCCCACTCAACATAGCTGGCATTCGGAT
ATGCGATGGTGAATGGCTTTACGCAGATACTGATGGTATCCTTGTTTCTCAGGTCGAATT
ATCTGTTTAGAAAAACAAAGAAATGGTGGAGGAGCTTTGTCTTCTTGTTAAATGGCTATC
AAAGCAAAA*TGTTGATGTCTTTGAAGGGATACGTTTTGGGGTTTGTGGCGTTAATAAGT
TAAATGTTTTTCATTATTTGTTTGTATTATTTTCGTGTCATGGCGTGTAACGTTTCTGAA
ATAAAATGGTTCTTTA
TAC

QA 3 738 3 738
DS 

RD RS1DU40JQ 722 0 0
CTTATCTTTCAGG
AGGTGAGAAGAAAAAAGAATGGCGTTTGTGACAACTGCGGAAGTTTGTGACGCGAATCAA
GATCTGATCCGTAGTGGCCAGCTCAGAGCTATGCAACCCTGTTT*CCAGATTTACGGTCG
TCGTCAAATATTCTCAGGTCCTGTTGTTACTGTCAAAGTGTTTGAAGACAATGGCTTGAT
CCGTCAGTTTCTCGAAGAGAAAGGCAATGGAAGAGTTCTTGTGGTGGATGGTGGAGGGAG
TTTACGATGTGCTATACTTGGAGGGAACCCGGTAGTACAAGCTCAGAACAACGGATGGGC
GGGGATCATAGTGAACGGTTGCATAAGAGACGTTGATGAGATCAACGGTTGTGACATTGG
AGTGAGAGCTTTGGCTTCACATCCCATAAAGGCTAGTAAGAAAGGACTTGGTGAACAGAG
AGTCCCACTCAACATAGCTGGCATTCGGATATGCGATGGTGAATGGCTTTACGCAGATAC
TGATGGTATCCTTGTTTCTCAGGTCGAATTATCTGTTTAGAAAAACAAAGAAATGGTGGA
GGAGCTTTGTCTTCTTGTTAAATGGCTATCAAAGCAAAAATGTTGATGTCTTTGAAGGGA
TACGTTTTGGGGTTTGTGGCGTTAATAAGTTAAATGTTTTTCATTATTTGTTTGTATTAT
TTTCGTGTCATGGCGTGTAACGTTTCTGAAATAAAATGGTTCTTTA
TAC

QA 14 719 14 719
DS 

RD RS1D858JQ 687 0 0
CGTTTGTGACAACTGCGGAAGTTTGTGACGCGAATCAAGATCTGATCCGTAGTGGCCAGC
TCAGAGCTATGCAACCCTGTTT*CCAGATTTACGGTCGTCGTCAAATATTCTCAGGTCCT
GTTGTTACTGTCAAAGTGTTTGAAGACAATGGCTTGATCCGTCAGTTTCTCGAAGAGAAA
GGCAATGGAAGAGTTCTTGTGGTGGATGGTGGAGGGAGTTTACGATGTGCTATACTTGGA
GGGAACCCGGTAGTACAAGCTCAGAACAACGGATGGGCGGGGATCATAGTGAACGGTTGC
ATAAGAGACGTTGATGAGATCAACGGTTGTGACATTGGAGTGAGAGCTTTGGCTTCACAT
CCCATAAAGGCTAGTAAGAAAGGACTTGGTGAACAGAGAGTCCCACTCAACATAGCTGGC
ATTCGGATATGCGATGGTGAATGGCTTTACGCAGATACTGATGGTATCCTTGTTTCTCAG
GTCGAATTATCTGTTTAGAAAAACAAAGAAATGGTGGGGGAGCTTTGTCTTCTTGTTAAA
TGGCTATCAAAGTAAAAATGTTGATGTCTTTGAAGGGATACGTTTTGGGGTTTGTGGCGT
TAATAAGTTAAATGTTTTTCATTATTTGTTTGTATTATTTTCGTGTCATGGCGTGTAACG
TTTCTGAAATAAAATGGTTCTTTATAC

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 3

CO CL1573Contig1 1473 3 9 U
GCTCATATCCGCCGGTGCTAGTCACTCCGTCGCTCTACTCACTGGGGATGTTGTTTGCTC
ATGGGGTAGAGGAGAGGATGGACAATTAGGTCATGGAGATGCGGAGGATCGACCTTCTCC
CACGCAGCTAAGCGCCTTGGATGACCACCAAATCGTTTCCGTTACCTGTGGTGCTGACCA
CACGGTTGCTTATTCTGAATCACGCATGGAGGTCTACAGTTGGGGATGGGGTGATTTTGG
GAGATTAGGCCATGGGAACTCCAGCGACTTGTTTACTCCGCTGCCGATCAAAGCATTGCA
CGGTGTTCGGATAAAGCAGATTGCTTGTGGGGATAGTCATTGTTTGGCTGTGACTATGGA
AGGAGAGGTGCAGAGCTGGGGGCGCAACCAGAATGGTCAACTTGGTCTGGGGGACACTGA
AGATTCTCTAGTTCCTCGGAAGATTCAAGCCTTTGAGGGAACACGAATCAAAATGGTTGC
TGCTGGTGCAGAACACACTGCTGCGGTTACAGAAGATGGTGATCTTTATGGATGGGGATG
GGGAAGATACGGAAATTTGGGATTAGGTGACCGGAATGACCGCTTGGTTCCTGAAAGGGT
TACCTCTGCTGGCGCTGAGAAGATGTCGATGGTTGCTTGTGGATGGCGGCACACGATATC
AGTTTCTTACTCTGGAGCATTATATACTTATGGATGGAGCAAATATGGACAGCTAGGACA
TGGTGACTTAGAGGATCACCTTATTCCTCACAAACTGGAAGCGCTGGGCAACAATGTTAT
CTCCCAGATTTCGGGAGGTTGGAGACATACAATGGCATTGACTTCTGATGGAAAACTATA
TGGATGGGGTTGGAATAAGTTTGGGCAAGTAGGAGTGGGAGATATCATAGATCAGTGTTC
TCCTGTGCATGTGCGGTTTCCCGATGATCCGAAAGTAGTTCAAGTTTCATGTGGATGGAG
ACATACCTTGGCTGTGACTGAAAGAAACAATGTGTTTGCTTGGGGAAGAGGTACAAATGG
GCAGCTCGGCATTGGAGAGTCGCTTGACAGGAATTCCCCCAAGATTATAGAAGCACTCAG
CGTGGATGGAGCAAGTGGACAACAGATAGAATTTTTTAATTTCGATCCAGCTTCAGGGAA
AAGCTGGGTGTCACCATCAGAGAGATATGCGGTTGTTCCTGATGAAACTGTAAATGGTTC
AAAGGAAGGCAATGGTGGTGATATCAGCGTACCACAAACTGATGCTAAGCGTGTACGAAT
TTGAGTTCAGACAAGTCGTCGTCTTTTTCGTGTTTGGTTTGGTCTTGGAGCGTTTATCCA
TCATCTCTTTTGGGGTTTTAAGGTTTGTTTGTACTAGTACGTCTGTCAAGTTCGGGATTT
GCTTTTTTTTTTTGTATTTTGTAACTTTTTACTTTAGAGTGTTTATTTCGCCAAGTAATC
AAAGAAGAAATAAAGAATAAAATTTGCATTATG


BQ
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G
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CAAGTCGTCGTCTTTTTCGTGTTTGGTTTGGTCTTGGAGCGTTTATCCATCATCTCTTTT
GGGGTTTTAAGGTTTGTTTGTACTAGTACGTCTGTCAAGTTCGGGATTTGCTTTTTTTTT
TTGTATTTTGTAACTTTTTACTTTAGAGTGTTTATTTCGCCAAGTAATCAAAGAAGAAAT
AAAGAATAAAATTTGCATTATG

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DS 



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AACATAATATCTATAACATATCAATAACCAATTATAAATATAATATGAAATAATGACACA
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ATCTTTCAAGTAGACTTTTATTAGCCTTTTGTTGTCTGTAGGAAGAA


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AF RS1CR21JQ U 1
AF RS1F627TF C 7
AF RS1F627JQ U 16
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CTTCTGACGAGGATGATTATGTTGTTTCCTTCTTGGCTGAGTACATCTTGGGATGAACAC
TCCTGTCCCTTTGCTCTCTTTAAGTAGGCTGTAATTCTTCTCATGGTACATCATATGTGG
TGTTGATGATGTTTGGTAGTTTTCTCTGAACAAACCCTGGAAGATAGAAGAAGAGAGTGA
GATAGGGATCTGTTCATCTTCATCTGTGATTAAGAGATTGATTTGTTTGCTTATGTCTGC
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DS 



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BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 5 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 10 

AF RS1CI29TF U 1
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C

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ATTTCATTCCTAATGTTGTAATGCTATGCCACTCCTTTGGGACTTTGTTCTAAATCCCTT
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C

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DS 

RD RS1DI75TF 639 0 0
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TATGGAGCTCTCTTCCTCTTGGCCCTCGTTGTCTTCTCCTTGCTCCAAACCATGGCTGTG
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TGCATTTTATTCTGCAACAACTGCTGCAGAAAATGTTTGTGTGTTCCTCCGGGTTACTAT
GGGAACAAACAAGTTTGCTCTTGCTACAACAACTGGAAAACTCAACAAGGTGGACCAAAA
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TCGATGATATTTATATTTCACTTTGATCCAACTGTTGGTTTTGTGTTTCTTGTTCTATCT
ATTTTATTCCTAATGTTGTAATTCTATGCCACTCCTTTGGGACTTTGTTCTAAATCCCTT
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T

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 5

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CG23JQ U 20
AF RS1AO95JQ U 1
AF RS1C161JQ U 16
AF RS1C161TF C 26
AF RS1AO95TFB C 300
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AAGTCTCTCAATTTA
TTTATTATTTCAAACTCAAAACATCAAAAGTTTAACAATGTTTGAAACTAAAAAGTTCAA
CAGCAAAGTACGAAAATACATACATATAGTTCACAATGCTCATCGTTTTAGCTCTCT**T
GATTCAGCATTTAGGTTTGTTTTTGGACAAAGCTATCTTACCGCAAGAACTCTCTTGGGT
CGGTGACATGACCGGTCAGAGCCGAGGCTGCAGCGGTGTAAGGCGAAACCAAGTAAATCT
GCCCTTCTTTGTGTCCCATCCGACCAGGAAAGTTTCTGTTTGTTGTCGAGACACACACTT
GAGGTTCATTCAAGCGAGCATAGGTATCTGCTGGGCCACCAAGGCAGGCACCACAACTAG
GACTAGTTGGTGTGTCGCAGCCAGATTCTTCGAATATCTGTGCACACGTTTTTCCACCTG
CTCCAGGCACAGGGAGGGCATACACATCCATCCACACCTTCTGGGTAGCGGGGAAAAGGA
AAGTTGGGACTTTGACTTGCTTTCCTGCTGCATGGAGAAGTTTAGCTGCAGCCATAAAAT
CCTCAGTCTTCCCACCAGTACAAGAACCAATGTATACTCTGTCAATTTTCACATCTTTGC
ATTCTCTTGCTAGAGCCCGGTTGTC

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DS 

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AAAGTTTAACAATGTTTGAAACTAAGAAGTTCAACAGCAAAGTACGAAAATACATACATA
TAGTTCACAATGCTCATCGTTTTAGCTCTCTCTTGATTCAGCATTTAGGTTTGTTTTCGG
ACAAAGCTATCTTACTGCAAGAACTCTCTTGGGTCGGTGACATGACCGGTCAGAGCCGAG
GCTGCAGCGGTGTAAGGCGAAGCCAAGTAAATCTGCCCTTCTTTGTGTCCCATCCGACCA
GGAAAGTTTCTGTTTGTTGTCGAGACACACACTTGAGGTTCATTCAAGCGAGCATAGGTA
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TCTTCGAATATCTGTGCACATGTCTTTCCACCTGCTCCAGGCACAGGGAGGGCATACACA
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GCTGCATGGAGAAGTTTAGCTGCAGCCATAAAATCCTCAGTCTTCCCACCAGTACAAGAA
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DS 

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TTTATTATTTCAAACTCAAAACATCAAAAGTTTAACAATGTTTGAAACTAAGAAGTTCAA
CAGCAAAGTACGAAAATACATACATATAGTTCACAATGCTCATCGTTTTAGCTCTCT**T
GATTCAGCATTTAGGTTTGTTTTTGGACAAAGCTATCTTACTGCAAGAACTCTCTTGGGT
CGGTGACATGACCGGTCAGAGCCGAGGCTGCAGCGGTGTAAGGCGAAGCCAAGTAAATCT
GCCCTTCTTTGTGTCCCATCCGACCAGGAAAGTTTCTGTTTGTTGTCGAGACACACACTT
GAGGTTCATTCAAGCGAGCATAGGTATCTGCTGGGCCACCAAGGCAGGCACCACAACTAG
GACTAGTTGGTGTGTCGCAGCCAGCTTCTTCGAATATCTGTGCACACGTTTTTCCACCTG
CTCCAGGCACAGGGAGGGCATACACATCCATCCACACCTTCTGGGTAGCGGGGACAAGGA
AAGTTGAGACTTTGACTTGCTTTCCTGCTGCATGGAGAAGTTTAGCTGCAGCCATAAAAT
CCTCAGTCTTCCCACCAGTACAAGAACCAATGTATACTCTGTCAATTTTCACATCTTTGC
ATTCTCTTGCTAGAGCCCGGTTGTCAGGAGAATGAGGCTTAGCCACC
C

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CTCAATTTA
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CAGCAAAGTACGAAAATACATACATATAGTTCACAATGCTCATCGTTTTAGCTCTCT**T
GATTCAGCATTTAGGTTTGTTTTTGGACAAAGCTATCTTACTGCAAGAACTCTCTTGGGT
CGGTGACATGACCGGTCAGAGCCGAGGCTGCAGCGGTGTAAGGCGAAGCCAAGTAAATCT
GCCCTTCTTTGTGTCCCATCCGACCAGGAAAGTTTCTGTTTGTTGTCGAGACACACACTT
GAGGTTCATTCAAGCGAGCATAGGTATCTGCTGGGCCACCAAGGCAGGCACCACAACTAG
GACTAGTTGGTGTGTCGCAGCCAGCTTCTTCGAATATCTGTGCACACGTTTTTCCACCTG
CTCCAGGCACAGGGAGGGCATACACATCCATCCACACCTTCTGGGTAGCGGGGACAAGGA
AAGTTGAGACTTTGACTTGCTTTCCTGCTGCATGGAGAAGTTTAGCTGCAGCCATAAAAT
CCTCAGTCTTCCCACCAGTACAAGAACCAATGTATACTCTGTCAATTTTCACATCTTTGC
ATTCTCTTGCTAGAGCCCGGTTGTCAGGAGAATGAGGCTTAGCCACC
C

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DS 

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ATCTGCTGGGCCACCAAGGCAGGCACCACAACTAGGACTAGTTGGTGTGTCGCAGCCAGC
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ATCCATCCACACCTTCTGGGTAGCGGGGACAAGGAAAGTTGGGACTTTGACTTGCTTTCC
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ACCAATGTACACTCTGTCAATTTTCACATCTTTGCATTCTCTTGCTAGAGCCCGGTTGTC
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AACAAAGCTTGCATTTCCATCACTATATACGGCCTCAAAGGGTACAGATGTCCTGTTCTC
AACGTAGTTAAATGTCGTCGCATCAGGAGGGATAACACCATTCTTTCCCCCAGCTTCCTC
AACCATGTTGCACAATGTCATTCTTTCTTCCATAGTCAGACTTTCAATAGTTGTGCCACT
GAACTCCATCGTCTTGTAAGTTGCACCAGCAACAGATATTTCACCAATGATTTGTAAAAT
CAGATCCTTTGCTTGCAGATAACTGGGCATTTCACCC

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 5

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CACAAATCGATCACAGATGGCGAAGGATCCAGCTCGTGTTCTCGTCACTGGAGCTGCAGG
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GCCAGTGATCCTCCACATGCTTGATATCCCTCCTGCTGCTGAAGCTTTGAACGGTGTCAA
AATGGAGTTGATCGATGCTGCTTTCCCTCTTCTCAAAGGTGTGGTGGCTACCACTGACGC
CGTGGAAGGGTGTACTGGTGTGAACGTTGCAGTTATGGTTGGTGGTTTCCCGAGGAAGGA
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TGCTTTGGAGAAGCACGCCGCACCTAACTGCAAGGTTTTGGTTGTTGCAAACCCTGCAAA
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CTTGACGAGGCTTGACCACAACAGGGCCTTGGGACAGGTCTCTGAGAGGTTAAACGTGCC
AGTCTCTGATGTCAAGAACGTGATTATCTGGGGAAACCACTCGTCGAGCCAGTACCCTGA
TGTGAATCACGCTAGCGTCAAGACTTCTTCTGGGGAGAAGCCAGTGCGTGAGCTTGTCAA
GGACGACGAGTGGTTGAATGGAGAGTTCATCACAACCGTTCAACAACGTGGAGCTGCTAT
TATCAAGGCCAGGAAGCTATCTAGTGCACTCTCTGCAGCTAGCTCAGCTTGTGACCATAT
CCGTGATTGGGTCCTTGGAACTCCCGAGGGCACATTTGTTTCAATGGGTGTGTACTCAGA
CGGATCATACAACGTTCCATCTGGACTTATCTATTCTTTCCCTGTAACCTGCCGTAACGG
AGAGTGGTCTATTGTCCAAGGTTTACCGATCGATGAAGTGTCGAGGAAGAAGATGGATTT
GACAGCAGAGGAGTTGAAGGAAGAGAAGGACCTTGCTTACTCATGCCTCTCTTAGACCGG
TTTTTATCCCTGAAAGATGATAACGGAGCTTTGTTTCGAATAAGGATGCTTTGTTTATTA
AAAAAAGAATACTTTGAATAACCTCATGAGGTTAGGAGCTGTACTTGTGTTTTCCAGTAT
TTTGAATCTTTGACCTCTTTCAGTCTGGGCTTTTGGCCGAAGTGTTCGGGTTTTATTTCG
TTTTTTTGGTCAAACTGTCCAAGATACACTACATGGTTCATCCATGGACTTCATTGATAG
GAAAATTCCCATGGACT


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GD34TF U 1
AF RS1FJ21TF U 553
AF RS1FJ21JQ C 1119
AF RS1F167TF U 1005
AF RS1GD34JQ C 661
BS 1 762 RS1GD34TF
BS 763 806 RS1FJ21TF
BS 807 807 RS1GD34JQ
BS 808 984 RS1FJ21TF
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BS 1124 1124 RS1F167TF
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BS 1155 1155 RS1F167TF
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BS 1221 1239 RS1F167TF
BS 1240 1337 RS1GD34JQ

RD RS1GD34TF 781 0 0
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CACAAATCGATCACAGATGGCGAAGGATCCAGCTCGTGTTCTCGTCACTGGAGCTGCAGG
ACAAATCGGATACGCTCTTGTACCTATGATCGCAAGAGGAATCATGCTCGGGGCAGATCA
GCCAGTGATCCTCCACATGCTTGATATCCCTCCTGCTGCTGAAGCTTTGAACGGTGTCAA
AATGGAGTTGATCGATGCTGCTTTCCCTCTTCTCAAAGGTGTGGTGGCTACCACTGACGC
CGTGGAAGGGTGTACTGGTGTGAACGTTGCAGTTATGGTTGGTGGTTTCCCGAGGAAGGA
AGGAATGGAGAGGAAGGATGTCATGTCCAAGAACGTTTCCATTTACAAGTCCCAAGCTGC
TGCTTTGGAGAAGCACGCCGCACCTAACTGCAAGGTTTTGGTTGTTGCAAACCCTGCAAA
CACCAACGCGTTGATCCTTAAGGAATTCGCACCGTCCATCCCCGAGAAGAACATCACTTG
CTTGACGAGGCTTGACCACAACAGGGCCTTGGGACAGGTCTCTGAGAGGTTAAACGTGCC
AGTCTCTGATGTCAAGAACGTGATTATCTGGGGAAACCACTCGTCGAGCCAGTACCCTGA
TGTGAATCACGCTAGCGTCAAGACTTCTTCTGGGGAGAAGCCAGTGCGTGAGCTTGTCAA
GGACGACGAGTGGTTGAATGGAGAGTTCATCACAACCGTTCA
CACGTGGAGCTGCTATATC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1FJ21TF 668 0 0
G
GACCACAACAGGGCCTTGGGACAGGTCTCTGAGAGGTTAAACGTGCCAGTCTCTGATGTC
AAGAACGTGATTATCTGGGGAAACCACTCGTCGAGCCAGTACCCTGATGTGAATCACGCT
AGCGTCAAGACTTCTTCTGGGGAGAAGCCAGTGCGTGAGCTTGTCAAGGACGACGAGTGG
TTGAATGGAGAGTTCATCACAACCGTTCAACAACGTGGAGCTGCTATTATCAAGGCCAGG
AAGCTATCTAGTGTACTCTCTGCAGCTAGCTCAGCTTGTGACCATATCCGTGATTGGGTC
CTTGGAACTCCCGAGGGCACATTTGTTTCAATGGGTGTGTACTCAGACGGATCATACAAC
GTTCCATCTGGACTTATCTATTCTTTCCCTGTAACCTGCCGTAACGGAGAGTGGTCTATT
GTCCAAGGTTTCCCGATCGATGAAGTGTCGAGGAAGAAGATGGATTTGACAGCAGAGGAG
TTGAAGGAAGAGAAGGACCTTGCTTACTCATGCCTCTCTTAGACCGGTTTTTATCCCTGA
AAGATGATAACGGAGCTTTGTTTCGAATAAAGATGCTTTGTTTATTAAAAAAAGAATACT
TCGAATAACCTCATGAG*TTAGGAGCTGTACTTGTGTTTTCCAGTATTTTGAATCTTTGA
CCTCTTT

QA 2 668 2 668
DS 

RD RS1FJ21JQ 103 0 0
AAAAAG
GATGCTTTGTTTATTAAAAAAAGAATACTTGGAATAACCTCATGAGGTTAGGAGCTGTAC
TTGTGTTTTCCAGTATTTTGAATTTTTGACCTCTTT
C

QA 7 102 7 102
DS 

RD RS1F167TF 235 0 0
GGAAGAAGATGGATTTGACAGCAGAGGAGTTGAAGGAAGAGAAGGACCTTGCTTACTCAT
GCCTCTCTTAGACCGGTTTTTATCCCTGAAAGATGATAGCGGAGCTTTGTTTCGAATAAG
GATGCTTTGTTTATTAAAAAAAGAATACTTTGAATAACCTCATGAGGTTAGGAGCTGTAC
TTGTGTTTTCCAGTATTTTGAATCTTTGATCTCTTTCAGTCTGGGCTTTTGGCCG

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DS 

RD RS1GD34JQ 677 0 0
TGTGAATCACGCTAGCGTCAAGACTTCTTCTGGGGAGAAGCCAGTGCGTGAGCTTGTCAA
GGACGACGAGTGGTTGAATGGAGAGTTCATCACAACCGTTCAACAACGTGGAGCTGCTAT
TATCAAGGCCAGGAAGCTATCTAGTGC*CTCTCTGCAGCTAGCTCAGCTTGTGACCATAT
CCGTGATTGGGTCCTTGGAACTCCCGAGGGCACGTTTGTTTCAATGGGTGTGTACTCAGA
CGGATCATACAACGTTCCATCTGGACTTATCTATTCTTTCCCTGTAACCTGCCGTAACGG
AGAGTGGTCTATTGTCCAAGGTTTACCGATCGATGAAGTGTCGAGGAAGAAGATGGATTT
GACAGCAGAGGAGTTGAAGGAAGAGAAGGACCTTGCTTACTCATGCCTCTCTTAGACCGG
TTTTTATCCCTGAAAGATGATAACGGAGCTTTGTTTCGAATAAGGATGCTTTGTTTATTA
AAAAAAGAATACTTTGAATAACCTCATGAGGTTAGGAGCTGTACTTGTGTTTTCCAGTAT
TTTGAATCTTTGACCTCTTTCAGTCTGGGCTTTTGGCCGAAGTGTTCGGGTTTTATTTCG
TTTTTTTGGTCAAACTGTCCAAGATACACTACATGGTTCATCCATGGACTTCATTGATAG
GAAAATTCCCATGGACT

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 4

CO CL1578Contig1 1032 4 10 U
GGGCTGCCGAAGCTTTCATCGATGGCGACGTTTCAGCTTTTCTCTTCTTCGAACGATAAG
TCATCATCCCAAGGTTTAGGGTTCTTCGATTCACCAGAGCCACCTCGTCCTCCACCGCCT
CCTCCTGTTGAAGTATTCTCCTCCGAGGTGTCTTCCTCCGTTGCTTTCACAGTAGATAAA
GTGAATATCGGCGAAGTCACTCTTTTGAAGGGTCGTGTGAACACTAAAGAGGTCTTTGGA
TTGCCTAATTCGGATTTGGTTCCTGGAGTATATGAAGGTGGGCTTAAGCTTTGGGAAGGA
TCTATAGATCTTGTCAAAGCTCTTGAAAAGGAGTCACAAATTGGGAACATATCATTCCCT
GGAAAACGGGTCCTCGAGCTTGGTTGTGGTCATGCACTTCCAGGAATCTATGCGCGTCTC
AAGGGTGCGGATGCAGTTCATTTCCAGGACTTTAATGCTGAGGTCCTTCGATGTCTCACC
ATTCCCAATCTGAATGCTAATCTCTCCCAGAAGTCTCCGTCTGTTTCAGATAGTGATATA
GAAGTACGCTTCTTTGCTGGTGAGTGGAGTGAAGTTCATCAGCTTCTTCCACTAGTTAAT
GATGGTGAGACTGAGAAGAA*GGGTGGTTATGACATCATTCTAATGGCTGAGACGATTTA
TTCCATCTCTGCTCAGAAAAGTCTCTATGAACTGATCAAAAGGTGCTTGGCCTATCCTGA
TGGAGCAGTGTACATGGCTGCAAAGAAGTACTATTTCGGGGTTGGTGGAGGGACGAGGCA
GTTCCTGTCTATGATTGAGAAAGACGGCGTTCTTGCTTCAACCTTGGTGTCTGAAGTCAC
AGATGGCTCCTCAAATGTCAGAGAGGTATGGAAACTTTCGTACAAGCCCTAGTTCATCCG
GGATTCAACATCGCTCTCTAGTTCAACGATTCATCAAGTTTTGTGGTTTTTCGTTTGTGG
TGCTCATCAAAATTAAGAAAACTCAAAATCTCCTCTATGTTAAACTTACAGATTATGTTA
GACTTTATTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1BJ72TF U 1
AF RS1DL74TF U 10
AF RS1DL74JQ C 250
AF RS1BJ72JQ C 421
BS 1 392 RS1BJ72TF
BS 393 393 RS1DL74TF
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BS 744 1030 RS1DL74JQ
BS 1031 1032 RS1BJ72JQ

RD RS1BJ72TF 698 0 0
GGGCTGCCGAAGCTTTCATCGATGGCGACGTTTCAGCTTTTCTCTTCTTCGAACGATAAG
TCATCATCCCAAGGTTTAGGGTTCTTCGATTCACCAGAGCCACCTCGTCCTCCACCGCCT
CCTCCTGTTGAAGTATTCTCCTCCGAGGTGTCTTCCTCCGTTGCTTTCACAGTAGATAAA
GTGAATATCGGCGAAGTCACTCTTTTGAAGGGTCGTGTGAACACTAAAGAGGTCTTTGGA
TTGCCTAATTCGGATTTGGTTCCTGGAGTATATGAAGGTGGGCTTAAGCTTTGGGAAGGA
TCTATAGATCTTGTCAAAGCTCTTGAAAAGGAGTCACAAATTGGGAACATATCATTCCCT
GGAAAACGGGTCCTCGAGCTTGGTTGTGGTCACGCACTTCCAGGAATCTATGCGCGTCTC
AAGGGTGCGGATGCAGTTCATTTCCAGGACTTTAATGCTGAGGTCCTTCGATGTCTCACC
ATTCCCAATCTGAATGCTAATCTCTCCCAGAAGTCTCCGTCTGTTTCAGATAGTGATATA
GAAGTACGCTTCTTTGCTGGTGAGTGGAGTGAAGTTCATCAGCTTCTTCCACTAGTTAAT
GATGGTGAGACTGAGAAGAA*GGGTGGTTATGACATCATTCTAATGGCTGAGACTATTTA
TTCCATCTCTGCTCAGAAAAGTCTCTATGAACTGATCA

QA 1 698 1 698
DS 

RD RS1DL74TF 744 0 0
AAGCTTTCATCGATGGCGACGTTTCAGCTTTTCTCTTCTTCGAACGATAAGTCATCATCC
CAAGGTTTAGGGTTCTTCGATTCACCAGAGCCACCTCGTCCTCCACCGCCTCCTCCTGTT
GAAGTATTCTCCTCCGAGGTGTCTTCCTCCGTTGCTTTCACAGTAGATAAAGTGAATATC
GGCGAAGTCACTCTTTTGAAGGGTCGTGTGAACACTAAAGAGGTCTTTGGATTGCCTAAT
TCGGATTTGGTTCCTGGAGTATATGAAGGTGGGCTTAAGCTTTGGGAAGGATCTATAGAT
CTTGTCAAAGCTCTTGAAAAGGAGTCACAAATTGGGAACATATCATTCCCTGGAAAACGG
GTCCTCGAGCTTGGTTGTGGTCATGCACTTCCAGGAATCTATGCGCGTCTCAAGGGTGCG
GATGCAGTTCATTTCCAGGACTTTAATGCTGAGGTCCTTCGATGTCTCACCATTCCCAAT
CTGAATGCTAATCTCTCCCAGAAGTCTCCGTCTGTTTCAGATAGTGATATAGAAGTACGC
TTCTTTGCTGGTGAGTGGAGTGAAGTTCATCAGCTTCTTCCACTAGTTAATGATGGTGAG
ACTGAGAAGAAAGGGTGGTTATGACATCATTCTAATGGCTGAGACGATTTATTCCATCTC
TGCTCAGAAAAGTCTCTATGA*CTGATCAAAAG*TGCTTGGCCTATCCTGATGGAGCAGT
GTACATGGCTGCAA
GAGTACTATT

QA 1 734 1 734
DS 

RD RS1DL74JQ 783 0 0
TCGGATTTGGTTCCTGGAGTATATGAAGGTGGGCTTAAGCTTTGGGAAGGATCTATAGAT
CTTGTCAAAGCTCTTGAAAAGGAGTCACAAATTGGGAACATATCATTCCCTGGAAAACGG
GTCCTCGAGCTTGGTTGTGGTCATGCACTTCCAGGAATCTATGCGCGTCTCAAGGGTGCG
GATGCAGTTCATTTCCAGGACTTTAATGCTGAGGTCCTTCGATGTCTCACCATTCCCAAT
CTGAATGCTAATCTCTCCCAGAAGTCTCCGTCTGTTTCAGATAGTGATATAGAAGTACGC
TTCTTTGCTGGTGAGTGGAGTGAAGTTCATCAGCTTCTTCCACTAGTTAATGATGGTGAG
ACTGAGAAGAA*GGGTGGTTATGACATCATTCTAATGGCTGAGACGATTTATTCCATCTC
TGCTCAGAAAAGTCTCTATGAACTGATCAAAAGGTGCTTGGCCTATCCTGATGGAGCAGT
GTACATGGCTGCAAAGAAGTACTATTTCGGGGTTGGTGGAGGGACGAGGCAGTTCCTGTC
TATGATTGAGAAAGACGGCGTTCTTGCTTCAACCTTGGTGTCTGAAGTCACAGATGGCTC
CTCAAATGTCAGAGAGGTATGGAAACTTTCGTACAAGCCCTAGTTCATCCGGGATTCAAC
ATCGCTCTCTAGTTCAACGATTCATCAAGTTTTGTGGTTTTTCGTTTGTGGTGCTCATCA
AAATTAAGAAAACTCAAAATCTCCTCTATGTTAAACTTACAGATTATGTTAGACTTTATT
A
CC

QA 1 781 1 781
DS 

RD RS1BJ72JQ 612 0 0
AAGGGTGCGGATGCAGTTCATTTCCAGGACTTTAATGCTGAGGTCCTTCGATGTCTCACC
ATTCCCAATCTGAATGCTAATCTCTCCCAGAAGTCTCCGTCTGTTTCAGATAGTGATATA
GAAGTACGCTTCTCTGCTGGTGAGTGGAGTGAAGTTCATCAGCTTCTTCCACTAGTTAAT
GATGGTGAGACTGAGAAGAA*GGGTGGTTATGACATCATTCTAATGGCTGAGACTATTTA
TTCCATCTCTGCTCAGAAAAGTCTCTATGAACTGATCAAAAGGTGCTTGGCCTATCCTGA
TGGAGCAGTGTACATGGCTGCAAAGAAGTACTATTTCGGGGTTGGTGGAGGGACGAGGCA
GTTCCTGTCTATGATTGAGAAAGACGGCGTTCTTGCTTCAACCTTGGTGTCTGAGGTCAC
AGATGGCTCCTCAAATGTCAGAGAGGTATGGAAGCTTTCGTACCAGCCCTAGTTCATCCG
GGATTCAACATCGCTCTCTAGTTCAACGATTCATCAAGTTTTGTGGTTTTTCGTTTGTGG
TGCTCATCAAAATTAAGAAAACTCAAAATCTCCTCTATGTTAAACTTACAGATTATGTTA
GACTTTATTATC

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 4

CO CL1579Contig1 1651 4 8 U
GGTATATTGGGGACATTGAATCCTGTGACTGCCATGGCAGAACTTTTGGGGATCTGCATA
GATGGGCTACTTCTTGTATCAGCTTTCAGGTAGCTGTCTCCAGCCTGCATCAGATGTTAT
TAACTCACTACACACCAAACACAACCACAACAATAAGAAAAACGGCAACCATTTTGAAGA
GCCAAACAAAAACCGGCACACAAGTTTCCTCCCCAAGCTGATAAAACCCCCTTCTAAATC
AAGCGCAGTGTCATTTTGAGAGGTCAACAAAATGGGACTTAAAGGTTATAGCGCCGGAGA
TGAAGTAGGAGAGATAATAGAGGTTCCAGGTGGTCACATCATTCGAGCCACTGGACGAAA
AGACCGTCACAGCAAAGTTTTCACATCAAAGGGTCCACGTGACCGGCGCGTGAGACTTGC
AGCCCACACGGCGATTCAGTTCTACGACGTGCAAGACCGGTTGCAGTATGACCGGCCAAG
CAAAGCCGTGGACTGGCTCATCAAGAAAGCTAAAGCTGCTATTGATAAGCTCGAAACCAC
TCAAGAACCAGAGAATACTACTACTAAACCGGGCTCTTCTTCTTCCGAGCCCAACTTGGT
TGATACTCAAACGCAGTTTGTGGCGGCCAATCTTGATCCTGAAGACGCAATGAAAACGTT
CTTCCCGGCGACAACAAGCGGCGGTGGTACGAACATGAATTTCCAAAACTACCCTCATCA
TCATGATACCGACAATATAGTTTCAAGAACCACAACAACAACACCGAATCTTAGCCAAGA
TCCTGGTCTCTCTCTTCACCCATTTCAAGGAAACAACATCAGCAACACAGTAGTCCCCGA
GACCAACAACTTCGCCACGGCTCATTTCGAGACATTCGGGAGAATCTCTGGATGGAACAA
TCACGACTTAACGATGACGTCATCGTCATCTCCATCCGAACAACAACAAGAGCAAGAAAG
AGGTAATGGTGGTTTCATGGTGAACCTTCACCATCATCAACCATCGATGATGACATTGCT
TAACAGTCAGCAACAACAAGTGTTTCTTGGTGGCCAACAACAACAACGGGGTACCCTTCA
GTCCAGTTTATTCCCTCACTCGTTTCGTGCTTGGGATCATCATCATCAAACGACTTCGGA
CAATCATCATCATCATCATCACAATCAAGCTTCTCCTGTGATGTTTGCTTCTTCATCACA
GTATGGTTCTCATGGGATGATGATGATGCAAGGCCTCAGCTTCCCCATCCATGGAGAAGA
ATCTACTCAACCAAACTCCTCTTCTTCTCCTCCTCCAAACTCACACCTCTAAACGCAGAG
AAAGGGGTGTTTCTCATTTCTTATGACGCTAAGCAAAAAGGAGGAATTAATGAGATGGAA
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GTGTGCCTTCAGTTGTTATGATTCAAGACTACTATTACTCTCTTCTTAGTATTTTTATTA
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GAGGTGGGCTCTTTGTGTGTGTTTTAATATGACCTTGTGTTGAGACATTAATGTTATCTC
ATTTTTGTTCTACAAGTGAGTTATAATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1E471JQ U 1
AF RS1E471TF C 498
AF RS1EW06TF U 697
AF RS1AJ54JQ C 1287
BS 1 632 RS1E471JQ
BS 633 696 RS1E471TF
BS 697 868 RS1EW06TF
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TAACTCACTACACACCAAACACAACCACAACAATAAGAAAAACGGCAACCATTTTGAAGA
GCCAAACAAAAACCGGCACACAAGTTTCCTCCCCAAGCTGATAAAACCCCCTTCTAAATC
AAGCGCAGTGTCATTTTGAGAGGTCAACAAAATGGGACTTAAAGGTTATAGCGCCGGAGA
TGAAGTAGGAGAGATAATAGAGGTTCCAGGTGGTCACATCATTCGAGCCACTGGACGAAA
AGACCGTCACAGCAAAGTTTTCACATCAAAGGGTCCACGTGACCGGCGCGTGAGACTTGC
AGCCCACACGGCGATTCAGTTCTACGACGTGCAAGACCGGTTGCAGTATGACCGGCCAAG
CAAAGCCGTGGACTGGCTCATCAAGAAAGCTAAAGCTGCTATTGATAAGCTCGAAACCAC
TCAAGAACCAGAGAATACTACTACTAAACCGGGCTCTTCTTCTTCCGAGCCCAACTTGGT
TGATACTCAAACGCAGTTTGTGGCGGCCAATC

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1E471TF 660 0 0
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CTACTACTAAACCGGGCTCTTCTTCTTCCGAGCCCAACTTGGTTGATACTCAAACGCAGT
TTGTGGCGGCCAATCTTGATCCTGAAGACGCAATGAAAACGTTCTTCCCGGCGACAACAA
GCGGCGGTGGTACGAACATGAATTTCCAAAACTACCCTCATCATCATGATACCGACAATA
TAGTTTCAAGAACCACAACAACAACACCGAATCTTAGCCAAGATCTTGGTCTCTCTCTTC
ACCCATTTCAAGGAAACAACATCAGCAACACAGTAGTCCTCGAGACCAACAACTTCGCCA
CGGCTCATTTCGAGACATTCGGGAGAATCTCTGGATGGAACAATCACGACTTAACGATGA
CGTCATCGTCATCTCCATCCGAACAACAACAAGAGCAAGAAAGAGGTAATGGTGGTTTCA
TGGTGAACCTTCACCATCATCAACCATCGATGATGACATTGCTTAACAGTCAGCAACAAC
AAGTGTTTCTTGGTGGCCAACAACAACAACGGGGTACCCTTCAGTCCAGTTTATTCCCTC
ACTCGTTTCGTGCTTGGGATCATCATCATCAAACGACTTCGGACAATCATCATCATCATC

QA 1 660 1 660
DS 

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GAATTTCCAAAACTACCCTCATCATCATGATACCGACAATATAGTTTCAAGAACCACAAC
AACAACACCGAATCTTAGCCAAGATCCTGGTCTCTCTCTTCACCCATTTCAAGGAAACAA
CATCAGCAACACAGTAGTCCCCGAGACCAACAACTTCGCCACGGCTCATTTCTAGACATT
CGGGAGAATCTCTGGATGGAACAATCACGACTTAACGATGACGTCATCGTCATCTCCATC
CGAACAACAACAAGAGCAAGAAAGAGGTAATGGTGGTTTCATGGTGAACCTTCACCATCA
TCAACCATCGATGATGACATTGCTTAACAGTCAGCAACAACAAGTGTTTCTTGGTGGCCA
ACAACAACAACGGGGTACCCTTCAGTCCAGTTTATTCCCTCACTCGTTTCGTTCTTGGGA
TCATCATCATCAAACGACTTCGGACAATCATCATCATCATCATCACAATCAAGCTTCTCC
TGTGATGTTTGCTTCTTCATCACAGTATGGTTCTCATGGGATGATGATGATGCAAGGCCT
CAGCTTCCCCATCCATGGAGAAGAATCTACTCAACCAAACTCCTCTTCTTCTCCTCCTCC
AAACTCACACCTCTAAACGCAGAGAAAGGGGTGTTTCTCATTTCTTATGACGCTA
GCAA

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1AJ54JQ 365 0 0
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CGCTAAGCAAAAAGGAGGAATTAATGAGATGGAAGAAGAGTACGCAATATATTTATTATT
TTACCATCTATGACCTATCTATATGTTTATAGATGTGTGCCTTCAGTTGTTATGATTCAA
GACTACTATTACTCTCTTCTTAGTATTTTTATTATTCAGTTTTGCTCATTTGTTTTATGA
TTTTAAATTTCTCATCAAGTTTACGATGTTGAACGAGGTGGGCTCTTTGTGTGTGTTTTA
ATATGACCTTGTGTTGAGACATTAATGTTATCTCATTTTTGTTCTACAAGTGAGTTATAA
TTTCC

QA 1 365 1 365
DS 



AS 1 4

CO CL1580Contig1 888 4 27 U
GGAGGTTATCTGCAGAGAGAGAATTCACACAGCTGTAATGGCGATTCCAATGGCAACGGC
CACACCAACTGACTCCCTGAGTAGAGTTTGGAGCATGTCTTCTCTCAGATCATCTCTTCC
CTCAGCCGTAACTTGCCGGCTACCTTCCTCGTCCCCTCGCCGTCCCGTCACTCTCCGCCT
CCCCATCTCAACTCCCACATCGCTCCCATCTTTCTCCGGTCTCTCTCCGGTCAATCCTCT
CATCTCAACCGGACTCCCAGGTTGGAAAAGTTTCGAGGACGGGTTCAAGATAATCGACGG
TGGTGGTCGCGTGTACGCCATGAGACACGGGAGGAGAGTCCCTAAGCTGAACAGACCACC
TGACCAGAGGAAGGCTCTTCTCCGTGGGCTCACAACGCAGCTGTTGAAGCCCGGGGGGAT
CAAGACGACAAGAGCTAGAGCAAGTGCGATGAGGAAGTTTGTTGATAAGATGATTACGCT
CGCTAAAGATGGGTCTCTGCACAAGCGGAGGCAAGCTCTGGGGTACATCTACGAGAAGCA
GATCGTTCACGCGCTGTTCGCTGAGGTTCCCGATAGGTACGGGGAGAGGAATGGTGGGTA
CACGAGGATCATTAGGACTCTTCCAAGGCGTGGGGATAATGCTCCTATGGCGTATATTGA
GCTTGTTTAAATGTTTTGTTGTCCCTTTTTATTGCGTAATTGCTTGACGTTTGGTTTTGT
AATTGACGGACTTTGGTTACATGTTGGTGATGGTTCCTTTGAGTTTTCTGGTTAAAAGTT
GATACCAGATGGTCTAGAACTCTTTTATGTCATTAGGTTTTGGATTTGTTCTGTTCGTCT
TTGTAATGCAAAATCAGTGCTAAGTCTAGCTAGCACTACATGCTTCAG


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 5 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GG
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TCAACTCCCACATCGCTCCCATCTTTCTCCGGTCTCTCTCCGGTCAATCCTCTCATCTCA
ACCGGACTCCCAGGTTGGAAAAGTTTCGAGGACGGGTTCAAGATAATCGACGGTGGTGGT
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CTCAGCCGTAACTTGCCGGCTACCTTCCTCGTCCCCTCGCCGTCCCGTCACTCTCCGCCT
CCCCATCTCAACTCCCACATCGCTCCCATCTTTCTCCGGTCTCTCTCCGGTCAATCCTCT
CATCTCAACCGGACTCCCGGGTTGGAAAAGTTTCGAGGACGGGTTCAAGATAATCGACGG
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DS 

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ATCATCTCTTCCCTCAGCCGTAACTTGCCGGCTACCTTCCTCGTCCCCTCGCCGTCCCGT
CACTCTCCGCCTCCCCATCTCAACTCCCACATCGCTCCCATCTTTCTCCGGTCTCTCTCC
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GATAATCGACGGTGGTGGTCGCGTGTACGCCATGAGACACGGGAGGAGAGTCCCTAAGCT
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GATGATTACGCTCGCTAAAGATGGGTCTCTGCACAAGCGGAGGCAAGCTCTGGGGTACAT
CTACGAGAAGCAGATCGTTCACGCGCTGTTCGCTGAGGTTCCCGATAGGTACGGGGAGAG
GAATGGTGGGTACACGAGGATCATTAG*ACTCTTCCAAGGCGTGGGGATAATGCTCCTAT
GGCGTATATTGAGCTTGTTTAAATGTTTTGTTGTCCCTTTTTATTGCGTAATTGCTTGAC
GTTTGGTTTTGTAATTGACG*ACTTTGGTTACATGTTGGTGATGGTTCCTTTGAGTTT*C
TGGTTAAA*GTTGATAC*AGATGGTCTAGAACT

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DS 

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CGATGAGGAAGTTTGTTGATAAGATGATTACGCTCGCTAAAGATGGGTCTCTGCACAAGC
GGAGGCAAGCTCTGGGGTACATCTACGAGAAGCAGATCGTTCACGCGCTGTTCGCTGAGG
TTCCCGATAGGTACGGGGAGAGGAATGGTGGGTACACGAGGATCATTAGGACTCTTCCAA
GGCGTGGGGATAATGCTCCTATGGCGTATATTGAGCTTGTTTAAATGTTTTGTTGTCCCT
TTTTATTGCGTAATTGCTTGACGTTTGGTTTTGTAATTGACGGACTTTGGTTACATGTTG
GTGATGGTTCCTTTGAGTTTTCTGGTTAAAAGTTGATACCAGATGGTCTAGAACTCTTTT
ATGTCATTAGGTTTTGGATTTGTTCTGTTCGTCTTTGTAATGCAAAATCAGTGCTAAGTC
TAGCTAGCACTACATGCTTCAG

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 5

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GACACATTCTCTCTCTCTCTCTCACACATCAGAAACAAGAAATGGGAGGAGTTTCTTTCC
TCTCCACTGTTCCCTCCTTCACCAACATCAACAATCGTCAACATCTCACACTCTCTTCTT
CTCATCGCTCTGTTCTCATTCGATGTTGCAAGATCGATCCTCAAGTTTCCGACAACACTT
TATCATTTCACCGGCGGGATGTTCTCAAACTCGCCGGCACTGCCCTCGGAATGGAACTAA
CAGGTAACGGCTTCATTAACCATGTGGGCGATGCAAAAGCTGCTGATTTGAATCAGCGCA
GGCAGCGATCCGAGTTTCAATCAAAGATCAAGCTTTCACTTTCCAAAGCGGCTAAGGCTA
AACCGGAGCTTGTACCTTCTTTACTAACTCTAGCTCTTAATGATGCTATGACTTATGATA
AGGCTACAAAATCCGGTGGAGCCAATGGATCCATACGGTTCAGCTCTGAGATAAGCAGAG
CAGAGAACGCTGGGCTTTCTGATGGGCTAGCTCTCATAGAGGAAGCCAAGAAGGAGATTG
ACTCGTTCTCAAAGGGTGGACCTATTTCATATGCAGATCTCATTCAACTCGCAGGGCAAT
CAGCGGTGAAGGCAACATATTTAGCATCAGCAATACGTAAATGCGGTGGAAATGAAGAGA
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AATTCGGAAGGAGTGATGCAACAGAGGCTGATCCAGAAGGGAGGATCCCATTATGGGGAA
AAGCAACTGTGCAAGAGATGAAAGATAAGT*CATTGCCATTGGATTGGGTCCTCGTCAGT
TAGCTGTAATGTCTGCATTCTTGGGTCCTGATCAAGCCGCAACAGATGAGCTCTTAGCTA
GCGACCCGCAAGTTGCACCATGGGTTCAGAAGTACCAACGTAGCCGTGAAACTGTATCTC
AGACAGATTACGAGGTTGATCTGATAACTGCATTGACAAAGCTAAGTGGTCTAGGGCAGC
AAATCAACTATGAGGCATATACATATCCTGTCGAGCGGATCAATTTAAGCAAACTCAAGC
TATGAGCATAGAGCGTGACAACAAGTTTTAAGTCAGTGTACACTATGTATAACTTGAGCA
AACTTGAACTCACTATTATATCCAAGATTTTTCTTGAAATTCAAATGAAAAAAATAGTTA
AAAATGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D874TF U 1
AF RS1CH87TF U 172
AF RS1GK81TF U 401
AF RS1FS18TF U 415
AF RS1FS18JQ C 580
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BS 352 352 RS1CH87TF
BS 353 415 RS1D874TF
BS 416 416 RS1CH87TF
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BS 619 619 RS1FS18TF
BS 620 704 RS1D874TF
BS 705 705 RS1FS18TF
BS 706 724 RS1D874TF
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BS 1011 1030 RS1FS18TF
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RD RS1D874TF 741 0 0
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TCTCCACTGTTCCCTCCTTCACCAACATCAACAATCGTCAACATCTCACACTCTCTTCTT
CTCATCGCTCTGTTCTCATTCGATGTTGCAAGATCGATCCTCAAGTTTCCGACAACACTT
TATCATTTCACCGGCGGGATGTTCTCAAACTCGCCGGCACTGCCCTCGGAATGGAACTAA
CAGGTAACGGCTTCATTAACCATGTGGGCGATGCAAAAGCTGCTGATTTGAATCAGCGCA
GGCAGCGATCCGAGTTTCAATCAAAGATCAAGCTTTCACTTTCCAAAGCGGTTAAGGCTA
AACCGGAGCTTGTACCTTCTTTACTAACTCTAGCTCTTAATGATGCTATGACTTACGATA
AGGCTACAAAATCCGGTGGAGCCAATGGATCCATACGGTTCAGCTCTGAGATAAGCAGAG
CAGAGAACGCTGGGCTTTCTGATGGGCTAGCTCTCATAGAGGAAGCCAAGAAGGAGATTG
ACTCGTTCTCAAAGGGTGGACCTATTTCATATGCAGATCTCATTCAACTCGCAGGGCAAT
CAGCGGTGAAGGCAACATTTTTAGCATCAGCAATACGTAAATGCGGTGGAAATGAAGAGA
AAGGGAACTTACTCTACACAGCATATGGTTCAAGTGGTCAGTGGGCTTTGTTTGATAGAC
AATT
TAGAAGAGTGATGCAAC

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DS 

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G
CAACACTTTATCATTTCACCGGCGGGATGTTCTCAAACTCGCCGGCACTGCCCTCGGAAT
GGAACTAACAGGTAACGGCTTCATTAACCATGTGGGCGATGCAAAAGCTGCTGATTTGAA
TCAGCGCAGGCAGCGATCCGAGTTTCAATCAAAGATCAAGCTTTCACTTTCCAAAGCGGC
TAAGGCTAAACCGGAGCTTGTACCTTCTTTACTAACTCTAGCTCTTAATGATGCTATGAC
TTATGATAAGGCTACAAAATCCGGTGGAGCCAATGGATCCATACGGTTCAGCTCTGAGAT
AAGCAGAGCAGAGAACGCTGGGCTTTCTGATGGGCTAGCTCTCATAGAGGAGGCCAAGAA
GGAGATTGACTCGTTCTCAAAGGGTGGACCTATTTCATATGCAGATCTCATTCAACTCGC
AGGGCAATCAGCGGTGAAGGCAACATTTTTAGCATCAGCAATACGTAAATGCGGTGGAAA
TGAAGAGAAAGGGAACTTACTCTACACAGCATATGGTTCAAGTGGTCAGTGGGCTTTGTT
TGATAGACAATTTGGAAGGAGTGATGCAACAGAGGCTGATCCAGAAGGGAGGATCCCATT
ATGGGGAAAAGCAACTGTGCAAGAGATGAAAGATAAGTTCATTGCCATTGGATTGGGTCC
TCGTCAGTTAGCTGTAATGTCTGCATTCTTGGGTCCTGATCAAGCCGCAACAGA*GAGCT
CTTATCTAGCGACC*GCAAGTTGCACCATGGGTTC

QA 2 756 2 756
DS 

RD RS1GK81TF 610 0 0
G
GATGCTATGACTTATGATAAGGCTACAAAATCCGGTGGAGCCAATGGCTCCATACGGTTC
AGCTCTGAGATAAGCAGAGCAGAGAACGCTGGGCTTTCTGATGGGCTAGCTCTCATAGAG
GAAGCCAAGAAGGAGATTGACTCGTTCTCAAAGGGTGGACCTATTTCATATGCAGATCTC
ATTCAACTCGCAGGGCAATCAGCGGTGAAGGCAACATTTTTAGCATCAGCAATACGTAAA
TGCGGTGGAAATGAAGAGAAAGGGAACTTACTCTACACAGCATATGGTTCAAGTGGTCAG
TGGGCTTTGTTTGATAGACAATTTGGAAGGAGTGATGCAACAGAGGCTGATCCAGAAGGG
AGGATCCCATTATGGGGAAAAGCAACTGTGCAAGAGATGAAAGATAAGTTCATTGCCATT
GGATTGGGTCCTCGTCAGTTAGCTGTAATGTCTGCATTCTTGGGTCCTGATCAAGCCGCA
ACAGAAGAGCTCTTAGCTAGCGACCCGCAAGTTGCACCATGGGTTCAGAAGTACCAACGT
AGCCGTGAAACTGTATCTCAGACAGATTACGAG*TTGATCTGATAACTGCATTGACAAAG
CTAAGTGGT

QA 2 610 2 610
DS 

RD RS1FS18TF 616 0 0
GT
GATAAGGCTACAAAATCCGGTGGAGCCAATGGATCCATACGGTTCAGCTCTGAGATAAGC
AGAGCAGAGAACGCTGGGCTTTCTGATGGGTTAGCTCTCATAGAGGAAGCCAAGAAGGAG
ATTGACTCGTTCTCAAAGGGTGGACCTATTTCATATGCAGATCTCATTCAACTGGCAGGG
CAATCAGCGGTGAAGGCAACATATTTAGCATCAGCAATACGTAAATGCGGTGGAAATGAA
GAGAAAGGGAACTTACTCTACACAGCATATGGTTCAAGTGGTCAGTGGAGTTTGTTTGAT
AGACAATTCGGAAGGAGTGATGCAACAGAGGCTGATCCAGAAGGGAGGATCCCATTATGG
GGAAAAGCAACTGTGCAAGAGATGAAAGATAAGT*CATTGCCATTGGATTGGGTCCTCGT
CAGTTAGCTGTAATGTCTGCATTCTTGGGTCCTGATCAAGCCGCAACAGATGAGCTCTTA
GCTAGCGACCCGCAAGTTGCACCATGGGTTCAGAAGTACCAACGTAGCCGTGAAACTGTA
TCTCAGACAGATTACGAGGTTGATCTGATAACTGCATTGACAAAGCTAAGTGGTCTAGGG
CAGCAAATCAACTA

QA 3 616 3 616
DS 

RD RS1FS18JQ 629 0 0
TCATTCAACTGGCAGGGCAATCAGCGGTGAAGGCAACATATTTAGCATCAGCAATACGTA
AATGCGGTGGAAATGAAGAGAAAGGGAACTTACTCTACACAGCATATGGTTCAAGTGGTC
AGTGGAGTTTGTTTGATAGACAATTCGGAAGGAGTGATGCAACAGAGGCTGATCCAGAAG
GGAGGATCCCATTATGGGGAAAAGCAACTGTGCAAGAGATGAAAGATAAGT*CATTGCCA
TTGGATTGGGTCCTCGTCAGTTAGCTGTAATGTTTGCATTCTTGGGTCCTGATCAAGCCG
CAACAGATGAGCTTTTAGCTAGCGACCCGCAAGTTGCACCATGGGTTCAGAAGTACCAAC
GTAGCCGTGAAACTGTATTTCAGACAGATTACGAGGTTGATTTGATAACTGCATTGACAA
AGCTAAGTGGTCTAGGGCAGCAAATCAACTATGAGGCATATACATATCCTGTCGAGCGGA
TCAATTTAAGCAAACTCAAGCTATGAGCATAGAGCGTGACAACAAGTTTTAAGTCAGTGT
ACACTATGTATAACTTGAGCAAACTTGAACTCACTATTATATCCAAGATTTTTCTTGAAA
TTCAAATGAAAAAAATAGTTAAAAATGCT

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 3

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GGACACGAGGTTACATTATCAACAGATAGCTAAGAAAATAACATAACACGCAGTCACATA
AATATAGCTTAATGGAGGTGCACAAGGTGGTTACTCCGCCGCATAGGAGCACGGCGGCGA
AGCTGAAGACAAGACTGAAGGAGACTTTCTTCCCTGACGATCCTCTAAGACAGTTCAGAG
GACAACCGAACCGTATCAAACTCATACGAGCCGCTCAATACATTTTCCCAATCCTCCAGT
GGTGTCCTGAGTACAGCTTTAGACTCCTCAAATCTGACGTCGTTTCAGGTCTCACCATCG
CTAGTTTAGCTATTCCTCAGGGGATAAGTTACGCGAAGCTAGCGAATTTACCTCCAATTG
TCGGTCTATACTCGAGCTTTGTACCACCGTTGGTTTATGCGGTGTTGGGAAGCTCAAGAG
ATCTAGCGGTCGGACCAGTATCCATAGCGTCGTTGATCTTAGGGTCCATGCTAAGGCAAC
AAGTATCTCCCGTAGACAATCCTATTCTCTTTTTACAGCTCGCTTTCACTTCTACCTTCT
TTGCTGGTCTCTTTCAAGCCTCTCTTGGAATCCTCAGGCTGGGATTTATAATCGACTTTC
TATCAAAAGCAACATTGATAGGTTTTATGGCGGGTGCAGCCATAATAGTATCATTGCAAC
AGCTAAAGGCTCTGCTTGGGATAACTCATTTCACTAAGCAAATGAGTGTAATCCCTGTTC
TCTCCTCCGTTTTCACCACACCAACGAGTGGTCATAGCAAACGATTGTGATGGGAGTCTG
CTT


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1E924TF U 3
AF RS1BH82TF U 1
AF RS1AR60TFB U 1
BS 1 783 RS1AR60TFB

RD RS1E924TF 662 0 0
GG
ACGAGGTTACATTATCAACAGATAGCTAAGAAAATAACATAACACGCAGTCACATAAATA
TAGCTTAATGGAGGTGCACAAGGTGGTTACTCCGCCGCATAGGAGCACGGCGGCGAAGCT
GAAGACAAGACTGAAGGAGACTTTCTTCCCTGACGATCCTCCAAGACAGTTCAGAGGACA
ACCGAACCGTATCAAACTCATACGAGCCGCTCAATACATTTTCCCAATCCTCCAGTGGTG
TCCTGAGTACAGCTTTAGACTCCTCAAATCTGACGTCGTTTCAGGTCTCGCCATCGCTAG
TTTAGCTATTCCTCAGGGGATAAGTTACGCGAAGCTAGCGAATTTACCTCCAATTGTCGG
TCTATACTCGAGCTTTGTACCACCGTTGGTTTATGCGGTGTTGGGAAGCTCAAGAGATCT
AGCGGTCGGACCAGTATCCATAGCGTCGTTGATCTTAGGGTCCATGCTAAGGCAACAAGT
ATCTCCCGTAGACAATCCTATTCTCTTTTTACAGCTCGCTTTCACTTCTACCTTCTTTGC
TGGTCTCTTTCAAGCCTCTCTTGGAATCCTCAGGCTGGGATTTATAATCGACTTTCTATC
AAAAGCAACATTGATAGGTTTTATGGCGGGTGCAGCCATAATAGTATCATTGCAACAGCT

QA 3 662 3 662
DS 

RD RS1BH82TF 685 0 0
GGAC
ACGAGGTTACATTATCAACAGATAGCTAAGAAAATAACATAACACGCAGTCACATAAATA
TAGCTTAATGGAGGTGCACAAGGTGGTTACTCCGCCGCATAGGAGCACGGCGGCGAAGCT
GAAGACAAGACTGAAGGAGACTTTC***CCTGACGATCCTCTAAGACAGTTCAGAGGACA
ACCGAACCGTATCAAACTCATACGAGCCGCTCAATACATTTTCCCAATCCTCCAGTGGTG
TCCTGAGTACAGCTTTAGACTCCTCAAATCTGACGTCGTTTCAGGTCTCACCATCGCTAG
TTTAGCTATTCCTCAGGGGATAAGTTACGCGAAGCTAGCGAATTTACCTCCAATTGTCGG
TCTATACTCGAGCTTTGTACCACCGTTGGTTTATGCGGTGTTGGGAAGCTCAAGAGATCT
AGCGGTCGGACCAGTATCCATAGCGTCGTTGATCTTAGGGTCCATGCTAAGGCAACAAGT
ATCTCCCGTAGACAATCCTATTCTCTTTTTACAGCTCGCTTTCACTTCTACCTTCTTTGC
TGGTCTCTTTCAAGCCTCTCTTGGAATCCTCAGGCTGGGATTTATAATCGACTTTCTATC
AAAAGCAACATTGATAGGTTTTATGGCGGGTGCAGCCATAATAGTATCATTGCAACAGCT
AAAG*CTCTGCTTGGGATAAC

QA 5 685 5 685
DS 

RD RS1AR60TFB 783 0 0
GGACACGAGGTTACATTATCAACAGATAGCTAAGAAAATAACATAACACGCAGTCACATA
AATATAGCTTAATGGAGGTGCACAAGGTGGTTACTCCGCCGCATAGGAGCACGGCGGCGA
AGCTGAAGACAAGACTGAAGGAGACTTTCTTCCCTGACGATCCTCTAAGACAGTTCAGAG
GACAACCGAACCGTATCAAACTCATACGAGCCGCTCAATACATTTTCCCAATCCTCCAGT
GGTGTCCTGAGTACAGCTTTAGACTCCTCAAATCTGACGTCGTTTCAGGTCTCACCATCG
CTAGTTTAGCTATTCCTCAGGGGATAAGTTACGCGAAGCTAGCGAATTTACCTCCAATTG
TCGGTCTATACTCGAGCTTTGTACCACCGTTGGTTTATGCGGTGTTGGGAAGCTCAAGAG
ATCTAGCGGTCGGACCAGTATCCATAGCGTCGTTGATCTTAGGGTCCATGCTAAGGCAAC
AAGTATCTCCCGTAGACAATCCTATTCTCTTTTTACAGCTCGCTTTCACTTCTACCTTCT
TTGCTGGTCTCTTTCAAGCCTCTCTTGGAATCCTCAGGCTGGGATTTATAATCGACTTTC
TATCAAAAGCAACATTGATAGGTTTTATGGCGGGTGCAGCCATAATAGTATCATTGCAAC
AGCTAAAGGCTCTGCTTGGGATAACTCATTTCACTAAGCAAATGAGTGTAATCCCTGTTC
TCTCCTCCGTTTTCACCACACCAACGAGTGGTCATAGCAAACGATTGTGATGGGAGTCTG
CTT

QA 1 783 1 783
DS 



AS 2 5

CO CL1583Contig1 734 2 7 U
GGGGATCTCGTGAGTTCCAATAGCTTGCGCCCCCGCTTTCTTCTCCAACCCCCAAATCTG
AGCTTAGCGTAAATCAGAATCCCTAGGGTTCTTCCGATTAGCTCTAAATCAGATCGAACA
TATCTTTTTCCCCGATTTAGAAAGATGTCTCAGAACGGGAAGCTGATCCCACCAAATATG
GATCAGAACAGTACGAGGCTCCTCAACCTCACAGTTCTCCAGCGACTCGATCCCTTCATC
GAGGAAATCCTCATCACCGCCGCTCACGTCACTTTCTACGAATTCAACATCGAGATCAGT
CAATGGAGTCGTAAGGATGTTGAAGGATCTTTGTTTGTTGTCAAAAGAAATAAACAACCC
CGGTTTCAGTTTATCGTGATGAATCGTCGGAATACAGATAATCTGGTGGAAGATCTCCTG
GGGGATTTTGAGTATGAAGTCCAAGGTCCATATTTACTTTACCGTAATGCATCTCAAGAA
GTGAATGGCATTTGGTTCTACAATAAACGCGAATGTGAGGAGGTTGCTCGTCTTTTCGAC
AGATTACTTAGCGCTTATTCCAAGGCTAACCAGAAGCCAAATACGTCATCTTCGAAAAGC
GAGTTTGAGGATTGGAAGCTGTGCCTACAATGGCAGTTATGGATGGTCCTCTTGAACCAT
CTTCAACTGCTAGGGATGCCCCTAACGATCCTGCTTTGTCACTTCTTCAGCTCAGCGATG
GCTCTTGGGACACT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G752TF U 2
AF RS1DW55TF U 1
BS 1 206 RS1DW55TF
BS 207 207 RS1G752TF
BS 208 416 RS1DW55TF
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BS 418 509 RS1DW55TF
BS 510 510 RS1G752TF
BS 511 734 RS1DW55TF

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GCTTAGCGTAAATCAGAATCCCTAGGTTTCTTCCGATTAGCTCTAAATCAGATCGAACAT
ATCTTTTTCCCCGATTTAGAAAGATGTCTCAGAACGGGAAGCTGATCCCACCAAATATGG
ATCAGAACAGTACGAGGCTCCTCAACCTCACAGTTCTCCAGCGACTCGATCCCTTCATCG
AGGAGATCCTCATCACCGCCGCTCACGTCACTTTCTACGAATTCAACATCGAGATCAGTC
AATGGAGTCGTAAGGATGTTGAAGGATCTTTGTTTGTTGTCAAAAGAAATAAACAACCTC
GGTTTCAGTTTATCGTGATGAATCGTCGGAATACAGATAATCTGGTGGAAGATCTCCTGG
GGGATTTTGAGTATGAAGTCCAAGGTCCATATTTACTTTACCGTAATGCATCTCAAGAAG
TGAATGGCATTTGGTTCTACAATAAACGCGAATGTGAGGAGGTTGCTCGTCTTTTCGACA
GATTACTTAGCGCTTATTCCAAG

QA 1 563 1 563
DS 

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GGGGATCTCGTGAGTTCCAATAGCTTGCGCCCCCGCTTTCTTCTCCAACCCCCAAATCTG
AGCTTAGCGTAAATCAGAATCCCTAGGGTTCTTCCGATTAGCTCTAAATCAGATCGAACA
TATCTTTTTCCCCGATTTAGAAAGATGTCTCAGAACGGGAAGCTGATCCCACCAAATATG
GATCAGAACAGTACGAGGCTCCTCAATCTCACAGTTCTCCAGCGACTCGATCCCTTCATC
GAGGAAATCCTCATCACCGCCGCTCACGTCACTTTCTACGAATTCAACATCGAGATCAGT
CAATGGAGTCGTAAGGATGTTGAAGGATCTTTGTTTGTTGTCAAAAGAAATAAACAACCC
CGGTTTCAGTTTATCGTGATGAATCGTCGGAATACAGATAATCTGGTGGAAGATCTGCTG
GGGGATTTTGAGTATGAAGTCCAAGGTCCATATTTACTTTACCGTAATGCATCTCAAGAA
GTGAATGGCATTTGGTTCTACAATAAACGTGAATGTGAGGAGGTTGCTCGTCTTTTCGAC
AGATTACTTAGCGCTTATTCCAAGGCTAACCAGAAGCCAAATACGTCATCTTCGAAAAGC
GAGTTTGAGGATTGGAAGCTGTGCCTACAATGGCAGTTATGGATGGTCCTCTTGAACCAT
CTTCAACTGCTAGGGATGCCCCTAACGATCCTGCTTTGTCACTTCTTCAGCTCAGCGATG
GCTCTTGGGACACT

QA 1 734 1 734
DS 



CO CL1583Contig2 935 3 13 U
AACATCGTATGTACGAAAATAACTTTAAGTTTAACAGAAAGAGGTTCATTGAAGTTTTAA
AGAGACATGGAGAATAACACTTGGCTAGAAGAGTGGTTGAAAGTAGAACAAAACTACGTT
TTAACTACATATTCTACATCAAACCCCCACGCATAGACGGCCCACCCCGCTCAGCTTCAC
GGTTGATGCGCATTTTGTAAAGCTAGGGTCACCATGTCGATGAATTCATTCTCCTGAACC
AGTGCTAACAGGGCTTCTTTGACTTTGTCTCTGTTGATAACCGGGCCACTGTGTGCAGGA
GCGAGTGATGCTGGTGGAGTTGGTGGTGGGAAAGGCTGGAGCATTGGAGTACCATATGGG
CGCTGCTGGTGAGTCGCATTATTAAGGTTCATAGGAGGTGTAGTAGGAATAGATGAACCA
GGAATGAGGTGTGGTTGTGCCATCATCCGTGGGGGCCTAAAGAACGAGGACGGCGTCACC
AAATCCGTGTGAACATTGGACTTGCTGCTGATAAGATCAGGATTGTTGTCAAAGAGAGGC
ATCATAGGCGAGGAGGATTGCAGAGGCGGTGGTGATAATATCTGTGGAGGTGCAGCTGTC
GGTGCAGGAGGGGCAAGGGTGGGTTGGTGAGGTTGCAGTGGAACTGCCGATGGTTGTTGG
TACGGTGGTCCACTTGCGGGTCCACTCGAAGTGTTCCCAAGAGCCATCGCTGAGCTGAAG
AAGTTGACGAAAGCAGGATCGTTAGGCGCATCCCTAGCAGTTGAAGATGGTTCAAGAGGA
CCATCCATAACTGCCATTGTAGGCACAGCTTCCAATTCCTCAAACTCGCTTTTCGAAGAT
GACGTATTTGGCTTCTGGTTTGCCTTGGAATAAGCGCTAAGTAATCTGTCGAAAAGACGA
GCAACCTCCTCACATTCGCGTTTATTGTAGAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 
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AF RS1G752JQ U 1
AF RS1DW55JQ U 13
AF RS1BC80TF C 231
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BS 27 27 RS1DW55JQ
BS 28 37 RS1G752JQ
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RD RS1G752JQ 649 0 0
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AGAGACATGGAGAATAACACTTGGCTAGAAGAGTGGTTGAAAGTAGAACAAAACTACGTT
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AGTGCTAACAGGGCTTCTTTGACTTTGTCTCTGTTGATAACCGGGCCACTGTGTGCAGGA
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CGCTGCTGGTGAGTCGCATTATTAAGGTTCATAGGAGGTGTAGTAGGAATAGATGAACCA
GGAATGAGGTGTGGTTGTGCCATCATCCGTGGGGGCCTAAAGAACGAGGACGGCGTCACC
AAATCCGTGTGAACATTGGACTTGCTGCTGATAAGATCAGGATTGTTGTCAAAGAGAGGC
ATCATAGGCGAGGAGGATTGCAGAGGCGGTGGTGATAATATCTGTGGAGGTGCAGCTGTC
GGTGCAGG*GGGGCAAGGGTGGGTTGGTGAGGTTGCAGTGGAACTGCCG

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1DW55JQ 680 0 0
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AATAACACTTGGCTAGAAGAGTGGTTGAAAGTAGAACAAAACTACGTTTTAACTACATAT
TCTACATCAAACCCCCACGCATAGACGGCCCACCCCGCTCAGCTTCACGGTTGATGCGCA
TTTTGTAAAGCTCGGGTCACCATGTCGATGAATTCATTCTCCTGAACCAGTGCTAACAGG
GCTTCTTTGACTTTGTCTCTGTTGATAACCGGGCCACTGTGTGCAGGAGCGAGTGATGCT
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ACATTGGACTTGCTGCTGATAAGATCAGGATTGTTGTCAAAGAGAGGCATCATAGGAGAG
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GCAAGGGTGGGTTGGTGAGGTTGCAGTGAAACTGCCGATGGTTGTTGGTACGGTGGTCCA
CTTG
TCTGTCCACTTGAAGT

QA 1 664 1 664
DS 

RD RS1BC80TF 705 0 0
TCT
CTGAACCAGTGCTAACAGGGCTTCTTTGACTTTGTCTCTGTTGATAACCGGGCCACTGTG
TGCAGGAGCGAGTGATGCTGGTGGAGTTGGTGGTGGGAAAGGCTGGAGCATTGGAGTACC
ATATGGGCGCTGCTGGTGAGTCGCATTATTAAGGTTCATAGGAGGTGTAGTAGGAATAGA
TGAACCAGGAATGAGGTGTGGTTGTGCCATCATCCGTGGGGGCCTAAAGAACGAGGACGG
CGTCACCAAATCCGTGTGAACATTGGACTTGCTGCTGATAAGATCAGGATTGTTGTCAAA
GAGAGGCATCATAGGCGAGGAGGATTGCAGAGGCGGTGGTGATAATATCTGTGGAGGTGC
AGCTGTCGGTGCAGGAGGGGCAAGGGTGGGTTGGTGAGGTTGCAGTGGAACTGCCGATGG
TTGTTGGTACGGTTGTCCACTTGCGGGTCCACTCGAAGTGTTCCCAAGAGCCATCGCTGA
GCTGAAGAAGTTGACGAAAGCAGGATCGTTAGGCGCATCCCTAGCAGTTGAAGATGGTTC
AAGAGGACCATCCATAACTGCCATTGTAGGCACAGCTTCCAATTCCTCAAACTCGCTTTT
CGAAGATGACGTATTTGGCTTCTGGTTTGCCTTGGAATAAGCGCTAAGTAATCTGTCGAA
AAGACGAGCAACCTCCTCACATTCGCGTTTATTGTAGAACCC

QA 4 705 4 705
DS 



AS 1 3

CO CL1584Contig1 745 3 2 U
TTTTGTTTGAATCATTTCGCCCAGTTTCCCTGTTTATTTATCTTTAATGCTCCAAAAGCC
AACCCAAAATATAGTTTTTCTTTTTTGAAAAAAGGTTGTTGTTCATAATTTTAGAAGAAA
AACTAAAGCATCCAAAATTAAAAGACACAAATGGCCATAGACTGCTTATTAGTAGAAAAC
TCTGAAGCTAAACGGTTGGAAAATGGAAATCGAATCACAGCTCGTGAGCTCCATATGTGT
CGTCCACATCTTCTCCGTCGTCTTCTTCTCCTCCTTCTGCTGCACCACCACCTCGTTTTT
CATTTACCGCAATAAGCTCTGTGTCAAATATCAGTGTTGCCCCACCGGGGATAGTTGGAG
GAGAGCCTTGTTCACCATATCCAAGTTTTGCAGGTATCTTTAACTTCCTCTTCTCTCCTA
CACACGCACCTAGCAAACCTTGATCCCAACCTTTGATAACCTGGCCACTTCCTAACTCAA
ACTCGAACGGTTCATCCCTTTCAAAGCTCGAATCAAATACAGTTCCATCGGTAAGTTTCC
CCCTGTAGTGCACCTTGATCATATCACCTTTGTGAGCCTTCACTTCACACGTTGTTGGCT
TAAACTTAACCCCGATCTGCAATTCCGACACATCTCCTGTCTTCTTCGCGAAACCTTGGA
GTAAGCTGAGAGAGAAGAAGATCAAGCAAAGGGAGTAACGGAGACACATCTTCCCCTCGT
TTTGATTTTCCGTTCACCTTCCCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EC54JQ U 447
AF RS1DK69JQ U 1
AF RS1DK69TF C 87
BS 1 687 RS1DK69JQ
BS 688 745 RS1DK69TF

RD RS1EC54JQ 163 0 0
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CTCGAATCAAATACAGTTCCATCCGTAAGTTTCCCCCTGTAGTGGACCTTGATCATATCA
CCTTTGTGAGCCTTCACTTCACACGTTGTTGGCTTAAAC
TTAA

QA 1 159 1 159
DS 

RD RS1DK69JQ 687 0 0
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AACCCAAAATATAGTTTTTCTTTTTTGAAAAAAGGTTGTTGTTCATAATTTTAGAAGAAA
AACTAAAGCATCCAAAATTAAAAGACACAAATGGCCATAGACTGCTTATTAGTAGAAAAC
TCTGAAGCTAAACGGTTGGAAAATGGAAATCGAATCACAGCTCGTGAGCTCCATATGTGT
CGTCCACATCTTCTCCGTCGTCTTCTTCTCCTCCTTCTGCTGCACCACCACCTCGTTTTT
CATTTACCGCAATAAGCTCTGTGTCAAATATCAGTGTTGCCCCACCGGGGATAGTTGGAG
GAGAGCCTTGTTCACCATATCCAAGTTTTGCAGGTATCTTTAACTTCCTCTTCTCTCCTA
CACACGCACCTAGCAAACCTTGATCCCAACCTTTGATAACCTGGCCACTTCCTAACTCAA
ACTCGAACGGTTCATCCCTTTCAAAGCTCGAATCAAATACAGTTCCATCGGTAAGTTTCC
CCCTGTAGTGCACCTTGATCATATCACCTTTGTGAGCCTTCACTTCACACGTTGTTGGCT
TAAACTTAACCCCGATCTGCAATTCCGACACATCTCCTGTCTTCTTCGCGAAACCTTGGA
GTAAGCTGAGAGAGAAGAAGATCAAGC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1DK69TF 659 0 0
GAAAAAAGGTT
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TAGACTGCTTATTAGTAGAAAACTCTGAAGCTAAACGGTTGGAAAATGGAAATCGAATCA
CAGCTCGTGAGCTCCATATGTGTCGTCCACATCTTCTCCGTCGTCTTCTTCTCCTCCTTC
TGCTGCACCACCACCTCGTTTTTCATTTACCGCAATAAGCTCTGTGTCAAATATCAGTGT
TGCCCCACCGGGGATAGTTGGAGGAGAGCCTTGTTCACCATATCCAAGTTTTGCAGGTAT
CTTTAACTTCCTCTTCTCTCCTACACACGCACCTAGCAAACCTTGATCCCAACCTTTGAT
AACCTGGCCACTTCCTAACTCAAACTCGAACGGTTCATCCCTTTCAAAGCTCGAATCAAA
TACAGTTCCATCGGTAAGTTTCCCCCTGTAGTGCACCTTGATCATATCACCTTTGTGAGC
CTTCACTTCACACGTTGTTGGCTTAAACTTAACCCCGATCTGCAATTCCGACACATCTCC
TGTCTTCTTCGCGAAACCTTGGAGTAAGCTGAGAGAGAAGAAGATCAAGCAAAGGGAGTA
ACGGAGACACATCTTCCCCTCGTTTTGATTTTCCGTTCACCTTCCCCA

QA 12 659 12 659
DS 



AS 1 4

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TCTTCCCCAGAGCTTCACTCGACCTGCAAATACGAGAAGAAGTTTTGCGGTTAGGAGGAT
CAACAGTAGATCGCACAATTCCAAAGGGTCTCTGAAGAAGTCAACAGTAAAATGTTCCTT
GGAGAATCCCATTGAAAGCAAGGAGACTTTAAGAAAGCATTTTGTTGCAGGCTTTGCTAC
CATTTTGCTTCTCTCTCAGGCAGGCCAGGGTGTTGCATTGGATCACAACATTTGTCAACT
GGGAAGTGCTGCTGTGGAAGAAAACAAACCTACTCTTCCACTTGATAGTGACCCGGAGGA
GATGATGATGATGATGATGATGAAAGGCATGACTGCCAAGAACTTTGACCCAGTTAGGTA
CTCTGGAAGATGGTTTGAAGTAGCTTCTCTTAAGCGTGGCTTTGCTGGTCAAGGCCAAGA
AGATTGCCATTGCACACAGGGAGTATACACGTTTGATATGAAGGAACCAGCTATAAGGGT
AGACACGTTTTGCGTTCACGGTAGCCCCGATGGGTATATAACAGGAATCAGAGGAAAAGT
TCAATGCGTTAGAGCACAAGACCTGGAGAAAACTGAGACTGACTTAGAAAAGCAAGAGAT
GATTAAAGAGAAATGTTACCTTCGGTTTCCCACCATTCCTTTCATCCCCAAGTTGCCTTA
TGATGTCATAGCTACAGACTATGACAACTACGCTTTTGTTTTTGGTGCCAAAGACAGGAG
CTTTGTTCAGGTATACTCAGTTTGGGTACGACCCGGAGAAAATAAAGGATACTCCACAGG
ACTGTGAAGTGATGTTTGATGGTCAGTTAGCTGCTATGATGTCCATGCCAGGTATGGAGA
AAACGCTGACAAACCAGTTTCCAGATCTTGAACTAAGAAAGCCAGTCCAGTTTGATCCCT
TCACAAGTGTGTTTGAAACCTTGAAGAAACTGGTCCCACTTTATTTCAAGTAGAGAAGCT
TTTTTGCCCCCAAGAGTTTTTTTTTTTTTTGAATTTTAAATGTAAGATTGGTTATCACTG
TCATTGTCAATATGCCTGTACACCTGACTGAGTGTATTGATATGAATTCTTTTTTAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D452TF U 1
AF RS1A772TF U 1
AF RS1G159TF U 7
AF RS1A772JQ C 334
BS 1 176 RS1A772TF
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BS 178 197 RS1A772TF
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GGGTGGCT
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ATTGCACACAGGGAGTATACACGTTTGATATGAAGGAACCAGCTATAAGGGTAGACACGT
TTTGCGTTCACGGTAGCCCTGATGGGTATATA

QA 9 580 9 580
DS 

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GGAGAATCCCATTGAAATCAAGGAGACTTTAAGAAAGCATTTTGTTGCAGGCTTTGCTAC
CATTTTGCTTCTCTCTCAGGCAGGCCAGGGTGTTGCATTGGATCACAACATTTGTCAACT
GG*AAGTGCTGCTGTGGAAGAAAACAAACCTACTCTTCCACTTGATAGTGACCCGGAGGA
GATGATGATGATGATGATGATGAAAGGCATGACTGCCAAGAACTTTGACCCAGTTAGGTA
CTCTGGAAGATGGTTTGAAGTAGCTTCTCTTAAGCGTGGCTTTGCTGGTCAAGGCCAAGA
AGATTGCCATTGCACACAGGGAGTATACACGTTTGATATGAAGGAACCAGCTATAAGGGT
AGACACGTTTTGCGTTCACGGTAGCCCCGATGGGTATATAACAGGAATCAGAGGAAAAGT
TCAATGCGTTAGAGCACAAGACCTGGAGAAAACTGAGACTGACTTAGAAAAGCAAGAGAT
GATTAAAGAGAAATGTTACCTTCGGTTTCCCACCATTCCTTTCATCCCCAAGTTGCCTTA
TGATGTCATAGCTACAGACTATGAC
A

QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1G159TF 739 0 0
GG
ACCAAGAGAAGATGGCAAGTAACATCATAACTAGCCTGTCAACGACACTAGTTCTTCCCC
AGAGCTTCACTCGACCTGCAAATACGAGAAGAAGTTTTGCGGTTAGGAGGATCAACAGTA
GATCGCACAATTCCAAAGGGTCTCTGAAGAAGTCAACAGTAAAATGTTCCTTGGAGAATC
CCATTGAAAGCAAGGAGACTTTAAGAAAGCATTTTGTTGCAGGCTTTGCTACCATTTTGC
TTCTCTCTCAGGCAGGCCAGGGTGTTGCATTGGATCACAACATTTGTCAACTGGGAAGTG
CTGCTGTGGAAGAAAACAAACCTACTCTTCCACTTGATAGTGACCCGGAGGAGATGATGA
TGATGATGATGA***AAGGCATGACTGCCAAGAACTTTGACCCAGGTAGGTACTCTGGAA
GATGGTTTGAAGTAGCTTCTCTTAAGCGTGGCTTTGCTGGTCAAGGCCAAGAAGATTGCC
ATTGCACACAGGGAGTATACACGTTTGATATGAAGGAACCAGCTATAAGGGTAGACACGT
TTTGCGTTCACGGTAGCCCTGATGGGTATATAACAGGAATCAGAGGAAAAGTTCAATGCG
TTAGAGCACAAGACCTGGAGAAAACTGAGACTGACTTAGAAAAGCAAGAGATGATTAAAG
AGAAATGTTACCTTCG*TTTCCCACCATTCCTTTCATCCCCAAGTTGCCTTATGATGTCA
TAGCTACAGACTATGAC

QA 3 739 3 739
DS 

RD RS1A772JQ 805 0 0
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GCGTGGCTTTGCTGGTCAAGGCCAAGAAGATTGCCATTGCACACAGGGAGTATACACGTT
TGATATGAAGGAACCAGCTATAAGGGTAGACACGTTTTGCGTTCACGGTAGCCCCGATGG
GTATATAACAGGAATCAGAGGAAAAGTTCAATGCGTTAGAGCACAAGACCTGGAGAAAAC
TGAGACTGACTTAGAAAAGCAAGAGATGATTAAAGAGAAATGTTACCTTCGGTTTCCCAC
CATTCCTTTCATCCCCAAGTTGCCTTATGATGTCATAGCTACAGACTATGACAACTACGC
TTTTGTTTTTGGTGCCAAAGACAGGAGCTTTGTTCAGGTATACTCAGTTTGGGTACGACC
CGGAGAAAATAAAGGATACTCCACAGGACTGTGAAGTGATGTTTGATGGTCAGTTAGCTG
CTATGATGTCCATGCCAGGTATGGAGAAAACGCTGACAAACCAGTTTCCAGATCTTGAAC
TAAGAAAGCCAGTCCAGTTTGATCCCTTCACAAGTGTGTTTGAAACCTTGAAGAAACTGG
TCCCACTTTATTTCAAGTAGAGAAGCTTTTTTGCCCCCAAGAGTTTTTTTTTTTTTTGAA
TTTTAAATGTAAGATTGGTTATCACTGTCATTGTCAATATGCCTGTACACCTGACTGAGT
GTATTGATATGAATTCTTTTTTAAG

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 3

CO CL1586Contig1 885 3 5 U
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TCTGTGGACTTATTATGTTTATTTTACCTCCTGAGATTTTCTGTAATAATAACAACAACA
CAATCAGATTCACGCAGCATGACGAGTATGTTTACTAAGAATACAAACAACAACGCGATC
AGGTTGAGACATGACGTAGCACAAGCTGAAGCTGATCCACATCCGGACCAATCAGGTTCA
AAACGGAGTTTCCTACACTAGGAAGCTCAGAAACTGCCGTTGTTATTATAGATGATGATG
ATGATGTGTCAGAAAGGTATGGCACTATATGCTTCTTCATGTCTTCATGAGATATCTGAA
GATGGTTTCCAGAGACGTTAACGAATTTGACCTTTCCAGCTTCGTCTAGAGCTCTCAAAC
CGATCCAGTCCTCGGTATAGAGCTTGGTCTCTTGTGGTGGAAGAATGGTCTTAAAAGACC
CATCAGGATAATATCCAAACCATGAGGTCTCTTTAGGTATTAGTATCGTATCATGCTCAA
ACATAATAAGCACAAGATTCTCCAAGCTAGAGAACCTCTCTTTATAAGTCGAGTTTTTAA
CTGGAAGTTCGTTGTTTAACTTTGGGAGAAACCTACAACCTTCCATGTAACCAGCAATGT
CAGTAGGGATTTTGAGAAAACCGCTAGGAGCCAAATGTTCCTGCATATAGTCGCTATAGA
TCTCTGTTTTGATCATACTGTCCAACATGATACAAATCCAGGTAACACCACAGAAAGGAA
TGGATGCAGTGCCAGCATGCGGTCCCCTATCGATACAAACTCTTAACAGTGGTGCATCAT
CGCAAACTCAATGAGAGCTCGACAATCATGTTACCCTGAGAAAGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F377TF C 95
AF RS1BT78JQ U 1
AF RS1AU85JQ U 1
BS 1 86 RS1AU85JQ
BS 87 87 RS1BT78JQ
BS 88 269 RS1AU85JQ
BS 270 270 RS1BT78JQ
BS 271 885 RS1AU85JQ

RD RS1F377TF 597 0 0
GATTTTCTGTAATAATAACAACAACACAATCAGATTCACGCAGCATGACGAGTATGTTTA
CTAAGAATACAAACAACAACGCGATCAGGTTGAGACATGACGTAGCACAAGCTGAAGCTG
ATCCACATCCGGACCAATCAGGTTCAAAACGGAGTTTCCTACACTAGGAAGCTCAGAAAC
TGCCGTTGTTATTATAGATGATGATGATGATGTGTCAGAGAGGTATGGCACTATATGCTT
CTTCATGTCTTCATGAGATATCTGAAGATGGTTTCCAGAGACGTTAACGAATTTGACCTT
TCCAGCTTCGTCTAGAGCTCTCAAACCGATCCAGTCCTCGGTATAGAGCTTGGTCTCTTG
TGGTGGAAGAATGGTCTTAAAAGACCCATCAGGATAATATCCAAACCATGAGGTCTCTTT
AGGTATTAGTATCGTATCATGCTCAAACATAATAAGCACAAGATTCTCCAAGCTAGAGAA
CCTCTCTTTATAAGTCGAGTTTTTAACTGGAAGTTCGTTGTTTAACTTTGGGAGAAACCT
ACAACCTTCCATGTAACCAGCAATGTCAGTAGGGATTTTGAGAAAACCGCTAGGAGC

QA 1 597 1 597
DS 

RD RS1BT78JQ 753 0 0
GCTTCATTACTTGTATTATTGATGTAATATGATTTGATCCAGATGTTGTGATATAATACA
TCTGTGGACTTATTATGTTTATTTTACCTCCTGAGATTTTCTGTAATAATAACAACAACA
CAATCAGATTCACGCAGCATGACGAGTATGTTTACTAAGAATACAAACAACAACGCGATC
AGGTTGAGACATGACGTAGCACAAGCTGAAGCTGATCCACATCCGGACCAATCAGGTTCA
AAACGGAGTTTCCTACACTAGGAAGCTCAGAAACTGCCGTTGTTATTATAGATGATGATG
ATGATGTGTCAGAAAGGTATGGCACTATATGCTTCTTCATGTCTTCATGAGATATCTGAA
GATGGTTTCCAGAGACGTTAACGAATTTGACCTTTCCAGCTTCGTCTAGAGCTCTCAAAC
CGATCCAGTCCTCGGTATAGAGCTTGGTCTCTTGTGGTGGAAGAATGGTCTTAAAAGACC
CATCAGGATAATATCCAAACCATGAGGTCTCTTTAGGTATTAGTATCGTATCATGCTCAA
ACATAATAAGCACAAGATTCTCCAAGCTAGAGAACCTCTCTTTATAAGTCGAGTTTTTAA
CTGGAAGTTCGTCGTTTAACTTTGGGAGAAACCTACAACCTTCCATGTAACCAGCAATGT
CAGTAGGGATTTTGAGAAAACCGCTAGGAGCCAAATGTTCCTGCATATAGTCGCTATAGA
TCTCTGTTTTGATCATACTGTCCAACATGATAC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1AU85JQ 885 0 0
GCTTCATTACTTGTATTATTGATGTAATATGATTTGATCCAGATGTTGTGATATAATACA
TCTGTGGACTTATTATGTTTATTTTATCTCCTGAGATTTTCTGTAATAATAACAACAACA
CAATCAGATTCACGCAGCATGACGAGTATGTTTACTAAGAATACAAACAACAACGCGATC
AGGTTGAGACATGACGTAGCACAAGCTGAAGCTGATCCACATCCGGACCAATCAGGTTCA
AAACGGAGTTTCCTACACTAGGAAGCTCAAAAACTGCCGTTGTTATTATAGATGATGATG
ATGATGTGTCAGAAAGGTATGGCACTATATGCTTCTTCATGTCTTCATGAGATATCTGAA
GATGGTTTCCAGAGACGTTAACGAATTTGACCTTTCCAGCTTCGTCTAGAGCTCTCAAAC
CGATCCAGTCCTCGGTATAGAGCTTGGTCTCTTGTGGTGGAAGAATGGTCTTAAAAGACC
CATCAGGATAATATCCAAACCATGAGGTCTCTTTAGGTATTAGTATCGTATCATGCTCAA
ACATAATAAGCACAAGATTCTCCAAGCTAGAGAACCTCTCTTTATAAGTCGAGTTTTTAA
CTGGAAGTTCGTTGTTTAACTTTGGGAGAAACCTACAACCTTCCATGTAACCAGCAATGT
CAGTAGGGATTTTGAGAAAACCGCTAGGAGCCAAATGTTCCTGCATATAGTCGCTATAGA
TCTCTGTTTTGATCATACTGTCCAACATGATACAAATCCAGGTAACACCACAGAAAGGAA
TGGATGCAGTGCCAGCATGCGGTCCCCTATCGATACAAACTCTTAACAGTGGTGCATCAT
CGCAAACTCAATGAGAGCTCGACAATCATGTTACCCTGAGAAAGC

QA 1 885 1 885
DS 



AS 1 4

CO CL1587Contig1 819 4 2 U
GGAGAAAGAAGATGTCTTGTTATATAAGAAAGCAGCAGCCATTGTTTGGAACAGAACAGA
GAGCTCCTAAAGGCTAAATATCTATAGAAACTGTTTCTTTTTTTAAAAAAACTTTCATAC
AAACATTGTAAGTACTCAAAACACTACTTGTCGTCAGGGATTGCTCGCAGAAGGATGCCT
GAAAAGATTTGTGTCTGGGCGGTTCAACGAATGCGCATAGTTCATAGCCGGTGAGTTTGG
CCACGGTGTATAAGCAGCCGGGTGATTAATAAAGGGACTCATAGCAGGGTTTAGCGGATG
ATGCCCGTAGTTTAGATGAGCTTGATGACCTCTTGGCATCTGCGGGAAACCTCCATCGTG
AAACGGAATGTGGAGAGGCATCGGATTGAAGCTTTGGCCAGACGGCATAACCCTAACGTA
CCTGTAGGCGGGATCCACGACATACCTGTCATAGCTCCTGTCATAATCAGGATCATAACG
ATCTTTCTCCCTATCTCTGATGATGGCTATAGAAGTCCTTCCAGATTCTCGATAACCACC
ACCAGCATCAAGAGAATTATTACTGACTGCCACCTCAGCCTCACTGCGGTTTACACTTGT
GTTTTTCACTTCAGGAGGAGGAGCAAGAGGAGGAGCTCGTAACGACGAAGAATCTTCAGA
GTCGGAACTACCAGGGCTATTAAAGATCCGAGCCCTAGCTTTATCATACTCCTCTTTCCT
CTCCTCAACACTTCTCTGAAGATTCTGCTGCACTCCGGACCCGCTACCTCCGGAGCCGGA
TCCTCTCTTGGGTCTCGCCTTGATAGCATCTTGAAACCC


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D937JQ U 63
AF RS1CH55JQ U 1
AF RS1CH55TF C 1
AF RS1DC77JQ U 4
BS 1 663 RS1CH55JQ
BS 664 819 RS1DC77JQ

RD RS1D937JQ 373 0 0
GCTCCTAAAGGCTAAATATCTATAGAAACTGTTTCTTTTTTTAAAAAAACTTTCATACAA
ACATTGTAAGTACTCAAAACACTACTTGTCGTCAGGGATTGCTCGCAAAAGGATGCCTGA
AAAGATTTGTGTCTGGGCGGTTCAACGAATGCGCATAGTTCATAGCCGGTGAGTTTGGCC
ACGGTGTATAAGCAGCCGGGTGATTAATAAAGGGACTCATAGCAGGGTTTACCGGATGAT
GCCCGTAGTTTAGATGAGCTTGATGACCTCTTGGCATCTACGGGAAACCTCCATCGTGAA
ACGGAATGTGGAGAGGCATCGGATTGAAGCTTTGGCCAGACGGCATAACCCTAACGTACC
TGTAGGCGGGATC

QA 1 373 1 373
DS 

RD RS1CH55JQ 664 0 0
GGAGAAAGAAGATGTCTTGTTATATAAGAAAGCAGCAGCCATTGTTTGGAACAGAACAGA
GAGCTCCTAAAGGCTAAATATCTATAGAAACTGTTTCTTTTTTTAAAAAAACTTTCATAC
AAACATTGTAAGTACTCAAAACACTACTTGTCGTCAGGGATTGCTCGCAGAAGGATGCCT
GAAAAGATTTGTGTCTGGGCGGTTCAACGAATGCGCATAGTTCATAGCCGGTGAGTTTGG
CCACGGTGTATAAGCAGCCGGGTGATTAATAAAGGGACTCATAGCAGGGTTTAGCGGATG
ATGCCCGTAGTTTAGATGAGCTTGATGACCTCTTGGCATCTGCGGGAAACCTCCATCGTG
AAACGGAATGTGGAGAGGCATCGGATTGAAGCTTTGGCCAGACGGCATAACCCTAACGTA
CCTGTAGGCGGGATCCACGACATACCTGTCATAGCTCCTGTCATAATCAGGATCATAACG
ATCTTTCTCCCTATCTCTGATGATGGCTATAGAAGTCCTTCCAGATTCTCGATAACCACC
ACCAGCATCAAGAGAATTATTACTGACTGCCACCTCAGCCTCACTGCGGTTTACACTTGT
GTTTTTCACTTCAGGAGGAGGAGCAAGAGGAGGAGCTCGTAACGACGAAGAATCTTCAGA
GTC
C

QA 1 663 1 663
DS 

RD RS1CH55TF 664 0 0
GGA
GAAAGAAGATGTCTTGTTATATAAGAAAGCAGCAGCCATTGTTTGGAACAGAACAGAGAG
CTCCTAAAGGCTAAATATCTATAGAAACTGTTTCTTTTTTTAAAAAAACTTTCATACAAA
CATTGTAAGTACTCAAAACACTACTTGTCGTCAGGGATTGCTCGCAGAAGGATGCCTGAA
AAGATTTGTGTCTGGGCGGTTCAACGAATGCGCATAGTTCATAGCCGGTGAGTTTGGCCA
CGGTGTATAAGCAGCCGGGTGATTAATAAAGGGACTCATAGCAGGGTTTAGCGGATGATG
CCCGTAGTTTAGATGAGCTTGATGACCTCTTGGCATCTGCGGGAAACCTCCATCGTGAAA
CGGAATGTGGAGAGGCATCGGATTGAAGCTTTGGCCAGACGGCATAACCCTAACGTACCT
GTAGGCGGGATCCACGACATACCTGTCATAGCTCCTGTCATAATCAGGATCATAACGATC
TTTCTCCCTATCTCTGATGATGGCTATAGAAGTCCTTCCAGATTCTCGATAACCACCACC
AGCATCAAGAGAATTATTACTGACTGCCACCTCAGCCTCACTGCGGTTTACACTTGTGTT
TTTCACTTCAGGAGGAGGAGCAAGAGGAGGAGCTCGTAACGACGAAGAATCTTCAGAGTC
C

QA 4 663 4 663
DS 

RD RS1DC77JQ 816 0 0
GAAAGAAGATGTCTTGTTATATAAGAAAGCAGCAGCCATTGTTTGGAACAGAACAGAGAG
CTCCTAAAGGCTAAATATCTATAGAAACTGTTTCTTTTTTTAAAAAAACTTTCATACAAA
CATTGTAAGTACTCAAAACACTACTTGTCGTCAGGGATTGCTCGCAGAAGGATGCCTGAA
AAGATTTGTGTCTGGGCGGTTCAACGAATGCGCATAGTTCATAGCCGGTGAGTTTGGCCA
CGGTGTATAAGCAGCCGGGTGATTAATAAAGGGACTCATAGCAGGGTTTAGCGGATGATG
CCCGTAGTTTAGATGAGCTTGATGACCTCTTGGCATCTGCGGGAAACCTCCATCGTGAAA
CGGAATGTGGAGAGGCATCGGATTGAAGCTTTGGCCAGACGGCATAACCCTAACGTACCT
GTAGGCGGGATCCACGACATACCTGTCATAGCTCCTGTCATAATCAGGATCATAACGATC
TTTCTCCCTATCTCTGATGATGGCTATAGAAGTCCTTCCAGATTCTCGATAACCACCACC
AGCATCAAGAGAATTATTACTGACTGCCACCTCAGCCTCACTGCGGTTTACACTTGTGTT
TTTCACTTCAGGAGGAGGAGCAAGAGGAGGAGCTCGTAACGACGAAGAATCTTCAGAGTC
GGAACTACCAGGGCTATTAAAGATCCGAGCCCTAGCTTTATCATACTCCTCTTTCCTCTC
CTCAACACTTCTCTGAAGATTCTGCTGCACTCCGGACCCGCTACCTCCGGAGCCGGATCC
TCTCTTGGGTCTCGCCTTGATAGCATCTTGAAACCC

QA 1 816 1 816
DS 



AS 1 3

CO CL1588Contig1 935 3 12 U
GGAGCTGGAGTTTCTTCCAAGCCACCGTCGACTTTACTTACTCCCTCCTCCGTCTTAGAT
TTCTTCTCCGTTCAAAACCCTAATCTTCCGATGTCGATCTTCGACTACAATGGAAGTGCA
ATTGTAGCTATGGTAGGGAAGAACTGCTTCGCCATCGCCAGTGATCGAAGGCTCGGTGTG
CAGCTACAGACGATCGCCACCGATTTCCAGAGAATCTCCAAGATCCACGATCGCGTCTTC
ATCGGACTCTCTGGTCTCGCCACCGATGTCCAAACACTGTACCAGCGCTTGGTGTTTCGT
CATAAGCTGTACCAGCTTCGTGAAGAGAGAGACATGAAGCCTGACACTTTCGCCAGTCTC
GTCTCTGCCATTCTTTACGAGAAGAGATTTGGTCCTTACTTATGCCAACCAGTGATTGCT
GGCTTGGGAGAAGATGACAAGCCCTTCATCTGCACCATGGACTCCATTGGTGCCAAGGAG
TTGGCTAAAGATTTTGTTGTGTCTGGAACTGCCTCAGAATCACTGTATGGGGCATGCGAA
GCAATGTACAAGCCAGATATGGAAGCGGAGGAACTGTTTGAGACTATATCGCAAGCACTT
CTCTCATCAGTTGACCGTGATTGTCTAAGTGGTTGGGGAGGCCATGTCTACGTTGTAACA
CCAACTGAGATTAAAGAGAGGATCCTAAAGGGAAGGATGGATTGATCTGATCCATCTTCA
TCATGAGCTTCTATCCAAGTTGTTATTTTCGCTCTATGTAATCCGGTTTAAATTAGAATA
ACCATCGCATCGCGGTTAAATCATAGAACATTCCTTCTATGAGATTATGACTTCTGGATG
AAGTTTGATTTTCCCCTCATGAATGTTTTATTAGAGTTAATGCCTGTACTGTACACACTG
GTTTCTACTTTTATTTTTACAAAAAAAAACCGTGG


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D011TF U 2
AF RS1EO22TF U 1
AF RS1EO22JQ C 421
BS 1 72 RS1EO22TF
BS 73 73 RS1D011TF
BS 74 120 RS1EO22TF
BS 121 121 RS1D011TF
BS 122 206 RS1EO22TF
BS 207 207 RS1D011TF
BS 208 269 RS1EO22TF
BS 270 270 RS1D011TF
BS 271 379 RS1EO22TF
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BS 381 662 RS1EO22TF
BS 663 935 RS1EO22JQ

RD RS1D011TF 512 0 0
GG
GCTGGAGTTTCTTCCAAGCCACCGTCGACTTTACTTACTCCCTCCTCCGTCTTAGATTTC
TTCTCCGTTCTAAACCCTAATCTTCCGATGTCGATCTTCGAGTGCAATGGAAGTGCAATT
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CTACAGACTATCGCCACCGATTTCCAGAGAATCTCCAAGATCCACGATCGCGTCTTCATC
GGACTCTCTGGTCTCGCCACCGATGTCCAAACACTGTACCAGCGCTTGGTGTTTCGTCAT
AAGCTGTACCAGCTTCGTGAAGAGAGAGACATGAAGCCTGACACTTTCGCTAGTCTCGTC
TCTGCCATTCTTTACGAGAAGAGATTTGGTCCTTACTTGTGCCAACCAGTGATTGCTGGC
TTGGGAGAAGATGACAAGCCCTTCATCTGTACCATGGACTCCATTGGTGCCAAGGAGCTG
GCTAAAGATTTTGTTGTGTCTGGAACTGC
T

QA 3 511 3 511
DS 

RD RS1EO22TF 665 0 0
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TTCTTCTCCGTTTAAAACCCTAATCTTCCGATGTCGATCTTCGACTACAATGGAAGTGCA
GTTGTAGCTATGGTAGGGAAGAACTGCTTCGCCATCGCCAGTGATCGAAGGCTCGGTGTG
CAGCTACAGACGATCGCCACCGATTTTCAGAGAATCTCCAAGATCCACGATCGCGTCTTC
ATCGGACTCTCTGGTCTCGCCACCGATGTTCAAACACTGTACCAGCGCTTGGTGTTTCGT
CATAAGCTGTACCAGCTTCGTGAAGAGAGAGACATGAAGCCTGACACTTTCGCCAGTCTC
GTCTCTGCCATTCTTTACGGGAAGAGATTTGGTCCTTACTTATGCCAACCAGTGATTGCT
GGCTTGGGAGAAGATGACAAGCCCTTCATCTGCACCATGGACTCCATTGGTGCCAAGGAG
TTGGCTAAAGATTTTGTTGTGTCTGGAACTGCCTCAGAATCACTGTATGGGGCATGCGAA
GCAATGTACAAGCCAGATATGGAAGCGGAGGAACTGTTTGAGACTATATCGCAAGCACTT
CTCTCATCAGTTGACCGTGATTGTCTAAGTGGTTGGGGAGGCCATGTCTACGTTGTAACA
CC
AAC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RS1EO22JQ 515 0 0
GGCTTGGGAGAAGATGACAAGCCCTTCATCTGCACCATGGACTCCATTGGTGCCAAGGAG
TTGGCTAAAGATTTTGTTGTGTCTGGAACTGCCTCAGAATCACTGTATGGGGCATGCGAA
GCAATGTACAAGCCAGATATGGAAGCGGAGGAACTGTTTGAGACTATATCGCAAGCACTT
CTCTCATCAGTTGACCGTGATTGTTTAAGTGGTTGGGGAGGCCATGTTTACGTTGTAACA
CCAACTGAGATTAAAGAGAGGATCCTAAAGGGAAGGATGGATTGATCTGATCCATCTTCA
TCATGAGCTTCTATCCAAGTTGTTATTTTCGCTCTATGTAATCCGGTTTAAATTAGAATA
ACCATCGCATCGCGGTTAAATCATAGAACATTCCTTCTATGAGATTATGACTTCTGGATG
AAGTTTGATTTTCCCCTCATGAATGTTTTATTAGAGTTAATGCCTGTACTGTACACACTG
GTTTCTACTTTTATTTTTACAAAAAAAAACCGTGG

QA 1 515 1 515
DS 



AS 2 4

CO CL1589Contig1 886 2 1 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGACTCTAAA
AGAGATAGAAAGACTTAAAGAGGCTAGTGAGCCAGCGAGCGTAGGTTTAACGTTTGAGAC
TCTGAGGAGGAGATGGAACCGACGACGACGCCGCTTCTTGAGCACGGTGGTGGTGGTGGT
GAGGTAAGGGAGGATTACTCGCCGGCGAGGACGTTAAGCGACGTGAAGCGAGTCTTTTCG
ATGGAGTCCGCCAAGCTGTGGAAGATCGCTGCTCCCATTGGTTTCAACATCATCTGCCAG
TACGGCGTCACCTCCCTCACCAACATCTTCGTCGGCCATATCGGCGAGATAGAGCTCTCC
GCCGTCTCCATCTCTCTGTCGGTCATCGGCACCTTCTCCTTCGGCTTCTTGCTTGGCATG
GGAAGTGCACTTGAAACACTCTGTGGCCAAGCCTTTGGAGCAGGTCAAGTCCACATGTTA
GGGGTCTACATGCAGAGATCATGGATCATCTTATTCGTTTCATGCATCTTCCTCCTCCCC
ATTTACATCTTCGCCACACCCGTCTTGAGACTTCTCGGCCAAGCAGAGGAGATCGCTGTT
GCAGCTGGAGAGTTCACACCTCTAACCATCCCTCAGCTCTTCTCGATGGCCTTCACTTTC
CCCACCTCAAAGTTCCTTCAAGCGCAGAGCAAAGTCATCGCCATTGCTTGGATCGGTTTC
GTCGCTCTTATCATGCACGTTGCTATGCTCTGGCTGTTCATTGTTGTCTTTGGTTGGGGC
ACAAACGGTGCCGCTTTGGCGTTTAGTATTACTAACTGGGGAACGGCGATCTCTCAGATT
GTTTATGTGATTGGTTGGTGCAACGAAAGATGGACTGGCTTGACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A304TF U 1
AF RS1A304TV U 180
BS 1 886 RS1A304TF

RD RS1A304TF 886 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGACTCTAAA
AGAGATAGAAAGACTTAAAGAGGCTAGTGAGCCAGCGAGCGTAGGTTTAACGTTTGAGAC
TCTGAGGAGGAGATGGAACCGACGACGACGCCGCTTCTTGAGCACGGTGGTGGTGGTGGT
GAGGTAAGGGAGGATTACTCGCCGGCGAGGACGTTAAGCGACGTGAAGCGAGTCTTTTCG
ATGGAGTCCGCCAAGCTGTGGAAGATCGCTGCTCCCATTGGTTTCAACATCATCTGCCAG
TACGGCGTCACCTCCCTCACCAACATCTTCGTCGGCCATATCGGCGAGATAGAGCTCTCC
GCCGTCTCCATCTCTCTGTCGGTCATCGGCACCTTCTCCTTCGGCTTCTTGCTTGGCATG
GGAAGTGCACTTGAAACACTCTGTGGCCAAGCCTTTGGAGCAGGTCAAGTCCACATGTTA
GGGGTCTACATGCAGAGATCATGGATCATCTTATTCGTTTCATGCATCTTCCTCCTCCCC
ATTTACATCTTCGCCACACCCGTCTTGAGACTTCTCGGCCAAGCAGAGGAGATCGCTGTT
GCAGCTGGAGAGTTCACACCTCTAACCATCCCTCAGCTCTTCTCGATGGCCTTCACTTTC
CCCACCTCAAAGTTCCTTCAAGCGCAGAGCAAAGTCATCGCCATTGCTTGGATCGGTTTC
GTCGCTCTTATCATGCACGTTGCTATGCTCTGGCTGTTCATTGTTGTCTTTGGTTGGGGC
ACAAACGGTGCCGCTTTGGCGTTTAGTATTACTAACTGGGGAACGGCGATCTCTCAGATT
GTTTATGTGATTGGTTGGTGCAACGAAAGATGGACTGGCTTGACTT

QA 1 886 1 886
DS 

RD RS1A304TV 674 0 0
TGAGGTAAGGGAGGATTACTCGCCGGCGAGGACGTTAAGCGACGTGAAGCGAGTCTTTTC
GATGGAGTCCGCCAAGCTGTGGAAGATCGCTGCTCCCATTGGTTTCAACATCATCTGCCA
GTACGGCGTCACCTCCCTCACCAACATCTTCGTCGGCCATATCGGCGAGATAGAGCTCTC
CGCCGTCTCCATCTCTCTGTCGGTCATCGGCACCTTCTCCTTCGGCTTCTTGCTTGGCAT
GGGAAGTGCACTTGAAACACTCTGTGGCCAAGCCTTTGGAGCAGGTCAAGTCCACATGTT
AGGGGTCTACATGCAGAGATCATGGATCATCTTATTCGTTTCATGCATCTTCCTCCTCCC
CATTTACATCTTCGCCACACCCGTCTTGAGACTTCTCGGCCAAGCAGAGGAGATCGCTGT
TGCAGCTGGAGAGTTCACACCTCTAACCATCCCTCAGCTCTTCTCGATGGCCTTCACTTT
CCCCACCTCAAAGTTCCTTCAAGCGCAGAGCAAAGTCATCGCCATTGCTTGGATCGGTTT
CGTCGCTCTTATCATGCACGTTGCTATGCTCTGGCTGTTCATTGTTGTCTTTGGTTGGGG
CACAAACGGTGCCGCTTTGGCGTTTAGTATTACTAACTGGGGAACGGCGATCTCTCAGAT
TGTTTATGTGATTG

QA 1 674 1 674
DS 



CO CL1589Contig2 958 2 1 U
TAACAAAAGCACCGTTTTGTTACTTCACAGGTTGAACTGTTTCCTAGAGCCTAATAAAGT
TACCAAACCAATGAGAGAAGACAAACAAGAAAAGAAGATAAGCTACATATTCATTTTCAA
AGCTAAACAAAACAGAAACCACATAATCATGCAATTACATCCTTTGATGTTATTTCACTC
CCTCCCCACTTCTTCATGCGTTCCATAGTCTCCTCCACCTCTTTATTCCAGTTTGTCTTG
TACAGAACAACCACCAGTAACAATGTTTGAAGCGTTGTTCCTGCTACCATTCCAGCCCAA
AGTCCCATCACCCCTAAGTTTGCTTTGTAGCCAAGAATATACCCAAAGGGCAGGCCAAAA
ATGTAGTAACAACCCAAGTTTATATAAGCCACTAAACCTTGCCAACCACCTCCAATAGCC
ACACCGGAAATAACTGGCTGCACGCTGTTGAGAACCATGGTTATACCAAGAAGATAAGCT
AGCTTAGACACTGCGCGTTGTAGTACTTCGCTGCTTGTGTAAATGATAGCAAAACGGTCT
CTGGCTATGATGATAGCCACCATAAAGACAAGACCGATCAGTAGAGACTGTAACACCGCG
ACATAAACAGAGTATTTAGCTGCTCGTGGACGGCCTAACCCAAGCTCATTAGAGACACGG
ACACTTATAGCAGCGTTTATTCCAATGAACAACATAGCCTCCAGGCCATTAACATTCATG
CATATAGAAAGAGAATCAACAGCGATGACAGCGTTGTCAAGGCGACCGGTAAGGACAATG
ATACTCATCATATACCAAAGCTCAAGACAAAGCATAACAGCAGATGCGATAGAGAGTCTA
ACAAAAGCCCAAATCTCTTTAAAAGCCAACCAAGTCAAGCCAGTCCATCCTTCGTTGCAC
CAACCAATCACATAAACATCTGAGAGATCGCCGTTCCCCAGTTAGTATACTAAACGCA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A304JQ U 2
AF RS1A304TR U 1
BS 1 958 RS1A304TR

RD RS1A304JQ 756 0 0
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ACCAAACCAATGAGAGAAGACAAACAAGAAAAGAAGATAAGCTACATATTCATTTTCAAA
GCTAAACAAAACAGAAACCACATAATCATGCAATTACATCCTTTGATGTTATTTCACTCC
CTCCCCACTTCTTCATGCGTTCCATAGTCTCCTCCACCTCTTTATTCCAGTTTGTCTTGT
ACAGAACAACCACCAGTAACAATGTTTGAAGCGTTGTTCCTGCTACCATTCCAGCCCAAA
GTCCCATCACCCCTAAGTTTGCTTTGTAGCCAAGAATATACCCAAAGGGCAGGCCAAAAA
TGTAGTAACAACCCAAGTTTATATAAGCCACTAAACCTTGCCAACCACCTCCAATAGCCA
CACCGGAAATAACTGGCTGCACGCTGTTGAGAACCATGGTTATACCAAGAAGATAAGCTA
GCTTAGACACTGCGCGTTGTAGTACTTCGCTGCTTGTGTAAATGATAGCAAAACGGTCTC
TGGCTATGATGATAGCCACCATAAAGACAAGACCGATCAGTAGAGACTGTAACACCGCGA
CATAAACAGAGTATTTAGCTGCTCGTGGACGGCCTAACCCAAGCTCATTAGAGACACGGA
CACTTATAGCAGCGTTTATTCCAATGAACAACATAGCCTCCAGGCCATTAACATTCATGC
ATATAGAAAGAGAATCAACAGCGATGACAGCGTTGT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RS1A304TR 958 0 0
TAACAAAAGCACCGTTTTGTTACTTCACAGGTTGAACTGTTTCCTAGAGCCTAATAAAGT
TACCAAACCAATGAGAGAAGACAAACAAGAAAAGAAGATAAGCTACATATTCATTTTCAA
AGCTAAACAAAACAGAAACCACATAATCATGCAATTACATCCTTTGATGTTATTTCACTC
CCTCCCCACTTCTTCATGCGTTCCATAGTCTCCTCCACCTCTTTATTCCAGTTTGTCTTG
TACAGAACAACCACCAGTAACAATGTTTGAAGCGTTGTTCCTGCTACCATTCCAGCCCAA
AGTCCCATCACCCCTAAGTTTGCTTTGTAGCCAAGAATATACCCAAAGGGCAGGCCAAAA
ATGTAGTAACAACCCAAGTTTATATAAGCCACTAAACCTTGCCAACCACCTCCAATAGCC
ACACCGGAAATAACTGGCTGCACGCTGTTGAGAACCATGGTTATACCAAGAAGATAAGCT
AGCTTAGACACTGCGCGTTGTAGTACTTCGCTGCTTGTGTAAATGATAGCAAAACGGTCT
CTGGCTATGATGATAGCCACCATAAAGACAAGACCGATCAGTAGAGACTGTAACACCGCG
ACATAAACAGAGTATTTAGCTGCTCGTGGACGGCCTAACCCAAGCTCATTAGAGACACGG
ACACTTATAGCAGCGTTTATTCCAATGAACAACATAGCCTCCAGGCCATTAACATTCATG
CATATAGAAAGAGAATCAACAGCGATGACAGCGTTGTCAAGGCGACCGGTAAGGACAATG
ATACTCATCATATACCAAAGCTCAAGACAAAGCATAACAGCAGATGCGATAGAGAGTCTA
ACAAAAGCCCAAATCTCTTTAAAAGCCAACCAAGTCAAGCCAGTCCATCCTTCGTTGCAC
CAACCAATCACATAAACATCTGAGAGATCGCCGTTCCCCAGTTAGTATACTAAACGCA

QA 1 958 1 958
DS 



AS 2 5

CO CL1590Contig1 532 3 1 U
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CGAAGTCTCTCAAAGAGCTCAGGATCCTTCTCTGTCAATCTTCCCCAGCTAGCGCTTCCG
CCAGAACGTTCGTGGAGAAGAATTACAGAGATTTGAAGTCTCTGAACCCTAAGTTTCCCT
TCCTGATACGCGAATGCAGTGGGATCCAGCCTCAGATGTGGGCTCGATATGATATGGGTG
TGGAGAGGTGTGTAAACTTGGATGGGATGAGCGAGTCACAGATTCTCAAGTCTCTTGAAG
ACCTTGTCAAAGCCGGAGGAGCTACAAAAGCCTAAGGTTTTTTGTTTTTCTTTTTTGTTT
TCCAGATGATCCCGAATAAGCTTGATCCGGAAACACTCATTTGACATTTTCCCGTCAATC
TACTATCGATTACTTTCGTTTTGAGTTGTTTTTTTTTCTTCTTGATGATGTAATCCTTGA
ACTTGGTATACATCAAAACCATTCCATATGATGATGATATGATTGAAATCAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A093TF U 1
AF RS1B538TF U 138
AF RS1A093TV U 1
BS 1 532 RS1A093TF

RD RS1A093TF 532 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGAAACGTAT
CGAAGTCTCTCAAAGAGCTCAGGATCCTTCTCTGTCAATCTTCCCCAGCTAGCGCTTCCG
CCAGAACGTTCGTGGAGAAGAATTACAGAGATTTGAAGTCTCTGAACCCTAAGTTTCCCT
TCCTGATACGCGAATGCAGTGGGATCCAGCCTCAGATGTGGGCTCGATATGATATGGGTG
TGGAGAGGTGTGTAAACTTGGATGGGATGAGCGAGTCACAGATTCTCAAGTCTCTTGAAG
ACCTTGTCAAAGCCGGAGGAGCTACAAAAGCCTAAGGTTTTTTGTTTTTCTTTTTTGTTT
TCCAGATGATCCCGAATAAGCTTGATCCGGAAACACTCATTTGACATTTTCCCGTCAATC
TACTATCGATTACTTTCGTTTTGAGTTGTTTTTTTTTCTTCTTGATGATGTAATCCTTGA
ACTTGGTATACATCAAAACCATTCCATATGATGATGATATGATTGAAATCAT

QA 1 532 1 532
DS 

RD RS1B538TF 388 0 0
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AGTGGGATCCAGCCTCAGATGTGGGCGCGATATGATATGGGTGTGGAGAGGTGTGTAAAC
TTGGATGGGATGAGCGAGTCACAGATTCTCAAGTCTCTTGAAGACCTTGTCAAAGCCGGA
GGAGCTACAAAAGCCTAAGGTTTTTTGTTTTTCTTTTTTGTTTTCCAGATGATCCCGAAT
AAGCTTGATCCGGAAACACTCATTTGACATTTTCCCGTCAATCTACTATCGATTACTTTC
GTTTTGAGTTGTTTTTTTTTCTTCTTGATGATGTAATCCTTGAACTTGGTATACATCAAA
ACCATTCCATATGATGATGATATGATTG

QA 1 388 1 388
DS 

RD RS1A093TV 532 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGAAACGTAT
CGAAGTCTCTCAAAGAGCTCAGGATCCTTCTCTGTCAATCTTCCCCAGCTAGCGCTTCCG
CCAGAACGTTCGTGGAGAAGAATTACAGAGATTTGAAGTCTCTGAACCCTAAGTTTCCCT
TCCTGATACGCGAATGCAGTGGGATCCAGCCTCAGATGTGGGCTCGATATGATATGGGTG
TGGAGAGGTGTGTAAACTTGGATGGGATGAGCGAGTCACAGATTCTCAAGTCTCTTGAAG
ACCTTGTCAAAGCCGGAGGAGCTACAAAAGCCTAAGGTTTTTTGTTTTTCTTTTTTGTTT
TCCAGATGATCCCGAATAAGCTTGATCCGGAAACACTCATTTGACATTTTCCCGTCAATC
TACTATCGATTACTTTCGTTTTGAGTTGTTTTTTTTTCTTCTTGATGATGTAATCCTTGA
ACTTGGTATACATCAAAACCATTCCATATGATGATGATATGATTG
AAATCAT

QA 1 525 1 525
DS 



CO CL1590Contig2 515 2 1 U
TTGATTCTGTGTTGCGCGACTGTAGAAGAAGAGAAGAAACAAATGGCGTGGAGAGGAAAC
GTATCGAAGTCTCTCAAAGAGCTCAGGATCCTTCTCTGTCAATCTTCCCCAGCTAGCGCT
TCCGCCAGAACGTTCGTGGAGAAGAATTACAGAGATTTGAAGTCTCTGAACCCTAAGTTT
CCCTTCCTGATACGCGAATGCAGTGGGATCCAGCCTCAGATGTGGGCGCGATATGATATG
GGTGTGGAGAGGTGTGTAAACTTGGATGGGATGAGCGAGTCACAGATTCTCAAGTCTCTT
GAAGACCTTGTCAAAGCCGGAGGAGCTACAAAAGCCTAAGGTTTTTTGTTTTTCTTTTTT
GTTTTCCAGATGATCCCGAATAAGCTTGATCCGGAAACACTCATTTGACATTTTCCCGTC
AATCTACCATCGATTACTTTCGTTTTGAGTTGTTTTTTTTTTCTTCTTGATGATGTAATC
CTTGAACTTGGTATACATCAAAACCATTCCATATG


BQ
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AF RS1H248JQB C 1
AF RS1H248TF U 1
BS 1 515 RS1H248TF

RD RS1H248JQB 515 0 0
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QA 1 515 1 515
DS 

RD RS1H248TF 515 0 0
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GTATCGAAGTCTCTCAAAGAGCTCAGGATCCTTCTCTGTCAATCTTCCCCAGCTAGCGCT
TCCGCCAGAACGTTCGTGGAGAAGAATTACAGAGATTTGAAGTCTCTGAACCCTAAGTTT
CCCTTCCTGATACGCGAATGCAGTGGGATCCAGCCTCAGATGTGGGCGCGATATGATATG
GGTGTGGAGAGGTGTGTAAACTTGGATGGGATGAGCGAGTCACAGATTCTCAAGTCTCTT
GAAGACCTTGTCAAAGCCGGAGGAGCTACAAAAGCCTAAGGTTTTTTGTTTTTCTTTTTT
GTTTTCCAGATGATCCCGAATAAGCTTGATCCGGAAACACTCATTTGACATTTTCCCGTC
AATCTACCATCGATTACTTTCGTTTTGAGTTGTTTTTTTTTTCTTCTTGATGATGTAATC
CTTGAACTTGGTATACATCAAAACCATTCCATATG

QA 1 515 1 515
DS 



AS 1 5

CO CL1591Contig1 1077 5 15 U
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GAAACACCAGAAGAGACAAACACAAGCTGTACAGAGAAACAAAAGACAAAACAGAGATCA
CAACACTACACATCCCCAACCATTTGATAGCTTAAAGAAAAACTCATAGAACAGCTTCTT
GTTTTCTCTACATCATTATTTTGGAGTTTCGATATTAAGTGAGATGGAGTTTGATTTTTT
TTTT*CTTTTCTCAATCTCCATGTGCAAGAACTGCTGCTCCTTCCACCTTGAAGGTGGCT
CCCCAAATTTCTTCCTCTTTAGCAGGAATGGCAGTGATCTTGTTCTTAGGGTTCTCAAAG
CTCCTTAGCCCACCTAACGCAGTCGAGTAAAAACAGCCTTGAGGGAACGAAGCAAGAGAT
TTGCCACAAGCACCTTTTAGCAACTCAATATCATCAGCAAATGCCACATACCCATCAGCT
GTTATCCCCCAATACAATGGAACCTTACCTTCTTGGTCAGAGGCTACAAACAGAGTGGAG
GTTGATTTGTCGAAAACCACGAAGGCGAAGTCGCCGCTTAGGTGAGACACGACATGGTTG
GCCGGGTAAGGAGCTCTGTCACGGAGAGTCTTATAAGCCTCGATGACCAAGAGAACCTCG
TTTGCGTTCTTTGCAAGCCCATATTGTTGTTTCAAGCTTCCTAGGTTGTCAAGTGATCCT
TGGAACAAGCAGAATATCTCATCCTTAGCCCCAAATGACCTTGGCCGGAGAGGACTCTCT
TTGTGGTGGCTGTACGCAAGCTGCACATAGTCGCCGACCTGTACGGACACGGCGGAGGGA
TTTTTCTCAACGAACTTGTTGACTAGGACCGAGCCGGTTGTCTTCGGCGATGGAGTTCGG
TTCCCGGCGGCCACCAGCTCTTCCGGCAAAGATACTATAGCTCCGCTGAAAATTCCCAAC
ATTTTTATCTCTCTTCCGACGATACCAACTAAAACCCCAAAAAGACTAGTTTTTTAGATA
ATTAAACTGTTTTGAGTTCTCTTGCTGTGAGAGATATATTGGACATGGAGGTTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DA23JQ U 1
AF RS1DR89JQ U 46
AF RS1CH25TF C 16
AF RS1CH25JQ U 22
AF RS1DR89TF C 382
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GAAACACCAGAAGAGACAAACACAAGCTGTACAGAGAAACAAAAGACAAAACAGAGATCA
CAACACTACACATCCCCAACCATTTGATAGTTTAAAGAAAAACTCATAAAACAGCTTCTT
GTTTTCTCTACATCATTATTTTGGAGTTTCGATATTAAGAGAGATGGAGCTTGATTTTTT
TTTT*CTTTTCTCAATCTCCATGTGCAAGAACTGCTGCTCCTTCCACCTTGAAGGTGGCT
CCCCAAATTTCTTCCTCTTTAGCAGGAATGGCAGTGATCTTGTTCTTAGGGTTCTCAAAG
CTCCTTAGCCCACCTAACGCAGTCGAGTAAAAACAGCCTTGAGGGAACGAAGCAAGAGAT
TTGCCACAAGCACCTTTTAGCAACTCAATATCATCAGCAAATGCCACATACCCATCAGCT
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GTTGATTTGTCGAAAACCACGAAGGCGAA

QA 1 569 1 569
DS 

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ATAGAACAGCTTCTTGTTTTCTCTACATCATTATTTTGGAGTTTCGATATTAAGAGAGAT
GGAGCTTGATTTTTTTTTTTCTTTTCTCAATCTCCATGTGCAAAAACTGCTGCTCCTTCC
ACCTTGAAGGGGGCTCCCCAAATTTCTTCCCCTTTAGCAGGAATGGCAGTGATCTTGTTC
TTAGGGTTCTCAAAGCTCCTAAGCCCACCTAACGCAGTCGAGTAAAAACAGCCTTGAGGG
AATGAAGCAAGAAATTTGCCACAAGCACCTTTTAGCAACTCAATATCATCAGCAAATGCC
ACATACCCATCAGCTGTTATCCCCCAATACAATGGAACCTTACCTTCTTGGTCAGAGGCT
ACAAACAGAGTGGAGGTTGATTTGTCGAAAACCACGAAGGCGAAGTCGCC

QA 1 530 1 530
DS 

RD RS1CH25TF 650 0 0
TTTTTT
AGAGTCTATGAGACATAACTTATTGGGACAAACACACTAGAAACACCAGAAGAGACAAAC
ACAAGCTGTACAGAGAAACAAAAGACAAAACAGAGATCACAACACTACACATCCCCAACC
ATTTGATAGCTTAAAGAAAAACTCATAGAACAGCTTCTTGTTTTCTCTACATCATTATTT
TGGAGTTTCGATATTAAGTGAGATGGAGTTTGATTTTTTTTTT*CTTTTCTCAATCTCCA
TGTGCAAGAACTGCTGCTCCTTCCACCTTGAAGGTGGCTCCCCAAATTTCTTCCTCTTTA
GCAGGAATGGCAGTGATCTTGTTCTTAGGGTTCTCAAAGCTCCTTAGCCCACCTAACGCA
GTCGAGTAAAAACAGCCTTGAGGGAACGAAGCAAGAGATTTGCCACAAGCACCTTTTAGC
AACTCAATATCATCAGCAAATGCCACATACCCATCAGCTGTTATCCCCCAATACAATGGA
ACCTTACCTTCTTGGTCAGAGGCTACAAACAGAGTGGAGGTTGATTTGTCGAAAACCACG
AAGGCGAAGTCGCCGCTTAGGTGAGACACGACATGGTTGGCCGGGTAAGGAGCTCTGTCA
CGGAGAGTCTTATAAGCCTCGATGACCAAGAGAACCTCGTTTGC

QA 7 650 7 650
DS 

RD RS1CH25JQ 644 0 0
AGAGTCTATGAGACATAACTTATTGGGACAAACACACTAGAAACACCAGAAGAGACAAAC
ACAAGCTGTACAGAGAAACAAAAGACAAAACAGAGATCACAACACTACACATCCCCAACC
ATTTGATAGCTTAAAGAAAAACTCATAGAACAGCTTCTTGTTTTCTCTACATCATTATTT
TGGAGTTTCGATATTAAGTGAGATGGAGTTTGATTTTTTTTTT*CTTTTCTCAATCTCCA
TGTGCAAGAACTGCTGCTCCTTCCACCTTGAAGGTGGCTCCCCAAATTTCTTCCTCTTTA
GCAGGAATGGCAGTGATCTTGTTCTTAGGGTTCTCAAAGCTCCTTAGCCCACCTAACGCA
GTCGAGTAAAAACAGCCTTGAGGGAACGAAGCAAGAGATTTGCCACAAGCACCTTTTAGC
AACTCAATATCATCAGCAAATGCCACATACCCATCAGCTGTTATCCCCCAATACAATGGA
ACCTTACCTTCTTGGTCAGAGGCTACAAACAGAGTGGAGGTTGATTTGTCGAAAACCACG
AAGGCGAAGTCGCCGCTTAGGTGAGACACGACATGGTTGGCCGGGTAAGGAGCTCTGTCA
CGGAGAGTCTTATAAGCCTCGATGACCAAGAGAACCTCGTTTGC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1DR89TF 696 0 0
CAGTCGAGTAAAACAG
CTTGAGGGAATGAAGCAAGAGATTTGCCACAAGCAC*TTTTAGCAACTCAATATCATCAG
CAAATGCCACATACCCATCAGCTGTTATCCCCCAATACAATGGAACCTTACTTTCTTGGT
CAGAGGCTACAAACAGAGTGGAGGTTGATTTGTCGAAAACCACGAAGGCGAAGTCGCCGC
TTAGGTGAGACACGACATGGTTGGCCGGGTAAGGAGCTCTGTCACGGAGAGTCTTATAAG
CCTCGATGACCAAGAGAACCTCGTTTGCGTTCTTTGCAAGCCCATATTGTTGTTTCAAGC
TTCCTAGGTTGTCAAGTGATCCTTGGAACAAGCAGAATATCTCATCCTTAGCCCCAAATG
ACCTTGGCCGGAGAGGACTCTCTTTGTGGTGGCTGTACGCAAGCTGCACATAGTCGCCGA
CCTGTACGGACACGGCGGAGGGATTTTTCTCAACGAACTTGTTGACTAGGACCGAGCCGG
TTGTCTTCGGCGATGGAGTTCGGTTCCCGGCGGCCACCAGCTCTTCCGGCAAAGATACTA
TAGCTCCGCTGAAAATTCCCAACATTTTTATCTCTCTTCCGACGATACCAACTAAAACCC
CAAAAAGACTAGTTTTTTAGATAATTAAACTGTTTTGAGTTCTCTTGCTGTGAGAGATAT
ATTGGACATGGAGGTTGTCC

QA 17 696 17 696
DS 



AS 1 5

CO CL1592Contig1 1351 5 16 U
GGGCATCGCTAAATCCTCTGGTAATCCCTTCTCCAACGAGTCCATTTTCCCTCGAGCTTT
CGTCTCCCCCAGGAGCTCCTTTGACCATGGCGTCTTGCTTACAAGCATCCATGAATTCTC
TGCTTCCACGCTCTTCTCTCTCTTTGAATTCATCCGGGAGGAGAAACTCGAAGGCCTTTC
GCGTTAAAGCCGCTGCCAAAATCCCCATGCCTCCGATAAACCCTAACGATCCTTTCCTCT
CGAAGCTCGCTTCCGTCGCCGCGCAATCTCCGGAGAAACTTCTCGCTCGTCCGTTAAACT
CCGATACGCCGCCATATCTTGACATCTTCGATTCGCCTCAGCTCATGTCTTCTCCTGCTC
AGGTTGAAAGGTCAGTGGCTTATAACGAGCACAGGCCAAGAACACCTCCACCAGACTTGC
CATCTATGCTTCTTGGCGGGAGAATTGTTTACATTGGCATGCCTCTGGTGCCGGCGGTTA
CAGAGCTAGTTGTAGCAGAGCTGATGTATCTTCAGTGGCTGGATCCCAAGGAACCTATAT
ACATTTACATCAACTCCACAGGGACCACTCGTGACGATGGCGAGACTGTTGAAATGGAAT
CAGAGGGTTTTGCGATATATGATTCTTTGATGCAACTTAAAAACGAGGTACATACAGTGT
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CTCTCTCTCTCTCTTTTTTATCCCCTCCTATTTCAATATTGGAAAATTTCAAACTGTCCT
TTTCAATAAGTTTTCTAGGATTTGCATTGGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1BM37JQ C 602
AF RS1GM04JQ C 778
AF RS1GM04TF U 616
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TGAATTCGATAAGAATGCTGGGATTAGAAGCGCAGAACGAGTTTAGTTTCAAATACTCTT
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DS 

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TGTGGGACTACTATCAAAGCACACTGGGAATTCTGTGGAGACTGTGGCTAACGTGATGAG
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TTCAATAAGTTTTCTAGGATTTGCATTGGC

QA 1 750 1 750
DS 

RD RS1GM04JQ 552 0 0
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CTGTTTCAGTGTGGACAACGTTAAATAGAATTACAAATTCCCTTGGTTGCGGGACTGCCT
TGTTTCGAACCACGGGTAAACTGTCGATCATGCGATTAGGAGAAACGTATTAAATATGAT
CTTCAAAAACTATGTGATGAAGTTGCAATGTGTTTCAAAAGCCTAAGTAAATGCAGTGTC
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CCTTTT
CAATAG

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DS 

RD RS1GM04TF 708 0 0
G
ATATGATTCTTTGATGCAACTTAAAAACGAGGTACATACAGTGTGTGTGGGAGCAGCCAT
AGGTCACGCATGTTTGTTGCTTTCAGCGGGCACAAAGGGTAAACGGTTTATGATGCCACA
CTCCAAAGCAATGATCCAACAGCCTCGTGTGCCTTCTTCTGGGTTGATGCCTGCCAGTGA
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AAAGCACACTGGGAATTCTGTGGAGACTGTGGCTAACGTGATGAGAAGGCCATATTACAT
GGATGCACCAAAAGCTAAAGAATTTGGAGTCATTGACAAGATTCTTTGGCGTGGTCAAGA
AAAGATTATTGCGGACGTTGTTCCTTCAGATGAATTCGATAAGAATGCTGGGATTAGAAG
CGCAGAACGAGTTTAGTTTCAAATACTCTTGCCTCAAATATCTGTTTCAGTGTGGACAAC
GTTAAATAGAATTACAAATTCCCTTGGTTGCGGGACTGCCTTGTTTCGAACCACGGGTAA
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AAGTTGCAATGTGTTTCAAAAGCCTAAGTAAATGCAGTGTCGAACTCTCTCTCTCTCTTT
TTTATCCCCTCCTATTTCAATATTGGAAAATTTCAAACTGTCCTTTT

QA 2 708 2 708
DS 



AS 2 4

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CTTGAACTTCAAATGAATTACTCGTAGTCATAGTCCTTCAAACTCGTATTAAACGGAATC
GAACAGACCGGATCCAAAAGTTATAAATAATTGAATAGGTCTAGGTTGTTGGTTGTCAGA
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CTAGTTACGCTATAGTTTAGAACTCACATACCATGGTAGGGTGATAAACTTTGGTTTAAA
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TATCACATTACCTATGTAAAGGGAACAAGACCCTTAGTCAAATTCATCCCCATCATCAAC
CAAAAATACTGTTCAGCTATAGAACCCTTTTTTTTTAAGAAAAGAAAAACTGCTCCTAAT
GCTTTTCTCTCTCTCTAATTGAATAAAATAAAAGCATATCCGATAAAAGAAACATGGCCG
TGTCTTCTTCTGATCATTTGTTGTCTTGTGTCTTTACCCTTCAACGGATCTGATGGTATT
GTGTGATGCCTCGTTTTGGTGGTAGCTTCCTCAAGATGAAGAGGACCAAAGAGGAAGGTA
ATATCTCTACCAACAGGTAATATATGAAGTTAAGAATGGGGTGATCCAACACATCAAGGT
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CTGGAAAATTTTGCAACATTAGGAAAAGCCGTCCACCGTAAAGTAGAAATC


BQ
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AF RS1BR76JQ U 1
AF RS1H151JQB U 471
BS 1 695 RS1BR76JQ
BS 696 696 RS1H151JQB
BS 697 768 RS1BR76JQ
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BS 770 809 RS1BR76JQ
BS 810 1131 RS1H151JQB

RD RS1BR76JQ 809 0 0
GGATAGTGTGGAAGGATACAAATTATTCGAATCAAACCGTAAACTTAGATTTCCAAATAA
CTTGAACTTCAAATGAATTACTCGTAGTCATAGTCCTTCAAACTCGTATTAAACGGAATC
GAACAGACCGGATCCAAAAGTTATAAATAATTGAATAGGTCTAGGTTGTTGGTTGTCAGA
ACTCAGTGGTGATTTGGTTTGCCCAATATCAAAACCTTCCTCGTTTTTGAGACTGTATTG
TTGGAACTAGCAAGACAGACTGTTCAAAGCACTTTTGAGTTGTGATTTGTAAACAAGACT
CTAGTTACGCTATAGTTTAGAACTCACATACCATGGTAGGGTGATAAACTTTGGTTTAAA
CTTCATTGTCCAAAACAAAAATTTAAAGCAATGATTTATATTCTAGGATATTATTCACTT
TCAACATGTTTATTAAATCTAAAATGGCAAAATAAGTCGTCAAATTAAGTAGTGAATTTT
GTTCTTTGTTTTGTTTATGAAAGCAAAGACACAATTACAATGAGTTAGGTAACGCAGGAG
TTAAGTTTTTAACACACCCTGCACAATCCTTTCCATGTACTTTTTTTAAACACTTTGCTT
TATCACATTACCTATGTAAAGGGAACAAGACCCTTAGTCAAATTCATCCCCATCATCAAC
CAAAAATACTGTTCAGCTATAGAACCCTTTTTTTT*AAGAAAAGAAAAACTGCTCCTAAT
GCTTTTCTCTCTCTCTAATTGAATAAAATAAAAGCATATCCGATAAAA*AAACATGGCCG
TGTCTTCTTCTGATCATTTGTTGTCTTGT

QA 1 809 1 809
DS 

RD RS1H151JQB 661 0 0
G
GTGAATTTTGTTCTTTGTTTTGTTTATGAAAGCAAAGACACAATTACAATGAGTTAGGTA
ACGTAGGAGTTAAGTTTTTAACACACCCTGCACAATCCTTTCCATGTACTTTTTTTAAAC
ACTTTGCTTTATCACATTACCTATGTAAAGGGAACAAGACCCTTAGTCAAATTCATCCCC
ATCATCAACCAAAAATACTGTTCAGCTATAGAACCCTTTTTTTTTAAGAAAAGAAAAACT
GCTCCTAATGCTTTTCTCTCTCTCTAATTGAATAAAATAAAAGCATATCCGATAAAAGAA
ACATGGCCGTGTCTTCTTCTGATCATTTGTTGTCTTGTGTCTTTACCCTTCAACGGATCT
GATGGTATTGTGTGATGCCTCGTTTTGGTGGTAGCTTCCTCAAGATGAAGAGGACCAAAG
AGGAAGGTAATATCTCTACCAACAGGTAATATATGAAGTTAAGAATGGGGTGATCCAACA
CATCAAGGTTTGCCCCCTCGTCGAAAGCAGCGAAGCACATCATGATACATCTGATGAGGA
AACACGTAGAGCATATGGTTGTCACGTAACCAACCTCTTGCAGCTTTTTGCGGCGTCCGT
TAGATTCTGCTGGAAAATTTTGCAACATTAGGAAAAGCCGTCCACCGTAAAGTAGAAATC

QA 2 661 2 661
DS 



CO CL1593Contig2 782 2 4 U
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TGATGCAATACGCGTCGGAGATGATGACGTCGTCTTCTTCGGCGGTGGAAGCGTTGGATC
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TCTTCCACGCTCTCGCTCTTCTCTACGGAATCGTCTCCATCGTCGCTCTGATTCAACTGG
TGAGAATCCAATTGAGAGTTCCAGAATACGGATGGACGACGCAGAAGGTCTTCCACTTCC
TCAATTTCGTCGTCAACGGAGTGAGGGCTGTGGTGTTTGTTTTCAGGAGAGATGTGCAGT
TTATGCATCCAGAGATTCTGCAACATATATTGCTTGATATACCAAGTCTTGCTTTCTTTA
CCACTTATGCTCTTCTAGTCCTCTTCTGGGCTGAGATTTACTATCAGGCGCGTGCTGTGT
CCACTGATGGACTAAGGCCAGGTTTCTTCACAATCAATGCTGTTGTGTATGTAGTTCAGA
TTGCTCTTTGGTTGGTTTTGTGGTGGAAGCCTGTTCGTGTTATGGTTATCCTTTCAAAGA
TGTTCTTTGCAGGTGCTTCCTTGTTTGCTGCCCTTGGATTTCTACTTTACGGTGGACGGC
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GGTGGGTACGTGACACCATATGCTCTACGTGTTCCTCATCAGATGTATCATGATGTGCTC
GC


BQ
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10 10 

AF RS1H151TF U 1
AF RS1CD15TF U 12
BS 1 262 RS1H151TF
BS 263 263 RS1CD15TF
BS 264 608 RS1H151TF
BS 609 782 RS1CD15TF

RD RS1H151TF 608 0 0
GGGAGGTGATTCAATCGATTTCTTAAAAAAGAAAAAAAATGAGAATCGGCGGTGTGGAGA
TGATGCAATACGCGTCGGAGATGATGACGTCGTCTTCTTCGGCGGTGGAAGCGTTGGATC
TCAAGGACGCTTCGAGTTGGTGGTCGGATGTCAACGAGTCTCCGATTTGGCAGGATCGTA
TCTTCCACGCTCTCGCTCTTCTCTACGGAATCGTCTCCATCGTCGCTCTGATTCAACTGG
TGAGAATCCAATTGAGAGTTCCTGAATACGGATGGACGACGCAGAAGGTCTTCCACTTCC
TCAATTTCGTCGTCAACGGAGTGAGGGCTGTGGTGTTTGTTTTCAGGAGAGATGTGCAGT
TTATGCATCCAGAGATTCTGCAACATATATTGCTTGATATACCAAGTCTTGCTTTCTTTA
CCACTTATGCTCTTCTAGTCCTCTTCTGGGCTGAGATTTACTATCAGGCGCGTGCTGTGT
CCACTGATGGACTAAGGCCAGGTTTCTTCACAATCAATGCTGTTGTGTATGTAGTTCAGA
TTGCTCTTTGGTTGGTTTTGTGGTGGAAGCCTGTTCGTGTTATGGTTATCCTTTCAAAGA
TGTTCTTT

QA 1 608 1 608
DS 

RD RS1CD15TF 771 0 0
G
AATCGATTTCTTAAAAAAGAAAAAAAATGAGAATCGGCGGTGTGGAGATGATGCAATACG
CGTCGGAGATGATGACGTCGTCTTCTTCGGCGGTGGAAGCGTTGGATCTCAAGGACGCTT
CGAGTTGGTGGTCGGATGTCAACGAGTCTCCGATTTGGCAGGATCGTATCTTCCACGCTC
TCGCTCTTCTCTACGGAATCGTCTCCATCGTCGCTCTGATTCAACTGGTGAGAATCCAAT
TGAGAGTTCCAGAATACGGATGGACGACGCAGAAGGTCTTCCACTTCCTCAATTTCGTCG
TCACCGGAGTGAGGGCTGTGGTGTTTGTTTTCAGGAGAGATGTGCAGTTTATGCATCCAG
AGATTCTGCAACATATATTGCTTGATATACCAAGTCTTGCTTTCTTTACCACTTATGCTC
TTCTAGTCCTCTTCTGGGCTGAGATTTACTATCAGGCGCGTGCTGTGTCCACTGATGGAC
TAAGGCCAGGTTTCTTCACAATCAATGCTGTTGTGTATGTAGTTCAGATTGCTCTTTGGT
TGGTTTTGTGGTGGAAGCCTGTTCGTGTTATGGTTATCCTTTCAAAGATGTTCTTTGCAG
GTGCTTCCTTGTTTGCTGCCCTTGGATTTCTACTTTACGGTGGACGGCTTTTCCTAATGT
TGCAAAATTTTCCAGCAGAATCTAACGGACGCCGCAAAAGCTGCAAGAGGTGGGTACGTG
ACACCATATGCTCTACGTGTTCCTCATCAGATGTATCATGATGTGCTCGC

QA 2 771 2 771
DS 



AS 2 5

CO CL1594Contig1 997 3 13 U
GGATCTCTTTTAAAATTGATTCTAGGGTTCATTCATCTCCCTCAAAGCTCTCTCTCATTC
ATTATCCTTCTCCATCAAACAGAGAGAGAGAGAGCGTAATCATGAACGCCGTGGCATCGA
GTTTCGCTCAATCTCCCTCCTTTCTTCGTCGAACTCCCAAAACCGCCTCTGGTTCGATTC
TCCTGACGTCAACCTCCCCTGGCTTCATCCGATTCGGTTCCGGACCTCAATTTCGCCACA
GAAACAGCTCTTGTCTTAAACTCTCGAGACCATCACAAAGCCGAACAACTTCTCTCAAGT
CTCGGACAAGCTTTGTCGTCAAAGCTTCAGCTTCAGGTGATGCGTCGTCCGACTCAATTG
CGCCGCTTCAGTTGAAGTCTCCCGTGGGGCAGTTTCTGTCGCAGATACTCGTCAGCCATC
CTCATCTCGTCCCTGCAGCTGTCGAACAACAGCTCGAACAGCTTCAAATCGACCGAGAAG
CCGAGCAACAGATCAACAAAGACTCTTCCTCCTCCTCTCTTCCTCCTGCAACAGACATTG
TTCTTTACAGGAGAATAGCTGAGGTTAAGGAGAAAGAGAGAAGAAGGGCTTTGGAAGAGA
TTTTATATGCTTTAGTTGTTCAGAAGTTCATGGACGCTAATGTTTCACTTGTACCTTCCA
TTACCTCCTCCTCTGGGAGAGTTGATACTTGGCCCACCCAAGAAGACGGGGAGCTCGAGC
AGCTTCACTCCCCCGAGGTCTACGAGATGATTCAGAATCATCTCTCCATCATTCTCAAAA
ACCGTGAGGGTGATCTCTCCACCGTGGCGCAGATAAGCAAGCTCGGTGTTGGACAGGTCT
ATGCTGCTTCCGTCATGTATGGCTATTTCCTGAAGCGGATCGACCAGAGGTTTCAGCTCG
AGAAGACGATGAAGATTCTTCCAGGTTGGTCTGATGAAGAGCGAGACTACTAGCATTGAG
CAAGCCGGAGGGAGCAGAGAGAGCTTCTATGGAGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D068TF U 1
AF RS1BW12TF U 42
AF RS1DB38TF U 253
BS 1 187 RS1D068TF
BS 188 188 RS1BW12TF
BS 189 441 RS1D068TF
BS 442 442 RS1BW12TF
BS 443 510 RS1D068TF
BS 511 511 RS1BW12TF
BS 512 587 RS1D068TF
BS 588 588 RS1BW12TF
BS 589 697 RS1D068TF
BS 698 698 RS1BW12TF
BS 699 704 RS1D068TF
BS 705 781 RS1BW12TF
BS 782 997 RS1DB38TF

RD RS1D068TF 704 0 0
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ATTATCCTTCTCCATCAAACAGAGAGAGAGAGAGCGTAATCATGAACGCCGTGGCATCGA
GTTTCGCTCAATCTCCCTCCTTTCTTCGTCGAACTCCCAAAACCGCCTCTGGTTCGATTC
TCCTGACTTCAACCTCCCCTGGCTTCATCCGATTCGGTTCCGGACCTCAATTTCGCCACA
GAAACAGCTCTTGTCTTAAACTCTCGAGACCATCACAAAGCCGAACAACTTCTCTCAAGT
CTCGGACAAGCTTTGTCGTCAAAGCTTCAGCTTCAGGTGATGCGTCGTCCGACTCAATTG
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CTCATCTCGTCCCTGCAGCTGCCGAACAACAGCTCGAACAGCTTCAAATCGACCGAGAAG
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TTTTATATGCTTTAGTTGTTCAGAAGTTCATGGACGCTAATGTTTCACTTGTACCTTCCA
TTACCTCCTCCTCTGGGAGAGTTGATACTTGGCCCACTCAAGAA

QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1BW12TF 740 0 0
GG
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CGCCTCTGGTTCGATTCTCCTGACGTCAACCTCCCCTGGCTTCATCCGATTCGGTTCCGG
ACCTCAATTTCGCCACAGAAACAGCTCTTGTCTTAAACTCTCGAGACCATCACAAAGCCG
AACAACTTCTCTCAAGTCTCGGACAAGCTTTGTCGTCAAAGCTTCAGCTTCAGGTGATGC
GTCGTCCGACTCAATTGCGCCGCTTCAGTTGAAGTCTCCCGTGGGGCAGTTTCTGTCGCA
GATACTCGTCAGCCATCCTCATCTCGTCCCTGCAGCTGTCGAACAACAGCTCGAACAGCT
TCAAATCGACCGAGAAGCCGAGCAACAGATCAACAAAGACTCTTCCTCCTCCTCTCTTCC
**CTGCAACAGACATTGTTCTTTACAGGAGAATAGCTGAGGTTAAGGAGAAAGAGAGAAG
AAGGGCTTTGGAAGAGATTTTATATGCTTTAGTTGTTCAGAAGTTCATGGACGCTAATGT
TTCACTTGTACCTTCCATTACCTCCTCCTCTGGGAGAGTTGATACTTGGCCCACCCAAGA
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CTCCATCATTCTCAAAAA

QA 3 740 3 740
DS 

RD RS1DB38TF 745 0 0
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TGAAGTCTCCCGTGGGGCAGTTTCTGTCGCAGATACTCGTCAGCCATCCTCATCTCGTCC
CTGCAGCTGTCAAACAACAGCTCGAACAGCTTCAAATCGACCGAGAAGCCGAGCAACAGA
TCAACAAAGACTCTTCCTCCTCCTCTCTTCCTCCTGCAACAGACATTGTTCTTTACAGGA
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TAGTTGTTCAGAAGTTCATGGACGCTAATGTTTCACTTGTACCTTCCATTACCTCCTCCT
CTGGGAGAGTTGATACTTGGCCCACCCAAGAAGACGGGGAGCTCGAGCAGCTTCACTCCC
CCGAGGTCTACGAGATGATTCAGAATCATCTCTCCATCATTCTCAAAAACCGTGAGGGTG
ATCTCTCCACCGTGGCGCAGATAAGCAAGCTCGGTGTTGGACAGGTCTATGCTGCTTCCG
TCATGTATGGCTATTTCCTGAAGCGGATCGACCAGAGGTTTCAGCTCGAGAAGACGATGA
AGATTCTTCCAGGTTGGTCTGATGAAGAGCGAGACTACTAGCATTGAGCAAGCCGGAGGG
AGCAGAGAGAGCTTCTATGGAGAGC

QA 1 745 1 745
DS 



CO CL1594Contig2 763 2 12 U
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ATATGCTCGTCCTTGGACGAATCAATCCCTTGCGGTGTTATCACAATCTCAGGCCTCCCA
AACAAGGCCTCCGTGTGCTTCTCAATGATCCCAACCGCTTCTCTCGATCTAATCGTAGCG
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GTTGTTTCGCTGCTGGAACCACCACTGGCATTAATCCCTCCCATTGAGGATACAGCTTGA
TAACTCTCTTCTTCTGCTTCTCAATAAAAGCTTCTCTCTGCTTCCCTCCCGGCTTGCTCA
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ACCTGTCCAACACCGAGCTTGCTTATCTGCGCCACGGTGGAGAGATCACCCTCACGGTTT
TTGAGAATGATGGAGAGATGATTCTGAATCATCTCGTAGACCT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DB38JQ U 1
AF RS1BW12JQ U 70
BS 1 376 RS1DB38JQ
BS 377 377 RS1BW12JQ
BS 378 400 RS1DB38JQ
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BS 631 712 RS1DB38JQ
BS 713 763 RS1BW12JQ

RD RS1DB38JQ 712 0 0
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ATATGCTCGTCCTTGGACGAATCAATCCCTTGCGGTGTTATCACAATCTCAGGCCTCCCA
AACAAGGCCTCCGTGTGCTTCTCAATGATCCCAACCGCTTCTCTCGATCTAATCGTAGCG
TATCTCTGAAGAGTTTTTCCATCGAAGGACATGACGTACGTCTTTAACCGGGACTGTTTC
GTTGTTTCGCTGCTGGAACCACCACTGGCATTAATCCCTCCCATTGAGGATACAGCTTGA
TAACTCTCTTCTTCTGCTTCTCCATAGAAGCTTCTCTCTGCTTCCCTCCCGGCTTGCTCA
ATGCTAGTAGTCTCGCCTCCTTCATCAGACCAACCTGGAAGAATCTTCATCGTCTTCTCG
AGCTGAAACCTCTGGTCGATCCGCTTCAG*AAATAGCCATACATGACGGAAGCAGCATAG
ACCTGTCCAACACCGAGCTTGCTTATCTGCGCCACGGTGGAGAGATCACCCT

QA 1 712 1 712
DS 

RD RS1BW12JQ 694 0 0
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TTCAGTACGAAGTGATACCTCGAATCCACATGACTCTCCGCATCCCAGAGGAACGAACCA
AACGTCACAGCCTCCAACACAAGCCTCTTCAGTCCCTTGAAACTGATCTTTATATGCTCG
TCCTTGGACGAATCAATCCCTTGCGGTGTTATCACAATCTCAGGCCTCCCAAACAAGGCC
TCCGTGTGCTTCTCAATGATCCCAACCGCTTCTCTCGATCTAATCGTAGCGTATCTCTGA
AGAGTTTCTCCATCGAAGGACATGACGTACGCCTTTAACCGGGACTGTTTCGTTGTTTCG
CTGCTGGAACCACCACTGGCATTAATCCCTCCCATTGAGGATACAGCTTGATAACTCTCT
TCTTCTGCTTCTCAATAAAAGCTTCTCTCTGCTTCCCTCCCGGCTTGCTCAATGCTAGTA
GTCTCGCCTCCTTCATCAGACCAACCTGGAAGAATCTTCATCGTCTTCTCGAGCTGAAAC
CTCTGGTCGATCCGCTTCAGGAAATAGCCATACATGACGGAAGCAGCATAGACCTGTCCA
ACACCGAGCTTGCTTATCTGCGCCACGGTGGAGAGATCACCCTCACGGTTTTTGAGAATG
ATGGAGAGATGATTCTGAATCATCTCGTAGACCT

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 5

CO CL1595Contig1 1339 5 12 U
GGGAACAAGGTCGCCCTAATTTTCTCCCAGACGTGAATATCGAGGCGCCGCATCTGAGAC
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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TGGA
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G
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AAAGTAACTGGTTGC
AC

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 4

CO CL1596Contig1 981 4 19 U
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TCCATGTACGAATCAGAAAACTCACTACCCTTTTTCACTTGAAAGATCTTTGCAGCTGGG
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TGGTAAAACGCGGTCGGGGGGTGGCCACCTCCTGCCACGTAGTCACGCTGGTCTAGGTTT
CCAAAGAAAGAAGCTTCCATCTTTGGGTGGATCAAGATGAGATACTTGCTCTTACAGAAC
TTACCAAAGTTGGAATCAGGGTTTGTAGCCAGAGCATCTAGTGGATCCATGTCTTTCAGA
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F173JQ U 1
AF RS1CR40JQ U 1
AF RS1E110JQ U 19
AF RS1F173TF C 334
BS 1 92 RS1CR40JQ
BS 93 93 RS1F173JQ
BS 94 172 RS1CR40JQ
BS 173 173 RS1F173JQ
BS 174 204 RS1CR40JQ
BS 205 205 RS1F173JQ
BS 206 235 RS1CR40JQ
BS 236 236 RS1F173JQ
BS 237 435 RS1CR40JQ
BS 436 438 RS1F173JQ
BS 439 718 RS1CR40JQ
BS 719 742 RS1E110JQ
BS 743 743 RS1F173TF
BS 744 777 RS1E110JQ
BS 778 778 RS1F173TF
BS 779 858 RS1E110JQ
BS 859 859 RS1F173TF
BS 860 871 RS1E110JQ
BS 872 981 RS1F173TF

RD RS1F173JQ 596 0 0
G
ATAATAAACTTCTTTTTGGTTGGGAGAATAAATATCTCGTTTGCTTATGAGTTCTGAACA
ATTACATGCAAGCTTACTGAAAAATACAATTTATAACAAGCAGAAAAAATAAAAGTTGCA
CAACAAAGTGGGAAGCTTTAGGACAAGACCAGAATCTCCTTCATTCAACGAGCTTAACAC
CTGAGACATAAACTCGGCTCTGAATCACACTTCCACCAATCCAAAACCCAGGCATCACCA
TAAGACCAACACTTGGGCTCTCTCCCTTTTCATCCACAACTATGTTCTTCAAAACACTTT
CCATGTACGAATCAAAAAACTCACTACCCTTTTTCACTTGAAAGATCTTTGCAGCTGGGT
CAAACGAGTAAGCCAGCCTGTGCAATAACCATATAGACTTTGCTAGTTTCAAGAAGGCCT
GGTAAAACGCGGTCGGGGGGTGGCCACCTCCTGCCACGTAGTCACGCTGGTCTAGGTTTC
CAAAGAAAGAAGCTTCCATCTTTGGGTGGATCAAGATGAGATACTTGCTCTTACAGAACT
TACCAAAGTTGGAATCAGGGTTTGTAGCCAGAGCATCTAGTGGATCCATGTCTTT

QA 2 596 2 596
DS 

RD RS1CR40JQ 731 0 0
AATAATAAACTTCTTTTTGGTTGGGAGAATAAATATCTCGTTTGCTTATGAGTTCTGAAC
AATTACATGCAAGCTTACTGAAAAATACAATTCATAACAAGCAGAAAAAATAAAAGTTGC
ACAACAAAGTGGGAAGCTTTAGGACAAGACCAGAATCTCCTTCATTCAACGACCTTAACA
CCTGAGACATAAACTCGGCTCTGAGTCACACTTCCACCAATCCAAAACCCAGGCACCACC
ATAAGACCAACACTTGGGCTCTCTCCCTTTTCATCCACAACTATGTTCTTCAAAACACTT
TCCATGTACGAATCAGAAAACTCACTACCCTTTTTCACTTGAAAGATCTTTGCAGCTGGG
TCAAACGAGTAAGCCAGCCTGTGCAATAACCATATAGACTTTGCTAGTTTCAAGAAGGCC
TGGTAAAACGCGGTCCTCGGGTGGCCACCTCCTGCCACGTAGTCACGCTGGTCTAGGTTT
CCAAAGAAAGAAGCTTCCATCTTTGGGTGGATCAAGATGAGATACTTGCTCTTACAGAAC
TTACCAAAGTTGGAATCAGGGTTTGTAGCCAGAGCATCTAGTGGATCCATGTCTTTCAGA
GCAAGAAACTGAGGGAAGAAGGTGTCAGTGTCATCCGAGTCTAATGAGAAAGTTTCCTGC
TGAAACCCACTGAACATCCTCTGGCATATGTATGATTCAAACGCATATTTCTTGTGAG
CAGATTGAAGCTG

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1E110JQ 870 0 0
GGTTGGGAGAATAAATATATCGTTTGCTTATGAGTTCTGAACAATTACATGCAAGCTTAC
TGAAAAATACAATTTATAACAAGCAGAAAAAATAAAAGTTGCACAACAAAGTGGGAAGCT
TTAGGACAAGACCAGAATCTCCTTCATTCAACGAGCTTAACACCTGAGACATAAACTCGG
CTCTGAATCACACTTCCACCAATCCAAAACCCAGGCATCACCATAAGACCAACACTTGGG
CTCTCTCCCTTTTCATCCACAACTATGTTCTTCAAAACACTTTCCATGTACGAATCAGAA
AACTCACTACCCTTTTTCACTTGAAAGATCTTTGCAGCTGGGTCAAACGAGTAAGCCAGC
CTGTGCAATAACCATATAGACTTTGCTAGTTTCAAGAAGGCCTGGTAAAACGCGGTCCTC
GGGTGGCCACCTCCTGCCACGTAGTCGCGCTGGT**AGGTTTCCAAAGAAAGAAGCTTCC
ATCTTTGGGTGGATCAAGATGAGATACTTGCTCTTACAGAACTTACCAAAGTTGGAATCA
GGGTTTGTAGCCAGAGCATCTAGTGGATCCATGTCATTCAGAGCAAGAAACTGAGGGAAG
AAGGTGTCAGTGTCATCCGAGTCTAATGAGAAAGTTTCCTGCTGAAACCCACTGAACATC
CTCTGGCATATGTATGATTCAAACGCATATTTCTTGTGAGGCCTCTTGGCGTAAGCAACA
TGAG*CTCAATGGAATCAGCTGCAGAATCAAGATCCCATTCCGCAGCTTTCATCATGTTG
ATCAACGGCTTTGAGAAATCATGAACAGCTTTAGAAGCAGCTTCATAGGTAGATACAAAA
*GCTCAATGGTCA
GTCAGAAACTGCAATCA

QA 1 853 1 853
DS 

RD RS1F173TF 648 0 0
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ATAGACTTTGCTAGTTTCAAGAAGGCCTGGTAAAACGCGGTCGGGGGGTGGCCACCTCCT
GCCACGTAGTCACGCTGGTCTAGGTTTCCAAAGAAAGAAGCTTCCATCTTTGGGTGGATC
AAGATGAGATACTTGCTCTTACAGAACTTACCAAAGTTGGAATCAGGGTTTGTAGCCAGA
GCATCTAGTGGATCCATGTCTTTCAGAGCAAGAAACTGAGGGAAGAAGGTGTCAGTGTCA
TCCGAGTCTAATGAGAAAGTTTCCTGCTGAAACCCACTGAACATCCTCTGGCATATGTAT
GATTCAAACGCATATTTCTTGTGAGGCCTCTTGGCGTAAGCAACATGAGGCTCAATGGAA
TCAGCTGCAGAATCAAGATCCCATCCCGCAGCTTTCATCATGTTGATCAACGGCTTTGAG
AAATCATGAACAGCTTTAGAAGCAGCTTCATAGGTAGATACAAAAAGCTCAATGGTCAAG
TCAGGAAACTGCAAATCACCAGAAGATTCATTAGTGGACGACGACATTCCTCTTAGCTTA
AGATTCTTCTCGAGCTTGAGACGTTTCTGATTAGCTTCCTCGATCTTC

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 5

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AAAATCATGTCGAACTTGCAACAATCTTACAATGCTGGGCAGACCAGGGGCCAAACTAAA
GAGAAGGCCGAGCAATGGACTGAATCAGCCAAGGAAACTGCACACAACGCTTGCGACAAG
ACTGCTAACGCAGCTCAGTCCACCAAAGAATCTGCCCAACACGGGCAACAACAAGCCTCT
GGTTTCATCCAACAAACTGGAGAGTCAGTGAAGAATATGGCTCAGGGTGCGGTTGATGGT
GTCAAGAACACTCTTGGAATGAATGAGAAGAAGAAATGAGAAATCAATACATTTCTCATG
TTATATTTTTCAATTTATTTGGAGCTCTCTCTAAAGTTCGAACAATTCTTGCTTTTCTAA
TTAATTTTGTAATAAAATTTTGAATTTTTTTTTCCAAAGATCTTGTAATAAGACATGCAT
AAGTAATAAAATGGTGCGAGTTACCCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 10 10 

AF RS1EP42TF U 1
AF RS1GO90TF U 5
AF RS1B441JQ C 12
AF RS1DK01TF U 12
AF RS1B441TF U 12
BS 1 40 RS1EP42TF
BS 41 41 RS1GO90TF
BS 42 84 RS1EP42TF
BS 85 85 RS1GO90TF
BS 86 114 RS1EP42TF
BS 115 115 RS1B441TF
BS 116 301 RS1EP42TF
BS 302 302 RS1GO90TF
BS 303 351 RS1EP42TF
BS 352 352 RS1GO90TF
BS 353 384 RS1EP42TF
BS 385 385 RS1GO90TF
BS 386 459 RS1EP42TF
BS 460 460 RS1GO90TF
BS 461 508 RS1EP42TF

RD RS1EP42TF 508 0 0
GGAATCAATCAATCAAAGCTCATTTATCATCCAAAAAAAA*GAACTACACTTCTTATAAT
AAAATCATGTCGAACTTGCAACAACCTTACAATGCTGGGCAGACCAGGGGCCAAGCTAAA
GAGAAGGCCGAGCAATGGACTGAATCAGCCAAGGAAACTGCACACAACGCTTGCGACAAG
ACTGCTAACGCAGCTCAGTCCACCAAAGAATCTGCCCAACACGGGCAACAACAAGCCTCT
GGTTTCATCCAACAAACTGGAGAGTCAGTGAAGAATATGGCTCAGGGTGCGGTTGATGGT
GCCAAGAACACTCTTGGAATGAATGAGAAGAAGAAATGAGAAATCAATACACTTCTCATG
TTATATTTTTCAATTTATTTGGAGTTCTCTCTAAAGTTCGAACAATTCTTGCTTTTCTAA
TTAATTTTGTAATAAAATTTTGAATTTTTTTTTCCAAAGGTCTTGTAATAAGACATGCAT
AAGTAATAAAATGGTGCGAGTTACCCAT

QA 1 508 1 508
DS 

RD RS1GO90TF 504 0 0
GGAATCA
ATCAAAGCTCATTTATCATCCAAAAAAAAAGAACTACACTTCTTATAATAAAATCATGTC
GAACTTGCAACAATCTTACAATGCTGGGCAGACCAGGGGCCAAGCTAAAGAGAAGGCCGA
GCAATGGACTGAATCAGCCAAGGAAACTGCACACAACGCTTGCGACAAGACTGCTAACAC
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ACAAACTGGAGAGTCAGTGAAGAATATGGCTCAGG*TGCGGTTGATGGTGTCAAGAACAC
TCTTGGAATGAATGAGAAGAAGAAATGAGAAATCAATACATTTCTCATGTTATATTTTTC
AATTTATTTGGAGCTCTCTCTAAAGTTCGAACAATTCTTGCTTTTCTAATTAATTTTGTA
ATAAAATTTTGAATTTTTTTTTCCAAAGATCTT**AATAAGACATGCATAAGTAATAAAA
TGGTGCGAGTTACCC
AT

QA 8 502 8 502
DS 

RD RS1B441JQ 495 0 0
ATCAAAGCTCATTTATCATCCAAAAAAAAAGAACTACACTTCTTATAATAAAATCATGTC
GAACTTGCAACAATCTTACAATGCTGGGCAGACCAGGGGCCAAACTAAAGAGAAGGCCGA
GCAATGGACTGAATCAGCCAAGGAAACTGCACACAACGCTTGCGACAAGACTGCTAACGC
AGCTCAGTCCACCAAAGAATCTGCCCAACACGGGCAACAACAAGCCTCTGGTTTCATCCA
ACAAACTGGAGAGTCAGTGAAGAATATGGCTCAGGGTGCGGTTGATGGTGTCAAGAACAC
TCTTGGAATGAATGAGAAGAAGAAATGAGAAATCAATACATTTCTCATGTTATATTTTTC
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ATAAAATTTTGAATTTTTTTTTCCAAAGATCTTGTAATAAGACATGCATAAGTAATAAAA
TGGTGCGAGTTACCC

QA 1 495 1 495
DS 

RD RS1DK01TF 494 0 0
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GAACTTGCAACAATCTTACAATGCTGGGCAGACCAGGGGCCAAGCTAAAGAGAAGGCCGA
GCAATGGACTGAATCAGCCAATGAAACTGCACACAACGCTTGCGACAAGACTGCTAACGC
AGCTCAGTCCACCAAAGAATCTGCCCAACACGGGCAACAACAAGCCTCTGGTTTCATCCA
ACAAACTGGAGAGTCAGTGAAGAATATGGCTCAGGGTGCGGTTGATGGTGTCAAGAACAC
TCTTGGAATGAATGAGAAGAAGAAATGAGAAATCAATACATTTCTCATGTTATATTTTTC
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ATAAAATTTTGAATTTTTTTTTCCAAAGATCTTGTAATAAGACGTGCATAAGTAATAAAA
TGGTGCGAGTTACC

QA 1 494 1 494
DS 

RD RS1B441TF 495 0 0
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GAACTTGCAACAATCTTACAATGCTGGGCAGACCAGGGGCCAAACTAAAGAGAAGGCCGA
GCAATGGACTGAATCAGCCAAGGAAACTGCACACAACGCTTGCGACAAGACTGCTAACGC
AGCTCAGTCCACCAAAGAATCTGCCCAACACGGGCAACAACAAGCCTCTGGTTTCATCCA
ACAAACTGGAGAGTCAGTGAAGAATATGGCTCAGGGTGCGGTTGATGGTGTCAAGAACAC
TCTTGGAATGAATGAGAAGAAGAAATGAGAAATCAATACATTTCTCATGTTATATTTTTC
AATTTATTTGGAGCTCTCTCTAAAGTTCGAACAATTCTTGCTTTTCTAATTAATTTTGTA
ATAAAATTTTGAATTTTTTTTTCCAAAGATCTTGTAATAAGACATGCATAAGTAATAAAA
TGGTGCGAGTTACCC

QA 1 495 1 495
DS 



AS 1 3

CO CL1598Contig1 1084 3 4 U
GCCATTTCGTCGTCCAGTGGCGACAACCGTCTTTTTGATTGATGAATGAAGAGGAAAAAG
TTACATGAAAACAGGATGCAAAAACAATTTCATAATATAAAGGTATATAAATTAATTTCT
AATAAACTGATTTGACTAATCGAGAGGTAACTCTGTTAAACATAGAGGAGAGTACACATT
TGATTTAGCAGAGGTTGATATCAACTCGAGGATGAAACTCTCGTGGTTGCATTTAACTAT
TTGTTAACGTCTTTGGTAGTGTGACGTGAGGTTGTTGCCTCTGATTTACTGCCTTTCGCC
ATCATCTTCTTCCTCTTCTTCTACATAGAACGAATCTGTCAACCTGATGACCTCAGTTCC
TTCACCTACCAAAACTCACTGTAATGTACTCTTCTGTGTTCGTTGAAACGTGCGTTTTTC
TCACCATCCCCATCTTCATCATCTTGATCCATTGGATCTACTTCATCCTTCTCCTAAGAC
GAGCTCCAGCCACCAGAACCAGACCCCAGGTTAGTATGTCTACTAGACAAGGCAGCCGCT
GGCTGGTTGAGAACGATTCTCAGTTCTGCCGCACGTTGCATATCATGAAATTGGATTCAT
CATCTTCACCTCTATTGGTTCCACTAGACTAAAACACACAGTAACACCAAACACACACAC
ACACACACTTGGACGTGAAAAGCTTATAATACCAGTTTCATGTTGTACTGCTGCATACTC
TTGGCATACTCACTCTTCCTGCCCTCTGCCTTGGAAGCGTAAGGTGCTTTCTCTTCCTCA
GTCATTGACTCCCATTTAGCTCCACCAGCCTTACCAACTTGGTATTAGGGTTCACCTCGT
TGAACTCCCGTCGGAAATCATCAAGGAAGACGAAGAAGGCGCTTGGAGGTCTCTTCGGTT
TGTTTGGGTCCTTCGTTGTCGTCTTCGTCTTCTTCTTCCTTCCTCTGGTTTTGAGTCTCT
GATTGGTGCTCGTCGCTTCGAATTTGGTTTCACCACAATTCATTTGAGTTTTGAGTCAGG
GTAGAGAATAGGGTGACTCGGGCTGAGTCGGTAGGAGCGTCTTGTTTACCTTGGAGGCGT
TCCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1AT47JQ U 2
AF RS1C326JQ U 1
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G
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GTTAACGTCTTTGGTAGTGTGACGTGAGGTTGTTGCCTCTGATTTACTGCCTTTCGCCAT
CATCTTCTTCCTCTTCTTCTACATAGAACGACTCTGTCAACCTGATGACCTCAGTTCCTT
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CTGGTTGA
AAA

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DS 

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AATAAACTGATTTGACTAATCGAGAGGTAACTCTGTTAAACATAGAGGAGAGTACACATT
TGATTTAGCAGAGGTTGATATCAACTCGAGGATGAAACTCTCGTGGTTGCATTTAACTAT
TTGTTAACGTCTTTGGTAGTGTGACGTGAGGTTGTTGCCTCTGATTTACTGCCTTTCGCC
ATCATCTTCTTCCTCTTCTTCTACATAGAACGAATCTGTCAACCTGATGACCTCAGTTCC
TTCACCTACCAAAACTCACTGTAATGTACTCTTCTGTGTTCGTTGAACCGTGCGTTTTTC
TCACCATCCCCATCTTCATCATCTTGATCCATTGGATCTACTTCATCCTTCTCCTAAGAC
GAGCTCCAGCCACCAGAACCAGACCCCAGGTTAGTATGTCTACTAGACAAGGCAGCCGCT
GGCTGGTTGAGAACGATTCTCAGTTCTGCCGCACGTTGCATATCATGAAATTGGATTCAT
CATCTTCACCTCTATTGGTTCCACTAGACTAAAACACACAGTAACACCAAACACACACAC
ACACACACTTGGACGTGAAAAGCTTATAATACCAGTTTCATGTTGTACTGCTGCATACTC
TTGGCATACTCACTCTTCCTGCCCTCTGCCTTGGAAGCG

QA 1 759 1 759
DS 

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TTTTTCTCACCATCCCCATCTTCATCATCTTGATCCATTGGATCTACTTCATCCTTCTCC
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GCCGCTGGCTGGTTGAGAACGATTCTCAGTTCTGCCGCACGTTGCATATCATGAAATTGG
ATTCATCATCTTCACCTCTATTGGTTCCACTAGACTAAAACACACAGTAACACCAAACAC
ACACACACACACACTTGGACGTGAAAAGCTTATAATACCAGTTTCATGTTGTACTGCTGC
ATACTCTTGGCATACTCACTCTTCCTGCCCTCTGCCTTGGAAGCGTAAGGTGCTTTCTCT
TCCTCAGTCATTGACTCCCATTTAGCTCCACCAGCCTTACCAACTTGGTATTAGGGTTCA
CCTCGTTGAACTCCCGTCGGAAATCATCAAGGAAGACGAAGAAGGCGCTTGGAGGTCTCT
TCGGTTTGTTTGGGTCCTTCGTTGTCGTCTTCGTCTTCTTCTTCCTTCCTCTGGTTTTGA
GTCTCTGATTGGTGCTCGTCGCTTCGAATTTGGTTTCACCACAATTCATTTGAGTTTTGA
GTCAGGGTAGAGAATAGGGTGACTCGGGCTGAGTCGGTAGGAGCGTCTTGTTTACCTTGG
AGGCGTTCCC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 3

CO CL1599Contig1 898 3 6 U
CTTCAGTAACTTTTCTGAGCTTCCGGTTGGTTCAGTTTGTGTCTCAAACATTCAGTTTAA
GGGTAAAGGTAAAAAGTTTGTTGGATTAGCTCTAAAAATAAAAGAAAATAGAATGTGTTA
ATTTTCGGACATATGATCGCAGGCAGAACAAAGAATGTCTGGGAATCCCCAAAGGGCTGT
CTGATGTATTCCTTTACGTTAGAAATGGAAGATGGTAGAATCGTGCCTTTGATTCAATAT
GTTGTTTCTCTTGCTGTTACCGAGGCAGTGAAAGATGTTTGTGACAACAAGGTAATAAAT
CTCTCTCTTACTTTCCTCCCTTCTTTGCATCAAAAACAAAAAGCTCTCACTTTTTTTTTT
TTGATATTAATTGCAGGGTTTGCCGTATATAGACGTTAAAATAAAGTGGCCCAATGATCT
TTACTTGAATGGCCTTAAACTCGGAGGCATTTTGTGTACCTCTACCTACAGATCTAGAAA
ATTTCACGTTAGTGTTGGTAATACCCATTAATTACTCTACTTTACAAGTTTGGCGTTGAC
TTGTTTGCTTCCAAGAAAATGGCTAAACTGATCCTTTTTTTTTTAATTGCAGGTGTGGGA
TTGAATGTGGACAACGATCAACCCACCACATGCTTAAACGCTGTACTAAAAGAGATATCT
CCTGCTGCATCAATTCTACTTAAAAGAGAAGAAATTATAGCTGCCTTCTTTCATAAATTC
GAGAAATTCTTTGATCTTTTCTTGGACCAAGGTAAATGTTAAACCTCTTATCTAGGAGAC
TGCTTAAAGATTCATCACTCAGTTGTTGATTTAATCTTATTATCAAGCCTGAAGCCTCAT
GTAGTCATCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GGGTAAAGGTAAAAAGTTTGTTGGATTAGCTCTAAAAATAAAAGAAAATAGAATGTGTTA
ATTTTCGGACATATGATCGCAGGCAGAACAAAGAATGTCTGGGAATCCCCAAAGGGCTGT
CTGATGTATTCCTTTACGTTAGAAATGGAAAATGGTAAAATCGTGCCTTTGATTCAATAT
GTTGTTTCTCTTGCTGTTACCGAGGCAGTGAAAGATGTTTGTGACAACAAGGTAATAAAT
CTCTCTCTTACTTTCCTCCCTTCTTTGCATCAAAAACAAAAAGCTCTCACTTTTTTTTTT
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DS 



AS 1 4

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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GCTTCTTGTATCATCATCACCATCACCCGATTGTATACTGTGTTTTCTTCTACTAGATCG
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TTTAT

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TCATTCACTTTAAGCTGACCCGCTTCAGAAACCTTTTTATCAACGTCTGGAATATTTCCT
TCTTCACCATCGAACCGAGCCTTTGGATTACTTGAAGCTTCAGGTTTTTCAATCTTTGCT
TTACCACTCGGTTTAACATACGGAGGTGGGGGAAGGGATTTGTACAAGGGTGACTTCATC
ATTCTCTCTGTTTCTCGCTCCTCAAACTTACTTGCTGGATCATGTTCATCTCCACCAACC
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CTACTATCTTGATCGCTGCGATGTCTACGGACTGAATCTATAGG
C

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DS 

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CATTCACTTTAAGCTGACCCGCTTCAGAAACCTTTTTATCAACGTCTGGAATATTTCCTT
CTTCACCATCGAACCGAGCCTTTGGATTACTTGAAGCTTCAGGTCTTTCAATCTTTGCTT
TACCACTCGGTTTAACATACGGAGGTGGGGGAAGGGATTTGTACAAGGGTGACTTCATCA
TTCTCTCTGTTTCTCGCTCCTCAAACTTACTTGCTGGATCATGTTCATCTCCACCAACCT
TGATGTTACAACCAGATGAACCATTTCCTGTGCCTTCTCCCACAGGAACTGCATTTTCTC
TACTATCTTGATCGCTGCGATGTCTACGGACTGAATCTATAGGTACTGTTCTTTTCGACC
TTGGCTTTGGAGGCATTGAGAGGT*ATCTTCCACTTTCTGAG
CGC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RS1CJ65JQ 808 0 0
TCTTTGCTTTACCACTCGGTTTAACATACGGAGGTGGGGGAAGGGATTTGTACAAGGGTG
ACTTCATCATTCTCTCTGTTTCTCGCTCCTCAAACTTACTTGCTGGATCATGTTCATCTC
CACCAACCTTGATGTTACAACCAGATGAACCATTTCCTGTGCCTTCTCCCACAGGAACTG
CATTTTCTCTACTATCTTGATCGCTGCGATGTCTACGGACTGAATCTATAGGTACTGTTC
TTTTCGACCTTGGCTTTGGAGGCATTGAGAGGTTATCTTCCACTTTCTGAGGCGCATGCT
CTTCGCCGTTCTCATGTTTGTATCCTTTGAAGAAACTTTCTTGCTTAAAGCCAAGAACTA
GCTTGTCCTCTGTTTTGGTGCTGCTACGCTTGGGTTTTTCTGACACCTCTTTTTTCTTAG
GCGCAGCAGCAGCTTCACCGTTTTGATGTCCAATCCCTTGAACGAGATTCTCACGTTTGA
TCTTCATCACTATAGTGTCACCTTCGTTAAAAATAGGTTGAGGTCTTCCTCTGGAAGGTT
GCTGTTTAGGTTGCAAATGGAACTCATTTCTTTCCGCCTTATCATCCTTGCTTCCCGATC
TGGAGGCGTGACGAACATCATCTGGCTTATCTTTAGATGTTACCCCATGCTGATGTTCTC
TGACACCGTTATGATAATTATCTGGTCGAAACAAAGGATCTCTTCTTTCTGATGCAACAT
CCTTTTTCCTTTCTGGTGGCAAGGCCATGTTTACGTCTACAGGCTTGTGCTTGTCGTAAG
TACTTTTTGGTGTCTCCTGCACATATCC

QA 1 808 1 808
DS 



AS 1 4

CO CL1601Contig1 860 4 11 U
AATTTAACGCCTGTAACATATAAACTGGAGTACCTTCTGACCAGCTCATTTAGGAATTCT
AATCAAATATTGTACTTAATACATATTAAGTCAACAGCACACGAAGGTCCTAAAATAAAA
TCATTTATTCTTGATTAAGGTAGTGGGTTTTGCAACCAACCTAATGGTTGATATGATAAG
CCTCTTATTTGTTCTGACATTTTTCCGAATCTAAACCCTTCCTGGATGAGATTTGATGGT
GCTCTAGAGTGCTGCAATACATTCAATCTCAATCTTGGCGTTTAGTGGCAAAGCTGCGAC
TTGATATGTTGATCTTGCTGGAGAAGGAGCTGGGAAGTATTTGGCGTAAATCTCGTTCAC
TTTCTTGAAGTCGCCTAAGTCAGCAAGCATGATGGTTGTCTTCACCACGGAGGCGTAATC
AACACCACTAGCTTTTAGTATCTCACCCATGTTCTTGAGGACCTGTTCAGTCTGATCTTC
AACGTCGTCCGAAACAAACTTTCCAGTCTCAGGTATAAGACCAAGAACACCGGAGACGAA
AACGAGATTGTTGGCTTTGATGGCCTGAGAGTATGGTCCCAAAGCAGCTGGTGCTTTCTC
TGTAGCCACTACTTCCTTCTTACCAGAAGCAGCAGAAGCTGAGACAGTGAGAGAAGCGAA
CGGAGGAGATCTCGAAGACATTCGGAGGAGAGAAACACCAGCGAGTGTTGTTGCGCAGCC
TGCACCTGCGGCGAACAATGGGCTACGAGTGGAGGAGCGAAGTGCGGCGGAGATGTCGAG
AGTTTGAGGGTTTATGGATCTGAAGACCGACCAAGTCATTTCACTCTCTCTCTCCCCGGC
GCTGTCGAGAGGTACAAAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H710JQB U 1
AF RS1H710TF C 1
AF RS1FF59JQ U 59
AF RS1FF59TF C 188
BS 1 206 RS1H710JQB
BS 207 207 RS1FF59JQ
BS 208 229 RS1H710JQB
BS 230 230 RS1FF59JQ
BS 231 239 RS1H710JQB
BS 240 240 RS1FF59JQ
BS 241 246 RS1H710JQB
BS 247 247 RS1FF59JQ
BS 248 309 RS1H710JQB
BS 310 632 RS1FF59JQ
BS 633 860 RS1FF59TF

RD RS1H710JQB 309 0 0
AATTTAACGCCTGTAACATATAAACTGGAGTACCTTCTGACCAGCTCATTTAGGAATTCT
AATCAAATATTGTACTTAATACATATTAAGTCAACAGCACACGAAGGTCCTAAAATAAAA
TCATTTATTCTTGATTAAGGTAGTGGGTTTTGCAACCAACCTAATGGTTGATATGATAAG
CCTCTTATTTGTTCTGACATTTTTCCAAATCTAAACCCTTCCTGGATGAAATTTGATGGG
GCTCTAAAGTGCTGCAATACATTCAATCTCAATCTTGGCGTTTAGTGGCAAAGCTGCGAC
TTGATATGT

QA 1 309 1 309
DS 

RD RS1H710TF 440 0 0
AATTTAACGCCTGTAACATATAAACTGGAGTACCTTCTGACCAGCTCATTTAGGAATTCT
AATCAAATATTGTACTTAATACATATTAAGTCAACAGCACACGAAGGTCCTAAAATAAAA
TCATTTATTCTTGATTAAGGTAGTGGGTTTTGCAACCAACCTAATGGTTGATATGATAAG
CCTCTTATTTGTTCTGACATTTTTCCGAATCTAAACCCTTCCTGGATGAGATTTGATGGT
GCTCTAGAGTGCTGCAATACATTCAATCTCAATCTTGGCGTTTAGTGGCAAAGCTGCGAC
TTGATATGTCGATCTTGCTGGAGAAGGAGCTGGGAAGTATTTGGCGTAAATCTCGTTCAC
TTTCTTGAAGTCGCCTAAGTCAGCAAGCATGATGGTTGTCTTCACCACGGAGGCGTAATC
AACACCACTAGCTTTTAGT
C

QA 1 439 1 439
DS 

RD RS1FF59JQ 574 0 0
CTAATCAAATATTGTACTTAATACATATTAAGTCAACAGCACACGAAGGTCCTAAAATAA
AATCATTTATTCTTGATTAAGGTAGTGGGTTTTGCAACCAACCTAATGGTTGATATGATA
AGCCTCTTATTTGTTCTGACATTTTTCCGAATCTAAACCCTTCCTGGATGAGATTTGATG
GTGCTCTAGAGTGCTGCAATACATTCAATCTCAATCTTGGCGTTTAGTGGCAAAGCTGCG
ACTTGATATGTTGATCTTGCTGGAGAAGGAGCTGGGAAGTATTTGGCGTAAATCTCGTTC
ACTTTCTTGAAGTCGCCTAAGTCAGCAAGCATGATGGTTGTCTTCACCACGGAGGCGTAA
TCAACACCACTAGCTTTTAGTATCTCACCCATGTTCTTGAGGACCTGTTCAGTCTGATCT
TCAACGTCGTCCGAAACAAACTTTCCAGTCTCAGGTATAAGACCAAGAACACCGGAGACG
AAAACGAGATTGTTGGCTTTGATGGCCTGAGAGTATGGTCCCAAAGCAGCTGGTGCTTTC
TCTGTAGCCACTACTTCCTTCTTACCAGAAGCAG

QA 1 574 1 574
DS 

RD RS1FF59TF 673 0 0
TATTTGTCTGACA
TTTTCCGAATCTAAACCCTTCCTGGATGAGATTTGATGGTGCTCTAGAGTGCTGCAATAC
ATTCAATCTCAATCTTGGCGTTTAGTGGCAAAGCTGCGACTTGATATGTTGATCTTGCTG
GAGAAGGAGCTGGGAAGTATTTGGCGTAAATCTCGTTCACTTTCTTGAAGTCGCCTAAGT
CAGCAAGCATGATGGTTGTCTTCACCACGGAGGCGTAATCAACACCACTAGCTTTTAGTA
TCTCACCCATGTTCTTGAGGACCTGTTCAGTCTGATCTTCAACGTCGTCCGAAACAAACT
TTCCAGTCTCAGGTATAAGACCAAGAACACCGGAGACGAAAACGAGATTGTTGGCTTTGA
TGGCCTGAGAGTATGGTCCCAAAGCAGCTGGTGCTTTCTCTGTAGCCACTACTTCCTTCT
TACCAGAAGCAGCAGAAGCTGAGACAGTGAGAGAAGCGAACGGAGGAGATCTCGAAGACA
TTCGGAGGAGAGAAACACCAGCGAGTGTTGTTGCGCAGCCTGCACCTGCGGCGAACAATG
GGCTACGAGTGGAGGAGCGAAGTGCGGCGGAGATGTCGAGAGTTTGAGGGTTTATGGATC
TGAAGACCGACCAAGTCATTTCACTCTCTCTCTCCCCGGCGCTGTCGAGAGGTACAAAAA

QA 14 673 14 673
DS 



AS 1 5

CO CL1602Contig1 1478 5 24 U
GGGATTCAAAAGCAAAATCTACATAGAGAGAAAGAAGTAAGTAATGGCAACCACCCCCAA
GTGCACTGAGTGGCAGTTCAGCGGTAGCGAGGCAGCCAAAGAAGCTGCTGCGGCCGCCCT
AGGTGCCTACACCTCTAAACTCATGGCTCTTTGTGATCCTAGTGGCAAGCCCATTTTGCC
CCCAAACAAAAAGGCCATAGAGACCAGCAATTCAGCCGAAAAAGCTGTCGTTAAAGTTGT
TCTCTCCGGCACTGGAAACGCCTATGCTCCTAGCATTGGCCATCCCGTCGCAAAAAGTGC
CGTAGCAGAGTATCTAAACCGAGATCTTCCGAAGAAGCTAACAGCAGATGACGTGTTTAT
GACTGTTGGATGCAAACGAGCGATTGACCTTGCGGTCGATATTCTTGCTAAACCAAAAGC
CAACGTTCTGCTTCCGAGGCCAGGCTTCCCATGGGATGTAGTACGCTCCATCTACAAGAA
GCTCGAGGTCCGTTACTATGATTTTATCCCTGAACAAAACTTTGAGATCGACTTCGAAAG
CGTCAAAAAGGTGACAGACAAGAACACGTTTGCTATATTTATCATCAACCCTCACAATCC
CAATGGAAACACCTACTCGGAGGCTCATCTCAAACAGCTCGCTGAATTGGCTAAGGAACT
CTCCATTATGGTGGTTTCTGATGAAGTTTTTAGATGGACCGTCTTCGGGAATAACCCTTT
TGTTCCGATGGGAAAGTTTTCTTCCATTGTACCAGTGGTTACACTCGGATCCTTATCTAA
GGGATGGAATATACCAGGATGGCGAACTGGCTGGCTCGCGCTGCACGATCTAGACGGTGT
CTTCAGAAACACTAAGATATTAGAAGCTGCCAACGAATTTCTCCAGATAAATGCCAAACC
TCCGACTGTTATTCAGGCGGCTATGCCTGACATTTTGGAGAGAACTCCAAAACATTTCTT
CCTTGAGAGGGGAAGTTTTCTGAAACATAAAGTTGATATTGGATACGCTAAGCTCAAGCA
CATACCTGGCCTCACTTGTTACATGAAACCCGAAGCGTGCACCTTTTTATGGACCAAGCT
GGATATATCGTGCTTTGCTGACATTGGAGACGATCAAGAGTTCTGCAGCAAGCTTGCTAT
GGAAGAAAATCTCGTCGTTTTGCCAGGGATTGCATTTAGACAGCCGAACTGGTTGAGGCA
TTCTATCGACATGGAGACGCCAACAGTTGAGGACGCATTTGAAAGATTGAAGAGCTTCTG
TGAACGCCATTCCACAAAAGGTGGAGCTTCACTCAAAAACGCCAATGGCGTCAACTAAAG
GGTCAAGATGATATGATCCTTGTCCAAGTCTATCAATGATAATAAATGGGTGTTTTTGGT
AATGTGAGATAAATCATGAACACTTTCGTAGTTGTAATAAATAAAATTGGTGTACTTATC
ATCAATCGTAGAATGTTTTCTCATGATGTATCATCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
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G
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CT

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G
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QA 1 758 1 758
DS 

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ATCATCAATCGTAGAATGTTTTCTCATGATGTATCATCTAC

QA 1 701 1 701
DS 



AS 2 4

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GC76TF U 1
AF RS1GC76JQ C 465
BS 1 734 RS1GC76TF
BS 735 735 RS1GC76JQ
BS 736 757 RS1GC76TF
BS 758 758 RS1GC76JQ
BS 759 785 RS1GC76TF
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BS 795 820 RS1GC76TF
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BS 826 826 RS1GC76JQ
BS 827 850 RS1GC76TF
BS 851 1135 RS1GC76JQ

RD RS1GC76TF 850 0 0
GGGTGATGTTTTCAGGATTCCAACCAATTCTGATCTCCTCTGCGTCTACGTTGGCACAGG
GGTCCAATGTTTAGGCATGGTTTTTGTCACAATGATCTTCGCCATGCTTGGGTTTCTCTC
CCCTCCGAACCGGGGTGGTCTGATGACGGCCATGCTTCTGCTCTGGGTCTTCATGGGACT
CTTTGCTGGTTACGCTTCCTCACGTCTCTACAAAATGTTCAAAGGAACAGAGTGGAAGAG
AATCGCCTTCAGAACAGCCTTCTTGTTCCCTGCAGTTGTCTCCTCCATTTTCTTTGTCCT
AAACGCTCTCATCTGGGGACAAAAGTCGTCTGGTGCTGTCCCCTTTGGAACAATGTTCGC
CTTGATCTTCCTCTGGTTTGGCATCTCCGTTCCTCTCGTCTTTGTTGGAGCTTACCTCGG
TTTCAAAAAAACAGCGGTTGATGACCCAGTGAAAACCAACAAAATCCCAAGGCAAATCCC
AGAGCAAGCATGGTACATGAACCCGGTTTTCTCAATCCTCATTGGAGGAATCCTACCGTT
TGGTGCTGTCTTCATCGAGCTCTTCTTTATCCTCACATCCATCTGGCTCAACCAGTTCTA
CTACATCTTTGGTTTCCTCTTCCTTGTCTTTGTAATCCTCATCGTCACTTGCGCCGAGAT
AACCGTAGTACTCTGCTACTTCCAGCTCTGCAGTGAGGACTACCTCTGGTGGTGGAGATC
GTACCTAACATCAG*CTCGTCAGCTCTGTATCTATTC*TCTACGCGACCTTCTACTTCTT
CACAA*GCTTCAA*TCACAAAACTGGTGTCGGCGATGCTT*ACTT*GGGTACATGCTCAT
CGCGTCTTAC

QA 1 850 1 850
DS 

RD RS1GC76JQ 671 0 0
TCCCAAGGCAAATCCCAGAGCAAGCATGGTACATGAACCCGGTTTTCTCAATCCTCATTG
GAGGAATCCTACCGTTTGGTGCTGTCTTCATCGAGCTCTTCTTTATCCTCACATCCATCT
GGCTCAACCAGTTCTACTACATCTTTGGTTTCCTCTTCCTTGTCTTTGTAATCCTCATCG
TCACTTGCGCCGAGATAACCGTAGTACTCTGCTACTTCCAGCTCTGCAGTGAGGACTACC
TCTGGTGGTGGAGATCGTACCTAACATCAGGCTCGTCAGCTCTGTATCTATTCCTCTACG
CGACCTTCTACTTCTTCACAAAGCTTCAAATCACAAAACTGGTGTCGGCGATGCTTTACT
TTGGGTACATGCTCATCGCGTCTTACGCATTTTTTGTGCTCACAGGGACAATAGGGTTCT
ATGCTTGTCTCTGGTTCACAAGGCTCATCTATTCCTCTGTTAAGATCGATTAGAGGAGTG
TGAATGACAGGTTAAAGGAACAAAGAAGGAAAGGTGATTATTGTTTTATCTTCTTTAAAA
ATGGTTTTGTTGCATTTTAGATATATTTTGTTGCAGAACAAGAGGGTTTAGTACAACATT
GTATTTTGTTTGATTTGTCTAATAACTCACGTTTTGATAATCTTTGCATGTGGAGTATGT
TATATAATATA

QA 1 671 1 671
DS 



CO CL1603Contig2 731 2 8 U
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TCCAGTGTTTAGGCATGGTATTTGTCACAATGATCTTCGCCATGCTCGGGCTTCTCTCCC
CTTCGAACCGTGGTGGTCTGATGACGGCCATGCTTCTTCTCTGGGTCTTCATGGGACTCT
TTGCTGGTTACGCTTCTTCACGTCTCTACAAAATGTTCAAAGGAACAGAGTGGAAGAGAA
TCGCCTTCAGAACAGCCTTCTTGTTCCCTGCGGTTGTCTCAGCCATCTTCTTTGTCCTAA
ACGCTCTCATCTGGGGACAGAAGTCATCCGGGGCTGTCCCATTCGGAACAACGTTCGCAT
TGATCTTCCTCTGGTTTGGCATCTCAGTTCCTCTCGTCTTTGTTGGAGCTTACCTGGGTT
CCAAGAAACCAGCGGTTGATGACCCAGTGAAAACCAACAAAATCCCAAGGCAAATCCCAG
AGCAAGCTTGGTACATGAACCCGGTTTTCCCAATCCTCATTGGAGGAATCCTACCTTTTG
GTGCAGTCTTCATCGAGCTCTTCTTCATCCTCACATCCATCTGGCTCAACCAGTTCTACT
ACATCTTCGGGTTCCTCTTCCTCGTCTTTGTGATCCTCATCGTTACTTGCGCTGAGATAA
CCGTAGTACTCTGCTACTTCCAGCTCTGCAGTGAGGACTACCTTTGGTGGTGGAGATCTT
ACCTAACATCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H748TF U 1
AF RS1CC05TF U 53
BS 1 110 RS1H748TF
BS 111 111 RS1CC05TF
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BS 511 675 RS1H748TF
BS 676 731 RS1CC05TF

RD RS1H748TF 675 0 0
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TCCAGTGTTTAGGCATGGTATTTGTCACAATGATCTTCGCCATGCTCGGGTTTCTCTCCC
CTTCGAACCGTGGTGGTCTGATGACGGCCATGCTTCTTCTCTGGGTCTTCATGGGACTCT
TTGCTGGTTACGCTTCTTCACGTCTCTACAAAATGTTCAAAGGAACAGAGTGGAAGAGAA
TCGCCTTCAGAACAGCCTTCTTGTTCCCTGCGGTTGTCTCAGCCATCTTCTTTGTCCTAA
ACGCTCTCATCTGGGGACAGAAGTCATCCGGGGCTGTCCCATTCGGAGCAACGTTCGCAT
TGATCTTCCTCTGGTTTGGCATCTCAGTTCCTCTCGTCTTTGTTGGAGCTTACCTGGGTT
CCAAGAAACCAGCGGTTGATGACCCAGTGAAAACCAACAAAATCCCAAGGCAAATCCCAG
AGCAAGCTTGGTACATGAACCCGGTTTTCTCAATCCTCATTGGAGGAATCCTACCTTTTG
GTGCAGTCTTCATCGAGCTCTTCTTCATCCTCACATCCATCTGGCTCAACCAGTTCTACT
ACATCTTCGGGTTCCTCTTCCTCGTCTTTGTGATCCTCATCGTTACTTGCGCTGAGATAA
CCGTAGTACTCTGCT

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1CC05TF 679 0 0
G
ACAGGGGTCCAGTGTTTAGGCATGGTATTTGTCACAATGATCTTCGCCATGCTCGGGCTT
CTCTCCCCTTCGAACCGTGGTGGTCTGATGACGGCCATGCTTCTTCTCTGGGTCTTCATG
GGACTCTTTGCTGGTTACGCTTCTTCACGTCTCTACAAAATGTTCAAAGGAACAGAGTGG
AAGAGAATCGCCTTCAGAACAGCCTTCTTGTTCCCTGCGGTTGTCTCAGCCATCTTCTTT
GTCCTAAACGCTCTCATCTGGGGACAGAAGTCATCCGGGGCTGTCCCATTCGGAACAATG
TTCGCATTGATCTTCCTCTGGTTTGGCATCTCAGTTCCTCTCGTCTTTGTTGGAGCTTAC
CTGGGTTCCAAGAAACCAGCGGTTGATGACCCAGTGAAAACCAACAAAATCCCAAGGCAA
ATCCCAGAGCAAGCTTGGTACATGAACCCGGTTTTCCCAATCCTCATTGGAGGAATCCTA
CCTTTTGGTGCAGTCTTCATCGAGCTCTTCTTCATCCTCACATCCATCTGGCTCAACCAG
TTCTACTACATCTTCGGGTTCCTCTTCCTCGTCTTTGTGATCCTCATCGTTACTTGCGCT
GAGATAACCGTAGTACTCTGCTACTTCCAGCTCTGCAGTGAGGACTACCTTTGGTGGTGG
AGATCTTACCTAACATCA

QA 2 679 2 679
DS 



AS 1 4

CO CL1604Contig1 1296 4 20 U
CTGTTATAAGTTAATGCTTCTATAAAGAAAACGAACAGAGATTCCTTCTTCATTCTTTGT
ACAAAAGCGACAAATAGGAACAAACCCACCACCAAGTGATCCTCTTCATCTTTTGCAAAG
GTCACTCTCAACCTCTGTCCATCGTGTCACCAATAATCTAAAAGAACTAAAGAACCTTAA
CTTGAAAGAGAAAAAAGAAGAAAACTATTCCACTTCATCTTCATCCTAGGAATCTAAAAA
CTTTTCCACTTCACTCTCATTCGACCAAACCACTTATCACTGTCCTTCTTTTGCTTCCAC
AAATGGCGACTGCACACTATCAGCATCTGAATCACTTCCTGATGAACTCCCCGAGTCTGA
ATCACTAGAGGAAGATCCACCACTAGAACTGGAGCTGCCAGAAGAACTAGACCCACCACT
TGCAGCATTAGCAGCAGCGGCTGTACCATCCCTTTCAATCTCCACTGATGGATAGTCCTC
AATCGGTATATCTTCCCCGATGTCTACATCCTCTTCCCCTCCATCTCCTCCTTTCCTTAC
TCTCTTCTCAGCACTTCCCATTTCCATCACCGGAGGCATATTTCTTGTCGGAGTCGACAA
GTTCTGTATGAACCCTTGCCGCTTGATCTTGCTCGCCATCTTCTTGTAGTTAGTGACGAA
ACGATCAAGCTCCCACAGAGTCTCATTGTCAAGCTCCTCGATATCTAACTCGATCTCGTC
TCCGTCTTGAGGCAGATTCGTGGTTCTCTTCTTAAGAATCTGAATCAACTGCCCAAGCTT
CTCAGGAGGCAACTCCTGTAGATTCACACCGAGCTTAGCCTTCTCTTCCATCGTCATCTC
TCGCTTATTTGAATCCTTAGCCTTCGGCTTCGGTAACTTCCCTTTCCTTCCCTTAGACGT
CGCTTCTCCCACCTCAAGTGGTGCTTCCACTTGGTTAACCGGTTGGGGAGGTTGGGGAGG
AGGTGTTTCAACTTTGCTAACCGGCTGGGGAGGTGGTGGTGATGGTAACTTAGCCGGTGA
CGGGACACGTGGCAGCTCCATAACCGGAGGAGGCAATGTAGGTAAAGGCTTAAAAGAATC
AAGCTTTTTCGCTATCGAAATCTGTTCAGGTCCTTTCCTTGCATTATTCTCCGACACAAC
TCTTTGGCTGAGTTCAGACACTACTACAGGACGAGGAGGACGAGAAGACGATCCCTGCTG
CTGAGCCTCGAACCTCTTCAAAACCGGACCAAACCAAACATCGAACTGACTCAGAAGCTT
CTCAGCCATTTTATAAACGTCTTCCCCTTTCGGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CX18JQ U 1
AF RS1BC60JQ U 26
AF RS1EO05TF C 394
AF RS1BC60TF C 578
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C

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TAACTTAGCCGGTGACGGGACACGTGGCAGCTCCATAACCGGAGGAGGCAATGTAGGTAA
AGGCTTAAAAGAATCAAGCTTTTTCGCTATCGAAATCTGTTCAGGTCCTTTCCTTGCATT
ATTCTCCGACACAACTCTTTGGCTGAGTTCAGACACTACTACAGGACGAGGAGGACGAGA
AGACGATCCCTGCTGCTGAGCCTCGAACCTCTTCAAAACCGGACCAAACCAAACATCGAA
CTGACTCAGAAGCTTCTCAGCCATTTTATAAACGTCTTCCCCTTTCGGATC

QA 9 719 9 719
DS 



AS 1 5

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BQ
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AF RS1CL76TF U 71
AF RS1EH84TF U 1
AF RS1EH84JQ C 1
AF RS1F423TF U 1
AF RS1F423JQ C 1
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QA 1 134 1 134
DS 

RD RS1EH84TF 628 0 0
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QA 1 628 1 628
DS 

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ACATGTTTCCCTTCCCACTGAACTGTTGTTCTTAGGAAAAAATAGTTGGTCCTTGTCCTT
TTTTTTTGGTTCAGTGTTGAAGAACATCTTTTGATACATATAGAAGAGTTTTTAG

QA 1 775 1 775
DS 

RD RS1F423TF 750 0 0
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TCCGGAAACGATGTGCATAGGATCTCACTCCCTCGACAGGGCAACGTTGCATCTCTCCGT
CTTGAATCCCGCAAGTTGCGATGTACGAGGAAGTTTCCAGGAGAAACAGTGTCTGAAGAC
ACGTCAACAGGAGTCAATGACTTTGGTCTTGAGAAGAAGCCTGAAGTAGTGAAGCTCAAT
CTGAAGACGAGCAAACTCGAGCCTCCTTAGAGTTCTTCAACGATATCAAGCTGGACTCAG
ACAACACGTATTCGATCCTGCTCTACGGGTTTGGTGCGGTACTTGCTGTCTACTTGACTT
CTGCAATCGTTGGTTCTCTCGAATCAGTTCCTCTGTTACCTAAGCTGATGGAAGTGGTTG
GTCTCGGATACACACTCTGGTTCACTACACGTTACTTACTTTTTAAGAGTAACAGAGAAG
AACTCAAGACAAAGATTAGTGAAATCAAGAAGCAAGTTCTTGGCTCTGATAGTGATATTG
AGTAGTTCGTTTTTTTCTCTTGTTTTTGGCTTGTGTAGAATGAAAAAAGAAAAAA*GAAA
ACATGTTTCCCTTCCCACTGAACTGTTGTTCTTAG**AAAAATAGTTGGTCCTTGTCCTT
TTTTTTTGGTTCAGTGTTGAAGAACATCTT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RS1F423JQ 775 0 0
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TCCACAGTCAGCACCATCACTCACGTCCCTTCTTCTAGCACCAGGCGCCACGTATATCTA
TCCGGAAACGATGTGCATAGGATCTCACTCCCTCGACAGGGCAACGTTGCATCTCTCCGT
CTTGAATCCCGCAAGTTGCGATGTACGAGGAAGTTTCCAGGAGAAACAGTGTCTGAAGAC
ACGTCAACAGGAGTCAATGACTTTGGTCTTGAGAAGAAGCCTGAAGTAGTGAAGCTCAAT
CTGAAGACGAGCAAACTCGAGCCTCCTTAGAGTTCTTCAACGATATCAAGCTGGACTCAG
ACAACACGTATTCGATCCTGCTTTACGGGTTTGGTGCGGTACTTGCTGTCTACTTGACTT
CTGCAATCGTTGGTTCTCTCGAATCAGTTCCTCTGTTACCTAAGCTGATGGAAGTGGTTG
GTCTCGGATACACACTCTGGTTCACTACACGTTACTTACTTTTTAAGAGTAACAGAGAAG
AACTCAAGACAAAGATTAGTGAAATCAAGAAGCAAGTTCTTGGCTCTGATAGTGATATTG
AGTAGTTCGTTTTTTTCTCTTGTTTTTGGCTTGTGTAGAATGAAAAAAGAAAAAAAGAAA
ACATGTTTCCCTTCCCACTGAACTGTTGTTCTTAGGAAAAAATAGTTGGTCCTTGTCCTT
TTTTTTTGGTTCAGTGTTGAAGAACATCTTTTGATACATATAGAAGAGTTTTTAG

QA 1 775 1 775
DS 



AS 2 5

CO CL1606Contig1 800 3 6 U
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AGTTTTGTGAGTGTCATGGGAGCACTATTGGTGTTAACCATCTTCCATGATCCGATCATC
GTCAACGCCGGCCAAGGTGTTCCGAATGTAGCACTGTTCACTTTTGGGGACTCTTACTAC
GACGTTGGAAACAAAGCGTTTCTAACCAAAAAACTCCCTCCACAAACCTTGTGGCCTTAC
GGCAAGTCCCGCGACGACCCCAACGGCAAGTTTTCAGACGGCTACATCGTCCCCGACTTC
ATCGCTGAATTCATGTCCATTCCAAACGGAATCCCGCCGGCGCTTAAACCTGGTGCTAAT
TTTTCACGTGGAGCTAGCTTTGCCGTCGCCGACGCTTCTATTCTTGGGGCTCCTGCGGAA
AGTATGACACTGACTCAACAAGTGAACAAATTCAGAAGTATGATATCAACTTGGTCCGAC
GACTACATCGAGCAATCATTGTTTATGATATATATCGGGACAGAAGATTATTTGAACTTC
ATCAAGGCCAATCCCACTGCGGATGGTTCTGCTCAACAAGCTTTTGTCACTTCCGTCACG
AACAAATTAAAGACCGACATCAACTTGTTATACTCCTTGGGAGCTAGTAAATTCGCAGTT
CCAACGCTAGCACCATTGGGTTGCTTACCGATCGTGAGACAAGAATACAAAACTGGCAAC
GACTGTTACGAGCCACTCAACAATTTGGCCAAACAAACAACGAGAAGATCGGTCCGATGT
TGACGAGTTGCTAAAACCCA


BQ
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C222TF U 1
AF RS1BW72TF U 15
AF RS1CN64TF U 1
BS 1 570 RS1C222TF
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RD RS1C222TF 780 0 0
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GACTGTTACGAGCCACTCAACAATTTGGCCAAACACACAACGAGAAGATCGGTCCGATGT

QA 1 780 1 780
DS 

RD RS1BW72TF 755 0 0
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AGCGTTTCTAACCAAAAAACTCCCTCCACAAACCTTGTGGCCTTACGGCAAGTCCCGCGA
CGACCCCAACGGCAAGTTTTCAGACGGCTACATCGTCCCCGACTTCATCGCTGAATTCAT
GTCCATTCCAAACGGAATCCCGCCGGCGCTTAAACCTGGTGCTAATTTT*CACGTGGAGC
TAGCTTTGCCATCGCCGACGCTTCTATTCTTGGGGCTCCTGCGGAAGGTATGACACTGAC
TCAACAAGTGAACAAATTCAGAAGTATGATATCAACTTGGTCCGACGACTACATCGAGCA
ATCATTGTTTATGATATATATCGGGACAGAAGATTATTTGAACTTCATCAAGGCCAATCC
CACTGCGGATGGTTCTGCTCAACAAGCTTTTGTCACTTCCGTCACGAACAAATTAAAGAC
CGACATCAACTTGTTATACTCCTTGGGAGCTAGTAAATTCGCAGTCCCAACGCTAGCACC
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ACAACACAACGAGAAGA

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1CN64TF 800 0 0
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GACGTTGGAAACAAAGCGTTTCTAACCAAAAAACTCCCTCCACAAACCTTGTGGCCTTAC
GGCAAGTCCCGCGACGACCCCAACGGCAAGTTTTCAGATGGCTACATCGTCCCCGACTTC
ATCGCTGAATTCATGTCCATTCCAAACGGAATCCCGCCGGCGCTTAAACCTGGTGCTAAT
TTTTCACGTGGAGCTAGCTTTGCCGTCGCCGACGCTTCTATTCTTGGGGCTCCTGCGGAA
AGTATGACACTGACTCAACAAGTGAACAAATTCAGAAGTATGATATCAACTTGGTCCGAC
GACTACATCGAGCAATCATTGTTTATGATATATATCGGGACAGAAGATTATTTGAACTTC
ATCAAGGCCAATCCCACTGCGGATGGTTCTGCTCAACAAGCTTTTGTCACTCCCGTCACG
AACAAATTAAAGACCGACATCAACTTGTTATACTCCTTGGGAGCTAGTAAATTCGCAGTT
CCAACGCTAGCACCATTGGGTTGCTTACCGATCGTGAGACA*GAATACAAA*CTGGCAAC
GACTGTTACGAGCCACTCAACA*TTTGGCCAA*CAAACAACGAGA*GATCGGTCCGATGT
TGACGAGTTGCTAAAACCCA

QA 1 800 1 800
DS 



CO CL1606Contig2 768 2 11 U
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CCTGAGCTTTCTCAGTGTTGTGACGTCCGTCAAAGAAGAAGTAAGATCTTTGGTACTCAC
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CAGCATTGTAGAAATCTAAGACGGTGAACTGAAAACCGCCGTTGGGTTTTTTAGCAAACT
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AACAGTCGTTGCCAGTTTTGTATTCTTGTCTCACGATCGGTAAGCAACCCAATGGTGCTA
GCGTTGGAACTGCGAATTTACTAGCTCCCAAGAGTATAACAAGTTGAT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C222JQ U 4
AF RS1CN64JQ U 1
BS 1 7 RS1CN64JQ
BS 8 8 RS1C222JQ
BS 9 44 RS1CN64JQ
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BS 216 216 RS1C222JQ
BS 217 768 RS1CN64JQ

RD RS1C222JQ 221 0 0
ACTAAGGGAATTGTAATACCCTTTTTATTATATTTTCCGTAAATTAAAAAACATACAAAT
ACATATCACGCAATTTATTCGACGGCACAAACATAGTTACCAAGCATTACAGCTAGGATA
CAATATTCGTAGGCTCACATGCATAACGAAAAATTTACCACAGTTATATTTCATCCAGCT
AATAATAAGCTGATAAATCGAGGTTATCACGAAATGAACGT

QA 1 221 1 221
DS 

RD RS1CN64JQ 768 0 0
GATACTAGGGGAATTGTAATACCCTTTTTATTATATTTTCCGTAGATTAGAAAACATACA
AATACATATCACGCAATTTATTCGACGGCACAAACATAGTTACCAAGCATTACAGCTAGG
ATACAATATTCGTAGGCTCACATGCATAACGAAAGATTTACCACAGTTATATTTCATCCA
GCTAATAATAAGCTGATAAATCGAGGTTATCACGAGATGAACGTCGACGACGAGTAGATA
GGTTGTTGGGTTCCCAAAACTCAAGCATGTTCTCCTTAGCCGGATAAACGATTAGCTCAC
GTATGGTCATTGGTTGGACCACGTTAGTATTGGCTCCATAGAAAATATGAGCGATTTCTT
CCTGAGCTTTCTCAGTGTTGTGACGTCCGTCAAAGAAGAAGTAAGATCTTTGGTACTCAC
ACAGCTTCGAGTGCACGTTAGCCATTCCACAACCATACGCGTTGTGAGTCCCTACCCCGC
AGCACGATGTGTTGGTAACATAAAACCGAAAGGCAGTATGCCTTATTGTCCTGCGGAGAA
CAGCATTGTAGAAATCTAAGACGGTGAACTGAAAACCGCCGTTGGGTTTTTTAGCAAACT
CGTTCAACATCGGACCGATCTTCTCGTTGTGTTGTTTGGCCAAATTGTTGAGTGGCTCGT
AACAGTCGTTGCCAGTTTTGTATTCTTGTCTCACGATCGGTAAGCAACCCAATGGTGCTA
GCGTTGGAACTGCGAATTTACTAGCTCCCAAGAGTATAACAAGTTGAT

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 5

CO CL1607Contig1 940 5 13 U
GGAAACTGATAATTATATTGCTAAAACAAATTTCTCTCTCTAGTTGCTCTCACCTCTCTC
TAAAAGAAAGCTTCCAATCTAAGATCTTTCTGTCGGTGGCCGGTGGCCCTCGCCGCCGGT
TACCATTTTTTTCTCTTTTTGGTTTGTATATATCTAGGTCTTTGTTTCAAATAAATCATC
GGGTAGGTGATATGTATCTTCGCTTTGGCGACTCCAACTTCCGTTTGTCGGATTATATAT
TTTCGCTTGGCGATCTTTTGTTGTGGTTTTCAATCCGATTCCAGAACTTTTCTTCATGAT
TTCTATGTTCTTTCTGGTTAACTCGGATTGATAATATACGGGTTTACCCAGATCTCAATC
CCCTTTCGCAAATAGAGCTTTATCCCGTTGCCTTTGGTTTTGAATTCTGTTTCCTCTGAT
CATGCTCAGACTCTGATCTTAGCTGAGAATTAAAGTTTTTTTGTTTAAGCTTAAGCGTGT
TTTCTTAAGTTATTTCTCATGCGGAGAAGATGAAGAGAAGTTGGATCCAGTTTGATCGAT
GGATGAGAAATTCAGTAAAGTTGGCATCTTTTGATGGTCCAACATAGGATTTGCTCTAAA
TCGATTAAACCTTCCCAGTTTCAATAATCAGAGAGAGCTAGAAGTCTAAGCTAAAGCTTC
GGTTGATGGCGGAAGGAAGAGTCTACGGATATAATTTTTGGAATCAATGAAGCATGAAAA
AGGGAAGAACATGATGTGTCGGTGGTTTGAAGGCATAGTCACCGGAGATTACCGTCAAGG
TTGCCGGCGAAGCAGAGTTTTCAAGATGCATGTTTCTCACCGTACACGTGTCTTTACCTT
TGTGAGATATGTGTAAACGTTTAGTGCTTTGTTCGTGTAATGTTTTATCCAAAGTTGTAT
CACGTGACTCTTTAGGATTTTAATGAAACACGAAGTCGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CR48TF U 18
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AF RS1C114JQ C 480
AF RS1AS39JQ C 176
AF RS1AS39TF U 176
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GG
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TGGTTTGTATATATCTAGGTCTTTGTTTCAAATAAATCATCGGGTAGGTGATATGTATCT
TCGCTTTGGCGACTCCAACTTCCGTTTGTCGGATTATATATTTTCGCTTGGCGATCTTTT
GTTGTGGTTTTCAATCCGATTCCAGAACTTTTCTTCATGATTTCTATGTTCTTTCTGGTT
AACTCGGATTGATAATATACGGGTTTACCCAGATCTCAATCCCCTTTCGCAAATAGAGCT
TTATCCCGTTGCCTTTGGTTTTGAATTCTGTTTCCTCTGATCATGCTCAGACTCTGATCT
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GTTGGCATCTTTTGATGGTCCAACATAGGATTTGCTCT

QA 3 580 3 580
DS 

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TAAAAGAAAGCTTCCAATCTAAGATCTTTCTGTCGGTGGCCGGTGGCCCTCGCCGCCGGT
TACCATTTTTTTCTCTTTTTGGTTTGTATATATCTAGGTCTTTGTTTCAAATAAATCATC
GGGTAGGTGATATGTATCTTCGCTTTGGCGACTCCAACTTCCGTTTGTCGGATTATATAT
TTTCGCTTGGCGATCTTTTGTTGTGGTTTTCAATCCGATTCCAGAACTTTTCTTCATGAT
TTCTACGTTCTTTCTGGTTAACTCGGATTGATAATATACGGGTTTACCCAGATCTCAATC
CCCTTTCGCAAATAGAGCTTTATCCCGTTGCCTTTGGTTTTGAATTCTGTTTCCTCTGAT
CATGCTCAGACTCTGATCTTAGCTGAGAATTAAAGTTTTTTTGTTTAAGCTTAAGCGTGT
TTTCTTAAGTTATTTCTCATGCGGAGAAGATGAAGAGAAGTTGGATCCAGTTTGATCGAT
GGATGAGAAATTCAGTAAAGTTGGCATCTTTTGATGGTCCAACATAGGATTTGCTCTAAA
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GGTTGATGGCGGAAGGAAGAGTCTACGGATATAAT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1C114JQ 344 0 0
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TGGATGAGAAATTCAGTAAAGTTGGCATCTTTTGATGGTCCAACATAGGATTTGCTTTAA
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AAGGGAAGAACATGATGTGTCGGTGGTTTGAAGGCATAGTCCCCGGAGATTCCCGTCAAG
GTTGCCGGCGAAGCAGAGTTTTCAAGATGCATGTTTCTCCCCGT

QA 1 344 1 344
DS 

RD RS1AS39JQ 765 0 0
GG
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TATTTTCGCTTGGCGATCTTTTGTTGTGGTTTTCAATCCGATTCCAGAACTTTTCTTCAT
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ATCCCCTTTCGCAAATAGAGCTTTATCCCGTTGCCTTTGGTTTTGAATTCTGTTTCCTCT
GATCATGCTCAGACTCTGATCTTAGCTGAGAATTAAAGTTTTTTTGTTTAAGCTTAAGCG
TGTTTTCTTAAGTTATTTCTCATGCGGAGAAGATGAAGAGAAGTTGGATCCAGTTTGATC
GATGGATGAGAAATTCAGTAAAGTTGGCATCTTTTGATGGTCCAACATAGGATTTGCTCT
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TATCACGTGACTCTTTAGGATTTTAATGAAACACGAAGTCGAC

QA 3 765 3 765
DS 

RD RS1AS39TF 736 0 0
GG
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TATTTTCGCTTGGCGATCTTTTGTTGTGGTTTTCAATCCGATTCCAGAACTTTTCTTCAT
GATTTCTATGTTCTTTCTGGTTAACTCGGATTGATAATATACGGGTTTACCCAGATCTCA
ATCCCCTTTCGCAAATAGAGCTTTATCCCGTTGCCTTTGGTTTTGAATTCTGTTTCCTCT
GATCATGCTCAGACTCTGATCTTAGCTGAGAATTAAAGTTTTTTTGTTTAAGCTTAAGCG
TGTTTTCTTAAGTTATTTCTCATGCGGAGAAGATGAAGAGAAGTTGGATCCAGTTTGATC
GATGGATGAGAAATTCAGTAAAGTTGGCATCTTTTGATGGTCCAACATAGGATTTGCTCT
AAATCGATTAAACCTTCCCAGTTTCAATAATCAGAGAGAGCTAGAAGTCTAAGCTAAAGC
TTCGGTTGATGGCGGAAGGAAGAGTCTACGGATATAATTTTTGGAATCAATGAAGCATGA
AAAAGGGAAGAACATGATGTGTCGGTGGTTTGAAGGCATAGTCACCGGAGATTACCGTCA
AAGTTGCCGGCGAAGCAGAGTTTTCAAGATGCATGTTTCTCACCGTACACGTGTCTTTAC
*TTTGTGAGATATGTGTAAACGTTTAGTGCTTTGTTCGTGTA*TGTTTTATCCAA*GTTG
TATCACGTGACTCT

QA 3 736 3 736
DS 



AS 1 5

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GGAACTATTATGTTGTTAGAACTTGTAGTTCGGTAATAAGTCTCTCACTTCCACTCTCTC
TCTCCATCTCCTTCCATTGTTCTTCCCCTTCTCTTCTTTCTCTCTCTCCTGTACTTCTAG
GGTTTCGTTCGATCACATCTCCGTTCATCTCAATTCATCTTTTTTATAAAAAAAAAATCC
TGTAAGAAGCAGAGGAAAATGGATTCCAATTCATCATGGATCAATTGTCCTTCCGTTTTC
TCATCCTCTTCTTCTTCTGCTTCTCGACGATGTCAACAATCCCGATCAGATCTGTATATA
GGTGCAGGAGGAGGAGGGTACGAGGATCTCGAAGGAGAAGACGATTTAAAATCGGAGTTC
ATCTGCCCGTTTTGCGCTGAAGTCTTCGACATCGTCGGGCTCTGCTGTCACATTGACGAA
GAGCATCCTGTCGAGGCCAAGAACGGGGTCTGTCCTGTATGCACAAAGAGGGTGGGATTA
GATATCGTCGGCCATATCACTACACAACATGCCAACTTTTTCAAGGTGCAGCGAAGGAGA
AGGTTGAGAAAAGGTGGTGGTGGATACAGCTCTGCTTATCTCGCCTTGAAGAAAGGGCTC
CGGGAAGCTAACTTACAGTCTCTTCTCGGTGGATCCTCGAGTTACACTTCTTCTACCAAT
ATAGATTCCGATCCGTTGCTCTCTTCCTTTATGTTTAATCCGTCAGCTGCAAACAAATCC
ACTGCACCTGTTACAGAAGGAGCCTCGGCTACAACGAAACTCTCGCAAAAGGAATCTCTC
AAAAGAGACGTTCGAGAAGCTCCACTTTCAGGGGAAGATCGAGAGAAGGCGAAGAAGAGC
GAGTTTGTGAGAGGTTTGTTCTTGTCAACCATGCTTGGTGAGGATTACTAATGAAAGCCT
ACTCGCCTTTTGTTGTGGGTGATTT*ATGAGAAAGTGAGCAATCTTGTGAGGTTAAAAAT
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GAACTACCACCTTATAATGTTTATAAACGGAAACAAAGTACTGTACTTTCTTTTCATTGA
GACATTCATAGATTCGAATAAAAACATTTAACACGTTTTGTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1E114TF U 1
AF RS1E114JQ C 437
AF RS1GN49TF U 645
AF RS1E930JQ C 753
AF RS1E930TF U 753
BS 1 605 RS1E114TF
BS 606 644 RS1E114JQ
BS 645 668 RS1GN49TF
BS 669 669 RS1E114JQ
BS 670 970 RS1GN49TF
BS 971 971 RS1E930TF
BS 972 1122 RS1GN49TF

RD RS1E114TF 605 0 0
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TCTCCATCTCCTTCCATTGTTCTTCCCCTTCTCTTCTTTCTCTCTCTCCTGTACTTCTAG
GGTTTCGTTCGATCACATCTCCGTTCATCTCAATTCATCTTTTTTATAAAAAAAAAATCC
TGTAAGAAGCAGAGGAAAATGGATTCCAATTCATCATGGATCAATTGTCCTTCCGTTTTC
TCATCCTCTTCTTCTTCTGCTTCTCGACGATGTCAACAATCCCGATCAGATCTGTATATA
GGTGCAGGAGGAGGAGGGTACGAGGATCTCGAAGGAGAAGACGATTTAAAATCGGAGTTC
ATCTGCCCGTTTTGCGCTGAAGTCTTCGACATCGTCGGGCTCTGCTGTCACATTGACGAA
GAGCATCCTGTCGAGGCCAAGAACGGGGTCTGTCCTGTATGCACAAAGAGGGTGGGATTA
GATATCGTCGGCCATATCACTACACAACATGCCAACTTTTTCAAGGTGCAGCGAAGGAGA
AGGTTGAGAAAAGGTGGTGGTGGATACAGCTCTGCTTATCTCGCCTTGAAGAAAGGGCTC
CGGGA

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DS 

RD RS1E114JQ 613 0 0
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TCACTACACAACATGCCAACTTTTTCAAGGTGCAGCGAAGGAGAAGGTTGAGAAAAGGTG
GTGGTGGATACAGCTCTGCTTATCTCGCCTTGAAGAAAGGGCTCCGGGAAGCTAACTTAC
AGTCTCTTCTCGGTGGATCCTCGAGTTACACTTCTTCTACCAATATAGATTCCGATCCGT
TGCTCTCTTCCTTTATGTTTAATCCGTCAGCTGCAAACAAATCCGCTGCACCTGTTACAG
AAGGAGCCTCGGCTACAACGAAACTCTCGCAAAAGGAATCTCTCAAAAGAGACGTTCGAG
AAGCTCCACTTTCAGGGGAAGATCGAGAGAAGGCGAAGAAGAGCGAGTTTGTGAGAGGTT
TGTTCTTGTCAACCATGCTTGGTGAGGATTACTAATGAAAGCCTACTCGCCTTTTGTTGT
GGGTGATTTTATGAGAAAGTGAGCAATCTTGTGAGGTTAAAAATTGTTAGAGCTTGTAAG
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ATGTTTATAAAC
C

QA 1 612 1 612
DS 

RD RS1GN49TF 478 0 0
CACTTCTTCTACCAATATAGATTCTGATCCGTTGCTCTCTTCCTTTATGTTTAATCCGTC
AGCTGCAAACAAATCCACTGCACCTGTTACAGAAGGAGCCTCGGCTACAACGAAACTCTC
GCAAAAGGAATCTCTCAAAAGAGACGTTCGAGAAGCTCCACTTTCAGGGGAAGATCGAGA
GAAGGCGAAGAAGAGCGAGTTTGTGAGAGGTTTGTTCTTGTCAACCATGCTTGGTGAGGA
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TTGTGAGGTTAAAAATTGTTAGAGCTCGTAAGTTAAGGAGGGGGAGGCAGAGTTAAATCC
ATATGTTATTGTCATCGAACTACCACCTTATAATGTTTATAAACGGAAACAAAGTACTGT
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DS 

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DS 

RD RS1E930TF 370 0 0
GAGTGAAGGGCAAAGAG
AGGAATCTCTCAAAAGAGACGTTCGAGAAGCTCCACTTTCAGGGGAAGATCGAGAGAAGG
CGAAGAAGAGCGAGTTTGTGAGAGGTTTGTTCTTGTCAACCATGCTTGGTGAGGATTACT
AATGAAAGCCTACTCGCCTTTTGTTGTGGGTGATTT*ATGAGAAAGTGAGCAATCTTGTG
AGGTTAAAAATTGTTAGAGCTTGTAAGTTAAGGAGGGGGAGGCAGAGTTAAATCCATATG
TTATTGTCATCGAACTACCACCTTATAATGTTTATAAACGGAAACAAAGTACTGTACTTT
CTTTTCATTGAGACATTCATAGATTCGAATAAAAACATTTAACACGTTTTGTG

QA 18 370 18 370
DS 



AS 1 5

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CCTCCGTCGCCAAAATCATTGGCAAGCCTGAGAACTATGTGATGATTGTGTTGAAAGGAT
CAGTGCCTATGGCATTTGGTGGCACCGAGGACCCTGCCGCTTATGGTGAACTTGTCTCCA
TCGGTGGCCTTAATCCCGATGTCAACAAGAAGCTCAGCGCTGCGGTCTCCGCCATCCTTG
AGACTAAGCTCTCTGTTCCCAAGTCTCGCTTCTTCCTCAAGTTTTACGACACCAAGGGAT
CCTTCTTAGGTTGGAATGGATCGACTTTCTAGATTCCGTGGCAAGTAAGAGGTTAATGTG
ATCTGCCAATCTATGAACGTGTGCGGTTATTATTCAAGCTTCTCTCATTGTCAACCAACT
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AGAGAGAAGAACTTTTTAATGTTTTATATGGTGCTGCTACAGCTCAACTTCAAAGATAAA
TGAGATGAACTGATCATATATTAATTTGGGTTAAGAGTA


BQ
10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1B372TF U 1
AF RS1CB46TF U 1
AF RS1BO41TF U 2
AF RS1C332JQ C 2
AF RS1C332TF U 2
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BS 595 619 RS1CB46TF
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CCTCCGTCGCCAAAATCATTGGCAAGCCTGAGAACTATGTGATGATTGTGTTGAAAGGAT
CAGTGCCTATGGCATTTGGTGGCACCGAGGACCCTGCCGCTTATGGTGAACTTGTCTCCA
TCGGTGGCCTTAATCCCGATGTCAACAAGAAGCTCAGCGCTGCGGTCTCCGCCATCCTTG
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CCTTCTTAGGTTGGAATGGATCGACTTTCTAGATTCCGTGGCAAGTAAGAGGTTAATGTG
ATCTGCCAATCTATGAACGTGTGCGGTTATTATTCAAGCTTCTCTCATTGTCAACCAACT
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AGAGAGAAGAACTTTTTAATG

QA 1 561 1 561
DS 

RD RS1CB46TF 619 0 0
G
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CTCCGTCGCCAAAATCATTGGCAAGCCTGAGAACTATGTGATGATTGTGTTGAAAGGATC
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TGAACTATTTCCAGTTGTAAACACTCCTTATCTCTTTAACGTTTGTCGGAGTTCCATTAA
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GAGATGAACTGATCATAT

QA 2 619 2 619
DS 

RD RS1BO41TF 624 0 0
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CTCCGTCGCCAAAATCATTGGCAAGCCTGAGAACTATGTGATGATTGTGTTGAAAGGATC
AGTGCCTATGGCATTTGGTGGCACCGAGGACCCTGCCGCTTATGGTGAACTTGTCTCCAT
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CTTCTTAGGTTGGAATGGATCGACTTTCTAGATTCCGTGGCAAGTAAGAGGTTAATGTGA
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TGAACTATTTCCAGTTGTAAACACCCCTTATCTCTTTAACGTTTGTCGGAGTTCCATTAA
GAGAGAAGAACTTTCTAATGTTTTATATGGTGCTGCTACAGCTCAACTTCAAAGATAAAT
GAGATGAACTGATCATAT
ATTAAA

QA 1 618 1 618
DS 

RD RS1C332JQ 637 0 0
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CTCCACCAACGTTAGCCTCGACGGCGTCGATACCTCTTCCATTCTCTCCGAAGCTACCTC
CTCCGTCGCCAAAATCATTGGCAAGCCTGAGAACTATTTGATGATTGTGTTGAAAGGATC
AGTGCCTATGGCATTTGGTGGCACCGAGGACCCTGCCGCTTATGGTGAACTTGTCTCCAT
CGGTGGCCTTAATCCCGATGTCAACAAGAAGCTCAGCGCTGCGGTCTCCGCCATCCTTGA
GACTAAGCTCTCTGTTCCCAAGTCTCGCTTCTTCCTCAAGTTTTACGACACCAAGGGATC
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TCTGCCAATCTATGAACGTGTGCGGTTATTATTCAAGCTTCTCTCATTGTCAACCAACTT
TGAACTATTTCCAGTTGTAAACACTCCTTATCTCTTTAACGTTTGTCGG*GTTCCATTAA
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GAGATGAACTGATCATATATTAATTTGGGTTAAGAGT

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DS 

RD RS1C332TF 638 0 0
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CTCCACCAACGTTAGCCTCGACGGCGTCGATACCTCTTCCATTCTCTCCGAAGCTACCTC
CTCCGTCGCCAAAATCATTGGCAAGCCTGAGAACTATTTGATGATTGTGTTGAAAGGATC
AGTGCCTATGGCATTTGGTGGCACCGAGGACCCTGCCGCTTATGGTGAACTTGTCTCCAT
CGGTGGCCTTAATCCCGATGTCAACAAGAAGCTCAGCGCTGCGGTCTCCGCCATCCTTGA
GACTAAGCTCTCTGTTCCCAAGTCTCGCTTCTTCCTCAAGTTTTACGACACCAAGGGATC
CTTCTTAGGTTGGAATGGATCGACTTTCTAGATTCCGTGGCAAGTAAGAGGTTAATGTGA
TCTGCCAATCTATGAACGTGTGCGGTTATTATTCAAGCTTCTCTCATTGTCAACCAACTT
TGAACTATTTCCAGTTGTAAACACTCCTTATCTCTTTAACGTTTGTCGG*GTTCCATTAA
GAGAGAAGAACTTTTTAATGTTTTATATGGTGCTGCTACAGCTCAACTTCAAAGATAAAT
GAGATGAACTGATCATATATTAATTTGGGTTAAGAGTA

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 5

CO CL1610Contig1 473 5 1 U
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TCCTCGTATCAAATTTCCTCAGAGACATTCCTCTTCTGCTACTTCATCAGGTTCTGGACC
AGCGCAGGGATCCGTTGCCGGCGGCAAGAGAAACGTGACGGCGAGTTCAGATGTCCCGGC
AGCCCCGAAGAACATTGCTGATGGAGGGAAAGCATCACTCCAGCCTAAACGCACTCCTGT
CTCCGACAAGGAAATCGAATCCATAATGTTGGGAGGTTGCATCTGATGTTTGAAGATTTG
ATCATCACTTTGGGCTTCTTGTCTTTTTCGGCTGGTGAATTTTATTATATGCTTTTTTAA
TGTAAAGGAAGAACTAATAATGCAGAGAAGATGATGTGTTGTATGAATGATGATGTTGTA
TGAATGATTCTGTTTCTCTTTGTCAATTAAAAAACAAAGTCTATATAGTTTCT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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G
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BQ
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20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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QA 1 623 1 623
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GG
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AATAGATTGTTCAATGCTATCGAGACCATTCCCTGCATTTCCAACAAGGCTAAATGGTGT
TTAGATTGGATTCAAAGTCCTATGTCTTTTGCTGTGAGGCTTGTTGCTTTTGCATGCGTC
GAAGGAATCTTCTTCTCTGGAAGCTTCTGTGCCATCTTCTGGCTGAAGAAGAGAGGTCTT
ATGCCGGGTTTGACTTTCTCAA*CGAGCTTATATCGAGAGACGAGGGTCTCCACTGTGAC
TTTGCTTGTCTCTTGTACAGTTTGCTGCAGA
G

QA 3 753 3 753
DS 

RD RS1CN71TF 650 0 0
GAAGAATGGGAGGAGGAACCTCTTTTAACGGCGCAGAACCAGAGGTTTACTATGTTCCCC
ATTAGGTACAAGTCGATTTGGGAGATGTATAAGAAGGCTGAGGCCAGCTTCTGGACTGCT
GAAGAAGTTGATCTTTCGACGGATGTGCAGCACTGGGGAAAGCTGTCGGATTCAGAGAAA
CATTTTATCAGCCATGTTCTGGCGTTTTTCGCCGCATCAGATGGGATTGTTCTGGAGAAT
CTGGCTGCTAGATTCTTGAATGATGTCCAAGTCCCTGAGGCTCGTGCTTTCTATGGGTTT
CAAATTGCCATGGAGAACATTCATTCTGAGATGTACAGCCAGCTTCTGGAGACATTTATA
AAGGATTCGCAGGAGAAGAATAGATTGTTCAATGCTATCGAGACCATTCCCTGCATTTCC
AACAAGGCTAAATGGTGTTTAGATTGGATTCAAAGTCCTATGTCTTTTGCTGTGAGGCTT
GTTGCTTTTGCATGCGTCGAAGGAATCTTCTTCTCTGGAAGCTTCTGTGCCATCTTCTGG
CTGAAGAAGAGAGGTCTTATGCCGGGTTTGACTTTCTCAAACGAGCTTATATCGAGAGAC
GAGGGTCTCCACTGTGACTTTGCTTGTCTCTTGTACAGTTTGCTGCAGA
A

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1CN71JQ 806 0 0
TAAATGGTGTTTAGATTGGATTCAAAGTCCTATGTCTTTTGCTGTGAGGCTTGTTGCTTT
TGCATGCGTCGAAGGAATCTTCTTCTCTGGAAGCTTCTGTGCCATCTTCTGGCTGAAGAA
GAGAGGTCTTATGCCGGGTTTGACTTTCTCAAACGAGCTTATATCGAGAGACGAGGGTCT
CCACTGTGACTTTGCTTGTCTCTTGTACAGTTTGCTGCAGAAGAAGGTTCCTGTGGAGAA
AGTTTATCAGATTGTTCATGAGGCAGTGGAAATCGAGACAGAGTTTGTCTGCAAGTCCCT
TCCATGTGATCTGATTGGAATGAACTCAAACCTCATGAGTCAATACATTCAATTTGTTGC
TGACCGTCTTCTGGTTACCTTGGGATGTGAAAGGAGATACAAAACAGATAATCCATTTGA
CTGGATGGAGTTCATATCTCTCCAAGGGAAGACAAACTTCTTTGAGAAGAGAGTGGGAGA
ATATCAAAAGGCATCTGTTATGTCAAGTCTCCAAGAAGGTAATAAGAACTACGAATTCAA
GATTGATGAGGACTTTTGAATGGAATTCGCCATTGAATCTGGGAAGGGCTCATCTCATTC
TTTATGAGTTACTCCAAAATGGGAACATTGTAGTAGACTAGAAGTAGTAGTACAAGAAAC
AAACTCACTTTAGATCGCATTTATTTTGGTTTTGGTTTAGCAGTAGATGTTATCTTAGTA
TTATTTGTGCCTTCTATAGTGTCTGACATTACATCTTTGTTAATACTTCCTTCTTTCCAA
AAATAAATGTTTTTGAAAATTGCTTC

QA 1 806 1 806
DS 

RD RS1BQ78JQ 733 0 0
CATGCGTCGAAGGAATCTTCTTCTCTGGAAGCTTCTGTGCCATCTTCTGGCTGAAGAAGA
GAGGTCTTATGCCGGGTTTGACTTTCTCAAACGAGCTTATATCGAGAGACGAGGGTCTCC
ACTGTGACTTTGCTTGTCTCTTGTACAGTTTGCTGCAGAAGAAGGTTCCTGTGGAGAAAG
TTTATCAGATTGTTCATGAGGCAGTGGAAATCGAGACAGAGTTTGTCTGCAAGTCCCTTC
CATGTGATCTGATTGGAATGAACTCAAACCTCATGAGTCAATACATTCAATTTGTTGCTG
ACCGTCTTCTGGTTACCTTGGGATGTGAAAGGAGATACAAAACAGATAATCCATTTGACT
GGATGGAGTTCATATCTCTCCAAGGGAAGACAAACTTCTTTGAGAAGAGAGTGGGAGAAT
ATCAAAAGGCATCTGTTATGTCAAGTCTCCAAGAAGGTAATAAGAACTACGAATTCAAGA
TTGATGAGGACTTTTGAATGGAATTCGCCATTGAATCTGGGAAGGGCTCATCTCATTCTT
TATGAGTTACTCCAAAATGGGAACATTGTAGTAGACTAGAAGTAGTAGTACAAGAAACAA
ACTCACTTTAGATCGCATTTATTTTGGTTTTGGTTTAGCAGTAGATGTTATCTTAGTATT
ATTTGTGCCTTCTATAATGTCTGACATTACATCTTTGTTAATACTTCCTTCTTTCCAAAA
ATAAATGTTTT
CG

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 5

CO CL1612Contig1 953 5 48 U
GTCTGAACCACTTTGAAGAACCAATAATGTTGGGACCTCAGTGCTGCGAAAACCCGCCGG
TTCTTAACCCTCTCTCCGGTTCGGGTCATGTAGAGAAGCTAGGTGGCCTCGATGCCTACG
TCTCTGGCTCTCCAGATTCCAAGAAGTGCGTCCTCCTCGTCTCCGATATTTATGGGTATG
AAGCTCCAAACTTGAGGGCGCTTGCGGACAAGGTTGCAGCTTCAGTATTCTATGTCGTGG
TTCCCGATTACTTCTATGGAGATCCTTATGACCCCTCTCATCAGGAGAGACCAGTCCATG
TCTGGATCAAAGACCATGGCCCTGATAAGGGGTTTGAAGACACAAAGCCAGTACTTGAAG
CCATAAAGAACAAAGGTATCACTGCCATTGGAGCTGCTGGGATGTGCTGGGGTGGAAAAG
TGGTTGTGGAATTGTCAAAACAAGAGCTTATCCAAGCCGCTGTTTTGCTTCATCCTACTT
ATGTCACTGTGGATGATATCAAGGGTGTGAAGGTTCCAATAGCTATACTAGGAGCTGAGG
ATGATTTTTTGACCCCACCAGCTCTCGTGAAGCAATTTGAAGAGATTCTTGCTTCCAAGC
CCGAGGTGAGTAGTTATGTGAAGATTTTCCTGAATGTCTCACACGGTTGGACAACTCGGT
ACTACCTCAATGACCTAGAGGCTGTTAAAGCTGCAGAAGAAGCTCACAAGGAGATGCTTG
ATTGGTTTGTGACTTACGTCAGATGATTGATTGAGAGAAGGCTCTATCTTACTTAAGTGA
TCACATTTGCTACTGTTTGTTGAATGAAAATAAGGAGAGAACTGATAAGTACAATAAAAC
TCATGGGTTGTGTGTGTCTCTCTACTCTCTGTCATTGTCTAATAGACTTTTGAAGTATAT
ATGTTGCTATTGATCTGAGTTTGGCCCTGTGATGCATGCATGCTGTTTATACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B650TF U 1
AF RS1A845TF U 13
AF RS1G968TF U 235
AF RS1A845JQ C 74
AF RS1H107TF U 235
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BS 908 953 RS1A845JQ

RD RS1B650TF 698 0 0
GTCTGAACCACTTTGAAGAACCAATAATGTTGGGACCTCAGTGCTGCGAAAACCCGCCGG
TTCTTGACCCTCTCTCCGGTTCGGGTCATGTAGAGAAGCTAGGTGGCCTCGATGCCTACG
TCTCTGGCTCTCCAGATTCCAAGAAGTGCGTCCTCCTTGTCTCCGATATTTATGGCTATG
AAGCCCCAAACTTGAGGGCGCTTGCGGACAAGGTTGCAGCTTCAGGATTCTATGTTGTGG
TTCCTGACTACTTCTATGGAGATCCTTATGACCCCTCTCATCAGGAGAGACCAGTCCATG
TCTGGATCAAAGACCATGGCCCTGATAAGGGGTTTGAAGACACAAAGCCAGTACTTGAAG
CCATAAAGAACAAAGGCATCACTGCCATTGGAGCTGCTGGGATGTGCTGGGGTGGAAAAG
TGGTTGTGGAATTGTCAAAACAAGAGCTGATCCAAGCAGGTGTTTTGCTTCATCCTACTT
ATGTCACTATCGATGATATCAAGGGTGTGAAGGTTCCAATAGCTATACTAGGAGCTGAGG
ATGATTTTTTGACCCCACCAGCTCTCGTGAAGCAATTTGAGGAGATTCTTGCTTCCAAGC
CCGAGGTGAGTAGTTATGTGAAGATTTTCCTGA*TGTCTCACATGGTTGGACAACTCGGT
ACGACATCA*TGACCTAGAG*CTGTTAAAGCTGCAGA
G

QA 1 697 1 697
DS 

RD RS1A845TF 798 0 0
GG
GAAGAACCAATAATGTTGGGACCTCAGTGCTGCGAAAACCCGCCGGTTCTTAACCCTCTC
TCCGGTTCGGGTCATGTAGAGAAGCTAGGTGGCCTCGATGCCTACGTCTCTGGCTCTCCA
GATTCCAAGAAGTGCGTCCTCCTCGTCTCCGATATTTATGGGTATGAAGCTCCAAACTTG
AGGGCGCTTGCGGACAAGGTTGCAGCTTCAGTATTCTATGTCGTGGTTCCCGATTACTTC
TATGGAGATCCTTATGACCCCTCTCATCAGGAGAGACCAGTCCATGTCTGGATCAAAGAC
CATGGCCCTGATAAGGGGTTTGAAGACACAAAGCCAGTACTTGAAGCCATAAAGAACAAA
GGTATCACTGCCATTGGAGCTGCTGGGATGTGCTGGGGTGGAAAAGTGGTTGTGGAATTG
TCAAAACAAGAGCTTATCCAAGCCGCTGTTTTGCTTCATCCTACTTATGTCACTGTGGAT
GATATCAAGGGTGTGAAGGTTCCAATAGCTATACTAGGAGCTGAGGATGATTTTTTGACC
CCACCAGCTCTCGTGAAGCAATTTGAAGAGATTCTTGCTTCCAAGCCCGAGGTGAGTAGT
TATGTGAAGATTTTCCTGAATGTCTCACACGGTTGGACAACTCGGTACTACCTCAATGAC
CTAGAGGCTGTTAAAGCTGCAGAAGAAGCTCACAAGGAGATGCTTGATTGGTTTGTGACT
TACGTCAGATGATTGATTGAGAGAAAGCTCTATCTTACTTAAGTGATCACATTTGCTACT
GTTTGTTGAATGAA
AA

QA 3 796 3 796
DS 

RD RS1G968TF 574 0 0
G
CGTGGTTCCCGATTACTTCTATGGAGATCCTTATGACCCCTCTCATCAGGAGAGACCAGT
CCATGTCTGGATCAAAGACCATGGCCCTGATAAGGGGTTTGAAGACACAAAGCCAGTACT
TGAAGCCATAAAGAACAAAGGTATCACTGCCATTGGAGCTGCTGGGATGTGCTGGGGTGG
AAAAGTGGTTGTGGAATTGTCAAAACAAGAGCTTATCCAAGCCGCTGTTTTGCTTCATCC
TACTTATGTCACTGTGGATGATATCAAGGGTGTGAAGGTTCCAATAGCTATACTAGGAGC
TGAGGATGATTTTTTGACCCCACCAGCTCTCGTGAAGCAATTTGAAGAGATTCTTGCTTC
CAAGCCCGAGGTGAGTAGTTATGTGAAGATTTTCCTGAATGTCTCACACGGTTGGACAAC
TCGGTACTACCTCAATGACCTAGAGGCTGTTAAAGCTGCAGAAGAAGCTCACAAGGAGAT
GCTTGATTGGTTTGTGACTTACGTCAGATGATTGATTGAGAGAAGGCTCTATCTTACTTA
AGTGATCACATTTGCTACTGTTTGTTGAATGAA

QA 2 574 2 574
DS 

RD RS1A845JQ 880 0 0
CTCCGGTTCGGGTCATGTAGAGAAGCTAGGTGGCCTCGATGCCTACGTCTCTGGCTCTCC
AGATTCCAAGAAGTGCGTCCTCCTCGTCTCCGATATTTATGGGTATGAAGCTCCAAACTT
GAGGGCGCTTGCGGACAAGGTTGCAGCTTCAGTATTCTATGTCGTGGTTCCCGATTACTT
CTATGGAGATCCTTATGACCCCTCTCATCAGGAGAGACCAGTCCATGTCTGGATCAAAGA
CCATGGCCCTGATAAGGGGTTTGAAGACACAAAGCCAGTACTTGAAGCCATAAAGAACAA
AGGTATCACTGCCATTGGAGCTGCTGGGATGTGCTGGGGTGGAAAAGTGGTTGTGGAATT
GTCAAAACAAGAGCTTATCCAAGCCGCTGTTTTGCTTCATCCTACTTATGTCACTGTGGA
TGATATCAAGGGTGTGAAGGTTCCAATAGCTATACTAGGAGCTGAGGATGATTTTTTGAC
CCCACCAGCTCTCGTGAAGCAATTTGAAGAGATTCTTGCTTCCAAGCCCGAGGTGAGTAG
TTATGTGAAGATTTTCCTGAATGTCTCACACGGTTGGACAACTCGGTACTACCTCAATGA
CCTAGAGGCTGTTAAAGCTGCAGAAGAAGCTCACAAGGAGATGCTTGATTGGTTTGTGAC
TTACGTCAGATGATTGATTGAGAGAAGGCTCTATCTTACTTAAGTGATCACATTTGCTAC
TGTTTGTTGAATGAAAATAAGGAGAGAACTGATAAGTACAATAAAACTCATGGGTTGTGT
GTGTCTCTCTACTCTCTGTCATTGTCTAATAGACTTTTGAAGTATATATGTTGCTATTGA
TCTGAGTTTGGCCCTGTGATGCATGCATGCTGTTTATACG

QA 1 880 1 880
DS 

RD RS1H107TF 673 0 0
G
CGTGGTTCCCGATTACTTCTATGGAGATCCTTATGACCCCTCTCATCAGGAGAGACCAGT
CCATGTCTGGATCAAAGACCATGGCCCTGATAAGGGGTTTGAAGACACAAAGCCAGTACT
TGAAGCCATAAAGAACAAAGGTATCACTGCCATTGGAGCTGCTGGGATGTGCTGGGGTGG
AAAAGTGGTTGTGGAATTGTCAAAACAAGAGCTTATCCAAGCCGCTGTTTTGCTTCATCC
TACTTATGTCACTGTGGATGATATCAAGGGTGTGAAGGTTCCAATAGCTATACTAGGAGC
TGAGGATGATTTTTTGACCCCACCAGCTCTCGTGAAGCAATTTGAAGAGATTCTTGCTTC
CAAGCCCGAGGTGAGTAGTTATGTGAAGATTTTCCTGAATGTCTCACACGGTTGGACAAC
TCGGTACTACCTCAATGACCTAGAGGCTGTTAAAGCTGCAGAAGAAGCTCACAAGGAGAT
GCTTGATTGGTTTGTGACTTACGTCAGATGATTGATTGAGAGAAGGCTCTATCTTACTTA
AGTGATCACATTTGCTACTGTTTGTTGAATGAAAATAAGGAGAGAACTGATAAGTACAAT
AAAACTCATGGGTTGTGTGTGTCTCTCTACTCTCTGTCATTGTCTAATAGACTTTTGAAG
TATATATGTTGC

QA 2 673 2 673
DS 



AS 1 5

CO CL1613Contig1 759 5 3 U
GGCAACAACATCGATTGGTACTTTTATTAATCAAATGCAAAAGAAACAAATACAACAGAT
ATGGATGAACAATGAAGCAAAAGAAGTATAAACTTGCAGATAACACACACAAACCCATAC
ATAATCCATATTATTGCATGTGAACGTTACATTCACCGTTTAAAACAATCCAAGAGAAAT
ACGTACAACAGAAATAATCACCAATTAAAAAACCACAAGAAGACAAGGTAATAAGTTCAA
GCATTCGTAAACCTTATGATTTTTTTTCTTAAGGTTGGCTTTAGATAAGTATTCAACTTA
TGCGCATAGGAAATTCTTTGGAGCTTTTCTACTACAAACATTGAGGAGTACGCTCAGATT
GATGGGAAGGTTAAGGTTGATGCCAAGAATGCTAGCTTTGAGCATGGTACAGAGACAGAC
CGCAGCTTCAAGGTCAGCCAAGCCTGCAATGAGAGAGCAGCATGGCTTTACGGGTGGGTT
TCCCAATTTTAGGTTCACTAGATTGAGCACATTAGCGCAAACACCTAGCTGTAGGGAATC
TTTAGGACAAGAGCCTGTGCTTGGGGTGCTTGGGGTGCTTGGGGTCGCTGGCGTGGGGAT
GCACTTGTAGCATGTAGCAGAAGTGTAAGTGAAGAAGAGGAGGTTGACAGCAAGGAAGAG
TGAAAGAGAGGTTCTTGGAGCCATTTGTTTGTAGCGGAAATGTTCTAACAAAGACTAAGA
ATTAGTAGTGTGTTTATTTTTCTTGGAGATCGGGTGGCC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1AI90JQ U 1
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TCTACTACAA

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TTT

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CC

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ACACACAAACCCATACATAATCCATATTATTGCATGTGAACGTTACATTCACCGTTTAAA
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QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 3

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CCACATTTTCTGAACTGAGTGTGTTTTGATCGAGGCCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GQ09JQ U 1
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AAC

QA 1 598 1 598
DS 

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GCTCCACATTTTCTGAACTGAGTGTGTTTTGATCGAGGCCC

QA 1 821 1 821
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ACTTGTCGAGGAACTTAGGCTCGATGACGAGCCAGAAGTCTAGCTCCTTTTCATTCTCTC
CGTAGTAACGAAGACGCTCGAACAATTGCTCCTGAA*GTGTTCCTCTTCGTCAAGCATGA
ACTTGGCGTTCGCTACCAGGAAGTAGTACTTGCTGCTAACTCCCTTAATATCAGACTGTT
GTTCAACGGAGGAGGTGGCAGCTGTTATGAAAGAGGGGGAGGAGAAATGTGAGGATAGAG
ACAGAGGCTGCTGCTGCTGAGAGAGAGATGGAGCTTATTTGTCTGCTTGGGAAGAAGAGT
AGAGGAGACGAGTAACGGTTTCGTACGGCAAGCGGCGGCGGTTGGCACCGCCACACCCAA
CGCTCCAGTGACGCTCCACATTTTCTGAACTGAGT
GTGTTTTGATCGAGGCCC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 4

CO CL1615Contig1 1021 4 14 U
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ATACGATTTCAAAATATATTTAGACGAAGTACAAGTTCAAACACATTGTATATATAAAAA
ATTACATAGCATATTTTACAGTACCGCAACGAACGAAAATTAAATTTATGTGACATTCTA
AAAGAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAATGTAAGCTCTAGCTACTTCTTAAATCTTCT
ATTGCCAACCGGAAAACTCGTCGATGGACCACTGACCTTTATTAAAAACATCAACATCCA
TTTCAATCCTCACCAGAACTTATACAGCAATAACTGTCAACTTTAGCTTTGTTCGGAATA
TCATCATTTGACGAATCATCTCGATACACCGAAGCAGACATGCCACTGAATGGTGCATAC
TGAAATGAAGATGAAGGAGGAGTTCTGAATTGATTCACATCATCCATCAACAGTTCTTGA
AACAACTTTTCAAATTCTTCCAAGGTTTCATCTCCCGTAGATGTAGTTTGTGCCATCAGA
GTCACCATCTCATTTATGAAATCAGCCATTCCAGTTTCGTCGTCATCACTGTCGTAAGCT
CCGATGTCATACAACATCCTCTTGTTAGAATCCGACAAAACAGAATAGGCTCGTTGAATG
GACTGAAATTTCGTATTGGCTTTGTCTTTCTCATTTTCTTCACTGAACCGATCTGGATGC
CATTTCAGAGCAAGGTTCTTGTAAGAAAGTTTGAGATCTCCTTGTGAACATTCATTGTTC
AAATCCATAATAGCGTACAAGTCTTCTTTCTCCATTGATGATGATACGAGAATGAGTTAC
ACAGAGAGCTTTGGTCTTGTTTAATATGTGTTAATAAGGTCAAGTCCACGAGTTTATTGG
ATGGAACAAGAGAATAAAAGATCGAAATAAATGTGTGTATAGGTGCAGAGGATTTGCAAA
CGTGGAATAAGAGTAGAAGAGAAGAGAAAAGAGAAAAGCAGAGAAGTTCTTGAGATTTTC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 

AF RS1E333JQ U 91
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AF RS1H410TF C 312
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TCTCCCGTAGATGTAGTTTGTGCCATC

QA 1 447 1 447
DS 

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AAAGAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAGAAAAATGTAAGCTCTAGCTACTTCTTAGATCTTCT
ATTGCCAACCGGAGAACTCGTCGATGGACCACTGACCTTTATTAAAAACATCAACATCCA
TTTCAATCCTCACCAGAACTTATACAGCAATAACTGTCAACTTTAGCTTTGTTCGGAATA
TCATCATTTGACGAATCATCTCGATACACCGAAGCAGACATGCCACTGAATGGTGCATAC
TGAAATGAAGATGAAGGAGGAGTTCTGAATTGATTCACATCATCCATCAACAGTTCTTGA
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CCGATGTCATACA

QA 1 613 1 613
DS 

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AAATTCTTCTAAGGTTTCATCTCCCGTAGATGTAGTTTGTGCCATCAGAGTCACCATCTC
ATTTATGAAATCAGCCATTCCAGTTTCGTCGTCATCACTGTCGTAAGCTCCGATGTCATA
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CGTATTGGCTTTGTCTTTCTCATTTTCTTCACTGAACCGATCTGGATGCCATTTCAGAGC
AAGGTTCTTGTAAGAAAGTTTGAGATCTCCTTGTGAACATTCATTGTTCAAATCCATAAT
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TGGTCTTGTTTAATATGTGTTAATAAGGTCAAGTCCACGAGTTTATTGGATGGAACAAGA
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AGTAGAAGAGAAGAGAAAAGAGAAAAGCAGAGAAGTTCTTGAGATTT
TCC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1E333TF 764 0 0
TCGTCGATGGACCACTGAC*TTTAT*AAAAACATCAACATCCATT*CAATCCTCACCAGA
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ATCTCGATACACCGAAGCAGACATGCCACTGAATGGTGCATACTGAAATGAAGATGAAGG
AGGAGTTTTGAATTGATTCACATCATCCATCAACAGTTCTTGAAACAACTTTTCAAATTC
TTCCAAGGTTTCATCTCCCGTAGATGTAGTTTGTGCCATCAGAGTCACCATCTCATTTAT
GAAATCAGCCATTCCAGTTTCGTCGTCATCACTGTCGTAAGCTCCGATGTCATACAACAT
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GGCTTTGTCTTTCTCATTTTCTTCACTGAACCGATCTGGATGCCATTTCAGAGCAAGGTT
CTTGTAAGAAAGTTTGAGATCTCCTTGTGAACATTCATTGTTCAAATCCATAATAGCGTA
CAAGTCTTCTTTCTCCATTGATGATGATACGAGAATGAGTTACACAGAGAGCTTTGGTCT
TGTTTAATATGTGTTAATAAGGTCAAGTCCACGAGTTTATTGGATGGAACAAGAGAATAA
AAGATCGAAATAAATGTGTGTATAGGTGCAGAGGATTTGCAAACGTGGAATAAGAGTAGA
AGAGAAGAGAAAAGAGAAAAGCAGAGAAGTTCTTGAGATTTTCC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 5

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AATTATTCTCCTCCCATGATAGTTAGCAATCTATCCTAAAATTGATCTTGAAACATAGTG
GACAACATCTGAAACTGGTGGACGTTCAGACTCCTCCAATCAAAACATTTGTGTGCCCCA
TATAGTACAGTTAGACTGTTTCTACAAATGTTCTTCTTTGTTCTCCTTGATTATTAATAG
TAACCACTTCATGATCAACACTATCCTTCACGTTCCTGCTTAGTTCCAGCTTTGGTTGTG
GTGATTCATCATCTACTTGTGGCGTGGAAGGATACTCATAATCTTTTCCTTTGCCCCATA
TCACAAGGTAGAGTCCAGCACATATAACCACCGCACCAAGAACCCTTCCCAAGTACATCT
GCTCAGCAAAGATGACAGTCGACATAATCGCTACTATGATCATGCAGAGAGGACTAAAAG
CTGTTACAAACACAGGACCTCTAGTTTTCATCACCATTCCTCCAACATAGTAAGCAATCG
CAGAGCACACTATCCCACTGTATGCAGCTGTAAGAAGTTCAGTGTCCCAACCAATGGCCC
AGGCTCCAGGGTTTCCTTTCTCCATCACTAATGCCACGGCAGTTCCTTCTATTGTTCCCA
TTAAACATATCCATGCTGTGAGTGAGAGCTCTGCTTGGTAAGTCCTCAATGTAACAGCTT
GGAGAATCATGAAACATGCATAGCTGAAACAACCAATAGTGACCAGAACTGCGCCTTTGA
TGGCACTGTGAATATCAGTCCCAGTTGTGTTTGGTGCAGAGACTCCTTTGGTCCAGAAAA
GGTCAAGAACCGGACCTTTTACAAGAGTCATGATCATAGCTCCTCCTACTGTAGCCAATG
TCCCAATTATCTTACCCGCGCTCCTGATGCAACGTAGGTTCACTCTTTCAAGCCCAAATA
AATAGGCAAGGACAAAAGTGATTGCAGGTAGGACATTGTACATGGCGGTTGCAAATGTAG
CTGTGGTGTATTTCATCCCTAAGTAGTATAAGTTCTGATCGATCACTGGCTCAAGTAGTC
CAAGAAGTGTTATCTTGCCAAATATCATCAACGTCATCTTTGGTCTCACCTTCTTGTCAA
AATAGAAGGCGAACGGGGCCATAACCACGGTAGCAACCGCATGACGGTAAACAACAAGGA
CATAGTTGCTCATGCCTTTGTTTAGGACAGCTTTTGAGAGAATGTCCATTCCTGCTAACC
CTACTTGCAACAATACCACTGAAATAAATGGCCTTGCCTTCTCCATACAATCTCTCTTCT
TTACTTCCTCCATCTTAATAACCTAAATCAACAATCTCCCTATTACTCTGTTTTGATTAT
GTTTAGAAGCAGTAGCAATAGAGATGTGGAGAGGTTTGTTTTCAATTGAATGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RS1FF44JQ U 1
AF RS1D778JQ U 35
AF RS1CB83JQ U 131
AF RS1D778TF C 735
AF RS1CB83TF C 779
BS 1 148 RS1FF44JQ
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BS 150 370 RS1FF44JQ
BS 371 371 RS1D778JQ
BS 372 430 RS1FF44JQ
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BS 490 663 RS1D778JQ
BS 664 664 RS1CB83JQ
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BS 670 897 RS1CB83JQ
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BS 1359 1431 RS1D778TF
BS 1432 1436 RS1CB83TF

RD RS1FF44JQ 465 0 0
AAATCATATTCATTTGTCTATTGCATGAATCCCATTGTTCCATCTCTATTCCTTTTCAAC
AATTATTCTCCTCCCATGATAGTTAGCAATCTATCCTAAAATTGATCTTGAAACATAGTG
GACAACATCTGAAACTGGTGGACGTTCAAACTCCTCCAATCAAAACATTTGTGTGCCCCA
TATAGTACAGTTAGACTGTTTCTACAAATGTTCTTCTTTGTTCTCCTTGATTATTAATAG
TAACCACTTCATGATCAACACTATCCTTCACGTTCCTGCTTAGTTCCAGCTTTGGTTGTG
GTGATTCATCATCTACTTGTGGCGTGGAAGGATACTCATAATCTTTTCCTTTGCCCCATA
TCACAAGGTAAAGTCCAGCACATATAACCACCGCACCAAGAACCCTTCCCAAGTACATCT
GCTCAGCAAAAATGACAGTCGACATAATCCCTACTATGATCATGC

QA 1 465 1 465
DS 

RD RS1D778JQ 635 0 0
TTGTTCCATCTCTATTCCTTTTCAACAATTATTCTCCTCTCATGATAGTTAGCAATCTAT
CCTAAAATTGATCTTGAAACATAGTGGACAACATCTGAAACTAGTGGACGTTCAGACTCC
TCCAATCAAAACATTTGTGTGCCCCATATAGTACAGTTAGACTGTTTCTACAAATGTTCT
TCTTTGTTCTCCTTGATTATTAATAGTAACCACTTCATGATCAACACTATCCTTCACGTT
CCTGCTTAGTTCCAGCTTTGGTTGTGGTGATTCATCATCTACTTGTGGCGTGGAAGGATA
CTCATAATCTTTTCCTTTGCCCCATATCACAAGGTAGAGTCCAGCACATATAACCACCGC
ACCAAGAACCCTTCCCAAGTACGTCTGCTCAGCAAAGATGACAGTCGACATAATCGCTAC
TATGATCATGCAGAGAGGACTAAAAGCTGTTACATACACAGGACCTCTAGTTTTCATCAC
CATTCCTCCAACATAGTAAGCAATCGCAGAGCACACTATCCCACTGTATGCAGCTGTAAG
AAGTTCAGTGTCCCAACCAATGGCCCAGGCTCCAGGGTTTCCTTTCTCCATCACTAATGC
CACGGCAGTTCCTTCTATTGTTCCCATTAGACATA

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1CB83JQ 767 0 0
GAAACTGGTGGACGTTAAGACTCCTCCAATCAAAACATTTGTGTGCCCCATATAGTACAG
TTAGACTGTTTCTACAAATGTTCTTCTTTGTTCTCCTTGATTATTAATAGTAACCACTTC
ATGATCAACACTATCCTTCACGTTCCTGCTTAGTTCCAGCTTTGGTTGTGGTGATTCATC
ATCTACTTGTGGCGTGGAAGGATACTCATAATCTTTTCCTTTGCCCCATATCACAAGGTA
GAGTCCAGCACATATAACCACCGCACCAAGAACCCTTCCCAAGTACATCTGCTCAGCAAA
GATGACAGTCGACATAATCGCTACTATGATCATGCAGAGAGGACTAAAAGCTGTTACAAA
CACAGGACCTCTAGTTTTCATCACCATTCCTCCAACATAGTAAGCAATCGCAGAGCACAC
TATCCCACTGTATGCAGCTGTAAGAAGTTCAGTGTCCCAACCAATGGCCCAGGCTCCAGG
GTTTCCTTTCTCCATCACTAATGCCACGGCAGTTCCTTCTATTGTTCCCATTAAACATAT
CCATGCTGTGAGTGAGAGCTCTGCTTGGTAAGTCCTCAATGTAACAGCTTGGAGAATCAT
GAAACATGCATAGCTGAAACAACCAATAGTGACCAGAACTGCGCCTTTGATGGCACTGTG
AATATCAGTCCCAGTTGTGTTTGGTGCAGAGACTCCTTTGGTCCAGAAAAGGTCAAGAAC
CGGACCTTTTACAAGAGTCATGATCATAGCTCCTCCTACTGTAGCCA

QA 1 767 1 767
DS 

RD RS1D778TF 699 0 0
CATGCATAGCTGAAACAACCAATAGTGACCAGAACTGCGC*TTTGATGGCACTGTGAATA
TCAGTCCCAGTTGTGTTTGGTGCGGAGACTCCTTTGGTCCAGAAAAGGTCAAGAACCGGA
CCTTTTACAAGAGTCATGATCATAGCTCCTCCTACTGTAGCCAATGTCCCAATTATCTTA
CCCGCGCTCCTGATGCAACGTAGGTTCACTCTTTCAAGCCCAAATAAATAGGCAAGGACA
AAAGTGATTGCTGGTAGGACATTGTACATGGCGGTTGCAAATGTAGCTGTGGTGTATTTC
ATCCCTAAGTAGTATAAGTTCTGATCGATCACTGGCTCAAGTAGTCCAAGAAGTGTTATC
TTGCCAAATATCATCAACGTCATCTTTGGTCTCACCTTCTTGTCAAAATAGAAGGCGAAC
GGGGCCATAACCACGGTAGCAACCGCATGACGGTAAACAACAAGGACATAGTTGCTCATG
CCTTTGTTTAGGACAGCTTTTGAGAGGATGTCCATTCCTGCTAACCCTACTTGCAACAAT
ACCACTGAAATAAATGGCCTTGCCTTCTCCATACAATCTCTCTTCTTTACTTCCTCCATC
TTAATAACCTAAATCAACAA****CCTATTACTCTGTTTTGATTATGTTTAGAAGCAGTA
GCAATAGAGATGTGGAGAGGTTTGTTTTCAATTGAAT
CC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RS1CB83TF 658 0 0
GATGGCACTGTGAATATCAGTCCCAGTTGTGTTTGGTGCAGAGACTCCTTTGGTCCAGAA
AAGGTCAAGAACCGGACCTTTTACAAGAGTCATGATCATAGCTCCTCCTACTGTAGCCAA
TGTCCCAATTATCTTACCCGCGCTCCTGATGCAACGTAGGTTCACTCTTTCAAGCCCAAA
TAAATAGGCAAGGACGAAAGTGATTGCAGGTAGGACATTGTACATGGCGGTTGCAAATGT
AGCTGTGGTGTATTTCATCCCTAAGTAGTATAAGTTCTGATCGATCACTGGCTCAAGTAG
TCCAAGAAGTGTTATCTTGCCAAATATCATCAACGTCATCTTTGGTCTGGCCTTCTTGTC
GAAATAGAAGGCGAACGGGGCCATAACCACGGTAGCAACCGCATGACGGTAAACAACAAG
GACATAGTTGCTCATGCCTTTGTTTAGGACAGCTTTTGAGAGAATGTCCATTCCTGCTAA
CCCTACTTGCAACAATACCACTGAAATAAATGGCCTTGCCTTCTCCATACAATCTCTCTT
CTTTACTTCCTCCATCTTAATAACCTAAATCAACAATCTCCCTATTACTCTGTTTTGATT
ATGTTTAGAAGCAGTAGCAATAGAGATGTGGAGAGGTTTGTTTTCAATTGAATGATCC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 2 5

CO CL1617Contig1 637 3 1 U
GCCAATAGTTCCAAAGCTAATAAAAATAAAACTGAATGTATTACAATTTTTGCCATATAC
TAGAGCAAAAAACTTAAAATTACAAAGAGAAAAGGAGGTTGCCAACTTATATATATGATA
TAAGTACATGGACCTTGCCAAAATATATTAATTGGATAGAAAGAAGCTAGCCAAAATATA
CTATGCGGCTAATTACTTTTATTATTGATGATTATATATATGAAATTGCTTCATGAGGCA
AAGCAGCCAAGGTTGCAGTTGTAAACGGGTTCAAGAGATAAATCAAGGTCGTTTCTCCTC
ATTGCCATTGGATCATCCTCTTCTTGATATAGGCCACCCATGTTGAGAAAAGGAGATGGC
TGATGAGAGAGAATGTATGGATGCTGGATTTGATGCTGCTGCGGGGGCGGAGGCAAATTT
TGGCCATGGTTCTGCTGGTCCCATTGCTCTTGCTGTGCCCTAAGAACTTTTTCCCTCTCC
TTGATCTGACAAGTTCCAATTTCACACACCAATTTGTTACCAACTTGTTCCATGCCATAT
TACATCATTATCAATTTTCAGAGCTACAACTTCATAACAAATAGATGATGTAACTGCATT
TTGATCTTTTGTTACACCTAGTGCCTTGCACTCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AE60JQ U 136
AF RS1BE81JQ U 1
AF RS1BE81TF C 1
BS 1 637 RS1BE81JQ

RD RS1AE60JQ 205 0 0
TGCCAAAATATATTAATTGGATAGAAAGAAGCTAGTCAAAATATACTATGCGGCTAATTA
CTTTTATTATTGATGATTATATATATGAAATTGCTTCATGAGGCAAAGCAGCCAAGGTTG
CAGTTGTAAACGGGTTCAAGAGATAAATCAAGGTCGTTTCTCCTCATTGCCATTGGATCA
TCCTCTTCTTGATATACGCCACC
GC

QA 1 203 1 203
DS 

RD RS1BE81JQ 637 0 0
GCCAATAGTTCCAAAGCTAATAAAAATAAAACTGAATGTATTACAATTTTTGCCATATAC
TAGAGCAAAAAACTTAAAATTACAAAGAGAAAAGGAGGTTGCCAACTTATATATATGATA
TAAGTACATGGACCTTGCCAAAATATATTAATTGGATAGAAAGAAGCTAGCCAAAATATA
CTATGCGGCTAATTACTTTTATTATTGATGATTATATATATGAAATTGCTTCATGAGGCA
AAGCAGCCAAGGTTGCAGTTGTAAACGGGTTCAAGAGATAAATCAAGGTCGTTTCTCCTC
ATTGCCATTGGATCATCCTCTTCTTGATATAGGCCACCCATGTTGAGAAAAGGAGATGGC
TGATGAGAGAGAATGTATGGATGCTGGATTTGATGCTGCTGCGGGGGCGGAGGCAAATTT
TGGCCATGGTTCTGCTGGTCCCATTGCTCTTGCTGTGCCCTAAGAACTTTTTCCCTCTCC
TTGATCTGACAAGTTCCAATTTCACACACCAATTTGTTACCAACTTGTTCCATGCCATAT
TACATCATTATCAATTTTCAGAGCTACAACTTCATAACAAATAGATGATGTAACTGCATT
TTGATCTTTTGTTACACCTAGTGCCTTGCACTCATCC

QA 1 637 1 637
DS 

RD RS1BE81TF 637 0 0
GCCAATA
GTTCCAAAGCTAATAAAAATAAAACTGAATGTATTACAATTTTTGCCATATACTAGAGCA
AAAAACTTAAAATTACAAAGAGAAAAGGAGGTTGCCAACTTATATATATGATATAAGTAC
ATGGACCTTGCCAAAATATATTAATTGGATAGAAAGAAGCTAGCCAAAATATACTATGCG
GCTAATTACTTTTATTATTGATGATTATATATATGAAATTGCTTCATGAGGCAAAGCAGC
CAAGGTTGCAGTTGTAAACGGGTTCAAGAGATAAATCAAGGTCGTTTCTCCTCATTGCCA
TTGGATCATCCTCTTCTTGATATAGGCCACCCATGTTGAGAAAAGGAGATGGCTGATGAG
AGAGAATGTATGGATGCTGGATTTGATGCTGCTGCGGGGGCGGAGGCAAATTTTGGCCAT
GGTTCTGCTGGTCCCATTGCTCTTGCTGTGCCCTAAGAACTTTTTCCCTCTCCTTGATCT
GACAAGTTCCAATTTCACACACCAATTTGTTACCAACTTGTTCCATGCCATATTACATCA
TTATCAATTTTCAGAGCTACAACTTCATAACAAATAGATGATGTAACTGCATTTTGATCT
TTTGTTACACCTAGTGCCTTGCACTCATCC

QA 8 637 8 637
DS 



CO CL1617Contig2 1147 2 2 U
GGCCGAGACTCAAACACAAGTCTTATTATAAAGGAAATAAAGAAAACTTTCCTAATTGGA
TCATACCAAAGCCTGGGCTCTTCTTTATCTCTCTTCTCGTAGTTTCTTGTTTTTTTGGTT
CTTTTAGAAGAAATAGTTTCTTAAAAAAGGGATCAAAATGGGAAGGGGTAGGGTTCAACT
GAAGAGGATAGAGAACTAGATCAATAGACAAGTGACATTCTCCAAAAGAAGAGCTGGTCT
TTTCAAGAAAGCTCATGAGATCTCTGTTCTCTGTGATGCTGAAGTTGCCCTTGTTGTCTT
CTCCCATAAGGGGAAACTCTTTGAATACTCCACTGATTCTTGCATGGAGAAGATACTTGA
ACGCTATGAGAGGTACTCTTACGCCGAGAGACAGCTTATTGCACCTGAGTCAGACGTCAA
TACGAACTGGTCAATGGAGTATAACAGGCTTAAGGCTAAGATTGAGCTTTTGGAGAGAAA
CCAGAGGCACTATCTTGGGGAAGACTTGCAAGCAATGAGCCCTAAAGAGCTCCAGAATCT
GGGGCAGCAGCTTGACACTGCTCTTAAGCACATCCGATCTAGAAAAAACCAACTTATGCA
TGACTCCGTCAGTGAGCTCCAAAGAAAGGAGAAGGCGATACAGGAAAAACAGCATGCTTT
CCAAACAGATCAAGGAGAGGGAAAAAGTTCTTAGGGCACAGCAAGAGCAATGGGACCAGC
AGAACCATGGCCAAAATTTGCCTCCGCCCCCGCAGCAGCATCAAATCCAGCATCCATACA
TTCTCTCTCATCAGCCATCTCCTTTTCTCAACATGGGTGGCCTATATCAAGAAGAGGATG
ATCCAATGGCAATGAGGAGAAACGACCTTGATTTATCTCTTGAACCCGTTTACAACTGCA
ACCTTGGCTGCTTTGCCTCATGAAGCAATTTCATATATATAATCATCAATAATAAAAGTA
ATTAGCCGCATAGTATATTTTGGCTAGCTTCTTTCTATCCAATTAATATATTTTGGCAAG
GTCCATGTACTTATATCATATATATAAGTTGGCAACCTCCTTTTCTCTTTGTAATTTTAA
GTATTTTGCTCTAGTATATGGCAAAAATTGTAATACATTCAGTTTTATTTTTATTAGCTT
TGGAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DK28TF U 1
AF RS1DK28JQ C 369
BS 1 629 RS1DK28TF
BS 630 1147 RS1DK28JQ

RD RS1DK28TF 629 0 0
GGCCGAGACTCAAACACAAGTCTTATTATAAAGGAAATAAAGAAAACTTTCCTAATTGGA
TCATACCAAAGCCTGGGCTCTTCTTTATCTCTCTTCTCGTAGTTTCTTGTTTTTTTGGTT
CTTTTAGAAGAAATAGTTTCTTAAAAAAGGGATCAAAATGGGAAGGGGTAGGGTTCAACT
GAAGAGGATAGAGAACTAGATCAATAGACAAGTGACATTCTCCAAAAGAAGAGCTGGTCT
TTTCAAGAAAGCTCATGAGATCTCTGTTCTCTGTGATGCTGAAGTTGCCCTTGTTGTCTT
CTCCCATAAGGGGAAACTCTTTGAATACTCCACTGATTCTTGCATGGAGAAGATACTTGA
ACGCTATGAGAGGTACTCTTACGCCGAGAGACAGCTTATTGCACCTGAGTCAGACGTCAA
TACGAACTGGTCAATGGAGTATAACAGGCTTAAGGCTAAGATTGAGCTTTTGGAGAGAAA
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GGGGCAGCAGCTTGACACTGCTCTTAAGCACATCCGATCTAGAAAAAACCAACTTATGCA
TGACTCCGTCAGTGAGCTCCAAAGAAAGG

QA 1 629 1 629
DS 

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GAGA
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AATGGAGTATAACAGGCTTAAGGCTAAGATTGAGCTTTTGGAGAGAAACCAGAGGCACTA
TCTTGGGGAAGACTTGCAAGCAATGAGCCCTAAAGAGCTCCAGAATCTGGGGCAGCAGCT
TGACACTGCTCTTAAGCACATCCGATCTAGAAAAAACCAACTTATGCATGACTCCGTCAG
TGAGCTCCAAAGAAAGGAGAAGGCGATACAGGAAAAACAGCATGCTTTCCAAACAGATCA
AGGAGAGGGAAAAAGTTCTTAGGGCACAGCAAGAGCAATGGGACCAGCAGAACCATGGCC
AAAATTTGCCTCCGCCCCCGCAGCAGCATCAAATCCAGCATCCATACATTCTCTCTCATC
AGCCATCTCCTTTTCTCAACATGGGTGGCCTATATCAAGAAGAGGATGATCCAATGGCAA
TGAGGAGAAACGACCTTGATTTATCTCTTGAACCCGTTTACAACTGCAACCTTGGCTGCT
TTGCCTCATGAAGCAATTTCATATATATAATCATCAATAATAAAAGTAATTAGCCGCATA
GTATATTTTGGCTAGCTTCTTTCTATCCAATTAATATATTTTGGCAAGGTCCATGTACTT
ATATCATATATATAAGTTGGCAACCTCCTTTTCTCTTTGTAATTTTAAGTATTTTGCTCT
AGTATATGGCAAAAATTGTAATACATTCAGTTTTATTTTTATTAGCTTTGGAACC

QA 5 779 5 779
DS 



AS 1 4

CO CL1618Contig1 852 4 15 U
GGGTAAAGGAATCTGTTTCCGTTGTCCAAAAAAAAAAAAAGGAATCTGTTTCCTTCTTCT
CAACTGAAACTTCTTCAGCGGATCTGAATCATTTCGACTCAACATTTGAAGGGAAGGGAA
GGGAAGGGAAAGAAGAATCAATCATGGGTTGGATCGGAGAAACAATGGATTCCATCAAAT
CAATCAAGATCCGTCAGCTTCTCACTCAGGCCGTCACCCTCGGTATGATAGTGACGTCGG
CATTGATAATATGGAAGGGGTTGATGTGTGTGACTGGCACTGAATCTCCAGTTGTTGTTG
TTCTCTCTGGAAGCATGGAACCTGGCTTTCAGAGAGGGGATATATTGTTCTTGACCATGA
CCAAAGAGCCCATTAGAACAGGCGAGATTGTTGTTTTCAAAATTGATGGTCGTGATATAC
CCATCGTCCATCGTGCAATCGAAGTTCATGAGAGGAAAACTACTGGAGCAGTTGATGTTC
TAACAAAAGGTGACAACAATGAGGTGGATGACGTCGGTCTCTATGCTGATGGACAAATGT
GGCTTCATCGTCACCATATAATGGGCAGAGCTGTTGCGTTCTTGCCTTATGTTGGATGGG
TTACTATTATCATGACAGAAAAGCCTATCATCAAGTATATACTCATCGGTGCATTGGGTC
TGCTCGTTATAACATCCAAAGACTGAGACAACAATACATAAAGACGGGTCTATGGTGTGG
GGAAGTGGCTCCTGCAAGTGCAACCCTCGTCATCTTTTGAACTCATTCCTTAAACCAAAG
AAACAAAACCAATTTTATGATTGAATTTTAGAATCTTATAACCCAAATTTAATAAATGTA
TTAAGTTTTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AV75TF U 36
AF RS1ET23TF U 1
AF RS1CG33TF U 34
AF RS1ET23JQ C 154
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GG
AAAGAAATCTGTTTCCTTCTTCTCAACTGAAACTTCTTCAGCGGATCTGAATCATTTTGA
CCCAAAATTTGAAGGGAAGGGAAGGG***GGAAAGAAGAATCAATCATGGGTTGGATCGG
AGAAACAATGGATTCCATCAAATCAATCAAGATCCGCCAGCTTCTCACTCAGGCCGTCAC
CCTCGGTATGATAGTGACGTCGGCATTGATAATATGGAAGGGGTTGATGTGTGTGACTGG
CACTGAATCTCCAGTTGTTGTTGTTCTCTCTGGAAGCATGGAACCTGGCTTTCAGAGAGG
GGATATATTGTTCTTGACCATGACCAAAGATCCCATTAGAACAGGCGAGATTGTTGTTTT
CAAAATTGATGGTCGTGATATACCCATCGTCCATCGTGCTATCGAAGTCCATGAGAGGAA
ATCTACTGGAGCAGTTGATGTTCTAACGAAAGGTGACAACAACGAGGTGGATGACATCGG
TCTCTATGCTGATGGACAAATGTGGCTTCATCGTCACCATATAATGGGCAGAGCTGTTGC
GTTCTTGCCTTATGTTGGATGGGTGACAATTATCATGACAGAAAAGCCTATCATCAAGTA
TATACTCATTGGTGCGTTGGGTCTGCTCGTTATAACATCCAAAGACTGAGACAACAATAC
ATAAAGACGG*TCTATGGTG
GTGG

QA 3 682 3 682
DS 

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CAACTGAAACTTCTTCAGCGGATCTGAATCATTTCGACTCAACATTTGAAGGGAAGGGAA
GGGAAGGGAAAGAAGAATCAATCATGGGTTGGATCGGAGAAACAATGGATTCCATCAAAT
CAATCAAGATCCGTCAGCTTCTCACTCAGGCCGTCACCCTCGGTATGATAGTGACGTCGG
CATTGATAATATGGAAGGGGTTGATGTGTGTGACTGGCACTGAATCTCCAGTTGTTGTTG
TTCTCTCTGGAAGCATGGAACCTGGCTTTCAGAGAGGGGATATATTGTTCTTGACCATGA
CCAAAGAGCCCATTAGAACAGGCGAGATTGTTGTTTTCAAAATTGATGGTCGTGATATAC
CCATCGTCCATCGTGCAATCGAAGTTCATGAGAGGAAAACTACTGGAGCAGTTGATGTTC
TAACAAAAGGTGACAACAATGAGGTGGATGACGTCGGTCTCTATGCTGATGGACAAATGT
GGCTTCATCGTCACCATATAATGGGCAGAGCTGTTGCGTTCTTGCCTTATGTTGGATGGG
TTACTATTATCATGACAGAAAAGCCTATCATCAAGTATATACTCATCGGTGCATTGGGTC
TGCTCGTTATAACATCCAAAGACTGAGACAACA*TACATAAAGACGG*TCTATGGTGTGG
GGAAGTGGCTCCTGCA*GTGCA*CCCTCGTCATCTT

QA 1 756 1 756
DS 

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GGGA
AAAGGAATCTGTTTCCTTCTTCTCAACTGAAACTTCTTCAGCGGATCTGAATCATTTCGA
CTCAACATTTGAAGGGAAGGGAAGGGAAGGGAAAGAAGAATCAATCATGGGTTGGATCGG
AGAAACAATGGATTCCATCAAATCAATCAAGATCCGTCAGCTTCTCACTCAGGCCATCAC
CCTCGGTATGATAGTGACGTCGGCATTGATAATATGGAAGGGGTTGATGTGTGTGACTGG
CACTGAATCTCCAGTTGTTGTTGTTCTCTCTGGAAGCATGGAACCTGGCTTTCAGAGAGG
GGATATATTGTTCTTGACCATGACCAAAGAGCCCATTAGAACAGGCGAGATTGTTGTTTT
CAAAATTGATGGTCGTGATATACCCATCGTCCATCGTGCAATCGAAGTTCATGAGAGGAA
AACTACTGGAGCAGTTGATGTTCTAACAAAAGGTGACAACAATGAGGTGGATGACATCGG
TCTCTATGCTGATGGACAAATGTGGCTTCATCGTCACCATATAATGGGCAGAGCTGTTGC
GTTCTTGCCTTATGTTGGATGGGTTACTATTATCATGACAGAAAAGCCTATCATCAAGTA
TATACTCATCGGTGCATTGGGTCTGCTCGTTATAACATCCAAAGACTGAGACAACAATAC
ATAAAGACGGGTCTATGGTGTGGGGAAGTGGCTCCTGCAAGTGCAACCCTCGTCATCTTT
TGAACTCATTCCTTAA*CCAAAGAAC**AAACCAATTTTATGATT

QA 5 769 5 769
DS 

RD RS1ET23JQ 699 0 0
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TCACCCTCGGTATGATAGTGACGTCGGCATTGATAATATGGAAGGGGTTGATGTGTGTGA
CTGGCACTGAATCTCCAGTTGTTGTTGTTCTCTCTGGAAGCATGGAACCTGGCTTTCAGA
GAGGGGATATATTGTTCTTGACCATGACCAAAGAGCCCATTAGAACAGGCGAGATTGTTG
TTTTCAAAATTGATGGTCGTGATATACCCATCGTCCATCGTGCAATCGAAGTTCATGAGA
GGAAAACTACTGGAGCAGTTGATGTTCTAACAAAAGGTGACAACAATGAGGTGGATGACG
TCGGTCTCTATGCTGATGGACAAATGTGGCTTCATCGTCACCATATAATGGGCAGAGCTG
TTGCGTTCTTGCCTTATGTTGGATGGGTTACTATTATCATGACAGAAAAGCCTATCATCA
AGTATATACTCATCGGTGCATTGGGTCTGCTCGTTATAACATCCAAAGACTGAGACAACA
ATACATAAAGACGGGTCTATGGTGTGGGGAAGTGGCTCCTGCAAGTGCAACCCTCGTCAT
CTTTTGAACTCATTCCTTAAACCAAAGAAACAAAACCAATTTTATGATTGAATTTTAGAA
TCTTATAACCCAAATTTAATAAATGTATTAAGTTTTGGT

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 5

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GGTCGTCAGTGTGCACGACCGAGAGAGAGATGGCGGCGAAATCGATGGCGACGCTTGATT
CTGGCACAACCTGCTCCTCATGGAACTACTCCGGCCACCGATTAGCCGCCGGATCCATAG
ACGGAACCCTCTCCGTTTACGACTCTCCCGTTCCATCTTCCTCTTCTTCTTTCACTAGCA
GTTCCAAAGTTAGGGTTAGCGAATCGAGTCTTGTAAAGATCCTCTGGCTTCCTTCGGAAT
ACGGCGATGCAGTCGCCTGCATTTGCGAAGACGGCAGCTTATCAATTTGGGAGGAGGTCT
CTCAAGACACGCATGCTCTTGAGTGGAAACTGCGTAAGAGCATGATGAACAAGTCTACCC
AAGTGCTTGATGTTCAGTTTGGGGTCTCCAAAAAGAGTCTAAAGATGGTTGCAGCATATT
CAGATGGGTACATTAGGGTCTTTGAGCTATTGAATCCATTGGAACTGAAAAACTGGCAAC
TTCAGGCTGAGTTTCAGAATGTTATTGATTCTCTGTCGGCTCTGGGCAAACCATCAACCC
TGTCTGCATCTGTTTCTTGGAATCCAATGAGGAGTGGGGAGCAAGAACCCAGCTTTGTTT
TAGCTTTCAACTCTGATTCTCCTCATCTTAATTCTTCCAAGATCTGGGAGTTTGACGAAG
CTCATAACAGATGGTTGGCTGTAGCAGAATTAGCCTCACCAGAAGACAAAGGTGATCCAG
TTTATGCTGTCTCGTGGGCCCCAAATATTGGCCGACCATACGAGGTTGTTGCTGTTGCAA
CTCATAAAGGCATAGGGATATGGCAAGTTGGTCTGGCTCCTGACCTTGATGGAAGGCTTC
CTGTAAAGAAGGCCGCCTCGCTTTCTGGTCATCAAGGCGAGGTTTGGCAGATGGAATGGG
ACACGAGTGGCATGACTTTAGCTACCACTGGAAGCGATGGGATGGTCAGATTGTGGCAGT
CCAACTTAAATGGTGAGTGGCACGAACAGGCCATGCTCGAACCAGTCTCCTCCTGAAGAT
TCCGGACTCACTTATTTAGAGTTTAGTTCGATGATTCATATCTTTCAATGTGAGTTAAAA
GGTTTTTAAGCTTTCTATTGTATAACAAATCATATCTTACAATGGTTTCAATTTCATCTC
GGTCTTGACGTTAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GT96TF U 1
AF RS1CM11TF U 28
AF RS1CG10JQ C 646
AF RS1CG10TF U 523
AF RS1CM11JQ C 570
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BS 1086 1086 RS1CG10JQ
BS 1087 1158 RS1CG10TF

RD RS1GT96TF 666 0 0
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CTGGCACAACCTGCTCCTCATGGAACTACTCCGGCCACCGATTAGCCGCCGGATCCATAG
ACGGAACCCTCTCCGTTTACGACTCTCCCGTTCCATCTTCCTCTTCTTCTTTCACTAGCA
GTTCCAAAGTTAGGGTTAGCGAATCGAGTCTTGTAAAGATCCTCTGGCTTCCTTCGGAAT
ACGGCGATGCAGTCGCCTGCATTTGCGAAGACGGCAGCTTATCAATTTGGGAGGAGGTCT
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TTCAGGCTGAGTTTCAGAATGTTATTGATTCTCTGTCGGCTCTGGGCAAACCATCAACCC
TGTCTGCATCTGTTTCTTGGAATCCAATGAGGAGTGGGGAGCAAGAACCCAGCTTTGTTT
TAGCTTTCAACTCTGATTCTCCTCATCTTAATTCTTCCAAGATCTGGGAGTTTGACGAAG
CTCATA

QA 1 666 1 666
DS 

RD RS1CM11TF 668 0 0
G
GATGGCGGCGAAATCGATGGCGACGCTTGATTCTGGCACAACCTGCTCCTCATGGAACTA
CTCCGGCCACCGATTAGCCGCCGGATCCATAGACGGAACCCTCTCCGTTTACGACTCTCC
CGTTCCATCTTCCTCTTCTTCTTTCACTAGCAGTTCCAAAGTTAGGGTTAGCGAATCGAG
TCTTGTAAAGATCCTCTGGCTTCCTTCGGAATACGGCGATGCAGTCGCCTGCATTTGCGA
AGACGGCAGCTTATCAATTTGGGAGGAGGTCTCTCAAGACACGCATGCTCTTGAGTGGAA
ACTGCGTAAGAGCATGATGAACAAGTCTACCCAAGTGCTTGATGTTCAGTTTGGGGTCTC
CAAAAAGAGTCTAAAGATGGTTGCAGCATATTCAGATGGGTACATTAGGGTCTTTGAGCT
ATTGAATCCATTGGAACTGAAAAACTGGCAACTTCAGGCTGAGTTTCAGAATGTTATTGA
TTCTCTGTCGGCTCTGGGCAAACCATCAACCCTGTCTGCATCTGTTTCTTGGAATCCAAT
GAGGAGTGGGGAGCAAGAACCCAGCTTTGTTTTAGCTTTCAACTCTGATTCTCCTCATCT
TAATTCTTCCAAGATCTGGGAGTTTGACGAAGCTCATAACAGATGGTTGGCTGTAGCAGA
ATTAGCC

QA 2 668 2 668
DS 

RD RS1CG10JQ 475 0 0
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ACAAAGGTGATCCAGTTTATGCTGTCTCGTGGGCCCCAAATATTGGCCGACCATACGAGG
TTGTTGCTGTTGCAACTCATAAAGGCATAGGGATATGGCAAGTTGGTTTGGCTCCTGACC
TTGATGGAAGGCTTCCTGTAAAGAAGGCCGCCTCGCTTTCTGGTCATCAAGGCGAGGTTT
GGCAGATGGAATGGGACACGAGTGGCATGACTTTAGCTACCACTGGAAGCGATGGGATGG
TCAGATTGTGGCAGTCCAACTTAAATGGTGAGTGGCACGAACAGGCCATGCTCGAACCAG
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CAATGTGAGTTAAAAGGTTTTTAAGCTTTTTATTGTATAACAAATCATATCTTAC

QA 1 475 1 475
DS 

RD RS1CG10TF 636 0 0
G
GGGCAAACCATCAACCCTGTCTGCATCTGTTTCTTGGAATCCAATGAGGAGTGGGGAGCA
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CTGGGAGTTTGACGAAGCTCATAACAGATGGTTGGCTGTAGCAGAATTAGCCTCACCAGA
AGACAAAGGTGATCCAGTTTATGCTGTCTCGTGGGCCCCAAATATTGGCCGACCATACGA
GGTTGTTGCTGTTGCAACTCATAAAGGCATAGGGATATGGCAAGTTGGTCTGGCTCCTGA
CCTTGATGGAAGGCTTCCTGTAAAGAAGGCCGCCTCGCTTTCTGGTCATCAAGGCGAGGT
TTGGCAGATGGAATGGGACACGAGTGGCATGACTTTAGCTACCACTGGAAGCGATGGGAT
GGTCAGATTGTGGCAGTCCAACTTAAATGGTGAGTGGCACGAACAGGCCATGCTCGAACC
AGTCTCCTCCTGAAGATTCCGGACTCACTTATTTAGAGTTTAGTTCGATGATTCATATCT
TTCAATGTGAGTTAAAAGGTTTCTAAGCTTTCTATTGTATAACAAATCATATCTTACAAT
GGTTTCAATTTCATCTCGGTCTTGACGTTAAAAAA

QA 2 636 2 636
DS 

RD RS1CM11JQ 572 0 0
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AATTCTTCCAAGATCTGGGAGTTTGACGAAGCTCATAACAGATGGTTGGCTGTAGCAGAA
TTAGCCTCACCAGAAGACAAAGGTGATCCAGTTTATGCTGTCTCGTGGGCCCCAAATATT
GGCCGACCATACGAGGTTGTTGCTGTTGCAACTCATGAAGGCATAGGGATATGGCAAGTT
GGTCTGGCTCCTGACCTTGATGGAAGGCTTCCTGTAAAGAAGGCCGCCTCGCTTTCTGGT
CATCAAGGCGAGGTTTGGCAGATGGAATGGGACATGAGTGGCATGACTTTAGCTACCACT
GGAAGCGACGGGATGGTCAGATTGTGGCAGTCCAACTTAAATGGTGAGTGGCACGAACAG
GCCATGCTCGAACCAGTCCCCTCCTGAAGATTCCGGACTCACTTATTTAGAGTTTAGTTC
GATGATTCATATCTTTCAATGTGAGTTAAAAGGTTTTTAAGCTTTCTATTGTATAACAAA
TCATATCTTACAATGGTTTCAATTTCATCTCG

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 5

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GGATCGCCGTAAAAATAAACTGAAGCAAAAAAATCTCTCTCTATCTGTGTTAGTCAAAAG
CTATGGAGAAACTCATCTACCGAATAACCCTTGTCTTCACCACTCTCTTCCTCTCATTCT
CTCTCTCCTCACCGTCTTCTCCGACGATCCACGACGTTCTTCGATCAAAAGGTCTCCCCG
CGGGACTATTACCCCAAGAGGTTGACTCTTACACTCTTTACAACGACGGTCGTCTCGAGG
TTTTCCTCGCGGCGCCGTGTCTCGCCAAGTCCGTGACGGGAATGCGCTTTGACTCTGTAG
TGAGAGCGAATCTGAGCTACGGGAGCCTTGTCGGAGTAGAAGGATTGTCGCAGTTCGAGC
TGTTTTTGTGGCTGTCGGTGAAAGATATTGTCGTCATGAAACCTGATTCCGGCGTCATTA
TAATCGATATCGGCGTTGCTTATAAACAACTCTCGCGTTCTCTCTTTGAAGATCCTCCCA
AGTGCTTACCTCACGGAGATTT*GAAAAAAAAGACGAGAGGATATGGAGGATTT*GAAGC
TCTCAAGATGAAAAATTTAAAAGAAGGGTGGATATCTCGATTGTTCTTTTGATTTATTCC
*ATATTATGCACTGATCAGAAAAACCAATATGCTAATTATATGAGTCGGTTAGGTTTTTG
TTTAAGAGTTCTTGTAAAGAAAAGATTCTCAATGTTCTATCCTATGTTTTTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 0 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BZ32TF U 474
AF RS1D119TF U 1
AF RS1BC22TF U 4
AF RS1D119JQ C 476
AF RS1BC22JQ C 240
BS 1 32 RS1D119TF
BS 33 33 RS1BC22TF
BS 34 148 RS1D119TF
BS 149 149 RS1BC22TF
BS 150 154 RS1D119TF
BS 155 155 RS1BC22TF
BS 156 247 RS1D119TF
BS 248 248 RS1BC22TF
BS 249 331 RS1D119TF
BS 332 332 RS1BC22TF
BS 333 361 RS1D119TF
BS 362 362 RS1BC22TF
BS 363 396 RS1D119TF
BS 397 397 RS1BC22TF
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BS 555 555 RS1BC22TF
BS 556 664 RS1D119TF
BS 665 665 RS1BC22TF
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BS 684 710 RS1BC22TF
BS 711 716 RS1BC22JQ

RD RS1BZ32TF 151 0 0
TCCCCAAGTTGTTTA
CCTCACGGAGATTTTGAAAAAAAAGACGAGAGGATATGGAGGATTTTGAAGCTCTCAAGA
TGAAAAATTTAAAAGAAGGGTGGATATCTCGATTGTTCTTTTGATTTATTCCCATATTAT
GCACTGATCAGAAAAA

QA 16 151 16 151
DS 

RD RS1D119TF 699 0 0
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CTATGGAGAAACTCATCTACCGAATAACCCTTGTCTTCACCACTCTCTTCCTCTCATTCT
CTCTCTCCTCACCGTCTTCTCCGACGATTCACGATGTTCTTCGATCAAAAGGTCTCCCCG
CGGGACTATTACCCCAAGAGGTTGACTCTTACACTCTTTACAACGACGGTCGTCTCGAGG
TTTTCCTTGCGGCGCCGTGTCTCGCCAAGTCCGTGACGGGAATGCGCTTTGACTCTGTAG
TGAGAGCGAATCTGAGCTACGGGAGCCTTGTTGGAGTAGAAGGATTGTCGCAGTTCGAGC
TATTTTTGTGGCTGTCGGTGAAAGATATTGTCGTCAAGAAACCTGATTCCGGCGTCATTA
TAAT*GATATCGGCGTTGCTTATAAACAACTCTCGCGTTCTCTCTTTGAAGATCCTCCCA
AGTGCTTACCTCACGGAGATTT*GAAAAAAAAGACGAGAGGATATGGAGGATTT*GAAGC
TCTCAAGATGAAAATTTTAAAAGAAGGGTGGATATCTCGATTGTTCTTTTGATTTATTCC
*ATATTATGCACTGATCAGAAAAACCAATATGCTAATTATATGAGTCGGTTAGGTTTTTG
TTTA*GAGTTCTTGTAAAGAAA
AGATTCTCATGTTCTAT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1BC22TF 712 0 0
GG
GCCGTAAAAATAAACTGAAGCAAAAAAATCTCTCTCTATCTGTGTTAGTCAAAAGCTATG
GAGAAACTCATCTACCGAATAACCCTTGTCTTCACCACTCTCTTCCTCTCATTCTCTCTC
TCCTCACCGTCTTCTCCGACGATCCACGACGTTCTTCGATCAAAAGGTCTCCCCGCGGGA
CTATTACCCCAAGAGGTTGACTCTTACACTCTTTACAACGACGGTCGTCTCGAGGTTTTC
CTCGCGGCGCCGTGTCTCGCCAAGTCCGTGACGGGAATGCGCTTTGACTCTGTAGTGAGA
GCGAATCTGAGCTACGGGAGCCTTGTCGGAGTAGAAGGATTGTCGCAGTTCGAGCTGTTT
TTGTGGCTGTCGGTGAAAGATATTGTCGTCATGAAACCTGATTCCGGCGTCATTATAATC
GATATCGGCGTTGCTTATAAACAACTCTCGCGTTCTCTCTTTGAAGATCCTCCCAAGTGT
TTACCTCACGGAGATTT*GAAAAAAAAGACGAGAGGATATGGAGGATTT*GAAGCTCTCA
AGATGAAAAATTTAAAAGAAGGGTGGATATCTCGATTGTTCTTTTGATTTATTCC*ATAT
TATGCACTGATCAGAAAAACCAATATGCTAATTATATGAGTCGGTTAGGTTTTTGTTTAA
GAGTTCTTGTAAAGAAA*GATTCTCAATGTTCTATCCTATGTTTT
GTTCC

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DS 

RD RS1D119JQ 237 0 0
TCCCAAGTGCTTCCCTCACGGAGATTT*GAAAAAAAAGACGAGAGGATATGGAGGATTT*
GAAGCTCTCAAGATGAAAATTTTAAAAGAAGGGTGGATATCTCGATTGTTCTTTTGATTT
ATTCC*ATATTATGCACTGATCAGAAAAACCAATATGCTAATTATATGAGTCGGTTAGGT
TTTTGTTTAAGAGTTCTTGTAAAGAAAAGATTCTCAATGTTCTATCCTATGTTTT
TA

QA 1 235 1 235
DS 

RD RS1BC22JQ 477 0 0
GTTTTCCTCGGGGCGCCGTGTCTCGCCAAGTCCGTGACGGGAATGCGCTTTGACTTTGTA
GTGAGAGGGAATTTGAGCTACGGGAGCCTTGTCGGAGTAGAAGGATTGTCGCAGTTCGAG
CTGTTTTTGTGGCTGTCGGTGAAAGATATTGTCGTCATGAAACCTGATTCCGGGGTCATT
ATAATCGATATCGGCGTTGCTTATAAACAACTCTCGCGTTCTTTCTTTGAAGATCCTCCC
AAGTGTTTCCCTCACGGGGATTT*GAAAAAAAAGACGGGAGGATATGGAGGATTT*GAAG
CTCTCAAGATGAAAAATTTAAAAGAAGGGGGGATATCTCGATTGTTCTTTTGATTTATTC
C*ATATTATGCACTGATCAGAAAAACCAATATGCTAATTATATGAGTCGGTTAGGTTTTT
GTTTAAGAGTTTTTGTAAAGAAAAGATTTTCAATGTTTTTTCCTATGTTTTTGTTCC

QA 1 477 1 477
DS 



AS 2 4

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ACACACACAAGTGTACTCTATAAAAAAAAGTAACAGAAATAAATAAGAAAACAGAAACCT
ACTAGGAGGACCTAAGCAAAGATGGTTTATGTGAACAAGAGGCCGCATATGAAAAACACA
GCGTACAAGCTAAAATCCATAGAAACAGCGTTCATTATCTTCTTCATCGTCAAGACCATC
TCCAGGGCGTTGCCCACTTGCTCCGCTATGCCTTGTTGTCCATTCATTACTGAGTTTTCT
CGCCTTGAAGCCGAGGAAGGTTCTCCATGATGATGGGTCAGTAAAACACGTCCCAGCACA
ATGGTGGCATCGGTCAAGAAAAGCAAGAAAACAGGCCTGAAGCTTACAATGCTGCCTAGG
GAAGAGAAGCCGAGATGAGATAGTAGGACGAGAAGGGCGATCAAAAGAGATGAAAACATC
CGTCCGTATTCGGAAGCATCAATGGCGGCTCCAATTTGTTTTGGAGTGATGGTATTCACA
AAACTAACCAGAGGAGTAAATGCTTGAGAAGCGCCCAAATCTACCACTGATGGGGTTGCA
GGAGACTGTCGTACCCTTGTCTCTCTGGGATCTGAAGCGGAGGCTTCTGCCACTGTTCCA
CTATACTTCAGAGGCTGAAGAGATTATGCTGTGCTTGGATGGATGATACGATCCATATTT
TCAAGCATCGAAGCCTCGGAGATGTTTT


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B433JQ U 2
AF RS1AW93JQ U 1
BS 1 16 RS1AW93JQ
BS 17 17 RS1B433JQ
BS 18 395 RS1AW93JQ
BS 396 396 RS1B433JQ
BS 397 748 RS1AW93JQ

RD RS1B433JQ 440 0 0
GG
ACATTAAAGCTTGCCTTTATTATCAAACAAACCAAATACTGGATTACATATGTTTTGACA
CACACAAGTGTACTCTATAAAAAAA*GTAACAGAAATAAATAAGAAAACAGAAACCTACT
AGGAGGACCTAAGCAAAGATGGTTTATGTGAACAAGAGGCCGCATATGAAAAACACAGCG
TACAAGCTAAAATCCATAGAAACAGCGTTCATTATCTTCTTCATCGTCAAGACCATCTCC
AGGGCGTTGCCCACTTGCTCCGCTATGCCTTGTTGTCCATTCATTACTGAGTTTTCTCGC
CTTGAAGCCGAGGAGGGTTCTCCATGATGATGGGTCAGTAGAACACGTCCCAGCACAATG
GTGGCATCGGTCAAGAGAAGCAAGAAGACAGGCCTGAAGCTTACAATGCTGCCTAGGGAA
GAGAAGCCGAGATGAGAT

QA 3 440 3 440
DS 

RD RS1AW93JQ 748 0 0
CAAACATTAAAGCTTGTCTTTATTATCAAACAAACCAAATACTGGATTACATATGTTTTG
ACACACACAAGTGTACTCTATAAAAAAAAGTAACAGAAATAAATAAGAAAACAGAAACCT
ACTAGGAGGACCTAAGCAAAGATGGTTTATGTGAACAAGAGGCCGCATATGAAAAACACA
GCGTACAAGCTAAAATCCATAGAAACAGCGTTCATTATCTTCTTCATCGTCAAGACCATC
TCCAGGGCGTTGCCCACTTGCTCCGCTATGCCTTGTTGTCCATTCATTACTGAGTTTTCT
CGCCTTGAAGCCGAGGAAGGTTCTCCATGATGATGGGTCAGTAAAACACGTCCCAGCACA
ATGGTGGCATCGGTCAAGAAAAGCAAGAAAACAGGTCTGAAGCTTACAATGCTGCCTAGG
GAAGAGAAGCCGAGATGAGATAGTAGGACGAGAAGGGCGATCAAAAGAGATGAAAACATC
CGTCCGTATTCGGAAGCATCAATGGCGGCTCCAATTTGTTTTGGAGTGATGGTATTCACA
AAACTAACCAGAGGAGTAAATGCTTGAGAAGCGCCCAAATCTACCACTGATGGGGTTGCA
GGAGACTGTCGTACCCTTGTCTCTCTGGGATCTGAAGCGGAGGCTTCTGCCACTGTTCCA
CTATACTTCAGAGGCTGAAGAGATTATGCTGTGCTTGGATGGATGATACGATCCATATTT
TCAAGCATCGAAGCCTCGGAGATGTTTT

QA 1 748 1 748
DS 



CO CL1621Contig2 728 2 6 U
GACGGCGTCTCTAATCTAATCTCCTCCGTCGTGAACTCTGATTCCTCCCAAGACAATGTC
GTCGAACAGCAGAGAAGCGAGGAGGCGGAAGATCTTAGAAAGAGGATCCGATCGTCTGGC
TTTTATCACTGGTCAGATCAACGGCGTTCCTCCTCCTTCTTCCGATCCCACTTCCCTTAC
TCAATCTCATCTCCGCACTAGTGATTCCTCACCGGAGATGATTCCGCCTCGCGATCAGAT
GCCTACGAATCGCGAAACAGCTTTCACCACTCATCAGGAAAACATCTCCGAGGCTTCGAT
GCTTGAAAATATGGATCGTATCATCCATCCAAGCACAGCAGAATCTCTTCAGCCTCTGAA
GTATAGTGGAACAGTGGCAGAAGCCTCCGCTTCAGATCCCAGAGAGACAAGGGTACGACA
GTCTCCTGCAACCCCATCAGTGGTAGATTTGGGCGCTTCTCAAACATTTACTCCTCTGGT
TAGTTTTGTGAATACCATCACTCCAAAACAAATTGGAGCCGCCATTGATGCTTCCGAATA
CGGACGGATGTTCTCATCTCTTTTGATCGCCCTTCTCGTCCTACTATCTCATCTCGGCTT
CTCTTCCCTAGGCAGCATTGTAAGCTTCAGACCTGTCTTCTTGCTTCTCTTGACCGATGC
CACCATTGTGCTGGGACGTGTTCTACTGACCCATCATCATGGAGAACCCTCCTCGGCTTC
AAGCGAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EP52TF U 1
AF RS1B433TF U 58
BS 1 565 RS1EP52TF
BS 566 566 RS1B433TF
BS 567 611 RS1EP52TF
BS 612 612 RS1B433TF
BS 613 708 RS1EP52TF
BS 709 728 RS1B433TF

RD RS1EP52TF 725 0 0
GACGGCGTCTCTAATCTAATCTCCTCCGTCGTGAACTCTGATTCCTCCCAAGACAATGTC
GTCGAACAGCAGAGAAGCGAGGAGGCGGAAGATCTTAGAAAGAGGATCCGATCGTCTGGC
TTTTATCACTGGTCAGATCAACGGCGTTCCTCCTCCTTCTTCCGATCCCACTTCCCTTAC
TCAATCTCATCTCCGCACTAGTGATTCCTCACCGGAGATGATTCCGCCTCGCGATCAGAT
GCCTACGAATCGCGAAACAGCTTTCACCACTCATCAGGAAAACATCTCCGAGGCTTCGAT
GCTTGAAAATATGGATCGTATCATCCATCCAAGCACAGCAGAATCTCTTCAGCCTCTGAA
GTATAGTGGAACAGTGGCAGAAGCCTCCGCTTCAGATCCCAGAGAGACAAGGGTACGACA
GTCTCCTGCAACCCCATCAGTGGTAGATTTGGGCGCTTCTCAAACATTTACTCCTCTGGT
TAGTTTTGTGAATACCATCACTCCAAAACAAATTGGAGCCGCCATTGATGCTTCCGAATA
CGGACGGATGTTCTCATCTCTTTTGGTCGCCCTTCTCGTCCTACTATCTCATCTCGGCTT
CTCTTCCCTAG*CAGCATTGTAAGCTTCAGACCTGTCTTCTTGCTTCTCTTGACCGATGC
CACCATTGTGCTGGGACGTGTTCTACTGACCCATCATCATGGAGAACC
TTCTCGGCTTCAGCGAG

QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1B433TF 671 0 0
GGGG
TCGAACAGCAGAGAAGCGAGGAGGCGGAAGATCTTAGAAAGAGGATCCGATCGTCTGGCT
TTTATCACTGGTCAGATCAACGGCGTTCCTCCTCCTTCTTCCGATCCCACTTCCCTTACT
CAATCTCATCTCCGCACTAGTGATTCCTCACCGGAGATGATTCCGCCTCGCGATCAGATG
CCTACGAATCGCGAAACAGCTTTCACCACTCATCAGGAAAACATCTCCGAGGCTTCGATG
CTTGAAAATATGGATCGTATCATCCATCCAAGCACAGCAGAATCTCTTCAGCCTCTGAAG
TATAGTGGAACAGTGGCAGAATCCTCCGCTTCAGATCCCAGAGAGACAAGGGTACGACAG
TCTCCTGCAACCCCATCAGTGGTAGATTTGGGCGCTTCTCAAGCATTTACTCCTCTGGTT
AGTTTTGTGAATACCATCACTCCAAAACAAATTGGAGCCGCCATTGATGCTTCCGAATAC
GGACGGATGTTCTCATCTCTTTTGATCGCCCTTCTCGTCCTACTATCTCATCTCGGCTTC
TCTTCCCTAGGCAGCATTGTAAGCTTCAGGCCTGTCTTCTTGCTTCTCTTGACCGATGCC
ACCATTGTGCTGGGACGTGTTCTACTGACCCATCATCATGGAGAACCCTCCTCGGCTTCA
AGCGAGA

QA 5 671 5 671
DS 



AS 1 5

CO CL1622Contig1 1006 5 6 U
GGGAGAACAAAGATGACAATGCAAACACTCTGCGTCATCACTCTCTTCATAGCTATCTTC
ACCCCTCAAACCACTTATGCTTACAGATTGAAATTCAACCACTTCGGTAACGGCTCCGAT
CTCTTCTCGTTCCATGGAGACGCAGAGTATGGTCACGGCACCGACGGCACGACCCGGTCC
GGTTCTCTCTCTTTGACCAAAGACAAAATTCCTTTCTCTCATGGTCGAGCCATTTTCATC
AACCCAATCACCTTCAAGCCTCCCAACAACGCTTCTTCTGTTTACCCTTTCAAGACCTCT
TTCACTTTCTCCATCACGCCTCACCGAACAAACCCTACTCCTGGTCACGGTCTCGCCTTC
CTCGTCGTCCCAAGTAACCAACATGCCGGTTCCGGTTTAGGCTACCTAAGTCTCGTGAAC
CGAACCAGCAACGGTCATCCCAGTAACCATCTGTTTGCTGTTGAGTTCGACGTGTTTCAG
GACAAGTCTTTTAAAGACATCAACGATAACCATGTCGGAATCGACATTAATTCGGTCGAT
TCGGTGAAGTCGGTTAAATCCGGTTATTGGGTTATGACAAGAAACGG*TTGGTTGTTCAA
GGACTTGAAGCTGAGCAGTGGAGATAAGTACACGGCTTGGGTCGAGTACAACAACAATTT
AAAAGTAATCTCGGTTACCATCGGTCTCGCGCATTTGAGGAAACCGAACCGACCATTGAT
CGAGGAGAAATTCGACCTCTCTAATGTGCTGCTCGAGAATATGTACGCCGGTTTTACCGG
TTCAATGGGCCGTGGTGTTGAGCGTCACGAGATCTGGGACTGGAGTTTTCAGAATTAGAT
AACAGTGTTTGTTCGATGTGAGATCGGTTTAAATCGGTTTTCCTTTGGTTTGTTTCTTTG
TCTTGTTTTGATAGCTTCTGTTAGTGTCTCCCGCTAATAATTGAAGTGAATAAATGCCCA
AGTTGTCGGTTTCCAAATTTCAAAGAATAATACTCCCTCCTTTCAT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
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AF RS1EL21TF U 1
AF RS1CB87TF U 2
AF RS1F152TF U 1
AF RS1F152JQ C 256
AF RS1CB87JQ C 866
BS 1 543 RS1EL21TF
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RD RS1EL21TF 546 0 0
GGGAGAACAAAGATGACAATGCAAACACTCTGCGTCATCACTCTCTTCATAGCTATCTTC
ACCCCTCAAACCACTTATGCTTACAGATTGAAATTCAACCACTTCGGTAACGGCTCCGAT
CTCTTCTCGTTCCATGGAGACGCAGAGTATGGTCACGGCACCGACGGCACGACCCGGTCC
GGTTCTCTCTCTTTGACCAAAGACAAAATTCCTTTCTCTCATGGTCGAGCCATTTTCATC
AACCCAATCACCTTCAAGCCTCCCAACAACGCTTCTTCTGTTTACCCTTTCAAGACCTCT
TTCACTTTCTCCATCACGCCTCACCGAACAAACCCTACTCCTGGTCACGGTCTCGCCTTC
CTCGTCGTCCCAAGTAACCAACATGCCGGTTCCGGTTTAGGCTACCTAAGTCTCGTGAAC
CGAACCAGCAACGGTCATCCCAGTAACCATCTGTTTGCTGTTGAGTTCGACGTGTTTCAG
GACAAGTCTTTTAAAGACATCAACGATAACCATGTCGGAATCGACATTAATTCGGTCGAT
TCG
TGA

QA 1 543 1 543
DS 

RD RS1CB87TF 658 0 0
GGAGAACAAAGATGACAATGCAAACACTCTGCGTCATCACTCTCTTCATAGCTATCTTCA
CCCCTCAAACCACTTATGCTTACAGATTGAAATTCAACCACTTCGGTAACGGCTCCGATC
TCTTCTCGTTCCATGGAGACGCAGAGTATGGTCACGGCACCGACGGCACGACCCGGTCCG
GTTCTCTCTCTTTGACCAAAGACAAAATTCCTTTCTCTCATGGTCGAGCCATTTTCATCA
ACCCAATCACCTTCAAGCCTCCCAACAACGCTTCTTCTGTTTACCCTTTCAAGACCTCTT
TCACTTCCTCCATCACGCCTCACCGAACAAACCCTACTCCTGGTCACGGTCTCGCCTTCC
TCGTCGTCCCAAGTAGCCAACATGCCGGTTCCGGTTTAGGCTACCTAAGTCTCGTGAACC
GAACCAGCAACGGTCATCCCAGTAACCATCTGTTTGTTGTTGAGTTCGACGTGTTTCAGG
ACAAGTCTTTTAAAGACATCAACGATAACCATGTCGGAATCGACATTAATTCGGTCGATT
CGGTGAAGTCGGTTAAATCCGGTTATTGGGTTATGACAAGAAACGGGTTGGTTGTTCAAG
*ACTTGAAGCTGAGCAGTGGAGATAAGTACACGGCTTGGGTCGAGTACAACAACAATT

QA 1 658 1 658
DS 

RD RS1F152TF 729 0 0
G
GGAGAACAAAGATGACAATGCAAACACTCTGCGTCATCACTCTCTTCATAGCTATCTTCA
CCCCTCAAACCACTTATGCTTACAGATTGAAATTCAACCACTTCGGTAACGGCTCCGATC
TCTTCTCGTTCCATGGAGACGCAGAGTATGGTCACGGCACCGACGGCACGACCCGGTCCG
GTTCTCTCTCTTTGACCAAAGACAAAATTCCTTTCTCTCATGGTCGAGCCATTTTCATCA
ACCCAATCACCTTCAAGCCTCCCAACAACGCTTCTTCTGTTTACCCTTTCAAGACCTCTT
TCACTTTCTCCATCACGCCTCACCGAACAAACCCTACTCCTGGTCACGGTCTCGCCTTCC
TCGTCGTCCCAAGTAACCAACATGCCGGTTCCGGTTTAGGCTACCTAAGTCTCGTGAACC
GAACCAGCAACGGTCATCCCAGTAACCATCTGTTTGCTGTTGAGTTCGACGTGTTTCAGG
ACAAGTCTTTTAAAGACATCAACGATAACCATGTCGGAATCGACATTAATTCGGTCGATT
CGGTGAAGTCGGTTAAATCCGGTTATTGGGTTATGACAAGAAACGG*TTGGTTGTTCAAG
GACTTGAAGCTGAGCAGTGGAGATAAGTACACGGCTTGGGTCGAGTACAACAACAATTTA
AAAGTAATCTCGGTTACCATCGGTCTCGCGCATTTGAG*AAACCGAACCGACCATTGATC
GAG
AGAAA

QA 2 724 2 724
DS 

RD RS1F152JQ 751 0 0
AAGCCTCCCAACAACGCTTCTTCTGTTTACCCTTTCAAGACCTCTTTCACTTTCTCCATC
ACGCCTCACCGAACAAACCCTACTCCTGGTCACGGTCTCGCCTTCCTCGTCGTCCCAAGT
AACCAACATGCCGGTTCCGGTTTAGGCTACCTAAGTCTCGTGAACCGAACCAGCAACGGT
CATCCCAGTAACCATCTGTTTGCTGTTGAGTTCGACGTGTTTCAGGACAAGTCTTTTAAA
GACATCAACGATAACCATGTCGGAATCGACATTAATTCGGTCGATTCGGTGAAGTCGGTT
AAATCCGGTTATTGGGTTATGACAAGAAACGG*TTGGTTGTTCAAGGACTTGAAGCTGAG
CAGTGGAGATAAGTACACGGCTTGGGTCGAGTACAACAACAATTTAAAAGTAATCTCGGT
TACCATCGGTCTCGCGCATTTGAGGAAACCGAACCGACCATTGATCGAGGAGAAATTCGA
CCTCTCTAATGTGCTGCTCGAGAATATGTACGCCGGTTTTACCGGTTCAATGGGCCGTGG
TGTTGAGCGTCACGAGATCTGGGACTGGAGTTTTCAGAATTAGATAACAGTGTTTGTTCG
ATGTGAGATCGGTTTAAATCGGTTTTCCTTTGGTTTGTTTCTTTGTCTTGTTTTGATAGC
TTCTGTTAGTGTCTCCCGCTAATAATTGAAGTGAATAAATGCCCAAGTTGTCGGTTTCCA
AATTTCAAAGAATAATACTCCCTCCTTTC
CT

QA 1 749 1 749
DS 

RD RS1CB87JQ 141 0 0
GGTTTAAATCGGTTTTCCTTTGGTTTGTTTCTTTGTCTTGTTTTGATAGCTTCTGTTAGT
GTCTCCCGCTAATAATTGAAGTGAATAAATGCCCAAGTTGTCGGTTTCCAAATTTCAAAG
AATAATACTCCCTCCTTTCAT

QA 1 141 1 141
DS 



AS 1 3

CO CL1623Contig1 1138 3 3 U
GCAAAAAGAGAAGGTCATTTTCATGAAGTTTCAATTTCAACAAAATAAAATAAAATAAAA
AAGTATTGGAAAGCTATCGACATAACAATCAATGTGGACCATTAGATCATGGTTGATGAA
TCGGAGGGTGAAGAATCAACCAAGTTGAGAATGCTATTCCAGTAGTTCTTGTTGTCCTCG
TAGTAGCTATACTCACTCTCGTTGACTGCGACGGCTCCGGCGGCCGCCTCGTCGTTTTTA
ACGGTGGAGAGACTCCGATCAGCTGAGTCACCGAGCAGAAGGCTGGTGAGTCCTTCTGTC
GGACAGTTGATCTGCCTCATCCAGTCGTGGTCGGAATCTTTGACATCGGAGGAGGTGGAA
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ATCAGATGGTGATTCTCGGAGAATGTCACCGTCGATGTCGGTGATTCAAGCTGTTGATCT
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TAAAAGAAGAAAATAGTTACCAGCTTTCTCAGGCAAAGAGCGCCAGCTTCCATGACCATG
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GGTGTAGTGTATGAGGTGGTAGTAGTAGTCATTAGATGATGATGATGATTGTCCACCC


BQ
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GATGATGTTGATGAGACCGGTGTTGAAGCCAAGGATGTTGAGCTCGTGATGACTCAGGCT
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BQ
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TTGTTGAAGAAGTAAAGATTGAGGAATCCATCAAA*GAGCAAATGAAGCTCGAGAAGGAA
GATGATGTTGTCGTTGAGGATGTCAAAGACGGAGATGAAGACGACGATGTGGATGACGAT
GACGATGACAACATCGATGGAGCTGGGGACAATGAGAGCTCTAAACAAAGCAGAAGCGAG
AAGAGAAGCCGCAAAGCTATGCTGAAACTTGGAATGAAACCTGTCACTGATGTTAGCAGA
GTGACTATCAAGAGATCAAAGAATGCTTTGTTCGTCATCTCGAAGCCGGATGTGTTCAAG
AGTCCCAACTCGGAGACATATGTGATATTCGGTGAGGCCAAGATTGATGACATGAGCTCT
CAGCTACAAGCTCAAGCTGCTCAGAGGTTCAAGATGCCGGACGTTGCTTCTATGATCCCT
AATGCCGATGCTTCTGAAGCAGCCGCGGTTGCTGCACGAGAGGAGGACGAAGATGATGAT
GATGATGTTGATGAGACCGGTGTTGAAGCCAAGGATGTTGAGCTCGTGATGACTCAGGCT
GGTGTTTCCAAGGCCAAAGCCACTAAGGCTCTTAAAGCCAATGATGGAGATATCGTTTCC
GCCATCATGGAACTCACTACGTAG*TTGAGTTGCAGAGTCTCGCA*TCGTC*TCTTTTCT
TA*TGTATGTTTCGTTTCTCGA*CATTGTTTGTGTTTCGC
CACT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1DB90JQ 826 0 0
GAAGTAAAGATTGAGGAATCCATCAAAAGAGCAAATGAAGCTCGAGAAGGAAGATGATGT
TGTCGTTGAGGATGTCAAAGACGGAGATGAAGACGACGATGTGGATGACGATGACGATGA
CAACATCGATGGAGCTGGGGACAATGAGAGCTCTAAACAAAGCAGAAGCGAGAAGAGAAG
CCGCAAAGCTATGCTGAAACTTGGAATGAAACCTGTCACTGATGTTAGCAGAGTGACTAT
CAAGAGATCAAAGAATGCTTTGTTCGTCATCTCGAAGCCGGATGTGTTCAAGAGTCCCAA
CTCGGAGACATATGTGATATTCGGTGAGGCCAAGATTGATGACATGAGCTCTCAGCTACA
AGCTCAAGCTGCTCAGAGGTTCAAGATGCCGGACGTTGCTTCTATGATCCCTAATGCCGA
TGCTTCTGAAGCAGCCGCGGTTGCTGCACGAGAGGAGGACGAAGATGATGATGATGATGT
TGATGAGACCGGTGTTGAAGCCAAGGATGTTGAGCTCGTGATGACTCAGGCTGGTGTTTC
CAAGGCCAAAGCCACTAAGGCTCTTAAAGCCAATGATGGAGATATCGTTTCCGCCATCAT
GGAACTCACTACGTAGGTTGAGTTGCAGAGTCTCGCAATCGTCCTCTTTTCTTAATGTAT
GTTTCGTTTCTCGAACATTGTTTGTGTTTCGCCACTTTAAAGGGCTATTTTTCTCTTCTA
TAAAACCATAAACAAACTTGATTCCAAATCTATAGCATGAGACGTTCATTTCTAATGTTG
TACTCAGTTTAGTACATGTAATTGTAGAGTTTGTTTGTTTTGTGAG

QA 1 826 1 826
DS 



CO CL1624Contig2 740 2 5 U
GGGGTTTCGTTGGAAGAAGATAAGAGGAAGATGCCAGGCTCTGTTGTTGAAGAAGTTAAG
ATTGAGGAATCCATCAAAGAGCAAATGAAGCTCGAGAAGGAAGATGATGTTGTCGTTGAG
GATGTCAAAGACGGAGATGAAGACGACGATGTGGATGACGATGACGATGACAACGTCCAT
GGAGGTGGTGACAATGAGAGCTCTAAACAAAGCAGAAGCGAGAAGAAAAGCCGCAAAGCT
ATGCTGAAACTTGGAATGAAACCTGTCACCGATGTTAGCAGAGTGACTATCAAGAGATCA
AAGAATGTTTTGTTTGTCATCTCGAAGCCGGATGTGTTCAAGAGTCCCAACTCTGAGACC
TATGTGATATTCGGTGAGGCCAAGATTGATGATATGAGCTCTCAGCTACAAGCTCAAGCT
GCTCAGAGGTTCAAGATGCCGGACGTTGCTTCCATGATCCCTAACGCCGATACTTCTGAA
GCTGCCGCGGCTGCTGCACAAGAGGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATGAGACCGGT
GTTGAAGCCAAGGACGTTGAGCTCGTGATGACTCAGGCTGGTGTTTCCAAGGCCAAAGCC
ACTAAGGCTCTTAAAGCCAATGATGGAGATATCGTTTCCGCCATCATGGAACTCACTACT
TAGTAGTTGAGACAGTCACGCAATTGTCCTCTTTTCTTATGAATGTCTCGTTTCTCGACA
TTGTTTGTGTTTCGCACTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EM08TF U 11
AF RS1FB14TF U 1
BS 1 471 RS1FB14TF
BS 472 472 RS1EM08TF
BS 473 490 RS1FB14TF
BS 491 491 RS1EM08TF
BS 492 740 RS1FB14TF

RD RS1EM08TF 563 0 0
G
GGAAGAAGATAAGAGGAAGATGCCAGGCTCTGTTGTTGAAGAAGTTAAGATTGAGGAATC
CATCAAAGAGCAAATGAAGCTCGAGAAGGAAGATGATGTTGTCGTTGAGGATGTCAAAGA
CGGAGATGAAGACGACGATGTGGATGACGATGACGATGACAACGTCCATGGAGGTGGTGA
CAATGAGAGCTCTAAACAAAGCAGAAGCGAGAAGAAAAGCCGCAAAGCTATGCTGAAACT
TGGAATGAAACCTGTCACCGATGTTAGCAGAGTGACTATCAAGAGATCAAAGAATGTTTT
GTTTGTCATCTCGAAGCCGGATGTGTTCAAGAGTCCCAACTCTGAGACCTATGTGATATT
CGGTGAGGCCAAGATTGATGATATGAGCTCTCAGCTACAAGCTCAAGCTGCTCAGAGGTT
CAAGATGCCGGACGTTGCTTCCATGATCCCTAACGCCGATACTTCTGAAGCTGCCGCGGC
TGCTGCACAAGAGGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATGAGACCGGTGTTGAAGCCAA
GGACGTTGAGCTCGTGATGACT

QA 2 563 2 563
DS 

RD RS1FB14TF 740 0 0
GGGGTTTCGTTGGAAGAAGATAAGAGGAAGATGCCAGGCTCTGTTGTTGAAGAAGTTAAG
ATTGAGGAATCCATCAAAGAGCAAATGAAGCTCGAGAAGGAAGATGATGTTGTCGTTGAG
GATGTCAAAGACGGAGATGAAGACGACGATGTGGATGACGATGACGATGACAACGTCCAT
GGAGGTGGTGACAATGAGAGCTCTAAACAAAGCAGAAGCGAGAAGAAAAGCCGCAAAGCT
ATGCTGAAACTTGGAATGAAACCTGTCACCGATGTTAGCAGAGTGACTATCAAGAGATCA
AAGAATGTTTTGTTTGTCATCTCGAAGCCGGATGTGTTCAAGAGTCCCAACTCTGAGACC
TATGTGATATTCGGTGAGGCCAAGATTGATGATATGAGCTCTCAGCTACAAGCTCAAGCT
GCTCAGAGGTTCAAGATGCCGGACGTTGCTTCCATGATCCCTAACGCCGATGCTTCTGAA
GCTGCCGCGGTTGCTGCACAAGAGGAGGATGACGATGATGATGATGTTGATGAGACCGGT
GTTGAAGCCAAGGACGTTGAGCTCGTGATGACTCAGGCTGGTGTTTCCAAGGCCAAAGCC
ACTAAGGCTCTTAAAGCCAATGATGGAGATATCGTTTCCGCCATCATGGAACTCACTACT
TAGTAGTTGAGACAGTCACGCAATTGTCCTCTTTTCTTATGAATGTCTCGTTTCTCGACA
TTGTTTGTGTTTCGCACTTT

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 4

CO CL1625Contig1 1106 4 2 U
GGACCAACCTGAGAAACTCGATTCGTGTACGACATTCATCAAAGCTGAGGCGTTTGGGAT
CGTGAAACATCTTCGAACCCAGAAAAGTTCGTAACTTTTAGGGTTTCCATGTATCATCCG
ACGAGAGGCGGTGTTCGTGGTGGTCGAGATCAGTTTAGCTGGGATGAAGTCAAGGCAGAT
AAACATAGGGAGAACTATTTGGGTCACAGTGTCAAGGCCCCTGTTGGGCGATGGCAAAAA
GGCAAAGATCTTAACTGGTATGCTAGAGATAAGAAACAAGGGGGTCCCAACACGGATGCT
ATTAAAGAGGAGATTCAAAGGGTTAAGGAACAAGAGGAACAAGCCATGAGGGAGGCTCTG
GGTTTGGCACCAAAGTCCTCTACAAGACCACAAGGCAATCGCCTTGACAAGCAAGAGTAT
ACTGAACTTATCAAAAGGGGTTCAACTGCCGAGGACCTGGGTGCAGGGAAGGCTGATGCA
GTTTGGGTTCACGGCATTGGCTATGCAAAGGCACCACGACCTTGGGAAGATCCTAGCACC
CTTGCACCATCTCAGACCGAAGATGCAGTGCCTGTACGTCTACCAGCAGAGGCACCAGCG
ATCAAAACTGTTGAAAAAGTACTAAATGATGCTGAGAGGAACCAAGAGAAGGATAAGCGC
GAGGAAAGGAAACCTGAGGATAGGAAACCTGCGAAGAGAGAGAGGGAAGAGAGGCACGAA
AAACATGAAAGGCGCGAGAAACGTGAGAGGCATGAAAAGCGACACAGCCGTGATTCAGAT
GACAGGAAGAAGCACAAGAAAGAGAAGAAGGATAGGAAGAGGAGGCATGACTCTGATTCC
GATTGAATTGAACTCTTACCAGTGTGTGTCCTGTCCTCTTATGGGGGGGAGGAGCTGTAT
CTTCTGCAAGATTTGAAACTTTCTTAGCTCATTTCGTTTGCAGATCATTGAGAACTATCA
ATATGTTAAGTGTGTTGAACGTTGATGTAATCCACTTGAAAAAGAAAAAAATGATCTATG
TTTGTTAAATGACATGGACAAAGTGATGTGATCCTGTAACAAAAGCAGACGCATGTTTTA
TCTTTATTTGTGTACACAACATTCAC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EN08TF U 27
AF RS1C830TF U 4
AF RS1AL13TF U 1
AF RS1AL13JQ C 553
BS 1 718 RS1AL13TF
BS 719 1106 RS1AL13JQ

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GG
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AGGCACCACGACCTTGGGAAGATCCTAGCACCCTTGCACCATCTCAGACCGAAGATGCAG
TGCCTGTACGTCTACCAGCAGAGGCACCAGCGATCAAAACTGTTGAAAAA

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GG
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AACATCTTCGAACCCAGAAAAGTTCGTAACTTTTAGGGTTTCCATGTATCATCCGACGAG
AGGCGGTGTTCGTGGTGGTCGAGATCAGTTTAGCTGGGATGAAGTCAAGGCAGATAAACA
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GGCACCAAAGTCCTCTACAAGACCACAAGGCAATCGCCCTGACAAGCAAGAGTATACTGA
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AGTTCACGGCATTGGCTATGCAAAGGCACCACGACCTTGGGAAGATCCTAGCACCCTTGC
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AACTGTTGAAAAAGTACTAAATGATGCTGAGAGGAACCAAGAGAA

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AAACATAGGGAGAACTATTTGGGTCACAGTGTCAAGGCCCCTGTTGGGCGATGGCAAAAA
GGCAAAGATCTTAACTGGTATGCTAGAGATAAGAAACAAGGGGGTCCCAACACGGATGCT
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GGTTTGGCACCAAAGTCCTCTACAAGACCACAAGGCAATCGCCTTGACAAGCAAGAGTAT
ACTGAACTTATCAAAAGGGGTTCAACTGCCGAGGACCTGGGTGCAGGGAAGGCTGATGCA
GTTTGGGTTCACGGCATTGGCTATGCAAAGGCACCACGACCTTGGGAAGATCCTAGCACC
CTTGCACCATCTCAGACCGAAGATGCAGTGCCTGTACGTCTACCAGCAGAGGCACCAGCG
ATCAAAACTGTTGAAAAAGTACTAAATGATGCTGAGAGGAACCAAGAGAAGGATAAGCGC
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DS 

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CCTGAGGATAGGAAACCTGCGAAGAGAGAGAGGGAAGAGAGGCACGAAAAACATGAAAGG
CGCGAGAAACGTGAGAGGCATGAAAAGCGACACAGCCGTGATTCAGATGACAGGAAGAAG
CACAAGAAAGAGAAGAAGGATAGGAAGAGGAGGCATGACTCTGATTCCGATTGAATTGAA
CTCTTACCAGTGTGTGTCCTGTCCTCTTATGGGGGGGAGGAGCTGTATCTTCTGCAAGAT
TTGAAACTTTCTTAGCTCATTTCGTTTGCAGATCATTGAGAACTATCAATATGTTAAGTG
TGTTGAACGTTGATGTAATCCACTTGAAAAAGAAAAAAATGATCTATGTTTGTTAAATGA
CATGGACAAAGTGATGTGATCCTGTAACAAAAGCAGACGCATGTTTTATCTTTATTTGTG
TACACAACATTCAC

QA 1 554 1 554
DS 



AS 1 5

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CAGAACGAGAGAGATGGCGACAGATGCAGGATCAGAGACGATGGCGACAGTGGCTTCAAA
GGCTCCGGTGACGGCCGAGAGGAGGGTCCGGACTGATCTCGATGATCGTCTCCCAAAACC
ATATGTGCCTCGAGCCATGGTTGCACCTGACATGGAAAATGTTAACGGGACAAGGGGACA
CAAGCACCAGGACATGTCTGTTCTTCAGCAGCACGTTGCCTTCTTTGACCAAGATGGTGA
TGGTGTCATCTACCCATCGGAGACATTCAAAGGTTTTAGAGAACTTGGTTTCAACGTGAT
CTTTAGTTTCTTTCTGACATTCATCGTGCATGTTACCATGAGTTACGCCACATCGCCTAG
TTGGATACCTTCTTTTTCCTTCCCGATTTACATCAAGAACATCCATAGAGCCAAACATGG
AAGCGACACTTCCACTTACGACACTGAAGGAAGGTATATTCCAGCAAATCTTGAGAACAT
GTTTAGTAAGTACGCACGTACCGTGCCTGATAAGCTAACCCGTTACGAGCTGTGGCAAAT
GACTGAGGCTAACCGCAACGCATTCGATTTCTTTGGCTGGGCAGCGAGTAAAATGGAGTG
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CTTGACCGGAAACACGAATCAGATCGTATCTTTTTGCTGCTTAAGTTTCTCATCTTTATA
ATGGTTCTTTTGGTTTCTGTATTTTGGCAAACTGCGTTTTTGAAGTATAACAAAATGTAC
GTGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

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DS 

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GGGGAGTACTATACTTACTGGCTAAAGACGAGAATGGCTACTTATCTAAAGAAGCTG

QA 6 662 6 662
DS 

RD RS1C416TF 789 0 0
GG
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AGGCTCCGGTGACGGCCGAGAGGAGGGTCCGGACTGATCTCGATGATCGTCTCCCAAAAC
CATATGTGCCTCGAGCCATGGTTGCACCTGACATGGAAAATGTTAACGGGACAAGGGGAC
ACAAGCACCAGGACATGTCTGTTCTTCAGCAGCACGTTGCCTTCTTTGACCAAGATGGTG
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TCTTTAGTTTCTTTCTGACATTCATCGTGCATGTTACCATGAGTTACGCCACATCGCCTA
GTTGGATACCTTCTTTTTCCTTCCCGATTTACATCAAGAACATCCATAGAGCCAAACATG
GAAGCGACACTTCCACTTACGACACTGAAGGAAGGTATATTCCAGCAAATCTTGAGAACA
TGTTTAGTAAGTACGCACGTACCGTGCCTGATAAGCTAACCCGTTACGAGCTGTGGCAAA
TGACTGAGGCTAACCGCAACGCATTCGATTTCTTTGGCTGGGCAGCGAGTAAAATGGAGT
GGGGAGTACTATACTTACTGGCTAAAGACGAGAATGGCTACTTATCTAAAGAAGCTGTTA
GGAGATGCTTCGATGGGAGCTTGTTTG**TACTGCGCCAAGTCGAGAGCTTCTTCTAAAA
*GACAGATTGATGACATGACGTTTACCATTTTTCTTGCTTAAGTAAACCTTTGTTTAATC
TCTTGAC

QA 3 789 3 789
DS 

RD RS1C416JQ 763 0 0
CTGATCTCGATGATCGTCTCCCAAAACCATATGTGCCTCGAGCCATGGTTGCACCTGACA
TGGAAAATGTTAACGGGACAAGGGGACACAAGCACCAGGACATGTCTGTTCTTCAGCAGC
ACGTTGCCTTCTTTGACCAAGATGGTGATGGTGTCATCTACCCATCGGAGACATTCAAAG
GTTTTAGAGAACTTGGTTTCAACGTGATCTTTAGTTTCTTTTTGACATTCATCGTGCATG
TTACCATGAGTTACGCCACATCGCCTAGTTGGATACCTTCTTTTTCCTTCCCGATTTACA
TCAAGAACATCCATAGAGCCAAACATGGAAGCGACACTTCCACTTACGACACTGAAGGAA
GGTATATTCCAGCAAATCTTGAGAACATGTTTAGTAAGTACGCACGTACCGTGCCTGATA
AGCTAACCCGTTACGAGCTGTGGCAAATGACTGAGGCTAACCGCAACGCATTCGATTTCT
TTGGCTGGGCAGCGAGTAAAATGGAGTGGGGAGTACTATACTTACTGGCTAAAGACGAGA
ATGGCTACTTATCTAAAGAAGCTGTTAGGAGATGCTTCGATGGGAGCTTGTTTG**TACT
GCGCCAAGTCGAGAGCTTCTTCTAAAAAGACAGATTGATGACATGACGTTTACCATTTTT
CTTGCTTAAGTAAACCTTTGTTTAATCTCTTGACCGGAAACCCGAATCAGATCGTATCTT
TTTGCTGCTTAAGTTTTTCATCTTTATAATGGTTCTTTTGGTT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RS1D871JQ 684 0 0
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ACTTGGTTTCAACGTGATCTTTAGTTTCTTTCTGACATTCATCGTGCATGTTACCATGAG
TTACGCCACATCGCCTAGTTGGATACCTTCTTTTTCCTTCCCGATTTACATCAAGAACAT
CCATAGAGCCAAACATGGAAGCGACACTTCCACTTACGACACTGAAGGAAGGTATATTCC
AGCAAATCTTGAGAACATGTTTAGTAAGTACGCACGTACCGTGCCTGATAAGCTAACCCG
TTACGAGCTGTGGCAAATGACTGAGGCTAACCGCAACGCATTCGATTTCTTTGGCTGGGC
AGCGAGTAAAATGGAGTGGGGAGTACTATACTTACTGGCTAAAGACGAGAATGGCTACTT
ATCTAAAGAAGCTGTTAGGAGATGCTTCGATGGGAGCTTGTTTGACTACTGCGCCAAGTC
GAGAGCTTCTTCTAAAAAGACAGATTGATGACATGACGTTTACCATTTTTCTTGCTTAAG
TAAACCTTTGTTTAATCTCTTGACCGGAAACACGAATCAGATCGTATCTTTTTGCTGCTT
AAGTTTCTCATCTTTATAATGGTTCTTTTGGTTTCTGTATTTTGGCAAACTGCGTTTTTG
AAGTATAACAAAATGTACGTGCTC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 4

CO CL1627Contig1 1025 4 4 U
GAAACAAGTTCAAAGAGTACAATTTGCAAAGATGATACTATTATTGCAAATGAAGCAATT
GAAACTCGGCAAAGATATAACAAAGGAGAGTTGGACCAACAATGATATGAATGCAACAAT
ATGATTCAAATATGGAAAGTTCAAACTATGAAATGAAATATTTTTTTTTTTTTTGAAATA
TGAAATACGAAATGTAAATATCAAAGAAGAAAAACTTTTTATATTTTTTTTGAAAACTTT
TTGATGATAAAGCAAAGAAATTCTGAAAAGAGAAACTAAATGTTGCAAGAACAA*TGATT
GATGCGCAAATGATATAAAAGGAAATATGCAATGCAATCAATCTAAAA*CACTTTCTTTT
GAAATTTTCTTTTAGAAACACGAATCAAACAAGGCAAAAACTCTTCTCTTTTCTTTTTCT
TTTTCGATTTATGCAACAAGAACACAAAGAACAACAATGGTGAAATCAAGAACTAAAGAA
AGAACAATTTTTTTTTGGCTTTTCTTAGATAAAACTACACGATCTAAATGGATAAGGAAA
AGAGATAACCAAATAAGGAACCTTTCGGCTCTGATACCAAAATGATATAGGCACAAAGAG
GGCCTTGCTCAAGCTGGCTGGATAGAGGTGAGGATCAATGAACCGGTTGATGGTGGAGTG
GAGTGAGATGGAAGGATCTGATGTAGAGGATAGTTTGAGTGATGGATCCGGTTGTATTGA
GACTCGCAAAGGCACCAATGGAGGTTGGAAAGCACCACTTGGTCGAATAACCAACTTGAT
ACTTCAAGGGATGAGAGATGGCGTGAGGATGAAGGATGGATCTTTGTTGCTTGTTCGTAT
AAACAACTCAACAATGATATAGAGATGGATAGATGGAGTGAAGGCTTATTGAATCTCACA
ATCAAAGAGATGGATCGAGGTGAACCACAAACTCTATGGGAGAGGAGTTTGATAATCACA
ATTTGCTTGGAGGCTGTTTCTCACAAACTCTCAAGACTTAGTTTAGTTGCTAGGGCAACT
GACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 5 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 

AF RS1H743TF U 1
AF RS1H743JQB C 65
AF RS1G661JQ U 175
AF RS1FQ56JQ U 175
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GAG

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DS 

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CGATTTATGCAACAAGAACACAAAGAACAACAATGGTGAAATCAAGAACTAAAGAAAGAA
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GAGATGGAAGGATCTGATGTAGAGGATAGTTTGAGTGATGGATCCGGT
GTCATTC

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DS 

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GTATAAACAACTCAACAATGATATAGAGAT

QA 3 692 3 692
DS 

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GC
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CCTTTTGATGATAAAGCAAAGAAATTCTGAAAAGAGAAACTAAATGTTGCAAGAACAAAT
GATTGATGCGCAAATGATATAAAAGGAAATATGCAATGCAATCAATCTAAAAACACTTTC
TTTTGAAATTTTCTTTTAAAAACACGAATCAAACAAAGCAAAAACTCTTCTCTTTTCTTT
TTCTTTTTCGATTTATGGAACAAGAACACAAAGAACAACAATGGTGAATCAAAGAACTAA
AGAAAGAACAATTTTTTTTTGGCTTTTCTTAAATAAAACTACACGATCTAAATGGATAAG
GAAAAGAGATAACCAAATAAGGAACCTTTCGGCTCTGATACCAAAATGATATAGGCACAA
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AGTGGAGTGAGATGGAAGGATCTGATGTAGAGGATAGTTTGAGTGATGGATCCGGTTGTA
TTGAGACTCGCAAAGGCACCAATGGAGGTTGGAAAGCACCACTTGGTCGAATAACCAACT
TGATACTTCAAGGGATGAGAGATGGCGTGAGGATGAAGGATGGATCTTTGTTGCTTGTTC
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CACAATCAAAGAGATGGATCGAGGTGAACCACAAACTCTATGGGAGAGGAGTTTGATAAT
CACAATTTGCTTGGAGGCTGTTTCTCACAAACTCTCAAGACTTAGTTTAGTTGCTAGGGC
AACTGACTC

QA 3 851 3 851
DS 



AS 1 4

CO CL1628Contig1 1259 4 13 U
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CTAATGTATGCGTTGGCTTATGATGCCAGTTCCATGTGGCTTCTCTTACTCGGCCGTCTC
TGTTGTGGGCTGGGATCAGCAAGAGCTGTGAACAGAAGATACATCAGTGATTGTGTTCCT
TTAAGAATCAGAATGCAGGCGTCAGCAGGTTTTGTGAGTGCTAGTGCTCTTGGAATGGCT
TGTGGTCCTGCACTCGCTGGTTTGCTCCAAATCAAATTCAAGATCTACAAGCTGACATTT
AACCAGTCTACTTTGCCTGGGTGGGTTATGGCTGTGGCTTGGCTGTTCTATTTGGTATGG
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CGAAAGCCGTTGCTGATTACTTCAGGACTCAAGGTGGAAGACGAAGATGAAGAGGATTGC
GATGAAAGCGAAGAGTCTGCAGAAGATTCTCGCAGACCTGCAAATTCTTTCGGTGATGCA
TACCGACTTCTTACTCCATCTGTTAAGGTTCAACTGTTGATCTACTTCATGCTCAAATAC
GCCATGGAGATATTACTGTCTGAATCTAGTGTGGTTACTTCATACTATTTTGGTTGGACA
ACAAGCTCCGTTGCCATCTTTCTGGCCTGCCTTGGCCTCACGGTGCTACCAATCAACATT
CTTGTTGGAAGTTACATCAGTAACATGTTTGAAGACAGGCAAATCCTTTTGACATCTGAG
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GGAGGATACTTGGGAAGAAACCATCTCTTGAATGCAACTCTTCTACCATCACTTGTCATC
TGCATTGGCTCCATTGTTGCTACTTGTTGTACTTATAACTCTCTCTATTGATATGTTTTT
AAGAGATTTTGCTACCAAATTTTACAAAAATAGAATAAAAAAAGGGACAGTGTGTGTGT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DQ75TF U 1
AF RS1DQ75JQ C 492
AF RS1CK15TF U 515
AF RS1FG87TF U 653
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BS 629 746 RS1DQ75TF
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BS 771 785 RS1DQ75TF
BS 786 1113 RS1CK15TF
BS 1114 1114 RS1FG87TF
BS 1115 1201 RS1CK15TF
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BS 1203 1226 RS1CK15TF
BS 1227 1259 RS1DQ75JQ

RD RS1DQ75TF 789 0 0
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TACCGACTTCTTACTCCATCTGTTAAG*TTCAACTGTTGATCTACTTCATGCTCAAATAC
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CTTGT
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G
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GTTGGTCTACTTCATGCTCAAATACGCCATGGAGATATTACTGTCGGAGTCTAGTGTGGT
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TCTGTTTGTTCCATACACCGTGCCTCAATACGTAATCTCTGGTCTAGTAATGTTTGTCGC
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TATAGAATAA

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GGT
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TGCCTCAATACGTAATCTCTGGTCTAGTAATGTTTGTCGCTGCTGAAGTACTCGAAGGTG
TGAACCTATCGTTGTTATCGAGGGTAATGTCATCGAGGCTATCAAAAGGAACATACAACG
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TTTTTAAGAGATTTTGCTACCAAATTTTACA
A

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DS 



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BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 

AF RS1E386TF U 5
AF RS1AC31JQ C 1
AF RS1AC31TF U 1
AF RS1E386JQ C 16
AF RS1AC33TF U 1
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G
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AGCCAGTTTGATTAATTTCTCCTTTAGATTGCTCGTTTATACTTTCCAGGTTTTACATTT
AGTGTGAAAACATTAAGCATTTCTTATTTTCGACAAAAAAACTCTTAACACATATTGTAT
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AACGTTGAG
CT

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DS 

RD RS1AC31TF 732 0 0
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DS 

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CT
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CC

QA 3 714 3 714
DS 

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AAAAAAAAATCTCTCCAGAGAGATGGCTGTGGGAATCCTCGAGGTTGATCTGATCAGTGG
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CAAAGTCATGGACCATGATACTATCTCCGCCGACGATCCCATTGGCGAAGCTACAATATA
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CTGTGTGTTGTGGTGAATCTCATTGTATTTAATTCCAGTATTCAAGAAAGTGTAAAACGT
TGAG

QA 6 729 6 729
DS 



AS 1 2

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AAGGCGTTCGTTCGCTTTTCCTCTCTAGCTCAATTCGTCATGTCTTGGTGCACGATCGAG
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ATCTTCCTTTTCAAATGGCAAGCTGGCGTCAAAGATGATCGTCCAACGATCCAAGATCCA
GTTTCTAACCTCTTTTTCGCAAACCAGGTCATTAACAATGCTTGTGCAACCCAAGCGATC
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ATAAGGACTGCTCACAACTCTTTCGCAAGGCCTGAGCCATTTGTCCCCGAGGAACAGAAA
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CAAAGCGGTATAGAGTGGCTGCAGCTGGTTCAGCCGGTGATCCAAGAGAGGATCGAGAGG
TACTCGCAGAGCGAGATCAGGTTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G257TF U 1
AF RS1EK84TF U 1
BS 1 744 RS1EK84TF

RD RS1G257TF 691 0 0
GGGGATTCGATCTCGAGCAATCCTAAGTCCGTCTCTCTCTCTATACCTACTTCAAAACAA
AAGGCGTTCGTTCGCTTTTCCTCTCTAGCTCAATTCGTCATGTCTTGGTGCACGATCGAG
TCGGATCCTGGTGTGTTTACAGAGCTTATTCAACAAATGCAAGTCAAAGGTGTCCAGGTT
GAAGAGTTGTACTCCCTTGATCTTGATTCTCTCAATAACCTCAGACCCGTGTACGGTCTG
ATCTTCCTTTTCAAATGGCAAGCTGGCGTCAAAGATGATCGTCCAACGATCCAAGATCCA
GTTTCTAACCTCTTTTTCGCAAACCAGGTCATTAACAATGCTTGTGCAACCCAAGCGATC
TTGTCTATCCTCTTGAACTCTCCCGACGTCGACATCGGTCCTGAGCTCTCGACGCTGAAA
GAGTTCACCAAGAACTTCCCATCTGACCTCAAGGGCTTGGCCATCAACAACAGCGAGGCG
ATAAGGACTGCTCACAACTCTTTCGCAAGGCCTGAGCCATTTGTCCCCGAGGAACAGAAA
GCTGCCACAAAAGACGACGACGCCTACCATTTCATTAGCTACATACCTGTGGATGGAGTC
TTGTACGAGCTCGACG*TCTCAAGGAAGGACCCATCAGCCTTGGTCCGTGCCCCGGGGAC
CAAAGCGGTATAGAGTGGCTGCAGCTGGTTC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1EK84TF 744 0 0
GGGGATTCGATCTCGAGCAATCCTAAGTCCGTCTCTCTCTCTATACCTACTTCAAAACAA
AAGGCGTTCGTTCGCTTTTCCTCTCTAGCTCAATTCGTCATGTCTTGGTGCACGATCGAG
TCGGATCCTGGTGTGTTTACAGAGCTTATTCAACAAATGCAAGTCAAAGGTGTCCAGGTT
GAAGAGTTGTACTCCCTTGATCTTGATTCTCTCAATAACCTCAGACCCGTGTACGGTCTG
ATCTTCCTTTTCAAATGGCAAGCTGGCGTCAAAGATGATCGTCCAACGATCCAAGATCCA
GTTTCTAACCTCTTTTTCGCAAACCAGGTCATTAACAATGCTTGTGCAACCCAAGCGATC
TTGTCTATCCTCTTGAACTCTCCCGACGTCGACATCGGTCCTGAGCTCTCGACGCTGAAA
GAGTTCACCAAGAACTTCCCATCTGACCTCAAGGGCTTGGCCATCAACAACAGCGAGGCG
ATAAGGACTGCTCACAACTCTTTCGCAAGGCCTGAGCCATTTGTCCCCGAGGAACAGAAA
GCTGCCACAAAAGACGACGACGCCTACCATTTCATTAGCTACATACCTGTGGATGGAGTC
TTGTACGAGCTCGACGGTCTCAAGGAAGGACCCATCAGCCTTGGTCCGTGCCCCGGGGAC
CAAAGCGGTATAGAGTGGCTGCAGCTGGTTCAGCCGGTGATCCAAGAGAGGATCGAGAGG
TACTCGCAGAGCGAGATCAGGTTC

QA 1 744 1 744
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL1632Contig1 812 3 9 U
CGGCTGGTCATTGGTACCATATATCAATTTCACATACACATGGAACAATGTCAAAATACT
ATTAATACACACTGTAACACTTCCCCACCATATACAACAATAAGATTACACATTTACCAC
TGAAGAGTGCTTTGTTTGCTGGAGCAATTGCTCGAACTCCTCATCAGTGCTCTTAAGCAT
CAACGACAACGGCAATTCCAAACCTCTCTCCATCGACTCCAGGTGCCTCGGCTTTATCCT
TTTCTCTAGACTGAACGCAAAATACTGCGGAAACTCCTTCAGACTCTCCACTCTACCTTT
GATCTCGCACATGAAGTAATCGAGCTTCGGTTTAAAGTTGTTCTCTATGCTGAATGTGAA
CAGAGCTGGACATCTAAGGATCATTCCAATCGCCTCTGATCTCGTAAACCCTATACTCTC
CAAGAATCTAAGCTTTGGGATGAGAGTGTGTTCAACACTAGAGACCAACAAGACAGGATC
TTGGTAAGCAAGAGCATCAAGATCCTTGAAACCAAGCCTCTACAAGTAGAACAGCGCAGG
CTTGAGCTGGTCTTCCACGCTGCTGATCAGTAGCCTCGGGCATTTCTTGACCACTCTTCG
GAACGCACTATCGGGGACGCGGAGATCGCTCGACAGGAACACGAAAACAGGGTTGAGTTC
TGTTCTGACGTCGGAAGTGAGGATCTTAGGACACATCCCCAAGATCCTCGGGAGGTCGTT
TGGGTATATTCCTTTTGACTGGAGGAAGTTGAGGACGGACTCGACGGAGTCGAGAGAGGC
GAGCGGAGGAAAGGGTGAGAGAGAGAGCTTTG


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D652JQ U 1
AF RS1GB28JQ U 1
AF RS1B550JQ U 9
BS 1 16 RS1D652JQ
BS 17 17 RS1GB28JQ
BS 18 281 RS1D652JQ
BS 282 521 RS1GB28JQ
BS 522 522 RS1B550JQ
BS 523 599 RS1GB28JQ
BS 600 600 RS1B550JQ
BS 601 685 RS1GB28JQ
BS 686 812 RS1B550JQ

RD RS1D652JQ 281 0 0
CGGCTGGTCATTGGTAACATATATCAATTTCACATACACATGGAACAATGTCAAAATACT
ATTAATACACACTGTAACACTTCCCCACCATATACAACAATAAGATTACACATTTACCAC
TGAAGAGTGCTTTGTTTGCTGGAGCAATTGCTCGAACTCCTCATCAGTGCTCTTAAGCAT
CAACGACAACGGCAATTCCAAACCTCTCTCCATCGACTCCAGGTGCCTCGGCTTTATCCT
TTTCTCTAGACTGAACGCAAAATACTGCGGAAACTCCTTCA

QA 1 281 1 281
DS 

RD RS1GB28JQ 685 0 0
CAA
CTGGTCATTGGTACCATATATCAATTTCACATACACATGGAACAATGTCAAAATACTATT
AATACACACTGTAACACTTCCCCACCATATACAACAATAAGATTACACATTTACCACTGA
AGAGTGCTTTGTTTGCTGGAGCAATTGCTCGAACTCCTCATCAGTGCTCTTAAGCATCAA
CGACAACGGCAATTCCAAACCTCTCTCCATCGACTCCAGGTGCCTCGGCTTTATCCTTTT
CTCTAGACTGAACGCAAAATACTGCGGAAACTCCTTCAGACTCTCCACTCTACCTTTGAT
CTCGCACATGAAGTAATCGAGCTTCGGTTTAAAGTTGTTCTCTATGCTGAATGTGAACAG
AGCTGGACATCTAAGGATCATTCCAATCGCCTCTGATCTCGTAAACCCTATACTCTCCAA
GAATCTAAGCTTTGGGATGAGAGTGTGTTCAACACTAGAGACCAACAAGACAGGATCTTG
GTAAGCAAGAGCATCAAGATCCTTGAAACCAAGCCTCTGCAAGTAGAACAGCGCAGGCTT
GAGCTGGTCTTCCACGCTGCTGATCAGTAGCCTCGGGCATTTCTTGACCACTCTTCTGAA
CGCACTATCGGGGACGCGGAGATCGCTCGACAGGAACACGAAAACAGGGTTGAGTTCTGT
TCTGACGTCGGAAGTGAGGATC

QA 4 685 4 685
DS 

RD RS1B550JQ 804 0 0
CATTGGTACCATATATCAATTTCACATACACATGGAACAATGTCAAAATACTATTAATAC
ACACTGTAACACTTCCCCACCATATACAACAATAAGATTACACATTTACCACTGAAGAGT
GCTTTGTTTGCTGGAGCAATTGCTCGAACTCCTCATCAGTGCTCTTAAGCATCAACGACA
ACGGCAATTCCAAACCTCTCTCCATCGACTCCAGGTGCCTCGGCTTTATCCTTTTCTCTA
GACTGAACGCAAAATACTGCGGAAACTCCTTCAGACTCTCCACTCTACCTTTGATCTCGC
ACATGAAGTAATCGAGCTTCGGTTTAAAGTTGTTCTCTATGCTGAATGTGAGCAGAGCTG
GACATCTAAGGATCATTCCAATCGCCTCTGATCTCGTAAACCCTATACTCTCCAAGAATC
TAAGCTTTGGGATGAGAGTGTGTTCAACACTAGAGACCAACAAGACAGGATCTTGGTAAG
CAAGAGCATCAAGATCCTTGAAACCAAGTCTCTACAAGTAGAACAGCGCAGGCTTGAGCT
GGTCTTCCACGCTGCTGATCAGTAGCCTCGGGCATTTCTTGACCACTCTTCGGAACGCAT
TATCGGGGACGCGGAGATCGCTCGACAGGAACACGAAAACAGGGTTGAGTTCTGTTCTGA
CGTCGGAAGTGAGGATCTTAGGACACATCCCCAAGATCCTCGGGAGGTCGTTTGGGTATA
TTCCTTTTGACTGGAGGAAGTTGAGGACGGACTCGACGGAGTCGAGAGAGGCGAGCGGAG
GAAAGGGTGAGAGAGAGAGCTTTG

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 5

CO CL1633Contig1 652 5 10 U
GGAGCCCCGAGCGAGAGAGAGAGTGAAGAAATGATGAAGCGTCTGATCCCAACGTTCAAC
CGCATCCTTGTGCAGAGAGTCATCCAGCCTGCCAAAACCGAAAGCGGCATCCTCCTCCCT
GAGAAGGCCTCCAAGCTGAACTCGGGAAAGGTGATAGCAGTGGGACCTGGGTCGAGGGAT
AAGGACGGGAAATTGATTCCGGTGTCTGTCAAGGAAGGCGACACTGTTCTTCTTCCAGAG
TACGGCGGTACTCAGGTCAAGCTTGGCGAGAAGGAGTACCATCTCTTCCGGGATGAGGAC
GTCTTGGGGACGTTGCACGAAGATTGAGAAAGGCTTAATTTAGCTACCAGCGTTGGTCTT
GTTGGCGTTTTAATGTTATGGGAAGAGAAACAAACAAGTTATTTTATAATTTTTAGTTTG
TGTTGTTGGACATGTCATTGAAATTTTACTTGAATGGAATATCTTTGTCCCTTCTGAGTC
GTCGTTCCAGTTTTTACAAATTGTCATCAATCTTAAGATAAGTTAACCTGAGTGTTAGCA
TTTTGTGATTCCAACCCTTTTGTGACGATGGCTTACTTGAATGTGCGTATTCTTGATCCT
TGTTTTTTTTTGTCACCGAATTCCTGTAGTGCATTCTTTATCTTCTACAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FW73TF U 1
AF RS1DI96JQ C 6
AF RS1DI96TF U 6
AF RS1BT06TF U 1
AF RS1BT06JQ C 47
BS 1 14 RS1BT06TF
BS 15 15 RS1DI96TF
BS 16 23 RS1BT06TF
BS 24 24 RS1DI96TF
BS 25 77 RS1BT06TF
BS 78 78 RS1FW73TF
BS 79 554 RS1BT06TF
BS 555 555 RS1DI96TF
BS 556 635 RS1BT06TF
BS 636 652 RS1BT06JQ

RD RS1FW73TF 476 0 0
GGAGCC
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CTTGTGCAGAGAGTCATCCAGCCTGCCAAAACCGAAAGCGGCATCCTCCTCCCTGAGAAG
GCCTCCAAGCTGAACTCGGGAAAGGTGATAGCAGTGGGACCTGGGTCGAGGGATAAGGAC
GGGAAATTGATTCCGGTGTCTGTCAAGGAAGGCGACACTGTTCT*CTTCCAGAGTACGGC
GGTACTCAGGTCAAGCTTGGCGAGAAGGAGTACCATCTCTTCCGGGATGAGGACGTCTTG
GGGACGTTGCACGAAGATTGAGAAAGGCTTAATTTAGCTACCAGCGTTGGTCTTGTTGGC
GTTTTAATGTTATGGGAAGAGAAACAAACAAGTTATTTTATAATTTTTAGTTTGTGTTGT
TGGACATGTCATTGAAATTTTACTTGAATGGAATATCTTTGTCCCTTCTG

QA 7 476 7 476
DS 

RD RS1DI96JQ 583 0 0
G
CCGAGCGAGAGAGAGAGTGAAGAAATGATGAAGCGTCTGATCCCAACGTTCAACCGCATC
CTTGTGCAGAGAGTCATCCAGCCTGCCAAAACCGAAAGCGGCATCCTCCTCCCTGAGAAA
GCCTCCAAGCTGAACTCGGGGAAGGTGATAGCAGTGGGACCTGGATCGAGGGATAAGGAC
GGGAAATTGATTCCAGTCTCTGTCAAGGAAGGCGACACTGTTCTTCTTCCAGAGTACGGC
GGTACTCAGGTCAAGCTTGGCGAGAAGGAGTACCATCTCTTCCGGGATGAGGACGTCTTG
GGGACGTTGCACGAAGATTGAGAAAGGCTTAATTTAGCTACCGGCGTTGGTCTTGTTGGC
GTTCTAATGTTATGGGAAGAGAAACAAACAAGTTATTTTATAATTTTTAGTTTGTGTTGT
TGGACATGTCATTGAAATTTTACTTGAATGGAATATCTTTGTCCCTTCTGAGTCGTCGTT
CCAGTTTTTACAAATTGTCATCAATCTTAAGATAAGTTAACCTGAGTGTTAGCATTTTGT
GATTCCAACCCTTTTGTGACGATGGCTTACTTGAATGTGCG
C

QA 2 582 2 582
DS 

RD RS1DI96TF 583 0 0
G
CCGAGCGAGAGAGAGAGTGAAGAAATGATGAAGCGTCTGATCCCAACGTTCAACCGCATC
CTTGTGCAGAGAGTCATCCAGCCTGCCAAAACCGAAAGCGGCATCCTCCTCCCTGAGAAA
GCCTCCAAGCTGAACTCGGGGAAGGTGATAGCAGTGGGACCTGGATCGAGGGATAAGGAC
GGGAAATTGATTCCAGTCTCTGTCAAGGAAGGCGACACTGTTCTTCTTCCAGAGTACGGC
GGTACTCAGGTCAAGCTTGGCGAGAAGGAGTACCATCTCTTCCGGGATGAGGACGTCTTG
GGGACGTTGCACGAAGATTGAGAAAGGCTTAATTTAGCTACCGGCGTTGGTCTTGTTGGC
GTTCTAATGTTATGGGAAGAGAAACAAACAAGTTATTTTATAATTTTTAGTTTGTGTTGT
TGGACATGTCATTGAAATTTTACTTGAATGGAATATCTTTGTCCCTTCTGAGTCGTCGTT
CCAGTTTTTACAAATTGTCATCAATCTTAAGATAAGTTAACCTGAGTGTTAGCATTTTGT
GATTCCAACCCTTTTGTGACGATGGCTTACTTGAATGTGCG
C

QA 2 582 2 582
DS 

RD RS1BT06TF 635 0 0
GGAGCCCCGAGCGAAAGAGAGAGAGAAGAAATGATGAAGCGTCTGATCCCAACGTTCAAC
CGCATCCTTGTGCAGAGGGTCATCCAGCCTGCCAAAACCGAAAGCGGCATCCTCCTCCCT
GAGAAGGCCTCCAAGCTGAACTCGGGAAAGGTGATAGCAGTGGGACCTGGGTCGAGGGAT
AAGGACGGGAAATTGATTCCGGTGTCTGTCAAGGAAGGCGACACTGTTCTTCTTCCAGAG
TACGGCGGTACTCAGGTCAAGCTTGGCGAGAAGGAGTACCATCTCTTCCGGGATGAGGAC
GTCTTGGGGACGTTGCACGAAGATTGAGAAAGGCTTAATTTAGCTACCAGCGTTGGTCTT
GTTGGCGTTTTAATGTTATGGGAAGAGAAACAAACAAGTTATTTTATAATTTTTAGTTTG
TGTTGTTGGACATGTCATTGAAATTTTACTTGAATGGAATATCTTTGTCCCTTCTGAGTC
GTCGTTCCAGTTTTTACAAATTGTCATCAATCTTAAGATAAGTTAACCTGAGTGTTAGCA
TTTTGTGATTCCAATCCTTTTGTGACGATGGCTTACTTGAATGTGCGTATTCTTGATCCT
TGTTTTTTTTTGTCACCGAATTCCTGTAGTGCATT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1BT06JQ 606 0 0
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GCATCCTCCTCCCTGAGAAGGCCTCCAAGCTGAACTCGGGAAAGGTGATAGCAGTGGGAC
CTGGGTCGAGGGATAAGGACGGGAAATTGATTCCGGTGTCTGTCAAGGAAGGCGACACTG
TTCTTCTTCCAGAGTACGGCGGTACTCAGGTCAAGCTTGGCGAGAAGGAGTACCATCTCT
TCCGGGATGAGGACGTCTTGGGGACGTTGCACGAAGATTGAGAAAGGCTTAATTTAGCTA
CCAGCGTTGGTCTTGTTGGCGTTTTAATGTTATGGGAAGAGAAACAAACAAGTTATTTTA
TAATTTTTAGTTTGTGTTGTTGGACATGTCATTGAAATTTTACTTGAATGGAATATCTTT
GTCCCTTTTGAGTCGTCGTTCCAGTTTTTACAAATTGTCATCAATCTTAAGATAAGTTAA
CCTGAGTGTTAGCATTTTGTGATTCCAATCCTTTTGTGACGATGGCTTACTTGAATGTGC
GTATTCTTGATCCTTGTTTTTTTTTGTCACCGAATTCCTGTAGTGCATTCTTTATCTTCT
ACAACT

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 5

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CATCTCCGTTGTTGCTTCGGCTTCGTCGCGTTTACTTCATCCTTCTTCATCGAACGGGAA
GACTAGCGTTCCTTCCGCTTCGCTTTCTCTACGCTCAGGTTCGAGACGGGGAGCGTTTTC
TCTCAGCTCTTCGACATCAGCCTCCGCTTCTTCTCAGCTGCTCCATTGCTCCTTTCTCTC
TTCATCTCTTTCCCTCGCATCCACATTTTCTGGTCTGTCCATTGCGTTTGATCTCAGCAA
TGGAACAAGTGGTCTGAGTAGCCAGAAACGCAGAGGGCTTGTGGTGAGAGCTGGGAAAGC
TGCTCTGTGTCAAACGAAGAGGAGCAGGTCGAGAAAATCTCTGGCTAGGACTCATGGTTT
CCGTTTGAGGATGAGAACCACCAGTGGAAGAGCCACCATCAAGCGCCGACGTGCCAAGGG
ACGTTGGAATCTCTGCCCTAAGTCCAACCCTAGCAGCGGCAAACGTGCTTGAATGCCCTC
GTTCTATCTGTAATCATGTCTGATATGCTTCTTCTTTTTCTTGTGTTTTCCGGCAGAAAA
TACGATGAGAAAACACAAGTCGATGAGCTCTTTTATGCTTTTTAACTCTTTATGTATCAT
TACATTGCGCTTTAGTAATTGCTTCGCTAAATTTTGAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G611TF U 22
AF RS1FG11TF U 1
AF RS1G611JQ C 28
AF RS1FG11JQ C 184
AF RS1B337TF U 257
BS 1 413 RS1FG11TF
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BS 517 682 RS1FG11TF
BS 683 701 RS1FG11JQ

RD RS1G611TF 637 0 0
ATAAGA
AAATAAAAAAATTTCAATGGCTTCTTCCTTATCCATCTCCGTTGTTGCTTCGGCTTCGTC
GCGTTTACTTCATCCTTCTTCATCGAACGGGAAGACTAGCGTTCCTTCCGCTTCGCTTTC
TCTACGCTCAGGTTCGAGACGGGGAGCGTTTTCTCTCAGCTCTTCGACATCAGCCTCCGC
TTCTTCTCAGCTGCTCCATTGCTCCTTTCTCTCTTCATCTCTTTCCCTCGCGTCCACATT
TTCTGGTCTGTCCATTGCGTTTGATCTCAGCAATGGAACAAGTGGTCTGAGTAGCCAGAA
ACGCAGATGGCTTGTGGTGAGAGCTGGGAAAGCTGCTCTGTGTCAAACGAAGAGGAGCAG
GTCGAGAAAATCTCTGGCTAGGACTCATGGTTTCCGTTTGAGGATGAGAACCACCAGTGG
AAGAGCCACCATCAAGCGCCGACGTGCCAAGGGACGTTGGAATCTCTGCCCTAAGTCCAA
CCCTAGCAGCGGCAAACGTGCTTGAATGCCCTCGTTCTATCTGTAATCATGTCTGATATG
CTTCTTCTTTTTCTTGTGTTTTCCGGCAGAAAATACGATGAGAAAACACAAGTCGATGAG
CTCTTTTATGCTTTTTAACTCTTTATGTATC

QA 7 637 7 637
DS 

RD RS1FG11TF 682 0 0
GGGAGATTGGGGAGGAAGAAGATGAGAAAATAAAAAAATTTCAATGGCTTCTTCCTTATC
CATCTCCGTTGTTGCTTCGGCTTCGTCGCGTTTACTTCATCCTTCTTCATCGAACGGGAA
GACTAGCGTTCCTTCCGCTTCGCTTTCTCTACGCTCAGGTTCGAGACGGGGAGCGTTTTC
TCTCAGCTCTTCGACATCAGCCTCCGCTTCTTCTCAGCTGCTCCATTGCTCCTTTCTCTC
TTCATCTCTTTCCCTCGCATCCACATTTTCTGGTCTGTCCATTGCGTTTGATCTCAGCAA
TGGAACAAGTGGTCTGAGTAGCCAGAAACGCAGAGGGCTTGTGGTGAGAGCTGGGAAAGC
TGCTCTGTGTCAAACGAAGAGGAGCAGGTCGAGAAAATCTCTGGCTAGGACTCTTGGTTT
CCGTTTGAGGATGAGAACCACCAGTGGAAGAGCCACCATCAAGCGCCGACGTGCCAAGGG
ACGTTGGAATCTCTGCCCTAAGTCCAACCCTAGCATCGGCAAACGTGCTTGAATGCCCTC
GTTCTATCTGTAATCATGTCTGATATGCTTCTTCTTTTTCTTGTGTTTTCCGGCAGAAAA
TACGATGAGAAAACACAAGTCGATGAGCTCTTTTATGCTTTTTAACTCTTTATGTATCAT
TACATTGCGCTTTAGTAATTGC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1G611JQ 655 0 0
AAATAAAAAAATTTCAATGGCTTCTTCCTTATCCATCTCCGTTGTTGCTTCGGCTTCGTC
GCGTTTACTTCATCCTTCTTCATCGAACGGGAAGACTAGCGTTCCTTCCGCTTCGCTTTC
TCTACGCTCAGGTTCGAGACGGGGAGCGTTTTCTCTCAGCTCTTCGACATCAGCCTCCGC
TTCTTCTCAGCTGCTCCATTGCTCCTTTCTCTCTTCATCTCTTTCCCTCGCGTCCACATT
TTCTGGTCTGTCCATTGCGTTTGATCTCAGCAATGGAACAAGTGGTCTGAGTAGCCAGAA
ACGCAGATGGCTTGTGGTGAGAGCTGGGAAAGCTGCTCTGTGTCAAACGAAGAGGAGCAG
GTCGAGAAAATCTCTGGCTAGGACTCATGGTTTCCGTTTGAGGATGAGAACCACCAGTGG
AAGAGCCACCATCAAGCGCCGACGTGCCAAGGGACGTTGGAATCTCTGCCCTAAGTCCAA
CCCTAGCAGCGGCAAACGTGCTTGAATGCCCTCGTTCTATCTGTAATCATGTCTGATATG
CTTCTTCTTTTTCTTGTGTTTTCCGGCAGAAAATACGATGAGAAAACACAAGTCGATGAG
CTCTTTTATGCTTTTTAACTCTTTATGTATCATTACATTGCGCTTTAGTAATTGC

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1FG11JQ 518 0 0
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ATCTCTTTCCCTCGCATCCACATTTTCTGGTCTGTCCATTGCGTTTGATCTCAGCAATGG
AACAAGTGGTCTGAGTAGCCAGAAACGCAGAGGGCTTGTGGTGAGAGCTGGGAAAGCTGC
TCTGTGTCAAACGAAGAGGAGCAGGTCGAGAAAATCTCTGGCTAGGACTCTTGGTTTCCG
TTTGAGGATGAGAACCACCAGTGGAAGAGCCACCATCAAGCGCCGACGTGCCAAGGGACG
TTGGAATCTCTGCCCTAAGTCCAACCCTAGCATCGGCAAACGTGCTTGAATGCCCTCGTT
CTATCTGTAATCATGTCTGATATGCTTCTTCTTTTTCTTGTGTTTTCCGGCAGAAAATAC
GATGAGAAAACACAAGTCGATGAGCTCTTTTATGCTTTTTAACTCTTTATGTATCATTAC
ATTGCGCTTTAGTAATTGCTTCGCTAAATTTTGAACCC

QA 1 518 1 518
DS 

RD RS1B337TF 431 0 0
GCA
TCCACATTTTCTGGTCTGTCCATTGCGTTTGATCTCAGCAATGGAACAAGTGGTCTGAGT
AGCCAGAAACGCAGAGGGCTTGTGGTGAGAGCTGGGAAAGCTGCTCTGTGTCAAACGAAG
AGGAGCAGGTCGAGAAAATCTCTGGCTAGGACTCATGGTTTCCGTTTGAGGATGAGAACC
ACCAGTGGAAGAGCCACCATCAAGCGCCGACGTGCCAAGGGACGTTGGAATCTCTGCCCT
AAGTCCAGCCCTAGCAGCGGCAAACGTGCTTGAATGCCCTCGTTCTATCTGTAATCATGT
CTGATATGCTTCTTCTTTTTCTTGTGTTTTCCGGCAGAAAATACGATGAGGAAACACAAG
TCGATGAGCTCTTTTATGCTTTTTAACTCTTTATGTATCATTACATTGCGCTTTAGTAAT
TGC
TTCGC

QA 4 426 4 426
DS 



AS 2 4

CO CL1635Contig1 568 2 3 U
CAGCAGAGATACAACATGTGATCAGTATCCCCAGTAGTCGTACGATTTCGTCATCAAACT
TCTTTTGAGTTCTGGGTGCTCTCAAAGTACTCATCTGCGGTCATGGTGCTGAGCTCTTTG
CTTATCTCTTGAACATCAACAATTTCTTTCTCTAGCCGTTCAGACTCCTTGAGCGACTTC
TGTTCTGCTTCTTTCAGTTCCACCAACAAAGCATCAAACTTGGGCTTGTACTCAGGGGGT
AACATTGTCCACGTACTTAGGAATCTCAATGCTGTCATAAGCTTCCTTGTACATGTCAAC
AATGCCAGAACCAATACCCTTTCTGTAGAAATCCCAATCAATGGGTTCCGGCTCCTGACT
GAACTTGGTCTGGAGCTGGGGTGTTGACCTCATCGAAAGCGCGACGGAGGTTAGAGAACT
CTCTTCGAGCCTCATCGGTGACAAGGACCTTCGCCATCCCTTCCCAATCTATAGTTCTCG
ACGCTTTGAACGCCACTTCCGCCACTTTCTTCCCCGCTCCGCTCATTTTTTTCTCTCTAT
TTCACCCAAAACAAACAACAAACACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CU28JQ U 198
AF RS1CU28TF C 1
BS 1 197 RS1CU28TF
BS 198 457 RS1CU28JQ
BS 458 568 RS1CU28TF

RD RS1CU28JQ 260 0 0
TTCCACCAACAAAGCATCAAACTTGGGCTTGTACTCAGGGGGTAACATTGTCCACGTACT
TAGGAATCTCAATGCTGTCATAAGCTTCCTTGTACATGTCAACAATGCCAGAACCAATAC
CCTTTCTGTAGAAATCCCAATCAATGGGTTCCGGCTCCTGACTGAACTTGGTCTGGAGCT
GGGGTGTTGACCTCATCGAAAGCGCGACGGAGGTTAGAGAACTCTCTTCGAGCCTCATCG
GTGACAAGGACCTTCGCCAT

QA 1 260 1 260
DS 

RD RS1CU28TF 568 0 0
CAGCAGAGATACAACATGTGATCAGTATCCCCAGTAGTCGTACGATTTCGTCATCAAACT
TCTTTTGAGTTCTGGGTGCTCTCAAAGTACTCATCTGCGGTCATGGTGCTGAGCTCTTTG
CTTATCTCTTGAACATCAACAATTTCTTTCTCTAGCCGTTCAGACTCCTTGAGCGACTTC
TGTTCTGCTTCTTTCAGTTCCACCAACAAAGCATCAAACTTGGGCTTGTACTCAGGGG*T
AACATTGTCCACGTACTTAGGAATCTCAATGCTGTCATAAGCTTCCTTGTACATGTCAAC
AATGCCAGAGCCAATACCCTTTCTGTAGAAATCCCAATCAATGGGTTCCGGCTCCTGACT
GAACTTGGTCTGGAGCTGGG*TGTTGACCTCATCGAAAGCGCGACGGAGGTTAGAGAACT
CTCTTCGAGCCTCATCGGTGACAAGGACCTTCGCCATCCCTTCCCAATCTATAGTTCTCG
ACGCTTTGAACGCCACTTCCGCCACTTTCTTCCCCGCTCCGCTCATTTTTTTCTCTCTAT
TTCACCCAAAACAAACAACAAACACTCC

QA 1 568 1 568
DS 



CO CL1635Contig2 741 2 8 U
GGGTTGTTTGTTTTGGGTGAAATAGAGAGAAAAAAATGAGCGGAGCGGGGAAGAAAGTGG
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TCACCGATGAGGCTCGAAGAGAGTTCTCTAACCTCCGTCGCGCTTTCGATGAGGTCAACA
CCCAGCTCCAGACTAAGTTCAGTCAGGAGCCGGAACCCATTGATTGGGATTTCTACAGAA
AGGGTATTGGCTCTGGCATTGTTGACATGTACAAGGAAGCTTATGACAGCATTGAGATTC
CTAAGTACGTGGACAATGTTACCCCTGAGTACAAGCCAAAGTTTGATGCTTTGTTGGTGG
AACTGAAAGAAGCAGAACAGAAGTCGCTCAAGGAGTCTGAACGTCTAGAGAAAGAAATCG
TTGATGTTCAAGAGATAAGCAAAAAGCTCAGCACCATGACCGCAGATGAGTACTTCGAGA
AGCACCCAGAACTCAAAAAGAAGTTTGATGACGAAATCCGTAACGACTACTGGGGATACT
GATTCACCATGTTGTATCTCTGGCCTGGAAAAGAAACTCTTTTCTCTTTTTTCTTTTGAT
GTGATTTTGTGAGAGTCGATCCATATAACATAATAAGGACCTACTCCATTTACTTCGAGA
TGTTCATTGGAGATCCAATGAGACAATGACGATAAACCCATTTGGTTTTCAGTTGTCAAT
GTCATAATATTGTTTGTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
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AF RS1ED45JQ C 1
AF RS1ED45TF U 56
BS 1 55 RS1ED45JQ
BS 56 641 RS1ED45TF
BS 642 642 RS1ED45JQ
BS 643 695 RS1ED45TF
BS 696 696 RS1ED45JQ
BS 697 718 RS1ED45TF
BS 719 719 RS1ED45JQ
BS 720 741 RS1ED45TF

RD RS1ED45JQ 741 0 0
GGGTTGTTTGTTTTGGGTGAAATAGAGAGAAAAAAATGAGCGGAGCGGGGAAGAAAGTGG
CGGAAGTGGCGTTCAAAGCGTCGAGGACGATAGATTGGGAAGGGATGGCGAAGGTCCTTG
TCACCGATGAGGCTCGAAGAGAGTTCTCTAACCTCCGTCGCGCTTTCGATGAGGTCAACA
CCCAGCTCCAGACTAAGTTCAGTCAGGAGCCGGAACCCATTGATTGGGATTTTTACAGAA
AGGGTATTGGCTCTGGCATTGTTGACATGTACAAGGAAGCTTATGACAGCATTGAGATTC
CTAAGTACGTGGACAATGTTACCCCTGAGTACAAGCCAAAGTTTGATGCTTTGTTGGTGG
AACTGAAAGAAGCAGAACAGAAGTCGCTCAAGGAGTTTGAACGTCTAGAGAAAGAAATCG
TTGATGTTCAAGAGATAAGCAAAAAGCTCAGCACCATGACCGCAGATGAGTACTTCGAGA
AGCACCCAGAACTCAAAAAGAAGTTTGATGACGAAATCCGTAACGACTACTGGGGATACT
GATTCACCATGTTGTATCTCTGGCCTGGAAAAGAAACTCTTTTCTCTTTTTTCTTTTGAT
GTGATTTTGTGAGAGTCGATCCATATAACATAATAAGGACCTACTCCATTTACTTCGAGA
TGTTCATTGGAGATCCAATGAGACAATGACGATAAACCCATTTGGTTTTCAGTTGTCAAT
GTCATAATATTGTTTGTTTCG

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1ED45TF 686 0 0
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CCTTGTCACCGATGAGGCTCGAAGAGAGTTCTCTAACCTCCGTCGCGCTTTCGATGAGGT
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CAGAAAGGGTATTGGCTCTGGCATTGTTGACATGTACAAGGAAGCTTATGACAGCATTGA
GATTCCTAAGTACGTGGACAATGTTACCCCTGAGTACAAGCCAAAGTTTGATGCTTTGTT
GGTGGAACTGAAAGAAGCAGAACAGAAGTCGCTCAAGGAGTCTGAACGTCTAGAGAAAGA
AATCGTTGATGTTCAAGAGATAAGCAAAAAGCTCAGCACCATGACCGCAGATGAGTACTT
CGAGAAGCACCCAGAACTCAAAAAGAAGTTTGATGACGAAATCCGTAACGACTACTGGGG
ATACTGATTCACCATGTTGTATCTCTGGCCTGGAAAAGAAACTCTTTTCTCTTTTTTCTT
TTGATGTGATTTTGTGAGAGTCGATCCATATAACATAATAAGGACC*ACTCCATTTACTT
CGAGATGTTCATTGGAGATCCAATGAGACAATGACGATAA*CCCATTTGGTTTTCAGTTG
TCA*TGTCATAATATTGTTTGTTTCG

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 5

CO CL1636Contig1 856 5 12 U
CCAGAATTAAAATTGACAAATTTCATTGGACGGAAATCATGATTATATAACGCAAATTAC
AAGAAGTTTACACAATATGAAAAAAAAAGAAGTTTACACAGTATGGAAGTGAACCATAAA
GCGATTATATGAAATTATGGTCCAACCTAGAAACACTTGTACAATAAAACTATATAACCC
ATCTGGATTACTAGAAATACAAGTTACTTCACACCCAACAGAGATCAAACCAAAAGCTCT
CTGATCTCTGAAAACACAAGCATTCATATTTTAAAACACATAATTAAGAAAAAAAAACCA
AACAAAGGAACTTAAAAGTCTTTATATAATGAACTCATCGAAGGTTCTTATACGCTTCAT
GTTCACTTGTACTCCAAGATCATGTTGTTCTCCGGAGCCAGCCCAACGCAGGCCCTAAGA
ATGTTCTCCAGCATCGCCCGCTGCTTAGACAACGCATTAACCACCGGTGTTCCAGGCGGC
ACGAGCGGTGCCTTGGTGAGGTAGCTGAGTATAGTGGCCACAGGATGGAAAGAATGAAAC
TTCCCCTCTTTCTCGGATTTGAACTGAATCCTGGTGCTGAGTTCAGCGAGGAGAACAAGA
TCCAAGATAATTGGAGCAGCTAGGAGAGAGTCCTCGCAGGTGTTGTGCATCACAATTGTG
TTCTTTCCTCCCATGAATATCTCTGATGTATACTCATCCATGGCTCGCTTGCTATCTGCA
ACATACGGTACATACTTGATGACAACAACATGGTCAGGGTGTTCCCCGGGCTCGAAGAGG
ATACCGTTGCTAGCAACCATATCATCCACCACATTACTTTTGGAGATCTCCTTAGATCTG
AATGTCTGTGGAGCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FH15JQ U 78
AF RS1FH15TF C 78
AF RS1A422JQ U 1
AF RS1A422TF C 151
AF RS1AU06JQ U 111
BS 1 149 RS1A422JQ
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G
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TTGAACTGAATCCTGGTGCTGAGTTCAGCGAGGAGAACAAGATCC

QA 2 526 2 526
DS 

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G
GAAAAAAAAAGAAGTTTACACAGTATGGAAGTGAACCATAAAGCGATTATATGAAATTAT
GGTCCAACCTAGAAACACTTGTACAATAAAACTATATAACCCATCTGGATTACTAGAAAT
ACAAGTTACTTCACACCCAACAGAGATCAAACCAAAAGCTCTCTGATCTCTGAAAACACA
AGCATTCATATTTTAAAACACATAATTAAGAAAAAAAA*CCAAACAAAGGAACTTAAAAG
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ATCATGTTGTTCTCCGGAGCCAGCCCAACGCAGGCCCTAAGAATGTTCTCCAGCATCGCC
CGCTGCTTAGACAACGCATTAACCACCGGTGTTCCAGGCGGCACGAGCGGTGCCTTGGTG
AGGTAGCTGAGTATAGTGGCCACAGGATGGAAAGAATGAAACTTCCCCTCTTTCTCGGAT
TTGAACTGAATCCTGGTGCTGAGTTCAGCGAGGAGAACAAGATCC

QA 2 526 2 526
DS 

RD RS1A422JQ 741 0 0
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AAGAAGTTTACACAATATGAAAAAAAAAGAAGTTTACACAGTATGGAAGTGAACCATAAA
GCGATTATATGAAATTATGGTCCAACCTAAAAACACTTGTACAATAAAACTATATAACCC
ATCTGGATTACTAGAAATACAAGTTACTTCACACCCAACAGAGATCAAACCAAAAGCTCT
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GTTCACTTGTACTCCAAGATCATGTTGTTCTCCGGAGCCAGCCCAACGCAGGCCCTAAAA
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TCCAAGATAATTGGAGCAGCTAGGAGAGAGTCCTCGCAGGTGTTGTGCATCACAATTGTG
TTCTTTCCTCCCATGAATATCTCTGATGTATACTCATCCATGGCTCGCTTGCTATCTGCA
ACATACGGTACATACTTGATG

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1A422TF 659 0 0
AAACACTTGTACAATAAAACTATATAACCCATCTGGATTACTAGAAATACAAGTTACTTC
ACACCCAACAGAGATCAAACCAAAAGCTCTCTGATCTCTGAAAACACAAGCATTCATATT
TTAAAACACATAATTAAGAAAAAAAAACCAAACAAAGGAACTTAAAAGTCTTTATATAAT
GAACTCATCGAAGGTTCTTATACGCTTCATGTTCACTTGTACTCCAAGATCATGTTGTTC
TCCGGAGCCAGCCCAACGCAGGCCCTAAGAATGTTCTCCAGCATCGCCCGCTGCTTAGAC
AACGCATTAACCACCGGTGTTCCAGGCGGCACGAGCGGTGCCTTGGTGAGGTAGCTGAGT
ATAGTGGCCACAGGATGGAAAGAATGAAACTTCCCCTCTTTCTCGGATTTGAACTGAATC
CTGGTGCTGAGTTCAGCGAGGAGAACAAGATCCAAGATAATTGGAGCAGCTAGGAGAGAG
TCCTCGCAGGTGTTGTGCATCACAATTGTGTTCTTTCCTCCCATGAATATCTCTGATGTA
TACTCATCCATGGCTCGCTTGCTATCTGCAACATACGGTACATACTTGATGACAACAACA
TGGTCAGGGTGTTCCCCGGGCTCGAAGAGGATACCGTTGCTAGCAACCATATCATCCAC

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DS 

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TATATAACCCATCTGGATTACTAGAAATACAAGTTACTTCAAACCCAACAGAGATCAAAC
CAAAAGCTCTCTGATCTCTGAAAACACAAGCATTCATATTTTAAAACACATAATTAAAAA
AAAAAAACCAAACAAAGGAACTTAAAAGTCTTTATATAATGAACTCATCGAAGGTTCTTA
TACGCTTCATGTTCACTTGTACTCCAAGATCATGTTGTTCTCCGGAGCCAGCCCAACGCA
GGCCCTAAGAATGTTCTCCAGCATCGCCCGCTGCTTAAACAACGCATTAACCACCGGTGT
TCCAGGCGGCACGAGCGGTGCCTTGGTGAGGTAGCTGAATATAGTGGCCACAGGATGGAA
AGAATGAAACTTCCCCTCTTTCTCGGATTTGAACTGAATCCTGGTGCTGAGTTCAGCGAG
GAGAACAAGATCCAAGATAATTGGAGCAGCTAGGAGAGAGTCCTCGCAGGTGTTGTGCAT
CACAATTGTGTTCTTTCCTCCCATGAATATCTCTGATGTATACTCATCCATGGCTCACTT
GCTATCTGCAACATACGGTACATACTTGATGACAACAACATGGTCAGGGTGTTCCCCGGG
CTCGAAGAGGGTACCGTTGCTAGCAACCATATCATCCACCACATTACTTTTGGAGATCTC
CTTAGATCTGAATGTCTGTGGAGCTG

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 5

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AACATGGCTTACGGTCCGTGCGTGGGTATGACGAGACTTGATCGATGGGAACGTGCATTG
CGCTTAGGGATGAATCCTCCCGGTGAAATCGAGAAGCTTTTGAAAGCTGAGAAGGTTCAG
CAGGATTGTCTTTGGCAAGGTCGCGTCTAATAAAGTTTCAATCTTTTTCAGCTATGCCCG
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GGCTTTAGTCTTTGACATTGTGTTGTCTGTCGGCTTAAGGTCTTGTGTTTGTATCCCAAC
AATGTATTCCTCCATGTTTATTCAATATCATCTTGAGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1E193JQ C 1
AF RS1E193TF U 1
AF RS1DJ07TF U 31
AF RS1DJ07JQ C 31
AF RS1BI13TF U 48
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CAGGATTGTCTTTGGCAAGGTCGCGTCTAATAAAGTTTCAATCTTTTTCAGCTATGCCCG
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A

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CTTTTGTGAATGTTTGGTTCAGCCACTGGTTGGATCACTCACTCTGTTGTTTTAATCTTA
AAAAACCTTGGTAATGGAATGCATTTTGTTGGCTTTAGTCTTTGACATTGTGTTGTCTGT
CGG

QA 1 603 1 603
DS 

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TCCAAGCCTTCTTCCCGGAAAGTGTCTCCCAAACACGCGGCCACCCAGGGCTCCGATGCT
ACGCAGCCGGCGGCGTTGGTTTCGCACGGCTCCCTCGATCTCAAGGATGATTACGACGAG
AAGGAGGAGATGCTCAGGCAATTTGACATGAACATGGCTTACGGTCCGTGCGTGGGTATG
ACGAGACTTGATCGATGGGAACGTGCATTGCGCTTAGGGATGGATCCTCCCGGTGAAATC
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TAAAGTTTCAATCTTTTTCAGCTATGCCCGCCCCTTGTATGATCCATTGTCACTTGCTGT
CTTTTGTGAATGTTTGGTTCAGCCACTGGTTGGATCACTCACTCTGTTGTTTTAATCTTA
AAAAACCTTGGTAATGGAATGCATTTTGTTGGCTTTAGTCTTTGACATTGTGTTGTCTGT
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TCTTGAGG

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1BI13TF 651 0 0
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TCCCTCGATCTCAAGGATGATTACGACGAGAAGGAGGAGATGCTCAGGCAATTTGACATG
AACATGGCTTACGGTCCGTGCGTGGGTATGACGAGACTTGATCGATGGGAACGTGCATTG
CGCTTAGGGATGAATCCTCCCGGTGAAATCGAGAAGCTTTTGAAAGCTGAGAAGGTTCAG
CAGGATTGTCTTTGGCAAGGTCGCGTCTAATAAAGTTTCAATCTTTTTCAACTATGCCCG
CCCCTTGTATGATCCATTGTCACTTGCTGTCTTTTGTGAATGTTTGGTTCAGCCACTGGT
TGGATCACTCACTCTGTTGTTTTAATCTTGAAAAACCTTGGTAATGGAATGCATTTTGTT
GGCTTTAGTCTTTGACATTGTGTTGTCTGTCGGCTTAAGGTCTTGTGTTTGTATCCCAAC
AATGTATTCCTCCATGTTTATTCAATATCATCTTGAGG

QA 14 651 14 651
DS 



AS 1 3

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TGACTCCACTTACGACATGATTGGTGGTCTTGACCAGCAAATTAAGGAAATTAAGGAGGT
CATTGAGCTACCAATCAAGCATCCTGAATTGTTCGAGTCTCTTGGAATCGCTCAGCCAAA
GGGTGTGTTGTTATATGGTCCACCTGGAACTGGGAAGACACTCTTGGCTCGGGCTGTGGC
ACATCACACTGACTGTACGTTCATCAGAGTTTCTGGTTCCGAGCTGGTCCAGAAATACAT
TGGAGAAGGTTCTAGAATGGTCAGAGAACTTTTTGTGATGGCAAGGGAGCATGCACCATC
GATCATCTTCATGGATGAAATCGATAGTATCGGGTCTGCTCGTATGGAATCTGGAAGTGG
AAACGGTGACAGTGAGGTTCAGCGGACTATGCTTGAGCTTCTCAATCAACCTGACGGTTT
CGAAGCGTCAAACAAGATCAAGGTTCTGATGGCGACAAATCGTATAGATATTCTGGATCA
AGCTCTTCTCAGGCCAGGAAGGATTGATAGGAAAATTGAATTCCCAAATCCTAATGAAGA
TTCACGTTTTGATATCTTGAAGATCCACTCGAGGAAAATGAATTTGATGCGTGGAATTGA
TCTGAAGAAGATTGCAGAGAAGATGAATGGTGCTTCAGGTGCTGAGCTGAAGGCTGTGTG
CACGGAGGCAGGCATGTTTGCTCTGAGGGAGAGGAGAGTACACGTGACACAGGAAGACTT
TGAGATGGCGGTGGCGAAGGTTATGAAGAAAGACACAGAGAAGAACATGTCTCTGCGTAA
GCTGTGGAAGTAGGAATATCAATCTGTTCTCTGTTCTTTCCAGAATCTCTTCTGTTTTTT
TCTTTAAGCGTTTGAAAACAGAGTTTTTTTTTACTGCCTAAACACTATTGTGTACTTGAA
ATGTTAGCATACCAGTTCCGAGTTCATCGTGTTAAACTAAGAGAGATTTTTC


BQ
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AF RS1FH83TF U 1
AF RS1A614TF U 7
AF RS1A614JQ C 548
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BS 213 213 RS1A614TF
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CGACAAAAAAATGGCGGCCGTAGGAATCGAGTCGAGGCGTTCCGAGACCGCGATGGAGGC
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CATAACGAAGCTTACACCATCAACAAGAGTTGCTCTCCGTAATGATAGCTATGTTCTCCA
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TGACTCCACTTACGACATGATTGGCGGTCTTGA

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GG
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AAATGGCGGCCGTAGGAATCGAGTCGAGGCGTTCCGAGACCGCGATGGAGGCTGAAACCT
GCAACGTCAAGGGAGCGGTGGCGAAACAAGGAGAGGGGCTTAAGCAGTACTATCTCCAGC
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CTCAGAGGAACGATCTCAACTCTCGAGTACGAATGCTGAGGGAAGAGTTGCAGCTGCTTC
AGGAACCTGGGTCCTATGTGGGTGAAGTGGTCAAAGTGATGGGCAAAAACAAGGTCTTGG
TTAAGGTTCATCCAGAGGGGAAGTATGTTGTTGATATTGACAAAAGCATAGACATAACGA
AGCTTACACCATCAACAAGAGTTGCTCTCCGTAATGATAGCTATGTTCTCCACCTTGTCC
TGCCAAGTAAAGTTGATCCCCTGGTTAACCTTATGAAAGTTGAGAAGGTTCCTGACTCCA
CTTACGACATGATTGGTGGTCTTGACCAGCAAATTAAGGAAATTAAGGAGGTCATTGAGC
TACCAATCAAGCATCCTGAATTGTTCGAGTCTCTTGGAATCGCTCAGCCAAAGGGTGTGT
TGTTATATGGTCCACCTGGAACTGGGAAGACACTCTTGGCTCGGGCTGTGGCACATCACA
CTGACTGTACGTTCATCAGAGT

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DS 

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GACATGATTGGTGGTCT*GACCAGCAAATTAAGGAAATTAAGGAGGTCATTGAGCTACCA
ATCAAGCATC*TGAATTGTTCGAGTCTCTTGGAATCGCTCAGCCAAAGGGTGTGTTGTTA
TATGGTCCACCTGGAACTGGGAAGACACTCTTGGCTCGGGCTGTGGCACATCACACTGAC
TGTACGTTCATCAGAGTTTCTGGTTCCGAGCTGGTCCAGAAATACATTGGAGAAGGTTCT
AGAATGGTCAGAGAACTTTTTGTGATGGCAAGGGAGCATGCACCATCGATCATCTTCATG
GATGAAATCGATAGTATCGGGTCTGCTCGTATGGAATCTGGAAGTGGAAACGGTGACAGT
GAGGTTCAGCGGACTATGCTTGAGCTTCTCAATCAACCTGACGGTTTCGAAGCGTCAAAC
AAGATCAAGGTTCTGATGGCGACAAATCGTATAGATATTCTGGATCAAGCTCTTCTCAGG
CCAGGAAGGATTGATAGGAAAATTGAATTCCCAAATCCTAATGAAGATTCACGTTTTGAT
ATCTTGAAGATCCACTCGAGGAAAATGAATTTGATGCGTGGAATTGATCTGAAGAAGATT
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ATGTTTGCTCTGAGGGAGAGGAGAGTACACGTGACACAGGAAGACTTTGAGATGGCGGTG
GCGAAGGTTATGAAGAAAGACACAGAGAAGAACATGTCTCTGCGTAAGCTGTGGAAGTAG
GAATATCAATCTGTTCTCTGTTCTTTCCAGAATCTCTTCTGTTTTTTTCTTTAAGCGTTT
GAAAACAGAGTTTTTTTTTACTGCCTAAACACTATTGTGTACTTGAAATGTTAGCATACC
AGTTCCGAGTTCATCGTGTTAAACTAAGAGAGATTTTTC

QA 7 945 7 945
DS 



AS 2 5

CO CL1639Contig1 863 3 13 U
GGAATTTTAAAACAAAACCAACTCACATGGAAAAAAACTCTCTCTCTCCTTTTAGAGACA
GACTTTTCTCTCGAACTTCCCTCTTACCAAATACCCATCTTTCAAAGGGTCTTTTGTTGT
ATCATATTTCGATCATTTGATCGATTTTCTATTTTCGTTGCGGATTTTTGTTTTTCGTTA
TGGCGGTTTTGTAGTGTTTCTTCGATCTCAAACTGATCAGCTTCTTCATGGTTTCATCTT
TTATCAGTTTTGTCGAAGATAAAATAAAGTCCGGACCTTATAATTCCGGTTGTGTCTTAC
TCTTTTGCGATTCTAAATCAAGATTCCGGTGTGTCTGTTATGATTTATCTTCATTGAAAG
ATAATTTTGGATTCCTTTTCCTTAGAAATCGGTCTTACCCGAAGCCTGT*GAAAAATCGG
CTTTGGGTTCAGCTTTCTTCAG********GTACAGGCGATGGCGAAAGACGAAAGAGAA
TATACAAGCATTGGGCTTGGATTAATGATGAGGCTGAAGGAAGAACATGAAGATCGACTC
TGGTAAAGATACGGCGGTGACGATGTAACTCGGCGAAGTTACAGCTTCGGTGAAGTCTTT
GTGTAGGCTCGACGTGTGTCCAACCACGTGTAAAACAAACGAGATAGTGGATAGCACGTG
GCAAAGGTTAAACTAGAGTCGGTTTTATTGTTTTTGGGCTAATATTTTTAATGATGTAAT
GTTTTTGGGCCTTATCGTTGAAGTCTGAATACTTATAATTTTGCCCATAGGCGTCACTTT
AATAGTGAATCAATTTGACAAAAAAGAAAAAAACCAACCCACATGTCGGTTAGAATTCTG
CTCTTCGATTTGGGCAAGGTACG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AE84TF U 1
AF RS1F362TF U 42
AF RS1AE84JQ C 24
BS 1 662 RS1AE84TF
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BS 710 730 RS1F362TF
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BS 732 741 RS1F362TF
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RD RS1AE84TF 662 0 0
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GACTTTTCTCTCGAACTTCCCTCTTACCAAATACCCATCTTTCAAAGGGTCTTTTGTTGT
ATCATATTTCGATCATTTGATCGATTTTCTATTTTCGTTGCGGATTTTTGTTTTTCGTTA
TGGCGGTTTTGTAGTGTTTCTTCGATCTCAAACTGATCAGCTTCTTCATGGTTTCATCTT
TTATCAGTTTTGTCGAAGATAAAATAAAGTCCGGACCTTATAATTCCGGTTGTGTCTTAC
TCTTTTGCGATTCTAAATCAAGATTCCGGTGTGTCTGTTATGATTTATCTTCATTGAAAG
ATAATTTTGGATTCCTTTTCCTTAGAAATCGGTCTTACCCGAAGCCTGT*GAAAAATCGG
CTTTGGGTTCAGCTTTCTTCAG********GTACAGGCGATGGCGAAAGACGAAAGAGAA
TATACAAGCATTGGGCTTGGATTAATGATGAGGCTGAAGGAAGAACATGAAGATCGACTC
TGGTAAAGATACGGCGGTGACGATGTAACTCGGCGAAGTTACAGCTTCGGTGAAGTCTTT
GTGTAGGCTCGACGTGTGTCCAACCACGTGTAAAACAAACGAGATAGTGGATAGCACGTG
GC

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DS 

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GG
CTCTTCTTTTAGAGACAGACTTTTCTCTCGAACTTCCCTCTTACCAAATACCCATCTTTC
AAAGGGTCTTTTGTTGTATCATATTTCGATCATTTGATCGATTTTCTATTTTCGTTGCGG
ATTTTTGTTTTTCGTTATGGCGGTTTTGTAGTGTTTCTTCGATCTCAAACTGATCAGCTT
CTTCATGGTTTCATCTTTTATCAGTTTTGTCGAAGATAAAATAAAGTCCGGACCTTATAA
TTCCGGTTGTGTCTTACTCTTTTGCGATTCTAAATCAAGATTCCGGTGTGTCTGTTATGA
TTTATCTTCATTGAAAGATAATTTTGGATTCCTTTTCCTTAGAAATCAGTCTTACCCGAA
GCCTGCCGAAAAATCGGCTTTGGGTTCAGCTTTCTTCAGATGTTCAGGTACAGGCGATGG
CGAAAGACGAAAGAGAATATACAAGCATTGGGCTTGGATTAATGATGAGGCTGAAGGAAG
AACATGAAGATCGACTCTGGTAAAGATACGGCGGTGACGATGTAACTCGGCGAAGTTACA
GCTTCGGTGAAGTCTTTGTGTAGGCTCGACGTGTGTCCAACCACGTGTAAAACAAACGAG
ATAGTGGATAGCACGTGGCAAAG*TTAAACTAGAGTCGGTTTTATTGTTTT*GGGCTA*T
ATTTT*AATGATGTAATGTTTTTGGGC*TTATCGTTGA
GTCTGATA

QA 3 700 3 700
DS 

RD RS1AE84JQ 840 0 0
CACATGGA
AAAAAACTCTCTCTCTCCTTTTAGAGACAGACTTTTCTCTCGAACTTCCCTCTTACCAAA
TACCCATCTTTCAAAGGGTCTTTTGTTGTATCATATTTCGATCATTTGATCGATTTTCTA
TTTTCGTTGCGGATTTTTGTTTTTCGTTATGGCGGTTTTGTAGTGTTTCTTCGATCTCAA
ACTGATCAGCTTCTTCATGGTTTCATCTTTTATCAGTTTTGTCGAAGATAAAATAAAGTC
CGGACCTTATAATTCCGGTTGTGTCTTACTCTTTTGCGATTCTAAATCAAGATTCCGGTG
TGTCTGTTATGATTTATCTTCATTGAAAGATAATTTTGGATTCCTTTTCCTTAGAAATCG
GTCTTACCCGAAGCCTGT*GAAAAATCGGCTTTGGGTTCAGCTTTCTTCAG********G
TACAGGCGATGGCGAAAGACGAAAGAGAATATACAAGCATTGGGCTTGGATTAATGATGA
GGCTGAAGGAAGAACATGAAGATCGACTCTGGTAAAGATACGGCGGTGACGATGTAACTC
GGCGAAGTTACAGCTTCGGTGAAGTCTTTGTGTAGGCTCGACGTGTGTCCAACCACGTGT
AAAACAAACGAGATAGTGGATAGCACGTGGCAAAGGTTAAACTAGAGTCGGTTTTATTGT
TTTTGGGCTAATATTTTTAATGATGTAATGTTTTTGGGCCTTATCGTTGAAGTCTGAATA
CTTATAATTTTGCCCATAGGCGTCACTTTAATAGTGAATCAATTTGACAAAAAAGAAAAA
AACCAACCCACATGTCGGTTAGAATTCTGCTCTTCGATTTGGGCAAGGTACG

QA 9 840 9 840
DS 



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ACTTTTCTCTCGAACTTCCCTCTTACCAAATACCCATCTTTCAAAGGGTCTTTTGTTGTA
TCATATTTCGATCATTTGATCGATTTTCTATTTTCGTTGCGGATTTTTGTTTTTCGTTAT
GGCGGTTTTGTAGTGTTTCTTCGATCTCAAACTGATCAGCTTCTTCATGGTTTCATCTTT
TATCAGTTTTGTCGAAGACAAAATAAAGTCCGGACCTTATAATTCCGGTTGTGTCTTACT
CTTTTGCGATTCTAAATCAAGATTCCGGTGTGTCTGTTATGATTTATCTTCATTGAAAGA
TAATTTTGGATTCCTTTTCCTTAGAAATCAGTCTTACCCGAACCCTGCCGAAAAATCGGC
TTTGGGTTCAGCTTTCTTCAGAGATGCAAGATGTTCAGGTACAGGCGATGGCGAAAGACG
AAAGAGAATATACAAGCATTGGGCTTGGATTAATGATGAGGCTGAAGGAAGAACATGAAG
ATCGACTCTGGTAAAGATACGGCGGTGACGATGTAACTCGGCGAAGTTACAGCTTCGGTG
AAGTCTTTGTGTAGGCTCGACGTGTGTCCAACCACGTGTAAAACAAACGAGATAGTGGAT
AGCACGTGGCAAAGGTTAAACTAGAGTCGGTTTTATTGTTTTTGGGCTAATATTTTTAAT
GATGTAATGTTTTTTGGGCCTTATCGTTGAAGTCTGAATACTTATAATTTTGCCCATGGG
CGTCACTTTAATAGTGAATCAATTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CM07TF U 1
AF RS1CM07JQ C 36
BS 1 402 RS1CM07TF
BS 403 403 RS1CM07JQ
BS 404 668 RS1CM07TF
BS 669 808 RS1CM07JQ

RD RS1CM07TF 668 0 0
GGAATTTTAAAACAAAACCAACTCACATGGAAAAAACTCTCTCTCTTCTTTTAGAGACAG
ACTTTTCTCTCGAACTTCCCTCTTACCAAATACCCATCTTTCAAAGGGTCTTTTGTTGTA
TCATATTTCGATCATTTGATCGATTTTCTATTTTCGTTGCGGATTTTTGTTTTTCGTTAT
GGCGGTTTTGTAGTGTTTCTTCGATCTCAAACTGATCAGCTTCTTCATGGTTTCATCTTT
TATCAGTTTTGTCGAAGACAAAATAAAGTCCGGACCTTATAATTCCGGTTGTGTCTTACT
CTTTTGCGATTCTAAATCAAGATTCCGGTGTGTCTGTTATGATTTATCTTCATTGAAAGA
TAATTTTGGATTCCTTTTCCTTAGAAATCAGTCTTACCCGAAGCCTGCCGAAAAATCGGC
TTTGGGTTCAGCTTTCTTCAGAGATGCAAGATGTTCAGGTACAGGCGATGGCGAAAGACG
AAAGAGAATATACAAGCATTGGGCTTGGATTAATGATGAGGCTGAAGGAAGAACATGAAG
ATCGACTCTGGTAAAGATACGGCGGTGACGATGTAACTCGGCGAAGTTACAGCTTCGGTG
AAGTCTTTGTGTAGGCTCGACGTGTGTCCAACCACGTGTAAAACAAACGAGATAGTGGAT
AGCACGTG

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1CM07JQ 773 0 0
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ATCTTTCAAAGGGTCTTTTGTTGTATCATATTTCGATCATTTGATCGATTTTCTATTTTC
GTTGCGGATTTTTGTTTTTCGTTATGGCGGTTTTGTAGTGTTTCTTCGATCTCAAACTGA
TCAGCTTCTTCATGGTTTCATCTTTTATCAGTTTTGTCGAAGACAAAATAAAGTCCGGAC
CTTATAATTCCGGTTGTGTCTTACTCTTTTGCGATTCTAAATCAAGATTCCGGTGTGTCT
GTTATGATTTATCTTCATTGAAAGATAATTTTGGATTCCTTTTCCTTAGAAATCAGTCTT
ACCCGAACCCTGCCGAAAAATCGGCTTTGGGTTCAGCTTTCTTCAGAGATGCAAGATGTT
CAGGTACAGGCGATGGCGAAAGACGAAAGAGAATATACAAGCATTGGGCTTGGATTAATG
ATGAGGCTGAAGGAAGAACATGAAGATCGACTCTGGTAAAGATACGGCGGTGACGATGTA
ACTCGGCGAAGTTACAGCTTCGGTGAAGTCTTTGTGTAGGCTCGACGTGTGTCCAACCAC
GTGTAAAACAAACGAGATAGTGGATAGCACGTGGCAAAGGTTAAACTAGAGTCGGTTTTA
TTGTTTTTGGGCTAATATTTTTAATGATGTAATGTTTTTTGGGCCTTATCGTTGAAGTCT
GAATACTTATAATTTTGCCCATGGGCGTCACTTTAATAGTGAATCAATTTGAC

QA 1 773 1 773
DS 



AS 2 5

CO CL1640Contig1 1062 3 9 U
CAACTCATTTTAATAATCTTTCTCAACTTATTACAATATAGTTAACAAGACCACACGTAT
AAAGATCATCACTGACAATAAGTTGACCTTACACTGATTTAACTTTCTCAGCGATTCAAG
CACAGTTGATAAACTACAGCTTCCTTACAGAAACTGTTGAGCTCTTGAACTTGCTTGATG
ATGATGGTGTTTTAAACAATGATGAAGGTTTGAATCCTCCACTCAATAAGCTCGACGCTG
ACCCTGCGCATATCTTCCTTCTCTTTGCCTCTAGCTCCAATCTTTTCTTGCTCGACGACG
ACATAAAGTAAGATGACTCCGGAAAGATGGAAGATGCATGGATCAGCGCTCGTTTATCCT
TTCGGTTCTTATCAAACTTGGTCTTGAACTTGACGTTTGACGCAGCTGCAATATCTTCTT
CGCTTTTTGGAAGAAGTTTTATCCCCAAGCCTAGCTTCCTTGAAGCAGCCTCTTCTTCAG
CTACGCGTTTCCTTTGTCCCCTAATCTGTGAACGTAGAGCTTTGTTCAGGGAGTAGTCAT
CTGCATGTCTTGCATCTGAGACTCGCTGGAGACGGACCAAAAGCGGTTCCATGGTTTCAG
CGTCTTCAACGTCATATTCCTCGACCTTCTTTTGAGCACCACTAGTAATCACATACTCGC
AGTTCTGAGGATCAGTCTGAATGACTATCTCCTGTTTGCAGCACGGTGCTTTCATCGCAA
AGCTCCATATCTTTGTAGAATAATAGTTGCCAACTTGCTTCTTTTCAGCATTGAAACGAA
CACCCTTGGCAATCATCGAATTGCAGCCACCACACCATATATTATACGGCATCTCGAACC
TTATGATGAGAATCCCTTCGCCTAGCTTCCTAGCCCTCTCTCTGAGAGGATGTTGTCCTT
GGAACTTGTTCAAGGAACCTTGGTCGGGTGTCCATTCTGGGGGATAGTAAAAGTTGTCTG
CCCTCGCAGCTGAAAGAGTCGACATCTTCTTCAATCGAGATTGATCGAATCCTTCTTCCT
AATACCCCTTTGGTCTCTCTCGCCCTATGAGTTGTACAAGAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EG59JQ U 1
AF RS1H480JQB U 1
AF RS1H480TF C 324
BS 1 437 RS1EG59JQ
BS 438 438 RS1H480JQB
BS 439 485 RS1EG59JQ
BS 486 486 RS1H480JQB
BS 487 510 RS1EG59JQ
BS 511 511 RS1H480JQB
BS 512 571 RS1EG59JQ
BS 572 810 RS1H480JQB
BS 811 1062 RS1H480TF

RD RS1EG59JQ 571 0 0
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AAAGATCATCACTGACAATAAGTTGACCTTACACTGATTTAACTTTCTCAGCGATTCAAG
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ATGATGGTGTTTTAAACAATGATGAAGGTTTGAATCCTCCACTCAATAAGCTCGACGCTG
ACCCTGCGCATATCTTCCTTCTCTTTGCCTCTAGCTCCAATCTTTTCTTGCTCGACGACG
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TTCGGTTCTTATCAAACTTGGTCTTGAACTTGACGTTTGACGCAGCTGCAATATCTTCTT
CGCTTTTTGGAAGAAGTCTTATCCCCAAGCCTAGCTTCCTTGAAGCAGCCTCTTCTTCAG
CTACG*GTTTCCTTTGTCCCCTAATCTGTGCACGTAGAGCTTTGTTCAGGGAGTAGTCAT
CTGCATGTCTTGCATCTGAGACTCGCTGGAG

QA 1 571 1 571
DS 

RD RS1H480JQB 810 0 0
CAACTCATTTTAATAATCTTTCTCAACTTATTACAATATAGTTAACAAGACCACACGTAT
AAAGATCATCACTGACAATAAGTTGACCTTACACTGATTTAACTTTCTCAGCGATTCAAG
CACAGTTGATAAACTACAGCTTCCTTACAGAAACTGTTGAGCTCTTGAACTTGCTTGATG
ATGATGGTGTTTTAGACAATGATGAAGGTTTGAATCCTCCACTCAATAAGCTCGACGCTG
ACCCTGCGCATATCTTCCTTCTCTTTGCCTCTAGCTCCAATCTTTTCTTGCTCGACGACG
ACATAGAGTACGATGACTCCGGAAAGATGGAAGATGCATGGATCAGCGCTCGTTTATCCT
TTCGGTTCTTATCAAACTTGGTCTTGAACTTGACGTTTGACGCAGCTGCAATATCTTCTT
CGCTTTTTGGAAGAAGTTTTATCCCCAAGCCTAGCTTCCTTGAAGCAGCCTCTTCTTCAG
CTACGCGTTTCCTTTGTCCCCTAATCTGTGAACGTAGAGCTTTGTTCAGGGAGTAGTCAT
CTGCATGTCTTGCATCTGAGACTCGCTGGAGACGGACCAAAAGCGGTTCCATGGTTTCAG
CGTCTTCAACGTCATATTCCTCGACCTTCTTTTGAGCACCACTAGTAATCACATACTCGC
AGTTCTGAGGATCAGTCTGAATGACTATCTCCTGTTTGCAGCACGGTGCTTTCATCGCAA
AGCTCCATATCTTTGTAGAATAATAGTTGCCAACTTGCTTCTTTTCAGCATTGAAACGAA
CACCCTTGGCAATCATCGAATTGCAGCCAC

QA 1 810 1 810
DS 

RD RS1H480TF 739 0 0
AAGATGGAAGATGCATGGATCAGCGCTCGTTTT**CTTTCGGTTCTTATCAAACTTGGTC
TTGAACTTGACGTTTGACGCAGCTGCAATATCTTCTTCGCTTTTTGGAAGAAGTTTTATC
CCCAAGCCTAGCTTCCTTGAAGCAGCCTCTTCTTCAGCTACGCGTTTCCTTTGTCCCCTA
ATCTGTGAACGTAGAGCTTTGTTCAGGGAGTAGTCATCTGCATGTCTTGCATCTGAGACT
CGCTGGAGACGGACCAAAAGCGGTTCCATGGTTTCAGCGTCTTCAACGTCATATTCCTCG
ACCTTCTTTTGAGCACCACTAGTAATCACATACTCGCAGTTCTGAGGATCAGTCTGAATG
ACTATCTCCTGTTTGCAGCACGGTGCTTTCATCGCAAAGCTCCATATCTTTGTAGAATAA
TAGTTGCCAACTTGCTTCTTTTCAGCATTGAAACGAACACCCTTGGCAATCATCGAATTG
CAGCCACCACACCATATATTATACGGCATCTCGAACCTTATGATGAGAATCCCTTCGCCT
AGCTTCCTAGCCCTCTCTCTGAGAGGATGTTGTCCTTGGAACTTGTTCAAGGAACCTTGG
TCGGGTGTCCATTCTGGGGGATAGTAAAAGTTGTCTGCCCTCGCAGCTGAAAGAGTCGAC
ATCTTCTTCAATCGAGATTGATCGAATCCTTCTTCCTAATACCCCTTTGGTCTCTCTCGC
CCTATGAGTTGTACAAGAG

QA 1 739 1 739
DS 



CO CL1640Contig2 693 2 19 U
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CCAAAAGAGATATTAGGAAGAAGGATTCGATCAATCTCGATTGAAGAAGATGTCGACTCT
TTCAGCTGCGAGGGCAGACAACTTTTACTATCCCCCAGAATGGACACCCGACCAAGGTTC
CTTGAACAAGTTCCAAGGACAACATCCTCTCAGAGAGAGGGCTAGGAAGCTAGGCGAAGG
GATTCTCATCATAAGGTTCGAGATGCCGTATAATATATGGTGTGGTGGCTGCAATTCGAT
GATTGCCAAGGGTGTTCGTTTCAATGCTGAAAAGAAGCAAGTTGGCAACTATTACTCTAC
AAAGATATGGAGCTTTGCGATGAAAGCACCGTGCTGCAAACAGGAGATAGTCATCCAGAC
TGATCCTCAGAACTGCGAGTATGTGATTACTAGTGGTGCTCAAAAGAAGGTCGAGGAATA
TGACGTTGAAGACGCTGAAACCATGGAACTCACTGCTGAGGAAGAGAAGGGAAAGCTTGC
AGACCCATTCTATCGTTTAGAGCACCAAGAAGTTGATTTGCAGAAGAAAAAAGCAGCAGA
ACCGCTTTTGGTCCGTCTCCAGCGAGTCTCAGATGCAAGACATGCAGATGACTACTCCCT
AAACAAAGCTCTACGTGCACAGATTATGGGACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GL67TF U 1
AF RS1EG59TF U 37
BS 1 71 RS1GL67TF
BS 72 72 RS1EG59TF
BS 73 165 RS1GL67TF
BS 166 166 RS1EG59TF
BS 167 171 RS1GL67TF
BS 172 172 RS1EG59TF
BS 173 198 RS1GL67TF
BS 199 199 RS1EG59TF
BS 200 201 RS1GL67TF
BS 202 202 RS1EG59TF
BS 203 396 RS1GL67TF
BS 397 397 RS1EG59TF
BS 398 399 RS1GL67TF
BS 400 400 RS1EG59TF
BS 401 471 RS1GL67TF
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BS 473 630 RS1GL67TF
BS 631 631 RS1EG59TF
BS 632 693 RS1GL67TF

RD RS1GL67TF 693 0 0
GGGCAACGTTCTATAGTAGAACAAAACTTCCCAAATTTACAACTCATAGGGCGAGAGAGA
CCAAAAGAGATTTTAGGAAGAAGGATTCGATCAATCTCGATTGAAGAAGATGTCGACTCT
TTCAGCTGCGAGGGCAGACAACTTTTACTATCCCCCAGAATGGACTCCCGATCAAGGTTC
CTTGAACAAGTTCCAAGGCCAGCATCCTCTCAGAGAGAGGGCTAGGAAGCTAGGCGAAGG
GATTCTCATCATAAGGTTCGAGATGCCGTATAATATATGGTGTGGTGGCTGCAATTCGAT
GATTGCCAAGGGTGTTCGTTTCAATGCTGAAAAGAAGCAAGTTGGCAACTATTACTCTAC
AAAGATATGGAGCTTTGCGATGAAAGCACCGTGCTGTAAGCAGGAGATAGTCATCCAGAC
TGATCCTCAGAACTGCGAGTATGTGATTACTAGTGGTGCTCAAAAGAAGGTTGAGGAATA
TGACGTTGAAGACGCTGAAACCATGGAACTCACTGCTGAGGAAGAGAAGGGAAAGCTTGC
AGACCCATTCTATCGTTTAGAGCACCAAGAAGTTGATTTGCAGAAGAAAAAAGCAGCAGA
ACCGCTTTTGGTCCGTCTCCAGCGAGTCTCGGATGCAAGACATGCAGATGACTACTCCCT
AAACAAAGCTCTACGTGCACAGATTATGGGACA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RS1EG59TF 653 0 0
GG
ACAACTCATAGGGCGAGAGAGACCAAAGGGG*TATTAGGAAGAAGGATTCGATCAATTTC
GATTGAAGAAGATGTCGACTCTTTCAGCTGCGAGGGCAGACAACTTTTACTATCCCCCAG
AATGGACACCCGACCAAGGTTCCTTGAACAAGTTCCAAGGACAACATCCTCTCAGAGAGA
GGGCTAGGAAGCTAGGCGAAGGGATTCTCATCATAAGGTTCGAGATGCCGTATAATATAT
GGTGTGGTGGCTGCAATTCGATGATTGCCAAGGGTGTTCGTTTCAATGCTGAAAAGAAGC
AAGTTGGCAACTATTATTCTACAAAGATATGGAGCTTTGCGATGAAAGCACCGTGCTGCA
AACAGGAGATAGTCATTCAGACTGATCCTCAGAACTGCGAGTATGTGATTACTAGTGGTG
CTCAAAAGAAGGTCGAGGAATATGACGTTGAAGACGCTGAAACCATGGAACTCACTGCTG
AGGAAGAGAAGGGAAAGCTTGCAGACCCATTTTATCGTTTAGAGCACCAAGAAGTTGATT
TGCAGAAGAAGAAAGCAGCAGAACCGCTTTTGGTCCGTCTCCAGCGAGTCTCAGATGCAA
GACATGCAGATGACTACTCCCTGAACAAAGCTCTACGTGCACAGATTA
TGG

QA 3 650 3 650
DS 



AS 1 5

CO CL1641Contig1 1245 5 16 U
GGCTACTCGAAATCGAACACGGCGGCTTGATTTGGAGACACTTTCTCTTGAGACAGGACA
TTCAAGTGGTGG*TGATGGAGATCGATTTGGGAGCAAACGCGTTCGGTATAGACTTCCAT
CCATCGAAGAATCTTGTAGCTGCTGGTCTCATTGATGGACACTTGCATCTATACCGTTAC
GACACAGAGTCTTCACTTGTCAGGGAGCGTAAAGTTCGTGCTCATAAGGAGTCTTGCAGA
GCTGTTCGGTTCATTGACGATGGCCAAAGAATCGTCACAGCTTCAGCTGATTGCTCTATT
CTAGCCACTGATGTGGAGACTGGTGCTAGTGTTGCACGTCTTGAGAATGCTCACGAGGAT
GCTGTTAATACTTTGATAACTGTCACTGAGACAACCATCGCTTCTGGGGATGATAAAGGC
TGTGTTAAGATTTGGGATACGAGACAACGCTCTTGCTCTCACGAGTTTAATGTACATGAG
GATTACATTTCTAGCATGGCCTTTGCATCTGATTCAATGAAGCTAGTGGCAACAAGTGGA
GATGGGACTCTATCTGTCTGTAATCTCAGAACGAATAAAGTCCAAGCTCAGTCCGAGTTT
TCTGAAGACGAACTGCTTTCTGTTGTTATAATGAAGAATGGCCGTAAAGCCATCTGTGGA
ACTCAAAATGGTATTCTCATGTTGTATTCATGGGGATTTTTCAAAGATTGTAGTGATCGG
TTTGTTGATCTATCTCCAAACTCAGTTGATGTCCTATTAAAGCTTGATGAAGACAGACTT
ATCGCTGGATGTGATAATGGAATAATAAGCCTCGTTAGAATACTACCCAACAGAATCATA
CAGCCAATTGGGTCTCACGAGTTCCCTATCGAAGATCTCGCTCTCTCGCATGATAACAAG
TTTCTTGGTAGCACAGCTCATGACAGTATGCTCAAGCTGTGGGATCTAGACGAGATTATA
GAAGGTGCTAATGGAAACGCATCGGGAGCTGCAGAAGACAGTGACAGCGACAACGACGGA
ATGGACCTTGACAATGATCCCAAGCCTTCCAAAGGTAGCAAGAGGAAAACAAAAAGCAAA
GCTGCTAATCCAGTGGACAACAGAGCTTTCTTCGCAGACATGTAGCTTTTGTTTCAGATT
TATCTGGAAAAAATATACCAGATTCATACTTGAGTTATCTATGTTTGATTCTGACAGTGT
TCTTAACCGATATTATCTTTTCTCAATGTTTCACCCATTACAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1BV95TF U 28
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G
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CTGATTCAATGAAGCTAGTGGCAACAAGTGGAGATGGGACTCTATCTGTCTGTAATCTCA
GAACGAATAAAGTCCAAGCTCAGTCCGAGTTTTCTGAAGACGAACTGCTTTCTGTTGTTA
TAATGAAGAATGGCCGTAAAGCCATCTGTGGAACTCAAAATGGTATTCTCATGTTGTACT
CATGGGGATTTTTCAAAGATTGT

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GG
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TATACCGTTACGACACAGAGTCTTCACTTGTCAGGGAGCGTAAAGTTCGTGCTCATAAGG
AGTCTTGCAGAGCTGTTCGGTTCATTGACGATGGCCAAAGAATCGTCACAGCTTCAGCTG
ATTGCTCTATTCTAGCCACTGATGTGGAGACTGGTGCTAGTGTTGCACGTCTTGAGAATG
CTCACGAGGATGCTGTTAATACTTTGATAACTGTCACTGAGACAACCATCGCTTCTGGGG
ATGATAAAGGCTGTGTTAAGATTTGGGATACGAGACAACGCTCTTGCTCTCACGAGTTTA
ATGTACATGAGGATTACATTTCTAGCATGGCCTTTGCATCTGATTCAATGAAGCTAGTGG
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AGTCCGAGTTTTCTGAAGACGAACTGCTTTCTGTTGTTATAATGAAGAATGGCCGTAAAG
CCATCTGTGGAACTCAAAATGGTATTCTCATGTTGTATCCATGGGGATTTT
C

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GCTGTTCGGTTCATTGACGATGGCCAAAGAATCGTCACAGCTTCAGCTGATTGCTCTATT
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GCTGTTAATACTTTGATAACTGTCACTGAGACAACCATCGCTTCTGGGGATGATAAAGGC
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TCTGAAGACGAACTGCTTTCTGTTGTTATAATGAAGAATGGCCGTAAAGCCATCTGTGGA
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TTTGTTGATCTATCTCCAA
CTCA

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TGGGACTCTATCTGTCTGTAATCTCAGAACGAATAAAGTCCAAGCTCAGTCCGAGTTTTC
TGAAGACGAACTGCTTTCTGTTGTTATAATGAAGAATGGCCGTAAAGCCATCTGTGGAAT
TCAAAATGGTATTCTCATGTTGTATTCATGGGGATTTTTCAAAGATTGTAGTGATCGGTT
TGTTGATCTATCTCCAAACTCAGTTGATGTCCTATTAAAGCTTGATGAGGATAGACTTAT
CGCTGGATGTGATAATGGAATAATCAGCCTCGTTAGAATACTACCCAACAGAATCATACA
GCCAATTGGGTCTCACGAGTTCCCTATCGAAGATCTCGCTCTCTCGCATGATAACAAGTT
TCTTGGTAGCACAGCTCATGACAGTATGCTCAAGCTGTGGGATCTAGACGAGATTATAGA
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GGACCTTGACAATGATCCCAAGCCTTCCAAAGGTAGCAAGAGGAAAACAAAAAGCAAAGC
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TCTGGAAAAAATATACCAGATTCATACTTGAGTTATCTATGTTTGATTCTGACAGTGTTC
TTAACCGATATTATCTTTTCTCAATGTTTCACCCATTACAATT

QA 1 823 1 823
DS 

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TCTCAGAACGAATAAAGTCCAAGCTCAGTCCGAGTTTTCTGAAGACGAACTGCTTTCTGT
TGTTATAATGAAGAATGGCCGTAAAGCCATCTGTGGAACTCAAAATGGTATTCTCATGTT
GTACTCATGGGGATTTTTCAAAGATTGTAGTGATCGGTTTGTTGATCTATCTCCAAATTC
AGTTGATGTCCTATTAAAGCTTGATGAAGACAGACTTATCGCTGGATGTGATAATGGAAT
AATAAGCCTCGTTGGAATACTACCCAACAGAATCATACAGCCAATTGGGTCTCACGAGTT
CCCTATCGAAGATCTCGCTCTCTCGCATGATAACAAGTTTCTTGGTAGCACAGTTCATGA
CAGTATGCTCAAGCTGTGGGATCTAGACGAGATTATAGAAGGTGCTAATGGAAACGCATC
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GCCTTCCAAAGGTAGCAAGAGGAAAACAAAAAGCAAAGCTGCTAATCCAGTGGACAACAG
AGCTTTCTTCGCAGACATGTAGCTTTTGTTTCAGATTTATCTGGAAAAAATATACCAGAT
TCATACTTGAGTTATCTATGTTTGATTCTGACAGTGTTCTTAACCGATATTATCTTTTCT
CAATGTTTCACCCAT

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 4

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GGTAAATAAAAAAGAGAGAAGGAAAGCCTTTTGATGGTTTCCATCTTTTTGTCTGAAATT
CTCTCTAAATGTGTTCATCGTTTGCTTGGTCGTCTGAATCTGTGATGGCATGAGCTACAT
CTGTCCCCCACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGGTAAAACCTAAAGTCAA
AATAAAAAGGGCGTTGAGGGGAGAAGTCTCTTTACGTCTCTCAACAACATTCGCCGTCTT
CCTTCCTCTAATCTCTCTCTCGATCGATTTCTTCTCCGCGATTCCAAATGTCGAGCCGTT
GGTTGAGACCTGAGGTGTATCCCTTGTTCGCGGCTACTGGAGCTGCGGTTGGGATCTGTG
CGTTCTCGTTGATTAGGAACATCACCGGAAACCCTGAAGTCAGATGTACCAAGGAGAACA
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GGAAGTATGTTCGCGACAAGCGTCCAGAAATCATGTCTGGCCTCAACAAGTTCTTCACCG
ATCCTACTTACTGAACCTACCATTTTTCTCAAGACTTTCTTGTATTGTTTTCTGGAATAT
TGGGATTTTGATTGAATCTCTCTCAGTGTCTCTTAATAAAAATATCATTTGTCATGTTGC
TACTTCATTTATGCTGGTGGCTTATGTTGTCGCTTTTAAGCAGAACTACAACTATCTGTA
TTGAACTGCTCTTTGGATACATAACTGGAGTTTACTTTGACAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1GR74TF U 1
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AF RS1FK76TF U 242
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AAATGAACAATTTTTAAAGGGGAAAAAAAAACCAGACAGAGATTAGTTCCAAAAGATTAG
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GCCTTAGAGTCAACCTCTCCAGAGATGGTGATGAACGACTTAGGACGCCACTCGTGTTGG
ATCAGTGCGTTGGCTATACCAGCATTGTTTACGCGTGTCTTAACCGTGGTCAATGGGTCC
AGAGCGTGCTGAGCACCCACGGTTATCGTGTTCACTTGGCTCTTCAAGCTGTGGCTAACC
TCGGCTCCAACCACTGTGTTCTTCAACGGGTTCACAATGTGGTAGTACGATGCATTCAAT
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H693JQB U 1
AF RS1H593JQB U 226
AF RS1H593TF C 410
BS 1 519 RS1H693JQB
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CTC

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ACCTTGGCAGATTTCTGA

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DS 

RD RS1H593TF 790 0 0
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TGAAGCTCACACCAGCGTTGAAATGTTTGAAGTTGCCAGATTCCGTGTCAAATGACACAT
CCGTACCAAGAGCCAACACACTGGTTCCAATCACACCGGAGAAATTGACAACGGGGCTAG
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TGGCAGATTTCTGATCAGGCACCTTGGCGCTAAGGATTGCCTTCAATCCAGGGGTAGCCT
CATCATAGGTGACAGTGGTAAGGATAGAAGAATCAGAGGCGACTTTGATATCAGCAGTTA
AGTTCTTGTTCTTGATTTGGGTAAGTACATCACCCACAAACAAATCTCCCTTGTTTGTTC
CAGTTGTTGTGATTGCAACCCCGGTTGAAGAGTAAGTGGTGATACTGAGCTTCTGGTCTC
CTTGGTAGTCCTTGTACAAAAGATCTCTGGCCTTTTTGCCGATCTCGGTGTAGAGTCCTG
GACCTTTACCCATGATTGTCTCTTTGAAGAAGTTGTGGTGAAGAATGAGCAGAGAAGAGA
GCTGTATTCC

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 4

CO CL1644Contig1 854 4 24 U
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CTCTAAGTTCATAAGAAAATGGAAGGAAGACAATATTACCCTCCAAGAGAAAACGTCGAC
GGGAACAGAACAGCCATGGGAGGACCTCACTCGCCATGGCATTCACCTGTTCCTTATCTT
TTTGGTGGTTTGGCAGCGATGCTTGGTCTCATAGCTTTCGCTCTTCTGATCCTCGCTTGC
CCTTACTGGCGTCTCTCCGGTTATCTCGACGGTGAGGAGGAGCAGAGCAGAGACAGAGAT
CTTGAGGCCGGAGATGTGAAACCCGATAAAGCGGTGAAGGCTGCACCTTTGCCGGAGAAG
TTCTTGGTGATTATGGCCGGAGACGTCAAGCCCACTTATTTGGCGACGCCGGCTGAAAAG
AGCTGTACTTGTGACTATGATGAAGATGGTGATGATGACGTGAAGGATGGTGATCAGGTG
GTGCGTCGGAGTACTGAGAGTAACGGTGCGACACAGTGAGAGATGAAGAGAAAGAAAAAA
CAGAGGCTCGTCTTAGGTGAACAGTTCATGATAACTGTTTGCATCTGACCCGGTTGCTTC
TGGTATTCGGATCGGGTCTGGTCAGAGCTCTACATGATGAGATTTATAGGCTATATAGTC
AAAACTAGAAAAAAAGGGAATTGGTTCTGATTAATGTTATTTAATCTCAGCTTTTTGCAT
TAATTTACTTAGGCTTTTTAAGTTGTAAGTTTGTAATTCATCAGTCTTGTTCCAATTCTT
AGTTATAATGAAAAAACATCGGAAAATTGTAAATTTTTAGAGACTTTGAATGGAAAATTT
ATGATTTTTTAGCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ET01TF U 1
AF RS1C653TF U 1
AF RS1ET01JQ C 66
AF RS1C185TF U 459
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CTTGAGGCCGGAGATGTGAAACCCGATAAAGCGGTGAAGGCTGCACCTTTGCCGGAGAAG
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GTGCGTCGGAGTACTGAGAGTAACGGTGCGACACAGTGAGAGATGAAGAGAAAGAAAAAA
CAGAGGCTCGTCTTAGGTGAACAGTTCATGATAACTGTTTGCA

QA 1 583 1 583
DS 

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CTCTAAGTTCATAAGAAAATGGAAGGAAGACAATATTACCCTCCAAGAGAAAACGTCGAC
GGGAACAGAACAGCCATAGGAGGACCTCACTCGCCGTGGCATTCACCTGTTCCTTATCTT
TTTGGTGGTTTGGCAGCGATGCTTGGTCTCATAGCTTTCGCTCTTCTGATCCTCGCCTGC
TCTTACTGGCGTCTCTCCGGTTATCTCGACGGTGAGGAGGAGCAGAGCGGAGACAGAGAT
CTTGAGGCCGGAGATGTGAAACCCGATAAAGCGGTGAAGGCTGCACCTTTGCCGGAGAAG
TTCTTGGTGATTATGGCCGGAGACGTCAAGCCCACTTACTTGGCGACTCCGGCTGAAAAG
AGTTGTACTTGTGATGATGATGAAGATGGTGATGATGACGTGAAGGCTGGTGATCAGGTG
GTGCGTCGGAGTACTGAGAGTAACGGTGCGACACATTGAGAGATGAAGAGAAAGAAAAAA
CAGAGGCTCGTCTTAGGTGAACAGTTCATGATAACTGTTTGCATCTGACCCGGTTGCTTC
TGGTATTCGGATCGGGTCTGGTCAGAGCTCTACATGATGAGATTTATAG
CTATAT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1ET01JQ 681 0 0
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CAGAACAGCCATGGGAGGACCTCACTCGCCATGGCATTCACCTGTTCCTTATCTTTTTGG
TGGTTTGGCAGCGATGCTTGGTCTCATAGCTTTCGCTCTTCTGATCCTCGCTTGCCCTTA
CTGGCGTCTTTCCGGTTATCTCGACGGTGAGGAGGAGCAGAGCAGAGACAGAGATCTTGA
GGCCGGAGATGTGAAACCCGATAAAGCGGTGAAGGCTGCACCTTTGCCGGAGAAGTTCTT
GGTGATTATGGCCGGAGACGTCAAGCCCACTTATTTGGCGACGCCGGCTGAAAAGAGCTG
TACTTGTGACTATGATGAAGATGGTGATGATGACGTGAAGGATGGTGATCAGGTGGTGCG
TCGGAGTACTGAGAGTAACGGTGCGACACAGTGAGAGATGAAGAGAAAGAAAAAACAGAG
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TTCGGATCGGGTCTGGTCAGAGCTCTACATGATGAGATTTATAGGCTATATAGTCAAAAC
TAGAAAAAAAGGGAATTGGTTCTGATTAATGTTATTTAATTTCAGCTTTTTGCATTAATT
TACTTAGGCTTTTTAAGTTG
C

QA 1 680 1 680
DS 

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G
GTGAAGGATGGTGATCAGGTGGTGCGTCGGAGTACTGAGAGTAACGGTGCGACACAGTGA
GAGATGAAGAGAAAGAAAAAACAGAGGCTCGTCTTAGGTGAACAGTTCATGATAACTGTT
TGCATCTGACCCGGTTGCTTCTGGTATTCGGATCGGGTCTGGTCAGAGCTCTACATGATG
AGATTTATAGGCTATATAGTCAAAACTAGAAAAAAAGGGAATTGGTTCTGATTAATGTTA
TTTAATCTCAGCTTTTTGCATTAATTTACTTAGGCTTTTTAAGTTGTAAGTTTGTAATTC
ATCAGTCTTGTTCCAATTCTTAGTTATAATGAAAAAACATCGGAAAATTGTAAATTTTTA
GAGACTTTGAATGGAAAATTTATGATTTTTTAGCT

QA 2 396 2 396
DS 



AS 1 5

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CTAAGAAAGAAAGAAAGAAAAAAAGGAGAAGTAAGTCAAAGTCAGCTCCAGATGTGATCG
TCGCATGGATCACAGCCTTCCTGAGCAATGTCGGTGATCTGAACGCCGGCGTCGTAGGTC
TTGCCGGCTTCCCAGTTGGCAGGAAGAACCTTGTGAGACCAGAGCGTTTTGCCGTCGTAG
CCAGCCGTCACCAAGAACCTGAACTGAAGAGATCCGGTGGGTACTTTGTCAGTGACCCAT
ACGGCACCGTGGCTTCGGGTCATGTAACTCCAGTTGGAGGAACCAACCTGAGCAATGTCG
ATAGCTACGACTTCGGTTTGGCCTCCTTGGTACAAGAGCTTTATAGCCAAGTAGTATGGT
TTT**GCTTGATTCTTCAACTCTCACATTCAACATTTTCTTCTTTCCGTAATCGCAAGGA
ACTCTGTGATATTCAATGTCGACGATGCCTTGTCTGAGAAGATCTGTGTCAGCGCCGACA
ACCGGTTTGGCCATGGCCCTGAAGGCTCTGCTGCTGAGGACGAGATCGGTCTGGTTGCTC
ATGTTGAGGTCGGTGACCATCACCGTGGTTCCTTTGGTGCTGCAAAGAGTGAGGTTGTTG
CATCTGACCTGAAAGCAAGCACCGCAGCCAGCGCCGTCTTTGTAGATGGAAGGAACGGCG
GCGGCGATGTGACCGGCGAAAAAACCCGTAGCCATAGAACCATAAGAACAAGCTCCGGAG
GATAGGGCAGATGCGGAGGAGAAGAAAGCAGCCTTAGAGCGGTGAGGACATCGGTCGCAA
GCGTCAACTGAGGAGGAGGAGAAGAGGAGCACAACAAAGAATAAGAAGAGAAAGCAGCAG
CCTCCCATTTTTTTTTAAAATTATATTTATTCTGCTTTAAGTTTCTATGATAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GO60JQ U 1
AF RS1GD43JQ U 1
AF RS1A630JQ U 6
AF RS1A630TF C 236
AF RS1GD43TF C 327
BS 1 245 RS1GD43JQ
BS 246 246 RS1A630JQ
BS 247 256 RS1GD43JQ
BS 257 257 RS1A630JQ
BS 258 324 RS1GD43JQ
BS 325 325 RS1A630JQ
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AGAAT
CTCAGTTAATGGTTTTGATTATTTATAGTACATGATGATGATATAAGGAATGCTTCTAAG
AAAGAAAGAAAGAAAAAAAGGAGAAGTAAGTCAAAGTCAGCTCCAGATGTGATCGTCGCA
TGGATCACAGCCTTCCTGAGCAATGTCGGTGATCTGAACGCCGGCGTCGTAGGTCTTGCC
GGCTTCCCAGTTGGCAGGAAGAACCTTGTGAGACCAGAGCGTTTTGCCGTCGTAGCCAGC
TGTCACCAAGAGCCTGAACTGAAGAGATCCGGTGGGTACTTTGTCAGTGACCCATACGGC
ACCGTGGCTTCGGGTCATGCAACTCCAGTTGGAGGAACCAACCTGAGCAATGTCGATAGC
TACGACTTCGGTTTGGCCTCCTTGGTACAAGAGCTTTATAGCCAAGTAGTATGGTTTT**
GCTTGATTCTTCAACTCTCACATTCAACATTTTCTTCTTTCCGTAATCGCAAGGAACTCT
GTGATATTCAATGT

QA 6 499 6 499
DS 

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CTAAGAAAGAAAGAAAGAAAAAAAGGAGAAGTAAGTCAAAGTCAGCTCCAGATGTGATCG
TCGCATGGATCACAGCCTTCCTGAGCAATGTCGGTGATCTGAACGCCGGCGTCGTAGGTC
TTGCCGGCTTCCCAGTTGGCAGGAAGAACCTTGTGAGACCAGAGCGTTTTGCCGTCGTAG
CCAGCTGTCACCAAGAGCCTGAACTGAAGAGATCCGGTGGGTACTTTGTCAGTGACCCAT
ACGGCACCGTGGCTTCGGGTCATGCAACTCCAGTTGGAGGAACCAACCTGAGCAATGTCG
ATAGCTACGACTTCGGTTTGGCCTCCTTGGTACAAGAGCTTTATAGCCAAGTAGTATGGT
TTT**GCTTGATTCTTCAACTCTCACATTCAACATTTTCTTCTTTCCGTAATCGCAAGGA
ACTCTGTGATATTCAATGTCGACGATGCCTTGTCTGAGAAGATCTGTGTCAGCGCCGACA
ACCGGTTTGGCCATGGCCCTGAAGGCTCTGCTGCTGAGGACGAGATCGGTCTGGTTGCTC
ATGTTGAGGTCGGTGACCATCACCGTGGTTCCTTTGGTGCTGCAAAGAGTGAGGTTGTTG
CATCTGACCTGAA

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DS 

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CTCAGTTAAAGGTTTTGATTATTTATAGTACATGATGATGATATAAGGAAAGCTTCTAAG
AAAGAAAGAAAGAAAAAAAGGAGAAGTAAGTCAAAGTCAGTTCCAGATGTGATCGTCGCA
TGGATCACAGCCTTCCTGAGCAATGTCGGTGATCTGAAGGCCGGCGTCGTAGGTCTTGCC
GGCTTCCCAGTTGGCAGGAAGAACCTTGTGAGACCAGAGCGTTTTGCCGTCGTAGCCAGC
CGTCACCAAGAACCTGAACTGAAGAGATCCGGTGGGTACTTTGTCAGTGACCCATACGGC
ACCGTGGCTTCGGGTCATGTAACTCCAGTTGGAGGAACCAACCTGAGCAATGTCGATAGC
TACGACTTCGGTTTGGCCTCCTTGGTACAAGAGCTTTATAGCCAAGTAGTATGGTTTTTT
GCTTGATTCTTCAACTCTCACATTCAACATTTTCTTCTTTCCGTAATCGCAAGGAACTCT
GTGATATTCAATGTCGACGATGCCTTGTCTGAAAAGATCTGTGTCAGCGCCGACAACCGG
TTTGGCCATGGCCCTGAAGGCTCTGCTGCTGAGGACGAGATCGGTCTGGTTGCTCATGTT
GAGGTCGGTGACCATCACCGTGGTTCCTTTGGTGCTGCAAAGAGTGAGGTTGTTGCATCT
GACCTGAAAGCAAGCACCGCAGCCAGCGCCGTCTTTGTAGATGGAAGGAACGGCGGCGGC
GATGTGACCGGCGAAAAAACCCGTAGCCATAGAACCATAAGAACAAGCTCCGGAGGATAG
GGCAGATGCGGAGGAGAAGAAAGCAGCCTTAGAGCGGTGAGGACATCGGTCGCAAGCGTC
AACT

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DS 

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CCCATACGGCACCGTGGCTTCGGGTCATGTAACTCCAGTTGGAGGAACCAACCTGAGCAA
TGTCGATAGCTACGACTTCGGTTTGGCCTCCTTGGTACAAGAGCTTTATAGCCAAGTAGT
ATGGTTTTTTGCTTGATTCTTCAACTCTCACATTCAACATTTTCTTCTTTCCGTAATCGC
AAGGAACTCTGTGATATTCAATGTCGACGATGCCTTGTCTGAGAAGATCTGTGTCAGCGC
CGACAACCGGTTTGGCCATGGCCCTGAAGGCTCTGCTGCTGAGGACGAGATCGGTCTGGT
TGCTCATGTTGAGGTCGGTGACCATCACCGTGGTTCCTTTGGTGCTGCAAAGAGTGAGGT
TGTTGCATCTGACCTGAAAGCAAGCACCGCAGCCAGCGCCGTCTTTGTAGATGGAAGGAA
CGGCGGCGGCGATGTGACCGGCGAAAAAACCCGTAGCCATAGAACCATAAGAACAAGCTC
CGGAGGATAGGGCAGATGCGGAGGAGAAGAAAGCAGCCTTAGAGCGGTGAGGACATCGGT
CGCAAGCGTCAACTGAGGAGGAGGAGAAGAGGAGCACAACAAAGAATAAGAAGAGAAAGC
AGCAGCCTCCCATTTTTTTTTAAAATTATATTTATTCTGCTTTAAGTTTCTATGAT

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DS 

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TTGGTACAAGAGCTTTATAGCCAAGTAGTATGGTTTT**GCTTGATTCTTCAACTCTCAC
ATTCAACATTTTCTTCTTTCCGTAATCGCAAGGAACTCTGTGATATTCAATGTCGACGAT
GCCTTGTCTGAGAAGATCTGTGTCAGCGCCGACAACCGGTTTGGCCATGGCCCTGAAGGC
TCTGCTGCTGAGGACGAGATCGGTCTGGTTGCTCATGTTGAGGTCGGTGACCATCACCGT
GGTTCCTTTGGTGCTGCAAAGAGTGAGGTTGTTGCATCTGACCTGAAAGCAAGCACCGCA
GCCAGCGCCGTCTTTGTAGATGGAAGGAACGGCGGCGGCGATGTGACCGGCGAAAAAACC
CGTAGCCATAGAACCATAAGAACAAGCTCCGGAGGATAGGGCAGATGCGGAGGAGAAGAA
AGCAGCCTTAGAGCGGTGAGGACATCGGTCGCAAGCGTCAACTGAGGAGGAGGAGAAGAG
GAGCACAACAACGAATAAGAAGAGAAGGCAGCAGCCTCCCATTTTTTTTTAAAATTATAT
TTATTCTGCTTTAAGTTTCTATGATAAAAAA

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 4

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CCAATGGCGTTCTCAACGACTCTGTCTCAGCTTTCTTCTCTTTCGAGGATCTCCTCTTCA
CTGCCACTTTCTTCTAGAAGATTCTCTCTTCGATCCCAGACTCAGTTCAGAGTCAAAGCA
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GCTTCAACCAAAACCCCTAAAACTCTTCCCAAGAAGCCAGTTTACTCGATGAAGAAGGGT
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CATCCACCTTTCTACAAAGGACTAGATTACATCTATGAAGATCGCGGCGAGGTCCTTGAC
ATTCGTGTCTTTGAGACAGGAGAGTATGCCCTTGTTGGATGGGTCGGTATCCCAACCGCA
CCGGCTTGGCTACCAACAGATATGCTCATCAAGTCCGAGAAACTTGTTTACGAGCGACTA
TAGAGTCCACAAGTCTCCAAGAAGAATGCAACTGATACGATGGGTTGTGAGATGAATGAT
AACACAATGGAACCACCATGATCATGTCAAGAGTTATACAATGTATCAAATGAGTTACCG
CAGTCAAAAAAACTGTTGTGGAATGGAAAAAAAATGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RS1GJ74TF U 1
AF RS1GJ74JQ C 15
AF RS1EO78TF U 73
AF RS1EO78JQ C 128
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RD RS1GJ74TF 641 0 0
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CCAATGGCGTTCTCAACGACTCTGTCTCAGCTTTCTTCTCTTTCGAGGATCTCCTCTTCA
CTGCCACTTTCTTCTAGAAGATTCTCTCTTCGATCCCAGACTCAGTTCAGAGTCAAAGCA
GAGGCAGAGAATGAGAAACAGAGCACACAGACTAAATCCGAAGGGGAAGCAGCTTCACCA
GCTTCAACCAAAACCCCTAAAACTCTTCCCAAGAAGCCAGTTTACTCGATGAAGAAGGGT
CAAATCGTTCGTGTAGACAAGGAGAAGTACCTCAACAGCATCAATTACTTATCAGTTGGT
CATCCACCTTTCTACAAAGGACTAGATTACATCTATGAAGATCGCGGCGAGGTCCTTGAC
ATTCGTGTCTTTGAGACAGGAGAGTATGCCCTTGTTGGATGGGTCGGTATCCCAACCGCA
CCGGCTTGGCTACCAACAGATATGCTCATCAAGTCCGAGAAACTTGTTTACGAGTGACTA
TAGAGTCCACAAGTCTCCAAGAAGAATGCAACTGATACGATGGGTTGTGAGATGAATGAT
AACACAATGGAACCACCATGATCATGTCAAGAGTTATACAA

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1GJ74JQ 672 0 0
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AACGACTCTGTCTCAGCTTTCTTCTCTTTCGAGGATCTCCTCTTCACTGCCACTTTCTTC
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CAAAGGACTAGATTACATCTATGAAGATCGCGGCGAGGTCCTTGACATTCGTGTCTTTGA
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AACAGATATGCTCATCAAGTCCGAGAAACTTGTTTACGAGTGACTATAGAGTCCACAAGT
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GTTGTGGAATGG

QA 1 672 1 672
DS 

RD RS1EO78TF 625 0 0
TCAA
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AACAGAGCACACAGACTAAATCCGAAGGGGAAGCAGCTTCACCAGCTTCAACCAAAACCC
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ACAAGGAGAAGTACCTCAACAGCATCAATTACTTATCAGTTGGTCATCCACCTTTCTACA
AAGGACTAGATTACATCTATGAAGATCGCGGCGAGGTCCTTGACATTCGTGTCTTTGAGA
CAGGAGAGTATGCCCTTGTTGGATGGGTCGGTATCCCAACCGCACCGGCTTGGCTACCAA
CAGATATGCTCATCAAGTCCGAGAAACTTGTTTACGAGCGACTATAGAGTCCACAAGTCT
CCAAGAAGAATGCAACTGATACGATGGGTTGTGAGATGAATGATAACACAATGGAACCAC
CATGATCATGTCAAGAGTTATACAATGTATCAAATGAGTTACCGCAGTCAAAAAAACTGT
TGTGGAATGGAAAAAAA
TGCG

QA 5 621 5 621
DS 

RD RS1EO78JQ 571 0 0
TTTTTTT
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GAAACAGAGCACACAGACTAAATCCGAAGGGGAAGCAGCTTCACCAGCTTCAACCAAAAC
CCCTAAAACTTTTCCCAAGAAGCCAGTTTACTCGATGAAGAAGGGTCAAATCGTTCGTGT
AGACAAGGAGAAGTACCTCAACAGCATCAATTACTTATCAGTTGGTCATCCACCTTTTTA
CAAAGGACTAGATTACATTTATGAAGATCGCGGCGAGGTCCTTGACATTCGTGTCTTTGA
GACAGGAGAGTATGCCCTTGTTGGATGGGTCGGTATCCCAACCGCACCGGCTTGGCTACC
AACAGATATGCTCATCAAGTCCGAGAAACTTGTTTACGAGCGACTATAGAGTCCACAAGT
TTCCAAGAAGAATGCAACTGATACGATGGGTTGTGAGATGAATGATAACACAATGGAACC
ACCATGATCATGTCAAGAGTTATACAATGTATCAAATGAGTTACCGCAGTCAAAAAAACT
GTTGTGGAATGGAAAAAAAATGCG

QA 8 571 8 571
DS 



AS 1 5

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CGCGCGGCGAGCGGCGCAGAAGGAGAGGGTTCGAATCCTCTATCGACGCGCCCTTAAGGA
TACTCTCAATTGGGCTGTTCATCGCCACATTTTCTACCGAGACGCTTCTGATCTGCGCGA
CAAGTTCAACGCCAACCAAGATGTGGAGGATGTTGACAGAATCGACAAACTGATTGCTCA
TGGTGAAGCTGAGTACGACAAATGGCGGCACCCTGATCCTTATATCGTTCCATGGGCTCC
TGGTGGCTCCAAGTTCTGTAGAAACCCCACTCCACCTGCTGGGATTGAGATTGTGTACAA
CTATGGTCAAGAAGACAACCCATAAAACTTAATTTTCCTGTGGCTATGGTTCAGAAAATA
AATTTTTACTTTCAAAGATGCTTTGTTTTAGCGTGACCACTCTTGTTTCAGCATGGTTTA
CATTTGTTCATCTAAAACATGTCATCATGAATCATGGATGTCCCATGAAAACTTATTCAA
TAAACAAACAAAAGTGTGTTCTGTCTT


BQ
10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1DI60TF U 2
AF RS1B794TF U 1
AF RS1DI60JQ C 2
AF RS1EH25JQ C 4
AF RS1EH25TF U 4
BS 1 439 RS1B794TF
BS 440 441 RS1EH25TF
BS 442 543 RS1B794TF
BS 544 567 RS1EH25TF

RD RS1DI60TF 314 0 0
GGTT
GAATTCAATCGGAAGCAGGAGGAGGAATGAGCGGAGTTTCAACGGCGGCGTATTTCGCGC
GGCGAGCGGCGCAGAAGTAGAGGGTTCGAATCCTCCATCGACGCGCCCTTAAGGATACTC
TCAATTGGGCTGTTCATCGCCACATTTTCTACCGAGACGCTTCTGATCTGCGCGACAAGT
TCAACGCCAACCAAGATGTGGAGGATGTTGACAGAATCGACAAACTGATTGCTCATGGTG
AAGCTGAGTACGACAAATGGCGGCACCCTGATCCTTATATCGTTCCATGGGCTCCTGGTG
GCTCCAAGTT

QA 5 314 5 314
DS 

RD RS1B794TF 543 0 0
GGGTTGAATTCAATCGGAAGCAGGAGGAGGAATGAGCGGAGTTTCAACGGCGGCGTATTT
CGCGCGGCGAGCGGCGCAGAAGGAGAGGGTTCGAATCCTCTATCGACGCGCCCTTAAGGA
TACTCTCAATTGGGCTGTTCATCGCCACATTTTCTACCGAGACGCTTCTGATCTGCGCGA
CAAGTTCAACGCCAACCAAGATGTGGAGGATGTTGACAGAATCGACAAACTGATTGCTCA
TGGTGAAGCTGAGTACGACAAATGGCGGCACCCTGATCCTTATATCGTTCCATGGGCTCC
TGGTGGCTCCAAGTTCTGTAGAAACCCCACTCCACCTGCTGGGATTGAGATTGTGTACAA
CTATGGTCAAGAAGACAACCCATAAAACTTAATTTTCCTGTGGCTATGGTTCAGAAAATA
AATTTTTACTTTCAAAGATTTTTTGTTTTAGCGTGACCACTCTTGTTTCAGCATGGTTTA
CATTTGTTCATCTAAAACATGTCATCATGAATCATGGATGTCCCATGAAAACTTATTCAA
TAA

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DS 

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GGTT
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GGCGAGCGGCGCAGAAGTAGAGGGTTCGAATCCTCCATCGACGCGCCCTTAAGGATACTC
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TCAACGCCAACCAAGATGTGGAGGATGTTGACAGAATCGACAAACTGATTGCTCATGGTG
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GTCAAGAAGACAACCCATAAAACTTAATTTTCCTGTGGCTATGGTTCAGAAAATAAATTT
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AAACAAAAGTGTGTTCTGTCTT

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DS 

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GG
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GGCGAGCGGCGCAGAAGGAGAGGGTTCGAATCCTCTATCGACGCGCCCTTAAGGATACTC
TCAATTGGGCTGTTCATCGCCACATTTTCTACCGAGACGCTTCTGATTTGCGCGACAAGT
TCAACGCCAACCAAGATGTGGAGGATGTTGACAGAATCGACAAACTGATTGCTCATGGTG
AAGCTGAGTACGACAAATGGCGGCACCCTGATCCTTATATCGTTCCATGGGCTCCTGGTG
GCTCCAAGTTCTGTAGAAACCCCACTCCACCTGCTGGGATTGAGATTGTGTACAACTATG
GTCAAGAAGACAACCCATAAAACTTAATTTTCCTGTGGCTATGGTTCAGAAAATAAATTT
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AAACAAAAGTGTGTTCTGTCTT

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DS 

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GG
GAATTCAATCGGAAGCAGGAGGAGGAATGAGCGGAGTTTCAACGGCGGCGTATTTCGCGC
GGCGAGCGGCGCAGAAGGAGAGGGTTCGAATCCTCTATCGACGCGCCCTTAAGGATACTC
TCAATTGGGCTGTTCATCGCCACATTTTCTACCGAGACGCTTCTGATCTGCGCGACAAGT
TCAACGCCAACCAAGATGTGGAGGATGTTGACAGAATCGACAAACTGATTGCTCATGGTG
AAGCTGAGTACGACAAATGGCGGCACCCTGATCCTTATATCGTTCCATGGGCTCCTGGTG
GCTCCAAGTTCTGTAGAAACCCCACTCCACCTGCTGGGATTGAGATTGTGTACAACTATG
GTCAAGAAGACAACCCATAAAACTTAATTTTCCTGTGGCTATGGTTCAGAAAATAAATTT
TTACTTTCAAAGATGCTTTGTTTTAGCGTGACCACTCTTGTTTCAGCATGGTTTACATTT
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AAACAAAAGTGTGTTCTGTCTT

QA 3 564 3 564
DS 



AS 1 5

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GTCTTCTTGATATTAAATAAAAGATCTGTTTTACTTGG


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 

AF RS1BJ48TF U 5
AF RS1BF40JQ C 1
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AF RS1BF40TF U 1
AF RS1CA65TF U 1
BS 1 6 RS1BF40TF
BS 7 179 RS1BJ48TF
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RD RS1BJ48TF 211 0 0
GG
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CTCGTCATCCTCCCTCTCATCGCCGTCGTGGAAGGCAACCTCGGTGGGTGGAAGAAGATT
GAAAACTTATCAGATCCGAACGTGGTGTCGCTCGCGAAGTATGCGGTTGATGATCATAAC
AAGCAGTCGAAAGCGAATCTGGTGTTCGT

QA 3 211 3 211
DS 

RD RS1BF40JQ 516 0 0
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CTT

QA 1 513 1 513
DS 

RD RS1CA65JQ 513 0 0
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QA 1 513 1 513
DS 

RD RS1BF40TF 516 0 0
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CTT

QA 1 513 1 513
DS 

RD RS1CA65TF 518 0 0
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TTCAAGGCTGTGTAGATCTGATTTGGAATATTGATATCTATATAGGTTTCCTTGGTTTGA
GATTTTGACACTATATGTTGTTGTTTTTTGACATTATATGTTGTTGTTTGGTAATAAAAA
GTCTTCTTGATATTAAATAAAAGATCTGTTTTACTTGG

QA 1 518 1 518
DS 



AS 1 4

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AATATACAAAACAGTTAGGAAGTTGCAACAGCTCCCTATTATTGCGGCTAGCCATAGTCC
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CAAACCACGGTTAACCTCTGTACCAACGGTTACACCAACATCTGCAAAGAAATCTTTTGG
AAGAACAAGGCGAGGCACTCTAGACTGCGATGAGCTGCGGTTTAGAGCCCCTGAGGCATT
AGACCAAACGAACTGCACGATCATACCAAGCAAGAGACCGTAACAAACGAGAGACAGAAA
ATGGAAGTTGATCCACTCGAAAAGCACCCAGATTGCAGTAGCTCCCATCAGAACACTCGC
AGAGATCTTCTTGTTCCTCCACAACAACACATCAGCAGATTTGCCACCGCCCAAGACATG
ATGAATCGGCTTCTCACGACCGAACAAGCGGTTGAAACGAGAAGAGACTGTATCTTCTTC
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ATCGCCGATAACATCCTCTACAATACTCTTCTCATGCATGATTCTTGGAAGGAGTTGGTG
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TGTAGATTCTGAGAGAGATGAATGAACCACAAAGAATGAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GS10JQ U 1
AF RS1GS10TF C 1
AF RS1AI61JQ U 28
AF RS1AI61TF C 170
BS 1 207 RS1GS10JQ
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BS 550 911 RS1AI61JQ
BS 912 1000 RS1AI61TF

RD RS1GS10JQ 550 0 0
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TCTCAAAGCATTAACTTGGCAAAGAGCAAAATATGATCCATTGTTCTAACAAGAAAGGGA
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TCAACTTCGTCTTCATATCTCTCATACAGAACCGG*CATTGTGTGTGCTCCCACAAACCC
AATATACAAAACAGTTAGGAAGTTGCAACAGCTCCCTATTATTGCGGCTAGCCATAGTCC
AATCACAGCCATGAGGAACTGTTTCAAACTCCCTCTACAAGCCAAGTCCTGAAGAAACAT
CAAACCACGGTTAACCTCTGTACCAACGGTTACACCAACATCTGCAAAGAAATCTTTTGG
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AGACCAAAC
C

QA 1 549 1 549
DS 

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TCTCAAAGCATTAACTTGGCAAAGAGCAAAATATGATCCATTGTTCTAACAAGAAAGGGA
AATTGATTTTAGTCATACTTCTTGAACCCAAACTTTCCACTTGGGATTCGACTGAGAAAA
CCAGTATCAATCTTCTTGTAGTGACTATGAAACTTCATGAGCAGAGAATCAACAAAACCA
TCAACTTCGTCTTCATATCTCTCATACAGAACCGG*CATTGTGTGTGCTCCCACAAACCC
AATATACAAAACAGTTAGGAAGTTGCAACAGCTCCCTATTATTGCGGCTAGCCATAGTCC
AATCACAGCCATGAGGAACTGTTTCAAACTCCCTCTACAAGCCAAGTCCTGAAGAAACAT
CAAACCACGGTTAACCTCTGTACCAACGGTTACACCAACATCTGCAAAGAAATCTTTTGG
AAGAACAAGGCGAGGCACTCTAGACTGCGATGAG***CGGTTTAGAGCCCCTGAGGCATT
AGACCAAAC
C

QA 1 549 1 549
DS 

RD RS1AI61JQ 884 0 0
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AAAATATGATCCATTGTTCTAACAAGAAAGGGAAATTGATTTTAGTCATACTTCTTGAAC
CCAAACTTTCCACTTGGGATTCGACTGAGAAAACCAGTATCAATCTTCTTGTAGTGACTA
CGAAACTTCATGAGCAGAGAATCAACAAAACCATCAACTTCGTCTTCATATCTCTCATAC
AGAACCGG*CATTGTGTGTGCTCCCACAAACCCAATATACAAAACAGTTAGGAAGTTGCA
ACAGCTCCCTATTATTGCGGCTAGCCATAGTCCAATCACAGCCATGAGGAACTGTTTCAA
ACTCCCTCTACAAGCCAAGTCCTGAAGAAACATCAAACCACGGTTAACCTCTGTACCAAC
GGTTACACCAACATCTGCAAAGAAATCTTTTGGAAGAACAAGGCGAGGCACTCTAGACTG
CGATGAGCTGCGGTTTAGAGCCCCTGAGGCATTAGACCAAACGAACTGCACGATCATACC
AAGCAAGAGACCGTAACAAACGAGAGACAGAAAATGGAAGTTGATCCACTCGAAAAGCAC
CCAGATTGCAGTAGCTCCCATCAGAACACTCGCAGAGATCTTCTTGTTCCTCCACAACAA
CACATCAGCAGATTTGCCACCGCCCAAGACATGATGAATCGGCTTCTCACGACCGAACAA
GCGGTTGAAACGAGAAGAGACTGTATCTTCTTCTTGTTCGAAGAAAGAAACGTTTTTCTT
CTTATGAACCGTATCGGTGAAGTTATCAACCAAATCGCCGATAACATCCTCTACAATACT
CTTCTCATGCATGATTCTTGGAAGGAGTTGGTGAAACAAGAATT

QA 1 884 1 884
DS 

RD RS1AI61TF 831 0 0
CGACTGAG
AAACCAGTATCAATCTC**TGTAGTGACTACGAAACTTCATGAGCAGAGAATCAACAAAA
CCATCAACTTCGTCTTCATATCTCTCATACAGAACCGGGCATTGTGTGTGCTCCCACAAA
CCCAATATACAAAACAGTTAGGAAGTTGCAACAGCTCCCTATTATTGCGGCTAGCCATAG
TCCAATCACAGCCATGAGGAACTGTTTCAAACTCCCTCTACAAGCCAAGTCCTGAAGAAA
CATCAAACCACGGTTAACCTCTGTACCAACGGTTACACCAACATCTGCAAAGAAATCTTT
TGGAAGAACAAGGCGAGGCACTCTAGACTGCGATGAGCTGCGGTTTAGAGCCCCTGAGGC
ATTAGACCAAACGAACTGCACGATCATACCAAGCAAGAGACCGTAACAAACGAGAGACAG
AAAATGGAAGTTGATCCACTCGAAAAGCACCCAGATTGCAGTAGCTCCCATCAGAACACT
CGCAGAGATCTTCTTGTTCCTCCACAACAACACATCAGCAGATTTGCCACCGCCCAAGAC
ATGATGAATCGGCTTCTCACGACCGAACAAGCGGTTGAAACGAGAAGAGACTGTATCTTC
TTCTTGTTCGAAGAAAGAAACGTTTTTCTTCTTATGAACCGTATCGGTGAAGTTATCAAC
CAAATCGCCGATAACATCCTCTACAATACTCTTCTCATGCATGATTCTTGGA*GGAGTTG
GTGAAACAAGAATTTGGTTTCTGAGAATCTCACAGAAATGAAAAGTTTTTTCTTTTTTCT
TTTTGTAGATTCTGAGAGAGATGAATGAACCACAAAGAATGAA

QA 9 831 9 831
DS 



AS 2 5

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AGAGGAGATTGTTCAGTCGTTGTTTTGTGCCATGGCTATGTATATTCGTGTGAAGCGCAT
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AGAAGTATTAGAGGATTCCAAATCTCTAGCAGAGCAGAAGGTTGAGAATGATGCAGTCGT
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CGATTTTTCTGTTGCATGAAGAATTAATTATAACTGGGGCTGGCTGTATCAGGAGAACCT
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TGAAGTCTTTTTTATGTTATCTCTCACATGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F465TF U 1
AF RS1F465JQ C 408
BS 1 642 RS1F465TF
BS 643 643 RS1F465JQ
BS 644 727 RS1F465TF
BS 728 815 RS1F465JQ

RD RS1F465TF 727 0 0
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AGAGGAGATTGTTCAGTCGTTGTTTTGTGCCATGGCTATGTATATTCGTGTGAAGCGCAT
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TAAGTAA

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1F465JQ 408 0 0
TAATGTCTACTGAAGAAGTATTAGAGGATTCCAAATCTCTAGCAGAGCAGAAGGTTGAGA
ATGATGCAGTCGTGGCTCTGACTTTGAGGAAAGACGATGACGACTTTGAGGATGTTGACA
TTGCACAGCCCACCGATTTTTTTGTTGCATGAAGAATTAATTATAACTGGGGCTGGCTGT
ATCAGGAGAACCTTTGCTTCAACAGGAGTAAGTATTGATGTTAACAAGAGTAGGAATCTA
TAAACGCTTGAAGTTGTATCTTTCTTTCTGCTTGTATCAATAATGTTTCTTTAGTTGTTA
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TTATAAGTTGTCATGAAGTCTTTTTTATGTTATCTCTCACATGTTTCC

QA 1 408 1 408
DS 



CO CL1650Contig2 625 3 2 U
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GCAAGATTATAAGTTGTCAAGAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GB27TF U 7
AF RS1FK67JQ C 1
AF RS1FK67TF U 1
BS 1 8 RS1FK67JQ
BS 9 625 RS1FK67TF

RD RS1GB27TF 465 0 0
GG
AAGTCTTTGGCTCTTGCCTTGTTCAGCTGAGTCTGAGAAGAAGAAGAAGCCAGACTTTCT
CAGATTTTTCCATCCTCGTGATTTTTCCCGGAAAGTAATCACAATCGGCGCCGGAGGAGG
AAGAGATTGTTCAGTCGTTGTCTTGTACCATGGCCATGTATATTCGTGTGAAGCGCATGA
AAGCCACTTACTTTATCCAATGCGATCCCACAGAGACTGTTTTGGATGTTAAGCAGAAAC
TCTTTACCCTCATCGAGCAACCAGTCAGCA*TCAGCGTCTCATCTTAATGTCTACTGAAG
AAGTATTAGAGGATTCCAAATCTCTAGCAGAGCAGAAGGTTGAGAACGATGCCGTCGTGG
CTCTGACTTTGAGGAAAGACGATGACGACTTTGAGGATGTTGACATTGCACAGCCCGCCG
ACTTTTCTGTTGCATGAAGAATTA
TAACTGGGGCTGGCTGTAT

QA 3 446 3 446
DS 

RD RS1FK67JQ 618 0 0
AGGGAAACAAGTCTTTGGCTCTTGCCTTGTTCAGCTGAGTCTGAGAAGAAGAAGAAGCCA
GACTTTCTCAGATTTT*CCATCCTCGTGATTTTTCCCGGAAAGTAATCACAATCGGCGCC
GGAGGAGGAAGAGATTGTTCAGTCGTTGTCTTGTACCATGGCCATGTATATTCGTGCGAA
GCGCATGAAAGCCACTTACTTTATCCAATGCGATCCCACAGAGACTGTTTTGGATGTTAA
GCAGAAACTCTTTACCCTCATCGAGCAACCAGTCAGCAATCAGCGTCTCATCTTAATGTC
TACTGAAGAAGTATTAGAGGATTCCAAATCTCTAGCAGAGCAGAAGGTTGAGAACGATGC
CGTCGTGGCTCTGACTTTGAGGAAAGACGATGACGACTTTGAGGATGTTGACATTGCACA
GCCCACCGACTTTTTTGTTGCATGAAGAATTATAACTGGGGCTGGCTGTATCAGGAGAAC
CTTTGCTTCAACAGGAGTAGGAATCTATAAACGCTTTAAGTTATATCTTTCTCTCTCTGC
TTGTATCAGACAATTGTTGTAAGTAAAGATATTGAGACGTGGAAGTGTGATTTGCAATTT
GCAAGATTATAAGTTGTC

QA 1 618 1 618
DS 

RD RS1FK67TF 625 0 0
AGGGAAAC
AAGTCTTTGGCTCTTGCCTTGTTCAGCTGAGTCTGAGAAGAAGAAGAAGCCAGACTTTCT
CAGATTTT*CCATCCTCGTGATTTTTCCCGGAAAGTAATCACAATCGGCGCCGGAGGAGG
AAGAGATTGTTCAGTCGTTGTCTTGTACCATGGCCATGTATATTCGTGCGAAGCGCATGA
AAGCCACTTACTTTATCCAATGCGATCCCACAGAGACTGTTTTGGATGTTAAGCAGAAAC
TCTTTACCCTCATCGAGCAACCAGTCAGCAATCAGCGTCTCATCTTAATGTCTACTGAAG
AAGTATTAGAGGATTCCAAATCTCTAGCAGAGCAGAAGGTTGAGAACGATGCCGTCGTGG
CTCTGACTTTGAGGAAAGACGATGACGACTTTGAGGATGTTGACATTGCACAGCCCACCG
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CAACAGGAGTAGGAATCTATAAACGCTTTAAGTTATATCTTTCTCTCTCTGCTTGTATCA
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A

QA 3 723 3 723
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AT
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DS 

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ACA
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AGCACCAATGAGGAAAGCAAGACCTCCAATAAACATGGAGACTTTGCGACCGTACTTCCT
TGTCACAACTGAAGCTGCAAAGGAAGACACAAGGGCCGCGAGATAAAGTGAGGAAGTAAA
CAATTGGAGCAGTTGGTTATCGAATTTGCAGTAAGCAGTCTCGCCCTTAGCGTTGTGCAT
TTGCCTATCCACTTCAGGGAAAAACTTGCTCAGAAACTCCTCCATTGATGTCACTCCTCC
TGAGATTCCGAGGTCGTAACCGAAGAGGAGACCTCCCATAGCGGCCACAATACATGTGAT
GATGACAAAGCCGGTGACTCCGCCTTCATAGCTTCCTCCACCACCACCATCTGATACAAA
GGCTCCTCCAGCCATTCTTCACTTATTAGTTATTTGCTTTATTAGTAATTATTGCCTTCT
GCTTTGTTATTCAAACAAAAAA

QA 4 685 4 685
DS 



AS 2 5

CO CL1652Contig1 816 2 1 U
CATACAAATATAATGGTTCATGCAGTTGATTCTTAATGGCTGTATCAACATACAATATAA
TGGTCTTTTTACAAAGGTTTTGAGGTGGATCAAGAAGAAAATAGCATAACAAGAAAAGAA
AAGAAAAAAGAGGGAGAAAAGGAGAGTGTTGTTATCATTGAGTGAGAGGAAGACATTCAA
GTTGTATCTCAAGAACACCTCTCTCCACCTTCTGAAGCCTGAGTGATATGTCTTGTTTCG
CTTTCCCCTATTCCTGTGAGATTATTCCATCACTCACCAACGTGTTCTCTTTGCTCGCCA
ACCAGCTCCCCAGCTGCATCGGTTCTTGTATGCTCGATGTCTCGTAAGCTTTTGCTGCAC
TACCAATGGTTGTATGTCTATCTCTGCTCAGGTATAGAAAGCATCAGTGTCTCATTCCAC
ACGGGGTTCAAGTTGCTCTTTATCACTCGTGTCTTCACCGATTGTTGGCCAAGAGTAAGG
ATAACATAAGGATCACTAGTCATCACATCTCGAACCGCAAGGTTTGTTCCTTTAACCACA
TTAACCTTAATCAATCCAACGAATTCAACCATACCTGCTAGAGAATTGCTCTTCTTGTGG
CCTTTGTGATCAGATTCTCTTCTCCCCCAACTATTCCTGAACGCATTACCAATACGGTTT
TTGGTAGAACGGTGGTTAGCAGAACACAAAGACGGTGTTGAATCATTTGTCTTGCTAGCC
TGCTGATAAGGGCACAGAGCACAATCTTTTGGATCCATAAACTGATGCAGCTCATACTTC
TTCCTGATGAAATCATTGCGTTCATCATTGTTGGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1A107JQ U 1
AF RS1A107TR U 86
BS 1 816 RS1A107JQ

RD RS1A107JQ 816 0 0
CATACAAATATAATGGTTCATGCAGTTGATTCTTAATGGCTGTATCAACATACAATATAA
TGGTCTTTTTACAAAGGTTTTGAGGTGGATCAAGAAGAAAATAGCATAACAAGAAAAGAA
AAGAAAAAAGAGGGAGAAAAGGAGAGTGTTGTTATCATTGAGTGAGAGGAAGACATTCAA
GTTGTATCTCAAGAACACCTCTCTCCACCTTCTGAAGCCTGAGTGATATGTCTTGTTTCG
CTTTCCCCTATTCCTGTGAGATTATTCCATCACTCACCAACGTGTTCTCTTTGCTCGCCA
ACCAGCTCCCCAGCTGCATCGGTTCTTGTATGCTCGATGTCTCGTAAGCTTTTGCTGCAC
TACCAATGGTTGTATGTCTATCTCTGCTCAGGTATAGAAAGCATCAGTGTCTCATTCCAC
ACGGGGTTCAAGTTGCTCTTTATCACTCGTGTCTTCACCGATTGTTGGCCAAGAGTAAGG
ATAACATAAGGATCACTAGTCATCACATCTCGAACCGCAAGGTTTGTTCCTTTAACCACA
TTAACCTTAATCAATCCAACGAATTCAACCATACCTGCTAGAGAATTGCTCTTCTTGTGG
CCTTTGTGATCAGATTCTCTTCTCCCCCAACTATTCCTGAACGCATTACCAATACGGTTT
TTGGTAGAACGGTGGTTAGCAGAACACAAAGACGGTGTTGAATCATTTGTCTTGCTAGCC
TGCTGATAAGGGCACAGAGCACAATCTTTTGGATCCATAAACTGATGCAGCTCATACTTC
TTCCTGATGAAATCATTGCGTTCATCATTGTTGGAA

QA 1 816 1 816
DS 

RD RS1A107TR 728 0 0
GGGAA
CAAGAAGAAAATAGCATAACAAGAAAAGAAAAGAAAAAAGAGGGAGAAAAGGAGAGTGTT
GTTATCATTGAGTGAGAGGAAGACATTCAAGTTGTATCTCAAGAACACCTCTCTCCACCT
TCTGAAGCCTGAGTGATATGTCTTGTTTCGCTTTCCCCTATTCCTGTGAGATTATTCCAT
CACTCACCAACGTGTTCTCTTTGCTCGCCAACCAGCTCCCCAGCTGCATCGGTTCTTGTA
TGCTCGATGTCTCGTAAGCTTTTGCTGCACTACCAATGGTTGTATGTCTATCTCTGCTCA
GGTATAGAAAGCATCAGTGTCTCATTCCACACGGGGTTCAAGTTGCTCTTTATCACTCGT
GTCTTCACCGATTGTTGGCCAAGAGTAAGGATAACATAAGGATCACTAGTCATCACATCT
CGAACCGCAAGGTTTGTTCCTTTAACCACATTAACCTTAATCAATCCAACGAATTCAACC
ATACCTGCTAGAGAATTGCTCTTCTTGTGGCCTTTGTGATCAGATTCTCTTCTCCCCCAA
CTATTCCTGAACGCATTACCAATACGGTTTTTGGTAGAACGGTGGTTAGCAGAACACAAA
GACGGTGTTGAATCATTTGTCTTGCTAGCCTGCTGATAAGGGCACAGAGCACAATCTTTT
GGATCCATAAACTGATGCAGCTCATACTTCTTCCTGATGAAATCATTGCGTTCATCATTG
TTG

QA 6 728 6 728
DS 



CO CL1652Contig2 903 3 5 U
GGGTTTGGAGGATGATGTAATTTCTCAGACATCATTTCTCCAAATCCTTTCGAAACTTCG
TTTTTGTTTTCTCTGTTTAGGTTTTCTTCCCCCCTCGTGTTATTATACAAACATAATTTG
TTCTCCTCGGTAGTCTACAAGATTAAAAAAAATCATAATTCAACTGATCTATAAAGCTGT
TAGGTTCTTCCGAGAAATTGAGTATTGAAGGAGGTCTTGATGAGTTTGGATTTCATAGTT
GCCCCTTGTTTACGATTCTCGTTGTTTGACAATGCAATGGCTCTTCAGGGAATGTCGTGA
TTTTGAGAAAAAAAATCTTTCGGACAAAACCTGTTTGAATGTCCCGACTTTTTGTCTGAA
CACCTTTTCATTGTCACGGCTCTAGTTCGAAATGTCTCTCGGCCAAGAACATGACAATCC
TGTTGAAGTTTCTGGGTCGCATGCTTGCTTATATGACCTGTTATGTTTAGAGACACCAAA
CGAGACTTTTCAAAATGATTTTCAGACATCTTCTTCTTCTGATCCTCGAGAACGGTTAGA
GAAGTTGATGAAACAACCTGCGAATAAATATTGTGCTGACTGTGGATCTCCTGACCCAAA
ATGGGTATCGTTAAGTCTCGGTGTGTTCATCTGCATAAAGTGTTCTGGTGTACACAGAAG
CCTTGGAGTTCATATAACAAAAGTTTTATCAGTTAAGCTAGATGACTGGACAGATGAACA
AGTTGATATGCTCGCAGAGTTCGGTGGAAACACTGTAGTGAACCAGAGATTCGAAGCTTG
CAACATCGACCATTTAAAGAAACCAAAACCTGATTCCAACAATGATGAACGCAATGATTT
CATCAGAGAGTATGAGCTGCATCAGTTTATGGATCCAAAAGATTGTGCTCTGTGCCCTTA
TCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1FP08TF U 1
AF RS1A107TF U 66
AF RS1A107TV U 66
BS 1 330 RS1FP08TF
BS 331 331 RS1A107TF
BS 332 679 RS1FP08TF
BS 680 735 RS1A107TF
BS 736 903 RS1A107TV

RD RS1FP08TF 679 0 0
GGGTTTGGAGGATGATGTAATTTCTCAGACATCATTTCTCCAAATCCTTTCGAAACTTCG
TTTTTGTTTTCTCTGTTTAGGTTTTCTTCCCCCCTCGTGTTATTATACAAACATAATTTG
TTCTCCTCGGTAGTCTACAAGATTAAAAAAAATCATAATTCAACTGATCTATAAAGCTGT
TAGGTTCTTCCGAGAAATTGAGTATTGAAGGAGGTCTTGATGAGTTTGGATTTCATAGTT
GCCCCTTGTTTACGATTCTCGTTGTTTGACAATGCAATGGCTCTTCAGGGAATGTCGTGA
TTTTGAGAAAAAAAATCTTTCGGACAAAACTTGTTTGAATGTCCCGACTTTTTGTCTGAA
CACCTTTTCATTGTCACGGCTCTAGTTCGAAATGTCTCTCGGCCAAGAACATGACAATCC
TGTTGAAGTTTCTGGGTCGCATGCTTGCTTATATGACCTGTTATGTTTAGAGACACCAAA
CGAGACTTTTCAAAATGATTTTCAGACATCTTCTTCTTCTGATCCTCGAGAACGGTTAGA
GAAGTTGATGAAACAACCTGCGAATAAATATTGTGCTGACTGTGGATCTCCTGACCCAAA
ATGGGTATCGTTAAGTCTCGGTGTGTTCATCTGCATAAAGTGTTCTGGTGTACACAGAAG
CCTTGGAGTTCATATAACA

QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1A107TF 670 0 0
GTTTTCTCTGTTTAGGTTTTCTTCCCCCCTCGTGTTATTATACAAACATAATTTGTTCTC
CTCGGTAGTCTACAAGATTAAAAAAAATCATAATTCAACTGATCTATAAAGCTGTTAGGT
TCTTCCGAGAAATTGAGTATTGAAGGAGGTCTTGATGAGTTTGGATTTCATAGTTGCCCC
TTGTTTACGATTCTCGTTGTTTGACAATGCAATGGCTCTTCAGGGAATGTCGTGATTTTG
AGAAAAAAAATCTTTCGGACAAAACCTGTTTGAATGTCCCGACTTTTTGTCTGAACACCT
TTTCATTGTCACGGCTCTAGTTCGAAATGTCTCTCGGCCAAGAACATGACAATCCTGTTG
AAGTTTCTGGGTCGCATGCTTGCTTATATGACCTGTTATGTTTAGAGACACCAAACGAGA
CTTTTCAAAATGATTTTCAGACATCTTCTTCTTCTGATCCTCGAGAACGGTTAGAGAAGT
TGATGAAACAACCTGCGAATAAATATTGTGCTGACTGTGGATCTCCTGACCCAAAATGGG
TATCGTTAAGTCTCGGTGTGTTCATCTGCATAAAGTGTTCTGGTGTACACAGAAGCCTTG
GAGTTCATATAACAAAAGTTTTATCAGTTAAGCTAGATGACTGGACAGATGAACAAGTTG
ATATGCTCGC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RS1A107TV 838 0 0
GTTTTCTCTGTTTAGGTTTTCTTCCCCCCTCGTGTTATTATACAAACATAATTTGTTCTC
CTCGGTAGTCTACAAGATTAAAAAAAATCATAATTCAACTGATCTATAAAGCTGTTAGGT
TCTTCCGAGAAATTGAGTATTGAAGGAGGTCTTGATGAGTTTGGATTTCATAGTTGCCCC
TTGTTTACGATTCTCGTTGTTTGACAATGCAATGGCTCTTCAGGGAATGTCGTGATTTTG
AGAAAAAAAATCTTTCGGACAAAACCTGTTTGAATGTCCCGACTTTTTGTCTGAACACCT
TTTCATTGTCACGGCTCTAGTTCGAAATGTCTCTCGGCCAAGAACATGACAATCCTGTTG
AAGTTTCTGGGTCGCATGCTTGCTTATATGACCTGTTATGTTTAGAGACACCAAACGAGA
CTTTTCAAAATGATTTTCAGACATCTTCTTCTTCTGATCCTCGAGAACGGTTAGAGAAGT
TGATGAAACAACCTGCGAATAAATATTGTGCTGACTGTGGATCTCCTGACCCAAAATGGG
TATCGTTAAGTCTCGGTGTGTTCATCTGCATAAAGTGTTCTGGTGTACACAGAAGCCTTG
GAGTTCATATAACAAAGGTTTTATCAGTTAAGCTAGATGACTGGACAGATGAACAAGTTG
ATATGCTCGCAGAGTTCGGTGGAAACACTGTAGTGAACCAGAGATTCGAAGCTTGCAACA
TCGACCATTTAAAGAAACCAAAACCTGATTCCAACAATGATGAACGCAATGATTTCATCA
GAGAGTATGAGCTGCATCAGTTTATGGATCCAAAAGATTGTGCTCTGTGCCCTTATCA

QA 1 838 1 838
DS 



AS 1 5

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GGAAGAGAAGATGGGAATAAGGTTCATATTGATGGTGAACAAGCAAGGGCAGACTCGCCT
TGCTCAGTACTACGAATGGCTCACCCTCGAGGAACGTCGTGCTCTCGAAGGCGAGATCGT
TCGTAAATGCCTCGCTCGTAACGACCAGCAGCGTTCGTTTGTGGAGCATCGCAACTACAA
GATCGTCTACAGGCGTTATGCGTCTCTCTTTTTCATGGTTGGCGTTGATGACGATGAAAA
CGAGCTGGCGATTCTAGAGTTCATACATCTTTTGGTCGAGACTATGGACAAGCATTTTGG
AAATGTGTGTGAGCTGGACATAATGTTCCATCTGGAGAAAGCTCATTTCATGCTCGAGGA
AATGGTGATGAATGGTTGCATTGTCGAGACTAGCAAAGCCAACATACTTTCGCCTATACA
GCTCATGGACAAAGCCCATTAAATTTCAAAAGACTTGTTATTTTCCTTTTCAGCACACTG
TTGAGACAACTTCTGTAATATTATTACTTCTTCACTCGTTTGTCCCATTCGAATCTAAAG
AACAATTTGTTTTCTTCCATGCTTTGAATGTTAGTGGTTAGAGTAGGGATGTTATGTGGG
GAAGATCCCCCCATCTAGACTCACGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 5 30 5 30 15 5 5 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G754JQ C 1
AF RS1EZ76TF U 4
AF RS1G754TF U 1
AF RS1EX31TF U 5
AF RS1EX31JQ C 265
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AACAATTTGTTT
CC

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DS 

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GGCCTC
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TTT
T

QA 7 609 7 609
DS 

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GGCAAGAAGAAGTAAAAAAAAAAAGAAGAAAAGTCGAAAGATCTGAGAGAGGAACGCTGA
GGAAGAGAAGATGGGAATAAGGTTCATATTGATGGTGAACAAGCAAGGGCAGACTCGCCT
TGCTCAGTACTACGAATGGCTCACCCTCGAGGAACGTCGTGCTCTCGAAGGCGAGATCGT
TCGTAAATGCCTCGCTCGTAACGACCAGCAGCGTTCGTTTGTGGAGCATCGCAACTACAA
GATCGTCTACAGGCGTTATGCGTCTCTCTTTTTCATGGTTGGCGTTGATGACGATGAAAC
CGAGCTGGCGATCCTAGAGTTCATACATCTTTTGGTCGAGACTATGGACAAGCATTTTGG
AAATGTGTGTGAGCTGGACATAATGTTCCATCTGGAGAAAGCTCATTTCATGCTCGAGGA
AATGGTGATGAATGGTTGCATTGTCGAGACTAGCAAAGCCAACATACTTTCGCCTATACA
GCTCATGGACAAAGCCCATTAAATTTCAAAAGACTTGTTCTTTTCCTTTTCACCACACTG
TTGAGACAGCTTCTGTAATATTATTACTTCTTCACTCGTTTGTCCCATTCGAATCTAAAG
AACAATTTGTTT
CCAAA

QA 1 612 1 612
DS 

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GGAAG
AAGAAGAGGTAAAAAAAAAAAAAGTCGAAAGATCTGAGAGAGGAACGCTGAGGAAGAGAA
GATGGGAATAAGGTTCATATTGATGGTGAACAAGCAAGGGCAGACTCGCCTTGCTCAGTA
CTACGAATGGCTCACCCTCGAGGAACGTCGTGCTCTCGAAGGCGAGATCGTTCGTAAATG
CCTCGCTCGCAACGACCAGCAGTGTTCGTTTGTGGAGCATCGCAACTACAAGATCGTCTA
CAGGCGTTATGCGTCTCTCTTTTTCATGGTCGGCGTTGATGACGATGAAAACGAGCTGGC
GATTCTAGAGTTCATACATCTTTTGGTCGAGACTATGGACAAGCATTTTGGAAATGTGTG
TGAGCTGGACATAATGTTCCATCTGGAGAAAGCTCATTTCATGCTCGAGGAAATGGTGAT
GAATGGTTGCATTGTCGAGACTAGCAAAGCCAACATACTTTCGCCTATACAGCTCATGGA
CAAAGCCCATTAAATTTCAAAAGACTTGTTATTTTCCTTTTCAGCACACTGTTGAGACAA
CTTCTGTAATATTATTACTTCTTCACTCGTTTGTCCCATTCGAATCTAAAGAACAATTTG
TTTTCTTCCATGCTTTGAATGTTAGTGGTTAGAGTAGGGATGTTATGTGGGGAA

QA 6 659 6 659
DS 

RD RS1EX31JQ 423 0 0
TTTT
TTTTTCATGGTCGGCGTTGATGACGATGAAAACGAGCTGGCGATTCTAGAGTTCATACAT
CTTTTGGTCGAGACTATGGACAAGCATTTTGGAAATGTGTGTGAGCTGGACATAATGTTC
CATCTGGAGAAAGCTCATTTCATGCTCGAGGAAATGGTGATGAATGGTTGCATTGTCGAG
ACTAGCAAAGCCAACATACTTTCGCCTATACAGCTCATGGACAAAGCCCATTAAATTTCA
AAAGACTTGTTATTTTCCTTTTCAGCACACTGTTGAGACAACTTCTGTAATATTATTACT
TCTTCACTCGTTTGTCCCATTCGAATCTAAAGAACAATTTGTTTTCTTCCATGCTTTGAA
TGTTAGTGGTTAGAGTAGGGATGTTATGTGGGGAAGATCCCCCCATCTAGACTCACGTT

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DS 



AS 1 5

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AAGCGTTTCATTGTCTTTTCCCTTTGTTTGCTTATGGTTCTTGAAGCCACAAAGGGTTTA
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AGGAGCCACCAAACCATAGCTAGGAGCTTTGAAGAGAAGGCAAAGAGGTTTAACGTGTTC
AAGCACAACGTGAGGCACATCCACGAGTCCAACAAGAAGGAAAAACCTTACAAGCTCAAG
CTCAATAGATTTGGTGACATGACGACTGAGGAATTTAGAAGATCATACGCTGGTTCGAAC
ATCAAACATCATAGGATGCTTAAAGGTGCAAGACGAGCAACAGAAAATTTCATGTATGCA
AATGTTAATGCTCTCCCGACCTCAGTTGATTGGAGAAAGAATGGAGCTGTCACTCCTATC
AAAAACCAAGGACAATGCGGGAGCTGCTGGGCGTTTTCGACAGTTGTGGCAGTGGGAAGG
GATCAACCAAATAAGAACGAAACGGTTGACATCACTATCAGAACAAGAGCTAGTGGATTG
TGATACGAATGAGAACCAAGGGTGTAATGGAGGTCTGATGGACCTGGCTTTTGAGTTCAT
CAAGGAGAAAGGAGGACTAACGAGCGAGCTAGTGTACCCTTACCAAGCTTCTGATGAAAC
TTGTGACAAAAATAAGGAAAATGCTCCGGTCGTTTCAATCGATGGACACGAAGATGTTCC
TGAGAACAGTGAGGATGATCTAATGAAAGCTGTTGCTAATCAGCCTGTCTCTGTTGCCAT
TGATGCTGGAAGTTCAGACTTCCAGTTCTACTCCGAGGGAGTGTTTACAGGGCGATGTGG
AACAGAACTAAATCATGGAGTCGCAGCTGTCGGTTATGGAACAACGATTGATGGAACAAA
GTACTGGATCGTTAAGAACTCTTGGGGAGAGGAATGGGGAGAAAAAGGGTACATAAGGAT
GCAAAGAGGAATCCGTCATAAGGAAGGTCTATGTGGTATTGCTATGGAGGCTTCTTATCC
TCTCAAGAACTCCAACACAAATCCTTCTGGACCTTCCTCCGCCACGCTAAAGGATGAACT
TTAAAGTTCTTTATATTAATATCTACAAGAAAATAATAAGTTTGATTATCATTTGTTTAT
GATGTCTTGTTTCCTTTCATACAGAAAAATGTCTTGTTTGTTTTTCTTTGTTGTGAAACT
TGAGAATAGAATCTATGTTTCTTATTATTAATCAATCATAAGGAACATTTCATATAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1C454TF U 1
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AF RS1A155TF U 610
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AF RS1C454JQ C 619
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AATGTTAATGCTCTCCCGACCTCAGTTGATTGGAGAAAGAATGGAGCTGTCACTCCTATC
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TTGTGAC
AAAA

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AAGCGTTTCATTGTCTTTTCCCTTTGTTTGCTTATGGTTCTTGAAGCCACAAAGGGTTTA
GATTTCCATGAAAAAGATTTGGAATCGGAGGATAGCTTGTGGGAGCTGTACGAGCGGTGG
AGGAGCCACCAAACCATAGCTAGGAGCTTTGAAGAGAAGGCAAAGAGGTTTAACGTGTTC
AAGCACAACGTGAGGCACATCCACGAGTCCAACAAGAAGGAAAAACCTTACAAGCTCAAG
CTCAATAGATTTGGTGACATGACGACTGAGGAATTTAGAAGATCATACGCTGGTTCGAAC
ATCAAACATCATAGGATGCTTAAAGGTGCAAGACGAGCAACAGAAAATTTCATGTATGCA
AATGTTAATGCTCTCCCGACCTCAGTTGATTGGAGAAAGAATGGAGCTGTCACTCCTATC
AAAAACCAAGGACAATGCGGGAGCTGCTGGGCGTTTTCGACAGTTGTGGCAGTGGGAAGG
GATCAACCAAATAAGAACGAAACGGTTGACATCACTATCAGAACAAGAGCTAGTGGATTG
TGATACGAATGAGAACCAAAGGTGTAATGGAGGTCTGATGGACCTGGCTTTTGAGTTCAT
CAAGGAGAAAGGAGGACTAACGAGCGAGCTAGTGTACCCTTACCAAGCTTCTGATGAAAC
TTGTGAC

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DS 

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AA
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AAGTTCAGACTTCCAGTTCTACTCCGAGGGAGTGTTTACAGGGCGATGTGGAACAGAACT
AAATCATGGAGTCGCAGCTGTCGGTTATGGAACAACGATTGATGGAACAAAGTACTGGAT
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AATCCGTCATAAGGAAGGTCTATGTGGTATTGCTATGGAGGCTTCTTATCCTCTCAAGAA
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TTTCCTTTCATACAGAAAAATGTCTTGTTTGTTTTTCTTTGTTGTGAAACTTGAGAATAG
AATCTATGTTTCTTATTATTAATCAATCATAAGGAACATTTCATAT

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DS 

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AACGAGCGAGCTAGTGTACCCTTACCAAGCTTCTGATGAAACTTGTGACAAAAATAAGGA
AAATGCTCCGGTCGTTTCAATCGATGGACACGAAGATGTTCCTGAGAACAGTGAGGATGA
TCTAATGAAAGCTGTTGCTAATCAGCCTGTCTCTGTTGCCATTGATGCTGGAAGTTCAGA
CTTCCAGTTCTACTCCGAGGGAGTGTTTACAGGGCGATGTGGAACAGAACTAAATCATGG
AGTCGCAGCTGTCGGTTATGGAACAACGATTGATGGAACAAAGTACTGGATCGTTAAGAA
CTCTTGGGGAGAGGAATGGGGAGAAAAAGGGTACATAAGGATGCAAAGAGGAATCCGTCA
TAAGGAAGGTCTATGTGGTATTGCTATGGAGGCTTCTTATCCTCTCAAGAACTCCAACAC
AAATCCTTCTGGACCTTCCTCCGCCACGCTAAAGGATGAACTTTAAAGTTCTTTATATTA
ATATCTACAAGAAAATAATAAGTTTGATTATCATTTGTTTATGATGTCTTGTTTCCTTTC
ATACAGAAAAATGTCTTGTTTGTTTTTCTTTGTTGTGAAACTTGAGAATAGAATCTATGT
TTCTTATTATTAATCAATCATAAGGAACATTTCATATAA

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DS 



AS 1 5

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TCTAGTGTCTTTCGCTCTCAGCTGCGGAATGCACTCATCGCCAGCGGTGAGGATATACTC
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CTTTGTCGACGACAGCAAGGTTGCTCTGTGGACCTCACGGCACTTGCCACCTCGCCAGGC
CGCATTTGTTGAGCAGTGTATTCACCGGAGACAACGTTGGGGGTTTCTGGATTCATCTAG
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ATGGAAGCACACACACACACATTGTGTTCCGTTGCTCGGGGTTTAGGGCCTATGGCTATT
TAGGTGATTCTAATAAACTAATCAATGAATTAAGAATTGCTAAAAAAGAAATAAGAAAGA
CGAAATGTTTTCAAGATTGCAAAAAAAAAATTTAATAGTAATCACCGGGGCGGCCGGCAT
ACATTGTATTCAGACAAATAACAAAATGGTATTATTGTGTTCTGTTTGAAAGAGAATAAA
GAAGGTAGAGATGAAACTAACTTGGTGTCCTAATAAACTAGGCATTGATAGATGAAATGT
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CCACGAGTGCTTTGAAGCTGTAAGGCTCATGCATAGAGAGCTCAGAGAGGACTTTACGGT
TAAGCTGGATGTTCTCCTTCATCAGTCCGTGGATAAAGTTACCGTAGTTCACTCCGTGCT
GACGAGAGCCGGCGTTGGTACGCTCGATCCAGAGACCTCTCATCTCACGTTTTTTGTTGC
GCCTGTCTCTGTAAGAGTACTGAAGAGCTTTCTCCACTCTCTCCCTCGCGATTCTTATGC
AGTTCTTCGCTCTTCCCCTGAATCCTTTGGCTAGCTTGAAGATCTCCTTCTTGTTCATAT
TTCTCTCTACTCCTCTTCTTCCTGTTCTCCTTCCTCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1DF60TF U 1
AF RS1FH28JQ U 555
AF RS1FH28TF C 555
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AF RS1E660TF C 614
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TAGGTGATTCTAATAAACTAATCAATGAATTAAGAATTGCTAAAAAAGAAATAAGAAAGA
CGAAATGTTTTCAAGATTGCAAAAAAAAAATTTAATAGTAATCACCGGGGCGGCCGGCAT
ACATTGTATTCAGACAAATAACAAAATGGTA

QA 1 631 1 631
DS 

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CCCCTGAATCCTTTGGCTAGCTTGAAGATCTCCTTCTTGTTCATATTTCTCTCTACTCCT
CTTCTTCCTGTTCTCCTTCCTCCTCC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RS1FH28TF 566 0 0
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GCTTGGACCACGTTCCAGTTTCCAGGGAAGGACTTGCGGGAGACGTCCACGAGTGCTTTG
AAGCTGTAAGGCTCATGCATAGAGAGCTCAGAGAGGACTTTACGGTTAAGCTGGATGTTC
TCCTTCATCAGTCCGTGGATAAAGTTACCGTAGTTCACTCCGTGCTGACGAGAGCCGGCG
TTGGTACGCTCGATCCAGAGACCTCTCATCTCACGTTTTTTGTTGCGCCTGTCTCTGTAA
GAGTACTGAAGAGCTTTCTCCACTCTCTCCCTCGCGATTCTTATGCAGTTCTTCGCTCTT
CCCCTGAATCCTTTGGCTAGCTTGAAGATCTCCTTCTTGTTCATATTTCTCTCTACTCCT
CTTCTTCCTGTTCTCCTTCCTCCTCC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RS1E660JQ 558 0 0
AAAAAAAATTTAATAGTAATCACCGGGGCGGCCGGCATACATTGTATTCAGACAAATAAC
AAAATGGTATTATTGTGTTCTGTTTGAAAGAGAATAAAGAAGGTAGAGATGAAACTAACT
TGGTGTCCTAATAAACTAGGCATTGATAGATGAAATGTCCACTTTCCGAGGCGCTTGGAC
CACGTTCCAGTTTCCAGGGAAGGACTTGCGGGAGACGTCCACGAGTGCTTTGAAGCTGTA
AGGCTCATGCATAGAGAGCTCAGAGAGGACTTTACGGTTAAGCTGGATGTTCTCCTTCAT
CAGTCCGTGGATAAAGTTACCGTAGTTCACTCCGTGCTGACGAGAGCCGGCGTTGGTACG
CTCGATCCAGAGACCTCTCATCTCACGTTTTTTGTTGCGCCTGTCTCTGTAAGAGTACTG
AAGAGCTTTCTCCACTCTCTCCCTCGCGATTCTTATGCAGTTCTTCGCTCTTCCCCTGAA
TCCTTTGGCTAGCTTGAAGATCTCCTTCTTGTTCATATTTCTCTCTACTCCTCTTCTTCC
TGTTCTCCTTCCTCCTCC

QA 1 558 1 558
DS 

RD RS1E660TF 507 0 0
ACAAATAACAAAATGGTATTATTGTGTTCTGTTTGAAAGAGAATAAAGAAGGTAGAGATG
AAACTAACTTGGTGTCCTAATAAACTAGGCATTGATAGATGAAATGTCCACTTTCCGAGG
CGCTTGGACCACGTTCCAGTTTCCAGGGAAGGACTTGCGGGAGACGTCCACGAGTGCTTT
GAAGCTGTAAGGCTCATGCATAGAGAGCTCAGAGAGGACTTTACGGTTAAGCTGGATGTT
CTCCTTCATCAGTCCGTGGATAAAGTTACCGTAGTTCACTCCGTGCTGACGAGAGCCGGC
GTTGGTACGCTCGATCCAGAGACCTCTCATCTCACGTTTTTTGTTGCGCCTGTCTCTGTA
AGAGTACTGAAGAGCTTTCTCCACTCTCTCCCTCGCGATTCTTATGCAGTTCTTCGCTCT
TCCCCTGAATCCTTTGGCTAGCTTGAAGATCTCCTTCTTGTTCATATTTCTCTCTACTCC
TCTTCTTCCTGTTCTCCTTCCTCCTCC

QA 1 507 1 507
DS 



AS 1 5

CO CL1656Contig1 707 5 5 U
GGACATATCCAAACCTCATAAAAGCTCACAAGAATCCAAAACATGAAGAATCTAGCAATC
CTTCTTGCTATCATACTCGTCTCATGCTATCTCACGTCTCTAGTCACAGCAAGTGATTTG
GAGTCAATGCCATCATCGCGTAACGAAAAGCTCGAATGGTGGCATTACCATTCCTACCCT
TACTTTCACCCCAAGCCACCACATTGGCCGTTCCCATGTTCTTCCGAAAAAGCCTTTCCG
CCACTCCCCGCCGGCTACAACCATTTCCACCCTGTTCCATTCCATCCACCACCGGTAGTC
ACCAAGTGCTTGTCTGATTGCAAGGATGTAAAAACATGTATGGCGGATATCCGGAAAGCT
TTCTTCACCCGCAAACCTGCTATTGGATCGGAATGTTGTGCTTCGATACAGAAGATGGAT
GAAGACTGTGACAAGACTGTCTTTGGAGCTTACCATAACCCTTTCTTTGACTGCTTTGTT
AAGCTACATTGTGCCACCAAAGCTGGATCTACTCCATCTGCTCCCTCGCCAGCTTAGAGG
TTTTAGTTAGTTATTAGAATTATAAATAATGAGTTTTAGTTGGTATTATAATTTTCCTTT
TTAATTATGCTTCTCCATATTAAGCTTCGAGGAAATAAAGTGCATCCTTCTTAATAATGA
TATCAGTGTTCTTATTTATTAAATTTGTGATTGTTTCCAAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EZ43JQ C 1
AF RS1EZ43TF U 1
AF RS1B629TF U 3
AF RS1GV32JQ C 3
AF RS1GV32TF U 3
BS 1 4 RS1EZ43JQ
BS 5 582 RS1EZ43TF
BS 583 583 RS1B629TF
BS 584 690 RS1EZ43TF
BS 691 707 RS1GV32TF

RD RS1EZ43JQ 698 0 0
GGACATATCCAAACCTCATAAAAGCTCACAAGAATCCAAAACATGAAGAATCTAGCAATC
CTTCTTGCTATCATACTCGTCTCATGCTATCTCACGTCTCTAGTCACAGCAAGTGATTTG
GAGTCAATGCCATCATCGCGTAACGAAAAGCTCGAATGGTGGCATTACCATTCCTACCCT
TACTTTCACCCCAAGCCACCACATTGGCCGTTCCCATGTTTTTCCGAAAAAGCCTTTCCG
CCACTCCCCGCCGGCTACAACCATTTCCACCCTGTTCCATTCCATCCACCACCGGTAGTC
ACCAAGTGCTTGTCTGATTGCAAGGATGTAAAAACATGTATGGCGGATATCCGGAAAGCT
TTCTTCACCCGCAAACCTGCTATTGGATCGGAATGTTGTGCTTCGATACAGAAGATGGAT
GAAGACTGTGACAAGACTGTCTTTGGAGCTTACCATAACCCTTTCTTTGACTGCTTTGTT
AAGCTACATTGTGCCACCAAAGCTGGATCTACTCCATCTGCTCCCTCGCCAGCTTAGAGG
TTTTAGTTAGTTATTAGAATTATAAATAATGAGTTTTAGTTG*TATTATAATTTTCCTTT
TTAATTATGCTTCTCCATATTAAGCTTCGAGGAAATAAAGTGCATCCTTCTTAATAATGA
TATCAGTGTTCTTATTTATTAAATTTGTGA
ATTGTTCC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1EZ43TF 703 0 0
GGAC
ATATCCAAACCTCATAAAAGCTCACAAGAATCCAAAACATGAAGAATCTAGCAATCCTTC
TTGCTATCATACTCGTCTCATGCTATCTCACGTCTCTAGTCACAGCAAGTGATTTGGAGT
CAATGCCATCATCGCGTAACGAAAAGCTCGAATGGTGGCATTACCATTCCTACCCTTACT
TTCACCCCAAGCCACCACATTGGCCGTTCCCATGTTCTTCCGAAAAAGCCTTTCCGCCAC
TCCCCGCCGGCTACAACCATTTCCACCCTGTTCCATTCCATCCACCACCGGTAGTCACCA
AGTGCTTGTCTGATTGCAAGGATGTAAAAACATGTATGGCGGATATCCGGAAAGCTTTCT
TCACCCGCAAACCTGCTATTGGATCGGAATGTTGTGCTTCGATACAGAAGATGGATGAAG
ACTGTGACAAGACTGTCTTTGGAGCTTACCATAACCCTTTCTTTGACTGCTTTGTTAAGC
TACATTGTGCCACCAAAGCTGGATCTACTCCATCTGCTCCCTCGCCAGCTTAGAGGTTTT
AGTTAGTTATTAGAATTATAAATAATGAGTTTTAGTTG*TATTATAATTTTCCTTTTTAA
TTATGCTTCTCCATATTAAGCTTCGAGGAAATAAAGTGCATCCTTCTTAATAATGATATC
AGTGTTCTTATTTATTAAATTTGTGA
ATTGTTCCAAAAA

QA 5 690 5 690
DS 

RD RS1B629TF 696 0 0
GG
ATATCCAAACCTCATAAAAGCTCACAAGAATCCAAAACATGAAGAATCTAGCAATCCTTC
TTGCTATCATACTCGTCTCATGCTATCTCACGCCTCTAGTCACAGCAAGTGATTTGGAGT
CAATGCCATCATCGCGTAACGAAAAGCTCGAATGGTGGCATTACCATTCCTACCCTTACT
TTCACCCCAAGCCACCACATTGGCCGTTCCCATGTTCTTCCGAAAAAGCCTTTCCGCCAC
TCCCCGCCGGCTACAACCATTTCCACCCTGTTCCATTCCATCCACCACCGGTAGTCACCA
AGTGCTTGTCTGATTGCAAGGAT**AAAAACATGTATGGCGGATATCCGGAAAGCTTTCT
TCACCCGCAAACCTGCTATTGGATCGGAATGTTGT*CTTCGATACAGAAGATGGATGAAG
ACTGTGACAAGACTGTCTTTGGAGCTTACCATAACCCTTTCTTTGACTGCTTTGTTAAGC
TACATTGTGCCACCAAAGCTGGATCTACTCCATCTGCTCCCTCGCCAGCTTAGAGGTTTT
AGTTAGTTATTAGAATTATAAATAATGAGTTTTAGTTGGTATTATAATTTTCCTTTTTAA
TTATGCTTCTCCATATTAAGCTTCGAGGAAATAAAGTGCATCCTTCTTAATAATGATATC
AGTGTTCTTATTTATTAAATGTGTGA
TTGTTTCA

QA 3 688 3 688
DS 

RD RS1GV32JQ 697 0 0
GG
ATATCCAAACCTCATAAAAGCTCACAAGAATCCAAAACATGAAGAATCTAGCAATCCTTC
TTGCTATCATACTCGTCTCATGCTATCTCACGTCTCTAGTCACAGCAAGTGATTTGGAGT
CAATGCCATCATCGCGTAACGAAGAGCTCGAATGGTGGCATTACCATTCCTACCCTTACT
TTCACCCCAAGCCACCACATTGGCCGTTCCCATGTTCTTCCGAAAAAGCCTTTCCGCCAC
TCCCCGCCGGCTACAACCATTTCCACCCTGTTCCATTCCATCCACCACCGGTAGTCACCA
AGTGCTTGTCTGATTGCAAGGATGTAAAAACATGTATGGCGGATATCCGGAAAGCTTTCT
TCACCCGCAAACCTGCTATTGGATCGGAATGTTGTGCTTCGATACAGAAGATGGATGAAG
ACTGTGACAAGACTGTCTTTGGAGCTTACCATAACCCTTTCTTTGACTGCTTTGTTAAGC
TACATTGTGCCACCAAAGCTGGATCTACTCCATCTGCTCCCTCGCCAGCTTAGAGGTTTT
AGTTAGTTATTAGAATTATAAATAATGAGTTTTAGTTGGTATTATAATTTTCCTTTTTAA
TTATGCTTCTCCATATTAAGCTTCGAGGAAATAAAGTGCATCCTTCTTAATAATGATATC
AGTGTTCTTATTTATTAAATTTGTGA
ATTGTTTCC

QA 3 688 3 688
DS 

RD RS1GV32TF 705 0 0
GG
ATATCCAAACCTCATAAAAGCTCACAAGAATCCAAAACATGAAGAATCTAGCAATCCTTC
TTGCTATCATACTCGTCTCATGCTATCTCACGTCTCTAGTCACAGCAAGTGATTTGGAGT
CAATGCCATCATCGCGTAACGAAGAGCTCGAATGGTGGCATTACCATTCCTACCCTTACT
TTCACCCCAAGCCACCACATTGGCCGTTCCCATGTTCTTCCGAAAAAGCCTTTCCGCCAC
TCCCCGCCGGCTACAACCATTTCCACCCTGTTCCATTCCATCCACCACCGGTAGTCACCA
AGTGCTTGTCTGATTGCAAGGATGTAAAAACATGTATGGCGGATATCCGGAAAGCTTTCT
TCACCCGCAAACCTGCTATTGGATCGGAATGTTGTGCTTCGATACAGAAGATGGATGAAG
ACTGTGACAAGACTGTCTTTGGAGCTTACCATAACCCTTTCTTTGACTGCTTTGTTAAGC
TACATTGTGCCACCAAAGCTGGATCTACTCCATCTGCTCCCTCGCCAGCTTAGAGGTTTT
AGTTAGTTATTAGAATTATAAATAATGAGTTTTAGTTGGTATTATAATTTTCCTTTTTAA
TTATGCTTCTCCATATTAAGCTTCGAGGAAATAAAGTGCATCCTTCTTA*TAATGATATC
AGTGTTCTTATTTATTAAATTTGTGATTGTTTCCAAAAAAAAA

QA 3 705 3 705
DS 



AS 2 4

CO CL1657Contig1 732 2 2 U
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GACGATATTCCTATAAGAAGATACCCAAAAAAGAGTGCGGCTACATTTCCTCTAAGACCA
ATGTGGCTTTACGGTTCCATATGGGGTGCTTCTTCTTGGGCAACTGAGAATGGTAAATAC
AAAGCTGACTACAAATATCAACCTTTCACTGCCAAGTACACCAATTTTAAAGCGATTGGT
TGCACCGCCTACTCACCCGCACGGTGCCATCCACTGTCAGCTTCACCATACCGTTCTGGC
GGATTAACTCGTAAGCAATACCAAGCAATGAGATGGGTGCAAACACATAATATGGTATAC
AATTATTGCAAAGATTATAAACGCGACCATTCTCTAACGCCGGAATGTGGGCGTTAGAAG
AAAATTTGAAAAATGTTCTGAAGCTTGAAATTTTTAATTTTCATTAAGAAAGTTTTGCAA
AAGAATTGGGAAAATTTCTGAAGGTTTTATGCTACTACATTATTGTCTGTTTTTTTTGTT
TCACAAAAAATAAAGGGTTTATTTTTTTTGCTTATCATCTTGTCGAATATGTAAAGGTGT
CCAATACCACATTGTTTGTCAAATGTGTTAAAAAGATGTTTGAATGTTGTTTCGTTATTC
CACACCATGATCAGACTTATCTTAGCAATTTATAAATCAATTATTAATAAAATGGAGGGT
ACAATGCCACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F068TF U 1
AF RS1F068JQ C 153
BS 1 706 RS1F068TF
BS 707 732 RS1F068JQ

RD RS1F068TF 711 0 0
GCTTCGGATTTTCACCATTATGCTATTCTTTGGAGCCCTAGAGAAATCATATTTTTGGTG
GACGATATTCCTATAAGAAGATACCCAAAAAAGAGTGCGGCTACATTTCCTCTAAGACCA
ATGTGGCTTTACGGTTCCATATGGGGTGCTTCTTCTTGGGCAACTGAGAATGGTAAATAC
AAAGCTGACTACAAATATCAACCTTTCACTGCCAAGTACACCAATTTTAAAGCGATTGGT
TGCACCGCCTACTCACCCGCACGGTGCCATCCACTGTCAGCTTCACCATACCGTTCTGGC
GGATTAACTCGTAAGCAATACCAAGCAATGAGATGGGTGCAAACACATAATATGGTATAC
AATTATTGCAAAGATTATAAACGCGACCATTCTCTAACGCCGGAATGTGGGCGTTAGAAG
AAAATTTGAAAAATGTTCTGAAGCTTGAAATTTTTAATTTTCATTAAGAAAGTTTTGCAA
AAGAATTGGGAAAATTTCTGAAGGTTTTATGCTACTACATTATTGTCTGTTTTTTTTGTT
TCACAAAAAATAAAGGGTTTATTTTTTTTGCTTATCATCTTGTCGAATATGTAAAGGTGT
CCAATACCACATTGTTTGTCAAATGTGTTAAAAAGATGTTTGAATGTTGTTTCGTTATTC
CACACCATGATCAGACTTATCTTAGCAATTTATAAATCAATTATTA
TAAAT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RS1F068JQ 580 0 0
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CAAGTACACCAATTTTAAAGCGATTGGTTGCACCGCCTACTCACCCGCACGGTGCCATCC
ACTGTCAGCTTCACCATACCGTTTTGGCGGATTAACTTGTAAGCAATACCAAGCAATGAG
ATGGGTGCAAACACATAATATGGTATACAATTATTGCAAAGATTATAAACGCGACCATTT
TTTAACGCCGGAATGTGGGCGTTAGAAGAAAATTTGAAAAATGTTTTGAAGCTTGAAATT
TTTAATTTTCATTAAGAAAGTTTTGCAAAAGAATTGGGAAAATTTTTGAAGGTTTTATGC
TACTACATTATTGTCTGTTTTTTTTGTTTCACAAAAAATAAAGGGTTTATTTTTTTTGCT
TATCATCTTGTCGAATATGTAAAGGTGTCCAATACCACATTGTTTGTCAAATGTGTTAAA
AAGATGTTTGAATGTTGTTTCGTTATTCCACACCATGATCAGACTTATTTTAGCAATTTA
TAAATCAATTATTAATAAAATGGAGGGTACAATGCCACCG

QA 1 580 1 580
DS 



CO CL1657Contig2 1128 2 2 U
GGACACAAAAGAAGAGAACCAAAACATGGCTAACTCTCTCATCTCTCTTCTCCCAATCTT
CCACTTGTTGGTGTTATTAGGATCCTCAGTGAATGCTTATTGGCCACCATCACCTGGTTA
CTGGCCAAGCTCCAAGGTTGGGTCCTTGAACTTCTACAAAGGTTTTAAGAATCTTTGGGG
TCCTCAGCATCAGAGAATAGACCAAAATGCCCTCACCATCTGGCTTGATAGAACCTCCGG
AAGTGGATTCAAGTCAGTGAAGCCATTCAGATCAGGCTACTTTGGAGCATCCATCAAACT
CCAACCTGGTTACACTGCTGGAGTCATCACATCTCTCTATCTATCAAATAATGAGGCACA
TCCAGGATTCCATGATGAGGTGGACATAGAATTCTTGGGGACAACATTTGGGAAGCCTTA
CACACTTCAGACAAATGTGTACATTAGAGGAAGTGGTGATGGCAAAATCATTGGTCGGGA
GATGAAGTTTCGCTTGTGGTTTGATCCCACTTCGGATTTTCACCATTATGCTATTCTTTG
GAGCCCTAGAGAAATCATATTTTTGGTGGACGATATTCCTATAAGAAGATACCCAAAAAA
GAGTGCGGCTACATTTCCTCTAAGACCAATGTGGCTTTACGGTTCCATATGGGATGCTTC
TTCTTGGGCAACTGAGAATGGTAAATACAAAGCTGACTACAAATATCAACCTTTCACTGC
CAAGTACACCAATTTTAAAGCGATTGGTTGCACCGCCTACTCACCCGCACGGTGCCATCC
ACTGTCAGCTTCACCATACCGTTTTGGCGGATTAACTCGTAAGCAATACCAAGCAATGAG
ATGGGTGCAAACACATAATATGGTATACAATTATTGCAAAGATTATAAACGCGACCATTT
TTTAACGCCGGAATGTGGGCGTTAGAAGAAAATTTGAAAAATGTTTTGAAGTTTGAAATT
TTTAATTTTCATTAAGAAAGTTTTAAAAAGAATTGGGAAAAATTTTGAAGGTTTTATGCT
ACTACATTATTGTTTGTTTTTTTTTGTTTCAAAAAAAATAAAGGGTTTATTTTTTTTTTT
TATCATCTTGTCGAATATGTAAAGGTGTCCAATACCACATTGTTTGTC


BQ
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AF RS1GR46TF U 1
AF RS1EO65JQ C 457
BS 1 638 RS1GR46TF
BS 639 1128 RS1EO65JQ

RD RS1GR46TF 638 0 0
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TCCTCAGCATCAGAGAATAGACCAAAATGCCCTCACCATCTGGCTTGATAGAACCTCCGG
AAGTGGATTCAAGTCAGTGAAGCCATTCAGATCAGGCTACTTTGGAGCATCCATCAAACT
CCAACCTGGTTACACTGCTGGAGTCATCACATCTCTCTATCTATCAAATAATGAGGCACA
TCCAGGATTCCATGATGAGGTGGACATAGAATTCTTGGGGACAACATTTGGGAAGCCTTA
CACACTTCAGACAAATGTGTACATTAGAGGAAGTGGTGATGGCAAAATCATTGGTCGGGA
GATGAAGTTTCGCTTGTGGTTTGATCCCACTTCGGATTTTCACCATTATGCTATTCTTTG
GAGCCCTAGAGAAATCATATTTTTGGTGGACGATATTCCTATAAGAAGATACCCAAAAAA
GAGTGCGGCTACATTTCCTCTAAGACCAATGTGGCTTT

QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1EO65JQ 672 0 0
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TTTTCACCATTATGCTATTCTTTGGAGCCCTAGAGAAATCATATTTTTGGTGGACGATAT
TCCTATAAGAAGATACCCAAAAAAGAGTGCGGCTACATTTCCTCTAAGACCAATGTGGCT
TTACGGTTCCATATGGGATGCTTCTTCTTGGGCAACTGAGAATGGTAAATACAAAGCTGA
CTACAAATATCAACCTTTCACTGCCAAGTACACCAATTTTAAAGCGATTGGTTGCACCGC
CTACTCACCCGCACGGTGCCATCCACTGTCAGCTTCACCATACCGTTTTGGCGGATTAAC
TCGTAAGCAATACCAAGCAATGAGATGGGTGCAAACACATAATATGGTATACAATTATTG
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AAAAATGTTTTGAAGTTTGAAATTTTTAATTTTCATTAAGAAAGTTTTAAAAAGAATTGG
GAAAAATTTTGAAGGTTTTATGCTACTACATTATTGTTTGTTTTTTTTTGTTTCAAAAAA
AATAAAGGGTTTATTTTTTTTTTTTATCATCTTGTCGAATATGTAAAGGTGTCCAATACC
ACATTGTTTGTC

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 3

CO CL1658Contig1 918 3 10 U
GATTTCTCGATTACACAATCAAACTTACAATACAAGAGCATAAGCAAAAAAAAACGAAAA
TTCAAAAACATAGAACTCAAATCTTCTGTTGCGTTCACTAACACACAAGCCTTGTGTTCG
AACTCCAATGGCAGCAAAAAAAAAACAAAATGTAAAATGTATAGCATTATTCAAATCTTT
CCCAATAACAATGGTATATAATGGATAGGTTTCCCAAACAGTGAGGCGAGAGTGTCTCTC
AGCAACTCAAAGTTCTTCCAACTGCCACCTTTTCGTTTTAAGCCTTTGGCTTGAGTGGCT
TGATCACCTCCCAAGTGAAATCAAGATCCTCACGCCCGAAATGCCCATAAGCAGCTGTCT
TCTGGAACCTGAAGTTACCTCCTCTCTTCAAATCAAGGTTAATAGCCATCATCCCAGGCC
TGAAGTCAAAGGCCTCCTTGATCAACACCAAGATGTCCTTATCCGGAATAGTCCCGGTCT
TGTACGTGTCAACAAACACAGAGAGAGGCTCAGGGACACCAATGGCGTACGACACCTGGA
CGATACATCTGCGCGCGAGTCCAGCAGCGACCACACTCTTCGCAGCCTGCCTGACGATGT
AAGCACCGCTTCTATCAACCTTGGTCGGATCCTTCCCTGAGAAAGCACCACCACCGTGAG
CACCCCAACCACCGTAAGTATCGATGATGATCTTCCTCCCCGTGAGTCCAGCATCACCGT
GAGGCCCTCCGATGACGAAACGACCAGAAGGGTTCAAGTGAAAGATGGTGTTGTCATCAA
GGTACTTAGCGGGAATCACCGGCTTGATCACATGCTCCTTCAAGTCCTTAGCGATCTCAT
CGTTGGTCACAGTCTCATCATGCTGAGTCGAGATGAGAACAGTGTGGACACGAATCGGAA
TCATCGCTCCACCGTCAC


BQ
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25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D246JQ U 1
AF RS1EJ72JQ U 67
AF RS1GQ55TF C 288
BS 1 105 RS1D246JQ
BS 106 106 RS1EJ72JQ
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BS 782 782 RS1EJ72JQ
BS 783 822 RS1D246JQ
BS 823 823 RS1EJ72JQ
BS 824 870 RS1D246JQ
BS 871 918 RS1GQ55TF

RD RS1D246JQ 870 0 0
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TTCAAAAACATAGAACTCAAATCTTCTGTTGCGTTCACTAACACATAAGCCTTGTGTTCG
AACTCCAATGGCAGCAAAAAAAAAACAAAATGTAAAATGTATAGCATTATTCAAATCTTT
CCCAATAACAATGGTATATAATGGATAGGTTTCCCAAACAGTGAGGCGAGAGTGTCTCTC
AGCAACTCAGAGTTCTTCCAACTGCCACCTTTTCGTTTTAAGCCTTTGGCTTGAGTGGCT
TGATCACCTCCCAAGTGAAATCAAGATCCTCACGCCCGAAATGCCCATAAGCAGCTGTCT
TCTGGAACCTGAAGTTACCTCCTCTCTTCAAATCAAGGTTAATAGCCATCATCCCAGGCC
TGAAGTCAAAGGCCTCCTTGATCAACACCAAGATGTCCTTATCCGGAATAGTCCCGGTCT
TGTACGTGTCAACAAACACAGAGAGAGGCTCAGGGACACCAATGGCGTACGACACCTGGA
CGATACATCTGCGCGCGAGTCCAGCAGCGACCACACTCTTCGCAGCCTGCCTGACGATGT
AAGCACCGCTTCTATCAACCTTGGTCGGATCCTTCCCTGAGAAAGCACCACCACCGTGAG
CACCCCAACCACCGTAAGTATCGATGATGATCTTCCTCCCCGTGAGTCCAGCATCACCGT
GAGGCCCTCCGATGACGAAACGACCAGAAGGGTTCAAGTGAAAGATGGTGTTGTCATCAA
G*TACTTAGCGGGAATCACCGGCTTGATCACATGCTCCTTCA*GTCCTTAGCGATCTCAT
CGTTGGTCACAGTCTCATCATGCTGAGTCG

QA 1 870 1 870
DS 

RD RS1EJ72JQ 811 0 0
G
ACATAGAACTCAAATCTTCTGTTGCGTTCACTAACACACAAGCCTTGTGTTCGAACTCCA
ATGGCAGCAAAAAAAAAACAAAATGTAAAATGTATAGCATTATTCAAATCTTTCCCAATA
ACAATGGTATATAATGGATAGGTTTCCCAAACAGTGAGGCGAGAGTGTCTCTCAGCAACT
CAAAGTTCTTCCAACTGCCACCTTTTCGTTTTAAGCCTTTGGCTTGAGTGGCTTGATCAC
CTCCCAAGTGAAATCAAGATCCTCACGCCCGAAATGCCCATAAGCAGCTGTCTTCTGGAA
CCTGAAGTTACCTCCTCTCTTCAAATCAAGGTTAATAGCCATCATCCCAGGCCTGAAGTC
AAAGGCCTCCTTGATCAACACCAAGATGTCCTTATCCGGAATAGTCCCGGTCTTGTACGT
GTCAACAAACACAGAGAGAGGCTCAGGGACACCAATGGCGTACGACACCTGGACGATACA
TCTGCGCGCGAGTCCAGCAGCGACCACACTCTTCGCAGCCTGCCTGACGATGTAAGCACC
GCTTCTATCAACCTTGGTCGGATCCTTCCCTGAGAAAGCACCACCACCGTGAGCACCCCA
ACCACCGTAAGTATCGATGATGATCTTCCTCCCCGTGAGTCCAGCATCACCGTGAGGCCC
TCCGATGACGAAACGACCAGAAGGGTTCAAGTGAAAGATGGTGTTGTCATCAAGGTACTT
AGCGGGAATCACCGGCTTGATCACATGCTCCTTCAAGTCCTTAGCGATCTCATCGTTGGT
CACAGTCTCATCATGCTGAGTCG
AGATGAG

QA 2 804 2 804
DS 

RD RS1GQ55TF 631 0 0
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ATCATCCCCGGCCTGAAGTCAAACGCCTCCTTGATCAACACCAAGATATCCTTATCAGGA
ATCGTCCCAGTCTTGTACGTGTCAGCAAACACAGAGAGAGGCTCAGGGACACCAATGGCG
TACGACACCTGAGCAATACATCTGCGCGCGAGTCCAGCAGCGACCACACTCTTCGCAGCT
TGCCTGACGATGTAAGCACCG**TCTATCAACCTTGGTGGGATCCTTCCCGGAGAAAGCA
CCACCACCGTGAGCACCCCAACCACCGTAAGTATCAATGATGATCTTCCTCCCCGTGAGT
CCAGCATCACCGTGAGGCCCTCCGACGACGAAACGACCGGACGGGTTCAAGTGAAAGATG
GTGTTGTCATCAAGGTACTTAGCGGGAATCACCGGCTTGATCACATGCTCCTTCAAGTCC
TTAGCGATCTCATCGTTGGTCACAGTCTCACCATGCTGAGTCGAGATGAGAACAGTGTGG
ACACGAATCGGAATCATCGCTCCACCGTCAC

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 5

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ATAGCAGCTTCAACGCCAGTTTATTGTTATTCCTCTTCCTCTTCCTCTTGCTCTCTCTCT
CTTTTCCTCAAAGTTACAGAATATGAACTCCCTCGCTATCCGAGTATCCAAGCTTCTCAG
ATCCTCTCCGATATCTCCTCTAGCAGTAAGTGGTGAGAAAGTGTCGAGGTCCTGGTTCTC
GACTGGTGGTCCCATTGATGAAGAAGGGTTGGAAGAAGATTTTGAAGAAACCATAGAAAG
ACCCGAGCTTCAGCCTCATGGTGTTGATCCCCGTAAAGGTTGGGGCTTTCGCGGTGTCCA
CAGGGCCATCATTTGTGGGAAGGTAGGGCAAGCACCTTTACAGAAGATTTTGAGAAACGG
GCGGACAGTGACCATCTTCACAGTTGGAACAGGCGGCATGTTTGATCAGAGGCTTATGGG
AGCAACGAACCAGCCTAAACCTGCTCAGTGGCATAGAATCGCTGTGCACAATGAAGTGCT
TGGCTCCTACGCTGTCCAAAAGCTCGCCAAAAA*CTCATCGGTTTATGTGGAAGGTGAAA
TTGAGACTAGAGTTTATAATGATAGTATCAGTAGTGAAGTGAAGAGTATCCCTGAGATTT
GCGTTCGTCGTGATGGGAAGATTCGGCTGATCAAATACGGGGAAAGCATTAGCAAGATCT
CTTTCGATGAGCTAAAAGAAGGATTGATTTAGTCGGAGCAAAGAGTATCCATTTGGCCGG
AGGACACACTGATTCAACGTTTTGGTTGTTCATTGTGAGAGCACTGCGTTCATTCTTATG
AATGTTAAGGCCATTTGTGTAATTGTCGATCAAAACTAGCCAGTTCTGCGTCTGTTCCTT
ATTACCATAAGCTGCTCGTCACCAAACATGGTTTATCATAGCTGTAATTTTGTCAAACCT
CCCACAAAATTGCTCCTTTGTATGACAATTTTATGATATCCTTTAGTATTTGGAGCATTG
GTTGATCAGCTTCAACCCTCTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GW59TF U 36
AF RS1CF42TF U 1
AF RS1BD12TF U 87
AF RS1CF42JQ C 238
AF RS1BD12JQ C 347
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RD RS1GW59TF 644 0 0
TGGG
AGACAGGGGGTTTAAAGGAAGATAGCAGCTTCAACGCCAGTTTATTGTTATTCCTCTTCC
TCTTCCTCTTGCTCTCTCTCTCTTTTCCTCAAAGTTACAGAATATGAACTCCCTCGCTAT
CCGAGTATCCAAGCTTCTCAGATCCTCTCCGATATCTTCTCTAGCAGTAAGTGGTGAGAA
AGTGTCGAGGTCCTGGTTCTCGACTGGTGGTCCCATTGATGAAGAAGGGTTGGAAGAAGA
TTTTGAAGAAACCATAGAAAGACCCGAGCTTCAGCCTCATGGTGTTGATCCCCGTAAAGG
TTGGGGCTTTCGCGGTGTCCACAGGGCCATCATTTGTGGGAAGGTAGGGCAAGCACCTTT
ACAGAAGATTTTGAGAAACGGGCGGACAGTGACCATCTTCACAGTTGGAACAGGCGGCAT
GTTTGATCAGAGGCTTATGGGAGCAACGAACCAGCCTAAACCTGCTCAGTGGCATAGAAT
CGCTGTGCACAATGAAGTGCTTGGCTCCTACGCTGTCCAAAAGCTCGCCAAAAA*CTCAT
CGGTTTATGTGGAAGGTGAAATTGAGACTAGAGTTTATAATGATAGTATCAGTAGTGAAG
TGAAGAGTATCCCTGAGATTTGCGTTCGTCGTGATGGGAA

QA 5 644 5 644
DS 

RD RS1CF42TF 736 0 0
TTTTTGTGTGTGTGATTCATCGAAACCCTAAGAAGCTTCAGACAGGGGGTTTAAAGGAAG
ATAGCAGCTTCAACGCCAGTTTATTGTTATTCCTCTTCCTCTTCCTCTTGCTCTCTCTCT
CTTTTCCTCAAAGTTACAGAATATGAACTCCCTCGCTATCCGAGTATCCAAGCTTCTCAG
ATCCTCTCCGATATCTCCTCTAGCAGTAAGTGGTGAGAAAGTGTCGAGGTCCTGGTTCTC
GACTGGTGGTCCCATTGATGAAGAAGGGTTGGAAGAAGATTTTGAAGAAACCATAGAAAG
ACCCGAGCTTCAGCCTCATGGTGTTGATCCCCGTAAAGGTTGGGGCTTTCGCGGTGTCCA
CAGGGCCATCATTTGTGGGAAGGTAGGGCAAGCACCTTTACAGAAGATTTTGAGAAACGG
GCGGACAGTGACCATCTTCACAGTTGGAACAGGCGGCATGTTTGATCAGAGGCTTATGGG
AGCAACGAACCAGCCTAAACCTGCTCAGTGGCATAGAATCGCTGTGCACAATGAAGTGCT
TGGCTCCTACGCTGTCCAAAAGCTCGCCAAAAAACTCATCGGTTTATGTGGAAGGTGAAA
TTGAGACTAGAGTTTATAATGATAGTATCAGTAGTGAAGTGAAGAGTATCCCTGAGATTT
GTGTTCGTCGTGATGGGAAGATTCG*CTGATCAA*TACGGG*AAAGCATTAGCAAGATCT
CTTTCGATGAGCTAAA

QA 1 736 1 736
DS 

RD RS1BD12TF 760 0 0
GG
ATTCCTCTTCCTCTTCCTCTTGCTCTCTCTCT**TTTCCTCAAAGTTACAGAATATGAAC
TCCCTCGCTATCCGAGTATCCAAGCTTCTCAGATCCTCTCCGATATCTCCTCTAGCAGTA
AGTGGTGAGAAAGTGTCGAGGTCCTGGTTCTCGACTGGTGGTCCCATTGATGAAGAAGGG
TTGGAAGAAGATTTTGAAGAAACCATAGAAAGACCCGAGCTTCAGCCTCATGGTGTTGAT
CCCCGTAAAGGTTGGGGCTTTCGCGGTGTCCGCAGGGCCATCATTTGTGGGAAGGTAGGG
CAAGCACCTTTACAGAAGATTTTGAGAAACGGGCGGACAGTGACCATCTTCACAGTTGGA
ACAGGCGGCATGTTTGATCAGAGGCTTATGGGAGCAACGAACCAGCCTAAACCTGCTCAG
TGGCATAGAATCGCTGTGCACAATGAAGTGCTTGGCTCCTACGCTGTCCAAAAGCTCGCC
AAAAA*CTCATCGGTTTATGTGGAAGGTGAAATTGAGACTAGAGTTTATAATGATAGTAT
CAGTAGTGAAGTGAAGAGTATCCCTGAGATTTGCGTTCGTCGTGATGGGAAGATTCGGCT
GATCAAATACGGGGAAAGCATTAGCAAGATCTCTTTCGATGAGCTAAAAGAAAGATTGAT
TTAGTCGGAGCAAAGAGTATCCATTTGGCCGGAGGACACACTGATTCAACGTTTTGGTTG
TTCATTGTGAGAGCACTGCGTTCATTCTTATGAATGTT

QA 3 760 3 760
DS 

RD RS1CF42JQ 790 0 0
CTCGACTGGTGGTCCCATTGATGAAGAAGGGTTGGAAGAAGATTTTGAAGAAACCATAGA
AAGACCCGAGCTTCAGCCTCATGGTGTTGATCCCCGTAAAGGTTGGGGCTTTCGCGGTGT
CCACAGGGCCATCATTTGTGGGAAGGTAGGGCAAGCACCTTTACAGAAGATTTTGAGAAA
CGGGCGGACAGTGACCATCTTCACAGTTGGAACAGGCGGCATGTTTGATCAGAGGCTTAT
GGGAGCAACGAACCAGCCTAAACCTGCTCAGTGGCATAGAATCGCTGTGCACAATGAAGT
GCTTGGCTCCTACGCTGTCCAAAAGCTCGCCAAAAAACTCATCGGTTTATGTGGAAGGTG
AAATTGAGACTAGAGTTTATAATGATAGTATCAGTAGTGAAGTGAAGAGTATCCCTGAGA
TTTGTGTTCGTCGTGATGGGAAGATTCGGCTGATCAAATACGGGGAAAGCATTAGCAAGA
TCTCTTTCGATGAGCTAAAAGAAGGATTGATTTAGTCGGAGCAAAGAGTATCCATTTGGC
CGGAGGACACACTGATTCAACGTTTTGGTTGTTCATTGTGAGAGCACTGCGTTCATTCTT
ATGAATGTTAAGGCCATTTGTGTAATTGTCGATCAAAACTAGCCAGTTCTGCGTCTGTTC
CTTATTACCATAAGCTGCTCGTCACCAAACATGGTTTATCATAGCTGTAATTTTGTCAAA
CCTCCCACAAAATTGCTCCTTTGTATGACAATTTTATGATATCCTTTAGTATTTGGAGCA
TTGGTTGATC

QA 1 790 1 790
DS 

RD RS1BD12JQ 698 0 0
TTTCGCGGTGTCCGCAGGGCCATCATTTGTGGGAAGGTAGGGCAAGCACCTTTACAGAAG
ATTTTGAGAAACGGGCGGACAGTGACCATCTTCACAGTTGGAACAGGCGGCATGTTTGAT
CAGAGGCTTATGGGAGCAACGAACCAGCCTAAACCTGCTCAGTGGCATAGAATCGCTGTG
CACAATGAAGTGCTTGGCTCCTACGCTGTCCAAAAGCTCGCCAAAAA*CTCATCGGTTTA
TGTGGAAGGTGAAATTGAGACTAGAGTTTATAATGATAGTATCAGTAGTGAAGTGAAGAG
TATCCCTGAGATTTGCGTTCGTCGTGATGGGAAGATTCGGCTGATCAAATACGGGGAAAG
CATTAGCAAGATCTCTTTCGATGAGCTAAAAGAAGGATTGATTTAGTCGGAGCAAAGAGT
ATCCATTTGGCCGGAGGACACACTGATTCAACGTTTTGGTTGTTCATTGTGAGAGCACTG
CGTTCATTCTTATGAATGTTAAGGCCATTTGTGTAATTGTCGATCAAAACTAGCCAGTTC
TGCGTCTGTTCCTTATTACCATAAGCTGCTCGTCACCAAACATGGTTTATCATAGCTGTA
ATTTTGTCAAACCTCCCACAAAATTGCTCCTTTGTATGACAATTTTATGATATCCTTTAG
TATTTGGAGCATTGGTTGATCAGCTTCAACCCTCTATT

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 4

CO CL1660Contig1 1012 4 9 U
GGGGGATATTTGTTTCCTGAAGGGGCGGCTAGACTCCCAGGTTTCCATTGCTGTGTTGGT
AGTGGTGGAGAAAAACTGCTTCCTGAATCATACAAACAGAAAGGGATTGAGTTGATACTA
AGCACAGAAATAGTGAAAGCAGATCTTGCTGCCAAGAGTCTTGTCAGCGCAGCTGGAGAT
GTCTTCAAATATGAAACTCTCATCATTGCAACTGGTTCTACTGTTCTCAGATTGACTGAT
TTTGGTGTGAAAGGTGCTGACTCAAAGAACATCCTCTATCTGAGGGAGATTGATGATGCT
GACAAAGTGGTTGAAGCAA****TCAAAGCAAAGAAAGGTGGAATTAAGACCGATGCATT
CTTCAAAACAAGTGTTCCGGATGTTTACGCTGTTGGTGACGTTGCCACTTTCCCCTTGAA
AATGTATGGAGACATGAGAAGGGTCGAGCATGTTGACCATTCTCGCAAATCCGCAGAGCA
AGCTGTTAAGGCGATCAAAGCGGCTGAAGGAGGCGGTGCCGTGGAGGAATATGACTATCT
CCCATTCTTCTACTCGCGCTCGTTTGATCTCTCATGGCAATTCTATGGAGACAACGTAGG
AGACTCTGTCTTGTTTGGAGACAGCAATCCATCAAACCCAAAACCAAGATTTGGAGCGTA
TTGGGTTAAAGATGGTAAAGTGGTTGGAGCATTCATGGAAGGAGGGAGTGGTGATGAGAA
CAAAGCTTTGGCTAAAGTGGCTAAAGCTAGACCTGCTGCAGAGAGCCTCGACGATCTTAC
CAAACAAGGCATCTCCTTCGCCGCTAAGATTTGAGGAGAAAAAATGGAGAGTTTAACCAC
CCTTTTTTTT*TATATTCTGTTACAATAAAAGCAATGTGTTTAGCACGGACTTGTGCTGA
AATAAGTTGTGTGTTTGAATGAGACCTGATTGGGTATTGGGAAACACTATCATTAAATAG
CTTTTTATCTTTGGACATGGTTCACTTGTGATGAGTAAAACCGTTATTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 10 25 25 25 10 10 25 25 25 10 25 25 25 10 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1FO51TF U 1
AF RS1FO75TF U 385
AF RS1FO51JQ C 280
AF RS1GH46JQ C 311
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RD RS1FO51TF 794 0 0
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CCCATTCTTCTACTCGCGCTCGTTTGATCTCTCATGGCAATTCTATGGAGACAACGTAGG
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AACAGCATCTCCTT

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DS 

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G
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GAGCATGTTGACCATTCTCGCAAATCCGCAGAGCAAGCTGTTAAGGCGATCAAAGCGGCT
GAAGGAGGCGGTGCCGTGGAGGAATATGACTATCTCCCATTCTTCTACTCGCGCTCGTTT
GATCTCTCATGGCAATTCTATGGAGACAACGTAGGAGACTCTGTCTTGTTTGGAGACAGC
AATCCATCAAACCCAAAACCAAGATTTAGAGCGTATTGGGTTAAAGAAGGTAAAGTGGTT
GGAGCATTCATGGAAGGAGGGAGTGGTGATGAGAACAAAGCTTTGGCTAAAGTGGCTAAA
GCTAGACCTGCTGCAGAGAGCCTCGACGATCTTACCAAACAAGGCATCTCCTTCGCCGCT
AAGATTTGAGGAGAAAAAATGGAGAGTTTAACCACCCTTTTTTTT*TATATTCTGTTACA
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CTGATTGGGTATTGGGAAACACTATCAT

QA 2 569 2 569
DS 

RD RS1FO51JQ 733 0 0
CTGAGGGAGATTGATGATGCTGACAAAGTGGTTGAAGCAA****TCAAAGCAAAGAAAGG
TGGAATTAAGACCGATGCATTCTTCAAAACAAGTGTTCCGGATGTTTACGCTGTTGGTGA
CGTTGCCACTTTCCCCTTGAAAATGTATGGAGACATGAGAAGGGTCGAGCATGTTGACCA
TTCTCGCAAATCCGCAGAGCAAGCTGTTAAGGCGATCAAAGCGGCTGAAGGAGGCGGTGC
CGTGGAGGAATATGACTATCTCCCATTCTTCTACTCGCGCTCGTTTGATCTCTCATGGCA
ATTCTATGGAGACAACGTAGGAGACTCTGTCTTGTTTGGAGACAGCAATCCATCAAACCC
AAAACCAAGATTTGGAGCGTATTGGGTTAAAGATGGTAAAGTGGTTGGAGCATTCATGGA
AGGAGGGAGTGGTGATGAGAACAAAGCTTTGGCTAAAGTGGCTAAAGCTAGACCTGCTGC
AGAGAGCCTCGACGATCTTACCAAACAAGGCATCTCCTTCGCCGCTAAGATTTGAGGAGA
AAAAATGGAGAGTTTAACCACCCTTTTTTTT*TATATTCTGTTACAATAAAAGCAATGTG
TTTAGCACGGACTTGTGCTGAAATAAGTTGTGTGTTTGAATGAGACCTGATTGGGTATTG
GGAAACACTATCATTAAATAGCTTTTTATCTTTGGACATGGTTCACTTGTGATGAGTAAA
ACCGTTATTTATC

QA 1 733 1 733
DS 

RD RS1GH46JQ 659 0 0
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AGTGTTCCTGATGTTTACGCTGTTGGTGACGTTGCCACTTTCCCCTTGAAAATGTATGGA
GACATGAGAAGGGTCGAGCATGTTGACCATTCTCGTAAATCCGCAGAGCAAGCTGTTAAG
GCGATCAAAGCGGCTGAAGGAGGCGGTGCGGTGGAGGAATACGACTACCTCCCATTCTTC
TACTCGCGCTCGTCTGATCTCTCATGGCAGTTCTATGGAGACAACGTAGGAGACTCTGTC
TTGTTCGGAGACAGCAATCCATCAAACCCAAAACCAAGATTTGGAGCGTATTGGGTTAAA
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GCTAAAGTCGCTAAAGCTAGACCTGCTGCAGAGAGCCTCGACGATCTTACCAAACAAGGC
ATCTCCTTTGCCGCTAAGATTTGAGGAGAAAAAATGGAGAGTTTAACCACCCTTTTTTTT
ATATATTCTGTTACAATAAAAGCAATGTGTTTAGCACGGACGTATGCTGAAATAAGTTGT
GTGTTTGAATGAGACCTGATTGGCTATTGGGAAACACTATCATTAAATAGCTTTTTATC

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 5

CO CL1661Contig1 915 5 19 U
GGGTATTGATTGATGTCTCATTAATTAAAAGCCCTGATAAAGTGAGTATGATTACATACT
TTGGTTTCGGTTACAACAATGTGAATGTTGAACCGAGTTATTACAGTAATCCCTTAGACA
GGTTTTGCACAAACCGTCCCCAATACAAGCTTTTTTCTTCTTCTTCTTACATCTTAGATT
GAAAACCCGGTTTAGACATCTTCAGCTGCTTGTCAAATTTGTCTTTGGCTCCGTAAAGGA
TTTTGTGAACCACATCAAAGTGAGGCAGTGTCGCCTTCCTCGTATTCTCAATCCATTCTT
CAACTTTCTTGTAAGGACTAAACAACCTAAGACGATCTTTCTCATCCAAAATCTGGAGCT
GCATAAGCTCGCATACAAGGTTGAGATCAGCTATGGATGGTTGGTTGCTTCCCAGCAAGA
ATTTACCATTGCCCTTAAGCCAGAAAGTCTCCAGAGTGGACAGAGACTTGGTTAGTAGCT
TCTCAGCTTCAGCAGCTGCTTTCGAATCCAGAGAACGGCCAAGAAATGGAGCTAGAACAC
TATTCATTACATATCCAGCTGCACCAGGGCGTAAATTGGTGTGATGCCAGTCCAAGACAG
AGTGAATCTTGGCTCTCTTCGAAAGATCATTTGGGTACCAATGATCCGCTACACTTGGGA
ATGCTGAGGCAAGATAAATCAAGATGGCGTGACTCTCGAAAAGCTTGAATATGCCGTCAA
CAATAGCTGGAACCTTCCCCAATGGGTTAATCTCTATGAAATCAGGGGATAATTGCTGAC
GCTTCGCCAAGTTAATCAAAACCTCATCGAATTGGATTCCATTAACCTTGCAGAATATGA
TTACAGCACGAGATGGCTGTGACATACGATCCGCATACACTTTCAGCTTCATCTTCTTCT
TCTTGTGATCTGTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FV69JQ U 1
AF RS1FX29JQ U 36
AF RS1D468JQ U 60
AF RS1FX29TF C 118
AF RS1FV69TF C 156
BS 1 177 RS1FV69JQ
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BS 179 194 RS1FV69JQ
BS 195 195 RS1D468JQ
BS 196 384 RS1FV69JQ
BS 385 385 RS1FX29JQ
BS 386 455 RS1FV69JQ
BS 456 456 RS1FX29JQ
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BS 465 465 RS1FX29JQ
BS 466 512 RS1FV69JQ
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BS 514 597 RS1FV69JQ
BS 598 618 RS1FX29JQ
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BS 659 710 RS1FX29TF
BS 711 711 RS1FV69TF
BS 712 734 RS1FX29TF
BS 735 915 RS1FV69TF

RD RS1FV69JQ 597 0 0
GGGTATTGATTGATGTCTCATTAATTAAAAGCCCTGATAAAGTGAGTATGATTACATACT
TTGGTTTCGGTTACAACAATGTGAATGTTGAACCGAGTTATTACAGTAATCCCTTAGACA
GGTTTTGCACAAACCGTCCCCAATACAAGCTTTTTTCTTCTTCTTCTTACATCTTAG*TT
GAAAACCCGGTTTAAACATCTTCAGCTGCTTGTCAAATTTGTCTTTGGCTCCGTAAAGGA
TTTTGTGAACCACATCAAAGTGAGGCAGTGTCGCCTTCCTCGTATTCTCAATCCATTCTT
CAACTTTCTTGTAAGGACTAAACAACCTAAGACGATCTTTCTCATCCAAAATCTGGAGCT
GCATAAGCTCGCATACAAGGTTGAAATCAGCTATGGATGGTTGGTTGCTTCCCAGCAAGA
ATTTACCATTGCCCTTAAGCCAGAAAGTCTCCAGAATGGACAGAAACTTGGTTAGTAGCT
TCTCAGCTTCAGCAGCTGCTTTCGAATCCAGAAAACGGCCAAGAAATGGAGCTAGAACAC
TATTCATTACATATCCAGCTGCACCAGGGCGTAAATTGGTGTGATGCCAGTCCAAGA

QA 1 597 1 597
DS 

RD RS1FX29JQ 583 0 0
GG
TAAAGTGAGTATGATTACATACTTTGGTTTCGGTTACAACAATGTGAATGTTGAATCGAG
TTATTACAGTAATCCCTTAGACAGGTTTTGCACAAACCGTCCCCAATACAAGCTTTTTTC
TTCTTCTTCTTACATCTTAAATTGAAAACCCGGTTTAAACATCTTCAGCTGCTTGTCAAA
TTTGTCTTTGGCTCCGTAAAGGATTTTGTGAACCACATCAAAGTGAGGCAGTGTCGCCTT
CCTCGTATTCTCAATCCATTCTTCAACTTTCTTGTAAGGACTAAACAACCTAAGACGATC
TTTCTCATCCAAAATCTGGAGCTGCATAAGCTCGCATACAAGGTTGAGATCAGCTATGGA
TGGTTGGTTGCTTCCCAGCAAGAATTTACCATTGCCCTTAAGCCAGAAAGTCTCCAGAGT
GGACAGAGACTTGGTTAGTAGCTTCTCAGCTTCAGCAGCTGCTTTCGAATCCAGAGAACG
GCCAAGAAATGGAGCTAGAACACTATTCATTACATATCCAGCTGCACCAGGGCGTAAATT
GGTGTGATGCCAGTCCAAGACAGAGTGAATCTTGGCTCTCT

QA 3 583 3 583
DS 

RD RS1D468JQ 599 0 0
TTTGGTTTCGGTTACAACAATGTGAATGTTGAACCGAGTTATTACAGTAATCCCTTAGAC
AGGTTTTGCACAAACCGTCCCCAATACAAGCTTTTTTCTTCTTCTTCTTACATCTTAAAT
TGAAAACCCGGTTTAGACATCTTCAGCTGCTTGTCAAATTTGTCTTTGGCTCCGTAAAGG
ATTTTGTGAACCACATCAAAGTGAGGCAGTGTCGCCTTCCTCGTATTCTCAATCCATTCT
TCAACTTTCTTGTAAGGACTAAACAACCTAAGACGATCTTTCTCATCCAAAATCTGGAGC
TGCATAAGCTCGCATACAAGGTTGAGATCAGCTATGGATGGTTGGTTGCTTCCCAGCAAG
AATTTACCATTGCCCTTAAGCCAGAAAGTCTCCAGAGTGGACAGAGACTTGGTTAGTAGC
TTCTCAGCTTCAGCAGCTGCTTTCGAATCCAGAGAACGGCCAAGAAATGGAGCTAGAACA
CTATTCATTACATATCCAGCTGCACCAGGGCGTAAATTGGTGTGATGCCAGTCCAAGACA
GAGTGAATCTTGGCTCTCTTCGAAAGATCATTTGGGTACCAATGATCCGCTACACTTGG

QA 1 599 1 599
DS 

RD RS1FX29TF 618 0 0
ACAGGTTTTGCACAAACCGTCCCCAATACAAGCTTTTTTCTTCTTCTTCTTACATCTTAG
ATTGAAAACCCGGTTTAGACATCTTCAGCTGCTTGTCAAATTTGTCTTTGGCTCCGTAAA
GGATTTTGTGAACCACATCAAAGTGAGGCAGTGTCGCCTTCCTCGTATTCTCAATCCATT
CTTCAACTTTCTTGTAAGGACTAAACAACCTAAGACGATCTTTCTCATCCAAAATCTGGA
GCTGCATAAGCTCGCATACAAGGTTGAGATCAGCTATGGATGGTTGGTTGCTTCCCAGCA
AGAATTTACCATTGCCCTTAAGCCAGAAAGTCTCCAGAGTGGACAGAGACTTGGTTAGTA
GCTTCTCAGCTTCAGCAGCTGCTTTCGAATCCAGAGAACGGCCAAGAAATGGAGCTAGAA
CACTATTCATTACATATCCAGCTGCACCAGGGCGTAAATTGGTGTGATGCCAGTCCAAGA
CAGAGTGAATCTTGGCTCTCTTCGAAAGATCATTTGGGTACCAATGATCCGCTACACTTG
GGAATGCTGAGGCAAGATAAATCAAGATGGCGTGACTCTCGAAAAGCTTGAATCTGCCGT
CAACAATAGCTGGAACC
C

QA 1 617 1 617
DS 

RD RS1FV69TF 760 0 0
TTTTTCTCTCTC
TACATCTTAG*TTGAAA*CCCGGTTTAGACATCT*CAGCTGCTTGTCAAATTTGTCTTTG
GCTC*GTAAAGGATTTTGTGAACCACATCAAAGTGAGGCAGTGTCGCTTTCCTCGTATTC
TCAATCCATTCTTCAACTTTCTTGTAAGGACTAAACAAC*TAAGACGATCTTTCTCATCC
AAAATCTGGAGCTGCATAAGCTCGCATACAAGGTTGAGATCAGCTATGGATGGTTGGTTG
CTTCCCAGCAAGAATTTACCATTGCCCTTAAGCCAGAAAGTCTCCAGAGTGGACAGAGAC
TTGGTTAGTAGCTTCTCAGCTTCAGCAGCTGCTTTCGAATCCAGAGAACGGCCAAGAAAT
GGAGCTAGAACACTATTCATTACATATCCAGCTGCACCAGGGCGTAAATTGGTGTGATGC
CAGTCCAAGACAGAGTGAATCTTGGCTCTCTTCGAAAGATCATTTGGGTACCAATGATCC
GCTACACTTGGGAATGCTGAGGCAAGATAAATCAAGATGGCGTGACTCTCGAAAAGCTTG
AATATGCCGTCAACAATAGCTGGAACCTTCCCCAATGGGTTAATCTCTATGAAATCAGGG
GATAATTGCTGACGCTTCGCCAAGTTAATCAAAACCTCATCGAATTGGATTCCATTAACC
TTGCAGAATATGATTACAGCACGAGATGGCTGTGACATACGATCCGCATACACTTTCAGC
TTCATCTTCTTCTTCTTGTGATCTGTCC

QA 13 760 13 760
DS 



AS 1 2

CO CL1662Contig1 1027 2 12 U
GGGCAAAACCTATTTCCGCCATGGCTGCTCTTCAATACTTGGAATCGCTGAAAACTTCGC
ATCCAGAGCTCAATGAATGGTACGATTCCCTCGCAGATCTGTATCAGAAAAAGCTATGGC
ATCAGCTCACCCTCAAGCTCGAGCAGTTCATCGCTCTCTCCTTTTTTCAGGCTGGAGATG
CTTTGGTACAGTTCTACCACAACTTCATCACCGACTTCGAGACGAAGATCAACCTCCTCA
AGCTCGCGCATTTCGCTGTGGTGGTCTCCCGTCAGTACGCTGAGAAAGAAGCTGCGGTTA
GCTATCTCGAAGGAGTGATTGAGAAGCTTAAAGCCACTAAGGAGCCTCGCATCACTGAAC
CTATCGTTTACATCGAGACGCAAAAGGCTTTGTTCAAGCTTGAGCAAGGTGATCAGAAGG
AATGCAAGAAGGTCTTGGACGATGCCAAGACATCTCTTGATAGCATGACTGACATTGATC
CTTCGGTGTTCGCGAACTTCTACTGGGTGTCTTCTCAGTACCACAAGTTCCGTCAGGAGT
TCTCTGATTTCTACAAAAGTGCTCTGCTTTATCTTGCATATACCTCTGTGGAGGCACCCT
CTGAATCCTTTAAGCTGGATTTGGCTTTCGATTTGTCACTTTCAGCTCTACTTGGAGAAA
ACATCTACAACTTTGGGGAACTCTTGGCTCATCCCATTTTGAAAAGTCTCCTTGGAACAA
ATGTGGAATGGCTTTACCACATTCTCCAGGCGTTCAACCATGGTGACTTAGTTCAGTATC
AAGAACTGTGTCGTGTGCACCATGCATCCTTGATTGCCCAACCTGCGCTGGTTGAGAATG
AGAAGAAACTATTGGAGAAGATCAACATTCTTTGCCTTATCGAGATCATCTTCAGCCGAC
CTGCTGAAGATAGGACTATTCCTTTGACTGTCATTGCTGAGCGTACTAAACTTTCCATTG
AAGAGGTGAGCACCTTCTCATGAAGAGTCTTTCTGTGCATCTGATTGAGGGGATATAGAT
CAAGTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DI89TF U 1
AF RS1EI06TF U 219
BS 1 570 RS1DI89TF
BS 571 571 RS1EI06TF
BS 572 577 RS1DI89TF
BS 578 578 RS1EI06TF
BS 579 583 RS1DI89TF
BS 584 584 RS1EI06TF
BS 585 597 RS1DI89TF
BS 598 598 RS1EI06TF
BS 599 709 RS1DI89TF
BS 710 710 RS1EI06TF
BS 711 716 RS1DI89TF
BS 717 1027 RS1EI06TF

RD RS1DI89TF 729 0 0
GGGCAAAACCTATTTCCGCCATGGCTGCTCTTCAATACTTGGAATCGCTGAAAACTTCGC
ATCCAGAGCTCAATGAATGGTACGATTCCCTCGCAGATCTGTATCAGAAAAAGCTATGGC
ATCAGCTCACCCTCAAGCTCGAGCAGTTCATCGCTCTCTCCTTTTTTCAGGCTGGAGATG
CTTTGGTACAGTTCTACCACAACTTCATCACCGACTTCGAGACGAAGATCAACCTCCTCA
AGCTCGCGCATTTCGCTGTGGTGGTCTCCCGTCAGTACGCTGAGAAAGAAGCTGCGGTTA
GCTATCTCGAAGGAGTGATTGAGAAGCTTAAAGCCACTAAGGAGCCTCGCATCACTGAAC
CTATCGTTTACATCGAGACGCAAAAGGCTTTGTTCAAGCTTGAGCAAGGTGATCAGAAGG
AATGCAAGAAGGTCTTGGACGATGCCAAGACATCTCTTGATAGCATGACTGACATTGATC
CTTCGGTGTTCGCGAACTTCTACTGGGTGTCTTCTCAGTACCACAAGTTCCGTCAGGAGT
TCTCTGATTTCTACAAAAGTGCTCTGCTTTTTCTTGCGTATACTTCTGTGGAGGCACTCT
CTGAATCCTTTAAGCTGGATTTGGCTTTCGATTTGTCACTTTCAGCTCTACTTGGAGAAA
ACATCTACAACTTTGGGGAACTCTTGGCTCATCCCATTTTGAAAAGTCTTCTTGGA
ACAAATGTGGAAT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RS1EI06TF 809 0 0
GAGACGAAGATCAACCTCCTCAAGCTCGCGCATTTCGCTGTGGTGGTCTCCCGTCAGTAC
GCTGAGAAAGAAGCTGCGGTTAGCTATCTCGAAGGAGTGATTGAGAAGCTTAAAGCCACT
AAGGAGCCTCGCATCACTGAACCTATCGTTTACATCGAGACGCAAAAGGCTTTGTTCAAG
CTTGAGCAAGGTGATCAGAAGGAATGCAAGAAGGTCTTGGACGATGCCAAGACATCTCTT
GATAGCATGACTGACATTGATCCTTCGGTGTTCGCGAACTTCTACTGGGTGTCTTCTCAG
TACCACAAGTTCCGTCAGGAGTTTTCTGATTTCTACAAAAGTGCTCTGCTTTATCTTGCA
TATACCTCTGTGGAGGCACCCTCTGAATCCTTTAAGCTGGATTTGGCTTTTGATTTGTCA
CTTTCAGCTCTACTTGGAGAAAACATCTACAACTTTGGGGAACTCTTGGCTCATCCCATT
TTGAAAAGTCTCCTTGGAACAAATGTGGAATGGCTTTACCACATTCTCCAGGCGTTCAAC
CATGGTGACTTAGTTCAGTATCAAGAACTGTGTCGTGTGCACCATGCATCCTTGATTGCC
CAACCTGCGCTGGTTGAGAATGAGAAGAAACTATTGGAGAAGATCAACATTCTTTGCCTT
ATCGAGATCATCTTCAGCCGACCTGCTGAAGATAGGACTATTCCTTTGACTGTCATTGCT
GAGCGTACTAAACTTTCCATTGAAGAGGTGAGCACCTTCTCATGAAGAGTCTTTCTGTGC
ATCTGATTGAGGGGATATAGATCAAGTGA

QA 1 809 1 809
DS 



AS 1 4

CO CL1663Contig1 879 4 10 U
GGGTCTAGCCGCAAGCCTTTCTCTGTGACATTCATCTGAGGTGAAGAAATGAAGCACAAC
AATGTCATCCCCGATGGTCACTTCAAGAAGCACTGGCAGAACTATGTCAAGACTTGGTTC
AACCAGCCTGCCAGGAAAACCAGGAGAAGAGTTGCGAGACAAAAGAAGGCTGTGAAGATC
TTCCCCCGTCCTACTGCTGGACCTCTCCGCCCTGTTGTGCATGGTCAGACTCTCAAGTAC
AACATGAAAGTCAGAACCGGTAAAGGTTTCACTCTTGAAGAGCTCAAGTCTGCTGGAATC
CCCAAGAAGTTGGCACCAACCATCGGTATCTCTGTTGACCATCGTCGCAAGAACAGATCT
CTCGAGGGTCTTCAGTCCAATGTCCAGAGGCTCAAAACCTACAAGGCTAAGTTGGTCATC
TTCCCTCGTCGTGCAAGGAAGACCAAGGCTGGTGATTCTACTGCAGAAGAGTTGGCCAAT
GCCACTCAAGTCCAAGGAGACTACATGCCAATAGTCCGTGAGAAGCAAGCAACTGAGCTT
GTGAAGCTTACCGCTGAGATGAAATCGTTCAAGGCTTATGACAAGATCCGTCTAGAGCGC
ACAAACAAGAGACACGCCGGTGCTAGAGCCAAGAGGGCTGCTGATGCCGAGAAGGAAGAG
AAGAAGTGAGACAACCCTTAGAAGAAACTCTTTTTATCTTGTCATCGTTTAAATCTCAGT
TTTTGTGTATCAGACTGTTTTTTTCTTCAGATTTTTGCAATTACTTATCTGGATTTAAGG
AAAACATCCTTCTACATTATCTTCCTACTTCTTGAAGTCTTGTCTTTCTTTACTACATTA
AGACACGTCCTTTGGTTAGGCATTCTACATTTTCTCAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BW82TF U 1
AF RS1BW82JQ C 21
AF RS1B157JQ C 216
AF RS1B157TF U 216
BS 1 289 RS1BW82TF
BS 290 291 RS1B157TF
BS 292 513 RS1BW82TF
BS 514 514 RS1B157TF
BS 515 543 RS1BW82TF
BS 544 544 RS1B157TF
BS 545 615 RS1BW82TF
BS 616 616 RS1B157TF
BS 617 646 RS1BW82TF
BS 647 879 RS1B157TF

RD RS1BW82TF 646 0 0
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AACCAGCCTGCCAGGAAAACCAGGAGAAGAGTTGCGAGACAAAAGAAGGCTGTGAAGATC
TTCCCCCGTCCTACTGCTGGACCTCTCCGCCCTGTTGTGCATGGTCAGACTCTCAAGTAC
AACATGAAAGTCAGAACCGGTAAAGGTTTCACTCTTGAAGAGCTCAAGT**GCTGGAATC
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ACAAACAAGAGACACTCCGGTGCTAGAGCCAAGAGGGCTGCTGATG

QA 1 646 1 646
DS 

RD RS1BW82JQ 775 0 0
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CTTCAAGAAGCACTGGCAGAACTATGTCAAGACTTGGTTCAACCAGCCTGCCAGGAAAAC
CAGGAGAAGAGTTGCGAGACAAAAGAAGGCTGTGAAGATCTTCCCCCGTCCTACTGCTGG
ACCTCTCCGCCCTGTTGTGCATGGTCAGACTCTCAAGTACAACATGAAAGTCAGAACCGG
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CATCGGTATCTCTGTTGACCATCGTCGCAAGAACAGATCTCTCGAGGGTCTTCAGTCCAA
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TTTTCTTCAGATTTTTGCAATTACTTATCTGGATTTAAGGAAAACATCCTTCTAC

QA 1 775 1 775
DS 

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G
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G
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GACCATCGTCGCAAGAACAGATCTCTCGAGGGTCTTCAGTCCAATGTCCAGAGGCTCAAA
ACCTACAAGGCTAAGTTGGTCATCTTCCCTCGTCGTGCAAGGAAGACCAAGGCTGGTGAT
TCTACTGCAGAAGAGTTGGCCAATGCCACTCAAGTCCAAGGAGACTACATGCCAATAGTC
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TATGACAAGATCCGTCTAGAGCGCACAAACAAGAGACACGCCGGTGCTAGAGCCAAGAGG
GCTGCTGATGCCGAGAAGGAAGAGAAGAAGTGAGACAACCCTTAGAAGAAACTCTTTTTA
TCTTGTCATCGTTTAAATCTCAGTTTTTGTGTATCAGACTGTTTTTTTCTTCAGATTTTT
GCAATTACTTATCTGGATTTAAGGAAAACATCCTTCTACATTATCTTCCTACTTCTTGAA
GTCTTGTCTTTCTTTACTACATTAAGACACGTCCTTTGGTTAGGCATTCTACATTTTCTC
AAG

QA 2 664 2 664
DS 



AS 1 5

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ATTTGGGTGGTTACTCTGATTCGCT


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 5 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1G335JQ C 4
AF RS1E914TF U 1
AF RS1G335TF U 4
AF RS1AB61JQ C 12
AF RS1AB61TF U 12
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TTGTGTTTTGTTTTTCTTGATTCTGACCTTCGTTTTGCTTTGCTTTTTA

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ATTTGGGTGG

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DS 

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GG
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ACGATTGATTTCCCAGAGTTCTTGAACCTCATGGCCCGCAAGATGAAAGACACTGACTCC
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GATGAGATGGTCCGTGAGGCTGACGTCGATGGTGATGGCCAGATCAACTATGATGAGTTC
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TTGTGTTTTGTTTTTCTTGATTCTGACCTTCGTTTTGCTTTGCTTTTTATTATTTATTTG
GGTGG
CAAAA

QA 3 607 3 607
DS 

RD RS1AB61JQ 614 0 0
GG
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CTTTGATTCGCT

QA 3 614 3 614
DS 

RD RS1AB61TF 614 0 0
GG
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GCTCCGCCACGTCATGACTAACCTCGGTGAGAAGCTCACTGACGAGGAAGTTGATGAGAT
GGTCCGTGAGGCTGACGTCGATGGTGATGGCCAGATCAACTATGATGAGTTCGTCAAAGT
TATGATGGCTAAGTGAGATTTTCTTTTTTTTTTT***ACAGATTTGCTTCCTTTGTGTTT
TGTTTT*CGTGATTCTGACCTTCGTTTTGCTTTGCTTTTTATTATTTATTTGGGTGGTTA
CTCTGATTCGCT

QA 3 614 3 614
DS 



AS 1 5

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TACAAATACATAATAATTAGTCATTAATTATTCTCTTTTTTTTTTCCTTCACTGCTCTTA
CATCAGTTTAAAAACCAAACCCTCCTTAAAAAAAAAAACATCTGATACCTCTCCTATCCT
CTCCTCTCCTCTCCTCTCTCCCAAAGTTTTTCATTTACAGTGTCTCTTCTTATTATGTTT
GGCTTGCGCCAGATTGTGGAAAAAGTCTACAACTACTGGCTCGTAATCTGGCATCTTTCC
GTAACCAGGGAAGTAATTGATGTCAATAACAGAAAACACGTTCTTGCTCCCATGTTCTCT
GATCATGTCTATGTTGAAAAGCCGAAGTCCCAATAAGGTTCGTAGCTCTTTCACAAGGGC
TTCGAGGAAAGGCTTTGGAGGTAGCTCAGCAACACTAGGTTCCAAGTCTGCGTTATCCGC
TGAAGCAGCTGCAGATGAAACCCTCGGGAATTTGAAGACGCCGTCAGCTTTGGCTTTGTC
GCAGTTACTCACGTTTGGTAGAGAGAACCGTCTCACTACTTTTTGATATCACCCACCACA
AAAACCTTGAACATAACTCCACCATGATTAACAAACTCTTGCAGGATTAAAGGAGGTTCA
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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AA

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CCGTCGACT

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GTACCGTCGACTGATAACTTCGTATAATGTATGCTATACGAAGTTATG

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AS 1 4

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30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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GG
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AAGTACACATTAACATGCTTCGAGCCGTTCTTGACGAAATCAAGCCTGAAGATGTTGATG
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TGCACATCAAATCATATGACTGGGTCGCTGATTCTCCCCAGTCGAGTTCGGATACTCGTT
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GA

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G

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DS 



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TCTTCAGGTCGTTTGATATCAGCAACTTTCTTCTTCTTCTTACCGAAATTGCCTAACTCA
AGTTGCTTCTTCCTGATAAAGGCAAGCTCATCCCTGTTCTTTCTCTTCTTAAGTATAACC
TCCGGTATGTAGTCCAAACCCTTATTAGCTTCTTCTACAGCCATCACCTTAGGTTCTTCC
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CTCTCGGTGGAGACGAAGCAATCGAACGGTGGCTGAAGAGATTCCAAGTTAATACGGCGG
CAATATCGTACTTTTGGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1DC33JQ U 1
AF RS1C192JQ U 42
AF RS1AX55TF C 259
AF RS1C192TF C 361
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QA 1 617 1 617
DS 

RD RS1C192JQ 733 0 0
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GAAAATATAGTAAAGTAGACTTCTGCTTGGCTGCTTCTAATTCATTTTGATGATGAGATC
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TCTGAAATGATCACCAACTCTTGCTATCTCATTCACAATGTCTTCTATGCAAAAGATACC
ATGTTCTCCTAGAGCCTGTTCGATTATGTTGTTGTCGGTAAGAGGAACAGGATTGCCTTC
TATTATTGTGTATCCCTTTTTGAATATAAGATCCTTAACGCTCTTACCATTCGGGTACCC
ATAAGTGACGTAAGGCTGCACTTTGAGAAGCTTTTGAAACAAACCATCAGTTGCTTTGGC
AAATACACCAGTGAAAGTGCTCCTTAGTTGCATACTGTTGAGAACCTTCTTGGTCTTTGG
GTGCATATCATTCTTGCCTTGTATGCGAATGATGAAAACGAGGTTTGATTTTACTGGTGG
AGGAGATGCTCTTGGCCTCTTCACCCTTTGCTTCATCCGGATAAGATCTATTTCCTTAGC
CCTGAACTCAAGCACAAAGTCTTCAGGTCGTTTGATATCAGCAACTTTCTTCTTCTTCTT
ACCGAAATTGCCT

QA 1 733 1 733
DS 

RD RS1AX55TF 783 0 0
GGTCCCAAGAATCTCATGACCTCTCTGAAATGATCACCAACTCTTGCTATCTCAT*CACA
ATGTCTTCTATGCAAAAGATACCATATTCTCCTAGAGCCTGTTCGATTATGTTGTTGTCG
GTAAGAGGAACAGGATTGCCTTCTATTATTGTGTATCCCTTTTTGAATATAAGATCCTTA
ACGCTCTTACCATTCGGGTACCCATAAGTGACGTAAGGCTGCACTTTGAGAAGCTTTTGA
AACAAACTATCAGTTGCTTTGGCAAATACACCAGTGAAAGTGCTCCTTAGTTGCATACTG
TTGAGGACCTTCTTGGTCTTTGGGTGCATATCATTCTTGCCTTGTATGCGAATGATGAAA
ACGAGGTTTGATTTTACTGGTGGAGGAGATGCTCTTGGCCTCTTCACCCTTTGCTTCATC
CGGATAAGATCTATTTCCTTAGCCCTGAACTCAAGCACAAAGTCTTCAGGTCGTTTGATA
TCAGCAACTTTCTTCTTCTTCTTACCGAAATTGCCTAACTCAAGTTGCTTCTTCCTGATA
AAGGCAAGCTCATCCCTGTTCTTTCTCTTCTTAAGTATAACCTCTGGTATGTAGTCCAAA
CCCTTATTAGCTTCTTCTACAGCCATCACCTTAGGTTCTTCTACAGCCATCACCTTAGCT
TCTTCTTCAGACATTACTACTATTATCTCTACTCTCTTTTCTCTC**GGTGGAGA***AG
CAATCGAACGGTGGCTGAAGAGATTCCGAGTTAATACGGCGGCAATGTCGTACTTTTGGT
TCC

QA 1 783 1 783
DS 

RD RS1C192TF 681 0 0
TCGATTATGTTGTTGTCGGTAAGAGGAACAGGATTGCCTTCTATTATTGTGTATCCCTTT
TTGAATATAAGATCCTTAACGCTCTTACCATTCGGGTACCCATAAGTGACGTAAGGCTGC
ACTTTGAGAAGCTTTTGAAACAAACCATCAGTTGCTTTGGCAAATACACCAGTGAAAGTG
CTCCTTAGTTGCATACTGTTGAGAACCTTCTTGGTCTTTGGGTGCATATCATTCTTGCCT
TGTATGCGAATGATGAAAACGAGGTTTGATTTTACTGGTGGAGGAGATGCTCTTGGCCTC
TTCACCCTTTGCTTCATCCGGATAAGATCTATTTCCTTAGCCCTGAACTCAAGCACAAAG
TCTTCAGGTCGTTTGATATCAGCAACTTTCTTCTTCTTCTTACCGAAATTGCCTAACTCA
AGTTGCTTCTTCCTGATAAAGGCAAGCTCATCCCTGTTCTTTCTCTTCTTAAGTATAACC
TCCGGTATGTAGTCCAAACCCTTATTAGCTTCTTCTACAGCCATCACCTTAGGTTCTTCC
ACAGCCATCACCTTAGCTTCTTCTTCAGCCATTACTA***TTATCTCTACTCTCTTTTCT
CTCTCGGTGGAGACGAAGCAATCGAACGGTGGCTGAAGAGATTCCAAGTTAATACGGCGG
CAATATCGTACTTTTGGTTC
C

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 5

CO CL1668Contig1 479 5 6 U
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ATTCTCAAATCAAGCACGCCGTGGTCGTTAAGGTCATGGGGAGAACTGGTTCTCGTGGTC
AGGTGACTCAGGTTAGAGTCAAGTTCACTGATTCGGACCGTTTTATCATGAGGAATGTGA
AAGGACCGGTGAGAGAAGGAGACATCCTAACTCTTCTCGAGTCCGAGAGAGAAGCCAGAA
GACTCCGTTGATTCCATATGCCCATTTCTCTCTGAAAGTGTTACCAATATTTACATTTTG
ATGATGCCCTCTTATGTTTATTGACCTTATGGTTGTTTTTTTTTTTT*GTCTAAGAAATA
CTCTGTTTTAATTACTCGAGTTTGCTAAGACAATGTTTGGATCTAGAAATGAATCTTTTT
CAAATACATGAAACTGTGGCAACATTTATCTTCTATCAGTATATGATCACTGTTTATTC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 5 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AW26TF U 1
AF RS1D143TF U 1
AF RS1DM65JQ C 1
AF RS1DM65TF U 1
AF RS1D143JQ C 53
BS 1 347 RS1AW26TF
BS 348 348 RS1D143TF
BS 349 391 RS1AW26TF
BS 392 404 RS1D143TF
BS 405 405 RS1DM65TF
BS 406 479 RS1D143TF

RD RS1AW26TF 392 0 0
GGAGGTTTTCTAGCAGAATCGATTTCGCCTAAGCTCCCGCCGCCTCCTTCTTCAGAATGG
ATTCTCAAATCAAGCACGCCGTGGTCGTTAAGGTCATGGGGAGAACTGGTTCTCGTGGTC
AGGTGACTCAGGTTAGAGTCAAGTTCACTGATTCGGACCGTTTTATCATGAGGAATGTGA
AAGGACCGGTGAGAGAAGGAGACATCCTAACTCTTCTCGAGTCCGAGAGAGAAGCCAGAA
GACTCCGTTGATTCCATATGCCCATTTCTCTCTGAAAGTGTTACCAATATTTACATTTTG
ATGATGCCCTCTTATGTTTATTGACCTTATGGTTGTTTTTTTTTTTTTGTCTAAGAAATA
CTCTGTTTTAATTACTCGAGTTTGCTAAGAC
C

QA 1 391 1 391
DS 

RD RS1D143TF 479 0 0
GGAGGTTTTCTAGCAGAATCGATTTCGCCTAAGCTCCCGCCGCCTCCTTCTTCAGAATGG
ATTCTCAAATCAAGCACGCCGTGGTCGTTAAGGTCATGGGGAGAACTGGTTCTCGTGGTC
AGGTGACTCAGGTTAGAGTCAAGTTCACTGATTCGGACCGTTTTATCATGAGGAATGTGA
AAGGACCGGTGAGAGAAGGAGACATCCTAACTCTTCTCGAGTCCGAGAGAGAAGCCAGAA
GACTCCGTTGATTCCATATGCCCATTTCTCTCTGAAAGTGTTACCAATATTTACATTTTG
ATGATGCCCTCCTATGTTTATTGACCTTATGGTTGTTTTTTTCTTT**GTCTAAGAAATA
CTCTGTTTTAATTACTCGAGTTTGCTAAGACAATGTTTGGATCTGGAAATGAATCTTTTT
CAAATACATGAAACTGTGGCAACATTTATCTTCTATCAGTATATGATCACTGTTTATTC

QA 1 479 1 479
DS 

RD RS1DM65JQ 421 0 0
GGAGGTTTTCTAGCAGAATCGATTTCGCCTAAGCTCCCGCCGCCTCCTTTTTCAGAATGG
ATTCTCAAATCAAGCACGCCGTGGTCGTTAAGGTCATGGGGAGAACTGGTTCTCGTGGTC
AGGTGACTCAGGTTAGAGTCAAGTTCACTGATTCGGACCGTTTTATCATGAGGAATGTGA
AAGGACCGGTGAGAGAAGGAGACATCCTAACTCTTCTCGAGTCCGAGAGAGAAGCCAGAA
GACTCCGTTGATTCCATATGCCCATTTCTCTCTGAAAGTGTTACCAATATTTACATTTTG
ATGATGCCCTCTTATGTTTATTGACCTTATGGTTGTTTTTTTTTTTT*GTTTAAGAAATA
CTCTGTTTTAATTACTCGAGTTTGCTAAGACAATGTTTGGATCTAGAAATGAATCTTTTT
C

QA 1 421 1 421
DS 

RD RS1DM65TF 421 0 0
GGAGGTTTTCTAGCAGAATCGATTTCGCCTAAGCTCCCGCCGCCTCCTTCTTCAGAATGG
ATTCTCAAATCAAGCACGCCGTGGTCGTTAAGGTCATGGGGAGAACTGGTTCTCGTGGTC
AGGTGACTCAGGTTAGAGTCAAGTTCACTGATTCGGACCGTTTTATCATGAGGAATGTGA
AAGGACCGGTGAGAGAAGGAGACATCCTAACTCTTCTCGAGTCCGAGAGAGAAGCCAGAA
GACTCCGTTGATTCCATATGCCCATTTCTCTCTGAAAGTGTTACCAATATTTACATTTTG
ATGATGCCCTCTTATGTTTATTGACCTTATGGTTGTTTTTTTTTTTT*GTCTAAGAAATA
CTCTGTTTTAATTACTCGAGTTTGCTAAGACAATGTTTGGATCTAGAAATGAATCTTTTT
C

QA 1 421 1 421
DS 

RD RS1D143JQ 427 0 0
CAGAATGGATTCTCAAATCAAGCACGCCGTGGTCGTTAAGGTCATGGGGAGAACTGGTTC
TCGTGGTCAGGTGACTCAGGTTAGAGTCAAGTTCACTGATTCGGACCGTTTTATCATGAG
GAATGTGAAAGGACCGGTGAGAGAAGGAGACATCCTAACTCTTCTCGAGTCCGAGAGAGA
AGCCAGAAGACTCCGTTGATTCCATATGCCCATTTCTCTCTGAAAGTGTTACCAATATTT
ACATTTTGATGATGCCCTCCTATGTTTATTGACCTTATGGTTGTTTTTTTCTTT**GTCT
AAGAAATACTCTGTTTTAATTACTCGAGTTTGCTAAGACAATGTTTGGATCTGGAAATGA
ATCTTTTTCAAATACATGAAACTGTGGCAACATTTATCTTCTATCAGTATATGATCACTG
TTTATTC

QA 1 427 1 427
DS 



AS 1 5

CO CL1669Contig1 505 5 3 U
GGATCTCACAAAGTAACAAAAAAATTATTTGCAAAGAACAAATACAATGTCAACATCTAG
ATTTACTTTATTTTGTATTGTCCTGGTTTTACTTGGTAGTTTTCATGAAGATGCTAACTT
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ACGCCGTCTTTAAAATTTCCAGAAGAAAAATTCTCTAATTATATATTTCAAATAATTATG
TACTTCTATTATTCTAATTAAGTAATAAATAGCAAATCCTGCTATACAGGAACAACTAGT
GTTGTCTGCTAAAAGACTTTTATATATTTCTTTGAATCGCTCAATTTTTTTTCTTTGGTT
TCTGTCTTACTTTCTGAAAGTGTATTTAATAAATCTATATATGTTTTAGATAAAAAGAAT
AAAATCATAATTAAGTGTTTATTAT


BQ
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RS1GT47TF U 1
AF RS1GY39TF U 1
AF RS1F559TF U 1
AF RS1GY75JQ C 1
AF RS1GY75TF U 1
BS 1 397 RS1F559TF
BS 398 398 RS1GY75TF
BS 399 505 RS1F559TF

RD RS1GT47TF 402 0 0
GGATCTCACAAATTAACAAAAAAATTATTTGCAAAGAACAAATACAATGTCAACATCTAG
ATTTACTTTATTTTGTATTGTCCTGGTTTTACTTGGTAGTTTTCATGAAGATGCTAACTT
AAAAGTTGATGCGCGGGGACCATATTGCTATAGAGAAAATGATTCTAGATGGTGCTGTAC
CGCAAAACCAAAACAGTGCCGAAGCATCAAAGTGGATTGTGACGCGATTTGTAAACCCAA
ACGCCGTCTTTAAAATTTCCAGAAGAAAAATTCTCTAATTATATATTTCAAATAATTATG
TACTTCTATTATTCTAATTAAGTAATAAATAGCAAATCCTGCTATACAGGAACAACTAGT
GTTGTCTGCTAAAAGACTTTTATATATTTCTTTGAATTGCTC

QA 1 402 1 402
DS 

RD RS1GY39TF 420 0 0
GGATCTCACAAAGTAACAAAAAAATTATTTGCAAAGAACAAATACAATGTCAACATCTAG
ATTTACTTTATTTTGTATTGTCCTGGTTTTACTTGGTAGTTTTCATGAAGATGCTAACTT
AAAAGTTGATGCGCGGGGACCATATTGCTATAGAGAAAATGATTCTAGATGGTGCTGTAC
CGCAAAACCAAAACAGTGCCGAAGCATCAAAGTGGATTGTGACGCGATTTGTAAACCCAA
ACGCCGTCTTTAAAATTTCCAGAAGAAAAATTCTCTAATTATATATTTCAAATAATTATG
TACTTCTATTATTCTAATTAAGTAATAAATAGCAAATCCTGCTATACAGGAACAACTAGT
GTTGTCTGCTAAAAGACTTTTATATATTTCTTTGAATTGCTCAATTTTTTTTCTTTGGTT

QA 1 420 1 420
DS 

RD RS1F559TF 505 0 0
GGATCTCACAAAGTAACAAAAAAATTATTTGCAAAGAACAAATACAATGTCAACATCTAG
ATTTACTTTATTTTGTATTGTCCTGGTTTTACTTGGTAGTTTTCATGAAGATGCTAACTT
AAAAGTTGATGCGCGGGGACCATATTGCTATAGAGAAAATGATTCTAGATGGTGCTGTAC
CGCAAAACCAAAACAGTGCCGAAGCATCAAAGTGGATTGTGACGCGATTTGTAAACCCAA
ACGCCGTCTTTAAAATTTCCAGAAGAAAAATTCTCTAATTATATATTTCAAATAATTATG
TACTTCTATTATTCTAATTAAGTAATAAATAGCAAATCCTGCTATACAGGAACAACTAGT
GTTGTCTGCTAAAAGACTTTTATATATTTCTTTGAATTGCTCAATTTTTTTTCTTTGGTT
TCTGTCTTACTTTCTGAAAGTGTATTTAATAAATCTATATATGTTTTAGATAAAAAGAAT
AAAATCATAATTAAGTGTTTATTAT

QA 1 505 1 505
DS 

RD RS1GY75JQ 503 0 0
GGATCTCACAAAGTAACAAAAAAATTATTTGCAAAGAACAAATACAATGTCAACATCTAG
ATTTACTTTATTTTGTATTGTCCTGGTTTTACTTGGTAGTTTTCATGAAGATGCTAACTT
AAAAGTTGATGCGCGGGGACCATATTGCTATAGAGAAAATGATTCTAGATGGTGCTGTAC
CGCAAAACCAAAACAGTGCCGAAGCATCAAAGTGGATTGTGACGCGATTTGTAAACCCAA
ACGCCGTCTTTAAAATTTCCAGAAGAAAAATTCTCTAATTATATATTTCAAATAATTATG
TGCTTCTATTATTCTAATTAAGTAATAAATAGCAAATCCTGCTATACAGGAACAACTAGT
GTTGTCTGCTAAAAGACTTTTATATATTTCTTTGAATCGCTCAATTTTTTTTCTTTGGTT
TCTGTCTTACTTTCTGAAAGTGTATTTAATAAATCTATATATGTTTTAGATAAAAAGAAT
AAAATCATAATTAAGTGTTTA
CC

QA 1 501 1 501
DS 

RD RS1GY75TF 503 0 0
GGATCTCACAAAGTAACAAAAAAATTATTTGCAAAGAACAAATACAATGTCAACATCTAG
ATTTACTTTATTTTGTATTGTCCTGGTTTTACTTGGTAGTTTTCATGAAGATGCTAACTT
AAAAGTTGATGCGCGGGGACCATATTGCTATAGAGAAAATGATTCTAGATGGTGCTGTAC
CGCAAAACCAAAACAGTGCCGAAGCATCAAAGTGGATTGTGACGCGATTTGTAAACCCAA
ACGCCGTCTTTAAAATTTCCAGAAGAAAAATTCTCTAATTATATATTTCAAATAATTATG
TGCTTCTATTATTCTAATTAAGTAATAAATAGCAAATCCTGCTATACAGGAACAACTAGT
GTTGTCTGCTAAAAGACTTTTATATATTTCTTTGAATCGCTCAATTTTTTTTCTTTGGTT
TCTGTCTTACTTTCTGAAAGTGTATTTAATAAATCTATATATGTTTTAGATAAAAAGAAT
AAAATCATAATTAAGTGTTTA
CC

QA 1 501 1 501
DS 



AS 1 5

CO CL1670Contig1 1147 5 24 U
TAATAGTTGACAATAGCTCTGATGATGACTTCTTACAAATTGATTTCAATGTCAGCTTTC
CTGCTCTCTCATGTGAATTTGCATCTGTTGATGTAAGCGACGTGTTGTCAACTAACAGGT
TGAACCTAACGAAAGAAATAAAGAAAGTTCCAATCGATCCGCATTTAAGAGAAACTGGGG
AGGAGTACCACCCCACCCCTAACTTAGATCTCATCCACCATGGAGACGAACATCAGGTCG
ACGACAATGCTTATGCTGCTATATCTTCCACAACGGTAGTGATCTTAGGGACGATCATGG
GCACCAAGAACATGATTCTTACCATGGAAATCGGGACACAGAGAGCTTAGTCAAGATGGT
GGACGAACTGCTCAGACCTATCAAGAAGTTTGATGGTACACCTAATCATGCGGCTTCAAG
TATTAGAAAGGCACCAGTTAGTGGAGGCTGTAGAATCGAAGGCTATGTGCGTGCCAAGAA
GGTTCCTGGTGAACTCGTTATCTCAGCTGTTTCAGGGGCTCATTCATTCGATGCTTCTCG
AATGAACATGACACATTTTGTAAACCATCTATCGTTTGGTAGGATGATTTCAGCTAGGTT
GTTGACTGATATGAAACGGTTACTGCCTTATCTTGGTCTAAGCCATGACAGGCTTAATGG
AAAATGGTTCGTTAATGAAGGAAAGTTTGCTGCTAATGTTACTATCGAACATTATCTTCA
AGTAGTAAAAACAGAAGTCGTTTCAAGAAGGTTCGGTCAAGAATACTTAGTGATTGAGGA
ATATGAATATACAGCTCATAGCAGTGTGGCTCATGGTTACTATTACCCTGTTGCAAAGTT
TCACTTCGACCTCTCTCCTATGCAGGTCATGATAAGCGAGAACCCAAAGTCATTCTCACA
CTTCGTCACAAATGTTTGCGCCATAATAGGTGGTGTTTTCACGGTTGCCGGGATACTAGA
TTCGATATTTCAAAGCACTTACGGAATAATGAAAAAGGTCGAACTAGGGAAGAACTTTTA
AAAGGGAGGAGTGAGTGATTACAAGTTGAATTTTTCAGTTTTATTTTT*ATGTCTACAAA
ACCATACAAGAAGATCTCGGTTCTTAAATAATTTGTAGACTGTTTGTTTTGGAATAAAAG
TTCCAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

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TGAACCTAACGAAAGAAATAAAGAAAGTTCCAATCGATCCGCATTTAAGAGAAACTGGGG
AGGAGTACCACCCCACCCCTAACTTAGATCTCATCCACCATGGAGACGAACATCAGGTCG
ACGACAATGCTTATGCTGCTATATCTTCCACAACGGTAGTGATCTTAGGGACGATCATGG
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TATTAGAAAGGCACCAGTTAGTGGAGGCTGTAGAATCGAAGGCTATGTGCGTGCCAAGAA
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AATGAACATGACACATTTTGTAAACCATCTATCGTTTGGTAG*ATGATTTCAGCTAG*TT
GTTGACTGATATGAAACGGTTACTGCCTTATCTTGGTCTA
GCCAT

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GAATACTCAGTGATTGAGGAATATGAATATACAGCTCATAGCAGTGTGGCTCATGGTTAC
TATTACCCTGTTGCAAAGTT*CACTTCGACCTCTCTCCTATGCAGGTCATGATAAGCGAG

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DS 

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GT
CCTAATCATGCGGCTTCAAGTATTAGAAAGGCACCAGTTAGTGGAGGCTGTAGAATCGAA
GGCTATGTGCGTGCCAAGAAGGTTCCTGGTGAACTCGTTATCTCAGCTGTTTCAGGGGCT
CATTCATTCGATGCTTCTCGAATGAACATGACACATTTTGTAAACCATCTATCGTTTGGT
AGGATGATTTCAGCTAGGTTGTTGACTGATATGAAACGGTTACTGCCTTATCTTGGTCTA
AGCCATGACAGGCTTAATGGAAAATGATTCGTTAATGAAGGAAAGTTTGCTGCTAATGTT
ACTATCGAACATTATCTTCAAGTAGTAAAAACAGAAGTCGTTTCAAGAAGGTTCGGTCAA
GAATACTCAGTGATTGAGGAATATGAATATACAGCTCATAGCAGTGTGGCTCATGGTTAC
TATTACCCTGTTGCAAAGTTTCACTTCGACCTCTCTCCTATGCAGGTCATGATAAGCGAG
AACCCAAAGTCATTCTCGCACTTCGTTACAAATGTTTGCGCCATAATAGGTGGTGTTTTC
ACGGTTGCCGGGATACTAGATTCGATATTTCAAAGCACTTACGGAATAATGAAAAAGGTC
GAACTAGGGAAGAACTTTTGAAAGGGAGGAGTGAGTGATTACAAGTTGAATTTTTCAGTT
TTATTTTT*ATGTCTACAAA
CCATACAA

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TGACACATTTTGTAAACCATCTATCGTTTGGTAGGATGATTTCAGCTAGGTTGTTGACTG
ATATGAAACGGTTACTGCCTTATCTTGGTCTAAGCCATGACAGGCTTAATGGAAAATGGT
TCGTTAATGAAGGAAAGTTTGCTGCTAATGTTACTATCGAACATTATCTTCAAGTAGTAA
AAACAGAAGTCGTTTCAAGAAGGTTCGGTCAAGAATACTTAGTGATTGAGGAATATGAAT
ATACAGCTCATAGCAGTGTGGCTCATGGTTACTATTACCCTGTTGCAAAGTTTCACTTCG
ACCTCTCTCCTATGCAGGTCATGATAAGCGAGAACCCAAAGTCATTCTCACACTTCGTCA
CAAATGTTTGCGCCATAATAGGTGGTGTTTTCACGGTTGCCGGGATACTAGATTCGATAT
TTCAAAGCACTTACGGAATAATGAAAAAGGTCGAACTAGGGAAGAACTTTTAAAAGGGAG
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*GAAGATCTCGGTTC

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DS 

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ACCAGTTAGTGGAGGCTGTAGAATCGAAGGCTATGTGCGTGCCAAGAAGGTTCCTGGTGA
ACTCGTTATCTCAGCTGTTTCAGGGGCTCATTCATTCGATGCTTCTCGAATGAACATGAC
ACATTTTGTAAACCATCTATCGTTTGGTAGGATGATTTCAGCTAGGTTGTTGACTGATAT
GAAACGGTTACTGCCTTATCTTGGTTTAAGCCATGACAGGCTTAATGGAAAATGGTTCGT
TAATGAAGGAAAGTTTGCTGCTAATGTTACTATCGAACATTATCTTCAAGTAGTAAAAAC
AGAAGTCGTTTCAAGAAGGTTCGGTCAAGAATACTTAGTGATTGAGGAATATGAATATAC
AGCTCATAGCAGTGTGGCTCATGGTTACTATTACCCTGTTGCAAAGTTTCACTTCGACCT
CTCTCCTATGCAGGTCATGATAAGCGAGAACCCAAAGTCATTCTCACACTTCGTCACAAA
TGTTTGCGCCATAATAGGTGGTGTTTTCACGGTTGCCGGGATACTAGATTCGATATTTCA
AAGCACTTACGGAATAATGAAAAAGGTCGAACTAGGGAAGAACTTTTAAAAGGGAGGAGT
GAGTGATTACAAGTTGAATTTTTCAGTTTTATTTTTTATGTCTACAAAACCATACAAGAA
GATCTCGGTTCTTAAATAATTTGTAGACTGTTTGTTTTGGAATAAAAGTTCCAAA

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 5

CO CL1671Contig1 894 5 11 U
GGAGATCACAAACCCAAAATACAAGCTAGAACAAACTATAACAATCATGGCGTGTCACAA
AATTTTCCTTGTAATCTCTGTGATGCTCGCTGCCTCATCATTGGTCAAGGCAGTTGACTT
CGCGGTAGTCGACAACACAGGCGACTCAGCTGGCGGAAGAAAATTTCGCGAAGAGATCGG
TGGCGAAAGCTACGGCACACAGTCACTAAGATCTGCCACGGACTTCGTCTGGGGTTTGTT
CCAGCAAACCGGCAACCCTTCGGACAGAAGAACCGTTACAAAGATCACTCTGTTCATGGA
GAACGGGAACGACGTGGCGTACAACACCAACTCAGGAAGCGAGATACACTTCAACGCGGG
GTATCTCGCGGGTTTCTCGGGAGATGTGAAGAGGGAATTTACCGGCGTGATTTATCACGA
GGTGGTTCATTCTTGGCAGTGGAACGGTCCAGGTGGCCTTATCGAAGGTATAGCGGACTA
TGTGAGGCTGAAAGCGGGTTATGCACCGGGTCACTGGGTAGGGCCCGGTGGTGGTGATAG
GTGGGATCAGGGTTATGACGTCACTGCGAGGTTCTTGGACTATTGTAACGATCTTCGGAA
TGGGTTTGTGGCGGAGCTGAATAAGAAGATGAGGAATGGCTACAGTGACAGCTTCTTTGT
TGATCTGCTCGGGAAAGACGTGAACCAACTCTGGACAGAGTATAAGGCCGAGTATGGTGG
GTAAATAGTTAAACACAAATTATAAAAGATAATCGTACGCGTGTGACATGCTATTCAAAA
AGTGAGACGTCTAAAAAACATATCAGCATC**TAGTAATTTGTATTCTGTTATGAATTTG
TAAGTTCGAATAAAACAACAGATATACATATATACTGTTGTGTAATTTGAAGCC


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1AT06TF U 1
AF RS1D250TF U 6
AF RS1CD81JQ C 78
AF RS1GW36TF U 239
AF RS1D250JQ C 159
BS 1 251 RS1AT06TF
BS 252 252 RS1D250TF
BS 253 706 RS1AT06TF
BS 707 707 RS1GW36TF
BS 708 718 RS1AT06TF
BS 719 769 RS1GW36TF
BS 770 770 RS1CD81JQ
BS 771 809 RS1GW36TF
BS 810 812 RS1CD81JQ
BS 813 849 RS1GW36TF
BS 850 894 RS1CD81JQ

RD RS1AT06TF 718 0 0
GGAGATCACAAACCCAAAATACAAGCTAGAACAAACTATAACAATCATGGCGTGTCACAA
AATTTTCCTTGTAATCTCTGTGATGCTCGCTGCCTCATCATTGGTCAAGGCAGTTGACTT
CGCGGTAGTCGACAACACAGGCGACTCAGCTGGCGGAAGAAAATTTCGCGAAGAGATCGG
TGGCGAAAGCTACGGCACACAGTCACTAAGATCTGCCACGGACTTCGTCTGGGGTTTGTT
CCAGCAAACCGACAACCCTTCGGACAGAAGAACCGTTACAAAGATCACTCTGTTCATGGA
GAACGGGAACGACGTGGCGTACAACACCAACTCAGGAAGCGAGATACACTTCAACGCGGG
GTATCTCGCGGGTTTCTCGGGAGATGTGAAGAGGGAATTTACCGGCGTGATTTATCACGA
GGTGGTTCATTCTTGGCAGTGGAACGGTCCAGGTGGCCTTATCGAAGGTATAGCGGACTA
TGTGAGGCTGAAAGCGGGTTATGCACCGGGTCACTGGGTAGGGCCCGGTGGTGGTGATAG
GTGGGATCAGGGTTATGACGTCACTGCGAGGTTCTTGGACTATTGTAACGATCTTCGGAA
TGGGTTTGTGGCGGAGCTGAATAAGAAGATGAGGAATGGCTACAGTGACAGCTTCTTTGT
TGATCTGCTCGGGAAAGACGTGAACCAACTCTGGACAGAGTATAAG*CCGAGTATGGT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1D250TF 696 0 0
GG
ACAAACCCAAAATACAAGCTAGAACAAACTATAACAATCATGGCGTGTCACAAAATTTTC
CTTGTAATCTCTGTGATGCTCGCTGCCTCATCATTGGTCAAGGCAGTTGACTTCGCGGTA
GTCGACAACACAGGCGACTCAGCTGGCGGAAGAAAATTTCGCGAAGAGATCGGTGGCGAA
AGCTACGGCACACAGTCACTAAGATCTGCCACGGACTTCGTCTGGGGTTTGTTCCAGCAA
ACCGGCAACCCTTCGGACAGAAGAACCGTTACAAAGATCACTCTGTTCATGGAGAACGGG
AACGACGTGGCGTACAACACCAACTCAGGAAGCGAGATACACTTCAACGCGGGGTATCTC
GCGGGTTTCTCGGGAGATGTGAAGAGGGAATTTACCGGCGTGATTTATCACGAGGTGGTT
CATTCTTGGCAGTGGAACGGTCCAGGTGGCCTTATCGAAGGTATAGCGGACTATGTGAGG
CTGAAAGCGGGTTATGCACCGGGTCACTGGGTAGGGCCCGGTGGTGGTGATAGGTGGGAT
CAGGGTTATGACGTCACTGCGAGGTTCTTGGACTATTGTAACGATCTTCGGAATGGGTTT
GTGGCGGAGCTGAATAAGAAGATGAGGAATGGCTACAGTGACAGCTTCTTTGTTGATCTG
CTCGGGAAAGACGTGAACCAACTCTGGACAGAGT

QA 3 696 3 696
DS 

RD RS1CD81JQ 817 0 0
CTGTGATGCTCGCTGCCTCATCATTGGTCAAGGCAGTTGACTTCGCGGTAGTCGACAACA
CAGGCGACTCAGCTGGCGGAAGAAAATTTCGCGAAGAGATCGGTGGCGAAAGCTACGGCA
CACAGTCACTAAGATCTGCCACGGACTTCGTCTGGGGTTTGTTCCAGCAAACCGGCAACC
CTTCGGACAGAAGAACCGTTACAAAGATCACTCTGTTCATGGAGAACGGGAACGACGTGG
CGTACAACACCAACTCAGGAAGCGAGATACACTTCAACGCGGGGTATCTCGCGGGTTTCT
CGGGAGATGTGAAGAGGGAATTTACCGGCGTGATTTATCACGAGGTGGTTCATTCTTGGC
AGTGGAACGGTCCAGGTGGCCTTATCGAAGGTATAGCGGACTATGTGAGGCTGAAAGCGG
GTTATGCACCGGGTCACTGGGTAGGGCCCGGTGGTGGTGATAGGTGGGATCAGGGTTATG
ACGTCACTGCGAGGTTCTTGGACTATTGTAACGATCTTCGGAATGGGTTTGTGGCGGAGC
TGAATAAGAAGATGAGGAATGGCTACAGTGACAGCTTCTTTGTTGATCTGCTCGGGAAAG
ACGTGAACCAACTCTGGACAGAGTATAAGGCCGAGTATGGTGGGTAAATAGTTAAACACA
AATTATAAAAGATAATCGTACGCGTGTGACATGCTATTCAAAAAGTGAGACGTCTAAAAA
ACATATCAGCATC**TAGTAATTTGTATTCTGTTATGAATTTGTAAGTTCGAATAAAACA
ACAGATATACATATATACTGTTGTGTAATTTGAAGCC

QA 1 817 1 817
DS 

RD RS1GW36TF 611 0 0
G
TCCAGCAAACCGACGACCCTTCGGACAGAAGAACCGTTACAAAGATCACTCTGTTCATGG
AGAACGGGAACGACGTGGCGTACAACACCAACTCAGGAAGCGAGATACACTTCAACGCGG
GGTATCTCGCGGGTTTCTCGGGAGATGTGAAGAGGGAATTTACCGGCGTGATTTATCACG
AGGTGGTTCATTCTTGGCAGTGGAACGGTCCAGGTGGCCTTATCGAAGGTATAGCGGACT
ATGTGAGGCTGAAAGCGGGTTATGCACCGGGTCACTGGGTAGGGCCCGGTGGTGGTGATA
GGTGGGATCAGGGTTATGACGTCACTGCGAGGTTCTTGGACTATTGTAACGATCTTCGGA
ATGGGTTTGTGGCGGAGCTGAATAAGAAGATGAGGAATGGCTACAGTGACAGCTTCTTTG
TTGATCTGCTCGGGAAAGACGTGAACCAACTCTGGACAGAGTATAAGGCCGAGTATGGTG
GGTAAATAGTTAAACACAAATTATAAAAGATAATCGTACGCGTGTGACAT*CTATTCAAA
AAGTGAGACGTCTAAAAAACATATCAGCATATGTAGTAATTTGTATTCTGTTATGAATTT
GTAAGTTCGA

QA 2 611 2 611
DS 

RD RS1D250JQ 736 0 0
GAAAATTTCGCGAAGAGATCGGTGGCGAAAGCTACGGCACACAGTCACTAAGATCTGCCA
CGGACTTCGTCTGGGGTTTGTTCCAGCAAACCGGCAACCCTTCGGACAGAAGAACCGTTA
CAAAGATCACTCTGTTCATGGAGAACGGGAACGACGTGGCGTACAACACCAACTCAGGAA
GCGAGATACACTTCAACGCGGGGTATCTCGCGGGTTTCTCGGGAGATGTGAAGAGGGAAT
TTACCGGCGTGATTTATCACGAGGTGGTTCATTCTTGGCAGTGGAACGGTCCAGGTGGCC
TTATCGAAGGTATAGCGGACTATGTGAGGCTGAAAGCGGGTTATGCACCGGGTCACTGGG
TAGGGCCCGGTGGTGGTGATAGGTGGGATCAGGGTTATGACGTCACTGCGAGGTTCTTGG
ACTATTGTAACGATCTTCGGAATGGGTTTGTGGCGGAGCTGAATAAGAAGATGAGGAATG
GCTACAGTGACAGCTTCTTTGTTGATCTGCTCGGGAAAGACGTGAACCAACTCTGGACAG
AGTATAAGGCCGAGTATGGTGGGTAAATAGTTAAACACAAATTATAAAAGATAATCGTAC
GCGTGTGACATGCTATTCAAAAAGTGAGACGTCTAAAAAACATATCAGCATC**TAGTAA
TTTGTATTCTGTTATGAATTTGTAAGTTCGAATAAAACAACAGATATACATATATACTGT
TGTGTAATTTGAAGCC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 2 5

CO CL1672Contig1 852 3 18 U
GGACATTTTCTTTACACTGAACCATCACTCCGAGAGTGCGCTTCACACAACAAACAAACA
AACAAACAAACAAAAAAAATGGCTAGACAATTTGCCATTGTTGCGATCTGCATCGTCCTC
ATCGCCGGCGTCGGAGGCCAAGCTCCGTCGTCACCACCAACCACAACACCAGCACCACCC
ACTACAACAACTCCACCACCAGCAGCGACCCCTCCTCCCGTCTCAGCTCCTCCACCAGTC
ACAACTTCTCCTCCTCCAGCCACTCCTCCTCCGGTCGCAACTCCTCC***AGTCGCAACT
CCTCCCCCCGTCGCAACTCCTCCTCCAGCAACTCCCCCTCCCGTCGCATCTCCTCCTCCA
GCAACTCCTCCACCCGTCGCAACTCCTCCTCCAGCAACCCCTCCTCCAGCTCCTCTTGCA
TCTCCTCCAGCTCAGGTTCCAGCTCTTGCTCCTACTAAGCCAGACGCTCCTACTGTATCT
CCCTCGTCTAGCCCTCCTTCCCCAGCGACTGATGGTCCTGGACCAAGCACCAGTGAGCTC
TCTCCAGGACCTTCCACAGGTCCCAATGACCAGAGTGGAGCAAGCAAGACGGTTTCAAGC
TTGGTACTTGGATCTGTTCTCGTTTGGTTTATGATCTAAGCGCGGGAGCCTTTCGCTCGG
CGTTCCTTGCATTTATTTTCATGTTGATGTTTGTTTGTTCCATTGTTATTATACTTTCGG
AACCGTATTCTTTTGGATTATTATCTTTTGGAGAGGATATTGTTGAGATGGAGATATCAG
GATATTTCGTTTGGAGATAATTTGTGGCTTTCCTTCTCATTCTATTTGATTATTAGTGTA
CTACATTGCTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B313TF U 1
AF RS1GN20TF U 1
AF RS1GN20JQ C 150
BS 1 70 RS1B313TF
BS 71 76 RS1GN20TF
BS 77 86 RS1B313TF
BS 87 87 RS1GN20TF
BS 88 164 RS1B313TF
BS 165 165 RS1GN20TF
BS 166 209 RS1B313TF
BS 210 210 RS1GN20TF
BS 211 218 RS1B313TF
BS 219 219 RS1GN20TF
BS 220 287 RS1B313TF
BS 288 290 RS1GN20TF
BS 291 398 RS1B313TF
BS 399 399 RS1GN20TF
BS 400 482 RS1B313TF
BS 483 483 RS1GN20TF
BS 484 555 RS1B313TF
BS 556 852 RS1GN20JQ

RD RS1B313TF 555 0 0
GGACATTTTCTTTACACTGAACCATCACTCCGAGAGTGCGCTTCACACAACAAACAAACA
AACAAACAAA******AAATGGCTAGGCAATTTGCCATTGTTGCGATCTGCATCGTCCTC
ATCGCCGGCGTCGGAGGCCAAGCTCCGTCGTCACCACCAACCACCACACCAGCACCACCC
ACTACAACAACTCCACCACCAGCAGCGACTCCTCCTCCTGTCTCAGCTCCTCCACCAGTC
ACAACTTCTCCTCCTCCAGCCACTCCTCCTCCGGTCGCAACTCCTCCTCCAGTCGCAACT
CCTCCCCCCGTCGCAACTCCTCCTCCAGCAACTCCCCCTCCCGTCGCATCTCCTCCTCCA
GCAACTCCTCCACCCGTCGCAACTCCTCCTCCAGCAACGCCTCCTCCAGCTCCTCTTGCA
TCTCCTCCAGCTCAGGTTCCAGCTCTTGCTCCTACTAAGCCAGACGCTCCTACTGTATCT
CCGTCGTCTAGCCCTCCTTCCCCAGCGACTGATGGTCCTGGACCAAGCACCAGTGAGCTC
TCTCCAGGACCTTCC

QA 1 555 1 555
DS 

RD RS1GN20TF 555 0 0
GGACATTTTCTTTACACTGAACCATCACTCCGAGAGTGCGCTTCACACAATAAACAAACA
AACAAACAAACAAAAAAAATGGCTAGACAATTTGCCATTGTTGCGATCTGCATCGTCCTC
ATCGCCGGCGTCGGAGGTCAAGCTCCGTCGTCACCACCAACCACAACACCAGCACCACCC
ACTACAACAACTCCACCACCAGCAGCGACCCCTCCTCCCGTCTCAGCTCCTCCACCAGTC
ACAACTTCTCCTCCTCCAGCCACTCCTCCTCCGGTCGCAACTCCTCC***AGTCGCAACT
CCTCCCCCCGTCGCAACTCCTCCTCCAGCAACTCCCCCTCCCGTCGCATCTCCTCCTCCA
GCAACTCCTCCACCCGTCGCAACTCCTCCTCCAGCAACCCCTCCTCCAGCTCCTCTTGCA
TCTCCTCCAGCTCAGGTTCCAGCTCTTGCTCCTACTAAGCCAGACGCTCCTACTGTATCT
CCCTCGTCTAGCCCTCCTTCCCCAGCGACTGATGGTCCTGGACCAAGCACCAGTGAGCTC
TCTCCAGGACCTTCC

QA 1 555 1 555
DS 

RD RS1GN20JQ 703 0 0
GTCACCACCAACCACAACACCAGCACCACCCACTACAACAACTCCACCACCAGCAGCGAC
CCCTCCTCCCGTCTCAGCTCCTCCACCAGTCACAACTTCTCCTCCTCCAGCCACTCCTCC
TCCGGTCGCAACTCCTCC***AGTCGCAACTCCTCCCCCCGTCGCAACTCCTCCTCCAGC
AACTCCCCCTCCCGTCGCATTTCCTCCTCCAGCAACTCCTCCACCCGTCGCAACTCCTCC
TCCAGCAACCCCTCCTCCAGCTCCTCTTGCATCTCCTCCAGCTCAGGTTCCAGCTCTTGC
TCCTACTAAGCCAGACGCTCCTACTGTATCTCCCTCGTCTAGCCCTCCTTCCCCAGCGAC
TGATGGTCCTGGACCAAGCACCAGTGAGCTCTCTCCAGGACCTTCCACAGGTCCCAATGA
CCAGAGTGGAGCAAGCAAGACGGTTTCAAGCTTGGTACTTGGATCTGTTCTCGTTTGGTT
TATGATCTAAGCGCGGGAGCCTTTCGCTCGGCGTTCCTTGCATTTATTTTCATGTTGATG
TTTGTTTGTTCCATTGTTATTATACTTTCGGAACCGTATTCTTTTGGATTATTATCTTTT
GGAGAGGATATTGTTGAGATGGAGATATCAGGATATTTCGTTTGGAGATAATTTGTGGCT
TTCCTTCTCATTCTATTTGATTATTAGTGTACTACATTGCTTT

QA 1 703 1 703
DS 



CO CL1672Contig2 408 2 2 U
GAAGAAAGCAATGTAGTACACTAATAATCAAATAAAATGAAAAGGAAAGCCACAAATTAT
CTCCAAACGAAATATCCCGATATCTCCATCTCAACTCTCAATAATATCCTCTCCAAAAAA
TAATAATCCAAAAAAATACGGTTCCCAAAGTATAATAACAATGGAACAAACAAACATCAA
CATGAAAATAAATGCAAAGGAACACCGAGCGAAAGTCTCCCGCGCTTAAATCATAAACCA
AACGAGAACAGATCCAAGTACCAAGCTTGAAACCGTCTTGCTTGCTCCACTCTGGTCATT
GGGACCTGTGGAAGGTCCTGGAAAAAGCTCACTGGTGCTTGGTCCAGGACCATCAGTCCC
TGGGGAAGGAGGGCTAAACAACGGAAATACAGTAGGAGCGTCTGGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
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AF RS1C801TF C 1
AF RS1B313JQ U 18
BS 1 17 RS1C801TF
BS 18 408 RS1B313JQ

RD RS1C801TF 182 0 0
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CA

QA 1 182 1 182
DS 

RD RS1B313JQ 391 0 0
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CGATATCTCCATCTCAACTCTCAATAATATCCTCTCCAAAAAATAATAATCCAAAAAAAT
ACGGTTCCCAAAGTATAATAACAATGGAACAAACAAACATCAACATGAAAATAAATGCAA
AGGAACACCGAGCGAAAGTCTCCCGCGCTTAAATCATAAACCAAACGAGAACAGATCCAA
GTACCAAGCTTGAAACCGTCTTGCTTGCTCCACTCTGGTCATTGGGACCTGTGGAAGGTC
CTGGAAAAAGCTCACTGGTGCTTGGTCCAGGACCATCAGTCCCTGGGGAAGGAGGGCTAA
ACAACGGAAATACAGTAGGAGCGTCTGGCTT

QA 1 391 1 391
DS 



AS 1 5

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CAAAACGGCGCTAAAGCTGCTGGATCCGTCGTCAACAAGCAGGTGAAGAAGCTTGCGTCG
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BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
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AF RS1D280TF U 5
AF RS1EP31TF U 1
AF RS1BW76TF U 349
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GG
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T

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CAAAACGGCGCTAAAGCTGCTGGATCCGTCGTCAACAAGCAGGTGAAGAAGCTTGCGTCG
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AATGCGTTCAAGACAAGGGCCATTCAGGTGAAGGAAGGTCTGGAGGGAGCTGTTCCTGAC
GTCACCGTGACGCTCAACCC*TGAAAAGCCAAGGCGCGGTTGCTTTGAGATCCGAGAGGA
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TGGCTTAGTTTGATCTGTTCTGTTTGTGGGATTAACTCGTATGTGTAA

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DS 

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AGGTGAAGGAAGGTCTGGAGGGAGCTGTTCCTGACGTCACCGTGACGCTCAACCC*TGAA
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TCC

QA 1 723 1 723
DS 

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*TGAAAAGCCAAGGCGCGGTTGCTTTGAGATCCGAGATGAAGGTGGTGAAACATTCATCA
GTCTTTTGGAGATGAAACGTCCATTT*GCTCCAATGAAGGCTCTTGATATGGAAGAAGTC
ATCGAGGACATCATTAAGAAGATCAAATGAGAGACATCTACAGAACTGCAAATAGGCTCT
TCTTTAGCCTAATCTGTCCCTTTT*GTTCCTACCAATCAGAATTATGTAGAAGACTTT*C
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TGTCTGG*TTGTTTTTGCATTGCATGATTGGCTTAGTTTGATCTGTTCTGTTTGTGGGAT
TAACTCGTATGTGTAAGGCTACTTTGATTCATCTCGTTGCT
CGT

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 5

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AAGCTCACTGGTCCAATCCCTCCCCAAATTGGACGACTGAGACGCCTGAAAGTACTAAAC
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CCTAAGCTGACATTCCTGTATCTTGATCACAACCAATTCACTGGGAGAATCCCAGACGCT
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TGACGAGGTAGAAGAATTCTAGGAGGAGGTTGTAGAGAAAAATGTCTCAGACCTACCTCC
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GAATAAACCAGTTATTAATGG


BQ
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5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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GTGGGTGACGATCCTTGCGGAGATGGAGACCTTCCTCCTTGGTCTGGTGCCACCTGTTCT
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CC

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GTTTCCCATCTCTCCGCAACCTGTACTTGAACAATAACTATTTGAGTGGAGGAATCCCTG
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ATATTGAAGGCAACATGTTCAAACAAGGCGTAAACCCAATTGGTACCCACAAAGTTCTTG
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CCTTAATCAAATTATAAGAATATGGATTGGAATAAACCAGTTATTAATGG

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DS 



AS 1 5

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TAACATCTCTCCTTTTTAATAAAATTGGGGATCCAAAACGAAAAAAAAA


BQ
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DS 



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BQ
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AGAAACTATGGCTTCATCTACTAAAACGGTTATGATCCCTATTGCTCACGGTACCGAGCC
TCTAGAAGCGGTGGCGATGATCACCGTCTTGCGGAGAGGTGGTGCTGATGTGACGGTGGC
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TCTTCTAGAGGGCAAAACAGCAACGGGTTACCCTGTTTTCATGGAGAAACTTGCGGCTAC
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AGCTGATGAAGTCTCTAAA*TCTTGCTGGT*CGTCCTAATCCTGGTGAGGAGTTTACTTT
TACCGAGCTTAACCAAACCAACTGGTCGTTCGA*GATACTCCACAGAT
CTGT

QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1D264TF 640 0 0
G
ATTGTTCTCCCCGGAGGGCTTCCCGGTGGCGAGACTCTTAAGAACTGCAAACCATTAGAG
AACATGGTGAA**AACAAGACACAGATGGAAGACTTAACGCAGCTATCTGTTGTGCTCCT
GCTTTGGCTCTTGGTACTTGGGGTTTTCTAGAGGGCAAAACAGCAACGGGTTACCCTGTT
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GGAAGGATTGTCACAAGTCGAGGACCAGGAACCACCATTGAATTCTCCATCACTCTTATT
GAGCAGTTGTTTGGGAAAGACAAAGCTGATGAAGTCTCTAAAATCTTGCTGGTTCGTCCT
AATCCTGGTGAGGAGTTTACTTTTACCGAGCTTAACCAAACCAACTGGTCGTTCGAAGAT
ACTCCACAGATTCTTGTCCCCATTGCAGAGGACTCCGAGGAGATCGAAGCTATTGCGCTT
GTAGATATCCTGAGGAGGGTAAAAGCAAATGTCGTGATAGCTGCAGTTGGTAACAGTTTG
GAAGTGGTAGGAGCTCGCAAATGTAAGCTAGTTGCAGATGTGCTTCTTGACGAGGTTGCA
GAGAAGTCGTTCGATCTGATCGTGTTGCCTGGAGGTCTT

QA 2 640 2 640
DS 

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CGT
CTAATCCTGGTGAGGAGTTTACTTTTACCGAGCTTAACCAAACCAACTGGTCGTTCGAAG
ATACTCCACAGATTCTTGTCCCCATTGCAGAGGACTCCGAGGAGATCGAAGCTATTGCGC
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TGGAAGTGGTAGGAGCTCGCAAATGTAAGCTAGTTGCAGATGTGCTTCTTGACGAGGTTG
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GAGTTGTTGTGGACGGGAATGTGATGACGAGCAGAGCTCCAGGGACTGCGATGGAGTTTT
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CACTTGTGTAAATTCTAAAGTATGAAAAATGTGGGGAGCCTGCGAGGGACGTTAATAAAA
GAGCCTTTTTATATATCTTTCTGTTGTTGATGATGAGTGGCTTTGTAATGTAAGCTTTTG
GCTGAATGGAGTGTGAATTTTATGTCTTTAATAATTGAATAAATAAAGGTTATTCTACTG

QA 4 783 4 783
DS 

RD RS1FL91TF 442 0 0
GCGGAAGCAAACAAACCTTATGGAGGAATCTGCGCATCACCTGTTTACGTCTTTGAGCAT
CATGGTTTACTCAAGGGTAAGAAGGCAACTACCCACCCAGTGGCGAGCGACAAACTTTCG
GACCAGAGTCACGTTGAGCACAGAGTTGTTGTGGACGGGAATGTGATAACGAGCAGAGCT
CCAGGGACTGCGATGGAGTTTTCACTTGCGATCGTTGAGAAGTTTTACGGGCGAGAGAAA
GCGTTTCAGCTCGCCAAGGGAACACTTGTGTAAATTCTAAAGTATGAAAAATGTGGGGAG
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GGCTTTGTAATGTAAGCTTTTGGCTGAATGGAGTGTGAATTTTATGTCTTTAATAATTGA
ATAAATAAAGGTTATT
CTACTG

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DS 

RD RS1BS58JQ 722 0 0
GTTCGAAGATACTCCACAGATTCTTGTCCCCATTGCAGAGGACTCCGAGGAGATCGAAGC
TATTGCGCTTGTAGATATCCTGAGGAGGGTAAAAGCAAATGTCGTGATAGCTGCAGTTGG
TAACAGTTTGGAAGTGGTAGGAGCTCGCAAATGTAAGCTAGTTGCAGATGTGCTTCTTGA
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GGGTAAGAAGGCAACTACCCACCCAGTGGTGAGCGACAAACTTTCGGACCAGAGTCACGT
TGAGCACAGAGTTGTTGTGGACGGGAATGTGATAACGAGCAGAGCTCCAGGGACTGCGAT
GGAGTTTTCACTTGCGATCGTTGAGAAGTTTTACGGGCGAGAGAAAGCGTTTCAGCTCGC
CAAGGGAACACTTGTGTAAATTCTAAAGTATGAAAAATGTGGGGAGCCTGCGAGGGACGT
TAATAAAAGAGCCTTTTTATATATCTTTCTGTTGTTGATGATGAGTGGCTTTGTAATGTA
AGCTTTTGGCTGAATGGAGTGTGAATTTTATGTCTTTAATAATTGAATAAATAAAGGTTA
TT

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 3

CO CL1677Contig1 1082 3 9 U
GCTTTGAAGATGAGTGAGCTTGTATATTCTTATCTCAAAATGATTCCCTGAATACGATTT
GCAATTATTTGGAGTACGATGCAAGAATATTGTTTTAACAAAGAGAGAATTGTATGGGAT
GGCTCTAGAATCTCTCTGAAGCAGTAGCAGTTTCAGTAGGTAGGAATTGATGGGTCAACC
TTGAGAGAATAGGCTTGTATTCCACCAGCCACATTGTACACACTCTTGAAGCCCTGAGAT
TGCAGCCAGTTCGCGACCTGCAACGACCTGCCACCAACCTTACACAGGACGAATGTATCC
TTCTCAGGGTTCAGCTTTGAAGTGATGTCTGGTGCCCAGGTTCCGAATTGGCGGAGCGGA
AACACTTTAAATCCTGGCAAGGATGCTGTGGCTATCTCGTCAGGTTCTCTGACATCAATC
AACTGAGCCTCGTCCATGAAAACTGGATCTTGCATTTTGGAATGCAGCTCCTCCACCTGG
ATGTCCTTCACAGGTTCCCTCTCAGATAGAACTTGTAACAAGTGCCAGCCAAATTGGGTT
TTACACCTGACTACATGATTCGGCTCTGCTTTAAACGCAGCTTCCTCAAACTCTGGTACC
ATTTGACCAAGTTTAACCCATCCAAGTATACCACCCTCCTTTTTAGATGGACAAATCGAG
TACTCAGCTGCAAGATCACTCATACCCTCTCCATCCAAGATTCGCTTCTGGAGTTCAGCA
AAGAGCTCAGAGTCACCCTCCTTAACAAGCACATGCTGCACCAGAATCTCTCTGCTTTGA
CTACTACTACTACTACTCCCACTGCTAAACGAAGCTCTCGCTTTGAGAGCCGAGAAGCCA
GAGAGTCTCATAGGGTACATGGAAGAAACGCGTGGTCGGACTCGGAGCGAAGAGATGTGT
CTGCCGAGAAGTGAACGAGAGAACGTGGAGAAGCGGAGGGGATGGGGAGGTGGTGATGAG
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CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1G588JQ U 1
AF RS1EQ40JQ U 32
AF RS1EQ40TF C 363
BS 1 485 RS1G588JQ
BS 486 486 RS1EQ40JQ
BS 487 665 RS1G588JQ
BS 666 666 RS1EQ40JQ
BS 667 684 RS1G588JQ
BS 685 685 RS1EQ40JQ
BS 686 722 RS1G588JQ
BS 723 836 RS1EQ40JQ
BS 837 1082 RS1EQ40TF

RD RS1G588JQ 722 0 0
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GCAATTATTTGGAGTACGATGCAAGAATATTGTTTTAACAAAGAGAGAATTGTATGGGAT
GGCTCTAGAATCTCTCTGAAGCAGTAGCAGTTTCAGTAGGTAGGAATTGATGGGTCAACC
TTGAGAGAATAGGCTTGTATTCCACCAGCCACATTGTACACACTCTTGAAGCCCTGAGAT
TGCAGCCAGTTCGCGACCTGCAACGACCTGCCACCAACCTTACACAGGACGAATGTATCC
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AACTGAGCCTCGTCCATGAAAACTGGATCTTGCATTTTGGAATGCAGCTCCTCCACCTGG
ATGTCTTTCACAGGTTCCCTCTCAGATAGAACTTGTAACAAGTGCCAGCCAAATTGGGTT
TTACACCTGACTACATGATTCGGCTCTGCTTTAAACGCAGCTTCCTCAAACTCTGGTACC
ATTTGACCAAGTTTAACCCATCCAAGTATACCACCCTCCTTTTTAGATGGACAAATCGAG
TACTCGGCTGCAAGATCACTCATATCCTCTCCATCCAAGATTCGCTTCTGGAGTTCAGCA
AA

QA 1 722 1 722
DS 

RD RS1EQ40JQ 805 0 0
G
TCTCAAAATGATTCCCTGAATACGATTTGCAATTATTTGGAGTACGATGCAAGAATATTG
TTTTAACAAAGAGAGAATTGTATGGGATGGCTCTAGAATCTCTCTGAAGCAGTAGCAGTT
TCAGTAGGTAGGAATTGATGGGTCAACCTTGAGAGAATAGGCTTGTATTCCACCAGCCAC
ATTGTACACACTCTTGAAGCCCTGAGATTGCAGCCAGTTGGCGACCTGCAACGACCTGCC
ACCAACCTTACACAGGACGAATGTATCCTTCTCAGGGTTCAGCTTTGAAGTGATGTCTGG
TGCCCAGGTTCCGAATTGGCGGAGCGGAAACACTTTAAATCCTGGCAAGGATGCTGTGGC
TATCTCGTCAGGTTCTCTGACATCAATCAACTGAGCCTCGTCCATGAAAACTGGATCTTG
CATTTTGGAATGCAGCTCCTCCACCTGGATGTCCTTCACAGGTTCCCTCTCAGATAGAAC
TTGTAACAAGTGCCAGCCAAATTGGGTTTTACACCTGACTACATGATTCGGCTCTGCTTT
AAACGCAGCTTCCTCAAACTCTGGTACCATTTGACCAAGTTTAACCCATCCAAGTATACC
ACCCTCCTTTTTAGATGGACAAATCGAGTACTCAGCTGCAAGATCACTCATACCCTCTCC
ATCCAAGATTCGCTTCTGGAGTTCAGCAAAGAGCTCAGAGTCACCCTCCTTAACAAGCAC
ATGCTGCACCAGAATCTCTCTGCTTTGACTACTACTACTACTACTCCCACTGCTAAACGA
AGCTCTCGCTTTGAGAGCCGAGAA

QA 2 805 2 805
DS 

RD RS1EQ40TF 720 0 0
CACTTTAAATCCTGGCAAGGATGCTGTGGCTATCTCGTCAGGTTCTCTGACATCAATCAA
CTGAGCCTCGTCCATGAAAACTGGATCTTGCATTTTGGAATGCAGCTCCTCCACCTGGAT
GTCCTTCACAGGTTCCCTCTCAGATAGAACTTGTAACAAGTGCCAGCCAAATTGGGTTTT
ACACCTGACTACATGATTCGGCTCTGCTTTAAACGCAGCTTCCTCAAACTCTGGTACCAT
TTGACCAAGTTTAACCCATCCAAGTATACCACCCTCCTTTTTAGATGGACAAATCGAGTA
CTCAGCTGCAAGATCACTCATACCCTCTCCATCCAAGATTCGCTTCTGGAGTTCAGCAAA
GAGCTCAGAGTCACCCTCCTTAACAAGCACATGCTGCACCAGAATCTCTCTGCTTTGACT
ACTACTACTACTACTCCCACTGCTAAACGAAGCTCTCGCTTTGAGAGCCGAGAAGCCAGA
GAGTCTCATAGGGTACATGGAAGAAACGCGTGGTCGGACTCGGAGCGAAGAGATGTGTCT
GCCGAGAAGTGAACGAGAGAACGTGGAGAAGCGGAGGGGATGGGGAGGTGGTGATGAGAA
AGCGAGAGTGTGGGAAACGGAGAGTCTCAGTGCGGCGGAGAATGACGCCGCCGCCGGAGA
TGATACCGCAGAGAGATTTCCGGTGATTCTAAACATTTTTGGGTCTAATAACGAGTTCCC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 5

CO CL1678Contig1 1352 5 28 U
GGAGAGGTACATTCTTTCCCTTGGGCTTTAGGGTTCTAATCTATATTAATCCAATCCAAT
CTGCTTTCATTCTAATCTCAAAATCCAAAATGGAACTTGTTAAGATTTCCCTTCTCCTTC
TTTCTTTCCTCCTCCTCTTCTCCCTCTCTGTCTCTGTCTCTGTCTCTTCTTCATCGTCCG
ACGGCGATGATGCCGTGATCCGGCAAGTGGTTGACGGAGGAGCCGAGCCCAATGTTTTAT
CATCCGAGCATCACTTTTCTGTGTTCAAGAGCAAGTTCGGCAAGGTGTACGGTTCGAGGG
AGGAGCATGACTACAGATTGTCCGTATTCAAAGCGAATCAGAGGAGAGCGAGGCGTCACC
AGAAGATGGATCCCTCTGCTCGTCACGGTGTTACACAGTTCTCGGATCTGACTCGATCTG
AGTTCAAGAAGAAGCATCTCGGTGTCAGAGGAGGGTTCAAGCTTCCCAAAGACGCCAACA
AGGCTCCCATTCTCCCTACCGAGAATCTCCCTCAGGATTTTGATTGGAGAGATCACGGTG
CCGTCACCCCCGTCAAAAACCAGGGATCATGCGGGTCTTGCTGGAGTTTCAGCGCCACCG
GAGCTCTTGAAGGTGCTAACTTCCTCTCTACCGGCAAACTCGTCAGCCTTAGCGAACAAC
AGCTCGTTGACTGTGATCATGAGTGTGACCCAGATGAGGCCGGTTCATGCGACTCTGGTT
GCAATGGTGGCCTCATGGATAGCGCTTTTGAATACACCCTCAAATCCGGAGGCCTCATGA
GAGAACAAGACTATCCTTACACCGTCGAGGACGGCTCCGTCTGCAAGTTAGACAAGTCCA
AGATCGTTGCCTCTGTCTCCAACTTCAGTGTCATCTCCATCGACGAAGACCAGATTGCTG
CTAACCTTGTTCAAAACGGACCTCTTGCTGTTGCCATCAACGCTGCCTATATGCAGACTT
ACATTGGCGGAGTCTCCTGCCCTTATATTTACACCAGGAGGCTCAACCACGGTGTCTTGT
TGGTCGGTTACGGCTCCGCTGGTTATGCCCCGGCTAGGTTCAAGGAGAAGCCTTACTGGA
TCATCAAGAACTCGTGGGGTGAGACTTGGGGTGAGAAGGGTTTCTACAAGATCTGCAAAG
GCCGTAACATCTGTGGCGTTGACAGTCTTGTCTCCACCGTTACAGCCGCCGTCTCTACCA
CCGCACATTAACTAAGCCAAAAAAAGGCTTTCATTTAATAAATCTAGTGATTTGTGTGAG
CGAGCACTCTTTGCCTTGACTCTCTGTTTCTCTCTGCTTTTTTTAAAAACAAAGATGGAA
GTTTGTAAATGAATTGCATCCTCTTTTGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1GW54TF U 1
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CTGCTTTCATTCTAATCTCAAAATCCAAAATGGAACTTGTTAAGATTTCCCTTCTCCTTC
TTTCTTTCCTCCTCCTCTTCTCCCTCTCTGTCTCTGTCTCTGTCTCTTCTTCATCGTCCG
ACGGCGATGATGCCGTGATCCGGCAAGTGGTTGATGG*GGAGCCGAGCCCAATGTTTTAT
CATCCGAGCATCACTTTTCTGTGTTCAAGAGCAAGTTCGGCAAGGTGTACGGTTCGAGGG
AGGAGCATGACTACAGATTGTCCGTATTCAAAGCGAATCAGAGGAGAGCGAGGCGTCACC
AGAAGATGGATCCCTCTGCTCGTCACGGTGTTACACAGTTCTCGGATCTGACTCGATCTG
AGTTCAAGAAGAATCATCTCGGTGTCAGAGGAGGGTTCAAGCTTCCCAAAGACGCCAACA
AGGCTCCCATTCTCCCTACCGAGGATCTCCCTCAGGATTTTGATTGGAGAGATCACGGTG
CCGTCACCCCCGTCAAAAACCAGGGATCATGCGGGTCTTGCTGGAGTTTCAGCGCCACCG
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AGCTCGTTGACTGTGATCATGAGTGTGACCCAGA

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DS 

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GGA
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AAGATTTCCCTTCTCCTTCTTTCTTTCCTCCTCCTCTTCTCCCTCTCTGTCTCTGTCTCT
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GCCGAGCCCAATGTTTTATCATCCGAGCATCACTTTTCTGTGTTCAAGAGCAAGTTCGGC
AAGGTGTACGGTTCGAGGGAGGAGCATGACTACAGATTGTCCGTATTCAAAGCGAATCAG
AGGAGAGCGAGGCGTCACCAGAAGATGGATCCCTCTGCTCGTCACGGTGTTACACAGTTC
TCGGATCTGACTCGATCTGAGTTCAAGAAGAAGCATCTCGGTGTCAGAGGGGGGTTCAAG
CTTCCCAAAGACGCCAACAAGGCTCCCATTCTCCCTACCGAGAATCTCCCTCAGGATTTT
GATTGGAGAGATCACGGTGCCGTCACCCCCGTCAAAAACCAGGGATCATGCGGGTCTTGC
TGGAGTTTCAGCGCCACCGGAGCTCTTGAAGGTGTTAACTTCCTCTCTACCGGCAAACTC
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GGTTCATGCGACTCTGGTTGCAATGGTGGCCTCATGAATAGCGCTTTTGAATACACCCTC
AAATCCGGAG*CCTCATGAGAGAACAAGACTATCCTTACACCGGCGAGGACG*CTCCGTC
TGCAAGT*AGACAAGTCCAAGATCGTTGCCTCTGTCT

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G
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CTCGATCTGAGTTCAAGAAGAAGCATCTCGGTGTCAGAGGAGGGTTCAAGCTTCCCAAAG
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ATCACGGTGCCGTCACCCCCGTCAAAAACCAGGGATCATGCGGGTCTTGCTGGAGTTTCA
GCGCCACCGGAGCTCTTGAAGGTGCTAACTTCCTCTCTACCGGCAAACTCGTCAGCCTTA
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ACAAGTCCAAGATCGTTGCCTCTGTCTCCAACTTCAGTGTCATCTCCATCGACGAAGACC
AGATTGCTGCTAACCTTGTTCAAAACGGACCTCTTGCTGTTGCCATCAACGCTGCCTATA
TGCAGACTTACATTGGCGGAGTCTCCTGCCCTTATATTT
GCA

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DS 

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GCGAACAACAGCTCGTTGACTGTGATCATGAGTGTGACCCAGATGAGGCCGGTTCATGCG
ACTCTGGTTGCAATGGTGGCCTCATGGATAGCGCTTTTGAATACACCCTCAAATCCGGAG
GCCTCATGAGAGAACAAGACTATCCTTACACCGTCGAGGACGGCTCCGTCTGCAAGTTAG
ACAAGTCCAAGATCGTTGCCTCTGTCTCCAACTTCAGTGTCATCTCCATCGACGAAGACC
AGATTGCTGCTAACCTTGTTCAAAACGGACCTCTTGCTGTTGCCATCAACGCTGCCTATA
TGCAGACTTACATTGGCGGAGTCTCCTGCCCTTATATTTGCACCAGGAGGCTCAACCACG
GTGTCTTGTTGGTCGGTTACGGCTCCGCTGGTTATGCCCCGGCTAGGTTCAAGGAGAAGC
CTTACTGGATCATCAAGAACTCGTGGGGTGAGACTTGGGGTGAGAAGGGTTTCTACAAGA
TCTGCAAAGGCCGTAACATCTGTGGCGTTGACAGTCTTGTCTCCACCGTTACAGCCGCCG
TCTCTACCACCGCACATTAACTAAGCCAAAAAGAGGCTTTCATTTAATAAATCTAGTGAT
TTGTGTGAGCGAGCACTCTTTGCCTTGACTCTCTGTTTCTCTCTGCTTTTTTTAAAAACA
AAGATGGAAGTTTGTAAATGAATTGCATCCTCTTTTGA
AC

QA 1 698 1 698
DS 

RD RS1GC02JQ 453 0 0
GCTAACCTTGTTCAAAACGGACCTCTTGCTGTTGCCATCAACGCTGCCTATATGCAGACT
TACATTGGCGGAGTCTCCTGCCCTTATATTTACACCAGGAGGCTCAACCACGGTGTCTTG
TTGGTCGGTTACGGCTCCGCTGGTTATGCCCCGGCTAGGTTCAAGGAGAAGCCTTACTGG
ATCATCAAGAACTCGTGGGGTGAGACTTGGGGTGAGAAGGGTTTTTACAAGATCTGCAAA
GGCCGTAACATCTGTGGCGTTGACAGTCTTGTTTCCACCGTTACAGCCGCCGTCTCTACC
ACCGCACATTAATTAAGCCAAAAAAAGGCTTTCATTTAATAAATTTAGTGATTTGTGTGA
GCGAGCACTCTTTGCCTTGACTTTCTGTTTCTTTCTGCTTTTTTTAAAAACAAAGATGGA
AGTTTGTAAATGAATTGCATCCTCTTTTGAGCC

QA 1 453 1 453
DS 



AS 1 3

CO CL1679Contig1 780 3 6 U
AGAAAAGAAGGATTTCATTATGATACAAGAATTCAAGAAACAAAACATAAAACAAAGGGA
CCAAAAGAGTGGCACAAGTTCCTTCTTCTGTAACCCTAATTCTCGGACTCAAGAACAGGT
CTGGTGCCACTAGATGTAACAATGTCACCATCACCGTCACTGTTTCCATCGTCATGACCA
GAAGAATCTCTAACACTCCGACCACCACCGTTGAAGCTAAACCTAACCCAAATCTCTCTT
CCATCATTACTTTTCTTTCCAACCTCATCTCCATCAACAGGCATGTCGTACCTACAAACA
GGACACGACCCATGAAGCCCTAACCATTTCTCTATGCATCCTCCATGAAATTTATGCTTA
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CCTACACAGCTAACGACATCAACGTTAAGCATCGCGTCGATGGAAGCCTTGGACGCTGGA
GGATGACCTTCCTCACGTGATTCAAATAAGCCGCGAAGCAGAGGATTCAATCCCGATGAC
TCCTCGAGGACGATCATTCCTTGCGTAAAAGGGTTGACCAGAATGATACGGTCACGCGTC
GAAGCAACGTCGTCGTCTCCATGTGATGACTCTTGATCAGAAAAGCCTAAGAGGAAAGGC
AAGAAGGGGTACAAGTCTCTGTTTCTTAGAAATCTTGCGGAAACAGAGGAAGTCTCTCTT
ACAACTTCAGCTTCTTGTTCTGTCGCCATAGGAAACAAAAGAATGGAGGATAGATACTCC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CL70JQ U 1
AF RS1GL08JQ U 1
AF RS1FE72TF C 13
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G
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TGGTGCCACTAGATGTAACAATGTCACCATCACCGTCACTGTTTCCATCGTCATGACCAG
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CATCATTACTTTTCTTTCCAACCTCATCTCCATCAACAGGCATGTCGTACCTACAAACAG
GACACGACCCATGAAGCCCTAACCATTTCTCTATGCATCCTCCATGAAATTTATGCTTAC
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GATGACCTTCCTCACGTGATTCAAATAAGCCGCGAAGCAGAGGATTCAATCCCGATGACT
CCTCGAGGACGATCATTCCTTGCGTAAAAGGGTTGACCAGAATGATACGGTCACGCGTCG
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CAACTTCAGCTTCTTGTTCTGT
GGACGCAG

QA 2 743 2 743
DS 

RD RS1FE72TF 768 0 0
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ACACTCCGACCACCACCGTTGAAACTAAACCTAACCCAAATCTCTCTTCCATCATTACTT
TTCTTTCCAACCTCATCTCCATCAATAGGCATCTCGTACCTACAAACAGGACACGACCCA
TGAAGCCCTAACCATTTCTCAATGCATCCTCCATGAAATTTATGCTTACACGGCATCTCC
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ACGACATCAACGTTAGGCATCGCGTCGATGGAAGCCTTGGACGCTGGAGGATGACCTTCC
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AAGTCTCTGTTTCTTAGAAATCTTGCGGAAACAGAGGAAGTCTCTCTTACAACTTCAGCT
TCTTGTTCTGTCGCCATAGGAAACAAAAGAATGGAGGATAGATACTCC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 5

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AGGAACTCTACTTCGCGTTTTGCAAGGAGCCTGTTCTCTTCGACAATGGTACAAAGAGCT
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AAAGTGTTGCGAAACTTCGTTATGGATGTTGGTTTGACTTTCGAGGCAGGGTGAAAACTT
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GTTTTGGTATCATTGTCAAATTGGTTATGCGATAGAGTGAAGAGGTGAAATCCAATTGAT
AAAAGAAGTGTCTCAAGTTGTGTTTGTTATGTAAAATTGGTTTTCTCCGGTTATGCTTTG
CAATGTTTGTGGATTTTGGGGGTTTATCAACTCGTATGAACAAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 
20 35 10 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 0 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D046TF U 167
AF RS1C314TF U 1
AF RS1B818TF U 66
AF RS1B818JQ C 267
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BS 769 769 RS1B818TF
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BS 783 849 RS1B818TF
BS 850 851 RS1B818JQ
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BS 1020 1066 RS1D046JQ

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QA 1 593 1 593
DS 

RD RS1C314TF 797 0 0
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GTGTCCTATCTCCAAGAACTCGTTACTCGGCTTACCTTGTGTTGAAGAACCCGTATAGTC
GTCGCATGCGTCAAGTGGGTTTAGAATCTAAG*ATGGAGGGATGATATCGATCTTCCAGA
GG*AGAGGGA*GATGGT*GGATGGAG*TAGATCTTGGGGGATTCTTCA*CGGAGATGAGA
TA
TGGACGTGATGAGAT

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DS 

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GG
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ATCTAGCGGCCAAAGCGGAGGAAAGCTCGGTTCGGATTCTTCGCCGCTCGATTCCTTTCC
GGAGGATTGCATGTCCAAGATAGTCTCATTCACAAGTCCACGTGATGCCTGCGTCGCCGC
TATGGTATCGAAAGCCTTTGAATCTGCGGCCAAGTCAGATTTGGTGTGGGAGAAGTTTCT
TCCGTCGGAGTATGAATCTCTTGTTCCTTCATCGCTTCATTCTTCGTCCAAGAAGGAACT
CTACTTCGCGTTTTGCAAGGAGCCTGTTCTCTTCGACAATGGTACAAAGAGCTTTTGGAT
AGAGAAGGCAAGTGGGAAGAGGTCAATAATGTTATCTGCGATTAACATCTCACTCAAATG
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TGCGAAACTTCGTTATGGATGTTGGTTTGAGATTCGAGGCAGGGTGAAAACTTGTGTCCT
ATCTCCAAGAACTCGTTACTCGGCTTACCTTGTGTTGAAGAACCCGTATAGTCGTCGCAT
GCGTCAAGTGGGTTTAGAATCTAAGGATGGAGGGATGATATCGATCTTCCCAGAG*AGAG
GGAAGATGGTTGGATGGAG*TAGATCTTGGGGGATTCTTTAACGGAGATGAGATAATGGA
CGGTGATGAGATTGAGATGAGTGCTTTAGAGACTAGGGACATCGGTTGGGACAGTGGCAT
GA

QA 3 784 3 784
DS 

RD RS1B818JQ 753 0 0
GAATCTGCGGCCAAGTCAGATTTGGTGTGGGAGAAGTTTCTTCCGTCGGAGTATGAATCT
CTTGTTCCTTCATCGCTTCATTCTTCGTCCAAGAAGGAACTCTACTTCGCGTTTTGCAAG
GAGCCTGTTCTCTTCGACAATGGTACAAAGAGCTTTTGGATAGAGAAGGCAAGTGGGAAG
AGGTCAATAATGTTATCTGCGATTAACATCTCACTCAAATGGGGAGATACTCCACAGTGT
TTGGAATGGATTACGATTCCTGAAGCTAGGTTTAAAAGTGTTGCGAAACTTCGTTATGGA
TGTTGGTTTGAGATTCGAGGCAGGGTGAAAACTTGTGTCCTATCTCCAAGAACTCGTTAC
TCGGCTTACCTTGTGTTGAAGAACCCGTATAGTCGTCGCATGCGTCAAGTGGGTTTAGAA
TCTAAGGATGGAGGGATGATATCGATCTTCCCAGAGGAGAGGGAAGATGGTTGGATGGAG
GTAGATCTTGGGGGATTCTTTAACGGAGATGAGATAATGGACGGTGATGAGATTGAGATG
AGTGCTTTAGAGACTAGGGACATCGGTTGGGACAGTGGCATGATCTTTCAAGGAATGGAA
ATCCGTCCTGCAAATATCCAGTAAACTTTCATCTGTTTTGGTATCATTGTCAAATTGGTT
ATGCGATAGAGTGAAGAGGTGAAATCCAATTGATAAAAGAAGTGTCTCAAGTTGTGTTTG
TTATGTAAAATTGGTTTTCTCCGGTTATGCTTT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1D046JQ 714 0 0
GTCCAAGAAGGAACTCTACTTCGCGTTTTGCAAGGAGCCTGTTCTCTTCGACAATGGTAC
AAAGAGCTTTTGGATAGAGAAAGCAAGTGGGAAGAGGTCAATAATGTTATCTGCGATTAA
CATCTCACTCAAATGGGGAGATACTCCACAGTGTTTGGAATGGATTACGATTCCTGAAGC
TAGGTTTAAAAGTGTTGCGAAACTTCGTTATGGATGTTGGTTTGACTTTCGAGGCAGGGT
GAAAACTTGTGTCCTATCTCCAAGAACTCGTTACTCGGCTTACCTTGTGTTGAAGAACCC
GTATAGTCGTCGCATGCTTCAAGTGGGTTTAGAATCTAAGGATGGAGGGATGATATCGAT
CTTCCCAGAGGAGAGGGAAGATGGTTGGATGGAGGTAGATCTTGGGGGATTCTTCAACGG
AGATGAGATAATGGACGGTGATGAGATTGAGATGAGTGCTTTAGAGACTAGGGACATCGG
TTGGGACAGTGGCATGATCGTTCAAGGAATGGAAATCCGTCCTGCAAATATCCAGTAAAC
TTTCATCTGTTTTGGTATCATTGTCAAATTGGTTATGCGATAGAGTGAAGAGGTGAAATC
CAATTGATAAAAGAAGTGTCTCAAGTTGTGTTTGTTATGTAAAATTGGTTTTCTCCGGTT
ATGCTTTGCAATGTTTGTGGATTTTGGGGGTTTATCAACTCGTATGAACAAGTT

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 5

CO CL1681Contig1 682 5 2 U
GACCGTATCAGTCATCAATTATTCATGCAAGTCCCACTTTCAACCAATGGGTTCCAATAA
TGAAAAGCCTTAACCACAATCACATATCAGAGGGTCTTACCTTATTTTAGAATCACAACA
ACAGACAGTTTGATGTTTACAAATGCAAATCACGAGACTAAAATCCTCTCAAACCATGAT
CCTGGGGGTAGACACTTTAGACTCTTCTTTGACTGCTTCACCAGATTGGGTGGTGAGTTC
TCCATAGATGGCCTTAAGAGTGGAGAGAGGAACAACCGCGGAAGCACCAGCAGAGGTGGC
TTCAGCAAAGAGCTGTTGTTTCCACTCCCACATTGTAACTTTCATATCCTTGTTAGACTT
GGACAGCGAATCTTTCTGCTCCTGCAAGGCCTCGACATACTTTTGCTGTTTATCAGATCT
AAGCCCCAGAACCACAAACGATACTCCAAGACACGTGTTTATCACAGCATTGCTGTTCAT
TGCTTCCGAGACCAGCATTGCAATCCTGTTCGCCATTCCTCCTCTCTATTCTCCTTCCAC
AGATCTAAAGTAGAGATCACAACTCACGATAATCTGCCAAATCCACAATATCAACACTCC
TAATTCACGATTCTCTGCAAAACCCACAACCCTGTACTCATTTCCTTGATTTCTCGCCGA
GTCGAAAACGTGTAAACCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1A141JQ U 1
AF RS1EA35TF C 25
AF RS1A141TR U 8
AF RS1CR49JQ U 41
AF RS1CR49TF C 41
BS 1 639 RS1A141JQ
BS 640 682 RS1CR49JQ

RD RS1A141JQ 641 0 0
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ACAGACAGTTTGATGTTTACAAATGCAAATCACGAGACTAAAATCCTCTCAAACCATGAT
CCTGGGGGTAGACACTTTAGACTCTTCTTTGACTGCTTCACCAGATTGGGTGGTGAGTTC
TCCATAGATGGCCTTAAGAGTGGAGAGAGGAACAACCGCGGAAGCACCAGCAGAGGTGGC
TTCAGCAAAGAGCTGTTGTTTCCACTCCCACATTGTAACTTTCATATCCTTGTTAGACTT
GGACAGCGAATCTTTCTGCTCCTGCAAGGCCTCGACATACTTTTGCTGTTTATCAGATCT
AAGCCCCAGAACCACAAACGATACTCCAAGACACGTGTTTATCACAGCATTGCTGTTCAT
TGCTTCCGAGACCAGCATTGCAATCCTGTTCGCCATTCCTCCTCTCTATTCTCCTTCCAC
AGATCTAAAGTAGAGATCACAACTCACGATAATCTGCCAAATCCACAATATCAACACTCC
TAATTCACGATTCTCTGCAAAACCCACAACCCTGTACTC
CA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RS1EA35TF 617 0 0
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GCAAATCACGAGACTAAAATCCTCTCAAACCATGATCCTGGGGGTAGACACTTTAGACTC
TTCTTTGACTGCTTCACCAGATTGGGTGGTGAGTTCTCCATAGATGGCCTTAAGAGTGGA
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CTCCCACATTGTAACTTTCATATCCTTGTTAGACTTGGACAGCGAATCTTTCTGCTCCTG
CAAGGCCTCGACATACTTTTGCTGTTTATCAGATCTAAGCCCCAGAACCACAAACGATAC
TCCAAGACACGTGTTTATCACAGCATTGCTGTTCATTGCTTCCGAGACCAGCATTGCAAT
CCTGTTCGCCATTCCTCCTCTCTATTCTCCTTCCACAGATCTAAAGTAGAGATCACAACT
CACGATAATCTGCCAAATCCACAATATCAACACTCCTAATTCACGATTCTCTGCAAAACC
CACAACCCTGTACTC
CC

QA 1 615 1 615
DS 

RD RS1A141TR 634 0 0
TCAGTCATCAATTATTCATGCAAGTCCCACTTTCAACCAAAGGGTTCCAATAATGAAAAG
CCTTAACCACAATCACATATCAGAGGGTCTTACCTTATTTTAGAATCACAACAACAGACA
GTTTGATGTTTACAAATGCAAATCACGAGACTAAAATCCTCTCAAACCATGATCCTGGGG
GTAGACACTTTAGACTCTTCTTTGACTGCTTCACCAGATTGGGTGGTGAGTTCTCCATAG
ATGGCCTTAAGAGTGGAGAGAGGAACAACCGCGGAAGCACCAGCAGAGGTGGCTTCAGCA
AAGAGCTGTTGTTTCCACTCCCACATTGTAACTTTCATATCCTTGTTAGACTTGGACAGC
GAATCTTTCTGCTCCTGCAAGGCCTCGACATACTTTTGCTGTTTATCAGATCTAAGCCCC
AGAACCACAAACGATACTCCAAGACACGTGTTTATCACAGCATTGCTGTTCATTGCTTCC
GAGACCAGCATTGCAATCCTGTTCGCCATTCCTCCTCTCTATTCTCCTTCCACAGATCTA
AAGTAGAGATCACAACTCACGATAATCTGCCAAATCCACAATATCAACACTCCTAATTCA
CGATTCTCTGCAAAACCCACAACCCTGTACTC
CA

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1CR49JQ 642 0 0
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CTTATTTTAGAATCACAACAACAGACAGTTTGATGTTTACAAATGCAAATCACGAGACTA
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CCAGATTGGGTGGTGAGTTCTCCATAGATGGCCTTAAGAGTGGAGAGAGGAACAACCGCG
GAAGCACCAGCAGAGGTGGCTTCAGCAAAGAGCTGTTGTTTCCACTCCCACATTGTAACT
TTCATATCCTTGTTAGACTTGGACAGCGAATCTTTCTGCTCCTGCAAGGCCTCGACATAC
TTTTGCTGTTTATCAGATCTAAGCCCCAGAACCACAAACGATACTCCAAGACACGTGTTC
ATCACAGCATTGCTGTTCATTGCTTCCGAGACCAGCATTGCAATCCTGTTCGCCATTCCT
CCTCTCTATTCTCCTTCCACAGATCTAAAGTAGAGATCA**ACTCACGATAATCTGCCAA
ATCCACAATATCAACACTCCTAATTCACGATTCTCTGCAAAACCCACAACCCTGTACTCA
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QA 1 642 1 642
DS 

RD RS1CR49TF 642 0 0
CAACCAATGGGTTCCAATAATGAAAAGCCTTAACCACAATCACATATCAGAGGGTCTTAC
CTTATTTTAGAATCACAACAACAGACAGTTTGATGTTTACAAATGCAAATCACGAGACTA
AAATCCTCTCAAACCATGATCCTGGGGGTAGACACTTTAGACTCTTCTTTGACTGCTTCA
CCAGATTGGGTGGTGAGTTCTCCATAGATGGCCTTAAGAGTGGAGAGAGGAACAACCGCG
GAAGCACCAGCAGAGGTGGCTTCAGCAAAGAGCTGTTGTTTCCACTCCCACATTGTAACT
TTCATATCCTTGTTAGACTTGGACAGCGAATCTTTCTGCTCCTGCAAGGCCTCGACATAC
TTTTGCTGTTTATCAGATCTAAGCCCCAGAACCACAAACGATACTCCAAGACACGTGTTC
ATCACAGCATTGCTGTTCATTGCTTCCGAGACCAGCATTGCAATCCTGTTCGCCATTCCT
CCTCTCTATTCTCCTTCCACAGATCTAAAGTAGAGATCA**ACTCACGATAATCTGCCAA
ATCCACAATATCAACACTCCTAATTCACGATTCTCTGCAAAACCCACAACCCTGTACTCA
TTTCCTTGATTTCTCGCCGAGTCGAAAACGTGTAAACCCTCC

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 5

CO CL1682Contig1 733 5 7 U
GGGATTTTACCATGACTGCAATTTTAGAGAGACGCGAGAGCGAAAGCCTATGGGGTCGCT
TCTGTAACTGGATAACTAGTACTGAAAACCGTCTTTACATTGGATGGTTTGGTGTTTTGA
TGATTCCTACCTTATTGACCGCAACTTCCGTTTTTATTATCGCATTTATTGCTGCTCCTC
CAGTAGATATTGATGGTATTCGTGAACCTGTTTCTGGATCTCTTCTTTACGGAAACAATA
TTATTTCAGGTGCCATTATTCCTACTTCTGCAGCTATTGGTTTGCATTTTTATCCGATCT
GGGAAGCTGCATCCGTTGATGAATGGCTATACAACGGTGGTCCTTATGAACTAATTGTTC
TACACTTTTTACTTGGTGTAGCTTGTTATATGGGTCGTGAGTGGGAACTTAGTTTCCGTC
TGGGTATGCGTCCTTGGATTGCTGTTGCATATTCAGCTCCTGTTGCAGCTGCTACTGCTG
TTTTCTTGATCTACCCAATTGGTCAAGGAAGTTTTTCTGATGGTATGCCTCTAGGAATCT
CTGGTACTTTCAACTTTATGATTGTATTCCAGGCTGAGCACAACATTCTTATGCACCCAT
TTCACATGTTAGGTGTAGCTGGTGTATTCGGCGGCTCCCTATTTAGTGCTATGCATGGTT
CTTTGGTAACTTCTAGTTTGATCAGGGAAACCACAGAAAATGAATCTGCTAATGAAGGGT
ACAGATTCGGCCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A760JQ C 1
AF RS1A760TF U 1
AF RS1BH93TF U 101
AF RS1C229JQ C 230
AF RS1C229TF U 230
BS 1 253 RS1A760TF
BS 254 254 RS1BH93TF
BS 255 689 RS1A760TF
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RD RS1A760JQ 687 0 0
GGGATTTTACCATGACTGCAATTTTAGAGAGACGCGAGAGCGAAAGCCTATGGGGTCGCT
TCTGTAACTGGATAACTAGTACTGAAAACCGTCTTTACATTGGATGGTTTGGTGTTTTGA
TGATTCCTACCTTATTGACCGCAACTTCCGTTTTTATTATCGCATTTATTGCTGCTCCTC
CAGTAGATATTGATGGTATTCGTGAACCTGTTTCTGGATCTCTTCTTTACGGAAACAATA
TTATTTCAGGTGCAATTATTCCTACTTCTGCAGCTATTGGTTTGCATTTTTATCCGATCT
GGGAAGCTGCATCCGTTGATGAATGGCTATACAACGGTGGTCCTTATGAACTAATTGTTC
TACACTTTTTACTTGGTGTAGCTTGTTATATGGGTCGTGAGTGGGAACTTAGTTTCCGTC
TGGGTATGCGTCCTTGGATTGCTGTTGCATATTCAGCTCCTGTTGCAGCTGCTACTGCTG
TTTTCTTGATCTACCCAATTGGTCAAGGAAGTTTTTCTGATGGTATGCCTCTAGGAATCT
CTGGTACTTTCAACTTTATGATTGTATTCCAGGCTGAGCACAACATTCTTATGCACCCAT
TTCACATGTTAGGTGTAGCTGGTGTATTCGGCGGCTCCCTATTTAGTGCTATGCATGGTT
CTTTGGTAACTTCTAGTTTGATCAGGG

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1A760TF 689 0 0
GGGATTTTACCATGACTGCAATTTTAGAGAGACGCGAGAGCGAAAGCCTATGGGGTCGCT
TCTGTAACTGGATAACTAGTACTGAAAACCGTCTTTACATTGGATGGTTTGGTGTTTTGA
TGATTCCTACCTTATTGACCGCAACTTCCGTTTTTATTATCGCATTTATTGCTGCTCCTC
CAGTAGATATTGATGGTATTCGTGAACCTGTTTCTGGATCTCTTCTTTACGGAAACAATA
TTATTTCAGGTGCAATTATTCCTACTTCTGCAGCTATTGGTTTGCATTTTTATCCGATCT
GGGAAGCTGCATCCGTTGATGAATGGCTATACAACGGTGGTCCTTATGAACTAATTGTTC
TACACTTTTTACTTGGTGTAGCTTGTTATATGGGTCGTGAGTGGGAACTTAGTTTCCGTC
TGGGTATGCGTCCTTGGATTGCTGTTGCATATTCAGCTCCTGTTGCAGCTGCTACTGCTG
TTTTCTTGATCTACCCAATTGGTCAAGGAAGTTTTTCTGATGGTATGCCTCTAGGAATCT
CTGGTACTTTCAACTTTATGATTGTATTCCAGGCTGAGCACAACATTCTTATGCACCCAT
TTCACATGTTAGGTGTAGCTGGTGTATTCGGCGGCTCCCTATTTAGTGCTATGCATGGTT
CTTTGGTAACTTCTAGTTTGATCAGGGAA

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DS 

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G
GGATGGTTTGGTGTTTTGATGATTCCTACCTTATTGACCGCAACTTCCGTTTTTATTATC
GCATTCATTGCTGCTCCTCCAGTAGATATTGATGGTATTCGTGAACCTGTTTCTGGATCT
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CCTTATGAACTAATTGTTCTACACTTTTTACTTGGTGTAGCTTGTTATATGGGTCGTGAG
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GGTATGCCTCTAGGAATCTCTGGTACTTTCAACTTTATGATTGTATTCCAGGCTGAGCAC
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GAATCTGCTAATGAAAGGTACAGAT

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G
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GCTACTGCTGTTTTCTTGATCTACCCAATTGGTCAAGGAAGTTTTTCTGATGGTATGCCT
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ATGCACCCATTTCACATGTTAGGTGTAGCTGGTGTATTCGGCGGCTCCCTATTTAGTGCT
ATGCATGGTTCTTTGGTAACTTCTAGTTTGATCAGGGAAACCACAGAAAATGAATCTGCT
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DS 

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G
GGAAACAATATTATTTCAGGTGCCATTATTCCTACTTCTGCAGCTATTGGTTTGCATTTT
TATCCGATCTGGGGAGCTGCATCCGTTGATGAATGGCTATACAACGGTGGTCCTTATGAA
CTAATTGTTCTACACTTTTTACTTGGTGTAGCTTGTTATATGGGTCGTGAGTGGGAACTT
AGTTTCCGTCTGGGTATGCGTCCTTGGATTGCTGTTGCATATTCAGCTCCTGTTGCAGCT
GCTACTGCTGTTTTCTTGATCTACCCAATTGGTCAAGGAAGTTTTTCTGATGGTATGCCT
CTAGGAATCTCTGGTACTTTCAACTTTATGATTGTATTCCAGGCTGAGCACAACATTCTT
ATGCACCCATTTCACATGTTAGGTGTAGCTGGTGTATTCGGCGGCTCCCTATTTAGTGCT
ATGCATGGTTCTTTGGTAACTTCTAGTTTGATCAGGGAAACCACAGAAAATGAATCTGCT
AATGAAGGGTACAGAT
TCGGCCG

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DS 



AS 1 5

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GAGATATCGAAGATGAGATCAGAGACGAGAAGAATCCTCCGCCCCTTGACGAAGATGACA
TCGCTCTCCTCAAGACTTACGGGTTAAGTCCTTACTCTGTAGCTGACAAGAAAGTGGAGA
AAGAAATCAAAGAGCTAGCCAAGAAGATCAACGACCTCTGTGGTATCAAGGAGTCTGATA
CTGGTTTAGCTCTTCCTAGTCAATGGGATCTCGTCGCTGATAAACAGATGATGCAAGAGG
AGCAACCTCTCCAGGTTGCTAGATGCACTAAGATAATTAGTCCAAACACTGAAGACGCCA
AGTACGTCATCAATGTCAAACAGATTGCTAAGTTTGTCGTTGGCCTTGGCGATAAAGTGT
CTCCCACTGACATTGAAGAAGGCATGCGTGTAGGAGTTGATAGGACCAAGTATCAGATAC
AGATTCCTCTACCTCCAAAGATCGATCCTAGTGTCACCATGATGACTGTTGAAGAGAAAC
CTGATGTTACTTACAATGATGTTGGTGGCTGCAAGGAGCAGATTGAGAAGATGAGAGAGG
TGGTTGAGCTGCCAATGCTTCATCC*AGAGAAGTTCGTGAAGCTTGGAATAGATCCTCCC
AAGGGTGTTCTCTGCTACGGTCCTCCTGGTACCGGCAAAACCCTTTTGGCAAGAGCCGTT
GCTAACAGAACCGATGCTTGCTTTATCAGAGTTATTGGCAGCGAGCTTGTTCAGAAGTAT
GTCGGTGAGGGAGCTAGGATGGTTCGTGAACTGTTTCAGATGGCTCGGTCCAAAAAAGCT
TGCATTGTGTTCTTTGATGAAGTTGATGCCATTGGTGGTGCAAGATTTGATGACGGTGCG
GGAGGTGATAACGAAGTCCAACGTACTATGCTTGAGATTGTGAATCAGCTTGATGGGTTT
GACGCACGGGGTAACATCAAGGTTCTTATGGCAACAAACAGGCCTGACACGCTGGACCCT
GCTCTTCTACGTCCTGGACGTCTTGACCGTAAGGTTGAGTTTGGTCTTCCTGACCTGGAG
AGCAGAACACAGATCTTCAAGATTCACACAAGAACCATGAACTGCGAGAGAGACATCCGT
TACGAACTCCTTGCTCGTCTCTGCCCGAACTCAACTGGAGCTGATATCAGAAGTGTGTGC
ACTGAAGCTGGAATGTATGCAATAAGAGCTAGGAGAAAGACTGTGACTGAGAAAGACTTT
CTGGACGCAGTGAACAAAGTCATCAAAGGTTATCAGAAGTTCAGTGCAACTCCCAAGTAC
ATGGTCTACAATTAGACTTTCTTTAGCAGAGCATATGTTCCATCAACTTTTGTTTTCGTC
TTCAATGTACTTTTTGACTCTTTAGAGATTCTCCTTTTTAAGTTTGTTATTTGCAGTCAA
AATCTTATGAAATAATTGAACCAGATCTAAATAGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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CTGGTTTAGCTCTTCCTAGTCAATGGGATCTCGTCGCTGATAAACAGATGATGCAAGAGG
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AGTACGTCATCAATGTCAAACAGATTGCTAAGTTTGTCGTTGGCCTTGGCGATAAAGTGT
CTCCCACTGACATTGAAGAAGGCATGCGTGTAGGAGTTGATAGGACCAAGTATCAGATAC
AGATTCCTCTACCTCCAAAGATCGATCCTAGTGTCACCATGATGACTGTTGAAGAGAAAC
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TGGTTGAGCTGCCAATGCTTCATCC*AGAGAAGTTTGTGAAGCTTGGAATAGATCCTCCC
AAGGGAGTTCTCTGCTACGGTCCTCCTGGTACCGGCAAA*CCCTTTTGGCAAGAGCCGTT
GCTAACAGAACCGATGCTTGCTTTATCAGAGT
ATG

QA 1 752 1 752
DS 

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AGTTTGTCGTTGGCCTTGGCGATAAAGTGTCTCCCACTGACATTGAAGAAGGCATGCGTG
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DS 

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GCCAAGTACGTCATCAATGTCAAACAGATTGCTAAGTTTGTCGTTGGCCTTGGCGATAAA
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GAGGTGGTTGAGCTGCCAATGCTTCATCC*AGAGAAGTTCGTGAAGCTTGGAATAGATCC
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CGTTGCTAACAGAACCGATGCTTGCTTTATCAGAGTTATTGGCAGCGAGCTTGTTCAGAA
GTATGTCGGTGAGGGAGCTAGGATGGTTCGTGAACTGTTTCAGATGGCTCGGTCCAAAAA
AGCTTGCATTGTGTTCTTTGATGAAGTTGATGCCATTGGTGGTGCAAGATTTGATGACGG
TGCGGGAGGTGATAA

QA 1 615 1 615
DS 

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CTTGTTCAGAAGTATGTCGGTGAGGGAGCTAGGATGGTTCGTGAACTGTTTCAGATGGCT
CGGTCCAAAAAAGCTTGCATTGTGTTCTTTGATGAAGTTGATGCCATTGGTGGTGCAAGA
TTTGATGACGGTGCGGGAGGTGATAACGAAGTCCAACGTACTATGCTTGAGATTGTGAAT
CAGCTTGATGGGTTTGACGCACGGGGTAACATCAAGGTTCTTATGGCAACAAACAGGCCT
GACACGCTGGACCCTGCTCTTCTACGTCCTGGACGTCTTGACCGTAAGGTTGAGTTTGGT
CTTCCTGACCTGGAGAGCAGAACACAGATCTTCAAGATTCACATAAGAACCATGAACTGC
GAGAGAGACATCCGTTACGAACTCCTTGCTCGTCTCTGCCCGAACTCAACTGGAGCTGAT
ATCAGAAGTGTGTGCACTGAAGCTGGAATGTATGCAATAAGAGCTAGGAGAAAGACTGTT
ACTGAGAAAGACTTTTTGGACGCAGTGAACAAAGTCATCAAAGGTTATCAGAAGTTCAGT
GCAACTCCCAAGTACATGGTCTACAATTAGACTTTCTTTAGCAGAGCATATGTTCCATCA
ACTTTTGTTTTCGTCTTCAGTGTGCTTTTTGACTCTTTAGATATTCTCCTTTTTAAGTTT
GTTATTTGCAGTCAAAATTTTATGAAATAATTGAACCAGA
CCG

QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1BD83JQ 716 0 0
AGCGAGCTTGTTCAGAAGTATGTTGGTGAGGGAGCTAGGATGGTTCGTGAACTGTTTCAG
ATGGCCCGGTCCAAAAAAGCTTGCATTGTGTTCTTTGATGAAGTTGATGCCATTGGTGGT
GCAAGATTTGATGACGGTGCGGGAGGTGATAACGAAGTCCAACGTACTATGCTTGAGATT
GTGAATCAGCTTGATGGGTTTGACGCACGGGGTAACATCAAGGTTCTTATGGCAACAAAC
AGGCCTGACACGCTGGACCCTGCTTTTTTACGTCCTGGACGTCTTGACCGTAAGGTTGAG
TTTGGTCTTCCTGATCTGGAGAGCAGAACACAGATCTTCAAGATTCACACAAGAACCATG
AACTGCGAGATAGACATCCGTTACGAACTCCTTGCTCGTCTCTGCCCGAACTCAACTGGA
GCTGATATCAGAAGTGTGTGCACTGAGGCTGGAATGTATGCGATCAGAGCTAGGAGAAAG
ACTGTGACTGAGAAAGACTTTCTGGACGCAGTGAACAAAGTCATCAAAGGTTATCAGAAG
TTCAGTGCCACTCCCAAGTACATGGTCTACAATTAGACTTTCTTTAGCAGAGCATATGTT
CCATCAACTTTTGTTTTCGTCTTCCATGTACTTTT*GACTCTTTT*AGATTCTTCTTTT*
AAGTTTGTTATTTGCAGTCAAA*TCTTATGAATTAATTGAACCAGATCTAAATAGT

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 5

CO CL1684Contig1 756 5 24 U
GGCTTCTAGGCTGCAGTGAAAAAGAAAGAGGCGAAGGAAGTTCAATTAGGGTTTTGTGAA
TCGCAGCTTCTTCGGAAAAAAAAAAACCAGCGAAGAGATGAGCCGGAGTCTGGGGATACC
GGTGAAGCTTCTTCACGAGTCGTCGGGTCATACAGTGACGGTGGAGCTGAAGAGCGGTGA
GCTGTACAGAGGAAACCTTCTCGAGTGTGAGGATAACTGGAACTGCCAGCTCGAGAACAT
CACCTATACCGCCAAGGATGGTAAGGTATCACAGCTTGAGCATGTCTTCATCCGAGGCAG
CAAAGTCAGGTTTATAGTGATACCAGACATGCTGAAGAATGCTCCGATGTTCAAGCGAGT
AAATGACAAAATCAAGGGAAAGAGCTCAATAGGTCTAGGCAGAGGTAGACCTTCAATGCG
AGGCAGAGGTACTGGGCGTGGGACAGGAGGAAGAGGAGGCGCACCACCTGTGAGGAGATA
GATCTTCTTCGGCTATGAGACAATTCTATTCAGCATCCAGGAGAAGCCAGCC*ATCTTCA
GCTTGTCGTTTATGCATCTTATGGTACTCATTAAACTCTCCTACAAGAAGAGAACCAGAG
AGAGAAAGGAACTAGTTTTGTATTTGTGCGTTACTATTGAACACCATGCGAAGATTATAT
AATGTTTCAAGTCTCAGTGGATCATCTGATGATTGTTGTAACTTCCTTTATAACAATTTT
ATTGCTCAAGCTATCATCGGACAAATATGGTCAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AX65TF U 1
AF RS1EZ22TF U 38
AF RS1EZ22JQ C 78
AF RS1DJ04TF U 9
AF RS1AX65JQ C 199
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RD RS1AX65TF 701 0 0
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CACCTATACCGCCAAGGATGGTAAGGTATCACAGCTTGAGCATGTCTTCATCCGAGGCAG
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AGGCAGAGGTACTGGGCGTGGGACAGCAGGAAGGGGAGGCGCACCACCTGTGAGGAGATA
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GCTTGTCGTTTATGCATCTTATGGTACTCATTAAACTCTCCTACAAGAAGAGAACCAGAG
AGAGAAAGGAACTAGTTTTGTATTTGTGCGTTACTATTGAACACCATGCGAAGATTATAT
AATGTTTCAAGTCTTAGTGGATCATCTGATGATTGTTGTA
G

QA 1 700 1 700
DS 

RD RS1EZ22TF 672 0 0
GG
GTTCAATTAGGGTTTTGTGAATCGCAGCTTCTTCGGAAAAAAAAA**CCAGCGAAGAGAT
GAGCCGGAGTCTGGGGATACCGGTGAAGCTTCTTCACGAGTCGTCGGGTCATACAGTGAC
GGTGGAGCTGAAGAGCGGTGAGCTGTACAGAGGAAACCTTCTCGAGTTTGAGGATAACTG
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GCATGTCTTCATCCGAGGCAGCAAAGTCAGGTTTATAGTGATACCAGACATGCTGAAGAA
TGCTCCGATGTTCAAGCGAGTAAATGACAAAATCAAGGGAAAGAGCTCAATAGGTCTAGG
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CGCACCACCTG**AGGAGATAGATCTTCTTCGGCTATGAGACAATTCTATTCAGCATCCA
GGAGAAGCCAGCC*ATCTTCAGCTTGTCGTTTATGCATCTTATGGTACTCATTAAACTCT
CCTACAAGAAGAGAACCAGAGAGAGAAAGGAACTAGTTTTGTATTTCTGCGTTACTATTG
AACACCATGCGAAGATTATATAATGTTTCAAGTCTCAGTGGATCATCTGATGATTGTTGT
A
ACTTTCAAA

QA 3 663 3 663
DS 

RD RS1EZ22JQ 629 0 0
AAAAAAAAACCAGCGAAGAGATGAGCCGGAGTCTGGGGATACCGGTGAAGCTTCTTCACG
AGTCGTCGGGTCATACAGTGACGGTGGAGCTGAAGAGCGGTGAGCTGTACAGAGGAAACC
TTCTCGAGTTTGAGGATAACTGGAACTGCCAGCTCGAGAACATCACCTATACCGCCAAGG
ATGGTAAGGTATCACAGCTTGAGCATGTTTTCATCCGAGGCAGCAAAGTCAGGTTTATAG
TGATACCAGACATGCTGAAGAATGCTCCGATGTTCAAGCGAGTAAATGACAAAATCAAGG
GAAAGAGCTCAATAGGTTTAGGCAGAGGTAGACCTTCAATGCGAGGCAGAGGTACTGGGC
GTGGGACAGGAGGAAGAGGAGGCGCACCACCTG**AGGAGATAGATTTTTTTCGGCTATG
AGACAATTTTATTCAGCATCCAGGAGAAGCCAGCC*ATCTTCAGCTTGTCGTTTATGCAT
CTTATGGTACTCATTAAACTCTCCTACAAGAAGAGAACCAGAGAGAGAAAGGAACTAGTT
TTGTATTTTTGCGTTACTATTGAACACCATGCGAAGATTATATAATGTTTCAAGTCTCAG
TGGATCATCTGATGATTGTTGTA
ACTTTC

QA 1 623 1 623
DS 

RD RS1DJ04TF 748 0 0
GGGGCAGTGAAAACAT
AAAGAGGCGAAGGGAGTTCAATTAGGGTTTTGTGAATCGCAGCTTCTTCGGAAAAAAAAA
AACCAGCGAAGAGATGAGCCGGAGTCTGGGGATACCGGTGAAGCTTCTTCACGAGTCGTC
GGGTCATACAGTGACGGTGGAGCTGAAGAGCGGTGAGCTGTACAGAGGAAACCTTCTCGA
GTGTGAGGATAACTGGAACTGCCAGCTCGAGAACATCACCTATACCGCCAAGGATGGTAA
GGTATCACAGCTTGAGCATGTCTTCATCCGAGGCAGCAAAGTCAGGTTTATAGTGATACC
AGACATGCTGAAGAATGCTCCGATGTTCAAGCGAGTAAATGACAAAATCAAGGGGAAGAG
CTCAATAGGTCTAGGCAGAGGTAGACCTTCAATGCGAGGCAGAGGTACTGGGCGTGGGAC
AGGAGGAAGAGGAGGCGCACCACCTGTGAGGAGATAGATCTTCTTCGGCTATGAGACAAT
TCTATTCAGCATCCAGGAGAAGCCAGCC*ATCTTCAGCTTGTCGTTTATGCATCTTATGG
TACTCATTAAACTCTCCTACAAGAAGAGAACCAGAGAGAGAAAGGAACTAGTTTTGTATT
TCTGCGTTACTATTGAACACCATGCGAAGATTATATAATGTTTCAAGTCTCAGTGGATCA
TCTGATGATTGTTGTAACTTTCTTTATAACAGTTTTATTGCTCAAGCTATCATCGGACAA
ATATGGTCAAGA

QA 17 748 17 748
DS 

RD RS1AX65JQ 545 0 0
TCTCGAGTGTGAGGATAACTGGAACTGCCAGCTCGAGAACATCACCTATACCGCCAAGGA
TGGTAAGGTATCACAGCTTGAGCATGTCTTCATCCGAGGCAGCAAAGTCAGGTTTATAGT
GATACCAGACATGCTGAAGAATGCTCCGATGTTCAAGCGAGTAAATGATAAAATCAAGGG
AAAGAGCTCAATAGGTCTAGGCAGAGGTAGACCTTCAATGCGAGGCAGAGGTACTGGGCG
TGGGACAGCAGGAAGGGGAGGCGCACCACCTGTGAGGAGATAGATCTTCTTCGGCTATGA
GACAATTCTATTCAGCATCCAGGAGAAGCCAGCCCATCGTCAGCTTGTCGTTTATGCATC
TTATGGTACTCATTAAACTCTCCTACAAGAAGAGAACCAGAGAGAGAAAGGAACTAGTTT
TGTATTTGTGCGTTACTATTGAACACCATGCGAAGATTATATAATGTTTCAAGTCTTAGT
GGATCATCTGATGATTGTTGTAGCTTCCTTTATAACAATTTTATTGCTCAAG
TTATTAATCAGAC

QA 1 532 1 532
DS 



AS 1 5

CO CL1685Contig1 683 5 5 U
GGATAGATAATCACATCATTAGCTATATAATCACAAATTAATTCAACGCCAATTGGGGTT
TATCAACTTTGAGATCAATGGAATCCAACAGATCTTTTTCCGCAGCCCTCTTCCTATCTC
TTAATCTCATGTTTTTT*GCGTATGTAAGTGGCTGCAACACTTGCTTGCCGCCTAAGCCA
ATCCCTAACCCTAACCCTATCAGCAATCCTACAAAACATAGCTGCCCAAGAGACGCCCTA
AAACTCGGAGTTTGCGCCAAAATACTGGACGGTGCGGTCGGAACAGTCATCGGAAACCCA
CCAGACACACCTTGCTGCTCATTCCTTCAAGGCCTCGTCGATCTTGAAGCTGCCGTTTGT
CTTTGCACCGCCATTAAAGCTAACGTTCTGGGGATTAACATTGATATTCCCATCTCCTTG
AGCTTACTCATCAATACTTGCGGCAAAGAGCTTCCCTCTGATTTTATTTGCGCCTGATGA
GTGTAAAGCGGACAGATCGAGTAGTTTGATTTGTTTGTAGTCTTTTGCTTCTGTTTGTTT
GGTCGGTCCTCGTCTAGTTCAGTCCGCAATTTCTTTTTCTTTTGGTCATCTCTAAGAGTT
TCGTACTTTGGTTGATGTAATATTTGATCTGTTTCATGCTATCAGTTCACATGTGTTAAG
TGTGTGCAAGTAGGTTTACAGAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BF35TF U 1
AF RS1EG50TF U 1
AF RS1EG50JQ C 133
AF RS1CI60JQ C 54
AF RS1CI60TF U 54
BS 1 137 RS1BF35TF
BS 138 138 RS1EG50TF
BS 139 645 RS1BF35TF
BS 646 650 RS1EG50TF
BS 651 683 RS1CI60TF

RD RS1BF35TF 645 0 0
GGATAGATAATCACATCATTAGCTATATAATCACAAATTAATTCAACGCCAATTGGGGTT
TATCAACTTTGAGATCAATGGAATCCAACAGATCTTTTTCCGCAGCCCTCTTCCTATCTC
TTAATCTCATGTTTTTTTGCGTATGTAAGTGGCTGCAACACTTGCTTGCCGCCTAAGCCA
ATCCCTAACCCTAACCCTATCAGCAATCCTACAAAACATAGCTGCCCAAGAGACGCCCTA
AAACTCGGAGTTTGCGCCAAAATACTGGACGGTGCGGTCGGAACAGTCATCGGAAACCCA
CCAGACACACCTTGCTGCTCATTCCTTCAAGGCCTCGTCGATCTTGAAGCTGCCGTTTGT
CTTTGCACCGCCATTAAAGCTAACGTTCTGGGGATTAACATTGATATTCCCATCTCCTTG
AGCTTACTCATCAATACTTGCGGCAAAGAGCTTCCCTCTGATTTTATTTGCGCCTGATGA
GTGTAAAGCGGACAGATCGAGTAGTTTGATTTGTTTGTAGTCTTTTGCTTCTGTTTGTTT
GGTCGGTCCTCGTCTAGTTCAGTCCGCAATTTCTTTTTCTTTTGGTCATCTCTAAGAGTT
TCGTACTTTGGTTGATGTAATATTTGATCTGTTTCATGCTATCAG

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1EG50TF 650 0 0
GGATAGATAATCACATCATTAGCTATATAATCACAAATTAATTCAACGCCAATTGGGGTT
TATCAACTTTGAGATCAATGGAATCCAACAGATCTTTTTCCGCAGCCCTCTTCCTATCTC
TTAATCTCATGTTTTTT*GCGTATGTAAGTGGCTGCAACACTTGCTTGCCGCCTAAGCCA
ATCCCTAACCCTAACCCTATCAGCAATCCTACAAAACATAGCTGCCCAAGAGACGCCCTA
AAACTCGGAGTTTGCGCCAAAATACTGGACGGTGCGGTCGGAACAGTCATCGGAAACCCA
CCAGACACACCTTGCTGCTCATTCCTTCAAGGCCTCGTCGATCTTGAAGCTGCCGTTTGT
CTTTGCACCGCCATTAAAGCTAACGTTCTGGGGATTAACATTGATATTCCCATCTCCTTG
AGCTTACTCATCAATACTTGCGGCAAAGAGCTTCCCTCTGATTTTATTTGCGCCTGATGA
GTGTAAAGCGGACAGATCGAGTAGTTTGATTTGTTTGTAGTCTTTTGCTTCTGTTTGTTT
GGTCGGTCCTCGTCTAGTTCAGTCCGCAATTTCTTTTTCTTTTGGTCATCTCTAAGAGTT
TCGTACTTTGGTTGATGTAATATTTGATCTGTTTCATGCTATCAGTTCAC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RS1EG50JQ 518 0 0
TTTTTTGCGTATGTAAGTGGCTGCAACACTTGCTTGCCGCCTAAGCCAATCCCTAACCCT
AACCCTATCAGCAATCCTACAAAACATAGCTGCCCAAGAGACGCCCTAAAACTCGGAGTT
TGCGCCAAAATACTGGACGGTGCGGTCGGAACAGTCATCGGAAACCCCCCAGACACACCT
TGCTGCTCATTCCTTCAAGGCCTCGTCGATCTTGAAGCTGCCGTTTGTCTTTGCACCGCC
ATTAAAGCTAACGTTCTGGGGATTAACATTGATATTCCCATCTCCTTGAGCTTACTCATC
AATACTTGCGGCAAAGAGCTTCCCTCTGATTTTATTTGCGCCTGATGAGTGTAAAGCGGA
CAGATCGAGTAGTTTGATTTGTTTGTAGTCTTTTGCTTCTGTTTGTTTGGTCGGTCCTCG
TCTAGTTCAGTCCGCAATTTCTTTTTCTTTTGGTCATCTCTAAGAGTTTCGTACTTTGGT
TGATGTAATATTTGATCTGTTTCATGCTATCAGTTCAC

QA 1 518 1 518
DS 

RD RS1CI60JQ 630 0 0
G
GGGGTTTATCAACTTTGAGATCAATGGAATCCAACAGATCTTTTTCCGCAGCCCTCTTCC
TATCTCTTAATCTCATGTTTTTT*GCGTATGTAAGTGGCTGCAACACTTGCTTGCCGCCT
AAGCCAATCCCTAACCCTAACCCTATCAGCAATCCTACAAAACATAGCTGCCCAAGAGAC
GCCCTAAAACTCGGAGTTTGCGCCAAAATACTGGACGGTGCGGTCGGAACAGTCATCGGA
AACCCACCAGACACACCTTGCTGCTCATTCCTACAAGGCCTCGTCGATCTTGAAGCTGCC
GTTTGTCTTTGCACCGCCATTAAAGCTAACATTCTGGGGATTAACATTGATATTCCCATC
TCCTTGAGTTTACTCATCAATACTTGCGGCAAAAAGCTTCCCTCTGATTTTATTTGCGCC
TGATGAGTGTAAAGCGGACAGATCGAGTAGTTTGATTTGTTTGTACTCTTTTGCTTCTGT
TTGTTTGGTCGGTCCTCGTCTAGTTCAGTCCGCAATTTCTTTTTCTTTTGGTCATCTCTA
AGAGTTTCGTACTTTGGTTGATGTAATATTTGATCTGTTTCATGCTATCAGTTCACATGT
GTTAAGTGTGTGCAAGTAGGTTTACAGAT

QA 2 630 2 630
DS 

RD RS1CI60TF 630 0 0
G
GGGGTTTATCAACTTTGAGATCAATGGAATCCAACAGATCTTTTTCCGCAGCCCTCTTCC
TATCTCTTAATCTCATGTTTTTT*GCGTATGTAAGTGGCTGCAACACTTGCTTGCCGCCT
AAGCCAATCCCTAACCCTAACCCTATCAGCAATCCTACAAAACATAGCTGCCCAAGAGAC
GCCCTAAAACTCGGAGTTTGCGCCAAAATACTGGACGGTGCGGTCGGAACAGTCATCGGA
AACCCACCAGACACACCTTGCTGCTCATTCCTACAAGGCCTCGTCGATCTTGAAGCTGCC
GTTTGTCTTTGCACCGCCATTAAAGCTAACATTCTGGGGATTAACATTGATATTCCCATC
TCCTTGAGTTTACTCATCAATACTTGCGGCAAAAAGCTTCCCTCTGATTTTATTTGCGCC
TGATGAGTGTAAAGCGGACAGATCGAGTAGTTTGATTTGTTTGTACTCTTTTGCTTCTGT
TTGTTTGGTCGGTCCTCGTCTAGTTCAGTCCGCAATTTCTTTTTCTTTTGGTCATCTCTA
AGAGTTTCGTACTTTGGTTGATGTAATATTTGATCTGTTTCATGCTATCAGTTCACATGT
GTTAAGTGTGTGCAAGTAGGTTTACAGAT

QA 2 630 2 630
DS 



AS 2 5

CO CL1686Contig1 705 3 1 U
GAGCCACACCTGTTCACATACGCCAACTCAAACTTTGTATATCTATCTACCCCCACTGGA
CTCAAATCAATCAAACCAGTTCACAAATTTTCTTCTCCCCTTATGGAACCACCAAGCAAG
AAACCTCTCGTACTAGAAACTACCACTAGTACGAAGATGGAGACCAAATACGAAGATATG
TTACCGATCATGGCAGAGAAAATGGACGTTGAAGAGTTTGTATCAGAGCTATGCAAAGGT
TTCAGTCTGCTAGCGGATCCAAAGAGAGATCTGATAACAGCTGAGAGTCTAAGGAGAAAC
TCGAGGGTGCTTGGGATTGAAGGAATGAGCGAGGAAGATGCGCAAGGAATGGTTAGAGAA
GGAGACCTCGACGGAGATGGTGCTCTTAACCAAACCGAGTTCTGTGTTCTCATGGTTCGG
TTAAGCCCTGAGATGATGGAAGATGCAGAAACTTGGCTGGAGAAAGCTATCAGCCAAGAA
CTTAATAATCACAATCATTCTTCTCTGCCTTGATGAATAACCTTTTCTTGTGCATTCTCT
TTCTTTCTCCTAAACTTTTGAATGTTTCTGAATATTTTCAAAGCTCTTTTGGCATGAACA
ATTGAATGATTTAGAGAGAATCCAACCTTTTGTCATTATTTTCATTATCTCTATTATAAA
AAGAGAAGTACACTTAGGAAATGCTCCTAAGTTTTCAATGTAAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RS1B929TF U 71
AF RS1EP03JQ C 1
AF RS1EP03TF U 1
BS 1 705 RS1EP03TF

RD RS1B929TF 548 0 0
GGAAACC
AGTTCACAAATTTTCTTCTCCCCTTATGGAACCACCAAGCAAGAAACCTCTCGTACTAGA
AACTACCACTAGTACGAAGTTGGAGACCAAATACGAAGATATGTTACCGATCATGGCAGA
GAAAATGGACGTTGAAGAGTTTGTATCAGAGCTATGCAAAGGTTTCAGTCTGCTAGCGGA
TCCAAAGAGAGATCTGATAACAGCTGAGAGTCTAAGGAGAAACTCGAGGGTGCTTGGGAT
TGAAGGAATGAGCGAGGAAGATGCGCAAGGAATGGTTAGAGAAGGAGACCTCGACGGAGA
TGGTGCTCTTAACCAAACCGAGTTCTGTGTTCTCATGGTTCGGTTAAGCCCTGAGATGAT
GGAAGATGCAGAAACTTGGTTGGAGAAAGCTATCAGCCAAGAACTTAATAATCACAATCA
TTCTTCTCTGCCTTGATGAATAACCTTTTCTTGTGCATTCTCTTTCTTTCTCCTAAACTT
TTGAATGTTTCTGAATATTTTCAAAGCTCTTTTGGCATGAACAATTGAATGATTTAGAGA
G

QA 8 548 8 548
DS 

RD RS1EP03JQ 701 0 0
GAGCCACACCTGTTCACATACGCCAACTCAAACTTTGTATATCTATCTACCCCCACTGGA
CTCAAATCAATCAAACCAGTTCACAAATTTTCTTCTCCCCTTATGGAACCACCAAGCAAG
AAACCTCTCGTACTAGAAACTACCACTAGTACGAAGATGGAGACCAAATACGAAGATATG
TTACCGATCATGGCAGAGAAAATGGACGTTGAAGAGTTTGTATCAGAGCTATGCAAAGGT
TTCAGTCTGCTAGCGGATCCAAAGAGAGATCTGATAACAGCTGAGAGTCTAAGGAGAAAC
TCGAGGGTGCTTGGGATTGAAGGAATGAGCGAGGAAGATGCGCAAGGAATGGTTAGAGAA
GGAGACCTCGACGGAGATGGTGCTCTTAACCAAACCGAGTTCTGTGTTCTCATGGTTCGG
TTAAGCCCTGAGATGATGGAAGATGCAGAAACTTGGCTGGAGAAAGCTATCAGCCAAGAA
CTTAATAATCACAATCATTCTTTTCTGCCTTGATGAATAACCTTTTCTTGTGCATTCTCT
TTCTTTCTCCTAAACTTTTGAATGTTTCTGAATATTTTCAAAGCTCTTTTGGCATGAACA
ATTGAATGATTTAGAGAGAATCCAACCTTTTGTCATTATTTTCATTATCTCTATTATAAA
AAGAGAAGTACACTTAGGAAATGCTCCTAAGTTTTCAATGT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RS1EP03TF 705 0 0
GAGCCACACCTGTTCACATACGCCAACTCAAACTTTGTATATCTATCTACCCCCACTGGA
CTCAAATCAATCAAACCAGTTCACAAATTTTCTTCTCCCCTTATGGAACCACCAAGCAAG
AAACCTCTCGTACTAGAAACTACCACTAGTACGAAGATGGAGACCAAATACGAAGATATG
TTACCGATCATGGCAGAGAAAATGGACGTTGAAGAGTTTGTATCAGAGCTATGCAAAGGT
TTCAGTCTGCTAGCGGATCCAAAGAGAGATCTGATAACAGCTGAGAGTCTAAGGAGAAAC
TCGAGGGTGCTTGGGATTGAAGGAATGAGCGAGGAAGATGCGCAAGGAATGGTTAGAGAA
GGAGACCTCGACGGAGATGGTGCTCTTAACCAAACCGAGTTCTGTGTTCTCATGGTTCGG
TTAAGCCCTGAGATGATGGAAGATGCAGAAACTTGGCTGGAGAAAGCTATCAGCCAAGAA
CTTAATAATCACAATCATTCTTCTCTGCCTTGATGAATAACCTTTTCTTGTGCATTCTCT
TTCTTTCTCCTAAACTTTTGAATGTTTCTGAATATTTTCAAAGCTCTTTTGGCATGAACA
ATTGAATGATTTAGAGAGAATCCAACCTTTTGTCATTATTTTCATTATCTCTATTATAAA
AAGAGAAGTACACTTAGGAAATGCTCCTAAGTTTTCAATGTAAAA

QA 1 705 1 705
DS 



CO CL1686Contig2 550 2 2 U
GAAAAGAGTTCACAAATTTTCTTCTCTCCTTATGGAACCACCAAGCAAGAAACCTCTTGT
ACTAGAAACTACTACTACTAGTACGAAGATGGAGACCAAATATGAAGATATGTTACCGAT
CATGGCAGAGAAAATGGACGTTGAAGAGTTTGTATCAGAGCTATGCAAAGGTTTCGAATT
GCTAGCGGATCCAGAGAGAGATCTGATAACAGCTGAGAGTCTAAGGAGAAACTCGAGGGT
ACTTGGGATTGAAGGAATGAGCGAGGAAGATGCGCAAGGAATGGTTATAGAAGGAGACCT
CGACGGAGATGGTGCTCTTAACCAAACCGAGTTCTGTGTTCTCATGGTTCGGTTAAGCCC
CGAGATGATGGAAGATGCAGAAACTTGGCTGGAGAAAGCTATCAGCCAAGAACTTAATAA
TCACAATCATTCTTCTCTGCCTTGATGAATAACCTTTTCTTGTGCATTCTCTTTCTTTCT
CCTAAACTTTTGAATGTTTCTGAATATTTTCAAAGCTCTTTTGGCATGAACAATTGAATG
ATTTAGAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1F455JQ C 1
AF RS1F455TF U 1
BS 1 6 RS1F455JQ
BS 7 550 RS1F455TF

RD RS1F455JQ 550 0 0
GAAAAGAGTTCACAAATTTTCTTCTCTCCTTATGGAACCACCAAGCAAGAAACCTCTTGT
ACTAGAAACTACTACTACTAGTACGAAGATGGAGACCAAATATGAAGATATGTTACCGAT
CATGGCAGAGAAAATGGACGTTGAAGAGTTTGTATCAGAGCTATGCAAAGGTTTCGAATT
GCTAGCGGATCCAGAGAGAGATTTGATAACAGCTGAGAGTCTAAGGAGAAACTCGAGGGT
ACTTGGGATTGAAGGAATGAGCGAGGAAGATGCGCAAGGAATGGTTATAGAAGGAGACCT
CGACGGAGATGGTGCTTTTAACCAAACCGAGTTCTGTGTTCTCATGGTTCGGTTAAGCCC
CGAGATGATGGAAGATGCAGAAACTTGGCTGGAGAAAGCTATCAGCCAAGAACTTAATAA
TCACAATCATTTTTCTCTGCCTTGATGAATAACCTTTTCTTGTGCATTCTCTTTCTTTCT
CCTAAACTTTTGAATGTTTCTGAATATTTTCAAAGCTCTTTTGGCATGAACAATTGAATG
ATTTAGAGAG

QA 1 550 1 550
DS 

RD RS1F455TF 550 0 0
GAAAAG
AGTTCACAAATTTTCTTCTCTCCTTATGGAACCACCAAGCAAGAAACCTCTTGTACTAGA
AACTACTACTACTAGTACGAAGATGGAGACCAAATATGAAGATATGTTACCGATCATGGC
AGAGAAAATGGACGTTGAAGAGTTTGTATCAGAGCTATGCAAAGGTTTCGAATTGCTAGC
GGATCCAGAGAGAGATCTGATAACAGCTGAGAGTCTAAGGAGAAACTCGAGGGTACTTGG
GATTGAAGGAATGAGCGAGGAAGATGCGCAAGGAATGGTTATAGAAGGAGACCTCGACGG
AGATGGTGCTCTTAACCAAACCGAGTTCTGTGTTCTCATGGTTCGGTTAAGCCCCGAGAT
GATGGAAGATGCAGAAACTTGGCTGGAGAAAGCTATCAGCCAAGAACTTAATAATCACAA
TCATTCTTCTCTGCCTTGATGAATAACCTTTTCTTGTGCATTCTCTTTCTTTCTCCTAAA
CTTTTGAATGTTTCTGAATATTTTCAAAGCTCTTTTGGCATGAACAATTGAATGATTTAG
AGAG

QA 7 550 7 550
DS 



AS 1 5

CO CL1687Contig1 1382 5 19 U
GGGCTGAAGGAATCGCTAACTCCCAGGTTTTGACCAGTAACGCTATCGATATCTTCCATT
CTATTGTCACCGCTATGTCCCAAATGGGTTTCAAAGTCGATGATGTGGGAGGAATTGGAG
CTCCTGGGCGTCGCCTTCTTGAAGACATCGACGCAAAGGGACTACCGAAATGGCTTTCTG
GCAAAGACAGGAAGCTTATGGCTCAGGTGGGACGTGGTGGTGATGATGGTATCGGTGAAG
GAGGCGGTAGTGGCGGTAAGATCAAGGCGACTCATGTGGTGGCTAAGGATGGAAGTGGAA
ACTTTAAGACGATTTCTGAAGCGGTTAACGCTTGCCCGGAGAAAAACCCTGGACGTTGCA
TTATCCATATCAAGGCTGGTGTCTACAAGGAAATGGTCAGAATCCCTAAGAAGAAGAACA
ACATTTTCATGTTTGGAGATGGTGCTACAAAAACCATCATTACTAATGACAAAAGTGTTG
CCCTTAGCAAAACCACTACTTCACTCAGTGCCACCGTTCAGGTTGAATCTGAGGGATTCA
TGGCGAAATGGATCGGATTCCAGAACACTGCTGGTCCATTGGGACACCAAGCGGTCGCAT
TCCGTGTGAACGGAGACCGTGCGGTCATATTCAACTGTAGATTTGACGCTTTCCAAGACA
CACTCTACGTCAACAACGGACGTCAGTTCTACAGGAACATTGTTGTATCCGGTACAGTCG
ATTTCATCTTCGGAAAATCTGCTACCGTGATCCAAAACTCTCTAATCCTCATCAGAAAGG
GTAGCCAGGGACAGGCCCACTACGTAACAGCCGACGGTAACATGAAAGGTGAAGCGGTCA
AGATCGGTATCGTTCTTCAGAACTGCCGTATCATGGCAGACAAAGATCTCGAAGCTGAGA
AACTAACCACCAAATCGTACCTAGGACGCCCGTGGAAGAAATTTTCCACCACCGTTATTA
TTGGAACTGAGATTAGTGATGTGATTAAGCCAGAAGGATGGTCAGAATGGAAAGGAGAAG
CTAACCACAAAACAGCTAAATACATTGAGTTCAATAACCGTGGACCAGGAGCTAACACTG
CTGCTAGGGTTCCTTGGGCTAAGATCGCTAAGTCTGCGGCTGAGGTTGAAAAGTACACCG
TCGCTAAATGGTTGACTCCGGTTAACTGGATTCAAGAAGCCAACGTGCCTGTCCAGCTTG
GATTGTAAGAAAAACAAACAAACTAAAATTTACTAATAAAACAGTATGTGATTATGTAAA
GAGGTATATACGACCTCGTCTCTGGGGACCAGGGCTCTTTTTGATATTATTATACAATAT
AGGGGGTTCTAGACATTATGGGATGAAGTTTGTATAAGATTGCTTTTGTTTCACGTGCAA
AA


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 15 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 

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ACC

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GG

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G
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AAAATCTGCTACCGTGATCCAAAACTCTCTAATCCTCATCAGAAAGGGTAGCCAGGGACA
GGCCCACTACGTAACAGCCGACGGTAACATGAAAGGTGAAGCGGTCAAGATCGGTATCGT
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DS 



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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CY26TF U 1
AF RS1FT72TF U 75
AF RS1BZ68TF U 85
AF RS1CY26JQ C 92
AF RS1FT72JQ C 729
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RD RS1CY26TF 687 0 0
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GAAAAGAAATAGAGAGAGTTTCTTCGCCGGAAAAGAAAAATTAAATTAAACTCTTCCGCC
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AACCTGAAGAAGAACCGTACATGCCAG

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DS 

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G
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GGAGAGTTCTTCTGAAAGTCATCATCCTCGGAGATAGCGGGGTTGGGAAGACATCGTTGA
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GGTGTGCATCTAAAGGAAACATTCCTTACTTTGAGACATCAGCCAAAGAAGGGTTCGATG
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AATGCTAATCACAGAGAGGGTACTATTAGTAT

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DS 

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AATTGTAATGTCAGTTCGTTGAAATGAATTGTTTT

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DS 

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AAAGAAAAATTAAATTAAACTCTTCCGCCAAATGTCGTCTCGCCGGAGAGTTCTTCTGAA
AGTCATCATCCTCGGAGATAGCGGGGTTGGGAAGACATCGTTGATGAATCAGTTTGTGAA
TCGCAAATTTAGCAATCAGTATAAAGCGACGATTGGAGCAGATTTCTTGACTAAAGAGGT
TCAAATTGATGACAGGATCTTCACTTTACAGATTTGGGATACTGCTGGGCAAGAAAGGTT
CCAAAGTTTGGGAGTAGCTTTCTACGGAGGAGCTGATTGTTGTGTTCTTGTGAACGATGT
CAATGTTATGAAGTCTTTTGAGAATCTTAATAACTGGAGAGAAGAGTTCTTGACTCAGGC
TAATCCATCCGATCCTGAAAACTTCCCTTTTGTCGTGTTGGGAAACAAGACCGATGTTGA
TGGTGGCAAAAGCCGAGTGGTTTCTGAGAAGAAAGCAAAGGCATGGTGTGCATCTAAAGG
AAACATTCCTTACTTTGAGACATCAGCCAAAGAAGGGTTCTATGTAGATGCAGCTTTTGA
ATGCATAACCAAAAACGCATTCAAGAATGAACCTGAAGAAGAACCGTACATGCCAGACAC
CATTGATGTTGCTGGAGGTCAGCAACAAAGATCAACAGGGTGTGAATGCTAATCACAGAG
AGGGTACTATTAGTATTCTGTTTTTCTTTTTCAATTTTTTATTTTGTATCACACAATATC
AATTGTAATGTCAGTTCGTTGAAATGAATTGTTTTCCAATTCCAGACAATATATTAAAAA
CATGTAATGTCATC

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DS 

RD RS1FT72JQ 182 0 0
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TTTATTTTGTATCACACAATATCAATTGTAATGTCAGTTCGTTGAAATGAATTGTTTTCC
AATTCCAGACAATATATTAAAAACATGTAATGTCATCACATTGTGATCTTTCTTTCTGTC
TC

QA 1 182 1 182
DS 



AS 1 5

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CGCGGCGGGTGCAGCCAATCTGCCGGCGTCTTCAATCGGTAGATCGATTCGGCGTTTACA
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AGATCGGACGATTGGCCGGATCCCCGCCGTGGTTTTCACTCAATCGCTTCTCGAGACTGA
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GAATAATAAGTCCCTTGAGAGAAGGATGTCCTGATGTCTATCTGTTGAACTTGACAAGGA
AAGAAGCACCCTTCAAGTCCTCTCTAGTTGCTTTTCTTTTTTTGTTCTTGAACGAAGCAA
ATTCAATTCGAATTGCTGATCAGATATCTGTTTTGTTTTTT*GCGTCTTTTGTGGAATGT
TACTTTAACTAGTAGTGCAAGAGTCCGAACAATGTGAATTTGGTCGTTAGCCATGAAAAT
AAGAGCCCTACAACGACTTGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1E971TF U 1
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AF RS1BL36TF U 264
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RD RS1E971TF 677 0 0
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CGCGGCGGGTGCAGCCAATCTGCCGGCGTCTTCAATCGGTAGATCGATTCGGCGTTTACA
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GGTCAGAGCTGGGCAAGGTTCTTCGTCTCTGGTTGAGTCGGGTCGTGTACTTCCTCTCAA
GATTCATAGAGATGAAGAAAGTGGGAAGATACTTAATTTAGTCTTCGTGTGGGCTAATGA
TGGAGAGCAGCTTAAGGTTGATGTTCCTCTTGTTTTCAAAGGATTAGATGATTCTCCAGG
TCTCAAGAAGGG*GGCAATCTACGGTCAATGCGAAGCACTCTGAAGCTTCTAGGCCCAGC
GGAGCACATTCCATCGAAAATCGAAGTAGACGTGAGCAAACTCGACATAGAGGACAAAGT
CTTGATGCAAGAAGTTG

QA 1 677 1 677
DS 

RD RS1FF03TF 703 0 0
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ACATCAGTATGAGACGATTCAGGCGATACCACGCGAGGCTACGGGGCGAAGAGTATCAGC
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G
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AAGCATAGAATAATAAGTCCCTTGAGAGAAGGATGTCCTGATGTCTATCTGTTGAACTTG
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GTTTAGTAAGAATGAGACCTTGCCTGTGTGTAAGATTGTTGCCACAAGTCTGGTCAAAGA
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TT*GCGTCTTTTGTGGAATGTTACTTTAACTAGTAGTGCAAGAGTCCGAACAATGTGAAT
TTGGTCGTTAGCCATGAAAATAAGAGCCCTACAACGACTTGGTCC

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DS 



AS 2 5

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TAACCCTGCCTATATTTTCTGAAAATATCCTCGGTTTCCGCGTTTCGGAACGCGCAGCAG
CCAATTATATAAACGATTATCAACCCGATTAACGCCAACAGAAGAAAGATATCTGCCTTT
AACCAATCAACCTTAAGATTTTGAAGCAAACCGGCTCTGCACGAATCACAAGCGTAGCAC
AAAGCGTTTTGGTCATTGTTCCACTGTAGACAATCCATATCTGCACTCATATCTATGGGA
CTTATCCAGTAAGTAGGGTTCACGAATGTGAATCCACATTTTGTTGGGGGCTTGCAGCAT
CCAGATTGAATGGGACTAAGATGAGCATTGAAGAAATCTAGAGCCGAAGTATATGTCTGA
TTCAGTTCAGGACAAATACTAGTAGTACTCAAACAAGTACGGATCCTATCCCATTTGTAA
GATCTCTGAACACGTCGACGCAAGTAACCAGAGAAATCTTGAAGACTATACTCAAGATAA
GCTCTGCTTGGTTCCGGATGACCAGAGCCTTTAATGGTGACCATGTAAATAAATCCGACA
AGAATCCC*TAGAAGTACGATGAGAACAAGCATGGCAATTAAGTAAACAATGAGAAGCCA
TGTGATTCTCCAGAACCCTCCTATGAAACCAGCAAGACCGACAAGAAGGATCAAGACTCC
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CCAGATCCCGGCGCCGATGACCGGAACTGAGAGGAGGACGGAGATGAAGTTTATGCAACC
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 10 10 25 25 10 25 25 10 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A560JQ U 1
AF RS1B202JQ U 1
AF RS1A560TF C 372
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RD RS1A560JQ 791 0 0
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TGTGATTCTCC

QA 1 791 1 791
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CCCAATAATTTGAAACATTCTCCCCGCTTTTGCCTCTAAACTTCTCAACCTGATCATGTA
TAACCCTGCCTATATTTTCTGAAAATATCCTCGGTTTCCGCGTTTCGGAACGCGCA**AG
CCAATTATATAAACGATTATCAACCCGATTAACGCCAGCAGAAGAAAGATATCTGCCTTT
AACCAATCAACCTTAAGATTTTGAAGCAAACCGGCTTTGCACGAATCA**AGCGTAGCAC
AAAGCGTTTTGGTCATTGCTCCACTGTAGACAATCCATATCTGCATTCATATCTATGGGA
CTTATACAGTAAGTAGGGTTCACGTATGTGAATCCACATTTTGTTGGGGGCTTGCAGCAA
CCAGATTGAATGGGACTAAGATGAGCATTGAAGAAATCTAGAGCCGAAGTATATGTCTGA
TTCAGTTCAGGACAAATACTAGTAGTACTCAAACAAGTACGGATCCTATCCCATTTGTAA
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AGTGAT
C

QA 1 786 1 786
DS 

RD RS1A560TF 767 0 0
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QA 1 767 1 767
DS 



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CGGTCTTGCTGGTTTCATAGGAGGGTTCTGGAGAATCACTTGGCTTCTCATTGTTTACTT
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AGATTTCTTCAATGCTCATCTTAGTCCCATTCAATCTGGTTGCTGCAAGCCCCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1B202TF U 1
AF RS1B304TF U 39
BS 1 655 RS1B202TF

RD RS1B202TF 655 0 0
GGGAATGTGGATCTTCTATCTCTCTCGCTCCATTTTTTCTCTCTCCCTAAGTTATCACGA
TTGTTGTTAAATCCCTTTCTTAACCCAAACAGATTTCAAAAACACAAAAGAGTCTATCTT
CCTCTCTTCCCAAAAAATGCCTTTAAGCAACAATGTAATCGGTTGCATAAACTTCATCTC
CGTCCTCCTCTCAGTTCCGGTCATCGGCGCCGGGATCTGGCTTGCCACCGGAGAAGTAAA
CTCCTGTGTGAAGCTCCTTCAGTGGCCAGTAATAATCCTCGGAGTCTTGATCCTTCTTGT
CGGTCTTGCTGGTTTCATAGGAGGGTTCTGGAGAATCACTTGGCTTCTCATTGTTTACTT
GATGGCCATGCTTGTTCTCATAGTACCTTTAGGTATTCTTGTCGGATTTATTTACATGGT
CACCATTAAAGGCTCTGGTCATCCGGAACCAAGCAGAGCTTATCTTGAGTATAGTCTTCA
AGATTTCTCTGGTTACTTGCGTCGACGTGCTCAGAGATCTTACAAATGGGATAGGATCCG
TACTTGTTTGAGTACTACTAGTATTTGTCCTGAACTGAATCAGACATATACTTCGGCTCT
AGATTTCTTCAATGCTCATCTTAGTCCCATTCAATCTGGTTGCTGCAAGCCCCCA

QA 1 655 1 655
DS 

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CTCTCTCCCTAAGTTATCACGATTGTTGTTAAATCCCTTTCTTAACCCAAACAGATTTCA
AAAACACAAAAGAGTCTATCTTCCTCTCTTCCCAAAAAATGCCTTTAAGCAACAATGTAA
TCGGTTGCATAAACTTCATCTCCGTCCTCCTCTCAGTTCCGGTCATCGGCGCCGGGATCT
GGTTTGCCACCGGAGAAGTAAACTCCTGTGTGAAGCTCCTTCAGTGGCCAGTAATAATCC
TCGGAGTCTTGATCCTTCTTGTCGGTCTTGCTGGTTTCATAGGAGGGTTCTGGAGAATCA
CTTGGCTTCTCATTGTTTACTTGATGGCCATGCTTGTTCTCATAGTACTTTTAGGTATTC
TTGTCGGATTTATTTACATGGTCACCATTAAAGGCTCTGGTCATCCGGAACCAAGCAGAG
CTTATCTTGAGTATAGTCTTCAAGATTTCTCTGGTTACTTGCGTCGACGTGTTCAGAGAT
CTTACAAATGGGATAGGATCCGTACTTGTTTGAGTACTACTAGTATTTGTCCTGAACTGA
ATCAGACATATACTTCGGCTCTAGATTTCTTCAATGCTCATCTTAGTCCCATTCAATCTG
GTTGCTGCAAGCCCC

QA 1 615 1 615
DS 



AS 1 4

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GGCTGTTTCGTCTGAATCGAATTCTAATTTATTTGCACACATTTTTCTCTGATCTTGCAC
GGAGACGACGACGAAAGAATGCAGTTCTTCGGTGGATCCGAGATATCTCCGTCGCCACAG
GTACCGACGGCGAGTGGAAACAACGCGCACATGATGTACGTTTTCAACCGCAACGGCGTG
TGTCTCCTCTACAAAGAATGGAACAGGCCTCTTCACACGCTCAACCCTCAGCAAGATCAC
AAGCTCATGTTCGGTCTTCTCTTCTCCCTCAAATCCCCCACCGCCAAGATGGATCCCGTC
AATGCGGATAAGGGGAATCTAGGGGTTCCACAGTTGCCAGGACAAGGATGCTCTTTCCAT
AGTTTCCGTACGAATACGTACAAGCTAAGCTTCATGGAGACTCCCTCTGGTATTAAGATT
ATCTTAGTAACTCATCCAAAGACTGGAGATTTGCGCGAATCCATGAAGTACATTTACGGT
TTATACGTTGAATATGTGGTGAAAAATCCTATCTACAACCCAGGATCTCCAATCAAGTCA
GAGTTGTTCAACACTGCACTTGACCAATATGTGAGGAGTATCTCATAGTGTTGTGTGCAT
TACAAGATTTGGCAATTTGGAACTTCACAGAACTTTTGTCTTGAATAAATTCTATGGAGA
GGAGAGAATTGTAGTAGAGTGACCGATCTCGTGTCAAGACTGTTTTTTCTCTGCGAATGT
TTGTTTTGCGTTTTTAATATAACTAGATTTTGACCCGCTCGACCGAGTGGATATCAATTT
TCATTTTTTTCTTCGTTTATATTGAATATTATACATGGTTTGTAATGTATGTACTAATAC
CATATATTTAAAAATAACAATGTACTTAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1GG52TF U 1
AF RS1BH96TF U 42
AF RS1BH96JQ C 191
AF RS1GG52JQ C 268
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RD RS1GG52TF 461 0 0
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GGAGACGACGACGAAAGAATGCAGTTCTTCGGTGGATCTGAGATATCTCCGTCGCCACAG
GTACCGACGGCGAGTGGAAACAACGCGCACATGATGTACGTTTTCAACCGCAACGGCGTG
TGTCTCCTCTACAAAGAATGGAACAGGCCTCTTCACACGCTCAACCCTCAGCAAGATCAC
AAGCTCATGTTCGGTCTTCTCTTCTCCCTCAAATCCCTCACCGCCAAGATGGATCCCGTC
AATGCGGATAAGGGGAATCTAGGGGTTCCACAGTTGCCAGGACAAGGATGCTCTTTCCAT
AGTTTCCGTACGAATACGTACAAGCTAAGCTTCATGGAGACTCCCTCTGGTATTAAGATT
ATCTTAGTAACTCATCCAAAGACTGGAGATTTGCGCGAATC

QA 1 461 1 461
DS 

RD RS1BH96TF 693 0 0
TTTTTCTCTGATCTTGCACGGAGACGACGACGAAAGAATGCAGTTCTTCGGTGGATCCGA
GATATCTCCGTCGCCACAGGTACCGACGGCGAGTGGAAACAACGCGCACATGATGTACGT
TTTCAACCGCAACGGCGTGTGTCTCCTCTACAAAGAATGGAACAGGCCTCTTCACACGCT
CAACCCTCAGCAAGATCACAAGCTCATGTTCGGTCTTCTCTTCTCCCTCAAATCCCCCAC
CGCCAAGATGGATCCCGTCAATGCGGATAAGGGGAATCTAGGGGTTCCACAGTTGCCAGG
ACAAGGATGCTCTTTCCATAGTTTCCGTACGAATACGTACAAGCTAAGCTTCATGGAGAC
TCCCTCTGGTATTAAGATTATCTTAGTAACTCATCCAAAGACTGGAGATTTGCGCGAATC
CATGAAGTACATTTACGGTTTATACGTTGAATATGTGGTGAAAAATCCTATCTACAACCC
AGGATCTCCAATCAAGTCAGAGTTGTTCAACACTGCACTTGACCAATATGTGAGGAGTAT
CTCATAGTGTTGTGTGCATTACAAGATTTGGCAATTTGGAACTTCACAGAACTTTTGTCT
TGAATAAATTCTATGGAGAGGAGAGAATTGTAGTAGAGTGACCGATCTCGTGTCAAGACT
GTTTTTTCTCTGCGAATGTTTGTTTTGCGTTTT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RS1BH96JQ 680 0 0
ACAAAGAATGGAACAGGCCTCTTCACACGCTCAACCCTCAGCAAGATCACAAGCTCATGT
TCGGTCTTCTCTTCTCCCTCAAATCCCCCACCGCCAAGATGGATCCCGTCAATGCGGATA
AGGGGAATCTAGGGGTTCCACAGTTGCCAGGACAAGGATGCTCTTTCCATAGTTTCCGTA
CGAATACGTACAAGCTAAGCTTCATGGAGACTCCCTCTGGTATTAAGATTATCTTAGTAA
CTCATCCAAAGACTGGAGATTTGCGCGAATCCATGAAGTACATTTACGGTTTATACGTTG
AATATGTGGTGAAAAATCCTATCTACAACCCAGGATCTCCAATCAAGTCAGAGTTGTTCA
ACACTGCACTTGACCAATATGTGAGGAGTATCTCATAGTGTTGTGTGCATTACAAGATTT
GGCAATTTGGAACTTCACAGAACTTTTGTCTTGAATAAATTCTATGGAGAGGAGAGAATT
GTAGTAGAGTGACCGATCTCGTGTCAAGACTGTTTTTTCTCTGCGAATGTTTGTTTTGCG
TTTTTAATATAACTAGATTTTGACCCGCTCGACCGAGTGGATATCAATTTTCATTTTTTT
CTTCGTTTATATTGAATATTATACATGGTTTGTAATGTATGTACTAATACCATATATTTA
AAAATAACAATGTACTTAGT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RS1GG52JQ 604 0 0
CTCAAATCCCTCACCGCCAAGATGGATCCCGTCAATGCGGATAAGGGGAATCTAGGGGTT
CCACAGTTGCCAGGACAAGGATGCTCTTTCCATAGTTTCCGTACGAATACGTACAAGCTA
AGCTTCATGGAGACTCCCTCTGGTATTAAGATTATTTTAGTAACTCATCCAAAGACTGGA
GATTTGCGGGAATCCATGAAGTACATTTACGGTTTATACGTTGAATATGTGGTGAAAAAT
CCTATTTACAACCCAGGATCTCCAATCAAGTCAGAGTTGTTCAACACTGCACTTGACCAA
TATGTGAGGAGTATTTCATAGTGTTGTGTGCATTACAAGATTTGGCAATTTGGAACTTCA
CAGAACTTTTGTCTTGAATAAATTTTATGGAGAAGAGAGAATTGTAGTAGAGAGACCGAT
CTCGTGTCAAGACTGTTTTTTTTTTGGGAATGTTTGTTTTGCGTTTTTAATATAACTAGA
TTTTGACCCGCTCGACCGAGTGGATATCAATTTTCATTTTTTTTTTCGTTTATATTGAAT
ATTATACATGGTTTGTAATGTATGTACTAATACCATATATTTAAAAATAACAATGTACTT
AGTT

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 4

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AAATACAGAAAATAGAGTACTAAATATTTCACTACATATTATTCACAATACACATAATAT
TTCTTTGAATAATATGTTCCACATAACATTTATTAAGAACGATGCGAAATGGTTGAAATC
CAGACACTTGTAGCACACACACGTACATAGTGACGTTCACACACGATATTCTTCATAAGC
CAACATGGCCGCGCGATGACTCGGTATACAATTTTACATGAACTTCTTGAAATAATTAAT
GACATATTCCGAGTCGGTTTTGGTCTGCGTATATGCAACCATCTTATCCATTTCCTCAAT
CCAAGCAGCTAGTTTTGGACGTCCAGCAGTAATATCGTACTTGAAAACTTCGCCGAGGAA
GACTTGAAATCGTTGGACGAATGGGATATATGCGACATCAACCAAGCTAAGGTCGCCGAG
GAAGAATGGACCATTCTCAAACTTTTGTAAAGCATTTTCCAAGTGATCGAAGACAGATGC
CGTATCTTTAGCCGGATCACCTTTGAAAGAGTCAAACACAACTTTAATGAATGTTGTATC
AACATATTTCAACATGTCTTCACCAAAGTCTCTCTTTTCAGGATCCAGGGGGTAAAGTGA
ATGTCCCTCGAAATTGCTATCCACATATTTGATTAAATCTAGACTCTCCCCCATGATTTT
GCCATTGTGTTCAAGAGCAGGCACCTTGTTTGCAGGGTTCACTTTCTCCTTGAACCAGGC
TGGTCTATTAGGAAGGTCTATAGGAACCAATTTGATCTTCTCTTGCAGACCCTTGAGGTT
TCTGGTAATCCAAACACGTTGTGCAAATGGGCAGGTGTAACTTATGTACAACCTCGTGGT
TCCGTCGAACAAAGCAGGTAGATCGGAGGTAGCATCAAGCGGAACTTGACGATCTTCTAC
CAAAGGAGAAGGTAAAGCCATGGATATGATCGATTCGCCTCGGAGGATTACTACAGATAG
ATGATGTTTTTTTTACATGAATGATCGATCAAACATGTAAAGCCACTTATATAACACATA
CTCGATGAAGAGCGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GU05JQ U 1
AF RS1AB66JQ U 133
AF RS1GU05TF C 235
AF RS1AB66TF C 190
BS 1 588 RS1GU05JQ
BS 589 731 RS1AB66JQ
BS 732 732 RS1AB66TF
BS 733 765 RS1AB66JQ
BS 766 1037 RS1AB66TF

RD RS1GU05JQ 588 0 0
AAATACAGAAAATAGAGTACTAAATATTTCACTACATATTATTCACAATACACATAATAT
TTCTTTGAATAATATGTTCCACATAACATTTATTAAGAACGATGCGAAATGGTTGAAATC
CAGACACTTGTAGCACACACACGTACATAGTGACGTTCACACACGATATTCTTCATAAGC
CAACATGGCCGCGCGATGACTCGGTATACAATTTTACATGAACTTCTTGAAATAATTAAT
GACATATTCCGAGTCGGTTTTGGTCTGCGTATATGCAACCATCTTATCCATTTCCTCAAT
CCAAGCAGCTAGTTTTGGACGTCCAGCAGTAATATCGTACTTGAAAACTTCGCCGAGGAA
GACTTGAAATCGTTGGACGAATGGGATATATGCGACATCAACCAAGCTAAGGTCGCCGAG
GAAGAATGGACCATTCTCAAACTTTTGTAAAGCATTTTCCAAGTGATCGAAGACAGATGC
CGTATCTTTAGCCGGATCACCTTTGAAAGAGTCAAACACAACTTTAATGAATGTTGTATC
AACATATTTCAACATGTCTTCACCAAAGTCTCTCTTTTCAGGATCCAG

QA 1 588 1 588
DS 

RD RS1AB66JQ 633 0 0
GCACA
CACACGTACATAGTGACGTTCACACACGATCTTCTTCATAAGCCAACATGGCCGCGCGAT
GACTCGGTATACAATTTTACATGAACTTCTTGAAATAATTAATGACATATTCCGAGTCGG
TTTTGGTCTGCGTATATGCAACCATCTTATCCATTTCCTCAATCCAAGCAGCTAGTTTTG
GGCGTCCAGCAGTAATATCGTACTTGAAAACTTCGCCGAGGAAGACTTGAAATCGTTGGA
CGAATGGGATATATGCGACATCAACCAAGCTAAGGTCGCCGAGGAAGAATGGACCATTCT
CAAACTTTTGTAAAGCATTTTCCAAGTGATCGAAGACAGATGCCGTATCTTTAGCCGGAT
CACCTTTGAAAGAGTCAAACACAACTTTAATGAATGTTGTATCAACATATTTCAACATGT
CTTCACCAAAGTCTCTCTTTTCAGGATCCAGGGGGTAAAGTGAATGTCCCTCGAAATTGC
TATCCACATATTTGATTAAATCTAGACTCTCCCCCATGATTTTGCCATTGTGTTCAAGAG
CAGGCACCTTGTTTGCAGGGTTCACTTTCTCCTTGAACCAGGCTGGTCTATTAG*AAGGT
CTATAGGAACCAATTTGATCTTCTCTTG

QA 6 633 6 633
DS 

RD RS1GU05TF 749 0 0
ATTAATGACATATTCCGAGTCGGTTT*GGTCTGCGTATATGCAACCATCTTATCCATTTC
CTCAATCCAAGCAGCTAGTTTTGGACGTCCAGCAGTAATATCGTACTTGAAAACTTCGCC
GAGGAAGACTTGAAATCGTTGGACGAATGGGATATATGCGACATCAACCAAGCTAAGGTC
GCCGAGGAAGAATGGACCATTCTCAAACTTTTGTAAAGCATTTTCCAAGTGATCGAAGAC
AGATGCCGTATCTTTAGCCGGATCACCTTTGAAAGAGTCAAACACAACTTTAATGAATGT
TGTATCAACATATTTCAACATGTCTTCACCAAAGTCTCTCTTTTCAGGATCCAGGGGGTA
AAGTGAATGTCCCTCGAAATTGCTATCCACATATTTGATTAAATCTAGACTCTCCCCCAT
GATTTTGCCATTGGGTTCAAGAGCAGGCACCTTGTTTGCAGGGTTCACTTTCTCCTTGAA
CCAGGCTGGTCTATTAGGAAGGTCTATAGGAACCAATTTGATCTTCTCTTGCAGACCCTT
GAGGTTTCTGGTAATCCAAACACGTTGTGCAAATGGGCAGGTGTAACTTATGTACAACCT
CGTGGTTCCGTCGAACAAAGCAGGTAGATCGGAGGTAGCATCAAGCGGAACTTGACGATC
TTCTACCAAAGGAGAAGGTAAAGCCATGGATATGATCGATTCGCCTCGGAGGATTACTAC
AGATAGATGATGTTTTTTTTACATGAAT
C

QA 1 748 1 748
DS 

RD RS1AB66TF 848 0 0
CGCG
CGATGACTCGGTATACAATTT*ACATGA*CTTCTTGAAATAATTAATGACATAT*CCGAG
TCGGTTT*GGTCTGCGTATATGCAACCATCTTATCCATTTCCTCAATCCAAGCAGCTAGT
TTTGGGCGTCCAGCAGTAATATCGTACTTGAAAACTTCGCCGAGGAAGACTTGAAATCGT
TGGACGAATGGGATATATGCGACATCAACCAAGCTAAGGTCGCCGAGGAAGAATGGACCA
TTCTCAAACTTTTGTAAAGCATTTTCCAAGTGATCGAAGACAGATGCCGTATCTTTAGCC
GGATCACCTTTGAAAGAGTCAAACACAACTTTAATGAATGTTGTATCAACATATTTCAAC
ATGTCTTCACCAAAGTCTCTCTTTTCAGGATCCAGGGGGTAAAGTGAATGTCCCTCGAAA
TTGCTATCCACATATTTGATTAAATCTAGACTCTCCCCCATGATTTTGCCATTGTGTTCA
AGAGCAGGCACCTTGTTTGCAGGGTTCACTTTCTCCTTGAACCAGGCTGGTCTATTAGGA
AGGTCTATAGGAACCAATTTGATCTTCTCTTGCAGACCCTTGAGGTTTCTGGTAATCCAA
ACACGTTGTGCAAATGGGCAGGTGTAACTTATGTACAACCTCGTGGTTCCGTCGAACAAA
GCAGGTAGATCGGAGGTAGCATCAAGCGGAACTTGACGATCTTCTACCAAAGGAGAAGGT
AAAGCCATGGATATGATCGATTCGCCTCGGAGGATTACTACAGATAGATGATGTTTTTTT
TACATGAATGATCGATCAAACATGTAAAGCCACTTATATAACACATACTCGATGAAGAGC
GTCC

QA 5 848 5 848
DS 



AS 1 4

CO CL1693Contig1 655 4 8 U
GGACCCAAGACAACAAACCCAACACATTCTTCATCTCTCTTCTTTGATCATCTCTTTCTA
CTACGCACCATGGGGTTTTCTCGAAAGGAAAAGCTCAACACAAACACTTCCACTTCAAAT
CCTAATCTCTCTTCTGCCAGTACCCATAATAGTTCATACGTCTACCACGGTCCACAAGTC
CATACCGTTAGAGAGTCCATAACATCTTCTACAAACGCGACTTTTTTGGTCTATCAATAT
CCAAATAATTCAGTCCTTGTAAAACAAGCGGTTTTGCCCGCAACTATAGAGTCAGCTCAA
CGTTTCCGTTGCTAGTCTCTTGCTTAAACCAAAGGCGATAAATAAGATCACTGTTCCA*C
CTTCCAGGTTTCGTTGTTAAGGGATGAAGTTAGAATTATGTAAAAAGTTGTCGGAGTTGT
CTTGCAATCTTTGTTTATTTAGATATGGTGTGAGTGAGTAAGTGCAGACCGGCTCAAACT
TTACTCTCTTAAGAGTTAGGTTGTAATATAATATTACAACTTGAATTTGTGTGCGTGTCT
GTTTGTAGCATGTTAAAAGTACATATATGTAACCTGGCCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTT
TGTAACTGAACCTGGCCTTCTTCTTCTTTTTAATGTAACTTGGTCTTATGTATGT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1GD23TF U 1
AF RS1GE15TF U 2
AF RS1GO54TF U 1
AF RS1GO54JQ C 134
BS 1 218 RS1GD23TF
BS 219 219 RS1GO54TF
BS 220 377 RS1GD23TF
BS 378 378 RS1GO54TF
BS 379 524 RS1GD23TF
BS 525 581 RS1GO54TF
BS 582 582 RS1GE15TF
BS 583 655 RS1GO54TF

RD RS1GD23TF 524 0 0
GGACCCAAGACAACAAACCCAACACATTCTTCATCTCTCTTCTTTGATCATCTCTTTCTA
CTACGCACCATGGGGTTTTCTCGAAAGGAAAAGCTCAACACAAACACTTCCACTTCAAAT
CCTAATCTCTCTTCTGCCAGTACCCATAATAGTTCATACGTCTACCACGGTCCACAAGTC
CATACCGTTAGAGAGTCCATAACATCTTCTACAAACGCAACTTTTTTGGTCTATCAATAT
CCAAATAATTCAGTCCTTGTAAAACAAGCGGTTTTGCCCGCAACTATAGAGTCAGCTCAA
CGTTTCCGTTGCTAGTCTCTTGCTTAAACCAAAGGCGATAAATAAGATCACTGTTCCA*C
CTTCCAGGTTTCGTTGTCAAGGGATGAAGTTAGAATTATGTAAAAAGTTGTCGGAGTTGT
CTTGCAATCTTTGTTTATTTAGATATGGTGTGAGTGAGTAAGTGCAGACCGGCTCAAACT
TTACTCTCTTAAGAGTTAGGTTGTAATATAATATTACAACTTGA

QA 1 524 1 524
DS 

RD RS1GE15TF 604 0 0
GACCCAAGACAACAAACCCAACACATTCTTCATCTCTCTTCTTTTATCATCTCTTTCTAC
TACGCACCATGGGATTTTCTCGAAAGGAAAAGCTCAACACAAACACTTCCACTTCAAATC
CTAATCTCTCTTCTGCCAGTACCCATAATAGTTCATACGTCTACCACGGTCCACAAGTCC
ATACCGTTAGAGAGTCCATAACATCTTCTACAAACGCAACTTTTTGTGTCTATCAATATC
CAAATAATTCAGTCCTTGTAAAACAAGCGGTTTTGCCCGCAACTATAGAGTCAGCTCAAC
GTTTCCGTTGCTAGTCTCTTGCTTAAACCAAAGGCGATAAATAAAATCACTGTTCCAGCC
TTTCAGGTTTCGTTGTTAAGGAATGAAGTTAGAATTATGGGAAAAGTTGTCGGAGTTGTC
TTGCAATCTTTGTTTATTTAGATATGGTGTGTGTGAGTGAGTGCGGACCGGCTCAAACTT
TACTCTCTTAAGAGTTAGGTTGTAATATAATATTACAACTTGAATTTGTGTGCGTGTCTG
TTTGTAGCATGTTAAAAGTACATATATGTAACCTGGCCGTTTTTTTTTTT
AGTGTAACCTGGTC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RS1GO54TF 655 0 0
G
GACCCAAGACAACAAACCCAACACATTCTTCATCTCTCTTCTTTGATCATCTCTTTCTAC
TACGCACCATGGGGTTTTCTCGAAAGGAAAAGCTCAACACAAACACTTCCACTTCAAATC
CTAATCTCTCTTCTGCCAGTACCCATAATAGTTCATACGTCTACCACGGTCCACAAGTCC
ATACCGTTAGAGAGTCCATAACATCTTCTACAAACGCGACTTTTTTGGTCTATCAATATC
CAAATAATTCAGTCCTTGTAAAACAAGCGGTTTTGCCCGCAACTATAGAGTCAGCTCAAC
GTTTCCGTTGCTAGTCTCTTGCTTAAACCAAAGGCGATAAATAAGATCACTGTTCCA*CC
TTCCAGGTTTCGTTGTTAAGGGATGAAGTTAGAATTATGTAAAAAGTTGTCGGAGTTGTC
TTGCAATCTTTGTTTATTTAGATATGGTGTGAGTGAGTAAGTGCAGACCGGCTCAAACTT
TACTCTCTTAAGAGTTAGGTTGTAATATAATATTACAACTTGAATTTGTGTGCGTGTCTG
TTTGTAGCATGTTAAAAGTACATATATGTAACCTGGCCTTCTTCTTTTTTTTTTTTTTTT
GTAACTGAACCTGGCCTTCTTCTTCTTTTTAATGTAACTTGGTCTTATGTATGT

QA 2 655 2 655
DS 

RD RS1GO54JQ 522 0 0
CTGCCAGTACCCATAATAGTTCATACGTCTACCACGGTCCACAAGTCCATACCGTTAGAG
AGTCCATAACATCTTCTACAAACGCGACTTTTTTGGTCTATCAATATCCAAATAATTCAG
TCCTTGTAAAACAAGCGGTTTTGCCCGCAACTATAGAGTCAGCTCAACGTTTCCGTTGCT
AGTCTCTTGCTTAAACCAAAGGCGATAAATAAGATCACTGTTCCA*CCTTCCAGGTTTCG
TTGTTAAGGGATGAAGTTAGAATTATGTAAAAAGTTGTCGGAGTTGTCTTGCAATCTTTG
TTTATTTAGATATGGTGTGAGTGAGTAAGTGCAGACCGGCTCAAACTTTACTCTCTTAAG
AGTTAGGTTGTAATATAATATTACAACTTGAATTTGTGTGCGTGTCTGTTTGTAGCATGT
TAAAAGTACATATATGTAACCTGGCCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTGTAACTGAACCT
GGCCTTCTTCTTCTTTTTAATGTAACTTGGTCTTATGTATGT

QA 1 522 1 522
DS 



AS 1 5

CO CL1694Contig1 890 5 12 U
GGGGATAATCGGTTGGCAAAGTCAAGGACGATCCTTCTTCTTCCTCGACTCGCTGCCATC
AACCTCCAAAACTTGGATACGATCTCTCAGCTCTATAATCTCATCAATTCTCTATATAGA
GATAAGCTATGGGATGTGCTGCTTCTCTTCCAGATAGGAACTCTGGAGCTTTAAACGGTC
TTACCAGCTCAGAGAATGCAGCTCCAGCAGATGCTAAGAATCTACGCGTGAAGTTAGTTC
TATTAGGAGATTCTGGTGTGGGTAAAAGTTGTATTGTCCTCCAGTTTGTCCGTGGTCAAT
TTGACGCAACATCTAAGGTAACTGTTGGAGCTTCATTCTTGTCCCAAACAATAACCTTGC
AAGACTCTACCACAGTGAAGTTTGAAATATGGGATACAGCAGGGCAAGAGAGGTATTCTG
CGCTTGCTCCACTATACTACCGTGGAGCTGGAGTTGCTGTTATTGTGTATGATATTACAA
GCCCTGAGTCGTTCAAGAAAGCTCAGTATTGGGTTAAGGAACTGCAGAAGCATGGAAGCC
CAGACATTGTGATGGCTTTGGTTGGTAACAAAGCTGATCTACATGAAAAAAGAGAAGTAC
TCTCCGAGGATGGTATGGAGCTTGCGGAGAAGAACGGCATGTTCTTTATTGAAACGTCAG
CTAAGACGGCAGATAACATAAATGAACTGTTTGAGGAAATTGGAAAGAGGCTACCTCGTC
CTTCTCAACCATCATGATTTGGAGTGTTTGGATCAACCCATCTTCAGCGAAAAGACCTTT
CTCTTGGTTACTAATCTACTTTCATGTAATGTTTATTAAACGGTTTCTATATATTGTTAA
AAGTGTGTTGTGTAATGTGAAGATTTGAGAAGCCAAATTAAATTTTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FW35TF U 22
AF RS1CB36TF U 1
AF RS1C486TF U 29
AF RS1DU32TF U 122
AF RS1DU32JQ C 189
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BS 810 818 RS1DU32TF
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RD RS1FW35TF 617 0 0
GGAAGGA
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AGCTCTATAATCTCATCAATTCTCTATATAGAGATAAGCTATGGGATGTGCTGCTTCTCT
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AGCTTCATTCTTGTCCCAAACAATAACCTTGCAAGACTCTACCACAGTGAAGTTTGAAAT
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TGGAGTTGTTGTTATTGTGTATGATATTACAAGCCCTGAGTCGTTCAAGAAAGCTCAGTA
TTGGGTTAAGGAACTGCAGAAGCATGGAAGCCCAGACATTGTGATGGCTTTGGTTGGTAA
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GAAGAACGGC

QA 8 617 8 617
DS 

RD RS1CB36TF 667 0 0
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AACCTCCAAAACTTGGATACGATCTCTCAGCTCTATAATCTCATCAATTCTCTATATAGA
GATAAGCTATGGGATGTGCTGCTTCTCTTCCAGATAGGAACTCTGGAGCTTTAAACGGTC
TTACCAGCTCAGAGAATGCAGCTCCAGCAGATGCTAAGAATCTACGCGTGAAGTTAGTTC
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TTGACGCAACATCTAAGGTAACTGTTGGAGCTTCATTCTTGTCCCAAACAATAACCTTGC
AAGACTCTACCACAGTGAAGTTTGAAATATTGGATACAGCAGGGCAAGAGAGGTATTCTG
CGCTTGCTCCACTATACTACCGTGGAGCTGGAGTTGCTGTTATTGTGTATGATATTACAA
GCCCTGAGTCGTTCAAGAAAGCTCAGTATTGGGTTAAGGAACTGCAGAAGCATGGAAGCC
CAGACATTGTGATGGCTTTGGTTGGTAACAAAGCTGATCTACATGAAAAAAGAGAAGTAC
TCTCCGAGGATGGTATGGAGCTTGCGGAGAAGAACGGCATGTTCTTTATTGAAACGTCAG
CTAAGAC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RS1C486TF 709 0 0
CGATCCTTCTTCTTCCTCGACTCGCTGCCATCAACCTCCAAAACTTGGATACGATCTCTC
AGCTCTATAATCTCATCAATTCTCTATATAGAGATAAGCTATGGGATGTGCTGCTTCTCT
TCCAGATAGGAACTCTGGAGCTTTAAACGGTCTTACCAGCTCAGAGAATGCAGCTCCAGC
AGATGCTAAGAATCTACGCGTGAAGTTAGTTCTATTAGGAGATTCTGGTGTGGGTAAAAG
TTGTATTGTCCTCCAGTTTGTCCGTGGTCAATTTGACGCAACATCTAAGGTAACTGTTGG
AGCTTCATTCTTGTCCCAAACAATAACCTTGCAAGACTCTACCACAGTGAAGTTTGAAAT
ATGGGATACAGCAGGGCAAGAGAGGTATTCTGCGCTTGCTCCACTATACTACCGTGGAGC
TGGAGTTGCTGTTATTGTGTATGATATTACAAGCCCTGAGTCGTTCAAGAAAGCTCAGTA
TTGGGTTAAGGAACTGCAGAAGCATGGAAGCCCAGACATTGTGATGGCTTTGGTTGGTTA
CAAAGCTGATCTACATGAAAAAAGAGAAGTACTCTCCGAGGATGGTATGGAGCTTGCGGA
GAAGAACGGCATGTTCTTTATTGAAACGTCAGCTAAGACGGCAGATAACATAAATGAACT
GTTTGAGGAAATTGGAAAGAG*CTACCTCGTCCTTCTCA*CCATCATGA

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1DU32TF 697 0 0
GG
AAGCTATGGGATGTGCTGCTTCTCTTCCAGATAGGAACTCTGGAGCTTTAAACGGTCTTA
CCAGCTCAGAGAATGCAGCTCCAGCAGATGCTAAGAATCTACGCGTGAAGTTAGTTCTAT
TAGGAGATTCTGGTGTGGGTAAAAGTTGTATTGTCCTCCAGTTTGTCCGTGGTCAATTTG
ACGCAACATCTAAGGTAACTGTTGTAGCTTCATTCTTGTCCCAAACAATAACCTTGCAAG
ACTCTACCACAGTGAAGTTTGAAATATGGGATACAGCAGGGCAAGAGAGGTATTCTGCGC
TTGCTCCACTATACTACCGTGGAGCTGGAGTTGCTGTTATTGTGTATGATATTACAAGCC
CTGAGTCGTTCAAGAAAGCTCAGTATTGGGTTAAGGAACTGCAGAAGCATGGAAGCCCAG
ACATTGTGATGGCTTTGGTTGGTAACAAAGCTGATCTACATGAAAAAAGAGAAGTACTCT
CCGAGGATGGTATGGAGCTTGCGGAGAAGAACGGCATGTTCTTTATTGAAACGTCAGCTA
AGACGGCAGATAACATAAATGAACTGTTTGAGGAAATTGGAAAGAGGCTACCTCGTCCTT
CTCAACCATCATGATTTGGAGTGTTTGGATCAACCCATCTTCAGCGAAAAGACCTTTCTC
TTGGTTACTAATCTACTTTCATGTA*TGTTTATTA

QA 3 697 3 697
DS 

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TCAGAGAATGCAGCTCCAGCAGATGCTAAGAATCTACGCGTGAAGTTAGTTCTATTAGGA
GATTCTGGTGTGGGTAAAAGTTGTATTGTCCTCCAGTTTGTCCGTGGTCAATTTGACGCA
ACATCTAAGGTAACTGTTGTAGCTTCATTCTTGTCCCAAACAATAACCTTGCAAGACTCT
ACCACAGTGAAGTTTGAAATATGGGATACAGCAGGGCAAGAGAGGTATTCTGCGCTTGCT
CCACTATACTACCGTGGAGCTGGAGTTGCTGTTATTGTGTATGATATTACAAGCCCTGAG
TCGTTCAAGAAAGCTCAGTATTGGGTTAAGGAACTGCAGAAGCATGGAAGCCCAGACATT
GTGATGGCTTTGGTTGGTAACAAAGCTGATCTACATGAAAAAAGAGAAGTACTCTCCGAG
GATGGTATGGAGCTTGCGGAGAAGAACGGCATGTTCTTTATTGAAACGTCAGCTAAGACG
GCAGATAACATAAATGAACTGTTTGAGGAAATTGGAAAGAGGCTACCTCGTCCTTCTCAA
CCATCATGATTTGGAGTGTTTGGATCAACCCATCTTCAGCGAAAAGACCTTTCTCTTGGT
TACTAATCTACTTTCATGTAATGTTTATTAAACGGTTTCTATATATTGTTAAAAGTGTGT
TGTGTAATGTGAAGATTTGAGAAGCCAAATTAAATTTTAAGC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 5

CO CL1695Contig1 712 5 11 U
GCTAAACAATTCATTTCATCTTTATTTGAAGAAAACATACACAAATAAATTTTCTTTCAA
AGTTCTATACTCTCGCGATCAAAATGGCGAGCGAGGAAGTCGTGGTGGTTGAAGGAGAGA
GAGCAGGAGCTGAGATCGTGTATGGAGCGGAGGAGTGTTACAAGAACTCGGTGGAGCTTC
TAGAGGAGCTAGGGTTTCCAAAAGGTGTTATGCCTTTGAAGAACCTCGTGGAGTGTGGAA
GAGTTAGAGCCACCGGTTTCGTGTGGATGAAGCAAAACACTCCATACGAACATTTCTTTG
AAGCCACCAACACTCGCGTTTCTTACGCTGTTGAGGTCACCGCCTATATCGACAAGTGTT
GTATGAAGAAGATGACAGGCGTGAAGAGTAAGCAGATGTTTTTGTGGGTGCCGATTGTGG
AGATGAGTATGGAGGAGCCTAAAAGCAAGAAGATTTACTTCAAGACTCCTATGGGAATCG
GCAAGTCTTTTCACGTTACCGCATTCATGGACGAGGAAGAGAAACGCAACTACTACTTGG
AGAATCCTAAAAAATAAATCGTTT*AAGTATTAGTATTATTAATTTATTATATTTTGGTT
GTCTTTGTTTTTATTTTAATAGTTGTACTCTTGTAAGGTTGCTTCATTGCAATTACTGAA
TTTTTATTTTTTATGATTATAAAGTGGAATAAGATTTGAAATGCAATGGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 
5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EB12TF U 1
AF RS1EB12JQ C 1
AF RS1F884JQ C 7
AF RS1AG17TF U 11
AF RS1F884TF U 7
BS 1 8 RS1EB12JQ
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RD RS1EB12TF 632 0 0
GCTAAACA
ATTCATTTCATCTTTATTTGAAGAAAACATACACAAATAAATTTTCTTGCAAAGTTCTAT
ACTCTCGCGATCAAAATGGCGAGCGAGGAAGTCGTGGTGGTTGAAGGAGAGAGAGCAGGA
GCTGAGATCGTGTATGGAGCGGAGGAGTGTTACAAGAACTCGGTGGAGCTTCTAGAGGAG
CTAGGGTTTCCAAAAGGTGTTATGCCTTTGAAGAACCTCGTGGAGTGTGGAAGAGTTAGA
GCCACCGGTTTCGTGTGGATGAAGCAAAACACTCCATACGAACATTTCTTTGAAGCCACC
AACACTCGCGTTTCTTACGCTGTTGAGGTCACCGCCTATATCGACAAGTGTTGTATGAAG
AAGATGACAGGCGTGAAGAGTAAGCAGATGTTTTTGTGGGTGCCGATTGTGGAGATGAGT
ATGGAGGAGCCTAAAAGCAAGAAGATTTACTTCAAGACTCCTATGGGAATCGGCAAGTCT
TTTCACGTTACCGCATTCATGGACGAGGAAGAGAAACGCAACTACTACTTGGAGAATCCT
AAAAAATAAATCGTTTTAAGTATTAGTATTATTAATTTATTATATTTTGGTTGCCTTTGT
TTTTATTTTAATAGTTGTACTCTT

QA 9 632 9 632
DS 

RD RS1EB12JQ 712 0 0
GCTAAACAATTCATTTCATCTTTATTTGAAGAAAACATACACAAATAAATTTTCTTGCAA
AGTTCTATACTCTCGCGATCAAAATGGCGAGCGAGGAAGTCGTGGTGGTTGAAGGAGAGA
GAGCAGGAGCTGAGATCGTGTATGGAGCGGAGGAGTGTTACAAGAACTCGGTGGAGCTTC
TAGAGGAGCTAGGGTTTCCAAAAGGTGTTATGCCTTTGAAGAACCTCGTGGAGTGTGGAA
GAGTTAGAGCCACCGGTTTCGTGTGGATGAAGCAAAACACTCCATACGAACATTTCTTTG
AAGCCACCAACACTCGCGTTTCTTACGCTGTTGAGGTCACCGCCTATATCGACAAGTGTT
GTATGAAGAAGATGACAGGCGTGAAGAGTAAGCAGATGTTTTTGTGGGTGCCGATTGTGG
AGATGAGTATGGAGGAGCCTAAAAGCAAGAAGATTTACTTCAAGACTCCTATGGGAATCG
GCAAGTCTTTTCACGTTACCGCATTCATGGACGAGGAAGAGAAACGCAACTACTACTTGG
AGAATCCTAAAAAATAAATCGTTTTAAGTATTAGTATTATTAATTTATTATATTTTGGTT
GCCTTTGTTTTTATTTTAATAGTTGTACTCTTGTAAGGTTGCTTCATTGCAATTACTGAA
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GG
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CTAGGGTTTCCAAAAGGTGTTATGCCTTTGAAGAACCTCGTGGAGTGTGGAAGAGTTAGA
GCCACCGGTTTCGTGTGGATGAAGCAAAACACTCCATACGAACATTTCTTTGAAGCCACC
AACACTCGCGTTTCTTACGCTGTTGAGGTCACCGCCTATATCGACAAGTGTTGTATGAAG
AAGATGACAGGCGTGAAGAGTAAGCAGATGTTTTTGTGGGTGCCGATTGTGGAGATGAGT
ATGGAGGAGCCTAAAAGCAAGAAGATTTACTTCAAGACTCCTATGGGAATCGGCAAGTCT
TTTCACGTTACCGCATTCATGGACGAGGAAGAGAAACGCAACTACTACTTGGAGAATCCT
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TTTTATTTTAATAGTTGTACTCTTGTAAGGTTGCTTCATTGCAATTACTGAATTTTTATT
TTTTATGATTATAAAGTGGAATAAGATTTGAAATGC

QA 3 698 3 698
DS 

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GG
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TCGCGATCAAAATGGCGAGCGAGGAAGTCGTGGTGGTTGAAGGAGAGAGAGCAGGAGCTG
AGATCGTGTATGGAGCGGAGGAGTGTTACAAGAACTCGGTGGAGCTTCTAGAGGAGCTAG
GGTTTCCAAAAGGTGTTATGCCTTTGAAGAACCTCGTGGAGTGTGGAAGAGTTAGAGCCA
CCGGTTTCGTGTGGATGAAGCAAAACACTCCATACGAACATTTCTTTGAAGCCACCAACA
CTCGCGTTTCTTACGCTGTTGAGGTCACCGCCTATATCGACAAGTGTTGTATGAAGAAGA
TGACAGGCGTGAAGAGTAAGCAGATGTTTTTGTGGGTGCCGATTGTGGAGATGAGTATGG
AGGAGCCTAAAAGCAAGAAGATTTACTTCAAGACTCCTATGGGAATCGGCAAGTCTTTTC
ACGTTACCGCATTCATGGACGAGGAAGAGAAACGCAACTACTACTTGGAGAATCCTAAAA
AATAAATCGTTT*AAGTATTAGTATTATTAATTTATTATATTTTGGTTGTCTTTGTTTTT
ATTTTAATAGTTGTACTCTTGTAAGGTTGCTTCATTGCAATTACTGAATTTTTATTTTT
TA

QA 3 661 3 661
DS 

RD RS1F884TF 698 0 0
GG
ATTCATTTCATCTTTATTTGAAGAAAACATACACAAATAAATTTTCTTTCAAAGTTCTAT
ACTCTCGCGATCAAAATGGCGAGCGAGGAAGTCGTGGTGGTTGAAGGAGAGAGAGCAGGA
GCTGAGATCGTGTATGGAGCGGAGGAGTGTTACAAGAACTCGGTGGAGCTTCTAGAGGAG
CTAGGGTTTCCAAAAGGTGTTATGCCTTTGAAGAACCTCGTGGAGTGTGGAAGAGTTAGA
GCCACCGGTTTCGTGTGGATGAAGCAAAACACTCCATACGAACATTTCTTTGAAGCCACC
AACACTCGCGTTTCTTACGCTGTTGAGGTCACCGCCTATATCGACAAGTGTTGTATGAAG
AAGATGACAGGCGTGAAGAGTAAGCAGATGTTTTTGTGGGTGCCGATTGTGGAGATGAGT
ATGGAGGAGCCTAAAAGCAAGAAGATTTACTTCAAGACTCCTATGGGAATCGGCAAGTCT
TTTCACGTTACCGCATTCATGGACGAGGAAGAGAAACGCAACTACTACTTGGAGAATCCT
AAAAAATAAATCGTTT*AAGTATTAGTATTATTAATTTATTATATTTTGGTTTTCTTTGT
TTTTATTTTAATAGTTGTACTCTTGTAAGGTTGCTTCATTGCAATTACTGAATTTTTATT
TTTTATGATTATAAAGTGGAATAAGATTTGAAATGC

QA 3 698 3 698
DS 



AS 1 5

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CAGCAATCAGGAGACTTCTCTCTTCCTCCGTCGTCCTCTCTCGCGCCGTTCGTCCGGCGG
CTTCTTCTTCTTCGCGCCTCTTCAATACTAACGCAGCTAGGAGATACGAAGAGGGAGATG
AAGGCGTCGATAGGAGGAGCCATCTCCCTAACCGAATTGTTTCTCCCCGCAGTGGCGATT
TCTTCTCAGACATGTACGATCCGTTTACGCCGACGAGGAGCTTGAGCCAGGTGCTTAATT
TCGTGGATCAGCTCGGCGAAACGCCTATAGTATCATCCACGCGTGGTGGGATGGGAGCTT
CGGGAGTGAGACGCGGATGGGACGCGAAGGAGAAAGACGACGGTTTACACCTGAGGATCG
ATATGCCGGGGCTGAGCAGAGAGGATGTGAAGCTGACTCTGGAGCAGAACACGCTCGTTA
TCGAAGGCGAAGGGGGCGGAGAAGAAGATGGGCGGAAGTTTTCGAGCAGGATTGGGTTGC
CTGAGAAATTGTACAAGACTGATGAGATAAAGGCGGAGATGAAGAATGGCGTGTTGAGAG
TCGTTGTTCCCAAGATGAATGAGGATGAGCGTAACAATGTTCGCCACATCCATGTTGATT
AGAGTTTGTTGTGAACGTGTTTTTTCAGTGAAACGTGTTGTTTCTCTTTTTCTTTTTTAA
TAATGTGTGAAATTCGTATTCAGTAAAAAAAAAGTTTTCTTCGTGGATACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1F560TF U 17
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QA 1 657 1 657
DS 

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ATT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1F560TF 640 0 0
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TCTCTCTTCCTCCGTCGTCCTCTCTCGCGCCGTTCGTCCGGCGGCTTCTTCTTCTTCGCG
CCTCTTCAATACTAACGCAGCTAGGAGATACGAAGAGGGAGATGAAGGCGTCGATAGGAG
GAGCCATCTCCCTAACCGAATTGTTTCTCCCCGCAGTGGCGATTTCTTCTCAGACATGTA
CGATCCGTTTACGCCGACGAGGAGCTTGAGCCAGGTTCTTAATTTCGTGGATCAGCTCGG
CGAAACGCCTATAGTATCATCCACGCGTGGTGGGATGGGAGCTTCGGGAGTGAGACGCGG
ATGGGACGCGAAGGAGAAAGACGACGGTTTACACCTGAGGATCGATATGCCGGGGCTGAG
CAGAGAGGATGTGAAGCTGACTCTGGAGCAGAACACGCTCGTTATCGAAGGCGAAGGGGG
CGGAGAAGAAGATGGGCGGAAGTTTTCGAGCAGGATTGGGTTGCCTGAGAAATTGTACAA
GACTGATGAGATAAAGGCGGAGATGAAGAATGGCGTGTTGAGAGTCGTTGTTCCCAAGAT
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QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1DG44JQ 610 0 0
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GGCGAAACGCCTATAGTATCATCCACGCGTGGTGGGATGGGAGCTTCGGGAGTGAGACGC
GGATGGGACGCGAAGGAGAAAGACGACGGTTTACACCTGAGGATCGATATGCCGGGGCTG
AGCAGAGAGGATGTGAAGCTGACTCTGGAGCAGAACACGCTCGTTATCGAAGGCGAAGGG
GGCGGAGAAGAAGATGGGCGGAAGTTTTCGAGCAGGATTGGGTTGCCTGAGAAATTGTAC
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ATGAATGAGGATGAGCGTAACAATGTTCGCCACATCCATGTTGATTAGAGTTTGTTGTGA
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CGTATTCAGT

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DS 

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CGACGGTTTACACCTGAGGATCGATATGCCGGGGCTGAGCAGAGAGGATGTGAAGCTGAC
TCTGGAGCAGAACACGCTCGTTATCGAAGGCGAAGGGGGCGGAGAAGAAGATGGGCGGAA
GTTTTCGAGCAGGATTGGGTTGCCTGAGAAATTGTACAAGACTGATGAGATAAAGGCGGA
GATGAAGAATGGCGTGTTGAGAGTCGTTGTTCCCAAGATGAATGAGGATGAGCGTAACAA
TGTTCGCCACATCCATGTTGATTAGAGTTTGTTGTGAACGTGTTTTTTCAGTGAAACGTG
TTGTTTCTCTTTTTCTTTTTTAATAATGTGTGAAATTCGTATTCAGTAAAAAAAAAGTTT
TCTTCGTGGATACTC

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DS 



AS 1 5

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TCAAATATTAACTAAAAAATCGGTTTACAAATAAACTAAACACACAATTATACAAAATCA
AAGAAAACAAGACAACACTACTAGAATTAAAAAACACAAAGATTAACTTCGACAGATCAC
CAAAGCAAAACCAAGAATGAGATCAATATGAGTTGACTATGAAAGATTCAAAGACAGAGA
GAATGAATCAGCGGATTCTCTTGTAGAGGGAGAGGACAGAGATGATGGAGAGGAGGAGGA
GAAGGATAGAAGCAACCAGTGAGACTGCGACTGCGCCTCCGACGTGACGGCAAAACGTGT
CGTAGAAATCACAGATTTCTCTCCACTGTACGTATTTGATGCCCTTCAGAACAATGTACG
CTACTCCACCTGATGCTCCGGTCGCTGAAGCTACTATACCTACCATCACCGCATCCATAA
TGGCAAGATTAAGCAAGAGAATCGCAGAGCAAGAGGAAGGCTTCTTGAAAGCAGATACGG
TGGCAAGTGTAGATAGAATGCTGTAAAAGCAAGCCACCGATAATGCTACCACAAAGTATA
TAAAAGCCGGTGAGTGTGTGAACTTTGCTTCCCTAGGAATGGGAATTCCAGGAATAGTCT
TGGTCTGTTTACTTGTAACCATCACCACAATTGATGTCAAAGTGGCTGCAAACAGAAATA
ACCTTAGCACAACTTGAACCATCCAACAACTCTTTGACGTGGTGCAGCTTCCTCCTGGCA
CGGTTGATTTCTCCGTGTCCAACGTCGATTTGATTTCATCGGAACCCATCTATATGGACA
AATCTTCGAATTGGTTAGGAAATGTGATGATTTTATGTTATGGGGAGTTGATGATCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

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G
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CC

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AACGAATTGAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

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TGGTGACTCTGTGGTCGATGTCGGAAACAACAACTATCTTCCTACCCTTTTCAGAGCCGA
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CAAATTAGCCACTGATATTACCGCTGAGACACTAGGGTTCACTAAATACCCACCAGCTTA
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GCTTCTTGATAACCTCTCTACATTTATCAAGCAAGTGTATGCGGTTGGAGCAAGGAAGAT
CGGTGTGACTTCTCTGCCTCCAACGGGATGTCTTCCAGCTGCA
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DS 

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TTGGTGACTCTGTGGTCGATGTCGGAAACAACAACTATCTTCCTACCCTTTTCAGAGCCG
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TGCTTCTTGATAACTTCTCTACATTTATCAAGCAAGTGTATGCGGTTGGAGCAAGGAAGA
TCGGTGTGACTTCTCTGCCTCCAACGGGATGTCTTCCAGCTGCA
GACCCTA

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DS 

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GG
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CAAATTAGCCACTGATATTACCGCTGAGACACTAGGGTTCACTAAATACCCACCAGCTTA
TCTAAGCCCCGTAGCTTCAGGCAAGAACCTTCTCATTGGTGCTAATTTCGCTTCTGCAGC
TTCGGGTTACGATGACAAAGCCGCTCTTCTCAATCA***TGCGATTCCATTGTATCAGCA
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TGATACGATCATTAAGGGAGCACTCTATCTCTTAAGTGCAGGAAGCAGTGACTTCGTTCA
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GCTTCTTGATAACTTCTCTACATTTATCAAGCAAGTGTATGCGGTTGGAGCAAGGAAGAT
CGGTGTGACTTCTCTGCCTCCAACGGGATGTCTTCCAGCTGCAAGAACCCTATTCGGATT
CCATGAAAAAGTT*GTGTTTCAAGACTCAATACAGATGCTCAGCAATTCAACAAGAAGCT
TAACGCAGCTGCTTCAAAGCTTCAGAAGCAATACTCTGGTCTAA

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DS 

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GTACTTCAAGGAGTACAAGAGCAAGCTCATAAAAGTTGCAGGAAGCAAACAATCTGATAC
GATCATTAAGGGAGCACTCTATCTCTTAAGTGCAGGA*GCAGTGACTTCGTTCAAAATTA
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TGATAACTTCTCTACATTTATCAAGCAAGTGTATGCGGTTGGAGCAAGGAAGATCGGTGT
GACTTCTCTGCCTCCAACGGGATGTCTTCCAGCTGCAAGAACCCTATTCGGATTCCATGA
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TGGGACATGCTCCAATGCTACTCAGTATGTGTTCTGGGACAGTGTTCATCCTTCTGAAGC
TGCCAATGAGATTCTCGCCACCTCTTTGATTGGACAGGGCTTCACTCTCATCGGTTGATC
TCCAAGTCTTATTAAATTCTCTTCTGTAATCGCTGTCAAACCTTGAGAGTCTTACACCGT
TCTTTCCATTTTGAATTTATGTATCAAAAACTACCACTATTTACTATAAACGAATTGAG

QA 1 839 1 839
DS 



AS 1 5

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TTCTTCACATGCAATAAATTCAAACAAAAGCCGCACAATAGTGTTTAGTAACAACCATTA
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TTTTGGATTTCTGCGGCTGCTTCTTGTGTCTTGTGTGCGAGGCTATGGAGGGAGGAGGAT
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TGTCTTCATCATCTGAAGACTTGAGAGGTAAAGACTCCAAGGCTGATTCATCACCCCCGG
TTTGGTTTATATAACCAGTTTCATCTCCATCAGACTCCTGAGAATCATCAGATCCAGCAT
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TCTCAAAGTCAGCATCTTTAGAATCCAACTCACCACCACAAACAGAGCTCATATCCAACT
AACTATAGTAACTTTTGTGGGTTGTAAACTTGCAAATCGATCAACGCCGAAAAAAAAGGG
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ATCAAAAGGAGGAGGAGGAGAAGCTTAGAGGGCACCGAAGGCATTCTTTATCTTATGCTC
TTCGAAACCCAACGGAAAAAAGCCCTAATTCTCTAATTTCGATTCCAATTAAAAAAACGC
AGAGATCTCAGAAGAAACTTCGATGCGGGATGAAAGAGAGGATATGACACGAAAAACCTA
AGATCGGATCGTGGAAACCAGATTAAAAGTTCAAAGGAAGAAGATGAAGCTAATTTGAGA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DM05JQ U 107
AF RS1DJ45JQ U 1
AF RS1FL14JQ U 53
AF RS1FL14TF C 544
AF RS1DJ45TF C 604
BS 1 256 RS1DJ45JQ
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RD RS1DM05JQ 601 0 0
G
GTAACAACCATTACCCATAAGAAAAGTTTTTTAAAAACTCAACAGGAAACAAACACACAC
ATTAAGTTATTTTATTATTTATTAGACAAAGGAAAGAGGCAAGCTCATAGATGTGAGATG
AAGATCTGCTTGACTATTAGAGAAGGCAGTGCCATTTAAGAAGATGCTGCAACTATAGGC
ATCTGAGTAACCCAATCAAATTTTTCGTAACTGAGTTTGCGAGAAGCTTGCTTCTTGTTC
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TGGCTGTCTTTGCTTTTGGATTTCTGCGGCTGCTTCTTGTGTCTTGTGTGCGAGGCTATG
GAGGGAGGAGGATCATACACGTCGTCCGCCCATGAAACACTCGACTTCTTCAGTGACAAG
CCATGCTTCTCCCGGCTGCCTTTTACGGCAGGGATGAAAACAACTGGTGTAGTAGTAGTA
AGGTTCTCATCCTTGTCTTCATCATCTGAAGACTTGAGAGGTAAAGACTCCAAGGCTGAT
TCATCACCCCCGGTTTGGTTTATATAACCAGTTTCATCTCCATCAGACTCCTGAGAATCA

QA 2 601 2 601
DS 

RD RS1DJ45JQ 742 0 0
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CCCATAAGAAAAGTTTTTTAAAAACTCAACAGGAAACAAACACACACATTAAGTTATTTT
ATTATTTATTAGACAAAGGAAAGAGGCAAGCTCATAGATGTGAGATGAAGATCTGCTTGA
CTATTAGAGAAGGCAGCGCCATTTAAGAAGATGCTGCAACTATAGGCATCTGAGTAACCC
AATCAAATTTTTCGTAACTGAGTTTGCGAGAAGCTTGCTTCTTGTTCTTGCCACTACGAG
AAGAAGAGCTGTCTTTGTTCTTCTGCCCTTTCTTCCCGGTCTTCTTGTGGCTGTCTTTGC
TTTTGGATTTCTGCGCCTGCTTCTTGTGTCTTGTGTGCGAGGCTATGGAGGGAGGAGGAT
CATACACGTCGTCCGCCCATGAAACACTCGACTTCTTCAGTGACAAGCCATGCTTCTCCC
GGCTGCCTTTTACGGCAGGGATGAGAACAACTGGTGTAGTAGTAGTAAGGTTCTCATCCT
TGTCTTCATCATCTGAAGACTTGAGAGGTAAAGACTCCAAGGCTGATTCATCACCCCCGG
TTTGGTTTATATAACCAGTTTCATCTCCATCAGACTCCTGAGAATCATCAGATCCAGCAT
GATGCGAGGAATGCTTCGAGCC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RS1FL14JQ 833 0 0
C
TGAGTTATTCTTCACATGCAATAAATTTAAACAAAAGCTGCACAATAGTGTTTAGTAACA
ACCATTACCCATAAGAAAAGTTTTTTAAAAACTCAACAGGAAACAAACACACACATTAAG
TTATTTTATTATTTATTAGACAAAGGAAAGAGGCAAGCTCATAGATGTGAGATGAAGATC
TGCTTGACTATTAAAGAAGGCAGTGCCATTTAAGAAGATGCTGCAACTATAGGCATCTGA
GTAACCCAATCAAATTTTTCGTAACTGAGTTTGCGAGAAGCTCGCTTCTTGTTCTTGCCA
CTACGAGAAGAAGAGCTGTCTTTGTTCTTCTGCCCTTTCTTCCCGGTCTTCTTGTGGCTG
TCTTTGCTTTTGGATTTCTGCGGCTGCTTCTTGTGTCTTGTGTGCGAGGCTATGGAGGGA
GGAGGATCATACACGTCGTCCGCCCATGAAACACTCGACTTCTTCAGTGACAAGCCATGC
TTCTCCCGGCTGCCTTTTACGGCAGGGATGAGAACAACTGGTGTAGTAGTAGTAAGGTTC
TCATCCTTGTCTTCATCATCTGAAGACTTGAGAGGTAAAGACTCCAAGGCTGATTCATCA
CCCCCGGTTTGGTTTATATAACCAGTTTCATCTCCATCAGACTCCTGAGAATCATCAGAT
CCAGCATGATGCGAGGAATGCTTCGAGCCATCAGAGGAGCATCGCGTGGGAGGACTCGAA
GCCGAGATCTCAAAGTCAGCATCTTTAGAATCCAACTCACCACCACAAACAGAGCTCATA
TCCA*CTAACTATAGTA*CTTTTGTGGGTTGTAA
CTTGCAATCGATCACGCC

QA 2 815 2 815
DS 

RD RS1FL14TF 715 0 0
CTG
CTTTTACGGCAGGGATGAGAACAACTGGTGTAGTAGTAGTAAGGTTCTCATCCTTGTCTT
CATCATCTGAAGACTTGAGAGGTAAAGACTCCAAGGCTGATTCATCACCCCCGGTTTGGT
TTATATAACCAGTTTCATCTCCATCAGACTCCTGAGAATCATCAGATCCAGCATGATGCG
AGGAATGCTTCGAGCCATCAGAGGAGCATCGCGTGGGAGGACTCGAAGCCGAGATCTCAA
AGTCAGCATCTTTAGAATCCAACTCACCACCACAAACAGAGCTCATATCCAACTAACTAT
AGTAACTTTTGTGGGTTGTAAACTTGCAAATCGATCAACGCCGAAAAAAAAGGGAGGAAC
TTTTTTTTTGCTTGTTGAAGGTTTTAAAAAGGAGGTAGAATCGAGCAACGTTAACTAAGA
TTACCACGCCAACGATTGGAGGACAAACCAGAGTGATAAGGAGTCAAAGAAGGAATCAAA
AGGAGGAGGAGGAGAAGCTTAGAGGGCACCGAAGGCATTCTTTATCTTATGCTCTTCGAA
ACCCAACGGAAAAAAGCCCTAATTCTCTAATTTCGATTCCAATTAAAAAAACGCAGAGAT
CTCAGAAGAAACTTCGATGCGGGATGAAAGAGAGGATATGACACGAAAAACCTAAGATCG
GATCGTGGAAACCAGATTAAAAGTTCAAAGGAAGAAGATGAAGCTAATTT
CC

QA 4 713 4 713
DS 

RD RS1DJ45TF 678 0 0
CTTCATCATCTGAAGACTTGAGAGGTAAAGACTCCAAGGCTGATTCATCACCCCCGGTTT
GGTTTATATAACCAGTTTCATCTCCATCAGACTCCTGAGAATCATCAGATCCAGCATGAT
GCGAGGAATGCTTCGAGCCATCAGAGGAGCATCGCGTGGGAGGACTCGAAGCCGAGATCT
CAAAGTCAGCATCTTTAAAATCCAACTCACCACCACAAACAGAGCTCATATCCAACTAAC
TATAGTAACTTTTGTGGGTTGTAAACTTGCAAATCGATCAACGCCGAAAAAAAAGGGAGG
AACTTTTTTTTTGCTTGTTGAAGGTTTTAAAAAGGAGGTAGAATCGAGCAACGTTAACTA
AGATTACCACGCCAACGATTGGAGGACAAACCAGAGTGATAAGGAGTCAAAGAAGGAATC
AAAAGGAGGAGGAGGAGAAGCTTAGAGGGCACCGAAGGCATTCTTTATCTTATGCTCTTC
GAAACCCAACGGAAAAAAGCCCTAATTCTCTAATTTCGATTCCAATTAAAAAAACGCAGA
GATCTCAGGAGACACTTCGATGCGGGATGAAAGAGAGGATATGACACGAAAAACCTAAGA
TCGGATCGTGGAAACCAGATTAA**GTTCAAAGGAAGAAGATGAAGCTAATTTGAGAAGA
CGACAACGAAGAAGATCC

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 5

CO CL1700Contig1 736 5 12 U
TACGAAGTTATCAGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGG
GGGATCCTTCAAAGCCATTTCGAAACCATTCTTGTATTGAGAAAGAGTACACAGACGAAA
ACAAGAAGAAAGTTTCAACGTTTATTGTCTGTTCTATCTTTCTCTCTTTCAAGAAACAAC
ATACTTCGAAAACATGGCTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGATTGTATCTGCTTTCGTCTC
TCAAGAACTCTCCAATGCAATCTTCCGACGCGGTTATGCGGCTACGGCGGCGCAAGCGGC
CGGTGTGAAAGGTGGAGCCGTTGTTTCGGCGGTGATGAAGAAGAAGAGAGTGGAAGAAT*
GACCCAAAAGATTGCTTGAATTCCAGACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGGAAACTTG
TTCAAAAGAGATAGACCCAGCAGAGCTACGAGCAGCTCTCTTGAACAACAAGCAGTAATG
AAAAAGAAGAAAAAAACAAGCAGTGATGAATTAACCGAAAAGAAGCGCTTTTTCTGTTAA
TTATTTGTTGTTAGTTTTAATGTCTTGGTGGAATAGGGTAATGATCCTTTGCGGTGAACC
CTATGTTTGTCTGTCTGCTACGTGCGATTCTGCAATTAATAACATAGAGAACTCTTTTGG
TTCCTCTACACTTTGTAACAAAATGATCAATGTATGTATGACTGAAAGTATTTATATACT
CCCTCCGTTTCAAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DW06TF U 62
AF RS1DW06JQ C 62
AF RS1A010TV U 1
AF RS1A010TF U 13
AF RS1DK60TF U 304
BS 1 359 RS1A010TV
BS 360 360 RS1DW06TF
BS 361 378 RS1A010TV
BS 379 379 RS1DW06TF
BS 380 432 RS1A010TV
BS 433 433 RS1DW06TF
BS 434 456 RS1A010TV
BS 457 457 RS1DW06TF
BS 458 706 RS1A010TV
BS 707 707 RS1A010TF
BS 708 729 RS1A010TV
BS 730 736 RS1DK60TF

RD RS1DW06TF 625 0 0
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TATTTGTTGTTAGTTTTAATGTCTTGGTGGAATAGGGTAATGATCCTTTGCGGTGAACCC
TATGTTTGTCTGTCTGCTACGTGCGATTCTGCAATTAATAACATAGAGAACTCTTTTGGT
TCCTCTACACTTTGTAACAAAA
AAA

QA 1 622 1 622
DS 

RD RS1DW06JQ 615 0 0
GGATCCTTCAAAGCCATTTCGAAACCATTCTTGTATTGAGAAAGAGTACACAGACGAAAA
CAAGAAGAAAGTTTCAACGTTTATTGTCTGTTCTATCTTTCTCTCTTTCAAGAAACAACA
TACTTCGAAAACATGGCTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGATTGTATCTGCTTTCGTCTCT
CAAGAACTCTCCAATGCAATCTTCCGACGCGGTTATGCGGCTACGGCGGCGCAAGCGGCC
GGTGTGAAAGGTGGAGCCGTTGTTTCGGCGGTGATGAAGAAGAAGAGAGTGGAAGAAT*G
ACCCAAAAGATTGCTTGAATTCCAGACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGGAAACTTGT
TCAAAAGAGATAGACCCAGCAGAGCTACGAGCAGCTCTCTTGAACAACAAGCAGTAATGA
AAAAGAAGAAAAAAACAAGCAGTGATGAATTAACCGAAAAGAAGCGCTTTTTCTGTTAAT
TATTTGTTGTTAGTTTTAATGTCTTGGTGGAATAGGGTAATGATCCTTTGCGGTGAACCC
TATGTTTGTCTGTCTGCTACGTGCGATTCTGCAATTAATAACATAGAGAACTCTTTTGGT
TCCTCTACACTTTGT

QA 1 615 1 615
DS 

RD RS1A010TV 731 0 0
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GGGATCCTTCAAAGCCATTTCGAAACCATTCTTGTATTGAGAAAGAGTACACAGACGAAA
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ATACTTCGAAAACATGGCTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGATTGTATCTGCTTTCGTCTC
TCAAGAACTCTCCAATGCAATCTTCCGACGCGGTTATGCGGCTACGGCGGCGCAAGCGGC
CGGTGTGAAAGGTGGAGCCGTTGTTTCGGCGGTGATGAAGAAGAAGAGAGTGGAAGAATC
GACCCAAAAGATTGCTTGGATTCCAGACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGGAAACTTG
TTCAAAAGAGATCGACCCAGCAGAGCTACGAGCAGCCCTCTTGAACAACAAGCAGTAATG
AAAAAGAAGAAAAAAACAAGCAGTGATGAATTAACCGAAAAGAAGCGCTTTTTCTGTTAA
TTATTTGTTGTTAGTTTTAATGTCTTGGTGGAATAGGGTAATGATCCTTTGCGGTGAACC
CTATGTTTGTCTGTCTGCTACGTGCGATTCTGCAATTAATAACATAGAGAACTCTTTTGG
TTCCTCTACACTTTGTAACAAAATGATCAATGTATGTATGACTGAA*GTATTTATATACT
CCCTCCGTT
TC

QA 1 729 1 729
DS 

RD RS1A010TF 717 0 0
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AGCCATTTCGAAACCATTCTTGTATTGAGAAAGAGTACACAGACGAAAACAAGAAGAAAG
TTTCAACGTTTATTGTCTGTTCTATCTTTCTCTCTTTCAAGAAACAACATACTTCGAAAA
CATGGCTCGTTCTCTCTCTAACGTTAAGATTGTATCTGCTTTCGTCTCTCAAGAACTCTC
CAATGCAATCTTCCGACGCGGTTATGCGGCTACGGCGGCGCAAGCGGCCGGTGTGAAAGG
TGGAGCCGTTGTTTCGGCGGTGATGAAGAAGAAGAGAGTGGAAGAATCGACCCAAAAGAT
TGCTTGGATTCCAGACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGGAAACTTGTTCAAAAGAGAT
CGACCCAGCAGAGCTACGAGCAGCCCTCTTGAACAACAAGCAGTAATGAAAAAGAAGAAA
AAAACAAGCAGTGATGAATTAACCGAAAAGAAGCGCTTTTTCTGTTAATTATTTGTTGTT
AGTTTTAATGTCTTGGTGGAATAGGGTAATGATCCTTTGCGGTGAACCCTATGTTTGTCT
GTCTGCTACGTGCGATTCTGCAATTAATAACATAGAGAACTCTTTTGGTTCCTCTACACT
TTGTAACAAAATGATCAATGTATGTATGACTGAAAGTATTTATATACTCCCTCCGTT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1DK60TF 433 0 0
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CCAAAAGATTGCTTGGATTCCAGACCCCAAAACCGGTTATTACAGACCGGAAACTTGTTC
AAAAGAGATAGACCCAGCAGAGCTACGAGCAGCTCTCTTGAACAACAAGCAGTAATGAAA
AAGAAGAAAAAAACAAGCAGTGATGAATTAACCGAAAAGAAGCGCTTTTTCTGTTAATTA
TTTGTTGTTAGTTTTAATGTCTTGGTGGAATAGGGTAATGATCCTTTGCGGTGAACCCTA
TGTTTGTCTGTCTGCTACGTGCGATTCTGCAATTAATAACATAGAGAACTCTTTTGGTTC
CTCTACACTTTGTAACAAAATGATCAATGGATGTATGACTGAAAGTATTTATATACTCCC
TCCGTTTCAAATT

QA 1 433 1 433
DS 



AS 1 5

CO CL1701Contig1 598 5 4 U
GGGTTCAAAGAAGAAAGAAGAGGAGAGAAAATGGGAGGTGTATTATCATCTGTGTTAGGA
GGTGGTGGAGAAGAAGCAGTCGCAGGGAATGAATCCGAAAATCGCGTCATGAAGTTTAGC
TCATCGGCTCGGTGGCAGCTTCACTTCAACGAGATCAAAGAATCCTCCAAACTGCTGGTG
GTTGACTTCTCAGCATCCTGGTGTGGACCTTGTAGGATGATCGAGCCTGCCTTCATTGCC
ATGTCTGCCAAGTTCACTGATGTTGAATTCGTCAAATTGGATGTCGATGAACTTCCCGAT
GTGGCTAAAGAGTTCAACGTGACGGGGATGCCAACTTTTGTACTGGTGAAAAATGGTAAA
GAGATTGAAAGGATCGTTGGAGCAAGGAAAGATGAACTTGAGAAGAAAGTTCTCAAACAC
AGGGCATAGTGATCCATTGAGTTAACACACCTTCACCCGATATAGCCATTGTGTAAAACT
TATTACTATTAAATAATTGGCTTTGTTGATCCCTCTTTCTCCCTTCTGTGTGATTGATTG
AAACGGTTTGCTGAAAATGTTTTTGGCTCTGCTCTATCATAATTAAGTTTATGCATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BJ04TF U 1
AF RS1BJ04JQ C 200
AF RS1D110TF U 197
AF RS1FE49TF U 80
AF RS1FE49JQ C 95
BS 1 92 RS1BJ04TF
BS 93 93 RS1FE49TF
BS 94 575 RS1BJ04TF
BS 576 598 RS1FE49TF

RD RS1BJ04TF 581 0 0
GGGTTCAAAGAAGAAAGAAGAGGAGAGAAAATGGGAGGTGTATTATCATCTGTGTTAGGA
GGTGGTGGAGAAGAAGCAGTCGCAGGGAATGATTCCGAAAATCGCGTCATGAAGTTTAGC
TCATCGGCTCGGTGGCAGCTTCACTTCAACGAGATCAAAGAATCCTCCAAACTGCTGGTG
GTTGACTTCTCAGCATCCTGGTGTGGACCTTGTAGGATGATCGAGCCTGCCTTCATTGCC
ATGTCTGCCAAGTTCACTGATGTTGAATTCGTCAAATTGGATGTCGATGAACTTCCCGAT
GTGGCTAAAGAGTTCAACGTGACGGGGATGCCAACTTTTGTACTGGTGAAAAATGGTAAA
GAGATTGAAAGGATCGTTGGAGCAAGGAAAGATGAACTTGAGAAGAAAGTTCTCAAACAC
AGGGCATAGTGATCCATTGAGTTAACACACCTTCACCCGATATAGCCATTGTGTAAAACT
TATTACTATTAAATAATTGGCTTTGTTGATCCCTCTTTCTCCCTTCTGTGTGATTGATTG
AAACGGTTTGCTGAAAATGTTTTTGGCTCTGCTCT
ATCATA

QA 1 575 1 575
DS 

RD RS1BJ04JQ 372 0 0
GGTGTGGACCTTGTAGGATGATCGAGCCTGCCTTCATTGCCATGTCTGCCAAGTTCACTG
ATGTTGAATTCGTCAAATTGGATGTCGATGAACTTCCCGATGTGGCTAAAGAGTTCAACG
TGACGGGGATGCCAACTTTTGTACTGGTGAAAAATGGTAAAGAGATTGAAAGGATCGTTG
GAGCAAGGAAAGATGAACTTGAGAAGAAAGTTTTCAAACACAGGGCATAGTGATCCATTG
AGTTAACACCCCTTCCCCCGATATAGCCATTGTGTAAAACTTATTATTATTAAATAATTG
GCTTTGTTGATCCCTCTTTCTCCCTTCTGTGTGATTGATTGAAACGGTTTGCTGAAAATG
TTTTTGG
TTTTG

QA 1 367 1 367
DS 

RD RS1D110TF 379 0 0
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CTGATGTTGAATTCGTCAAATTGGATGTCGATGAACTTCCCGATGTGGCTAAAGAGTTCA
ACGTGACGGGGATGCCAACTTTTGTACTGGTGAAAAATGGTAAAGAGATTGAAAGGATCG
TTGGAGCAAGGAAAGATGAACTTGAGAAGAAAGTTCTCAAACACAGGGCATAGTGATCCA
TTGAGTTAACACACCTTCACCCGATATAGCCATTGTGTAAAACTTATTACTATTAAATAA
TTGGCTTTGTTGATCCCTCTTTCTCCCTTCTGTGTGATTGATTGAAACGGTTTGCTGAAA
ATGTTTTTGGCTCTGCTCT

QA 1 379 1 379
DS 

RD RS1FE49TF 519 0 0
CAGTCGCA
AATGAATCCGAAAATCGCGTCATGAAGTTTAGCTCATCGGCTCGGTGGCAGCTTCACTTC
AACGAGATCAAAGAATCCTCCAAACTGCTGGTGGTTGACTTCTCAGCATCCTGGTGTGGA
CCTTGTAGGATGATCGAGCCTGCCTTCATTGCCATGTCTGCCAAGTTCACTGATGTTGAA
TTCGTCAAATTGGATGTCGATGAACTTCCCGATGTGGCTAAAGAGTTCAACGTGACGGGG
ATGCCAACTTTTGTACTGGTGAAAAATGGTAAAGAGATTGAAAGGATCGTTGGAGCAAGG
AAAGATGAACTTGAGAAGAAAGTTCTCAAACACAGGGCATAGTGATCCATTGAGTTAACA
CACCTTCACCCGATATAGCCATTGTGTAAAACTTATTACTATTAAATAATTGGCTTTGTT
GATCCCTCTTTCTCCCCTCTGTGTGATTGATTGAAACGGTTTGCTGAAAATGTTTTTGGC
TCTGCTCTATCATAATTAAGTTTATGCATCT

QA 9 519 9 519
DS 

RD RS1FE49JQ 504 0 0
CCGAAAATCGCGTCATGAAGTTTAGCTCATCGGCTCGGTGGCAGCTTCACTTCAACGAGA
TCAAAGAATCCTCCAAACTGCTGGTGGTTGACTTCTCAGCATCCTGGTGTGGACCTTGTA
GGATGATCGACCCTCCCTTCATTGCCATGTCTGCCAAGTTCACTGATGTTGAATTCGTCA
AATTGGATGTCGATGAACTTCCCGATGTGGCTAAAGAGTTCAACGTGACGGGGATGCCAA
CTTTTGTACTGGTGAAAAATGGTAAAGAGATTGAAAGGATCGTTGGAGCAAGGAAAGATG
AACTTGAGAAGAAAGTTCTCAAACACAGGGCATAGTGATCCATTGAGTTAACACCCCTTC
CCCCGATATAGCCATTGTGTAAAACTTATTACTATTAAATAATTGGCTTTGTTGATCCCT
CTTTCTCCCCTCTGTGTGATTGATTGAAACGGTTTGCTGAAAATGTTTTTGGCTCTGCTC
TATCATAATTAAGTTTATGCATCT

QA 1 504 1 504
DS 



AS 1 5

CO CL1702Contig1 609 5 8 U
GGATATAAGTGTGTTAAGAGGCGAAAAGAGTTATTTAATGGCGACGTCAGGGTTTAAGCA
TTTGGTGGTTGTGAAGTTTAAGGAAGATGCTAAGGTTGATGAGATCTTGAAGGGCTTGGA
GAATCTTGTTTCTCAAATTGATTCTGTCAAATCCTTTGAATGGGGAGAAGATAATGAGAG
TCACGAGATGCTTAGACAAGGATTCACTCATGCATTCTCGATGACTTTTGAGAATAAAGA
TGCTTACGTTTCTTTCACAAGCCATCCTCTTCACATTGAGTTCTCTGCCGCTTTCACCGC
TGTCATCGACAAGATTGTGGTCATGGACTTCACCGTCGCCGCCGTCAAATCTCCCGTTGT
AGCACCGTGAAACTCATCGTACTTGTTTCTTAAATTAATCTCGTTTTATAATTTAATCGA
GGTTTGTGAGTTGTTTCGGTTTATGTAATTCTGTTGGTTTAAGTATGTTTTGGTTTGATC
CGTTCAATTCCGGTTCGGAATAATAAAAAACAGGTTTGGTTGGTAGTTTGGTTATTGTTT
ACTTTGAAGTGAAAATAAATATATAATCTTGTGTTAAATGGAATTCAAGTGAGTAATCTG
TTTTTTTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EY11TF U 5
AF RS1A715TF U 1
AF RS1DS55TF U 5
AF RS1G203TF U 5
AF RS1G203JQ C 155
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BS 360 378 RS1A715TF
BS 379 379 RS1DS55TF
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GG
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TGTCATCGACAAGATTGTGGTCATGGACTTCACCGTCGCCGCCGTCAAATCTCCCGTTTT
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CGTTCAATTCCGGTTCGGAATAATAAAAAACAGGTTTGGTTGGTAGTTTGGTTATTGTTT
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T

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DS 

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GG
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GGTTGTGAAGTTTAAGGAAGATGCTAAGGTTGATGAGATCTTGAAGGGCTTGGAGAATCT
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TTA

QA 3 605 3 605
DS 

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TTCTCGATGACTTTTGAGAATAAAGATGCTTACGTTTCTTTCACAAGCCATCCTCTTCAC
ATTGAGTTTTCTGCCGCTTTCACCGCTGTCATCGACAAGATTGTGGTCATGGACTTCACC
GTCGCCGCCGTCAAATCTCCCGTTGTAGCACCGTGAAACTCATCGTACTTGTTTCTTAAA
TTAATCTCGTTTTATAATTTAATCGAGGTTTGTGAGTTGTTTCGGTTTATGTAATTCTGT
TGGTTTAAGTATGTTTTGGTTTGATCCGTTCAATTCCGGTTCGGAATAATAAAAAACAGG
TTTGGTTGGTAGTTTGGTTATTGTTTACTTTGAAGTGAAAATAAATATATAATCTTGTGT
TAAATGGAATTCAAGTGAGTAATCTGTTTTTTTTA

QA 1 455 1 455
DS 



AS 1 4

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CTAGAGCTATCTTTGAGCTAGCGATATCTCAGCCAGCTCTTGACATGCCCGAGCTGCTAT
GGAAGGCATACATAGATTTTGAGATAGCAGAAGGAGAATTAGAGAGGACACGAGCTTTAT
ATGAGCGACTATTGGACCGCACAAAGCATTACAAGGTGTGGGTTAGTTTTGCAAAGTTTG
AAGCTTCTGCTGCAGAACAAGAAGAAGACGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAGCAAGAACAAA
CAGCTGCTACTGAAGGCAAGAAAGAGTGCATCAGACGCGCCAGAGCGATTTTCGAGAGAG
CCAACAGCTACTTCAAAGATTC***ACCAGAGCTGAAAGAAGAAAGAGCTACACTCTTGG
AGGATTGGCTTAACG*GGAGACAAACTTTGGTAATCTCGGGGACGTGAGTGTCGTACAAT
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TTCTTGAAGCAGCTTACAAATGGAAGAAGCAGAAGCTTGCTACTTCTGAGGAGGATTACG
ATTAACTAAAGTTGCTTCTTAGTTATATCAAAACTGTGACTTGTTGTTTTGTATTCTTTC
TTAGTTCTATGTACATCGCCACTCATCTTTATGGTTCAGCAGTAATCTTTTATTGTGTTA
GCAAAAAAAAAAAACATTCTGTTACTGTTTTTGTTCTTTTTTGGTATTACCTTTTGGTTT
GCGTGAATCCGGTTTAGAAAATATGGGAC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DG49TF U 1
AF RS1DG49JQ C 1
AF RS1FF74JQ C 34
AF RS1D040TF U 589
BS 1 2 RS1DG49JQ
BS 3 743 RS1DG49TF
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RD RS1DG49TF 743 0 0
GG
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AGAGCTATCTTTGAGCTAGCGATATCTCAGCCAGCTCTTGACATGCCCGAGCTGCTATGG
AAGGCATACATAGATTTTGAGATAGCAGAAGGAGAATTAGAGAGGACACGAGCTTTATAT
GAGCGACTATTGGACCGCACAAAGCATTACAAGGTGTGGGTTAGTTTTGCAAAGTTTGAA
GCTTCTGCTGCAGAACAAGAAGAAGACGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAGCAAGAACAAACA
GCTGCTACTGAAGGCAAGAAAGAGTGCATCAGACGCGCCAGAGCGATTTTCGAGAGAGCC
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AAGCTCCCGAAGAAGCTCAAGAAGAGAAAGCCGATCACAAGAGAAGATGGCTCTACAGAG
TATGAAGAGTACATTGACTATCTATATCCAGAAGAATCACAGACAACGAATCCCAAGATT
CTTGAAGCAGCTTACAAATGGAAGAAGCAGAAGCTTGCTACTTCTGAGGAGGATTACGAT
TAACTAAAGTTGCTTCTTAGTTATATCAAAACTGTGACTTGTTGTTTTGTATTCTTTCTT
AGTTCTATGTACATCGCCACT

QA 3 743 3 743
DS 

RD RS1DG49JQ 782 0 0
GGTGCTATGCTTGGAGCAAGTATGCTGAGCTGGAGAGGTCTCTTGCTGAGACTGAACGAG
CTAGAGCTATCTTTGAGCTAGCGATATCTCAGCCAGCTCTTGACATGCCCGAGCTGCTAT
GGAAGGCATACATAGATTTTGAGATAGCAGAAGGAGAATTAGAGAGGACACGAGCTTTAT
ATGAGCGACTATTGGACCGCACAAAGCATTACAAGGTGTGGGTTAGTTTTGCAAAGTTTG
AAGCTTCTGCTGCAGAACAAGAAGAAGACGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAGCAAGAACAAA
CAGCTGCTACTGAAGGCAAGAAAGAGTGCATCAGACGCGCCAGAGCGATTTTCGAGAGAG
CCAACAGCTACTTCAAAGATTC***ACCAGAGCTGAAAGAAGAAAGAGCTACACTCTTGG
AGGATTGGCTTAACG*GGAGACAAACTTTGGTAATCTCGGGGACGTGAGTGTCGTACAAT
CTAAGCTCCCGAAGAAGCTCAAGAAGAGAAAGCCGATCACAAGAGAAGATGGCTCTACAG
AGTATGAAGAGTACATTGACTATCTATATCCAGAAGAATCACAGACAACGAATCCCAAGA
TTCTTGAAGCAGCTTACAAATGGAAGAAGCAGAAGCTTGCTACTTCTGAGGAGGATTACG
ATTAACTAAAGTTGCTTCTTAGTTATATCAAAACTGTGACTTGTTGTTTTGTATTCTTTC
TTAGTTCTATGTACATCGCCACTCATCTTTATGGTTCAGCAGTAATCTTTTATTGTGTTA
GC

QA 1 782 1 782
DS 

RD RS1FF74JQ 749 0 0
AGAGGTCTCTTGCTGAGACTGAACGAGCTAGAGCTATCTTTGAGCTAGCGATATCTCAGC
CAGCTCTTGACATGCCCGAGCTGCTATGGAAGGCATACATAGATTTTGAGATAGCAGAAG
GAGAATTAGAGAGGACACGAGCTTTATATGAGCGATTATTGGACCGCACAAAGCATTACA
AGGTGTGGGTTAGTTTTGCAAAGTTCGAAGCGTCTGCTGCAGAACAAGAAGAAGACGAGG
AAGAGGAAGAGGAAGAGCAAGAACAAACAGCTGCTACTGAAGGCAAGAAAGAGTGCATCA
GACGCGCCAGAGCGATTTTCGAGAGAGCCAACAGCTACTTCAAAGATTCTGCACCAGAGC
TGAAAGAAGATAGAGCTACACTCTTGGAGGATTGGCTTAACATGGAGACAAACTTTGGTA
ATCTCGGGGACGTGAGTGTCGTACAATCTAAGCTCCCGAAGAAGCTCAAGAAGAGAAAGC
CGATCACAAGAGAAGATGGCTCTACAGAGTATGAAGAGTACATTGACTATCTATATCCAG
AAGAATCACAGACAACGAATCTCAAGATTCTTGAAGCAGCTTACAAATGGAAGAAGCAGA
AGCTTGCTACTTCTGAGGAGGATTACGATTAACTAAAGTTGCTTCTTAGTTATATCAAAA
CTGTGACTTGTTGTTTTGTATTCTTTCTTAGTTCTATGTACATCGCCACTCATCTTTATG
GTTCAGCAGTAATCTTTTATTGTGTTAGC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RS1D040TF 281 0 0
G
GAATCTCAAGATTCTTGAAGCAGCTTACAAATGGAAGAAGCAGAAGCTTGCTACTTCTGA
GGAGGATTACGATTAACTAAAGTTGCTTCTTAGTTATATCAAAACTGTGACTTGTTGTTT
TGTATTCTTTCTTAGTTCTATGTACATCGCCACTCATCTTTATGGTTCAGCAGTAATCTT
TTATTGTGTTAGCAAAAAAAAAAAACATTCTGTTACTGTTTTTGTTCTTTTTTGGTATTA
CCTTTTGGTTTGCGTGAATCCGGTTTAGAAAATATGGGAC

QA 2 281 2 281
DS 



AS 1 5

CO CL1704Contig1 1318 5 8 U
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TTCCATTAATGGGCTGGCCTTTCCCCAAGTACCCACCTTTCACAATGGTCAACCCTAATA
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ATCTTAACAAAGATGGAGGAAACCCATGAAGACTGAAGTTTCACTTGTGTTTAAAAACAC
TTTATATGGTTTTACATTTCAACATAAAAAAAA*TAAAAATTGTATCTTTAACAATTGAA
TGGTAAGACAAAGAAGATGTTACCTATCTATCAATCAGCTCAAAATGATTTTAGCTATGA
CAGATACAGGAATATTCACAACGTGTCCTGCCTTTCCAAACAAACCTATTCTTCCAAAAC
TAGAACTTGAACTGTTCCTTGTCGCCTCCAGGATTATGCTTAGCACTTGAGTTTCTCCCA
TTCCTATAAAAAACTGAGCAGGAGATACCTTCATTGAAACACCATAAGGAGGACTCCAAC
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CATTAAGGGTTGATAATGTGATCGACGGCAAGTTGAGATCAAAACCTCTGATTGTTGAAT
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TTTGGTCAGGATTAGGATAAGTACGCTGAGCCATTATGGGACCTCCACTGTTATCATTAA
GAAGAGCGGTTGTTGAAAGTGCAGACGCGACTGCTGAAAGAGTAAAGTTGGGGTAAGTTT
GTTTGATCAGTGCAGCCACACCAGCTACATGAGGAGCAGCCATGCTTGTACCGGACATCA
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BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EM70TF U 1
AF RS1EN27TF U 4
AF RS1EN27JQ C 347
AF RS1GK25JQ U 389
AF RS1GK25TF C 628
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GG
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TTCTGTTTACTCCTCCTCGGCGTCTTCTTCCTTAGTTCTCAACCTGCACTCTCACTCCGC
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TTAATGGGCTGGCCTTTCCCCAAGTACCCACCTTTCACAATGGTCAACCCTAATATCCCA
ACAAACCCATCTGGAGCTCAAGAGGAATCAGAGAAGCTACCTTCTTCCCCAAGTAATCTT
AACAAAGATGGAGGAAACCCATGAAGACTGAAGTTTCACTTGTGTTTAAAAACACTTTAT
ATGGTTTTACATTTCAACATAAAAAAAA*TAAAAATTGTATCTTTAACAATTGAATGGTA
AGACAAAGAAGATGTTACCTATCTATCAATCAGCT

QA 3 517 3 517
DS 

RD RS1EN27JQ 174 0 0
TTT
TTCCCCAAGTAATTTTAACAAAGATGGAGGAAACCCATGAAGACTGAAGTTTCACTTGTG
TTTAAAAACACTTTATATGGTTTTACATTTCAACATAAAAAAAA*TAAAAATTGTATCTT
TAACAATTGAATGGTAAGACAAAGAAGATGTTACCTATCTATCAATCAGCT

QA 4 174 4 174
DS 

RD RS1GK25JQ 814 0 0
G
AGACTGAAGTTTCACTTGTGTTTAAAAACACTTTATATGGTTTTACATTTCAACATAAAA
AAAA*TAAAAATTGTATCTTTAACAATTGAATGGTAAGACAAAGAAGATGTTACCTATCT
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AGGATTATGCTTAGCACTTGAGTTTCTCCCATTCCTATAAAAAACTGAGCAGGAGATACC
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QA 2 814 2 814
DS 

RD RS1GK25TF 691 0 0
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CCTTCATTGAAACACCATAAGGAGGACTCCAACCAACATTGTACGTCTCATTTCCAGCTA
TGTTTCTCACCCATCTTTTGAAAACTTGCGTGCCATTAAGGGTTGATAATGTGATCGACG
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TGTAGTTAAACACCGCTGAATCTGAACCGTTGATTCCACACAGAAATGACATGTAGTCTT
CAAAACTAGTATCGAAAATTAAACCAGGGTCTAAAGCTGCCGTGGCGTTCACGAAACCGC
TACCCATATCAAACGGTGTTGCGTTAATGAGGCTTTGGTCAGGATTAGGATAAGTACGCT
GAGCCATTATGGGACCTCCACTGTTATCATTAAGAAGAGCGGTTGTTGAAAGTGCAGACG
CGACTGCTGAAGGAGTAAAGTTGGGGTAAGTTTGTTTGATCAGTGCAGCCACACCAGCTA
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TTGAATCTATGGAAGCGGAACTCCAAGCACCCCAAATAGAGTTTCCAGGAGCTACGAGGT
TAGGTTTCAATATGTCAGCGTCGTTGAAAGC

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 5

CO CL1705Contig1 911 5 8 U
GCACACTTCCAATCAATCGGCGAGACTTCAAAGATGGCGACACAAATCAGCAAGAAGAGA
AAGTTTGTAGCGGACGGTGTGTTCTACGCTGAGCTGAACGAGGTTTTAACCAGAGAGCTT
GCGGAGGATGGTTACTCTGGTGTGGAGGTTAGGGTTACTCCGATGAGGACTGAGATTATC
ATCAGAGCCACACGTACTCAAAATGTTCTCGGTGAGAAGGGAAGGAGGATCAGAGAGTTG
ACACCTCTTGTGCAGAAGAGATTCAGGTTTCCTCAAGACAGTGTTGAGCTTTACGCTGAG
AAGGTGACCAACAGAGGTCTCTGCGCTATTGCTCAGGCTGAGTCTCTTCGTTACAAGCTT
CTCGGTGGACTTGCTGTCCGCAGGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGATTCGTTATGGAGAGT
GGTGCTAAAGGATGTGAGGTGATTGTGAGTGGAAAGCTTCGTGCAGCACGTGCCAAGTCC
ATGAAATTCAAGGACGGGTACATGGTTTCCTCCGGTCAGCCAACCAAGGATTACATCGAC
TCTGCTGTCAGACATGTTCTGCTTAGACAGGGTGTGCTGGGAATCAAGGTGAAGGTCATG
CTTGACTGGGACCCTAAGGGAGTAAATGGACCAAAGACACCATTGCCTGATGTTGTCATC
ATCCATGCTCCCAAGGAGGAAGATGTCAACTCTGCTCCTGCTCAGGTTACTGCTCCGGCT
GCCCTTGCACCGGAAGCTCCCCTCACAGCAGTAGACTACCCTGAGATGATCCCAGTCGCC
TAGAAGAAGGAATCTCTTTTCACTACTACTATGTGATTTTGCTCTTGTAACTTTTTTGCT
TTTTTTTTTTTTGACAGTTTATAGTTATATCGTATCTCCGAATCAGACACCTTTCTTGAA
ATCTTATTTCT


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E841TF U 1
AF RS1FY62TF U 1
AF RS1BN71TF U 3
AF RS1FY62JQ C 254
AF RS1BN71JQ C 192
BS 1 243 RS1E841TF
BS 244 244 RS1BN71TF
BS 245 587 RS1E841TF
BS 588 588 RS1FY62TF
BS 589 675 RS1E841TF
BS 676 676 RS1BN71JQ
BS 677 701 RS1E841TF
BS 702 911 RS1BN71JQ

RD RS1E841TF 701 0 0
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AAGTTTGTAGCGGACGGTGTGTTCTACGCTGAGCTGAACGAGGTTTTAACCAGAGAGCTT
GCGGAGGATGGTTACTCTGGTGTGGAGGTTAGGGTTACTCCGATGAGGACTGAGATTATC
ATCAGAGCCACACGTACTCAAAATGTTCTCGGTGAGAAGGGAAGGAGGATCAGAGAGTTG
ACATCTCTTGTGCAGAAGAGATTCAGGTTTCCTCAAGACAGTGTTGAGCTTTACGCTGAG
AAGGTGACCAACAGAGGTCTCTGCGCTATTGCTCAGGCTGAGTCTCTTCGTTACAAGCTT
CTCGGTGGACTTGCTGTCCGCAGGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGATTCGTTATGGAGAGT
GGTGCTAAAGGATGTGAGGTGATTGTGAGTGGAAAGCTTCGTGCAGCACGTGCCAAGTCC
ATGAAATTCAAGGACGGGTACATGGTTTCCTCCGGTCAGCCAACCAAGGATTACATCGAC
TCTGCTGTCAGACATGTTCTGCTTAGACAGGGTGTGCTGGGAATCAAAGTGAAGGTCATG
CTTGACTGGGACCCTAAGGGAGTAAATGGACCAAAGACACCATTGCCTGATGTTGTCATC
ATCCATGCTCCCAAG*AGGAAGATGTCAACTCTGCTCCTGC

QA 1 701 1 701
DS 

RD RS1FY62TF 672 0 0
GCAC
ACTTCCAATCAATCGGCGAGACTTCAAAGATGGCGACACAAATCAGCAAGAAGAGAAAGT
TTGTAGCGGACGGTGTGTTCTACGCTGAGCTGAACGAGGTTTTAACCAGAGAGCTTGCGG
AGGATGGTTACTCTGGTGTGGAGGTTAGGGTTACTCCGATGAGGACTGAGATTATCATCA
GAGCCACACGTACTCAAAATGTTCTCGGTGAGAAGGGAAGGAGGATCAGAGAGTTGACAT
CTCTTGTGCAGAAGAGATTCAGGTTTCCTCAAGACAGTGTTGAGCTTTACGCTGAGAAGG
TGACCAACAGAGGTCTCTGCGCTATTGCTCAGGCTGAGTCTCTTCGTTACAAGCTTCTCG
GTGGACTTGCTGTCCGCAGGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGATTCGTTATGGAGAGTGGTG
CTAAAGGATGTGAGGTGATTGTGAGTGGAAAGCTTCGTGCAGCACGTGCCAAGTCCATGA
AATTCAAGGACGGGTACATGGTTTCCTCCGGTCAGCCAACCAAGGATTACATCGACTCTG
CTGTCAGACATGTTCTGCTTAGACAGGGTGTGCTGGGAATCAAGGTGAAGGTCATGCTTG
ACTGGGACCCTAAGGGAGTAAATGGACCAAAGACACCATTGCCTGATGTTGTCATCATCC
ATGCTCCC

QA 5 672 5 672
DS 

RD RS1BN71TF 699 0 0
GG
ACTTCCAATCAATCGGCGAGACTTCAAAGATGGCGACACAAATCAGCAAGAAGAGAAAGT
TTGTAGCGGACGGTGTGTTCTACGCTGAGCTGAACGAGGTTTTAACCAGAGAGCTTGCGG
AGGATGGTTACTCTGGTGTGGAGGTTAGGGTTACTCCGATGAGGACTGAGATTATCATCA
GAGCCACACGTACTCAAAATGTTCTCGGTGAGAAGGGAAGGAGGATCAGAGAGTTGACAC
CTCTTGTGCAGAAGAGATTCAGGTTTCCTCAAGACAGTGTTGAGCTTTACGCTGAGAAGG
TGACCAACAGAGGTCTCTGCGCTATTGCTCAGGCTGAGTCTCTTCGTTACAAGCTTCTCG
GTGGACTTGCTGTCCGCAGGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGATTCGTTATGGAGAGTGGTG
CTAAAGGATGTGAGGTGATTGTGAGTGGAAAGCTTCGTGCAGCACGTGCCAAGTCCATGA
AATTCAAGGACGGGTACATGGTTTCCTCCGGTCAGCCAACCAAGGATTACATCGACTCTG
CTGTCAGACATGTTCTGCTTAGACAGGGTGTGCTGGGAATCAAGGTGAAGGTCATGCTTG
ACTGGGACCCTAAGGGAGTAAATGGACCAAAGACACCATTGCCTGATGTTGTCATCATCC
ATGCTCCCAAG*AGGAAGATGTCAACTCTGCTCCTGC

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DS 

RD RS1FY62JQ 639 0 0
AGAAGAGATTCAGGTTTCCTCAAGACAGTGTTGAGCTTTACGCTGAGAAGGTGACCAACA
GAGGTCTTTGCGCTATTGCTCAGGCTGAGTCTCTTCGTTACAAGCTTCTCGGTGGACTTG
CTGTCCGCAGGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGATTCGTTATGGAGAGTGGTGCTAAAGGAT
GTGAGGTGATTGTGAGTGGAAAGCTTCGTGCAGCACGTGCCAAGTCCATGAAATTCAAGG
ACGGGTACATGGTTTCCTCCGGTCAGCCAACCAAGGATTACATCGACTTTGCTGTCAGAC
ATGTTTTGCTTAGACAGGGTGTGCTGGGAATCAAGGTGAAGGTCATGCTTGACTGGGACC
CTAAGGGAGTAAATGGACCAAAGACACCATTGCCTGATGTTGTCATCATCCATGCTCCCA
AGGAGGAAGATGTCAACTCTGCTCCTGCTCAGGTTACTGCTCCGGCTGCCCTTGCACCGG
AAGCTCCCCTCACAGCAGTAGACTACCCTGAGATGATCCCAGTCGCCTAGAAGAAGGAAT
CTCTTTTCACTACTACTATGTGATTTTGCTCTTGTAACTTTTTTGCTTTTTTTTTTTTTG
ACAGTTTATAGTTATATCGTATCTCCGAATCAGACACC
G

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DS 

RD RS1BN71JQ 720 0 0
ACGTACTCAAAATGTTCTCGGTGAGAAGGGAAGGAGGATCAGAGAGTTGACACCTCTTGT
GCAGAAGAGATTCAGGTTTCCTCAAGACAGTGTTGAGCTTTACGCTGAGAAGGTGACCAA
CAGAGGTCTTTGCGCTATTGCTCAGGCTGAGTCTCTTCGTTACAAGCTTCTCGGTGGACT
TGCTGTCCGCAGGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGATTCGTTATGGAGAGTGGTGCTAAAGG
ATGTGAGGTGATTGTGAGTGGAAAGCTTCGTGCAGCACGTGCCAAGTCCATGAAATTCAA
GGACGGGTACATGGTTTCCTCCGGTCAGCCAACCAAGGATTACATCGACTTTGCTGTCAG
ACATGTTTTGCTTAGACAGGGTGTGCTGGGAATCAAGGTGAAGGTCATGCTTGACTGGGA
CCCTAAGGGAGTAAATGGACCAAAGACACCATTGCCTGATGTTGTCATCATCCATGCTCC
CAAGGAGGAAGATGTCAACTCTGCTCCTGCTCAGGTTACTGCTCCGGCTGCCCTTGCACC
GGAAGCTCCCCTCACAGCAGTAGACTACCCTGAGATGATCCCAGTCGCCTAGAAGAAGGA
ATCTCTTTTCACTACTACTATGTGATTTTGCTCTTGTAACTTTTTTGCTTTTTTTTTTTT
TGACAGTTTATAGTTATATCGTATCTCCGAATCAGACACCTTTCTTGAAATCTTATTTCT

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 4

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AGAGAAGCTCTCCTTCATTGTTATCCAGCTTCCGTTTTTCAAAAGAATCACAATGGACGG
TGGTGACGTGGCCACGCCTGTACAAAAGAAGGCACACGAGGCATGGAGAGTTTACAAATA
CTACCTCGACAAGACCACACCTCACTCAACCTACAGGTGGATTGGCACATTCGTCGTCTT
TCTCATCTACTGCTTGAGAGTTTTCTCCATTCACGGTTTCTACATCATCTCCTACGGTCT
CGGCATCTACCTCCTCAACCTCCTCATCGGCTTCTTGTCTCCCCTCGTTGACCCCGAGCT
CGACGCTGTCTCTGATGGTGGTGGTGCTTCTCTCCCTACTCGTGGCTCTGATGAGTTCAA
GCCTTTTATCCGCCGACTCCCTGAGTTCAAGTTCTGGTACTCCATGACGAAAGCATTCTG
CATTGCCTTTCTCATGACGTTCTTCTCGGTTTTTGATGTTCCCGTCTTCTGGCCTATACT
GCTTTGCTACTGGATCGTTCTCTTTGTCCTCACCATGAGACGCCAGATCTCCCACATGAT
CAAGCACAAGTACATTCCTTTCAGCATCGGTAAACAGAAATATAGCGGTCGGAGATCTGC
TGGCTCTCGTGCTGATTGATTGATCCAGAAGAACGAGAAAAAAAGGGAGATAGGGTTCAA
AAACCAATTTGGAGTGTTTTTTGTAGTGTGATGAATTGAATCAAATTCCCTATCAGCTAC
CTATTGGCAACAAGGGTGTGATTAGTTTAATCTGTTATATGTTGCAAGAAAAATGTTCTT
TGTTAGTTCCCCTTTAATCCTAAGTACTTCTGTAAATATGGATTTACTTTTATTTCGAAA
CACATTCATTCCTTTGTTTATCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RS1FQ07TF U 1
AF RS1FQ07JQ C 127
AF RS1AN36JQ C 607
AF RS1AN36TF U 607
BS 1 623 RS1FQ07TF
BS 624 919 RS1AN36TF
BS 920 924 RS1FQ07JQ

RD RS1FQ07TF 623 0 0
GGGCGTTGGTGTTCCTTAAGCTCAGAATCAGATCCGCTTGCTTCGCCGACGAGGTGACGC
AGAGAAGCTCTCCTTCATTGTTATCCAGCTTCCGTTTTTCAAAAGAATCACAATGGACGG
TGGTGACGTGGCCACGCCTGTACAAAAGAAGGCACACGAGGCATGGAGAGTTTACAAATA
CTACCTCGACAAGACCACACCTCACTCAACCTACAGGTGGATTGGCACATTCGTCGTCTT
TCTCATCTACTGCTTGAGAGTTTTCTCCATTCACGGTTTCTACATCATCTCCTACGGTCT
CGGCATCTACCTCCTCAACCTCCTCATCGGCTTCTTGTCTCCCCTCGTTGACCCCGAGCT
CGACGCTGTCTCTGATGGTGGTGGTGCTTCTCTCCCTACTCGTGGCTCTGATGAGTTCAA
GCCTTTTATCCGCCGACTCCCTGAGTTCAAGTTCTGGTACTCCATGACGAAAGCATTCTG
CATTGCCTTTCTCATGACGTTCTTCTCGGTTTTTGATGTTCCCGTCTTCTGGCCTATACT
GCTTTGCTACTGGATCGTTCTCTTTGTCCTCACCATGAGACGCCAGATCTCCCACATGAT
CAAGCACAAGTACATTCCTTTCA

QA 1 623 1 623
DS 

RD RS1FQ07JQ 798 0 0
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CGACAAGACCACACCTCACTCAAC*TACAGGTGGATTGGCACATTCGTCGTCTTTCTCAT
CTACTGCTTGAGAGTTTTCTCCATTCACGGTTTCTACATCATCTCCTACGGTCTCGGCAT
CTACCTCCTCAACCTCCTCATCGGCTTCTTGTCTCCCCTCGTTGACCCCGAGCTCGACGC
TGTCTCTGATGGTGGTGGTGCTTCTCTCCCTACTCGTGGCTCTGATGAGTTCAAGCCTTT
TATCCGCCGACTCCCTGAGTTCAAGTTCTGGTACTCCATGACGAAAGCATTCTGCATTGC
CTTTCTCATGACGTTCTTCTCGGTTTTTGATGTTCCCGTCTTCTGGCCTATACTGCTTTG
CTACTGGATCGTTCTCTTTGTCCTCACCATGAGACGCCAGATCTCCCACATGATCAAGCA
CAAGTACATTCCTTTCAGCATCGGTAAACAGAAATATAGCGGTCGGAGATCTGCTGGCTC
TCGTGCTGATTGATTGATCCAGAAGAACGAGAAAAAAAGGGAGATAGGGTTCAAAAACCA
ATTTGGAGTGTTTTTTGTAGTGTGATGAATTGAATCAAATTCCCTATCAGCTACCTATTG
GCAACAAGGGTGTGATTAGTTTAATCTGTTATATGTTGCAAGAAAAATGTTCTTTGTTAG
TTCCCCTTTAATCCTAAGTACTTCTGTAAATATGGATTTACTTTTATTTCGAAACACATT
CATTCCTTTGTTTATCCT

QA 1 798 1 798
DS 

RD RS1AN36JQ 313 0 0
G
AAGTACATTCCTTTCAGCATCGGTAAACAGAAATATAGCGGTCGGAGATTTGCTGGCTCT
CGTGCTGATTGATTGATCCAGAAGAACGAGAAAAAAAGGGAGATAGGGTTCAAAAACCAA
TTTGGAGTGTTTTTTGTAGTGTGATGAATTGAATCAAATTCCCTATCAGCTACCTATTGG
CAACAAGGGTGTGATTAGTTTAATCTGTTATATGTTGCAAGAAAAATGTTCTTTGTTAGT
TCCCCTTTAATCCTAAGTACTTCTGTAAATATGGATTTACTTTTATTTCGAAACACATTC
ATTCCTTTGTTT

QA 2 313 2 313
DS 

RD RS1AN36TF 313 0 0
G
AAGTACATTCCTTTCAGCATCGGTAAACAGAAATATAGCGGTCGGAGATCTGCTGGCTCT
CGTGCTGATTGATTGATCCAGAAGAACGAGAAAAAAAGGGAGATAGGGTTCAAAAACCAA
TTTGGAGTGTTTTTTGTAGTGTGATGAATTGAATCAAATTCCCTATCAGCTACCTATTGG
CAACAAGGGTGTGATTAGTTTAATCTGTTATATGTTGCAAGAAAAATGTTCTTTGTTAGT
TCCCCTTTAATCCTAAGTACTTCTGTAAATATGGATTTACTTTTATTTCGAAACACATTC
ATTCCTTTGTTT

QA 2 313 2 313
DS 



AS 1 5

CO CL1707Contig1 1343 5 12 U
GGGATTTCGACAAGGATTATGACGCCAGTATGTTTGAGACAACCATAAGAGTTTTAGGGG
GACTTCTCAGTACGTACGATCTTTCAGGGGACAAACTTTTCCTCGATAAGGCTAAGGATA
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AAACCTCGGAAGTGAAGCTCTATAGGGAAATGTGGGAGAAATCAATGAAAGGTTTACTAA
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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CT
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G
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TGCTGAAGAGCTTGCATGGACTTGTTATAACTTTTACCAA*TCAACACCAACAAAA*CTT
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CGGTTAACTGGGAACAAGACATATCAGGAGTGGGGATGGAATATATTCCAAGCATTTGAG
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QA 1 502 1 502
DS 

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GACCAGAAACTGTTGAATCTCTGTTTTACCTCTGGCGGTTAACTGGGAACAAGACATATC
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ATGTTGGCTTGAAGGATGTCAATACAGGTGCTAAAGACAACAAGATGCAAAGCTTCTTCT
TAGCTGAGACTCTCAAGTATCTTTATCTTCTCTTTTCGCCTTCATCGGTTATTTCATTAG
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ACTGGAATTTGATATATCTTATTATATAATACAGCGACGTTTGAGGCATATTGTTGTATT
AGTTTGGATAATAGATAAAGAACAACATTTGTAACAACAATTAGTACTGTTTTCTTCTGA
TTTTAAAAAGAGAGCAATCAACTTTGACCGC

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 4

CO CL1708Contig1 1199 4 30 U
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CTTTAGTTACAACACACTAAGTCTTTCATGATTAAAAAAAAACCATAAATAAGTGAAGCA
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GAACTTCATTTGCCCTCTTCTCCGCTTCAAGTCTTGCTGCTTGTTCTTCACCTAGCTGCT
TCTCCAGCCTCTTTGCCGTTTCTCTCAGCTTTGTCTCCACCATATCTGTGATGCGATTAA
GCTGTCGGTCATATGATATCTCTATTTGCTTCTTGAACTCTGATATTTCATCCTTTGAAT
AACCCTTGAGCGATTCAACCTCCTTCTTCTGGTCACGTACCTTGATAGCCTCTTCCTGAA
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CATGTGAGAGGAGCTTCTGAACTTGCGCAGCTTTCTTGCGCTTATCCTTAGTCTTGTTAT
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CTCCACCCATCTTCAACAAACTCATATACCTTCTTGCTTGCAGAGAGAGGAACTAAAAC


BQ
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CATCTTCAGCCAAAGTCATGCATCTCACAATTTCTTTACAG
C

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TCTCCACCCATCTTCAACAAACTCATATACCTTCTTGCTTGCAGAGAGAGGAACTAAAAC

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DS 



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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FX14JQ U 1
AF RS1F602JQ U 22
AF RS1FX14TF C 147
AF RS1EZ07TF C 185
BS 1 213 RS1FX14JQ
BS 214 214 RS1FX14TF
BS 215 648 RS1FX14JQ
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BS 853 934 RS1FX14TF
BS 935 948 RS1EZ07TF

RD RS1FX14JQ 839 0 0
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CTAAACTCAGAAAAATAGATGTTTTCGTTTTACACCTTTCATAGATAGCCTAGATTCACA
CGTGCATGACGGCAAAAGACACGACAATTGAATTGCCTACTGGTCACAAGGGGCTTCACA
GACCCTTTAAAGAATCTCCAGCTTTGCCTGACCTAGCATCTGTCCAAGCTTTGGCTATCG
TCTTCTTCATCTCTTCATCTCCTCCCTCGTACATGTTCTTTATCAAGTCCATGATTCCAG
CCATTGGGTCTTTCTCTTTCTCAAGACTAGGTTTAATCTTATCTTCTTTGTAGTGAATGT
CAATCCAGTTTCCTTTCGAAGACTTGAACATTGTGATAACAATCCTCTTAGGCTTTACAA
GCACTTTACACTTCTCGGAGACAATCTCTTTGTGCAACTTGGGGATTGCACATCGGTAGT
TCTTCCCTTGGACATCATGAATCTTGACATCCAAAGACATCGGCTTGAACTCAGCTTCCA
CCTTGTTTTCATCAACACCTTCCAAAGATATGTACACCTTGACTTTTT***TGTCTTGAT
CCCAGCTGAACGTTCCGAGAGTTACGTAGTTCACTGCAGGAGAAACCGGCTTAACCGAAG
AAGAAACCGGTGCGGGAACCACCGCCGGTTCGACCTCTGGCTTTACAATTGAA*CACTTG
CCGACTCTCTTAGCTTCTCCAAATTGCAAATCTCGGA*CTGATGAGAT*GAGAACACGA

QA 1 839 1 839
DS 

RD RS1F602JQ 831 0 0
GCG
AAACCAAGAACAAGTTTGAATCATTTGCACAGCTACTCGGAAATATTAAACAGTCTAAAA
TGCTCCAGAAACAGCAAAACCAAACAAAACGTATGACTAAACTCAGAAAAATAGATGTTT
TCGTTTTACACCTTTCATAGATAGCCTAGATTCACACGTGCATGACGGCAAAAGACACGA
CAATTGAATTGCCTACTGGTCACAAGGGGCTTCACAGACCCTTTAAAGAATCTCCAGCTT
TGCCTGACCTAGCATCTGTCCAAGCTTTGGCTATCGTCTTCTTCATCTCTTCATCTCCTC
CCTCGTACATGTTCTTTATCAAGTCCATGATTCCAGCCATTGGGTCTTTCTCTTTCTCAA
GACTAGGTTTAATCTTATCTTCTTTGTAGTGAATGTCAATCCAGTTTCCTTTCGAAGACT
TGAACATTGTGATAACAATCCTCTTAGGCTTTACAAGCACTTTACACTTCTCGGGGACAA
TCTCTTTGTGCAACTTGGGGATTGCACATCGGTAGTTCTTCCCTTGGACATCATGAATCT
TGACATCCAAAGACATCGGCTTGAACTCAGCTTCCACCTTGTTTTCATCAACACCTTCCA
AAGATATGTACACCTTGACTTTTTCATTGTCTTGATCCCAGCTGAACGTTCCGAGAGTTA
CGTAGTTCACTGCAGGAGAAACCGGCTTAACCGATGAAGAAACCGGTGCGGGAACCACCG
CCGGTTCGACCTCTGGCTTTACAATTGAAACACTTGCCGACTCTCTTAGCTTCTCCAAAT
TGCAA*TCTCGGAACTGATGAGAT*GAGAACACGAGTTCTCTTGGCGA

QA 4 831 4 831
DS 

RD RS1FX14TF 788 0 0
TCGTTTACA
CTTTCATAGATAGC*TAGAT*CACACGTGCATGACGC**AAAGACACGACAATTGAATG*
*CTACTG*TCACAAGGG*CTTCACAGACCCTTTAAAGAATCTCCAGCTTTGC*TGAC*TA
GCATCTGTCCAAGCTTTGGCTATCGTCTTCTTCATCTCTTCATCTCCTCCCTCGTACATG
TTCTTTATCAAGTCCATGATTCCAGCCATTGGGTCTTTCTCTTTCTCAAGACTAGGTTTA
ATCTTATCTTCTTTGTAGTGAATGTCAATCCAGTTTCCTTTCGAAGACTTGAACATTGTG
ATAACAATCCTCTTAGGCTTTACAAGCACTTTACACTTCTCGGAGACAATCTCTTTGTGC
AACTTGGGGATTGCACATCGGTAGTTCTTCCCTTGGACATCATGAATCTTGACATCCAAA
GACATCGGCTTGAACTCAGCTTCCACCTTGTTTTCATCAACACCTTCCAAAGATATGTAC
ACCTTGACTTTTT***TGTCTTGATCCCAGCTGAACGTTCCGAGAGTTACGTAGTTCACT
GCAGGAGAAACCGGCTTAACCGAAGAAGAAACCGGTGCGGGAACCACCGCCGGTTCGACC
TCTGGCTTTACAATTGAAACACTTGCCGACTCTCTTAGCTTCTCCAAATTGCAAATCTCG
GAACTGATGAGATTGAGAACACGAGTTCTCTTGGCGATGTTCTGGAGTTGTCTGAGTTCT
TCCAAATCAAGCCCGAGTTCTTCAGCCATTGGTATATATCTTTGAGTAGTCTTTTCAAG

QA 10 788 10 788
DS 

RD RS1EZ07TF 764 0 0
CATGACGGC*AAAGACACGACAATTGAATG**CTACTG*TCACAAGGGGCTTCACAGACC
CTTTAAAGAATCTCCAGCTTTGC*TGACCTAGCATCTGTCCAAGCTTTGGCTATCGTCTT
CTTCATCTCTTCATCTCCTCCCTCGTACATGTTCTTTATCAAGTCCATGATTCCAGCCAT
TGGGTCTTTCTCTTTCTCAAGACTAGGTTTAATCTTATCTTCTTTGTAGTGAATGTCAAT
CCAGTTTCCTTTCGAAGACTTGAACATTGTGATAACAATCCTCTTAGGCTTTACAAGCAC
TATACACTTCTCGGGGACAATATCTTTGTGCAACTTGGGGATTGCACATCGGTAGTTCTT
CCCTTGGACATCATGAATCTTGACATCCAAAGACATCGGCTTGAACTCAGCTTCCACCTT
GTTTTCATCAACACCTTCCAAAGATATGTACACCTTGACTTTTTCATTGTCTTGATCCCA
GCTGAACGTTCCGAGAGTTACGTAGCTCACTGCAGGAGAAACCGGCTTAACCGAAGAAGA
AACCGGTGCGGGAACCACCGCCGGTTCGACCTCTGGCTTTACAATTGAAACACTTGCCGA
CTCTCTTAGCTTCTCCAAATTGCAAATCTCGGAACTGATGAGATTGAGAACACGAGTTCT
CTTGGCGATGTTCTGGAGTTGTCTGAGTTCTTC*AAATCAAGCCCGAGTTCTTCAGCCAT
TGGTATATATCTTTGAGTAGTCTTTTCAAGCAAAGGAAACGTTA

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 5

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GGACACCCAATCAACCAACCTTGATCTCTCTCACTCTCTCTCACACACAAATCCTTGGCA
AAGAAAATGGCCGATCAACTCACCGATGATCAGATCTCCGAGTTCAAGGAAGCTTTCAGC
CTTTTCGACAAGGACGGAGATGGTTGCATCACAACCAAAGAGCTTGGCACAGTGATGAGG
TCACTCGGACAGAACCCGACAGAAGCAGAGCTTCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCC
GACGGGAACGGAACCATAGACTTCCCCGAGTTTCTCAACCTGATGGCTCGTAAGATGAAG
GACACGGATTCGGAGGAAGAGCTCAAAGAAGCTTTCAGGGTTTTCGACAAGGACCAGAAC
GGTTTCATCTCCGCTGCGGAGCTGAGACATGTGATGACCAATTTGGGGGAGAAGTTGACT
GATGAAGAGGTGGATGAGATGATCAGAGAAGCTGATGTTGATGGAGATGGTCAGATCAAT
TATGAAGAGTTTGTCAAAGTTATGATGGCAAAGTGAGGATAAACATTTTCTCAATCTCTC
TCTCTCCCTTTTTTTTGTTCTTTGATCCTCAAAAGAAAAGGTCTTTATGCTACTTTTTTA
ATCGAATTTGAACAAGTGTGATTCTGTTTTTAATTCACCATCATACATCCGTTTTTGTGT
TCTGTTGTTTGTTCGTCTTTTGTCATTTTCACCCCAATAATTTTATATTTACTTTGTC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CD93TF U 1
AF RS1FI35JQ C 14
AF RS1FI35TF U 14
AF RS1GF26TF U 3
AF RS1GF26JQ C 58
BS 1 32 RS1CD93TF
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RD RS1CD93TF 545 0 0
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AAGAAAATGGCCGATCAACTCACCGATGATCAGATCTCCGAGTTCAAGGAAGCTTTCAGC
CTTTTCGACAAGGACGGAGATGGTTGCATCACAACCAAAGAGCTTGGCACAGTGATGAGG
TCACTCGGACAGAACCCGACAGAAGCAGAGCTTCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCC
GACGGGAACGGAACCATAGACTTCCCCGAGTTTCTCAACCTGATGGCTCGTAAGATGAAG
GACACGGATTCGGAGGAAGAGCTCAAGGAAGCTTTCAGGGTTTTCGACAAGGACCAGAAC
GGTTTCATCTCCGCTGCGGAGCTGAGACATGTGATGACCAATTTGGGGGAGAAGTTGACT
GATGAAGAGGTGGATGAGATGATCAGAGAAGCTGATGTTGATGGAGATGGTCAGATCAAT
TATGAAGAGTTTGTCAAAGTTATGATGGCAAAGTGAGGATAAGCATTTTCTCAATCTCTC
TCTCT

QA 1 545 1 545
DS 

RD RS1FI35JQ 629 0 0
GG
CAACCTTGATCTCTCTCACTCTCTCTCACACACAAATCCTTGGCAAAGAAAATGGCCGAT
CAACTCACCGATGATCAGATCTCCGAGTTCAAGGAAGCTTTCAGCCTTTTCGACAAGGAC
GGAGATGGTTGCATCACAACCAAAGAGCTTGGCACAGTGATGAGGTCACTCGGACAGAAC
CCGACAGAAGCAGAGCTTCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCCGACGGGAACGGAACC
ATAGACTTCCCCGAGTTTCTCAACCTGATGGCTCGTAAGATGAAGGACACGGATTCGGAG
GAAGAGCTCAAAGAAGCTTTCAGGGTTTTCGACAAGGACCAGAACGGTTTCATTTCCGCT
GCGGAGCTGAGACATGTGATGACCAATTTGGGGGAGAAGTTGACTGATGAAGAGGTGGAT
GAGATGATCAGAGAAGCTGATGTTGATGGAGATGGTCAGATCAATTATTAAGAGTTTGTC
AAAGTTATGATGGCAAAGTGAGGATAAACATTTTCTCAATCTCTCTCTCTCCCTTTTTTT
*GTTCTTTGATCCTCAAAAGAAAAGGTCTTTATGCTACTTTTTTAATTGAATTTGAACAA
GTGTGATTCTGTTTTTAATTCACCA
CC

QA 3 627 3 627
DS 

RD RS1FI35TF 629 0 0
GG
CAACCTTGATCTCTCTCACTCTCTCTCACACACAAATCCTTGGCAAAGAAAATGGCCGAT
CAACTCACCGATGATCAGATCTCCGAGTTCAAGGAAGCTTTCAGCCTTTTCGACAAGGAC
GGAGATGGTTGCATCACAACCAAAGAGCTTGGCACAGTGATGAGGTCACTCGGACAGAAC
CCGACAGAAGCAGAGCTTCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCCGACGGGAACGGAACC
ATAGACTTCCCCGAGTTTCTCAACCTGATGGCTCGTAAGATGAAGGACACGGATTCGGAG
GAAGAGCTCAAAGAAGCTTTCAGGGTTTTCGACAAGGACCAGAACGGTTTCATCTCCGCT
GCGGAGCTGAGACATGTGATGACCAATTTGGGGGAGAAGTTGACTGATGAAGAGGTGGAT
GAGATGATCAGAGAAGCTGATGTTGATGGAGATGGTCAGATCAATTATTAAGAGTTTGTC
AAAGTTATGATGGCAAAGTGAGGATAAACATTTTCTCAATCTCTCTCTCTCCCTTTTTTT
*GTTCTTTGATCCTCAAAAGAAAAGGTCTTTATGCTACTTTTTTAATTGAATTTGAACAA
GTGTGATTCTGTTTTTAATTCACCA
CC

QA 3 627 3 627
DS 

RD RS1GF26TF 695 0 0
GG
ACCCAATCAACCAACCTTGATCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACAAATCCTTGGCAAAGA
AAATGGCCGATCAACTCACCGATGATCAGATCTCCGAGTTCAAGGAAGCTTTCAGCCTTT
TCGACAAGGACGGAGATGGTTGCATCACAACCAAAGAGCTTGGCACAGTGATGAGGTCAC
TCGGACAGAACCCGACAGAAGCAGAGCTTCAAGACATGATCAACGAAGTCGATGCCGACG
GGAACGGAACCATAGACTTCCCCGAGTTTCTCAACCTGATGGCTCGTAAGATGAAGGACA
CGGATTCGGAGGAAGAGCTCAAAGAAGCTTTCAGGGTTTTCGACAAGGACCAGAACGGTT
TCATCTCCGCTGCGGAGCTGAGACATGTGATGACCAATTTGGGGGAGAAGTTGACTGATG
AAGAGGTGGATGAGATGATCAGAGAAGCTGATGTTGATGGAGATGGTCAGATCAATTATG
AAGAGTTTGTCAAAGTTATGATGGCAAAGTGAGGATAAACATTTTCTCAATCTCTCTCTC
TCCCTTTTTTTTGTTCTTTGATCCTCAAAAGAAAAGGTCTTTATGCTACTTTTTTAATCG
AATTTGAACAAGTGTGATTCTGTTTTTAATTCACCATCATACATCCGTTTTTGTGTTCTG
TTGTTTGTTCGTCTTTTGTCATTTTCACCCCAA

QA 3 695 3 695
DS 

RD RS1GF26JQ 661 0 0
GCAAAGAAAATGGCCGATCAACTCACCGATGATCAGATCTCCGAGTTCAAGGAAGCTTTC
AGCCTTTTCGACAAGGACGGAGATGGTTGCATCACAACCAAAGAGCTTGGCACAGTGATG
AGGTCACTCGGACAGAACCCGACAGAAGCAGAGCTTCAAGACATGATCAACGAAGTCGAT
GCCGACGGGAACGGAACCATAGACTTCCCCGAGTTTCTCAACCTGATGGCTCGTAAGATG
AAGGACACGGATTCGGAGGAAGAGCTCAAAGAAGCTTTCAGGGTTTTCGACAAGGACCAG
AACGGTTTCATCTCCGCTGCGGAGCTGAGACATGTGATGACCAATTTGGGGGAGAAGTTG
ACTGATGAAGAGGTGGATGAGATGATCAGAGAAGCTGATGTTGATGGAGATGGTCAGATC
AATTATGAAGAGTTTGTCAAAGTTATGATGGCAAAGTGAGGATAAACATTTTCTCAATCT
CTCTCTCTCCCTTTTTTTTGTTCTTTGATCCTCAAAAGAAAAGGTCTTTATGCTACTTTT
TTAATCGAATTTGAACAAGTGTGATTCTGTTTTTAATTCACCATCATACATCCGTTTTTG
TGTTCTGTTGTTTGTTCGTCTTTTGTCATTTTCACCCCAATAATTTTATATTTACTTTGT
C

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 5

CO CL1711Contig1 629 5 3 U
GGGCTTACGGAGTAGTCAGTCGCATCGAGATCGATCTTAGGAAGCAGCAAAAATGGCCGT
TCCTTTGCTTACGAAGAAGGTGGTGAAGAAGAGGTCCGCCAAGTTCATCAGGCCCCAGAG
CGACCGCAGAATCACCGTAAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCAAAGGGTATTGACTCGAGGGT
CAGAAGGAAGTTCAAGGGTGTCACCTTGATGCCCAATGTTGGATACGGATCTGACAAGAA
GACCCGCCATTACCTCCCCAATGGGTTCAAGAAGTTCGTTGTGCACAACACGAGTGACCT
CGAGTTGTTGATGATGCACAACAGGACCTACTGCGCTGAGATTGCACACAACGTTTCCAC
CAAGAAGAGGAAGGCTATCGTCGAGAGAGCTTCTCAGCTTGATATTGTTGTCACCAACAG
GCTTGCTAGGCTCCGTAGCCAAGAAGACGAGTGAAGATAACGAAGAAGCTACTTGAGATA
TTTAGTTGTTTCTGGTTTGTTGCATTTCCCTTTTTGTTATCAGACTGTTTTGGTTTCTTT
TGTGTTTGCTGTCAAAACAGACAAGAGTTTTGGTTTAAGACAGACTATGTTGAGATGGTT
CGTAAACTATTTCAGCTTCAGTATTTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RS1E785JQ C 1
AF RS1BA48TF U 5
AF RS1E785TF U 1
AF RS1B348JQ C 7
AF RS1B348TF U 7
BS 1 8 RS1E785JQ
BS 9 627 RS1BA48TF
BS 628 629 RS1B348JQ

RD RS1E785JQ 629 0 0
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CCCATTGCTTACGAAGAAGGTGGTGAAGAAGAGGTCCGCCAAGTTCATCAGGCCCCAGAG
CGACCGCAGAATCACCGTAAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCAAAGGGTATTGACTCGAGGGT
CAGAAGGAAGTTCAAGGGTGTCACCTTGATGCCCAATGTTGGATACGGATCTGACAAGAA
GACCCGCCATTACCTCCCCAATGGGTTCAAGAAGTTCGTTGTGCACAACACGAGTGACCT
CGAGTTGTTGATGATGCACAACAGGACCTACTGCGCTGAGATTGCACACAACGTTTCCAC
CAAGAAGAGGAAGGCTATCGTCGAGAGAGCTTCTCAGCTTGATATTGTTGTCACCAACAG
GCTTGCTAGGCTCCGTAGCCAAGAAGACGAGTGAAGATAACGAAGAAGCTACTTGAGATA
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TGTGTTTGCTGTCAAAACAGACAAGAGTTTTGGTTTAAGACAGACTATGTTGAGATGGTT
CGTAAACTATTTCAGCTTCAGTATTTC
TC

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DS 

RD RS1BA48TF 624 0 0
GGAC
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TTACGAAGAAGGTGGTGAAGAAGAGGTCCGCCAAGTTCATCAGGCCCCAGAGCGACCGCA
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ATTACCTCCCCAATGGGTTCAAGAAGTTCGTTGTGCACAACACGAGTGACCTCGAGTTGT
TGATGATGCACAACAGGACCTACTGCGCTGAGATTGCACACAACGTTTCCACCAAGAAGA
GGAAGGCTATCGTCGAGAGAGCTTCTCAGCTTGATATTGTTGTCACCAACAGGCTTGCTA
GGCTCCGTAGCCAAGAAGACGAGTGAAGATAACGAAGAAGCTACTTGAGATATTTAGTTG
TTTCTGGTTTGTTGCATTTCCCTTTTTGTTATCAGACTGTTTTGGTTTCTTTTGTGTTTG
CTGTCAAAACAGACAAGAGTTTTGGTTTAAGACAGACTATGTTGAGATGGTTCGTAAACT
ATTTCAGCTTCAGTATTTC
T

QA 5 623 5 623
DS 

RD RS1E785TF 629 0 0
GGGCTTAC
GGAGTAGTCAGTCACATCGAGATCGATCTTAGGAAGCAGCAAAAATGGCCGTCCCATTGC
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ATTACCTCCCCAATGGGTTCAAGAAGTTCGTTGTGCACAACACGAGTGACCTCGAGTTGT
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GGCTCCGTAGCCAAGAAGACGAGTGAAGATAACGAAGAAGCTACTTGAGATATTTAGTTG
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ATTTCAGCTTCAGTATTTC
TC

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DS 

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GG
GGAGTAGTCAGTCGCATCGAGATCGATCTTAGGAAGCAGCAAAAATGGCCGTTCCTTTGC
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GAATCACCGTAAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCAAAGGGTATTGACTCGAGGGTCAGAAGGA
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ATTACCTCCCCAATGGGTTCAAGAAGTTCGTTGTGCACAACACGAGTGACCTCGAGTTGT
TGATGATGCACAACAGGACCTACTGCGCTGAGATTGCACACAACGTTTCCACCAAGAAGA
GGAAGGCTATCGTCGAGAGAGCTTTTCAGCTTGATATTGTTGTCACCAACAGGCTTGCTA
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CTGTCAAAACAGACAAGAGTTTTGGTTTAAGACAGACTATGTTGAGATGGTTCGTAAACT
ATTTCAGCTTCAGTATTTCAC

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DS 

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GG
GGAGTAGTCAGTCGCATCGAGATCGATCTTAGGAAGCAGCAAAAATGGCCGTTCCTTTGC
TTACGAAGAAGGTGGTGAAGAAGAGGTCCGCCAAGTTCATCAGGCCCCAGAGCGACCGCA
GAATCACCGTAAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCAAAGGGTATTGACTCGAGGGTCAGAAGGA
AGTTCAAGGGTGTCACCTTGATGCCCAATGTTGGATACGGATCTGACAAGAAGACCCGCC
ATTACCTCCCCAATGGGTTCAAGAAGTTCGTTGTGCACAACACGAGTGACCTCGAGTTGT
TGATGATGCACAACAGGACCTACTGCGCTGAGATTGCACACAACGTTTCCACCAAGAAGA
GGAAGGCTATCGTCGAGAGAGCTTCTCAGCTTGATATTGTTGTCACCAACAGGCTTGCTA
GGCTCCGTAGCCAAGAAGACGAGTGAAGATAACGAAGAAGCTACTTGAGATATTTAGTTG
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CTGTCAAA*CAGACAAGAGTTTTGGTTTAAGACAGACTATGTTGAGATGGTTCGTA

QA 3 598 3 598
DS 



AS 1 3

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GGGCAGACGTCTTTGATAGAGAGAACAAAAAAAAAAATATGGCTTCTTCTCCTTGTTCTA
CATTTTTCACTTTCTCTAGTCAGACCACACTGCACTCTCTTCCTCAGAGAAACACCATTC
TCACCAAAACCCAATTTCCAGCTCCCACAAAATCATCAGAATCTAACTTCTTTGGTCTCA
GACTCTCTCCCTCCACCTCTCTCTCTCCCCTCTACTCTCCCGGTTCTTTCAAAAGCTCAA
TCTTTGCTAAGGTAAACAAGGGGCAGAGTGCACCAGACTTCACACTAAAGGATCAAAACG
GAAAGCCGGTGAGCCTCAAGAAGTATAAAGGGAAGCCTGTTGTTCTATATTTTTACCCTG
CAGATGAAACCCCTGGCTGCACCAAGCAGGCTTGTGCTTTCAGAGACTCTTATGAGAAAT
TCAAGAAGGCCGGCGCAGAGGTCATTGGCATAAGTGGTGATGATTCTGCTTCCCACAAGG
CTTTTGCAAGCAAATACAAGCTTCCATACACATTGTTGAGTGACGAAGGGAATAAGGTGA
GGAAAGACTGGGGAGTGCCTGGAGATCTGTTTGGGGCATTGCCAGGGAGGCAGACTTATG
TTCTTGACAAAAACGGTGTCGTTCAGCTCATCTACAACAACCAGTTCCAGCCTGAGAAAC
ACATTGATGAGACCTTAAAGTTCCTCAAAGCTGCTTGATCTTCTCTTCTTCCTCTTCTGC
ATCTTTACAAAACAACAATTCATGACCTTCCTTTATTGTTCTCATTGCTGTTTTCCCAAT
GACTCCTATTCAAACACCAACTTGATATAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CO58JQ C 134
AF RS1E131TF U 1
AF RS1AC21TF U 7
BS 1 50 RS1E131TF
BS 51 51 RS1AC21TF
BS 52 205 RS1E131TF
BS 206 207 RS1AC21TF
BS 208 731 RS1E131TF
BS 732 811 RS1AC21TF

RD RS1CO58JQ 564 0 0
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CACCTCTCTCTCTCCCCTCTACTCTCCCGGTTCTTTCAAAAGCTCAATCTTTGCTAAGGT
AAACAAGGGGCAGAGTGCACCAGACTTCACACTAAAGGATCAAAACGGAAAGCCGGTGAG
CCTCAAGAAGTATAAAGGGAAGCCTGTTGTTCTATATTTTTACCCTGCAGATGAAACCCC
TGGCTGCACCAAGCAGGCTTGTGCTTTCAGAGACTCTTATGAGAAATTCAAGAAGGCCGG
CGCAGAGGTCATTGGCATAAGTGGTGATGATTCTGCTTCCCACAAGGCTTTTGCAAGCAA
ATACAAGCTTCCATACACATTGTTGAGTGACGAAGGGAATAAGGTGAGGAAAGACTGGGG
AGTGCCTGGAGATCTGTTTGGGGCATTGCCAGGGAGGCAGACTTATGTTCTTGACAAAAA
CGGTGTCGTTCAGCTCATCTACAACAACCAGTTCCAGCCTGAGAAACACATTGATGAGAC
CTTAAAGTTCCTCAAAGCTGCTTG

QA 1 564 1 564
DS 

RD RS1E131TF 736 0 0
GGGCAGACGTCTTTGATAGAGAGAACAAAAAAAAAAATATGGCTTCTTCTTCTTGTTCTA
CATTTTTCACTTTCTCTAGTCAGACCACACTGCACTCTCTTCCTCAGAGAAACACCATTC
TCACCAAAACCCAATTTCCAGCTCCCACAAAATCATCAGAATCTAACTTCTTTGGTCTCA
GACTCTCTCCCTCCACCTCTCTCTC**CCCTCTACTCTCCCGGTTCTTTCAAAAGCTCAA
TCTTTGCTAAGGTAAACAAGGGGCAGAGTGCACCAGACTTCACACTAAAGGATCAAAACG
GAAAGCCGGTGAGCCTCAAGAAGTATAAAGGGAAGCCTGTTGTTCTATATTTTTACCCTG
CAGATGAAACCCCTGGCTGCACCAAGCAGGCTTGTGCTTTCAGAGACTCTTATGAGAAAT
TCAAGAAGGCCGGCGCAGAGGTCATTGGCATAAGTGGTGATGATTCTGCTTCCCACAAGG
CTTTTGCAAGCAAATACAAGCTTCCATACACATTGTTGAGTGACGAAGGGAATAAGGTGA
GGAAAGACTGGGGAGTGCCTGGAGATCTGTTTGGGGCATTGCCAGGGAGGCAGACTTATG
TTCTTGACAAAAACGGTGTCGTTCAGCTCATCTACAACAACCAGTTCCAGCCTGAGAAAC
ACATTGATGAGACCTTAAAGTTCCTCAAAGCTGCTTGATCTTCTCTTCTTCCTCTTCTGC
ATCTTTACAAA
CACAA

QA 1 731 1 731
DS 

RD RS1AC21TF 805 0 0
GGGTC
TTTGATAGAGAGAACAAAAAAAAA**TATGGCTTCTTCTCCTTGTTCTACATTTTTCACT
TTCTCTAGTCAGACCACACTGCACTCTCTTCCTCAGAGAAACACCATTCTCACCAAAACC
CAATTTCCAGCTCCCACAAAATCATCAGAATCTAACTTCTTTGGTCTCAGACTCTCTCCC
TCCACCTCTCTCTCTCCCCTCTACTCTCCCGGTTCTTTCAAAAGCTCAATCTTTGCTAAG
GTAAACAAGGGGCAGAGTGCACCAGACTTCACACTAAAGGATCAAAACGGAAAGCCGGTG
AGCCTCAAGAAGTATAAAGGGAAGCCTGTTGTTCCATATTTTTACCCTGCAGATGAAACC
CCTGGCTGCACCAAGCAGGCTTGTGCTTTCAGAGACTCTAATGAGAAATTCAAGAAGGCC
GGCGCAGAGGTCATTGGCATAAGTGGTGATGATTCTGCTTCCCACAAGGCTTTTGCAAGC
AAATACAAGCTTCCATACACATTGTTGAGTGACGAAGTGAATAAGGTGAGGAAAGACTGG
GGAGTGCCTGGAGATCTGTTTGGGGCATTGCCAGGGAGGCAGACTTATGTTCTTGACAAA
AACGGTGTCGTTCAGCTCATCTACAACAACCAGTTCCAGCCTGAGAAACACATTGATGAG
ACCTTAAAGTTCCTCAAAGCTGCTTGATCTTCTCTTCTTCCTCTTCTGCATCTTTACAAA
ACAACAATTCATGACCTTCCTTTATTGTTCTCATTGCTGTTTTCCCAATGACTCCTATTC
AAACACCAACTTGATATAAA

QA 6 805 6 805
DS 



AS 1 5

CO CL1713Contig1 722 5 6 U
GGTCTCTCCTCAACACTTTCCGTGCAGCCGTCTTCGTCTCTGAGATAACAAAGACTTTTT
TTTTTTAAAAGGCATTTGAAAGAGACAAAACATGTCTGGTGAAGAGGCTGCTGCTCCAGT
TGTTGTTCCTCCCGTTGCTGAGCCAGCGGCCATCCCGGAGGACATGGATTTGTTGACCGC
ATTGGAGTTGACTCTCAGGAAATCACGTGCTCATGGTGGTGTTGTTCGTGGTCTCCACGA
AAGCGCTAAGCTTATTGAGAAGCGTGTGGCCCAGCTCTGTGTATTGGCTGAAGACTGCAA
CCAGCCTGATTACGTCAAGCTTGTTAAGGCTCTCTGCGCTGATCACAACATCAACTTGCT
TACTGTTCCAAGTGCCAAGACCCTCGGCGAATGGGCTGGTCTCTGTAAGATTGACTCTGA
GGGTAATGCTAGAAAGGTTGTTGGATGCTCCTGTCTTGTGGTCAAGGACTACGGTGAGGA
CACGACTGCACTCAACATCGTCAAGAAGCACATCGAATCTAACTAAGTTTTAAGAAGGAT
TTGAAATCTCGATTTACAAATGTTTTCGTTCTCAAATTCTCTCAATGCTGTTTTCTACTG
GTTTTGATATTTACTATGTTAGCAGACTCCTCTCCACATTTGTTTGGAATATAAACAAGT
TTTGCTGTCATGTAGGATCTACTCTTCCAGTGAATCTACTTTCTTAGGTTTTCTCTACCC
AG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RS1DY59TF U 13
AF RS1GM90TF U 1
AF RS1DY59JQ C 13
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AF RS1AR16TFB U 22
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T

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CTTCCAGTGAATCTACTTTCTTAGGTTTTCTCTACCCAG

QA 3 701 3 701
DS 



AS 2 5

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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AK91TF U 1
AF RS1BT67TF U 1
AF RS1ER13TF U 540
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QA 1 744 1 744
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ACTCAGGTCCTTGGTTAAAAAGTGGCAGACTTTGATCGAGTCTCATGTTGATGTCAAGAC
AACTGACAACTACACGTTGAGGCTTTTCTGCATTGCCTTCACCAAGAGACGTGCTAACCA
AGTCAAGAGAACTTGCTATGCTCAATCCAGCCAGATCCGTCAGATCCGGAGCAAGATGAG
GGAGATCATGATCAAGGAAGCTTCGTCTTGTGACCTCAAGGAGCATGTTGCCAAGTTTAT
TCCCGAATCTATTGGGAAG*ACATTGAGAAGGCAACTCAGGGCATCTACCCTCTTCAGA*
CGTCTTCATCCGTAAAGTCAAGATCCTCAAG*CTCC*AAATTCGACCTTGGAA*GCTCAT
GGAGGTT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1ER13TF 446 0 0
GGGAGATAATGATCAAGGAAGCTTCGTCTTGTGACCTCAAGGAGCTTGTTGCCAAGTTTA
TTCCCGAATCTATTGGGAAGGATATTGAGAAGGCAACTCAGGGCATCTACCCTCTTCAGG
ACGTCTTCATCCGTAAAGTCAAGATCCTCAAGGCTCCCAAATTCGACCTCGGAAAGCTCA
TGGAGGTTCACGGAGACCACACAGCAGAGGATGTTGGTGTGAAGGTTGACAGGCCGGCCG
ATGAGACTGTCGAGGAACCAACTGAGATTATTGGAGCTTAAGAGAGAAGAAAAGTCAAAA
CTGAGAGATCATTTTTTCATCTAAAACTTTTTTAGTATCTTTTATTCACACTCGTTTGAT
TCCCCTGTTTCTTTTTGGTGTATTGATGACTTTTTATTTAGTATGAACTTGCGAGTTTGG
ATAATTTATGCAAAACGATTTTTCTC

QA 1 446 1 446
DS 



CO CL1714Contig2 976 2 10 U
GGATCCTCAGCCATGGCCGTCGGTAAGAACAAGAGAATCTCTAAGGGAAGAAAGGGAGGC
AAGAAGAAGATTGTTGATCCCTTCTCCAAGAAGGATTGGTATGATATCAAGGCTCCCTCT
CTCTTCACTCAGAGAAATGTCGGAAAGACACTTGTTTCCAGAACTCAGGGCACCAAGATT
GCATCAGAGGGTCTGAAACACAGAGTTTTCGAGGTGTCTCTTGCTGATCTCAACAAGGAT
GAGGACCAAGCTTACAGGAAGATCCGTCTCAGGGCCGAAGATGTCCAGGGAAGGAATATC
TTGACCCAGTTCTGGGGCATGGACTTCACAACCGACAAGCTCAGGTCCTTGGTTAAAAAG
TGGCAGACTTTGATCGAGTCTCATGTCGATGTTAAGACCACCGATAACTACACCCTGAGG
CTTTTCTGCATCGCCTTCACCAAGAGACGTGCTAACCAAGTCAAGAGAACTTGCTACGCT
CAATCGAGCCAGATCCGTCAGATCCGCAGCAAGATGAGGGAGATCATGATCAAGGAAGCT
TCTTCTTGTGACCTCAAGGAGCTTGTTGCCAAGTTTATTCCCGAATCCATTGGGAAGGAT
ATTGAGAAGGCAACTCAGGGCATCTACCCTCTTCAGAACGTCTTCATCCGTAAAGTCAAG
ATCCTCAAGGCTCCCAAATTCGACCTCGGAAAGCTCATGGAGGTTCACGGAGACTACACA
GCAGAGGATGTTGGTGTGAAGGTTGACAGGCCGGCTGATGAGACTGTCGAGGAACCTACT
GAGATTATTGGAGCTTAAGAGAGGTTTTTGAAGAATGTCAAAACTGAGAGATCGTTTTTT
TCAGCTAAAACTTTTTTAGTATCTTTTATTCACACTCGTTTGATTCCCCAGTTTCTTTTT
GGTGTATTGATGACTTTTTTTTTTGTATGAACTTGCGAGTTTTGGATAATTTATGCAAAA
CGATTTTTCTCAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FL86TF U 1
AF RS1CW68TF U 544
BS 1 576 RS1FL86TF
BS 577 577 RS1CW68TF
BS 578 669 RS1FL86TF
BS 670 670 RS1CW68TF
BS 671 704 RS1FL86TF
BS 705 705 RS1CW68TF
BS 706 743 RS1FL86TF
BS 744 744 RS1CW68TF
BS 745 773 RS1FL86TF
BS 774 976 RS1CW68TF

RD RS1FL86TF 787 0 0
GGATCCTCAGCCATGGCCGTCGGTAAGAACAAGAGAATCTCTAAGGGAAGAAAGGGAGGC
AAGAAGAAGATTGTTGATCCCTTCTCCAAGAAGGATTGGTATGATATCAAGGCTCCCTCT
CTCTTCACTCAGAGAAATGTCGGAAAGACACTTGTTTCCAGAACTCAGGGCACCAAGATT
GCATCAGAGGGTCTGAAACACAGAGTTTTCGAGGTGTCTCTTGCTGATCTCAACAAGGAT
GAGGACCAAGCTTACAGGAAGATCCGTCTCAGGGCCGAAGATGTCCAGGGAAGGAATATC
TTGACCCAGTTCTGGGGCATGGACTTCACAACCGACAAGCTCAGGTCCTTGGTTAAAAAG
TGGCAGACTTTGATCGAGTCTCATGTCGATGTTAAGACCACCGATAACTACACCCTGAGG
CTTTTCTGCATCGCCTTCACCAAGAGACGTGCTAACCAAGTCAAGAGAACTTGCTACGCT
CAATCGAGCCAGATCCGTCAGATCCGCAGCAAGATGAGGGAGATCATGATCAAGGAAGCT
TCTTCTTGTGACCTCAAGGAGCTTGTTGCCAAGTTTGTTCCCGAATCCATTGGGAAGGAT
ATTGAGAAGGCAACTCAGGGCATCTACCCTCTTCAGAACGTCTTCATCCGTAAAGTCAAG
ATCCTCAAG*CTCCCAAATTCGACCTCGGAAAGCTCATGGAGGT*CACGGAGACTACACA
GCAGAGGATGTTGGTGTGAAGGT*GACAGGCCGGCTGATGAGACTGTCGAGGA
CCTACTGAGATATG

QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1CW68TF 433 0 0
G
CTTGTGACCTCAAGGAGCTTGTTGCCAAGTTTATTCCCGAATCCATTGGGAAGGATATTG
AGAAGGCAACTCAGGGCATCTACCCTCTTCAGAACGTCTTCATCCGTAAAGTCAAGATCC
TCAAGGCTCCCAAATTCGACCTCGGAAAGCTCATGGAGGTTCACGGAGACTACACAGCAG
AGGATGTTGGTGTGAAGGTTGACAGTCCGGCTGATGAGACTGTCGAGGAACCTACTGAGA
TTATTGGAGCTTAAGAGAGGTTTTTGAAGAATGTCAAAACTGAGAGATCGTTTTTTTCAG
CTAAAACTTTTTTAGTATCTTTTATTCACACTCGTTTGATTCCCCAGTTTCTTTTTGGTG
TATTGATGACTTTTTTTTTTGTATGAACTTGCGAGTTTTGGATAATTTATGCAAAACGAT
TTTTCTCAAACC

QA 2 433 2 433
DS 



AS 1 5

CO CL1715Contig1 618 5 3 U
GGATCTGCAAATTCACAAACTTCATAGCTAAATCCAAAAACTCAAAACAAAGCATTCAAA
AAAGAAAAGAGGAAGTCTTCTCCTGAATCATTCAGTCGATATCGAGATGAATTCTACAAG
CAAGGCATGGACGGTGGCAGCAAGTATTGGAGTTGTGGAGACACTAAAAGATCAGTTAGG
CGTTTGCCGGTGGAACTACGTTCTCCGTTCGATGAATCAACATCTCCGGAATAACATCAG
ATCCATTTCTCAGACCAAAAATCTTTCATCCTCAGCCTCCACCGTATCCTCATCCTCCGG
TAATACGAAGAAAGCTGAGGAATCGCTCAGGACTGTCATGTATTTGAGTTGTTGGGGTCC
TAGCTAGGTTTCAGGACATCTATTTGACGGATTTGCTCAACAAAAAAAAATCAAAATCAG
ATCGCTGATTCGTCTTCATGAATTTTGAAAGTCTGTGTAGGCTTTTGATTGGTTTGGTCC
AAGACTAATATAAAGAGTAGATAGAGATGCAAAAAGAATCTTATTCAAAAAGATGGTTTA
ATTGTATTACCATCTTACTTGTATATTGTATATAAAGGCTAATTTAGTCAATCTGAATAG
ACTTAAAAATCATTTACG


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D318JQ C 1
AF RS1D318TF U 1
AF RS1ER01JQ C 88
AF RS1ER01TF U 1
AF RS1BO92TF U 6
BS 1 5 RS1D318JQ
BS 6 398 RS1D318TF
BS 399 618 RS1ER01TF

RD RS1D318JQ 398 0 0
GGATCTGCAAATTCACAAACTTCATAGCTAAATCCAAAAACTCAAAACAAAGCATTCAAA
AAAGAAAAGAGGAAGTCTTCTCCTGAATCATTCAGTCGATATCGAGATGAATTCTACAAG
CAAGGCATGGACGGTGGCAGCAAGTATTGGAGTTGTGGAGACACTAAAAGATCAGTTAGG
CGTTTGCCGGTGGAACTACGTTCTCCGTTCGATGAATCAACATCTCCGGAATAACATCAG
ATCCATTTCTCAGACCAAAAATCTTTCATCCTCAGCCTCCACCGTATCCTCATCCTCCGG
TAATACGAAGAAAGCTGAGGAATCGCTCAGGACTGTCATGTATTTGAGTTGTTGGGGTCC
TAGCTAGGTTTCAGGACATCTATTTGACGGATTTGCTC

QA 1 398 1 398
DS 

RD RS1D318TF 398 0 0
GGATC
TGCAAATTCACAAACTTCATAGCTAAATCCAAAAACTCAAAACAAAGCATTCAAAAAAGA
AAAGAGGAAGTCTTCTCCTGAATCATTCAGTCGATATCGAGATGAATTCTACAAGCAAGG
CATGGACGGTGGCAGCAAGTATTGGAGTTGTGGAGACACTAAAAGATCAGTTAGGCGTTT
GCCGGTGGAACTACGTTCTCCGTTCGATGAATCAACATCTCCGGAATAACATCAGATCCA
TTTCTCAGACCAAAAATCTTTCATCCTCAGCCTCCACCGTATCCTCATCCTCCGGTAATA
CGAAGAAAGCTGAGGAATCGCTCAGGACTGTCATGTATTTGAGTTGTTGGGGTCCTAGCT
AGGTTTCAGGACATCTATTTGACGGATTTGCTC

QA 6 398 6 398
DS 

RD RS1ER01JQ 490 0 0
TCATTCAGTCGATATCGAGATGAATTCTACAAGCAAGGCATGGACGGTGGCAGCAAGTAT
TGGAGTTGTGGAGACACTAAAAGATCAGTTAGGCGTTTGCCGGTGGAACTACGTTCTCCG
TTCGATGAATCAACATCTCCGGAATAACATCAGATCCATTTCTCAGACCAAAAATCTTTC
ATCCTCAGCCTCCACCGTATCCTCATCCTCCGGTAATACGAAGAAAGCTGAGGAATCGCT
CAGGACTGTCATGTATTTGAGTTGTTGGGGTCCTAGCTAGGTTTCAGGACATCTATTTGA
CGGATTTGCTCAACAAAAAAAAATCAAAATCAGATCGCTGATTCGTCTTCATGAATTTTG
AAAGTCTGTGTAGGCTTTTGATTGGTTTGGTCCAAGACTAATATAAAGAGTAGATAGAGA
TGCAAAAAGAATTTTATTCAAAAAGATGGTTTAATTGTATTACCATCTTACTTGTATATT
GTATATAAAG

QA 1 490 1 490
DS 

RD RS1ER01TF 618 0 0
GGATC
TGCAAATTCACAAACTTCATAGCTAAATCCAAAAACTCAAAACAAAGCATTCAAAAAAGA
AAAGAGGAAGTCTTCTCCTGAATCATTCAGTCGATATCGAGATGAATTCTACAAGCAAGG
CATGGACGGTGGCAGCAAGTATTGGAGTTGTGGAGACACTAAAAGATCAGTTAGGCGTTT
GCCGGTGGAACTACGTTCTCCGTTCGATGAATCAACATCTCCGGAATAACATCAGATCCA
TTTCTCAGACCAAAAATCTTTCATCCTCAGCCTCCACCGTATCCTCATCCTCCGGTAATA
CGAAGAAAGCTGAGGAATCGCTCAGGACTGTCATGTATTTGAGTTGTTGGGGTCCTAGCT
AGGTTTCAGGACATCTATTTGACGGATTTGCTCAACAAAAAAAAATCAAAATCAGATCGC
TGATTCGTCTTCATGAATTTTGAAAGTCTGTGTAGGCTTTTGATTGGTTTGGTCCAAGAC
TAATATAAAGAGTAGATAGAGATGCAAAAAGAATCTTATTCAAAAAGATGGTTTAATTGT
ATTACCATCTTACTTGTATATTGTATATAAAGGCTAATTTAGTCAATCTGAATAGACTTA
AAAATCATTTACG

QA 6 618 6 618
DS 

RD RS1BO92TF 600 0 0
TGCAAATTCACAAACTTCATAGCTAAATCCAAAAACTCAAAACAAAGCATTCAAAAAAGA
AAAGAGGAAGTCTTCTCCTGAATCATTCAGTCGATATCGAGATGAATTCTACAAGCAAGG
CATGGACGGTGGCAGCAAGTATTGGAGTTGTGGAGACACTAAAAGATCAGTTAGGCGTTT
GCCGGTGGAACTACGTTCTCCGTTCGATGAATCAACATCTCCGGAATAACATCAGATCCA
TTTCTCAGACCAAAAATCTTTCATCCTCAGCCTCCACCGTATCCTCATCCTCCGGTAATA
CGAAGAAAGCTGAGGAATCGCTCAGGACTGTCATGTATTTGAGTTGTTGGGGTCCTAGCT
AGGTTTCAGGACATCTATTTGACGGATTTGCTCAACAAAAAAAAAACAAAATCAGATCGC
TGATTCGTCTTCATGAATTTTGAAAGTCTGTGTAGGCTTTTGATTGGTTTGGTCCAAGAC
TAATATAAAGAGTAGATAGAGATGCAAAAAGAATCTTATTCAAAAAGATGTTTTAATTGT
ATTACCATCTTACTTGTATATTGTATATAAAGGCTAATTTAGTCAATCTGAATAGACTTA

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 3

CO CL1716Contig1 815 3 5 U
GGAAGCTTAATTCTTACCATGGATGCAAAACAACTGTAGTATGACACAATGTCGCAGTCA
AACTTTATTCAGGATAAACAGTAAAGAAAAAAAAAAAAGATGAGAAGAAAACATACATAA
*CAAATATATAAAATATAGGAAAAGAGGCAACATATAGTCTTTTGGTTTCAACAATAAGA
GTTCCCTCTTTATCCCGTTCCTTCTTAGCTCAGTGCCTTGTCCTGCTTCTTCGCCTGGGA
GATCTTGAATACGAGGAAGAGCGTCTGCGAGAGCGTTTAGGAGAGCGTGATCGTGACCTA
GAAGGGGACCTAGACCGTGATCTTGAACCATGCCTGCGGGATCTCCTGCTTCTGCTTCGG
CTTCTACTTCTACTTCTGCTTCGTCTGTGTCTTCTCGGTGGTGGTGATCGACTATAACTC
CTACTACGGCTGCGATGTCTACTCCGACTCAACCGGCTTGTTTCCGCTAATTTCTCCAGC
CTTTGCTTCTCCTGTTCTCGTTTTTTAGCAGTCTCCGTTGCAGTGTCTTTCTTAATCTGT
TGCGTTAGCTGTTTGTTCATGATTCTCTTCAGTCGTTCTTGGGGAGTTTCTTTCTTCACC
ACCGGTGTCTGCTTGGAAGATCCTCCAGCAGAGTTACCTGCTTTTGAAAGCTTCGCTAGT
GCTGAGGAAGTACTCACTGACGGTTTAGGTAGTTTAATAATCTTGTCTTTCTCAAGAGAA
ACACCAGATGCGGGATCAACATGCAGCGCCTCAAGAATATGTCCTGACGATGGTCTGCAG
GGAGATACAAAATTATAATTTCCTACTCTATGCAC


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DD48JQ U 1
AF RS1DJ92JQ U 1
AF RS1AB53TF C 2
BS 1 300 RS1DD48JQ
BS 301 301 RS1DJ92JQ
BS 302 595 RS1DD48JQ
BS 596 781 RS1DJ92JQ
BS 782 815 RS1AB53TF

RD RS1DD48JQ 595 0 0
GGAAGCTTAATTCTTACCATGGATGCAAAACAACTGTAGTATGACACAATGTCGCAGTCA
AACTTTATTCAGGATAAACAGTAAAGAAAAAAAAAAAAGATGAGAAGAAAACATACATAA
*CAAATATATAAAATATAGGAAAAGAGGCAACATATAGTCTTTTGGTTTCAACAATAAGA
GTTCCCTCTTTATCCCGTTCCTTCTTAGCTCAGTGCCTTGTCCTGCTTCTTCGCCTGGGA
GATCTTGAATACGAGGAAGAGCGTCTGCGAGAGCGTTTAGGAGAGCGTGATCGTGACCTA
AAAGGGGACCTAGACCGTGATCTTGAACCATGCCTGCGGGATCTCCTGCTTCTGCTTCGG
CTTCTACTTCTACTTCTGCTTCGTCTGTGTCTTCTCGGTGGTGGTGATCGACTATAACTC
CTACTACGGCTGCGATGTCTACTCCGACTCAACCGGCTTGTTTCCGCTAATTTCTCCAGC
CTTTGCTTCTCCTGTTCTCGTTTTTTAGCAGTCTCCGTTGCAGTGTCTTTCTTAATCTGT
TGCGTTAGCTGTTTGTTCATGATTCTCTTCAGTCGTTCTTGGGGAGTTTCTTTCT

QA 1 595 1 595
DS 

RD RS1DJ92JQ 783 0 0
GA
AAGCTTAATTCTTACCATGGATGCAAAACAACTGTAGTATGACACAATGTCGCAGTCAAA
CTTTATTCAGGATAAACAGTAAAGAAAAAAAAAAAAGATGAGAAGAAAACATACATAA*C
AAATATATAAAATATAGGAAAAGAGGCAACATATAGTCTTTTGGTTTCAACAATAAGAGT
TCCCTCTTTATCCCGTTCCTTCTTAGCTCAGTGCCTTGTCCTGCTTCTTCGCCTGGGAGA
TCTTGAATACGAGGAAGAGCGTCTGCGAGAGCGTTTAGGAGAGCGTGATCGTGACCTAGA
AGGGGACCTAGACCGTGATCTTGAACCATGCCTGCGGGATCTCCTGCTTCTGCTTCGGCT
TCTACTTCTACTTCTGCTTCGTCTGTGTCTTCTCGGTGGTGGTGATCGACTATAACTCCT
ACTACGGCTGCGATGTCTACTCCGACTCAACCGGCTTGTTTCCGCTAATTTCTCCAGCCT
TTGCTTCTCCTGTTCTCGTTTTTTAGCAGTCTCCGTTGCAGTGTCTTTCTTAATCTGTTG
CGTTAGCTGTTTGTTCATGATTCTCCTCAGTCGTTCTTGGGGAGTTTCTTTCTTCACCAC
CGGTGTCTGCTTGGAAGATCCTCCAGCAGAGTTACCTGCTTTTGAAAGCTTCGCTAGTGC
TGAGGAAGTACTCACTGACGGTTTAGGTAGTTTAATAATCTTGTCTTTCTCAAGAGAAAC
ACCAGATGCGGGATCAACATGCAGCGCCTCAAGAATATGTCCTGACGATGGTCTGCAGG
AA

QA 3 781 3 781
DS 

RD RS1AB53TF 814 0 0
A
AAGCTTAATTCTTACCATGGATGCAAAACAACTGTAGTATGACACAATGTCGCAGTCAAA
CTTTATTCAGGATAAACAGTAAAGAAAAAAAAAA**GATGAGAAGAAAACATACATAAAC
AAATATATAAAATATAGGAAAAGAGGCAACATATAGTCTTTTGGTTTCAACAATAAGAGT
TCCCTCTTTATCCCGTCCCTTCTTAGCTCAGTGCCTTGTCCTGCTTCTTCGCCTGGGAGA
TCTTGAATACGAGGAAGAGCGTCTGCGAGAGCGTTTAGGAGAGCGTGATCGTGACCTAGA
AGGGGACCTAGACCGTGATCTTGAACCATGCCTGCGGGATCTCCTGCTTCTGCTTCGGCT
TCTACTTCTACTTCTGCTTCGTCTGTGTCTTCTCGGTGGTGGTGATCGACTATAACTCCT
ACTACGGCTGCGATGTCTACTCCGACTCAACCGGCTTGTTTCCGCTAATTTCTCCAGCCT
TTGCTTCTCCTGTTCTCGTTTTTTAGCAGTCTCCGTTGCAGTGTCTTTCTTAATCTGTTG
CGTTAGCTGTTTGTTCATGATTCTCTTCAGTCGTTCTTGGGGAGTTTCTTTCTTCACCAC
CGGTGTCTGCTTGGAAGATCCTCCAGCAGAGTTACCTGCTTTTGAAAGCTTCGCTAGTGC
TGAGGAAGTACTCACTGACGGTTTAGGTAGTTTAATAATCTTGTCTTTCTCAAGAGAAAC
ACCAGATGCGGGATCAACATGCAGCGCCTCAAGAATATGTCCTGACGATGGTCTGCAGGG
AGATACAAAATTATAATTTCCTACTCTATGCAC

QA 2 814 2 814
DS 



AS 1 5

CO CL1717Contig1 777 5 7 U
GGGTTGCAGATTGAAAGAAAAACAAATATCCATACAAACACAATACATATCTGAGAGACA
CAGAGGAAGAGAGTAACGCCCATTCGTAGTTTTCTTGCAAAAAAAAAAAAACAAGCCAAA
AATCAGAACGAGAAGATGGGAGTTGGAGGAACATTAGAGTATATATCTGAGCTAATAGGA
AGTGGAGGAAGTCATAGCTATGGCAAGAGGAAGAAGAAGAAGCAGTTTCAGACAGTGGAG
CTCAAAGTGAGAATGGATTGTGATGGTTGTGTCCTCAAAGTCAAGAACTCTCTTTCTTCT
CTAAAAGGAGTTAAATCGGTGGAGATAAACAAGAAGCAGCAAAAGGTGACGGTGAGTGGT
TACGCGGAACCGAGCAAGGTGCTGAAGAAGGCCAAAGCGACGGGGAAGAAGGCTGAGATA
TGGCCTTACGTTCCCTACAACTTGGTGGCTCAGCCCTACATCGCTCAGGCTTACGACAAG
AAGGCGCCGCCTGGTTACGTCAGAAAAGTCGACCCATACGCCACCACGGGGACGATGGCT
GTTTACAACGATGACCCTTCTTACACTTCTATGTTTAGTGATGATAATCCTAATGCTTGC
TCCATTATGTAATTACTAAATCAATAATAAAGACGGTTTATATGTATATGTATAAATATG
AGTTATATAGATTTTGGTGTTTTTTGTTCAGGATTTTGTCTTCTTTTGCATGTGCTTTAT
GTTTGTGTTACAAGAATGTTAATTAATTTTAATAAATGCCTATTATATAGACTAATC


BQ
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DT80TF U 1
AF RS1EX42TF U 1
AF RS1AB59JQ C 1
AF RS1DT80JQ C 1
AF RS1AB59TF U 1
BS 1 276 RS1DT80TF
BS 277 277 RS1EX42TF
BS 278 409 RS1DT80TF
BS 410 684 RS1EX42TF
BS 685 690 RS1AB59TF
BS 691 691 RS1AB59JQ
BS 692 777 RS1AB59TF

RD RS1DT80TF 409 0 0
GGGTTGCAGATTGAAAGAAAAACAAATATCCATACAAACACAATACATATCTGAGAGACA
CAGAGGAAGAGAGTAACGCCCATTCGTAGTTTTCTTGCAAAAAAAAAAAAACAAGCCAAA
AATCAGAACGAGAAGATGGGAGTTGGAGGAACATTAGAGTATATATCTGAGCTAATAGGA
AGTGGAGGAAGTCATAGCTATGGCAAGAGGAAGAAGAAGAAGCAGTTTCAGACAGTGGAG
CTCAAAGTGAGAATGGATTGTGATGGTTGTGTCCTCGAAGTCAAGAACTCTCTTTCTTCT
CTAAAAGGAGTTAAATCGGTGGAGATAAACAAGAAGCAGCAAAAGGTGACGGTGAGTGGT
TACGCGGAACCGAGCAAGGTGCTGAAGAAGGCCAAAGCGACGGGGAAGA

QA 1 409 1 409
DS 

RD RS1EX42TF 686 0 0
GGGTTGCAGATTGAAAGAAAAACAAATATCCATACAAACACAATACATATCTGAGAGACA
CAGAGGAAGAGAGTAACGCCCATTCGTAGTTTTCTTGCAAAAAAAAAAAAACAAGCCAAA
AATCAGAACGAGAAGATGGGAGTTGGAGGAACATTAGAGTATATATCTGAGCTAATAGGA
AGTGGAGGAAGTCATAGCTATGGCAAGAGGAAGAAGAAGAAGCAGTTTCAGACAGTGGAG
CTCAAAGTGAGAATGGATTGTGATGGTTGTGTCCTCAAAGTCAAGAACTCTCTTTCTTCT
CTAAAAGGAGTTAAATCGGTGGAGATAAACAAGAAGCAGCAAAAGGTGACGGTGAGTGGT
TACGCGGAACCGAGCAAGGTGCTGAAGAAGGCCAAAGCGACGGGGAAGAAGGCTGAGATA
TGGCCTTACGTTCCCTACAACTTGGTGGCTCAGCCCTACATCGCTCAGGCTTACGACAAG
AAGGCGCCGCCTGGTTACGTCAGAAAAGTCGACCCATACGCCACCACGGGGACGATGGCT
GTTTACAACGATGACCCTTCTTACACTTCTATGTTTAGTGATGATAATCCTAATGCTTGC
TCCATTATGTAATTACTAAATCAATAATAAAGACGGTTTATATGTATATGTATAAATATG
AGTTATATAGATTTTGGTGTTTTT
GT

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1AB59JQ 777 0 0
GGGTTGCAGATTGAAAGAAAAACAAATATCCATACAAACACAATACATATCTGAGAGACA
CAGAGGAAGAGAGTAACGCCCATTCGTAGTTTTCTTGCAAAAAAAAAAAA*CAAGCCAAA
AATCAGAACGAGAAGATGGGAGTTGGAGGAACATTAGAGTATATATCTGAGCTAATAGGA
AGTGGAGGAAGTCATAGCTATGGCAAGAGGAAGAAGAAGAAGCAGTTTCAGACAGTGGAG
CTCAAAGTGAGGATGGATTGTGATGGTTGTGTCCTCAAAGTCAAGAACTCTCTTTTTTCT
CTAAAAGGAGTTAAATCGGTGGAGATAAACAAGAAGCAGCAAAAGGTGACGGTGAGTGGT
TACGCGGAACCGAGCAAGGTGCTGAAGAAGGCCAAAGCGACGGGGAAGAAGGCTGAGATA
TGGCCTTACGTTCCCTACAACTTGGTGGCTCAGCCCTACATCGCTCAGGCTTACGACAAG
AAGGCGCCGCCTGGTTACGTCAGAAAAGTCGACCCATACGCCACCACGGGGACGATGGCT
GTTTACAACGATGACCCTTCTTACACTTCTATGTTTAGTGATGATAATCCTAATGCTTGC
TCCATTATGTAATTACTAAATCAATAATAAAGACGGTTTATATGTATATGTATAAATATG
AGTTATATAGATTTTGGTGTTTTTTGTTCAGGATTTTGTCTTCTTTTGCATGTGCTTTAT
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QA 1 750 1 750
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TACGCGGAACCGAGCAAGGTGCTGAAGAAGGCCAAAGCGACGGGGAAGAAGGCTGAGATA
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GTTTACAACGATGACCCTTCTTACACTTCTATGTTTAGTGATGATAATCCTAATGCTTGC
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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QA 1 587 1 587
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GG84TF U 1
AF RS1B049TF U 218
BS 1 558 RS1GG84TF
BS 559 1030 RS1B049TF

RD RS1GG84TF 558 0 0
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TGTTTCTTCTCCTTTCTCGTCCCTCGCTTTTTCTTCCCTCCTTAAATACCTACCTATACA
GACAAATTTACTCTGTTATCATCGAAAATTTTCTATTTTCTATTTTTTTTTTCGTTTTAT
TCCTCCTCCATATAACACAATCTTGTCCCCATTGTTATCAAGAAAAGAAGGCGGGGAAAA
AACAAAAGCAATGGTTATGGCTATGGATCGGATCGCTTTTACCTCATCCCCATTAGCTTA
TCAACGTTCTTCTCATCCTCATGGCTACAGATCGTCTAGAGTTTTCATGTCTTCTACCAT
CCGTCCAGCCTCTACAGAGGTCACCAATGGAAGGAAACCGCATCTCCCTCCTCGTGAGGT
CCATCTCCAAGTGAAATACTCAATGCCACCACAAAAGCTGGAGATCTTCAAGTCCTTAGA
AGGATGGGCCAACGACAACTTGCTGCCTTACCTAAAACCTGTCGAGAAATCATGGCAGCC
AACTGATTTCCTCCCTGA

QA 1 558 1 558
DS 

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GG
AAGAAAAGAAGGCGGGGAAAAAACAAAAGCAATGGTTATGGCTATGGATCGGATCGCTTT
TACCTCATCCCCATTAGCTTATCAACGTTCTTCTCATCCTCATGGCTACAGGTCGTCTAG
AGTTTTCATGTCTTCTACCATCCGTCCAGCCTCTACAGAGGTCACCAATGGAAGGAAACC
GCATCTCCCTCCTCGTGAGGTCCATCTCCAAGTGAAATACTCAATGCCACCACAAAAGCT
GGAGATCTTCAAGTCCTTAGAAGGATGGGCCAACGACAACTTGCTGCCTTACCTAAAACC
TGTCGAGAAATCATGGCAGCCAACTGATTTCCTCCCTGAACCTGAGTCAGAAGGGTTCTA
TGACCAAGTCAAGGAGCTGAGAGAGAGGTGCAAAGAGCTTTCTGATAACTACTTTGTAGT
GCTTGTTGGGGATATGATCACAGAGGAAGCGCTTCCAACTTATCAGACCATGATTAATAC
ATTGGATGGGGTTAGAGATGAGACGGGAGCGAGTCCTACTCCTTGGGCTGTGTGGACAAG
GGCATGGACTGCTGAAGAGAACAGGCACGGTGATCTTCTCAACAAGTATCTTTACCTCTC
TGGAAGAGTGGACATGAGGCAGATTGAAAAGACCATTCAGTATCTGATTGGTTCTGAAAT
GGATCCAAAGACTGAGAACAACCCTTACTTGGGTTTCATCTACACATCTTTTCAAGAAAG
AGCTACATTCATCTCTTATGGAAACACTGCTGGACTTGCAAGAGCTTGGGGACTCGAACT
AGCGCAGATTTGTGGCACATCGCTGCTGATG

QA 3 813 3 813
DS 



AS 1 3

CO CL1719Contig1 1221 3 3 U
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CTTGAAGTAGCTAGACTGTTTTCCACTCTTTACTCAAATCCCAAGACAAGAGGAAGATAC
AATTTACTTTTTGCACTGACATCTGGTGGACCCTACAACTACGAAGGAACTCAGAAGTGG
TTGAAAAGCCTTGATCAGAGGATGCGTGAGAGCATTGATTATGCCATTTGCTTGAACAGT
GTTGGCTCTTGGGACAATGAATTACTGGTTCACGTGTCAAAGCCTCCGGAGAACGCCTAT
ATAAAACAAATCTTTGAGGGCTTCTCTAATGTGGCAGAAGACTTGGGTTTTCAAGTTTCC
CTGAAGCACAAGAAGATTAATATCTCTAATTCACGAGTTGCTTGGGAGCATGAACAATTT
TCAAGACTCAGAGTAACAGCAGCCACTGTATCCGGACTTTCGACTCCACCCGAGTTACTG
GAAAGTGCTGGAAGTTTGTCTGATACGAGGCAACATGTGAATGAGGATGCTATCATTAAA
GGTGTCAAGTTAGTGGCTGAAAGCCTTGCGAGGCATATCTATGGTCACCAAGGAAAAGAC
ATACAGATTTTTGCGGATAATAGTAGTTTGGCTGTAAATCCGTTTTATGTGAGATCGTGG
TTGGACAGTTTGTCACAAACTCCTCGGGTGGCACCATTTCTCTCAAAGAATGAACCACTA
ATAATGGCTCTGAAGAAGGAACTAGAGGATTATACTGCTGAAGTGAGTATCCAACAAGAA
TCTTTAGATGGAATTTTCACCTTTTACGACTCAACAAAGGCTAGCCTTAACATATACCAG
GTGGCGAGTGTAACATTCGACTTGCTCTTGCTTCTGGTGTTAGGATCATACTTGATAATG
CTTTTCAGTTTCCTCGTCATAACAACTCGGGGTCTGGATGACTTGATAAGCATATTCCGC
CGGCCTCCTTCCCGGAAAATGAAAATGGCCTGATCGTCCACTTTATACTCTTCTCATCTC
TTTCTTTTTTGGCCATTCACTCTCGGATTTGTTACAAGTTGAATCTTGAATGAAGAATTC
AGAAAGAGAAAAGCAAAGGAAAAATGAGAATGTCTTGGCTCCTCCTCTTCGACCTTTTGT
TTTGTTGTATTCCTTTCTTGATTGAGCTGTTAATCGCTTCTTATTATTAACGTTGTAGTT
TTCGTTTAATTTCTTTTGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GE10TF U 1
AF RS1E203TF U 192
AF RS1GE10JQ C 546
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BS 951 1221 RS1GE10JQ

RD RS1GE10TF 734 0 0
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CTTGAAGTAGCTAGACTGTTTTCCACTCTTTACTCAAATCCCAAGACAAGAGGAAGATAC
AATTTACTTTTTGCACTGACATCTGGTGGACCCTACAACTACGAAGGAACTCAGAAGTGG
TTGAAAAGCCTTGATCAGAGGATGCGTGAGAGCATTGATTATGCCATTTGCTTGAACAGT
GTTGGCTCTTGGGACAATGAATTACTGGTTCACGTGTCAAAGCCTCCGGAGAACGCCTAT
ATAAAACAAATCTTTGAGGGCTTCTCTAATGTGGCAGAAGACTTGGGTTTTCAAGTTTCC
CTGAAGCACAAGAAGATTAATATCTCTAATTCACGAGTTGCTTGGGAGCATGAACAATTT
TCAAGACTCAGAGTAACAGCAGCCACTGTATCCGGACTTTCGACTCCACCCGAGTTACTG
GAAAGTGCTGGAAGTTTGTCTGATACGAGGCAACATGTGAATGAGGATGCTATCATTAAA
GGTGTCAAGTTAGTGGCTGAAAGCCTTGCGAGGCATATCTATGGTCACCAAGGAAAAGAC
ATACAGATTTTTGCGGATAATAGTAGTTTGGCTGTAAATCCGTTTTATGTGAGATCGTGG
TTGGACAGTTTGTCACAAACTCCTCGGGTGGCACCATTTCTCTCAAAGAATGAACCACTA
ATAATGGCTCTGA
G

QA 1 733 1 733
DS 

RD RS1E203TF 759 0 0
G
GATCAGAGGATGCGTGAGAGCATTGATTATGCCATTT*CTTGAACAGTGTTGGCTCTTGG
GACAATGAATTACTGGTTCACGTGTCAAAGCCTCCGGAGAACGCCTATATAAAACAAATC
TTTGAGGGCTTCTCTAATGTGGCAGAAGACTTGGGTTTTCAAGTTTCCCTGAAGCACAAG
AAGATTAATATCTCTAATTCACGAGTTGCTTGGGAGCATGAACAATTTTCAAGACTCAGA
GTAACAGCAGCCACTGTATCCGGACTTTCGACTCCACCCGAGTTACTGGAAAGTGCTGGA
AGTTTGTCTGATACGAGGCAACATGTGAATGAGGATGCTATCATTAAAGGTGTCAAGTTA
GTGGCTGAAAGCCTTGCGAGGCATATCTATGGTCACCAAGGAAAAGACATACAGATTTTT
GCGGATAATAGTAGTTTGGCTGTAAATCCGTTTTATGTGAGATCGTGGTTGGACAGTTTG
TCACAAACTCCTCGGGTGGCACCATTTCTCTCAAAGAATGAACCACTAATAATGGCTCTG
AAGAAGGAACTAGAGGATTATACTGCTGAAGTGAGTATCCAACAAGAATCTTTAGATGGA
ATTTTCACCTTTTACGACTCAACAAAGGCTAGCCTTAACATATACCAGGTGGCGAGTGTA
ACATTCGACTTGCTCTTGCTTCTGGTGTTAGGATCATACTTGATAATGCTTTTCAGTTTC
CTCGTCATAACAACTCGGGGTCTGGATGACTTGATAAG

QA 2 759 2 759
DS 

RD RS1GE10JQ 676 0 0
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CAGTTTGTCACAAACTCCTCGGGTGGCACCATTTCTCTCAAAGAATGAACCACTAATAAT
GGCTCTGAAGAAGGAACTAGAGGATTATACTGCTGAAGTGAGTATCCAACAAGAATCTTT
AGATGGAATTTTCACCTTTTACGACTCAACAAAGGCTAGCCTTAACATATACCAGGTGGC
GAGTGTAACATTCGACTTGCTCTTGCTTCTGGTGTTAGGATCATACTTGATAATGCTTTT
CAGTTTCCTCGTCATAACAACTCGGGGTCTGGATGACTTGATAAGCATATTCCGCCGGCC
TCCTTCCCGGAAAATGAAAATGGCCTGATCGTCCACTTTATACTCTTCTCATCTCTTTCT
TTTTTGGCCATTCACTCTCGGATTTGTTACAAGTTGAATCTTGAATGAAGAATTCAGAAA
GAGAAAAGCAAAGGAAAAATGAGAATGTCTTGGCTCCTCCTCTTCGACCTTTTGTTTTGT
TGTATTCCTTTCTTGATTGAGCTGTTAATCGCTTCTTATTATTAACGTTGTAGTTTTCGT
TTAATTTCTTTTGGTT

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 4

CO CL1720Contig1 1107 4 8 U
CATTGTCTTTATCGCGAAAAAAAAAAATTGAGAGCAACTCTTCTAAGGAGACGAAGAAGG
AGACTCTTCATCGGAACTGCTATACCGTCAGAGGTGATCCAGCGGTGGTGCAGGAGGAGA
CTCATCATCGGAACTGCTATACCGTCAGCCTTGCGAAGGTGAAAGGGAGGTTCTCAAAAT
TGAGATCCGTGGAGCTTAGGGGAAACATGTATGCGTGGATAGAGGCGATGGGGAGGGTAC
GTGTATCCGTGGATAGAGGCGATGTCAACGTCTGTCTGGAGGAGATAAGGCTGAAGAGGA
TGGTTACAAGTCTCGTTGCCAGATTGTGAACCTTCACCACATGTTGTCAAAGGCTGTGAT
TAAGTCCAATCCTAGTGTCTTATGGTGTTACAAGGATAAACTTGATATCAACGATTATTA
CCACCAAGCTCGGCTTGCCAAAAAGTCTGCAAAGCCTCTGTTCTGTCCTTCTCATCTGAA
GGAACACCACCATCCCGCTTAGCATTGAGGGATCGTCCCTGAGGGATGCATAGGTTTGTT
CAAAGAATTGCTGCATTGAAGTGGAGGATCAAATTGCTTGCTACAGAGAAAGACAGAGAG
CTGCTTGCTGTTAAACTTGATAACGAAGCGGAATGTTTGTTGTTGGTTTATACAAATTAA
TTATCTGAATGGTTTGATACTCTTAAGTTTTCTTTGTAAACTTCCACTAGGCCTGGTCGA
AAGAGGGTCTTCTCAGAGAACAAAACAAAGAACTTGCTACTCTCAGAAGGGAGCATGATC
ATTCTGATGCTGAGAGGTCCCAAAACATACATAAACTATCTGAACTTCAGGAGCATTTTC
AAGAGAAAGAGAGACAATACGCTGAATTGCAGGAACATGTTTGCTTTACACCATCAAGTT
ATGTTTGGACTACCATTCTTGCCACTCTTCACGCTCTCTGCCTAATGATCTGGATCAGAC
CCCAAGTGGTATAGTTTTTAGAAAAATCTCATTGCTTTCTTATTATCTTAAGGCTTCATA
AAACTAAATGTAGTTCAAAGTTTTTCTCCCTTATATGTAGAACATAAACACATTTGATCA
TATTGCTAATTCTTTTTATTCCTAAGC


BQ
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1G583TF U 1
AF RS1AQ69TFB U 8
AF RS1AQ69JQ C 240
AF RS1G583JQ C 408
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AGGCGATGTCAACGTCTGTCTGGAGGAGATAAGGCTGAAGAGGATGGTTACAAGTCTCGT
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GTCTTATGGTGTTACAAGGATAAACTTGATATCAACGATTATTACCACCAAGCTCGGCTT
GCCAAAAAGTCTGCAAAGCCTCTGTTCTGTCCTTCTCATCTGAAGGAACACCACCATCCC
GCTTAGCATTGAGGGATCGTCCCTGAGGGATGCATAGGTTTGTTCAAAGAATTGCTGCAT
TGAAGTGGAGGATCAAATTGCTTGCTACAGAGAAAGACAGAGAGCTGCTTGCTGTTAAAC
T

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CATTCTGATGCTGAGAGGTCCCAAAACATACATAAACTATCTGAACTTCAGGAGCATTTT
CAAGAGAAAGAGAGACAATACGCTGAATTGCAGGAACATGTTTGCTTTACACCATCAAGT
TATGTTTGGACTACCATTCTTGCCACTCTTCACGCTCTCTGCCTAATGATCTGGATCAGA
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AAAACTAAATGTAGTTCAAAGTTTTTCTCCCTTATATGTAGAACATAAACACATTTGATC
ATATTGCTAATTCTTTTTATTCCTAAGC

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DS 

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TTATACAAATTAATTATCTGAATGGTTTGATACTCTTAAGTTTTCTTTGTAAACTTCCAC
TAGGCCTGGTCGAAAGAGGGTCTTCTCAGAGAACAAAACAAAGAACTTGCTACTCTCAGA
AGGGAGCATGATCATTCTGATGCTGAGAGGTCCCAAAACATACATAAACTATCTGAACTT
CAGGAGCATTTTCAAGAGAAAGAGAGACAATACGCTGAATTGCAGGAACATGTTTGCTTT
ACACCATCAAGTTATGTTTGGACTACCATTCTTGCCACTCTTCACGCTCTCTGCCTAATG
ATCTGGATCAGACCCCAAGTGGTATAGTTTTTAGAAAAATCTCATTGCTTTCTTATTATC
TTAAGGCTTCATAAAACTAAATGTAGTTCAAAGTTTTTCTCCCTTATATGTAGAACATAA
ACACATTTGATCATA

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 5

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TGTCATAGTAAGTGCTGTCTTGACGAGCAGAGCCATCTTCCAGAGAATGAAGAACTACAC
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ATGGAAGTTCGACTTCTCACCATTCATGGTGTTGGTGATAGCCATCCTGAATGATGGTAC
TATCATGACCATATCAAAGGACAGAGTAAAGCCTTCTCCGCTTCCTGATTCATGGAAACT
CAAAGAGATATTTACCACTGGCGTTGTTCTTGGCACATACCTTGCAGTCATGACTGTTGT
TTTCTTCTGGGCTGCAGAGAGCACTGACTTCTTCTCTGCAAAGTTTGGGGTGAGATCTAT
CAGTGGGAATCCGCATGAGCTTACATCAGCTATATACCTCCAAGTTAGTATAATTAGCCA
GGCACTTATCTTTGTCACAAGGTCACGTAGCTGGTCTTATGCTGAACGTCCTGGCCTATG
GTTGATCGCTGCCTTTTTCTTAGCTCAGCTGATTGCTACTCTCATTGCTGTGTACGCAAA
CTGGGATTTTGCAAGAATCAGAGGTACAGGG*TGGGGATGGGCAGGAGTGATCTGGCTCT
ACAGTATAGTTACTTACGTTCCATTGGATATACTCAAGTTCATCATCAGATATTCACTAA
GTGGTAGAGCCTGGGATAATGTCATTGAGAACAAGACCGCTTTCACGTCAAAGAAAGACT
ATGGAAAAGGGGAGAGGGAAGCACAATGGGCACAAGCTCAACGTACCCTTCACGGATTGC
AACCTGCTCAACCCTCAGATATGTTCAACGATAAGAGTACTTATAGAGAACTTTCAGAGA
TAGCTGATCAAGCCAAGAGACGAGCTGAAGTCGCAAGGTTAAGAGAGCATCATACATTGA
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ACTACACCCTGTGATTGATTTTCAGAAACAAAGTGTGTTTCTCAGTTTAGTTTAGAACTA
AAACCCCACAAGAGTATTGAATAATAAACCACCACCACCATAAGAAAATACTGCAAGAAA
AAAATGTTAATTTCTTTTATCAGCAGTGGCTGTTGGCTGCTTTATTTGTTTTGAGATATT
CTTGTTTTTTTGCTATGACAAGCTACAAAGCTAATAAGATATTACAGTTACTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1BS84TF U 1
AF RS1DJ05TF U 30
AF RS1DJ05JQ C 408
AF RS1DN54TF U 611
AF RS1DF24TF U 642
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BS 662 663 RS1DJ05TF
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BS 1212 1254 RS1DF24TF
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RD RS1BS84TF 771 0 0
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TGTCATAGTAAGTGCTGTCTTGACGAGCAGAGCCATCTTCCAGAGAATGAAGAACTACAC
GATCTACGCAGTCTCCATCACAATCCGTGTAGTGATGGGCTTTATGCTCCTTGCACTCAT
ATGGAAGTTCGACTTCTCACCATTCATGG**TTGGTGATAGCCATCCTGAATGATGGTAC
TATCATGACCATATCGAAGGACAGAGTAAAGCCTTCTCCGCTTCCTGATTCATGGAAACT
CAAAGAGATATTTGCCACTGGCGTTGTTCTTGGCACATACCTTGCAGTCATGACTGTTGT
TTTCTTCTGGGCTGCAGAGAGCACTGACTTCTTCTCTGCAAAGTTTGGGGTGAGATCTAT
CAGTGGGAATCCGCATGAGCTTACATCAGCTATATACCTCCAAGTTAGTATAATTAGCCA
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GTTGATCGCTGCCTTTTTCTTAGCTCAGCTGATTGCTACTCTCATTGCTGTGTACGCAAA
CTGGGATTTTGCAAGAATCAGAGGTACAGGG*TGGGGATGGGCAGGAGTGATCTGGCTCT
A**GTATAGTTACTTACGTTCCATTGGATATACTCAAGTTCATCATCAGATATTCACTAA
GTGGTAGAGCCTGGGATAATGTCATTGAGAACAAGACCGCTTTCACGTCAA

QA 1 771 1 771
DS 

RD RS1DJ05TF 795 0 0
GC
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GCCATCTTCCAGAGAATGAAGAACTACACGATCTACGCAGTCTCCATCACAATCCGTGTA
GTGATGGGCTTTATGCTCCTTGCACTCATATGGAAGTTCGACTTCTCACCATTCATGGTG
TTGGTGATAGCCATCCTGAATGATGGTACTATCATGACCATATCAAAGTACAGAGTAAAG
CCTTCTCCGCTTCCTGATTCATGGAAACTCAAAGAGATATTTACCACTGGCGTTGTTCTT
GGCACATACCTTGCAGTCATGACTGTTGTTTTCTTCTGGGCTGCAGAGAGCACTGACTTC
TTCTCTGCAAAGTTTGGGGTGAGATCTATCAGTGGGAATCCGCATGAGCTTACATCAGCT
ATATACCTCCAAGTTAGTATAATTAGCCAGGCACTTATCTTTGTCACAAGGTCACGTAGC
TGGTCTTATGCTGAACGTCCTGGCCTATGGTTGATCGCTGCCTTTTTCTTAGCTCAGCTG
ATTGCTACTCTCATTGCTGTGTACGCAAACTGGGATTTTGCAAGAATCAGAGGTACAGGG
GTGGGGATGGGCAGGAGTGATCTGGCTCTACAGTATAGTTACTTACGTTCCATTGGATAT
ACTCAAGTTCATCATCAGATATTCACTAAGTGGTAGAGCCTGGGATAATGTCATTGAGAA
CAAGACCGCTTTCACGTCAAAGAAAGACTATGGAAAAGGG*AGAGGGA*GCACAATGGGC
ACAAGCTCA
CGTA

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DS 

RD RS1DJ05JQ 848 0 0
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GTATAATTAGCCAGGCACTTATCTTTGTCACAAGGTCACGTAGCTGGTCTTATGCTGAAC
GTCCTGGCCTATGGTTGATCGCTGCCTTTTTCTTAGCTCAGCTGATTGCTACTCTCATTG
CTGTGTACGCAAACTGGGATTTTGCAAGAATCAGAGGTACAGGG*TGGGGATGGGCAGGA
GTGATCTGGCTCTACAGTATAGTTACTTACGTTCCATTGGATATACTCAAGTTCATCATC
AGATATTCACTAAGTGGTAGAGCCTGGGATAATGTCATTGAGAACAAGACCGCTTTCACG
TCAAAGAAAGACTATGGAAAAGGGGAGAGGGAAGCACAATGGGCACAAGCTCAACGTACC
CTTCACGGATTGCAACCTGCTCAACCCTCAGATATGTTCAACGATAAGAGTACTTATAGA
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GCAATCCAGCAACACTACACCCTGTGATTGATTTTCAGAAACAAAGTGTGTTTCTCAGTT
TAGTTTAGAACTAAAACCCCACAAGAGTATTGAATAATAAACCACCACCACCATAAGAAA
ATACTGCAAGAAAAAAATGTTAATTTCTTTTATCAGCAGTGGCTGTTGGCTGCTTTATTT
GTTTTGAGATATTCTTGTTTTTTTGCTATGACAAGCTACAAAGCTAATAAGATATTACAG
TTACTTAG

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DS 

RD RS1DN54TF 599 0 0
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TACTTACGTTCCATTGGATATACTCAAGTTCATCATCAGATATTCACTAAGTGGTAGAGC
CTGGGATAATGTCATTGAGAACAAGACCGCTTTCACGTCAAAGAAAGACTATGGAAAAGG
GGAGAGGGAAGCACAATGGGCACAGGCTCAACGTACCCTTCACGGATTGCAACCTGCTCA
ACCCTCAGATATGTTCAACGATAAGAGTACTTATAGAGAACTTTCAGAGATAGCTGATCA
AGCCAAGAGACGAGCTGAAGTCGCAAGGTTAAGAGAGCATCATACATTGAAAGGTCACGT
GGAATCAGTAGTGAAGCAGAAGGGACTTGACATAGAGGCAATCCAGCAACACTACACCCT
GTGATTGATTTTCAGAAACAAAGTGTGTTTCTCAGTTTAGTTTAGAACTAAAACCCCACA
AGAGTATTGAATAATAAACCACCACCACCATAAGAAAATACTGCAAGAAAAAAATGTTAA
TTTCTTTTATCAGCAGTGGCTGTTGGCTGCTTTATTTGTTTTGAGATATTCTTGTTTTT

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DS 

RD RS1DF24TF 613 0 0
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ATCATCAGATATTCACTAAGTGGTAGAGCCTGGGATAATGTCATTGAGAACAAGACCGCT
TTCACGTCAAAGAAAGACTATGGAGAAGGGGAGAGGGAAGCACAATGGGCACAAGCTCAA
CGTACCCTTCACGGATTGCAACCTGCTCAACCCTCAGATATGTTCAACGATAAGAGTACT
TATAGAGAACTTTCAGAGATAGCTGATCAAGCCAAGAGACGAGCTGAAGTCGCAAGGTTA
AGAGAGCATCATACATTGAAAGGTCACGTGGAATCAGTAGTGAAGCAGAAGGGACTTGAC
ATAGAGGCAATCCAGCAACACTACACCCTGTGATTGATTTTCAGAAACAAAGTGTGTTTC
TCAGTTTAGTTTAGAACTAAAACCCCACAAGAGTATTGAATAATAAACCACCACCACCAT
AAGAAAATACTGCAAGAAAAAAATGTTAATTTCTTTTATCAGCAGTGGCTGTTGGCTGCT
TTATTTGTTTTGAGATATTCTTGTTTTTT*GCTATGACAAGCTACAAAGCTAATAAGATA
TTACAGTTACTTA

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 5

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GAGGTTGCTCGCTTGCGGTGCTCACCGGATTACGCATATGGTCCTGGTGGATTTCCCGCG
TGGGGAATCCAGCCAAACTCGGTTCTCGACTTTGAAATCGAAGTACTCAGCGTGCAGTAA
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ATCGCTTCGGGGATCTTTGTTCAAATAAAACTTTGTGATGTCACTCTTGTCAGTACTTGT
CTAAACTCGGTGGACAACGTTCTATCTTAAATAAAAGACCCCCGTTACTCTTGTTCCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RS1E283TF U 14
AF RS1EG60JQ C 1
AF RS1EG60TF U 1
AF RS1E916TF U 22
AF RS1E283JQ C 14
BS 1 595 RS1EG60TF
BS 596 598 RS1EG60JQ

RD RS1E283TF 492 0 0
GG
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AAAGCGATGGGTGTAGAGAAGCAAGTCATCAGACCCGGCACTGGTGCCAAACCCGCTCCA
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GTCATCAAAGGATGGGATGAAGGCGTTATGGGAATGCAAATTGGAGAGGTTGCTCGCTTG
CGGTGCTCACCGGATTACGCATATGGTCCTGGTGGATTTCCCGCGTGGGGAATCCAGCCA
AACTCGGTTCTCGACTTTGAAATCGAAGTACTCAGCGTGCAGTAATGCTCTCTCTATTGA
CAAAAGCACAACAAAACTTATGTGGTGTTTACCCTTTTTATGTTTATCGCTTCGGGGATC
TTTGTTCAAA

QA 3 492 3 492
DS 

RD RS1EG60JQ 598 0 0
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GCCAAACCCGCTCCAGGTCAAACCGTCACCGTCCACTGCACTGGATTCGGGAAAGGTGGT
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ATCGGTGAAGGTGCTGTCATCAAAGGATGGGATGAAGGCGTTATGGGAATGCAAATTGGA
GAGGTTGCTCGCTTGCGGTGCTCACCGGATTACGCATATGGTCCTGGTGGATTTCCCGCG
TGGGGAATCCAGCCAAACTCGGTTCTCGACTTTGAAATCGAAGTACTCAGCGTGCAGTAA
TGCTCTCTCTATTGACAAAAGCACAACAAAACTTATGTGGTGTTTACCCTTTTTATGTTT
ATCGCTTCGGGGATCTTTGTTCAAATAAAACTTTGTGATGTCACTCTTGTCAGTACTTGT
CTAAACTCGGTGGACAACGTTCTATCTTAAATAAAAGACCCCCGTTACTCTTGTTCCG

QA 1 598 1 598
DS 

RD RS1EG60TF 598 0 0
GGATAAGCATCTGGAGATTCGACAGAGCTACCCGAGAGAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAG
AGAGAAGATTAAGCAAAAGCGATGGGTGTAGAGAAGCAAGTCATCAGACCCGGCACTGGT
GCCAAACCCGCTCCAGGTCAAACCGTCACCGTCCACTGCACTGGATTCGGGAAAGGTGGT
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ATCGGTGAAGGTGCTGTCATCAAAGGATGGGATGAAGGCGTTATGGGAATGCAAATTGGA
GAGGTTGCTCGCTTGCGGTGCTCACCGGATTACGCATATGGTCCTGGTGGATTTCCCGCG
TGGGGAATCCAGCCAAACTCGGTTCTCGACTTTGAAATCGAAGTACTCAGCGTGCAGTAA
TGCTCTCTCTATTGACAAAAGCACAACAAAACTTATGTGGTGTTTACCCTTTTTATGTTT
ATCGCTTCGGGGATCTTTGTTCAAATAAAACTTTGTGATGTCACTCTTGTCAGTACTTGT
CTAAACTCGGTGGACAACGTTCTATCTTAAATAAAAGACCCCCGTTACTCTTGTT
CCG

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DS 

RD RS1E916TF 575 0 0
GG
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GGGTGTAGAGAAGCAAGTCATCAGACCCGGCACTGGTGCCAAACCCGCTCCAGGTCAAAC
CGTCACCGTCCACTGCACTGGATTCGGGAAAGGTGGTGATCTTTCCCAACAGTTCTGGAG
TACAAAGGACGCTGGGCAAAAACCTTTCTCCTTCCAAATCGGTGAAGGTGCTGTCATCAA
AGGATGGGATGAAGGCGTTATGGGAATGCAAATTGGAGAGGTTGCTCGCTTGCGGTGCTC
ACCGGATTACGCATATGGTCCTGGTGGATTTCCCGCGTGGGGAATCCAGCCAAACTCGGT
TCTCGACTTTGAAATCGAAGTACTCAGCGTGCAGTAATGCTCTCTCTATTGACAAAAGCA
CAACAAAACTTATGTGGTGTTTACCCTTTTTATGTTTATCGCTTCGGGGATCTTTGTTCA
AATAAAACTTTGTGATGTCACTCTTGTCAGTACTTGTCTAAACTCGGTGGACAACGTTCT
ATCTTAAATAAAAGACCCCCGTTACTC
TTGTTT

QA 3 569 3 569
DS 

RD RS1E283JQ 577 0 0
GG
GATTCGACAGAGCTACCCGAGAGAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAGAAGATTAAGCA
AAAGCGATGGGTGTAGAGAAGCAAGTCATCAGACCCGGCACTGGTGCCAAACCCGCTCCA
GGTCAAACCGTCACCGTCCACTGCACTGGATTCGGGAAAGGTGGTGATCTTTCCCAACAG
TTCTGGAGTACAAAGGACGCTGGGCAAAAACCTTTCTCCTTCCAAATCGGTGAAGGTGCT
GTCATCAAAGGATGGGATGAAGGCGTTATGGGAATGCAAATTGGAGAGGTTGCTCGCTTG
CGGTGCTCACCGGATTACGCATATGGTCCTGGTGGATTTCCCGCGTGGGGAATCCAGCCA
AACTCGGTTCTCGACTTTGAAATCGAAGTACTCAGCGTGCAGTAATGCTCTCTCTATTGA
CAAAAGCACAACAAAACTTATGTGGTGTTTACCCTTTTTATGTTTATCGCTTCGGGGATC
TTTGTTCAAATAAAACTTTGTGATGTCACTCTTGTCAGTACTTGTCTAAACTCGGTGGAC
AACGTTCTATCTTAAATAAAAGACCCCCGTTACTC

QA 3 577 3 577
DS 



AS 1 5

CO CL1723Contig1 938 5 12 U
GGAGATTTTGTTGTTTGTGTTTGTAAAGTTTTGATGGGCCTAGTTGTGGCCGGTTAGCTT
ATCGCTGCCGGTCGCCACCCCCTTTGTATTATATGTTTTGTTTTTGTATCACATGCTTCG
ATCTATAGATCGATATAAACTTTCGTTATCAGATCTTCGCTAGGCGATTAAGTTCTTCGC
GGTGGCGATTTTGTTTGTGTTTGTGTGTATCTAGTAATCTCATCCACAAAAAGATCTGTT
CTTCATGTTTTTTTCTTTTATCACTTTGTGGTTGAGACTATAAGTTAAAAACAAAAGCCT
TTCATCCTGTTCTTTCGTTTCAACATTCGTTTGATTACAAGTTAGATGTTCTCATTTGCT
GCTCACTTTAATCTCTTTCTTAAGAGAATCAGACTCTGTCCATGTAGTTTGGCCTTTATG
GCTGTTGATAGAGCATCTCGGATGAAAGAAGATTAAGTTGATGGATCTTTTGAGTCCTAT
ATGAAGTGGGTTCAGAAGAGTTGGCGCCTTCGTCGCGGTCCGACAAAGAGTCTATCTTCA
ATCCGACTCAAGCTTCCTCTGGTACACAATCCAGTGAATCAGAACCTCTCTATCTATGTA
GTCTACGCTTTGATGAAAGGCATCTGCGCAGTATCAGTGTTAGAAGAAGTTCTCGTAAGG
ATCCAAAGCCTTCTACGGCGGAGATGGAGATAAACAGAGAAGATTACTCTAGAACGTGCG
GTGAAGAAGACTTCAACGGTGAAGTAACGGTGACGTAAGCTGTTTGGCTAATGAAGGTCA
CGTAGCTTTGTTTTTCTTCGTTAACCGACACGTGTAAAGCACTCTAATTGATTAAAATGC
TCATGTTTATCCCTTTGAATGTATAAATGGGCCTTACACTTCTTTCGGCCTGATATTGTT
GTATTGCCTTCGGGCTTTATATTAATAAAACAGTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 10 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1DL15TF U 1
AF RS1GT50TF U 15
AF RS1E372TF U 125
AF RS1GT50JQ C 113
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ATCTATAGATCGATATAAACTTTCGTTATCAGATCTTCGCTAGGCGATTAAGTTCTTCGC
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GG
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GTGTTTGTGTGTATCTAGTAATCTCATCCACAAAAAGATCTGTTCTTCATGTTTTTTTCT
TTTATCACTTTGTGGTTGAGACTATAAGTTAAAAACAAAAGCCTTTCATCCTGTTCTTTC
GTTTCAACATTCGTTTGATTACAAGTTAGATGTTCTCATTTGCTGCTCACTTTAATCTCT
TTCTTAAGAGAATCAGACTCTGTCCATGTAGTTTGGCCTTTATGGCTGTTGATAGAGCAT
CTCGGATGAAAGAAGATTAAGTTGATGGATCTTTTGAGTCCTATATGAAGTGGGTTCAGA
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GG
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GTTTTTTTCTTTTATCACTTTGTGGTTGAGACTATAAGTTAAAAACAAAAGCCTTTCATC
CTGTTCTTTCGTTTCAACATTCGTTTGATTACAAGTTAGATGTTCTCATTTGCTGCTCAC
TTTAATCTCCTTCTTAAGAGAATCAGACTCTGTCCATGTAGTTTGGCCTTTATGGCTGTT
GATAGAGCATCTCGGATGAAAGAAGATTAAGTTGATGGATCTTTTGAGTCCTATATGAAG
TGGGTTCAGAAGAGTTGGCGCCTTCGTCGCGGTCCGACAAAGAGTCTATCTTCAATCCGA
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TTCTTCGCGGTGGCGATTTTGTTTGTGTTTGTGTGTATCTAGTAATCTCATCCACAAAAA
GATCTGTTCTTCATGTTTTTT*CTTTTATCACTTTGTGGTTGAGACTATAAGTTAAAAAC
AAAAGCCTTTCATCCTGTTCTTTCGTTTCAACATTCGTTTGATTACAAGTTAGATGTTCT
CATTTGCTGCTCACTTTAATCTCTTTCTTAAGAGAATCAGACTCTGTCCATGTAGTTTGG
CCTTTATGGCTGTTGATAGAGCATCTCGGATGAAAGAAGATTAAGTTGATGGATCTTTTG
AGTCCTATATGAAGTGGGTTCAGAAGAGTTGGCGCCTTCGTCGCGGTCCGACAAAGAGTC
TATCTTCAATCCGGCTCAAGCTTCCTCTGGTACACAATCCAGCGAATCAGAACCTCTCTA
TCTATGTAGTCTACGCTTTGATGAAAGGCATCTGCGCAGTATCAGTGTTAGAAGAAGTTC
TCGTAAGGATCCAAAGCCTTCTACGGCGGAGATGGAGATAAACAGAGAAGATTACTCTAG
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ATATTGTTGTATTGCCTTCGGGCTTTATATTAATAAAACAGTTG
AC

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DS 

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TCTGTCCATGTAGTTTGGCCTTTATGGCTGTTGATAGAGCATCTCGGATGAAAGAAGATT
AAGTTGATGGATCTTTTGAGTCCTATATGAAGTGGGTTCAGAAGAGTTGGCGCCTTCGTC
GCGGTCCGACAAAGAGTCTATCTTCAATCCGACTCAAGCTTCCTCTGGTACACAATCCAG
TGAATCAGAACCTCTCTATCTATGTAGTCTACGCTTTGATGAAAGGCATCTGCGCAGTAT
CAGTGTTAGAAGAAGTTCTCGTAAGGATCCAAAGCCTTTTACGGCGGAGATGGAGATAAA
CAGAGAAGATTACTCTAGAACGTGCGGTGAAGAAGACTTCAACGGTGAAGTAACGGTGAC
GTAAGCTGTTTGGCTAATGAAGGTCACGTAGCTTTGTTTTTCTTCGTTAACCGACACGTG
TAAAGCACTCTAATTGATTAAAATGCTCATGTTTATCCCTTTGAATGTATAAATGGGCCT
TACACTTCTTTCGGCCTGATATTGTTGTATTGCCTTCGGGCTTTATATTAATAAAACAGT
TGGC

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DS 



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ATGTTCTAGAGCCC


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1AU51JQ U 36
AF RS1AS22JQ U 40
AF RS1AS22TF C 40
AF RS1AU51TF C 1
AF RS1C873JQ U 40
BS 1 39 RS1AU51TF
BS 40 466 RS1AS22JQ
BS 467 494 RS1C873JQ

RD RS1AU51JQ 333 0 0
TTTAA
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TTCGCCT

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DS 

RD RS1AS22TF 427 0 0
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TTCGCCT

QA 1 427 1 427
DS 

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TGGAAACTGAAAAATAAAGAAAGAAATGGTATTCTTGTGTGGTCAGAACATCTCCATGAC
TAGAACCTGTGCTCCAGCTTCTCCTTTTCTATGTAGTGTTGAGCATACGAGTAGGTTCCG
ATGACCGGAGCGAGGAGGAGAATAGTGCTGATCCAATTCTCTGAGACCTTGTGGTGGATC
TTCTCAGGTAGATCCTTCCATAGACCGGTCATGATCTTCTGCTGAAACGGCGATAACGCG
TAAACCACCGCCTTCAATTTCACCGGCTGCTTTCCCATCTTCGCCTTCTTCCTCCACCAA
ATGTTCTAGAGCC

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TCTGAGACCTTGTGGTGGATCTTCTCAGGTAGATCCTTCCATAGACCGGTCATGATCTTC
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TTCGCCTTCTTCCTCCACCAAATGTTCTAGAGCCC

QA 1 455 1 455
DS 



AS 1 4

CO CL1725Contig1 809 4 5 U
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CATGCAAGATTTCAAAACCGGTTACATGACATTAGCTTCGCCGAGATCAATGTTCTTGAG
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CAAGGCCTTTCCTGACTTCGGTCAAACCGGAACCGCGTATCCCGCACCTTACGCCTTAGT
CTACAGAAACATGTCGATACTCGGGGTAGAAGGATTCTCTGCTCTTCCCCACAATTGCCT
CATGCTCTGTTACATATTCTTCGCGGCAGCAGTGTTTGTGAACGGTGTGAGAGACGCCGT
GGGGCCTAACTGGTCTCGGTTCATCCCTCTCCCGATGGCTATGGCTATACCGTTTTACAT
CGGAGGTTACTTCACGATCGATATGTGCGTGGGAAGTCTGATTCTATTCTTATGGAGGAA
GCTGAATAGACCAAAAGCAGATGCGTACTCTTCAGCTGTTGCTTCTGGTTTGATATGTGG
TGAAGGGATATGGACGTTACCGAGCTCCGTACTTGCCTTAGCTAGTGTTAAGCCTCCTAT
CTGCATGAAGTTCTTGTCTGCCGCTACCAACGTTAAGGTTGATTCTTTCTTAAACCCTTC
TTAACTGTGTTTTGGTTTTTCTTTTCATTTGTTATTTCTAGAATTACGGTTTTCTATGTT
TCTTGTCTATCTCTCTTAGTTTCAACTTCAGTTCTACTCAATTATGTATAAAAAGATGAT
TGAATTATTGGTTTTCTAGTTGCTATTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GM77TF U 1
AF RS1GM77JQ C 63
AF RS1CU84JQ C 520
AF RS1CU84TF U 520
BS 1 636 RS1GM77TF
BS 637 637 RS1CU84TF
BS 638 767 RS1GM77TF
BS 768 786 RS1CU84TF
BS 787 809 RS1GM77JQ

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CATGCAAGATTTCAAAACCGGTTACATGACATTAGCTTCGCCGAGATCAATGTTCTTGAG
CCAAGCGATTGGCACAGCGATGGGCTGCGTCATCTCTCCTTGCGTCTTCTGGCTATTCTA
CAAGGCCTTTCCTGACTTCGGTCAAACCGGAACCGCGTATCCCGCACCTTACGCCTTAGT
CTACAGAAACATGTCGATACTCGGGGTAGAAGGATTCTCTGCTCTTCCCCACAATTGCCT
CATGCTCTGTTACATATTCTTCGCGGCAGCAGTGTTTGTGAACGGTGTGAGAGACGCCGT
GGGGCCTAACTGGTCTCGGTTCATCCCTCTCCCGATGGCTATGGCTATACCGTTTTACAT
CGGAGGTTACTTCACGATCGATATGTGCGTGGGAAGTCTGATTCTATTCTTATGGAGGAA
GCTGAATAGACCAAAAGCAGATGCGTACTCTTCAGCTGTTGCTTCTGGTTTGATATGTGG
TGAAGGGATATGGACGTTACCGAGCTCCGTACTTGCCTTAGCTAGTGTTAAGCCTCCTAT
CTGCATGAAGTTCTTGTCTGCCGCTACCAACGTTAAAGTTGATTCTTTCTTAAACCCTTC
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TCTTGTCTATCTCTCTTAGTTTCAACTTCAGTTCTACTCAATTATGT
G

QA 1 767 1 767
DS 

RD RS1GM77JQ 747 0 0
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AAGCGATTGGCACAGCGATGGGCTGCGTCATCTCTCCTTGCGTCTTCTGGCTATTCTACA
AGGCCTTTCCTGACTTCGGTCAAACCGGAACCGCGTATCCCGCACCTTACGCCTTAGTCT
ACAGAAACATGTCGATACTCGGGGTAGAAGGATTCTCTGCTCTTCCCCACAATTGCCTCA
TGCTCTGTTACATATTCTTCGCGGCAGCAGTGTTTGTGAACGGTGTGAGAGACGCCGTGG
GGCCTAACTGGTCTCGGTTCATCCCTCTCCCGATGGCTATGGCTATACCGTTTTACATCG
GAGGTTACTTCACGATCGATATGTGCGTGGGAAGTCTGATTCTATTCTTATGGAGGAAGC
TGAATAGACCAAAAGCAGATGCGTACTCTTCAGCTGTTGCTTCTGGTTTGATATGTGGTG
AAGGGATATGGACGTTACCGAGCTCCGTACTTGCCTTAGCTAGTGTTAAGCCTCCTATCT
GCATGAAGTTCTTGTCTGCCGCTACCAACGTTAAGGTTGATTCTTTCTTAAACCCTTCTT
AACTGTGTTTTGGTTTTTCTTTTCATTTGTTATTTCTAGAATTACGGTTTTCTATGTTTC
TTGTCTATCTCTCTTAGTTTCAACTTCAGTTCTACTCAATTATGTGTAAAAAGATGATTG
AATTATTGGTTTTCTAGTTGCTATTCT

QA 1 747 1 747
DS 

RD RS1CU84JQ 267 0 0
G
GCTTTTGGTTTGATATGTGGTGAAGGGATATGGACGTTACCGAGCTCCGTACTTGCCTTA
GCTAGTGTTAAGCCTCCTATCTGCATGAAGTTTTTGTCTGCCGCTACCAACGTTAAGGTT
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GAATTACGGTTTTCTATGTTTCTTGTCTATCTCTCTTAGTTTCAACTTCAGTTCTACTCA
ATTATGTATAAAAAGATGATTGAATT

QA 2 267 2 267
DS 

RD RS1CU84TF 267 0 0
G
GCTTCTGGTTTGATATGTGGTGAAGGGATATGGACGTTACCGAGCTCCGTACTTGCCTTA
GCTAGTGTTAAGCCTCCTATCTGCATGAAGTTCTTGTCTGCCGCTACCAACGTTAAGGTT
GATTCTTTCTTAAACCCTTCTTAACTGTGTTTTGGTTTTTCTTTTCATTTGTTATTTCTA
GAATTACGGTTTTCTATGTTTCTTGTCTATCTCTCTTAGTTTCAACTTCAGTTCTACTCA
ATTATGTATAAAAAGATGATTGAATT

QA 2 267 2 267
DS 



AS 1 5

CO CL1726Contig1 819 5 7 U
GGACCACTCAGCTATATAAACGAAGCTGTGAGTACTAGTGAGAGATAGACTCGAATCACA
CAAACTAAAAGAAAACAGTGAGTGATGGCTTGTGTTGGTTACAAATCATCAGATCTATGT
CAATGCAAACCTCACATTGCTTCCGACGAGAGTAGTAAGAAGCTGGAGAAGAAGAATAAG
AAGAAGAAGAGCCACGTGTTGCTAGAAGGCTACGTTGAGAATCTCGCCACGTTGGACAAC
CAAGACGATCTGACGAGATCCAAGAGCTTGACCGACGACGATCTCGAAGACCTCAAAGGT
TGTCTGGATCTAGGGTTTGGTTTCAGCTACGACGAGATCCCTGAGCTCTGCAGCACTTTA
CCTGCTCTAGAGCTTTGCTATTCCATGAGCCAGAGATTCTCTGACGACAACAAGCAGATC
AATGCCAACAACAACAACAAGTCTTCACCGGAAAATTCGTCGGTGGACGATTCTCCGGCG
CCTCCTATTGCCAACTGGAAGATATCTAGCCCTGGTGATCATCCGGATGATGTGAAAGCT
CGGCTCAAGTACTGGGCACAAGCCGTTGCCTGTACTGTCCAATTGTGCAGCTGAACGATT
CATTGTCACGTCTGAAGCAGGAACTCTAGTGAAGATGTGATATTTACATGAACATTGTTT
AGCTGAGAAGAGATCTCAGAAAGGCATTGAAAGGTCTGAAATTTAACTGAACACCTAGTA
GTATGATTTTTAATTACCATTCCATCTATCCGTAGTAGTAGTAATTTTTGTGAACGGAAA
ATAAAGGTATCATTGAATAAAAACAGCACATTCTTTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1G164TF U 1
AF RS1GV81TF U 43
AF RS1FX42TF U 45
AF RS1G164JQ C 291
AF RS1FX42JQ C 312
BS 1 440 RS1G164TF
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CAAACTAAAAGAAAACAGTGAGTGATGGCTTGTGTTGGTTACAAATCATCAGATCTATGT
CAATGCAAACCTCACATTGCTTCCGACGAGAGTAGTAAGAAGCTGGAGAAGAAGAATAAG
AAGAAGAAGAGCCACGTGTTGCTAGAAGGCTACGTTGAGAATCTCGCCACGTTGGACAAC
CAAGACGATCTGACGAGATCCAAGAGCTTGACCGACGACGATCTCGAAGACCTCAAAGGT
TGTCTGGATCTAGGGTTTGGTTTCAGCTACGACGAGATCCCTGAGCTCTGCAGCACTTTA
CCTGCTCTAGAGCTTTGCTATTCCATGAGCCAGAGATTCTCTGACGACAACAAGCAGATC
AATGCCAACAACAACAACAATTCTTCACCGGAAAATTCGTCGGTGGACGATTCTCCGGCG
CCTCCTATTGCCAACTGGAAGATATCTAGCCCTGGTGATCATCCGGATGATGTGAAAGCT
CGGCTCAAGTACTGGGCACAAGCCGTTGCCTGTACTGTCCAATTGTGCAGCTGAACGATT
CATTGTCACGTCTGAA

QA 1 616 1 616
DS 

RD RS1GV81TF 574 0 0
AGGG
AGACTCGAATCACACAAACTAAAAGAAAACAGTGAGTGATGGCTTGTGTTGGTTACAAAT
CATCAGATCTATGTCAATGCAAACCTCACATTGCTTCCGACGAGAGTAGTAAGAAGCTGG
AGAAGAAGAATAAGAAGAAGAAGAGCCACGTGTTGCTAGAAGGCTACGTTGAGAATCTCG
CCACGTTGGACAACCAAGACGATCTGACGAGATCCAAGAGCTTGACCGACGACGATCTCG
AAGACCTCAAAGGTTGTCTGGATCTAGGGTTTGGTTTCAGCTACGACGAGATCCCTGAGC
TCTGCAGCACTTTACCTGCTCTAGAGCTTTGCTATTCCATGAGCCAGAGATTCTCTGACG
ACAACAAGCAGATCAATGCCAACAACAACAACAAGTCTTCACCGGAAAATTCGTCGGTGG
ACGATTCTCCGGCGCCTCCTATTGCCAACTGGAAGATATCTAGCCCTGGTGATCATCCGG
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GCAGCTGAACGATTCATTGTCACGTCTGAA

QA 5 574 5 574
DS 

RD RS1FX42TF 737 0 0
GG
AGACTCGAATCACACAAACTAAAAGAAAACAGTGAGTGATGGCTTGTGTTGGTTACAAAT
CATCAGATCTATGTCAATGCAAACCTCACATTGCTTCCGACGAGAGTAGTAAGAAGCTGG
AGAAGAAGAATAAGAAGAAGAAGAGCCACGTGTTGCTAGAAGGCTACGTTGAGAATCTCG
CCACGTTGGACAACCAAGACGATCTGACGAGATCCAAGAGCTTGACCGACGACGATCTCG
AAGACCTCAAAGGTTGTCTGGATCTAGGGTTTGGTTTCAGCTACGACGAGATCCCTGAGC
TCTGCAGCACTTTACCTGCTCTAGAGCTTTGCTATTCCATGAGCCAGAGATTCTCTGACG
ACAACAAGCAGATCAATGCCAACAACAACAACAAGTCTTCACCGGAAAATTCGTCGGTGG
ACGATTCTCCGGCGCCTCCTATTGCCAACTGGAAGATATCTAGCCCTGGTGATCATCCGG
ATGATGTGAAAGCTCGGCTCAAGTACTGGGCACAAGCCGTTGCCTGTACTGTCCAATTGT
GCAGCTGAACGATTCATTGTCACGTCTGAAGCAGGAACTCTAGTGAAGATGTGATATTTA
CATGAACATTGTTTAGCTGAGAAGAGATCTCAGAAAGGCATTGAAAGGTCTGAAATTTAA
CTGAACACCTAGTAGTATGATTTTTAATTACCATTCCATCTATCCGTAGTAGTAGTAATT
TT*GTGAACGGAAA
T

QA 3 736 3 736
DS 

RD RS1G164JQ 529 0 0
CCTCAAAGGTTGTCTGGATCTAGGGTTTGGTTTCAGCTACGACGAGATCCCTGAGCTCTG
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CAAGCAGATCAATGCCAACAACAACAACAATTTTTCACCGGAAAATTCGTCGGTGGACGA
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AACATTGTTTAGCTGAGAAGAGATCTCAGAAAGGCATTGAAAGGTCTGAAATTTAACTGA
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DS 

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GCTTTGCTATTCCATGAGCCAGAGATTTTCTGACGACAACAAGCAGATCAATGCCAACAA
CAACAACAAGTCTTCACCGGAAAATTCGTCGGTGGACGATTTTCCGGCGCCTCCTATTGC
CAACTGGAAGATATCTAGCCCTGGTGATCATCCGGATGATGTGAAAGCTCGGCTCAAGTA
CTGGGCACAAGCCGTTGCCTGTACTGTCCAATTGTGCAGCTGAACGATTCATTGTCACGT
CTGAAGCAGGAACTCTAGTGAAGATGTGATATTTACATGAACATTGTTTAGCTGAGAAGA
GATTTCAGAAAGGCATTGAAAGGTCTGAAATTTAACTGAACACCTAGTAGTATGATTTTT
AATTACCATTCCATCTATCCGTAGTAGTAGTAATTTTTGTGAACGGAAAATAAAGGTATC
ATTGAATAAAAACAGCACATTCTTTCC

QA 1 507 1 507
DS 



AS 1 5

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CCCCACACTTGATTCCATATCAGTCTCACAATTCTTATCAAATCATTTCTGATTGTCATA
ACCGACTAACCAACCCCTCCAAATAAAACAAAATGTATATTACATCAACTTCCAGATATT
CTATAATTTCAATATTATCCATATTCAGCTTATTGTTCTCTCTCCAAGGAACTCATGGGG
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CCATGGGTGGAGCTTGTGGCTATGGAAATCTGTATAGCCAAGGTTACGGGACGAACACAG
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AGTGCAACGATGACCCGAGATGGTGTGTCGGTTCCACTATCACCGTCACGGCTACAAACT
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AACACTTCGACCTAGCCGAGCCAGCTTTTCTCCAAATCGCTCAGTACCGTGCCGGCATTG
TCCCTGTCTCTTTCCGAAGAGTACCGTGTATGAAGAAAGGAGGGATAAGGTTTACAATCA
ACGGCCACTCTTACTTCAATCTTGTTCTGATCTCCAACGTAGGAGGAGCAGGAGACGTCC
ACGCTGTCTCGATCAGAGGCTCAAAAACAGGGTCGTGGCAAGCAATGTCTAGGAACTGGG
GGCAAAACTGGCAGAGCAATTCTTACCTCAACGACCAGAGCCTCTCGTTCCAGGTCACAA
CCAGCGATGGTCGCACCGTCGTCAGCAACGACGTGGCTCCTTCTAATTGGCAGTTCGGAC
AAACCTTCCAAGGTGGTCAGTTCTGAGTCCTCTCCCATGTGTTTGGTGTGCTGATGTGGC
TGCGTATTGCTGAGGTGGCTCATAAGCACCCGCTTGGCTTTCAAATGGTTGTATTTTTCG
TGCCTACGAAGAGCAAGTTTTTATTTTGTTTTACATGTTTATTGAACTTAGCCTTTTGGC
ATATACTCAAAAATGTGTTAGTCAAATACATATTGTTGAAAGAAAGTCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FN78TF U 1
AF RS1E430TF U 75
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AF RS1E430JQ C 323
AF RS1FN78JQ C 487
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GG
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GG
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ATCCATATTCAGCTTATTGTTCTCTCTCCAAGGAACTCATGGGGACGACGGAGGTTGGCA
AGGTGGCCATGCCACGTTCTACGGTGGCGGTGACGCTTCCGGCACCATGGGTGGAGCTTG
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ACTGTTCAACAACGGACTCACGTGCGGCGCGTGCTACGAGATGAAGTGCAACGATGACCC
GAGATGGTGTGTCGGTTCCACTATCACCGTCACGGCTACAAACTTTTGTCCACCGAACTT
TGGCCTCTCGAACGATAACGGAGGATGGTGCAACCCTCCTCTTCAACACTTCGACCTAGC
CGAGCCAGCTTTTCTCCAAATCGCTCAGTACCGTGCCGGCATTGTCCCTGTCTCTTTCCG
AAGAGTACCGTGTATGAAGAAAGGAGGGATAAGGTTTACAATCAACGGCCACTCTTACTT
CAATCTTGTTCTGATCTCCAACGTAGGAGGA

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DS 

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TGTTCTGATCTCCAACGTAGGAGGAGCAGGAGACGTCCACGCTGTCTCGATCAGAGGCTC
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CTGAGTCCTCTCCCATGTGTTTGGTGTGCTGATGTGGCTGCGTATTGCTGAGGTGGCTCA
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CAAATACATATTGTTGAAAGAAAGTCTTTT

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DS 

RD RS1FN78JQ 632 0 0
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TCTCGATCAGAGGCTCAAAAACAGGGTCGTGGCAAGCAATGTTTAGGAACTGGGGGCAAA
ACTGGCAGAGCAATTCTTACCTCAACGACCAGAGCCTCTCGTTCCAGGTCACAACCAGCG
ATGGTCGCACCGTCGTCAGCAACGACGTGGCTCCTTTTAATTGGCAGTTCGGACAAACCT
TCCAAGGTGGTCAGTTTTGAGTCCTCTCCCATGTGTTTGGTGTGCTGATGTGGCTGCGTA
TTGCTGAGGTGGCTCATAAGCACCCGCTTGGCTTTCAAATGGTTGTATTTTTCGTGCCTA
CGAAGAGCAAGTTTTTATTTTGTTTTACATGTTTATTGAACTTAGCCTTTTGGCATGTAC
TCAAAAATGTGTTAGTCAAATACATATTGTTG

QA 1 632 1 632
DS 



AS 2 5

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AAGCTTAAAGTTTGTGTTTCTGGAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAGCTACCCATGGGAGTG
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TGCAACTCA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A313TR U 1
AF RS1A313JQ U 1
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A
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AGCTTAAAGTTTGTGTTTCTGGAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAGCTACCCATGGGAGTGA
CCATTTATTCATCATCCTTGTACGGATACTCC

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DS 

RD RS1A313JQ 189 0 0
AAAACAGCTAAAAAATGGATTAATAGGTTTGTGCCAAACATAAAACAGCATTCATTTTCA
AAGCTTAAAGTTTGTGTTTCTGGAAAAAAAAAAAAAGCAAAAAAGCTACCCATGGGAGTG
ACCATTTATTCATCATCCTTGTACGGATACTCCTCAGCGACTTGCTTCAGTAGCTTCACC
TGCAACTCA

QA 1 189 1 189
DS 



CO CL1728Contig2 797 3 2 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAGATCAAAA
GCAAACACAACCAGAACGAGGAAACCTTCTTTGTCGGTGAGATTCAGACATGGCTCCTGT
TGGTCCTCGTTCCGGTGATGCCATCTTCTCCAGCATCGATCGCGTGAATGCAGAGTTGTT
CACATTGACGTACGGTGCAATCGTGCGTCAATTGCTTACTGACCTTGAAGATGTCGATGA
AGTCAACAAACAGCTTGATCAAATGGGATACAACATTGGAATCAGACTTATCGATGAGTT
TCTTGCCAAATCTGGCGTTTCCAGATGCGTTGATTTCAAGGAAACTGCTGAAATGATTGC
CAAGGTGGGTTTCAAGATGTTTTTGGGGGTCACTGCATCAGTCTCAAGCTGGGACGCGGA
CGGGACTTGCTGCAGTATCATCTTGGAAGACAATCCACTCGTTGATTTCGTGGAGCTTCC
CGATACTTGCCAAGGGCTTTACTACTGCAACGTCTTAAGTGGAGTCATTAGAGGCGCTTT
GGAAATGGTGTCAATGAAGACGGAAGTGACGTGGACGCGTGATGCTCTTAGAGGTGATGA
TGCTTATGAGTTGCAGGTGAAGCTACTGAAGCAAGTCGCTGAGGAGTATCCGTACAAGGA
TGATGAATAAATGGTCACTCCCATGCGTAGCTTCTTTGCTCTTTTTCTTCTTCCAGAAAC
ACAAACTTTAAGCTTTGAAAATGAATGCTGTTTTATGTTTGGCACAAACCTATTAATCCA
TTTCTTAGCTGTTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
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G
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DS 



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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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ATAATACAATCTTGATAAATAATAAACCGACCTTATTCTATGAGACTGCAGCAACATAGG
CTAATTATTATGTGCCACGCTCAAAAGTGTACGTACTTTGGTTAAATCTCATTGCGTACA
TACCAATATGTTCCATAACTTTCTCGTTCTCCTCAAGATTTTCCCAATAAACTGAGCTAT
ACACGATTCGATCATATTAGACGAGGGAATAAAACTCGTTCTCGTCGGAGTTATTCCGGC
CAAAGAAACTCCGGTTTCATGAGCTCCCTTTCGAAGATAGAAGCTTCTACTTCCTATTTC
TCCGATTATTTCCTTTCTCTCCAAACACTGGATGCTGAAATGAGATTGATGTAACTCATA
GGCAGCCCCTTCGTCGAGTTTCGGTGTTCGTCCTTCTTCGCAATATTTTTCCAGGACAAA
TTTGATCATTTCTTCGACATTGCAGCTCAATTTAACCATAGTTCTTACAGGTCCAGGGCT
TCCTTCAACTGCTACGTTGATTACAACTTTTGTTGCTTCTCTTTTATTTTCCTCTTGATT
GGTCGGAAATTGAGA

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DS 

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TA
TCCGGCCAAAGAAACTC*GGTTTCATGAGCTCC*TTTCGAAGATAGAAGCTTCTACTTCC
TATTTCTCCGATTATTTCCTTTCTCTCCAAACACTGGATGCTGAAATGAGATTGATGTAA
CTCATAGGCAGCCCCTTCGTCGAGTTTCGGTGTTCGTCCTTCTTCGCAATATTTTTCCAG
GACAAATTTGATCATTTCTTCGACATTGCAGCTCAATTTAACCATAGTTCTTACAGGTCC
AGGGCTTCCTTCAACTGCTACGTTGATTACAACTTTTGTTGCTTCTCTTTTATTTTCCTC
TTGATTGGTCGGAAATTGAGACGACGGCGAAGATAAGCCCAACAACGACGGAGAAGAAGC
CATAACCTCAGAGCGAATCCTTGGCAAGTAGACGATCGGACCAGATTCTTCCGTCGGTAA
GCCACTCAACGGCGAGGATCGCCGCATGCAAGTACCGTCTCCGTCGCGACGGCGATTGAG
ACTCGAATCGGAAAAGCTTCGCTCGAAGACCTGATTAGTCGATTTTGAACGGTTTTTATC
AGAAACGCATCGGGAAGCCGTCCGTCTCATCCTGATGCTCCGGCCTCCGTTTCCGACCGG
AGTCGTAACTCTTCTCCGGTGAGTCGAATTTGACATTTTGTTGGAAGTGATGACTTTGCT
TGAGGAGGAGGAGGAAGATGAATGAAATTGAGAGGTGTTTGTGGTTTGCTTGGCAAAGAA
GCGAA
GTAAGGGATTCTCTCC

QA 3 727 3 727
DS 

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AAACAGAGTCTAA
CCTCTTGATTGGTCGGAAATTGAGACGACGGCGAAGATAAGCCCAACAACGACGGAGAAG
AAGCCATAACCTCAGAGCGAATCCTTGGCAAGTAGACGATCGGACCAGATTCTTCCGTCG
GTAAGCCACTCAACGGCGAGGATCGCCGCATGCAAGTACCGTCTCCGTCGCGACGGCGAT
TGAGACTCGAATCGGAGAAGCTTCGCTCGAAGACCTGATTAGTCGATTTTGAACGGTTTT
TATCAGAGACGCATCGGGAAGCCGTCCGTCTCATCCTGATGCTCCGGCCTCCGTTTCCGA
CCGGAGTCGTAACTCTTCTCCGGTGAGTCGAATTTGACATTTTGTTGGAAGTGATGACTT
TGCTTGAGGAGGAGGAGGAAGATGAATGAAATTGAGAGGTGTTTGTGGTTTGCTTGGCAA
AGAAGCGAAATCAAGGAGGAGTTCAAGAAAATCAACAAGCGGAATGGAGGAAGAATCAGT
ACGCTAGTAGAGCCCCTCGGGAGGGAGGGGGATGAGTTTGCTTATCACAAGATAAATTAT
ATAAGCAGCCTGCTAATCTGACTATAAGCCAAGACTCACACACAAAGGTTTGTTTATTTT
TCTCCTTTTTT*CTGCTGTCTTGTGTGACTGTGTCACATAGAGCTCCTACGTATTGGATA
TGTGTGCGTCTTTCTCCATATGAA*GATTTTAATTTGGGTAGCTCTTTTAATTAGTGCAT
TGCGAATTG

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DS 

RD RS1DX94JQ 687 0 0
GCCACTCAACGGCGAGGATCGCCGCATGCAAGTACCGTCTCCGTCGCGACGGCGATTGAG
ACTCGAATCGGAGAAGCTTCGCTCGAAGACCTGATTAGTCGATTTTGAACGGTTTTTATC
AGAGACGCATCGGGAAGCCGTCCGTCTCATCCTGATGCTCCGGCCTCCGTTTCCGACCGG
AGTCGTAACTCTTCTCCGGTGAGTCGAATTTGACATTTTGTTGGAAGTGATGACTTTGCT
TGAGGAGGAGGAGGAAGATGAATGAAATTGAGAGGTGTTTGTGGTTTGCTTGGCAAAGAA
GCGAAATCAAGGAGGAGTTCAAGAAAATCAACAAGCGGAATGGAGGAAGAATCAGTACGC
TAGTAGAGCCCCTCGGGAGGGAGGGG*ATGAGTTTGCTTATCACAAGATAAATTATATAA
GCAGCCTGCTAATCTGACTATAAGCCAAGACTCACACACAAAGGTTTGTTTATTTTTCTC
CTTTTTTTCTGCTGTCTTGTGTGACTGTGTCACATAGAGCTCCTACGTATTGGATATGTG
TGCGTCTTTCTCCATATGAAAGATTTTAATTTGGGTAGCTCTTTTAATTAGTGCATTGCG
AATTGTGGTATATGAAAGAAAATTAGAATAATCTAATCATAGCAAATTGTACTATTTATT
AATGTAAGACTCATAGCAAATTGAGTC

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 4

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GCTTGGGCAAGAGCAGTTTGAGCAGGCGAAGCTTTGCTGGTACCATGCACTCAAAGGCAA
GGTAGACGTGGAGAGTGAGGTCGCTCAGGAGGTCCTTATGCTCTATAACAAAGCTGAGGA
TAGCATGGAGAGGGGTATGCAGATTTGGGAAGAGATGGAAGAACGTCGTCTAAACGGAAT
CTCCAAGTTGGATATACAGAGAGCACTGCTGCATAAGATGGGGTTGGATGGATGGTTTAG
AGAAGCTGCTGCAGATGAAGAAACGGTGGAGCAGACAGCTAATATGAGTTCCCAGATTAA
TCTCTTGTGGGGCTCATTGCTGTATGAACGGTCTATAGTGGAGTATAAGCTGGGGCTCAC
AACTTGGGAGGAATGTTTGGAGGTTGCAGTTGAGAAATTTGAGCTAGCTGGAGCTTCTGC
AACTGATATAGCTGTGATGGTGAAGAATCATTGTTCAAGCGAGAGTGCACTTGAAGGTAT
GGGGTTCAAGATTGATGAGATAGTACAGGCGTGGAATGAGATGTATGATGCTAAAAGATG
GCAGATGGGGGTGTCATCTTTCCGGCTAGAACCAATGTTCCGGAGACGAGCCCCAAAACT
GCATGATATCTTAGAGAATGTATTTTCTGAGTCTGCTTGAGGAAACATTCTTCTCATATG
TATCAGTAGATGTATTGCAGGCACATTGTTTGTTTGGGAGTAGTGTTCATTTTTCTCTCC
TCCCTTTATGTTTTATTTTTTGGGTGGATATCGATCTCCACGGGATATACTCTTGGCCTC
TGCGATATTCATATGTGGTGGCTGAAACTAATTAGGATTGGGATTCAGTCCAGAGAAGAA
GGTTATAGATGGTTATAACTCTCTTCTCTTCAGATTTTATACAACATATTGGTTGTTTGT
TTTGTTTGGTTTTATACCATAGCTGCGTAATCATTCTTGTTTTGGATTAGTGTCTGTTAA
ATTGGTGATTGTTGTATGAGTGATTATTGTATGACTTCAGATTGTTTTTATCTTCAAAAG
AAAAAGAATAATGGATGTTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1FQ83TF U 1
AF RS1EZ29TF U 241
AF RS1FQ83JQ C 248
AF RS1C448JQ C 276
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RD RS1FQ83TF 638 0 0
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GGTAGACGTGGAGAGTGAGGTCGCTCAGGAGGTCCTTATGCTCTATAACAAAGCTGAGGA
TAGCATGGAGAGGGGTATGCAGATTTGGGAAGAGATGGAAGAACGTCGTCTAAACGGAAT
CTCCAAGTTGGATATACAGAGAGCACTGCTGCATAAGATGGGGTTGGATGGATGGTTTAG
AGAAGCTGCTGCAGATGAAGAAACGGTGGAGCAGACAGCTAATATGAGTTCCCAGATTAA
TCTCTTGTGGGGCTCATTGCTGTATGAACGGTCTATAGTGGAGTATAAGCTGGGGCTCAC
AACTTGGGAGGAATGTTTGGAGGTTGCAGTTGAGAAATTTGAGCTAGCTGGAGCTTCTGC
AACTGATATAGCTGTGATGGTGAAGAATCATTGTTCAAGCGAGAGTGCACTTGAAGGTAT
GGGGTTCAAGATTGATGAGATAGTACAGGCGTGGAATGAGATGTATGATGCTAAAATATG
GCAGATGGGGGTGTCATCTTTCCGGCTAGAACCAATGTTCCGGAGACGAGCCCCAAAACT
GCATGATATCTTAGAGAATGTATTTTCTGAGTCTG
CTT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1EZ29TF 423 0 0
GGAAGCT
GCTGCAGATGAAGAAACGGTGGAGCAGACGGCTAATATGAGTTCTCAGATTAATCTCTTG
TGGGGCTCTTTGCTGTATGAACGGTCTATAGTGGAGTATAAGCTGGGGCTAACAACTTGG
GAGGAATGTTTGGAGGTTGCAGTTGAGAAATTTGAACTGGCTGGAGCTTCTGCGACTGAT
ATAGCTGTGATGGTGAAGAATCATTGTTCAAGCAAGAGTGCACTTGAAGGTATGGGGTTC
AGGATTGATGAGATAGTACAGGCATGGAATGAGATGTATGATGCTAAAAGGTGGCAGATG
GGGGTGTCATCTTTCCGGCTAGAACCAATGTTCCGGAGACGAGCCCCCAAATTGCATGAT
ATCTTAGAAAATGTATTTTCTGAGTCTGCTTGAGGAAACATTCTTCTCATATGTAT

QA 8 423 8 423
DS 

RD RS1FQ83JQ 796 0 0
GCTGCAGATGAAGAAACGGTGGAGCAGACAGCTAATATGAGTTCCCAGATTAATCTCTTG
TGGGGCTCATTGCTGTATGAACGGTCTATAGTGGAGTATAAGCTGGGGCTCACAACTTGG
GAGGAATGTTTGGAGGTTGCAGTTGAGAAATTTGAGCTAGCTGGAGCTTCTGCAACTGAT
ATAGCTGTGATGGTGAAGAATCATTGTTCAAGCGAGAGTGCACTTGAAGGTATGGGGTTC
AAGATTGATGAGATAGTACAGGCGTGGAATGAGATGTATGATGCTAAAATATGGCAGATG
GGGGTGTCATCTTTCCGGCTAGAACCAATGTTCCGGAGACGAGCCCCAAAACTGCATGAT
ATCTTAGAGAATGTATTTTCTGAGTCTGCTTGAGGAAACATTCTTTTCATATGTATCAGT
AGATGTATTGCAGGCACATTGTTTGTTTGGGAGTAGTGTTCATTTTTCTCTCCTCCCTTT
ATGTTTTATTTTTTGGGTGGATATTGATCTCCACGGGATATACTCTTGGCCTCTGCGATA
TTCATATGTGGTGGCTGAAACTAATTAGGATTGGGATTCAGTCCAGAGAAGAAGGTTATA
GATGGTTATAACTCTCTTCTCTTCAGATTTTATACAACATATTGGTTGTTTGTTTTGTTT
GGTTTTATACCATAGCTGCGTAATCATTCTTGTTTTGGATTAGTGTCTGTTAAATTGGTG
ATTGTTGTATGAGTGATTATTGTATGACTTCAGATTGTTTTTATCTTCAAAAGAAAAAGA
ATAATGGATGTTTC
CC

QA 1 794 1 794
DS 

RD RS1C448JQ 768 0 0
CA
GCTAATATGAGTTCCCAGATTAATCTCTTGTGGGGCTCATTGCTGTATGAACGGTCTATA
GTGGAGTATAAGCTGGGGCTCACAACTTGGGAGGAATGTTTGGAGGTTGCAGTTGAGAAA
TTTGAGCTAGCTGGAGCTTCTGCAACTGATATGGCTG**ATGGTGAAGAATCATTGTTCA
AGCGAGAGTGCACTTGAAGGTATGGGGTTCAAGATTGATGAGATAGTACAGGCGTGGAAT
GAGATGTATGATGCTAAAAGATGGCAGATGGGGGTGTCATCTTTCCGGCTAGAACCAATG
TTCCGGAGACGAGCCCCAAAACTGCATGATATCTTAGAGAATGTATTTTCTGAGTCTGTT
TGAGGAAACATTCTTCTCATATGTATCAGTAGATGTATTGCGGGCACATTGTTTGTTTGG
GAGTAGTGTTCATTTTTCTCTCCTCCCTTTATGTTTTATTTTTTGGGTGGATATCGATCT
CCACGGGATATACTCTTGGCCTCTGCGATATTCATATGTGGTGGCTGAAACTAATTAGGA
TTGGGATTCAGTCCAGAGAAGAAGGTTATAGATGGTTATAACTCTCTTCTCTTCAGATTT
TATACAACATATTGGTTGTTTGTTTTGTTTGGTTTTATACCGTAGCTGCGTAATCATTCT
TGTTTTGGATTAGTGTCTGTTAAATTGGTGATTGTTGTATGAGTGATTATTGTATGACTT
CAGATTGTTTTTATCTTCAAAAGAAAAAGAATAATGGATGTTTCTC

QA 3 768 3 768
DS 



AS 1 4

CO CL1731Contig1 627 4 3 U
GGAAAGGAATACGACCTAGAAAATAGAAAGACATTCTCATTCATTCACAAAGTCGCAGCC
TCGCAGTTCCACTTGGAAGATGCATTGCATCAGGAGCTCAATCCTGCAACACTTGAGACT
CAGAGTGCCGGTCAGACCGGGTTTGCTTCTCGAGAAGGAGAATGTTTTCATTAGTAAAAT
GAATTTCACATCAGGAGGAGGAGGAGGAGGCCAAGATCAGGTTTTGAGTAAGGTTATTGA
ACTGGTCAAGAAGTACGACACAGCCAATGCATCTAAGGTTACTGAAACGGCTGATTTCAA
AAAGGATTTGTCGCTGGACAGTTTAGATAGGGTGGAGATAGTGATGGCTATTGAAGAAGA
GTTCTCCGTTGAGATCCCTGATGAAAAGGCAGATAAGCTTACTTGCTGTGCTGACATTGC
AAGCTTCATTGTCTCTGAAAGTCGCCCCAAAGCGCCAGAGTCCTGACTTTATTTCTTTTC
TTCATTGTTCTGTTAATCAAAGTCTAGAGACATGTTGTGTCTCTCAGCCGTTTTTCATTT
GGGTCACTGCTGTTACATTCCATCTGATGTATTCAAGTGTGATCATACTACCTTCACACA
TAATTTGATGCAAACATCATTCTTAAT


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RS1B018JQ C 1
AF RS1B018TF U 1
AF RS1A927JQ C 31
AF RS1A927TF U 31
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AAAGGATTTGTCGCTGGACAGTTTAGATAGGGTGGAGATAGTGATGGCTATTGAAGAAGA
GTTCTCCGTTGAGATCCCTGATGAAAAGGCAGATAAGCTTACTTGCTGTGCTGACATTGC
AAGCTTCATTGTCTCTGAAAGTCGCCCCAAAGCGCCAGAGTCCTGACTTTATTTCTTTTC
TTCATTGTTCTGTTAATCAAAGTCTAGAGACATGTTGTGTCTCTCAGCCGTTTTTCATTT
GGGTCACTGCTGTTACATTCCATCTGATGTATTCAAGTGTGATCATACTACCTTCACACA
TAATTTGATGC

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GG
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GG
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CTAAGGTTACTGAAACGGCTGATTTCAAAAAGGATTTGTCGCTGGACAGTTTAGATAGGG
TGGAGATAGTGATGGCTATTGAAGAAGAGTTCTCCGTTGAGATCCCTGATGAAAAGGCAG
ATAAGCTTACTTGCTGTGCTGACATTGCAAGCTTCATTGTCTCTGTAAGTCGCCCCAAAG
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TCAAGTGTGATCATACTACCTTCACACATAATTTGATGCAAACATCATTCT
TAAT

QA 3 593 3 593
DS 



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CTCAGATTATCCTCCTCTGTATCCATAATTCACTACACGCCGAGGCGCTTATAATCAGTC
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CTTTATGAGGACCCGCTTATCCGACCCAGACATCAGAGGAGGAAGAGCATCCATCGGTTC
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TAGACTCTCTGGAGACAATCCAATCGAAGCTCTCTTCAATAACAACGGCTCACCTGGCAT
TGGCATCACGCGTGGTGGTAATAACAACACTGGCGACTATTTCTTCGGCCCTGGTCTTGA
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TTCGATAGATGCATTGCCAACCATCAAGATCGCGCAGAGGCATCTCGGGTCGTCGGACTC
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CACAACCAGAAACTACAGAAGTAGCAATGAAAGGAGGAACCCTTTCTCTTCCTTGTG*CC
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AAGAAACTCGGACACGACAGATGAGAACCAAAACTATCATTACCAGCAACATCGACAACA
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TGCATGTGTAAAACCTGCTTTATGTCA


BQ
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AF RS1CK85TF U 1
AF RS1FF37TF U 523
AF RS1FF37JQ C 908
AF RS1CK85JQ C 846
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BS 1315 1347 RS1CK85JQ

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CTCAGATTATCCTCCTCTGTATCCATAATTCACTACACGCCGAGGCGCTTATAATCAGTC
AAATGAGCTGAAGCTTCTTTCTTAGGTACTCAGTCAAGCAGAGGATTTCGTTTTTTTCTT
TTTTCCTGAGTCCACAGAGAGGATGTCAAGCGGTCGAAATACCCACTGGTGTCATAGATG
CCAGCGTGCTGTCCGTCTTCACGGCCCAGACCTTCTCTGTCCTTATTGTGGAGGAGGATT
TGTTGAGGAACTTGATGTTATCCCTCCTCAAGCCATACCCACCCCGTTTGATATGTTCAC
TAGTCACAGGGATGCCCTACGACGTGATCCCGCTTTTGATCTCATGGATGCTTTCTCCTC
CTTTATGAGGACCCGCTTATCCGACCCAGACATCAGAGGAGGAAGAGCATCCATCGGTTC
TCGTCCTGATAGCTTCCCCGGTCTGGCTCCTCTGCTTATCTTCGGTGGTCAGGTCCCTTA
TAGACTCTCTGGAGACAATCCAATCGAAGCTCTCTTCAATAACAACGGCTCACCTGGCAT
TGGCATCACGCGTGGTGGTAATAACAACACTGGCGACTATTTC

QA 1 643 1 643
DS 

RD RS1FF37TF 796 0 0
G
GGTGGTCAGGTCCCTTATAGACTCTCTGTAGACAATCCAATCGAAGCTCTCTTCAATAAC
AACGGCTCACCTGGCATTGGCATCACGCGTGGTGGTAATAACAACACTGGCGACTATTTC
TTCGGCCCTGGTCTTGATGAGCTCTTTGAGCAGCTCTCTACTACTCGCCGCGGCGGCCCA
CCTCCCGCTCCGAGATCTTCGATAGATGCATTGCCAACCATCAAGATCGCGCAGAGGCAT
CTCGGGTCGTCGGACTCCAACTGTCCTGTCTGCAAAGACGAGTTCGAGCTGGGAGCAGAA
GCGAAACTGATGCCGTGTAACCACATCTATCATTCTGACTGTATCGTCCCCTGGCTGGTT
CAGCACAACTCATGCCCTGTCTGTCGCCAAGAGCTGCCATCAGCTAGAGTGTCCTCAAGC
AATGAAAACAGAAGTACCACAACCAGAAACTACAGAAGTAGCAATGAAAGGAGGAACCCT
TTCTCTTCCTTGTG*CCATTTCGCTCGTCCGGTTCAAGCTCAAACAACAACACTCAGAAC
CGTGGGGGCACAACAAGAAGAAACTCGGACACGACAGATGAGAACCAAAACTATCATTAC
CAGCAACATCGACAACAGTCACATATGGGTTACAGTGGCTGGCCTTTTGATTACTAAAGG
TGAGCTAAAGTAATAAAAACTTTGGTCTCACTATCTATTATGGCTTGTGATTTTGCGCTT
TCTACTCTTTTATCTGTCTCCTCTCACTCTCCTGTCA*CATAAATAAAACAGAGAACAAA
TGTTACTGTTG
AGCA

QA 2 792 2 792
DS 

RD RS1FF37JQ 410 0 0
CGCCAAGAGCTGCCATCAGCTAGAGTGTCCTCAAGCAATGAAAACAGAAGTACCACAACC
AGAAACTACAGAAGTAGCAATGAAAGGAGGAACCCTTTTTTTTCCTTGTG*CCATTTCGC
TCGTCCGGTTCAAGCTCAAACAACAACACTCAGAACCGTGGGGGCACAACAAGAAGAAAC
TCGGACACGACAGATGAGAACCAAAACTATCATTACCAGCAACATCGACAACAGTCACAT
ATGGGTTACAGTGGCTGGCCTTTTGATTACTAAAGGTGAGCTAAAGTAATAAAAACTTTG
GTCTCACTATCTATTATGGCTTGTGATTTTGCGCTTTCTACTCTTTTATCTGTCTCCTCT
CACTCTCCTGTCAACATAAATAAAACAGGGAACAAATGTTACTGTTG
GGC

QA 1 407 1 407
DS 

RD RS1CK85JQ 502 0 0
ACATCTATCATTCTGACTGTATCGTCCCCTGGCTGGTTCAGCACAACTCATGCCCTGTCT
GTCGCCAAGAGCTGCCATCAGTTAGAGTGTCCTCAAGCAATGAAAACAGAAGTACCACAA
CCAGAAACTACAGAAGTAGCAATGAAAGGAGGAACCCTTTCTCTTCCTTGTGGCCATTTC
GCTCGTCCGGTTCAAGCTCAAACAACAACACTCAGAACCGTGGGGGCACAACAAGAAGAA
ATTCGGACACAACAGATGAGAACCAAAACTATCATTACCAGCAACATCAACAACAGTCAC
ATATGGGTTACAGTGGCTGGCCTTTTGATTACTAAAGGTGAGCTAAAGTAATAAAAACTT
TGGTCTCACTATCTATTATGGCTTGTGATTTTGCGCTTTTTACTCTTTTATCTGTCTCCT
CTCACTCTCCTGTCAACATAAATAAAACAGAGAACAAATGTTACTGTTGATTTTGTGCAT
GTGTAAAACCTGCTTTATGTCA

QA 1 502 1 502
DS 



AS 1 5

CO CL1733Contig1 1022 5 9 U
GGGGCTTCGGTTCTGACTTGAAAACAAAGAAATCACCCATTCTAAGTTCGATTCGATCCT
TGCTCAAATCGAGTTCGCTCAAATCAAACTAAAGAAAAGAGAAGATGAGTAGCATTGGAA
CTGGATACGATCTGTCGGTGACGACTTTCTCACCCGATGGGCGGGTTTTCCAGATCGAGT
ACGCCGCCAAAGCTGTCGACAACAGTGGAACCGTTGTTGGAATCAAGTGCAAGGACGGGA
TTGTTATGGGTGTGGAGAAACTTATAGCATCAAAGATGATGCTACCAGGATCCAACAGGA
GAATCCATTCTGTTCATCGTCATGCTGGCATGGCTGTTGCTGGGCTTGCTGCTGACGGCA
GGCAAATTGTTGCAAGGGCCAAATCTGAAGCCAGAAGTTACGAAAGTGTTTATGGGGACG
CTGTACCAGTGAAGGAACTTTCAGAGCGTGTTGCAAGCTACGTTCATTTGTGTACCCTTT
ATTGGTGGCTCAGGCCTTTTGGATGTGGGGTCATTCTTGGTGGTTATGATAAAGATGGTC
CTCAATTGTACATGATTGAGCCATCCGGGATATCATACAGATATTTTGGTGCTGCGATTG
GCAAAGGCAAACAAGCTGCTAAAACGGAAATTGAGAAACTGAAATTATCTGAGATGACAT
GCAAAGAAGGCGTTATTGAAGTGGCGAAAATCATTTACAAGCTACATGATGAAGCCAAAG
ACAAGGCATTTGAATTGGAGATGAGCTGGATATGTGAGGAGTCTAAACGAGAGCATCAGA
AGGTCCCTGATGATCTTCTGGAAGAAGCAAAGACGGCAGCTAAAACTGCACTCGAGGAGA
TGGATGCTGACTAAACTGAGGAAAAATGGGTCAAATTAGTTTTTTTTTTTGTTTAATGCA
ACGTTTGGTCGTGTTCTGTTGTAAGACCTTGAATTGTGTCTCTAGGGGCAATTTGTTGCA
GTTTCTCATGAAACCTTTGGACTCTTTCGTCATTATTGATATCGACAGTTTCTTCTACGA
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 20 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1C578TF U 1
AF RS1CV07TF U 63
AF RS1B130TF U 70
AF RS1C578JQ C 126
AF RS1B130JQ C 106
BS 1 591 RS1C578TF
BS 592 615 RS1CV07TF
BS 616 616 RS1B130TF
BS 617 668 RS1CV07TF
BS 669 669 RS1B130TF
BS 670 758 RS1CV07TF
BS 759 954 RS1B130JQ
BS 955 955 RS1C578JQ
BS 956 1022 RS1B130JQ

RD RS1C578TF 591 0 0
GGGGCTTCGGTTCTGACTTGAAAACAAAGAAATCACCCATTCTAAGTTCGATTCGATCCT
TGCTCAAATCGAGTTCGCTCAAATCAAACTAAAGAAAAGAGAAGATGAGTAGCATTGGAA
CTGGATACGATCTGTCGGTGACGACTTTCTCACCCGATGGGCGGGTTTTCCAGATCGAGT
ACGCCGCCAAAGCTGTCGACAACAGTGGAACCGTTGTTGGAATCAAGTGCAAGGACGGGA
TTGTTATGGGTGTGGAGAAACTTATAGCATCAAAGATGATGCTACCAGGATCCAACAGGA
GAATCCATTCTGTTCATCGTCATGCTGGCATGGCTGTTGCTGGGCTTGCTGCTGACGGCA
GGCAAATTGTTGCAAGGGCCAAATCTGAAGCCAGAAGTTACGAAAGTGTTTATGGGGACG
CTGTACCAGTGAAGGAACTTTCAGAGCGTGTTGCAAGCTACGTTCATTTGTGTACCCTTT
ATTGGTGGCTCAGGCCTTTTGGATGTGGGGTCATTCTTGGTGGTTATGATAAAGATGGTC
CTCAATTGTACATGATTGAGCCATCCGGGATATCATACAGATATTTTGGTG

QA 1 591 1 591
DS 

RD RS1CV07TF 714 0 0
GGGATTCGATCCTT
GCTCAAATCAAACTAAAGAAAAGAGAAGATGAGTAGCATTGGAACTGGATACGATCTGTC
GGTGACGACTTTCTCACCCGATGGGCGTGTTTTCCAGATCGAGTACGCCGCCAAAGCTGT
CGACAACAGTGGAACCGTTGTTGGAATCAAGTGCAAGGACGGGATTGTTATGGGTGTGGA
GAAACTTATAGCATCAAAGATGATGCTACCAGGATCTAACAGGAGAATCCATTCTGTTCA
TCGTCATGCTGGCATGGCTGTTGCTGGGCTTGCTGCTGACGGCAGGCAAATTGTTGCAAG
GGCCAAATCTGAAGCCAGAAGTTACGAAAGTGTTTATGGGGACGCTGTACCAGTGAAGGA
ACTTTCAGAGCGTGTTGCAAGCTACGTTCATTTGTGTACCCTTTATTGGTGGCTCAGGCC
TTTTGGATGTGGGGTCATTCTTGGTGGTTATGATAAAGATGGTCCTCAATTGTACATGAT
TGAGCCATCCGGGATATCATACAGATATTTTGGTGCTGCGATTGGCAAAGGCAAACAAGT
TGCTAAAACGGAAATTGAGAAACTGAAATTATCTGAGATGACATGCAAAGAAAGCGTTAT
TGAAGTGGCGAAAATCATTTACAAGCTACATGATGAAGCCAAAGACAAGGCATTTGAATT
GGAGATGAGCTGGATATGTGAG
GAGTCTAAACGAGAGCAT

QA 15 696 15 696
DS 

RD RS1B130TF 706 0 0
GGAGTTC
GCTCAAATCAAACTAAAGAAAAGAGAAGATGAGTAGCATTGGAACTGGATACGATCTGTC
GGTGACGACTTTCTCACCCGATGGGCGGGTTTTCCAGATCGAGTACGCCGCCAAAGCTGT
CGACAACAGTGGAACCGTTGTTGGAATCAAGTGCAAGGACGGGATTGTTATGGGTGTGGA
GAAACTTATAGCATCAAAGATGATGCTACCAGGATCCAACAGGAGAATCCATTCTGTTCA
TCGTCATGCTGGCATGGCTGTTGCTGGGCTTGCTGCTGACGGCAGGCAAATTGTTGCAAG
GGCCAAATCTGAAGCCAGAAGTTACGAAAGTGTTTATGGGGACGCTGTACCAGTGAAGGA
ACTTTCAGAGCGTGTTGCAAGCTACGTTCATTTGTGTACCCTTTATTGGTGGCTCAGGCC
TTTTGGATGTGGGGTCATTCTTGGTGGTTATGATAAAGATGGTCCTCAATTGTACATGAT
TGAGCCATCCGGGATATCATACAGATATTTTGGTGCTGCGATTGGCAAAGGCAAACAAGC
TGCTAAAACGGAAATTGAGAAACTGAAATTATCTGAGATGACATGCAAAGAAGGCGTTAT
TGAAGTGGCGAAAATCATTTACAAGCTACATGATGAAGCCAAAGACAAG*CATTTGAATT
GGAGATGAGCTGGATATGTGAG
AGTCTAACGAGAGCATC

QA 8 689 8 689
DS 

RD RS1C578JQ 850 0 0
TACGATCTGTCGGTGACGACTTTCTCACCCGATGGGCGGG*TTTCCAGATCGAGTACGCC
GCCAAAGCTGTCGACAACAGTGGAACCGTTGTTGGAATCAAGTGCAAGGACGGGATTGTT
ATGGGTGTGGAGAAACTTATAGCATCAAAGATGATGCTACCAGGATCCAACAGGAGAATC
CATTCTGTTCATCGTCATGCTGGCATGGCTGTTGCTGGGCTTGCTGCTGACGGCAGGCAA
ATTGTTGCAAGGGCCAAATCTGAAGCCAGAAGTTACGAAAGTGTTTATGGGGACGCTGTA
CCAGTGAAGGAACTTTCAGAGCGTGTTGCAAGCTACGTTCATTTGTGTACCCTTTATTGG
TGGCTCAGGCCTTTTGGATGTGGGGTCATTCTTGGTGGTTATGATAAAGATGGTCCTCAA
TTGTACATGATTGAGCCATCCGGGATATCATACAGATATTTTGGTGCTGCGATTGGCAAA
AGCAAACAAGCTGCTAAAACGGAAATTGAGAAACTGAAATTATCTGAGATGACATGCAAA
GAAGGCGTTATTGAAGTGGCGAAAATCATTTACAAGCTACATGATGAAGCCAAAGACAAG
GCATTTGAATTGGAGATGAGCTGGATATGTGAGGAGTCTAAACGAGAGCATCAGAAGGTC
CCTGATGATCTTCTGGAAGAAGCAAAGACGGCAGCTAAAACTGCACTCGAGGAGATGGAT
GCTGACTAAACTGAGGAAAAATGGGTCAAATTAGTTTTTTTT***GTTTAATGCAACGTT
TGGTCGTGTTCTGTTGTAAGACCTTGAATTGTGTCTCTAGGGGCAATTTGTTGCAGTTTC
TCATGAAACC

QA 1 850 1 850
DS 

RD RS1B130JQ 917 0 0
GAGATGAGTAGCATGACT
GATACGATCTGTCGGTGACGACTT*CTCACCCGATGG*CGG**TTTCCAGATCGAGTACG
CG**CAAAGCTGTCGACAACAGTGGAACCGTG**TGGGATCAAGTGCAAGGACGGGATTG
TTATGGGTGTGGAGAAACTTATAGCATCAAAGATGATGCTACCAGGATCCAACAGGAGAA
TCCATTCTGTTCATCGTCATGCTGGCATGGCTGTTGCTGGGCTTGCTGCTGACGGCAGGC
AAATTGTTGCAAGGGCCAAATCTGAAGCCAGAAGTTACGAAAGTGTTTATGGGGACGCTG
TACCAGTGAAGGAACTTTCAGAGCGTGTTGCAAGCTACGTTCATTTGTGTACCCTTTATT
GGTGGCTCAGGCCTTTTGGATGTGGGGTCATTCTTGGTGGTTATGATAAAGATGGTCCTC
AATTGTACATGATTGAGCCATCCGGGATATCATACAGATATTTTGGTGCTGCGATTGGCA
AAGGCAAACAAGCTGCTAAAACGGAAATTGAGAAACTGAAATTATCTGAGATGACATGCA
AAGAAGGCGTTATTGAAGTGGCGAAAATCATTTACAAGCTACATGATGAAGCCAAAGACA
AGGCATTTGAATTGGAGATGAGCTGGATATGTGAGGAGTCTAAACGAGAGCATCAGAAGG
TCCCTGATGATCTTCTGGAAGAAGCAAAGACGGCAGCTAAAACTGCACTCGAGGAGATGG
ATGCTGACTAAACTGAGGAAAAATGGGTCAAATTAGTTTTTTTTTTTGTTTAATGCAACG
TTTGGTCGTGTTCTGTTGTAAGACCTTGAATTGTGTCTCTAGGGGCAATTTTTTGCAGTT
TCTCATGAAACCTTTGGACTCTTTCGTCATTATTGATATCGACAGTTTCTTCTACGACC

QA 19 917 19 917
DS 



AS 1 4

CO CL1734Contig1 595 4 9 U
GGGATTCCAAAGCAGAGCTTCAGCGATCTTCCTCCTCCTCTGGTTTCGTATCTAAATCTG
ATTTGGTGAACGAGATGGGTTTCATAATGGAGTTTGCGGAGAATCTGGTGCTGAGGTTGA
TGGAGGATCCGGAGGTGAGAGACAGGAAGGCGAGGGAGCACATATATGAGATGCACGAGA
GGTGCAAGAAGATTAAGGAGATGTGGGCTTTGCCTATTCGTCCTTACGGTTTCTGGACGT
TTGAGCGTCACAACGCTCAGCTTCGTTGGGATCCTCAGATCAGTCAGGTTGCTGGTCGCA
GGGATCCTTATGATGATCTCCTCCAGGACCATCCTTCTTCTTCATCTTCAGACTGATCGA
ACAGTGAACGAAGACGTCTTATGATACTGTCTTGAAGGATGCGTATGTCTCCCTTTGTTT
CTTTTTTTTTTTGTTCTTCAGGTGCCTGGAAGCTTGGTACAAACTCAAATAATAACACTC
TTGAAGACTTGTTTTCAAATGAGAGAGTACTCATTGTTTCTTAGTAAAGCTGTTTTGATT
CTCTACTTGCATCTTTGTTATGAATATACTTTCTGAAATGTGATAATTTTTTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RS1DZ04JQ C 1
AF RS1FZ53JQ C 57
AF RS1FG60TF U 12
AF RS1DZ04TF U 1
BS 1 13 RS1DZ04TF
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BS 209 209 RS1DZ04TF
BS 210 287 RS1FG60TF
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BS 289 431 RS1FG60TF
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RD RS1DZ04JQ 595 0 0
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TTGAGCGTCACAACGCTCAGCTTCGTTGGGATCCTCAGATCAGTCAGGTTGCTGGTCGCA
GGGATCCTTATGATGATCTCCTCCAGGACCATCCTTCTTCTTCATCTTCAGACTGATCGA
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CTTTTTTTTTTTGTTCTTCAGGTGCCTGGAAGCTTGGTACAAACTCAAATAATAACACTC
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CTCTACTTGCATCTTTGTTATGAATATACTTTCTGAAATGTGATAATTTTTTTCC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RS1FZ53JQ 539 0 0
ATTTGGGGAAC
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TCCGGAGGTGAGAGACAGGAAGGCGAGGGAGCACATATATGAGACGAACGAGAGGTGCAA
GAAGATTAAGGAGATGTGGGCTTTGCCTATTCGTCCCTACGGTTTCTGGACGTTTGAGCG
TCACAACGCTCAGCTTCGTTGGGATCCTCAGATCAGTCAGGTTGCTGGTCGCAGGGATCC
TTATGATGATCTCCTCCAGGACCATCCTTTTTTTTCATTTTCAGACTGATCGAACAGTGA
ACGAAGACGTCTTATGATACTGTCTTGAAGGATGCGTATGTCTCCCTTTGTTTCTTTTTT
TTTTTGTTCTTCAGGTGCCTGGAAGCTTGGTACAAACTCAAATAATAACACTCTTGAGGA
CTTGTTTTCAAATGAGAGAGTACTCATTGTTTCTTAGTAAAGCTGTTTTGATTCTCTACT
TGCATCTTTGTTATGAATATACTTTCTGAAATGTGATAATTTTTTTC
T

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DS 

RD RS1FG60TF 584 0 0
GG
AGAGCTTCAGCGATCTTCCTCCTCCTCTGGTTTCGTATCTAAATCTGATTTGGTGAACGA
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GGTGAGAGACAGGAAGGCGAGGGAGCACATATATGAGATGCACGAGAGGTGCAAGAAGAT
TAAGGAGATGTGGGCCTTGCCTATTCGTCCTTACGGTTTCTGGACGTTTGAGCGTCACAA
CGCTCAGCTTCGTTGGGATCCTCAGATCAGTCAGTTTGCTGGTCGCAGGGATCCTTATGA
TGATCTCCTCCAGGACCATCCTTCTTCTTCATCTTCAGACTGATCGAACAGTGAACGAAG
ACGTCTTATGATACTGTCTTGAAGGATGCGTATGTCTCCCTTTGTTTCTTTTTTTTTT*G
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TTCAAATGAGAGAGTACTCATTGTTTCTTAGTAAAGCTGTTTTGATTCTCTACTTGCATC
TTTGTTATGAATATACTTTCTGAAATGTGATAATTTTTTTC
G

QA 3 583 3 583
DS 

RD RS1DZ04TF 595 0 0
GGGATTCCAAAGCAGAGCTTCAGCGATCTTCCTCCTCCTCTGGTTTCGTATCTAAATCTG
ATTTGGTGAACGAGATGGGTTTCATAATGGAGTTTGCGGAGAATCTGGTGCTGAGGTTGA
TGGAGGATCCGGAGGTGAGAGACAGGAAGGCGAGGGAGCACATATATGAGATGCACGAGA
GGTGCAAGAAGATTAAGGAGATGTGGGCTTTGCCTATTCGTCCTTACGGTTTCTGGACGT
TTGAGCGTCACAACGCTCAGCTTCGTTGGGATCCTCAGATCAGTCAGGTTGCTGGTCGCA
GGGATCCTTATGATGATCTCCTCCAGGACCATCCTTCTTCTTCATCTTCAGACTGATCGA
ACAGTGAACGAAGACGTCTTATGATACTGTCTTGAAGGATGCGTATGTCTCCCTTTGTTT
CTTTTTTTTTTTGTTCTTCAGGTGCCTGGAAGCTTGGTACAAACTCAAATAATAACACTC
TTGAAGACTTGTTTTCAAATGAGAGAGTACTCATTGTTTCTTAGTAAAGCTGTTTTGATT
CTCTACTTGCATCTTTGTTATGAATATACTTTCTGAAATGTGATAATTTTTTTC
C

QA 1 594 1 594
DS 



AS 1 5

CO CL1735Contig1 927 5 4 U
GGATGCATATAAAAAAACACTAAGATAAGTATATATAAAGAAAAAAATGCTTGACAAACT
TATCGGAGGGCATAGGTATGGCAACGGGTACGGCCACAAGGACCACAGAAGCAGCGGCTA
TGCCTTCCAGGAGCACAAGAAATTCATGTCTTACGAGGAGTCAGAAGGAGGATACTTTGA
CCGTCAATCCCGCTACGATCACCACATGAGGCTTCCGGCCAACTACGGCCGTCCACCCAT
GGCTCACATGCCTGTCTTTGATGAAGAAGACTCAGACTCAGACGTAGAGGATTTCTATAA
GAGCAGCCAGAGCCACCGCACTACGGTGCTGCCAAATCACGGCAAAAACCACCACCAACA
GCCACCTCATATGAACTTCATGACCCTACCTCCGATGACTCAATTTCACCACAATGGAAA
GATGGGTAATGGATGGCAGGGGATGCATGAAGATGCATATCATGGAGGATACGGGATGCA
GCAACACGGTGCGCAAGGGATGGAGCACCAGGACAGGCTTATGGCTCCTCAGGTTCCACC
ACATCATGTCTACATGAACCCCAGCCATGGCAGTGGCAGTGGCCATGCAGTTATGTTCAA
CGCTTCGGAGAACTGGCGATTCAGCAACTATAGCGGCGGCCACCACAAAGCCGGGTGGAG
GAATAAGGGACTCTGACCCAACTATGCCGGTTTAAAAAGAAGTAATGATTATGTATGCTA
AATAATAAAATTATAAGTAAGATGTGTGCGTGATAAACATATTTCAGTATCGTACTAAAA
CCAAACAAGGGACTTTAGCAAAAAGAAACAAAGTGTTCTTGTTTGATGAACTTATAATTA
GTAAGGAGTGTTGTTGCTGTGTATCTAATATATCAATACTATTAAAACAGGTGATCTTTT
TTTGAGGTGACCTTCTATTTCAATATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 30 30 30 30 30 30 30 
0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BQ72JQ C 403
AF RS1GQ48TF U 1
AF RS1BQ72TF U 1
AF RS1G016TF U 1
AF RS1GQ48JQ C 301
BS 1 592 RS1BQ72TF
BS 593 593 RS1G016TF
BS 594 686 RS1BQ72TF
BS 687 927 RS1GQ48JQ

RD RS1BQ72JQ 209 0 0
ATTTCACCACAATGGAAAGATGGGTAATGGATGGCAGGGGATGCATGAAGATGCATATCA
TGGAGGATACGGGATGCAGCAACACGGTGGGCAAGGGATGGAGCACCAGGACAGGCTTAT
GGCTCCTCAGGTTCCACCACATCATGTTTACATGAACCCCAGCCATGGCAGTGGCAGTGG
CCATGCAGTTGTGTTCAA
GGTTTTGGAGA

QA 1 198 1 198
DS 

RD RS1GQ48TF 596 0 0
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GCCACCTCATATGAACTTCATGACCCTACCTCCGATGACTCAATTTCACCACAATGGAAA
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GCAACACGGTGCGCAAGGGATGGAGCACCAGGACAGGCTTATGGCTCCTCAGGTTCCACC
ACATCATGTCTACATGAACCCCAGCCATGGCAGTGGCAGTGGCCATGCAGTT
ATGT

QA 1 592 1 592
DS 

RD RS1BQ72TF 686 0 0
GGATGCATATAAAAAAACACTAAGATAAGTATATATAAAGAAAAAAATGCTTGACAAACT
TATCGGAGGGCATAGGTATGGCAACGGGTACGGCCACAAGGACCACAGAAGCAGCGGCTA
TGCCTTCCAGGAGCACAAGAAATTCATGTCTTACGAGGAGTCAGAAGGAGGATACTTTGA
CCGTCAATCCCGCTACGATCACCACATGAGGCTTCCGGCCAACTACGGCCGTCCACCCAT
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GCCACCTCATATGAACTTCATGACCCTACCTCCGATGACTCAATTTCACCACAATGGAAA
GATGGGTAATGGATGGCAGGGGATGCATGAAGATGCATATCATGGAGGATACGGGATGCA
GCAACACGGTGCGCAAGGGATGGAGCACCAGGACAGGCTTATGGCTCCTCAGGTTCCACC
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CGCTTCGGAGAACTGGCGATTCAGCAACTATAGCGGCGGCCACCACAAAGCCGGGTGGAG
GAATAAGGGACTCTGACCCAACTATG

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1G016TF 662 0 0
GGATGCATATAAAAAAACACTAAGATAAGTATATATAAAGAAAAAAATGCTTGACAAACT
TATCGGAGGGCATAGGTATGACAACGGGTACGGCCACAAGGACCACAGAAGCAGCGGCTA
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CCGTCAATCCCGCTACGATCACCACATGAGGCTTCCGGCCAACTACGGCCGTCCACCCAT
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GCAACACGGTGCGCAAGGGATGGAGCACCAGGACAGGCTTATGGCTCCTCAGGTTCCACC
ACATCATGTCTACATGAACCCCAGCCATGGCAGTGGCAGTGGCCATGCAGTTATGTTCAA
*GCTTCGGAGAACTGGCGATTCAGCAACTATAGCGGCGGCCACCACAAAGCCGGGTGGAG
GA

QA 1 662 1 662
DS 

RD RS1GQ48JQ 627 0 0
GAGCAGCCAGAGCCACCGCACTACGGTGCTGCCAAATCACGGCAAAAACCACCACCAACA
GCCACCTCATATGAACTTCATGACCCTACCTCCGATGACTCAATTTCACCACAATGGAAA
GATGGGTAATGGATGGCAGGGGATGCATGAAGATGCATATCATGGAGGATACGGGATGCA
GCAACACGGTGCGCAAGGGATGGAGCACCAGGACAGGCTTATGGCTCCTCAGGTTCCACC
ACATCATGTCTACATGAACCCCAGCCATGGCAGTGGCAGTGGCCATGCAGTTATGTTCAA
GGCTTCGGAGAACTGGCGATTCAGCAACTATAGCGGCGGCCACCACAAAGCCGGGTGGAG
GAATAAGGGACTCTGACCCAACTATGCCGGTTTAAAAAGAAGTAATGATTATGTATGCTA
AATAATAAAATTATAAGTAAGATGTGTGCGTGATAAACATATTTCAGTATCGTACTAAAA
CCAAACAAGGGACTTTAGCAAAAAGAAACAAAGTGTTCTTGTTTGATGAACTTATAATTA
GTAAGGAGTGTTGTTGCTGTGTATCTAATATATCAATACTATTAAAACAGGTGATCTTTT
TTTGAGGTGACCTTCTATTTCAATATT

QA 1 627 1 627
DS 



AS 2 4

CO CL1736Contig1 1572 2 6 U
GGAAGCAAAAAAAAAACGGAAAAAAGAGAGAAAGCATATCGGAGAAGACGACGGAGAAGC
TTGTGAGAGGAGGAGATGTCGACGATCTACGTGCTAGAGCCACCGACGAAGGGAAAGGTC
ATCGTGAATACAACTCATGGCCCAATCGACATCGAGCTATGGCCTAAGGAAGCCCCCAAA
TCAGTGCGGAACTTCGTTCAGCTCTGCCTCGAGGGTTACTTCGACGACACCATCTTCCAC
CGTGTTATTCCCGGGTTCCTCGTCCAAGGCGGAGATCCCACCGGCTCCGGCACAGGTGGA
GAGAGCATATACGGAGGTGTATTTGCGGATGAGTTTCATTCGAGGCTGAGATTTAACCAC
CGTGGGATTGTGGCTATGGCTAATGAGAGCTCGCCGAATACTAATGGAAGTCAGTTCTTT
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GGTGATTCAATCTTCAATCTTCTGAGACTAGGAGAGATTGACACTGGTAAAGATGATCGT
CCCCTGGATCCTGCCCCCAAAATTTTATCTGTTGAACGATCCTCGACTATTGAAGGCAGA
AGCTACAAATACAGAACGGAATGCACCTGACTCGAAGGAGTTGCTATCTGTGCGGGAAGC
TCTGGGTTCTAAGAAAGAAAGCGCTCAAAAAGAGAAAAGCTGGCCTGTATCCGATCCAGT
TGGACATAGTGATGATGACGATGATGATGGAGATGAGACTAAGTTTGATGCAAAGATGAG
GAATCAAGTGCTTAGCAGAAGGAAAGAGATGGGAGATATTCCTCCAAAACCGACTCAGAA
AAAAAAGAGCTCTAGTGTGAAAGCCCCGGAAGAATCTACCAAAAGGTCTGATGTTGAAAG
TAGTGAGGATGAGAAACCGAAGATGGAAAAGTTATCACTGAAGAAAAAGGGAATAGGTTC
AGAAGCCAAAGCCGAACGGTTGGAAAATGGAGACGCTGATTTACAGCTTTACAACGCTTC
TGAACGCGTCCGACAGCTACACAAGTTGAAGAAGCGCAGAATGCAAGGAAACGAGGATGC
TGTGTTGGCGAAACTCGAGAAATTTAAGCAGTCCATTTCCGCAAAACCGTTTGGCTCGAG
TAGTAGTGAACCAGGAGGAGGCAATATAGAGGAGGAAGATGTCTCTGATTGGAAGAAAGT
AAAGCTCAAGTTTGCACCCGAGCATGGCAAGTCTCGCAAGGATGATCCAGATGCGTACGT
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AAAACGAAAGGAACGAGAATGGTCAGGAAAGTCTCTTGCCTGAATGTTGGAAAAATCTGA
ATTCGACCACCATCAAAGGCTGAATCAAAATTTGGAGGTTAGACACTTTTCAGATGCAAT
ACATGTACTACTTTTTGGTTGTCTGAAAACTTATTCAATTTCCTCACTTTAAAAAATCAA
ATCTGTGATAGAACGTGTCTGTAGAAAGAATCTGGCATTGTCTTGCTATTAAAAGTGATG
TTTCATAGTTAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AA16TF U 1
AF RS1AA16JQ C 647
BS 1 773 RS1AA16TF
BS 774 774 RS1AA16JQ
BS 775 799 RS1AA16TF
BS 800 800 RS1AA16JQ
BS 801 819 RS1AA16TF
BS 820 1572 RS1AA16JQ

RD RS1AA16TF 823 0 0
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TTGTGAGAGGAGGAGATGTCGACGATCTACGTGCTAGAGCCACCGACGAAGGGAAAGGTC
ATCGTGAATACAACTCATGGCCCAATCGACATCGAGCTATGGCCTAAGGAAGCCCCCAAA
TCAGTGCGGAACTTCGTTCAGCTCTGCCTCGAGGGTTACTTCGACGACACCATCTTCCAC
CGTGTTATTCCCGGGTTCCTCGTCCAAGGCGGAGATCCCACCGGCTCCGGCACAGGTGGA
GAGAGCATATACGGAGGTGTATTTGCGGATGAGTTTCATTCGAGGCTGAGATTTAACCAC
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TTCACTTTGGATAAGTGTGATTGGCTTGATAAGAAGCACACTATCTTTGGAAAGGTTACA
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CCCCTGGATCCTGCCCCCAAAATTTTATCTGTTGAACGATCCTCGACTATTGAAGGCAGA
AGCTACAAATACAGAACGGAATGCACCTGACTCGAAGGAGTTGCTATCTGTGCGGGAAGC
TCTGGGTTCTAAGAAAGAAAGCGCTCAAAAAGAGAAAAGCTGGCCTGTATCCGATCCAGT
TGGACATAGTGATGATGACGATGATGATGGAGATGAGACTAAGTTTGATGCAA*GATGAG
GAATCAAGTGCTTAGCAGA*GGAAAGAGATGGGAGATAT
CCTC

QA 1 819 1 819
DS 

RD RS1AA16JQ 926 0 0
TCTGTGCGGGAAGCTCTGGGTTCTAAGAAAGAAAGCGCTCAAAAAGAGAAAAGCTGGC*T
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GATGCAAAGATGAGGAATCAAGTGCTTAGCAGAAGGAAAGAGATGGGAGATATTCCTCCA
AAACCGACTCAGAAAAAAAAGAGCTCTAGTGTGAAAGCCCCGGAAGAATCTACCAAAAGG
TCTGATGTTGAAAGTAGTGAGGATGAGAAACCGAAGATGGAAAAGTTATCACTGAAGAAA
AAGGGAATAGGTTCAGAAGCCAAAGCCGAACGGTTGGAAAATGGAGACGCTGATTTACAG
CTTTACAACGCTTCTGAACGCGTCCGACAGCTACACAAGTTGAAGAAGCGCAGAATGCAA
GGAAACGAGGATGCTGTGTTGGCGAAACTCGAGAAATTTAAGCAGTCCATTTCCGCAAAA
CCGTTTGGCTCGAGTAGTAGTGAACCAGGAGGAGGCAATATAGAGGAGGAAGATGTCTCT
GATTGGAAGAAAGTAAAGCTCAAGTTTGCACCCGAGCATGGCAAGTCTCGCAAGGATGAT
CCAGATGCGTACGTTGTGGTTGACCCTCTTCTCGAAAAGGGAAAGGAAAAGTTCAACAGA
ATGCAAGCCAAACAAAAACGAAAGGAACGAGAATGGTCAGGAAAGTCTCTTGCCTGAATG
TTGGAAAAATCTGAATTCGACCACCATCAAAGGCTGAATCAAAATTTGGAGGTTAGACAC
TTTTCAGATGCAATACATGTACTACTTTTTGGTTGTCTGAAAACTTATTCAATTTCCTCA
CTTTAAAAAATCAAATCTGTGATAGAACGTGTCTGTAGAAAGAATCTGGCATTGTCTTGC
TATTAAAAGTGATGTTTCATAGTTAA

QA 1 926 1 926
DS 



CO CL1736Contig2 978 2 4 U
GGAAACGGAAAAAGAGAGAAAGCATATCGGAGAAGACGACGGAGAAGCTTGTGAGAGGAG
GAGATGTCGACGATCTACGTGCTAGAGCCACCGACGAAGGGAAAGGTCATCGTGAATACA
ACTCATGGCCCAATCGACATCGAGCTATGGCCTAAGGAAGCCCCCAAATCAGTGCGGAAC
TTCGTTCAGCTCTGCCTCGAGGGTTACTTCGACGACACCATCTTCCACCGTGTTATTCCC
CGGTTCCTCGTCCAAGGCGGAGATCCCACCGGCTCCGGCACAGGTGGAGAGAGTATATAC
GGAGGTGTATTTGCGGATGAGTTTCATTCGAGGCTGAGATTTAACCACCGTGGGATTGTG
GCTATGGCTAATGAGAGCTCGCCGAATACTAATGGAAGTCAGTTCTTTTTCACTTTGGAT
AAGTGTGATTGGCTTGATAAGAAGCACACTATCTTTGGAAAGGTTACAGGTGATTCAATC
TTCAATCTTCTGAGACTAGGAGAGATTGACACTGGTAAAGATGATCGTCCCCTGGATCCT
GCCCCCAAAATTTTATCTGTTGAGGTTTTGTGGAACCCTTTCGAAGATATTGTTCCTAGA
GTGCTAGCAAAGACATCGAATGCTGTTGCTGAAGTGAAGGAACCCCCAAAGAAGCCTGTC
AAGAAATTGGATTTACTGTCATTCGGAGAAGAAGCTGAGGAAGAGGAGAAGGAACTTGCA
GCTGTAAAGCAAAAGATTAAGAGCAGTCATGACGTGTTGAACGATCCTCGACTATTGAAG
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GAAGCTCTGGGTTCTAAGAAAGAAGCGCTCAAAAAGAGAAAAGCTGGCCTGTATCCGATC
CAGTTGGACATAGTGATGATGACGATGATGATGGAGATGAGACTAAGTTTGATGCAAAGA
TGAGGAATCAAGTGCTTA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AX48TF U 1
AF RS1BO09TF U 299
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AAGTGTGATTGGCTTGATAAGAAGCACACTATCTTTGGAAAGGTTACAGGTGATTCAATC
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DS 

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GATGAGTTTCATTCGAGGCTGAGATTTAACCACCGTGGGATTGTGGCTATGGCTAATGAG
AGCTCGCCGAATACTAATGGAAGTCAGTTCTTTTTCACTTTGGATAAGTGTGATTGGCTT
GATAAGAAGCACACTATCTTTGGAAAGGTTACAGGTGATTCAATCTTCAATCTTCTGAGA
CTAGGAGAGATTGACACTGGTAAAGATGATCGTCCCCTGGATCCTGCCCCCAAAATTTTA
TCTGTTGAGGTTTTGTGGAACCCTTTCGAAGATATTGTTCCTAGAGTGCTAGCAAAGACA
TCGAATGCTGTTGCTGAAGTGAAGGAACCCCCAAAGAAGCCTGTCAAGAAATTGGATTTA
CTGTCATTCGGAGAAGAAGCTGAGGAAGAGGAGAAGGAACTTGCAGCTGTAAAGCAAAAG
ATTAAGAGCAGTCATGACGTGTTGAACGATCCTCGACTATTGAAGGCAGAAGCTACAAAT
ACAGAACGGAATGCACCTGACTCGAAGGAGTTGCTATCTGTGCGGGAAGCTCTGGGTTCT
AAGAAAGAAGCGCTCAAAAAGAGAAAAGCTGGCCTGTATCCGATCCAGTTGGACATAGTG
ATGATGACGATGATGATGGAGATGAGACTAAGTTTGATGCAAAGATGAGGAATCAAGTGC
TTA

QA 18 680 18 680
DS 



AS 1 4

CO CL1737Contig1 1316 4 11 U
GAGTTCTTTTAGGGTTCTTCGGTGGCCTAGTTTTCGCATCAACCTCATACTTCATACCTT
GCATTATATGGTTGGTCATGAAGCGACCAAAACTATTTAGCTTCCATTGGTTTGCCTCTT
GGTTTGCAATAACAATTGGGGTCTTGATAGCAATTTTCGCGCCCATTGGAGGAATGAGAC
ACATTATCCTTTCAGCAAAAAGCTACAAGCTTTTTTCATAGGCTTTTAAGAAAGAAAAAA
ACAAAAGCAACCACCATCGCGTCAACTTTTTATAAAAGTTTTTTTCTATCATTTAATTTA
GCATAGTTTAGATATTTTGATTTTTTGGGGTTTTTTATTTTTCTTGCCTTCCTTTCATGG
AGTGTCATTTTTTTTTTTTTTTTCGCTAAAATCCTTCCGTCGAGAACTGCCTTCCGAATT
GCTTCTGGATATCCGTGAAAGCTTCTACGTGGTTCGGACCGAGGCTGTGACGGATGTTCT
CTCCAACCAGTCATTTGAAATCACCTTGCAAAGGAATACCATATGGTCTATAAATTTTCT
ACTGCAGTTAACGAATTAATTGGCTGTGTAGAATTCAAAGCTTTCTGGTTTTGGATCGTA
ATAAAACATCTGAATAATATGATTGGCTATCCGTTAATTTTGATGTTGAGTTTGTATCAA
ATTCGTATTCACCATCCTTAAAAAACGTGCGGTCTAGTATATCTTTCACAATGCAATTAA
TGAAAGATAGCAAAAGAGAATATGTAACTGCTAGTATGCTACATTACACTCTTTTCTATC
TTGGTCTTATAAGGTAATGATGACACCAAGCCTAGATTAATTATTCGAAGTAATCATTGT
TAGTATCGACCAATCCAATTGAGACACACCATATAACCAAACTACCACATGACATAATCC
CAAAAGAAAAATTAAAGGAGTTTGTCTCTTTGTCCCCTAAAGAAAACAAAAACCATAGTA
AAAACTGTAACGGTTCTCACTTGAGCAACTCAAATTAACACAATCCCATCACAATGACGA
CTAATCTCCACTTTCCGATTACCTTGAAACTCATTCTCTCTAGCTTAGCATCTCTCGTCG
TGATCACTCTCTTCTTCATCACCAGAACCGATTTCTCACCGTCTTCATTTCAGCCAGCGC
CGGCCAAAACTATCCAGATCTCCAGCTCCTCCACCAGAACTAAAGAACAGAGCGCAGACT
CCGTGAGTTGCGGTAAGATCCTTCCTTCGCTTGC*GACGCTCTCATCCACTACGCCGCCT
CCAACGTCACTCCTCAGCAAACACTCTCTGAAATCTCCGTCACCAAGAAGGTAACT


BQ
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AF RS1H078JQB C 1
AF RS1AX30JQ U 384
AF RS1ES38JQ U 385
AF RS1AX30TF C 684
BS 1 384 RS1H078JQB
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BS 1188 1208 RS1AX30JQ
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BS 1210 1247 RS1AX30JQ
BS 1248 1316 RS1AX30TF

RD RS1H078JQB 612 0 0
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GCATTATATGGTTGGTCATGAAGCGACCAAAACTATTTAGCTTCCATTGGTTTGCCTCTT
GGTTTGCAATAACAATTGGGGTCTTGATAGCAATTTTCGCGCCCATTGGAGGAATGAGAC
ACATTATCCTTTCAGCAAAAAGCTACAAGCTTTTTTCATAGGCTTTTAAGAAAGAAAAAA
ACAAAAGCAACCACCATCGCGTCAACTTTTTATAAAAGTTTTTTTCTATCATTTAATTTA
GCATAGTTTAGATATTTTGATTTTTTGGGGTTTTTTATTTTTCTTGCCTTCCTTTCATGG
AGTGTCATTTTTTTTTTTTTTTTCGCTAAAATCCTTCCGTCGAGAACTGCCTTCCGAATT
GCTTCTGGATATCCGTGAAAGCTTCTACGTGGTTCGGACCGAGGCTGTGACGGATGTTCT
CTCCAACCAGTCATTTGAAATCACCTTGCAAAGGAATACCATATGGTCTATAAATTTTCT
ACTGCAGTTAACGAATTAATTGGCTGTGTAGGATTCAAAGCTTTCTGGTCTTGGATCGTA
ATAAAACATCTG

QA 1 612 1 612
DS 

RD RS1AX30JQ 868 0 0
C
GCTAAAATCCTTCCGTCGAGAACTGCCTTCCGAATTGCTTCTGGATATCCGTGAAAGCTT
CTACGTGGTTCGGACCGAGGCTGTGACGGATGTTCTCTCCAACCAGTCATTTGAAATCAC
CTTGCAAAGGAATACCATATGGTCTATAAATTTTCTACTGCAGTTAACGAATTAATTGGC
TGTGTAGAATTCAAAGCTTTCTGGTTTTGGATCGTAATAAAACATCTGAATAATATGATT
GGCTATCCGTTAATTTTGATGTTGAGTTTGTATCAAATTCGTATTCACCATCCTTAAAAA
ACGTGCGGTCTAGTATATCTTTCACAATGCAATTAATGAAAGATAGCAAAAGAGAATATG
TAACTGCTAGTATGCTACATTACACTCTTTTCTATCTTGGTCTTATAAGGTAATGATGAC
ACCAAGCCTAGATTAATTATTCGAAGTAATCATTGTTAGTATCGACCAATCCAATTGAGA
CACACCATATAACCAAACTACCACATGACATAATCCCAAAAGAAAAATTAAAGGAGTTTG
TCTCTTTGTCCCCTAAAGAAAACAAAAACCATAGTAAAAACTGTAACGGTTCTCACTTGA
GCAACTCAAATTAACACAATCCCATCACAATGACGACTAATCTCCACTTTCCGATTACCT
TGAAACTCATTCTCTCTAGCTTAGCATCTCTCGTCGTGATCACTCTCTTCTTCATCACCA
GAACCGATTTCTCACCGTCTTCATTTCAGCCAGCGCCGGCCAAA*CTATCCAGATCTCCA
GCTCCTC*ACCAGAACTAAAGA*CAGAGCGCAGACTCCGTGAGT*GCGGTAAGATCCTTC
CTTCGCTTGC*GACGCTCTCATC
ACTA

QA 2 864 2 864
DS 

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GCTAAAATCCTTCCGTCGAGAACTGCCTTCCGAATTGCTTCTGGATATCCGTGAAAGCTT
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CTCGCAAAGGAATACCATATGGTCTATAAATTTTCTACTGCAGTTAACGAATTAATTGGC
TGTGTAGAATTCAAAGCTTTCTGGTTTTGGATCGTAATAAAACATCTGAATAATATGATT
GGCTATCCGTTAATTTTGATGTTGAGTTTGTATCAAATTCGTATTCACCATCCTTAAAAA
ACGTGCGGTCTAGTATATCTTTCACAATGCAATTAATGAAAGATAGCAAAAGAGAATATG
TAACTGCTAGTATGCTACATTACACTCTTTTCTATCTTGGTCTTATAAGGTAATGATGAC
ACCAAGCCTAGATTAATTATTCGAAGTAATCATAGTTAGTATCGACCAATCCAATTGAGA
CACACCATATAACCAAACTACCACATGACATAATCCCAAAAGAAAAATTAAAGGAGTTTG
TCTCTTTGTCCCCTAAAGAAAACAAAAACCATAGTAAAAACTGTAACGGTTCTCACTTGA
GCAACTCAAATTAACACAATCCCATCACAATGACGACTAATCTCCACTTTCCGATTACCT
TGAAACTCATTCTCTCTAGCTTAGCATCTCTCGTCGTGATCACTCTCTTCTTCATCACCA
GAGCCGATTTCTCACCGTCTTCATTTCAGCCAGCGCCGGCCAAAACTATCCAGATCTCCA
GCTCCTCCACCAGAACTAAAGAACAGAGCGCAGACTCCGTGAGTTGCGGTA*GATCCTTC
*TTCGCTTGC*GACGCTCTCATC
CACTACGCCG

QA 1 863 1 863
DS 

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GTAACTGCTAGTATGCTACATTACACTCTTTTCTATCTTGGTCTTATAAGGTAATGATGA
CACCAAGCCTAGATTAATTATTCGAAGTAATCATTGTTAGTATCGACCAATCCAATTGAG
ACACACCATATAACCAAACTACCACATGACATAATCCCAAAAGAAAAATTAAAGGAGTTT
GTCTCTTTGTCCCCTAAAGAAAACAAAAACCATAGTAAAAACTGTAACGGTTCTCACTTG
AGCAACTCAAATTAACACAATCCCATCACAATGACGACTAATCTCCACTTTCCGATTACC
TTGAAACTCATTCTCTCTAGCTTAGCATCTCTCGTCGTGATCACTCTCTTCTTCATCACC
AGAACCGATTTCTCACCGTCTTCATTTCAGCCAGCGCCGGCCAAAACTATCCAGATCTCC
AGCTCCTCCACCAGAACTAAAGAACAGAGCGCAGACTCCGTGAGTTGCGGTAAGATCCTT
CCTTCGCTTGCCGACGCTCTCATCCACTACGCCGCCTCCAACGTCACTCCTCAGCAAACA
CTCTCTGAAATCTCCGTCACCAAGAAGGTAACT

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 4

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GGACATCTTCCATTCTTCTTCTTCTTCTGTGTAGTAAAAGGTCTCATCAATAACCTCCTG
AGATGAAGCGTGAAGGCAAGCAACACGGTATGGTTAGAACCTACAGGATCCTGCCTCCGT
CGCTGAATCCAAGACCGCAAGCCAAGTTGGTCAATCCTTTGACCTGTCGTCCAACCGCCG
GGCTATTCACCAAAGTGTCATCTAAGCCGACCAATCACTCCAAGTTCACCGGAAAATGTG
GCCAGGCAAGGTGCCTTGAGTGCCATATGCATCCCATCACCAAGTCCAAAGTCAAAAGTA
AAGGCTCTTCTAAGGTGAGATCAAATGATATCACTTACAAGATGCTGACTTGGCAGGTTG
CTTCTGGTGGGCACAGACCCGGCTTGAAGCTTTCCGGGTTCTCGGCTACTGGACTTCTTG
ATCTTACGTCTGATGATTATGGTTATGATCATGATCATGAATCTGATGAAGAAGAAGAAG
AAGAAGAGGAGGAAGAAGAATACACAGGATGTGTTGTAGAGGAAATAGTGAATATACAGA
GTGGTGGTGATGGTGAAAAGGAAGAAGATGGGTCTCTTGATGATGATGTTGATGATGATG
ATGATGATGATGATGGAAGGATGAGTTTTTGTGATGTGGGGGTGATGATGATGGTTGATC
ATGTGGAAGTATTTGATGAAGGATGGTGTTTGGTTGAAGAAATGATGACTTAACTGATCT
CTTTGATTTATTCCCCCAAATCATTGTATTTCCTTTTGCTTTTGTAAATTGTTTTAATAA
ATTTGGGGATGAACGATTATTATCTATGTAAATGTGATTTATTATTTAAAAATCAAAAAC
TATGATTTGTAATTATAATAACTTCTGTAAAGTTGAAACATTTACTCTCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1B643TF U 1
AF RS1FU57JQ C 195
AF RS1AF30JQ C 453
AF RS1AF30TF U 648
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ATGTGGAAGTATT
TG

QA 1 673 1 673
DS 

RD RS1FU57JQ 681 0 0
GC
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TGAGTGCCATATGCATCCCATCACCAAGTCCAAAGTCAAAAGTAAAGGCTCTTCTAAGGT
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AAGGATGAGTTTTTGTGATGTGGGGGTGATGATGATGGTTGATCATGTGGAAGTATTCGA
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AATAACTTCTGTAAAGT
CG

QA 3 679 3 679
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GATT
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TGGGGGTGATGATGATGGTTGATCATGTGGAAGTATTTGATGAAGGATGGTGTTTGGTTG
AAGAAATGATGACTTAACTGATCTCTTTGATTTATTCCCCCAAATCATTGTATTTCCTTT
TGCTTTTGTAAATTGTTTTAATAAATTTGGGGATGAACGATTATTATCTATGTAAATGTG
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AACTTTTACTCTCAGC

QA 5 440 5 440
DS 

RD RS1AF30TF 245 0 0
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AAAAATCAAAAACTATGATTTGTAATTATAATAACTTCTGTAAAGTTGAAACATTTACTC
TCAGC

QA 1 245 1 245
DS 



AS 1 4

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AAACGGGTAACATTGGGAGCGGAACCACAACTCAGACACAAAGCGCTCCATTTATGTTTG
GGTCATCTGCATCAGCTCCTACATTTGGTTTGTCTGGGAACAACACCTCATCGAACAGTT
CCCCTTCAGTGTTTGCTTCTGGTTCAACCCCTCAACTGGGCTCGACAAATTCGTCTTCAA
GCTCTAGTGGTACAACTAGCTCTCCTCTGTTTGGGACGAACTGGCAAGCTCCCAAACCTG
CTCCAGCCTTTACTTCCTCATTCACCCCTTCCTCATCTCCAACATTTTCGTTTGGAGGAT
CATCTGCTGCTACCGCTTCAAGCGCTTCTGCTCCCATGACCTTTAGTTTCAACTCAACCG
CTCCTGCCATTCCTCAGCAGTCAGTATTTGGTAACTCAGCCCCCTCAGCGACTCCTCCCT
CGCCCTTTGGAAACTCAACCCCCTCGTTTGCGTTTGGTGCGACTGCTACACCACCAAATA
CTACAAACGGTTTCAACAATAATAACCAGCAAATGAGCATGGAGGACAGTATGGCAGAAG
ACACAGACCAAGCCAACAAAACATCCATGGTACAACAACCAGTGTTTGGACAACAGCCTG
TCTCAATGCCTCAACCAAGCTTTACCTTTGGAGGAGGAGCACCACCAGCAACGCCTCCAA
CAATGGCTAACCCGTTCCAGTTTGGTGGCCAGCCGATTGCAAGCACAGCGCCACAGAACG
CATCACCTTTCCAGGCATCACAGAGTCTAGAGTTCCAAGGAGGTGGGAGCTTCTCACTGG
GCAGCACTGGAGGAGGCGACAAGTCCGGGCGCAGAATCATCAAACCAAGGAAAAGCAACA
GAAAGAAGTAAAAGCGGTATGGATCATCACCAGTATACAACTCATGAAGAGTCTCATTTT
ATTTTACAGTCAGAACTTGGATTCGTCATGTTTTGATGGAAGAGGTAAAATGTCAAGATG
TGGGTTTTCATTTTATGCTTGTCTGTCATTTTCGTGTTAAAGAGTCAGGATTTGTGGGGT
TAAAATGTTGAGACTTATAAAGTTGGTTGGAAAGTTTTGTAATTTTTCAGAAAATACGGG
ATGTAAGAGTAGTAGGTTTGTCTAAAACTCTATTGCACTAGTGTTTTTGTAAGGCACAAC
AAATAGTCGAACTTTTCTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1CX80TF U 1
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CATCTGCTGCTACCGCTTCAAGCGCTTCTGCTCC
ATGACTTTGGTTTCACTCA

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G
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TACTTCCTCATTCACCCCTTCCTCATCTCCAACATTTTCGTTTGGAGGATCATCTGCTGC
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AAACTCAACCCCCTCGTTTGCGTTTGGTGCGACTGCTACACCACCAAATACTACAAACGG
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ATGGCTAACCCGTTCCAGTTTGGTGGCCAGCCGATTGCAAGCACAGCGCCACAGAACGCA
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AAGAAGTAAAAGCGGTATGGATCATCACCAGTATACAACTCATGAAGAGTCTCATTTTAT
TTTACAGTCAGAACTTGGATTCGTCATGTTTTTATGGAAGAGGTAAAATGTCAAGATGTG
GGTTTTCATTTTATGCTTGTCTGTCATTTTCGTGTTAAAGAGTCAGGATTTGTGGGGTTA
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ATAGTCG

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DS 

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TAATAACCAGCAAATGAGCATGGAGGACAGTATGGCAGAAGACACAGACCAAGCCAACAA
AACATCCATGGTACAACAACCAGTGTTTGGACAACAGCCTGTCTCAATGCCTCAACCAAG
CTTTACCTTTGGAGGAGGAGCACCACCAGCAACGCCTCCAACAATGGCTAACCCGTTCCA
GTTTGGTGGCCAGCCGATTGCAAGCACAGCGCCACAGAACGCATCACCTTTCCAGGCATC
ACAGAGTCTAGAGTTCCAAGGAGGTGGGAGCTTCTCACTGGGCAGCACTGGAGGAGGCGA
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TGGATCATCACCAGTATACAACTCATGAAGAGTCTCATTTTATTTTACAGTCAGAACTTG
GATTCGTCATGTTTTGATGGAAGAGGTAAAATGTCAAGATGTGGGTTTTCATTTTATGCT
TGTCTGTCATTTTCGTGTTAAAGAGTCAGGATTTGTGGGGTTAAAATGTTGAGACTTATA
AAGTTGGTTGGAAAGTTTTGTAATTTTTCAGAAAATACGGGATGTAAGAGTAGTAGGTTT
GTCTAAAACTCTATTGCACTAGTGTTTTTGTAAGGCACAACAAATAGTCGAACTTTTCTT

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DS 



AS 1 4

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CTCAACCGCAATGGCCGCCTCAACAATGGCTCTCTCCTCCCCTGCCTTCGCCGGAAAGGC
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GACCGTAGCCAAGCCAAATGGCCCATCAGGCAGCCCATGGTACGGATCCGAGAGAGTCAA
GTACTTGGGTCCATTCTCCGGCGAGCCACCGAGCTACCTTACCGGAGAGTTCCCCGGAGA
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CATCTTGGCTATTTGGGCTACTCAAGTGATCTTGATGGGAGCCGTTGAAGGTTACAGAGT
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ATTTGTATGATTTACCATTTAATCAAATAACTCTTTGTCTT


BQ
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AF RS1G527TF U 1
AF RS1CU41TF U 1
AF RS1CU41JQ C 195
AF RS1G527JQ C 365
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GACCGTAGCCAAGCCAAATGGCCCATCAGGCAGCCCATGGTACGGATCCGAGAGAGTCAA
GTACTTGGGTCCATTCTCCGGCGAGCCACCGAGCTACCTTACCGGAGAGTTCCCCGGAGA
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CATCTTGGCTATTTGGGCTACTCAAGTGATCTTGATGGGAGCCGTTGAAAGTTACAGAGT
CGCGGGTGATGGGCCGTTGGGAGAG*CCGAGGACTTGCT

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DS 

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TCTCCGGCGAGCCACCGAGCTACCTTACCGGAGAGTTCCCCGGAGACTACGGATGGGACA
CCGCCGGTCTCTCAGCCGATCCCGAGACGTTCGCGAGGAGCCGTGAGCTAGAAGTTATCC
ACTGCAGATGGGCCATGCTCGGAGCCCTAGGCTGTGTCTTCCCGGAACTGTTGGCCAGGA
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CTACCGACCCAGAGGCCTTTGCGGAGTTGAAGGTGAAGGAGATCAAGAACGGAAGATTGG
CTATGTTCTCTATGTTTGGATTCTTTGTTCAAGCTATTGTCACTGGTAAGGGACCTTTGG
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CCATTTAATCAAATAACTCTTTGTCTT

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DS 

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TTGGCCAGGAACGGTGTCAAGTTCGGAGAGGCGGTTTGGTTCAAGGCCGGTTCGCAGATC
TTCAG**AAGGAGGGCTTGATTACTTGGGAAACCCTAGCTTGGTTCATGCTCAGAGCATC
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GGTGATGGGCCGTTGGGAGAGGCCGAGGACTTGCTTTACCCAGGTGGCAGCTTTGACCCG
TTGGGTTTGGCTACCGACCCAGAGGCCTTTGCGGAGTTGAAGGTGAAGGAGATCAAGAAC
GGAAGATTGGCTATGTTCTCTATGTTTGGATTCTTTGTTCAAGCTATTGTCACTGGTAAG
GGACCTTTGGAGAATCTTGCTGACCATTTGGCTGATCCAGTCAACAACAATGCATGGGCT
TTTGCTACCAACTTTGTTCCCGGAAAGTGAGCAAAGTTTTTATCTGTAATTTGCTTCAGT
ATTTGCTTTGTGTTAAGGGGAGAAAGAGATGTTGTTTAGATGTAAAATTTGCAAGTATTT
GTATGATTTACCATTTAATCAAATAACTCTTTGTCTT

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DS 



AS 1 5

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AGAATAACACTATAACATATATTATATATAACATGAATAGGAAAAATGTTCTAAAGGATC
TTGATCAAATTTTAAGGTCAAATTATTCAACCAGTGCCTTGCTTCTTGGTCAAGTCACCA
TATCACTCGTCTACTCCTCTAGGCTGCAGCCCAAACCCTGCAGCATCCGATCTTTTCATA
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CAATCTCCATCTTTGTCTTCGTATATGGTCACGTATTCGCAGTTATCACCATCTTTCAAG
GCCACTCCAATGCCATGGAAACCGAAGAGCTTATCGAGAGCAAATGCTAAATCATCGTAA
CCTTGGCTCGAACCAAGATCCATCTTCCTCATGTAAGGCACACCATCCATGCTCACTTTC
ACATACCCTAACCCCACTCTCGTCGTTGAAACTTCCTTACAGCTGTTTTTCCTCCGGTAT
GAGCAAACTGGCGGCCATCCCACCACCTGACTTTTCGCAACCGGAGACTCATTAGCTTTC
TCTACGTCACAACCTGATGAAACGACGCCGCTTTCACATTGATTACTATTACTTCCCGAA
GACGTCATGATCATCTCCGTGAAACCTCTCTTCTTCATCATCTTCTCCGTCCCCGGAAGA
CCTAGTCTCAGCTCAGTTATCTCAAGCTCGAGTCCACCTTTCTCCATTTCTTAAATTTTT
TTTGTTATTCGATATAGTTATGAAATATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1B762JQ U 1
AF RS1B762TF C 108
AF RS1CO37JQ U 11
AF RS1CN38JQ U 29
AF RS1CN38TF C 101
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QA 1 392 1 392
DS 

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CGTCCCCGGAAGACCTAGTCTCAGCTCAGTTATCTCAAGCTCGAGTCCACCTTTCTCCAT
TTCTT
C

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1CO37JQ 790 0 0
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TTTAAGGTCAAATTATTCAACCAGTGCCTTGCTTCTTGGTCAAGTCACCATATCACTCGT
CTACTCCTCTAGGCTGCAGCCCAAACCCTGCAGCATCCGATCTTTTCATAATCCTCAACC
TCTTGCATGACTCTATGAACATTCCCCAAGGTACATCTCCCGCGAGCATCCAATCTCCAT
CTTTGTCTTCGTATATGGTCACGTATTCGCAGTTATCACCATCTTTCAAGGCCACTCCAA
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GATATAGTTA

QA 1 790 1 790
DS 

RD RS1CN38JQ 782 0 0
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AACCAGTGCCTTGCTTCTTGGTCAAGTCACCATATCACTCGTCTACTCCTCTAGGCTGCA
GCCCAAACCCTGCAGCATCCGATCTTTTCATAATCCTCAACCTCTTGCATGACTCTATGA
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TCACGTATTCGCAGTTATCACCATCTTTCAAGGCCACTCCAATGCCATGGAAACCGAAGA
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TCATGTAAGGCACACCATCCATGCTCACTTTCACATACCCTAACCCCACTCTCGTCGTTG
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CGCTTTCACATTGATTACTATTACTTCCCGAAGACGTCATGATCATCTCCGTGAAACCTC
TCTTCTTCATCATCTTCTCCGTCCCCGGAAGACCTGGTCTCAGCTCAGTTATCTCAAGCT
CGAGTCCACCTTTCTCCATTTCTTAAATTTTTTTTGTTATTCGATATAGTTATGAAATAT
CC

QA 1 782 1 782
DS 

RD RS1CN38TF 710 0 0
GAAAAATGTTCTAAAGGATCTTGATCAAATTTTAAGGTCAAATTATTCAACCAGTGCCTT
GCTTCTTGGTCAAGTCACCATATCACTCGTCTACTCCTCTAGGCTGCAGCCCAAACCCTG
CAGCATCCGATCTTTTCATAATCCTCAACCTCTTGCATGACTCTATGAACATTCCCCAAG
GTACGTCTCCCGCGAGCATCCAATCTCCATCTTTGTCTTCGTATATGGTCACGTATTCGC
AGTTATCACCATCTTTCAAGGCCACTCCAATGCCATGGAAACCGAAGAGCTTATCGAGAG
CAAATGCTAAATCATCGTAACCTTGGCTCGAACCAAGATCCATCTTCCTCATGTAAGGCA
CACCATCCATGCTCACTTTCACATACCCTAACCCCACTCTCGTCGTTGAAACTTCCTTAC
AGCTGTTTTTCCTCCGGTATGAGCAAACTGGCGGCCATCCCACCACCTGACTTTTCGCAA
CCGGAGACTCATTAGCTTTCTCTA*GTCACAACCTGATGAAACGACGCCGCTTTCACATT
GATTACTATTACTTCCCGAAGACGTCATGATCATCTCCGTGAAACCTCTCTTCTTCATCA
TCTTCTCCGTCCCCGGAAGACCTGGTCTCAGCTCAGTTATCTCAAGCTCGAGTCCACCTT
TCTCCATTTCTTAAATTTTTTTTGTTATTCGATATAGTTATGAAATATCC

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 3

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AAGGGGAAAAATTATACAGAGAAATATTTTTACTTGAGATGTCTCTAAAACTCACTTTTC
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AGCGACCGTGCGTTGTGAGATCCTTGAAGCCAACATGCTTCCTCCTACAACCGCCAGCGA
TGTACAAATTGTGTGTCCTACTGATGCCCCTATCGCCACTCCTATAGCGTTCTTGTGCGT
CGCCAAAGCTATTGTTGCAATCTGGCTACGGTCTCCCCATTCGGCTAGAAAGGTTAAGAT
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TGAATCAGATGACCTCCAAGCAATGTAGAGAAGTCGTAGACCAAAAAATGCATAGAGAAC
TGTAGCAGCGCTGTTAGTGTGCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BD77JQ U 5
AF RS1BD77TF C 5
AF RS1DD61JQ U 1
BS 1 12 RS1DD61JQ
BS 13 13 RS1BD77JQ
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BS 83 83 RS1BD77JQ
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RD RS1BD77JQ 227 0 0
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QA 3 227 3 227
DS 

RD RS1BD77TF 227 0 0
CG
AAAACAATGGCTTTGGATTACTTTGGTTTCGTCATCGAACCCATACAACAATCAAAGGGG
AAAAATTATACAGAGAAATATTTTTACTTGAGATGTCTCTAAAACTCACTTTTCGCAAGC
AAAGGAAAGAAGCACATTTAGAATGCAGAAATGTAGCATAGTGCAAAACAACTACAGTGG
AGGGTAGAAATAGGAAGAGACTGAAAAGCCGAGGAAGAGTAAGCC

QA 3 227 3 227
DS 

RD RS1DD61JQ 625 0 0
AAAGCAAAAACATTGGCTTTGGATTACTTTGGTTTCGTCATCGAACCCATACAACAATCA
AAGGGGAAAAATTATACAGAGAGATATTTTTACTTGAGATGTCTCTAAAACTCACTTTTC
GCAAGCAAAGGAAAGAAGCACATTTAGAATGCAGAAATGTAGCATAGTGCAAAACAACTA
CAGTGGAGGGTAGAAATAGGAAGAGACTGAAAAGCCGAGGAAGAGTAAGCCCCCAACAGT
AGCGACCGTGCGTTGTGAGATCCTTGAAGCCAACATGCTTCCTCCTACAACCGCCAGCGA
TGTACAAATTGTGTGTCCTACTGATGCCCCTATCGCCACTCCTATAGCGTTCTTGTGCGT
CGCCAAAGCTATTGTTGCAATCTGGCTACGGTCTCCCCATTCGGCTAGAAAGGTTAAGAT
GAAGGACTCTAGAAATATTGGGGTACAAAATCTTGAGAAAAATCGACGGAAGGGTGTCTT
CCCTTGGCCTGACTCAAGCTTCTCCTCAACTTCCTCCATTTCCTTCTTTTGATTCGACTT
TGAATCAGATGACCTCCAAGCAATGTAGAGAAGTCGTAGACCAAAAAATGCATAGAGAAC
TGTAGCAGCGCTGTTAGTGTGCTTC

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 4

CO CL1743Contig1 1024 4 40 U
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AAGCTGCTCGTATGTATCGAATGGAATGCGAGAAGGTTGATACGCTTATCTCTGGGGAGA
TTGACTGTGATGATCTCAGACGAAAGCTGTTGACTAACAAAGATAAACCCGCCATTCTTA
ATGTTAACATAGGTACAACGGTAAAAGGAGCCGTTGATGATCTCGACCTTGTTATCAAAA
CTCTTGAAGAGTGTGGGTTCTCACATGACAGGTTCTATATTCACTGCGATGGCGCTCTCT
TTGGACTTATGATGCCTTTTGTCAAACGTGCACCAAAAGTCACGTTCAATAAACCGATAG
GGAGTGTGAGTGTGTCAGGCCACAAATTTGTCGGGTGTCCAATGCCTTGTGGTGTTCAGA
TAACAAGGATGAAACACATCAAAGTCCTATCCAGCAACGTCGAGTACCTGGCGTCAAGGG
ATGCAACAATCATGGGAAGCAGAAACGGGCATGCTCCTCTGTTCCTTTGGTACACTCTAA
ACCACAAGGGCTACAAAGGGTTCCAGAAAGAAGTTCAGAAATGCCTGAGAAATACCCATT
ACCTTAAAGACAAACTCCGTGAATCTGGGATCAGCTCCATGCTCAACGAGCTTAGCAGCA
CTGTTGTCTTTGAAAGGCCCAAGGATGAAGAGTTCGTTAGGAGGTGGCAGCTCGCTTGCC
AAGGCGATATAGCTCATGTGGTGGTGATGCCGAGTGTTACAATCGAGAAGCTCGATCATT
TTGTGAAAGACCTGGTCGAACACAGATCGGTCTGGTGTAAGGACGGATCTCAAACACCAT
GCCTTGCAAAGGATGTAGGAACCAACAACTGCGCCTGTCCAGCTCACAAGTGAAGTGACC
GTGCTGTTTCACCATATGTTTTTGATTCCTTTGTTTCTGGTTTTTATTTCTATCCGTTGC
AGTCATGAATTTTTCGTAAAATTTTCCAGTTTCACTTCGTTATTAATAAAAGTCATATGA
TTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 15 30 
30 30 30 5 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 5 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RS1D608TF U 1
AF RS1D756TF U 170
AF RS1AR43TFB U 362
AF RS1AR43JQ C 448
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BS 204 269 RS1D608TF
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AAGCTGCTCGTATGTATCGAATGGAATGCGAGAAGGTTGATACGCTTATCTCTGGGGAGA
TTGACTGTGATGATCTCAGACGAAAGCTGTTGACTAACAAAGATAAACCCGCCATTCTTA
ATGTTAACATAGGTACAACGGTTAAAGGAGCCGTTGATGATCTCGACCTTGTTATCAAAA
CTCTTGAAGAGTGTGGGTTCTCACATGACTGGTTCTATATTCACTGCGATGGCGCTCTCT
TTGGACTTATGATGCCTTTTGTCAAACGTGCACCAAAAGTCACGTTCAATAAACCGATAG
GGAGTGTGAGTGTGTCGGGCCACAAATTCGTCGGGTGTCCAATGCCTTGTGGTGTTCAGA
TAACAAGAATGAAACACATCAAAGTCCTATCCAGCAACGTTGAGTACCTGGCGTCAAGGG
ATGCGACAATCATGGGAAGCAGAAACGGACATGCTCCTCTGTTCCTTTGGTACACTCTTA
ACCGCAAAGGCTACAAAGGATTCCAGAAGGAAGTTCAGAAGTGCCTGAGAAACGCCCATT
ACCTTAAAGACAGACTCCGTGAATCTGGGATCAGCGCCATGCTCAACGAGCTTAGCAGCA
CCGTTGTCTTTG

QA 1 672 1 672
DS 

RD RS1D756TF 620 0 0
G
GCCATTCTTAATGTTAACATAGGTACAACGGTAAAAGGAGCCGTTGATGATCTCGACCTT
GTTATCAAAACTCTTGAAGAGTGTGGGTTCTCACATGACAGGTTCTATATTCACTGCGAT
GGCGCTCTCTTTGGACTTATGATGCCTTTTGTCAAACGTGCACCTAAAGTCACGTTCAAT
AAACCGATAGGGAGTGTGAGTGTGTCAGGCCACAAATTTGTCGGGTGTCCAATGCCTTGT
GGTGTTCAGATAACAAGGATGAAACACATCAAAGTCCTATCCAGCAACGTCGAGTACCTG
GCGTCAAGGGATGCAACAATCATGGGAAGCAGAAACGGGCATGCTCCTCTGTTCCTTTGG
TACACTCTAAACCGCAAAGGCTACAAAGGGTTCCAGAAAGAAGTTCAGAAATGCCTGAGA
AATGCCCATTACCTTAAAGACAAACTCCGTGAATCTGGGATCAGCGCCATGCTCAACGAG
CTTAGCAGCACTGTTGTCTTTGAAAGGCCCAAGGATGAAGAGTTCGTTAGGAGGTGGCAG
CTCGCTTGCCAAGGCGATATAGCTCATGTGGTGGTGATGCCGAGTGTTACAATCGAGAAG
CTCGATCATTTTGTGAAAG

QA 2 620 2 620
DS 

RD RS1AR43TFB 663 0 0
GAGTGTGAGTGTGTCAGGCCACAAATTTGTCGGGTGTCCAATGCCTTGTGGTGTTCAGAT
AACAAGGATGAAACACATCAAAGTCCTATCCAGCAACGTCGAGTACCTGGCGTCAAGGGA
TGCAACAATCATGGGAAGCAGAAACGGGCATGCTCCTCTGTTCCTTTGGTACACTCTAAA
CCACAAGGGCTACAAAGGGTTCCAGAAAGAAGTTCAGAAATGCCTGAGAAATACCCATTA
CCTTAAAGACAAACTCCGTGAATCTGGGATCAGCTCCATGCTCAACGAGCTTAGCAGCAC
TGTTGTCTTTGAAAGGCCCAAGGATGAAGAGTTCGTTAGGAGGTGGCAGCTCGCTTGCCA
AGGCGATATAGCTCATGTGGTGGTGATGCCGAGTGTTACAATCGAGAAGCTCGATCATTT
TGTGAAAGACCTGGTCGAACACAGATCGGTCTGGTGTAAGGACGGATCTCAAACACCATG
CCTTGCAAAGGATGTAGGAACCAACAACTGCGCCTGTCCAGCTCACAAGTGAAGTGACCG
TGCTGTTTCACCATATGTTTTTGATTCCTTTGTTTCTGGTTTTTATTTCTATCCGTTGCA
GTCATGAATTTTTCGTAAAATTTTCCAGTTTCACTTCGTTATTAATAAAAGTCATATGAT
TTT

QA 1 663 1 663
DS 

RD RS1AR43JQ 577 0 0
TATCCAGCAACGTCGAGTACCTGGCGTCAAGGGATGCAACAATCATGGGAAGCAGAAACG
GGCATGCTCCTCTGTTCCTTTGGTACACTTTAAACCACAAGGGCTACAAAGGGTTCCAGA
AAGAAGTTCAGAAATGCCTGAGAAATACCCATTACCTTAAAGACAAACTCCGTGAATCTG
GAATCAGCTCCATGCTCAACGAGCTTAGCAGCACTGTTGTCTTTGAAAGGCCCAAGGATG
AAGAGTTCGTTAGGAGGTGGCAGCTCGCTTGCCAAGGCGATATAGCTCATGTGGTGGTGA
TGCCGAGTGTTACAATCGAGAAGCTCGATCATTTTGTGAAAGACCTGGTCGAACACAGAT
CGGTTTGGTGTAAGGACGGATTTCAAACACCATGCCTTGCAAAGGATGTAGGAACCAACA
ACTGCGCCTGTCCAGCTCACAAGTGAAGTGACCGTGCTGTTTCACCATATGTTTTTGATT
CCTTTGTTTTTGGTTTTTATTTCTATCCGTTGCAGTCATGAATTTTTCGTAAAATTTTCC
AGTTTCACTTCGTTATTAATAAAAGTCATATGATTTT

QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 3

CO CL1744Contig1 1354 3 11 U
AAAGATGAACACATCACAACGAAAATCAAAAGGGTAACGTAAATGTAGCCATTCCAAGCT
CCCAAACCAGCTCTTACAGAGGTATTCGTTGCAACAATTCAAATAAAAATCTGAAAGATA
AAACGACCAAGACCCAAATATATATAAAAAAAGGTTTTGGGGGAGATGATGGATATAGAG
AAAGAAGATGACCACCAATACCGTATCGATGCGGCTTTTCTATCCACAAGTTTCAAAGAT
CCTGCTGCTGCTACTAGCCAATACTTCCCAACAGTCGTTCCACAGCAGCGTTAACGTTTC
CATTGGTTGCAAGCAAAGCCCTTATGTTCTCCGCTCTGTCATAAAATCCCATCTCTTGTA
GCTGTTGCAACTGAGTCGCAAAGCGTTCCTCAGGAGGAACATTGGGATGGTTTGTGCCAC
TCAGGCCACCAGCTCCAAGACCGCCAAACAGATTCATCAATAAATCCATCCCTCCGTTAT
TGCCTGCGGCAGCAGCACCAGTTTGCCCTGGTTCCTGGCTGGTCGTATTCCTATTCTGGG
AGGAAAGTAACTGTTGTAGACACATCATTTGCTGCATCATCTCCGGGGAGCTAAATTGAC
GAAGGAGATCTGGGTTCTGCATCATTTCCCTCAATTGAGGATTCGAATCAAGCATACTTC
GGAGTTGTGGGTTGAGATTGATAAGCTGGTTTACGTATTGTGGATTGGAAAGCATGCTTT
GCATCATCTGAGACATGGCTGGATTTTGCAATATCTGGCTCAACTGAGAAGCATCTGGAG
TGGCACCAAGAGGTGAATCCGCTCCAAGCATACCCAGTCCACCGAGGCCCCCAAGACCAC
CGAGGCCACCAAGACCACCAAGTCCAGGGCTTCTCGCATCCCCACCAGAATTTGTCCTTC
CTGGGGCATTTGTCTGGCCAGCAGTAGCACCCCAAGGGTTAGGAAGTGGGTTCGCATTCG
GAATACCATTTCCTGTCCCCGTTTCAGCATTAGGCGTCGAAGAATTATTAGAAGCATCGC
TACCTTGTGTGGAGTAACCCCCTGGTTTCCAAGGAGAGCAGCAAAAGGATTAGAAGCCGC
ATTGTTCCCAGCGTTCCCAGACATAGTAGTAGCATTCATGAGCGGCTCCTGAACATTCTC
ATACATACGCCTAAGATGGTTAAACCCCTCAGGCATAGACTCAATATTACTCATGGCCCT
ATCAGTATTCCGCATCATCTCCCGCATCAGCTCCGGGTTCCTCGCAGCTTCCAGAGTCTG
CCTAAGGATGCTGGGATCATTAAGCACGTGGCCAAGCTCAGGGTTTCGATCAACGAGGTC
ACGCATCTGAGGGTTGCTCATGATAATACTCCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1CW63JQ U 1
AF RS1CK02JQ U 28
AF RS1F212TF C 666
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AAACGACCAAGACCCAAATATATATAAAAAA*GGTTTTGGGGGAGATGATGGATATAGAG
AAAGAAGATGACCACCAATACCGTATCGATGCGGCTTTTCTATCCACAAGTTTCAGAGAT
CCTGCTGCTGCTACTAGCCAATACTTCCCAACAGTCGTTCCACAGCAGCGTTAACGTTTC
CATTGGTTGCAAGCAAAGCCCTTATGTTCTCCGCTCTGTCATAAAATCCCATTTCTTGTA
GCTGTTGCAACTGAGTCGCAAAGCGTTCCTCAGGAGGAACATTGGGATGGTTTGTGCCAC
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AGGAAAGTAACTGTTGTAGAGACATCATTTGCTGCATCATCTCCGGGGAGCTAAATTGAC
GAA

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DS 

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GTTGCAACAATTCAAATAAAAATCTGAAAGATAAAACGACCAAGACCCAAATATATATAA
AAAAAGGTTTTGGGGGAGATGATGGATATAGAGAAAGAAGATGACCACCAATACCGTATC
GATGCGGCTTTTCTATCCACAAGTTTCAAAGATCCTGCTGCTGCTACTAGCCAATACTTC
CCAACAGTCGTTCCACAGCAGCGTTAACGTTTCCATTGGTTGCAAGCAAAGCCCTTATGT
TCTCCGCTCTGTCATAAAATCCCATCTCTTGTAGCTGTTGCAACTGAGTCGCAAAGCGTT
CCTCAGGAGGAACATTGGGTTGGTTTGTGCCACTCAGGCCACCAGCTCCAAGACTGCCAA
ACAGATTCATCAATAAATCCATCCCTCCGTTATTGCCTGCGGCAGCAGCACCAGTTTGCC
CTGGTTCCTGGCTGGTCGTATTCCTATTCTGGGAGGAAAGTAATTGTTGTAGACTCATCA
TTTGCTGCATCATCTCCGGGGAGCTAAATTGACGAAGGAGATCTGGGTTCTGCATCATTT
CCCTCAATTGAGGATTCGAATCAAGCATACTTCGGAGTTGTGGGTTGAGATTGATAAGCT
GGTTTACGTATTGTGGATTGGAAAGCATGCTTTGCATCATCTGAGACATGGCTGGATTTT
GCAATATCTGGCTCAACTGAGAAGCATCTGGAGTGGCACCAAGAGGTGAATCCG

QA 1 774 1 774
DS 

RD RS1F212TF 689 0 0
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ATCTGGGACATGGCTGGATTTTGCAATATCTGGCTCAACTGAGAAGCATCTGGAGTGGCA
CCAAGAGGTGAATCCGCTCCAAGCATACCCAGTCCACCGAGGCCCCCAAGACCACCGAGG
CCACCAAGACCACCAAGTCCAGGGCTTCTCGCATCCCCACCAGAATTTGTCCTTCCTGGG
GCATTTGTCTGGCCAGCAGTAGCACCCCAAGGGTTAGGAAGTGGGTTCGCATTCGGAATA
CCATTTCCTGTCCCCGTTTCAGCATTAGGCGTCGAAGAATTATTAGAAGCATCGCTACCT
TGTGTGGAGTAACCCCCTGGTTTCCAAGGAGAGCAGCAAAAGGATTAGAAGCCGCATTGT
TCCCAGCGTTCCCAGACATAGTAGTAGCATTCATGAGCGGCTCCTGAACATTCTCATACA
TACGCCTAAGATGGTTAAACCCCTCAGGCATAGACTCAATATTACTCATGGCCCTATCAG
TATTCCGCATCATCTCCCGCATCAGCTCCGGGTTCCTCGCAGCTTCCAGAGTCTGCCTAA
GGATGCTGGGATCATTAAGCACGTGGCCAAGCTCAGGGTTTCGATCAACGAGGTCACGCA
TCTGAGGGTTGCTCATGATAATACTCCGC

QA 1 689 1 689
DS 



AS 0 0

AS 1 4

CO CL1746Contig1 1503 4 11 U
GGGTCGGCTTTGGCTTCCCACACGCGACCGTCTTCTTCTCCGGCGACGAAGCCAAGAGAG
AGACAGAGAGAGAGATTGAGAGATGACGGACAATATCTTCGAAGGTCTACCTCCTCCGTC
TTCTCAACAGCAAGTGCTTCCTAAATCTTCAAATCCAGACGAGCCGAAAGATGAAAGTCC
CTCCATAGCTCCTCCGACTCTGGTTCTCAAGAGTTCCCTGAAGCGATCTAAACCGGCAGA
ATCTGCACCCCATGTCTCAGCTCCTCCTGTTCTCAAGAGCGCACGTAAGCGTTCAAAACC
AGCAGAATCTACTCCGGAACCAGAACCTGAAGCTCCTAAGAAGCGTCTACAGTTCAAGAC
ATCGACAGATGCATCAGAAGAACAAGTGATAGAAGCGATGCAGAAGATAACATCCCACAT
CAAGAACCCTTCCAAGTTCTCCAAAGCCTCAAAGCTTGCGATACGCCTGATTCAAGCTGG
AAGCGTGAAGCCTGAGACAAGCAGTTACTTCATTGCGATGCTCGAAGCTGCAATGTCGTC
GAAAACTCCTTGTACAGATCGATTGGTTAGAGCAGATTATCATGCTTTGTTCTCAGCTGC
TCAGGATGTCGCCGAGTGCCTTAATAAAAGCCAGAAGAATCTGCTGACCATATGGACGAT
TAAAGCAGTTGTGGCTAATGACCTCTTTACTGATGACAGCTTCATGTTTTCCAAGACTGG
TACTCAAATAAAGGAGGCTATATCTGATCTTCCAGTGGCAACTGAGGAAGATGATGCGGA
AGAAGCAGCTGCTCTTGAACAAGAGGCTGTGAAGGACAATGGAGAAGAGCAGACAACACA
GGACGTGGATGAAGCTGCTTCAGCGGGAGGTCAAGAGGATGCCGAGTCTGATCCCTTTGG
GCTGGATGCATGGATCTCCAGTGGTGTGAAGAAAAATGGTAAAACAAAGATGACGAAAGA
AGATACAGATGCCTTGGAGAACAAGAAATTTCTCAGGTCAAAAAGAGAAGCTTTGATTAC
ATGCCTGGAGATCGCTGCACGCCGTTACAGAGTTCCATGGTGCCAGACTGTTATAGACAT
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GGAGAAACTATGGGCTTCGGTTAGAGAACAACACCTCCGTAGGAAGCAAGGCAAATCAGT
GACGGGGAAACTTGACGTGACTGCTTTCGAAAGTCTTCAGGATAAATACGCCAACGAGAA
GATGAGCATCCGGCGATCTGTTGGAGCCAACGGTGAACGCCGTGCACAACAATGGCTTGG
TTGATAAAAACATGTTACCAAAAACAAAAGTGTAATTTGTATGATTTTTACACTAAGACA
GAAGTAGTAGAAAGCAGATATTTGCTCTGTTTCCTTCCGATTGCGTCTTGATACAAAAAC
TTTCAACCTGTATCCAAAAGATATTTGCCAGATCATGTCTTAAATGTCTTGCGTGATTTT
GAC


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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 
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G
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CAAAAACAAAAGTGTAATTTGTATGATTTTTACATTAAGACAGAAGTAGTAGAAAGCAGA
TATTTGCTCTGTTTCCTTCCGATTGCGTCTTGATACAAAAACTTTCAACCTGTATCCAAA
AGATATTTGCCAGATCATGTCTTAAATGTCTTGCGTGATTTTGAC

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DS 



AS 1 3

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TCGAATTGAATTTGCTTTTAATCTCCAAAAAATGAGGACGATCGTTTCGCGTTTGATCCG
TCACAAATCGTCAATTCCACAGTCACGATTCGTTTCTGCATCATCAAGTGGCGGTGGGAG
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CCTTCTATCATCTGATTTATTGAAAGATGCTCTTGATGGAGTCACTTCTGTGATCTCTTG
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AACTCGCAGCGTTGGGAACATGAAGATCCCATTGGGAGTCTTTGGTTCACCCATGGAAAT
GATTCTTCAACAAGCAAAACCGCTGAACCAGCTCCCACTAGTCGGACCTTTGTTCACGCC
TCCGGTGAACGTTGAATCGGTTGCCAAAGTTGCGGTTAGAGCGGCTACTGATCCGGTGTT
CCCTCCAGGAATTGTTGATGTTCATGGTATACAACGTTACAGCCAACAGAAATCAAGATA
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ATACACTC


BQ
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TCTTGAGCCTG

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TAGATCGTGGCTTATCTGTCTCTAGCCTTAGCAGATCAGGTAGGTCGTCTTTACAAGAGT
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AAGAAGACACGCTTTTTTATTGATTACTGTGCATCCCTAAGAGAGCAAGCTACTTTGTAT
TAGCTCTCCAAAACTTTTTTTCCTATAATCACATTTTTATACACAAGACATACACTC

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DS 



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ATTAAAGTTTGTATTTTTAATACTTCTTTTGCTGTAATTTTTCCATACACTCAAAAATCT
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ATGTCGGAACATAGACTTAGGTACGAGTGTGCTTGATCTGATCTCATGTGGCTGTGGTCG
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CGGCGGAGGGAATCTGGTGTTTCTCCGGCGTGACGTGGGGAGGAGTTGCAGAGCTGTTCC
GACAAAACCCAAAGAGATCTCTTTGGTCAACGGAATAGGTGAAGCCAAAACGGTGAGTTT
TGAATTGAGGCAAGAGACCTCAAAGCAGCCTATCTCATTGTCGAATCTGTTTGAGGTTGT
AGCTGATGATCTGCAGACGTTGAATGACAATCTTTTATCGATTGTGGGTGCAGAGAATCC
GGTTTTGATATCCGCAGCTGAGCAAATCTTCGGAGCGGGTGGTAAAAGAATGAGACCCGG
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GGAACATAGGCGTTTGGGTGAGATCATTGAGATGATTCACACTGCAAGCTTGATACATGA
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CAACCTCGAGAACCTGGAAGTTATCAAGCTCATAAGTCAGGTGATCAAAGACTTTGCGAG
CGGAGAGATAAAGCAAGCGTCGAGTCTGTTCGACTGTGACGTTACCCTACAAGACTACTT
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GATGATTATTAATAGTACAGTAAAGCAATACAGAGAGATTTGTGTACACATTAAAAAAAA
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GCAATATTGTATATGACTATGTGAACCCC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DM89TF U 1
AF RS1DS75TF U 203
AF RS1B311TF U 838
AF RS1B311JQ C 1024
AF RS1DS75JQ C 1224
BS 1 372 RS1DM89TF
BS 373 373 RS1DS75TF
BS 374 411 RS1DM89TF
BS 412 412 RS1DS75TF
BS 413 706 RS1DM89TF
BS 707 709 RS1DS75TF
BS 710 744 RS1DM89TF
BS 745 745 RS1DS75TF
BS 746 759 RS1DM89TF
BS 760 880 RS1DS75TF
BS 881 881 RS1B311TF
BS 882 941 RS1DS75TF
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BS 1572 1572 RS1B311JQ
BS 1573 1587 RS1B311TF
BS 1588 1588 RS1B311JQ
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BS 1670 1670 RS1DS75JQ
BS 1671 1685 RS1B311JQ
BS 1686 1769 RS1DS75JQ

RD RS1DM89TF 759 0 0
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CTCGTCCACTCGAATCTAATTAAATCAATCCACTTGTTTTATTTTAATTCTTTATATTAT
ATTAAAGTTTGTATTTTTAATACTTCTTTTGCTGTAATTTTTCCATACACTCAAAAATCT
CTCGGCGGAGAAAAAAGAGGAGAGTCAGCCTTTATTGCTTCTTCATGTGAAAAAAGCTTG
AAGGCAGCTTTGATAGATACTCCAAAGTCTTTTTAGAGCTTAGAGAATGATGATGACGTC
ATGTCGGAACATAGACTTAGGTACGAGTGTGCTTGATCTGATCTCATGTGGCTGTGGTCG
TCGTCAGTTTCTTTTAGGCAACTTCCCCAAGTCTGTTTGTACGGCGAGAAGCTACGGCGG
CGGCGGAGGGAATCTGGTGTTTCTCCGGCGTGACGTGGGGAGGAGTTGCAGAGCTGTTCC
GACAAAACCCAAAGAGATCTCTTTGGTCAACGGAATAGGTGAAGCCAAAACGGTGAGTTT
TGAATTGAGGCAAGAGACCTCAAAGCAGCCTATCTCATTGTCGAATCTGTTTGAGGTTGT
AGCTGATGATCTGCAGACGTTGAATGACAATCTTTTATCGATTGTGGGTGCAGAGAATCC
GGTTTTGATATCCGCAGCTGAGCAAATCTTCGGAGCGGGTGGTAAA**GATGAGACCCGG
TTTAGTGTTCCTCGTATCACGAGC*ACTGCAGAGCTAGC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RS1DS75TF 764 0 0
AGTCAGCCTTTATTGCTTCTTCATGTGAAAAAAGCTTGAAGGCAGCTTTGATAGATACTC
CAAAGTCTTTTTAGAGCTTAGAGAATGATGATGACGTCGTGTCGGAACATAGACTTGGGT
ACGAGTGTGCTTGATCTGATCTCATGTGGCTGTGGTCGTCGTCAGTTTCTCTTAGGCAAC
TTTCCCAAGTCTGTTTGTACGGCGAGAAGATACGGTGGCGGCGGAGGGAATCTGGTGTTT
CTCCGGCGTGACGTGGGGAGGAGTTGCAGAGCTGTTCCGACAAAACCCAAAGAGATCTCT
TTGGTCAACGGAATAGGTGAAGCCAAAACGGTGAGTTTTGAATTGAGGCAAGAGACCTCA
AAGCAGCCTATCTCATTGTCGAATCTGTTTGAGGTTGTAGCTGATGATCTGCAGACGTTG
AATGACAATCTTTTATCGATTGTGGGTGCAGAGAATCCGGTTTTGATATCCGCAGCTGAG
CAAATCTTCGGAGCGGGTGGTAAAAGAATGAGACCCGGTTTAGTGTTCCTCGTATCACGA
GCCACTGCAGAGCTAGCTGGCCTTAAGGAACTTACAACGGAACATAGGCGTTTGGGTGAG
ATCATTGAGATGATTCACACTGCAAGCTTGATACATGATGATGTGTTAGATGAGAGTGAT
ATGCGCAGAGGAAAGGAA*CAGTTCACGAACTATTTGGCACAAGAGTAGCCGTATTAGCT
GGTGATTTCATGTTTGCTCGAGCATCATGGTACTTAGCCA
CTCG

QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1B311TF 774 0 0
G
GATGATGTGTTAGATGAGAGTGATATGCG*AGAGGAAAGGAAACAGTTCACGAACTATTT
GGCACAAGAGTAGCTGTATTAGCTGGTGATTTCATGTTTGCTCAAGCATCATGGTACTTA
GCCAACCTCGAGAACCTGGAAGTTATCAAGCTCATAAGTCAGGTGATCAAAGACTTTGCG
AGCGGAGAGATAAAGCAAGCGTCGAGTCTGTTCGACTGTGACGTTACCCTACAAGACTAC
TTGCTCAAGAGTTACTACAAGACAGCCTCGTTGGTGGCTGCGAGCACCAAAGGAGCTGCC
ATCTTCAGCAGAGTCCAGACCGATGTGACAGAGCAAATGTACGAGTTCGGGAAGAATCTC
GGCCTCTCTTTCCAAGTAGTCGACGACATTTTGGACTTCACTCAGTCGTCAGAGCAGCTA
GGGAAGCCAGCAGGGAGTGATTTGGCCAAAGGTAACTTAACCGCGCCTGTGATTTTCGCG
CTGGAGAAGGAGCCGAGGCTGAGAGAGATCATAGAGTCTGAGTTTTGTGAGGAGGGTTCG
CTGGAAGAAACCATTGAGTTGGTGAGAGAAG*TGGTGGGATCAGAAGAGCACAAGAGTTG
GCTAGGGAGAAAGCTGATGAAGCTTTGAAGAATCTGCAGTGCTTGCCTCAGAGTGGCTTC
AG*TCGGCTCTAGAAGAAATGGTGATGTTTAATCTCGAA**GATCGATTAGT*AGA*GAC
ATGATGAT*ATTA*TAGTACAGTAAAGCA*TACAGAGAGATTTGTGTACACAT

QA 2 774 2 774
DS 

RD RS1B311JQ 662 0 0
AGAGATAAAGCAAGCGTCGAGTCTGTTCGACTGTGACGTTACCCTACAAGACTACTTGCT
CAAGAGTTACTACAAGACAGCCTCGTTGGTGGCTGCGAGCACCAAAGGAGCTGCCATCTT
CAGCAGAGTCCAGACCGATGTGACAGAGCAAATGTACGAGTTCGGGAAGAATCTCGGCCT
CTCTTTCCAAGTAGTCGACGACATTTTGGACTTCACTCAGTCGTCAGAGCAGCTAGGGAA
GCCAGCAGGGAGTGATTTGGCCAAAGGTAACTTAACCGCGCCTGTGATTTTCGCGCTGGA
GAAGGAGCCGAGGCTGAGAGAGATCATAGAGTCTGAGTTTTGTGAGGAGGGTTCGCTGGA
AGAAACCATTGAGTTGGTGAGAGAAGGTGGTGGGATCAGAAGAGCACAAGAGTTGGCTAG
GGAGAAAGCTGATGAAGCTTTGAAGAATCTGCAGTGCTTGCCTCAGAGTGGCTTCAGGTC
GGCTCTAGAAGAAATGGTGATGTTTAATCTCGAAAGAATCGATTAGTTAGAAGACATGAT
GATTATTAATAGTACAGTAAAGCAATACAGAGAGATTTGTGTACACATTAAAAAAAAAAT
AGTATTTGGCTGCAATGCAGAGATTGTGTTGGCAGCAATTGTTACTTGAATTTCAAGGAA
AC

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DS 

RD RS1DS75JQ 546 0 0
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CCAAAGGTAACTTAACCGCGCCTGTGATTTTCGCGCTGGAGAAGGAGCCGAGGCTGAGAG
AGATCATAGAGTTTGAGTTTTGTGAGGAGGGTTCGCTGGAAGAAGCCATTGAGTTGGTGA
GAGAAGGTGGTGGGATCAGAAGAGCACAAGAGTTGGCTAGGGAGAAAGCTGATGAAGCTT
TGAAGAATCTGCAGTGCTTGCCTCAGAGTGGCTTCAGGTCGGCTCTAGAAGAAATGGTGA
TGTTTAATCTCGAAAGAATCGATTAGTTAGAAGACATGATTATTATTAATAGTACAGTAA
AGCAATACAGAGAGACTTGTGTACACATTAAAAAAAAAATAGTATTTGGCTGCAATGCAG
AGATTGTGTTGGCAGCAATTGTTACTCGAATTTCAAGGAAACTCTTATTCTTCCTTGCCT
TTTATGTCACGTATGTTTGCCTTATGCTCAGGATGGTGCAATATTGTATATGACTATGTG
AACCCC

QA 1 546 1 546
DS 



AS 1 3

CO CL1749Contig1 557 3 3 U
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GAGGACAGTGCTGAGGAACTTCAGAATCTGATGGAACAAGATTATGACATTGGATCTGCT
ATCCGGGAGAAGATTATCCCTCATGCAGTCTCATGGTTTACTGGTGAGGCTATGGATGGA
GAGGAGTTTGATTTAGATGATGATGAGGACGATGATATTGACGAGGACGAAGATGAGGAG
GAAGAGGATGAGGAGGATGATGAAGATGAAGAAGATAGCAAGACTAAAAAGAAGCCATCA
AGCGGTCGCAAGAAGGGAGGCAGGTCTCAGGTGGTTGTTGGTGACGGTCAACAAGGCGAG
AGGCCACCTGAATGCAAGCAGCAATAGTAATGTCTACGCTCTACTGAATGAAAAAGCATG
CGTGAAAACACATACCCTTGGCTCATTCGCTGTTCATCTATCATTTAATTTTTGGTGTTT
ATCTTCTTAGAATCACTTAAGACTTTTCCTTGGTGTTTATCAATCAAATATCAATCAATG
AATTATCCCCTTATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A377TF U 1
AF RS1E781TF U 182
AF RS1E781JQ C 182
BS 1 328 RS1A377TF
BS 329 465 RS1E781TF
BS 466 557 RS1E781JQ

RD RS1A377TF 328 0 0
GAAAGCTTCTTCAACTTCTTTAATCCTCCACAAGTCCCGGAGGAAGATGAAGATATCGAC
GAGGACAGTGCTGAGGAACTTCAGAATCTGATGGAACAAGATTATGACATTGGATCTGCT
ATCCGGGAGAAGATTATCCCTCATGCAGTCTCATGGTTTACTGGTGAGGCTATGGATGGA
GAGGAGTTTGATTTAGATGATGATGAGGACGATGATATTGACGAGGACGAAGATGAGGAG
GAAGAGGATGAGGAGGATGATGAAGATGAAGAAGATAGCAAGACTAAAAAGAAGCCATCA
AGCGGTCGCAAGAAGGGAGGCAGGTCTC

QA 1 328 1 328
DS 

RD RS1E781TF 284 0 0
G
GGAGTTTGATTTAGATGATGATGAGGACGATGATATTGACGAGGACGAAGATGAGGAGGA
AGAGGATGAGGAGGATGATGAAGATGAAGAAGATAGCAAGACTAAAAAGAAGCCATCAAG
CGGTCGCAAGAAGGGAGGCAGGTCTCAGGTGGTTGTTGGTGACGGTCAACAAGGCGAGAG
GCCACCTGAATGCAAGCAGCAATAGTAATGTCTACGCTCTACTGAATGAAAAAGCATGCG
TGAAAACACATACCCTTGGCTCATTCGCTGTTCATCTATCATT

QA 2 284 2 284
DS 

RD RS1E781JQ 376 0 0
G
GGAGTTTGATTTAGATGATGATGAGGACGATGATATTGACGAGGACGAAGATGAGGAGGA
AGAGGATGAGGAGGATGATGAAGATGAAGAAGATAGCAAGACTAAAAAGAAGCCATCAAG
CGGTCGCAAGAAGGGAGGCAGGTCTCAGGTGGTTGTTGGTGACGGTCAACAAGGCGAGAG
GCCACCTGAATGCAAGCAGCAATAGTAATGTTTACGCTTTACTGAATGAAAAAGCATGCG
TGAAAACACATACCCTTGGCTCATTCGCTGTTCATCTATCATTTAATTTTTGGTGTTTAT
CTTCTTAGAATCACTTAAGACTTTTCCTTGGTGTTTATCAATCAAATATCAATCAATGAA
TTATCCCCTTATTTT

QA 2 376 2 376
DS 



AS 2 5

CO CL1750Contig1 844 3 30 U
GGGAGAAACGCTGTTTGCGTTGGAACCAAACAGCAGTAGCGATCTTGAACTCCATCACCT
CTGATAATGGCTAACGCAGTTAGATTCTTCGAGCTCAACACTGGCGCTAAGATCCCGTCA
GTGGGTTTGGGAACATGGCAAGCCTCTCCTGGTCTTGTCGGTGATGCCGTCGCCGCAGCT
GTTAAGATCGGATATCGTCATATTGATTGCGCTCAGATCTACGGCAACGAAAAAGAGATT
GGGGCAGTTTTTAAAAAATTGTTTAAAGACAATGTAGTGAAACGCGAAGAGTTGTTCATC
ACTTCCAAGCTCTGGTGTACTGATCATGACCCTCAAGATGTGCCGGAGGCACTGAAAAGA
ACTCTACAGGATCTGCAGCTT*GACTATGTCGATCTCTATTTGATACACTGGCCTGTACG
GATGAAGAAAGGTTCTGTT*GGAGCTAAGCCCGAGAACCTTATGCCTGTAGATATTTCTA
GCACATGGAAAGCGATGGAAGCACTCTATGACTCGGGCAAGGCACGAGCCATAGGAGTAA
GCAACTTCTCCACCAAGAAGCTAGCTACTCTCTTAGAGTTAGCTCGTGTTCCTCCTGCCG
TTAATCAGGTCGAATGTCATCCTTCTTGGCAACAGACTAAACTACGAGAGTTCTGCAAAT
CCAAAGGAGTTCACCTCACCGCATACTCTCCATTGGGTTCTCCAGGAACAACATGACTCA
AGAGCGATGTTTTGAAGAACCCTATACTGAATACTGTTGCTGAAAACTCGAAAGTCTCCA
GCGCAAGTCGCGCTTCGCTGGGACTACAATGGGTAACAGTGTTCTTCCTAAAGCACAATG
AAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1BW77TF U 117
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AF RS1A842TF U 45
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ATG

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DS 

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GTGGGTTTGGGAACATGGCAAGCCTCTCCTGGTCTTGTCGGTGATGCCGTCGCCGCAGCT
GTTAAGATCGGATATCGTCATATTGATTGCGCTCAGATCTACGGCAATGAAAAAGAGATT
GGGGCAGTTTTTAAAAAATTGTTTGAAGACAATGTAGTGAAACGCGAAGAGTTGTTCATC
ACTTCCAAGCTCTGGTGTACTGATCATGACCCTCAAGATGTGCCAGAGGCACTGAAAAGA
ACTCTACAGGATCTGCAGCTT*GACTATGTCGATCTCTATTTGATACACTGGCCTGTACG
GATGAAGAAAGGTTCTGTT*GGAGCTAAGCCCGATAACCTTATGCCTGTAGATATTTCTA
GCACATGGAAAGCGATGGAAGCACTCTTTGACTCGGGCAAGGCACGAGCCATAGGAGTAA
GCAACTTCTCCACCAAGAAGCTAGCTACTCTCTTAGAGTTAGCTCGCGTTCCTCCTGCCG
TTAATCAG*TCGAATGTCATCCTTCTTGGCAACAGACTAAGCTGCGAGAGTTCTGCAAAT
CCAAAGGAGTTCACCTCACCGCATACTCTCCATTGGGTTCTCCAGGAACAACGTGGCTCA
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GCGCAAGTC

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DS 

RD RS1A842TF 800 0 0
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CGCTAAGATCCCGTCAGTGGGTTTGGGAACATGGCAAGCCTCTCCTGGTCTTGTCGGTGA
TGTCGTCGCCGCAGCTGTTAAGATCGGATATCGTCATATTGATTGCGCTCAGATCTACGG
CAACGAAAAAGAGATTGGGGCAGTTTTTAAAAAATTGTTTAAAGACAATGTAGTGAAACG
CGAAGAGTTGTTCATCACTTCCAAGCTCTGGTGTACTGATCATGACCCTCAAGATGTGCC
GGAGGCACTGAAAAGAACTCTACAGGATCTGCAGCTT*GACTATGTCGATCTCTATTTGA
TACACTGGCCTGTACGGATGAAGAAAGGTTCTGTT*GGAGCTAAGCCCGAGAACCTTATG
CCTGTAGATATTTCTAGCACATGGAAAGCGATGGAAGCACTCTATGACTCGGGCAAGGCA
CGAGCCATAGGAGTAAGCAACTTCTCCACCAAGAAGCTAGCTACTCTCTTAGAGTTAGCT
CGTGTTCCTCCTGCCGTTAATCAGGTCGAATGTCATCCTTCTTGGCAACAGACTAAACTA
CGAGAGTTCTGCAAATCCAAAGGAGTTCACCTCACCGCATACTCTCCATTGGGTTCTCCA
GGAACAACATGACTCAAGAGCGATGTTTTGAAGAACCCTATATTGAATACTGTTGCTGAA
AACTCGAAAGTCTCCAGCGCAAGTCGCGCTTCGCTGGGACTACAATGGGTAACAGTGTTC
TTCCTAAAGCACAATGAAGA

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DS 



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AATTCTTCAAGAGACTTATAGGGGCTCAGCGTATCATGAACGAAGAAGGAAGCATTCAAT
AACCTAGCCTGTTCAATCTCTGAAAACTTGGCAAACAAGTCATCAGGTATCGACCAGTCG
AAAACCTCAAAGTTCTCTCTGATTCTTCCTTCATTGGTGCTTTTAGGAAGAACACTGTTA
CCCACTTGTAGTCCCCAGCGAAGCGCGACTTGCGCTGGAGACTTTCCGAGTTTTTCAGCA
ACAGTATTCAATATAGGGTTCTTCAAAACATCGCTCTTGAGCCACGTTGTTCCTGGAGAA
CCCAATGGAGAGTATGCGGTGAGGTGAACTCCTTTGGATTTGAAGAACTCTCGCAGCTTA
GTCTGTTGCCAAGAAGGATGACATTCGACCTGATTAACGGCAGGAGGAACACGAGCTAAC
TCTAAGAGAGTAGCTAGCTTCTTGGTGGAGAAGCTGCTTACTCCTATGGCTCGTGCCTTG
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AGATCGACATAGTCAAGCTGCAGATCCTGTAGAGTTCTTTTCAGTGCCTCTGGCACATCT
TGAGGGTCATGATCAGTACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BW77JQ U 1
AF RS1A910JQ U 57
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RD RS1BW77JQ 742 0 0
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CAGA

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DS 

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GG
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TACCCATTTGTAGTCCCCAGCGAAGCGCGACTTGCGCTGGAGACTTTCCGAGTTTTTCAG
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GGTTATCGGGCTTAGCTCCAACAGAACCTTTCTTCATCCGTACAGGCCAGTGTATCAAAT
AGAGATCGACATAGTCAAGCTGCAGATCCTGTAGAGTTCTTTTCAGTGCCTCTGGCACAT
CTTGAGGGTCATGATCAGTACAC

QA 3 805 3 805
DS 



AS 1 4

CO CL1751Contig1 949 4 29 U
GGGATTCTCAAATCTGTACCTGAAAAATCTCAAACTCTCAGATCTGCCAATACCTCTCTC
TTATCGTGACGGTGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAAAAAAATGGC
GGCGGTGACACCATTAGCAAAGTTCAAGCTCGTCTTCCTGGGAGATCAATCCGTCGGCAA
GACCAGCATCATCACTCGTTTCATGTACGACAAATTCGACACCACCTATCAGGCAACGAT
TGGGATTGATTTCTTGTCAAAGACAATGTACCTTGAGGATAGGACTCTTCGTCTCCAGCT
TTGGGATACTGCCGGGCAGGAAAGGTTTCGAAGTCTGATACCAAGTTATATCAGAGATTC
CTCTGTTGCTGTCATTGTCTATGACGTTGCTAATAGGCAGTCGTTCTTGAACACCTCGAA
GTGGGTTGAGGATGTTCGTACAGAGAGAGGTAACGATGTTATAATTGTTCTCGTGGGTAA
CAAAACTGATCTCGTTGACAAGAGGCAAGTGTCGATAGAGGAAGGGGATAACAAAGCTCG
TGATTTTGGAGTTATATTCATAGAGACGAGTGCAAAAGCAGGATTTAACATCAAGCCACT
ATTCCGGAAGATTTCGGCAGCATTACCAGGAATGGATACACTTTCTTCAGCGAAACAAGG
CGATATGGTTGATGTTAACCTTAAGTCATCGAACCATTCGTCTAATGCGGAGCAACAAAG
TGGTGACTGTTCGTGCTGATTAATCTTTACTAAAAAAATATATACTTTTAACAGCAACAG
AGTATGGAGATTTTTAAAAATGATTCATAACTTGATGGAGTAAAATAAACTCTGGTGTAA
GGTAAGAGATTTTTACTTGGAGTCTCTAGTATTCTTTAAGATGTTTTGAGTTCAATATGG
AGATGTGTAATAATGACACGCTTGCAAGCTTAAGAAGAATGTTTCGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1CJ88TF U 1
AF RS1A727TF U 81
AF RS1EP77JQ C 230
AF RS1A727JQ C 286
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BS 927 949 RS1EP77JQ

RD RS1CJ88TF 757 0 0
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GGCGGTGACACCATTAGCAAAGTTCAAGCTCGTCTTCCTGGGAGATCAATCCGTCGGCAA
GGCCAGCATCATCACTCGTTTCATGTACGACAAATTCGATACCACCTATCGGGCAACGAT
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CTCTGTTGCTGTCATTGTCTATGACGTTGCTAATAGGCAGTCGTTCTTGAACACCTCGAA
GTGGGTTGAGGATGTTCGTACAGTGAGAGGTAACGATGTTATAATTGTTCTCGTGGGTAA
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CGATATGGTTGATGTTAACCTTAAGTCATCGAACCATTCGTCTA*TGCGGAGCAACAA*G
TGGTGGCTGTTCGTGCTGAT*AATCTTTACTAAAAAA

QA 1 757 1 757
DS 

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GG
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TTCAAGCTCGTCTTCCTGGGAGATCAATCCGTCGGCAAGACCAGCATCATCACTCGTTTC
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AGGTTTCGAAGTCTGATACCAAGTTATATCAGAGATTCCTCTGTTGCTGTCATTGTCTAT
GACGTTGCTAATAGGCAGTCGTTCTTGAACACCTCGAAGTGGGTTGAGGATGTTCGTACA
GAGAGAGGTAACGATGTTATAATTGTTCTCGTGGGTAACAAAACTGATCTCGTTGACAAG
AGGCAAGTGTCGATAGAGGAAGGGGATAACAAAGCTCGTGATTTTGGAGTTATATTCATA
GAGACGAGTGCAAAAGCAGGATTTAACATCAATCCACTATTCCGGAAGATTTCGGCAGCA
TTACCAGGAATGGATACACTTTCTTCAGCGAAACAAGGCGATATGGTTGATGTTAACCTT
AAGTCATCGAACCATTCGTCTAATGCGGAGCAACAAAGTGGTGACTGTTCGTGCTGATTA
ATCTTTACTAAAAAAATATATACTTTTAACAGCAACAGAGTATGGAGATTTTTAAAAATG
ATTCATAACTTGATGGAGTAAAATAAACTCTGGTGTAAGGTAAGAGATTTTTACTTGGAG
TCTCTAGTATTCTTTAAGATGTTTTGAGTC**ATATGGAGATGTGTAATA*TGACACGCT
TGCA
GCTTAGAG

QA 3 846 3 846
DS 

RD RS1EP77JQ 720 0 0
CA
GGCAACGATTGGGATTGATTTCTTGTCAAAGACAATGTACCTTGAGGATAGGACTCTTCG
TCTCCAGCTTTGGGATACTGCCGGGCAGGAAAGGTTTCGAAGTCTGATACCAAGTTATAC
CAGAGATTCCTCTGTTGCTGTCATTGTCTATGACGTTGCTAATAGGCAGTCGTTCTTGAA
CACCTCGAAGTGGGTCGAGGATGTTCGTACAGAGAGAGGTAACGATGTCATAATTGTTCT
GGTGGGTAACAAAACTGATCTCGTTGACAAGAGGCAAGTGTCGATAGAGGAAGGGGATAA
CAAAGCTCGTGATTTTGGAGTTATATTCATAGAGACGAGTGCAAAAGCAGGATTTAACAT
CAAGCCACTATTCCGGAAGATTTCGGCAGCATTACCAGGAATGGATACACTTTCTTCAGC
GAAACAAGGCGATATGGTTGATGTTAACCTTAAGTCATCGATCCATTCGTCTAATGTGGA
GCAACAAAGTGGTGGCTGTTCGTGCTGATTAATCTTTACTAAAAAAATATATACTTTTAA
CAGCAACAGAGTATGGAGATTTTTAAAAATGATTCATAACTTGATGGAGTAAAATAAACT
CTGGTGTAAGGTAAGAGATTTTTACTTGGAGTCTCTAGTATTCTTTAAGATGTTTTGAGT
TCAATATGGAGATGTGTAATAATGACACGCTTGCAAGCTTAAGAAGAATGTTTCGCCC

QA 3 720 3 720
DS 

RD RS1A727JQ 664 0 0
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TTATATCAGAGATTCCTCTGTTGCTGTCATTGTCTATGACGTTGCTAATAGGCAGTCGTT
CTTGAACACCTCGAAGTGGGTTGAGGATGTTCGTACAGAGAGAGGTAACGATGTTATAAT
TGTTCTCGTGGGTAACAAAACTGATCTCGTTGACAAGAGGCAAGTGTCGATAGAGGAAGG
GGATAACAAAGCTCGTGATTTTGGAGTTATATTCATAGAGACGAGTGCAAAAGCAGGATT
TAACATCAATCCACTATTCCGGAAGATTTCGGCAGCATTACCAGGAATGGATACACTTTT
TTCAGCGAAACAAGGCGATATGGTTGATGTTAACCTTAAGTCATCGAACCATTCGTTTAA
TGCGGAGCAACAAAGTGGTGACTGTTCGTGCTGATTAATCTTTACTAAAAAAATATATAC
TTTTAACAGCAACAGAGTATGGAGATTTTTAAAAATGATTCATAACTTGATGGAGTAAAA
TAAACTCTGGTGTAAGGTAAGAGATTTTTACTTGGAGTCTCTAGTATTCTTTAAGATGTT
TTGAGTTCAATATGGAGATGTGTAATAATGACACGCTTGCAAGCTTAAGAAGAATGTTTC
GCCC

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 5

CO CL1752Contig1 850 5 9 U
GGCTCCTCTACTGCTTCGCTTGAAACAAAACAACGTTCGTCGTCTCTGCGATCTCGAGAA
AATCGAAGGTGGAAAGATGGGCTATATCGGAGAAACCATAGATTCAATAAAATCTATACA
GATCCGTCAGCTTCTCACTCAGGCCATAAGCCTTGGGATGATTGTGACGTCAGCTTTGAT
CATATGGAAAGCTTTGATGTGTGTGACTGGAAGTGAATCTCCCGTGGTTGTTGTTCTCTC
CGGAAGCATGGAACCTGGTTTCAAGAGGGGGGATATATTGTTCTTGCACATGAGTAAGGA
CCCGATTCGAGCTGGCGAGATTGTTGTTTTCAATGTTGATGGTCGTGATATTCCAATTGT
TCATCGTGTCATTAAGGTACACGAAAGAGACAATACAGGAGAAGTCGATGTTTTGACAAA
AGGTGACAATAACTATGGGGATGACAGACTTCTCTATGCTGAAGGTCAGCAATGGCTTCA
TCGACATCATATAATGGGTCGTGCTGTCGGGTTCTTGCCTTATGTTGGATGGGTGACTAT
AATTATGACAGAAAAGCCTATCATCAAGTATATTCTCATAGGTGCATTGGGTTTACTTGT
TATAACGTCCAAGGATTGAAGTCTTTT*AGAGATGGGACTCTGCAAGCCTTTGTGTGTTG
TGTTATCATCCTTCATGTCTTGTTATATCAACTTGGTCATTTT*GTGGTTTAGACCACTT
CTAAAACAGTATAATCAATCAGAAGCTAACTTTTTAATTTTAATCGTGGAGATTAGTTTT
ACCCCAAAATTCTAGAGTCTTGCTTATTTATGAACAGCAATCAATATAAATGAAACAAGA
ATATAAATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 20 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BE23TF U 3
AF RS1FW39TF U 1
AF RS1BE23JQ C 9
AF RS1AN43TF U 9
AF RS1AN43JQ C 9
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GGCCTCTT
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GGAAAGATGGGCTATATCGGAGAAACCATAGATTCAATAAAATCTATACAGATCCGTCAG
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GCTGGCGAGATTGTTGTTTTCAATGTTGATGGTCGTGATATTCCAATTGTTCATCGTGTC
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AACTATGGGGATGACATACTTCTCTATGCTGAAGGTCAGCAATGGCTTCATCGACATCAT
ATAATGGGTCGTGCTGTCGGGTTCTTGCCTTATGTTGGATGGGTGACTATAATTATGACA
GAAAAGCCTATCATCAAGTATATTCTCATAGGTGCATTGGGTTTACTTGTTATAACGTC

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DS 

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AATCGAAGGTGGAAAGATGGGCTATATCGGAGAAACCATAGATTCAATAAAATCTATACA
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TCATCGTGTCATTAAGGTACACGAAAGAGACAATACAGGAGAAGTCGATGTTTTGACAAA
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TCGACATCATATAATGGGTCGTGCTGTCGGGTTCTTGCCTTATGTTGGATGGGTGACTAT
AATTATGACAGAAAAGCCTATCATCAAGTATATTCTCATAGGTGCATTGGGTTTACTTGT
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TGTTATCATCCTTCATGTCTTGTTATATCAACTTGGTCATTT

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TT
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GCTGGCGAGATTGTTGTTTTCAATGTTGATGGTCGTGATATTCCAATTGTTCATCGTGTC
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AACTATGGGGATGACATACTTCTCTATGCTGAAGGTCAGCAATGGCTTCATCGACATCAT
ATAATGGGTCGTGCTGTCGGGTTCTTGCCTTATGTTGGATGGGTGACTATAATTATGACA
GAAAAGCCTATCATCAAGTATATTCTCATAGGTGCATTGGGTTTACTTGTTATAACGTCC
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CTTCATGTCTTGTTATATCAACTTGGTCATTTT*GTGGTTTAGACCACTTCTAAAACAGT
ATAATCAATCAGAAGCTAACTTTTTAATTTT

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GG
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GAACCTGGTTTCAAGAGGGGGGATATATTGTTCTTGCACATGAGTAAGGACCCGATTCGA
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AACTATGGGGATGACAGACTTCTCTATGCTGAAGGTCAGCAATGGCTTCATCGACATCAT
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GAAAAGCCTATCATCAAGTATATTCTCATAGGTGCATTGGGTTTACTTGTTATAACGTCC
AAGGATTGAAGTCTTTTTAGAGATGGGACTCTGCAAGCCTTTGTGTGTTGTGTTATCATC
CTTCATGTCTTGTTATATCAACTTGGTCATTTTTGTGGTTTAGACCACTTCTAAAACAGT
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TCTAGAGTCTTGCTTATTTATGA
CAGCATC

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DS 

RD RS1AN43JQ 842 0 0
GG
CTGCTTCGCTTGAAACAAAACAACGTTCGTCGTCTCTGCGATCTCGAGAAAATCGAAGGT
GGAAAGATGGGCTATATCGGAGAAACCATAGATTCAATAAAATCTATACAGATCCGTCAG
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GCTTTGATGTGTGTGACTGGAAGTGAATCTCCCGTGGTTGTTGTTCTCTCCGGAAGCATG
GAACCTGGTTTCAAGAGGGGGGATATATTGTTCTTGCACATGAGTAAGGACCCGATTCGA
GCTGGCGAGATTGTTGTTTTCAATGTTGATGGTCGTGATATTCCAAT*GTTCATCGTGTC
ATTAAGGTACACGAAAGAGACAATACAGGAGAAGTCGATGTTTTGACAAAAGGTGACAAT
AACTATGGGGATGACAGACTTCTCTATGCTGAAGGTCAGCAATGGCTTCATCGACATCAT
ATAATGGGTCGTGCTGTCGGGTTCTTGCCTTATGTTGGATGGGTGACTATAATTATGACA
GAAAAGCCTATCATCAAGTATATTCTCATAGGTGCATTGGGTTTACTTGTTATAACGTCC
AAGGATTGAAGTCTTTT*AGAGATGGGACTCTGCAAGCCTTTGTGTGTTGTGTTATCATC
CTTCATGTCTTGTTATATCAACTTGGTCATTTT*GTGGTTTAGACCACTTCTAAAACAGT
ATAATCAATCAGAAGCTAACTTTTTAATTTTAATCGTGGAGATTAGTTTTACCCCAAAAT
TCTAGAGTCTTGCTTATTTATGAACAGCAATCAATATAAATGAAACAAGAATATAAATGG

QA 3 842 3 842
DS 



AS 2 5

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TTAGCCTTTTATCTTCTTGTTTCACTTGCAACTATGGCCACACATTCAGCTCTTGCCGTC
TCCAGAATCCCTGTCAAACCGAGGCAGCAGTCTAAGAGTGCCATTCACTCTTTCCCAGCT
CAATGTTCCTCCAAGAGGCTAGAAGTGGCTGCATTCTCCGGCCTGCGAGTCAGCAACAAC
GGTGGGGAAGCATCTTTCTTTGATGCCATAGCTGCACAAATCACCCCCAAGGCTGTGGGA
ACATCCACTCCTGTTAGAGGAGAGACAGTGGCAAAACTGAAGGTTGCCATCAATGGGTTT
GGGAGGATTGGTAGGAACTTCCTCAGGTGTTGGCACGGCCGCAAGGACTCTCCTCTTGAA
GTTGTTGTGCTTAACGACAGTGGTGGTGTCAAGAACGCATCCCACTTGCTCAAGTACGAC
TCCATGCTTGGAACCTTCAAGGCCGATGTGAAAATAGTCGACAATGAAACTATTAGCGTT
GATGGCAAGCTCATCAAAGTCGTCTCAAACAGAGATCCTCTTAAGCTTCCATGGGCTGAG
CTCGGCATTGACATTGTCATCGAGGGAACAGGAGTGTTTGTTGATGGGCCAGGAGCAGGG
AAGCACATCCAAGCTGGAGCCTCGAAAGTGATCATCACAGCACCAGCTAAAGGTGCTGAT
ATCCCAACCTATGTT*GTGGGAGTCAATGAGCAAGACTATTCTCATGACGTTGCTAACAT
CATTAGCAATGCATCTTGCACCACCAACTGTTTGGCTCCCTTTGCGAAAGTTTTGGATGA
AGAATTTGGAATCGTCAAGGGGACAATGACAACGACACACTCTTACACCGGAGACCAAAG
GCTCCTAGATGCATCACACAGGGACCTAAGGCGTGCAAGAGCCGCAGCACTGAACATTGT
ACCTACTAGCACAGTGCAGCAAAGCGGTGTCGTTGGTGCTCCCCCAGCTGAAGGGTAAAC
TCAACGGCATTGCACTCCGTGTGCGACCCAAACGTCTCTGTGGTTGACTTGTTATAACGT
TGAGAGAAAGTTTGACAGCTGAGACGTTACGACGCCTTCAGAAAGCGGCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EC35TF U 1
AF RS1AL57TF U 21
AF RS1FM29TF U 265
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RD RS1EC35TF 757 0 0
TTAGCCTTTTATCTTCTTGTTTCACTTTCAACTATGGCCACACATTCAGCTCTTGCCGTC
TCCAGAATCCCTGTCAAACCGAGGCAGCAGTCTAAGAGTGCCATTCACTCTTTCCCAGCT
CAATGTTCCTCCAAGAGGCTAGAAGTGGCTGCATTCTCCGGCCTGCGAGTCAGCAACAAC
GGTGGGGAAGCATCTTTCTTTGATGCCATAGCTGCACAAATCACCCCCAAGGCTGTGGGA
ACATCCACTCCTGTTAGAGGAGAGACAGTGGCAAAACTGAAGGTTGCCATCAATGGGTTT
GGGAGGATTGGTAGGAACTTCCTCAGGTGTTGGCACGGCCGCAAGGACTCTCCTCTTGAA
GTTGTTGTGCTTAACGACAGTGGTGGTGTCAAGAACGCATCCCACTTGCTCAAGTACGAC
TCCATGCTTGGAACCTTCAAGGCCGATGTGAAAATAGTCGACAATGAAACTATTAGCGTT
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CTCGGCATTGACATTGTCATCGAGGGAACAGGAGTGTTTGTTGATGGGCCAGGAGCAGG*
AAGCACATCCAAGCTGGAGCCTCGAAAGTGATCATCACAGCACCAGCTAAAG*TGCTGAT
ATCCCAACCTATGTT*GTGGGAGTCA*TGAGCA*GACTATTCTCATGACGTTGCTA*CAT
CATTAGCAATGCATCTTGCACCACCAACTGTTTGGCT

QA 1 757 1 757
DS 

RD RS1AL57TF 822 0 0
TTCACTTGCAACTATGGCCACACATTCAGCTCTTGCCGTCTCCAGAATCCCTGTCAAACC
GAGGCAGCAGTCTAAGAGTGCCATTCACTCTTTCCCAGCTCAATGTTCCTCCAAGAGGCT
AGAAGTGGCTGCATTCTCCGGCCTGCGAGTCAGCAACAACGGTGGGGAAGCATCTTTCTT
TGATGCCATAGCTGCACAAATCACCCCCAAGGCTGTGGGAACATCCACTCCTGTTAGAGG
AGAGACAGTGGTAAAACTGAAGGTTGCCATCAATGGGTTTGGAAGGATTGGTAGGAACTT
CCTCAGGTGTTGGCACGGCCGCAAGGACTCTCCTCTCGAAGTTGTTGTGCTTAACGACAG
TGGTGGTGTCAAGAACGCATCCCACTTGCTCAAGTATGACTCCATGCTTGGAACCTTCAA
GGCCGATGTGAAAATAGTCGACAATGAAACTATCAGCGTTGATGGCAAGCTCATCAAAGT
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CGAGGGAACAGGAGTGTTTGTTGATGGGCCAGGAGCAGGGAAGCACGTCCAAGCTGGAGC
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GAGTCAATGAACAAGACTATTCTCATGAAGTTGCTAACATCATTAGCAATGCATCTTGCA
CCACCAACTGTTTGGCTCCCTTTGCGAAAGTTTTGGATGAG**ATTTGGAATCGTCAAGG
GGACA*TGACA*CGACACACTCTTACACCGGAGACCAAAG
CT

QA 1 820 1 820
DS 

RD RS1FM29TF 807 0 0
G
CAGTGGCAAAACTGAAGGTTGCCATCAATGGGTTTGGGAGGATTGGTAGGAACTTCCTCA
GGTGTTGGCACGGCCGCAAGGACTCTCCTCTTGAAGTTGTTGTGCTTAACGACAGTGGTG
GTGTCAAGAACGCATCCCACTTGCTCAAGTACGACTCCATGCTTGGAACCTTCAAGGCCG
ATGTGGAAATAGTCGACAATGAAACTATTAGCGTTGATGGCAAGCTCATCAAAGTCGTCT
CAAACAGAGATCCTCTTAAGCTTCCATGGGCTGAGCTCGGCATTGACATTGTCATCGAGG
GAACAGGAGTGTTTGTTGATGGGCCAGGAGCAGGGAAGCACATCCAAGCTGGAGCCTCGA
AAGTGATCATCACAGCACCAGCTAAAGGTGCTGATATCCCAACCTATGTT*GTGGGAGTC
AATGAGCAAGACTATTCTCATGACGTTGCTAACATCATTAGCAATGCATCTTGTACCACC
AACTGTTTGGCTCCCTTTGCGAAAGTTTTGGATGAAGAATTTGGAATCGTCAAGGGGACA
ATGACAACGACACACTCTTACACCGGAGACCAAAGGCTCCTAGATGCATCACACAGGGAC
CTAAGGCGTGCAAGAGCCGCAGCACTGAACATTGTACCTACTAGCACAGTGCAGCAAAGC
GGTGTCGTTGGTGCTCCCCCAGCTGAAGGGTAAACTCAACGGCATTGCACTCCGTGTGCG
ACCCAAACGTCTCTGTGGTTGACTTGTTATAACGTTGAGAGAAAGTTTGACAGCTGAGAC
GTTACGACGCCTTCAGAAAGCGGCGC

QA 2 807 2 807
DS 



CO CL1753Contig2 707 2 1 U
CGGGTATTACATCGCCTCTTGATATAATAGTAAAAATAAAGAAAACCAAATACATGATTG
AGTTTTAAGAGGTATGGATTATATGATATCGATAAATTGTCACTGGAAGATAAGCCAAAT
TGCTTGGAAACAGTTTGGAAAAAAAGATTAAAATCAAGCTTCATAGACTTTGCATTCCTC
GTCGGCTGGGTTTGTCTTGCAAAAATCTTCCAAAGGGTCTCCGCTTCCAGCAGCAACCTC
TCCCGGCCACTTGGCAGCCACAAGGTGAGCCAAATCCACTACTCTTTGGCTGTAACCCCA
CTCGTTGTCGTACCAGGCGACCACCTTGACCATATCATCACCCATGACCATTGTGAGGGA
AGAGTCAATGGTGGTTGAGACATCAGAGCACCTGAAGTCACAAGAGACAAGCGGCGTGTC
GCAGACGTCTAGAACGCCCTTGAGCGGTCCAGCGGCCGCTTTTCTGAAGGCGTCGTTAAC
GTCTTCAGCTGTCAAACCTTTCTTCTCAACGTTTATAACAAGGTCAACCACAGAGACGTT
TGGGGTCGGCACACGGAGTGCAATGCCGTTGAGTTTACCCTTCAGCTGGGGGAGCACCAA
CGACACCGCCTTTGCTGCACCTGTGCTAGTAGGTACAATGTTCAGTGCTGCGGCTCTTGC
ACGCCTTAGTCCCTGTGTGATGCATCTAGGAGCCTTTGGTCTCCGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EC35JQ U 65
AF RS1FM29JQ U 1
BS 1 707 RS1FM29JQ

RD RS1EC35JQ 319 0 0
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TGGAAACAGTTTGGAAAAAAAGATTAAAATCAAGCTTCATAGACTTTGCATTCCTCGTCG
GCTGGGTTTGTCTTGCAAAAATCTTCCAAAGGGTCTCCGCTTCCAGCAGCAACCTCTCCC
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TCAATGGTGGTTGAGACAT

QA 1 319 1 319
DS 

RD RS1FM29JQ 707 0 0
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AGTTTTAAGAGGTATGGATTATATGATATCGATAAATTGTCACTGGAAGATAAGCCAAAT
TGCTTGGAAACAGTTTGGAAAAAAAGATTAAAATCAAGCTTCATAGACTTTGCATTCCTC
GTCGGCTGGGTTTGTCTTGCAAAAATCTTCCAAAGGGTCTCCGCTTCCAGCAGCAACCTC
TCCCGGCCACTTGGCAGCCACAAGGTGAGCCAAATCCACTACTCTTTGGCTGTAACCCCA
CTCGTTGTCGTACCAGGCGACCACCTTGACCATATCATCACCCATGACCATTGTGAGGGA
AGAGTCAATGGTGGTTGAGACATCAGAGCACCTGAAGTCACAAGAGACAAGCGGCGTGTC
GCAGACGTCTAGAACGCCCTTGAGCGGTCCAGCGGCCGCTTTTCTGAAGGCGTCGTTAAC
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TGGGGTCGGCACACGGAGTGCAATGCCGTTGAGTTTACCCTTCAGCTGGGGGAGCACCAA
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ACGCCTTAGTCCCTGTGTGATGCATCTAGGAGCCTTTGGTCTCCGGT

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 5

CO CL1754Contig1 696 5 10 U
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CATTCTTGCCTCAAGCTTTCACAAAACAGCAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAGGCTTT
TCTAAAGCAGCCTAAGGTCTTCCTTAGCTCGAAGATATCTGGAAAGGGAAAGCGACCTGG
GAAGGGTGGAAACCGTTTCTCCAAGAACATCGGTTTGGGCTTCAAGACTCCTCGTGAAGC
CATTCAAGGAACTTACATTGACAGAAAATGTCCCTTCACCGGAACTGTCTCCATCAGAGG
CCGTATCTTAGCCGGTACTTGCCACAGCGCCAAGATGCAGAGGACCATCATCGTGAGAAG
GAACTATCTTCACTTTGTCAAGAAGTATCAGAGGTACGAGAAGAGGCACTCGAACATCCC
TGCTCATGTCTCACCATGCTTCCGTGTCAAGGAAGGAGACCATGTCATCATCGGCCAATG
CAGGCCATTGTCCAAGACTGTGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATTCCCGCTGGTGCTTC
TGCTTTCGCGAAGAAGGCTTTTACTGGAATGTAAGAAGGGAGCTTTTCATCTTAGTTTAT
GTTTTTGGATGCTTTTATCCCTTTATCTATGGAAGAATTTCACATTTGAGTGTTCAGATA
TTAATGTTTTAATGCATCGATTTTGTTTATTTTGCA


BQ
20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AG23JQ C 1
AF RS1AK83TF U -2
AF RS1AG23TF U 1
AF RS1FR40TF U 1
AF RS1FR40JQ C 75
BS 1 2 RS1AG23TF
BS 3 42 RS1AK83TF
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BS 674 680 RS1AG23TF
BS 681 696 RS1FR40TF

RD RS1AG23JQ 680 0 0
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CATTCTTGCCTCAAGCTTTCACAAAACAGCAGCCATGGCAGAACAGACTGAGAAGGCTTT
TCTAAAGCAGCCTAAGGTCTTCCTTAGCTCGAAGATATCTGGAAAGGGAAAGCGACCTGG
GAAGGGTGGAAACCGATTCTCCAAGAACATCGGTTTGGGCTTCAAGACTCCTCGTGAAGC
CATTCAAGGAACTTACATTGACAGAAAATGTCCCTTCACCGGAACTGTCTCTATTAGAGG
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TGCTTTCGCGAAGAAGGCTTTTACTGGAATGTAATAAGGGAGCTTTTCAGCTTAGTTTAT
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TTAATGTTTTAATGCATCGA

QA 1 680 1 680
DS 

RD RS1AK83TF 676 0 0
GGCTC
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TTTTGGATGCTTTTATCCCTTTATCTATGGAAGAATTTCACATTTGAGTGTTCAGATATT
AATGTTTTAAT

QA 6 676 6 676
DS 

RD RS1AG23TF 680 0 0
GGGAAGCTTTAGCCGTCTCTGCCTCTCCTATCATATCATATCATATCATATCGTCTCCTA
CATTCTTGCCTCAAGCTTTCACAAAACAGCAGCCATGGCAGAACAGACTGAGAAGGCTTT
TCTAAAGCAGCCTAAGGTCTTCCTTAGCTCGAAGATATCTGGAAAGGGAAAGCGACCTGG
GAAGGGTGGAAACCGATTCTCCAAGAACATCGGTTTGGGCTTCAAGACTCCTCGTGAAGC
CATTCAAGGAACTTACATTGACAGAAAATGTCCCTTCACCGGAACTGTCTCTATTAGAGG
CCGTATCTTAGCCGGTACTTGCCACAGTGCCAAGATGCAGAGGACCATCATCGTGAGAAG
GAACTATCTCCACTTTGTCAAGAAGTATCAGAGGTACGAGAAGAGGCACTCGAACATCCC
TGCTCATGTCTCACCATGCTTCCGTGTCAAGGAAGGAGACCATGTCATCATCGGCCAATG
CAGGCCATTGTCCAAGACTGTGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATTCCCGCTGGTGCTTC
TGCTTTCGCGAAGAAGGCTTTTACTGGAATGTAATAAGGGAGCTTTTCAGCTTAGTTTAT
GTTTTTGGATGCTTTTATCCCTTTATCTATGGAAGAATTTTACATTTGAGTGTTCAGATA
TTAATGTTTTAATGCATCGA

QA 1 680 1 680
DS 

RD RS1FR40TF 696 0 0
GG
GAAGCTTTAGCCGTCTCTGCCTCTCCTATCATATCATATC**********GTCTCCTACA
TTCTTGCCCCAAGCTTTCACAAAACAGCAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAGGCTTTTC
TAAAGCAGCCTAAGGTCTTCCTTAGCTCGAAGATATCTGGAAAGGGAAAGCGACCTGGGA
AGGGTGGAAACCGTTTCTCCAAGAACATCGGTTTGGGCTTCAAGACTCCTCGTGAAGCCA
TTCAAGGAACTTACATTGACAGAAAATGTCCCTTCACCGGAACTGTCTCCATCAGAGGCC
GTATCTTAGCCGGTACTTGCCACAGCGCCAAGATGCAGAGGACCATCATCGTGAGAAGGA
ACTATCTTCACTTTGTCAAGAAGTATCAGAGGTACGAGAAGAGGCACTCGAACATCCCTG
CTCATGTCTCACCATGCTTCCGTGTCAAGGAAGGAGACCATGTCATCATCGGCCAATGCA
GGCCATTGTCCAAGACTGCGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATTCCCGCTGGTGCTTCTG
CTTTCGCGAAGAAGGCTTTTACTGGAATGTAAGAAGGGAGCTTTTCATCTTAGTTTATGT
TTTTGGATGCTTTTATCCCTTTATCTATGGAAGAATTTCACATTTGAGTGTTCAGATATT
AATGTTTTAATGCATCGATTTTGTTTATTTTGCA

QA 3 696 3 696
DS 

RD RS1FR40JQ 606 0 0
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AGGTCTTCCTTAGCTCGAAGATATCTGGAAAGGGAAAGCGACCTGGGAAGGGTGGAAACC
GTTTCTCCAAGAACATCGGTTTGGGCTTCAAGACTCCTCGTGAAGCCATTCAAGGAACTT
ACATTGACAGAAAATGTCCCTTCACCGGAACTGTCTCCATCAGAGGCCGTATCTTAGCCG
GTACTTGCCACAGCGCCAAGATGCAGAGGACCATCATCGTGAGAAGGAACTATCTTCACT
TTGTCAAGAAGTATCAGAGGTACGAGAAGAGGCACTCGAACATCCCTGCTCATGTCTCAC
CATGCTTCCGTGTCAAGGAAGGAGACCATGTCATCATCGGCCAATGCAGGCCATTGTCCA
AGACTGCGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATTCCCGCTGGTGCTTCTGCTTTCGCGAAGA
AGGCTTTTACTGGAATGTAAGAAGGGAGCTTTTCATCTTAGTTTATGTTTTTGGATGCTT
TTATCCCTTTATCTATGGAAGAATTTCACATTTGAGTGTTCAGATATTAATGTTTTAATG
CATCGA

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 4

CO CL1755Contig1 1080 4 19 U
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AGAAAAAAACGGAAGTAAAGAGGTACAAGATGCGTCCAGCTTTAAAAACACTAACTACAT
TGGCATTGTGTTCAGAATTCAGATCATCACATCTGCAAAACTATAAATTAAAAAAAAAAA
GAGAGAGAAGATCTCGTAGGAAAAGGGCCAAGATTTGCTGAGATGTGTAAGCTTTAATGT
TCTGTCATCTTTCTTCATCCCATTTGTCTTTAGGGATCTCTCCAGAATCAGCAATCACAA
CTTTCTTCCTTGGTTTGCCACTGTAAGTACCGGCTCCACCTTCAATGGCGAACACATTGT
CCATTCCTTGTATCACCTTCCCAAACACAACATGCTCCCCTTCCAACCAGCTAGCCTTGA
CAGTAGTGATAAAGAACTGTGAGCCATTAGAATCAGGTCCTGTATTAGCCATCGCCACAA
CACCTGCATGTGAATGCTTAATCTTGAAATTTTCGTCAGGAAAGGTACCACCATAGATTG
AGTCACTCCCTTTGCCATCACCATGGATGATGTCTCCTCCTTGGATTACGAATCCAGATA
TTATTCTATGAAAGGGTGTTCCTTTATAGTGCAGAGGCTTCCCGCTTGAAGTTTTCCCCT
TCTCTCCTGTGCATAATGCCCTGAAGTTTTCAACAGTTTTGGGTACAACAGTGCCATATA
ATCCAATAACGATCCTGCCTAAGCGTTGGCCGTCGATATCAACATCGAGAAACACTCTGT
GTGTGATTTCATAATCCTGGATCACTTGCTTCTCCTCCTCCTTGCCGGTGTTGAAGAGCG
CGAAGATGAGAAAGATGGTTAGGGCTACGAGGAGAAGAAGGCACCTGGGCTGTAACAAAA
ACGACATCTCTCTACCCATCTTTCCTTCTTAAGATTTCATCTCACTCCCAGAGCTCGATC
TCACCCTCCAAATCTCACTCCAAAGAGAGAAACTTTCGCTCTTTTTAAGATTCGATGCTA
TGGAAATTGTGTAAATCTTCGCGGCAATCAAGTTTGACAGACAGAGTCTGAACCCAAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GF72JQ U 1
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AF RS1GV68JQ U 104
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G
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DS 



AS 1 5

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BQ
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AF RS1C866JQ C 1
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QA 1 480 1 480
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QA 1 480 1 480
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RD RS1GD35TF 633 0 0
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QA 3 633 3 633
DS 



AS 1 5

CO CL1757Contig1 1408 5 7 U
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TCAGGGATAACCCTGAAGGAAACGGACACATACTACCTAACGAAACAACAAGAACCGCAG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CV20TF U 1
AF RS1H053TF U 477
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RD RS1CV20TF 640 0 0
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TCCTTGGGTTTTCTGCTGGTGCTAGCGGACAATGGCAAGAATGGCTCCCGTTCCTAACCA
GTAGAGCATGTTGCGCTGCATGTGGAAGTCTTAAAGCAGCTTTTCTTCTTGCAGTGGTGT
TTCTCACTATACGCACCCTTGTCACAATCTATTTTGCTGAAGAGATTCCTTTGGCAAGCA
GTAAGCCCAGCCGCATACAAGATTCTGCACCTTTGCTGGATGATCTCAAGCTTAAAGGCC
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TACAGCTTGGAAAGTCAAACAATGAGCATCAAGACGAGACCTATATTGAAGGCCCTGGAT
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TTATAGTCATGGCTCTTACATGGTTATCGTGGTTCCCCTTCTTTCTGTTTGATACAGATT
GGATGGGAAGAGAAGTTTACCATGGGGATCCAACAAAAAA

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1H053TF 615 0 0
GGATCTGTTTTAGTAAATTTGTTAACCGGTTTAAGGCATTTGCCGCCTGCTATGCACTCA
GTTCTTATAGTCATGGCTCTTACATGGTTATCGTGGTTCCCCTTCTTTCTGTTTGATACA
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CTTTATGGTCAAGGTGTCCGGGAAGGTGCATTTGGCTTGCTACTTAACTCTGTTGTTCTG
GGGATCAGCTCATTCTTGATCGAACCAATGTGTCAGCGGATGGGTGCACGAGCTGTATGG
GCTCTGAGCAACTTTACTGTATTTGCGTGCATGGCAGGGACAGCTGTCATTAGCTTGATG
TCTCTCAGGGATAACCCTGAAGGAAACGGACACATACTACCTAACGAAACAACAAGAACC
GCAGCCGTAATCGTCTTTGCACTCCTTGGTTTCCCTCTAGTTATTACATACAGTGTCCCT
TTCTCTGTCACAGCGGAAGTTACTGCTGATTCTGGTGGCGGTCAAGGTTTGGCTATAGGA
GTGTTGAATCTTGCAATTGTTATCCCCCAGATGATAGTGTCGCTTGGAGCGGGTCCATGG
GATGCATTGTTTGGA

QA 1 615 1 615
DS 

RD RS1CV20JQ 808 0 0
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TTCTGTTTGATACAGATTGGATGGGAAGAGAAGTTTACCATGGGGATCCAACAAAAAATA
GTTTTCTCGTGGAACTTTATGGTCAAGGTGTCCGGGAAGGTGCATTTGGCTTGCTACTTA
ACTCTGTTGTTCTGGGGATCAGCTCATTCTTGATCGAACCAATGTGTCAGCGGATGGGTG
CACGAGCTGTATGGGCTCTGAGCAACTTTACTGTATTTGCGTGCATGGCAGGGACAGCTG
TCATTAGCTTGATGTCTCTCAGGGATAACCCTGAAGGAAACGGACACATACTACCTAACG
AAACAACAAGAACCGCAGCCGTAATCGTCTTTGCACTCCTTGGTTTCCCTCTAGCTATTA
CATACAGTGTCCCTTTCTCTGTCACAGCGGAAGTTACTGCTGATTCTGGTGGCGGTCAAG
GTTTGGCTATAGGAGTGTTGAATCTTGCAATTGTTATCCCCCAGATGATAGTGTCGCTTG
GAGCGGGTCCATGGGATGCATTGTTTGGAGGAGGAAACTTACCTGCGTTTGTCTTGGCGT
CTGTTGCTGCTTTTGCTTCCGGAGTTATTGCTTTGCGTAGCCTTCCAACATTATCTAGTT
CGTTCAAGTCTACAGGTTTCCATATCGGGTAAAATCTTTACAAAACCGAGTCACACAGTC
TTTTTCAGGCGATATAGTCTTAAATTCAGATTTAGATCCATTCGATTCTTTCTTGGCCAT
GTTATCCTCTCTCGGCGTATATGTATGTAGACGTTTTTGTATATATGATTGTTATATTAT
ATTGTAAATACAA

QA 16 808 16 808
DS 

RD RS1C374TF 546 0 0
G
GGACACATACTACCTAACGAAACAACAAGAACCGCAGCCGTAATCGTCTTTGCACTCCTT
GGTTTCCCTCTAGCTATTACATACAGTGTCCCTTTCTCTGTCACAGCGGAAGTTACTGCT
GATTCTGGTGGCGGTCAAGGTTTGGCTATAGGAGTGTTGAATCTTGCAATTGTTATCCCC
CAGATGATAGTGCCGCTTGGAGCGGGTCCATGGGATGCATTGTTTGGAGGAGGAAACTTA
CCTGCGTTTGTCTTGGCGTCTGTTGCTGCTTTTGCTTCCGGAGTTATTGCTTTGCGTAGC
CTTCCAACATTATCTAGTTCGTTCAAGTCTACAGGTTTCCATATCGGGTAAAATCTTTAC
AAAACCGAGTCACACAGTCTTTTTCAGGCGATATAGTCTTAAATTCAGATTTAGATCCAT
CCGATTCTTTTTTGGCCATGTTATCCTCTCTCGGCGTATATGTATGTAGACGTTTTTGTA
TATATGATTGTTATATTATATTGTAAATACAACAATTTGACTCTAAATCTACAAATACCT
CTCTT

QA 2 546 2 546
DS 

RD RS1H053JQB 484 0 0
TAATCGTCTTTGCACTCCTTGGTTTCCCTCTAGTTATTACATACAGTGTCCCTTTTTCTG
TCACAGCGGAAGTTACTGCTGATTCTGGTGGCGGTCAAGGTTTGGCTATAGGAGTGTTGA
ATCTTGCAATTGTTATCCCCCAGATGATAGTGTCGCTTGGAGCGGGTCCATGGGATGCAT
TGTTTGGAGGAGGAAACTTACCTGCGTTTGTCTTGGCGTCTGTTGCTGCTTTTGCTTCCG
GAGTTATTGCTTTGCGTAGCCTTCCAACATTATTTAGTTCGTTCAAGTCTACAGGTTTCC
ATATCGGGTAAAATCTTTACAAAACCGAGTCACACAGTCTTTTTCAGGCGATATAGTCTT
AAATTCAGATTTAGATCCATTCGATTCTTTTTTGGCCATGTTATCCTCTCTCGGCGTATA
TGTATGTAGACGTTTTTGTATATATGATTGTTATATTATATTGTAAATACAACAATTTGA
CTC
C

QA 1 483 1 483
DS 



AS 2 5

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ACCACTATTGGTACTCTTTCGGTTGAACCACACATGGCAGCAACCATACAACCAGCACCA
GGCCATTTTGAAGATCCGTCATATGTCCAACCGCATCACGGTTGGTTGCGATGAAAAGAC
ATCCCGGATTCTCGCGTACACATAGCGTCGCGTACCTGCCCATGCGTTAGTCTAAAAATC
ATAGATACTTGATTTAAGGCAACAAACTTGCATATGCATGCAGATAGTGTATCAATCTTA
CTGAAGCTTATAGTAGTTGATGGTTGGGGGTCTAGTCCAACCACAACTGCTCCCACGGTT
TTATCATGATCAAAGAGACAGTTTGATTTCCATTGTGCCTTCTTTTCACCGTCTGCAGGA
CCACCAAAACCTGTAAAACCAGCAAGCTGAAGCTCCTCAAGAATGCCTTCTCCACCAATC
GCATAAACCTTCTTGTCCTTGGGGAAGTTGTTGGTTTTGAGGTACATAGCTGCCGCAAAA
GACGAAGAGAAATCTCTTCCTGAGTAACAGAAGTTAGACCCAAAGATTGGAACTTCTCTG
CGTATTGCCTCCTCGATTTCATCGAGTTGTTAGTCACAAAGACAATGTTTTTACCCTTGG
ATCGGAGTAAGTCGAGAGTTCGAGAGACGCCATCGATGAGCGTATCCCCCTTCCATATAA
CACCATCGCAGTCAAAGAGGAAAGTGTTGACAGAGTCGAACAGAGATTTGAAGTTACTGG
AGGAGAGAAGCTTAGGCGCCATTAGAGAGTCTCCTCTTTCTCAAAAGAAAGAATGTTCCT
TTTTCCCCAGAACTTGTGAGTAGTAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AR41JQ U 138
AF RS1AR41TFB C 1
BS 1 137 RS1AR41TFB
BS 138 456 RS1AR41JQ
BS 457 869 RS1AR41TFB

RD RS1AR41JQ 327 0 0
GTCATATGTCCAACCGCATCACGGTTGGTTGCGATGAAAAGACATCCCGGATTCTCGCGT
ACACATAGCGTCGCGTACCTGCCCATGCGTTAGTCTAAAAATCATAGATACTTGATTTAA
GGCAACAAACTTGCATATGCATGCAGATAGTGTATCAATCTTACTGAAGCTTATAGTAGT
TGATGGTTGGGGGTCTAGTCCAACCACAACTGCTCCCACGGTTTTATCATGATCAAAGAG
ACAGTTTGATTTCCATTGTGCCTTCTTTTCACCGTCTGCAGGACCACCAAAACCTGTAAA
ACCAGCAAGCTGAAGCTCC
CTCAAGAA

QA 1 319 1 319
DS 

RD RS1AR41TFB 869 0 0
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ACCACTATTGGTACTCTTTCGGTTGAACCACACATGGCAGCAACCATACAACCAGCACCA
GGCCATTTTGAAGATCCGTCATATGTCCAACCGCATCACGGTTGGTTGCGATGAAAAGAC
ATCCCGGATTCTCGCGTACACATAGCGTCGCGTACCTGCCCATGCGTTAGTCTAAAAATC
ATAGATACTTGATTTAAGGCAACAAACTTGCATATGCATGCAGATAGTGTATCAATCTTA
CTGAAGCTTATAGTAGTTGATGTT**GGGGTCTAGTCCAACCACAACTGCTCCCACGGTT
TTATCATGATCAAAGAGACAGTTTGATTTCCATTGTGCCTTCTTTTCACCGTCTGCAGGA
CCACCAAAACCTGTAAAACCAGCAAGCTGAAGCTCCTCAAGAATGCCTTCTCCACCAATC
GCATAAACCTTCTTGTCCTTGGGGAAGTTGTTGGTTTTGAGGTACATAGCTGCCGCAAAA
GACGAAGAGAAATCTCTTCCTGAGTAACAGAAGTTAGACCCAAAGATTGGAACTTCTCTG
CGTATTGCCTCCTCGATTTCATCGAGTTGTTAGTCACAAAGACAATGTTTTTACCCTTGG
ATCGGAGTAAGTCGAGAGTTCGAGAGACGCCATCGATGAGCGTATCCCCCTTCCATATAA
CACCATCGCAGTCAAAGAGGAAAGTGTTGACAGAGTCGAACAGAGATTTGAAGTTACTGG
AGGAGAGAAGCTTAGGCGCCATTAGAGAGTCTCCTCTTTCTCAAAAGAAAGAATGTTCCT
TTTTCCCCAGAACTTGTGAGTAGTAGTCC

QA 1 869 1 869
DS 



CO CL1758Contig2 1111 3 10 U
GGATTCAACTCAACTTTTTATTAAAGCTAGCAGGCCATGTTTTCTGTTGATGTAATAGTA
TAACAGATCACCAGATTGATTATTACAGTAAAGCAAAAAAATCAGAAATTTCATCTTGCC
ATATATACCCAAAACTGTTTCAGGGTAGAGACCAAGATGGTGATGATGCCCTTTACTTAC
TATGGGGGGAGTCCATAAGTTTAGTGATATCAGAGACCATGCTTGTGTAATAGTCTGGTT
CAATCTTATTGCTCTCGTCTAGTAAATTAAACTCACTTGTACACCCTGTTAGGACGAGGA
AAGTTTTGCAGCCAGCATTCTGTCCAAACAATACATCAGTGTCGAGCCTATCACCCACCA
TGCACATTCTCGACGTTT*TGTCCCAAATTTCTGCATCAGAAAGTCCATCATGAAAGTAG
CTGGTTTACCAACCACTATTGGTTCTCTTTCGGTTGAACCACACATGGCAGCAACCATAC
AACCAGCACCAGGCCACTCTTGAAGATCGGTCATATGTCCAACCGCATCACGGTTGGTCG
CAATGAAAAGACATCCCGGATTCTCGCGTACACATAGCGTCGCGTACTGAAGCTTATAGT
AGTTGATGTTGGGGTCTAGTCCAACCACAACTGCTCCCACGGTTTTATCATGTTCAAAGA
GACAGTTTGATTTCCATTGTGCCTTCTTTTCACCGTCTGCAGGACCACCAAGACCTGTAT
AACCAGCAAGCTGAAGCTCCTCAAGAATGCCTTCTCCACCGATCGCATAAACCTTCTTGT
CCTTGGGGAAGTTGTTGGCTTTGAGGTACATAGCTGCCGCAAAAGACGAAGAGAATATCT
CTTCCTGAGTAACAGAAGTTAGACCCAAAGATTGGAACTTCTCTGCGTATTGCCTTCTCG
ATTTCATAGAGTTGTTCGTCACAAAGACTATGTTTTTACCCTTGGATCGGAGTAAGTCGA
GAGTTTGAGGGACGCCATCGATGAGCGTATCCCCCTTCCATATAACACCATCGCAGTCAA
AGAGGAAAGTGTCGACAGAATCGAATAGAGATTTGAAGTTAGTGGAGGAGAGAAGCTTAG
GCGCCATTAGAGTATCTTTCTCAAAAGCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1C422JQ U 235
AF RS1DV10JQ U 1
AF RS1C422TF C 314
BS 1 264 RS1DV10JQ
BS 265 265 RS1C422JQ
BS 266 269 RS1DV10JQ
BS 270 270 RS1C422JQ
BS 271 300 RS1DV10JQ
BS 301 301 RS1C422JQ
BS 302 378 RS1DV10JQ
BS 379 379 RS1C422JQ
BS 380 671 RS1DV10JQ
BS 672 1111 RS1C422TF

RD RS1C422JQ 268 0 0
CTGGTTCAATCTTATTGCTCTCGTCTAGTAAATTAAACTCACTTGTACACCCTGTTAGGA
CGAGGAAAGTTTTGCAGCCAGCATTCTGTCCAAACAATACATCAGTGTCGAGCCTATCAC
CCACCATGCACATTCTCGACGTTT*TGTCCCAAATTTCTGCATCAAAAAGTCCATCATGA
AAGTAGCTGGTTTACCAACCACTATTGGTTCTCTTTCGGTTGAACCACACATGGCAGCAA
CCATACAACCAGCACCAGGCCA
CTCTTG

QA 1 262 1 262
DS 

RD RS1DV10JQ 671 0 0
GGATTCAACTCAACTTTTTATTAAAGCTAGCAGGCCATGTTTTCTGTTGATGTAATAGTA
TAACAGATCACCAGATTGATTATTACAGTAAAGCAAAAAAATCAGAAATTTCATCTTGCC
ATATATACCCAAAACTGTTTCAGGGTAGAGACCAAGATGGTGATGATGCCCTTTACTTAC
TATGGGGGGAGTCCATAAGTTTAGTGATATCAGAGACCATGCTTGTGTAATAGTCTGGTT
CAATCTTATTGCTCTCGTCTAGTAGATTAGACTCACTTGTACACCCTGTTAGGACGAGGA
GAGTTTTGCAGCCAGCATTCTGTCCAAACAATACATCAGTGTCGAGCCTATCACCCACCA
TGCACATTCTCGACGTTTCTGTCCCAAATTTCTGCATCAGAAAGTCCATCATGAAAGTAG
CTGGTTTACCAACCACTATTGGTTCTCTTTCGGTTGAACCACACATGGCAGCAACCATAC
AACCAGCACCAGGCCACTCTTGAAGATCGGTCATATGTCCAACCGCATCACGGTTGGTCG
CAATGAAAAGACATCCCGGATTCTCGCGTACACATAGCGTCGCGTACTGAAGCTTATAGT
AGTTGATGTTGGGGTCTAGTCCAACCACAACTGCTCCCACGGTTTTATCATGTTCAAAGA
GACAGTTTGAT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1C422TF 798 0 0
CAGCA
TCTGTCCAAACA*TACATCAGTGTCGAGC*TATCACCCACCATGCACAT*CTCGACGTTT
*TGTCCCAAATTTCTGCATCAGAAAGTCCATCATGAAAGTAGCTGGTTTACCAACCACTA
TTGGTTCTCTTTCGGTTGAACCACACATGGCAGCAACCATACAACCAGCACCAGGCCACT
CTTGAAGATCGGTCATATGTCCAACCGCATCACGGTTGGTCGCAATGAAAAGACATCCCG
GATTCTCGCGTACACATAGCGTCGCGTACTGAAGCTTGTAGTAGTTGATGTTGGGGTCTA
GTCCAACCACAACTGCTCCCACGGTTTTATCATGTTCAAAGAGACAGTTTGATTTCCATT
GTGCCTTCTTTTCACCGTCTGCAGGACCACCAAGACCTGTATAACCAGCAAGCTGAAGCT
CCTCAAGAATGCCTTCTCCACCGATCGCATAAACCTTCTTGTCCTTGGGGAAGTTGTTGG
CTTTGAGGTACATAGCTGCCGCAAAAGACGAAGAGAATATCTCTTCCTGAGTAACAGAAG
TTAGACCCAAAGATTGGAACTTCTCTGCGTATTGCCTTCTCGATTTCATAGAGTTGTTCG
TCACAAAGACTATGTTTTTACCCTTGGATCGGAGTAAGTCGAGAGTTTGAGGGACGCCAT
CGATGAGCGTATCCCCCTTCCATATAACACCATCGCAGTCAAAGAGGAAAGTGTCGACAG
AATCGAATAGAGATTTGAAGTTAGTGGAGGAGAGAAGCTTAGGCGCCATTAGAGTATCTT
TCTCAAAAGCCCT

QA 6 798 6 798
DS 



AS 1 5

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TAAAACACATAGTTTTGGAATCTTAAGTAGAATAGAAGAGAACATTAGAGTTCTTTGAAA
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CTTGGCTTCTCCTTCTTCTCCTTGAAGAGGGCCAAGAGTGAGACACCAGAAACCTTGACG
ACCTTGAACCTAACTCCGGGAATATCTCCCACAGCATGACCTTTACGCCCAAATCCAGCA
ATCAACACCTCGTCATTTTCCTCAATGTAGTTCAAGAAACCATCGTTGGGGACAAAAGCG
GCAATCTTCTTGCCGTTCTTGATAAGCTGAACTCTAGCACACTTACGGATAGCAGAGTTA
GGCTGCTTAGCCTCAATACCGATTTTCTCAAGAACGATGCCCTTGGCGTGGGAAGAACCA
GCGAAAGGCTTCTTCCATTCATTCCCCTGATGTGACTTCTTGTACTGCTTGTCAGCCCAC
CTCTGATTGATCCGGAGTCTTTTGAGCTTGCGCCCTGCTCCCATACCCCTTGTCTTACCC
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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

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QA 1 748 1 748
DS 

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QA 1 740 1 740
DS 

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GGCCAAGAGTGAGACACCAGAAACCTTGACGACCTTGAACCTAACTCCGGGAATATCTCC
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GTTCAAGCAACCATCGTTGGGGACAAAAGCGGCAATCTTCTTGCCGTTCTTGATAAGCTG
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QA 1 659 1 659
DS 

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CTGTGAAAACCCTAACCCTCC

QA 1 261 1 261
DS 



AS 1 5

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AACGATAATCCGGGATAAATAATCAAACTTGCGTGCTTTTTGC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F511TF U 1
AF RS1CD23TF U 21
AF RS1H746TF U 21
AF RS1EK75TF U 1
AF RS1CD23JQ C 657
BS 1 682 RS1EK75TF
BS 683 683 RS1CD23JQ
BS 684 730 RS1EK75TF
BS 731 1363 RS1CD23JQ

RD RS1F511TF 526 0 0
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TCAAAGATCGAAACGACATCTTCTGCAAGCATGTCAAGCGAAGGAGACACCACCCTCAAG
TCTATTTGCTACAAGCCTGGCTCTCTCCAGTTACTCGATCAGAGGAAGCTTCCTTTGGAG
ACTACTTACTTAGAGATCCGTGATGCTGCTGATGGATGGAGTGCGATACAGGAGATGGTG
GTACGTGGTGCTCCTGCTATAGCCATTGCTGCAGCTCTCTCTTTAGCTGTTGAAGTCTCC
AACTTTAGTGGTTTCGATGGATCATCAGCAGAAGCTGTTACTCTCCTTGAGAAGAAGTTG
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AAACATGTTATAGCAAATGCCTTGGCTACTTCTGCCCTTGAACCTAACTCCATTTTCAAG
GCATATATCGAAGCTGCTGAGAATATACTCGAAGATGATGTCGCTT

QA 1 526 1 526
DS 

RD RS1CD23TF 670 0 0
GG
ACACAGAGTCTTTCGCATTCCTTTATTCCGACGCCAATTCAAAGATCGAAACGACATCTT
CTGCAAGCATGTCAAGCGAAGGAGACACCACCCTCAAGTCTATCTGCTACAAGCCTGGCT
CTCTCCAGTTACTCGATCAGAGGAAGCTTCCTTTGGAGACTACTTACTTAGAGATCCGTG
ATGCTGCTGATGGATGGAGTGCGATACAGGAGATGGTGGTACGTGGTGCTCCTGCTAT*G
CCATTGCTGCAGCCCTCTCTTTAGCTGTTGAAGTCTCCAACTTTAGTGGTTTCGATGGAT
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CAACAGCTGTTAATCTTGCGGATGCTGCTTTGAAACTTAAACATGTTATAGCAAATGCCT
TGGCTACTTCTGCCCTTGAACCTAACTCCATTTTCAAGGCATATATCGAAGCTGCTGAGA
ATATGCTCGAAGATGATGTCGCTTCAAACAAAGCAATAGGTACCTTTGGTTCAAGCTTAC
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GCCTTGCTACTGCCGGATATGGAACTGCCCTGGGTGTTATCCGTGCACTCCACACTCAAG
GAGTCTTA

QA 3 662 3 662
DS 

RD RS1H746TF 663 0 0
GG
ACACACAGTCTTTCGCATTCATTTATTCCGACGCCAATTCAAAGATCGAAACGACATCTT
CTGCAAGCATGCCAAGCGAAGGAGACACCACCCTCAAGTCTATTTGCTACAAGCCTGGCT
CTCTCCAGTTACTCGATCAGAGGAAGCTTCCTTTGGAGACTACTTACTTAGAGATCCGTG
ATGCTGCTGATGGATGGAGTGCGATACAGGAGATGGTGGTACGTGGTGCTCCTGCTATAG
CCATTGCTGCAGCTCTCTCTTTAGCTGTTGAAGTCTCCAACTTTAGTGGTTTCGATGGAT
CATCAGCAGAAGCTGTTACTCTCCTTGAGAAGAAGTTGGATTATTTGGTGTCAAGCCGGC
CAACAGCTGTTAATCTTGCGGATGCTGCTTTGAAACTTAAACATGTTATAGCAAATGCCT
TGGCTACTTCTGCCCTTGAACCTAACTCCATTTTCAAGGCATATATCGAAGCTGCTGAGA
ATATGCTCGAAGATGATGTCGCTTCAAACAAAGCAATAGGGACCTTTGGTTCAAGCTTAC
TGAGGCAGCAAGCCAAAAATCCTGACAAGCGTTCTGTTCTGACCCATTGCAACACCGGCA
GCCTTGCTACTGCCGGATATGGAACTGCCCTGGGTGTTATCCGTGCACTCCACACTCAAG
A

QA 3 662 3 662
DS 

RD RS1EK75TF 739 0 0
GGGATTCTCATTTCTCACACCCACACACAGTCTTTCGCATTCATTTATTCCGACGCCAAT
TCAAAGATCGAAACGACATCTTCTGCAAGCATGTCAAGCGAAGGAGACACCACCCTCAAG
TCTATTTGCTACAAGCCTGGCTCTCTCCAGTTACTCGATCAGAGGAAGCTTCCTTTGGAG
ACTACTTACTTAGAGATCCGTGATGCTGCTGATGGATGGAGTGCGATACAGGAGATGGTG
GTACGTGGTGCTCCTGCTATAGCCATTGCTGCAGCTCTCTCTTTAGCTGTTGAAGTCTCC
AACTTTAGTGGTTTCGATGGATCATCAGCAGAAGCTGTTACTCTCCTTGAGAAGAAGTTG
GATTATTTGGTGTCAAGCCGGCCAACAGCTGTTAATCTTGCGGATGCTGCTTTGAAACTT
AAACATGTTATAGCAAATGCCTTGGCTACTTCTGCCCTTGAACCTAACTCCATTTTCAAG
GCATATATCGAAGCTGCTGAGAATATACTCGAAGATGATGTCGCTTCAAACAAAGCAATA
GGGACCTTTGGTTCAAGCTTACTGAGGCAGCAAGCCAAAAATCCTGACAAGCTTTCTGTT
CTGACCCATTGCAACACCGGCAGCCTTGCTACTGCCGGATATGGAACTGCCCTGGGTGTT
ATCCGTGCACTCCACACTCAAG*AGTCTTAGAAAGAGCATACTGCACAGAAACACGTCCA
TTCAATCAAG
ATCGAGGCT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RS1CD23JQ 707 0 0
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TCCATTCAATCAAGGATCTAGGCTTACAGCGTTTGAGTTGGTCCATGAAAAGATCCCTGC
AACTCTCATTGCAGACTCAGCTGCAGCTGCACTTATGAAAGATGGTCGTGTAGATGATGT
CATTGTTGGAGCAGACCGTGTGGCTTCAAATGGTGATACTGCTAACAAGATTGGGACTTA
CAGTCTCGCCCTGTGCGCAAAACATCACGGGATACCGTTTTATGTTGCTGCACCTCTCAC
CTCAGTGGATCTTTTTCTGTCGTCCGGGAAAGAGATAGTGATAGAAGAAAGAACAGCGAA
CGAGTTGCTGAACACACATGGAGGGCTTGGTGAACGCATTGCAGCACCAGGGATCTCGGT
TTGGAACCCAGCTTTTGATGTGACTCCAGCTGAGCTGATTGCAGGAATCATAACCGAGAA
GGGGGTCATAACAAAGAATGACAATGATGCATTTGACATAAGCAGCTTTGCCAAAAAGAT
GACAGGAAAGTGAAGTTGTGTACGAGTCGCCGATGTGTCCACCTCTATGTTATTGCAACA
AAGCACAATACTTTGTAACTAACGATACAATAAGCTTTGTACTGTTTTAAACTACTTAAT
TTGTAACGATAATCCGGGATAAATAATCAAACTTGCGTGCTTTTTGC

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 4

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AAGAGGAGAAGGCAAGAGTGGTTCTCAAGTTTGTGTGGATGGAAAAAAACATAGGATTAG
GATTGGACCAGCATGTACCTGGACACGGCACAATCCCACTAAGTCCTTACTTCTTCTGAC
CAAGAAAAGATGCTTGGGAAGAGCTTAGAGTCCACTCTTGAAGCTAAGCCATGGATCTCT
CAGAAGAAGATGATCATTCTCCTTAATCAAGCCACTGACATCATCAATCTCTGGCAACAA
AGTGGCGGCAACTTAACTTCCCAATAATCTTTGTCTATTGAGAGTTATTTTTTTTTTTAC
AATCATATCTAAACAAATATTACATAATTGAAAATGTTTTCAAGTTGAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DD12JQ C 1
AF RS1BC30JQ C 23
AF RS1BC30TF U 23
AF RS1DD12TF U 1
BS 1 22 RS1DD12TF
BS 23 41 RS1BC30TF
BS 42 42 RS1DD12TF
BS 43 286 RS1BC30TF
BS 287 287 RS1DD12TF
BS 288 387 RS1BC30TF
BS 388 388 RS1DD12TF
BS 389 536 RS1BC30TF
BS 537 538 RS1DD12TF
BS 539 570 RS1BC30TF
BS 571 589 RS1DD12TF

RD RS1DD12JQ 589 0 0
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GCTCTTCTTTCATCTCTCAACATCCAAAACTCTCCTTCACTGCTTCTCCATCGTTCCATA
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CAAGAAAAGATGCTTGGGAAGAGCTTTGAGTCCACTCTTGAAGCTAAGCCATGGATCTCT
CAGAAGAAGATGATCATTCTCCTTAATCAAGCCACTGACATCGTCAATCTCTGGCAACAA
AGTGGCGGCAACTTAACTTCCCAATAATCTTTGTCTATTGAGAGTTATTTTTTTTTTTAC
AATCATATCTAAACAAATATTACATAATTGAAAATGTTTTCAAGTTGAT

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1BC30JQ 548 0 0
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TCCAAAACTCTCCTTCACTGCTTTTCCATCGTTCCATAACCACGCCACAAAACCCATATC
TTTAAACCGGAAGAAGATCGTGGCTCTTGCAGCTCCAGAGACACTCACCGGAACTGATGT
TTCCGACACTCCACAACCAAAACAGGTAGTGAACCAACAAGAGGAGAAGGCAAGAGTGGT
TCTCAAGTTTGTGTGGATGGAAAAGAACATAGGATTAGGATTGGACCAGCATGTACCTGG
ACACGGCACAATCCCACTAAGTCCTTACTTCTTCTGACCAAGAAAAGATGCTTGGGAAGA
GCTTA*AGTCCACTCTTGAAGCTAAGCCATGGATCTCTCAGAAGAAGATGATCATTCTCC
TTAATCAAGCCACTGACATCATCAATCTCTGGCAACAAAGTGGCGGCAACTTAACTTCCC
AATAATCTTTGTCTATTGAGAGTTATTTTTTTTT**ACAATCATATCTAAACAAATATTA
CATAATTG

QA 1 548 1 548
DS 

RD RS1BC30TF 548 0 0
GATGTCATCAATGGCACTC*ACTCATCTGCTTCCATGTGCTCTTCTTTCATCTCTCAACA
TCCAAAACTCTCCTTCACTGCTTCTCCATCGTTCCATAACCACGCCACAAAACCCATATC
TCTAAACCGGAAGAAGATCGTGGCTCTTGCAGCTCCAGAGACACTCACCGGAACTGATGT
TTCCGACACTCCACAACCAAAACAGGTAGTGAACCAACAAGAGGAGAAGGCAAGAGTGGT
TCTCAAGTTTGTGTGGATGGAAAAGAACATAGGATTAGGATTGGACCAGCATGTACCTGG
ACACGGCACAATCCCACTAAGTCCTTACTTCTTCTGACCAAGAAAAGATGCTTGGGAAGA
GCTTA*AGTCCACTCTTGAAGCTAAGCCATGGATCTCTCAGAAGAAGATGATCATTCTCC
TTAATCAAGCCACTGACATCATCAATCTCTGGCAACAAAGTGGCGGCAACTTAACTTCCC
AATAATCTTTGTCTATTGAGAGTTATTTTTTTTT**ACAATCATATCTAAACAAATATTA
CATAATTG

QA 1 548 1 548
DS 

RD RS1DD12TF 589 0 0
GGAGAAACAAGTAAAAGAAAATGATGTCATCAATGGCACTCCACTCATCTGCTTCCATGT
GCTCTTCTTTCATCTCTCAACATCCAAAACTCTCCTTCACTGCTTCTCCATCGTTCCATA
ACCACGCCACAAAACCCATATCTCTAAACCGGAAGAAGATGGTGGCTCTTGCAGCTCCAG
AGACACTCACCGGAACTGATGTTTCCGACACTCCACAACCAAAACAGGTAGTGAACCAAC
AAGAGTAGAAGGCAGGAGTGGTTCTTAAGTTTGTGTGGATGGAAAAAAACATAGGATTAG
GATTGGACCAGCATGTACCTGGACATGGCACAATCCCACTAAGTCCTTACTTCTTCTGGC
CAAGAAAAGATGCTTGGGAAGAGCTTTGAGTCCACTCTTGAAGCTAAGCCATGGATCTCT
CAGAAGAAGATGATCATTCTCCTTAATCAAGCCACTGACATCGTCAATCTCTGGCAACAA
AGTGGCGGCAACTTAACTTCCCAATAATCTTTGTCTATTGAGAGTTATTTTTTTTTTTAC
AATCATATCTAAACAAATATTACATAATTGAAAATGTTTTCAAGTTGAT

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 5

CO CL1762Contig1 1163 5 7 U
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AAACTTTAAAATTTTTCAACCACTAAACATTAACTCACGGAATTGTTTCTTTTATTTAAA
GAAAAAGCTGCAACCACTCCGTACAGACCAAAAGCACAACTAGTTTCTTTTATTTGGAAG
GGAAAAAAAGTCCAAAAATCAACTAGGGAAAGAGAAAGTGCTTCTCAAGCATAATGTGTC
TTAGGATGCAAATAAAAAGACGAAAGTGTCTTATGAAGTAATCCACTCATGAATTATTAG
AGCTTGCCACATGACCAGACAGATCTAGTCAAGGTAAAACAATTATTGCCACTACACCAC
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AATCGAACTGTCCAGCTCCAAGCGACACCACCATTTGTGGTACCACGATTGCCAAATTTA
AAACTCCCAGTGAAAGCCCTTGACCAGCGCCAGAATTGCTTGAGATTATGGAAGCTAATG
CAAACGGAATACTAAACGTAATAGCAAGTGGAATACCAAGAATAGCAAAGAGAGTCAATG
CACCAGCTCTAATGCCATCGGTCGGACCGGCCAATTCACCGGCGGTTTTCCTGTGAGCTT
CAGCCAACTTTGTAACCAAAACCGTCATAGCCAAACACACTGCAAGAATAAAGTTCACAA
CTCCCCAAAGTCGTTTAGCACCTCCCATTATCCGACTAATCCATTCAATACCAAGCGACA
TGAATCCAAGAACGATGGCATTTATCATCAGTCCCAACGCACCGGCTTGCACTCCTTGGT
TGTAAAGCTTCTTCAAACCATCGTTCCCGCTCGAGTCTCCACCGTACACCTCACGACCCA
TCCAATCGGTATCAAACAGAAGAAAAGGGAACCATGCGATCCAGTTAATGGCAGTGACGA
TTATCAGCATCCACATGGGACGTTCCATCACCTTGAAGGCTTTGACGATCTCCCCGAAGA
AGGGTGTCTTCACGTCGAGGTCTTCCTTTTCCGGCAACCATTGCTTGTCTTTAACGTACC
AGAGCGATGATATGGTTACGAACAAGAGTAAAATGATGGAGAGGAAGAAACAGCTCTTGA
GATTCGCGCAATAAATATCACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1H082JQB U 1
AF RS1GZ39JQ U 35
AF RS1FH14JQ U 96
AF RS1E718TF C 291
AF RS1FH14TF C 1005
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AAACTCCCAGTGAAAGCCCTTGACCAGCGCCAGAATTGCTTGAGATTATGGAAGCTAATG
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CACAACTAGTTTCTTTTATTTGGAAGGGAAAAAAAGTCCAAAAATCAACTAGGGAAAGAG
AAAGTGCTTCTCAAGCATAATGTGTCTTAGGATGCAAATAAAAAGACGAAAGTGTCTTAT
GAAGTAATCCACTCATGAATTATTAGAGCTTGCCACATGACCAGACAGATCTAGTCAAGG
TAAAACAATTATTGCCACTACACCACTGATTGCAGCTGCAATTGCTCCGACCACAAATGC
TGGTAGGTTTCCACCTCCGAACCACGAATCGAACTGTCCAGCTCCAAGCGACACCACCAT
TTGTGGTACCACGATTGCCAAATTTAAAACTCCCAGTGAAAGCCCTTGACCAGCGCCAGA
ATTGCTTGAGATTATGGAAGCTAATGCAAACGGAATACTAAACGTAATAGCAAGTGGAAT
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TTCACCGGCGGTTTTCCTGTGAGCTTCAGCCAACTTTGTAACCAAAACCGTCATAGCCAA
ACACACTGCAAGAATAAAGTTCACAACTCC

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AAGTAATCCACTCATGAATTATTAGAGCTTGCCACATGACCAGACAGATCTAGTCAAGGT
AAAACAATTATTGCCACTACACCACTGATTGCAGCTGCAATTGCTCCGACCACAAATGCT
GGTAGGTTTCCACCTCCGAACCACGAATCGAACTGTCCAGCTCCAAGCGACACCACCATT
TGTGGTACCACGATCGCCAAATTTAAAACTCCCAGTGAAAGCCCTTGACCAGCGCCAGAA
TTGCTTGAGATTATGGAAGCTAATGCAAACGGAATACTAAACGTAATAGCAAGTGGAATA
CCAAGAATAGCAAAGAGAGTCAATGCACCAGCTCTAATGCCATCGGTCGGACCGGCCAAT
TCACCGGCGGTTTTCCTGTGAGCTTCAGCCAACTTTGTAACCAAAACCGTCATAGCCAAA
CACACTGCAAGAATAAAGTTCACAACTCCCCAAAGTCGTTTAGCACCTCCCATTATCCGA
CTAATCCATTCAATACCAAGCGACATGAATCCAAGAACGATGGCATTTAT

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GAACTGTCCAGCTC*AAGCGACACCACCATTTGTGGTACCACGATTGCCAAATTTAAAAC
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CCAAAGTCGTTTAGCACCTCCCATTATCCGACTAATCCATTCAATACCAAGCGACATGAA
TCCAAGAACGATGGCATTTATCATCAGTCCCAACGCACCGGCTTGCACTCCTTGGTTGTA
AAGCTTCTTCAAACCATCGTTCCCGCTCGAGTCTCCACCGTACACCTCACGACCCATCCA
ATCGGTATCAAACAGAAGAAAAGGGAACCATGCGATCCAGTTAATGGCAGTGACGATTAT
CAGCATCCACATGGGACGTTCCATCACCTTGAAGGCTTTGACGATCTCCCCGAAGAAGGG
TGTCTTCACGTCGAGGTCTTCCTTTTCCGGC

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AAGAAACAGCTCTTGAGATTCGCGCAATAAATATCACAC

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DS 



AS 1 5

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AAGACGAAAGACGTAAAGAGTCTAACAAAGGGAAGTACATGAAATAAACTAGGCAATAGA
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AGAGAGCTCTCTTACGCTGACCAAGCATGTACCTGTACATGTGCGGGCTACCAGGGACAT
AGATTGCAAGGACAAGTATTGTTGCGTAGAAGAAGTCGAATGAGAAGTTTAATGTGTTAG
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CTACTTCACTGGTGATACCGGTAGGATATAGCACTAAAAAGCTGCTGTATCTGAGCCACA
AGTGCCATGAAGGTGCAAAGCCTAGAGCTTCCTTAAGTCCAAAGAAGGAGTAGCGGATAA
TCTCCGTGATAGACCAGCTTATGACCAGCGACGCAACAAGAAAATGTGATTGGACCTCTG
GAAAACTGTATAGGATGCCCCAAGTGAGAAACAGCCTTGAACCTATCTGTGGCAGAGTAG
CAGAAACAGGAGATCTGACCAAACCTACTAATCCATGAAGAATCTCGAGAACAGCGGCGG
TCTGAGCAAGCTGGAGAGGCTTCTCAACGGCCTCATAGACATTTTCATGTCCCGTTTCCT
TCAACGTCTTTACCGCAAAGTACAAAACTTGAGCCCATCCAGCAAAGACGATCCAGTTGT
AGAGAGTGAGGTACACGCGACGGATGAAGGAGAAAGAGCCTGCCATGGAAAGGAAGGTGG
AGACAGCGACTTCGGACTCACCAAAGAGAGAGCAAAAGAGTAGAGACTTTATGGCGGAGA
GATCGGAAGTGAAAGCATCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTA
CCGTCGACT


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A164JQ U 1
AF RS1G338JQ U 271
AF RS1A164TR U 1
AF RS1A164TF C 97
AF RS1A164TV C 45
BS 1 821 RS1A164JQ
BS 822 969 RS1A164TV

RD RS1A164JQ 821 0 0
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AAGACGAAAGACGTAAAGAGTCTAACAAAGGGAAGTACATGAAATAAACTAGGCAATAGA
AGACAGTTGATGGGCGAGCCTTGGTCTCTCTATAAGCTTTTTATTCCCTCTTGGATTTGG
AGAGAGCTCTCTTACGCTGACCAAGCATGTACCTGTACATGTGCGGGCTACCAGGGACAT
AGATTGCAAGGACAAGTATTGTTGCGTAGAAGAAGTCGAATGAGAAGTTTAATGTGTTAG
GCATCCTAACGCTGTACATCTCAGACGTCTTGATGTGTGGTAAGGCAAGGTAGATAAGAC
CTACTTCACTGGTGATACCGGTAGGATATAGCACTAAAAAGCTGCTGTATCTGAGCCACA
AGTGCCATGAAGGTGCAAAGCCTAGAGCTTCCTTAAGTCCAAAGAAGGAGTAGCGGATAA
TCTCCGTGATAGACCAGCTTATGACCAGCGACGCAACAAGAAAATGTGATTGGACCTCTG
GAAAACTGTATAGGATGCCCCAAGTGAGAAACAGCCTTGAACCTATCTGTGGCAGAGTAG
CAGAAACAGGAGATCTGACCAAACCTACTAATCCATGAAGAATCTCGAGAACAGCGGCGG
TCTGAGCAAGCTGGAGAGGCTTCTCAACGGCCTCATAGACATTTTCATGTCCCGTTTCCT
TCAACGTCTTTACCGCAAAGTACAAAACTTGAGCCCATCCAGCAAAGACGATCCAGTTGT
AGAGAGTGAGGTACACGCGACGGATGAAGGAGAAAGAGCCT

QA 1 821 1 821
DS 

RD RS1G338JQ 537 0 0
AA
AAGTCGAATGAGAAGTTTAATGTGTTAGGCATCCTAACGCTGTACATCTCAGACGTCTTG
ATGTGTGGTAAGGCAAGGTAGATAAGACCTACTTCACTGGTGATACCGGTAGGATATAGC
ACTAAAAAGCTGCTGTATCTGAGCCACAAGTGCCATGAAGGTGCAAAGCCTAGAGCTTCC
TTAAGTCCAAAGAAGGAGTAGCGGATAATCTCCGTGATAGACCAGCTTATGACCAGCGAC
GCAACAAGAAAATGTGATTGGACCTCTGGAAAACTGTATAGGATGCCCCAAGTGAGAAAC
AGCCTTGAACCTATCTGTGGCAGAGTAGCAGAAACAGGAGATCTGACCAAACCTACTAAT
CCATGAAGAATCTCGAGAGCAGCGGCGGTCTGAGCAAGCTGGAGAGGCTTCTCAACGGCC
TCATAGACATTTTCATGTCCCGTTTCCTTCAACGTCTTTACCGCAAAGTACAAAACTTGA
GCCCATCCAGCAAAGACGATCCAGTTGTAGAGAGTGAGGTACACGCGACG
ATGAA

QA 3 532 3 532
DS 

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GAGACGTTACTTTTCGTATTAATCTTAAAACATTACATTACTCTTAGTTGAGTAGTACAG
AAGACGAAAGACGTAAAGAGTCTAACAAAGGGAAGTACATGAAATAAACTAGGCAATAGA
AGACAGTTGATGGGCGAGCCTTGGTCTCTCTATAAGCTTTTTATTCCCTCTTGGATTTGG
AGAGAGCTCTCTTACGCTGACCAAGCATGTACCTGTACATGTGCGGGCTACCAGGGACAT
AGATTGCAAGGACAAGTATTGTTGCGTAGAAGAAGTCGAATGAGAAGTTTAATGTGTTAG
GCATCCTAACGCTGTACATCTCAGACGTCTTGATGTGTGGTAAGGCAAGGTAGATAAGAC
CTACTTCACTGGTGATACCGGTAGGATATAGCACTAAAAAGCTGCTGTATCTGAGCCACA
AGTGCCATGAAGGTGCAAAGCCTAGAGCTTCCTTAAGTCCAAAGAAGGAGTAGCGGATAA
TCTCCGTGATAGACCAGCTTATGACCAGCGACGCAACAAGAAAATGTGATTGGACCTCTG
GAAAACTGTATAGGATGCCCCAAGTGAGAAACAGCCTTGAACCTATCTGTGGCAGAGTAG
CAGAAACAGGAGATCTGACCAAACCTACTAATCCATGAAGAATCTCGAGAACAGCGGCGG
TCTGAGCAAGCTGGAGAGGCTTCTCAACGGCCTCATAGACATTTTCATGTCCCGTTTCCT
TCAACGTCTTTACCGCAAAGTACAAAACTTGAGCCCATCCAGCAAAGACGATCCAGTTGT
AGAGAGT

QA 1 787 1 787
DS 

RD RS1A164TF 761 0 0
ACATGAAATAAACTAGGCAATAGAAGACAGTTGATGGGCGAGCCTTGGTCTCTCTATAAG
CTTTTTATTCCCTCTTGGATTTGGAGAGAGCTCTCTTACGCTGACCAAGCATGTACCTGT
ACATGTGCGGGCTACCAGGGACATAGATTGCAAGGACAAGTATTGTTGCGTAGAAGAAGT
CGAATGAGAAGTTTAATGTGTTAGGCATCCTAACGCTGTACATCTCAGACGTCTTGATGT
GTGGTAAGGCAAGGTAGATAAGACCTACTTCACTGGTGATACCGGTAGGATATAGCACTA
AAAAGCTGCTGTATCTGAGCCACAAGTGCCATGAAGGTGCAAAGCCTAGAGCTTCCTTAA
GTCCAAAGAAGGAGTAGCGGATAATCTCCGTGATAGACCAGCTTATGACCAGCGACGCAA
CAAGAAAATGTGATTGGACCTCTGGAAAACTGTATAGGATGCCCCAAGTGAGAAACAGCC
TTGAACCTATCTGTGGCAGAGTAGCAGAAACAGGAGATCTGACCAAACCTACTAATCCAT
GAAGAATCTCGAGAACAGCGGCGGTCTGAGCAAGCTGGAGAGGCTTCTCAACGGCCTCAT
AGACATTTTCATGTCCCGTTTCCTTCAACGTCTTTACCGCAAAGTACAAAACTTGAGCCC
ATCCAGCAAAGACGATCCAGTTGTAGAGAGTGAGGTACACGCGACGGATGAAGGAGAAAG
AGCCTGCCATGGAAAGGAAGGTGGAGACAGCGACTTCGGAC

QA 1 761 1 761
DS 

RD RS1A164TV 925 0 0
CTAG
TGAGTAGTACAGAAGACGAAAGACGTAAAGAGTCTAACAAAGGGAAGTACATGAAATAAA
CTAGGCAATAGAAGACAGTTGATGGGCGAGCCTTGGTCTCTCTATAAGCTTTTTATTCCC
TCTTGGATTTGGAGAGAGCTCTCTTACGCTGACCAAGCATGTACCTGTACATGTGCGGGC
TACCAGGGACATAGATTGCAAGGACAAGTATTGTTGCGTAGAAGAAGTCGAATGAGAAGT
TTAATGTGTTAGGCATCCTAACGCTGTACATCTCAGACGTCTTGATGTGTGGTAAGGCAA
GGTAGATAAGACCTACTTCACTGGTGATACCGGTAGGATATAGCACTAAAAAGCTGCTGT
ATCTGAGCCACAAGTGCCATGAAGGTGCAAAGCCTAGAGCTTCCTTAAGTCCAAAGAAGG
AGTAGCGGATAATCTCCGTGATAGACCAGCTTATGACCAGCGACGCAACAAGAAAATGTG
ATTGGACCTCTGGAAAACTGTATAGGATGCCCCAAGTGAGAAACAGCCTTGAACCTATCT
GTGGCAGAGTAGCAGAAACAGGAGATCTGACCAAACCTACTAATCCATGAAGAATCTCGA
GAACAGCGGCGGTCTGAGCAAGCTGGAGAGGCTTCTCAACGGCCTCATAGACATTTTCAT
GTCCCGTTTCCTTCAACGTCTTTACCGCAAAGTACAAAACTTGAGCCCATCCAGCAAAGA
CGATCCAGTTGTAGAGAGTGAGGTACACGCGACGGATGAAGGAGAAAGAGCCTGCCATGG
AAAGGAAGGTGGAGACAGCGACTTCGGACTCACCAAAGAGAGAGCAAAAGAGTAGAGACT
TTATGGCGGAGAGATCGGAAGTGAAAGCATCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTCCCGGGC
ATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 5 925 5 925
DS 



AS 1 5

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GGAAGGGAAGAAGAGAAGGAAGAAAGCTCTGACGAATCCAACAATGGCGATTTCGACTTT
AACACTCACATCATCTATCTATACACGTTCCTTCAGACCCACCATCTCTTCTTCTTC***
ATCGTCATTCTCGTGTCTCTGTTCTTCTTCTCCCATTGACTGCCAGCAGAAACAGAGGAG
CTTCACCGCCGCGAAGAAGAACGTTTTCGGAGTGGGTTTAGGCATTTTAGCCACCACGAT
TCTCTCTCTGACGCCTCTGGACGCAGACGCCACGAGGATAGAGTACTACGCCACTGTTGG
AGACCCTCTCTGCGAATACAGCTACGCAAAATCAGGGCTTGGATTCTGCGATATCGCTGT
TGGGTTCGGTGACAAAGCTCCTCGTGGCGTACTTGTCAATGTTCACTATACGGCGAGGTT
TGCAGACGGAACGTTGTTTGACAGTACCTATAAGCGTGCAAGACCACTTACTATGCGGAT
TGGTGTCGGCAAGGTTATAAGGGGTCTAGACCAAGGGATTCTTGGAGGCGAAGGAGTACC
TCCTATGCGAGTAGGGGGGAAGCGTAAGCTTCAGATTCCACCTAAGTTAGCTTATGGACC
TGAGCCTGCAGGGTGCTTTTCTGGTGACTGTAACATACCTGGCAATGCAACTTTGCTCTA
TGATATCAATTTTGTTGAGATCTACCCCGGAAGTAACACAAGATGAAGCTCTAATTTCGT
TCTGTAAAGGAAGAAAAAAAAACTATGTATATGATATATATCACCAGATTCTGGATTTTA
TCATCTGTAAACATTGACATTTTCCAACTTAAACCCAATGAGCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C265TF U 18
AF RS1C662TF U 1
AF RS1DQ54JQ C 18
AF RS1DQ54TF U 18
AF RS1C662JQ C 123
BS 1 117 RS1C662TF
BS 118 120 RS1DQ54TF
BS 121 168 RS1C662TF
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BS 170 665 RS1C662TF
BS 666 666 RS1C265TF
BS 667 677 RS1C662TF
BS 678 678 RS1C265TF
BS 679 727 RS1C662TF
BS 728 825 RS1C662JQ

RD RS1C265TF 679 0 0
GGAAGAAAGCTCTTACGAATCCAACAATGGCGACTTCGACTTTAACACTCACATCATCTA
TCTATACACGTTCCTTCAGACCCACCATCTCTTCTTCTTCTTCATCGTCATTCTCGTGTC
TCTGTTCTTCTTCTCCCATTGACTTCCAGCAGAAACAGAGGAGCTTCACCGCCGCGAAGA
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TGGACGCAGACGCCACGAGGATAGAGTACTACGCCACTGTTGGAGACCCTCTCTGCGAAT
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TAAGGGGTCTAGACCAAGGGATTCTTGGAGGCGAAGGAGTACCTCCTATGCGAGTAGGGG
GGAAGCGTAAGCTTCAGATTCCACCTAAGTTAGCTTATGGACCTGAGCCTGCAGGGTGCT
TTTCTGGTGACTGTAACATACCTGGCAATGCAACTTTGCTCTATGATATCAATTTTGTTG
AGATCTACCCCGGAAGTAA

QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1C662TF 732 0 0
GGAAGGGAAGAAGAGAAGGAAGAAAGCTCTGACGAATCCAACAATGGCGATTTCGACTTT
AACACTCACATCATCTATCTATACACGTTCCTTCAGACCCACCATCTCTTCTTCTTCTTC
ATCGTCATTCTCGTGTCTCTGTTCTTCTTCTCCCATTGACTGCCAGCAAAAACAGAGGAG
CTTCACCGCCGCGAAGAAGAACGTTTTCGGAGTGGGTTTAGGCATTTTAGCCACCACGAT
TCTCTCTCTGACGCCTCTGGACGCAGACGCCACGAGGATAGAGTACTACGCCACTGTTGG
AGACCCTCTCTGCGAATACAGCTACGCAAAATCAGGGCTTGGATTCTGCGATATCGCTGT
TGGGTTCGGTGACAAAGCTCCTCGTGGCGTACTTGTCAATGTTCACTATACGGCGAGGTT
TGCAGACGGAACGTTGTTTGACAGTACCTATAAGCGTGCAAGACCACTTACTATGCGGAT
TGGTGTCGGCAAGGTTATAAGGGGTCTAGACCAAGGGATTCTTGGAGGCGAAGGAGTACC
TCCTATGCGAGTAGGGGGGAAGCGTAAGCTTCAGATTCCACCTAAGTTAGCTTATGGACC
TGAGCCTGCAGGGTGCTTTTCTGGTGACTGTAACATACCTGGCAATGCAACTTTGCTCTA
TGATACCAATTTTGTTGTGATCTACCCCGGAAGTAACACAAGATGAAGCTCTAATTTCGT
TCTGTAA
AGGAG

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1DQ54JQ 713 0 0
GGAAGAAAGCTCTGACGAATCCAACAATGGCGATTTCGACTTTAACACTCACATCATCTA
TCTATACACGTTCCTTCAGACCCACCATCTCTTCTTCTTC***ATCGTCATTCTCGTGTC
TCTGTTCTTCTTCTCCCATTGACTGCCAGCAGAAACAGAGGAGCTTCACCGCCGCGAAGA
AGAACGTTTTCGGAGTGGGTTTAGGCATTTTAGCCACCACGATTCTCTCTCTGACGCCTC
TGGACGCAGACGCCACGAGGATAGAGTACTACGCCACTGTTGGAGACCCTCTCTGCGAAT
ACAGCTACGCAAAATCAGGGCTTGGATTCTGCGATATCGCTGTTGGGTTCGGTGACAAAG
CTCCTCGTGGCGTACTTGTCAATGTTCACTATACGGCGAGGTTTGCAGACGGAACGTTGT
TTGACAGTACCTATAAGCGTGCAAGACCACTTACTATGCGGATTGGTGTCGGCAAGGTTA
TAAGGGATCTAGACCAAGGGATTCTTGGAGGCGAAGGAGTACCTCCTATGCGAGTAGGGG
GGAAGCGTAAGCTTCAGATTCCACCTAAGTTAGCTTATGGACCTGAGCCTGCAGGGTGCT
TTTCTGGTGACTGTAACATACCTGGCAATGCAACTTTGCTCTATGATATCAATTTTGTTG
AGATCTACCCCGGAAGTAACACAAGATGAAGCTCTAATTTCGTTCTGTAA
AGG

QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1DQ54TF 710 0 0
GGAAGAAAGCTCTGACGAATCCAACAATGGCGATTTCGACTTTAACACTCACATCATCTA
TCTATACACGTTCCTTCAGACCCACCATCTCTTCTTCTTC***ATCGTCATTCTCGTGTC
TCTGTTCTTCTTCTCCCATTGACTGCCAGCAGAAACAGAGGAGCTTCACCGCCGCGAAGA
AGAACGTTTTCGGAGTGGGTTTAGGCATTTTAGCCACCACGATTCTCTCTCTGACGCCTC
TGGACGCAGACGCCACGAGGATAGAGTACTACGCCACTGTTGGAGACCCTCTCTGCGAAT
ACAGCTACGCAAAATCAGGGCTTGGATTCTGCGATATCGCTGTTGGGTTCGGTGACAAAG
CTCCTCGTGGCGTACTTGTCAATGTTCACTATACGGCGAGGTTTGCAGACGGAACGTTGT
TTGACAGTACCTATAAGCGTGCAAGACCACTTACTATGCGGATTGGTGTCGGCAAGGTTA
TAAGGGATCTAGACCAAGGGATTCTTGGAGGCGAAG*AGTACCTCATATGCGAGTAGGGG
GGAAGCGTAAGCTTCAGATTCCACCTAAGTTAGCTTATGGACCTGAGCCTGCAGGGTGCT
TTTCTGGTGACTGTAACATACCTGGCAATGCAACTTTGCTCTATGATATCAATTTTGTTG
AGATCTACCCCGGA*GTAACACAAGATGA*GCTCTAATTTCGTTCTGTAA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1C662JQ 703 0 0
CGTCATTCTCGTGTCTCTGTTCTTCTTCTCCCATTGACTGCCAGCAAAAACAGAGGAGCT
TCACCGCCGCGAAGAAGAACGTTTTCGGAGTGGGTTTAGGCATTTTAGCCACCACGATTC
TCTCTCTGACGCCTCTGGACGCAGACGCCACGAGGATAGAGTACTACGCCACTGTTGGAG
ACCCTCTCTGCGAATACAGCTACGCAAAATCAGGGCTTGGATTCTGCGATATCGCTGTTG
GGTTCGGTGACAAAGCTCCTCGTGGCGTACTTGTCAATGTTCACTATACGGCGAGGTTTG
CAGACGGAACGTTGTTTGACAGTACCTATAAGCGTGCAAGACCACTTACTATGCGGATTG
GTGTCGGCAAGGTTATAAGGGGTCTAGACCAAGGGATTCTTGGAGGCGAAGGAGTACCTC
CTATGCGAGTAGGGGGGAAGCGTAAGCTTCAGATTCCACCTAAGTTAGCTTATGGACCTG
AGCCTGCAGGGTGCTTTTCTGGTGACTGTAACATACCTGGCAATGCAACTTTGCTCTATG
ATACCAATTTTGTTGTGATCTACCCCGGAAGTAACACAAGATGAAGCTCTAATTTCGTTC
TGTAAAGGAAGAAAAAAAAACTATGTATATGATATATATCACCAGATTCTGGATTTTATC
ATCTGTAAACATTGACATTTTCCAACTTAAACCCAATGAGCAG

QA 1 703 1 703
DS 



AS 2 5

CO CL1765Contig1 1226 3 16 U
GCACAACAACAACAACAACAGCCACCACCACCACAACAACAAGAGATGATCATGAGCACG
GATCAATCCTCGTCACCGTCGCCATCGCGATGGCCAAAGGCGGAGATTCTTGCGCTTATA
AACCTGAGAAGCGGAATGGAACCGAGGTACCAAGACAATGTCCCTAAAGGACTTTTATGG
GAAGAGATCTCATCTTCCATGAAGAGAATGGGATACAATAGAAACGCAAAGAGATGCAAA
GAGAAATGGGAAAACATAAACAAATACTACAAGAAAGTTAAAGAAAGCAACAAGGAACGT
CCTCAAGATGCTAAGGCCTGTCCTTACTTTCACCGCCTCGATCTTCTTTACCGCAGCAAA
GTACTTGGAACTGGTGGCAGTTCTAGCGCTTTCGGTCTACCTCAAGACCAAACATCAACA
GTACAAAAGCAGAGTCCGGTCTCTGCAGTGAAGCCCCCACAAGGAGCTGTTGGGTCAGCT
TCAAGTGAGGAAGAAGATGCTAGAGAGGAAAGTCCACAAGGAACAGAGAAGCCAGAAGAC
CTTGTGGTGAAAGAGCTGATGCAACGCCAACAACAAGAACAACAACAAGATTCAATGATA
AGTGAGTAAAAAAATTGAGGAGTCTCACAATTATAATAACATGGAAGAAGAGGAAGAAGA
GGAAGAGGAGATGGATGAAGAACTAGACGAGGATGAGAAATCTGCGGCTTATGAGGTTGC
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GGTTCAGTAAATCGGAATCACTGTTTCTGAATTGCCCTCGTCCCAAGAAAATGTACTTAT
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GGAGACTTAAGATTTCAGAAACAAAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1B951TF U 1
AF RS1EV35TF U 688
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G
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DS 

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CTGACACCAGAAACTGAAAATCAAGGTCTCACCAATCTTGATTTCCAGTGAATACAATTC
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QA 1 687 1 687
DS 



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BQ
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AF RS1E092TF C 1
AF RS1E092JQ U 6
BS 1 6 RS1E092TF
BS 7 599 RS1E092JQ

RD RS1E092TF 599 0 0
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GAAGGTGTTTTGAGTTTTTTTTTGTTTTTTTGGGTGTTGTTTAGAAACTATGCACACATA
AGTACATTTTCTTGGGACGAGGGCAATTCAGAAACAGTGATTCAGATTTACTGAACCATT
GTCAAGAAAGGTGGCTCGGTATGGCCATTGCCTCCTCTGTTTGCAGGGCTCTGAAACGCA
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TCCTCTTCTTCCATGTTATTATAATTGTGAGACTCCTCAATTTTTT
CGTATTCACTTAC

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DS 

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G
AAAAAAAGACTCTTTATTCCCCAATTAACCAATCAACCAATGCTTAAACAAGAAAAAAAA
AAGAGTGAGACTTGCTGATGAATTACAACTCCAAATAAACTAAAAGACCTTTAGCTAGAG
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AACAACCAAGAGACGGTGAGAAAGAAAAGGAACAAAGGGAAAGAATGTGAAGAAAGAATT
GTATTCACTGGAAATCAAGATTGGTGAGACCTTGATTTTCAGTTTCTGGTGTCAGAAGGT
GTTTTGAGTTTTTTTTTGTTTTTTTGGGTGTTGTTTAGAAACTATGCACACATAAGTACA
TTTTCTTGGGACGAGGGCAATTCAGAAACAGTGATTCAGATTTACTGAACCATTGTCAAG
AAAGGTGGCTCGGTATGGCCATTGCCTCCTCTGTTTGCAGGGCTCTGAAACGCAACCTCA
TAAGCCGCAGATTTCTCATCCTCGTCTAGTTCTTCATCCATCTCCTCTTCCTCTTCCTCT
TCTTCCATGTTATTATAATTGTGAGACTCCTCAATTTTTTCGTATTCACTTAC

QA 2 594 2 594
DS 



AS 1 5

CO CL1766Contig1 852 5 6 U
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ATGACACACTCATATACATCATCAATATGCACATATTTATATTTTTATATATTTCATTAG
TTGGTATAGAATATTTATTTAGAGACACGTGATATTGGACAGTCTTAACTAGATGGTGTC
TTCCTGAGACTCGTCGAGAGGGAAACACGTCTCATCACCGCCCGTGTTCCATAGAAAATT
AGCGTAATTAGCTGCATAGAAAGAGTTGGTGGGATCGGCATCGACTGCTTCCAAGAAAGT
CTCTTCAGCAGCCCAAAGATCGTCCCGTGCTCTCCATAAGAACGTGGCGTATTTGCTCAG
GGCCTCTGCGTCTTTCGGTTCCACTCCTACCGCTCTTTTGAAGTACTCTTCTGCTCTGTC
ATAGTCATTAGAGACGATGTAAAGGAACTGAGCATAGTTAGCGAGAAGCAGAGGATTACT
AGGCTCTTGAGACAGTCCCGTTTGGTATAGAAGCTCTGTTCTGAAGTAATCAATCTCCTC
ATCAGCTTCCTCTGCTCGAGCATCCAAAGGAGACACGAACCGCTTCCTCGTCTCGTGATC
TATCTTCGAATCCTGCATTTGCTCTGCTTCCTCCACAATCGAATTCCACAGCCTGAGTTC
GTCTCGTCCCGACACCGATGCCTTCTCCGAATCCGTTGTCGTTGACCCGAGCGTTGACGA
GACTCCTTCGGGTATAATCGTCTTAAACTGTTCGGATCCGTCATCAACATCAGCTCCGTT
TATCACCGGACGGATGTTCCCGCCACCGCCATTATTGTTCCCGCCCACGACGGAAGTCGT
GTTCCCGTTGGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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CTCGTCTCGTGATCT

QA 1 495 1 495
DS 

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TTCCTGAGACTCGTCGAGAGGGAAACACGTCTCATCACCGCCCGTGTTCCATAGAAAATT
AGCGTAATTAGCTGCATAGAAAGAGTTGGTGGGATCGGCATCGACTGCTTCCAAGAAAGT
CTCTTCAGCAGCCCAAAGATCGTCCCGTGCTCTCCATAAGAACGTGGCGTATTTGCTCAG
GGCCTCTGCGTCTTTCGGTTCCACTCCTACCGCTCTTTTGAAGTACTCTTCTGCTCTGTC
ATAGTCATTAGAGACGATGTAAAGGAACTGAGCATAGTTAGCGAGAAGCAGAGGATTACT
AGGCTCTTGAGACAGTCCCGTTTGGTATAGAAGCTCTGTTCTGAAGTAATCAATCTCCTC
ATCAGCTTCCTCTGCTCGAGCATCCAAAGGAGACACGAACCGCTTCCTCGTCTCGTGATC
TATCTTCGAATCCTGCATTTGCTCTGCTTCCTCCACAATCGAATTCCACAGCCTGAGTTC
GTCTCGTCCCGACACCGATGCCTTCTCCGAATCCGTTGTCGTTGACCCGAGCGTTGACGA
GACTCCTTCGGGTATAATCGTCTTAAACTGTTCGGATCCGTCATCAACATCAGCTCCGTT
TA

QA 1 782 1 782
DS 

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G
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AGAGGGAAACACGTCTCATCACCGCCCGTGTTCCATAGAAAATTAGCGTAATTAGCTGCA
TAGAAAGAGTTGGTGGGATCGGCATCGACTGCTTCCAAGAAAGTCTCTTCAGCAGCCCAA
AGATCGTCCCGTGCTCTCCATAAGAACGTGGCGTATTTGCTCAGGGCCTCTGCGTCTTTC
GGTTCCACTCCTACCGCTCTTTTGAAGTACTCTTCTGCTCTGTCATAGTCATTAGAGACG
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CGAGCATCCAAAGGAGACACGAACCGCTTCCTCGTCTCGTGATCTATCTTCGAATCCTGC
ATTTGCTCTGCTTCCTCCACAATCGAATTCCACAGCCTGAGTTCGTCTCGTCCCGACACC
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ATCGTCTTAAACTGTTCGGATCCGTCATCACCATCAGCTCCGTTTATCACCGGACGGATG
TTCCCGCCACCGCCATTATTGTTCCCGCCCAC

QA 2 753 2 753
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AATTAGCTGCATAGAAAGAGTTGGTGGGATCGGCATCGACTGCTTCCAAGAAAGTCTCTT
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CTTGAGACAGTCCCGTTTGGTATAGAAGCTCTGTTCTGAAGTAATCAATCTCCTCATCAG
CTTCCTCTGCTCGAGCATCCAAAGGAGACACGAACCGCTTCCTCGTCTCGTGATCTATCT
TCGAATCCTGCATTTGCTCTGCTTCCTCCACAATCGAATTCCACAGCCTGAGTTCGTCTC
GTCCCGACACCGATGCCTTCTCCGAATCCGTTGTCGTTGACCCGAGCGTTGACGAGACTC
CTTCGGGTATAATCGTCTTAAACTGTTCGGATCCGTCATCAACATCAGCTCCGTTTATCA
CCGGACGGATGTTCCCGCCACCGCCATTATTGTTCCCGCCCACGACGGAAGTCGTGTTCC
CGTTGGT

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 3

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TGAGAGAAGTGGCGGAGAGCTGTGTAGACACTATGTTGATGGAGATGGTGGCGATGTACA
GCGGCAGATTCTACGCCAACAAGCCGGAACTCGCCGCTCGGAGGATCGAGGCCATCGGTT
ATCAGGTCGGCCACCAGCTCTCCGAGAGGTACACTATGGAAAGACCAAGGTTCAGCGACC
ATCTAGAGGCAATCAAGTTTATCTGTAAAGACTTCTGGTCTGAGGTTTTCAAGAAGCAGA
TTGATAATCTCAAGACTAATCACCGGGGTACTTTTGTATTGCAAGACAACAAGTTCAGAT
GGCTATCTCGTGTCTCGATTGACCCTTCGTCTGAGAAGGAAACCGAAGATCCGTCTACTC
CAGGGGAAAGCAAAGCAGCACAAGCGGTGAGCATGTACCTGTATTTCCCATGTGGAATCA
TAAGAGGTGTCCTCTCCAACTTGGGGATACCTTGTGCTGTCTCTGCAGACATATCCAGCC
TTCCCACTCGCTCCTTCGTGATTCGGGTCAAGGCTTGATTCTGGCATTAGCTTGGGAGTC
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TTCTGCCAGTTCTCACAACTTTGAATTCCCTTCCCTGTAAAACAATAGTATTTGAATGCC
TAATGGGCCTATCTCGTCCTAAAAGCTGTTAGCAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D848TF U 1
AF RS1FO09TF U 33
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BS 714 726 RS1D848TF
BS 727 737 RS1FO09TF
BS 738 738 RS1FO09JQ
BS 739 761 RS1FO09TF
BS 762 764 RS1FO09JQ
BS 765 775 RS1FO09TF
BS 776 776 RS1FO09JQ
BS 777 817 RS1FO09TF

RD RS1D848TF 726 0 0
GGGTGCTCGTCGTCGTCGTCGAAAGAGAGAGAGAGAGAGTGGAGAGAGACGAGAAAATGG
TGAGAGAAGTGGCGGAGAGCTGTGTAGACACTATGTTGATGGAGATGGTGGCGATGTACA
GCGGCCGATTCTACGCCAACAAGCCGGGACTCGCCGCTCGGAGGATCGAGGCCATCGGTT
ATCAGGTCGGCCACCAGCTCTCCGAGAGGTACACTATGGAAAGACCAAGGTTCAGCGACC
ATCTAGAGGCAATCAAGTTTATCTGTAAAGACTTCTGGTCTGAGGTTTTCAAGAAGCAGA
TTGATAATCTCAAGACTAATCACCGGGGTACTTTTGTATTGCAAGACAACAAGTTCAGAT
GGCTATCTCGTGTCTCAATTGACCCTTCGTCTGAGAAGGAAACCGAAGATCCGTCTACTC
CAGGGGAAAGCAAAGCAGCACAAGCGGTGAGCATGTACCTGTATTTCCCATGTGGAATCA
TAAGAGGTGTCCTCTCCAACTTGGGGATACCTTGTGCTGTCTCTGCAGACATATCCAGCC
TTCCCACTTGCTCCTTCGTGATTCGGGTCAAGGCTTGATTCTGGCATTAGCTTGGGAGTC
CTCTCATTTTCAGATTCCAGCTCGGCTTTATGGTTTCAACTTTCAAGGAAGATAAGAGTC
TTT*GAGTCCTAAGAGATTTAACTAAAAGCCCTTCCCCGAAGGCTTCTGTTTCCTGCGGC
TTCTGC

QA 1 726 1 726
DS 

RD RS1FO09TF 785 0 0
GAGAGAGGA
GAGAGAGACGAAAAAATGGTGAGAGAAGTGGCGGAGAGCTGTGTAGACACTATGTTGATG
GAGATGGTGGCGATGTACAGCGGCAGATTCTACGCCAACAAGCCGGAACTCGCCGCTCGG
AGGATCGAGGCCATCGGTTATCAGGTCGGCCACCAGCTCTCCGAGAGGTACACTATGGAA
AGACCAAGGTTCAGCGACCATCTAGAGGCAATCAAGTTTATCTGTAAAGACTTCTGGTCT
GAGGTTTTCAAGAAGCAGATTGATAATCTCAAGACTAATCACCGGGGTACTTTTGTATTG
CAAGACAACAAGTTCAGATGGCTATCTCGTGTCTCGATTGACCCTTCGTCTGAGAAGGAA
ACCGAAGATCCGTCTACTCCAGGGGAAAGCAAAGCAGCACAAGCGGTGAGCATGTACCTG
TATTTCCCATGTGGAATCATAAGAGGTGTCCTCTCCAACTTGGGGATACCTTGTGCTGTC
TCTGCAGACATATCCAGCCTTCCCACTCGCTCCTTCGTGATTCGGGTCAAGGCTTGATTC
TGGCATTAGCTTGGGAGTCCTCTCATTTTCAGATTCCAGCTCGGCTTTATGGTTTCAACT
TTCAAGGAAGATAAGAGTCTTTAGAGTCCTAAGAGATTTAACTAAAAGCCCTTCTC**AA
GGCTTCTGTTTGCTGCGGCTTCTGCCAGTTCTCACA*CTTTGAATTCCCTTCCCTGTAAA
C**ATAGTATTTGA*TGCCTAATGGGCCTATCTCGTCCTAAAAGCTGTTAGCAAAA

QA 10 785 10 785
DS 

RD RS1FO09JQ 771 0 0
GAGACGAAAAAATGGTGAGAGAAGTGGCGGAGAGCTGTGTAGACACTATGTTGATGGAGA
TGGTGGCGATGTACAGCGGCAGATTCTACGCCAACAAGCCGGAACTCGCCGCTCGGAGGA
TCGAGGCCATCGGTTATCAGGTCGGCCACCAGCTCTCCGAGAGGTACACTATGGAAAGAC
CAAGGTTCAGCGACCATCTAGAGGCAATCAAGTTTATCTGTAAAGACTTCTGGTCTGAGG
TTTTCAAGAAGCAGATTGATAATCTCAAGACTAATCACCGGGGTACTTTTGTATTGCAAG
ACAACAAGTTCAGATGGCTATCTCGTGTCTCGATTGACCCTTCGTCTGAGAAGGAAACCG
AAGATCCGTTTACTCCAGGGGAAAGCAAAGCAGCACAAGCGGTGAGCATGTACCTGTATT
TCCCATGTGGAATCATAAGAGGTGTCCTCTCCAACTTGGGGATACCTTGTGCTGTCTCTG
CAGACATATCCAGCCTTCCCACTCGCTCCTTCGTGATTCGGGTCAAGGCTTGATTCTGGC
ATTAGCTTGGGAGTCCTCTCATTTTCAGATTCCAGCTCGGCTTTATGGTTTCAACTTTCA
AGGAAGATAAGAGTCTTTAGAGTCCTAAGAGATTTAACTAAAAGCCCTTCTC**AAGGCT
TCTGTTTGCTGCGGCTTCTGCCAGTTCTCACAACTTTGAATTCCCTTCCCTGTAAAACAA
TAGTATTTGAATGCCTAATGGGCCTATCTCGTCCTAAAA
AGCCTGTTAAGC

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 5

CO CL1768Contig1 920 5 8 U
GGAGCTTCATTCTTCCTGGCGTGTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCCCTCCCTCCATC
AATGGCGACCACAAACTCTCTCCATCACCACCACTCTTCTTACCAACACAACCGCCACAA
CTTCCATTACCAATCTCACTTCACACCAACTTCTCTCTCCCTCAAACAACCCACTTCCAC
CGCCACATTCTCATCACTCATCTGCTCTTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCGGCCGTCGTCAC
CTCTGCTACCACCACAAACGCTTCCGACATAACCACCGAAACCACAACCGAGTTCGATGT
CCTAGCGACCCATCTGATCAACCAAGATTTCAAGAAAGCAGACGAAGAAACTAGGAGACT
TCTCATTCAGATAGCAGGAGAAGCAGCCATTAAACGCGGCTATGTTTTCTTCTCTGAGGT
GAAGTCCATCTCCGTTGAAGATCTTCAGGCTATCGACAACCTCTGGACAAAACACAGCGA
TGGGAGGTTCGGATACAGTGTGCAACGCAAAATATGGTTAAAAGTCAAGAAAGACTTCAC
AAGATTCTTCATTAAAGTCGAGTGGATGAAGCTTCTTGATACAGAGGTGGTCCAGTACAA
CTACAGAGCTTTCCCTGATGAGTTCAAGTGGGAGCTTAATGATGAAACGCCTCTAGGACA
CTTACCGCTAACAAACGCGTTGAGAGGAACGCAGCTTCTGAAATGCGTTTTGAGCCATCC
TGCGTTTGAGATAGCTGGTGATGATGATAATGAAGGAGGAGAAGAAGCTGAGAACAGAGG
TGGTGGTAAAGCACAGACAAAAGACGCAAGAGTGTTTAAAACAGATTA**GCTTCTGATG
TCTTTGATTTTCATTTGGATTATGAATATGTATGAACAGTCAATTAGTTAATTAATATAA
ACCAAAAGTCTTTATTGGTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 10 30 10 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C360TF U 1
AF RS1C908TF U 1
AF RS1AU12JQ C 445
AF RS1C908JQ C 131
AF RS1AU12TF U 269
BS 1 733 RS1C360TF
BS 734 755 RS1C908TF
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BS 776 907 RS1AU12TF
BS 908 920 RS1C908JQ

RD RS1C360TF 733 0 0
GGAGCTTCATTCTTCCTGGCGTGTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCCCTCCCTCCATC
AATGGCGACCACAAACTCTCTCCATCACCACCACTCTTCTTACCAACACAACCGCCACAA
CTTCCATTACCAATCTCACTTCACACCAACTTCTCTCTCCCTCAAACAACCCACTTCCAC
CGCCACATTCTCATCACTCATCTGCTCTTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCGGCCGTCGTCAC
CTCTGCTACCACCACAAACGCTTCCGACATAACCACCGAAACCACAACCGAGTTCGATGT
CCTAGCGACCCATCTGATCAACCAAGATTTCAAGAAAGCAGACGAAGAAACTAGGAGACT
TCTCATTCAGATAGCAGGAGAAGCAGCCATTAAACGCGGCTATGTTTTCTTCTCTGAGGT
GAAGTCCATCTCCGTTGAAGATCTTCAGGCTATCGACAACCTCTGGACAAAACACAGCGA
TGGGAGGTTCGGATACAGTGTGCAACGCAAAATATGGTTAAAAGTCAAGAAAGACTTCAC
AAGATTCTTCATTAAAGTCGAGTGGATGAAGCTTCTTGATACAGAGGTGGTCCAGTACAA
CTACAGAGCTTTCCCTGATGAGTTCAAGTGGGAGCTTAATGATGAAACGCCTCTAGGACA
CTTACCGCTAACAAACGCGTTGAGAGGAACGCAGCTTCTGAAATGCGTTTTGAGCCATCC
TGCGTTTGAGATA

QA 1 733 1 733
DS 

RD RS1C908TF 775 0 0
GGAGCTTCATTCTTCCTGGCGTGTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTC**CCCCTCCCTCCATC
AATGGCGACCACAAACTCTCTCCATCACCACCACTCTTCTTACCAACACAACCGCCACAA
CTTCCATTACCAATCTCACTTCACACCAACTTCTCTCTCCCTCAAACAACCCACTTCCAC
CGCCACATTCTCATCACTCATCTGCTCTTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCGGCCGTCGTCAC
CTCTGCTACCACCACAAACGCTTCCGACATAACCACCGAAACCACAACCGAGTTCGATGT
CCTAGCGACCCATCTGATCAACCAAGATTTCAAGAAAGCAGACGAAGAAACTAGGAGACT
TCTCATTCAGATAGCAGGAGAAGCAGCCATTAAACGCGGCTATGTTTTCTTCTCTGAGGT
GAAGTCCATCTCCGTTGAAGATCTTCAGGCTATCGACAACCTCTGGACAAAACACAGCGA
TGGGAGGTTCGGATACAGTGTGCAACGCAAAATATGGTTAAAAGTCAAGAAAGACTTCAC
AAGATTCTTCATTAAAGTCGAGTGGATGAAGCTTCTTGATACAGAGGTGGTCCAGTACAA
CTACAGAGCTTTCCCTGATGAGTTCAAGTGGGAGCTTAATGATGAAACGCCTCTAGGACA
CTTACCGCTAACAAACGCGTTGAGAGGAACGCAGCTTCTGAAATGCGTTTTGAGCCATCC
TGCGTTTGAGATAGCTGGTGATGATGATAATGAAG*AGGAGAA*AAGCTGAGAAC

QA 1 775 1 775
DS 

RD RS1AU12JQ 442 0 0
TCAGGCTATCGACAACCTCTGGACAAAACACAGCGATGGGAGGTTCGGATACAGTGTGCA
ACGCAAAATATGGTTAAAAGTCAAGAAAGACTTCACAAGATTTTTCATTAAAGTCGAGTG
GATGAAGCTTCTTGATACAGAGGTGGTCCAGTACAACTACAGAGCTTTCCCTGATGAGTT
CAAGTGGGAGCTTAATGATGAAACGCCTTTAGGACACTTACCGCTAACAAACGCGTTGAG
AGGAACGCAGCTTTTGAAATGCGTTTTGGGCCATCCTGCGTTTGAGATAGCTGGTGATGA
TGATAATGAAGGAGGAGAAGAAGCTGAGAACAGAGGTGGTGGTAAAGCACAGACAAAAGA
CGCAAGAGTGTTTAAAACAGATTA**GCTTCTGATGTCTTTGATTTTCATTTGGATTATG
AATATGTATGAACAGTCAATTA

QA 1 442 1 442
DS 

RD RS1C908JQ 790 0 0
CC
ATCTCACTTCACACCAACTTCTCTCTCCCTCAAACAACCCACTTCCACCGCCACATTCTC
ATCACTCATCTGCTCTTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCGGCCGTCGTCACCTCTGCTACCAC
CACAAACGCTTCCGACATAACCACCGAAACCACAACCGAGTTCGATGTCCTAGCGACCCA
TCTGATCAACCAAGATTTCAAGAAAGCAGACGAAGAAACTAGGAGACTTCTCATTCAGAT
AGCAGGAGAAGCAGCCATTAAACGCGGCTATGTTTTTTTTTTTGAGGTGAAGTCCATCTC
CGTTGAAGATCTTCAGGCTATCGACAACCTCTGGACAAAACACAGCGATGGGAGGTTCGG
ATACAGTGTGCAACGCAAAATATGGTTAAAAGTCAAGAAAGACTTCACAAGATTCTTCAT
TAAAGTCGAGTGGATGAAGCTTCTTGATACAGAGGTGGTCCAGTACAACTACAGAGCTTT
CCCTGATGAGTTCAAGTGGGAGCTTAATGATGAAACGCCTTTAGGACACTTACCGCTAAC
AAACGCGTTGAGAGGAACGCAGCTTTTGAAATGCGTTTTGAGCCATCCTGCGTTTGAGAT
AGCTGGTGATGATGATAATGAAGGAGGAGAAGAAGCTGAGAACAGAGGTGGTGGTAAAGC
ACAGACAAAAGACGCAAGAGTGTTTAAAACAGATTACAGCTTCTGATGTCTTTGATTTTC
ATTTGGATTATGAATATGTATGAACAGTCAATTAGTTAATTAATATAAACCAAAAGTCTT
TATTGGTT

QA 3 790 3 790
DS 

RD RS1AU12TF 639 0 0
GG
AACCACCGAAACCACAGCCGAGTTCGATGTCCTAGCGACCCATCTGATCAACCAAGATTT
CAAGAAAGCAGACGAAGAAACTAGGAGACTTCTCATTCAGATAGCAGGAGAAGCAGCCAT
TAAACGCGGCTATGTTTTCTTCTCTGAGGTGAAGTCCATCTCCGTTGAAGATCTTCAGGC
TATCGACAACCTCTGGACAAAACACAGCGATGGGAGGTTCGGATACAGTGTGCAACGCAA
AATATGGTTAAAAGTCAAGAAAGACTTCACAAGATTCTTCATTAAAGTCGAGTGGATGAA
GCTTCTTGATACAGAGGTGGTCCAGTACAACTACAGAGCTTTCCCTGATGAGTTCAAGTG
GGAGCTTAATGATGAAACGCCTCTAGGACACTTACCGCTAACAAACGCGTTGAGAGGAAC
GCAGCTTCTGAAATGCGTTTTGGGCCATCCTGCGTTTGAGATAGCTGGTGATGATGATAA
TGAAGGAGGAGAAGAAGCTGAGAACAGAGGTGGTGGTAAAGCACAGACAAAAGACGCAAG
AGTGTTTAAAACAGATTA**GCTTCTGATGTCTTTGATTTTCATTTGGATTATGAATATG
TATGAACAGTCAATTAGTTAATTAATATAAACCAAAA

QA 3 639 3 639
DS 



AS 2 5

CO CL1769Contig1 812 2 2 U
CCTCCTCCTCCACCCGTTTCTCAGCCGTCTCCTCCGGCACCGGTGCTAACCCCGGGGAGC
TTTGTTCAGTCGCATCAGCAAAGCTTGACGCTAGATTTCACCAGACCGAGCGTGTTTGGC
GCCAAAACCAAGAGCGCGGAGTTTGCGAAGGAGAGCTTTAGTGTCTCCTCGAACTCTTCT
TTCATGTCTTCGGCGATCACCGGCGACGGGAGTGTATCTAAGGGATCTTCGATTTTTCTT
GCTCCGACGGCGCCTGTAGCTTCCTCGGGGAAACCGCCGCTTGCTGGTCTTCCTTACAGA
AAGAGATGTTTTGAGCATGACCACTCTCAGAACTTTTCCGGCAAGATCTCTGCCTCCGGA
AACGGAAAGTGTCATTGCAAGAAAAGCAAGAAAAATCGGATGAAGAGAAGCGTGAGAGTA
CCGGCGATAAGTGCAAAGATAGCTGATATTCCGGTGGACGAGTATTCATGGAGGAAATAC
GGACAAAAACCGATCAAGGGCTCACCACACCCACGGGGTTACTACAAATGTAGTACGTTT
AGAGGGTGTCCAGCCAGGAAACACGTGGAACGAACATTGGATGATCCAACGATGCTTATT
GTGACTTACGAAGGGGAGCACCGTCACCAAAAGTCCGCTATGAACGATAACATATTTTCC
AGTTTGGTGTTTGGCTCGGGCTTGAATGGTTGATAATTAGAAAAGAGAATGAAATTAATT
AGTTTTATAGACTTTGTAATTTTTTGAAAAATAGAGGGGGGATTTGTATTTTGAATGGAT
TTTAATCTTACTACCGTGAAAGAGACTTGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EI17TF U 1
AF RS1EI17JQ C 414
BS 1 608 RS1EI17TF
BS 609 812 RS1EI17JQ

RD RS1EI17TF 608 0 0
CCTCCTCCTCCACCCGTTTCTCAGCCGTCTCCTCCGGCACCGGTGCTAACCCCGGGGAGC
TTTGTTCAGTCGCATCAGCAAAGCTTGACGCTAGATTTCACCAGACCGAGCGTGTTTGGC
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TTCATGTCTTCGGCGATCACCGGCGACGGGAGTGTATCTAAGGGATCTTCGATTTTTCTT
GCTCCGACGGCGCCTGTAGCTTCCTCGGGGAAACCGCCGCTTGCTGGTCTTCCTTACAGA
AAGAGATGTTTTGAGCATGACCACTCTCAGAACTTTTCCGGCAAGATCTCTGCCTCCGGA
AACGGAAAGTGTCATTGCAAGAAAAGCAAGAAAAATCGGATGAAGAGAAGCGTGAGAGTA
CCGGCGATAAGTGCAAAGATAGCTGATATTCCGGTGGACGAGTATTCATGGAGGAAATAC
GGACAAAAACCGATCAAGGGCTCACCACACCCACGGGGTTACTACAAATGTAGTACGTTT
AGAGGGTGTCCAGCCAGGAAACACGTGGAACGAACATTGGATGATCCAACGATGCTTATT
GTGACTTA

QA 1 608 1 608
DS 

RD RS1EI17JQ 399 0 0
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GAAATACGGACAAAAACCGATCAAGGGCTCACCACACCCACGGGGTTACTACAAATGTAG
TACGTTTAGAGGGTGTCCAGCCAGGAAACACGTGGAACGAACATTGGATGATCCAACGAT
GCTTATTGTGACTTACGAAGGGGAGCACCGTCACCAAAAGTCCGCTATGAACGATAACAT
ATTTTCCAGTTTGGTGTTTGGCTCGGGCTTGAATGGTTGATAATTAGAAAAGAGAATGAA
ATTAATTAGTTTTATAGACTTTGTAATTTTTTGAAAAATAGAGGGGGGATTTGTATTTTG
AATGGATTTTAATCTTACTACCGTGAAAGAGACTTGACG

QA 1 399 1 399
DS 



CO CL1769Contig2 752 3 2 U
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CTCTCTGATAACTTCCATCATGACCGTCGATATCATGCGTTTTCCTAAGATGGAAGATCA
AACGGCTATACAGGAAGCTGCATCGCAAGGCTTAAAAAGCATGGAACACATGATCCGTCT
CCTCTCTAACCGCCCTGAAGACCGTAACGTTGACTGCTCCGAGATCACCGATTTCACCGT
TTCCAAATTCAAAAAAGTCATATCTCTCCTTAACCGTACCGGTCACGCCCGGTTTAGACG
TGGACCGGTTCAGTCCTCTCCTTCTTCTTCATCCTCCTCCGCCACAGCTCCTCCTCCTCC
TCCACCCGTTTCTCAGCCTTCACCTCCGGCTCCGGTGCTAACTCCGGGGAGCTTTGTTCA
GTTGCATCAGCAAA*GCTTGACGCTAGATTTCACCAAACCAAGCGTGTTTGGCGCCAAAA
*CCAAGAGCACGGAGTTT*GCAAAGGAGAGCTTTAGTGTCTCCTCGAACTCTTCTTT*CA
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TCCTTCGGCGCCTGTAGCTTTCCTCGGGGGAAACCGCCGCTTGCTGGGTCTTCCTTACAG
AAAGAGATGTTTTTGAGCATGACCACTCTCAGAACTTTTCCGGCAAGATCTCTGCCTCTG
GCAGCGGAAAGTGTCATTGCAAGAGAGCAAGA


BQ
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AF RS1GB05TF U 1
AF RS1AC42JQ C 386
AF RS1AC42TF U 390
BS 1 576 RS1GB05TF
BS 577 752 RS1AC42TF

RD RS1GB05TF 576 0 0
TGCACTTTCGCACTCATAAACAAAAACTTCCATTTTTTCAGATCTTCAAGCTTTTAATTT
CTCTCTGATAACTTCCATCATGACCGTCGATATCATGCGTTTTCCTAAGATGGAAGATCA
AACGGCTATACAGGAAGCTGCATCGCAAGGCTTAAAAAGCATGGAACACATGATCCGTCT
CCTCTCTAACCGCCCTGAAGACCGTAACGTTGACTGCTCCGAGATCACCGATTTCACCGT
TTCCAAATTCAAAAAAGTCATATCTCTCCTTAACCGTACCGGTCACGCCCGGTTTAGACG
TGGACCGGTTCAGTCCTCTCCTTCTTCTTCATCCTCCTCCGCCACAGCTCCTCCTCCTCC
TCCACCCGTTTCTCAGCCTTCACCTCCGGCTCCGGTGCTAACTCCGGGGAGCTTTGTTCA
GTTGCATCAGCAAA*GCTTGACGCTAGATTTCACCAAACCAAGCGTGTTTGGCGCCAAAA
*CCAAGAGCACGGAGTTT*GCAAAGGAGAGCTTTAGTGTCTCCTCGAACTCTTCTTT*CA
TGTCTTCGGCGATCACCGGCGACGGGAGTGTATCTA

QA 1 576 1 576
DS 

RD RS1AC42JQ 192 0 0
CCGG
CTCCGGTGCTAACTCCGGGGAGCTTTGTTCAGTTGCATCAGCAAAAGCTTGACGCTAGAT
TTCACCAAACCAAGCGTGTTTGGCGCCAAAAACCAAGAGCACGGAGTTT*GCAAAGGAGA
GCTTTAGTGTCTCCTCGAACTCTTCTTT*CATGTCTTCGGCGATCACCGGCGACGGGAGT
GTATCTA
A

QA 5 191 5 191
DS 

RD RS1AC42TF 363 0 0
CT
CCGGTGCTAACTCCGGGGAGCTTTGTTCAGTTGCATCAGCAAA*GCTTGACGCTAGATTT
CACCAAACCAAGCGTGTTTGGCGCCAAAA*CCAAGAGCACGGAGTTTTGCAAAGGAGAGC
TTTAGTGTCTCCTCGAACTCTTCTTTTCATGTCTTCGGCGATCACCGGCGACGGGAGTGT
ATCTAAAGGGATCTTCGATTTTTCTTTGCTCCTTCGGCGCCTGTAGCTTTCCTCGGGGGA
AACCGCCGCTTGCTGGGTCTTCCTTACAGAAAGAGATGTTTTTGAGCATGACCACTCTCA
GAACTTTTCCGGCAAGATCTCTGCCTCTGGCAGCGGAAAGTGTCATTGCAAGAGAGCAAG
A

QA 3 363 3 363
DS 



AS 1 5

CO CL1770Contig1 1012 5 30 U
GGGGGAATCTGAAAAATTTTTTGAATGAAATAACAATACAAAACACACCTTTCATATCAC
AGGTATTTTTCCTGGATCAAGAATATTTTTAGAGTATATTATACATAATCCTGGCTTTAC
CACACCCAAACATAAATGGTTTGACCATATAAAAACCAACAACAAATAGAATCACGAAGT
AGACAGATATGTGTTTTTCCTTATGTGACCAATGATCATATTGATCATCAATCTTTTTCT
TGCTATAAACCGATCATCAAGAAAGTTTTTTGCAACAAAAAGTTCATGCTTACTTTCTGG
TAGATGGAAACAAGTGAAAGATCTTTTGGTGATGTGTCATTGAGGAAGAACAGGAGGTGC
GACGGCTCTGGTGTTGTAAGATCTACAGTGTCCACATTTCTGTCCTATTATGTGGAAATA
AACTTCTGTTGTGTCGTTACAGTCGTTGCATAGTATCCACACCTTCTTGTCGCGGTAATC
TGAAGGCATAGAAGTGGCTTCAATCTCTTCATCCATTCTCTGCCATGTTTTTGACATATC
AATCACTGACCTCGAGCAAATAGGACAGCAAAATTTGTCACGCTTGATCATCTCATGGTA
GCATTCACAGTGCATAGTGTGTCCACATTTCATCACTGTTGTTTCTTTAAGAGAGTCAAA
GAGATACTCGTAACAAATGGGACAGTGATGTCTCATTGAATCCTCAACGCAGCGATGGTT
GTTGCGCAGACCAGTCGCATAACAAGATCCACATTTCTTGCAATGGAAGAAGTTCTCACG
TCCACCAACTCTGCAGATTCCACAGTCATCACAATGGAACTGTTGTTTCTCAGTATTATC
ATCATAGAACTTGCAGATATTGCAAAAGTATTCTCCCATGTTGACACCACAGTTGGAGCA
TATTTGAGCTACCGGTTGCTCTGTATCGCAAACAGAACAAATCACTTGTTTAACGTCTTG
ACGAACAAGCTCATGACGGTCGTAAATATTGCGCAGAGTGCTAGTGAACTCC


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AATCACTGAC

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TTTTAGAGTATATTATACATAATCCTGGCTTTACCACACCCAAACATAAATGGTTTGACC
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GACCAATGATCATATTGATCATCAATCTTTTTCTTGCTATAAACCGATCATCAAGAAAGT
TTTTTGCAACAAAAAGTTCATGCTTACTTTCTGGTAGATGGAAACAAGTGAAAGATCTTT
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CTTCATCCATTCTCTGCCATGTTTTTGACATATCAATCACTGACCTCGAGCAAATAGGAC
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GTATT

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CC

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TCAATCACTGACCTCGAGCAAATAGGACAGCAAAATTTGTCACGCTTGATCATCTCATGG
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CATATTTGAGCTACCGGTTGCTCTGTATCGCAAACAGAACAAATCACTTGTTTAACGTCT
TGACGAACAAGCTCATGACGGTCGTAAATATTGCGCAGAGTGCTAGTGAACTCC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 5

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ATTTCCTCTGTTATTTATATTTGGACTTTGTTTATACAATTTATTTATCTAAATAT


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FT19TF U 1
AF RS1CS04TF U 1
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AF RS1H339TF U 4
AF RS1CS04JQ C 51
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CTCTGTTATTTATATTTGGACTTTGTTTATACAATTTATTTA
TCC

QA 6 767 6 767
DS 

RD RS1H339TF 726 0 0
GG
GGAGTTCCTGTCTTTTCTTGTCTGATCTTTTGTCTTTTACCTCTTATCCAATCCTTGTCT
GTTTCCTCCATCAACCACACAAACAAAAAGAACCTCATCTGTAAACAGGTGTTTATCCAA
AGATGAAAAAGATTCTGAAGCTTGTGGACATGGAAAAGAAACTGATAATGCTAATGTTGC
TTCTGCAACTTCTGTCCTTAAACTCTTTGTCTCTGGTTCAGTCCTCATCCAAACCAACTG
CAAATATCACTGTAACGGGTCTTGTTTATTGCGATGTCTGTTCCACCAACAGTTTCTCCA
AACACAGCTACTTCATGTCCG***GTGTGGAAGTGAGAATAATCTGCAGATTTAAGACAG
CTTCATCGAAAACTAGGGAGATGATCACGTTCTCTGCAAATCGAACCACGAACGAGCTTG
GACTCTACAAGGTAGACATAAAATCTGTGGAAGGTGTTTCTTGCGCCACAGAAGCGAACA
AAGATTCTCTAGTGGCTTCATGTCAGGCGAGCTTGATCGGCAGCTCCTCGGATTCCTGCA
ACGTTCCTGGCTACAAAACTACAACGGAACAGGTTAAGTCCAAGAGGTCTAATCTCTGTG
TCTACCGATTCACCTCCTTGAATTTCAGACCGTTTAAGAAGAATATTGACTTGTGTGGCA
AGCAATAGAAAATAAGCTGCAAATTTCTATCACTGTTTATTTCTACGAGAACTCTATTTC
CTCT

QA 3 726 3 726
DS 

RD RS1CS04JQ 726 0 0
TATCCAAT
CTTGTCTGTTTCCTCCATCAACCACACAAACAAAAAGAACCTCATCTGTAAACAGGTGTT
TATCCAAAGATGAAAAAGATTCTGAAGCTTGTGGACATGGAAAAGAAACTGATAATGCTA
ATGTTGCTTCTGCAACTTCTGTCCTTAAACTCTTTGTCTCTGGTTCAGTCCTCATCCAAA
CCAACTGCAAATATCACTGTAACGGGTCTTGTTTATTGCGATGTCTGTTCCACCAACAGT
TTCTCCAAACACAGCTACTTCATGTCCGCAGGTGTGGAAGTGAGAATAATCTGCAGATTT
AAGACAGCTTCATCGAAAACTAGGGAGATGATTACGTTCTCTGCAAATCGAACCACGTAC
GAGCTTGGACTCTACAAGGTAGACATAAAATCTGTGGAAGGTGTTTCTTGCGCCACAGAA
GCGAACAAAGATTCTCTAGTGGCTTCATGTCAGGCGAGCTTGATCGGCAGCTCCTCGGAT
TCCTGCAACGTTCCTGGCTACAAAACTACAACGGAACAGGTTAAGTCCAAGAGGTCTAAT
CTCTGTGTCTACCGATTCACCTCCTTGAATTTCAGACCGTTTAAGAAGAATATTGACTTG
TGTGGCAAGCAATAGAAAATAAGCTGCAAATTTCTATCACTGTTTACTTCTACGAGAACT
CTATTTCCTCTGTTATTTATATTTGGACTTTGTTTATACAATTTATTTATCTAAATAT

QA 9 726 9 726
DS 



AS 1 5

CO CL1772Contig1 757 5 3 U
GGACCCCCAACACCCCTTTTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATGATGGCTTCTTCACAAGCC
CTCCTTTTGCTCACACTGTCTATGGTGTTAATCCCCTTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATG
ATGGCTCCTTCTGGCTCAATGTCCATGCCACCAATGCCTAGCGGCGGCTCTCCAATGTCA
ATGATGACTCCACCACCTATGCCTATGATGACTCCACCACCTATGCCTATGGCGCCACCA
CCTATTATGACTCCACCACCTATGCCTATGGCACCACCACCTATGCCCATGACTCCACCA
CCTATGCCTATGGCTCCACCGCCAATGTCCATGGCTACACCACCTATGACGCCAATGACT
CCATCTTCAAGCCCAATGAGCCCACCAACTACTCCTATGAGCCCAGGCCCTAGCCCAGCA
ACTGTCCCCGATATGGCTTCGCCACCGATGCCACCAGCAATGGAATCTTCTCCTTCTCCG
GGACCGGGACCCATGCCACCGGCTACGGCCTCGCCGGGGGATTCCGGAGCTTTCAATGTA
AGAATCGACGCCGTGGCACTTTCTTTCCTCGTTGCAGCCCATTTGCTCCTCGTTTGAGAT
TATTACTGAGCGTCGTTTTCGTGTAATTTACTTTAATTATTCTTCGAGCCATAGTTTTCA
TCGTTTTATCATATTTGAGTTTGTGTTTGATATGTACGATTCAGACATTTGTTTGCTTTA
TCAATCTATCGTTGACTCTAGTTGGTGTATGCGATCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1G157TF U 1
AF RS1FU80TF U 1
AF RS1FU80JQ C 20
AF RS1G157JQ C 516
AF RS1EA17TF U 519
BS 1 606 RS1FU80TF
BS 607 607 RS1G157TF
BS 608 757 RS1FU80TF

RD RS1G157TF 697 0 0
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CTCCTTTTGCTCACACTGTCTATGGTGTTAATCCCCTTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATG
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ATGATGACCCCACCACCTATGCCTATGATGACTCCACCACCTATGCCTATGGGGCCACCA
CCTATGATGACTCCACCACCTATGCCTATGGCACCACCACCTATGCCCATGACTCCACCA
CCTATGCCTATGGCTCCACCGCCAATGTCCATGGCTACACCACCTATGACGCCAATGACT
CCATCTTCAAGCCCAATGAGCCCACCAACTACTCCTATGAGCCCAGGCCCTAGCCCAGCA
ACTGTCCCCGATATGGCTTCGCCACCGATGCCACCAGCAATGGAATCTTCTCCTTCTCCG
GGACCGGGACCCATGCCACCGGCTACGGCCTCGCCGGGGGATTCCGGAGCTTTCAATGTA
AGAATCGACGCCGTGGCACTTTCTTTCCTCGTTGCAGCCCATTTGTTCCTCGTTTGAGAT
TATTACTGAGCGTCGTTTTCGTGTAATTTACTTTAATTATTCTTCGAGCCATAGTTTTCA
TCGTTTTATCATATTTGAGTTTGTGTTTGATATGTAC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RS1FU80TF 757 0 0
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CTCCTTTTGCTCACACTGTCTATGGTGTTAATCCCCTTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATG
ATGGCTCCTTCTGGCTCAATGTCCATGCCACCAATGCCTAGCGGCGGCTCTCCAATGTCA
ATGATGACTCCACCACCTATGCCTATGATGACTCCACCACCTATGCCTATGGCGCCACCA
CCTATTATGACTCCACCACCTATGCCTATGGCACCACCACCTATGCCCATGACTCCACCA
CCTATGCCTATGGCTCCACCGCCAATGTCCATGGCTACACCACCTATGACGCCAATGACT
CCATCTTCAAGCCCAATGAGCCCACCAACTACTCCTATGAGCCCAGGCCCTAGCCCAGCA
ACTGTCCCCGATATGGCTTCGCCACCGATGCCACCAGCAATGGAATCTTCTCCTTCTCCG
GGACCGGGACCCATGCCACCGGCTACGGCCTCGCCGGGGGATTCCGGAGCTTTCAATGTA
AGAATCGACGCCGTGGCACTTTCTTTCCTCGTTGCAGCCCATTTGCTCCTCGTTTGAGAT
TATTACCGAGCGTCGTTTTCGTGTAATTTACTTTAATTATTCTTCGAGCCATAGTTTTCA
TCGTTTTATCATATTTGAGTTTGTGTTTGATATGTACGATTCAGACATTTGTTTGCTTTA
TCAATCTATCGTTGACTCTAGTTGGTGTATGCGATCG

QA 1 757 1 757
DS 

RD RS1FU80JQ 738 0 0
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CTATGGTGTTAATCCCCTTCTCTTTAGCTCAATCTCCCATGATGGCTCCTTCTGGCTCAA
TGTCCATGCCACCAATGCCTAGCGGCGGCTCTCCAATGTCAATGATGACTCCACCACCTA
TGCCTATGATGACTCCACCACCTATGCCTATGGCGCCACCACCTATTATGACTCCACCAC
CTATGCCTATGGCACCACCACCTATGCCCATGACTCCACCACCTATGCCTATGGCTCCAC
CGCCAATGTCCATGGCTACACCACCTATGACGCCAATGACTCCATCTTCAAGCCCAATGA
GCCCACCAACTACTCCTATGAGCCCAGGCCCTAGCCCAGCAACTGTCCCCGATATGGCTT
CGCCACCGATGCCACCAGCAATGGAATTTTCTCCTTTTCCGGGACCGGGACCCATGCCAC
CGGCTACGGCCTCGCCGGGGGATTCCGGAGCTTTCAATGTAAGAATCGACGCCGTGGCAC
TTTCTTTCCTCGTTGCAGCCCATTTGCTCCTCGTTTGAGATTATTACCGAGCGTCGTTTT
CGTGTAATTTACTTTAATTATTCTTCGAGCCATAGTTTTCATCGTTTTATCATATTTGAG
TTTGTGTTTGATATGTACGATTCAGACATTTGTTTGCTTTATCAATCTATCGTTGACTCT
AGTTGGTGTATGCGATCG

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1G157JQ 211 0 0
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AGCCCATTTGTTCCTCGTTTGAGATTATTACTGAGCGTCGTTTTCGTGTAATTTACTTTA
ATTATTCTTCGAGCCATAGTTTTCATCGTTTTATCATATTTGAGTTTGTGTTTGATATGT
ACGATTCAGACATTTGTTTGCTTTATCAATC

QA 1 211 1 211
DS 

RD RS1EA17TF 230 0 0
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CCATTTGCTCCTCGTTTGAGATTATTACTGAGCGTCGTTTTCGTGTAATTTACTTTAATT
ATTCTTCGAGCCATAGTTTTCATCGTTTTATCATATTTGAGTTTGTGTTTGATATGTACG
ATTCAGACATTTGTTTGCTTTATCAATCTATCGTTGACTCTAGTTGGTGT

QA 1 230 1 230
DS 



AS 1 3

CO CL1773Contig1 1214 3 14 U
GGATTCTCAATCACATCTCTCCTGGTCAACGCTGCTGCTAAGCCTTCACCATTTTGCTCC
AAGATGTGGAAGCTCTGCTTCTGTCTACCTTTCCTACTCCTTGACGTCGGTGTAGCCAAG
GCTTCTGCATCCATCTACCTCCCTAGTCAAACCGGCGGTGATGGTTCTTCTAACCCTGTT
TGCTCCTCCCCGGATCCTAACCTGAACTACAGACCGGTCATCGGGATACTGAGCCACCCT
GGTGATGGAGCCTCGGGTCGGCTGAGCAATGATACGACCTCGACTTACATCGCAGCTTCT
TACGTGAAGTTCGCTGAGGCAGGTGGGGCACGTGTCATCCCTCTCATCTACAACGAGCCT
GAAGATGTTCTCTTCAAGAAGCTAGAGCTAGTCAATGGTGTGATATTCACTGGTGGTTGG
GCTAAAAAATATGAATATTTCGACATGGTCACAAAAATCTTCAAAAAAGCTTTAGAGAGA
AATGATGCTGGAGACCATTTTCCAATATATGGCATTTGCCTCGGTTTCGAGCTTATGTCT
ATCATCGTCAGTCAGAACAGAGACATTCTTGAAAGATTTGATGCTGAAGATAATGCATCA
AGTCTTCAGTTCGTTGAAAATGTTAATATTGAAGGCACCTTGTTCCAAAGGTTTCCTCCA
GAGTTGTTGAGAAAAGTCAGTACAGACTGTTTGGTTATGCAGAAACACAAGTGGGGTATC
ACACCAAAAAAATTCAAAGCGAACCATGCTCTGTCTAGTTTCTTTGAAATTGTCACAACC
TGCATTGATGAAAACAGCAAGACTTACGTTTCAACTGTTAAAGCAAAGAGATACCCAATA
ACTGGCTTCCAGTGGCATCCTGAGAAAAACGCATTTGAATGGGGTTCATCTCAAATTCCA
CACTCAGCTGACGCTATCCAGGTGACACAGTACGCTGCTAGTCATTTAGTCAGTGAAGCT
AGGAAGTCACAGAACAGACCATCTTCTGAGAAAGTGCTGAAGAACCTCATATACAACTAC
AAGCCAACATACTGCGGATACGCAGGGAAGGGTTATGACGAAGTTTACCTTTTCACACAA
CCAAAGTCCCGTTTATAAGAACGTCCTCAGTCTTTGTGTCTCTGTTGTCAGAAGTGCATG
TTCTTTAATCTGAACTCTTGTAGCATCTGATATGTGTTAAGAGCCGATTGTTTGACTCGC
TGCATGATTTCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AM62TF U 1
AF RS1DJ27JQ C 606
AF RS1DJ27TF U 447
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RD RS1AM62TF 849 0 0
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GCTAAAAAATATGAATATTTCGACATGGTCACAAAAATCTTCAAAAAAGCTTTAGAGAGA
AATGATGCTGGAGACCATTTTCCAATATATGGCATTTGCCTCGGTTTCGAGCTTATGTCT
ATCATCGTCAGTCA**ATAGAGACATTCTTGAAAGATTTGATGCTGAAGATAATGCATCA
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ACTGGCTTC

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AAAAAAATTCAAAGCGAACCATGTTCTGTTTAGTTTTTTTGAAATTGTCACAACCTGCAT
TGATGAAAACAGCAAGACTTACGTTTCAACTGTTAAAGCAAAGAGATACCCAATAACTGG
CTTCCAGTGGCATCCTGAGAAAAACGCATTTGAATGGGGTTCATCTCAAATTCCACACTC
AGCTGACGCTATCCAGGTGACACAGTACGCTGCTAGTCATTTAGTCAGTGAAGCTAGGAA
GTCACAGAACAGACCAT
TT

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DS 

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ATATGGCATTTGCCTCGGTTTCGAGCTTATGTCTATCATCGTCAGTCAGAACAGAGACAT
TCTTGAAAGATTTGATGCTGAAGATAATGCATCAAGTCTTCAGTTCGTTGAAAATGTTAA
TATTGAAGGCACCTTGTTCCAAAGGTTTCCTCCAGAGTTGTTGAGAAAAGTCAGTACAGA
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AAACGCATTTGAATGGGGTTCATCTCAAATTCCACACTCAGCTGACGCTATCCAGGTGAC
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CTGATATGTGTTAAGAGCCGATTGTTTGACTCGCTGCATGATTTCTCT

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 4

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CATCGGTTTTAAAGGTGAAGCAACCCAGTTGAAAAGGGATGTTGTTGCAACGATTGTATA
TGAGATAAGACCGAATCCTTCAGATCACAAGACAAAAGCTGAGACTGGGTGGAGTTTCTC
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ATGTTTCCTCAATAAGTTTTGGCCTATTGTAACAAACATATATGTATCGAATAAAATGCC
GGAGACTTGTTAAATGTGGAATTTTTTTATACTTGAACCGGTATGAGTTATTTTGAACTT
TTATAACAATGAACTTTATTTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BI43TF U 1
AF RS1B489TF U 9
AF RS1CW32JQ C 52
AF RS1B489JQ C 660
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CGAAGGAGACCCTGAATTGCTTGTCTTTGTACCATTCATATCAGACGTCAAGATCAAGAG
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TGGCAACATCACATTGCATTTCCCTGAGAGTTTTGGTGGTGACACAACCCAAATACGCTA
CATCGGTTTTAAAGGTGAAGCAACCCAGTTGAAAAGGGATGTTGTTGCAACGATTGTATA
TGAGATAAGACCGAATCCTTCAGATCACAAGACAAAAGCTGAGACTGGGTGGAGTTTCTC
ACAAGTTGAGTGAAGATATTATCTGCTTCCAACTTCACTCCTTAGCCTTT*CACATACCT
AT

QA 1 722 1 722
DS 

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GG
GTTCTTCTTGGCCCCCAATTTCTGATTTGGAAAAACAAAAAAGAAAAAATGTCGTGTACG
CATGATCACAACTGCGAGGATCACGAGTGTTCCTCCGATTGGTCACTCTACAAGCACATC
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AAAGCATGGGAACAGCGTTTACACTCTTCTGGGGAGCATTTGGAGAGCAACGAAGGAGAC
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ATTGACTTCTCTGACGCTGAGGGCATGCAAGCCGTTCAGGAATGGGAGTTAGCTGAAAAT
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AA*AAGTTTTGGCCTATTGTA

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AATACGCTACATCGGTTTTAAAGGTGAAGCAACCCAGTTGAAAAGGGATGTTGTTGCAAC
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AGGTTTCTCACAAGTTGAGTGAAGATATTATCTGCTTCCAACTTCACTCCTTAGCCTTTT
CACATACCTATGTTTCCTCAATAAGCTTTGGCCTATTGTAACAAACATATATGTATCGAA
TAAAATGCCGGAGACTTGTT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RS1B489JQ 208 0 0
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TATGTTTCCTCAATAAGTTTTGGCCTATTGTAACAAACATATATGTATCGAATAAAATGC
CGGAGACTTGTTAAATGTGGAATTTTTTTATACTTGAACCGGTATGAGTTATTTTGAACT
TTTATAACAATGAACTTTATTTTTTTTT

QA 1 208 1 208
DS 



AS 1 5

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TTCTTCTCGTTTCGAGTCCGTAAGATCCCCTCGAAAACAAAAAAAGAGATGGCGGAGGAG
AAGAAAGTCGCCCCGATTGGTGTCTGGACCGCCGTGAAGCCCTTCGTCAATGGCGGGCCT
CCGGTATGCTCGCGACTTGCGTCATCCAGCCGATTGACATGATCAAGGTGAGGATTCAAC
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CTTTCTACAAGGGATTGTCTGCTGTTTGCTGAGGCAAGCAACTTACACCACAGCCCGTCT
TGGATCCTTCAAGATGCTGACTGCGAAAGCGATTGAAGCTAACGACGGGAAGCCGCTACC
CCAGTATCAGAAGGCTCTGTGTGGTCTGACGGCCGGTGCCATTGGTGCTTGCGTCGGTAG
TCCGGCCGATCTGGCGCTTATCAGAATGCAAGCCGACAACACCTTGCCGTTAGCTCAGCG
CAGGAACTACACCAACGCCTTCCACGCGCTGTACCGTATCAGCGCCGATGAAGGAGTTTT
GGCGCTCTGGAAAGGTTGTGGTCCCACCGTGGTCAGAGCCATGGCTTTGAACATGGGGAT
GCTTGCTTCTTATGATCAGAGTGCTGAGTACATGAGAGATAATCTCGGTCTTGGGGAGAC
TTCTACCGTCGTTGGAGCAAGTGCCGTTTCGGGGTTTTGCGCTGCGGCTTGCAGTTTACC
ATTTTACTTTGTCAAAACTCAGATCCAGAAAATGCAACCTGACGCTCAGGGGAAGTATCC
ATACACTGGTTCGCTTGACTGTGCAATGCAAACCTTGAAGTCAGGAGGACCTTTGAAGTT
CTACACAGGTTTCCCTGTTTACTGCGTCAGGATCGCCCCTCACGTCATGATGACATGGAT
CTTCCTGAACCAGATTACAAAGTTTCAGAAGACCATTGGTCTGCGAGATTCAAGCATTGT
GAAGTGCGTGGCGAGAATAAGATGAGAAGAAAAACACAATTGGAATTGTGTTAGATTTGC
CTTTTTTTTATTCATATACATGATGATCACATTGCCTTGACGCATTATTGGAAACTGTTG
AAGACTTAATATTTTTGTTGTTGTTGAGGATCGTTGATTGGTCTGGTAAACTTCCTTTTG
AAATTTAAAAAGAAACACAATTCTGAGATCTTAATTAG


BQ
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GG
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TTGATTGGTCTGGTAAACTTCCTTTTGAAATTTAAAAAGAAACACAATT
CTGAG

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DS 



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CTCATCTCCAAAACCCAACAACAATGCTGCCTACCAACACGTGTTCGTGATGCGTCACGG
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GCCTCTCTTTCAAGACGGTTTTATTCGAGCTTTCAGAACCGGTCAAAAGATCCGATCTCA
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35 35 35 35 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 0 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DD44TF U 1
AF RS1DY28TF U 8
AF RS1DX90TF U 19
AF RS1DD44JQ C 308
AF RS1DY28JQ C 387
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GATGTTGAACACAGTGGCTATAAGGCGTGAGCTTGCTCCTAAAGATGGAAACTTTGACTT
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GGTTTATAAAGAGATGCCAAAATGGGGAGAGTCTGTGGAAGGTTGTAGAGAACGTTATGT
TAATATTGTAAAGGCTCTTGCTGATAAGTATCCTACAGAGAACTTGCTCTTAGTCACCCA
CGGG

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DS 

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CCAAAACCCAACAACAATGCTGCCTACCAACACGTGTTCGTGATGCGTCACGGCGATCGA
ATCGACAACTTCGAGCCACTCTGGGTCTCAACAGCTGCCAGGCCTTGGGATCCGCCTCTC
TTTCAAGACGGTTTTATTCGAGCTTTCAGAACCGGTCAAAAGATCCGATCTCAGATCGGG
TTCCCGGTTCACCGCGTCTTCGTCTCCCCTTTCCTCCGTTGCATTCAGACAGCTTCCGAG
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CCTTCCGTTGATACATCTAAGCTCAAGGTTGCTATTGAGTATGGTCTGTGTGAGATGTTG
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AAAGAGATGCCAAAATGGGAAGAGTCTGTGGAAAGTTGTAGAGAACGTTATGTTAATATT
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TGCGCTTAT
TTGAGTGGAGAG

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DS 

RD RS1DX90TF 767 0 0
G
CAGCGAAGAGAAAGAAAAAAAAACATAAACAAAACAATGGACTCATCTCCAAAACCCAAC
AACAATGCTGCCTACCAACACGTGTTCGTGATGCGTCACGGCGATCGAATCGACAACTTC
GAGCCACTCTGGGTCTCTACAGCTGCCAGGCCTTGGGATCCGCCTCTCTTTCAAGACGGT
TTTATTCGAGCTTTCAGAACCGGTCAAAAGATCCGATCTCAGATCGGGTTCCCGGTTCAC
CGCGTCTTCGTCTCCCCTTTCCTCCGTTGCATTCAGACAGCTTCCGAGGTTGTCTCGGCT
CTCTCCGCGGTTAATGTTGACCCCAACGCCATGTCTTCCAAAGACGTACCTTCCGTTGAT
ACATCTAAGCTCAAGGTTGCTATTGAGTATGGTCTGTGTGAGATGTTGAACGCAGTGGCT
ATAAGGCGTGAGCTTGCTCCTAAAGATGGAAACTTTGACTTTAGGTTATCAGATCTCGAA
GCTCTGTTTCCTGAAGGGATGGTTGATCATAACGTGGATATGGTTTATAAAGAGATGCCA
AAATGGGAAGAGTCTGTGGAAGGTTGTAGAGAACGTTATGTTAATATTGTAAAGGCTCTT
GCTGATAAGTATCCTACAGAGAACTTGCTCTTAGTCACCCACGGGGAAAGAGTATGAACT
ACATTTTCGACGTTCTATAGAGATACAACTGTGTACGAATTAGACTACTGCGCTTATGTT
GAGTTGAGAGGAGAG*TCGCAAGTAAAGATGGGTCTGT
GAACTGGG

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DS 

RD RS1DD44JQ 684 0 0
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CCTTCCGTTGATACATCTAAGCTCAAGGTTGCTATTGAGTATGGTCTGTGTTAGATGTTG
AACACAGTGGCTATAAGGCGTGAGCTTGCTCCTAAAGATGGAAACTTTGACTTTAGGTTA
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AAAGAGATGCCAAAATGGGGAGAGTCTGTGGAAGGTTGTAGAGAACGTTATGTTAATATT
GTAAAGGCTCTTGCTGATAAGTATCCTACAGAGAACTTGCTCTTAGTCACCCACGGGGAA
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TGCGCTTATGTTGAGTTGAGAAGAGAGGTCGCAAGTAAAGATGGGTCTGTTGAAACTGGG
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CC

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AAATCAAATAAGACTTATACACTTCTGGC

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DS 



AS 1 5

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AGGTTTAATGTTTTAGC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BS15TF U 1
AF RS1FG29JQ C 224
AF RS1FG29TF U 38
AF RS1FZ93TF U 1
AF RS1FZ93JQ C 289
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QA 1 712 1 712
DS 

RD RS1FG29JQ 481 0 0
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GCATTTGTTTTTGCTTTATGATGAAACTACTTTTAGATACTTTGTTAAATTTATTATGC
CC

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DS 

RD RS1FG29TF 667 0 0
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CTCCAGGTTCATTCCTCTCAAGTGAAGAAGAAGCTTATATTGCTGCTTGGGGAATGTGTT
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TATGC
CC

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1FZ93TF 688 0 0
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TTGACATGTCTACTGATGATCTCGTCAAGCTCTTCCCTTCTCGTATTCGCAGAAGGTTCT
CAAGAGGTTTGACCAGGAAGCCAATGGCTCTCATTAAGAAGCTGCGTAAGGCCAAAAGGG
AGGCACCACAAGGTGAGAAGCCAGAACCAGTGAGAACCCACTTGAGGAACATGATCATTG
TCCCAGAGATGATCGGAAGCATCATTGGGGTGTACAATGGAAAGACCTTTAACCAGGTCG
AGATCAAGCCTGAGATGATTGGTCACTACTTGGCTGAGTTCTCCATCTCGTACAAGCCGG
TTAAGCACGGTAGGCCTGGTGTTGGTGCTACCCACTCCTCCAGGTTCATTCCTCTCAAGT
GAAGAAGAAGCTTATATTGCTGCTTGGGGAATGTGTTCCTTCATCGTTATATGGTCTTTG
CTTTGAGTTGTCTTCTATGTATTCGGATCCTTTTTTTT**TCTGCATTTGTTTTTGCTTT
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DS 

RD RS1FZ93JQ 449 0 0
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TTAACCAGGTCGAGATCAAGCCTGAGATGATTGGTCACTACTTGGCTGAGTTCTCCATTT
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TTCCTCTCAAGTGAAGAAGAAGCTTATATTGCTGCTTGGGGAATGTGTTCCTTCATCGTT
ATATGGTCTTTGCTTTGAGTTGTCTTCTATGTATTCGGATCCTTTTTTTT**TCTGCATT
TGTTTTTGCTTTATGATGAAACTACTTTTAGATACTTTGTTAAATTTATTATGCTCATGC
ATTTTCGTTATTAGGTTTAATGTTTTAGC

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DS 



AS 1 5

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TGTGAGAGAGAATCAAAATGGCTTCAAAGCTGGTGATAATCATTGTGTTCATACTAGATC
TAATCGCCGTCGGTTTAGCCATTGCCGCCGAGCAAAGACGAAGCGTCGGTAAGGTTGTAC
CGGATAAGGAGAAGGTGTATGAGTATTGTGAGTACGGCTCAGACATAGCTACTAGTTATG
GAGCTGGTGCTTTTGTCCTTCTCTTGACCAGTCAAGTCATTATCATGGTGGCTAGTCGCT
GCTTCTGCTGTGGGAAGTCTCTTAACCCGGGTGGTTCAAGAGCATGTGCCATCATGCTCT
TCCTCATTTGCTGGGCGTTTTTCTTGATTGCTGAGATATGTCTGCTCGCGGCATCGATCA
GAAACGCGTACCACACTAAGTACAGGAAGATGTGGAACATCGATGCCCCTCCTAGCTGTG
AAGTGATCCGTAAAGGTGTGTTTGCTGCTGGTGCTTCGTTCGCGCTCTTCACTGCTATCG
TCTCTCAGTTCTACTACGTCTGCTACTCTCGTGCTCGTGATGATTACAAGAACCCACCTT
ACTAAAATGAGTGGAACTGTTTTATCCCTTCACTGATTCGATAGGATGTTTCAAGATTTG
ATTGTGTTTCCTTTAAGCTTTTTGATTATCAAGACATTACCTTTTGCGTTTCATTGTATA
AATACTTATTTAACATCTACGTTGAGTATCTAAGATTGTTTGTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C646TF U 30
AF RS1C512TF U 1
AF RS1FO54TF U 28
AF RS1C646JQ C 30
AF RS1EQ22TF U 37
BS 1 81 RS1C512TF
BS 82 82 RS1FO54TF
BS 83 112 RS1C512TF
BS 113 113 RS1FO54TF
BS 114 179 RS1C512TF
BS 180 180 RS1FO54TF
BS 181 283 RS1C512TF
BS 284 311 RS1FO54TF
BS 312 312 RS1EQ22TF
BS 313 374 RS1FO54TF
BS 375 375 RS1EQ22TF
BS 376 749 RS1FO54TF
BS 750 767 RS1C646JQ

RD RS1C646TF 187 0 0
G
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QA 2 187 2 187
DS 

RD RS1C512TF 283 0 0
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TGTGAGAGAGAATCAAAATGGTTTCAAAGCTGGTGATAATCATTGTGTTCAT*CTAGATC
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QA 1 283 1 283
DS 

RD RS1FO54TF 722 0 0
GGA
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DS 

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G
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TGGTGATAATCATTGTGTTCATACTAGATCTAATCGCCGTCGGTTTAGTCATTGCCGCCG
AGCAAAGACGAAGCGTCGGTAAGGTTGTACCGGATAAGGAGAAGGTGTATGAGTATTGTG
AGTACGGCTCAGACATAGCTACTAGTTATGGAGCTGGTGCTTTTGTCCTTCTCTTGACCA
GTCAAGTCATTATCATGGTGGCTAGTCGCTGCTTCTGCTGTGGGAAGTCTCTTAACCCGG
GTGGTTCAAGAGCATGTGCCATCATGCTCTTCCTCATTTGCTGGGCGTTTTTCTTGATTG
CTGAGATATGTCTGCTCGCGGCATCGATCAGAAACGCGTACCACACTAAGTACAGGAAGA
TGTGGAACATCGATGCCCCTCCTAGCTGTGAAGTGATCCGTAAAGGTGTGTTTGCTGCTG
GTGCTTCGTTCGCGCTCTTCACTGCTATCGTCTCTCAGTTCTACTACGTCTGCTACTCTC
GTGCTCGTGATGATTACAAGAACCCCCCTTACTAAAATGAGTGGAACTGCTTTATCCCTT
CACTGATTCGATAGGATGTTTCAAGATTTGATTGTGTTTCCTTTAAGCTTTTTGATTATC
AAGACATTACCTTTTGCGTTTCATTGTATAAATACTTATTTAACATCTACGTTGAGTATC
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DS 

RD RS1EQ22TF 694 0 0
GG
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ATCATTGTGTTCATACTAGATCTAATCGCCGTCGGTTTAGCCATTGCCGCCGAGCAAAGA
CGAAGCGTCGGTAAGGTTGTACCGGATAAGGAGAAGGTGTATGAGTATTGTGAGTACGGC
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ATTATCATGGTGGCTAGTCGCTGCTTCTGCTGTGGGAAGTCTCTTAACCCGGGTGGTTCA
AGAGCATGTGCCATCATGCTCTTCCTCATTTGCTGGGCGTTTTTCTTGATTGCTGAGATA
TGTCTGCTCGCGGCATTGATCAGAAACGCGTACCACACTAAGTACAGGAAGATGTGGAAC
ATCGATGCCCCTCCTAGCTGTGAAGTGATCCGTAAAGGTGTGTTTGCTGCTGGTGCTTCG
TTCGCGCTCTTCACTGCTATCGTCTCTCAGTTCTACTACGTCTGCTACTCTCGTGCTCGT
GATGATTACAAGAACCCACCTTACTAAAATGAGTGGAACTGTTTTATCCCTTCACTGATT
CGATAGGATGTTTCAAGATTTGATTGTGTTTCCTTTAAGCTTTTTGATTATCAAGACATT
ACCTTTTGCGTCTCATTGTATAAATACTTATT

QA 3 694 3 694
DS 



AS 1 5

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GACGAAATGTTTGTGCAACGGTTAGGTATCTAATACGATCTTATTTCTGGTTC


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1A673JQ C 1
AF RS1A673TF U 1
AF RS1BD61TF U 1
AF RS1AU30JQ C 1
AF RS1AU30TF U 1
BS 1 19 RS1A673TF
BS 20 20 RS1BD61TF
BS 21 157 RS1A673TF
BS 158 158 RS1BD61TF
BS 159 400 RS1A673TF
BS 401 402 RS1BD61TF
BS 403 434 RS1A673TF
BS 435 435 RS1BD61TF
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BS 475 510 RS1A673TF
BS 511 593 RS1AU30TF

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DS 

RD RS1A673TF 510 0 0
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TACTGAGTGTGAAAATAATTTCCGAGTTTC

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DS 

RD RS1BD61TF 505 0 0
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QA 1 593 1 593
DS 

RD RS1AU30TF 593 0 0
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GACGAAATGTTTGTGCAACGGTTAGGTATCTAATACGATCTTATTTCTGGTTC

QA 1 593 1 593
DS 



AS 1 4

CO CL1780Contig1 1252 4 10 U
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AAGAGAAAAAATGTCTCCACTCTCAGATCTCCTTAACCTCAATCTCGACACCAAGCAAAT
CATCGCTGAATACATATGGATAGGTGGGTCTGGAATGGACATTAGAAGCAAAGGCAGAAC
ATTACCAGGACCAGTAAGTGATCCATCAAAGCTTCCGAAATGGAACTACGATGGATCCAG
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GAAGGCTGAAGAGCCTTGGTTTGGGATAGAGCAAGAATACACATTACTTAAGAAAGACGT
CAAGTGGCCATTAGGTTGGCCCATTGGTGGCTTTCCTGGTCCTCAGGGACCGTACTATTG
CGCGGTGGGTGCAGACAAAGCCTTTGGTCGTGACATTGTGGATGGTCACTACAAAGCTTG
TCTTTACGCTGGTTTAAGCATAGGTGGTGCCAATGGTGAAGTCATGCCTGGACAGTGGGA
GTTTCAGATCAGCCCTACTGTTGGTATTGGTGCAGGTGATCAGTTATGGGTTGCTCGCTA
CATACTCGAGAGGATTACTGAGATATGCGGCGTGATTGTCTCATTTGATCCCAAACCAAT
CGAGGGTGATTGGAACGGAGCAGCTGCTCATACAAACTTCAGTACAAAATCAATGAGGAA
AGAAGGAGGATTAGACTTGATCAAGAAAGCAATAGGGAAGCTTGAAGTAAAGCATAAACA
ACACATTGCTGCTTATGGTGAAGGCAATGAGAGGCGTCTCACTGGGAAGCATGAAACCGC
AGACATCAACAAGTTCTCTTGGGGAGTGGCGGATCGTGGAGCATCGGTGAGGGTGGGAAG
AGATACGGAGAAGGAAGGGAAAGGTTATTTTGAAGATCGAAGGCCTTCGTCTAATATGGA
TCCTTATCTTGTTACCTCCATGATAGCTGAAACCACCATCCTCGGCTAAGCTTTCTTTTG
AAGTTGTTGCATATGTTCTTTTGTTTCTTCATGTTTCGGTTAATTTCGGTTTGAGACTCT
TTTTTTATTGCTAATAATTCATAGGATGGTCTTGATCCTATTGTTTGTTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1CZ83TF U 1
AF RS1BP05TF U 55
AF RS1CD46JQ C 535
AF RS1CZ83JQ C 566
BS 1 522 RS1CZ83TF
BS 523 540 RS1BP05TF
BS 541 541 RS1CD46JQ
BS 542 649 RS1BP05TF
BS 650 650 RS1CD46JQ
BS 651 695 RS1BP05TF
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BS 697 774 RS1BP05TF
BS 775 1250 RS1CD46JQ
BS 1251 1252 RS1CZ83JQ

RD RS1CZ83TF 522 0 0
GGAATGTTCACCACAGTCTGGTTATTATAACTCGATCATCTTCTTTTTCAGCTCGATGGA
AAGAGAAAAAATGTCTCCACTCTCAGATCTCCTTAACCTCAATCTCGACACCAAGCAAAT
CATCGCTGAATACATATGGATAGGTGGGTCTGGAATGGACATTAGAAGCAAAGGCAGAAC
ATTACCAGGACCAGTAAGTGATCCATCAAAGCTTCCGAAATGGAACTACGATGGATCCAG
CACCAATCAAGCCGCCGGAGATGACAGTGAAGTCATTCTATATCCTCAGGCCATTTTTAA
AGACCCATTCAGGAAAGGGAATAACATTCTCGTGATGTGTGATGCCTACACACCGAAAGG
AGATCCAATCCCAACCAACAATAGGCACAAAGCCGTGAAAATCTTCGATCATCCCAATGT
GAAGGCTGAAGAGCCTTGGTTTGGGATAGAGCAAGAATACACATTACTTAAGAAAGACGT
CAAGTGGCCATTAGGTTGGCCCATTGGTGGCTTTCCTGGTCC

QA 1 522 1 522
DS 

RD RS1BP05TF 721 0 0
AGG
GGAAAGAGAAAAAATGTCTCCACTCTCAGATCTCCTTAACCTCAATCTCGACACCAAGCA
AATCATCGCTGAATACATATGGATAGGTGGGTCTGGAATGGACATTAGAAGCAAAGGCAG
AACATTACCAGGACCAGTAAGTGATCCATCAAAGCTTCCGAAATGGAACTACGATGGATC
CAGCACCAATCAAGCCGCCGGAGATGACAGTGAAGTCATTCTATATCCTCAGGCCATTTT
TAAAGACCCATTCAGGAAAGGGAATAACATTCTCGTGATGTGTGATGCCTACACACCGAA
AGGAGATCCAATCCCAACCAACAATAGGCACAAAGCCGTGAAAATCTTCGATCATCCCAA
TGTGAAGGCTGAAGAGCCTTGGTTTGGGATAGAGCAAGAATACACATTACTTAAGAAAGA
CGTCAAGTGGCCATTAGGTTGGCCCATTGGTGGCTTTCCTGGTCCTCAGGGACCGTACTA
TTGTGCGGTGGGTGCAGACAAAGCCTTTGGTCGTGACATTGTGGATGGTCACTACAAAGC
TTGTCTTTACGCTGGTTTAAGCATAGGTGGTGCCAATGGTGAAGTCATGCCTAGACAGTG
GGAGTTTCAGATCAGCCCTACTGTTGGTATTGGTGCAG*TGATCAGTTATGGGTTGCTCG
CTACATACTCGAGAGGATTACTGAGATATGCGGCGTGATTGTCTCATTTGATCCCAA
C

QA 4 720 4 720
DS 

RD RS1CD46JQ 716 0 0
CTATTGCGCGGTGGGTGCAGACAAAGCCTTTGGTCGTGACATTGTGGATGGTCACTACAA
AGCTTGTCTTTACGCTGGTTTAAGCATAGGTGGTGTCAATGGTGAAGTCATGCCTGGACA
GTGGGAGTTTCAGATCAGCCCTACTGTTGGTATTGGTGCAGGTGATCAGTTATGGGTTGC
TCGCTACATACTCGAGAGGATTACTGAGATATGCGGCGTGATTGTCTCATTTGATCCCAA
ACCAATCGAGGGTGATTGGAACGGAGCAGCTGCTCATACAAACTTCAGTACAAAATCAAT
GAGGAAAGAAGGAGGATTAGACTTGATCAAGAAAGCAATAGGGAAGCTTGAAGTAAAGCA
TAAACAACACATTGCTGCTTATGGTGAAGGCAATGAGAGGCGTCTCACTGGGAAGCATGA
AACCGCAGACATCAACAAGTTCTCTTGGGGAGTGGCGGATCGTGGAGCATCGGTGAGGGT
GGGAAGAGATACGGAGAAGGAAGGGAAAGGTTATTTTGAAGATCGAAGGCCTTCGTCTAA
TATGGATCCTTATCTTGTTACCTCCATGATAGCTGAAACCACCATCCTCGGCTAAGCTTT
CTTTTGAAGTTGTTGCATATGTTCTTTTGTTTCTTCATGTTTCGGTTAATTTCGGTTTGA
GACTCTTTTTTTATTGCTAATAATTCATAGGATGGTCTTGATCCTATTGTTTGTTT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RS1CZ83JQ 687 0 0
GGTCGTGACATTGTGGATGGTCACTACAAAGCTTGTCTTTACGCTGGTTTAAGCATAGGT
GGTGCCAATGGTGAAGTCATGCCTGGACAGTGGGAGTTTCAGATCAGCCCTACTGTTGGT
ATTGGTGCAGGTGATCAGTTGTGGGTTGCTCGCTACATACTCGAGAGGATTACTGAGATA
TGCGGCGTGATTGTCTCATTTGATCCCAAACCAATCGAGGGTGATTGGAACGGAGCAGCT
GCTCATACAAACTTCAGTACAAAATCAATGAGGAAAGAAGGAGGATTAGACTTGATCAAG
AAAGCAATAGGGAAGCTTGAAGTAAAGCATAAACAACACATTGCTGCTTATGGTGAAGGC
AATGAGAGGCGTCTCACTGGGAAGCATGAAACCGCAGACATCAACAAGTTCTCTTGGGGG
GTGGCGGATCGTGGAGCATCGGTGAGGGTGGGAAGAGATACGGAGAAGGAAGGGAAAGGT
TATTTTGAAGATCGAAGGCCTTCGTCTAATATGGATCCTTATCTTGTTACCTCCATGATA
GCTGAAACCACCATCCTCGGCTAAGCTTTCTTTTGAAGTTGTTGCATATGTTCTTTTGTT
TCTTCATGTTTCGGTTAATTTCGGTTTGAGACTCTTTTTTTATTGCTAATAATTCATAGG
ATGGTCTTGATCCTATTGTTTGTTTAG

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 5

CO CL1781Contig1 520 5 4 U
GGGGATCGTCTTCAATCCTACTTTCAAAGTCCAGGCGGAGAATACTCGACGAGACAAAAC
CCAGATCGAGAAGGGAAAGAGAACAACTTTATACGCAAAACATGAATCTAGGTTTCGTAA
TTGGAGTTCTCGGCGTCCTGATTCTTTCCCACGCCGCCTATTCAACAATCCAATATAGAG
GATTGTTGAAGATCACGGAGGAAGAGTTCACCGGACCTCCGTTGAATGTTGTTGTGGAGT
TGATCGTGGGACTAGCTCTCTGTATGTGGGCTGCTTTGACTTTCCCTGGCAAGTTTCTCT
CCATTCACCCCGACTCCGATGAAAACAGGGCGGTGTCTTTACCAGATAACTCGGATTTCA
TGATTTTCAATCACCGTGGCCGCCTCTTCCCACCTGAGATCACCATGAAGTTTTGATTTT
TCTTCTTTTTTTTTCCGTTATCATACTGCTTAGTCAAACACTCTTCTGTCCAATGTAATG
AGATATTGTTTCCATTGATATTCTACCCTGTTTTCCCATA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 10 10 10 

AF RS1B062TF U 1
AF RS1DA64TF U 1
AF RS1EF26TF U 209
AF RS1GM64JQ C 39
AF RS1GM64TF U 39
BS 1 75 RS1B062TF
BS 76 76 RS1DA64TF
BS 77 516 RS1B062TF
BS 517 520 RS1DA64TF

RD RS1B062TF 516 0 0
GGGGATCGTCTTCAATCCTACTTTCAAAGTCCAGGCGGAGAATACTCGACGAGACAAAAC
CCAGATCGAGAAGGGTAAGAGAACAACTTTATACGCAAAACATGAATCTAGGTTTCGTAA
TTGGAGTTCTCGGCGTCCTGATTCTTTCCCACGCCGCCTATTCAACAATCCAATATAGAG
GATTGTTGAAGATCACGGAGGAAGAGTTCACCGGACCTCCGTTGAATGTTGTTGTGGAGT
TGATCGTGGGACTAGCTCTCTGTATGTGGGCTGCTTTGACTTTCCCTGGCAAGTTTCTCT
CCATTCACCCCGACTCCGATGAAAACAGGGCGGTGTCTTTACCAGATAACTCGGATTTCA
TGATTTTCAATCACCGTGGCCGCCTCTTCCCACCTGAGATCACCATGAAGTTTTGATTTT
TCTTCTTTTTTTTTCCGTTATCATACTGCTTAGTCAAACACTCTTCTGTCCAATGTAATG
AGATATTGTTTCCATTGATATTCTACCCTGTTTTCC

QA 1 516 1 516
DS 

RD RS1DA64TF 520 0 0
GGGGATCGTCTTCAATCCTACTTTCAAAGTCCAGGCGGAGAATACTCGACGAGACAAAAC
CCAGATCGAGAAGGGAAAGAGAACAACTTTATACGCAAAACATGAATCTAGGTTTCGTAA
TTGGAGTTCTCGGCGTCCTGATTCTTTCCCACGCCGCCTATTCAACAATCCAATATAGAG
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TGATCGTGGGACTAGCTCTCTGTATGTGGGCTGCTTTGACTTTCCTTGGCAAGTTTCTCT
CCATTCACCCCGACTCCGATGAAAACAGGGCGGTGTCTTTACCAGATAACTCGGATTTCA
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TCTTCTTTTTTTT*CCGTTATCATACTGCTTAGTCAGACACTCTTCTGTCCAATGTAATG
AGATATTGTTTCCATTGATATTCTACCCTGTTTTCCCATA

QA 1 520 1 520
DS 

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GGCTGCTTTGACTTTCCCTGGCAAGTTTCTCTCCATTCACCCCGACTCCGATGAAAACAG
GGCGGTGTCTTTACCAGATAACTCGGATTTCATGATCTTCAATCACCGTGGCCGCCTCTT
CCCACCTGAGATCACCATGAAGTTTTGATTTTTCTTCTTTTTTTTTCCGTTATCATACTG
CTTAGTCAAACACTCTTCT*TCCAATGTAATGAGATATTGTTTCCATTGATATTCTACCC
TGTTTTCCC
AT

QA 1 309 1 309
DS 

RD RS1GM64JQ 479 0 0
GCG
ATACTCGACGAGACAAAACCCAGATCGAGAAGGGAAAGAGAACAACTTTATACGCAAAAC
ATGAATTTAGGTTTCGTAATTGGAGTTCTCGGCGTCCTGATTCTTTCCCACGCCGCCTAT
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TTGAATGTTGTTGTGGAGTTGATCGTGGGACTAGCTCTCTGTATGTGGGCTGCTTTGACT
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CCAGATAACTCGGATTTCATGATTTTCAATCACCGTGGCCGCCTCTTCCCACCTGAGATC
ACCATGAAGTTTTGATTTTTCTTCTTTTTTTTTCCGTTATCATACTGCTTAGTCAAACAC
TCTTCTGTCCAATGTAATGAGATATTGTTTCCATTGATATTCTACCCTGTTTTCCC

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DS 

RD RS1GM64TF 479 0 0
GCG
ATACTCGACGAGACAAAACCCAGATCGAGAAGGGAAAGAGAACAACTTTATACGCAAAAC
ATGAATCTAGGTTTCGTAATTGGAGTTCTCGGCGTCCTGATTCTTTCCCACGCCGCCTAT
TCAACAATCCAATATAGAGGATTGTTGAAGATCACGGAGGAAGAGTTCACCGGACCTCCG
TTGAATGTTGTTGTGGAGTTGATCGTGGGACTAGCTCTCTGTATGTGGGCTGCTTTGACT
TTCCCTGGCAAGTTTCTCTCCATTCACCCCGACTCCGATGAAAACAGGGCGGTGTCTTTA
CCAGATAACTCGGATTTCATGATTTTCAATCACCGTGGCCGCCTCTTCCCACCTGAGATC
ACCATGAAGTTTTGATTTTTCTTCTTTTTTTTTCCGTTATCATACTGCTTAGTCAAACAC
TCTTCTGTCCAATGTAATGAGATATTGTTTCCATTGATATTCTACCCTGTTTTCCC

QA 4 479 4 479
DS 



AS 1 5

CO CL1782Contig1 1290 5 28 U
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ATCAGGGGAAATGGGACAGAGTCTGGTCGGATTATTACAACCACAAAGAAGGGTCTGAAC
GATCAGATAGACAAGACAATCTCGTACAAAGCTGAACATGTAATTGGCACTGGCTCATTC
GGTGTTGTCTTTCAGGCTAAGTGCTTAGAGACAGAAGAAAAAGTAGCAATCAAGAAAGTG
TTACAAGACAAGAGATACAAGAACAGAGAGCTTCAGATCATGCGAATGCTCGACCATCCT
AACGTCGTTGAGCTCAAGCATTCTTTCTTCTCCACCACTGAGAAAGACGAGCTTTATCTC
AACCTTGTTCTCGAGTATGTACCTGAGACTATATACCGTGCATCAAGATCTTACACCAAG
ATGAATCATCAGATGCCCCTGATCTATATTCAGCTCTACACATATCAGATTTGCCGCGCT
GTGAACTATCTACATCGAGCTGTTGGAGTGTGCCACCGTGACATTAAACCACAAAACCTA
TTGGTGAATAATGTTACACATGAGGTGAAGATATGTGACTTTGGAAGCGCGAAAATGCTG
ATTCCTGGAGAACCCAATATATCTTACATATGCTCAAGGTATTACAGAGCTCCAGAACTC
ATCTTTGGAGCAACTGAGTACACAACCGCCATCGATATGTGGTCTGTAGGTTGTGTAATG
GCTGAGCTTTTTCTTGGACATCCTTTGTTCCCTGGAGAGACTAGTGTTGATCAATTGGTG
GAGATCATTAAGGTTTTGGGAACACCAGCAAGAGAAGAGATAAAGAACATGAACCCTAGT
TACAATGATTTCAAGTTCCCACAGATAAAACCTCAGCCATGGCACAAGATTTTTAGTAGA
CAGGTACCTCCTGAAGCATTGGATCTTGACTCTAGACTCCTCCAGTATTCACCAAACCTG
AGATGCTCAGCGCTTGAAGCCTGTGCGCACCCGTTCTTTGATGCTCTGAGAGACCCCAAC
GCATCCTTGCCTAATGGAAGAGCACTTCCTCCATTGATTGATTTCACAGCTCAAGAATTG
GCTGGTGCATCTGTTGAACTGCGTCATCGCTTAATCCCTGAGCATGCAAGGAAATGACCT
CTTCTCTTCTCTCTACACATGTCCTTGTTCACTGACCTCTGCAACCACTCGGACTAGTAG
TTAAAAAAGTGTAATAATTTTTATAAGTTTGCAACTTTGTAGCTTCCATTGTTGTATACA
GAAATGCAGAATTTTCCAACTCTTTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AU68TF U 1
AF RS1G534TF U 72
AF RS1AM36TF U 250
AF RS1AU68JQ C 425
AF RS1CE91JQ C 455
BS 1 487 RS1AU68TF
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BS 489 499 RS1AU68TF
BS 500 500 RS1G534TF
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BS 751 767 RS1AU68TF
BS 768 792 RS1G534TF
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BS 794 815 RS1G534TF
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BS 817 877 RS1G534TF
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BS 892 928 RS1AU68JQ
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RD RS1AU68TF 768 0 0
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ATCAGGGGAAATGGGACAGAGTCTGGTCGGATTATTACAACCACAAAGAAGGGTCTGAAC
GATCAGATAGACAAGACAATCTCGTACAAAGCTGAACATGTAATTGGCACTGGCTCATTC
GGTGTTGTCTTTCAGGCTAAGTGCTTAGAGACAGAAGAAAAAGTAGCAATCAAGAAAGTG
TTACAAGACAAGAGATACAAGAACAGAGAGCTTCAGATCATGCGAATGCTCGACCATCCT
AACGTCGTTGAGCTCAAGCATTCTTTCTTCTCCACCACTGAGAAAGACGAGCTTTATCTC
AACCTTGTTCTCGAGTATGTACCTGAGACTATATACCGTGCATCAAGATCTTACACCAAG
ATGAATCATCAGATGCCCCTGATCTATATTCAGCTCTACACATATCAGATTTGCCGCGCT
GTGAACTGTCTACATCGAGTTGTTGGAGTGTGCCACCGTGACATTAAACCACAAAACCTA
TTGGTGAATAATGTTACACATGAGGTGAAGATATGTGACTTTGGAAGCGCGAAAATGCTG
ATTCCTGGAGAACCCAATATATCTTACATATGCTCA*GGTATTACAGAGCTCCAGAACTC
ATCTTTGGAGCAACTGAGTACACAACCGCCATCGATATGTGGTCTGTAG*TTGTGTA*TG
GCTGAGCTTTT*CTTGGACATCCTTTGT**CCTGGAGAGACTAGTGT
G

QA 1 767 1 767
DS 

RD RS1G534TF 820 0 0
G
GGGACAGAGTCTGGTCGGATTATTACAACCACAAAGAAGGGTCTGAACGATCAGATAGAC
AAGACAATCTCGTACAAAGCTGAACATGTAATTGGCACTGGCTCATTCGGTGTTGTCTTT
CAGGCTAAGTGCTTAGAGACAGAAGAAAAAGTAGCAATCAAGAAAGTGTTACAAGACGAG
AGATACAAGAACAGAGAGCTTCAGATCATGCGAATGCTCGACCATCCTAACGTCGTTGAG
CTCAAGCATTCTTTCTTCTCCACCACTGAGAAAGACGAGCTTTATCTCAACCTTGTTCTC
GAGTATGTACCTGAGACTATATACCGTGCATCAAGATCTTACACCAAGATGAATCATCAG
ATGCCCCTGATCTATATTCAGCTCTACACATATCAGATTTGCCGCGCTGTGAACTATCTA
CATCGAGCTGTTGGAGTGTGCCACCGTGACATTAAACCACAAAACCTATTGGTGAATAAT
GTTACACATGAGGTGAAGATATGTGACTTTGGAAGCGCGAAAATGCTGATTCCTGGAGAA
CCCAATATATCTTACATATGCTCAAGGTATTACAGAGCTCCAGAACTCATCTTTGGAGCA
ACTGAGTACACAACCGCCATCGATATGTGGTCTGTAG*TTGTGTAATGGCTGAGCTTTTT
CTTGGACATCCTTTGTTCCCTGGAGAGACTAGTGTTGATCAATTGGTGGAGATCATTAAG
*TTTTGGGAACACCAGCAAGAGA*GAGATAAAGAACATGAACCCTAGTTACAATGATTTC
AAGTTCCCACAGATAAAACCTCAGC*ATGGCACAAGATT

QA 2 820 2 820
DS 

RD RS1AM36TF 649 0 0
G
AGAGATACAAGAACAGAGAGCTTCAGATCATGCGAATGCTCGACCATCCTAACGTCGTTG
AGCTCAAGCATTCTTTCTTCTCCACCACTGAGAAAGACGAGCTTTATCTCAACCTTGTTC
TCGAGTATGTACCTGAGACTATATACCGTGCATCAAGATCTTACACCAAGATGAATCATC
AGATGCCCCTGATCTATATTCAGCTCTACACATATCAGATTTGCCGCGCTGTGAACTATC
TACATCGAGCTGTTGGAGTGTGCCACCGTGACATTAAACCACAAAACCTATTGGTGAATA
ATGTTACACATGAGGTGAAGATATGTGACTTTGGAAGCGCGAAAATGCTGATTCCTGGAG
AACCCAATATATCTTACATATGCTCAAGGTATTACAGAGCTCCAGAACTCATCTTTGGAG
CAACTGAGTACACAACCGCCATCGATATGTGGTCTGTAGGTTGTGTAATGGCTGAGCTTT
TTCTTGGACATCCTTTGTTCCCTGGAGAGACTAGTGTTGATCAATTGGTGGAGATCATTA
AGGTTTTGGGAACACCAGCAAGAGAAGAGATAAAGAACATGAACCCTAGTTACAATGATT
TCAAGTTCCCACAGATAAAACCTCAGCCATGGCACAAGATT
TTTAGTA

QA 2 642 2 642
DS 

RD RS1AU68JQ 853 0 0
ATCATCAGATGCCC*TGATCTATAT*CAGCTCTACACATATCAGATT*GCCGCGCTGTGA
ACTGTCTACATCGAGTTGTTGGAGTGTGCCACCGTGACATTAAACCACAAAACCTATTGG
TGAATAATGTTACACATGAGGTGAAGATATGTGACTTTGGAAGCGCGAAAATGCTGATTC
CTGGAGAACCCAATATATCTTACATATGCTCAAGGTATTACAGAGCTCCAGAACTCATCT
TTGGAGCAACTGAGTACACAACCGCCATCGATATGTGGTCTGTAGGTTGTGTAATGGCTG
AGCTTTTTCTTGGACATCCTTTGTTCCCTGGAGAGACTAGTGTTGATCAATTGGTGGAGA
TCATTAAGGTTTTGGGAACACCAGCAAGAGAAGAGATAAAGAACATGAACCCTAGTTACA
ATGATTTCAAGTTCCCACAGATAAAACCTCAGCCATGGCACAAGATTTTTAGTAGACAGG
TACCTCCTGAAGCATTGGATCTTGGCTCTAGACTCCTCCAGTATTCACCAAACCTGAGAT
GCTCAGCGCTTGAAGCCTGTGCGCACCCGTTCTTTGATGCTCTGAGAGACCCCAACGCAT
CCTTGCCTAATGGAAGAGCACTTCCTCCATTGTTTGATTTCACAGCTCAAGAATTGGCTG
GTGCATCTGTTGAACTGCGTCATCGCTTAATCCCTGAGCATGCAAGGAAATGACCTCTTC
TCTTCTCTCTACACATGTCCTTGTTCACTGACCTCTGCAACCACTCGGACTAGTAGTTAA
AAAAGTGTAATAATTTTTATAAGTTTGCAACTTTGTAGCTTCCATTGTTGTATACAGAAA
TGCAGAATTTTCC

QA 1 853 1 853
DS 

RD RS1CE91JQ 836 0 0
TCTACACATATCAGATTTGCCGCGCTGTGAACTATCTACATCGAGCTGTTGGAGTGTGCC
ACCGTGACATTAAACCACAAAACCTATTGGTGAATAATGTTACACATGAGGTGAAGATAT
GTGACTTTGGAAGCGCGAAAATGCTGATTCCTGGAGAACCCAATATATCTTACATATGCT
CAAGGTATTACAGAGCTCCAGAACTCATCTTTGGAGCAACTGAGTACACAACCGCCATCG
ATATGTGGTCTGTAGGTTGTGTAATGGCTGAGCTTTTTCTTGGACATCCTTTGTTCCCTG
GAGAGACTAGTGTTGATCAATTGGTGGAGATCATTAAGGTTTTGGGAACACCAGCAAGAG
AAGAGATAAAGAACATGAACCCTAGTTACAATGATTTCAAGTTCCCACAGATAAAACCTC
AGCCATGGCACAAGATTTTTAGTAGACAGGTACCTCCTGAAGCATTGGATCTTGACTCTA
GACTCCTCCAGTATTCACCAAACCTGAGATGCTCAGCGCTTGAAGCCTGTGCGCACCCGT
TCTTTGATGCTCTGAGAGACCCCAACGCATCCTTGCCTAATGGAAGAGCACTTCCTCCAT
TGATTGATTTCACAGCTCAAGAATTGGCTGGTGCATCTGTTGAACTGCGTCATCGCTTAA
TCCCTGAGCATGCAAGGAAATGACCTCTTCTTTTCTCTCTACACATGTCCTTGTTCACTG
ACCTCTGCAACCACTCGGACTAGTAGTTAAAAAAGTGTAATAATTTTTATAAGTTTGCAA
CTTTGTAGCTTCCATTGTTGTATACAGAAATGCAGAATTTTCCAACTCTTTTCTCC

QA 1 836 1 836
DS 



AS 1 5

CO CL1783Contig1 895 5 8 U
GGATCACTTACTAACAAGCTCAACTGTGTTTGTGTGTGTTTTGTAATAGAAAAGAGAGGA
AAGATGGTGCTAAAGGTGTACGGACCTCACTTTGCTTCGCCCAAGCGTGCTCTGGTAACG
CTTATCGAGAAGGGCATTCCCTTCAAGACCATCCCCGTCGATCTCATGAAAGGAGAGCAC
AAGCAGCCTGCTTATCTCGCCTTACAGCCTTTCGGTACCGTTCCAGCTTTTGTCGACGGT
GACTACAAGATCTTCGAGTCACGTGCGGTGATGAGGTACGTAGCTGAGAAGTACAGGTCC
CAAGGACCCGACCTTTTGGGCAAAACCGTCGAAGACAGAGGTCAAGTTGAGCAATGGCTC
GACGTTGAGGCCACCACTTTCCACCCACCCCTCCTTAACCTCACACTCCACATCATGTTC
GCGTCAGTCATGGGATTCCCATCTGACGAGAAGCTGATCAAGGAGAGCGAGGAGAAGCTT
TCTGCTGTGCTCGATGTCTACGAGGCACAGCTCTCCAAGAGCAAGTACTTGGCTGGTGAC
TTCGCCAGCTTGGCTGATTTGGCTCACCTCCCTTTCACTGATTACTTGGTTGGACCCATC
GGTAAGGCTTACATGATCAAAGACAGGAAGCACGTGAGCGCGTTGTGG*ATGATATTAGC
AGCCGTCCTGCCTGGAAGGAGACTATTGAGAAGTACTCATTCCCTGCTTAAAGATGATTA
TGATGATCATCATTGTTCTTGTTTTTGAGTTTTTAAGCAATGTTTGTGTTTAATAAAGAG
TGGAACTGTATGCCTCCTCTTATCTTTATGTATGTCACCTCTCTGTCTCTTCTGTTTCAT
ATTGTAACAATGTGTGATTGAGTTGAGGTTTGAATCAAGAGGAACTTAATTATCC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1EZ89TF U 4
AF RS1BG19TF U 1
AF RS1BG19JQ C 286
AF RS1H711JQB C 444
AF RS1H711TF U 444
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GG
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GCCTGCTTATCTCGCCTTACA

QA 3 203 3 203
DS 

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AAGATGGTGCTAAAGGTGTACGGACCTCACTTTGCTTCGCCCAAGCGTGCTCTGGTAACG
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AAGCAGCCTGCTTATCTCGCCTTACAGCCTTTCGGTACCGTTCCAGCTTTTGTCGACGGT
GACTACAAGATCTTCGAGTCACGTGCGGTGATGAGGTACGTAGCTGAGAAGTACAGGTCC
CAAGGACCCGACCTTTTGGGCAAAACCGTCGAAGACAGAGGTCAAGTTGAGCAATGGCTC
GACGTTGAGGCCACCACTTTCCACCCACCCCTCCTTAACCTCACACTCCACATCATGTTC
GCGTCAGTCATGGGATTCCCATCTGACGAGAAGCTGATCAAGGAGAGCGAGGAGAAGCTT
TCTGCTGTGCTCGATGTCTACGAGGCACAGCTCTCCAAGAGCAAGTACTTGGCTGGTGAC
TTCGCCAGCTTGGCTGATTTGGCTCACCTCCCTTTCACTGATTACTTGGTTGGACCCATC
GG

QA 1 602 1 602
DS 

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GTTGAGCAATGGCTCGACGTTGAGGCCACCACTTTCCACCCACCCCTCCTTAACCTCACA
CTCCACATCATGTTCGCGTCAGTCATGGGATTCCCATCTGACGAGAAGCTGATCAAGGAG
AGCGAGGAGAAGCTTTCTGCTGTGCTCGATGTCTACGAGGCACAGCTCTCCAAGAGCAAG
TACTTGGCTGGTGACTTCGCCAGCTTGGCTGATTTGGCTCACCTCCCTTTCACTGATTAC
TTGGTTGGACCCATCGGTAAGGCTTACATGATCAAAGACAGGAAGCACGTGAGCGCGTGG
TGGGATGATATTAGCAGCCGTCCTGCCTGGAAGGAGACTATTGAGAAGTACTCATTCCCT
GCTTAAAGATGATTATGATGATCATCATTGTTCTTGTTTTTGAGTTTTTAAGCAATGTTT
GTGTTTAATAAAGAGTGGAACTGTATGCCTCCTCTTATCTTTATGCATGTCACCTCTCTG
TCTCTTCTGTTTCATATTGTAACAATGTGTGATTGAGTTGAGGTTTGAA
CC

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DS 

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G
GACGAGAAGCTGATCAAGGAGAGCGAGGAGAAGCTTTCTGCTGTGCTCGATGTTTACGAG
GCACAGCTCTCCAAGAGCAAGTACTTGGCTGGTGACTTCGTCAGCTTGGCTGATTTGGCT
CACCTCCCTTTCACTGATTACTTGGTTGGACCCATCGGTAAGGCTTACATGATCAAAGAC
AGGAAGCACGTGAGCGCGTTGTGG*ATGATATTAGCAGCCGTCCTGCCTGGAAGGAGACT
ATTGAGAAGTACTCATTCCCTGCTTAAAGATGATTATGATGATCATCATTGTTCTTGTTT
TTGAGTTTTTAAGCAATGTTTGTGTTTAATAAAGAGTGGAACTGTATGCCTCCTCTTATC
TTTATGTATGTCACCTCTCTGTCTCTTCTGTTTCATATTGTAACAATGTGTGATTGAGTT
GAGGTTTGAATCAAGAGGAACTTAATTATCC

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DS 

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G
GACGAGAAGCTGATCAAGGAGAGCGAGGAGAAGCTTTCTGCTGTGCTCGATGTCTACGAG
GCACAGCTCTCCAAGAGCAAGTACTTGGCTGGTGACTTCGTCAGCTTGGCTGATTTGGCT
CACCTCCCTTTCACTGATTACTTGGTTGGACCCATCGGTAAGGCTTACATGATCAAAGAC
AGGAAGCACGTGAGCGCGTTGTGG*ATGATATTAGCAGCCGTCCTGCCTGGAAGGAGACT
ATTGAGAAGTACTCATTCCCTGCTTAAAGATGATTATGATGATCATCATTGTTCTTGTTT
TTGAGTTTCTAAGCAATGTTTGTGTTTAATAAAGAGTGGAACTGTATGCCTCCTCTTATC
TTTATGTATGTCACCTCTCTGTCTCTTCTGTTTCATATTGTAACAATGTGTGATTGAGTT
GAGGTTTGAATCAAGAGGAACTTAATTATCC

QA 2 452 2 452
DS 



AS 1 5

CO CL1784Contig1 1240 5 8 U
CGGTGGAGGATAAACATATCATTAATTATTACATGTGTTTTGTTTGCATTCTACAAAGTT
GAGTTACAACGACTTATTATTTTGATTATACGTAAGAATACAAAACTCAAGAATCCACCC
GAAAGAGAAGTACCTACAGGATCTGAATCAAGCTCGACCCAGATCCTGGCTAAGTACTCA
TCTCAAGAAACGGCTTAAAGAAACAGTCTCTACCCTTGAATCCCCTAAAAGCTTGAACCT
TTATGTCTCTACTATGTCATATGCCATCACTACTGTCTCCTGATGATGTCGAGAACAGAG
ACAGCGAGAGCATTGTGTTGATACCATCTGTTTGTTTTGTCCTGCAATTTCTTAACTCAG
ACAATTGATTTTCATCTCCGGACATTGGTTTTAATCTTTTGAGTGATGATACTTCTCTCT
CTTGTTCTTCTCGGAGTCTTTTCTCATGGCTCGTCCTTCTGATCTCGAGCAGAGGCAGAG
TCTTGTTCTCCATGTTGTTTCTGTCAAGTCCAACACGGACAGCATGCAACTCATTGCCAC
TTATCCTGTTACACCAGCTCGAAGGTCGCATTACAAAGTTAGCTCCCAGATTTGTGAAGA
CCGCGCCTTGACTGTTTACCCTTGAAGGAACTGTTTTAGGGTAATAGGCATGTCTTAAAT
CACCATAAGGCATATCAATCATGTCTAACAAATAGTTTCTTTGTGCTCCCACCATAGCTC
CAACGTCATGTAGAGACGTTGCCTCGAGCTTCTTACTCCGATACATCTGCAAGTGACTCT
TGACATGCGCAATACTCAATCCTTTCAGATTCATCATCTGAAGAACCATTTTAGGTGTCG
CCCTGTGTGGGCCGCCAAGTCGTCGGACTGCACGGACGAAGGAAATATGAAGATCAGGCG
TCCAGCGAAGACGAGGCATGTTGGACCGAACATACTGTCTCACGTTGTTACTACTTGTGA
CTTGTTGGTCTTCATCTTCAACTGATGACTCCTCTTCGTTGTTCTTCTCCTCCGCCGCCT
CTTCTCTGTTTAGGTCAAGCAACATGGAGCCTTTCTCCGGCGAAAATGGTCCGTCCATGT
CTCTTCGGCGACAATGGTCTCTAGCTAGCTATCTCGATCAGTGACTAACTATATCACAAT
GTGTATAGTCTTTCTATGATCATTTCAACGTTGGAACTTAATAATACATATGATCAGATA
TCAGTGTCCTATATGCATTACTATATAGTCCTCTTGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BG02JQ U 6
AF RS1AD57JQ U 49
AF RS1GL71JQ U 1
AF RS1BG02TF C 550
AF RS1GL71TF C 611
BS 1 254 RS1GL71JQ
BS 255 255 RS1BG02JQ
BS 256 328 RS1GL71JQ
BS 329 329 RS1BG02JQ
BS 330 830 RS1GL71JQ
BS 831 863 RS1BG02TF
BS 864 864 RS1GL71TF
BS 865 1240 RS1BG02TF

RD RS1BG02JQ 353 0 0
GC
GGATAAACATATCATTAATTATTACATGTGTTTTGTTTGCATTCTACAAAGTTGAGTTAC
AACGACTTATTATTTTGATTATACGTAAGAATACAAAACTCAAGAATCCACCCGAAAGAG
AAGTACCTACAGGATCTGAATCAAGCTCGACCCAGATCCTGGCTAAGTACTCATCTCAAG
AAACGGCTTAAAGAAACAGTCTCTACCCTTGAATCCCCTAAAAGCTTGAACCTTTATGTC
TCTACTATGTCATATGCCATCACTACTGTCTCCTGATGATGTCGAGAACAGAGACAGCGA
GAGCATTGTGTTGATACCATCTGTTTGTTTTGTCCTGCAATTTCTTAACTC

QA 3 353 3 353
DS 

RD RS1AD57JQ 486 0 0
TTCTACAAAGTTGAGTTACAACGACTTATTATTTTGATTATACGTAAGAATACAAAACTC
AAGAATCCACCCGAAAGAGAAGTACCTACAGGATCTGAATCAAGCTCGACCCAGATCCTG
GCTAAGTACTCATCTCAAGAAACGGCTTAAAGAAACAGTCTCTACCCTTGAATCCCCTAA
AAGCTTGAACCTTTATGTCTCTACCATGTCATATGCCATCACTACTGTCTCCTGATGATG
TCGAGAACAGAGACAGCGAGAGCATTGTGTTGATACCATCTGTTTGTTTTGTCCTGCAAT
TTCTTAACTCAGACAATTGATTTTCATCTCCGGACATTGGTTTTAATCTTTTGAGTGATG
ATACTTCTCTCTCTTGTTCTTCTCGGAGTCTTTTCTCATGGCTCGTCCTTCTGATCTCGA
GCAGAGGCAGAGTCTTGTTCTCCATGTTGTTTCTGTCAAGTCCAACACGGACAGCATGCA
ACTCAT

QA 1 486 1 486
DS 

RD RS1GL71JQ 830 0 0
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GAGTTACAACGACTTATTATTTTGATTATACGTAAGAATACAAAACTCAAGAATCCACCC
GAAAGAGAAGTACCTACAGGATCTGAATCAAGCTCGACCCAGATCCTGGCTAAGTACTCA
TCTCAAGAAACGGCTTAAAGAAACAGTCTCTACCCTTGAATCCCCTAAAAGCTTGAACCT
TTATGTCTCTACTA*GTCATATGCCATCACTACTGTCTCCTGATGATGTCGAGAACAGAG
ACAGCGAGAGCATTGTGTTGATACCATCCGTTTGTTTTGTCCTGCAATTTCTTAACTCAG
ACAATTGATTTTCATCTCCGGACATTGGTTTTAATCTTTTGAGTGATGATACTTCTCTCT
CTTGTTCTTCTCGGAGTCTTTTCTCATGGCTCGTCCTTCTGATCTCGAGCAGAGGCAGAG
TCTTGTTCTCCATGTTGTTTCTGTCAAGTCCAACACGGACAGCATGCAACTCATTGCCAC
TTATCCTGTTACACCAGCTCGAAGGTCGCATTACAAAGTTAGCTCCCAGATTTGTGAAGA
CCGCGCCTTGACTGTTTACCCTTGAAGGAACTGTTTTAGGGTAATAGGCATGTCTTAAAT
CACCATAAGGCATATCAATCATGTCTAACAAATAGTTTCTTTGTGCTCCCACCATAGCTC
CAACGTCATGTAGAGACGTTGCCTCGAGCTTCTTACTCCGATACATCTGCAAGTGACTCT
TGACATGCGCAATACTCAATCCTTTCAGATTCATCATCTGAAGAACCATT

QA 1 830 1 830
DS 

RD RS1BG02TF 691 0 0
TACACCAGCTCGAAGGTCGCATTACAAAGTTAGCTCCCAGATTTGTGAAGACCGCGCTTT
GACTGTTTACCCTTGAAGGAACTGTTTTAGGGTAATAGGCATGTCTTAAATCACCATAAG
GCGTATCAATCATGTCTAACAAATAGTTTCTTTGTGTCCCCATCATAGCTCCAACGTCAT
GTAGAGACGTTGCCTCGAGCTTCTTACTCCGATACATCTGCAAGTGACTCTTGACATGCG
CAATACTCAATCCTTTCAGATTCATCATCTGAAGAACCATTTTAGGTGTCGCCCTGTGTG
GGCCGCCAAGTCGTTGGACTGCACGGACGAAGGAAATATGAAGATCAGGCGTCCAGCGAA
GACGAGGCATGTTGGACCGAACATACTGTCTCACGTTGTTACTACTTGTGACTTGTTGGT
CTTCATCTTCAACTGATGACTCCTCTTCGTTGTTCTTCTCCTCCGCCGCCTCTTCTCTGT
TTAGGTCAAGCAACATGGAGCCTTTCTCCGGCGAAAATGGTCCGTCCATGTCTCTTCGGC
GACAATGGTCTCTAGCTAGCTATCTCGATCAGTGACTAACTATATCACAATGTGTATAGT
CTTTCTATGATCATTTCAACGTTGGAACTTAATAATACATATGATCAGATATCAGTGTCC
TATATGCATTACTATATAGTCCTCTTGTTTC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1GL71TF 618 0 0
ACTGTTTACCCTTGAAGGAACTGTTTTAGGGTAATAGGCATGTCTTAAATCACCATAAGG
CATATCAATCATGTCTAACAAATAGTTTCTTTGTGCTCCCACCATAGCTCCAACGTCATG
TAGAGACGTTGCCTCGAGCTTCTTACTCCGATACATCTGCAAGTGACTCTTGACATGCGC
AATACTCAATCCTTTCAGATTCATCATCTGAAGAACCATTTTAGGTGTCGCCCTGTGTGG
GCCGCCAAGTCGTCGGACTGCACGGACGAAGGAAATATGAAGATCAGGCGTCCAGCGAAG
ACGAGGCATGTTGGACCGAACATACTGTCTCACGTTGTTACTACTTGTGACTTGTTGGTC
TTCATCTTCAACTGATGACTCCTCTTCGTTGTTCTTCTCCTCCGCCGCCTCTTCTCTGTT
TAGGTCAAGCAACATGGAGCCTTTCTCCGGCGAAAATGGTCCGTCCATGTCTCTTCGGCG
ACAATGGTCTCTAGCTAGCTATCTCGATCAGTGACTAACTATATCTCAATGTGTATAGTC
TTTCTATGATCATTTCAACGTTGGAACTTAATAATACATATGATCAGATATCAGTGTCCT
ATATGCATTACTATAT
CC

QA 1 616 1 616
DS 



AS 2 4

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GGATATCACAAATACATTTTACTCTTAAATCCCAAAAGAGATTGTTTGTTTCTGTAAATC
ATAGTATTCTGTCTTGTTCAAAACATGACGATTGCTTTAACCATCGGAGGAAACGTGTTC
TCGGGTCTATCCGTATCAAATAACATCAGAAGAAAGAACAAGAAGATGATAAACAGAACT
GGAGTCGTTTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCTTATAAGACACTTAAGATCCGACCA
GATTCATCTGAATACGAGGTCAAACAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCCT
GATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGTGTACAGTTTCAAACAATCAACGAAGCTTACGAT
ATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGAATGGAACGGAGGAATATGAGCCATTCGAT
GTGTATGACGACGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGAGGAATGG
ATGGGGTGGGAAGGTGCAGGAACAAGAGACTA


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BP18TF U 1
AF RS1GU84TF U 1
BS 1 512 RS1BP18TF

RD RS1BP18TF 512 0 0
GGATATCACAAATACATTTTACTCTTAAATCCCAAAAGAGATTGTTTGTTTCTGTAAATC
ATAGTATTCTGTCTTGTTCAAAACATGACGATTGCTTTAACCATCGGAGGAAACGTGTTC
TCGGGTCTATCCGTATCAAATAACATCAGAAGAAAGAACAAGAAGATGATAAACAGAACT
GGAGTCGTTTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCTTATAAGACACTTAAGATCCGACCA
GATTCATCTGAATACGAGGTCAAACAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCCT
GATGTTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGTGTACAGTTTCAAACAATCAACGAAGCTTACGAT
ATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGAATGGAACGGAGGAATATGAGCCATTCGAT
GTGTATGACGACGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACACGTGGGAGGAATGG
ATGGGGTGGGAAGGTGCAGGAACAAGAGACTA

QA 1 512 1 512
DS 

RD RS1GU84TF 495 0 0
GGAT
ATCACAAATACATTTTACTCTTAAATCCCAAAAGAGATTGTTTGTTTCTGTAAATCATAG
TATTCTGTCTTGTTCAAAACATGACGATTGCTTTAACCATCGGAGGAAACGTGTTCTCGG
GTCTATCCGTATCGAATAACATCGGAAGAAAGAACAAGAAGATGATAAACAGAACTGGAG
TCGTTTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCTTATAAGACACTTAAGATCCGACCAGATT
CATCTGAATACGAGGTCAAACAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCCTGATG
TTTGTAGAGGAAGCAACTGTGGTGTACAGTTTCAAACAATCAACGAAGCTTACGATATTG
TGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGAATGGAACGGAGGAATATGAGCCATTCGATGTGT
ATGACGACGGATTCAACGGAATGAATGATCCAGATTGTGACGCGTGGGAGGAATGGATGG
GGTGGGAAGGT

QA 5 495 5 495
DS 



CO CL1785Contig2 703 2 1 U
GGATCACAAATACATTTTACTCTTAAATCCCCCAAAAAGATTGTTTCCTTCTGTAAATCA
TAATATTCTGTCTTGTTCAAAACATGACGATTGCTTTAACCATCGGTGGAAACGTGTTCT
CGGGTCAATCCGTATCAAAAAATAACATCAGAAGAAATAACAAGAAGATGCTAAACAGAA
CTGGAGTCGTTTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCTTATAAGACACTTAAGATCCGAC
CAGATTCATCTGAATACGAGGTCAAACAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATC
CTGATGTTTGTAGGGGAAGCAACTGTGGTCTACAGTTTCAAACAATCAACGAAGCTTACG
ATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGATGGAACGGAGGAATATGAGCCATTCG
ATGTGTATGAAGACGGATTCAACGGAATGAATGATACAGATTGTGACACGTGGGAGGAAT
GGATGGGGTGGGAAGGTGCAGGAACAAGAGAATACTCTTCTCACGTCAACCCTTATGCTT
GAAGAACAAGAAAATGATTCGAATGCACATAAATAACATCTGAAACTGATGTTAATGAAC
GATGTAGATAGGTCTCGTGAATGGTTACTTGGAACATGTAAATAAAAGTAGTTTCTCCAA
TCATGTGAATCAATCAATAATTACCATTACTTTTAAGACTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1F053TF U 1
AF RS1F053JQ C 203
BS 1 703 RS1F053TF

RD RS1F053TF 703 0 0
GGATCACAAATACATTTTACTCTTAAATCCCCCAAAAAGATTGTTTCCTTCTGTAAATCA
TAATATTCTGTCTTGTTCAAAACATGACGATTGCTTTAACCATCGGTGGAAACGTGTTCT
CGGGTCAATCCGTATCAAAAAATAACATCAGAAGAAATAACAAGAAGATGCTAAACAGAA
CTGGAGTCGTTTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCTTATAAGACACTTAAGATCCGAC
CAGATTCATCTGAATACGAGGTCAAACAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATC
CTGATGTTTGTAGGGGAAGCAACTGTGGTCTACAGTTTCAAACAATCAACGAAGCTTACG
ATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGATGGAACGGAGGAATATGAGCCATTCG
ATGTGTATGAAGACGGATTCAACGGAATGAATGATACAGATTGTGACACGTGGGAGGAAT
GGATGGGGTGGGAAGGTGCAGGAACAAGAGAATACTCTTCTCACGTCAACCCTTATGCTT
GAAGAACAAGAAAATGATTCGAATGCACATAAATAACATCTGAAACTGATGTTAATGAAC
GATGTAGATAGGTCTCGTGAATGGTTACTTGGAACATGTAAATAAAAGTAGTTTCTCCAA
TCATGTGAATCAATCAATAATTACCATTACTTTTAAGACTTCC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1F053JQ 501 0 0
TTCTGTAATGGATCCTTATAAGACACTTAAGATCCGACCAGATTCATCTGAATACGAGGT
CAAACAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCCTGATGTTTGTAGGGGAAGCAA
CTGTGGTTTACAGTTTCAAACAATCAACGAAGCTTACGATATTGTGTTGAAGCAAATAAA
GAATCAGATGGATGGAACGGAGGAATATGAGCCATTCGATGTGTATGAAGACGGATTCAA
CGGAATGAATGATACAGATTGTGACACGTGGGAGGAATGGATGGGGTGGGAAGGTGCAGG
AACAAGAGAATACTCTTCTCACGTCAACCCTTATGCTTGAAGAACAAGAAAATGATTCGA
ATGCACATAAATAACATCTGAAACTGATGTTAATGAACGATGTAGATAGGTCTCGTGAAT
GGTTACTTGGAACATGTAAATAAAAGTAGTTTCTCCAATCATGTGAATCAATCAATAATT
ACCATTACTTTTAAGACTTCC

QA 1 501 1 501
DS 



AS 1 5

CO CL1786Contig1 679 5 8 U
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AAGAAGATTCAATCCGAAAGACAAAGAAAATGAGTGCTGTTGCGGTTAACCATTTGTTCG
GTTTGCCGGAGACGATCGAGAAGCTGATCTTCCCAACCTCACGCTCCGGTGAGGGTAACG
AGACTCGAGGAGGAAGCAGCAACAACAATAACATCCCCATTGACATTCTTGAATCTCCCA
AAGAGTACATCTTCTACATCGACATCCCCGGAGTGTCCAAATCCGACATCCAGGTGACTG
TAGAGGAAGAGAGGATCCTTGTGATAAAGAGTAACGGGAAGAGGAAGAGAGAGGATCATG
ACGAGAGCGAAGAAGGATGCAAGTACATCAGGCTCGAGAGGAGGCTTCCTCAGAATCTCG
TGAAGAAGTTCCGTTTACCTGAAGATGCTGACGTGGAGGCCGTGGCGGCTAAATATCAAG
ATGGGGTTCTGACAGCTACCGTTGGGAAAGTACCGCCGCAGCCACCGAAGTCTAAGACGG
TTCAGATCGCGGTTTCTTGAACGGTTTAGAGAATAGACCGGTTTGTGAACGTGTTTCGTA
GTTTGTAAAGGTGTTTTTTTGTTTGGTCTGTAACCCCATCAGGGTCCCTTAATGATATTT
TAAATATTAATTGTCAGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C770TF U 38
AF RS1AS54JQ C 1
AF RS1BT94TF U 38
AF RS1AS54TF U 1
AF RS1C770JQ C 38
BS 1 39 RS1AS54TF
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RD RS1C770TF 329 0 0
GG
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AGAGGAAGAGAGAGGATCATGAC
TAGA

QA 3 325 3 325
DS 

RD RS1AS54JQ 678 0 0
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TAAATATTAATTG
TCAGG

QA 1 673 1 673
DS 

RD RS1BT94TF 636 0 0
GG
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QA 3 636 3 636
DS 

RD RS1AS54TF 677 0 0
GGGGTTTTATCGAAAACGTAAGGAAACATCGCGAAAAACATATCACAACTCGACAATACG
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GTTTGCCGGAGACGATCGAGAAGCTGATCTTCCCAACCTCACGCTCCGGTGAGGGTAACG
AGACTCGAGGAGGAAGCAGCAACAACAATAACATCCCCATTGACATTCTTGAATCTCCCA
AAGAGTACATCTTCTACATCGACATCCCCGGAGTGTCCAAATCCGACATCCAGGTGACTG
TAGAGGAAGAGAGGATCCTTGTGATAAAGAGTAACGGGAAGAGGAAGAGAGAGGATCATG
ACGAGAGCGAAGAAGGATGCAAGTACATCAGGCTCGAGAGGAGGCTTCCTCAGAATCTCG
TGAAGAAGTTCCGTTTACCTGAAGATGCTGACGTGGAGGCCGTGGCGGCTAAATATCAAG
ATGGGGTTCTGACAGCTACCGTTGGGAAAGTACCGCCGCAGCCACCGAAGTCTAAGACGG
TTCAGATCGCGGTTTCTTGAACGGTTTAGAGAATAGACCGGTTTGTGAACGTGTTTCGTA
GTTTGTAAAGGTGTTTTTTTGTTTGGTCTGTAACCCCATCAGGGTCCCTTAATGATATTT
TAAATATTAATTG
TCAG

QA 1 673 1 673
DS 

RD RS1C770JQ 642 0 0
GG
ATATCACAACTCGACAATACGAAGAAGATTCAATCCGAAAGACAAAGAAAATGAGTGCTG
TTGCGGTTAACCATTTGTTCGGTTTGCCGGAGACGATCGAGAAGCTGATCTTCCCAACCT
CACGCTCCGGTGAGGGTAACGAGACTCGAGGAGGAAGCAGCAACAACAATAACATCCCCA
TTGACATTCTTGAATCTCCCAAAGAGTACATCTTCTACATCGACATCCCCGGAGTGTCCA
AATCCGACATCCAGGTGACTGTAGAGGAAGAGAGGATCCTTGTGATAAAGAGTAACGGGA
AGAGGAAGAGAGAGGATCATGACGAGAGCGAAGAAGGATGCAAGTACATCAGGCTCGAGA
GGAGGCTTCCTCAGAATCTCGTGAAGAAGTTCCGTTTACCTGAAGATGCTGACGTGGAGG
CCGTGGCGGCTAAATATCAAGATGGGGTTCTGACAGTTACCGTTGGGAAAGTACCGCCGC
AGCCACCGAAGTCTAAGACGGTTCAGATCGCGGTTTCTTGAACGGTTTAGAGAATAGACC
GGTTTGTGAACGTGTTTCGTAGTTTGTAAAGGTGTTTTTTTGTTTGGTCTGTAACCCCAT
CAGGGTCTCTTAATGATATTTTAAATATTAATTGTCAGTT

QA 3 642 3 642
DS 



AS 1 4

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TCTTTATATATTTTCATAAATACACATTCTCAGATTCCTTGCCTCCTCTCCTCTCCTCTC
CTCGACGTCTTTAATTTGTAGCATTCCTCCATCGTTGATTTGAGAAGAAGAAAAGTTTGG
ATTTTTTTTTTTATATAAGTAAAGAAGAGAGATGGGTTACATAGGAGCACATGGTGTAGC
AGCGCTTCATAGACACAAATACAGTGGTGTGGATCACCCTTATCTCGCCAAATACGTTCT
CCAACCCTTTTGGAATCGTTTCGTCAAAATCTTCCCTCTCTGGATGCCACCCAACATGAT
AACACTTACGGGGTTCATGTTTCTCATCATATCTGCGCTGTTAGGCTATGTCTACTCCCC
TCAGTTGAATTCTCCTCCTCCTCGTTGGGTTCACTTGGTACATGGACTACTTCTCTTTTT
GTATCAGACGCTTGATGCGGTTGATGGGAAGCAAGCACGAAGAACTAACTCCAGTAGCCC
ACTCGGAGAGCTCTTTGATCATGGTTGCGATGCACTTGCTTGTGCGTTTGAAACGATGGC
GTATGGGAGTACTGCTATGTGTGGAAGAGACACGTTCTGGTTCTGGATCATTTCAGCTGT
TCCATTTATTGGTTCTACATGGGAAACCTATTTTACCAATATACTTACTCTTCCGGTAGT
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TGGTGCTGAATGGTGGGCTCAGCAGTTTGGAGAGTCAATCCCCTTGTTTAGTTGGGTGCC
CTTCTTGAGCGAGATTACTACATCGAGAGTAGTACTAATAACGATGATTGCTTTTGGTGT
TATACCAACATTTGCATTGAGCGTGTCGAATGTATACAAAGTTATACAGGCAAGAAAAGG
AAGCATGTTTCTAGCATTGTCTATGCTGTTTCCCTTCGTTGGGCTACTTGCTGGAGTTTT
GATTTGGGACTACTTGTCTCCAACTGATCTCATAAGAAACTACCCTCACTTAGTTGTATT
GGGAACTGGTCTTTCATTTGGATTCATTGTGGGAAGAATAATTCTAGCTCACATATGTGA
TGAACCAAAAGGATTAAAAACAAACATGTGCATGTCACTGCTTTACCTTCCCTTTGCACT
AGCAAATGCTCTAACCGCTAGACTCAACAACGGGGTTGCTCTTGTGGATGAGTTTTGGGT
TCTTCTTGGTTATTGTATATTCACAATGGCACTATATATGCATTTTGCAACCTCAGTCAT
TCATGAGATCACTGCTGCACTTGGAATCTACTGCTTCAGGATTACGCGTAAAGAAGCTTG
AAGGAAGCTTAAGGGAGGATAATGCAAATCCCAACACGAATCTTGATATTATTTTTTTTA
CTGAAATTAAACGACTGATCGATATATTTTTGGATGAATAGCCTTTAATGTTTTCATTTT
GTTTGGTCGAAATAGGTAATTCATGTAGAACTATTTTTGTAACGTTTTCTACGGAAAAGA
ATGATTTTTCGTGATTATTTATTTATGAATTTGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GB36TF U 23
AF RS1BY81TF U 1
AF RS1GZ31TF U 630
AF RS1BY81JQ C 863
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GG
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CATTCTCAGATTCTTTGCCTCCTCTCCTCTCCTCTCCTCGACGTCTTTAATTTGTAGCAT
TCCTCCATCGTTGATTTGAGAAGAAGAAAAGTTTGGATTTTTTTTTTTATATAAGTAAAG
AAGAGAGATGGGTTACATAGGAGCACATGGTGTAGCAGCGCTTCATAGACACAAATACAG
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TTGGGTTCACTTGGTACATGGACTACTTCTCTTTTTGTATCAGACGCTTGATGCGGTTGA
TGGGAAGCAAGCACGAAGAACTAACTCCAGTAGCCCACTCGGAGAGCTCTTTGAT

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DS 

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TCTTTATATATTTTCATAAATACACATTCTCAGATTCCTTGCCTCCTCTCCTCTCCTCTC
CTCGACGTCTTTAATTTGTAGCATTCCTCCATCGTTGATTTGAGAAGAAGAAAAGTTTGG
ATTTTTTTTTTTATATAAGTAAAGAAGAGAGATGGGTTACATAGGAGCACATGGTGTAGC
AGCGCTTCATAGACACAAATACAGTGGTGTGGATCACTCTTATTTCGCCAAATACGTTCT
CCAACCCTTTTGGAATCGTTTCGTCAAAATCTTCCCTCTCTGGATGCCACCCAACATGAT
AACACTTACGGGGTTCATGTTTCTCATCATATCTGCGCTGTTAGGCTATGTCTACTCTCC
TCAGTTGAATTCTCCTCCTCCTCGTTGGGTTCACTTGGTACATGGACTACTTCTCTTTTT
GTATCAGACGTTTGATGCGGTTGATGGGAAGCAAGCACGAAGAACTAACTCCAGTAGCCC
ACTCGGAGAGCTCTTTGATCATGGTTGCGATGCACTTGCTTGTGCGTTTGAAACGATGGC
GTATGGGAGTACTGCTATGTGTGGAAGAGACACGTTCTGGTTCTGGATCATTTCAGCTGT
TCCATTTATTGGTTCTACATGGGAAACCTATTTTACCAATATACTTACTCTTCCGGTAGT
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TGGTGCTGAATGGT

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DS 

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G
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TTTTACCAATATACTTACTCTTCCGGTAGTCAATGGTCCTACAGAAGGTCTTGCACTTAT
ATACTGTGGTCACTTCTTCACAGCCATTGTTGGTGCTGAATGGTGGGCTCAGCAGTTTGG
AGAGTCAATCCCCTTGTTTAGTTGGGTGCCCTTCTTGAGCGAGATTACTACATCGAGAGT
AGTACTAATAACGATGATTGCTTTTGGTGT*ATACCAACATTTGCATTGAGCGTGTCGAA
TG
ATACAAA

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DS 

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GTGTCGAATGTATACAAAGTTATACAGGCAAGAAAAGGAAGCATGTTTCTAGCATTGTCT
ATGCTGTTTCCCTTCGTTGGGCTACTTGCTGGAGTTTTGATTTGGGACTACTTGTCTCCA
ACTGATCTCATAAGAAACTACCCTCACTTAGTTGTATTGGGAACTGGTCTTTCATTTGGA
TTCATTGTGGGAAGAATAATTCTAGCTCACATATGTGATGAACCAAAAGGATTAAAAACA
AACATGTGCATGTCACTGCTTTACCTTCCCTTTGCACTAGCAAATGCTCTAACCGCTAGA
CTCAACAACGGGGTTGCTCTTGTGGATGAGTTTTGGGTTCTTCTTGGTTATTGTATATTC
ACAATGGCACTATATATGCATTTTGCAACCTCAGTCATTCATGAGATCACTGCTGCACTT
GGAATCTACTGCTTCAGGATTACGCGTAAAGAAGCTTGAAGGAAGCTTAAGGGAGGATAA
TGCAAATCCCAACACGAATCTTGATATTATTTTTTTTACTGAAATTAAACGACTGATCGA
TATATTTTTGGATGAATAGCCTTTAATGTTTTCATTTTGTTTGGTCGAAATAGGTAATTC
ATGTAGAACTATTTTTGTAACGTTTTCTACGGAAAAGAATGATTTTTCGTGATTATTTAT
TTATGAATTTGGTT

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 4

CO CL1788Contig1 919 4 2 U
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CTTTGATGAATCAATATGTTAATAAGAAGTTTAGCAACCAGTACAAGGCCACCATTGGTG
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GCTGTGTACTTGTCTATGATGTCAACTCCGCCAAATCATTTGAGGATCTCAATAACTGGA
GGGAAGAGTTTCTGATTCAGGCGAGCCCATCTGATCCAGAGAACTTCCCTTTTGTTGTCA
TCGGTAACAAAATCGATGTAGATGGTGGAAACAGCCGTGTGGTTTCAGAGAAGAAGGCTC
GAGCTTGGTGTGCTTCAAAAGGAAACATCCCATACTATGAAACTTCTGCTAAAGAAGGCA
CCAATGTTGAAGACGCATTCTTGTGTATTACCAAGAATGCAATGAAGAGTGGAGAAGAGG
ATGAAATGTACTTGCCGGACACAATCGATGTCGGAACCAGCAACCCACAGAGGTCAGCAG
GATGTGAATGCTAAAAGGATTCTTTTACCTTTGCTCTCTGACCACCAGTTTATCTCATTC
TCCGAGGTTTTTTACCTTCTTGTAAATCTGTTGTTCTGTGGTAAATTATTGAAAATAAAA
AAATAAACCCATAACGTTGTTTACCGTTGTTGTTGTTGTCTATCACATTTATGAAAAGAC
TCAATGGTCTCGTACTTTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1CI15TF U 1
AF RS1DY66TF U 1
AF RS1CI15JQ C 128
AF RS1DY66JQ C 159
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BS 696 919 RS1CI15JQ

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TCGGTAACAAAATCGATGTAGATGGTGGAAACAGCCGTGTGGTTTCAGAGAAGAAGGCTC
GAGCTTGGTGTGCTTCAAAAGGAAACATCCCATACTATGAAACTTCTGCTAAAGAAGGCA
CCAATGTTGAAGACGCATTCTTGTGTATTACCAAGAATGCAATGAAGAGTGGAGAAGAGG
ATGAAATGTACTTGCCGGACACAATCGATGTCGGA
CCAGCACCCAC

QA 1 695 1 695
DS 

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GATAGCCGAGATCCATCCGTGAATCGTTGATTTCATCTCTAGTCCGAGTTTCGATGACTT
CCCGTAGAAGAACTCTCCTCAAAGTCATCATCCTCGGCGATAGCGGGGTGGGGAAGACCT
CTTTGATGAATCAATATGTTAATAAGAAGTTTAGCAACCAGTACAAGGCCACCATTGGTG
CCGATTTCTTGACTAAGGAAGTACACTATGAAGACCGCCTTTTCACTTTACAGATATGGG
ACACCGCTGGTCAGGAAAGGTTCCAGAGCCTTGGGGTAGCTTTTTATCGCGGTGCTGATT
GCTGTGTACTTGTCTATGATGTCAACTCCGCCAAATCATTTGAGGATCTCAATAACTGGA
GGGAAGAGTTTCTGATTCAGGCGAGCCCATCTGATCCAGAGAACTTCCCTTTTGTTGTCA
TCGGTAACAAAATCGATGTAGATGGTGGAAACAGCCGTGTGGTTTCAGAGAAGAAGGCTC
GAGCTTGGTGTGCTTCAAAAGGAAACATCCCATACTATGAAACTTCTGCTAAAGAAGGCA
CCAATGTTGAAGACGCATTCTTGTGTATTACCAAGAATGCAATGAAGAGTGGAGAAGAGG
ATGAAATGTACTTGCCGGACACAATCGAT

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1CI15JQ 792 0 0
AAGAACTCTC*TCAAAGTCATCATCCTCGGCGATAGCGGG*TGGGGAAGAC*TCTTTGAT
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CTTGACTAAGGAAGTACACTATGAAGACCGCCTTTTCACTTTACAGATATGGGACACCGC
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GTTTCTGATTCAGGCGAGCCCATCTGATCCAGAGAACTTCCCTTTTGTTGTCATCGGTAA
CAAAATCGATGTAGATGGTGGAAACAGCCGTGTGGTTTCAGAGAAGAAGGCTCGAGCTTG
GTGTGCTTCAAAAGGAAACATCCCATACTATGAAACTTCTGCTAAAGAAGGCACCAATGT
TGAAGACGCATTCTTGTGTATTACCAAGAATGCAATGAAGAGTGGAGAAGAGGATGAAAT
GTACTTGCCGGACACAATCGATGTCGGAACCAGCAACCCACAGAGGTCAGCAGGATGTGA
ATGCTAAAAGGATTCTTTTACCTTTGCTCTCTGACCACCAGTTTATCTCATTCTCCGAGG
TTTTTTACCTTCTTGTAAATCTGTTGTTCTGTGGTAAATTATTGAAAATAAAAAAATAAA
CCCATAACGTTGTTTACCGTTGTTGTTGTTGTCTATCACATTTATGAAAAGACTCAATGG
TCTCGTACTTTC

QA 1 792 1 792
DS 

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CAGTACAAGGCCACCATTGGTGCCGATTTCTTGACTAAGGAAGTACACTATGAAGACCGC
CTTTTCACTTTACAGATATGGGACACCGCTGGTCAGGAAAGGTTCCAGAGCCTTGGGGTA
GCTTTTTATCGCGGTGCTGATTGCTGTGTACTTGTCTATGATGTCAACTCCGCCAAATCA
TTTGAGGATCTCAATAACTGGAGGGAAGAGTTTCTGATTCAGGCGAGCCCATCTGATCCA
GAGAACTTCCCTTTTGTTGTCATCGGTAACAAAATCGATGTAGATGGTGGAAACAGCCGT
GTGGTTTCAGAGAAGAAGGCTCGAGCTTGGTGTGCTTCAAAAGGAAACATCCCATACTAT
GAAACTTCTGCTAAAGAAGGCACCAATGTTGAAGACGCATTCTTGTGTATTACCAAGAAT
GCAATGAAGAGTGGAGAAGAGGATGAAATGTACTTGCCGGACACAATCGATGTCGGAACC
AGCAACCCACAGAGGTCAGCAGGATGTGAATGCTAAAAGGATTCTTTTACCTTTGCTCTC
TGACCACCAGTTTATCTCATTCTCCGAGGTTTTTTACCTTCTTGTAAATCTGTTGTTCTG
TGGTAAATTATTGAAAATAAAAAAATAAACCCATAACGTTGTTTACCGTTGTTGTTGTTG
TCTATCACATTTATGAAAAGACTCAATGGTCTCGTACTTTC

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 4

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CAAAGACGATGGTTTAACTCCAGAGCAACGCCGTGAAAGGGATGCAAAAGCATTGCAAGA
GAAGGCGGCGAAAAAAGCTGCTCAAGCTGCAGGATCAGCTGCTTCCGGAGGAGGAGGAGG
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TTTCTTTTGAGATCGGTATTGTTTCTGTGTTGAACTTAATTTACTTTTGAATCTGAAACT
TTGATGTTTGTTGTGTGAGTTGTTTTGCTCTCTTTTAATGGAATGCATTTTCGGTTTGAA
AAATGACATTTTGAGG


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1GI86JQ C 1
AF RS1GI86TF U 1
AF RS1EF74JQ C 1
AF RS1EF74TF U 54
BS 1 8 RS1EF74JQ
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BS 54 182 RS1EF74TF
BS 183 183 RS1GI86TF
BS 184 338 RS1EF74TF
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BS 340 402 RS1EF74TF
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BS 404 496 RS1EF74TF

RD RS1GI86JQ 477 0 0
GGATTGTT
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GAGATCGGTATTGTTTCTGTGTTGAACTTAATTTACTTTTGAATCTGAAACTTTGATGTT
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QA 9 477 9 477
DS 

RD RS1GI86TF 477 0 0
GGATTGTC
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ACGCGGGTTTCTCTGCTAAAGCTCACCATCAATCCATCATCATGACTCGAGGAAGCCAGA
GAGAGCGAGACCGTGAAAGAGCTCAAGCTCGTGCCGGAGGAAAAGGAAAGACCAAAGACG
ATGGTTTAACTCCAGAGCAACGCCGTGAAAGGGATGCAAAAGCATTGCAAGAGAAGGCGG
CGAAAAAAGCTGCTCAAGCTGCAGGATCAGCTGCTTCCGGAGGAGGAGGAGGCAAAGGAA
ACAATAATAAGAAATGATTCGTTGTTGTTGCTGTAACTTGTAACTTTCTTTCTTTCTTTT
GAGATCGGTATTGTTTCTGTGTTGAACTTAATTTACTTTTGAATCTGAAACTTTGATGTT
TGTTGTGTGAGTTGTTTTGCTCTCTTTTAATGGAATGCATTTTCGGTTT

QA 9 477 9 477
DS 

RD RS1EF74JQ 496 0 0
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AAGCCAGAGAGAGCGAGACCGTGAAAGAGCTCAAGCTCGTGCCGGAGGAAAAGGAAAGAC
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GAAGGCGGCGAAAAAAGCTGCTCAAGCTGCAGGATCAGCTGCTTCCGGAGGAGGAGGAGG
CAAAGGAAACAATAATAAGAAATGATTCGTTGTTGTTGTTGTAACTTGTAACTTTCTTTC
TTTCTTTTGAGATCGGTATTGTTTCTGTGTTGAACTTAATTTGCTTTTGAATTTGAAACT
TTGATGTTTGTTGTGTGAGTTGTTTTGCTCTCTTTTAATGGAATGCATTTTCGGTTTGAA
AAATGACATTTTGAGG

QA 1 496 1 496
DS 

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GAAAGACCAGAGACGATGGTTTAACTCCAGAGCAACGCCGTGAAAGGGATGCAAAAGCAT
TGCAAGAGAAGGCGGCGAAAAAAGCTGCTCAAGCTGCAGGATCAGCTGCTTCCGGAGGAG
GAGGAGGCAAAGGAAACAATAATAAGAAATGATTCGTTGTTGTTGTTGTAACTTGTAACT
TTCTTTCTTTCTTTTGAGATCGGTATTGTTTCTGTGTTGAACTTAATTTGCTTTTGAATC
TGAAACTTTGATGTTTGTTGTGTGAGTTGTTTTGCTCTCTTTTAATGGAATGCATTTTCG
GTTTGAAAAATGACATTTTGAGG

QA 1 443 1 443
DS 



AS 1 5

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TGCGCAAGAGATGGAGATGGAGAAGTACAAGCCGGTGATGGCGTTAGTGCTGCTACAGTT
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CTCCGCTTGGAGCAGAACAAGCAAACCTTCTCTTGGACTAAGAGGCTTTTGGTGGGTGGC
TTTCACAGCTGTTTTTGGTGTTACTGTGAATCAGAACGCTTATTTTAAAGGGCTTGACTT
ATCTTCTTCATCCATGGCTTGTGCCATGACCAATCTTATTCCTGCTGTCACCTTCATCAT
CTCCATCATTGTTGGATTCGAGAGGATAAAGAGGAGAAGTTTGAAAAGTGTAGCAAAGAT
AATAGGAACAGGTGTGTGTGTAGGAGGAGCCATGGCAATGACTTTTCTAAGAGGACCTAA
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TCTTCTCGTCAGCACATTTTCTTGGTCTTCTTGGTTGATCCTTCAG*TTCCAATTGCTAA
TCATTGTCATGATCACTTGTACACTTCCTCCTGGACTTGTTTCTTGGCTACCATAGCCTC
TTTCTTCATGGCCCTCGCCTTAGGCAACACTGACTTAACGTCCTGGAAGCTTGATTCCTC
GTTGAAACTCTCCTGCTGCATATACTCTGGACTTCAACTCGCGGTTTCTTTCTTTCTACA
AGCTTGGTGCGTGTCGCGGAAAGGACCTCTTTTCTCTGCACTCTTCAACCCTCTTTCTAC
GGTCATTGTCACTTTCTTCGGCGCTCTGTATCTAAACGAGCAGACTTACCTTGGGAGCTT
GCTGGGGGCTTTGGCTATCATCGTTGGTCTCTATATTGTTCTCTGGGGCAAAACCGAAGA
CTATCAAGAAGAAGCAACAGACCTGAAACTGCAAAATGAATACAGCACTAGCTCCCAATC
TGACTTTGTTCCCATTCTGATTGGCGACAGGGCTTTTAGTAGTTCTGAGCTCTTAGAACC
TCTTCTCATGTAAACTCTTATCAAAAGTCAAAATTCTAGATGAGTGTAAGGATAAGTTTT
TGACAGAGTAAAAATGAAATGGGCACTTGTTTCGC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GP60TF U 47
AF RS1GA84TF U 4
AF RS1DZ69TF U 1
AF RS1CD28TF U 5
AF RS1CD28JQ C 541
BS 1 195 RS1DZ69TF
BS 196 196 RS1GA84TF
BS 197 365 RS1DZ69TF
BS 366 367 RS1GA84TF
BS 368 738 RS1DZ69TF
BS 739 743 RS1CD28TF
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BS 758 758 RS1CD28JQ
BS 759 786 RS1CD28TF
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GTGCTGCTACAGTTTACATCTGCAGGAGTTGCACTCTTCACCAAAGCTGCTTTCATGGAA
GGACTCAATCCCACCGTCTTCGTAGTTTACCGTCAAGCCATCGCTACTCTTTTCATCTGT
CCCATCTCTTTCTTCTCCGCTTGGAGCAGAACAAGCAAACCTTCTCTTGGACTAAGAGGC
TTTTGGTGGGTGGCTTTCACAGCTGTTTTTGGTGTTACTGTGAATCAGAACGCTTATTTT
AAAGGGCTTGACTTATCTTCTTCATCCATGGCTTGTGCCATGACCAATCTTATTCCTGTT
GTCACCTTCATCATCTCCATCATTGTTGGATTCGAGAGGATAAAGAGGAGAAGTTTG

QA 1 417 1 417
DS 

RD RS1GA84TF 646 0 0
GG
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AAGAGATGGAGATGGAGAAGTACAAGCCGGTGATGGCGTTAGTGCTGCTACAGTTTACAT
CTGCAGGAGTTGCACTCTTCACCAAAGCTGCTTTCATGGAAGGACTCAATCCCACCGTCT
TCGTAGTTTACCGTCAAGCCATCGCTACTCTTTTCATCTGTCCCATCTCTTTCTTCTCCG
CTTGGAGCAGAACAAACAAACCTTCTCTTGGACTAAGAGGCTTTTGGTGGGTGGCTTTCA
CAGCTGTTTTTGGTGTTACTGTGAATCAGAACGCTTATTTTAAAGGGCTTGACTTATCTT
CTTCATCCATGGCTTGTGCCATGACCAATCTTATTCCTGCTGTCACCTTCATCATCTCCA
TCATCGTTGGATTCGAGAGGATAAAGAGGAGAAGTTTGAAAAGTGTAGCAAAGATAATAG
GAACAGGTGTGTGTGTAGGAGGAGCCATGGCAATGACTTTTCTAAGAGGACCTAAACTGC
TCAACGCCATGTTAAACCAAGACAACGACACCACTTGGTTACTCGGTTGCTTATGTCTTC
TCGTCAGCACATTTTCTTGGTCTTCTTGGTTGATCCTTCAG
TTC

QA 3 643 3 643
DS 

RD RS1DZ69TF 756 0 0
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TGCGCAAGAGATGGAGATGGAGAAGTACAAGCCGGTGATGGCGTTAGTGCTGCTACAGTT
TACATCTGCAGGAGTTGCACTCTTCACCAAAGCTGCTTTCATGGAAGGACTCAATCCCAC
CGTCTTCGTAGTTTATCGTCAAGCCATCGCTACTCTTTTCATCTGTCCCATCTCTTTCTT
CTCCGCTTGGAGCAGAACAAGCAAACCTTCTCTTGGACTAAGAGGCTTTTGGTGGGTGGC
TTTCACAGCTGTTTTTGGTGTTACTGTGAATCAGAACGCTTATTTTAAAGGGCTTGACTT
ATCTT**TCATCCATGGCTTGTGCCATGACCAATCTTATTCCTGCTGTCACCTTCATCAT
CTCCATCATTGTTGGATTCGAGAGGATAAAGAGGAGAAGTTTGAAAAGTGTAGCAAAGAT
AATAGGAACAGGTGTGTGTGTAGGAGGAGCCATGGCAATGACTTTTCTAAGAGGACCTAA
ACTGCTCAACGCCATGTTAAACCAAGACAACGACACCACTTGGTTACTCGGTTGCTTATG
TCTTCTCGTCAGCACATTTTCTTGGTCTTCTTGGTTGATCCTTCAG*TTCCAATTGCTAA
TCATTGTCATGATCACTTGTACACTTCCTCCTGGACTTGTTTCTTGGCTACCATAGCCTC
TTTCTTCATGGCCCTCGC
TTAGCACACTGACTAACG

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1CD28TF 793 0 0
G
ATTTGTAGTGAGATACATTAAATCTTAAAATAA**AAGAGAAATAGAGAGAAAGGTGCGC
AAGAGATGGAGATGGAGAAGTACAAGCCGGTGATGGCGTTAGTGCTGCTACAGTTTACAT
CTGCAGGAGTTGCACTCTTCACCAAAGCTGCTTTCATGGAAGGACTCAATCCCACCGTCT
TCGTAGTTTACCGTCAAGCCATCGCTACTCTTTTCATCTGTCCCATCTCTTTCTTCTCCG
CTTGGAGCAGAACAAGCAAACCTTCTCTTGGACTAAGAGGCTTTTGGTGGGTGGCTTTCA
CAGCTGTTTTTGGTGTTACTGTGAATCAGAACGCTTATTTTAAAGGGCTTGACTTATCTT
CTTCATCCATGGCTTGTGCCATGACCAATCTTATTCCTGCTGTCACCTTCATCATCTCCA
TCATTGTTGGATTCGAGAGGATAAAGAGGAGAAGTTTGAAAAGTGTAGCAAAGATAATAG
GAACAGGTGTGTGTGTAGGAGGAGCCATGGCAATGACTTTTCTAAGAGGACCTAAACTGC
TCAACGCCATGTTAAACCAAGACAACGACACCACTTGGTTACTCGGTTGCTTATGTCTTC
TCGTCAGCACATTTTCTTGGTCTTCTTGGTTGATCCTTCAG*TTCCAATTGCTAATCATT
GTCATGATCACTTGTACACTTCCTCCTGGACTTGTTTCTTGGCTACCATAGCCTCTTTCT
TCATGGCCCTCGCCTTAG**CACACTGACTTA*CGTCCTGGAAGCTTGATTCCTCGTTGA
A
CTCTCTGCTGC

QA 2 782 2 782
DS 

RD RS1CD28JQ 695 0 0
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TCTTCTCGTCAGCACATTTTCTTGGTCTTCTTGGTTGATCCTTCAGGTTCCAATTGCTAA
TCATTGTCATGATCACTTGTACACTTCCTCCTGGACTTGTTTCTTGGCTACCATAGCCTC
TTTCTTCATGGCCCTCGCCTTAGGCAACACTGACTTAACGTCCTGGAAGCTTGATTCCTC
GTTGAAACTCTCCTGCTGCATATACTCTGGACTTCAACTCGCGGTTTCTTTCTTTCTACA
AGCTTGGTGCGTGTCGCGGAAAGGACCTCTTTTCTCTGCACTCTTCAACCCTCTTTCTAC
GGTCATTGTCACTTTCTTCGGCGCTCTGTATCTAAACGAGCAGACTTACCTTGGGAGCTT
GCTGGGGGCTTTGGCTATCATCGTTGGTCTCTATATTGTTCTCTGGGGCAAAACCGAAGA
CTATCAAGAAGAAGCAACAGACCTGAAACTGCAAAATGAATACAGCACTAGCTCCCAATC
TGACTTTGTTCCCATTCTGATTGGCGACAGGGCTTTTAGTAGTTCTGAGCTCTTAGAACC
TCTTCTCATGTAAACTCTTATCAAAAGTCAAAATTCTAGATGAGTGTAAGGATAAGTTTT
TGACAGAGTAAAAATGAAATGGGCACTTGTTTCGC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 5

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GGCTTATATGGCATTGGTGGGATCATTTCCGTTTAATTCATTCCTGTCTGGAGTGCTCTC
TTGTGTTGGGACGGCTGTTCTTGCTGTTTGCCTCCGGATTCAAGTTAACAAAGAAAACAA
GGAATTCAAGGATTTGGCACCGGAACGAGCATTTGCAGATTTTGTACTCTGCAACTTGGT
CCTCCACTTGGTGATCATCAACTTCCTCGGATAGGTTCTCCTCTCCTATCACACCGAGGT
TGCTTTCATGTTATGGAGTTTCTTAGTTGTCACTTGGAATCAGAACTTATAGTTTTGAGA
TAATTTTGTACTGTATTTGTCAAAAGAATCAAACCTTTTCGGCTCTCCAATAAAACACTG
TTTCGTGCCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 30 30 10 10 10 

AF RS1CC75JQ C 1
AF RS1CP06TF U 19
AF RS1CC75TF U 1
AF RS1F326JQ C 24
AF RS1F326TF U 24
BS 1 25 RS1CC75TF
BS 26 385 RS1CP06TF
BS 386 388 RS1CC75TF
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RD RS1CC75JQ 548 0 0
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GGCTTATATGGCTTTGGTTGGATCATTTCCGTTTAATTCATTCCTGTCTGGAGTGCTCTC
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TAATTTTGTACTGTATTTGTCAAAAGAATCAAACCTTTTCGGCTCTCCAATAAAACACTG
TTTCGTGC

QA 1 548 1 548
DS 

RD RS1CP06TF 528 0 0
GGAGAGA
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GTTGTTTTCGCTGTCTTCACTGCTCTGATTCAGGTGGCTTATATGGCATTGGTGGGATCA
TTTCCGTTTAATTCATTCCTGTCTGGAGTGCTCTCTTGTGTTGGGACGGCTGTTCTTGCT
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CGAGCATTTGCAGATTTTGTACTCTGCAACTTGGTCCTCCACTTGGTGATCATCAACTTC
***GGATAGGTTCTCCTCTCCTATCGCACCGAGGTTGCTTTCATGTTATGGAGTTTCTTA
GTTGTCACTTGGAATCAGAACTTATAGTTTTGAGATAATTTTGTACTGTATTTGTCAAAA
GAATCAAACCTTTTCGGCTCTCCAATAAAACACTGTTTCGT

QA 8 528 8 528
DS 

RD RS1CC75TF 548 0 0
GGGGTAGTAGAAGGAAGAAGAAAGAGAGATCAGAGATTGAGAAAGGATGGTGAAATCGAC
AAGTAAGGATGCGCAGGATCTATTCCGTTCTCTTCACTCCGCTTACTCCGCTACTCCCAC
TAATCTGAAGATCATCGACTTGTATGTTGTTTTCGCTGTCTTCACTGCTCTGATTCAGGT
GGCTTATATGGCTTTGGTTGGATCATTTCCGTTTAATTCATTCCTGTCTGGAGTGCTCTC
TTGTGTTGGGACGGCAGTTCTTGCTGTTTGCCTCCGGATTCAAGTTAACAAAGAAAACAA
GGAATTCAAGGATTTGGCACCCGAACGAGCATTTGCAGATTTTGTACTCTGCAACTTGGT
CCTCCACTTGGTGATCATCAACTTCCTCGGATAGGTTCTTCTCTCCTATCACACCGAGGT
TGCTTTCATGTTATGGAGTTTCTTAGTTGTCACTTGGAATCAGAACTTATAGTTTTGAGA
TAATTTTGTACTGTATTTGTCAAAAGAATCAAACCTTTTCGGCTCTCCAATAAAACACTG
TTTCGTGC

QA 1 548 1 548
DS 

RD RS1F326JQ 528 0 0
GT
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GTTGTTTTCGCTGTCTTCACTGCTCTGATTCAGGTGGCTTATATGGCATTGGTGGGATCA
TTTCCGTTTAATTCATTCCTGTCTGGAGTGCTCTCTTGTGTTGGGACGGCTGTTCTTGCT
GTTTGCCTCCGGATTCAAGTTAACAAAGAAAACAAGGAATTCAAGGATTTGGCACCGGAA
CGAGCATTTGCAGATTTTGTACTCTGCAACTTGGTCCTCCACTTGGTGATCATCAACTTC
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GTTGTCACTTGGAATCAGAACTTATAGTTTTGAGATAATTTTGTACTGTATTTGTCAAAA
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QA 3 528 3 528
DS 

RD RS1F326TF 528 0 0
GT
GAGATCAGAGATTGAGAAAGAATGGTGAAATCGACAAGTAAGGACGCGCAGGATCTATTC
CGTTCTCTTCACTCCGCTTACTCCGCTACTCCCACTAATCTCAAGATCATCGACTTGTAT
GTTGTTTTCGCTGTCTTCACTGCTCTGATTCAGGTGGCTTATATGGCATTGGTGGGATCA
TTTCCGTTTAATTCATTCCTGTCTGGAGTGCTCTCTTGTGTTGGGACGGCTGTTCTTGCT
GTTTGCCTCCGGATTCAAGTTAACAAAGAAAACAAGGAATTCAAGGATTTGGCACCGGAA
CGAGCATTTGCAGATTTTGTACTCTGCAACTTGGTCCTCCACTTGGTGATCATCAACTTC
CTCGGATAGGTTCTCCTCTCCTATCACACCGAGGTTGCTTTCATGTTATGGAGTTTCTTA
GTTGTCACTTGGAATCAGAACTTATAGTTTTGAGATAATTTTGTACTGTATTTGTCAAAA
GAATCAAACCTTTTCGGCTCTCCAATAAAACACTGTTTCGTGC
ACC

QA 3 525 3 525
DS 



AS 1 2

CO CL1792Contig1 1078 2 2 U
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ACATAGGAACAAGGGGAAGCCTCCAGCACACGATTCTTTCGGTTCATTGGGTTCACATGT
TTGGCCCTATATTATAACACAGAGATGCAAAGGGAAGATATTTGCTCAACTAAGAGATGA
CCTGACATGGAGCGACGCTCAGAACTTGGCTACCTTTTTGGGACAACAACTACGCAACCT
TCACCAACTGCCATATCCTCCAGTCACACGTCCTGAGTTATTGAATGCAAACGATGCTCA
TGAGGAGTTGAAGATTCCTCCAGAATGGAAAGTCTTCGTCGATGATCTGTGCCAAAAGAA
GAAGGACGTGACTAGTCGTCTGGAGAACTGGGGAAATCCTATTCCTAAGGCTTTGATGAA
CAAAATAGACGAATACATGCCTGATGAGTTCTTTGTGGATTTGCTCCATGTTTTCAAGGA
GATGTTGGAGACGAAACCAAGCCCTGCACCTGGATACACTCGGACGTCATGGACGACAAC
ATCCACATGGAACCATGCGCAGCTGATGATTCTGTTGATGGCCAACACAACTCATGGCGT
CCCGGTCATATTCTTGACTTCAGCGATTTATCCATAGGGGATCCCATCTTCGATTTGATA
CCAATACACTTGGACGTGTTCAGAGGAGACACTGATCTCTTCAAGAAGCTTCTAGAGAGC
TACGGCCTTCCTTTAATCAGAAGTAAATCGGCGGCAGCAGACGGTACGAGGAAGAAAGTA
CTGTCTCCTTCCTACCGCACAATGTGTTATTGTTTATTGCATGAAGACAATGTGTTGGGT
GCAATGTTCAGTATCTGGGATGAACTTCGGACAGCTGAATCATGGGAACAGGTTGAACTC
ACTGTTTGGAGTCTACTCAACTCGTACTAGTCTCTTTCCAACCAATAATTTATATTACAC
ATCACCAAACTAAATGTGTCTAAAATAAATCAATGCTGTAAAATCACGTTTTGTGTGTAG
AACAAGAACATGAAATCTCTTTGTTTTTGGTAATGCAAATGAAAAAAGAAATGGTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BX13TF U 1
AF RS1BX13JQ C 433
BS 1 698 RS1BX13TF
BS 699 1078 RS1BX13JQ

RD RS1BX13TF 702 0 0
GGATGCATCAATGTTGAACAGCGAGTTCCCATTTGGTATTTGGAACAAAACGCTACTTCA
ACATAGGAACAAGGGGAAGCCTCCAGCACACGATTCTTTCGGTTCATTGGGTTCACATGT
TTGGCCCTATATTATAACACAGAGATGCAAAGGGAAGATATTTGCTCAACTAAGAGATGA
CCTGACATGGAGCGACGCTCAGAACTTGGCTACCTTTTTGGGACAACAACTACGCAACCT
TCACCAACTGCCATATCCTCCAGTCACACGTCCTGAGTTATTGAATGCAAACGATGCTCA
TGAGGAGTTGAAGATTCCTCCAGAATGGAAAGTCTTCGTCGATGATCTGTGCCAAAAGAA
GAAGGACGTGACTAGTCGTCTGGAGAACTGGGGAAATCCTATTCCTAAGGCTTTGATGAA
CAAAATAGACGAATACATGCCTGATGAGTTCTTTGTGGATTTGCTCCATGTTTTCAAGGA
GATGTTGGAGACGAAACCAAGCCCTGCACCTGGATACACTCGGACGTCATGGACGACAAC
ATCCACATGGAACCATGCGCAGCTGATGATTCTGTTGATGGCCAACACAACTCATGGCGT
CCCGGTCATATTCTTGACTTCAGCGATTTATCCATAGGGGATCCCATCTTCGATTTGATA
CCAATACACTTGGACGTGTTCAGAGGAGACACTGATCT
CTTC

QA 1 698 1 698
DS 

RD RS1BX13JQ 646 0 0
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GAAACCAAGCCCTGCACCTGGATACACTCGGACGTCATGGACGACAACATCCACATGGAA
CCATGCGCAGCTGATGATTCTGTTGATGGCCAACACAACTCATGGCGTCCCGGTCATATT
CTTGACTTCAGCGATTTATCCATAGGGGATCCCATCTTCGATTTGATACCAATACACTTG
GACGTGTTCAGAGGAGACACTGATCTCTTCAAGAAGCTTCTAGAGAGCTACGGCCTTCCT
TTAATCAGAAGTAAATCGGCGGCAGCAGACGGTACGAGGAAGAAAGTACTGTCTCCTTCC
TACCGCACAATGTGTTATTGTTTATTGCATGAAGACAATGTGTTGGGTGCAATGTTCAGT
ATCTGGGATGAACTTCGGACAGCTGAATCATGGGAACAGGTTGAACTCACTGTTTGGAGT
CTACTCAACTCGTACTAGTCTCTTTCCAACCAATAATTTATATTACACATCACCAAACTA
AATGTGTCTAAAATAAATCAATGCTGTAAAATCACGTTTTGTGTGTAGAACAAGAACATG
AAATCTCTTTGTTTTTGGTAATGCAAATGAAAAAAGAAATGGTCAC

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 4

CO CL1793Contig1 924 4 2 U
GCATCGAGTACTTGAACACCCGTGACATGAAAGCGGCATATAAACAGGGTGATGGAAGGA
AGATTGATGGTAGAAGGGTGTTGGTTGATGTGGAGAGAGGTAGGACAGTCCCTAACTGGC
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GCGAGGAGGAGCCACAACAGCCCTCCCAAGCAAGAACATCCCGCTCAGAGGAGCCTAAAG
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ACGAGCGGTCTCATGAAAGGTCTCATGAGAGGTCCCGTGAAAGGTCTCGTGATAGACCGA
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GGGACCGAGAAAGAGAGAGCAGACGTGACAGAGGAGACAGAGACCGTCGTAGTCGGGATC
ATGATAGGGAGCGGAGTAGGAAGAGGGAACGGGACTACGAGAGCGGAGAGTACGAAGAAG
AGGGTGGGTATGAGAGAGGTGGGTCGAAGCAGAGGAGAGGAGAGTCAGAGGAAGGGCATG
GGTACTACGAAGGGCGTAGTAGACGTTCAAGCCATTATGAGCGTGAGGAGGAACAAGGAG
GAGGTGAGCAAGACCGGTACGATGATCGTTATGGGAGAGTGGAGGAAGAAGAATACCGTT
ATGATGATCGTGAGTACAAGCGTTCAGAGCGTTCCAAGTCGCGTGATTATTAAACTTGAT
GGACGACGTTATTTTCTTGCGTAGCTATAAACAATAAACTTTGTTTGTGTGTTGTGATGA
ATCTTTTGTCGGATTTCGCTTTTGCGTTTCTTTTGATTTGGTCTGACAATTTGTTGAATC
TTATTAAACAAGAACCATTTCAGC


BQ
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AF RS1ES43TF U 1
AF RS1ES43JQ C 248
AF RS1F715TF U 302
AF RS1EZ46TF U 689
BS 1 563 RS1ES43TF
BS 564 924 RS1F715TF

RD RS1ES43TF 563 0 0
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AGATTGATGGTAGAAGGGTGTTGGTTGATGTGGAGAGAGGTAGGACAGTCCCTAACTGGC
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GCGAGGAGGAGCCACAACAGCCCTCCCAAGCAAGAACATCCCGCTCAGAGGAGCCTAAAG
TCCGTGAAGACCGGGAGAAATCTCGTGATAGGGGCAAAGAAAGGGAACGCGAGGTGTCTC
ACGAGCGGTCTCATGAAAGGTCTCATGAGAGGTCCCGTGAAAGGTCTCGTGATAGACCGA
GAGAGAGTCATAGAGAGGAAAAGCACCACAGAGACCGGGACCGAGGTAGAGACAGAGACA
GGGACCGAGAAAGAGAGAGCAGACGTGACAGAGGAGACAGAGACCGTCGTAGTCGGGATC
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AGGGTGGGTATGAGAGAGGTGGG

QA 1 563 1 563
DS 

RD RS1ES43JQ 669 0 0
AGACCGGGAGAAATCTCGTGATAGGGGCAAAGAAAGGGAACGCGAGGTGTCTCACGAGCG
GTCTCATGAAAGGTCTCATGAGAGGTCCCGTGAAAGGTCTCGTGATAGACCGAGAGAGAG
TCATAGAGAGGAAAAGCACCACAGAGACCGGGACCGAGGTAGAGACAGAGACAGGGACCG
AGAAAGAGAGAGCAGACGTGACAGAGGAGACAGAGACCGTCGTAGTCGGGATCATGATAG
GGAGCGGAGTAGGAAGAGGGAACGGGACTACGAGAGCGGAGAGTACGAAGAAGAGGGTGG
GTATGAGAGAGGTGGGTCGAAGCAGAGGAGAGGAGAGTCAGAGGAGGGGCATGGGTACTA
CGAAGGGCGTAGTAGACGTTCAAGCCATTATGAGCGTGAGGAGGAACAAGGAGGAGGTGA
GCAAGACCGGTACGATGATCGTTATGGGAGAGTGGAGGAAGAAGAATACCGTTATGATGA
TCGTGAGTACAAGCGTTCAGAGCGTTCCAAGTCGCGTGATTATTAAACTTGATGGACGAC
GTTATTTTCTTGCGTAGCTATAAACAATAAACTTTGTTTGTGTGTTGCGATGAATCTTTT
GTCGGATTTCGCTTTTGCGTTTCTTTTGATTTGGTCTGACAATTTGTTGAATCTTTTTAA
ACAAG
AACC

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1F715TF 623 0 0
G
GAGCGGTCTCGTGAAAGGTCTCATGAGAGGTCCCGTGAAAGGTCTCGTGATAGACCGAGA
GAGAGTCATAGAGAGGAAAAGCACCACAGAGACCGGGACCGAGGTAGAGACAGAGACAGG
GACCGAGAAAGAGAGAGCAGACGTGACAGAGGAGACAGAGACCGTCGTAGTCGGGATCAT
GATAGGGAGCGGAGTAGGAAAAGGGAACGGGACTACGAGAGCGGAGAGTACGAAGAAGAG
GGTGAGTATGAGAGAGGTGGGTCGAAGCAGAGGAGAGGAGAGTCAGAGGAAGGGCATGGG
TACTACGAAGGGCGTAGTAGACGTTCAAGCCATTATGAGCGTGAGGAGGAACAAGGAGGA
GGTGAGCAAGACCGGTACGATGATCGTTATGGGAGAGTGGAGGAAGAAGAATACCGTTAT
GATGATCGTGAGTACAAGCGTTCAGAGCGTTCCAAGTCGCGTGATTATTAAACTTGATGG
ACGACGTTATTTTCTTGCGTAGCTATAAACAATAAACTTTGTTTGTGTGTTGTGATGAAT
CTTTTGTCGGATTTCGCTTTTGCGTTTCTTTTGATTTGGTCTGACAATTTGTTGAATCTT
ATTAAACAAGAACCATTTCAGC

QA 2 623 2 623
DS 

RD RS1EZ46TF 224 0 0
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GCGTTCCAAGTCGCGTGATTATTAAACTTGATGGACGACGTTATTTTCTTGCGTAGCTAT
AAACAATAAACTTTGTTTGTGTGTTGTGATGAATCTTTTGTCGGATTTCGCTTTTGCGTT
TCTTTTGATTTGGTCTGACAATTTGTTGAATCTTATTAAACAAG

QA 1 224 1 224
DS 



AS 2 4

CO CL1794Contig1 1303 2 4 U
GAGAAACAACCTTGGATGGCCTTATGAGCCATTCCAAGTACCTGATGATGTTAAAAGCCA
CTGGAGCCGTCATACGCCTGAAGGCAAAGCTCTTGAGTCTGTCTGGAATGCATCATTTGC
AGCATATGAAAAGAAGTACCCAGAGGACGCTGCAGAGTTGAAATCAATCATCACTGGTGA
GCTACCTGCTGGCTGGGAGAAGGCACTACCAACATACACACCTGAGTCTCCAGGAGATGC
CACTAGAAACCTCTCACAGCAATGTCTTAACGCCATAGCCAAAGTTGTACCCGGTTTCCT
CGGTGGAAGTGCTGACCTTGCATCATCCAACATGACACTCCTGAAAGCCTCTGGTGACTT
CCAAAAGGCAACACCCGAAGAGAGAAACCTTAGGTTCGGTGTCAGGGAGCACGGAATGGG
AGCCATCTGCAACGGCATTGCCCTTCACAGCCCTGGTCTCATCCCTTACTGCGCAACCTT
CTTTGTCTTCACTGACTACATGAGAGGTGCGATGAGAATCTCAGCCTTGTCCGAAGCTGG
AGTGATCTACGTGATGACTCACGACTCCATTGGTCTTGGAGAAGATGGACCAACCCATCA
GCCCATTGAGCACATCGCTAGCTTCCGTGCCATGCCCAACACTCTCATGTTCCGTCCCGC
TGATGGAAACGAGACGGCCGGTGCGTACAAGATCGCTGTCACCAAGCGCAAGACGCCGTC
TATCTTGGCCTTGTCTAGACAGAAGCTTCCACAGCTTCCAGGGACGTCCATCGAGGGAGT
TGAGAAGGGAGGATACACAATCTCTGACAACTCCTCGGGGAACAAACCTGATGTGATCTT
GATTGTAACCGGTTCAGAGCTGGAGATTGCTGCACAGGCTGGAGAGGTGCTTAGGAAAGA
AGGGAAGACGGTTAGAGTTGTGTCGTTTGTGTGCTGGGAGCTGTTTGATGAGCAGACGGA
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TTCGACTTTTGGTTGGGGAAAGATTGTTGGAGGGAAAGGGAAGTCTATTGGTATTAACTC
GTTTGGAGCTAGTGCACTAGCTCCCTTGCTCTACAAGGAGTTTGGCATCACCGTTGAAGC
TGTTGTTGATGCGGCTAAGTCATTCTTCTAAGAGACTTAGAGATCAGAACCATTCTCTCT
ATAAGATTTCATAACATTGTCTCATTATCTCAAAATAAAATGCAACAAGACGAAAAGACT
TTCTTTCTTCTTTTTTTTTTGGTTTCTTGTAATTCGGTTCAAC


BQ
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G
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BQ
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C
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A

QA 2 782 2 782
DS 



AS 1 5

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ACCAAAGTTTCAGAAACGATCTCTGGCTCTCTGTATACGACGAAGTGCTTCCGCATCAGT
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GTTACACGCTTTCTCCACCTTCACAGTCGTTGGAATCGATGGGAGTCCCTGGCTTCGAAG
ATGAGCAACTCGGGTTGCATAAGACTGAAGAGTTTCATTCTTTGGTTCTACTGATAGTGC
AAACTTGACGTTGCTTGCTGTGTTTTCGCGACCACAGTATATAGTTGTATCATCTGGTAA
AGAGACGATCTTTTGAAATGATGAAAGCATCTGCTCAGGGGTACCTTCTGAGAGGGTACC
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GCTTATATGGCCTTGGGTGTGACCAGGAGTGCCAAGTACTCGAACCTCATGGCCAGCAAA
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AGCTGAGCCAATCACCTTTGCGCCACATTTTGCTTTCAGTTCAGCATTCCCACCCACGTG
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ATACCTTCTTCTTTTCAAAAGCCTTCCTTGGAAAAGCTTTGCCTGAGCTGAGCTGTGAGG
AGGACGAGTCTGCGACTTCGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 15 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 
35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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DS 

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QA 1 359 1 359
DS 

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AAGCTATATATCAAGTCTCCTGTGAATATTGTGGCTGACCCTGGGAAGTAGAAGCTTATA
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TGATGATGAGTA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1EA06TF 771 0 0
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TCTGCTCAGGGGTAC*TTCTGAGAGGGTACCACAGGATAAGCTATATATCAAGTCTCCTG
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TGTCAACTCCAGGAATCCGATCCTTATCCAGAGCTGAGCCAATCACCTTTGCGCCATATT
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AAAGCTGGCCTCCAATCCTAGAGCACGAGGGAATTGATGAATTGGTGGTAGATGAAGCTT
TGGAGATCATCGGCATCCTCTCTCTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGATAGAT
C

QA 1 770 1 770
DS 

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AAACATCCACTTATCACTATCATTCAGAAATATGTCAACTCCAGGAATCCGATCCTTATC
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GTGATCATCATGATGATGAGTATTCAAAATGTAAGTCAAGTTCCAGTTTTTCCTACTCAG
CGCCTCTATAACAGGAGCAGCCTCACAAGGATCAACGACTCCAACAGTGCCGGTGTCTTC
ATCGTGCAAAAGATAAGCATAGTTGTCCTTCTTACTACACGCCACCAGTTCGATTTTTAA
CGAGGAGGGCATGTTGGAGATGCTACAGAAGTGGGTGATCTGAAGCGTTTTTCTAGCTCC
GCGGAGGGTTTTGAGCGGCATGGAGAATAACCACATGACTCCGTATAATAAGCTTTTCCT
AAGGCAGAGATGTCTCAAACTAGGCCACACACAAAGCTGGCCTCCAATCCTAGAGCACGA
GGGAATTGATGAATTGGTGGTAGATGAAGCTTTGGAGATCATCGGCATCCTCTCTCTCTG
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AATATACCTTCTTCTTTTCAAAAGCCTTCCTTGGAAAAGCTTTGCCTGAGCTGAGCTGTG
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QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 3

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ATGGGGTATCATCAGGCCCGAAAATGACAGCGTTCCAGAGCATGATATTGTTGTCTTGAG
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BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A279JQ U 1
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AF RS1A279TF C 69
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GCGGTTTATTTGGATAGTCTTC

QA 1 502 1 502
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AG
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ATACTCCCATCAGCATAAATATTTGGATGGAACATCCGTGACACAAAACGAACAGTTGGC
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QA 1 638 1 638
DS 



AS 2 4

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BB16TF U 1
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DS 

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QA 10 392 10 392
DS 



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TCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 10 

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AF RS1DG94TF U 1
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TCTTCC

QA 1 546 1 546
DS 

RD RS1DG94TF 546 0 0
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C

QA 10 545 10 545
DS 



AS 1 5

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ATCGTTGTCACAAACGCTTGATACATTTTTGTTCACTCCTTCGTTAAGACAAGTAACTAA
AATTTTTAAGACAAAAAAAATTGATTGGTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AS 2 5

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BQ
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AF RS1E712JQ U 46
AF RS1AW59JQ U 1
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DS 

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ACAGTGAGTATAGTTTGATAATAACATTGGCTTTCACAAAAAGTCTTCAGAGGCCAAGAA
GAAGACTTTGGTTATGGAACAAAAGTATATAATGGTGGAGAGACTTGAGAGACACCATGA
GCTTGATTTGGTCATATGCGGACAAAAGTAGGTTAAAACAAGGGGCCAGCGGATGAGAAA
CCAGCTGCTCTAACCTCTTTGAGCGTAGAGGATAACCAGTCTAAGCCTTCATAGAGGCCA
TCTCCTTGAAGAGCACATGTGCCTTGTATATGCCATTTCCTGTTCTTGAGATCTAATAAG
CCAAGCCCTTCACATACTTCTCGGGGAGACATGGCTCCTCTCATGTCTTGTTTGTTTGCA
AACACTAGAATGACGCTATTAAGCATGAATGGGTCTTTTATGATCTCCTGAAACTCTTGC
TTAGCTTTACCAATTCTCTCGCGGTCCAAGGAATCTACCACGTATATAAGTCCATCGGTA
TTATTGAAGTAATGCCTCCACAAGGGCCTGAGCTTTTCTTGGCCACCAACATCCCAAACT
GTGAACATCACATTCTTGTACTGGACTTTCTCCACATTGAAACCGATTGTGGGAACAGTG
GACAGAACTTCTCCTATGTGGAGCTTGTAGGGTATAGTTGTTTTGCCGGCCGCATCCAGA
CCCAGCATAACGACCCTCATTTCCTGAT*GCCGAAGAAAGTATCGAAA*GCTTGCGAAA*
GTTTGACCCATGTCA
CGCTCCCAAATCTCCCT

QA 1 795 1 795
DS 

RD RS1AW59TF 695 0 0
TT
GAGCGTAGAGGATAACCAGTCTAAGCCT*CATAGAGGCCATCTCCTTGAAGAGCACATGT
GCCTTGTATATGCCATTTCCTGTTCTTGAGATCTAATAAGCCAAGCCCTTCACATACTTC
TCGGGGAGACATGGCTCCTCTCATGTCTTGTTTGTTTGCAAACACTAGAATGACGCTATT
AAGCATGAATGGGTCTTTTATGATCTCCTGAAACTCTTGCTTAGCTTTACCAATTCTCTC
GCGGTCCAAGGAATCTACCACGTATATAAGTCCATCGGTATTATTGAAGTAATGCCTCCA
CAAGGGCCTGAGCTTTTCTTGGCCACCAACATCCCAAACTGTGAACATCACATTCTTGTA
CTGGACTTTCTCCACATTGAAACCGATTGTGGGAACAGTGGACAGAACTTCTCCTATGTG
GAGCTTGTAGGGTATAGTTGTTTTGCCGGCCGCATCCAGACCCAGCATAACGACCCTCAT
TTCCTGATTGCCGAAGAAAGTATCGAAAAGCTTGCGAAAAGTTTGACCCATGTCAACGCT
CCCAAAATCTCCCTGATCCCTCCTCTATTGTACTTTCTATTAATAACAGAGACAATTAAA
CGAAGACGATTGATTGATTTCCAGGAAACACGACGAAGATCTTTCTTCCGAAAAAGAAAA
AGGGAAGAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGGTAG

QA 3 695 3 695
DS 



CO CL1799Contig2 684 2 4 U
CTACCTTCTCTTCTCTCTTCCCTTTCTCTTTCTCGGAAGAAAGATCTTCGTCGTGTTTCC
TGGAAATCAATCAATCAATCGTCTTCGTTTAGTTATCTCTGTTATTAATAGAAAGTACAA
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TTTCGATACTTTCTTCGGCAATCAGGAAATGAGGGTCGTTATGCTGGGTCTCGATGCGGC
CGGCAAAACAACTATACTCTACAAGCTCCACATAGGAGAAGTTCTGTCCACTGTTCCCAC
AATCGGTTTCAATGTGGAGAAAGTCCAGTACAAGAATGTGATGTTCACAGTTTGGGATGT
TGGTGGCCAAGAAAAGCTCAGGCCCTTGTGGAGGCATTACTTCAATAATACCGATGGACT
TATATACGTGGTAGATTCCTTGGACCGTGAGAGAATTGGTAAAGCTAAGCGAGTTTCAGG
AGATCATAAAAGACCCATTCATGCTTAATAGCGTCATTCTAGTGTTTGCAAACAAACAAG
ACATGAGAGGAGCCATGTCTCCCCGAGAAGTATGTGAAGGGCTTGGCTTATTAGATCTCA
AGAACAGGAAATGGCATAGACAAAGCACATGTGCTCTTCAAGAGATGGCCTCTATGAAGC
TTAGACTGGTTATCCTCTACGCTC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E712TF U 1
AF RS1FY74TF U 1
BS 1 231 RS1E712TF
BS 232 232 RS1FY74TF
BS 233 464 RS1E712TF
BS 465 684 RS1FY74TF

RD RS1E712TF 464 0 0
CTACCTTCTCTTCTCTCTTCCCTTTCTCTTTCTCGGAAGAAAGATCTTCGTCGTGTTTCC
TGGAAATCAATCAATCAATCGTCTTCGTTTAGTTATCTCTGTTATTAATAGAAAGTACAA
TAGAGGAGGGATCAGGGAGCTTTTGGGGGGCGTTGACATGGGTCAAACTTTTCGCAAGCT
TTTCGATACTTTCTTCGGCAATCAGGAAATGAGGGTCGTTATGCTGGGTCTGGATGCGGC
CGGCAAAACAACTATACTCTACAAGCTCCACATAGGAGAAGTTCTGTCCACTGTTCCCAC
AATCGGTTTCAATGTGGAGAAAGTCCAGTACAAGAATGTGATGTTCACAGTTTGGGATGT
TGGTGGCCAAGAAAAGCTCAGGCCCTTGTGGAGGCATTACTTCAATAATACCGATGGACT
TATATACGTGGTAGATTCCTTGGACCGTGAGAGAATTGGTAAAG

QA 1 464 1 464
DS 

RD RS1FY74TF 684 0 0
CTAC
CTTCTCTTCTCTCTTCCCTTTCTCTTTCTCGGAAGAAAGATCTTCGTCGTGTTTCCTGGA
AATCAATCAATCAATCGTCTTCGTTTAGTTATCTCTGTTATTAATAGAAAGTACAATAGA
GGAGGGATCAGGGAGCTTTTGGGGGGCGTTGACATGGGTCAAACTTTTCGCAAGCTTTTC
GATACTTTCTTCGGCAATCAGGAAATGAGGGTCGTTATGCTGGGTCTCGATGCGGCCGGC
AAAACAACTATACTCTACAAGCTCCACATAGGAGAAGTTCTGTCCACTGTTCCCACAATC
GGTTTCAATGTGGAGAAAGTCCAGTACAAGAATGTGATGTTCACAGTTTGGGATGTTGGT
GGCCAAGAAAAGCTCAGGCCCTTGTGGAGGCATTACTTCAATAATACCGATGGACTTATA
TACGTGGTAGATTCCTTGGACCGTGAGAGAATTGGTAAAGCTAAGCGAGTTTCAGGAGAT
CATAAAAGACCCATTCATGCTTAATAGCGTCATTCTAGTGTTTGCAAACAAACAAGACAT
GAGAGGAGCCATGTCTCCCCGAGAAGTATGTGAAGGGCTTGGCTTATTAGATCTCAAGAA
CAGGAAATGGCATAGACAAAGCACATGTGCTCTTCAAGAGATGGCCTCTATGAAGCTTAG
ACTGGTTATCCTCTACGCTC

QA 5 684 5 684
DS 



AS 1 4

CO CL1800Contig1 1103 4 14 U
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ACTACAACAGCGAACCTTGTGCATATGTATTATTTCTTGCCAAGAATAATTCCTTAAAAC
TGTATACAAATGGTAAAAGCTTGTGAAAATAACTTGTTTGCTTGCTCTCCAGGAAATGAC
TATTATTACTTTGGTAAGAAGTTACCATAGGCTTGACAATGGCAATGAGAATATCCGGTA
GCTGCCCTCTCCAACTTTAGCTCAGGGCATTATAGATGTAAGAAATGATTCCAAGGACCA
CACAGAGAAGAATAATGTCGATGCAGAAGTTGCGGCTCGATCTCATCTTTACAAGCTGTT
GCTTGAGCCGAACATTGGTGTTCTTCAAATCCGAAGTTGCTCCATCAACCTTTGTTTCCA
TTTCATCCATCAATGGGACTTGCTTGTCAAGTTCCTCGTTCATGTCACGTGCTAAGTTCT
TCAGTGCATCCAAACCTTCTGATATAACATCAAGGCCCTCGTCCTGCTTCTTTTTTCTCA
TTTCATATTCTTGTCGAAACTGGCTGGATTCTTCAGTTTGCTGGAAAAACCCGTCATCCA
TGTCTTCCTCAGATATATCAAACTTGATGTTCTTGTTAGGGGCAGAAGCACCTCCCCATT
CATTATTAGATTGTCTTTCATGTCCGTCAGGTATCACTTGAATCCTATCGGCTAGCGCGA
TAACTAGATCACATCGGGACTCTCGTTCCTCTTTTGTGAGCCCTTTGACCTTTTTAACGG
CGAGTTTCTGCAGTTTAACAACATCTTCAGCTAAGCGAGCTTTTGTCCTTCGAACCTCAG
CATTCAAGGCCACAGCTGCAGCTCTGTTGCCCTCTGTTGATGCCAACTCCGCTTTATGTA
CAACCGATTCAATATCGGTATCAATGGAGTTGAAGAGACGGGAGAAGGCATCGTCTCCGG
AAGCGCCGAGCTCACGCTGCTTGTCGACGTCGTACTTGTCGTACTTCTTGCATATCTCAT
CGACTCTGAAGATAATATTTATGACCGTCATCTCTCCCTTACTCTTTTTCTTCTTCTTCT
ATAATGTCCCTGCTTATTTTTCC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AM12JQ U 5
AF RS1E050JQ U 1
AF RS1AM12TF C 300
AF RS1AT52TF C 411
BS 1 136 RS1E050JQ
BS 137 137 RS1AM12JQ
BS 138 283 RS1E050JQ
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BS 659 760 RS1E050JQ
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BS 871 871 RS1AT52TF
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BS 1062 1062 RS1AT52TF
BS 1063 1103 RS1AM12TF

RD RS1AM12JQ 714 0 0
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1BI95TF U 1
AF RS1CF57TF U 646
AF RS1BP02TF U 824
AF RS1BP02JQ C 1240
AF RS1CF57JQ C 1324
BS 1 687 RS1BI95TF
BS 688 688 RS1CF57TF
BS 689 735 RS1BI95TF
BS 736 961 RS1CF57TF
BS 962 962 RS1BP02TF
BS 963 1277 RS1CF57TF
BS 1278 1278 RS1BP02TF
BS 1279 1289 RS1CF57TF
BS 1290 1290 RS1BP02TF
BS 1291 1348 RS1CF57TF
BS 1349 1349 RS1BP02TF
BS 1350 1358 RS1CF57TF
BS 1359 1434 RS1BP02TF
BS 1435 1435 RS1BP02JQ
BS 1436 1483 RS1BP02TF
BS 1484 1591 RS1BP02JQ
BS 1592 1592 RS1CF57JQ
BS 1593 1997 RS1BP02JQ
BS 1998 2042 RS1CF57JQ

RD RS1BI95TF 735 0 0
GGGGCTTTCATTCTACCTCGGTGGACTTTATTATGGGAAGAACAAACTCCAAGTTAACAA
TGTTGCAAAAGCTGGATCTTCCTTGGACGTTGACAACTCTCCTCAAGTCAAATCCGTTTC
TTTCTCGGAGTGTAGCAGTGACTACCAAGATTACACTCCCTGCACAGATCCAAGGAAATG
GAAGAAGTATGGTACTCACAGGCTTACCTTCATGGAACGCCATTGTCCTCCTGTGTTTGA
TAGAAAGCAGTGTCTTGTTCCTCCTCCTAATGGGTATAAGCCACCGATAAGATGGCCTAA
GAGCAATAACGAATGTTGGTACAGGAATGTGCCATATGATTGGATCAACAAGCAGAAATC
TAACCAGCATTGGCTAAAGAAAGAGGGTGAGAAGTTTATTTTCCCTGGTGGAGGTACAAT
GTTTCCAAATGGAGTTAGCGCTTACGTCGATTTGATGCAAGATTTGATCCCTGAAATGAA
AGATGGGACTATAAGAACTGCCATTGACACTGATTGTGGGGTTGCAAGCTGGGGAGGAGA
CCTTTTGGACCGTGGTATCCTCACAGTGTCACTAGCACCAAGAGACAACCATGAAGCCCA
AGTCCAGTTTGCTCTAGAACGTGGAATTCCTGCGATTCTCGGCATCATTTCAACTCAACG
TCTCCCTTTCCCTTCAAACTCATTCGATATGGCTCATTGCTCAAGATGCCTTATTCCATG
GACTGAGTTTGGTGG

QA 1 735 1 735
DS 

RD RS1CF57TF 719 0 0
GATCTCG
ACTCAACGTCTCCCTTTCCCTTCAAACTCATTCGACATGGCTCATTGCTCAAGATGCCTT
ATTCCATGGACTGAGTTTGGTGGAGTTTATCTCCTGGAGGTACACCGTATCCTAAGACCC
GGTGGCTTCTGGGTCCTATCCGGTCCACCGGTCAACTGCGAGAACCGCTGGAAAGGATGG
GACACGACCGTGGAAGCGCAGAGAACAAACTACGAGAAGCTCCAGGATCTCTTAACCTCG
ATGTGCTTCAAAATGTACGCCAAGAAAGACGACATCGCGGTGTGGCAGAAATCTCCAGAC
AACAAGTGCTACGACAAGCTGTCTAACGACCCCGAAGCGTACCCTCTGAAATGCGACGAC
AGCCTCGAGCCGGACTCTGCTTGGTACACTCCCATACGCCCTTGCGTGGTGGTCCCCAGC
CCTAAGCTTAAGAAGACGGGTTTGGAGTCTACTCCTAAATGGCCTGGGAGGTTGCACTCG
ACACCCGAGAGGATCTCTGATGTCCCTGGAGGAAACGGTGGGTTGTTTAAGCGGGACGGT
AGCAAGTGGAAGACTAGGGCTAAGCATTACAAGAAGCTGTTGCCTGCTGTTGGGTCTGAC
AAGATAAGGAATGTGATGGATATGA*CACTGCTTACG*TGGTTTGGCTGCTGCTTTGGTC
GATGATCCTTTGTGGGTGATGAACGTTGTGTCGTCT*ACGCTGCGA
TACGCT

QA 8 713 8 713
DS 

RD RS1BP02TF 660 0 0
GTCCATGGACTGAGTTTG
GTGGAAGCGCAGAGAACAAACTACGAGAAGCTCCAGGATCTCTTAACCTCGATGTGCTTC
AAAATGTACGCCAAGAAAGACGACATCGCGGTGTGGCAGAAATCTCCAGACAACAAGTGC
CACGACAAGCTGTCTAACGACCCCGAAGCGTACCCTCTGAAATGCGACGACAGCCTCGAG
CCGGACTCTGCTTGGTACACTCCCATACGCCCTTGCGTGGTGGTCCCCAGCCCTAAGCTT
AAGAAGACGGGTTTGGAGTCTACTCCTAAATGGCCTGGGAGGTTGCACTCGACACCCGAG
AGGATCTCTGATGTCCCTGGAGGAAACGGTGGGTTGTTTAAGCGGGACGGTAGCAAGTGG
AAGACTAGGGCTAAGCATTACAAGAAGCTGTTGCCTGCTGTTGGGTCTTACAAGATAAGG
AATGTGATGGATATGAACACTGCTTACGGTGGTTTGGCTGCTGCTTTGGTCGATGATCCT
TTGTGGGTGATGAACGTTGTGTCGTCTTACGCTGCGAATACGCTTCCCGTTGTGTTTGAT
CGTGGATTGATTGGAACATATCACGACTGGTGTGAAGCTTTTTCGACGTATCCCAGAACT
TACGATCTTCTTCATGTTGATGGTCTGTTTACATCTGAGAAC

QA 19 660 19 660
DS 

RD RS1BP02JQ 758 0 0
TGTTGGGTCT*ACAAGATAAGGAATGTGATGGATATGAACACTGCTTACGGTGGTTTGGC
TGCTGCTTTGGTCGATGATCCTTTGTGGGTGATGAACGTTGTGTCGTCTTACGCTGCGAA
TACGCTTCCCGTTGTGTTTGATCGTGGATTGATTGGAACATATCACGACTGGTGTGAAGC
TTTTTCGACGTATCCAAGAACTTACGATCTTCTTCATGTTGATGGTCTGTTTACATCTGA
GAACCAAAGGTGTGATATGAAATATGTAATGTTGGAAATGGATAGGATCTTGCGTCCTAA
TGGGTATGCGATTATACGCGAGTCTAGCTATTTCGTGGAGAATATAGCATCGTTTGCTAA
AGGACTGAGATGGAGTTGCCGTAAGGAGAAAACAGAGTCTGAGTCCGAGAACGAGAAGCT
CTTGATTTGCCAGAAGAAGCTTTGGTATTCATCTAACGCAACGTCAGAAACAAAATAGTA
GAAGAAAAAAAAGCTTGAGCTTAAAGCTTTTGTCTTGTCCGGAGGTTTCTTGAGAACAAA
GTCACTACAACAAAGCATCGGTTCTTTGTATCGCTTTAAAGCCAAGAAAGCTTTTTAAAA
GCGGCTGCCAATTATTATTTTGTTATCCCAGCATATTTATCAACTTTTTCGATTTTTCTT
ATAGTATATGCTTGGTGAGATATATTATTGATCTTTTGTTTAAACTGTAATTTTAAATTG
TCGATTTCTCCAACGTTAGGTATATTGATTTGTGATAC

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1CF57JQ 719 0 0
GTGGGTGATGAACGTTGTGTCGTCTTACGCTGCGAATACGCTTCCCGTTGTGTTTGATCG
TGGATTGATTGGAACATATCACGACTGGTGTGAAGCTTTTTCGACGTATCCAAGAACTTA
CGATCTTCTTCATGTTGATGGTCTGTTTACATCTGAGAACCAAAGGTGTGATATGAAATA
TGTAATGTTGGAAATGGATAGGATCTTGCGTCCTAATGGGTATGCGATTATACGCGAGTC
TAGCTATTTCGTGGAGAATATAGCATCGGTTGCTAAAGGACTGAGATGGAGTTGCCGTAA
GGAGAAAACAGAGTCTGAGTCCGAGAACGAGAAGCTCTTGATTTGCCAGAAGAAGCTTTG
GTATTCATCTAACGCAACGTCAGAAACAAAATAGTAGAAGAAAAAAAAGCTTGAGCTTAA
AGCTTTTGTCTTGTCCGGAGGTTTCTTGAGAACAAAGTCACTACAACAAAGCATCGGTTC
TTTGTATCGCTTTAAAGCCAAGAAAGCTTTTTAAAAGCGGCTGCCAATTATTATTTTGTT
ATCCCAGCATATTTATCAACTTTTTCGATTTTTCTTATAGTATATGCTTGGTGAGATATA
TTATTGATCTTTTGTTTAAACTGTAATTTTAAATTGTCGATTTCTCCAACGTTAGGTATA
TTGATTTGTGATACAGTTGTATTGTTTTACACGTTAATGAGTTGGTGGTCCATTAATCC

QA 1 719 1 719
DS 



AS 2 5

CO CL1802Contig1 827 3 3 U
GGAGCGAAACCGTGGTTCGCTCCTTCGTCATCTTCGCTCCTCTTCAATCGGCGACGAGAC
TATACAGTTTCCGTAACGGTAGGCGTCAAGCTTTATTCGTCTTGAATTGTCTTAATTCGT
GAGCCCACTACGAGACCTTCCACTGGTCTGTTCGTCAGCGAATCAGTCCGGGTGGTGCTC
ATCGGTTGTCGAGGCCAGATTGATTCGATTCCGGGAGGCTCGGAAAGTTGTGGGGAGCTT
ACGTGGATGGATTTGCT***AGTGGATGTTAACAAAAGGACAGAGACCATAATCAAAAAG
AGAATCAGAAACTGAGTCTATACAAGCCTTGAGTCTAAAGACCTAAAACTCTACTCTGTT
TGGTGTTGGCTATCTGAGTCACCCTTTCTTATAGTTAAACGTATGATTGCTAAGAAGGCC
AGTTTCTGCATCCCAAGGAGACCCATCACCATCATTCCCTTACTTTCTTGAACTAAAATG
TTTCATGATATCTGATACTAGAGACTGTTGCAGATAGAATAAGCGGGCCTGTTTGAATGC
ACATAGTGGCTTGGATAGTCTCTGCCTTTGAGTTATCTTTCTTTCAGTGTCATTACTGTG
CTTCAGTGTCAATTTATATCGTCTGGGGATAGCTTCTAACTTTAACGTTCAGTCTCTTTA
TTTCCATTCACGTTCTTAGTAAGATCTTATTGTTTCTAATTAATGAGCTTCTTAGTGAGG
CTTTTCTGGTCTTTAAGCTACTAATGAATCTCATGTGTATTTGTGCTCCTAAAATTGGAT
GTATTCTTCTATTGAGTTTTTGTGAATCTATTTAAATGTTATTGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D478TF U 1
AF RS1CL43TF U 93
AF RS1D478JQ C 157
BS 1 713 RS1D478TF
BS 714 740 RS1CL43TF
BS 741 827 RS1D478JQ

RD RS1D478TF 713 0 0
GGAGCGAAACCGTGGTTCGCTCCTTCGTCATCTTCGCTCCTCTTCAATCGGCGACGAGAC
TATACAGTTTCCGTAACGGTAGGCGTCAAGCTTTATTCGTCTTGAATTGTCTTAATTCGT
GAGCCCACTACGAGACCTTCCACTGGTCTGTTCGTCAGCGAATCAGTCCGGGTGGTGCTC
ATCGGTTGTCGAGGCCAGATTGATTCGATTCCGGGAGGCTCGGAAAGTTGTGGGGAGCTT
ACGTGGATGGATTTGCT***AGTGGATGTTAACAAAAGGACAGAGACCATAATCAAAAAG
AGAATCAGAAACTGAGTCTATACAAGCCTTGAGTCTAAAGACCTAAAACTCTACTCTGTT
TGGTGTTGGCTATCTGAGTCACCCTTTCTTATAGTTAAACGTATGATTGCTAAGAAGGCC
AGTTTCTGCATCCCAAGGAGACCCATCACCATCATTCCCTTACTTTCTTGAACTAAAATG
TTTCATGATATCTGATACTAGAGACTGTTGCAGATAGAATAAGCGGGCCTGTTTGAATGC
ACATAGTGGCTTGGATAGTCTCTGCCTTTGAGTTATCTTTCTTTCAGTGTCATTACTGTG
CTTCAGTGTCAATTTATATCGTCTGGGGATAGCTTCTAACTTTAACGTTCAGTCTCTTTA
TTTCCATTCACGTTCTTAGTAAGATCTTATTGTTTCTAATTAATGAGCTTCTT

QA 1 713 1 713
DS 

RD RS1CL43TF 648 0 0
GG
ATTCGTCTTGAATTGTCTTAATTCGTGAGCCCACTACGAGACCTTCCACTGGTCTGTTCG
TCAGCGAATCAGTCCGGGTGGTGCTCATCGGTTGTCGAGGCCAGATTGATTCGATTCCGG
GAGGCTCGGAAAGTTGTGGGGAGCTTACGTGGATGGATTTGCTTATAGTGGATGTTAACA
AAAGGACAGAGACCATAATCAAAAAGAGAATCAGAAACTGAGTCTATACAAGCCTTGAGT
CTAAAGACCTAAAACTCTACTCTGTTTGGTGTTGGCTATCTGAGTCACCCTTTCTTATAG
TTAAACGTATGATTGCTAAGAAGGCCAGTTTCTGCATCCCAAGGAGACCCATCACCATCA
TTCCCTTACTTTCTTGAACTAAAATGTTTCATGATATCTGATACTAGAGACTGTTGCAGA
TAGAATAAGCGGGCCTGTTTGAATGCACATAGTGGCTTTGATAGTCTCTGCCTTTGAGTT
ATCTTTCTTTCAGTGTCATTACTGTGCTTCAGTGTCAATTTATATCGTCTGGGGATAGCT
TCTAACTTTAACGTTCAGTCTCTTTATTTCCATTCACGTTCTTAGTAAGATCTTATTGTT
TCTAATTAATGAGCTTCTTAGTGAGGCTTTTCTGGTCTTTAAGCTA

QA 3 648 3 648
DS 

RD RS1D478JQ 671 0 0
AG
CGAATCAGTCCGGGTGGTGCTCATCGGTTGTCGAGGCCAGATTGATTCGATTCCGGGAGG
CTCGGAAAGTTGTGGGGAGCTTACGTGGATGGATTTGCT***AGTGGATGTTAACAAAAG
GACAGAGACCATAATCAAAAAGAGAATCAGAAACTGAGTCTATACAAGCCTTGAGTCTAA
AGACCTAAAACTCTACTCTGTTTGGTGTTGGCTATCTGAGTCACCCTTTCTTATAGTTAA
ACGTATGATTGCTAAGAAGGCCAGTTTCTGCATCCCAAGGAGACCCATCACCATCATTCC
CTTACTTTCTTGAACTAAAATGTTTCATGATATCTGATACTAGAGACTGTTGCAGATAGA
ATAAGCGGGCCTGTTTGAATGCACATAGTGGCTTGGATAGTCTCTGCCTTTGAGTTATCT
TTCTTTCAGTGTCATTACTGTGCTTCAGTGTCAATTTATATCGTCTGGGGATAGCTTCTA
ACTTTAACGTTCAGTCTCTTTATTTCCATTCACGTTCTTAGTAAGATCTTATTGTTTCTA
ATTAATGAGCTTCTTAGTGAGGCTTTTCTGGTCTTTAAGCTACTAATGAATCTCATGTGT
ATTTGTGCTCCTAAAATTGGATGTATTCTTCTATTGAGTTTTTGTGAATCTATTTAAATG
TTATTGGCC

QA 3 671 3 671
DS 



CO CL1802Contig2 679 2 3 U
GCTAAGAACGTGAATGAAAATAAAGAGACTGAACGTTAAAGTTAGAAGCTATCCTCAGAC
GATATAAATTGACACTGAAGCACAGTAATGACACTGAAGGGAAGATAACTCAAAGGTAGA
GACTATCAAAACCACTATGTGCATTCAAACAGGCCCGCTTAATCTATCTGCAACAGTCTT
TAGTATCAGATATCATGAAACATTTTAGTTCAAGAAAGTAAGGGAATGATGGTGATGGGT
CTCCTTGGGATGCAGAAACTGGCCTTCTTATCAATCATACGTTTAACTATAAGAAAGGGT
GACTCAGATAGCCAACACCAAACAGAGTAGAGTTTTAGGTCTTTAGACTCAAGGCTTGTA
TAGACTCAGTTTCTGATTCTCTTCTTGATTATGGTCTCTGTCCTTTTGTTAACATCCACT
ATAAGCAAATCCATCCATGTAAGCTCCCCACAACTTTCCGAGCCTCCCGGAATCGAATCA
ATCTGGCCTCGGCAACCGATGAGCACCACCCGGACTGATTCGTTGATGAACAGACCAATG
GAAGGTCTCGTAGTGGGCTCACGAATTAAGACGATCCAAGACGAATAAAGCTCGACGCCT
ACCGTTACGGAAACTGTATCGTCTCGTCGGCGATCGAAGAGGAGTGAAGATGACGAAGGA
GCAAACCACGGTTTCGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DB42JQ U 42
AF RS1DB42TF C 1
BS 1 41 RS1DB42TF
BS 42 552 RS1DB42JQ
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GGGAATGATGGTGATGGGTCTCCTTGGGATGCAGAAACTGGCCTTCTTATCAATCATACG
TTTAACTATAAGAAAGGGTGACTCAGATAGCCAACACCAAACAGAGTAGAGTTTTAGGTC
TTTAGACTCAAGGCTTGTATAGACTCAGTTTCTGATTCTCTTCTTGATTATGGTCTCTGT
CCTTTTGTTAACATCCACTATAAGCAAATCCATCCATGTAAGCTCCCCACAACTTTCCGA
GCCTCCCGGAATCGAATCAATCTGGCCTCGGCAACCGATGAGCACCACCCGGACTGATTC
GTTGATGAACAGACCAATGGAAGGTCTCGTA

QA 1 511 1 511
DS 

RD RS1DB42TF 679 0 0
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GATATAAATTGACACTGAAGCACAGTAATGACACTGAAGGGAAGATAACTCAAAGGTAGA
GACTATCAAAACCACTATGTGCATTCAAACAGGCCCGCTTAATCTATCTGCAACAGTCTT
TAGTATCAGATATCATGAAACATTTTAGTTCAAGAAAGTAAGGGAATGATGGTGATGGGT
CTCCTTGGGATGCAGAAACTGGCCTTCTTATCAATCATACGTTTAACTATAAGAAAGGGT
GACTCAGATAGCCAACACCAAACAGAGTAGAGTTTTAGGTCTTTAGACTCAAGGCTTGTA
TAGACTCAGTTTCTGATTCTCTTCTTGATTATGGTCTCTGTCCTTTTGTTAACATCCACT
ATAAGCAAATCCATCCATGTAAGCTCCCCACAACTTTCCGAGCCTCCCGGAATCGAATCA
ATCTGGCCTCGGCAACCGATGAGCACCACCCGGACTGATTCGTTGATGAACAGACCAATG
GAAGGTCTCGTAGTGGGCTCACGAATTAAGACGATCCAAGACGAATAAAGCTCGACGCCT
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GCAAACCACGGTTTCGCCC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 5

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GCCTTCCTTTCGCAACTCGATAGTTCTCTTTCTCTCATGATCTATGATTGCAATCTTTGT
TGGTGTGTTCAAGTACACTCTATCAATCTCACCGTCAAAGGTAATTGCATCAGCCTGCTC
GGTGAATCTTTCTCTACGCATCAAGTTGTCCAGATAATCAAGCGTCTCTAGACCTTCAAC
CCTAACTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FB52TF C 1
AF RS1EL73TF C 1
AF RS1FB52JQ U 12
AF RS1EL73JQ U 58
AF RS1G724JQ U 155
BS 1 11 RS1EL73TF
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TGGTGTGTTCAAGTA

QA 1 555 1 555
DS 

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CTCTCTCTCAACTCATTATATCATAGTTTTGTTTGGGCATTATTATTGCTTTGTCCATCA
TGAAGACGATTAAATATACAAGACTGATGATGTTTTGTATATATTTATATAGAGTGTTTG
ATGAGTATATCAGTGATCCCCGTAAAGAACCTTACGTGGATCAAGCTGACCACTGCAGTA
GCTTGATGAGACGATAGAAAGTTCCTGCCTGCCTCTCCACTCCTCACATGGTTTCAACAA
GATTGGAGTTTCTATTGCGCCAGAGTCTACGCATAGCATTGTTGTGTAGTCCTCATCTCC
CATATCAGCAATACTCTTTGCCTTCTTGTCCCATGGGTTCCACACAACTGCATTTGGCAT
GCCTTCCTTTCGCAACTCGATAGTTCTCTTTCTCTCATGATCTATGATTGCAATCTTTGT
TGGTGTGTTCAAGTACACTCTATCAATCTCACCGTCAAAGGTAATTGCATCAGCCTGCTC
GGTGAATCTTTC
C

QA 1 612 1 612
DS 

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CGATAGAAAGTTCCTGCCTGCCTCTCCACTCCTCACATGGTTTCAACAAGATTGGAGTTT
CTATTGCGCCAGAGTCTACGCATAGCATTGTTGTGTAGTCCTCATCTCCCATATCAGCAA
TACTCTTTGCCTTCTTGTCCCATGGGTTCCACACAACTGCATTTGGCATGCCTTCCTTTC
GCAACTCGATAGTTCTCTTTCTCTCATGATCTATGATTGCAATCTTTGTTGGTGTGTTCA
AGTACACTCTATCAATCTCACCGTCAAAGGTAATTGCATCAGCCTGCTCGGTGAATCTTT
C
C

QA 1 601 1 601
DS 

RD RS1EL73JQ 556 0 0
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TCATGAAGACGATTAAATATACAAGACTGATGATGTTTTGTATATATTTATATAGAGTGT
TTGATGAGTATATCAGTGATCCCCGTAAAGAACCTTACGTGGATCAAGCTGACCACTGCA
GTAGCTTGATGAGACGATAGAAAGTTCCTGCCTGCCTCTCCACTCCTCACATGGTTTCAA
CAAGATTGGAGTTTCTATTGCGCCAGAGTCTACGCATAGCATTGTTGTGTAGTCCTCATC
TCCCATATCAGCAATACTCTTTGCCTTCTTGTCCCATGGGTTCCACACAACTGCATTTGG
CATGCCTTCCTTTCGCAACTCGATAGTTCTCTTTCTCTCATGATCTATGATTGCAATCTT
TGTGGGTGTGTTCAAGTACACTCTATCAATCTCACCGTCAAAGGTAATTGCATCAGCCTG
CTCGGTGAATCTTTC
C

QA 1 555 1 555
DS 

RD RS1G724JQ 514 0 0
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TTGTATATATTTATATAGAGTGTTTGATGAGTATATCAGTGATCCCCGTAAAGAACCTTA
CGTGGATCAAGCTGACCACTGCAGTAGCTTGATGAGACGATAGAAAGTTCCTGCCTGCCT
CTCCACTCCTCACATGGTTTCAACAAGATTGGAGTTTCTATTGCGCCAGAGTCTACGCAT
AGCATTGTTGTGTAGTCCTCATCTCCCATATCAGCAATACTCTTTGCCTTCTTGTCCCAT
GGGTTCCACACAACTGCATTTGGCATGCCTTCCTTTCGCAACTCGATAGTTCTCTTTCTC
TCATGATCTATGATTGCAATCTTTGTCGGTGTGTTCAAGTACACTCTATCAATCTCACCG
TCAAAGGTAATTGCATCAGCCTGCTCGGTGAATCTTTCTCTACGCATCAAGTTGTCCAGA
TAATCAAGCGTCTCTAGACCTTCAACCCTAACTT

QA 1 514 1 514
DS 



AS 1 4

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GGACCTTCCTGCTGTTGTTGAGTCTTTTAAAACTTATGATGACTCTGCACTTGTCAAAAC
TGCTGACATTGGCCAGATGATCATGGTTAGGGAGCAGGGTGATCCTGCGCCTAATACAGT
TGAGTACAGACATGGTCTAACTCCTCCTATGAAGGATGCTCGTAAGAGAAGATTTCGTCG
AGAGCCTGATCTTAATCCGGAGCTTGTACAGCGCGTTGAGAGGGACTTGCTCAACATCTT
GAGTGGCAGAACTGTCGAAAACGGAAATGAGCAGCAAGAGGAGACAGTTGCGGAGGAGAA
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AGAAGCTCCTGAGGCAGGGACTAATAATAACAATCATAATACTCCAGCAGAAGTTGAGCA
GGAGAGAAGTGAATCAGAAGATTCTGATGATTCTATGTGAAAGGTTGGTTATTGTATGTG
ACGTTTGAAGAAATGAATGCAGCTATGTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C219TF U 1
AF RS1B057TF U 5
AF RS1G859TF U 5
AF RS1B057JQ C 563
BS 1 218 RS1C219TF
BS 219 219 RS1B057TF
BS 220 222 RS1C219TF
BS 223 223 RS1B057TF
BS 224 469 RS1C219TF
BS 470 470 RS1B057TF
BS 471 657 RS1C219TF
BS 658 753 RS1B057JQ

RD RS1C219TF 657 0 0
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AAAGATGGAGGAACAGTTCATACTTAGGGTTCCACAGTCTGTTTCAGAGCGAATCGATCG
CCTTTTGAGCGACGAGGCTTCTTCTACTTCCGACGAGATCCCTTTAGATTTGTGCTTTTC
AGAGGATGGGAGAAGCGGGACGTTTGTAATTGGAAACGGAGATTTCCCGGCTTCTCTGCT
GGACCTTCCTGCTGTTGTTGAGTCTTTTAAAACTTATGATGACTCTGCACTTGTCAAAAC
TGCTGACATTGGCCAGATGATCATGGTTAGGGAGCAGGGTGATCCTGCGCCTAATACAGT
TGAGTACAGACATGGTCTAACTCCTCCTATGAAGGATGCTCGTAAGAGAAGATTTCGTCG
AGAGCCTGATCTTAATCCGGAGCTTGTACAGCGCGTTGAGAGGGACTTGTTCAACATCTT
GAGTGGCAGAACTGTCGAAAACGGAAATGAGCAGCAAGAGGAGACAGTTGCGGAGGAGAA
TACAAATAAGAAAGTCTCTTCTACTTCTTCACCTGCTGCTACACCTGTTGAAAAGCCTGA
AGAAGCTCCTGAGGCAGGGACTAATAATAACAATCATAATACTCCAGCAGAAGTTGA

QA 1 657 1 657
DS 

RD RS1B057TF 653 0 0
G
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TGGAGGAACAGTTCATACTTAGGGTTCCACAGTCTGTTTCAGAGCGAATCGATCGCCTTT
TGAGCGACGAGGCTTCTTCTACTTCCGACGAGATCCCTTTAGATTTGTGCTTTTCAGAGG
ATGGGAGAAGCGGGACGTTTGTAATTGGAAACGAAGAGTTCCCGGCTTCTCTGCTGGACC
TTCCTGCTGTTGTTGAGTCTTTTAAAACTTATGATGACTCTGCACTTGTCAAAACTGCTG
ACATTGGCCAGATGATCATGGTTAGGGAGCAGGGTGATCCTGCGCCTAATACAGTTGAGT
ACAGACATGGTCTAACTCCTCCTATGAAGGATGCTCGTAAGAGAAGATTTCGTCGAGAGC
CTGATCTTAATCCGGAGCTTGTACAGCGCGTTGAGAGGGACTTGCTCAACATCTTGAGTG
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ATAAGAAAGTCTCTTCTACTTCTTCACCTGCTGCTACACCTGTTGAAAAGCCTGAAGAAG
CTCCTGAGGCAGG*ACTAATAATAACAATCATAATACTCCAGCAGAAGTTGA

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DS 

RD RS1G859TF 608 0 0
G
GGGTTCAATAGATTCTTTCTCTTGTCTTGTCTCTTCAAAGCCACGCCCCGTTGGTAAAGA
TGGAGGAACAGTTCATACTTAGGGTTCCACAGTCTGTTTCAGAGCGAATCGATCGCCTTT
TGAGCGACGAGGCTTCTTCTACTTCCGACGAGATCCCTTTAGATTTGTGCTTTTCAGAGG
ATGGGAGAAGCGGGACGTTTGTAATTGGAAACGAAGAGTTCCCGGCTTCTCTGCTGGACC
TTCCTGCTGTTGTTGAGTCTTTTAAAACTTATGATGACTCTGCACTTGTCAAAACTGCTG
ACATTGGCCAGATGATCATGGTTAGGGAGCAGGGTGATCCTGCGCCTAATACAGTTGAGT
ACAGACATGGTCTAACTCCTCCTATGAAGGATGCTCGTAAGAGAAGATTTCGTCGAGAGC
CTGATCTTAATCCGGAGCTTGTACAGCGCGTTGAGAGGGACTTGCTCAACATCTTGAGTG
GCAGAACTGTCGAAAACGGAAATGAGCAGCAAGAGGAGACAGTTGCGGAGGAGAATACAA
ATAAGAAAGTCTCTTCTACTTCTTCACCTGCTGCTACACCTGTTGAAAAGCCTGAAGAAG
CTCCTGA

QA 2 608 2 608
DS 

RD RS1B057JQ 191 0 0
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AATAATAACAATCATAATACTCCAGCAGAAGTTGAGCAGGAGAGAAGTGAATCAGAAGAT
TCTGATGATTCTATGTGAAAGGTTGGTTATTGTATGTGACGTTTGAAGAAATGAATGCAG
CTATGTTTACC

QA 1 191 1 191
DS 



AS 1 5

CO CL1805Contig1 815 5 14 U
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CTTTTGAGAAAATTGATTCACATCGACGATCGTCGTGATTAGCTTAAAATTTGGTCCATC
CATCCGTAGTTCGA****GACACCATGCCGAAGAACAAGGGAAAAGGAGGAAAGAACAGG
AAGAGAGGAAAGAACGAAGCTGATGACGAGAAGCGTGAGCTTATCTTTAAAGAAGATGGC
CAAGAGTACGCTCAAGTCCTCCGCATGCTCGGCAATGGCCGATGCGAAGCCATGTGCATT
GACGGAACCAAACGTCTCTGCCATATCCGTGGTAAGATGCACAAGAAGGTCTGGATCGCA
GCCGGTGACATCGTCCTTGTTGGCCTGAGGGACTACCAAGATGACAAAGCTGACGTCATC
CTCAAGTACATGTCTGATGAGGCCAGGCTTCTCAAGGCCTATGGTGAGCTTCCTGAGAAT
ACCCGTCTTAATGAAGGCATTGTTGGTGATCTTGATGAAGATGATGATAATAATGTTGAT
GATTACGTTGAGTTTGAGGACGAGGATATTGATAGGATCTAAGTTGGCCTTGTAATATCA
AAGTTGGATGATGCAACATCTTCTGAGAAAACCCAAGATTTGGTGATATGTTAAAATAAA
GAAAATTGTTATGTGTTGTATCTCTATTACTGTCATTTGATTCCCCCAAATAATTTACAG
CATGTTCTTTATTTCCCGTTTTGCAGCTTGTTAGTGCGGTTTTGCCTTTCTTTGTAGGTA
TCTTTTATCTTTACCCTATTATGCATTCTCTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DJ62TF U 1
AF RS1DJ20TF U 4
AF RS1GM58TF U 4
AF RS1DJ62JQ C 1
AF RS1GM58JQ C 127
BS 1 5 RS1DJ62JQ
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RD RS1DJ62TF 660 0 0
GAACC
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GGATGATGCAACATCTTCTGAGAAAACCCAAGATTTGGTGATATGTTAAA
ATAAA

QA 6 655 6 655
DS 

RD RS1DJ20TF 720 0 0
GG
AGATCAACACGCAGCTACACGAAACTCAAATTCCTATAAAAAGAAAGAGAGAGAGCTTTT
GAGAAAATTGATTCACATCGACGATCGTCGTGATTAGCTTAAAATTTGGTCCATCCATCC
GTAGTTCGATACAGACACCATGCCGAAGAACAAGGGAAAAGGAGGAAAGAACAGGAAGAG
AGGAAAGAACGAAGCTGATGACGAGAAGCGTGAGCTTATCTTTAAAGAAGATGGCCAAGA
GTACGCTCAAGTCCTCCGCATGCTCGGCAATGGCCGATGCGAAGCCATGTGCATTGACGG
AACCAAACGTCTCTGCCATATCCGTGGTAAGATGCACAAGAAGGTCTGGATCGCAGCCGG
TGACATCGTCCTTGTTGGCCTGAGGGACTACCAAGATGACAAAGCTGACGTCATCCTCAA
GTACATGTCTGATGAGGCCAGGCTTCTCAAGGCCTATGGTGAGCTTCCTGAGAATACCCG
TCTTAATGAAGGCATTGTTGGTGATCTTGATGAAGATGATGATAATAATGTTGATGATTA
CGTTGAGTTTGAGGACGAGGATATTGATAGGATCTAAGTTGGCCTTGTAATATCAAAGTT
GGATGATGCAACATCTTCTGAGGAAACCCAAGATTTGGTGATATGTTAAA*TAAAGAAAA
TTGTTATGTGTTGTATCTCTATTACTGTCATTTGATTCCCC
AAATATTTACAGCATGT

QA 3 703 3 703
DS 

RD RS1GM58TF 699 0 0
GG
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GAGAAAATTGATTCACATCGACGATCGTCGTGATTAGCTTAAAATTTGGTCCATCCATCC
GTAGTTCGATACAGACACCATGCCGAAGAACAAGGGAAAAGGAGGAAAGAACAGGAAGAG
AGGAAAGAACGAAGCTGATGACGAGAAGCGTGAGCTTATCTTTAAAGAAGATGGCCAAGA
GTACGCTCAAGTCCTCCGCATGCTCGGCAATGGCCGATGCGAAGCCATGTGCATTGACGG
AACCAAACGTCTCTGCCATATCCGTGGTAAGATGCACAAGAAGGTCTGGATCGCAGCCGG
TGACATCGTCCTTGTTGGCCTGAGGGACTACCAAGATGACAAAGCTGACGTCATCCTCAA
GTACATGTCTGATGAGGCCAGGCTTCTCAAGGCCTATGGTGAGCTTCCTGAGAATACCCG
TCTTAATGAAGGCATTGTTGGTGATCTTGATGAAGATGATGATAATAATGTTGATGATTA
CGTTGAGTTTGAGGACGAGGATATTGATAGGATCTAAGTTGGCCTTGTAATATCAAAGTT
GGATGATGCAACATCTTCTGGGAAAACCCAAGATTTGGTGATATGTTAAA*TAAAGAAAA
TTGTTATGTGTTGTATCTCTATTACTGTCATTTGATT

QA 3 699 3 699
DS 

RD RS1DJ62JQ 730 0 0
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CTTTTGAGAAAATTGATTCACATCGACGATCGTCGTGATTAGCTTAAAATTTGGTCCATC
CATCCGTAGTTCGA******CACCATGCCGAAGAACAAGGGAAAAGGAGAAAAGAACAGG
AAGAGAGGAAAGAACGAAGCTGATGACGAGAAGCATGAGCTTATCTTTAAAGAAGATGGC
CAAGAGTACGCTCAAGTCCTCCGCATGCTCGGCAATGGCCGATGCGAAGCCATGTGCATT
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GCCGGTGACATCGTCCTTGTTGGCCTGAGGGACTACCAAGATGACAAAGCTGACGTCATC
CTCAAGTACATGTCTGATGAGGCCAGGCTTCTCAAGGCCTATGGTGAGCTTCCTGAGAAT
ACCCGTCTTAATGAAGGCATTGTTGGTGATCTTGATGAAGATGATGATAATAATGTTGAT
GATTACGTTGAGTTTGAGGACGAGGATATTGATAGGATCTAAGTTGGCCTTGTAATATCA
AAGTTGGATGATGCAACATCTTCTGAGAAAACCCAAGATTTGGTGATATGTTAAAATAAA
GAAAATTGTTATGTGTTGTATCTCTATTACTGTCATTTGATTCCCCCAAATAATTTACTG
CATGTTCTTT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RS1GM58JQ 689 0 0
TAGTTCGATACA
GACACCATGCCGAAGAACAAGGGAAAAGGAGGAAAGAACAGGAAGAGAGGAAAGAACGAA
GCTGATGACGAGAAGCGTGAGCTTATCTTTAAAGAAGATGGCCAAGAGTACGCTCAAGTC
CTCCGCATGCTCGGCAATGGCCGATGCGAAGCCATGTGCATTGACGGAACCAAACGTTTC
TGCCATATCCGTGGTAAGATGCACAAGAAGGTCTGGATCGCAGCCGGTGACATCGTCCTT
GTTGGCCTGAGGGACTACCAAGATGACAAAGCTGACGTCATCCTCAAGTACATGTCTGAT
GAGGCCAGGCTTCTCAAGGCCTATGGTGAGCTTCCTGAGAATACCCGTCTTAATGAAGGC
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GACGAGGATATTGATAGGATTTAAGTTGGCCTTGTAATATCAAAGTTGGATGATGCAACA
TCTTCTGGGAAAACCCAAGATTTGGTGATATGTTAAAATAAAGAAAATTGTTATGTGTTG
TATCTCTATTACTGTCATTTGATTCCCCCAAATAATTTACAGCATGTTCTTTATTTCCCG
TTTTGCAGCTTGTTAGTGCGGTTTTGCCTTTCTTTGTAGGTATCTTTTATCTTTACCCTA
TTATGCATTCTCTTGTC

QA 13 689 13 689
DS 



AS 1 4

CO CL1806Contig1 1045 4 10 U
GGGACATTTGTCCCCCGGAAAATTCTCAGCTTCTACTTCCTATTGATGGCAAACATTCCC
ATAACCATTCCTTCTCTTTTTTCTTCTTTCTTTGAGTTTCAGTTTTCTCTCTCTTGTTAG
TTCTTTTTTTTTTTTTAAACTTATCTCTTGTTAGTTCTTGGTAAAAGAAAAGAAATGAAT
TTTATTATTGAACAAGATGATTCTACATGGAAGCTATGCCGATGTTTCTTGCTGACACCA
ACAAACATACAAACAGAGACAGAACCTTTTTAGTTTCAAAAAGCTGCATTTTCTTCGTTT
ATTAAAATGTCTAATCTTTCAGCACGAACAGGACGAGACCGTCAACGTTATGACAACAAC
TTCCGTCTTGTTTCTGGATGCATTCCGTATAGAGTGGTGGAAGATGAAGAGGACTCGAGT
GTTGACTTTCAAAACAAGCTTCAAGTTCTCATGGTTTCATCTCCTAACCGACACGATCTT
GTCTTCCCCAAGGGAGGATGGGAAGACGATGAAACCGTTCTTGAAGCTGCTTCTCGTGAG
GCCATGGAAGAAGCAGGAGTCAAAGGAATACTAAGAGAAGATCCATTAGGAGTTTGGGAG
TTTAGAAGCAAGAGTAGCAGTGTGGAACCTGACTGCATCTTTGGTGGATGCAAAGGCTAT
ATGTTTGCGTTAGAGGTGACTGAAGAGCTTGCCACATGGCCAGAGCACGAAAACCGCGAG
AGGAAATGGCTGAATGTTAAAGAAGCTTTGGAACTGTGTCGGTATGAGTGGATGCAGTGT
GCTCTCGAAGAGTTCCTAAGAGTCATGGCAGAAGATGGAAGGACAAAAGAAGAGACTCTT
GCGGCTTCAAGCATTTCAAATCGAGAAGAGCGTCAGATCGGTTCATCGGTCCTGCTTTGT
AGTTAAATTTAGTTTTGGTTTCTGTTAGGCAACGTCATCAAACTTCTTCAATTGTTATAT
ATTTTCTTGATTGTTGAAAAGCTTTCTTTTGTTAAACAAAGTTAAAGACATGAGAAAGCT
AATGAATTAAGACTCAGTTTGTTTC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1H286TF U 2
AF RS1FJ05TF U 1
AF RS1AX01JQ C 278
AF RS1H286JQB C 555
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RD RS1H286TF 660 0 0
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TCTTTTTTTTTTTTTAAACTTATCTCTTGTTAGTTCTTGGTAAAAGAAAAGAAATGAATT
TTATTATTGAACAAGATGATTCTACATGGAAGCTATGCTGATGTTTCTTGCTGACACCAA
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QA 1 660 1 660
DS 

RD RS1FJ05TF 785 0 0
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ATAACCATTCCTTCTCTTTTTTCTTCTTTCTTTGAGTTTCAGTTTTCTCTCTCTTGTTAG
TTCTTTTTTTTTTTTTAAACTTATCTCTTGTTAGTTCTTGGTAAAAGAAAAGAAATGAAT
TTTATTATTGAACAAGATGATTCTACATGGAAGCTATGCCGATGTTTCTTGCTGACACCA
ACAAACATACAAACAGAGACAGAACCTTTTTAGTTTCAAAAAGCTGCATTTTCTTCGTTT
ATTAAAATGTCTAATCTTTCAGCACGAACAGGACGAGACCGTCAACGTTATGACAACAAC
TTCCGTCTTGTTTCTGGATGCATTCCGTATAGAGTGGTGGAAGATGAAGAGGACTCGAGT
GTTGACTTTCAAAACAAGCTTCAAGTTCTCATGGTTTCATCTCCTAACCGACACGATCTT
GTCTTCCCCAAGGGAGGATGGGAAGACGATGAAACCGCTCTTGAAGCTGCTTCTCGTGAG
GCCATGGAAGAAGCAGGAGTCAAAGGAATACTAAGAGAAGATCCATTAGGAGTTTGGGAG
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GCTCT

QA 1 785 1 785
DS 

RD RS1AX01JQ 768 0 0
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ACCGTCAACGTTATGACAACAACTTCCGTCTTGTTTCTGGATGCATTCCGTATAGAGTGG
TGGAAGATGAAGAGGACTCGAGTGTTGACTTTCAAAACAAGCTTCAAGTTCTCATGGTTT
CATCTCCTAACCGACACGATCTTGTCTTCCCCAAGGGAGGATGGGAAGACGATGAAACCG
TTCTTGAAGCTGCTTCTCGTGAGGCCATGGAAGAAGCAGGAGTCAAAGGAATACTAAGAG
AAGATCCATTAGGAGTTTGGGAGTTTAGAAGCAAGAGTAGCAGTGTGGAACCTGACTGCA
TCTTTGGTGGATGCAAAGGCTATATGTTTGCGTTAGAGGTGACTGAAGAGCTTGCCACAT
GGCCAGAGCATGAAAACCGCGAGAGGAAATGGCTGAATGTTAAAGAAGCTTTGGAACTGT
GTCGGTATGAGTGGATGCAGTGTGCTCTCGAAGAGTTCCTAAGAGTCATGGCAGAAGATG
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AAAGTTAAAGACATGAGAAAGCTAATGAATTAAGACTCAGTTTGTTTC

QA 1 768 1 768
DS 

RD RS1H286JQB 481 0 0
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TAGCAGTGTGGAACCTGACTGCATCTTTGGTGGATGCAAAGGCTATATGTTTGCGTTAGA
GGTGACTGAAGAGCTTGCCACATGGCCAGAGCACGAAAACCGCGAGAGGAAATGGCTGAA
TGTTAAAGAAGCT**GGAACTGTGTCGGTATGAGTGGATGCAGTGTGCTCTCGAAGAGTT
CCTAAGAGTCATGGCAGAAGATGGAAGGACAAAAGAAGAGACTCTTGCGGCTTCAAGCAT
TTCAAATCGAGAAGAGCGTCAGATCGGTTCATCGGTCCTGCTTTGTAGTTAAATTTAGTT
TTGGTTTCTGTTAGGCAACGTCATCAAACTTCTTCAATTGTTATATATTTTCTTGATTGT
TGAAAAGCTTTCTTTTGTTAAACAAAGTTAAAGACATGAGAAAGCTAATGAATTAAGAC
AC

QA 1 479 1 479
DS 



AS 1 5

CO CL1807Contig1 1051 5 13 U
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CTAATCGTAGATCCACCGGAATCATAGTATCAATGTCGACTCCCGCAACCGCCGGCAGAG
GATCGATCACTCACGTGATCTTCGACATGGACGGTCTTCTTCTCGACACGGAGAAGTTCT
ACACGGAGGTACAGGAGATCATACTTGCTAGATTCAACAAGACTTTTGACTGGTCTCTCA
AGGCTAAGATGATGGGAAGAAAAGCCATTGAAGCTGCCAGGATCTTTGTTGACGAAAGCG
GGATTAGTGATTCTCTTTCAGCTGAGGACTTCCTTGTCGAGAGAGAGGCCATGCTTCAAG
AACTCTTCCCTACTAGTGAGCTTATGCCAGGGGCTAGCAGGCTCATCAAGCATCTCCATG
CTAACAACATTCCAATATGTATTGCTACGGGAACTCACACACGTCACTTTGATCTAAAAA
CTCAAAGACACAAAGAGTTGTTCTCACTGATGCATCACGTAGTTCGCGGTGATGATCCTG
AGGTGAAGCAAGGAAAGCCTGCCCCTGACGGCTTTCTTGCTGCATCCAGGAGATTTAAGG
ATGGTCCTGTTGACCCACAAAAGGTTCTGGTATTTGAAGATGCTCCATCCGGAGTTCTTG
CTGCTAAAAACGCCGGAATGAACGTGGTGATGGTGCCAGATCCTAGACCAGATATATCTC
ACCAAGACGTTGCAGATCAAATCATGACTTCTCTACTCGATTTCAAACCAGAGGAATGGG
GTTTGCCTCCATTTGAGGATTCAAACTAAAGCTTCTTCGGGGTAATAATAAGAAGACAGA
ATCATGAATCGTTGAGAGAGCGTGATTGTTTGTCTTTTTGTTATATTTGTTTTTTTGGCA
CTTACATGACAAGGCCATGAGGTTTTATGTCGTCAAGGGTATTATGATGTTTTGGCTACT
GAAGCCATAAAAAAAAAACAGAAACTAAGTTTGTGACGTGACAAGAGACCAAACAAACAA
CTGCCTTGGCGTTTAAACAAAGAGATTGTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1GD22TF U 1
AF RS1A558TF U 144
AF RS1GD22JQ C 340
AF RS1FC47JQ C 479
AF RS1FC47TF U 479
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BS 709 709 RS1FC47TF
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BS 728 773 RS1A558TF
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RD RS1GD22TF 618 0 0
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CTAATCGTAGATCCACCGGAATCATAGTATCAATGTCGACTCCCGCAACCGCCGGCAGAG
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ACACGGAGGTACAGGAGATCATACTTGCTAGATTCAACAAGACTTTTGACTGGTCTCTCA
AGGCTAAGATGATGGGAAGAAAAGCCATTGAAGCTGCCAGGATCTTTGTTGACGAAAGCG
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AACTCTTCCCTACTAGTGAGCTTATGCCAGGGGCTAGCAGGCTCATCAAGCATCTCCATG
CTAACAACATTCCAATATGTATTGCTACGGGAACTCACACACGTCACTTTGATCTAAAAA
CTCAAAGACACAAAGAGTTGTTCTCACTGATGCATCACGTAGTTCGCGGTGATGATCCTG
AGGTGAAGCAAGGAAAGCCTGCCCCTGACGGCTTTCTTGCTGCATCCAGGAGATTTAAAG
ATGGTCCTGTTGACCCAC

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DS 

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CTTGCTAGATTCAACAAGACTTTTGACTGGTCTCTCAAGGCTAAGATGATGGGAAGAAAA
GCCATTGAAGCTGCCAGGATCTTTGTTGACGAAAGCGGGATTAGTGATTCTCTTTCAGCT
GAGGACTTCCTTGTCGAGAGAGAGGCCATGCTTCAAGAACTCTTCCCTACTAGTGAGCTT
ATGCCAGGGGCTAGCAGGCTCATCAAGCATCTCCATGCTAACAACATTCCAATATGTATT
GCTACGGGAACTCACACACGTCACTTTGATCTAAAAACTCAAAGACACAAAGAGTTGTTC
TCACTGATGCATCACGTAGTTCGCGGTGATGATCCTGAGGTGAAGCAAGGAAAGCCTGCC
CCTGACGGCTTTCTTGCTGCATCCAGGAGATTTAAGGATGGTCCTGTTGACCCACAAAAG
GTTTTGGTATTTGAAGATGCTCCATCCGGAGTTCTTGCTGCTAAAAACGCCGGAATGAAC
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ATGACTTCTCTACTCGATTTCAAACCAGAG

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DS 

RD RS1GD22JQ 712 0 0
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GGCTCATCAAGCATCTCCATGCTAACAACATTCCAATATGTATTGCTACGGGAACTCACA
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ATGCTCCATCCGGAGTTCTTGCTGCTAAAAACGCCGGAATGAACGTGGTGATGGTGCCAG
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ATTTCAAACCAGAGGAATGGGGGTTGCCTCCATTTGAGGATTCAAACTAAAGCTTCTTCG
AGGTAATGATAAGAGGACAGAATCATGAATCGTTGAGAGAGCGTGATTGTTTGTCTTTTT
GTTATATTTGTTTTTTTGGCACTTACATGACAAGGCCATGAGGTTTTATGTCGTCAAGGG
TATTATGATGTTTTGGCTATTGAAGCCATAAAAAAAAA*CAGAAACTAAGTTTGTGACGT
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G
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DS 

RD RS1FC47TF 573 0 0
G
ACTCAAAGACACAAAGAGTTGTTCTCACTGATGCATCACGTAGTTCGCGGTGATGATCCT
GAGGTGAAGCAAGGAAAGCCTGCCCCTGACGGCTTTCTCGCTGCATCCAGGAGATTTAAG
GATGGTCCTGTTGACCCACAAAAGGTTCTGGTATTTGAAGATGCTCCATCCGGAGTTCTT
GCTGCTAAAAACGCCGGAATGAACGTGGTGATGGTGCCAGATCCTAGACCGGATATCTCT
CACCAAGACGTTGCAGATCAAATCATGACTTCTTTACTCGATTTCAAACCAGAGGAATGG
GGTTTGCCTCCATTTGAGGATTCAAACTAAAGCTTCTTCGGGGTAATAATAAGAAGACAG
AATCATGAATCGTTGAGAGAGCGTGATTGTTTGTCTTTTTGTTATATTTGTTTTTTTGGC
ACTTACATGACAAGGCCATGAGGTTTTATGTCGTCAAGGGTATTATGATGTTTTGGCTAC
TGAAGCCATAAAAAAAAAACAGAAACTAAGTTTGTGACGTGACAAGAGACCAAACAAACA
ACTGCCTTGGCGTTTAAACAAAGAGATTGTAC

QA 2 573 2 573
DS 



AS 1 4

CO CL1808Contig1 973 4 15 U
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GAGATTCCGCGGCAATTATATCAGATAGATGCCAAATCGAAAAAACTAAAATCAGGAGAA
GGAGAGAGAGAGATCTTCGATGGCGGATTCGAACGCAGAGAGGCCGCTTCGAAAAATCTC
AACCGCGTTCAAAGAACTAGCAGCCACCGTGAGTTCGCCGAGTCCTCAAGTCCCCGTGGC
GCAGTTCTCACACGCTTGCTCCCTCGTCTCGCCTCTCTTTGGCTGCCTCGGGATCGCCTT
CAAGTTCGCAGAGATGGACTACGTCGCCAAGGTTGATGATCTGGCAAAGGCGTCGAGTTC
GGTATCGACATTAGTAGTAATGGTGGACAAAGATATTGAGGCAAACTGTGTAAGGAAAGC
TGGTAGTCATACTAGAAACCTCTTGAGGGTAAAGCGTGGTCTTGACATGGTGAAGGCTCT
TTTTGAAGAGATTATAGCTTCCGAAGGTAATAATTCTTTAAAGGATCCAGCATCTAAGTC
TTATGCTCAAGTGTTTGCTCCACACCATGGATGGGCTATACGCAAAGCTGTTGCTTTAGG
AATGTACGCTCTTCCCACTAGATCTCAGCTACTTTCCATGCTCAATGAGGAAGAAGCGGA
GGCTAAGATAGAGATGCAAAGCTATGTAAATGCATCAGCACCAGTAATCGCGTATGTTGA
TAATCTATTCCACTCCAAGCAACTCGGTATCGATTGGTGAAGAACCTTGAAGAGTTTTTT
ATTAACGATCTTTGACAAGTCTGTATCACACCAAATAACCAATACGGTTCTATCAACTCA
TGTAATGACTTCACAAGGACCAAACCAGAGCTATCTAAAAATTAAAACCACTATGAATAA
GTTTATGCTATCTCTAGTTTGCGGATCTGTGTAATGTGTTGATGTGTAAAATATCATCAT
AAATACGGAAGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C538TF U 1
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AF RS1CG26JQ C 229
AF RS1C538JQ C 228
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RD RS1C538TF 760 0 0
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GAGATTCCGCGGCAATTATATCAGATAGATGCCAAATCGAAAAAACTGAAATCAGGAGAA
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GCAGTTCTCACACGCTTGCTCCCTCGTCTCGCCTCTCTTTGGCTGCCTCGGGATCGCCTT
CAAGTTCGCAGAGATGGACTACGTCGCCAAGGTTGATGATCTGGCAAAGGCGTCGAGTTC
GGTATCGACATTAGTAGTAATGGTGGACAAAGATATTGAGGCAAACTGTGTAAGTAAAGC
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QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1A424TF 772 0 0
GG
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CAAACTGTGTAAGGAAAGCTGGTAGTCATACTAGAAACCTCTTGAGGGTAAAGCGTGGTC
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GCAAAGCTGTTGCTTTAGGAATGTACGCTCTTCCCACTAGATCTCAGCTACTTTCCATGC
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GAACCTTGAAGAGTTTTTTATTAACGATCTTTGACAAGTCTGTATCACAC

QA 3 772 3 772
DS 

RD RS1CG26JQ 680 0 0
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GGCGTCGAGTTCGGTATCGACATTAGTAGTAATGGTGGACAAAGATATTGAGGCAAACTG
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GGTGAAGGCTCTTTTTGAAGAGATTATAGCTTCCGAAGGTAATAATTCTTTAAAGGATCC
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TGTTGCTTTAGGAATGTACGCTCTTCCCACTAGATTTCAGCTACTTTCCATGCTCAATGA
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TCTATCAACTCATGTAATGACTTCACAAGGACCAAACCAGAGCTATCTAAAAATTAAAAC
CACTATGAATAAGTTTATGC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RS1C538JQ 746 0 0
AAGTCCCCGTGGCGCAGTTCTCACACGCTTGCTCCCTCGTCTCGCCTCTCTTTGGCTGCC
TCGGGATCGCCTTCAAGTTCGCAGAGATGGACTACGTCGCCAAGGTTGATGATCTGGCAA
AGGCGTCGAGTTCGGTATCGACATTAGTAGTAATGGTGGACAAAGATATTGAGGCAAACT
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CAGCATCTAAGTCTTATGCTCAAGTGTTTGCTCCACACCATGGATGGGCTATACGCAAAG
CTGTTGCTTTAGGAATGTACGCTCTTCCCACTAGATCTCAGCTACTTTCCATGCTCAATG
AGGAAGAAGCGGAGGCTAAGATAGAGATGCAAAGCTATGTAAATGCATCAGCACCAGTAA
TCGCGTATGTTGATAATCTATTCCACTCCAAGCAACTCGGTATCGATTGGTGAAGAACCT
TGAAGAGTTTTTTATTAACGATCTTTGACAAGTCTGTATCACACCAAATAACCAATACGG
TTCTATCAACTCATGTAATGACTTCACAAGGACCAAACCAGAGCTATTTAAAAATTAAAA
CCACTATGAATAAGTTTATGCTATCTCTAGTTTGCGGATCTGTGTAATGTGTTGATGTGT
AAAATATCATCATAAATACGGAAGTG

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 5

CO CL1809Contig1 1191 5 6 U
GGGAGGATACTTGACTTCTTCTCGCACCACCCTGAGAGTCTCCACATGTTTTCTTTCCTC
TTTGATGATCTCGGTATCCCACAGGACTACAGGCACATGGATGGCTTTGGTGTCAACACT
TACATGCTTATCAACAGATCCGGAAAAGCTCACTATGTGAAGTTCCACTGGAAACCCTCT
TGTGGGGTTAAATGCCTCCTTGATGAGGAAGCTATCAAGGTCGGTGGATCTAATCACAGC
CATGCTACTAAGGATCTCTATGACTCCATCGCTGCCGGGAACTATCCGGAGTGGAATCTC
TTCGTTCAAGTGATGGATCCTGCTCATGAAGACAAGTTTGACTTCGACCCTCTTGATGTC
ACAAAGATCTGGCCTGAAGATATCTTGCCTCTCCAGCCCGTTGGCCGCTTGGTGTTGAAC
AAAAACATCGACAACTTCTTTAACGAGAATGAGCAGATTGCCTTCTGTCCTGCTATTGTG
GTTCCTGGCGTCCATTATTCAGATGATAAACTGCTCCAGACCAGGATCTTCTCCTACGCT
GATAGTCAGAGACACCGTCTCGGACCAAACTATCTGCAACTACCTGTCAATGCTCCAAAA
TGTGCTCACCACAACAATCACCATGAAGGTTTTATGAACTTCATGCACAGAGATGAGGAG
GT*AATTACTTCCCTTCAAGGTTGAATCCGGTTCGTCATGCTGACAAATACCCAACAACT
CCTGTTTTCTGCTCTGGAAATCGTGAGAAGTGCATGATTGAGAAGGAGAACAACTTTCAG
CAGCCAGGGGAACGGTACCGGTCCTGGGATGCAGACAGGCAAGAGCGTTTCGTGAAGCGT
TTTGTTGAAGCGCTTGCTGAGCCTCGTGTCACCCACGAGATCCGCAGCATTTGGATATCT
TACTGGTCTCAGGCAGACAAATCTCTTGGACAGAAACTAGCTACTCGTCTTAACGTGAAG
CCAAAGTTCTGAATGGTTATCATCTCAAAAGACTATTAAGTAAAACCCAATATGTGCTCA
CATATTGCGCTTTGGTTTCTATGTAAGCTATTTGGTAATAGTTCATTTAAATAATCCGCG
ACAATGAAATGTGTAAAGAAGGATACTTCTATTTCATGTTGTAATCTTCTATTCACAATG
TTAACGAATATTTTCTAAGGCAAGTAATAAAAAGCTATGCGTTATGTAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1GW03TF U 1
AF RS1EY34TF U 23
AF RS1GX82JQ C 541
AF RS1AR76JQ C 955
AF RS1AR76TFB U 955
BS 1 660 RS1GW03TF
BS 661 661 RS1EY34TF
BS 662 680 RS1GW03TF
BS 681 954 RS1GX82JQ
BS 955 1188 RS1AR76TFB
BS 1189 1191 RS1GX82JQ

RD RS1GW03TF 686 0 0
GGGAGGATACTTGACTTCTTCTCGCACCACCCTGAGAGTCTCCACATGTTTTCTTTCCTC
TTTGATGATCTCGGTATCCCACAGGACTACAGGCACATGGATGGCTTTGGTGTCAACACT
TACATGCTTATCAACAGATCCGGAAAAGCTCACTATGTGAAGTTCCACTGGAAACCCTCT
TGTGGGGTTAAATGCCTCCTTGATGAGGAAGCTATCAAGGTCGGTGGATCTAATCACAGC
CATGCTACTAAGGATCTCTATGACTCCATCGCTGCCGGGAACTATCCGGAGTGGAATCTC
TTCGTTCAAGTGATGGATCCTGCTCATGAAGACAAGTTTGACTTCGACCCTCTTGATGTC
ACAAAGATCTGGCCTGAAGATATCTTGCCTCTCCAGCCCGTTGGCCGCTTGGTGTTGAAC
AAAAACATCGACAACTTCTTTAACGAGAATGAGCAGATTGCCTTCTGTCCTGCTATTGTG
GTTCCTGGCGTCCATTATTCAGATGATAAACTGCTCCAGACCAGGATCTTCTCCTACGCT
GATAGTCAGAGACACCGTCTCGGACCAAACTATCTGCAACTACCTGTCAATGCTCCAAAA
TGTGCTCACCACAACAATCACCATGAAGGTTTTATGAACTTCATGCACAGAGATGAGGAG
TT*AATTACTTCCCTTCAAG
TTGATC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RS1EY34TF 662 0 0
CGCACCACCCTGAGAGTCTCCACATGTTTTCTTTCCTCTTTGATGATCTCGGTATCCCAC
AGGACTACAGGCACATGGATGGCTTTGGTGTCAACACTTACATGCTTATCAACAGATCCG
GAAAAGCTCACTATGTGAAGTTCCACTGGAAACCCTCTTGTGGGGTTAAATGCCTCCTTG
ATGAGGAAGCTATCAAGGTCGGTGGATCTAATCACAGCCATGCTACTAAGGATCTCTATG
ACTCCATCGCTGCCGGGAACTATCCGGAGTGGAATCTCTTCGTTCAAGTGATGGATCCTG
CTCATGAAGACAAGTTTGACTTCGACCCTCTTGATGTCACAAAGATCTGGCCTGAAGATA
TCTTGCCTCTCCAGCCCGTTGGCCGCTTGGTGTTGAACAAAAACATCGACAACTTCTTTA
ACGAGAATGAGCAGATTGCCTTCTGTCCTGCTATTGTGGTTCCTGGCGTCCATTATTCAG
ATGATAAACTGCTCCAGACCAGGATCTTCTCCTACGCTGATAGTCAGAGACACCGTCTCG
GACCAAACTATCTGCAACTACCTGTCAATGCTCCAAAATGTGCTCACCACAACAATCACC
ATGAAGGTTTTATGAACTTCATGCACAGAGATGAGGAGGT*AATTACTTCCCTTCAAG
TTGA

QA 1 658 1 658
DS 

RD RS1GX82JQ 651 0 0
GATAGTCAGAGACACCGTCTCGGACCAAACTATCTGCAACTACCTGTCAATGCTCCAAAA
TGTGCTCACCACAACAATCACCATGAAGGTTTTATGAACTTCATGCACAGAGATGAGGAG
GTTAATTACTTCCCTTCAAGGTTGAATCCGGTTCGTCATGCTGACAAATACCCAACAACT
CCTGTTTTCTGCTCTGGAAATCGTGAGAAGTGCATGATTGAGAAGGAGAACAACTTTCAG
CAGCCAGGGGAACGGTACCGGTCCTGGGATGCAGACAGGCAAGAGCGTTTCGTGAAGCGT
TTTGTTGAAGCGCTTGCTGAGCCTCGTGTCACCCACGAGATCCGCAGCATTTGGATATCT
TACTGGTCTCAGGCAGACAAATCTCTTGGACAGAAACTAGCTACTCGTCTTAACGTGAAG
CCAAAGTTCTGAATGGTTATCATCTCAAAAGACTATTAAGTAAAACCCAATATGTGCTCA
CATATTGCGCTTTGGTTTCTATGTAAGCTATTTGGTAATAGTTCATTTAAATAATCCGTG
ACAATGAAATGTGTAAAGAAGGATACTTCTAGTTCATGTTGTAATCTTCTATTCACAATG
TTAACGAATATTTTCTAAGGCAAGTAATAAAAAGCTATGCGTTATGTAGCC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1AR76JQ 236 0 0
GTGAAGCCAAAGTTCTGAATGGTTATCATCTCAAAAGACTATTAAGTAAAACCCAATATG
TGCTCACATATTGCGCTTTGGTTTCTATGTAAGCTATTTGGTAATAGTTCATTTAAATAA
TCCGCGACAATGAAATGTGTAAAGAAGGATACTTCTATTTCATGTTGTAATCTTCTATTC
ACAATGTTAACGAATATTTTCTAAGGCAAGTAATAAAAAGCTATGCGTTATGTA
AC

QA 1 234 1 234
DS 

RD RS1AR76TFB 236 0 0
GTGAAGCCAAAGTTCTGAATGGTTATCATCTCAAAAGACTATTAAGTAAAACCCAATATG
TGCTCACATATTGCGCTTTGGTTTCTATGTAAGCTATTTGGTAATAGTTCATTTAAATAA
TCCGCGACAATGAAATGTGTAAAGAAGGATACTTCTATTTCATGTTGTAATCTTCTATTC
ACAATGTTAACGAATATTTTCTAAGGCAAGTAATAAAAAGCTATGCGTTATGTA
AC

QA 1 234 1 234
DS 



AS 1 3

CO CL1810Contig1 960 3 10 U
GGCAGGAAATAAAGAACAGTTTATTCAAATTTTCGCTCTCTTCTTAGTCCTTTTCTGTTT
CCAGTTATTTTGGAAACGTCCCCCACCATGTAGAAGTACAAACAGATTACAAATACAAAA
AGATTTCACTGTCTTAAATTTTTTTTTTATAAAACAAACAAACAAAAGGTTTCAAACTTC
AAGATATTTAGCCACCGTCTGAACATCTTTATCTCCTCTTCCGCTGAAGTTCAAGACCAC
TCTAGCTCCGTCCGGTAACGTGGGACACAGCTTCTCGAGGTGAGCTAGTGCGTGAGAGGT
CTCCAGTGCCGGGATGATTCCCTCTAACCGCGAAACTCTCTTGAACGCTTCCAACGCTTC
TTCATCGGTTACGCTAAAGTATTCAGCTCGTCCCATGTCTTTAAGGAAACTGTGCTCCGG
TCCAACTCCAGGGTAGTCCAATCCTGCACTGATGGAGTGAGGTTCAATGATTTGACCATC
ATCATCTTGCAGCAAGTAACTCATAGCACCATGTAGAACACCAACATCTCCCTTTGTCAA
CGTAGCAGCGTGTTTACCACTATCCACTCCAAATCCCGCAGCTTCCACACCGATCAACCT
GGCCTCTGTATCATCCACAAACTCATGGAACAGTCCCATCGCGTTCGAACCCCCACCAAC
ACAAGCAACCAAGACATCCGGCTTCCCTCCCCATTTCTCCATCGCTTGTTTCCTCGTTTC
TTTACCTATCACCGCGTGAAAGTCTCTGACCATCATAGGGTAAGGATGAGGACCCGCCAC
GGATCCCAATATGTAATGTGTAGTCTCAACGTTCGTCACCCAATCTCTTATGGCTTCTGA
TGTAGCATCCTTCAACGTTGCTGTTCCAGAGTGAACTCCTCTCACCTCGGCACCAAGAAG
TCGCATCCTGAACACATTGAGCGCTTGTCTCTCCATATCTTGAGCACCCATATAGATAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BF06JQ U 1
AF RS1BZ45JQ U 30
AF RS1BZ45TF C 200
BS 1 148 RS1BF06JQ
BS 149 149 RS1BZ45JQ
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BS 603 630 RS1BF06JQ
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BS 632 709 RS1BF06JQ
BS 710 710 RS1BZ45JQ
BS 711 744 RS1BF06JQ
BS 745 960 RS1BZ45TF

RD RS1BF06JQ 746 0 0
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CCAGTTATTTTGGAAACGTCCCCCACCATGTAGAAGTACAAACAGATTACAAATACAAAA
AGATTTCACTGTCTTAAATTTTTTTTTTTTAAAACAAACAAACAAAAGGTTTCAAACTTC
AAGATATTTAGCCACCGTCTGAACATCTTTATCTCCTCTTCCGCTGAAGTTCAAGACCAC
TCTAGCTCCGTCCGGTAACGTGGGACACAGCTTCTCGAGGTGAGCTAGTGCGTGAGAGGT
CTCCAGTGCCGGGATGATTCCCTCTAACCGCGAAACTCTCTTGAACGCTTCCAACGCTTC
TTCATCGGTTACGCTAAAGTATTCAGCTCGTCCCATGTCTTTAAGGAAACTGTGCTCCGG
TCCAACTCCAGGGTAGTCCAATCCTGCACTGATGGAGTGAGGTTCAATGATTTGACCATC
ATCATCTTGCAGCAAGTAACTCATAGCACCATGTAGAACACCAACATCTCCCTTTGTCAA
CGTAGCAGCGTGTTTACCACTATCCACTCCAAATCCCGCAGCTTCCACACCGATCAACCT
GACCTCTGTATCATCCACAAACTCATGGAAGAGTCCCATCGCGTTCGAACCCCCACCAAC
ACAAGCAACCAAGACATCCGGCTTCCCTCCCCATTTCTCCATCGCTTGTCTCCTCGTTTC
TTTACCTATCACCGCGTGAAAGTC
TC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1BZ45JQ 715 0 0
TTTTTGCTCTCTTCTTAGTCCTTTTCTGTTTCCAGTTATTTTGGAAACGTCCCCCACCAT
GTAGAAGTACAAACAGATTACAAATACAAAAAGATTTCACTGTCTTAAATTTTTTTTTTA
*AAAACAAACAAACAAAAGGTTTCAAACTTCAAGATATTTAGCCACCGTCTGAACATCTT
TATCTCCTCTTCCGCTGAAGTTCAAGACCACTCTAGCTCCGTCCGGTAACGTGGGACACA
GCTTCTCGAGGTGAGCTAGTGCGTGAGAGGTCTCCAGTGCCGGGATGATTCCCTCTAACC
GCGAAACTCTCTTGAACGCTTCCAACGCTTCTTCATCGGTTACGCTAAAGTATTCAGCTC
GTCCCATGTCTTTAAGGAAACTGTGCTCCGGTCCAACTCCAGGGTAGTCCAATCCTGCAC
TGATGGAGTGAGGTTCAATGATTTGACCATCATCATCTTGCAGCAAGTAACTCATAGCAC
CATGTAGAACACCAACATCTCCCTTTGTCAACGTAGCAGCGTGTTTACCACTATCCACTC
CAAATCCCGCAGCTTCCACACCGATCAACCTGGCCTCTGTATCATCCACAAACTCATGGA
ACAGTCCCATCGCGTTCGAACCCCCACCAACACAAGCAACCAAGACATCCGGCTTCCCTC
CCCATTTCTCCATCGCTTGTTTCCTCGTTTCTTTACCTATCACCGCGTGAAAGTC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1BZ45TF 761 0 0
TGAACATCTTTATCTC*TCTTCCGCTGAAGTTCAAGACCACTCTAGCTCCGTCCGGTAAC
GTGGGACACAGCTTCTCGAGGTGAGCTAGTGCGTGAGAGGTCTCCAGTGCCGGGATGATT
CCCTCTAACCGCGAAACTCTCTTGAACGCTTCCAACGCTTCTTCATCGGTTACGCTAAAG
TATTCAGCTCGTCCCATGTCTTTAAGGAAACTGTGCTCCGGTCCAACTCCAGGGTAGTCC
AATCCTGCACTGATGGAGTGAGGTTCAATGATTTGACCATCATCATCTTGCAGCAAGTAA
CTCATAGCACCATGTAGAACACCAACATCTCCCTTTGTCAACGTAGCAGCGTGTTTACCA
CTATCCACTCCAAATCCCGCAGCTTCCACACCGATCAACCTGGCCTCTGTATCATCCACA
AACTCATGGAACAGTCCCATCGCGTTCGAACCCCCACCAACACAAGCAACCAAGACATCC
GGCTTCCCTCCCCATTTCTCCATCGCTTGTTTCCTCGTTTCTTTACCTATCACCGCGTGA
AAGTCTCTGACCATCATAGGGTAAGGATGAGGACCCGCCACGGATCCCAATATGTAATGT
GTAGTCTCAACGTTCGTCACCCAATCTCTTATGGCTTCTGATGTAGCATCCTTCAACGTT
GCTGTTCCAGAGTGAACTCCTCTCACCTCGGCACCAAGAAGTCGCATCCTGAACACATTG
AGCGCTTGTCTCTCCATATCTTGAGCACCCATATAGATAAT

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 4

CO CL1811Contig1 1161 4 11 U
CGATCCATAACAGTTTGATATTTCTTATTGAATATAAACCTTAACACACATACATACATA
CATACACATATGTTTATTATCTTTCACAGCATTATAATCAATTAGAGTTCACATAACGGC
AATCCTTCCTTATCTCCCCTTGATCACCGGTAAGAGGGTTGGTCTCGGACAAGAGCCTGA
CACCGCGTGAGAATTGCTCATGGAAGTAACCATTGTCCGCAGCCATCTTGGCCACAAAAG
GTGCCGTCCTCGGGTCACTGGCTAGCTCATCATCAATGACAAGGAGCCCTTTATGAGCCA
TGATGTTCTTGTAATACATGTTGTCCACAACCATGGGAGTCTCACGGTCATTACGGGAGT
ATAAGACTGCGTTCGGGTCCGGGTTTGGACTTGGGCAACGCTTTTTCAAGTAAAGGGCGT
AATTTGGGTCGAGAGTCGGGTCAATCGTTGGGTATAGCCGGTGCACTAGATTAACGCAAT
GGACCCTACCAACGGAGTGAGCACCTAAGAGCGCAACGGTGGCTTCAACATCGATACC*G
ATGGAGTTGAAGTTTGAGAGAACAGAGGAGATAGAGTCATTGTGGTTAGGAACTAGAGTC
TGAACATCATTCAAGTAGCTTCCTCTACTGTCTCTCCTTCCTGTCTTGATCATATCTATC
TTTGGCCCTTTCAACATGACAATACCATCTCTAGCAGAGAGAGCAACAATATCAGCGCAA
GAGACTGTGCCAGGACATTCTTTCTCGAGTGCGTCTTTGATAAACTTAACGTACTTAAAG
TTTCTCATACCAAAACTCCTCGTCGACTTTTGCTCAGATTCCACACCACTTGTTGTCCCA
AGTAGTAGTGACGCATCACACGACTTGACGACGCAGTCATGGAAGAGATTACGGAGCCAA
GAGACGGCTGTGTTGCCGTGTTTGTAGTAAAGCGTTTCCACTTGTTGCCTGATTATCTCT
TCCGCTCTCGGACAACTCTCTCTGTAATAATTCATCTCCAGTTCCGCATTTCCGATATGG
AAAATGGAAAATAACTGTAATAACAGACAAAAGAAGGCTAAACGACAGAAGGGCATCTTC
GCACTCGCCATCTCTCTCTTTCTTTTTCTCTACTTTGTTGATTGGGTGTCTCTTTATGTG
TACCAAAGTAGGGTTATATCC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1FV32JQ U 1
AF RS1A587JQ U 5
AF RS1FV32TF C 432
AF RS1A587TF C 509
BS 1 790 RS1FV32JQ
BS 791 791 RS1A587JQ
BS 792 810 RS1FV32JQ
BS 811 811 RS1A587JQ
BS 812 826 RS1FV32JQ
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BS 886 1022 RS1FV32TF
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BS 1024 1076 RS1FV32TF
BS 1077 1078 RS1A587TF
BS 1079 1161 RS1FV32TF

RD RS1FV32JQ 826 0 0
CGATCCATAACAGTTTGATATTTCTTATTGAATATAAACCTTAACACACATACATACATA
CATACACATATGTTTATTATCTTTCACAGCATTATAATCAATTAGAGTTCACATAACGGC
AATCCTTCCTTATCTCCCCTTGATCACCGGTAAGAGGGTTGGTCTCGGACAAGAGCCTGA
CACCGCGTGAGAATTGCTCATGGAAGTAACCATTGTCCGCAGCCATCTTGGCCACAAAAG
GTGCCGTCCTCGGGTCACTGGCTAGCTCATCATCAATGACAAGGAGCCCTTTATGAGCCA
TGATGTTCTTGTAATACATGTTGTCCACAACCATGGGAGTCTCACGGTCATTACGGGAGT
ATAAGACTGCGTTCGGGTCCGGGTTTGGACTTGGGCAACGCTTTTTCAAGTAAAGGGCGT
AATTTGGGTCGAGAGTCGGGTCAATCGTTGGGTATAGCCGGTGCACTAGATTAACGCAAT
GGACCCTACCAACGGAGTGAGCACCTAAGAGCGCAACGGTGGCTTCAACATCGATACC*G
ATGGAGTTGAAGTTTGAGAGAACAGAGGAGATAGAGTCATTGTGGTTAGGAACTAGAGTC
TGAACATCATTCAAGTAGCTTCCTCTACTGTCTCTCCTTCCTGTCTTGATCATATCTATC
TTTGGCCCTTTCAACATGACAATACCATCTCTAGCAGAGAGAGCAACAATATCAGCGCAA
GAGACTGTGCCAGGACATTCTTTCTCGAGTGCGTCTTTGATAAACTTAACGTACTTAAAG
TTTCTCATAC*AAAACTCCTCGTCGACTTT*GCTCAGATTCCACAC

QA 1 826 1 826
DS 

RD RS1A587JQ 881 0 0
G
CATAACAGTTTGATATTTCTTATTGAATATAAACCTTAACACACATACATACATACATAC
ACATATGTTTATTATCTTTCACAGCATTATAATCAATTAGAGTTCACATAACGGCAATCC
TTCCTTATCTCCCCTTGATCACCGGTAAGAGGGTTGGTCTCGGACAAGAGCCTGACACCG
CGTGAGAATTGCTCATGGAAGTAACCATT*TCCGCAGCCATCTTGGCCACAAAAGGTGCC
GTCCTCGGGTCACTGGCTAGCTCATCATCAATGACAAGGAGCCCTTTATGAGCCATGATG
TTCTTGTAATACATGTTGTCCACAACCATGGGAGTCTCACGGTCATTACGGGAGTATAAG
ACTGCGTTCGGGTCCGGGTTTGGACTTGGGCAACGCTTTTTCAAGTAAAGGGCGTAATTT
GGGTCGAGAGTCGGGTCAATCGTTGGGTATAGCCGGTGCACTAGATTAACGCAATGGACC
CTACCAACGGAGTGAGCACCTAAGAGCGCAACGGTGGCTTCAACATCGATACC*GATGGA
GTTGAAGTTTGAGAGAACAGAGGAGATAGAGTCATTGTGGTTAGGAACTAGAGTCTGAAC
ATCATTCAAGTAGCTTCCTCTACTGTCTCTCCTTCCTGTCTTGATCATATCTATCTTTGG
CCCTTTCAACATGACAATACCATCTCTAGCAGAGAGAGCAACAATATCAGCGCAAGAGAC
TGTGCCAGGACATTCTTTCTCGAGTGCGTCTTTGATAAACTTAACGTACTTAAAGTTTCT
CATACCAAAACTCCTCGTCGACTTTTGCTCAGATTCCACACCACTTGTTGTCCCAAGTAG
TAGTGACGCATCACACGACTTGACGACGCAGTCATGGAAG

QA 2 881 2 881
DS 

RD RS1FV32TF 730 0 0
GAGAGTC
GGTCAATCGTTGGGTATAGCCGGTGCACTAGATTAACGCAATGGACCCTACCAACGGAGT
GAGCACCTAAGAGCGCAACGGTGGCTTCAACATCGATACCCGATGGAGTTGAAGTTTGAG
AGAACAGAGGAGATAGAGTCATTGTGGTTAGGAACTAGAGTCTGAACATCATTCAAGTAG
CTTCCTCTACTGTCTCTCCTTCCTGTCTTGATCATATCTATCTTTGGCCCTTTCAACATG
ACAATACCATCTCTAGCAGAGAGAGCAACAATATCAGCGCAAGAGACTGTGCCAGGACAT
TCTTTCTCGAGTGCGTCTTTGATAAACTTAACGTACTTAAAGTTTCTCATACCAAAACTC
CTCGTCGACTTTTGCTCAGATTCCACACCACTTGTTGTCTCAAGTAGTAGTGACGCATCA
CACGACTTGACGACGCAGTCATGGAAGAGATTACGGAGCCAAGAGACGGCTGTGTTGCCG
TGTTTGTAGTAAAGCGTTTCCACTTGTTGCCTGATTATCTCTTCCGCTCTCGGACAACTC
TCTCTGTAATAATTCATCTCCAGTTCCGCATTTCCGATATGGAAGATGGAAAATAACTGT
AATAACAGACAAAAGAAGGCTAAACGACAGAAGGGCAT**TCGCACTCGCCATCTCTCTC
TTTCTTTTTCTCTACTTTGTTGATTGGGTGTCTCTTTATGTGTACCAAAGTAGGGTTATA
TCC

QA 8 730 8 730
DS 

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AGATAGAGTCATTGTGGTTAGGAACTAGAGTCTGAACATCATTCAAGTAGCTTCCTCTAC
TGTCTCTCCTTCCTGTCTTGATCATATCTATCTTTGGCCCTTTCAACATGACAATACCAT
CTCTAGCAGAGAGAGCAACAATATCAGCGCAAGAGACTGTGCCAGGACATTCTTTCTCGA
GTGCGTCTTTGATAAACTTAACGTACTTAAAGTTTCTCATACCAAAACTCCTCGTCGACT
TTTGCTCAGATTCCACACCACTTGTTGTCCCAAGTAGTAGTGACGCATCACACGACTTGA
CGACGCAGTCATGGAAGAGATTACGGAGCCAAGAGACGGCTGTGTTGCCGTGTTTGTAGT
AAAGCGTTTCCACTTGTTGCCTGATTATCTCTTCCGCTCTCGGACAACTCTCTCTGTAAT
AATTCATCTCCAGTTCCGCATTTCCGATATGGAAAATGGAAAATAACTGTAATAACAGAC
AAAAGAAGGCTAAACGACAGAAGGGCATCTTCGCACTCGCCATCTCTCTCTTTCTTTTTC
TCTACTTTGTTGATTGGGTGTCTCTTTATGTGTACCAAAGTAGGGTTATATCC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 2 5

CO CL1812Contig1 713 3 2 U
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AAGGACCCCCACCC*ATCAAGAGAGAGAGAGGTATCAAGATTCTGCAATGGGGAAAGCTG
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TTCTCTTGAACTCTTGGTAGCCCCAGGAGCAACGTCCTTGATCGCAAGGTACC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H214JQB U 1
AF RS1BA28JQ U 1
AF RS1BA28TF C 1
BS 1 681 RS1BA28JQ
BS 682 713 RS1BA28TF

RD RS1H214JQB 544 0 0
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AGCC

QA 1 544 1 544
DS 

RD RS1BA28JQ 682 0 0
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C

QA 1 681 1 681
DS 

RD RS1BA28TF 713 0 0
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QA 1 713 1 713
DS 



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TCTTGGGTGACAACTTCTTTGTACCTTCGTGCGGGTTGTAGTTGTCGAGCACGAGCAGAC
CTAGCGAAAGTCGGTTTCTGAAGACTCGTCGCTCCCCAGAGAGAGTAGCCTTCAGCATGT
CTGATCTCTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DC34JQ U 1
AF RS1AZ42JQ U 60
BS 1 327 RS1DC34JQ
BS 328 328 RS1AZ42JQ
BS 329 545 RS1DC34JQ
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BS 775 775 RS1AZ42JQ
BS 776 789 RS1DC34JQ
BS 790 911 RS1AZ42JQ

RD RS1DC34JQ 789 0 0
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GAAGAGGAGCCAGAGGTGCCTACACGTCCATAGAGATCGAACCAGAGACTCGTCAGCATT
CTCTTGAACTCTTGGTAGCTCCCAGGAGCAACGTCCTTGATCGCAAGGTACTTGTGAAGG
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TCTTGGGTG

QA 1 789 1 789
DS 

RD RS1AZ42JQ 852 0 0
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TAATAATAATAATTCAATAGAGTACTGCTCAACGCATAGATATTTTGTAATGTTTTTTTG
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TCTCTTGAACTCTTGGTAGCTCCCAGGAGCAACGTCCTTGATCGCAAGGTACTTGTGAAG
GTACTTAACAACAGCGGTTCTGCTGATCTCTTCGATGAAAGCCGCCTGTTCTTGCCTCTC
TTCTTGGGTGACAACTTCTTTGTACCTTCGTGCGGGTTGTAGTTGTCGAGCACGAGCAGA
CCTAGCGAAAGTCGGTTTCTGAAGACTCGTCGCTCCCCAGAGAGAGTAGCCTTCAGCATG
TCTGATCTCTCG

QA 1 852 1 852
DS 



AS 1 4

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ACAACAACTTCATAACCGACTTCGAGACGAAGATCAACCTCCTGAAGCTAGCCCACTTCG
CGGTCGTTGTCTCCAGGCAGTACCCTGAGAAAGAAGCGGCGGTTAGTTATCTCCAGGGAG
TGATTGAGAAGCTTAGAGCTACTAAGGAGTCACGCATCAGTGAGCCGGTCAGCTATGTAG
AAACGCAGATAGCTTTGTTCAAGCTTGAGCAAGGTGACCAGAAGGAGTGCAAGAAGATAC
TTGACGATGTGAAAAGCTCTCTCGATAGTATGACAGACATCGATCCGTCGGTGTATGCCA
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AGAATGCTCTTCTTTATCTTGCGTATACTTCTGTGGAGTCACTCTCTGAATCGTTCAAGC
TGGACTTGGCTTTTGATCTGTCGCTGTCAGCTCTACTGGGAGAGAATATTTACAACTTTG
GGGAACTGTTAGCCCATCCAGTTCTGAAGAGTCTGCTTGGAACAAATGTGGAATGGCTTT
ACCACATTCTACGGGCGTTCAACCACGGTGATTTGGTTCAGTACCAGGAACTCTGCCGTG
TTCACAATGCAGCCTTGAGCGCACAACCAGCATTGGTTGAGAATGAGAAGAAGCTGTTAG
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CCATACCGTTGAGTGTCATTGCTGAGCGTACTAAGCTCTCAATCGAAGATGTTGAGCACC
TTCTCATGAAGAGCTTATCTGTGCACTTAATAGAGGGTGGATGGAACGGTGCATGTGTCA
TGGGCGCAACCGAGGGTGCTAGGGATACCGCAGATCAAGTCATTGAGGGATCAGTTAGAT
AGCTGGGTTGATAAGGTTCACACGACCTTGTTGTCCGTTGAGGCTGAGACACCTGATCTT
GTTGCAGCTTAAGACTCTTGTTTCTTCTTTGTTTTCCTTTTGAGCTACAAGATTGTATCA
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TACAGTCGTTTTTCTTAAAACGTTTGCTCTCAACAAACTCATGAATGTATCCTCCTTTCT
CCAATGATTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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CGGTCGTTGTCTCCAGGCAGTACCCTGAGAAAGAAGCGGCGGTTAGTTATCTCCAGGGAG
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GGGAACTGTTAGCCCATCCAGTTCTGAAGAGTCTGCT

QA 1 757 1 757
DS 

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G
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TATGCCAACTTCTACTGG*TGTCTTCTCAGTACCATAAGTTCCGTCAGGAGTTTTCTGAT
TTCTACAAGAATGCTCTTCTTTATCTTGCGTATACTTCTGTGGAGTCGCTCTCTGAATCG
TTCAAGCTGGACTTGGCTTTTGATCTGTCGCTGTCAGCTCTACTGGGAGAGAATATTTAC
AACTTTGGGGAACTGTTAGCCCATCCAGTTCTGAAGAGTCTGCTTGGAACAAATGTGGAA
TGGCTTTACCACATTCTACAGGCGTTCAACCACGGTGATTTGGTTCAGTACCAAGAACTC
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QA 2 661 2 661
DS 

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G
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AGAAGATACTTGACGATGTTAAAAGCTCTCTCGATAGTATGACAGACATCGATCCGTCGG
TGTATGCCAACTTCTACTGGGTGTCTTCTCAGTACCATAAGTTCCGTCAAGAGTTTTCTG
ATTTCTATAAGAATGCTCTTCTTTATCTTGCGTATACTTCTGTGGAGTCACTCTCTGAAT
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ACAACTTTGGGGAACTGTTAGCCCATCCAGTTCTGAAGAGTCTGCTTGGAACAAATGTGG
AATGGCTTTACCACATTCTACGGGCGTTCAACCACGGTGATTTGGTTCAGTACCAGGAAC
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AAGATAGGACCATACCGTTGAGTGTCATTGCTGAGCGTACTAAGCTCTCAATCGAAGATG
TTGAGCACCTTCTCATGAAGAGCTTATCTGTGCACTTAATAGAGGGTGGATGGAACGGTG
CATGTGTCATGGGCGCAACCGAGG
TGC

QA 2 685 2 685
DS 

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CTGACGATGTT
AAAGCTCTCTCGATAGTATGACAGACATCGATC*GTCGGTGTATGCCAACTTCTACTGGG
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TTTATCTTGCGTATACTTCTGTGGAGTCACTCTCTGAATCGTTCAAGCTGGACTTGGCTT
TTGATCTGTCGCTGTCAGCTCTACTGGGAGAGAATATTTACAACTTTGGGGAACTGTTAG
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AAGGTTCACACGACCTTGTTGTCCGTTGAGGCTGAGACACCTGATCTTGTTGCAGCTTAA
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TCTTAAAACGTTTGCTCTCAACAAACTCATGAATGTATCCTCCTTTCTCCAATGATTCTT
CC

QA 12 913 12 913
DS 



AS 1 4

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ACCGCAACACCGTGCCGTTTTTCTGAAACCATGGTCGCCTCCGTCGCTGCTCAAGTCTGG
GTCCATCCTCGTGGTTGAAGCCAAAACCAAAACCAGCAGCGAAGACAGAATCGCCCGCCA
CTCTCGCATCCGTAAGAAGGTTAACGGTACAACGGAGAGGCCAAGGATGTGTGTGTTTCG
CTCAAACAAGCATCTCTATGTGCAGGTGATTGATGACACCAAGATGCACACTTTAGCTTC
AGCTTCCACCAAGCAGAAACCCATCTCTGAGGAGTTTGACTACACCTCTGGACCTACCAT
TGAGGTGGCGAAGAAAGTAGGGGAAGTGATAGCGAAATCATGCTTGGAGAAAGGGATCAC
AAAGGTGGCATTTGACCGTGGTGGTTACTCTTACCATGGTCGCATTGAAGCTCTTGCCGC
TGCTGCTCGTGAACACGGTCTTCAGTTTTAACTCTTGTTTTTCTTATCTCCTTTTGTTTC
TGCGGAACAGAGAGTATGATTTGTAGACTATATCCATTGAAATGTTGAAGTTTCCCTTTA
TAAAGAGTGTTCTTTGTTGATAACCAAAAGATTCTTGAGTGGCGTTCTCTGAATGTGAAA
AGAGCTAATCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CV69TF U 1
AF RS1H422JQB C 76
AF RS1H422TF U 76
AF RS1GM95TF U 673
BS 1 182 RS1CV69TF
BS 183 183 RS1H422TF
BS 184 246 RS1CV69TF
BS 247 247 RS1H422TF
BS 248 351 RS1CV69TF
BS 352 352 RS1H422TF
BS 353 384 RS1CV69TF
BS 385 385 RS1H422TF
BS 386 568 RS1CV69TF
BS 569 569 RS1H422TF
BS 570 624 RS1CV69TF
BS 625 625 RS1H422TF
BS 626 637 RS1CV69TF
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BS 639 668 RS1CV69TF
BS 669 739 RS1H422TF
BS 740 793 RS1GM95TF

RD RS1CV69TF 677 0 0
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GATAAGGCAAAAAGGATTTTGCTTACACAACCCAGAGAGCGAGAGAGCTAAAATGACGAG
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ACTGCAACACCGTGCCGTTTTTCTGAAACCATGGTCGCCTCCGTCGCTGCTCAAGTCTGG
GTCCATGCTCGTGGTTGAAGCCAAAACCAAAACCAGCAGCGAAGACAGAATCGCCCGCCA
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CTCAAACAAGCATCTCTATGTGCAAGTGATTGATGACACCAAGATGCACACTTTAGCTTC
AGCTTCCACCAAGCAGAAACCCATCTCTGAGGAGTTTGACTACACCTCTGGACCTACCAT
TGAGGTGGCGAAGAAAGTAGGGGAAGTGATAGCGAAATCATGCTTGGAGAAAGGGATCAC
AAAGGTGGCATTTGACCGTGGTGGTTACCCTTACCATGGTCGCATTGAAGCTCTTGCCGC
TGCTGCTCGTGAACACGGTCTTCAATTTTAACTCTTGCTTTTCTTATCTCCTTTTGTTTC
TGCGGAAC
TATCCATTG

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1H422JQB 652 0 0
T
TTTTGCTTACACAACCCAGAGAGCGAGAGAGCTAAAATGACGAGCGTGAGTGGGTGTGGT
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GTTTTTCTGAAACCATGGTCGCCTCCGTCGCTGCTCAAGTCTGGGTCCATCCTCGTGGTT
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DS 

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T
TTTTGCTTACACAACCCAGAGAGCGAGAGAGCTAAAATGACGAGCGTGAGTGGGTGTGGT
TCGGTGAGCCTCTTAACTAACCGCAATGCGTTCTTAGGAAGCGGACCGCAACACCGTGCC
GTTTTTCTGAAACCATGGTCGCCTCCGTCGCTGCTCAAGTCTGGGTCCATCCTCGTGGTT
GAAGCCAAAACCAAAACCAGCAGCGAAGACAGAATCGCCCGCCACTCTCGCATCCGTAAG
AAGGTTAACGGTACAACGGAGAGGCCAAGGATGTGTGTGTTTCGCTCAAACAAGCATCTC
TATGTGCAGGTGATTGATGACACCAAGATGCACACTTTAGCTTCAGCTTCCACCAAGCAG
AAACCCATCTCTGAGGAGTTTGACTACACCTCTGGACCTACCATTGAGGTGGCGAAGAAA
GTAGGGGAAGTGATAGCGAAATCATGCTTGGAGAAAGGGATCACAAAGGTGGCATTTGAC
CGTGGTGGTTACTCTTACCATGGTCGCATTGAAGCTCTTGCCGCTGCTGCTCGTGAACAC
GGTCTTCAGTTTTAACTCTTGTTTTTCTTATCTCCTTTTGTTTCTGCGGAACAGAGAGTA
TGATTTGTAGACTATATCCATTGAAATGTTGAAGTTTCCCTTTATAAAGAGTGTTCTTTG
TTG

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G
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TTGTTGATAACCAAAAGATTCTTGAGTGGCGTTCTCTGAATGTGAAAAGAGCTAATCATC

QA 2 121 2 121
DS 



AS 1 4

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GAACGTGGTTCCGACTATTACTAAGAAGACGTTGAGTGTTGTCTATGAGAGAGGTCTCAT
TGGTATCTATCATGACTGGTGTGAAGGGTTTTCAACTTATCCAAGAACATATGATTTTAT
TCACGCTAATGGTCTCTTCAGCATGTATCAGCACAGCTGCAAGATTGAGGATATACTTCT
TGAAATGGATCGGATCTTAAGGCCAGAAGGGATTGTGATAATCAGGGATGAGGTTGATGT
TTTGAACGATGTGAGGAAGATTGCTGATGGGATGAGATGGGACACTAAGTTGATGGATCA
TGAAGATGGTCCTCCCGTTCCGGAGAAGATTCTTTACGCCGTTAAACAGTACTGGGGTGG
CCGGCGGCGACGATGCAAACAGTCAGGCATCGTCTGCTGATAGTAGTGGAGAAGAGTAAA
GAAACACTCAGGTGAAGTGTGGAGCTATTTTATGACACCTGGAAAATTCTTCTTATCAAA
GAAATCAGAATTTTCATGGAAGAAAGGGGGTCGAAAGTTGAAATACATTATAGATGATTA
AGATGAATATGTGCATTTATGTTTTTTTTGTACTTTTAAAGGAACAGAAAATAGTTCCAT
GTGTTTTTTTTTTGAAAATTAGTTGAATCCTTGAACGTTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GX90TF U 4
AF RS1GX90JQ C 318
AF RS1BJ43TF U 1
AF RS1BJ43JQ C 281
BS 1 36 RS1BJ43TF
BS 37 40 RS1GX90TF
BS 41 354 RS1BJ43TF
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BS 495 495 RS1GX90TF
BS 496 678 RS1BJ43TF
BS 679 823 RS1BJ43JQ

RD RS1GX90TF 543 0 0
GGACACTCA
AAAGCTTTATACTTTCCGCAAGCTCATTCATCACTGAAACAGAGCTAAAACCAGAGATCT
GAAGAGATTTTAGAGTCTCTCT**GCAACAAGAAGATCTACATCAACCAGGAGAGAGTTT
TCAAAATGGGTTCGCTGCTGCTTTGGAGTCTCCCAAGTCTTGGGTTATGAACGTGGTTCC
GACTATTACTAA*AAGACGTTGAGTGTTGTCTATGAGAGAGGTCTCATTGGTATCTATCA
TGACTGGTGTGAAGGGTTTTCAACTTATCCAAGAACATATGATTTCATTCACGCTAATGG
TCTCTTCACCATGTATCACCACAGCTGCAAGATTGAGGATATACTTCTTGAAATGGATCG
GATCTTAAGGCCAGAAGGGATTGTGATAATCAGGGATGAGGTTGATGTTTTGAACGATGT
GAGGAAGATTGCTGATGGGATGAGATGGGACACTAAGTTGATGGATCATGAAGATGGTCC
TCCCGTTCCGGAGAAGATTCTTTACGCCGTTAAACAGTACTGGG
TCGCCGGCGG

QA 10 533 10 533
DS 

RD RS1GX90JQ 211 0 0
TC
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AGGCCAGAAGGGATTGTGATAATCAGGGATGAGGTTGATGTTTTGAACGATGTGAGGAAG
ATTGCTGATGGGATGAGATGGGACACTAAGTTGATGGATCATGAAGATGGTCCTCCCGTT
CCGGAGAAGATTCTTTACGCCGTTAAACA

QA 3 211 3 211
DS 

RD RS1BJ43TF 681 0 0
GGGTCCACACTCAAAGCTTTATACTTTCCGCAAGCT****CATCACTGAAACAGAGCTAA
AACCAGAGATCTGAAGAGATTTTAGAGTCTCTCTCTGCAACAAGAAGATCTACATCAACC
AGGAGAGAGTTTTCAAAATGGGTTCGCTGCTGCTTTGGAGTCTCCCAAGTCTTGGGTTAT
GAACGTGGTTCCGACTATTACTAAGAAGACGTTGAGTGTTGTCTATGAGAGAGGTCTCAT
TGGTATCTATCATGACTGGTGTGAAGGGTTTTCAACTTATCCAAGAACATATGATTTTAT
TCACGCTAATGGTCTCTTCAGCATGTATCAGCACAGCTGCAAGATTGAGGATATTCTTCT
TGAGATGGATCGGATCTTAAGGCCAGAAGGGATTGTGATAATCAGGGATTAGGTTGATGT
TTTGAACGATGTGAGGAAGATTGCTGATGGGATGAGATGGGACACTAAGTTGATGGATCA
TGAAGATGGTCCTCTCGTTCCGGAGAAGATTCTTTACGCCGTTAAACAGTACTGGGGTGG
CCGGCGGCGACGATGCAAACAGTCAGGCATCGTCTGCTGATAGTAGTGGAGAAGAGTAAA
GAAACACTCAGGTGAAGTGTGGAGCTATTTTATGACACCTGGAAAATTCTTCTTATCAAA
GAAATCAGAATTTTCATG
GAA

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1BJ43JQ 543 0 0
C
CAAGAACATATGATTTTATTCACGCTAATGGTCTTTTCAGCATGTATCAGCACAGCTGCA
AGATTGAGGATATTTTTCTTGAGATGGATCGGATTTTAAGGCCAGAAGGGATTGTGATAA
TCAGGGATTAGGTTGATGTTTTGAACGATGTGAGGAAGATTGCTGATGGGATGAGATGGG
ACACTAAGTTGATGGATCATGAAGATGGTCCTCTCGTTCCGGAGAAGATTCTTTACGCCG
TTAAACAGTACTGGG*TGGCCGGCGGGGACGATGCAAACAGTCAGGCATCGTTTGCTGAT
AGTAGTGGAGAAGAGTAAAGAAACACTCAGGTGAAGTGTGGAGCTATTTTATGACACCTG
GAAAATTTTTTTTATCAAAGAAATCAGAATTTTCATGGAAGAAAGGGGGTCGAAAGTTGA
AATACATTATAGATGATTAAGATGAATATGTGCATTTATGTTTTTTTTGTACTTTTAAAG
GAACAGAAAATAGTTCCATGTGTTTTTTTTTTGAAAATTAGTTGAATCCTTGAACGTTTG
TT

QA 2 543 2 543
DS 



AS 1 5

CO CL1816Contig1 794 5 7 U
GGAGACAAACAATGCAGTAAAAGTTTAACCCTAATAAATTAGCAAATAATGGTAAGGCCA
CCGCCGATCACAACACCTCCAGGACTTCTCCCTCCGATCATTAACCCACCTCCGGTCGCA
ACTCCTCCAGGAATTCTCCCTCCAATCACAACACCTCCAGGACTTCTCCCTCCTATCATT
AACCCACCTCCTATCACAACTCCACCACCATCCTCGGGTTATCCACCGTATCATGGTGGT
CCACCTTCCGGAGGAGGAGGGGCTCAACCAACGTGTCCGATCAACGCACTGAAGCTTGGA
GCTTGTGTTGACGTTCTGGGAGGTTTGATCCATATTGGACTTGGAAATCCAGTGGAGAAT
GTGTGTTGTCCAGTGTTACAAGGGTTACTTGAGTTAGAAGCAGCCGTTTGTCTTTGCACA
ACCATAAGACTTAAGCTTCTAAACTTAAACATCTTCATTCCTCTTGCACTGCAAGCTCTC
ATCACTTGTGGAATCAACCCTCCTCCTGGTTTTATCTGCCCTCCTCTTACTTGATAACAA
ACAACGTACGATCTATCAAGGGTTACGAGGCTTTTGAAATAATCTAAATATTTATATTTG
TGTTCTTTTTGTTGAAGATCAGGTTTGTTGGTTGTCTAGGGTTTTAACAAGTGCTTTTTA
ATTTTTGTCCCTTGTCGTTGTTGTGATGATTAAGCTAGGGGTTTTGCATGTGTCTTCTTG
AGTTGTTTGCTGTAATCTGTCATTTTGTGTTTGAATCTATTTGAATCTTTAATCTTATTA
AGAAAGCCTTGCGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BH77TF U 1
AF RS1FB29JQ C 64
AF RS1FB29TF U 64
AF RS1BH77JQ C 173
AF RS1FN19TF U 196
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BS 135 135 RS1FB29TF
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BS 340 618 RS1BH77TF
BS 619 755 RS1FB29TF
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RD RS1BH77TF 618 0 0
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AACCCACCTCCTATCACAACTCCACCACCATCCTCGGGTTATCCACCGTATCATGGTGGT
CCACCTTCCGGAGGAGGAGGGGCTCAACCAACGTGTCCGATCAACGCACTGAAGCTTGGA
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GTGTGTTGTCCAGTGTTACAAGGGTTACTTGAGTTAGAAGCAGCCGTTTGTCTTTGCACA
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ACAACGTACGATCTATCAAGGGTTACGAGGCTTTTGAAATAATCTAAATATTTATATTTG
TGTTCTTTTTGTTGAAGA

QA 1 618 1 618
DS 

RD RS1FB29JQ 692 0 0
G
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CTCCAGGAATTCTCCCTCCAATCACAACACCTCCAGGACTTCTCCCTCCTATCATTAACC
CACCTCCTATCACAACTCCACCACCATCCTCGGGTTATCCACCGTATCATGGTGGTCCAC
CTTCCGGAGGAGGAGGGGCTCAACCAACGTGTCCGATCAACGCACTGAAGCTTGGAGCTT
GTGTTGACGTTCTGGGAGGTTTGATCCATATTGGACTTGGAAATCCAGTGGAGAATGTGT
GTTGTCCAGTGTTACAAGGGTTACTTGAGTTAGAAGCAGCCGTTTGTCTTTGCACAACCA
TAAGACTTAAGCTTCTAAACTTAAACATCTTCATTCCTCTTGCACTGCAAGCTCTCATCA
CTTGTGGAATCAACCCTCCTCCTGGTTTTATCTGCCCTCCTCTTACTTGATAACAAACAA
CGTACGATCTATCAAGGGTTACGAGGCTTTTGAAATAATCTAAATATTTATATTTGTGTT
CTTTTTGTTGAAGATCAGGTTTGTTGGTTGTCTAGGGTTTTAACAAGTGCTTTTTAATTT
TTGTCCCTTGTCGTTGTTGTGATGATTAAGCTAGGGGTTTTGCATGTGTCTTCTTGAGTT
GTTTGCTGTAATCTGTCATTTTGTGTTTGAA

QA 2 692 2 692
DS 

RD RS1FB29TF 692 0 0
G
CGATCACAACACCTCCAGGACTTCTCCCTCCGATCATTAACCCACCTCCGGTCGCAACTC
CTCCAGGAATTCTCCCTCCAATCACAACACCTCCAGGACTTCTCCCTCCTATCATTAACC
CACCTCCTATCACAACTCCACCACCATCCTCGGGTTATCCACCGTATCATGGTGGTCCAC
CTTCCGGAGGAGGAGGGGCTCAACCAACGTGTCCGATCAACGCACTGAAGCTTGGAGCTT
GTGTTGACGTTCTGGGAGGTTTGATCCATATTGGACTTGGAAATCCAGTGGAGAATGTGT
GTTGTCCAGTGTTACAAGGGTTACTTGAGTTAGAAGCAGCCGTTTGTCTTTGCACAACCA
TAAGACTTAAGCTTCTAAACTTAAACATCTTCATTCCTCTTGCACTGCAAGCTCTCATCA
CTTGTGGAATCAACCCTCCTCCTGGTTTTATCTGCCCTCCTCTTACTTGATAACAAACAA
CGTACGATCTATCAAGGGTTACGAGGCTTTTGAAATAATCTAAATATTTATATTTGTGTT
CTTTTTGTTGAAGATCAGGTTTGTTGGTTGTCTAGGGTTTTAACAAGTGCTTTTTAATTT
TTGTCCCTTGTCGTTGTTGTGATGATTAAGCTAGGGGTTTTGCATGTGTCTTCTTGAGTT
GTTTGCTGTAATCTGTCATTTTGTGTTTGAA

QA 2 692 2 692
DS 

RD RS1BH77JQ 607 0 0
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ATGGTGGTCCACCTTCCGGAGGAGGAGGGGCTCAACCAACGTGTCCGATCAACGCACTGA
AGCTTGGAGCTTGTGTTGACGTTCTGGGAGGTTTGATCCATATTGGGCTTGGAAATCCAG
TGGAGAATGTGTGTTGTCCAGTGTTACAAGGGTTACTTGAGTTAGAAGCAGCCGTTTGTC
TTTGCACAACCATAAGACTTAAGCTTCTAAACTTAAACATCTTCATTCCTCTTGCACTGC
AAGCTCTCATCACTTGTGGAATCAACCCTCCTCCTGGTTTTATCTGCCCTCCTCTTACTT
GATAACAAACAACGTACGATCTATCAAGGGTTACGAGGCTTTTGAAATAATCTAAATATT
TATATTTGTGTTCTTTTTGTTGAAGATCAGGTTTGTTGGTTGTCTAGGGTTTTAACAAGT
GCTTTTTAATTTTTGTCCCTTGTCGTTGTTGTGATGATTAAGCTAGGGGTTTTGCATGTG
TCTTCTTGAGTTGTTTGCTGTAATCTGTCATTTTGTGTTTGAATCTATTTGAATCTTTAA
TCTTATT

QA 1 607 1 607
DS 

RD RS1FN19TF 599 0 0
G
CAACTCCACCACCATCCTCGGGTTATCCACCGTATCATGGTGGTCCACCTTCCGGAGGAG
GAGGGGCTCAACCAATGTGTCCGATCAACGCACTGAAGCTTGGAGCTTGTGTTGACGTTC
TGGGAGGTTTGATCCATATTGGACTTGGAAATCCAGTGGAGAATGTGTGTTGTCCAGTGT
TACAAGGGTTACTTTAGTTAGAAGCAGCCGTTTGTCTTTGCACAACCATAAGACTTAAGC
TTCTAAACTTAAACATCTTCATTCCTCTTGCACTGCAAGCTCTCATCACTTGTGGAATCA
ACCCTCCTCCTGGTTTTATCTGCCCTCCTCTTACTTGATAACGAACAACGTACGATCTAT
CAAGGGTTACGAGGCTTTTGAAATAATCTAAATATTTATATTTGTGTTCTTTTTGTTGAA
GATCAGGTTTGTTGGTTGTCTAGGGTTTTAACAAGTGCTTTTTAATTTTTGTCCCTTGTC
GTTGTTGTGATGATTAAGCTAGGGGTTTTGCATGTGTCTTCTTGAGTTGTTTGCTGTAAT
CTGTCATTTTGTGTTTGAATCTATTTGAATCTTTAATCTTATTAAGAAAGCCTTGCGA

QA 2 599 2 599
DS 



AS 1 3

CO CL1817Contig1 1137 3 4 U
GGATTTTAAGACACGATAGATTTATTAAAGTGCTCCAACATATAATCCGAAACTGGATTA
AGAACATAATAATATCCAAGGAAACAAAATTGAAAATTCTAAAACTTCAACGAACAGAAG
ACGATAACAAAAAAGAAAGAAACAGTTTGATAGATGTCTAAAGAGTGATCCAAAGGACAG
GAAAAGGAAAGGAGAATGACACTTATTGAAGTGGGGAGGAAACTTGCATTCATTCTTGGA
CGACTTCTTCAGTGACGTCAATAACATCCTCAAACTCAACTTCTTTGACTTCTTTGGCTT
CATCCTCTTCTTCTTCCTCATCACTGATTTCTCCATCCCTGAGGTTTTGCCTCGCAAGTT
TCTCCTCTTCCTGCAGCGACTTCCACTGCTTCACCCATTTCTCCCACTCTTCCTTCAACG
CCTTCCTCTTCTCCCTGTCTTGTTCACTCAAGAGCAACGACACGTCCTGATCCTCTAACT
CGTACTTCTTGCTGTACTTCTTCAGGTTCTTTGCTATCTCTTCTTCCTTCTCTGGAGACA
AGAATGATGGAGGTCTTGGGCGCCATGCCAACTGGAAGAAATGATCCTTCAGATTCCGGT
AAAGCAATTTTCCATTGAACGACCAGATGGTGAATCCATTCTCCATCTCATGGACTGACG
TCACTGCTGTTGCAACATACCTTCCAGTTGGGTCCCATTCGATATCAGTGGCCATGAAGT
GTTCAGTTGTGGCCATCGTCTCGAGCTCATCCACGTTGAAAAACTCAAGCTGGCCGTTGA
AATTCTTCAACCCAGCAAGAATAATGTACTTGCCTGTGGGAGACCAGAAGAGGGCATTGG
CTTGTTTGGCTTTCAAAGTACCGAGCTTCGTAACCCTTCCACCGTGTTGCGTGGTCTTCA
TCGTGTAGAAACTCACATCTGGTCTTGGTTGGTCACCGTGAATCACAGCAAACCTGTGAC
CCTTGGGCTCCCACGCGAAAGCGATGATCTTGTCGTTCTTGTTGTCCAGCTCGAGAACCT
CGATGGGAATATCCCTCTCTTTGATACGGAAGAGCCCGAAGCCAGAGTACGTGCTCTTCT
TCGTCTTTGTGTAACGGTCAACCTTGACGGCGAGATACTCTCCACTACTCTGCCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
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20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G387JQ U 54
AF RS1EP33JQ U 1
AF RS1EP33TF C 430
BS 1 319 RS1EP33JQ
BS 320 320 RS1G387JQ
BS 321 722 RS1EP33JQ
BS 723 1137 RS1EP33TF

RD RS1G387JQ 536 0 0
C
GGATTAAGAACATAATAATATCCAAGGAAACAAAATTGAAAATTCTAAAACTTCAACGAA
CAGAAGACGATAACAAAAAAGAAAGAAACAGTTTGATAGATGTCTAAAGAGTGATCCAAA
GGACAGGAAAAGGAAAGGAGAATGACACTTATTGAAGTGGGGAGGAAACTTGCATTCATT
CTTGGACGACTTCTTCAGTGACGTCAATAACATCCTCAAACTCAACTTCTTTGACTTCTT
TGGCTTCATCCTCTTCTTCTTCCTCATCACTGATTTCTCCATCCCTGAGGTTTTGCCTCG
CAAGTTTCTCCTCTTCCTGCAGCGACTTCCACTGCTTCACCCATTTCTCCCACTCTTCCT
TCAACGCCTTCCTCTTCTCCCTGTCTTGTTCACTCAAGAGCAACGACACGTCCTGATCCT
CTAACTCGTACTTCTTGCTGTACTTCTTCAGGTTCTTTGCTATCTCTTCTTCCCTCTCTG
GAGACAAGAATGATGGAGGTCTTGGGCGCCATGCCAACTGGAAGAAATGATCCTT

QA 2 536 2 536
DS 

RD RS1EP33JQ 722 0 0
GGATTTTAAGACACGATAGATTTATTAAAGTGCTCCAACATATAATCCGAAACTGGATTA
AGAACATAATAATATCCAAGGAAACAAAATTGAAAATTCTAAAACTTCAACGAACAGAAG
ACGATAACAAAAAAGAAAGAAACAGTTTGATAGATGTCTAAAGAGTGATCCAAAGGACAG
GAAAAGGAAAGGAGAATGACACTTATTGAAGTGGGGAGGAAACTTGCATTCATTCTTGGA
CGACTTCTTCAGTGACGTCAATAACATCCTCAAACTCAACTTCTTTGACTTCTTTGGCTT
CATCCTCTTCTTCTTCCTCGTCACTGATTTCTCCATCCCTGAGGTTTTGCCTCGCAAGTT
TCTCCTCTTCCTGCAGCGACTTCCACTGCTTCACCCATTTCTCCCACTCTTCCTTCAACG
CCTTCCTCTTCTCCCTGTCTTGTTCACTCAAGAGCAACGACACGTCCTGATCCTCTAACT
CGTACTTCTTGCTGTACTTCTTCAGGTTCTTTGCTATCTCTTCTTCCTTCTCTGGAGACA
AGAATGATGGAGGTCTTGGGCGCCATGCCAACTGGAAGAAATGATCCTTCAGATTCCGGT
AAAGCAATTTTCCATTGAACGACCAGATGGTGAATCCATTCTCCATCTCATGGACTGACG
TCACTGCTGTTGCAACATACCTTCCAGTTGGGTCCCATTCGATATCAGTGGCCATGAAGT
GT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RS1EP33TF 708 0 0
TTCT
CCTGTCTTGTTCACTCAAGAGCAACGACACGTC*TGATCCTCTAACTCGTACTTCTTGCT
GTACTTCTTCAGGTTCTTTGCTATCTCTTCTTCCTTCTCTGGAGACAAGAATGATGGAGG
TCTTGGGCGCCATGCCAACTGGAAGAAATGATCCTTCAGATTCCGGTAAAGCAATTTTCC
ATTGAACGACCAGATGGTGAATCCATTCTCCATCTCATGGACTGACGTCACTGCTGTTGC
AACATACCTTCCAGTTGGGTCCCATTCGATATCAGTGGCCATGAAGTGTTCAGTTGTGGC
CATCGTCTCGAGCTCATCCACGTTGAAAAACTCAAGCTGGCCGTTGAAATTCTTCAACCC
AGCAAGAATAATGTACTTGCCTGTGGGAGACCAGAAGAGGGCATTGGCTTGTTTGGCTTT
CAAAGTACCGAGCTTCGTAACCCTTCCACCGTGTTGCGTGGTCTTCATCGTGTAGAAACT
CACATCTGGTCTTGGTTGGTCACCGTGAATCACAGCAAACCTGTGACCCTTGGGCTCCCA
CGCGAAAGCGATGATCTTGTCGTTCTTGTTGTCCAGCTCGAGAACCTCGATGGGAATATC
CCTCTCTTTGATACGGAAGAGCCCGAAGCCAGAGTACGTGCTCTTCTTCGTCTTTGTGTA
ACGGTCAACCTTGACGGCGAGATACTCTCCACTACTCTGCCAGC

QA 5 708 5 708
DS 



AS 1 3

CO CL1818Contig1 716 3 17 U
GGACTTCGTCGTCGGCTCTGCCAAAAAAAAAAAAAAACTCTCTCTTATTCGCCGGAGATA
TGGGAGAAGGGAAAGGCTCTACTCTAGTTTTCGTCCTCGTCATCGCCCTCTGCTTAGTCG
CCTTCGGCTTCTCCATCGCCGCCGAACGCCGCCGGAGCATTGGAAAAAGTATACAAGATC
CAATAACAAATGCAACGTACTGCGTTTATAGCTCTGATGTAGCCACTGGTTATGGAGTTG
GAGCATTCCTTTTCCTCCTCTCTAGTGAATCATTGCTTATGGGTGTCACCAAATGTATGT
GCTTTGGTAGACCTTTGTCCCCAGGAAGTGACCGCGCTTGGTCTATTATCTATTTCATCT
CTTCTTGGATCACATTTCTGGTAGCTGAAGCTTGTTTAATTGCTGGAGCGACGAAGAACG
CATACCACACAAAGTACTTGAGCGCACAAGCCTTCTCGTGTGAGTCACTGCGCAAAGGAA
TTTTCATTGCAGGAGCAGTGTTTACGGTTGCAACTATGATCCTTAATGTCTACTACTACT
TCCACTTTACCAAATCCGTCTCTTCACCGCCTACTCACAAAGCAAACCGCTCTGGTTCAA
ATATCGGTATGGCTGTCTATGCATAAACGTCCCGGATGAAGAATAGAAATTGGTTAGTCA
TTTGTGGATGTAAGAAAAGAGGTGTTGCATTGTTACTATTGGTTACTCTTATATGT


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 0 5 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CD31TF U 11
AF RS1CW60TF U 2
AF RS1FV25TF U 1
BS 1 31 RS1FV25TF
BS 32 32 RS1CD31TF
BS 33 44 RS1FV25TF
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BS 223 253 RS1FV25TF
BS 254 254 RS1CD31TF
BS 255 310 RS1FV25TF
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BS 312 373 RS1FV25TF
BS 374 374 RS1CD31TF
BS 375 556 RS1FV25TF
BS 557 557 RS1CW60TF
BS 558 565 RS1FV25TF
BS 566 566 RS1CW60TF
BS 567 716 RS1FV25TF

RD RS1CD31TF 478 0 0
GGGTCGTCGGCTCTGCC
AAAAAAAAAACACTCTCTTATTCGCCGGAGATATGGGAGAAGGGAAAGGCTCTACTCTAG
TTTTCGTCCTCGTCATCGCCCTTTGTTTAGTCGCCTTCGGCTTCTCCATCGCCGCCGAAC
GCCGACAGAGCATTGGAAAAAGTATACAA**TCCAATAACAAATGCAACGTACTGCGTTT
ATAGCTCTGATGTAGCCACTGGTTATGGAGTTGGAGCATTCCTTTTCCTCCTCTCTAGTG
AATCATTGCTTATGGGTGTCACCAAATGTATGTGCTTTGGTAGACCTTTGTCCCCAGGAA
GTGACCGCGCTTGGTCTATTATCTATTTCATCTCTTCTTGGATCACATTTCTGGTAGCTG
AAGCTTGTTTAATTGCTGGAGCGACGAAGAATGCATACCACACAAAGTACTTGAGCGCAC
AAGCCTTCTCGTGCGAGTCACTGCGCAAAGGAATTTTCATT

QA 18 478 18 478
DS 

RD RS1CW60TF 571 0 0
GG
CTTCGTCGTCGGTTCTGCCAAAAAAAAA***AAACTCTCTCTTATTCGCCGGAGATATGG
GAGAAGGGAAAGGCTCTACTCTAGTTTTCGTCCTCGTCATCGCCCTCTGCTTAGTCGCCT
TCGGCTTCTCCATCGCCGCCGAACGCCACCGGAGCATTGGAAAAAGTATACAAGATCCAA
TAACAAATGCAACGTACTGCGTTTATAGCTCTGATGTAGCCACTGGTTATGGAGTTGGAG
CATTCCTTTTCCTCCTCTCTAGTGAATCATTGCTTATGGGTGTCGCCAAATGTATGTGCT
TTGGTAGACCTTTGTCCCCAGGAAGTGACCGCGCTTGGTCTATTATCTATTTCATCTCTT
CTTGGATCACATTTCTGGTAGCTGAAGCTTGTTTAATTGCTGGAGCGACGAAGAACGCAT
ACCACACAAAGTACTTGAGCGCACAAGCCTTCTCGTGTGAGTCACTGCGGAAAGGAATTT
TCATTGCAGGAGCAGTGTTTACGGTTGCAACTATGATCCTTAATGTCTACTACTACTTCC
ACTTTACCAAATCCGTCTCTTCACCGCCT

QA 3 571 3 571
DS 

RD RS1FV25TF 716 0 0
GGACTTCGTCGTCGGCTCTGCCAAAAAAAAAGAAAAACTCTCTCCTATTCGCCGGAGATA
TGGGAGAAGGGAAAGGCTCTACTCTAGTTTTCGTCCTCGTCATCGCCCTCTGCTTAGTCG
CCTTCGGCTTCTCCATCGCCGCCGAACGCCGCCGGAGCATTGGAAAAAGTATACAAGATC
CAATAACAAATGCAACGTACTGCGTTTATAGCTCTGATGTACCCACTGGTTATGGAGTTG
GAGCATTCCTTTTTCTCCTCTCTAGTGAATCATTGCTTATGGGTGTCACCAAATGTATGT
GCTTTGGTAGGCCTTTGTCCCCAGGAAGTGACCGCGCTTGGTCTATTATCTATTTCATCT
CTTCTTGGATCACGTTTCTGGTAGCTGAAGCTTGTTTAATTGCTGGAGCGACGAAGAACG
CATACCACACAAAGTACTTGAGCGCACAAGCCTTCTCGTGTGAGTCACTGCGCAAAGGAA
TTTTCATTGCAGGAGCAGTGTTTACGGTTGCAACTATGATCCTTAATGTCTACTACTACT
TCCACTTTACCAAATCTGTCTCTTCTCCGCCTACTCACAAAGCAAACCGCTCTGGTTCAA
ATATCGGTATGGCTGTCTATGCATAAACGTCCCGGATGAAGAATAGAAATTGGTTAGTCA
TTTGTGGATGTAAGAAAAGAGGTGTTGCATTGTTACTATTGGTTACTCTTATATGT

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 3

CO CL1819Contig1 1307 3 27 U
GGATGAGAAACTGGTATCAATATCTCAATTGATCAAATGTCTGAATTAAACCATTATGAA
AAACAAGAAACCTCTGCAACTGTCAATAAATAAAGATCACAGACCACCTATTTTAAAACA
AAAAAACGAAACTGCTTTCTTCTTGATGTTTGAGTCCATATTCCCTCGTCTTTTTTCCCC
AGTGCTTTTGATTTTATGATCGATAGAAAAATATCCATGTGAGACTTACTCGGCCTTTGT
CTTAAATTTCTTGAGAAGACTGGAAGTTCTGAACTCAGCATCGTCTCTAATAAAGCTCCA
CCAGAGAACAGTAAGAGGAACTGTGATGGCGTGCCAGATGGAGTGAGCATCGAAGTAGCC
TTCAAACGGAGGAAAATCATATATCTCCAAAAGCATAGCTAAGCCTCCAGCAATCACAAC
CACCCAAAGTTTCCAACTAGAAGGATGTCTCGAGACAGCTGCCCATCTTGACCATAGCAA
TAGCTGAGCGACTCCCATGGTCACACACACAATCATGTTCCAACCATAGTCGAGTTTGTA
GAAGTTAATGTATAGTATGTGGGTGGTGACGAAAGCTAGTATTGGAGCGGACACCATGAC
TCTTGCAACCTCGACTCGAACATCAAAGGTTCTTAAGATGGCTAAGATGAGTGAGAATCC
GAGAAATGCAATTGCAGATGAGTAGTCCAACCTCTCTGCGAGATCAACATCCCGGCTGTG
GAAAACAGCACTCCAGAACCAAGAGTTCATGGAGAGGAGACCATACATATGCCACAAACC
GACGTACTCATAGTAAGCCGTCTTGTCTTGTTTGAGAAGCAACTTATAGTATAGTGTAAT
GAAGAAGGAAAGCCAGCCATGGAAATGCATCGCTAGGTTGAGCACAGAGAAAGCAACAGA
AGCAGGCTCCTGAATCCCAAGGACACGCTTGAAGGGCCATTTACCATGGTACTTGACAGG
GACATGACCAAGAGATTCTCGTTCTTTCTCTCTATTAACCATACAGTGATAACGGCAATC
ACCTTGACAGCCCAGCTTCTGCCATTGTAGATACAGAGGTTCTTGTGTGTACCATGGACC
GCCATCGGTGGAAGAAGAATTGCACTGAGGAAAGCACACTTGTCCAACGCAACCGTTTCT
CTCGCAATCTGCAACACATGTCCTGTAGTTTGGATCGGCATCGCCAAGGCTAGCATATGA
AACACTGACAAGGCATGACAACACTAGCGATAGGGCTGTCAGATAATGAACTGCCATCTG
AGGAAAAGATCAACAAGCTGCGAGTTCGAGAGTCTGGTCTTCGCCCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1G978JQ U 1
AF RS1AF49JQ U 2
AF RS1GX83TF C 520
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AAAAAACGAAACTGCTTTCTTCTTGATGTTTGAGTCCATATTCCCTCGTCTTTTTTCCC*
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TCT
TGCAGCC

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DS 

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A
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AAAACGAAACTGCTTTCTTCTTGATGTTTGAGTCCATATTCCCTCGTCTTTTTTCCCCAG
TGCTTTTGATTTTATGATCGATAGAAAAATATCCATGTGAGACTTACTCGGCCTTTGTCT
TAAATTTCTTGAGAAGACTGGAAGTTCTGAACTCAGCATCGTCTCTAATAAAGCTCCACC
AGAGAACAGTAAGAGGAACTGTGATGGCGTGCCAGATGGAGTGAGCATCGAAGTAGCCTT
CAAACGGAGGAAAATCATATATCTCCAAAAGCATAGCTAAGCCTCCAGCAATCACAACCA
CCCAAAGTTTCCAACTAGAAGGATGTCTCGAGACAGCTGCCCATCTTGACCATAGCAATA
GCTGAGCGACTCCCATGGTCACACACACAATCATGTTCCAACCATAGTCGAGTTTGTAGA
AGTTAATGTATAGTATGTGGGTGGTGACGAAAGCTAGTATTGGAGCGGACACCATGACTC
TTGCAACCTCGACTCGAACATCAAAGGTTCTTAGGATGGCTAAGATGAGTGAGAATCCGA
GAAATGCAATTGCAGATGAGTAGTCTAACCTCTCTGTGAGATCAACATCCCGGCTGTGGA
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GTTGAAG

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DS 

RD RS1GX83TF 788 0 0
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TTTACCATGGTACTTGACAGGGACATGACCAAGAGATTCTCGTTCTTTCTCTCTATTAAC
CATACAGTGATAACGGCAATCACCTTGACAGCCCAGCTTCTGCCATTGTAGATACAGAGG
TTCTTGTGTGTACCATGGACCGCCATCGGTGGAAGAAGAATTGCACTGAGGAAAGCACAC
TTGTCCAACGCAACCGTTTCTCTCGCAATCTGCAACACATGTCCTGTAGTTTGGATCGGC
ATCGCCAAGGCTAGCATATGAAACACTGACAAGGCATGACAACACTAGCGATAGGGCTGT
CAGATAATGAACTGCCATCTGAGGAAAAGATCAACAAGCTGCGAGTTCGAGAGTCTGGTC
TTCGCCCC

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 5

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GAGAAATAGATAACAATGGCTGAAGAAGAAGCTAAGGCGATGGCTGTAGAAGAAACTAAA
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GGCAAGAAGAAGAAGAAGAAAGTTGCTGATATCAAACGTCCTGAAGATTTTGTCTTAGAG
TACAGAGCTAAGGAAGTAGATCTTATCAGGATGAAGCAAAGGGTTAAGAGGCCAAAGTCA
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ATGCACCCAAAGACCAAGAAGGTTCTTAACAGTATGCAACTAAGAAGCACTTTCACTGGT
GTCTTTGCCAAAGCAACTGACGGTTTGTTTCAAAAGCTTCTCAAAGTTCAGCCTTACGTT
ACCTACGGATATCCGAGTGATAAGAGCGTTAAGGACCTCATATTCAAAAAGGGGTACACA
ATCATAGAGGGCAACCCTGTTCCTCTTACAGACAACAACATAATCGAACAGGCTCTTGGA
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TTCAGAGAAGTTATGAGATTTTTGGGGCCTTTGAAACTCAACAAGCCTGAGGCTGGTGTC
TTGCATGGCAAGAAACAGGTTTTCAGTGAAGGAGGTGATACAGGAAACCGTCAAGACAAG
ATCAACGATCTCATCATCAAAATGAACTAAGTTGTTTTAGTTTTTTCAGAAAAAATCTGT
ATGAGACTCTTTTTTTTAAAACGCTATTGCAATTTTGATTAAAATAGGAAAATCATTCCC
CAGTTTGATTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1GA28TF U 22
AF RS1ET30TF U 1
AF RS1EI22TF U 22
AF RS1EI22JQ C 447
AF RS1GA28JQ C 485
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BS 225 225 RS1EI22TF
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BS 676 740 RS1EI22TF
BS 741 741 RS1EI22JQ
BS 742 750 RS1EI22TF
BS 751 751 RS1EI22JQ
BS 752 794 RS1EI22TF
BS 795 973 RS1EI22JQ

RD RS1GA28TF 304 0 0
GG
GCTTCTCGGCCAACTTCGATTGCTTCGTCGCCACTGAGAGAAATAGATAACAATGGCTGA
AGAAGAAGCTAAGGCGATGGCTGTAGAAGAAACTAAAGTTATGGCTGAAGAAGAACCTAA
GGGGTTAGACTACATACCTGAGGTTATACTGAAGAAGAGGAAGAACAGAGATGAGCTTGC
CTTTATCAGGAAGAAACAGCTTGAGCTTGGAAACTTCGGCAAGAAGAAGAAGAAGAAAGT
TGCTGATATCAAACGTCCTGAAGATTTTGTCTTAGAGTACAGAGCTAAGGAAGTAGATCT
TA

QA 3 304 3 304
DS 

RD RS1ET30TF 647 0 0
GGGCTAGAAATCTCAATCAGTCAGCTTCTCGGCCAACTTCGATTGCTTCGTCGCCACTGA
GAGAAATAAATAACAATGGCTGAAGAAGAAGCTAAGGCGATGGCTGTAGAAGAAACTAAA
GTTATGGCTGAAGAAGAACCTAAGGGGTTAGACTACATACCTGAGGTTATACTGAAGAAG
AGTAAAAACAGAGATGAGCTTGCCTTTATCAGGAAGAAACAGCTCGAGCTTGGAAACTTC
GGCAAGAAGAAGAAGAAGAAAGTTGCTGATATCAAACGTCCTGAAGATTTTGTCTTAGAG
TACAGAGCTAAGGAATTAGATCTTATCAGGATGAAGCAAAGGGTTAAGAGGCCAAAGTCA
TCTCCTCCACCAATCAATTCTAACCTTGTCTTCATCATACGCATACAAGGGAAGAATGAT
ATGCACCCAAAGACCAAGAAGGTTCTTAACAGTATGCAACTAAGAAGCACTTTCACTGGT
GTCTATGCCAAAGCAACTGACGGTTTGTTTCAAAAGCTTCTCAAAGTTCAGCCTTACGTT
ACCTACGGATATCCGAGTGATAAGAGCGTTAAGGACCTCATATTCAAAAAGGGGTACACA
ATCATAGAGGGCAACCCTGTTCCTCTTACAGACAACAACATAATCGA

QA 1 647 1 647
DS 

RD RS1EI22TF 773 0 0
GG
GCTTCTCGGCCAACTTCGATTGCTTCGTCGCCACTGAGAGAAATAGATAACAATGGCTGA
AGAAGAAGCTAAGGCGATGGCTGTAGAAGAAACTAAAGTTATGGCTGAAGAAGAACCTAA
GGGGTTAGACTACATACCTGAGGTTATACTGAAGAAGAGGAAGAACAGAGATGAGCTTGC
CTTTATCAGGAAGAAACAGCTTGAGCTTGGAAACTTCGGCAAGAAGAAGAAGAAGAAAGT
TGCTGATATCAAACGTCCTGAAGATTTTGTCTTAGAGTACAGAGCTAAGGAAGTAGATCT
TATCAGGATGAAGCAAAGGGTTAAGAGGCCAAAGTCATCTCCTCCACCAATCAATTCTAA
CCTTGTCTTCATCATACGCATACAAGGGAAGAATGATATGCACCCAAAGACCAAGAAGGT
TCTTAACAGTATGCAACTAAGAAGCACTTTCACTGGTGTCTTTGCCAAAGCAACTGACGG
TTTGTTTCAAAAGCTTCTCAAAGTTCAGCCTTACGTTACCTACGGATATCCGAGTGATAA
GAGCGTTAAGGACCTCATATTCAAAAAGGGGTACACAATCATAGAGGGCAACCCTGTTCC
TCTTACAGACAACAACATAATCGAACAGGCTCTTGGAGAGCACGAAATCTTCTGCATTGA
AGACCTTGTGAATGAGATAGCAAGGGTCGGTGTTCATTTCAGAGAAGTTATGAGATTCTT
GGGGCCTCTGAAACTCAACAAGCCTGAGGCTGGTGTCTTGCATGGCAAGAA

QA 3 773 3 773
DS 

RD RS1EI22JQ 527 0 0
TAACAGTATGCAACTAAGAAGCACTTTCACTGGTGTCTTTGCCAAAGCAACTGACGGTTT
GTTTCAAAAGCTTCTCAAAGTTCAGCCTTACGTTACCTACGGATATCCGAGTGATAAGAG
CGTTAAGGACCTCATATTCAAAAAGGGGTACACAATCATAGAGGGCAACCCTGTTCCTTT
TACAGACAACAACATAATCGAACAGGCTTTTGGAGAGCACGAAATTTTTTGCATTGAAGA
CCTTGTGAATGAGATAGCAAGGGTCGGTGTTCATTTCAGAGAAGTTATGAGATTTTTGGG
GCCTTTGAAACTCAACAAGCCTGAGGCTGGTGTCTTGCATGGCAAGAAACAGGTTTTCAG
TGAAGGAGGTGATACAGGAAACCGTCAAGACAAGATCAACGATCTCATCATCAAAATGAA
CTAAGTTGTTTTAGTTTTTTCAGAAAAAATCTGTATGAGACTCTTTTTTTTAAAACGCTA
TTGCAATTTTGATTAAAATAGGAAAATCATTCCCCAGTTTGATTTTG

QA 1 527 1 527
DS 

RD RS1GA28JQ 489 0 0
T
TGCCAAAGCAACTGACGGTTTGTTTCAAAAGCTTCTCAAAGTTCAGCCTTACGTTACCTA
CGGATATCCGAGTGATAAGAGCGTTAAGGACCTCATATTCAAAAAGGGGTACACAATCAT
AGAGGGCAACCCTGTTCCTTTTACAGACAACAACATAATCGAACAGGCTCTTGGAGAGCA
CGAAATTTTTTGCATTGAAGACCTTGTGAATGAGATAGCAAGGGTCGGTGTTCATTTCAG
AGAAGTTATGAGATTTTTGGGGCCTTTGAAACTCAACAAGCCTGAGGCTGGTGTCTTGCA
TGGCAAGAAACAGGTTTTCAGTGAAGGAGGTGATACAGGAAACCGTCAAGACAAGATCAA
CGATCTCATCATCAAAATGAACTAAGTTGTTTTAGTTTTTTCAGAAAAAATCTGTATGAG
ACTCTTTTTTTTAAAACGCTATTGCAATTTTGATTAAAATAGGAAAATCATTCCCCAGTT
TGATTTTG

QA 2 489 2 489
DS 



AS 2 4

CO CL1821Contig1 766 2 16 U
TGATAGACTCGCCACAAAAAAATCAGTTTCTCTCTCTCTAAGCAAAGAAAAACTGAAGGA
ACTCCATTCTCACAAGAATGGGGAAGCTTAAGCAATGTTGGTCAAGTGTGCTAGTGTTGG
CAATAGTGGTGATCGGAACAGGAGCCGTTCCCATCACTTATCTACAAAGCGCCGTAGCTA
AAGGAGCCGTGTGTTTGGATGGGAGTGCACCAGCCTACCATTTCGACAAAGGGTTTGGTT
CGGGAGTTAACAACTGGATTGTTCACATGGAGGGAGGAGGATGGTGTACCGATGTGGCTT
CATGTATTAAGCGTAAGGGTACAATGAAGGGTTCGTCCAAATTCATGAACAAAGACTTTG
GTTTCTCCGGTATCTTGGGTGGCAAGCAAAACACTAACCCAGATTTTTACAATTGGAATA
GAATCAAAGTACGTTATTGTGACGGATCATCTTTCACCGGCAATGTAGAAGCTGTTAATC
CGGCGAATAAGCTGTTCTTCCGCGGTGCACGAGTTTGGCGTGCGGTGATCGATGATCTCA
TGGCTAAAGGAATGAAAAACGCTCAAAATGCGATACTCTCGGGTTGTTCAGCCGGAGCAT
TGGCGGCAATTCTACATTGTGACACGTTCCGCGCCATACTTCCCCGGACAGCTAGAGTCA
AATGTGTTTCCGACGCCGGTTACTTCATCCACGGTAAAGATATCTCAGAGGATCATATAT
TCAATCTTACTACAGTAAAGTTGTCGCACTCCACGGATCTGCAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A411TF U 1
AF RS1BN51TF U 70
BS 1 103 RS1A411TF
BS 104 104 RS1BN51TF
BS 105 288 RS1A411TF
BS 289 289 RS1BN51TF
BS 290 560 RS1A411TF
BS 561 561 RS1BN51TF
BS 562 592 RS1A411TF
BS 593 593 RS1BN51TF
BS 594 625 RS1A411TF
BS 626 626 RS1BN51TF
BS 627 670 RS1A411TF
BS 671 671 RS1BN51TF
BS 672 688 RS1A411TF
BS 689 689 RS1BN51TF
BS 690 704 RS1A411TF
BS 705 766 RS1BN51TF

RD RS1A411TF 704 0 0
TGATAGACTCGCCACAAAAAAATCAGTTTCTCTCTCTCTAAGCAAAGAAAAACTGAAGGA
ACTCCATTCTCACAAGAATGGGGAAGCTTAAGCAATGTTGGTCGAGTGTGCTAGTGTTGG
CAATAGTGGTGATCGGAACAGGAGCCGTTCCCATCACTTATCTACAAAGCGCCGTAGCTA
AAGGAGCCGTGTGTTTGGATGGGAGTGCACCAGCCTACCATTTCGACAAAGGGTTTGGTT
CGGGAGTTAACAACTGGATTGTTCACATGGAGGGAGGAGGATGGTGTATCGATGTGGCTT
CATGTATTAAGCGTAAGGGTACAATGAAGGGTTCGTCCAAATTCATGAACAAAGACTTTG
GTTTCTCCGGTATCTTGGGTGGCAAGCAAAACACTAACCCAGATTTTTACAATTGGAATA
GAATCAAAGTACGTTATTGTGACGGATCATCTTTCACCGGCAATGTAGAAGCTGTTAATC
CGGCGAATAAGCTGTTCTTCCGCGGTGCACGAGTTTGGCGTGCGGTGATCGATGATCTCA
TGGCTAAAGGAATGAAAAACTCTCAAAATGCGATACTCTCGGGTTGTTCAGCTGGAGCAT
TGGCGGCAATTCTACATTGTGACACTTTCCGCGCCATACTTCCCCGGACAGCTAGAGTCA
AATGTGTTTCGGACGCCGGTTACTTCATTCACGGTAAAGATATC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1BN51TF 697 0 0
TCACAAGAATGGGGAAGCTTAAGCAATGTTGGTCAAGTGTGCTAGTGTTGGCAATAGTGG
TGATCGGAACAGGAGCCGTTCCCATCACTTATCTACAAAGCGCCGTAGCTAAAGGAGCCG
TGTGTTTGGATGGGAGTGCACCAGCTTACCATTTCGACAAAGGGTTTGGTTCGGGAGTTA
ACAACTGGATTGTTCACATGGAGGGAGGAGGATGGTGTACCGATGTGGCTTCATGTATTA
AGCGTAAGGGTACAATGAAGGGTTCGTCCAAATTCATGAACAAAGACTTTGGTTTCTCCG
GTATCTTGGGTGGCAAGCAAAACACTAACCCAGATTTTTACAATTGGAATAGAATCAAAG
TACGTTATTGTGACGGATCATCTTTCACCGGCAATGTAGAAGCTGTTAATCCGGCGAATA
AGCTGTTCTTCCGCGGTGCGCGAGTTTGGCGTGCGGTGATCGATGATCTCATGGCTAAAG
GGATGAAAAACGCTCAAAATGCTATACTCTCGGGTTGTTCAGCCGGAGCATTGGCGGCAA
TTCTACATTGTGACACGTTCCGCGCCATACTTCCCCGGACAGCTAGAGTCAAATGTGTTT
CCGACGCCGGTTACTTCATCCACGGTAAAGATATCTCAGAGGATCATATATTCAATCTTA
CTACAGTAAAGTTGTCGCACTCCACGGATCTGCAAAG

QA 1 697 1 697
DS 



CO CL1821Contig2 865 2 6 U
AACGGAAAATTACTCTTTTATTCATTATTGCTGCAGTTTTGTCTTAATAAACTCTTTTTA
TTCATCTCAGCAATTAATAATTTATCCGAATATCCGAGTGATTTTTATTTGAAATTTTAA
AAATTACATTTTTCAATAATATAATATAAGATTTATTCGTCGGTAGAGATAGCAGGACAA
GTAGGGTTGCAAATCGGCGACGGACAGTCTATCTTCTGGAATGCACTCCGGCCGTAAAAC
CAGTTTCCCACCGCTACCGAAATTTTCGTATTGGCGACTTGGGGACCTTTGGCGCCGGAC
CAAGAGGCGGCGCTTCCACCTTGGCAATGAGCGTGACACGAGTCCAAGAACAATCCTCTC
GACGGAGTACTGTGGACCGGAAACAATGCTCGCATCATCTCATCTCTAAACCCTTGGACG
GCTTTGAGCTGAGCGGCCGAACATTTCTTGAGATCGAGCTTGCAGTTCGCCCACTCTTTG
CGCTTATCTACTCCCGTCGGAGCCAAAACGTTCTTGATCTGCCAGGAGTCGAATGCAGCG
TTAATGACAAAGAGCGGTGTTCGCATGGAAGGGACGACGTATTGCGGGAAGAAACAGAGT
TCGGGTTTCATTTTTGAGGTACATGAAAGAGGAAGACTCTCTGCAGATCCGTGGAGTGCA
ACAACTTTACTGTAGTAAGATTGTATGTATGATCCTCCTGAGATATCTTTACCGTGAATG
AAGTAACCGGCGTCCGAAACACATTTGACTCTAGCTGTCCGGGGAAGTATGGCGCGGAAA
GTGTCACAATGTAGAATTGCCGCCAATGCTCCAGCTGAACAACCCGAGAGTATCGCATTT
TGAGAGTTTTTCATTCCTTTAGCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G036JQ U 1
AF RS1A411JQ U 60
BS 1 412 RS1G036JQ
BS 413 413 RS1A411JQ
BS 414 421 RS1G036JQ
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RD RS1G036JQ 498 0 0
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TTCATCTCAGCAATTAATAATTTATCCGAATATCCGAGTGATTTTTATTTGAAATTTTAA
AAATTACATTTTTCAATAATATAATATAAGATTTATTCGTCGGTAGAGATAGCAGGACAA
GTAGGGTTGCAAATCGGCGACGGACAGTCTATCTTCTGGAATGCACTCCGGCCGTAAAAC
CAGTTTCCCACCGCTACCGAAATTTTCGTATTGGCGACTTGGGGACCTTTGGCGCCGGAC
CAAGAGGCGGCGCTTCCACCTTGGCAATGAGCGTGACACGAGTCCAAGAACAATCCTCTC
GACGGAGTACTGTGGACCGGAAACAATGCTCGCATCATCTCATCTCTAAACCTTTGGACG
GTTTTGAGCTGAGCGGCCGAACATTTCTTGAGATCGAGCTTGCAGTTCGCCCACTCTTTG
CGCTTATCTACTCC
CGTC

QA 1 494 1 494
DS 

RD RS1A411JQ 806 0 0
ATTCATCTCAGCAATTAATAATTTATCCGAATATCCGAGTGATTTTTATTTGAAATTTTA
AAAATTACATTTTTCAATAATATAATATAAGATTTATTCGTCGGTAGAGATAGCAGGACA
AGTAGGGTTGCAAATCGGCGACGGACAGTCTATCTTCTGGAATGCACTCCGGCCGTAAAA
CCAGTTTCCCACCGCTACCGAAATTTTCGTATTGGCGACTTGGGGACCTTTGGCGCCGGA
CCAAGAGGCGGCGCTTCCACCTTGGCAATGAGCGTGACACGAGTCCAAGAACAATCCTCT
CGACGGAGTACTGTGGACCGGAGACAATGCTCGCATCATCTCATCTCTAAACCCTTGGAC
GGCTTTGAGCTGAGCGGCCGAACATTTCTTGAGATCGAGCTTGCAGTTCGCCCACTCTTT
GCGCTTATCTACTCCCGTCGGAGCCAAAACGTTCTTGATCTGCCAGGAGTCGAATGCAGC
GTTAATGACAAAGAGCGGTGTTCGCATGGAAGGGACGACGTATTGCGGGAAGAAACAGAG
TTCGGGTTTCATTTTTGAGGTACATGAAAGAGGAAGACTCTCTGCAGATCCGTGGAGTGC
AACAACTTTACTGTAGTAAGATTGTATGTATGATCCTCCTGAGATATCTTTACCGTGAAT
GAAGTAACCGGCGTCCGAAACACATTTGACTCTAGCTGTCCGGGGAAGTATGGCGCGGAA
AGTGTCACAATGTAGAATTGCCGCCAATGCTCCAGCTGAACAACCCGAGAGTATCGCATT
TTGAGAGTTTTTCATTCCTTTAGCCA

QA 1 806 1 806
DS 



AS 1 5

CO CL1822Contig1 827 5 5 U
GGAACACATTATCATCCTCTCTCTCTCTCTTAAAGATGGGATTGCTCGATCTGGAGAA*C
ACTTCGCCTTCTACGGCGCATACCACAGCAACCCAATCAACATCGCGATCCACATCATCT
TCGTATGGCCCATCGTCTTCACAGCCTTGCTTCTCCTCTACCCAGCCTCCCCAATTTACG
ACCTTTCTCAATTAGGGTTTCCTCAGTCGATGACCCTCGACGGCGTTCTGAGGTTAGACG
TCGGGTTCGTCGTCACGGTGGCTTATGCTCTGTTCTACATCTGTTTGGATAAGAAATCCG
GGTTCGTCGCGGCTCTCATGTGTTTCGCTTGCTGGGTTGGGTCCAGTGTCCTCGCTGTTC
GGTTAGGACCTTCTCTTGCCGTAAAGGTTGGGTTAGCATCTCAGCTGTTATGTTGGACCG
GGCAGTTTCTTGGACATGGATTATTCGAGAAACGAGCACCTGCGCTTTTAGACAATCTAG
CCCAAGCTTTTCTCATGGCTCCTTTCTTTGTGTTGCTTGAGATTCTTCAAATGGTTTTCG
GGTACGAGCCATATCCAGGTTTTCAAGCTCGTGTCAATGCCAAGGTAGAAAGTAGCATAA
AGGAATGGAGAGAAAAGAAGCAGATGAAGAATAATAAGCTCACATAAGCTTTGGATTAAT
ATAACTGAAGAACCTAAAACCCATTGTCATGTTTATTACATTAAAACCCCACGTAATAAT
AAGACCACCATTGATTGATGGGTTTGTGTATAACTATGTTTCAATATAGTTGACAAAAAA
ATTGCGTTTCAGTTCAATATGTTGAACGGAACTTCAAAGTTGAACAC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DF44TF U 0
AF RS1CA52TF U 3
AF RS1CA52JQ C 109
AF RS1AK01TF U 1
AF RS1AK01JQ C 4
BS 1 392 RS1AK01TF
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RD RS1DF44TF 610 0 0
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TGGCTTATGCTCTGTTCTACATCTGTTTGGATAAGAAATCCGGGTTCGTCGCGGCTCTCA
TGTGTTTCGCTTGCTGGGTTGGGTCCAGTGTCCTCGCTGTTCGGTTAGGACCTTCTCTTG
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GTTTTCAAGCTCGTGTCAATGCCAAGGTAGAAAGTAGCATAAAGGAATGGA

QA 20 610 20 610
DS 

RD RS1CA52TF 701 0 0
GGAACACATTATCATC
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CATACCACAGCAACCCAATCAACATCGCGATCCACATCATCTTCGTATGGCCCATCGTCT
TCACAGCCTTGCTTCTCCTCTACCCAGCCTCCCCAATTTACGACCTTTCTCAATTAGGGT
TTCCTCAGTCGATGACCCTCGACGGCGTTCTGAGGTTAGACGTCGGGTTCGTCGTCACGG
TGGCTTATGCTCTGTTCTACATCTGTTTGGATAAGAAATCCGGGTTCGTCGCGGCTCTCA
TGTGTTTCGCTTGCTGGGTTGGGTCCAGTGTCCTCGCTGTTCGGTTAGGACCTTCTCTTG
CCGTAAAGGTTGGGTTAGCATCTCAGCTGTTATGTTGGACCGGGCAGTTTCTTGGACATG
GATTATTCGAGAAACGAGCACCTGCGCTTTTAGACAATCTAGCCCAAGCTTTTCTCATGG
CTCCTTTCTTTGTGTTGCTTGAGATTCTTCAAATGGTTTTCGGGTACGAGCCATATCCAG
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ACCCATTGTCATGTTTATTACATTA

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DS 

RD RS1CA52JQ 629 0 0
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TCCTCGCTGTTCGGTTAGGACCTTCTCTTGCCGTAAAGGTTGGGTTAGCATCTCAGCTGT
TATGTTGGACCGGGCAGTTTCTTGGACATGGATTATTCGAGAAACGAGCACCTGCGCTTT
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AAAGTAGCATAAAGGAATGGAGA**AAAGAAGCAGATGAAGAATAATAAGCTCACATAAG
CTTTGGATTAATATAACTGAAGAACCTAAAACCCATTGTCATGTTTATTACATTAAAACC
CCACGTAATAATAAGACCACCATTGAT
GG

QA 1 627 1 627
DS 

RD RS1AK01TF 827 0 0
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ACCTTTCTCAATTAGGGTTTCCTCAGTCGATGACCCTCGACGGCGTTCTGAGGTTAGACG
TCGGGTTCGTCGTCACGGTGGCTTATGCTCTGTTCTACATCTGTTTGGATAAGAAATCCG
GGTTCGTCGCGGCTCTCATGTGTTTCGCTTGCTGGGTTGGGTCCAGTGTCCTCGCTGTTC
GGTTAGGACCTTCTCTTGCCGTAAAGGTTGGGCTAGCATCTCAGCTGTTATGTTGGACCG
GGCAGTTTCTTGGACATGGATTATTCGAGAAACGAGCACCTGCGCTTTTAGACAATCTAG
CCCAAGCTTTTCTCATGGCTCCTTTCTTTGTGTTGCTTGAGATTCTTCAAATGGTTTTCG
GGTACGAGCCATATCCAGGTTTTCAAGCTCGTGTCAATGCCAAGGTAGAAAGTAGCATAA
AGGAATGGAGAGAAAAGAAGCAGATGAAGAATAATAAGCTCACATAAGCTTTGGATTAAT
ATAACTGAAGAACCTAAAACCCATTGTCATGTTTATTACATTAAAACCCCACGTAATAAT
AAGACCACCATTGATTGATGGGTTTGTGTATAACTATGTTTCAATATAGTTGACAAAAAA
*TTGCGTTTCAGTTCAATATGTTGAACGGAACTTCAAAGTTGAACAC

QA 1 827 1 827
DS 

RD RS1AK01JQ 824 0 0
ACACATTATCATCCTCTCTCTCTCTCTTAAAGATGGGATTGCTCGATCTGGAGAA*CACT
TCGCTTTCTACGGCGCATACCACAGCAACCCAATCAACATCGCGATCCACATCATCTTCG
TATGGCCCATCGTCTTCACAGCCTTGCTTCTCCTCTACCCAGCCTCCCCAATTTACGACC
TTTCTCAATTAGGGTTTCCTCAGTCGATGACCCTCGACGGCGTTCTGAGGTTAGACGTCG
GGTTCGTCGTCACGGTGGCTTATGCTCTGTTCTACATCTGTTTGGATAAGAAATCCGGGT
TCGTCGCGGCTCTCATGTGTTTCGCTTGCTGGGTTGGGTCCAGTGTCCTCGCTGTTCGGT
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AGTTTCTTGGACATGGATTATTCGAGAAACGAGCACCTGCGCTTTTAGACAATCTAGCCC
AAGCTTTTCTCATGGCTCCTTTCTTTGTGTTGCTTGAGATTCTTCAAATGGTTTTCGGGT
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AATGGAGAGAAAAGAAGCAGATGAAGAATAATAAGCTCACATAAGCTTTGGATTAATATA
ACTGAAGAACCTAAAACCCATTGTCATGTTTATTACATTAAAACCCCACGTAATAATAAG
ACCACCATTGATTGATGGGTTTGTGTATAACTATGTTTCAATATAGTTGACAAAAAAATT
GCGTTTCAGTTCAATATGTTGAACGGAACTTCAAAGTTGAACAC

QA 1 824 1 824
DS 



AS 1 5

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ATCCTATTCGTCAACCACACAAGAAATGGCTAGTTTTATGTCCGGAGCAGTACAGTTCAG
AAGAGGTCTGAAACCTAAAGGGAAGACTTATGGATTGACCAATCAAAAGAGAAGAGAGAT
TAGAGAAATCTTTGATCTCTTCGACATAGACGGTTCAGGTAGCATCGATGCTCGCGAGCT
CAACGTTGCTATGAGGTCTCTGGGGTTTGAGATGACTAATGAGCAAATAAACGAACTGAT
GGCGGAGGTGGATAAAAACAATAGCGGAACAATAGATTTCGAAGAGTTTGTGCATATGAT
GACAACTAAATTCGGAGAACGAGACTCTACAGATGAATTGTCCAAAGCATTTAAGATCAT
TGATCACGACAACAATGGAAAGATTTCACCTCACGATATAAAGCAGATTGCGAAGGAGCT
AGGAGAAAATTTCACAGATAATGAGATAGAAGAAATGGTCGAAGAAGCTGATCGTGATAA
AGATGGAGAAGTTAGTTTGGAGGAGTTCATGAAGATGATGAGGAGAACTTCTTACGGCTA
CTAATAGTATTGCTTGTTGAATATATTAAGTTAATCACTGCGATTATATAATAAAACTGA
TTTGTCGTAAATAAAGAAGTTTGAAGTGTGTTTTGAGAATAAAAATGTAATGATGTAATT
ACATCCATTATTGAGAACATGTCAAATGTCTCATATTTGTTTTATGCCTCTGCGCCATAT
CTATGTATATAATATTAGTCACATCATTATATCATATGACCTGTTTGTATAAACTCAAAA
ACAATAGGAAATGTATTCGGTGC


BQ
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GG
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E454TF U 1
AF RS1AS80TF U 1
AF RS1CU95TF U 446
AF RS1CU95JQ C 675
AF RS1AS80JQ C 661
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BS 252 759 RS1AS80TF
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CACGAACGTGACATCGATGGTAGAGTACGGTAAACGCCCAAAAAAGTACTACAGAAAAAC
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CCTTGGGCAAACTGATTGGACGGTGAAAACATTAGATCAGATTACAAAACGGGACTTCGA
CGTCTTCCTACTTCCCGGCGACCTCTCCTATGCAGACAACCACCAGCCACTATGGGATTC
TTTTGGCCGCCTC

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DS 

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CAGTATATTCTTTTTCTCTCCGTTTTTATCTCAAGCTTATAATCATGATTCGAATTACAC
CCGCCCGCCGCCTCGTGCAAACTTCATCGTCTCTCATGGCCACCCAAACTTCTATCCTCA
ACAGGTGCACGTATCATTGGCGGGTATGGATCACATGAGAGTAACATACATAACGGACGA
CACGAACGTGGCATCGATGGTAGAGTACGGTAAACGCCCAAAAAAGTACGACAGAAAAAC
AACTGGAGAATCCACTTCTTATAGATTCTTCTTCTACAGCTCCGGCAAGATCCACCATAT
CAAGATTGGTCCTCTTCAGCCAAGCACCACTTACTATTACCGTTGCGGTGGCCATGGTAA
AGAGTTTTCTTTCAGAACTCCTCCGTCCACATTTCCGGTCGAGTTTGCCGTTGCTGGTGA
CCTTGGGCAAACTGATTGGACGGTGAAAACATTAGATCAGATTACAAAACGGGACTTCGA
CGTCTTCCTACTTCCCGGCGACCTCTCCTATGCAGACAACCACCAGCCACTATGGGATTC
TTTTGGCCGCCTCCTGGAGAACCTGGCTAGCACCCGCCCATGGATGGTCACCGAGGGAAA
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CCGATGACTTATGCCGCACGCTGAAAGCCTCTCTCACTC*AATCTTTACTACTCTTT*GA
TGCAGCCG

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DS 

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G
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AAACATTAGATCAGATTACAAAACGGGACTTCGACGTCTTCCTACTTCCCGGCGACCTCT
CCTATGCAGACAACCACCAGCCACTATGGGATTCTTTTGGCCGCCTCCTGGAGAACCTGG
CTAGCACCCGCCCATGGATGGTCACCGAGGGAAACCACGAAATCGAGTCTGCCCGGATCA
TTGAAGAACACATAAGCTTTAAAGCATACAATGCCCGATGGCTTATGCCGCACGCTGAAA
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TAAGAAAGATTGACCGTAAAAGAACGCCGTGGTTGGTGGTGGTGATG

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DS 

RD RS1CU95JQ 686 0 0
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CGCACGCTGAAAGCCTCTCTCACTCCAATCTTTACTACTCTTTTGATGCAGCCGGTGTCC
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CCATGGAGGGTTTGCTTTATCGGGCTGAAGTCGACATTGTTTTTGCCGGCCACATTCATA
CCTACGAACGTTTCAGGCCGGTATACAACCACAAGGCCGACCCATGTGGACCAATGTACA
TAACCATCGGTGACGGTGGAAATCGAGAAGGGCTGGCTTATAAATTTCATAACCCTCGTT
CACCTTTGTCGGCATTCCGTGAATCGAGTTTTGGACATGGGAGATTGAGAGTTATAGACA
AGAAACGAGCACATTGGTCGTGGCATAGAAACAACGACAACTTCTCAGTTATTGCGGATG
AAGTATGGTTTGAAAGCCACACGTCATCAACACATTGTATTCTTAATCACTTTAAAAATG
AACTCTAAATCGCTTTTACCGAAAAA

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DS 

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CCACGAAATCGAGTCTGCCCGGATCATTGAAGAACACATAAGCTTTAAAGCATACAATGC
CCGATGACTTATGCCGCACGCTGAAAGCCTCTCTCACTCCAATCTTTACTACTCTTTTGA
TGCAGCCGGTGTCCACATTGTTATGATTGTTTCTTACACCCACTATGACTCCCACTCTGA
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GGTGGTGGTGATGCACACTCCATGGTATAGCACAAACGAGGCGCATGAAGGTGAAGGGGA
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CGGCCACATTCATACCTACGAACGTTTCAGGCCGGTATACAACCACAAGGCCGACCCATG
TGGACCAATGTACATAACCATCGGTGACGGTGGAAATCGAGAAGGGCTGGCTTATAAATT
TCATAACCCTCGTTCACCTTTGTCGGCATTCCGTGAATCGAGTTTTGGACATGGGAGATT
GAGAGTTATAGACAAGAAACGAGCACATTGGTCGTGGCATAGAAACAACGACAACTTCTC
AGTTATTGCGGATGAAGTATGGTTTGAAAGCCACACGTCATCAACACATTGTATTCTTAA
TCACTTTAAAAATGAACTCTAAATCGCTTTTACCGAAAAACTTCATACATTATTCTTCTC
TTCTTAAAG

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 4

CO CL1825Contig1 1156 4 3 U
GAAAAGAAGAAACCAACACAAAATGGGTAGCTATCTGATCTCTCTTCTCCCAGTTGTCCT
CATGTTGGTGTTATTAGGATCCTCAGTAGATGCTTATTGGCCACCATCACCTGGTTACTG
GCCAAGCTCCAAGGTTGGACCCGTGAGCTTCTACAAAGGTTTTAGGAATCTTTGGGGTCC
TCAGCATCAGAGAATGGACCAAAATGCTCTTAACCTCTGGCTTGATAGAGCCTCAGGAAG
TGGATTCAAGTCAGTGAAGCCATTCAGATCAGGTTACTTTGGAGCATCCATTAAACTCCA
ACCTGGCTACACTGCTGGAGTCATCACATCTCTCTATCTATCAAATAATGAGGCACATCC
AGGCTTCCATGATGAAGTGGACATTGAATTTTTGGGGACAACATTTGGAAAACCATACAC
ACTTCAGACAAATGTGTACATTAGTGGAAGTGGTGATGGCAAAATTATTGGTCGTGAAAT
GAAGTATCGCTTGTGGTTTGATCCCACTTCAGGTTTTCACCATTATGCTATTCTTTGGAA
CCCTAAAGAAATCATATTTTTGGTAGATGATATTCCAATAAGAAGATACCCAAAGAAGAG
TGCGGCCACATTTCCTTTAAGACCAATGTGGCTTTATGGCTCCATATGGGACGCTTCTTC
TTGGGCAACGGAAGATGGTAAATACAAAGCCGACTATAAATATCAACCTTTTACTGCCAA
ATACACCAACTTTAAAGCCATCGGTTGTACTGCTTATTCGTCAGCATGGTGCCATCCCGT
GTCGGCTTCACCATACCGTTCTGGTGGGTTAACCCGAAAGCAATACCAAGCTATGAGATG
GGTTCAAACACATAGCATGGTATACGACTATTGCAAAGATTATAAGCGAGACCATTCTCT
AACGCCGGAATGTTGGCGTTAGGAAAAAATCCAGGGCAGTTTCGAAGTTCCAGAATTTTA
ATTAAATCAAAGGAAGTACAACAAAAGCTTGGTAATTTTTTGGGACTTCTTCTGCTACTA
TATTATTGTGGTTTTTGTTTCACAAAATAAAAGTTCTTTTTTTTGCTTATAATCGTTGTG
TAATGTGTAAATGTTTCAAATACAATGTTGTTGATCAACTTTGAATCATAAAAAAAATTG
TTTGAAAGGTTTTCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D531TF U 1
AF RS1AV39TF U 112
AF RS1D531JQ C 299
AF RS1C011TF U 834
BS 1 780 RS1D531TF
BS 781 834 RS1D531JQ
BS 835 1156 RS1C011TF

RD RS1D531TF 784 0 0
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ACTTCAGACAAATGTGTACATTAGTGGAAGTGGTGATGGCAAAATTATTGGTCGTGAAAT
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CCCTAAAGAAATCATATTTTTGGTAGATGATATTCCAATAAGAAGATACCCAAAGAAGAG
TGCGGCCACATTTCCTTTAAGACCAATGTGGCTTTATGGCTCCATATGGGACGCTTCTTC
TTGGGCAACGGAAGATGGTAAATACAAAGCCGACTATAAATATCAACCTTTTACTGCCAA
ATACACCAACTTTAAAGCCATCGGTTGTACTGCTTATTCGTCAGCATGGTGCCATCCCGT
GTCG

QA 1 780 1 780
DS 

RD RS1AV39TF 669 0 0
G
GGTTACTGGCCAAGCTCCAAGGTTGGACCCGTGAGCTTCTACAAAGGTTTTAGGAATCTT
TGGGGTCCTCAGCATCAGAGAATGGACCAAAATGCTCTTAACCTCTGGCTTGATAGAGCC
TCAGGAAGTGGATTCAAGTCAGTGAAGCCATTCAGATCAGGTTACTTTGGAGCATCCATT
AAACTCCAACCTGGCTACACTGCTGGAGTCATCACATCTCTCTATCTATCAAATAATGAG
GCACATCCAGGCTTCCATGATGAAGTGGACATTGAATTTTTGGGGACAACATTTGGAAAA
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CGTGAAATGAAGTATCGCTTGTGGTTTGATCCCACTTCAGGTTTTCACCATTATGCTATT
CTTTGGAACCCTAAAGAAATCATATTTTTGGTAGATGATATTCCAATAAGAAGATACCCA
AAGAAGAGTGCGGCCACATTTCCTTTAAGACCAATGTGGCTTTATGGCTCCATATGGGAC
GCTTCTTCTTGGGCAACGGAAGATGGTAAATACAAAGCCGACTATAAATATCAACCTTTT
ACTGCCAAATACACCAACTTTAAAGCCATCGGTTGTACTGCTTATTCGTCAGCATGGTGC
CATCCCGT

QA 2 669 2 669
DS 

RD RS1D531JQ 846 0 0
CAACCTGGCTACACTGCTGGAGTCATCACATCTCTCTATCTATCAAATAATGAGGCACAT
CCAGGCTTCCATGATGAAGTGGACATTGAATTTTTGGGGACAACATTTGGAAAACCATAC
ACACTTCAGACAAATGTGTACATTAGTGGAAGTGGTGATGGCAAAATTATTGGTCGTGAA
ATGAAGTATCGCTTGTGGTTTGATCCCACTTCAGGTTTTCACCATTATGCTATTCTTTGG
AACCCTAAAGAAATCATATTTTTGGTAGATGATATTCCAATAAGAAGATACCCAAAGAAG
AGTGCGGCCACATTTCCTTTAAGACCAATGTGGCTTTATGGCTCCATATGGGACGCTTCT
TCTTGGGCAACGGAAGATGGTAAATACAAAGCCGACTATAAATATCAACCTTTTACTGCC
AAATACACCAACTTTAAAGCCATCGGTTGTACTGCTTATTCGTCAGCATGGTGCCATCCC
GTGTCGGCTTCACCATACCGTTCTGGTGGGTTAACCCGAAAGCAATACCAAGCTATGAGA
TGGGTTCAAACACATAGCATGGTATACGACTATTGCAAAGATTATAAGCGAGACCATTCT
CTAACGCCGGAATGTTGGCGTTAGGAAAAAATCCAGGGCAGTTTCGAAGTTCCAGAATTT
TAATTAAATCAAAGGAAGTACAACAAAAGCTTGGTAATTTTTTGGGACTTCTTCTGCTAC
TATATTATTGTGGTTTTTGTTTCACAAAATAAAAGTTCTTTTTTTTGCTTATAATCGTTG
TGTAATGTGTAAATGTTTCAAATACAATGTTGTTGATCAACTTTGAATCATAAAAAAAAT
TGTT
CG

QA 1 844 1 844
DS 

RD RS1C011TF 323 0 0
G
GAGATGGGTTCAAACACATAGCATGGTATACGACTATTGCAAAGATTATAAGCGAGACCA
TTCTCTAACGCCGGAATGTTGGCGTTAGGAAAAAATCCAGGGCAGTTTCGAAGTTCCAGA
ATTTTAATTAAATCAAAGGAAGTACAACAAAAGCTTGGTAATTTTTTGGGACTTCTTCTG
CTACTATATTATTGTGGTTTTTGTTTCACAAAATAAAAGTTCTTTTTTTTGCTTATAATC
GTTGTGTAATGTGTAAATGTTTCAAATACAATGTTGTTGATCAACTTTGAATCATAAAAA
AAATTGTTTGAAAGGTTTTCGT

QA 2 323 2 323
DS 



AS 1 4

CO CL1826Contig1 709 4 2 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGGCGCCACC
ATTAAACCAGAGTCTTGCTCTCACTCGCTCGCTCTCTCTCTGCGAAATTTCACGGTTTGG
AAATGGCGACAGTTCCAGGACAATTGATCTGGGAGATCGTTAAGACCAACAACTGTTTCT
TGGTCAAACAGTTCGGACGAGGCAACGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAAGAGAAGAACAATC
TCTGCAACCTTAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCAAACAAGAAGACAGTGACCATCC
AGCCAGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAAGAAGCAGAACA
AGCCTAAGGTCTCTGTCAACAAGTCTATCCTGAAGAAGGAATTCCCCAGGATGTCCAAGG
CTGTTGCTAACCAGGTGGTTGACACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAAATTCGCCCTTGC
AAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGCCAAGCAAAGAAA
CCGTCAAGCTTAAGCTTTTTCCAGAATATGTTCTTCTTTTGGAAGTTAAAAAAGATTTTG
CTGAACATGTTTTTATCTATAAGTTGTTTTGTTGAATCATAACACTATGCTCCTTTTCAG
AAGGAGTAAGTTTTTCTTATGCTTATGGTACTTGTGTGGGGTTTGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RS1A267TV U 1
AF RS1A267JQ C 50
AF RS1A267TF U 56
AF RS1A267TR C 50
BS 1 708 RS1A267TV
BS 709 709 RS1A267JQ

RD RS1A267TV 709 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGGCGCCACC
ATTAAACCAGAGTCTTGCTCTCACTCGCTCGCTCTCTCTCTGCGAAATTTCACGGTTTGG
AAATGGCGACAGTTCCAGGACAATTGATCTGGGAGATCGTTAAGACCAACAACTGTTTCT
TGGTCAAACAGTTCGGACGAGGCAACGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAAGAGAAGAACAATC
TCTGCAACCTTAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCAAACAAGAAGACAGTGACCATCC
AGCCAGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAAGAAGCAGAACA
AGCCTAAGGTCTCTGTCAACAAGTCTATCCTGAAGAAGGAATTCCCCAGGATGTCCAAGG
CTGTTGCTAACCAGGTGGTTGACACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAAATTCGCCCTTGC
AAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGCCAAGCAAAGAAA
CCGTCAAGCTTAAGCTTTTTCCAGAATATGTTCTTCTTTTGGAAGTTAAAAAAGATTTTG
CTGAACATGTTTTTATCTATAAGTTGTTTTGTTGAATCATAACACTATGCTCCTTTTCAG
AAGGAGTAAGTTTTTCTTATGCTTATGGTACTTGTGTGGGGTTTGTTG
C

QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1A267JQ 660 0 0
GG
GGCGCCACCATTAAACCAGAGTCTTGCTCTCACTCGCTCGCTCTCTCTCTGCGAAATTTC
ACGGTTTGGAAATGGCGACAGTTCCAGGACAATTGATCTGGGAGATCGTTAAGACCAACA
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AGAACAATCTCTGCAACCTTAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCAAACAAGAAGACAG
TGACCATCCAGCCAGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAAGA
AGCAGAACAAGCCTAAGGTCTCTGTCAACAAGTCTATCCTGAAGAAGGAATTCCCCAGGA
TGTCCAAGGCTGTTGCTAACCAGGTGGTTGACACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAAATT
CGCCCTTGCAAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGCCAA
GCAAAGAAACCGTCAAGCTTAAGCTTTTTCCAGAATATGTTCTTCTTTTGGAAGTTAAAA
AAGATTTTGCTGAACATGTTTTTATCTATAAGTTGTTTTGTTGAATCATAACACTATGCT
CCTTTTCAGAAGGAGTAAGTTTTTCTTATGCTTATGGTACTTGTGTGGGGTTTGTTGC

QA 3 660 3 660
DS 

RD RS1A267TF 656 0 0
CCACCATTAAACCAGAGTCTTGCTCTCACTCGCTCGCTCTCTCTCTGCGAAATTTCACGG
TTTGGAAATGGCGACAGTTCCAGGACAATTGATCTGGGAGATCGTTAAGACCAACAACTG
TTTCTTGGTCAAACAGTTCGGACGAGGCAACGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAAGAGAAGAA
CAATCTCTGCAACCTTAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCAAACAAGAAGACAGTGAC
CATCCAGCCAGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAAGAAGCA
GAACAAGCCTAAGGTCTCTGTCAACAAGTCTATCCTGAAGAAGGAATTCCCCAGGATGTC
CAAGGCTGTTGCTAACCAGGTGGTTGACACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAAATTCGCC
CTTGCAAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGCCAAGCAA
AGAAACCGTCAAGCTTAAGCTTTTTCCAGAATATGTTCTTCTTTTGGAAGTTAAAAAAGA
TTTTGCTGAACATGTTTTTATCTATAAGTTGTTTTGTTGAATCATAACACTATGCTCCTT
TTCAGAAGGAGTAAGTTTTTCTTATGCTTATGGTACTTGTG
GTGGGGGTTTGTTGC

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1A267TR 660 0 0
GG
GGCGCCACCATTAAACCAGAGTCTTGCTCTCACTCGCTCGCTCTCTCTCTGCGAAATTTC
ACGGTTTGGAAATGGCGACAGTTCCAGGACAATTGATCTGGGAGATCGTTAAGACCAACA
ACTGTTTCTTGGTCAAACAGTTCGGACGAGGCAACGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAAGAGA
AGAACAATCTCTGCAACCTTAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCAAACAAGAAGACAG
TGACCATCCAGCCAGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAAGA
AGCAGAACAAGCCTAAGGTCTCTGTCAACAAGTCTATCCTGAAGAAGGAATTCCCCAGGA
TGTCCAAGGCTGTTGCTAACCAGGTGGTTGACACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAAATT
CGCCCTTGCAAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGCCAA
GCAAAGAAACCGTCAAGCTTAAGCTTTTTCCAGAATATGTTCTTCTTTTGGAAGTTAAAA
AAGATTTTGCTGAACATGTTTTTATCTATAAGTTGTTTTGTTGAATCATAACACTATGCT
CCTTTTCAGAAGGAGTAAGTTTTTCTTATGCTTATGGTACTTGTGTGGGGTTTGTTG
C

QA 3 659 3 659
DS 



AS 1 4

CO CL1827Contig1 745 4 4 U
GGACAGCTCCGAGAGGATCCAAGTTTCTTTCTCATTCGTTCCATCGATGGCGGCTCTTTC
GACATCTCTCTCTCCTCCCAGGAATACTCAACAACTCCACCCTCCATCTGGCTTTTCTCT
GAAGTCAGTTGCTCGTCGTGTCAACGTTTCTTTCGGTCTGAATCCTTCTAAAAAGCTCCA
GTTTTCTGCCCCCAGAAGCAAAAGGATCCTAACCATCCAATCAGCATACAGAGATGATGA
CAGTTCAGGAAGCACTGGCCTATTTGTGGGAGGGTTCATTTTGGGCGGGCTCATAGTGGG
CGCTCTTGGATGTGTGTATGCGCCACAGATCAGCAAGGCTATAGCTGGAGCAGACCGAAA
GGATCTCATGAGGAAATTGCCTAAGTTCATTTATGACGAGGAAAAAGCTTTGGAGAAAAC
TCGCAAGGTATTGGCTGACAAGATTGCTCAGCTCAACTCTGCTATCGACGATGTGTCCTC
TCAGCTAAAATCAGAAGACACCCCTAATGGTGCCGCTCTAAGCACCGATGAAGTCGAGGC
TACAGCCTGAAATAATCTCTCATCTGTTTTTAGGATGCTGAAACTCAAATTATGGGTCAT
TGTTACTTCTTGTTGTTTGCTGTTTCTGTGTAATTTTGTCTAAAACTTTTCCTCCATCTT
CAAAACCACTACCATTGTCCTGTCTGTTTTTTTTTCATTAGACTATGTTGAACGATTTAT
CATCATCATTTCAGATTCCTTACGC


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AR88TFB U 3
AF RS1GV47TF U 1
AF RS1GV47JQ C 164
AF RS1AR88JQ C 3
BS 1 124 RS1GV47TF
BS 125 125 RS1AR88TFB
BS 126 674 RS1GV47TF
BS 675 745 RS1AR88JQ

RD RS1AR88TFB 569 0 0
GG
AGCTCCGAGAGGATCCAAGTTTCTTTCTCATTCGTTCCATCGATGGCGGCTCTTTCGACA
TCTCTCTCTCCTCCCAGGAATACTCAACAACTCCACCCTCCATCTGGCTTTTCTCTGAAG
TCAGTTGCTCGTCGTGTCAACGTTTCTTTCGGTCTGAATCCTTCTAAAAAGCTCCAGTTT
TCTGCCCCCAGAAGCAAAAGGATCCTAACCATCCAATCAGCATACAGAGATGATGACAGT
TCAGGAAGCACTGGCCTATTTGTGGGAGGGTTCATTTTGGGCGGGCTCATAGTGGGCGCT
CTTGGATGTGTGTATGCGCCACAGATCAGCAAGGCTATAGCTGGAGCAGACCGAAAGGAT
CTCATGAGGAAATTGCCTAAGTTCATTTATGACGAGGAAAAAGCTTTGGAGAAAACTCGC
AAGGTATTGGCTGACAAGATTGCTCAGCTCAACTCTGCTATCGACGATGTGTCCTCTCAG
CTAAAATCAGAAGACACCCCTAATGGTGCCGCTCTAAGCACCGATGAAGTCGAGGCTACA
GCCTGAAATAATCTCTCATCTGTTTTT

QA 3 569 3 569
DS 

RD RS1GV47TF 674 0 0
GGACAGCTCCGAGAGGATCCAAGTTTCTTTCTCATTCGTTCCATCGATGGCGGCTCTTTC
GACATCTCTCTCTCCTCCCAGGAATACTCAACAACTCCACCCTCCATCTGGCTTTTCTCT
GAAGCCAGTTGCTCGTCGTGTCAACGTTTCTTTCGGTCTGAATCCTTCTAAAAAGCTCCA
GTTTTCTGCCCCCAGAAGCAAAAGGATCCTAACCATCCAATCAGCATACAGAGATGATGA
CAGTTCAGGAAGCACTGGCCTATTTGTGGGAGGGTTCATTTTGGGCGGGCTCATAGTGGG
CGCTCTTGGATGTGTGTATGCGCCACAGATCAGCAAGGCTATAGCTGGAGCAGACCGAAA
GGATCTCATGAGGAAATTGCCTAAGTTCATTTATGACGAGGAAAAAGCTTTGGAGAAAAC
TCGCAAGGTATTGGCTGACAAGATTGCTCAGCTCAACTCTGCTATCGACGATGTGTCCTC
TCAGCTAAAATCAGAAGACACCCCTAATGGTGCCGCTCTAAGCACCGATGAAGTCGAGGC
TACAGCCTGAAATAATCTCTCATCTGTTTTTAGGATGCTGAAACTCAAATTATGGGTCAT
TGTTACTTCTTGTTGTTTGCTGTTTCTGTGTAATTTTGTCTAAAACTTTTCCTCCATCTT
CAAAACCACTACCA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1GV47JQ 547 0 0
CCTTCTAAAAAGCTCCAGTTTTCTGCCCCCAGAAGCAAAAGGATCCTAACCATCCAATCA
GCATACAGAGATGATGACAGTTCAGGAAGCACTGGCCTATTTGTGGGAGGGTTCATTTTG
GGCGGGCTCATAGTGGGCGCTCTTGGATGTGTGTATGCGCCACAGATCAGCAAGGCTATA
GCTGGAGCAGACCGAAAGGATCTCATGAGGAAATTGCCTAAGTTCATTTATGACGAGGAA
AAAGCTTTGGAGAAAACTCGCAAGGTATTGGCTGACAAGATTGCTCAGCTCAACTCTGCT
ATCGACGATGTGTCCTTTCAGCTAAAATCAGAAGACACCCCTAATGGTGCCGCTCTAAGC
ACCGATGAAGTCGAGGCTACAGCCTGAAATAATCTTTCATCTGTTTTTAGGATGCTGAAA
CTCAAATTATGGGTCATTGTTACTTCTTGTTGTTTGCTGTTTCTGTGTAATTTTGTCTAA
AACTTTTCCTCCATCTTCAAAACCACTACCATTGTCCTGTCTGTTTTTTTTTCATTAGAC
TATGTTG

QA 1 547 1 547
DS 

RD RS1AR88JQ 743 0 0
GG
AGCTCCGAGAGGATCCAAGTTTCTTTCTCATTCGTTCCATCGATGGCGGCTCTTTCGACA
TCTCTCTCTCCTCCCAGGAATACTCAACAACTCCACCCTCCATCTGGCTTTTCTCTGAAG
TCAGTTGCTCGTCGTGTCAACGTTTCTTTCGGTCTGAATCCTTCTAAAAAGCTCCAGTTT
TCTGCCCCCAGAAGCAAAAGGATCCTAACCATCCAATCAGCATACAGAGATGATGACAGT
TCAGGAAGCACTGGCCTATTTGTGGGAGGGTTCATTTTGGGCGGGCTCATAGTGGGCGCT
CTTGGATGTGTGTATGCGCCACAGATCAGCAAGGCTATAGCTGGAGCAGACCGAAAGGAT
CTCATGAGGAAATTGCCTAAGTTCATTTATGACGAGGAAAAAGCTTTGGAGAAAACTCGC
AAGGTATTGGCTGACAAGATTGCTCAGCTCAACTCTGCTATCGACGATGTGTCCTTTCAG
CTAAAATCAGAAGACACCCCTAATGGTGCCGCTTTAAGCACCGATGAAGTCGAGGCTACA
GCCTGAAATAATCTTTCATCTGTTTTTAGGATGCTGAAACTCAAATTATGGGTCATTGTT
ACTTCTTGTTGTTTGCTGTTTCTGTGTAATTTTGTCTAAAACTTTTCCTCCATCTTCAAA
ACCACTACCATTGTCCTGTCTGTTTTTTTTTCATTAGACTATGTTGAACGATTTATCATC
ATCATTTCAGATTCCTTACGC

QA 3 743 3 743
DS 



AS 1 5

CO CL1828Contig1 746 5 23 U
GGGAGGATGATGCTAGTGCTGAGTGTGTATATGAGTTTTGGTTCTTGAGTAACTTGATTC
ATGTGTCAAAGATTCTGATGGTTGGTATTATTAGCCATACATAAGGTTTCTGTATCGTTT
ACTGGTGTTGGGTGGGGTTTGTAGACAATGAGAAGAGGTAGAGGGAAAGGGAAGAGGCAG
AGTGCATCATCTGCTAGGGAAGATCATGGAAGCGGTGAAGAAGATGAGAAGATTCCAGCT
TACAGGAGAAGAGGAAGGCCACTGAAACCTATGAAAGATGATTTCGAAGAGGAGGAAGAT
GAAGAGTTAGAGAAGATGGAGGAGGAAGATGAAGAAGAAGAAGAGGATGATTCAGTAACA
AGTAAAAAAGAAGAGAAAGAAAGGAAGAGGAAGATGGTTAATGGAAGCAACACTGATGTC
AATGAAGAAGAGAATAATAGGCTAGGATCAAAATCAAGTAGGGATGATTCCACCCAGTCC
ACATCTACTGGTTTCAGACAGAACGGGAGCAGGAGAAAAAGCAAGCCGAGAAGAGCTGCT
GAAGCTGTTGTGGAATGTAATGGAGTTTGAGCAAAACTTCTTTGGTCAAGAACCGTCAAG
AAACATGATGGACACATTAACTCGAGGCTTCTTCTTCTTTCTGGTTATCTTACAAGTTCT
TTTTTAAGTTAAGAACTTTGGAAATCTTTTGGTGTATCAATCTGCATTCTCTTTCTTTCT
TATCAATCTGCGTTTTTTTTTTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BC13TF U 1
AF RS1BS75JQ C 29
AF RS1CN79JQ C 195
AF RS1CN79TF U 59
AF RS1BS75TF U 29
BS 1 118 RS1BC13TF
BS 119 119 RS1BS75TF
BS 120 150 RS1BC13TF
BS 151 151 RS1CN79TF
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BS 176 176 RS1BS75TF
BS 177 179 RS1BC13TF
BS 180 180 RS1CN79TF
BS 181 227 RS1BC13TF
BS 228 228 RS1CN79TF
BS 229 285 RS1BC13TF
BS 286 286 RS1CN79TF
BS 287 301 RS1BC13TF
BS 302 343 RS1CN79TF
BS 344 344 RS1BS75TF
BS 345 441 RS1CN79TF
BS 442 442 RS1BS75TF
BS 443 604 RS1CN79TF
BS 605 605 RS1BS75TF
BS 606 658 RS1CN79TF
BS 659 659 RS1BS75TF
BS 660 725 RS1CN79TF
BS 726 746 RS1BS75JQ

RD RS1BC13TF 301 0 0
GGGAGGATGATGCTAGTGCTGAGTGTGTATATGAGTTTTGGTTCTTGAGTAACTTGATTC
ATGTGTCAAAGATTCTGATGGTTGGTATTATTAGCCATACATAAGGTTTCTGTATCGTGT
ACTGGTGTTGGGTGGGGTTTGTAGACAATGGGAAGAGGTAGAGGGAAAGGGAAGAAGCAT
AGTGCATCATCTGCTAGGGAAGATCATGGAAGCGGTGAAGAAGATGAAAAGATTCCAGCT
TACAGGAGAAGAGGAAGGCCACTGAAACCTATGAAAGATGATTTCTAAGAGGAGGAAGAT
G

QA 1 301 1 301
DS 

RD RS1BS75JQ 718 0 0
GG
ATGAGTTTTGGTTCTTGAGTAACTTGATTCATGTGTCAAAGATTCTGATGGTTGGTATTA
TTAGCCATACATAAGGTTTCTGTATCGTTTACTGGTGTTGGGTGGGGTTTGTAGACAATG
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AGCGGTGAAGAAGATGAGAAGATTCCAGCTTACAGGAGAAGAGGAAGGCCACTGAAACCT
ATGAAAGATGATTTCGAAGAGGAGGAAGATGAAGAGTTAGAGAAGATGGAGGAGGAAGAT
GAAGAAGAAGAAGAGGATGATTCAGTAACAAGTAAAAAAGAAGAGAAAGAAAGGAAGAGG
AAGATGGTTAATGGAAGCAACACTGATGTCAATGAAGAAGAGAATAATAGGCTAGGATCA
AAATCAAGTAGGGATGATTCCACCCAGTCCACATCTACTGGTTTCAGACAGAACGGGAGC
AGGAGAAAAAGCAAGCCGAGAAGAGCTGCTGAAGCTGTTGTGGAATGTAATGGAGTTTGA
GCAAAACTTCTTTGGTCAAGAACCGTCAAGAAACATGATGGACACATTAACTCGAGGCTT
CTTCTTCTTTCTGGTTATCTTACAAGTTCTTTTTTAAGTTAAGAACTTTGAAAATCTTTT
GGTGTATCAATCTGCATTCTCTTTCTTTCTTATCAATCTGCGTTTTTTTTTTTGAC

QA 3 718 3 718
DS 

RD RS1CN79JQ 547 0 0
TAGGGAAGATCATGGAAGCGGTGAAGAAGATGAGAAGATTCCAGCTTACAGGAGAAGAGG
AAGGCCACTGAAACCTATGAAAGATGATTTCGAAGAGGAGGAAGATGAAGAGTTAGAGAA
GATGGAGGAGGAAGATGAAGAAGAAGAAGGGGATGATTCAGTAACAAGTAAAAAAGAAGA
GAAAGAAAGGAAGAGGAAGATGGTTAATGGAAGCAACACTGATGTCAATGAAGAAGAGAA
TAATAGGTTAGGATCAAAATCAAGTAGGGATGATTCCACCCAGTCCACATTTACTGGTTT
CAGACAGAACGGGAGCAGGAGAAAAAGCAAGCCGAGAAGAGCTGCTGAAGCTGTTGTGGA
ATGTAATGGAGTTTGAGCAAAACTTCTTTGGTCAAGAACCGTCAAGAAACGTGATGGACA
CATTAACTCGAGGCTTTTTTTTCTTTCTGGTTATCTTACAAGTTTTTTTTTAAGTTAAGA
ACTTTGGAAATCTTTTGGTGTATCAATCTGCATTCTCTTTCTTTCTTATCAATCTGCGTT
TTTTTTT

QA 1 540 1 540
DS 

RD RS1CN79TF 676 0 0
GG
ATGTATCAAAGATTCTGATGGTTGGTATTATTAGCCATACATAAGGTTTCTGTATCGTGT
ACTGGTGTTGGGTGGGGTTTGTAGACAATGAGAAGGGGTAGAGGGAAAGGGAAGAAGCAG
AGTGCATCATCTGCTAGGGAAGATCATGGAAGCGGTGAAGAAGATGAGAAGATTCCAGCT
TACAGGAGAAGAGGAAGGCCACTGAAACCTATGAAAGATGATTTCGAAGAGGAGGAAGAT
GAAGAGTTAGAGAAGATGGAGGAGGAAGATGAAGAAGAAGAAGGGGATGATTCAGTAACA
AGTAAAAAAGAAGAGAAAGAAAGGAAGAGGAAGATGGTTAATGGAAGCAACACTGATGTC
AATGAAGAAGAGAATAATAGGTTAGGATCAAAATCAAGTAGGGATGATTCCACCCAGTCC
ACATCTACTGGTTTCAGACAGAACGGGAGCAGGAGAAAAAGCAAGCCGAGAAGAGCTGCT
GAAGCTGTTGTGGAATGTAATGGAGTTTGAGCAAAACTTCTTTGGTCAAGAACCGTCAAG
AAACGTGATGGACACATTAACTCGAGGCTTCTTCTTCTTTCTGGTTATCTTACAAGTTTT
TTTTTAAGTTAAGAACTTTGGAAATCTTTTGGTGTATCAATCTGCATTCTCTTTCTTTCT
TATCA
ATCTGCGTT

QA 3 667 3 667
DS 

RD RS1BS75TF 702 0 0
GG
ATGAGTTTTGGTTCTTGAGTAACTTGATTCATGTGTCAAAGATTCTGATGGTTGGTATTA
TTAGCCATACATAAGGTTTCTGTATCGTTTACTGGTGTTGGGTGGGGTTTGTAGACAATG
AGAAGAGGTAGAGGGAAAGGGAAGAGGCAGAGTGCATCATCTGCTAGGGAAGATCATGGA
AGCGGTGAAGAAGATGAGAAGATTCCAGCTTACAGGAGAAGAGGAAGGCCACTGAAACCT
ATGAAAGATGATTTCGAAGAGGAGGAAGATGAAGAGTTAGAGAAGATGGAGGAGGAAGAT
GAAGAAGAAGAAGAGGATGATTCAGTAACAAGTAAAAAAGAAGAGAAAGAAAGGAAGAGG
AAGATGGTTAATGGAAGCAACACTGATGTCAATGAAGAAGAGAATAATAGGCTAGGATCA
AAATCAAGTAGGGATGATTCCACCCAGTCCACATCTACTGGTTTCAGACAGAACGGGAGC
AGGAGAAAAAGCAAGCCGAGAAGAGCTGCTGAAGCTGTTGTGGAATGTAATGGAGTTTGA
GCAAAACTTCTTTGGTCAAGAACCGTCAAGAAACATGATGGACACATTAACTCGAGGCTT
CTTCTTCTTTCTGGTTATCTTACAAGTTCTTTTTTAAGTTAAGAACTTTG*AAATCTTTT
GGTGTATCAATCTGCATTCTCTTTCTTTCTTATCA
TCTGC

QA 3 697 3 697
DS 



AS 2 5

CO CL1829Contig1 674 2 5 U
AAGAACCCTTTAACTTGCAAAAAGGATGGCTCGTGTGGAGTGGGATCGGTCTGGTTGGTG
CTGTTGGCGCTATTGCGTTAACAGGTGTTGTTTTGTCCTTATTCAGGACAGAGGCACCAG
AAAGAGAGGTAGACTCTTTGATGAAGCTTCTCCCATTAATTGGATCCTCAAACATAAGCA
CGTTAAGCTTAGTGGGGATAACTGGAGTCCTTGCTCCACTTCTTGAGGAGACAGTGTTTC
GCGGTTTCTTCATGGTCTCTCTTACCAAATGGGTTCCGACCCCAATAGCGATCATCATCA
GTTCAGCTGCGTTTGCACTTGCGCACCTCACACCCGGTGAATTCCCACAGTTGTTTATGC
TAGGATCGGTTTTGGGATTATCGTATGCGCAGACCCGCAATCTCATAACCCCGATGGTCA
TACACGGTTTCTGGAACTCGGGAGTTATTTTGCTGCTCACTTTCCTTCAGGTCCAAGGGT
ATGACATCAAGGAACTATTGTTGCAGGGAAACTAGCAAGAGTTTGAGTATTGAACTATAG
ACTCGTCACGGCCGTTCCCCTATAAAGTGAAATGCTTGTAATGTCCACTAAAAAGCTCAA
TGCTAAATTACAAAAGAAAGGAAGCAAAAACATTCACATTTTCAGTTTATACAAAATGCA
CAAAATCAGAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RS1CW37JQ C 1
AF RS1CP27TF U 381
BS 1 381 RS1CW37JQ
BS 382 551 RS1CP27TF
BS 552 552 RS1CW37JQ
BS 553 669 RS1CP27TF
BS 670 674 RS1CW37JQ

RD RS1CW37JQ 674 0 0
AAGAACCCTTTAACTTGCAAAAAGGATGGCTCGTGTGGAGTGGGATCGGTCTGGTTGGTG
CTGTTGGCGCTATTGCGTTAACAGGTGTTGTTTTGTCCTTATTCAGGACAGAGGCACCAG
AAAGAGAGGTAGACTCTTTGATGAAGCTTCTCCCATTAATTGGATCCTCAAACATAAGCA
CGTTAAGCTTAGTGGGGATAACTGGAGTCCTTGCTCCACTTCTTGAGGAGACAGTGTTTC
GCGGTTTCTTCATGGTCTCTCTTACCAAATGGGTTCCGACCCCAATAGCGATCATCATCA
GTTCAGCTGCGTTTGCACTTGCGCACCTCACACCCGGTGAATTCCCACAGTTGTTTATGC
TAGGATCGGTTTTGGGATTATCGTATGCGCAGACCCGCAATCTCATAACCCCGATGGTCA
TACACGGTTTCTGGAACTCGGGAGTTATTTTGCTGCTCACTTTCCTTCAGGTCCAAGGGT
ATGACATCAAGGAACTATTGTTGCAGGGAAACTAGCAAGAGTTTGAGTATTGAACTATAG
ACTCGTCACGGCCGTTCCCCTATAAAGTGAAATGCTTGTAATGTCCACTAAAAAGCTCAA
TGCTAAATTACAAAAGAAAGGAAGCAAAAACATTCACATTTTCAGTTTATACAAAATGCA
CAAAATCAGAAACC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1CP27TF 289 0 0
G
CGTATGCGCAGACCCGCAATCTCATAACCCCGATGGTCATACACGGTTTCTGGAACTCGG
GAGTTATTTTGCTGCTCACTTTCCTTCAGGTCCAAGGGTATGACATCAAGGAACTATTGT
TGCAGGGAAACTAGCAAGAGTTTGAGTATTGAACTATAGACTCGTCACGGTCGTTCCCCT
ATAAAGTGAAATGCTTGTAATGTCCACTAAAAAGCTCAATGCTAAATTACAAAAGAAAGG
AAGCAAAAACATTCACATTTTCAGTTTATACAAAATGCACAAAATCAG

QA 2 289 2 289
DS 



CO CL1829Contig2 1326 3 9 U
GGACTCTTACCAATCTAGTTGCTTTGGTCGGAAAAAAAAACTTTCGATCAAACAAATTAG
ATGGTTTCGCAGATGATCTCGTGTTTAACTATATCTCCGTCGTCTCTTTTCTGCATCTCC
GGTCCCCGGAGTTTAATTCCGCCGAAGACTTATTATAACCGCGGCGGTTTGTACCGGTTC
TCCGGGATTCGCTAGCCGCCGGTTATCTACGGTTAACCGGAGGAAATGGAGATCCGCGTG
CATTTTCAACTCTGGGAAAGAAACTGAAGGAGAGGGAAAGTTACAGGGAGGTGGGTCAGA
GTGGCCGATACTTGAGAGATGGGAAGTGCCATGGGAATGGCAGACGGTTTCTTTAACTTC
GCTTGCTTGTGGTTTAAGGCAGTTTTGTTTTGACAGGATTAACTGAGATGGTAGCCATAC
CGTATCTCGGAATCGATGTTCAGAAGCTGAGCCTGGACGAAAAGGCTGAGATTATTCCTG
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GAGCCACTTCCTCTAGACATTTTGCGTTATGATTTGAAATAACCCTTTAACTTGCAAAAA
AGGATGGCTCGTGTGGAGTGGGATCGGTCTGGTTGGTGCTGTTGGCGCTATTGCGTTAAC
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GAAGCTTCTCCCATTAATTGGATCCTCAAACATAAGCACGTTAAGCTTAGTGGGGATAAC
TGGAGTCCTTGCTCCACTTCTTGAGGAGACAGTGTTTCGCGGTTTCTTCATGGTCTCTCT
TACCAAATGGTAAAAAAAAAGGAAGGGTCTTTGTCTTCTTCTCATTTTTGCTTCTGAACA
AAGAAAGCTAACTACATTTTTCAGGGTTCCGACCCCAATAGCGGTCATCATCAGCTCAGC
TGCGTTTGCACTTGCGCACCTCACACCCGGTGAATTCCCACAGTTGTTTATGCTAGGATC
GGTTTTGGGATTATCGTATGCGCAGACCCGCAACCTCATAACCCCGATGGTCATACACGG
TTTCTGGAACTCGGGAGTTATTTTGCTGCGCACTTTCCTTCAGGTCCAAGGGTATGACAT
CAAGGAACTATTGTTGCAGGGAAACTAGCAAGAGATTGAGTATTGAACTGTAGACTCGTC
ACGGTCGTTCCCTATAAAGTGAAATGCTTGTAATGCCCACTAAAAAGCTCAATGCTAAAT
TACAAAAGAAAGGAAGCAAAAACATTCACATTTTCAGTTTATACAAAATGCACAAAATCA
GAAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1CW37TF U 1
AF RS1DA08TF U 521
AF RS1DA08JQ C 521
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G
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QA 2 600 2 600
DS 

RD RS1DA08JQ 806 0 0
G
CACCGTTGCCAGAACATTTGAGCCACTTCCTCTAGACATTTTGCGTTATGATTTGAAATA
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GAGAGGTAGACTCTTTGATGAAGCTTCTCCCATTAATTGGATCCTCAAACATAAGCACGT
TAAGCTTAGTGGGGATAACTGGAGTCCTTGCTCCACTTCTTGAGGAGACAGTGTTTCGCG
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AGTTGTTTATGCTAGGATCGGTTTTGGGATTATCGTATGCGCAGACCCGCAACCTCATAA
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ATTGAACTGTAGACTCGTCACGGTCGTTCCCTATAAAGTGAAATGCTTGTAATGCCCACT
AAAAAGCTCAATGCTAAATTACAAAAGAAAGGAAGCAAAAACATTCACATTTTCAGTTTA
TACAAAATGCACAAAATCAGAAACG

QA 2 806 2 806
DS 



AS 1 5

CO CL1830Contig1 1235 5 7 U
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ATCAGCCTGTCCATTTACTCGTTGGAACTCCTGGCAGAATTTTGGATCTCACCAAGAAAG
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AAATTACAGAACTTGGGTATTCTTGCTTTTACATTCATGCAAAGATGCTTCAGGATCATC
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AGAATGCAGAAACATATCTTCACAGGGTTGGTCGATCAGGAAGGTTTGGCCATCTTGGTT
TAGCGGTGAATCTTATCACCTATGAGGACCGCTTTAATCTTTACCGGATTGAGCAAGAGC
TTGGTACGGAGATCAAGCAAATTCCTCCACATATTGATCAGGCAATTTATTGCCAATAAG
TTTGACGGCCTTGGTCTTATTTTAGGTCTATCAGTAATAAGTGGTTTGTTGATGCAATGT
GTGACTTGTCTAGCCGTGCAGGATAAACCAGAACCCAAAAAGTCCTCACATTCATCCTCT
TTCCTTCAAAATGTTTTCTGTGCGTCTTTGGGTTTTCCTTCTTTCTAAATAATCAACTAC
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TTTTATTTTATTTTAACAAGTCGTTTGGTGCTATGTTTCTGTCATTGTCGTAGACTGGTC
AGTGTTGTGATACGTGTTCAAGGAGCGGGTGGTTTCTTGACTCTTTAATGCTTTGTTTGC
AGCTTTTCCAACTTCAATAATAAGTCTTTGAGACC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D282TF U 305
AF RS1D782TF U 1
AF RS1CO92TF U 107
AF RS1D782JQ C 739
AF RS1CO92JQ C 413
BS 1 535 RS1D782TF
BS 536 537 RS1CO92TF
BS 538 695 RS1D782TF
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G
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TTTGTTGAAGAACGTCAGAAAATTCATTGCTTGAATACACTCTTCTCCAAGCTGCAAATT
AACCAATCGATCATATTCTGCAATTCCGTGAACCGTGTGGAGCTCTTAGCTAAGAAAATT
ACAGAACTTGGGTATTCTTGTTTTTACATTCGTGCAAAGATGCTGCAGGA
CCATCGTAAC

QA 2 231 2 231
DS 

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ATCAGCCTGTCCATTTACTCGTTGGAACTCCTGGCAGAATTTTGGATCTCACCAAGAAAG
GTGTTTGTGTTTTGAAGGATTGTTCTGTGCTCGCTATGGACGAGGCTGATAAGCTTTTAT
CTCAAGAGTTCCAACCTTCCGTGGAACATTTGATCAGCTTTCTTCCCGAAAATCGCCAGA
TTTTGATGTTCTCAGCCACGTTTCCTGTCACTGTCAAGTATTTCAAGGATCGATTTTTGA
CGAATCCTTACATCATTAATCTCATGGATGAACTTACGCTCAAGGGTATTACCCAATTTT
ATGCTTTTGTTGAAGAACGTCAGAAAATTCATTGCTTGAATACACTCTTCTCCAAGCTGC
AAATCAACCAATCGATCATATTCTGCAATTCCGTTAACCGTGTGGAGCTCTTAGCTAAGA
AAATTACAGAACTTGGGTATTCTTGCTTTTACATTCATGCAAAGATGCTTCAGGA**ATC
GAAACAGAGTGTTCCATGACTTTCGCAATGGTGCATGCCGGAATCTTGTGTGTACTGACC
TGTTCACACGTGGGATTGACATTCAAGCAGTCAATGTGGTGATAAACTTTGATTTCCCAA
AGAATGCAGAAACATATCTTCACAGGGTTGGTCGA

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DS 

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G
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GATAAGCTTTTATCTCAAGAGTTCCAACCTTCCGTGGAACATTTGATCAGCTTTCTTCCC
GAAAATCGCCAGATTTTGATGTTCTCAGCCACGTTTCCTGTCACTGTCAAGTATTTCAAG
GATCGATTTTTGACGAATCCTTACATCATTAATCTCATGGATGAACTTACGCTCAAGGGT
ATTACCCAATTTTATGCTTTTGTTGAAGAACGCCAGAAAATTCATTGCTTGAATACACTC
TTCTCCAAGCTGCAAATCAACCAATCGATCATATTCTGCAATTCCGTTAACCGTGTGGAG
CTCTTAGCTAAGAAAATTACAGAACTTGGGTATTCTTGCTTTTACATTCATGCAAAGATG
CTTCAGGATCATCGAAACAGAGTGTTCCATGACTTTCGCAATGGTGCATGCCGGAATCTT
GTGTGTACTGACCTGTTCACACGTGGGATTGACATTCAAGCAGTCAATGTGGTGATAAAC
TTTGATTTCCCAAAGAATGCAGAAACATATCTTCACAGGGTTGGTCGATCAGGAAGGTTT
GGCCATCTTGGTTTAGCGGTGAATCTTATCACCTATGAGGACCGCTTTAATCTTTACCGG
ATTGAGCAAGAGCTTGGTACGGAGATCAAGCAAATTCCTCCACATAT

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DS 

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AAATTCCTCCACATATTGATCAGGCAATTTATTGCCAATAAGTTTGACGGCCTTGGTTTT
ATTTTAGGTCTATC*GTAATAAGTGGTTTGTTGATGCAATGTGTGACTTGTCTAGCCGTG
CAGGATAAACCAGAACCCAAAAAGTCCTCACATTCATCCTCTTTCCTTCAAAATGTTTT

QA 1 239 1 239
DS 

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AGCTAAGAAAATTACAGAACTTGGGTATTCTTGCTTTTACATTCATGCAAAGATGCTTCA
GGATCATCGAAACAGAGTGTTCCATGACTTTCGCAATGGTGCATGCCGGAATCTTGTGTG
TACTGACCTGTTCACACGTGGGATTGACATTCAAGCAGTCAATGTGGTGATAAACTTTGA
TTTCCCAAAGAATGCAGAAACATATCTTCACAGGGTTGGTCGATCAGGAAGGTTTGGCCA
TCTTGGTTTAGCGGTGAATCTTATCACCTATGAGGACCGCTTTAATCTTTACCGGATTGA
GCAAGAGCTTGGTACGGAGATCAAGCAAATTCCTCCACATATTGATCAGGCAATTTATTG
CCAATAAGTTTGACGGCCTTGGTCTTATTTTAGGTCTATCAGTAATAAGTGGTTTGTTGA
TGCAATGTGTGACTTGTCTAGCCGTGCAGGATAAACCAGAACCCAAAAAGTCTTCACATT
CATCCTCTTTCCTTCAAAATGTTTTCTGTGCGTCTTTGGGTTTTCCTTCTTTCTAAATAA
TCAACTACATATAGACAAAAGGCCTGGGAGGTGTGAAATTCCTGGTAGTAGTGGAAGTTG
GGAGTCTTTTTTATTTTATTTTAACAAGTCGTTTGGTGCTATGTTTCTGTCATTGTCGTA
GACTGGTCAGTGTTGTGATACGTGTTCAAGGAGCGGGTGGTTTCTTGACTCTTTAATGCT
TTGTTTGCAGCTTTTCCAACTTCAATAATAAGTCTTTGAGACC

QA 1 823 1 823
DS 



AS 1 4

CO CL1831Contig1 1234 4 14 U
GGGACATTTGAAACCCTAGTTCACAAAACCTCTCTTGTCCGAGAGTATCTCTGCGTCGCC
GGATTTTAAAACTCCACGGTGAAAGATGCAGCACGACGAGGTCATATGGCAAGTTATCAG
ACACAAACACTGCAGTTACATGGCCAAAATCGAAACCGGAATCTTCTGTAGAAATCCTTA
CAACGTAACTGGTATTTGCAACCGAAGCTCTTGTCCCCTTGCTAACAGCCGTTACGCCAC
CATCAGAGACCACGATGGTGTTTTTTATTTGTATATGAAGACAATAGAGAGAGCCCATAT
GCCTAAGAACTTGTGGGAGAGAGTGAAGTTGCCTAGAAACTACGAGAAGGCTCTTGAAAC
CATTGACAAGCACTTGTTGTATTGGCCTAAGTTATTACAGCACAAGATCAAACAGAGACT
GACCAAAATGACTCAGATGCGTATTCGTATGAGGAAACTTGCTCTCAAGACAAGGGAGAA
GATAATGACTACACCAAGAAGGGATATCAAGAGAGAATCAAGAAGGGAGGAGAAGGCTAT
CAAAGCAGCGGTCTTGGATAAGGCTATTGAGACCGAGTTGCTAGAGCGTTTGAAGAAGGG
TATTTATGGTGACATATACAATTACCCAGAGCTCGAGTGGAACAAGGTTCTTGATGAAGA
AAAGCAAGCGGCAGAGGGTGTTGAGGTAGAGGAAGAAGAGGAGGAGCCAGAGATTGAATA
TGTTGAAGGATATGAAGAGCTTGAAGATGAGGAAGATATGGAAGACTTCTCTGGTTTTCC
CTCTAAGATGTCTGACTTCAACGATGATGAACATGATTCAGCTGATGAGGAGGAAGATGA
TGACGGTGAGGAGCAAGTTGTGATTCATAAAAAAGGAAAGAGAGATTAAGAAAGTCTGAT
GATCTTGGGAAATCAAAGAAGAAGAAGAAGAGAGTGATTGTTGAGATGGAGCAAGAAGAT
GGAGACGTGATACGAACCTTGAGAACCGCAAGCTGAGCTTAGATGCCAAAACCCTGAAGC
TGAAATGGCAGAGGAAAGTGTAGTTTGTTTTGTTTTGTTGTGCTACTGTGGGACAAGAGA
AAGGAAAAGCTTTCTTCTTGACAGACAGTTGAAAGACTCTTGAACGCTTTCCAGTTTTGT
ACCCTTTTCATTTTCATGTATTGTAGGAACTTAATATGTTCTTCTGACGTTTGAATTTTT
GTATACTTGGTTAAAATGAAGCATTTTCTTTGAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1GT46TF U 1
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GCAACCGAAGCTCT
TGTC

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CACAAACATTGCAGTTACATGGCCAAAATCGAAACCGGAATATTCTGTAGAAATCCTTAC
AGCGTAACTGGTATTTGCAACCGAAGCTCTTGTCCCCTTGCTAACAGCCGTTACGCCACC
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ACCAAAATGACTCAGATGCGTATTCGTATGAGGAAACTTGCTCTCAAGACAAGGGAGAAG
ATAATGACTACACCGAGGAGGGATATCAAGAGAGAATCAA

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DS 

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GGATTTTAAAACTCCACGGTGAAAGATGCAGCACGACGAGGTCATATGGCAAGTTATCAG
ACACAAACACTGCAGTTACATGGCCAAAATCGAAACCGGAATCTTCTGTAGAAATCCTTA
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CATCAGAGACCACGATGGTGTTTTTTATTTGTATATGAAGACAATAGAGAGAGCCCATAT
GCCTAAGAACTTGTGGGAGAGGGTGAAGTTGCCTAGAAACTACGAGAAGGCTCTTGAAAC
CATTGACAAGCACTTGTTGTATTGGCCTAAGTTATTACAGCACGAGATCAAACAGAGACT
GACCAAAATGACTCAGATGCGTATTCGTATGAGGAAACTTGCTCTCAAGACAAGGGAGAA
GATAATGACTACACCAAGAAGGGATATCAAGAGAGAATCAAGAAGGGAGGAGAAGGCTAT
CAAAGCAGCGGTCTTGGATAAGGCTATTGAGACCGAGTTGCTAGAGCGTTTGAAGAAGGG
TATTTATGGTGACATATACAATTACCCAGAGCTCGAGTGGAACAAG*TTCTTGATGAAGA
AAAGCAAGCGGCAGAGGGTGTTGAG*TAGAGGAAGAAGAGGAGGAGC*AGAGATTGAATA
TGTTGA*GGATATGAAGAGCTTGAAGATGAGGAAGA

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DS 

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ACG
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TCAAGACAAGGGAGAAGATAATGACTACACCAAGAAGGGATATCAAGAGAGAATCAAGAA
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AGCGTTTGAAGAAGGGTATTTATGGTGACATATACAATTACCCAGAGCTCGAGTGGAACA
AGGTTCTTGATGAAGAAAAGCAAGCGGCAGAGGGTGTTGAGGTAGAGGAAGAAGAGGAGG
AGCCAGAGATTGAATATGTTGAAGGATATGAAGAGCTTGAAGATGAGGAAGATATGGAAG
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GCCAAAACCCTGAAGCTGAAATGGCAGAGGAAAGTGTAGTTTGTTTTGTTTTGTTGTGCT
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TGACGTTTGAATTTTTGTATACTTGGTTAAAATGAAGCATTTTCTTTGAC

QA 4 833 4 833
DS 



AS 1 4

CO CL1832Contig1 1275 4 16 U
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TTACCATCATCAAAGCTTCTTTCCATTCTTCGTTTCCTCCTCCTCTCCGATCACAATCAT
CATCATCACTCTCTGTTGGATCTCATATTCAGCTTGGAAAGCACGATCACTCCGTAGTCG
CTGCTGCTTCTTCTGGTGGTGTCTCCATGTCAACAAACAGAGATTCTCACGGATCGTCTT
CACACGTTGCTGAACCATTCTTCAGAAGCGTATTAGGGCAGATGGAAACGGTTTACCTAA
ACCGGAACCCGACTCCTAAATCCGTCTTGGAGCTTGTCCGATCCGTTGACGACGAGCAGC
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TTGCAAGTTTTTTCCTTGACTATGGGTATACCCAAATGGATGAGCTGAGGTTTCCGGCCA
AAAAGCTCCGAGCTTTGTGGTTTGCGCCTCCTCATGCTTCTGCTGTTCTTGGTGGAAGTG
GTGTAAATGGTCCTTTACCAAGAGTTTTTATCTCAGAGCTTCTAGTTGAGCAGATGAGTT
CACAGACTCAGGATGTGATCAGAAAATACACCGAAACATCGCCTAATGGGAAAAAGTATG
CTGCTCTCTCTAGTGCTTTGGGTAGTCTGCCCTGGGAAAAGCCTCAATCTTCTGAGTTTG
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ACCACGTCACTATCTCTGTCCATCGCCTTAAATCTCATCTAAACAAAATCAAGAAGCTCA
ATCAGTTCCTTGAAGAAAAAGGTTTTAAATTGAACTCAGAAGGAGGAGTCCTTAAAGTTA
GTCCTGATGGTGGTTTGCTGCAAAGCTCAACTGTAGCAGATTCGATTTCTTTCAAGTTCT
CTGATGGAGTCACCAAATCTATCCCTTGTTCGTACATTGAGTTTGCTGAACGCCTCGTGC
TTCCCCAGTTTCAAAATGTACCCGAAAGCGAGATAAAGGAGTCTCATCGGCGAGATGGAT
TTGAGGTGAGAAATGCAGACAAGATCTTCGAGAGCACAAACCAGGAACAGCTTTCCCGAC
GAACCGGGTGATGAGCAGGGCTTTGGCCATATGTTCGTTTCATCATACCTTTGTACATAC
ACGTGTGAAGAATAAGAGCTGAAACTGTTTGTAATGTTGTTAACCACTAAAGATAAAACT
AATCCAAAAATCCCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G828TF U 2
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AF RS1C721JQ C 565
AF RS1G828JQ C 795
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RD RS1G828TF 380 0 0
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TACCATCATCAAAGCTTCTTTCCATTCTTCGTTTCCTCCTCCTCTCCGATCACAATCATC
ATCATCACTCTCTGTTGGATCTCATATTCAGCTTGGAAAGCACGATCACTCCGTAGTCGC
TGCTGCTTCTTCTGGTGGTGTCTCCATGTCAACAAACAGAGATTCTCACGGATCGTCTTC
ACACGTTGCTGAACCATTCTTCAGAAGCGTATTAGGGCAGATGGAAACGGTTTACCTAAA
CCGGGACCCGACTCCTAAATCCGTCTTGGAGCTTGTCCGATCCGTTGACGACGAGCAGCT
TTGCTATGATCATCTCGCTT

QA 1 380 1 380
DS 

RD RS1C721TF 729 0 0
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TTACCATCATCAAAGCTTCTTTCCATTCTTCGTTTCCTCCTCCTCTCCGATCACAATCAT
CATCA***CTCTCTGTTGGATCTCGTATTCAGCTTGGAAAGCACGATCACTCCGTAGTCG
CTGCTGCTTCTTCTGGTGGTGTCTCCATGTCAACAAACAGAGATTCTCACGGATCGTCTT
CACACGTTGCTGAACCATTCTTCAGAAGCGTATTAGGGCAGATGGAAACGGTTTACCTAA
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TTTGCTATGATCATCTCGCTTTCAGGACCTTTGGGATTGGTGGTTATGGGATTGACTCGC
TTGCAAGTTTTTTCCTTGACTATGGGTATACCCAAATGGATGAGCTGAGGTTTCCGGCCA
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GTGTAAATGGTCCTTTACCAAGAGTTTTTATCTCAGAGCTTCTAGTTGAGCAGATGAGTT
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CTGCTCTCTCTAGTGCTTTGGGTAGTCTGCCCTGGGAAA*GCCTCAATCTTCTGAGTTTG
AGCAATTAG

QA 1 729 1 729
DS 

RD RS1C721JQ 711 0 0
TTTTTATCTCAGAGCTTCTAGTTGAGCAGATGAGTTCACAGACTCAGGATGTGATCAGAA
AATACACCGAAACATCGCCTAATGGGAAAAAGTATGCTGCTCTCTCTAGTGCTTTGGGTA
GTCTGCCCTGGGAAAAGCCTCAATCTTCTGAGTTTGAGCAATTAGCTAGGGAAAGTGAAT
ATGCAGCATGGACACTTGCCAATGGGTATGCACTTAACCACGTCACTATCTCTGTCCATC
GCCTTAAATCTCATCTAAACAAAATCAAGAAGCTCAATCAGTTCCTTGAAGAAAAAGGTT
TTAAATTGAACTCAGAAGGAGGAGTCCTTAAAGTTAGTCCTGATGGTGGTTTGCTGCAAA
GCTCAACTGTAGCAGATTCGATTTCTTTCAAGTTCTCTGATGGAGTCACCAAATCTATCC
CTTGTTCGTACATTGAGTTTGCTGAACGCCTCGTGCTTCTCCAGTTTCATAATGTACCCG
AAAGCGAGATAAAGGAGTCTCATCGGCGAGATGGATTTGAGGTGAGAAATGCAGACAAGA
TCTTCGAGAGCACAAACCAGGAACAGCTTTCCCGACGAACCGGGTGATGAGCAGGGCTTT
GGCCATATGTTCGTTTCATCATACCTTTGTACATACACGTGTGAAGAATAAGAGCTGAAA
CTGTTTGTAATGTTGTTAATCACTAAAGATAAAACTAATCCAAAAATCCCC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RS1G828JQ 472 0 0
TCTGTCCATCGCCTTAAATCTCATCTAAACAAAATCAAGAAGCTCAATCAGTTCCTTGAA
GAAAAAGGTTTTAAATTGAACTCAGAAGGAGGAGTCCTTAAAGTTAGTCCTGATGGTGGT
TTGCTGCAAAGCTCAACTGTAGCAGATTCGATTTCTTTCAAGTTTTCTGATGGAGTCACC
AAATCTATCCCTTGTTCGTACATTGAGTTTGCTGAACGCCTCGTGCTTCCCCAGTTTCAA
AATGTACCCGAAAGCGAGATAAAGGAGTTTCATCGGCGAGATGGATTTGAGGTGGGAAAT
GCAGACAAGATCTTCGAGAGCACAAACCAGGAACAGCTTTCCCGACGAACCGGGTGATGA
GCAGGGCTTTGGCCATATGTTCGTTTCATCATACCTTTGTACATACACGTGTGAAGAATA
AGAGCTGAAACTGTTTGTAATGTTGTTAACCACTAAAGATAAAACTAATCC
T

QA 1 471 1 471
DS 



AS 1 5

CO CL1833Contig1 737 5 4 U
GGACAGTTTCCAAACTAGCTAGCAATGACAAAACTTTATTTAGCTCTCGTGATATCGTTG
GGTCTCCTACTCTTCGCTAGTGCGGATGAAGCAGCAACCAAGACTAGCCGTCCGGACAAA
ACCAAGGGTATGTTCCAGTCTGCACATGAAGCTCCTCCGGCAGAAACCACTAAACCTTTG
CTTCATGTTGTACCTGTGAAGCCACCAAACACCGCAACCAAAACCAAGGATCTGCTCCAG
TCTGCACATGAAGCTCCTCCAGGCAAAACCACAAACAGTTTCCTTCATTCTGAACCTGTG
ACGCCAACAAATACTGCAAGAAAAACCAAGGGTATGTTCCAGTCTGCACATGAAGCTCCT
CCGGCAGAAACCACAAAACGTTTGCTTCATGTTGTACCAGTGCAGCCACCGAATACCGCA
AGCAAAACCAATAATGGTCTATTCCAGTATGCACATGAAGCTCCTCCAGCAAAAACCACG
AACAGTTTTCTTCATTCTGAACCAGTGAACCCATCAAAAACTGCAACCAAGACAGAGACT
TTGTTCTGAAACTTTGTACTGCAAATATGCAGAAACGCAAGACTATGTGTAAGAGCCGTC
GGTAATAATAACTAGTCAGTTCGTTCCATTATCATAAGTGCCTTTTTAAAAGTGTCGATC
TTTCCAATGTGAGTTTCAAATATTGAAACTTTTGATGAAGCTTCTTAGTATTGTATTGAT
GATCAAACATTATTCTC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 0 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1F601TF U 1
AF RS1DK74TF U 1
AF RS1DH73TF U 2
AF RS1BA04JQ C 125
AF RS1BA04TF U 125
BS 1 244 RS1DK74TF
BS 245 245 RS1F601TF
BS 246 721 RS1DK74TF
BS 722 737 RS1BA04TF

RD RS1F601TF 597 0 0
G
GACAGTTTCCAAACTAGCTAGCAATGACAAAACTTTATTTAGCTCTCGTGATATCGTTGG
GTCTCCTACTCTTCGCTAGTGCGGATGAAGCAGCAACCAAGACTAGCCGTCCGGACAAAA
CCAAGGGTATGTTCCAGTCTGCACATGAAGCTCCTCCGGCAGAAACCACTAAACCTTTGC
TTCATGTTGTACCTGTGAAGCCACCAAACACCGCAACCAAAACCAAGGATCTGCTCCAGT
CTGCACATGAAGCTCCTCCAGGCAAAACCACAAACAGTTTCCTTCATTCTGAACCTGTGA
CGCCAACAAATACTGCAAGAAAAACCAAGGGTATGTTCCAGTCTGCACATGAAGCTCCTC
CGGCAGAAACCACAAAACGTTTGCTTCATGTTGTACCAGTGCAGCCACCGAATACCGCAA
GCAAAACCAATAATGGTCTATTCCAGTATGCACATGAAGCTCCTCCAGTAAAAACCACGA
ACAGTTTTCTTCATTCTGAACCAGTGAACCCATCAAAAACTGCAACCAAGACAGAGACTT
TGTTCTGAAACTTTGTACTGCAAATATGCAGAAACGCAAGGCTATGTGTAAGAGCC

QA 2 597 2 597
DS 

RD RS1DK74TF 721 0 0
GGACAGTTTCCAAACTAGCTAGCAATGACAAAACTTTATTTAGCTCTCGTGATATCGTTG
GGTCTCCTACTCTTCGCTAGTGCGGATGAAGCAGCAACCAAGACTAGCCGTCCGGACAAA
ACCAAGGGTATGTTCCAGTCTGCACATGAAGCTCCTCCGGCAGAAACCACTAAACCTTTG
CTTCATGTTGTACCTGTGAAGCCACCAAACACCGCAACCAAAACCAAGGATCTGCTCCAG
TCTGTACATGAAGCTCCTCCAGGCAAAACCACAAACAGTTTCCTTCATTCTGAACCTGTG
ACGCCAACAAATACTGCAAGAAAAACCAAGGGTATGTTCCAGTCTGCACATGAAGCTCCT
CCGGCAGAAACCACAAAACGTTTGCTTCATGTTGTACCAGTGCAGCCACCGAATACCGCA
AGCAAAACCAATAATGGTCTATTCCAGTATGCACATGAAGCTCCTCCAGCAAAAACCACG
AACAGTTTTCTTCATTCTGAACCAGTGAACCCATCAAAAACTGCAACCAAGACAGAGACT
TTGTTCTGAAACTTTGTACTGCAAATATGCAGAAACGCAAGACTATGTGTAAGAGCCGTC
GGTAATAATAACTAGTCAGTTCGTTCCATTATCATAAGTGCCTTTTTAAAAGTGTCGATC
TTTCCAATGTGAGTTTCAAATATTGAAACTTTTGATGAAGCTTCTTAGTATTGTATTGAT
G

QA 1 721 1 721
DS 

RD RS1DH73TF 721 0 0
GACAGTTTCCAAACTAGCTAGCAATGACAAAACTTTATTTAGCTCTCGTGATATCGTTGG
GTCTCCTACTCTTCGCTAGTGCGGATGAAGCAGCAACCAAGACTAGCCGTCCGGACAAAA
CCAAGGGTATGTTCCAGTCTGCACATGAAGCTCCTCCGGCAGAAACCACTAAACCTTTGC
TTCATGTTGTACCTGTGAAGCCACCAAACACCGCAACCAAAACCAAGGATCTGCTCCAGC
CTGCACATGAAGCTCCTCCAGGCAAAACCACAAACAGTTTCCTTCATTCTGAACCTGTGA
CGCCAACAAATACTGCAAGGAAAACCAAGGGTATGTTCCAGTCTGCACATGAAGCTCCTC
CGGCAGAAACCACAAAACGTTTGCTTCATGTTGTACCAGTGCAGCCACCGAATACCGCAA
GCAAAACCAATAATGGTCTATTCCAGTATGCACATGAAGCTCCTCCAGCAAAAACCACGA
ACAGTTTTCTTCATTCTGAACCAGTGAACCCATCAAAAACTGCAACCAAGACAGAGACTT
TGTTCTGAAACTTTGTACTGCAAATATGCAGAAACGCAAGACTATGTGTAAGAGCCGTCG
GTAATAATAACTAGTCAGTTCGTTCCATTATCATAAGTGCCTTTTTAAAAGTGTCGATCT
TTCCAATGTGAGTTTCAAATATTGAAACTTTTGATGA*GCTTCTTAGTATTGTATTGATG
A

QA 1 720 1 720
DS 

RD RS1BA04JQ 613 0 0
G
GGGTATGTTCCAGTCTGCACATGAAGCTCCTCCGGCAGAAACCACTAAACCTTTGCTTCA
TGTTGTACCTGTGAAGCCACCAAACACCGCAACCAAAACCAAGGATCTGCTCCAGTCTGC
ACATGAAGCTCCTCCAGGCAAAACCACAAACAGTTTCCTTCATTCTGAACCTGTGACGCC
AACAAATACTGCAAGAAAAACCAAGGGTATGTTCCAGTCTGCACATGAAGCTCCTCCGGC
AGAAACCACAAAACGTTTGCTTCATGTTGTACCAGTGCAGCCACCGAATACCGCAAGCAA
AACCAATAATGGTCTATTCCAGTATGCACATGAAGCTCCTCCAGCAAAAACCACGAACAG
TTTTTTTCATTCTGAACCAGTGAACCCATCAAAAACTGCAACCAGGACAGAGACTTTGTT
CTGAAACTTTGTACTGCAAATATGCAGAAACGCAAGACTATGTGTAAGAGCCGTCGGTAA
TAATAACTAGTCAGTTCGTTCCATTATCATAAGTGCCTTTTTAAAAGTGTCGATCTTTCC
AATGTGAGTTTCAAATATTGAAACTTTTGATGAAGCTTCTTAGTATTGTATTGATGATCA
AACATTATTCTC

QA 2 613 2 613
DS 

RD RS1BA04TF 613 0 0
G
GGGTATGTTCCAGTCTGCACATGAAGCTCCTCCGGCAGAAACCACTAAACCTTTGCTTCA
TGTTGTACCTGTGAAGCCACCAAACACCGCAACCAAAACCAAGGATCTGCTCCAGTCTGC
ACATGAAGCTCCTCCAGGCAAAACCACAAACAGTTTCCTTCATTCTGAACCTGTGACGCC
AACAAATACTGCAAGAAAAACCAAGGGTATGTTCCAGTCTGCACATGAAGCTCCTCCGGC
AGAAACCACAAAACGTTTGCTTCATGTTGTACCAGTGCAGCCACCGAATACCGCAAGCAA
AACCAATAATGGTCTATTCCAGTATGCACATGAAGCTCCTCCAGCAAAAACCACGAACAG
TTTTCTTCATTCTGAACCAGTGAACCCATCAAAAACTGCAACCAGGACAGAGACTTTGTT
CTGAAACTTTGTACTGCAAATATGCAGAAACGCAAGACTATGTGTAAGAGCCGTCGGTAA
TAATAACTAGTCAGTTCGTTCCATTATCATAAGTGCCTTTTTAAAAGTGTCGATCTTTCC
AATGTGAGTTTCAAATATTGAAACTTTTGATGAAGCTTCTTAGTATTGTATTGATGATCA
AACATTATTCTC

QA 2 613 2 613
DS 



AS 1 5

CO CL1834Contig1 640 5 23 U
GGGTTTTCTGCAGCGGCTGGAGGTCCATCCGAGAAGAAGAGAAAACAA*TGGCAACACCA
CAAGTGAAGACTGGTTTGTTCGTTGGTCTGAACAAAGGACACGTCGTCACAAGACGCGAG
TTGGCTCCTCGTCCTAACTCTCGCAAAGGGAAAACGAGCAAGAGGACATTGTTCATCAGA
TCACTGATCAGGGAAGTTGCTGGATTTGCTCCATACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTC
AAGGTTGGTAAAGACAAGAGGGCTCTTAAGGTTGCCAAGAGGAAGTTGGGTACCCACAAG
AGAGCCAAGCGAAAGAGAGAGGAGATGTCTAGTGTTCTCCGCAAAATGAGGTCTGGTGGA
GGTGCTACTACTGAGAAGAAGAAGTAAACATCTTAGTCTTCTGTGTTTTGATTGGAACTC
TTTTCAAGTTTTGGTTCGCTCTTGCAAATCAGCTTTATGCTCTAAAAACCATGTTGTGTT
TTCGTGTTTTGTTAGAGATATTGATCAAACGTTGCTTCACTATGTTACCATTTATCATAA
AGCTTTTCAAACTTGCTACTTTTACTCTGAACCATTATTCAAAACAGTCTTGGTATTTGT
AGTCCGTTAACAACCAATACTTTTTTTTTTTGAACAACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AD81TF U 184
AF RS1FY77TF U 30
AF RS1DX14TF U 8
AF RS1FS67TF U 1
AF RS1FS67JQ C 1
BS 1 9 RS1FS67JQ
BS 10 25 RS1DX14TF
BS 26 26 RS1FS67TF
BS 27 30 RS1DX14TF
BS 31 123 RS1FY77TF
BS 124 124 RS1DX14TF
BS 125 183 RS1FY77TF
BS 184 197 RS1AD81TF
BS 198 198 RS1FY77TF
BS 199 359 RS1AD81TF
BS 360 361 RS1FY77TF
BS 362 410 RS1AD81TF
BS 411 411 RS1FY77TF
BS 412 461 RS1AD81TF
BS 462 462 RS1FY77TF
BS 463 495 RS1AD81TF
BS 496 496 RS1FY77TF
BS 497 534 RS1AD81TF
BS 535 544 RS1DX14TF
BS 545 545 RS1FS67TF
BS 546 557 RS1DX14TF
BS 558 579 RS1FS67TF
BS 580 640 RS1FS67JQ

RD RS1AD81TF 351 0 0
CTGATCAGGGAAGTAGCTGGATTTGCTCCATACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTCAAG
GTTGGTAAAGACAAGAGGGCTCTTAAGGTTGCCAAGAGGAAGTTGGGTACCCACAAGAGA
GCCAAGCGAAAGAGAGAGGAGATGTCTAGTGTTCTCCGCAAAATGAGGTCTGGTGGTAGT
GCTACTACTGAGAAGAAGAAGTAAACATCTTAGTCTTCTGTGTTTTGTTTGGAACTCTTT
TCAAGTTTTGGTTCGCTCTTGCAAATCAGCTTTATGCT*TAAAAACCATGTTGTGTTTTC
GTGTTTTGTTAGGGATATTGATCAAACGTTGCTTCACTATGTTACCATTTA

QA 1 351 1 351
DS 

RD RS1FY77TF 505 0 0
G
GAGAAGAAGAGAAAACAA*TGGCAACACCACAAGTGAAGACTGGTTTGTTCGTTGGTCTG
AACAAAGGACACGTCGTCACAAGACGCGAGTTGTCTCCTCGTCCTAACTCTCGCAAAGGG
AAAACGAGCAAGAGGACATTGTTCATCAGATCACTGATCAGGGAAGTTGCTGGATTTGCT
CCATACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTCAAGGTTGGTAAAGACAAGAGGGCTCTTAAG
GTTGCCAAGAGGAAGTTGGGTACCCACAAGAGAGCCAAGCGAAAGAGAGAGGAGATGTCT
AGTGTTCTCCGCAAAATGAGGTCTGGTGGAGGTGCTACTACTGAGAAGAAGAAGTAAACA
TCTTAGTCTTCTGTGTTTTGATTGGAACTCTTTTCAAGTTTTGGTTCGCTCTTGCAAATC
AGCTTTATGCTCTAAAAACCATGTTGTGTTTTCGTGTTTTGTTAGAGATATTGATCAAAC
GTTGCTTCACTATGTTACCATTTA

QA 2 505 2 505
DS 

RD RS1DX14TF 550 0 0
GA
GCAGCGGCTGGAGGTCGATCCGAGAAGAAGAGAAAACAAATGGCAACACCACAAGTGAAG
ACTGGTTTGTTCGTTGGTCTGAACAAAGGACACGTCGTCACAAGACGCGAGTTGGCTCCT
CGTCCTAACTCTCGCAAAGGGAAAACGAGCAAGAGGACGTTGTTCATCAGATCACTGATC
AGGGAAGTAGCTGGATTTGCTCCATACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTCAAGGTTGGT
AAAGACAAGAGGGCTCTTAAGGTTGCCAAGAGGAAGTTGGGTACCCACAAGAGAGCCAAG
CGAAAGAGAGAGGAGATGTCTAGTGTTCTCCGCAAAATGAGGTCTGGTGGAGGTGCTACA
ACTGAGAAGAAGAAGTAAACATCTTAGTCTTCTGTGTTTTGTTTGGAACTCTTTCCAAGT
TTTGGTTCGCTCTTGCAAATCAGCTTTATGCTTTAAAAACCATGTTGTGTTTTCGTGTTT
TGTTAGAGATATTGATCAAACGTTGCTTCACTATGTTACCATTTATCATAAAGCTCTTCA
AACTTGCT

QA 3 550 3 550
DS 

RD RS1FS67TF 579 0 0
GGGTTTTCT
GCAGCGGCTGGAGGTCCATCCGAGAAGAAGAGAAAACAA*TGGCAACACCACAAGTGAAG
ACTGGTTTGTTCGTTGGTCTGAACAAAGGACACGTCGTCACAAGACGCGAGTTGGCTCCT
CGTCCTAACTCTCGCAAAGGGAAAACGAGCAAGAGGACATTGTTCATCAGATCACTGATC
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AAAGACAAGAGGGCTCTTAAGGTTGCCAAGAGGAAGTTGGGTACCCACAAGAGAGCCAAG
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 30 
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BQ
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35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RS1GK06JQ U 1
AF RS1GF13JQ U 2
AF RS1FS08JQ U 3
AF RS1ED54JQ U 3
AF RS1GK06TF C 9
BS 1 578 RS1GK06JQ
BS 579 724 RS1ED54JQ
BS 725 728 RS1GK06TF

RD RS1GK06JQ 578 0 0
GTGAAAAATTAAAATTTCATCAATAACATTATTGATCTGTTTCAGCATATTATATCGGCA
ACAATATGCAATTGCCTCAACCACATAGAAATGGCCTAAAACCATAGAAAAAAACAATCT
CAACAAATAGCTTTTTTTCTTGTATGAAAACAACCCCTTATAGCCTAATTAGCTAATGCC
TTCACAGCTTTCTCTGCTGCGTCATCCAAATCATCAGCTGTTATGAGTTTCATTCCACTT
TCCTTGAGGATTCTCTTTCCTTGTTCAACATTTGTTCCTTCCAGACGAACCACCACTGGT
ACTTTCAGTGACACCTCTTTAGCAGCATTCACAATTCCACTAGCAATCACATCACATTTC
ATTATCCCACCGAATATGTTCACCAATATTGCTTTCACTTTATCGTCCGATGTCAGTATC
TTAAACGCCTCCACCACCTGGTGTTCAGAAGCGTTTCCACCAACGTCAAGGAAATTTGCA
GGAGTCCCACCGTGGAGTTTAATGATGTCCATGGTTGCCATGGCCAATCCCGCACCATTC
ACCATGCACCCAATCTCTCCATCTAAACCGATATAGTT

QA 1 578 1 578
DS 

RD RS1GF13JQ 548 0 0
CGA
AAAATTAAAATTTCATCAATAACATTATTGATCTGTTTCAGCATATTATATCGGCAACAA
TATGCAATTGCCTCAACCACATAGAAATGGCCTAAAACCATAAAAAAAAACAATCTCAAC
AAATAGCTTTTTTTCTTGTATGAAAACAACCCCTTATAGCCTAATTAGCTAATGCCTTCA
CAGCTTTCTCTGCTGCGTCATCCAAATCATCAGCTGTTATGAGTTTCATTCCACTTTCCT
TGAGGATTCTCTTTCCTTGTTCAACATTTGTTCCTTCCAGACGAACCACCACTGGTACTT
TCAGTGACACCTCTTTAGCAGCATTCACAATTCCACTAGCAATCACATCACATTTCATTA
TCCCACCGAATATGTTCACCAATATTGCTTTCACTTTATCGTCCGATGTCAGTATCTTAA
ACGCCTCCACCACCTGGTGTTCAAAAGCGTTTCCACCAACGTCAAGGAAATTTGCAGGAG
TCCCACCGTGGAGTTTAATGATGTCCATGGTTGCCATGGCCAATCCCGCACCATTCACCA
TGCAC

QA 4 548 4 548
DS 

RD RS1FS08JQ 693 0 0
GG
AAAATTAAAATTTCATCAATAACATTATTGATCTGTTTCAGCATATTATATCGGCAACAA
TATGCAATTGCCTCAACCACATAGAAATGGCCTAAAACCATAGAAAAAAACAATCTCAAC
AAATAGCTTTTTTTCTTGTATGAAAACAACCCCTTATAGCCTAATTAGCTAATGCCTTCA
CAGCTTTCTCTGCTGCGTCATCCAAATCATCAGCTGTTATGAGTTTCATTCCACTTTCCT
TGAGGATTCTCTTTCCTTGTTCAAAATTTGTTCCTTCCAGACGAACCCCCACTGGTACTT
TCAGTGACACCTCTTTAGCAGCATTCACAATTCCACTAGCAATCACATCACATTTCATTA
TCCCACCGAATATGTCCACCAATATTGCTTTCACTTTATCGTCCGATGTCAGTATCTTAA
ACGCCTCCACCACCTGGTGTTCAGAAGCGTTTCCACCAACGTCAAGGAAATTCGCAGGAG
TCCCGCCGTGGAGTTTAATGATGTCCATGGTTGCCATGGCCAATCCCGCACCATTCACCA
TGCACCCAATCTCTCCATCTAAACCGATATAGTTCAGGTCCACTTTTGCAGCAGCCACCT
CTCGTGGATCCTCCTGTGTTGGATCACGAAGGGCAAAAATTTCTTTCTGACGGAAAGCAG
CATTATCATCAAAGTTCAACTTAGCATCAGC

QA 3 693 3 693
DS 

RD RS1ED54JQ 722 0 0
GA
AAAATTAAAATTTCATCAATAACATTATTGATCTGTTTCAGCATATTATATCGGCAACAA
TATGCAATTGCCTCAACCACATAGAAATGGCCTAGAACCATAGAAAAAAACAATCTCAAC
AAATAGCTTTTTTTCTTGTATGAAAACAACCCCTTATAGCCTAATTAGCTAATGCCTTCA
CAGCTTTCTCTGCTGCGTCATCCAAATCATCAGCTGTTATGAGTTTCATTCCACTTTCCT
TGAGGATTCTCTTTCCTTGTTCAACATTTGTTCCTTCCAGACGAACCACCACTGGTACTT
TCAGTGACACCTCTTTAGCAGCATTCACAATTCCACTAGCAATCACATCACATTTCATTA
TCCCACCGAATATGTTCACCAATATTGCTTTCACTTTATCGTCCGATGTCGGTATCTTAA
ACACCTCCACCACCTGGTGTTCAGAAGCGTTTCCACCAACGTCAAGGAAATTTGCAGGAG
TCCCACCGTGGAGTTTAATGATGTCCATGGTTGCCATGGCCAATCCCGCACCATTCACCA
TGCACCCAATCTCTCCATCTAAACCGATATAGTTCAGGTCCACTTTTGCAGCAGCCACCT
CTCGTGGATCCTCCTGTGTTGGATCACGAAGGGCAAAAATTTCTTTCTGACGGAAAGCAG
CATTATCATCAAAGTTCAACTTAGCATCAGCAGCTACCAATTGGTTCGTGGATGTCTCAG

QA 3 722 3 722
DS 

RD RS1GK06TF 720 0 0
TTAAAATTTCATCAATAACATTATTGATCTGTTTCAGCATATTATATCGGCAACAATATG
CAATTGCCTCAACCACATAGAAATGGCCTAGAACCATAGAAAAAAACAATCTCAACAAAT
AGCTTTTTTTCTTGTATGAAAACAACCCCTTATAGCCTAATTAGCTAATGCCTTCACAGC
TTTCTCTGCTGCGTCATCCAAATCATCAGCTGTTATGAGTTTCATTCCACTTTCCTTGAG
GATTCTCTTTCCTTGTTCAACATTTGTTCCTTCCAGACGAACCACCACTGGTACTTTCAG
TGACACCTCTTTAGCAGCATTCACAATTCCACTAGCAATCACATCACATTTCATTATCCC
ACCGAATATGTTCACCAATATTGCTTTCACTTTATCGTCCGATGTCAGTATCTTAAACGC
CTCCACCACCTGGTGTTCAGAAGCGTTTCCACCAACGTCAAGGAAATTTGCAGGAGTCCC
ACCGTGGAGTTTAATGATGTCCATGGTTGCCATGGCCAATCCCGCACCATTCACCATGCA
CCCAATCTCTCCATCTAAACCGATATAGTTCAGGTCCACTTTTGCAGCAGCCACCTCTCG
TGGATCCTCCTGTGTTGGATCACGAAGGGCAAAAATTTCTTTCTGACGGAAAGCAGCATT
ATCATCAAAGTTCAACTTAGCATCAGCAGCTACCAATTGGTTCGTGGATGTCTCAGCGCC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 5

CO CL1837Contig1 354 5 4 U
GGATTCACGTCTGAGCATTCAAAAAATAAAAAGTCATGGGGTTTGCGGCGATTTGGAACT
CTCATCCCAAGAAGTA*GGGCCTGGTTCCCGCACCTGCCGTGTGTGCGGAAACTCACATG
GGCTAATCAGGAAGTATGGTCTGAACTGCTGTAGGCAGTGCTTCCGCAGCAACGCCAAGG
AAATCGGATTCATCAAGTACCGTTAAAGATCTGGTGTTGTTTATGCAGTTGCAGTCATTT
TGTTTTCTTAAGCTTTTGAGACTTCAATATTGTAATGGATCTTATTAATATGCAATACAT
TTGAGTTGTTGAACGTTTTAGTTTACTTGTTTTAATCCACAATCTTGGTTCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1FL37JQ C 1
AF RS1FL37TF U 1
AF RS1G808TF U 1
AF RS1BK66TF U 5
AF RS1BZ24TF U 106
BS 1 6 RS1FL37JQ
BS 7 311 RS1FL37TF
BS 312 338 RS1G808TF
BS 339 354 RS1BK66TF

RD RS1FL37JQ 311 0 0
GGATTCACGTTTGAGCATTCAAAAAATAAAAAGTCATGGGGTTTGCGGCGATTTGGAACT
CTCATCCCAAGAAGTA*GGGCCTGGTTCCCGCACCTGCCGTGTGTGCGGAAACTCACATG
GGCTAATCAGGAAGTATGGTTTGAACTGCTGTAGGCAGTGCTTCCGCAGCAACGCCAAGG
AAATCGGATTCATCAAGTACCGTTAAAGATCTGGTGTTGTTTATGCAGTTGCAGTCATTT
TGTTTTTTTAAGCTTTTGAGACTTCAATATTGTAATGGATCTTATTAATATGCAATACAT
TTGAGTTGTTG

QA 1 311 1 311
DS 

RD RS1FL37TF 311 0 0
GGATTC
ACGTCTGAGCATTCAAAAAATAAAAAGTCATGGGGTTTGCGGCGATTTGGAACTCTCATC
CCAAGAAGTA*GGGCCTGGTTCCCGCACCTGCCGTGTGTGCGGAAACTCACATGGGCTAA
TCAGGAAGTATGGTCTGAACTGCTGTAGGCAGTGCTTCCGCAGCAACGCCAAGGAAATCG
GATTCATCAAGTACCGTTAAAGATCTGGTGTTGTTTATGCAGTTGCAGTCATTTTGTTTT
CTTAAGCTTTTGAGACTTCAATATTGTAATGGATCTTATTAATATGCAATACATTTGAGT
TGTTG

QA 7 311 7 311
DS 

RD RS1G808TF 338 0 0
GGATTC
ACGTCTGAGCATTCAAAAAATAAAAAGTCATGGGGTTTGCGGCGATTTGGAACTCTCATC
CCAAGAAGTACGGGCCTGGTTCCCGCACCTGCCGTGTGTGCGGAAACTCACATGGGCTAA
TCAGGAAGTATGGTCTGAACTGCTGTAGGCAGTGCTTCCGCAGCAACGCCAAGGAAATCG
GATTCATCAAGTACCGTTAAAGATCTGGTGTTGTTTATGCAGTTGCAGTCATTTTGTTTT
CTTAAGCTTTTGAGACTTCAATATTGTAATGGATCTTATTAATATGCAATACATTTGAGT
TGTTGAACGTTTTAGTTTACTTGTTTTAATCC

QA 7 338 7 338
DS 

RD RS1BK66TF 350 0 0
GG
ACGTCTGAGCATTCAAAAAATAAAAAGTCATGGGGTTTGCGGCGATTTGGAACTCTCATC
CCAAGAAGTACGGGCCTGGTTCCCGCACCTGCCGTGTGTGCGGAAACTCACATGGGCTAA
TCAGGAAGTATGGTCTGAACTGCTGTAGGCAGTGCTTCCGCAGCGACGCCAAGGAAATCG
GATTCATCAAGTACCGTTAAAGATCTGGTGCTGTTTATGCAGTTGCAGTCATTTTGTTTT
CTTAAGCTTTTGAGACTTCAATATTGTAATGGATCTTATTAATATGCAATACATTTGAGT
TGTTGAACGTTTTAGTTTACTTGTTTTAATCCACAATCTTGGTTCTGC

QA 3 350 3 350
DS 

RD RS1BZ24TF 249 0 0
GCGGAAACTCACATGGGCTAATCAGGAAGTATGGTCTGAACTGCTGTAGGCAGTGCTTCC
GCAGCAACGCCAAGGAAATCGGATTCATCAAGTACCGTTAAAGATCTGGTGTTGTTTATG
CAGTTGCAGTCATTTTGTTTTCTTAAGCTTTTGAGACTTCAATATTGTAATGGATCTTAT
TAATATGCAATACATTTGAGTTGTTGAACGTTTTAGTTTACTTGTTTTAATCCACAATCT
TGGTTCTGC

QA 1 249 1 249
DS 



AS 1 5

CO CL1838Contig1 1040 5 9 U
GGGTACTTGCATGTTCCTGTGTGAGAGTCTGAGAGAGAAGAGAGAACTGTACCGAGCGGG
TGAAGAGATCCAGACGTGTGTATAAAAGAATCAAATCGGAAAAAAAA*ATGGAGAAGAAG
AAGGTGCCAAAAAGACTCCAAGGTAAAGTAGCGATCGTGACGGCATCGACGCAAGGGATA
GGCTTCGGTATCGTTGAGCGGCTTGGCCTCGAAGGCGCTTCTGTCGTCGTCTCCTCTCGC
AAACAGAGAAACGTGGATGAGGCGGTAGAGAAGCTTAAAGCTCAGGGGATTGATGCATTT
GGAATCGTTTGTCATGTCTCTAATGCTCAACATCGCCAGATTCTTGTCCAAAAGACAATT
CAAAGATATGGAAAGATAGATATTGTTGTGTGCAATGCAGCTGTGAATCCATCTACTGAC
CCAATCTTATCCACCAAAGAACCTGCCCTTGACAAGCTTTGGGAAGTCAATGTCAAATCA
TCTATCCTTCTCCTCCAGGATATGGCTCCTCACTTAGAGAAGGGTTCTTCTGTAATCTTC
ATAACCTCCATTGCTGCGTTTCAACCGCAAGTACCAACGGCAATGTATGGAGTTACTAAA
ACAGCTCTTCTCGGCCTAACCAAGGCACTTGCTGCTGAGATGGGACCGGACACAAGAGTG
AACGCAGTAGCTCCTGGTGTTGTGCCAACACACTTTGCCTCTTTCATCACCCGGAACTCT
GAAGTGAGAAGAGCCAATGAGGAGAAAACTCTGCTCAACAGGCTGGGAACAACGGATGAC
ATGGCCGCTGCAACCGCTTTCTTGGCTTCTGATGATGCTTCTTACATCACCGGAGAAACT
TTAGTGGTCGCCGGAGGAATGCCCTCCAGGCTCTGAATCAAAATCCCCAACTAGTAATAA
TTATTCATATATCAATAAAACTTTTTGATGATGTACAAGAAAAAAACCATACATTTGTTA
CTGTTGTATGATCATGTGATGTGGGATACTTTAATTTCTCATTTTGAATTAGTAGTAAAT
GGAACATATTTAATCTACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D427TF U 19
AF RS1CW72TF U 19
AF RS1EE60TF U 1
AF RS1D427JQ C 238
AF RS1EE60JQ C 485
BS 1 76 RS1EE60TF
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BS 107 107 RS1CW72TF
BS 108 251 RS1EE60TF
BS 252 252 RS1D427TF
BS 253 718 RS1EE60TF
BS 719 946 RS1D427JQ
BS 947 1040 RS1EE60JQ

RD RS1D427TF 498 0 0
GG
GTGAGAGTCTGAGAGAGAAGAGAGAACTGTACCGAGCGGGTGAAGAGATCCAGACGTGTG
TATAAAAGAATCAAATCGGAAAAAAAA*ATGGAGAAGAAGAAGGTGCCAAAAAGACTCCA
AGGTAAAGTAGCGATCGTGACGGCATCGACGCAAGGGATAGGCTTCGGTATCGTTGAGCG
GCTTGGCCTCGAAGGCGCTTCTGTCGTCGTCTCCTCTCGCAAACAGAGAAACGTGGATGA
GGCGGTAGAGAAGCTTAAAGCTCAGGGGATTGATGCATTTGGAATCGTTTGTCATGTCTC
TAATGCTCAACATCGCCAGATTCTTGTCCAAAAGACAATTCAAAGATATGGAAAGATAGA
TATTGTTGTGTGCAATGCAGCTGTGAATCCATCTACTGACCCAATCTTATCCACCAAAGA
ACCTGCCCTTGACAAGCTTTGGGAAGTCAATGTCAAATCATCTATCCTTCTCCTCCAGGA
TATGGCTCCTCACT
CA

QA 3 496 3 496
DS 

RD RS1CW72TF 602 0 0
GG
GTGAGAGTCTGAGAGAGAAGAGAGAACTGTACCGAGCGGGTGAAGAGATCCAGACGTGTG
TATAAAAGAATCAAATCGGAAAAAAAAAATGGAGAAGAAGAAGGTGCCAAAAAGACTCCA
AGGTAAAGTAGCGATCGTGACGGCATCGACGCAAGGGATAGGCTTCGGTATCGTTGAGCG
GCTTGGCCTCGAAGGCGCTTCTGTCGTCGTCTCCTCTCGCAAACAGAGAAATGTGGATGA
GGCGGTAGAGAAGCTTAAAGCTCAGGGGATTGATGCACTTGGAATCGTTTGTCATGTCTC
TAATGCTCAACATCGCCAGATTCTTGTCCAAAAGACAATTCAAAGATATGGAAAGATAGA
TATTGTTGTGTGCAATGCAGCTGTGAATCCATCTACTGACCCAATCTTATCCACCAAAGA
ACCTGCCCTTGACAAGCTTTGGGAAGTCAATGTCAAATCATCTATCCTTCTCCTCCAGGA
TATGGCTCCTCACTTAGAGAAGGGTTCTTCTGTAATCTTCATAACCTCCATTGCTGCGTT
TCAACCGCAATTACCAACGGCAATGTATGGAGTTACTAAAACAGCTCTTCTCGGCCTAAC

QA 3 602 3 602
DS 

RD RS1EE60TF 722 0 0
GGGTACTTGCATGTTCCTGTGTGAGAGTCTGAGAGAGAAGAGAGAACTGTACCGAGCGGG
TGAAGAGATCCAGACGCGTGTATAAAAGAATCAAATCGGAAAAAAA**ATGGAGAAGAAG
AAGGTGCCAAAAAGACTCCAAGGTAAAGTAGCGATCGTGACGGCATCGACGCAAGGGATA
GGCTTCGGTATCGTTGAGCGGCTTGGCCTCGAAGGCGCTTCTGTCGTCGTCTCCTCTCGC
AAACAGAGAAATGTGGATGAGGCGGTAGAGAAGCTTAAAGCTCAGGGGATTGATGCATTT
GGAATCGTTTGTCATGTCTCTAATGCTCAACATCGCCAGATTCTTGTCCAAAAGACAATT
CAAAGATATGGAAAGATAGATATTGTTGTGTGCAATGCAGCTGTGAATCCATCTACTGAC
CCAATCTTATCCACCAAAGAACCTGCCCTTGACAAGCTTTGGGAAGTCAATGTCAAATCA
TCTATCCTTCTCCTCCAGGATATGGCTCCTCACTTAGAGAAGGGTTCTTCTGTAATCTTC
ATAACCTCCATTGCTGCGTTTCAACCGCAAGTACCAACGGCAATGTATGGAGTTACTAAA
ACAGCTCTTCTCGGCCTAACCAAGGCACTTGCTGCTGAGATGGGACCGGACACAAGAGTG
AACGCAGTAGCTCCTGGTGTTGTGCCAACACACTTTGCCTCTTTCATCACCCGGAACT
CTGA

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DS 

RD RS1D427JQ 709 0 0
CGCAAACAGAGAAACGTGGATGAGGCGGTAGAGAAGCTTAAAGCTCAGGGGATTGATGCA
TTTGGAATCGTTTGTCATGTCTCTAATGCTCAACATCGCCAGATTCTTGTCCAAAAGACA
ATTCAAAGATATGGAAAGATAGATATTGTTGTGTGCAATGCAGCTGTGAATCCATCTACT
GACCCAATCTTATCCACCAAAGAACCTGCCCTTGACAAGCTTTGGGAAGTCAATGTCAAA
TCATCTATCCTTCTCCTCCAGGATATGGCTCCTCACTCAGAGAAGGGTTCTTCTGTAATC
TTCATAACCTCCATTGCTGCGTTTCAACCGCAAGTACCAACGGCAATGTATGGAGTTACT
AAAACAGCTCTTCTCGGCCTAACCAAGGCACTTGCTGCTGAGATGGGACCGGACACAAGA
GTGAACGCAGTAGCTCCTGGTGTTGTGCCAACACACTTTGCCTCTTTCATCACCCGGAAC
TCTGAAGTGAGAAGAGCCAATGAGGAGAAAACTCTGCTCAACAGGCTGGGAACAACGGAT
GACATGGCCGCTGCAACCGCTTTCTTGGCTTCTGATGATGCTTCTTACATCACCGGAGAA
ACTTTAGTGGTCGCCGGAGGAATGCCCTCCAGGCTCTGAATCAAAATCCCCAACTAGTAA
TAATTATTCATATATCAATAAAACTTTTTGATGATGTACAAGAAAAAAA

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DS 

RD RS1EE60JQ 556 0 0
TCCTTCTCCTCCAGGATATGGCTCCTCACTTAGAGAAGGGTTTTTCTGTAATCTTCATAA
CCTCCATTGCTGCGTTTCAACCGCAAGTACCAACGGCAATGTATGGAGTTACTAAAACAG
CTTTTTTCGGCCTAACCAAGGCACTTGCTGGTGAGATGGGACCGGACACAAGAGTGAACG
CAGTAGCTCCTGGTGTTGTGCCAACACACTTTGCCTCTTTCATCACCCGGAACTTTGAAG
TGAGAAGAGCCAATGAGGAGAAAACTTTGCTCAACAGGCTGGGAACAACGGATGACATGG
CCGCTGCAACCGCTTTCTTGGCTTTTGATGATGCTTCTTACATCACCGGAGAAACTTTAG
TGGTCGCCGGAGGAATGCCCTCCAGGCTTTGAATCAAAATCCCCAACTAGTAATAATTAT
TCATATATCAATAAAACTTTTTGATGATGTACAAGAAAAAAACCATACATTTGTTACTGT
TGTATGATCATGTGATGTGGGATACTTTAATTTCTCATTTTGAATTAGTAGTAAATGGAA
CATATTTAATCTACCG

QA 1 556 1 556
DS 



AS 1 5

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CAATAACAGCAATGGGGAAGAGGAAGTCAAGGGCAAAGCCTGCTACACCGAAGCGAATGG
ACAAGCTTGACACTGTCTTTAGCTGTCCCTTTTGCAATCACGGCTCTAGTGTCGAATGCC
AAATTAATATGAAGGAGATGATTGGTATT*GCCACTTGTAGGATCTGTGAAGAAAGCTTT
AGCACTACTATCACAGCTTTGAGTGAAGCTATAGACATCTATAGCGAGTGGATTGATGAG
TGCGAGAGGGTCAATACTGTGGAGGACGATGTTGAGCAAGAAGAGGGAGTGGAGGAAGAA
GAGGTATATGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAAGAGGAAGATGATGTTGAAGATGAACGTGTG
TCTACTAAAAGGAAGTTTAACTACCGGGACGATTGATCTGTAGCGAAAACCATGCAAGTC
CTCTTTAGACATTCCCGTATGTTGTAATATCTACTGATACTCGTTGCTATCTATCACCTT
CGTTTTTTCTTTTGTTTTCCATTTGCTGAAACAGTAATCTGAGATCAAGAAGATAGATGA
GATTAGTCAAGTTTAGAACCGTCAAGAGCAAGAAATATAATAATCAGGAGGGTTTGAGAT
TAGTTAAAGCTTTCCGAAAACGCACCATCTTGATTGTACGCTTACTAGTTGGGTTTGTTT
CTCTGTATGTTTAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BC75JQ C 1
AF RS1BC75TF U 1
AF RS1CB72TF U 69
AF RS1CB72JQ C 111
AF RS1G333TF U 103
BS 1 164 RS1BC75TF
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BS 166 209 RS1BC75TF
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BS 613 661 RS1CB72TF
BS 662 734 RS1G333TF

RD RS1BC75JQ 612 0 0
GGAATTGACATCTTTCTAGGGTTTCGTATTTCGCTGCTCCTCGAGGAATCGATCTTTGTG
CAATAACAGCAATGGGGAAGAGGAAGTCAAGGGCAAAGCCTGCTACACCGAAGCGAATGG
ACAAGCTTGACACTGTCTTTAGCTGTCCCTTTTGCAATCACGGCCCTAGTGTCGAATGCC
AAATTAATATGAAGGAGATGATTGGTATTTGCCACTTGTAGGATCTGTGAAGAAAGCTTT
AGCACTACTATCACAGCTTTGAGTGAAGCTATAGACATCTATAGCGAGTGGATTGATGAG
TGCGAGAGGGTCAATACTGTGGAGGACGATGTTGAGCAAGAAGAGGGAGTGGAGGAAGAA
GAGGTATATGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAAGAGGAAGATGATGTTGAAGATGAACGTGTG
TCTACTAAAAGGAAGTTTAACTACCGGGACGATTGATCTGTAGCGAAAACCATGCAAGTC
CTCTTTAGACATTCCCGTATGTTGTAATATCTACTGATACTCGTTACTATCTATCACCTT
CGTTTTTTCTTTTGTTTTCCATTTGCTGAAACAGTAATCTGAGATCAAGAAGATAGATGA
GATTAGTCAAGT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RS1BC75TF 612 0 0
GGAATTGACATCTTTCTAGGGTTTCGTATTTCGCTGCTCCTCGAGGAATCGATCTTTGTG
CAATAACAGCAATGGGGAAGAGGAAGTCAAGGGCAAAGCCTGCTACACCGAAGCGAATGG
ACAAGCTTGACACTGTCTTTAGCTGTCCCTTTTGCAATCACGGCCCTAGTGTCGAATGCC
AAATTAATATGAAGGAGATGATTGGTATTTGCCACTTGTAGGATCTGTGAAGAAAGCTTT
AGCACTACTATCACAGCTTTGAGTGAAGCTATAGACATCTATAGCGAGTGGATTGATGAG
TGCGAGAGGGTCAATACTGTGGAGGACGATGTTGAGCAAGAAGAGGGAGTGGAGGAAGAA
GAGGTATATGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAAGAGGAAGATGATGTTGAAGATGAACGTGTG
TCTACTAAAAGGAAGTTTAACTACCGGGACGATTGATCTGTAGCGAAAACCATGCAAGTC
CTCTTTAGACATTCCCGTATGTTGTAATATCTACTGATACTCGTTACTATCTATCACCTT
CGTTTTTTCTTTTGTTTTCCATTTGCTGAAACAGTAATCTGAGATCAAGAAGATAGATGA
GATTAGTCAAGT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RS1CB72TF 593 0 0
GCAATGGGGAAGAGGAAGTCAAGGGCAAAGCCTGCTACAACGAAGCGAATGGACAAGCTT
GACACTGTCTTTAGCTGTCCCTTTTGCAATCACGGCTCTAGTGTCGAATGCCAAATTAAT
ATGAAGGAGATGATTGGTATT*GCCACTTGTAGGATCTGTGAAGAAAGCTTTAGCACTAC
TATCACAGCTTTGAGTGAAGCTATAGACATCTATAGCGAGTGGATTGATGAGTGCGAGAG
GGTCAATACTGTGGAGGACGATGTTGAGCAAGAAGAGGGAGTGGAGGAAGAAGAGGTATA
TGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAAGAGGAAGATGATGTTGAAGATGAACGTGTGTCTACTAA
AAGGAAGTTTAACTACCGGGACGATTGATCTGTAGCGAAAACCATGCAAGTCCTCTTTAG
ACATTCCCGTATGTTGTAATATCTACTGATACTCGTTGCTATCTATCACCTTCGTTTTTT
CTTTTGTTTTCCATTTGCTGAAACAGTAATCTGAGATCAAGAAGATAGATGAGATTAGTC
AAGTTTAGAACCGTCAAGAGCAAGAAATATAATAATCAGGAGGGTTTGAGATT

QA 1 593 1 593
DS 

RD RS1CB72JQ 551 0 0
AAGCGAATGGACAAGCTTGACACTGTCTTTAGCTGTCCCTTTTGCAATCACGGCTTTAGT
GTCGAATGCCAAATTAATATGAAGGAGATGATTGGTATT*GCCACTTGTAGGATTTGTGA
AGAAAGCTTTAGCACTACTATCACAGCTTTGAGTGAAGCTATAGACATTTATAGGGAGTG
GATTGATGAGTGCGAGAGGGTCAATACTGTGGAGGACGATGTTGAGCAAGAAGAGGGAGT
GGAGGAAGAAGAGGTATATGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAAGAGGAAGATGATGTTGAAGA
TGAACGTGTGTTTACTAAAAGGAAGTTTAACTACCGGGACGATTGATCTGTAGCGAAAAC
CATGCAAGTCCTCTTTAGACATTCCCGTATGTTGTAATATTTACTGATACTCGTTGCTAT
CTATCACCTTCGTTTTTTTTTTTGTTTTCCATTTGCTGAAACAGTAATTTGAGATCAAGA
AGATAGATGAGATTAGTCAAGTTTAGAACCGTCAAGAGCAAGAAATATAATAATCAGGAG
GGTTTGGGATT

QA 1 551 1 551
DS 

RD RS1G333TF 632 0 0
GGCCAA
CGAAGCGAATGGACAAGCT*GACACTGTCTTTAGCTGTCCCTTTTGCAATCACGGCTCTA
GTGTCGAATGCCAAATTAATATGAAGGAGATGATTGGTATT*GCCACTTGTAGGATCTGT
GAAGAAAGCTTTAGCACTACTATCACAGCTTTGAGTGAAGCTATAGACATCTATAGCGAG
TGGATTGATGAGTGCGAGAGGGTCAATACTGTGGAGGACGATGTTGAGCAAGAAGAGGGA
GTGGAGGAAGAAGAGGTATATGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAAGAGGAAGATGATGTTGAA
GATGAACGTGTGTCTACTAAAAGGAAGTTTAACTACCGGGACGATTGATCTGTAGCGAAA
ACCATGCAAGTCCTCTTTAGACATTCCCGCATGTTGTAATATCTACTGATACTCGTTGCT
ATCTATCACCTTCGTTTTTTCTTTTGTTTTCCATTTGCTGAAACAGTAATCTGAGATCAA
GAAGATAGATGAGATTAGTCAAGTTTAGAACCGTCAAGAGCAAGAAATATAATAATCAGG
AGGGTTTGAGATTAGTTAAAGCTTTCCGAAAACGCACCATCTTGATTGTACGCTTACTAG
TTGGGTTTGTTTCTCTGTATGTTTAC

QA 7 632 7 632
DS 



AS 1 4

CO CL1840Contig1 815 4 18 U
GCGCTGGGTCCCATTGCCGCTGCACCGTGGGGGTCTGCCCTTATCTTGCCAATATCTTAC
TCTTACATTGCCATGATGGGATCTGGTGGACTCACTGAGGCCTCAAAGATTGCAATCTTG
AATGCCAATTACATGGCGAAGCGCCTAGAGAAGCACTTCCCAATTCTGTTCCGTGGTGCC
AACGGAACAGTAGCACACGAATTCATCATAGATTTGAGAGGCTTCAAGAACACTGCTGGA
ATAGAAGCAGAGGATGTGGCGAAACGGCTAATGGACTATGGATTCCATGCACCCACAATG
TCTTTCCCTGTCTCTGGAACGCTTATGATTGAGCCCACCGAGAGTGAAAGCAAGGCGGAG
TTAGACAGGTTCTGCGATACTCTCATTTCGATCAGGGAAGAAATTGCACAGATTGAAAAA
GGAAATGCAGATGTCCAGATCAACGTTCTCATGGGAGCTCCACATTCTCCAGCTATGCTA
ATGTCAGACACATGGAAGAAGCCGTATTCCCGAGAGTACGCTGCTTTCCCTACCGCATGG
CTCCGATCTGCCAAGTTCTGGCCAACCACAGGGCGTGTGGACAATGTGTATGGAGACAGG
AAGCTGGTGTGCACTCTCCTCCCAGAAGAAGAACAAGTCGCAGCTGCAGTATCAGCTTGA
TTTGCATTCATGTCTTTATGTTATGTGTCCCCCCCCCTCTTTCCCTCATTTCTCTTCTCT
CTCTGCTCATCCATGTTTATGTCCACAGTGTTCTTATTATCATACACTTTCTATCTAGCT
GTGTAATGTTTACATTGGAATGTTGCTATTCACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CW48TF U 1
AF RS1E757TF U 83
AF RS1AH58JQ C 154
AF RS1AH58TF U 30
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BS 337 439 RS1CW48TF
BS 440 440 RS1AH58TF
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BS 453 479 RS1CW48TF
BS 480 480 RS1AH58TF
BS 481 575 RS1CW48TF
BS 576 576 RS1AH58TF
BS 577 630 RS1CW48TF
BS 631 815 RS1AH58TF

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TCTTACATTGCCATGATGGGATCTGGTGGACTCACTGAGGCCTCAAAGATTGCAATCTTG
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CTCCGATCTGCCAAGTTCTGGCCAACCACAGGGCGGGTGGACAATGTGTATGGAGACAGG
AAGCTGGTGTGCACTCTCCTCCCAGAAGAA

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DS 

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G
TGGTGGACTCACTGAGGCCTCAAAGATTGCAATCTTGAATGCCAATTACATGGCAAAGCG
CCTGGAGAAGCACTTCCCAATTCTGTTCCGTGGTGCCAACGGGACAGTAGCACACGAATT
CATCATAGATTTGAGAGGCTTCAAGAACACTGCTGGAATAGAAGCAGAGGATGTGGCGAA
ACGGCTAATGGACTATGGATTCCATGCACCCACAATGTCTTTCCCTGTCTCTGGAACGCT
TATGATTGAGCCCACCGAGAGTGAAAGCAAGGCGGAGTTAGACAGGTTCTGCGATACTCT
CATTTCGATCAGGGAAGAAATTGCACAGATTGAAAAAGGAAATGCAGATGTCCAGAACAA
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AACCACAGGGCGTGTGGACAATGTGTATGGAGACAGGAA

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DS 

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GACTATGGATTCCATGCACCCACAATGTCTTTCCCTGTTTTTGGAACGCTTATGATTGAG
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GGAGCTCCACATTCTCCAGCTATGCTAATGTCAGACACATGGAAGAAGCCGTATTCCCGA
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CAAGTCGCAGCTGCAGTATCAGCTTGATTTGCATTCATGTCTTTATGTTATGTGTCCC
CCCCCCTCTTTCC

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DS 

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GGGA
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CACTTCCCAATTCTGTTCCGTGGTGCCAACGGAACAGTAGCACACGAATTCATCATAGAT
TTGAGAGGCTTCAAGAACACTGCTGGAATAGAAGCAGAGGATGTGGCGAAACGGCTAATG
GACTATGGATTCCATGCACCCACAATGTCTTTCCCTGTCTCTGGAACGCTTATGATTGAG
CCCACCGAGAGTGAAAGCAAGGCGGAGTTAGACAGGTTCTGCGATACTCTCATTTCGATC
AGGGAAGAAATTGCACAGATTGAAAAAGGAAATGCAGATGTCCAGATCAACGTTCTCATG
GGAGCTCCACATTCTCCAGCTATGCTAATGTCAGACACATGGAAGAAGCCGTATTCCCGA
GAGTACGCTGCTTTCCCTACCGCATGGCTCCGATCTGCCAAGTTCTGGCCAACCACAGGG
CGTGTGGACAATGTGTATGGAGACAGGAAGCTGGTGTGCACTCTCCTCCCAGAAGAAGAA
CAAGTCGCAGCTGCAGTATCAGCTTGATTTGCATTCATGTCTTTATGTTATGTGTCCCCC
CCCCTCTTTCCCTCATTTCTCTTCTCTCTCTGCTCATCCATGTTTATGTCCACAGTGTTC
TTATTATCATACACTTTCTATCTAGCTGTGTAATGTTTACATTGGAATGTTGCTATTCAC
AT

QA 5 786 5 786
DS 



AS 1 3

CO CL1841Contig1 945 3 3 U
GGAAGTGAGGTATAACAAAATCAAAGCTTTCAGATCTTGAACAAGAACCTCTAATCTCTC
TCTCTCTTCGGTTACTTCGAAAAAGATGACTTTTACTATTCCGATTGATAACGGAGATGC
CGTGAAGAACGCAGAAGCTGATTCACAAAGAACACTTTACCCATATGTCACTGGGACATC
GATTGTCGCAATCAAGTACAAAGATGGGGTTCTAATGGCTTCCGACATGGGAGGTTCATA
TGGATCGACCTTAAGATACAAGAACATTGAGAGAGTCAAGGCTATTGGTAAGCATTCTCT
TCTGGGTGCCAGCGGAGAAATCAGTGACTTTCAGGAGATTCTTCGTTATCTTGATGAGCT
CGTCTTGAATGATAGCATGTGGGATGATGGTAACTCTTTGGGACCAAAAGAGGTTCACAA
CTATCTGACTCGTGTCATGTACAACCGCCTCAACAAGTTCAACCCTCTCTGGAACACTCT
CGTCCTTGGAGGCGTCAAGAATGGTGAAAGCTACCTCGGCATGGTGTCCATGATTGGTGT
TAGTTTCGAGGACAATCATGTTGCCACTGGATTTGGGAACCACCTAGCTAGGCCAATTCT
TCGTGATGAGTGGCATGCGGATCTGAGCTTCGAAGAAAGTGTCAAGCTCCTTGAGAAGTG
TATGCGTGTGCTTCTTTACCGTGACAGATCTGCTATTAACAAGCTTCAGATAGCGAAAAT
CACGGAAGAAGGGGTGACTGTCTCTCAGCCCTACTCGTTGAAGACGTTTTGGGAGTTCCA
GGCTTTCCACAACCCAACTGCTGGTGCTCAAGGCTCCTGGTAAGAAGCCTATTTATCAAT
CTTGAGATCAAGCTGCCTCTTTATTTTTATTTCATGTGATGTTGTTAACATACTATGTAC
TGGAGTGGATTTCCTGTTGGGTTATATCTCAATGAAAGTTTTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E816TF U 1
AF RS1E484TF U 51
AF RS1E816JQ C 98
BS 1 634 RS1E816TF
BS 635 726 RS1E484TF
BS 727 945 RS1E816JQ

RD RS1E816TF 634 0 0
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TGGATCGACCTTAAGATACAAGAACATTGAGAGAGTCAAGGCTATTGGTAAGCATTCTCT
TCTGGGTGCCAGCGGAGAAATCAGTGACTTTCAGGAGATTCTTCGTTATCTTGATGAGCT
CGTCTTGAATGATAGCATGTGGGATGATGGTAACTCTTTGGGACCAAAAGAGGTTCACAA
CTATCTGACTCGTGTCATGTACAACCGCCTCAACAAGTTCAACCCTCTCTGGAACACTCT
CGTCCTTGGAGGCGTCAAGAATGGTGAAAGCTACCTCGGCATGGTGTCCATGATTGGTGT
TAGTTTCGAGGACAATCATGTTGCCACTGGATTTGGGAACCACCTAGCTAGGCCAATTCT
TCGTGATGAGTGGCATGCGGATCTGAGCTTCGAA

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DS 

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GGAA
TCTCTCTCTCTCT*CGGTTACTTCGAAAAAGATGACTTTTACTATTCCGATTGATAACGG
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TTCATATGGATCGACCTTAAGATACAAGAACATTGAGAGAGTCAAGGCTATTGGTAAGCA
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TGAGCTCGTCTTGAATGATAACATGTGGGATGATGGTAACTCTTTGGGACCAAAAGAGGT
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TGGTGTTAGTTTCGAGGACAATCATGTTGCCACTGGATTTGGGAACCACCTAGCTAGGCC
AATTCTTCGTGATGAGTGGCATGCGGATCTGAGCTTCGAAGAAAGTGTCAAGCTCCTTGA
GAAGTGTATGCGTGTGCTTCTTTACCGTGACAGATCTGCTATTAACAAGCTTCAGATAGC
GAAAATCACGGA

QA 5 676 5 676
DS 

RD RS1E816JQ 848 0 0
ATTCCGATTGATAACGGAGATGCCGTGAAGAACGCAGAAGCTGAT*CACAAAGAACACTT
TACCCATATGTCACTGGGACATCGATTGTCGCAATCAAGTACAAAGATGGGGTTCTAATG
GCTTCCGACATGGGAGGTTCATATGGATCGACCTTAAGATACAAGAACATTGAGAGAGTC
AAGGCTATTGGTAAGCATTCTCTTCTGGGTGCCAGCGGAGAAATCAGTGACTTTCAGGAG
ATTCTTCGTTATCTTGATGAGCTCGTCTTGAATGATAGCATGTGGGATGATGGTAACTCT
TTGGGACCAAAAGAGGTTCACAACTATCTGACTCGTGTCATGTACAACCGCCTCAACAAG
TTCAACCCTCTCTGGAACACTCTCGTCCTTGGAGGCGTCAAGAATGGTGAAAGCTACCTC
GGCATGGTGTCCATGATTGGTGTTAGTTTCGAGGACAATCATGTTGCCACTGGATTTGGG
AACCACCTAGCTAGGCCAATTCTTCGTGATGAGTGGCATGCGGATTTGAGCTTCGAAGAA
GGTGTCAAGCTCCTTGAGAAGTGTATGCGTGTGCTTCTTTACCGTGACAGATCTGCTATT
AACAAGCTTCAGATAGCGAAAATCACGGAAGAAGGGGTGACTGTCTCTCAGCCCTACTCG
TTGAAGACGTTTTGGGAGTTCCAGGCTTTCCACAACCCAACTGCTGGTGCTCAAGGCTCC
TGGTAAGAAGCCTATTTATCAATCTTGAGATCAAGCTGCCTCTTTATTTTTATTTCATGT
GATGTTGTTAACATACTATGTACTGGAGTGGATTTCCTGTTGGGTTATATCTCAATGAAA
GTTTTCTG

QA 1 848 1 848
DS 



AS 1 3

CO CL1842Contig1 1024 3 21 U
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TGAGATACTTAGTCGCGTAACTCTCACCTCAGAGATTCTTTTCCTCCCACACAAGTTTCG
AATCCTACAGCGATGGATCTCAATCTCGATGCGCCGCACTCTATGGGAACAACCATCATC
GGCGTCACTTACAACGGAGGCGTCGTCCTCGGAGCCGACTCACGTACCAGCACCGGCATG
TACGTAGCGAATCGAGCTTCAGACAAGATCACACAGCTCACCGACAATGTCTACGTCTGC
CGTTCTGGATCGGCTGCTGATTCTCAGGTTGTCTCTGACTACGTCCGCTACTTCCTTCAC
CAGCATACAATTCAGCTGGGACAGCCTGCGACTGTTAAGGTTTCTGCAAACCTCATTAGG
ATGCTCGCTTACAATAACAAGAACATGCTGCAAACTGGCCTCATAGTTGGTGGCTGGGAT
AAGTATGAAGGCGGGAAGATCTACGGGATTCCACTTGGTGGAACTGTAGTTGAGCAACCG
TTTGCTATTGGAGGCTCTGGCTCGAGTTATCTTTACGGGTTCTTTGATCAGGCCTGGAAA
GAAAACATGACCAAAGAAGAAGCTGAGCAACTTGTTGTGAAGGCGGTTTCGCTAGCCATC
GCCCGTGATGGAGCCAGTGGAGGAGTTGTACGAACTGTCATAATAAACTCAGAGGGAGTG
ACCAGAAACTTCTACCCTGGAGATAAGTTGCAGCTATGGCACGAGGAGTTGGAGCCCCAG
AACTCCTTGTTAGACATCCTCAACGCTGCTGGTCCTGAACCAATGGCTATGTGATTCATC
ATTCTCTCACTCTGTTAAGCAAATGTTTAGATGTTTCTCTACATTCACCGAAGTCGTATT
TTAAACTCTGTTTGATGTTCTTTTAAATTGACCAGATCTTTCTTCACTTAAATGGATATC
ATGTTTGTTTATTGTTATGGTTCTAATTTATGTGTCCTGAAAATGAGTGTGTAGAAACGT
TAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1D232TF U 1
AF RS1AS16TF U 47
AF RS1AV50JQ C 179
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AAGTA

QA 1 485 1 485
DS 

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GG
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GGTGGCTGGGATAAGTATGAAGGCGGGAAGATCTACGGGATTCCACTTGGTGGAACTGTA
GTTGAGCAACCGTTTGCTATTGGAGGCTCTGGCTCGAGTTATCTTTACGGGTTCTTTGAT
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TTGGAGCCC*AGA*CTCCTTGTTAGACATCCTCA
CGCTG

QA 3 756 3 756
DS 

RD RS1AV50JQ 846 0 0
ATCGACGTCAC
TACAACGGAGGCGTCGTCCTCGGAGCCGACTCACGTACCAGCACCGGCATGTACGTAGCG
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TCGGCTGCTGATTCTCAGGTTGTCTCTGACTACGTCCGCTACTTCCTTCACCAGCATACA
ATTCAGCTGGGACAGCCTGCGACTGTTAAGGTTTCTGCAAACCTCATTAGGATGCTCGCT
TACAATAACAAGAACATGCTGCAAACTGGCCTCATAGTTGGTGGCTGGGATAAGTATGAA
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GGAGGCTCTGGCTCGAGTTATCTTTACGGGTTCTTTGATCAGGCCTGGAAAGAAAACATG
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GGAGCCAGTGGAGGAGTTGTACGAACTGTCATAATAAACTCAGAGGGAGTGACCAGAAAC
TTCTACCCTGGAGATAAGTTGCAGCTATGGCACGAGGAGTTGGAGCCCCAGAACTCCTTG
TTAGACATCCTCAACGCTGCTGGTCCTGAACCAATGGCTATGTGATTCATCATTCTCTCA
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GTTTGATGTTCTTTTAAATTGACCAGATCTTTCTTCACTTAAATGGATATCATGTTTGTT
TATTGTTATGGTTCTAATTTATGTGTCCTGAAAATGAGTGTGTAGAAACGTTAAG

QA 12 846 12 846
DS 



AS 1 4

CO CL1843Contig1 938 4 12 U
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AGAAGAGAGATCTAATCTCTGGTTTGATCCAACTGAAGATTATCATCAATACAGTATCCT
CTGGTCTGATTCCCACATCATATTCTTTGTAGACAATGTTCCTATCAGGGAGGTAAAGCG
AACAGCATCGATGGGCGGTGACTTCCCATCAAAGCCGATGTCTCTCTACACAACAATATG
GGACGGTTCTAAATGGGCAACTAACGGTGGCAAGTACGGTGTAAACTACAAATATGCCCC
TTATGTCACGCAGCTCACTGACTTAGTCCTTCATGGCTGCGCTGTGGACCCAATTGAACA
GTTTCCTAAGTGCGACGAAGGAGCGGACGAGGATATCCGTGCGGCTCAGGAGATTAGCCC
ATCACAGAGGGTCAAGATGAGCATTTTCAGGAGGAAACACATGACGTACTCATATTGCTA
TGATCGGAACAGGTACAAAGTTGCTCTACCTGAGTGCGTAGTGAATCCCGCAGAGGCTCA
GCGGCTTAGGGTTCATGATCCCGTCACGTTTGGTGGGATTCCGAGGCGTCACCGCAACCG
AAAGCACCGGGGCAAGAGAAGCCGTGTTGATGGAACAGAGTCGATATGATGAATATAGTC
CAACTATGTGATGGTGTTTGG*AGGGGGTTCTATATAATAAGTCCATTTTTATTGGTATT
TTATGTTTGGTGCATTTTCACAGTTATAGTGGGCATTTGTTGCTTGTATATGGAATAAAA
TAATTTATTTATTTATTTGAGAGATTTGGGGTTTTGCAATACTTATATGATAATAATGTG
TAGTTTTTGTTTTTGTGGATACATATTCCGTTCACGAATATTTGGGTTGTAATTTTAACT
TTCTGTTGATATTTATTGTCATTTTCTTGTTGTAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FO36TF U 1
AF RS1AZ37JQ C 125
AF RS1BV59JQ C 193
AF RS1BV59TF U 211
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RD RS1FO36TF 716 0 0
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AGAAGAGAGATCTAATCTCTGGTTTGATCCAACTGAAGATTATCATCAATACAGTATCCT
CTGGTCTGATTCCCACATCATATTCTTTGTAGACAATGTTCCTATCAGGGAGGTAAAGCG
AACAGCATCGATGGGCGGTGACTTCCCATCAAAGCCGATGTCTCTCTACACAACAATATG
GGACGGTTCTAAATGGGCAACTAACGGTGGCAAGTACGGTGTAAACTACAAATATGCCCC
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GTTTCCTAAGTGCGACGAAGGAGCGGACGAGGATATCCGTGCGGCTCAGGAGATTAGCCC
ATCACAGAGGGTTAAGATGAGCATTTTCAGGAGGAAACACATGACGTACTCATATTGCTA
TGATCGGAACAGGTACAAAGTTGCTCTACCTGAGTGCGTAGTGAATCCCGCAGAGGCTCA
GCGGCTTAGGGTTCATGATCCCGTCACGTTTGGTGGGATTCCGAGGCGTCACCGCAACCG
AAAGCATCGGGGCAAGAGAAGCCGTGTTGATGGAACAGAGTCGATATGATGAATATAGTC
CAACTATGTGATGGTGTTTGG*AGGGGGTTCTATATAATAAGTCCATTTTTATTGG

QA 1 716 1 716
DS 

RD RS1AZ37JQ 727 0 0
TCTGATTCTCACATCATATTCTTTGTAGACAATGTTCCTATCAGGGAGGTAAAGCGAACA
GCATCGATGGGCGGTGACTTCCCATCAAAGCCGATGTCTCTCTACACAACAATATGGGAC
GGTTCTAAATGGGCAACTAACGGTGGCAAGTACGGTGTAAACTACAAATATGCCCCTTAT
GTCACGCAGCTCACTGACTTAGTCCTTCATGGCTGCGCTGTGGACCCAATTGAACAGTTT
CCTAAGTGCGACGAAGGAGCGGACGAGGATATCCGTGCGGCTCAGGAGATTAGCCCATCA
CAGAGGGTTAAGATGAGCATTTTCAGGAGGAAACACATGACGTACTCATATTGCTATGAT
CGGAACAGGTACAAAGTTGCTCTACCTGAGTGCGTAGTGAATCCCGCAGGGGCTCAGCGG
CTTAGGGTTCATGATCCCGTCACGTTTGGTGGGATTCCGAGGCGTCACCGCAACCGAAAG
CACCGGGGCAAGAGAAGCCGTGTTGATGGAACAGAGTCGATATGATGAATATAGTCCAAC
TATGTGATGGTGTTTGG*AGGGGGTTCTATATAATAAGTCCATTTTTATTGGTATTTTAT
GTTTGGTGCATTTTCACAGTTATAGTGGGCATTTGTTGCTTGTATATGGAATAAAATAAT
TTATTTATTTATTTGAGAGATTTGGGGTTTTGCAATACTTATATGATAATAATGTGTAGT
TTTTGTT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1BV59JQ 740 0 0
GGGCGGTGACTTCCCATCAAAGCCGATGTCTCTCTACACAACAATATGGGACGGTTCTAA
ATGGGCGACTAACGGTGGCAAGTACGGTGTAAACTACAAATATGCCCCTTATGTCACGCA
GCTCACTGACTTAGTCCTTCATGGCTGCGCTGTGGACCCAATTGAACAGTTTCCTAAGTG
CGACGAAGGAGCGGACGAGGATATCCGTGCGGCTCAGGAGATTAGCCCATCACAGAGGGT
CAAGATGAGCATTTTCAGGAGGAAACACATGACGTACTCATATTGCTATGATCGGAACAG
GTACAAAGTTGCTCTACCTGAGTGCGTAGTGAATCCCGCAGAGGCTCAGCGGCTTAGGGT
TCATGATCCCGTCACGTTTGGTGGGATTCCGAGGCGTCACCGCAACCGAAAGCACCGGGG
CAAGAGAAGCCGTGTTGATGGAACAGAGTCGATATGATGAATATAGTCCAACTATGTGAT
GGTGTTTGG*AGGGGGTTCTATATAATAAGTCCATTTTTATTGGTATTTTATGTTTGGTG
CATTTTCACAGTTATAGTGGGCATTTGTTGCTTGTATATGGAATAAAATAATTTATTTAT
TTATTTGAGAGATTTGGGGTTTTGCAATACTTATATGATAATAATGTGTAGTTTTTGTTT
TTGTGGATACATATTCCGTTCACGAATATTTGGGTTGTAATTTTAACTTTCTGTTGATAT
TTATTGTCATTTTCTTGTT
T

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DS 

RD RS1BV59TF 728 0 0
AAAGCCGATGTCTCTCTACACAACAATATGGGACGGTTCTAAATGGGCGACTAACGGTGG
CAAGTACGGTGTAAACTACAAATATGCCCCTTATGTCACGCAGCTCACTGACTTAGTCCT
TCATGGCTGCGCTGTGGACCCAATTGAACAGTTTCCTAAGTGCGACGAAGGAGCGGACGA
GGATATCCGTGCGGCTCAGGAGATTAGCCCATCACAGAGGGTCAAGATGAGCATTTTCAG
GAGGAAACACATGACGTACTCATATTGCTATGATCGGAACAGGTACAAAGTTGCTCTACC
TGAGTGCGTAGTGAATCCCGCAGAGGCTCAGCGGCTTAGGGTTCATGATCCCGTCACGTT
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TGGAACAGAGTCGATATGATGAATATAGTCCAACTATGTGATGGTGTTTGGGAGGGGGTT
CTATATAATAAGTCCATTTTTATTGGTATTTTATGTTTGGTGCATTTTCACAGTTATAGT
GGGCATTTGTTGCTTGTATATGGAATAAAATAATTTATTTATTTATTTGAGAGATTTGGG
GTTTTGCAATACTTATATGATAATAATGTGTAGTTTTTGTTTT*GTGGATACATATTCCG
TTCACGA*TATTTGGGTTGTAATTT*AACTTTCTGTTGATATTTATTGTCATTTTCTTGT
TGTAAAAA

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 5

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TTTTTTTTTCGAGCAAGAAACTGGAACTATAAAATAGGTTTCAAAATTGAAAAGTACAGA
CACAAGTCTTTGTGAAATGTAACATTAAAGATTGTGAATACCACAACATATAAATTCAAA
ACCTCACTTCTCTATCTTGATGATGATTCTTCAGAGCATCATCCATCATCAAGCTTCCAC
CGGGTACTCAAAAGTGACATCCTTTCCAGTAAGTTTGCGGTACACTCCCACCATAGTCTC
GAGCTTGTACTCTGTGTTGTTCCTTTCCTTGGCCTCCAAATACACCTTCATGACTTTGGA
TCCATCGAGACGGTAACGAGTACGTTTTCCAACGATCTCAGCAGGGTAAGCCACGTCCTC
GAGCATAGCTTCATGAACAGAGGTTAGAGTCCTGTTGCGTGGCCTCTGAACAGCAGCACC
CTTCTTTGGTGGACGCATGATCCTTCTTGTGGCAACAAAGATAACATCCTTTCCACTGAA
CTTCTTCTCAAGCTCTCTAACGAGACGGGGGTGGATCTTGCGGAAAGCTTTCCTCAATCT
GAACGGGACGTAAATCACAATAGCCTTGCGGTTTCCAGAGATGTCCATGTTAACAGCTTG
GTTGATGTAAAGATCTTTCAACTCGCTTTTCAACTCCTGGTTAGTGTTTTCTAAATCAAA
CAAAGCCTGAGCAACTTGCACATCGCATTCTGTCGGCTCGGCATTCTTGTCCTTCTTGAT
CTTGTTCTGAGCGGAGAACATCTTCACAGAATCGGTTAACGAAATCTGCAAGGATGAAGA
AGAGTCTGTCTTAAGAGGTTTTGCGACTTCTTCTTACAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RS1BH35JQ U 23
AF RS1FY25JQ U 10
AF RS1F631JQ U 16
AF RS1F631TF C 1
AF RS1FY25TF C 127
BS 1 15 RS1F631TF
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RD RS1BH35JQ 225 0 0
G
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TTCCAGCAAGTTTGCGGTACACTCCCACCATAGTCTCGAGCTTG

QA 2 225 2 225
DS 

RD RS1FY25JQ 650 0 0
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GACATCCTTTCCAGTAAGTTTGCGGTACACTCCCACCATAGTCTCGAGCTTGTACTCTGT
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ACGAGTACGTTTTCCAACGATCTCAGCAGGGTAAGCCACGTCCTCGAGCATAGCTTCATG
AACAGAGGTTAGAGTCCTGTTGCGTGGCCTCTGAACAGCAGCACCCTTCTTTGGTGGACG
CATGATCCTTCTTGTGGCAACAAAGATAACATCCTTTCCACTGAACTTCTTCTCAAGCTC
TCTAACGAGACGGGGGTGGATCTTGCGGAAAGCTTTCCTCAATCTGAACGGGACGTAAAT
CACAATAGCCTTGCGGTTTCCAGAGATGTCCATGTTAACAGCTTGGTTGATGTAAAGATC
TTTCAACTCGCTTTTCAACTCCTGGTTAGTGTTTTCTAAATCAA

QA 7 650 7 650
DS 

RD RS1F631JQ 588 0 0
AGAAACTG
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ATTAAAGATTGTGAATACCACAACATATAAATTCAAAACCTCACTTCTCTATCTTGATGA
TGATTCTTCAAAGCATCATCCATCATCAAGCTTCCACCGGGTACTCAAAAGTGACATCCT
TTCCAGTAAGTTTGCGGTACACTCCCACCATAGTCTCGAGCTTGTACTCTGTGTTGTTCC
TTTTCTTGGCCTCCAAATACACCTTCATGACTTTGGATCCATCGAGACGGTAACGAGTAC
GTTTTCCAACGATCTCAGCAGGGTAAGCCACGTCCTCGAGCATAGCTTCATGAACAGAGG
TTAGAGTCCTGTTGCGTGGCCTCTGAACAGCAGCACCCTTCTTTGGTGGACGCATGATCC
TTCTTGTGGCAACAAAGATAACATCCTTTCCACTGAACTTCTTCTCAAGCTCTCTAACGA
GACGGGGGTGGATCTTGCGGAAAGCTTTCCTCAATCTGAACGGGACGTAAATCACAATAG
CCTTGCGGTTTCCAGAGATGTCCATGTTAACAGCTTGGTT

QA 9 588 9 588
DS 

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CACAAGTCTT*GTGAAATGTAACATTAAAGATTGTGAATACCACAACATATAAATTCAAA
ACCTCACTTCTCTATCTTGATGATGATTCTTCAGAGCATCATCCATCATCAAGCTTCCAC
CGGGTACTCAAAAGTGACATCCTTTCCAGTAAGTTTGCGGTACACTCCCACCATAGTCTC
GAGCTTGTACTCTGTGTTGTTCCTTTTCTTGGCCTCCAAATACACCTTCATGACTTTGGA
TCCATCGAGACGGTAACGAGTACGTTTTCCAACGATCTCAGCAGGGTAAGCCACGTCCTC
GAGCATAGCTTCATGAACAGAGGTTAGAGTCCTGTTGCGTGGCCTCTGAACAGCAGCACC
CTTCTTTGGTGGACGCATGATCCTTCTTGTGGCAACAAAGATAACATCCTTTCCACTGAA
CTTCTTCTCAAGCTCTCTAACGAGACGGGGGTGGATCTTGCGGAAAGCTTTCCTCAATCT
GAACGGGACGTAAATCACAATAGCCTTGCGGTTTCCAGAGATGTCCATGTTAACAGCTTG
GTTGATGTAAAGATCTTTCAACTCGCTTTTCAACTCCTGGTTAGTGTTTTCTAAATCAAA
CAAAGCCTGAGCAACTTGCACATCGCATTCTGTCGGCTCGGCATTCTTGTCCTTCTTGAT
CTTGTTCTGAGCGGAGAACATCTTCACAGAATCGGTTAACGAAATCTGCAAGGATGAAGA
AGAGTCTGTCTTAAGAGGTTTTGCGACTTCTTCTTAC
CC

QA 1 817 1 817
DS 

RD RS1FY25TF 696 0 0
CTTCTCTATCTTGATGATGATTCTTCAG**CATCATCCATCATCAAGCTTCCACCGGGTA
CTCAAAAGTGACATCCTTTCCAGTAAGTTTGCGGTACACTCCCACCATAGTCTCGAGCTT
GTACTCTGTGTTGTTCCTTTCCTTGGCCTCCAAATACACCTTCATGACTTTGGATCCATC
GAGACGGTAACGAGTACGTTTTCCAACGATCTCAGCAGGGTAAGCCACGTCCTCGAGCAT
AGCTTCATGAACAGAGGTTAGAGTCCTGTTGCGTGGCCTCTGAACAGCAGCACCCTTCTT
TGGTGGACGCATGATCCTTCTTGTGGCAACAAAGATAACATCCTTTCCACTGAACTTCTT
CTCAAGCTCTCTAACGAGACGGGGGTGGATCTTGCGGAAAGCTTTCCTCAATCTGAACGG
GACGTAAATCACAATAGCCTTGCGGTTTCCAGAGATGTCCATGTTAACAGCTTGGTTGAT
GTAAAGATCTTTCAACTCGCTTTTCAACTCCTGGTTAGTGTTTTCTAAATCAAACAAAGC
CTGAGCAACTTGCACATCGCATTCTGTCGGCTCGGCATTCTTGTCCTTCTTGATCTTGTT
CTGAGCGGAGAACATCTTCACAGAATCGGTTAACGAAATCTGCAAGGATGAAGAAGAGTC
TGTCTTAAGAGGTTTTGCGGCTTCTTCTTACAAGCC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 2 4

CO CL1845Contig1 928 2 14 U
GGACGGCTCCATCATCTTCTTCTCCTTCAACACGGATTCCAGCAATCTCGTGTTCTCCGT
CATCCTCCCACCAAACCTCGAACATTCATCAGATCGGTGATGGGTTCGTCTTCCTCTTTC
TCCTCTTCGAAGCTTCTCTTCCGACAGCTCTTCGAGAAAGAGTCTTCCACCTACACTTAT
CTTCTCGCCGACATTTCCCATCCGGACAAACCTGCTCTCTTGATTGATCCGGTGGACAAG
ACTGTTGATAGAGACTTGAAGCTGATTAATGAGTTGGGCTTGAAGCTTGTCTATGCTATG
AACACTCATGTTCATGCTGATCATGTCACTGGAACTGGTCTTCTTAAGACAAAGCTCCCA
GGTGTGAAATCTGTAATCTCGAAAGCGAGTTGTTCCAAAGCAGATAAGTTTCTTGAACAT
GGAGAGAAAGTATCTATTGGTGGTATATACCTCGAGGTACGTGCTACACCTGGACATACA
GCAGGATGTGTTACATATGTGACTGGAGAAGGACCAGATCAGCCCCAACCAAGAATGGCT
TTTACTGGGGATGCTGTACTGATCCGCGGTTGTGGTAGGACCGACTTTCAGGGTGGAAGC
TCTGATCAGCTCTATGAGTCTGTGCACTCTCAGATATTTACATTACCAAAGGACACATTG
ATCTATCCAGCTCATGACTACAAAGGCTACGAGGTAAGTACAGTTGGAGAAGAGATGCAA
CACAACCCTCGTTTAACTAAAGACAAAGAAACATTCAAAACCATCATGTCAAATCTGAAT
CTGGCATATCCGAAGATGATTGATGTTGCAGTACCAGCAAACATGGTATGTGGATTACAG
GACTTGCCTTCTCAACCCAACTAAAGGACTTCTACGCTATTGTTTCTCCTTCATTCTATA
TTTTATCAGAGACATAAAAGCTCTAGAG


BQ
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AF RS1AM91TF U 1
AF RS1CW80TF U 191
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RD RS1AM91TF 881 0 0
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GGAACTTCTACGCTAT

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DS 

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G
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ATCTATTGGTGGTATATACCTCGAGGTACGTGCTACACCTGGACATACAGCAGGATGTGT
TACATATGTGACTGGAGAAGGACCAGATCAGCCCCAACCAAGAATGGCTTTTACTGGGGA
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ACATAAAAGCTCTAGAG

QA 2 738 2 738
DS 



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AF RS1E294TF U 1
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DS 

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G
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CATGGTATGTGGGTTACAAGACCTGCCTTCTCAACCCAACTAAAAAAAACTTCTACGCTT
TTGGTTTCTCCTACATTTTATATTTTATCAGAAGACAAATAAAAAGCTCTAGAGAGTGAG
TTTGTGTAATAAGATCTTTGTTACATTTGATTAAGATACGGTAGAAGTATGTGCAACTTA
GGTTGAGCATATGGAGGTTTGTGTTGAAAGATGAAAACATATTTGCGTGTTCC

QA 2 354 2 354
DS 



AS 2 4

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GTCGATACCGAACTGAGTCAAATCTATCTGTCCTGTGCGAAGTACGTAGGTAAATGCATC
TACTTGCTGACGAAAAGGAGGGCTCTGTAACAACTCCAGTATATCTTCATCCCTACAGTG
ACCCTCAGGTAAATAGGAAGACAATCGTTCTTGTACCGGTAACATCTCAAGCAATGGCAT
AATCAACTCAGGCTTCAGGATATCCCCTAATACTAGGCCTTCCTCTTCATCTCCAGGGAT
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ACCAAACTCTAGTGGTTGAT


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AF RS1GQ88JQ U 10
AF RS1EM36JQ U 1
BS 1 374 RS1EM36JQ
BS 375 375 RS1GQ88JQ
BS 376 680 RS1EM36JQ

RD RS1GQ88JQ 541 0 0
GCTTGAAAACCTGTGTTCGACAAAATAAAATCCCAACACATAAACTTCAACAAAATTCAT
AAACCCAAATTCATCGAACAACGGAAATGATTTTCTTAGTTGAAAGGTCGAACTTTAAAC
AAAATCATTATGAAAAGATCAACTCTCATCCATTGCGTCGTTTGATTGCGTTGCAACCGA
GTCCTCAAGTGCCTCAAGGAATGAGACAACTGTGAACTTATATTTACTTGGGTCGATACC
GAACTGAGTCAAATCTATCTGTCCTGTGCGAAGTACGTAGGTAAATGCATCTACTTGCTG
ACGAAAAGGAGGGCTCTGTAACAACTCCAGTATATCTTCATCCCTACAGTGACCCTCAGG
TAAATAGGAAGACAATCGTTCTTGTACCGGTAACATCTCAAGCAATGGCATAATCAACTC
AGGCTTCAGGATATCCCCTAATACTAGGCCTTCCTCTTCATCTCCAGGGATACCTACAGG
ACCAGAAGAGAGGTTGTTCAGAATTCTTTGCAAGTCTGCCAGCTTAACTGGTCCAGACGA
A

QA 1 541 1 541
DS 

RD RS1EM36JQ 680 0 0
GGTAACAATGCTTGAAAACCTGTGTTCGACAAAATAAAATCCCAACACATAAACTTCAAC
AAAATTCATAAACCCAAATTCATCGAACAACGGAAATGATTTTCTTAGTTGAAAGGTCGA
ACTTCAAACAAAATCATTATGAAAAGATCAACTCTCATCCATTGCGTCGTTTGATTGCGT
TGCAACCGAGTCCTCAAGTGCCTCAAGGAATGAGACAACTGTGAACTTATATTTACTTGG
GTCGATACCGAACTGAGTCAAATCTATCTGTCCTGTGCGAAGTACGTAGGTAAATGCATC
TACTTGCTGACGAAAAGGAGGGCTCTGTAACAACTCCAGTATATCTTCATCCCTACAGTG
ACCCTCAGGTAAATGGGAAGACAATCGTTCTTGTACCGGTAACATCTCAAGCAATGGCAT
AATCAACTCAGGCTTCAGGATATCCCCTAATACTAGGCCTTCCTCTTCATCTCCAGGGAT
ACCTACAGGACCAGAAGAGAGGTTGTTCAGAATTCTTTGCAAGTCTGCCAGCTTAACTGG
TCCAGACGAAGATGACACATCACTCACCTCTGTAGACACATTTGGTACAACCAAGTTTCC
AGCTCTGGATGAAACATCGTCTTCTGCCATGTCTTCCACATCCTCCGGCACAGCAACTTC
ACCAAACTCTAGTGGTTGAT

QA 1 680 1 680
DS 



CO CL1846Contig2 782 2 8 U
GGAGGAAGGAATCCGAGGAACACCCTAAAATAAAAGAAAGGTTAAAAACCCAAGAGAGAC
GAAGCAAATCGAAAGAAAAAACGAGAGAGGTTTTCAGCTAAATCAAATTCCTAGCGAAGT
TTCTCGTGATAAGAAGAAAGAGAGTCGGTGGTGATATGAGTTCAAGTGAAGCTTTCCCCG
TGATGCAGGAAATCATGCTTGAGTTTCGTGCTGGTAAGATGTCTTTGCAGGGAACAAGAG
TTGTCCCTGATGCACGAAAAGGACTTGTCCGCATTGCTAGAGGTGAGGAGGGACTGGTTC
ATTTCCAGTGGCTTGATCGAACCCAGAATGCAGTGGAAGATGATCAAATCGTTTTCCCTG
ATGAAGCTCTATTTGAAAAGGTTAATCAATCATCAGACAGGGTGTACATTCTGAAGTTCA
ACAGTGATGACCGCAAGCTATTCTTATGGATACAGGAGCCGAGAGCTGAAGGTGATGCAG
ATATATGTTCTGCGGTCAATCAGTACCTTAATCAACCACTAGAGTTTGGTGAAGTTGCTG
TGCCGGAGGATGTGGAAGACATGGCAGAAGACGATGTTTCATCCAGAGCTGGAAACTTGG
TTGTACCAAATGTGTCTACAGAGGTGAGTGATGTGTCATCTTCGTCTGGACCAGTTAAGC
TGGCAGACTTGCAAAGAATTCTGAACAACCTCTCTTCTGGTCCTGTAGTATCCCTGGAGA
TGAGAGAAGCCTAGTATTAGGGATATCCTGAAGCCTGAGTTGATATGCATTGCTTGAGAT
GT


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1EM36TF U 1
AF RS1EN93TF U 3
BS 1 131 RS1EM36TF
BS 132 132 RS1EN93TF
BS 133 391 RS1EM36TF
BS 392 392 RS1EN93TF
BS 393 395 RS1EM36TF
BS 396 396 RS1EN93TF
BS 397 554 RS1EM36TF
BS 555 782 RS1EN93TF

RD RS1EM36TF 554 0 0
GGAGGAAGGAATCCGAGGAACACCCTAAAATAAAAGAAAGGTTAAAAACCCAAGAGAGAC
GAAGCAAATCGAAAGAAAAAACGAGAGAGGTTTTCAGCTAAATCAAATTCCTAGCGAAGT
TTCTCGTGATAGGAAGAAAGAGAGTCGGTGGTGATATGAGTTCAAGTGAAGCTTTCCCCG
TGATGCAGGAAATCATGCTTGAGTTTCGTGCTGGTAAGATGTCTTTGCAGGGAACAAGAG
TTGTCCCTGATGCACGAAAAGGACTTGTCCGCATTGCTAGAGGTGAGGAGGGACTGGTTC
ATTTCCAGTGGCTTGATCGAACCCAGAATGCAGTGGAAGATGATCAAATCGTTTTCCCTG
ATGAAGCTCTATTTGAAAAGGTTAATCAATCGTCATACAGGGTGTACATTCTGAAGTTCA
ACAGTGATGACCGCAAGCTATTCTTATGGATACAGGAGCCGAGAGCTGAAGGTGATGCAG
ATATATGTTCTGCGGTCAATCAGTACCTTAATCAACCACTAGAGTTTGGTGAAGTTGCTG
TGCCGGAGGATGTG

QA 1 554 1 554
DS 

RD RS1EN93TF 780 0 0
G
GGAAGGAATCCGAGGAACACCCTAAAATAAAAGAAAGGTTAAAAACCCAAGAGAGACGAA
GCAAATCGAAAGAAAAAACGAGAGAGGTTTTCAGCTAAATCAAATTCCTAGCGAAGTTTC
TCGTGATAAGAAGAAAGAGAGTCGGTGGTGATATGAGTTCAAGTGAAGCTTTCCCCGTGA
TGCAGGAAATCATGCTTGAGTTTCGTGCTGGTAAGATGTCTTTGCAGGGAACAAGAGTTG
TCCCTGATGCACGAAAAGGACTTGTCCGCATTGCTAGAGGTGAGGAGGGACTGGTTCATT
TCCAGTGGCTTGATCGGACCCAGAATGCAGTGGAAGATGATCAAATCGTTTTCCCTGATG
AAGCTCTATTTGAAAAGGTTAATCAATCATCAGACAGGGTGTACATTCTGAAGTTCAACA
GTGATGACCGCAAGCTATTCTTATGGATACAGGAGCCGAGAGCTGAAGGTGATGCAGATA
TATGTTCTGCGGTCAATCAGTACCTTAATCAACCACTAGAGTTTGGTGAAGTTGCTGTGC
CGGAGGATGTGGAAGACATGGCAGAAGACGATGTTTCATCCAGAGCTGGAAACTTGGTTG
TACCAAATGTGTCTACAGAGGTGAGTGATGTGTCATCTTCGTCTGGACCAGTTAAGCTGG
CAGACTTGCAAAGAATTCTGAACAACCTCTCTTCTGGTCCTGTAGTATCCCTGGAGATGA
GAGAAGCCTAGTATTAGGGATATCCTGAAGCCTGAGTTGATATGCATTGCTTGAGATGT

QA 2 780 2 780
DS 



AS 1 4

CO CL1847Contig1 888 4 9 U
AAACCAATTAAAGAACATACGTTGCTTTGTCTCATCATGAGTGTTGCAGTATTACACTTG
CTTATAATTATAATACTAATTATGAAACAGAAAAACCGGGGTTTCAACAAAAAAGAACAA
TCAATAGAAAAAAAAAAGGATTATCATGAAAATTTCCTAAAAAGGAAAATCATACGAAAT
CAGTTGCACATATATGTTGATACGAAGATGCTAAACAACATAACATAACATGACTACTAG
ACTCTAGAGAAGCAGTTTTAGTAGATTATTGCGGAATAGTGATGATAACAAACACATATA
TTAAAGATGGTGAAAGAATGGGAGGAAGAGTGTAAAGCTTATAATCCCCTTAGCGATAGC
TATGATAGGAAGGGCTGTACATGCTGCTCTCAGCACACTTCTCCAGCTCCTTGGGCTGAG
GCAACCTCGTCGCCAATCCCAGTTCATAGGCCTTGGCAGCCACTCTAGCTGCAATACGAG
CTGAGATTTTTCTGATATTCCTAAAGGGAGGGAATATCATCCCCTTCTCATAGTGCTCCT
CCATCAGTTGCTCAGCCAAAGCTTCTGAAGCAGCCAGAAGCATGTCATCATGAACACGGA
TGGTCCCTGACATTATTAGCCCCAGTCCGAACCCAGGGAATATGTAAGCATTGTTTGCCT
GTCCAGGCACAAACGTCCTCCCCTCATACTCTACCGGCGGAAATGGGCTTCCACTTGCAA
AGATCACTCGTCCCTTACTCCACGTGTAAGCCTGTTCCGCTGTACATTCCGACTGAGAAG
TTGGGTTTGAAAGAGAAAGGATGATGGGTTTCTCATTTAGCTCTGCCATGGTTTCCACCA
CTTCTTGAGTGAATGTTTGACCTACTCCTGATGTTCCAATTAAAACGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CZ89TF C 1
AF RS1G934TF C 144
AF RS1GG05JQ U 105
AF RS1AV60JQ U 129
BS 1 104 RS1CZ89TF
BS 105 263 RS1GG05JQ
BS 264 264 RS1AV60JQ
BS 265 484 RS1GG05JQ
BS 485 485 RS1AV60JQ
BS 486 852 RS1GG05JQ
BS 853 853 RS1AV60JQ
BS 854 871 RS1GG05JQ
BS 872 888 RS1AV60JQ

RD RS1CZ89TF 603 0 0
AAACCAATTAAAGAACATACGTTGCTTTGTCTCATCATGAGTGTTGCAGTATTACACTTG
CTTATAATTATAATACTAATTATGAAACAGAAAAACCGGGGTTTCAACAAAAAAGAACAA
TCAATAGAAAAAAAAA*GGATTATCATGAAAATTTCCTAAAAAGGAAAATCATACGAAAT
CAGTTGCACATATATGTTGATACGAAGATGCTAAACAACATAACATAACATGACTACTAG
ACTCTAGAGAAGCAGTTTTAGTAGATTATTGCGGAATAGTGATGATAACAAACACATATA
TTAAAGATGGTGAAAGAATGGGAGGAAGAGTGTAAAGCTTATAATTCCCTTAGCGATAGC
TATGATAGGAAGGGCTGTACATGCTGCTCTCAGCACACTTCTCCAGCTCCTTGGGCTGAG
GCAACCTCGTCGCCAATCCCAGTTCATAGGCCTTGGCAGCCACTCTAGCTGCAATACGAG
CTGAGATTTTTCTGATATTCCTAAAGGGAGGGAATATCATCCCCTTCTCATAGTGCTCCT
CCATCAGTTGCTCAGCCAAAGCTTCTGAAGCAGCCAGAAGCATGTCATCATGAACACGGA
TG
C

QA 1 602 1 602
DS 

RD RS1G934TF 460 0 0
TCATGAAAATTTCCTAAAAAGGAAAATCATACGAAATCAGTTGCACATATATGTTGATAC
GAAGATGCTAAACAACATAACATAACATGACTACTAGACTCTAGAGAAGCAGTTTTAGTA
GATTATTGCGGAATAGTGATGATAACAAACACATATATTAAAGATGGTGAAAGAATGGGA
GGAAGAGTGTAAAGCTTATAATTCCCTTAGCGATAGCTATGATAGGAAGGGCTGTACATG
CTGCTCTCAGCACACTTCTCCAGCTCCTTGGGCTGAGGCAACCTCGTCGCCAATCCCAGT
TCATAGGCCTTGGCAGCCACTCTAGCTGCAATACGAGCTGAGATTTTTCTGATATTCCTA
AAGGGAGGGAATATCATCCCCTTCTCATAGTGCTCCTCCATCAGTTGCTCAGCCAAAGCT
TCTGAAGCAGCCAGAAGCATGTCATCATGAACACGGATG
C

QA 1 459 1 459
DS 

RD RS1GG05JQ 767 0 0
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GAAAATCATACGAAATCAGTTGCACATATATGTTGATACGAAGATGCTAAACAACATAAC
ATAACATGACTACTAGACTCTAGAGAAGCAGTTTTAGTAAATTATTGCGGAATAGTGATG
ATAACAAACACATATATTAAAGATGGTGAAAGAATGGGAGGAAGAGTGTAAAGCTTATAA
TCCCCTTAGCGATAGCTATGATAGGAAGGGCTGTACATGCTGCTCTCAGCACACTTCTCC
AGCTCCTTGGGCTGAGGCAACCTCGTCGCCAATCCCAGTTCATAGGCCTTGGCAGCCACT
CTAGCTGCAATACGAGCTGAAATTTTTCTGATATTCCTAAAGGGAGGGAATATCATCCCC
TTCTCATAGTGCTCCTCCATCAGTTGCTCAGCCAAAGCTTCTGAAGCAGCCAGAAGCATG
TCATCATGAACACGGATGGTCCCTGACATTATTAGCCCCAGTCCGAACCCAGGGAATATG
TAAGCATTGTTTGCCTGTCCAGGCACAAACGTCCTCCCCTCATACTCTACCGGCGGAAAT
GGGCTTCCACTTGCAAAGATCACTCGTCCCTTACTCCACGTGTAAGCCTGTTCCGCTGTA
CATTCCGACTGAGAAGTTGGGTTTGAAAGAGAAAGGATGATGGGTTTCTCATTTAGCTCT
GCCATGGTTTCCACCACTTCTTGAGTGA*TGTTTGACCTACTCCTGA

QA 1 767 1 767
DS 

RD RS1AV60JQ 760 0 0
GA
AAAAAAAGGATTATCATGAAAATTTCCTAAAAAGGAAAATCATACGAAATCAGTTGCACA
TATATGTTGATACGAAGATGCTAAACAACATAACATAACATGACTACTAGACTCTAGAGA
AGCAGTTTTAGTAGATTATTGCGGAATAGTGATGATAACAAACACATAT**TAAAGATGG
TGAAAGAATGGGAGGA*GAGTGTAAAGCTTATAATCCCCTTAGCGATAGCTATGATAGGA
AGGGCTGTACATGCTGCTCTCAGCACACTTCTCCAGCTCCTTGGGCTGAGGCAACCTCGT
CGCCAATCCCAGTTCATAGGCCTTGGCAGCCACTCTAGCTGCAATACGAGCTGAGATTTT
TCTGATATTCCTAAAGGGAGGGAATATCATCCCCTTCTCATAGTGCTCCTCCATCAGTTG
CTCAGCCAAAGCTTCTGAAGCAGCCAGAAGCATGTCATCATGAACACGGATGGTCCCTGA
CATTATTAGCCCCAGTCCGAACCCAGGGAATATGTAAGCATTGTTTGCCTGTCCAGGCAC
AAACGTCCTCCCCTCATACTCTACCGGCGGAAATGGGCTTCCACTTGCAAAGATCACTCG
TCCCTTACTCCACGTGTAAGCCTGTTCTGCTGTACATTCTGACTGAGAAGTTGGGTTTGA
AAGAGAAAGGATGATGGGTTTCTCATTTAGCTCTGCCATGGTTTCCACCACTTCTTGAGT
GAATGTTTGACCTACTCCTGATGTTCCAATTAAAACGG

QA 3 760 3 760
DS 



AS 1 5

CO CL1848Contig1 1118 5 10 U
GGACATTACCCACTCACATAGAAAGAAAAAAAAATACTCTTAAGAGAGAGAAATGGAAGG
CAAGGAAGAAGATGTTAGAGTCGGAGCTAACAAGTTTCCGGAGAGACAACCCATCGGAAC
ATCGGCTCAGAGCGACAAGGACTACAAGGAGCCACCTCCTGCTCCCTTGTTCGAGCCAGG
CGAGCTTGCTTCCTGGTCCTTCTGGAGAGCCGGTATCGCCGAGTTCATCGCCACGTTTCT
GTTCCTTTACATCACCGTGTTGACCGTCATGGGCGTGAAGAGAGCACCGAACATGTGTGC
TTCTGTCGGAATCCAAGGGATCGCTTGGGCTTTCGGTGGTATGATCTTCGCTCTCGTCTA
CTGCACCGCTGGTATCTCCGGTGGACACATCAACCCAGCTGTCACGTTTGGTCTATTCTT
GGCCAGGAAGCTTTCGCTTACGCGAGCTGTGTACTACATAGTGATGCAGTGCTTGGGAGC
CATTTGTGGAGCTGGTGTGGTGAAGGGTTTCCAGCCTAAGCAATACCAAGCTCTAGGAGG
TGGAGCCAACACTGTAGCTCCTGGTTACACCAAAGGGAGTGGTCTTGGAGCTGAGATTAT
TGGAACCTTTGTCCTCGTTTACACCGTTTTCTCCGCCACTGACGCCAAAAGAAACGCTCG
TGACTCTCATGTTCCCATTCTTGCTCCTCTCCCAATTGGATTCGCTGTGTTCTTGGTCCA
CTTAGCAACCATCCCCATCACTGGAACTGGAATCAACCCAGCTAGAAGTCTTGGAGCTGC
CATCATCTTCAACAAGGATAACGCTTGGGACGACCATTGGGTCTTTTGGGTTGGACCATT
CATCGGTGCTGCTCTTGCTGCTCTGTACCACGTGATAGCCATCAGAGCCATCCCATTTAA
GTCCAGAAGCTGATCCAGTCACTCTTAAAAATCTAGCTTTGCGCTATTAATAGTTTGCTT
TCTTTTTGTGAATTGTGCGAAGCAACGTGTGTGTATTTGCTTGTTCCTCTTCTTTGCCTA
ATGCAAGACTATTTGTAAAACAAAGACATTCCCCCTTGCAAAATTTGTAATCTCTCTTCT
ATAACTGGAACATTCTGAGCAGACATTTATCTTGAAGC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E224TF U 1
AF RS1EU03TF U 2
AF RS1E443TF U 3
AF RS1E443JQ C 357
AF RS1EU03JQ C 296
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RD RS1E224TF 690 0 0
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GTTCCTTTACATCACCGTGTTGACCGTCATGGGCGTGAAGAGAGCACCGAACATGTGTGC
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TGGAGCCAACACTGTAGCTCCTGGTTACACCAAAGGGAGTGGTCTTGGAGCTGAGATTAT
TGGAACCTTTGTCCTCGTTTACACCGTTTTCTCCGCCACTGACGCCAAAAGAAACGCTCG
TGACTCTCATGTTCCCATTCTTGCTCCTCT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1EU03TF 720 0 0
GAC
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CTTGCTTCCTGGTCCTTCTGGAGAGCCGGTATCGCCGAGTTCATCGCCACGTTTCTGTTC
CTTTACATCACCGTGTTGACCGTCATGGGCGTGAAGAGAGCACCGAACATGTGTGCTTCT
GTCGGAATCCAAGGGATCGCTTGGGCTTTCGGTGGTATGATCTTCGCTCTCGTCTACTGC
ACCGCTGGTATCTCCGGTGGACACATCAACCCAGCTGTCACGTTTGGTCTATTCTTGGCC
AGGAAGCTTTCGCTTACGCGAGCTGTGTACTACATAGTGATGCAGTGCTTGGGAGCCATT
TGTGGAGCTGGTGTGGTGAAGGGTTTCCAGCCTAAGCAATACCAAGCTCTAGGAGGTGGA
GCCAACACTGTAGCTCCTGGTTACACCAAAGGGAGTGGTCTTGGAGCTGAGATTATTGGA
ACCTTTGTCCTCGTTTACACCGTTTTCTCCGCCACTGACGCCAAA*GAAACGCTCGTGAC
TCTCATGTTCCCATTCTTGCTCCTCTCCCAATTGGATTCGCTGTGTTCTTGGTCCAC

QA 4 720 4 720
DS 

RD RS1E443TF 745 0 0
GG
ATTACCCACTCACATAGAAAGAAAAAAAA*TACTCTTAAGAGAGAGAAATGGAAGGCAAG
GAAGAAGATGTTAGAGTCGGAGCTAACAAGTTTCCGGAGAGACAACCCATCGGAACATCG
GCTCAGAGCGACAAGGACTACAAGGAGCCACCTCCTGCTCCCTTGTTCGAGCCAGGCGAG
CTTGCTTCCTGGTCCTTCTGGAGAGCCGGTATCGCCGGGTTCATCGCCACGTTTCTGTTC
CTTTACATCACCGTGTTGACCGTCATGGGCGTGAAGAGAGCACCGAACATGTGTGCTTCT
GTCGGAATCCAAGGGATCGCTTGGGCTTTCGGTGGTATGATCTTCGCTCTCGTCTACTGC
ACCGCTGGTATCTCCGGTGGACACATCAACCCAGCTGTCACGTTTGGTCTATTCTTGGCC
AGGAAGCTTTCGCTTACGCGAGCTGTGTACTACATAGTGATGCAGTGCTTGGGAGCCATT
TGTGGAGCTGGTGTGGTGAAGGGTTTCCAGCCTAAGCAATACCAAGCTCTAGGAGGTGGA
GCCAACACTGTAGCTCCTGGTTACACCAAAGGGAGTGGTCTTGGAGCTGAGATTATTGGA
ACCTTTGTCCTCGTTTACACCGTTTTCTCCGCCACTGACGCCAAA*GAAACGCTCGTGAC
TCTCATGTTCCCATTCTTGCTCCTCTCCCAATTGGATTCGCTGTGTTCTTGGTCCACTTA
GCA*CCATCCCCATCACTGGAAC

QA 3 745 3 745
DS 

RD RS1E443JQ 680 0 0
TCTACTGCACCGCTGGTATCTCCGGTGGACACATCAACCCAGCTGTCACGTTTGGTCTAT
TCTTGGCCAGGAAGCTTTCGCTTACGCGAGCTGTGTACTACATAGTGATGCAGTGCTTGG
GAGCCATTTGTGGAGCTGGTGTGGTGAAGGGTTTCCAGCCTAAGCAATACCAAGCTCTAG
GAGGTGGAGCCAACACTGTAGCTCCTGGTTACACCAAAGGGAGTGGTCTTGGAGCTGAGA
TTATTGGAACCTTTGTCCTCGTTTACACCGTTTTTTCCGCCACTGACGCCAAAAGAAACG
CTCGTGACTCTCATGTTCCCATTCTTGCTCCTCTCCCAATTGGATTCGCTGTGTTCTTGG
TCCACTTAGCAACCATCCCCATCACTGGAACTGGAATCAACCCAGCTAGAAGTCTTGGAG
CTGCCATCATCTTCAACAAGGATAACGCTTGGGACGACCATTGGGTCTTTTGGGTTGGAC
CATTCATCGGTGCTGCTCTTGCTGCTCTGTACCACGTGATAGTCATCAGAGCCATCCCAT
TTAAGTCCAGAAGCTGATCCAGTCACTCTTAAAAATCTAGCTTTGTGCTATTAATAGTTT
GCTTTCTTTTTGTGAATTGTGCGAAGCAACGTGTGTGTATTTGCTTGTTCCTCTTCTTTG
CCTAATGCAAGACTATTTGT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RS1EU03JQ 823 0 0
TGTGCTTCTGTCGGA*TCCAAGGGATCGCTTGGGCTTTCGGTGGTATGATCTTCGCTCTC
GTCTACTGCACCGCTGGTATCTCCGGTGGACACATCAACCCAGCTGTCACGTTTGGTCTA
TTCTTGGCCAGGAAGCTTTCGCTTACGCGAGCTGTGTACTACATAGTGATGCAGTGCTTG
GGAGCCATTTGTGGAGCTGGTGTGGTGAAGGGTTTCCAGCCTAAGCAATACCAAGCTCTA
GGAGGTGGAGCCAACACTGTAGCTCCTGGTTACACCAAAGGGAGTGGTCTTGGAGCTGAG
ATTATTGGAACCTTTGTCCTCGTTTACACCGTTTTCTCCGCCACTGACGCCAAAAGAAAC
GCTCGTGACTCTCATGTTCCCATTCTTGCTCCTCTCCCAATTGGATTCGCTGTGTTCTTG
GTCCACTTAGCAACCATCCCCATCACTGGAACTGGAATCAACCCAGCTAGAAGTCTTGGA
GCTGCCATCATCTTCAACAAGGATAACGCTTGGGACGACCATTGGGTCTTTTGGGTTGGA
CCATTCATCGGTGCTGCTCTTGCTGCTCTGTACCACGTGATAGCCATCAGAGCCATCCCA
TTTAAGTCCAGAAGCTGATCCAGTCACTCTTAAAAATCTAGCTTTGCGCTATTAATAGTT
TGCTTTCTTTTTGTGAATTGTGTGAAGCATCGTGTGTGTATTTGCTTGTTCCTCTTCTTT
GCCTAATGCAAGACTATTTGTAAAACAAAGACATTCCCCCTTGCAAAATTTGTAATCTCT
CTTCTATAACTGGAACATTCTGAGCAGACATTTATCTTGAAGC

QA 1 823 1 823
DS 



AS 1 5

CO CL1849Contig1 621 5 3 U
GGGCTCGATCTCGTCTCTCGACTGCTCCTCAAAGACCGAGATTTAGCTGGTTTAAGACTA
ATCTTCGGAGAATTTGTTGAGCTGCAAGCGAATATGAGTAGACCAATGGAAGAGGATACC
AACCAGGGAAAGACGGAGGAGGAGGAGTTCAACACGGGACCCCTTTCTGTTCTGATGATG
AGTGTCAAGAACAACACTCAGGTGCTGATCAATTGCCGCAACAACAGGAAACTCCTTGGT
CGTGTTAGAGCTTTTGACAGGCACTGCAACATGGTCCTGGAAAACGTCAGAGAAATGTGG
ACCGAGGTACCTAAAACTGGGAAAGGAAAGAAGAAAGCTCTTCCTGTTAACAGAGATCGC
TTCATCAGCAAGATGTTTCTCCGTGGTGACTCTGTCATTATCGTCCTCAGGAACCCCAAG
TGAGAGAGAGATATGTCGCTGTTTGTACTTGTTTCTTCTCGTCAAATTCTAATTGTTGCA
TCAACGGAGATAATCTTTGAGTATCAGTCTTAAATCTAGTCTTGCCCTTGTATTTTTCAC
TTGTGTTTTCCCCTATCTCTTATGAGTAAGATGCAGTGGTGTTTAGTGCCTCCTAAACTT
AAATAATTACAAAAGACATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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AF RS1E284TF U 1
AF RS1D107JQ C 11
AF RS1D107TF U 11
AF RS1FK29JQ C 36
AF RS1FK29TF U 36
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AGTGTCAAGAACAACACTCAGGTGCTGATCAATTGCCGCAACAACAGGAAACTCCTTGGT
CGTGTTAGAGCTTTTGACAGGCACTGCAACATGGTCCTGGAAAACGTCAGAGAAATGTGG
ACCGAGGTACCTAAAACTGGGAAAGGAAAGAAGAAAGCTCTTCCTGTTAACAGAGATCGC
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TCAACGGAGATAATCTTTGAGTATCAGTCTTAAATCTAGTCTTGCCCTTGTATTTTTCAC
TTGTGTTTTCCCCTATCTCTTATGAGTAAGATGCAGTGGTGTTTA

QA 1 585 1 585
DS 

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GG
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AAAACTGGGAAAGGAAAGAAGAAAGCTCTTCCTGTTAACAGAGATCGCTTCATCAGCAAG
ATGTTTCTCCGTGGTGACTCTGTCATTATCGTCCTCAGGAACCCCAAGTGAGAGAGAGAT
ATGTCGCTGTTTGTACTTGTTTCTTCTCTTCAAATTCTAATTGTTGCATCAACGGAGATA
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CTATCTCTTATGAGTAAGATGCAGTGGTGTTTAGTGCC

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DS 

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GG
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TTTGTTGAGCTGCAAGCGAATATGAGTAGACCAATGGAAGAGGATACCAAC***GGAAAG
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AACACTCAGGTGCTGATCAATTGCCGCAACAACAGGAAACTCCTTGGTCGTGTTAGAGCT
TTTGACAGGCACTGCAACATGGTCCTGGAAAACGTCAGAGAAATGTGGACCGAGGTACCT
AAAACTGGGAAAGGAAAGAAGAAAGCTCTTCCTGTTAACAGAGATCGCTTCATCAGCAAG
ATGTTTCTCCGTGGTGACTCTGTCATTATCGTCCTCAGGAACCCCAAGTGAGAGAGAGAT
ATGTCGCTGTTTGTACTTGTTTCTTCTCTTCAAATTCTAATTGTTGCATCAACGGAGATA
ATCTTTGAGTATCAGTCTTAAATCTAGTCTTGCCCTTGTATTTTTCACTTGTGTTTTCCC
CTATCTCTTATGAGTAAGATGCAGTGGTGTTTAGTGCC

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GG
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TGGAAAACGTCAGAGAAATGTGGACCGAGGTACCTAAAACTGGGAAAGGAAAGAAGAAAG
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TTATCGTCCTCAGGAACCCCAAGTGAGAGAGAGATATGTCGCTGTTTGTACTTGTTTCTT
CTCGTCAAATTCTAATTGTTGCATCAACGGAGATAATCTTTGAGTATCAGTCTTAAATCT
AGTCTTGCCCTTGTATTTTTCACTTGTGTTTTCCCCT**CTCTTATGAGTAAGATGCAGT
GGTGTTTAGTGCCTCCTAAACTTAAATAATTACAAAAGACATGT

QA 3 586 3 586
DS 



AS 1 5

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GATCTAGAAACTCAAAAACATAAAAAGAATCAGAGTTTAATTGTGAATATAGAAGAAAAT
CATTCTTTTTTAATTTTCTTCTAATCTTACCTGCAATTAAAGTTAAACAAATTAAACTTA
TCAATATCAGAATTCTATTACAACATACTAAGAAAACAAAAAAAAAAGATATGGAGAACA
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CTCCAGTAAAGTCAAACTCCGGTTCGAAGAAGTCAACGGTACAAAAATGCGATAGCTTTG
CTTCTAAAGCTACAAGAGATGCATGGGATCGTATGTTCGACGAAGCTCATGGGGCTGATG
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GGATAGCGATGAAACAAAGTCACCCTAGTCTTCATAAAGAGCTCTTACGCTCTGTCTCTT
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AGATGTTGTTGAAACATTTGGCGGTATGTAAACTGAGATCAATCCCTGGTGGTTGCAGCC
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CTCCTTTCTTTTTGCAGGCAATTGATGTTACTATGTGACATTATTATTTTATTTCATAAT
AGTTAGAGATTAGATGTGTAATATAAATAGGTAGAAGTTTTTTTTTTTTTGTGAAGAGAG
AGATAGAGAAATTCAAACAATTTTCACTCTCTAGTTACATCACAAACCTCGTTTAAAAGA
GTGTGTTTGATCATAATACCATGAGTGTTATGGAATTCTTGTGACATGGTAATAATAATA
AGAAGATTATC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1DO23TF U 1
AF RS1G450TF U 352
AF RS1GG01TF U 538
AF RS1DO23JQ C 869
AF RS1G450JQ C 869
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BS 580 580 RS1G450TF
BS 581 708 RS1DO23TF
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BS 710 734 RS1DO23TF
BS 735 1116 RS1G450TF
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BS 1550 1571 RS1DO23JQ

RD RS1DO23TF 734 0 0
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CATTCTTTTTTAATTTTCTTCTAATCTTACCTGCAATTAAAGTTAAACAAATTAAACTTA
TCAATATCAGAATTCTATTACAACATACTAAGAAAACAAAAAAAAAAGATATGGAGAACA
TCGACGTTATCTCACCTGAGAACGCCTCAGGACCATCATCATCACCACCACCACCTCCTC
CTCCAGTAAAGTCAAACTCCGGTTCGAAGAAGTCAACGGTACAAAAATGCGATAGCTTTG
CTTCTAAAGCTACAAGAGATGCATGGGATCGTATGTTCGACGAAGCTCATGGGGCTGATG
TTTTGATCCATACGGATGATAGTGGCTTGATTTACGCCCATTCTAACGTCATCGGAATGG
CTTCTGATGTAATTAGAGGAATGATAAAGCAAGATAAGAGAAACTCTCGCCGTAAATCAA
TCTCAATCCTCGGCGTTCCTCACGACGCTGTTCGCGTTTCCGTTAGATTCTTATACTCTT
CTTGCTACGAGAAACAAGACATGGAAGATTTCGCAATGCATCTTCTCGTGCTATCACACG
TCTACGTGGTTCCGCAACTAAAACGAGTGTGCGAGTCTCATTTCGAAA*CACTTTGCTCA
ACAAAGAGAATGTG

QA 1 734 1 734
DS 

RD RS1G450TF 765 0 0
G
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GGCTGATGTTTTGATCCATACGGATGATAGTGGCTTGATTTACGCCCATTCTAACGTCAT
CGGAATGGCTTCTGATGTAATTAGAGGAATGATAAAGCAAGATAAGAGAAACTCTCGCCG
TAAATCAATCTCAATCCTCGGCGTTCCTCACGACGCTGTTCGCGTTTTCGTTAGATTCTT
ATACTCTTCTTGCTACGAGAAACAAGACATGGAAGATTTCGCAATGCATCTTCTCGTGCT
ATCACACGTCTACGTGGTTCCGCAACTAAAACGAGTGTGCGAGTCTCATTTCGAAAACAC
TTTGCTCAACAAAGAGAATGTGATTGATGTGTTTCAGCTAGCTCTTCTCTGTGACGCTCC
TCGTCTAGGTCTTCTCTGTCACAGAATGATTCTAAAGAGCTTTGAAGAAGTCTCTAATTC
TCAAGGATGGATAGCGATGAAACAAAGTCACCCTAGTCTTCATAAAGAGCTCTTACGCTC
TGTCTCTTACGAACTTAACAGCTTGAAGCAAAGAAGCAGGAAACAGAAAGAGATACAGAC
ATACACTCAGCTGTATGATGCAATGGAAGCTTTTGTCCACATATGTAGAGATGGATGCAG
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CGGTTTGGAGATGTTGTTGAAACATTTGGCGGTATGTAAACTGA

QA 2 765 2 765
DS 

RD RS1GG01TF 719 0 0
G
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TTCTTGCTACGAGAAACAAGACATGGAAGATTTCGCAATGCATCTTCTCGTGCTATCACA
CGTCTACGTGGTTCCGCAACTAAAACGAGTGTGCGAGTCTCATTTCGAAAACACTTTGCT
CAACAAAGAGAATGTGATTGATGTGTTTCAGCTAGCTCTTCTCTGTGACGCTCCTCGTCT
AGGTCTTCTCTGTCACAGAATGATTCTAAAGAGCTTTGAAGAAGTCTCTAATTCTCAAGG
ATGGATAGCGATGAAACAAAGTCACCCTAGTCTTCATAAAGAGCTCTTACGCTCTGTCTC
TTACGAACTTAACAGCTTGAAGCAAAGAAGCAGGAAACAGAAAGAGATACAGACATACAC
TCAGCTGTATGATGCAATGGAAGCTTTTGTCCACATATGTAGAGATGGATGCAGAGAGAT
TGGTCCAACAAAGATCGAAACCCCGCATGTCTCTTGTGGGTTTCAAGCGTGCAACGGTTT
GGAGATGTTGTTGAAACATTTGGCGGTATGTAAACTGAGATCAATCCCTGGTGGTTGCAG
CCGTTGTAAGAGAATGTGGCAGCTTCTTGAGCTTCATTCACGTATTTGTGTAGACTCGGA
GCAATGTAAAGTCCCTCTTTGCAGTAGCTTCAA*GAGAGGATGA
GAAACAAACAGAAA

QA 2 705 2 705
DS 

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TACTATGTGACATTATTATTTTATTTCATAATAGTTAGAGATTAGATGTGTAATATAAAT
AGGTAGAAGTTTTTTT****TTGTGAAGAGAGAGATAGAGAAATTCAAACAATTTTCACT
CTCTAGTTACATCACAAACCTCGTTTAAAAGAGTGTGTTTGATCATAATGCCATGAGTGT
TATGGAATTCTTGTGACATGTTAATAATAATAAGAAGATTATC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1G450JQ 703 0 0
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CAGGAAACAGAAAGAGATACAGACATACACTCAGCTGTATGATGCAATGGAAGCTTTTGT
CCACATATGTAGAGATGGATGCAGAGAGATTGGTCCAACAAAGATCGAAACCCCGCATGT
CTCTTGTGGGTTTCAAGCGTGCAACGGTTTGGAGATGTTGTTGAAACATTTGGCGGTATG
TAAACTGAGATCAATCCCTGGTGGTTGCAGCCGTTGTAAGAGAATGTGGCAGCTTCTTGA
GCTTCATTCACGTATTTGTGTAGACTCGGAGCAATGTAAAGTCCCTCTTTGCAGTAGCTT
CAAAGAGAGGATGAAGAAACAAAACAGGAAAGATGAGAAGAGATGGAAACTGTTGGTGAA
GAATGTTTTGAGCACCAAAAGAATAGGAGGATCTCCTTTCTTTTTGCAGGCAATTGATGT
TACTATGTGACATTATTATTTTATTTCATAATAGTTAGAGATTAGATGTGTAATATAAAT
AGGTAGAAGTTTTTTTTTTTTTGTGAAGAGAGAGATAGAGAAATTCAAACAATTTTCACT
CTCTAGTTACATCACAAACCTCGTTTAAAAGAGTGTGTTTGATCATAATACCATGAGTGT
TATGGAATTCTTGTGACTTGGTAATAATAATAAGAAGATTATC

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 5

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ATACGAGTCTGGGAAAGCAATACCCAACCAGCAGATCCTTTCTAAGCTGGAGAGAGCACT
TGGAGCTAAACTCCGTGGAAAGAAGTAGTAATCAACAAAACCTCCTTTAATGTTTTAAAA
CTGAAAAAAGCTAATCACGGTTCTGTCTCCAGTTCATAAACTATCTTATATAAAGCCTAC
TGCTCTATGCGATAAATCTCTTTTATGGTGTAAGAACGAAACAAAAGCTGTTTGTAACCG
TTTGTCATTTATAAATAATCCCATTGTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 10 10 

AF RS1DR90TF U 1
AF RS1BQ63JQ C 15
AF RS1BQ63TF U 15
AF RS1GS34JQ C 19
AF RS1GS34TF U 19
BS 1 287 RS1DR90TF
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BS 369 683 RS1DR90TF
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RD RS1DR90TF 683 0 0
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TGGAGCTAAACTCCGTGGAAAGAAGTAGTAATCAACAAAACCTCCTTTAATGTTTTAAAA
CTGAAAAAAGCTAATCACGGTTCTGTCTCCAGTTCATAAACTATCTTATATAAAGCCTAC
TGCTCTATGCGATAAATCTCTTTTATGGTGTAAGAACGAAACAAAAGCTGTTTGTAACCG
TTTGTCATTTATAAATAATCCCA

QA 1 683 1 683
DS 

RD RS1BQ63JQ 676 0 0
GGAAAC
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TTTTATGGTGTAAGAACGAAACAAAAGCTGTTTGTAACCGTTTGTCATTTATAAATAATC
CCATTGTTAG

QA 7 676 7 676
DS 

RD RS1BQ63TF 676 0 0
GGAAAC
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ATATCGAAACCGTCCGAAAATACAATGCTGCGACGAACAAGGCGGCTTCGAGCAGCACCT
CCTTGAACACAAAGATGCTTGATGATGATACTGAGAACTTAGCTCATGAACGTGTGCCTA
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TCGCTCAACTGATCAACGAGAAGCCACAAGTGATCCAAGAATACGAGTCTGGGAAAGCAA
TACCCAACCAGCAGATCCTTTCTAAGCTGGAGAGAGCACTTGGAGCTAAACTCCGTGGAA
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TTCTGTCTCCAGTTCATAAACTATCTTATATAAAGCCTACTGCTCTATGCGATAAATCTC
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CCATTGTT
AG

QA 7 674 7 674
DS 

RD RS1GS34JQ 672 0 0
GG
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CCTTGAACACAAAGATGCTTGATGATGATACTGAGAACTTAGCTCATGAACGTGTGCCTA
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TACCCAACCAGCAGATCCTTTTTAAGCTGGAGAGAGCACTTGGAGCTAAACTCCGTGGAA
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CCATTGTT
CT

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RD RS1GS34TF 672 0 0
GG
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ATATCGAAACCGTCCGAAAATACAATGCTGCGACGAACAAGGCGGCTTCGAGCAGCACCT
CCTTGAACACAAAGATGCTTGATGATGATACTGAGAACTTAGCTCATGAACGTGTGCCTA
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TCGCTCAACTGGTCAACGAGAAGCCACAAGTGATCCAAGAATACGAGTCTGGGAAAGCAA
TACCCAACCAGCAGATCCTTTCTAAGCTGGAGAGAGCACTTGGAGCTAAACTCCGTGGAA
AGAAGTAGTAATCAACAAAACCTCCTTTAATGTTTTAAAACTGAAAAAAGCTAATCACGG
TTCTGTCTCCAGTTCATAAACTATCTTATATAAAGCCTACTGCTCTATGCGATAAATCTC
TTTTATGGTGTAAGAACGAAACAAAAGCTGTTTGTAACCGTTTGTCATTTATAAATAATC
CCATTGTT
CT

QA 3 670 3 670
DS 



AS 1 4

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GGTTCTCAATCTCACGAGATAACTTAGGGTTTCTTGTTGTTCCCCACAAGAAAGTTTTCT
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ATGGAGGACAAGTTCTTTCTTGGAAGACTGAGAGAGGTGATGAATTGTTATTCACCAGTG
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AGTTTGGAACTCGAGGATCACTTGAGCAGCACGGTTTTGCGAGAAACAAGATGTGGCTTG
TGGAAAATGATCCTCCTGCTTTACCTTCATTCGACTCAACCGACAAAGCCTATGTGGATT
TGGTACTTAAGTCCTCTGATGAAGACACAACAAGGATCTGGCCTTACAGCTTTGAGTTTC
ACTTGAGAGTTTCATTGGGATTAGATGGGAACCTATCGCTGATATCACGAGTCAGAAACA
TCAACTCAAAGCCTTTTAGCTTCTCCATTGCTTACCACACTTACTTCTCCATCTCCGATA
TCAGTGAAGTAAGAGTTGAAGGACTTGAAACTCTTGACTATCTTGATAACTTGCTTGATA
AAGAGCGGTTTACTGAGCAAGGCGATGCATTAACGTTTGAATCCGAGATCGATAGAGTGT
ACTTAAACTCTAAAGACGTGGTTGCTGTTTTTGACCATGAGAGAAAACGTACATTCCTCA
TCGAGAAAGAAGGTCTACCTGATGTTGTGGTGTGGAATCCATGGGACAAGAAAGCTAAAG
CACTGCCAGATTTGGGAGATGAAGAGTACAAACAGATGCTTTGTGTTGATGGAGCAGCCA
TTGAGAAACCAATCACCTTGAAACCGGGTGAAGAATGGACCGGGAAATTAAATCTCTCCC
TTGTCCTTTCCACCTGAAAAAACCGGTACCGGTTATCTTCAAACCTATCGATTCTTCTTT
GTCTCTCTTATTATTATATTTTTCGGTATAGTCTATAGAAGATCATCACAGTGTGTGTGT
GTGTGATTCTTTGGCATCAAAATCCTGAATATTAAAAGGAAACCTGAGATTTGAAAAATG
TCACCAGTTTTTTTTGGCTGTGACAAGATCCTGGTTTTGTGCGAGATTCATTTAACTTGT
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BQ
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35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AAGCATCGGCGGGTCGTGTGCAAGATTCATGTGTTTCGCCTCGATCCTTTTAGCGGTGGT
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TGGTACG

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G
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GGGTGGAAAGCCACGGAGGAGCCTCCTTGTTCCTCCTACTCTTATTTCTTAGGCTTGGTT
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G
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TACGGTGTAGATTTTGGTGCTCCCTGACTGTACCTCGAGACTTGATCGTAGTCTCTTTCA
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TGGTTCCTGTGGTGAACTCTTGATTCTCTGGTGTTGCTCTGTTTCTTTGTGAGTTAGTTT
GAGAGAATGTTTGAGAGAATGTTTTCTCTTACTCTTATGTGTAATATGTCTAAGTCTCCG
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CTCGCGCTTTCGGG*CGTAGCGGGTT*GGTACGGTGTAGATTTTGGTGCTCCCTGACTGT
ACCTCGAGACTTGATCGTAGTCTCTTTCAACCTTGGCTTTTTGGTTTGGTTCCAAGAGCA
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ATTTTGACCTGTTTGGAGAAGTGTGGAAGTGGTTCCTGTGGTGAACTCTTGATTCTCTGG
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AATTCCTCTTCGACTTTGTATATTTTCATGTTTAAATCA

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G
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GAGGCGCGTGGGGTTTATTTTCGCTAGTGGCCAAGCTCAGTGTTCCGATGTTGATAGAGT
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TTTCGGG*CGTAGCGGGTTTGGTACGGTGTAGATTTTGGTGCTCCCTGACTGTACCTCGA
GACTTGATCGTAGTCTCTTTCAACCTTGGCTTTTTGGTTTGGTTCCAAGAGCATAAGGTT
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CTTCGACTTTGTATATTTTCATGTTTAAATCAATGTGTTTTAAA

QA 2 705 2 705
DS 



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TCCGTGCTCTCTGCACAGGAGAGAAGGGTCTCGGGGCAGCAGGGAAGGCGTTGCACTACA
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AGCTGAAGCACACTGGTCCGGGGATTTTGTCCATGGCTAATTCGGGTCCCAACACGAATG
GTTCTCAGTTCTTTATCTGCACCGCGAAGACGCCGTGGCTTGATGGGAAACACGTGGTGT
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GGGGGAATACCTCTGAGCCAGTTGTGATTGAAGATTGTGGTGAGCTCAAGAACGAAAGTT
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TGGGGTTTGACAATACCTTATGAAGTGATTGAACCTTATGAGTTTGATTTTATTTTATTT
TTTCAAAAAATCCCATGTAAAAGAGTAGGGTGGATAATAAAATGGAAGGACACTCCTTTG
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GTATCAATTTGAAAGGAAGATTTTTTTTGGTC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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GGACAGA
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GAAAAATGCCAAACCCGAAGGTCTTCTTTGACATCTTGGTAGGAAAGAGCAAAGCGGGTC
GTGTTGTGATGGAGCTCTTCGCTGATGTGACACCGAAAACCGCTGAAAACTTCCGTGCTC
TCTGCACAGGAGAGAAGGGTCTCGGGGCAGCAGGGAAGGCGTTGCACTACAAAGGCTCTG
CCTTTCACCGTATCATCCCGGGGTTCATGTGCCAAGGTGGTGATTTCACCCGTGGGAATG
GAACCGGTGGAGAATCTATCTACGGGTCTAAGTTTCAGGACGAGAACTTCAAGCTGAAGC
ACACTGGTCCGGGGATTTTGTCCATGGCTAATTCGGGTCCCAACACGAATGGTTCTCAGT
TCTTTATCTGCACCGCGAAGACGCCGTGGCTTGATGGGAAACACGTGGTGTTTGGGAAGG
TTGTTGATGGGTACAATATGGTGGAGGAAATGGAGAAGGTCGGGTCTGAGAGGGGGAATA
CCTCTGAGCCAGTTGTGATTGAAGATTGTGGTGAGCTCAAGAACGAAAGTTCA

QA 8 600 8 600
DS 

RD RS1H644TF 766 0 0
GGACAGACTCTCGTTCGAGAAGACAAGACTTTCAATCTGCAAAAAGGATTTGGAGTGAAG
AGATGACAGGAAAAATGCCAAACCCGAAGGTCTTCTTTGACATCTTGGTAGGAAAGAGCA
AAGCGGGTCGTGTTGTGATGGAGCTCTTCGCTGATGTGACACCGAAAACCGCTGAAAACT
TCCGTGCTCTCTGCACAGGAGAGAAGGGTCTCGGGGCAGCAGGGAAGGCGTTGCACTACA
AAGGCTCTGCCTTTCACCGTATCATCCCGGGGTTCATGTGCCAAGGTGGTGATTTCACCC
GTGGGAATGGAACCGGTGGAGAATCTATCTACGGGTCTAAGTTTCAGGACGAGAACTTCA
AGCTGAAGCACACTGGTCCGGGGATTTTGTCCATGGCTAATTCGGGTCCCAACACGAATG
GTTCTCAGTTCTTTATCTGCACCGCGAAGACGCCGTGGCTTGATGGGAAACACGTGGTGT
TTGGGAAGGTTGTTGATGGGTACAATATGGTGGAGGAAATGGAGAAGGCCGGGTCTGAGA
GGGGGAATACCTCTGAGCCAGTTGTGATTGAAGATTGTGGTGAGCTCAAGAACGAAAGTT
CATAAATCACAACATTAAGTATGTTGTGAAGTGTTTATGTTTTGAGATCGAAACACTAGT
TGGGGTTTGACAATACCTTATGAAGTGATTGAACTTTATGAGTTTGATTTTATTTTATTT
TT*CAAAAA*TCCCATGTAAAAGAGTAGG*TGGATAATAAAATGGA

QA 1 766 1 766
DS 

RD RS1EK19TF 697 0 0
G
GAAGGTCTTCTTTGACATCTTGGTAGGAAAGAGCAAAGCGGGTCGTGTTGTGATGGAGCT
CTTCGCTGATGTGACACCGAAAATCGCTGAAAACTTCCGTGCTCTCTGCACAGGAGAGAA
GGGTCTCGGGGCAGCAGGGAAGGCGTTGCACTACAAAGGCTCTGCCTTTCACCGTATCAT
CTCGGGGTTCATGTGCCAAGGTGGTGATTTCACCCGTGGGAATGGAACCGGTGGAGAATC
TATCTACGGGTCTAAGTTTCAGGACGAGAACTTCAAGCTGAAGCACACTGGTCCGGGGAT
TTTGTCCATGGCTAATTCGGGTCCCAACACGAAGGGTTCTCAGTTCTTTATCTGCACCGC
GAAGACGCCGTGGCTTGATGGGAAACACGTGGTGTTTGGGAAGGTTGTTGATGGGTACAA
TATGGTGGAGGAAATGGAGAAGGTCGGGTCTGAGAGGGGGAATACCTCTGAGCCAGTTGT
GATTGAAGATTGTGGTGAGCTCAAGAACGAAAGTTCATAAATCACAACATTAAATATGTT
GTGAAGTGTTTATGTTTTGAGATCGAAACACTAGTTGGGGTTTGACAATACCTTATGAAG
TGATTGAACCTTATGAGTTTGATTTTATTTTATTTTTTCAAAAA*TCCCATGTAAAAGAG
TAGGGTGGATAATAAAATGGAAG*ACACTCCTTTGT

QA 2 697 2 697
DS 

RD RS1H644JQB 632 0 0
TGTGACACCGAAAACCGCTGAAAACTTCCGTGCTCTCTGCACAGGAGAGAAGGGTCTCGG
GGCAGCAGGGAAGGCGTTGCACTACAAAGGCTCTGCCTTTCACCGTATCATCCCGGGGTT
CATGTGCCAAGGTGGTGATTTCACCCGTGGGAATGGAACCGGTGGAGAATCTATCTACGG
GTCTAAGTTTCAGGACGAGAACTTCAAGCTGAAGCACACTGGTCCGGGGATTTTGTCCAT
GGCTAATTCGGGTCCCAACACGAATGGTTCTCAGTTCTTTATCTGCACCGCGAAGACGCC
GTGGCTTGATGGGAAACACGTGGTGTTTGGGAAGGTTGTTGATGGGTACAATATGGTGGA
GGAAATGGAGAAGGCCGGGTCTGAGAGGGGGAATACCTCTGAGCCAGTTGTGATTGAAGA
TTGTGGTGAGCTCAAGAACGAAAGTTCATAAATCACAACATTAAGTATGTTGTGAAGTGT
TTATGTTTTGAGATCGAAACACTAGTTGGGGTTTGACAATACCTTATGAAGTGATTGAAC
TTTATGAGTTTGATTTTATTTTATTTTTTCAAAAAATCCCATGTAAAAGAGTAGGGTGGA
TAATAAAATGGAAGGACACTCCTTTGT
TTGAC

QA 1 627 1 627
DS 

RD RS1D838JQ 553 0 0
CACCGCGAAGACGCCGTGGCTTGATGGGAAACACGTGGTGTTTGGGAAGGTTGTTGATGG
GTACAATATGGTGGAGGAAATGGAGAAGGTCGGGTCTGAGAGGGGGAATACCTCTGAGCC
AGTTGTGATTGAAGATTGTGGTGAGCTCAAGAACGAAAGTTCATAAATCACAACATTAAA
TATGTTGTGAAGTGTTTATGTTTTGAGATCGAAACACTAGTTGGGGTTTGACAATACCTT
ATGAAGTGATTGAACCTTATGAGTTTGATTTTATTTTATTTTTTCAAAAAATCCCATGTA
AAAGAGTAGGGTAGATAATAAAATGGAAGGACACTCCTTTGTTTGACATTTGGTTTTGTT
TTTAGGTGATATAGGTTGTTTCTTTGTTTTAGGTTTCATGACCTCTTTCAACTTCAGTGG
ACTATGATGTTAAATATTGTGAAGGCTGTTACTTTTTCAATTTATCAATGTTTTGCAGAA
TGTTGTACTCCAAATGTGGATTGTGATAAACATTATGTATAGTATCAATTTGAAAGGAAG
ATTTTTTTTGGTC

QA 1 553 1 553
DS 



AS 2 5

CO CL1855Contig1 688 2 3 U
AAATTAGCGTAGTTATTATTTTGTTAAAATATAATAGACTAAAATACGTGTTTAGATAGC
ATTATTGCTACCATATGGGTAAAGTTTTTCGCAAAAGACTTTATTTAACTTGATCATCAT
CTGCAGCACCACTATTATTAGAAACAACAAGTTAAGTTTTGTTGTTGTTGTTGTGCTTAT
GTTGCTATGGCAAACCCAACTCTGCGTTGATACCACTGCTTAGTGTAACAAAGACAGAGA
ATGTAGCTCGAAAGCTCTATCATAAGATCAAAATGTCAGGTCACTCACACCGGGTACGTA
GTAAAACATTACTTCAGTGAGACGCAGTGGAGTTGGTGACCCAATACTGCTTCACAGCAA
TCAAAACCTTCTCAGGAACCAAAGGACCATCCTCATGGTCAACCATCTTCGAGTCCCATC
TCATTCCAAAAATGATTCCCTTCACCTTCATCAATGTGTCAACATCCTCCCTGATTATAA
CCGCTCCTTCTGGACGCAAAATCCTATCCATCTCCAGAAGAATGTCCTCCGCATTGCACT
TGTTCTTGTAAAGACTGAAGAGATGGTTCGCATGAATTAAGTCATATGTTCTCGGGTATG
TCGAGAAAGCCTCACACCAGTCATGGTAGATACCAATGAGTCCACGTTCATACACAACTC
CAAGCCTATTCTTCTCAGCAATGGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AJ72JQ U 329
AF RS1AJ72TF C 1
BS 1 332 RS1AJ72TF
BS 333 509 RS1AJ72JQ
BS 510 688 RS1AJ72TF

RD RS1AJ72JQ 181 0 0
GGAA
TTGGTGACCCAATACTGCTTCACAGCAATCAAAACCTTCTCAGGAACCAAAGGACCATCC
TCATGGTCAACCATCTTCGAGTCCCATCTCATTCCAAAAATGATTCCCTTCACCTTCATC
AATGTGTCAACATCCTCCCTGATTATAACCGCTCCTTCTGGACGCAAAATCCTATCC

QA 5 181 5 181
DS 

RD RS1AJ72TF 688 0 0
AAATTAGCGTAGTTATTATTTTGTTAAAATATAATAGACTAAAATACGTGTTTAGATAGC
ATTATTGCTACCATATGGGTAAAGTTTTTCGCAAAAGACTTTATTTAACTTGATCATCAT
CTGCAGCACCACTATTATTAGAAACAACAAGTTAAGTTTTGTTGTTGTTGTTGTGCTTAT
GTTGCTATGGCAAACCCAACTCTGCGTTGATACCACTGCTTAGTGTAACAAAGACAGAGA
ATGTAGCTCGAAAGCTCTATCATAAGATCAAAATGTCAGGTCACTCACACCGGGTACGTA
GTAAAACATTACTTCAGTGAGACGCAGTGGAGTTGGTGACCCAATACTGCTTCACAGCAA
TCAAAACCTTCTCAGGAACCAAAGGACCATCCTCATGGTCAACCATCTTCGAGTCCCATC
TCATTCCAGAGATGATTCCCTTCACCTTCATCAATGTGTCAACATCGTCCCTGATTATAA
CCGCTCCTTCTGGACGCAGAATCCTATCCATCTCCAGAAGAATGTCCTCCGCATTGCACT
TGTTCTTGTAAAGACTGAAGAGATGGTTCGCATGAATTAAGTCATATGTTCTCGGGTATG
TCGAGAAAGCCTCACACCAGTCATGGTAGATACCAATGAGTCCACGTTCATACACAACTC
CAAGCCTATTCTTCTCAGCAATGGTTGC

QA 1 688 1 688
DS 



CO CL1855Contig2 1223 3 4 U
GCTTGAAGCATAACTCGGTCATTATAAAAGTTGATAATTCAATGATACACCACAAAAGTT
CCAAGCTTTTGGGACAAAGAAACAAATATAAACTATTACATTTAATAAATAGAGATTGTA
CTTATAAAAGTGGTAACAAAGAGAGAGAATGTAGCTCGAAAGCTCTATCATAAGATAAAA
ATGTCAGGTCACTCACACCGGGTACGTAGTAAACATTACTTCAGTGAGACGCAGTGGAGT
TGGTGACCCAATACTGCTTCACAGCAATCAAAACCTTCTCAGGAACCAAAGGACCATCCT
AATGGTCAACCATCTTCGAGTCCCATCTCATTCCAGAAATGATTCCCTTCACCTTCATCA
ATGTGTCAACATCGTCCCGGATTATAACCGCTCCTTCTGGACGCAGAATCCTATCCATCT
CCAGAAAAATGTCTTCCGCATTACACTTGTTCTTGTAAAGACTGAAAAAATGGTTCGCAT
GGATTAAGTCATATGTTCTCGGGTATGTCGAGAAAGCCTCGCACCAGTCATGGTAGATAC
CAATGAGTCCTCGTTCATACACAACTCCAAGCCTATTCTTCTCAGCAATGGTTGGAACAA
CATTCATAACCCAAAGCTTCTGTGACTCCAAAGCAGCAGCAAACCCACCAAACCCTGCGT
TCATGTCCATGATGTTACGGTACCTCCCAGTATCAATCAAACTATTGATCCTCTTGTAAG
CCTTCACATGCTTCTTCCACTGTCTGTTATCATCCTCATACGCATCAGCCGTGACACCAG
AGACCGAACCACTAGAGATCCTAGGCGGCACCGCGTTGAGCCTATCAGGGAAAACCTGAA
GCTCTCCTCCAGCCACTTCGTCAGAGCTGCTCGTCTCGGGATAAGGCGTAATGCACGCCT
CCATTTTCTTGTACCACACGTCATCGGTGTCATCAGTGGTTTTGCAGAAGTTGGCTCTAG
GGTCGTCTTGTCTTGAGCGGCACGCCTCGTCGTTGACTCTCTTCTGCCAGATGGCGATCT
CGCCGTGTTCGTACTTCTTGTTTTGTTGTCGGACTTGATCGCCATGGTTTTGATAGATTT
AGAAATGAATCTGGGGAGATCTGCTGGTGGCTACAATTGGCTAATCAGATGTAAGAGTTG
CTGAGATTGATTGATGAAACGTGGAAGATAGCTTGTGGAGAGAACACTAGTTTATGTGAA
TCATCTTGTTTGCCATGGGATCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FJ39JQ U 1
AF RS1F154JQ U 1
AF RS1FJ39TF C 431
BS 1 407 RS1F154JQ
BS 408 408 RS1FJ39JQ
BS 409 796 RS1F154JQ
BS 797 1223 RS1FJ39TF

RD RS1FJ39JQ 470 0 0
GCTTGAAGCATAACTCGGTCATTATAAAAGTTGATAATTCAATGATACACCACAAAAGTT
CCAAGCTTTTGGGACAAAGAAACAAATATAAACTATTACATTTAATAAATAGAGATTGTA
CTTATAAAAGTGGTAACAAAGAGAGAGAATGTAGCTCGAAAGCTCTATCATAAGATCAAA
ATGTCAGGTCACTCACACCGGGTACGTAGTAAACATTACTTCAGTGAGACGCAGTGGAGT
TGGTGACCCAATACTGCTTCACAGCAATCAAAACCTTCTCAGGAACCAAAGGACCATCCT
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ATGTGTCAACATCGTCCCGGATTATAACCGCTCCTTCTGGACGCAGAATCCTATCCATCT
CCAGAAGAATGTCTTCCGCATTACACTTGTTCTTGTAAAGACTGAA
AAAA

QA 1 466 1 466
DS 

RD RS1F154JQ 796 0 0
GCTTGAAGCATAACTCGGTCATTATAAAAGTTGATAATTCAATGATACACCACAAAAGTT
CCAAGCTTTTGGGACAAAGAAACAAATATAAACTATTACATTTAATAAATAGAGATTGTA
CTTATAAAAGTGGTAACAAAGAGAGAGAATGTAGCTCGAAAGCTCTATCATAAGATAAAA
ATGTCAGGTCACTCACACCGGGTACGTAGTAAACATTACTTCAGTGAGACGCAGTGGAGT
TGGTGACCCAATACTGCTTCACAGCAATCAAAACCTTCTCAGGAACCAAAGGACCATCCT
AATGGTCAACCATCTTCGAGTCCCATCTCATTCCAGAAATGATTCCCTTCACCTTCATCA
ATGTGTCAACATCGTCCCGGATTATAACCGCTCCTTCTGGACGCAGAGTCCTATCCATCT
CCAGAAAAATGTCTTCCGCATTACACTTGTTCTTGTAAAGACTGAAAAAATGGTTCGCAT
GGATTAAGTCATATGTTCTCGGGTATGTCGAGAAAGCCTCGCACCAGTCATGGTAGATAC
CAATGAGTCCTCGTTCATACACAACTCCAAGCCTATTCTTCTCAGCAATGGTTGGAACAA
CATTCATAACCCAAAGCTTCTGTGACTCCAAAGCAGCAGCAAACCCACCAAACCCTGCGT
TCATGTCCATGATGTTACGGTACCTCCCAGTATCAATCAAACTATTGATCCTCTTGTAAG
CCTTCACATGCTTCTTCCACTGTCTGTTATCATCCTCATACGCATCAGCCGTGACACCAG
AGACCGAACCACTAGA

QA 1 796 1 796
DS 

RD RS1FJ39TF 793 0 0
TGTCTTCCGCATA
CACTTGTTCTTGTAAAGACTGAAGAGATGGT*CGCATGGATTAAGTCATATGTTCTCGGG
TATGTCGAGAAAGCCTCGCACCAGTCATGGTAGATACCAATGAGTC*TCGTTCATACACA
ACTCCAAGCCTATTCTTCTCAGCAATGGTTGGAACGACATTCATAACCCAAAGCTTCTGT
GACTCCAAAGCAGCAGCAAACCCACCAAACCCTGCGTTCATGTCCATGATGTTACGGTAC
CTCCCAGTATCAATCAAACTATTGATCCTCTTGTAAGCCTTCACATGCTTCTTCCACTGT
CTGTTATCATCCTCATACGCATCAGCCGTGACGCCAGAGACCGAACCGCTAGAGATCCTA
GGCGGCACCGCGTTGAGCCTATCAGGGAAAACCTGAAGCTCTCCTCCAGCCACTTCGTCA
GAGCTGCTCGTCTCGGGATAAGGCGTAATGCACGCCTCCATTTTCTTGTACCACACGTCA
TCGGTGTCATCAGTGGTTTTGCAGAAGTTGGCTCTAGGGTCGTCTTGTCTTGAGCGGCAC
GCCTCGTCGTTGACTCTCTTCTGCCAGATGGCGATCTCGCCGTGTTCGTACTTCTTGTTT
TGTTGTCGGACTTGATCGCCATGGTTTTGATAGATTTAGAAATGAATCTGGGGAGATCTG
CTGGTGGCTACAATTGGCTAATCAGATGTAAGAGTTGCTGAGATTGATTGATGAAACGTG
GAAGATAGCTTGTGGAGAGAACACTAGTTTATGTGAATCATCTTGTTTGCCATGGGATCC

QA 14 793 14 793
DS 



AS 1 4

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GAAGGAGATAGAGACGAAGAGACAGATCAATCATGATCCTTGCGGTGTTATTCGCTAATT
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GGCGATCTTTCTTGGTTAAGTTGGGAGCAGAGAATCTCAAAGGTGTTAAGAACGAGGAGC
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TCTTCCTTGTTGGTAAAGACGAGTACGATGAACTTGCTTTGGCAGAAGCCATCTTTATCA
TAACAGGGGCTGTGAAAGACATATGCGGGAAACCTCCTACAGAGCGAGTGTTTCTGGACA
AATACGGAAGGATTTGTTTGTGTCTTGATGAAATCGTTTGGAACGGACTTCTCGAGAACA
CCGACAAAGATAGGATCAAGCGTCTCATTAGATTGAAACCTCCTTCTGAGTTTTGATTCC
CTCTCTCCAACTCCAAACCACACACCCTTGCAATATGTTTTTTCAACACTTATCAATCTG
AATCACTTCTCTCTATCAAGTATTGTACTGTTAACTACTGCTGTTCTTCGTTCAGACATT
GGAAGCAATTTTAGTGTGGCAATGTTTATTG


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 5 5 5 5 20 20 20 20 5 5 5 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BD89TF U 1
AF RS1D558TF U 1
AF RS1AQ30TFB U 12
AF RS1CM48JQ C 115
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GAAGGAGATAGAGACGAAGAGACAGATCAATCATGATCCTTGCGGTGTTATTCGCTAATT
CCGTAGGGAACGTTTTAATCGAAAGGTTCAATGGAGTTCCAGCTGAGGAACGGCTCACCT
GGCGATCTTTCTTGGTTAAGTTGGGAGCAGAGAATCTCAAAGGTGTTAAGGACGAGGAGC
TTCTCGTTGCTTGCCACAAGTCGGTTTATATCGTGTACACAATGCTAGGGGATGTTAGCA
TCTTCCTTGTTGGTAAAGACGAGTACGATGAACTTGCTTTGGCAGAAGCCATCTTTATCA
TAACAGGGGCTGTGAAAGACATATGCGGGAAACCTCCTACAGAGCGAGTGTTTCTGGACA
AATACGGAAGGATTTGTTTGTGTCTTGATGAAATCGTTTGGAACGGACTTCTCGAGAACA
CCGACAAAGATAGGATCAAGCGTCTCATTAGATTGAAACCTCCTTCTGAGTTTTGATTCC
CTCTCTCCAAC

QA 1 551 1 551
DS 

RD RS1D558TF 680 0 0
GG
AAAGAGAGATCAAATCAAAGAGAAGCGAATGGTTTGAGAGGTTAGATAATAAGTAGAAGA
AGGAGATAGAGACGAAGAGACAGATCAATCATGATCCTTGCGGTGTTATTCGCTAATTCC
GTAGGGAACGTTTTAATCGAAAGGTTCAATGGAGTTCCAGCTGAGGAACGGCTCACCTGG
CGATCTTTCTTGGTTAAGTTGGGAGCAGAGAATCTCAAAGGTGTTAAGAACGAGGAGCTT
CTCGTTGCTTGCCACAAGTCGGTTTATATCGTGTACACAATGCTAGGGGATGTTAGCATC
TTCCTTGTTGGTAAAGACGAGTACGATGAACTTGCTTTGGCAGAAGCCATCTTTATCATA
ACAGGGGCTGTGAAAGACATATGCGGGAAACCTCCTACAGAGCGAGTGTTTCTGGACAAA
TACGGAAGGATTTGTTTGTGTCTTGATGAAATCGTTTGGAACGGACTTCTCGAGAACACC
GACAAAGATAGGATCAAGCGTCTCATTAGATTGAAACCTCCTTCTGAGTTTTGATTCCCT
CTCTCCAACTCCAAACCACACACCCTTGCAATATGTTTTTTCAACACTTATCAATCTGAA
TCACTTCTCCCTATCAAGTATTGTACTGTTAACTACTGCTGTTCTTCGTTCAGACATTGG
AAGCAATTTTAGT
GTGGC

QA 3 675 3 675
DS 

RD RS1AQ30TFB 668 0 0
G
CAAATCAAAGAGAAGCGAATGGTTTGAGAGGTTAGATAATAAGTAGAAGAAGGACCAAGA
GA****GAGATCAAAAAATCATGATCCTTGCAGTGTTGTTCGCTAATTCCGTAGGGAACG
TTTTAATCGAAAGGTTCAATGGAGTGCCAGCTGAGGAACGGCTCACCTGGCGATCTTTCT
TGGTTAAGTTGGGAGCAGAGAATCTCAAAGGTGTTAAGAGTGAGGAGCTTCTCGTTGCTT
GCCACAAGTCGGTTTATATCGTGTACACAATGCTAGGGGATGTTAGCATCTTCCTTGTTG
GTAAAGACGAGTACGATGAACTTGCTTTGGCAGAAGCCATCTTTATCATAACAGGGGCTG
TGAAAGACATATGCGGGAAACCTCCTACAGAGCGAGTGTTTCTGGACAAATACGGAAGGA
TTTGTCTGTGTCTTGATGAAATCGTTTGGAACGGACTTCTCGAGAACACCGACAAAGATA
GGATCAAGCGTCTCATTAGATTGAAACCTCCTTCTGAGTTTTGATTCCCTCTCTCCAACT
CCAAACCACACACCCTTGCAATATGTTTTTTCAACACTTATCAATCTGAATCACTTCTCT
CTATCAAGTATTGTACTGTTAACTACTGCTGTTCTTCGTTCAGACATTGGAAGCAATTTT
AGT
TTGG

QA 2 664 2 664
DS 

RD RS1CM48JQ 577 0 0
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TCACCTGGCGATCTTTCTTGGTTAAGTTGGGAGCAGAGAATCTCAAAGGTGTTAAGAACG
AGGAGCTTCTCGTTTCTTGCCACAAGTCGGTTTATATCGTGTACACAATGCTAGGGGATG
TTAGCATCTTCCTTGTTGGTAAAGACGAGTACGATGAACTTGCTTTGGCAGAAGCCATCT
TTATCATAACAGGGGCTGTGAAAGACATATGCGGGAAACCTCCTACAGAGCGAGTGTTTC
TGGACAAATACGGAAGGATTTGTTTGTGTCTTGATGAAATCGTTTGGAACGGACTTCTCG
AGAACACCGACAAAGATAGGATCAAGCGTCTCATTAGATTGAAACCTCCTTCTGAGTTTT
GATTCCCTCTCTCCAACTCCAAACCACACACCCTTGCAATATGTTTTTTCAACACTTATC
AATTTGAATCACTTCTCTCTATCAAGTATTGTACTGTTAACTACTGCTGTTCTTCGTTCA
GACATTGGAAGCAATTTTAGTGTGGCAATGTTTATTG

QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 5

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GGATCAAGATCCTGATCCAATTACGATGGGATCAACGTTCCGTGATCGCACGGCGGAGTT
TCGTTCGCTCTCCCAGACGCTGAAGAAGATCGGAGCGATCCCGTCTTCCGTCCATCAAGC
CGAAAGTGATCCAACAACATCCTCCACCAAACGGTCGCCGCCGGGGGGATCTTCAAGATC
CGAGTTCAACAAGAAGGCTTCCCAGATCGGTCTGCGTATCCACGAGACGTCTCAGAAGAC
CGCGAGGCTCGCTAAATTGGGGAAAGAATCGTCGATTTTCAATGACCGGACTTTGGAGAT
ACAGGAGCTAACCGTATTGATCAGGAACGACATCACGGGGCTCAACATGGCTCTCTCTGA
TCTGCAGACACTTCAGAACATGGAGATCGCTGATGGGAGCTATTCCCATGACAAAGTCGG
TCACTACACAGCTGTTTGCGATGACTTGAAAACCAGGCTCATGGGAGCTACAAAGCAATT
TCAGGACGTTCTAACCGCGAGATCAGAGAACATGAAGGCTCATGAAAACAGGAAACAGCT
CTTCTCCGCGAAAAACGCAGCAGTGGATAATAATCAGAATAATGCAAAAGCTGTACCTGA
GCCTCCTCCTTGGTCTAGCTCATCAGTTCCTTCCGGGAATTTACAACAACAGCCACTGTT
GCCGCCAGTAAATAGTGGAGCTCCTTCAGGCAGCCAGCTTAGACGCAGATCTGCTATCGA
GAATCCACCATCGCAACAAATGGAGATGTCTATGTTACAGCAGACAGTCCCGAGGCAGGA
GAATTATAGCCAAAACAGAGCTGTTGCGCTTCACAGCGTGGAATCAACGATAACAGAGCT
GAGTGGGATATTCACACATCTAGCTACCATGGTCACTCAACAGGGAGAGCTAGCTATCAG
AATCGATGATAATATGGATGAATCGTTAGTTAATGTAGAGGGAGCACGCAGCGCTCTTCT
ACAGCATCTCACTCGAATTTCATCGAATAGATGGCTCATGATCAAGATTTTCGTTGTTAT
CATATTGTTCCTCATTGTTTTCCTATTCTTCGTGGCTTGAAACAATACCTTTATATCTTG
TTGCATCACATCCACAGCTAAAAGCATCTATACGCATGTTAAGCTTGCAATTGCAAGCTT
CAAAAGTTCAAAAGTTTTTTTTCCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 5 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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CGAGTTCAACAAGAAGGCTTCCCAGATCGGTCTGCGTATCCACGAGACGTCTCAGAAGAC
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DS 

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G
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ACAACATCCTCCACCAAACGGTCGCCGCCGGG***ATCTTCGAGATCCGAGTTCAACAAG
AAGGCTTCTCAGATCGGTCTGCGTATCCACGAGACGTCTCAGAAGACCGCTAGGCTCGCT
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CAGAACATGGAGATCGCTGATGGGAGCTATTCCCATGACAAAGTCGGTCACTACACAGCT
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TCTAGCTCATCAGTTCCTTCCGGGAATTTACAACAACAGCCACTGTTGCCGCCAGTAAAT
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CAGCAAATGGAGATGTCTATGTTACAGCAGACAGTCCCGAG
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CACCATCGCAACAAATGGAGATGTCTATGTTACAGCAGACAGTCCCGAG*CAG*AGA*TT
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DS 

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TTGAAACAATACCTTTATATCTTGTTGCATCACATCCACAGCTAAAAGCATCTATACGCA
TGTTAAGCTTGCAATTGCAAGCTTCAGAAGT
CC

QA 1 751 1 751
DS 

RD RS1AA88JQ 628 0 0
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AGCCTCCTCCTTGGTCTAGCTCATCAGTTCCTTCCGGGAATTTACAACAACAGCCACTGT
TGCCGCCAGTAAATAGTGGAGCTCCTTCAGGCAGCCAGCTTAGACGCAGATCTGCTATCG
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AGAATTATAGCCAAAACAGAGCTGTTGCGCTTCACAGCGTGGAATCAACGATAACAGAGC
TGAGTGGGATATTCACACATCTAGCTACCATGGTCACTCAACAGGGAGAGCTAGCTATCA
GAATCGATGATAATATGGATGAATCGTTAGTTAATGTAGAGGGAGCACGCAGCGCTCTTC
TGCAGCATCTCACTCGAATTTCATCGAATAGATGGCTCATGATCAAGATTTTCGTTGTTA
TCATATTGTTCCTCATTGTTTTCCTATTCTTCGTGGCTTGAAACAATACCTTTATATCTT
GTTGCATCACATCCACAGCTAAAAGCATCTATACGCATGTTAAGCTTGCAATTGCAAGCT
TCAAAAGTTCAAAAGTTTTTTTTCCTAC

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 4

CO CL1858Contig1 1281 4 44 U
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AGCAGGTACTACACTAGAGGGGAGTTTAAACGAAAAACAGTGTGCATATTTGCCTCATAA
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ATCTTTGCACTATCCCGAGTAATCTTAGCCAGTGGAGGCTCATCCTCTTTCTTCCTGTGA
AGACTGGCCGGTATTCCTCCAAACCGGGAGTGCGCCAGCTGACTCTCTGCTTGCTCAAGC
TTCTCAGCCAAGTCTGATATCTGTCCAGCAACATAGTCTCCATTGCCCAGTAGCGGGGAA
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GATGACTTGAAATAAGTGATGTCCAACGAATAGTACTGCTTGCAATGAACACCAAAGTCC
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CCCTCCGGATAAGTCCTGAACGCCCCAATCTCAACCTTACCAGCCGAAACAGTCCTCGTC
GGATCAATCACAACAGCCAAGAAAGGCTCCTGATACTGCTGGTTAAGCATCTGCGTTGAG
ACATCGATACCCGAGAGCCAGCATCCATACCCAGGGTGTGAGTGATACCATCCCACAACA
TTCTCCAATCTCCCAGCCAGCTTGTTGGTCTGAGAGTACTCAACCATGTACTCATAAGCA
TCAGCCTGAGCATTAACCCTAGTCTCGGTTCCTTCGACAGGCAAGGCGAAAGCGTCCGTC
ACGATGATGGTATCGCCATCGGTCTTCCCCTGCATAAGACCCATGATCTCAATCGTCCCG
CCGGAGCGCGCGTGGACGACCATCTTGAGGAGCGCGAGTGCCGAGATCTGGACGCGCTTG
AAGTAGTTGGGGTAGGAGGTCCAAGGCTTCTCCTGCTGGACCTTGGTCTGAGAAGCTTCG
TCGTAGTAGAATATTCCGTCGGAGGAGGATGAATCGGGTTGGTCCACGGTGAGGATGTTG
TTCTCGAGCTCCCATGTCTTGCGAGCGATGGTCGAAGAATCGTCCATTGTTTGGTGATTT
TGATCAAATCGCGAGAATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GO03JQ U 1
AF RS1D786JQ U 8
AF RS1B521JQ U 91
AF RS1B521TF C 495
BS 1 31 RS1GO03JQ
BS 32 32 RS1D786JQ
BS 33 95 RS1GO03JQ
BS 96 96 RS1D786JQ
BS 97 179 RS1GO03JQ
BS 180 180 RS1D786JQ
BS 181 224 RS1GO03JQ
BS 225 225 RS1D786JQ
BS 226 242 RS1GO03JQ
BS 243 243 RS1D786JQ
BS 244 320 RS1GO03JQ
BS 321 321 RS1D786JQ
BS 322 327 RS1GO03JQ
BS 328 328 RS1D786JQ
BS 329 335 RS1GO03JQ
BS 336 524 RS1D786JQ
BS 525 525 RS1B521JQ
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BS 781 787 RS1B521JQ
BS 788 788 RS1D786JQ
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BS 792 795 RS1D786JQ
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BS 798 799 RS1D786JQ
BS 800 801 RS1B521JQ
BS 802 804 RS1D786JQ
BS 805 807 RS1B521JQ
BS 808 808 RS1D786JQ
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BS 811 811 RS1D786JQ
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BS 815 815 RS1B521JQ
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BS 817 818 RS1B521JQ
BS 819 820 RS1D786JQ
BS 821 823 RS1B521JQ
BS 824 825 RS1D786JQ
BS 826 913 RS1B521JQ
BS 914 914 RS1B521TF
BS 915 931 RS1B521JQ
BS 932 1281 RS1B521TF

RD RS1GO03JQ 335 0 0
GGCTGATGCTTGTCATGTTAATGTCATTTAATGAAAGCTCATCCCAAAGAACTTGTCTAA
AGCAGGTACTACACTAGAGGGGAGTTTAAACGAAAGACAGTGTGCATATTTGCCTCATAA
ACCGGGTAAAAGCAAAGTCAATTTGCACTTGCGTAAGACAAAACAAAAGAACAACTTCAA
GATGTAATCATCGGCTCTGGTTCTGACGGGTCGCTGGGAGTTTTGTCGGACTGGCGTGCT
GAGTTGAACAATATGTCTTTGATAACCTGTGACATTAATCCATGGACCTGCTCAACAGTT
ATCTTTGCACTATCCCGAGTTATCTTAACCAGTGG

QA 1 335 1 335
DS 

RD RS1D786JQ 824 0 0
GCTTGTCATGTTAATGTCATTTAAAGAAAGCTCATCCCAAAGAACTTGTCTAAAGCAGGT
ACTACACTAGAGGGGAGTTTAAACGAAAAACAGTGTGCATATTTGCCTCATAAACCGGGT
AAAAGCAAAGTCAATTTGCACTTGCGTAAGACAAAACAAAAGAACAACTTCACGATGTAA
TCATCGGCTCTGGTTCTGACGGGTCGCTGGGAGTTTTCTCGGACTGGCGTGCTGAATTGA
ACAATATGTCTTTGATAACCTGTGACATTAATCCATGGACCTGCTCAACAGTTATCTTTG
CACTATCCCGAGTAATCTTAGCCAGTGGAGGCTCATCCTCTTTCTTCCTGTGAAGACTGG
CCGGTATTCCTCCAAACCGGGAGTGCGCCAGCTGACTCTCTGCTTGCTCAAGCTTCTCAG
CCAAGTCTGATATCTGTCCAGCAACATAGTCTCCATTGCCCAGTAGCGGGGAAGAAGAGA
GAGTGTTCACCCAGTACTTGTTCCAAAGGAGATCCAGGAGGTGGCTATCAAGAGATGACT
TGAAATAAGTGATGTCCAACGAATAGTACTGCTTGCAATGAACACCAAAGTCCTCAATCT
TGTTCAAAGGGATAGTCTGATACTCAGAAACATGATCATCAGAGATCTTATGCCCCTCCG
GATAAGTCCTGAACGCCCCAATCTCAACCTTACCAGCCGAAACAGTCCTCGTCGGATCAA
TCACAACAGCCAAGAAAGGCTCCTGATACTGCTGGTTAAGCATCTGCGTTGAGGATGTTG
TTCTCGAGCTCC**CATGTCTTGCGAGCGA*TGGTCGA
GATCGT

QA 1 818 1 818
DS 

RD RS1B521JQ 849 0 0
CGAAAAACAGTGTGCATATTTGCCTCATAAACCGGGTAAAAGCAAAGTCAATTTGCACTT
GCGTAAGACAAAACAAAAGAACAACTTCACGATGTAATCATCGGCTCTGGTTCTGACGGG
TCGCTGGGAGTTTTCTCGGACTGGCGTGCTGAATTGAACAATATGTCTTTGATAACCTGT
GACATTAATCCATGGACCTGCTCAACAGTTATCTTTGCACTATCCCGAGTAATCTTAGCC
AGTGGAGGCTCATCCTCTTTCTTCCTGTGAAGACTGGCCGGTATTCCTCCAAACCGGGAG
TGCGCCAGCTGACTCTCTGCTTGCTCAAGCTTCTCAGCCAAGTCTGATATCTGTCCAGCA
ACATAGTCTCCATTGCCCAGTAGCGGGGAAGAAGAGAGAGTGTTCACCCAGTACTTGTTC
CAAAGGAGATCCAGAAGGTGGCTATCAAGAGATGACTTGAAATAAGTGATGTCCAACGAA
TAGTACTGCTTGCAATGAACACCAAAGTCCTCAATCTTGTTCAAAGGGATAGTCTGATAC
TCAGAAACATGATCATCAGAGATCTTATGCCCCTCCGGATAAGTCCTGAACGCCCCAATC
TCAACCTTACCAGCCGAAACAGTCCTCGTCGGATCAATCACAACAGCCAAGAAAGGCTCC
TGATACTGCTGGTTAAGCATCTGCGTTGAGACATCGATACCCGAGAGCCAGCATCCATAC
CCAGGGTGTGAGTGATACCATCCCACAACATTCTCCAATCTCCCAGCCAGCTTGTTGGTC
TGAGAGTACTCAACCATGTACTCATAAGCATCAGCCTGAGCAT*AACCCTAGTCTCGGTT
C
TTCGACAG

QA 1 841 1 841
DS 

RD RS1B521TF 787 0 0
CACCCAGTACTTGT*CCAAAG*AGATCCAGAAGGTGGCTATCAAGAGATGACTTGAAATA
AGTGATGTCCAACGAATAGTACTGCTTGCAATGAACACCAAAGTCCTCAATCTTGTTCAA
AGGGATAGTCTGATACTCAGAAACATGATCATCAGAGATCTTATGCCCCTCCGGATAAGT
CCTGAACGCCCCAATCTCAACCTTACCAGCCGAAACAGTCCTCGTCGGATCAATCACAAC
AGCCAAGAAAGGCTCCTGATACTGCTGGTTAAGCATCTGCGTTGAGACATCGATACCCGA
GAGCCAGCATCCATACCCAGGGTGTGAGTGATACCATCCCACAACATTCTCCAATCTCCC
AGCCAGCTTGTTGGTCTGAGAGTACTCAACCATGTACTCATAAGCATCAGCCTGAGCATT
AACCCTAGTCTCGGTTCCTTCGACAGGCAAGGCGAAAGCGTCCGTCACGATGATGGTATC
GCCATCGGTCTTCCCCTGCATAAGACCCATGATCTCAATCGTCCCGCCGGAGCGCGCGTG
GACGACCATCTTGAGGAGCGCGAGTGCCGAGATCTGGACGCGCTTGAAGTAGTTGGGGTA
GGAGGTCCAAGGCTTCTCCTGCTGGACCTTGGTCTGAGAAGCTTCGTCGTAGTAGAATAT
TCCGTCGGAGGAGGATGAATCGGGTTGGTCCACGGTGAGGATGTTGTTCTCGAGCTCCCA
TGTCTTGCGAGCGATGGTCGAAGAATCGTCCATTGTTTGGTGATTTTGATCAAATCGCGA
GAATCCC

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

CO CL1859Contig1 746 2 16 U
GGGATACTCATGATCTCATTCTTTTCTTTCCTAGTATCCATGGCCAAATCTTCAACTCTC
CTCCTCTTTCTCTCTGTTTTCATCTCCATCACTACAGAACCCGCCTTGGCTCAAACATGT
TCTAACTACAGATTCACCAGCAACAGTCTCTTTGAGTCTTGTAACGACCTTCCTGTTCTT
GACTCCTTTATCTACTACACCTATGATTCTTCTTCCGGAAATTTCCAAATGGCTTATCGC
CACACAAACCTCTCCCCGGGGAAATGGGTGGCATGGGCCGTAAACCCCACATCCACCGGC
ATGGTTGGAGCTCAAGCCATTGTAGCTTACCCACAATCAGACGGAACCGTCAGGGCTTAC
ACTTCACCTATCGACAGCTACCAGACGAGTCTCCAAGAAGGTGAACTGAGCTTCAACGTC
TCACAGTTATCTGCCACTTACCAAAACAACGAGATGATCATCTTCGCAACTCTGAGTCTT
CCACTTGCAAACGGTGGAAACATTAATATTGTGTGGCAAGATGGGTCTCTTTCAGGGAAC
ACTCTTCTGCCTCATCCAACTTCTGGCAACAACATCCGCTCTGTTGCCACTATGAATCTA
AACTCCGGTACATCTGCATCCGCCTCAGGAGGAGGAGCCGGAGACTCCAAGCTTAGAAAA
CGCAACATTCATGGGGTCTTGAACGCAGTGAGCTGGGGAATAATGATGCCATAGAGCAAT
CATTGCTAGATATTTGAGAGTATCCA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DE33TF U 1
AF RS1BG25TF U 2
BS 1 53 RS1DE33TF
BS 54 54 RS1BG25TF
BS 55 55 RS1DE33TF
BS 56 56 RS1BG25TF
BS 57 85 RS1DE33TF
BS 86 86 RS1BG25TF
BS 87 137 RS1DE33TF
BS 138 138 RS1BG25TF
BS 139 341 RS1DE33TF
BS 342 342 RS1BG25TF
BS 343 410 RS1DE33TF
BS 411 411 RS1BG25TF
BS 412 423 RS1DE33TF
BS 424 424 RS1BG25TF
BS 425 708 RS1DE33TF
BS 709 746 RS1BG25TF

RD RS1DE33TF 708 0 0
GGGATACTCATGATCTCATTCTTTTCTTTCCTAGTATCCATGGCCAAATCTTCGATTCTC
CTCCTCTTTCTCTCTGTTTTCATCTTCATCACTACAGAACCCGCCTTGGCTCAAACATGT
TCTAACTACAGATTCAC*AGCAACAGTCTCTTTGAGTCTTGTAACGACCTTCCTGTTCTT
GACTCCTTTATCTACTACACCTATGATTCTTCTTCCGGAAATTTCCAAATGGCTTATCGC
CACACAAACCTCTCCCCGGGGAAATGGGTGGCATGGGCCGTAAACCCCACATCCACCGGC
ATGGTTGGAGCTCAAGCCATTGTAGCTTACCCACAATCAGATGGAACCGTCAGGGCTTAC
ACTTCACCTATCGACAGCTACCAGACGAGTCTCCAAGAAGGTGAACTGAGTTTCAACGTC
TCAGAGTTATCTGCCACTTACCAAAACAACGAGATGATCATCTTCGCAACTCTGAGTCTT
CCACTTGCAAACGGTGGAAACATTAATATTGTGTGGCAAGATGGGTCTCTTTCAGGGAAC
ACTCTTCTGCCTCATCCAACTTCTGGCAACAACATCCGCTCTGTTGCCACTATGAATCTA
AACTCCGGTACATCTGCATCCGCCTCAGGAGGAGGAGCCGGAGACTCCAAGCTTAGAAAA
CGCAACATTCATGGGGTCTTGAACGCAGTGAGCTGGGGAATAATGATG

QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1BG25TF 745 0 0
GGATACTCATGATCTCATTCTTTTCTTTCCTAGTATCCATGGCCAAATCTTCAACTCTCC
TCCTCTTTCTCTCTGTTTTCATCTCCATCACTACAGAACCCGCCTTGGCTCAAACATGTT
CTAACTACAGATTCTCCAGCAACAGTCTCTTTGAGTCTTGTAACGACCTTCCTGTTCTTG
ACTCCTTTATCTACTACACCTATGATTCTTCTTCTGGAAATTTCCAAATGGCTTATCGCC
ACACAAACCTCTCCCCGGGGAAATGGGTGGCATGGGCCGTGAACCCCACATCCACCGGCA
TGGTTGGAGCTCAAGCCATTGTGGCTTATCCACAATCAGACGGAACCGTTAGGGCTTACA
CTTCACCTATCGACAGCTACCAGACGAGTCTCCAAGAAGGTGAACTGAGCTTCAACGTCT
CGCAGTTATCTGCCACTTACCAAAACAACGAGATGATCATCTTCGCAACTCTGAGTCTTC
CACTTGCAAACGGTGGAAACATTAATATTGTGTGGCAAGATGGGTCTCTTTCAGGGAACA
CTCTTCTGCCTCATCCAACTTCTGGCAATAACATCCGCTCTGTTGCCACTATGAATCTAA
ACTCTGGTACATCTGCATCGGCCTCAG*AGGAGGAGCCGGAGACTCCAAGCTTAGAAA*C
GCAACATTCATGGGGTCTTGA*CGCAGTGAGCTGGGGAATAATGATGCCATAGAGCAATC
ATTGCTAGATATTTGAGAGTATCCA

QA 1 745 1 745
DS 



AS 2 4

CO CL1860Contig1 710 2 6 U
GGGCGGCGTAGGCATTAAATTTGTTTCCGTCAATCGATATCGAGATCCAACCAAATCTGC
TTCTCTCTCAGCTTGTTGAATTTGCTTACTATGGGAGACGCTAGGGACAACGAAGCTTAT
GAGGAGGAGCTCCTAGACTATGAGGAAGAGGACGAGAAGGTTTTAGATTCTGGATCTAAA
GTTAACGGCGATGCCGTTAAGAAAGGTTACGTGGGAATACACAGTTCAGGATTCAGAGAC
TTCCTTTTGAAGCCGGAGCTTCTCCGTGCTATTGTTGACTCTGGATTTGAACATCCATCT
GAAGTGCAACATGAACGTATCCCTCAAGCTATCTTGGGCATGGATGTTATCTGCCAAGCA
AAGTCCGGTATGGGGAAGACTGCTGTTTTTGTGCTTTCCACTCTACAACAGATCGAGCCT
ACTCCTGGTCAGGTGTCTGCACTTATCCTGTGCCACACAAGAGAGTTAGCTTACCAGATC
TGCAATGAGTTCGTGAGATTCAGTACCTACCTGCCTGATACGAAGGTTTCAGTGTTCTAT
GGAGGAGTCAACAACAAGATTCACAAAGAATTGCTGAAGAATGAATGTCCTCACATTGTT
GTTGGTACACCTGGTCGGGTTCTTGGACTTGCCAGGGACAAAGATCTCTCTTTGAAGATG
TGAGCATTTTATTCTTGACGAGTGTGATAAAATGCTCGAGTCTCTAGACA


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1CV54TF U 1
AF RS1BJ15TF U 3
BS 1 315 RS1CV54TF
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ACTCCTGGTCAGGTGTCTGCACTT

QA 1 444 1 444
DS 

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GG
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QA 3 708 3 708
DS 



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BQ
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AF RS1FB16JQ C 1
AF RS1EM74TF U 476
BS 1 476 RS1FB16JQ
BS 477 770 RS1EM74TF
BS 771 771 RS1FB16JQ
BS 772 817 RS1EM74TF

RD RS1FB16JQ 815 0 0
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GCTGATACATACCTTCACAGGGTTGGAAGAGCTGGTAGGTTTGGAACAAAGGGTCTTGCA
ATAACATTTGTGGCGTCAGCTTCAGACTCGGAAGTTCTTAATCAGGTACAAGCTAGGTTC
GAGGTTGATATAAAGCAACTTCCTGAGAATATTGATACTTCTACCTACATGCCGTCCTAA
AGTGACAAACAAGCTGCGTTGTGTATTTTGTTTTTTAGACTGTTTGTAACCCTTTAAAAA
GGAAAGAGAGCTTTCTAGGCATTACCCCTATCATCTGAAATTCTTAATATTTCTCTAGAA
GCGAATATGATACTTTATGTTGTCAGATTATTCAGGCATTGATTTTTTTTTCTTTCTTCG
TCTTTCGTGGAGTTTATAATGAATGAAACTACC
CC

QA 1 813 1 813
DS 

RD RS1EM74TF 342 0 0
G
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CTAAAGTGACAAACAAGCTGCGTTGTGTATTTTGTTTTTTAGACTGTTTGTAACCCTTTA
AAAAGGAAAGAGAGCTTTCTAGGCATTACCCCTATCATCTGAAATTCTTAATATTTCTCT
AGAAGCGAATATGATACTTTATGTTGTCAGATTATTCAGGCATTGATTTTTTTT*CTTTC
TTCGTCTTTCGTGGAGTTTATAATGAATGAAACTACCTCTT

QA 2 342 2 342
DS 



AS 1 5

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CTTGACCAAAATGTCGAGCAAGATGTTCTGGTACTGAAAAGGAATCTGTTAAAGTACATT
AACGTAAAAGAATTTGCGGCTGAAGCCGAATTTTTTGACCCTGGGCCCTCCTTTATCTTG
CCTAATGTGGCTTGCAGCAACTGTGACGCCTACAGAGACCTAGATATAGGCAGAGACCCA
GCTCTATTAACAGAGAAAGAATGGTGCTGCGTAGATTCACAATGTGGGAAGATATATGAC
AGAGAGCAGATGGAGAATAGTCTTCTCCAGATGGTGAGACAGAGAGAAAGAATGTACCAC
ATGCAGGATCTAGTTTGCACGAGGTGCAATCAGGTGAAAGCGGCTCATTTGACAGAGCAG
TGTGAGTGTTCTGGATCCTTTAGATGCAAGGAGAGCGGGTCTGAGTTCCGCAAGAGGATG
GAGATTTTCTTGGATATAGCAAAGCGCCAGAAGTTTCAACTGTTGGAAGAATGCACATCT
TGGATTATAGATCCCACCGGAAGCTGGCAAACCAATACCGGAAGACATCATTCATAGGTT
ATAGATTTTTGCATAGATTTATTGACACCCTAAACGACTCAAAATGAGAATGTGGGCTAC
AAGTATTGTTATAATTGCATTTGTTAGCAAGCAACAGACTCATTACAGACGTAACTAGCG
ATCTTGGCTTGGCTCATTATTTTTCTTAAAAAGTATGTGACAACATAATTAATTCGATAA
GTATTATATTGGATATACCC


BQ
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1G062TF U 1
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AF RS1AE17TF U 119
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AF RS1C834TF U 316
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A

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RD RS1AE17TF 570 0 0
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TGGATTATAGATCCCACCGGAAGCTGGCAAACCAATACCGGAAGACATCATTCATAGGTT
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AAGTATTGTTATAATTGCATTTGTTAGC

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G
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G
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ACCC

QA 2 485 2 485
DS 



AS 1 5

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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AR66JQ U 1
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AF RS1ER02JQ U 25
AF RS1AF74JQ U 1
AF RS1AF74TF C 194
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ACC

QA 1 458 1 458
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G
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QA 2 816 2 816
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RD RS1AF74JQ 884 0 0
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QA 1 884 1 884
DS 

RD RS1AF74TF 676 0 0
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GTCAATGCTCAATCCCAGCTTCAACATCCTGTGGATTCTGCTCCCAAAAGTGTTTGGCTC
GTCTAGGCTGAAACCTGAAGTCAGAAGGGCAGTCTCGAACAGGAGGAGGACAAGATCTTT
CACAGACTTGTCATTCTTGTCGGCTTCAGCTCTCTTCCTCAGCTCGTCCATGATAGCATT
CTCTGGGTTGATCTCCATTGTCTTCTTGGAAGACATGTAACCAGCCATGCTGCTGTCTCT
CAAGGCCTGCGCTTTCATGATCCTCTCCATGTTTGCGGTCCAGCCGTATTCACCTGTTAC
CAGACAGCATGGTGAGTCCACAACACGGTCAGAGACAATGACCTTCTCGACCTTGTCTCC
GAGAACATCCTTGATCACTTTGCAGAGTCCTTCGAACTTCTCCTTGAGCTCCTCCTTTTT
CTTCTTCTCGTCCTCTGACTCACCCAGTTTCAGACCTTCCTTGGTTGCAGACACGAGCTT
CTTTCCCTCGAATTCCTTGGG*CTGGCCAATGGCGTACTCATCGATAGCATCAACCATGT
AGAGAACTTCATACCCTTTCTTCTTGAGCTTCTCGAGGAATGGAGAGTTCTCCACAGCCT
TCTTGCTCTCACCGGT

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 4

CO CL1863Contig1 940 4 4 U
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TCTCCAACAACTGTGGAATGCTTCACTACACATCTGGTGGCCAGTTCACTATCCCCGTTG
TCATCCATGGTCCCGGTGGAGTGGGACGCCAGCTTGGCGCTGAGCATTCCCAGCGGCTAG
AGTCTTACTTCCAGTCCATTCCTGGGATCCAGATGGTTGCTTGCTCGACTCCTTACAACG
CCAAAGGCTTGATGAAAGCTGCGATCAGGAGCGAGAACCCTGTGATTCTGTTTGAGCACG
TTCTGCTTTACAACCTCAAGGAGAAAATCCCGGATGAAGAGTACATATGTAACCTTGAAG
AAGCTGAGATGGTCAGACCTGGAGAGCACATCACCATCCTCACTTACTCCCGGATGAGGT
ACCATGTGATGCAGGCAGCTAAAACTCTGGTGAACAAAGGGTATGACCCTGAGGTTATCG
ACATCAGGTCGCTGAAACCGTTTGATCTTCACACGATCGGGAACTCGGTTAAAAACGCAC
CGGGTTTTGATCGTGGAGGAGTGTATGAGAACCGGTGGGATTGGAGCTAGTCTTACTGCT
GCAATTAATGAGAACTTTCATGACTATTTAGATGCTCCGGTGATGTGTTTGTCTTCTCAG
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GATCGTGACTGCTGTTGAGCAGCTTTGCCAGTGAAAATCGTATTTTATCC*GGTGAGCCA
TTGTTTACCATATTTACCTCTCCATTTACTTTCTCTTTAGCTTAGTTCGCAAGAACTTGT
CTGTTTGATTTTGTTAACGTTTTGTTGTCCCTTTTCTTGTGTTTTGAAGCTCATACTGTT
TCGTTTGTTAATCCATCTTTCACATTTTTATTTTTATCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A351TF U 145
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TTTACTTTCTCT

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DS 

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CTGTTTGATTTTGTTA
CGTTT

QA 1 856 1 856
DS 

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AGTGGGACGCCAGCTTGGCGCTGAGCATTCCCAGCGGCTAGAGTCTTACTTCCAGTCCAT
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TGCGATCAGGAGCGAGAACCCTGTGATTCTGTTTGAGCACGTTCTGCTTTACAACCTCAA
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TGGAGAGCACATCACCATCCTCACTTACTCCCGGATGAGGTACCATGTGATGCAGGCAGC
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CTGGTACACTGGAGGAGTGG*ACCGTTGTTCAACCGGCTCAGATCGTGACTGCTGTTGAG
CAGCTTTGCCAGTGAAAATCGTATTTTATCC*GGTGAGCCATTGTTTACCATATTTACCT
CTCCATTTACTTTCTCTTTAGCTTAGTTCGCAAGAACTTGTCTGTTTGATTTTGTTAACG
TTTTGTTGTCCCTTTTCTTGTGTTTTGAAGCTCATACTGTTTCGTTTGTTAATCCATCTT
TCACATTTTTATTTTTATCCT

QA 1 861 1 861
DS 

RD RS1A351TR 823 0 0
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ACGTTCTGCTTTACAACCTCAAGGAGAAAATCCCGGATGAAGAGTACATATGTAACCTTG
AAGAAGCTGAGATGGTCAGACCTGGAGAGCACATCACCATCCTCACTTACTCCCGGATGA
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GCTGCAATTAATGAGAACTTTCATGACTATTTAGATGCTCCGGTGATGTGTTTGTCTTCT
CAGGACGTTCCTACACCGTACGCTGGTACACTGGAGGAGTGG*ACCGTTGTTCAACCGGC
TCAGATCGTGACTGCTGTTGAGCAGCTTTGCCAGTGAAAATCGTATTTTATCC*GGTGAG
CCATTGTTTACCATATTTACCTCTCCATTTACTTTCTCTTTAGCTTAGTTCGCAAGAACT
TGTCTGTTTGATTTTGTTAACGTTTTGTTGTCCCTTTTCTTGTGTTTTGAAGCTCATACT
GTTTCGTTTGTTAATCCATCTTTCACATTTTTATTTTTATCCT

QA 1 823 1 823
DS 



AS 2 5

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ATCGCCTTCTTCGTCATCATCAACATCAGTCTTTTTGTTAAAGCTTCGAAAAGCGATGAC
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TGGAAAGTCACGAATCCAACACTCTCTCCTTCCCATCTCCAAGACTTGCCGGGTTATACA
AGAAGTGTATACAAACGAGATCATGCGTTGATAACACCTGAAAGTCATGTGTACAGCCCT
TTACCTGACTGGACAAACACATTAGGGGCGTATTTGATCACACCTGCAATGGGTTCCCAT
TTTGTCATGTACTTTGCGAAAATGAAAGAAATGTCAAGTTCGGGTTTACCTCCAAAAGAC
ATAGAGCGTCTTGTATTCGTTGTCGAGGGTGCTGTGACACTGACTAACACTTCCAGTTCC
TCAACAAAACTGACGGTTGATACATATGCATACCTACCTCCAAACTTTTATCATTCCCTG
GACTGTGCCGAGTCTGCAACACTTATTGTCTTTGAGCGGAGGTATGAACATCTAGGGAGT
CACACAACAGAGCTTATCGTTGGCTCCACAGACAAGCAACCACTACTTGAGACTCCCGGT
GAGGTTTTTGAGCTGCGGAAACTTCTTCCGGTCTCCCTTGCTTATGACTTCAACATCCAT
ATTATGGATTTTCAGCCTGGAGAGTTTCTCAATGTTAAGGAAGTTCATTATAACCAACAT
GGTTTGTTGCTTCTGGAAGGCCAAGGCATTTATCGCTTGGGTGATAACTGGTATTCAGTT
CAGGCTGGTGATGTCATATGGATGGCTCCTTTTGTTCCTCAGTGGTATGCTGCGCTTGGA
AAGACTAGGTCTCGGTATTTGTTGTACAAAGATGTGAATCGGAATCCCTTGTAATCAAAA
AGATCCAAATGACTTGATGTGAAGAGTTCTTTGTTCTAGAAGCCAGAATCTTGTTCTTTT
AGCTTTCAGTCATAAAAAAAAAGCCTCATGTGCCATTTCCATGTATCAGCAGCTACTTTT
GTTTGTACGAAGAAAACTAATTTGAAATGTCAGTTGCCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C183TF U 12
AF RS1BQ84TF U 1
AF RS1BQ84JQ C 307
BS 1 82 RS1BQ84TF
BS 83 83 RS1C183TF
BS 84 177 RS1BQ84TF
BS 178 178 RS1C183TF
BS 179 761 RS1BQ84TF
BS 762 762 RS1BQ84JQ
BS 763 789 RS1BQ84TF
BS 790 1121 RS1BQ84JQ

RD RS1C183TF 738 0 0
TGAATCGTTATTCCATTAATCCTCAGCGACAATGCGCTCACTTCACCTAATCGCCTTCTT
CGTCATCATCAACATCAGTCTTTTTGTTAAAGCTTCGAAAAGCGATGACGGGTTTTGTTC
AGCGCCTTCGATCACTGAATCAGACGAGGAGAAGCCGAAACCCATTGACTGGAAAGTCAC
GAATCCAACACTCTCTCCTTCCCATCTCCAAGACTTGCCGGGTTATACAAGAAGTGTATA
CAAACGAGATCATGCGTTGATAACACCTGAAAGTCATGTGTACAGCCCTTTACCTGACTG
GACA****CATTAGGGGCGTATTTGATCACACCTGCAATGGGTTCCCATTTTGTCATGTA
CTTTGCGAAAATGAAAGAAATGTCAAGTTCAGGTTTACCTCCAAAAGACATAGAGCGTCT
TGTATTCGTTGTCGAGGGTGCTGTGACACTGACTAACACTTCCAGTTCCTCAACAAAACT
GACGGTTGATACATATGCATACCTACCTCCAAACTTTTATCATTCCCTGGACTGTGCCGA
GTCTGCAACACTTATTGTCTTTGAGCGGAGGTATGAACATCTAGGGAGTCACACGACAGA
GCTTATCGTTGGCTCCACAGACAAGCGACCACTACTTGAGACTCCCGGTGAGGTTTTTGA
GCTGCGGAAACTTCTTCCGGTCTCCCTTGCTTATGACTTCAACATCCATATTATGGATTT
*CAGCCTGGAGAGTTTCT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1BQ84TF 795 0 0
GGACTGAAACCTGAATCGTTATTCCATTAATCCTCAGCGACAATGCGCTCACTTCACCTA
ATCGCCTTCTTCGTCATCATCAGCATCAGTCTTTTTGTTAAAGCTTCGAAAAGCGATGAC
GGGTTTTGTTCAGCGCCTTCGATCACTGAATCAGACGAGGAGAAGCCGAAACCCATTTAC
TGGAAAGTCACGAATCCAACACTCTCTCCTTCCCATCTCCAAGACTTGCCGGGTTATACA
AGAAGTGTATACAAACGAGATCATGCGTTGATAACACCTGAAAGTCATGTGTACAGCCCT
TTACCTGACTGGACAAACACATTAGGGGCGTATTTGATCACACCTGCAATGGGTTCCCAT
TTTGTCATGTACTTTGCGAAAATGAAAGAAATGTCAAGTTCGGGTTTACCTCCAAAAGAC
ATAGAGCGTCTTGTATTCGTTGTCGAGGGTGCTGTGACACTGACTAACACTTCCAGTTCC
TCAACAAAACTGACGGTTGATACATATGCATACCTACCTCCAAACTTTTATCATTCCCTG
GACTGTGCCGAGTCTGCAACACTTATTGTCTTTGAGCGGAGGTATGAACATCTAGGGAGT
CACACAACAGAGCTTATCGTTGGCTCCACAGACAAGCAACCACTACTTGAGACTCCCGGT
GAGGTTTTTGAGCTGCGGAAACTTCTTCCGGTCTCCCTTGCTTATGACTTCAACATCCAT
ATTATGGATTTTCAGCCTGGAGAGTTTCTCAATGTTAAGGA*GTTCATTATAACCAACAT
GGTTTGTTG
CTTCTG

QA 1 789 1 789
DS 

RD RS1BQ84JQ 815 0 0
GACTGGACAA
ACACATTAGGGGCGTATTTGATCACAC*TGCAATGGGTTCCCATTTTGTCATGTACTTTG
CGAAAATGAAAGAAATGTCAAGTTCGGGTTTACCTCCAAAAGACATAGAGCGTCTTGTAT
TCGTTGTCGAGGGTGCTGTGACACTGACTAACACTTCCAGTTCCTCAACAAAACTGACGG
TTGATACATATGCATACCTACCTCCAAACTTTTATCATTCCCTGGACTGTGCCGAGTCTG
CAACACTTATTGTCTTTGAGCGGAGGTATGAACATCTAGGGAGTCACACAACAGAGCTTA
TCGTTGGCTCCACAGACAAGCAACCACTACTTGAGACTCCCGGTGAGGTTTTTGAGCTGC
GGAAACTTCTTCCGGTCTCCCTTGCTTATGACTTCAACATCCATATTATGGATTTTCAGC
CTGGAGAGTTTCTCAATGTTAAGGAAGTTCATTATAACCAACATGGTTTGTTGCTTCTGG
AAGGCCAAGGCATTTATCGCTTGGGTGATAACTGGTATTCAGTTCAGGCTGGTGATGTCA
TATGGATGGCTCCTTTTGTTCCTCAGTGGTATGCTGCGCTTGGAAAGACTAGGTCTCGGT
ATTTGTTGTACAAAGATGTGAATCGGAATCCCTTGTAATCAAAAAGATCCAAATGACTTG
ATGTGAAGAGTTCTTTGTTCTAGAAGCCAGAATCTTGTTCTTTTAGCTTTCAGTCATAAA
AAAAAAGCCTCATGTGCCATTTCCATGTATCAGCAGCTACTTTTGTTTGTACGAAGAAAA
CTAATTTGAAATGTCAGTTGCCTCT

QA 11 815 11 815
DS 



CO CL1864Contig2 768 2 5 U
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TATGACTGAAAGCTAAAAGAACAAGATTCTGGCTTCTAGAACAAAGAACTCTTCACATCA
AGTCATTTGGATCTTTTTGATTACAAGAGATTCCGATTCACATCTTTGTACAACAAATAT
CGAGACCTAGTCTTTCCAAGCGCAGCATACCACTGAGGAACAAAAGGAGCCATCCATATG
ACATCACCAGCCTGAACTGGATACCAGTTATCTCCCAAGCGATAAATGCCTTGGCCTTCC
AAAAACAACAAACCATGTTGGTTATAATGAACTTCCTTAACATTGAAAAACTCTCCAGGC
TGAAAATCCATAATATGGATGTTGAAGTCATAAGCAAGGGAAACCGGAAGAAGTTTCCGC
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AGCTCTGTTGTGTGACTCCCTAGATGTTCATACCTCCGCTCAAAGACAACAAGTGTTGCA
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GTCAATTTTGTTGAGGAACTGGAGGAAGTGTTAGTCAGTGCCACAGCACCCTCGACCACG
AATACAAGACGCTCTATGTCTTTTGGAGATAAACCTGAACTTGACATTTCTTTCATTTTC
GCAAAGTACATGACAAAATGGGAACCCATTGCAGGTGTGATCAAATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E180JQ U 164
AF RS1E180TF C 1
BS 1 163 RS1E180TF
BS 164 245 RS1E180JQ
BS 246 246 RS1E180TF
BS 247 409 RS1E180JQ
BS 410 768 RS1E180TF

RD RS1E180JQ 249 0 0
CTTTGTACAACAAATATCGAGACCTAGTCTTTCCAAGCGCAGCATACCACTGAGGAACAA
AAGGAGCCATCCATATGACATCCCCAGCCTGAACTGGATACCAGTTATCTCCCAAGCGAT
AAATGCCTTGGCCTTCCAAAAACAACAAACCATGTTGGTTATAATGAACTTCCTTAACAT
TGAAAAACTCTCCAGGCTGAAAATCCATAATATGGATGTTGAAGTCATAAGCAAGGGAAA
CCGGAA
AAA

QA 1 246 1 246
DS 

RD RS1E180TF 768 0 0
GTTTTCTTCGTACAAACAAAAGTAGCTGCTGATACATGGAAATGGCACATGAGGCTTTTT
TATGACTGAAAGCTAAAAGAACAAGATTCTGGCTTCTAGAACAAAGAACTCTTCACATCA
AGTCATTTGGATCTTTTTGATTACAAGAGATTCCGATTCACATCTTTGTACAACAAATAT
CGAGACCTAGTCTTTCCAAGCGCAGCATACCACTGAGGAACAAAAGGAGCCATCCATATG
ACATCACCAGCCTGAACTGGATACCAGTTATCTCCCAAGCGATAAATGCCTTGGCCTTCC
AGAAGCAACAAACCATGTTGGTTATAATGAACTTCCTTAACATTGAGAAACTCTCCAGGC
TGAAAATCCATAATATGGATGTTGAAGTCATAAGCAAGGGAGACCGGAAGAAGTTTCCGC
AGCTCAAAAACTTCACCGGGAGTCTCAAGTAGTGGTTGCTTGTCTGTGGAGCCAACGATA
AGCTCTGTTGTGTGACTCCCTAGATGTTCATACCTCCGCTCAAAGACAACAAGTGTTGCA
GACTCTGCACAGTCCAAGGATTGATAGAAGTTTGGAGGTAGGTATGCATATGAATCAACC
GTCAATTTTGTTGAGGAACTGGAGGAAGTGTTAGTCAGTGCCACAGCACCCTCGACCACG
AATACAAGACGCTCTATGTCTTTTGGAGATAAACCTGAACTTGACATTTCTTTCATTTTC
GCAAAGTACATGACAAAATGGGAACCCATTGCAGGTGTGATCAAATAC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 5

CO CL1865Contig1 1245 5 30 U
GGACACAATTCACCAAAAACTTTAAAGTGTTTTAAGAGAGAAAAAGGATCAAAGAGACTC
ACGGAAATGGAAAATGCAGTAGCGAAACAGATCATCCCTCTCCTCACTCCCTACAAGATG
GGAAGATTCAATCTTTCCCACAGGGTTGTGCTGGCACCACTGACGAGACAGAGATCATAC
GGAAACGTTCCTCAGCCTCACGCTGTCTTGTACTACTCTCAGAGAACAAGCCCAGGAGGG
TTTCTTGTCACTGAAGCTACAGGAGTTTCAGACACAGCTCAAGGCTACCAAGATACTCCT
GGTATATGGACTAAAGAGCATGTGGAGGCATGGAAGCCTATTGTGGATGCTGTTCATGCC
AAAGGTGGTGTATTCTTCTGTCAAATCTGGCATGTTGGCCGTGTTTCTAACCGAGGTTTT
CAACCAAATGGGCAAGCTCCCATCTCTTGTTCAGACAAGCCATTGATGCCTCAAATCCGC
TCTAATGGCATCGATGAAGCCATGTTCACCCCTCCAAGACGGCTAAGTACTGAAGAAATC
CCCAGCATTGTCAACGACTTTAGGCTCGCAGCAAGAAACGCCATGGAAGCTGGCTTTGAT
GGAGTTGAGATTCATGGTGCTAATGGCTATCTGATAGACCAGTTCATGAAAGATACTGTG
AATGACAGAACAGATGAATACGGTGGATCATTACAAAACCGTTGCAAATTTGCTTTAGAC
ATAGTTGAAGCAGTGGCTAACGAGATAGGACCAGACCGTGTTGGCATCAGGCTCTCTCCC
TTTGCTGACTACATGGAGTCAGCAGACACTAACCCACAAGCGTTAGCCCTTCACATGGGT
GAATCTTTAAACAAATATGGTATCCTCTACTGTCATGTGATAGAGCCAAGAATGAAAACA
ATGGGAGAGATAACGGAGTGTCCTCACTTGCTAGTGCCGATGAGGAAAGCCTTTCAAGGG
ACTTTCATTTCAGCGGGAGGTTACACGAGGAAAGATGGGAATGAGGCAGTGGCAGAGGGA
CGGACCGATCTTGTGGCTTATGGTCGGTGGTTTCTAGCGAACCCTGATCTGCCTAAGAGG
CTTGAAGTGGATGCAGAGCTGAATAAATATGATAGGCCAACGTTTTACATTTCTGATCCT
GTCGTGGGTTATACGGATTACCCTTTTCTGGAATCAACAGCTTAGACATTGTCACTAAGC
ATGTTAATGTGTAATCCTCTTTCATATAATAAGTTTATCTGGCAT


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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TATGGACTAAAGAGCATGTGGAGGCATGGAAGCCTATTGTGGATGCTGTTCATGCCAAAG
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CAAATGGGCAAGCTCCCATCTCTTGTTCAGACAAGCCATTGGTGCCTCAAATCCGCTCTA
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TGTCACTAAGCATGTTAATGTGTAATCCTCTTTCATATAATAAGTTTATCTGGCAT

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DS 



AS 1 5

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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C122TF U 1
AF RS1CM80TF U 4
AF RS1E255TF U 30
AF RS1C122JQ C 96
AF RS1CM80JQ C 108
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RD RS1C122TF 642 0 0
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TAACAATGGCGAGAAGACCGGAAGAAGAATACGACTACTTGTTTAAAGTGGTTCTCATCG
GAGACTCCGGCGTCGGCAAGTCGAATCTCCTCTCTAGATTCACTCGCGACGAGTTCTGCT
TGGAATCCAAATCTACCATCGGTGTCGAATTCGCTACTCGCACTCTCCAAGTGGAAGGAA
GGACTGTGAAAGCGCAGATATGGGACACGGCTGCGCAAGAACGATACAGAGCCATAACCA
GCGCCTACTACAGAGGTGCCCATGGTGCTCTCTTGGTTTACGACGTCACTAAACCAACAA
CGTTTGAGAACGTTAGCCGGTGGTTGAAAGAGCTCAGAGACCATGCGGATTCCAACATCG
TCATCATGTTGATCGGAAACAAGACGGACCTGAAGCATCTCAGAGCTGTTGCCACGGAGG
ATGCTCAGAGCTTCGCCGAGAAAGAAGGCTTGTCTTTCATCGAGACGTCGGCTCTCGAGG
CGCTGAACGTGGAGAAGGCCTTTCAGACGATTCTCTCGGAGATTTACAGGATCATCAGCA
AGAAATCGATATCTTCGGACCAGGCAGATGCAAATGGTAACG

QA 1 642 1 642
DS 

RD RS1CM80TF 639 0 0
GG
GAAAATCCCAATCACGCTCTTCTCCAGAAAAAAAAAGAAAAAAAAGAAAGGGTTTTAACA
ATGGCGAGAAGACCGGAAGAAGAATACGACTACTTGTTTAAAGTGGTTCTCATCGGAGAC
TCCGGCGTCGGCAAGTCGAATCTCCTCTCTAGATTCACTCGCGACGAGTTCTGCTTGGAA
TCCAAATCTACCATCGGTGTCGAATTCGCTACTCGCACTCTCCAAGTGGAAGGAAGGACT
GTGAAAGCGCAGATATGGGACACGGCTGGGCAAGAACGATACAGAGCCATAACCAGCGCC
TACTACAGAGGTGCCCTTGGTGCTCTCTTGGTTTACGACGTCACTAAACCAACAACGTTT
GAGAACGTTGGCCGGTGGTTGAAAGAGCTCAGAGACCATGCGGATTCCAACATCGTCATC
ATGTTGATCGGAAACAAGACGGACCTGAAGCATCTCAGAGCTGTTGCCACGGAGGATGCT
CAGAGCTTCGCCGAGAAAGAAGGCTTGTCTTTCATCGAGACGTCGGCTCTCGAGGCGCTG
AACGTGGAGAAGGCCTTTCAGACGATTCTCTCGGAGATTTACAGGATCATCAGCAAGAAA
TCGATATCTTCGGACCAGGCAGATGCAAATGGTAACG

QA 3 639 3 639
DS 

RD RS1E255TF 735 0 0
GGA
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GACTACTTGTTTAAAGTGGTTCTCATCGGAGACTCCGGTGTCGGCAAGTCGAATCTCCTC
TCTAGATTCACTCGCGACGAGTTCTGCTTGGAATCCAAATCTACCATCGGTGTCGAATTC
GCTACTCGCACTCTCCAAGTGGAAGGAAGGACTGTGAAAGCGCAGATATGGGACACCGCT
GGGCAAGAACGATACAGAGCCATAACCAGCGCCTACTACAGAGGCGCGCTCGGTGCTCTC
TTGGTCTACGAAGTCACTAAACCAACAACGTTCGAGAACGTTAGCCGGTGGTTGAAAGAG
CTCAGAGACCATGCGGATTCCAACATCGTCATCATGTTGATCGGAAACAAGACGGATCTG
AAGCATCTCAGAGCTGTTGCCACGGAGGATGCTCAGAGCTTCGCCGAGAAAGAAGGCTTG
TCTTTCATCGAGACGTCGGCTCTCGAGGCGCTGAACGTGGAGAAGGCCTTTCAGACAATT
CTCTCGGAGATCTACAGGATCATCAGCAAGAAATCGATATCTTCGGACCAGGCAGATGCA
AATGGTAACGTCAGGGAAGGTCAAACAATCGATGTCGCTGCTGCCTCTTCTGAATCAAAC
ACTAAGAAGCCTTGTTGCTCTTCTTCCTGAAAGGGCTTATCACACTTCGAAGCCAATATC
TATGTATTTCCT

QA 4 735 4 735
DS 

RD RS1C122JQ 740 0 0
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AGATTCACTCGCGACGAGTTCTGCTTGGAATCCAAATCTACCATCGGTGTCGAATTCGCT
ACTCGCACTCTCCAAGTGGAAGGAAGGACTGTGAAAGCGCAGATATGGGACACGGCTGCG
CAAGAACGATACAGAGCCATAACCAGCGCCTACTACAGAGGTGCCCATGGTGCTCTCTTG
GTTTACGACGTCACTAAACCAACAACGTTTGAGAACGTTAGCCGGTGGTTGAAAGAGCTC
AGAGACCATGCGGATTCCAACATCGTCATCATGTTGATCGGAAACAAGACGGACCTGAAG
CATCTCAGAGCTGTTGCCACGGAGGATGCTCAGAGCTTCGCCGAGAAAGAAGGCTTGTCT
TTCATCGAGACGTCGGCTCTCGAGGCGCTGAACGTGGAGAAGGCCTTTCAGACGATTCTC
TCGGAGATTTACAGGATCATCAGCAAGAAATCGATATCTTCGGACCAGGCAGATGCAAAT
GGTAACGTCAGGGAAGGTCAAACAATCGATGTCGCTGCTGCCTCTTCTGAATCAAACACT
AAGAAGCCTTGTTGCTCTTCTTCCTGAAAGGGCTTATCACACTTCGAAGCCAATATCTAT
GTATTTCCTTTTTACGGCTTGCTTGCGTTGTGTAATATAACTCAAGGATCATTCCTATAT
GAATTGTGAAATTCAAATGC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RS1CM80JQ 744 0 0
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GACGAGTTCTGCTTGGAATCCAAATCTACCATCGGTGTCGAATTCGCTACTCGCACTCTC
CAAGTGGAAGGAAGGACTGTGAAAGCGCAGATATGGGACACGGCTGGGCAAGAACGATAC
AGAGCCATAACCAGCGCCTACTACAGAGGTGCCCTTGGTGCTCTCTTGGTTTACGACGTC
ACTAAACCAACAACGTTTGAGAACGTTGGCCGGTGGTTGAAAGAGCTCAGAGACCATGCG
GATTCCAACATCGTCATCATGTTGATCGGAAACAAGACGGACCTGAAGCATTTCAGAGCT
GTTGCCACGGAGGATGCTCAGAGCTTCGCCGAGAAAGAAGGCTTGTCTTTCATCGAGACG
TCGGCTCTCGAGGCGCTGAACGTGGAGAAGGCCTTTCAGACGATTCTCTCGGAGATTTAC
AGGATCATCAGCAAGAAATCGATATCTTCGGACCAGGCAGATGCAAATGGTAACGTCAGG
GAAGGTCAAACAATCGATGTCGCTGCTGCCTCTTTTGAATCAAACACTAAGAAGCCTTGT
TGCTCTTCTTCCTGAAAGGGCTTATCACACTTCGAAGCCAATATCTATGTATTTCCTTTT
TACGGCTTGCTTGCGTTGTGTAATATAACTCAAGGATCATTCCTATATGAATTGTGAAAT
TCAAATGCAAGTAATTGTTGTCCC

QA 1 744 1 744
DS 



AS 2 5

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GTACCAATAAAGGGGTTAGTTTCCATTCCCTGCGATGGTAGATAAAAGTCAAGTAATCAG
CCTCTGTCGTTCCCTGCTTCGAGCGGGGCGTCAGTACCCTGACTACAACATCAGGCAGTA
CGCTAAGCGAAGGACCTTGGATGGGTTCCGCATGAACAAGAATCTCACTGACCATTCTAA
GGTGGAGGAGGCTTATAATGAAGGTAAGGCGCAGCTGGAGGTTGTAGAGAGGGTGGTTAA
GGTTTACATGGCGTATCCTCCAAAGACCAAGAACATCATGGAACTCAAGCTTCAGTAGTT
TGATGTATGCTTGTCATTATTGTTATTGGTTCATGTTTCTTAGTTCTTTTCCAACTATGA
AACATTGCGTTGTTTGATTCTCATGTAATATTTATGTCTTGATGGCATCAGTACCCTTAT
TAAGTGAAGAGAGGATCAGAGAATAATCTTGGATTAGAGCAGAGATGAAGAGTGTTTTTT
GTTGATTGTCATTAATAATAAATGTCACACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RS1AT16TF U 1
AF RS1AT16JQ C 28
BS 1 566 RS1AT16TF
BS 567 571 RS1AT16JQ

RD RS1AT16TF 571 0 0
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GTACCAATAAAGGGGTTAGTTTCCATTCCCTGCGATGGTAGATAAAAGTCAAGTAATCAG
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CGCTAAGCGAAGGACCTTGGATGGGTTCCGCATGAACAAGAATCTCACTGACCATTCTAA
GGTGGAGGAGGCTTATAATGAAGGTAAGGCGCAGCTGGAGGTTGTAGAGAGGGTGGTTAA
GGTTTACATGGCGTATCCTCCAAAGACCAAGAACATCATGGAACTCAAGCTTCAGTAGTT
TGATGTATGCTTGTCATTATTGTTATTGGTTCATGTTTCTTAGTTCTTTTCCAACTATGA
AACATTGCGTTGTTTGATTCTCATGTAATATTTATGTCTTGATGGCATCAGTACCCTTAT
TAAGTGAAGAGAGGATCAGAGAATAATCTTGGATTAGAGCAGAGATGAAGAGTGTTTTTT
GTTGATTGTCATTAATAATAAATGTC
ACACC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RS1AT16JQ 544 0 0
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CCCTGCGATGGTAGATAAAAGTCAAGTAATCAGCCTCTGTCGTTCCCTGCTTCGAGCGGG
GCGTCAGTACCCTGACTACAACATCAGGCAGTACGCTAAGCGAAGGACCTTGGATGGGTT
CCGCATGAACAAGAATCTCACTGACCATTCTAAGGTGGAGGAGGCTTATAATGAAGGTAA
GGCGCAGCTGGAGGTTGTAGAGAGGGTGGTTAAGGTTTACATGGCGTATCCTCCAAAGAC
CAAGAACATCATGGAACTCAAGCTTCAGTAGTTTGATGTATGCTTGTCATTATTGTTATT
GGTTCATGTTTCTTAGTTCTTTTCCAACTATGAAACATTGCGTTGTTTGATTCTCATGTA
ATATTTATGTCTTGATGGCATCAGTACCCTTATTAAGTGAAGAGAGGATCAGAGAATAAT
CTTGGATTAGAGCAGAGATGAAGAGTGTTTTTTGTTGATTGTCATTAATAATAAATGTCA
CACC

QA 1 544 1 544
DS 



CO CL1867Contig2 645 3 2 U
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CCCATTTGTCGACGACGTGTGCACTTCGGCGTTTTCGTTTTGGCTTTGTACCAATAAAGG
GGTTAGTTTCCATTCCCTGCGATGGTCGATAAAAGTCAAGTGATCAGCCTCTGTCGTTCC
CTGCTTCGAGCGGGGCGTCAGTACCCTGACTACAACATCAGGCAGTACGCTAAGCGAAGG
ACCTTGGATGGGTTCCGCATGAACAAGAATCTCACCGACCATTCTAAGGTGGAGGAGGCT
TATAATGAAGGTAAGGCGCAGCTGGAGGTTGTAGAGAGGGTGGTTAAGGTTTACTTGGCG
TATCCTCCAAAGACCAAGAACATCATGGAACTCAAGCTTCAGTAGTTTGATGTATGTTTG
TCATTATTGTTATTGGTACATGTTTCTTAGTTCTTTCTCAACTATGAAACATTGCTTTGT
GCGATTCTCATGTTATCTTTGTGTCTTGATGGCATCGGTACCCTTTATTAAGTGAAGAGA
GGATCAGAGAATAATCTTGGATTAGAGCAGGGATAAAGAGTGTTTTTTTTGTTGATTATC
ATTAATAATAAATGTCCACTATTTTGCAGTTGCTGCATTTTAGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EJ70TF U 1
AF RS1EV44TF U 5
AF RS1EJ70JQ C 7
BS 1 373 RS1EJ70TF
BS 374 645 RS1EV44TF

RD RS1EJ70TF 373 0 0
GGAACTAACTAGGTTTATGTCAAACACAGAGAACCTCAACGCCAACGCCGAGCTCCTTCC
CCCATTTGTCGACGACGTGTGCACTTCGGCGTTTTCGTTTTGGCTTTGTACCAATAAAGG
GGTTAGTTTCCATTCCCTGCGATGGTCGATAAAAGTCAAGTGATCAGCCTCTGTCGTTCC
CTGCTTCGAGCGGGGCGTCAGTACCCTGACTACAACATCAGGCAGTACGCTAAGCGAAGG
ACCTTGGATGGGTTCCGCATGAACAAGAATCTCACCGACCATTCTAAGGTGGAGGAGGCT
TATAATGAAGGTAAGGCGCAGCTGGAGGTTGTAGAGAGGGTGGTTAAGGTTTACTTGGCG
TATCCTCCAAAGA

QA 1 373 1 373
DS 

RD RS1EV44TF 641 0 0
GG
AACTAGGTTTATGTCAAACACAGAGAACCTCAACGCCAACGCCGAGCTCCTTCCCCCATT
TGTCGACGACGTGTGCACTTCGGCGTTTTCGTTTTGGCTTTGTACCAATAAAGGGGTTAG
TTTCCATTCCCTGCGATGGTCGATAAAAGTCAAGTGATCAGCCTCTGTCGTTCCCTGCTT
CGAGCGGGGCGTCAGTACCCTGACTACAACATCAGGCAGTACGCTAAGCTAAGGACCTTG
GATGGGTTCCGCATGAACAAGAATCTCACCGACCATTCTAAGGTGGAGGAGGCTTATAAT
GAAGGTAAGGCGCAGCTGGAGGTTGTAGAGAGGGTGGTTAAGGTTTACTTGGCGTATCCT
CCAAAGACCAAGAACATCATGGAACTCAAGCTTCAGTAGTTTGATGTATGTTTGTCATTA
TTGTTATTGGTACATGTTTCTTAGTTCTTTCTCAACTATGAAACATTGCTTTGTGCGATT
CTCATGTTATCTTTGTGTCTTGATGGCATCGGTACCCTTTATTAAGTGAAGAGAGGATCA
GAGAATAATCTTGGATTAGAGCAGGGATAAAGAGTGTTTTTTTTGTTGATTATCATTAAT
AATAAATGTCCACTATTTTGCAGTTGCTGCATTTTAGTG

QA 3 641 3 641
DS 

RD RS1EJ70JQ 622 0 0
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AATAAATGTC
CCACTATTTTGC

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 5

CO CL1868Contig1 1265 5 22 U
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CAAAAGGAGGGAAAGTCTCATTAACGGACTAGCCAGCTTACATACACGTTAAAAATTATA
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GAAGGATCAAACTGTCCCGGATCCGAAAAGAAATCAGCATTGTGATGAATATTTCTGAAT
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TGAGCTAACTCCTTGCGAGCTTTCATGGCTTTGTGGAATAGTGTTCCCGGGAGATTAATC
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TCTTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 20 35 35 
20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1GG49JQ U 25
AF RS1A839JQ U 1
AF RS1CU24JQ U 1
AF RS1GG49TF C 281
AF RS1A839TF C 383
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RD RS1GG49JQ 420 0 0
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AAATTTAATTCTCTACATTTCATAAACCTAAACTAAAAATATTAAAATCACTGAAAACTA
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TTTT**ATTTCTTAGCCAATGAAGTAATTTTCTCACTCGAATGAAAAAAAATCTTCCACT
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TTCGCTCTAAGGCAATAGGCAATCCATTTTGAGGAAGAGCAAACGGTCCATACTGAATTC

QA 1 420 1 420
DS 

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GAATGGATCCCATTCCCAAATGGCATGAATGTATTTGGTTTCGGCGCAACTTCAAATCTT
GAAGGATCAAACTGTCCCGGATCCGAAAAGAAATCAGCATTGTGATGAATATTTCTGAAT
AGTGGCAGTACTTTCCATCCCTTTGGTATCAAGTATCCATCGTATTCAACATCTTCAACA
GCTTCTCTGAATGTGAAAGATAAGATTGTAGCAACTCTCATTGTCTCCTGGACAACT

QA 1 777 1 777
DS 

RD RS1CU24JQ 794 0 0
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CAAAAGGAGGGAAAGTCTCATTAACGGACTAGCCAGCTTACATACACGTTAAAAATTATA
TAACCTGTTTTCGTATTGCTCCCAAAATTTAATTCTCTACATTTCATAAACCTAAACTAA
AAATATTAAAATCACTGAAAACTATATACACTTGGGATCCCAATAGGGATTTTCCTTTCC
TATTCCCTTTTCATCTCTAATATTTTTTTTATTTCTTAGCCAATGAAGTAATTTTCTCAC
TCGAATGAAAAAGAATCTTCCACTTTCAAACTTTAGAAAGCTACGAAGGTGCTCTTGTAA
TTTTCTAAACGTCCACCTCTGGTTTTTGCTCTAAGGCAATAGGCAATCCATTTTGAGGAA
GAGCAAACGGTCCATACTGAATTCCATCGCTAGGTCCCATAATTGACCACCTGTACTTAG
TGGTGAGATGATGGATTAGAATAGAGATTTCAAGTTTAGCTA*CTCATTGCCCGG*ACAA
GAATGGATCCCATTCCCAAATGTCATGAATGTATTTGGTTTCGGCGCAACTTCAAATCTT
GAAGGATCAAACTTTCCCGGATCCGAAAAGAAATCAGCATTGTGATGAATATTTCTGAAT
AGTGGCAGTACTTTCCATCCCTTTGGTATCAAGTATCCATCGTATTCAACATCTTCAACA
GCTTCTCTGAATGTGAAAGATAAGATTGTAGCAACTCTCATTGTCTCCTGGACAACTCTA
GAAGTTAGTGTCAT

QA 1 794 1 794
DS 

RD RS1GG49TF 603 0 0
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CTACGAAGGTGCTCTTGTAATTTTCTAAACGTCCACCTCTGGTTTTCGCTCTAAGGCAAT
AGGCAATCCATTTTGAGGAAGAGCAAACGGTCCATACTGAATTCCATCGCTAGGTCCCAT
AATTGACCACCTGTACTTAGTGGTGAGATGATGGATTAGAATAGAGATTTCAAGTTTAGC
TAACTCATTGCCCGG*ACAAGAATGGATCCCATTCCCAAATGGCATGAATGTATTTGGTT
TCGGCGTAACTTCAAATCTTGAAGGATCAAACTTTCCCGGATCCGAAAAGAAATCAGCAT
TGTGATGAATGTTTCTGAATAGTGGCAGTACTTTCCATCCCTTTGGTATCAAGTATCCAT
CGTATTCAACATCTTCAACAGCTTCTCTGAATGTGAAAGATAAGATTGTAGCAACTCTCA
TTGTCTCCTGGACAACTCTAGAAGTTAGTGTCATCTTCTTTGTATCTTCCCAAGTGAGAC
TCTCTCCTTCTTTCTTCCCTTTCCTTATCGCCATTTGTTCTTCAGTGACAGCTTCTAGGA
CA
C

QA 1 602 1 602
DS 

RD RS1A839TF 883 0 0
GTTTT
GCTCTAAGGCAATAGGCAATCCATTT*GAG*AAGAGCAAACGGTCCATACTGAATTCCAT
CGCTAGGTCCCATAATTGACCAC*TGTACTTAGTGGTGAGATGATGGATTAGAATAGAGA
TTTCAAGTTTAGCTAACTCATTGCCCGGGACATGAATGGATCCCATTCCCAAATGGCATG
AATGTATTTGGTTTCGGCGCAACTTCAAATCTTGAAGGATCAAACTGTCCCGGATCCGAA
AAGAAATCAGCATTGTGATGAATATTTCTGAATAGTGGCAGTACTTTCCATCCCTTTGGT
ATCAAGTATCCATCGTATTCAACATCTTCAACAGCTTCTCTGAATGTGAAAGATAAGATT
GTAGCAACTCTCATTGTCTCCTGGACAACTCTAGAAGTTAGTGTCATCTTCTTTGTATCT
TCCCAAGTGAGACTCTCTCCTTCCTTCTTCCCTTTCCTTATCGCCATTTGTTCTTCAGTG
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TGTCTTCTTTTGGCTAAGATGTTAGCGAGGATCTGAGCTAACTCCTTGCGAGCTTTCATG
GCTTTGTGGAATAGTGTTCCCGGGAGATTAATCGGCATCGAGTTGTAACCTTTCTCAAGA
ATGTAGTAGCATCGTTTCAGATCTTCACGGTAAAGGACTGCGTCTTGTCCGAGTATTGAG
ATTAACGCCACGTTGAAAGTGTATGTTTTCATCTCTTC

QA 6 883 6 883
DS 



AS 1 5

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CTAATAGGAGTTTCTCTTATAAACGATTTATATATTTAATTTATTTGGAAAATAAAAAAT
AACAAATAATTATAATAGTATGGGGATGGCTAAAACTATTAAAGTTATTTTCTCTCTAGC
TTTTGTGGTGTTCTTGGCTTTTGCAGCAACCAATATTGAGGCAAGATACATAAGCTATTA
TGGCCTTCATAAAGGAGATCCCGAATTCGGTTGCAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAA
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CGCTCAAAAGTAGACCACCACTCTTGCTTAATTTTTAAATGCCATCCCCGTATTAATATC
AAATGATTAATTCCATGTGTTTGTTATTTATATTCTTTTATTGCTCATGTAACTGATTGT
TACCCTATTATTTATGATAATGAATAAAATAATTATATTTATGTT


BQ
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35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 10 

AF RS1CI51JQ C 1
AF RS1G775TF U 5
AF RS1CI51TF U 1
AF RS1FP68TF U 5
AF RS1CH42TF U 5
BS 1 6 RS1CI51JQ
BS 7 522 RS1G775TF
BS 523 524 RS1CI51TF
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RD RS1CI51JQ 525 0 0
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TTTTGTGGTGTTCTTGGCTTTTGCAGCAACCAATATTGAGGCAAGATACATAAGCTATTA
TGGCCTTCATAAAGGAGATCCCGAATTCGGTTGCAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAA
TAAGGTACCAGCCAATCCTTATAGAAGAGGTTGTGAGGCTAGCCAACGTTGCCGTGATAA
CGCTCAAAAGTAGACCACCACTCTTGCTTAATTTTTAAATGCCATCCCCGTATTAATATC
AAATGATTAATTCCATGTGTTTGTTATTTATATTCTTTTATTGCTCATGTAACTGATTGT
TACCCTATTATTTATGATAATGAATAAAATAATTATATTTATGT
T

QA 1 524 1 524
DS 

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GG
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GGAGTTTCTCTTATAAACGATTTATATATTTAATTTATTTGGAAAATAAAAAATAACAAA
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GGTGTTCTTGGCTTTTGCAGCAACCAATATTGAGGCAAGATACATAAGCTATTATGGCCT
TCATAAAGGAGATCCCGAATTCGGTTGCAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAATAAGGT
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ATTATTTATGATAATGAATAAAATAATTATATTTAT

QA 3 518 3 518
DS 

RD RS1CI51TF 525 0 0
GGAACC
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GGAGTTTCTCTTATAAACGATTTATATATTTAATTTATTTGGAAAATAAAAAATAACAAA
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GGTGTTCTTGGCTTTTGCAGCAACCAATATTGAGGCAAGATACATAAGCTATTATGGCCT
TCATAAAGGAGATCCCGAATTCGGTTGCAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAATAAGGT
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AAAGTAGACCACCACTCTTGCTTAATTTTTAAATGCCATCCCCGTATTAATATCAAATGA
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T

QA 7 524 7 524
DS 

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GGAGTTTCTCTTATAAACGATTTATATATTTAATTTATTTGGAAAATAAAAAATAACAAA
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GGTGTTCTTGGCTTTTGCAGCAACCAATATTGAGGCAAGATACATAAGCTATTATGGCCT
TCATAAAGGAGATCCCGAATTCGGTTGCAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAATAAGGT
ACCAGCCAATCCTTATAGAAGAGGTTGTGAGGCTAGCCAACGTTGCCGTGATAACGCTCA
AAAGTAGACCACCACTCTTGCTTAATTTTTAAATGCCATCCCCGTATTAATATCAAATGA
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GG
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TCATAAAGGAGATCCCGAATTCGGTTGCAGTAAACTACACCCTCAATTCTGCAATAAGAT
ACCAGCCAATCCTTATAGAAGAGGTTGTGAGGCTAGCCAACGTTGCCGTGATAACGCTCA
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QA 3 521 3 521
DS 



AS 1 2

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CTGCACCAGTGATTAAGAAATGGGTGAGGAACACTGATACAACTACGACGACAGCATGAG
AGCCACTATGGTCATACGTGGCATAGTAGGCTAAAGTTGCAACAATAAGAAGCAGGCTAC
AGATCACAATAAAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BO04JQ U 17
AF RS1AN31JQ U 1
BS 1 112 RS1AN31JQ
BS 113 116 RS1BO04JQ
BS 117 166 RS1AN31JQ
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BS 297 301 RS1AN31JQ
BS 302 302 RS1BO04JQ
BS 303 351 RS1AN31JQ
BS 352 352 RS1BO04JQ
BS 353 387 RS1AN31JQ
BS 388 388 RS1BO04JQ
BS 389 402 RS1AN31JQ
BS 403 403 RS1BO04JQ
BS 404 439 RS1AN31JQ
BS 440 440 RS1BO04JQ
BS 441 736 RS1AN31JQ

RD RS1BO04JQ 636 0 0
CAA
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AATAGGGGACAGGACAATCACGATGCCAATAGGGTAAAGGAAAAAGGTTGTTCGTTCCAA
AAATGGAAGCACGTCATATCCTAGGAAGTTAAAATAATGGTAATACGAAGCCCCGACCAT
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ATGGGTGAGGAACACTGATACAACTACGACGAC

QA 4 636 4 636
DS 

RD RS1AN31JQ 736 0 0
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TACTCTCTTCTTCCTTGGTGATGTATATGCAGTGCAAAGCCCTTGAGATTCCACTGATGT
GGCTTGTTCTGATTTATAATCTTTGGCTGAAGTACATGTTCATGAAATATCTTGAGGGGT
TGAATCCACTTAAGATCAAAATAGGGGACAGGACAATCACGATCCCAATAGGGTAGAGGA
AGAAGGTTGTTCGTTCCAAAAATGGAAGCACGTCATATCCTAGGAAGTTAAGATAATGGT
AATACGAAGCCCCGACCATGAAAAGCAGATTTGAAAGTAGTAGAGCGATGAATCCATGAG
TTATCAGGAGTGGTGATAAGAAATAGTGTACGACGTAAAGCAGCACAAACATTGGAAAGA
ACGAGTTGCAGTGAACATCAAACGTATACAGCCATTCAACACGTTGTTCCACCACATGAC
TGTTAGGAGCCTCCTCGCGAAGGTAAGAGTTCGTCAGAAACCAACAGCATGTAGCTATAA
CTGCACCAGTGATTAAGAAATGGGTGAGGAACACTGATACAACTACGACGACAGCATGAG
AGCCACTATGGTCATACGTGGCATAGTAGGCTAAAGTTGCAACAATAAGAAGCAGGCTAC
AGATCACAATAAAAGC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 3

CO CL1871Contig1 733 3 10 U
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TACGAGATTGCTTCTTTCCCTTCCAGGTTCCAGCCCAAGAACGGTGCAGACACTCGCGCC
ACCTACACCCTTAACCCCGACGGCACGGTGCACGTCTTGAACGAGACGTGGGACGGAGGC
AAGAGAGGTTTCATCCAAGGGTCGGCTTACAAAGCTGATCCTAAGAGCGACGAGGCTAAG
CTTAAAGTCAAGTTCTTTGTTCCTCCTTTCCTTCCCGTCATTCCCGTCACGGGGGATTAC
TGGGTGTTGTATGTTGATCCTGAGTACCAGCATGCTGTTATCGGACAGCCTTCAAAGAGT
TATCTTTGGATACTGAGCAGGACGGCGCATGTGGAGGAAGAGACGTATAAGCAGCTGGTG
GAGAAGGCGGTGGAGGAAGGGTATGATGTTAGCAAGCTTCATAGGACACCTCAGAGCGAC
ACACCACCTGAGTCCAACACTGCTCCTGACGACACCAAGGGTGTTTGGTGGATTAAATCT
ATCTTGGGCAAATAGATATTACATGAACGCTAAAAGGAGACTTGTTTCACTTCCTTTGTC
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ATTTTCAACATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GM23TF U 26
AF RS1BQ77TF U 1
AF RS1GM23JQ C 84
BS 1 53 RS1BQ77TF
BS 54 55 RS1GM23TF
BS 56 236 RS1BQ77TF
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BS 238 335 RS1BQ77TF
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BS 537 537 RS1GM23JQ
BS 538 551 RS1BQ77TF
BS 552 733 RS1GM23JQ

RD RS1GM23TF 504 0 0
G
GTAAAAGCAATAAGCAAAAAAAAAAAAAATGACGGAGAAGAAAGAGATGAACGTTGTGAA
AGGTCTCGACTTGGAGAGATACATGGGACGCTGGTACGAGATTGCTTCTTTCCCTTCCAG
GTTCCAGCCCAAGAACGGTGCAGACACTCGCGCCACCTACACCCTTAACCCCGACGGCAC
GGTGCACGTCTTGAACGAGACGTGGGACGGAGGCAAGAGAGGTTTCATCCAAGGGTCGGC
TTACAAAGCTGATCCTAAGAGCGACGAGGCTAAGCTTAAAGTCAAGTTCTTTGTTCCTCC
TTTCCTTCCCGTCATTCCCGTCACGGGGGATTACTGGGTGTTGTATGTTGATCCTGAGTA
CCAGCATGCTGTTATCGGACAGCCTTCAAAGAGTTATCTTTGGATACTGAGCAGGACGGC
GCATGTGGAGGAAGAGACGTATAAGCAGCTGGTGGAGAAGGCGGTGGAGGAAGGGTATGA
TGTTAGCAAGCTTCATAGGACAC

QA 2 504 2 504
DS 

RD RS1BQ77TF 551 0 0
GGACCAAACCTCAAAATATCTAAATCGTAAAAGCAATAAGCAAAAAAAAAAAA**TGACG
GAGAAGAAAGAGATGAACGTTGTGAAAGGTCTCGACTTGGAGAGATACATGGGACGCTGG
TACGAGATTGCTTCTTTCCCTTCCAGGTTCCAGCCCAAGAACGGTGCAGACACTCGCGCC
ACCTACACCCTTAACCCCGACGGCACGGTGCACGTCTTGAACGAGACGTGGGACGGGGGC
AAGAGAGGTTTCATCCAAGGGTCGGCTTACAAAGCTGATCCTAAGAGCGACGAGGCTAAG
CTTAAAGTCAAGTTCTTTGTTCCTCCTTTCCTTCCTGTCATTCCCGTCACGGGGGATTAC
TGGGTGTTGTATGTTGATCCTGAGTACCAGCATGCTGTTATCGGACAGCCTTCAAAGAGT
TATCTTTGGATACTGAGCAGGACGGCGCATGTGGAGGAAGAGACGTATAAGCAGCTGGTG
GAGAAGGCGGTGGAGGAAGGGTATGATGTTAGCAAGCTTCATAGGACACCTCAGAGTGAC
ACACCACCTGA

QA 1 551 1 551
DS 

RD RS1GM23JQ 650 0 0
GAAAGGTCTCGACTTGGAGAGATACATGGGACGCTGGTACGAGATTGCTTCTTTCCCTTC
CAGGTTCCAGCCCAAGAACGGTGCAGACACTCGCGCCACCTACACCCTTAACCCCGACGG
CACGGTGCACGTCTTGAACGAGACGTGGGACGGAGGCAAGAGAGGTTTCATCCAAGGGTC
GGCTTACAAAGCTGATCCTAAGAGCGACGAGGCTAAGCTTAAAGTCAAGTTCTTTGTTCC
TCCTTTCCTTCCCGTCATTCCCGTCACGGGGGATTACTGGGTGTTGTATGTTGATCCTGA
GTACCAGCATGCTGTTATCGGACAGCCTTCAAAGAGTTATCTTTGGATACTGAGCAGGAC
GGCGCATGTGGAGGAAGAGACGTATAAGCAGCTGGTGGAGAAGGCGGTGGAGGAAGGGTA
TGATGTTAGCAAGCTTCATAGGACACCTCAGAGCGACACACCACCTGAGTCCAACACTGC
TCCTGACGACACCAAGGGTGTTTGGTGGATTAAATCTATCTTGGGCAAATAGATATTACA
TGAACGCTAAAAGGAGACTTGTTTCACTTCCTTTGTCTGTGTAGTATATATACTACACCT
TTCGTTTAATTTAGTACTCATCGTTCTGCTTTTGTTTATTTTCAACATTT

QA 1 650 1 650
DS 



AS 2 5

CO CL1872Contig1 751 3 10 U
GGATGAAAACCATTAGCACCCAAAAGACAATAAAATCTCGACAAAAAAGGATGAGTTCAT
CATCCTTTTTACGAGTAATATTGCTCTTAGGTGCTATTAATCTTTTCGTAACAATATCAA
CAACCAAAGCTGCAACACTCGGTCAAGTATTTGAAATCTGTAGGAGTTTATGCCCGGGAT
GTGACTACGACTCGTTACAGTTCTTGTTCCGACACAACTTGGTCCGTGCCGCAAGATTCG
AACCTCCTTTGATATGGGATCAAACACTCGAGAACTACGCTCAAAACTGGGCTAATCAAA
GAAAGTCAGATTGTGCTTTGCGACATTCTTTCCAAGACGGAGAGTTTACTCTCGGCGAGA
ATATTTTCTGGGGATACGGCGCCAACTGGTCTCCTGCCGACGCGGTGGTCGCGTGGGCCA
GCGAGAAGAGGTTTTATCATTATGGCTCCAACTCGTGCGACTCTGGACAGATGTGTGGGC
ATTACACACAGCTCGTGTGGAAGAACACGAGGAGGATCGGGTGCGCACGTGTAGTGTGCG
ACAACGGTGGGATCTTCATGACTTGTAACTATGATCCTCCCGGTAACCGGCCAGAAACCC
TATTGATCGATCATTCATCTTATTTTTAGAAGTTCTTATGACTTTTTAAAGGAAGTTAGG
TGGATGTATTTTGTATTTTACCAGAAATAGAAGTGTTTGTGGGGTTTGTGATATTGAATA
CGTTTGTATCGCTATACATGATTTGTCACGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CV05TF U 1
AF RS1FT39TF U 13
AF RS1GR30TF U 14
BS 1 73 RS1CV05TF
BS 74 74 RS1FT39TF
BS 75 331 RS1CV05TF
BS 332 332 RS1FT39TF
BS 333 458 RS1CV05TF
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BS 460 638 RS1CV05TF
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BS 738 751 RS1FT39TF

RD RS1CV05TF 638 0 0
GGATGAAAACCATTAGCACCCAAAAGACAATAAAATCTCGACAAAAAAGGATGAGTTCAT
CATCCTTTTTACGGGTAATATTGCTCTTAGGTGCTATTAATCTTTTCGTAACAATATCAA
CAACCAAAGCTGCAACACTCGGTCAAGTATTTGAAATCTGTAGGAGTTTATGCCCGGGAT
GTGACTACGACTCGTTACAGTTCTTGTTCCGACACAACTTGGTCCGTGCCGCAAGATTCG
AACCTCCTTTGATATGGGATCAAACACTCGAGAACTACGCTCAAAACTGGGCTAATCAAA
GAAAGTCAGATTGTGCTTTGCGACATTCTTTTCAAGACGGAGAGTTTACTCTCGGCGAGA
ATATTTTCTGGGGATACGGCGCCAACTGGTCTCCTGCCGACGCGGTGGTCGCGTGGGCCA
GCGAGAAGAGGTTTTATCATTATGGCTCCAACTCGTGCTACTCTGGACAGATGTGTGGGC
ATTACACACAGCTCGTGTGGAAGAACACGAGGAGGATCGGGTGCGCACGTGTAGTGTGCG
ACAACGGTGGGATCTTCATGACTTGTAACTATGATCCTCCCGGTAACCGGCCAGAAACCC
TATTGATCGATCATTCATCTTATTTTTAGAAGTTCTTA

QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1FT39TF 739 0 0
GG
AGCACCCAAAAGACAATAAAATCTCGACAAAAAAGGATGAGTTCATCATCCTTTTTACGA
GTAATATTGCTCTTAGGTGCTATTAATCTTTTCGTAACAATATCAACAACCAAAGCTGCA
ACACTCGGTCAAGTATTTGAAATCTGTAGGAGTTTATGCCCGGGATGTGACTACGACTCG
TTACAGTTCTTGTTCCGACACAACTTGGTCCGTGCCGCAAGATTCGAACCTTCTTTGATA
TGGGATCAAACACTCGAGAACTACGCTCAAAACTGGGCTAATCAAAGAAAGTCAGATTGT
GCTTTGCGACATTCTTTCCAAGACGGAGAGTTTACTCTCGGCGAGAATATTTTCTGGGGA
TACGGCGCCAACTGGTCTCCTGCCGACGCGGTGGTCGCGTGGGCCAGCGAGAAGAGGTTT
TATCATTATGGCTCCAACTCGTGCGACTCTGGACAGATGTGTGGGCATTACACACAGCTC
GTGTGGAA**ACACGAGGAGGATCGGGTGCGCACGTGTAGTGTGCGACAACGGTGGGATC
TTCATGACTTGTAACTATGATCCTCCCGGTAACCGGCCAGAAACCCTATTGATCGATCAT
TCATCTTATTTTTAGAAGTTCTTATGACTTTTTAAAGGAAGTTAGGTGGATGTATTTTGT
ATTTTACCAGAAATAGAAGTGTTTGTGGGGTTTGTGATATTGAATACGTTTGTATCGCTA
TAGATGATTTGTCACGT

QA 3 739 3 739
DS 

RD RS1GR30TF 737 0 0
G
AGCACCCAAAAGACAATAAAATCTCGACAAAAAAGGATGAGTTCATCATCCTTTTTACGA
GTAATATTGCTCTTAGGTGCTATTAATCTTTTCGTAACAATATCAACAACCAAAGCTGCA
ACACTCGGTCAAGTATTTGAAATCTGTAGGAGTTTATGCCCGGGATGTGACTACGACTCG
TTACAGTTCTTGTTCCGACACAACTTGGTCCGTGCCGCAAGATTCGAACCTCCTTTGATA
TGGGATCAAACACTCGAGAACTACGCTCAAAACTGGGCTAATCAAAGAAAGTCAGATTGT
GCTTTGCGACATTCTTTCCAAGACGGAGAGTTTACTCTCGGCGAGAATATTTTCTGG**A
TACGGCGCCAACTGGTCTCCTGCTGACGCGGTGGTCGCGTGGGCCAGCGAGAAGAGGTTT
TATCATTATGGCTCCAACTCGTGCGACTCTGGACAGATGTGTGGGCATTACACACAGCTC
GTGTGGAAGAACACGAGGAGGATCGGGTGCGCACGTGTAGTGTGCGACAACGGTGGGATC
TCCATGACTTGTAACTATGATCCTCCCGGTAACCGGCCAGAAACCCTATTGACCGATCAT
TCATCTTATTTTTAGAAGTTCTTATGACTTTTTAAAGGAAGTTAGGTGGATGTATTTTGT
ATTTTACCAGAAATAGAAGTGTTTGTGGGGTTTGTGATATTGAATACGTTTGTATCGCTA
TACATGATTT
TGTCAC

QA 2 731 2 731
DS 



CO CL1872Contig2 767 2 12 U
CTCGCTCTATATTTAAACACCATACTTCTCATGAAAACCATTAGCACCCAAAAGACAATA
AAATCTCGACAAAAAAGGATGAGTTCATCATCCTTTTTACGAGTAATATTGCTCTTAGGT
GCTATTAATCTTTTCGTAACAATATCAACAACCAAAGCTGCAACACTCGGTCAAGTATTT
GAAATCTGTAGGAGTTTATGCCCGGGATGTGACTACGACTCGTTACAGTTCTTGTTCCGA
CACAACTTGGTCCGTGCCGCAAGATTCGAACCTCCTTTGATATGGGATCAAACACTCGAG
AACTACGCTCAAAACTGGGCTAATCAAAGAAAGTCAGATTGTGCTTTGCAACACTCTTTC
CAAGACGGAGAGTTTACTCTCGGCGAGAATATTTTCTGGGGATACGGAGCCAACTGGTCT
CCGGCTGACGCTGTGGTCGCGTGAGCCAGCGAGAAGAGGTTTTATCATTATGGCTCCAAC
TCGTGCGACGCTGGACAGATGTGTGGGCATTACACACAGCTCGTGTGGAAGAACACGAGG
AGGATTGGGTGCGCACGTGTAGTGTGCGACAACGGTGGGATCTTCATGACTTGTAACTAT
GATCCTCCCGGTAACTACATCGGCCAGAAACCCTATTGATCGATCATTCATCTTATTTTT
TAGAAGTTCTTATGACTTTTTAAAGGAAGTTAGATGGATGTATTTTGTATTTTACTAAAA
ATAGAAGTGTTTGTGGGGTTTGTGATATTGAATACGTTTGTATCGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DE64TF U 1
AF RS1DE64JQ C 55
BS 1 629 RS1DE64TF
BS 630 630 RS1DE64JQ
BS 631 680 RS1DE64TF
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BS 722 740 RS1DE64TF
BS 741 767 RS1DE64JQ

RD RS1DE64TF 748 0 0
CTCGCTCTATATTTAAACACCATACTTCTCATGAAAACCATTAGCACCCAAAAGACAATA
AAATCTCGACAAAAAAGGATGAGTTCATCATCCTTTTTACGAGTAATATTGCTCTTAGGT
GCTATTAATCTTTTCGTAACAATATCAACAACCAAAGCTGCAACACTCGGTCAAGTATTT
GAAATCTGTAGGAGTTTATGCCCGGGATGTGACTACGACTCGTTACAGTTCTTGTTCCGA
CACAACTTGGTCCGTGCCGCAAGATTCGAACCTCCTTTGATATGGGATCAAACACTCGAG
AACTACGCTCAAAACTGGGCTAATCAAAGAAAGTCAGATTGTGCTTTGCAACACTCTTTC
CAAGACGGAGAGTTTACTCTCGGCGAGAATATTTTCTGGGGATACGGAGCCAACTGGTCT
CCGGCTGACGCTGTGGTCGCGTGAGCCAGCGAGAAGAGGTTTTATCATTATGGCTCCAAC
TCGTGCGACGCTGGACAGATGTGTGGGCATTACACACAGCTCGTGTGGAAGAACACGAGG
AGGATTGGGTGCGCACGTGTAGTGTGCGACAACGGTGGGATCTTCATGACTTGTAACTAT
GATCCTCCCGGTAACTACATCGGCCAGAA*CCCTATTGATCGATCATTCATCTTATTTTT
TAGAAGTTCTTATGACTTTT*AAAGGAG**TAGATGGATGTATTTTGTATTT*ACTAAAA
*TAGAAGTGTTTGTGGGGTT
GTGATATT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RS1DE64JQ 713 0 0
ACAATAAAATCTCGACAAAAAAGGATGAGTTCATCATCCTTTTTACGAGTAATATTGCTC
TTAGGTGCTATTAATCTTTTCGTAACAATATCAACAACCAAAGCTGCAACACTCGGTCAA
GTATTTGAAATCTGTAGGAGTTTATGCCCGGGATGTGACTACGACTCGTTACAGTTCTTG
TTCCGACACAACTTGGTCCGTGCCGCAAGATTCGAACCTCCTTTGATATGGGATCAAACA
CTCGAGAACTACGCTCAAAACTGGGCTAATCAAAGAAAGTCAGATTGTGCTTTGCAACAC
TCTTTCCAAGACGGAGAGTTTACTCTCGGCGAGAATATTTTCTGGGGATACGGAGCCAAC
TGGTCTCCGGCTGACGCTGTGGTCGCGTGAGCCAGCGAGAAGAGGTTTTATCATTATGGC
TCCAACTCGTGCGACGCTGGACAGATGTGTGGGCATTACACACAGCTCGTGTGGAAGAAC
ACGAGGAGGATTGGGTGCGCACGTGTAGTGTGCGACAACGGTGGGATCTTCATGACTTGT
AACTATGATCCTCCCGGTAACTACATCGGCCAGAAACCCTATTGATCGATCATTCATCTT
ATTTTTTAGAAGTTCTTATGACTTTTTAAAGGAAGTTAGATGGATGTATTTTGTATTTTA
CTAAAAATAGAAGTGTTTGTGGGGTTTGTGATATTGAATACGTTTGTATCGCC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 4

CO CL1873Contig1 825 4 2 U
AGTCATATGATTTTTCATTCTTTGTCTTGTATCACATATGATTAGAAGAGTTATTACTCA
GCTCATAGTTTGGTTACATGTATGTTTAGGAGAAGTATATATTGTTCAAGATGAATCTAT
ATAGAGCTACACATTCCCATACTCTCACAAAAATTGTATTTTAACCAAAACCATATAATC
TAGTGGGGGGGGCAACTTCCCTAAATCCCCTCAGCAGCAGGTCCACCAACATCTGCATCT
CCAAGCCACGCCTTGAGACTCGCTTCTTTACCAGCCTTGAACTCCTCCAACTTTGCCGTC
TCCACCAAATGTTCACCTTTCACTCAAGACTCCTTCTTCCACATTCTGTGGCCATTTAAT
GCTGCTCGCTTTCTCCTTAGCCGACTTGAACACCGTCGTAAAATAGCCGCTGCTTTCACC
ATTCTCCTCCTGGCTATAATCAGAACCAGGCGTTGTTGTTAGAACCACCACCCTCCAGGA
GCTCTTGATGTCCCCTATCATCTCATCAGCAACAGACGACGAGCCACACTCTCTCATCGA
TCTCACCATGTCTATAGAATCATATCCAAGTCTTCCGAATGCTGCTGGATGTACTTGATC
ATCATCTCGGCTAAGCTCTCGTTCATCTCCGCAAAACCATCAACTTTAGAGAACTCATGC
ATCAGGAAACCCTAGATGAAGACGGAATTGGAATCCTCTGGGTCTCTCTTGATGTGTTCC
TTCCTTTTCCTCCTCTCATTCGATTCGAAAAGCCAATCTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTT
TTTTTGCCTCTTGACCTACCTCTCACGGTAATAAAGTGCAGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1EE08JQ U 30
AF RS1EV43JQ U 1
AF RS1EE08TF C 190
AF RS1EV43TF C 257
BS 1 745 RS1EV43JQ
BS 746 825 RS1EE08TF

RD RS1EE08JQ 524 0 0
TATCACATATGATTAGAAGAGTTATTACTCAGCTCATAGTTTGGTTACATGTATGTTTAG
GAGAAGTATATATTGTTCAAGATGAATCTATATAGAGCTACACATTCCCATACTCTCACA
AAAATTGTATTTTAACCAAAACCATATAATCTGGTGGGGGGGGCAACTTCCCTAAATCCC
CTCAGCAGCAGGTCCACCAACATCTGCATCTCCAAGCCACGCCTTGAGACTCGCTTCTTT
ACCAGCCTTGAACTCCTCCAACTTTGCCGTCTCCACCAAATGTTCACCTTTCACTCAAGA
CTCCTTCTTCCACATTCTGTGGCCATTTAATGCTGCTCGCTTTCTCCTTAGCCGACTTGA
ACACCGTCGTAAAATAGCCGCTGCTTTCACCATTCTCCTCCTGGCTATAATCAGAACCAG
GCGTTGTTGTTAGAACCACCACCCTCCAGGAGCTCTTGATGTCCCCTATCATCTCATCAG
CAACAGACGACGAGCCACACTCTCTCATCGATCTCACCATGTCT

QA 1 524 1 524
DS 

RD RS1EV43JQ 745 0 0
AGTCATATGATTTTTCATTCTTTGTCTTGTATCACATATGATTAGAAGAGTTATTACTCA
GCTCATAGTTTGGTTACATGTATGTTTAGGAGAAGTATATATTGTTCAAGATGAATCTAT
ATAGAGCTACACATTCCCATACTCTCACAAAAATTGTATTTTAACCAAAACCATATAATC
TAGTGGGGGGGGCAACTTCCCTAAATCCCCTCAGCAGCAGGTCCACCAACATCTGCATCT
CCAAGCCACGCCTTGAGACTCGCTTCTTTACCAGCCTTGAACTCCTCCAACTTTGCCGTC
TCCACCAAATGTTCACCTTTCACTCAAGACTCCTTCTTCCACATTCTGTGGCCATTTAAT
GCTGCTCGCTTTCTCCTTAGCCGACTTGAACACCGTCGTAAAATAGCCGCTGCTTTCACC
ATTCTCCTCCTGGCTATAATCAGAACCAGGCGTTGTTGTTAGAACCACCACCCTCCAGGA
GCTCTTGATGTCCCCTATCATCTCATCAGCAACAGACGACGAGCCACACTCTCTCATCGA
TCTCACCATGTCTATAGAATCATATCCAAGTCTTCCGAATGCTGCTGGATGTACTTGATC
ATCATCTCGGCTAAGCTCTCGTTCATCTCCGCAAAACCATCAACTTTAGAGAACTCATGC
ATCAGGAAACCCTAGATGAAGACGGAATTGGAATCCTCTGGGTCTCTCTTGATGTGTTCC
TTCCTTTTCCTCCTCTCATTCGATT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1EE08TF 636 0 0
GGGCAACTTCCCTAAATCCCCTCAGCAGCAGGTCCACCAACATCTGCATCTCCAAGCCAC
GCCTTGAGACTCGCTTCTTTACCAGCCTTGAACTCCTCCAACTTTGCCGTCTCCACCAAA
TGTTCACCTTTCACTCAAGACTCCTTCTTCCACATTCTGTGGCCATTTAATGCTGCTCGC
TTTCTCCTTAGCCGACTTGAACACCGTCGTAAAATAGCCGCTGCTTTCACCATTCTCCTC
CTGGCTATAATCAGAACCAGGCGTTGTTGTTAGAACCACCACCCTCCAGGAGCTCTTGAT
GTCCCCTATCATCTCATCAGCAACAGACGACGAGCCACACTCTCTCATCGATCTCACCAT
GTCTATAGAATCATATCCAAGTCTTCCGAATGCTGCTGGATGTACTTGATCATCATCTCG
GCTAAGCTCTCGTTCATCTCCGCAAAACCATCAACTTTAGAGAACTCATGCATCAGGAAA
CCCTAGATGAAGACGGAATTGGAATCCTCTGGGTCTCTCTTGATGTGTTCCTTCCTTTTC
CTCCTCTCATTCGATTCGAAAAGCCAATCTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTTTGCCT
CTTGACCTACCTCTCACGGTAATAAAGTGCAGACCC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RS1EV43TF 569 0 0
GACTCGCTTCTTTACCAGCCTTGAACTCCTCCAACTTTGCCGTCTCCACCAAATGTTCAC
CTTTCACTCAAGACTCCTTCTTCCACATTCTGTGGCCATTTAATGCTGCTCGCTTTCTCC
TTAGCCGACTTGAACACCGTCGTAAAATAGCCGCTGCTTTCACCATTCTCCTCCTGGCTA
TAATCAGAACCAGGCGTTGTTGTTAGAACCACCACCCTCCAGGAGCTCTTGATGTCCCCT
ATCATCTCATCAGCAACAGACGACGAGCCACACTCTCTCATCGATCTCACCATGTCTATA
GAATCATATCCAAGTCTTCCGAATGCTGCTGGATGTACTTGATCATCATCTCGGCTAAGC
TCTCGTTCATCTCCGCAAAACCATCAACTTTAGAGAACTCATGCATCAGGAAACCCTAGA
TGAAGACGGAATTGGAATCCTCTGGGTCTCTCTTGATGTGTTCCTTCCTTTTCCTCCTCT
CATTCGATTCGAAAAGCCAATCTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTTTGCCTCTTGACC
TACCTCTCACGGTAATAAAGTGCAGACCC

QA 1 569 1 569
DS 



AS 1 3

CO CL1874Contig1 1200 3 11 U
GAAGAGCGGTTTGGTCGCCTTGAAACTCGATTTCGCTGAAGTCGCGACCTTTGTCAAAGA
ACGCTTAGGCAAAGAGGTGGAGATGAGTGGATGCAAAGGACCCATCACAACTTTCATTGT
TGAGCCCTTTGTCCCTCACAATGAGGAGTTTTACCTCAACATTGTTTCGGATAGGCTTGG
CTGCAGCATTAGCTTTTCTGAGTGTGGAGGGATTGACACCGAGGAGAACTGGGACAAGGT
CAAGACCATCTCTGTGCCCACTGGTTCTTCCTTGACACCTGAGATATGCGCACCTCTTGT
TGCTACCCTTCCTCTTGAGATCAAAGGGGAACTTGAAGATTTTATTCAAGTTATTTTCAC
CCTTTTCCAAGATCTTGATTTCACTTTCTTGGAGATGAATCCTTTTGCACTGGTTGATGG
GAAGCCTTATCCTCTGGATATGAGGGGTGAGCTTGACGACACCGCTGCTTTCAAAAACTT
TAAGAAGTGGGGAGACATTGAATTCCCCATGCCATTTGGAAGAGTGATGAGCCCCACAGA
GAGCTTCATCCACGGTCTAGATGAGAAGACAAGCGCATCTTTGAAGTTCACTGTTCTGAA
TCCCAAGGGAAGGATTTGGACTATGGTCGCTGGAGGAGGTGCAAGTGTCATCTATGCCGA
TACGGTTGGAGATCTCGGGTATGCATCTGAGCCTGGAAACTATGCTGAATACAGTGGAGC
ACCAAAAGAAGACGAGGTTTTGCAGTACGCCAGAGTCGTCATTGATTGTGCTACAGCAAA
TCCGGATGGAAAAACCAGAGCACTAGTGATCGGAGGTGGAATTGCTAACTTCACCGATGT
TGCTGCTACCTTCAATGGCATTATCCGAGCTCTCAAGGAAAAGGAAGCAAAGCTGAAAGC
AGCAAGGATGCATATATATGTGAGGAGAGGAGGACCAAACTACCAAAAGGGACTTGCTAA
AATGAGATCCCTTGGAGATAAAATCGGTGTCCCAATCGAGGTGTATGGTCCTGAAGCAAC
AATGACAGGTATCTGCAAGGAGGCAATTGAGTACATCACAGCGGCTGCATAAAAGCCTTT
AACTCTACTGTGTTACTTCAAATGCTCTTTATGATTTGTGTTGAGTCTTATGGTTGGATT
ATATGTTTCACTTCTTAAGTTTCTTATTTGTATTCATAATAATCAACGAGGATCTTTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 0 20 20 20 
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G
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DS 



AS 1 4

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BQ
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TCAGGGATCCTCTGCTGTAACTGATCAAATGTTTCCACTGTCATACCACCAGGTCGTCCC
GAATGCCTCCTGTACAGCTTCTGGTTCCTCTTCTTTCCAGACACAGCAACTTTCTCAGCA
TTCACCACAATCACAAAGGCTCCCATGTCGACACTGGGAGTGTAGGAGGCAAGGTT

QA 1 536 1 536
DS 

RD RS1ES75TF 416 0 0
T
AACTGATCAAATGTTTCCACTGTCATACCACCAGGTCGTCCCGAATGCCTCCTGTACAGC
TTCTGGTTCCTCTTCTTTCCAGACACAGCAACTTTCTCAGCATTCACCACAATCACAAAG
GCTCCCATGTCGACACTGGGAGTGTAGGAGGCAAGGTTCTTCCCACGGATGTGATTAGCA
ATGGTGGATGCCAATCTACCGAGAATCTTGTCGGTTGCATCGACAACATACCAAGGCTTG
TCCGTGTTCACATGGTCTGAAGCCTTTGGATACCATGTTGTGTTCCAAATGTCAGGGCCG
TTTGCTTCTTCTTCGTCGAACATCCACCGTTGATTCGCCGGAACAAGGGAGGAAGTAGTA
GCAGTAGTACCCTGCTCCTCCGCTTCGCATTTCACCTGCAATCCCCTTTTCGTGT

QA 2 416 2 416
DS 

RD RS1A656JQ 643 0 0
GCAGAACAAGCGGCTTCTGCGCCTCGTGAGGATGCTCTGGGCCTTTGTACACCTTCAGGT
GATTGAACAGAGCTCTCCCAAGCCGTCCCTTTGGAAGCATTCCACGAACAGCATGCTCAA
TGATTCTTTCAGGGATCCTCTGCTGCAACTGATCAAATGTTTCCACTGTCATACCACCAG
GTCGTCCCGAATGCCTCCTGTACAGCTTCTGGTTCCTCTTCTTTCCAGACACAGCAACTT
TCTCAGCATTCACCACAATCACAAAGGCTCCCATGTCGACACTGGGAGTGTAGGAGGCAA
GGTTCTTCCCACGGATGTGGTTAGCAATGGTGGATGCCAATCTACCGAGAATCTTGTCTG
TTGCATCGACAACATACCAAGGCTTGTCCGTGTTCACATGGTCCGAAGCCTTTGGATACC
ATGTTGTGTTCCAAATGTCAGGGCCATTAGCTTCTTCTTCGTCGAACATCCACCGTTGAT
TCGCCGGAACA*GGGAGGAAGTAGTAGCAGTAGTACCCTGCTCCTCCGCTTCGCACTTCA
CCTGCAATCCCCTCTTCGTGTTCGCGTAAATGCCGACTCCCCACCGACGGTTTCGAGATA
GCAGCTAGAGAGA*GCCTAGAAACGGAGACCTTCTGT
ACCACC

QA 1 637 1 637
DS 

RD RS1A656TF 841 0 0
TAGTACAGATTATTCCCA
TGGTGTATCTATTTCTGCAGCTGTAT*CTCT*GTCC*TGATGGGCAGATCAAGCGGCT*C
TGCGCCTCGTGAGGATGCTCTGGGCCTTTGTACAC*TTCAGGTGATTGAACAGAGCTCTC
CCAAGCCGTCCCTTTGGAAGCATTCCACGAACAGCATGCTCAATGATTCTTTCAGGGATC
CTCTGCTGCAACTGATCAAATGTTTCCACTGTCATACCACCAGGTCGTCCCGAATGCCTC
CTGTACAGCTTCTGGTTCCTCTTCTTTCCAGACACAGCAACTTTCTCAGCATTCACCACA
ATCACAAAGGCTCCCATGTCGACACTGGGAGTGTAGGAGGCAAGGTTCTTCCCACGGATG
TGGTTAGCAATGGTGGATGCCAATCTACCGAGAATCTTGTCTGTTGCATCGACAACATAC
CAAGGCTTGTCCGTGTTCACATGGTCCGAAGCCTTTGGATACCATGTTGTGTTCCAAATG
TCAGGGCCATTAGCTTCTTCTTCGTCGAACATCCACCGTTGATTCGCCGGAACAAGGGAG
GAAGTAGTAGCAGTAGTACCCTGCTCCTCCGCTTCGCACTTCACCTGCAATCCCCTCTTC
GTGTTCGCGTAAATGCCGACTCGC*ACCGACGGTTTCGAGATAGCAGCTAGAGAGAAGCC
TAGAAACGGAGACCTTCTGTTACCACCAGAGGTTTTCACCGAAGGGAGTATAACTGTTGA
AGACGAACAGAGAACCGCCATGTTTGTTTGTGTTTCTCTCCTCTGCTGCTGTCTTTTGAT
TTCTCGGATAAGATTGGGTTCTTCAGTTAATAATAACAGTGGT

QA 19 841 19 841
DS 



AS 1 3

CO CL1876Contig1 1173 3 13 U
GGGTGGACCTACGAGGATGGAGAATGCGAAGATCGCTGTGATTCAGTTCCAGATCTCGCC
TCCCAAGACTGATATCGAGCAGAGTATTGTTGTCTCTGATTATACTCAGATGGATAGGAT
CTTGAAGGAAGAGAGGAACTACATCTTGGGGATGATTAAGAAGATCAAGGCGACTGGTTG
CAATGTGTTGCTGATCCAGAAGAGTATTTTGAGAGATGCCGTGACTGATCTGTCGCTTCA
CTATTTGGCTAAGGCGAAGATCATGGTGATTAAGGATGTGGAGAGGGATGAGATTGAGTT
CGTGACGAAGACGTTGAACTGCTTGCCGATTTCTAACATTGAGCATTTTAGGGCGGAGAA
GCTTGGTTTTGCTGATCTCGTTGAAGAAGCGTCGCTTGGAGATGGGAAGATTTTGAAGAT
CACTGGGATTAAAGACATGGGGAGAACCACATCTGTTCTCGTCCGTGGCTCTAACCAGCT
TGTTCTTGACGAAGCCGAGAGGAGTCTGCACGATGCGTTGTGTGTTGTCAGGTGTCTGGT
GAGCAAGAGGTTTTTGATTGCGGGAGGTGGTGCGCCGGAGATTGAGCTCTCGAGGCAGCT
AGGTGCTTGGGCTAAGGTGCTCCATGGGATGGAAGGTTACTGCGTGAAGTCTTTCGCTGA
AGCTCTGGAGGTTATTCCTTACACGCTGGCTGAGAATGCAGGTCTGAATCCTATTGCAAT
TGTGACTGAGCTCAGGAACAAGCATGCTCAAGGGGAAATCAACTCTGGGATCAATGTCAG
GAAAGGGCAGATCACTAATATCTTGGAGGAGAACGTGGTGCAGCCTCTGCTTGTGAGCAC
CAGCGCAATCACTCTCGCAACTGAATGCGTAAGGATGATTTTGAAGATTGATGACATCGT
TACGGTGAGGTAGTGGGGTAGTTTCATTCTAAACGGGTCATCAGTACACTCCTCTTTCTC
TATCTATCTAAGCTTTGTTTCCCTTTTGGTGTTTTGATGTGTTTTTTTTTTTTTTTTGCA
ATGGTTGAACTTAGAACCCTAGTTGCCTTTCATCATGTTCTATTGCATCTTTTTTTTGTC
AGCGTTTTATTGCAGCCTAGTGGTCTTCTTGTGGTTTGTGCTACTTTGTTTCTTTCTAGT
GACTTTAAATATCAAGATTTCTCGTTTTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C064TF U 1
AF RS1F616TF U 424
AF RS1F616JQ C 551
BS 1 450 RS1C064TF
BS 451 451 RS1F616TF
BS 452 535 RS1C064TF
BS 536 536 RS1F616TF
BS 537 633 RS1C064TF
BS 634 634 RS1F616TF
BS 635 641 RS1C064TF
BS 642 642 RS1F616TF
BS 643 701 RS1C064TF
BS 702 1076 RS1F616TF
BS 1077 1077 RS1F616JQ
BS 1078 1163 RS1F616TF
BS 1164 1173 RS1F616JQ

RD RS1C064TF 704 0 0
GGGTGGACCTACGAGGATGGAGAATGCGAAGATCGCTGTGATTCAGTTCCAGATCTCGCC
TCCCAAGACTGATATCGAGCAGAGTATTGTTGTCTCTGATTATACTCAGATGGATAGGAT
CTTGAAGGAAGAGAGGAACTACATCTTGGGGATGATTAAGAAGATCAAGGCGACTGGTTG
CAATGTGTTGCTGATCCAGAAGAGTATTTTGAGAGATGCCGTGACTGATCTGTCGCTTCA
CTATTTGGCTAAGGCGAAGATCATGGTGATTAAGGATGTGGAGAGGGATGAGATTGAGTT
CGTGACGAAGACGTTGAACTGCTTGCCGATTTCTAACATTGAGCATTTTAGGGCGGAGAA
GCTTGGTTTTGCTGATCTCGTTGAAGAAGCGTCGCTTGGAGATGGGAAGATTTTGAAGAT
CACTGGGATTAAAGACATGGGGAGAACCACCTCTGTTCTCGTCCGTGGCTCTAACCAGCT
TGTTCTTGACGAAGCCGAGAGGAGTCTGCACGATGCGTTGTGTGTTGTCAGGTGTTTGGT
GAGCAAGAGGTTTTTGATTGCGGGAGGTGGTGCGCCGGAGATTGAGCTCTCGAGGCAGCT
AGGTGCTTGGGCTAAGGTGCTCCATGGGATGGAGGGTTACTACGTGAAGTCTTTCGCTGA
AGCTCTGGAGGTTATTCCTTACACGCTGGCTGAGAATGCAG
TCT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RS1F616TF 741 0 0
G
GGGATTAAAGACATGGGGAGAACCACATCTGTTCTCGTCCGTGGCTCTAACCAGCTTGTT
CTTGATGAAGCCGAGAGGAGTCTGCACGATGCGTTGTGTGTTGTCAGGTGTCTGGTGAGC
AAGAGGTTTTTGATTGCGGGAGGTGGTGCGCCGGAGATTGAGCTCTCGAGGCAGCTAGGT
GCTTGGGCTAAGGTGCTCCATGGGATGGAAGGTTACTGCGTGAAGTCTTTCGCTGAAGCT
CTGGAGGTTATTCCTTACACGCTGGCTGAGAATGCAGGTCTGAATCCTATTGCAATTGTG
ACTGAGCTCAGGAACAAGCATGCTCAAGGGGAAATCAACTCTGGGATCAATGTCAGGAAA
GGGCAGATCACTAATATCTTGGAGGAGAACGTGGTGCAGCCTCTGCTTGTGAGCACCAGC
GCAATCACTCTCGCAACTGAATGCGTAAGGATGATTTTGAAGATTGATGACATCGTTACG
GTGAGGTAGTGGGGTAGTTTCATTCTAAACGGGTCATCAGTACACTCCTCTTTCTCTATC
TATCTAAGCTTTGTTTCCCTTTTGGTGTTTTGATGTGTTTTTTTTTTTTTTTTGCAATGG
TTGAACTTAGAACCCTAGTTGCCTTTCATCATGTTCTATTGCATCTTTTTTT*GTCAGCG
TTTTATTGCAGCCTAGTGGTCTTCTTGTGGTTTGTGCTACTTTGTTTCTTTCTAGTGACT
TTAAATATCAAGATTTCTC
G

QA 2 740 2 740
DS 

RD RS1F616JQ 623 0 0
TTTTTGATTGCGGGAGGTGGTGCGCCGGAGATTGAGCTCTCGAGGCAGCTAGGTGCTTGG
GCTAAGGTGCTCCATGGGATGGAAGGTTACTGCGTGAAGTCTTTCGCTGAAGCTTTGGAG
GTTATTCCTTACACGCTGGCTGAGAATGCAGGTTTGAATCCTATTGCAATTGTGACTGAG
CTCAGGAACAAGCATGCTCAAGGGGAAATCAACTCTGGGATCAATGTCAGGAAAGGGCAG
ATCACTAATATCTTGGAGGAGAACGTGGTGCAGCCTCTGCTTGTGAGCACCAGCGCAATC
ACTCTCGCAACTGAATGCGTAAGGATGATTTTGAAGATTGATGACATCGTTACGGTGAGG
TAGTGGGGTAGTTTCATTTTAAACGGGTCATCAGTACACTCCTCTTTCTCTATCTATTTA
AGCTTTGTTTCCCTTTTGGTGTTTTGATGTGTTTTTTTTTTTTTTTTGCAATGGTTGAAC
TTAGAACCCTAGTTGCCTTTCATCATGTTCTATTGCATCTTTTTTTTGTCAGCGTTTTAT
TGCAGCCTAGTGGTCTTCTTGTGGTTTGTGCTACTTTGTTTCTTTCTAGTGACTTTAAAT
ATCAAGATTTCTCGTTTTGTTCC

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 5

CO CL1877Contig1 999 5 8 U
GGATTGTCACTCAAACATGAACGAGAGTCTCCCCGATAATCATCACTCACGCGTCGGTAG
CAATAACGTGGAAATGAGTTCCACAACTGTGAACAACGCTTTCACAAAGCCTGGAGATCC
AAAAGTAAGCCCAGCAGGATCTTCATCAGCAAAGCGTTCATTGTTTCAGCCTCTACCCTG
TGATCATCATCACTCCTCCTATAATCCGGTTCACGTCCCTGAGCGGAAGTTACCACCACA
GTATGGATCCTCAAATGTGTACAATGAGACGGTTGAAGGTAACAACAACAACACAGTGAA
TTACAGTGTGAATGGAAGTGGATCAGGTAGTGGTCATGGAAGCAATGACCCGTATGGAAG
CAGTAATGGCATGAATGCTGGAGGAGTGAACATGGGAAGTGAAAATGGTGCTGGCAAAAG
CGGAAGCGGCGATGGTAGTGGAAGTGGAAGTGGGAATGTAGCAGATGAGAATAAGATCTC
TCAAAGAGAAGCAGCTTTGACAAAGTTCCGCCAGAAGAGAAAGGAGAGGTGCTTCAGAAA
GAAGGTAAGATACCAAAGCAGGAAAAAACTAGCGGAACAACGACCTCGTGTGCGTGGCCA
GTTCGTCCGTAAAACAGCTGCTGCAACGGATGATAACGACATAAAAACACCGAGGGATAG
CTAACGGGAAATCTGCTAATGTCAGCAGGAAGAAAGAAAAAAACTTGTAAGGTTCTCATC
ATCCTTGTTGGGTCAATCTATCTATCAGTCTATATATCACGTGTGTTAACAGTTTTTCTT
TACTCTCAAAGTCTGATTCTTTGATACTACTACACTAGTATTCCACGAACACACCGACAG
ACAAATTGATTGTTTGTTATTTTGTCGTCGTATAGTGTGGTTTGTGGATTCAGGACACAA
AGGATTTGGTTCATGAGTTGGAGGGTGTGGTT*GTAGATGTTGTAAACTTTTGTAAAAC*
AATAACCC*ACTGTTTGTATAAGCTATTGGTTTTGGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RS1A780TF U 1
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AF RS1A681TF U 325
AF RS1DM38TF U 525
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CAATAACGTGGAAATGAGTTCCACAACTGTGAACAACGCTTTCACAAAGCCTGGAGATCC
AAAAGTAAGCCCAGCAGGATCTTCATCAGCAAAGCGTTCATTGTTTCAGCCTCTACCCTG
TGATCATCATCACTCCTCCTATAATCCGGTTCACGTCCCTGAGCGGAAGTTACCACCACA
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DS 

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G
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CATGAATGCTGGAGGAGTGAACATGGGAAGTGAAAATGGTGCTGGCAAAAGCGGAAGCGG
CGATGGTAGTGGAAGTGGAAGTGGGAATGTAGCAGATGAGAATAAGATCTCTCAAAGAGA
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TAAAACAGCTGCTGCAACGGATGATAACGACATAAAAACACCGAGGGATAGCTAACGGGA
AATCTGCTAATGTCAGCAGGAAGAAAGAAAAAAACTTGTAAGGTTCTCATCATCCTTGTT
GGGTCAATCTATCTATCAGTCTATATATCACGTGTGTTAACAGTTTTTCTTTACTCTCAA
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GCAGGAAGAAAGAAAAAAACTTGTAAGGTTCTCATCATCCTTGTTGGGTCAATCTATCTA
TCAGTCTATATATCACGTGTGTTAACAGTTTTTCTTTACTCTCAAAGTCTGATTCTTTGA
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TATTGGTTTTGGATC

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DS 

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GGAT

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DS 

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AAAAAACTAGCGGAACAACGACCTCGTGTGCGTGGCCAGTTCGTCCGTAAAACAGCTGCT
GCAACGGATGATAACGACATAAAAACA**GAGGGATAGCTAACGGGAAATCTGCTAATGT
CAG***GAAGAAAGAAAAAAACTTGTAAGGTTCTCATCATCCTTGTTGGGTCAATCTATC
TATCAGTCTATATATCACGTGTGTTAACAGTTTTTCTTTACTCTCAAAGTCTGATTCTTT
GATACTACTACACTAGTATTCCACGAACACACCGACAGACAAATTGATTGTTTGTTATTT
TGTCGTCGTATAGTGTGGTTTGTGGATTCAGGACACAAAGGATTTGGTTCATGAGTTGGA
GGGTGTGGTT*GTAGATGTTGTAAACTTTTGTAAAACTAATAACCC*ACTGTTTGTATAA
GCTATTGATTTT

QA 1 552 1 552
DS 



AS 1 5

CO CL1878Contig1 955 5 11 U
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TTTAAGAAACAGCCCAACACGATGATAAGTACAACATAAAATATAAAGCCCAAACAAAAC
ACGTGTAAGGCAATCCTTAAGAGTTGCTGCAAGCTGGCTTCAACTTTATATTAGTGGAGA
ACACGTGGCTTAGTTTCATCCTTCTTGGCTCCACCGCTTTGACTCTGCGAAGGTGAAACC
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CCATTAACTAATCTTGTACTCAATGATTATGAAACCTTTCGCTCTAGCCGAAATTACTTG
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TAGAAAGAGGTTGGAGAAAAACTCGGAAGAGAGAGGTTAGAAGATACTAACCTCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A995JQ U 1
AF RS1BX71JQ U 1
AF RS1C079JQ U 1
AF RS1C079TF C 256
AF RS1BX71TF C 266
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CCATTAACTAATC

QA 1 313 1 313
DS 

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GT
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ACGTGGCTTAGTTTCATCCTTCTTGGCTCCACCGCTTTGACTCTGCGAAGGTGAAACCGT
CGGTGAAACCGTCGGTGAAACCGTCGGTGAAACCGTCGGTGAAACCATCACAGCCCTTCC
ATTAACTAATCTTGTACTCAATGATTATGAAACCTTTCGCTCTAGCCGAAATTACTTGAC
CTGAGAGACCTTGGTTTACCGTTAGTAAGCACAGAGGAAGCTTGGGTCGGATCGAAGGAA
GACTCTTTGTTGGACCGTTGTGAAAAACGCCAACTCTACTGAATCTACTTCGAAGAGACC
AAGAAAACCCATCAAAACTCGACCTTCTATCATCAGAGAAGCTTTACTTTGAAACGCCAA
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ATAAGCAAAGCTTTAGAACAAGTAATTGACGGG

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DS 

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GC
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DS 

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DS 

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QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 5

CO CL1879Contig1 1550 5 27 U
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GAGATCCGCCGCGCTGATCTCCTTATTCCTTCTTCCGTTGCTTAGCTTCTCGTTCTCCGT
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TGCACATTCATTGAACCCTACCAACAATCTGGTTTTGAAAGTTCTTTCAGCTTCTCCCTC
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CAATTTCGCTAGTCTCTGTCATGCACGCCAGGAACAATGCTAGGGTTGTGATCTCTGACT
CTTTGCAGTTGCTTAGCGATAGGTTGTTCAGATCTGGTGTCCAGAAAGCTGGGAGTCCGA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G704TF U 11
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AF RS1B101TF U 820
AF RS1AI44JQ C 661
AF RS1B101JQ C 838
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GG
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GCTGATCTCCTTATTCCTTCTTCCGTTGCTTAGCTTCTCGTTCTCCGTCGATAATCCGAC
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CTTCAACACTCTCAAATCCCGTGGATTCGATCTCGATTTCAAATTAGCAGATGATTCGAA
GCTCGCGCTTCAACGATACGGCCAGTACTTGTACGACGGGCTCATCATCTTCGCCCCCTC
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AGAATGTGGTGTTGATTTCGATGAGGATTCTTCGGCTATGGTTATTGATCATTCGAGCTT
CTCAGTATCTGACGGCGACCACACCCTGATTGCTGCCGATGATTTAGTCAAGTCCGATGT
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TAACCCGAGCTCT

QA 3 675 3 675
DS 

RD RS1AI44TF 759 0 0
GGTCACTCACTCACTCTAAACCCGTGAAAAGACCTAAGAGGCAAAGATGATGAACCTTTC
GAGATCCGCGGCGCTGATCTCCTTATTCCTTCTTCCGTTGCTTAGCTTCTCGTTCTCCGT
CGATAATCCGACGGATCGGCGGGTTCTAGTTCTTCTCGACGATCTGTCACTCAAATCCTC
TCATTCTATCTTCTTCAACACTCTCAAATCCCGTGGATTCGATCTCGATTTCAAATTAGC
AGATGATTCGAAGCTCGCGCTTCAACGATACGGCCAGTACTTGTACGATGGGCTCATCAT
CTTCGCCCCCTCCACAGAGCGATTTGGAGGTTCATTGGATTCGAAATCGATAGCTGATTT
CGTAGATTCGGGTCGTGACTTGATCTTATCGGCGGATACTTCTGCATCTGATCTGATTCG
GGGGATTGCTTTAGAATGTGGTGTTGATTTCGATGAGGATTCTTCGGCTATGGTTATTGA
TCATTCCAGCTTCTCTGTCTCTGACGGCGACCACACCTTGATTGCTGCTGATGATTTAGT
TAAGTCCGATGTCATTTTAGGAAAAGCCAAAATTGAGGCTCCCATGCTCTTCAGAGGTGT
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AGCTTATTCTGCTAACCCGAGCTCTAAGTTGTCGAGTCCTCCCC*AGCTCACTGGGTCTG
CAATTTCGCTAGTCTCTGTCATGCACGCCAGGAACAATG

QA 1 759 1 759
DS 

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G
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ACTAAGCAAATGGGTCTTCCACGAAAGGGGCCACCTGAAGGCTGGTAGTCTTGTACACCA
TAGGGTTGGAGAAACAGATGAGCCAGCAATATATAGGATAAAGGACGACCTGGAATTTTC
TGTGGAGATACTGGAGTGGTCAGGGAAGAGCTGGGAACCATATGTAGCTGATGATGTGCA
GGTTCAGTTTTACATGATGAGCCCATATGTGTTGAAAACCTTGTCAACAGACAAGAAGGG
TATGTTTCATACATCTTTCAAGGTGCCTGATGTGTATGGTGTATTCCAGTTTAAGGTCGA
ATATGAAAAGCTAGGCTACACTACGTTACCTCTTTCAAAGCAGATTCCTGTGAGGCCTTA
CAGACACAATGAGTATGAGAGATTTATTCCAACTGCGTATCCTTATTATGGAGCCTGCTT
TACCACTATGGCTGGTTTCTTTGTCTTCAGCTTCGTCTACCTCTACCATAAGTAGAAAAA
TCTCCTAAATAGTTATCGAGTCGCCTAAAGTAAGCTGGACCTTCATATTTAGACGAGAAA
AAATACA*TTTGAATCTTGATACCATTAGTTTTTTTT*GGCCAA***GCTTTATAACACT
TGCAACCTTTTTTT
G

QA 2 675 2 675
DS 

RD RS1AI44JQ 882 0 0
AGCTTATTCTGCTAACCCGAGCTCTAAGTTGTCGAGTCCTCCCCCAGCTCACTGGGTCTG
CAATTTCGCTAGTCTCTGTCATGCAGGCCAGGAACAATGCTAGGGTTGTGATCTCTGACT
CTTTGCAGTTGCTTAGCGATAGGTTGTTCAGATCTGGTGTCCAGAAAGCTGGGAGTCCGA
ACAAATATGAAAAATCTGGAAACGAACAGTTTGTGACTGAAGTAAGCAAATGGGTCTTCC
ACGAAAGAGGCCACCTGAAGGCTGGTAGTCTGGTACACCATAGGGTTGGAGAAACAGATG
AGCCAGCAATATATAGGATAAAGGATGACCTGGAATTTTCGGTGGAGATACTGGAGTGGT
CAGGGAAGAGCTGGGAACCGTATGTATCTGATGATGTGCAGGTTCAGTTTTACATGATGA
GCCCATATGTGTTGAAAACCTTGTCAACAGACAAGAAGGGTATGTTTCATACATCTTTCA
AGGTGCCTGATGTGTATGGTGTATTCCAGTTTAAGGTTGAATATGGAAAGCTAGGCTACA
CTACGTTATCTCTTTCAAAGCAGATTCCTGTGAGGCCTTACAGACATAATGAGTATGAGA
GATTTATTCCAACTGCGTATCCTTATTATGGAGCCTGCTTTACCACTATGGCTGGTTTCT
TTGTCTTCAGCTTCGTCTACCTCTACCATAAGTAGAAAAATCTCCTAAATGGTTATCGAG
TCGCCTAAAGTAAGCTAGACCTTCATATTTAGACGAGAAAAAATACAATTTGAATCTTGA
TACCATTAGTCTCTTTT*GGCCAACAAGCTTTATAATACTTGCAACCTTTTTTTTGGGTT
CCCCAGATATTTTATGTGAACGTAAGCTTACCCCTTCTTAGC

QA 1 882 1 882
DS 

RD RS1B101JQ 713 0 0
CGAACAAATATGAAAAATCTGGAAACGAACAGTTTGTGACTGAACTAAGCAAATGGGTCT
TCCACGAAAGGGGCCACCTGAAGGCTGGTAGTCTTGTACACCATAGGGTTGGAGAAACAG
ATGAGCCAGCAATATATAGGATAAAGGACGACCTGGAATTTTCTGTGGAGATACTGGAGT
GGTCAGGGAAGAGCTGGGAACCATATGTAGCTGATGATGTGCAGGTTCAGTTTTACATGA
TGAGCCCATATGTGTTGAAAACCTTGTCAACAGACAAGAAGGGTATGTTTCATACATCTT
TCAAGGTGCCTGATGTGTATGGTGTATTCCAGTTTAAGGTCGAATATGAAAAGCTAGGCT
ACACTACGTTACCTCTTTCAAAGCAGATTCCTGTGAGGCCTTACAGACACAATGAGTATG
AGAGATTTATTCCAACTGCGTATCCTTATTATGGAGCCTGCTTTACCACTATGGCTGGTT
TCTTTGTCTTCAGCTTCGTCTACCTCTACCATAAGTAGAAAAATCTCCTAAATAGTTATC
GAGTCGCCTAAAGTAAGCTGGACCTTCATATTTAGACGAGAAAAAATACA*TTTGAATCT
TGATACCATTAGTTTTTTTTTGGCCAA***GCTTTATAACACTTGCAACCTTTTTTTTGG
GTTCCCCAGATATTTTATGTGAACGTAAGCTTACACCTTCTTAGCTAAAATAT

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 5

CO CL1880Contig1 697 5 2 U
GGCCGCTCCGGCATCATCACCATCTAAACCCGAGTCTCTCTCTCTCACGGTCTTGGAAAT
GGCGACAGTACCGGGACAATTGGTATGGGAGATCGTTAAGAGAAACAACTGTTTCTTGGT
CAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCCAAGGTTCAGTTCAGCAAAGAGAAGAACAATCTCTG
CAACCTCAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCGAACAAGAAGACAGTGACCATCCAGCC
AGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAAGAAGCAGAACAAGCC
TAAGGTCTCTGTCAACAAGTCTATCCTTAAGAAGGAATTCCCCAGGATGTCCAAGGCTGT
TGCTAACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAAATTCGCTCTTGCCAG
ACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGCCAAGCAAAGAAACCG
TCAAGCTTAAGCTTTTATCTTCAGAAACTGTTTGTTTGTTTTTTTTTGAGTAAAAGCTTT
AGCTGAAGGGTTTTTATTGAAGTTGTTTTTGTTGAAGTTGAACCACAACACTATGCTATG
CTCCTTTCCTTATCCTTTTCAACAAGGAGTTAGAACTTTCTCTTATTATGCATTTGTTTC
GTGTTGGACCTTTTTTAAATCAAATCAAGAAGTTGAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DI38TF U 1
AF RS1DI38JQ C 208
AF RS1G251TF U 14
AF RS1GC43TF U 1
AF RS1GC43JQ C 29
BS 1 644 RS1DI38TF
BS 645 697 RS1GC43TF

RD RS1DI38TF 645 0 0
GGCCGCTCCGGCATCATCACCATCTAAACCCGAGTCTCTCTCTCTCACGGTCTTGGAAAT
GGCGACAGTACCGGGACAATTGGTATGGGAGATCGTTAAGAGAAACAACTGTTTCTTGGT
CAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCCAAGGTTCAGTTCAGCAAAGAGAAGAACAATCTCTG
CAACCTCAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCGAACAAGAAGACAGTGACCATCCAGCC
AGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAAGAAGCAGAACAAGCC
TAAGGTCTCTGTCAACAAGTCTATCCTTAAGAAGGAATTCCCCAGGATGTCCAAGGCTGT
TGCTAACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAAATTCGCTCTTGCCAG
ACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGCCAAGCAAAGAAACCG
TCAAGCTTAAGCTTTTATCTTCAGAAACTGTTTGTTTGTTTTTTTTTGAGTAAAAGCTTT
AGCTGAAGGGTTTTTATTGAAGTTGTTTTTGTTGAAGTTGAACCACAACACTATGCTATG
CTCCTTTCCTTATCCTTTTCAACAAGGAGTTAGAACTTTCTCTT
A

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1DI38JQ 437 0 0
TCTTGCGAACAAGAAGACAGTGACCATCCAGCCAGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCT
CGCCACCACCAAGACCAAGAAGCAGAACAAGCCTAAGGTTTCTGTCAACAAGTCTATCCT
TAAGAAGGAATTCCCCAGGATGTCCAAGGCTGTTGCTAACCAGGTGGTTGACAACTACTA
CAGGCCAGACTTGAAGAAATTCGCTCTTGCCAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAG
GGTTGCCAAGTCCGGTGCCAAGCAAAGAAACCGTCAAGCTTAAGCTTTTATTTTCAGAAA
CTGTTTGTTTGTTTTTTTTTGAGTAAAAGCTTTAGCTGAAGGGTTTTTATTGAAGTTGTT
TTTGTTGAAGTTGAACCACAACACTATGCTATGCTCCTTTCCTTATCCTTTTCAACAAGG
AGTTAGAACTTTTTCTT

QA 1 437 1 437
DS 

RD RS1G251TF 627 0 0
TCATCACCATCTAAACCCGAGTCTCTCTCTC**ACGGTCTTGGAAATGGCGACAGTACCG
GGACAATTGGCATGGGAGATCGTTAAGAGAAACAACTGTTTCTTGGTCAAACAGTTCGGT
AGAGGCAATGCCAAGATTCAGTTCAGCAAAGAGAAGAACAATCTCTGCAACCTCAACTCC
TACAAGCACTCTGGTCTTGCGAACAAGAAGACAGTGACCATCCAGCCAGCTGACAAGGAA
CAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAAGAAGCAGAACAAGCCTAAGGTCTCTGTC
AACAAGTCTATCCTTAAGAAGGAATTCCCCAGGATGTCCAAGGCTGTTGCTAACCAGGTG
GTTGACAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAAATTCGCTCTTGCCAGACTCAGTGTCATC
AGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGCCAAGCAAAGAAACCGTCAAGCTTAAGCT
TTTATCCTCAGAAACTGTTTGTTTGTTTTTTTTTGAGTAGAAGCTTTAGCTGAAGGGTTT
TTATTGAAGTTGTTTTTGTTGAAGTTGAACCACAACACTATGCTATGCTCCTTTCCTTAT
CCTTTTCAACAAGGAGTTAGAACTTTC

QA 1 627 1 627
DS 

RD RS1GC43TF 697 0 0
GGCCGCTCCGGCATCATCACCATCTAAACCCGAGTCTCTCTCTCTCACGGTCTTGGAAAT
GGCGACAGTACCGGGACAATTGGTATGGGAGATCGTTAAGAGAAACAACTGTTTCTTGGT
CAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCCAAGGTTCAGTTCAGCAAAGAGAAGAACAATCTCTG
CAACCTCAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCGAACAAGAAGACAGTGACCATCCAGCC
AGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAAGAAGCAGAACAAGCC
TAAGGTCTCTGTCAACAAGTCTATCCTTAAGAAGGAATTCCCCAGGATGTCCAAGGCTGT
TGCTAACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAAATTCGCTCTTGCCAG
ACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGCCAAGCAAAGAAACCG
TCAAGCTTAAGCTTTTATCTTCAGAAACTGTTTGTTTGTTTTTTTTTGAGTAAAAGCTTT
AGCTGAAGGGTTTTTATTGAAGTTGTTTTTGTTGAAGTTGAACCACAACACTATGCTATG
CTCCTTTCCTTATCCTTTTCAACAAGGAGTTAGAACTTTCTCTTATTATGCATTTGTTTC
GTGTTGGACCTTTTTTAAATCAAATCAAGAAGTTGAT

QA 1 697 1 697
DS 

RD RS1GC43JQ 648 0 0
CCCGAGTC
TCTCTCTCTCACGGTCTTGGAAATGGCGACAGTACCGGGACAATTGGTATGGGAGATCGT
TAAGAGAAACAACTGTTTCTTGGTCAAACAGTTCGGTAGAGGCAATGCCAAGGTTCAGTT
CAGCAAAGAGAAGAACAATCTCTGCAACCTCAACTCCTACAAGCACTCTGGTCTTGCGAA
CAAGAAGACAGTGACCATCCAGCCAGCTGACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCAC
CAAGACCAAGAAGCAGAACAAGCCTAAGGTCTCTGTCAACAAGTCTATCCTTAAGAAGGA
ATTCCCCAGGATGTCCAAGGCTGTTGCTAACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGA
CTTGAAGAAATTCGCTCTTGCCAGACTCAGTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAA
GTCCGGTGCCAAGCAAAGAAACCGTCAAGCTTAAGCTTTTATCTTCAGAAACTGTTTGTT
TGTTTTTTTTTGAGTAAAAGCTTTAGCTGAAGGGTTTTTATTGAAGTTGTTTTTGTTGAA
GTTGAACCACAACACTATGCTATGCTCCTTTCCTTATCCTTTTCAACAAGGAGTTAGAAC
TTTCTCTTATTATGCATTTGTTTCGTGTTGGACCTTTTTT

QA 9 648 9 648
DS 



AS 1 5

CO CL1881Contig1 841 5 13 U
GGGGACTCGTAACTTGGAGAAAGGCAAAGGCATCGTTCATCTTTCCAGAGAGAGAAAGGT
TTAGGGTTAGGGTTGCAGAGAAGCAGGGGAAGGAGGATTCTAAGAATCGAACCGACTCTG
TATTCGCTCTGTCCCTCCCTTTCTTTTAAATCTTCTCGATAAAAAAACAATGGGGCTTCA
ATCTTTTCCTATCTCTGAAATGGACACGACCGACGATATGCACGAAGCCATGTTCGCGAA
GAGAGGTTGTTGTTTCCTCCTCCCATGTCTCGGATCATCTCAGCCGTCCGGTCCAGGTGG
TAACGTATGGTGGCAACGAATCACAACGGTGGATAAGTTGGAGCCCGACGAGCGTTGGTG
GATCTCCGGGTGGAACAAGATGAGGGAGTGGTCTGAAATCTTGGCTGGCCCCAGGTGGAA
GACCTTCATCCGCCGCGTTGGCCGGAGTCACTTCTGCGGCTGCGGAGGGGACGGCTGTAG
TAGTAGGCCGGATCAGGTTGGTTTCCGGTACGATACGTCGAGTTACTCGTTGAATTTTGA
CGATGGTAAACAGATGGGACATTTCGAAGATGAGTTTCCTTACCGTGATTACTCGATGAG
GTTCACCGCACCGTTGTCTCTGCCGGTCTCCACCAAATGCTCCATTGATCTCGACAACGA
TAACTACGCGCCTCCGATGATTAAGTAAAGGCCACACGTTTTTGTTTTTGTGGGTTGTCT
TCTAACGTGCACCTATGAAAGGTATCGGATTTTATGAAGAATTATTATTTTATACATTTT
TGTTTTCTTTTCAGATTTTGTAATATCATTTCACTTTGAGTGCACTCATTTTTTAGATGA
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RS1C182TF U 1
AF RS1C182JQ C 421
AF RS1ED14TF U 47
AF RS1C551JQ C 349
AF RS1C551TF U 349
BS 1 102 RS1C182TF
BS 103 103 RS1ED14TF
BS 104 204 RS1C182TF
BS 205 205 RS1ED14TF
BS 206 345 RS1C182TF
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BS 439 439 RS1C551TF
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BS 771 771 RS1C551TF
BS 772 783 RS1ED14TF
BS 784 841 RS1C551TF

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TTAGGGTTAGGGTTGCAGAGAAGCAGGGGAAGGAGGATTCTAGGAATCGAACCGACTCTG
TATTCGCTCTGTCCCTCCCTTTCTTTTAAATCTTCTCGATAAAAAAACAATGGGGCTTCA
ATCTTTTCCTATCTCTGAAATGGATACGACCGACGATATGCACGAAGCCATGTTCGCGAA
GAGAGGTTGTTGTTTCCTCCTCCCATGTCTCGGATCATCTCAGCCGTCCGGTCCAGGTGG
TAACGTATGGTGGCAACGAATCACAACGGTGGATAAGTTGGAGCC*GACGAGCGTTGGTG
GATCTCCGGGTGGAACAAGA

QA 1 380 1 380
DS 

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TAGTAGGCCGGATCAGGTTGGTTTCCGGTACGATACGTCGAGTTACTCGTTGAATTTTGA
CGATGGTAAACAGATGGGACATTT
TGA

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DS 

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GCG
GAGAGAAAGGTTTAGGGTTAGGGTTGCAGAGAAGCAGGGGAAGGAGGATTCTAAGAATCG
AACCGACTCTGTATTCGCTCTGTCCCTCCCTTTCTTTTAAATCTTCTCGATAAAAAAACA
ATGGGGCTTCAATCTTTTCCTATCTCTGAAATGGACACGACCGACGATATGCACGAAGCC
ATGTTCGCGAAGAGAGGTTGTTGTTTCCTCCTCCCATGTCTCGGATCATCTCAGCCGTCC
GGTCCAGGTGGTAACGTATGGTGGCAACGAATCAGAACGGTGGATAAGTTGGAGCCCGAC
GAGCGTTGGTGGATCTCCGGGTGGAACAAGATGAGGGAGTGGTCTGAAATCTTGGCTGGC
CCCAGGTGGAAGACCTTCATCCGCCGCGTCGGCCGGAGTCACTTCTGCGGCTGCGGAGGG
GACGGCTGTAGTAGTAGGCCGGATCAGGTTGGTTTCCGGTACGATACGTCGAGTTACTCG
TTGAATTTTGACGATGGTAAACAGATGGGACATTTCGAAGATGAGTTTCCTTACCGTGAT
TACTCGATGAGGTTCACCGCACCGTTGTCTCTGCCGGTCTCCACCAAATGCTCCATTGAT
CTCGACAACGATAACTACGCGCCTCCGATGATTAAGTAAAGGCCACACGTTTTTGTTTTT
GTGGGTTGTCTTCTAACGTGCACCTATGAAAGGTATCGGATTTTATGAAGAATTATTATT
T*ATACATTTTTGT

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DS 

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G
GAGCGTTGGTGGATTTCCGGGTGGAACAAGATGAGGGAGTGGTTTGAAATCTTGGCTGGC
CCCAGGTGGAAGACCTTCATCCGCCGCGTTGGCCGGAGTCACTTTTGCGGCTGCGGAGGG
GACGGCTGTAGTAGTAGGCCGGATCAGGTTGGTTTCCGGTACGATACGTCGAGTTACTCG
TTGAATTTTGACGATGGTAAACAGATGGGACATTTCGAAGATGAGTTTCCTTACCGTGAT
TACTCGATGAGGTTCACCGCACCGTTGTTTCTGCCGGTCTCCACCAAATGCTCCATTGAT
CTCGACAACGATAACTACGCGCCTCCGATGATTAAGTAAAGGCCCCACGTTTTTGTTTTT
GTGGGTTGTCTTCTAACGTGCCCCTATGAAAGGTATCGGATTTTATGAAGAATTATTATT
TTATACATTTTTGTTTTCTTTTCAGATTTTGTAATATCATTTCACTTTGAGTGCACTCAT
TTTTTAGATGAT

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DS 

RD RS1C551TF 493 0 0
G
GAGCGTTGGTGGATCTCCGGGTGGAACAAGATGAGGGAGTGGTCTGAAATCTTGGCTGGC
CCCAGGTGGAAGACCTTCATCCGCCGCGTTGGCCGGAGTCACTTCTGCGGCTGCGGAGGG
GACGGCTGTAGTAGTAGGCCGGATCAGGTTGGTTTCCGGTACGATACGTCGAGTTACTCG
TTGAATTTTGACGATGGTAAACAGATGGGACATTTCGAAGATGAGTTTCCTTACCGTGAT
TACTCGATGAGGTTCACCGCACCGTTGTCTCTGCCGGTCTCCACCAAATGCTCCATTGAT
CTCGACAACGATAACTACGCGCCTCCGATGATTAAGTAAAGGCCACACGTTTTTGTTTTT
GTGGGTTGTCTTCTAACGTGCACCTATGAAAGGTATCGGATTTTATGAAGAATTATTATT
TTATACATTTTTGTTTTCTTTTCAGATTTTGTAATATCATTTCACTTTGAGTGCACTCAT
TTTTTAGATGAT

QA 2 493 2 493
DS 



AS 1 4

CO CL1882Contig1 897 4 17 U
ATAGAGATCCCGTCCCGTGGAGGAGAATTTCTAGCAGACCGATCTCTTATCT****TCTC
TGTCTTTCTCGGAAACTTTTTGAGTTTTCTAAATCATAAACTATGGGTTTGTGGGATGCT
TTTCTCAATTGGCTTCGCAGCCTCTTCTTCAAGCAAGAAATGGAGCTTTCCTTGATCGGA
CTTCAAAATGCAGGAAAGACATCTCTTGTTAACGTCGTTGCTACCGGTGGATACAGTGAA
GACATGATTCCTACGGTAGGGTTCAACATGAGGAAAGTGACAAAAGGAAGCGTCACAATC
AAACTCTGGGATCTTGGTGGTCAACCTAGGTTCCGCAGCATGTGGGAACGCTACTGCCGT
TCTATTTCCGCCATTGTGTATGTAGTTGATGCTGCTGATCCTGACAACCTTAGTGTCTCG
AAAAGCGAACTCCATGATTTGTTGAGCAAGACGTCGCTTAGTGGTATCCCTCTTCTAGTC
CTCGGAAACAAAATCGACAAGCCTGGTGCTCTAACCAAAGATGACTTAACCGAGGAAATG
GGGCTCAAGTCGCTCACAGATAGAGAAGTCTGTTGCTTCATGATATCTTGCAAGAACTCT
ACCAACATTGACCAAGTGATTGATTGGCTTGTAAAGCACTCCAAATCAGCAAGCTAAAAC
AAGAACCCTCCTTCTGCATTTTCTTCATCTTTTCTCAGTCTTCCTGTGTGTTGCAACTCC
TTTGATGGTGGAAGAGTGACAATTTTTTTCTTTCTTTGTTTTTAAATCCTGTGAGAAACA
AGATTTGTCTTTGTCTTTATCGTCTTTCTTCTTCTGTATATTAGTTTTGATTTGTTTTCT
TTAATTCACATTCCTTCAGGGTTGATGTGAAAGAATTAAAACATATGGGGTTAATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EH26TF U 1
AF RS1AG51TF U 16
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AF RS1AG51JQ C 52
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RD RS1EH26TF 608 0 0
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GGGCTCAAGTCGCTCACAGATAGAGAAGTCTGTTGCTTCATGATATCTTGCAAGAACTCT
ACCAACAT

QA 1 608 1 608
DS 

RD RS1AG51TF 765 0 0
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TCAACATGAGGAAAGTGACAAAAGGAAGCGTCACAATCAAACTCTGGGATCTTG*TGGTC
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GAGAAGTCTGTTGCTTCATGATATCTTGCAAGAACTCTACCAACATTGACCAAGTGATTG
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CTTCATCTTTTCTCAGTCTTCCTGTGTGTTGCAACTCCTTTGATGGTGGAAGAGTGACAA
TTTTTTTCTTTCTTTGTTTTTAAATCCTGTGAGAAAC
A

QA 8 764 8 764
DS 

RD RS1A466JQ 834 0 0
GA
GAGAATTTCTAGCAGACCGATCTCTTATCT*****CTCTGTCTTTCTCGGAAACTTTTTG
AGTTTTCTAAATCATAAACTATGGGTTTGTGGGATGCTTTTCTCAATTGGCTTCGCAGCC
TCTTCTTCAAGCAAGAAATGGAGCTTTCCTTGATCGGACTTCAAAATGCAGGAAAGACAT
CTCTTGTTAACGTCGTTGCTACCGGTGGATACAGTGAAGACATGATTCCTACGGTAGGGT
TCAACATGAGGAAAGTGACAAAAGGAAGCGTCACAATCAAACTCTGGGATCTTGGTGGTC
AACCTAGGTTCCGCAGCATGTGGGAACGCTACTGCCGTTCTGTTTCCGCCATTGTGTATG
TAGTTGATGCTGCTGATCCTGACAACCTTAGTGTCTCGAAAAGCGAACTCCATGATTTGT
TGAGCAAGACGTCGCTTAGTGGTATCCCTCTTCTAGTCCTCGGAAACAAAATCGACAAGC
CTGGTGCTCTGACCAAAGATGACTTAACCGAGGAAATGGGGCTCAAGTCGCTCACAGATA
GAGAAGTCTGTTGCTTCATGATATCTTGCAAGAACTCTACCAACATTGACCAAGCGATTG
ATTGGCTTGTAAAGCACTCCAAATCAGCAAGCTAAAACAAGAACCCTCCTTCTGCATTTT
CTTCATCTTTTCTCAGTCTTCCTGTGTGTTGCAACTCCTTTGATGGTGGAAGAGTGACAA
TTTTTTTCTTTCTTTGTTTTCAAATCCTGTGAGAAACCAGATTTGTCTTTGTCTTTATCG
TCTTTCTTCTTCTGTATATTAGTTTTGATTTGTTTTCTTTAATTCACTTTCC

QA 3 834 3 834
DS 

RD RS1AG51JQ 846 0 0
CTCTG
TCTCTGTCTTTCTCGGAAGCTTTT*GAGTTTTCTAAATCATAA*CTATGGGTTTGTGGGA
TGCTTTTCTCAATTGGCTTCGCAGCCTCTTCTTCAAGCAAGAAATGGAGCTTTCCTTGAT
CGGACTTCAAAATGCAGGAAAGACATCTCTTGTTAACGTCGTTGCTACCGGTGGATACAG
TGAAGACATGATTCCTACGGTAGGGTTCAACATGAGGAAAGTGACAAAAGGAAGCGTCAC
AATCAAACTCTGGGATCTTG*TGGTCAACCTAGGTTCCGCAGCATGTGGGAACGCTACTG
CCGTTCTATTTCCGCCATTGTGTATGTAGTTGATGCTGCTGATCCTGACAACCTTAGTGT
CTCGAAAAGCGAACTCCATGATTTGTTGAGCAAGACGTCGCTTAGTGGTATCCCTCTTCT
AGTCCTCGGAAACAAAATCGACAAGCCTGGTGCTCTATCCAAAGATGACTTAACCGAGGA
AATGGGGCTCAAGTCGCTCACAGATAGAGAAGTCTGTTGCTTCATGATATCTTGCAAGAA
CTCTACCAACATTGACCAAGTGATTGATTGGCTTGTAAAGCACTCCAAATCAGCAAGCTA
AAACAAGAACCCTCCTTCTGCATTTTCTTCATCTTTTCTCAGTCTTCCTGTGTGTTGCAA
CTCCTTTGATGGTGGAAGAGTGACAATTTTTTTCTTTCTTTGTTTTTAAATCCTGTGAGA
AACAAGATTTGTCTTTGTCTTT*********CTTCTTCTGTATATTAGTTTTGATTTGTT
TTCTTTAATTCACATTCCTTCAGGGTTGATGTGAAAGAATTAAAACATATGGGGTTAATT
C

QA 6 846 6 846
DS 



AS 1 4

CO CL1883Contig1 897 4 20 U
GGGTGTAAAACAAAACGTTTTCTATTATTGTTCCTTGTGGCTTGCTCAAGGGGTAAACAT
TCTAATTTCTAGGGTTTCGATTTAGACCTTGGATTCCTTTGATCTCTATCTCCACAGGTG
TATCCAGACGCTAGGATTTGAGAAGACAATGGCGAATAGATTAGACAATGAGTATGATTA
CCTGTTCAAGGTCGTCCTAATCGGTGACTCCGGTGTTGGCAAATCCAACATTCTCTCCAG
ATTCACCAGAAACGAGTTCTGTCTCGAATCCAAATCCACCATTGGCGTTGAGTTCGCCAC
CAGGACATTACAGGTTGAAGGCAAAACAGTGAAGGCTCAGATATGGGACACAGCGGGACA
AGAGCGTTACAGAGCGATCACAAGCGCCTACTACAGAGGAGCTGTTGGAGCTCTTCTCGT
CTACGACATAACCAAGAGACAGACCTTCGAGAATGTGCTGAGATGGTTACACGAGCTTAG
GGATCACGCTGATTCCAACATTGTGATCATGATGGCTGGAAACAAGTCGGATCTAAACCA
TCTGAGATCTGTTGCTGATGAGGATGGTCGGTCTTTGGCTGAGAAGGAAGGTTTGTCGTT
TCTCGAGACGTCTGCTTTAGAAGCGAGTAACATCGAGAAAGCGTTTCAGACGATCTTGTC
TGATATTTATCATATCATAAGCAAGAAAGCGTTGGCGGCACAAGAAGCTGCGGGTAATCT
TCCGGGGCAAGGAACCGCTATTAACATATCGGAGTCATCTGTAGATAACAGGAAAGGATG
CTGTTCTACTTAGTCATCTACTTATCTCTTCCAGCTATAGCAGCAATGACTAATCATTTC
AATTAATCACGTTTGTTTTCAAGAATATCTATTTTGAACTTCTTTTTTTATTAGCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
5 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D849TF U 72
AF RS1E622TF U 1
AF RS1FI44TF U 25
AF RS1FI44JQ C 114
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BS 203 291 RS1E622TF
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TAGGATTTGAGAAGACAATGGCGAATAGATTAGACAATGAGTATGATTACCTGTTCAAGG
TCGTCCTAATAGGTGACTCCGGTGTTGGCAAATCCAACATTCTCTCCAGATTCACCAGAA
ACGAGTTCTGTCTCGAATCCAAATCCACCATTGGCGTTGAATTCGCCACCAGGACATTAC
AGGTTGAAGGCAAAACAGTGAAGGCTCAGATATGGGACACAGCAGGACAAGAGCGTTACA
GAGCGATCACAAGCGCTTACTACAGAGGAGCTGTTGGAGCTCTTCTCGTCTACGACATAA
CCAAGAGACAAACCTTCGGGAATGTGCTGAGATGGTTACACGAGCTTAGGGATCACGCTG
ATTCCAACATTGTGATCATGATGGCTGGAAACAAATCAGATCTAAACCACCTGAGATCTG
TTGCTGATGAGGATGGTCGGTCTTTGGCTGAGAAGGAAGGTTTGTCGTTTCTCGAGACGT
CTGCT

QA 1 545 1 545
DS 

RD RS1E622TF 721 0 0
GGGTGTAAAACAAAACGTTTTCTATTATTGTTCCTTGTGGCTTGCTCAAGGGGTAAACAT
TCTAATTTCTAGGGTTTCGATTTAGACCTTGGATTCCTTTGATCTCTATCTCCACAGGTG
TATCCAGACGCTAGGATTTGAGAAGACAATGGCGAATAGATTAGACAATGAGTATGATTA
CCTGTTCAAGGTCGTCCTAATAGGTGACTCCGGTGTTGGCAAATCCAACATTCTCTCCAG
ATTCACCAGAAACGAGTTCTGTCTCGAATCCAAATCCACCATTGGCGTTGAATTCGCCAC
CAGGACATTACAGGTTGAAGGCAAAACAGTGAAGGCTCAGATATGGGACACAGCAGGACA
AGAGCGTTACAGAGCGATCACAAGCGCTTACTACAGAGGAGCTGTTGGAGCTCTTCTCGT
CTACGACATAACCAAGAGACAAACCTTCGAGAATGTGCTGAGATGGTTACACGAGCTTAG
GGATCACGCTGATTCCAACATTGTGATCATGATGGCTGGAAACAAATCAGATCTAAACCA
CCTGAGATCTGTTGCTGATGAGGATGGTCGGTCTTTGGCTGAGAAGGAAGGTTTGTCGTT
TCTCGAGACGTCTGCTTTAGAAGCGAGTAACATCGAGAAAGCGTTTCAGACGATCTTGTC
TGATATTTATCATATCATAAGTAAGAAAGCGTTGGCGGCACAAGAAGCTGCGGGTAAT
CTT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1FI44TF 696 0 0
GG
ATTGTTCCTTGTGGCTTGCTCAAGGGGTAAACATTCTAATTTCTAGGGTTTCGATTTAGA
CCTTGGATTCCTTTGATCTCTATCTCCACAGGTGTATCCAGACGCTAGGATTTGAGAAGA
CAATGGCGAATAGATTAGACAATGAGTATGATTACCTGTTCAAGGTCGTCCTAATCGGTG
ACTCCGGTGTTGGCAAATCCAACATTCTCTCCAGATTCACCAGAAACGAGTTCTGTCTCG
AATCCAAATCCACCATTGGCGTTGAGTTCGCCACCAGGACATTACAGGTTGAAGGCAAAA
CAGTGAAGGCTCAGATATGGGACACAGCGGGACAAGAGCGTTACAGAGCGATCACAAGCG
CCTACTACAGAGGAGCTGTTGGAGCTCTTCTCGTCTACGACATAACCAAGAGACAGACCT
TCGAGAATGTGCTGAGATGGTTACACGAGCTTAGGGATCACGCTGATTCCAACATTGTGA
TCATGATGGCTGGAAACAAGTCGGATCTAAACCATCTGAGATCTGTTGCTGATGAGGATG
GTCGGTCTTTGGCTGAGAAGGAAGGTTTGTCGTTTCTCGAGACGTCTGCTTTAGAAGCGA
GTAACATCGAGAAAGCGTTTCAGACGATCTTGTCTGATATTTATCATATCATAAGCAAGA
AAGCGTTGGCGGCACAAGAAGCTGCGGGTAAT
CT

QA 3 694 3 694
DS 

RD RS1FI44JQ 784 0 0
ACAGGTGTATCCAGACGCTAGGATTTGAGAAGACAATGGCGAATAGATTAGACAATGAGT
ATGATTACCTGTTCAAGGTCGTCCTAATCGGTGACTCCGGTGTTGGCAAATCCAACATTC
TCTCCAGATTCACCAGAAACGAGTTCTGTCTCGAATCCAAATCCACCATTGGCGTTGAGT
TCGCCACCAGGACATTACAGGTTGAAGGCAAAACAGTGAAGGCTCAGATATGGGACACAG
CGGGACAAGAGCGTTACAGAGCGATCACAAGCGCCTACTACAGAGGAGCTGTTGGAGCTC
TTTTCGTTTACGACATAACCAAGAGACAGACCTTCGAGAATGTGCTGAGATGGTTACACG
AGCTTAGGGATCACGCTGATTCCAACATTGTGATCATGATGGCTGGAAACAAGTCGGATC
TAAACCATTTGAGATCTGTTGCTGATGAGGATGGTCGGTCTTTGGCTGAGAAGGAAGGTT
TGTCGTTTCTCGAGACGTCTGCTTTAGAAGCGAGTAACATCGAGAAAGCGTTTCAGACGA
TCTTGTTTGATATTTATCATATCATAAGCAAGAAAGCGTTGGCGGCACAAGAAGCTGCGG
GTAATCTTCCGGGGCAAGGAACCGCTATTAACATATCGGAGTCATCTGTAGATAACAGGA
AAGGATGCTGTTCTACTTAGTCATCTACTTATCTCTTCCAGCTATAGCAGCAATGACTAA
TCATTTCAATTAATCACGTTTGTTTTCAAGAATATCTATTTTGAACTTCTTTTTTTATTA
GCAG

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 4

CO CL1884Contig1 947 4 11 U
GGACACATTTCCCCAGGTATCCTCTCAGTTTCACTTCCGGCTTTTATTCATCACTCTCTC
AACCAACAAGAAAGAAGAAAAAATGAGCTCCCAAATCTGCAGATCTGCTTCGAAAGCAGC
AAGGTCTCTTCTCTCTTCAGCTAAGAATGCTCGTTTCTTCTCTGAAGGACGAGCCGTTGG
TGCAGCAGCATCGGTTACCGCATCTGGAAAGATGCCTCTCTATGCATCTAACTTTGGAAG
ATCATCAGGTTCTGGTGCCGCCTCAAAGACTTGGATCACTGGACTCTTGGCTCTTCCTGC
TGCAGCCTTCATGGTTCAAGATCAGGAGGTTTTTGCTGCTGAGATGGAACGCACTTTCAT
TGCTATCAAGCCTGATGGAGTGCAGCGAGGACTGATATCAGAGATCATTTCTCGATTCGA
ACGCAAGGGCTTCAAGCTTGTTGGTATCAAGGTCGTTGTTCCTTCCAAGGATTTCGCACA
GAAGCATTACCATGATCTCAAGGAAAGACCTTTCTTCAATGGCATGTGTGACTTCCTTAG
CTCTGGTCCTGTTATTGCCATGGTATGGGAAGGAGAAGGTGTGATCAGATACGGGCGTAA
ACTGATTGGAGCCACCGATCCTCAGAAATCTGAGCCTGGGACAATCAGAGGAGATCTTGC
CGTTGTTGTTGGGAGGAACATAATCCATGGAAGTGATGGACCAGAGACTGCGAAGGATGA
GATCAATCTGTGGTTTAAGCCTCAAGAACTTGTCTCTTACACCAACAACGCTGAGAAGTG
GATCTATGGCGACAACTAAATTCCTCTTTCTTTTTTCTTTTGACATCCAATGAAATTGTT
CTTGTTCCTTACCCCCAAACAATAAAAACAAAAGACAGGTATTACGGATACAAACCCATT
CCGGGTTTTGTATTTTCCCTGGTGAACTCAGTTGTCAGAGCAGAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BS53TF U 163
AF RS1GJ10TF U 1
AF RS1CQ52TF U 13
AF RS1BS53JQ C 408
BS 1 164 RS1GJ10TF
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BS 694 794 RS1CQ52TF
BS 795 947 RS1BS53JQ

RD RS1BS53TF 370 0 0
CGA
AGGACGAGCCATTGGTGCAGCAGCTGCGGTTATCGCATCAGGAAAGATGCCTCTCTATGC
ATCTAACTTTGGAAGATCATCAGGTTCTGGTGCCGCCTCTAAGACTTGGATCACTGGACT
CTTGGCTCTTCCTGCTGCAGCCTTCATGGTTCAAGATCAAGAGGTTTTTGCTGCTGAGAT
GGAACGCACTTTCATTGCTATCAAGCCTGATGGAGTGCAGCGAGGACTGATATCAGAGAT
CATTTCTCGATTCGAACGCAAGGGCTTCAAGCTTGTTGGTATCAAGGTCGTTGTTCCTTC
CAAGGATTTCGCACAGAAGCATTACCATGATCTCAAGGAAAGACCTTTCTTCAATGGCAT
GTGTGAC

QA 4 370 4 370
DS 

RD RS1GJ10TF 697 0 0
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AACCAACAAGAAAGAAGAAAAAATGAGCTCCCAAATCTGCAGATCTGCTTCGAAAGCAGC
AAGGTCTCTTCTCTCTTCAGCTAAGAATGCTCGTTTCTTCTCTGGAGGACGAGCCGTTGG
TGCAGCAGCATCGGTTACCGCATCTGGAAAGATGCCTCTCTATGCATCTAACTTTGGAAG
ATCATCAGGTTCTGGTGCCGCCTCAAAGACTTGGATCACTGGACTCTTGGCTCTTCCTGC
TGCAGCCTTCATGGTTCAAGATCAGGAGGTTTTTGCTGCTGAGATGGAACGCACTTTCAT
TGCTATCAAGCCTGATGGAGTGCAGCGAGGACTGATATCAGAGATCATTTCTCGATTTGA
ACGCAAGGGCTTCAAGCTTGTTGGTATCAAGGTCGTTGTTCCTTCCAAGGATTTCGCACA
GAAGCATTACCATGATCTCAAGGAAAGACCTTTCTTCAATGGCTTGTGTGACTTCCTTAG
CTCTGGTCCTGTTATTGCCATGGTATGGGAAGGAGAAAGTGTGATCAGATACGGGCGTAA
ACTGATTGGAGCCACCGATCCTCAGAAATCTGAGCCTGGGACAATCAGAGGAGATCTTGC
CGTTGTTGTTGGGAGGAACATAATCCATGGAAG
TGAT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RS1CQ52TF 782 0 0
GG
AGGTATCCTCTCAGTTTCACTTCCGGCTTTTATTCATCACTCTCTCAACCAACAAGAAAG
AAGAAAAAATGAGCTCCCAAATCTGCAGATCTGCTTCGAAAGCGGCAAGGTCTCTTCTCT
CTTCAGCTAAGAATGCTCGTTTCTTCTCTGAAGGACGAGCCGTTGGTGCAGCAGCATCGG
TTACCGCATCTGGAAAGATGCCTCTCTATGCATCTAACTTTGGAAGATCATCAGGTTCTG
GTGCCGCCTCAAAGACTTGGATCACTGGACTCTTGGCTCTTCCTGCTGCAGCCTTCATGG
TTCAAGATCAGGAGGTTTTTGCTGCTGAGATGGAACGCACTTTCATTGCTATCAAGCCTG
ATGGAGTGCAGCGAGGACTGATATCAGAGATCATTTCTCGATTTGAACGCAAGGGCTTCA
AGCTTGTTGGTATCAAGGTCGTTGTTCCTTCCAAGGATTTCGCACAGAAGCATTACCATG
ATCTCAAGGAAAGACCTTTCTTCAATGGCTTGTGTGACTTCCTTAGCTCTGGTCCTGTTA
TTGCCATGGTATGGGAAGGAGAAGGTGTGATCAGATACGGGCGTAAACTGATTGGAGCCA
CCGATCCTCAGAAATCTGAGCCTGGGACAATCAGAGGAGATCTTGCCGTTGTTGTTGGGA
GGAACATAATCCATGGAAGTGATGGACCAGAGACTGCGAAGGATGAGATCAATCTGTGGT
TTAAGCCTCAAGAACTTGTCTCTTACACCAACAACGCTGAGAAGTGGATCTATGGCGACA

QA 3 782 3 782
DS 

RD RS1BS53JQ 540 0 0
TTTCTCGATTCGAACGCAAGGGCTTCAAGCTTGTTGGTATCAAGGTCGTTGTTCCTTCCA
AGGATTTCGCACAGAAGCATTACCATGATTTCAAGGAAAGACCTTTTTTCAATGGCATGT
GTGACTTCCTTAGCTCTGGTCCTGTTATCGCCATGGTATGGGAAGGAGAAGGTGTGATCA
GATACGGGCGTAAACTGATTGGAGCCACCGATCCTCAGAAATTTGAGCCTGGGACAATCC
GTGGAGATCTTGCCGTGGTTGTTGGGAGGAACATAATCCATGGAAGTGATGGACCAGAGA
CTGCGAAGGATGAGATCAATCTGTGGTTTAAGCCTCAAGAACTTGTTTTTTACACCAACA
ACGCTGAGAAGTGGATTTATGGCGACAACTAAATTCCTCTTTCTTTTTTCTTTTGACATC
CAATGAAATTGTTCTTGTTCCTTACCCCCAAACAATAAAAACAAAAGACAGGTATTACGG
ATACAAACCCATTCCGGGTTTTGTATTTTCCCTGGTGAACTCAGTTGTCAGAGCAGAAGT

QA 1 540 1 540
DS 



AS 1 3

CO CL1885Contig1 962 3 4 U
GGGCCGCCTCTTGTTTCTTTCATCGATTTCCTTTGCATTTCACACTTTTTTCGGGAAGAA
TTAATCGGAGGGAGGGAGAATGGAAGGGAGCAAAGGCGAAGCGGTGTACGATTCAATGAA
TTTGAATCCTCACCTTTTCATCAATGCAGCACTCAACATCGTCCAAGACGTTCTCGACGA
AGCTTTCCACTTCTATACCCTTGAAGCATCCAATCTCCTCAAAATCGATGAACGAACTGA
TAACAACAGGTCACGGGAGTTATCGAAAGGTATTGATCGTGTTCGTGATATGATTCAATC
GGTTCTCGACAGCCGCTTGGAGATGTGGGAACATTACTGTCTTCGATACACTTTTGCTGT
TCCTGAAGATTTTGTGCTGCTTCCGCCACAGAGATGACCGAAATATCCAGCCTTTGACAA
ACGACCAAGAGTTGGATGCAGAATCGGATTCCCTAAGGCGTAAGCTTCATTTGGTAGGAA
ACAGGTCTGTTGAGCTTAACTCGGAGCTCCATGCTTTGGAAAGAAAATCTGCTTCAAATG
CAAGACTCGTTGATGAAGCTTCAAAGCTTTATGATCAATCATCAGTGGACGATATGTTCA
AAGAAATGACAGAAGTGGCATTAGAACTTCGCACAGGGATCATCAATAGGCTGAAAGCAA
GAAAAATGAATGCTGCTGCTGAAAGCGCCAAAATGAATGATTTCTCGGCAACGCCTGCTC
CCGATGGAAAGATTGAAGACCTCGACAAATTTCTAGCCGAGTTAAGAAAGATGTGAACAT
GTTTTAACAATTGCCTCTGAACTCTCCCGTTTCGTAGATATGTTGTTTTTTGCTTTACCT
AATGGCCACTTCTCCGCCTTTCAAATGTTTGTTTTGTTAACATACAAAAAGATCTACGCA
TATCTAGATATAAAGCTTGGAACCGGAGCTCGTTTATGCTAATGAAAACCCAACTTTGAT
TC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1CR73TF U 49
AF RS1CO77TF U 1
AF RS1CO77JQ C 168
BS 1 154 RS1CO77TF
BS 155 155 RS1CR73TF
BS 156 830 RS1CO77TF
BS 831 962 RS1CO77JQ

RD RS1CR73TF 294 0 0
GG
TCGGGAAGAATTAATCGGAGGGAGGGAGAATGGAAGGGAGCAAAGGCGAAGCGGTGTACG
ATTCAATGAATTTGAATCCTCACCTTTTCATCAATGCAGCACTCAACATCGTC*AAGACG
TTCTCGACGAAGCTTTCCACTTCTATACCCTTGAAGCATCCAATCTCCTCAAAATCGATG
AACGAACTGATAACAACAGGTCACGGGAGTTATCGAAAGGTATTGATCGTGTTCGTGATA
TGATTCAATCGGTTCTCGACAGCCGCTTGGAGATGTGGGAACATTACTGTCT

QA 3 294 3 294
DS 

RD RS1CO77TF 830 0 0
GGGCCGCCTCTTGTTTCTTTCATCGATTTCCTTTGCATTTCACACTTTTTTCGGGAAGAA
TTAATCGGAGGGAGGGAGAATGGAAGGGAGCAAAGGCGAAGCGGTGTACGATTCAATGAA
TTTGAATCCTCACCTTTTCATCAATGCAGCACTCGACATCGTCCAAGACGTTCTCGACGA
AGCTTTCCACTTCTATACCCTTGAAGCATCCAATCTCCTCAAAATCGATGAACGAACTGA
TAACAACAGGTCACGGGAGTTATCGAAAGGTATTGATCGTGTTCGTGATATGATTCAATC
GGTTCTCGACAGCCGCTTGGAGATGTGGGAACATTACTGTCTTCGATACACTTTTGCTGT
TCCTGAAGATTTTGTGCTGCTTCCGCCACAGAGATGACCGAAATATCCAGCCTTTGACAA
ACGACCAAGAGTTGGATGCAGAATCGGATTCCCTAAGGCGTAAGCTTCATTTGGTAGGAA
ACAGGTCTGTTGAGCTTAACTCGGAGCTCCATGCTTTGGAAAGAAAATCTGCTTCAAATG
CAAGACTCGTTGATGAAGCTTCAAAGCTTTATGATCAATCATCAGTGGACGATATGTTCA
AAGAAATGACAGAAGTGGCATTAGAACTTCGCACAGGGATCATCAATAGGCTGAAAGCAA
GAAAAATGAATGCTGCTGCTGAAAGCGCCAAAATGAATGATTTCTCGGCAACGCCTGCTC
CCGATGGAAAGATTGAAGACCTCGACAAATTTCTAGCCGAGTTAAGAAAGATGTGAACAT
GTTTTAACAATTGCCTCTGAACTCTCCCGTTTCGTAGATATGTTGTTTTT

QA 1 830 1 830
DS 

RD RS1CO77JQ 795 0 0
ACGTTCTCGACGAAGCTTTCCACTTCTATACCCTTGAAGCATCCAATCTCCTCAAAATCG
ATGAACGAACTGATAACAACAGGTCACGGGAGTTATCGAAAGGTATTGATCGTGTTCGTG
ATATGATTCAATCGGTTCTCGACAGCCGCTTGGAGATGTGGGAACATTACTGTCTTCGAT
ACACTTTTGCTGTTCCTGAAGATTTTGTGCTGCTTCCGCCACAGAGATGACCGAAATATC
CAGCCTTTGACAAACGACCAAGAGTTGGATGCAGAATCGGATTCCCTAAGGCGTAAGCTT
CATTTGGTAGGAAACAGGTCTGTTGAGCTTAACTCGGAGCTCCATGCTTTGGAAAGAAAA
TCTGCTTCAAATGCAAGACTCGTTGATGAAGCTTCAAAGCTTTATGATCAATCATCAGTG
GACGATATGTTCAAAGAAATGACAGAAGTGGCATTAGAACTTCGCACAGGGATCATCAAT
AGGCTGAAAGCAAGAAAAATGAATGCTGCTGCTGAAAGCGCCAAAATGAATGATTTCTCG
GCAACGCCTGCTCCCGATGGAAAGATTGAAGACCTCGACAAATTTCTAGCCGAGTTAAGA
AAGATGTGAACATGTTTTAACAATTGCCTCTGAACTCTCCCGTTTCGTAGATATGTTGTT
TTTTGCTTTACCTAATGGCCACTTCTCCGCCTTTCAAATGTTTGTTTTGTTAACATACAA
AAAGATCTACGCATATCTAGATATAAAGCTTGGAACCGGAGCTCGTTTATGCTAATGAAA
ACCCAACTTTGATTC

QA 1 795 1 795
DS 



AS 1 2

CO CL1886Contig1 802 2 9 U
TGTATCCCGTTGGTGGATCCAACTCTTTGGGAACTTGGGGTTATATTGAAGCAGCAAGGG
AAATTGAGGAGCAGCTAAAATGTAGAACCGATGACCTGAAGTTTGATGATATTGTGGTGG
CATGTGGCAGTGGTGGTACGATTGCTGGTATCTCATTGGGGTCTTGGTTGGGAACACTAA
AAGCCAAGGTTCATGCTTTCTCCGTATGCGATGATCCTGATTACTTCTATGACTTTGTCC
AAGGTCTTCTGGACGGACTTCAAGCTGGTGTTAACTCTCGTGATATTGTTACCATCCACA
ATGCCAAGGGAAAAGGTTATGCCATGAACACTGCAGAGGAGCTTAAGTTTTTAAAGGACC
TAGCAAGTGCAACAAGTGTTATTCTTGATCCTGTTTACAGTGGGAAAGCTGCATACGGTT
TGATAAATGAGATGACTAAGGATCCCAAAAATTGGGAGGGAAAGAAGATATTGTTCATAC
ACACTGGTGGGCTCCTTGGGCTGTATGATAAAGTTGATCAAATGGCTTCTATGATGGGAA
ACTGGAGCCGGATGGATGTTCAAGAATCCGTCCCAAGAAAAGAAGGTGTTGGAAAAATGT
TCTAGCAGAACAAAAATCTGATTCTGTAATAATCCTGTGAAGATGAGACAGGTTGAGTCC
ACAATTATTTGTGCATTTAACATATCAATTCCTGTTAATTTTATTGTGTGTATTATGTTT
AATAGCACTATCGATGATTACGATAAATAATTGGTGTCTCCACTCTCTTTCTTTCCTATA
TATATATATATATGTTCAGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DP77TF U 11
AF RS1DW78JQ C 1
BS 1 11 RS1DW78JQ
BS 12 493 RS1DP77TF
BS 494 494 RS1DW78JQ
BS 495 540 RS1DP77TF
BS 541 541 RS1DW78JQ
BS 542 651 RS1DP77TF
BS 652 652 RS1DW78JQ
BS 653 775 RS1DP77TF
BS 776 802 RS1DW78JQ

RD RS1DP77TF 768 0 0
G
GGTGGATCCAACTCTTTGGGAACTTGGGGTTATATTGAAGCAGCAAGGGAAATTGAGGAG
CAGCTAAAATGTAGAACCGATGACCTGAAGTTTGATGATATTGTGGTGGCATGTGGCAGT
GGTGGTACGATTGCTGGTATCTCATTGGGGTCTTGGTTGGGAACACTAAAAGCCAAGGTT
CATGCTTTCTCCGTATGCGATGATCCTGATTACTTCTATGACTTTGTCCAAGGTCTTCTG
GACGGACTTCAAGCTGGTGTTAACTCTCGTGATATTGTTACCATCCACAATGCCAAGGGA
AAAGGTTATGCCATGAACACTGCAGAGGAGCTTAAGTTTTTAAAGGACCTAGCAAGTGCA
ACAAGTGTTATTCTTGATCCTGTTTACAGTGGGAAAGCTGCATACGGTTTGATAAATGAG
ATGACTAAGGATCCCAAAAATTGGGAGGGAAAGAAGATATTGTTCATACACACTGGTGGG
CTTCTTGGGCTGTATGATAAAGTTGATCAAATGGCTTCTATGATGGGAAGCTGGAGCCGG
ATGGATGTTCAAGAATCCGTCCCAAGAAAAGAAGGTGTTGGAAAAATGTTCTAGCAGAAC
AAAAATCTGATTCTGTAATAATCCTGTGAAGATGAGACAG*TTGAGTCCACAATTATTTG
TGCATTTAACATATCAATTCCTGTTAATTTTATTGTGTGTATTATGTTTAATAGCACTAT
CGATGATTACGATAAATAATTGGTGTCTCCACTCTCTTTCTTTC
TAT

QA 2 765 2 765
DS 

RD RS1DW78JQ 802 0 0
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AAATTGAGGAGCAGCTAAAATGTAGAACCGATGACCTGAAGTTTGATGATATTGTGGTGG
CATGTGGCAGTGGTGGTACGATTGCTGGTATCTCATTGGGGTCTTGGTTGGGAACACTAA
AAGCCAAGGTTCATGCTTTCTCCGTATGCGATGATCCTGATTACTTCTATGACTTTGTCC
AAGGTCTTCTGGACGGACTTCAAGCTGGTGTTAACTCTCGTGATATTGTTACCATCCACA
ATGCCAAGGGAAAAGGTTATTCCATGAACACTGCAGAGGAGCTTAAGTTTTTAAAGGACC
TAGCAAGTGCAACAAGTGTTATTCTTGATCCTGTTTACAGTGGGAAAGCTGCATACGGTT
TGATAAATGAGATGACTAAGGATCCCAAAAATTGGGAGGGAAAGAAGATATTGTTCATAC
ACACTGGTGGGCTCCTTGGGCTGTATGATAAAGTTGATCAAATGGCTTCTATGATGGGAA
ACTGGAGCCGGATGGATGTTCAAGAATCCGTCCCAAGAAAAGAAGGTGTTGGAAAAATGT
TCTAGCAGAACAAAAATCTGATTCTGTAATAATCCTGTGAAGATGAGACAGGTTGAGTCC
ACAATTATTTGTGCATTTAACATATCAATTCCTGTTAATTTTATTGTGTGTATTATGTTT
AATAGCACTATCGATGATTACGATAAATAATTGGTGTCTCCACTCTCTTTCTTTCCTATA
TATATATATATATGTTCAGTGG

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 4

CO CL1887Contig1 893 4 5 U
GAACTCGTGGAACTAGCGCTTAAAGTAAATAACAAAGCTTTGAAAGCTCTCTTCAATGCC
ACCGAGCTTGATGTTGATGGTGATTTCTTATACTTCGTAGCTGATGCACAAGTTATGGCG
TTCCAGTACGGAAATCCAGATAAACTATGTGTTCCTATGGTGGAAGCTAAGAAGAACGGT
GGTGATTTAGTGGAAGCATATGCTAAATATGTTAGAGAGTATTGCTTCGGAGTTTTTGGG
TTAAGCGCTAAAACATATAGCAGGAAACATCTGCTAGACACTGCCATTACCCCAGAGAGT
TCAGATCGTTTGTGGTGGTTCCAAGTTTGCACTGAAGTGGCGTATTTTCAGGTGGCGCCT
GCAAACGATAGCATCCGGTCTCATCAAGTCAATACAGAGTATCATTTGGATCTATGCAAG
AGTCTGTTTGGTAAAGGTGTTTATCCTGAAGTTGATGCAACAAACCTGTACTATGGAGGT
GATAGAATTGCTGGAACTAAAATCATCTTCACAAATGGGTCACAAGATCCATGGCGTCAT
GCATCCAAACAGACCTCATCTCCTGACCTGCCTTCTTACATTGTGAAATGTCACAACTGT
GGCCATGGAAGTGATCTTAGAGGATGCCCTCAGTCTCCATTGATCATTGAAGGTGATTCC
AAGAATTGCAGTTCACCAGATGCGGTGAACAAAGTGAGGCAGCATATAGTAGAACACATC
GACTTGTGGCTCTCTGAGTGCCGTGGAGTGCTTAGGAGTTCCATCTAGAGTTGCACACCT
CACACACATACTCACGTTTCTATCAAACATCATATCAATCTTCCAAACTTGTATCTATAT
ACATTTAACCTCCCATGTACGTTTCAAACTTTTATTTATGAATCCTTTGAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FD35TF U 1
AF RS1EW39JQ C 278
AF RS1FZ71TF U 667
AF RS1GQ65TF U 667
BS 1 528 RS1FD35TF
BS 529 529 RS1EW39JQ
BS 530 751 RS1FD35TF
BS 752 875 RS1FZ71TF
BS 876 893 RS1EW39JQ

RD RS1FD35TF 751 0 0
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TTCCAGTACGGAAATCCAGATAAACTATGTGTTCCTATGGTGGAAGCTAAGAAGAACGGT
GGTGATTTAGTGGAAGCATATGCTAAATATGTTAGAGAGTATTGCTTCGGAGTTTTTGGG
TTAAGCGCTAAAACATATAGCAGGAAACATCTGCTAGACACTGCCATTACCCCAGAGAGT
TCAGATCGTTTGTGGTGGTTCCAAGTTTGCACTGAAGTGGCGTATTTTCAGGTGGCGCCT
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AGTCTGTTTGGTAAAGGTGTTTATCCTGAAGTTGATGCAACAAACCTGTACTATGGAGGT
GATAGAATTGCTGGAACTAAAATCATCTTCACAAATGGGTCACAAGATTCATGGCGTCAT
GCATCCAAACAGACCTCATCTCCTGACCTGCCTTCTTACATTGTGAAATGTCACAACTGT
GGCCATGGAAGTGATCTTAGAGGATGCCCTCAGTCTCCATTGATCATTGAAGGTGATTCC
AAGAATTGCAGTTCACCAGATGCGGTGAACAAAGTGAGGCAGCATATAGTAGAACACATC
GACTTGTGGCTCTCTGAGTGCCGTGGAGTGC

QA 1 751 1 751
DS 

RD RS1EW39JQ 616 0 0
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AGTATCATTTGGATTTATGCAAGAGTTTGTTTGGTAAAGGTGTTTATCCTGAAGTTGATG
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GGTCACAAGATCCATGGGGTCATGCATCCAAACAGACCTCATTTCCTGACCTGCCTTTTT
ACATTGTGAAATGTCACAACTGTGGCCATGGAAGTGATTTTAGAGGATGCCCTCAGTTTC
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GGCAGCATATAGTAGAACACATCGACTTGTGGCTCTTTGAGTGCCGTGGAGTGCTTAGGA
GTTCCATCTAGAGTCGCACACCTCACACACATACTCACGTTTTTATCAAACATCATATCA
ATTTTCCAAACTTGTATCTATATACATTTAACCTCCCATGTACGTTCCAAACTTTTATTT
ATGAATCCTTTGAGCT

QA 1 616 1 616
DS 

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G
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GGCTCTCTGAGTGCCGTGGAGTGCTTAGGAGTTCCATCTAGAGTTGCACACCTCACACAC
ATACTCACGTTTCTATCAAACATCATATCAATCTTCCAAACTTGTATCTATATACATTTA
ACCTCCCATGTACGTTTCAAACTTTTAT
CT

QA 2 209 2 209
DS 

RD RS1GQ65TF 211 0 0
G
GCAGTTCACCAGATGCGGTGAACAAAGTGAGGCAGCATAAAGTAGAACACATCGACTTGT
GGCTCTCTGAGTGCCGTGGAGTGCTTAGGAGTTCCATCTAGAGTTGCACACCTCACACAC
ATACTCACGTTTCTATCAAACATCATATCAATCTTCCAAACTTGTATCTATATACATTTA
ACCTCCCATGTACGTTTCAAACTTTTAT
CT

QA 2 209 2 209
DS 



AS 1 5

CO CL1888Contig1 926 5 9 U
GGACTGACCAAAGTGTAACTTCCCCTCATTATAACACAGACACGATCTAAAGGGATCCTT
ATAATAACGAGACTGAGAGATGGCGAATGAAATACCTACCAAAGGGATCCTCAAGACCGA
AGCTCTGAAACATTACATCTTGGAAACGTCAGCATATCCAAGAGAGCATGGGCTGCTTAA
GGAACTCCGTAAAGCCACAGTCCAGAAATATGGCAATTTAAGCGAGATGGAAGTTCCGGT
TGATGAGGGCCTTCTTCTATCGATGCTTTTAAAGATCGCCAACGCTAAGAACACACTCGA
GCTCGGTGTTTTCACCGGTTACTCTCTTCTCTCCACGGCACTTGCTTTGCCTGAAGATGG
CCGCATTACTGCAATAGATATTGACAAAGAAGCCTACGAAGTGGGACTAGAGTTTATCAA
GAAGGCAGGTGTTGATCACAAGATCAATTTCATTCACTCCGATGGTATTAAGGCCTTAGA
CCAATTGGTGAAAGACAAAAAGGAGTTTGATTTCGCATTTGCGGATGCTGACAAGTCGAA
CTACGTCAACTTCCATGAGAGGCTTCTGAAATTGGTTAAGGTTGGAGGAATCATTGCGTT
CGACAACACCTTGTGGTTTGGTTTCGTGGCTGAGGACGAAGAGGGAGTTCCTGAACATAT
GAGGGAATATAGAAAGGCTCTTATAGAGTTCAATAAGAAACTGGCTTTGGATACACGAGT
TGAGGTCTCTCAGATTTCCATTGGAGATGGTTTCACGCTCTGTAGACGCCTTGTATGATC
AACAAATTCAAGACCAAGAGCAATTGGGAGTTTAGAATAAAACTGTTAGATCCTCCAATA
ATGACTTTTTCTTTGGTGTTACTATAAGTTTAATTAGTGCTTTTAATAAGATGTTTTAAC
TTTTAAGTACTTCATATCGTTTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AW68TF U 1
AF RS1FR66TF U 38
AF RS1GS96TF U 94
AF RS1FR66JQ C 326
AF RS1GS96JQ C 330
BS 1 202 RS1AW68TF
BS 203 203 RS1FR66TF
BS 204 545 RS1AW68TF
BS 546 546 RS1FR66TF
BS 547 654 RS1AW68TF
BS 655 655 RS1FR66TF
BS 656 712 RS1AW68TF
BS 713 802 RS1GS96TF
BS 803 926 RS1FR66JQ

RD RS1AW68TF 712 0 0
GGACTGACCAAAGTGTAACTTCCCCTCATTATAACACAGACACGATCTAAAGGGATCCTT
ATAATAACGAGACTGAGAGATGGCGAATGAAATACCTACCAAAGGGATCCTCAAGACCGA
AGCTCTGAAACATTACATCTTGGAAACGTCAGCATATCCAAGAGAGCATGGGCTGCTTAA
GGAACTCCGTAAAGCCACAGTCTAGAAATATGGCAATTTAAGCGAGATGGAAGTTCCGGT
TGATGAGGGCCTTCTTCTATCGATGCTTTTAAAGATCGCCAACGCTAAGAACACACTCGA
GCTCGGTGTTTTCACCGGTTACTCTCTTCTCTCCACGGCACTTGCTTTGCCTGAAGATGG
CCGCATTACTGCAATAGATATTGACAAAGAAGCCTACGAAGTGGGACTAGAGTTTATCAA
GAAGGCAGGTGTTGATCACAAGATCAATTTCATTCACTCCGATGGTATTAAGGCCTTAGA
CCAATTGGTGAAAGACAAAAAGGAGTTTGATTTCGCATTTGCGGATGCTGACAAGTCGAA
CTACGCCAACTTCCATGAGAGGCTTCTGAAATTGGTTAAGGTTGGAGGAATCATTGCGTT
CGACAACACCTTGTGGTTTGGTTTCGTGGCTGAGGACGAAGAGGGAGTTCCTGAGCATAT
GAGGGAATATAGAAAGGCTCTTATAGAGTTCAATAAGAAACTGGCTTTGGAT

QA 1 712 1 712
DS 

RD RS1FR66TF 635 0 0
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ACCAAAGTGATCCTCAAGACCGAAGCTCTGAAACATTACATCTTGGAAACGTCAGCATAT
CCAAGAGAGCATGGGCTGCTTAAGGAACTCCGTAAAGCCACAGTCCAGAAATATGGCAAT
TTAAGCGAGATGGAAGTTCCGGTTGATGAGGGCCTTCTTCTATCGATGCTTTTAAAGATC
GCCAACGCTAAGAACACACTCGAGCTCGGTGTTTTCACCGGTTACTCTCTTCTCTCCACG
GCACTTGCTTTGCCTGAAGATGGCCGCATTACTGCAATAGATATTGACAAAGAAGCCTAC
GAAGTGGGACTAGAGTTTATCAAGAAGGCAGGTGTTGATCACAAGATCAATTTCATTCAC
TCCGATGGTATTAAGGCCTTAGACCAATTGGTGAAAGACAAAAAGGAGTTTGATTTCGCA
TTTGCGGATGCTGACAAGTCGAACTACGTCAACTTCCATGAGAGGCTTCTGAAATTGGTT
AAGGTTGGAGGAATCATTGCGTTCGACAACACCTTGTGGTTTGGTTTCGTGGCTGAGGAC
GAAGAGGGAGTTCCTGAACATATGAGGGAATATAG

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1GS96TF 709 0 0
ACCTACCAAAGGGATCCTCAAGACCGAAGCTCTGAAACATTACATCTTGGAAACGTCAGC
ATATCCAAGAGAGCATGGGCTGCTTAAGGAACTCCGTAAAGCCACAGTCCAGAAATATGG
CAATTTAAGCGAGATGAAAGTTCCGGTTTATGAGGGCCTTCTTCTATCGATGCTTTTAAA
GATCGCCAACGCTAAGAGCACACTCGAGCTCGGTGTTTTCACCGGTTACTCTCTTCTCTC
CACGGCACTTGCTTTGCCTGAAGATGGCCGCATTACTGCAATAGATATTGACAAAGAAGC
CTACGAAGTGGGACTAGAGTTTATCAAGAAGGCAGGTGTTGATCACAAGATCAATTTCAT
TCACTCCGATGGTATTAAGGCCTTAGACCAATTGGTGAAAGACAAAAAGGAGTTTGATTT
CGCATTTGCGGATGCTGACAAGTCGAACTACGTCAACTTCCATGAGAGGCTTCTGAAATT
GGTTAAGGTTGGAGGAATCATTGCGTTCGACAACACCTTGTGGTTTGGTTTCGTGGCTGA
GGACGAAGAGGGAGTTCCTGAACATATGAGGGAATATAGAAAGGCTCTTATAGAGTTCAA
TAAGAAACTGGCTTTGGATACACGAGTTGAGGTCTCTCAGATTTCCATTGGAGATGGTTT
CACGCTCTGTAGACGCCTTGTATGATCAACAAATTCAAGACCAAGAGCA

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1FR66JQ 601 0 0
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AAAGAAGCCTACGAAGTGGGACTAGAGTTTATCAAGAAGGCAGGTGTTGATCACAAGATC
AATTTCATTCACTCCGATGGTATTAAGGCCTTAGACCAATTGGTGAAAGACAAAAAGGAG
TTTGATTTCGCATTTGCGGATGCTGACAAGTCGAACTACGTCAACTTCCATGAGAGGCTT
CTGAAATTGGTTAAGGTTGGAGGAATCATTGCGTTCGACAACCCCTTGTGGTTTGGTTTC
GTGGCTGAGGACGAAGAGGGAGTTCCTGAACATATGAGGGAATATAGAAAGGCTTTTATA
GAGTTCAATAAGAAACTGGCTTTGGATACACGAGTTGAGGTCTTTCAGATTTCCATTGGA
GATGGTTTCACGCTCTGTAGATGCCTTGTATGATCAACAAATTCAAGACCAAGAGCAATT
GGGAGTTTAGAATAAAACTGTTAGATCCTCCAATAATGACTTTTTCTTTGGTGTTACTAT
AAGTTTAATTAGTGCTTTTAATAAGATGTTTTAACTTTTAAGTACTTCATATCGTTTATC
C

QA 1 601 1 601
DS 

RD RS1GS96JQ 579 0 0
TCTCCACGGCACTTGCTTTGCCTGAAGATGGCCGCATTACTGCAATAGATATTGACAAAG
AAGCCTACGAAGTGGGACTAGAGTTTATCAAGAAGGCAGGTGTTGATCACAAGATCAATT
TCATTCACTCCGATGGTATTAAGGCCTTAGACCAATTGGTGAAAGACAAAAAGGAGTTTG
ATTTCGCATTTGCGGATGCTGACAAGTCGAACTACGTCAACTTCCATGAGAGGCTTCTGA
AATTGGTTAAGGTTGGAGGAATCATTGCGTTCGACAACACCTTGTGGTTTGGTTTCGTGG
CTGAGGACGAAGAGGGAGTTCCTGAACATATGAGGGAATATAGAAAGGCTCTTATAGAGT
TCAATAAGAAACTGGCTTTGGATACACGAGTTGAGGTCTCTCAGATTTCCATTGGAGATG
GTTTCACGCTCTGTAGACGCCTTGTATGATCAACAAATTCAAGACCAAGAGCAATTGGGA
GTTTAGAATAAAACTGTTAGATCCTCCAATAATGACTTTTTCTTTGGTGTTACTATAAGT
TTAATTAGTGCTTTTAATAAGATGTTTTAACTTTTAAGT

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

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CCATAGTTAAAACATTCATTACAACTTGAAAAGAAACCAAACATAAAAGAGACCCGGAGT
AGTTGACCAAAAAAAAAAAGAGACCCGGAGTCATAATAGATCGATAACACCACATAGCAC
AGATAATAAACGGGCAAACAAAGACGGAATCTTCAAATTTGCATAGCATCTTGTTCGTCT
TATTCTTCTCCATCAGCTTCGACTGGTTCGCTAAACATATACTGACTCTGATACTCGACG
AGGTACTGCATCGATCTCCTCGCATCCAAGAACAATCGATAAACTCTGTTGATATCCTCA
ATCTCCACGACTTTCCCTTTCCGTTTCTGGCAAGACAACGCACCGGCCGTAATCAGATGA
ATCGCATACCTCAAAAAAGTATAACGTCCGATCAAAGTCAAAAGCTGCTTGGCCTCCTCG
TTCATCTCGACGTCCTCTTCTTGGCAACGAATCTCCAAGATCTTCCTTATGTCCTCGTCC
GTGTAAGGCTGAGTTGTGATGATGAGGAAACGGTCGAGGAGATCGATCGGGATCCCGTGG
GGTGATTTCTGGTTCGTCCCGCGGATCGTCGTGACTCCTCGGTTGGTTGCCACGACGAGG
ATCGGTGACATTTCGTTCTCGAGGGCTCGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EY84JQ U 156
AF RS1EA89JQ U 1
BS 1 204 RS1EA89JQ
BS 205 205 RS1EY84JQ
BS 206 215 RS1EA89JQ
BS 216 216 RS1EY84JQ
BS 217 402 RS1EA89JQ
BS 403 403 RS1EY84JQ
BS 404 568 RS1EA89JQ
BS 569 569 RS1EY84JQ
BS 570 692 RS1EA89JQ

RD RS1EY84JQ 423 0 0
ATAA
ATCGATAACACCACATAGCACAGATAATAAACGGGCAAACAAAGACGGAATCTTCAAATT
TGCATAGCATCTTGTTCGTCTTCTTCTTCTCCATCAGCTTCGACTGGTTCGCTAAACATA
TACTGACTCTGATACTCGACGAGGTACTGCATCGATCTCCTCGCATCCAAGAACAATCGA
TAAACTCTGTTGATATCCTCAATCTCCACGACTTTCCCTTTCCGTTTCTGGCAAGACAAC
GCACCGGCCGTAATCAGATGAATCGCATACCTCAAAAAAGTATCACGTCCGATCAAAGTC
AAAAGCTGCTTGGCCTCCTCGTTCATCTCGACGTCCTCTTCTTGGCAACGAATCTCCAAG
ATCTTCCTTATGTCCTCGTCCGTGTAAGGCTGAGTTGTGATGATGAGGAAACGGTCGAG

QA 5 423 5 423
DS 

RD RS1EA89JQ 692 0 0
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AGTTGACCAAAAAAAAAAAGAGACCCGGAGTCATAATAGATCGATAACACCACATAGCAC
AGATAATAAACGGGCAAACAAAGATGGAATCTTCAGATTTGCATAGCATCTTGTTCGTCT
TATTCTTCTCCATCAGCTTCGACTGGTTCGCTAAACATATACTGACTCTGATACTCGACG
AGGTACTGCATCGATCTCCTCGCATCCAAGAACAATCGATAAACTCTGTTGATATCCTCA
ATCTCCACGACTTTCCCTTTCCGTTTCTGGCAAGACAACGCAGCGGCCGTAATCAGATGA
ATCGCATACCTCAAAAAAGTATAACGTCCGATCAAAGTCAAAAGCTGCTTGGCCTCCTCG
TTCATCTCGACGTCCTCTTCTTGGCAACGAATCTCCAAGATCTTCCTTATGTCCTCGTCC
GTGTAAGGCTGAGTTGTGATGATGAGGAGACGGTCGAGGAGATCGATCGGGATCCCGTGG
GGTGATTTCTGGTTCGTCCCGCGGATCGTCGTGACTCCTCGGTTGGTTGCCACGACGAGG
ATCGGTGACATTTCGTTCTCGAGGGCTCGGTT

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 5

CO CL1890Contig1 537 5 12 U
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AACGTGTTCTTCTATTCCTTACTTCTTTTATGTTTCGTCTTTTCCATATATCTTCCTCAT
ACCCTACTCAGACACCATAACTTGATTGACTATTTTATACGTCATTTATTAAAAAAA


BQ
30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C706JQ C 1
AF RS1FS89JQ C 1
AF RS1FS89TF U 1
AF RS1C706TF U 1
AF RS1ER57TF U 1
BS 1 207 RS1FS89TF
BS 208 208 RS1C706TF
BS 209 291 RS1FS89TF
BS 292 292 RS1C706TF
BS 293 294 RS1FS89TF
BS 295 295 RS1C706TF
BS 296 350 RS1FS89TF
BS 351 351 RS1C706TF
BS 352 369 RS1FS89TF
BS 370 370 RS1C706TF
BS 371 420 RS1FS89TF
BS 421 537 RS1ER57TF

RD RS1C706JQ 437 0 0
GGAGACCTGCAAGAAACAAAAAAAAGTAACAAAACTACCAAACAAAAAGAAGAAAATAAA
CCCTTTCAGGTCTCAACTAAAAATGGAGATGAAGAAGATTGCTTGCGGAGTTCTTTTCGC
TGCTGCTTCCATGACCGCCGTCATGGCAACAGAAGTTGGAGCTCCAGCACCAGGACCCGC
CGCAAGCGGAGCCTCTGTAGCCTTACCGGCTCTTGGCTCTTTGGTTGGGGCTTCCCTTGT
GTCTCTCTTCACCTACTACTTGAACTAAATTAAGCTTATACCAAAAAAAAA*TTGATTTC
TCTACCATGTCCGATTTTGAACGTGTTGTTTAGACAGGCAAAGTGAATAATACGGAAGAG
CTAATAATTTGATTATGATCAGACAAATTTTATGTAATGCTGATTAATAAAAATAAATAA
AATGTGTTCTTCTATCC

QA 1 420 1 420
DS 

RD RS1FS89JQ 432 0 0
GGAGACCTGCAAGAAACAAAAAAAAGTAACAAAACTACCAAACAAAAAGAAGAAAATAAA
CCCTTTCAGGTCTCAACTAAAAATGGAGATGAAGAAGATTGCTTGCGGAGTTCTTTTCGC
TGCTGCTTCCATGACCGCCGTCATGGCAACAGAAGTTGGAGCTCCAGCACCAGGACCCGC
CGCAAGCGGAGCCTCTGTAGCCGTACCCGCTCTTGGCTCTTTGGTTGGGGCTTCCCTTGT
GTCTCTCTTCACCTACTACTTGAACTAAATTAAGCTTATACCAAAAAAAAAATTAATTTC
TCTACCATGTCCGATTTTGAACGTGTTGTTTAGACAGGCAAAGTGAATAAGACGGAAGAG
CTAATAATTCGATTATGATCAGACAAATTTTATGTAATGCTGATTAATAAAAATAAATAA
TTGTGTTCTTCC

QA 1 420 1 420
DS 

RD RS1FS89TF 432 0 0
GGAGACCTGCAAGAAACAAAAAAAAGTAACAAAACTACCAAACAAAAAGAAGAAAATAAA
CCCTTTCAGGTCTCAACTAAAAATGGAGATGAAGAAGATTGCTTGCGGAGTTCTTTTCGC
TGCTGCTTCCATGACCGCCGTCATGGCAACAGAAGTTGGAGCTCCAGCACCAGGACCCGC
CGCAAGCGGAGCCTCTGTAGCCGTACCCGCTCTTGGCTCTTTGGTTGGGGCTTCCCTTGT
GTCTCTCTTCACCTACTACTTGAACTAAATTAAGCTTATACCAAAAAAAAAATTAATTTC
TCTACCATGTCCGATTTTGAACGTGTTGTTTAGACAGGCAAAGTGAATAAGACGGAAGAG
CTAATAATTCGATTATGATCAGACAAATTTTATGTAATGCTGATTAATAAAAATAAATAA
TTGTGTTCTTCC

QA 1 420 1 420
DS 

RD RS1C706TF 437 0 0
GGAGACCTGCAAGAAACAAAAAAAAGTAACAAAACTACCAAACAAAAAGAAGAAAATAAA
CCCTTTCAGGTCTCAACTAAAAATGGAGATGAAGAAGATTGCTTGCGGAGTTCTTTTCGC
TGCTGCTTCCATGACCGCCGTCATGGCAACAGAAGTTGGAGCTCCAGCACCAGGACCCGC
CGCAAGCGGAGCCTCTGTAGCCTTACCGGCTCTTGGCTCTTTGGTTGGGGCTTCCCTTGT
GTCTCTCTTCACCTACTACTTGAACTAAATTAAGCTTATACCAAAAAAAAA*TTGATTTC
TCTACCATGTCCGATTTTGAACGTGTTGTTTAGACAGGCAAAGTGAATAATACGGAAGAG
CTAATAATTTGATTATGATCAGACAAATTTTATGTAATGCTGATTAATAAAAATAAATAA
AATGTGTTCTTCTATCC

QA 1 420 1 420
DS 

RD RS1ER57TF 537 0 0
GGT
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TTTCAGGTCTCAACTAAAAATGGAGATGAAGAAGATTGCTTGCGGAGTTCTTTTCGCTGC
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ATAATTTGATTATGATCAGACAAATTTTATGTAATGCTGATTAATAAAAATAAATAAAAC
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CTACTCAGACACCATAACTTGATTGACTATTTTATACGTCATTTATTAAAAAAA

QA 4 537 4 537
DS 



AS 1 5

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AAGTGTGTTTAAATTCAATTGAAGGCTCCACAGTCACGACGGATATTACCATTACGACCG
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TGATCTGACGTGAACAATCCTTTCCCTTGTTGCAAGTTTTTGTAGTAAACGTTGTCGAAT
TGTCTAGGTGTTGTTGGGTCCATGTTTATAGCCACCCTTGGGTCTATGTTTCTAGGACAT
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TTATTGACGTTGTCCGTCGGCTGGGGCAGCTTTCCCTCGACGCTAGCCGCCGTTGACGAT
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TCACGAGTAGCTATTGTGATAATATCAGCGCAAGAAACTTTGTTACGACAGTTTGCAACG
GCGTCAAGAGCTTCTTTGGCTTTATTGACGGTGTCGAACCCATCACCGGCCAGGGACAAA
TTATCCGGATGATCTTTCTCCGCCTTGTTATTACCGGTTGATGCTATCATCACCGAGGCA
TCGCAACCGTTGACGAAACAATCGTGGAAATAGAGGCGGAGAGTAGCGGGGATGGTGGTG
AAAGTTTGTTGGACTTTTTTTTGAACTGCGTTTCTGACGATTTGTTCGACGTTGGGACAA
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AAGATAAAGAGCAATAAGAGATTCTTCGCAGCCATTTTAGCTGTTTTAACTATTTCAACT
CGCTTTCTCTCTTTATATATGATTTCAATTTGTGTTATTTATCTATGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
5 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D941JQ U 46
AF RS1AG25JQ U 1
AF RS1A806JQ U 7
AF RS1AG25TF C 388
AF RS1A806TF C 382
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DS 

RD RS1AG25JQ 682 0 0
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AAGTGTGTTTAAATTCAATTGAAGGCTCCACAGTCACGACGGATATTACCATTACGACCG
GTTTTAACACCAACACGACCAAGCTTGATCATGGAGTTAGTAAAAGCTTGATTAAACAAG
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QA 1 682 1 682
DS 

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TTATTGGCCCATAAGTCAACGGTTGGCTTTGACCGACGGTCTGTGAACAAATCTTGATCT
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A

QA 1 888 1 888
DS 

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TTTCTGACGATTTGTTCGACGTTGGGACAACTTCCGGCGTAGAAGTTACGGCGGAGTTGA
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TGTGTTATTTATCTATGATTCC

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TGGGGTCTACTTGCGTTGTCTTGTTGAAACTGTAAATTCTGTTGAACACTTTGGTGCAAT
GAGCGAATCCTAATGTGTGCGCTCCGGAGAGAGCGACCATGTCGTTAAGGCTAAGGCCGT
TTTTGGCAAAAAGTGAAGTGAGTTTATTGACGTTGTCCGTCGGCTGGGGCAGCTTTCCCT
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GTCCACCCGCGAGATTAACGACGTCACGAGTAGCTATTGTGATAATATCAGCGCAAGAAA
CTTTGTTACGACAGTTTGCAACGGCGTCAAGAGCTTCTTTGGCTTTATTGACGGTGTCGA
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GGAGAGTAGCGGGGATGGTGGTGAAAGTTTGTTGGACTTTTTTTTGAACTGCGTTTCTGA
CGATTTGTTCGACGTTGGGACAACTTCCGGCGTAGAAGTTACGGCGGAGTTGAGCGGAGA
CGAGGTTAACGGTGAGAAAAAGAAAGATAAAGAGCAATAAGAGATTCTTCGCAGCCATTT
TAGCTGTTTTAACTATTTCAACTCGCTTTCTC
CC

QA 17 828 17 828
DS 



AS 1 3

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CTTTCAAATATTTTTGTTCTCTTGACCTTTTTATGCCGAACTACAAGTGCAGCGAAAGAG
TCATTGAATAAGAAGAAAGAATAAACTAAGTAAAAAGCTAAAGTCTCTGCATTTAAAAGC
AGAGAAGCTTTTTTCGAGAGTAAACACATTATTCGACATTTCATTCTTATTTCATCCTTT
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TCCATCATCATCATCATACCGCCTTTTGTTGCAACTCAGCAGCACTAACACCAACAGCTT
CATCAGGTATAAACCTTCCCCAGAACCAGTGTGCCTTCCACACTCTGTTCATCTCTTCGA
TTGGTACATTCTTCGTCTCAGGCAACATCAAGTAGATGAATATCGTCATTATGAAGACAA
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GAGCTACAAGGAATGTGAAGAACATGTTGACCGCTACGTTAATGGCTTGTGCTGCTGATC
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BC20JQ U 80
AF RS1DY13JQ U 1
AF RS1FU96JQ U 114
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G
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ATAAACTAAGTAAAAAGCTAAAGTCTCTGCATTTAAAAGCAGAGAAGCTTTTTTCGAGAG
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CAAGTTTTCTCCCAAGTCTTTTCCTCAAACAAAATGTTGTTCCATCATCATCATCATACC
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CAGAACCAGTGTGCCTTCCACACTCTGTTCATCTCTTCGATCGGTACATTCTTCGTCTCA
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CCAAATTTGACTCCA
ATCACG

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TCATTGAATAAGAAGAAAGAATAAACTAAGTAAAAAGCTAAAGTCTCTGCATTTAAAAGC
AGAGAAGCTTTTTTCGAGAGTAAACACATTATTCGACATTTCATTCTTATTTCATCCTTT
TATTCATCACCTTTCTCTTTCAAGTTTTCTCCCAAATCTTTTCCTCAAACAAAATGTTGT
TCCATCATCATCATCATACCGCCTTTTGTTGCAACTCAGCAGCACTAACACCAACAGCTT
CATCAGGTATAAACCTTCCCCAGAACCAGTGTGCCTTCCACACTCTGTTCATCTCTTCGA
TTGGTACATTCTTCGTCTCAGGCAACATCAAGTAGATGAATATCGTCATTATGAAGACAA
ACACCGCAAAGAAGAAGAATAGTCCAAACTTCATGTGACAGAGCATTGCGAGGAAGAGCT
GAGCTACAAGGAATGTGAAGAACATGTTGACCGCTACGTTAATGGCTTGTGCTGCTGATC
GGATCTCTAGAGGAGATATCTCACTAGGTACCAGCCATCCCAACGGTCCCCATGACCAGG
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DS 

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GAAAGAGTCATTGAATAAGAAGAAAGAATAAACTAAGTAAAAAGCTAAAGTCTCTGCATT
TAAAAGCAGAGAAGCTTTTT*CGAGAGTAAACACATTATTCGACATTTCATTCTTATTTC
ATCCTTTTATTCATCACCTTTCTCTTTCAAGTTTTCTCCCAAATCTTTTCCTCAAACAAA
ATGTTGTTCCATCATCATCATCATACCGCCTTTTGTTGCAACTCAGCAGCACTAACACCA
ACAGCTTCATCAGGTATAAACCTTCCCCAGAACCAGTGTGCCTTCCACACTCTGTTCATC
TCTTCGATTGGTACATTCTTCGTCTCAGGCAACATCAAGTAGATGAATATCGTCATTATG
AAGACAAACACCGCAAAGAAGAAGAATAGTCCAAACTTCATGTGACAGAGCATTGTGAGG
AAGAGCTGAGCTACAAGGAATGTGAAGAACATGTTGACCGCTACGTTAATGGCTTGTGCT
GCTGATCGGATCTCTAGAGGAGATATCTCACTAGGTACCAGCCATCCCAACGGTCCCCAT
GACCAGGCGAAACCCGCTACATAGATGCAGATCAGTGCCACGATTACATTAGCATCGGTT
TTCCCTATGTTCCCTGTTCCAGCTGTTCCAAATTTGACTCCAATCATGATTCCAATAGCG
ATCTGAGAGATAAGCATTTGGATACCTCC
CTGG

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 5

CO CL1893Contig1 1036 5 17 U
ATCAAACTTTCCTTCCAGATGACGGTTTCTATTATTAGCTTTGGATATGAGTACATGTAT
TTCTATTTGTAAATAGCTCATATACCACCTCCATAACACAGAAAAATCTGATGAACTTAT
GATGCCATGAAAAGCTTAAGATATATTCTCTTTACATTTTGAGCTTCAGGGCAAAATAAA
AATAAACAAAAAGGCTCCATTGTGTTTGATTTTGGAATCCTACTGGCTAGAGACATAAAC
TCTGTTCCAATGTTGTTGACGAACTAAAATCTTGAAATCTAGTTGTTTATTCGCACATAC
TCTCTAGCTGCTTTCTCTAAAAGTGCTGACTCTTGCTTCAGGTTCTACAGGATCAATTCT
CACCTCTATGCTCTCTCTTGGTGTTGCTTCAACCTCATCAGCTTCATCGCAATCTCCTAA
TATCTTTTGACATGTCTCAACCAGACAGTGTCTACATTTAGGACAAGTCATATGTTGTGT
AAGCCACTTGTCGATACAACGAACGTGGAACCCATGGTTACACTTTGGAAGCAGCCGTAT
CTGTTCTCCAGCTACGAAATCAGACAAGCAAATGACACACTCTTCGCCAACCCC*TGACA
AGTTCATCTCAGGTGAGTAAGTCACTACCGGGAACATCTTGAGAACTTTCTTCTTGATGC
CTTTGTTTGCTGCTGAGCCTCGTGGTGTGGACGGGATTGGGATGGGATCAGAGATCATGA
AACTCGAGGAACGTCTAAATGCGCAACGGATTATGTAATGCAACCCTAGTGAGCAGATGA
TACCGCAGACAAGGATAGAGAGAAGCAGGAGAATGTTGCCGCTCAAGTTGTTCTTGTCAG
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CTGAAGACATCTTTACTCTTTTTTTTTTCTCTTTTGATTTGGTTTCTCTTATGCTGTTTT
GCTATGTTTTATTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GA16JQ U 15
AF RS1H394JQB U 108
AF RS1B796JQ U 1
AF RS1H394TF C 347
AF RS1GA16TF C 431
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BS 1031 1036 RS1GA16TF

RD RS1GA16JQ 425 0 0
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CTCCATTGTGTTTGATTTTGGAATCCTACTGGCTAGAGACATAAACTCTGTTCCAATGTT
GTTGACGAACTAAAATCTTGAAATCTAGTTGTTTATTCCCACATACTCTCTAGCTGCTTT
CTCTAAAAGTGCTGACTCTTGCTTCAGGTTCTACAGGATCAATTCTCACCTCTATGCTCT
CCCTTGGTGTTGCTTCAACCTCATCAGCTTCATCGCAATCTCCTAATATCTTTTGACATG
TCTCA

QA 1 425 1 425
DS 

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TAGAGACATAAACTCTGTTCCAATGTTGTTGACGAACTAAAATCTTGAAATCTAGTTGTT
TATTCGCACATACTCTCTAGCTGCTTTCTCTAAAAGTGCTGACTCTTGCTTCAGGTTCTA
CAGGATCAATTCTCACCTCTATGCTCTCTCTTGGTGTTGCTTCAACCTCATCAGCTTCAT
CGCAATCTCCTAATATCTTTTGACATGTCTCAACCAAACAGTGTCTACATTTAGGACAAG
TCATATGTTGTGTAAGCCACTTGTCGATACAACGAACGTGGAACCCATGGTTACACTTTG
GAAGCACCCGTATCTGTTCTCCAGCTACGAAATCAGACA

QA 1 459 1 459
DS 

RD RS1B796JQ 788 0 0
ATCAAACTTTCCTTCCAGATGACGGTTTCTATTATTAGCTTTGGATATGAGTACATGTAT
TTCTATTTGTAAATAGCTCATATACCACCTCCATAACACAGAAAAATCTGATGAACTTAT
GATGCCATGAAAAGCTTAAGATATATTCTCTTTACATTTTGAGCTTCAGGGCAAAATAAA
AATAAACAAAAAGGCTCCATTGTGTTTGATTTTGGAATCCTACTGGCTAGAGACATAAAC
TCTGTTCCAATGTTGTTGACGAACTAAAATCTTGAAATCTAGTTGTTTATTCGCACATAC
TCTCTAGCTGCTTTCTCTAAAAGTGCTGACTCTTGCTTCAGGTTCTACAGGATCAATTCT
CACCTCTATGCTCTCCCTCGGTGTTGATTCAACCTCATCAGCTTCATCGCAATCTCCTAA
TATCTTTTGACATGTCTCAACCAGACAGTGTCTACATTTAGGACAAGTCATATGTTGTGT
AAGCCACTTGTCGATACAACGAACGTGGAACCCATGGTTACACTTTGGAAGCAGCCGTAT
CTGTTCTCCAGCTACGAAATCAGACAAGCAAATGACACACCCTTCGCCAACCCC*TGACA
AGTTCATCTCAGGTGAGTAAGTCACTACCGGGAACATCTTGAGAACCTTCTTCCTGATGC
CTTTGTTTGCTGCTGAGCCTCGTGGTGTGGACGGGATTGGGATGGGATCAGAGATCATGA
AACTCGAGGAACGTCTAAATGCGCAACGGATTATGTAATGCAACCCTAGTGAGCAGATGA
TACCGCAG

QA 1 788 1 788
DS 

RD RS1H394TF 687 0 0
ACAGGATCAATTCTCACCTCTATGCTCTCTCTTGGTGTTGCTTCAACCTCATCAGCTTCA
TCGCAATCTCCTAATATCTTTTGACATGTCTCAACCAGACAGTGTCTACATTTAGGACAA
GTCATATGTTGTGTAAGCCACTTGTCGATACAACGAACGTGGAACCCATGGTTACACTTT
GGAAGCAGCCGTATCTGTTCTCCAGCTACGAAATCAGACAAGCAAATGACACACTCTTCG
CCAACCCC*TGACAAGTTCATCTCAGGTGAGTAAGTCACTACCGGGAACATCTTGAGAAC
TTTCTTCTTGATGCCTTTGTTTGCTGCTGAGCCTCGTGGTGTGGACGGGATTGGGATGGG
ATCAGAGATCATGAAACTCGAGGAACGTCTAAATGCGCAACGGATTATGTAATGCAACCC
TAGTGAGCAGATGATACCGCAGACAAGGATAGAGAGAAGCAGGAGAATGTTGCCGCTCAA
GTTGTTCTTGTCAGGTACTTGAGCTTGTTGCTGTTGTATGTTGTGATGAAAAGGAAGCTG
CTGAAGCAATTTTCTTGAGAGGAAGCTGTTGATGGAGTGTTCTTGGAAGGCTTGAGATGA
AGAAGGTGAGTGATCTGAAGACATCTTTACTCTTTTTTTTT*CTCTTTTGATTTGGTTTC
TCTTATGCTGTTTTGCTATGTTTT
TCC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1GA16TF 606 0 0
CATGTCTCAACCAGACAGTGTCTACATTTAGGACAAGTCATATGTTGTGTAAGCCACTTG
TCGATACAACGAACGTGGAACCCATGGTTACACTTTGGAAGCAGCCGTATCTGTTCTCCA
GCTACGAAATCAGACAAGCAAATGACACACTCTTCGCCAACCCCCTGACAAGTTCATCTC
AGGTGAGTAAGTCACTACCGGGAACATCTTGAGAACTTTCTTCTTGATGCCTTTGTTTGC
TGCTGAGCCTCGTGGTGTGGACGGGATTGGGATGGGATCAGAGATCATGAAACTCGAGGA
ACGTCTAAATGCGCAACGGATTATGTAATGCAACCCTAGTGAGCAGATGATACCGCAGAC
AAGGATAGAGAGAAGCAGGAGAATGTTGCCGCTCAAGTTGTTCTTGTCAGGTACTTGAGC
TTGTTGCTGTTGTATGTTGTGATGAAAAGGAAGCTGCTGAAGCAATTTTCTTGAGAGGAA
GCTGTTGATGGAGTGTTCTTGGAAGGCTTGAGATGAAGAAGGTGAGTGATCTGAAGACAT
CTTTACTCTTTTTTTTTTCTCTTTTGATTTGGTTTCTCTTATGCTGTTTTGCTATGTTTT
ATTCCC

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 3

CO CL1894Contig1 780 3 4 U
GGAAGTTAACATAATGATGAACTCAGCGTATCGAAGCCTTCACTTGACAGCGTCTCGTCT
GATAAACCCTAACCCCATCTCCTCTTCCCTTCTTCATTTTCTCCCTCTCTACTCCGTCAA
CGCTGGTTCTCATCGTTCCACTCCTCTCCGCCGTAGAAACGCACTGACTCCTTTCTCCTC
CTCTTCTTCTTCTTCTTTGTACGCTCCTATGGCGGCAGGAGATGACCAGGTTCATTTGCT
GGAGAAGCAGTTCGAGAGCTTCCGTGGTCAGCTCGAAGAGTCAGCAGCTTTGAGAGAGCA
GATTCGTGCTGTGGTTATGGAGATTGAGTCCGCCACCAGGCTCATTCAAGCTAACCTCCT
CCTCGTTCATCAGTCTCGACCCATTCCCGAGATTATCGAGAAAGCTAAGGAAAAGATGGA
TGATTTGAAGAAGTTCTACGGTCGGCTTGCTGAGATCCTTCAGAAATGTCCTGGACAGTA
CTATAGGTACCATGGGGACTGGAGGAGTGAGACACAGGCAGTGGTCTCCCAGCTCGCTTT
CATGCACTGGCTAGAAACTGGAAGTCTCCTTGTGCATACCGAAGCTGAAGCAAAACTTGG
GTTGAACAGTTTGGAGTTTGGACTGGAGACGGAAGATTATCTGACTGGAATATGCTTCAT
GTCAAACGATTTGCCTAGGTACGTGGTGAACAGAGTAACAGCAGTGACTATGACTGTCCA
AGAAAGTGATGACTTCTTGACGATCTTCATGCTGCCTTCGCATGCTCATCTCAGAACGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BV50TF U 1
AF RS1AS09TF U 44
AF RS1CV39TF U 44
BS 1 529 RS1BV50TF
BS 530 530 RS1AS09TF
BS 531 665 RS1BV50TF
BS 666 780 RS1AS09TF

RD RS1BV50TF 673 0 0
GGAAGTTAACATAATGATGAACTCAGCGTATCGAAGCCTTCACTTGACAGCGTCTCGTCT
GATAAACCCTAACCCCATCTCCTCTTCCCTTCTTCATTTTCTCCCTCTCTACTCCGTCAA
CGCTGGTTCTCATCGTTCCACTCCTCTCCGCCGTAGAAACGCACTGACTCCTTTCTCCTC
CTCTTCTTCTTCTTCTTTGTACGCTCCTATGGCGGCAGGAGATGACCAGGTTCATTTGCT
GGAGAAGCAGTTCGAGAGCTTCCGTGGTCAGCTCGAAGAGTCAGCAGCTTTGAGAGAGCA
GATTCGTGCTGTGGTTATGGAGATTGAGTCCGCCACCAGGCTCATTCAAGCTAACCTCCT
CCTCGTTCATCAGTCTCGACCCATTCCCGAGATTATCGAGAAAGCTAAGGAAAAGATGGA
TGATTTGAAGAAGTTCTACGGTCGGCTTGCTGAGATCCTTCAGAAATGTCCTGGACAGTA
CTATAGGTACCATGGGGACTGGAGGAGTGAGACACAGGCAGTGGTCTCCTAGCTCGCTTT
CATGCACTGGCTAGAAACTGGAAGTCTCCTTGTGCATACCGAAGCTGAAGCAAAACTTGG
GTTGAACAGTTTGGAGTTTGGACTGGAGACGGAAGATTATCTGACTGGAATATGCTTCAT
GTCAA
CGATTTGC

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1AS09TF 737 0 0
GG
GACAGCGTCTCGTCTGATAAACCCTAACCCCATCTCCTCTTCCCTTCTTCATTTTCTCCC
TCTCTACTCCGCCAACGCTGGTTCTCATCGTTCCACTCCTCTCCGCCGTAGAAACGCACT
GACTCCTTTCTCCTCCTCTTCTTCTTCTTCTTTGTACGCTCCTATGGCGGCAGGAGATGA
CCAGGTTCATTTGCTGGAGAAGCAGTTCGAGAGCTTCCGTGGTCAGCTCGAAGATTCAGC
AGCTTTGAGAGAGCAGATTCGTGCTGTGGTTATGGAGATTGAGTCCGCCACCAGGCTCAT
TCAAGCTAACCTCCTCCTCGTTCATCAGTCTCGACCCATTCCCGAGATTATCGAGAAAGC
TAAGGAAAAGATGGATGATTTGAAGAAGTTCTACGGTCGGCTTGCTGAGATCCTTCAGAA
ATGTCCTGGACAGTACTATAGGTACCATGGGGACTGGAGGAGTGAGACACAGGCAGTGGT
CTCCCAGCTCGCTTTCATGCACTGGCTAGAAACTGGAAGTCTCCTTGTGCATACCGAAGC
TGAAGCAAAACTTGGGTTGAACAGTTTGGAGTTTGGACTGGAGACGGAAGATTATCTGAC
TGGAATATGCTTCATGTCAAACGATTTGCCTAGGTACGTGGTGAACAGAGTAACAGCAGT
GACTATGACTGTCCAAGAAAGTGATGACTTCTTGACGATCTTCATGCTGCCTTCGCATGC
TCATCTCAGAACGAT

QA 3 737 3 737
DS 

RD RS1CV39TF 704 0 0
GG
GACAGCGTCTCGTCTGATAAACCCTAACCCCATCTCCTCTTCCCTTCTTCATTTTCTCCC
TCTCTACTCCGTCAACGCTGGTTCTCATCGTTCCACTCCTCTCCGCCGTAGAAACGCACT
GACTCCTTTCTCCTCCTCTTCTTCTTCTT***TGTACGCTCCTATGGCGGCAGGAGATGA
CCAGGTTCATTTGCTGGAGAAGCAGTTCGAGAGCTTCCGTGGTCAGCTCGAAGAGTCAGC
AGCTTTGAGAGAGCAGATTCGTGCTGTGGTTATGGAGATTGAGTCCGCCACCAGGCTCAT
TCAAGCTAACCTCCTCCTCGTTCACCAGTCTCGACCCATTCCCGAGATTATCGAGAAAGC
TAAGGAAAAGATGGATGATTTGAAGAAGTTCTACGGTCGGCTTGCTGAGATCCTTCAGAA
ATGTCCTGGACAGTACTATAGGTACCATGGGGACTGGAGGAGTGAGACACAGGCAGTGGT
CTCCCAGCTCGCTTTCATGCACTGGCTAGAAACTGGAAGTCTCCTTGTGCATACCGAAGC
TGAAGCAAAACTTGGGTTGAACAGTTTGGAGTTTGGACTGGAGACGGAAGATTATCTGAC
TGGAATATGCTTCATGTCAAACGATTTGCCTAGGTACGTGGTGAACAGAGTAACAGCAGT
GACTATGACTGTCCAAGAAAGTGATGACTTCTTGACG
GATCT

QA 3 699 3 699
DS 



AS 1 5

CO CL1895Contig1 1283 5 16 U
GGAGTTCATCATATCCTCTTTTGAAACCTAAATTAAATTCGATCCGAGACGGAAAAGCTC
GACGAGTCGCCGGCGGCGGAGTAAAACAAAAACAGTCGGAGCTATGGCGATGCAAACCGG
AATCGGCTTATCAAGGATCTTTCTCTTAGCCGGAGCAGGTTATACTGGTACGATCATGAT
GAAGAACGGCAAATTATCTGATATATTGGGTGAATTGCAGTCTCTGGTGAAGGGTATGGA
GAGATCGGGAGATGAGGGAGATTCTGATGTGTCCGATGCTATAGCTGCTCAGGTTCGTCG
GTTGGCTATGGAGGTTCGTCAGCTAGCTTCAGCAAGGCAGATAACCGTCATGAATGGAGT
TTCTGGTGCAAACTTGCAAGCTCTTGCTGTTCCTGCTGCGGCGTTGGGAGCTTTAGGATA
TGGTTATATGTGGTGGAAGGGACTCTCTTTCACTGACCTTATGTATGTGACTAAAGCCAA
CATGGCTACTGCTGTGGCTAACTTGACTAAGAATCTGGAGCAAGTTTCAGCCACCCTTGC
GGCTGCAAAAAGGCATTTAACGCAAAAGATTCAGAATATGGATGATAAGGTAGAGCACCA
GATTGATCTCTCCAAGGAAATCAAGAACCAGGTCACCTTGGCTCATGGAGATATCAACTC
GCCTGAGAGTGAGTTGCAGTCACTGAATGATTTGATTAGTGGTCTGGATGGGAAGTTGGA
CACGCTGGAATACAAGCAGGATGTCACAAATGTTTGCATGCTACACTTGTATAACTATTT
TGGAGGAAAGAGCACAAAGCTACCTGACATGGAGCAGCTTCAACTTCCTGTAAACCAGAA
AGCTCGTAATCTGCTTGGAGATGCTTGGACCAGGGGGCTGAAAAACTTTGCTGAACAACT
GCTTATAAGCAATGACACAGAGGGAGGAGCAACCACGGTGAGAAGAATTGGTATAGCCAA
GGCCAATAACAAGTCGAGGCCAGTGTTATCAAGGGTTACTTCAGCTGGGTGTTGATGTGG
AAGTTTCCTGATGGTGGTTAGCTTGCGGGATGTATATAACAACAAAACTCTAATACAAAA
TTGTCTCGTGAGCTCACGGTAGAAAGGCTCTCTTATATCTATATTCGTTGGATTGGTTTG
TCTCTCCTCCCTCTAAACTATGTTGGTTTGTACTTTGGGAGTATTTACTTGAACTTGGAG
TTTGTTTATTGACATGGGCATGTGTTGTGTCCGCTTTTTTGGACCTTTGAAGCAAATAAA
ATAAAGTTGATGTGTGGAGGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 10 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RS1H239TF U 1
AF RS1BZ25TF U 9
AF RS1BZ25JQ C 553
AF RS1CU80JQ C 677
AF RS1CU80TF U 677
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BS 275 284 RS1H239TF
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BS 286 636 RS1H239TF
BS 637 637 RS1BZ25TF
BS 638 644 RS1H239TF
BS 645 645 RS1BZ25TF
BS 646 662 RS1H239TF
BS 663 663 RS1BZ25TF
BS 664 739 RS1H239TF
BS 740 740 RS1CU80TF
BS 741 763 RS1H239TF
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BS 784 1280 RS1CU80TF
BS 1281 1283 RS1CU80JQ

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GAGATCGGGAGATGAGGGAGATTCTGATGTGTCTGATGCTATAGTTGCTCAGGTTCGTCG
GTTGGCTATGGAGGTTCGTCAGCTAGCTTCAGCAAGGCAGATAACCGTCATGAATGGAGT
TTCTGGTGCAAACTTGCAAGCTCTTGCTGTTCCTGCTGCGGCGTTGGGAGCTTTAGGATA
TGGTTATATGTGGTGGAAGGGACTCTCTTTCACTGACCTTATGTATGTGACTAAAGCCAA
CATGGCTACTGCTGTGGCTAACTTGACTAAGAATCTGGAGCAAGTTTCAGCCACCCTTGC
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QA 1 763 1 763
DS 

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GGG
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GGCGGCGGAGTAAAACAAAAACAGTCGGAGCTATGGCGATGCAAACCGGAATCGGCTTAT
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AATTATCTGATATATTGGGTGAATTGCAGTCTCTGGTGAAGGGTATGGAGAGGTCGGGAG
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AGGTTCGTCAGCTAGCTTCAGCAAGGCAGATAACCGTGATGAATGGAGTTTCTGGTGCAA
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GGTGGAAGGGACTCTCTTTCACTGACCTTATGTATGTGACTAAAGCCAACATGGCTACTG
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GGCGTTTAACGCAAAAGATTCAGAATATGGATGATAAGGTAGAGCACCAGATTGATCTCT
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DS 

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GCG
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GCAGGATGTCACAAATGTTTGCATGCTACACTTGTATAACTATTTTGGAGGAAAGAGCAC
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TGGAGATGCTGGAACCAAGGGGCTGAAAAACTTTGCTGAACAACTGCTTATAAGCAATGA
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GGTTAGCTTGCGGGATGTATATAACAACAAAACTCTAATACAAAATTGTCTCGTGAGCTC
ACGGTAGAAAGGCTCTCTTATATCTATATTCGTTGGATTGGTTCGTCTCTCCTCCCTCTA
AACTATGTTGGTTTGTACTTTGGGAGTATTTACTTGAACTTGGAGTTTGTTTATTGACAT
GGGCATGTGTTGTGTCCGCTTTTTTGGACCTTTGAAGCAAATAAAATAAAGTTGATGTGT
GGAGG

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DS 

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GG
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DS 

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GG
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GGATGTCACAAATGTTTGCATGCTACACTTGTATAACTATTTTGGAGGAAAGAGCACAAA
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AGATGCTTGGACCAGGGGGCTGAAAAACTTTGCTGAACAACTGCTTATAAGCAATGACAC
AGAGGGAGGAGCAACCACGGTGAGAAGAATTGGTATAGCCAAGGCCAATAACAAGTCGAG
GCCAGTGTTATCAAGGGTTACTTCAGCTGGGTGTTGATGTGGAAGTTTCCTGATGGTGGT
TAGCTTGCGGGATGTATATAACAACAAAACTCTAATACAAAATTGTCTCGTGAGCTCACG
GTAGAAAGGCTCTCTTATATCTATATTCGTTGGATTGGTTTGTCTCTCCTCCCTCTAAAC
TATGTTGGTTTGTACTTTGGGAGTATTTACTTGAACTTGGAGTTTGTTTATTGACATGGG
CATGTGTTGTGTCCGCTTTTTTGGACCTTTGAAGCAAATAAAATAAAGTTGATGTGTGGA
GG
ATT

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DS 



AS 1 3

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CTCGTAGATCCCTCTGTTTCCCTTTCTGTCTTTCGAATCTGAAGATCATGTGTGAGAACG
CCATGTCAGGTCATCTCAAGAAACTAACGATCGACACAGGACGTTCAGAGACTCTCGTGG
TCTGTTTCGGTGAAATGTTGATCGATTTTGTGCCAACGGTGGGAGGTGTTTCGCTCGCTG
AAGCACCAGCTTTCAAGAAAGCTCCAGGAGGTGCACCTGCTAATGTTGCTGTTGGTGTCT
CTAGACTCGGTGGCTCCTCTGCTTTCATTGGAAAGGTTGGTGATGATGAGTTTGGAAAAA
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AAGCACGTACTGCTCTCGCCTTTGTTACGCTAAGAGGTGATGGAGAGAGGGAGTTTCTGT
TCTTCAGACACCCGAGTGCCGATATGCTTCTCACGGAGTCTGAGCTTGACAAGAACTTAA
TCCAAAAGGCCAAGATCTTTCATTACGGATCAATCAGTTTGATCAAGGAACCTTGCCGAT
CGACTCATCTCGCAGCCATGAATATCGCTAAAGCCGCAGGGAGTCTCTTGTCGTATGACC
CAAACTTGAGGTTACCATTGTGGCCATCAGAGGAAGCTGCAAGGAAAGAGATCATGAGTA
TCTGGCATCTAGCTGATGTTATTAAGATCAGTGAGGACGAGATTACATTCCTGACTGGTG
GAGATGATCCTTACAGTGATGAAGTTGTGTTGCAAAAGCTGTTTCATCCAAATCTTAAGC
TTCTCGTTGTTTCAGAAGGACCTAATGGGTGTAGATACTACACTAAGGGGTTTAAAGGTA
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AGGCGCTTCTATTCGCAAACGCTTGTGGAGCCATTACTGTGACAGAGAGAGGAGCTATTC
CGGCTATGCCGACCATGGATGCTGTTCAAGAACTTGTCAAATCTTCTCGCTCCTGAAAAT
GCTCATAAAGAGTCTCTTTTTGAGTGAAATCAGTTCCATTCTCTTTCTCACTGTACCTTT
TTTTTTTCTCTCTCCTTTTCCCAATTTGTAGGAACGCAAGAATGTTGTGTGTGTGTGTGT
GTTTTAGTTTGTTGATCTTCTGGAGTTTTGATTTGGTTTTAAACTGCTTGTCGTTTATTG
GTTGCGGAGGAAGGATATTTTAGTTTTGAACTAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GT23TF U 2
AF RS1EF43TF U 1
AF RS1GT23JQ C 593
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TAGACTCGGTGGCTCCTCTGCTTTCATTGGAAAGGTTGGTGATGATGAGTTTGGAAAAAT
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CTTCAGACACCCGAGTGCCGATATGCTTCTCACGGAGTCTGAGCTTGACAAGAACTTAAT
CCAAAAGGCCAAGATCTT

QA 1 558 1 558
DS 

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CTCGTAGATCCCTCTGTTTCCCTTTCTGTCTTTCGAATCTGAAGATCATGTGTGAGAACG
CCATGTCAGGTCATCTCAAGAAACTAACGATCGACACAGGACGTTCAGAGACTCTCGTGG
TCTGTTTCGGTGAAATGTTGATCGATTTTGTGCCAACGGTGGGAGGTGTTTCGCTCGCTG
AAGCACCAGCTTTCAAGAAAGCTCCAGGAGGTGCACCTGCTAATGTTGCTGTTGGTGTCT
CTAGACTCGGTGGCTCCTCTGCTTTCATTGGAAAGGTTGGTGATGATGAGTTTGGAAAAA
TGTTAGCTGAGATTCTAAGGCTGAACAACGTGGACAACTCTGGGATGAGATTCGACCACA
AAGCACGTACTGCTCTCGCCTTTGTTACGCTAAGAGGTGATGGAGAGAGGGAGTTTCTGT
TCTTCAGACACCCGAGTGCTGATATGCTTCTCACGGAGTCTGAGCTTGACAAGAACTTAA
TCCAAAAGGCCAAGATCTTTCATTACGGATCAATCAGTTTGATCAAGGAACCTTGCCGAT
CGACTCATCTCGCAGCCATGAATATCGCTAAAGCCGCAGGGAGTCTCTTGTCGTATGACC
CAAACTTGAG*TTACCATTGTGGCCATCAGAGGAAGCTGC

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DS 

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CATGAGTATCTGGCATCTAGCTGATGTTATTAAGATCAGTGAGGACGAGATTACATTCCT
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TCTTAAGCTTCTCGTTGTTTCAGAAGGACCTAATGGGTGTAGATACTACACTAAGGGGTT
TAAAGGTAGAGTTGGTGGAGTGAAAGTGAAAGCGGTTGACACAACAGGTGCAGGAGATGC
ATTCGTGAGCGGTCTATTGAACAGCTTAGCTTCTGATCTCACTCTTCTCACTGATGAGAA
GCTAAGAGAGGCGCTTCTATTCGCAAACGCTTGTGGAGCCATTACTGTGACAGAGAGAGG
AGCTATTCCGGCTATGCCGACCATGGATGCTGTTCAAGAACTTGTCAAATCTTCTCGCTC
CTGAAAATGCTCATAAAGAGTCTCTTTTTGAGTGAAATCAGTTCCATTCTCTTTCTCACT
GTACCTTTTTTTTTTCTCTCTCCTTTTCCCAATTTGTAGGAACGCAAGAATGTTGTGTGT
GTGTGTGTGTTTTAGTTTGTTGATCTTCTGGAGTTTTGATTTGGTTTTAAACTGCTTGTC
GTTTATTGGTTGCGGAGGAAGGATATTTTAGTTTTGAACTAC

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 4

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AGGAGGAGAGATTACGATCCTCGCTTCGATTATACGCCGAAAGCGTTTGATAGAGTACCG
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TGGAGAGGAGCTGAAGGGTATCGTTTCGCAGCCATTCCTTCCTACTGAATTCAAATTAGC
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CACAGACTGTTGTTATGTTTTATTGATCTTACTTGTGAATCTTATTGTACCTCGTTTTTT
TAATCCAAATGTCGTATGCGTTTTTGAGTTTTTTTCGGCAAAGAAGACATTGAACTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H219TF U 1
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AF RS1CP95JQ C 12
AF RS1CP95TF U 12
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DS 

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GG
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GTTTTATTGATCTTACTTGTGAATCTTATTGTACCTCGTTT
TTT

QA 3 643 3 643
DS 

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GG
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TATGTTTTATTGATCTTACTTGTGAATCTTATTGTACCTCGTTTTTTTAATCCAAATGTC
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DS 

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GG
GACGAAGAACAAATGCAAATCATCTCGTCAAAGTAGAGATCCGGATCATCATCTCTATCC
TCCCGAAGACGGAATAATCCAACTCCGGTATGGCGGCGAGGAGAAACGTACGGTACGCTC
AGCTTCCAGGGGACGAAGACGATGAGGATTACGGAAACGGTGGCGGGAGGAGGAGAGATT
ACGATCCTCGCTTCGATTATACGCCGAAAGCGTTTGATAGAGTACCGTGGAAATCGATAG
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TTACTTTCCTCCCTGGGTTCTATGAGACTCGGATTGCTTACTATTCGTGGAGAGGAGCTG
AAGGGTATCGTTTCGCAGCCATTCCTTCCTACTGAATTCAAATTAGCTGGAGAGATGGTT
ACACGACTCTATCTGTGCATAAACTTATTGGAGAAATGTGATAATAGACTTGAGGTGTTT
CATGAATCAATCACTCCAAAAGGCTAGGATTATAGATAGAGATACTACACAGACTGTTGT
TATGTTTTATTGATCTTACTTGTGAATCTTATTGTACCTCGTTTTTTTAATCCAAATGTC
GTATG

QA 3 667 3 667
DS 



AS 1 5

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GAAACCGTCATTAAAAGGTTTAAAACCCTAAAAATCCATCATTAATCGAATTCCTTTATA
TATATATACATATTATTCTCTTCCCTTCTTTTTAATACTTTGTTATTTTCCTTCTTTCAA
TCAAACCCTCCTAAACGATCATCGCTTTCTTCCTCTTTAAGGTACTGATCGAATCGCCAT
GGCTAAGAACTCCTTCAAGCTCTCTAATCCTCTTGAGGTAAGAATGGCTGAATCTAGTCG
TATCAGAGAGAAGTACCAAGACAGAGTTCCCGTGATTGTGGAGAAAGCTGAACAGAGTGA
TGTTCCTGACATTGACAAGAAGAAGTATCTTGTACCAGCTGATCTAACCGTTGGGCAATT
CGTATACGTTGTGAGGAAAAGAATCAAGCTTGGAGCCGAGAAAGCAATCTTTGTCTTTGT
CAAGAACACGTTACCTCCAACTGCGGCGTTGATGTCTGCAACCTATGAAGAACACAAAGA
CGAAGATGGGTTTCTCTACATGACTTACAGTGGAGAGAACACATTTGGATCTGCATGCTA
ATCAGCTCTGCTTTTGACAGTTTGATCTTGATCATGATGATGATTGTACATTCCTTTCCC
TCTCTAGCGTTTGCTCTGTTTCGTCGACTTCAATAATGTCTTTTTTACTTTCTGGGATTT
ATGTTCTGAGCTCTCTTTATTATCTATGGATCAGTTTGATTTGATTTAACCGTCTAATTA
CATTGTTTCGTTTTAAGCATCTATATCTTCAGCATTGGTATCTGGACTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E337TF U 149
AF RS1G190TF U 1
AF RS1AP39TFB U 155
AF RS1E337JQ C 195
AF RS1G190JQ C 268
BS 1 269 RS1G190TF
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BS 271 741 RS1G190TF
BS 742 764 RS1AP39TFB
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BS 778 830 RS1E337JQ

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TTTTTAAT
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TTAAGGTACTGATCGAATCGCCATGGCTAAGAACTCCTTCAAGCTCTCTAATCCTCTTGA
GGTAAGAATGGCTGAATCTAGTCGTATCAGAGAGAAGTACCAAGACAGAGTTCCCGTGAT
TGTGGAGAAAGCTGAACAGAGTGATGTTCCTGACATTGACAAGAAGAAGTATCTTGTACC
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TGT

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DS 

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TATATATACATATTATTCTCTTCCCTTCTTTTTAATACTTTGTTATTTTCCTTCTTTCAA
TCAAACCCTCCTAAACGATCATCGCTTTCTTCCTCTTTAAGGTACTGATCGAATCGCCAT
GGCTAAGAACTCCTTCAAGCTCTCTAATCGTCTTGAGGTAAGAATGGCTGAATCTAGTCG
TATCAGAGAGAAGTACCAAGACAGAGTTCCCGTGATTGTGGAGAAAGCTGAACAGAGTGA
TGTTCCTGACATTGACAAGAAGAAGTATCTTGTACCAGCTGATCTAACCGTTGGGCAATT
CGTATACGTTGTGAGGAAAAGAATCAAGCTTGGAGCCGAGAAAGCAATCTTTGTCTTTGT
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CGAAGATGGGTTTCTCTACATGACTTACAGTGGAGAGAACACATTTGGATCTGCATGCTA
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TCTCTAGCGTTTGCTCTGTTTCGTCGACTTCAATAATGTCTTTTTTACTTTCTGGGATTT
ATGTTCTGAGCTCTCTTTATT
TC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1AP39TFB 610 0 0
GG
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TTAAGGTACTGATCGAATCGCCATGGCTAAGAACTCCTTCAAGCTCTCTAATCCTCTTGA
GGTAAGAATGGCTGAATCTAGTCGTATCAGAGAGAAGTACCAAGACAGAGTTCCCGTGAT
TGTGGAGAAAGCTGAACAGAGTGATGTTCCTGACATTGACAAGAAGAAGTATCTTGTACC
AGCTGATCTAACCGTTGGGCAATTCGTATACGTTGTGAGGAAAAGAATCAAGCTTGGAGC
CGAGAAAGCAATCTTTGTCTTTGTCAAGAACACGTTACCTCCAACTGCGGCGTTGATGTC
TGCAACCTATGAAGAGCACAAAGACGAAGATGGGTTTCTCTACATGACTTACAGTGGAGA
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ATGATGATTGTACATTCCTTTCCCTCTCTAGCGTTTTCTCTGTTTCGTCGACTTCAATAA
TGTCTTTTTTACTTTCTGGGATTTATGTTCTGAGCTCTCTTTATTATCTATGGATCAGTT
TGATTTGA

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DS 

RD RS1E337JQ 636 0 0
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ACCAAGACAGAGTTCCCGTGATTGTGGAGAAAGCTGAACAGAGTGATGTTCCTGACATTG
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GGAAAAGAATCAAGCTTGGAGCCGAGAAAGCAATCTTTGTCTTTGTCAAGAACACGTTAC
CTCCAACTGCGGCGTTGATGTCTGCAACCTATGAAGAACACAAAGACGAAGATGGGTTTC
TCTACATGACTTACAGTGGAGAGAACACATTTGGATCTGCATGCTAATCAGCTCTGCTTT
TGACAGTTTGATCTTGATCATGATGATGATTGTACATTCCTTTCCCTCTCTAGCGTTTGC
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CTTTATTATCTATGGATCAGTTTGATTTGATTTAACCGTCTC*TTACATTGTTTCGTTTT
AAGCATCTATATCTTCAGCATTGGTATCTGGACTCT

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DS 

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TCG
TCTTGAGGTAAGAATGGCTGAATCTAGTCGTATCAGAGAGAAGTACCAAGACAGAGTTCC
CGTGATTGTGGAGAAAGCTGAACAGAGTGATGTTCCTGACATTGACAAGAAGAAGTATCT
TGTACCAGCTGATCTAACCGTTGGGCAATTCGTATACGTTGTGAGGAAAAGAATCAAGCT
TGGAGCCGAGAAAGCAATCTTTGTCTTTGTCAAGAACACGTTACCTCCAACTGCGGCGTT
GATGTCTGCAACCTATGAAGAACACAAAGACGAAGATGGGTTTCTCTACATGACTTACAG
TGGAGAGAACACATTTGGATCTGCATGCTAATCAGCTCTGCTTTTGACAGTTTGATCTTG
ATCATGATGATGATTGTACATTCCTTTCCCTCTCTAGCGTTTGCTCTGTTTCGTCGACTT
CAATAATGTCTTTTTTACTTTCTGGGATTTATGTTCTGAGCTCTCTTTATTATCTATGGA
TCAGTTTGATTTGATTTAACCGTCTAATTACATTGTTTCGTTTTAAGC

QA 4 531 4 531
DS 



AS 1 2

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ATGTCCTGTTCTTTTGCTTACTGGATATATGAAAGTTTAATTACAGTTCTTATCTCTATA
TCAGACATTTTTGTATTATATATGTAACTTATTTATCAACTAGTTTAAGCTTGCATGTCT
TTCCACAAAAGAAAATATTCTCAAACTAGAAGTAATTTAGCCCATGAACGTTAATTGGGC
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TATGGAACTAATATAATTTTTTCAAAAAAAATTGAATTAGAAGCAAAAGAAATCCAAAAA
CATACTCATAGAAAAAGTTCGAACATAGTTTAGCTAAACAAAAAAACATATTCTCATCAT
CTGAATTCATCATAACAAAGGGGTTTCATCATCATATCTTCAAAGATCTTGCACACTCAA
ACCTGAAAAATTGTTACAACAGCAAAGCATATACCGTGTCAACAACATACAGCAAAGCAT
ATACCGTGTCAACAACATGCGAATCAATAACAGTGTAAAACAGTAGAAAAGCTGAGTTGT
AAGGATTATATAAACGAACCTGGAGGAAGAGACTGCTTAAGCTTGTCGGCTTTCTCTTGG
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TTGCTTCTCTTG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A259JQ U 8
AF RS1A259TR U 1
BS 1 912 RS1A259TR

RD RS1A259JQ 778 0 0
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AAAGAAAATATTCTCAAACTAGAAGTAATTTAGCCCATGAACGTTAATTGGGCTAGATTA
ACAGCTTTCAACCCAACCGTTATAAAATTCAAAAGCCCATAGTATCAAACACGGAACACA
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TTTAGTTCGGGTAATAAATTCTAAAGGTTGTATTAGTAATCGTAGAGCAGATGTATGGAA
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GTCAACAACATGCGAATCAATAACAGTGTAAAACAGTAGAAAAGCTGAGTTGTAAGGA

QA 1 778 1 778
DS 

RD RS1A259TR 912 0 0
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CTAAAAAAGAAAGAAAAGAAAGATTCTATTTGGTCTCATTATCCATTTTGGGTTTGTATA
ATGTCCTGTTCTTTTGCTTACTGGATATATGAAAGTTTAATTACAGTTCTTATCTCTATA
TCAGACATTTTTGTATTATATATGTAACTTATTTATCAACTAGTTTAAGCTTGCATGTCT
TTCCACAAAAGAAAATATTCTCAAACTAGAAGTAATTTAGCCCATGAACGTTAATTGGGC
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TACTAGTTTTAGTTCGGGTAATAAATTCTAAAGGTTGTATTAGTAATCGTAGAGCAGATG
TATGGAACTAATATAATTTTTTCAAAAAAAATTGAATTAGAAGCAAAAGAAATCCAAAAA
CATACTCATAGAAAAAGTTCGAACATAGTTTAGCTAAACAAAAAAACATATTCTCATCAT
CTGAATTCATCATAACAAAGGGGTTTCATCATCATATCTTCAAAGATCTTGCACACTCAA
ACCTGAAAAATTGTTACAACAGCAAAGCATATACCGTGTCAACAACATACAGCAAAGCAT
ATACCGTGTCAACAACATGCGAATCAATAACAGTGTAAAACAGTAGAAAAGCTGAGTTGT
AAGGATTATATAAACGAACCTGGAGGAAGAGACTGCTTAAGCTTGTCGGCTTTCTCTTGG
TCAAAGACGCAGAGAGTGTAGAGGTACTTGGAGCATCTGACCTTGAACTTGACAATGTCT
TTGCTTCTCTTG

QA 1 912 1 912
DS 



AS 1 5

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AGTGAACTGATTAAAATCAACCGTGAAACATTTTTTTTGGTCAGGAAGAGTCAAAACCTG
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TGTCAACATCGTTTACTAATGTTGCTTCTAATCAATCACTTTGGTCCTCAGAATCTTCAC
TTCATGGATTGGCCTGTCGGTGTTATCGGTTTGGACACTACCGAGCCTCTTGATCACCTC
CATACCACGGCAGACTCTGCCAAATATCGTGTGCTTTCCATCCAATGAAGGTGCTGGAGC
TAAAGTGATGAAGAACTGGCTCCCGTTTGTGTTAGGACCAGCGTTTGCCATTGACAAGAT
CCCAGCTCCCGTGTGCTTCAACTCTGGCTTTATCTCGTCCTCAAACTTTGAACCGTAAAT
GGATTGGCCACCTCTTCCAGTTCCAGTAGGATCACCACCTTGCACGATGAAATCCTTAAT
AATTCTGTGGAACAGAACGTTGTCGTAGTAACCTCTCCGTGATAGCTCCACGAAGTTACG
GCACGTTCTCGGGGAGTGTTTGTAATACATCTCGACGGTGAACGGACCCATGGAGGTTTC
TAGTGTAACCTCCGGGGGACTTCCTTCAGGTCTCGCCGTCATTTTCTCAGAGAGAGCAGC
GACACGTCAGGAACCGAGTCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1D978TF C 122
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AT
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AGTGTAACCTCCGGGGGACTTCCTTCAGGTCTCGCCGTCATTTTCTCAGAGAGAGCAGCG
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DS 



AS 1 5

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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 5 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GN67TF U 1
AF RS1BR08TF U 449
AF RS1BR08JQ C 454
AF RS1GN67JQ C 542
AF RS1BX85TF U 555
BS 1 625 RS1GN67TF
BS 626 626 RS1BR08TF
BS 627 719 RS1GN67TF
BS 720 1137 RS1BR08TF
BS 1138 1138 RS1BX85TF
BS 1139 1176 RS1BR08TF
BS 1177 1182 RS1BX85TF
BS 1183 1184 RS1BR08JQ
BS 1185 1214 RS1BX85TF
BS 1215 1215 RS1BR08JQ
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BS 1226 1238 RS1BX85TF
BS 1239 1239 RS1BR08JQ
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BS 1280 1280 RS1GN67JQ
BS 1281 1290 RS1BX85TF
BS 1291 1315 RS1GN67JQ

RD RS1GN67TF 726 0 0
GGTTAGAGGTTGATGAAATCAAAGGAGATGATGTCATTTGCCTTTCAAGGAATGCTGCTA
CTCTTGCTGGTGCTCTCTTCACTTTGCACGCCTCTCAAGTTCACATCGACCTGCCAACTC
TCACGGAGAAAGATAAGGAGGTTATAAGCACATGGGGAGTTCAAAATAAAATTGATTTTC
TCTCACTGTCCTATTGTCGACATGCGGAAGATGTTCGCCAGACCCGTGAAATGCTTAAAA
AGCTGGGTGACCTCTCTCAAACCCAAATATTTGCCAAGATTGAGAATGTAGAGGGACTAA
CCCACTTTGATGAGATTCTTCAAGAAGCTGATGGAATTATTCTTTCTCGTGGGAATTTGG
GTATAGATCTACCCCCGGAGAAGGTGTTTTTGTTTCAAAAGGCGGCTCTTTACAAGTGCA
ACATGGCTGGAAAGCCAGCCGTTCTTACCCGTGTTGTTGATAGTATGACTGACAACTTGC
GACCAACTCGTGCGGAGGCAACTGATGTTGCTAATGCTGTTTTAGATGGAAGTGATGCAA
TTCTTCTTGGTGCTGAGACTCTTCGTGGATTGTATCCTGTTGAGACTATATCGATTGTCG
GAAAGATCTGTGCTGAGGCAGAGAAAGTTTTCAATCAAGATTTGTACTTCAAGAAGACTG
TCAAGTATGTTGGAGAACCGATGAGTCATCTGGAATCCATTGCTTCTTCAGCTGTACGG
CAGCCAT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RS1BR08TF 728 0 0
GCCGTGTTG
TGATAGTATGACTGACAACTTGCGACCAACTCGTGCGGAGGCAACTGATGTTGCTAATGC
TGTTTTAGATGGAAGTGATGCAATTCTTCTTGGTGCTGAGACTCTTCGTGGATTGTATCC
TGTTGAGACTATATCGATTGTCGGAAAGATCTGTGCTGAGGCAGAGAAGGTTTTCAATCA
AGATTTGTACTTCAAGAAGACTGTCAAGTATGTTGGAGAACCGATGAGTCATCTGGAATC
CATTGCTTCTTCAGCTGTACGGGCAGCCATCAAGGTTAAGGCATCCGTTATTATATGCTT
CACGTCTTCTGGAAGAGCAGCAAGGTTAATTGCCAAATACAGGCCAACAATGCCGGTTAT
TTCTGTTGTCATTCCACGAGTTAAGACAAATCAGCTGAAATGGAGCTTTAGTGGAGCATT
TGAGGCGAGGCAGTCACTTATTGTCAGAGGACTCTTCCCCATGCTTGCTGACCCTCGTCA
CCCTGCGGAATCAACAAGTGCAACGAACGAGTCAGTCCTGAAGGTTGCACTAGACCACGG
GAAGCAAGCAGGAGTGATCAAGTCGCATGACAGAGTGGTGGTGTGTCAGAAAGTTGGTGA
TGCATCTGTGGTGAAGATCATCGAGCTAGAAGATTAATAAATGGGAGGAAGAAAACAAAC
TCTGCTGCCTACTTTGTTTT*GCTTTGATCCAATGCCGGAGTTAAAGTATATACTAATC

QA 10 728 10 728
DS 

RD RS1BR08JQ 812 0 0
GTTG
TGATAGTATGACTGACAACTTGCGACCAACTCGTGCGGAGGCAACTGATGTTGCTAATGC
TGTTTTAGATGGAAGTGATGCAATTCTTCTTGGTGCTGAGACTCTTCGTGGATTGTATCC
TGTTGAGACTATATCGATTGTCGGAAAGATCTGTGCTGAGGCAGAGAAGGTTTTCAATCA
AGATTTGTACTTCAAGAAGACTGTCAAGTATGTTGGAGAACCGATGAGTCATCTGGAATC
CATTGCTTCTTCAGCTGTACGGGCAGCCATCAAGGTTAAGGCATCCGTTATTATATGCTT
CACGTCTTCTGGAAGAGCAGCAAGGTTAATTGCCAAATACAGGCCAACAATGCCGGTTAT
TTCTGTTGTCATTCCACGAGTTAAGACAAATCAGCTGAAATGGAGCTTTAGTGGAGCATT
TGAGGCGAGGCAGTCACTTATTGTCAGAGGACTCTTCCCCATGCTTGCTGACCCTCGTCA
CCCTGCGGAATCAACAAGTGCAACGAACGAGTCAGTCCTGAAGGTTGCACTAGACCACGG
GAAGCAAGCAGGAGTGATCAAGTCGCATGACAGAGTGGTGGTGTGTCAGAAAGTTGGTGA
TGCATCTGTGGTGAAGATCATCGAGCTAGAAGATTAATAAATGGGAGGAAGAAAACAAAC
TCTGCTGCCTACTTTGTTTTTGCTTTGATCCAATGCCGGAGTTAAAGTATATACTAATCT
TCGGGA*CTTTTGGTTTTTGTACTTGGGAGATCTGATATCTCTAACTATTCCCTTTCTTT
CGCTTAGCTTATACATTTAGTTGGTTTC

QA 5 812 5 812
DS 

RD RS1GN67JQ 774 0 0
TCTTCTTGGTGCTGAGACTCTTCGTGGATTGTATCCTGTTGAGACTATATCGATTGTCGG
AAAGATCTGTGCTGAGGCAGAGAAGGTTTTCAATCAAGATTTGTACTTCAAGAAGACTGT
CAAGTATGTTGGAGAACCGATGAGTCATCTGGAATCCATTGCTTCTTCAGCTGTACGGGC
AGCCATCAAGGTTAAGGCATCCGTTATTATATGCTTCACGTCTTCTGGAAGAGCAGCAAG
GTTAATTGCCAAATACAGGCCAACAATGCCGGTTATTTCTGTTGTCATTCCACGAGTTAA
GACAAATCAGCTGAAATGGAGCTTTAGTGGAGCATTTGAGGCGAGGCAGTCACTTATTGT
CAGAGGACTCTTCCCCATGCTTGCTGACCCTCGTCACCCTGCGGAATCAACAAGTGCAAC
GAACGAGTCAGTCCTGAAGGTTGCACTAGACCACGGGAAGCAAGCAGGAGTGATCAAGTC
GCATGACAGAGTGGTGGTGTGTCAGAAAGTTGGTGATGCATCTGTGGTGAAGATCATCGA
GCTAGAAGATTAATAAATGGGAGGAAGAAAACAAACTCTGCTGCCTACTTTGTTTTTGCT
TTGATCCAATGCCGGAGTTAAAGTATATACTAATCTTCGGGA*CTTTTGGTTTTTGTACT
TGGGAGATCTGATATCTCTAACTATTCCCTTTCTTTCGCTTAGCTTATACATTTAGTTGG
TTTCAGATTAATGCTACGGTAAGAAAAAAGAAGTATACGATGTTACAAATTTTC

QA 1 774 1 774
DS 

RD RS1BX85TF 736 0 0
GAGACTCTTCGTGGATTGTATCCTGTTGAGACTATATCGATTGTCGGAAAGATCTGTGCT
GAGGCAGAGAAGGTTTTCAATCAAGATTTGTACTTCAAGAAGACTGTCAAGTATGTTGGA
GAACCGATGAGTCATCTGGAATCCATTGCTTCTTCAGCTGTACGGGCAGCCATCAAGGTT
AAGGCATCCGTTATTATATGCTTCACGTCTTCTGGAAGAGCAGCAAGGTTAATTGCCAAA
TACAGGCCAACAATGCCGGTTATTTCTGTTGTCATTCCACGAGTTAAGACAAATCAGCTG
AAATGGAGCTTTAGTGGAGCATTTGAGGCGAGGCAGTCACTTATTGTCAGAGGACTCTTC
CCCATGCTTGCTGACCCTCGTCACCCTGCGGAATCAACAAGTGCAACGAACGAGTCAGTC
CTGAAGGTTGCACTAGACCACGGGAAGCAAGCAGGAGTGATCAAGTCGCATGACAGAGTA
GTGGTGTGTCAGAAAGTTGGTGATGCATCTGTGGTGAAGATCATCGAGCTAGAAGATTAA
TAAATGGGAGGAAGAAAACAAACTCTGCTGCCCACTTTGTTTTTGCTTTGATCCAATGCC
GGAGTTAAAGTATATACTAATCTTCGGGGGCTTTTGGTTTTTGTACTTGGGAGATCTGAT
GTCTCTAACTTTTCCCTTTCTTTCTCTTCGCT*ATACATTTAGTTGGTTTCAGATTAATG
CTACG*TAAGAAAAAA

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 5

CO CL1902Contig1 574 5 5 U
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ATCCATCATCATCATCGTTCACAAGGAGCTTCATTCCGATCTGATCAAACATGGCTTTCC
TTGTGACATCGTTAATATTCGCTGTGGTCGGCATCATTGCTTCGGTTTTCACAAGAATCT
GCTTCAACCAAGGCTCCTCCACCAATCTGCTACATTTTACTTTGGTCATTACAGCCACTG
TCTGCTGTTGGTTGATGTGGGCAATTGTATACATTGCGCAGATGAAGCCTCTCATTGTCC
CAATCCTAAGCGAGGTTGAGTAGAAACCATCTCTACTCACACTAGGCAACCCAATGCACG
GATTTGGTTGTCTGCTTGTTCTTTCTGTGTTTCCCTCTTCAATCATATCGGTTTTCCTTT
CCCTTTTGTAATTTTTACAGCTGTGGAACAAACAATACGTTTGCCTCTTCTTCACTGTCA
CATCTCGTCTCTCATTCATTTATATAACAGTCTGCATAGACTGCCACAGAGTTCAGTCTG
TATTATTTGTTGATGAAATAAAAATCTTTGGAGC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RS1AW41TF U 351
AF RS1CF60JQ C 1
AF RS1CF60TF U 1
AF RS1CX11JQ C 1
AF RS1CX11TF U 1
BS 1 97 RS1CF60TF
BS 98 101 RS1CX11TF
BS 102 351 RS1CF60TF
BS 352 501 RS1AW41TF
BS 502 574 RS1CF60TF

RD RS1AW41TF 151 0 0
G
CAATGCACGGATTTGGTTGTCTGCTTGTTCTTTCTGTGTTTCCCTCTTCAATCATATCGG
TTTTCCTTTCCCTTTTGTAATTTTTACAGCTGTGGAACAAACAATACGTTTGCCTCTTCT
TCACTGTCACATCTCGTCTCTCATTCATTT

QA 2 151 2 151
DS 

RD RS1CF60JQ 564 0 0
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ATCCATCATCATCATCGTTCACAAGGAGCTTCATTCC****TGATCAAACATGGCTTTCC
TTGTGACATCGTTAATATTCGCTGTGGTCGGCATCATTGCTTCGGTTTTCACAAGAATCT
GCTTCAACCAAGGCTCCTCCACCAATCTGCTACATTTTACTTTGGTCATTACAGCCACTG
TCTGCTGTTGGTTGATGTGGGCAATTGTATACATTGCGCAGATGAAGCCTCTCATTGTCC
CAATCCTAAGCGAGGTTGAGTAGAAACCATCTCTACTCACACTAGGCAACCCAATGCACG
GATTTGGTTGTCTGCTTGTTCTTTCTGTGTTTCCCTCTTCAATCATATCGGTTTTCCTTT
CCCTTTTGTAATTTTTACAGCTGTGGAACAAACAATACGTTTGCCTCTTCTTCACTGTCA
CATCTCGTCTCTCATTCATTTATATAACAGTCTGCATAGACTGCCACAGAGTTCAGTCTG
TATTATTTGTTGATGAAATAAAAA

QA 1 564 1 564
DS 

RD RS1CF60TF 574 0 0
GGACGCGGCACAGAGATCATCACACTGAGAGGCCACGAAACGAAAAAATACGATCCTCCA
ATCCATCATCATCATCGTTCACAAGGAGCTTCATTCC****TGATCAAACATGGCTTTCC
TTGTGACATCGTTAATATTCGCTGTGGTCGGCATCATTGCTTCGGTTTTCACAAGAATCT
GCTTCAACCAAGGCTCCTCCACCAATCTGCTACATTTTACTTTGGTCATTACAGCCACTG
TCTGCTGTTGGTTGATGTGGGCAATTGTATACATTGCGCAGATGAAGCCTCTCATTGTCC
CAATCCTAAGCGAGGTTGAGTAGAAACCATCTCTACTCACACTAGGCAACCCAATGCACG
GATTTGGTTGTCTGCTTGTTCTTTCTGTGTTTCCCTCTTCAATCATATCGGTTTTCCTTT
CCCTTTTGTAATTTTTACAGCTGTGGAACAAACAATACGTTTGCCTCTTCTTCACTGTCA
CATCTCGTCTCTCATTCATTTATATAACAGTCTGCATAGACTGCCACAGAGTTCAGTCTG
TATTATTTGTTGATGAAATAAAAATCTTTGGAGC

QA 1 574 1 574
DS 

RD RS1CX11JQ 574 0 0
GGACGCGGCACAGAGATCATCACACTGAGAGGCCACGAAACGAAAAAATGCGATCCTCCA
ATCCATCATCATCATCGTTCACAAGGAGCTTCATTCCGATCTGATCAAACATGGCTTTCC
TTGTGACATCGTTAATATTCGCTGTGGTCGGCATCATTGCTTCGGTTTTCACAAGAATTT
GCTTCAACCAAGGCTCCTCCACCAATCTGCTACATTTTACTTTGGTCATTACAGCCACTG
TCTGCTGTTGGTTGATGTGGGCAATTGTATACATTGCGCAGATGAAGCCTCTCATTGTCC
CAATCCTAAGCGAGGTTGAGTAGAAACCATCTCTACTCACACTAGGCAACCCAATGCACG
GATTTGGTTGTCTGCTTGTTCTTTCTGTGTTTCCCTCTTCAATCATATCGGTTTTCCTTT
CCCTTTTGTAATTTTTACAGCTGTGGAACAAACAATACGTTTGCCTCTTCTTCACTGTCA
CATCTCGTCTCTCATTCATTTATATAACAGTCTGCATAGACTGCCACAGAGTTCAGTCTG
TATTATTTGTTGATGAAATAAAAATCTTTGGAG
G

QA 1 573 1 573
DS 

RD RS1CX11TF 574 0 0
GGACGCGGCACAGAGATCATCACACTGAGAGGCCACGAAACGAAAAAATGCGATCCTCCA
ATCCATCATCATCATCGTTCACAAGGAGCTTCATTCCGATCTGATCAAACATGGCTTTCC
TTGTGACATCGTTAATATTCGCTGTGGTCGGCATCATTGCTTCGGTTTTCACAAGAATCT
GCTTCAACCAAGGCTCCTCCACCAATCTGCTACATTTTACTTTGGTCATTACAGCCACTG
TCTGCTGTTGGTTGATGTGGGCAATTGTATACATTGCGCAGATGAAGCCTCTCATTGTCC
CAATCCTAAGCGAGGTTGAGTAGAAACCATCTCTACTCACACTAGGCAACCCAATGCACG
GATTTGGTTGTCTGCTTGTTCTTTCTGTGTTTCCCTCTTCAATCATATCGGTTTTCCTTT
CCCTTTTGTAATTTTTACAGCTGTGGAACAAACAATACGTTTGCCTCTTCTTCACTGTCA
CATCTCGTCTCTCATTCATTTATATAACAGTCTGCATAGACTGCCACAGAGTTCAGTCTG
TATTATTTGTTGATGAAATAAAAATCTTTGGAG
G

QA 1 573 1 573
DS 



AS 1 5

CO CL1903Contig1 1267 5 12 U
GGACATCACTGCACTTTTCATTTCCAGTATCTTTTTTATCACCCAATACACTTTGGTTTT
GAAATGGAGGGTTACTCAAGGAAATGGTGTGTAGTGTTTGTGTTGTTGGCTTTAGCGTCC
ATAGTAGCAAAAGCACAACAAGTCCCATGTTACTTCATTTTTGGTGATTCTTTGGTTGAC
AATGGAAACAACAACGGTCTTGTTTCTTTTGCGAGAGCCAATTACTTTCCTTACGGCATC
GATTTTGGCGGTCCCACTGGCCGTTTCTCAAATGGAAAGACCACCGTTGATGAGATTGCT
GACCTACTCGGATTTAAAGACTACATTCCTGCCTACAATACTGTGAGTGGTCAGCAAATA
CTCGCGGGAGTTAACTACGCATCTGCAGCTGCCGGAATTCGAGAAGAAACTGGTCGACAG
TTGGGACAAAGAATAAGCTTTAGCGGGCAAGTTAGGAACTACCAGACAACGGTACGGCAG
GTGGTGAGCGTACTAGGAGGCGAGGCTCAAGCAGCTGATTACCTCAAGAAATGCATTTAC
TCTGTTGGTATAGGAAGCAACGACTATCTAAACAACTACTTCATGCCTACGTTCTACTCT
TCTAGCAGACAGTTCACACCAGAACAATTCGCTAGTGATCTCATCAGTCGTTACAGCACT
CAGCTTACTGCACTATACAACTATGGGGCCAGAAAGTTTGCATTGATCGGAGTTGGCGCC
ATTGGTTGTAGTCCAAACGCGCTCTCGCGCAGTCGGGACAGTAAGACTTGCGATGATCGA
ATTAACTCAGCGAACCAAATCTTCAACAACAAGCTAAGATCTATGGTTGATCAGCTCAAC
AACAATCATCCTGATGCAAGGTTTACTTACATCAATGCTTATGGCATTTTCCAGGACATG
ATCACAAACCCCTCTAGATTTGGGTTTACAACGACAAACGCAGGGTGTTGTGGTATTGGA
AGAAATGCTGGTCAGATCACATGTTTACCGGGACAAAGACCATGCGGAAACCGAAACGCA
TATGTATTTTGGGACGCTTTTCATCCGACCGAAGCCGCAAACGTGGTTATCGCCAGGAGA
TCGTACACCGCACAATCGCCTTTTGACGCATACCCTATTGATATATCAAGCCTAGCACGG
CTTTGAAAAACCATAAGAGAAAATAAGAACTAAAAGAAGTTCCACAAACTAATATGTGAT
CTTCATCATGTACCATCTTTTCATATAAAATCAAGCATAACGTTATTATATATAACACCA
TTTCTGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 
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AT
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GACCTACTCGGATTTAAAGACTACATTCCTGCCTACAATACTGTGAGTGGTCAGCAAATA
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AS 2 5

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GA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1FD91TF U 1
AF RS1FD91JQ C 81
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BS 584 602 RS1FD91JQ

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TGAGGGCAATGCCAGGAAGGTTGTTGGATGCTCCTGTCTTGTAGTCAAGGACTACGGTGA
GGATACAACTGCGCTCAATATCGTCAAGAAGCACATTGAGTCTAACTAAGTTTTAAGGAG
CATTTCGAATCTCGAATATTAAAATGTGTTTTTTTTTTTGTTTCTTTCATCTCAGTGCCT
TTTATCTTGGTTATAATATTTTAGCAGACAGCTCTCTCTCTCTCTCTCGCGCTTTGTTTG
GAACGTGATCAAGTTTTGCTGTTATGTAAGCCACGACTCTTAC
GAGCCCCATTTTTATT

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DS 

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AGCTTGTCAAGGCTCTTTGCGCTGATCACAGCATCAACTTGCTTACTGTTCCAAGTGCCA
AGACCCTTGGCGAATGGGCTGGTTTCTGTAAGATCGACTCTGAGGGCAATGCCAGGAAGG
TTGTTGGATGCTCCTGTCTTGTAGTCAAGGACTACGGTGAGGATACAACTGCGCTCAATA
TCGTCAAGAAGCACATTGAGTCTAACTAAGTTTTAAGGAGCATTTCGAATCTCGAATATT
AAAATGTGTTTTTTTTTTTGTTTCTTTCATCTCAGTGCCTTTTATCTTGGTTATAATATT
TTAGCAGACAGCTCTCTCTCTCTCTCTCGCGCTTTGTTTGGAACGTGATCAAGTTTTGCT
GTTATGTAAGCCACGACTCTTACGAGGCCCCATTTTTATTGA

QA 1 522 1 522
DS 



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GCTCCCGTTGTTGTTCCTCCCGTTGCTGAGCCAGCGGCCGTCATCCCAGAGGACATGGAC
TTGTTGACCGCATTGGAGCTGACTCTTAGGAAAGCACGTGCCCATGGTGGTGTTGTACGT
GGTCTCCACGAGAGCGCTAAGCTTATTGAGAAGCGTGTGGCTCAGCTCTGTGTCTTGGCT
GAAGACTGCAACCAGCCTGATTACGTGAAGCTTGTCAAGGCTCTCTGCGCTGATCACAGC
ATCAACTTGCTTACTGTTCCAAGTGCCAAGACCCTTGGCGAATGGGCTGGTCTCTGTAAG
ATCGACTCTGAGGGCAATGCCAGGAAGGTTGTTGGATGCTCCTGTCTTGTAGTCAAGGAC
TACGGTGAGGATACAACTGCGCTCAATATCGTCAAGAAGCACATTGAATCTAACTAAGTT
TTAAGGAGCATTTCGAATCTCGAATATTCAA*TGTGTTTTTTTT*TCTCTTTCATCTCAG
TGCCTTTTATCTTGGTTATAATATTTTAGCAGACAGCTCTCTCTCGCGCTTTGTTTGGAA
CATGATCAAGTTTTGCTGTTATGTAAGCCACGACTCTTACAAGGCCCCATTTTAATTGAG
GTTTCTTTTGCCTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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TCTCTCTC

QA 1 645 1 645
DS 

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GG
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TACGTGAAGCTTGTCAAGGCTCTCTGCGCTGATCACAGCATCAACTTGCTTACTGTTCCA
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AGGAAGGTTGTTGGATGCTCCTGTCTTGTAGTCAAGGACTACGGTGAGGATACAACTGCG
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QA 3 680 3 680
DS 

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ATGTAAGCCACGACTCTTACAAGGCCCCATTTTAATTGAGGTTTCTTTTGCCTACT

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 5

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AAATATCAATTTCTCGTCACTTTTTTCACCACCAGATCTCAACTTCGTCTCCATCATAGC
TCGTCGTTCTTACAGCCCTGCGTGTGTTTTTATTTACAGCTCGTCGTTCTCGTCACCTTT
TTCTCTCGCACTCTCTGTCTCTCTCTCCTAGAGTTCTGATTCTGGTTTTGTTTTTGTGTT
CTTAGTTAAATAACTCGTGCTCTTTTTTTGCCAGATTTACTTTTCCAATCTCAATCTAAC
ATGTCTGATTCAAATGTTTTTCGCTTGAGATTCTTGTGATTTGTTAATAAATTATGAATG
ATTTTCTGTAGATTTAAGAAACGAAGAAGAAGATAGCTTGAGAGAGACAGCCTCAGAACC
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AAACTCTGATGCAAGGAGGAGGATGGAGAGGAAGGTGACAGGCGGCGTAGATTAGATTAG
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TATAAACCC


BQ
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25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 5 35 35 35 35 35 35 35 5 5 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 5 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 20 35 35 20 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 35 
35 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FR57TF U 81
AF RS1DH64JQ C 4
AF RS1DH64TF U 4
AF RS1C091TF U 1
AF RS1C091JQ C 178
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CGTGTGTTTTTATTTACAGCTCGTCGTTCTCGTCACCTTTTTCTCTCGCACTCTCTGTCT
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TTGGTTCATTAGGTTTGGTTTAGTTAGGTTTTGGTTTAATATGTTGCAATGTAAACCGGG
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QA 1 581 1 581
DS 

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GG
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DS 

RD RS1DH64TF 717 0 0
GG
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TCAATTTCTCGTCACTTTTTTCACCACCAGATCTCAACTTCGTCTCCATCATAGCTCGTC
GTTCTTACAGCCCTGCGTGTGTTTTTATTTACAGCTCGTCGTTCTCGTCACCTTTTTCTC
TCGCACTCTCTGTCTCTCTCTCCTAGTGTTCTGATTCTGGTTTTGTTTTTGTGTTCTTAG
TTAAATAACTCGTGCTCTTTTTTTGCCAGATTTACTTTTCAAATCTCAATCTAACATGTC
TGATTCAAATGTTTTCCGCTTGAGATTCTTGTGATTTGTTTAAAAATTATTTATGATTTT
CTGTAGATTTAAGAAACGAAGAAGAAGATAGCTTGAGAGAGACAGCCTCAGAACCATGGC
AGAAGAAAAAGCGACGAACATACGGCGATGGACAAGCGCGGGGCTCGAGCATGAGAAACG
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GCAATGTAAACCGGGTAGTGCTTTTTTAGATTTTGTTTT*AAACCCGGTTTGTATGTAAA
CCGGTTTAATTTGTAAACCGAAA*TATTTGTAATCTGTGGTTTAATTTATAAACT

QA 3 717 3 717
DS 

RD RS1C091TF 782 0 0
GGCTCACAAAACTCATCTTCTCTCTCAATTCCTTAATCTCTCCACGGAGACATCTAAAAC
AAAGATCAATCTCTCGTCACTTTTTTCACCGCCAGATCTCAACTTCGTCTCCATCATAGC
TCGTCGTTCTTACAGCCCTGCGTGTGTTTTTATTTACAGCTCGTCGTTCTCGTCACCTTT
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ATTTTCTGTAGATTTAAGAAACGAAGAAGAAGATAGCTTGAGAGAGACAGCCTCAGAACC
ATGGCAGAAGAAAAAGCGACGAACATACGGCGATGGACAAACGCGGGGCTCGAGCATGAG
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ATGTTGCAATGTAAACCGGGTAGTGCTTTTTTAGATTTTGTTTTTAA*CCCGGTTTGTAT
GTAAACCGGTTTAATTTGTAAACC*AAAATATTTGTAATCTGTGGTTTAATTTATAAACT
GAAATCAGTTGTATACCGAATTTTAATATAAACCGGTTTGATTT*TATATCGAA
CCAGTTAT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RS1C091JQ 612 0 0
TTTTTCTCTCGCACTCTCTGTCTCTCTCTCCTAGAGTTCTGATTCTGGTTTTGTTTT*GT
GTTCTTAGTTAAATAACTAGTGCTCTTTTTTTGCCAGATTTACTTTTCCAATCTCAATCT
AACATGTCTGATTCAAATGTTTTTCGCTTGAGATTCTTGTGATTTGTTAATAAATTATGA
ATGATTTTCTGTAGATTTAAGAAACGAAGAAGAAGATAGCTTGAGAGAGACAGCCTCAGA
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GAGAAACTCTGATGCAAGGAGGAGGATGGAGAGGAAGGTGACAGGCGGCGTAGATTAGAT
TAGATTAGGTTTAGGCTTAGGTTTTGGCTCATTAGGTTTGGTTTAGTTAGGTTTTGGTTT
AATATGTTGCAATGTAAACCGGGTAGTGCTTTTTTAGATTTTGTTTTTAAACCCGGTTTG
TATGTAAACCGGTTTAATTTGTAAACCAAAAATATTTGTAATCTGTGGTTTAATTTATAA
ACTGAAATCAGTTGTATACCGAATTTTAATATAAACCGGTTTGATTTATATATCGAAACC
AGTTATAAACCC

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 3

CO CL1906Contig1 869 3 24 U
GTCTCAAGTTGTTTGGTCTTATTTGGTTTTTTCAATAACTAAATCCACAACAAACTCGTT
CTGCTGACTTAACCGAAGCTAAAGCAAAATGAACTATCTCAAACCAAAAACATTTATAAG
CAGTTAAGAAAGACAATGGTGAGAGACCAACCAAGATGATCAGTTTACTTGCACTGGTTA
TTGGTATTGGATGTAGAACTGTTGGTTAAAGCTTTGGTAACCACATGAGAAACGATTCCA
ACCGGACAGAAGAGAAGGCAAAGTGAAACCGAGTGCCTAGTCTCGATCTTATTCTCCAAG
CCATCGTTAAAAACTTGTCTAGCAGCAAAAAGATCGATAACAAGAAGATGGATCCAAGCA
GAAGCAAGAGTCATTTCACTTGAGAACATTTTCGCTATTCCGGACAACTCTGGCAACAAG
TATTTACTGGAAAACATGTATTTGAGCGTATCAGGTGTCCAAGAAAGGTATAACAAATAC
GCGTATAATAGGCCTAAGACGACATACGGTATGCTACTCTCCATACACTTCTTGGTAATT
TCAGCTTTAGGAGCTACAACCATCAGAGTGTAAAAAGGAAGAACCGTGGTTGTTCCGACA
GCAAATACACTGCTTGCGATCTGAGAAGTAGCTAACCATGAAGCTCGTACGCAGGAGGGT
TTCTTGTGAACAAAGGAGGATGAATTCGTCGAAACACTAGGGAGAAAAGCGAGTCGTGAT
CCTCCGATGAAGCTCCAGCGATTCTGGAATTGAATCTTTAAAGAATCAACGCACACTCTA
GACTTGTTGAGAGAAAGACTTGCTGTCACCGAGCTATTAGCTACAATGCTACGATTCATC
ATCGTGAGAGACGAAGAGACAGAGGCTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GZ82TF C 82
AF RS1E769JQ U 1
AF RS1D441JQ U 33
BS 1 524 RS1E769JQ
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BS 761 815 RS1E769JQ
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BS 824 869 RS1D441JQ

RD RS1GZ82TF 675 0 0
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TTCTGGAATTGAAT
C

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1E769JQ 826 0 0
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CTGCTGACTTAACCGAAGCTAAAGCAAAATGAACTATCTCAAACCAAAAACATTTATAAG
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TTGGTATTGGATGTAGAACTGTTGGTTAAAGCTTTGGTAACCACATGAGAAACGATTCCA
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GAAGCAAGAGTCATTTCACTTGAGAACATTTTCGCTATTCCGGACAACTCTGGCAACAAG
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GCGTATAATAGGCCTAAGACGACATACGGTATGCTACTCTCCATGCACTTCTTGGTAATT
TCAGCTTTAGGTGCTACAACCATCAGAGTGTAAAAAGGAAGAACCGCGGTTGTTCCGACC
GCAAATACACTGCTTGCGATCTGAGAAGTAGCTAACCATGAAGCTCGTACGCAGGAGCGT
TTCTTGTGAACAAAGGAGGATGAATTCGTCGAAAGACTAGGGAGAAAAGCGAGTCGTGAT
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GACTTGTTGAGAGAAAGACTTGCTGTCACCGAGCTCTTAGCTA
GAA

QA 1 823 1 823
DS 

RD RS1D441JQ 837 0 0
CAATAACTAAATCCACAACAAACTCGTTCTGCTGACTTAACCGAAGCTAAAGCAAAATGA
ACTATCTCAAACCAAAAACATTTATAAGCAGTTAAGAAAGACAATGGTGAGAGACCAACC
AAGATGATCAGTTTACTTGCACTGGTTATTGGTATTGGATGTAGAACTGTTGGTTAAAGC
TTTGGTAACCACATGAGAAACGATTCCAACCAGACAGAAGAGA*GGCAAAGTGAAACCGA
GTGCCTAGTCTCGATCTTATTCTCCAAGCCATCGTTAAAAACTTGTCTAGCAGCAAAAAG
ATCGATAACAAGAAGATGGATCCAAGCAGAAGCAAGAGTCATTTCACTTGAGAACATTTT
CGCTATTCCGGACAACTCTGGCAACAAGTATTTACTGGAAAACATGTATTTGAGCGTATC
AGGTGTCCAAGAAAGGTATAACAAATACGCGTATAATTGGCCTAAGACGACATACGGTAT
GCTACTCTCCATACACTTCTTGGTAATTTCAGCTTTAGGAGCTACAACCATCAGAGTGTA
AAAAGGAAGAACCGTGGTTGTTCCGACAGCAAATACACTGCTTGCGATCTGAGAAGTAGC
TAACCATGAAGCTCGTACGCAGGAGGGTTTCTTGTGAACAAAGGAGGATGAATTCGTCGA
AACACTAGGGAGAAAAGCGAGTAGTGATCCTCCGATGAAGCTCCAGCGATTCTGGAATTG
AATCTTTAAAGAATCAACGCACACTCTAGACTTGTTGAGAGAGAGACTTGCTGTCACCGA
GCTATTAGCTACAATGCTACGATTCATCATCGTGAGAGACGAAGAGACAGAGGCTGA

QA 1 837 1 837
DS 



AS 1 4

CO CL1907Contig1 1215 4 7 U
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AACTTCTCAAAACTCATCATCATCAAGATCACAACACAAAGCATAATGTGAGAATACACT
CACTGAATCTCAGAAATCTCTCTGACAAGTTCTTTGATATTTGAAATGAATCAAGAAATT
GGGAAAATTTATCATCTCCACTGTGTCCCTTTGAGAGTTTTTGTTTCAACACATTGACAG
TAGTCCAGATTTAAGATGAGAAAACTCCTTCACCGACAGCAGCGGGAACATTGTTCATCA
CTTGATGTCCCAAGTGAATAACATTTGGTTGTTTCTGAAGAAGTTTGTCAACGAAGAAAC
AAATGGCAATAATGATGTAGCAAAGCAATAGAACCAATCCCTTCATGTAGTGAGAAGTCC
CATCCTGTAATGTGAAGGCTGTGATTATAATGGAAAGAGCAAGAGAACCGGTTTCAAGGA
GATTGAAATTGAGATCCATGTTAATTCCTATAATCCACGCTACGATAATGGTCAAGGGGA
CGACAAATAAGCCAATCTGAGTTGCAGAACCTAAGGCAACTCCCAAAGATATATCAAGCT
TGTTCTTAAAAGCGAAAATGATGGCTCCAGCGTGTTCAGCTGCGTTTCCAACAATAGGAA
GCAATATGATACTTATGAAACTCACTGATAGTCCCCATGATTCCGATGCGTCCTCAATGG
TGGCCACAACATACTCTGATAGCAATGCGATGACTAGTGTCATCCCAACCAACCACACAA
ATCCACTCCAAAATCCAATCACCGCGGTTTCTTCCTCAGTGACATCGTCATTGTACGCAT
CATCCTGATCTTGTGCGTCGAACAATTGGAGGTGAGTAAAAAGCTGAAAAACGAGATACG
CGATATAACTGATCAACACAACAATAATGCTGGCTCGTGACAAGTTCAGTGACATGTCAG
CAATTAAATCAGCTGAGGTCTCTCCGGTTGCAACGTATCCCAACAACATTGGCAGCAAGT
GACACAACAATCCCATAAGGAGTAAGAAGAAGTTCACATCAGCTTGTTTCCGGTCGAACC
GTTGCTCCCTTTGAAGATTTTTAATTCCACCACAGAAGAGTGAAGTCCCGAGAACCAATA
GAAGGTTCGACAAAATCGAACCTAGAAGCGAGTACTTCACCACTGCGACCTTGTGATTGG
TCAATACCAGAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1AM72JQ U 261
AF RS1FW65TF C 397
AF RS1AM72TF C 402
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C

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DS 



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GTTTGATATCC


BQ
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25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DF23JQ U 17
AF RS1C712JQ U 1
AF RS1C712TF C 232
BS 1 244 RS1C712JQ
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RD RS1DF23JQ 405 0 0
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QA 1 405 1 405
DS 

RD RS1C712JQ 686 0 0
ATCTCCTTGCAATTTCGCAAATACAAAGTATATTATCAAACACCACACATGTTCCTATTA
ACCACATTGATCTTGAAATTATTAGAAGTACAAAGGAAGAAGAGGTAAGCATCAAAACAA
AAGCAGCGGATAAAAGAAAAAGATAAATTCAAAGTCAACGCGGTTTTGCTCAACTTCCCA
ATTACGCAAAGTAAACAACTCATTTGCTCTGCTCTATCTTGGCTTTCCTCTTCTCGTTGA
CAAAAAAAACAAGAAGAGCCAGGACGGAAAACACGCTGAAGCAAACGGAGGCAATATCCA
AGGACTTGTGGCGACCACTGATAGCCTGAACACTGAAAAGCTTGGTTGACTTTGCCTCGT
CCGTGCTCTGTCCAAAAGCAACTTCATGGCCTTTGGCATCAACTGCGTAGGCGCGAACGA
AGTAGGTCCCCGTTGGGATGTCGCGTTCTAGGGTATATTCAAATGATTGAGGGGATTTAT
CATAGGGCCTGGTAATGATCTTGTGTGGGCAGCTTTTATCCTTGAAGAGCTCATTTTCTG
TCTTGCGCCATGGTCGGTCAACTTGGCTTACCGGAGCGTAGCATAGCTTTACTTTGATGG
TCGTAAATTCAGCCTCTTTTGTAGCTGTCGAGCTTAGCTTCCATGTAATGCTCAACTTGT
CAATTCCGGCATCCAAAACGCCTTCT

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1C712TF 680 0 0
TCTCGTTGACAAAGAAGACAAGAAGAGCCAGGACGGAGAACACGCTGAAGCAGACGGAGG
CAATATCCAAGGACTTGTGGCGACCACTGATAGCCTGAACACTGAAGAGCTTGGTTGACT
TTGCCTCGTCCGTGCTCTGTCCAAAAGCAACTTCATGGCCTTTGGCATCAACTGCGTAGG
CGCGAACGAAGTAGGTCCCCGTTGGGATGTCGCGTTCTAGGGTATATTCAAATGATTGAG
GGGATTTATCATAGGGCCTGGTAATGATCTTGTGTGGGCAGCTTTTATCCTTGAAGAGCT
CATTTTCTGTCTTGCGCCATGGTCGGTCAACTTGGCTTACCGGAGCGTAGCATAGCTTTA
CTTTGATGGTCGTAAATTCAGCCTCTTTTGTAGCTGTCGAGCTTAGCTTCCATGTAATGC
TCAACTTGTCAATTCCGGCATCCAAAACGCCTTCTCGGCTGGGTGTAGCGGTGACCTCAA
GTGCACCTTTCTCCAGGTCAGAGAAGAGCCTTTCTTCGGTAGCACCATGACTAATTTGGA
ACAGTAAGCAGATTAGAAGTGAAGCGAAGAAGATCTTGTGGATAGCCATGGAGATCTTTG
AATCTGAATATTTAGAAATTAAGGCTTATGAAGAGAAGAGGAATATGCCTTTGTTTTGCT
GACTTTTATGTTTGATATCC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 4

CO CL1909Contig1 776 4 6 U
AAGCATAGAGATTGTTTGAAATTGATAACGATAACCTCCAAAAATTGGTTCATGCTGGAT
ACGTAGATTCTAAACCAACTGAAGTACAAAAAAAAAAAACAAGAGATCCCAACAGCGATG
GTCTGAGACAGAGGCTGACACCACAAAACAAAACAAAATAGAAACAAACTTCTTCAACCA
GTGATGTTCTGAGACTTGTTGAGGATAACTCCTTCGTACTTAACTTGGAACCAATTCATG
GCATCATCCTTCGTAACTCTATGCTGAATCCCAACGCGAGTCTTGCACCTACGGCGACGA
GCAAAACGGTAACCAGGACGTTCGAGAACAACGTAGAAGTCCATTCCATAGATACCGGTG
GAAGGATCGTACTTGATTCCAAGATCAATGTGCTCTTGGATACCGAACCCAAAGCAGCCA
GTGTCACTGAAGTTCCTCCTCAACAGCTCGTACTCCTTGACTTTCAATCCGCTCTCGAGA
AGCTGCATCGCCTTGTCTCCTCTCACGGTGACGTAGCAAGCAATCTTTTCGTTACGCCTG
ATTCCGAAAGACCTCACAGTGTACCTCGCCTTGGAGAAGACAGGGGTTTGACCACTGAGC
TGTTCCAACACCTTGG*AGGCACGAGTGAGACGATCACCGCTCTCACCAACAGAGATGTT
AAGAACGAGCTTCTGAACCTTGATGTCCCTCATAGGGTTCGACAGCTTCTTCTCTGACGC
CATCTTTGCGATTAAGGGATTCAAAATTGAGGGAGGTGAGCAAAGAAGAGTGGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GQ28JQ U 24
AF RS1A880TF C 1
AF RS1A880JQ U 361
AF RS1GQ28TF C 97
BS 1 23 RS1A880TF
BS 24 335 RS1GQ28JQ
BS 336 336 RS1A880TF
BS 337 360 RS1GQ28JQ
BS 361 741 RS1A880JQ
BS 742 776 RS1A880TF

RD RS1GQ28JQ 611 0 0
GATAACGATAACCTCCAAAAATTGGTTCATGCTGGATACGTAGATTCTAAACCAACTGAA
GTACAAAAAAAAAAAACAAGAGATCCCAACAGCGATGGTCTGAGACAGAGGCTGACACCA
CAAAACAAAACAAAATAGAAACAAACTTCTTCAACCAGTGATGTTCTGAGACTTGTTGAG
GATAACTCCTTCGTACTTAACTTGGAACCAATTCATGGCATCATCCTTCGTAACTCTATG
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ATCAATGTGCTCTTGGATACCGAACCCAAAGCAGCCAGTGTCACTGAAGTTCCTCCTCAA
CAGCTCGTACTCCTTGACTTTCAATCCGCTCTCGAGAAGCTGCATCGCCTTGTCTCCTCT
CACGGTGACGTAGCAAGCAATCTTTTCGTTACGCCTGATTCCGAAAGACCTCACAGTGTA
CCTCGCCTTGGAGAAGACAGGGGTTTGACCACTGAGCTGTTCCAACACCTTGGGAGGCAC
GAGTGAGACGA

QA 1 611 1 611
DS 

RD RS1A880TF 776 0 0
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ACGTAGATTCTAAACCAACTGAAGTACAAAAAAAAAAA****GAGATCCCAACAGCGATG
GTCTGAGACAGAGGCTGACACCACAAAACAAAACAAAATAGAAACAAACTTCTTCAACCA
GTGATGTTCTGAGACTTGTTGAGGATAACTCCTTCGTACTTAACTTGGAACCACTTCATG
GCATCATCTTTCGTAACTCTATGCTGAATCCCAACGCGAGTCTTGCACCTACGGCGACGA
GCAACACGGTAACCAGGACGTTCGAGAACAACGTAGAAGTCCATTCCATAGATACCGGTG
GAAGGATCGTACTTGATTCCAAGATCAATGTGCTCTTGGATACCGAACCCAAAGCAGCCA
GTGTCACTGAAGTTCCTCCTCAACAGCTCGTACTCCTTGACTTTCAATCCGCTCTCGAGA
AGCTGCATCGCCTTGTCTCCTCTCACGGTGACGTAGCAAGCAATCTTTTCGTTACGCCTG
ATTCCGAAAGACCTCACAGTGTACCTCGCCTTGGAGAAGACAGGGGTTTGACCACTGAGC
TGTTCCAACACCTTGG*AGGCACGAGTGAGACGATCACCGCTCTCACCAACAGAGATGTT
AAGAACGAGCTTCTGAACCTTGATGTCCCTCATAGGGTTCGACAGCTTCTTCTCTGACGC
CATCTTTGCGATTAAGGGATTCAAAATTGAGGGAGGTGAGCAAAGAAGAGTGGCCC

QA 1 776 1 776
DS 

RD RS1A880JQ 381 0 0
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GTGTCACTGAAGTTCCTCCTCAACAGCTCGTACTCCTTGACTTTCAATCCGCTCTCGAGA
AGCTGCATCGCCTTGTCTCCTCTCACGGTGACGTAGCAAGCAATCTTTTCGTTACGCCTG
ATTCCGAAAGACCTCACAGTGTACCTCGCCTTGGAGAAGACAGGGGTTTGACCACTGAGC
TGTTCCAACACCTTGG*AGGCACGAGTGAGACGATCACCGCTCTCACCAACAGAGATGTT
AAGAACGAGCTTCTGAACCTTGATGTCCCTCATAGGGTTCGACAGCTTCTTCTCTGACGC
CATCTTTGCGATTAAGGGATT

QA 1 381 1 381
DS 

RD RS1GQ28TF 661 0 0
AAAC
AAGAGATCCCAACAGCGATGGTCTGAGACAGAGGCTGACACCACAAAACAAAACAAAATA
GAAACAAACTTCTTCAACCAGTGATGTTCTGAGACTTGTTGAGGATAACTCCTTCGTACT
TAACTTGGAACCAATTCATGGCATCATCCTTCGTAACTCTATGCTGAATCCCAACGCGAG
TCTTGCACCTACGGCGACGAGCAAAACGGTAACCAGGACGTTCGAGAACAACGTAGAAGT
CCATTCCATAGATACCGGTGGAAGGATCGTACTTGATTCCAAGATCAATGTGCTCTTGGA
TACCGAACCCAAAGCAGCCAGTGTCACTGAAGTTCCTCCTCAACAGCTCGTACTCCTTGA
CTTTCAATCCGCTCTCGAGAAGCTGCATCGCCTTGTCTCCTCTCACGGTGACGTAGCAAG
CAATCTTTTCGTTACGCCTGATTCCGAAAGACCTCACAGTGTACCTCGCCTTGGAGAAGA
CAGGGGTTTGACCACTGAGCTGTTCCAACACCTTGG*AGGCACGAGTGAGACGATCACCG
CTCTCACCAACAGAGATGTTAAGAACGAGCTTCTGAACCTTGATGTCCCTCATAGGGTTC
GACAGCTTCTTCTCTGACGCCATCTTTGCGATTAAGGGATTCAAAATTGGGGGAGGT

QA 5 661 5 661
DS 



AS 1 4

CO CL1910Contig1 681 4 6 U
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TATCTACGACTTCACCGTCAAGGATATTGAAGGTAAGGATGTGAGTTTGAGCCAATTCAA
AGGCAAAACTCTTCTGATTGTAAATGTTGCCTCCAAATGTGGCTTGACGGATGCGAACTA
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CCCATGCAATCAGTTCTTGGGACAAGAACCGGGAAACAATGAAGAGATTCAGCAAACTGT
CTGCACAAGGTTCAAAGCTGAGTTCCCTATCTTTGACAAGGTGGATGTGAACGGGAAGAA
CACGGCGCCGTTATACAAGTACTTGAAAGCAGAGAAAGGAGGTTTGCTTATTGATGCAAT
CAAATGGAACTTCACAAAGTTCTTGGTTTCTCCTGACGGCAAAGTCTCCCAGAGATACTC
TCCCAGAACCTCTCCTCTTCAATTCGAGAAAGACATTCAAACTCTGTTGGGACAGGCTTC
TTCTTGAATCATCATCAAAAGTTGTTAAGAACCGTTTTATCTGAATATTTGTTTTTTTCC
TTAAGAATCCCACAATGTTTGCAAACAAACTATTATTCTCTGAATCTGCGTTTTGAATAA
ACATGTCGTCTTCTCGTTGGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B209TF U 16
AF RS1B209JQ C 16
AF RS1E775TF U 1
AF RS1E775JQ C 1
BS 1 20 RS1E775TF
BS 21 211 RS1B209TF
BS 212 212 RS1E775TF
BS 213 580 RS1B209TF
BS 581 656 RS1E775TF
BS 657 681 RS1E775JQ

RD RS1B209TF 565 0 0
TGGGG
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TAAATGTTGCCTCCAAATGTGGCTTGACGGATGCGAACTACAAGGAACTCAATGTTCTGT
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GACAAGAACCGGGAAACAATGAAGAGATTCAGCAAACTGTCTGCACAAGGTTCAAAGCTG
AGTTCCCTATCTTTGACAAGGTGGATGTGAACGGGAAGAACACGGCGCCGTTATACAAGT
ACTTGAAAGCAGAGAAAGGAGGTTTGCTTATTGATGCAATCAAATGGAACTTCACAAAGT
TCTTGGTTTCTCCTGACGGCAAAGTCTCCCAGAGATACTCTCCCAGAACCTCTCCTCTTC
AATTCGAGAAAGACATTCAAACTCTGTTGGGACAGGCTTCTTCTTGAATCATCATCAAAA
GTTGTTAAGAACCGTTTTAT

QA 6 565 6 565
DS 

RD RS1B209JQ 643 0 0
TGGGG
ACAAAGAGAGACGAAAAATGGCGGAAGAATCTCCAAAGTCTATCTACGACTTCACCGTCA
AGGATATTGAAGGTAAGGATGTGAGTTTGAGCCAATTCAAAGGCAAAACTCTTCTGATTG
TAAATGTTGCCTCCAAATGTGGCTTGACGGATGCGAACTACAAGGAACTCAATGTTCTGT
ATGATAAATACGAGGAACAAGGGTTGGAGATATTAGCGTTCCCATGCAATCAGTTCTTGG
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AGTTCCCTATCTTTGACAAGGTGGATGTGAACGGGAAGAACACGGCGCCGTTATACAAGT
ACTTGAAAGCAGAGAAAGGAGGTTTGCTTATTGATGCAATCAAATGGAACTTCACAAAGT
TCTTGGTTTCTCCTGACGGCAAAGTCTCCCAGAGATACTCTCCCAGAACCTCTCCTCTTC
AATTCGAGAAAGACATTCAAACTCTGTTGGGACAGGCTTCTTCTTGAATCATCATCAAAA
GTTGTTAAGAACCGTTTTATCTGAATATTTGTTTTTTTCCTTAAGAATCCCACGATGTTT
GCAAACAAACTATTATTCTCTGAATCTGCGTTTTGA
AT

QA 6 641 6 641
DS 

RD RS1E775TF 656 0 0
GGATTCTTCAAAACTAAAACACAAAGAGAGACGAAAAATGGCGGAAGAATCTCCAAAGTC
TATCTACGACTTCACCGTCAAGGATATTGAAGGTAAGGATGTGAGTTTGAGCCAATTCAA
AGGCAAAACTCTTCTGATTGTAAATGTTTCCTCCAAATGTGGCTTGACGGATGCGAACTA
CAAGGAACTCAATGTTCTGTATGATAAATGCAAGGAACAAGGGTTGGAGATATTAGCGTT
CCCATGCAATCAGTTCTTGGGACAAGAACCGGGAAACAATGAAGAGATTCAGCAAACTGT
CTGCACAAGGTTCAAAGCTGAGTTCCCTATCTTTGACAAGGTGGATGTGAACGGGAAGAA
CACGGCGCCGTTATACAAGTACTTGAAAGCAGAGAGAGGAGGTTTGCTTATTGATGCAAT
CAAATGGAACTTCACAAAGTTCTTGGTTTCTCCTGACGGCAAAGTCTCCCAGAGATACTC
TCCCAGAACCTCTCCTCTTCAATTCGAGAAAGACATTCAAACTCTGTTGGGACAGGCTTC
TTCTTGAATCATCATCAAAAGTTGTTAAGAACCGTTTTATCTGAATATTTGTTTTTTTCC
TTAAGAATCCCACAATGTTTGCAAACAAACTATTATTCTCTGAATCTGCGTTTTGA

QA 1 656 1 656
DS 

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TATCTACGACTTCACCGTCAAGGATATTGAAGGTAAGGATGTGAGTTTGAGCCAATTCAA
AGGCAAAACTCTTCTGATTGTAAATGTTTCCTCCAAATGTGGCTTGACGGATGCGAACTA
CAAGGAACTCAATGTTCTGTATGATAAATGCAAGGAACAAGGGTTGGAGATATTAGCGTT
CCCATGCAATCAGTTCTTGGGACAAGAACCGGGAAACAATGAAGAGATTCAGCAAACTGT
CTGCACAAGGTTCAAAGCTGAGTTCCCTATCTTTGACAAGGTGGATGTGAACGGGAAGAA
CACGGCGCCGTTATACAAGTACTTGAAAGCAGAGAGAGGAGGTTTGCTTATTGATGCAAT
CAAATGGAACTTCACAAAGTTCTTGGTTTCTCCTGACGGCAAAGTCTCCCAGAGATACTC
TCCCAGAACCTCTCCTCTTCAATTCGAGAAAGACATTCAAACTCTGTTGGGACAGGCTTC
TTCTTGAATCATCATCAAAAGTTGTTAAGAACCGTTTTATCTGAATATTTGTTTTTTTCC
TTAAGAATCCCACAATGTTTGCAAACAAACTATTATTCTCTGAATCTGCGTTTTGAATAA
ACATGTCGTCTTCTCGTTGGC

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 4

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ATACTTATATAACTCCTGTTCTTCTTCAAAATCGTGAGATCAAAGCAGCTCCTCCGTCTT
TCCAATAATCATCAAACTATAACTAAGAGAGAAGAAATATGAAGAAGATGGTGGTGGTGA
TGGTGATGATGTTGGTGATGGTGAGTGAAGCGAGTATGATAGAGCAGACATGCAAAGAGA
CACCAGATTTCAATCTATGCGTCTCTCTCCTCGACTCCGACCCACGTGGCTCCTCTGCCG
ACACCTCTGGCCTCGCTCTTATCCTCGTCGACAAAATCAAGGGGTTGGCGACGAAGACCT
TGAACGAAATCAACTATCTATATAAAAAGAGACCGGAACTGAAACAGGCTTTAGACGAAT
GTAGTCGAAGATACAAAACAATCTTAAAGGCTGATGTTCCCGAAGCCATTGAAGCTATAT
CTAAAGGAGTTCCGAAGTTCGGCGAGGACGGTGTGATCGATGCTGGTGTGGAAGCTGCTG
TATGTGAAGGAGAATTTAAAGGGAAATCTCCGTTGACTAGTTTGACCAAATCAATGCAGA
AAATCTCTAATGTGACAAGAGCCATTGTGAGAATGTTGCTTTGATTTTATCTTTTATTTA
CAAGTATGTGGTATAGCCGTATGGGTGTTTGATGGGATTTTATCCTTCATAAGAATAAAA
CTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 

AF RS1CM49TF U 1
AF RS1FK53TF U 87
AF RS1CM49JQ C 33
AF RS1FK53JQ C 87
BS 1 138 RS1CM49TF
BS 139 139 RS1FK53TF
BS 140 617 RS1CM49TF
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BS 620 711 RS1CM49TF
BS 712 725 RS1CM49JQ

RD RS1CM49TF 711 0 0
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ATACTTATATAACTCCTGTTCTTCTTCAAAATCGTGAGATCAAAGCAGCTCCTCCGTCTT
TCCAATAATCATCAAACTGTAACTAAGAGAGAAGAAATATGAAGAAGATGGTGGTGGTGA
TGGTGATGATGTTGGTGATGGTGAGTGAAGCGAGTATGATAGAGCAGACATGCAAAGAGA
CACCAGATTTCAATCTATGCGTCTCTCTCCTCGACTCCGACCCACGTGGCTCCTCTGCCG
ACACCTCTGGCCTCGCTCTTATCCTCGTCGACAAAATCAAGGGGTTGGCGACGAAGACCT
TGAACGAAATCAACTATCTATATAAAAAGAGACCGGAACTGAAACAGGCTTTAGACGAAT
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TATGTGAAGGAGAATTTAAAGGGAAATCTCCGTTGACTAGTTTGACCAAATCAATGCAGA
AAATCTCTAATGTGACAG*AGCCATTGTGAGAATGTTGCTTTGATTTTATCTTTTATTTA
CAAGTATGTGGTATAGCCGTATGGGTGTTTGATGGGATTTTATCCTTCATA

QA 1 711 1 711
DS 

RD RS1FK53TF 631 0 0
GGG
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CTCGACTCCGACCCACGTGGCTCCTCTGCCGACACCTCTGGCCTCGCTCTTATCCTCGTC
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AGACCGGAACTGAAACAGGCTTTAGACGAATGTAGTCGAAGATACAAAACAATCTTAAAG
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GGTGTGATCGATGCTGGTGTGGAAGCTGCTGTATGTGAAGGAGAATTTAAAGGGAAATCT
CCGTTGACTAGTTTGACCAAATCAATGCAGAAAATCTCTAATGTGACAAGAGCCATTGTG
AGAATGTTGCTTTGATTTTATCTTTTATTTACAAGTATGTGGTATAGCCGTATGGGTGTT
TGATGGGATTTTATCCTTCATA
AGAATA

QA 4 625 4 625
DS 

RD RS1CM49JQ 693 0 0
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AGAAATATGAAGAAGATGGTGGTGGTGATGGTGATGATGTTGGTGATGGTGAGTGAAGCG
AGTATGATAGAGCAGACATGCAAAGAGACACCAGATTTCAATCTATGCGTCTCTCTCCTC
GACTCCGACCCACGTGGCTCCTCTGCCGACACCTCTGGCCTCGCTCTTATCCTCGTCGAC
AAAATCAAGGGGTTGGCGACGAAGACCTTGAACGAAATCAACTATCTATATAAAAAGAGA
CCGGAACTGAAACAGGCTTTAGACGAATGTAGTCGAAGATACAAAACAATCTTAAAGGCT
GATGTTCCCGAAGCCATTGAAGCTATATCTAAAGGAGTTCCGAAGTTCGGCGAGGACGGT
GTGATCGATGCTGGTGTGGAAGCTGCTGTATGTGAAGGAGAATTTAAAGGGAAATCTCCG
TTGACTAGTTTGACCAAATCAATGCAGAAAATCTCTAATGTGACAGGAGCCATTGTGAGA
ATGTTGCTTTGATTTTATCTTTTATTTACAAGTATGTGGTATAGCCGTATGGGTGTTTGA
TGGGATTTTATCCTTCATAAGAATAAAACTTTT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RS1FK53JQ 639 0 0
GGG
AATCGTGAGATCAAAGCAGCTCCTCCGTCTTTCCAATAATCATCAAACTATAACTAAGAG
AGAAGAAATATGAAGAAGATGGTGGTGGTGATGGTGATGATGTTGGTGATGGTGAGTGAA
GCGAGTATGATAGAGCAGACATGCAAAGAGACACCAGATTTCAATCTATGCGTCTCTCTC
CTCGACTCCGACCCACGTGGCTCCTCTGCCGACACCTCTGGCCTCGCTCTTATCCTCGTC
GACAAAATCAAGGGGTTGGCGACGAAGACCTTGAACGAAATCAACTATCTATATAAAAAG
AGACCGGAACTGAAACAGGCTTTAGACGAATGTAGTCGAAGATACAAAACAATCTTAAAG
GCTGATGTTCCCGAAGCCATTGAAGCTATATCTAAAGGAGTTCCGAAGTTCGGCGAGGAC
GGTGTGATCGATGCTGGTGTGGAAGCTGCTGTATGTGAAGGAGAATTTAAAGGGAAATCT
CCGTTGACTAGTTTGACCAAATCAATGCAGAAAATCTTTAATGTGACAAGAGCCATTGTG
AGAATGTTGCTTTGATTTTATCTTTTATTTACAAGTATGTGGTATAGCCGTATGGGTGTT
TGATGGGATTTTATCCTTCATAAGAATAAAACTTTT

QA 4 639 4 639
DS 



AS 1 4

CO CL1912Contig1 917 4 7 U
CAACATCTAGAAAAACAATTTGTCAGAGCTTTTTCAGCAAAGATAATTTGCTCAAAGACA
GTTTACAAAGAAGATGTCTACCATTCAGGAAAGGAGCGTACCGATTCAATCTCCGGTGGA
AGATAAGGCGATGAAACCACTTAACTATGAGACGAAGAAACCACATAACTATGAGACCAT
TCTCAGAGACGCAGATCTTCCACTCCCCCCCTTCCACCGAACAGCTACGCTCTGGTGTTC
TCTTGAAAAAACTTATCAAATATTGGGTGGACGACAAAAACAGCAATTGCTTCATGATCT
TTCCAAGGAAACTCTCTATCACTTGGTCTGATGACCCAAACTATTGGACATGGCTTCCCA
ACGACTCACCAAACGAGAAAGGTGTAGAAGCTGCGGAATTGAAAAACGTGTGTTGGCTTG
ACATCACGGGAAAATTCGACACAAGTAATCTTACTCCTGGGATTACGTACGAGGTGGTCT
TTCAGATGAAGCTAGAGGATCCTGCCTACGGATGGGACACACCGGTGAACGTGAAGCTAG
TGTTGCCTAACGGTAAGAATAATTTACATGAGAAAAAAGTGACTTTAAGGGAACAACCGA
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AGATCACTTTCTCAATGTATGAACATGCGGCTGGTGTTTGGAAGAAAGGACTCTTCCCCA
AAGGTGTTGCAATTCGTCCCAAGTATAATATTTAATATGGGATATAAAAACATTTGATAA
TCCATATGCACTTATGGACCTATTCTATGTATATTTCACGTCATACCATACATAAATATA
TATCAACGTGTGTGTGTGTCTGTATATCTGATAAGATTTTGATCTACTTTTAATAACAAC
TTTGATGTTGGTGTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H059TF U 1
AF RS1AA90TF U 35
AF RS1AA90JQ C 216
AF RS1H059JQB C 227
BS 1 210 RS1H059TF
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BS 741 917 RS1AA90JQ

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GTTTACAAAGAAGATGTCTACCATTCAGGAAAGGAGCGTACCGATTCAATCTCCGGTGGA
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TCTTGAAAAAACTTATCAAATATTGGGTGGACGACAAAAACAGCAATTGCTTCATGATCT
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TTCAGATGAAGCTAGAGGATCCTGCCTACGGATGGGACACACCGGTGAACGTGAAGCTAG
TGTTGCCTAACGGTAAGAATAAT

QA 1 563 1 563
DS 

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AGCGTACCGATTCAATCTCCGGTGGAATATAAGGCGATGAAACCACTTAACTATGAGACG
AAGAAACCACATAACTATGAGACCATTCTCAGAGACGCAGATCTTCCACTCCCCCCCTTC
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CAAAAACAGCAATTGCTTCATGATCTTTCCAAGGAAACTCTCTATCACTTGGTCTGATGA
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GGAATTGAAAAACGTGTGTTGGCTTGACATCACGGGAAAATTCGACACAAGTAATCTTAC
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TGTTTGGAAGAAAGGACTCTTCC
CC

QA 1 683 1 683
DS 

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ACCGAACAGCTACGCTCTGGTGTTCTCTTGAAAAAACTTATCAAATATTGGGTGGACGAC
AAAAACAGCAATTGCTTCATGATCTTTCCAAGGAAACTCTCTATCACTTGGTCTGATGAC
CCAAACTATTGGACATGGCTTCCCAACGACTCACCAAACGAGAAAGGTGTAGAAGCTGCG
GAATTGAAAAACGTGTGTTGGCTTGACATCACGGGAAAATTCGACACAAGTAATCTTACT
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GTTTGGAAGAAAGGACTCTTCCCCAAAGGTGTTGCAATTCGTCCTAAGTATAATATTTAA
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TCACGTCATACCATACATAAATATATATCAACGTGTGTGTGTGTCTGTATATCTGATAAG
ATTTTGATCTACTTTTAATAACAACTTTGATGTTGGTGTTGG

QA 1 702 1 702
DS 

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ACGCTCTGGTGTTCTCTTGAAAAAACTTATCAAATATTGGGTGGACGACAAAAACAGCAA
TTGCTTCATGATCTTTCCAAGGAAACTCTCTATCACTTGGTCTGATGACCCAAACTATTG
GACATGGCTTCCCAACGACTCACCAAACGAGAAAGGTGTAGAAGCTGCGGAATTGAAAAA
CGTGTGTTGGCTTGACATCACGGGAAAATTCGACACAAGTAATCTTACTCCTGGGATTAC
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GAACGTGAAGCTAGTGTTGCCTAACGGTAAGAATAATTTACATGAGAAAAAAGTGAGTTT
AAGGGAACAACCGAGGTATAAATGGGTCGATATTAAAGTCGGAGAGTTCAAGCATGAGAG
AGATTCCGTCGGAGAGATCACTTTCTCAATGTATGAACATGCGGCTGGTGTTTGGAAGAA
AGGACTCTTCCTCAAAGGTGTTGCAATTCGTCCCAAGTATAATATTTAATATGGGATATA
AAAACATTTGATAATCCATATGCACTTATGGACCTATTCTATGTATATTTCACGTCATAC
CATATATAAATATATATCAACGTGTGTGTGTGTCTGTATATCTGATAAGATTTTGATCTA
CTTTTAATAACAACTTTG

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 3

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GGATCATTCAAATGAACATATAACCGCAACACAATGATAATACCAGTAACAAGATATATG
AGTAGTACCCACGAAGAAATGAACAAAAACACCAATGAGAACATATAGTAACACATTCAC
CATCTGGTCAACCAAGCTTCTTATCAGATCCTTTAATGTTCAAGTTAAACCATTTCCTTT
TCGATTTGTCTCTACTCTCTGTTCCACCTTCTTCTCCTGCACAATCACCATCTCCTTTCT
GCTCATCTCCCTGCGCTTTGCTGCTACTTCCATTGCTCAAGTTGTTACCACTTGGTGGTG
TCTTCACAACAGAGAAGGACGAATGAATGGAGTCCCGTTGCTTTAGCAGTTCATCCACAG
TTTGCTTCTCCTGGGTGTATCTGGTGGTAACTTCTTGAAAGCGAGCCAAAGCTTTTCGGT
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TCAACTTCTCTGTTGTGTCCTCATAGGTCTTGGCACAGAGTGCCTCAATTGTGTAAGACG
CAGTCTTAAAGAAGTTATCACCGTAAACTGCAAATATATGAGTGCCAGCTCTCAGTTCCG
AGACCTCACAAGGCTGAAGACCTTCCAATCGCTTGAAGAAAGCTGATTCAGGGTCTTTGG
CTGCAGCTAACGCATTGACAGTTGAATCCATTCTGTACACTTGAAAATGTAAGAAATACA
TGCCGGATGACGTCACCTTGCCTGTTTTCTCACTCTCTTCCTGTAAGGCCAATCCATAGC
CGCCACTTGAATCTTGCTCAAAATAAAGCAATTTGAATTTACTTTGTGCTGTTGAAGTTA
CTCTAACAACAACCCCTGACTCAGCTTGTTGTTCACTTATTGTAACTCCAAAGAAGTGAG
CGCATTGCTTCTCAACCTTCCCGCTAACAGATGTACCAATAGGAAGAGGCCTAACGGTAA
CAGTCCCATTCATAGCCTCTTCAAGAACATTGGCAGACACAGTAGTCTTGATAGGCACAC
CTAGTTTGCTGAATAATGCAGCAAACATGGTGTTAACAGTTCCTAAGTTAGACAAGTCAA
TTTCCATCTCCATTCCATCAGCATCAAGAGCCTCAAACCCTGCATTGTCGTATTGCCTTC
TCTTCTCTGGGTCAGACAAGATGCTGTAAGAGAAAGCAACTTCCTTGAAAAGATCAGAAG
CTTCTGGATTATTAGCGTTCTTGTCCGGATGATACTTTAGGGCTAATTTTCGGTAAGCGG
ATTGGATTTCTTGATCGGAAGCGTCTCTTGCGACGGAGAGCACCTCGTGCGGGTCTCTTC
TATTCGCCGGAGCCGACGACCCTTCCACCTTCTTCGATGAACTCATCGTTTTTGAGCCTT
TTTTGCTTCGAATTTGCGCGAATCGACAGAGACGATTGGAATAGAAGATCTAATCTAATC
TCCAGCTGTTTAAGAGCGGACAGAGGGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FI07JQ U 14
AF RS1BZ51JQ U 1
AF RS1BZ51TF C 661
BS 1 243 RS1BZ51JQ
BS 244 244 RS1FI07JQ
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BS 327 756 RS1BZ51JQ
BS 757 1471 RS1BZ51TF

RD RS1FI07JQ 522 0 0
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AAGAAATGAACAAAAACACCAATGAGAATATATAGTAACACATTCATCATCTGGTCAACC
AAGCTTCTTATCAGATCCTTTAATGTTCAAGTTGAACCATTTCCTTTTCGATTTGTCTCT
ACTCTCTGTTCCACCTTCTTCTCCTGCACAATCACCATCTCCTTTCTGCTCATCTCCCTG
CGCTTTGCTGCTACTTCCATTGCTCAAGTTGTTACCACTTGGTGGTGTCTTCACAACAGA
GAAGGACGAATGAATGGAGTCCCGTTGCTTTAGCAGTTCATCCACAGTTTGCTTCTCCTG
GGTGTATCTGGTGGTAACTTCTTGAAAGCGAGCCAAAGCTTTTCGGTACTCAGTTTCAAA
CTGCCGCAAGTCGTTTCTCTTTCTTAAGATCTGAGCTTCAATCTCCTTCAACTTCTCTGT
TGTGTCCTCATAGGTCTTGGCACAGAGTGCCTCAATTGTGTA

QA 1 522 1 522
DS 

RD RS1BZ51JQ 756 0 0
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AGTAGTACCCACGAAGAAATGAACAAAAACACCAATGAGAACATATAGTAACACATTCAC
CATCTGGTCAACCAAGCTTCTTATCAGATCCTTTAATGTTCAAGTTAAACCATTTCCTTT
TCGATTTGTCTCTACTCTCTGTTCCACCTTCTTCTCCTGCACAATCACCATCTCCTTTCT
GCTTATCTCCCTGCGCTTTGCTGCTACTTCCATTGCTCAAGTTGTTACCACTTGGTGGTG
TCTTCACAACAGAGAAGGACGAATGGATGGAGTCCCGTTGCTTTAGCAGTTCATCCACAG
TTTGCTTCTCCTGGGTGTATCTGGTGGTAACTTCTTGAAAGCGAGCCAAAGCTTTTCGGT
ACTCAGTTTCAAACTGCCGCAAGTCGTTTCTCTTTCTTAAGATCTGAGCTTCAATCTCCT
TCAACTTCTCTGTTGTGTCCTCATAGGTCTTGGCACAGAGTGCCTCAATTGTGTAAGACG
CAGTCTTAAAGAAGTTATCACCGTAAACTGCAAATATATGAGTGCCAGCTCTCAGTTCCG
AGACCTCACAAGGCTGAAGACCTTCCAATCGCTTGAAGAAAGCTGATTCAGGGTCTTTGG
CTGCAGCTAACGCATTGACAGTTGAATCCATTCTGTACACTTGAAAATGTAAGAAATACA
TGCCGGATGACGTCACCTTGCCTGTTTTCTCACTCT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RS1BZ51TF 811 0 0
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TGCCGGATGACGTCACCTTGCCTGTTTTCTCACTCTCTTCCTGTAAGGCCAATCCATAGC
CGCCACTTGAATCTTGCTCAAAATAAAGCAATTTGAATTTACTTTGTGCTGTTGAAGTTA
CTCTAACAACAACCCCTGACTCAGCTTGTTGTTCACTTATTGTAACTCCAAAGAAGTGAG
CGCATTGCTTCTCAACCTTCCCGCTAACAGATGTACCAATAGGAAGAGGCCTAACGGTAA
CAGTCCCATTCATAGCCTCTTCAAGAACATTGGCAGACACAGTAGTCTTGATAGGCACAC
CTAGTTTGCTGAATAATGCAGCAAACATGGTGTTAACAGTTCCTAAGTTAGACAAGTCAA
TTTCCATCTCCATTCCATCAGCATCAAGAGCCTCAAACCCTGCATTGTCGTATTGCCTTC
TCTTCTCTGGGTCAGACAAGATGCTGTAAGAGAAAGCAACTTCCTTGAAAAGATCAGAAG
CTTCTGGATTATTAGCGTTCTTGTCCGGATGATACTTTAGGGCTAATTTTCGGTAAGCGG
ATTGGATTTCTTGATCGGAAGCGTCTCTTGCGACGGAGAGCACCTCGTGCGGGTCTCTTC
TATTCGCCGGAGCCGACGACCCTTCCACCTTCTTCGATGAACTCATCGTTTTTGAGCCTT
TTTTGCTTCGAATTTGCGCGAATCGACAGAGACGATTGGAATAGAAGATCTAATCTAATC
TCCAGCTGTTTAAGAGCGGACAGAGGGACCC

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 4

CO CL1914Contig1 880 4 11 U
AGGGAACTTAGAACCCTAATTCCAAAGTCTCTCTCCCTAAAAATCCAAATCATGGAGGTT
AATATTCTTCCTCAGGCAGTCGTAGGAAATGTGGTTTTGTTGCAAGGTGGAGGAGCCAGA
GTAACGATTCCACCGGGTAATGGTTTTACCATTACTGTCAATCCGGTGGAATTTGCTGCC
GCTGGTGCTTTAGGAGCTGGCGCTGGTGAGGGAGCTGCCAATAACATAGCCGCTATCACA
GCCGGTATCCTGCAGGCTTCGGTTGACAGGCCGCTATCTGCCACTGAGGTACTGCATATG
CTAAGGGTCGACAACACGTTAATGGTGCAAGACGATTATCCACCCGTACCTCCCGCCACA
GGTCTTTTCCTCTACGACATGGAGATTGCAAACCGTTCAGACCACCATCACTTCGACACC
CGACCTTGCTACTACAAACAGCCTGCTCAGTTTGGAGCTGGATTCGTGGTGATCAAGCAC
CGTCGGAGGGTGGCCGTTCATCCAGCACATGTTGCACATCAGAGAGTTGTGTGCCGGAGA
TATTTGATACTAGGAGATCCACGTGTCCTCTTTCACTACCTGGAAGAGCATGTAGATGAT
GCATTTGTAGAGGAGGAGGAACCAGCCATCCCATTTGACCCAGTGGTACCACTCCTCATA
TAGGGTGGTTTCCAGTTTAAAATTTCTTTGTTTAAAAAGTTCGGTCATAATGAAGTCTTG
GTGGGATATTGGTTTTTATGCTTATTCAATTTTCTTTGATAAAGAATTTTTGTAACAAAA
TGTAGCTGGAAATTGTTTCACTTTTCCGGTTCGAGATCCTTCTTGATTTTTTTTTGTTTC
TTGAGGTTTGTCAAAAATTAAATCGAACCTTGAGGTTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E531TF U 1
AF RS1CR78TF U 280
AF RS1D048TF U 280
AF RS1E531JQ C 68
BS 1 664 RS1E531TF
BS 665 665 RS1CR78TF
BS 666 697 RS1E531TF
BS 698 698 RS1CR78TF
BS 699 718 RS1E531TF
BS 719 719 RS1CR78TF
BS 720 729 RS1E531TF
BS 730 730 RS1CR78TF
BS 731 744 RS1E531TF
BS 745 798 RS1CR78TF
BS 799 880 RS1E531JQ

RD RS1E531TF 744 0 0
AGGGAACTTAGAACCCTAATTCCAAAGTCTCTCTCCCTAAAAATCCAAATCATGGAGGTT
AATATTCTTCCTCAGGCAGTCGTAGGAAATGTGGTTTTGTTGCAAGGTGGAGGAGCCAGA
GTAACGATTCCACCGGGTAATGGTTTTACCATTACTGTCAATCCGGTGGAATTTGCTGCC
GCTGGTGCTTTAGGAGCTGGCGCTGGTGAGGGAGCTGCCAATAACATAGCCGCTATCACA
GCCGGTATCCTGCAGGCTTCGGTTGACAGGCCGCTATCTGCCACTGAGGTACTGCATATG
CTAAGGGTCGACAACACGTTAATGGTGCAAGACGATTATCCACCCGTACCTCCCGCCACA
GGTCTTTTCCTCTACGACATGGAGATTGCAAACCGTTCAGACCACCATCACTTCGACACC
CGACCTTGCTACTACAAACAGCCTGCTCAGTTTGGAGCTGGATTCGTGGTGATCAAGCAC
CGTCGGAGGGTGGCCGTTCATCCAGCACATGTTGCACATCAGAGAGTTGTGTGCCGGAGA
TATTTGATACTAGGAGATCCACGTGTCCTCTTTCACTACCTGGAAGAGCATGTAGATGAT
GCATTTGTAGAGGAGGAGGAACCAGCCATCCCATTTGACCCAGTGGTACCACTCCTCATA
TAGG*TGGTTTCCAGTTTAAAATTTCTTTGTTTAAAA*GTTCGGTCATAATGAAGTCT*G
GTGGGATAT*GGTTTTTATGCTTA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1CR78TF 520 0 0
GCCACTGAGGTACTGCATATGCTAAGGGTCGACAACACGTTAATGGTGCAAGACGATTAT
CCACCCGTACCTCCCGCCACAGGTCTTTTCCTCTACGACATGGAGATTGCAAACCGTTCA
GACCACCATCACTTCGACACCCGACCTCGCTACTACAAACAGCCTGCTCAGTTTGGAGCT
GGATTCGTGGTGATCAAGCACCGTCGGAGGGTGGCCGTTCATCCAGCACATGTTGCACAT
CAGAGAGTTGTGTGCCGGAGATATTTGATACTAGGAGATCCACGTGTCCTCTTTCACTAC
CTTGAAGAGCATGTAGATGATGCATTTGTAGAGGAGGAGGAACCAGCCATCCCATTTGAC
CCAGTGGTACCACTCCTCATATAGGGTGGTTTCCAGTTTAAAATTTCTTTGTTTAAAAAG
TTCGGTCATAATGAAGTCTTGGTGGGATATTGGTTTTTATGCTTATTCAATTTTCTTTGA
TAAAGAATTTTTGTAACAAAATGTAGCTGGAAATTGTTT
T

QA 1 519 1 519
DS 

RD RS1D048TF 519 0 0
GCCACTGAGGTACTGCATATGCTAAGGGTCGACAACACGTTAATGGTGCAAGACGATTAT
CCACCCGTACCTCCCGCCACAGGTCTTTTCCTCTACGACATGGAGATTGCAAACCGTTCA
GACCACCATCACTTCGACACCCGACCTCGCTACTACAAACAGCCTGCTCAGTTTGGAGCT
GGATTCGTGGTGATCAAGCACCGTCGGAGGGTGGCCGTTCATCCAGCACATGTTGCACAT
CAGAGAGTTGTGTGCCGGAGATATTTGATACTAGGAGATCCACGTGTCCTCTTTCACTAC
CTTGAAGAGCATGTAGATGATGCATTTGTAGAGGAGGAGGAACCAGCCATCCCATTTGAC
CCAGTGGTACCACTCCTCATATAGGGTGGTTTCCAGTTTAAAATTTCTTTGTTTAAAAAG
TTCGGTCATAATGAAGTCTTGGTGGGATATTGGTTTTTATGCTTATTCAATTTTCTTTGA
TAAAGAATTTTTGTAACAAAATGTAGCTGGAAATTGTTT

QA 1 519 1 519
DS 

RD RS1E531JQ 813 0 0
TTCCTCAGGCAGTCGTAGGAAATGTGGTTTTGTTGCAAGGTGGAGGAGCCAGAGTAACGA
TTCCACCGGGTAATGGTTTTACCATTACTGTCAATCCGGTGGAATTTGCTGCCGCTGGTG
CTTTAGGAGCTGGCGCTGGTGAGGGAGCTGCCAATAACATAGCCGCTATCACAGCCGGTA
TCCTGCAGGCTTCGGTTGACAGGCCGCTATCTGCCACTGAGGTACTGCATATGCTAAGGG
TCGACAACACGTTAATGGTGCAAGACGATTATCCACCCGTACCTCCCGCCACAGGTCTTT
TCCTCTACGACATGGAGATTGCAAACCGTTCAGACCACCATCACTTCGACACCCGACCTT
GCTACTACAAACAGCCTGCTCAGTTTGGAGCTGGATTCGTGGTGATCAAGCACCGTCGGA
GGGTGGCCGTTCATCCAGCACATGTTGCACATCAGAGAGTTGTGTGCCGGAGATATTTGA
TACTAGGAGATCCACGTGTCCTCTTTCACTACCTGGAAGAGCATGTAGATGATGCATTTG
TAGAGGAGGAGGAACCAGCCATCCCATTTGACCCAGTGGTACCACTCCTCATATAGGGTG
GTTTCCAGTTTAAAATTTCTTTGTTTAAAAAGTTCGGTCATAATGAAGTCTTGGTGGGAT
ATTGGTTTTTATGCTTATTCAATTTTCTTTGATAAAGAATTTTTGTAACAAAATGTAGCT
GGAAATTGTTTCACTTTTCCGGTTCGAGATCCTTCTTGATTTTTTTTTGTTTCTTGAGGT
TTGTCAAAAATTAAATCGAACCTTGAGGTTGCG

QA 1 813 1 813
DS 



AS 1 4

CO CL1915Contig1 518 4 3 U
GGATGAACATTCAGAACAAGAACTCGTCCTACTTTGTGGAGTGGATCCCGAACAATGTCA
AGTCCAGCGTCTGTGATATTGCGCCGACGGGTTTGAAAATGGCCTCGACTTTCATCGGAA
ACTCGACTTCGATCCAGGAGATGTTTAGGCGTGTGAGTGAACAGTTCACTGCTATGTTCA
GGAGAAAGGCTTTCCTTCATTGGTACACAGGAGAAGGAATGGACGAGATGGAGTTCACGG
AAGCAGAGAGTAACATGAACGATCTTGTTGCAGAGTATCAGCAGTACCAGGATGCTACGG
CCGACAGTGAAGAGGAGTATGAAGAGGAAGAAGAGGAGTACGATGAGGCTTGAGATGTTG
TTGGTCAATGGCTTCCGTCTTGACTCATAAGCTGTGGATTTCTTCTTTCTAAATTTCTTC
TTTAAATATCTGTCCAGTTAATGTTTGCTTTGTTCCTTTACTCGTGTTCTGGATTTGTTA
AACGTTTGCGTGCATTGGTTTATTGTTTTTGTCCAGTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1E534JQ C 1
AF RS1C767JQ C 306
AF RS1C767TF U 306
AF RS1E534TF U 1
BS 1 306 RS1E534TF
BS 307 501 RS1C767TF
BS 502 518 RS1E534TF

RD RS1E534JQ 518 0 0
GGATGAACATTCAGAACAAGAACTCGTCCTACTTTGTGGAGTGGATCCCGAACAATGTCA
AGTCCAGCGTCTGTGATATTGCGCCGACGGGTTTGAAAATGGCCTCGACTTTCATCGGAA
ACTCGACTTCGATCCAGGAGATGTTTAGGCGTGTGAGTGAACAGTTCACTGCTATGTTCA
GGAGAAAGGCTTTCCTTCATTGGTACACAGGAGAAGGAATGGACGAGATGGAGTTCACGG
AAGCAGAGAGTAACATGAACGATCTTGTTGCAGAGTATCAGCAGTACCAGGATGCTACGG
CCGACAGTGAAGAGGAGTATGAAGAGGAAGAAGAGGAGTACGATGAGGCTTGAGATGTTG
TTGGTCAATGGCTTCCGTCTTGACTCATAAGCTGTGGATTTCTTCTTTCTAAATTTCTTC
TTTAAATATCTGTCCAGTTAATGTTTGCTTTGTTCCTTTACTCGTGTTCTGGATTTGTTA
AACGTTTGCGTGCATTGGTTTATTGTTTTTGTCCAGTG

QA 1 518 1 518
DS 

RD RS1C767JQ 196 0 0
G
GTGAAGAGGAGTATGAAGAGGAAGAAGAGGAGTACGATGAGGCTTGAGATGTTGTTGGTC
AATGGCTTCCGTCTTGACTCATAAGCTGTGGATTTCTTCTTTCTAAATTTTTTCTTTAAA
TATCTGTCCAGTTAATGTTTGCTTTGTTCCTTTACTCGTGTTCTGGATTTGTTAAACGTT
TGCGTGCATTGGTTT

QA 2 196 2 196
DS 

RD RS1C767TF 196 0 0
G
GTGAAGAGGAGTATGAAGAGGAAGAAGAGGAGTACGATGAGGCTTGAGATGTTGTTGGTC
AATGGCTTCCGTCTTGACTCATAAGCTGTGGATTTCTTCTTTCTAAATTTCTTCTTTAAA
TATCTGTCCAGTTAATGTTTGCTTTGTTCCTTTACTCGTGTTCTGGATTTGTTAAACGTT
TGCGTGCATTGGTTT

QA 2 196 2 196
DS 

RD RS1E534TF 518 0 0
GGATGAACATTCAGAACAAGAACTCGTCCTACTTTGTGGAGTGGATCCCGAACAATGTCA
AGTCCAGCGTCTGTGATATTGCGCCGACGGGTTTGAAAATGGCCTCGACTTTCATCGGAA
ACTCGACTTCGATCCAGGAGATGTTTAGGCGTGTGAGTGAACAGTTCACTGCTATGTTCA
GGAGAAAGGCTTTCCTTCATTGGTACACAGGAGAAGGAATGGACGAGATGGAGTTCACGG
AAGCAGAGAGTAACATGAACGATCTTGTTGCAGAGTATCAGCAGTACCAGGATGCTACGG
CCGACAGTGAAGAGGAGTATGAAGAGGAAGAAGAGGAGTACGATGAGGCTTGAGATGTTG
TTGGTCAATGGCTTCCGTCTTGACTCATAAGCTGTGGATTTCTTCTTTCTAAATTTCTTC
TTTAAATATCTGTCCAGTTAATGTTTGCTTTGTTCCTTTACTCGTGTTCTGGATTTGTTA
AACGTTTGCGTGCATTGGTTTATTGTTTTTGTCCAGTG

QA 1 518 1 518
DS 



AS 2 4

CO CL1916Contig1 1275 2 4 U
CTCTAGGCATAGCTCTTACAGTATACGGAAGAGAAGAAGGAGCAGACACTTTGATTGAGC
AGATGACTAGAGATCAAGATCCTATCATCCGTTATGGTGGCATGTACGCACTGGCACTGG
CTTACAGTGGAACAGCAAACAATAAGGCAATTCGCCAATTGCTACACTTTGCTGTATCTG
ATGTTAGTGATGATGTTAGAAGGACTGCCGTTCTGGCACTTGGATTTGTCTTGTACTCTG
ATCCAGAGCAGACTCCTCGCATTGTATCATTACTTTCCGAGTCGTACAACCCACATGTTC
GCTATGGAGCGGCACTTGCAGTGGGTATTTCATGTGCAGGCACTGGCCTCAGCGAAGCAA
TATCCTTGTTGGAGCCACTTACATCAGATGTGGTTGACTTTGTCCGTCAAGGTGCTTTGA
TTGCAATGGCCATGGTGATGGTCCAAATCAGCGAAGCAAGCGATTCTCGTGTTGGAACAT
TCAGGCGCCAACTTGAGAAGATCTTACTCGACAAGCACGAGGACACAATGAGCAAGATGG
GAGCGATTCTGGCCTCTGGTATCCTCGATGCCGGTGGTAGGAACGTTACTATAAGGTTGC
TCTCTAAGACCAAACACGACAAAGTCACTGCTGTTATTGGCCTCGCTGTCTTCAGCCAGT
TTTGGTACTGGTACCCTCTGATCTACTTCATCAGCTTGGCCTTCTCACCAACAGCGTTCA
TCGGTTTGAACTACGACCTTAAGGTCCCAAAGTTCGAGTTCATGTCACACGCTAAACCGT
CTTTGTTTGAGTACCCAAAGCCCACCACAGTGCCTACAGCCAATACCGCTGCCAAACTTC
CAACTGCTGTTCTCTCGACCTCAGTTAAAGCCAAAGCTAGGGCTAAGAAAGATGCAGAGC
AGAAAGCTAATGCTGAAAAAGCATCTGGTGCGGAGAAGTCCGTCAATGAAAGTGGCTCTG
GGAAAGGGAAAGATTCGGCTGAGAAGGAAGGTGACTCTATGCAGATTGATAGCACAGTAC
CGGTGGAGAAGAAAGCTGCGGAGCCAGAGCCAGCGTTTGAGATTCTAGTGAACCCAGCAC
GAGTAGTCCCAGCCCAAGAGAAGTACATTAAGCTACTTGAAGACAGCAGATACGTACCAG
TGAAGCTAGCTCCATCGGGGTTTGTTCTTCTCAAGGACTTGCGTGAACACGAGCCAGAGT
TTCTCTTTCTGACGGATGCACCAACTTCAACAGCTTCTGCTGCAACTGGTGCAGCTGCTG
CGGCTACACAAGGAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AL56TF U 1
AF RS1AL56JQ C 581
BS 1 813 RS1AL56TF
BS 814 814 RS1AL56JQ
BS 815 826 RS1AL56TF
BS 827 1275 RS1AL56JQ

RD RS1AL56TF 827 0 0
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CTTACAGTGGAACAGCAAACAATAAGGCAATTCGCCAATTGCTACACTTTGCTGTATCTG
ATGTTAGTGATGATGTTAGAAGGACTGCCGTTCTGGCACTTGGATTTGTCTTGTACTCTG
ATCCAGAGCAGACTCCTCGCATTGTATCATTACTTTCCGAGTCGTACAACCCACATGTTC
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TATCCTTGTTGGAGCCACTTACATCAGATGTGGTTGACTTTGTCCGTCAAGGTGCTTTGA
TTGCAATGGCCATGGTGATGGTCCAAATCAGCGAAGCAAGCGATTCTCGTGTTGGAACAT
TCAGGCGCCAACTTGAGAAGATCTTACTCGACAAGCACGAGGACACAATGAGCAAGATGG
GAGCGATTCTGGCCTCTGGTATCCTCGATGCCGGTGGTAGGAACGTTACTATAAGGTTGC
TCTCTAAGACCAAACACGACAAAGTCACTGCTGTTATTGGCCTCGCTGTCTTCAGCCAGT
TTTGGTACTGGTACCCTCTGATCTACTTCATCAGCTTGGCCTTCTCACCAACAGCGTTCA
TCGGTTTGAACTACGACCTTAAGGTCCCAAAGTTCGAGTTCATGTCACACGCTAAACCGT
CTTTGTTTGAGTACCCAAAGCCCACCACAGTGC*TACAGCCAATAC
G

QA 1 826 1 826
DS 

RD RS1AL56JQ 695 0 0
GAACGTTACTATAAGGTTGCTCTCTAAGACCAAACACGACAAAGTCACTGCTGTTATTGG
CCTCGCTGTCTTCAGCCAGTTTTGGTACTGGTACCCTCTGATCTACTTCATCAGCTTGGC
TTTCTCACCAACAGCGTTCATCGGTTTGAACTACGACCTTAAGGTCCCAAAGTTCGAGTT
CATGTCACACGCTAAACCGTCTTTGTTTGAGTACCCAAAGCCCACCACAGTGCCTACAGC
CAATACCGCTGCCAAACTTCCAACTGCTGTTCTCTCGACCTCAGTTAAAGCCAAAGCTAG
GGCTAAGAAAGATGCAGAGCAGAAAGCTAATGCTGAAAAAGCATCTGGTGCGGAGAAGTC
CGTCAATGAAAGTGGCTCTGGGAAAGGGAAAGATTCGGCTGAGAAGGAAGGTGACTCTAT
GCAGATTGATAGCACAGTACCGGTGGAGAAGAAAGCTGCGGAGCCAGAGCCAGCGTTTGA
GATTCTAGTGAACCCAGCACGAGTAGTCCCAGCCCAAGAGAAGTACATTAAGCTACTTGA
AGACAGCAGATACGTACCAGTGAAGCTAGCTCCATCGGGGTTTGTTCTTCTCAAGGACTT
GCGTGAACACGAGCCAGAGTTTCTCTTTCTGACGGATGCACCAACTTCAACAGCTTCTGC
TGCAACTGGTGCAGCTGCTGCGGCTACACAAGGAA

QA 1 695 1 695
DS 



CO CL1916Contig2 706 2 6 U
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ACGGCTTTCATCGGTTTGAACTACGACCTTAAGGTCCCAAAGTTTGAGTTCATGTCGCAC
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AGCACAGTACCGGTGGAGAAGAAAGCTGCGGAGCCAGAGGCAGCGTTTGAGATTCTGGTG
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CAACCTCCACAGGCCTTCGAATACGCTACCTGATTTTTAGTTTCTT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1F516TF U 1
AF RS1H424TF U 1
BS 1 612 RS1F516TF
BS 613 613 RS1H424TF
BS 614 622 RS1F516TF
BS 623 623 RS1H424TF
BS 624 662 RS1F516TF
BS 663 706 RS1H424TF

RD RS1F516TF 667 0 0
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ACGGCTTTCATCGGTTTGAACTACGACCTTAAGGTCCCAAAGTTTGAGTTCATGTCGCAC
GCAAAACCGTCTTTGTTTGAGTACCCAAAGCCCACCACAGTGCCTACAGCCAATACCGCT
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AGTGGCTCTGGGAAAGGGAAAGATTCGGCTGAGAAGGAAGGTGACTCTATGCAGATTGAT
AGCACAGTACCGGTGGAGAAGAAAGCTGCGGAGCCAGAGGCAGCGTTTGAGATTCTGGTG
AACCCAGCCAGAGTAGTCCCAGCTCAAGAGAAATTCATAAAGTTGCTCGAAGACAGCAGA
TACGTACCGGTGAAGCTAGCTCCATCGGGTTTCGTTCTTCTCAAGGACTTGCGTGAACAC
GAGCCAGAGGTTCTCTCTCTGACGGATGCACCAACTTCAACAGCTTCTGCTGCAACTGGT
GCAGCTGCTTCG*CTACACAAG*AACAACAGCCTCGGCTATGGCTGTAGATGATGAGCCA
CA
CCTCC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RS1H424TF 706 0 0
G
TCAGCCAGTTTTGGTATTGGTACCCTCTGATCTACTTCATTAGCTTGGCCTTCTCACCGA
CGGCTTTCATCGGTTTGAACTACGACCTTAAGGTCCCAAAGTTTGAGTTCATGTCGCACG
CAAAACCGTCTTTGTTTGAGTACCCAAAGCCCACCACAGTGCCTACAGCCAATACCGCTG
CCAAACTTCCAACTGCTGTTCTCTCCACCTCAGTTAAAGCCAAAGCTAGGGCTAAGAAAG
ATGCAGAGCAGAAAGCTAATGCTGAAAAAGCATCTGGTGCGGAGAAGTCCGTCAATGAAA
GTGGCTCTGGGAAAGGGAAAGATTCGGCTGAGAAGGAAGGTGACTCTATGCAGATTGATA
GCACAGTACCGGTGGAGAAGAAAGCTGCGGAGCCAGAGGCAGCGTTTGAGATTCTGGTGA
ACCCAGCCAGAGTAGTCCCAGCTCAAGAGAAATTCATAAAGTTGCTCGAAGACAGCAGAT
ACGTACCGGTGAAGCTAGCTCCATCGGGTTTCGTTCTTCTCAAGGACTTGCGTGAACACG
AGCCAGAGGTTCTCTCTCTGACGGATGCACCAACTTCAACAGCTTCTGCTGCAACTGGTG
CAGCTGCTTCGGCTACACAAGGAACAACAGCCTCGGCTATGGCTGTAGATGATGAGCCAC
AACCTCCACAGGCCTTCGAATACGCTACCTGATTTTTAGTTTCTT

QA 2 706 2 706
DS 



AS 1 3

CO CL1917Contig1 1527 3 9 U
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BQ
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TCAGATATCGTTCTCACTGAGCCAGGACTCAGCGTTATCATCAGTGCTGTCCTCACCAGC
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TGCGGTGTATCTGCAAGTTAGTATCATTAGTC

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DS 

RD RS1FU93TF 775 0 0
G
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GGAAAAGAAGAGAGGGAGGCTCAATGGGCAGTTGCTCAGAGAACACTTCACGGCTTGCTG
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QA 2 775 2 775
DS 

RD RS1FU93JQ 729 0 0
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TGCTGTGTACGCCAACTGGGAGTTTGCAAAGGTTAAGGGTATTGGATGGGGATGGGCTGG
AGTGATCTGGATATACAGTATTGTAACATACGTCCCACAGGACATTTTCAAGTTTGCCAT
TAGATACATCTTGAGTGGAAAGGCTTGGCTCAACTTGTTTGAGAACAGGGTTGCTTTAAC
TAACAAGAAATATTTTGGAAAAGAAGAGAGGGAGGCTCAATGGGCAGTTGCTCAGAGAAC
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GGTTATTGTTTGCATAGGGAGAGAGAGATCTTTGTTTATTTCCATAACTCTTCCCCCATT
CCTATTGTTAGTGTTCTTGTTTCTCTGATATGTAACCAACCTCCTTTAGAAGAATCAAGA
CATGCTTTT

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 3

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GCGGTTTTCGGTGGCGCTAATCTTGGTTCTGTTTCCTTCTCCTCTCATCTGCTCAACCAA
CAGTCTTCTTTTCTCTCTTGCCCTCTTAGACTCCCCCCTTCTTCCTCCTCTTCTTCTTCT
TCAAATAGAACCTCTCTCCTCTGCGTCGTCAAGTCCTTCTCAGGCTCCGTAACCCCGATA
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GGATGTCTACTGATTGGAAGCTGGCAAAAGCTTATTGTAAGAGTGGTGACACGTTTGAAG
GCGAAGTCGAAGGCTTTAATGGTGGTGGCTTGCTTATTCGTTTTCACTCTCTTGTCGGTT
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AGGTCTCGTGGGATTACGTTCAAGATGTTAGGGATGTGTTACGTGATGGTGATGAGGTTC
GAGTTATAGTCACAAATATCGACAAAGAGAAATCAAGGATCACACTATCCATCAAACAAC
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AGTTGGGTCATCATAAGCATATAATCAAAAGTGGAGCAGCAGCTACTTGGGAAATCTAGA
AAACGGGCAATGCAAATTCATTTGTATGTGACACATAACACAACCTATGAAAAAAAAATA
TATGTTGATACTCACTCAATTCACATTATATAATTCCATTTACAT


BQ
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TTCTGT

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GGATACAATTGAGCCTCTTCCAGGTCTAGAAACTATACTTGAAGAGCTACTGCAAGAAGA
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GAAAGCGTTACAGCGAGTACTAGAACGCGTCCCCTAAAGAGACTGTGCTTCTTAGCCCCT
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G
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AATCTAGAAAACGGGCAATGCAAATTCATTTGTATGTGACACATAACACAACCTATGAAA
AAAAAATATATGTTGATACTCACTCAATTCACATTATATAATTCCATTTACAT

QA 2 354 2 354
DS 



AS 1 3

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GAGCTCCAGCCCTCTCCGGTCTGTCCAAAGAACTTTGTCATTTTCGATCAGACGTATGAC
CACAACAGCCAAGTGATGTACCATCCTGACCTCACACCTAGGCTCGTGAACTCCGGATTG
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BQ
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AF RS1GU16TF U 1
AF RS1FE85TF U 106
AF RS1GU16JQ C 224
BS 1 188 RS1GU16TF
BS 189 189 RS1FE85TF
BS 190 595 RS1GU16TF
BS 596 761 RS1FE85TF
BS 762 762 RS1GU16JQ
BS 763 815 RS1FE85TF
BS 816 816 RS1GU16JQ
BS 817 875 RS1FE85TF
BS 876 887 RS1GU16JQ

RD RS1GU16TF 595 0 0
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GAGCTCCAGCCCTCTCCGGTCTGTCCAAAGAACTTTGTCATTTTCGATCAGACGTATGAC
CACAACAGCCAAGTGATGTACCATCCTGACCTCACACCTAGGCTCGTGAACTCCGGATTG
GCTTCCACTTTTCAGAACGAGTATGTTGGGGGAGGTTATGGTTATAATAACTATGGCGGC
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ACAGATGAAGATGAGGAGGGGGAGGAGGAGGATGGTGGTGATTCAGAAGAGGTCATCAGC
ACGGCTCGTAACGCTTCTTCGAGGGAGTATGGGAATACATCGGCTGAGACTTGTTACTCA
AGTTATGGGTGTAACAGCAGCTCAAGAAGGAAGCAGAGTTCGTCAGGAAGTGCTGCTAGT
AGTTCTAACAATGATGGGAAAGGAGGAAGGAAGAAGAAGGTGAAGAAGATGATGGGAATG
TTGAGGAAGATTGTCCCTGGAGGTGAAGAGATGAATACAGCTTCCGTTCTTGATG

QA 1 595 1 595
DS 

RD RS1FE85TF 770 0 0
GATCAGACGTATGACCACAACAGCCAAGTGATGTACCATCCTGACCTCACACCTAGGCTC
GTGAACTCCGGATTGGCTTCCACGTTTCAGAACGAGTATGTTGGGGGAGGTTATGGTTAT
AATAACTATGGCGGCCAAGAAGTAGTCTCCTCTCCTTACCAAGAAGATCCGAACGAGATT
GATGCTCTCTTGAGCACAGATGAAGATGAGGAGGGGGAGGAGGAGGATGGTGGTGATTCA
GAAGAGGTCATCAGCACGGCTCGTAACGCTTCTTCGAGGGAGTATGGGAATACATCGGCT
GAGACTTGTTACTCAAGTTATGGGTGTAACAGCAGCTCAAGAAGGAAGCAGAGTTCGTCA
GGAAGTGCTGCTAGTAGTTCTAACAATGATGGGAAAGGAGGAAGGAAGAAGAAGATGAAG
AAGATGATGGGAATGTTGAGGAAGATTGTCCCTGGAGGTGAAGAGATGAATACAGCTTCC
GTTCTTGATGAAGCTGTTCAGTACCTCAAGTCGCTTAAACTTGAAGCTCAGAAACTTGGT
CATTTCTCAAATCAGTCTTGATTGCTACTTTGGACCGTTCTTGGCAAAGTAAACTGACCC
TGGCTCTATCTGGTGGGACCACTCCTCTCTCCTCTCTTCCGTTTTGGCAGGATGGGGTCT
ACTCAAAGGTCATCTGATAATATAGTATGTTGAAATCTCTCTCTTTATTGTGTGTTGTTG
CACAAGTTGTACTTGTGGATTTGATTTGTGCTTTGGTTTGGTATCGTTTA

QA 1 770 1 770
DS 

RD RS1GU16JQ 664 0 0
ATAATAACTATGGCGGCCAAGAAGTAGTCTCCTCTCCTTACCAAGAAGATCCGAACGAGA
TTGATGCTCTCTTGAGCACAGATGAAGATGAGGAGGGGGAGGAGGAGGATGGTGGTGATT
CAGAAGAGGTCATCAGCACGGCTCGTAACGCTTCTTCGAGGGAGTATGGGAATACATCGG
CTGAGACTTGTTACTCAAGTTATGGGTGTAACAGCAGCTCAAGAAGGAAGCAGAGTTCGT
CAGGAAGTGCTGCTAGTAGTTCTAACAATGATGGGAAAGGAGGAAGGAAGAAGAAGGTGA
AGAAGATGATGGGAATGTTGAGGAAGATTGTCCCTGGAGGTGAAGAGATGAATACAGCTT
CCGTTCTTGATGAAGCTGTTCAGTACCTCAAGTCGCTTAAACTTGAAGCTCAGAAACTTG
GTCATTTCTCAAATCAGTCTTGATTGCTACTTTGGACCGTTCTTGGCAAAGTAAACTGAC
CCTGGCTCTATCTGGTGGGACCACTCCTCTCTCCTCTCTTCCGTTTTGGCAGGATGGGAT
CTACTCAAAGGTCATCTGATAATATAGTATGTTGAAATCTCTCTCTTTATTGCGTGTTGT
TGCACAAGTTGTACTTGTGGATTTGATTTGTGCTTTGGTTTGGTATCGTTTAAACTTTTA
CTGC

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

CO CL1920Contig1 1052 2 8 U
TTTTTAAAAAAAAAAATCTTTATTTTTCTTACTCAGAAGGGATGGATCTAGAAGATTGGG
AACTGCTCCCCAGAGATCCCTACAAGGGTCTCGATCATGATGATGAAGACGATCATGAGG
CAGCGATGAAGATTACTAGAAACACCGAGAAAAGCTTGGACATGGATTACTTCATTTGCC
CAACACAAGCCTCTGTCGGAAAAACAGAGTTCCATCAAAGAGTGGTCCCCACTCAGCTCC
TCCATGTTCCCGTAACTTGGGAACCCGTGTCCACCGTGGAAGACACAGACATCAAGAAGA
ACCAGGACATGACAATAGACTTACCGGAGAGATTCGCAAGTCCTCTGCCACAGAACGATG
AGGAACACACTGGCTCAGGAGGAGAGTACCATGATGAAATGGGAACAGAGGTTGATGAAG
GTGGTGACTTGAGGAGCAAGAAAGAGGTTGAGTGGGAGGAAGAGGAAAACATATGTGGTG
AAAAAATGAATAAGTGGAAGATGGGTCTTCATGGAATTGGAGCTATATGTTCATTTGGTG
TTGCTGCTGCCACCTTCTGTGTCTTCTTCCTTGGGCACAACAATAGCATACAAGGTTGCC
GAAACAAGAACAAGAACCAGATCCTCAGGTTCCAGATTTACTCTGATGATAATAAGCGAA
TGAATGAAGTGGTGAAGCGTGCAACAAAGCTAAACGAAGCAATATCTGTGATGAAAAGTC
TACCAGTGGCAAGAACTCAGATATCTTTTGGAGGATACTACGATGCACTTTGAATATCAT
AGCCAAATCCATTTAGAATAATAATACATCATGATCCAAAATGTCTAGTATAGCTTTAGT
TATACTATGGATTTGTGAAATTCAATAAATGGTGTTTATAAATTCTACATTCTGTCAAAG
TGCATATCTAGTCTAATTTTATATGAACGTTGATATACATAGTTGATTTGGTTATAAAAT
CGACCATTGCATTAAATGTTCCTGATATGTTGAAAAGTGTGTAGTGTGTGTTGATCTCAG
CTGAAATCAAGTCCAATATCTTCCCTTGAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BT65TF U 1
AF RS1DK16TF U 377
BS 1 451 RS1BT65TF
BS 452 452 RS1DK16TF
BS 453 594 RS1BT65TF
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BS 660 1052 RS1DK16TF

RD RS1BT65TF 661 0 0
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AACTGCTCCCCAGAGATCCCTACAAGGGTCTCGATCATGATGATGAAGACGATCATGAGG
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AGGAACACACTGGCTCAGGAGGAGAGTACCATGATGAAATGGGAACAGAGGTTGATGAAG
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AAAAAATGAATAAGTGGAAGATGGGTCTTCATGGAATTGGAGCTATATGTTCATTTGGTG
TTGCTGCTGCCACCTTCTGTGTCTTCTTCCTTGGGCACAACAATAGCATACAAG*TTGCC
GAAACAAGAACAAGAACCAGATCCTTAGGTTCCAGATTTACTCTGATGATAATAAGCGA
TG

QA 1 659 1 659
DS 

RD RS1DK16TF 676 0 0
G
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AAGAAAGAGTTTGAGTGGGAGGAAGAGGAAAACATATGTGGTGAAAAAATGAATAAGTGG
AAGATGGGTCTTCATGGGATTGGAGCTATATGTTCATTTGGTGTTGCTGCTGCCACCTTC
TGTGTCTTCTTCCTTGGGCACAACAATAGCATACAAGGTTGCCGAAACAAGAACAAGAAC
CATATCCTCAGGTTCCAGATTTACTCTGATGATAATAAGCGAATGAATGAAGTGGTGAAG
CGTGCAACAAAGCTAAACGAAGCAATATCTGTGATGAAAAGTCTACCAGTGGCAAGAACT
CAGATATCTTTTGGAGGATACTACGATGCACTTTGAATATCATAGCCAAATCCATTTAGA
ATAATAATACATCATGATCCAAAATGTCTAGTATAGCTTTAGTTATACTATGGATTTGTG
AAATTCAATAAATGGTGTTTATAAATTCTACATTCTGTCAAAGTGCATATCTAGTCTAAT
TTTATATGAACGTTGATATACATAGTTGATTTGGTTATAAAATCGACCATTGCATTAAAT
GTTCCTGATATGTTGAAAAGTGTGTAGTGTGTGTTGATCTCAGCTGAAATCAAGTCCAAT
ATCTTCCCTTGAAAA

QA 2 676 2 676
DS 



AS 1 4

CO CL1921Contig1 1342 4 10 U
GGAAGAAAAAACAACTCTTATTATAACAAGAAAACGATCATTCTAAAGAAAAATAGAGAG
ACATGGGTTGTATTCACTTCGAGTCATCATCAGATCAATGGACACGCTCTGTCCAAGACC
AAG***AAACATCCAACACAGTTTCACCACAACACGAACAAGGAGGAGGAGGAATCCAAG
AAGCTTGGGACGAGATCGAGACTCGCCGAGGTGGTGTTTTCGCCGGAGAGAATAAGAACA
AGCTTGAGAAGAGGAAGAGCCAAGTGCTGCTCGAGGGATACGTAGTGGAGGCTGCTGATC
AAGAAGATCTTACGAGAGGTAAGAGTTTGACGGATGACGATCTTGAGGAGCTTAAAGGCT
GTTTGGATCTAGGGTTTGGGGTCAGCTACGACGAGATCCCTGAGCTCTGCAACACTTTGC
CTGCTCTAGAGCTTTGTTACTCCATGAGCCAGAAGTTCTTGGATGATAAGCAGAACCAAA
TGTGTCCAGCTGAAGAAGATTCTCAGCCACCACCACCGACCACGAGCAACCCAGTTGCAA
ACTGGAAGATCTCTAGCCCTGGTGATAATCCAGATGATGTAAAAGCAAGACTCAAATACT
GGGCACAAGCCGTAGCTTGCACTGTCCGGTTATGTAGCTGAACAACATTCATCATGATCT
TGTCTGAACATATTGGTTGAATCAGGAGCAAAAAAAATCTACTGATGAAGACCTTTCCTT
TGCATGAATGAAGTCTCTGCCCCTTGTTAGCTGAGAATGGACCTGCATTAATTGTGTGAC
ACATGGAGTAACTAGTTTGGTTTTACTTTTTTTTTTAATTGCATGTTATGTGTATTAGTA
TTATTCGTCTAGTGTTTGTTAATGAAAAATAAATGTGTTGCTGAATAAAAAAATTCAAAT
TCTTTTGTGCGTTTTTTGCATTTGCTTCTTGCAATAATGGTTTGCTTTAACATCTGACAT
CTAAATAGAGTTCTTGTCCTCGTTATATGCGGTGATGAGATCTATAGAGAGACAAAGAAA
CAACTCTGTTTTTGAAGTCCTCTGTTTTTGTTTGGCTGAGGTAACTCATCATCTAACTGT
CAGCGTTTTGATTAATAAGTTAATCTTCTTGTTTATGATATTGTTTTTGTATCATTGGTA
ATTAGGGCTCTAGATGATGGTAAAGCTCGTGGCTTTGCTTCAGTTACAACATGTACTTAC
TTGTGATTCTTTTTATCTTTTTTTTTGTCTTTCCCGTTTGTGGGAAAAGAATCAGAAACT
TTGTGGTCATAAGTTGTGAACACGCTTAACGTGTCGTGTACGATAGGGCGAAATGTTAAG
ACATGATCATCCTTTCCTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
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25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AATCTTCTTGTTTATGATATTGTTTTTGTATCATTGGTAATTAGGGCTCTAGATGATGGT
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G

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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

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AGAGTAACGGAGGTGTGCGAAGGTAGGCTCAAGCAAAGATTCTGCTCGTGAGCGTAATGG
TATAAGCCTGCCTGACTGTGGGACCGACTGGTCGAACAGAGACGAAAGTCGGCCATAGTG
ATCCGGGAGTCCCGTGTGGAAGGACTCTCGCTCAACGGATCAAAGGTACGCCGGGGATAA
CAGGCTGATGACTCCCAAGAGCTCTTATCGACGGAGTCGTTTGGCACCTCGATGTCGACT
C***ACATCCTGGGGTTGAAGAAGGTCCCAAGGGTTCGGTTGTTCGCCGATTCAAGTGGT
ACGTGAGTTGGGTTTAGAACGTCGTGAGACAGTCCGGTTCCTATCTACCGTTGGTGTTAA
AGCGAGAACTGCGAGGAGCCAACCCTAGTACGAGAGGACTGGGTTGGGCCAACCTATGGT
GTACCGGTTGTTATGGCAATAGCAGCGCCGGGAAGCTAAGTTGGTATGGAAGAACTGCTG
CTTAGCGGGAAATCCTTCTCTATACAAGTTCTCGGA*CAG*TTTTAGAACAGAACTT

QA 1 657 1 657
DS 

RD RS1FR79TF 695 0 0
G
AGACCACTCTTTCGTCTAAGGGTGCCTAACCGCCGCACCGAGAATTCGGGGGGAGGCGGG
ACACTGCGAGGTGGGTAGTTTATCTGGGGCGGATGCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGTGTG
CGAAGGTAGGCTCAAGCAAAGATTCTGCTCGTGAGCGTAATGGTATAAGCCTGCCTGACT
GTGAGACCGACTGGTCGAACAGAGACGAAAGTCGGCCATAGTGATCCGGGAGTCCCGTGT
GGAAGGGCTCTCGCTCAACGGATCAAAGGTACGCCGGGGATAACAGGCTGATGACTCCCA
AGAGCTCTTATCGACGGAGTCGTTTGGCACCTCGATGTCGACTCATCACATCCTGGGGTT
GAAGAAGGTCCCAAGGGTTCGGTTGTTCGCCGATTCAAGTGGTACGTGAGTTGGGTTTAG
AACGTCGTGAGACAGTTCGGTTCCTATCTACCGCTGGTGTTAAAGCGAGAACTGCGAGGA
GCCAACCCTAGTACGAGAGGACTGGGTTGGGCCAACCTATGGTGTACCGGTTGTTATGAC
AATAGCAGCGCCGGGAAGCTAAGTTGGTATGGAAGAACTGCTGCTTAGCGGGAAATCCTT
CTCTATACAAGTTCTCGGAACAGGTTTTAGAACAGAACTTCGATAGGCGAGAGGTGGAAG
CACCGCGAGGGGTGGAGCCATCTCGTACTAAACG

QA 2 695 2 695
DS 

RD RS1F429JQ 679 0 0
CTAAGGGTGCCTAACCGCCGCACCGAGAATTCGGGGGGAGGCGGGACACTGCGAGGTGGG
TAGTTTATCTGGGGCGGATGCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGTGTGCGAAGGTAGGCTCAA
GCAAAGATTCTGCTCGTGAGCGTAATGGTATAAGCCTGCCTGACTGTGGGACCGACTGGT
CGAACAGAGACGAAAGTCGGCCATAGTGATCCGGGAGTCCCGTGTGGAAGGACTCTCGCT
CAACGGATCAAAGGTACGCCGGGGATAACAGGCTGATGACTCCCAAGAGCTTTTATCGAC
GGAGTCGTTTGGCACCTCGATGTCGACTC***ACATCCTGGGGTTGAAGAAGGTCCCAAG
GGTTCGGTTGTTCGCCGATTCAAGTGGTACGTGAGTTGGGTTTAGAACGTCGTGAGACAG
TCCGGTTCCTATCTACCGTTGGTGTTAAAGCGAGAACTGCGAGGAGCCAACCCTAGTACG
AGAGGACTGGGTTGGGCCAACCTATGGTGTACCGGTTGTTATGGCAATAGCAGCGCCGGG
AAGCTAAGTTGGTATGGAAGAACTGCTGCTTAGCGGGAAATCCTTCTCTATACAAGTTCT
CGGAACAGGTTTTAGAACAGAACTTCGATAGGCGAGAGGTGGAAGCACCGCGAGGTGTGG
AGCCATCTCGTACTAAACG

QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1FR79JQ 609 0 0
GGGGCGGATGCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGTGTGCGAAGGTAGGCTCAAGCAAAGATTC
TGCTCGTGAGCGTAATGGTATAAGCCTGCCTGACTGTGAGACCGACTGGTCGAACAGAGA
CGAAAGTCGGCCATAGTGATCCGGGAGTCCCGTGTGGAAGGGCTCTCGCTCAACGGATCA
AAGGTACGCCGGGGATAACAGGCTGATGACTCCCAAGAGCTCTTATCGACGGAGTCGTTT
GGCACCTCGATGTCGACTCATCACATCCTGGGGTTGAAGAAGGTCCCAAGGGTTCGGTTG
TTCGCCGATTCAAGTGGTACGTGAGTTGGGTTTAGAACGTCGTGAGACAGTTCGGTTCCT
ATCTACCGCTGGTGTTAAAGCGAGAACTGCGAGGAGCCAACCCTAGTACGAGAGGACTGG
GTTGGGCCAACCTATGGTGTACCGGTTGTTATGACAATAGCAGCGCCGGGAAGCTAAGTT
GGTATGGAAGAACTGCTGCTTAGCGGGAAATCCTTCTCTATACAAGTTCTCGGAACAGGT
TTTAGAACAGAACTTCGATAGGCGAGAGGTGGAAGCACCGCGAGGGGTGGAGCCATCTCG
TACTAAACG

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 3

CO CL1923Contig1 745 3 7 U
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ACAAAGAGAATCTGTTTCAAAGTGATTAGAGTATAGGCTTTGACAATTATTAATGGAAGG
TAAAGGACGAGTCGGATCATCAACTTCTTCTTCTTTCACCACCGAACTCTTCGGCTTCAA
AGATCCTTCGCAGTCATCTTCTTCCTCTGGAATCTTCTCTTCTATTTTCCCTCATCCCTC
CAAGAGTTCTCAGGGCTTTACAAGAGATGGTTCAAGCTCCAAACATGGCTCACAAGCTCA
ACGTAGAGAATCTTCAACTACCCAAGAAGACAGAGTTGAGTCATGTCATCTAAGTTCTTC
TCTTTACTATGGTGGTCAAGACGTATACTCTCGATCCACCACCAACCAAAGTTACCCTAC
AGAAAAAAACGACCGTCTTAGAAGCGTAGAAAATGATGCTAATGGACAGAACTCGCAAGA
CGCTTCAAGAGGAGACTGGTGGCAAGGTTCTCTTTATTACTGAAAAACCGGTTCCTTTAT
TTGCTTTGTAAATCTCTCCACAAACCAATGAAGCTCAAGCCAAGTACTAATTATCTACCG
AACCAAGACGTTGTATAAATAAGTTTATGCAAAAAAACCGATCATTAATTTATCAGGCGA
TTTCTAAGATTAAAAAGTAATATTACAGAGATCTCCTAGTAAAAGGGTCTTGAATAGATT
GTCTAGTACTTGTTCTGATCAGTAT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B131TF U 1
AF RS1ES30TF U 1
AF RS1ES30JQ C 1
BS 1 207 RS1B131TF
BS 208 208 RS1ES30TF
BS 209 453 RS1B131TF
BS 454 454 RS1ES30TF
BS 455 481 RS1B131TF
BS 482 637 RS1ES30TF
BS 638 745 RS1ES30JQ

RD RS1B131TF 481 0 0
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TCTTTACTATGGTGGTCAAGACGTATACTCTCGATCCACCACCAACCAAAGTTACCCTAC
AGAAAAAAACGACCGTCTTAGAAGCGTAGAAAACGATGCTAATGGACAGAACTCGCAAGA
C

QA 1 481 1 481
DS 

RD RS1ES30TF 637 0 0
GGATACAAACTTCAGAGAACTGTCCTCCTCTCAGTCTATTTTACTTACATAAAAAGAATC
ACAAAGAGAATCTGTTTCAAAGTGATTAGAGTATAGGCTTTGACAATTATTAATGGAAGG
TAAAGGACGAGTCGGATCATCAACTTCTTCTTCTTTCACCACCGAACTCTTCGGCTTCAA
AGATCCTTCGCAGTCATCTTCTTCCTCTGGAATCTTCTCTTCTATTTTCCCTCATCCCTC
CAAGAGTTCTCAGGGCTTTACAAGAGATGGTTCAAGCTCCAAACATGGCTCACAAGCTCA
ACGTAGAGAATCTTCAACTACCCAAGAAGACAGAGTTGAGTCATGTCATCTAAGTTCTTC
TCTTTACTATGGTGGTCAAGACGTATACTCTCGATCCACCACCAACCAAAGTTACCCTAC
AGAAAAAAACGACCGTCTTAGAAGCGTAGAAAATGATGCTAATGGACAGAACTCGCAAGA
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AACCAAGACGTTGTATAAATAAGTTTATGCAAAAAAA

QA 1 637 1 637
DS 

RD RS1ES30JQ 745 0 0
GGATACAAACTTCAGAGAACTGTCCTCCTCTCAGTCTATTTTACTTACATAAAAAGAATC
ACAAAGAGAATCTGTTTCAAAGTGATTAGAGTATAGGCTTTGACAATTATTAATGGAAGG
TAAAGGACGAGTCGGATCATCAACTTCTTCTTCTTTCACCACCGAACTCTTCGGCTTCAA
AGATCCTTCGCAGTCATCTTCTTCCTCTGGAATCTTCTCTTCTATTTTCCCTCATCCCTC
CAAGAGTTCTCAGGGCTTTACAAGAGATGGTTCAAGCTCCAAACATGGCTCACAAGCTCA
ACGTAGAGAATCTTCAACTACCCAAGAAGACAGAGTTGAGTCATGTCATCTAAGTTCTTC
TCTTTACTATGGTGGTCAAGACGTATACTCTCGATCCACCACCAACCAAAGTTACCCTAC
AGAAAAAAACGACCGTCTTAGAAGCGTAGAAAATGATGCTAATGGACAGAACTCGCAAGA
CGCTTCAAGAGGAGACTGGTGGCAAGGTTCTCTTTATTACTGAAAAACCGGTTCCTTTAT
TTGCTTTGTAAATCTCTCCACAAACCAATGAAGCTCAAGCCAAGTACTAATTATCTACCG
AACCAAGACGTTGTATAAATAAGTTTATGCAAAAAAACCGATCATTAATTTATCAGGCGA
TTTCTAAGATTAAAAAGTAATATTACAGAGATCTCCTAGTAAAAGGGTCTTGAATAGATT
GTCTAGTACTTGTTCTGATCAGTAT

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 2

CO CL1924Contig1 589 2 4 U
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ATAAAGTCACTCTCAAACCTCCCCTTCAAAGCAACAAATAATACACTAAATGTTACTCAC
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AGCTGCAATTGCTGCTCCCACAAACGGACCGACCCAGAAGATCCATTGATCATCCCAAGC
CTTTTGATTGTTGTAGATGACTGCAGCTCCAAAACTCCTAGCCGGGTTAATTCCAGTTCC
AGTGGTTGGGATTGTGGCTAAATGAACCATGAACACCGAAAATCCAATTGGCAATGGTGC
CAATACAGGAATGTGAGAGTCACGGGCATTACGCTTAGGGTCTGTCGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F116JQ U 1
AF RS1DV45JQ U 22
BS 1 384 RS1F116JQ
BS 385 385 RS1DV45JQ
BS 386 399 RS1F116JQ
BS 400 589 RS1DV45JQ

RD RS1F116JQ 399 0 0
AAATTTATAATTATGAAACATCACACAACAAATCGAAGGATTTATAAGTAGAGAATATAT
ATAACAAATACATCAAATAAAAACATACATTCCACAAGCTTGGATACATCAAACTGGTTT
ATAAAGTCACTCTCAAACCTCCCCTTCAAAGCAACAAATAATACACTAAATGTTACTCAC
CAATAAATTTTTTTTAATTATTATTTTGATATTTTTTCCCTTCCTCCTGGCCCAAAGAAA
TCTCCACCTCTTAAATAGTTTTGAAAAAATCAAATTCTAAGCGTGAAGCTCGTGAAGCTG
GCTCCTGACTGACCCATAAGCCCTCATAGCACCAGCTCTCAACACAAACTGGTGGTACAA
AGCTGCAATTGCTGCTCCCACAAATGGACCGACCCAGAA

QA 1 399 1 399
DS 

RD RS1DV45JQ 568 0 0
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AACATACATTCCACAAGCTTGGATACATCAAACTGGTTTATAAAGTCACTCTCAAACCTC
CCCTTCAAAGCAACAAATAATACACTAAATGTTACTCACCAATAAATTTTTTTTAATTAT
TATTTTGATATTTTTTCCCTTCCTCCTGGCCCAAAGAAATCTCCACCTCTTAGATAGTTT
TGAAAAAATCAAATTCTAAGCGTGAAGCTCGTGAAGCTGGCTCCTGACTGACCCATAAGC
CCTCATAGCACCAGCTCTCAACACAAACTGGTGGTACAAAGCTGCAATTGCTGCTCCCAC
AAACGGACCGACCCAGAAGATCCATTGATCATCCCAAGCCTTTTGATTGTTGTAGATGAC
TGCAGCTCCAAAACTCCTAGCCGGGTTAATTCCAGTTCCAGTGGTTGGGATTGTGGCTAA
ATGAACCATGAACACCGAAAATCCAATTGGCAATGGTGCCAATACAGGAATGTGAGAGTC
ACGGGCATTACGCTTAGGGTCTGTCGCG

QA 1 568 1 568
DS 



AS 0 0

AS 1 4

CO CL1926Contig1 519 4 2 U
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GTCAAGAAAAAAAAAACAAGGGATTTTTTTCTCCCACCATCTCTCCTCTCTCGGGCTCTC
TCTCCTCGCCGACCTTGTGTCTTCTAGCCGGACTCTCCCTCCCGCCTCTCCTCTCTGCCG
CCATGTCATCTCTCCTCGTCGCCAGCTTCCTCTCTCTCTCTCTCTGGTGGTGGTGCGGCG
GAGGAGGCAAAGAGTCGGCTGATTTATTTTCTAGGGTTAATTTTTTTTTAGAATTAGGTT
TGGTTAAGTTTAGTTAGGTTAGCTTAATTAGGTTTAGTTAAACCGGTTTATTTAACTAAA
CCAGTTTATTATAATTTTTTAGGCTTTTAATATATTCATGTATTTAAATATGTATCTGTA
TGTATATATATTTCGTTATATATATTTATTTACATTTTTTATTTTTTATTTTGTGTTTTT
GTTAATTTTTTTTTAATAATCTTAAAAGAATTTGCGACG


BQ
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BQ
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GTCTTGAAAGCAAACAAGACTATGGCATTTGTGTCAAATT

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DS 

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ATGCAGTCAACAAAGAAACATCTTTCTAAGGAGCTATCGAAATTGGATTGGAAGGTGGAA
GAGCAGACCGAGATATCTAAAATGATTCTAAGTGATGTAACAGATGTGAAATCAAGTATT
TCACAACTTGGGTTTGACTTTCAACAAATTAATGAAATGATATCCGGAATAGAAGGGAAG
ATTGACAGTCTTGAAAGCAAACAAGACTATGGCATTTGTGTCAAATTGCAGGAGTTAAAG
ACAGCCCGGCCACTAAAGTCATTCAGGATGTTGGTGCGAGACTACCTATCGATGCAAAAC
CATCATCTAACAATTTTCTTCCGGGTTTGCGGTTCCTAACAGAAGGAGAGGAGGGTGTAA
ATGTAATACACAACAAGCCTCTTTTGGAGAAAGAATGCCCGTTGGTGGTGGAGGAGAAAA
CAAAAGCTGCCATGGTGACAAGAACCAGAGTTCACAGAGCGTTTCCCGGTGGAATATCTT
GGGTACAAGACCTTACCAAACAATCATAAAACACATTTTTGGGGATTTTTTCTTACAAAG
AATTTACTTTATATGGTTCCAACTTGTGATACTGATACTGGGACTCGCAATTATTTATCT
GT

QA 1 722 1 722
DS 

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CTCTTTTGGAGAAAGAAAGCCCGTTGGTGGTGGAGGAGAAAACAAAAGCTGCCATGGTGA
CAAGAACCAGAGTTCACAGAGCGTTTCCCGGTGGAATATCTTGGGTACAAGACCTTACCA
AACAATCATAAAACACATTTTTGGGGATTTTTTTTTACAAAGAATTTACTTTATATGGTC
CCAACTTGTGATACTGATACTGGGACTCGCAATTATTTATCTGTAAGTAAGCAAACTATA
CACATATTACATTCATCAACGTTTTTGTTGGTTGCCCTTATTGTTTGTGAAAGAAAGAGT
GTGAAACACGTATGTTTGAATGAGAATAAAGTGATACGCGGATTTGTTCT

QA 1 410 1 410
DS 



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ACCCAAATAAGAAGCTCTTTGGCCTTAACACCGGTCAACTTCTTGATCTTTCCAACTTCC
ACCACAGCAGTGACCTCGGTGCCGTAAGAGACAAGTTTCCCAATAGTTTCAAACTTGTGA
GTGATGCTCTTCTTCTGCTTAAGCCACACAACACCTGTTTCTCTGTCGTATCCAACCTCT
TCTATGTCCTTCAATGGCAATAACCCATTAGGCATATTGACTTCCTTGAGGAACACCTTC
GTCTTCTCACGGCATAACTCATCCCCTGTGTATTTCTCTGCCCTAGCTCTCACTTCATCT
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CC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 

AF RS1CA47TF C 1
AF RS1CA47JQ U 5
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AF RS1DS30TF C 23
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RD RS1CA47TF 662 0 0
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GTCTTCTCACGGCATAACTCATCCCCTGTGTATTTCTCTGCCCTAGCTCTCACTTCATCT
GTAACCAAACCCATCTCTCTGTTTTTCTGTGTTTTTTGTTTTTGAGATCTGTCTTTTGGG
CC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RS1CA47JQ 658 0 0
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AGTATTACGTGATTAAGATAATTAAAAGTAGAGAGTGCGGCTTAAGTAACTAAGCATCGC
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CAGCAGTGACCTCGGTGCCGTAAGAGACAAGTTTCCCAATAGTTTCAAACTTGTGAGTGA
TGCTCTTCTTCTGCTTCAGCCACACAACACCTGTTTCTCTGTCGTATCCAACCTCTTCTA
TGTCCTTCAATGGCAATAACCCATTAGGCATATTGACTTCCTTGAGGAACACCTTCGTCT
TCTCACGGCATAACTCATCCCCTGTGTATTTCTCTGCCCTAGCTCTCACTTCATCTGTAA
CCAAACCCATCTCTCTGTTTTTCTGTGTTTTTTGTTTTTGAGATCTGTCTTTTGGGCC

QA 1 658 1 658
DS 

RD RS1DS30JQ 649 0 0
G
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AACCACAAAAGCTGAAACTGGAAAAGTCCTGGAGAGACCAGTCGGTGTCCTGAAATTGAT
CTTACCTGAACTTGTTGGCTGCTCCAAGACAAGCTCATTGAGAGTGACCCAAATAAGAAG
CTCTTTGGCCTTAACACCGGTCAACTTCTTGATCTTTCCAACTTCCACCACAGCAGTGAC
CTCGGTGCCGTAAGAGACAAGTTTCCCAATAGTTTCAAACTTGTGAGTGATGCTCTTCTT
CTGCTTAAGCCACACAACACCTGTTTCTCTGTCGTATCCAACCTCTTCTATGTCCTTCAA
TGGCAATAACCCATTAGGCATATTGACTTCCTTGAGGAACACCTTCGTCTTCTCACGGCA
TAACTCATCCCCTGTGTATTTCTCTGCCCTAGCTCTCACTTCATCTGTAACCAAACCCAT
CTCTCTGTTTTTCTGTGTTTTTTGTTTTTGAGATCTGTCTTTTGGGCC

QA 2 649 2 649
DS 

RD RS1DS30TF 640 0 0
ATT
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CTGAAACTGGAAAAGTCCTGGAGAGACCAGTCGGTGTCCTGAAATTGATCTTACCTGAAC
TTGTTGGCTGCTCCAAGACAAGCTCATTGAGAGTGACCCAAATAAGAAGCTCTTTGGCCT
TAACACCGGTCAACTTCTTGATCTTTCCAACTTCCACCACAGCAGTGACCTCGGTGCCGT
AAGAGACAAGTTTCCCAATAGTTTCAAACTTGTGAGTGATGCTCTTCTTCTGCTTAAGCC
ACACAACACCTGTTTCTCTGTCGTATCCAACCTCTTCTATGTCCTTCAATGGCAATAACC
CATTAGGCATATTGACTTCCTTGAGGAACACCTTCGTCTTCTCACGGCATAACTCATCCC
CTGTGTATTTCTCTGCCCTAGCTCTCACTTCATCTGTAACCAAACCCATCTCTCTGTTTT
TCTGTGTTTTTTGTTTTTGAGATCTGTCTTTTGGGCC

QA 4 640 4 640
DS 



AS 1 4

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AAAAAAGCGTGTAAAAATGCAAACGCATAATACAACTCCCATCTCATTGTCAAAACGTTT
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TCACCACATCCATTCCTTCTATAACTTGCCCGAACACCACATGCCTACCGTCCAGCCATG
ACGTCTTAACAGTGCAAATGAAGAACTGACTTCCATTTGTATTAGGGCCAGCATTTGCCA
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CATATACACTTTTACCTCCAGTCCCATTGCCCTTGTCAAAGTCTCCACCCTGAATCATGA
AATCTCTGATGACACGGTGGAAAGTTGAACCCTTGTAGCCAAAACCCTTCTCACCAGTAC
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TGTGAGTGAAGGAAACCC


BQ
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15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DR26JQ U 1
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AF RS1C059TF C 211
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AAAAAAGCGTGTAAAAATGCAAACGCATAATACAACTCCCATCTCATTGTCAAAACGTTT
TGTGTTTTAAATGTGTTGTTGTTACTTAAGCTTCAAACATTGGAAGTTGACCACAATCTG
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ACGTCTTAACAGTGCAAATGAAGAACTGACTTCCATTTGTATTAGGGCCAGCATTTGCCA
TACTCACAACTCCTGGTCCGACATGGGATAAATTGAAATTCTCATCCTTGAATGTCCGGC
CATATACACTTTTACCTCCAGTCCCATTGCCCTTGTCAAAGTCTCCACCCTGAATCATGA
AATCTCTGATGACACGGTGGAAAGTTGAACCCTTGTAGCCAAAACCCTTCTCACCAGTAC
AAAGAGCACGGAAGTTCTCAACAGTTTGGGGAACATCATCACCAAACAAACCAATCACAA
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TTATCT

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AAAATGCAAACGCATAATACAACTCCCATCTCATTGTCAAAACGTTTTGTGTTTTAAATG
TGTTGTTGTTACCTAAGCTTCAAACATTGGAAGTTGACCACAATCTGCAATGATCACCTT
CTTTCTGGGACGGTCGCCTCTGTCTGTCTCTTGTTCCTCTATAAGCCTCACCACATCCAT
TCCTTCTATAACTTGCCCGAACACCACATGCCTACCGTCCAGCCATGACGTCTTAACAGT
GCAAATGAAAAACTGACTTCCATTTGTATTAGGGCCAGCATTTGCCATACTCACAACTCC
TGGTCCGACATGGGATAAATTGAAATTCTCATCCTTGAATGTCCGGCCATATACACTTTT
ACCTCCAGTCCCATTGCCCTTGTCAAAGTCTCCACCCTGAATCATGAAATCTCTGATGAC
ACGGTGGAAAGTTGAACCCTTGTAGCCAAAACCCTTCTCACCAGTACAAAGAGCACGGAA
GTTCTCAACAGTTTGGGGAACATCATCACCAAACAAACCAATCACAATCCTCCCAGCTAA
TTTCCCCACTGGGTTCCCAACACTTATGTCGAAATACACCTTGTGCGTTATCTTCGATTG
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GAAG
CAGACTTGGCGT

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DS 

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CGAACACCACATGCCTACCGTCCAGCCATGACGTCTTAACAGTGCAGATGAAGAACTGAC
TTCCATTTGTATTAGGGCCAGCATTTGCCATACTCACAACTCCTGGTCCGACATGGGATA
AATTGAAATTCTCATCCTTGAATGTCCGGCCATATACACTTTTACCTCCAGTCCCATTGC
CCTTGTCAAAGTCTCCACCCTGAATCATGAAATCTCTGATGACACGGTGGAAAGTTGAAC
CCTTGTAGCCAAAACCCTTCTCACCAGTACAAAGAGCACGGAAGTTCTCAACAGTTTGGG
GAACATCATCACCAAACAAACCAATCACAATCCTCCCAGCTAATTTCCCCACTGGGTTCC
CAACACTTATGTCGAAATACACCTTGTGCGTTATCTTCGATTGCGGCTCTGCTAAAGGCT
CAGCACTGGATTGAACAGATAAGCAGCGGCGGTTTCTTCTGGTGGAAGAAGATGTATGGA
GGAGGAGCGATGAGGCGGTTAAAGACGGAAACTTGATGGAGTCGAAGGCAGACTTGGCGT
TCAAACTCAATCGGAAAGTGGTGGAAGAGGTGTTGATTGGAGAAAGTCTTCGTGGAGCAA
CTGAGAACGACCTCGGATTTGACAGAGTCATCGAGAAGGTCGCCATGGCCAGGGGAGCTC
AAAACTCCTCTTGCTCGGTAGCTTAGCTGATGTGAGTGAAGGAAACCC

QA 1 768 1 768
DS 

RD RS1DR26TF 678 0 0
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ATTTGCCATACTCACAACTCCTGGTCCGACATGAGATAAATTGAAATTCTCATC*TTGAA
TGTCCGGCCATATACACTTTTACCTCCAGTCCCATTGCCCTTGTCAAAGTCTCCACCCTG
AATCATGAAATCTCTGATGACACGGTGGAAAGTTGAACCCTTGTAGCCAAAACCCTTCTC
ACCAGTACAAAGAGCACGGAAGTTCTCAACAGTTTGGGGAACATCATCACCAAACAAACC
AATCACAATCCTCCCAGCTAATTTCCCCACTGGGTTCCCAACACTTATGTCGAAATACAC
CTTGTGCGTTATCTTCGATTGCGGCTCTGCCAAAGGCTCAGCACTGGATTGAACAGATAA
GCAGCGGCGGTTTCTTCTGGTGGAAGAAGATGTATGGAGGAGGAGCGATGAGGCGGTTAA
AGACGGAAACTTGATGGAGTCGAAGGTAGACTTGGCGTTCAAACTCAATCGGAAAGTGGT
GGAAGAGGTGTTGATTGGAGAAAGTCTTCGTGGAGCAACTGAGAACGACCTCGGATTTGA
CAGAGTCATCGAGAAGGTCGCCATGGCCAGGGGAGCTCAAAACTCCTCTTGCTCGGTAGC
TTAGCTGATGTGAGTG
CC

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

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TCGATGTCTCTGAGTTGCTGAACGGATCTTGGGTGGTTGTGGCTGGGGACTCGCAGGCGA
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CGGTTAGAGAGGAGCTTTTCAAGAGGCATAGCGATTACAGCGTCGTGGTTAAGGAGATTG
GGATGAAGCTGGACTTCGTGTGGGCTCCTTACGAGAAAGATCTCGACGATCTCGTCGTGT
CGTACATGAAGAGGAGCAAGTTCCCTGACGTGGTGATCATGGGAAGCGGGTTGTGGCATA
TGCTCCACGCCAACAACGCTTCTGATTTCGGGTTTAGGTTGAAGGAGTTGAGGAGTCACG
TTGAGTCTTTAGTGCCAGTGACGACGAAAGGCGGGTCGGTTTCGGGGAGGTCTATGCATA
TGTTCTGGATAGGGATGCCGGTTTTGATTAATGGTATGTTGAATAGTGAGGAGAAGATGG
AGAAGATGAGCGATACGGTGTGGCATGAGTATGATAGGACGTTAGGGGAGAGTAAGATCT
TGCGACAGATGGGAGGTCCGCTTATATTGCTTGATGTGCAGTCTTTTACTTGGAACTGTG
GACCGCAGTGTACGCTCGATGGGATGCATTATGACTCTGCGGTGTATGATGCTGCTGTTC
ATGTCATGCTCAATGCGTTGCTTGTCGAATCTCATCAAACCTTATGGGAGAGAGGTCTAT
GATGATGATACAGGTTTTTTTTTCTTTTCTTTTTCTTTCAAATTGTTTGGAGTTTTCTTT
GTAGGGAGAAATGGGATGTGTTCATAGGAGTTTTTTTTTTTACAACACACGATGATCCTT
TTTGGTCTAAATGATCTAAGTGAACTTTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DR52TF U 1
AF RS1DR52JQ C 172
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TGCGTGCTTGTC

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DS 

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TCGTCGTGTCGTACATGAAGAGGAGCAAGTTCCCTGACGTGGTGATCATGGGAAGCGGGT
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CTATGCATATGTTCTGGATAGGGATGCCGGTTTTGATTAATGGTATGTTGAATAGTGAGG
AGAAGATGGAGAAGATGAGCGATACGGTGTGGCATGAGTATGATAGGACGTTAGGGGAGA
GTAAGATCTTGCGACAGATGGGAGGTCCGCTTATATTGCTTGATGTGCAGTCTTTTACTT
GGAACTGTGGACCGCAGTGTACGCTCGATGGGATGCATTATGACTCTGCGGTGTATGATG
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ATGATCCTTTTTGGTCTAAATGATCTAAGTGAACTTTTTAC

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 4

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TAGATCCGAAGAAGAACTTCTTGGCTCGTCTTCATATGAAGTCCGCCTCTAACCGCCTCC
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AAGCGCTTAATCGGTTGCCTAGAGAGGTCGTTGATGCTCGGAACCAGCGTCTTAAGCGTG
CAATGGACCTCTCCATGAAACATGAGTACCTCCCGGATGATCTCCAGGCAGTGCAGACAC
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AGGCTTTGGGAGCTTTACCTCTCTACCAGAGGACTATTCCTTAAGCATGTTGATGTTAGT
CTCTCTCTTGTCCTGTATTGTAATGCCATCTTAACCAAACAGATCCTAGTCGTCTCTGTA
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CGTGTTTATGCACGTATAAGGTTATAATATTGATGTGTAATGTATAATAAGCTTCGTGAT
GTATTGGTGGTTAGTACAACCAAAAAAGGAGGTTAAGTGTTT


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EL12TF U 1
AF RS1EJ21TF U 3
AF RS1EO29TF U 3
AF RS1EO29JQ C 91
BS 1 86 RS1EL12TF
BS 87 89 RS1EJ21TF
BS 90 105 RS1EL12TF
BS 106 106 RS1EO29TF
BS 107 162 RS1EL12TF
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BS 165 190 RS1EL12TF
BS 191 191 RS1EO29TF
BS 192 582 RS1EL12TF
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TAGATCCGAAGAAGAACTTCTTGGCT***CTTCATATGAAGTCCGTCTCTAACCGCCTCC
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AAGCGCTTAACCGGTTGCCTAGAGAGGTCGTTGATGCTCGGAACCAGCGTCTTAAGCGTG
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AGGCTTTGGGAGCTTTACCTCTCTACCAGAGGACTATTCCTTAAGCATGTTGATGTTAGT
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TTATAATTTCTTTAGGCTCCAATCTGCCACACAATTTGCTTTGTATGGCTATCCACGGTC
CGTGTTTATGCACGTATAAGGTTATAATATTGATGTGTAATG

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ATACGGTCTTAGGTACGACGATCTCTACGACCCTATGTACGATCTTGACATTAAAGAAGC
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GGACCTCTCCATGAAACATGAGTACCTCCCGGATGATCTCCAGGCAGTGCAGACACCATT
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TTTGGGAGCTTTACCTCTCTACCAGAGGACTATTCCTTAAGCATGTTGATGTTAGTCTCT
CTCTTGTCCTGTATTGTAATGCCATCTTAACCAAACAGATCCTAGTCGTCTCTGTATTAT
AATTTCTTTAGGCTCCAATCTGCCACACAATTTGCTTTGTATGGCTATCCACGGTCCGTG
TTTATGCACGT

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GG
ATAGCAGTCAGAGGAGTCAGAAGAAGATATGGCGTCGTCGTTTCTCCAGAGATTAGTAGA
TCCGAAGAAGAACTTCTTGGCTCGTCTTCATATGAAGTCCGCCTCTAACCGCCTCCGCAA
ATACGGTCTTAGGTACGACGATCTCTACGACCCTATGT**GATCTTGACATTAAAGAAGC
GCTTAATCGGTTGCCTAGAGAGGTCGTTGATGCTCGGAACCAGCGTCTTAAGCGTGCAAT
GGACCTCTCCATGAAACATGAGTACCTCCCGGATGATCTCCAGGCAGTGCAGACACCATT
CAGGAGCTACCTCCAAGAAATGCTAGCTCTTGTGAAGCGGGAGAGAGCTGAGCGAGAGGC
TTTGGGAGCTTTACCTCTCTACCAGAGGACTATTCCTTAAGCATGTTGATGTTAGTCTCT
CTCTTGTCCTGTATTGTAATGCCATCTTAACCAAACAGATCCTAGTCGTCTCTGTATTAT
AATTTCTTTAGGCTCCAATCTGCCACACAATTTGCTTTGTATGGCTATCCACGGTCCGTG
TTTATGCACGTATAAGGTTATAATATTGATGTGTAATGTATAATAAGCTTCGTGATGTAT
TGGTGGTTAGTACAACCAAAAAAGGAGGTTAAGTGTTT

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ACGACCCTATGT**GATCTTGACATTAAAGAAGCGCTTAATCGGTTGCCTAGAGAGGTCG
TTGATGCTCGGAACCAGCGTTTTAAGCGTGCAATGGACCTCTCCATGAAACATGAGTACC
TCCCGGATGATCTCCAGGCAGTGCAGACACCATTCAGGAGCTACCTCCAAGAAATGCTAG
CTCTTGTGAAGCGGGAGAGAGCTGAGCGAGAGGCTTTGGGAGCTTTACCTCTTTACCAGA
GGACTATTCCTTAAGCATGTTGATGTTAGTCTCTCTCTTGTCCTGTATTGTAATGCCATT
TTAACCAAACAGATCCTAGTCGTCTCTGTATTATAATTTCTTTAGGCTCCAATTTGCCAC
ACAATTTGCTTTGTATGGCTATCCACGGTCCGTGTTTATGCACGTATAAGGTTATAATAT
TGATGTGTAATGTATAATAAGCTTCGTGATGTATTGGTGGTTAGTACAACCAAAAAAGGA
GGTTAAGTGTTT

QA 1 552 1 552
DS 



AS 1 4

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GTACAATGAAAGAACCACACAAGAGAAGAAAATCAGTTGATGAGCTTTTGGTATCCTCTC
TGTAAGATTTTTTTTATTCCCTCTTAAATTTGGAGAGAGCTCTCTTACGCTGACCAAGCA
TGTACCTGTACATGTGTGGACTACCTGGGACATAGATAGCAAGGACGAGTATGGTTGCAT
AGAAAAAGTCGAATGAGAAGTTCAAAGTGTTAGGCATCCTAACGCCGTACATCTCAAACG
TCTTGATGTGTGGTAAGGCAAGGTAGACAAGACCTACTTCACTGGTGATACCGGTCGGGT
ATAGCACTAAAAAGCTGCTGTATCTGAGCCACAAGTGCCATGAAGGTGCAAAGCCTAGAG
CTTCCTTGAAACCAAAGAAGGAGTAGCGAATAATCTCCGTGATAGACCAGCTTATGACCA
GCGAGGCAACAAGAAAATGTGATTGGACCTCTGGGAAGCTGTATAGGATGCCCCAAGTGA
GAAACAGCCTTGAGCCAATCTGTGGCAGAGTTGCAGAAACAGGAGATCTGACCAAACCTA
CTAAACCATGAAGAATCTCGAGGACAGCGGTAGTCTGAGCAAGCTAGAGAGGCTTCTCCA
CAGCATCATAGACATTTTCATGTCCCGTTTCCTTCAACGTCTTTACCGCAAAGTACAAAA
CCTGAGCCCATCCAGCAAAGACGACCCAGTTGTAGAGAGTGAGGTACACTCGACGAATGA
TGGAGAGAAACGACGCCATGGAAAGTGGAGAATAGATTAGAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EL53JQ U 54
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AF RS1FI71TF C 216
AF RS1EL53TF C 265
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DS 

RD RS1FI71JQ 769 0 0
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TGTAAGATTTTTTTTATTCCCTCTTAAATTTGGAGAGAGCTCTCTTACGCTGACCAAGCA
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AGAAAAAGTCGAATGAGAAGTTCAAAGTGTTAGGCATCCTAACGCCGTACATCTCAAACG
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GGAG

QA 1 765 1 765
DS 

RD RS1FI71TF 725 0 0
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ATAGCAAGGACGAGTATGGTTGCATAGAAGAAGTCGAATGAGAAGTTCAAAGTGTTAGGC
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GAAACAGGAGATCTGACCAAACCTACTAAACCATGAAGAATCTCGAGGACAGCGGTAGTC
TGAGCAAGCTGGAGAGGCTTCTCCACAGCATCATAGACATTTTCATGTCCCGTTTCCTTC
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AGAGTGAGGTACACTCGACGAATGATGGAGAGAAACGACGCCATGGAAAGTGGAGAATAG
ATT
CC

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1EL53TF 682 0 0
TAG
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GGACATAGATAGCAAGGACGAGTATGGTTGCATAGAAGAAGTCGAATGAGAAGTTCAAAG
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CAAGACCTACTTCACTGGTGATACCGGTCGGGTATAGCACTAAAAAGCCGCTGTATCTGA
GCCACAAGTGCCATGAAGGTGCAAAGCCTAGAGCTTCCTTGAGACCAAAGAAGGAGTAGC
GAATAATCTCCGTGATAGACCAGCTTATGACCAGCGAGGCAACAAGAAAATGTGATTGGA
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GAGTTGCAGAAACAGGAGATCTGACCAAACCTACTAAACCATGAAGAATCTCGAGGACAG
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TTTCCTTCAACGTCTTTACCGCAAAGTACAAAACCTGAGCCCATCCAGCAAAGACGACCC
AGTTGTAGAGAGTGAGGTACACTCGACGAATGATGGAGAGAAACGACGCCATGGAAAGTG
GAGAATAGATTAGAGATCC

QA 4 682 4 682
DS 



AS 1 4

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CTAGTGACATAGTGTTACAGACATCATCTCCTAAACTCTCACAGAAGCAAGACTACATCT
TCCACGGAGGGAGACGCCATGTGAGGCCGTACTACTTCGAGTTCATCTCTCATGTGAACA
AACGCTGGACTGGGAAAACAATTGTGGACTTGTTCGCTGATGAATTCAAAGGCAGACAAC
GTGACTACTATGTTGGGGCAGTCAAAAGTGGAAGAATCAAAGTTGATGGAGAAACTGTAC
CTGTTTCATACATTGTTAAATCTTCTCAAAAGATCACTCATTTCGTCCACAGACATGAAC
CACCTGTGATGACTGATGATGTAGAGATCCTTGTGAATGAACCTGATGTTGTTACTGTCT
GCAAACCCGCTTCTATTCCCGTCCATCCATGTGGTCAATACCGTAAGAACACAGTTGTTG
GAATCCTTGATGCTGAGCATGACCTCGGCCCTCTTTTCCCTATTCACCGATTAGACCGTT
TGGTTTCTGGATTGCTCATCATAGCTAGAACTGCTGCCAAAGCTGATTTTTTCAGGCAAC
AGATCGAGGGTGGAATGGTTAAGAAACGTTATATTGCAAAAGTTATTGGCGTGTTCCCAG
AAGATGAGAAAGTAGTCGACGCCAACATAAACTATAATGGTAGTGAAGGAAGGAGTACAG
CAGAGGAGGCCAATTCAAGTGGTGATGATAAGAAGGTGAAGGGGAAGCCTGCGTGTACCA
AGTTCACCAGAATCGACACAAATGGGACCCATAGCCTCGCCTTGTGCGAACCAGTGACAG
GACGAACTCATCAAATACGAGTGCATCTACAATATACAGGGCATCCAATAGCAAATGACC
CACTTTATCTCAATCAACAAGTGGATGATCTCGAAACCAAGATTGCTAAAAGGATTGATG
CGGGTGAGAGAAAGATGGTCTCCCCAGACGACTACGTGTATTCGAGTGATGATTTCATCA
TCGATCCAATGTGCACAAACTGCCCAAAGTTGATCCCACAAGGGTACGAGGAGCATGATG
AGGCTCTTTGGTTGCATTGCGTTAGATACTCTGGAACAGGATGGGAATACGATTGTCCTT
ATCCATCTTGGGCATCTCTTTAACTACATTTTACTTGCTATTGCCTAGACAATATCAACT
GTAATTCTTATTACCAACGTTTGTAGCAAATGGATTGTAAACGAGTTTTGCAGTTATGAT
CTGATCAGGTTTGGACT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1GM38TF U 1
AF RS1GP41TF U 1
AF RS1GM38JQ C 592
AF RS1GP41JQ C 692
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AACGCTGGACTGGGAAAACAATTGTGGACTTGTTCGCTGATGAATTCAAAGGCAGACAAC
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CTGTTTCATACATTGTTAAATCTTCTCAAAAGATCACTCATTTC*TCCACAGAC*TGAAC
CACCTGT

QA 1 367 1 367
DS 

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GGGACGACGCCGTAGAGAAACCCGCCTCTTCTTCTTCTATCATCGCCACTAGCATGAATA
CTAGTGACATAGTGTTACAGACATCATCTCCTAAACTCTCACAGAAGCAAGACTACATCT
TCCACGGAGGGAGACGCCATGTGAGGCCGTACTACTTCGAGTTCATCTCTCATGTGAACA
AACGCTGGACTGGGAAAACAATTGTGGACTTGTTCGCTGATGAATTCAAAGGCAGACAAC
GTGACTACTATGTTGGGGCAGTCAAAAGTGGAAGAATCAAAGTTGATGGAGAAACTGTAC
CTGTTTCATACATTGTTAAATCTTCTCAAAAGATCACTCATTTCGTCCACAGACATGAAC
CACCTGTGATGACTGATGATGTAGAGATCCTTGTGAATGAACCTGATGTTGTTACTGTCT
GCAAACCCGCTTCTATTCCCGTCCATCCATGTGGTCAATACCGTAAGAACACAGTTGTTG
GAATCCTTGATGCTGAGCATGACCTCGGCCCTCTTTTCCCTATTCACCGATTAGACCGTT
TGGTTTCTGGATTGCTCATCATAGCTAGAACTGCTGCCAAAGCTGATTTTTTCAGGCAAC
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CAGAGGAG*CCAATTCAAGTGGTGATGATA
GAGTGAGGG

QA 1 750 1 750
DS 

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CGTGTACCAAGTTCACCAGAATCGACACAAATGGGACCCATAGCCTCGCCTTGTGCGAAC
CAGTGACAGGACGAACTCATCAAATACGAGTGCATCTACAATATACAGGGCATCCAATAG
CAAATGACCCACTTTATCTCAATCAACAAGTGGATGATCTCGAAACCAAGATTGCTAAAA
GGATTGATGCGGGTGAGAGAAAGATGGTCTCCCCAGACGACTACGTGTATTCGAGTGATG
ATTTCATCATCGATCCAATGTGCACAAACTGCCCAAAGTTGATCCCACAAGGGTACGAGG
AGCATGATGAGGCTCTTTGGTTGCATTGCGTTAGATACTCTGGAACAGGATGGGAATACG
ATTGTCCTTATCCATCTTGGGCATCTCTTTAACTACATTTTACTTGCTATTGCCTAGACA
ATATCAACTGTAATTCTTATTACCAACGTTTGTAGCAAATGGATTGTAAACGAGTTTTGC
AGTTATGATCTGATCAGGTTTGGACT

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1GP41JQ 586 0 0
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GAAGGTGAAGGGGAAGCCTGCGTGTACCAAGTTCACCAGAATCGACACAAATGGGACCCA
TAGCCTCGCCTTGTGCGAACCAGTGACAGGACGAACTCATCAAATACGAGTGCATCTACA
ATATACAGGGCATCCAATAGCAAATGACCCACTTTATCTCAATCAACAAGTGGATGATCT
CGAAACCAAGATTGCTAAAAGGATTGATGCGGGTGAGAGAAAGATGGTCTCCCCAGACGA
CTACGTGTATTCGAGTGATGATTTCATCATCGATCCAATGTGCACAAACTGCCCAAAGTT
GATCCCACAAGGGTACGAGGAGCATGATGAGGCTCTTTGGTTGCATTGCGTTAGATACTC
TGGAACAGGATGGGAATACGATTGTCCTTATCCATCTTGGGCATCTCTTTAACTACATTT
TACTTGCTATTGCCTAGACAATATCAACTGTAATTCTTATTACCAACGTTTGTAGCAAAT
GGATTGTAAACGAGTTTTGCAGTTATGATCTGATCAGGTTTGGACT

QA 1 586 1 586
DS 



AS 1 4

CO CL1934Contig1 780 4 9 U
GAGAAACAAGAGTGATTCGAGTCATTTCTAAAAAACATTATTCACCAATCTTTATATGAC
AATAACCAAGAGTCTCAAGACTTCAATTCGACGACCTTATTACTACTAGCAGTCACACTA
GTTTCACAGAGCAAAGACAAAACAAAATGCGAGCCAGCGAAGTTTCACACATCACAAGTA
TACATTATTATTATTATTATCACAAGGTTGCATCCCCCGGTGCGAACTTGAGGGAGACAC
TGTTGACACAGTGTCGCTCATCGGTAGGAGTAGGGAAACCTTCTCCTTTGAAAACATGTC
CGAGATGTCCTCCACAAGCCGCACAAGTGATCTCGATTCCTCTCCCGTCTGGATCCGCGG
TTCGGTTAATGGCCCCTGGGAGGCCGTCAAAGAAAGCAGGCCAGCCACAGCCAGAGTCGA
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CGAATACTTTGTTGTATTCTCCTGTCCCTGGATATTCAGTGACTTTCTGCCTGAGGATCC
TGAATTGCTCAGGAGATAGAATCGCACGCCACTCTTCCTCTGCCTTGTTAACCGATCCGG
GAGCTGAAGAACCCATTGCTGTTATACGACGAAAACCTCGACGAAGGAGGCTGAGATTCG
GGAGAGAGGAAGCAAATCGAGGTGTAACCAAGGCTTTTTTGATCGTGGACGAGGTCAAAG
ACGTGGCTGAAGATACACGCGCAGATGATGATACCACGTTCAACGCCATTTTTTTATCCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CQ07JQ U 1
AF RS1CQ07TF C 1
AF RS1CB70JQ U 92
AF RS1CB70TF C 100
BS 1 197 RS1CQ07JQ
BS 198 200 RS1CB70JQ
BS 201 303 RS1CQ07JQ
BS 304 304 RS1CB70JQ
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BS 655 774 RS1CB70JQ
BS 775 780 RS1CB70TF

RD RS1CQ07JQ 654 0 0
GAGAAACAAGAGTGATTCGAGTCATTTCTAAAAAACATTATTCACCAATCTTTATATGAC
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TACATTATTATTATTAT***CACAAGGTTGCATCCCCCGGTGCGAACTTGAGGGAGACAC
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CGAATACTTTGTTGTATTCTCCTGTCCCTGGATATTCAGTGACTTTCTGCCTGAGGATCC
TGAATTGCTCAGGAGATAGAATCGCACGCCACTCTTCCTCTGCCTTGTTAACCGATCCGG
GAGCTGAAGAACCCATTGCTGTTATACGACGAAAACCTCGACGAAGGAGGCTGA

QA 1 654 1 654
DS 

RD RS1CQ07TF 686 0 0
GAGAAACAAGAGTGATTCGAGTCATTTCTAAGAAACATTATTCACCAATCTTTATATGAC
AATAACCAAGAGTCTCAAGACTTCAATTCGACGACCTTATTACTACTAGCAGTCACACTA
GTTTCACAGAGCAAAGACAAAACAAAATGCGAGCCAGCGAAGTTTCACACATCACAAGTA
TACATTATTATTATTAT***CACAAGGTTGCATCCCCCGGTGCGAACTTGAGGGAGACAC
TGTTGACACAGTGTCGCTCATCGGTAGGAGTAGGGAAACCTTCTCCTTTGAAAACATGTC
CGAGATGTCCTCCACAAGCCGCACAAGTGATCTCGATTCTTCTCCCGTCTGGATCCGCGG
TTCGGTTAATGGCCCCTGGGAGGCCGTCAAAGAAAGCAGGCCAGCCACAGCCAGAGTCGA
ACTTGGTGGCGGATTTGTATAGAGGAGTCCCACATCCTGCGCAGCTATAGATCCCGTCTG
CGAATACTTTGTTGTATTCTCCTGTCCCTGGATATTCAGTGACTTTCTGCCTGAGGATCC
TGAATTGCTCAGGAGATAGAATCGCACGCCACTCTTCCTCTGCCTTGTTAACCGATCCGG
GAGCTGAAGAACCCATTGCTGTTATACGACGAAAACCTCGACGAAGGAGGCTGAGATTCG
GGAGAGAGGAAGCAAATCGAGGTGT
C

QA 1 685 1 685
DS 

RD RS1CB70JQ 688 0 0
CGACCTTATTACTACTAGCAGTCACACTAGTTTCACAGAGCAAAGACAAAACAAAATGCG
AGCCAGCGAAGTTTCACACATCACAAGTATACATTATTATTATTATTATCACAAGGTTGC
ATCCCCCGGTGCGAACTTGAGGGAGACACTGTTGACACAGTGTCGCTCATCGGTAGGAGT
AGGGAAACCTTCTCCTTTGAAAACATGTCCGAGATGTCCTCCACAAGCCGCACAAGTGAT
CTCGATTCCTCTCCCGTCTGGATCCGCGGTTCGGTTAATGGCCCCTGGGAGGCCGTCAAA
GAAAGCAGGCCAGCCACAGCCAGAGTCGAACTTGGTGGCGGATTTGTATAGAGGAGTCCC
ACATCCTGCGCAGCTATAGATCCCGTCTGCGAATACTTTGTTGTATTTTCCTGTCCCTGG
ATATTCAGTGCCTTTCTGCCTGAGGATCCTGAATTGCTCAGGAGATAGAATCGCACGCCA
CTCTTCCTCTGCCTTGTTAACCGATCCGGGAGCTGAAGAACCCATTGCTGTTATACGACG
AAAACCTCGACGAAGGAGGCTGAGATTCGGGAGAGAGGAAGCAAATCGAGGTGTAACCAA
GGCTTTTTTGATCGTGGACGAGGTCAAAGACGTGGCTGAAGATACACGCGCAGATGATGA
TACCACGTTCAACGCCATTTTTT
ATCCT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RS1CB70TF 681 0 0
TTACTACTAGCAGTCACACTAGTTTCACAGAGCAAAGACAAAACAAAATGCGAGCCAGCG
AAGTTTCACACATCACAAGTATACATTATTATTATTATTATCACAAGGTTGCATCCCCCG
GTGCGAACTTGAGGGAGACACTGTTGACACAGTGTCGCTCATCGGTAGGAGTAGGGAAAC
CTTCTCCTTTGAAAACATGTCCGAGATGTCCTCCACAAGCCGCACAAGTGATCTCGATTC
CTCTCCCGTCTGGATCCGCGGTTCGGTTAATGGCCCCTGGGAGGCCGTCAAAGAAAGCAG
GCCAGCCACAGCCAGAGTCGAACTTGGTGGCGGATTTGTATAGAGGAGTCCCACATCCTG
CGCAGCTATAGATCCCGTCTGCGAATACTTTGTTGTATTTTCCTGTCCCTGGATATTCAG
TGCCTTTCTGCCTGAGGATCCTGAATTGCTCAGGAGATAGAATCGCACGCCACTCTTCCT
CTGCCTTGTTAACCGATCCGGGAGCTGAAGAACCCATTGCTGTTATACGACGAAAACCTC
GACGAAGGAGGCTGAGATTCGGGAGAGAGGAAGCAAATCGAGGTGTAACCAAGGCTTTTT
TGATCGTGGACGAGGTCAAAGACGTGGCTGAAGATACACGCGCAGATGATGATACCACGT
TCAACGCCATTTTTTTATCCT

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 4

CO CL1935Contig1 813 4 4 U
GGATCCACTCATCAGTAAATTAAGAAAGAGAGATGGCATCTTCTAAAGTATCTTGCATGC
TTGTCTCTCTCCTTCTTCTCGTTCTTGTACTTTCCGATATGGATAAAGCCCTGGGTGAAC
CATTTCAGCTCCGCAACCGCAAACTTAAAGTGACTGATCATCATGATCAAGTGACGACAG
ACCGACGTCTCGCTGTTACTACTAAGCGTGTTTTGTTCCGTAAACCGAATGGGTTGGTAG
GGGTGATGCCGAAGGTGCCGGATTTGATGGCAAACCCGAAGGTGTTGGAATTCATGAAAA
AAAACCCGACGGTGTCAAACCCGAAGCTGTTGGAATGGGTGAAAAAAAAACCCGAAAATG
ACGTCGAAAATTTTGTCGGAATGGGTGAAAGAAAACCCGAAAAAGACGTCGGAATGGATG
AAAAAAAACCCGAATGTGTTGGAATGGGTGAAAAAAAATCCGAAGAAGGCATCAGAATGG
GTGAAAAAGATCCAGGACTTGATGGGCGCTATACCTCCGCCCCCTCCATCGTCGGAATGC
GAGAAAAATGACGACGAATGTAAAAGGCTTGTGAAAGAGGCGAAGGCAAAATCCCCTCTA
CCGCCTTAAAGGTTTTCCAAAGGCGAAAGCATATGATTCCACAAATTTCTTGATGAAAAA
ATATTTTCACAAGTTGTCACCATAAATGTAATTTTGAAATTTTTTTGCAAAATAAAAGAT
ATTATGCCACTTGTGATGATGGTATGATGATATGTTGTTACAAGTTTTAAGCTATTGTAG
AACTGTTTTATTAAAAAAAAAGTGTTTTATTTT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F231TF U 1
AF RS1GW75TF U 4
AF RS1GW75JQ C 205
AF RS1F231JQ C 343
BS 1 302 RS1F231TF
BS 303 548 RS1GW75TF
BS 549 708 RS1GW75JQ
BS 709 813 RS1F231JQ

RD RS1F231TF 302 0 0
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ACCGACGTCTCGCTGTTACTACTAAGCGTGTTTTGTTCCGTAAACCGAATGGGTTGGTAG
GGGTGATGCCGAAGGTGCCGGATTTGATGGCAAACCCGAAGGTGTTGGAATTCATGAAAA
AA

QA 1 302 1 302
DS 

RD RS1GW75TF 545 0 0
GG
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TCTCTCCTTCTTCTCGTTCTTGTACTTTCCGATATGGATAAAGCCCTGGGTGAACCATTT
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AAACCCGAATGTGTTGGAATGGGTGAAAAAAAATCCGAAGAAGGCATCAGAATGGGTGAA
AAAGATCCAGGACTTGATGGGCGCTATACCTCCGCCCCCTCCATCGTCGGAATGCGAGAA
AAA

QA 3 545 3 545
DS 

RD RS1GW75JQ 505 0 0
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TGATGGCAAACCCGAAGGTGTTGGAATTCATGAAAAAAAACCCGACGGTGTCAAACCCGA
AGCTGTTGGAATGGGTGAAAAAAAAACCCGAAAATGACGTCGAAAATTTTGTCGGAATGG
GTGAAAGAAAACCCGAAAAAGACGTCGGAATGGATGAAAAAAAACCCGAATGTGTTGGAA
TGGGTGAAAAAAAATCCGAAGAAGGCATCAGAATGGGTGAAAAAGATCCAGGACTTGATG
GGCGCTATACCTCCGCCCCCTCCATCGTCGGAATGCGAGAAAAATGACGACGAATGTAAA
AGGCTTGTGAAAGAGGCGAAGGCAAAATCCCCTCTACCGCCTTAAAGGTTTTCCAAAGGC
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AATGTAATTTTGAAATTTTTTTGC
G

QA 1 504 1 504
DS 

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AAGACGTCGGAATGGATGAAAAAAAACCCGAATGTGTTGGAATGGGTGAAAAAAAATCCG
AAGAAGGCATCAGAATGGGTGAAAAAGATCCAGGACTTGATGGGCGCTATACCTCCGCCC
CCTCCATCGTCGGAATGCGAGAAAAATGACGACGAATGTAAAAGGCTTGTGAAAGAGGCG
AAGGCAAAATCCCCTTTACCGCCTTAAAGGTTTTCCAAAGGCGAAAGCATATGATTCCAC
AAATTTCTTGATGAAAAAATATTTTCACAAGTTGTCACCATAAATGTAATTTTGAAATTT
TTTTGCAAAATAAAAGATATTATGCCACTTGTGATGATGGTATGATGATATGTTGTTACA
AGTTTTAAGCTATTGTAGAACTGTTTTATTAAAAAAAAAGTGTTTTATTTT

QA 1 471 1 471
DS 



AS 1 4

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AACAAAACAAAAGAAGAAGAAAAAATGGGATTTTGTTTTTGTATATCCTCAGGAGGATCA
ACAGATAGAAATCAGATTTACGAGATAAATGAGTATGGACAAGAAAATGCAGTTCTATAC
TCTGAACAACATGAATTTCCTCAAGACTTTGGCTCTGTCTCGTCTTTAGCTGGAGGCAAG
GGCTTCAATCAAGATGCTGCCATACTCCACCTGGGATATGGAACTGAAGAAGGAGCGTTA
TGTGGAGTATTTGATGGTCATGGAGGGAAGGGTGAATTGGTGAGCAAGATCGTAAGAAAC
CAGTTGCCATCTTTATTGTTAGGTCACATGAACAATCATTCAGTGACTCGAGACTGGAAA
CTCATCTGCGAAACTACGTGTTTGGGCATGGACAAAAGGATTCTTAAACTCAAGAACACT
CTTGATTGCTCCTCATCCGGAACTGCGGCTGTTTTCGCCGTTAAACATGGAAATCAAGTG
ATGGTGGCAAACCTAGGAGATTCAAGGGCTATTATGATTGGAACAAGTGAGAACGGAGAA
ACGGAGGTGGTTCAGTTAACCAGTGACCTAAAGCCAAGTGTCCCAAGCGAAGCGGACAGA
ATAAGGAAACGCAACGGAATAGTCTTAGCTTTAGAGTCAGAGCCTCATATTCTAAGAGTA
TGGCCTCCACATGAAAACCGACCAGGCCTAGCCATGTCTAGGGCTTTTGGTGACTTCGTT
CTTAAAAGCTATGGTGTCATTGCGACTCCTGAAGTCTCTTCGCATCAAATCACTTGTCGC
GACCAGTTTCTGCTCCTTGCTTCCGATGGGGTGTGGGACGTGCTTAGTAACGAAGAAGTG
GCTAAGGTGGTGAAGTCGGCAAATGAGGCAGGAGCGGCCAACGCGGTGACAGAAGCGGCG
ACTAATGCGTGGAGACAGAAATATCCAACGGCTAAGGTTGATGATATCACTGTCGTGTGT
CTCTCTGTCAACAAGAGACATGTTCCACAGCCTCGTATATGATTAAACAAACACACTTGC
GAAGAAACAAATAAAGACTAATCAAAGATGGATGACAAAAAAGCTTACTCAGAGACTTCT
GCGTGTTTGCCTATGAGTGTGAACGTATGTGTATATCTACCGTTGTATGCTACGTCGTGT
GATTATTACTTAGTAATGAAATGATATAGAAGTTAGGAGTGGTGTGTGTCGTGAGATAAA
AGCAACAAGGACGTTGACATTTCGGACACACGTCACGGGAATCTAGTTATAACTATTGGA
GCTTA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 

AF RS1FV76TF U 1
AF RS1GV08TF U 1
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AF RS1FV76JQ C 513
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AACAAAACAAAAGAAGAAGAAAAAATGGGATTTTGTTTTTGTATATCCTCAGGAGGATCA
ACAGATAGAAATCAGATTTACGAGATAAATGAGTATGGACAAGAAAATGCAGTTCTATAC
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GGCTTCAATCAAGATGCTGCCATACTCCACCTGGGATATGGAACTGAAGAAGGAGCGTTA
TGTGGAGTATTTGATGGTCATGGAGGGAAGGGTGTATTGGTGAGCAAGATCGTAAGAAAC
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CTTGATTGCTCCTCATCCGGAACTGCGGCTGTTTTCGCCGTTAAACATGGAAATCAAGTG
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ACGGAGGTGGTTCAGTTAACCAGTGACCTAAAGCCAAGTGTCCCAAGCGA

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DS 

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AACAAAACAAAAGAAGAAGAAAAAATGGGATTTTGTTTTTGTATATCCTCAGGAGGATCA
ACAGATAGAAATCAGATTTACGAGATAAATGAGTATGGACAAGAAAATGCAGTTCTATAC
TCTGAACAACATGAATTTCCTCAAGACTTTGGCTCTGTCTCGTCTTTAGCTGGAGGCAAG
GGCTTCAATCAAGATGCTGCCATACTCCACCTGGGATATGGAACTGAAGAAGGAGCGTTA
TGTGGAGTATTTGATGGTCATGGAGGGAAGGGTGAATTGGTGAGCAAGATCGTAAGAAAC
CAGTTGCCATCTTTATTGTTAGGTCACATGAACAATCATTCAGTGACTCGAGACTGGAAA
CTCATCTGCGAAACTACGTGTTTGGGCATGGACAAAAGGATTCTTAAACTCAAGAACACT
CTTGATTGCTCCTCATCCGGAACTGCGGCTGTTTTCGCCGTTAAACATGGAAATCAAGTG
ATGGTGGCAAACCTAGGAGATTCAAGGGCTATTATGATTGGAACAAGTGAGAACGGAGAA
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ATGT

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DS 

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GGGCTTTTGGTGACTTCGTTCTTAAAAGCTATGGTGTCATTGCGACTCCTGAAGTCTCTT
CGCATCAAATCACTTGTCGCGACCAGTTTCTGCTCCTTGCTTCCGATGGGGTGTGGGACG
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GATTAAACAAACACACTTGCGAAGAAACAAATAAAGACTAATCAAAGATGGATGACAAAA
AAGCTTACTCAGAGACTTCTGCGTGTTTGCCTATGAGTGTGAACGTATGTGTATATCTAC
CGTTGTATGCTACGTCGTGTGATTATTACTTAGTAATGAAATGATATAGAAG
CC

QA 1 772 1 772
DS 

RD RS1FV76JQ 813 0 0
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TATGATTGGAACAAGTGAGAACGGAGAAACGGAGGTGGTTCAGTTAACCAGTGACCTAAA
GCCAAGTGTCCCAAGCGAAGCGGACAGAATAAGGAAGCGCAACGGAAGAGTCTTAGCTTT
AGAGTCAGAGCCTCATATTCTAAGAGTATGGCTTCCACATGAAAACCGACCAGGCCTAGC
CATGTCTAGGGCTTTTGGTGACTTCGTTCTTAAAAGCTATGGTGTCATTGCGACTCCTGA
AGTCTCTTCGCATCAAATCACTTGTCGCGACCAGTTTCTGCTCCTTGCTTCCGATGGGGT
GTGGGACGTGCTTAGTAACGAAGAAGTGGCTAAGGTGGTGAAGTCGGCAAATGAGGCAGG
AGCGGCCAACGCGGTGACAGAAGCGGCGACTAATGCGTGGAGACAGAAATATCCAACGGC
TAAGGTTGATGATATCACTGTCGTGTGTCTCTCTGTCAACAAGAGACATGTTCCACAGCC
TCGTATATGATTAAACAAACACACTTGCGAAGAAACAAATAAAGACTAATCAAAGATGGA
TGACAAAAAAGCTTACTCAGAGACTTCTGCGTGTTTGCCTATGAGTGTGAACGTATGTGT
ATATCTACCGTTGTATGTTACGTCGTGTGATTATTACTTAGTAATGAAATGATATAGAAG
TTAGGAGTGGTGTGTGTCGTGAGATAAAAGCAACAAGGACGTTGACATTTCGGACACACG
TCACGGGAATCTAGTTATAACTATTGGAGCTTA

QA 1 813 1 813
DS 



AS 1 4

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GCAAAGCAAACTATATGATTGTGTATGTGTTAACACTTTGCTTTGTATATTGAGTGAATC
AAAAAAAGAGTGAAAAGTCAATGCTTCTTCTGGTAACCCCATGGATTGTTGTTTGCCCAA
TTCCACTGGTCTCTGCACATCTCGTCCACTCCATACTTTGCCTTCCAGCCAAGTTCTTTC
TCAGCTCTCTCTGTTGAAGCATAAACTGCAGTTGCATCTCCTGGCCTTCTCGGGCAGAGC
TTGGTTGGTATTTTCTTGCCAGAAGATTTCTCAAAAGCAGCAACCATCTCTAACACAGAC
GTTCCCCGTCCAGTCCCTAGATTGTAAGCAGTACAGCCTATCTTGGGATCATCAAATAGC
TTCCTTAACGCAGCGATATGTCCATCAGCCAAATCCATCACATGTATGTAGTCCCTCACC
GCACTACCATCCTCGGTAGGATAGTCATGTCCATAGACGTTGAGTTCAGGTAGACGTCCA
ACAGCTACTTGCTGTATGTAAGGCATGAGGTTATTGGGGATACCCTTTGGATCCTCGCCA
ATTCTGCCGCTCTCGTGCGCTCCCACAGGATTGAAGTACCTCAGCAGCACAATTCTCCAC
TCTGGTTCAGCCGCCTGGATATCTCTAGCTATGTCTTCAAGAAAGAGCTAGTACGACCGT
AAGGATTCATAGCCTTCAACTCGAAGTCTTCCGTGCATGGAATCTTCTCAGGTTGTCCAT
ACACAGTCGCAGACGATGAAAACACCATGTTTTTGCAGTTGTGCTTGGCCATGGTCTCGT
AAAGATTGATAGTTCCAACCAAGTTGTTGTCAAAGTAGCGGCGAGGGTTGGCAACACTTT
CACCCACAGCTTTAAGACCCGCGAAATGGATCACAGCATCAAACCTCTGTTTGGAGAAGA
GTTTCTCAATATCACCTTTGTTTCTTAGATCACCCTGAGTAAAGTTGAGCTTCTTGGAGA
GATGAGGACCAACGAGCTCCCTAACCCTGTCGACGGCTTCGATAACAGAGTTGTCGAGGT
TATCGATGATCGAGACCTTAAAACCTTCCTTCAGGAGCTGAACAACGGTATGCGTCCCGA
TGAATCCAGCACCGCCAGTGACAAGAATGTTCTGCTCCACAGACGAACCCATATCGAGAG
TAGCAAGCAAAGAGAACCCACTTCGAAAGATCGATTCTTTCGGATAAGAGAGAGAAACAG
AGAGATCACAGCGAACGAACAGAGAGAAGTCACAAGAAAGTTCC


BQ
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AF RS1DX24JQ U 1
AF RS1DX24TF C 152
AF RS1CX21JQ U 7
AF RS1CX21TF C 589
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BS 768 1304 RS1CX21TF

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GCAAAGCAAACTATATGATTGTGTATGTGTTAACACTTTTCTTTGTATATTGAGTGAATC
AAAAAAAGAGTGAAAAGTCAATGCTTCTTCTGGTAACCCCATGGATTGTTGTTTGCCCAA
TTCCACTGGTCTCTGCACATCTCGTCCACTCCATACTTTGCCTTCCAGCCAAGTTCTTTC
TCAGCTCTCTCTGTTGAAGCATAAACTGCAGTTGCATCTCCTGGCCTTCTCGGGCAGAGC
TTGGTTGGTATTTTCTTGCCAGAAGATTTCTCAAAAGCAGCAACCATCTCTAACACAGAC
GTTCCCCGTCCAGTCCCTAGATTGTAAGCAGTACAGCCTATCTTGGGATCATCAAATAGC
TTCCTTAACGCAGCGATATGTCCATCAGCCAAATCCATCACATGTATGTAGTCCCTCACC
GCACTACCATCCTCGGTAGGATAGTCATGTCCATAGACGTTGAGTTCAGGTAGACGTCCA
ACAGCTACTTGCTGTATGTAAGGCATGAGGTTATTGGGGATACCCTTTGGATCCTCGCCA
ATTCTGCCGCTCTCGTGCGCTCCCACAGGATTGAAGTACCTCAGCAGCACAATTCTCCAC
TCTGGTTCAGCCGCCTGGATATCTC
C

QA 1 685 1 685
DS 

RD RS1DX24TF 535 0 0
GGTAACCCCATGGATTGTTGTTTGCCCAATTCCACTGGTCTCTGCACATCTCGTCCACTC
CATACTTTGCCTTCCAGCCAAGTTCTTTCTCAGCTCTCTCTGTTGAAGCATAAACTGCAG
TTGCATCTCCTGGCCTTCTCGGGCAGAGCTTGGTTGGTATTTTCTTGCCAGAAGATTTCT
CAAAAGCAGCAACCATCTCTAACACAGACGTTCCCCGTCCAGTCCCTAGATTGTAAGCAG
TACAGCCTATCTTGGGATCATCAAATAGCTTCCTTAACGCAGCGATATGTCCATCAGCCA
AATCCATCACATGTATGTAGTCCCTCACCGCACTACCATCCTCGGTAGGATAGTCATGTC
CATAGACGTTGAGTTCAGGTAGACGTCCAACAGCTACTTGCTGTATGTAAGGCATGAGGT
TATTGGGGATACCCTTTGGATCCTCGCCAATTCTGCCGCTCTCGTGCGCTCCCACAGGAT
TGAAGTACCTCAGCAGCACAATTCTCCACTCTGGTTCAGCCGCCTGGATATCTC
C

QA 1 534 1 534
DS 

RD RS1CX21JQ 761 0 0
GT
CAACTAGCTGTTTTATTCATAGAAGTAACAAGACCCGTTCGTTACATGGAAAGCAAAGCA
AACTATATGATTGTGTATGTGTTAACACTTTGCTTTGTATATTGAGTGAATCAGAGAAAG
AGTGAAAAGTCAATGCTTCTTCTGGTAACCCCATGGATTGTTGTTTGCCCAATTCCACTG
GTCTCTGCACATCTCGTCCACTCCATACTTTGCCC*CCAGCCAAGTTCTTTCTCAGCTCT
CTCTGTTGAAGCATAAACTGCAGTTGCATCTCCTGGCCTTCTCGGGCAGAGCTTGGTTGG
TATTTTCTTGCCAGAAGCTTTCTCAAAAGCAGCAACCATCTCTAACACAGACGTTCCCCG
TCCAGTCCCTAGATTGTAAGCAGTACAGCCTATCTTGGGATCATCAAATAGCTTCCTTAA
CGCAGCGATATGTCCATCAGCCAAATCCATCACATGTATGTAGTCCCTCACCGCACTACC
ATCCTCGGTAGGATAGTCATGTCCATAGACGTTGAGTTCAGGTAGACGTCCAACAGCTAC
TTGCTGTATGTAAGGCATGAGGTTATTGGGGATACCCTTTGGATCCTCGCCAATTCTGCC
GCTCTCGTGCGCTCCCACAGGATTGAAGTACCTCAGCAGCACAATTCTCCACTCTGGTTC
AGCCGCCTGGATATCTCTAGCTATGTCTTCAAGAAAGAGCTAGTACGACCGTAAGGATTC
ATAGCCTTCAACTCGAAGTCTTCCGTGCATGGAATCTTC

QA 3 761 3 761
DS 

RD RS1CX21TF 716 0 0
GGATCCTCGCCAAT*CTGCCGCTCTCGTGCGCTCCCACAGGATTGAAGTAC*TCAGCAGC
ACAATTCTCCACTCTGGTTCAGCCGCCTGGATATCTCTAGCTATGTCTTCAAGAAAGAGC
TAGTACGACCGTAAGGATTCATAGCCTTCAACTCGAAGTCTTCCGTGCATGGAATCTTCT
CAGGTTGTCCATACACAGTCGCAGACGATGAAAACACCATGTTTTTGCAGTTGTGCTTGG
CCATGGTCTCGTAAAGATTGATAGTTCCAACCAAGTTGTTGTCAAAGTAGCGGCGAGGGT
TGGCAACACTTTCACCCACAGCTTTAAGACCCGCGAAATGGATCACAGCATCAAACCTCT
GTTTGGAGAAGAGTTTCTCAATATCACCTTTGTTTCTTAGATCACCCTGAGTAAAGTTGA
GCTTCTTGGAGAGATGAGGACCAACGAGCTCCCTAACCCTGTCGACGGCTTCGATAACAG
AGTTGTCGAGGTTATCGATGATCGAGACCTTAAAACCTTCCTTCAGGAGCTGAACAACGG
TATGCGTCCCGATGAATCCAGCACCGCCAGTGACAAGAATGTTCTGCTCCACAGACGAAC
CCATATCGAGAGTAGCAAGCAAAGAGAACCCACTTCGAAAGATCGATTCTTTCGGATAAG
AGAGAGAAACAGAGAGATCACAGCGAACGAACAGAGAGAAGTCACAAGAAAGTTCC

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 3

CO CL1938Contig1 1109 3 4 U
CACCAGCATTGCTTCAAAAGCTAGAGTTGCCAGAAACTGTACAACTCAGATTGGAAGCAG
GCTCAGTTCCACTAGGAATTATGCAGCGAAAGACATAAGGTTCGGTGTGGAAGGCCGGGC
TTTGGTGCTTAGAGGTGTTGAGGAGCTCGCTGATGCTGTCAAAAGTCACTATGGGACCAA
AAGGGTCGTAATGTCATCATCGAACAAAGCTGGGGAGCACCAAAGGTGACAAAGGATGGT
GTGACTGTAGCCAAGAGCATTGAGTTCAAGGACGGAGTCAAGAACGTTGGTGCCAGTCTT
GTCAAACAGGTTTGCTAACGCCCACCAATGACGTAGCTGGTGATGGAACAACGTGTGCTA
CAGTTCTTACAAGAGCTATCTTCGCAGAAGGCTGCAAATCAGTCGCTGCTGGAATGAATG
CGATGGACCTAAGACGCGGTATCAAACCGGCCGTTGACACAGTTGTGACGAACTTGAAGA
GCCGAGCACGCATGATTAGCACTTCTGAGGAAATTGCTCAAGTTGGAACTATATCAGCTA
ATGGAGATAGAGAAATCGGTGAATTGATTGCAAAGGCTATGGAAAGTGTTGGCAAAGAGG
GAGTGATCACAATCCAAGATGGGAAGACCTTGTTTAACGAGCTTGAAGTTGTTGAGGGTA
TGAAGATTGACAGGGGATACATCTCCCCATACTTCATTACAAACCAGAAGAACCAAAAAT
GTGAACTAGAAGATCCTCTCATTCTCATCCACGAGAAGAAAATCTCCAATTTGAATTCTA
TGGTGAAAGTCTTAGAACTGGCCCTCAAGAGTCAAAGGTCGCTGTCGATCGTTGCGGAGG
ATTTGGAGAGTGATGCTCTTGCCGTACTAATTCTGAACAAGCTTCGTGCTGGAATCAAGG
TCTGTGCTGTGAAGGCCCCTGGTTTTGGAGAAAACCGTAAGGCCAACATGCACGATCTAG
CTACGCTCACCGGAGCTCAGGTGATAACTGAAGAGTTGGGTATGAATCTCGAGAAAATCG
ATCTCAGCATGCTTGGAAACTGCAAAAAGATAACTGTATCCAAGGACGACACTGTTTTCC
TTGACGGAGCTGGTGACAAGAAATCAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BL40TF U 277
AF RS1BL40JQ C 1
AF RS1FQ01TF U 478
BS 1 276 RS1BL40JQ
BS 277 386 RS1BL40TF
BS 387 478 RS1BL40JQ
BS 479 1109 RS1FQ01TF

RD RS1BL40TF 110 0 0
GTCAAGAACGTTGGTGCCAGTCTTGTCAAACAGGTTTGCTAACGCCCACCAATGACGTAG
CTGGTGATGGAACAACGTGTGCTACAGTTCTTACAAGAGCTATCTTCGCA

QA 1 110 1 110
DS 

RD RS1BL40JQ 704 0 0
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GCTCAGTTCCACTAGGAATTATGCAGCGAAAGACATAAGGTTCGGTGTGGAAGGCCGGGC
TTTGGTGCTTAGAGGTGTTGAGGAGCTCGCTGATGCTGTCAAAAGTCACTATGGGACCAA
AAGGGTCGTAATGTCATCATCGAACAAAGCTGGGGAGCACCAAAGGTGACAAAGGATGGT
GTGACTGTAGCCAAGAGCATTGAGTTCAAGGACGGAGTCAAGAACGTTGGTGCCAGTCTT
GTCAAACAGGTT*GCTAACGCC*ACCAATGACGTAGCTGGTGATGGAACAACGTGTGCTA
CAGTTCTTACAAGAGCTATCTTCGCAGAAGGCTGCAAATCAGTCGCTGCTGGAATGAATG
CGATGGACCTAAGACGCGGTATCAAACCGGCCGTTGACACAGTTGTGACGAACTTGAAGA
GCCGAGCACGCATGATTAGCACTTCTGAGGAAATTGCTCAAGTTGGAACTATATCAGCTA
ATGGAGATAGAGAAATCGGTGAATTGATTGCAAAGGCTATGGAAAGTGTTGGCAAAGAGG
GAGTGATCACAATCCAAGATGGGAAGACCTTGTTTAACGAGCTTGAAGTTGTTGAGGGTA
TGAAGATTGACAGGGGATACATCTCCCCATACTTCATTACAAAC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1FQ01TF 632 0 0
G
GAGCCGAGCACGCATGATTAGCACTTCTGAGGAAATTGCTCAAGTTGGAACTATATCAGC
TAATGGAGATAGAGAAATCGGTGAATTGATTGCAAAGGCTATGGAAAGTGTTGGCAAAGA
GGGAGTGATCACAATCCAAGATGGGAAGACCTTGTTTAACGAGCTTGAAGTTGTTGAGGG
TATGAAGATTGACAGGGGATACATCTCCCCATACTTCATTACAAACCAGAAGAACCAAAA
ATGTGAACTAGAAGATCCTCTCATTCTCATCCACGAGAAGAAAATCTCCAATTTGAATTC
TATGGTGAAAGTCTTAGAACTGGCCCTCAAGAGTCAAAGGTCGCTGTCGATCGTTGCGGA
GGATTTGGAGAGTGATGCTCTTGCCGTACTAATTCTGAACAAGCTTCGTGCTGGAATCAA
GGTCTGTGCTGTGAAGGCCCCTGGTTTTGGAGAAAACCGTAAGGCCAACATGCACGATCT
AGCTACGCTCACCGGAGCTCAGGTGATAACTGAAGAGTTGGGTATGAATCTCGAGAAAAT
CGATCTCAGCATGCTTGGAAACTGCAAAAAGATAACTGTATCCAAGGACGACACTGTTTT
CCTTGACGGAGCTGGTGACAAGAAATCAATT

QA 2 632 2 632
DS 



AS 1 4

CO CL1939Contig1 837 4 7 U
ACCCACGAACAAACATAGTTTTTTACATTTTTATTATAATACAAATTTGGGAATCACATC
GATAACGTCTTGACATTGTAAACTGGTTACATGCTTTTTTCTGAAACACTCGAGTTCAAA
ACCATTCACTATTACTTTTTATTTAATTTTATATATTGAAATGATATACGACTAGAATGA
TAGAAAGAACAATGAAAATACCCTACC*ATGATTTACCACATATAATATTAGCCCAATCC
AAGTGAGTCTGCTCGTCCAACACTAACCTTTGGTTAGATCAATGTTCTTGCTTAGCTCTT
CCAGCGTCTTTAATCTCATTTTCTCGCTCTCTCCCTCCAACTCCTGTAGCTTGGTGATCA
GCTCCACCTTCTCCTTGTTCTTTTCATTAAATGCTTCAAGTGCATCCTTGTACTCTACTT
CCTTTTTCTGAACAGTATTCCCCAATGGTTTAATCTCTTTATCGAGAGAATCAATCTTCT
TCCGGATCAAAGTTACTTCCTTCCTCATGGGATCAGCAAATCCTTCAAGTTCCTCGCGGA
TCAAAGCGAGACGCTTGGTCTCGTCTTCAACACGGCCTAGCTGAGCTAAAACTCGTTCTC
TGATCTCCATCTTCTTCTTCTCGATCTCATCTTCTTTCGCCTTGAACGCCGACAGAGCTT
TCACCGACAGCTCCTCGTCTTCCTTCTTCATTTGGCTGCTGAAGCTCATGCTCTCCGATA
GCTCATCCTTTAGTCGCCGGCTCTGTTCCGCCGTCGCCGGCCGCGTCGCCTCTGTCGGCT
GCATCTTTCTTCTCCCAGCGAACTTTTTATCAATCTGATGCGCTCTCTACGATCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RS1EO93JQ U 1
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AF RS1EO93TF C 26
AF RS1D779TF C 55
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TCTCATTTTCTCGCTCTCTCCCTCCAACTCCTGTAGCTTGGTGATCAGCTCCACCTTCTC
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ACA
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ATCAATCTGATGCGCTCTCTACGATCCC

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TCTTCTTCCGGATCAAAGTTACTTCCTTCCTCATGGGATCAGCAAATCCTTCAAGTTCCT
CGCGGATCAAAGCGAGACGCTTGGTCTCGTCTTCAACACGGCCTAGCTGAGCTAAAACTC
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TCGGCTGCATCTTTCTTCTCCCAGCGAACTTTTTATCAATCTGATGCGCTCTCTACGATC
CCC

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 4

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AGGACACTCTTAAACAATCACCAACAGTTGTTTCCCGACTCTTTACTACTCATCATCCTC
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GCGGAAGCTTTAACCTCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1D929JQ U 1
AF RS1CS70JQ U 54
AF RS1CS70TF C 474
AF RS1D929TF C 474
BS 1 700 RS1D929JQ
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DS 

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CACGCATTGGGCTGCCTTCTTCAGGAGTCAGACTTCGCTTCCTATCTTTGGATGGAGGAG
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CA

QA 1 722 1 722
DS 

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TGCGACGAGGAGACCTAGACCGAGACCTAACCGGCGATCTTGAGTAACTTGCGTCCCGCC
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CCAGTCTGTACCTCGCATCATCAGCATCTCTAGGATCACTGAACTCAATGAAGGCATAGT
CTCGCTTCATGTCCAAATCTCGAATTCTTCCGTATTTGCTGAAGAGGTGTTCAAGATCTC
GTTCCCTTGTTCGAGAGGAGAGGTGTCCCACATAGAGACGTGCACCGCCGTATCGGCCAT
TGCTGCTGTAACGATCATCGTAGCGAGGCATCTTAAAGTCTCGTGATCAGATAGTTCGCC
GCGCTCCGCGGAAGCTTTAACCTCC

QA 1 625 1 625
DS 

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TGCGACGAGGAGACCTAGACCGAGACCTAACCGGCGATCTTGAGTAACTTGCGTCCCGCA
TGAGCCTCTTAGGACTGTTCTTGCAGTTCCTCTCGATGTGACCCCTATCTCCACAACGAT
AACATTTGTTCTTCCAGTCACCAGCAGAGCAATCTCGAGCCCAGTGACCTTCAAGACCAC
AGTTGAAGCAACGACCACTCCCTGGAGGAGGGCCTCTGCTCGAGGAAAACTCCCGGGAAC
CACGAGGTGTCCCTCTGGCAAACTCAACAGTGATACGGCTTCCATCAAAGTCTCTTCCGT
CCAGTCTGTACCTCGCATCATCAGCATCTCTAGGATCACTGAACTCAATGAAGGCATAGT
CTCGCTTCATGTCCAAATCTCGAATTCTTCCGTATTTGCTGAAGAGGTGTTCAAGATCTC
GTTCCCTTGTTCGAGAGGAGAGGTGTCCCACATAGAGACGTGCACCGCCGTATCGGCCAT
TGCTGCTGTAACGATCATCGTAGCGAGGCATCTTAAAGTCTCGTGATCAGATAGTTCGCC
GCGCTCCGCGGAAGCTTTAACCTCC

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 4

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GCCAAATAAGTTGAACATGTGTTGGCTTGGATACATTGTGTAATATGCCTTATTATTACA
GAAAATTATTAGTTGAATTATAAAGGGTTAATGATAAACTATGAGTTTTGTTGAAAAGAA
GTTAAATATCGGCAGGAGGATGCCCAGGCATGCTTGGACAGGTTGTTTTGTTAGGATTCT
TATTGTCCAAAGGGTTCTTGTTCTTATACTCATTGTTCTTGTTGTCATTGTTCATCCCCA
ATTTGTTCTTCACTGCCTCTGATGCTTCTTGTGCCATGTTCTTCACTTGCTCTCCTTTCT
CCTGGAGAAAGCTTGATGCTTGAGAAGAGTTGGTGTTGTCTGCTTTGCATTCAGCCCTCT
TCACATGTGCTTGGCCCACGATTTGGCCGGCCCTCACACTGAATTCCTCATCCTGTCTGC
TCGCCATTTCTTACTTGTTATTCTCCTTTCTCGTCAAACAACGTCCC


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1G577JQ U 1
AF RS1G577TF C 1
AF RS1AA42TF C 2
AF RS1AA42JQ U 218
BS 1 385 RS1G577JQ
BS 386 527 RS1AA42JQ

RD RS1G577JQ 385 0 0
AAGTGAAACCATAGTCTTTTTATTTGTTGGGGTCCAACACAAGTGTGAACATGTCTAAAA
GCCAAATAAGTTGAACATGTGTTGGCTTGGATACATTGTGTAATATGCCTTATTATTACA
GAAAATTATTAGTTGAATTATAAAGGGTTAATGATAAACTATGAGTTTTGTTGAAAAGAA
GTTAAATATCGGCAGGAGGATGCCCAGGCATGCTTGGACAGGTTGTTTTGTTAGGATTCT
TATTGTCCAAAGGGTTCTTGTTCTTATACTCATTGTTCTTGTTGTCATTGTTCATCCCCA
ATTTGTTCTTCACTGCCTCTGATGCTTCTTGTGCCATGTTCTTCACTTGCTCTCCTTTCT
CCTGGAGAAAGCTTGATGCTTGAGA

QA 1 385 1 385
DS 

RD RS1G577TF 527 0 0
AA
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TAAATATCGGCAGGAGGATGCCCAGGCATGCTTGGACAGGTTGTTTTGTTAGGATTCTTA
TTGTCCAAAGGGTTCTTGTTCTTATACTCATTGTTCTTGTTGTCATTGTTCATCCCCAAT
TTGTTCTTCACTGCCTCTGATGCTTCTTGTGCCATGTTCTTCACTTGCTCTCCTTTCTCC
TGGAGAAAGCTTGATGCTTGAGAAGAGTTGGTGTTGTCTGCTTTGCATTCAGCCCTCTTC
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GCCATTTCTTACTTGTTATTCTCCTTTCTCGTCAAACAACGTCCC

QA 3 527 3 527
DS 

RD RS1AA42TF 526 0 0
G
GTGAAACCATAGTCTTTTTATTTGTTGGGGTCCAACACAAGTGTGAACATGTCTAAAAGC
CAAATAAGTTGAACATGTGTTGGCTTGGATACATTGTGTAATATGCCTTATTATTACAGA
AAATTATTAGTTGAATTATAAAGGGTTAATGATAAACTATGAGTTTTGTTGAAAAGAAGT
TAAATATCGGCAGGAGGATGCCCAGGCATGCTTGGACAGGTTGTTTTGTTAGGATTCTTA
TTGTCCAAAGGGTTCTTGTTCTTATACTCATTGTTCTTGTTGTCATTGTTCATCCCCAAT
TTGTTCTTCACTGCCTCTGATGCTTCTTGTGCCATGTTCTTCACTTGCTCTCCTTTCTCC
TGGAGGAAGCTTGATGCTTGAGAAGAGTTGGTGTTGTCTGCTTTGCATTCAGCCCTCTTC
ACATGTGCTTGGCCCACGATTTGGCCGGCCCTCACACTGAATTCCTCATCCTGTCTGCTC
GCCATTTCTTACTTGTTATTCTCCTTTCTCGTCAAACAACGTCCC

QA 2 526 2 526
DS 

RD RS1AA42JQ 310 0 0
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CTTGTTGTCATTGTTCATCCCCAATTTGTTCTTCACTGCCTCTGATGCTTCTTGTGCCAT
GTTCTTCACTTGCTCTCCTTTCTCCTGGAGGAAGCTTGATGCTTGAGAAGAGTTGGTGTT
GTCTGCTTTGCATTCAGCCCTCTTCACATGTGCTTGGCCCACGATTTGGCCGGCCCTCAC
ACTGAATTCCTCATCCTGTCTGCTCGCCATTTCTTACTTGTTATTCTCCTTTCTCGTCAA
ACAACGTCCC

QA 1 310 1 310
DS 



AS 1 4

CO CL1942Contig1 981 4 5 U
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TTCTCCGGACGTTACTCCAAAAAAAAAATACTAAAAAGGGTTAAACTTTAAAACATAGTA
GATTAAATAAAACAACTGTTAACATCACTACGAGTCGCTGGACCCAATACCACTAGCCGT
CGCCGGAAAACACCTCGGAATATCCGCCACCGAGTACGATCTCCACGCACAAAAACCCGT
CGATGACGACGGCTTAGGCGACTTCAAGTCCCCAAAAGACTCTCGACTTCTACTAGGATA
CAGCGGAGGAAGCATAATACTACCATGTCTCTGCCTCGGAGGAGATCCCGACGTCGTCGA
GCTTGACGATCCCGGCGAAGAAGACGAATCTCCTCCGGAGGAAGAAGAAGAAGATCCTTC
TCTCGCCATCACCCCAGCAGCAACCGCCATGGCTAGCGTCAAAGCGCTCCTGCTCGAGCT
CATGACGTGTTTCTTCGAGATCCCGCCACGTGGAGTCGTTTTGCTGTTCTCCCAGATCTG
ATGGCAGAGGAGATTCCTCCGACGACGGCTGTATGGATTCTCCGGCTTCGCCAAGTCTTT
CATCGACGAGGAGGAACTCAACGCCGAGGCAGCCGCCGCTAAGTTCGTGAAAGACTTCGA
CTTCCCGCTGTAAAAGTTCGATATCCCTTTCCTAACGGGCAAGACTTCTTCCAGAGATTC
CATCAGATCAAGAGGACCTTTGTAGGAAGACTCAGCTTCGTTGTTCTCTTCTCCCTCGCC
GTGAAACTCTTCTTCTTCGTCGCTGTTCCTCCCAATTGAAGAAGACGCCGAAGAAGAAGA
GAAAGACTCAGAAGAAGACTGATCTCCGCTGAAATTAAACATATAAGATTCAACTCTATC
CATCGCGCAATGACTTAAGCAGAAAACCTTGCAGCTTTTGTTATATTACTCTCAAAACTC
ACAATACATACAGATGGGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AY24JQ U 35
AF RS1DW64JQ U 1
AF RS1DW64TF C 241
AF RS1AY24TF C 242
BS 1 87 RS1DW64JQ
BS 88 88 RS1AY24JQ
BS 89 724 RS1DW64JQ
BS 725 896 RS1DW64TF
BS 897 981 RS1AY24TF

RD RS1AY24JQ 626 0 0
TCAAAGATTTGAAACTCGTATATACATTCTCCGGACGTTACTCCAAAAAAAAAATACTAA
AAAGGGTTAAACTTTAAAACATAGTAGATTTAATAAAACAACTGTTAACATCCCTACGAG
TCGCTGGACCCAATACCACTAGCCGTCGCCGGAAAACACCTCGGAATATCCGCCACCGAG
TACGATCTCCACGCACAAAAACCCGTCGATGACGACGGCTTAGGCGACTTCAAGTCCCCA
AAAGACTCTCGACTTCTACTAGGATACAGCGGAGGAAGCATCATACTACCATGTCTCTGC
CTCGGAGGAGATCCCGACGTCGTCGAGCTTGACGATCCCGGCGAAGAAGACGAATCTCCT
CCGGAGGAAGAAGAAGAAGATCCTTCTCTCGCCATCACCCCAGCAGCAACCGCCATGGCT
AGCGTCAAAGCGCTCCTGCTCGAGCTCATGACGTGTTTCTTCGAGATCCCGCCACGTGGA
GTCGTTTTGCTGTTCTCCCAGATCTGATGGCAGAGGAGATTCCTCCGACGACGGCTGTAT
GGATTCTCCGGCTTCGCCAAGTCTTTCATCGACGAGGAGGAACTCAACGCCGAGGCAGCC
GCCGCTAAGTTCGTGAAAGACTTCGA

QA 1 626 1 626
DS 

RD RS1DW64JQ 724 0 0
CTAAAACAACAGAAAAAAGATGTGTGGATCCATTTCAAAGATTTGAAACTCGTATATACA
TTCTCCGGACGTTACTCCAAAAAAAAA*TACTAAAAAGGGTTAAACTTTAAAACATAGTA
GATTAAATAAAACAACTGTTAACATCACTACGAGTCGCTGGACCCAATACCACTAGCCGT
CGCCGGAAAACACCTCGGAATATCCGCCACCGAGTACGATCTCCACGCACAAAAACCCGT
CGATGACGACGGCTTAGGCGACTTCAAGTCCCCAAAAGACTCTCGACTTCTACTAGGATA
CAGCGGAGGAAGCATAATACTACCATGTCTCTGCCTCGGAGGAGATCCCGACGTCGTCGA
GCTTGACGATCCCGGCGAAGAAGACGAATCTCCTCCGGAGGAAGAAGAAGAAGATCCTTC
TCTCGCCATCACCCCAGCAGCAACCGCCATGGCTAGCGTCAAAGCGCTCCTGCTCGAGCT
CATGACGTGTTTCTTCGAGATCCCGCCACGTGGAGTCGTTTTGCTGTTCTCCCAGATCTG
ATGGCAGAGGAGATTCCTCCGACGACGGCTGTATGGATTCTCCGGCTTCGCCAAGTCTTT
CATCGACGAGGAGGAACTCAACGCCGAGGCAGCCGCCGCTAAGTTCGTGAAAGACTTCGA
CTTCCCGCTGTAAAAGTTCGATATCCCTTTCCTAACGGGCAAGACTTCTTCCAGAGATTC
CATC

QA 1 724 1 724
DS 

RD RS1DW64TF 657 0 0
C
GATGACGACGGCTTAGGCGACTTCAAGTCCCCAAAAGACTCTCGACTTCTACTAGGATAC
AGCGGAGGAAGCATAATACTACCATGTCTCTGCCTCGGAGGAGATCCCGACGTCGTCGAG
CTTGACGATCCCGGCGAAGAAGACGAATCTCCTCCGGAGGAAGAAGAAGAAGATCCTTCT
CTCGCCATCACCCCAGCAGCAACCGCCATGGCTAGCGTCAAAGCGCTCCTGCTCGAGCTC
ATGACGTGTTTCTTCGAGATCCCGCCACGTGGAGTCGTTTTGCTGTTCTCCCAGATCTGA
TGGCAGAGGAGATTCCTCCGACGACGGCTGTATGGATTCTCCGGCTTCGCCAAGTCTTTC
ATCGACGAGGAGGAACTCAACGCCGAGGCAGCCGCCGCTAAGTTCGTGAAAGACTTCGAC
TTCCCGCTGTAAAAGTTCGATATCCCTTTCCTAACGGGCAAGACTTCTTCCAGAGATTCC
ATCAGATCAAGAGGACCTTTGTAGGAAGACTCAGCTTCGTTGTTCTCTTCTCCCTCGCCG
TGAAACTCTTCTTCTTCGTCGCTGTTCCTCCCAATTGAAGAAGACGCCGAAGAAGAAGAG
AAAGACTCAGAAGAAGACTGATCTCCGCTGAAATTAAACATATAAGATTCAACTC
C

QA 2 656 2 656
DS 

RD RS1AY24TF 740 0 0
GATGACGACGGCTTAG*CGACTTCAAGTCCCCAAAAGACTCTCGACTTCTACTAGGATAC
AGCGGAGGAAGCATCATACTACCATGTCTCTGCCTCGGAGGAGATCCCGACGTCGTCGAG
CTTGACGATCCCGGCGAAGAAGACGAATCTCCTCCGGAGGAAGAAGAAGAAGATCCTTCT
CTCGCCATCACCCCAGCAGCAACCGCCATGGCTAGCGTCAAAGCGCTCCTGCTCGAGCTC
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CAATACATACAGATGGGGCC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 4

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TCTATCGTCACCATAACTCAGATCGATCAACATGCTAGCCGTTCACCGCCCTTCTTCCGC
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CCCTTCTCTCACACGCGACTCAACCGCTGCTCATTTCCACACGCACGAGGTTGGTCCTAA
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AGGCGGAGACGGTGGTAACGTTGGTAGCCTACGTCAAGTCCACGTCGTCTCTGGCCTACC
CGCGGGGAGCTCCACCGAACGTCTTGATATCCTGGACGACGAGCGTCACGTCATCAGCTT
CAGCGTCGTCGGCGGTGACCATAGGTTATCTAACTATAGATCCGTCACGACTCTTCACCC
TTCTCCGATCTCCGGGACCGTCGTTGTTGAGTCCTACGTCGTTGATGTGCCTCAAGGGAA
CACAAAGGAAGAGACATGCGACTTTGTGGACGTTATAGTACGATGCAATCTCCAGTCACT
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TATCATATGCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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CCT

QA 1 709 1 709
DS 

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C*GGGACCGTCGTTGTTGAGTCCT

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DS 

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TT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RS1AX14JQ 848 0 0
CTAA
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ACCATAACTCAGATCGATCAACATGCTAGCCGTTCACCGCCTTTCTTCCGCCGTATCAAA
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CACACGCGACTCAACCGCTGCTCATTTCCACACGCACGAGGTTGGTCCTAACCAGTGTTG
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AGCTGAAAATTCTGAGGCGGAGGTGAAGAAGAAGACATCCATGTGATGAGTGTGCTTGGT
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TCTATGTTTTTGCCGGCTTTTTGTGTGAAAAAATACATTAGTAAATTAATCTATCATATG
CATC

QA 5 848 5 848
DS 



AS 1 4

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GAACCCTATTATTGGTTTTATCAGAGACCATATATCAAACCTTATCCAGCTGGATCTCTT
AAATTATTGAACATAAGGATAAACAAACTTAACATAGTTTCTCAAGCAGATTTATTTGAA
CTGACATTAACAACCTTCATATCTTTGATTAGTTGTCTTGGGGCTCTGCGTCATCCGCCG
CTTTCACTGACTTGGACACGTATGTAACCGGTTTTTTTTGGTTCTCATTTACTGTCAAGT
TAAATATCTCTGGCCTTGAGTAATGTC**ACCACATCGAAATATAACTTGGCACGTGCAA
TATCACCAAGATCAAGATCAGCAGTGATGAGACCCTCTGATTCAAAGCTTGGTCCGGCGA
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GTTCACCGTCGTACATGCCGGAGCTTGGGTCGGTGAACAAGTAATCAGCATGGTCAGGGA
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TGTGCATCATAAACGATTGCCAATTCTTGGTACCGTCAGCAGTAGGTGCACAGTATAATT
CAATTCCTTTCCCGTACAAGGCAGTTCTGAAGAGAGGCATCCTATTTTCCCAGCAAATAG
CAGCACCGAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GU79JQ U 18
AF RS1A983JQ U 58
AF RS1A983TF C 1
AF RS1EH64JQ U 8
BS 1 7 RS1A983TF
BS 8 61 RS1EH64JQ
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BS 85 85 RS1A983JQ
BS 86 86 RS1EH64JQ
BS 87 156 RS1A983JQ
BS 157 157 RS1EH64JQ
BS 158 168 RS1A983JQ
BS 169 169 RS1EH64JQ
BS 170 390 RS1A983JQ
BS 391 391 RS1EH64JQ
BS 392 463 RS1A983JQ
BS 464 464 RS1EH64JQ
BS 465 554 RS1A983JQ
BS 555 732 RS1EH64JQ

RD RS1GU79JQ 426 0 0
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TTATCAGAGACCATATATCAAACCTTATCCAGCTGGATCTCTTAAATTATTGAACATAAG
GATAAACAAACTTAACATAGTTTCTCAAGCAGATTTATTTGAACTGACATTAACAACCTT
CATATCTTTGATTAGTTGTCTTGGGGCTCTGCGTCATCCGCCGCTTTCACTGACTTGGAC
ACGTATGTAACCGGTTTTTTTTGGTTCTCATTTACTGTCAAGTTAAATATCTCTGGCCTT
GAGTAATGTCCGACCACATCGAAATATAACTTGGCACGTGCAATATCACCAAGATCAAGA
TCAGCAGTGATGAGACCCTCTGATTCAAAGTTTGGTCCGGCGAGTATCTTTCCCAATGGT
GAAAT
C

QA 1 425 1 425
DS 

RD RS1A983JQ 497 0 0
AAAA
AACCCTATTATTGGTTTTATCAAAAACCATATATCAAACCTTATCCAGCTGGATCTCTTA
AATTATTGAACATAAGGATAAACAAACTTAACATATTTTCTCAAGCAAATTTATTTGAAC
TGACATTAACAACCTTCATATCTTTGATTAGTTGTCTTGGGGCTCTGCGTCATCCGCCGC
TTTCACTGACTTGGACACGTATGTAACCGGTTTTTTTTGGTTCTCATTTACTGTCAAGTT
AAATATCTCTGGCCTTGAGTAATGTC**ACCACATCGAAATATAACTTGGCACGTGCAAT
ATCACCAAGATCAAGATCAGCAGTGATGAAACCCTCTGATTCAAAGCTTGGTCCGGCGAG
TATCTTTCCCAATGGTGAAATAATGACACTACCGCCCTGGGAAACAATAGTGTCTTGGTG
TTCACCGTCGTACATGCCGGAGCTTGGGTCGGTGAACAAGTAATCAGCATGGTCAGGGAA
ATCTTTACGCACA

QA 5 497 5 497
DS 

RD RS1A983TF 669 0 0
AGATGTTATCAATATTTCAACTTAAAATAAATTGCACAATATCCAAAATACAAGAGAAGA
GAACCCTATTATTGGTTTTATCAGAGACCATATATCAAACCTTATCCAGCTGGATCTCTT
AAATTATTGAACATAAGGATAAACAAACTTAACATAGTTTCTCAAGCAGATTTATTTGAA
CTGACATTAACAACCTTCATATCTTTGATTAGTTGTCTTGGGGCTCTGCGTCATCCGCCG
CTTTCACTGACTTGGACACGTATGTAACCGGTTTTTTTTGGTTCTCATTTACTGTCAAGT
TAAATATCTCTGGCCTTGAGTAATGTC**ACCACATCGAAATATAACTTGGCACGTGCAA
TATCACCAAGATCAAGATCAGCAGTGATGAGACCCTCTGATTCAAAGCTTGGTCCGGCGA
GTATCTTTCCCAATGGTGAAATAATGACACTACCGCCCTGGGAGACAATAGTGTCTTGGT
GTTCACCGTCGTACATGCCGGAGCTTGGGTCGGTGAACAAGTAATCAGCATGGTCAGGGA
AATCTTTACGCACAGAGAACTGGCAAGCCGACAACACGAAGCATCCACCCTCAATTGCAA
TGTGCATCATAGACGATTGCCAATTCTTGGTACCGTCAGCAGTAGGTGCACAGTATAATT
CAATTCC
CC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RS1EH64JQ 725 0 0
ATCAATATTTCAACTTAAAATAAATTGCACAATATCCAAAATACAAGAGAAGAGAACCCT
ATTATTGGTTTTATCAGAGACCATATATCAAACCTTATCCAGCTGGATCTCTTAAATTAT
TGAACATAAGGATAAACAAACTTAACATAGTTTCTCAAGCAGATTTATTTGAACTGACAT
TAACAACCTTCATATCTTTGATTAGTTGTCTTGGGGCTCTGCGTCATCCGCCGCTTTCAC
TGACTTGGACACGTATGTAACCGGTTTTTTTTGGTTCTCATTTACTGTCAAGTTAAATAT
CTCTGGCCTTGAGTAATGTCCGACCACATCGAAATATAACTTGGCACGTGCAATATCACC
AAGATCAAGATCAGCAGTGATGAGACCCTCTGATTCAAAGTTTGGTCCGGCGAGTATCTT
TCCCAATGGTGAAATAATGACACTACCGCCCTGGGAGACAATAGTGTCTTGGTGTTCACC
GTCGTACATGCCGGAGCTTGGGTCGGTGAACAAGTAATCAGCATGGTCAGGGAAATCTTT
ACGCACAGAGAACTGGCAAGCCGACAACACGAAGCATCCACCCTCAATTGCAATGTGCAT
CATAAACGATTGCCAATTCTTGGTACCGTCAGCAGTAGGTGCACAGTATAATTCAATTCC
TTTCCCGTACAAGGCAGTTCTGAAGAGAGGCATCCTATTTTCCCAGCAAATAGCAGCACC
GAGTT

QA 1 725 1 725
DS 



AS 2 4

CO CL1945Contig1 981 2 8 U
GGCTCTCTCGCTCGTCAATTTCCATCGTAAAAGCAGACGCGATGATGAGCTTGCCGTTTC
TGAACGCGACAGGGATCCCGTTGCCGTCGACAGGATCAATTCGCCGGAGATCGCACATTG
TTTCACGGCAGGATCTTCCTGAACTATCGTCTAAAGCAGTCGTCTCTTCCCCCAGCCCCA
GGCTTAGCTTCTCTCGTAACGACAGGTTTCTCTCGCCGGAGGTATCGTCCTCTCCGATCC
GATCGGTGACTGTGAGATCGCAATTGAGTACACCTCTCATTTCAGGTAACGATGAGTGGG
GGACTTGGACTGCTCTCTTCGCCACTGGTGCTTTCGGTCTCTGGTCGGAGAAGACGAAGG
TGGGAAGTGCGGTGAGTGGGGCGTTGGTGAGCACACTGATCGGTCTTGCAGCTAGTAACC
TTGGGATCATTTCTTCAGACGCTCCTGCTTTTGCTGTTGTCTTGAACTTCCTCCTCCCAT
TAGCTGTTCCTCTCTTGCTCTTCCGAGCTGATCTCCGCCGTGTCGTTCAGTCCACTGGAA
AGCTTCTCTTGGCTTTCTTGATTGGATCAATTGCAACAACTGTGGGTACAGCCCTGGCCT
ACTACCTAGTGCCAATGAGAGCACTTGGTAATGATAGTTGGAAGATTGCAGCTGCTCTCA
TGGGGAGGCATATCGGTGGAGCCGTCAACTATGTTGCCATAGCGAATGCTCTCGGAGTTT
CACCATCAGTATTAGCGGCTGGACTCGCTGCTGATAATGTTATTTGCGCTGTTTATTTCA
CGTCTTTGTTCGCAATTGGCTCCAAAATACCTGCCGAAACCTTGCCTCCACCAACTAGTG
ATGCAGATGCAAACAAAGATTCCGAATCTACAAACAAAATCCCTGTGCTACTGATAGCTA
CTGGAATTGCTGTGTCATTAGCTATATGCAAGCAGGGCTTTGCTAACAAAGCATTTCGGG
ATTCGGTGGTAGCTTGTCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C447TF U 1
AF RS1G582TF U 237
BS 1 592 RS1C447TF
BS 593 593 RS1G582TF
BS 594 705 RS1C447TF
BS 706 706 RS1G582TF
BS 707 761 RS1C447TF
BS 762 762 RS1G582TF
BS 763 772 RS1C447TF
BS 773 981 RS1G582TF

RD RS1C447TF 772 0 0
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TGAACGCGACAGGGATCCCGTTGCCGTCGACAGGATCAATTCGCCGGAGATCGCACATTG
TTTCACGGCAGGATCTTCCTGAACTATCGTCTAAAGCAGTCGTCTCTTCCCCCAGCCCCA
GGCTTAGCTTCTCTCGTAACGACAGGTTTCTCTCGCCGGAGGTATCGTCCTCTCCGATCC
GATCGGTGACTGTGAGATCGCAATTGAGTACACCTCTCATTTCAGGTAACGATGAGTGGG
GGACTTGGACTGCTCTCTTCGCCACTGGTGCTTTCGGTCTCTGGTCGGAGAAGACGAAGG
TGGGAAGTGCGGTGAGTGGGGCGTTGGTGAGCACACTGATCGGTCTTGCAGCTAGTAACC
TTGGGATCATTTCTTCAGACGCTCCTGCTTTTGCTGTTGTCTTGAACTTCCTCCTCCCAT
TAGCTGTTCCTCTCTTGCTCTTCCGAGCTGATCTCCGCCGTGTCGTTCAGTCCACTGGAA
AGCTTCTCTTGGCTTTCTTGATTGGATCAATTGCAACAACTGTGGGTACAGCTCTGGCCT
ACTACCTAGTGCCAATGAGAGCACTTGGTAATGATAGTTGGAAGATTGCAGCTGCTCTCA
TGGGGAGGCATATCGGTGGAGCCGTCAACTATGTTGCCATAGCGA*TGCTCTCGGAGTTT
CACCATCAGTATTAGCGGCTGGACTCGCTGCTGATAATGTT*TTTGCGCTGT

QA 1 772 1 772
DS 

RD RS1G582TF 745 0 0
G
TCCGATCGGTGACTGTGAGATCGCAATTGAGTACACCTCTCATTTCAGGTAACGATGAGT
GGGGGACTTGGACTGCTCTCTTCGCCACTGGTGCTTTCGGTCTCTGGTCGGAGAAGACGA
AGGTGGGAAGTGCGGTGAGTGGGGCGTTGGTGAGCACACTGATCGGTCTTGCAGCTAGTA
ACCTTGGGATCATTTCTTCAGACGCTCCTGCTTTTGCTGTTGTCTTGAACTTCCTCCTCC
CATTAGCTGTTCCTCTCTTGCTCTTCCGAGCTGATCTCCGCCGTGTCGTTCAGTCCACTG
GAAAGCTTCTCTTGGCTTTCTTGATTGGATCAATTGCAACAACTGTGGGTACAGCCCTGG
CCTACTACCTAGTGCCAATGAGAGCACTTGGTAATGATAGTTGGAAGATTGCAGCTGCTC
TCATGGGGAGGCATATCGGTGGAGCCGTCAACTATGTTGCCATAGCGAATGCTCTCGGAG
TTTCACCATCAGTATTAGCGGCTGGACTCGCTGCTGATAATGTTATTTGCGCTGTTTATT
TCACGTCTTTGTTCGCAATTGGCTCCAAAATACCTGCCGAAACCTTGCCTCCACCAACTA
GTGATGCAGATGCAAACAAAGATTCCGAATCTACAAACAAAATCCCTGTGCTACTGATAG
CTACTGGAATTGCTGTGTCATTAGCTATATGCAAGCAGGGCTTTGCTAACAAAGCATTTC
GGGATTCGGTGGTAGCTTGTCAGC

QA 2 745 2 745
DS 



CO CL1945Contig2 739 2 5 U
GCGTAAATACTCTGAATTTTATTGGTTTTTTTTATCTTGCAACCAAAATCGACATAACCG
AGATTGGATAAGAAAAGCAGAAAATCCAATTCATAATCTTAGTCATATTAGCAAGCATCT
TCACATGAACTTGAGGACCTTCACACCAAATGCAATCCCTATGAAAGTTGCAATGGCGAT
ACCGAATATTCCAGCAAGAATCCCTGGAACGATCAACGAGTTCCATCCCTTTGCAGTCGC
CATTCCAGCTGCAGTGGTGGGTCCACCGACGTCAGCATTTGATGCCAAAAGCAGCAACCT
TAGCTCGATGTTGAGCAGCTTCCCTATGCCCAATATCACAGCGAGATGTGTCCCAATTTG
GACCAATGCAAACAAGAATATGCTCGGTGCCGTGTTTATCACAATCCATATGTTTCCGCT
CGCACCTATCACAGTGAAGAACACCTGCATAAGAATTAGAGCCATGGCTTCTCCAGATGG
AGCAAGACGACCAAACTGTGAAGGAAAGATTGTGGCTAGAACAACAACCACGGCGGTTAT
AGCTGACAAGCTACCACCCGAAATCCCGAAATGCTTTGTTAGCAAAGCCCCTGCCTTGCA
TATAGCTAATGACACAGCAATTCCAGTAGCTATCAGTAGCACAGGGATTTTGTTTGTAGA
TTCAGAATCTTTGTTTGCATCTGCATCACTAGTTGGTGGAGGCAAGGTTTCGGCAGGTAT
TTTGGAGCCAATTGCGAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C447JQ U 13
AF RS1G582JQ U 1
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GAGCAGCTTCCCTATGCCCAATATCACAGCGAGATGTGTCCCAATTTGGACCAATGCAAA
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AGTGAAGAACACCTGCATAAGAATTAGAGCCATGGCTTCTCCAGATGGAGCAAGACGACC
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GTTTGCATCTGCATCACTAGT

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DS 

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AGATTGGCTAAGAAAAGCAGAAAATCCAATTCATAATCTTAGTCATATTAGCAAGCATCT
TCACATGAACTTGAGGACCTTCACACCAAATGCAATCCCTATGAAAGTTGCAATGGCGAT
ACCGAATATTCCAGCAAGAATCCCTGGAACGATCAACGAGTTCCATCCCTTTGCAGTCGC
CATTCCAGCTGCAGTGGTGGGTCCACCGACGTCAGCATTTGATGCCAAAAGCAGCAACCT
TAGCTCGATGTTGAGCAGCTTCCCTATGCCCAATATCACAGCGAGATGTGTCCCAATTTG
GACCAATGCAAACAAGAATATGCTCGGTGCCGTGTTTATCACAATCCATATGTTTCCGCT
CGCACCTATCACAGTGAAGAACACCTGCATAAGAATTAGAGCCATGGCTTCTCCAGATGG
AGCAAGACGACCAAACTGTGAAGGAAAGATTGTGGCTAGAACAACAACCACGGCGGTTAT
AGCTGACAAGCTACCACCCGAAATCCCGAAATGCTTTGTTAGCAAAGCCCCTGCCTTGCA
TATAGCTAATGACACAGCAATTCCAGTAGCTATCAGTAGCACAGGGATTTTGTTTGTAGA
TTCGGAATCTTTGTTTGCATCTGCATCACTAGTTGGTGGAGGCAAGGTTTCGGCAGGTAT
TTTGGAGCCAATTGCGAAC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

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GAAAAGTGTATAGGGGAAAAGATAGTATAACATGAAAGGGCACGTGAAAATGAAATCCAT
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CTTTTTAGCTGCTCATCAGTAGCTTCTTCGTTTAACTTTCAACTTTATAAACAGCTTACA
CTTTCGGAGGAATCTTCAGTTTCTGTGTTATCTGTTTAATCACCGGAAGCCTCTGACTGA
TGGGACCTGGGTCGCTATAGAATGCTAAATCAACTGGATATCCTTTCGCAAATAGAGACT
TAAATGTTGTTTCCCTCCAACAGCTTTCACGAAGAACTGTGGGTGTCTCCCCTTTGCCAA
AGACATAATGCATTCTCGTCTCCCTCAACCTCATAAGTACACCATCAACTCTAAGCCAAA
ATCGTAAGAGGAGAAACCATGAACTTGGCATGACTCTCACTTTCACAGTCAGAAGTGACA
CCCCATTGTCAGCCAGTTCATCTTCATACAAAACTACCTCATCATAGAAGATAATAGGTT
CTTTAAGTGAGAGAGCAGCCAAATCAATCTGCTCTTCACAGTTCTCCCACTTAAGACTAG
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BQ
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AF RS1EZ68JQ U 1
AF RS1FQ60JQ U 149
BS 1 349 RS1EZ68JQ
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RD RS1EZ68JQ 808 0 0
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CTTTTTAGCTGCTCATCAGTAGCTTCTTCGTTTAACTTTCAACTTTATAAACAGCTTACA
CTTTCGGAGGAATCTTCAGTTTCTGTGTTATCTGTTTAATCACCGGAAGTCTCTGACTGA
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TAAATGTTGTTTCCCTCCAACAGCTTTCACGAAGAACTGTGGGTGTCTCCCCTTTGCCAA
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CCCCATTGTCAGCCAGTTCATCTTCATACAAAACTACCTCATCATAGAAGATAATAGGTT
CTTTAAGTGAGAGAGCAGCCAAATCAATCTGCTCTTCACAGTTCTCCCACTTAAGACTAG
CATCCCCCTCAGGACTTGCTTTTCCCTCAGCCGTTTCTTGGTCTTTCTCAACAACTCCAC
TCCCACAGTAGG*CGTAGTAAAAGTATA

QA 1 808 1 808
DS 

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G
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CGAAGAACTGTGGGTGTCTCCCCTTTGCCAAAGACATAATGCATTCTCGTCTCCCTCAAC
CTCATAAGTACACCATCAACTCTAAGCCAAAATCGTAAGAGGAGAAACCATGAACTTGGC
ATGACTCTCACTTTCACAGTCAGAAGTGACACTCCATTGTCAGCCAGTTCATCTTCATAC
AAAACTACCTCATCATAGAAGATAATAGGTTCTTTAAGTGAGAGAGCAGCCAAATCAATC
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AATGAATCTTAGTGTTGCTCCTCAAGTGTTT

QA 2 812 2 812
DS 



AS 1 4

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GAAGTCAAACACTAAAATTAAAAGAAATGGCGGTAAAGAGATCTTCGAAAGTAACACAAA
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TTCAGCAAGCAGAGGAAGAGTTTGGTTTCCACCACGACATGGGAGGACTCACTATCCCTT
GTGAAGAAGTCGTTTTTCTCTCTCTAACATCCATGATCCGATGAGATGCAGAGAAAGTTT
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GAGTTCTTTGAAACTAAGAAATATTCAATCTTTGTAGTATGTTCTTTTTTCACGGATGTA
TAGTACGTTTTGAGTTGTGTGCGAGTGATGTATAAATTTAAGCTTC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D902JQ C 379
AF RS1D902TF U 373
AF RS1CR11TF U 1
AF RS1CR11JQ C 42
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DS 

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AAAATTCTTTCTTTTTGCCTTTGGATAATAATTTGTTATCCAAACGGTTTTTTTTTCCTG
GACTAATCAAAACCTGTAAGATCCACCTAAAAGATCATTCTCTAAGCGGATCATGTAAAT
CTCCGGGTTTTTAGCACGGTAATTCTCCCTAATGGGGTTAGTATTCGATGG

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DS 

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ACATTATGAACAAAGACTAAAATTCTTTCTTTTTGCCTTTGGATAATAATTTGTTATCCA
AATGGTTTTTTTTTCCTGGACTAATCAAAACCTGTAAGATCCACCTAAAAGATCATTCTC
TAAGCGGATCATGTAAATCTCCGGGTTTTTAGCACGGTAATTCTCCCTAATGGGGTTAGT
ATTCGATGGAACACATATGTTTTTTTTCTTTTCATTGAGCTGATAAGTGGTGGCTTGCGC
TAATCGATGATTACCGCAGTGTTGGCCGATTTTT

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DS 

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GATAAGTGGTGGCTTGCGCTAATCGATGATTACCGCAGTGTTGGCCGATTTTTTTAAGGT
TTGAATCTTGTGATCGTTCGAGTTCTTTGAAACTAAGAAATATTCAATCTTTGTAGTATG
TTCTTTTTTCACGGATGTATAGTACGTTTTGAGTTGTGTGCGAGTGATGTATAAATTTAA
GCTTC

QA 1 785 1 785
DS 



AS 2 4

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CCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 

AF RS1C647JQ C 1
AF RS1C647TF U 1
BS 1 663 RS1C647TF

RD RS1C647JQ 663 0 0
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CCG

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DS 

RD RS1C647TF 663 0 0
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GTACAATTCCACTGTCCACTTACCTCAGAACCTTCAAGGTCGGAGATTACGTCGATGTTA
AAGTGAACGGTGCGATCCACAAGGGTATGCCTCACAAGTTCTACCATGGTCGTACTGGTC
GCGTCTGGAACGTCACCAAACGTGCCGTTGGTGTCGAAGTCAACAAACAGATCGGAAACA
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TTTTCTTTGTAACTCGAACTAAGAATGCGATTTTATATGAGAATTTTGCAATCCAGTTTT
CCG

QA 1 663 1 663
DS 



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TCTTCTCTTTGGTGGACGCGACAAGTCTAAACCTTAAAACAGCCGACC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EX65TF C 1
AF RS1EX65JQ U 6
BS 1 5 RS1EX65TF
BS 6 648 RS1EX65JQ

RD RS1EX65TF 648 0 0
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TTCCAAAACACACAGCAAGAACAAGGAAGAAGAGTAAGAACTAATAGCCTCCTTTGAGAT
CGTTGACGACGTCGTAGGGGACTGGGGTGACTGTCTCCAAGGTCATACCTTCAACCATGA
ATCCTGGTTTGGGTCCTTTAGGCTGCCTCTTGGTGCTTACCGTCTCTCCTCTGGCTTTGG
CTGCAGCTTTGAGCTCATCGTTCTTCTTCTTTCTCAGTTTGAACTCCTCAGCACACCTAG
ACTGCTGCACGTGCTCCACACGCACATGAAGTCTCTTCTTTATGATCCTGTTTCCGATCT
GTTTGTTGACTTCGACACCAACGGCGCGTTTGGTGACGTTCCAGACGCGACCAGTACGAC
CATGGTAGAACTTGTGAGGCATGCCCTTGTGGATCGCACCGTTCACTTTAACATCGACGT
AATCGCCGACCTTGAAGGTTCTGAGGTAAGTGGACAATGGGATTGTACCCTTCTTCCTGA
ACCCCCTCGCGAACAGATCCCTCGTTCGAGCACGAACTCCATGTCCTGCCGGAATTTTTG
TCTTCTCTTTGGTGGACGCGACAAGTCTAAACCTTAAAACAGCCGACC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1EX65JQ 643 0 0
CTCATATAAAATCACATTCTTAGTTCAAGTCGCTACAAAAAATACATTTGCAGAGTTCCA
AAACACACAGCAAGAACAAGGAAGAAGAGTAAGAACTAATAGCCTCCTTTGAGATCGTTG
ACGACGTCGTAGGGGACTGGGGTGACTGTCTCCAAGGTCATACCTTCAACCATGAATCCT
GGTTTGGGTCCTTTAGGCTGCCTCTTGGTGCTTACCGTCTCTCCTCTGGCTTTGGCTGCA
GCTTTGAGCTCATCGTTCTTCTTCTTTCTCAGTTTGAACTCCTCAGCACACCTAGACTGC
TGCACGTGCTCCACACGCACATGAAGTCTCTTCTTTATGATCCTGTTTCCGATCTGTTTG
TTGACTTCGACACCAACGGCGCGTTTGGTGACGTTCCAAACGCGACCAGTACGACCATGG
TAGAACTTGTGAGGCATGCCCTTGTGGATCGCACCGTTCACTTTAACATCGACGTAATCG
CCGACCTTGAAGGTTCTGAGGTAAGTGGACAATGGGATTGTACCCTTCTTCCTGAACCCC
CTCGCGAACAGATCCCTCGTTCGAGCACGAACTCCATGTCCTGCCGGAATTTTTGTCTTC
TCTTTGGTGGACGCGACAAGTCTAAACCTTAAAACAGCCGACC

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 4

CO CL1949Contig1 878 4 4 U
GGGCACACAACAAACAGAATGTTCGCTGTTTCGTTAGTACCTCGTACGACAACGTGCCGT
TTAACCTCTGCGTTTCTTTGCCACCTCTCGATTCCCTCTCCCTCACCACGGCCCCACCAT
CTCCACTACCAGCAGCAGCCACATCTTCCGTCTCTCTCTTCTTCTCAGTTTCAGATTCGT
TCGTTCAGAAAACAGATCGACATGGCAGCTCCTCCAGTGATGAAGCAAAAGACAGGGGGA
GGTTCGTACGAGGAAGCGTTGGCTGCTTTGTCTTCTTTGATAACGAAGCGAAGTCGTGCT
GATAAGAGCAATAAAGGAGATCGTTTCGAGCTTGCCTTTGATTATCTTAAGCTACTCGAT
CTGGAAGAAGACATGTTAAAGATGAAAGTTATCCATGTCGCTGGTACCAAAGGCAAGGGA
TCCACATGTGCCTTTACTGAGTCTATTTTACTTCACTGCCAATGGCAATAAAATGGTTAA
GGGATAGTGTCCATGAGAGTAGCTCAGGCACACGTTTGCAGGTTCTTGTAACTGGTTCGT
TACACCTTGTAGGCGATGTACTGAGATTAATCAGAAAATGAAGGTAAAACAAAACACATT
GTCATCATTATTCAAATCACACACTAAATCACCGAAGCCACAGCCGGAAGAAGGTGGCCT
TTGTTATGAACTCTTTATCTGTATTATTTCGATTTTTACTTTTCCACATATAGATTTTCT
TTCAAAGGAACAGATTCACAAGTGCTAGCTTGATTTATTTCTTTCAAAAATGAAAATCAG
TTGAACCAGGGGGCCCCTGTTCAGTATCATGAGATTAGGGTGAAAACACAAACAATCATA
TGCTAAACGTATTGAAATAAAAATTTGTTTCAATGTAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1E281TF U 1
AF RS1C494TF U 1
AF RS1C494JQ C 153
AF RS1E281JQ C 286
BS 1 653 RS1C494TF
BS 654 654 RS1C494JQ
BS 655 699 RS1C494TF
BS 700 878 RS1C494JQ

RD RS1E281TF 643 0 0
GGGCACACAACAAACAGAATGTTCGCTGTTTCGTTAGTACCTCGTACGACAACGTGCCGT
TTAACCTCTGCGTTTCTTTGCCACCTCTCGATTCCCTCTCCCTCACCACGGCCCCACCAT
CTCCACTACCAGCAGCAGCCACATCTTCCGTCTCTCTCTTCTTCTCAGTTTCAGATTCGT
TCGTTCAGAAAACAGATCGACATGGCAGCTCCTCCAGTGATGAAGCAAAAGACAGGGGGA
GGTTCGTACGAGGAAGCGTTGGCTGCTTTGTCTTCTTTGATAACGAAGCGAAGTCGTGCT
GATAAGAGCAATAAAGGAGATCGTTTCGAGCTTGCCTTTGATTATCTTAAGCTACTCGAT
CTGGAAGAAGACATGTTAAAGATGAAAGTTATCCATGTCGCTGGTACCAAAGGCAAGGGA
TCCACATGTGCCTTTACTGAGTCTATTTTACTTCACTGCCAATGGCAATAAAATGGTTAA
GGGATAGTGTCCATGAGAGTAGCTCAGGCACACGTTTGCAGGTTCTTGTAACTGGTTCGT
TACACCTTGTAGGCGATGTACTGAGATTAATCAGAAAATGAAAGTAAAACAAAACACATT
GTCATCATTATTCAAATCACACACTAAATCACCGAAGCCACAG

QA 1 643 1 643
DS 

RD RS1C494TF 699 0 0
GGGCACACAACAAACAGAATGTTCGCTGTTTCGTTAGTACCTCGTACGACAACGTGCCGT
TTAACCTCTGCGTTTCTTTGCCACCTCTCGATTCCCTCTCCCTCACCACGGCCCCACCAT
CTCCACTACCAGCAGCAGCCACATCTTCCGTCTCTCTCTTCTTCTCAGTTTCAGATTCGT
TCGTTCAGAAAACAGATCGACATGGCAGCTCCTCCAGTGATGAAGCAAAAGACAGGGGGA
GGTTCGTACGAGGAAGCGTTGGCTGCTTTGTCTTCTTTGATAACGAAGCGAAGTCGTGCT
GATAAGAGCAATAAAGGAGATCGTTTCGAGCTTGCCTTTGATTATCTTAAGCTACTCGAT
CTGGAAGAAGACATGTTAAAGATGAAAGTTATCCATGTCGCTGGTACCAAAGGCAAGGGA
TCCACATGTGCCTTTACTGAGTCTATTTTACTTCACTGCCAATGGCAATAAAATGGTTAA
GGGATAGTGTCCATGAGAGTAGCTCAGGCACACGTTTGCAGGTTCTTGTAACTGGTTCGT
TACACCTTGTAGGCGATGTACTGAGATTAATCAGAAAATGAAGGTAAAACAAAACACATT
GTCATCATTATTCAAATCACACACTAAATCACCGAAGCCACAGCCGGAAGAAG*TGGCCT
TTGTTATGAACTCTTTATCTGTATTATTTCGATTTTTAC

QA 1 699 1 699
DS 

RD RS1C494JQ 726 0 0
TCTCTCTTCTTCTCAGTTTCAGATTCGTTCGTTCAGAAAACAGATCGACATGGCAGCTCC
TCCAGTGATGAAGCAAAAGACAGGGGGAGGTTCGTACGAGGAAGCGTTGGCTGCTTTGTC
TTCTTTGATAACGAAGCGAAGTCGTGCTGATAAGAGCAATAAAGGAGATCGTTTCGAGCT
TGCCTTTGATTATCTTAAGCTACTCGATCTGGAAGAAGACATGTTAAAGATGAAAGTTAT
CCATGTCGCTGGTACCAAAGGCAAGGGATCCACATGTGCCTTTACTGAGTCTATTTTACT
TCACTGCCAATGGCAATAAAATGGTTAAGGGATAGTGTCCATGAGAGTAGCTCAGGCACA
CGTTTGCAGGTTCTTGTAACTGGTTCGTTACACCTTGTAGGCGATGTACTGAGATTAATC
AGAAAATGAAGGTAAAACAAAACACATTGTCATCATTATTCAAATCACACACTAAATCAC
CGAAGCCACAGCCGGAAGAAGGTGGCCTTTGTTATGAACTCTTTATCTGTATTATTTCGA
TTTTTACTTTTCCACATATAGATTTTCTTTCAAAGGAACAGATTCACAAGTGCTAGCTTG
ATTTATTTCTTTCAAAAATGAAAATCAGTTGAACCAGGGGGCCCCTGTTCAGTATCATGA
GATTAGGGTGAAAACACAAACAATCATATGCTAAACGTATTGAAATAAAAATTTGTTTCA
ATGTAT

QA 1 726 1 726
DS 

RD RS1E281JQ 593 0 0
AAGCGAAGTCGTGCTGATAAGAGCAATAAAGGAGATCGTTTCGAGCTTGCCTTTGATTAT
CTTAAGCTACTCGATCTGGAAGAAGACATGTTAAAGATGAAAGTTATCCATGTCGCTGGT
ACCAAAGGCAAGGGATCCACATGTGCCTTTACTGAGTCTATTTTACTTCACTGCCAATGG
CAATAAAATGGTTAAGGGATAGTGTCCATGAGAGTAGCTCAGGCACACGTTTGCAGGTTC
TTGTAACTGGTTCGTTACACCTTGTAGGCGATGTACTGAGATTAATCAGAAAATGAAGGT
AAAACAAAACACATTGTCATCATTATTCAAATCACACACTAAATCACCGAAGCCACAGCC
GGAAGAAGGTGGCCTTTGTTATGAACTCTTTATCTGTATTATTTCGATTTTTACTTTTCC
ACATATAGATTTTCTTTCAAAGGAACAGATTCACAAGTGCTAGCTTGATTTATTTCTTTC
AAAAATGAAAATCAGTTGAACCAGGGGGCCCCTGTTCAGTATCATGAGATTAGGGTGAAA
ACACAAACAATCATATGCTAAACGTATTGAAATAAAAATTTGTTTCAATGTAT

QA 1 593 1 593
DS 



AS 1 4

CO CL1950Contig1 699 4 3 U
GGGCGCCTTTCAGAGTCAAATTCCCAATTCAAAAAAAAAAAAAAAGAGAGGCGGAAGGGA
AAAAACATGAGCCTCGAATCGGTGAAGCAGTATCTGGAAGGAGTGAAGAATGACGAGGAA
AAGGAATCGAAAGTGGCGAATTTGCCACAGAGATTCATCGAGAGATTCGTGACGAAAGGT
ATTAAAGTAGATCTCATCGAACCCGGTCGAATCATCTGCTCCATCAAAGTCCAACCTCAC
CTCCTGAACGCAGGCAATTCCTTACACGGAGGAGCAACGGCGACTCTGGTTGACTTGATA
GGATCGGCTGTGATTTACACAACCGGACTTTCGAGCTCCGGAGTGTCGGTGGAGATCAAT
GTTTCTTACCTCGATGCTGCTTTACTTGACGAAGAGATAGAGATTGAGTCAAAGGCTTTG
CGTGTGGGTAAAGCTGTAGCAGTTGTGAGTGTTGAGCTGAGGAAGAAGAAGAATGGTAAG
CTTATTGCTCAAGGTCGCCATACTAAGTACCTTGCTCCTCGTACCAAGCTTTGATTCTTA
TTCGTTACTAGTCTCATTTTCAACTCAAACAAATATGAATCGGTTTGTCTTATCTCATCA
TGTGTTTGTGTTAATCACATTAAACTATGTTGAACGAGTTAAAAACGATATGTATGTCTA
CACTTTAAACATAAACAATTCGAAACTATTATCACCGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RS1G817TF U 1
AF RS1FK06JQ C 61
AF RS1G817JQ C 227
AF RS1FK06TF U 61
BS 1 642 RS1G817TF
BS 643 694 RS1FK06TF
BS 695 699 RS1FK06JQ

RD RS1G817TF 642 0 0
GGGCGCCTTTCAGAGTCAAATTCCCAATTCAAAAAAAAAAAAAAAGAGAGGCGGAAGGGA
AAAAACATGAGCCTCGAATCGGTGAAGCAGTATCTGGAAGGAGTGAAGAATGACGAGGAA
AAGGAATCGAAAGTGGCGAATTTGCCACAGAGATTCATCGAGAGATTCGTGACGAAAGGT
ATTAAAGTAGATCTCATCGAACCCGGTCGAATCATCTGCTCCATCAAAGTCCAACCTCAC
CTCCTGAACGCAGGCAATTCCTTACACGGAGGAGCAACGGCGACTCTGGTTGACTTGATA
GGATCGGCTGTGATTTACACAACCGGACTTTCGAGCTCCGGAGTGTCGGTGGAGATCAAT
GTTTCTTACCTCGATGCTGCTTTACTTGACGAAGAGATAGAGATTGAGTCAAAGGCTTTG
CGTGTGGGTAAAGCTGTAGCAGTTGTGAGTGTTGAGCTGAGGAAGAAGAAGAATGGTAAG
CTTATTGCTCAAGGTCGCCATACTAAGTACCTTGCTCCTCGTACCAAGCTTTGATTCTTA
TTCGTTACTAGTCTCATTTTCAACTCAAACAAATATGAATCGGTTTGTCTTATCTCATCA
TGTGTTTGTGTTAATCACATTAAACTATGTTGAACGAGTTAA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RS1FK06JQ 639 0 0
AAAAACATGAGCCTCGAATCGGTGAAGCAGTATCTGGAAGGAGTGAAGAATGACGAGGAA
AAGGAATCGAAAGTGGCGAATTTGCCACAGAGATTCATCGAGAGATTCGTGACGAAAGGT
ATTAAAGTAGATCTCATCGAACCCGGTCGAATCATCTGCTCCATCAAAGTCCAACCTCAC
CTCCTGAACGCAGGCAATTCCTTACACGGAGGAGCAACGGCGACTCTGGTTGACTTGATA
GGATCGGCTGTGATTTACACAACCGGACTTTCGAGCTCCGGAGTGTCGGTGGAGATCAAT
GTTTCTTACCTCGATGCTGCTTTACTTGACGAAGAGATAGAGATTGAGTCAAAGGCTTTG
CGTGTGGGTAAAGCTGTAGCAGTTGTGAGTGTTGAGCTGAGGAAGAAGAAGAATGGTAAG
CTTATTGCTCAAGGTCGCCATACTAAGTACCTTGCTCCTCGTACCAAGCTTTGATTCTTA
TTCGTTACTAGTCTCATTTTCAACTCAAACAAATATGAATCGGTTTGTCTTATCTCATCA
TGTGTTTGTGTTAATCACATTAAACTATGTTGAACGAGTTAAAAACGATATGTATGTCTA
CACTTTAAACATAAACAATTCGAAACTATTATCACCGGC

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DS 

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TGGTTGACTTGATAGGATCGGCTGTGATTTACACAACCGGACTTTCGAGCTCCGGAGTGT
CGGTGGAGATCAATGTTTCTTACCTCGATGCTGCTTTACTTGACGAAGAGATAGAGATTG
AGTCAAAGGCTTTGCGTGTGGGTAAAGCTGTAGCAGTTGTGAGTGTTGAGCTGAGGAAGA
AGAAGAATGGTAAGCTTATTGCTCAAGGTCGCCATACTAAGTACCTTGCTCCTCGTACCA
AGCTTTGATTCTTATTCGTTACTAGTCTCATTTTCAACTCAAACAAATATGAATCGGTTT
GTCTTATCTCATCATGTGTTTGTGTTAATCACATTAAACTATGTTGAACGAGTTAAAAAC
GATATGTATGTCTACACTTTAAACATAAACAATTCGAAACTATTATCA
T

QA 1 468 1 468
DS 

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AAGGAATCGAAAGTGGCGAATTTGCCACAGAGATTCATCGAGAGATTCGTGACGAAAGGT
ATTAAAGTAGATCTCATCGAACCCGGTCGAATCATCTGCTCCATCAAAGTCCAACCTCAC
CTCCTGAACGCAGGCAATTCCTTACACGGAGGAGCAACGGCGACTCTGGTTGACTTGATA
GGATCGGCTGTGATTTACACAACCGGACTTTCGAGCTCCGGAGTGTCGGTGGAGATCAAT
GTTTCTTACCTCGATGCTGCTTTACTTGACGAAGAGATAGAGATTGAGTCAAAGGCTTTG
CGTGTGGGTAAAGCTGTAGCAGTTGTGAGTGTTGAGCTGAGGAAGAAGAAGAATGGTAAG
CTTATTGCTCAAGGTCGCCATACTAAGTACCTTGCTCCTCGTACCAAGCTTTGATTCTTA
TTCGTTACTAGTCTCATTTTCAACTCAAACAAATATGAATCGGTTTGTCTTATCTCATCA
TGTGTTTGTGTTAATCACATTAAACTATGTTGAACGAGTTAAAAACGATATGTATGTCTA
CACTTTAAACATAAACAATTCGAAACTATTATCA
CCGGC

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DS 



AS 1 4

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CAATGTCCTAATCTAATCTCTATATTGACTTTCTTGTTCTTTTTGTCTGAAACCTGAAAA
AAAAGCTTCTTCTTCTTCAAGGGCCTCTCATCTTTTCAACAATCTGTCTACTTCTTTCCT
CCATATGACGCTTCTTCTCTTCAAACTTCTCCCCAACTTTCTTCCTAAAATCAAACATCC
TCTCCCTTGTTCCCATTTTCTTTCCCTTGAAGCTCGTATCAACCTCTTCATTTGTTGCCG
CAATAAACCTCGACTGTGGCTGGACACTAACCGGAACAATCTCCCCGTCGTTGCCTCCTC
CTCCTCCTCCTGCTACTATTTCCTGCTTGTCGCTGCTTTCCAAAAGCGGAGTTTTGAGTT
CTTCCAAGGATTTGTCACTTTCTACTGTAAGAGCTGCTGAGCTAGCTGGTGGTTGTGCAG
CCACAGGTTCTTCCTCAACTCTTGGTTTCTGTGGACCGTTGGTAGTTTTCTTCGTTTGTT
CAGCTTTAGCTTTCCCTTCTGCAGCTTCGAAGCTGCTGTCGTGATCACTAGTTGAGTCTT
GAT*CAGCCACATGAACGGCGCGACACTGCGTTGGACCCAATCATCCTTTTCAGCTATCA
TCCACGGAATGGTTACGCTTTCGCAGTTAGGGAGCACCATGACCTCTCGTATCCCGGTCT
TAAACCGGTTGATCAAGAACATAGCAACGTGGCTGTTTGTGATTTTGTGTTCACCAACAG
ATGAGACAAGGTTAAACTCAATCTCGGGCATGCTTGTGAATCCAAACCATAGTTGATCAG
ATGGAGGTGGCTTCATGTGTACACGCAGTGTCCCTCGAAGTGAAGAGACTCCTATTGACA
AAGTAATTGGAACCTGAGAGACTTGCTCAGCGATGTTCTTCAGAATAGACTTCCACTTAG
ATCCATTGTTTGGAGCTGCCTTTGTACCTTCTGATCCCTTTGGTTCATCAGCTTTATCGC
TTCCTCCAGATTTGACATCTTGTGCATCAACGGTTCCTCCAGGGACACTTAACTGCTTCT
CAAAATCTGCAAGACCTTCAAGGAGATGTGGTGGAACATCCCCTGAAGCATTTGGCTACA
GTTTTCCTTCAGCTATGCCTTTCTGCAGATCTTCCTCTCGAGCATCAACCCGAGTCTCAA
CTATAAGTCCCGCACCACCGGTGTATTCAACATCTAGCTCGAACGCCCACACGCCATTCA
TCTCCATTGGAAGAATCCTTGTACCATGTATATAAGGCGGGAGACTCCCAATCTTTACAT
CACAGCAGATTAAATCGCCTACGTAGCTGGGACGTCTCATGTTAGACAACACCCGCTGTA
TTCGTTC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1DN12JQ U 1
AF RS1DI33JQ U 5
AF RS1DN12TF C 501
AF RS1DI33TF C 576
BS 1 16 RS1DN12JQ
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BS 605 737 RS1DI33JQ
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BS 992 1248 RS1DN12TF
BS 1249 1387 RS1DI33TF

RD RS1DN12JQ 269 0 0
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CAATGTCCTAATCTAATCTCTATATTGACTTTCTTGTTCTTTTTGTCTGAAACCTGAAAA
AAAAGCTTCTTCTTCTTCAAGGGCCTCTCATCTTTTCAACAATCTGTCTACTTCTTTCCT
CCATATGACGCTTCTTCTCTTCAAACTTCTCCCCAACTTTCTTCCTAAAATCAAACATCC
TCTCCCTTGTTCCCATTTTCTTTCCCTTG

QA 1 269 1 269
DS 

RD RS1DI33JQ 733 0 0
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GTCCTAATCTAATCTCTATATTGACTTTCTTGTTCTTTTTGTCTGAAACCTGAAAAAAAA
GCTTCTTCTTCTTCAAGGTCCTCTCATCTTTTCAACAATCTGTCTACTTCTTTCCTCCAT
ATGACGCTTCTTCTCTTCAAACTTCTCCCCAACTTTCTTCCTAAAATCAAACATCCTCTC
CTTTGTTCCCATTTTCTTTCCCTTGAAGCTCGTATCAACCTCTTCATTTGTTGCCGCAAT
AAACCTCGACTGTGGCTGGACACTAACCGGAACAATCTCCCCGTCGTTGCCTCCTCCTCC
TCCTCCTGCTACTATTTCCTGCTTGTCGCTGCTTTCCAAAAGCGGAGTTTTGAGTTCTTC
CAAGGATTTGTCACTTTCTACTGTAAGAGCTGCTGAGCTAGCTGGTGGTTGTGCAGCCAC
AGGTTCTTCCTCAACTCTTGGTTTCTGTGGACCGTTGGTAGTTTTCTTCGTTTGTTCAGC
TTTAGCTTTCCCTTCTGCAGCTTCGAAGCTGCTGTCGTGATCACTAGTTGAGTCTTGATT
CAGCCACATGAACGGCGCGACACTGCGTTGGACCCAATCATCCTTTTCAGCTATCATCCA
CGGAATGGTTACGCTTTCGCAGTTAGGGAGCACCATGACCTCTCGTATCCCGGTCTTAAA
CCGGTTGATCAAG

QA 1 733 1 733
DS 

RD RS1DN12TF 749 0 0
CTTGGTTTCTGTGGACCGTTGGTAGTTTTCTTCGTTTGTTCAGCTTTAGCTTTCC*TTCT
GCAGCTTCGAAGCTGCTGTCGTGATCACTAGTTGAGTCTTGAT*CAGCCACATGAACGGC
GCGACACTGCGTTGGACCCAATCATCATTTTCAGCTATCATCCACGGAATGGTTACGCTT
TCGCAGTTAGGGAGCACCATGACCTCTCGTATCCCGGTCTTAAACCGGTTGATCAAGAAC
ATAGCAACGTGGCTGTTTGTGATTTTGTGTTCACCAACAGATGAGACAAGGTTAAACTCA
ATCTCGGGCATGCTTGTGAATCCAAACCATAGTTGATCAGATGGAGGTGGCTTCATGTGT
ACACGCAGTGTCCCTCGAAGTGAAGAGACTCCTATTGACAAAGTAATTGGAACCTGAGAG
ACTTGCTCAGCGATGTTCTTCAGAATAGACTTCCACTTAGATCCATTGTTTGGAGCTGCC
TTTGTACCTTTTGATCCCTTTGGTTCATCAGCTTTATCGCTTCCTCCAGATTTGACATCT
TGTGCATCAACGGTTCCTCCAGGGACACTTAACTGCTTCTCAAAATCTGCAAGACCTTCA
AGGAGATGTGGTGGAACATCCCCTGAAGCATTTGGCTACAGTTTTCCTTCAGCTATGCCT
TTCTGCAGATCTTCCTCTCGAGCATCAACCCGAGTCTCAACTATAAGTCCCGCACCACCG
GTGTATTCAACATCTAGCTCGAACGCCC
C

QA 1 748 1 748
DS 

RD RS1DI33TF 812 0 0
CTGTCGTGATCACTAGT*GAGTCTTGAT*CAGCCACATGAACGGCGCGACACTGCGT*GG
ACCCAATCATCCTTTTCAGCTATCATCCACGGAATGGTTACGCTTTCGCAGTTAGGGAGC
ACCATGACCTCTCGTATCCCGGTCTTAAACCGGTTGATCAAGAACATAGCAACGTGGCTG
TTTGTGATTTTGTGTTCACCAACAGATGAGACAAGGTTGAACTCAATCTCGGGCATGCTT
GTGAATCCAAACCATAGTTGATCAGATGGAGGTGGCTTCGTGTGTACACGCAGTGTCCCT
CGAAGTGAAGAGACTCCTATTGACAAAGTAATTGGAACCTGAGAGACTTGCTCAGCGATG
TTCTTCAGAATAGACTTCCACTTAGATCCATTGTTTGGAGCTGCCTTTGTACCTTCTGAT
CCCTTTGGTTCATCAGCTTTATCGCTTCCTCCAGATTTGACATCTTGTGCATCAACGGTT
CCTCCAGGGACACTTAACTGCTTCTCAAAATCTGCAAGACCTTCAAGGAGATGTGGTGGA
ACATCCCCTGAAGCATTTGGCTGCAGTTTTCCTTCAGCTATGCCTTTCTGCAGATCTTCC
TCTCGAGCATCAACCCGAGTCTCAACTATAAGTCCCGCACCACCGGTGTATTCAACATCT
AGCTCGAACGCCCACACGCCATTCATCTCCATTGGAAGAATCCTTGTACCATGTATATAA
GGCGGGAGACTCCCAATCTTTACATCACAGCAGATTAAATCGCCTACGTAGCTGGGACGT
CTCATGTTAGACAACACCCGCTGTATTCGTTC

QA 1 812 1 812
DS 



AS 1 4

CO CL1952Contig1 651 4 2 U
GCATCTCCAGCGACCCTGTTTCGGCATTCCCCGACGACCCTGTTGCCGCATTCTCCAGCT
TCTCCAGTGAATTGTTCGCCTCCTCCGCTGAATATAAGTCACACGTCTCTCTCAGCTTGT
CCGGAGATTTCCATCGACGAGCCTGCTTTTCCAGCGGTTCACCACCATCGCAACTCAACT
CCGACAATTACTTTGCCATTGAACTCAGATCAAGTTACTCCACCTTGAACTCTGATTCTT
CCTCCGATTACACCACCATTGACTGCACTTCTTCTGTTTTCTTCTTGAGCTCAAAACTCA
GAGAGATTCATGATTCTCTCTCAAGTTTTCATCTTCTCTCGAGCTATCACCATGATCCTG
TGATATCAATGCTCAAGAGCCTCCAGCCTCAGACTCATCTCTCTTGATAAGTTGCAAACA
GAGCTAGTGCACTGGCTTGTCTTCTCTCTACAGCTTGTCCGGTGAAAGCCTTCACCACCT
CCCCTGTTTTTAAGACGTTTCCTTATGTAATCTCCTCCAGTGACCCTCTTGGTCAGACCA
TCACCACATACCTCCGTCGGTATCCATTGGCGACTCTGCCTCATTTTTTTTT*CTTCACA
GCTCCCACAGCTCCACCTTGAACATGGAATCATCTCTGCAGCCTTGTACGC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DP27JQ U 1
AF RS1DP27TF C 1
AF RS1G778JQ U 1
AF RS1GP11JQ U 1
BS 1 628 RS1DP27JQ
BS 629 651 RS1G778JQ

RD RS1DP27JQ 629 0 0
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CCGGAGATTTCCATCGACGAGCCTGCTTTTCCAGCGGTTCACCACCATCGCAACTCAACT
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CCTCCGATTACACCACCATTGACTGCACTTCTTCTGTTTTCTTCTTGAGCTCAAAACTCA
GAGAGATTCATGATTCTCTCTCAAGTTTTCATCTTCTCTCGAGCTATCACCATGATCCTG
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GAGCTAGTGCACTGGCTTGTCTTCTCTCTACAGCTTGTCCGGTGAAAGCCTTCACCACCT
CCCCTGTTTTTAAGACGTTTCCTTATGTAATCTCCTCCAGTGACCCTCTTGGTCAGACCA
TCACCACATACCTCCGTCGGTATCCATTGGCGACTCTGCCTCATTTTTTTTT*CTTCACA
GCTCCCACAGCTCCACCTTGAACATGGA
C

QA 1 628 1 628
DS 

RD RS1DP27TF 629 0 0
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TCTCCAGTGAATTGTTCGCCTCCTCCGCTGAATATAAGTCACACGTCTCTCTCAGCTTGT
CCGGAGATTTCCATCGACGAGCCTGCTTTTCCAGCGGTTCACCACCATCGCAACTCAACT
CCGACAATTACTTTGCCATTGAACTCAGATCAAGTTACTCCACCTTGAACTCTGATTCTT
CCTCCGATTACACCACCATTGACTGCACTTCTTCTGTTTTCTTCTTGAGCTCAAAACTCA
GAGAGATTCATGATTCTCTCTCAAGTTTTCATCTTCTCTCGAGCTATCACCATGATCCTG
TGATATCAATGCTCAAGAGCCTCCAGCCTCAGACTCATCTCTCTTGATAAGTTGCAAACA
GAGCTAGTGCACTGGCTTGTCTTCTCTCTACAGCTTGTCCGGTGAAAGCCTTCACCACCT
CCCCTGTTTTTAAGACGTTTCCTTATGTAATCTCCTCCAGTGACCCTCTTGGTCAGACCA
TCACCACATACCTCCGTCGGTATCCATTGGCGACTCTGCCTCATTTTTTTTT*CTTCACA
GCTCCCACAGCTCCACCTTGAACATGGA
C

QA 1 628 1 628
DS 

RD RS1G778JQ 651 0 0
GCATCTCCAGCGACCCTGTTTCGGCATTCCCCGACGACCCTGTTGCCGCATTCTCCAGCT
TCTCCAGTGAATTGTTCGCCTCCTCCGCTGAATATAAGTCACACGTCTCTCTCAGCTTGT
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CCTCCGATTACACCACCATTGACTGCACTTCTTCTGTTTTCTTCTTGAGCTCAAAACTCA
GAGAGATTCTTGATTCTCTCTCAAGTTTTCATCTTCTCTCGAGCTATCACCATGATCCTG
TGATATCAATGCTCAAGAGCCTCCAGCCTCAGACTCATCTCTCTTGATAAGTTGCAAACA
GAGCTAGTGCACTGGCTTGTCTTCTCTCTACAGCTTGTCCGGTGAAAGCCTTCACCACCT
CCCCTGTTCTTAAGACGTTTCCTTATGTAATCTCCTCCAGTGACCCTCTTGGTCAGACCA
TCACCACATACCTCCGTCGGTATCCATTGGCGACTCTGCCTCATTTTTTTTTTCTTCACA
GCTCCCACAGCTCCACCTTGAACATGGAATCATCTCTGCAGCCTTGTACGC

QA 1 651 1 651
DS 

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TCTCCAGTGAATTGTTCGCCTCCTCCGCTGAATATAAGTCACACGTCTCTCTCAGCTTGT
CCGGAGATTTCCATCGACGAGCCTGCTTTTCCAGCGGTTCACCACCATCGCAACTCAACT
CCGACAATTACTTTGCCATTGAACTCAGATCAAGTTACTCCACCTTGAACTCTGATTCTT
CCTCCGATTACACCACCATTGACTGCACTTCTTCTGTTTTCTTCTTGAGCTCAAAACTCA
GAGAGATTCTTGATTCTCTCTCAAGTTTTCATCTTCTCTCGAGCTATCACCATGATCCTG
TGATATCAATGCTCAAGAGCCTCCAGCCTCAGACTCATCTCTCTTGATAAGTTGCAAACA
GAGCTAGTGCACTGGCTTGTCTTCTCTCTACAGCTTGTCCGGTGAAAGCCTTCACCACCT
CCCCTGTTCTTAAGACGTTTCCTTATGTAATCTCCTCCAGTGACCCTCTTGGTCAGACCA
TCACCACATACCTCCGTCGGTATCCATTGGCGACTCTGCCTCATTTTTTTTTTCTTCACA
GCTCCCACAGCTCCACCTTGAACATGGAATCATCTCTGC

QA 1 639 1 639
DS 



AS 2 4

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GTAACAGACCAAGAAAGTTTCAACAACGTCAAGCAATGGCTAAATGAAATCGACCGCTAC
GCCAGTGAGAATGTGAACAAGCTACTTGTTGGCAACAAAAACGATCTCACTTCACAGAAA
GTTGTCTCCACTGAAACTGCCAAGGCTTTCGCAGATGAACTTGGGATCCCATTCCTGGAA
ACAAGTGCCAAGAATGCTACCAATGTAGAAGAAGCTTTCATGGCCATGACTGCTGCAATC
AAGACAAGAATGGCGATTCAACCTGCAGGAGGGGCCAAGCCAGCAACGGTCCAGATCCGA
GGACAACCAGTAAACCGACAATCAGGCTGCTGCTCTTCTTAATTCGCTCTGTGAAAAACT
TATTAACCATATGTTATCTCCTTCGTATGCATATGTAAGACATCTGAACATCGGTCTTCT
TTCATCTGGTCTTCTTTGGTTTTTCAGTTTATGTCCAAAATTTTATAAATTCTTTGTAAT
CTACTTGCAATAATAAACTTCTCAGTAAAAGTTTTCATTCATACC


BQ
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AF RS1DA81TF U 1
AF RS1DA81JQ C 1
BS 1 2 RS1DA81JQ
BS 3 353 RS1DA81TF
BS 354 585 RS1DA81JQ

RD RS1DA81TF 353 0 0
GG
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AAGTGCCAAGAATGCTACCAATGTAGAAGAAGCTTTCATGGCCATGACTGCTGCAATCAA
GACAAGAATGGCGATTCAACCTGCAGGAGGGGCCAAGCCAGCAACGGTCCA

QA 3 353 3 353
DS 

RD RS1DA81JQ 585 0 0
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GTAACAGACCAAGAAAGTTTCAACAACGTCAAGCAATGGCTAAATGAAATCGACCGCTAC
GCCAGTGAGAATGTGAACAAGCTACTTGTTGGCAACAAAAACGATCTCACTTCACAGAAA
GTTGTCTCCACTGAAACTGCCAAGGCTTTCGCAGATGAACTTGGGATCCCATTCCTGGAA
ACAAGTGCCAAGAATGCTACCAATGTAGAAGAAGCTTTCATGGCCATGACTGCTGCAATC
AAGACAAGAATGGCGATTCAACCTGCAGGAGGGGCCAAGCCAGCAACGGTCCAGATCCGA
GGACAACCAGTAAACCGACAATCAGGCTGCTGCTCTTCTTAATTCGCTCTGTGAAAAACT
TATTAACCATATGTTATCTCCTTCGTATGCATATGTAAGACATCTGAACATCGGTCTTCT
TTCATCTGGTCTTCTTTGGTTTTTCAGTTTATGTCCAAAATTTTATAAATTCTTTGTAAT
CTACTTGCAATAATAAACTTCTCAGTAAAAGTTTTCATTCATACC

QA 1 585 1 585
DS 



CO CL1953Contig2 896 2 2 U
GGATCGTTTACGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGAGTCGCGCTCCTCCTCACCGACGAAGAT
CGCGGCCGTATTCTCTATTCACAACTAGCGGTAGTTTTCGAGATCAACCATGAATCCTGA
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GCTTCTTAGGTTTGCTGATGATTCCTACCTGGATAGCTACATCAGCACCATTGGTGTTGA
CTTTAAAATCCGCACAGTTGAACAAGATGGAAAGACCATCAAACTCCAGATTTGGGATAC
GGCTGGTCAAGAACGTTTCAGAACCATCACTAGCAGTTACTACAGAGGAGCTCACGGCAT
CATTGTGACTTATGATGTAACAGACCAAGAAAGTTTCAACAATGTCAAGCAATGGCAAAA
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TCTCACTTCACAGAAAGTTGTCTCCACTGAAACTGCCAAGGCTTTCGCTGATGAACTTGG
GATCCCATTCCTGGAAACAAGTGCCAAGAATGCTACCAATGTAGAAGAAGCTTTCATGGC
CATGACTGCTGCAATCAAGACAAGAATGGCGAGTCAACCTGCAGGAGGGGCCAAGCCAGC
AACGGTCCAGATCCGAGGACAACCAGTTAACCAACAATCAGGCTGTTGCTCTTCTTAATT
CGCTCTGTGAAACACTTATTAACCAACCATATGTCATATGTTATCTCCTTCGTATGCATG
TAAGACATCTGAACATCGTTTTTCTTTCATCTGGTCTTTGGTTTTTCAGTTTATGTCCAA
AAATTTATAAATTCTTTGTAATGTTACTTGCAATAATAAACTTCTTAGTAAAAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DY32TF U 1
AF RS1DY32JQ C 205
BS 1 644 RS1DY32TF
BS 645 896 RS1DY32JQ

RD RS1DY32TF 654 0 0
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CGCGGCCGTATTCTCTATTCACAACTAGCGGTAGTTTTCGAGATCAACCATGAATCCTGA
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GCTTCTTAGGTTTGCTGATGATTCCTACCTGGATAGCTACATCAGCACCATTGGTGTTGA
CTTTAAAATCCGCACAGTTGAACAAGATGGAAAGACCATCAAACTCCAGATTTGGGATAC
GGCTGGTCAAGAACGTTTCAGAACCATCACTAGCAGTTACTACAGAGGAGCTCACGGCAT
CATTGTGACTTATGATGTAACAGACCAAGAAAGTTTCAACAATGTCAAGCAATGGCAAAA
TGAAATCGACCGCTACGCCAGTGAGAATGTGAACAAGCTACTCGTTGGCAACAAAAACGA
TCTCACTTCACAGAAAGTTGTCTCCACTGAAACTGCCAAGGCTTTCGCTGATGAACTTGG
GATCCCATTCCTGGAAACAAGTGCCAAGAATGCTACCAATGTAGAAGAAGCTTTCATGGC
CATGACTGCTGCAATCAAGACAAGAATGGCGAGTCAACCTGCAG
AGGGCCAAGC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1DY32JQ 692 0 0
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AGATGGAAAGACCATCAAACTCCAGATTTGGGATACGGCTGGTCAAGAACGTTTCAGAAC
CATCACTAGCAGTTACTACAGAGGAGCTCACGGCATCATTGTGACTTATGATGTAACAGA
CCAAGAAAGTTTCAACAATGTCAAGCAATGGCAAAATGAAATCGACCGCTACGCCAGTGA
GAATGTGAACAAGCTACTCGTTGGCAACAAAAACGATCTCACTTCACAGAAAGTTGTCTC
CACTGAAACTGCCAAGGCTTTCGCTGATGAACTTGGGATCCCATTCCTGGAAACAAGTGC
CAAGAATGCTACCAATGTAGAAGAAGCTTTCATGGCCATGACTGCTGCAATCAAGACAAG
AATGGCGAGTCAACCTGCAGGAGGGGCCAAGCCAGCAACGGTCCAGATCCGAGGACAACC
AGTTAACCAACAATCAGGCTGTTGCTCTTCTTAATTCGCTCTGTGAAACACTTATTAACC
AACCATATGTCATATGTTATCTCCTTCGTATGCATGTAAGACATCTGAACATCGTTTTTC
TTTCATCTGGTCTTTGGTTTTTCAGTTTATGTCCAAAAATTTATAAATTCTTTGTAATGT
TACTTGCAATAATAAACTTCTTAGTAAAAGTC

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 4

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GGATCGCTCTGCCTCTAACCCTAATACGCTTCATCGAGAAAACAGAGGTTGTCTCATTCC
GATGACCTCTGCGACTTGAAACGGTCTGAGTAATGGCTCCGTTTAGATGTGTCTTCAAAG
CGTTGTTTAGATCTGAGAGGCGATGTGATTTCAGTATAAATATATGTGAGATCCCTCACC
TTGAACTCATCTCTTATTCAAGGATGCTCCCATGAATGTTCGTCTCCTACTTCGTGGTGG
GTGACTCCACGAACAGAATCTCTCCTTCCTCTGATTACGCCTCCATCTCCTCCGGTCACC
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GTCACTGGCACGACGTCTTCCGGTCAGCCATCTTTTTTGATCCACCTCATATGCTTAGGA
TTCGCGCTCGCGGTGCTTGGACTCAACAAGGCTTCTTGGAGAATCACAAAGGCCTCACCG
AGGACTACTTGCCACTCTACGCTGTTGCGGGCGGCATTTGTGTCTTTATCGGTTGGGTCT
GGTCGTTGCTTCTCGGCTCTTACGCCAATGAGATGATGAAAGTGTCGGTTCACATCTTGA
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GCGTGTTCGCTGTTGGAGCTCTGTTGCAGTTTCTGTATGTTATCTCAGGTGTAGATAGGT
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AA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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10 10 

AF RS1BS05TF U 1
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AF RS1G389TF U 118
AF RS1BS05JQ C 38
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RD RS1BS05TF 748 0 0
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AGGACTACTTGCCACTCTACGCTGTTGCGGGTGGCATTTGTGTCTTTATCGGTTGGGTCT
GGTCGTTGCTTCTCGGCTCTTACGCCAATGAGATGATGAAAGTGTCGGTTCACATCTTGA
CCACCTACTTAGCCGTGGTTAGCATGCTGTGTTTCTGGTGCAG*CAGTTCTTTTGGGGCG
GCGTGTTCGCTGTTGGAGCTCTGTTGCAGTTTCTGTATGTTATCTCAG*TGTAGATAG*T
GCATAG*AGAGTTGTA*TATGTCTGA
CC

QA 1 746 1 746
DS 

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G
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GGGTGACTCCACGAACAGAATCTCTCCTTCCTCTGATTACGCCTCCATCTCCTCCGGTCA
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CCGTCACTGGCACGACGTCTTCCGGTCAGCCATCTTTTTTGATCCACCTCATATGCTTAG
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CTGGTCGTTGCTTCTCGGCTCTTACGCCAATGAGATGATGAAAGTGTCGGTTCACATCTT
GACCACCTACTTAGCCGTGGTTAGCATGCTGTGTTTCTGGTGCAGGCAGTTCTTTTGGGG
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DS 

RD RS1G389TF 658 0 0
G
AGCGTTGTTTAGATCTGAGAGGCGATGTGATTTCAGTATAAATATATGTGAGATCCCTCA
CCTTGAACTCATCTCTTATTCAAGGATGCTCCCATGAATGTTCGTCTCCTACTTCGTGGT
GGGTGACTCCACGAACAGAATCTCTCCTTCCTCTGATTACGCCTCCATCTCCTCCGGTCA
CCAGTCTCTTCAGAAGAGTCGAAAGAGCGGAGATGCCAACCGAGCCATCGTCCGCGGGTC
CCGTCACTGGCACGACGTCTTCCGGTCAGCCATCTTTTTTGATCCACCTCATATGCTTAG
GATTCGCGCTCGCGGTGCTTGGACTCAACAAGGCTTCTTGGAGAATCACAAAGGCCTCAC
CGAGGACTACTTGCCACTCTACGCTGTTGTGGGCGGCATTTGTGTCTTTATCGGTTGGGT
CTGGTCGTTGCTTCTCGGCTCTTACGCCAATGAGATGATGAAAGTGTCGGTTCACATCTT
GACCACCTACTTAGCCGTGGTTAGCATGCTGTGTTTCTGGTGCAGGCAGTTCTTTTGGGG
CGGCGTGTTCGCTGTTGGAGCTCTGTTGCAGTTTTTGTATGTTATCTCAGGTGTAGATAG
GTGCATAGGAGAGTTGTAATATGTCTGAACCGTTATGGTTATTTAGTAATGTTTATT

QA 2 658 2 658
DS 

RD RS1BS05JQ 745 0 0
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AAATATATGTGAGATCCCTCACCTTGAACTCATCTCTTATTCAAGGATGCTCCCATGAAT
GTTCGTCTCCTACTTCGTGGTGGGTGACTCCACGAACAGAATCTCTCCTTCCTCTGATTA
CGCCTCCATCTCCTCCGGTCACCAGTCTCTTCAGAAGAGTCGAAAGAGCGGAGATGCCAA
CCGAGCCATCGTCCGCGGGTCCCGTCACTGGCACGACGTCTTCCGGTCAGCCATCTTTTT
TGATCCACCTCATATGCTTAGGATTCGCGCTCGCGGTGCTTGGACTCAACAAGGCTTCTT
GGAGAATCACAAAGGCCTCACCGAGGACTACTTGCCACTCTACGCTGTTGCGGGTGGCAT
TTGTGTCTTTATCGGTTGGGTCTGGTCGTTGCTTCTCGGCTCTTACGCCAATGAGATGAT
GAAAGTGTCGGTTCACATCTTGACCCCCTACTTAGCCGTGGTTAGCATGCTGTGTTTCTG
GTGCAGGCAGTTCTTTTGGGGCGGCGTGTTCGCTGTTGGAGCTCTGTTGCAGTTTCTGTA
TGTTATCTCAGGTGTAGATAGGTGCATAGGAGAGTTGTAATATGTCTGAACCGTTATGGT
TATTTAGTAATGTTTATTGTTTCAA

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 4

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TCTCGGAGAGCAGCAAGAACGCACTCAAATGGGCCATCGAGAACTTAGCTGACAAAGGAG
ACACACTTTACATCATCCACACGTTACCTACCCCTGATGCTGAATCTCGCAACGCCCTCT
GGCTCGAATCCGGTTCTCCTCTCATACCGTTGGATGAGTTTAGGGAACCGAAGATCATGG
AGAACTACGGTGTCAAGATCGACATCGCATGTCTTGACATGCTCGACACTGGTTCAAGGA
AGAAAGAGGTTCATGTCGTGACAAAACTATACTGGGGTGATGCAAGAGAGAAGCTGGTTG
ATGCTGTTAAAGAACTCAAACTGGATTCTATTGTCATGGGAAGCAGAGGACTCAGTGCCC
TTCAAAGAATAATAATGGGAAGCGTGAGCAGCTTTGTGATCGACCACGCGCCTTGCCCTG
TCACCATTGTCAAGGATGACTAGAAAGAAATGTCTTCTTCGCGCGTATAATCTACCAAAA
ATAATGTCGCAGTTTATGTTTTTAATAAAGAACTTTTTTTCTTGCTTGTGTTTGTTCTAT
TTGAAATATTGACACATAATTTTCGCTTATGTGCGCTGAGATAATATTGAGAGGTGGCCT
A


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1C066TF U 467
AF RS1G181JQ C 278
AF RS1B315TF U 5
AF RS1C920TF U 1
BS 1 212 RS1C920TF
BS 213 213 RS1B315TF
BS 214 294 RS1C920TF
BS 295 295 RS1B315TF
BS 296 721 RS1C920TF

RD RS1C066TF 180 0 0
G
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GCGCCTTGCCCTGTCACCATTGTCAAGGATGACTAGAAAGAAATGTCTTCTTCGCGCGTA
TAATCTACCAAAAATAATGTCGCAGTTTATGTTTTTAATAAAGAACTTTTTTTCTTG
CT

QA 2 178 2 178
DS 

RD RS1G181JQ 411 0 0
A
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ATGCTCGACACTGGTTCAAGGAAGAAAGAGGTGCATGTAGTGACAAAACTATACTGGGGT
GATGCAAGAGAGAAGCTGGTTGATGCTGTTAAAGAACTCAAACTGGATTCTATTGTCATG
GGAAGCAGAGGACTCAGTGCCCTTCAAAGAATAATAATGGGAAGCGTGAGCAGCTTTGTG
ATCGACCACGCGCCTTGCCCTGTCACCATTGTCAAGGACAACTAGAAAGAAATGTCTTCA
TCGCGCGTATAATCTACCAAAAATAATGTCGCAGTTTATGTTTTCAATAAAGAACTTTTT
TTCTTGCTTCTGTTTGTTCTATTTGAAATATCGACACCTAATTTTCG
CTT

QA 2 408 2 408
DS 

RD RS1B315TF 681 0 0
G
CTCACAACTCTTCACCATCTCTCTCTGTAAAAATCTAAACAAAACTCATTTCAAGTTCGA
TCAAGAAAACCAAGAACGATGCCTAAAGACAGGAAGATCGGAATCGCCATGGATTTCTCG
GAGAGCAGCAAGAACGCACTCAAATGGGCCATCGAGAACTTAGCTGACAAAGGAGACACA
CTTTACATCATCCACACGTTACCTACCCCTGATGCTGAATCTCGCAACGCCCTCTGGCTC
GAATCCGGTTCTCCTCTCATACCGTTGGATGAGTTTAGGGAACCGAAGATCATGGAGAAC
TACGGTGTCAAGATCGACATCGCATGTCTTGACATGCTCGACACTGGTTCAAGGAAGAAA
GAGGTTCATGTCGTGACAAAACTATACTGGGGTGATGCAAGAGAGAAGCGGGTTGATGCT
GTTAAAGAACTCAAACTGGATTCTATTGTCATGGGAAGCAGAGGACTCAGTGCCCTTCAA
AGAATAATAATGGGAAGCGTGAGCAGCTTTGTGATCGACCACGCGCCTTGCCCTGTCACC
ATTGTCAAGGATGACTAGAAAGAAATGTCTTCTTCGCGCGTATAATCTACCAAAA*TAAT
GTCGCAGTTTATGTTTTTAATAAAGAACTTTTTTTCTTGTTTGTGTTTGTTCTATTTGAA
ATATTGACACATAATTTTCG

QA 2 681 2 681
DS 

RD RS1C920TF 721 0 0
GGATTCTCACAACTCTTCACCATCTCTCTCTGTAAAAATCTAAACAAAACTCATTTCAAG
TTCGATCAAGAAAACCAAGAACGATGCCTAAAGACAGGAAGATCGGAATCGCCATGGATT
TCTCGGAGAGCAGCAAGAACGCACTCAAATGGGCCATCGAGAACTTAGCTGACAAAGGAG
ACACACTTTACATCATCCACACGTTACCTACCTCTGATGCTGAATCTCGCAACGCCCTCT
GGCTCGAATCCGGTTCTCCTCTCATACCGTTGGATGAGTTTAGGGAACCGAAGACCATGG
AGAACTACGGTGTCAAGATCGACATCGCATGTCTTGACATGCTCGACACTGGTTCAAGGA
AGAAAGAGGTTCATGTCGTGACAAAACTATACTGGGGTGATGCAAGAGAGAAGCTGGTTG
ATGCTGTTAAAGAACTCAAACTGGATTCTATTGTCATGGGAAGCAGAGGACTCAGTGCCC
TTCAAAGAATAATAATGGGAAGCGTGAGCAGCTTTGTGATCGACCACGCGCCTTGCCCTG
TCACCATTGTCAAGGATGACTAGAAAGAAATGTCTTCTTCGCGCGTATAATCTACCAAAA
ATAATGTCGCAGTTTATGTTTTTAATAAAGAACTTTTTTTCTTGCTTGTGTTTGTTCTAT
TTGAAATATTGACACATAATTTTCGCTTATGTGCGCTGAGATAATATTGAGAGGTGGCCT
A

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 4

CO CL1956Contig1 1055 4 16 U
GGACAACACAATTACACAAAACATGGCTCTCACAAAATTATCCTTAGTCCTTTTCCTCTG
CCTCTTAGGTCTATACTCTGAAACCGTCAAGTCTCAAAACTGCGGTTGCGCCCCAAACCT
GTGTTGCAGTCAGTTCGGTTACTGCGGTTCCACCGACGCTTATTGTGGTACTGGGTGCCG
ATCAGGCCCTTGCAGAAGCCCTGGTGGAACCCCTCCCGCTGGTGGTGGATCAGTTGGTAG
CATTGTGACACAAGCTTTCTTTAACGGTATTATCAACCAAGCCGGTGGTGGTTGCGCCGG
AAAGAATTTCTACACCCGTGATTCTTTCGTTAACGCCGCAAATACCTTCCCCAACTTTGC
CAATTCCGTTACAAGACGTGAAATTGCAACCATGTTTGCTCATTTCACCCACGAGACTGG
ACATTTCTGCTACATAGAAGAAATAAACGGAGCTCCACGTGACTACTGCGACGAAAACAA
CAGGCAGTACCCATGTGCACCGGGCAAAGGCTACTTCGGTCGTGGTCCAATCCAACTATC
ATGGAACTACAACTACGGAGCTTGTGGCCAGAGTCTTAACCTCAACCTCTTAGGCCAGCC
CGAGCTAGTGAGTAGCAACCCAACTGTCGCTTTCAGGACGGGTTTGTGGTTTTGGATGAA
TAGCGTGAGACCAGTACTAAACCAAGGGTTTGGAGCCACCATTAGAGCCATCAATGGAAT
GGAATGTAACGGTGGGAACTCAGGTGCGGTCAATGCAAGGATTAGGTACTATAGAGACTA
TTGTGGACAGCTTGGTGTGGACCCTGGTCCTAACCTTAGCTGCTAAAAATTTATTCGAAA
CAAGCACGCACACATGACGTGGGTAGTGATGGAGAAAGTTGAAGTTATGAAATAATAAAT
GAGATAATAAAGTTAGATTTCATCTATGCTCTTGGGTTGGGTTTTAGTGTTTCCTGCGTC
ACAAGCAATAAGTAGTCGTAATAATCTTGTGAAAATGATTTTTTTATAAATGTACTATGA
AGTGAATGCAACATTAATAAATGCCTAAGAAAGAT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1GG74TF U 2
AF RS1B188TF U 1
AF RS1B188JQ C 489
AF RS1GG74JQ C 607
BS 1 26 RS1B188TF
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BS 71 71 RS1GG74TF
BS 72 246 RS1B188TF
BS 247 247 RS1GG74TF
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BS 346 346 RS1GG74TF
BS 347 454 RS1B188TF
BS 455 455 RS1GG74TF
BS 456 636 RS1B188TF
BS 637 637 RS1B188JQ
BS 638 643 RS1B188TF
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BS 645 682 RS1B188TF
BS 683 1055 RS1B188JQ

RD RS1GG74TF 559 0 0
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CTCTTAGGTCTATACTCTGAAACCGTCAAGTCTCAAAACTGCGGTTGCGCCCCAAACCTG
TGTTGCAGTCAGTTCGGTTACTGCGGTTCCACCGACGCTTATTGTGGTACTGGGTGCCGA
TCAGGCCCTTGCAGAAGCCCTGGTGGAACCCCTCCCGCTGGTGGTGGATCCGTTGGTAGC
ATTGTGACACAAGCTTTCTTTAACGGTATTATCAACCAAGCCGGTGGTGGTTGCGCCGGA
AAGAATTTCTACACCCGTGATTCTTTCGTTAACGCCGCAAATACCTTCCCCAACTTTGCC
AATTCCGTTACAAGACGTGAAATTGCAACCATGTTTGCTCATTTCACCCACGAGACTGGA
CATTTCTGCTACATAGAAGAAATAAATGGAGCTCCACGTGACTACTGCGACGAAAACAAC
AGGCAGTACCCATGTGCACCGGGCAAAGGCTACTTCGGTCGTGGTCCAATTCAACTATCA
TGGAACTACAACTACGGAG

QA 1 559 1 559
DS 

RD RS1B188TF 682 0 0
GGACAACACAATTACACAAAACATGGTTCTCACAAAATTATCCTTAGTCCTTTTCCTCTG
CCTCTTAGGTTTATACTCTGAAACCGTCAAGTCTCAAAACTGCGGTTGCGCCCCAAACCT
GTGTTGCAGTCAGTTCGGTTACTGCGGTTCCACCGACGCTTATTGTGGTACTGGGTGCCG
ATCAGGCCCTTGCAGAAGCCCTGGTGGAACCCCTCCCGCTGGTGGTGGATCAGTTGGTAG
CATTGTTACACAAGCTTTCTTTAACGGTATTATCAACCAAGCCGGTGGTGGTTGCGCCGG
AAAGAATTTCTACACCCGTGATTCTTTCGTTAACGCCGCAAATACTTTCCCCAACTTTGC
CAATTCCGTTACAAGACGTGAAATTGCAACCATGTTTGCTCATTTCACCCACGAGACTGG
ACATTTCTGCTACATAGAAGAAATAAACGGAGCTTCACGTGACTACTGCGACGAAAACAA
CAGGCAGTACCCATGTGCACCGGGCAAAGGCTACTTCGGTCGTGGTCCAATCCAACTATC
ATGGAACTACAACTACGGAGCTTGTGGCCAGAGTCTTAACCTCAACCTCTTAGGCCAGCC
CGAGCTAGTGAGTAGCAACCCAACTGTCGCTTTCAG*ACGGGTCTGTGGTTTTGGATGAA
TAGCGTGAGACCAGTACTAAAC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1B188JQ 567 0 0
ACCCATGTGCACCGGGCAAAGGCTACTTCGGTCGTGGTCCAATCCAACTATCATGGAACT
ACAACTACGGAGCTTGTGGCCAGAGTTTTAACCTCAACCTTTTAGGCCAGCCCGAGCTAG
TGAGTAGCAACCCAACTGTCGCTTTCAGGACGGGTTTGTGGTTTTGGATGAATAGCGTGA
GACCAGTACTAAACCAAGGGTTTGGAGCCACCATTAGAGCCATCAATGGAATGGAATGTA
ACGGTGGGAACTCAGGTGCGGTCAATGCAAGGATTAGGTACTATAGAGACTATTGTGGAC
AGCTTGGTGTGGACCCTGGTCCTAACCTTAGCTGCTAAAAATTTATTCGAAACAAGCACG
CACACATGACGTGGGTAGTGATGGAGAAAGTTGAAGTTATGAAATAATAAATGAGATAAT
AAAGTTAGATTTCATCTATGCTCTTGGGTTGGGTTTTAGTGTTTCCTGCGTCACAAGCAA
TAAGTAGTCGTAATAATCTTGTGAAAATGATTTTTTTATAAATGTACTATGAAGTGAATG
CAACATTAATAAATGCCTAAGAAAGAT

QA 1 567 1 567
DS 

RD RS1GG74JQ 429 0 0
AGTGAGTAGCAACCCAACTGTCGCTTTCAGGACGGGTTTGTGGTTTTGGATGAATAGCGT
GAGACCAGTATTAAACCAAGGGTTTGGAGCCCCCATTAGAGCCATCAATGGAATGGAATG
TAACGGTGGGAACTCAGGTGCGGTCAATGCAAGGATTAGGTACTATAGAGACTATTGTGG
ACAGCTTGGTGTGGACCCTGGTCCTAACCTTAGCTGCTAAAAATTTATTCGAAACAAGCA
CGCACACATGACGTGGGTAGTGATGGGGAATGTTGAAGTTATGAAATAATAAATGAGATA
ATAAAGTTAGATTTCATTTATGCTCTTGGGTTGGGTTTTAGTGTTTCCTGGGTCACAAGC
AATAAGTAGTTGTAATAATTTTGTGAAAATGATTTTTTTATAAATGTACTATGAAGTGAA
TGCAACATT

QA 1 429 1 429
DS 



AS 1 4

CO CL1957Contig1 655 4 2 U
TTTTTTTTCGACTCGATTTGGTTCGTTTTGAATTATATAATAAAACCCTTAGACATATTA
GACAGGGAAAACAAAAGGACCCTTCAAACATAACAGACCTTGGAAGGTTTTTTAGGATAC
TACTACTTGACAATGCAGTTTGTCTACTTAGAAACTTATTACAACATTAAAACATCCGAA
GAAAACGGCAGGAGAAAGACAGACTTAAACATGGTGAGTCTTGTCCGAGTCCTCGAGACT
TGTGGGACGAAACCAAGCAGTCTCCTCCAACACCGACGAGTCTTGGCGAGCAGCCTCTGC
TGCTGCACTCTGATCAGTCGTGGAAGGACCAAAGACTCCGGTTTGAGGATGAGGAGACCA
GTATTTATCAAAATCTGGCTTTATGACGTCATCAGGAACTGCAGTTGCCTGCAATTCATC
CTCCACGTTCTTGTCATAAGCTGAGGAATGCCCACTCCGTGAAGTGAAGAGAGCAGTGTA
GGTGGCGCGTGAGGAAGCGCGTGGGATGACAGCGAGCTTCCTTAGGCCGGCGATCAATTG
AAAGCTCTTCGATCTGGTTGCCATACAATACAACTCAGTTTCTTCGTCAGAGAGTAGCAG
AGAAGAGAGATTTTCTTTCTTTCTTTACTTCTTTGGTTGTTGTAATAGTGAGTCC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

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AF RS1FH88JQ U 9
AF RS1FN11JQ U 9
AF RS1FH88TF C 53
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BS 9 655 RS1FH88JQ

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TCC

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DS 



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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A635JQ U 7
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AF RS1CT59TF C 138
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GAGAGAAAG
ACATAGT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RS1CT59TF 675 0 0
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TTTTGTGGGAAAATGATGAATCAAACCTGTTGGTAGAGAGAAAGGACATAGTTACGGTAT
TGCATCC

QA 9 675 9 675
DS 



AS 1 4

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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RS1GO69JQ U 1
AF RS1GO69TF C 1
AF RS1E237JQ U 32
AF RS1E237TF C 32
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GTTATTTATTTCTTTAAGAATCACAAGGCTTCATCTTCGTCATTCTTTGGCAACAACATG
GTCTGTTTCAGACGCAAAATCGTGTTTTATTTTGCGGGTAAGTTGGTATATGCCTGTTGC
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DS 

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TCATAGTAAAAGTTTTAATCGTTGACATGATGATTTCTTGGAATAATCACAAGAAGACGA
GTTATTTATTTCTTTAAGAATCACAAGGCTTCATCTTCGTCATTCTTTGGCAACAACATG
GTCTGTTTCAGACGCAAAATCGTGTTTTATTTTGCGGGTAAGTTGGTATATGCCTGTTGC
TGCCATAGCAAGACTAACACTAAAGAGATTCCAGTTTTTTTGGAGTGATTACAGTGCTGT
AACGTGACCAGATGAGTCCAGTGCCTGTGATCACCATTTGCTGCGGGTATGAAAGTGTGT
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CCCAGAAATGAATTGTCTTAGGTCCTGCTGGATGATTCCAGAGAGCTTGAAGCTTCGTCG
CTGACATTTGATTTTCTCTGTGGGTTCCTCAACGTTCTCTCC

QA 1 522 1 522
DS 

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TTGCGGGTAAGTTGGTATATGCCTGTTGCTGCCATAGCAAGACTAACACTAAAGAGATTC
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ACGTTCTCTCCC

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DS 

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GATTTCTTGGAATAATCACAAGAAAACGAGTTATTTATTTCTTTAAGAATCACAAGGCTT
CATCTTCGTCATTCTTTGGCAACAACATGGTCTGTTTCAGATGCAAAATCGTGTTTTATT
TTGCGGGTAAGTTGGTATATGCCTGTTGCTGCCATAGCAAGACTAACACTAAAGAGATTC
CAGTTTTTT*GGAGTGATTACAGTGCTGTAACGTGACCAGATGAGTCCAGTGCCTGTGAT
CACCATTTGCTGCGGGTATGAAAGTGTGTCTGGAGGTTTCTTAAAATCTGCAATGTTAGC
AATGCTTATACCCCACTTGAACGTTGGCGCCCAGAAATGAATTGTCTTAGGTCCTGCTGG
ATGATTCCAGAGAGCTTGAAGCTTCGTCGCTGACATTTGATTTTCTCTGTAGGTTCCTCA
ACGTTCTCTCC
C

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DS 



AS 1 4

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GGTGGTTTCTCTTACATTTTCTTGCAGTGTTATGGGAGCCTTAATATTGGGTTGCCTTCT
GCTTCAAGCATCAAACTCTAACGCCCAGTTAAGGCCTAACTTCTATTCCACAACATGTCC
GCGTGTTTTCGATATCATTGGGAATATCATCGGCCGTGAATTGGGCTCTGATCCTCGTAT
TACCGCTAGCCTCATTCGCCTTCACTTCCATGACTGTTTCGTTAATGGCTGTGATGCCTC
GATCCTGCTCGACAATTCTACATCGTTCAGGACTGAGAAAGATGCTCTTCCAAACGCAAA
TTCGGCTAGAGGATTTAACGTCATAGATAGAATGAAAACCCAGATTGAGAGAGCTTGCCC
AAGAACAGTGTCTTGTGCAGATATTCTCACTATAGCTTCTCAAGTATCAGTCGTTTTGTC
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TGAGGCTAATAACCTTCCTTCTCCATTTGCCACTCTTGATGAACTTAAAGCAAATTTTTC
TTCCGTTGGTCTAGACCGCACCTCAGATCTAGTCGCTCTTTCTGGTGCCCACACATTTGG
AAGAGCACAATGTCAACTTGTAACACCGCGTCTCTACAATTTCAACAATACCAATGGCCC
AGACCCGAGTCTTGACACAACCTACCTCACTCAACTGCGTGCATTGTGCCCTGAAAACGG
AGACGGCACCGTTCTTGCCAACTTCGACCCCGTGACTCCAAATACTTTCGATAACCAATA
CTACACCAATCTTCGTAACGGGAGAGGTCTAATTCAGAGTGATCAAGAACTGTTTTCGAC
TCCTCAAGCCGACACAATTTCACTAGTGGAGCAATACAGCAGCAACAGGTCCGTATTCTT
TAGAGCATTCATTGAAGCAATGATTCGGATGGGAGATCTTAAACCTTTGACTGGAAACCA
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ATGCATCGGGAAATGATATATGTATTTCGACTAAATAAATGTTCTCACGAGTTATGAATG
AGATAGTTATGAAATTTGGTCTTGATTTAATACTATTAATTCTTGGTTGATTCTTGTGTG
TGTGTTTTAGCAAAATTTCCACTTGTATCGAATGGTATTGTTGTAGAGAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E764TF U 6
AF RS1AO22TFB U 1
AF RS1E764JQ C 380
AF RS1AO22JQ C 562
BS 1 775 RS1AO22TFB
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BS 1052 1052 RS1AO22JQ
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BS 1172 1227 RS1E764JQ
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BS 1243 1251 RS1E764JQ
BS 1252 1312 RS1AO22JQ

RD RS1E764TF 537 0 0
G
ACCATCATCCACACTCACCACTCAAAACCAGCTCTTGTCTCGCTCCTGGAAAATGGTGGT
TTCTCTTACATTTTCTTGCAGTGTTATGGGAGCCTTAATATTGGGTTGCCTTCTGCTTCA
AGCATCAAACTCTAACGCTCAGTTAAGGCCTAACTTCTATTCCACAACATGTCCGCGTGT
TTTCGATATCATTGGGAATATCATCGGCCGTGAATTGGGCTCTGATCCTCGTATTACCGC
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GCTCGACAATTCTACATCGTTCGGGACTGAGAAAGATGCTCTTCCAAACGCAAATTCGGC
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AGTGTCTTGTGCAGATATTCTCACTATAGCTTCTCAAGTATCAGTCGTTTTGTCAGGAGG
TCCAAGTTGGTCGGTTCCGTTGGGGAGGAGAGATGGCTTACAAGCTTTCTTCGCTG

QA 2 537 2 537
DS 

RD RS1AO22TFB 775 0 0
GAATTCACCATCATCCACACTCACCACTCAAAACCAGCTCTTGTCCCGCTCCTGGAAAAT
GGTGGTTTCTCTTACATTTTCTTGCAGTGTTATGGGAGCCTTAATATTGGGTTGCCTTCT
GCTTCAAGCATCAAACTCTAACGCCCAGTTAAGGCCTAACTTCTATTCCACAACATGTCC
GCGTGTTTTCGATATCATTGGGAATATCATCGGCCGTGAATTGGGCTCTGATCCTCGTAT
TACCGCTAGCCTCATTCGCCTTCACTTCCATGACTGTTTCGTTAATGGCTGTGATGCCTC
GATCCTGCTCGACAATTCTACATCGTTCAGGACTGAGAAAGATGCTCTTCCAAACGCAAA
TTCGGCTAGAGGATTTAACGTCATAGATAGAATGAAAACCCAGATTGAGAGAGCTTGCCC
AAGAACAGTGTCTTGTGCAGATATTCTCACTATAGCTTCTCAAGTATCAGTCGTTTTGTC
AGGAGGTCCAAGTTGGTCGGTTCCGTTGGGGAGGAGAGATGGCTTACAAGCTTTCTTCGC
TGAGGCTAATAACCTTCCTTCTCCATTTGCCACTCTTGATGAACTTAAAGCAAATTTTTC
TTCCGTTGGTCTAGACCGCACCTCAGATCTAGTCGCTCTTTCTGGTGCCCACACATTTGG
AAGAGCACAATGTCAACTTGTAACACCGCGTCTCTACAATTTCAACAATACCAATGGCCC
AGACCCGAGTCTTGACACAACCTACCTCACTCAACTGCGTGCATTGTGCCCTGAA

QA 1 775 1 775
DS 

RD RS1E764JQ 873 0 0
ACGTCATAGATAAATG
AAACCCAGATTGAGAGAGCT*GCCCAAGAACAGTGTCTTGTGCAGATATTCTCACTATAG
CTTCTCAAGTATCAGTCGTTTTGTCAGGAGGTCCAAGTTGGTCGGTTCCGTTGGGGAGGA
GAGATGGCTTACAAGCTTTCTTCGCTGAGGCTAATAACCTTCCTTCTCCATTTGCCACTC
TTGATGAACTTAAAGCAAATTTTTCTTCCGTTGGTCTAGACCGCACCTCAGATCTAGTCG
CTCTTTCTGGTGCCCACACATTTGGAAGAGCACAATGTCAACTTGTAACACCGCGTCTCT
ACAATTTCAACAATACCAATGGCCCAGACCCGAGTCTTGACACAACCTACCTCACTCAAC
TGCGTGCATTGTGCCCTGAAAACGGAGACGGCACCGTTCTTGCCAACTTCGACCCCGTGA
CTCCAAATACTTTCGATAACCAATACTACACCAATCTTCGTAACGGGAGAGGTCTAATTC
AGAGTGATCAAGAACTGTTTTCGACTCCTCAAGCCGACACAATTTCACTAGTGGAGCAAT
ACAGCAGCAACAGGTCCGTATTCTTTAGAGCATTCATTGAAGCAATGATTCGGATGGGAG
ATCTTAAACCTTTGACTGGAAACCAAGGGGAGATAAGACTGAATTGTAGGGTTGTGGACT
CAAGGAGGAGTGTGGAGAATGAGGATGATGGTGTTGTGAGTTCGATTTGATCATGTCGGG
ATATGGATATGTAAGAAAGCATAAAATGCATCGGGAAATGATATATGTATTTCGATTAAA
TAAATGTTCTCACGAGTTATGAATGAGATAGTTATGAAATTTGGTCTTGATT*AATACTA
TTAATTTTTGGTTGAT
C

QA 17 872 17 872
DS 

RD RS1AO22JQ 751 0 0
TCCATTTGCCACTCTTGATGAACTTAAAGCAAATTTTTCTTCCGTTGGTCTAGACCGCAC
CTCAGATCTAGTCGCTCTTTCTGGTGCCCACACATTTGGAAGAGCACAATGTCAACTTGT
AACACCGCGTCTCTACAATTTCAACAATACCAATGGCCCAGACCCGAGTCTTGACACAAC
CTACCTCACTCAACTGCGTGCATTGTGCCCTGAAAACGGAGACGGCACCGTTCTTGCCAA
CTTCGACCCCGTGACTCCAAATACTTTCGATAACCAATACTACACCAATCTTCGTAACGG
GAGAGGTCTAATTCAGAGTGATCAAGAACTGTTTTCGACTCCTCAAGCCGACACAATTTC
ACTAGTGGAGCAATACAGCAGCAACAGGTCCGTATTCTTTAGAGCATTCGTTGAAGCAAT
GATTCGGATGGGAGATTTTAAACCTTTGACTGGAAACCAAGGGGAGATAAGACTGAATTG
TAGGGTTGTGAACTCAAGGAGGGGTGTGGGGAATGAGGATGATGGTGTTGTGAGTTCGAT
TTGATCATGTCGGGATATGGATATGTAAGAAAGCATAAAATGCGTCGGGAAATGATATAT
GTATTTCGACTAAATAAATGTTCTCACGAGTTATGAATGAGATAGTTATGAAATTTGGTC
TTGATTTAATACTATTAATTCTTGGTTGATTCTTGTGTGTGTGTTTTAGCAAAATTTCCA
CTTGTATCGAATGGTATTGTTGTAGAGAGTT

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

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GGGAGGCGTCCAGGGAGCTTTCATCGGTGGTCTCATGGGTACTCTCTCCCCTGAGATGCC
TCCTCAGACTGGCGTGGACCCTCAGGCCATGGCGTCGTTGCAGCAAACTCAGGCTCTTGT
GGGTGGGCCCTTGGTCCAAGCTCGGAACTTTGCTGCTATTACTGGTGTTAATGCTGGTAT
TGCTTGTGTTATGAAACGTATTAGAGGCAAAGAGGATCTTGAGTCTGCTGTGGTTGCGGC
GTTTGGATCTGGAGTGGCATATTCTCTGGTGAGCGCAGGGTTACAAGGACAGCCTATGAA
TGCAATCACCACTGCTGCTGGTTTCTCTCTTTTTCAAGGAATTTTTTTCAAGTTAGGGGA
AAGGTTCTCTAAACCAAGCGTTGAAGATCCATACTATGCTCGGGCGAGATCCATGCTGCT
GAAACTGGGTCTAGAGAAGTATGAGAAGAACTTCAAGAAGGGTTTGTTGGCAGATCCCAC
TTTGCCATTGCTCACTGATAGTGCGCTTAAAGACGTGAGCATCCCACCGGGACCAAGGCT
ACTGATACTAGATCACATCCAGAGGGACCCTGAGCTTAAGGGTAAACGAGGAAACCGTGG
TTGAGACTTGAGAAAGAGCATCTTTGTATGTTTGGCATAATCTTTGTATGGTTTCGTTAT
CAAGTATCTCAAGCACAATTAGTTTCTTGTACGGTGGTATTATTATTTTTATTATTATAC
TATTATTGGCTCATGTTGCTAGCAATAAACTTGTAATATCTTCTTATGAACTATGATTAC
AGATTACTTCGATTACCAATTTATGATTTTTATTTTAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AJ50TF U 1
AF RS1AJ50JQ C 388
BS 1 793 RS1AJ50TF
BS 794 820 RS1AJ50JQ

RD RS1AJ50TF 797 0 0
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TCCTCAGACTGGCGTGGACCCTCAGGCCATGGCGTCGTTGCAGCAAACTCAGGCTCTTGT
GGGTGGGCCCTTGGTCCAAGCTCGGAACTTTGCTGCTATTACTGGTGTTAATGCTGGTAT
TGCTTGTGTTATGAAACGTATTAGAGGCAAAGAGGATCTTGAGTCTGCTGTGGTTGCGGC
GTTTGGATCTGGAGTGGCATATTCTCTGGTGAGCGCAGGGTTACAAGGACAGCCTATGAA
TGCAATCACCACTGCTGCTGGTTTCTCTCTTTTTCAAGGAATTTTTTTCAAGTTAGGGGA
AAGGTTCTCTAAACCAAGCGTTGAAGATCCATACTATGCTCGGGCGAGATCCATGCTGCT
GAAACTGGGTCTAGAGAAGTATGAGAAGAACTTCAAGAAGGGTTTGTTGGCAGATCCCAC
TTTGCCATTGCTCACTGATAGTGCGCTTAAAGACGTGAGCATCCCACCGGGACCAAGGCT
ACTGATACTAGATCACATCCAGAGGGACCCTGAGCTTAAGGGTAAACGAGGAAACCGTGG
TTGAGACTTGAGAAAGAGCATCTTTGTATGTTTGGCATAATCTTTGTATGGTTTCGTTAT
CAAGTATCTCAAGCACAATTAGTTTCTTGTACGGTGGTATTATTATTTTTATTATTATAC
TATTATTGGCTCATGTTGCTAGCAATAAACTTGTAATATCTTCTTATGAACTATGATTAC
AGATTACTTCGAT
ACCA

QA 1 793 1 793
DS 

RD RS1AJ50JQ 433 0 0
TCCATATTATGTTCGGGGGAGATCCATGCTGCTGAAACTGGGTTTAGAGAAGTATGAGAA
GAACTTCAAGAAGGGTTTGTTGGCAGATCCCACTTTGCCATTGCTCACTGATAGTGCGCT
TAAAGACGTGAGCATCCCCCCGGGACCAAGGCTACTGATATTAGATCACATCCAGAGGGA
CCCTGAGCTTAAGGGTAAACGAGGAAACCGTGGTTGAGACTTGAGAAAGAGCATCTTTGT
ATGTTTGGCATAATTTTTGTATGGTTTCGTTATCAAGTATTTCAAGCACAATTAGTTTTT
TGTACGGTGGTATTATTATTTTTATTATTATATTATTATTGGCTCATGTTGCTAGCAATA
AACTTGTAATATTTTTTTATGAACTATGATTACAGATTATTTCGATTACCAATTTATGAT
TTTTATTTTAGTC

QA 1 433 1 433
DS 



AS 1 3

CO CL1962Contig1 1192 3 11 U
CCATTGCCAATAAACTTATCAAATAGTCTTTAGTATACATCTTTTCAGTTACAAAAAAAA
AACTTATCAATACATGAAACATGTACAGAGGGCTCTTACAGTTACAACAACATATCACAT
CTTTAATCATTACAGAACAATATAGTTACTTTTATTACCGAACTGGACATAAAATCGAAT
GTAACTTGCAAAGGAAGCAACATAGTCGGTACAGTGTTAGTTCCCTCCACGTTTGTTTTT
TCTCCATTCCAATGGCTTCTCTGGATTTTTAGCCGCCCACAAGCCAATACGCTTCTGCTT
AGCCTCATTTTCCCACTTTGCAAGCTCTGGACGCTTGTCATAGGCTAAATAATGCCATGC
AAGACCTTTCTTTAACATTACTTCTTGTACAAACTTTCCATTGCAGTATATATCTCCTAC
ACATCTTCCATAACGGTCCTCTGCATAAACTAACACCTTCAAGCTTTTCCCTTCAACCAT
CTCAAGCAGCTCATCATGTGACTCTTTTCCAAACGGCATTTTACTTTCCGGTGCATCAAT
TCCCCTTAGTCTTATTCTGAACTTTTTAGCAAGCACTTCTTTGTTCTGAACATTTATCAT
CCTGTAACCAGAAGCTATGATCTTCTTGTGAAGTGCATCTGCTTCTGTGTAATTCTTACT
CTCACGGGCCTTAGCTCTTTTTGCCGCAGCAAGACTCACTTCCTTAGGAAGTGTAGATGA
CACAATAGGGTCTGTGCTACTAACATACACATTAACTGTATCCCCATCTGCCACAGATTT
TTCATCCACCGGAAGCGTTAGGAGCTCAAATTTAAGGCCTTCAAGTACAGGCGCAGCGGA
TTCACTGGAGACCTCATCAGGCTTACCAGGTGACGGGAGTCTATAGAAAGACAAAAGTCC
CTCAACATCAGCTTTCTTATGCCCCTTTAGAGTGGTGATAACAAGCCTTGCAGCTTCCTC
ATCGGTCTGAGGCCGAGGCTTAGCTTGCTTCCATGTCTCAAGTATCTTTCCATACCAGTT
TGCTTGAGCCTTTGTAGAAGACACAACATAACTTCCAAGCCCTTCAGGAACCCGAGAAGT
GGTCTCGAAAGAGCTGAAACGCCGTGAGGCTTATCGTCCGTCGTGGGGCTGCAACATTTC
CGGTAGAGTAACCTAATAGCGTTACCCATTTCTTCGATACGATCTGAAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DK43JQ U 1
AF RS1BV16JQ U 51
AF RS1DK43TF C 514
BS 1 90 RS1DK43JQ
BS 91 91 RS1BV16JQ
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RD RS1DK43JQ 723 0 0
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AACTTATCAATACATGAAACATGTACAGAGTGCTCTTACAGTTACAACAACATATCACAT
CTTTAATCATTACAGAACAATATAGTTACTTTTATTACCGAACTGGACATAGAATCGAAT
GTAACTTGCAAAGGAAGCAACATAGTCGGTACAGTGTTAGTTCCCTCCACGTTTGTTTTT
TCTCCATTCCAATGGCTTCTCTGGATTTTTAGCCGCCCACAAGCCAATACGCTTCTGCTT
AGCCTCATTTTCCCACTTTGCAAGCTCTGGACGCTTGTCATAGGCTAGATAATGCCATGC
AAGACCTTTCTTTAACATTACTTCTTGTACAAACTTTCCATTGCAGTATATATCTCCTAC
ACATCTTCCATAACGGTCCTCTGCATAGACTAACACCTTCAAGCTTTTCCCTTCAACCAT
CTCAAGCAGCTCATCATGTGACTCTTTTCCAAACGGCATTTTACTTTCCGGTGCATCAAT
TCCCCTTAGTCTTATTCTGAACTTTTTAGCAAGCACTTCTTTGTTCTGAACATTTATCAT
CCTGTAACCAGAAGCTATGATCTTCTTGTGAAGTGCATCTGCTTCTGTGTAATTCTTACT
CTCACGGGCCTTAGCTCTTTTTGCCGCAGCAAGACTCACTTCCTTAGGAAGTGTAGATGA
CAC

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1BV16JQ 698 0 0
CA
AAAAAAAAAACTTATCAATACATGAAACATGTACAGAGGGCTCTTACAGTTACAACAACA
TATCACATCTTTAATCATTACAGAACAATATAGTTACTTTTATTACCGAACTGGACATAA
AATCGAATGTAACTTGCAGAGGAAGCAACATAGTCGGTACAGTGTTAGTTCCCTCCACGT
TTGTTTTTTCTCCATTCCCATGGCTTCTCTGGATTTTTAGCCGCCCACAAGCCAATACGC
TTCTGCTTAGCCTCATTTTCCCACTTTGCAAGCTCTGGACGCTTGTCATAGGCTAAATAA
TGCCATGCAAGACCTTTCTTTAACATTACTTCTTGTACAAACTTTCCATTGCAGTATATA
TCTCCTACACATCTTCCATAACGGTCCTCTGCATAAACTAACACCTTCAAGCTTTTCCCT
TCAACCATCTTAAGCAGCTCATCATGTGACTCTTTTCCAAACGGCATTTTACTTTCCGGT
GCATCAATTCCCCTTAGTCTTATTCTGAACTTTTTAGCAAGCACTTCTTTGTTCTGAACA
TTTATCATCCTGTAACCAGAAGCTATGATCTTCTTGTGAAGTGCATCTGCTTCTGTGTAA
TTCTTACTCTCACGGGCCTTAGCTCTTTTTGCCGCAGCAAGACTCACTTCCTTAGGAAGT
GTAGATGACACAATAGGGTCTGTGCTACTAACATAC

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DS 

RD RS1DK43TF 679 0 0
AACGCA
TTTACTTTCCGGTGCATCAATTCCCCTTAGTCTTATTCTGAACTTTTTAGCAAGCACTTC
TTTGTTCTGAACATTTATCATCCTGTAACCAGAAGCTATGATCTTCTTGTGAAGTGCATC
TGCTTCTGTGTAATTCTTACTCTCACGGGCCTTAGCTCTTTTTGCCGCAGCAAGACTCAC
TTCCTTAGGAAGTGTAGATGACACAATAGGGTCTGTGCTACTAACATACACATTAACTGT
ATCCCCATCTGCCACAGATTTTTCATCCACCGGAAGCGTTAGGAGCTCAAATTTAAGGCC
TTCAAGTACAGGCGCAGCGGATTCACTGGAGACCTCATCAGGCTTACCAGGTGACGGGAG
TCTATAGAAAGACAAAAGTCCCTCAACATCAGCTTTCTTATGCCCCTTTAGAGTGGTGAT
AACAAGCCTTGCAGCTTCCTCATCGGTCTGAGGCCGAGGCTTAGCTTGCTTCCATGTCTC
AAGTATCTTTCCATACCAGTTTGCTTGAGCCTTTGTAGAAGACACAACATAACTTCCAAG
CCCTTCAGGAACCCGAGAAGTGGTCTCGAAAGAGCTGAAACGCCGTGAGGCTTATCGTCC
GTCGTGGGGCTGCAACATTTCCGGTAGAGTAACCTAATAGCGTTACCCATTTCTTCGATA
CGATCTGAAAACC

QA 7 679 7 679
DS 



AS 1 4

CO CL1963Contig1 957 4 9 U
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ATTCTTAGTGATCAACAAGTTAACAAGACATGATCAATAGCCAGAGAAGAAATCAAGTTG
AATGCTCTATCACTGAAGATTATACAATAACAAATCACTGTAAAAGATCCACAAACAAAC
ACTAGGAGCTCAACAATGGCCTTACACGCCTACCGACATCGAACTGAACTTCAGAAAGAC
CGGTGATTCCAGCGTTTATCTTCTGACCAATCTTTACAGGTCCAATACCTTCTGGTGTAC
CTGTCAAGATGACATCTCCTCTGAAAAGGGTCATTACAGAACTTATGTAGCTGATGAGAT
ATGGGACCTTGTAGATCATGTCCTTTGTCCAACCTTTTTGTCTTATCTCATCATCAACCT
TTAGCCAGAGTTCCAGGTTATTTGGATCGACCACCATTGCCTTTGGTAGAACAGAGCTGA
TGGGAGTGAAGGTATCCTGTGCTTTAGCAAGTGTACATGGCAGACCAGATGCCATGGCAG
TAGCGTGGTATTCCTTAGCAGTCATATCAAGAGCAAGCGCATATCCTCCGATGTAATCCA
TGGCTAACCGTTCAGGGACATCTCTAGCCTTGTGTCCAATCACTACAGCGAGTTCAACCT
CGTGGTGAAGTGAATCCAGAGGATGAGGGATCTCTATCGTTCCACCGTTTTCTAAATACG
AAGATGTTGGCTTCAAGAACACAATCGGATCCTTCGGGAGTGCGTTGCCAAGTTCTTTGG
CGTGTGAAGCGTAATTGAGACCAACGCCTACGATCTTCGTGCCTTGCTTGAACATCCTCT
GGATCATCGAACTCGCCATCTAAGTCGTCGTCGTCTGGGAAAGATTCGTTGTTGACCGAG
TTTCCGAGTCCACTAGGTGAGACTAGACTAAGGAGAAATCGTCTCCAATGCCCGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C629JQ U 1
AF RS1B721JQ U 18
AF RS1C629TF C 215
AF RS1B721TF C 207
BS 1 168 RS1C629JQ
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AATGCTCTATCACTGAAGATTATACAATAACAAATCACTGTAAAAGATTCACAAACAAAC
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TAGCGTGGTATTCCTTAGCAGTCATATCAAGAGCAAGCGCATATCCTCCGATGTAATCCA
TGGCTAACCGTTCAGGGACATCTCTAGCCTTGTGTCCAATCACTACAGCGAGTTCAACCT
CGTGGTGAAGTGAATCCA

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1B721JQ 837 0 0
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GGCCTTACACGCCTACCGACATCGAACTGAACTTCAGAGAGACCGGTGATTCCAGCGTTT
ATCTTCTGACCAATCTTTACAGGTCCAATACCTTCTGGTGTACCTGTCAAGATGACATCT
CCTCTGAAAAGGGTCATTACAGAACTTATGTAGCTGATGAGATATGGGACCTTGTAGATC
ATGTCCTTTGTCCAACCTTTTTGTCTTATCTCATCATCAACCTTTAGCCAGAGTTCCAGG
TTATTTGGATCGACCACCATTGCCTTTGGTAGAACAGAGCTGATGGGAGTGAAGGTATCC
TGTGCTTTAGCAAGTGTACATGGCAGACCAGATGCCATGGCAGTAGCGTGGTATTCCTTA
GCAGTCATATCAAGAGCAAGCGCATATCCTCCGATGTAATCCATGGCTAACCGTTCAGGG
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AGACCAACGCCTACGATCTTCGTGCCTTGCTTGA*CATCCTCTGGATCATCGA
CTCG

QA 1 833 1 833
DS 

RD RS1C629TF 678 0 0
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TACAGGTCCAATACCTTCTGGTGTACCTGTCAAGATGACATCTCCTCTGAAAAGGGTCAT
TACAGAACTTATGTAGCTGATGAGATATGGGACCTTGTAGATCATGTCCTTTGTCCAACC
TTTTTGTCTTATCTCATCATCAACCTTTAGCCAGAGTTCCAGGTTATTTG*ATCGACCAC
CATTGCCTTTGGTAGAACAGAGCTGATGGGAGTGAAGGTATCCTGTGCTTTAGCAAGTGT
ACATGGCAGACCAGATGCCATGGCAGTAGCGTGGTATTCCTTAGCAGTCATATCAAGAGC
AAGCGCATATCCTCCGATGTAATCCATGGCTAACCGTTCAGGGACATCTCTAGCCTTGTG
TCCAATCACTACAGCGAGTTCAACCTCGTGGTGAAGTGAATCCAGAGGATGAGGGATCTC
TATCGTTCCACCGTTTTCTAAATACGAAGATGTTGGCTTCAAGAACACAATCGGATCCTT
CGGGAGTGCGTTGCCAAGTTCTTTGGCGTGTGAAGCGTAATTGAGACCAACGCCTACGAT
CTTCGTGCCTTGCTTGAACATCCTCTGGATCATCGAACTCGCCATCTAAGTCGTCGTCGT
CTGGGAAAGATTCGTT
CC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1B721TF 751 0 0
CACGCTA
CGACATCGAACTGAACT*CAGAGAGACCGGTGATTCCAGCGTTTATCTTCTGACCAATCT
TTACAGGTCCAATACTTTCTGGTGTACCTGTCAAGATGACATCTCCTCTGAAAAGGGTCA
TTACAGAACTTATGTAGCTGATGAGATATGGGACCTTGTAGATCATGTCCTTTGTCCAAC
CTTTTTGTCTTATCTCATCATCAACCTTTAGCCAGAGTTCCAGGTTATTTGGATCGACCA
CCATTGCCTTTGGTAGAACAGAGCTGATGGGAGTGAAGGTATCCTGTGCTTTAGCAAGTG
TACATGGCAGACCAGATGCCATGGCAGTAGCGTGGTATTCCTTAGCAGTCATATCAAGAG
CAAGCGCATATCCTCCGATGTAATCCATGGCTAACCGTTCAGGGACATCTCTAGCCTTGT
GTCCAATCACTACAGCGAGTTCAACCTCGTGGTGAAGTGAATCCAGAGGATGAGGGATCT
CTATCGTTCCACCGTTTTCTAAATACGAAGATGTTGGCTTCAAGAACACAATCGGATCCT
TCGGGAGTGCGTTGCCAAGTTCTTTGGCGTGTGAAGCGTAATTGAGACCAACGCCTACGA
TCTTCGTGCCTTGCTTGAACATCCTCTGGATCATCGAACTCGCCATCTAAGTCGTCGTCG
TCTGGGAAAGATTCGTTGTTGACCGAGTTTCCGAGTCCACTAGGTGAGACTAGACTAAGG
AGAAATCGTCTCCAATGCCCGTCC

QA 8 751 8 751
DS 



AS 1 4

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AAAAATAATTCATGGAGATGTCAGAAGCTTCAAAACAGACTACAAGACATGTAGAAGAAT
CAGAACACCTTCAGAATCCAGAAACAGACCAGATCTTGAGCCAAAGAAGATCGTTGATTG
TAAATCAAAGAAAATGGTGGCTCTCTGTTTCGTTGTGTCTTTTCTTGGTCGTTCTCGGAG
ACTCTCTGGTCATGCTTCTCTTGAACTTCTTCTATGTCCAACTCAATCGAGAAGATAGTG
ATCAGGATCAACAATACACAGGAACATGGACACAAGCTCTGATTCAAAACGCTGCGTTTC
CAGTCCTTATCCCTCTCTTCTTCATCTTCCGTTCGCCAAAACAAAACCCTGAAACCAACA
ATACTCGTTCTATCTCTTTTCGTCTCCTCTTTCTTTACTTATCTCTTGGTGTTCTTGTTG
CTGCTCACAGCAAGTTATTCGCACTTGGGAAGTTATACGCAAACTACGGCATATTCACGT
TGATTTCCGCGACCCAATTGATATTTACCGCTATTTTCACCGCCATCATTAACCGTTTCA
AGTTTAACAGATGGATTATCATATCTATACTCCTCACTATTGTGATATACGTTTTCGGTA
GCCCTGAATTTGGAGGAGAGCCTGATGAAAATGAAGAATTTTATAACATCCAAGCTTGGG
TAACCTTCGCAGGTTCGGTTGCTTTCGCACTATCTCTCTGCTTCTTCCAACTCGGGTTTG
AGAAACTTTTGGTGAAAACAAAGAGATATGGTAACAAGAGAGTGTTTAGAATGGTCTTAG
AGATGCAAATATGTGTCTCTTTTGTCGCATCAGTTGTTTGTCTTGTTGGTTTGATTGCGA
GTGGTGAATATAAGGAGTTGAAAGGCGATAGCCAACGGTTTAAGAAAGGCGAAACATATT
ATGTTTTGAGTTTGGTTGGGTTAGCTTTGTCGTGGCAGGTTTGGGCGGTCGGATTGATAG
GGTTGGTGCTTTATGTTTCGGGTGTGTTTGGTGATGTCGTACATATGTGTACTTCACCAC
TTGTGGCTCTGATTGTTGTGTTAGCATTTGATTTTATGGATGATGATTTTAGTTGGCCTA
GAATAGGTGCTTTAATAGGAACAACTTTGGCTTTAGGATCGTATTTCTACTCAATTCACA
AGAAAAATAAGAAGGAGATGATAGAACTTGACCGAAGAGAGAACATTGTTGAAGTTTAAT
CTCTCATGTCAAATGTATGTTTGGGTCTTTTCTAATACTTTCTTGTACTTCTTTATCTTT
CAAATGAATGTCCAATAAGTTGTATAGATCTTAAAACTGTGTAATACATTGTTATTTGTT
AC


BQ
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10 10 

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G
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G
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TGTTTGGGTCTTTTCTAATACTTTCTTGTACTTCTTTATCTTTCAAATGAATGTCCAATA
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AC

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CTCTGCTTCTTCCAACTCGGGTTTGAGAAACTTTTGGTGAAAACAAAGAGATATGGTAAC
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CAGGTTTGGGCGGTCGGATTGATAGGGTTGGTGCTTTATGTTTCGGGTGTGTTTGGTGAT
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DS 



AS 1 4

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ATTCGTTCTGTAGCGAGTAGAAGAACCCTAGGCGGTCTAAAGGAGACGTCTTCGAGGCTT
GTGGGATGGAGAGGGATCCAGACTTTCACGCTTCCTGATCTTCCATATGATTACAGCGCG
CTGGAGCCGGCGATCAGCGGCGAGATTATGCAGATTCATCACAAGAAGCATCACCAGACG
TACGTCACTAATTACAACAATGCCCTCGAGCAGCTTGATCAGGCCGTTAACAACGGAGAC
GCTTCCACTGTCGTCAAGCTCCATAGCGCCATCAAGTTCAACGGCGGAGGTCATGTGAAC
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AATCTTGCTCCTGTCAACCAAGGTGGTGGAGAGCCACCGAAGGGAGCACTTGGTGGAGCT
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CGA

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AAGAATGTG

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TGGAAGAATCTTGCTCCTGTCAACCAAGGTGGTGGAGAGCCGCCGAAGGGAGCTCTTGGT
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CCTGATTATCTGAAGAACGTCTGGAAGGTTATCAACTGGAACTACGCAAACGAAGTTTAT
GAGAAGGAATGCTAGTGAGTTCGTTACAAATAATAACATAAAAGAGAGGACCCAGTTCCC
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AACTACAGTAATTTGCAAAAATAAAGTTTTTTTTTGTGAT

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AT
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GCTCCTGTCAACCAAGGTGGTGGAGAGCCACCGAAGGGAGCACTTGGTGGAGCTATTGAA
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GAAAAAAATTTGCAAAA

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DS 



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GTTATTATAAATAAAACTCCAAAGCTTGTCTGTAACTACTCTCGTCTTCAATGTTAATCA
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GCGAAATCGAAGAACAACCTCCGTTACCAACCGCGAAAATCAGCATCGCGATCGACACAA
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TCTGTTCTACCAAAGAAGAGAGATGCTTTACTTTTCTGGAACATGAGACCTGATGCCTCT
CTAGACCCTTCCAGTTTGCACGGTGGATGCCCAGTGGTAAAAGGAAACAAATGGTCATCC
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ACACGACAGCAAAAGTTTGTGGGGATACATACAGTTACAAACAGATGTATTATTGTATTT
CTCTTTTCAAGTGAGAAATGATCTTTAGGCTGTGTTTTATCATGAGCGATATTTGAACTT
TTTCTTTTAAACTATTTGAGATTTTTGTAACTTTACATGTTCTGTTTTTATAACATCAAT
AATTTAATAC


BQ
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BS 830 830 RS1AS05JQ
BS 831 839 RS1AS05TF
BS 840 841 RS1AS05JQ
BS 842 842 RS1AS05TF
BS 843 843 RS1AS05JQ
BS 844 870 RS1AS05TF
BS 871 871 RS1AS05JQ
BS 872 881 RS1AS05TF
BS 882 1270 RS1AS05JQ

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DS 

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GG
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TTTCTGATTTCACCTTCATTCCTGTTGAAAATGGAGAAGGTCTTCATGTTCTTCACTACC
AAGTTGGGCAGAAGTATGAGCCTCACTATGATTATTTCTTAGATGAGTTCAACACCAAGA
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CGAA
TGTG

QA 3 786 3 786
DS 

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GGCAGCAAAGATAGCAGAGTAAGGACTAGCTCTGGGACTTTTCTTAAAAGAGGACATGAC
CATGTTGTCGAGAGGATTGAGCAAAGGATTTCTGATTTCACCTTCATTCCTGTTGAAAAT
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TATTTCTTAGATGAGTTCAACACCAAGAACGGAGGACAACGAATAGCCACTGTTCTTATG
TACCTCTCGGATGTTGATGATGGTGGCGAGACCGTGTTCCCAGCAGCAAAAGGAAACATT
AGTGCAGTCCCATGGTGGGACCAGCTCTCGAAATGTGGCAAAGAAGGACTTTCTGTTCTA
CCAAAGAAGAGAGATGCTTTACTTTTCTGGAACATGAGACCTGATGCCTCTCTAGACCCT
TCCAGTTTGCACGGTGGATGCCCAGTGGTAAAAGGAAACAAATGGTCATCCACGAAATGG
TTCCACGTCCATGAGTTCAAGGTTTAAGAAAACTAAGATAAGAGGAGGTTTACACGACAG
CAAAAGTTTGTGGGGATACATACAGTTACAAACAGATGTATTATTGTATTTCTCTTTTCA
AGTGAGAAATGATCTTTAGGCTGTGTTTTATCATGAGCGATATTTGAACTTTTTCTTTTA
AACTATTTGAGATTTTTGTAACTTTACATGTTCTGTTTTTATAACATCAATAATTTAATA
C

QA 8 788 8 788
DS 



AS 1 4

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GTATGTTGTAGTCAGTACGGTTATTGCGGCAATGGACCAGACTACTGTGGTTCAGGTTGC
CGATCAGGTCCTTGCACTGGCACCCAAGGCGGTAGTCTTGGTACCATTGTGTCACAAGCT
TTCTTTAGCAATATCATCAACCGAGCTGATAATGGCTGCGCCGGAAAAAGATTCCACACA
CGTGATTCTTTCATTAGTGCCGCTAATACGTTCCCCAACTTTGCTACCTCCGTTACTAGG
CGTGAAATTGCGACTATGTTTGCTCATTTCACCCAGGAGGTCGGATATTTCTGCTACATT
GAAGAGATAAACGGAGCGTCAAGAAACTATTGCGACGACAGGAATTATCCACAATACCCA
TGTGCACCAGGCAAAACCTACTACGGTCGTGGTCCGATCCAGTTATCATGGAACTACAAT
TATGCACAGTGTGGTCAGAGTCTCGGTCTGGATCTTCTACGTCAGCCAGAGCAAGTAAGC
AGCAATCCAACTCTAGCTTTCAGGACAGCTTTGTGGTTTTGGGTGAATAACGTAAGGCCG
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CTTGGTGTGGACCCTGGTCCTAACCTTAGCTGCTAAAAAGCTCTTTAATTGGTGACTATT
GTTGGACCTTAGTGTTTATGCTGAAACAAATAAATGAGATGATAAAATTAAATCTCATGC
ATGTAATTTGTGTTGGGTTTCAATGTTTCCTGCTCCACAAGCAAAAAAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BH85TF U 1
AF RS1G420TF U 1
AF RS1BH85JQ C 286
AF RS1G420JQ C 575
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TT

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CGATCAGGTCCTTGCACTGGCACCCAAGGCGGTAGTCTTGGTACCATTGTGTCACAAGCT
TTCTTTAGCAATATCATCAACCGAGCTGATAATGGCTGCGCCGGAAAAAGATTCTACACA
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CGTGAAATTGCGACTATGTTTGCTCATTTCACCCAGGAGGTCGGATATTTCTGCTACATT
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TGTGCACCAGGCAAAACCTACTACGGTCGTGGTCCGATCCAGTTATCATGGAACTACAAT
TATGCACAGTGTGGTCAGAGTCTCGGTCTGGATCTTCTACGTCAGCCAGAGCAAGTAAGC
AGCAATCCAACTCTAGCTTTCAGGACAGCTTTGTGGTTTTGGGTGAATAACGTAAGGCCG
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TTAACGC

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DS 

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TATCCACAATACCCATGTGCACCAGGCAAAACCTACTACGGTCGTGGTCCGATCCAGTTA
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GACTACTGTGGGCAGCTTGGTGTGGACCCTGGTCCTAACCTTAGCTGCTAAAAAGCTCTT
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AAAAAA

QA 1 666 1 666
DS 

RD RS1G420JQ 368 0 0
TTT
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TTTGGGTGAATAACGTAAGGCCGGTACTGAACCAAGGATTTGGAGCCACCATTAGGGCCA
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ACTACAGAGACTACTGTGGGCAGCTTGGTGTGGACCCTGGTCCTAACCTTAGCTGCTAAA
AAGCTCTTTAATTGGTGACTATTGTTGGACCTTAGTGTTTATGCTGAAACAAATAAATGA
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CAAGC

QA 4 368 4 368
DS 



AS 1 3

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GGCCCCTGCTCCAGTCCTTGGGCTACATCCTCAACGTAAGTGATCTTCCCTTCTCTAATA
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CCTTGAAGCTTAACCCGCTTGTAAATGACGATCGCTAGGTTGCGTACACCTTCCTGCTCC
TCCAGGTTGTACTGTGAGATCATTCCGCATACCGCGATACGGCCTTTTAGGTTCATGTTT
AGGAGCACTGCGTCTAGCATCTTGCCTCCTACGTTCTCAAAGTATATGTCGATGCCTTCC
GGGAAACACCTCTTCAGAGCAGCATCAAGGTCTTTCCCTTCTTTGTAATTGAAAGCTTCA
TCAAACCCAAACTTATCCTTGAGAAGATCAACCTTTTCATTACTGCCGGCACTTCCAACG
ACATAACATCCCATAATCTTTGCGAGCTGTCCCACGAGCTGACCAACAGCACCAGATGCA
GCTGACACGAAGACAGTCTCTCCTTTCTTAGGAGAACAGATTTCATAAAACCCTGAATAA
GCAGTCATCCCAGCCATACCGAGAAGTCCAGTGTAGTGGGACAAGGGAACATCAGTGTGT
AGGATCTTAAAATGTGAGTAAATAGTTGGAGTAATAACACTGTACTCCTCCCATCCAACA
ATACCCCAAAGCAGGTCTCCCTTTGTGTAATCAGGGTGCCCTGAATCTACCACTTTTGAC
ACTCCATACCCATAGATTTGCTGGCCAGGGGTGTAGGGTAGAGCGAGGGCTGCAGCGGAG
GGATCAGCTTGCCCATGCGAATGCGCATGTAAGGATCACAAGACAAGTAGAGATTCTTCA
CCAGAACCTTGTTAGATCCAGCCGGAACACTTAGATCCACGGTGGCATCGTTGAAGACGA
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CGGTCGACGCTTCGCCTGTGGGTGCCATTCTATATATTCTGCTTTAGGTTTTGGTAACAA
ATGACAAATGTATGTATGTGGTTTCTCGTTTCTTCTTCTTCTTTTTTTGTTTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 0 0 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E328JQ U 1
AF RS1FU68JQ U 9
AF RS1FU68TF C 636
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TCAAACCCAAACTTATCCTTGAGAAGATCAACCTTTTCATTACTGCCGGCACTTCCAACG
ACATAACATCCCATAATCTTTGCGAGCTGTCCCACGAGCTGACCAACAGCACCAGATGCA
GCTGACACGAAGACAGTCTCTCCTTTC

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AATACAACAAACAAAAGGGTTTATTTATTACATAACGAAAGTGAAGTACTTAAGGCGAAA
CTTAAACTTCTTACAAAACAACTAAAGCGTAATTAACTAACTCATCTCCAGCTGATAACC
AAACTCAAAACGTCTCTCAATCATCACTCACGAGACACCACAATGAGCTGTTTGCCGACG
TTCTTACCATGGAAGAGTCCAATCAAAGCAGAAGGCCCCTGCTCCAGTCCTTGGGCTACA
TCCTCAACGTAAGTGATCTTCCCTTCTCTAATGTAGGGAAGCACAAACTCCAAAAACTTG
GAGTATTTGTCATAGAAATCAGAGACCACAAAGCCTTGAAGCTTAACCCGCTTGTAAATG
ACGATCGCTAGGTTGCGTACACCTTCCTGCTCCTCCAGGTTGTACTGTGAGATCATTTCG
CATACCGCGATACGGCCTTTTAGGTTCATGTTTAGGAGCACTGCGTCTAGCATCTTGCCT
CCTACGTTCTCAAAGTATATGTCGATGCCTTCCGGGAAACACCTCTTCAGGGCAGCGTCA
AGGTCTTTCTCTTCTTTGTAATTGAAAGCTTCATCAAACCCAAACTTATTCTTGAGAAGA
TCAACCTTTTCATTACTGCCGGCACTTCCAACGACATAACATCCCATAATCTTTGCGAGC
TGTCCCACGAGCTGACCAACAGCACCAGATGCAGCTGACACGAAGACAGTCTCTCCTTTC
TTAGGAGAACAGATTTCATAAAACCCTGAATAAGCAGTCATCCCAGCCATACCGAGAAGT
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GGAGTAATAACACTGTACT

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DS 

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ACAGATTTCATAAAACCCTGAATAAGCAGTCATCCCAGCCATACCGAGAAGTCCAGTGTA
GTGGGACAAGGGAACATCAGTGTGTAGGATCTTAAAATGTGAGTAAATAGTTGGAGTAAT
AACACTGTACTCCTCCCATCCAACAATACCCCAAAGCAGGTCTCCCTTTGTGTAATCAGG
GTGCCCTGAATCTACCACTTTTGACACTCCATACCCATAGATTTGCTGGCCAGGGGTGTA
GGGTAGAGCGAGGGCTGCAGCGGAGGGATCAGCTTGCCCATGCGAATGCGCATGTAAGGA
TCACAAGACAAGTAGAGATTCTTCACCAGAACCTTGTTAGATCCAGCCGGAACACTTAGA
TCCACGGTGGCATCGTTGAAGACGAGGTCTGATTCCTTGGGGAAGCCGGTGACGTAGTCT
CTCAATATGACTTGCTTGTTGTTCACGGTCGACGCTTCGCCTGTGGGTGCCATTCTATAT
ATTCTGCTTTAGGTTTTGGTAACAAATGACAAATGTATGTATGTGGTTTCTCGTTTCTTC
TTCTTCTTTTTTTGTTTGTTCC

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 3

CO CL1969Contig1 743 3 11 U
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CCTCGTCATCACCCTTTCTGTCGTTGCATTCGCCGACCGTGAACCACACTGCGTCTACAC
ATTCTACATCGAAACTGGACCGGTGGAAAATGCCGGCACAGATT**ATCATAAGCGTTAA
AATCTCGGACAATTCGGGACAGGACATTGATATCCCAGACATAGTGACATGGGGTGGGTT
AATGGGACCAAGTTACGACTACTTCGAGAGAGGCAATTTGGACATTTTCAGTGGTAAAGC
GCAGTGTCTTCCGAGCCCAGTCTGTTCACTGAGTCTGACCTCAGACGGCTCCGGCGTTTA
CCCGGCCTGGTTTGTTAACTACGTGGACGTCACGACGGTCAGTGTTCATCTTAAGAGTGA
ACATCAATACTTCAATGTGGAGCAATGGCTTGCGACTGATACGCCGCCGTATAATCTCAC
TGCCGTGCGGAACAACTGCCAGGTTTCTCCTATCGGTAGGGTCGGGTCTGAGATCCGGAA
GAGTCTCTCCTAGGATCGTGTTGTAAATCAATGTGTGGGAGATTTGTGTTAACGTATGGT
TGCAATGCCGATAATGTAAACGATCCGATCGAATAAAAGTGTCGTCTCTGAACATTTGAT
AGAGTACTGTAAAATGATCTGATCGAATAAAATCATACATATATGAACATGTGATTGCAA
TAAGAAGAGTCATGTCTGCATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DA40TF U 9
AF RS1DA40JQ C 22
AF RS1C255TF U 1
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RD RS1DA40TF 677 0 0
GG
ACATTCATATCACCAACTATGGCTGGTCGTGACGTTCTCCTCCTCTCCCTCCTCGTCATC
ACCCTTTCTGTCGTTGCATTCGCCGACCGTGAACCACACTGCGTCTACACATTCTACATC
GAAACTGGACCGGTGGAAAATGCCGGCACAGATT**ATCATAAGCGTTAAAATCTCGGAC
AATTCGGGACAGGACATTGATATCCCAGACATAGTGACATGGGGTGGGTTAATGGGACCA
AGTTACGACTACTTCGAGAGAGGCAATTTGGACATTTTCAGTGGTAAAGCGCAGTGTCTT
CCGAGCCCAGTCTGTTCACTGAGTCTGACCTCAGACGGCTCCGGCGTTTACCCGGCCTGG
TTTGTTAACTACGTGGACGTCACGACGGTCAGTGTTCATCTTAAGAGTGAACATCAATAC
TTCAATGTGGAGCAATGGCTTGCGACTGATACGCCGCCGTATAATCTCACTGCCGTGCGG
AACAACTGCCAGGTTTCTCCTATCGGTAGGGTCGGGTCTGAGATCCGGAAGAGTCTCTCC
TAGGATCGTGTTGTAAATCAATGTGTGGGAGATTTGTGTTAACGTATGGTTGCAATGCCG
ATAATGTAAACGATCCGATCGAATAAAAGTGTCGTCTCTGAACATTTGATAGAGTACTGT
AAA*TGATCTGATCG

QA 3 677 3 677
DS 

RD RS1DA40JQ 684 0 0
ACCAACTATGGCTGGTCGTGACGTTCTCCTCCTCTCCCTCCTCGTCATCACCCTTTCTGT
CGTTGCATTCGCCGACCGTGAACCACACTGCGTCTACACATTCTACATCGAAACTGGACC
GGTGGAAAATGCCGGCACAGATT**ATCATAAGCGTTAAAATCTCGGACAATTCGGGACA
GGACATTGATATCCCAGACATAGTGACATGGGGTGGGTTAATGGGACCAAGTTACGACTA
CTTCGAGAGAGGCAATTTGGACATTTTCAGTGGTAAAGCGCAGTGTCTTCCGAGCCCAGT
CTGTTCACTGAGTCTGACCTCAGACGGCTCCGGCGTTTACCCGGCCTGGTTTGTTAACTA
CGTGGACGTCACGACGGTCAGTGTTCATCTTAAGAGTGAACATCAATACTTCAATGTGGA
GCAATGGCTTGCGACTGATACGCCGCCGTATAATCTCACTGCCGTGCGGAACAACTGCCA
GGTTTCTCCTATCGGTAGGGTCGGGTCTGAGATCCGGAAGAGTCTCTCCTAGGATCGTGT
TGTAAATCAATGTGTGGGAGATTTGTGTTAACGTATGGTTGCAATGCCGATAATGTAAAC
GATCCGATCGAATAAAAGTGTCGTCTCTGAACATTTGATAGAGTACTGTAAAATGATCTG
ATCGAATAAAATCATACATATATG

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1C255TF 743 0 0
GGATTTTCTTACATTCATATCACCAACTATGGCTGGCCGTGACGTTCTCCTCCTCTCCCT
CCTCGTCATCACCCTTTCTGTCGTTGCATTCGCCGACCGTGAACCACACTGCGTCTACAC
ATTCTACATCGAAA*TGGACCGGTGGAAAATGCCGGCACAGATTCTATCATAAGCGTTAA
AATCTCGGACAATTCGGGACAGGACATTGGTATCCCAGACATAGTGACATGGGGTGGGTT
AATGGGACCAAGTTACGACTACTTCGAGAGAGGCAATTTGGACATTTTCAGTGGTAAAGC
GCAGTGTCTTCCGAGCCCAGTCTGTTCACTGAGTCTGACCTCAGACGGCTCCGGCGTTTA
CCCGGCCTGGTTTGTTAACTACGTGGACGTCACGACGGTCAGTGTTCATCTTAAGAGTGA
ACATCAATACTTCAATGTGGAGCAATGGCTTGCGACTGATACGCCGCCGTATAATCTCAC
TGCCGTGCGGAACAACTGCCTGGTTTCTCCTATCGGTAGGGTCGGGTCTGAGATCCGGAA
GAGTCTCTCCTAGGATCGTGTTGTAAATCAATGTGTGGGAGATTTGTGTTAACGTATGGT
TGCAATGCCGATAATGTAAACGATCCGATCGAATAAAAGTGTCGTCTCTGAACATTTGAT
AGAGTACTGTAAAATGATCTGATCGAATAAAATCATACATATATGAACATGTGATTGCAA
TAAGAAGAGTCATGTCTGCATCT

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 4

CO CL1970Contig1 694 4 4 U
CCATCAATATTTTTAATAAAAAATAACAGGCCGAAACCCAAACAAATTACAAAGCCCATT
ACAAATCGGGCCAACAAACACCACTCAACTAGGCCTAAAGTCAAGACTCTAAGAAACCCT
AGCTTCTAAACGCGGCCGCCTTGCAAATCGGACTAGAGAGAGGAGCAGACACGTGTTACC
AACCTCACCGTCGAATGACACAAGTAGCAAGGGCCGTCACGTCACCACCGCTATTCGTCC
AACCGGAGGTCCAAACACCGAATCACCAGGCCTCGCCGGATTCGACACCTCCACATCACT
CCACCGTGAACGCCTTCGATCTCATGGGTGTTCGAAATCGTAGAGCATCAATTGCCGTGG
CGAGATCTCATCCGCCAGTAAATTCCGCGAAAACCCAAGAGGAAGCTTCACATGCATCAA
CATTCTTTCCGTCATAGGTCTTCACCGACCTTCGACGAAGATTCAAACAAAGAAAATAAA
AGGAAACGAATAGAACATAACAAAGAAGGAAAAAAGCTAAACCCTAAAGACCTAGGGAAT
CTGAAGCCGACGACGCAAAATTGTAGTAACTTTCACCTTCCAAAGACTAGAACCGACGAC
GTCGGAACTGAAGAAGCTTCCACGTCCCGGAAGTAAAAACCGGCGGTGACGAAACTGTGA
GAACCCCGTCTCTCGGAAACATAACTCAAACTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CH44JQ U 1
AF RS1AO48JQ U 18
AF RS1AO48TFB C 151
AF RS1CH44TF C 420
BS 1 145 RS1CH44JQ
BS 146 146 RS1AO48JQ
BS 147 685 RS1CH44JQ
BS 686 694 RS1AO48JQ

RD RS1CH44JQ 685 0 0
CCATCAATATTTTTAATAAAAAATAACAGGCCGAAACCCAAACAAATTACAAAGCCCATT
ACAAATCGGGCCAACAAACACCACTCAACTAGGCCTAAAGTCAAGACTCTAAGAAACCCT
AGCTTCTAAACGCGGCCGCCTTGCAGATCGGACTAGAGAGAGGAGCAGACACGTGTTACC
AACCTCACCGTCGAATGACACAAGTAGCAAGGGCCGTCACGTCACCACCGCTATTCGTCC
AACCGGAGGTCCAAACACCGAATCACCAGGCCTCGCCGGATTCGACACCTCCACATCACT
CCACCGTGAACGCCTTCGATCTCATGGGTGTTCGAAATCGTAGAGCATCAATTGCCGTGG
CGAGATCTCATCCGCCAGTAAATTCCGCGAAAACCCAAGAGGAAGCTTCACATGCATCAA
CATTCTTTCCGTCATAGGTCTTCACCGACCTTCGACGAAGATTCAAACAAAGAAAATAAA
AGGAAACGAATAGAACATAACAAAGAAGGAAAAAAGCTAAACCCTAAAGACCTAGGGAAT
CTGAAGCCGACGACGCAAAATTGTAGTAACTTTCACCTTCCAAAGACTAGAACCGACGAC
GTCGGAACTGAAGAAGCTTCCACGTCCCGGAAGTAAAAACCGGCGGTGACGAAACTGTGA
GAACCCCGTCTCTCGGAAACATAAC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RS1AO48JQ 677 0 0
AAAAAATAACAGGCCGAAACCCAAACAAATTACAAAGCCCATTACAAATCGGGCCAACAA
ACACCACTCAACTAGGCCTAAAGTCAAGACTCTAAGAAACCCTAGCTTCTAAACGCGGCC
GCCTTGCAAATCGGACTAGAGAGAGGAGCAAACACGTGTTACCAACCTCACCGTCGAATG
ACACAAGTAGCAAGGGCCGTCACGTCACCACCGCTATTCGTCCAACCGGAGGTCCAAACA
CCGAATCACCAGGCCTCGCCGGATTCGACACCTCCACATCACTCCACCGTGAACGCCTTC
GATCTCATGGGTGTTCGAAATCGTAAAGCATCAATTGCCGTGGCGAGATCTCATCCGCCA
GTAAATTCCGCGAAAACCCAAGAGGAAGCTTCACATGCATCAACATTCTTTCCGTCATAG
GTCTTCACCGACCTTCGACGAAAATTCAAACAAAGAAAATAAAAGGAAACGAATAGAACA
TAACAAAGAAGGAAAAAAGCTAAACCCTAAAGACCTAGGGAATCTGAAGCCGACGACGCA
AAATTGTAGTAACTTTCACCTTCCAAAGACTAGAACCGACGACGTCGGAACTGAAGAAGC
TTCCACGTCCCGGAAGTAAAAACCGGCGGTGACGAAACTGTGAGAACCCCGTCTCTCGGA
AACATAACTCAAACTAC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RS1AO48TFB 544 0 0
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GGGCCGTCACGTCACCACCGCTATTCGTCCAACCGGAGGTCCAAACACCGAATCACCAGG
CCTCGCCGGATTCGACACCTCCACATCACTCCACCGTGAACGCCTTCGATCTCATGGGTG
TTCGAAATCGTAGAGCATCAATTGCCGTGGCGAGATCTCATCCGCCAGTAAATTCCGCGA
AAACCCAAGAGGAAGCTTCACATGCATCAACATTCTTTCCGTCATAGGTCTTCACCGACC
TTCGACGAAGATTCAAACAAAGAAAATAAAAGGAAACGAATAGAACATAACAAAGAAGGA
AAAAAGCTAAACCCTAAAGACCTAGGGAATCTGAAGCCGACGACGCAAAATTGTAGTAAC
TTTCACCTTCCAAAGACTAGAACCGACGACGTCGGAACTGAAGAAGCTTCCACGTCCCGG
AAGTAAAAACCGGCGGTGACGAAACTGTGAGAACCCCGTCTCTCGGAAACATAACTCAAA
CTAC

QA 1 544 1 544
DS 

RD RS1CH44TF 266 0 0
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AAGGAAACGAATAGAACATAACAAAGAAGGAAAAAAGCTAAACCCTAAAGACCTAGGGAA
TCTGAAGCCGACGACGCAAAATTGTAGTAACTTTCACCTTCCAAAGACTAGAACCGACGA
CGTCGGAACTGAAGAAGCTTCCACGTCCCGGAAGTAAAAACCGGCGGTGACGAAACTGTG
AGAACCCCGTCTCTCGGAAACATAAC

QA 1 266 1 266
DS 



AS 1 4

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AAGAGTGGATCTTCTAATGGTGAAAAATCATCAGTTAGTACAAGTTTACCAAGCGGTGCA
AAATCACATGGCAGTAAAAAAGTATCTAGTGATACAAATTTACCTAGAGGTACAAATAAA
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CCAAGGAGAGAAAATTCATCTAGTGGTGGAACTTCAACTAAAAGTGAAAGTAAACACATG
CGTAAAAGAAAATTCAGGGTCGAAAGCAAATCTAAGATTCAAAATGAGTTTGGGGATCAA
AATGGTTCATCAATGAGTAAAACCTCTTCAAAAGACGAAACAAGATCAGAAAGAGAATCA
TCTATGCGTTCATTTAGTGG*GAAAATTCACATGTAAGTAGAAGTTCATCAAGCAAAAGA
AGTTCATCAAGCGAAAGAAGTTCATTTAGACATGAAAATAAACACAATGGATAAAAATAA
ACAAATAGTCTAAGATTAGAAGTAAACTTCGTTGTCATTGTGATTTGTCAATGGATAGAG
ATATACTAAATGGTGAAAGTAAACACAATGAAAAAATTCAATTAACGATCAAATTTACCT
AAAATGTAAAATTGTGACTGCTTAGTACGATATAATATTGTCTATAATGTAGTATAATAT
GTTAACATTTATTTCATTCAAAAGATTGGATATTACCGAATCTGGCATGCCATATATTGT
CATCTAAAATAGATAATTTATACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AO70TFB U 30
AF RS1DP86JQ C 37
AF RS1G413TF U 1
AF RS1G413JQ C 153
BS 1 728 RS1G413TF
BS 729 805 RS1G413JQ

RD RS1AO70TFB 365 0 0
TAAACAC
AAAGGTAAAAATAAATTAAAAGACAAGAGTAGATCTTCTAATGGTGAAAAATCATCAGGT
AGTACAAGTTTACCAAGCGGTGCAAAATCACATGGCAGTAAAAAAGTATCTAGTGATACA
AATTTACCTAGAGGTACAAATAAAAACATGGATAAAAATAGAGATTTATTTGATGGTGAA
AGTTCAGCGATGAGTACGAGCTCGCCAAGGAGAGAAAATTCATCTAGTGGTGGAACTTCA
ACTAAAAGTGAAAGTAAACACATGCGTAAAAGAAAATTCAGGGTCAAAAGCAAATCTAAG
ATTCAAAATGAGTTTGGGGATCAAAATGGTTCATCAATGAGTAAAACCTCTTCAAA
GA

QA 8 363 8 363
DS 

RD RS1DP86JQ 646 0 0
AAAGGTAAAAATAAATTAAAAGACAAGAGTGGATCTTCTAATGGTGAAAAATCATCAGTT
AGTACAAGTTTACCAAGCGGTGCAAAATCACATGGCAGTAAAAAAGTATCTAGTGATACA
AATTTACCTAGAGGTACAAATAAAAACATGGATAAAAGTAGAGATTTATTTGATGGTGAA
AGTTCAGCGATGAGTACGAGCTCGCCAAGGAGAGAAAATTCATCTAGTGGTGGAACTTCA
ACTAAAAGTGAAAGTAAACACATGCGTAAAAGAAAATTCAGGGTCGAAAGCAAATCTAAG
ATTCAAAATGAGTTTGGGGATCAAAATGGTTCATCAATGAGTAAAACCTCTTCAAAAGAC
GAAACAAGATCAGAAAGAGAATCATCTATGCGTTCATTTAGTGGCGAAAATTCACATGTA
AGTAGAAGTTCATCAAGCAAAAGAAGTTCATCAAGCGAAAGAAGTTCATTTAGACATGAA
AATAAACACAATGGATAAAAATAAACAAATAGTCTAAGATTAGAAGTAAACTTCGTTGTC
ATTGTGATTTGCCAATGGATAGAGATATACTAAATGGTGAAAGTAAACACAATGAAAAAA
TTCAATTAACGATCAAATTTACCTAAAATGTAAAATTGTGACTGCT

QA 1 646 1 646
DS 

RD RS1G413TF 728 0 0
GGCGGTGCAAGTTCACCTAAGACTGGAAATAAACACAAAGGTAAAAATAAATTAAAAGAC
AAGAGTGGATCTTCTAATGGTGAAAAATCATCAGTTAGTACAAGTTTACCAAGCGGTGCA
AAATCACATGGCAGTAAAAAAGTATCTAGTGATACAAATTTACCTAGAGGTACAAATAAA
AACATGGATAAAAGTAGAGATTTATTTGATGGTGAAAGTTCAGCGATGAGTACGAGCTCG
CCAAGGAGAGAAAATTCATCTAGTGGTGGAACTTCAACTAAAAGTGAAAGTAAACACATG
CGTAAAAGAAAATTCAGGGTCGAAAGCAAATCTAAGATTCAAAATGAGTTTGGGGATCAA
AATGGTTCATCAATGAGTAAAACCTCTTCAAAAGACGAAACAAGATCAGAAAGAGAATCA
TCTATGCGTTCATTTAGTGG*GAAAATTCACATGTAAGTAGAAGTTCATCAAGCAAAAGA
AGTTCATCAAGCGAAAGAAGTTCATTTAGACATGAAAATAAACACAATGGATAAAAATAA
ACAAATAGTCTAAGATTAGAAGTAAACTTCGTTGTCATTGTGATTTGTCAATGGATAGAG
ATATACTAAATGGTGAAAGTAAACACAATGAAAAAATTCAATTAACGATCAAATTTACCT
AAAATGTAAAATTGTGACTGCTTAGTACGATATAATATTGTCTATAATGTAGTATAATAT
GTTAACAT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1G413JQ 653 0 0
TACAAATTTACCTAGAGGTACAAATAAAAACATGGATAAAAGTAGAGATTTATTTGATGG
TGAAAGTTCAGCGATGAGTACGAGCTCGCCAAGGAGAGAAAATTCATCTAGTGGTGGAAC
TTCAACTAAAAGTGAAAGTAAACACATGCGTAAAAGAAAATTCAGGGTCGAAAGCAAATC
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TGTAAGTAGAAGTTCATCAAGCAAAAGAAGTTCATCAAGCGAAAGAAGTTCATTTAGACA
TGAAAATAAACACAATGGATAAAAATAAACAAATAGTCTAAGATTAGAAGTAAACTTCGT
TGTCATTGTGATTTGTCAATGGATAGAGATATACTAAATGGTGAAAGTAAACACAATGAA
AAAATTCAATTAACGATCAAATTTACCTAAAATGTAAAATTGTGACTGCTTAGTACGATA
TAATATTGTCTATAATGTAGTATAATATGTTAACATTTATTTCATTCAAAAGATTGGATA
TTACCGAATCTGGCATGCCATATATTGTCATCTAAAATAGATAATTTATACCG

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 4

CO CL1972Contig1 488 4 12 U
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CTAAAAACTCTTTCTTCCTCCTCACCAAAAAAAAACTAGAGAGTTTGACAGTAACAATGA
AGAAGACATTCGTAAAACTCAAGAAAACAGTATTACCGAAGCAGAGAGATTGAATTAAAG
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TGTCGAGGCTAACAGGCTTGCCGTCTTCTGCAACGATATCCACTACGGTTCCGGTTTGAT
CAGACTCTATTTCATTCACTAACTTCATGGCTTCGACGATGCATAGAACTTGCCCCTTCT
GCACTTTGTCTCCAACCTTGATAAAAGGTGGTTCACCAGGTCCCGGACTGCGGTAAAATG
TGCCTGCCATGGGACTTTTAACAGTTGGAAGCGATGATTTCGCTGGACTAGGTGGAGATG
GTGCGGGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1BR23JQ U 1
AF RS1BR23TF C 1
AF RS1G150JQ U 14
AF RS1A986JQ U 63
BS 1 56 RS1BR23JQ
BS 57 57 RS1G150JQ
BS 58 121 RS1BR23JQ
BS 122 122 RS1G150JQ
BS 123 124 RS1BR23JQ
BS 125 125 RS1G150JQ
BS 126 163 RS1BR23JQ
BS 164 164 RS1G150JQ
BS 165 275 RS1BR23JQ
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BS 417 488 RS1G150JQ

RD RS1BR23JQ 276 0 0
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CTAAAAACTCTTTCTTCCTCCTCACCAAAAAAAAACTAGAGAGTTTGACAGTAACAATGA
AAAAAACATTCGTAAAACTCAAGAAAACAGTATTACCGAAGCAAAGAGATTGAATTAAAG
TAGCCACGTTTCCCCGTTTCTCATGGTGTCGATTCTACGGTTGAACCACAAACAGAGGAG
TGTCGAGGCTAACAGGCTTGCCGTCTTCTGCAACG
C

QA 1 275 1 275
DS 

RD RS1BR23TF 276 0 0
CGCGAATAAAACAGAGGTCTCATCTTTTTTTCTTTTTCTTTTTTGTTTAACCAATAGAAA
CTAAAAACTCTTTCTTCCTCCTCACCAAAAAAAAACTAGAGAGTTTGACAGTAACAATGA
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TAGCCACGTTTCCCCGTTTCTCATGGTGTCGATTCTACGGTTGAACCACAAACAGAGGAG
TGTCGAGGCTAACAGGCTTGCCGTCTTCTGCAACG
C

QA 1 275 1 275
DS 

RD RS1G150JQ 475 0 0
GAGGTCTCATCTTTTTTTCTTTTTCTTTTTTGTTTAACCAATAGAAACTAAAAACTCTTT
CTTCCTCCTCACCAAAAAAAA*CTAGAGAGTTTGACAGTAACAATGAAGAAGACATTCGT
AAAACTCAAGAAAACAGTATTACCAAAGCAGAGAGATTGAATTAAAGTAGCCACGTTTCC
CCGTTTCTCATGGTGTCGATTCTACGGTTGAACCACAAACAGAGGAGTGTCGAGGCTAAC
GGGCTTGCCGTCTTCTGCAACGATATCCACTACGGTTCCGGTTTGATCAGACTCTATTTC
ATTCACTAACTTCATGGCTTCGACGATGCATAGAACTTGCCCCTTCTGCACTTTGTCTCC
AACCTTGATAAAAGGTGGTTCACCAGGTCCCGGACTGCGGTAGAATGTGCCTGCCATGGG
ACTTTTAACAGTTGGAAGCGATGATTTCGCTGGACTAGGTGGAGATGGTGCGGGC

QA 1 475 1 475
DS 

RD RS1A986JQ 424 0 0
AAAAACTCTTTCTTCCTCCTCACAAAAAAAAAACTAGAGAGTTTGACAGTAACAATGAAG
AAAACATTCGTAAAACTCAAGAAAACAGTATTACCAAAGCAGAGAGATTGAATTAAAGTA
GCCACGTTTCTCCGTTTCTCATGGTGTCGATTCTACGGTTGAACCACAAACAGAGGAGTG
TCGAGGCTAACAGGCTTGCCGTCTTCTGCAACGATATCCACTACGGTTCCGGTTTGATCA
GACTCTATTTCATTCATTAACTTCATGGCTTCGACGATGCATAGAACTTGCCCCTTCTGC
ACTTTGTCTCCAACCTTGATAAAAGGTGGTTCACCAGGTCCTGGACTGCGGTAAAATGTG
CCTGCCATGGGACTTTTAACAGTTGGAAGCGATGATTTCGCTGGACTAGGTGGGGATGGT
GCGG

QA 1 424 1 424
DS 



AS 1 4

CO CL1973Contig1 917 4 9 U
GCGATTTACTCCCAGATGACGACTTTCACGGTGGAACAAGCCACGTTCATGGAGCGTAAA
CTCGGGTCTTTCACGGTTCCCGCGGGGTCCTACTCCGCGTTTCTAATCCTCACCATTCTC
CTCTTCACTTCCCTTAACGAGAGAGTCTTTGTGCCTTTAGCAAGAAAGGTCACAAAGAAA
CCTCAAGGGATCACCAGCCTTCAGAGAATCGGAGTAGGGCTTGTGTTGTCAATGGGTGCA
ATGGCGGTGGCAGCGGTTATAGAGAACGCTAGACGCGAGGCAGAAGTTACCAACGGTTAT
AAGATAAGCGCGTTCTGGTTGATCCCACAGTATTTCTTGGTCGGTGCGGGTGAAGCGTTT
GCTTACGTTGGACAGCTTGAGTTCTTTATAAGGGAAGCACCGGAGAGGATGAAGTCGATG
AGCACCGGGTTGTTCTTGAGCACGATTTCGATGGGATTCTTTGTGAGCAGCTTGCTTGTT
TCTCTTGTTGATAAGGTTACGCACAAGAGCTGGCTTAGAAGCAACCTTAACAAAGCGAGA
TTGAACTACTTCTACTGGTTGCTTGTTGTCTTGGGAGCTTTTAACTTCTTGGTTTTTATA
GTGTTTGCGATGAGGCATCAGTATAAAGCTGATATGATTAGTGTTGGGGTTGATGATTCA
CAGGAGAAGGAGAAGGATAACGAGAAAGACAAATCTGAGCTTGAGCTTAAAGACATTCCA
TAAAACCAGAGATTTGTCTTGGATCTTTCTTCCCACTTGCTTGTTGTTGCTTTGAAGATT
TTCATTTTTTTTTGGTATTTTTAAAACTATAATGTGTGTATGAAATACAAGCATTTCTAC
ATATAGTTTGGATTATAATTTTGTAAAATTTGAAAACATTTGTTATTACTATTTAATGGT
AGCTTTTCTTTTGCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G274TF U 1
AF RS1G274JQ C 159
AF RS1CR52JQ C 259
AF RS1CR52TF U 259
BS 1 263 RS1G274TF
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RD RS1G274TF 660 0 0
GCGATTTACTCCCAGATGACGACTTTCACGGTGGAACAAGCCACGTTCATGGAGCGTAAA
CTCGGGTCTTTCACGGTTCCCGCGGGGTCCTACTCCGCGTTTCTAATCCTCACCATTCTC
CTCTTCACTTCCCTTAACGAGAGAGTCTTTGTGCCTTTAGCAAGAAAGGTCACAAAGAAA
CCTCAAGGGATCACCAGCCTTCAGAGAATCGGAGTAGGGCTTGTGTTGTCAATGGGTGCA
ATGGCGGTGGCAGCGGTTATAGATAACGCTAGACGCGAGGCAGAAGTTACCAACGGTTAT
AAGATAAGCGCGTTCTGGTTGATCCCACAGTATTTCTTGGTCGGTGCGGGTGAAGCGTTT
GCTTACGTTGGACAGCTTGAGTTCTTTATAAGGGAAGCACCGGAGAGGATGAAGTCTATG
AGCACCGGGTTGTTCTTGAGCACGATTTCGATGGGATTCTTTGTGAGCAGCTTGCTTGTT
TCTCTTGTTGATAAGGTTA*GCACAAGAGCTGGCTTAGAAGCAACCTTAACAAAGCGAGA
TTGAACTACTTCTACTGGTTGCTTGTTGTCTTGGGAGCTTTTAACTTCTTGGTTTTTATA
GTGTTTGCGATGAGGCATCAGTATAAAGCTGATATGATTAGTGTTGGGGTTGATGATTCA

QA 1 660 1 660
DS 

RD RS1G274JQ 759 0 0
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GCTTGTGTTGTCAATGGGTGCAATGGCGGTGGCAGCGGTTATAGATAACGCTAGACGCGA
GGCAGAAGTTACCAACGGTTATAAGATAAGCGCGTTCTGGTTGATCCCACAGTATTTCTT
GGTCGGTGCGGGTGAAGCGTTTGCTTACGTTGGACAGCTTGAGTTCTTTATAAGGGAAGC
ACCGGAGAGGATGAAGTCTATGAGCACCGGGTTGTTCTTGAGCACGATTTCGATGGGATT
CTTTGTGAGCAGCTTGCTTGTTTCTCTTGTTGATAAGGTTA*GCACAAGAGCTGGCTTAG
AAGCAACCTTAACAAAGCGAGATTGAACTACTTCTACTGGTTGCTTGTTGTCTTGGGAGC
TTTTAACTTCTTGGTTTTTATAGTGTTTGCGATGAGGCATCAGTATAAAGCTGATATGAT
TAGTGTTGGGGTTGATGATTCACAGGAGAAGGAGAAGGATAACGAGAAAGACGAATCTGA
GCTTGAGCTTAAAGACATTCCATAAAACCAGAGATTTGTCTTGGATCTTTCTTCCCACTT
GCTTGTTGTTGCTTTGAAGATTTTCATTTTTTTT*GGTATTTTTAAAACTATAATGTGTG
TATGAAATACAAGCATTTCTACATATAGTTTGGATTGTAATTTTGTAAAATTTGAAAACA
TTTGTTATTACTATTTAATGGTAGCTTTTCTTTTGCATC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RS1CR52JQ 644 0 0
G
TAGAGAACGCTAGACGCGAGGCAGAAGTTACCAACGGTTATAAGATAAGCGCGTTCTGGT
TGATCCCACAGTATTTCTTGGTCGGTGCGGGTGAAGCGTTTGCTTACTTTGGACAGCTTG
AGTTCTTTATAAGGGAAGCACCGGAGAGGATGAAGTCGATTAGCACCGGGTTGTTCTTGA
GCACGATTTCGATGGGATTCTTTGTGAGCAGCTTGCTTGTTTCTCTTGTTGATAAGGTTA
CGCACAAGAGCTGGCTTAGAAGCAACCTTAACAAAGCGAGATTGAACTACTTCTACTGGT
TGCTTGTTGTCTTGGGAGCTTTTAACTTCTTGGTTTTTATAGTGTTTGCGATGAGGCATC
AGTATAAAGCTGATATGATTAGTGTTGGGGTTGATGATTCACAGGAGAAGGAGAAGGATA
ACGAGAAAGACAAATTTGAGCTTGAGCTTAAAGACATTCCATAAAACCAGAGATTTGTCT
TGGATCTTTCTTCCCACTTGCTTGTTGTTGCTTTGAAGATTTTCATTTTTTTTTGGTATT
TTTAAAACTATAATGTGTGTATGAAATACAAGCATTTCTACATATAGTTTGGATTATAAT
TTTGTAAAATTTGAAAACATTTGTTATTACTATTTAATGGTAG

QA 2 644 2 644
DS 

RD RS1CR52TF 644 0 0
G
TAGAGAACGCTAGACGCGAGGCAGAAGTTACCAACGGTTATAAGATAAGCGCGTTCTGGT
TGATCCCACAGTATTTCTTGGTCGGTGCGGGTGAAGCGTTTGCTTACTTTGGACAGCTTG
AGTTCTTTATAAGGGAAGCACCGGAGAGGATGAAGTCGATTAGCACCGGGTTGTTCTTGA
GCACGATTTCGATGGGATTCTTTGTGAGCAGCTTGCTTGTTTCTCTTGTTGATAAGGTTA
CGCACAAGAGCTGGCTTAGAAGCAACCTTAACAAAGCGAGATTGAACTACTTCTACTGGT
TGCTTGTTGTCTTGGGAGCTTTTAACTTCTTGGTTTTTATAGTGTTTGCGATGAGGCATC
AGTATAAAGCTGATATGATTAGTGTTGGGGTTGATGATTCACAGGAGAAGGAGAAGGATA
ACGAGAAAGACAAATCTGAGCTTGAGCTTAAAGACATTCCATAAAACCAGAGATTTGTCT
TGGATCTTTCTTCCCACTTGCTTGTTGTTGCTTTGAAGATTTTCATTTTTTTTTGGTATT
TTTAAAACTATAATGTGTGTATGAAATACAAGCATTTCTACATATAGTTTGGATTATAAT
TTTGTAAAATTTGAAAACATTTGTTATTACTATTTAATGGTAG

QA 2 644 2 644
DS 



AS 1 4

CO CL1974Contig1 695 4 4 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAACGAAAAC
AATAAGCAAGAAACAAAGAATTTATCAAGAAAGCAACACGAGAAGGGTCTAACAATGGAA
TTTGTAAGGTTTCCGATTGTCTCAATCCTCGAAGACATGCTAGAAGTTCCCGAGGATCAC
AACGAGAGGAGCCGCAACAACCCTTCAAGATCTTACATGCGTGACGCGAAGGCAATGGCG
GCTACGCCAGCTGACGTGATCGAGCACCCGAACGCGTACGTTTTCGTGGTGGACATGCCT
GGAATCAAAGGAGAGGAGATCAAGGTCCAGGTGGAGAACGAGAACGTGCTCGTGGTGAGT
GGGGAGAGGCAGAGAGAGAACAAGGAGAGCGAGGGACTGAAGTATGTGAGGATGGAGAGG
AGAATGGGGAAGTTTATGAGGAAGTTTCAGCTGCCTGAGAATGCTGATTTGGAGGAGATC
TCTGCTGTTTGTCATGACGGTGTGTTGAAAGTGACTGTTCAGAAGCTTCCTCCTCCTGAG
CCTAAGAAACCAAAGACTATTCAAGTCCAAGTTGCTTGAGTTTCTGGATTTTGTCCTTTT
TATGCCATGTTGGTTTGGTTTTCGGGTTCGGATGTTATTTGAATGTGTGAGAGACTGTGT
GATGACGTGCGTTCTAAGCTTAAATAAAGTTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 

AF RS1A156TV U 1
AF RS1AH62TF U 47
AF RS1AH62JQ C 154
AF RS1A156TF U 174
BS 1 187 RS1A156TV
BS 188 188 RS1AH62TF
BS 189 691 RS1A156TV
BS 692 695 RS1A156TF

RD RS1A156TV 695 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAACGAAAAC
AATAAGCAAGAAACAAAGAATTTATCAAGAAAGCAACACGAGAAGGGTCTAACAATGGAA
TTTGTAAGGTTTCCGATTGTCTCAATCCTCGAAGACATGCTAGAAGTTCCCGAGGATCAC
AACGAGAAGAGCCGCAACAACCCTTCAAGATCTTACATGCGTGACGCGAAGGCAATGGCG
GCTACGCCAGCTGACGTGATCGAGCACCCGAACGCGTACGTTTTCGTGGTGGACATGCCT
GGAATCAAAGGAGAGGAGATCAAGGTCCAGGTGGAGAACGAGAACGTGCTCGTGGTGAGT
GGGGAGAGGCAGAGAGAGAACAAGGAGAGCGAGGGACTGAAGTATGTGAGGATGGAGAGG
AGAATGGGGAAGTTTATGAGGAAGTTTCAGCTGCCTGAGAATGCTGATTTGGAGGAGATC
TCTGCTGTTTGTCATGACGGTGTGTTGAAAGTGACTGTTCAGAAGCTTCCTCCTCCTGAG
CCTAAGAAACCAAAGACTATTCAAGTCCAAGTTGCTTGAGTTTCTGGATTTTGTCCTTTT
TATGCCATGTTGGTTTGGTTTTCGGGTTCGGATGTTATTTGAATGTGTGAGAGACTGTGT
GATGACGTGCGTTCTAAGCTTAAATAAAGTT
GTTC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1AH62TF 649 0 0
GGATC
AACGAAAACAATAAGCAAGAAACAAAGAATTTATCAAGAAAGCAACACGAGAAGGGTCTA
ACAATGGAATTTGTAAGGTTTCCGATTGTCTCAATCCTCGAAGACATGCTAGAAGTTCCC
GAGGATCACAACGAGAGGAGCCGCAACAACCCTTCAAGATCTTACATGCGTGACGCGAAG
GCAATGGCGGCTACGCCAGCTGACGTGATCGAGCACCCGAACGCGTACGTTTTCGTGGTG
GACATGCCTGGAATCAAAGGAGAGGAGATCAAGGTCCAGGTGGAGAACGAGAACGTGCTC
GTGGTGAGTGGGGAGAGGCAGAGAGAGAACAAGGAGAGCGAGGGACTGAAGTATGTGAGG
ATGGAGAGGAGAATGGGGAAGTTTATGAGGAAGTTTCAGCTGCCTGAGAATGCTGATTTG
GAGGAGATCTCTGCTGTTTGTCATGACGGTGTGTTGAAAGTGACTGTTCAGAAGCTTCCT
CCTCCTGAGCCTAAGAAACCAAAGACTATTCAAGTCCAAGTTGCTTGAGTTTCTGGATTT
TGTCCTTTTTATGCCATGTTGGTTTGGTTTTCGGGTTCGGATGTTATTTGAATGTGTGAG
AGACTGTGTGATGACGTGCGTTCTAAGCTTAAATAAAGTT
GTGC

QA 6 645 6 645
DS 

RD RS1AH62JQ 538 0 0
GACATGCTAGAAGTTCCCGAGGATCACAACGAGAGGAGCCGCAACAACCCTTCAAGATCT
TACATGCGTGACGCGAAGGCAATGGCGGCTACGCCAGCTGACGTGATCGAGCACCCGAAC
GCGTACGTTTTCGTGGTGGACATGCCTGGAATCAAAGGAGAGGAGATCAAGGTCCAGGTG
GAGAACGAGAACGTGCTCGTGGTGAGTGGGGAGAGGCAGAGAGAGAACAAGGAGAGCGAG
GGACTGAAGTATGTGAGGATGGAGAGGAGAATGGGGAAGTTTATGAGGAAGTTTCAGCTG
CCTGAGAATGCTGATTTGGAGGAGATCTCTGCTGTTTGTCATGACGGTGTGTTGAAAGTG
ACTGTTCAGAAGCTTCCTCCTCCTGAGCCTAAGAAACCAAAGACTATTCAAGTCCAAGTT
GCTTGAGTTTCTGGATTTTGTCCTTTTTATGCCATGTTGGTTTGGTTTTCGGGTTCGGAT
GTTATTTGAATGTGTGAGAGACTGTGTGATGACGTGCGTTTTAAGCTTAAATAAAGTT

QA 1 538 1 538
DS 

RD RS1A156TF 522 0 0
GGATCACAACGAGAAGAGCCGCAACAACCCTTCAAGATCTTACATGCGTGACGCGAAGGC
AATGGCGGCTACGCCAGCTGACGTGATCGAGCACCCGAACGCGTACGTTTTCGTGGTGGA
CATGCCTGGAATCAAAGGAGAGGAGATCAAGGTCCAGGTGGAGAACGAGAACGTGCTCGT
GGTGAGTGGGGAGAGGCAGAGAGAGAACAAGGAGAGCGAGGGACTGAAGTATGTGAGGAT
GGAGAGGAGAATGGGGAAGTTTATGAGGAAGTTTCAGCTGCCTGAGAATGCTGATTTGGA
GGAGATCTCTGCTGTTTGTCATGACGGTGTGTTGAAAGTGACTGTTCAGAAGCTTCCTCC
TCCTGAGCCTAAGAAACCAAAGACTATTCAAGTCCAAGTTGCTTGAGTTTCTGGATTTTG
TCCTTTTTATGCCATGTTGGTTTGGTTTTCGGGTTCGGATGTTATTTGAATGTGTGAGAG
ACTGTGTGATGACGTGCGTTCTAAGCTTAAATAAAGTTGTTC

QA 1 522 1 522
DS 



AS 1 4

CO CL1975Contig1 612 4 6 U
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GGGTGCGGGGAAGGAAGCAAACTTACGTGCCTTGCTTTCCACGCTACAATATGTTCTTTG
GCCAGAATGCGGTTGGCAGCCTGTTTCATTGACCGATTTAATTACAGCTGCTTCTGTCAA
GAAATTTTACAGGAAGGCCACTCTCTGTATACACCCTGACAAAGTACAGCAAAAAGGCGC
TAATCTCCAGCAGAAATACATTGCGGAGAAAGTGTTCGACATGCTCAAGGAAGCATGGAA
CAAGTTCAACTCCGAAGAACTCTTTTAAACTGGATTATGTTTTGAGTTAGTGTCATTTTG
TGTGTCGCCAAAAAGATGAAGCAAGTTCATTCATTAAAATGCCAAAAACGTGGTGCCAAA
GTTGGATTACCCAAATATTGCATCATTGTAGCCATTGCAGCAATTGGGCAGTCTTATTTT
TTGTTGTTGATTTTTTTCCCTCTCACTTTCACTATCCAGGTCTTTGTAAGACTACGATGG
AAAATTTGTTGATGTTGATTTCTTGTATCAGAGTACAATATTTATACATATATAAATGTT
TATTGAGGTTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RS1EY66TF U 68
AF RS1E439JQ C 1
AF RS1EY66JQ C 244
AF RS1E439TF U 1
BS 1 67 RS1E439TF
BS 68 496 RS1EY66TF
BS 497 497 RS1E439TF
BS 498 593 RS1EY66TF
BS 594 611 RS1E439TF
BS 612 612 RS1E439JQ

RD RS1EY66TF 526 0 0
GGGAAGGAAGCAAACTTACGTGCCTTGCTTTCCACGCTACAATATGTTCTTTGGCCAGAA
TGCGGTTGGCAGCCTGTTTCATTGACCGATTTAATTACAGCTGCTTCTGTCAAGAAATTT
TACAGGAAGGCCACTCTCTGTATACACCCTGACAAAGTACAGCAAAAAGGCGCTAATCTC
CAGCAGAAATACATTGCGGAGAAAGTGTTCGACATGCTCAAGGAAGCATGGAACAAGTTC
AACTCCGAAGAACTCTTTTAAACTGGATTATGTTTTGAGTTAGTGTCATTTTGTGTGTCG
CCAAAAAGATGAAGCAAGTTCATTCATTAAAATGCCAAAAACGTGGTGCCAAAGTTGGAT
TACCCAAATATTGCATCATTGTAGCCATTGCAGCAATTGGGCAGTCTTATTTTTTGTTGT
TGATTTTTT*CCCTCTCACTTTCACTATCCAGGTCTTTGTAAGACTACGATGGAAAATTT
GTTGATGTTGATTTCTTGTATCAGAGTACAATATTTATACATATAT

QA 1 526 1 526
DS 

RD RS1E439JQ 612 0 0
GAAGAGAACAAGCTGAGAAAAATAGGATTGGTGAGACCTTGGATGTTAGATAAAACGTTG
GGGTGCGGGGAAGGAAGCAAACTTACGTGCCTTGCTTTCCACGCTACAATATGTTCTTTG
GCCAGAATGCGGTTGGCAGCCTGTTTCATTGACCGATTTAATTACAGCTGCTTCTGTCAA
GAAATTTTACAGGAAGGCCACTCTCTGTATACACCCTGACAAAGTACAGCAAAAAGGCGC
TAATCTCCAGCAGAAATACATTGCGGAGAAAGTGTTCGACATGCTCAAGGAAGCATGGAA
CAAGTTCAACTCCGAAGAACTCTTTTAAACTGGATTATGTTTTGAGTTAGTGTCATTTTG
TGTGTCGCCAAAAAGATGAAGCAAGTTCATTCATTAAAATGCCAAAAACGTGGTGCCAAA
GTTGGATTACCCAAATATTGCATCATTGTAGCCATTGCAGCAATTGGGCAGTCTTATTTT
TTGTTGTTGATTTTTTTCCCTCTCACTTTCACTATCCAGGTCTTTGTAAGACTACGATGG
AAAATTTGTTGATGTTGATTTCTTGTATCAGAGTACAATATTTATACATATATAAATGTT
TATTGAGGTTTG

QA 1 612 1 612
DS 

RD RS1EY66JQ 368 0 0
TT
TCCAGCAGAAATACATTGCGGAGAAAGTGTTTGACATGCTCAAGGAAGCATGGAACAAGT
TCAACTCCGAAGAACTTTTTTAAACTGGATTATGTTTTGAGTTAGTGTCATTTTGTGGGT
CGCCAAAAAGATGAAGCAAGTTCATTCATTAAAATGCCAAAAACGGGGTGCCAAAGTTGG
ATTACCCAAATATTGCATCATTGTAGCCATTGCAGCAATTGGGCAGTTTTATTTTTTGTT
GTTGATTTTTT*CCCTCTCACTTTCACTATCCAGGTTTTTGTAAGACTACGATGGAAAAT
TTGTTGATGTTGATTTTTTGTATCAGAGTACAATATTTATACATATATAAATGTTTATTG
AGGTTT

QA 3 368 3 368
DS 

RD RS1E439TF 612 0 0
GAAGAGAACAAGCTGAGAAAAATAGGATTGGTGAGACCTTGGATGTTAGATAAAACGTTG
GGGTGCGGGGAAGGAAGCAAACTTACGTGCCTTGCTTTCCACGCTACAATATGTTCTTTG
GCCAGAATGCGGTTGGCAGCCTGTTTCATTGACCGATTTAATTACAGCTGCTTCTGTCAA
GAAATTTTACAGGAAGGCCACTCTCTGTATACACCCTGACAAAGTACAGCAAAAAGGCGC
TAATCTCCAGCAGAAATACATTGCGGAGAAAGTGTTCGACATGCTCAAGGAAGCATGGAA
CAAGTTCAACTCCGAAGAACTCTTTTAAACTGGATTATGTTTTGAGTTAGTGTCATTTTG
TGTGTCGCCAAAAAGATGAAGCAAGTTCATTCATTAAAATGCCAAAAACGTGGTGCCAAA
GTTGGATTACCCAAATATTGCATCATTGTAGCCATTGCAGCAATTGGGCAGTCTTATTTT
TTGTTGTTGATTTTTTTCCCTCTCACTTTCACTATCCAGGTCTTTGTAAGACTACGATGG
AAAATTTGTTGATGTTGATTTCTTGTATCAGAGTACAATATTTATACATATATAAATGTT
TATTGAGGTTT
G

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 4

CO CL1976Contig1 942 4 10 U
GGATCTTCTGAAATTCATCAATAACACATCTCTCAACAACAACCAACAATGGCAACTTCC
ATGACCCAACTTTTTGTTACCCTCTTGCTTGTGGCTGCCCACACGGCCTTCGCGGAAACA
AACATGCTTCAAGATCTTTGTGTTGCTGATCTCAAAGGTACCAAAGTAAACGGATACGCA
TGCAAAGACCCATCACAAGTAACACCAGATGATTTCTACTACATAGGCTTAGCCGCCCCT
GCAGACACATCCAACACCGCAATGGGGTCAGCCGTTACAGCAGGCAACGTTGAGAAAATC
CCTGGCCTCAACATGATGGGTACCTCCATGTCTCGTATCGACTACGCACCTGGTGGACTC
AACCCGCCACATCTTCACCCCCGAGCTTCTGAAGCCATATTCGTCCTCGAAGGACGTCTC
TTCGTCGGCTTCTTGACCACCACTGGAAAACTCATCTCCAAACACATCAACAAAGGAGAC
GTCTTTGTATTCCCAAGAGCTCTCCTCCATTTCCAGCAGAACCCTAACGACGCTCCTGCC
TCCGTGATTGCTGCTTTCGATAGTCAGAACCCTGGGACTCAAAGTGTTGGACCGTCTCTG
TTTGGTGCGAACCCTCCTATTCCTGATGACTTGCTTGCCAAGGCGTTCGGTGTTGAACCA
CAGGTGATTCAGAAGGTTAAGGGAAAATTCCCAGCCAAGAAATGAATATAGGTTTCAGAC
CATACCTAATATAATGCAATAATAATATACAAATAATGAACATAAAAAAATTGTAAAATT
ACTAAACAAAAGCAAAAAAAAAAAATGCTTGTAAGTTTTGTAATTGTTGTAGATATTCTG
TAACTTTTTTTGGTCCACTGATTACAACGGGCAACTTAAAAATCATTACAATCTGTTTTG
TCAAGTTAAAATATTTTGTAACTTTCTTTGTTCTTTATGATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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GG
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AA
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CAGGTGATTCAGAAGGTTAAGGGAAAATTCCCAGCCAAGAAATGAATATAGGTTTCAGAC
CATACCTAATATAATGCAATAATAATATACAAATAATGAACATAAAAAA*TTGTAAAATT
ACTAAACAAAAGCAAAAAAAAAAAATGCTTGTAAGTTTTGTAATTGTTGTAGATATTCTG
TAACTTTTTT*GGTCCACTGATTACAACGGGCAACTTAAAAATCATTACAATCTGTTTTG
TCAAGTTAAAATATTTTGTAACTTTCTTTGTTCTTTATGATA

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DS 



AS 1 4

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BQ
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AF RS1DT81TF U 56
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GGGTCAGCGTTACAAAGACGCTTTCACTTGGAACCCTTCAGACCCGGATAATGAGATCCT
TGTCTTCGCCAGAAGGACTGTTAAAGACTTGAAACTTCCACAGGCGTTCAACACTCAGAT
TTCTCAATCTATTCAGTCTCAGCTCGCAGATTTTAGAGCATATGAAGGACAAGATATGTA
CACTGGTGAAAAGATCATACCAATCAAGCTTGATCTCCGAGTTAATCATACCCTCATCAA
GGATCAGTTCTTGTGGGACCTAAACAATTTTGAGAGTGATCCTGAGGAATTTTCAAGAAC
CTTGTGTAAGGATTTAGGTGTTGAAGATCCTGAAGTTGGCCCTGCTGTTGCCTTTGCCAT
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GG
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CGTCAAGTTCAGGATGCCTACTGCTGAGAACTTGGTACCTATCCGTTTGGACATTCAATT
CGAGGGTCAGCGTTACAAAGACGCTTTCACTTGGAACCCTTCAGACCCGGATAATGAGAT
CCTTGTCTTCGCCAGAAGGACTGTTAAAGACTTGAAACTTCCACAGGCGTTCAACACTCA
GATTTCTCAATCTATTCAGTCTCAGCTCGCAGATTTTGGAGCATATGAAGGACAAGATAT
GTACACTGGTGAAAAGATCATACCAATCAAGCTTGATCTCCGAGTTAATCATACCCTCAT
CAAGGATCAGTTCTTGTGGGACCTAAACAATTTTGAGAGTGATCCTGAGGAATTTGCAAG
AACCTTGTGTAAGGATTTAGGTGTTGAAGATCCTGAAGTTGGCCCTGCTGTTGCCTTTGC
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GACTTAGTGAAATTATTCAGCTTTAAGTCCAGTGTAGTTCGGAAAAGGAAAGACTTGGAT
TTTTATGAACCAATGGTGGATATGCTAACAAA

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GGTGAAAAGATCATACCAATCAAGCTTGATCTCCGAGTTAATCATACCCTCATCAAGGAT
CAGTTCTTGTGGGACCTAAACAATTTTGAGAGTGATCCTGAGGAATTTGCAAGAACCTTG
TGTAAGGATTTAGGTGTTGAAGATCCTGAAGTTGGCCCTGCTGTTGCCTTTGCCATCAGA
GAACAACTTTACGAGATTGCAGTTCAAAGTGTAACTTCAGCTAGGGAGAGTAGGTTAAGC
AAGAAAAGCCGCAGAGGATCTGATTATGGTTCAGCGAGGCTGGCTTGTCAATGGACTTAG
TGAAATTATTCAGCTTTAAGTCCAGTGTAGTTCGGAAAAGGAAAGACTTGGATTTTTATG
AACCAATGGTGGATATGCTAACAAATGAGGAAGTTGATGCTCTTGAAGGCAGAGAAGAGA
GGCATGCAAGGTGAAGAGTTCCGTGGAACATGTATATGTCTTAGGACAGAACTCAAAATG
AAGATTAGCACGAACTCAAATGATGTTGTACTAAGGTTAACTGGAAGCTTATGATCTTAG
GGGAACTTTTCT
CC

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TAACAAATGAGGAAGTTGATGCTCTTGAAGGCAGAGAAGAGAGGCATGCAAGGTGAAGAG
TTTCGTGGAACATGTATATGTCTTAGGACAGAACTCAAAATGAAGATTAGCACGAACTCA
AATGATGTTGTACTAAGGTTAACTGGAAGCTTATGATCTTAGGGGAACTTTTCTTCAATT
CATCGACTTAGGATTCTTGCAACAAATTATATAGACTCATATCTGATAAGACACTTAATC
ATCTACATTAGTGGTTGC

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DS 



AS 1 4

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TCACTCATTGGACATAACAGTAGTAACAAGCTAACCATGATACCAAAACAGCTTACAAGA
AGTAAACTTACATTCACTAACATTTTTTCTAACACAAGAAAGTTCCCTATTCAGTATCCA
AAGACCAAAGCAAACAGAGTATCATCAACAAGCCAGTTGATCTCTCAGTGGTAAGATCTC
TTCGAAAATCGGAAGCCTTCTCGTCCTCAAAGGCCTCCTCCATTCTTTCATAAACTCGTC
AATCCCTTCCACGACCGCGATCTCATCCATACCGACTTCACATTCCACAGACACAGAAAA
AGCGACAACAGGCTCTAGCTCGCTCAGCAGCTCTTGAACTCGAACCTTCAACCTCGAATC
ATCATCAAACCCTTCTCTCTTCTCTTGCAACACATCGCGATACAGAATCGTCCTCGCCTC
GTCGACCTTCCCTTGCTTGATGAGACAAGTGCACAGATTACAAGCCTTGTTTGCATCAGG
CTCTACAACTTGAGCTTTACGGTACACGGTTTCAGCCGCTGTGTAGTCTTTTAGCTGCAT
ATAAGCCCATCCCAAGTTCCCCAAGATCCTAGACGTCTCCTTCTCGACCGTGACCTGAAA
CTTCTTCCCGTGAGGTCTCGCCGTCTTCGTCGGCTTCCCGTTGAACGCTTCCCCTTGGTA
TATCATCCAAAGCTTCTGCTTCAATAGCTCGACTTGCTCTTCTATCCTCCCACACTTCTT
GTAGAGATCGATGAGGACATTGTCGAGTGACTCTTGAGCTTGTCTCGAACAAAGATATCT
AAAGGAATGAATCGCATCAATGGCTTCCTCTGCTCTGTTCTGTTGTTTCATAAGCAAAGC
CATGTCCTTAAGAGCGCTGTCCACGCTGTCCCTCGCTTTGATCGCTATCCAGAACAGCTC
TATCGCTGCTTCTGCATCCTTCTCCACCAGCTGAACATGTTTTGCTCGGACATAAGGACT
GTCACCGTGAGGCAGCTTATGGACAACGTTGTACGCTGCCGGAAAGTCTTGTCTTTCTCC
TCCTCTTCTCAGACTCATCATCACAAACTCTCTCTTCTCTTCTCTGTATCTAAATTTTCT
AAATGAAGAAACAAACTTCTTCTCTCTATATCTTTCTCTCTCCTAAAAGCGGTAACACCG
TTTTCTCTATCTATCTCTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RS1A557JQ U 240
AF RS1DC91JQ U 1
AF RS1A557TF C 496
AF RS1DC91TF C 546
BS 1 358 RS1DC91JQ
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BS 1094 1223 RS1A557TF

RD RS1A557JQ 394 0 0
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QA 1 394 1 394
DS 

RD RS1DC91JQ 701 0 0
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TTCGAAAATCGGAAGCCTTCTCGTCCTCAAAGGCCTCCTCCATTCTTTCATAAACTCGTC
AATCCCTTCCACGACCGCGATCTCATCCATACCGACTTCACATTCCACAGACACAGAAGA
AGCGACAACAGGCTCTAGCTCGCTCAGCAGCTCTTGAACTCGAACCTTCAACCTCGAATC
ATCATCAAACCCTTCTCTCTTCTCTTGCAACACATCGCGATACAGAATCGTCCTCGCCTC
GTCGACCTTCCCTTGCTTGATGAGACAAGTGCACAGATTACAAGCCTTGTTTGCATCAGG
CTCTACAACTTGAGCTTTACGGTACACGGTTTCAGCCGCTGTGTAGTCTTTTAGCTGCAT
ATAAGCCCATCCCAAGTTCCCCAAGATCCTAGACGTCTCCTTCTCGACCGTGACCTGAAA
CTTCTTCCCGTGAGGTCTCGCCGTCTTCGTCGGCTTCCCGT

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DS 

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TTTACGGTACACGGTTTCAGCCGCTGTGTAGTCTTTTAGCTGCATATAAGCCCATCCCAA
GTTCCCCAAGATCCTAGACGTCTCCTTCTCGACCGTGACCTGAAACTTCTTCCCGTGAGA
TCTCGCCGTCTTCGTCGGCTTCCCGTTGAACGCTTCCCCTTGGTATATCATCCAAAGCTT
CTGCTTCAATAGCTCGACTTGCTCTTCTATCCTCCCACACTTCTTGTAGAGATCGATGAG
GACATTGTCGAGTGACTCTTGAGCTTGTCTCGAACAAAGATATCTAAAGGAATGAATCGC
ATCAATGGCTTCTTCTGCTCTGTTCTGTTGTTTCATAAGCAAAGCCATGTCCTTAAGAGC
GCTGTCCACTCTGTCCCTCGCTTTGATCGCTATCCAGAACAGCTCTATCGCTGCTTCTGC
ATCCTTCTCCACCAGCTGAACATGTTTTGCTCGGACATAAGGACTGTCACCGTGAGGCAG
CTTATGGACAACGTTGTACGCTGCCGGAAAGTCTTGTCTTTCTCCTCCTCTTCTCAGGCT
CATCATCACAAACTCTCTCTTCTCTTCTCTGTATCTAAATTTTCTAAATGAAGAAACAAA
CTTCTTCTCTCTATATCTTTCTCTCTCCTAAAAGCGGTAACACCGTTTTCTCTATCTATC
TCTCTCCC

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1DC91TF 676 0 0
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CCCATCCCAAGTTCCCCAAGATCCTAGACGTCTCCTTCTCGACCGTGACCTGAAACTTCT
TCCCGTGAGGTCTCGCCGTCTTCGTCGGCTTCCCGTTGAACGCTTCCCCTTGGTATATCA
TCCAAAGCTTCTGCTTCAATAGCTCGACTTGCTCTTCTATCCTCCCACACTTCTTGTAGA
GATCGATGAGGACATTGTCGAGTGACTCTTGAGCTTGTCTCGAACAAAGATATCTAAAGG
AATGAATCGCATCAATGGCTTCCTCTGCTCTGTTCTGTTGTTTCATAAGCAAAGCCATGT
CCTTAAGAGCGCTGTCCACGCTGTCCCTCGCTTTGATCGCTATCCAGAACAGCTCTATCG
CTGCTTCTGCATCCTTCTCCACCAGCTGAGCATGTTTTGCTCGGACATAAGGACTGTCAC
CGTGAGGCAGCTTATGGACAACGTTGTACGCTGCCGGAAAGTCTTGTCTTTCTCCTCCTC
TTCTCAGACTCATCATCACAAACTCTCTCTTCTCTTCTCTGTATCTAAATTTTCTAAATG
AAGAAACAAACTTCTTCTCTCTATATCTTTCTCTCTCCTAAAAGCGGTAACACCGTTTTC
TCTATCTATCTCTC
CC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 3

CO CL1979Contig1 752 3 16 U
GGATTGCGATTCACTCTTCTCCCCCATCATCTTTCAGTCAGGAGATATCTGACGGATTTG
AACGGCTATGATGGAACCGCTTGGTGGTAACAAAGGACAAGGATTCAACGATGTTGGTTT
TGAAGGTGTGAAGAAAATAACTGTGGGAGCCGATGATGTAAACATAACTTATATCAAGAT
CGAATACGTAAAGAACGGAAAAGTCGACATCCGTGAGCATGGAGCGGCTCGTGGCGAACT
AAAAGAGTTTTCAGTGGATTATCCGAAAGATAGTATCACTGCCGTTGGTGGAACCTACAA
GCATATTTACTCTTATGATACAACGCTTATCACATCGCTGTACTTCACAACCTCTAAAGG
ATTTACCTCTCCTTTATTCGGTGAGATGAAGGGAACCGAATTCGAGTTCAAAGGTGAAAA
TGGAGAAAAGCTTATTGGATTCCATGGACGTAGCAGTAATGCTATCGATGCCATCGGAGC
TTATTTCGGCTCTAACTCCGGAGGTGATGACTCAAACAGTGGAAGCGGATCTAGTACTCA
AAAACTTGACGCTCAAGGTGGCAACGGAGGCAATGAATGGGATGATGG*AGGTGATCACG
ACGGTGTGACAAAGATACATATCGCAGTTGG*TAGAGGTATTGAGCAAATCAGTTTGATT
ATCTCAAGAACGGACAGACAAAGGAAGACCGCCCATGGTGTGAAGGGTGGCAGATCTCCA
TTAGAACGTTTGAGATAGTCATCCCACGAGTA


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BC91TF U 1
AF RS1CC16TF U 1
AF RS1BA03TF U 2
BS 1 16 RS1BC91TF
BS 17 18 RS1CC16TF
BS 19 66 RS1BC91TF
BS 67 67 RS1CC16TF
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BS 69 69 RS1CC16TF
BS 70 207 RS1BC91TF
BS 208 208 RS1CC16TF
BS 209 419 RS1BC91TF
BS 420 420 RS1CC16TF
BS 421 499 RS1BC91TF
BS 500 501 RS1CC16TF
BS 502 671 RS1BC91TF
BS 672 672 RS1CC16TF
BS 673 679 RS1BC91TF
BS 680 752 RS1BA03TF

RD RS1BC91TF 684 0 0
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TGAAGGTGTGAAGAAAATAACTGTGGGAGCCGATGATGTAAACATAACTTATATCAAGAT
CGAATACGTAAAGAACGGAAAAGTCGAGATCCGTGAGCATGGAGCGGCTCGTGGCGAACT
AAAAGAGTTTTCAGTGGATTATCCGAAAGATAGTATCACTGCCGTTGGTGGAACCTACAA
GCATATTTACTCTTATGATACAACGCTTATCACATCGCTGTACTTCACAACCTCTAAAGG
ATTTACCTCTCCTTTATTCGGTGAGATGAAGGGAACCGAATTCGAGTTCAAAGGTGAAAG
TGGAGAAAAGCTTATTGGATTCCATGGACGTAGCAGTAATGCTATCGATGCCATCGGAGC
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AAAACTTGACGCTCAAGGTGGCAACGGAGGCAATGAATGGGATGATGG*AGGTGATCACG
ACGGTGTGACAAAGATACATATCGCAGTTGG*TAGAGGTATTGAGCAAATCAGTTTGATT
ATCTCAAGAACAGACAGAC
AAAGA

QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1CC16TF 679 0 0
G
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GAAGGTGTGAAGAAAATAACTGTGGGAGCCGATGATGTAAACATAACTTATATCAAGATC
GATTACGTAAAGAACGGAAAAGTCGACATCCGTGAGCATGGAGCGGCTCGTGGCGAACTA
AAAGAGTTTTCAGTGGATTATCCAAAAGATAGTATCACTGCCGTTGGTGGAACCTACAAG
CATATTTACTCTTATGATACAACGCTTATCACATCGCTGTACTTCACAACCTCTAAAGGA
TTTACCTCTCCTTTATTCGGTGAGATGAAGGGAACCGAATTCGAGTTCAAAGGTGAAAAT
GGAGAAAAGCTTATTGGATTCCATGGACGTAGCAGTAATGCTATCGATGCCATCGGAGCT
TATTTCGGCTCTAACTCCGGAGGTGATGACTCAAACAGTGGAAGCGGATCTAGTACTCAA
AAACTTGACGCTCAAGGTGGCAACGGAGGCAATGAATGGGATGATGGGAGGTGATCACGA
CGGTGTGACAAAGATACATATCGCAGTTGGGTAGAGGTATTGAGCAAATCAGTTTGATTA
TCTCAAGAACGGACAGAC

QA 2 679 2 679
DS 

RD RS1BA03TF 751 0 0
GATTGCGATTCACTCTTCTCCCCCATCATCTTTCAGTCAGTAGATATCTGACGGATTTGA
ACGGCTATGATGGAACCGCTTGGTGGTAACAAAGGACAAGGATTCAACGATGTTGGTTTT
GAAGGTGTGAAGAAAATAACTGTGGGAGCCGATGATGTAAACATAACTTATATCAAGATC
GAATACGTAAAGAACGGAAAAGTCGACATCCGTGAGCATGGAGCGGCTCGTGGCGAACTA
AAAGAGTTTTCAGTGGATTATCCGAAAGATAGTATCACTGCCGTTGGTGGAACATACAAG
CATATTTACTCTTATGATACAACGCTTATCACATCGCTGTACTTCACAACCTCTAAAGGA
TTTACCTCTCCTTTATTCGGTGAGATGAAGGGAACCGAATTCGAGTTCAAAGGTGAAAAT
GGAGAAAAGCTTATTGGATTCCATGGACGTAGCAGTAATGCTATCGATGCCATCGGAGCT
TATTTCGGCTCTAACTCCGGAGGTGATGACTCAAACAGTGGAAGCGGATCTAGTACTCAA
AAACTTGACGCTCAAGGTGGCAACGGAGGCAATGAATGGGATGATGG*AGGTGATCACGA
CGGTGTGACAAAGATACATATCGCAGTTGG*TAGAGGTATTGAGCAAATCAGGTTTGATA
TCTCAAGAACGGACAGACAAAGGAAGACCGCCCATGGTGTGAAGGGTGGCAGATCTCCAT
TAGAACGTTTGAGATAGTCATCCCACGAGTA

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 4

CO CL1980Contig1 1000 4 14 U
GCGACGGGAGGACCTGCTGCGTTAAACGCTGTGAACAGTATGTGCGTAACGGGACAAATA
AAGACGACAGCGTCTGAGTTTCATCAAGGAGACGAAACTGTCGGTAACCTCAAGAGCAGT
GACGAGATGGGTGGTTTTGTCTTGTGGCAGAAGGATCCGGATCTCTGGTGTTTGGAGCTC
GTTGTCTCTGGCTGTAAAGTCATATGTGGGAGTAACGGTCGTCTTTCGTGGCGGCATTCT
TCTAACCAACAAACACCCGCCTCTACCGGTACGCCGAGACCTCTCCGTCGGTTTTTACAG
GGTTTAGATCCTCGATCGACGGCTAATCTATTCCTCGACGCCACGTGCATCGGAGAGAAG
ATAATCAACGGCGAGGATTGCTTTATACTAAAACTGGAGACGAGTCCGGCGGTTCGAGAG
GCACAGAGCGGTTCGAATTTCGAGATCATTCACCACACGATATGGGGTTACTTTAGCCAG
AGATCGGGGCTGTTGATTCAGTTCGAGGACTCGCGGCTTCTGAGTATGCGGACCAAGGAC
GGCGACGTTTTCTGGGAGACTAGCGCCGAGTCGGTGATGGATGATTACAGGTACGTGGAC
AATGTGAACATCGCTCACGGCGGGATAACGTCGGTTACGGTGTTTCGGTACGGTGAAGCA
TCGGCGAATCATCGGAGACAGATGACGGAGAAGTGGCGGATCGAAGAAGTTGATTTTAAC
ATTTGGGGTCTCTCGGTGGATCATTTTCGTCCTCCCGCCAATTTGCGCATCGGGAAATAA
CATTTTGCTCCTATTTTATTATTTTTTTCGTTAGTTTTTAAATATATCAACTAAAAAGTC
GGTGCATTTAAGATTTTGTTTATTTTTATTTGATTTTGACAACGAAAGGCTCTATAGAAG
TTTAATGAGTCTACTAAACTGATTTACACAAAAAAAAATGATGCTGAAAAATATGTATTA
TTAAAAATTTATTACAACATTTTAATTATGATTATGATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1F055TF U 1
AF RS1E636TF U 323
AF RS1F055JQ C 298
AF RS1E636JQ C 340
BS 1 588 RS1F055TF
BS 589 589 RS1E636TF
BS 590 690 RS1F055TF
BS 691 691 RS1E636TF
BS 692 704 RS1F055TF
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BS 708 718 RS1F055TF
BS 719 719 RS1E636TF
BS 720 760 RS1F055TF
BS 761 762 RS1E636TF
BS 763 776 RS1F055TF
BS 777 886 RS1E636TF
BS 887 997 RS1F055JQ
BS 998 1000 RS1E636JQ

RD RS1F055TF 781 0 0
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AAGACGACAGCGTCTGAGTTTCATCAAGGAGACGAAACTGTCGGTAACCTCAAGAGCAGT
GACGAGATGGGTGGTTTTGTCTTGTGGCAGAAGGATCCGGATCTCTGGTGTTTGGAGCTC
GTTGTCTCTGGCTGTAAAGTCATATGTGGGAGTAACGGTCGTCTTTCGTGGCGGCATTCT
TCTAACCAACAAACACCCGCCTCTACCGGTACGCCGAGACCTCTCCGTCGGTTTTTACAG
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GCACAGAGCGGTTCGAATTTCGAGATCATTCACCACACGATATGGGGTTACTTTAGCCAG
AGATCGGGGCTGTTGATTCAGTTCGAGGACTCGCGGCTTCTGAGTATGCGGACCAAGGAC
GGCGACGTTTTCTGGGAGACTAGCGCCGAGTCGGTGATGGATGATTACTGGTACGTGGAC
AATGTGAACATCGCTCACGGCGGGATAACGTCGGTTACGGTGTTTCGGTACGGTGAAGCA
TCGGCGAATCATCGGAGACAGATGACGGAGGAGTGGCGGATCGA**GAGTTGATTTTA*C
ATTTGGGGTCTCTCGGTGGATCATTTTCGTCCTCCCGCCA**TTGCGCATCGGGAA
TACAT

QA 1 776 1 776
DS 

RD RS1E636TF 564 0 0
GG
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ATACTAAAACTGGAGACGAGTCCGGCGGTTCGAGAGGCACAGAGCGGTTCGAATTTCGAG
ATCATTCACCACACGATATGGGGTTACTTTAGCCAGAGATCGGGGCTGTTGATTCAGTTC
GAGGACTCGCGGCTTCTGAGTATGCGGACCAAGGACGGCGACGTTTTCTGGGAGACTAGC
GCCGAGTCGGTGATGGATGATTACAGGTACGTGGACAATGTGAACATCGCTCACGGCGGG
ATAACGTCGGTTACGGTGTTTCGGTACGGTGAAGCATCGGCGAATCATCGGAGACAGATG
ACGGAGAAGTGGCGGATCGAAGAAGTTGATTTTAACATTTGGGGTCTCTCGGTGGATCAT
TTTCGTCCTCCCGCCAATTTGCGCATCGGGAAATAACATTTTGCTCCTATTTTATTATTT
TTTTCGTTAGTTTTTAAATATATCAACTAAAAAGTCGGTGCATTTAAGATTTTGTTTATT
TTTATTTGATTTTGACAACGAA

QA 3 564 3 564
DS 

RD RS1F055JQ 701 0 0
CAGGGTTTAGATCCTCGATCGACGGCTAATCTATTCCTCGACGCCACGTGCATCGGAGAG
AAGATAATCAACGGCGAGGATTGCTTTATACTAAAACTGGAGACGAGTCCGGCGGTTCGA
GAGGCACAGAGCGGTTCGAATTTCGAGATCATTCACCACACGATATGGGGTTACTTTAGC
CAGAGATCGGGGCTGTTGATTCAGTTCGAGGACTCGCGGCTTTTGAGTATGCGGACCAAG
GACGGCGACGTTTTTTGGGAGACTAGCGCCGAGTCGGTGATGGATGATTACTGGTACGTG
GACAATGTGAACATCGCTCACGGCGGGATAACGTCGGTTACGGTGTTTCGGTACGGTGAA
GCATCGGCGAATCATCGGAGACAGATGACGGAGGAGTGGCGGATCGAAGAAGTTGATTTT
AACATTTGGGGTCTCTCGGTGGATCATTTTCGTCCTCCCGCCAATTTGCGCATCGGGAAA
TAACATTTTGCTCCTATTTTATTATTTTTTTCGTTAGTTTTTAAATATATCAACTAAAAA
GTCGGTGCATTTAAGATTTTGTTTATTTTTATTTGATTTTGACAACGAAAGGCTCTATAG
AAGTTTAATGAGTCTACTAAACTGATTTACACAAAAAAAAATGATGCTGAAAAATATGTA
TTATTAAAAATTTATTACAACATTTTAATTATGATTATGA
G

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DS 

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CTGAGTATGCGGACCAAGGACGGCGACGTTTTCTGGGAGACTAGCGCCGAGTCGGTGATG
GATGATTACAGGTACGTGGACAATGTGAACATCGCTCACGGCGGGATAACGTCGGTTACG
GTGTTTCGGTACGGTGAAGCATCGGCGAATCATCGGAGACAGATGACGGAGAAGTGGCGG
ATCGAAGAAGTTGATTTTAACATTTGGGGTCTCTCGGTGGATCATTTTCGTCCTCCCGCC
AATTTGCGCATCGGGAAATAACATTTTGCTCCTATTTTATTATTTTTTTCGTTAGTTTTT
AAATATATCAACTAAAAAGTCGGTGCATTTAAGATTTTGTTTATTTTTATTTGATTTTGA
CAACGAAAGGCTCTATAGAAGTTTAATGAGTCTACTAAACTGATTTACACAAAAAAAA*T
GATGCTGAAAAATATGTATTATTAAAAATTTATTACAACATTTTAATTATGATTATGATA
C

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 3

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AATCCTGGTCTTGTTATCTAGGTGGCGGGAATAGAAGTCTCTCTCTCTCTTATCATGGCT
AGTAAGAAGCAGAGACCAGCCAAGCTCTCTGTCTACCTTTACATTCCCAATATCGTTGGG
TACATGAGAGTTCTCTTGAATTGCATTGCCTTTGCTGTGTGCTTCTCCAACAAGACGCTC
TTCTCCCTCTTGTACTTTTTCAGTTTTTGTTGCGATGCTGTTGATGGATGGTGCGCTCGT
AAATTCAACCAAGTTTCTACATTTGGAGCTGTTCTTGACATGGTCACAGACAGAGTCAGC
ACAGCGTGTCTTCTCGTGATTCTCTCCCAAATATACAGGCCTAGCTTGGTTTTCCTCTCT
CTTCTGGCCTTAGATATTGCTAGTCACTGGCTGCAAATGTACAGTACATTTCTATCAGGG
AAGACCAGCCATAAGGATGTGAAAGATAGCACGAGCTGGCTGTTTAGACTATACTATGGT
AACCGGATGTTCATGGGTTATTGCTGTGTTTCCTGCGAGGTTCTTTACATAATCCTCTTT
CTTATAGCAAAGAACCATACTGAAAATCTGATGAACGTACTAGTTGAATCATTGACACAG
TTTTCACCGCTCTCTTTACTCTTGGCTTTGAGTATATTTGGTTGGTCGATCAAGCAGATC
ATCAATGTGATTCAGATGAAAACGGCTGCAGATGTTTGTGTCCAGTATGACATAGAGAAG
CAGCATAAGCCCTGAGGTTGAATCGCGTTTTAAAAAAAAAACTCTTTTGTTGCATGCTGT
GTATGACACTGTGTACATATATGGATATGCACTTAATGTAGTCTTTATGTTTTTGAATAA
ATACAAAATATCAATGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1C513TF U 1
AF RS1G066TF U 55
AF RS1C513JQ C 177
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QA 1 770 1 770
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GG
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CTTTCTTATAGCAAAGAACCATACTGAAAATCTGATGAACGTAGTAGTTGAATCATTGAC
ACAGTTTTCACCACTCTCTTTACTCTTTTCTTTGAGTATATTTGGTTGGTCGATCAAGCA
GATCATCAATGTGAT
TCAGATG

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DS 

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CAGCACAGCGTGTCTTCTCGTGATTCTCTCCCAAATATACAGGCCTAGCTTGGTTTTCCT
CTCTCTTCTGGCCTTAGATATTGCTAGTCACTGGCTGCAAATGTACAGTACATTTCTATC
AGGGAAGACCAGCCATAAGGATGTGAAAGATAGCACGAGCTGGCTGTTTAGACTATACTA
TGGTAACCGGATGTTCATGGGTTATTGCTGTGTTTCCTGCGAGGTTCTTTACATAATCCT
CTTTCTTATAGCAAAGAACCATACTGAAAATCTGATGAACGTACTAGTTGAATCATTGAC
ACAGTTTTCACCGCTCTTTTTACTCTTGGCTTTGAGTATATTTGGTTGGTCGATCAAGCA
GATCATCAATGTGATTCAGATGAAAACGGCTGCAGATGTTTGTGTCCAGTATGACATAGA
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QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 4

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CGATTTTGGGCACTTAGTCTTTTATGAAATTTTATTTGCTGAAGCAAAACAAAACCCTTA
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TTCAGTCCAGCAAGCAAATCCCACATCTATCCATCTCCATTCACTGTTCTTGTTGAGAGA
GACTTCAGTCCAACAACTTGAATCCATCCTCCATCTCTCTATCCTTGTTCTTGATTTTTA
TTTCATTTTGTTTCTGTTTGCATCATCATCTATTCTGCATCTGAAAAATCCCATAAAAAT
CATATTTGCTTCTGTTCTTATTTTCTTATCAGTTTTCCTTTCTGTTCTTCATCTTTAAAC
TCATAAGAAAACTCATAAAAATCTCTCTTTGTTTCAGGTACAAATCAAGCACCAATACTC
TCCCCATCCAGTCGCCAATCTCTCTCTAAAATAACCATCCGGCCAGTTTGGGTTCTTGCC
CACAACATTTTGGTATCAGAGCTTAAGGCTCCTGCAAGTTTTGGTTGTTTCTACTCTCCT
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AAAAAAAAAATTTGTTGCATTGTGTTCTTGGTGTTCTTGATGTTCATCATTGTTCTTATT
GCATTTTGGTAGATCTTTGTTGTGCATCCAATCTGTTTTACAACTTGTTATTGCTCTTGG
TCGATTTTTACCTTCCATTTTTGGAGGTTGAATTGATTATTTGCATTAATTTGTTTTGTA
ATTGCATCAATCATATAGATTAATTAGTTTGCATTCATTTCTAATTGGCATCTCATTTAT
TCTGATTGCTTGCATTCATTTTAGATTATCAATCATCT


BQ
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30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

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CGATTTTGGGCACTTAGTCTTTTATGAAATTTTATTTGCTGAAGCAAAACAAAACCCTTA
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TTCAGTCCAGCAAGCAAATCCCACATCTATCCATCTCCATTCACTGTTCTTGTTGAGAGA
GACTTCAGTCCAACAACTTGAATCCATCCTCCATCTCTCTATCCTTGTTCTTGATTTTTA
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CATATTTGCTTCTGTTCTTATTTTCTTATCAGTTTTCCTTTCTGTTCTTCATCTTTAAAC
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TCCCCATCCAGTCGCCAATCTCTCTCTAAAATAACCATCCGGCCAGTTTGGGTTCTTGCC
CACAACATTTTGGTATCAGAGCTTAAGGCTCCTGCAAGTTTTGGTTGTTTCTACTCTCCT
TTGCTTGTTCATCATCCTGTTATTGTCATCATATTTTTTTTTTTATTTGCATCAAAAGTC
AAAAAAAAAATTTGTTGCATTGTGTTCTTGGTGTTCTTGATGTTCATCATTGTTCTTATT
GCATTTTGGTAGATCTTTGTTGTGCATCCAATCTGTTTTACAACTTGTTATTGCTCTTGG
TCGAT

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GATTTTGGGCACTTAGTCTTTTATGAAATTTTATTTGCTGAAGCAAAACAAAACCCTTAA
GTCTTTCTAGTTTGTGAGAAGCAGCCAGAGAGCAACTCAAGATCTTATCAAGCTTTCTTC
CACCAAAGCTTGTGGCGATTTACACTCCATCCTCATCCATTGATTTGCTTGAGAGAGACT
TCAGTCCAGCAAGCAAATCCCACATCTATCCATCTCCATTCACTGTTCTTGTTGAGAGAG
ACTTCAGTCCAACAACTTGAATCCATCCTCCATCTCTCTATCCTTGTTCTTGATTTTTAT
TTCATTTTGTTTCTGTTTGCATCATCATCTATTCTGCATCTGAAAAATCCCATAAAAATC
ATATTTGCTTCTGTTCTTATTTTCTTATCAGTTTTCCTTTCTGTTCTTCATCTTTAAACT
CATAAGAAAACTCATAAAAATCTCTCTTTGTTTCAGGTACAAATCAAGCACCAATACTCT
CCCCATCCAGTCGCCAATCTCTCTCTAAAATAACCATCCGGCCAGTTTGGGTTCTTGCCC
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TGCTTGTTCATCATCCTGTTATTGTCATCATATTTTTTTTTTTATTTGCATCAAAAGTCA
AAAAAAAAATTTGTTGCATTGTGTTCTTGGTGTTCTTGATGTTCATCATTGTTCTTATTG
CATTTTGGTAGATCTTTGTTGTGCATCCAATCTGTTTTACAACTTGTTATTGCTCTTGGT
CGAT
TTTT

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CCATCTCTCTATCCTTGTTCTTGATTTTTATTTCATTTTGTTTCTGTTTGCATCATCATC
TATTCTGCATCTGAAAAATCCCATAAAAATCATATTTGCTTCTGTTCTTATTTTCTTATC
AGTTTTCCTTTCTGTTCTTCATCTTTAAACTCATAAGAAAACTCATAAAAATCTCTCTTT
GTTTCAGGTACAAATCAAGCACCAATACTCTCCCCATCCAGTCGCCAATCTCTCTCTAAA
ATAACCATCCGGCCAGTTTGGGTTCTTGCCCACAACATTTTGGTATCAGAGCTTAAGGCT
CCTGCAAGTTTTGGTTGTTTCTACTCTCCTTTGCTTGTTCATCATCCTGTTATTGTCATC
ATATTTTTTTTTTTATTTGCATCAAAAGTCAAAAAAAAAATTTGTTGCATTGTGTTCTTG
GTGTTCTTGATGTTCATCATTGTTCTTATTGCATTTTGGTAGATCTTTGTTGTGCATCCA
ATCTGTTTTACAACTTGTTATTGCTCTTGGTCGATTTTTACCTTCCATTTTTGGAGGTTG
AATTGATTATTTGCATTAATTTGTTTTGTAATTGCATCAATCATATAGATTAATTAGTTT
GCATTCATTTCTAATTGGCATCTCATTTATTCTGATTGCTTGCATTCATTTTAGATTATC
AATCATCT

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GCATCTGAAAAATCCCATAAAAATCATATTTGCTTCTGTTCTTATTTTCTTATCAGTTTT
CCTTTCTGTTCTTCATCTTTAAACTCATAAGAAAACTCATAAAAATCTCTCTTTGTTTCA
GGTACAAATCAAGCACCAATACTCTCCCCATCCAGTCGCCAATCTCTTTTTAAAATAACC
ATCCGGCCAGTTTGGGTTTTTGCCCACAACATTTTGGTATCAGAGCTTAAGGCTCCTGCA
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TTTTTTTTATTTGCATCAAAAGTCAAAAAAAAAATTTGTTGCATTGTGTTCTTGGTGTTC
TTGATGTTCATCATTGTTCTTATTGCATTTTGGTAGATCTTTGTTGTGCATCCAATCTGT
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ATTTCTAATTGGCATCTCATTTATTCTGATTGCTTGCATTCATTTTAGATTATCAATCAT
CT

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 4

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GCAAGGATCAAGTGTATCTTAAGTTATAAAATATTCTACCGAGTTTTACAACATGCGAGT
GTATCCATAAATATGCGAACAAGGGTAAGTTGCTCTGCTCTTTTCTCTACAACTTGATAA
CTAAACATCACAGTCTCAAGTACAAGGATGTTAAAGAAAGCTCCAAATTGTATCAATCTC
ATAAGTCGTTCATGTTGCAGACACCATTATCAAAAAAACTATGAGGGAAGCCAAATATCA
TCTTGTATTCCAACTAGCCAACCTTGGCAACTTTTCTTGGCTCAGTTTGTCCCGACAAAG
GGCATTGCATCTCTGTCCAGCTAATCGGAACCATGGTTTCACCAGCAGCACTCTCCGCTG
AGACCACACCAAGCTCATTCTTAGCAGTTGACAAATAGTAAGCCCGTGAGTCACCAAGGG
ACAGAACCATGGCTCTAACAATGTCACTAGGACGAAAAGACTGATGCATATCAACTTTGT
CAATCTCTGTTGCTCTTACATCTTGTTGCCTAATTATGCCAGCAAATTTTTCACGAACGG
CCTTGGGACCAACACACAAGATATCAACAGAAGCCATCCTAGCCATAACTTTAGTCACCC
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CCACAATAGCTCTCTGGTCAGGAGAGTCGGGAAGAGAAGAAACAATCCGACGAGATCCAG
TGAGGGAAGCGTAGATTGTTTTGTCGTTGACGTAAGCTCCTTTGCCGGCTTTAAACTCAG
CCACATTCCCAAGTACATCTCCAGGCGTTACTATGTCCGTCATTTCAAGAGATTTCGACT
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GTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1GE50JQ U 1
AF RS1CH28JQ U 152
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RD RS1GE50JQ 622 0 0
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GCAAGGATCAAGTGTATCTTAAGTTATAAAATATTCTACCGAGTTTTACAACATGCGAGT
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ATAAGTCGTTCATGTTGCAGACACCATTATCAAAAAAACTATGAGGGAAGCCAAATATCA
TCTTGTACTCCAACTAGCCAACCTTGGCAACTTTTCTTGGCTCAGTTTGTCCCGACAAAG
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CCTTGGGACCAACACACAAGAT

QA 1 622 1 622
DS 

RD RS1CH28JQ 674 0 0
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TAAAGAAAGCTCCAAATTGTATCAATCTCATAAGTCGTTCATGTTGCAGACACCATTATC
AAAAAAACTATGAGGGAAGCCAAATATCATCTTGTATTCCAACTAGCCAACCTTGGCAAC
TTTTCTTGGCTCAGTTTGTCCCGACAAAGGGCATTGCATCTCTGTCCAGCTAATCGGAAC
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ACGAAAAGACTGATGCATATCAACTTTGTCAATCTCTGTTGCTCTTACATCTTGTTGCCT
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AGCCATCCTAGCCATAACTTTAGTCACCCTAGCTAAGACAACAGAACCAGGCTCAGGAAT
AAGCCCATGTGCCTTGTGACCCGTAACTTCCACAATAGCTCTCTGGTCAGGAGAGTCGGG
AAGAGAAGAAACAATCCGACGAGATCCAGTGAGGGAAGCGTAGATTGTTTTGTCGTTGAC
GTAAGCTCCTTTGC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1GE50TF 631 0 0
CAACT
TTTCTTGGCTCAGTTTGTCCCGACAAAGGGCATTGCATCTCTGTCCAGCTAATCGGAACC
ATGGTTTCACCAGCAGCACTCTCCGCTGAGACCACACCAAGCTCATTCTTAGCAGTTGAC
AAATAGTAAGCCCGTGAGTCACCAAGGGACAGAACCATGGCTCTAACAATGTCACTAGGA
CGAAAAGACTGATGCATATCAACTTTGTCAATCTCTGTTGCTCTTACATCTTGTTGCCTA
ATTATGCCAGCAAATTTTTCACGAACGGCCTTGGGACCAACACACAAGATATCAACAGAA
GCCATCCTAGCCATAACTTTAGTCACCCTAGCTAAGACAACAGAACCAGGCTCAGGAATA
AGCCCATGTGCCTTGTGACCCGTAACTTCCACAATAGCTCTCTGGTCAGGAGAGTCGGGA
AGAGAAGAAACAATCCGACGAGATCCAGTGAGGGAAGCGTAGATTGTTTTGTCGTTGACG
TAAGCTCCTTTGCCGGCTTTAAACTCAGCCACATTCCCAAGTACATCTCCAGGCGTTACT
ATGTCCGTCATTTCAAGAGATTTCGACTGAGACACTGTTGATAAACGAGGAAGAAGAGTA
CAAGGCAGAACACAAATTATTACT
CC

QA 6 629 6 629
DS 

RD RS1CH28TF 737 0 0
TGTATCAATCTCATAAGTCGTTCATGT*GCAGACACCATTATCAAAAAA*CTATGAGGGA
*GCCAAATATCATCTTGTATTCCAACTAGCCAAC*TTGGCAACTTT*CTTGGCTCAGTTT
GTCCCGACAAAGGGCATTGCATCTCTGTCCAGCTAATCGGAACCATGGTTTCACCAGCAG
CACTCTCCGCTGAGACCACACCAAGCTCATTCTTAGCAGTTGACAAATAGTAAGCCCGTG
AGTCACCAAGGGACAGAACCATGGCTCTAACAATGTCACTAGGACGAAAAGACTGATGCA
TATCAACTTTGTCAATCTCTGTTGCTCTTACATCTTGTTGCCTAATTATGCCAGCAAATT
TTTCACGAACGGCCTTGGGACCAACACACAAGATATCAACAGAAGCCATCCTAGCCATAA
CTTTAGTCACCCTAGCTAAGACAACAGAACCAGGCTCAGGAATAAGCCCATGTGCCTTGT
GACCCGTAACTTCCACAATAGCTCTCTGGTCAGGAGAGTCGGGAAGAGAAGAAACAATCC
GACGAGATCCAGTGAGGGAAGCGTAGATTGTTTTGTCGTTGACGTAAGCTCCTTTGCCGG
CTTTAAACTCAGCCACATTCCCAAGTACATCTCCAGGCGTTACTATGTCCGTCATTTCAA
GAGATTTCGACTGAGACACTGTTGATAAACGAGGAAGAAGAGTACAAGGCAGAACACAAA
TTATTACTATGGGTCCC

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 4

CO CL1984Contig1 1459 4 7 U
GGGTCCCCGAGTCGTTTCCTTTCGTTGGGTATTAAGATTTGGCTTTGAGAGAGGCATATA
GAGAGAGATACTCAGATCTGTATCGCCCCCTTATCCCATTTCTCTATCCCCCCCAAAGCT
TTGAGAAAAAATGGAGACTTTCCTACTTACATCTGAGTCCGTCAACGAAGGACACCCAGA
CAAGCTTTGCGACCAGATCTCCGACGCTGTCCTCGACGCCCGCCTTGAGCAAGACCCCGA
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CACCACCAAAGCCACCGTCGACTATGAGAAGATCGTCCGCGACACTTGCCGCTCCATTGG
TTTCATCTCTGATGATGTCGGTCTCGACGCTGACAAATGCAAAGTCCTTGTCAACATCGA
GCAGCAGAGTCCGGACATTGCTCAAGGTGTTCACGGTCACTTCACCAAGCGCCCTGAAGA
CATCGGAGCTGGTGACCAGGGACACATGTTTGGTTACGCCACCGATGAGACCCCTGAGCT
CATGCCTCTGAGCCATGTTCTCGCGACCAAGATCGGTGCTAAGCTTACTGAGGTCAGAAA
GAACGGGACTTGCCGTTGGTTAAGACCAGACGGCAAGACCCAAGTCACTGTCGAGTACTA
CAACGACAACGGTGCGATGGTTCCGGTCCGTGTCCACACCGTCCTCATCTCGACCCAGCA
CGATGAGACCGTCACCAACGACGAGATCGCACGTGACCTCAAGGAGCACGTGATCAAACC
CATCATCCCTGAGAAGTACCTCGACGACAAAACCATCTTCCACCTCAACCCATCAGGCAG
GTTCGTGATCGGTGGACCACACGGTGACGCCGGTTTAACCGGACGTAAGATCATCATCGA
CACTTACGGAGGATGGGGAGCTCACGGAGGAGGTGCTTTCTCCGGGAAAGACCCGACCAA
GGTCGACAGAAGCGGAGCTTACATCGTGAGGCAAGCAGCCAAGAGCGTTGTTGCTAACGG
GATGGCTCGTAGGGCTCTTGTCCAGGTCTCCTACGCCATTGGAGTTCCCGAGCCTTTGTC
TGTGTTCGTGGACACTTACGGAACAGGGTTGATTCCAGACAAGGAGATACTGAAGATCGT
GAAGGAGACCTTCGATTTCAGACCAGGGATGATGACGATCAACTTGGACTTGAAGAGAGG
AGGCAATGGGAGGTTCTTGAAAACGGCGGCGTATGGACATTTCGGAAGGGACGACCCTGA
CTTCACCTGGGAGGTCGTGAAGCCACTCAAGTGGGACAAACCTCAAGCTTAAGTAATGAT
TTAATATCATTTCATATGCTTGTTTCTCTTATCTTTTT*CACTTTAAAAACATTTACCGT
GAAC*AATAATCAATCCTTATGTTTCTGTTTTCTTTTTCTTTTTGTACTTTTGGAATGAA
AGTTTCTGGTTTGTTTATC


BQ
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GCTTGTTTCTCTTATCTTTTT*CACTTTAAAAACATTTTCCGTGAAC*AATAATCAATCC
TTATGTTTCTGTTTTCTTTT
C

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CGTGGTCAAACCCATCATCCCTGAGAAGTACCTCGACGACAAAACCATCTTCCACCTCAA
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AGACCCGACCAAGGTCGACAGAAGCGGAGCTTACATCGTGAGGTAAGCAGCCAAGAGCGT
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CGAGCCTTTGTCTGTGTTCGTGGACACTTACGGAACAGGGTTGATTCCAGACAAGGAGAT
ACTGAAGATCGTGAAGGAGACCTTCGATTTCAGACCAGGGATGATGACGATCAACTTGGA
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TTTTGGAATGAAAGTTTCTGGTTTGTTTATC

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GGAGGTTCTTGAAAACGGCGGCGTATGGACATTTCGGAAGGGACGACCCTGACTTCACCT
GGGAGGTCGTGAAGCCACTCAAGTGGGACAAACCTCAAGCTTAAGTAATGGTTTAATATC
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AATCAATCCTTATGTTTCTGTTTTCTTTTTCTTTTTGTACTTTTGGAATGAAAGTTTCTG
GTTTGTT
C

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DS 



AS 1 3

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TCCGTTAATGTAACCATCCTCCTCTTCGCAATGATGATCGGCGTTTCGTATGCCGTCGAC
ATGTCGATCATCTCATACGACGAGAAACACCACATCACCGCCGCCGCCGACAACGAGCGG
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TCTGTTGACTGGAGAAAAGAAGGTGCCGTCGCCGCCGTTAAAGATCAGGGAAGCTGCGGG
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CGATGATGCCTA


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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D831TF U 5
AF RS1FV95TF U 5
AF RS1GO31TF U 1
BS 1 343 RS1GO31TF
BS 344 344 RS1D831TF
BS 345 792 RS1GO31TF

RD RS1D831TF 388 0 0
GG
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AATGTAACCATCCTCCTCTTCGCAATGATGATCGGCGTTTCGTATGCCGTCGACATGTCG
ATCATCTCATACGACGAGAAACACCACATCACCGCCGCCGCCGACAACGAGCGGAGCGAC
ACCGAGGTTGCGAAAATCTACGAGGCCTGGATGGAGAAACACGGCAAGAAGGCGCAGAGC
AACGGTCTTGTCGTCGGTGAGGAGAAGGACCAGAGGTTTGAGATCTTCAAAGACAATCTC
AGATTCATCGACCAACACAACAACAAAAACCTCAGTTACAAACTCGGTCTAACCCGGTTC
GCTGATCTA*CCAACGAAGAGTACCG

QA 3 388 3 388
DS 

RD RS1FV95TF 488 0 0
GG
ATACAATTGTCTTCTTCATCTTTCTTTCTTCCTCAGAAAACTAAAAACATGGGATCCGTT
AATGTAACCATCCTCCTCTTCGCAATGATGATCGGCGTTTCGTATGCCGTCGACATGTCG
ATCATCTCATACGACGAGAAACACCACATCACCGCCGCCGCCGACAACGAGCGGAGCGAC
GCCGAGGTTGCGAAAATCTACGAGGCCTGGATGGAGAAACACGGCAAGAAGGCGCAGAGC
AACGGTCTTGTCGTCGGTGAGGAGAAGGACCAGAGGTTTGAGATCTTCAAAGACAATCTC
AGATTCATCGACCAACACAACAACAAAAACCTCAGTTACAAACTCGGTCTAACCCGGTTC
GCTGATCTAACCAACGAAGAGTACCGATCCATCTACCTCGGCGCCAAATCGAGGAAGAGA
GTCCTCAAAACCAGCGATCGTTATCAGCCGCGTGTTGGTGACGCGCTTCCTGATTCTGTT
GACTGG

QA 3 488 3 488
DS 

RD RS1GO31TF 792 0 0
GGAATCATACAATTGTCTTCTTCATCTTTCTTTCTTCCTCAGAAAACTAAAAACATGGGA
TCCGTTAATGTAACCATCCTCCTCTTCGCAATGATGATCGGCGTTTCGTATGCCGTCGAC
ATGTCGATCATCTCATACGACGAGAAACACCACATCACCGCCGCCGCCGACAACGAGCGG
AGCGACGCCGAGGTTGCGAAAATCTACGAGGCCTGGATGGAGAAACACGGCAAGAAGGCG
CAGAGCAACGGTCTTGTCGTCGGTGAGGAGAAGGACCAGAGGTTTGAGATCTTCAAAGAC
AATCTCAGATTCATCGACCAACACAACAACAAAAACCTCAGTTGCAAACTCGGTCTAACC
CGGTTCGCTGATCTAACCAACGAAGAGTACCGATCCATCTACCTCGGCGCCAAATCGAGG
AAGAGAGTCCTCAAAACCAGCGATCGTTATCAGCCGCGTGTTGGTGACGCGCTTCCTGAT
TCTGTTGACTGGAGAAAAGAAGGTGCCGTCGCCGCCGTTAAAGATCAGGGAAGCTGCGGG
GAGTTGTTGGGCATTTTCAACCATTGGAGCGGTGGAAGGAATAAACAAGATCGTGACAGG
AGACTTGATCTCTTTGTCTGAACAAGAACTTGTTGATTGTGACACATCTTACAACCAAGT
TGTAATGGAGTTTGATGGATTATGCGTTTGAGTCATCATTAAAACGTGGCATGACACCGA
GGAGATATCATACAAGCTGCTGATAATCATGTGATCAGAGCAGAAAACGCAAAGTTGTCA
CGATGATGCCTA

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 4

CO CL1986Contig1 997 4 4 U
GGTAAAGCTCCGACATTCACTCCACAATGGCGATGACAATGGCGTCTCTTTCCTTCCCAT
CTCCACTCCCCAAAACAACCTTATCCTACTCACTCTCCCTCCCATCGAAAGCCTCCACCT
TTCTCACCAAACCCTCTCCCAAACGCCGAACCCTCACAATCTCCATGTCCATGGAAGCCG
GAATCGGCGTGATGGCCTCGAAGCTCGGGATGATGTCTTTCTTCGAGCCAGACGGAACCG
TGGTCCCCGTGACCGTCGTCGGGTTCCGCGAAGGCAACATCGTGACCCAAGTCAAGACCT
TAGCCACCGACGGATACGACGCCGTCCAGGTCGGGTACCGCCGCGTCCGCGACAAGAAGC
TCACCAAGCCCGAGACGGGTCACCTCGAGAAGGCCGGCGTCATCCCCTTGCGGCATCTCC
AGGAGTTCAGGCTCACGAGCGTGGAAGGGTTCGAGCCGAACCAGAGGCTTGTCTTCGACG
AGATTTTCAAGTAAGGGGATCTTGTCGACGTGGCGGGGACGACGATTGGGAAAGGGTTTC
AGGGTGGGATTAAGAGGCATAATTTCAAGAGAGGGCAGATGACTCATGGTTCCAAGAGTC
ATCGTGCTTTGGGTTCGATTGGTGCGGGTACGACTCCCGGGAGGGTTTATAAAGGGAAGA
AGATGCCTGGGAGGATGGGTGGGACGAGGACGAAGATTAGGAAGCTTAGGATTGTTAAGG
TTGATAAGGAGTTGAATGTTGTTATGATCCAAGGTGCTTTGCCTGGTAAGCCTGGGAATC
TCCTCCGTATTACTCCCGCTAAGATCGTTGGAGTTAATATCCCCAAGAACTAGTGGACTC
AGATATTGTGTTATGTTTGTGTTGCGTTGCTTTTGAATTCGTTTCATTTTGTGGACTTTT
GAGCTTAAATCCTTTCTTGTGTTATGTTGTAAGCACTTCTTTTGACTTGGCTCAGTTTGT
GGATGGTGAGTTTACAACCATATTGTGTTATCTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CG37TF U 1
AF RS1CG37JQ C 327
AF RS1AE88JQ C 643
AF RS1AE88TF U 643
BS 1 560 RS1CG37TF
BS 561 642 RS1CG37JQ
BS 643 979 RS1AE88TF
BS 980 997 RS1CG37JQ

RD RS1CG37TF 560 0 0
GGTAAAGCTCCGACATTCACTCCACAATGGCGATGACAATGGCGTCTCTTTCCTTCCCAT
CTCCACTCCCCAAAACAACCTTATCCTACTCACTCTCCCTCCCATCGAAAGCCTCCACCT
TTCTCACCAAACCCTCTCCCAAACGCCGAACCCTCACAATCTCCATGTCCATGGAAGCCG
GAATCGGCGTGATGGCCTCGAAGCTCGGGATGATGTCTTTCTTCGAGCCAGACGGAACCG
TGGTCCCCGTGACCGTCGTCGGGTTCCGCGAAGGCAACATCGTGACCCAAGTCAAGACCT
TAGCCACCGACGGATACGACGCCGTCCAGGTCGGGTACCGCCGCGTCCGCGACAAGAAGC
TCACCAAGCCCGAGACGGGTCACCTCGAGAAGGCCGGCGTCATCCCCTTGCGGCATCTCC
AGGAGTTCAGGCTCACGAGCGTGGAAGGGTTCGAGCCGAACCAGAGGCTTGTCTTCGACG
AGATTTTCAAGTAAGGGGATCTTGTCGACGTGGCGGGGACGACGATTGGGAAAGGGTTTC
AGGGTGGGATTAAGAGGCAT

QA 1 560 1 560
DS 

RD RS1CG37JQ 671 0 0
CAGGTCGGGTACCGCCGCGTCCGCGACAAGAAGCTCACCAAGCCCGAGACGGGTCACCTC
GAGAAGGCCGGCGTCATCCCCTTGCGGCATCTCCAGGAGTTCAGGCTCACGAGCGTGGAA
GGGTTCGAGCCGAACCAGAGGCTTGTCTTCGACGAGATTTTCAAGTAAGGGGATCTTGTC
GACGTGGCGGGGACGACGATTGGGAAAGGGTTTCAGGGTGGGATTAAGAGGCATAATTTC
AAGAGAGGGCAGATGACTCATGGTTCCAAGAGTCATCGTGCTTTGGGTTCGATTGGTGCG
GGTACGACTCCCGGGAGGGTTTATAAAGGGAAGAAGATGCCTGGGAGGATGGGTGGGACG
AGGACGAAGATTAGGAAGCTTAGGATTGTTAAGGTTGATAAGGAGTTGAATGTTGTTATG
ATCCAAGGTGCTTTGCCTGGTAAGCCTGGGAATCTCCTCCGTATTACTCCCGCTAAGATC
GTTGGAGTTAATATCCCCAAGAACTAGTGGACTCAGATATTGTGTTATGTTTGTGTTGCG
TTGCTTTTGAATTCGTTTCATTTTGTGGACTTTTGAGTTTAAATCCTTTCTTGTGTTATG
TTGTAAGCACTTCTTTTGACTTGGCTCAGTTTGTGGATGGTGAGTTTACAACCATATTGT
GTTATCTTGAC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1AE88JQ 337 0 0
GGGTTTATAAAGGGAAGAAGATGCCTGGGAGGATGGGTGGGACGAGGACGAAGATTAGGA
AGCTTAGGATTGTTAAGGTTGATAAGGAGTTGAATGTTGTTATGATCCAAGGTGCTTTGC
CTGGTAAGCCTGGGAATCTCCTCCGTATTACTCCCGCTAAGATCGTTGGAGTTAATATCC
CCAAGAACTAGTGGACTCAGATATTGTGTTATGTTTGTGTTGCGTTGCTTTTGAATTCGT
TTCATTTTGTGGACTTTTGAGCTTAAATCCTTTCTTGTGTTATGTTGTAAGCACTTCTTT
TGACTTGGCTCAGTTTGTGGATGGTGAGTTTACAACC

QA 1 337 1 337
DS 

RD RS1AE88TF 337 0 0
GGGTTTATAAAGGGAAGAAGATGCCTGGGAGGATGGGTGGGACGAGGACGAAGATTAGGA
AGCTTAGGATTGTTAAGGTTGATAAGGAGTTGAATGTTGTTATGATCCAAGGTGCTTTGC
CTGGTAAGCCTGGGAATCTCCTCCGTATTACTCCCGCTAAGATCGTTGGAGTTAATATCC
CCAAGAACTAGTGGACTCAGATATTGTGTTATGTTTGTGTTGCGTTGCTTTTGAATTCGT
TTCATTTTGTGGACTTTTGAGCTTAAATCCTTTCTTGTGTTATGTTGTAAGCACTTCTTT
TGACTTGGCTCAGTTTGTGGATGGTGAGTTTACAACC

QA 1 337 1 337
DS 



AS 1 4

CO CL1987Contig1 835 4 27 U
GGGTTGACATAAGTTTGGTTGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTCAAATCGTCAAACAG
TTTGTTTCTTCGCGATCAGATCTCATCGGAAGAAGAGACACACAGTTCACGACGAGGCGA
TGGCTTCAGGTTTCAGCGGCGATGAAACTGCTCCGTTCTTCGGATTCCTCGGCGCTGCCG
CCGCTCTCGTCTTCTCCTGTATGGGAGCAGCGTACGGGGCAGCGAAGAGCGGGGTTGGTG
TAGCGTCGATGGGTGTGATGAGACCAGAGCTTGTAATGAAATCGATTGTTCCCGTCGTTA
TGGCTGGTGTGTTAGGTATCTATGGTCTCATCATTGCCGTCATAATCAGTACTGGTATCA
ACCCTAAAGCCAAGTCTTACTATCTCTTCGATGGCTATGCTCATCTCTCTTCCGGTCTCG
CTTGTGGTCTCGCCGGTCTCTCCGCCGGTATGGCTATTGGCATCGTCGGCGATGCCGGTG
TTCGAGCGAATGCACAACAACCAAAGCTGTTTGTGGGGATGATATTGATTCTCATCTTTG
CTGAAGCACTTGCGCTGTACGGTCTCATTGTTGGTATCATTCTCTCTTCTCGTGCTGGTC
AGTCTAGAGCCGAGTGATATCGGAAAAGTCTTTTCATATGTTCTAAATTCTTGTCATGTT
TTTTTTATATATTTCACTTCCTTTTGTGGCATTGTGAGTTTTTTTTTTGCTTTTCTCATG
ATAAACAACCAAACAATCATTTGAATTTGGTTCTAAATATTTATTTTAAAATTTGAACAC
TGTAAGAAATACACCAATAAGTATAATATAATAAAATGATTCAATGGTTTTACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RS1BS22TF U 1
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TGGCTGGTGTGTTAGGTATCTATGGTCTGATCATTGCCGTCATCATCAGTACTGGTATCA
ACCCTAAATCCAAGTCTTACTATCTCTTCGATGGCTATGCTCATCTCTCTTCCGGTCTCG
CTTGTGGTCTCGCTGGTCTCTC
T

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G
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TTGGTGTAGCGTCGATGGGTGTGATGATACCAGAGCTTGTAATGAAATCGATTGTTCCCG
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CTGGTCAGTCTAGAGCCGAGTGATATCGGAAA
GTCTTTT

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TACGGGGCAGCGAAGAGCGGGGTTGGTGTAGCGTCGATGGGTGTGATGATACCAGAGCTT
GTAATGAAATCGATTGTTCCCGTCGTTATGGCTGGTGTGTTAGGTATCTATGGTCTCATC
ATTGCTGTCATAATCAGTACTGGTATCAACCCTAAGGCCAAGTCTTACTATCTCTTCGAT
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GCTATTGGCATCGTCGGCGATGCCGGTGTTCGAGCGAATGCACAACAACCAAAGCTGTTT
GTGGGGATGATATTGATTCTCATCTTTGCTGAAGCACTTGCGCTGTACGGTCTCATTGTT
GGTATCATTCTCTCTTCTCGTGCTGGTCAGTCTAGAGCCGAGTGATATCGGAAA*GTCTT
TTCATATGTTCTTAATTCTTGTCATGTTTTTTT*ATATATTTCACTTCCTTTTGTGGCAT
TGTGAGTTTTTTTTT*GCTTTTCTCATGATAAACAACCAAACAATCGTTTGAATTTGGTT
CTAAATATTTATTTTTAAATTTGAACACTGTAAGAAATACACCAATAAGTATAATATAAT
AAAATGATTCAATGGTTTT

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DS 

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ATCGATTGTTCCTGTCGTTATGGCTGGTGTGTTAGGTATCTATGGTCTGATCATTGCCGT
CATCATCAGTACTGGTATCAACCCTAAATCCAAGTCTTACTATCTCTTCGATGGCTATGC
TCATCTCTCTTCCGGTCTCGCTTGTGGTCTCGCTGGTCTCTCTGCCGGTACGGCTATTGG
CATCGTCGGAGATGCCGGTGTTAGAGCGAATGCACAACAGCCAAAGCTGTTTGTTGGGAT
GATATTGATTCTCATCTTTGCTGAAGCACTTGCGCTGTACGGTCTCATTGTTGGTATCAT
CCTCTCTTCTCGTGCTGGTCAGTCTAGAGCCGAGTGATATCGGAAAAGTCTTTTCATATG
TTCTAAATTCTTGTCATGTTTTTTTTATATATTTCACTTCCTTTTGTGGCATTGTGAGTT
TTTTTTTTGCTTTTCTCATGATAAACAACCAAACAATCATTTGAATTTGGTTCTAAATAT
TTATTTTAAAATTTGAACACTGTAAGAAATATGCCAATAAGTATAATATAATAAAATGAT
TCAATGGTTTTACTC

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DS 



AS 1 4

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CTGGAAGGACTCCGATGGATTCGCGGCGACCATCGCCGATGCTCTGAACCCTAATCCAAC
CTCCTCTCTTCGTAAACTAGAAGAGCAGATCCAGCTTCCGTTGGTTAATTACGGCGTCGA
AGACGGCGGAAACGGCGGGAGCGTCGTTCACTTCGTCGACGAAGACGGAGCTTACCAGGT
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GCTTGACATGATTACAAGGGAAGCAGCATCGACTATTGTAGCTCCTTTCTTTGTCCCGGC
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TAAAGCACTAAACGAAGAGCTTCAGGTGATCCATGAAACAGGGGAGCTTGTGGCTAGTTG
GACCGGATTGACTTTTGAAAGAGACGGAATCAAGTGGAACGCATCAAAGACATCAAAAGA
AGAAGAAAGTCCATGGCGAGCTCTTTACGGTTAATCTTCTCAGGTCAGGTCTTTTTTTTT
TTCATGGCCCAAACACTATTGCTACAGTATTGGGCTTGGATCTTTGCACTTTATTTCCCA
TTTTGTTGTAGCTCTTTGTTAAGACTCTTTTACTCAGCTGAAACAAAAGCCATGTCACTA
TGCTTTCCTCTTATGATTTCTTTAAGAAACT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G194TF U 1
AF RS1AQ05TFB U 6
AF RS1AQ05JQ C 251
AF RS1G194JQ C 596
BS 1 336 RS1G194TF
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TCGTTACTTTCACGTTGGTCCAGAAACAGAGGCCGCCGGGCTGTTTGCTACTCGCGTTGA
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TCGTGTCAAAT

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DS 

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GG
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GACTCCGATGGATTCGCGGCGACCATCGCCGTTGCTCTGAACCCTAATCCAACCTCCTCT
CTTCGTAAACTAGAAGAGCAGATCCAGCTTCCGTTGGTTAATTACGGCGTCGAAGACGGC
GGAAACGGCGGGAGCGTCGTTCACTTCGTCGACGAAGACGGAGCTTACCAGGTCTCTGTT
TTTCTGCTGCGAAGCTATGAACCTCCTTCACTAGTGTGTGCAATGAACGAACTGCTTGAC
ATGATTACAAGGGAAGCAGCATCGACTATTGTAGCTCCTTTCTTTGTCCCGGCATCTAAG
CTTAAGTTCAATAACAAGTCCCTTGAAGCAAGCAGCAGAGAAGTAGCTAGTCTTCGTTAC
TTTCACGTTGGTCCGGAAACAGAGGCCGCCAGGCTGTTTGCTACTCGCGTCGAGAAACCG
CCGCCGTTGATGCAGATCCATCATGAGCCTCTGTCGTGCCTGCTTCATCTAGCTCGTGTC
AAATGCTTGCCTACGTCTATTCTCATAGGGCAAAGGAGTAGTAGCGTATCTCATAAAGCA
CTAAACGAAGAGCTTCAGGTGATCCATGAAACAGGGGAGCTTGTGGCTAGTTGGACCGGA
TTGACTTTTGAAAGAGACGGAATCAAGTGGAACGCATCAAAGACATCAAAAGAAGAAGAA
AGTCCATGGCGAGCTCTTTACGGTTAATCTTC

QA 3 754 3 754
DS 

RD RS1AQ05JQ 631 0 0
CTGCTGCGAAGCTATGAACCTCCTTCACTAGTGTGTGCAATGAACGAACTGCTTGACATG
ATTACAAGGGAAGCAGCATCGACTATTGTAGCTCCTTTCTTTGTCCCGGCATTTAAGCTT
AAGTTCAATAACAAGTCCCTTGAAGCAAGCAGCAGAGAAGTAGCTAGTTTTCGTTACTTT
CACGTTGGTCCGGAAACAGAGGCCGCCAGGCTGTTTGCTACTCGCGTCGAGAAACCGCCG
CCGTTGATGCAGATCCATCATGAGCCTCTGTCGTGCCTGCTTCATCTAGCTCGTGTCAAA
TGCTTGCCTACGTCTATTCTCATAGGGCAAAGGAGTAGTAGCGTATCTCATAAAGCACTA
AACGAAGAGCTTCAGGTGATCCATGAAACAGGGGAGCTTGTGGCTAGTTGGACCGGATTG
ACTTTTGAAAGAGACGGAATCAAGTGGAACGCATCAAAGACATCAAAAGAAGAAGAAAGT
CCATGGCGAGCTCTTTACGGTTAATCTTCTCAGGTCAGGTCTTTTTTT***TCATGGCCC
AAACACTATTGCTACAGTATTGGGCTTGGATCTTTGCACTTTATTTCCCATTTTGTTGTA
GCTCTTTGTTAAGACTCTTTTACTCAGCTGA

QA 1 631 1 631
DS 

RD RS1G194JQ 336 0 0
TCTCATAAAGCACTAAACGAAGAGCTTCAGGTGATCCATGAAACAGGGGAGCTTGTGGCT
AGTTGGACCGGATTGACTTTTGAAAGAGACGGAATCAAGTGGAACGCATCAAAGACATCA
AAAGAAGAAGAAAGTCCATGGCGAGCTCTTTACGGTTAATCTTCTCAGGTCAGGTCTTTT
TTTTTTTCATGGCCCAAACACTATTGCTACAGTATTGGGCTTGGATCTTTGCACTTTATT
TCCCATTTTGTTGTAGCTCTTTGTTAAGACTCTTTTACTCAGCTGAAACAAAAGCCATGT
CACTATGCTTTCCTCTTATGATTTCTTTAAGAAACT

QA 1 336 1 336
DS 



AS 0 0

AS 1 4

CO CL1990Contig1 812 4 13 U
GGGATTTGTCGAACAAGCAAGAGTTGAAAACAAAATACTCTCACTTTGCAGATCGCCAAC
TTCCTTCCCACGCTTAGCTAGAGGAGGAATCTATACTTAGTCTTCTTCTACATCTCTGAT
TTGTAACCAACGATTCTGCTTCGAGAAGTGAAATCAATTCTGAAGAACCAGACAACATCC
TTCAGATGGGAGATACTTCATTTCTCGATAGAATGCTTCTCCAGCTTCGTTCCACTTGCA
AGTACTACAGTGGTTACCCTAAGGATCTAGGGCCATCGCGGGTTATCCATTTCACATCAG
AAAGAGAGTTTGTCCAGCTCCTTCACCAGGGCTATCCTGTCGTTGTCGCATTCACCATTA
GAAGTAACTACACACAACATCTTGACCGGATGCTTGAGGAAGCCGCTGCTGAGTTCTATC
CCAACATCAAGTTTATGCGTGTTGAGTGCCCCAAGTATCCTGGATTCTGCATAACTCGCC
AGAAAAGCGAATATCCCTTCATTGAAATATTCCATAGCCCACAACAAGCGGGTAATGAAG
GAAAGGTACAGGACCCAAATATCACCCGCTATTCTGTGAAAGTCGTACCTTACAATTATG
ATATGAGCCCTTATGGGTTCAGAGAGTTCTTCAAGCGCCAGGGAGTTCGTACTTCGGATC
CTAAATGAACAACTTGAAGGTTTGGTGCGTATTCAAAAACCTTTTGAGTGTATCAATGG*
CTTCTATTAGCTACCAATGATTTGTTTTTTTAAGAACTATTGTAATACTATACTTCACTT
CCCTCTTCCTTCAAAATAAATAAACTTTTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RS1BB81TF U 1
AF RS1AI52JQ C 10
AF RS1BB81JQ C 135
AF RS1AI52TF U 10
BS 1 159 RS1BB81TF
BS 160 160 RS1AI52TF
BS 161 403 RS1BB81TF
BS 404 404 RS1AI52TF
BS 405 637 RS1BB81TF
BS 638 698 RS1AI52TF
BS 699 699 RS1AI52JQ
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BS 720 720 RS1AI52JQ
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BS 797 811 RS1AI52TF
BS 812 812 RS1AI52JQ

RD RS1BB81TF 637 0 0
GGGATTTGTCGAACAAGCAAGAGTTGAAAACAAAATACTCTCACTTTGCAGATCGCCAAC
TTCCTTCCCACGCTTAGCTAGAGGAGGAATCTATACTTAGTCTTCTTCTACATCTCTGAT
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TTCAGATGGGAGATACTTCATTTCTCGATAGAATGCTTCTCCAGCTTCGTTCCACTTGCA
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CCAACATCAAGTTTATGCGTGTTGAGTGCCCCAAGTATCCTGGATTCTGCATAACTCGCC
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GAAAGGTACAGGACCCAAATATCACCCGCTATTCTGTGAAAGTCGTACCTTACAATTATG
ATATGAGCCCTTATGGGTTCAGAGAGTTCTTCAAGCG

QA 1 637 1 637
DS 

RD RS1AI52JQ 803 0 0
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TTGTCCAGCTCCTTCACCAGGGCTATCCTGTCGTTGTCGCATTCACCATTAGAAGTAACT
ACACACAACATCTTGACCGGATGCTTGAGGAAGCCGCTGCTGAGTTCTATCCCAACATCA
AGTTTATGCGTGTTGAGTGCCCCAAGTATCCTGGATTCTGCATAACTCGCCAGAAAAGCG
AATATCCCTTCATTGAAATATTCCATAGCCCACAACAAGCGGGTAATGAAGGAAAGGTAC
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CTTATGGGTTCAGAGAGTTCTTCAAGCGCCAGGGAGTTCGTACTTCGGATCCTAAATGAA
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GCTACCAATGATTTGTTTTTTTAAGAACTATTGTAATACTATACTTCACTTCCCTCTTCC
TTCAAAATAAATAAACTTTTGCG

QA 1 803 1 803
DS 

RD RS1BB81JQ 677 0 0
TCTGCTTCGAGAAGTGAAATCAATTTTGAAGAACCAGACAACATCCTTCAGATGGGAGAT
ACTTCATTTCTCGATAGAATGCTTCTCCAGCTTCGTTCCACTTGCAAGTACTACAGTGGT
TACCCTAAGGATCTAGGGCCATCGCGGGTTATCCATTTCACATCAGAAAGAGAGTTTGTC
CAGCTCCTTCACCAGGGCTATCCTGTCGTTGTCGCATTCACCATTAGAAGTAACTACACA
CAACATCTTGACCGGATGCTTGAGGAAGCTGCTGCTGAGTTCTATCCCAACATCAAGTTT
ATGCGTGTTGAGTGCCCCAAGTATCCTGGATTCTGCATAACTCGCCAGAAAAGCGAATAT
CCCTTCATTGAAATATTCCATAGCCCACAACAAGCGGGTAATGAAGGAAAGGTACAGGAC
CCAAATATCACCCGCTATTCTGTGAAAGTCGTACCTTACAATTATGATATGAGCCCTTAT
GGGTTCAGAGAGTTCTTCAAGCGCCAGGGAGTTCGTACTTCGGATCCTAAATGAACAACC
TGAAGGTTTGGTGCGTATTCAAAAACCTTTTGAGTGTATCAATGG*CTTCTATTAGCTAT
CAATGATCTGTTTTTTTAAGAACTATTGTAATACTATACTTCACTTCCCTCTTCCTTCAA
AATAAATAAACTTTTGC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RS1AI52TF 803 0 0
CGAACAAGCAAGAGTTGAAAACAAAATACTCTCACTTTGCAGATCGCCAACTTCCTTCCC
ACGCTTAGCTAGAGGAGGAATCTATACTTAGTCTTCTTCTACATCTCTGATTTGTAACCA
ACGATTCTGCTTCGAGAAGTGAAATCAATTCTGAAGAACCAGACAACATCCTTCAGATGG
GAGATACTTCATTTCTCGATAGAATGCTTCTCCAGCTTCGTTCCACTTGCAAGTACTACA
GTGGTTACCCTAAGGATCTAGGGCCATCGCGGGTTATCCATTTCACATCAGAAAGAGAGT
TTGTCCAGCTCCTTCACCAGGGCTATCCTGTCGTTGTCGCATTCACCATTAGAAGTAACT
ACACACAACATCTTGACCGGATGCTTGAGGAAGCCGCTGCTGAGTTCTATCCCAACATCA
AGTTTATGCGTGTTGAGTGCCCCAAGTATCCTGGATTCTGCATAACTCGCCAGAAAAGCG
AATATCCCTTCATTGAAATATTCCATAGCCCACAACAAGCGGGTAATGAAGGAAAGGTAC
AGGACCCAAATATCACCCGCTATTCTGTGAAAGTCGTACCTTA*AATTATGATATGAGCC
CTTATGGGTTCAGAGAGTTCTTCAAGCGCCAGGGAGTTCGTACTTCGGATCCTAAATGAA
CAACTTGAAGGTTTGGTGCGTATTCAAAA*CCTTTTGAGTGTATCAATGGGCTTCTATTA
GCTACCAATGATTTGTTTTTTTAAGAACTATTGTAATACTATACTTCACTTCCCTCTTCC
TTCAAA*TAAATAAACTTTTGC
G

QA 1 802 1 802
DS 



AS 2 4

CO CL1991Contig1 768 2 16 U
AGATAGAAAGACAGGTTCTCTTATTAATAGTCTTGTAATGGTCCAAGACAGACTGTATAA
GCAAGCCATGAGACTGTTCTCACAAATGTTTTTTCTCATGGTTAAATTTACAAATGAGAG
ATGCATAGATATATCAATATTAAGTGTATAAAAAGCCCGCTTCTTGTTTCATCAGTCCAC
ACATTTTTTCGGCCATGCTGAAACGTTCTGAGTTTCAGTAGTCCAGCCATAGGGGTTAGT
GGTTGGAGCAGGATGGTGAGTTTGAGTGTTTCTTATTCTCTGCAAATGAGAGTTAGTTTG
GGAGTTTAAGGAAGGAGTAGGAATGAAACTGTTTTCGAGTCTTGGAGAAGGAATGGTTGG
TAGTCCCCCCATGTTTAGGTTTGATTGTGGCTGAAAAGGTGGAAGGCATGAAAAAGCCAT
CCTGCTGTTACCAGTTAATGGCATTCTATTGTTGTTGTTGCTATGTCCATTTGATCTACC
GAGAAGCATAGGATTCATTCCTGTTACTCTCTTAACGGTCTCTTCCGCCATTTTCACCTT
AGCTCTTAATGTCTCAATGTCGGCTTTTAGTATTCTATTGCCAACAGCAGCGTCATCATA
CTTGTGATTCATGTTGCTAAATTGCTTCAGAAGTGATGAATGCTCACCTTTTAGCTCATT
AACCTGTGTCTCAAGATCACATGTTTGCCCCTGCTTTCTCCTTCTAGACCGCCTAGCAGA
CTCTCGATTTGACAGCATCCTTCTGGATTTTTTAACGTCCTCTGGTTT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CV84JQ U 1
AF RS1CW13JQ U 2
BS 1 37 RS1CV84JQ
BS 38 38 RS1CW13JQ
BS 39 207 RS1CV84JQ
BS 208 208 RS1CW13JQ
BS 209 390 RS1CV84JQ
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BS 716 768 RS1CW13JQ

RD RS1CV84JQ 715 0 0
AGATAGAAAGACAGGTTCTCTTATTAATAGTCTTGTACTGGTCCAAGACAGACTGTATAA
GCAAGCCATGAGACTGTTCTCACAAATGTTTTTTCTCATGGTTAAATTTACAAATGAGAG
ATGCATAGATATATCAATATTAAGTGTATAAAAAGCCCGCTTCTTGTTTCATCAGTCCAC
ACATTTTTTCGGCCATGCTGAAACGTTTTGAGTTTCAGTAGTCCAGCCATAGGGGTTAGT
GGTTGGAGCAGGATGGTGAGTTTGAGTGTTTCTTATTCTCTGCAAATGAGAGTTAGTTTG
GGAGTTTAAGGAAGGAGTAGGAATGAAACTGTTTTCGAGTCTTGGAGAAGGAATGGTTGG
TAGTCCCCCCATGTTTAGGTTTGATTGTGGTTGAAAAGGTGGAATGCATGAAGAAGCCAT
CCTGCTGTTACCAGTTAATGGTATTCTATTGTTGTTGTTGCTATGTCCATTTGATCTACC
GAGAAGCATAGGATTCATTCCTGTTACTCTCTTAACGGTCTCTTCCGCCATTTTCACCTT
AGCTCTTAATGTCTCAATGTCGGCTTTTAGTATTCTATTGCCAACAGCAGCGTCATCATA
CTTGTGATTCATGTTGCTAAATTGCTTCAGAAGTGATGAATGCTCACCTTTTAGCTCATT
AACCTGTGTCTCAAGATCACATGTTTGCTCCTGCTTTCTCCTTCTAGACCGCCTA

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1CW13JQ 767 0 0
A
ATAGAAAGACAGGTTCTCTTATTAATAGTCTTGTAATGGTCCAAGACAGACTGTATAAGC
AAGCCATGAGACTGTTCTCACAAATGTTTTTTCTCATGGTTAAATTTACAAATGAGAGAT
GCATAGATATATCAATATTAAGTGTATAAAAAGTCCGCTTCTTGTTTCATCAGTCCACAC
ATTTTTTCGGCCATGCTGAATCGTTCTGAGTTTCAGTAGTCCAGCCATAGGGGTTAGTGG
TTGGAGCAGGATGGTGAGTTTGAGTGTTTCTTATTCTCTGCAAATGAGAGTTAGTTTGGG
AGTTTAAGGAAGGGGTAGGAATGAAACTGTTTTCGAGTCTTGGAGATGGAATGGTTGGTA
GTCCCCCCATGTTTAGGTTTGATTGTGGCTGAAAAGGTGGAAGGCATGAAAAAGCCATCC
TGCTGTTACCAGTTAATGGCATTCTATTGTTGTTG***CTATGTCCATTTGATCTGCCGA
GAAGCATAGGATTCATTCCTGTTACTCTCTTAACGGTCTCTTCCGCCATTTTCACCTTAG
CTCTTAATGTCTCGATGTCGGCTTTTAGTATTCTATTGCCAACAGCAGCGTCATCATACT
TGTGATTCATGTTGCTAAGTTGCTTCAGAAGTGATGAATGCTCACCTTTTAGCTCATTAA
CCTGTGTCTCAAGATCACATGTTTGCCCCTGCTTTCTCCTTCTAGACCGCCTAGCAGACT
CTCGATTTGACAGCATCCTTCTGGATTTTTTAACGTCCTCTGGTTT

QA 2 767 2 767
DS 



CO CL1991Contig2 722 2 2 U
GGGAAAAGAATCAAAGGAACAAAGAGAGAGAGGCAGAGGAGATGAACAGTATCTTCTCCA
TAGACGATTTCTCCGATCCCTTTTGGGAATCTTCTCCGCCTCTCGATTCGGACTCGGCCA
AGGTCGTCACGGCGGAGGAATGGACCGTCGAGATGTTTCTCGAAGAGATCGCTTCCTCGG
TGAGCTCGGAGCCTGTCGGAAACAACAACGAGAAGAACAACAACGCGATCGTCGGTGTCT
CGTCGGCGCAGTCTCTTCCTTCCGTCTCCGGACAGAACGATTTCGAAGAAGACAGTCGGT
TTCGCCGCGATTCCGATGAGTACCGTCGCGTTCTTGAGAACAAGCTCGAGACTGAGTGTG
CTACTGTTGTAGCTCTTAGGGCTGGTTCTGTGAAGCCTGAAGATTCGACTGGTTCTCCTG
AAACTCTGTTTCAACCAGCTCAGTCTAGTCCTCTCACTCAAGGTTCTTTGGTGACGCCTG
GAGAAGTTGGTGTCACTTCTTCATTACTGGCTGAGGTGAAAAAAAAACTGGTGTACCCAT
CAAGCAGGTTACCAGTGGATCATCGAGAGATTATTCTGATGATGATGACCTTGATGAAGA
GAATGAGACCACTGGTTCCTTGAAACCAGAGGACGTTAAAAAATCCAGAAGAATGCTGTC
AAATCGAGAGTCTGCTAGCGGTCTAGAAGAGAAAGCAGAGCAAACATGTGATCTTGAGAC
AC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1CW13TF U 1
AF RS1CV84TF U 33
BS 1 513 RS1CW13TF
BS 514 722 RS1CV84TF

RD RS1CW13TF 513 0 0
GGGAAAAGAATCAAAGGAACAAAGAGAGAGAGGCAGAGGAGATGAACAGTATCTTCTCCA
TAGACGATTTCTCCGATCCCTTTTGGGAATCTTCTCCGCCTCTCGATTCGGACTCGGCCA
AGGTCGTCACGGCGGAGGAATGGACCGTCGAGATGTTTCTCGAAGAGATCGCTTCCTCGG
TGAGCTCGGAGCCTGTCGGAAACAACAACGAGAAGAACAACAACGCGATCGTCGGTGTCT
CGTCGGCGCAGTCTCTTCCTTCCGTCTCCGGACAGAACGATTTCGAAGAAGACAGTCGGT
TTCGCCGCGATTCCGATGAGTACCGTCGCGTTCTTGAGAACAAGCTCGAGACTGAGTGTG
CTACTGTTGTAGCTCTTAGGGCTGGTTCTGTGAAGCCTGAAGATTCGACTGGTTCTCCTG
AAACTCTGTTTCAACCAGCTCAGTCTAGTCCTCTCACTCAAGGTTCTTTGGTGACGCCTG
GAGAAGTTGGTGTCACTTCTTCATTACTGGCTG

QA 1 513 1 513
DS 

RD RS1CV84TF 690 0 0
GG
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TCCGCCTCTCGATTCGGACTCGGCCAAGGTCGTCACGGCGGAGGAATGGACCGTCGAGAT
GTTTCTCGAAGAGATCGCTTCCTCGGTGAGCTCGGAGCCTGTCGGAAACAACAACGAGAA
GAACAACAACGCGATCGTCGGTGTCTCGTCGGCGCAGTCTCTTCCTTCCGTCTCCGGACA
GAACGATTTCGAAGAAGACAGTCGGTTTCGCCGCGATTCCGATGAGTACCGTCGCGTTCT
TGAGAACAAGCTCGAGACTGAGTGTGCTACTGTTGTAGCTCTTAGGGCTGGTTCTGTGAA
GCCTGAAGATTCGACTGGTTCTCCTGAAACTCTGTTTCAACCAGCTCAGTCTAGTCCTCT
CACTCAAGGTTCTTTGGTGACGCCTGGAGAAGTTGGTGTCACTTCTTCATTACTGGCTGA
GGTGAAAAAAAAACTGGTGTACCCATCAAGCAGGTTACCAGTGGATCATCGAGAGATTAT
TCTGATGATGATGACCTTGATGAAGAGAATGAGACCACTGGTTCCTTGAAACCAGAGGAC
GTTAAAAAATCCAGAAGAATGCTGTCAAATCGAGAGTCTGCTAGCGGTCTAGAAGAGAAA
GCAGAGCAAACATGTGATCTTGAGACAC

QA 3 690 3 690
DS 



AS 1 4

CO CL1992Contig1 943 4 11 U
GGAACAAGTAGCCAGCCACTCACTCTCTCTCACTGTTTTCTCCACTTTCTCTTCTTCTTG
CTCTAGAGATCTCTCTATCTCTATCTTCATTATTTTCCTCTCTAGAGGACATAAACAGTG
ACATTCTATCTGAACGCATCTATGGCTGCTCTGGTTCTTTCACTTCTCATTCTAGCCATG
GCCGGACACTCTAGTGCGTCATGGTGTGTGTGCAAAACAGGGCTCAGTGATTCAGTGCTA
CAGAATACCTTAGACTACGCCTGTGGAAATGGAGCAGACTGTAATCCCACTCACCCAAAG
GCACCTTGCTTTAACCCTGACAATGTCAGGTCGCACTGCAACTATGCGGTCAATAGCTTC
TTTCAAAAGAAGGGTCAATCTCCAGGCACTTGTGATTTCAGTGGCACTGCCACTCCAACT
ACCACTGATCCAAGCTATTCAGGATGTACCTTCCCAACTAGTGCTAGCGGCTCTGGAGGC
AGCACCACTGTGACACCAGGCACAACCAATCCAAAAGGCAGCTCAACCACCACCACATTT
CCTGGTGGCAACAGTCCTTATTCAGGAACCTCAGCCAATGGAGGTTTTGGAAACAATAGC
ACAGGAGCCACTGGGACAGGGATTAATCCAGATTACTCAATAGAAAGCAGTGCCTTTGCT
CTCGAGAACTCAAGCAAATTGTTCACTTGCCTTATCTTGATCTCTTTAAGTGGATTATGT
TATTTCTCGATGCTGTTCTAAGGATGTTAACTGTTAATGTTCTCTTGTTTTGTTGGTGCA
CTTATTGTCTCTAGGACATTGTATTGTCTCTAGGACATCGGTCTAGCTTAGTGGTAGTCT
ATGTATGTGTGTGTTTTAGTTCTGTGTTATTTCTTGTTGTGAGATGATTTCAGCCTCTTG
GTCTTACTCTGGTAGATTTGATCGTAGTGAAAAAAATTTATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 0 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G191TF U 1
AF RS1B823TF U 27
AF RS1B823JQ C 242
AF RS1G191JQ C 226
BS 1 224 RS1G191TF
BS 225 225 RS1B823TF
BS 226 326 RS1G191TF
BS 327 327 RS1B823TF
BS 328 738 RS1G191TF
BS 739 743 RS1B823TF
BS 744 744 RS1G191JQ
BS 745 747 RS1B823TF
BS 748 748 RS1G191JQ
BS 749 790 RS1B823TF
BS 791 943 RS1G191JQ

RD RS1G191TF 738 0 0
GGAACAAGTAGCCAGCCACTCACTCTCTCTCACTGTTTTCTCCACTTTCTCTTCTTCTTG
CTCTAGAGATCTCTCTATCTCTATCTTCATTATTTTCCTCTCTAGAGGACATAAACAGTG
ACATTCTATCTGAACGCATCTATGGCTGCTCTGGTTCTTTCACTTCTCATTCTAGCCATG
GCCGGACACTCTAGTGCGTCATGGTGTGTGTGCAAAACAGGGCTGAGTGATTCAGTGCTA
CAGAATACCTTAGACTACGCCTGTGGAAATGGAGCAGACTGTAATCCCACTCACCCAAAG
GCACCTTGCTTTAACCCTGACAATGTTAGGTCGCACTGCAACTATGCGGTCAATAGCTTC
TTTCAAAAGAAGGGTCAATCTCCAGGCACTTGTGATTTCAGTGGCACTGCCACTCCAACT
ACCACTGATCCAAGCTATTCAGGATGTACCTTCCCAACTAGTGCTAGCGGCTCTGGAGGC
AGCACCACTGTGACACCAGGCACAACCAATCCAAAAGGCAGCTCAACCACCACCACATTT
CCTGGTGGCAACAGTCCTTATTCAGGAACCTCAGCCAATGGAGGTTTTGGAAACAATAGC
ACAGGAGCCACTGGGACAGGGATTAATCCAGATTACTCAATAGAAAGCAGTGCCTTTGCT
CTCGAGAACTCAAGCAAATTGTTCACTTGCCTTATCTTGATCTCTTTAAGTGGATTATGT
TATTTCTCGATGCTGTTC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1B823TF 764 0 0
GG
CTCACTGTTTTCTCCACTTTCTCTTCTTCTTGCTCTAGAGATCTCTCTATCTCTATCTTC
ATTATTTTCCTCTCTAGAGGACATAAACAGTGACATTCTATCTGAACGCATCTATGGCTG
CTCTGGTTCTTTCACTTCTCATTCTAGCCATGGCCGGAGACTCTAGTGCGTCATGGTGTG
TGTGCAAAACAGGGCTCAGTGATTCAGTGCTACAGAATACCTTAGACTACGCCTGTGGAA
ATGGAGCAGACTGTAATCCCACTCACCCAAAGGCACCTTGCTTTAACCCTGACAATGTCA
GGTCTCACTGCAACTATGCGGTCAATAGCTTCTTTCAAAAGAAGGGTCAATCTCCAGGCA
CTTGTGATTTCAGTGGCACTGCCACTCCAACTACCACTGATCCAAGCTATTCAGGATGTA
CCTTCCCAACTAGTGCTAGCGGCTCTGGAGGCAGCACCACTGTGACACCAGGCACAACCA
ATCCAAAAGGCAGCTCAACCACCACCACATTTCCTGGTGGCAACAGTCCTTATTCAGGAA
CCTCAGCCAATGGAGGTTTTGGAAACAATAGCACAGGAGCCACTGGGACAGGGATTAATC
CAGATTACTCAATAGAAAGCAGTGCCTTTGCTCTCGAGAACTCAAGCAAATTGTTCACTT
GCCTTATCTTGATCTCTTTAAGTGGATTATGTTATTTCTCGATGCTGTTCTAAGG*TGT*
AACTGTTAATGTTCTCTTGTTTTGTTGGTGCACTTATTGTCT

QA 3 764 3 764
DS 

RD RS1B823JQ 650 0 0
AGAATACCTTAGACTACGCCTGTGGAAATGGAGCAGACTGTAATCCCACTCACCCAAAGG
CACCTTGCTTTAACCCTGACAATGTCAGGTCTCACTGCAACTATGCGGTCAATAGCTTCT
TTCAAAAGAAGGGTCAATCTCCAGGCACTTGTGATTTCAGTGGCACTGCCACTCCAACTA
CCACTGATCCAAGCTATTCAGGATGTACCTTCCCAACTAGTGCTAGCGGCTCTGGAGGCA
GCACCACTGTGACACCAGGCACAACCAATCCAAAAGGCAGCTCAACCACCACCACATTTC
CTGGTGGCAACAGTCCTTATTCAGGAACCTCAGCCAATGGAGGTTTTGGAAACAATAGCA
CAGGAGCCACTGGGACAGGGATTAATCCAGATTACTCAATAGAAAGCAGTGCCTTTGCTC
TCGAGAACTCAAGCAAATTGTTCACTTGCCTTATCTTGATCTCTTTAAGTGGATTATGTT
ATTTCTCGATGCTGTTCTAAGGGTGTTAACTGTTAATGTTCTCTTGTTTTGTTGGTGCAC
TTATTGTCTCTAGGACATTGTATTGTCTCTAGGACATCGGTCTAGCTTAGTGGTAGTCTA
TGTATGTGTGTGTTTTAGTTCTGTGTTATTTCTTGTTGTGAGATGATTTC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RS1G191JQ 718 0 0
AGTGATTCAGTGCTACAGAATACCTTAGACTACGCCTGTGGAAATGGAGCAGACTGTAAT
CCCACTCACCCAAAGGCACCTTGCTTTAACCCTGACAATGTTAGGTCGCACTGCAACTAT
GCGGTCAATAGCTTCTTTCAAAAGAAGGGTCAATCTCCAGGCACTTGTGATTTCAGTGGC
ACTGCCACTCCAACTACCACTGATCCAAGCTATTCAGGATGTACCTTCCCAACTAGTGCT
AGCGGCTCTGGAGGCAGCACCACTGTGACACCAGGCACAACCAATCCAAAAGGCAGCTCA
ACCACCACCACATTTCCTGGTGGCAACAGTCCTTATTCAGGAACCTCAGCCAATGGAGGT
TTTGGAAACAATAGCACAGGAGCCACTGGGACAGGGATTAATCCAGATTACTCAATAGAA
AGCAGTGCCTTTGCTCTCGAGAACTCAAGCAAATTGTTCACTTGCCTTATCTTGATCTCT
TTAAGTGGATTATGTTATTTCTCGATGCTGTTCTAAGGATGTTAACTGTTAATGTTCTCT
TGTTTTGTTGGTGCACTTATTGTCTCTAGGACATTGTATTGTCTCTAGGACATCGGTCTA
GCTTAGTGGTAGTCTATGTATGTGTGTGTTTTAGTTCTGTGTTATTTCTTGTTGTGAGAT
GATTTCAGCCTCTTGGTCTTACTCTGGTAGATTTGATCGTAGTGAAAAAAATTTATAC

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 4

CO CL1993Contig1 519 4 13 U
GGACTCACAAATCATCTAATTCTCCTTCCATTCGATTCTAGAGTAAGTTCAAAAAAAATG
TCAGGAAGAGGAAAAGGAGGAAAGGGACTTGGAAAAGGAGGAGCGAAGAGACACAGGAAA
GTTCTGAGAGACAACATCCAAGGGATCACGAAGCCTGCGATCAGGAGACTCGCTCGCAGA
GGAGGCGTGAAGCGAATCAGCGGATTGATCTACGAAGAAACCAGAGGTGTTCTGAAGATC
TTTCTCGAGAATGTCATCAGAGACGCCGTCACTTACACCGAGCACGCGAGGAGGAAGACG
GTCACGGCGATGGATGTCGTTTACGCTTTGAAGAGGCAAGGACGCACTCTCTATGGATTC
GGTGGTTAATTATCTCGGTTTGCTGTGTTGCTACTGATTAAGTCTTACTGTCAAGAAATC
TTAGAGTGTTTTGTCGGTTCGTTTCTTTGTTAGTGTTTTTATAATTGCAGTACTGTAATG
AAAGTTCGATCACTCTATTTTAAGTTTTTTTTTTGTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AE74JQ C 1
AF RS1AE74TF U 1
AF RS1A907JQ C 5
AF RS1A907TF U 5
BS 1 10 RS1AE74JQ
BS 11 21 RS1AE74TF
BS 22 22 RS1A907TF
BS 23 203 RS1AE74TF
BS 204 204 RS1A907TF
BS 205 406 RS1AE74TF
BS 407 407 RS1A907TF
BS 408 460 RS1AE74TF
BS 461 461 RS1A907TF
BS 462 490 RS1AE74TF
BS 491 491 RS1A907TF
BS 492 496 RS1AE74TF
BS 497 519 RS1A907TF

RD RS1AE74JQ 496 0 0
GGACTCACAAATCATCTAATTTTCCTTCCATTCGATTCTAGAGTAAGTTCAAAAAAAATG
TCAGGAAGAGGAAAAGGAGGAAAGGGACTTGGAAAAGGAGGAGCGAAGAGACACAGGAAA
GTTCTGAGAGACAACATCCAAGGGATCACGAAGCCTGCGATCAGGAGACTCGCTCGCAGA
GGAGGCGTGAAGCGAATCAGCGGCTTGATCTACGAAGAAACCAGAGGTGTTCTGAAGATC
TTTCTCGAGAATGTCATCAGAGACGCCGTCACTTACACCGAGCACGCGAGGAGGAAGACG
GTCACGGCGATGGATGTCGTTTACGCTTTGAAGAGGCAAGGACGCACTCTCTATGGATTC
GGTGGTTAATTATCTCGGTTTGCTGTGTTGCTACTGATTAAGTCTTGCTGTCAAGAAATC
TTAGAGTGTTTTGTCGGTTCGTTTCTTTGTTAGTGTTTTTGTAATTGCAGTACTGTAATG
AAAGTTCGATTACTCT

QA 1 496 1 496
DS 

RD RS1AE74TF 496 0 0
GGACTCACAA
ATCATCTAATTTTCCTTCCATTCGATTCTAGAGTAAGTTCAAAAAAAATGTCAGGAAGAG
GAAAAGGAGGAAAGGGACTTGGAAAAGGAGGAGCGAAGAGACACAGGAAAGTTCTGAGAG
ACAACATCCAAGGGATCACGAAGCCTGCGATCAGGAGACTCGCTCGCAGAGGAGGCGTGA
AGCGAATCAGCGGCTTGATCTACGAAGAAACCAGAGGTGTTCTGAAGATCTTTCTCGAGA
ATGTCATCAGAGACGCCGTCACTTACACCGAGCACGCGAGGAGGAAGACGGTCACGGCGA
TGGATGTCGTTTACGCTTTGAAGAGGCAAGGACGCACTCTCTATGGATTCGGTGGTTAAT
TATCTCGGTTTGCTGTGTTGCTACTGATTAAGTCTTGCTGTCAAGAAATCTTAGAGTGTT
TTGTCGGTTCGTTTCTTTGTTAGTGTTTTTGTAATTGCAGTACTGTAATGAAAGTTCGAT
TACTCT

QA 11 496 11 496
DS 

RD RS1A907JQ 515 0 0
GGACAG
ATCATCTAATTCTCCTTC*ATTCGATTCTAGAGTAAGTTCAAAAAAA*TGTCAGGAAGAG
GAAAAGGAGGGAAGGGACTTGGAAAAGGAGGAGCGAAGAGACACAGGAAAGTTTTGAGAG
ACAACATCCAAGGGATCACGAAGCCTGCGATCAGGAGACTCGCTCGCAGAGGAGGCGTGA
AGCGAATCAGCGGATTGATTTACGAAGAAACCAGAGGTGTTCTGAAGATCTTTCTCGAGA
ATGTCATCAGAGGCGCCGTCACTTACACCGAGCACGCGAGGAGGAAGACGGTCACGGCGA
TGGATGTTGTTTACGCTTTGAAGAGGCAAGGACGCACTCTCTATGGATTCGGTGGTTAAT
TATCTCGGTTTGCTGT*TTGCTACTGATTAAGTCTTACTGTCAAGAAATCT*AGAGTGTT
TTGTCGGTTCGTTTCTTTGTTAGTGTTTTTATAATTGTAGTACTGTAATGAAAGTTCGAT
CACTCTATTTTAAGTTTTTTTTTTGTGCC

QA 7 515 7 515
DS 

RD RS1A907TF 515 0 0
GGACAG
ATCATCTAATTCTCCTTC*ATTCGATTCTAGAGTAAGTTCAAAAAAA*TGTCAGGAAGAG
GAAAAGGAGGGAAGGGACTTGGAAAAGGAGGAGCGAAGAGACACAGGAAAGTTCTGAGAG
ACAACATCCAAGGGATCACGAAGCCTGCGATCAGGAGACTCGCTCGCAGAGGAGGCGTGA
AGCGAATCAGCGGATTGATCTACGAAGAAACCAGAGGTGTTCTGAAGATCTTTCTCGAGA
ATGTCATCAGAGGCGCCGTCACTTACACCGAGCACGCGAGGAGGAAGACGGTCACGGCGA
TGGATGTTGTTTACGCTTTGAAGAGGCAAGGACGCACTCTCTATGGATTCGGTGGTTAAT
TATCTCGGTTTGCTGT*TTGCTACTGATTAAGTCTTACTGTCAAGAAATCT*AGAGTGTT
TTGTCGGTTCGTTTCTTTGTTAGTGTTTTTATAATTGTAGTACTGTAATGAAAGTTCGAT
CACTCTATTTTAAGTTTTTTTTTTGTGCC

QA 7 515 7 515
DS 



AS 1 4

CO CL1994Contig1 957 4 4 U
TTTTTGAGCATTTCTGGAAGAAGGATCTTTTGAAAGTATACAAAGAAACGAGGAACGGAA
TGTTGGGACCTGATTACTCTACAAAATTCTCTCCATGGCTTGCCTTTGGATGTATCTCTC
CTCGCTTTATCTACGAAGAGGTTCAAAGATATGAAAGTGAAAGAGTAGCAAACAACTCAA
CATACTGGGTGTTGTTTGAGCTAATATGGAGGGATTACTTTAGGTTTCTTTCGATCAAGT
GTGGCAACTCCTTGTTCCATCTAGGTGGTCCAAGGAATGTGCAAGGTGAATGGAGTCAGG
ATAAGAAGCTGTTTGAGTCTTGGAGAGATGGCAAGACCGGGTATCCTATTATAGATGCAA
ACATGAAGGAGTTATCCACTACAGGTTTCATGTCAAATCGTGGACGACAGATTGTTTGTT
CGTTTCTTGTGAGGGACATAGGGTTGGACTGGAGGATGGGTGCGGAATGGTTTGAGACAT
GTCTGTTGGATTATGATCCGTGTTCTAATTACGGAAACTGGACCTATGGAGCAGGAGTTG
GAAATGATCCTAGAGAAGACCGGTACTTCAGCATTCCCAAGCAAGCACAGAACTATGATC
CAGAAGGAGAATACGTAGCGTTTTGGGTGCAGCAGCTGCGTCGGCTTCCAAAAGAGAAGA
GGCATTGGCCAGGGAGATTGATGTATATGGACACAGTTGTGCCATTGAAGCATGGTCATG
GTGGTAGTGGTGGTAATGCTCAAACGTCAAAGTCTGGTGGTTTCAGAGGGAATCACAACG
GGAGACGTTCAAGACACAATGGTCCTTAGATCAACTCCTTCTTCACCAAAGAGTTTGTAT
TACATAAGTAACATATTATTACTCAGATTAAAAAAAAATAAAACATTATGTGAAATGAGT
AAAACTGTAACTGCGCGCGTTACAGTTTTTAAGCTGTTCTAGTTTCGTTTGTTGCGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1EU05TF U 1
AF RS1E818TF U 1
AF RS1E818JQ C 213
AF RS1EU05JQ C 234
BS 1 543 RS1E818TF
BS 544 544 RS1E818JQ
BS 545 602 RS1E818TF
BS 603 957 RS1E818JQ

RD RS1EU05TF 530 0 0
TTTTTGAGCATTTCTGGAAGAAGGATCTTTTGAAAGTATACAAAGAAACGAGGAACGGAA
TGTTGGGACCTGATTACTCTACAAAATTCTCTCCATGGCTTGCCTTTGGATGTATCTCTC
CTCGCTTTATCTACGAAGAGGTTCAAAGATATGAAAGTGAAAGAGTAGCAAACAACTCAA
CATACTGGGTGTTGTTTGAGCTAATATGGAGGGATTACTTTAGGTTTCTTTCGATCAAGT
GTGGCAACTCCTTGTTCCATCTAGGTGGTCCAAGGAATGTGCAAGGTGAATGGAGTCAGG
ATAAGAAGCTGTTTGAGTCTTGGAGAGATGGCAAGACCGGGTATCCTATTATAGATGCAA
ACATGAAGGAGTTATCCACTACAGGTTTCATGTCAAATCGTGGACGACAGATTGTTTGTT
CGTTTCTTGTGAGGGACATAGGGTTGGACTGGAGGATGGGTGCGGAATGGTTTGAGACAT
GTCTGTTGGATTATGATCCGTGTTCTAATTACGGAAACTGGACCTATGGA

QA 1 530 1 530
DS 

RD RS1E818TF 602 0 0
TTTTTGAGCATTTCTGGAAGAAGGATCTTTTGAAAGTATACAAAGAAACGAGGAACGGAA
TGTTGGGACCTGATTACTCTACAAAATTCTCTCCATGGCTTGCCTTTGGATGTATCTCTC
CTCGCTTTATCTACGAAGAGGTTCAAAGATATGAAAGTGAAAGAGTAGCAAACAACTCAA
CATACTGGGTGTTGTTTGAGCTAATATGGAGGGATTACTTTAGGTTTCTTTCGATCAAGT
GTGGCAACTCCTTGTTCCATCTAGGTGGTCCAAGGAATGTGCAAGGTGAATGGAGTCAGG
ATAAGAAGCTGTTTGAGTCTTGGAGAGATGGCAAGACCGGGTATCCTATTATAGATGCAA
ACATGAAGGAGTTATCCACTACAGGTTTCATGTCAAATCGTGGACGACAGATTGTTTGTT
CGTTTCTTGTGAGGGACATAGGGTTGGACTGGAGGATGGGTGCGGAATGGTTTGAGACAT
GTCTGTTGGATTATGATCCGTGTTCTAATTACGGAAACTGGACCTATGGAGCAGGAGTTG
GAA*TGATCCTAGAGAAGACCGGTACTTCAGCATTCCCAAGCAAGCACAGAACTATGATC
CA

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AAAAAATAAAACATTATGTGAAATGAGTAAAACTGTAACTGCGCGCGTTACAGTTTTTAA
GCTGTTCTAGTTTCGTTTGTTGCGT

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AGTCAGGATAAGAAGCTGTTTGAGTCTTGGAGAGATGGCAAGACCGGGTATCCTATTATA
GATGCAAACATGAAGGAGTTATCCACTACAGGTTTCATGTCAAATCGTGGACGACAGATT
GTTTGTTCGTTTCTTGTGAGGGACATAGGGTTGGACTGGAGGATGGGTGCGGAATGGTTT
GAGACATGTCTGTTGGATTATGATCCGTGTTCTAATTACGGAAACTGGACCTATGGAGCA
GGAGTTGGAAATGATCCTAGAGAAGACCGGTACTTCAGCATTCCCAAGCAAGCACAGAAC
TATGATCCAGAAGGAGAATACGTAGCGTTTTGGGTGCAGCAGCTGCGTCGGCTTCCAAAA
GAGAAGAGGCATTGGCCAGGGAGATTGATGTATATGGACACAGTTGTGCCATTGAAGCAT
GGTCATGGTGGTAGTGGTGGTAATGCTCAAACGTCAAAGTCTGGTGGTTTCAGAGGGAAT
CACAACGGGAGACGTTCAAGACACAATGGTCCTTAGATCAACTCCTTCTTCACCAAAGAG
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AATGAGTAAAACTGTAACTGCGCGCGTTACAGTTTTTAAGCTGTTCTAGTTTCGTTTGTT
GCGT

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DS 



AS 1 3

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TATCAACATCATAACAAAAGTAAAAAAAAAGGACAAAAAATCACTCAGACCACCTGGGTC
AAAAGTGGTTTCCCAGCAAAATGCGCTTCCAAGTTACCAACAACAAAATCTGCCATTGCA
TTCCGTGTCTCCACAGTGGCACTCCCAACGTGAGGAAGCAAAACCACATTTTCAAGTCCA
AAAAGCTCCTCAGGCACATGCGGCTCCTCCTCGAACACATCCAGCCCAGCCCCACCTAGG
CGCCCTTCTGTTAAAGCTTTCACTAGCTCTTTCTCACCAACATGTGGCCCACGCCCTATG
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GTCTCGTCGGTCAATGGGCACGCCACCACGAGGATGTCAAAATTCTGAGCAAGCTCAACC
ACGGTTGGGTAATACTTGTAGCCTACATCAGGCTTCTCTGTTCTTGAGTAGTAATTAATC
GGGCAGCTGAAGCCTTGTGCCCTCTTTGCGATGGCTGTCCCAATTCTACCGAGACCGATG
ATGCCCACAGACTTTCCACTAAACTTAGTAGTGAGTTTGAAATCACCGTACTTCCACTTG
CCACTCTTCACATAGCGATCGCACTGACACAAGCGTCGGAGCAGAGCCAGTATAAGCCCA
ATCGCCAGATCCGCTACGTCCTCCGTGAGAACGTCGGGAGTGTTGGTGACTCGGATCCCT
TTTTCCTTGCATTTCCCCAAATCGATCTTGTCGAGGCCGACGCTGAAGCTGGAGATAATC
TCGAGCTTGGGGAGATCATCGATGAGCTGAGCGTCGGCTCCCGCAGAAGCGTTTCCAACG
ATGGCGCGGATGGAGTTACGATGAGTTTCCAGAAACGCGGGTTTCTCCGGACAAGTCCAG
AAGCGGTGGAGGTTGTAGCGCTTCTGAAGCTCGTTCTCGAGGTAGGCGTTCATGGGGCAC
ATCATCAGGACTCCGATTGATTCCATCTCTGTAACGGCTCACACAAAAA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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QA 1 447 1 447
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TATCAACATCATAACAAAAGTAAAAAAAAAGGACAAGAAATCACTCAGACCACCTGGGTC
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TTCCGTGTCTCCACAGTGGCACTCCCAACGTGAGGAAGCAGAACCACATTTTCAAGTCCA
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CGCCCTTCTGTTAGAGCTTTCACTAGCTCTTTCTCACCAACATGTGGCCCACGCCCTATG
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QA 1 705 1 705
DS 

RD RS1E460TF 666 0 0
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TTCTACCGAGACCGATGATGCCCACAGACTTTCCACTAAACTTAGTAGTGAGTTTGAAAT
CACCGTACTTCCACTTGCCACTCTTCACATAGCGATCGCACTGACACAAGCGTCGGAGCA
GAGCCAGTATAAGCCCAATCGCCAGATCCGCTACGTCCTCCGTGAGAACGTCGGGAGTGT
TGGTGACTCGGATCCCTTTTTCCTTGCATTTCCCCAAATCGATCTTGTCGAGGCCGACGC
TGAAGCTGGAGATAATCTCGAGCTTGGGGAGATCATCGATGAGCTGAGCGTCGGCTCCCG
CAGAAGCGTTTCCAACGATGGCGCGGATGGAGTTACGATGAGTTTCCAGAAACGCGGGTT
TCTCCGGACAAGTCCAGAAGCGGTGGAGGTTGTAGCGCTTCTGAAGCTCGTTCTCGAGGT
AGGCGTTCATGGGGCACATCATCAGGACTCCGATTGATTCCATCTCTGTAACGGCTCACA
CAAAAA

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 4

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AATGGGGGTTTCTCGTTCATTTTCTTGTAGGGCTATGGGAGCCCTAATATTGGGTTGCCT
TCTCCTTCAAGCATCAACCTCCAATGCTCAGTTAAGGCCTGATTTCTATTTCCGAACATG
CCCGGGTGTTTTCCTTATCGTTGGGAAAGTCATCGTCGAAGAATTGGGGAGTGATCCTCG
TATTGCTGCTAGCCTCCTCCGCCTTCATTTCCATGACTGTTTTGTTAACGGCTGCGATGC
ATCGGTCCTACTCGACAATTCCACGTCATTCAGGACCGAGAAAGAAGCTCTTCCGAACTT
AAACTCGGCAAGAGGGTTTGATGTTGTAGATAGAATGAAAGCCGAGATTGAGAGAGCTTG
TCCAAGAACAGTGTCTTGTGCAGATGTTCTCGCCATCGCTGCCCAAATATCAGTGCTTTT
GTCAGGAGGTCCATGGTGGCCGGTTTCACTGGGGAGGAAAGACGGGTTCGAGGCTTTCTT
TGATCTATCTAATACAGCTCTTCCTTCTCCATTTGCCACTCTTGCTGAACTCAAAACAGT
TTTTAGTGACGCTGGTCTAAACCGCACCTCAGATCTAGTTGCTCTTTCTGGCGCTCACAC
ATTTGGAAGAGCACAATGTATAGTAATCACACCTCGTCTCTACAACTTCAACGGTACCAA
TAAACCTGACCCAAGTATAAACCCAACTTTCCTCACCGAACTCCGTAATCTGTGCCCTGA
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CTCGACTCCAGGAGCCGACACAATTCGACTGGTGGAACTATACAGCAAAAACACGTTCGA
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T


BQ
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1D420TF U 16
AF RS1AC02TF U 1
AF RS1D420JQ C 409
AF RS1AC02JQ C 402
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BS 274 739 RS1AC02TF
BS 740 1261 RS1AC02JQ

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TATCGTTGGGAAAGTCATCGTCGAAGAATTGGGGAGTGATCCTCGTATTGCTGCTAGCCT
CCTCCGCCTTCATTTCCATGACTGTTTTGTTAACGGCTGCGATGCATCGGTCCTACTCGA
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TCTAAACCGCACCTCAGATCTAGTTGCTCTTTCTGGCGCTCACACATTTGG

QA 1 651 1 651
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AATGGGGGTTTCTCGTTCATTTTCTTGTAGGGCTATGGGAGCCCTAATATTGGGTTGCCT
TCTCCTTCAAGCATCAACCTCCAATGCTCAGTTAAGGCCTGATTTCTATTTCCGAACATG
CCCGGGTGTTTTCCTTATCGTTGGGAAAGTCATCGTCGAAGAATTGGGGAGTGATCCTCG
TATTGCTGCTAGCCTCCTCCGCCTTCATTTCCGTGACTGTTTTGTTAACGGCTGCGATGC
ATCGGTCCTACTCGACAATTCCACGTCATTCAGGACCGAGAAAGAAGCTCTTCCGAACTT
AAACTCGGCAAGAGGGTTTGATGTTGTAGATAGAATGAAAGCCGAGATTGAGAGAGCTTG
TCCAAGAACAGTGTCTTGTGCAGATGTTCTCGCCATCGCTGCCCAAATATCAGTGCTTTT
GTCAGGAGGTCCATGGTGGCCGGTTTCACTGGGGAGGAAAGACGGGTTCGAGGCTTTCTT
TGATCTATCTAATACAGCTCTTCCTTCTCCATTTGCCACTCTTGCTGAACTCAAAACAGT
TTTTAGTGACGCTGGTCTAAACCGCACCTCAGATCTAGTTGCTCTTTCTGGCGCTCACAC
ATTTGGAAGAGCACAATGTATAGTAATCACACCTCGTCTCTACAACTTCAACGGTACCAA
TAAACCTGACCCAAGTATA

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AACCCGACAGTTCTAGCCAACTTTGACCGAGCGACTCCAAATACTTTCGATAGTCATTAC
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CCAGGAGCCGACACAATTCGACTGGTGGAACTATACAGCAAAAACACGTTCGAGTTCTTT
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ACAATGCGTGGGGAACTATATATGTATTTAGACTTAATAAATGTCGTATCGAGTTTTGTA
TTAAAAATAATGAAAGTTGGCAAAAAGTTGAC

QA 20 831 20 831
DS 

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ACGGGTTCGAGGCTTTCTTTGATCTATCTAATACAGCTCTTCCTTCTCCATTTGCCACTC
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CTCTTTCTGGCGCTCACACATTTGGAAGAGCACAATGTATAGTAATCACACCTCGTCTCT
ACAACTTCAACGGTACCAATAAACCTGACCCAAGTATAAACCCAACTTTCCTCACCGAAC
TCCGTAATCTGTGCCCTGAAAACGGGAACCCGACAGTTCTAGCCAACTTTGACCGAGCGA
CTCCAAATACTTTCGATAGTCATTACTACACCAATCTTCGTCAAGGGAAAGGTGTAATCC
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ACAGCAAAAACACGTTCGAGTTCTTTACGGCATTCTCTAAATCAATGGTTCGAATGGGAA
AACTTAAACCTTTGACTGGAACTCAAGGCGAGGTAAGACTGAATTGTAGGGTTGTGAACT
CGAGAACTAGGGGTGTGGAGAATGAAGATGATGGAGTTGTGAGCCCGATTTGATTATGTC
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TAATAAATGTCGTATCGAGTTTTGTATTAAAAATAATGAAAGTTGGCAAAAAGTTGACAC
TTGTAATTCTTGTTTGATTT

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DS 



AS 1 4

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TATATAAATAAAATTAGAGCACTTAGGTATCAACATGAACAACTCACATCCTGGTGACGA
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TGCGCTGTTTGTAACAAGTCGCTTTATGTTTGGTTGTTTAACCGAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1ED83TF U 1
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AF RS1ED83JQ C 115
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AACCAGCTGGTCCGGACTAAATTGTGTCTCAGTTTA

QA 4 639 4 639
DS 

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GTG
GAGCCAATAATAAACACACAACACAAAGGGAAGCCGATACTTGTCGCCAGTCTCTGTTCG
TCATCACGACCGTTCCGCGAAGATCTGAGGACAAAAGCAATCTCCTTCAACCTCAATTAA
TCAAAGCATTCGAGCAAATCAATACATATATAAATAAAATTAGAGCACTTAGGTATCAAC
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CCTGTATCTCCGGTTTCAAGTTACAACAATGTGTATTCCGCAACTGAAGACGAGACAAGA
GACCCTCCAGCTGTACCCCCACATCTTCAACACTCTCTGTTAGGCCATACAGGCAGCACG
GAATTGCCTTGTGCGCCACAGAGTGCCGTCCTCAACCATCTCTTTATCGAAAACCGTGAC
CCCCCAAGATCCGTTGTAGCGCTTGGTTTCTCGCGTCGGTTCAGGTCTAAGTATGTCACT
GTTGTGATATACAAGCCGGTCCAAAGAAGAGGAAACGCCAATGTTTAGTGATGATGCATC
TTCTTTAAAATTGTGTTGGAATCTTGCTTCTTTGTGGATTCAGTTTGGTATATACAAAAA
AACCAGCTGGTCCGGACTAAATTGTGTCTCAGTTTAGGGAATTCGATTGAAATCATCTTT
GTGTGGACGTTTATATAAAATCTTCCTGCGCTGTTTGTAACAAGTCGCTTTATGTTTGGT
TGTTTAACCGAATCC

QA 4 738 4 738
DS 

RD RS1ED83JQ 646 0 0
AGATCTGAGGACAAAAGCAATCTCCTTCAACCTCAATTAATCAAAGCATTCCAGCAAATC
AATACATATATAAATAAAATTAGAGCACTTAGGTATCAACATGAACAACTCACATCCTGG
TGACGATCATGAGAACACAACGGTGGATGGATTTGAAGTACCTGTATCTCCGGTTTCAAG
TTACAACAATGTGTATTCCGCAACTGAAGACGAGACAAGAGACCCTCCAGCTGTACCCCC
ACATTTTCAACACTTTCTGTTAGGCCATACAGGCAGCACGGAATTGCCTTGTGCGCCACA
GAGTGCCGTCCTCAACCATCTCTTTATCGAAAACCGTGACCCCCCAAGATCCGTTGTAGC
GCTTGGTTTCTCGCATCGGTTCAGGTCTAAGTATGTCACTGTTGTGATATACAAGCCGGT
CCAAAGAAGAGGAAACGCCAATGTTTAGTGATGATGCATCTTCTTTAAAATTGTGTTGGA
ATCTTGCTTCTTTGTGGATTCAGTTTGGTATATACAAAAAAACCAGCTGGTCCGGACTAA
ATTGTGTCTCAGTTTAGGGAATTCGATTGAAATCATCTTTGTGTGGACGTTTATATAAAA
TCTTCCTGCGCTGTTTGTAACAAGTCGCTTTATGTTTGGTTGTTTA

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 4

CO CL1998Contig1 675 4 2 U
TTTTTTTACCAAAAACAATTTCAAGTTCCTAGATAACATATATAGGAAATCAATCTTGCA
TCTTACCCGCTATACAAACAAAAAGAGTCAGAAAAAAAGCTTTCTTCCCAGCTTTGGACC
ACATTACTGAAAACATGGGACCTTTAACCCCTATCAACTAAAACTTTTCCATAAGACACT
GTTATCTGATTGTACTCTCTTAATCCTTTTAGTTATCATTGCTTGCTGTGGTTTAGTTCC
AACCTTTGACCTCTTTCCCTCTCCCTTATAGCTAGTCTTGGCGTTTCAACAGACAGCCTT
TCACTGAACCTATCCGACCCAAACCCATCTTTTGTTAGCTGACCGCTGCCGTACTGATCC
GCCCAGAACCGCCCGCTTCTGTTGCCTGCATCTGACCCTGGAGTTGAGCAGTAGTTCCCA
TCCATTATCATATCTCCTTCTAGTATACGCAACACCTGAGACATGCGTGGCCTCAAATGT
GGGTCTCTACGTATGCACAAGGAAGCTGCATGAAGCATAAAATGACCTCGCTTTCCACAA
AACGGTCCCCAAGTCTCGGATCGATAAGTTCTTCTACAGCATATTCTTCCAGTAGCGGAC
GTGCCCATTCAGTGAGGCATTGCTGGCCTTTCGGCATTGTAATGTCAATGGCTTTGCGGC
CTGTGACTAGCTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1G040JQ U 23
AF RS1G040TF C 1
AF RS1EQ59JQ U 23
AF RS1EQ59TF C 24
BS 1 26 RS1G040TF
BS 27 675 RS1EQ59JQ

RD RS1G040JQ 538 0 0
AAGT
TCCTAGATAACATATATAGGAAATCAATCTTGCATCTTACCCGCTATACAAACAAAAAGA
GTCAGAAAAAAAGCTTTCTTCCCAGCTTTGGACCACATTACTGAAAACATGGGACCTTTA
ACCCCTATCAACTAAAACTTTTCCATAAGACACTGTTATCTGATTGTACTCTCTTAATCC
TTTTAGTTATCATTGCTTGCTGTGGTTTAGTTCCAACCTTTGACCTCTTTCCCTCTCCCT
TATAGCTAGTCTTGGCGTTTCAACAGACAGCCTTTCACTGAACCTATCCGACCCAAACCC
ATCTTTTGTTAGCTGACCGCTGCCGTACTGATCCGCCCAGAACCGCCCGCTTCTGTTGCC
TGCATCTGACCCTGGAGTTGAGCAGTAGTTCCCATCCATTATCATATCTCCTTCTAGTAT
ACGCAACACCTGAGACATGCGTGGCCTCAAATGTGGGTCTCTACGTATGCACAAGGAAGC
TGCATGAAGCATAAAATGACCTCGCTTTCCACAAAACGGTCCCCAAGTCTCGGA

QA 5 538 5 538
DS 

RD RS1G040TF 675 0 0
TTTTTTTACCAAAAACAATTTCAAGTTCCTAGATAACATATATAGGAAATCAATCTTGCA
TCTTACCCGCTATACAAACAAAAAGAGTCAGAAAAAAAGCTTTCTTCCCAGCTTTGGACC
ACATTACTGAAAACATGGGACCTTTAACCCCTATCAACTAAAACTTTTCCATAAGACACT
GTTATCTGATTGTACTCTCTTAATCCTTTTAGTTATCATTGCTTGCTGTGGTTTAGTTCC
AACCTTTGACCTCTTTCCCTCTCCCTTATAGCTAGTCTTGGCGTTTCAACAGACAGCCTT
TCACTGAACCTATCCGACCCAAACCCATCTTTTGTTAGCTGACCGCTGCCGTACTGATCC
GCCCAGAACCGCCCGCTTCTGTTGCCTGCATCTGACCCTGGAGTTGAGCAGTAGTTCCCA
TCCATTATCATATCTCCTTCTAGTATACGCAACACCTGAGACATGCGTGGCCTCAAATGT
GGGTCTCTACGTATGCACAAGGAAGCTGCATGAAGCATAAAATGACCTCGCTTTCCACAA
AACGGTCCCCAAGTCTCGGATCGATAAGTTCTTCTACAGCATATTCTTCCAGTAGCGGAC
GTGCCCATTCAGTGAGGCATTGCTGGCCTTTCGGCATTGTAATGTCAATGGCTTTGCGGC
CTGTGACTAGCTCAC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1EQ59JQ 653 0 0
AAGT
TCCTAGATAACATATATAGGAAATCAATCTTGCATCTTACCCGCTATACAAACAAAAAGA
GTCAGAAAAAAAGCTTTCTTCCCAGCTTTGGACCACATTACTGAAAACATGGGACCTTTA
ACCCCTATCAACTAAAACTTTTCCATAAGACACTGTTATCTGATTGTACTCTCTTAATCC
TTTTAGTTATCATTGCTTGCTGTGGTTTAGTTCCAACCTTTGACCTCTTTCCCTCTCCCT
TATAGCTAGTCTTGGCGTTTCAACAGACAGCCTTTCACTGAACCTATCCGACCCAAACCC
ATCTTTTGTTAGCTGACCGCTGCCGTACTGATCCGCCCAGAACCGCCCGCTTCTGTTGCC
TGCATCTGACCCTGGAGTTGAGCAGTAGTTCCCATCCATTATCATATCTCCTTCTAGTAT
ACGCAACACCTGAGACATGCGTGGCCTCAAATGTGGGTCTCTACGTATGCACAAGGAAGC
TGCATGAAGCATAAAATGACCTCGCTTTCCACAAAACGGTCCCCAAGTCTCGGATCGATA
AGTTCTTCTACAGCATATTCTTCCAGTAGCGGACGTGCCCATTCAGTGAGGCATTGCTGG
CCTTTCGGCATTGTAATGTCAATGGCTTTGCGGCCTGTGACTAGCTCAC

QA 5 653 5 653
DS 

RD RS1EQ59TF 652 0 0
AAG
TCCTAGATAACATATATAGGAAATCAATCTTGCATCTTACCCGCTATACAAACAAAAAGA
GTCAGAAAAAAAGCTTTCTTCCCAGCTTTGGACCACATTACTGAAAACATGGGACCTTTA
ACCCCTATCAACTAAAACTTTTCCATAAGACACTGTTATCTGATTGTACTCTCTTAATCC
TTTTAGTTATCATTGCTTGCTGTGGTTTAGTTCCAACCTTTGACCTCTTTCCCTCTCCCT
TATAGCTAGTCTTGGCGTTTCAACAGACAGCCTTTCACTGAACCTATCCGACCCAAACCC
ATCTTTTGTTAGCTGACCGCTGCCGTACTGATCCGCCCAGAACCGCCCGCTTCTGTTGCC
TGCATCTGACCCTGGAGTTGAGCAGTAGTTCCCATCCATTATCATATCTCCTTCTAGTAT
ACGCAACACCTGAGACATGCGTGGCCTCAAATGTGGGTCTCTACGTATGCACAAGGAAGC
TGCATGAAGCATAAAATGACCTCGCTTTCCACAAAACGGTCCCCAAGTCTCGGATCGATA
AGTTCTTCTACAGCATATTCTTCCAGTAGCGGACGTGCCCATTCAGTGAGGCATTGCTGG
CCTTTCGGCATTGTAATGTCAATGGCTTTGCGGCCTGTGACTAGCTCAC

QA 4 652 4 652
DS 



AS 1 4

CO CL1999Contig1 873 4 4 U
GGATTCCAAAGAGAGAAAATCAATAAGAGAGATTATAAAAATGGGTTTGAGTGTCCATCA
GCTTCTACCCAATATCACTCTTCAGTCATTATTTCTTGTTCTTGTATTGTTTTCTCTTTC
AACATTTTCCATTAGTGGGTCAACTTCTTTTTCGTTAAATACAGACAGAGAAGCTTTGCT
CTCGTTCAGGTCCCAAATAAGCCAAAACCTACGATCAGTTTCTTTCTCTTGGGACCGAAA
CACATCTCCTTGTAATTGGACTGGCGTGACATGCAATACACGTAACAAAAGAGTGGCTTC
CATCAACCTCTCTGGTCATTTTCTCGCTGGTTCCATAAGCCCAAATATTGAGTATGGGCT
TGGAGAAAAGCCATCACAAGCAGGAGATGTGTATAGCTTTGGAGTGATGTTGTTAGAGCT
TATGAGTGGGAAAAGCCCAATGCACGAGAGCTTCGAAGGAGATCAAAATCTGATATCATG
GATGAGTTATAATTTTCAAAGTAATGCAATTACGGAAGTGATCGATCCTAAACTTATGGG
ACTCATCGATGTTTCAGGTGCACAACTTCATGCAAAACTTGATTGCCTTAAGAAAACTAT
TGAAGTTGGCTTGGCTTGTACTGCGTATGCAGTTGGCGAACGGATGAACATGAGAGATGT
GCTACGCTTATTGAAAGAGGCCAAGGACATGCTTATCAAGGGAAACTAATTGATTATATT
TTCCCATTAGTTATTTTAAGTGAATATATAAGTTTTCTTTTGTCGGGAATATATGTCTTT
AGTTACAATTTTTGTTTAATAAGGTTTTTAATTCTCTAGTAAAAAGTAATTGCTTGTAAT
TTTCTGGAAATAAGGAAGTTGAATAGCAGTAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GS01TF U 221
AF RS1GS01JQ C 107
AF RS1F047TF U 1
AF RS1F047JQ C 148
BS 1 557 RS1F047TF
BS 558 558 RS1GS01JQ
BS 559 679 RS1F047TF
BS 680 873 RS1F047JQ

RD RS1GS01TF 137 0 0
TCTTTCTCTTGGGACCGAAACACATCTCCTTGTAATTGGACTGGCGTGACATGCAATACA
CGTAACAAAAGAGTGGCTTCCATCAACCTCTCTGGTCATTTTCTCGCTGGTTCCATAAGC
CCAAATATTGAGTATGG

QA 1 137 1 137
DS 

RD RS1GS01JQ 526 0 0
TTGTTTTCTCTTTCAACATTTTCCATTAGTGGGTCAACTTCTTTTTCGTTAAATACAGAC
AGAGAAGCTTTGCTCTCGTTCAGGTCCCAAATAAGCCAAAACCTACGATCAGTTTCTTTC
TCTTGGGACCGAAACACATCTCCTTGTAATTGGACTGGCGTGACATGCAATACACGTAAC
AAAAGAGTGGCTTCCATCAACCTCTCTGGTCATTTTCTCGCTGGTTCCATAAGCCCAAAT
ATTGAGTATGGGCTTGGAGAAAAGCCATCACAAGCAGGAGATGTGTATAGCTTTGGAGTG
ATGTTGTTAGAGCTTATGAGTGGGAAAAGCCCAATGCACGAGAGCTTCGAAGGAGATCAA
AATCTGATATCATGGATGAGTTATAATTTTCAAAGTAATGCAATTACGGAAGTGATCGAT
CCTAAACTTATGGGACTCATCGATGTTTCAGGTGCACAACTTCATGCAAAACTTGATTGC
CTTAAGAAAACTATTGAAGTTGGCTTGGCTTGTACTGGGTATGCAG

QA 1 526 1 526
DS 

RD RS1F047TF 690 0 0
GGATTCCAAAGAGAGAAAATCAATAAGAGAGATTATAAAAATGGGTTTGAGTGTCCATCA
GCTTCTACCCAATATCACTCTTCAGTCATTATTTCTTGTTCTTGTATTGTTTTCTCTTTC
AACATTTTCCATTAGTGGGTCAACTTCTTTTTCGTTAAATACAGACAGAGAAGCTTTGCT
CTCGTTCAGGTCCCAAATAAGCCAAAACCTACGATCAGTTTCTTTCTCTTGGGACCGAAA
CACATCTCCTTGTAATTGGACTGGCGTGACATGCAATACACGTAACAAAAGAGTGGCTTC
CATCAACCTCTCTGGTCATTTTCTCGCTGGTTCCATAAGCCCAAATATTGAGTATGGGCT
TGGAGAAAAGCCATCACAAGCAGGAGATGTGTATAGCTTTGGAGTGATGTTGTTAGAGCT
TATGAGTGGGAAAAGCCCAATGCACGAGAGCTTCGAAGGAGATCAAAATCTGATATCATG
GATGAGTTATAATTTTCAAAGTAATGCAATTACGGAAGTGATCGATCCTAAACTTATGGG
ACTCATCGATGTTTCAG*TGCACAACTTCATGCAAAACTTGATTGCCTTAAGAAAACTAT
TGAAGTTGGCTTGGCTTGTACTGCGTATGCAGTTGGCGAACGGATGAACATGAGAGATGT
GCTACGCTTATTGAAAGAG
CCAAGACATGC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1F047JQ 726 0 0
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CCTACGATCAGTTTCTTTCTCTTGGGACCGAAACACATCTCCTTGTAATTGGACTGGCGT
GACATGCAATACACGTAACAAAAGAGTGGCTTCCATCAACCTCTCTGGTCATTTTCTCGC
TGGTTCCATAAGCCCAAATATTGAGTATGGGCTTGGAGAAAAGCCATCACAAGCAGGAGA
TGTGTATAGCTTTGGAGTGATGTTGTTAGAGCTTATGAGTGGGAAAAGCCCAATGCACGA
GAGCTTCGAAGGAGATCAAAATCTGATATCATGGATGAGTTATAATTTTCAAAGTAATGC
AATTACGGAAGTGATCGATCCTAAACTTATGGGACTCATCGATGTTTCAGGTGCACAACT
TCATGCAAAACTTGATTGCCTTAAGAAAACTATTGAAGTTGGCTTGGCTTGTACTGCGTA
TGCAGTTGGCGAACGGATGAACATGAGAGATGTGCTACGCTTATTGAAAGAGGCCAAGGA
CATGCTTATCAAGGGAAACTAATTGATTATATTTTCCCATTAGTTATTTTAAGTGAATAT
ATAAGTTTTCTTTTGTCGGGAATATATGTCTTTAGTTACAATTTTTGTTTAATAAGGTTT
TTAATTCTCTAGTAAAAAGTAATTGCTTGTAATTTTCTGGAAATAAGGAAGTTGAATAGC
AGTAGT

QA 1 726 1 726
DS 



AS 2 4

CO CL2000Contig1 878 2 5 U
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CAACGTAATCTAGTATAAGACACCAACCAGATTCATAAAACTAGCATCCTGAGTTTCTGA
TACAACATTAAAAAAGTTTTCACATCTTCTACAGCGTCACATCTTACAAAGCTTCTATGC
TTGGATGAACCCCATTTAGAGGCACCATACAGCAGTTGCATGCCTAAACCGTAAACAACC
CCTAGGTGGGGGGTCGTTGAACCAATCACGACTCTGCGTAGTTCCTAAGGTCAAAAGACA
TCGTACTCGAGCAACTCTTATCGACGTCTCTGTAAACTCCAACCAGAGCTTCAGCCTTGT
CATAGAAGCTGTCCTTGAGAGATATTACAATGCTTTGGAAGCCATGCCCGTCCTCTGCAT
CCTGGTTGTCACGTGCGGCTTGGCAGGATTTGCTACGTATAAACTGAGCGACTTTTGCAA
CGTTTAAATTATCGAGCGCAGCATCCACTTCATCCAGTATGAAGAAAGGCGAAGGCCTAT
AGCTATGGATGGAGAAGAGCAAAGCCAAAGCCGCAACTGTTTTCTCTCCTCCAGAGAGCT
GTTCCATGTCACGGAAACGCTTTGTCGGGGGCATTGTAGTATATTTTATACCATGTAGAA
ACGGATCATCCTCATTCTCCAAGTTTAGATAAGCAGTCCCACCCAATTGATGCGTATTAC
TCTTGGTTAGCTGCTTGTAGATCTTGTCAATGATATTAGAAATGTGGTTGAACGCTTCCA
TAAATAGCTCATACCTCTTCTGCTTACAGCATTGTATGCATCCGCTACTTGTTTCTCCTC
TTTCCTGGCAGCTTCAACTCTTGGCTACTTTTTTTCTT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1DW66JQ U 3
AF RS1DR66JQ U 1
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BS 530 530 RS1DW66JQ
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BS 751 878 RS1DR66JQ

RD RS1DW66JQ 776 0 0
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TAGGTGGGGGGTCGTTGAACCAATCACGACTCTGCGTAGTTCCTAAGGTCAAAAGACATC
GTACTCGAGCAACTCTTATCGACGTCTCTGTAAACTCCAACCAGAGCTTCAGCCTTGTCA
TAGAAGCTGTCCTTGAGAGATATTACAATGCTTTGGAAGCCATGCCCGTCCTCTGCATCC
TGGTTGTCACGTGCGGCTTGGCAGGATTTGCTACGTATAAACTGAGCGACTTTTGCAACG
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TCCATGTCACGGAAACGCTTTGTCGGGGGCATTGTAGTATATTTTATACCATGTAGAAAC
GGATCATCCTCATTCTCCAAGTTTAGATAAGCAGTCCCACCCAATTGATGCGTATTACTC
TTGGTTAGCTGCTTGTAGATCTTGTCAATGATATTAGAAATGTGGTTGAACGCTTC

QA 1 776 1 776
DS 

RD RS1DR66JQ 878 0 0
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CAACGTAATCTAGTATAAGACACCAACCAGATTCATAAAACTAGCATCCTGAGTTTCTGA
TACAACATTAAAAAAGTTTTCACATCTTCTACAGCGTCACATCTTACAAAGCTTCTATGC
TTGGATGAACCCCATTTAGAGGCACCATACAGCAGTTGCATGCCTAAACCGTAAACAACC
CCTAGGTGGGGGGTCGTTGAACCAATCACGACTCTGCGTAGTTCCTAAGGTCAAAAGACA
TCGTACTCGAGCAACTCTTATCGACGTCTCTGTAAACTCCAACCAGAGCTTCAGCCTTGT
CATAGAAGCTGTCCTTGAGAGATATTACAATGCTTTGGAAGCCATGCCCGTCCTCTGCAT
CCTGGTTGTCACGTGCGGCTTGGCAGGATTTGCTACGTATAAACTGAGCGACTTTTGCAA
CGTTTAAATTATCGAGCGCAGCATCCACTTCATCCAGTATGAAGAAAGGTGAAGGCCTAT
AGCTATGGATGGAGAAGAGCAAAGCCAAAGCCGCAACTGTTTTCTCTCCTCCAGAGAGCT
GTTCCATGTCACGGAAACGCTTTGTCGGGGGCATTGTAGTATATTTTATACCATGTAGAA
ACGGATCATCCTCATTCTCCAAGTTTAGATAAGCAGTCCCACCCAATTGATGCGTATTAC
TCTTGGTTAGCTGCTTGTAGATCTTGTCA*TGATATTAGAAATGTGGTTGAACGCTTCCA
TAAATAGCTCATACCTCTTCTGCTTACAGCATTGTATGCATCCGCTACTTGTTTCTCCTC
TTTCCTGGCAGCTTCAACTCTTGGCTACTTTTTTTCTT

QA 1 878 1 878
DS 



CO CL2000Contig2 1070 2 4 U
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AAACCGAGATGTGGGGTCACGAATTCGAAAGCTAGAATCTTCTATCAGTTCGTTGGAAAC
TGATTTGGAGAACATACAGAAGAGGAAGTCCGAACTTAAGGAGTTAACAGAAAAAGCTAC
TAATGAAATCAACAATTGGAAAAAGGAAATGGGAGAGTGCAAACAAAAAGCAGAAGAGTA
TGAAAAAGAAATTCTGGATTGGAAAAAGCAGGCTTCTCAAGCGACAACAAGCATAACCAA
ACTCAATCGTCAGATAAATTCTAAGGAAACGCAAATTGAGCAGCTGATCTCGCAAAAACA
GGAAATAGTTGAGCAGTGTGAGCTTGAACGTATTACGCTTCCTGTTTTATCAGATGCTGC
GGAGGAAGACGACTCAGATGGGCCACAGTTTGACTTTAGTGAGTTGGATAGAGCTCATCT
CCAAGAACGGAGACCATCTGCTCGTGACAAGATGGATGCGGAATTTAGGCAGAAAATAGA
ATCGAAATCATCAGAGATCGAAAGAACGGCCCCAAACTTGAGAGCTCTTGACCAGTATGA
GGCTATACAAGAGAAAGAAAAACAAGTTAGCCAAGAGTTTGAAGCTGCCAGGAAAGAGGA
GAAACAAGTAGCGGATGCATACAATGCTGTTAAGCAGAAGAGGCATGAGCTATTTATGGA
AGCGTTCAACCACATTTCTAATATCATTGACAAGATCTACAAGCAGCTAACCAAGAGTAA
TACGCATCAATTGGGTGGGACTGCTTATCTAAACTTGGAGAATGAGGATGATCCGTTTCT
ACATGGTATAAAATATACTACAATGCCCCGACAAAGCGTTTCCGTGACATGGACAGCTCT
CTGGAGAGAGAAACAGTTGCGGCTTTGGCTTTGCTCTTCTCATCATAGCT


BQ
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AF RS1DR66TF U 1
AF RS1DW66TF U 323
BS 1 685 RS1DR66TF
BS 686 686 RS1DW66TF
BS 687 738 RS1DR66TF
BS 739 1070 RS1DW66TF

RD RS1DR66TF 738 0 0
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TGTTGCCAATATACGTGAATATGAAGAAAAACAGCTCAAGGAGGCTCAAGAAGTGGCGGA
AGAAAGGCTGAATCTGAGTAACCAGCTTGCTAAGTTAAAATACCAGGTGGAATATGAGCA
AAACCGAGATGTGGGGTCACGAATTCGAAAGCTAGAATCTTCTATCAGTTCGTTGGAAAC
TGATTTGGAGAACATACAGAAGAGGAAGTCCGAACTTAAGGAGTTAACAGAAAAAGCTAC
TAATGAAATCAACAATTGGAAAAAGGAAATGGGAGAGTGCAAACAAAAAGCAGAAGAGTA
TGAAAAAGAAATTCTGGATTGGAAAAAGCAGGCTTCTCAAGCGACAACAAGCATAACCAA
ACTCAATCGTCAGATAAATTCTAAGGAAACGCAAATTGAGCAGCTGATCTCGCAAAAACA
GGAAATAGTTGAGCAGTGTGAGCTTGAACGTATTACGCTTCCTGTTTTATCAGATGCTGC
GGAGGAAGACGACTCAGATGGGCCACAGTTTGACTTTAGTGAGTTGGATAGAGCTCATCT
CCAAGAACGGAGACCATCTGCTCGTGACAAGATGGATGCGGAATTTAGGCAGAAAATAGA
ATCGAAATCATCAGAGATCGAAAGA*CGGCCCCAAACTTGAGAGCTCTTGACCAGTATGA
GGCTATACAAGAGAAAGA

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1DW66TF 748 0 0
G
AGGAAATGGGAGAGTGCAAACAAAAAGCAGAAGAGTATGAAAAAGAAATTCTGGATTGTA
TAAAGCAGGCTTCTCAAGCGACAACAAGCATAACCAAACTCAATCGTCAGATAAATTCTA
AGGAAACGCAAATTGAGCAGCTGATCTCGCAAAAACAGGAAATAGTTGAGCAGTGTGA*C
TTGAACGTATTGCGCTTCCTGTTTTATCAGATGCTGCGGAGGAAGACGACTCAGATGGGC
CACAGTTTGACTTTAGTGAGTTGGATAGAGCTCATCTCCAAGAACGGAGACCATCTGCTC
GTGACAAGATG****CGGAATTTAGGCAGAAAATAGAATCGAAATCATCAGAGATCGAAA
GAACGGCCCCAAACTTGAGAGCTCTTGACCAGTATGAGGCTATACAAGAGAAAGAAAAAC
AAGTTAGCCAAGAGTTTGAAGCTGCCAGGAAAGAGGAGAAACAAGTAGCGGATGCATACA
ATGCTGTTAAGCAGAAGAGGCATGAGCTATTTATGGAAGCGTTCAACCACATTTCTAATA
TCATTGACAAGATCTACAAGCAGCTAACCAAGAGTAATACGCATCAATTGGGTGGGACTG
CTTATCTAAACTTGGAGAATGAGGATGATCCGTTTCTACATGGTATAAAATATACTACAA
TGCCCCGACAAAGCGTTTCCGTGACATGGACAGCTCTCTGGAGAGAGAAACAGTTGCGGC
TTTGGCTTTGCTCTTCTCATCATAGCT

QA 2 748 2 748
DS 



AS 1 4

CO CL2001Contig1 1110 4 3 U
GGGGAAGCGAAGAGTTTCTACTTCGATCTCATTAACATCTATGGAGTTTCGATTTCAATC
CATGTTAAACAGGCCTCCGTGAATCTTAGTTCTCGAATTCTGTCTGTTCTTTACACAAAC
TGAAACGTTACTCCTAAATGATTCATCCTCTTATCGTTTTCTTTAACTTCATCACCCCTC
TGCGAGCACGATCTGTTAATGAATACACCGTATTCCTCTGTAAGGCAGTATCTCTATTCC
TGTAAAAGTCTATCCAGTCGATGCTCATCCACCGTACAAGTTTGATTGCTCCGGTTCTGG
AAGACTATAAACGTCAGACGCTGCGAGGAGCTGATGGCGTAGATATGCTCTTACTGGATT
CAAAGGTCAAGACGGAAGTCATTTTTAACCAAGACCTGTCTCATCACCAATTCCAAATAA
ATGTGACTGGGAAACTGAACCTGCTGAGCTGGATTTCCCTAATAGCGCCATGATCATAAA
GGGACTGGTGGAGGCGTTTAATGAACTGTGCACCGTCATGGAGGGAAGTAGCTGCAAGTT
TAGTTCTCATACATATGAACTGCTAACGGAATGACCTCCTGATAGCACGTAAGGTGTTAC
CGTTAGAGGATAGTGCAAAACTCAGACCTGAACTCATGCAAGTAGCTTCGTTTTCCTGTC
ATGGTGCTACTGACTATACATTAAGGGTCTAAACCATGATCCAGGCTTCTATTCCCGAAA
ATCCTGAATCTTTGAGACAACTGGGTATTTAATTTTCAGTGAAAGTCTCACTAGCTCACT
GCAAATAAGAGAAGACACAAACACATGATAAACCGTTGAAGCAACCACTTCATGCTTGAC
ACGTACTTCTGCCGCGCAGTTGAACCATTGATTCTACAGTGTGTATCAAGAGTTTGAAAA
TATACCAATGTTGGCTTTGTCGTCTGAAGATGTCCGAGGAAGTCGGAGGATGTCGTGACT
TGAGTCCAGTTTTTTTTCAGCTGAGGAAAAGTGTGTTATTTTGGTTTACGAATAATATGA
AAAAGTTGGATGTGCTCTGTATAAACTGTCAATGAGATGTGTAATCAGAATCAAGGATAA
GGCACAATCAATTTAAACAGCTTTCTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1GD83TF U 1
AF RS1FD12TF U 9
AF RS1GD83JQ C 446
AF RS1FD12JQ C 467
BS 1 682 RS1GD83TF
BS 683 755 RS1FD12TF
BS 756 1110 RS1GD83JQ

RD RS1GD83TF 682 0 0
GGGGAAGCGAAGAGTTTCTACTTCGATCTCATTAACATCTATGGAGTTTCGATTTCAATC
CATGTTAAACAGGCCTCCGTGAATCTTAGTTCTCGAATTCTGTCTGTTCTTTACACAAAC
TGAAACGTTACTCCTAAATGATTCATCCTCTTATCGTTTTCTTTAACTTCATCACCCCTC
TGCGAGCACGATCTGTTAATGAATACACCGTATTCCTCTGTAAGGCAGTATCTCTATTCC
TGTAAAAGTCTATCCAGTCGATGCTCATCCACCGTACAAGTTTGATTGCTCCGGTTCTGG
AAGACTATAAACGTCAGACGCTGCGAGGAGCTGATGGCGTAGATATGCTCTTACTGGATT
CAAAGGTCAAGACGGAAGTCATTTTTAACCAAGACCTGTCTCATCACCAATTCCAAATAA
ATGTGACTGGGAAACTGAACCTGCTGAGCTGGATTTCCCTAATAGCGCCATGATCATAAA
GGGACTGGTGGAGGCGTTTAATGAACTGTGCACCGTCATGGAGGGAAGTAGCTGCAAGTT
TAGTTCTCATACATATGAACTGCTAACGGAATGACCTCCTGATAGCACGTAAGGTGTTAC
CGTTAGAGGATAGTGCAAAACTCAGACCTGAACTCATGCAAGTAGCTTCGTTTTCCTGTC
ATGGTGCTACTGACTATACATT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1FD12TF 747 0 0
GAAGAGTTTCTACTTCGATCTCATTAACATCTATGGAGTTTCGATTTCAATCCATGTTAA
ACAGGCCTCCGTGAATCTTAGTTCTCGAATTCTGTCTGTTCTTTACACAAACTGAAACGT
TACTCCTAAATGATTCATCCTCTTATCGTTTTCTTTAACTTCATCACCCCTCTGCGAGCA
CGATCTGTTAATGAATACACCGTATTCCTCTGTAAGGCAGTATCTCTATTCCTGTAAAAG
TCTATCCAGTCGATGCTCATCCACCGTACAAGTTTGATTGCTCCGGTTCTGGAAGACTAT
AAACGTCAGACGCTGCGAGGAGCTGATGGCGTAGATATGCTCTTACTGGATTCAAAGGTC
AAGACGGAAGTCATTTTTAACCAAGACCTGTCTCATCACCAATTCCAAATAAATGTGACT
GGGAAACTGAACCTGCTGAGCTGGATTTCCCTAATAGCGCCATGATCATAAAGGGACTGG
TGGAGGCGTTTAATGAACTGTGCACCGTCATGGAGGGAAGTAGCTGCAAGTTTAGTTCTC
ATACATATGAACTGCTAACGGAATGACCTCCTGATAGCACGTAAGGTGTTACCGTTAGAG
GATAGTGCAAAACTCAGACCTGAACTCATGCAAGTAGCTTCGTTTTCCTGTCATGGTGCT
ACTGACTATACATTAAGGGTCTAAACCATGATCCAGGCTTCTATTCCCGAAAATCCTGAA
TCTTTGAGACAACTGGGTATTTAATTT

QA 1 747 1 747
DS 

RD RS1GD83JQ 665 0 0
GAGCTGGATTTCCCTAATAGCGCCATGATCATAAAGGGACTGGTGGAGGCGTTTAATGAA
CTGTGCACCGTCATGGAGGGAAGTAGCTGCAAGTTTAGTTCTCATACATATGAACTGCTA
ACGGAATGACCTCCTGATAGCACGTAAGGTGTTACCGTTAGAGGATAGTGCAAAACTCAG
ACCTGAACTCATGCAAGTAGCTTCGTTTTCCTGTCATGGTGCTACTGACTATACATTAAG
GGTCTAAACCATGATCCAGGCTTCTATTCCCGAAAATCCTGAATCTTTGAGACAACTGGG
TATTTAATTTTCAGTGAAAGTCTCACTAGCTCACTGCAAATAAGAGAAGACACAAACACA
TGATAAACCGTTGAAGCAACCACTTCATGCTTGACACGTACTTCTGCCGCGCAGTTGAAC
CATTGATTCTACAGTGTGTATCAAGAGTTTGAAAATATACCAATGTTGGCTTTGTCGTCT
GAAGATGTCCGAGGAAGTCGGAGGATGTCGTGACTTGAGTCCAGTTTTTTTTCAGCTGAG
GAAAAGTGTGTTATTTTGGTTTACGAATAATATGAAAAAGTTGGATGTGCTCTGTATAAA
CTGTCAATGAGATGTGTAATCAGAATCAAGGATAAGGCACAATCAATTTAAACAGCTTTC
TTTGC

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1FD12JQ 644 0 0
GCCATGATCATAAAGGGACTGGTGGAGGCGTTTAATGAACTGTGCACCGTCATGGAGGGA
AGTAGCTGCAAGTTTAGTTCTCATACATATGAACTGCTAACGGAATGACCTCCTGATAGC
ACGTAAGGTGTTACCGTTAGAGGATAGTGCAAAACTCAGACCTGAACTCATGCAAGTAGC
TTCGTTTTCCTGTCATGGTGCTACTGACTATACATTAAGGGTCTAAACCATGATCCAGGC
TTCTATTCCCGAAAATCCTGAATCTTTGAGACAACTGGGTATTTAATTTTCAGTGAAAGT
CTCACTAGCTCACTGCAAATAAGAGAAGACACAAACACATGATAAACCGTTGAAGCAACC
ACTTCATGCTTGACACGTACTTCTGCCGCGCAGTTGAACCATTGATTCTACAGTGTGTAT
CAAGAGTTTGAAAATATACCAATGTTGGCTTTGTCGTCTGAAGATGTCCGAGGAAGTCGG
AGGATGTCGTGACTTGAGTCCAGTTTTTTTTCAGCTGAGGAAAAGTGTGTTATTTTGGTT
TACGAATAATATGAAAAAGTTGGATGTGCTCTGTATAAACTGTCAATGAGATGTGTAATC
AGAATCAAGGATAAGGCACAATCAATTTAAACAGCTTTCTTTGC

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 4

CO CL2002Contig1 1373 4 16 U
GGGAGAGAGAGAGAGAGAGATGAGGGCGTTGATGAAGTCAGCCGGTGTCCGAGCTCTGAA
ATTGTCGTCGGCGGTGAATTTCAGGTTGAACCAAAGCGGACGTTCTCTGAGATCCTTCTC
TATGCTTATGTCGCCACCGTCAAACGCCATCGTGTATGAGCAGCACGGCTCTCCCGATTC
TGTCACCAGATTGGTGACTCTCCCGCCGGTGGAGGTTAGAGACAACGATGTATGCGTTAA
AATGATCGCCGCGCCGATCAATCCCTCCGATATCAACCGAATCGAAGGTGTGTACCCGGT
TAGGCCACCTGTACCAGCCGTTGGTGGTTATGAAGGTGTTGGTGAAGTCTATGCTGTTGG
CTCCAACGTCAATGCTCTTTCTCCGGGTGATTGGGTTATTCCATCTCCACCATCCTCAGG
GACTTGGCAGACGTATGTTGTCAAGGAGGAGAGTGTGTGGCACAAAATTGACAAATCTTG
TCCGATGGAGTACGCGGCGACCGTTACTGTTAATCCCTTGACGGCTTTAAGGATGCTTGA
AGATTTTAAGCCCTTAGCTTCCGGAGATTCTGTGGTACAGAATGGTGCAACAAGTATCGT
GGGTCAATGTGTAATCCAGTTAGCTAGGCTCCGTGGCATCAGTACCATCAATATCATCCA
TGATAGGCCCGGGTCGGATGAACCAAAAGAGAATCTAAAAGCTCTAGGTGCAGACCAAGT
GTTTTCGGAGAGTCATCTGAATGTGAAGAATGTGAAAAGTCTTTTGGGAGAGTTACCTGA
ACCAGCTCTGGGATTCAACTGTGTTGGTGGCAATGCTGCCTCTCTCGTCCTCAAGTTTCT
GAGGGAAGGAGGAACCATGGTAACATATGGTGGGATGTCTAAGAAGCCAATCACTGTTTC
AACAACATCTTTCATCTTCAAGGATTTGGAGTTGAAAGGGTTTTGGCTGCAGAACTGGTT
GAGTTTGGGTAAAGTAAAAGAATGCAGGGAGATGATAGACTATCTTCTCGGGCTTGCCCG
GGACGGAAAGCTAAAATACGAAACGGAACTGGTTCCTTTCGACGAGTTCCCTGTCGCCCT
CGATAAAGCTCTCGGGAAGGTAGGTAGACAACCCAAACAAGTCATCACATTCTGAAGCTT
CCTTACTGTGAGCCGTTTAGGAAGGGTTAACACTGTGTTAGTGTTATGTGTGAACGTATT
AGTAATCTGCTGATGCAAATTGTACTTTATTGCACTCTCTGTTTCTTCTTCTTTCTCCAT
GTATCAGAAACAATAAAAATGTGGACTGAACGAACCAAAATAAATCATTAGACTGAATGA
ACAATGCGTTTTTGTATAAGCGGAGAGATATTCAATGTATGTAACCTACCGAT


BQ
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G
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CT

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ACCGAT

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DS 



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BQ
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G
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AAAAAAACACAAATTCTTCCAAAGATGTGATGATCATCATCTCAAAGGCTGTGAAGAGCA
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TTTAGTTCGTTTTGTTTTGCAGTTTGCAGACTTTATCAAATGTTTTTTACACAATGTGTT
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DS 



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BQ
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AGGAGTGCTGTTATTGAACCTCGGAGGCCCCGAGACTTTGGATGATGTGCAACCCTTCTT
GTTTAACCTCTTTGCTGACCCGGACATTATAAGATTGCCGCCCTTGTTCCAGTTTCTTCA
GAAGCCATTGGCACA

QA 1 315 1 315
DS 

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CATCTGCTTCGTCTTCCTGTTCCTACTCAACGTTTCGTCCTCGTCATCCAAGAGTGTTGT
TACCACACGATTCACAGAGATCTGTGCAGTTTTCAAGATTACATAGTGAGCAGCAGGCTT
CGGATGGATGGGGTGAGAAAACGCAACCGCAACC******GCCACTCCGGCTGCTTGGGA
AACAGTCATTGCCTTTGAGAGCGGTGGTGACCACCTCATCCTC***AAACATTTCAACAT
CCGATGAGATTGAGAAAGTAGGAGTGCTGTTATTGAACCTCGGAGGCCCCGAGACTTTGG
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AAAGCAAGGAAGGTTACGCTTCTATTGGTGGTGGTTCTCCTCTTCGCCGCATTACTGATT
CACAGGCTGAAGAATTAAGTAAATGCCTTTCCGAAAAAAACGTCCCAGCGAAGGTATATG
TTGGCATGCGTTATTGGCATCCATTCACTGAGGAAGCCATTGAACAGATAAAGACAGATG
G

QA 1 721 1 721
DS 

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GAAAACGCAAC
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TGTTATTGAACCTCGGAGGCCCCGAGACTTTGGATGATGTGCAACCCTTCTTGTTTAACC
TCTTTGCTGACCCGGACATTATAAGATTGCCGCCCTTGTTCCAGTTTCTTCAGAAGCCAT
TGGCACAGTTCATATCTGTAGCAAGGGCTCCCAAAAGCAAGGAAGGTTACGCTTCTATTG
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TTTCCGAAAAAACCGCCCCAGCGAAGGTATATGTTGGCATGCGTTATTGGCATCCATTCA
CTGAGGAAGCCATTGAACAGATAAAGACAGATGGAATTACAAAACTTGTTGTCCTACCAC
TCTATCCCCAATTTTCGATATCGACAAGTGGTTCAAGCCTAAGACTCTTGGAGAAAATAT
TCCGAGAGGACGAGTATCTTGTGAACATGCAGCATACTGTTATACCATCATGGTATCAGC
GGGAGGGATATATAACGGCAATGGCAAACTTGATCCAAAACGAGTTGGGAAAATTTGAT
C

QA 12 670 12 670
DS 

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GCAGAG
ATCTGTGCAGTTTTCAAGATTACATAGTGAG**GCTG*CTTCGGATGGATGGGGTGAGAA
AACGCAACCGCAACCGCAACCGCCACTCCGGCTGCTTGGGAAACAGTCATTGCCTTTGAG
AGCGGTGGTGACCACCTCATCCTC***AAACATTTCAACATCCGATGAGATCGAGAAAGT
AGGAGTGCTGTTATTGAACCTCGGAGGCCCCGAGACTTTGGATGATGTGCAACCCTTCTT
GTTTAACCTCTTTGCTGACCCGGACATTATAAGATTGCCGCCCTTGTTCCAGTTTCTTCA
GAAGCCATTGGCACAGTTCATATCTGTAGCAAGGGCTCCCAAAAGCAAGGAAGGTTACGC
TTCTATTGGTGGTGGTTCTCCTCTTCGCCGCATTACTGATTCCCAGGCTGAAGAATTAAG
TAAATGCCTTTCCGAAAAAACCGTCCCAGCGAAGGTATATGTTGGCATGCGTTATTGGCA
TCCATTCACTGAGGAAGCCATTGAACAGATAAAGACAGATGGAATTACAAAACTTGTTGT
CCTACCACTCTATCCCCAATTTTCGATATCGACAAGTGGTTCAAGCCTAAGACTCTTGGA
GAAAATATTCCGAGAGGACGAGTATCTTGTGAACATGCAGCATACTGTTATACCATCATG
GTATCAGCGGGAGGGATATATAACGGCAATGGCAAACTTGATCCAAA*CGAGTTGGGAAA
ATTTGATTCCCCTAGTCAGTTTGTAATATTTTCAGTGCACATGGCGTGCACTTGCATATG
TT

QA 7 788 7 788
DS 



AS 1 4

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CTGTTCCGGTCTCTCCTTCAGACATGCTCACCATGTTCTTTCAGGCTGATGGAACTTTGA
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TAAAAGTTCAAGTTTCTGAAGGTGTTGCCGTTGTTGAGCTTTCAAAGCAAACAACGGTTC
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AATTTAATAGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C953JQ C 22
AF RS1EB51TF U 1
AF RS1C953TF U 22
AF RS1EB51JQ C 1
BS 1 22 RS1EB51TF
BS 23 662 RS1C953TF
BS 663 731 RS1EB51JQ

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G
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QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1C953TF 648 0 0
G
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AAGCCCTAACTTTTCTTCGACCCATCTTCTTCCCCTATCGAAAAACCTCACCTTTCGAAC
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CCTTGGGATGACGAAGCTTTCGTCTCTTGGAGAAGGAGGAGGAGAAGACGGCGTTGCAAT
TGCGGATGAAGAGCAACAACAACAGCAAGAGACAGTCTCTGTTCCGGTCTCTCCTTCAGA
CATGCTCACCATGTTCTTTCAGGCTGATGGAACTTTGAACGAAGCAGCTATTCCTAATGT
GACTAAGGCCTTACAGGACATAGATGGAGTTTCCAACTTAAAAGTTCAAGTTTCTGAAGG
TGTTGCCGTTGTTGAGCTTTCAAAGCAAACAACGGTTCAAGCAACAGGAGTGGCGTCAAG
CTTGGTGGAGACTATACAAGGAGCTGGCTTTAAGTTACAAACTCTGAATCTGAGCTTTGA
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ATCACTT

QA 2 641 2 641
DS 

RD RS1EB51JQ 731 0 0
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CGAAAAACCTCACCTTTCGAACCAGACCCATCGGGAACAGCAGAGTTTGCAGCTTTGATG
GGTTCACTAAACAGAGTCGTCGCCTTGGGATGACGAAGCTTTCGTCTCTTGGAGAAGGAG
GAGGAGAAGACGGCGTTGCAATTGCGGATGAAGAGCAACAACAACAGCAAGAGACAGTCT
CTGTTCCGGTCTCTCCTTCAGACATGCTCACCATGTTCTTTCAGGCTGATGGAACTTTGA
ACGAAGCAGCTATTCCTAATGTGACTAAGGCCTTACAGGACATAGATGGAGTTTCCAACT
TAAAAGTTCAAGTTTCTGAAGGTGTTGCCGTTGTTGAGCTTTCAAAGCAAACAACGGTTC
AAGCAACAGGAGTGGCGTCAAGCTTGGTGGAGACTATACAAGGAGCTGGCTTTAAGTTAC
AAACTCTGAATCTGAGCTTTGAAGACGAAGATGAGGTTCTTGTCTAATAATTGAATCATG
TTTCTGTTGCTCCGTTTTGTGATTAAAGACAAAACACATTAATGTTCCAATATTTATTGT
AGGATCACTTTCTTTCATTTGTTCCCGCAAGAAGACAACGTAGTAAATTACAAAAAGTAG
AATTTAATAGG

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 3

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AAAGACTAAGACTGGCTCCAGCCAAGATCATTTTCTTCACAACCTCGATATGTCCATTCA
AACAAGCCCAATGCAGAGGAGCATTGTTCTCCTCGTTAAGAGCGTTAATATCTACTCCTT
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CCGCTTCTGCACCCATCTTCTCCACCGGACAAAATCTACTTTATCAAATCCTGAGGGTTT
CCGTCGTTGGGTTTTTAATTAGGGTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D554JQ U 1
AF RS1FW01JQ U 25
AF RS1D554TF C 1
BS 1 688 RS1D554JQ

RD RS1D554JQ 688 0 0
ATGTCCACTGGAACTATATCAATTGTAGCAACGATCTTTTTTTTTGGTGGAATTCGAATT
CAGATGATTCCAGTTCTAACCATCAGTCTACACATAACAACGCAAAAACTTCCACATAAC
AAAAACTATGCTGAAAACTACAGAGAGAGAACAAGCATTTTATGAAGACAGCCATTTAAA
GTCAGGCGACATGGGTGTTTTCAAGTTCCATTTGTGCAACAGTGGTGTTGATAGCATCTA
TAATCTCCATCTTCCCTGCACCAATAGCTTCGTCCATGGGAGTCCGCTCGTACCGGTTCA
AAAGACTAAGACTGGCTCCAGCCAAGATCATTTTCTTCACAACCTCGATATGTCCATTCA
AACAAGCCCAATGCAGAGGAGCATTGTTCTCCTCGTTAAGAGCGTTAATATCTACTCCTT
GACTGATGAGATACTCCACCATACTCATATGTCCATTCGCCGCGGCCATATGAAGCGCTG
TTCGACCTTGGGAATCGCGAGAGTTAAGGGAGACACCATCAAAGGCCAAGCTTTTGAGAT
CATCTATATCATTGTATCTAGCTGCATCGAGCAAGTCGTCGACTTTCTCTGCTTCCACGA
CCGCTTCTGCACCCATCTTCTCCACCGGACAAAATCTACTTTATCAAATCCTGAGGGTTT
CCGTCGTTGGGTTTTTAATTAGGGTTCC

QA 1 688 1 688
DS 

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AGTCTACACATAACAACGCAAAAACTTCCACATAACAAAAACTATGCTGAAAACTACAGA
GAGAGAACAAGCATTTTATGAAGACAGCCATTTAAAGTCAGGCGACATGGGTGTTTTCAA
GTTCCATTTGTGCAACAGTGGTGTTGATAGCATCTATAATCTCCATCTTCCCTGCACCAA
TAGCTTCGTCCATGGGAGTCCGCTCGTACCGGTTCAAAAGACTAAGACTGGCTCCAGCCA
AGATCATTTTCTTCACAACCTCGATATGTCCATTCAAACAAGCCCAATGCAGAGGAGCAT
TGTTCTCCTCGTTAAGAGCGTTAATATCTACTCCTTGACTGATGAGATACTCCACTATAC
TCATATGTCCATTCGCCGCGGCCATATGAAGCGCTGTTCGGCCTTGGGAATCGCGAGAGT
TAAGGGAGACACCATCAAAGGCCAAGCTTTTGAGATCATCTATATCATTGTATCTAGCTG
CATCGAGCAAGTCGTCGACTTTCTCTGCTTCCACGACCGCTTCTGCACCCATCTTCTCCA
CCGGACAAAATCTACTTTATCAAATCCTGAGGGTTTCCGTCG
TTCC

QA 1 642 1 642
DS 

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CAGATGATTCCAGTTCTAACCATCAGTCTACACATAACAACGCAAAAACTTCCACATAAC
AAAAACTATGCTGAAAACTACAGAGAGAGAACAAGCATTTTATGAAGACAGCCATTTAAA
GTCAGGCGACATGGGTGTTTTCAAGTTCCATTTGTGCAACAGTGGTGTTGATAGCATCTA
TAATCTCCATCTTCCCTGCACCAATAGCTTCGTCCATGGGAGTCCGCTCGTACCGGTTCA
AAAGACTAAGACTGGCTCCAGCCAAGATCATTTTCTTCACAACCTCGATATGTCCATTCA
AACAAGCCCAATGCAGAGGAGCATTGTTCTCCTCGTTAAGAGCGTTAATATCTACTCCTT
GACTGATGAGATACTCCACCATACTCATATGTCCATTCGCCGCGGCCATATGAAGCGCTG
TTCGACCTTGGGAATCGCGAGAGTTAAGGGAGACACCATCAAAGGCCAAGCTTTTGAGAT
CATCTATATCATTGTATCTAGCTGCATCGAGCAAGTCGTCGACTTTCTCTGCTTCCACGA
CCGCTTCTGCACCCATCTTCTCCACCGGACAAAATCTACTTTATCAAATCCTGAGGGTTT
CCGTCG

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 4

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GGGTGAATCTTAGATGGATTTTAGGCAATTCATTGCTTTAGAGTTTGTCATATAAACACA
ACATTACCGCATAA*TAGCTACATAATACATAGTGTAAAACAACAAACAATAGTTCTTCT
AGTTTTCCAAAGAAACATATTGGATGGCTAGTAATTGACAGTGGACTTGATTGCATCCAA
TATCTTGTTCTTGGTGGGCATGTAGAACGGCTCAAACACAAGAGGGAATGGAGTGTCCAG
ACCACAAACTCTGCTTACTGGCGCTTCTAACTTCAAGAAGCAACGTTCGAGGATTGTTGC
AGAGATCTCTGCTCCAAAACCTCCCGTCACAGGAGCTTCATGGCTTATAAGAAGCCTGCC
AGTCTTTTTAACAGAGGCCTCCACTGTTTCTTTGTCCCAAGGTAGTAGAGTCTTGAGATC
TATCAGTTCACATGATATTCCTTCCTTCTCCGCGTCTAGACAAGCTTGTTCCATAACGGT
AAGCTGAGCTCCCCACCCAACAAGTGTTATGTCATTGCCTTGTCTAATAACCTCAGCTTC
TGATAAAGGTATCATATAGTCATGCTCTGGAACTTCCTCTACCGCTTGACGATATAGCCA
CTTTGGTTCGAAGAAGACAACAGGATTTGGATCACGGATAGAGGACAACAGTAGTCCCTT
AGCTTCTCGTGGACTCCGGGGGATAACAACCTTAATACCAGGGACATGGCAGAAGAAAGC
CTCAGGGGATTGGGAATGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CA23JQ U 1
AF RS1E958JQ U 31
AF RS1CA23TF C 1
AF RS1CY80JQ U 52
BS 1 649 RS1CA23JQ
BS 650 739 RS1CY80JQ

RD RS1CA23JQ 650 0 0
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C

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1E958JQ 582 0 0
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QA 18 582 18 582
DS 

RD RS1CA23TF 650 0 0
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AGTTTTCCAAAGAAACATATTGGATGGCTAGTAATTGACAGTGGACTTGATTGCATCCAA
TATCTTGTTCTTGGTGGGCATGTAGAACGGCTCAAACACAAGAGGGAATGGAGTGTCCAG
ACCACAAACTCTGCTTACTGGCGCTTCTAACTTCAAGAAGCAACGTTCGAGGATTGTTGC
AGAGATCTCTGCTCCAAAACCTCCCGTCACAGGAGCTTCATGGCTTATAAGAAGCCTGCC
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CTTTGGTTCGAAGAAGACAACAGGATTTGGATCACGGATAGAGGACAAC
C

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1CY80JQ 688 0 0
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CTTGAGATCTATCAGTTCACATGATATTCCTTCCTTCTCCGCGTCTAGACAAGCTTGTTC
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QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

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CTTTTGGTAAAGAGATCTCTTTTCCCTCGAAGGAAAGACGGAGATGGTCCACTTGGTGGT
CCCATTTCGCAGCCTTTTGGGCCTCGAGTGTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1EN71JQ U 1
AF RS1FP43JQ U 1
BS 1 751 RS1EN71JQ
BS 752 752 RS1FP43JQ

RD RS1EN71JQ 751 0 0
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CCGGCACAACGTTGACCCAAATCTCGGCAACGTCAGGTAACGTGACCAACACGGAGTTCA
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CCCATTTCGCAGCCTTTTGGGCCTCGAGTGT

QA 1 751 1 751
DS 

RD RS1FP43JQ 752 0 0
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CCAAATGCACAACATCAACGTTCATAGCTAATTCAATATTTGGCCAACCAAAAAATAAGC
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CGACGACCGGCATAGCCACCCCTGGCTTCGCAGGATTCTAGAAATCCTCTCTGTATGTTC
TTCCCAAAACACCCTCCACGTTCGGCGACAACCTCAAGAACCGGAACTGGACTTCGAGAT
GGGCAAAACAGTCATTTTCAGGTCTCCCGTATTTATGTATCGTGTCGTCTTCCTTTGTAA
CCGGCACAACGTTGACCCAAATCTCGGCAACGTCAGGTAACGTGACCAACACGGAGTTCA
TGTCTGAAGTTCTCTCGATCGTTATATAGCTCCCCGGGGGAGTCCAGATAGACGAATCCC
CTTTTGGTAAAGAGATCTCTTTTCCCTCGAAGGAAAGACGGAGATGGTCCACTTGGTGGT
CCCATTTCGCAGCCTTTTGGGCCTCGAGTGTG

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 4

CO CL2009Contig1 822 4 5 U
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TCTTTTCTCATCACTCTCCTCTTGGCGACAGTGGCCTGCACACACGGACAAGAACCGGTG
AAAGACACTGCCGGGAATTCTCTTGAGATAGGTCAGCAATACTTCATCCGGCCGATCAAG
ACTGAAAGCCTCAATGGTGGTGGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAAATTTCCCCCTTGCCCA
CTTGGCATCAACCAAGCACTCTTTCCGTTCCTACCGGGCCAACCGCTTAGCTTCCAGTTT
TCTGACTCCGTCACAGAATCCATCGTTAAGACATCTACTGATGTAACCATCGAGTTCAAC
GCTAGCAAGCCGCTACCACTCTGCAACGAATTTTCCTTTATATGGGAAGTTGAGTCCTCA
TCGGCTTCCGAGCCAGCAATTCTCCTCGGTGGTATAGCGGGGAGCCAAAATAGCCGGTTT
AAGATAGAGAAAGCCGGAGAAGGATTAGGAGAAAACACTTATAAGCTGACCAGCTTAGAC
GGGACCGTTGGAAGCGTCCCCGGTTTTTTTGGGGCACCAAAACTAGTTCTCACCAATGAT
GACGCTAAGACCATATTCGTCAAATTCAACAAATATAATGAAGCTACTACATCTGCTTCT
CGTGTTGAGAACTCAGGTCTAAGGATGTTCCCATTCTAATAGTCAAGATAATGTAACGTT
AAGCCTAAGACTCGTCCATGGCCAAAAATAAGGGGTTGAGATAATACCCGCATGCATGTT
TCTTTACTTTCCTCATGAATATATAAAATGAAATTATGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EF65TF U 1
AF RS1FE02TF U 6
AF RS1FE02JQ C 30
AF RS1EF65JQ C 36
BS 1 122 RS1EF65TF
BS 123 123 RS1FE02TF
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BS 672 761 RS1FE02JQ
BS 762 822 RS1EF65JQ

RD RS1EF65TF 676 0 0
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TCTTTTCTCATCACTCTCCTCTTGGCGACAGTGGCCTGCACACACGGACAAGAACCGGTG
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CTTGGCATCAACCAAGCACTCTTTCCGTTCCTACCGGGCCAACCGCTTAGCTTCCAGTTT
TCTGACTCCGTCACAGAATCCATCGTTAAGACATCTACTGATGTAACCATCGAGTTCAAC
GCTAGCAAGCCGCTACCACTCTGCAACGAATTTTCCTTTATATGGGAAGTTGAGTCCTCA
TCGGCTTCCGAGCCAGCAATTCTCCTCGGTGGTATAGCGGGGAGCCAAAATAGCCGGTTT
AAGATAGAGAAAGCCGGAGAAGGATTAGGAGAAAACACTTATAAGCTGACCAGCTTAGAC
GGGACCGTTGGAAGCGTCCCCGGTTTTTTTGGGGCACCAAAACTAGTTCTCACCAATGAT
GACGCTAAGACCATATTCGTCAAATTCAACAAATATAATGAAGCTACTACATCTGCTTCT
CGTGTTGAGAA
CTCAG

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1FE02TF 666 0 0
G
AAACACCCCAAACACCAAACCTAAAAACACAAGAACATCATCACAATGAAGATCTCTTTT
CTCATCACTCTCCTCTTGGCGACAGTGGCCTGCACACACGGACAAGAACCGGTGAAAGAC
ACTGCCGGGAATTCTCTTGAGATAGGTCAGCAATACTTCATCCGGCCGATCAAGACTGAA
AGCCTCAATGGTGGTGGTCTTGTTCCAGCCGCCATTAAATTTCCCCCTTGCCCACTTGGC
ATCAATCAAGCACTCTTTCCGTTCCTACCGGGCCAACCGCTTAGCTTCCAGTTTTCTGAC
TCCGTCACAGAATCCATCGTTAAGACATCTACTGATGTAACCATCGAGTTCAACGCTAGC
AAGCCGCTACCACTCTGCAACGAATTTTCCTTTATATGGGAAGTTGAGTCCTCATCGGCT
TCCGAGCCAGCAATTCTCCTCGGTGGTATAGCGGGGAGCCAAAATAGCCGGTTTAAGATA
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GTTGGAAGCGTCCCCGGTTTTTTTGGGGCACCAAAGCTAGTTCTCACCAATGATGACGCT
AAGACCATATTCGTCAAATTCAACAAATATAATGAAGCTACTACATCTGCTTCTCGTGTT
GAGAA

QA 2 666 2 666
DS 

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AAAACA
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CTGCACACACGGACAAGAACCGGTGAAAGACACTGCCGGGAATTCTCTTGAGATAGGTCA
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CGCCATTAAATTTCCCCCTTGCCCACTTGGCATCAATCAAGCACTCTTTCCGTTCCTACC
GGGCCAACCGCTTAGCTTCCAGTTTTCTGACTCCGTCACAGAATCCATCGTTAAGACATC
TACTGATGTAACCATCGAGTTCAACGCTAGCAAGCCGCTACCACTCTGCAACGAATTTTC
CTTTATATGGGAAGTTGAGTCCTCATCGGCTTCCGAGCCAGCAATTCTCCTCGGTGGTAT
AGCGGGGAGCCAAAATAGCCGGTTTAAGATAGAGAAAGCCGGAGA*GGATTAGGAGAAAA
CACTTATAAGCTGACCAGCTTAGACGGGACCGTTGGAAGCGTCCCCGGTTTTTTTGGGGC
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TTGAGA
C

QA 7 732 7 732
DS 

RD RS1EF65JQ 787 0 0
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CTGCACACACGGACAAGAACCGGTGAAGGACACTGCCGGGAATTCTCTTGAGATAGGTCA
GCAATACTTCATCCGGCCGATCAAGACTGAAAGCCTCAATGGTGGTGGTCTTGTTCCAGC
CGCCATTAAATTTCCCCCTTGCCCACTTGGCATCAACCAAGCACTCTTTCCGTTCCTACC
GGGCCAACCGCTTAGCTTCCAGTTTTCTGACTCCGTCACAGAATCCATCGTTAAGACATC
TACTGATGTAACCATCGAGTTCAACGCTAGCAAGCCGCTACCACTTTGCAACGAATTTTC
CTTTATATGGGAAGTTGAGTCCTCATCGGCTTCCGAGCCAGCAATTTTCCTCGGTGGTAT
AGCGGGGAGCCAAAATAGCCGGTTTAAGATAGAGAAAGCCGGAGAAGGATTAGGAGAAAA
CACTTATAAGCTGACCAGCTTAGACGGGACCGTTGGAAGCGTCCCCGGTTTTTTTGGGGC
ACCAAAACTAGTTCTCACCAATGATGACGCTAAGACCATATTCGTCAAATTCAACAAATA
TAATGAAGCTACTACATCTGCTTCTCGTGTTGAGAACTCAGGTCTAAGGATGTTCCCATT
TTAATAGTCAAGATAATGTACCGTTAAGCCTAAGACTCGTCCATGGCCAAAAATAAGGGG
TTGAGATAATACCCGCATGCATGTTTCTTTACTTTCCTCATGAATATATAAAATGAAATT
ATGTTTT

QA 1 787 1 787
DS 



AS 0 0

AS 1 3

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AATATATCATTTTGAAGAAGATGAAGAAGCAGTAAGATGTTTAAGGACAGCATCAGAAGA
ATGATGAGCAAAGTGCTTCTGCCTGAGCTTGACATACGGGTAACCAAGGAAGGACAAGAA
ATGAGCTGGCTTTGACAAGGACGTTATCTCATACCACACTTTACCATCTCCATCCAACTC
AATCGAAAACCGCTCTTCTCCAGCTAGTAAATGTCCCTCGAGAGTGCCGCATCCGTAACC
GAAATGCGCGGGACCTTTCCTAGACTTCTTGCTTTCGTCCACGTAAGCCACTTGAAGAGG
AAAAATCACCCATGGAAGTACTTCTTTCACACACACGCAAAACTTCTTACCGGTTTCAAC
CGGAGTTTTGGGATCAACAAATGCCCAATCCATACCAATGTGCTCCCAGTTCTGAAGAGC
TTGTTTCCCCTTGTCGTAACTCTCTTTACCAGAACCAACTAGGACACGAGAGTGGTTGAT
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AGCTCCTCTGTACTTGCTGTCGTAATTGAACGTTCCTGATTTGTCGATAACTTGTTGGTG
TTGCTCGGTAGATGGACGGCCCCAGCTCAAGAACACCATCTCTTCCCCCACTCGAATTGA
ATCAGACCCACAAACAATGACCTGATAGATAAATAACACTGTAATAGCCAGAACCAGTTG
TTTTTTTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EW80JQ U 22
AF RS1EW80TF C 1
AF RS1C018JQ U 5
BS 1 13 RS1EW80TF
BS 14 21 RS1C018JQ
BS 22 600 RS1EW80JQ
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BS 658 658 RS1EW80TF
BS 659 790 RS1C018JQ

RD RS1EW80JQ 579 0 0
AAAAGATGCAACACTGTTTTATTGTAAGCATACAACTTAAATATATCATTTTGAAGAAGA
TGAAGAAGCAGTAAGATGTTTAAGGACAGCATCAGAAGAATGATGAGCAAAGTGCTTCTG
CCTGAGCTTGACATACGGGTAACCAAGGAAGGACAAGAAATGAGCTGGCTTTGACAAGGA
CGTTATCTCATACCACACTTTACCATCTCCATCCAACTCAATCGAAAACCGCTCTTCTCC
AGCTAGTAAATGTCCCTCGAGAGTGCCGCATCCGTAACCGAAATGCGCGGGACCTTTCCT
AGACTTCTTGCTTTCGTCCACGTAAGCCACTTGAAGAGGAAAAATCACCCATGGAAGTAC
TTCTTTCACACACACGCAAAACTTCTTACCGGTTTCAACCGGAGTTTTGGGATCAACAAA
TGCCCAATCCATACCAATGTGCTCCCAGTTCTGAAGAGCTTGTTTCCCCTTGTCGTAACT
CTCTTTACCAGAACCAACTAGGACACGAGAGTGGTTGATGAAGAACCCATCTTTGTTGAC
TTCTGAATCTTCTTTTAGTTTAGATACTGATCTAGACGA

QA 1 579 1 579
DS 

RD RS1EW80TF 728 0 0
TATTCGATATATAGAGACAAGAAAAGATGCAACACTGTTT*ATTGTAAGCATACAACTTA
AATATATCATTT*GAAGAAGATGAAGAAGCAGTAAGATGTTTAAGGACAGCATCAGAAGA
ATGATGAGCAAAGTGCTTCTGCCTGAGCTTGACATACGGGTAACCAAGGAAGGACAAGAA
ATGAGCTGGCTTTGACAAGGACGTTATCTCATACCACACTTTACCATCTCCATCCAACTC
AATCGAAAACCGCTCTTCTCCAGCTAGTAAATGTCCCTCGAGAGTGCCGCATCCGTAACC
GAAATGCGCGGGACCTTTCCTAGACTTCTTGCTTTCGTCCACGTAAGCCACTTGAAGAGG
AAAAATCACCCATGGAAGTACTTCTTTCACACACACGCAAAACTTCTTACCGGTTTCAAC
CGGAGTTTTGGGATCAACAAATGCCCAATCCATACCAATGTGCTCCCAGTTCTGAAGAGC
TTGTTTCCCCTTGTCGTAACTCTCTTTACCAGAACCAACTAGGACACGAGAGTGGTTGAT
GAAGAACCCATCTTTGTTGACTTCTGAATCTTCTTTTAGTTTAGATACTGATCTAGACGA
AGCTCCTCTGTACTTGCTGTCGTAATTGAACGTTCCTGATTTGTCGATAACTTGTTGGTG
TTGCTCGGTAGATGGACGGCCCCAGCTCAAGAACACCATCTCTTCCCCCACTGGAATTGA
ATCAGACC

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1C018JQ 786 0 0
GATATATAG
GAGACAAGAAAAGATGCAACATTGTTTTATTGTAAGCATACAACTTAAATATATCATTTT
GAAGAAGATGAAGAAGCACTAAGATGTTTAAGGACAGCATCAGAAGAATGATGAGCAAAG
TGCTTCTGCCTGAGCTTGACATAAGGATAACCAAGGAAGGACAAGAAATGAGCTGGCTTT
GACAAGGACGTTATCTCATACCACACTTTACCATCTCCGTCCAGCTCAATCGAAAACCGC
TCTTCTCCAGCTAGTAAATGTCCCTCGAGAGTGCCGCATCCGTAACCGAAATGCGCGGGA
CCTTTCCTAGACTTCTTGCTTTCGTCCACGTAAGCCACTTGAAGAGGAAGCATCACCCAT
GGAAGTACTTCTTTCACACATACGCAAAACTTCTTACCGGTTTCAACCGGAGTTTTGGGA
TCAACAAATGCCCAATCCATACCAATGTGCTTCCAGTTCTGAAGAGCTTGTTTCCCCTTG
TCGTAACTCTCTTTACCAGAACCAACTAGGACACGAGAGTGGTTGATGAAGAACCCATCT
TTGTTGACTTCTGAATCTTCTTTTAGTTTAGATACTGATCTAGACGAAGCTCCTCTGTAC
TTGCTGTCGTAATTGAACGTTCCTGATTTGTTGATAACTTGTTGTTGTTGCTCGGTAGAT
GGACGGCCCCAGCTCAAGAACACCATCTCTTCCCCCACTCGAATTGAATCAGACCCACAA
ACAATGACCTGATAGATAAATAACACTGTAATAGCCAGAACCAGTTGTTTTTTTTTG

QA 10 786 10 786
DS 



AS 1 4

CO CL2012Contig1 696 4 2 U
TTTTTTGGAAACTTTTTTAATACATTTGAGAACAATCAAATTAAGAATTTAAATAAATAT
ACAAGGAATTAAATGTTCCTTTTTGACATTTTCCTTTTGAATTTCAATAGTCGTTAAGCT
AACAAGAGACGAAAATTTTGATAAAATCCTATTAACGAATTTTTTTTTTTGTTTGCACAA
CCCGGTTAACGACTTTAACCCTCCAGAAAACCGGTTAACCTGAGAACCGAATTACGAACC
CGGCTAAGATCCCGTCCTTTGAGAGTCCTTCCGTTACCTGTACAAACGGAAAACGCCATT
TGACAACCTTCCATTCTCCGTCCGACAATCAGATGCGGCGGAACCATGTTCCTTCCTCCG
TCATCGGAATATTCCTTTTCATCCGTGTACCTTCGCATCACATTACCCGGTATATTCACT
GGTAGAGAAGTCGAGAATGCCGCTGGTGAAGGTAACGGCGTCGTTTTGCTCCGCCTCGGT
TTATTTTTGGAGTTTTCTCGGAAACCAACCGGACGGTTTTCTTTCTCGTTCATGTCGTCA
CGCCGGCGAGTCGGGAAGAAACTGTCGGAGAAAATGATATCGGATTCGTCGAATTCTTCC
GACATTTCAAGAAAGACAAGGGGTTTTAAGTTGTGTAGTGAGAAACTTTATAAAGATTTT
AGTTTTGTTTGGAAAGCTGAGATGAGATTAGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1FA79JQ U 28
AF RS1FA79TF C 1
AF RS1C090JQ U 28
AF RS1C090TF C 28
BS 1 27 RS1FA79TF
BS 28 696 RS1C090JQ

RD RS1FA79JQ 402 0 0
GAGAACAATCAAATTAAGAATTTAAATAAATATACAAGGAATTAAATGTTCCTTTTTGAC
ATTTTCCTTTTGAATTTCAATAGTCGTTAAGCTAACAAGAGACGAAAATTTTGATAAAAT
CCTATTAACGAATTTTTTTTTTTGTTTGCACAACCCGGTTAACGACTTTAACCCTCCAGA
AAACCGGTTAACCTGAGAACCGAATTACGAACCCGGCTAAAATCCCGTCCTTTGAGAGTC
CTTCCGTTACCTGTACAAACGGAAAACGCCATTTGACAACCTTCCATTCTCCGTCCGACA
ATCAAATGCGGCGGAACCATGTTCCTTCCTCCGTCATCGGAATATTCCTTTTCATCCGTG
TACCTTCCCATCACATTACCCGGTATATTCACTGGTA
AAAAA

QA 1 397 1 397
DS 

RD RS1FA79TF 696 0 0
TTTTTTGGAAACTTTTTTAATACATTTGAGAACAATCAAATTAAGAATTTAAATAAATAT
ACAAGGAATTAAATGTTCCTTTTTGACATTTTCCTTTTGAATTTCAATAGTCGTTAAGCT
AACAAGAGACGAAAATTTTGATAAAATCCTATTAACGAATTTTTTTTTTTGTTTGCACAA
CCCGGTTAACGACTTTAACCCTCCAGAAAACCGGTTAACCTGAGAACCGAATTACGAACC
CGGCTAAGATCCCGTCCTTTGAGAGTCCTTCCGTTACCTGTACAAACGGAAAACGCCATT
TGACAACCTTCCATTCTCCGTCCGACAATCAGATGCGGCGGAACCATGTTCCTTCCTCCG
TCATCGGAATATTCCTTTTCATCCGTGTACCTTCGCATCACATTACCCGGTATATTCACT
GGTAGAGAAGTCGAGAATGCCGCTGGTGAAGGTAACGGCGTCGTTTTGCTCCGCCTCGGT
TTATTTTTGGAGTTTTCTCGGAAACCAACCGGACGGTTTTCTTTCTCGTTCATGTCGTCA
CGCCGGCGAGTCGGGAAGAAACTGTCGGAGAAAATGATATCGGATTCGTCGAATTCTTCC
GACATTTCAAGAAAGACAAGGGGTTTTAAGTTGTGTAGTGAGAAACTTTATAAAGATTTT
AGTTTTGTTTGGAAAGCTGAGATGAGATTAGATTCC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RS1C090JQ 669 0 0
GAGAACAATCAAATTAAGAATTTAAATAAATATACAAGGAATTAAATGTTCCTTTTTGAC
ATTTTCCTTTTGAATTTCAATAGTCGTTAAGCTAACAAGAGACGAAAATTTTGATAAAAT
CCTATTAACGAATTTTTTTTTTTGTTTGCACAACCCGGTTAACGACTTTAACCCTCCAGA
AAACCGGTTAACCTGAGAACCGAATTACGAACCCGGCTAAGATCCCGTCCTTTGAGAGTC
CTTCCGTTACCTGTACAAACGGAAAACGCCATTTGACAACCTTCCATTCTCCGTCCGACA
ATCAGATGCGGCGGAACCATGTTCCTTCCTCCGTCATCGGAATATTCCTTTTCATCCGTG
TACCTTCGCATCACATTACCCGGTATATTCACTGGTAGAGAAGTCGAGAATGCCGCTGGT
GAAGGTAACGGCGTCGTTTTGCTCCGCCTCGGTTTATTTTTGGAGTTTTCTCGGAAACCA
ACCGGACGGTTTTCTTTCTCGTTCATGTCGTCACGCCGGCGAGTCGGGAAGAAACTGTCG
GAGAAAATGATATCGGATTCGTCGAATTCTTCCGACATTTCAAGAAAGACAAGGGGTTTT
AAGTTGTGTAGTGAGAAACTTTATAAAGATTTTAGTTTTGTTTGGAAAGCTGAGATGAGA
TTAGATTCC

QA 1 669 1 669
DS 

RD RS1C090TF 669 0 0
GAGAACAATCAAATTAAGAATTTAAATAAATATACAAGGAATTAAATGTTCCTTTTTGAC
ATTTTCCTTTTGAATTTCAATAGTCGTTAAGCTAACAAGAGACGAAAATTTTGATAAAAT
CCTATTAACGAATTTTTTTTTTTGTTTGCACAACCCGGTTAACGACTTTAACCCTCCAGA
AAACCGGTTAACCTGAGAACCGAATTACGAACCCGGCTAAGATCCCGTCCTTTGAGAGTC
CTTCCGTTACCTGTACAAACGGAAAACGCCATTTGACAACCTTCCATTCTCCGTCCGACA
ATCAGATGCGGCGGAACCATGTTCCTTCCTCCGTCATCGGAATATTCCTTTTCATCCGTG
TACCTTCGCATCACATTACCCGGTATATTCACTGGTAGAGAAGTCGAGAATGCCGCTGGT
GAAGGTAACGGCGTCGTTTTGCTCCGCCTCGGTTTATTTTTGGAGTTTTCTCGGAAACCA
ACCGGACGGTTTTCTTTCTCGTTCATGTCGTCACGCCGGCGAGTCGGGAAGAAACTGTCG
GAGAAAATGATATCGGATTCGTCGAATTCTTCCGACATTTCAAGAAAGACAAGGGGTTTT
AAGTTGTGTAGTGAGAAACTTTATAAAGATTTTAGTTTTGTTTGGAAAGCTGAGATGAGA
TTAGATTCC

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 4

CO CL2013Contig1 696 4 3 U
GGTTCTCAGCATTTGATCCTTGGTTATTCATCTCAGGAAGAGAGAAAGATCCTCGCTTCA
GCTATCAGATCAGATGGCGTCACCTTTCACGTTAAGGAAGATCGGCGTACCTCCGAACTC
AGCGAACCTAACGGAAGCTCGCCGCCGTGTATTCTATTACTTCAGAGCAGCCTGTAGATC
CATCCCTACAATCATGGACATTTACAATCTCCAAGACGTCGTCGCGCCTTCTCAGCTCCG
TTTCGCAATCTCTGCTCAGATTCGTAAAAACGCTCACGTCACTGACCCTAAGGTGATTGA
TCTTCTTCTATCCAAGGGAATGGAAGAGCTGACTGACATAGTGGATCACGCAAAGCAGCG
TCACCATATCATCGGTCAATACGTGGTTGGTGAAGGGCTCGTCCAGAATACCGGGAGCAA
GGATCAAGGAAAGTCTGATTTTCTCAAAAATTTCTACACCAGCAACTACTTTTGAACTCC
TTCTCGAGTTTTACATAAGCCTTTCCAGTATTCGTATTTCATGACTTGAACAAGTCTTCT
TCCCGAAAATAATTAGACCTTTTTTCATTTGTATGAGTTTGGTCAAACCTCTCTCAAAGT
TTTATCTGTGACAGTGTTTGTTGTGCAGATATTGCTATGATTTAACTCTCAAATATAAAC
TGATATTGATCTGTTTGATTAAACAATCCAAGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DK54JQ C 238
AF RS1DK54TF U 238
AF RS1FH57TF U 1
AF RS1FH57JQ C 303
BS 1 512 RS1FH57TF
BS 513 513 RS1DK54TF
BS 514 696 RS1FH57TF

RD RS1DK54JQ 329 0 0
G
CGTTTCGCAATCTCTGCTCAGATTCGTAAAAACGCTCACGTCACTGACCCTAAGGTGATT
GATCTTCTTCTATTCAAGGGAATGGAAGAGCTGACTGACATAGTGGATCACGCAAAGCAG
CGTCACCATATCATCGGTCAATACGTGGTTGGTGAAGGGCTCGTCCAGAATACCGGGAGC
AAGGATCAAGGAAAGTCTGATTTTCTCAAAAATTTCTACACCAGCAACTACTTTTGAACT
CCTTCTCGAGTTTTACATAAGCCTTTCCAGTATTCGTATTTCATGACTTGAACAAGTCTT
CTTCCCGAAAATAATTAGACCTTTTTTC

QA 2 329 2 329
DS 

RD RS1DK54TF 329 0 0
G
CGTTTCGCAATCTCTGCTCAGATTCGTAAAAACGCTCACGTCACTGACCCTAAGGTGATT
GATCTTCTTCTATTCAAGGGAATGGAAGAGCTGACTGACATAGTGGATCACGCAAAGCAG
CGTCACCATATCATCGGTCAATACGTGGTTGGTGAAGGGCTCGTCCAGAATACCGGGAGC
AAGGATCAAGGAAAGTCTGATTTTCTCAAAAATTTCTACACCAGCAACTACTTTTGAACT
CCTTCTCGAGTTTTACATAAGCCTTTCCAGTATTCGTATTTCATGACTTGAACAAGTCTT
CTTCCCGAAAATAATTAGACCTTTTTTC

QA 2 329 2 329
DS 

RD RS1FH57TF 696 0 0
GGTTCTCAGCATTTGATCCTTGGTTATTCATCTCAGGAAGAGAGAAAGATCCTCGCTTCA
GCTATCAGATCAGATGGCGTCACCTTTCACGTTAAGGAAGATCGGCGTACCTCCGAACTC
AGCGAACCTAACGGAAGCTCGCCGCCGTGTATTCTATTACTTCAGAGCAGCCTGTAGATC
CATCCCTACAATCATGGACATTTACAATCTCCAAGACGTCGTCGCGCCTTCTCAGCTCCG
TTTCGCAATCTCTGCTCAGATTCGTAAAAACGCTCACGTCACTGACCCTAAGGTGATTGA
TCTTCTTCTATCCAAGGGAATGGAAGAGCTGACTGACATAGTGGATCACGCAAAGCAGCG
TCACCATATCATCGGTCAATACGTGGTTGGTGAAGGGCTCGTCCAGAATACCGGGAGCAA
GGATCAAGGAAAGTCTGATTTTCTCAAAAATTTCTACACCAGCAACTACTTTTGAACTCC
TTCTCGAGTTTTACATAAGCCTTTCCAGTATTTGTATTTCATGACTTGAACAAGTCTTCT
TCCCGAAAATAATTAGACCTTTTTTCATTTGTATGAGTTTGGTCAAACCTCTCTCAAAGT
TTTATCTGTGACAGTGTTTGTTGTGCAGATATTGCTATGATTTAACTCTCAAATATAAAC
TGATATTGATCTGTTTGATTAAACAATCCAAGTTCC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RS1FH57JQ 394 0 0
TTT
TTCTATCCAAGGGAATGGAAGAGCTGACTGACATAGTGGATCACGCAAAGCAGCGTCACC
ATATCATCGGTCAATACGTGGTTGGTGAAGGGTTCGTCCAGAATACCGGGAGCAAGGATC
AAGGAAAGTTTGATTTTTTCAAAAATTTTTACACCAGCAACTACTTTTGAACTCCTTCTC
GAGTTTTACATAAGCCTTTCCAGTATTTGTATTTCATGACTTGAACAAGTCTTCTTCCCG
AAAATAATTAGACCTTTTTTCATTTGTATGAGTTTGGTCAAACCTCTCTCAAAGTTTTAT
CTGTGACAGTGTTTGTTGTGCAGATATTGCTATGATTTAACTCTCAAATATAAACTGATA
TTGATCTGTTTGATTAAACAATCCAAGTTCC

QA 4 394 4 394
DS 



AS 1 4

CO CL2014Contig1 986 4 5 U
GGAACACACATCAGAACAAAGCTCTCTATACTCATAACATTAACGAAAGAAGAAGACACC
AACTTAGCTCAGCAACACCCAATCATGGCTTTGAAGACGGCGTCGACCAACAGTATGTGG
ATGACCGAGGAATGCAAGAGATCGTTCATGGAGATGAAGTGGAAGAAAGTGCACAGATAC
ATCGTTTTCAAGATCGAGGAGAAATCCAAGAAAGTCACCGTCGACAAGGTTGGTGCTGCC
GGCGAGAGCTATCATGATCTCGCCGCCTCCTTGCCGGAGGATGACTGTCGCTACGCGGTT
TTTGATTTCGACTACGTCACC*GTCGATAACTGCCGCATGAGCAAGCTCTTTTTCATCAC
CTGGTCAGTGTTTTAGTTCTACTGTCAAACTGTTTTTTTTAGCAACATTGTCAAACTGTT
AAACGTATTCTTTTACCACCTACAAGATGGTCAAATTCATTTGAACGTAACGAATCCGAA
ATCACAATTATACCAAACCAATCTGAACAGAAACCGAACCAATCCGGCCAAGGGTCAAAA
CGTAATTTATTTGTTGTTGTATGGATATATAGGTCGCCGGAAGCGTCGAGGATAAGGGAG
AAGATGATGTACGCAACGTCGAAGAGTGGGCTGAGAAGAGTGTTAGAAGGCATTCACTAT
GAGCTTCAAGCCACTGGCCCAACCGAGATGGGATTTGACAAAATCCAGGACCGGACCAAA
TAAGTTTACAGTCCATTTAACCGGAGCGTCAGTGATCACTAGCTGTTATTAACAACAGTA
ATGAGCAGCAATTAATTATCTGTTAATGTTAGCTATTGATGTTTAGTACTGATTAACTTC
GTATTTGCTTTTAGTTGTCAAACAAAAGAATATCACTCCTTTTGTTGACAAGAATTGTAT
CGACTATCGTTGTTTCTGGTTCCTGTTTGTTAGTCTTAATGTTAAATATTATGTACGTCT
CTTGTGTCGCTAATGCTAATAAAAAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1CW17TF U 1
AF RS1CW62TF U 1
AF RS1CW17JQ C 246
AF RS1CW62JQ C 350
BS 1 528 RS1CW17TF
BS 529 702 RS1CW62TF
BS 703 703 RS1CW17JQ
BS 704 715 RS1CW62TF
BS 716 986 RS1CW17JQ

RD RS1CW17TF 528 0 0
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AACTTAGCTCAGCAACACCCAATCATGGCTTTGAAGACGGCGTCGACCAACAGTATGTGG
ATGACCGAGGAATGCAAGAGATCGTTCATGGAGATGAAGTGGAAGAAAGTGCACAGATAC
ATCGTTTTCAAGATCGAGGAGAAATCCAAGAAAGTCACCGTCGACAAGGTTGGTGCTGCC
GGCGAGAGCTATCATGATCTCGCCGCCTCCTTGCCGGAGGATGACTGTCGCTACGCGGTT
TTTGATTTCGACTACGTCACC*GTCGATAACTGCCGCATGAGCAAGCTCTTTTTCATCAC
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QA 1 528 1 528
DS 

RD RS1CW62TF 715 0 0
GGAACACACATCAGAACAAAGCTCTCTATACTCATAACATTAACGAAAGAAGAAGACACC
AACTTAGCTCAGCAACACCCAATCATGGCTTTGAAGACGGCGTCGACCAACAGTATGTGG
ATGACCGAGGAATGCAAGAGATCGTTCATGGAGATGAAGTGGAAGAAAGTGCACAGATAC
ATCGTTTTCAAGATCGAGGAGAAATCCAAGAAAGTCACCGTCGACAAGGTTGGTGCTGCC
GGCGAGAGCTATCATGATCTCGCCGCCTCCTTGCCGGAGGATGACTGTCGCTACGCGGTT
TTTGATTTCGACTACGTCACC*GTCGATAACTGCCGCATGAGCAAGCTCTTTTTCATCAC
CTGGTCAGTGTTTTAGTTCTACTGTCAAACTGTTTTTTTTAGCAACATTGTCAAACTGTT
AAACGTATTCTTTTACCACCTACAAGATGGTCAAATTCATTTGAACGTAACGAATCCGAA
ATCACAATTATACCAAACCAATCTGAACAGAAACCGAACCAATCCGGCCAAGGGTCAAAA
CGTAATTTATTTGTTGTTGTATGGATATATAGGTCGCCGGAAGCGTCGAGGATAAGGGAG
AAGATGATGTACGCAACGTCGAAGAGTGGGCTGAGAAGAGTGTTAGAAGGCATTCACTAT
GAGCTTCAAGCCACTGGCCCAACCGAGATGGGATTTGACAAA*TCCAGGACCGGA

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1CW17JQ 741 0 0
GAGCTATCATGATCTCGCCGCCTCCTTGCCGGAGGATGACTGTCGCTACGCGGTTTTTGA
TTTCGACTACGTCACCCGTCGATAACTGCCGCATGAGCAAGCTCTTTTTCATCACCTGGT
CAGTGTTTTAGTTCTACTGTCAAACTGTTTTTTTTAGCAACATTGTCAAACTGTTAAACG
TATTCTTTTACCACCTACAAGATGGTCAAATTCATTTGAACGTAACGAATCCGAAATCAC
AATTATACCAAACCAATCTGAACAGAAACCGAACCAATCCGGCCAAGGGTCAAAACGTAA
TTTATTTGTTGTTGTATGGATATATAGGTCGCCGGAAGCGTCGAGGATAAGGGAGAAGAT
GATGTACGCAACGTCGAAGAGTGGGCTGAGAAGAGTGTTAGAAGGCATTCACTATGAGCT
TCAAGCCACTGGCCCAACCGAGATGGGATTTGACAAAATCCAGGACCGGACCAAATAAGT
TTACAGTCCATTTAACCGGAGCGTCAGTGATCACTAGCTGTTATTAACAACAGTAATGAG
CAGCAATTAATTATCTGTTAATGTTAGCTATTGATGTTTAGTACTGATTAACTTCGTATT
TGCTTTTAGTTGTCAAACAAAAGAATATCACTCCTTTTGTTGACAAGAATTGTATCGACT
ATCGTTGTTTCTGGTTCCTGTTTGTTAGTCTTAATGTTAAATATTATGTACGTCTCTTGT
GTCGCTAATGCTAATAAAAAG

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1CW62JQ 637 0 0
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GTCAAACTGTTAAACGTATTCTTTTACCACCTACAAGATGGTCAAATTCATTTGAACGTA
ACGAATCCGAAATCACAATTATACCAAACCAATCTGAACAGAAACCGAACCAATCCGGCC
AAGGGTCAAAACGTAATTTATTTGTTGTTGTATGGATATATAGGTCGCCGGAAGCGTCGA
GGATAAGGGAGAAGATGATGTACGCAACGTCGAAGAGTGGGCTGAGAAGAGTGTTAGAAG
GCATTCACTATGAGCTTCAAGCCACTGGCCCAACCGAGATGGGATTTGACAAAATCCAGG
ACCGGACCAAATAAGTTTACAGTCCATTTAACCGGAGCGTCAGTGATCACTAGCTGTTAT
TAACAACAGTAATGAGCAGCAATTAATTATCTGTTAATGTTAGCTATTGATGTTTAGTAC
TGATTAACTTCGTATTTGCTTTTAGTTGTCAAACAAAAGAATATCACTCCTTTTGTTGAC
AAGAATTGTATCGACTATCGTTGTTTCTGGTTCCTGTTTGTTAGTCTTAATGTTAAATAT
TATGTACGTCTCTTGTGTCGCTAATGCTAATAAAAAG

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 4

CO CL2015Contig1 730 4 8 U
GGACTACATTTTGTTACTTTTGATTACGGAGACAACAAAATGGATACTTCTCATAGCCGT
CGTCGAGGCTACATCTTTCTTCTAGTTCTATCTTATTCCTCTGTGCTTGGTTTAGCTTCC
AATATGAATATTTCTTCCAATGATGCAAGAGGCAACAAAACCGACAGTTTCTTTGAAGAT
CAATATGCTTACACTCATTATGGCACAGACATGGGCAAGGAATATATTATCTGTGCAGAA
TCTACTATGGAATCTCCGTGGGTGCTTGGTTGCAATAAGTCTAAAGAAGTTTTTACAAAG
ATCAATTTTGCTGATTATGGAGATCCTTCCGGCAAGTGTGAACACTATAGACATGGAAAT
TGCGGCGCAGAAGCTGCCTTGAAGGTCGCCAAAAAGAATTGTGTTGGAAAAAACATATGT
GTGTTTATGACTTCGGACGAGATGTTTGGTGCGAGTCACTGCAATAAAGAGGCTAAGTTT
TTTATTCAACTCACTTGTAAAAAAGCTTGAGTTTCTTAGTTGCTCCTTAATTAATAAGGT
CTTTAAGAAAATGGTTGCATGGTTTGTTTTCTTGTAATGATCAAGTTCTTATTGATTATT
AAAGGAATGTCCGAGATAAGTTATTTATTCTATTTGTTATTTTGCAACAAGGATTGATGT
TGATGTCTCTTTGGGTGATCCAATTCATCTTCCATATCAACCTTCTCAATCTCATACTTC
TCACAAAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1EL78TF U 1
AF RS1EL78JQ C 54
AF RS1C143TF U 8
AF RS1C143JQ C 73
BS 1 450 RS1EL78TF
BS 451 451 RS1C143TF
BS 452 561 RS1EL78TF
BS 562 562 RS1C143TF
BS 563 614 RS1EL78TF
BS 615 615 RS1C143TF
BS 616 626 RS1EL78TF
BS 627 730 RS1C143TF

RD RS1EL78TF 632 0 0
GGACTACATTTTGTTACTTTTGATTACGGAGACAACAAAATGGATACTTCTCATAGCCGT
CGTCGAGGCTACATCTTTCTTCTAGTTCTATCTTATTCCTCTGTGCTTGGTTTAGCTTCC
AATATGAATATTTCTTCCAATGATGCAAGAGGCAACAAAACCGACAGTTTCTTTGAAGAT
CAATATGCTTACACTCATTATGGCACAGACATGGGCAAGGAATATATTATCTGTGCAGAA
TCTACTATGGAATCTCCGTGGGTGCTTGGTTGCAATAAGTCTAAAGAAGTTTTTACAAAG
ATCAATTTTGCTGATTATGGAGATCCTTCCGGCAAGTGTGAACACTATAGACATGGAAAT
TGCGGCGCAGAAGCTGCCTTGAAGGTCGCCAAAAAGAATTGTGTTGGAAAAAACATATGT
GTGTTTATGACTTCGGACGAGATGTTTGGTTCGAGTCACTGCAATAAAGAGGCTAAGTTT
TTTATTCAACTCACTTGTAAAAAAGCTTGAGTTTCTTAGTTGCTCCTTAATTAATAAGGT
CTTTAAGAAAATGGTTGCATGTTTTGTTTTCTTGTAATGATCAAGTTCTTATTGATTATT
AAAGGAATGTCCGATATAAGTTATTT
AAAAAA

QA 1 626 1 626
DS 

RD RS1EL78JQ 573 0 0
TAGCCGTCGTCGAGGCTACATCTTTCTTCTAGTTCTATCTTATTCCTCTGTGCTTGGTTT
AGCTTCCAATATGAATATTTCTTCCAATGATGCAAGAGGCAACAAAACCGACAGTTTCTT
TGAAGATCAATATGCTTACACTCATTATGGCACAGACATGGGCAAGGAATATATTATCTG
TGCAGAATCTACTATGGAATCTCCGTGGGTGCTTGGTTGCAATAAGTCTAAAGAAGTTTT
TACAAAGATCAATTTTGCTGATTATGGAGATCCTTCCGGCAAGTGTGAACACTATAGACA
TGGAAATTGCGGCGCAGAAGCTGCCTTGAAGGTCGCCAAAAAGAATTGTGTTGGAAAAAA
CATATGTGTGTTTATGACTTCGGACGAGATGTTTGGTTCGAGTCACTGCAATAAAGAGGC
TAAGTTTTTTATTCAACTCACTTGTAAAAAAGCTTGAGTTTCTTAGTTGCTCCTTAATTA
ATAAGGTCTTTAAGAAAATGGTTGCATGTTTTGTTTTCTTGTAATGATCAAGTTCTTATT
GATTATTAAAGGAATGTCCGATATAAGTTATTT

QA 1 573 1 573
DS 

RD RS1C143TF 723 0 0
T
TTTTGTTACTTTTGATTACGGAGACAACAAAATGGATACTTCTCATAGCCGTCGTCGAGG
CTACATCTTTCTTCTAGTTCTATCTTATTCCTCTGTGCTTGGTTTAGCTTCCAATATGAA
TATTTCTTCCAATGATGCAAGAGGCAACAAAACCGACAGTTTCTTTGAAGATCAATATGC
TTACACTCATTATGGCACAGACATGGGCAAGGAATATATTATCTGTGCAGAATCTACTAT
GGAATCTCCGTGGGTGCTTGGTTGCAATAAGTCTAAAGAAGTTTTTACAAAGATCAATTT
TGCTGATTATGGAGATCCTTCCGGCAAGTGTGAACACTATAGACATGGAAATTGCGGCGC
AGAAGCTGCCTTGAAGGTCGCCAAAAAGAATTGTGTTGGAAAAAACATATGTGTGTTTAT
GACTTCGGACGAGATGTTTGGTGCGAGTCACTGCAATAAAGAGGCTAAGTTTTTTATTCA
ACTCACTTGTAAAAAAGCTTGAGTTTCTTAGTTGCTCCTTAATTAATAAGGTCTTTAAGA
AAATGGTTGCATGGTTTGTTTTCTTGTAATGATCAAGTTCTTATTGATTATTAAAGGAAT
GTCCGAGATAAGTTATTTATTCTATTTGTTATTTTGCAACAAGGATTGATGTTGATGTCT
CTTTGGGTGATCCAATTCATCTTCCATATCAACCTTCTCAATCTCATACTTCTCACAAAA
GA

QA 2 723 2 723
DS 

RD RS1C143JQ 657 0 0
ATCTTTCTTCTAGTTCTATCTTATTCCTCTGTGCTTGGTTTAGCTTCCAATATGAATATT
TCTTCCAATGATGCAAGAGGCAACAAAACCGACAGTTTCTTTGAAGATCAATATGCTTAC
ACTCATTATGGCACAGACATGGGCAAGGAATATATTATCTGTGCAGAATCTACTATGGAA
TCTCCGTGGGTGCTTGGTTGCAATAAGTCTAAAGAAGTTTTTACAAAGATCAATTTTGCT
GATTATGGAGATCCTTCCGGCAAGTGTGAACACTATAGACATGGAAATTGCGGCGCAGAA
GCTGCCTTGAAGGTCGCCAAAAAGAATTGTGTTGGAAAAAACATATGTGTGTTTATGACT
TCGGACGAGATGTTTGGTGCGAGTCACTGCAATAAAGAGGTTAAGTTTTTTATTCAACTC
ACTTGTAAAAAAGCTTGAGTTTTTTAGTTGCTCCTTAATTAATAAGGTCTTTAAGAAAAT
GGTTGCATGGTTTGTTTTCTTGTAATGATCAAGTTCTTATTGATTATTAAAGGAATGTCC
GAGATAAGTTATTTATTTTATTTGTTATTTTGCAACAAGGATTGATGTTGATGTCTCTTT
GGGTGATCCAATTCATCTTCCATATCAACCTTCTCAATCTCATACTTCTCACAAAA
A

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 4

CO CL2016Contig1 570 4 13 U
GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGGATGGCGTGGAGAGGAAAC
ATAGCGAAGTCTCTGAAAGAGCTCAGGATTCTCCTCTGTCAATCTTCCCCAGCTAGCGCT
TCCACCAGGACGTTCGTAGAGAAGAATTACAAAGATTTGAAGTCACTGAACCCTAAATTC
CCTTTCCTGATCCGCGAATGCAGTGGGATCCAGCCTCAGATGTGGGCCAGATATGATATG
GGTGTGGAGAGGTGTGTCAACTTGGATGGTATGAACGAGTCACAGATTCTCAAGTCTCTT
GAAGACCTTGTCAAAGCCGGAGGAGCTACAAAAGCCTAAAAGGTTGTTCCCTAAAAAAAA
AAGAATCTTAGATGATCCCGAATAAGATACAAACTTGAAACACATTCATCTGATCTGACT
GTTCTTGTTATTCTATTACTTTGCAATTGCAACTAGTTGGTGTCGTATCGCCTTTCGTTT
TTGTTTGTAATCCTTGGAACTTGTTATTAAATGAACCTTCCGTATGATTGTTGAAAACAT
ATTTAGTGTGAGGTTTGTGATGTGTTTCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1GL25JQ C 14
AF RS1GL25TF U 14
AF RS1D791JQ C 1
AF RS1D791TF U 1
BS 1 28 RS1D791TF
BS 29 154 RS1GL25TF
BS 155 155 RS1D791TF
BS 156 164 RS1GL25TF
BS 165 165 RS1D791TF
BS 166 200 RS1GL25TF
BS 201 201 RS1D791TF
BS 202 274 RS1GL25TF
BS 275 275 RS1D791TF
BS 276 360 RS1GL25TF
BS 361 362 RS1D791TF
BS 363 533 RS1GL25TF
BS 534 570 RS1D791TF

RD RS1GL25JQ 520 0 0
GGCGAGAAGGGGGAG
GAAGAAGAAGAGGGATGGCGTGGAGAGGAAACATAGCGAAGTCTCTGAAAGAGCTCAGGA
TTCTCCTCTGTCAATCTTCCCCAGCTAGCGCTTCCACCAGGACGTTCGTAGAGAAGAATT
ACAAAGCTTTGAAGTCCCTGAACCCTAAATTCCCTTTCCTGATCCGCGAATGTAGTGGGA
TCCAGCCTCAGATGTGGGCCAGATATGATATGGGTGTGGAGAGGTGTGTCAACTTGGATG
GTATGAGCGAGTCACAGATTCTCAAGTCTCTTGAAGACCTTGTCAAAGCCGGAGGAGCTA
CAAAAGCCTAAAAGGTTGTTCCCTAAAAAAAA**GAATCTTAGATGATCCCGAATAAGAT
ACAAACTTGAAACACATTCATCTGATCTGACTGTTCTTGTTATTCTATTACTTTGCAATT
GCAACTAGTTGGTGTCGTATCGCCTTTCGTTTTTGTTTGTAATCCTTGGAACTTGTTATT
AAATGAACCTTCCGTATGATTGTTG

QA 16 520 16 520
DS 

RD RS1GL25TF 520 0 0
GGCGAGAAGGGGGAG
GAAGAAGAAGAGGGATGGCGTGGAGAGGAAACATAGCGAAGTCTCTGAAAGAGCTCAGGA
TTCTCCTCTGTCAATCTTCCCCAGCTAGCGCTTCCACCAGGACGTTCGTAGAGAAGAATT
ACAAAGCTTTGAAGTCCCTGAACCCTAAATTCCCTTTCCTGATCCGCGAATGTAGTGGGA
TCCAGCCTCAGATGTGGGCCAGATATGATATGGGTGTGGAGAGGTGTGTCAACTTGGATG
GTATGAGCGAGTCACAGATTCTCAAGTCTCTTGAAGACCTTGTCAAAGCCGGAGGAGCTA
CAAAAGCCTAAAAGGTTGTTCCCTAAAAAAAA**GAATCTTAGATGATCCCGAATAAGAT
ACAAACTTGAAACACATTCATCTGATCTGACTGTTCTTGTTATTCTATTACTTTGCAATT
GCAACTAGTTGGTGTCGTATCGCCTTTCGTTTTTGTTTGTAATCCTTGGAACTTGTTATT
AAATGAACCTTCCGTATGATTGTTG

QA 16 520 16 520
DS 

RD RS1D791JQ 570 0 0
GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGGATGGCGTGGAGAGGAAAC
ATAGCGAAGTCTCTGAAAGAGCTCAGGATTCTCCTCTGTCAATCTTCCCCAGCTAGCGCT
TCCACCAGGACGTTCGTAGAGAAGAATTACAAAGATTTGAAGTCACTGAACCCTAAATTC
CCTTTCCTGATCCGCGAATGCAGTGGGATCCAGTCTCAGATGTGGGCCAGATATGATATG
GGTGTGGAGAGGTGTGTCAACTTGGATGGTATGAACGAGTCACAGATTCTCAAGTCTCTT
GAAGACCTTGTCAAAGCCGGAGGAGCTACAAAAGCCTAAAAGGTTGTTCTCTAAAAAAAA
AAGAATCTTAGATGATCCCGAATAAGATACAAACTTGAAACACATTCATCTGATCTGACT
GTTCTTGTTATTCTATTACTTTGCAATTGCAACTAGTTGGTGTCGTATCGCCTTTCGTTT
TTGTTTGTAATCCTTGGAACTTGTTATTAAATGAACCTTCCGTATGATTGTTGAAAACAT
ATTTAGTGTGAGGTTTGTGATGTGTTTCCC

QA 1 570 1 570
DS 

RD RS1D791TF 570 0 0
GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGGATGGCGTGGAGAGGAAAC
ATAGCGAAGTCTCTGAAAGAGCTCAGGATTCTCCTCTGTCAATCTTCCCCAGCTAGCGCT
TCCACCAGGACGTTCGTAGAGAAGAATTACAAAGATTTGAAGTCACTGAACCCTAAATTC
CCTTTCCTGATCCGCGAATGCAGTGGGATCCAGTCTCAGATGTGGGCCAGATATGATATG
GGTGTGGAGAGGTGTGTCAACTTGGATGGTATGAACGAGTCACAGATTCTCAAGTCTCTT
GAAGACCTTGTCAAAGCCGGAGGAGCTACAAAAGCCTAAAAGGTTGTTCTCTAAAAAAAA
AAGAATCTTAGATGATCCCGAATAAGATACAAACTTGAAACACATTCATCTGATCTGACT
GTTCTTGTTATTCTATTACTTTGCAATTGCAACTAGTTGGTGTCGTATCGCCTTTCGTTT
TTGTTTGTAATCCTTGGAACTTGTTATTAAATGAACCTTCCGTATGATTGTTGAAAACAT
ATTTAGTGTGAGGTTTGTGATGTGTTTCCC

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 3

CO CL2017Contig1 405 3 3 U
GGACACAGAGAGAAGAAGGGAAACTCTGAGATCGGAAACAATGGACTCTACACTTTCGCT
GAAGCCCAGAGGAAAAGGGAAAGGATCAAAGGGATCTTCCTCCTCCAATGACAAATCCAA
GTATCAGCTCCTCAAGGAATGGAGCAACTGGTCTCTCAAGAAAGCCAAAGTCGCCACTCA
CTACGGATTCATCCCTCTCATCATCATCGTCGGCATGAACTCCGATCCAAAGCCCTATCT
CTTCCAGCTCCTTAGCCCTGTCTGATCCAGGAACGAAGATCGATGAATCTTCTTTTATGT
TTTCAGAATCTGTGGTTTGTATTGAATCAGTTTAACTTGTGAAATCGAATTCATGTTTTG
AATCTCTGTTTGCAAATTATTGAATCAGTAATAATAATGCTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BG59JQ C 1
AF RS1BG59TF U 1
AF RS1BJ80TF U 4
BS 1 13 RS1BG59JQ
BS 14 358 RS1BG59TF
BS 359 405 RS1BJ80TF

RD RS1BG59JQ 359 0 0
GGACACAGAGAGAAGAAGGGAAACTCTGAGATCGGAAACAATGGACTCTACACTTTCGCT
GAAGCCCAGAGGAAAAGGGAAAGGATCAAAGGGATCTTCCTCCTCCAATGACAAATCCAA
GTATCAGCTCCTCAAGGAATGGAGCAACTGGTCTCTCAAGAAAGCCAAAGTCGCCACTCA
CTACGGATTCATCCCTCTCATCATCATCGTCGGCATGAACTCCGATCCAAAGCCCTATCT
CTTCCAGCTCCTTAGCCCTGTCTGATCCAGGAACGAAGATCGATGAATCTTCTTTTATGT
TTTCAGAATCTGTGGTTTGTATTGAATCAGTTTAACTTGTGAAATCGAATTCATGTTT
G

QA 1 358 1 358
DS 

RD RS1BG59TF 360 0 0
GGACACAGAGAGA
AGAAGGGAAACTCTGAGATCGGAAACAATGGACTCTACACTTTCGCTGAAGCCCAGAGGA
AAAGGGAAAGGATCAAAGGGATCTTCCTCCTCCAATGACAAATCCAAGTATCAGCTCCTC
AAGGAATGGAGCAACTGGTCTCTCAAGAAAGCCAAAGTCGCCACTCACTACGGATTCATC
CCTCTCATCATCATCGTCGGCATGAACTCCGATCCAAAGCCCTATCTCTTCCAGCTCCTT
AGCCCTGTCTGATCCAGGAACGAAGATCGATGAATCTTCTTTTATGTTTTCAGAATCTGT
GGTTTGTATTGAATCAGTTTAACTTGTGAAATCGAATTCATGTTT
TG

QA 14 358 14 358
DS 

RD RS1BJ80TF 402 0 0
GGACACAGAG
AGAAGGGAAACTCTGAGATCGGAAACAATGGATTCTACACTTTCGCTGAAGCCCAGAGGA
AAAGGGAAAGGATCAAAAGGAGCTTCCTCCTCCAATGACAAATCCAAGTATCAGCTCCTC
AAGGAATGGAGCAACTGGTCTCTCAAGAAGGCCAAAGTCGCCACTCACTACGGATTCATC
CCTCTCATCATCATCGTCGGCATGAACTCCGATCCAAACCCCCATCTCTTCCAGCTCCTT
AGCCCTGTCTGATCC*GGAACGAAGATCGATGAATCTTCTTTTATGTTTTCAGAATCTGT
GGTTTGTATTGAATCAGTTTAACTTGTGAAATCGAATTCATGTTTTGAATCTCTGTTTGC
AAATTATTGAATCAGTAATAATAATGCTTTTT

QA 11 402 11 402
DS 



AS 1 2

CO CL2018Contig1 540 2 3 U
ATAGACACTCAAAACAACTAGTCTCTACTAACCATTGTTTATAACTATCATCATAGGATT
CCCCTACAAGCCGAACAAATTTACACACAAAAAAATATCTGTCAATACAAATTATATATT
CCAGGGTATCTAAAAAAAATGTAACAGTGTTTTCATCCGCTTATGAAAATGTTCAAAGTC
TTCCTCAACGCTCGGATTCCTTGAACGTGTAGCGCCTTCACTATGGGATGATAATGGATT
CTTATTCGATGGATTGACTCGCTTTCCAAGATCGATCTGCACAGAAAGCTTAACATGCGA
AAAATCAATGCCTGCGTTCTGGAGTGCTTGTGTTAATGAGCTTAATAGCTCATGCGAGTA
GACAGTAAAAATGCTAATGGTTCCACCTTCAATAACCAGGTCGTCACTTAGGCCTAGCCC
ATGACCTGCTGCAGGACATTCATTATTATTATTAGATTGTTCACCCTGTACCAATGGATG
GACTGGTAATCTCTTGTCATCTAACTCAGGTTGACTGGAGGCTATATCTCTTCCTTTCTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1DT77JQ U 1
AF RS1GE32JQ U 1
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QA 1 540 1 540
DS 

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TTCCTCAACGCTCGGATTCCTTGAACGTGTAGCGCCTTCACTATGGGATGATAATGGATT
CTTATTCGATGGATTGACTCGCTTTCCAAGATCGATCTGCACAGAAAGCTTAACATGCGA
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GACTGGTAATCTCTTGTCATCTAACTCAGGTTGACTGGAGGCTATATCTCTTCCTTT

QA 1 537 1 537
DS 



AS 1 4

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BQ
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EZ31TF U 1
AF RS1CH21JQ C 61
AF RS1CH21TF U 61
AF RS1EZ31JQ C 167
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QA 1 752 1 752
DS 

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G
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G

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DS 

RD RS1CH21TF 662 0 0
G
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TCTGGCGGTTTTGGATAATTTCGAGAGAGCCAAGTCCCAGATCAAGGTGGAGACTGAGGG
AGAAGAGAAAGTCACCAACAGCTACCAGAGCATATACAAACAGTTTGTTGAGATTCTAGG
TTCGCTTGGTGTTGTCACTGTGGAGACTGTCGGCAAACAGTTTGATCCAATGCTTCACGA
GGCAATAATGAGGGAGGATTCTGCGGAATACGAAGAGGGTATAGTACTTGAAGAATACAG
GAAAGGTTTCTTGCTAGGGGAAAGACTTTTACGTCCTTCAATGGTGAAAGTATCAGCTAG
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CAGAAGGAGCAGAAGCAGAAGCGTCTTCTTCATCTTGAATGAACAGACAATCAAGACTAA
GCAGTTTTGTGGTGTGCGTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG**TGAGAGAAGGGTCTGGTT
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G

QA 2 662 2 662
DS 

RD RS1EZ31JQ 633 0 0
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QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 4

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TCCGTTGAACCTGATTATGAGTTATTGGCCGCGTTACTTAAGAACCCGGATCTTCTACAT
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AACTTTTTGTTCTTTCGATGCCCCAATACTTGTTTTAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A522TF U 34
AF RS1BA93TF U 1
AF RS1A522JQ C 315
AF RS1BA93JQ C 318
BS 1 704 RS1BA93TF
BS 705 705 RS1A522JQ
BS 706 733 RS1BA93TF
BS 734 1061 RS1A522JQ

RD RS1A522TF 644 0 0
GAAAAAGAAACAACATATCAATCTCTTCAAACTATACCGCTGAATCCTAAAGAACCATGG
GACAGGGAATTGGACTTTGATGACAGTTTGACACCTGAAATTCCATCTCAACAGCCACAA
GAAGAAAGTATAACAGAACCACAGGATTCACTTGATGAACGGAGAACCGCTGCTGGTGCT
GCCTCAACCTCTTCATCTCAAAGTAGTTCCGTTGAACCTGATTATGAGTTATTGGCCGCG
TTACTTAAGAACCCGGATCTTCTACATGCGCTGACTTCTGGTCAGCCCGGTAATTTAGCC
GGCCAAGATATGGTAAAACTGCTTGATGTGATTAAAACTGGTGCACCAAATTTAAGCAGT
AGCTCAAATATGAAGGTTGACGAACAGGTTGAAGTGTCCCTTCCATCTCCAACACCATCA
ACCAATCCTGGAATGAGCGGGTGGGGACAAGAAGTGACTCGGAATCCACTTTCAAGACAA
ACCCAAGTTGGTGCCTCAGTTGCTAGAATGAGTACTCGGCTTCCTGTTGCTTCCATGCAA
TGGCAACCATCAAACGGACAATCGATCCCTCAACATACTCCATCAGCATATAACTCATTC
ATATTGCCTCACACAGAAAGACAACACCAACAACGCATGCAACC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1BA93TF 733 0 0
GAGGCTGATGTTCAGAAAAACCGAAACCGGCGGGAAAAAGAAACAACATATCAATCTCTT
CAAACTATACCGCTGAATCCTAAAGAACCATGGGACAGGGAATTGGACTTTGATGACAGT
TTGACACCTGAAATTCCATCTCAACAGCCACAAGAAGAAAGTATAACAGAACCACAGGAT
TCACTTGATGAACGGAGAACCGCTGCTGGTGCTGCCTCAACCTCTTCATCTCAAAGTAGT
TCCGTTGAACCTGATTATGAGTTATTGGCCGCGTTACTTAAGAACCCGGATCTTCTACAT
GCGCTGACTTCTGGTCAGCCCGGTAATTTAGCCGGCCAAGATATGGTAAAACTGCTTGAT
GTGATTAAAACTGGTGCACCAAATTTAAGCAGTAGCTCAAATATGAAGGTTGACGAACAG
GTTGAAGTGTCCCTTCCATCTCCAACACCATCAACCAATCCTGGAATGAGCGGGTGGGGA
CAAGAAGTGACTCGGAATCCACTTTCAAGACAAACCCAAGTTGGTGCCTCAGTTGCTAGA
ATGAGTACTCGGCTTCCTGTTGCTTCCATGCAATGGCAACCATCAAACGGACAATCGATC
CCTCAACATACTCCATCAGCATATAACTCATTCATATTGCCTCACACAGAAAGACAACAC
CAACAACGCATGCAACCAAGGCTCCATCAAAATCAACATCTTCA*CAACAACCAATCTCG
ACAACCTCGTATG

QA 1 733 1 733
DS 

RD RS1A522JQ 747 0 0
TCA
GCCCGGTAATTTAGCCGGCCAAGATATGGTAAAACTGCTTGATGTGATTAAAACTGGTGC
ACCAAATTTAAGCAGTAGCTCAAATATGAAGGTTGACGAACAGGTTGAAGTGTCCCTTCC
ATCTCCAACACCATCAACCAATCCTGGAATGAGCGGGTGGGGACAAGAAGTGACTCGGAA
TCCACTTTCAAGACAAACCCAAGTTGGTGCCTCAGTTGCTAGAATGAGTACTCGGCTTCC
TGTTGCTTCCATGCAATGGCAACCATCAAACGGACAATCGATCCCTCAACATACTCCATC
AGCATATAACTCATTCATATTGCCTCACACAGAAAGACAACACCAACAACGCATGCAACC
AAGGCTCCATCAAAATCAACATCTTCAACAACAACCAATCTCGACAACCTCGTATGTGGT
CAGGGAATCAGTAGGAAAGATGGACATAGGTACATCGGCTTCATGGAGGTCCCAGCAGAG
TCAGAATAGTTACTACTCACATCAAGCAAACGGGATTGGGTCAGATGCTTCCTACCAAGG
GAATGAGCAGTCCATGACTAGTAGTAATCCAGGATATGAATCATGGAGTCCTGATAATAG
CCCAAGTAGGAACCACCCTAACATGAGGGGACAACAACAACCATCGAGGAAACATGACCC
TTATTGGAACCAAAACAAAAGATGGCGTTAAAACATATATCAAAACTTTTTGTTCTTTCG
ATGCCCCAATACTTGTTTTAACCC

QA 4 747 4 747
DS 

RD RS1BA93JQ 744 0 0
GCCCGGTAATTTAGCCGGCCAAGATATGGTAAAACTGCTTGATGTGATTAAAACTGGTGC
ACCAAATTTAAGCAGTAGCTCAAATATGAAGGTTGACGAACAGGTTGAAGTGTCCCTTCC
ATCTCCAACACCATCAACCAATCCTGGAATGAGCGGGTGGGGACAAGAAGTGACTCGGAA
TCCACTTTCAAGACAAACCCAAGTTGGTGCCTCAGTTGCTAGAATGAGTACTCGGCTTCC
TGTTGCTTCCATGCAATGGCAACCATCAAACGGACAATCGATCCCTCAACATACTCCATC
AGCATATAACTCATTCATATTGCCTCACACAGAAAGACAACACCAACAACGCATGCAACC
AAGGCTCCATCAAAATCAACATTTTCAACAACAACCAATCTCGACAACCTCGTATGTGGT
CAGGGAATCAGTAGGAAAGATGGACATAGGTACATCGGCTTCATGGAGGTCCCAGCAGAG
TCAGAATAGTTACTACTCACATCAAGCAAACGGGATTGGGTCAGATGCTTCCTACCAAGG
GAATGAGCAGTCCATGACTAGTAGTAATCCAGGATATGAATCATGGAGTCCTGATAATAG
CCCAAGTAGGAACCACCCTAACATGAGGGGACAACAACAACCATCGAGGAAACATGACCC
TTATTGGAACCAAAACAAAAGATGGCGTTAAAACATATATCAAAACTTTTTGTTCTTTCG
ATGCCCCAATACTTGTTTTAACCC

QA 1 744 1 744
DS 



AS 2 4

CO CL2021Contig1 733 2 4 U
AAACATCATTGGTTGATTTAGAAACTGCCAAACCTGTTTGAGTATTGAGCATATAAGTTT
TGTGTTATTAAATTGCTACAGAACAAAACACAAAAAGGCTTTTTATAAACCTTTCAAATA
CCACAATGTGTTGTCTCTGTCAATCAAAAGACAAAGATCTTTGTATGTTTTCTTAGAGCA
TTCTATCCTGAAGATCACTGAATATACCAGATGCCAATGACCCCAGCTTCTTGGTCGTTT
CTTCCGCTATGTTAACAAGGGACGACACATCTTGCTGCGCATGGAAAGAAATTCGGTTGA
TGAGATCGCTTGCAGTGATATCGACGTTGGAATCATCTTGTCCATGACCAAAAAGATCAG
CACTTGAAATAGCTGCTGAGCCCGAGAACTTCTGAAGAGTAGCTTTTGATTCAAGATCAG
CATCTCTGTTCTGATTCCCGTAAAACTGTGCAGATGAAATCGATTTCGCGTTTGAAAACT
TCTTTCTCGCTTCATCAGTTTCTTCAACTTGAACTTTTGACGAGCTTGAGGTTGGTTTCT
TGGAGAAAGAAGTGTCCATTCCATACTCATTAAAGAAATTCGATGACTTTGGTGGAGCGA
CGTGACTAAGCACACGTGTGCCACTTTGCCCACCGGACTGCTCCTCATCAAAGTACTCAA
ACCGAGAGGCAAACACTGATCCAGCTGATGATGATGATGTGGTTTTAGTCGAAGAAGCAG
CAGGAATCACAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CA78JQ U 1
AF RS1BW34JQ U 15
BS 1 280 RS1CA78JQ
BS 281 281 RS1BW34JQ
BS 282 486 RS1CA78JQ
BS 487 733 RS1BW34JQ

RD RS1CA78JQ 486 0 0
AAACATCATTGGTTGATTTAGAAACTGCCAAACCTGTTTGAGTATTGAGCATATAAGTTT
TGTGTTATTAAATTGCTACAGAACAAAACACAAAAAGGCTTTTTATAAACCTTTCAAATA
CCACAATGTGTTGTCTCTGTCAATCAAAAGACAAAGATCTTTGTATGTTTTCTTAGAGCA
TTCTATCCTGAAGATCACTGAATATACCAGATGCCAATGACCCCAGCTTCTTGGTCGTTT
CTTCCGCTATGTTAACAAGGGACGACACATCTTGCTGCGCCTGGAAAGAAATTCGGTTGA
TGAGATCGCTTGCAGTGATATCGACGTTGGAATCATCTTGTCCATGACCAAAAAGATCAG
CACTTGAAATAGCTGCTGAGCCCGAGAACTTCTGAAGAGTAGCTTTTGATTCAAGATCAG
CATCTCTGTTCTGATTCCCGTAAAACTGTGCAGATGAAATCGATTTCGCGTTTGAAAACT
TCTTTC

QA 1 486 1 486
DS 

RD RS1BW34JQ 719 0 0
GATTTAGAAACTGCCAAACCTGTTTGAGTATTGAGCATATAAGTTTTGTGTTATTAAATT
GCTACAGAACAAAACACAAAAAGGCTTTTTATAAACCTTTCAAATACCACAATGTGTTGT
CTCTGTCAATCAAA*GACAAAGATCTTTGTATGTTTTCTTAGAGCATTCTATCCTGAAGA
TCACTGAATATACCAGATGCCAATGACCCCAGCTTCTTGGTCGTTTCTTCCGCTATGTTA
GCAAGGGACGACACATCTTGCTGCGCATGGAAAGAAATTCGGTTGATGAGATCGCTTGCA
GTGATATCGACGTTGGAATCATCTTGTCCATGACCAAAAAGATCAGCACTTGAAATAGCT
GCTGAGCCCGAGAACTTCTGAAGAGTAGCTTTTGATTCAAGATCAGCATCTCTGTTCTGA
TTCCCGTAAAACTGTGCAGATGAAATCGATTTCGCGTTTGAAAACTTCTTTCTCGCTTCA
TCAGTTTCTTCAACTTGAACTTTTGACGAGCTTGAGGTTGGTTTCTTGGAGAAAGAAGTG
TCCATTCCATACTCATTAAAGAAATTCGATGACTTTGGTGGAGCGACGTGACTAAGCACA
CGTGTGCCACTTTGCCCACCGGACTGCTCCTCATCAAAGTACTCAAACCGAGAGGCAAAC
ACTGATCCAGCTGATGATGATGATGTGGTTTTAGTCGAAGAAGCAGCAGGAATCACAGG

QA 1 719 1 719
DS 



CO CL2021Contig2 853 2 22 U
GGAAGAAACGAAACGAAGAAAACACGAAAGAAAAAAATAATCTCTCAGCAGCTTTGAAGA
AGAGAGAGTTTTGATCTATCGTCCGTCACAAGTTGTTCAGAACTCCAGATTTCTTCTTTC
TCTCGATCTGTAAAATCTCCTGCATAGCTCCTTAACGATGGCGACTGAGAATCACGCCGA
TAAGAATGTTGTTTTCAGAAAACTCAAAGCCAAATCGGAGAACAAGGTGTGCTTCGACTG
TAGTGCGAAGAATCCAACCTGGGCTTCGGTCACTTACGGCGTCTTTCTCTGCATCGATTG
CTCAGCTGTTCATCGAAACCTCGGTGTCCACATCAGCTTCGTCAGGTCGACGAACTTGGA
TTCGTGGAGTCCAGAGCAGCTAAGAACAATGATGTTTGGGGGTAACAACCGAGCTCAGGT
GTTTTTCAAGCAGCATGGCTGGAACGAAGGCGGCAGAATCGATGCTAAGTACACTTCGAG
AGCTGCTGATTTGTATAAGCAAACTCTCGCTAAGGAAGTTGCTAAAGCAATGGCTGAAGA
AGAAGCTACTTTGCCTTCTTCATCTGTTGCTGCTACTTCTCAGCCGGTGGAGCCTCCAGC
AAAAGAGACTTCTTTGGTTGTTAAGGAAGAGGCAACTGTTGCTGTCTCTTCTCCACCAAA
GGCTTCTCAGGGAGCTGTGGCTAGTACCTTTAAGAAACCTCTTGTTGCTAGAAAGACTGG
GAAGACTGGTGGTCTTGGTGCTCGTAAGCTTACCACTAAGCCGAAGAGAACCTTTATGAT
CAGAAGCCTGAAGAGCCTGTACCTGTGATTCCTGCTGCTTCTTCGACTAAACACATCATC
ATCATCAGCTGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CA78TF U 1
AF RS1BW34TF U 8
BS 1 36 RS1CA78TF
BS 37 37 RS1BW34TF
BS 38 83 RS1CA78TF
BS 84 84 RS1BW34TF
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BS 103 134 RS1CA78TF
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BS 304 304 RS1BW34TF
BS 305 399 RS1CA78TF
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BS 401 528 RS1CA78TF
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BS 549 560 RS1CA78TF
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BS 562 596 RS1CA78TF
BS 597 853 RS1BW34TF

RD RS1CA78TF 596 0 0
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QA 1 596 1 596
DS 

RD RS1BW34TF 846 0 0
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CTGTAAAATCTCCTGCATAGCTCCTTAACGATGGCGACTGAGAATCACGCCGATAAGAAT
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AAGAATCCAACCTGGGCTTCGGTTACTTACGGCGTCTTTCTCTGCATCGATTGCTCAGCT
GTTCATCGAAACCTCGGTGTCCACATCAGCTTCGTCAGGTCGACGAACTTGGATTCGTGG
AGTCCAGAGCAGCTAAGAACAATGATGTTTGGGGGTAACAACCGAGCTCAGGTGTTTTTC
AAGCAGCATGGCTGGAACGAAGGCGGCAGAATCGATGCTAAGTACACTTCGAGAGCTGCT
GATTTGTATAAGCAAACTCTCGCTAAGGAAGTTGCTAAAGCAATGGCTGAAGAAGAAGCT
ACTTTGCCTTCTTCATCTGTTGCTGCTACTTCTCAGCCGGTGGAGCCTCCAGCAAAAGAG
ACTTCTTTGGTTGTTAAGGAAGAGGCAACTGTTGCTGTCTCTTCTCCACCAAAGGCTTCT
CAGGGAGCTGTGGCTAGTACCTTTAAGAAACCTCTTGTTGCTAGAAAGACTGGGAAGACT
GGTGGTCTTGGTGCTCGTAAGCTTACCACTAAGCCGAAGAGAACCTTTATGATCAGAAGC
CTGAAGAGCCTGTACCTGTGATTCCTGCTGCTTCTTCGACTAAACACATCATCATCATCA
GCTGGA

QA 1 846 1 846
DS 



AS 1 4

CO CL2022Contig1 827 4 11 U
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CTCTTCCGCTCCAAGTCCAAGTCCTCGGTCTCAAGATCCGAACCTTCTTCCTCCAGCTCC
GGCGCTTCATCATCCGACGGCTCGTACAGTGACCTCAAGCAAGGTCCCGCGGCCACTCCC
GTCAGCGTCCTCCCCGGAGAACAAGATTTTTACTCCGAGCTGGTCCAGGCCTTTAAGCTC
ATAGACCGTGACGACGACGGCGTGGTCTCGAGAAGAGACCTAGCCGCGCTGCTTAGCAGG
CTTAGCCCTGAGCCTCCGAGTCAAGAAGAGGTGACTCTGATGCTTCAAGAAGTCGATGGA
GGAGGAGACGGTTGTATCAGCCTCGAGGAGCTTGCTAGCCGCGTGGCGGGAACCTCCTCT
GACTCTGATGAAGGCTCCGTTGCTGAGATGAGAGAGGTGTTTGAGTTTTTCGACGCGGAC
CACGACGGGAGGATATCGGCGGAGGAGTTGCATAGAGTTTTTGGAGTTATCGGAGACGAG
GGGTGCACGTTGGATGAGTGTGTGCGTATGATAGCGACCGTTGACGGGAACGGTGACGGT
TTTGTTTGCTTCCGTGACTTCTGCCGCATGATGCAGCTTCAAGGTCCAGCGTTGAGTGAA
TGATCAAATCATTGAGTCATGTTTGTATGATTGATGATAATGACATCGTTACACATTATT
TTATATTACTGTAATAATTTCTATTTTGCGGTGGGTATAATTTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DW41TF U 1
AF RS1AO92JQ C 6
AF RS1AO92TFB U 6
AF RS1DW41JQ C 199
BS 1 101 RS1DW41TF
BS 102 102 RS1AO92TFB
BS 103 172 RS1DW41TF
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BS 792 827 RS1DW41JQ

RD RS1DW41TF 555 0 0
GGACACCAACAATACACTAACCTCAATATCATATCTCTTCTCATCTCTTTTTTATCTTCT
CCCGCTATGAAGCTCGCCACTAGCCTCAGCTCCAAGTTCCTACGCCTCAGTCCTAAACGC
CTCTTCCGCTCCAAGTCCAAGTCCTCGGTCTCAAGATCCGAACCTTCTTCCTTCAGCTCC
GGCGCTTCATCATCCGACGGCTCGTACAGTGACCTCAAGCAAGGTCCCGCGGCCACTCCC
GTCAGCGTCCTCCCCGGAGAACAAGATTTTTACTCCGAGCTGGTCCAGGCCTTTAAGCTC
ATAGACCGTGACGACGACGGCGTGGTCTCGAGAAGAGACCTAGCCGCGCTGCTTAGCAGG
CTTAGCCCTGAGCCTCCGAGTCAAGAAGAGGTGACTCTGATGCTTCAAGAAGTCGATGGA
GGAGGAGACGGTTGTATCAGCCTCGAGGAGCTTGCTAGCCGCGTGGCGGGAACCTCCTCT
GACTCTGATGAAAGCTCCGTTGCTGAGATGAGAGAGGTGTTTGAGTTTTTCGACGCGGAC
CACGACGGGAGGATA

QA 1 555 1 555
DS 

RD RS1AO92JQ 786 0 0
GG
AACAATACACTAACCTCAATATCATATCTCTTCTCATCTCTTTTTTATCTTCTCCCGCTA
TGAAGCTCGCCACTAGCCTCAGCTCCAAGTTCCTCCGCCTCAGTCCTAAACGCCTCTTCC
GCTCCAAGTCCAAGTCCTCGGTCTCAAGATCCGAACCTTCTTCCTCCAGCTCCGGCGCTT
CATCATCCGACGGCTCGTACAGTGACCTCAAGCAAGGTCCCGCGGCCACTCCCGTCAGCG
TCCTCCCCGGAGAACAAGATTTTTAC*CCGAGCTGGTCCAGGCCTTTAAGCTCATAGACC
GTGACGACGACGGCGTGGTCTCGAGAAGAGACCTAGCCGCGCTGCTTAGCAGGCTTAGCC
CTGAGCCTCCGAGTCAAGAAGAGGTGACTCTGATGCTTCAAGAAGTCGATGGAGGAGGAG
ACGGTTGTATCAGCCTCGAGGAGCTTGCTAGCCGCGTGGCGGGAACCTCCTCTGACTTTG
ATGAAGGCTCCGTTGCTGAGATGAGAGAGGTGTTTGAGTTTTTCGACGCGGACCACGACG
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CGTTGGATGAGTGTGTGCGTATGATAGCGACCGTTGACGGGAACGGTGACGGTTTTGTTT
GCTTCCGTGACTTCTGCCGCATGATGCAGCTTCAAGGTCCAGCGTTGAGTGAATGATCAA
ATCATTGAGTCATGTTTGTATGATTGATGATAATGACATCGTTACACATTATTTTATATT
ACTG

QA 3 786 3 786
DS 

RD RS1AO92TFB 786 0 0
GG
AACAATACACTAACCTCAATATCATATCTCTTCTCATCTCTTTTTTATCTTCTCCCGCTA
TGAAGCTCGCCACTAGCCTCAGCTCCAAGTTCCTCCGCCTCAGTCCTAAACGCCTCTTCC
GCTCCAAGTCCAAGTCCTCGGTCTCAAGATCCGAACCTTCTTCCTCCAGCTCCGGCGCTT
CATCATCCGACGGCTCGTACAGTGACCTCAAGCAAGGTCCCGCGGCCACTCCCGTCAGCG
TCCTCCCCGGAGAACAAGATTTTTAC*CCGAGCTGGTCCAGGCCTTTAAGCTCATAGACC
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CTGAGCCTCCGAGTCAAGAAGAGGTGACTCTGATGCTTCAAGAAGTCGATGGAGGAGGAG
ACGGTTGTATCAGCCTCGAGGAGCTTGCTAGCCGCGTGGCGGGAACCTCCTCTGACTCTG
ATGAAGGCTCCGTTGCTGAGATGAGAGAGGTGTTTGAGTTTTTCGACGCGGACCACGACG
GGAGGATATCGGCGGAGGAGTTGCATAGAGTTTTTGGAGTTATCGGAGACGAGGGGTGCA
CGTTGGATGAGTGTGTGCGTATGATAGCGACCGTTGACGGGAACGGTGACGGTTTTGTTT
GCTTCCGTGACTTCTGCCGCATGATGCAGCTTCAAG*TCCAGCGTTGAGTGAATGATCAA
ATCATTGAGTCATGTTTGTATGATTGATGATAATGACATCGTTACACATTATTTTATATT
ACTG

QA 3 786 3 786
DS 

RD RS1DW41JQ 629 0 0
GGCTCGTACAGTGACCTCAAGCAAGGTCCCGCGGCCACTCCCGTCAGCGTCCTCCCCGGA
GAACAAGATTTTTACTCCGAGCTGGTCCAGGCCTTTAAGCTCATAGACCGTGACGACGAC
GGCGTGGTCTCGAGAAGAGACCTAGCCGCGCTGCTTAGCAGGCTTAGCCCTGAGCCTCCG
AGTCAAGAAGAGGTGACTCTGATGCTTCAAGAAGTCGATGGAGGAGGAGACGGTTGTATC
AGCCTCGAGGAGCTTGCTAGCCGCGTGGCGGGAACCTCCTCTGACTCTGATGAAGGCTCC
GTTGCTGAGATGAGAGAGGTGTTTGAGTTTTTCGACGCGGACCACGACGGGAGGATATCG
GCGGAGGAGTTGCATAGAGTTTTTGGAGTTATCGGAGACGAGGGGTGCACGTTGGATGAG
TGTGTGCGTATGATAGCGACCGTTGACGGGAACGGTGACGGTTTTGTTTGCTTCCGTGAC
TTTTGCCGCATGATGCAGCTTCAAGGTCCAGCGTTGAGTGAATGATCAAATCATTGAGTC
ATGTTTGTATGATTGATGATAATGACATCGTTACACATTATTTTATATTACTGTAATAAT
TTCTATTTTGCGGTGGGTATAATTTTGCC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 4

CO CL2023Contig1 1234 4 3 U
CATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATCAGTCGACGGTACCGGACATATGCC
CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGACAGCCATTAGAAGAATCATCAGTAGATAATC
AAGAATGGCTTGTGAAAACCGCTGTAACGGACAAGCATGTGCTACAGTGGATGCTAGTGC
TGAGTCAAATAGGTCTTGATGTTATCAGAACGGATCGTTATCTCTGCTTTTACGAGAGTG
AGGGTAACCAAGCAAGACTCTGGGATGTTCTTTCCATATACACATGGTTGAATCCTGATA
TTGGTTATGTTCAAGGAATGAGTGATATATGTTCTCCGACGATAATCTTGCTAGAAGATG
AAGCTGATGCTTTCTGGTGCTTTGAGCGTGCAATGAGAAGACTAAGAGAAAACTTCAGGA
CAACTGAGACATCAATGGGGGTACAGACTCAGCTTGGTATGCTCTCACAGGTTATTCAAA
CCGTTGATCCTAGGCTCCACCAGCATCTAGAGGATCTAGACGGTGGAGAGTATCTGTTTG
CTATAAGGATGCTGATGGTTTTGTTCAGGAGAGAGTTCTCCTTCCTTGATGCCTTGTACC
TTTGGGAGATGATGTGGGCTATGGAGTACAATCCAAACAACTTTGCATCATATGAAAAAA
CAGAGAACGGAACCAAACAGGATCCGCGGTTACTGAAGCAGTATGGAAAGTTTGAGAGAA
AGTATGTAAAGAGTGGTCAGAACGAGCAACATCACAACACGCTTGCTGTTTTCGTTGTGG
CGAGTGTTCTTGAAACAAAGAACAAACGTCTCTTGAAAGAAGCTAAAGGCCTAGACGACG
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CGTTGAAGATTCATGAAAAGTTTTTGAGAAAGGCTAATAAGCAATAGACATATTGCTTAA
CCATAAACCATGTGTTATCCGGTTTTATCAAACCGATTTCGGTGTGATCTTGGCCTGGAT
TGGTTACCGTTGGACGCTGATAAATGTAGTAAAGATTGCGGGAGGGATCCCATGAGAACG
TCTCTAGTTCACTTGTTCTCTCATGTTGATATGATCTATACCTACGTGTGCCGTTTCTTG
TCTAAAAGAAGGAACTTCGTGTCGTTTTATTTTTTTCATCTTCTGTGGAAAATGATGCAA
GTGTAATCAACTAACTAATCATTCTTGAAATTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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TTGATCCTAGGCTCCACCAGCATCTAGAGGATCTAGACGGTGGAGAGTATCTGTTTGCTA
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CTAGTTCACTTGTTCTCTCATGTTGATATGATCTATACCTACGTGTGCCGTTTCTTGTCT
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TAATCAACTAACTAATCATTCTTGAAATTCG

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DS 

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AGGATCTAGACGGTGGAGAGTATCTGTTTGCTATAAGGATGCTGATGGTTTTGTTCAGGA
GAGAGTTCTCCTTCCTTGATGCCTTGTACCTTTGGGAGATGATGTGGGCTATGGAGTACA
ATCCAAACAACTTTGCATCATATGAAAAAACAGAGAACGGAACCAAACAGGATCCGCGGT
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ATCACAACACGCTTGCTGTTTTCGTTGTGGCGAGTGTTCTTGAAACAAAGAACAAACGTC
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ATTTGGACGCAAGAAAAGCGTGTAAAGAAGCGTTGAAGATTCATGAAAAGTTTTTGAGAA
AGGCTAATAAGCAATAGACATATTGCTTAACCATAAACCATGTGTTATCCGGTTTTATCA
AACCGATTTCGGTGTGATCTTGGCCTGGATTGGTTACCGTTGGACGCTGATAAATGTAGT
AAAGATTGCGGGAGGGATCCCATGAGAACGTCTCTAGTTCACTTGTTCTCTCATGTTGAT
ATGATCTATACCTACGTGTGCCGTTTCTTGTCTAAAAGAAGGAACTTCGTGTCGTTTTAT
TTTTTTCATCTTCTGTGGAAAATGATGCAAGTGTAATCAACTAACTAATCATTCTTGAAA
TTCG

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 3

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GGACACCACTCCATTGCTATTGCTCTGTACTTTTGATTCCTCAAAGTGAAAGAGGGAGCG
CGTGGAATATATCATGGCTGACGGTACTAACACCTTCGCGTGCGGCGTAAGTAAAGTGAT
TATGCTGTTCGGTTTTAGGGTCGTGCTTGATCCTATGAGAAAGAGCGTTAGTTTGAACAA
TTTGTCTGAGTATGAGAATACTGAGGTCACCTTAAAGATCGTTGGAGAGGATGGAGATGG
ACAAGACAAGAACAAAACATCCTCCTGTTACGCCTCGGCTGATGACGCTGTTCCGGTTTC
TTCTAATCGTGAGAGGAAACGAGGAGTTCCATGGACTGAGGAAGAGCACAAGCTGTTCCT
GCTTGGTCTGGAGAAAGTAGGAAAAGGAAATTGGAAAGGAATCTCCAAGAACTTTGTCAA
GAGCAGGACGTCTACGCAAGTTGCTAGTCATGCTCAGAAATACTTTCTCCGGCGAAGTAA
TCTCAACCGTCGCCGCCGGAGAAGATCTAGCCTTTTTGACATGACAACTGCTACGGTCTT
GCCCTTGGAAGAAGTGCAGGAGAACACATCACAACCATCTTCTCTTGTACCGGATGTTAA
CAGCTTCACTAGTCACCCAGTTTTGCAAATCTTTCCTGAGTTCCCTGCACCACCATCTGG
TGATAATGCATCACGACAGTTCTCTTCTTCTAATCTCATCAACCTGGTCCCGTTTACTTT
TCAAGCAAGGCCTACACCGATCTCCCTCAACCTCTCACTAGCTTCATCTACTCTTAATGA
GCCATCTTCTATTTCAAGGCATTCAGCATTCAACACGATTGGAGTCGCTTGATGAAAAAT
CCCAGAGGTGAATCTGCTACACATACACCTTGTTTGTTTCTCTCTTGTACAGATAGGTGT
TGACTTTTTTATATTTTAATCAAATTTATGTCTTTGGCTGAAAATATCTGTGGTAAAAAA
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EY47TF U 3
AF RS1AV27TF U 1
AF RS1AV27JQ C 387
BS 1 135 RS1AV27TF
BS 136 136 RS1EY47TF
BS 137 650 RS1AV27TF
BS 651 651 RS1EY47TF
BS 652 692 RS1AV27TF
BS 693 693 RS1AV27JQ
BS 694 720 RS1AV27TF
BS 721 721 RS1AV27JQ
BS 722 729 RS1AV27TF
BS 730 730 RS1AV27JQ
BS 731 751 RS1AV27TF
BS 752 752 RS1AV27JQ
BS 753 763 RS1AV27TF
BS 764 1087 RS1AV27JQ

RD RS1EY47TF 673 0 0
GG
ACCACTCCATTGCTATTGCTCTGTACTTTTGATTCCTCAAAGTGAAAGAGGGAGCGCGTG
GAATATATCATGGCTGACGGTACTAACACCTTCGCGTGCGGCGTAAGTAAAGTGATTATG
CTGTTCGGTTTTAGGGTCGTGCTTGATCCTATGAGAAAGAGCGTTAGTTTGAACAATTTG
TCTGAGTATGAGAATACTGAGGTCACCTTAAAGATCTTTGGAGAGGATGGAGATGGACAA
GACAAGAACAAAACATCCTCCTGTTACGCCTCGGCTGAT*ACGCTGTTCCGGTTTCTTCT
AATCGTGAGAGGAAACGAGGAGTTCCATGGACTGAGGAAGAGCACAAGCTGTTCCTGCTT
GGTCTGGAGAAAGTAGGAAAAGGAAATTGGAAAGGAATCTCCAAGAACTTTGTCAAGAGC
AGGACGTCTACGCAAGTTGCTAGTCATGCTCAGAAATACTTTCTCCGGCGAAGTAATCTC
AACCGTCGCCGCCGGAGAAGATCTAGCCTTTTTGACATGACAACTGCTACGGTCTTGCCC
TTGGAAGAAGTGCAGGAGAACACATCACAACCATCTTCTCTTGTACCGGATGTTAACAGC
TTCACTAGTCACCCAGTTATGCAAATCTTTCCTGAGTTCCCTGCACCACCATCTGGTGAT
AATGCATCA
CG

QA 3 671 3 671
DS 

RD RS1AV27TF 772 0 0
GGACACCACTCCATTGCTATTGCTCTGTACTTTTGATTCCTCAAAGTGAAAGAGGGAGCG
CGTGGAATATATCATGGCTGACGGTACTAACACCTTCGCGTGCGGCGTAAGTAAAGTGAT
TATGCTGTTCGGTTT*AGGGTCGTGCTTGATCCTATGAGAAAGAGCGTTAGTTTGAACAA
TTTGTCTGAGTATGAGAATACTGAGGTCACCTTAAAGATCGTTGGAGAGGATGGAGATGG
ACAAGACAAGAACAAAACATCCTCCTGTTACGCCTCGGCTGATGACGCTGTTCCGGTTTC
TTCTAATCGTGAGAGGAAACGAGGAGTTCCATGGACTGAGGAAGAGCACAAGCTGTTCCT
GCTTGGTCTGGAGAAAGTAGGAAAAGGAAATTGGAAAGGAATCTCCAAGAACTTTGTCAA
GAGCAGGACGTCTACGCAAGTTGCTAGTCATGCTCAGAAATACTTTCTCCGGCGAAGTAA
TCTCAACCGTCGCCGCCGGAGAAGATCTAGCCTTTTTGACATGACAACTGCTACGGTCTT
GCCCTTGGAAGAAGTGCAGGAGAACACATCACAACCATCTTCTCTTGTACCGGATGTTAA
CAGCTTCACTAGTCACCCAGTTTTGCAAATCTTTCCTGAGTTCCCTGCAC*ACCATCTGG
TGATAATGCATCACGACAGTTCTCTTCTTCTA*TCTCATCAACCTGGTCCCGTTTACTTT
*CAAGCAAG*CCTACACCGATCTCCCTCAAC*TCTCACTAGCT
CATCTACTC

QA 1 763 1 763
DS 

RD RS1AV27JQ 701 0 0
GAAATTGGAAAGGAATCTCCAAGAACTTTGTCAAGAGCAGGACGTCTACGCAAGTTGCTA
GTCATGCTCAGAAATACTTTCTCCGGCGAAGTAATCTCAACCGTCGCCGCCGGAGAAGAT
CTAGCCTTTTTGACATGACAACTGCTACGGTCTTGCCCTTGGAAGAAGTGCAGGAGAACA
CATCACAACCATCTTCTCTTGTACCGGATGTTAACAGCTTCACTAGTCACCCAGTTTTGC
AAATCTTTCCTGAGTTCCCTGCACCACCATCTGGTGATAATGCATCAGGACAGTTCTCTT
CTTCTAATCTCATCAACCTGGTCCCGTTTACTTTTCAAGCAAGGCCTACACCGATCTCCC
TCAACCTCTCACTAGCTTCATCTACTCTTAATGAGCCATCTTCTATTTCAAGGCATTCAG
CATTCAACACGATTGGAGTCGCTTGATGAAAAATCCCAGAGGTGAATCTGCTACACATAC
ACCTTGTTTGTTTCTCTCTTGTACAGATAGGTGTTGACTTTTTTATATTTTAATCAAATT
TATGTCTTTGGCTGAAAATATCTGTGGTAAAAAAAAATAATAGACAGAGCAGATTGGAGA
ATAGGACTAAGTGGAATTTTTAGGGTTTTCATAATCTTTTATGTTTGTTCCCTTACATGT
TTGGAAGTTGTTGTAATACTATATGGTCTGGTTTGTTTCAC

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 4

CO CL2025Contig1 811 4 8 U
GGAAGAGTCTGCAACTACAGAGTAAACAGAATCTCAACCATTAGTCGAGACAACTGAGAG
AAGAAACTTGACATGGCTAACGAAGGACAAAAAAGCAGCATTTTGACAGCTCTTGACAAT
GCAAAGACTCAATGGTATCACGTCACGACTGTCATAATCTCCGGTATGGGTTTCTTTACG
GACTCATACGATCTCTTTGTGATATCTCTCATCACGAAGCTCCTAGGTCGGATCTACTAT
CAGAAACCTGGCTCCTCCTCTCCAGGAAGCCTCCCTGACGGCATATCTGCCACAGTGAGC
GGTGTGGCTTTTGCCGGAACGTTTCTCGGACAGATTTTCTTCGGGTGTCTCGGAGACAAG
CTCGGCCGTAAGAGAGTCTACGGTTTGACTCTCGTGATCATGACCTTATGCTCCATTTGC
TCTGGTCTTTCCCTTGGCACCGACCCTAAATTCGTCATGACAACGCTCTGCTTTTTCCGC
TTCTGGCTCGGGTTTGGCATCGGTGGTGACTACCCTCTATCGGCTACGATCATGTCCGAG
TATGCCAACAAACGTACACGTGGTGCGTTCATAGCGTCGGTTTTCGCCATGCAAGGGGTT
GGGATCTTAGCCGCGGGGGG*TGTTTCTTTACTTGTCTCGTACATTTTCGAGCTTCATTT
TCCATCTCCAGCTTATATGGTCGACCCGGTCACCTCCACCGTTCCGCAGCAGATTACGTT
TGGAGGATCATCCTGATGTTAGGAGCTATACCGGCTCTCCTTACTTACTACTGGCGTGTG
AAGATGCTGAAACCGCTCGTTACACTGCTCT


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H206TF U 1
AF RS1BJ28TF U 2
AF RS1B495TF U 3
AF RS1E027TF U 33
BS 1 358 RS1H206TF
BS 359 359 RS1BJ28TF
BS 360 591 RS1H206TF
BS 592 662 RS1BJ28TF
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BS 685 703 RS1B495TF
BS 704 811 RS1E027TF

RD RS1H206TF 591 0 0
GGAAGAGTCTGCAACTACAGAGTAAACAGAATCTCAACCATTAGTCGAGACAACTGAGAG
AAGAAACTTGACATGGCTAACGAAGGACAAAAAAGCAGCATTTTGACAGCTCTTGACAAT
GCAAAGACTCAATGGTATCACGTCACGACTGTCATAATCTCCGGTATGGGTTTCTTTACG
GACTCATACGATCTCTTTGTGATATCTCTCATCACGAAGCTCCTAGGTCGGATCTACTAT
CAGAAACCTGGCTCCTCCTCTCCAGGAAGCCTCCCTGACGGCATATCTGCCACAGTGAGC
GGTGTGGCTTTTGCCGGAACGTTTCTCGGACAGATTTTCTTCGGGTGTCTCGGAGACAGG
CTCGGCCGTAAGAGAGTCTACGGTTTGACTCTCGTGATCATGACCTTATGCTCCATTTGC
TCTGGTCTTTCCCTTGGCACCGACCCTAAATTCGTCATGACAACGCTCTGCTTTTTCCGC
TTCTGGCTCGGGTTTGGCATCGGTGGTGACTACCCTCTATCGGCTACGATCATGTCCGAG
TATGCCAACAAACGTACACGTGGTGCGTTCATAGCGTCGGTTTTCGCCATG

QA 1 591 1 591
DS 

RD RS1BJ28TF 683 0 0
GAA
GAGTCTGCAACTACAGAGTAAACAGAATCTCAACCATTAGTCGAGACAACTGAGAGAAGA
AACTTGACATGGCTAACGAAGGACAAAAAAGCAGCATTTTGACAGCTCTTGACAATGCAA
AGACTCAATGGTATCACGTCACGACTGTCATAATCTCCGGTATGGGTTTCTTTACGGACT
CATACGATCTCTTTGTGATATCTCTCATCACGAAGCTCCTAGGTCGGATCTACTATCAGA
AACTTGGCTCCTCCTCTCCAGGAAGCCTCCCTGACGGCATATCTGCCACAGTGAGCGGTG
TGGCTTTTGCCGGAACGTTTCTCGGACAGATTTTCTTCGGGTGTCTCGGAGACAAGCTCG
GCCGTAAGAGAGTCTACGGTTTGACTCTCGTGATCATGACCTTATGCTCCATTTGCTCTG
GTCTTTCCCTTGGCACCGACCCTAAATTCGTCATGACAACGCTCTGCTTTTTCCGCTTCT
GGCTCGGGTTTGGCATCGGTGGTGACCACCCTCTATCGGCTACGATCATGTCCGAGTATG
CCAACAAACGTACACGTGGTGCGTTCATAGCGTCGGTTTTCGCCATGCAAGGGGTTGGGA
TCTTAGCCGCGGGGGG*TGTTTCTTTACTTGTCTCGTACATTTTCGAGCTTCATTTTC*A
TCTCCAGCTTATATGGTCGA

QA 4 683 4 683
DS 

RD RS1B495TF 701 0 0
GG
GAGTCTGCAACTACAGAGTAAACAGAATCTCAACCATTAGTCGAGACAACTGAGAGAAGA
AACTTGACATGGCTAACGAAGGACAAAAAAGCAGCATTTTGACAGCTCTTGACAATGCAA
AGACTCAATGGTATCACGTCACGACTGTCATAATCTCCGGTATGGGTTTCTTG**GGACT
CATACGATCTCTTTGTGATATCTCTCATCACGAAGCTCCTAGGTCGGATCTACTATCAGA
AACCTGGCTCCTCCTCTCCAGGAAGCCTCCCTGACGGCATATCTGCCACAGTGAGCGGTG
TGGCTTTTGCCGGAACGTTTCTCGGACAGATTTTCTTCGGGTGTCTCGGAGACAAGCTCG
GCCGTAAGAGAGTCTACGGTTTGACTCTCGTGATCATGACCTTATGCTCCATTTGCTCTG
GTCTTTCCCTTGGCACCGACCCTAAATTCGTCATGACAACGCTCTGCTTTTTCCGCTTCT
GGCTCGGGTTTGGCATCGGTGGTGACTACCCTCTATCGGCTACGATCATGTCCGAGTATG
CCAACAAACGTACACGTGGTGCGTTCATAGCGTCGGTTTTTGCCATGCAAGGGGTTGGGA
TCTTAGCCGCGGGGGG*TGTTTCTTTACTTGTCTCGTACATTTTCGAGCTTCATTTTCCA
TCTCCAGCTTATATGGTCGACCCGGTCACCTCCACCGTT

QA 3 701 3 701
DS 

RD RS1E027TF 779 0 0
GGGTTTTCAG
AGTCGAGACAACTGAGAGAAGAAGCTTGACATGGCTAACGAAAGACAAAAAAGCAGCATT
TTGACAGCTCTTGACAATGCAAAGACTCAATGGTATCACGTCACGACTGTCATAATCTCC
GGTATGGGTTTCTTTACGTACTCATACGATCTCTTTGTGATATCTCTCATCACGAAGCTC
CTAGGTCGGATCTACTATCAGAAACCTGGCTCCTCCTCTCCAGGAAGCCTCCCTGACGGC
ATATCTGCCACAGTGAGCGGTGTGGCTTTTGCCGGAACGTTTCTCGGACAGATTTTCTTC
GGGTGTCTCGGAGACAAGCTCGGCCGTAAGAGAGTCTACGGTTTGACTCTCGTGATCATG
ACCTTATGCTCCATTTGCTCTGGTCTTTCCCTTGGCACCGACCCTAAATTCGTCATGACA
ACGCTCTGCTTTTTCCGCTTCTGGCTCGGGTTTGGCATCGGTGGTGACTACCCTCTATCG
GCTACGATCATGTCCGAGTATGCCAACAAACGTACACGTGGTGCGTTCATAGCGTCGGTT
TTCGCCATGCAAGGGGTTGGGATCTTAGCCGCGGGGGGGTGTTTCTTTACTTGTCTCGTA
CATTTTCGAGCTTCATTTTCCATCTCCAGCTTATATGGTCGACCCGGTCACCTCCACCGT
TCCGCAGCAGATTACGTTTGGAGGATCATCCTGATGTTAGGAGCTATACCGGCTCTCCTT
ACTTACTACTGGCGTGTGAAGATGCTGAAACCGCTCGTTACACTGCTCT

QA 11 779 11 779
DS 



AS 1 4

CO CL2026Contig1 1143 4 14 U
GAATCGAAAGGGATATATTTGTTCTTAGGAATGATGAGCACACGTATGTCTTAGGTCAAG
TAGTTGCAGTTGTTACTAAGAACAATAACAAAACAAAAAAAATTCACAAATTGATTGTTT
ATGATATCCATTAAACCAAGAAAGATAAGATATTATCTCCAAGAGACTTGGAGATTGATT
CGTTAGCTTTCTGGGATTCGGCTCTTTCCCCTCGCTTCTTCTTCTCCCTCTCGACATACT
CCTTGAGTAGTTCCTTGGCTTGGACAAGCTTTGAAAGCAGGTTGCGATACACATCGAGGT
CCCGATCCACGCTTTTCTTGTTGATATTTAGGGACGCACAAAGCTTGTCAAGGACGGTGG
GATCAGTAGCACCTGCAAGCTCAAGCAAGCGAAACAAGCCAACAGCGAAGAACCTGCTGT
AACTGAAACCTTCCTTACTGCCAGCTCTTTCTGAAATGTCCTTAAGAATCGCTTCGACTT
CTCCGTCCTTAGACGAGAAGTCAACTAGTGAAGCAGAAGTCTGACTTCGCGCCTATTCCT
CCATCTTCTGCGCATCAGCTCGGTATTGGTTAGGATCCTCATTCAAAGCTTGGACGTAGG
CTTGAAAAATGGAATCACGATCCTGATCGCTGGGATAGCCATCCATGAGCTGATCGTAGA
CAGTGACGAAGCCGAGGGCGAAAACAGGGTCGTAACGGTAAGTCTTTTTATACCTCATCA
AATGCTGCTGTACGATGAGCTCCTGGAGGACGGTGTTGTAGATGCTGGGGATTGGTCGCT
TGTACGCTTTTAGGAAGTTTGACTTTGTCTCCGATACAGGTGGCACATCGGTAACACTAG
ACATGCAGTGGATGATTAGTTTCGAAGCTCTAGAAGAAGAAGAAGAAGTCAAAGAGTGGC
GAGAAATCCTCCTGGAGATGGCGGAGACGGAGGCGAGAGGAAGAGAAAGCGTGGTTGAAT
TGGAAATCTTTGCGGATTGGCCCAGCGCCGGAAAGGAGAGAGAAGCGATTGCAGCAGCCA
TTTCGAATCTGAAGAAGATTGAGAAGAAAGAGGGAGATAGAGAGAGAGAGAGGAGAGTTT
TGTTATTGGGATTTGGGGAGAGGAGAGGAGGATGGCTTGGCCATGGGAAAGAGGGAGGAT
CCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 

AF RS1DD65JQ U 1
AF RS1CS44JQ U 115
AF RS1DD65TF C 365
AF RS1CS44TF C 537
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BS 1088 1143 RS1CS44TF

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DS 

RD RS1CS44JQ 701 0 0
TTGTTTATGATATCCATTAAACCAAGAAAGATAAGATATTATCTCCAAGAGACTTGGAGA
TTGATTCGTTAGCTTTCTGGGATTCGGCTCTTTCCCCTCGCTTCTTCTTCTCCCTCTCGA
CATACTCCTTGAGTAGTTCCTTGGCTTGGACAAGCTTTGAAAGCAGGTTGCGATACACAT
CGAGGTCCCGATCCACGCTTTTCTTGTTGATATTTAGGGACGCACAAAGCTTGTCAAGGA
CGGTGGGATCAGTAGCACCTGCAAGCTCAAGCAAGCGAAACAAGCCAACAGCGAAGAACC
TGCTGTAACTGAAACCTTCCTTACTGCCAGCTCTTTCTGAAATGTCCTTAAGAATCGCTT
CGACTTCTCCGTCCTTAGACGAGAAGTCAACTGGTGAAGCAGAAGTCTGACTTCGCGCCC
ATTCCTCCATCTTCTGCGCATCAGCTCGGTATTGGTTAGGATCCTCATTCAAAGCTTGGA
CGTAGGCTTGAAAAATGGAATCACGATCCTGATCGCTGGGATAGCCATCCATGAGCTGAT
CGTGGACAGTGACGAAGCCGAGGGCGAAAACAGGGTCGTAACGGTAAGTCTTTTTATACC
TCATCAAATGCTGCTGTACGATGAGCTCCTGGAGGACGGTGTTGTAGATGCTGGGGATTG
GTCGCTTGTACGCTTTTAGGAAGTTTGACTTTGTCTCCGAT

QA 1 701 1 701
DS 

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CAGTAGCA
CTGCAAGCTCAAGCAAGCGAAACAAGCCAACAGCGAAGAAC*TGCTGTAACTGAAACCTT
CTTTACTGCCAGCTCTTTCTGAAATGTCCTTAAGAATCGCTTCGACTTCTCCGTCCTTAG
ACGAGAAGTCAACTAGTGAAGCAGAAGTCTGACTTCGCGCCTATTCCTCCATCTTCTGCG
CATCAGCTCGGTATTGGTTAGGATCCTCATTCAAAGCTTGGACGTAGGCTTGAAAAATGG
AATCACGATCCTGATCGCTGGGATAGCCATCCATGAGCTGATCGTAGACAGTGACGAAGC
CGAGGGCGAAAACAGGGTCGTAACGGTAAGTCTTTTTATACCTCATCAAATGCTGCTGTA
CGATGAGCTCCTGGAGGACGGTGTTGTAGATGCTGGGGATTGGTCGCTTGTACGCTTTTA
GGAAGTTTGACTTTGTCTCCGATACAGGTGGCACATCGGTAACACTAGACATGCAGTGGA
TG*TTAGTTTCGAAGCTCTAGAAGAAGAAGAAGAAGTCAAAGAGTGGCGGGAAATCCTCC
TGGAGATGGCGGAGACGGAGGCGAGAGGAAGAGAAGGCGTGGTTGAATTGGAAATCTTTG
CGGATTGGCCCAGCGCCGGAAAGGAGAGAGAAGCGATTGCAGCAGCCATTTCGAATCTGA
AGAAGATTG*GAAGAAAGAGGGAGATAGAGAGAGAGAGAGGAGAGTTTTGTTATT
CC

QA 9 723 9 723
DS 

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TCCTCCATCTTCTGCGCATCAGCTCGGTATTGGTTAGGATCCTCATTCAAAGCTTGGACG
TAGGCTTGAAAAATGGAATCACGATCCTGATCGCTGGGATAGCCATCCATGAGCTGATCG
TGGACAGTGACGAAGCCGAGGGCGAAAACAGGGTCGTAACGGTAAGTCTTTTTATACCTC
ATCAAATGCTGCTGTACGATGAGCTCCTGGAGGACGGTGTTGTAGATGCTGGGGATTGGT
CGCTTGTACGCTTTTAGGAAGTTTGACTTTGTCTCCGATACAGGTGGCACATCGGTAACA
CTAGACATGCAGTGGATGATTAGTTTCGAAGCTCTAGAAGAAGAAGAAGAAGTCAAAGAG
TGGCGAGAAATCCTCCTGGAGATGGCGGAGACGGAGGCGAGAGGAAGAGAAAGCGTGGTT
GAATTGGAAATCTTTGCGGATTGGCCCAGCGCCGGAAAGGAGAGAGAAGCGATTGCAGCA
GCCATTTCGAATCTGAAGAAGATTTAGAAGAAAGAGGGAGATAGAGAGAGAGAGAGGAGA
GTTTTGTTATTGGGATTTGGGGAGAGGAGAGGAGGATGGCTTGGCCATGGGAAAGAGGGA
GGATCCC

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 4

CO CL2027Contig1 957 4 5 U
AAAACGCTTCAGGAAGGATTCTTTTATACCAAATAAAGTGACAGATATACAGAGATTATA
AAGCTCGGTGTTTGCTTGACCAATCAGAGACTGTTGCAGTAATGAAACTATAGACGTATG
GCTAATTCAACTTGATCCAGCTGGTTTGGCTGCATTCGTCTGCACGGATAAAGATTCCAA
CGTAAACCCTTCAGGTCCCTTGGCTGGAGCGATGCTGCAACGATCTGTGTTGTGTAGTCG
GATGGCATCTTTTATCTTCTGGAACTTGGCAAGAGAACATGAGAAGGACTCGAGCTGGCC
ATCAGCTCCACGGTAAAAGTGGAAATAAGGAAGCACTTTGACGTTCAAACTCTTGCACAT
TGGTTTGTTCTCACCAAAGTTTACTTTGAGGAACAATATATCCGGATGTTCTACCGCTGT
CTTGCAAAGCTTGGGGAACAATGCTCTGCAAGAAGCACACCAAGTTCCATAAAACTCTAC
AATGACTAATCTTTCACCCGCTTCGCTTAAAGCCTTCAAGAATTCTTCAGTGGAATGAAT
GTCAACCATGTTCGGTCCAGCATTCCTCTCCCACCATTTCGGTGGCTCTGTCTCCGCCAC
ACTCTCATCTACCTTGACGTGAACCACCTTGCTCTTGGATCGTTTAAGAGGGATGTGGCT
AGGGAGACCTAAAGATGTGTAATGAGAAGACGAGCACGAGGGAAGATAAGAGAGCTGACG
AACTCTCTTGTCGGAATTCAGATTTGGAAGTGAGCGAGGTTTGAGAGTGGTTGCAAAGGA
GGTGAAGGAGGAAGAGGCGCGAATGGCCTGAACCGACGTCGATGATATTCGAACGACTCC
AGCCATCAAAATTCACCAGCACAGTAGAGAGATAGAGAGATTGTTCTTAGCTACGAGAGA
TCCTCCAGAGATAAAAGAAGATCAGAGAAACTGTCTGGTTCAGATTCTCAGTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FU17JQ U 1
AF RS1AB21JQ U 403
AF RS1FU17TF C 77
AF RS1AB21TF C 193
BS 1 549 RS1FU17JQ
BS 550 550 RS1AB21JQ
BS 551 754 RS1FU17JQ
BS 755 923 RS1FU17TF
BS 924 957 RS1AB21TF

RD RS1FU17JQ 754 0 0
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AAGCTCGGTGTTTGCTTGACCAATCAGAGACTGTTGCAGTAATGAAACTATAGACGTATG
GCTAATTCAACTTGATCCAGCTGGTTTGGCTGCATTCGTCTGCACGGATAAAGATTCCAA
CGTAAACCCTTCAGGTCCCTTGGCTGGAGCGATGCTGCAACGATCTGTGTTGTGTAGTCG
GATGGCATCTTTTATCTTCTGGAACTTGGCAAGAGAACATGAGAAGGACTCGAGCTGGCC
ATCAGCTCCACGGTAAAAGTGGAAATAAGGAAGCACTTTGACGTTCAAACTCTTGCACAT
TGGTTTGTTCTCACCAAAGTTTACTTTGAGGAACAATATATCCGGATGTTCTACCGCTGT
CTTGCAAAGCTTGGGGAACAATGCTCTGCAAGAAGCACACCAAGTTCCATAAAACTCTAC
AATGACTAATCTTTCACCCGCTTCGCTTAAAGCCTTCAAGAATTCTTCAGTGGAATGAAT
GTCAACCAT*TTCGGTCCAGCATTCCTCTCCCACCATTTCGGTGGCTCTGTCTCCGCCAC
ACTCTCATCTACCTTGACGTGAACCACCTTGCTCTTGGATCGTTTAAGAGGGATGTGGCT
AGGGAGACCTAAAGATGTGTAATGAGAAGACGAGCACGAGGGAAGATAAGAGAGCTGACG
AACTCTCTTGTCGGAATTCAGATTTGGAAGTGAG

QA 1 754 1 754
DS 

RD RS1AB21JQ 330 0 0
CGGATGTTCTACCGCTGTCTTGCAAAGCTTGGGGAGCAATGCTCTGCAAGAAGCACACCA
AGTTCCATAAAACTCTACAATGACTAATCTTTCACCCGCTTCGCTTAAAGCCTTCAAGAA
TTCTTCAGTGGAATGAATGTCAACCATGTTCGGTCCAGCATTCCTCTCCCACCATTTCGG
TGGCTCTGTCTCCGCCACACTCTCATCTACCTTGACGTGAACCACCTTGCTCTTGGATCG
TTTAAGAGGGATGTGGCTAGGGAGACCTAAAGATGTGTAATGAGAAGACGAGCACGAGGG
AAGATAAGAGAGCTGACGAACTCTCTTGTC

QA 1 330 1 330
DS 

RD RS1FU17TF 849 0 0
CTGACC
ATCAGAGACTGTTGCAGTAATGAAACTATAGACGTATG*CTAAT*CAACT*GATCCAGCT
GGTT*GGCTGCAT*CGTCTGCACGGATAAAGATTCCAACGTAAACCTTTCAGGTCCCTTG
GCTGGAGCGATGCTGCAACGATCTGTGTTGTGTAGTCGGATGGCATCTTTTATCTTCTGG
AACTTGGCAAGAGAACATGAGAAGGACTCGAGCTGGCCATCAGCTCCACGGTAAAAGTGG
AAATAAGGAAGCACTTTGACGTTCAAACTCTTGCACATTGGTTTGTTCTCACCAAAGTTT
ACTTTGAGGAACAATATATCCGGATGTTCTACCGCTGTCTTGCAAAGCTTGGGGAACAAT
GCTCTGCAAGAAGCACACCAAGTTCCATAAAACTCTACAATGACTAATCTTTCACCCGCT
TCGCTTAAAGCCTTCAAGAATTCTTCAGTGGAATGAATGTCAACCAT*TTCGGTCCAGCA
TTCCTCTCCCACCATTTCGGTGGCTCTGTCTCCGCCACACTCTCATCTACCTTGACGTGA
ACCACCTTGCTCTTGGATCGTTTAAGAGGGATGTGGCTAGGGAGACCTAAAGATGTGTAA
TGAGAAGACGAGCACGAGGGAAGATAAGAGAGCTGACGAACTCTCTTGTCGGAATTCAGA
TTTGGAAGTGAGCGAGGTTTGAGAGTGGTTGCAAAGGAGGTGAAGGAGGAAGAGGCGCGA
ATGGCCTGAACCGACGTCGATGATATTCGAACGACTCCAGCCATCAAAATTCACCAGCAC
AGTAGAGAGATAGAGAGATTGTTCTTAGCTACGAGAGATCCTCCAGAGATAAAAGAAGAT
C
CC

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DS 

RD RS1AB21TF 765 0 0
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TATCTTCTGGAACTTGGCAAGAGAACATGAGAAGGACTCGAGCTGGCCATCAGCTCCACG
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ATCAAAGTTTACTTTGAGGAACAATATATCCGGATGTTCTACCGCTGTCTTGCAAAGCTT
GGGGAGCAATGCTCTGCAAGAAGCACACCAAGTTCCATAAAACTCTACAATGACTAATCT
TTCACCCGCTTCGCTTAAAGCCTTCAAGAATTCTTCAGTGGAATGAATGTCAACCATGTT
CGGTCCAGCATTCCTCTCCCACCATTTCGGTGGCTCTGTCTCCGCCACACTCTCATCTAC
CTTGACGTGAACCACCTTGCTCTTGGATCGTTTAAGAGGGATGTGGCTAGGGAGACCTAA
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GGAATTCAGATTTGGAGGTGAGCGAGGTTTGAGAGTGGTTGCAAAGGAGGTGAAGGAGGA
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TCACCAGCACAGTAGAGAGATAGAGAGGTTGTTCTTAGCTACGAGAGATCCTCCAGAGAT
AAAAGAAGATCAGAGAAACTGTCTGGTTCAGATTCTCAGTGATCC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 4

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CTTTGCTCCATATCTGCTTGTTCAACCTCACGTCTACCCTAACGTCCTTGGTTCCCATGG
CTTTCTCTGCAAACTTCCTTATCTCCTTAATGGCCTTTGGTGCCTTCTTCTTAAAGGTGC
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TTCCCTTTTTCTCAGACATCTTCTCTTTGTTGTCTGTCTTGTACTTCTTCACACTCTTAC
CTTTGCGGCTCGAAGAACGTCGACAGACCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RS1EW05JQ U 1
AF RS1EW05TF C 1
AF RS1DK14JQ U 55
AF RS1DK14TF C 55
BS 1 107 RS1EW05JQ
BS 108 108 RS1DK14JQ
BS 109 481 RS1EW05JQ
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BS 483 614 RS1EW05JQ
BS 615 626 RS1EW05TF
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RD RS1EW05JQ 617 0 0
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CTTTCTCTGCAAACTTCCTTATCTCCTTAATGGCCTTTGGTGCCTTCTTCTTAAAGGTGC
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CTTTGCGGCTCGAA
GAA

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DS 

RD RS1EW05TF 628 0 0
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AGATTCATCGCAAGGTCTATATAGTAAATGAGTCTTTCAAATAATAAGCTGCAACTGTGA
CTTCTTTGAACGAAAACAAACAAGAAATTTAAGAGAAAAACACCAAAACTTGTCTAAACC
ACAGACTAGTAGTCCCTTCTCAATCCTCCTCATCGATGACCTTTGTGCCGAGTCCACTTA
GTCCTTCGGCAGGGATTTCGGCAACGGTGACAAGTGAGAAAAACTCTTCCTTTGCGTCTT
CATCGTCGTTCCTCTTACGTGCAACGCGGACCCTGATCCTTCTTGGGGGACCTCTGATAC
CTTTGCTCCATATCTGCTTGTTCAACCTCACGTCTACCCTAACGTCCTTGGTTCCCATGG
CTTTCTCTGCAAACTTCCTTATCTCCTTAATGGCCTTTGGTGCCTTCTTCTTAAAGGTGC
AGCTGTGGAGGCGTCTGTGGAGGTTGATGGTGTACTCTCTGGTCACCACTTCCTCTTTCC
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CTTTGCGGCTCGAAGAACGTCGACAG
CC

QA 1 626 1 626
DS 

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CCATGGCTTTCTCTGCAAACTTCCTTATCTCCTTAATGGCCTTTGGTGCCTTCTTCTTAA
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CTTTCCTTCCCTTTTTCTCAAACATCTTCTCTTTGTTGTCTGTCTTGTACTTCTTCACAC
TCTTACCTTTGCGGCTCGAA
AAA

QA 1 560 1 560
DS 

RD RS1DK14TF 576 0 0
AAAAAAAGATTCATCGCAAGGTCTATATAGTAAATGAGTCTTTCCAATAATAAACTGCAA
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CACTTAGTCCTTCGGCAGGGATTTCGGCAACGGTGACAAGTGAGAAAAACTCTTCCTTTG
CGTCTTCATCGTCGTTCCTCTTACGTGCAACGCGGACCCTGATCCTTCTTGGGGGACCTC
TGATACCTTTGCTCCATATCTGCTTGTTCAACTTCACGTCTACCCTAACGTCCTTGGTTC
CCATGGCTTTCTCTGCAAACTTCCTTATCTCCTTAATGGCCTTTGGTGCCTTCTTCTTAA
AGGTGCAACTGTGGAGGCGTCTGTGGAGGTTGATGGTGTACTCTCTGGTCACCACTTCCT
CTTTCCTTCCCTTTTTCTCAGACATCTTCTCTTTGTTGTCTGTCTTGTACTTCTTCACAC
TCTTACCTTTGCGGCTCGAAGAACGTCGACAGACCC

QA 1 576 1 576
DS 



AS 1 4

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AGAGAATCTGTCTCGATGCCTAGATCAAGAAGTCGCGTCCTGATTCTCTTATTGCCTCTA
GCCTTTGTGTTCTACCTGTACAGGTACCTGCCTTCTCCAGCTATTGTCGACCAATCATCA
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AAGTTCACTGGAAAGGTGCTTCTTATTGTCAATGTAGCCTCTAAGTGTGGTCTAACACAG
GGAAACTACAAAGAGTTGAACATTTTGTATGCCAAGTACAAAACTAAGGGGCTTGAGATC
TTAGCGTTTCCCTGCAACCAATTTGGAGGTCAAGAGCCAGGTAGCAACAAGGAGATTAAG
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GGTGAGAACGCTTCACCTCTATACAAGTTCTTGAAAGAACAGAAAGGTGGATTGTTTGGG
GATTCTATCAAGTGGAACTTCGCAAAGTTTCTGGTAGACAAACAAGGAAATGTTGTGGAT
CGATATGCTCCTACGACATCACCTCTTGAGATTGAGAAGGACATAGAGAAGCTATTGGCA
TCTGCTTGAACATAAAAAGAATTTTAAAGGACAGGAGATCAGAAGCATGGAGCATGTCCG
AGTTGGAGACTGAAGAGCTACTTTTATATACTTGATTCTCTTTAGATGTATGCTTTGTGT
TGTGTGAATGAATGTTCTTGGTACCAATCTTCATCAAAAGAATAGAACTTTATTTATGTT
CTTTCTTACAAGAATGCATTACAACAAATTTCATTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GB42TF U 1
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AGAGAATCTGTCTCGATGCCTAGATCAAGAAGTCGCGTCCTGATTCTCTTATTGCCTCTA
GCCTTTGTGTTCTACCTGTACAGGTACCTGCCTTCTCCAGCTATTGTCGACCAATCATCA
TACAGCTCCATCTACCACATCTCCGTTAAGGACATTGATGGGAATGATGTGAGTTTAAGC
AAGTTCACAGGAAAGGTGCTTCTTATTGTCAATGTAGCCTCTAAGTGTGGTCTAACACAG
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GGTGAGAATGCTTCACCTCTATACAAGTTCTTGAAAGAACAGAAAGGTGGATTGTTTGGG
GATTCTATCAAGTGGAACTTCGCAAAGTTTCTGGTAGACAAACA

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DS 

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GG
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GTGAGTTTAAGCAAGTTCACAGGAAAGGTGCTTCTTATTGTCAATGTAGCCTCTAAGTGT
GGTCTAACACAGGGAAACTACAAAGAGTTGAACATTTTGTATGCCAAGTACAAAACTAAG
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GGATTGTTTGGGGATTCTATCAAGTGGAACTTCGCAAAGTTTCTGGTAGACAAACAAGGA
AATGTTGTGGATCGATATGCTCCTACAACATCACCTCTTGAGATTGAGAAGGATATAGAG
AAGCTATTGGCATCTGCTTGAACATAAAAAGAAATTTAAAGGAAAGGAGATCAGAAGCAT
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TATGCTT*GTGTTGTGTGACTGAATGTTCTTGGTACCAATCTTCATCAAA
A

QA 3 772 3 772
DS 

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AGATTAAGGACAACATTTGCACAACCTTCAAAGGAGAGTTTCCCATCTTTGACAAGATTG
AAGTGAACGGTGAGAACGCTTCACCTCTATACAAGTTCTTGAAAGAACAGAAAGGTGGAT
TGTTTGGGGATTCTATCAAGTGGAACTTCGCAAAGTTTCTGGTAGACAAACAAGGAAATG
TTGTGGATCGATATGCTCCTACGACATCACCTCTTGAGATTGAGAAGGACATAGAGAAGC
TATTGGCATCTGCTTGAACATAAAAAGAATTTTAAAGGACAGGAGATCAGAAGCATGGAG
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CTTTGTGTTGTGTGAATGAATGTTCTTGGTACCAATCTTCATCAAA*GAATAGAACTTTA
TTTATGTTCT
CTCT

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AGGGAAACTACAAAGAGTTGAACATTTTGTATGCCAAGTACAAAACTAAGGGGCTTGAGA
TCTTAGCGTTTCCCTGCAACCAATTTGGAGGTCAAGAGCCAGGTAGCAACAAGGAGATTA
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GGGATTCTATCAAGTGGAACTTCGCAAAGTTTCTGGTAGACAAACAAGGAAATGTTGTGG
ATCGATATGCTCCTACGACATCACCTCTTGAGATTGAGAAGGACATAGAGAAGCTATTGG
CATCTGCTTGAACATAAAAAGAATTTTAAAGGACAGGAGATCAGAAGCATGGAGCATGTC
CGAGTTGGAGACTGAAGAGCTACTTTTATATACTTGATTCTCTTTAGGTGTATGCTTTGT
GTTGTGTGAATGAATGTTCTTGGTACCAATCTTCATCAAAAGAATAGAACTTTATTTATG
TTCTTTCTTACAAGAATGCATTACAACAAATTTCATTACC

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DS 



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AATTAATCTATGTCTTAGTCATGTATTGTTTGTGTCTCTTTGAATTCTTGTAATTGATTT
ATATTGAGTTTGGTCCG


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1BE16JQ C 1
AF RS1BE16TF U 1
AF RS1DN70JQ C 1
AF RS1DN70TF U 1
BS 1 377 RS1BE16TF

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AGCGTTCTTTGCGGTTCAACATTCGGCTGCAGCGGTTGACGCTCCGGCCCCGAGCCCCTC
CTCCGATGCCTGCTCGTTTATCCCTACTTTCTTTGCCTCCGTCGCCGTTCTGGCATTTGG
ATTACTCTTTTAATAAGTTTTATGTTTTTTCTTCTTATTTTTAACTGAATTAAATAAATC
AATTAATCTATGTCTTAGTCATGTATTGTTTGTGTCTCTTTGAATTCTTGTAATTGATTT
ATATTGAGTTTGGTCCG

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AGCGTTCTCTGCGGTTCAACATTCGGCTGCAGCGGTTGACGCTCCGGCCCCGAGCCCCTC
CTCCGATGCCTGCTCGTTTATCCCTACTTTCTTTGCCTCCGTCGCCGTTCTGGCATTTGG
ATTACTCTTTTAATAAGTTTTATGTTTTTTCTTCTTATTTTTAACTGAATTAAATAAATC
AATTAATCTATGTCTTAGTCATGTATTGTTTGTGTCTCTTTGAATTCTTGTAATTGATTT
ATATTGAGTTTGGTCCG

QA 1 377 1 377
DS 

RD RS1DN70JQ 377 0 0
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AGCGTTCTCTGCGGTTCAACATTCGGCTGCAGCGGTTGACGCTCCGGCCCCGAGCCCCTC
CTCCGATGCCTGCTCGTTTATCCCTACTTTCTTTGCCTCCGTCGCCGTTCTGGCATTTGG
ATTACTCTTTTAATAAGTTTTATGTTTTTTCTTCTTATTTTTAACTGAATTAAATAAATC
AATTAATCTATGTCTTAGTCATGTATTGTTTGTGTCTCTTTGAATTCTTGTAATTGATTT
ATATTGAGTTTGGTCCG

QA 1 377 1 377
DS 

RD RS1DN70TF 377 0 0
GGGACACCTCAAAATCAAGAACAGCGATAAACACCAAACCTTCTCTATCATATTAAAAAG
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AGCGTTCTCTGCGGTTCAACATTCGGCTGCAGCGGTTGACGCTCCGGCCCCGAGCCCCTC
CTCCGATGCCTGCTCGTTTATCCCTACTTTCTTTGCCTCCGTCGCCGTTCTGGCATTTGG
ATTACTCTTTTAATAAGTTTTATGTTTTTTCTTCTTATTTTTAACTGAATTAAATAAATC
AATTAATCTATGTCTTAGTCATGTATTGTTTGTGTCTCTTTGAATTCTTGTAATTGATTT
ATATTGAGTTTGGTCCG

QA 1 377 1 377
DS 



AS 1 4

CO CL2031Contig1 1262 4 7 U
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TAGTAGGCTCTGTTTTCACTCAAGGAGGATGGTCTAACTTTCTGTGCTCGGAGAAGAAAG
TTGAGCAAGCTGTTGACGTTGCACTTGTGTTCATCGGCAGAGAGTTACTGTCTTCTGATG
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CTTTCAAAGATCATTTGCTTGCTAGAAGAGAAACAAGAAAAGAAGGAGAAACTGACTTGG
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TTAAGTCATCGCTTTTGGAAGGCATACTAGTGGGAATCGTTTTCCTTCTCATCCTCATCA
GTGGACTTTGTTGTATGGCCGGTATCGATACACCAACTAGATTCGAGACTCCTCAAGATT
CTTGAGCAGTTGACTTCTAAAAGAGTCATCCCCACCTTTTGCTTTGCTTTTGCTTGTGGA
CGGGTCTTTCTTTTCTTCTGCATAGTGCGTATGGTGAAAAAGGTATCTCAATGTCGATTG
TTACATCTCAAAAACAAAAATGGATATGCGATAAAAAAATCCCCTTGTAACATTTATTCA
TCTTGTTTGTGAGTCTTTCCTTAACGTTATAAATTAATAATGGAGAACGAGTAAAAGAAC
CT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1CB48TF U 1
AF RS1FT69JQ C 669
AF RS1FT69TF U 590
AF RS1CB48JQ C 504
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BS 680 1256 RS1FT69TF
BS 1257 1262 RS1CB48JQ

RD RS1CB48TF 635 0 0
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CGAAGATGATGAAGATGCAGCGAATTGGTGTGGTGGCGTTTATGGTGGCTCTATCTGCGA
TTGAATTTGGATTGACTTCTGCCAATACCGTTCCTGCTTTCCTCTGGTCTCCGCATCTCC
AGCGTGTTAATGGTGAAGTGGATGAGGGTGTAAACTATCAGGTGATGTCTGCGAAGGATC
TAGTAGGCTCTGTTTTCACTCAAGGAGGATGGTCTAACTTTCTGTGCTCGGAGAAGAAAG
TTGAGCAAGCTGTTGACGTTGCACTTGTGTTCATCGGCAGAGAGTTACTGTCTTCTGATG
TTTCCTCGAAAAAGAATTCGGACCCTGCCCTTGTCAACACACTGAATAGTCTGTTTACTG
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CTTTGTTGCTTTCAGGGCTTAGAGAAGCTTGCCCAAACAATGTAGGAGTCAGCAATATTG
TCTTCTCTGATTCTTGCTTTGTTGAAGATGGAACAGTTCAGAAACTATCTGACTTGCAGT
CTTTCAAAGATCATTTGCTTGCTAGAAGAGAAACA

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GTTCTGAG
GG*TTCCCAATCAATTAGTGAATCTGGCCACTCACATTCAGAGCGTGAAAGCATTTCGGA
ACTTGTTAGTTCTGTAGAACAATCTGGCAGTAAATACACAGCTCTTTATGTTTTTGATCC
TTATTGGTACACATTTTACAAAACTCTCCAAAGGTTTTTAGCTGAAAGCGCTACAGGAAA
CAGCAGTGTTGGTGTTTCCACAACCTGTGATGAACTTTGCAAATTTAAGTCATCGCTTTT
GGAAGGCATACTAGTGGGAATCGTTTTCCTTTTCATCCTCATCAGTGGACTTTGTTGTAT
GGCCGGTATCGATACACCAACTAGATTCGAGACTCCTCAAGATTCTTGAGCAGTTGACTT
CTAAAAGAGTCATCCCCCCCTTTTGCTTTGCTTTTGCTTGTGGACGGGTCTTTCTTTTTT
TTTGCATAGTGCGTATGGTGAAAAAGGTATCTCAATGTCGATTGTTACATCTCAAAAACA
AAAATGGATATGCGATAAAAAAATCCCCTTGTAACATTTATTCATCTTGTTTGTGAGTCT
TTCCTTAACGTTATAAATTAATAATGGAGAACGAGTAAAA
GAACC

QA 9 588 9 588
DS 

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G
GACTTGCAGTCTTTCAAAGATCATTTGCTTGCTAGAAGAGAAACAATAAAAGAAGGAGAA
ACTGACTTGGTTGTGCTCTGTTCTGAGGGTTCCCAATCAATTAGTGAATCTGGCCACTCA
CATTCAGAGCGTGAAAGCATTTCGGAACTTGTTAGTTCTGTAGAACAATCTGGCAGTAAA
TACACAGCTCTTTATGTTTCTGATCCTTATTGGTACACATCTTACAAAACTCTCCAAAGG
TTTCTAGCTGAAAGCGCTACAGGAAACAGCAGTGTTGGTGTTTCCACAACCTGTGATGAA
CTCTGCAAATTTAAGTCATCGCTTTTGGAAGGCATACTAGTGGGAATCGTTTTCCTTCTC
ATCCTCATCAGTGGACTTTGTTGTATGGCCGGTATCGATACACCAACTAGATTCGAGACT
CCTCAAGATTCTTGAGCAGTTGACTTCTAAAAGAGTCATCCCCACCTTTTGCTTTGCTTT
TGCTTGTGGACGGGTCTTTCTTTTCTTCTGCATAGTGCGTATGGTGAAAAAGGTATCTCA
ATGTCGATTGTTACATCTCAAAAACAAAAATGGATATGCGATAAAAAAATCCCCTTGTAA
CATTTATTCATCTTGTTTGTGAGTCTTTCCTTAACGTTATAAATTAATAATGGAGAACGA
GTAAAA

QA 2 667 2 667
DS 

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GAAGATGGAACAGTTCAGAAACTATCTGACTTGCAGTCTTTCAAAGATCATTTGCTTGCT
AGAAGAGAAACAAGAAAAGAAGGAGAAACTGACTTGGTTGTGCTCTGTTCTGAGG*TTCC
CAATCAATTAGTGAATCTGGCCACTCACATTCAGAGCGTGAAAGCATTTCGGAACTTGTT
AGTTCTGTAGAACAATCTGGCAGTAAATACACAGCTCTTTATGTTTCTGATCCTTATTGG
TACACATCTTACAAAACTCTCCAAAGGTTTCTAGCTGAAAGCGCTACAGGAAACAGCAGT
GTTGGTGTTTCCACAACCTGTGATGAACTCTGCAAATTTAAGTCATCGCTTTTGGAGGGC
ATACTAGTGGGAATCGTTTTCCTTCTCATCCTCATCAGTGGACTTTGTTGTATGGCCGGT
ATCGATACACCAACTAGATTCGAGACTCCTCAAGATTCTTGAGCAGTTGACTTCTAAAAG
AGTCATCCCCACCCTTTGCTTTGCTTTTGCTTGTGGACGGGTCTTTCTTTTCTTCTGCAT
AGTGCGTATGGTGAAAAAGGTATCTCAATGTCGATTGTTACATCTCAAAAACAAAAATGG
ATATGCGATAAAAAAATCCCCTTGTAACATTTATTCATCTTGTTTGTGAGTCTTTCCTTA
ACGTTATAAATTAATAATGGAGAACGAGTAAAAGAACCT

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 4

CO CL2032Contig1 782 4 7 U
AGGGTCATAATTCACCTATTTTTTGGTGGACATATATAGATAGAATCTCAAACAAACAGC
ATAACATTCAAGTCATAGGCAAATATCAAAAGCTTCAAATGATGTTTTATATATACATTA
TCCCTTCTATCAATACAAATTGACCGTGGTTCCCTCCAACTTCTCTCTCTCTCTCTCTCT
CTCTTCACATCACACAACATTTAGCTGGTCCCTTTGGATCTGCCCTAGCTTCCTCGGTAC
CTTCCGGGGGTTGAGCTAGATTGCGGTTATGGGAAGTCATCATTTCTTTTTTTCAGCTTA
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GGTTCAACCACTCCAGTTTCAGGGTTGACACAAGCCATGTTGATCCGGGTCTGGAACCTG
ACAGTTGGTGGACTTTCAGGGTATTCCTTGCCACAGAAGAGCTTCAGCTGGAAGATTTTC
CCTTCGTATGCAGTATTGTGAGGGCCGAGAATGGTGCCAGTCCAGGACTGCATATAGATG
TCATCAGCATCGTCCATTCCATAGCTTACCGTACCATCTCCGATCCCTTTCTCACCTCTC
TCTAGCTCCTCCAACAATCTAAAGTTCCTCGGAACGACGACCTTAGCTTCCTCCGTAGTC
ATGGCCTGGATCGTGGAAGAGTTTCAGGTGAAATGATAAGGTTAGGTGTGTGTGTGTGAG
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CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1F869JQ U 1
AF RS1F869TF C 36
AF RS1CZ26JQ U 25
AF RS1CZ26TF C 216
BS 1 259 RS1F869JQ
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RD RS1F869JQ 458 0 0
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ATAACATTCAAGTCATAGGCAAATATCAAAAGCTTCAAATGATGTTTTATATATACATTA
TCCCTTCTATCAATACAAATTGACCGTGGTTCCCTCCAACTTCTCTCTCTCTCTCTCTCT
CTCTTCACATCACACAACATTTAGCTGGTCCCTTTGGATCTGCCCTAGCTTCCTCGGTAC
CTTCCGGGGGTTGAGCTAGCTTGCGGTTATGGGAAGTCATCATTTCTTTTTT*CAGCTTA
AACAGAATGTCCTCCATTGTGTATTCTCGCCTCCAGTTTGCGAGCATAGGGAAGAGGCTC
GGTTCAACCACTCCAGTTTCAGGGTTGACACAAGCCATGTTGATCCGGGTCTGGAACCTG
ACAGTTGGTGGACTTTCAGGGTATTCCTTGCCACAGAA

QA 1 458 1 458
DS 

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CCAACTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCACATCACACAACATTTAGCTGGTCCCTTT
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GTCATCATTTCTTTTTT*CAGCTTAAACAGAATGTCCTCCATTGTGTATTCTCGCCTCCA
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ATAAGGTTAGGTGTGTGTGT
CC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RS1CZ26JQ 746 0 0
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ATCAAAAGCTTCAAATGATGTTTTATATATACATTATCCCTTCTATCAATACAAATTGAC
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CTGGTCCCTTTGGATCTGCCCTAGCTTCCTCGGTACCTTCCGGGGGTTGAGCTAGATTGC
GGTTATGGGAAGTCATCATTTCTTTTTTTCAGCTTAATCAGAATGTCCTCCATTGTGTAT
TCTCGCCTCCAGTTTGCGAGCATAGGGAAGAGGCTCGGTTCAACCACTCCAGTTTCAGGG
TTGACACAAGCCATGTTGATCCGGGTCTGGAACCTGACAGTTGGTGGACTTTCAGGGTAT
TCCTTGCCACAGAAGAGCTTCAGCTGGAAGATTTTCCCTTCGTATGCAGTATTGTGAGGG
CCGAGAATGGTGCCAGTCCAGGACTGCATATAGATGTCATCAGCATCGTCCATTCCATAG
CTTACCGTACCATCTCCGATCCCTTTCTCACCTCTCTCTAGCTCCTCCAACAATCTAAAG
TTCCTCGGAACGACGACCTTAGCTTCCTCCGTAGTCATGGCCTGGATCGTGGAAGAGTTT
CAGGTGAAATGATAAGGTTAGGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAAATCAACAATCAATAGCTA
AAGAGAGAGAGGGAGACAGTTCACCG

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1CZ26TF 567 0 0
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GTCATCATTTCTTTTTTTCAGCTTAATCAGAATGTCCTCCATTGTGTATTCTCGCCTCCA
GTTTGCGAGCATAGGGAAGAGGCTCGGTTCAACCACTCCAGTTTCAGGGTTGACACAAGC
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GAAGAGCTTCAGCTGGAAGATTTTCCCTTCGTATGCAGTATTGTGAGGGCCGAGAATGGT
GCCAGTCCAGGACTGCATATAGATGTCATCAGCATCGTCCATTCCATAGCTTACCGTACC
ATCTCCGATCCCTTTCTCACCTCTCTCTAGCTCCTCCAACAATCTAAAGTTCCTCGGAAC
GACGACCTTAGCTTCCTCCGTAGTCATGGCCTGGATCGTGGAAGAGTTTCAGGTGAAATG
ATAAGGTTAGGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAAATCAACAATCAATAGCTAAAGAGAGAGAG
GGAGACAGTTCACCGTAAGGATTGGCC

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 4

CO CL2033Contig1 681 4 1 U
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GAAACGTAAGAAAGCTGAGAACTTTAAGTCGAAACAAGTGAAGCCGCCACAGACAATGAA
GGAGGAGCTGTTTGTAAGATCACCAGCAACGAGGAACAGCAAAGTTTCATCGAAGCTCAG
AGAAACGCGATCATCAAGAAACAGAGCATCAACAACAGAGTTCACTACTTTTCGGAGCCA
AACGCAAACGCAGATTGCACCGATCACCAAACGCACAGTGGTTCTCGAAGATGTTGATGA
AATGGTGGCCGGAGAATTCCCGGCGACGGCGACACTGTCGGAGCTGGTGGCGTCTGAAGG
CGAAGGAATCGTGACGGAGCTCGAGAGAGGAATCTTCGAAGCCCTCGTGGCCGAAACGAC
CGCGTATTATTACGACACGTGGAGCAAACCGGCGCCGTTTATGAGAAACGATGATGTAAG
TGGCACGTGGGGAGTTCACGTGCCGAGATGCCATTCAAAGGTGGGGACCCACCATGACTC
GTCCTCTTTGTTTCGCGAAAGGAGATTGAGGTGTCCACGTGGGTAAATTATCGATTGGCT
TTTATTTGTATAGATTTTGATTTATATTGATTTTCAAATAACTTTGTTGCCGTTAATAAC
CTAAAATAAAATAATATTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

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AF RS1A193TR C 50
AF RS1A193TV U 38
AF RS1A193JQ C 50
BS 1 681 RS1A193TF

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CGAAGGAATCGTGACGGAGCTCGAGAGAGGAATCTTCGAAGCCCTCGTGGCCGAAACGAC
CGCGTATTATTACGACACGTGGAGCAAACCGGCGCCGTTTATGAGAAACGATGATGTAAG
TGGCACGTGGGGAGTTCACGTGCCGAGATGCCATTCAAAGGTGGGGACCCACCATGACTC
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CTAAAATAAAATAATATTTTC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RS1A193TR 632 0 0
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TTTCGGAGCCAAACGCAAACGCAGATTGCACCGATCACCAAACGCACAGTGGTTCTCGAA
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GCGTCTGAAGGCGAAGGAATCGTGACGGAGCTCGAGAGAGGAATCTTCGAAGCCCTCGTG
GCCGAAACGACCGCGTATTATTACGACACGTGGAGCAAACCGGCGCCGTTTATGAGAAAC
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CACCATGACTCGTCCTCTTTGTTTCGCGAAAGGAGATTGAGGTGTCCACGTGGGTAAATT
ATCGATTGGCTTTTATTTGTATAGATTTTGATTTATATTGATTTTCAAATAACTTTGTTG
CCGTTAATAACCTAAAATAAAATAATATTTTC

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1A193TV 644 0 0
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GTGAAGCCGCCACAGACAATGAAGGAGGAGCTGTTTGTAAGATCACCAGCAACGAGGAAC
AGCAAAGTTTCATCGAAGCTCAGAGAAACGCGATCATCAAGAAACAGAGCATCAACAACA
GAGTTCACTACTTTTCGGAGCCAAACGCAAACGCAGATTGCACCGATCACCAAACGCACA
GTGGTTCTCGAAGATGTTGATGAAATGGTGGCCGGAGAATTCCCGGCGACGGCGACACTG
TCGGAGCTGGTGGCGTCTGAAGGCGAAGGAATCGTGACGGAGCTCGAGAGAGGAATCTTC
GAAGCCCTCGTGGCCGAAACGACCGCGTATTATTACGACACGTGGAGCAAACCGGCGCCG
TTTATGAGAAACGATGATGTAAGTGGCACGTGGGGAGTTCACGTGCCGAGATGCCATTCA
AAGGTGGGGACCCACCATGACTCGTCCTCTTTGTTTCGCGAAAGGAGATTGAGGTGTCCA
CGTGGGTAAATTATCGATTGGCTTTTATTTGTATAGATTTTGATTTATATTGATTTTCAA
ATAACTTTGTTGCCGTTAATAACCTAAAATAAAATAATATTTTC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1A193JQ 632 0 0
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CAGACAATGAAGGAGGAGCTGTTTGTAAGATCACCAGCAACGAGGAACAGCAAAGTTTCA
TCGAAGCTCAGAGAAACGCGATCATCAAGAAACAGAGCATCAACAACAGAGTTCACTACT
TTTCGGAGCCAAACGCAAACGCAGATTGCACCGATCACCAAACGCACAGTGGTTCTCGAA
GATGTTGATGAAATGGTGGCCGGAGAATTCCCGGCGACGGCGACACTGTCGGAGCTGGTG
GCGTCTGAAGGCGAAGGAATCGTGACGGAGCTCGAGAGAGGAATCTTCGAAGCCCTCGTG
GCCGAAACGACCGCGTATTATTACGACACGTGGAGCAAACCGGCGCCGTTTATGAGAAAC
GATGATGTAAGTGGCACGTGGGGAGTTCACGTGCCGAGATGCCATTCAAAGGTGGGGACC
CACCATGACTCGTCCTCTTTGTTTCGCGAAAGGAGATTGAGGTGTCCACGTGGGTAAATT
ATCGATTGGCTTTTATTTGTATAGATTTTGATTTATATTGATTTTCAAATAACTTTGTTG
CCGTTAATAACCTAAAATAAAATAATATTTTC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 3

CO CL2034Contig1 991 3 5 U
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ACAAAGAACAGTGACTCGTTTTCAAGTAAAATGAAAAAAGAAGCAGAATCGTATTAATAT
AAAATTATTATAACAGTTATTAAAGATAGTCAACATTAATATTAAATTAAAGATTTCTTA
CGAAACTATTGCAACTACTGGTCTCTTCATCAGAAGAGAAGAGCTCCGTCGTGAGTCCAC
TTGAAGCGTGGTCGGAAGAAGGAGAGCTAGGTAAAAGGTTCAAGTCTGTGGTCCTTTCTT
TTCTCATGAAGTCGAAGAAGATTGGTTTAGTTTTATCTTCGGTTTGGTTCGTTGTAATTA
TTTCAATTTGGTCATTATCATATCTAATACTCCGGTTATCTCCGTCGTCGTCGTCGCTCT
TGTTACCAGCTCTCTTTTTAAGGAAGATACGACAAAGAACCCAGTTCTGAGTAGGACCCA
TTGAACTCGGTGGGGAAGAAGATAGACGATATTCGTGCATGATCCAATCGGTTCTTGAGC
CATGAGGTGGTTTGCCTTTGTAGAAAACGAGTGTTTTCTTCAAACCAACGATTTGATTTC
CTCTAGAGGTCACTACCCGTTTATCAATACCGGTAGCTTTCCAATAACCCGAACCCGTTG
CTCTATTAGACCGGTTCCCATTTGGGTACTTAGCTTCCCTTGTGCTGAAGAAGTACCTCT
CCTTCTCCAAATTGCCAGGCAAGTCCCAAGGATCAGCTCTGCAAACATCAAAGTCAGGAA
TGATGGAAGCTGGTAATGGAGAACACAAGACTTTTCTCTTGAGATACTGAACCACAAGCT
CTTCATCAGTGGGATGAAATCTGAATCCAGGTGGCAATCTCATAACACCATTCTTTACGA
GTTTAACCTTATCCATAGTTCCAAACAAAATGGAGAGATAAATGAGAGAGAGAGAGAGAG
GGGGAAGAAGAAGACAGAGTGCGGTGTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DJ33JQ U 1
AF RS1GI02JQ U 102
AF RS1DJ33TF C 303
BS 1 180 RS1DJ33JQ
BS 181 181 RS1GI02JQ
BS 182 689 RS1DJ33JQ
BS 690 746 RS1GI02JQ
BS 747 991 RS1DJ33TF

RD RS1DJ33JQ 689 0 0
GCTACATTTTTCATGCAATTCAATAGTTCACGAAATATATGTTTTAGGAAAATATATGAA
ACAAAGAACAGTGACTCGTTTTCAAGTAAAATGAAAAAAGAAGCAGAATCGTATTAATAT
AAAATTATTATAACAGTTATTAAAGATAGTCAACATTAATATTAAATTAAAGATTTCTTA
TGAAACTATTGCAACTACTGGTCTCTTCATCAGAAGAGAAGAGCTCCGTCGTGAGTCCAC
TTGAAGCGTGGTCGGAAGAAGGAGAGCTAGGTAAAAGGTTCAAGTCTGTGGTCCTTTCTT
TTCTCATGAAGTCGAAGAAGATTGGTTTAGTTTTATCTTCGGTTTGGTTCGTTGTAATTA
TTTCAATTTGGTCATTATCATATCTAATACTCCGGTTATCTCCGTCGTCGTCGTCGCTCT
TGTTACCAGCTCTCTTTTTAAGGAAGATACGACAAAGAACCCAGTTCTGAGTAGGACCCA
TTGAACTCGGTGGGGAAGAAGATAGACGATATTCGTGCATGATCCAATCGGTTCTTGAGC
CATGAGGTGGTTTGCCTTTGTAGAAAACGAGTGTTTTCTTCAAACCAACGATTTGATTTC
CTCTAGAGGTCACTACCCGTTTATCAATACCGGTAGCTTTCCAATAACCCGAACCCGTTG
CTCTATTAGACCGGTTCCCATTTGGGTAC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1GI02JQ 645 0 0
G
GCAGAATCGTATTAATATAAAATTATTATAACAGTTATTAAAGATAGTCAACATTAATAT
TAAATTAAAGATTTCTTCCGAAACTATTGCAACTACTGGTCTCTTCATCAGAAGAGAAGA
GCTCCGTCGTGAGTCCACTTGAAGCGTGGTCGGAAGAAGGAGAGCTAGGTAAAAGGTTCA
AGTCTGTGGTCCTTTCTTTTCTCATGAAGTCGAAGAAAATTGGTTTAGTTTTATCTTCGG
TTTGGTTCGTTGTAATTATTTCAATTTGGTCATTATCATATATAATACTCCGGTTATCTC
CGTCGTCGTCGTCGCTCTTGTTACCAGCTCTCTTTTTAAGGAAGATACGACAAAGAACCC
AGTTCTGAGTAGGACCCATTGAACTCGGTGGGGAAGAAGATAGACGATATTCGTGCATGA
TCCAATCGGTTCTTGAGCCATGAGGTGGTTTGCCTTTGTAGAAAACGAGTGTTTTCTTCA
AACCAACGATTTGATTTCCTCTAGAGGTCACTACCCGTTTATCAATACCGGTAGCTTTCC
AATAGCCCGAACCCGTTGCTCTATTAGACCGGTTCCCATTTGGGTACTTAGCTTCCCTTG
TGCTGAAGAAGTACCTCTCCTTCTCCAAATTGCCAGGCAAGTCC

QA 2 645 2 645
DS 

RD RS1DJ33TF 689 0 0
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TCAATTTGGTCATTATCATATCTAATACTCCGGTTATCTCTGTCGTCGTCGTCGCTCTTG
TTACCAGCTCTCTTTTTAAGGAAGATACGACAAAGAACCCAGTTCTGAGTAGGACCCATT
GAACTCGGTGGGGAAGAAGATAGACGATATTCGTGCATGATCCAATCGGTTCTTGAGCCA
TGAGGTGGTTTGCCTTTGTAGAAAACGAGTGTTTTCTTCAAACCAACGATTTGATTTCCT
CTAGAGGTCACTACCCGTTTATCAATACCGGTAGCTTTCCAATAACCCGAACCCGTTGCT
CTATTAGACCGGTTCCCATTTGGGTACTTAGCTTCCCTTGTGCTGAAGAAGTACCTCTCC
TTCTCCAAATTGCCAGGCAAGTCCCAAGGATCAGCTCTGCAAACATCAAAGTCAGGAATG
ATGGAAGCTGGTAATGGAGAACACAAGACTTTTCTCTTGAGATACTGAACCACAAGCTCT
TCATCAGTGGGATGAAATCTGAATCCAGGTGGCAATCTCATAACACCATTCTTTACGAGT
TTAACCTTATCCATAGTTCCAAACAAAATGGAGAGATAAATGAGAGAGAGAGAGAGAGGG
GGAAGAAGAAGACAGAGTGCGGTGTATCC

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 4

CO CL2035Contig1 988 4 6 U
GGGAAAGGTATCCTCGCCAAGGACAAGTCTCCGCCGCCTCTACCGAAATCAGGAACGAAG
CGGCCGAGTGAAGAGACCTCAAGGGAGACGAACTCGAAGCGAGAGAAGAAGACAGGCGAA
GACTCAAAGAAGCCAGCTGCTTTCCAGAGACTATGGACTGAAGACGACGAGATCTCTGTC
TTACAAGGTATGATCGATTTCAAGAACGATACAGGCAACTCTCCTTACGACGACACTAAT
GCTTACTATGATCACATGAAGAAATTTATTAGCTTTGAGGTTAGTAAGAACCAGTTCATG
GATAAGCTTAGGAGTTTAAAGAAGAAGTATATGGGTAAAGAGAAGCCTTCTTTCACTAAA
CCTCATGATCAGAAGTCTTTTACATTGTGCAAGTTTATCTGGGGACCTGATGGGATGTGT
CTTGAGACTGCTGTTAAGTCCAATGGTGTCTCCAAAAAGAAGACCAACTCTGTCAAGCAA
GACCCTTCTTCTCCCAATGTTGATGATATGAGAGTCTTGGTTCATGAATCTGATTGGTTT
GAGAGATCTTTTCTTGTTAGAGGGATTGCGGGTTTTGGTGTCGATGAGCATTTTGTGAAA
CAGAGTTGGAGGTTAGTCCCGGTTGAGACCAAGAAGAAAGTTGAAGAGAAGGTTAAGATG
TTGCAGGCTAAGGAAATTGAGTTTGTCTTGCACAAGACTCAGATTTTGCATGAAGTTACC
TCTATGATCGCTGAAGCATCCAAGAACAAGCCATTATAATGATATATTTGATCCCGTTTC
AATGCCAATGTCTTTTGTTTTGATGGCTTTCTCTCATATGAAAACTCTATATTATTAGGT
TTTTTACTCACATATAAAAACACCATAAAAACAAAGTACTGTCAAGCTTGTGGCAACTTT
TGCTTGGTTCTTTCGGTGTTTTTTTT*GGATATTTCAAATGTAAGGGAACTGTTGGGTAT
TTTTTGAAATACAGTTAAGTTTTTGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RS1BN62TF U 1
AF RS1BN62JQ C 249
AF RS1FJ55JQ C 464
AF RS1FJ55TF U 464
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BS 407 407 RS1BN62JQ
BS 408 452 RS1BN62TF
BS 453 464 RS1BN62JQ
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BS 987 988 RS1BN62JQ

RD RS1BN62TF 452 0 0
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CGGCCGAGTGAAGAGACCTCAAGGGAGACGAACTCGAAGCGAGAGAAGAAGACAGGCGAA
GACTCAAAGAAGCCAGCTGCTTTCCAGAGACTATGGACTGAAGACGACGAGATCTCTGTC
TTACAAGGTATGATCGATTTCAAGAACGATACAGGCAACTCTCCTTACGACGACACTAAT
GCTTACTATGATCACATGAAGAAATTTATTAGCTTTGAGGTTAGTAAGAACCAGTTCATG
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CCTCATGATCAGAAGTCTTTTACATTGTGCAAGTTTATCTGGGGAC*TGATGGGATGTGT
CTTGAGACTGCTGTTAAGTCCAATGGTGTCTC

QA 1 452 1 452
DS 

RD RS1BN62JQ 740 0 0
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TGCTGTTAAGTCCAATGGTGTCTCCAAAAAGAAGACCAACTCTGTCAAGCAAGACCCTTT
TTCTCCCAATGTTGATGATATGAGAGTCTTGGTTCATGAATCTGATTGGTTTGAGAGATC
TTTTCTTGTTAGAGGGATTGCGGGTTTTGGTGTCGATGAGCATTTTGTGAAACAGAGTTG
GAGGTTAGTCCCGGTTGAGACCAAGAAGAAAGTTGAAGAGAAGGTTAAGATGTTGCAGGC
TAAGGAAATTGAGTTTGTCTTGCACAAGACTCAGATTTTGCATGAAGTTACCTCTATGAT
CGCTGAAGCATCCAAGAACAAGCCATTATAATGATATATTTGATCCCGTTTCAATGCCAA
TGTCTTTTGTTTTGATGGCTTTCTCTCATATGAAAACTCTATATTATTAGGTTTTTTACT
CACATATAAAAACACCATAAAAACAAAGTACTGTCAAGCTTGTGGCAACTTTTGCTTGGT
TCTTTCGGTGTTTTTTTTTGGATATTTCAAATGTAAGGGAACTGTTGGGTATTTTTTGAA
ATACAGTTAAGTTTTTGGCT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RS1FJ55JQ 525 0 0
G
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TGAATCTGATTGGTTTGAGAGATCTTTTCTTGTTAGAGGGATTGCGGGTTTTGGTGTCGA
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TTTGCATGAAGTTACCTCTATGATCGCTGAAGCATCCAAGAACAAGCCATTATAATGATA
TATTTGATCCCGTTTCAATGCCAATGTCTTTTGTTTTGATGGCTTTCTCTCATATGAAAA
CTCTATATTATTAGGTTTTTTACTCACATATAAAAACACCATAAAAACAAAGTACTGTCA
AGCTTGTGGCAACTTTTGCTTGGTTCTTTCGGTGTTTTTTTT*GGATATTTCAAATGTAA
GGGAACTGTTGGGTATTTTTTGAAATACAGTTAAGTTTTTGG
GT

QA 2 523 2 523
DS 

RD RS1FJ55TF 525 0 0
G
CAACTCTGTCAAGCAAGACCCTTCTTCTCCCAATGTTGATGATATGAGAGTCTTGGTTCA
TGAATCTGATTGGTTTGAGAGATCTTTTCTTGTTAGAGGGATTGCGGGTTTTGGTGTCGA
TGAGCATTTTGTGAAACAGAGTTGGAGGTTAGTCCCGGTTGAGACCAAGAAGAAAGTTGA
AGAGAAGGTTAAGATGTTGCAGGCTAAGGAAATTGAGTTTGTCTTGCACAAGACTCAGAT
TTTGCATGAAGTTACCTCTATGATCGCTGAAGCATCCAAGAACAAGCCATTATAATGATA
TATTTGATCCCGTTTCAATGCCAATGTCTTTTGTTTTGATGGCTTTCTCTCATATGAAAA
CTCTATATTATTAGGTTTTTTACTCACATATAAAAACACCATAAAAACAAAGTACTGTCA
AGCTTGTGGCAACTTTTGCTTGGTTCTTTCGGTGTTTTTTTT*GGATATTTCAAATGTAA
GGGAACTGTTGGGTATTTTTTGAAATACAGTTAAGTTTTTGG
GT

QA 2 523 2 523
DS 



AS 1 4

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AGATATGAAGTTTGGGGATATGGCATCGGCCTTTAGATCACCCACAAGGTTGATTCTTGT
ATTCGGTGTATTGGTTTTGTGCTCGGTTTCTCCTGCTCAAAGTTGGAGTAAAGAAGGTCA
TATTCTTACATGCCGAATTGCTCAAAAACTTTTAGAAGCAGGACCGGCACATATCGTAGA
GAATCTATTACCGGATTACGCGAAAGGAGATTTATCGTCATTATGTGTATGGCCAGACCA
AATCCGACATTGGTACAAGTACCGTTGGACCAGCCCTCTCCATTTCATCGACACTCCCGA
CCAAGCCTGCTCTTACGAATACTCCAGGGATTGTCATGATCAACATGGGTTAAAGGATAT
GTGTGTGGATGGAGCAATTCAAAATTTCACGTCTCAGCTTCAGCATTACGGTGAAGGAAC
ATCTGACCGTCGATACAACATGACAGAAACCCTTTTGTTCCTGTCTCATTTCATGGGAGA
CATTCATCAGCCGATGCATGTTG*ATTCACAAGTGATGAAGGAGGAAACACGATAGATCT
ACGTTGGTACAGACACAAATCAAATTTACATCATGTATGGGACAGGGAGATCATTCTCAC
GGCTCTAAAAGAATACTACGACAAGGACTTGGATCTTCTCCAAGAAGATCTTGAGAAGAA
CATCACCAATGGATTATGGCATGACGATCTATCTTCGTGGACAGAATGCAACGACCTCAT
CGCTTGTCCACACAAGTATGCGTCGGAGAGTATAAAGTTAGCTTGTAAATATGGCTACGA
AGGCGTGAAGTCGGGTGAAACGTTATCAGAGGAGTATTTCGATACAAGGATGCCAATAGT
GATGAAGAGAATTGTTCAAGGAGGAGTTAGACTAGCAATGATACTAAACCGGGTTTTTAG
TGATACTCATGCTGAAGTTGCTGCCACTTGAACCAAACCCGGACCAGACCGGATCACCAA
GGCATTTGATTAGGAGATTATTTGCTCATTTCACAAAGTTAAAATAAGACTGATCGGATA
TTCTTTTCTTTGTAGCCATTTCCATTTGACAGCTAATTATTGCCCGTGGGCTACTTTTTA
AAAATAGATGTGTTTAGGATTAGAGGTCATATGCTAATTTCGTGTGTTTGTTTTATATAC
TATGAAATTTTAAAATAAATAAGAAATCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BL90TF U 1
AF RS1AC68TF U 11
AF RS1AC68JQ C 697
AF RS1BL90JQ C 517
BS 1 43 RS1BL90TF
BS 44 44 RS1AC68TF
BS 45 64 RS1BL90TF
BS 65 65 RS1AC68TF
BS 66 495 RS1BL90TF
BS 496 496 RS1AC68TF
BS 497 837 RS1BL90TF
BS 838 842 RS1AC68TF
BS 843 843 RS1BL90JQ
BS 844 854 RS1AC68TF
BS 855 855 RS1BL90JQ
BS 856 880 RS1AC68TF
BS 881 999 RS1BL90JQ
BS 1000 1000 RS1AC68JQ
BS 1001 1230 RS1BL90JQ

RD RS1BL90TF 837 0 0
TAGGGAGTTGTTGTAAACAAGAGAACATAGAGAAGACACTCTTGCTCTACGTAAAAGAAG
AGATTTGAAGTTTGGGGATATGGCATCGGCCTTTAGATCACCCACAAGGTTGATTCTTGT
ATTCGGTGTATTGGTTTTGTGCTCGGTTTCTCCTGCTCAAAGTTGGAGTAAAGAAGGTCA
TATTCTTACATGCCGAATTGCTCAAAAACTTTTAGAAGCAGGACCGGCACATATCGTAGA
GAATCTATTACCGGATTACGCGAAAGGAGATTTATCGTCATTATGTGTATGGCCAGACCA
AATCCGACATTGGTACAAGTACCGTTGGACCAGCCCTCTCCATTTCATCGACACTCCCGA
CCAAGCCTGCTCTTACGAATACTCCAGGGATTGTCATGATCAACATGGGTTAAAGGATAT
GTGTGTGGATGGAGCAATTCAAAATTTCACGTCTCAGCTTCAGCATTACGGTGAAGGAAC
ATCTGACCGTCGATATAACATGACAGAAACCCTTTTGTTCCTGTCTCATTTCATGGGAGA
CATTCATCAGCCGATGCATGTTG*ATTCACAAGTGATGAAGGAGGAAACACGATAGATCT
ACGTTGGTACAGACACAAATCAAATTTACATCATGTATGGGACAGGGAGATCATTCTCAC
GGCTCTAAAAGAATACTACGACAAGGACTTGGATCTTCTCCAAGAAGATCTTGAGAAGAA
CATCACCAATGGATTATGGCATGACGATCTATCTTCGTGGACAGAATGCAACGACCTCAT
CGCTTGTCCACACAAGTATGCGTCGGAGAGTATAAAGTTAGCTTGTAAATATGGCTA

QA 1 837 1 837
DS 

RD RS1AC68TF 870 0 0
GG
GTAAACAAGAGAACATAGAGAAGACACTCTTACTCTACGTACAAGAAGAGATATGAAGTT
TGGGGATATGGCATCGGCCTTTAGATCACCCACAAGGTTGATTCTTGTATTCGGTGTATT
GGTTTTGTGCTCGGTTTCTCCTGCTCAAAGTTGGAGTAAAGAAGGTCATATTCTTACATG
CCGAATTGCTCAAAAACTTTTAGAAGCAGGACCGGCACATATCGTAGAGAATCTATTACC
GGATTACGCGAAAGGAGATTTATCGTCATTATGTGTATGGCCAGACCAAATCCGACATTG
GTACAAGTACCGTTGGACCAGCCCTCTCCATTTCATTGACACTCCCGACCAAGCCTGCTC
TTACGAATACTCCAGGGATTGTCATGATCAACATGGGTTAAAGGATATGTGTGTGGATGG
AGCAATTCAAAATTTCACGTCTCAGCTTCAGCATTACGGTGAAGGAACATCTGACCGTCG
ATACAACATGACAGAAGCCCTTTTGTTCTTGTCTCATTTCATGGGAGACATTCATCAGCC
GATGCATGTCGGATTCACAAGTGATGAAGGAGGAAACACGATAGATCTACGTTGGTACAG
ACACAAATCAAATTTACATCATGTATGGGACAGGGAGATCATTCTCACGGCTCTAAAAGA
ATACTACGACAAGGACTTGGATCTTCTCCAAGAAGATCTTGAGAAGAACATCACCAATGG
ATTATGGCATGACGATCTATCTTCGTGGACAGAATGCAACGACCTCATCGCTTGTCCACA
CAAGTATGCGTCGGAGAGTATAAAGTTAGCTTGTAAATATGGCTACGAAG*CGTGAAGTC
GG*TGAAACGTTATCAGAGGAGTATTTC

QA 3 870 3 870
DS 

RD RS1AC68JQ 313 0 0
TCTCCAAGAAGATCTTGAGAAGAACATCACCAATGGATTATGGCATGACGATCTATCTTC
GTGGACAGAATGCAACGACCTCATCGCTTGTCCACACAAGTATGCGTCGGAGAGTATAAA
GTTAGCTTGTAAATATGGCTACGAAGGCGTGAAGTCGGGTGAAACGTTATCAGAGGAGTA
TTTCGATACAAGGATGCCAATAGTGATGAAGAGAATTGTTCAAGGAGGAGTTAGACTAGC
AATGATACTGAACCGGGTTTTTAGTGATACTCATGCTGAAGTTGCTGCCACTTGAACCAA
ACCCGGACCAGAC

QA 1 313 1 313
DS 

RD RS1BL90JQ 714 0 0
GTTCCTGTCTCATTTCATGGGAGACATTCATCAGCCGATGCATGTTG*ATTCACAAGTGA
TGAAGGAGGAAACACGATAGATCTACGTTGGTACAGACACAAATCAAATTTACATCATGT
ATGGGACAGGGAGATCATTCTCACGGCTCTAAAAGAATACTACGACAAGGACTTGGATCT
TCTCCAAGAAGATCTTGAGAAGAACATCACCAATGGATTATGGCATGACGATCTATCTTC
GTGGACAGAATGCAACGACCTCATCGCTTGTCCACACAAGTATGCGTCGGAGAGTATAAA
GTTAGCTTGTAAATATGGCTACGAAGGCGTGAAGTCGGGTGAAACGTTATCAGAGGAGTA
TTTCGATACAAGGATGCCAATAGTGATGAAGAGAATTGTTCAAGGAGGAGTTAGACTAGC
AATGATACTAAACCGGGTTTTTAGTGATACTCATGCTGAAGTTGCTGCCACTTGAACCAA
ACCGGGACCAGACCGGATCACCAAGGCATTTGATTAGGAGATTATTTGCTCATTTCACAA
AGTTAAAATAAGACTGATCGGATATTCTTTTCTTTGTAGCCATTTCCATTTGACAGCTAA
TTATTGCCCGTGGGCTACTTTTTAAAAATAGATGTGTTTAGGATTAGAGGTCATATGCTA
ATTTCGTGTGTTTGTTTTATATACTATGAAATTTTAAAATAAATAAGAAATCTG

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 4

CO CL2037Contig1 770 4 7 U
GGTGCACATTGTGTAACAGTGCCACTATGAGACATAACATTACTGAACAAAAGTACAATA
AAGAAAAACATCAATCAGGTTTCACACTGAAACAACTTTTTCATGTGCCTAGTTTGTTTA
TTCATCTGGATGTTTCATAGACATAAGCTTGAAAGGGCAGAGCAGTTCCTAGATAAACTC
ACAAATACTGTGTTAAGGCTTTTTCTTATGAGAGTTGAATTGGTTCGCCACATAGACTCT
CTAACTCCTCTTCCAACAGTTTATGCAACTTTGCTTCTGTTCGTCGATAAATCCACGCAT
TAGCATCACGGTCCCAGTCAAATCTAGAAGGACCACTGACAGGTGAAGACATCCATATCT
GCCGATTTGGGGTTTGCTTATTCATTACATACGTGCCTAAAGATCCAAGCTTAAGGGTGA
GAACTTCATTCCCATAGTCAATGTCGAAACCATCAATCTGGACATTATCACCATAATCCT
CAATCTTCTCAAGAAGGTCATTTATAGTGAAGTTGACTAATTTGTGAAACTCATCCTCCT
GCAAGACCGAACTATAATCGATAGGAGCAGGACCTTGAGAAGAGAAGCTTCTGGTAGTCA
TAGGAGAATCATGGCGGATACGAGATCCTAGTGGCTCGTTACTTTTGTGAGCAGGAAAGG
TTAAAACCCTCGTGCCATTGCTACGGAGAAGGGTTGTTGGAGGAAGCTTGAGAGACCTCT
GTAGTTTCCGGAGAAACCTTGAAGCTGTAGCCATGGCGGTTCCGGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1DL72JQ U 42
AF RS1EV62JQ U 1
AF RS1EV62TF C 111
AF RS1DL72TF C 112
BS 1 49 RS1EV62JQ
BS 50 50 RS1DL72JQ
BS 51 515 RS1EV62JQ
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BS 517 684 RS1EV62JQ
BS 685 769 RS1EV62TF
BS 770 770 RS1DL72TF

RD RS1DL72JQ 540 0 0
ACTGAACAAAAGTACAATAAAGAAAAACATCAATCAGGTTTCACACTGAAACAACTTTTT
CATGTGCCTAGTTTGTTTATTCATCTGGATGTTTCATAGACATAAGCTTGAAAGGGCGGA
GCAGTTCCTAGATAAACTCACAAATACTGTGTTAAGGCTTTTTCTTATGAGAGTTGAATT
GGTTCGCCACATAGACTCTCTAACTCCTCTTCCAACAGTTTATGCAACTTTGCTTCTGTT
CGTCGATAAATCCACGCATTAGCATCACGGTCCCAGTCAAATCTAGAAGGACCACTGACA
GGTGAAGACATCCATATCTGCCGATTTGGGGTTTGCTTATTCATTACATACGTGCCTAAA
GATCCAAGCTTAAGGGTGAGAACTTCATTCCCATAGTCAATGTCGAAACCATCAATCTGG
ACATTATCACCATAATCCTCAATCTTCTCAAGAAGGTCATTTATAGTGAAGTTGACTAAT
TTGTGAAACTCATCCTCCTGCAAGACCGAACTATAATCGATAGGAGCAGGACCTTGAGAA

QA 1 540 1 540
DS 

RD RS1EV62JQ 684 0 0
GGTGCACATTGTGTAACAGTGCCACTATGAGACATAACATTACTGAACAGAAGTACAATA
AAGAAAAACATCAATCAGGTTTCACACTGAAACAACTTTTTCATGTGCCTAGTTTGTTTA
TTCATCTGGATGTTTCATAGACATAAGCTTGAAAGGGCAGAGCAGTTCCTAGATAAACTC
ACAAATACTGTGTTAAGGCTTTTTCTTATGAGAGTTGAATTGGTTCGCCACATAGACTCT
CTAACTCCTCTTCCAACAGTTTATGCAACTTTGCTTCTGTTCGTCGATAAATCCACGCAT
TAGCATCACGGTCCCAGTCAAATCTAGAAGGACCACTGACAGGTGAAGACATCCATATCT
GCCGATTTGGGGTTTGCTTATTCATTACATACGTGCCTAAAGATCCAAGCTTAAGGGTGA
GAACTTCATTCCCATAGTCAATGTCGAAACCATCAATCTGGACATTATCACCATAATCCT
CAATCTTCTCAAGAAGGTCATTTATAGTGAAGTTGGCTAATTTGTGAAACTCATCCTCCT
GCAAGACCGAACTATAATCGATAGGAGCAGGACCTTGAGAAGAGAAGCTTCTGGTAGTCA
TAGGAGAATCATGGCGGATACGAGATCCTAGTGGCTCGTTACTTTTGTGAGCAGGAAAGG
TTAAAACCCTCGTGCCATTGCTAC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1EV62TF 659 0 0
A
GTTTGTTTATTCATCTGGATGTTTCATAGACATAAGCTTGAAAGGGCAGAGCAGTTCCTA
GATAAACTCACAAATACTGTGTTAAGGCTTTTTCTTATGAGAGTTGAATTGGTTCGCCAC
ATAGACTCTCTAACTCCTCTTCCAACAGTTTATGCAACTTTGCTTCTGTTCGTCGATAAA
TCCACGCATTAGCATCACGGTCCCAGTCAAATCTAGAAGGACCACTGACAGGTGAAGACA
TCCATATCTGCCGATTTGGGGTTTGCTTATTCATTACATACGTGCCTAAAGATCCAAGCT
TAAGGGTGAGAACTTCATTCCCATAGTCAATGTCGAAACCATCAATCTGGACATTATCAC
CATAATCCTCAATCTTCTCAAGAAGGTCATTTATAGTGAAGTTGGCTAATTTGTGAAACT
CATCCTCCTGCAAGACCGAACTATAATCGATAGGAGCAGGACCTTGAGAAGAGAAGCTTC
TGGTAGTCATAGGAGAATCATGGCGGATACGAGATCCTAGTGGCTCGTTACTTTTGTGAG
CAGGAAAGGTTAAAACCCTCGTGCCATTGCTACGGAGAAGGGTTGTTGGAGGAAGCTTGA
GAGACCTCTGTAGTTTCCGGAGAAACCTTGAAGCTGTAGCCATGGCGGTTCCGGTTTC

QA 2 659 2 659
DS 

RD RS1DL72TF 659 0 0
GTTTGTTTATTCATCTGGATGTTTCATAGACATAAGCTTGAAAGGGCGGAGCAGTTCCTA
GATAAACTCACAAATACTGTGTTAAGGCTTTTTCTTATGAGAGTTGAATTGGTTCGCCAC
ATAGACTCTCTAACTCCTCTTCCAACAGTTTATGCAACTTTGCTTCTGTTCGTCGATAAA
TCCACGCATTAGCATCACGGTCCCAGTCAAATCTAGAAGGACCACTGACAGGTGAAGACA
TCCATATCTGCCGATTTGGGGTTTGCTTATTCATTACATACGTGCCTAAAGATCCAAGCT
TAAGGGTGAGAACTTCATTCCCATAGTCAATGTCGAAACCATCAATCTGGACATTATCAC
CATAATCCTCAATCTTCTCAAGAAGGTCATTTATAGTGAAGTTGACTAATTTGTGAAACT
CATCCTCCTGCAAGACCGAACTATAATCGATAGGAGCAGGACCTTGAGAAGAGAAGCTTC
TGGTAGTCATAGGAGAATCATGGCGGATACGAGATCCTAGTGGCTCGTTACTTTTGTGAG
CAGGAAAGGTTAAAACCCTCGTGCCATTGCTACGGAGAAGGGTTGTTGGAGGAAGCTTGA
GAGACCTCTGTAGTTTCCGGAGAAACCTTGAAGCTGTAGCCATGGCGGTTCCGGTTTCC

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 3

CO CL2038Contig1 1472 3 13 U
GAATATCATATGTATAATCAATTATCAATGAAACATATAATAATATCATCTTTGTAGTTA
ATCATCACTCACAAAACCAACTTCATTCATATACTGGTAAAGGCAGTGATTACAGATTCT
GATAGTTTGCAAATTGAAATAAAAGTTTTCAAGAAAATGGAGCTGCAGCAGGTTTGAGGA
GAGGCTGTAGGGCCTTCACAACTATGCTCATATTTGGTCTAAATTCAGCTTCATATTGCA
CACACAATGCCGCCACCGCCGCTAGCTTAGCAACTGCTTTTGGAGGGTAATCCGCTAGCT
TTGGATCAATGCACTCTTTGACTTTATCTTCACTGAGTCTTGGTGTCGCCCAGGTGACAA
GACTTTGTTGACCACGAGGCATGTTATTATCGACAGGTTTCCTCCCAGTCAGAAGTTCTA
GAAGTACAACCCCAAAGCTGTACACATCACTCTTCTGAGTTAATTGTCCAGTCATTGCAT
ATTCAGGAGCATGATAACCAAAAGTTCCCAAGACTCTAGTAGAGTGAAGACGAGCAGCAT
TATCAGGCGATTGGTTTGAGAGATTGAAATCAGAAATCTTTGGTTTGTAGTCTTCGAAAA
GAAGAATATTGCTAGATCTTATGTCTTTGTGGATGACAGGAGGCTAAGACTTGTCATGAA
GGTATTCCAAACCCCTAGCCGCCTCAACTGCTATTTTCACCCTTGTTGTCCAGTCAAGTG
TTGGACCTGGCTGTGCCCCTTGAACTCCCTTCCTACCATGTAAGACGTCATGCAATGATC
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ACTGAACGAGATTCTCATGCTTCAGTATAGAAACCATGGAGACCTGACTCAAGAAGTCGG
CATCAGATTCAGCTTCAGGTGCGGCGTCAAGTTTCTTGAGAGCAACAGCAATGCCATCAT
TTAATGTGCCGTAGTAAACTCTTCCGTAAGAGCCTTCACCAATCAGGGCCTTGGATCCGA
AGTTATCAGTCTTTTCCTTGACCTCGTCCAAAGACAAAGAAGGAACCTCGATGGGAAGAG
GTTCCTTCCGCACCTCAGGCTTTGCAACAACAGCTGGTGGTTTTGGATTCTTGTGATTTG
CATCAGAATGATGCTGATGCTGATGCTGGTGAGAAGATTTCAAATGTTCCTCATCATTAG
AGTCTTGAATTTGACATGTACAGCACATCCACTTGCACATCCTCATCTTCTCCACACACC
TTCTTTATTTTTTTTGGCTCTCCTTTGTCGTCTAACCACCGTGCGTCACCAACAAAACTC
GCTGTCCCTCTCAATCTCTTTCTCTACGATTCGTTGCGTAACGATCGTCTCCTCTTCGAG
AGAGAGAGAGAGAGAGGAGGTTGCTTGCTGGAGACGACGAACGAGAATGAAAGAAAAAAG
AGAGATTAAGCCTTTGTGGGTGCGTTTATCCC


BQ
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AF RS1EK49JQ U 1
AF RS1DG65JQ U 63
AF RS1DG65TF C 755
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BS 743 827 RS1DG65JQ
BS 828 1472 RS1DG65TF

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ATCATCACTCACAAAACCAACTTCATTCATATACTGGTAAAGGCAGTGATTACAGATTCT
GATAGTTTGCAAATTGAAATAAAAGTTTTCAAGAAAATGGAGCTGCAGCAGGTTTGAGGA
GAGGCTGTAGGGCCTTCACAACTATGCTCATATTTGGTCTAAATTCAGCTTCGTATTGCA
CACACAATGCCGCCACCGCTGCTAGCTTAGCAACTGCTTTTGGAGGGTAATCCGCTAGCT
TTGGATCAATGCACTCTTTGACTTTATCTTCACTGAGTCTTGGTGTCGCCCAGGTGACAA
GACTTTGTTGGCCACGAGGCATGTTATTATCGACAGGTTTCCTCCCAGTCAGAAGTTCTA
GAAGTACAACCCCAAAGCTGTACACATCACTCTTCTGAGTTAATTGTCCAGTCATTGCAT
ATTCAGGAGCATGATAACCAAAAGTTCCCAAGACTCTAGTAGAGTGAAGACGAGCAGCAT
TATCAGGCGATTGGTTTGAGAGATTGAAATCAGAAATCTTTGGTTTGTAGTCTTCGAAAA
GAAGAATATTGCTAGATCTTATGTCTTTGTGGATGACAGGAGGCTGAGACTTGTCATGAA
GGTATTCCAAACCCCTAGCTGCCTCAACTGCTATTTTCACCCTTGTTGTCCAGTCAAGTG
TTGGACCTGGCTGTGCCCCTTG
GAC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RS1DG65JQ 765 0 0
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TAGTTTGCAAATTGAAATAAAAGTTTTCAAGAAGATGGAGCTGCAGCAGGTTTGAGGAGA
GGCTGTAGGGCCTTCACAACTATGCTCATATTTGGTCTAAATTCAGCTTCATATTGCACA
CACAATGCCGCCACCGCCGCTAGCTTAGCAACTGCTTTTGGAGGGTAATCCGCTAGCTTT
GGATCAATGCACTCTTTGACTTTATCTTCACTGAGTCTTGGTGTCGCCCAGGTGACAAGA
CTTTGTTGACCACGAGGCATGTTATTATCGACAGGTTTCCTCCCAGTCAGAAGTTCTAGA
AGTACAACCCCAAAGCTGTACACATCACTCTTCTGAGTTAATTGTCCAGTCATTGCATAT
TCAGGAGCATGATAACCAAAAGTTCCCAAGACTCTGGTAGAGTGAAGACGAGCAGCGTTA
TCAGGCGATTGGTTTGAGAGATTGAAATCAGAAATCTTTGGTTTGTAGTCTTCGAAAAGA
AGAATATTGCTAGATCTTATGTCTTTGTGGATGACAGGAGGCTAAGACTTGTCATGAAGG
TATTCCAAACCCCTAGCCGCCTCAACTGCTATTTTTACCCTTGTTGTCCAGTCAAGTGTT
GGACCTGGCTGTGCCCCTTGAACTCCCTTCCTACCATGTAAGACGTCATGCAATGATCCC
ATAGTTGCAAACTCATATGCAAGGACACGGAGCTTTCCATCAACA

QA 1 765 1 765
DS 

RD RS1DG65TF 718 0 0
ACCATGTAAGACGTCATGCAATGATCCCATAGTTGCAAACTCATATGCAAGGACACGGAG
CTTTCCATCAACACAAAAACCAAGCAACTGAACGAGATTCTCATGCTTCAGTATAGAAAC
CATGGAGACCTGACTCAAGAAGTCGGCATCAGATTCAGCTTCAGGTGCGGCGTCAAGTTT
CTTGAGAGCAACAGCAATGCCATCATTTAATGTGCCGTAGTAAACTCTTCCGTAAGAGCC
TTCACCAATCAGGGCCTTGGATCCGAAGTTATCAGTCTTTTCCTTGACCTCGTCCAAAGA
CAAAGAAGGAACCTCGATGGGAAGAGGTTCCTTCCGCACCTCAGGCTTTGCAACAACAGC
TGGTGGTTTTGGATTCTTGTGATTTGCATCAGAATGATGCTGATGCTGATGCTGGTGAGA
AGATTTCAAATGTTCCTCATCATTAGAGTCTTGAATTTGACATGTACAGCACATCCACTT
GCACATCCTCATCTTCTCCACACACCTTCTTTATTTTTTTTGGCTCTCCTTTGTCGTCTA
ACCACCGTGCGTCACCAACAAAACTCGCTGTCCCTCTCAATCTCTTTCTCTACGATTCGT
TGCGTAACGATCGTCTCCTCTTCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGGTTGCTTGCTGGAGA
CGACGAACGAGAATGAAAGAAAAAAGAGAGATTAAGCCTTTGTGGGTGCGTTTATCCC

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 4

CO CL2039Contig1 1163 4 10 U
ACCCCCAAATATTGCATAATACAAAAAGACCAGATGTACAAATGAAAGCAAATGATACAC
AGCAGTAATCTTATTCAACTTTCACCATGTTTTCGTGATTATCCGGCTGTTAACAACCAG
CATACTCTCTTGTGTAGGTTTCTCTTGTTGGTTATAAAGAAAATATTTTAAAAAAAAAAA
AAACAAATGAAAGATTGATGCTCAAAGCACCACAGCTCCTTTAAGTCATCGAGGCTTTGT
TCTCCAAGGGGGTGAAGGAAAAGTTGCCGGAAAATATGGACTCTTTATCTGTTAAAGAAA
GAAAACCAACTTCTCTCCGGACATATCTTGCCATTGCCTTTGCTGCTTTTAATTCCGTTT
CATCAGGTGTTGTTGCTCCATCATCAGAAAATATATTCCTCCATAATTTGATTTGTAAAT
CATTTGGTTTAGCATCTGGAAGTAGTGCCGCATCATAGGCAACAACGTTTCCGTAGAATA
TTCTCTCCAATTCCTTCATCCAAGTCAAGAGAAGCAAGTTAACCCCGGCTTTAGATACCC
TGACTTCCACATTATGATTGTAGATCTCATAAACATATTGACCAAGATCAACACCTTCCT
TTCCCTCTGCCTTCAAGCGTCGTAATACAAGCCACATATGAAGGACAAGTAACGAATATG
TTATTTTGAATGTTTTCTCCAAGTTGAACACATCATAAATGGCAGGCGTGTCGACTTGAG
CAATGATGCGCTTGTAGATAACGTTTGCGCCACGGATAGATGTGCTCTGTTTGCTGTAGA
ACAAAAGCATCTTTAGTATAAAGCGACGAACCCCTTGGTAGTCAGGCTCATCAATTCTGA
GAGGAGAGTCTTTAGGCAGAGCCAGTGAAGATGGCTTTGACCAAAACATCTTATCCAAGT
TCACCGGAGATTTGGTGGGGGAAATCATTCGGCGAGGGAGCATCATCCGCGTGAGCTACA
GTCGCGTAGCCACAGCGCGAGAAAAAGGAGAGATTTTTAGGCGATCCATTTGAGGAGAAA
GATGGGAGCTTTGAGATTTGAGTGACAGCTCGACCTAATCTCGGAAACATTTGGAGACAA
AGCCCTTTGACTCGAGTGATGGAGTTTCTAAAACCCTCTCCGTCGCCGACTTGGGTCTCT
GTGTGTGTGTGGATCTTTACTCC


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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
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25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RS1FC48JQ U 1
AF RS1EY17JQ U 14
AF RS1EY17TF C 356
AF RS1DB23TF C 546
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ATGATTGTAGATCTCATAAACATATTGACCAAGATCAACACCTTCCTTTCCCTCTGCCTT
CAAGCGTCGTAATACAAGCCACATATGAAGGACAAGTAACGAATATGTTATTTTGAATGT
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GTAGATAACGTTTGCGCCACGGATAGATGTGCTCTGTTTGCTGTAGAACAAAAGCATCTT
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TCTTT
CC

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TGTGTGGATCTTTACTCC

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DS 



AS 1 4

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CATGTGGCTTAATAATATTAAGTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1EU58TF U 72
AF RS1DJ79TF U 1
AF RS1DJ79JQ C 206
AF RS1EU58JQ C 424
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RD RS1EU58TF 430 0 0
GG
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GGGTTCTT

QA 3 430 3 430
DS 

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TACCAACTCTTTCCTTTTGGTTTGTATGTATATATGGTTTTCGATCTCTAGTTTGATCTC
TGTTTCTAGCTAGCGGAACTTCTCTTCCTTTGGGGATTTTGGTGTGTTTTCAATCCAAAA
ATTGAAAGCTGTTGGTTTCACTCTCTTTTTAACGCTTTGTTTTTGGATTGAGTAATAAGT
TATATTCCGATCGTTTGATCGGCTATGTTATGTTTTAAACAGAATGTCTTTCACTGGTTT
TATTTCAATCCCGATGAACTCTTTGAGCAGGAGATCATGTTTTCAACGCTCAACCTAATC
TCTTTCGACAAGAATCAGTCTTTGCCCTGTTATCTATGGCGATATGGTAAAGCATCTTTA
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TTGGTGTTTCTTAGAAACAGTCCGATAAAGGATCATTCTCTACCTTGATTTATGTTCTCC
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TGGTT

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DS 

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GC

QA 1 722 1 722
DS 

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TTATAAATCCAGCCAATCAGGAACTTTCTGATCAAGGAGTCACGGTAGTGGTGGAAGGCA
TCTATGGAGTATATGATTCAAGAGTCTTTGAGTCTTGCGGTGGTTTGATATCGGAATTCT
TGTCGGCAATTTGAAGTTTATCGGCGGTGGAGAAAAGACATCACATCTATCAACTAATGG
CCACGTAGCATAAGATTCATTGCTTGCCTTACACGTGTTGTTATTAATGTGTTCTGATTT
CTTATAATTGATAATGTGTAGGCTATAAGGCTTTGATCTGTATTCCTTTTCTAAGTCCAT
GTGGCTTAATAATATTAAGTTG
AC

QA 1 502 1 502
DS 



AS 1 4

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GTTATAGTTTGTTTGATGGTAACTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATA
CGTGCAACAAACCCCGACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGAGAACATCTT
TTCTACAAACAATAATAGCTATCTGAAACATGAACTCGACGATAGCTTCCAAAGACGGAC
GTGTTTCAGGTGGCTCGGCAGAGTTTCTTCAGACTAGATTGAATCATATACATGATCCCA
AGGAGAACCAGTGTTCTTCGGTTCTCATTAAGCATATCAAAGCGCCTGTTCATCTTGTTT
GGTCTCTAGTGAGGAGATTCGATCAGCCACAGAAGTACAAGCCTTTTGTCAGCAGGTGTG
TGATGAAAGGTGATGCTGGCATCGGCTGTGTCCGAGAGGTAGACGTTAGATCTGGCCTCC
CGGCTACCACTAGCACCGAGAGGTTGGAGTTCTTGGACGATAATGAACACATTCTTGGTA
TCAGAATCCTTGGTGGTGATCACAGGCTTAAGAACTACTCATCAGTGGTTACAGTACATC
CAGAGATAATAGATGGAAGAGCGGGAACAATGGTAATAGAGTCATTCGTGTTGGATGTAC
CAGAAGGGAACGCCAAAAACGAGACTTGTTACTTCGTGGAAGCACTTATACGATGCAATC
TCAATTCTCTGTCCAGCGTTTGCGAAAGAATGGCAGCTCAGGACATGACATGAGTTGTGA
ACCTGTACTTACGTATTTTTCCTCAAATTGTAGGATTGTATAGCAACATTGGTAAGCGAA
ATTGATCGTGACATACATACTCTCTGGATTTATAGCCAAAGAGTCCTGAGTACTCATTTG
GACATCTCCATGACTGATTCTGAATTTACTGGTCGTACAAGTTAAAAATTAGTAGGAATG
TAGCTTTATAATTTAGTAGGAATGTAGCTTTACCTTTCAGTCACGTTTCTATTCAAAAAA
TATATGTAGCACCAAGAAGTGCGTTAATGTTTAATTTTTTGGTTTTAAAAAACAGAGGAA
ATTCAACTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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TCAATTCTCTGTCCAGCGTTTGCGAAAGA*TGGCAGCTCAG
ACAT

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RD RS1AX94JQ 750 0 0
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GCAACATTGGTAAGCGAAATTGATCGTGAC

QA 1 750 1 750
DS 

RD RS1AW95TF 741 0 0
GGAC
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AAAGACGGACGTGTTTCAGGTGGCTCGGCAGAGTTTCTTCAGACTAGATTGAATCATATA
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CATCTTGTTTGGTCTCTAGTGAGGAGATTCGATCAGCCACAGAAGTACAAGCCTTTTGTC
AGCAGGTGTGTGATGAAAGGTGATGTTGGCATCGGCTGTGTCCGAGAGGTAGACGTTAGA
TCTGGCCTCCCGGCTACCACTAGCACCGAG**GTTGGAGTTCTTGGACGATAATGAACAC
ATTCTTGGTATCAGAATCCTTGGTGGTGATCACAGGCTTAAGAACTACTCATCAGTGGTT
ACAGTACATCCAGAGATAATAGATGGAAGAGCGGGAACAATGGTAATAGAGTCATTCGTG
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CGATGCAATCTCAATTCTCTGTCCAGCGTTTGCGAAAGAATGGCAGCTCAG*ACATGACA
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TACTCATTTGGACATCT

QA 5 741 5 741
DS 

RD RS1AW95JQ 542 0 0
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ACGCCAAAAACGAGACTTGTTACTTCGTGGAAGCACTTATACGATGCAATCTCAATTCTC
TGTCCAGCGTTTGCGAAAGAATGGCAGCTCAGGACATGACATGAGTTGTGAACCTGTACT
TACGTATTTTTCCTCAAATTGTAGGATTGTATAGCAACATTGGTAAGCGAAATTGATCGT
GACATACATACTCTCTGGATTTATAGCCAAAGAGTCCTGAGTACTCATTTGGACATCTCC
ATGACTGATTCTGAATTTACTGGTCGTACAAGTTAAAAATTAGTAGGAATGTAGCTTTAT
AATTTAGTAGGAATGTAGCTTTACCTTTCAGTCACGTTTCTATTCAAAAAATATATGTAG
CACCAAGAAGTGCGTTAATGTTTAATTTTTTGGTTTTAAAAAACAGAGGAAATTCAACTT
CC

QA 1 542 1 542
DS 



AS 1 4

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AAAGGAGTTCATTGTTGGCTCCACAGTTCTTCCCATTGTAATTTGTATTCGTTTCAAACC
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CAACTCTGTAATTTGTATTTCTCACCACTGTTGTCTTGCTAATGTTCCCACTTTGTTTGT
GATTTATGATCTCCTAAAAATATTTATCACATTGTGATT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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CCT

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AAAAA

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DS 



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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FQ40TF U 1
AF RS1F726TF U 366
AF RS1F726JQ C 768
AF RS1FQ40JQ C 982
BS 1 486 RS1FQ40TF
BS 487 487 RS1F726TF
BS 488 719 RS1FQ40TF
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RD RS1FQ40TF 749 0 0
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CTTCACTACACGACATCTACTTTCAACAGGAGCAAGCCCAGACCATTGTACTGCCAAGGG
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AGCGGTTTTTCACGTCATCTTCTGTGCCTCAACCATGGTTCTTGGAGGAGCTAGGATACA
ACAATGGAAGCGTTGGGAGGATAAGTTCAAGAAACCTCCTTCTCAAAAGGATGCTTCAAA
GCCTGGTCATGCTCACGCTCATCATGCTCATGCTCATGCTCATGCTCATGCTCATGCACT
TCACGAGTTGTTTACCGCAAATCATGAGTTCTTCAAGATGCATGCTGGAGGATTTTGGAG
AAGATCTGTTGTCATCAGCTGGCTGAGATCATTCTGCAAGCAGTTCTATGGTTCTGTCAC
CAAATCAGAATATATAGCTCTGCGACATGGGTTCATCATGACTCATTGCCCTACAAACC*
ATCATTTA*TTTTCACAAGTACATGCTA
G

QA 1 748 1 748
DS 

RD RS1F726TF 674 0 0
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GGAAGCGTTGGGAGGATAAGTTCAAGAAACCTCCTTCTCAAAAGGATGCTTCAAAGCCTG
GCCATGCTCACGCTCATCATGCTCATGCTCATGCTCATGCTCATGCTCATGCACTTCACG
AGTTGTTTACCGCAAATCATGAGTTCTTCAAGATGCATGCTGGAGGATTTTGGAGAAGAT
CTGTTGTCATCAGCTGGCTGAGATCATTCTGCAAGCAGTTCTATGGTTCTGTCACCAAAT
CAGAATATATAGCTCTGCGACATGGGTTCATCATGACTCATTGCCCTACAAACCCATCAT
TTAATTTTCACAAGTACATGCTAAGAACAGTGGAGATAGATTTCAAGAAAGTTGTGACCA
TAAGCTGGTATCTCTGGCTCTTTGTCGTCGTCTTTCTACTGCTGAATGTAGGAGGATGGA
ATACTTACTTCTGGTTGTCTTTCTTGCCTTTAATATTGTTACTAATGGTGGGTGCCAAAT
TGTAGAATATAATAAGTAGCTTAGCTGTGGATGTTTGCGAGAAGAGAAACCGTGGGGAAC
AAGCAGTCATCACACCTTCTGATGAACTCTTTTGGTTCCACAGGCCAGACATTGTTCTCC
AACTTGTCCACTTC

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DS 

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TGAATGTAGGAGGATGGAATACTTACTTCTGGTTGTCTTTCTTGCCTTTAATATTGTTAC
TAATGGTGGGTGCCAAATTGTAGAATATAATAAGTAGCTTAGCTGTGGATGTTTGCGAGA
AGAGAAACCGTGGGGAACAAGCAGTCATCACACCTTCTGATGAACTCTTTTGGTTCCACA
GGCCAGACATTGTTCTCCAACTTGTCCACTTCATTTTCTTTCAGAATGCATTTGAGATCG
CTTTCTTCTTCTGGATTTTGTTCACATATGGAATACATTCGTGTATCATGGAGAAACTAG
GCTTCCTTATTCCACGACTTGTCATGGGAGTGTTAGTCCAAGTGCTTTGCAGTTACAGCA
CATTGCCACTTTATGCTCTTGTTACACAAATGGGTAGCAAATTCAAGAAAGGGATATTCG
ACGATTTAGTACACTCCACACTGGAAGTATGGTTGTCAGATACGAGGAACAAAGGCGAAT
CCACAAGCGAGGCTCACAGGATGGAGATACAACCCACCATTCCCGAGTCTTTTAATGTCC
AAATCAATGAAGTCATGGAAT*TGACAACCCTTAAGTTACAATTTATGTCCCAAGTCCAA
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ATTAGATCGTTGTGCTATGCTAACTTTAGAGCTCTCATTACAAGATTGTGTCGATCTGTT
TGGCATTGCATTACGAACATGGTGATAATAAAGTCAATAGCCTCATTCATAGCC

QA 1 834 1 834
DS 

RD RS1FQ40JQ 611 0 0
TTCTGATGAACTCTTTTGGTTCCACAGGCCAGACATTGTTCTCCAACTTGTCCACTTCAT
TCTCTTTCAGAATGCATTTGAGATCGCTTTCTTCTTCTGGATTTTGTTCACATATGGAAT
ACATTCGTGTATCATGGAGAAACTAGGCTTCCTTATTCCACGACTTGTCATGGGAGTGTT
AGTCCAAGTGCTTTGCAGTTACAGCACATTGCCACTTTATGCTCTTGTTACACAAATGGG
TAGCAAATTCAAGAAAGGGATATTTGACGATTTAGTACACTCCACACTGGAAGTATGGTT
GTCAGATACGAGGAACAAAGGCGAATCCACAAGCGAGGCTCACAGGATGGAGATACAACC
CACCATTCCCGAGTCTTTTAATGTCCAAATCAATGAAGTCATGGAATGTGACAACCCTTA
AGTTACAATTTATGTCCCAAGTCCAATGAGATCGGCTACATCATTCCATACGCTATCCCT
CTTAACTATCCGTTGTAACATTTTGCATTAGATCGTTGTGCTATGCTAACTTTAGAGCTC
TCATTACAAGATTGTGTCGATCTGTTTGGCATTGCATTACGAACATGGTGATAATAAAGT
CAATAGCC
CCG

QA 1 608 1 608
DS 



AS 1 4

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ACAACATTCCTATGCAGAAAAGACTTCATAGTTGTGCAGAGAAAATAGAAGAAGTACAAT
GCTTGATTGAATAAGACACCATCAGGAGATGTGTTTTTTTTATCACTTGCCTATGATAAG
TTTAGCTCTGGCATCTCCTTTGTTGATCTGGAACTGATCTGTTAATCCAAAGTGAGCCAT
TAAAAGCCAAACAAAGTTGATCAGCTCACCACCTCTACTAAGATGCTCCACATGAGCTGT
GGAATCACAATGACACGCTGCATAACAGAGAAGTTCCACCCACACTTTGCTCAGTATCTC
CCATTTGTCTTTCCCATACCTCTCCTCCAGCTGCCTCAGGTCTTTAGCTAACCTGCTCGC
GTCAAACAACACAGACTTGCTTCTATCTCCCTTAACACCCATCGGATCAATATCACTACT
GACGTCAAGGATGGTATTGCTGGCTATTTTCACATCTCTGACGTTCTCAATATGCCTCCT
GTGGAAGAACTTGTCAGCTTCAGCCATTGTGTCTCTGAACCTGATCTTCCCAATTCCAGC
AACTTCGGACATCAGACCAGGTTGCATGATAAGGAGATACATCACGTAGTCTGAAACGAT
TTTGCTGAACTCACGGTTGCTGTAGTGCTTACTTTCATCATAGCCCTTAGGGATGGTCTC
TTCCTGTTGGTAACAGAGCTCTGTTGCAATGTGCCACATCAAAAGACTCTGATCGTAATC
AAAGTTTGTGACATAACCCACAAGCTTCTCCCGGTCGGCATCCTCTGGAAGGTTGTCTCT
CAAAGTCCACTGTCCTCGAGCCAGAGATATCCTTTTAGCATTCTCAGGACTGTCTCCAAA
CTTTGACTTGTACTTCAGCTCATTGAACATGAACGCCCAGAGCTCTTTAGTCATAGGCTC
TCCATGGACAAAGAGCGTCTTGTAAACCATATCAAGCATGTCCGAGATGTCGAAGAAGTC
GCTGAACTC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B792JQ U 2
AF RS1EX69JQ U 1
AF RS1E594JQ U 1
AF RS1EX69TF C 225
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RD RS1B792JQ 812 0 0
A
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GGAAGAACTTGTCAGCTTCAGCCATTGTGTCTCTGAACCTGATCTTCCCAATTCCAGCAA
CTTCGGACATCAGGCCAGGTTGCATGATAAGGAGATACATCACGTAGTCTGAAATGATTT
TGCTGAACTCACGGTTGCTGTAGTGCTTACTTTCATCATAGCCCTTAGGGATGGTCTCTT
CCTGTTGGTAACAGAGCTCTGTTACAATGTGCCACATCAAA*GACTCTGATCGTA*TCAA
AATTTGTGACATA*CCCACAAGCTTCTC
ACG

QA 2 809 2 809
DS 

RD RS1EX69JQ 792 0 0
GG
GCAAACGGTGCAACAGACATCACAAGGTTCCATCATAAAACATACAATGTCAACAACAAC
AACATTCCTATGCAGAAAAGACTTCATAGTTGTGCGGAGAAAATAGAAAAAGTACAATGC
TTGATTGAATAAGACACCATCAGGAGATGTGTTTTTTTTATCACTTGCCTATGATAAGTT
TAGCTCTGGCATCTCCTTTGTTGATCTGGAACTGATCTGTTAATCCAAAGTGAGCCATTA
AAAGCCAAACAAAGTTGATCAGCTCACCACCTCTACTAAGATGCTCCACATGAGCTGTGG
AATCACAATGACACGCTGCATAACAGAAAAGTTCCACCCACACTTTGCTCAGTATCTCCC
ATTTGTCTTTCCCATACCTCTCCTCCAGCTGCCTCAGGTCTTTAGCTAACCTGCTCGCGT
CAAACAACACAGACTTGCTTCTATCTCCCTTAACACCCATCGGATCAATATCACTACTGA
CGTCAAGGATGGTATTGCTGGCTATTTTCACATCTCTGACGTTCTCAATATGCCTCCTGT
GGAAGAACTTGTCAGCTTCAGCCATTGTGTCTCTGAACCTGATCTTCCCAATTCCAGCAA
CTTCGGACATCAGACCAGGTTGCATGATAAGGAGATACATCACGTAGTCTGAAACGATTT
TGCTGAACTCACGGTTGCTGTAGTGCTTACTTTCATCATAGCCCTTAGGGATGGTCTCTT
CCTGTTGGTAACAGAGCTCTGTTGCAATGTGCCACATCAAAAGACTCTGATCGTAATCAA
AGTTTGTGAC

QA 3 792 3 792
DS 

RD RS1E594JQ 853 0 0
GAGCAAACGGTGCAACAGACATCACAAGGTTCCATCATAAAACATACAATGTCAACAACA
ACAACATTCCTGTGCAGAAAAGACTTCATAGTTGTGCAGAGGAAATAGAAGAAGTACAAT
GCTTGATTGAATAAGACACCATCAGGAGATGTGTTTTTTTTATCACTTGCCTATGATAAG
TTTAGCTCTGGCATCTCCTTTGTTGATCTGGAACTGATCTGTTAATCCAAAGTGAGCCAT
TAAAAGCCAAACAAAGTTGATCAGCTCACCACCTCTACTAAGCTGCTCCACATGAGCTGT
GGAATCACAATGACACGCTGCATAACAGAGAAGTTCCACCCACACTTTGCTCAGTATCTC
CCATTTGTCTTTCCCATACCTCTCCTCCAGCTGCCTCAGGTCTTTAGCTAACCTGCTCGC
GTCAAACAACACAGACTTGCTTCTATCTCCCTTAACACCCATCGGATCAATATCACTACT
GACGTCAAGGATGGTATTGCTGGCTATTTTCACATCTCTGACGTTCTCAATATGCCTCCT
GTGGAA*AACTTGTCAGCTTCAGCCATTGTGTCTCTGAACCTGATCTTCCCAATTCCAGC
AACTTCGGACATCAGACCAGGTTGCATGATAAGGAGATACATCACGTAGTCTGAAATGAT
TTTGCTGAACTCACGGTTGCTGTAGTGCTTACTTT*ATCATAGCC*TTAGGGATGGTCTC
TTCCTGTTGGTAACAGAGCTCTGTTGCAATGTGCCACATCAAAAGACTCTGATCGTAATC
AAAGTTTGTGACATAACCCACAAGCTTCTCCCGGTCGGCATCCTCTGGAAG**TGTCTCT
CAAAGTCCACTGT

QA 1 853 1 853
DS 

RD RS1EX69TF 805 0 0
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GCTCCACATGAGCTGTGGA*TCACAATGACACGCTGCATAACAGAGAAGTTCCACCCACA
CTTTGCTCAGTATCTCCCATTTGTCTTTCCCATACCTCTCCTCCAGCTGCCTCAGGTCTT
TAGCTAACCTGCTCGCGTCAAACAACACAGACTTGCTTCTATCTCCCTTAACACCCATCG
GATCAATATCACTACTGACGTCAAGGATGGTATTGCTGGCTATTTTCACATCTCTGACGT
TCTCAATATGCCTCCTGTGGAAGAACTTGTCAGCTTCAGCCATTGTGTCTCTGAACCTGA
TCTTCCCAATTCCAGCAACTTCGGACATCAGACCAGGTTGCATGATAAGGAGATACATCA
CGTAGTCTGAAACGATTTTGCTGAACTCACGGTTGCTGTAGTGCTTACTTTCATCATAGC
CCTTAGGGATGGTCTCTTCCTGTTGGTAACAGAGCTCTGTTGCAATGTGCCACATCAAAA
GACTCTGATCGTAATCAAAGTTTGTGACATAACCCACAAGCTTCTCCCGGTCGGCATCCT
CTGGAAGGTTGTCTCTCAAAGTCCACTGTCCTCGAGCCAGAGATATCCTTTTAGCATTCT
CAGGACTGTCTCCAAACTTTGACTTGTACTTCAGCTCATTGAACATGAACGCCCAGAGCT
CTTTAGTCATAGGCTCTCCATGGACAAAGAGCGTCTTGTAAACCATATCAAGCATGTCCG
AGATGTCGAAGAAGTCGCTGAACTC

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 4

CO CL2045Contig1 524 4 5 U
GGACAGTTCATAGCAGAGAGAGATTCGTAGATCGATCGAAGATGAACACTGACATCACAG
CCTTGGAGAAGCCCCAGTACCCAGTCGTAGATCGGAACCCTCCGTTCACGAAAGTCGTCG
GAAACTTCAGCGTACTCGATTACCTCCGTTTCTCCACCATCACCGGCGTTTCCGTAACCG
TCGGCTACCTATCAGGGATAAAACCAGGGATCAAGGGACCGTCGATGGTGACGGGAGGAT
TGATCGGAGTCATGGGTGGTTTCATGTACGCTTACCAGAACTCCGCGGGTAGACTCATGG
GCTTTTTCCCTAACGAAGGAGAGGTCGCTAGTGACCAGAAGCAGAAGCGTGGTGGTGGTG
GTTCCTTCAATTGAATCTTCTAGGGTGGCTTTTCCTGGGTCCTTCGAATCCTTTCATGTA
ATTGGATCGATTTTTCTTTGCTGTTTTGAGGATACATTTGCCTCTGTTTATCTGTTATGA
TGACTTACGGTTAATAATTAAAAAAAAAACACAGAGCTTTCTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1F292TF U 11
AF RS1B836JQ C 1
AF RS1F292JQ C 11
AF RS1B836TF U 1
BS 1 12 RS1B836TF
BS 13 321 RS1F292TF
BS 322 322 RS1B836TF
BS 323 342 RS1F292TF
BS 343 524 RS1B836TF

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GG
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DS 

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DS 

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GG
GCAGAGAGAGATTCGTAGATCGATCGAAGATGAACACTGACATCACAGCCTTGGAGAAGC
CCCAGTACCCAGTCGTAGATCGGAACCCTCCGTTCACGAAAGTCGTTGGAAACTTCAGCG
TACTCGATTACCTCCGTTTTTCCACCATCACCGGCGTTTCCGTAACCGTCGGCTACCTAT
CAGGGATAAAACCAGGGATCAAGGGACCGTCGATGGTGACGGGAGGATTGATCGGAGTCA
TGGGTGGTTTCATGTACGCTTACCAGAACTCCGCGGGTAGACTCATGGGCTTTTTCCCTA
ACGAAGGAGGGGTCGCTAGTGACCAGAAGCAGAAGCGTGGTGGTGGTGGTTCCTTCAATT
GAATTTTTTAGGGTGGTTTTTCCTGGGTCCTTCGAATCCTTTCATGTAATTGGATCGATT
TTTTTTTGCTGTTTTGAGGATACATTTGCCTCTGTTTATCTGTTATGATGACTTACGGTT
AATAATT

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GAAACTTCAGCGTACTCGATTACCTCCGTTTCTCCACCATCACCGGCGTTTCCGTAACCG
TCGGCTACCTATCAGGGATAAAACCAGGGATCAAGGGACCGTCGATGGTGACGGGAGGAT
TGATCGGAGTCATGGGTGGTTTCATGTACGCTTACCAGAACTCCGCGGGTAGACTCATGG
GCTTTTTCCCTAACGAAGGAGAGGTCGCTAGTGACCAGAAGCAGAAGCGTGGTGGTGGTG
GTTCCTTCAATTGAATCTTCTAGGGTGGCTTTTCCTGGGTCCTTCGAATCCTTTCATGTA
ATTGGATCGATTTTTCTTTGCTGTTTTGAGGATACATTTGCCTCTGTTTATCTGTTATGA
TGACTTACGGTTAATAATTAAAAAAAAAACACAGAGCTTTCTCG

QA 1 524 1 524
DS 



AS 1 4

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CACTCCTCCAACTAGCCGAGGAAGAGTTTGGGTTCGAGCATGACATGGGTCTCACTATCC
CTTGTGATGAAGTTGTCTTTCAATCACTCATCTCCATGTTCGGATAGAACTCAGTCTAGA
AAGAGACTGATACATTTCCACACTCTAGACTCGGAAGACCAATACATTAAACTTATTAAT
TACCAAGAAACAAGAATAAGAAATACATAAATATATTATTTAGGTTCTTTTCTATGCTAA
GAAGACAGAATCAAATGGCGGGCATTGCGTCGGGTGAAGCATCGACTCGAGATTTGTGGC
TTTATTAATATATCTAACAGTTTTTATATAACCACTCTCTTGGATGTATTTTTCCTTCTT
ATGAATGTTTTTTGGGGTCATGTATATTTGTTTTGAATATTTTGTATATTAGTTTGGTGG
GCGACTTTTCCCATAAGTCAACGTGTGTTGTTGACCGTTGGTTCTTGAGAGGAATAGCTA
GTTTTTTTTTGGTATTAATTATGAAAAAATAAAAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1BA59TF U 1
AF RS1BF96TF U 1
AF RS1BA59JQ C 36
AF RS1BF96JQ C 54
BS 1 728 RS1BA59TF
BS 729 731 RS1BF96TF
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CTTGTGATGAAGTTGTCTTTCAATCACTCATCTCCATGTTCGGATAGAACTCAGTCTAGA
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TACCAAGAAACAAGAATAAGAAATACATAAATATATTATTTAGGTTCTTTTCTATGCTAA
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TTTATTAATATATCTAACAGTTTTTATATAACCACTCTCTTGGATGTATTTTTCCTTCTT
ATGAATGTTTTTTGGGGTCATGTATATTTGTTTTGAATATTTTGTATATTAGTTTGGTGG
GCGACTTT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1BF96TF 766 0 0
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ACAAGTTAGGTTTCAATAAGCTCAAAATCATGGCGATAAAGAAGTCGAACAAAGTGGCAG
CAGCGTCTCAAGCGGCGTCTCTAAAGAAGATCTTGAAGAGATGTTCAAGTCTTGGAAAGA
AGAATCAAGGTAATTGCTACTTCAACGACGTGCCAAAGGGTCACTTCCCGGTCTACGTTG
GTCAGCAACGTAGTCGCTACGTGGTCCCAATATCATGGCTAGCTCATCCTGAGTTTCAGT
CACTCCTCCAACTAGCCGAGGAAGAGTTTGGGTTCGAGCATGACATGGGTCTCACTATCC
CTTGTGATGAAGTTGTCTTTCAATCACTCATCTCCATGTTCGGATAGAACTCAGTCTAGA
AAGAGACTGATACATTTCCACACTCTAGACTCGGAAGACCAATACATTAAACTTATTAAT
TACCAAGAAACAAGAATAAGAAATACATAAATATATTATTTAGGTTCTTTTCTATGCTAA
GAAGACAGAATCAAATGGCGGGCATTGCGTCGGGTGAAGCATCGACTCGAGATTTGTGGC
TTTATTAATATATCTAACAGTTTTTATATAACCACTCTCTTGGATGTATTTTTCCTTCTT
ATGAATGTTTTTTGGGGTCATGTATATTTGTTTTGAATATTTTGTATATTAGTTTGGTGG
GCGACTTTTCC*ATAAGTCA*CGTGTGTTGTTGACCGTTGGTTCTT

QA 1 766 1 766
DS 

RD RS1BA59JQ 780 0 0
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ATAAAGAAGTCGAACAAAGTGGCAGCAGCGTCTCAAGCGGCGTCTCTAAAGAAGATCTTG
AAGAGATGTTCAAGTCTTGGAAAGAAGAATCAAGGTAATTGCTACTTCAACGACGTGCCA
AAGGGTCACTTCCCGGTCTACGTTGGTCAGCAACGTAGTCGCTACGTGGTCCCAATATCA
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GAGCATGACATGGGTCTCACTATCCCTTGTGATGAAGTTGTCTTTCAATCACTCATCTCC
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TTATTTAGGTTCTTTTCTATGCTAAGAAGACAGAATCAAATGGCGGGCATTGCGTCGGGT
GAAGCATCGACTCGAGATTTGTGGCTTTATTAATATATCTAACAGTTTTTATATAACCAC
TCTCTTGGATGTATTTTTCCTTCTTATGAATGTTTTTTGGGGTCATGTATATTTGTTTTG
AATATTTTGTATATTAGTTTGGTGGGCGACTTTTCCCATAAGTCAACGTGTGTTGTTGAC
CGTTGGTTCTTGAGAGGAATAGCTAGTTTTTTTTTGGTATTAATTATGAAAAAATAAAAT

QA 1 780 1 780
DS 

RD RS1BF96JQ 762 0 0
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GGAAAGAAGAATCAAGGTAATTGCTACTTCAACGACGTGCCAAAGGGTCACTTCCCGGTC
TACGTTGGTCAGCAACGTAGTCGCTACGTGGTCCCAATATCATGGCTAGCTCATCCTGAG
TTTCAGTCACTCCTCCAACTAGCCGAGGAAGAGTTTGGGTTCGAGCATGACATGGGTCTC
ACTATCCCTTGTGATGAAGTTGTCTTTCAATCACTCATCTCCATGTTCGGATAGAACTCA
GTCTAGAAAGAGACTGATACATTTCCACACTCTAGACTCGGAAGACCAATACATTAAACT
TATTAATTACCAAGAAACAAGAATAAGAAATACATAAATATATTATTTAGGTTCTTTTCT
ATGCTAAGAAGACAGAATCAAATGGCGGGCATTGCGTCGGGTGAAGCATCGACTCGAGAT
TTGTGGCTTTATTAATATATCTAACAGTTTTTATATAACCACTCTCTTGGATGTATTTTT
CCTTCTTATGAATGTTTTTTGGGGTCATGTATATTTGTTTTGAATATTTTGTATATTAGT
TTGGTGGGCGACTTTTCCCATAAGTCAACGTGTGTTGTTGACCGTTGGTTCTTGAGAGGA
ATAGCTAGTTTTTTTTTGGTATTAATTATGAAAAAATAAAAT

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 4

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GGAAGTCTCACCAGACAATCTAATAGGTGACCTTGAGAAAGAAAACAACGGGACAAATAA
TGGTAACGGAGGAAATTGAGGTAGACGTGGAGATCAAATCTCCGGCTAATAAGTTCCACA
TGTTCATCGGAAGATTACAACATCTGCCCAAAGCCACTCGCTATATTCAGGGATGTGATT
TGCTCGAAGGGGACTGGGGCATGGTTGGAAGCATAGTCTTGTGGAAACTACTTTTTGATG
GAGAGGAAATAGTGTCAAAAGATATGATCGAGGCGATGGATTTTGAGAAGAATGTTATTC
AGTTGAGAGTGTTAGAGGGACCTCTTAAGACAGTGTACAACAGCCTCTTGAAAACGATGA
AGGTGAGCCCTAACCATGGAGAACCAGGAAGCACGGTAAAGTGGAACGTGAAGTACGAGA
GGATTGATGAGAACGTTGCTCACCCTGAGAGGCAGCTCCAGTTCTTGGTCGAAGTGACTA
AACAGGTCGACGGATACCTCTTATCTGAGGAATAAAGCCTCTTCGGGTTGGCAATATCTA
AATAATTAATGCTTCACATACAACATGTTTGTGTGGAAGAGTTATTGTTACGTAATAGAG
GACTCCTCTTGCGTGTTTGTATGTGTTTCTCAATAATGTATTAATGTGACATTTATCGGA
TCGAAAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EP92TF U 1
AF RS1DJ95TF U 1
AF RS1CF73TF U 48
AF RS1DJ95JQ C 22
BS 1 669 RS1DJ95TF

RD RS1EP92TF 651 0 0
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TCGAAAAAA

QA 1 669 1 669
DS 

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G
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TATTTGAGGAATAAAGCCTCTTCGGGTTGGCAATATCTAAATAATTAATGCTTCACATAC
AACATGTTTGTGTGGAAGAGTTATTGTTACGTAATAGAGGACTCCTCTTGCGTGTTTGTA
TGTGTTTCTCAATAATGTATTAATGTGACATTTATCGGATC
G

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 4

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1D429JQ U 1
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AF RS1BA75JQ U 74
AF RS1BA75TF C 74
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CC

QA 1 596 1 596
DS 

RD RS1BA75JQ 656 0 0
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QA 1 656 1 656
DS 

RD RS1BA75TF 656 0 0
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TTCCGCTGCTGCCATTTTTGCCGTCAAAGCCCTCCTCTTACACCAAGTTATTTTCC

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DS 



AS 1 4

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TGCTTTAATATAACTCTCTGCTTTTCCATGTGAGAATACAAAAGACAACTCCAATGAATT
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TTATAGTTTTGATTTACTCTTTACTTTAATGAACGATCCACAGTTACACTTTTGTCTTTT
TGTTTTGTTTGTTGTATAAACAATGTTTTCATCAAATGAGATAAGAAGCCGAAGGCATCT
TTCTTCC


BQ
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AG

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CTTTTCCATGTGAGAATACAAAAGACAACTCCAATGAATTGGCAGTGTTACTATATTATA
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DS 



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BQ
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AF RS1AO16JQ U 1
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CCTAGTCCAGTGTCTAACACTTGGAATGTAGTCTTCACCGACGTAAGTACAAACAGTGTC
TCTGTTTACGATGACGAAGTCTATAATCTCAGGCTTCACGTTAGGCTCTTCCTCGAATAT
AACAAGAAGGTTTTTCTTGGGCTTCAAGAAAGATCTAGGGATGTGATATTCTATTTGCGT
GGATTGATTTAATGAGTTCAAGAAAGACATCCAATATCTTCCAACGCCTTCTCCATTCAC
CCAAATCAATCCCTTTCCCATT

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ACCCTCAGTTCTTCCTGTCACGAGCACACTTGACTTGCACGGCAAGCGTATTGACAACGT
TCTTGCATGAATCTTTCTTGTCTTGTTTGAATGTGCTTTTGTTCACCGGAATCACACACT
CTCCTTTCCCCAAACAATGCTTCTCGACGACTTTCTTTGAAACGGGAGCATTACAAGTAC
CAAGTGTGAAGTTTCCACAAGTACCAATAGGGTTTCCGAAGCTAGCGAACTCGACTTCTG
CGATCTTCTCGTTGCCAGAGCATTTAAAAGTAGCTGTGAAACTCACGTTATCAGTGATGG
CTTGGACCTGGTCTTGCTTCCTTGTCCAGTGCCTAACACTTGGAATGTAGTCTTCTCCGA
CGTAAGTACAAACAGTGTCACTGTTGACGATGACGAAGTCTATAATCTCAGGTTTCACAT
TAGGCTCTTCCTCGAATATAACAAGAAGGTTTTTCTTGGGCTTCAAGAAAGATCTAGGGA
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AATGAGTTCAAGAAAGACATCCAATATCTTCCAACGCCTTCTCCATTCACCCAAATCAAT
CCCTTTCCCATTCCACTCATGCGAACCGCTGCTGCGCTTTCACTCTCCGGTGCATCGAAG
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CATTTGCTGCTTTCAGTGAGGTCAAGTACTCCAGAACTCAATCCTAAGATGGAAACACTA
CGAGGACCAGTGTATCTGTGCTCCAAGTAAGCTCCACTATCTGGAAATCCAGTGAGAACA
CAAGCATAACAAGGTGATTCTCTCCTTCTTTTAGTGCAACCGGTTCTTGGAAAACAAAAC
TCTTCTCGTCATGGCTTCCATGTCCACTTCCAAGGTATTCTCCGTTAAACCAAACGTGCA
ATGCGTGTCCAAGACTAGCAATCCTCACATCAGTTTTAGCTCCTTTCTTCTTAGGTAATT
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AACCGTAAAGCTCAACGGGTATGTAAGAGTCACCCTTTAGCC

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DS 



AS 1 4

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GGACATTTAGAGACTAGTATTTGAAGCAGACCCACCATCACCGTTCCTGGGCGACAAACC
ACACGCACTTGAAATAAGCATTTGAAATGAACTCTCTGAATCATCGAATATGGGTCGTGG
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GAAACGTATCTTCCCATCCATGAATCCAGGTTGTGAGGTTTCTTGATTAACGTTCGTTGC
AGAACCAAGATTGAAACCAATCATTCCTGTGTTGCTGTTCCCGCAATCAGAGCTCCCTCT
CTGCGCAGAAGGTTTTGTCTCTTCAAGTGGGATGGCAGGGGTGTGTCCTTGGAACAGAGC
GATGTGACCAAACAGCTTGTCTTTCCTCGAAAACGTTGTGCCGCATGAACAGAGCCACTT
GTTTTTCCCGCAGTGCTTCTCGTGGGTTTTGAGATCCGCAATGACGGAGAATTTCTTGGT
ATGGCATCGGCTGCAAGTGAAGCTCTTGTCGCAGTGGGTGCGTTTGTAGTGGTTCTTGAC
GCATAGTATCGTCTTCAAAGGCTGGAACTTTTTTGTGATCCTTGTTACGTTTGCAGCCAG
GGAATGGGGCAGGAGTACCTTTTGATCAGCAACGGCTCAGACCCAGGAAGGGCTTCTTTT
GTTGGGTTTAGCAAGAGCAGCGGGAGTTTTGTACTCGTCTCCGTGACCTCTCATGTGCAT
CCTCAGGTTAGCGTCTCTCTTGAAACCCTTGAAAGTTATCTTATCGCGCGAATCTCCTCG
AGATCAGAAATATCGCTTCAAATGGTTCTTTGGGACCTCCAATGGCCGTTTTAAAGGATC
GAGAGATAGAGAGGAAGAGGGAAGCAGAGCTCGAGCGGGGTTCGTCTTTTTATTAAGGGA
AAATCTCCTTCTCTACTTTTGTGATTTACTCCTTCCTACTAAAGTCAACGCATTCATCTT
AGCCGTTTAGATGCATTTTTATGAGCATCCGCCAGATCTGACGGCTAAGATGTGTTTCAT
CGCGTCGAACCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DB29JQ U 1
AF RS1DB29TF C 121
AF RS1CS75JQ U 638
AF RS1CS75TF C 569
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ACACGCACTTGAAATAAGCATTTGAAATGAACTCTCTGAATCATCGAATATGGGTCGTGG
GAACTCATGGAACCCTCCAAAATTACACGTGTCAAAGCTCAGCGGCGAGAAGGAGTCCTC
GAAACGTATCTTCCCATCCATGAATCCAGGTTGTGAGGTTTCTTGATTAACGTTCGTTGC
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CTGCGCAGAA

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AGAAAAAAAAAGAAAAAAAGAGAAGAGCTAGAACATCTTACATAGCATATATATGGCAAA
GGACATTTAGAGACTAGTATTTGAAGCAGACCCACCATCACCGTTCCTGGGCGACAAACC
ACACGCACTTGAAATAAGCATTTGAAATGAACTCTCTGAATCATCGAATATGGGTCGTGG
GAACTCATGGAACCCTCCAAAATTACACGTGTCAAAGCTCAGCGGCGAGAAGGAGTCCTC
GAAACGTATCTTCCCATCCATGAATCCAGGTTGTGAGGTTTCTTGATTAACGTTCGTTGC
AGAACCAAGATTGAAACCAATCATTCCTGTGTTGCTGTTCCCGCAATCAGAGCTCCCTCT
CTGCGCAGAAGGTTTTGTCTCTTCAAGTGGGATGGCAGGGGTGTGTCCTTGGAACAGAGC
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GTTTTTCCCGCAGTGCTTCTCGTGGGTTTTGAGATCCGCAATGACGGAGAATTTCTTGGT
ATGGCATCGGCTGCAAGTGAAGCTCTTGTCGCAGTG
C

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DS 

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ATCCTTGTTACGTTTGCAGCCAGGGAATGGGGCAGGAGTACCTTTTGATCAGCAACGGCT
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TCTCCGTGACCTCTCATGTGCATCCTCAG*TTAGCGTCTCTCTTGAAA

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DS 

RD RS1CS75TF 644 0 0
GTGTTGCTGTTC
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ATGACGGAGAATTTCTTGGTATGGCATCGGCTGCAAGTGAAGCTCTTGTCGCAGTGGGTG
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CTTGTTACGTTTGCAGCCAGGGAATGGG*CAGGAGTACCTTTTGATCAGCAACGGCTCAG
ACCCAGGAAGGGCTTCTTT*GTTGGGTTTAGCAAGAGCAGCGGGAGTTTTGTACTCGTCT
CCGTGACCTCTCATGTGCATCCTCAGGTTAGCGTCTCTCTTGAAACCCTTGAAAGTTATC
TTATCGCGCGAATCTCCTCGAGATCAGAAATATCGCTTCAAATGGTTCTTTGGGACCTCC
AATGGCCGTTTTAAAGGATCGAGAGATAGAGAGGAAGAGGGAAGCAGAGCTCGAGCGGGG
TTCGTCTTTTTATTAAGGGAAAATCTCCTTCTCTACTTTTGTGATTTACTCCTTCCTACT
AAAGTCAACGCATTCATCTTAGCCGTTTAGATGCATTTTTATGAGCATCCGCCAGATCTG
ACGGCTAAGATGTGTTTCATCGCGTCGAACCC

QA 13 644 13 644
DS 



AS 1 3

CO CL2052Contig1 1193 3 18 U
CCTAGTTAACCATATTCATTTAGTCTAAGAAGAAATCACAACTGATCATTCTTCAATCCT
TTTACATGTACAAATTACATATATCTATGAAGAGCAGTAAGAACTCCCCCCAACGATCTA
ACTCCTCAGCTGTTTCGATTGCTTGCATCCATCTCCATGGAACACAATCTCAGTTCACTG
AATCTGATGGTACTGCGTGATACCACGTTTTGGTGGAAGCTTCCTTAGGATAAAGAGGAC
CAGAATAGAAGGCAATATCTCCACCAACAGGTAATATATGAAGTTTAGGATTGGGTGATC
CAAGACATCAAGATCTGCTGCATCGTCGAACGCATTAAAGCACATCATGATACACCTGAT
GAGGAAACAGGTAAAGCATATGGATGTCACGTAACCGACCTCTTGCAGCTTCTTGCGCCT
CCCTTTGGATTCTACTGGAAACCGTTGCAGCATTAGGAAAAGCCTTCCTCCATATAATAA
AAATCCAAGGGCTGCGAACAATGACACACCTGCAAAGAACATCTTGGAAATGATTACCAT
AACGTGAACAGGCTTCCACCACAAAACCAACCAAAGAGCAATCTGAACTACATATACAAC
AGCATTAATAGTGAAGAAACTCGGCCTCAGTCCATCAGTTGATACAGCACGTGCCTGGTA
GTATATCTCAGCCCAAAAGAGGACGAGAAGCGCATACGTAGTGAAGAAAACAAGACTTGG
AATGTCAAGCAACATATGCTGTAGAATCTCTGGCTGCATGTTCTGTGCATCACGCCTGAA
GACAAACACTAGAGCTCGAACTCCGTTGACAAGGAAATTGAGAAAGTGAAAGACTTTCTG
CGTCGTCCATCCGTACTCTGGTACTCTCAATTGTATTCTCACCAATTGAATCACAGCAAT
GACGGAAACGATTGCGTATAGAACAGCGAGGATGTGGAAGATACGGTCCTGCCAGACCGG
AGATTCGTTCACGTCCCACCACCAATTCGTTGCCTCCTTCAGATTAAGCGAAGAAGAAGA
CGACGACGACGGAGAGGACAGAGAGTGCATCAGATACAAGCCGCCGCCGGTTCTCATCGC
TTAGGAATCAATGTAGTTTGGATTCGTTGATGGGTTTAGCTTCGATGAACGAAAAGAGAA
TCGATCGAATCGCTTTATCCTCTCTCTTTCTCCTTCCTTCCTTGTTTAGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ED34JQ U 54
AF RS1CO39JQ U 1
AF RS1CO39TF C 514
BS 1 77 RS1CO39JQ
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BS 849 863 RS1CO39JQ
BS 864 1193 RS1CO39TF

RD RS1ED34JQ 728 0 0
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AATGTCAAGCAAGATATGCTGTAGAATCTCTGGCTGCATGTTCTGTGCATCACGCCTGAA
G

QA 8 728 8 728
DS 

RD RS1CO39JQ 863 0 0
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TTTACATGTACAAATTA**TATATCTATGAAGAGCAGTAAGAACTCCCCCCAACGATCTA
ACTCCTCAGGTGTTTCGATTGTTTGCATCCATCTCCATGGGACACAATCTCAGTTCACTG
AATCTGATGGTACTGCGTGATACCACGTTTTGGTGGAAGCTTCCTTAGGATAAAGAGGAC
CAGAATAGAAGGCAATATCTCCACCAACAGGTAATATATGAAGTTTAGGATTGGGTGATC
CAAGACATCAAGATCTGCTGCATCGTCGAACGCATTAAAGCACATCATGATACACCTGAT
GAGGAAACGGGTAAAGCATATGGATGTCACGTAACCGACCTCTTGCAGCTTCTTGCGCCT
CCCTTTGGATTCTACTGGAAACCGTTGCAGCATTAGGAAAAGCCTTCCTCCATATAATAA
AAATCCAAGGGCTGCGAACAATGACACACCTGCAAAGAACATCTTGGAAATGATTACCAT
AACGTGAACAGGCTTCCACCACAAAACCAACCAAAGAGCAATCTGAACTACATATACAAC
AGCATTAATAGTGAAGAAACTCGGCCTCAGTCCATCAGTTGATACAGCACGTGCCTGGTA
GTATATCTCAGCCCAAAAGAGGACGAGAAGCGCATACGTAGTGAAGAAAACAAGACTTGG
AATGTCAAGCAACATATGCTGTAGAATCTCTGGCTGCATGTTCTGTGCATCACGCCTGAA
GACAA*CACTAGAGCTCGAACTCCGTTGACAAG*AAATTGAGAAAGTGAAAGACTTTCTG
CGTCGTC*ATCCGTACTCTGGTA

QA 1 863 1 863
DS 

RD RS1CO39TF 680 0 0
AAAGAACATCTTGGAAATGATTACCATAACGTGAACAGGCTTCCACCACAAAACCAACCA
AAGAGCAATCTGAACTACATATACAACAGCATTAATAGTGAAGAAACTCGGCCTCAGTCC
ATCAGTTGATACAGCACGTGCCTGGTAGTATATCTCAGCCCAAAAGAGGACGAGAAGCGC
ATACGTAGTGAAGAAAACAAGACTTGGAATGTCAAGCAACATATGCTGTAGAATCTCTGG
CTGCATGTTCTGTGCATCACGCCTGAAGACAAACACTAGAGCTCGAACTCCGTTGACAAG
GAAATTGAGAAAGTGAAAGACTTTCTGCGTCGTCCATCCGTACTCTGGTACTCTCAATTG
TATTCTCACCAATTGAATCACAGCAATGACGGAAACGATTGCGTATAGAACAGCGAGGAT
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ATACAAGCCGCCGCCGGTTCTCATCGCTTAGGAATCAATGTAGTTTGGATTCGTTGATGG
GTTTAGCTTCGATGAACGAAAAGAGAATCGATCGAATCGCTTTATCCTCTCTCTTTCTCC
TTCCTTCCTTGTTTAGTTCC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 3

CO CL2053Contig1 1391 3 9 U
GGGTGAATAACCAGGTATATTAGATAAGAACTCCTTCTCTCTCTCTCCGCTCTCTCTTAA
AAAAAAAAAAGACTTCGAAACCTAATTGACGTCGGCGGCGGTTTGGAGGCAATAGCCTTC
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TCCTCTGTTGATATGCTCGCATCTCTGCTTGGTGGTGATTCGGCGAGACAGAGTTAGGGT
TCGGTGGTGGTTGGCACGGCAGCGGGAGATTTCCTTTTTCCGTCTCAGATCTGGAGGCTT
TCTCAGATCTGGATTGACGCAGGCGGCAACACGGTGCTTGAGGACTGTACCTGTAAGTTG
TCTCGCGTTTAGCCAGTAGGGTTAGTTATCCAGAAATTTTAACTTGAGCCGGTTACGGAG
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GGGAAGTGGCGTATGTTCCTCAGTTCATCCTCTGTTCTGGATCTAGACCTTGAAACAGGG
GTTTGAGAGTTGTATTTAGTTGTCTCTCAATCCACTCTGTTGGCTGTGCACGGGGAGGAG
ATCTGCGGTGATGCAGTGGTGTGTGTGGCTATCTACGCGCGTGTGGTTAGCTGGTGGTGT
CATGCTTGCTTCTCTGACCGTGAGAATGTTCTGCGCAGAGAACTTCACGGGCATGAAGCT
TCTTCTTCTTTTAGCAGCTCCGGTGGTGTGGCAAACTCTACCTTTCACGCCCCTTCCGAA
TAAGAGCAGTGTCTTGTAGGAGTGCTTGACTTGAACTGATGAAAGAGAAGCGCAACAGTC
AATCGATGTTTGGTGTGAGCAGCATCTCCGTTTTTTGCAGTGGTACTCGGCGGATGAGTG
GGCGTTTCATGCGGTAGCACAGATTAGCTAACTGTGCGGCAAAGGTTTTGGCTAGATCGG
TGGGGCAGAGGCATACAACTCCACCTTTATCCGGACCTCCGGTTCAACCGGGCCGAACCG
TCCACTCCGAATGCATCCGTTTGAGCCATTGTAAGACTTGGAAGGTGTGTGAGCTAATTT
TGCAGGTTATCAAAGGCGTGTATGTGATGAAGCTGTTGGTCCGGAGGGGTTTTGAGGGCT
GGCCAATCCTCCGTAGACTCGCGGCAACTTAGCAGCCACAACAATGAGACTCCAGCTCTT
GGCTCACTGCGATCCTAGGCAAAGTGCGTTGTTATGTTATCCAAGCTCTGTTTCAGTTTT
TGTATTTCTAGATTTTGTTGTGTTTTTCTTTTTGTTCTTGGTGTTGTGTAGTTGTCTTTA
TTTTTCTGCTACTTGTTTTCATTGTAACTTCTGTCAAAAATTAAAATGGTATAAAATTTA
ACATTCATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1C534TF U 1
AF RS1BJ84TF U 47
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AAAAAAAAAAGACTTCGAAGCCTAATTGACGTCGGCGGCGGTTTGGAGGCAATAGCCTTC
ACCGTCAGCCTTTGTGTTCTTCTTTTCTTCTTTTCTGTTCGCTTTTCACCTTCGTTTTCC
TCCTCTGTTGATATGCTCGCATCTCTGCTTGGTGGTGATTCGGCGAGACAGAGTTAGGGT
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TCTCAGATCTGGATTGACGCAGGCGGCAACACGGTGCTTGAGGACTGTAC*TGTAAGTTG
TCTCGCGTTTAGCCAGTAGGGTTAGTTATCCAGAAATTTTAACTTGAGCCGGTTACGGAG
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GTTTGAGAGTTGTATTTAGTTGTCTCTCAATCCACTCTGTTGGCTGTGCACGGGGAGGAG
ATCTGCGGTGATGCAGTGGTGTGTGTGGCTATCTACGCGCGTGTGGTTAGCTGGTGGTGT
CATGCTTGCTTCTCTGACCGTGAGA*TGTTCTGCGCAGAGAACTTCACGGGCATGAAGCT
T

QA 1 721 1 721
DS 

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GG
GCTCTCTCTTAAAAAAAAAAA*GACTTCGAAACCTAATTGACGTCGGCGGCGGTTTGGAG
GCAATAGCCTTCACCGTCAGCCTTTGTGTTCTTCTTTTCTTCTTTTCTGTTCGCTTTTCA
CCTTCGTTTTCCTCCTCTGTTGATATGCTCGCATCTCTGCTTGGTGGTGATTCGGCGAGA
CAGAGTTAGGGTTCGGTGGTGGTTGGCACGGCAGTGGGAGATTTCCTTTTTCCGTCTCAG
ATCTGGAGGCTTTCTCAGATCTGGATTGACGCAGGCGGTAACACGGTGCTTGAGGACTGT
ACCTGTAAGTTGTCTCGCGTTTAGCCAGTAGGGTTAGTTATCCAGAAATTTTAACTTGAG
CCGGTTACGGAGATCTCGGGGTGCGTCGGTGCGGGGACTACCGTTGGTCAGACAGTTCTC
GGAGATGGGATGGGGAAGTGGCGTATGTTCCTCAGTTCATCCTCTGTTCTGGATCTAGAC
CTTGAAACAGGGGTTTGAGAGTTGTATTTAGTTGTCTCTCAATCCACTCTGTTGGCTGTG
CACGGGGAGGAGATCTGCGGTGATGCAGTGGTGTGTGTGGCTATCTACGCGCGTGTGGTT
AGCTGGTGGTGTCATGCTTGCTTCTCTGACCGTGAGAATGTTCTGCGCAGAGAACTTCAC
GGGCATGAAGCTTCTTCTTCTTTTAGCAGCTCCGGTGGTGTGGCAAACTC

QA 3 712 3 712
DS 

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TATCTACGCGCGTGTGGTTAGCTGGTGGTGTCATGCTTGCTTCTCTGACCGTGAGAATGT
TCTGCGCAGAGAACTTCACGGGCATGAAGCTTCTTCTTCTTTTAGCAGCTCCGGTGGTGT
GGCAAACTCTACCTTTCACGCCCCTTCCGAATAAGAGCAGTGTCTTGTAGGAGTGCTTGA
CTTGAACTGATGAAAGAGAAGCGCAACAGTCAATCGATGTTTGGTGTGAGCAGCATCTCC
GTTTTTTGCAGTGGTACTCGGCGGATGAGTGGGCGTTTCATGCGGTAGCACAGATTAGCT
AACTGTGCGGCAAAGGTTTTGGCTAGATCGGTGGGGCAGAGGCATACAACTCCACCTTTA
TCCGGACCTCCGGTTCAACCGGGCCGAACCGTCCACTCCGAATGCATCCGTTTGAGCCAT
TGTAAGACTTGGAAGGTGTGTGAGCTAATTTTGCAGGTTATCAAAGGCGTGTATGTGATG
AAGCTGTTGGTCCGGAGGGGTTTTGAGGGCTGGCCAATCCTCCGTAGACTCGCGGCAACT
TAGCAGCCACAACAATGAGACTCCAGCTCTTGGCTCACTGCGATCCTAGGCAAAGTGCGT
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TTTTGTTCTTGGTGTTGTGTAGTTGTCTTTATTTTTCTGCTACTTGTTTTCATTGTAACT
TCTGTCAAAAATTAAAATGGTATAAAATTTAACATTCATACC

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 4

CO CL2054Contig1 1345 4 8 U
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CGGCAATAGCAAATGGAAAGACCTACTTCATCCTCTTGACTTGGATCTACGCCGTTACAT
CCTCCACTACGGAGACATGGCTGAAGTCGGATACGTTAGCTTTAATAGTGACCGCCGATC
CAAATATGTAGGAGATAGCTGCTACACTAAGGAAGAGCTCTTTGCTCGTACCGGCTACCT
CAAGGCCAACCCTTTCAGGTACGAGGTGACTAAGTACATATATGGAACATCGTCGATAAG
GTTACCAGAATGTTTCTTAATCAACTCATTGTCAGGGGAAGCATGGAACAAAGAGTCTAA
CTGGTTAGGCTACATTGCGGTGGCCACAGACGAAGGCAGAGAGTTGTTAGGGAGAAGAGA
CATTGTTGTAGCATGGCGAGGGACCATTCAGCTGTATGAGTGGGCTAATGATTTCGATTT
CCCACTTGAACTAACTACCTCGGTTTTCCCTACAACTGACCCGAATGACCCAGGTGACCC
CCCTCGTATTGCCAATGGTTGGCTGTCTCTATACACAACCTCTGATACACGCTCACGTTT
TGACAAGACCAGTGCACAAGAACAGGTTCAAGGAGAGCTAAAAAGATTACTAGAATTGTA
TAAACATGAAGAAGTTAGCATCACCTTTACAGGCCATAGCTTGGGTGCAGTTCTATCGAT
TCTATCCGCCACAGACTTTCTCCACAACGAATGGCCTAAGACCACAACAAGTCTTGGAGA
CACGCTTTCTTGTGTAACGGTGTTTGCTTTCGGCAGTCCCCGCATCGGTGACCTCAACTT
CAGAAGACTGGTTGAGTCCTTAAAAAAACTCAACATCTTGAGAATAACAAATGTCCCCGA
TCTCATTCCGCATTACCCGGTGTTCAGGTTCAGAGATGTAGGAGAGGAGCTTGAGATCAA
CACATTGAAATCAGAGTACCTGAAACGGTCTCTAAACTTGGCACATTTCCATAACCTGGA
GGCTTACTTGCACGGCGTGGCGGGGACACAACACAACCAAGATGAGTTCAAGCTGGAGAT
TAACCGGGATATCGCGCTGCTCAATAAGGATTTAGATGCTCTCCAAGATAAGTACTTAGT
GCCTGGGCACTGGTTGGTTCTTGAAAACAGAGGGATGGTTCAAGCAGATGACGGGACATG
GATTCTTAATGGAGATATGGGAAATAATGATCAAGAAGAAGAAAAAGACAAATGCGAATT
ACCATGAATATATCTATAATACATTTTTAATTAACAGGCACAAAAAATCCTTTTGAAGAA
GTAAAACAACAAGAAAATGTTACTT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GQ71TF U 1
AF RS1EJ01TF U 629
AF RS1GQ71JQ C 598
AF RS1EJ01JQ C 611
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G

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G
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ATCTATAATACATTTTTAATTAACAGGCACAAAAAATCCTTTTGAAGAAGTAAAACAACA
AGAAAATGTTACTT

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AS 1 4

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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1ET43TF U 1
AF RS1ET43JQ C 45
AF RS1AJ24TF U 12
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GG
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G
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CATCAAAACAAATTTATCACAAGATTATTAATTAATATTTTTAAAAAATTTTATCTATGT
AATACTATCAAGTTTCAGATAGATTTATCTATGTAATGATTTTTAATAAAGTGTCCACGT
GGATTCTGTTTTCTTATATTTTTTTTTCCAGAAAGAAAAGAAACCAGTAATAAGAATAAA
GAAATATGC

QA 2 790 2 790
DS 



AS 1 3

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AGCTTGTTTCTTGGGAAGAAGGTGGCTATAGAGTTTCAGACAAACCAATGCCTCGAGGGG
AGATTGTGGTAGGTGGTAACAGTGTAACAGCAGGTTACTTCAACAATCAAGAAAAAACAG
ATGAGGTTTACAAGGTTGATGAGAAGGGCACGAGGTGGTTTTACACAGGAGACATTGGGA
GATTCCACCCGGATGGATGTCTTGAAGTTATTGACAGGAAGAAAGATATCGTTAAACTTC
AACATGGGGAATATGTATCCCTTGGAAAGGTGGAGGCAGCTTTGGGTTCAAGCAATTACG
TTGACAACATTATGGTACACGCAGACCCAATGAACAGCTACTGTGTCGCTCTTGTTGTAC
CATCACACGGAGCAATAGAGAAATGGGCAGAGGAAGCAGGAGTTAAATCCAGCGACGTCT
CTGAGCTATGCGAGAACGGTGAAGCAGTCAAGGAGGTTCAACAATCTCTTACCAAGGCAG
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CTTGTAACAAAACTTCATATTTGTTTGTGTTTTTCGGCCTTACTTTACATTAATAAAGTT
TGATCATAAGGGGGTTTTTCTCCCTCTTTTGGTTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1BI27TF U 1
AF RS1A719TF U 98
AF RS1D270JQ C 123
BS 1 126 RS1BI27TF
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RD RS1BI27TF 715 0 0
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QA 1 715 1 715
DS 

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G
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TTCAACAATCAAGAAAAAACAGATGAGGTTTACAAGGTTGATGAGAAGGGCACGAGGTGG
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AAGAAAGATATCGTTAAACTTCAACATGGGGAATATGTATCCCTTGGAAAGGTGGAGGCA
GCTTTGGGTCCAAGCAATTACGTTGACAACATTATGGTACACGCAGACCCAATGAACAGC
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AAGATAAAGTTATTGCCGGAGCCGTGGACACCAGAGTCGGGACTAGTGACAGCTGCTCTC
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TAAAGTCTTTATATATATAACACTTGTAACAAAACTTCATATTTGTTTGTGTTTTTCGGC
CTTACTTTACATTAATAAAGTTTGATCA

QA 2 689 2 689
DS 

RD RS1D270JQ 696 0 0
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GAGGTTTACAAGGTTGATGAGAAGGGCACGAGGTGGTTTTACACAGGAGACATTGGGAGA
TCCCACCCGGATGGATGTCTTGAAGTTATTGACAGGAAGAAAGATATCGTTAAACTTCAA
CATGGGGA*TATGTATCCCTTGGAAAGGTGGAGGCAGCTTTGGGTTCAAGCAATTACGTT
GACAACATTATGGTACACGCAGACCCAATGAACAGCTACTGTGTCGCTCTTGTTGTACCA
TCACACGGAGCAATAGAGAAATGGGCAGAGGAAGCAGGAGTTAAATCCAGCGACGTCTCT
GAGCTATGCGAGAACGGTGAAGCAGTCAAGGAGGTTCAACAATCTCTTACCAAGGCAGCA
AAGGCGGCAAAGCTAGAAAAGTTTGAAATCCCAGCAAAGATAAAGTTATTGCCGGAGCCG
TGGACACCAGAGTCGGGACTAGTGACAGCTGCTCTCAAAATAAAGAGGGAGCAAATAAAG
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ATCATAAGGGGGTTTTTCTCCCTCTTTTGGTTTCCC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 4

CO CL2057Contig1 1134 4 10 U
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ATCTCATGGAGTTTTTCATTCCCCAGATTTATTGGACTGTAAGTCTTTCGTCCCTTCAAT
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CTGCCTCTGACGAACTCACGCCTTCCTGGAAAATTTATAAAAATATAGTTGGTATCAGTC
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CAATGGTATGTAGAGTCCGGTGGACATCTCTAGCCATGCCCTTAGCATCACCGCATACAT
AGAGGTATCCTTCTTCCTTTATTAGATTCCAAACTTGTGCTGCCTGAACACAAAATGAAA
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TCATCCTCGTAAATAAAGTCCTGCAAGTCATACAATATAAAAAACAGGTCAACATCCTGA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A007TF U 28
AF RS1A007TV U 1
AF RS1A007TR C 479
AF RS1A007JQ C 480
BS 1 860 RS1A007TV
BS 861 861 RS1A007TR
BS 862 911 RS1A007TV
BS 912 912 RS1A007TR
BS 913 924 RS1A007TV
BS 925 925 RS1A007TR
BS 926 959 RS1A007TV
BS 960 1101 RS1A007TR
BS 1102 1102 RS1A007JQ
BS 1103 1134 RS1A007TR

RD RS1A007TF 828 0 0
GAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGATACTAAAATCTCATGGAGTTTTTCATTCCCCAGA
TTTATTGGACTGTAAGTCTTTCGTCCCTTCAATACTTTTGTTCCATACAAAGAGACACTT
TTGACAAATCTTTGAATCTTTGACTATAGTAAGTAAGAAAATGAGACAAGAGGAAGGAAA
ATAAACGAATAAAATATCTAAATGGTAAAAGCAGCCTTCCTATCAAGAAATCTTTTGGAA
AAAAGGCAGAGCATCCCCAAAAACGAAACATCATCAATCACCAGACATCTCTGAGGTATC
TTCCTTCAGTTTGAAGTTTCTTAACTATAGCCTCTGCCTCTGACGAACTCACGCCTTCCT
GGAAAATTTATAAAAATATAGTTGGTATCAGTCTTCCAAGGGATTCAACCAAAAATCTAC
TACTTGCACGCTCATTCATTACCTGCTCCTGAACAATGGTATGTAGAGTCCGGTGGACAT
CTCTAGCCATGCCCTTAGCATCACCGCATACATAGAGGTATCCTTCTTCCTTTATTAGAT
TCCAAACTTGTGCTGCCTGAACACAAAATGAAATGTAAACGAGAAATGAGATTATTTAAC
ATTCCTCTTTTCCCAAAGCCTGATGCTGATGCATCCCAGGATATGCTTACCTTCTCTATT
ATTTTATGTTGAACATACTCCTTCTGTGCTCCCTCACGAGAGAACGCCACAATGAGCTCA
GAGATTACGCCTTGATCAACAAAGTTGTTGAGTTCATCCTCGTAAATAAAGTCCTGCAAG
TCATACAATATAAAAAACAGGTCAACATCCTGATGACACTGCAAATGA

QA 1 828 1 828
DS 

RD RS1A007TV 959 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGATACTAAA
ATCTCATGGAGTTTTTCATTCCCCAGATTTATTGGACTGTAAGTCTTTCGTCCCTTCAAT
ACTTTTGTTCCATACAAAGAGACACTTTTGACAAATCTTTGAATCTTTGACTATAGTAAG
TAAGAAAATGAGACAAGAGGAAGGAAAATAAACGAATAAAATATCTAAATGGTAAAAGCA
GCCTTCCTATCAAGAAATCTTTTGGAAAAAAGGCAGAGCATCCCCAAAAACGAAACATCA
TCAATCACCAGACATCTCTGAGGTATCTTCCTTCAGTTTGAAGTTTCTTAACTATAGCCT
CTGCCTCTGACGAACTCACGCCTTCCTGGAAAATTTATAAAAATATAGTTGGTATCAGTC
TTCCAAGGGATTCAACCAAAAATCTACTACTTGCACGCTCATTCATTACCTGCTCCTGAA
CAATGGTATGTAGAGTCCGGTGGACATCTCTAGCCATGCCCTTAGCATCACCGCATACAT
AGAGGTATCCTTCTTCCTTTATTAGATTCCAAACTTGTGCTGCCTGAACACAAAATGAAA
TGTAAACGAGAAATGAGATTATTTAACATTCCTCTTTTCCCAAAGCCTGATGCTGATGCA
TCCCAGGATATGCTTACCTTCTCTATTATTTTATGTTGAACATACTCCTTCTGTGCTCCC
TCACGAGAGAACGCCACAATGAGCTCAGAGATTACGCCTTGATCAACAAAGTTGTTGAGT
TCATCCTCGTAAATAAAGTCCTGCAAGTCATACAATATAAAAAACAGGTCAACATCCTGA
TGACACTGCAAATGAATAAG*TGCATCGATTGTATCAAGTCTCACCATTCGCCTATTTCT
ACACCCAAAGA*GAGCAAGGATGA*CCTAGTTCTAGTCCATCTTCTTTAAGTGCTATCC

QA 1 959 1 959
DS 

RD RS1A007TR 656 0 0
A
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TAGAGGTATCCTTCTTCCTTTATTAGATTCCAAACTTGTGCTGCCTGAACACAAAATGAA
ATGTAAACGAGAAATGAGATTATTTAACATTCCTCTTTTCCCAAAGCCTGATGCTGATGC
ATCCCAGGATATGCTTACCTTCTCTATTATTTTATGTTGAACATACTCCTTCTGTGCTCC
CTCACGAGAGAACGCCACAATGAGCTCAGAGATTACGCCTTGATCAACAAAGTTGTTGAG
TTCATCCTCGTAAATAAAGTCCTGCAAGTCATACAATATAAAAAACAGGTCAACATCCTG
ATGACACTGCAAATGAATAAGGTGCATCGATTGTATCAAGTCTCACCATTCGCCTATTTC
TACACCCAAAGAAGAGCAAGGATGAACCTAGTTCTAGTCCATCTTCTTTAAGTGCTATCC
TCTCTTGAAGAAATCCTCTAAAAGGAGCAAGGCCAGTCCCAGGTCCCACCATAACGATTG
GAGTTGAAGGGTTGGACGGCAACTTGAAATTAGATGCACGAATAAAGATTGGTGCTCCAC
TACATTCAAGACTTTTCTCCGCGGGAACTGCATTCTGAGTTTTTCAAAAGCTATT

QA 2 656 2 656
DS 

RD RS1A007JQ 655 0 0
ACAATGGTATGTAGAGTCCGGTGGACATCTCTAGCCATGCCCTTAGCATCACCGCATACA
TAGAGGTATCCTTCTTCCTTTATTAGATTCCAAACTTGTGCTGCCTGAACACAAAATGAA
ATGTAAACGAGAAATGAGATTATTTAACATTCCTCTTTTCCCAAAGCCTGATGCTGATGC
ATCCCAGGATATGCTTACCTTCTCTATTATTTTATGTTGAACATACTCCTTCTGTGCTCC
CTCACGAGAGAACGCCACAATGAGCTCAGAGATTACGCCTTGATCAACAAAGTTGTTGAG
TTCATCCTCGTAAATAAAGTCCTGCAAGTCATACAATATAAAAAACAGGTCAACATCCTG
ATGACACTGCAAATGAATAAGGTGCATCGATTGTATCAAGTCTCACCATTCGCCTATTTC
TACACCCAAAGAAGAGCAAGGATGAACCTAGTTTTAGTCCATCTTCTTTAAGTGCTATCC
TCTCTTGAAGAAATCCTCTAAAAGGAGCAAGGCCAGTCCCAGGTCCCACCATAACGATTG
GAGTTGAAGGGTTGGACGGCAACTTGAAATTAGATGCACGAATAAAGATTGGTGCTCCAC
TACATTCAAGACTTTTCTCCGCAGGAACTGCATTCTGAGTTTTTCAAAAGCTATT

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 2

CO CL2058Contig1 649 2 2 U
CAATATAATAATCAATCTTTTGTTTAACTGACTTTTTCATATTAAAGACATAAAGGAAAT
AAAAAGATACAAGCTTAAGAGGCCTTAGTATGTTTTTAGTCCAGTCCAATTACAGAATCT
CATATCAATAATCCTAGTTTAGCTTAAGCCCAAATAAAAAACAGAGGAGCTACGGAGAAA
CCAAAGAGTATATTAGTGTTTGTGGAAATTAACGCAGTCACTAATTCGAGTTTCAGTGTG
TTTGTTTGGGTTTTATTGAGTCAAGTTCATAGGTAGAATATTTTAATGTTGATTATTGTG
AATTGAATTCTTGCAGTAGGTAGATTTGTTTCATGTTCTTATTATACTGTGTGCATTTTT
ATGGTATTGGCTTAACAGGGTTTCCAAAGACTTACTTTCTTGTTGGATGCTGCAATGACG
ACACTTCTCAAAAGTTCAAGGGAAAGACTGTCATATAAGTTTGTTCGAAAACGCGGGCTA
AGCGGCCGAGTACTCGCCGGAAACACGCAAATCGGACCACCACCGTGGCGAATTAATGTT
ATTCGGTCAATAAATCGGACATTGAAAAAAACTCAAAGTTTTCATGGATTTTATGTTTGA
AATCGCGAATACGTTTTAGATTTGATGTATTTTCAATTAAACTTGCAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AZ23TF U 1
AF RS1AZ23JQ C 61
BS 1 566 RS1AZ23TF
BS 567 649 RS1AZ23JQ

RD RS1AZ23TF 566 0 0
CAATATAATAATCAATCTTTTGTTTAACTGACTTTTTCATATTAAAGACATAAAGGAAAT
AAAAAGATACAAGCTTAAGAGGCCTTAGTATGTTTTTAGTCCAGTCCAATTACAGAATCT
CATATCAATAATCCTAGTTTAGCTTAAGCCCAAATAAAAAACAGAGGAGCTACGGAGAAA
CCAAAGAGTATATTAGTGTTTGTGGAAATTAACGCAGTCACTAATTCGAGTTTCAGTGTG
TTTGTTTGGGTTTTATTGAGTCAAGTTCATAGGTAGAATATTTTAATGTTGATTATTGTG
AATTGAATTCTTGCAGTAGGTAGATTTGTTTCATGTTCTTATTATACTGTGTGCATTTTT
ATGGTATTGGCTTAACAGGGTTTCCAAAGACTTACTTTCTTGTTGGATGCTGCAATGACG
ACACTTCTCAAAAGTTCAAGGGAAAGACTGTCATATAAGTTTGTTCGAAAACGCGGGCTA
AGCGGCCGAGTACTCGCCGGAAACACGCAAATCGGACCACCACCGTGGCGAATTAATGTT
ATTCGGTCAATAAATCGGACATTGAA

QA 1 566 1 566
DS 

RD RS1AZ23JQ 589 0 0
AAAAAGATACAAGCTTAAGAGGCCTTAGTATGTTTTTAGTCCAGTCCAATTACAGAATCT
CATATCAATAATCCTAGTTTAGCTTAAGCCCAAATAAAAAACAGAGGAGCTACGGAGAAA
CCAAAGAGTATATTAGTGTTTGTGGAAATTAACGCAGTCACTAATTCGAGTTTCAGTGTG
TTTGTTTGGGTTTTATTGAGTCAAGTTCATAGGTAGAATATTTTAATGTTGATTATTGTG
AATTGAATTCTTGCAGTAGGTAGATTTGTTTCATGTTCTTATTATACTGTGTGCATTTTT
ATGGTATTGGCTTAACAGGGTTTCCAAAGACTTACTTTCTTGTTGGATGCTGCAATGACG
ACACTTCTCAAAAGTTCAAGGGAAAGACTGTCATATAAGTTTGTTCGAAAACGCGGGCTA
AGCGGCCGAGTACTCGCCGGAAACACGCAAATCGGACCACCACCGTGGCGAATTAATGTT
ATTCGGTCAATAAATCGGACATTGAAAAAAACTCAAAGTTTTCATGGATTTTATGTTTGA
AATCGCGAATACGTTTTAGATTTGATGTATTTTCAATTAAACTTGCAAG

QA 1 589 1 589
DS 



AS 2 4

CO CL2059Contig1 794 2 4 U
GGATCTTTTGTGCACACTTCAACAAACTTTTGTTCCGGCCACGCTCGCTCTATATTCTCC
GTGCGAGTGTCGTCTTCTCTACTCTCTCCCTCTCTCTCGCATTAGATCACTCCGTTGACT
CTGCTTCCACCCGGAGAAGATCTGTGGTTTCGGAGACTGTAGCTGATTCGCTGTTGAAGC
TAACTCGGCAGCCATGAGCTCAATTTTGCAGGGGTTTACGAAGTCACTCGCGATGACTTT
TGTGTCGGAGATTGGCGATAAGACCTTCTTCGCCGCCGCTATTCTGGCGATGCGTTATCC
TAGGAGACTCGTGTTGGCTGGTTGTGTATCTGCTCTGATTGTCACGACTATCCTCTCTGC
TGCCATTGGATGGGCTGCTCCTAATCTGATCTCTCGCAAATGGACCCATCACATAACAAC
CTTGTTGTTCTTTGGTTTCGGGCTATGGTCTTTGTGGGACGGTTTCACAGAAGAAGGAGG
GGATTCTGACGAATTGGCCGAAGTGGAAGCAGAACTGGATTCTGATTTGAAGACTAATAA
TGGCAAGACTACAAAAGATAACAGTAAGATTGAAGATGAAAACAAGAAGAAACAGAAAAG
GCCATTCCTCACACAATTCTTCTCTCCTATTTTTCTCAAGCCTTTTCGATTAACTTCTTT
GGTGAATTTGGTGACAAGAGTCAGCTTGCTACATTGGTTTAGCCGCTGATGAAACCCGTT
TGGGGTTGTCCTTGGTGGAGTGTGGCACAGCTTGTGTGTACACTGCTGCTGTGATTGGAG
GAAAGAGCGTAGCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EV40TF U 1
AF RS1GQ80TF U 12
BS 1 156 RS1EV40TF
BS 157 157 RS1GQ80TF
BS 158 285 RS1EV40TF
BS 286 794 RS1GQ80TF

RD RS1EV40TF 285 0 0
GGATCTTTTGTGCACACTTCAACAAACTTTTGTTCCGGCCACGCTCGCTCTATATTCTCC
GTGCGAGTGTCGTCTTCTCTACTCTCTCCCTCTCTCTCGCATTAGATCACTCCGTTGACT
CTGCTTCCACCCGGAGAAGATCTGTGGTTTCGGAGATTGTAGCTGATTCGCTGTTGAAGC
TAACTCGGCAGCCATGAGCTCAATTTTGCAGGGGTTTACGAAGTCACTCGCGATGACTTT
TGTGTCGGAGATTGGCGATAAGACCTTCTTCGCCGCCGCTATTCT

QA 1 285 1 285
DS 

RD RS1GQ80TF 783 0 0
GG
ACACTTCAACAAACTTTTGTTCCGGCCACGCTCGCTCTATATTCTCCGTGCGAGTGTCGT
CTTCTCTACTCTCTCCCTCTCTCTCGCATTAGATCACTCCGTTGACTCTGCTTCCACCCG
GAGAAGATCTGTGGTTTCGGAGACTGTAGCTGATTCGCTGTTGAAGCTAACTCGGCAGCC
ATGAGCTCAATTTTGCAGGGGTTTACGAAGTCACTCGCGATGACTTTTGTGTCGGAGATT
GGCGATAAGACCTTCTTCGCCGCCGCTATTCTGGCGATGCGTTATCCTAGGAGACTCGTG
TTGGCTGGTTGTGTATCTGCTCTGATTGTCACGACTATCCTCTCTGCTGCCATTGGATGG
GCTGCTCCTAATCTGATCTCTCGCAAATGGACCCATCACATAACAACCTTGTTGTTCTTT
GGTTTCGGGCTATGGTCTTTGTGGGACGGTTTCACAGAAGAAGGAGGGGATTCTGACGAA
TTGGCCGAAGTGGAAGCAGAACTGGATTCTGATTTGAAGACTAATAATGGCAAGACTACA
AAAGATAACAGTAAGATTGAAGATGAAAACAAGAAGAAACAGAAAAGGCCATTCCTCACA
CAATTCTTCTCTCCTATTTTTCTCAAGCCTTTTCGATTAACTTCTTTGGTGAATTTGGTG
ACAAGAGTCAGCTTGCTACATTGGTTTAGCCGCTGATGAAACCCGTTTGGGGTTGTCCTT
GGTGGAGTGTGGCACAGCTTGTGTGTACACTGCTGCTGTGATTGGAGGAAAGAGCGTAGC
T

QA 3 783 3 783
DS 



CO CL2059Contig2 712 2 10 U
CGATTACCAGAACTTTATTGAAGTCAAATGGCTGCTTCAGCGCCCCTTTTAATGTTTTTT
TTCAAGGTTAAATAAACTTTCCGATTTGTTTTGTAATGACTTGCGTAAAACATCTAGTAT
CAAAGATTACAAATCTAAAGAAAGTATAGATAGCAAAGTTCTTCATCGTCATCTTCAGCT
CTCCCTACAACCCAAAAAGAAGCATTAGGCCTCAACAGAAGTAAGAAACGATTGGATGCC
AAATATAATGAATAGCATTCCACCAGAAAGAGCAACTATTCGTTCGGATATCTGAGAAGC
TAAGCTCTTTCCTCCAATCACAGCAGCAGTGGTACACACAAGCTGTGCCACAACTCCACC
AAGGACAACCCCAAACAGGTTTTCATCAGCGGCTAAACCAATTGTAGCAAGCTGACTCTT
GTCACCAAATTCACCAAAGAAGTTAATCGAAAAGGCCTTGAGAAAAATAGGAGAGAAGAA
TTGTGTGAGGAATGGCCTTTTCTGTTTCTTCTTGTTTTCATCTTCAATCTTACTGTTATC
TTTTGTAGTCTTGCCATTATTAGCCTTCAAATCAGAATCCAGTTCTGCTTCCACTTCGGC
CAATTCGTCAGAATCCCCTCCTTCTTCTGTGAAACCGTCCCACAAAGACCATAGCCCGAA
ACCAAAGAACAACAAGGTTGTTATGTGATGGGTCCATTTGCGAGAGATCAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GQ80JQ U 1
AF RS1EV40JQ U 34
BS 1 264 RS1GQ80JQ
BS 265 265 RS1EV40JQ
BS 266 302 RS1GQ80JQ
BS 303 303 RS1EV40JQ
BS 304 376 RS1GQ80JQ
BS 377 377 RS1EV40JQ
BS 378 563 RS1GQ80JQ
BS 564 564 RS1EV40JQ
BS 565 577 RS1GQ80JQ
BS 578 712 RS1EV40JQ

RD RS1GQ80JQ 577 0 0
CGATTACCAGAACTTTATTGAAGTCAAATGGCTGCTTCAGCGCCCCTTTTAATGTTTTTT
TTCAAGGTTAAATAAACTTTCCGATTTGTTTTGTAATGACTTGCGTAAAACATCTAGTAT
CAAAGATTACAAATCTAAAGAAAGTATAGATAGCAAAGTTCTTCATCGTCATCTTCAGCT
CTCCCTACAACCCAAAAAGAAGCATTAGGCCTCAACAGAAGTAAGAAACGATTGGATGCC
AAATATAATGAATAGCATTCCACCGGAAAGAGCAACTATTCGTTCGGATATCTGAGAAGC
TACGCTCTTTCCTCCAATCACAGCAGCAGTGGTACACACAAGCTGTGCCACAACTCCACC
AAGGACAACCCCAAACGGGTTTTCATCAGCGGCTAAACCAATTGTAGCAAGCTGACTCTT
GTCACCAAATTCACCAAAGAAGTTAATCGAAAAGGCCTTGAGAAAAATAGGAGAGAAGAA
TTGTGTGAGGAATGGCCTTTTCTGTTTCTTCTTGTTTTCATCTTCAATCTTACTGTTATC
TTTTGTAGTCTTGCCATTATTAGTCTTCAAATCAGAA

QA 1 577 1 577
DS 

RD RS1EV40JQ 679 0 0
GCTTCAGCGCCCCTTTTAATGTTTTTTTTCAAGGTTAAATAAACTTTCCGATTTGTTTTG
TAATGACTTGCGTAAAACATCTAGTATCAAAGATTACAAATCTAAAGAAAGTATAGATAG
CAAAGTTCTTCATCGTCATCTTCAGCTCTCCCTACAACCCAGAAAGAAGCATTAGGCCTC
AACAGAAGTAAGAAACGATTGGATGCCAAATATAATGAATAGCATTCCACCAGAAAGAGC
AACTATTCGTTCGGATATCTGAGAAGCTAAGCTCTTTCCTCCAATCACAGCAGCAGTGGT
ACACACAAGCTGTGCCACAACTCCACCAAGGACAACCCCAAACAGGTTTTCATCAGCGGC
TAAACCAATTGTAGCAAGCTGACTCTTGTCACCAAATTCACCAAAGAAGTTAATCGAAAA
GGCCTTGAGAAAAATAGGAGAGAAGAATTGTGTGAGGAATGGCCTTTTCTGTTTCTTCTT
GTTTTCATCTTCAATCTTACTGTTATCTTTTGTAGTCTTGCCATTATTAGCCTTCAAATC
AGAATCCAGTTCTGCTTCCACTTCGGCCAATTCGTCAGAATCCCCTCCTTCTTCTGTGAA
ACCGTCCCACAAAGACCATAGCCCGAAACCAAAGAACAACAAGGTTGTTATGTGATGGGT
CCATTTGCGAGAGATCAGA

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 3

CO CL2060Contig1 858 3 11 U
TAACTTCCAACTCACAATCTTTTATCTAAATGATGTCTAACGTCGAATCTCAGAGAACTG
CCCTGACGCCGTTTCTCACCAAAACCTTTAACCTCGTGGAAGAGCCTTCCATCAACGACG
TTATATCATGGAACGAAGATGGTTCCTCCTTCGTCGTCTGGAACCCGACAGACTTCGCCA
AAGACTTGCTTCCTAAACACTTCAAACACAACAACTTCTCCAGCTTCGTCCGCCAGCTCA
ACACTTACGGGTTCAAGAAAGTTGTACCGGACCGGTGGGAGTTCTCTAACGACTCCTTCA
GGAGAGGAGAGAAACGTCTCCTCCGCGACATCCAGCGTCGGAAACTGAACCCTCATCATC
AAGCAGCTGTTTCTCCTCCGCCTCAGCAGCCTGAGAAAGCCGTCGTGTCTCCGTCGAGTA
GCTCAGGAGAAGATCAAACCATGTCTCCGTGCGGTGGTTTGTCCGTTGAGCTGTTGGAGG
AGAACGAGAGGCTTCGGAGTCAGAACATACAGCTTAACCGTGACCTCACTCAGATGAAGT
CTCCCTATGGTAACATCTTTACGCTCATGTCGACCTACGCCGGATCTAGTAGCAGTCAAC
ACGTGGAGGTTGAGGAAGAAGCGAGCCCGAG*CTGTTTGGTGTTTCGATAGGACTGAAAC
GGACGAGAAGTGAAGGAGCTTCTCAGGTGAAGACGGCGGCGATAGGAGGAGGGGAGACGC
CGTGGCTGAGACACTATAATCTTCTAGCCAATCAGAGAGTCTGTAATTAAACGGCTCAGA
TTAAATGTGTTAAGCTTTCAGACAGTCAGCACGTGTCCTATATGTCTTTCGAGAAGTTTC
TATCAATTAATCTTTTTG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ED77TF U 1
AF RS1C031TF U 2
AF RS1C031JQ C 90
BS 1 61 RS1ED77TF
BS 62 62 RS1C031TF
BS 63 543 RS1ED77TF
BS 544 544 RS1C031TF
BS 545 547 RS1ED77TF
BS 548 548 RS1C031TF
BS 549 598 RS1ED77TF
BS 599 599 RS1C031TF
BS 600 664 RS1ED77TF
BS 665 675 RS1C031TF
BS 676 858 RS1C031JQ

RD RS1ED77TF 666 0 0
TAACTTCCAACTCACAATCTTTTATCTAAATGATGTCTAACGTCGAATCTCAGAGAACTG
CTCTGACGCCGTTTCTCACCAAAACCTTTAACCTCGTGGAAGAGCCTTCCATCAACGACG
TTATATCATGGAACGAAGATGGTTCCTCCTTCGTCGTCTGGAACCCGACAGACTTCGCCA
AAGACTTGCTTCCTAAACACTTCAAACACAACAACTTCTCCAGCTTCGTCCGCCAGCTCA
ACACTTACGGGTTCAAGAAAGTTGTACCGGACCGGTGGGAGTTCTCTAACGACTCCTTCA
GGAGAGGAGAGAAACGTCTCCTCCGCGACATCCAGCGTCGGAAACTGAACCCTCATCATC
AAGCAGCTGTTTCTCCTCCGCCTCAGCAGCCTGAGAAAGCCGTCGTGTCTCCGTCGAGTA
GCTCAGGAGAAGATCAAACCATGTCTCCGTGCGGTGGTTTGTCCGTTGAGCTGTTGGAGG
AGAACGAGAGGCTTCGGAGTCAGAACATACAGCTTAACCGTGACCTCACTCAGATGAAGT
CTCTCTACGGTAACATCTTTACGCTCATGTCGACCTACGCCGGATCTAGTAGCAGTCA*C
ACGTGGAGGTTGAGGAAGAAGCGAGCCCGAG*CTGTTTGGTGTTTCGATAGGACTGAAAC
GGAC
AA

QA 1 664 1 664
DS 

RD RS1C031TF 688 0 0
AACTTCCAACTCACAATCTTTTATCTAAATGATGTCTAACGTCGAATCTCAGAGAACTGC
CCTGACGCCGTTTCTCACCAAAACCTTTAACCTCGTGGAAGAGCCTTCCATCAACGACGT
TATATCATGGAACGAAGATGGTTCCTCCTTCGTCGTCTGGAACCCGACAGACTTCGCCAA
AGACTTGCTTCCTAAACACTTCAAACACAACAACTTCTCCAGCTTCGTCCGCCAGCTCAA
CACTTACGGGTTCAAGAAAGTTGTACCGGACCGGTGGGAGTTCTCTAACGACTCCTTCAG
GAGAGGAGAGAAACGTCTCCTCCGCGACATCCAGCGTCGGAAACTGAACCCTCATCATCA
AGCAGCTGTTTCTCCTCCGCCTCAGCAGCCTGAGAAAGCCGTCGTGTCTCCGTCGAGTAG
CTCAGGAGAAGATCAAACCATGTCTCCGTGCGGTGGTTTGTCCGTTGAGCTGTTGGAGGA
GAACGAGAGGCTTCGGAGTCAGAACATACAGCTTAACCGTGACCTCACTCAGATGAAGTC
TCCCTATGGTAACATCTTTACGCTCATGTCGACCTACGCCGGATCTAGTAGCAGTCAACA
CGTGGAGGTTGAGGAAGAAGCGAGCCCGAG*CTGTTTGGTGTTTCGATAGGACTGAAACG
GACGAGAAGTGAAG
AGCTTCTCAGTGAA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1C031JQ 769 0 0
AACCTCGTGGAAGAGC*TTCCATCAACGACGTTATATCATGGAACGAAGATGGTTCCTCC
TTCGTCGTCTGGAACCCGACAGACTTCGCCAAAGACTTGCTTCCTAAACACTTCAAACAC
AACAACTTCTCCAGCTTCGTCCGCCAGCTCAACACTTACGGGTTCAAGAAAGTTGTACCG
GACCGGTGGGAGTTCTCTAACGACTCCTTCAGGAGAGGAGAGAAACGTCTCCTCCGCGAC
ATCCAGCGTCGGAAACTGAACCCTCATCATCAAGCAGCTGTTTCTCCTCCGCCTCAGCAG
CCTGAGAAAGCCGTCGTGTCTCCGTCGAGTAGCTCAGGAGAAGATCAAACCATGTCTCCG
TGCGGTGGTTTGTCCGTTGAGCTGTTGGAGGAGAACGAGAGGCTTCGGAGTCAGAACATA
CAGCTTAACCGTGACCTCACTCAGATGAAGTCTCCCTATGGTAACATCTTTACGCTCATG
TCGACCTACGCCGGATCTAGTAGCAGTCAACACGTGGAGGTTGAGGAAGAAGCGAGCCCG
AGGCTGTTTGGTGTTTCGATAGGACTGAAACGGACGAGAAGTGAAGGAGCTTCTCAGGTG
AAGACGGCGGCGATAGGAGGAGGGGAGACGCCGTGGCTGAGACACTATAATCTTCTAGCC
AATCAGAGAGTCTGTAATTAAACGGCTCAGATTAAATGTGTTAAGCTTTCAGACAGTCAG
CACGTGTCCTATATGTCTTTCGAGAAGTTTCTATCAATTAATCTTTTTG

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 4

CO CL2061Contig1 877 4 5 U
ATAAATTCGATTTGATTTTTTTTAGATGATAGTTTGTGAAACTGTGAATGCTGGAACAAC
ATAAGAAAGGTCTTATTAAACAGAAATAGGAGGAAGAGTGTGAAGCAACTTTAACAAGAA
AATCTTTCCAAAGAGTTTTTTTACTCTCAAACAGAACCAAAACTATCCGACAAAAAAGAA
GAATTAAAACAACATTGTATCTCCTCAAGCTTCAGCGACTGGGTACTCGAAAACTACATC
TTTCCCTGTAAGTTTCCTGTACACACCAACCATTGTCTCAAGCTTGTACTCAGTGTTATT
CCTCTCCTTAGGCTCCAAATAGACCTTCATGATCTTGGTGCCATCAACACGGTATCTGGT
ACGCTTTCCGACAATCTCAGCAGGGTAAGCGACATCCTCAAGCATGGCTTCATGGACGGA
AGTGAGAGTCCTGTTGCGTGGTCTCTGAACAGCAGAGCCTTTCTTAGGAGGACGCATGAT
TCTTCTGGTGGCAACAAAGATAACATCGTTACCACTGAACTTCTTCTCGAGTTCTCTGAC
GAGACGAGGATGGATCTTGCGGAAAGCTTTCCTCAGTCTGAATGGAACGTAGATCACAAC
AGCCTTGCGGTTGCCAGCAATATCCATTGAAACAGCTTGGTTAATGTATAGATCTTTCAA
GTCACTTTTCAACTCCTGATTGGTGTTCTCCAAATCAAAGAAAGCCTGAGCAACTCGCTC
CTCAAACTCAGTTGGTGCAACACCCTTATCCTTGTGGATCTTGTTCTGAGCAGAGAACAT
CTTGGCAGTTTCAGTAAACGACGACGAAGAACACTAGAAGGTGGAAAAAAAGGTTTACGG
CTTCCTGCTTTCCAGAGCTTCGTGGTCAGAGGAGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GJ09JQ U 1
AF RS1B075JQ U 50
AF RS1B075TF C 142
AF RS1GJ09TF C 330
BS 1 262 RS1GJ09JQ
BS 263 263 RS1B075JQ
BS 264 528 RS1GJ09JQ
BS 529 804 RS1B075JQ
BS 805 877 RS1B075TF

RD RS1GJ09JQ 528 0 0
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ATAAGAAAGGTCTTATTAAACAGAAATAGGAGGAAGAGTGTGAAGCAACTTTAACAAGAA
AATCTTTCCAAAGAGTTTTTTTACTCTCAAACAGAACCAAAACTATCCGACAAAAAAGAA
GAATTAAAACAACATTGTATCTCCTCAAGCTTCAGCGACTGGGTACTCGAAAACTACATC
TTTCCCTGTAAGTTTCCTGTACGCACCAACCATTGTCTCAAGCTTGTACTCAGTGTTATT
CCTCTCCTTAGGCTCCAAATAGACCTTCATGATCTTGGTGCCATCAACACGGTATCTGGT
ACGCTTTCCGACAATCTCAGCAGGGTAAGCGACATCCTCAAGCATGGCTTCATGGACGGA
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TCTTCTGGTGGCAACAAAGATAACATCGTTACCACTGAACTTCTTCTC

QA 1 528 1 528
DS 

RD RS1B075JQ 755 0 0
AT
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TAACAAGAAAATCTTTCCAAAGAGTTTTTTTACTCTCAAACAGAACCAAAACTATCCGAC
AAAAAAGAAGAATTAAAACAACATTGTATCTCCTCAAGCTTCAGCGACTGGGTACTCGAA
AACTACATCTTTCCCTGTAAGTTTCCTGTACACACCAACCATTGTCTCAAGCTTGTACTC
AGTGTTATTCCTCTCCTTAGGCTCCAAATAGACCTTCATGATCTTGGTGCCATCAACACG
GTATCTGGTACGCTTTCCGACAATCTCAGCAGGGTAAGCGACATCCTCAAGCATGGCTTC
ATGGACGGAAGTGAGAGTCCTGTTGCGTGGTCTCTGAACAGCAGAGCCTTTCTTAGGAGG
ACGCATGATTCTTCTGGTGGCAACAAAGATAACATCGTTACCACTGAACTTCTTCTCGAG
TTCTCTGACGAGACGAGGATGGATCTTGCGGAAAGCTTTCCTCAGTCTGAATGGAACGTA
GATCACAACAGCCTTGCGGTTGCCAGCAATATCCATTGAAACAGCTTGGTTAATGTATAG
ATCTTTCAAGTCACTTTTCAACTCCTGATTGGTGTTCTCCAAATCAAAGAAAGCCTGAGC
AACTCGCTCCTCAAACTCAGTTGGTGCAACACCCTTATCCTTGTGGATCTTGTTCTGAGC
AGAGAACATCTTGGCAGTTTCAGTAAACGACGA

QA 3 755 3 755
DS 

RD RS1B075TF 736 0 0
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TC*TCAAGCTTCAGCGACTGGGTACTCGAAAACTACATCTTTCCCTGTAAGTTTCCTGTA
CACACCAACCATTGTCTCAAGCTTGTACTCAGTGTTATTCCTCTCCTTAGGCTCCAAATA
GACCTTCATGATCTTGGTGCCATCAACACGGTATCTGGTACGCTTTCCGACAATCTCAGC
AGGGTAAGCGACATCCTCAAGCATGGCTTCATGGACGGAAGTGAGAGTCCTGTTGCGTGG
TCTCTGAACAGCAGAGCCTTTCTTAGGAGGACGCATGATTCTTCTGGTGGCAACAAAGAT
AACATCGTTACCACTGAACTTCTTCTCGAGTTCTCTGACGAGACGAGGATGGATCTTGCG
GAAAGCTTTCCTCAGTCTGAATGGAACGTAGATCACAACAGCCTTGCGGTTGCCAGCAAT
ATCCATTGAAACAGCTTGGTTAATGTATAGATCTTTCAAGTCACTTTTCAACTCCTGATT
GGTGTTCTCCAAATCAAAGAAAGCCTGAGCAACTCGCTCCTCAAACTCAGTTGGTGCAAC
ACCCTTATCCTTGTGGATCTTGTTCTGAGCAGAGAACATCTTGGCAGTTTCAGTAAACGA
CGACGAAGAACACTAGAAGGTGGAAAAAAAGGTTTACGGCTTCCTGCTTTCCAGAGCTTC
GTGGTCAGAGGAGGCC

QA 1 736 1 736
DS 

RD RS1GJ09TF 540 0 0
TGATCTTGGTGCCATCAACACGGTATCTGGTACGCTTTCCGACAATCTCAGCAGGGTAAG
CGACATCCTCAAGCATGGCTTCATGGACGGAAGTGAGAGTCCTGTTGCGTGGTCTCTGAA
CAGCAGAGCCTTTCTTAGGAGGACGCATGATTCTTCTGGTGGCAACAAAGATAACATCGT
TACCACTGAACTTCTTCTCGAGTTCTCTGACGAGACGAGGATGGATCTTGCGGAAAGCTT
TCCTCAGTCTGAATGGAACGTAGATCACAACAGCCTTGCGGTTGCCAGCAATATCCATTG
AAACAGCTTGGTTAATGTATAGATCTTTCAAGTCACTTTTCGACTCCTGATTGGTGTTCT
CCAAATCAAAGAAAGCCTGAGCAACTCGCTCCTCAAACTCAGTTGGTGCAATACCCTTAT
CCTTGTGGATCTTGTTCTGAGCAGAGAACATCTTGGCAGTTTCAGTAAACGACGACGAAG
AACACTAGAAGGTGGAAAAAAAGGTTTACGGCTTCCTGCTTTCCAGAGCTTCGTGGTC
CC

QA 1 538 1 538
DS 



AS 2 4

CO CL2062Contig1 797 2 3 U
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AACGCTCACGGCAATTTTAACAACCAAACCTTTGACCTGATCAACCAACTACCATACAGG
AACAAGTTTTAAAGAATCTGTAGTTTCAGTTGTAAAGTAACAAAAATGCTTAAAGCACAT
TATCTGGAGGATATGGAGAAAAGCCGGACGCTTGAGCGGTCATACGAATGCATATACGGT
AAAAGCTCAAACGGAGGCTTAAGTTCTTCAGTCAAGTCTGTGATGGAAAGGTTCATCTGG
TCCACAAGTGTCAAGAACGCATTGAAAGTGTCTGCATTGCGGATCACAGATGCGATATAA
GCCACTGCAGGGCTGCTGCTTCCTTCAGTCTCGAGAGAGCCATTGTCTCTTTTGGTTGAT
CTCCTTAAAAGGGCTACTAAAACCCGAAGTAGATGAGGGAAACATGACGGATCATAGATT
ACATCTGCGCCTAGAACAATATCTGGACGATACTCGCTCACTTCACTATCCGATGCAGTT
TCCCATGGGAGATGGATGCATTTAACTCGTGAGCTCTCAGCTTCTCCGTGTTGTTTGAGC
AGCTCGTCCTCATAGTTTAAGTCATTCCTCTCCAAGTTAAGCTTCATGTTAGATAGAGTT
AAGAGATCTCCGTCTGTTAATATCACCTTCTTTGCCTTTACATGTGCAAGACAAATTCCA
ACCAAACCAACTCCAGAACCAACCTCAAAACACGATTTATCAGTGAATAACTCTGGATAT
GACAGAACAAACTCTGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FY91JQ U 1
AF RS1E739JQ U 1
BS 1 200 RS1E739JQ
BS 201 201 RS1FY91JQ
BS 202 797 RS1E739JQ

RD RS1FY91JQ 698 0 0
AACGTTTTGTAGTAACAAGCAGTGATAGTGTTTAGCGGTTGTATTGCCACAACCAGATGA
AACGCTCACGGCAATTTTAACAACCAAACCTTTGACCTGATCAACCAACTACCATACAGG
AACAAGTTTTAAAGAATCTGTAGTTTCAGTTGTAAAGTAACAAAAATGCTTAAAGCACAT
TATCTGGAGGATATGGAGAAAAGCCGGACGCTTGAGCGGTCATACGAATGCATATACGGT
AAAAGCTCAAACGGAGGCTTAAGTTCTTCAGTCAAGTCTGTGATGGAAAGGTTCATCTGG
TCCACAAGTGTCAAGAACGCATTGAAAGTGTCTGCATTGCGGATCACAGATGCGATATAA
GCCACTGCAGGGCTGCTGCTTCCTTCAGTCTCGAGAGAGCCATTGTCTCTTTTGGTTGAT
CTCCTTAAAAGGGCTACTAGAACCCGAAGTAGATGAGGGAAACATGACGGATCATAGATT
ACATCTGCGCCTAGAACAATATCTGGACGATACTCGCTCACTTCACTATCCGATGCAGTT
TCCCATGGGAGATGGATGCATTTAACTCGTGAGCTCTCAGCTTCTCCGTGTTGTTTGAGC
AGCTCGTCCTCATAGTTTAAGTCATTCCTCTCCAAGTTAAGCTTCATGTTAGATAGAGTT
AAGAGATCTCCGTCTGTTAATATCACCTTCTTTGCCTT

QA 1 698 1 698
DS 

RD RS1E739JQ 797 0 0
AACGTTTTGTAGTAACAAGCAGTGATAGTGTTTAGCGGTTGTATTGCCACAACCAGATGA
AACGCTCACGGCAATTTTAACAACCAAACCTTTGACCTGATCAACCAACTACCATACAGG
AACAAGTTTTAAAGAATCTGTAGTTTCAGTTGTAAAGTAACAAAAATGCTTAAAGCACAT
TATCTGGAGGATATGGAGAAGAGCCGGACGCTTGAGCGGTCATACGAATGCATATACGGT
AAAAGCTCAAACGGAGGCTTAAGTTCTTCAGTCAAGTCTGTGATGGAAAGGTTCATCTGG
TCCACAAGTGTCAAGAACGCATTGAAAGTGTCTGCATTGCGGATCACAGATGCGATATAA
GCCACTGCAGGGCTGCTGCTTCCTTCAGTCTCGAGAGAGCCATTGTCTCTTTTGGTTGAT
CTCCTTAAAAGGGCTACTAAAACCCGAAGTAGATGAGGGAAACATGACGGATCATAGATT
ACATCTGCGCCTAGAACAATATCTGGACGATACTCGCTCACTTCACTATCCGATGCAGTT
TCCCATGGGAGATGGATGCATTTAACTCGTGAGCTCTCAGCTTCTCCGTGTTGTTTGAGC
AGCTCGTCCTCATAGTTTAAGTCATTCCTCTCCAAGTTAAGCTTCATGTTAGATAGAGTT
AAGAGATCTCCGTCTGTTAATATCACCTTCTTTGCCTTTACATGTGCAAGACAAATTCCA
ACCAAACCAACTCCAGAACCAACCTCAAAACACGATTTATCAGTGAATAACTCTGGATAT
GACAGAACAAACTCTGA

QA 1 797 1 797
DS 



CO CL2062Contig2 658 2 3 U
GGGGCACGGCGAAGTCATGGCGGCGAGCGAGAACTCGACGGAGGCAGAGTCACAGCAGTA
CCTTCATGTACTATCTGCTTTCCTCGCAATGGAACCGGTGGACTCCGTCATTGCTCTCGC
GAGAGGGTGTTCCGGAGGATCACTTACGGAGAGTGTCCAGAGGTTTCTGTGGGAGGTTTG
CGTCAAAGCTGCTGCCAATGGTAACGCATCATACGCGAAAAAGTTACTGAAGAAACTCAT
AACTGAAGTTGAGTTGGAGAAAGGTGAAGTGTTAGATGAAGTGTATGAAGAGTATGCTCT
TTACATGTCAGCGGCTTCTAAGGAGGATGCATTGGTGAAAGAAAACATAAGGATTACCAA
GTTCATCTCTTTTCTTTTCCCAGAAGGTTTATACGGACATCCAAGTTGTCCAAGTTCAAG
GAAGTTAGTTGTTCCGCTGCAGTGTTCATTGAACATGCTTGAAGGAGATACCGGGTGTTC
AATCTGGCCTTCAAGTTTGTTTTTGTCAGAGTTTGTTCTGTCATATCCAGAGTTATTCAC
TGATAAATCGTGTTTTGAGGTTGGTTCTGGAGTTGGTTTGGTTGGAATTTGTCTTGCACA
TGTAAAGGCAAAGAAAGTGATATTAACAGACGAGATCTCTTAACTCTATCTACATGAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E739TF U 1
AF RS1FY91TF U 1
BS 1 615 RS1E739TF
BS 616 616 RS1FY91TF
BS 617 658 RS1E739TF

RD RS1E739TF 658 0 0
GGGGCACGGCGAAGTCATGGCGGCGAGCGAGAACTCGACGGAGGCAGAGTCACAGCAGTA
CCTTCATGTACTATCTGCTTTCCTCGCAATGGAACCGGTGGACTCCGTCATTGCTCTCGC
GAGAGGGTGTTCCGGAGGATCACTTACGGAGAGTGTCCAGAGGTTTCTGTGGGAGGTTTG
CGTCAAAGCTGCTGCCAATGGTAACGCATCATACGCGAAAAAGTTACTGAAGAAACTCAT
AACTGAAGTTGAGTTGGAGAAAGGTGAAGTGTTAGATGAAGTGTATGAAGAGTATGCTCT
TTACATGTCAGCGGCTTCTAAGGAGGATGCATTGGTGAAAGAAAACATAAGGATTACCAA
GTTCATCTCTTTTCTTTTCCCAGAAGGTTTATACGGACATCCAAGTTGTCCAAGTTCAAG
GAAGTTAGTTGTTCCGCTGCAGTGTTCATTGAACATGCTTGAAGGAGATACCGGGTGTTC
AATCTGGCCTTCAAGTTTGTTTTTGTCAGAGTTTGTTCTGTCATATCCAGAGTTATTCAC
TGATAAATCGTGTTTTGAGGTTGGTTCTGGAGTTGGTTTGGTTGGAATTTGTCTTGCACA
TGTAAAGGCAAAGAA*GTGATATTAACAGACGAGATCTCTTAACTCTATCTACATGAA

QA 1 658 1 658
DS 

RD RS1FY91TF 628 0 0
GGGGCACGGCGAAGTCATGGCGGCGAGCGAGAACTCGACGGAGGCAGAGTCACAGCAGTA
CCTTCATGTACTATCTGCTTTCCTCGCAATGGAACCGGTGGACTCCGTCATTGCTCTCGC
GAGAGGGTGTTCCGGAGGATCACTTACGGAGAGTGTCCAGAGGTTTCTGTGGGAGGTTTG
CGTCAAAGCTGCTGCCAATGGTAACGCATCATACGCGAAAAAGTTACTGAAGAAACTCAT
AACTGAAGTTGAGTTGGAGAAAGGTGAAGTGTTAGATGAAGTGTATGAAGAGTATGCTCT
TTACATGTCAGCGGCTTCTAAGGAGGATGCATTGGTGAAAGAAAACATAAGGATTACCAA
GTTCATCTCTTTTCTTTTCCCAGAAGGTTTATACGGACATCCAAGTTGTCCAAGTTCAAG
GAAGTTAGTTGTTCCGCTGCAGTGTTCATTGAACATGCTTGAAGGAGATACCGGGTGTTC
AATCTGGCCTTCAAGTTTGTTTTTGTCAGAGTTTGTTCTGTCATATCCAGAGTTATTCAC
TGATAAATCGTGTTTTGAGGTTGGTTCTGGAGTTGGTTTGGTTGGAATTTGTCTTGCACA
TGTAAAGGCAAAGAAAGTGATATTAACA

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 4

CO CL2063Contig1 615 4 16 U
GCACGGCGGAGGTTCTGTGCGGGTTGAAGAGAGGGGAGACCGACGAGCTTAGCGCTGTGA
TGGGGAATGGTTTCGATATGGGTCAGGTTGATCCTCCCGAGGAGTATCCCACGGTTTTGA
TTTTCGCCACTGGATCTGGAATCAGTCCCATCCTCTCACTGATTGAGACAGGATTTGGCG
CTGATAGAAGATCCGATGTAAGACTATATTATGGAGCTCGGAACCTGAAAAGAATGGCTT
ATCAGGAAAAGTTTAAAGAGTGGGAATCATCGGGTGTCAAAGTTGTGCCTGTATTATCGC
AGCCAGATGATGGGTGGACAGGGGAAACCGGATATGTCCAGGCTGCTTTTGCAAGGGCTA
AACAAGTTTCAAAACCTGAGGCCACAGGAGTGGTGCTATGCGGACAGAGACAAATGGCTG
AGGAGATAACCGCGATGCTTGTAGCTGATGGAGTCTCAGATGACAAGATGCTCAAAAACT
TTTGACAGATAAATTTATTTGTATGTTGTAGTAACTTATATACTGTGTCATCATCATATG
ATTCTTTTGCTACCAAAATCAAACACAGATTTTTGTAATACCTTAAAGATGAATAATAGT
ACTGTGTTGATTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RS1CZ69TF U 1
AF RS1H569JQB C 255
AF RS1H569TF U 255
AF RS1CZ69JQ C 463
BS 1 298 RS1CZ69TF
BS 299 299 RS1H569TF
BS 300 346 RS1CZ69TF
BS 347 347 RS1H569TF
BS 348 397 RS1CZ69TF
BS 398 398 RS1H569TF
BS 399 402 RS1CZ69TF
BS 403 403 RS1H569TF
BS 404 412 RS1CZ69TF
BS 413 413 RS1H569TF
BS 414 556 RS1CZ69TF
BS 557 557 RS1H569TF
BS 558 562 RS1CZ69TF
BS 563 563 RS1H569TF
BS 564 613 RS1CZ69TF
BS 614 615 RS1CZ69JQ

RD RS1CZ69TF 613 0 0
GCACGGCGGAGGTTCTGTGCGGGTTGAAGAGAGGGGAGACCGACGAGCTTAGCGCTGTGA
TGGGGAATGGTTTCGATATGGGTCAGGTTGATCCTCCCGAGGAGTATCCCACGGTTTTGA
TTTTCGCCACTGGATCTGGAATCAGTCCCATCCTCTCACTGATTGAGACAGGATTTGGCG
CTGATAGAAGATCCGATGTAAGACTATATTATGGAGCTCGGAACCTGAAAAGAATGGCTT
ATCAGGAAAAGTTTAAAGAGTGGGAATCATCGGGTGTCAAAGTTGTGCCTGTATTATCAC
AGCCAGATGATGGGTGGACAGGGGAAACCGGATATGTCCAGGCTGCCTTTGCAAGGGCTA
AACAAGTTTCAAAACCTGAGGCCACAGGAGTGGTGCTGTGCGTACAGAGACAGATGGCTG
AGGAGATAACCGCGATGCTTGTAGCTGATGGAGTCTCAGATGACAAGATGCTCAAAAACT
TTTGACAGATAAATTTATTTGTATGTTGTAGTAACTTATATACTGTGTCATCATCATATG
ATTCTTTTGCTACCAAGATCAAGCACAGATTTTTGTAATACCTTAAAGATGAATAATAGT
ACTGTGTTGATTG

QA 1 613 1 613
DS 

RD RS1H569JQB 361 0 0
G
AAGAGTGGGAATCATCGGGTGTCAAAGTTGTGCCTGTATTATCGCAGCCAGATGATGGGT
GGACAGGGGAAACCGGATATGTCCAGGCTGCTTTTGCAAGGGCTAAACAAGTTTCAAAAC
CTGAGGCCACAGGAGTGGTGCTATGCGGACAGAGACAAATGGCTGAGGAGATAACCGCGA
TGCTTGTAGCTGATGGAGTTTCAGATGACAAGATGCTCAAAAACTTTTGACAGATAAATT
TATTTGTATGTTGTAGTAACTTATATACTGTGTCGTCATCATATGATTCTTTTGCTACCA
AAATCAAACACAGATTTTTGTAATACCTTAAAGATGAATAATAGTACTGTGTTGATTG
TC

QA 2 359 2 359
DS 

RD RS1H569TF 361 0 0
G
AAGAGTGGGAATCATCGGGTGTCAAAGTTGTGCCTGTATTATCGCAGCCAGATGATGGGT
GGACAGGGGAAACCGGATATGTCCAGGCTGCTTTTGCAAGGGCTAAACAAGTTTCAAAAC
CTGAGGCCACAGGAGTGGTGCTATGCGGACAGAGACAAATGGCTGAGGAGATAACCGCGA
TGCTTGTAGCTGATGGAGTCTCAGATGACAAGATGCTCAAAAACTTTTGACAGATAAATT
TATTTGTATGTTGTAGTAACTTATATACTGTGTCGTCATCATATGATTCTTTTGCTACCA
AAATCAAACACAGATTTTTGTAATACCTTAAAGATGAATAATAGTACTGTGTTGATTG
TC

QA 2 359 2 359
DS 

RD RS1CZ69JQ 153 0 0
ACAAGATGTTCAAAAACTTTTGACAGATAAATTTATTTGTATGTTGTAGTAACTTATATA
CTGTGTCATCATCATATGATTTTTTTGCTACCAAAATCAAGCACAGATTTTTGTAATCCC
TTAAAGATGAATAATAGTACTGTGTTGATTGTC

QA 1 153 1 153
DS 



AS 1 2

CO CL2064Contig1 829 2 2 U
CTCAAAATCTTAATTTACTTGTTTATTCATCTCCTTCAAACCTACAAGTGCCAAGCAGAT
CATCCACAATCAGAGGAAAGAAAGTCTTTAAGTTTTACATAATCTCAGAAATATGAACAT
ACATATATATGATCAACAGCGGATTTACACTTACTACAAAAACCGAACAGGAGAAAGGTA
TTGAAAACTTTTTTTAACTCTGCAGGTGATGAGATACCGCCTGACTGGTAATGATAGATA
TATATATATAGGGGCTTGCTCTGTTATAGAAACTTTCCCATGATGCCTTCTCTTGCTTTA
ATGTTTTACCAAGTATGATTACGGATTCTGAACTTCAAAGCTTTCACGGCTGCCTTAGCA
TATATCTGAGCAGCTTCAGCTTCGGCTTCTGCTCTTTCTGCCTCTTTTGCTGCTTCTTCT
GCCTCTGTGATTGCAAACTCTGCTTCCGCAACTGCTCTTGCAGCAGCTTCTGCAGCGTCT
TGAGCTGTCATGCCTTTTATCATAAGCAACTCTCCGTCTGCTCGGGGGGCTACGGGTTCT
GGTGAGTCTTTTTTGTTGTTTCCTTCCAGCAAGAGTTGAGGAGACTTCTGTCTTGCTCCA
ACGCTAGTTAAATTAGTTGAAAACCTGTACTTGTGCTTTATCTTAACTAATGGTCCATTT
GATGACAAGTGCTTTAATCTTAATGCCACATTTCTTTTCATATTCGGCGGAGTCTTGAAA
TTCTCCTCTATATACATAAAGATGGATGTTCTGTCAGAACCGCGTGGTTCCTTCAAGTTA
GTAATTGCCTCCAAGATAATCCTGTCCAAGCTTGTAATTGATCTCTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1CX55JQ U 1
AF RS1E946JQ U 75
BS 1 745 RS1CX55JQ
BS 746 829 RS1E946JQ

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CATCCACAATCAGAGGAAAGAAAGTCTTTAAGTTTTACATAATCTCAGAAATATGAACAT
ACATATATATGATCAACAGCGGATTTACACTTACTACAAAAACCGAACAGGAGAAAGGTA
TTGAAAACTTTTTTTAACTCTGCAGGTGATGAGATACCGCCTGACTGGTAATGATAGATA
TATATATATAGGGGCTTGCTCTGTTATAGAAACTTTCCCATGATGCCTTCTCTTGCTTTA
ATGTTTTACCAAGTATGATTACGGATTCTGAACTTCAAAGCTTTCACGGCTGCCTTAGCA
TATATCTGAGCAGCTTCAGCTTCGGCTTCTGCTCTTTCTGCCTCTTTTGCTGCTTCTTCT
GCCTCTGTGATTGCAAACTCTGCTTCCGCAACTGCTCTTGCAGCAGCTTCTGCAGCGTCT
TGAGCTGTCATGCCTTTTATCATAAGCAACTCTCCGTCTGCTCGGGGGGCTACGGGTTCT
GGTGAGTCTTTTTTGTTGTTTCCTTCCAGCAAGAGTTGAGGAGACTTCTGTCTTGCTCCA
ACGCTAGTTAAATTAGTTGAAAACCTGTACTTGTGCTTTATCTTAACTAATGGTCCATTT
GATGACAAGTGCTTTAATCTTAATGCCACATTTCTTTTCATATTCGGCGGAGTCTTGAAA
TTCTCCTCTATATACATAAAGATGG

QA 1 745 1 745
DS 

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AACAGCGGATTTACACTTACTACAAAAACCGAACAGGAGAAAGGTATTGAAAACTTTTTT
TAACTCTGCAGGTGATGAGATACCGCCTGACTGGTAATGATAGATATATATATATAGGGG
CTTGCTCTGTTATAGAAACTTTCCCATGATGCCTTCTCTTGCTTTAATGTTTTACCAAGT
ATGATTACGGATTCTGAACTTCAAAGCTTTCACGGCTGCCTTAGCATATATCTGAGCAGC
TTCAGCTTCGGCTTCTGCTCTTTCTGCCTCTTTTGCTGCTTCTTCTGCCTCTGTGATTGC
AAACTCTGCTTCCGCAACTGCTCTTGCAGCAGCTTCTGCAGCGTCTTGAGCTGTCATGCC
TTTTATCATAAGCAACTCTCCGTCTGCTCGGGGG*CTACGGGTTCTGGTGAGTCTTTTTT
GTTGTTTCCTTCCAGCAAGAGTTGAGGAGACTTCTGTCTTGCTCCAACGCTAGTTAAATT
AGTTGAAAACCTGTACTTGTGCTTTATCTTAACTAATGGTCCATTTGATGACAAGTGCTT
TAATCTTACTGCCACATTTCTTTTCATATTCGGCGGAGTCTTGAAATTCTCCTCTATATA
CATAAAGATGGATGTTCTGTCAGAACCGCGTGGTTCCTTCAAGTTAGTAATTGCCTCCAA
GATAATCCTGTCCAAGCTTGTAATTGATCTCTTTG

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

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ATCATGTATTTTGAAACATCAAAACTTCCTAAAACTTCATCTATTGTGAAACGGAGGGAG
TACTAAAACTGTGCGCCGAACGTGACCGGTTGGCTTATAATTTGATAAAAGCCACACAAA
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AACTGCGCCGTTCTGGCCTTTTGTTTTATTATCACCATCTCTTTGAAAAAGCGCTTCGAT
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CAAAAACGACATGGACACCGTAGCGTTCATCACTCTATTCACCGCAACGCCGAGACTTGC
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CGCGCCAATCATTCCCCCAACGCTGGTCAACAAAAGCTTCCTCCGACCTACCTTGTCGAG
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CGTCGCACCGCAGGCGTTGGTCTTAAGATCAGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1F357JQ U 1
AF RS1BK59TF C 105
BS 1 164 RS1F357JQ
BS 165 165 RS1BK59TF
BS 166 782 RS1F357JQ
BS 783 936 RS1BK59TF

RD RS1F357JQ 782 0 0
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ATCATGTATTTTGAAACATCAAAACTTCCTAAAACTTCATCTATTGTGAAACGGAGGGAG
TACTAAAACTGTGCGCCGAACGTGACCGGTTGGCTTATAATTTGGTAAAAGCCACACAAA
GAACATAGCAAACGCTACAAGTGGCAAACGAAACGAAAAGAAAAAAAAGCAAGCACATCA
AACTGCGCCGTTCTGGCCTTTTGTTTTATTATCACCATCTCTTTGAAAAAGCGCTTCGAT
CTCTTCAAGCGACTTACCTTTCGTCTCCGGCATAAGGAAGAAAAAAAAGTTCCACGCCGC
CACCGCAACTCCAGCAAACATAAAGAACGCCCCCCCGGGGGTTATCGCCCTACTCAACGA
CAAAAACGACATGGACACCGTAGCGTTCATCACTCTATTCACCGCAACGCCGAGACTTGC
TCCTTGCGCCCTAAGCTTCAACGGGAACACCTCAGAGCTGTACACCCAAGTTATCGGCCC
AAGCCCAACAGAGAAAAACGCTACAAAACTATAAGCCGAAACTATGCTCAATATCAAAGC
CCAAACCAGTTTCCCGCCAGAGCTCTGAGCCATCGTGAGCCCAAACCCTAACATCGTCAA
CGCGCCAATCATTCCCCCAACGCTGGTCAACAAAAGCTTCCTCCGACCTACCTTGTCGAG
CAAGAAAGTCGCTGTGAATATAAACGTCGTCTTCATGATTCCGACACCGATCGTAACCAA
GA

QA 1 782 1 782
DS 

RD RS1BK59TF 832 0 0
TGTGAAACGGAGGGAGTACTAAAACTGTGCGCCGAACGTGACCGGTTGGCTTATAATT*G
ATAAAAGCCACACAAAGAACATAGCAAACGCTGCAAGTGGCAAACGAAACGAAAAGAAAA
AAAAGCAAGCACATCAAACTGCGCCGTTCTGGCCTTTTGTTTTATTATCACCATCTCTTT
GAAAAAGCGCTTCGATCTCTTCAAGCGACTTACCTT*CGTCTCCGGCATAAGGAAGAAGA
AGAAGTTCCACGCCGCCACCGCAACTCCAGCAAACATAAAGAACGCTCCCCCGGTGGTTA
TCGCCCTACTCAACGACAAAAACGACATGGACACCGTAGCGTTCATCACTCTATTCACCG
CAACGCCGAGACTTGCTCCTTGCGCCCTAAGCTTCAACGGGAACACCTCAGAGCTGTACA
CCCAAGTTATCGGCCCAAGCCCAACAGAGAAAAACGCTACAAAACTATAAGCCGAAACTA
TGCTCAATATCAAAGCCCAAACCAGTTTCCCGCCAGAGCTCTGAGCCATCGTGAGCCCAA
ACCCTAACATCGTCAACGCGCCAATCATTCCCCCAACGCTGGTCAACAAAAGCTTCCTCC
GACCTACCTTGTCGAGCAAGAAAGTCGCTGTGAATATAAACGTCGTCTTCATGATTCCGA
CACCGATCGTAACCAAGAAAAGCTTGTCTTTAGTCGTGATCCCCGCCTTCTTAAAGATCT
TTGGACCGTACAAAAGCACCGCTTCGATCCCCGTGGCGTGCTGGAAGAAATGTATCCCCA
ACGAGTCAAAAGAACTCGTCGCACCGCAGGCGTTGGTCTTAAGATCAGCTCC

QA 1 832 1 832
DS 



AS 1 3

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CCTTTATGGATTAAAACCTCATATTGTGATACATAATCAACTGCTTCCACCACCACCACC
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GGGGGCTGCAGCCACAGCAGCCGTGCCAGTGACAAGAACCGCTGATTTTGTGAAATCAAA
AAAGCGATACTTGTCGTCCGCTGACCTCACGGCTTCCATACTAAACTGAATGTTTTGTGT
GAGGCCAATGTAACGGCCGATCTCTGCCAATTTGTTGGCTACCGAGCTTGAAAATCTCTG
AAACTCGTCCAAAGCCTTGGCTTTACCGAATGCATCTTTGCTTAGAACGTAGCCTTTAGA
TATCATTGTCTTGACGACTTGCTGAGCAATGGTTACTGCTCCTCCAGGCGACGAAGCAAA
TGCATCCGCGTGACTTTGAGTAACCGTTACAGTATAGTCTCCTTCTCGTGTGATATTGTT
AGATTCGTGTAGATAGACACCGTACATGGATATCCACACGGTCTGATCAACGATCGTAGC
TCCGTTAAGTAACAAGGCCATATCCAGAGCATACGCATCTCTGAATGTTACATAAGCCGT
TAACGCATCATTCCCTCCGCATCCAGTGATCTCGACAAGCTCGACAATTCCGCAATGAGA
GAAGAAACTATGAACATCTTTCTCAGTGGCTCGAGGAGACAAGTTGGTGACTTCAGCAAC
GTAACCACAGGGATACATCTCTAGCACAAACCTCCAGATATCCTGATTTTTTGATTTTTA
AGGTAAAGATAGTTAGATGAGGAAAGTCTCAAAGCAAATCAACCGAAAGAGACGGAGATG
ATGAAAAGAACACAGAATTAGTGTGAAGCCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG
TTATGTTCATCTTCTTCTTTTTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C009JQ U 1
AF RS1FV91JQ U 6
AF RS1FV91TF C 440
BS 1 60 RS1C009JQ
BS 61 61 RS1FV91JQ
BS 62 304 RS1C009JQ
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BS 306 464 RS1C009JQ
BS 465 465 RS1FV91JQ
BS 466 478 RS1C009JQ
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BS 480 520 RS1C009JQ
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BS 522 535 RS1C009JQ
BS 536 712 RS1FV91JQ
BS 713 1046 RS1FV91TF

RD RS1C009JQ 535 0 0
AACATGCAGGGAAATCATGTGATTGTATTAATTATACATTTATGTTTTTTTATTCCAGCA
TCTTTATGGATTAAAACCTCATATTGTGATACATAATCAACTGCTTCCACCACCACCACC
CATATGGGCCGCTGCTTTTGCAGCCCGGCCCAAAGCATCTGAAAACCATAAAGCCCCGTT
AGCAAAGTATCGACTGTTGACCACAGTGGTGGCAGCAGCAGCAGCCACTTTTCCAGTAAT
GGGGGCTGCAGCCACAGCAGCCGTGCCAGTGACAAGAACCGCTGATTTTGTGAAATCAAA
AAAGTGATACTTGTCGTCCGCTGACCTCACGGCTTCCATACTAAACTGAATGTTTTGTGT
GAGGCCAATGTAACGGCCGATCTCTGCCAATTTGTTGGCTACCGAGCTTGAAAATCTCTG
AAACTCGTCCAAAGCCTTGGCTTTACCGAATGCATCTTTGCTTAAAACGTAGCCTTTAAA
TATCATTGTCTTGACGACTTGCTGAGCAATGGTTACTGCTTCTCCAGGCGACGAA

QA 1 535 1 535
DS 

RD RS1FV91JQ 707 0 0
A
CAGGGAAATCATGTGATTGTATTAATTATACATTTATGTTTTTTTATTCCAGCACCTTTA
TGGATTAAAACCTCATATTGTGATACATAATCAACTGCTTCCACCACCACCACCCATATG
GGCCGCTGCTTTTGCAGCCCGGCCCAAAGCATCTGAAAACCATAAAGCCCCGTTAGCAAA
GTATCGACTGTTGACCACAGTGGTGGCAGCAGCAGCAGCCACTTTTCCAGTAATGGTGGC
TGCAGCCACAGCAGCCGTGCCAGTGACAAGAACCGCTGATTTTGTGAAATCAGAGAAGCG
ATACTTGTCGTCCGCTGACCTCACGGCTTCCATACTAAACTGAATGTTTTGTGTGAGGCC
AATGTAACGGCCGATCTCTGCCAATTTGTTGGCTACCGAGCTTGAGAATCTCTGAGACTC
GTCCAAAGCCTTGGCTTTACCGAATGCATCTTTGCTTAGAACGTAGCCTTTAGATATCAT
TGTCTTGACGACTTGCTGAGCAATGGTTACTGCTCCTCCAGGCGACGAAGCAAATGCATC
CGCGTGACTTTGAGTAACCGTTACAGTATAGTCTCCTTCTCGTGTGATATTGTTAGATTC
GTGTAGATAGACACCGTACATGGATATCCACACGGTCTGATCAACGATCGTAGCTCCGTT
AAGTAACAAGGCCATATCCAGAGCATACGCATCTCTGAATGTTACA

QA 2 707 2 707
DS 

RD RS1FV91TF 607 0 0
GCTTTACCGAATGCATCTTTGCTTAGAACGTAGCCTTTAGATATCATTGTCTTGACGACT
TGCTGAGCAATGGTTACTGCTCCTCCAGGCGACGAAGCAAATGCATCCGCGTGACTTTGA
GTAACCGTTACAGTATAGTCTCCTTCTCGTGTGATATTGTTAGATTCGTGTAGATAGACA
CCGTACATGGATATCCACACGGTCTGATCAACGATCGTAGCTCCGTTAAGTAACAAGGCC
ATATCCAGAGCATACGCATCTCTGAATGTTACATAAGCCGTTAACGCATCATTCCCTCCG
CATCCAGTGATCTCGACAAGCTCGACAATTCCGCAATGAGAGAAGAAACTATGAACATCT
TTCTCAGTGGCTCGAGGAGACAAGTTGGTGACTTCAGCAACGTAACCACAGGGATACATC
TCTAGCACAAACCTCCAGATATCCTGATTTTTTGATTTTTAAGGTAAAGATAGTTAGATG
AGGAAAGTCTCAAAGCAAATCAACCGAAAGAGACGGAGATGATGAAAAGAACACAGAATT
AGTGTGAAGCCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTTATGTTCATCTTCTTCTT
TTTTCCC

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 4

CO CL2067Contig1 664 4 8 U
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TTACAAATAGGTGGGAGTTTGTTTTAGAGGTCCCCAACTTGTCTCAAGATCCAAAGCCTG
CCAACTAAACTACACATTGATAAAAGGAACCTAAAAGTGTTCTAGCTCAGCCCTTGTATT
AGTACTATGATAATGCCTGTCAATGTCTTTTTCCTTTACTCTTCCTCCTCTTCTTCTTAG
TAGGATGCTTATCCAACGGTTCAAACTTCTTTTGCTTACCCAGCGACGATTCAAACTTCT
TTTCGCATAAGACGACTCTGTAACTTGCGTGAGGTCCTTCAGCAGTTTCACGTAAGGTCG
TGCGCCATCTCATTGCGTTTCCAATCTCTTGAAGCTCGCTCATCACGTTGATAGTGTCCC
TTATGTATACACGTCCTCCAGGTCTCAAAATCCGGTCCATCTCTAGCATAACTGTTGTCA
TGTTGCACCTTTTTCTTTCGATGGAAAATAGACCAGCGGCATGCAGCAAATCATAGGTTC
TTGGGTAAGTATCGAATGGTTCACACCAATCGTGCATCACTCCTAGTAGTCCACGGTCAT
ATATAACAGGCAGTGTATTTGGCCCACTGACCGGAACAACATTGAGAACCCAGCAATCAA
CCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1BQ15JQ U 10
AF RS1BQ15TF C 10
AF RS1F836JQ U 1
AF RS1A535TF C 49
BS 1 86 RS1F836JQ
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BS 312 582 RS1F836JQ
BS 583 664 RS1A535TF

RD RS1BQ15JQ 391 0 0
GAACCTGTATCCACACATTGGTATTTTCTACTTTTGTTTAACGCCCAAACCTTACAAATA
GGTGGGAGTTTGTTTTAGAGGTCCCCAACTTGTCTCAAGATCCAAAGCCTGCCAACTAAA
CTACACATTGATAAAAGGAACCTAAAAGTGTTCTAGCTCAGCCCTTGTATTAGTACTATG
ATAATGCCTGTCAATGTCTTTTTCCTTTACTCTTCCTCCTCTTCTTCTTAGTAGGATGCT
TATCCAACGGTTCAAACTTCTTTTGCTTACCCAGCGACGATTCAAACTTCTTTTCGCATA
AGACGACTCTGTAACTTGCGTGAGGTCCTTCAGCAGTTTCACGTAAGGTCGTGCGCCATC
TCATTGCGTTTCCAATCTCTTGAAGCTC
ACC

QA 1 388 1 388
DS 

RD RS1BQ15TF 391 0 0
GAACCTGTATCCACACATTGGTATTTTCTACTTTTGTTTAACGCCCAAACCTTACAAATA
GGTGGGAGTTTGTTTTAGAGGTCCCCAACTTGTCTCAAGATCCAAAGCCTGCCAACTAAA
CTACACATTGATAAAAGGAACCTAAAAGTGTTCTAGCTCAGCCCTTGTATTAGTACTATG
ATAATGCCTGTCAATGTCTTTTTCCTTTACTCTTCCTCCTCTTCTTCTTAGTAGGATGCT
TATCCAACGGTTCAAACTTCTTTTGCTTACCCAGCGACGATTCAAACTTCTTTTCGCATA
AGACGACTCTGTAACTTGCGTGAGGTCCTTCAGCAGTTTCACGTAAGGTCGTGCGCCATC
TCATTGCGTTTCCAATCTCTTGAAGCTC
ACC

QA 1 388 1 388
DS 

RD RS1F836JQ 582 0 0
CATGTCTTTGAACCTGTATCCACACATTGGTATTTTCTACTTTTGTTTAACGCCCAAACC
TTACAAATAGGTGGGAGTTTGTTTTAAAGGTCCCCAACTTGTCTCAAGATCCAAAGCCTG
CCAACTAAACTACACATTGATAAAAGGAACCTAAAAGTGTTCTAGCTCACCCCTTGTATT
AGTACTATGATAATGCCTGTCAATGTCTTTTTCCTTTACTCTTCCTCCTCTTCTTCTTAG
TAGGATGCTTATCCAACGGTTCAAACTTCTTTTGCTTACCCAGCGACGATTCAAACTTCT
TTTCGCATAAAACGACTCTGTAACTTGCGTGAGGTCCTTCAGCAGTTTCACGTAAGGTCG
TGCGCCATCTCATTGCGTTTCCAATCTCTTGAAGCTCGCTCATCACGTTGATAGTGTCCC
TTATGTATACACGTCCTCCAGGTCTCAAAATCCGGTCCATCTCTAGCATAACTGTTGTCA
TGTTGCACCTTTTTCTTTCGATGGAAAATAGACCAGCGGCATGCAGCAAATCATAGGTTC
TTGGGTAAGTATCGAATGGTTCACACCAATCGTGCATCACTC

QA 1 582 1 582
DS 

RD RS1A535TF 616 0 0
AACGCCCAAACCTTACAAATAGGTGGGAGTTTGTTTTAGAGGTCCCCAACTTGTCTCAAG
ATCCAAAGCCTGCCAACTAAACTACATATTGATAAAAGGAACCTAAAAGTGTTCTAGCTC
AGCCCTTGTATTAGTACTATGATAATGCCTGTCAATGTCTTTTTCCTTTACTCTTCCTCC
TCTTCTTCTTAGTAGGATGCTTATCCAACGGTTCAAACTTCTTTTGCTTACCCAGCGACG
ATTCAAACTTCTTTTCGCATAAGACGACTCTGTAACTTGCGTGAGGTCCTTCAGCAGTTT
CACGTAAGGTCGTGCGCCATCTCATTGCGTTTCCAATCTCTTGAAGCTCGCTCATCACGT
TGATAGTGTCCCTTATGTATACACGTCCTCCAGGTCTCAGAATCCGGTCCATCTCTAGCA
TAACTGTTGTCATGTTGCACCTTTTTCTTTCGATGGAAAATAGACCAGCGGCATGCAGCA
AATCATAGGTTCTTGGGTAAGTATCGAATGGTTCACACCAATCGTGCATCACTCCTAGTA
GTCCACGGTCATATATAACAGGCAGTGTATTTGGCCCACTGACCGGAACAACATTGAGAA
CCCAGCAATCAACCTC

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 3

CO CL2068Contig1 1335 3 3 U
CATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATCAGTCGACGGTACCGGACATATGCC
CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGAAATCAGTTGAAGCAAATCTCAAAGGATTGGTTT
CTAGGGGAAAACTGACACAAGATAAAGCAAGCAAGGCCTTCTCTTTGCTCAAGGGAGTAC
TGGATTACACAGAATTCAATGACGTGGACATGGTCATAGAGGCGGTGATTGAAAACATTC
TGTTGAAACAAAAGATATTCAAAGAAATCGAAGAGGTCTGTCCACCAAACTGCATTTTGG
CGAGCAACACATCCACTATCGACCTCAACGTAATTGGGGAAAAAACTAACGCAAAAGATC
GCATTGTTGGCGCACATTTCTTCAGCCCGGCACATCTGATGACCCTTCTGGAGATAGTTC
GTACAGAGAACACATCTGCTCAGGTGATTCTTGATCTCATGGCGCTTGGAAAAGCCATAA
AGAAAGTCCCCGTGGTGGTTGGGAACTGCATAGGCTTTGCGGTGAATAGAACATTCTTTC
CCTATACACAATCTGCACACATGTTGGTCAATCTTGGTGTTGATTTGTTCAGAGTAGACA
GCGTTATCACCTCTTTCGGCTTGCCGTTGGGTCCTTTCCAGCTAGGTGATTTGGCTGGAC
ACGGGATTGGAATAGCAGTCAAGGATATATACGCCAAGGCCTATGGTGACCGAATGTTCG
CCTCTCCGTTGACAGAGCTTCTGCTCAAGAGCGGGAGAAATGGGAAGATCAACGGGAGAG
GATACTATATCTACGAAAAGGGAAGCAAACCAAAACCTGATTCATCAGTGCTGTCTGTTG
TTGAGGAATCGAGGAGACTTACCAATATCATGCCCGGTGGGAAGCCTATAACAGTAACTG
ACAAAGAGATTGTTGAGATGATATTGTTCCCTGTGGTTAACGAGGCGTGCCGTGTCCTGG
ATGAAGGAGTTGTGATCCGAGCCTCAGACTTGGACGTTGCTTCTGTCCTTGGAATGAATT
TTCCTTCTTACCGCGGGGGACTTATATTCTGGGCAGACACGGTTGGACCAAAGTACATAT
ATGAAAGGCTCAAGAGATTGTCGGAGACTTATGGTGCCTTTTTCAAACCGTCGGGGTATC
TGGAGGAAAGGGCAATGAAAGGAATGCTTCTGAGTGAACAACCTAAATCGTCGAGGTCTC
GACTGTGAATGCACAAAAGGGAACTTAAGAAGTAAGCAACAAAAGATGGGTTGGAACATG
TTTATGCTGAAATTGTTAAAGTCACTAAATGAGCTGATTGTTTTAAACATTCGAAAAGCG
AGTTCTTATGTTCTT


BQ
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AF RS1A296TF U 1
AF RS1A296TV U 37
AF RS1FC68JQ C 632
BS 1 834 RS1A296TF
BS 835 868 RS1A296TV
BS 869 1335 RS1FC68JQ

RD RS1A296TF 834 0 0
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CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGAAATCAGTTGAAGCAAATCTCAAAGGATTGGTTT
CTAGGGGAAAACTGACACAAGATAAAGCAAGCAAGGCCTTCTCTTTGCTCAAGGGAGTAC
TGGATTACACAGAATTCAATGACGTGGACATGGTCATAGAGGCGGTGATTGAAAACATTC
TGTTGAAACAAAAGATATTCAAAGAAATCGAAGAGGTCTGTCCACCAAACTGCATTTTGG
CGAGCAACACATCCACTATCGACCTCAACGTAATTGGGGAAAAAACTAACGCAAAAGATC
GCATTGTTGGCGCACATTTCTTCAGCCCGGCACATCTGATGACCCTTCTGGAGATAGTTC
GTACAGAGAACACATCTGCTCAGGTGATTCTTGATCTCATGGCGCTTGGAAAAGCCATAA
AGAAAGTCCCCGTGGTGGTTGGGAACTGCATAGGCTTTGCGGTGAATAGAACATTCTTTC
CCTATACACAATCTGCACACATGTTGGTCAATCTTGGTGTTGATTTGTTCAGAGTAGACA
GCGTTATCACCTCTTTCGGCTTGCCGTTGGGTCCTTTCCAGCTAGGTGATTTGGCTGGAC
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CCTCTCCGTTGACAGAGCTTCTGCTCAAGAGCGGGAGAAATGGGAAGATCAACGGGAGAG
GATACTATATCTACGAAAAGGGAAGCAAACCAAAACCTGATTCATCAGTGCTGT

QA 1 834 1 834
DS 

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AAGCAAATCTCAAAGGATTGGTTTCTAGGGGAAAACTGACACAAGATAAAGCAAGCAAGG
CCTTCTCTTTGCTCAAGGGAGTACTGGATTACACAGAATTCAATGACGTGGACATGGTCA
TAGAGGCGGTGATTGAAAACATTCTGTTGAAACAAAAGATATTCAAAGAAATCGAAGAGG
TCTGTCCACCAAACTGCATTTTGGCGAGCAACACATCCACTATCGACCTCAACGTAATTG
GGGAAAAAACTAACGCAAAAGATCGCATTGTTGGCGCACATTTCTTCAGCCCGGCACATC
TGATGACCCTTCTGGAGATAGTTCGTACAGAGAACACATCTGCTCAGGTGATTCTTGATC
TCATGGCGCTTGGAAAAGCCATAAAGAAAGTCCCCGTGGTGGTTGGGAACTGCATAGGCT
TTGCGGTGAATAGAACATTCTTTCCCTATACACAATCTGCACACATGTTGGTCAATCTTG
GTGTTGATTTGTTCAGAGTAGACAGCGTTATCACCTCTTTCGGCTTGCCGTTGGGTCCTT
TCCAGCTAGGTGATTTGGCTGGACACGGGATTGGAATAGCAGTCAAGGATATATACGCCA
AGGCCTATGGTGACCGAATGTTCGCCTCTCCGTTGACAGAGCTTCTGCTCAAGAGCGGGA
GAAATGGGAAGATCAACGGGAGAGGATACTATATCTACGAAAAGGGAAGCAAACCAAAAC
CTGATTCATCAGTGCTGTCTGTTGTTGAGGAATCGAGGAGACTTACCAATAT
CATG

QA 1 832 1 832
DS 

RD RS1FC68JQ 704 0 0
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CGCCAAGGCCTATGGTGACCGAATGTTCGCCTCTCCGTTGACAGAGCTTCTGCTCAAGAG
CGGGAGAAATGGGAAGATCAACGGGAGAGGATACTATATCTACGAAAAGGGAAGCAAACC
AAAACCTGATTCATCAGTGCTGTCTGTTGTTGAGGAATCGAGGAGACTTACCAATATCAT
GCCCGGTGGGAAGCCTATAACAGTAACTGACAAAGAGATTGTTGAGATGATATTGTTCCC
TGTGGTTAACGAGGCGTGCCGTGTCCTGGATGAAGGAGTTGTGATCCGAGCCTCAGACTT
GGACGTTGCTTCTGTCCTTGGAATGAATTTTCCTTCTTACCGCGGGGGACTTATATTCTG
GGCAGACACGGTTGGACCAAAGTACATATATGAAAGGCTCAAGAGATTGTCGGAGACTTA
TGGTGCCTTTTTCAAACCGTCGGGGTATCTGGAGGAAAGGGCAATGAAAGGAATGCTTCT
GAGTGAACAACCTAAATCGTCGAGGTCTCGACTGTGAATGCACAAAAGGGAACTTAAGAA
GTAAGCAACAAAAGATGGGTTGGAACATGTTTATGCTGAAATTGTTAAAGTCACTAAATG
AGCTGATTGTTTTAAACATTCGAAAAGCGAGTTCTTATGTTCTT

QA 1 704 1 704
DS 



AS 2 4

CO CL2069Contig1 777 2 9 U
GGACTCCCCTCCCCTACCATCCTCCACTCTCTCCGCCGGCGGTAAAACCATGTCGCACTT
CGGAAGGTCAGGTCCGCCGGACATCAGCGACACCTACTCTCTTCTCGTCCTCAACATCAC
CTTCCGTACGACTGCAGATGACCTCTATCCTCTATTCGCCAAGTATGGAAAGGTCGTGGA
TGTCTTCATCCCCAGAGATCGTAGGACTGGTGATTCGCGTGGTTTTGCGTTTGTTCGATA
TAAGTATAAAGATGAAGCTCATAAAGCTGTGGAAAGGCTTGATGGACGAGAGGTTGATGG
TAGAGAAATTACTGTTCAGTTTGCAAAGTATGGCCCTAATGCTGAGAAGATTTCCAAAGG
AAGAGTTGTGGAACCACCTCCAAGGTCACGAAGGTCAAGAAGCCGTAGTCCTCGAAGGAG
CCGTAGCCCTTATAGACGCCGTAGTCCTAGGAGAAGCCGCAGTCCCCGCAGGAGGTCCCG
AGATGATTACAGGGAAAGAGACTACAGGAAGAGGAGCAGAAGTAGAAGCAACGAAAGGCG
TGATAGGCATCATGACAAGGATAGAGATTACCGCCGTCGCAGTAGGTCTCGTAGTGCCAG
CCCAGATGACAAACGCAGAGTCAGAGGCCGTTATGATGATGACAGACGCAGTCGCTCCTT
GAGTGCATCTCCCCCTCGCCGCAGCCGCAGCCCTAGAAGTGCCTCCCCACTAAAAGCCTC
TCCTGGAAGCGAAGCAAAGAGAGGTCTCCAACTCCTGTTCCCCGCAGCCGTAGCCCA


BQ
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15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E523TF U 1
AF RS1BM44TF U 1
BS 1 168 RS1BM44TF
BS 169 169 RS1E523TF
BS 170 412 RS1BM44TF
BS 413 413 RS1E523TF
BS 414 570 RS1BM44TF
BS 571 571 RS1E523TF
BS 572 603 RS1BM44TF
BS 604 604 RS1E523TF
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RD RS1E523TF 671 0 0
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GAGTGCGTCTC

QA 1 671 1 671
DS 

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CTTCCGTACGACTGCAGATGACCTCTATCCTCTATTCGCCAAGTATGGCAAGGTCGTGGA
TGTCTTCATCCCCAGAGATCGTAGGACTGGTGATTCGCGTGGTTTTGCGTTTGTTCGATA
TAAGTATAAAGATGAAGCTCATAAAGCTGTGGAAAGGCTTGATGGACGAGAGGTTGATGG
TAGAGAAATTACTGTTCAGTTTGCAAAGTATGGCCCTAATGCTGAGAAGATTTCCAAAGG
AAGAGTTGTGGAACCACCTCCAAGGTCACGAAGGTCAAGAAGCCGTAGTCCTGGAAGGAG
CCGTAGCCCTTATAGACGCCGTAGTCCTAGGAGAAGCCGCAGTCCCCGCAGGAGGTCCCG
AGATGATTACAGGGAAAGAGACTACAGGAAGAGGAGCAGAAGTAGAAGCAACGAAAGGCG
TGATAGGCATCATGACAAGGATAGAGATTATCGCCGTCGCAGTAGGTCTCGTAGTGCCAG
CCCTGATGACAAACGCAGAGTCAGAGGCCGTTATGATGATGACAGACGCAGTCGCTCCTT
GAGTGCATCTCCCCCTCGCCGCAGCCGCAGCCCTAGAAGTGCCTCCCCACTAAAAGCCTC
TCCTGGAAGCGAAGCAAAGAGAGGTCTCCAACTCCTGTTCCCCGCAGCCGTAGCCCA

QA 1 777 1 777
DS 



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GAGGAGATGGGGACCTATCATTGCTCTTCCTCTCAGGAGAAGCCTTTTCCATGGAAGGAC
TTCTTGGGCTACGGCTGCGGGGAACAGGAGTTGGAGACCTCTCTTTGCTTCGCCTTCCAG
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CACTCAAGGAGCGACTGCGTCTGTCATCATCATAACGGCCTCTGACTCTGCGTTTGTCAT
CAGGGCTGGCACTACGAGACCTACTGCGACGGCGATAATCTCTATCCTTCTCATGATGCC
TATCACGCCTTTCGTTGCTTCTACTTCTGCTCCTCTTCCTGTAGTCTCTTTCCCTGTAAT
CATCTCGGGACCTCCTGCGGGGACTGCGGCTTCTCCTAGGACTACCGCGTCTATAAGGGC
TACGGCTCCTTCGAGGACTACGGCTTCTTGACCTTCGTGACCTTGGAGGTGGTTCCACAA
CTCTTCCTTTGGAATCTTCTCAGCATTAGGGCCATACTTTGCAAACTGAACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1BM44JQ U 12
AF RS1E523JQ U 1
BS 1 340 RS1E523JQ
BS 341 341 RS1BM44JQ
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RD RS1BM44JQ 705 0 0
CG
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GTTGCTTCTACTTCTGCTCCTCTTCCTGTAGTCTCTTTCCCTGTAATCATCTCGGGACCT
CCTGCGGGGACTGCGGCTTCTCCTAGGACTACGGCGTCTATAA

QA 3 705 3 705
DS 

RD RS1E523JQ 832 0 0
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AAACACACAGTAGTAGTTTAGAGCACCTACGGAAATTCAACCAATACTACAGAGGATAGA
AGTTCCCATGCTTGAAGATGAAACATCATCAATTCAAGCAAAACATGTTTGATACACACT
CTCCTTCACAAGTATGCCGTCATTCCTCCGCATTAGGAGATTGACTACGAGCTGTGTCCC
GAGGAGATGGGGACCTATCATTGCTCTTCCTCTCAGGAGAGGCCTTTTCCATGGAAGGAC
TTCTTGGGCTACGGCTGCGGGGAACAGGAGTTGGAGACCTCTCTTTGCTTCGCCTTTCAG
GAGAGGCTTTTAGTGGGGAGGCACTTCTAGGGCTGCGGCTGCTGCGGCGAGGGGGAGACG
CACTCAAGGAGCGACTGCGTCTGTCATCATCATAACGGCCTCTGACTCTGCGTTTGTCAT
CTGGGCTGGCACTACGAGACCTACTGCGACGGCGGTAATCTCTATCCTTCTCATGATGCC
TATCACGCCTTTCGTTGCTTCTACTTCTGCTCCTCTTCCTGTAGTCTCTTTCCCTGTAAT
CATCTCGGGACCTCCTGCGGGGACTGCGGCTTCTCCTAGGACTACCGCGTCTATAAGGGC
TACGGCTCCTTCGAGGACTACGGCTTCTTGACCTTCGTGACCTTGGAGGTGGTTCCACAA
CTCTTCCTTTGGAATCTTCTCAGCATTAGGGCCATACTTTGCAAACTGAACA

QA 1 832 1 832
DS 



AS 1 4

CO CL2070Contig1 878 4 16 U
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CGATATGCTCTACAAGGAGCAGAGCACGTTACTTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D115TF U 1
AF RS1FH35TF U 6
AF RS1FH35JQ C 62
AF RS1D115JQ C 152
BS 1 66 RS1D115TF
BS 67 69 RS1FH35TF
BS 70 254 RS1D115TF
BS 255 255 RS1FH35TF
BS 256 417 RS1D115TF
BS 418 421 RS1FH35TF
BS 422 519 RS1D115TF
BS 520 520 RS1FH35TF
BS 521 566 RS1D115TF
BS 567 657 RS1FH35TF
BS 658 658 RS1FH35JQ
BS 659 695 RS1FH35TF
BS 696 696 RS1FH35JQ
BS 697 709 RS1FH35TF
BS 710 836 RS1FH35JQ
BS 837 878 RS1D115JQ

RD RS1D115TF 566 0 0
GGCTCTTGAAGATTTTCTGCTCACTCTCCGCCGTACCTCTCACCCGCGACGCTTCACAAT
CTCAGC***TATGGCCGCCGCCGCGGAAATCGACGCTGAGATTCAGCAGCAGCTCACCAA
CGAGGTCAAGCTCTTCAACCGCTGGACCTACGACGACGTTTCGGTCACAGATATCAGTCT
TGTTGACTACATTGGAGTTCAGGCAGCTAAGCACGCCACCTTCGTCCCCCACACAGCCGG
AAGATACTCCGTGACGAGATTCAGGAAGGCTCAGTGTCCCATCGTCGAGAGGCTCACAAA
CTCTCTCATGATGCACGGGAGAAACAACGGAAAGAAGTTGATGGCGGTTAGGATCATCAA
GCACGCCATGGAGATCATCCACCTCTTGACCGATGCCAACCCAATCCAGGTCATCAT***
*GCCATTGTTAACAGTGGTCCTCGTGAAGATGCTACAAGAATTGGATCTGCTGGTGTTGT
TAGGAGACAAGCCGTTGATATCTCCCCTCTAAGACGTGTGAACCAGGCTATCTTCTTGCT
TACAACCGGTGCTCGTGAGGCTGCTT

QA 1 566 1 566
DS 

RD RS1FH35TF 708 0 0
GG
GAAGATTTTCTGCTCACTCTCCGCCGTACCTCTCACCCGCGACGCTTCACAATCTCAGCA
GCTATGGCCGCCGCCGCGGAAATCGACGCTGAGATTCAGCAGCAGCTCACCAACGAGGTC
AAGCTCTTCAACCGCTGGACCTACGACGACGTTTCGGTCACAGATATCAGTCTTGTTGAC
TACATTGGAGTTCAGGCAGCTAAGCACGCCACCTTCGTCCCCCACACAGCCGGAAGATAC
TCCGTGAAGAGATTCAGGAAGGCTCAGTGTCCCATCGTCGAGAGGCTCACAAACTCTCTC
ATGATGCACGGGAGAAACAACGGAAAGAAGTTGATGGCGGTTAGGATCATCAAGCACGCC
ATGGAGATCATCCACCTCTTGACCGATGCCAACCCAATCCAGGTCATCATTGATGCCATT
GTTAACAGTGGTCCTCGTGAAGATGCTACAAGAATTGGATCTGCTGGTGTTGTTAGGAGA
CAAGCCGTTGATATCTCCCCTCTAAGACGTGTCAACCAGGCTATCTTCTTGCTTACAACC
GGTGCTCGTGAGGCTGCTTTCAGGAACATTAAGACTATTGCTGAGTGCCTTGCTGATGAA
TTGATCAACGCAGCCAAGGGCTCCTCCAACAGCTATGCCATCAAAAAGAAAGATGAGATT
GAGAGAGTTGCCAAGGCTAATCGTTAAG*AGTTTCCTTTTGC
TCTG

QA 3 704 3 704
DS 

RD RS1FH35JQ 775 0 0
TCAG
CAGCTATGGCCGCCGCCGCGGAAATCGACGCTGAGATTCAGCAGCAGCTCACCAACGAGG
TCAAGCTCTTCAACCGCTGGACCTACGACGACGTTTCGGTCACAGATATCAGTCTTGTTG
ACTACATTGGAGTTCAGGCAGCTAAGCACGCCACCTTCGTCCCCCACACAGCCGGAAGAT
ACTCCGTGAAGAGATTCAGGAAGGCTCAGTGTCCCATCGTCGAGAGGCTCACAAACTCTC
TCATGATGCACGGGAGAAACAACGGAAAGAAGTTGATGGCGGTTAGGATCATCAAGCACG
CCATGGAGATCATCCACCTCTTGACCGATGCCAACCCAATCCAGGTCATCATTGATGCCA
TTGTTAACAGTGGTCCTCGTGAAGATGCTACAAGAATTGGATCTGCTGGTGTTGTTAGGA
GACAAGCCGTTGATATCTCCCCTTTAAGACGTGTCAACCAGGCTATCTTCTTGCTTACAA
CCGGTGCTCGTGAGGCTGCTTTCAGGAACATTAAGACTATTGCTGAGTGCCTTGCTGATG
AATTGATCAACGCAGCCAAGGGCTCCTCCAACAGCTATGCCATCAAAAAGAAGGATGAGA
TTGAGAGAGTTGCCAAGGCTAATCGTTAAGGAGTTTCCTTTTGCCCTGAGGGTTATAATT
TTTATCAAATCAATTTTATGCTCTTTTTTCAACTAGATTGGGACGTGTTTCAGATGTCTT
GTTCTTTGAAGTTTATTTTGTCTGGACGACTTTGAATAGATACATTTATTT

QA 5 775 5 775
DS 

RD RS1D115JQ 727 0 0
GACGACGTTTCGGTCACAGATATCAGTCTTGTTGACTACATTGGAGTTCAGGCAGCTAAG
CACGCCACCTTCGTCCCCCACACAGCCGGAAGATACTCCGTGACGAGATTCAGGAAGGCT
CAGTGTCCCATCGTCGAGAGGCTCACAAACTCTCTCATGATGCACGGGAGAAACAACGGA
AAGAAGTTGATGGCGGTTAGGATCATCAAGCACGCCATGGAGATCATCCACCTCTTGACC
GATGCCAACCCAATCCAGGTCATCAT****GCCATTGTTAACAGTGGTCCTCGTGAAGAT
GCTACAAGAATTGGATCTGCTGGTGTTGTTAGGAGACAAGCCGTTGATATCTCCCCTCTA
AGACGTGTGAACCAGGCTATCTTCTTGCTTACAACCGGTGCTCGTGAGGCTGCTTTCAGG
AACATTAAGACTATTGCTGAGTGCCTTGCTGATGAATTGATCAACGCAGCCAAGGGCTCC
TCCAACAGCTATGCCATCAAAAAGAAGGATGAGATTGAGAGAGTTGCCAAGGCTAATCGT
TAAGGAGTTTCCTTTTGCCCTGAGGGTTATAATTTTTATCAAATCAATTTTATGCTCTTT
TTTCAACTAGATTGGGACGTGTTTCAGATGTCTTGTTCTTTGAAGTTTATTTTGTCTGGA
CGACTTTGAATAGATACATTTATTTATTTCGATATGCTCTACAAGGAGCAGAGCACGTTA
CTTTGGC

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 4

CO CL2071Contig1 966 4 15 U
ATGAAGAAAGTGCTCAAAACATCCATAATAAAAACAAAACAAGAGTTCCAACAGCTAAAC
AAAAAAAGAGGTCTATCAAGTTTTACGATAATCCCAGCAAACGACAGACAATAATAAAAG
ATATGCATCTTAGTTCATCCTTTGGGCAGCCTCTTTCGCAAGAACCCTTTCCTTGGCCTT
TGTCCTCGCCTGCGATTTGGATCCCATGATGCCTCCTCCCCATTTCTTCCTGTACTCCTC
GTACTTGTCGTTGAAGTTTGCCTT*GATGGCCTCAAGGATCTTGCTGAACTCTAGCTTGT
CCTCGTTCTTGACAGTTGTCAAACACAA*GCAAGCAGCAGTCTTCTGGTGAACGACCGTT
CCAAGACGAGATTTGCCTTTAACAATGCAGTAAGGCACTTCCATCTTTCTGCAAAGAGCA
GGCAACCAGACGACCAACTCGATGGGGTCAACATCGTGCGCAATGACGACAAGCTGTGCC
TTGTTCTGCTCGATGAGGTAAGTGACGTGGTTGAGTCCGTACTTGACGACAATGGGCTTC
TTGGATTCAGAAGGCTTTCCCTCGGCCTCGGCTTGAGCCTTTTTGAGAAGACGATCCTTC
TTGGCGGCCTTGTCCTCTGGTCTGTACTTCATAAGAACCTTGAAGAGCTGGGTGGCAAGG
TTCTTGTCAAGAGTCTTGGTGAACTGGTTCAAAGCCGGGGGGACCTTGAGCCTCTGCTTA
AGGATACGCTTCTGCCTTTGGAGACGGATTGACTTAGGCCATTTGGTGCAGCGAGTCAGA
TCCTTCTTTGG*AGGAAGAGCTCCTCCGATACCGAATTGCTTAGGCCTCCTCTCGAACAG
AGGGTTCGTTACTTTCTCCGTCTTCTTCTTGGCAGCTACCTTCACTCCTTTCTTCGGGGC
CATTGTCGTCCTCCTCTGCTGCAACTCCAAATGATGTGAAACGGACGGCTGAGTGAAAGG
AAGTCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1ER44JQ U 1
AF RS1AJ64JQ U 3
AF RS1ER44TF C 267
AF RS1AJ64TF C 240
BS 1 101 RS1ER44JQ
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BS 551 591 RS1ER44JQ
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BS 759 791 RS1AJ64JQ
BS 792 792 RS1AJ64TF
BS 793 823 RS1AJ64JQ
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BS 825 838 RS1AJ64JQ
BS 839 966 RS1AJ64TF

RD RS1ER44JQ 591 0 0
ATGAAGAAAGTGCTCAAAACATCCATAATAAAAACAAAACAAGAGTTCCAACAGCTAAAC
AAAAAAAGAGGTCTATCAAGTTTTACGATAATCCCAGCAAATGACAGACAATAATAAAAG
ATATGCATCTTAGTTCATCCTTTGGGCAGCCTCTTTCGCAAGAACCCTTTCCTTGGCCTT
TGTCTTCGCCTGCGATTTGGATCCCATGATGCCTCCTCCCCATTTCTTCCTGTACTCCTC
GTACTTGTCGTTGAAGTTTGCCTT*GATGGCCTCAAGGATCTTGCTGAACTCTAGCTTGT
CCTCGTTCTTGACAGTTGTCAAACACAA*GCAAGCAGCAGTCTTCTGGTGAACGACCGTT
CCAAGACGAGATTTGCCTTTAACAATGCAGTAAGGCACTTCCATCTTTCTGCAAAGAGCA
GGCAACCAGACGACCAACTCGATGGGGTCAACATCGTGCGCAATGACGACAAGCTGTGCC
TTGTTCTGCTCGATGAGGTAAGTGACGTGGTTGAGTCCGTACTTGACGACAATGGGCTTC
TTGGATTCAAAAGGCTTTCCCTCGGCCTCGGCTTGAGCCTTTTTGAGAAGA

QA 1 591 1 591
DS 

RD RS1AJ64JQ 836 0 0
GAAGAAAGTGCTCAAAACATCCCTAATAAAAACAAAACAAGAGTTCCAACAGCTAAACAA
AAAA*GAGGTCTATCAAGTTTTACGATAATCCCAGCAAACGACAGACAATAATAAAAGAT
ATGCATCTTAGTTCATCTTTTGGGCAGCCTCTTTCGCAAGAACCCTTTCCTTGGCCTTTG
TCCTCGTCTGCGATTTGGATCCCATGATGCCTCCTCCCCATTTCTTCCTGTACTCCTCGT
ACTTGTCGTTGAAGTTTGCCTT*GATGGCCTCAAGGATCTTGCTGAACTCTAGTTTGTCC
TCGTTCTTGACAGTTGTCAAACACAA*GCAAGCGGCAGTCTTCTGGTGAACGACCGTTCC
AAGACGAGATTTGCCTTTAACAATGCAGTAAGGCACTTCCATCTTTCTGCAAAGAGCAGG
CAACCAGACGACCAACTCGATGGGGTCAACATCGTGCGCAATGACGACAAGCTGTGCCTT
GTTCTGCTCGATGAGGTAAGTGACGTGGTTGAGTCCGTACTTGACGACAATGGGCTTCTT
GGATTCAGAAGGCTTTCCCTCGGCCTCGGCTTGAGCCTTTTTGAGAAGACGATCCTTCTT
GGCGGCCTTGTCCTCTGGTCTGTACTTCATAAGAACCTTGAAGAGCTGGGTGGCAAGGTT
CTTGTCAAGAGTCTTGGTGAACTGGTTCAAAGCCGGGGGGACCTTGAGCCTCTGCTTAAG
GATACGCTTCTGCCTTTGGAGACGGATTGACTTAG*CCATTTGGTGCAGCGAGTCAGATC
CTTCTTTGGGAGGAAGAGCTCCTCCGATACCGAATTGCTTACGCCTCCTCTCGAAC

QA 1 836 1 836
DS 

RD RS1ER44TF 691 0 0
ATGGCCTCAAGGATCTTGCTGAACTCTAGCTTGTCCTCGTTCTTGACAGTTGTCAAACAC
AA*GCAAGCAGCAGTCTTCTGGTGAACGACCGTTCCAAGACGAGATTTGCCTTTAACAAT
GCAGTAAGGCACTTCCATCTTTCTGCAAAGAGCAGGCAACCAGACGACCAACTCGATGGG
GTCAACATCGTGCGCAATGACGACAAGCTGTGCCTTGTTCTGCTCGATGAGGTAAGTGAC
GTGGTTGAGTCCGTACTTGACGACAATGGGCTTCTTGGATTCAGAAGGCTTTCCCTCGGC
CTCGGCTTGAGCCTTTTTGAGAAGACGATCCTTCTTGGCGGCCTTGTCCTCTGGTCTGTA
CTTCATAAGAACCTTGAAGAGCTGGGTGGCAAGGTTCTTGTCAAGAGTCTTGGTGAACTG
GTTCAAAACCGGGGGGACCTTGAGCCTCTGCTTAAGGATACGCTTCTGCCTTTGGAGACG
GATTGACTTAGGCCATTTGATGTAGCGAGTCAGATCCTTCTTTGG*AGGAAGAGCTCCTC
CGATACCGAATTGCTTAGGCCTCCTCTCGAACAGAGGGTTCGTTACTTTCTCCGTCTTCT
TCTTGGCAGCTACCTTCACTCCTTTCTTCGGGGCCATTGTCGTCCTCCTCTGCTGCAACT
CCAAATGATGTGAAACGGACGGCTGAGT
CCC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RS1AJ64TF 727 0 0
CGTACTTGTCGTTGAAGTTTGCCTTTGATGGCCTCAAGGATCTTGCTGAACTCTAGTTTG
TCCTCGTTCTTGACAGTTGTCAAACACAAAGCAAGCGGCAGTCTTCTGGTGAACGACCGT
TCCAAGACGAGATTTGCCTTTAACAATGCAGTAAGGCACTTCCATCTTTCTGCAAAGAGC
AGGCAACCAGACGACCAACTCGATGGGGTCAACATCGTGCGCAATGACGACAAGCTGTGC
CTTGTTCTGCTCGATGAGGTAAGTGACGTGGTTGAGTCCGTACTTGACGACAATGGGCTT
CTTGGATTCAGAAGGCTTTCCCTCGGCCTCGGCTTGAGCCTTTTTGAGAAGACGATCCTT
CTTGGCGGCCTTGTCCTCTGGTCTGTACTTCATAAGAACCTTGAAGAGCTGGGTGGCAAG
GTTCTTGTCAAGAGTCTTGGTGAACTGGTTCAAAGCCGGGGGGACCTTGAGCCTCTGCTT
AAGGATACGCTTCTGCCTTTGGAGACGGATTGACTTAGGCCATTTGGTGCAGCGAGTCAG
ATCCTTCTTTGG*AGGAAGAGCTCCTCCGATACCGAATTGCTTAGGCCTCCTCTCGAACA
GAGGGTTCGTTACTTTCTCCGTCTTCTTCTTGGCAGCTACCTTCACTCCTTTCTTCGGGG
CCATTGTCGTCCTCCTCTGCTGCAACTCCAAATGATGTGAAACGGACGGCTGAGTGAAAG
GAAGTCC

QA 1 727 1 727
DS 



AS 2 4

CO CL2072Contig1 1027 2 8 U
GGAACAAAACCTGAATCTTCCGGAAGAAATTGGTAAAAAAGCAATGAAGCGATTCTTCAA
GCCGATAGAGAAAGAGGGCTCATCGGCGCCTAAGAAGCCCTGCCTCCTCTCCCCTGAAAA
GCGCAACGGAGAAGCAGTTGAAGAACAGAAACAGAAAGAGCCAACAAAGTTTGTAACTTG
GAACGCTAATAGCTTCCTCCTTCGTGTCAAAAACGACTGGTCCGACCTCTCTAAGTTCGT
TTCCGATTTCGACCCTGATGTCATTGCCATACAGGAAGTAAGAATGCCTGCAGCTGGTGG
CAAGGGTAAACCTAAAAATTATGCCGAGTTGAGTGATGACACCAAACCTTTGCGTGAGGA
GAGACAGATATTGATGCGGGCTCTCTCAAGTCCACCATTTGGAAACTATCGAGTTTGGTG
GTCTCTTGCGGAGTCCAAGTATGCAGGGACAGCCTTGCTTGTCAAAAAGTGTTTCAACCC
CCTCAAAGTTTACTTCAACCTTGACAAACTTGCGTCTAAACATGAAGCTGATGGTCGTGT
AATCTTAGCTGAGTTCGAGACGTTTCGTCTTTTGAACACGTATTCGCCTAACAATGGTTG
GAAAGAGGAGGAGAATTCGTTTCTGAGGAGAAGAAAATGGGACAAGAGGATTCTTGACTT
CCTCTCCCAAACTTCTGATAAACCTCTCATATGGTGCGGCGACTTAAATGTCAGTCATGA
GGAGGTAGATGTTAGCCATCCAGATTTTTTCGCAACAGCAAAGCTTAATGGTTATGTTCC
TCCAAACAAAGAGGACTGCGGACAGCCTGGATTTACGCCATCAGAGAGAGCACGCTTCGG
TACAATCATGAAAGAAGGAAGGCTTGTTGATGCATACCGGTATCTACACAAGGAACCAGA
CACGGAAAGTGGGTTCTCATGGTCTGGGAATCCCATTGGAAAGTACAGGGAAAGAGGATG
AGATCGACTATTTTCTGGTTTCTGACAGCTCAAGACCGTATAGTTTCTGTAGATGCACGG
TCGTGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C617TF U 1
AF RS1CJ28TF U 257
BS 1 365 RS1C617TF
BS 366 366 RS1CJ28TF
BS 367 547 RS1C617TF
BS 548 548 RS1CJ28TF
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BS 580 644 RS1C617TF
BS 645 1027 RS1CJ28TF

RD RS1C617TF 644 0 0
GGAACAAAACCTGAATCTTCCGGAAGAAATTGGTAAAAAAGCAATGAAGCGATTCTTCAA
GCCGATAGAGAAAGAGGGCTCATCGGCGCCTAAGAAGCCCTGCCTCCTCTCCCCTGAAAA
GCGCAACGGAGAAGCAGTTGAAGAACAGAAACAGAAAGAGCCAACAAAGTTTGTAACTTG
GAACGCTAATAGCTTCCTCCTTCGTGTCAAAAACGACTGGTCCGACCTCTCTAAGTTCGT
TTCCGATTTCGACCCTGATGTCATTGCCATACAGGAAGTAAGAATGCCTGCAGCTGGTGG
CAAGGGTAAACCTAAAAATTATGCCGAGTTGAGTGATGACACCAAACCTTTGCGTGAGGA
GAGACGGATATTGATGCGGGCTCTCTCAAGTCCACCATTTGGAAACTATCGAGTTTGGTG
GTCTCTTGCGGAGTCCAAGTATGCAGGGACAGCCTTGCTTGTCAAAAAGTGTTTCAACCC
CCTCAAAGTTTACTTCAACCTTGACAAACTTGCGTCTAAACATGAAGCTGATGGTCGTGT
AATCTTATCTGAGTTCGAGACGTTTCGTCTTTTGAACATGTATTCGCCTAACAATGGTTG
GAAAGAGGAGGAGAATTCGTTTCTGAGGAGAAGAAAATGGGACA

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1CJ28TF 771 0 0
GATGTCATTGCCATACAGGAAGTAAGAATGCCTGCAGCTGGTGGCAAGGGTAAACCTAAA
AATTATGCCGAGTTGGGTGATGACACCAAACCTTTGCGTGAGGAGAGACAGATATTGATG
CGGGCTCTCTCAAGTCCACCATTTGGAAACTATCGAGTTTGGTGGTCTCTTGCGGAGTCC
AAGTATGCAGGGACAGCCTTGCTTGTCAAAAAGTGTTTCAACCCCCTCAAAGTTTACTTC
AACCTTGACAAACTTGCGTCTAAACATGAAGCTGATGGTCGTGTAATCTTAGCTGAGTTC
GAGACGTTTCGTCTTTTGAACACGTATTCGCCTAACAATGGTTGGAAAGAGGAGGAGAAT
TCGTTTCTGAGGAGAAGAAAATGGGACAAGAGGATTCTTGACTTCCTCTCCCAAACTTCT
GATAAACCTCTCATATGGTGCGGCGACTTAAATGTCAGTCATGAGGAGGTAGATGTTAGC
CATCCAGATTTTTTCGCAACAGCAAAGCTTAATGGTTATGTTCCTCCAAACAAAGAGGAC
TGCGGACAGCCTGGATTTACGCCATCAGAGAGAGCACGCTTCGGTACAATCATGAAAGAA
GGAAGGCTTGTTGATGCATACCGGTATCTACACAAGGAACCAGACACGGAAAGTGGGTTC
TCATGGTCTGGGAATCCCATTGGAAAGTACAGGGAAAGAGGATGAGATCGACTATTTTCT
GGTTTCTGACAGCTCAAGACCGTATAGTTTCTGTAGATGCACGGTCGTGGG

QA 1 771 1 771
DS 



CO CL2072Contig2 611 2 7 U
AATATTTGGTTAAATCACTATTAATATTTGGTTAAATCACAACAATACGTAGTACCTTTG
AGAGCTCATCAAAGCAACAAGGCGAAATACGTGTCTCAATAACATCAACCTAAATCTTTT
TTAAGTCTTTCAAAAGTAAACTAAAGATCATCTAAGCTCAACTCTGATAAAAACAAGCTT
TGGTTTGAGTCTAAAGAAAGCTTGTTTTCTGTTGCAAACGATGATGGTTTTCAGTTAAAA
ACCTGTTTCTCTTCCGACTCTGAAGGTGGCTTCGAAAGCTCAAGTGAAACCGGACAGTGA
TCACTCCCATAGAAACCTTCTAATTCTATCCCACGACCGTGCACCTTACAAGAAACTATA
CGGTCTTTGAGCTGTTCAAAAACCAAAAAATAGTCGATCCCCATCCTCTTTCCCCTGTAC
TTTCCAATGGGATTCCCAGACCATGAGAACCCACTTTCCGTGTCTGGTTCCTTGTGTAGA
TACCGGTATGCATCAACAAGCCTTCCTTCTTTCATGATTGTACCGAAGCGTGCTCTCTCT
GATGGCGTAAATCCAGGCTGTCCGCAGTCCTCTTTGTTTGGAGGAACATAACCATTAAGC
TTTGCTGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C617JQ U 132
AF RS1CJ28JQ U 1
BS 1 282 RS1CJ28JQ
BS 283 283 RS1C617JQ
BS 284 343 RS1CJ28JQ
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BS 401 401 RS1C617JQ
BS 402 611 RS1CJ28JQ

RD RS1C617JQ 417 0 0
AAAAGTAAACTAAAGATCATCTAAGCTCAACTCTGATAAAAACAAGCTTTGGTTTGAGTC
TAAAGAAAGCTTGTTTTCTGTTGCAGACGATGATGGTTTTCAGTTAGAAACCTGTTTCTC
TTCCGACTCTGAAGGTGGCTTCGAAAGCTCAAGTGAAACCGGACAGTGATCACTCCCATA
GAAACCTTCTAATTCTATCCCACGACCGTGCACCTTACAAGAAACTATACGGTCTTTGAG
CTGTTCAGAAACCAGAAAATAGTCGATCCCCATCCTCTTTCCCCTGTACTTTCCAATGGG
ATTCCCAGACCATGAGAACCCACTTTCCGTGTCTGGTTCCTTGTGTAGATACCGGTATGC
ATCAACAAGCCTTCCTTCTTTCATGATTGTACCGAAGCGTGCTCTCTCTGATGGCGT

QA 1 417 1 417
DS 

RD RS1CJ28JQ 611 0 0
AATATTTGGTTAAATCACTATTAATATTTGGTTAAATCACAACAATACGTAGTACCTTTG
AGAGCTCATCAAAGCAACAAGGCGAAATACGTGTCTCAATAACATCAACCTAAATCTTTT
TTAAGTCTTTCAAAAGTAAACTAAAGATCATCTAAGCTCAACTCTGATAAAAACAAGCTT
TGGTTTGAGTCTAAAGAAAGCTTGTTTTCTGTTGCAAACGATGATGGTTTTCAGTTAAAA
ACCTGTTTCTCTTCCGACTCTGAAGGTGGCTTCGAAAGCTCAGGTGAAACCGGACAGTGA
TCACTCCCATAGAAACCTTCTAATTCTATCCCACGACCGTGCATCTTACAAGAAACTATA
CGGTCTTTGAGCTGTTCAAAAACCAAAAAATAGTCGATCCTCATCCTCTTTCCCCTGTAC
TTTCCAATGGGATTCCCAGACCATGAGAACCCACTTTCCGTGTCTGGTTCCTTGTGTAGA
TACCGGTATGCATCAACAAGCCTTCCTTCTTTCATGATTGTACCGAAGCGTGCTCTCTCT
GATGGCGTAAATCCAGGCTGTCCGCAGTCCTCTTTGTTTGGAGGAACATAACCATTAAGC
TTTGCTGTTGC

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 3

CO CL2073Contig1 984 3 7 U
GGTCATGAGCGAGCTCTTCGGGAAAGTCACCGGTTGCTGCAGAGGCCAAGGTGGGTCCAT
GCACATGTTCTCTAAAGAACACAACGTGCTCGGTGGGTTCGCCTTTATCGGAGAAGGCAT
CCCTGTCGCCACCGGTGCTGCTTTCACTTCCAAGTACAAGAGGGAAGTCTTGAAACAGGA
CTGCGAAGACGTCACCGTTGCGTTTTTTGGAGATGGGACTTGTAACAACGGGCAGTTCTA
CGAGTGTCTCAACATGGCTGCGCTTTATAAGTTGCCTATTATCTTCGTTGTTGAGAATAA
CTTGTGGGCGATTGGGATGTCTCATTTGAGGTCGACTTCTGATCCCGAGATATGGAAGAA
AGGACCTGCGTTTGGGATGCCTGGTGTTCATGTCGACGGTATGGATGTGCTGAAGGTGAG
GGAAGTGGCTAAAGAGGCAGTGGGAAGAGCTAGAAGAGGTGAAGGTCCAACCTTGGTGGA
GTGTGAGACTTACAGGTTCAGAGGACACTCCTTGGCTGATCCTGATGAGCTCCGTGATGC
TGCTGAGAAAGCCAAGTACGCGGCTAGAGACCCGATCACAGCGCTGAAGAAGTATCTGGT
AGAGAACAAGCTTGCTAATGAAGGGGAGCTTAAGTCGATAGAGAAGAAGATAGACGAGTT
GGTTGAGGAAGCGGTTGAGTTTGCAGACGCGAGTCCACAGCCTGGTCGGAGTCAGTTGCT
AGAGAATGTGTTTGCTGATCCCAAAGGGTTTGGAATTGGACCTGATGGACGTTACAGATG
CGAGGATCCCAAGTTTACTGAAGGCACTGCTCAAGTCTGAGACAAGAGATAAAAGAGAGA
GAGTTAAATTATAATGTCTTTGGCTTCTGTTTGATGTTCTCTTACATATTATGAAGTTAA
AATGCCCCAGAGAAACAGTTTGTATCGTCTGAAGTTTTTTTTTTCCTGGCTGGATGGTTT
TATGATTTACAAATATGTTCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GY21TF U 1
AF RS1FS35TF U 245
AF RS1AQ27JQ C 144
BS 1 179 RS1GY21TF
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GCACATGTTCTCTAAAGAACACAACGTGCTCGGTGGGTTCGCCTTTATCGGAGAAGGCAT
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TTGCGAAGACGTCACCGTTGCGTTTTTTGGAGATGGGACTTGTAACAACGGGCAGTTCTA
CGAGTGTCTCAACATGGCTGCGCTTTATAAGTTGCCTATTATCTTTGTTGTTGAGAATAA
CTTGTGGGCGATTGGGATGTCTCATTTGAGGTCGACTTCTGATCCCGAGATATGGAAGAA
AGGACCTGCGTTTGGGATGCCTGGTGTTCATGTCGACGGTATGGATGTGCTGAAGGTGAG
GGAAGTGGCTAAAGAGGCAGTGGGAAGAGCTAGAAGAGGTGAAGGTCCAACCTTGGTGGA

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DS 

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TGGGCGATTGGGATGTCTCATTTGAGGTCGACTTCTGATCCCGAGATATGGAAGAAAGGA
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GAGGAAGCGGTTGAGTTTGCAGACGCGAGTCCACAGCCTGGTCGGAGTCAGTTGCTAGAG
AATGTGTTTGCTGATCCCAAAGGGTTTGGAATTGGACCTGATGGACGTTACAGATGCGAG
GATCCCAAGTTTACTGAAGGCACTGCTCAAGTCTGAGACAAGAGATAAAAGAGAGAGAGT
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QA 1 653 1 653
DS 

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TTTATAAGTTGCCTATTATCTTCGTTGTTGAGAATAACTTGTGGGCGATTGGGATGTCTC
ATTTGAGGTCGACTTCTGATCCCGAGATATGGAAGAAAGGACCTGCGTTTGGGATGCCTG
GTGTTCATGTCGACGGTATGGATGTGCTGAAGGTGAGGGAAGTGGCTAAAGAGGCAGTGG
GAAGAGCTAGAAGAGGTGAAGGTCCAACCTTGGTGGAGTGTGAGACTTACAGGTTCAGAG
GACACTCCTTGGCTGATCCTGATGAGCTCCGTGATGCTGCTGAGAAAGCCAAGTACGCGG
CTAGAGACCCTATCACAGCGCTGAAGAAGTATCTGGTAGAGAACAAGCTTGCTAATGAAG
GGGAGCTTAAGTCGATAGAGAAGAAGATAGACGAGTTGGTTGAGGAAGCGGTTGAGTTTG
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AAGGGTTTGGAATTGGACCTGATGGACGTTACAGATGCGAGGATCCCAAGTTTACTGAAG
GCACTGCTCAAGTTTGAGACAAGAGATAAAAGAGAGAGAGTTAAATTATAATGTCTTTGG
CTTCTGTTTGATGTTCTCTTACATATTATGAAGTTAAAATGCCCCAGAGAAACAGTTTGT
ATCGTCTGAAGTTTTTTTTTTCCTGGCTGGATGGTTTTATGATTTACAAATATGTTCTTT
T

QA 1 841 1 841
DS 



AS 1 2

CO CL2074Contig1 1130 2 2 U
GATAGAATAGAATGGCTTCTTCGTCTCCCTCTCCTACGGCAGCGATGAAGGAAGGAGACT
ACGCAAACTGGGCGGAGCTTCCGCCGGAGCTGACGTCATCGATCCTTCACCGGCTCGGCG
CGATCGAGATAGTGGAAACCGCTCAGAAAGTGTGCAGATCGTGGCGTCGCGTCTGTAAAG
ACCCTTCGATGTGGCGCAAAATCGACATGCATAGCCTCGGAGACTGTGAAGACATGTACT
ACGAGAAATTGTGCCGTCACGCAGTTGATCTTAGCCAGGGAGGCTTGGTTGAGATCAACC
TCTGCCACTTCGCTACTGATTCTCTCCTCAATTACATCGCCGATAGTTCAAGTAACCTGA
GAAGCCCTAAAGTTGCAATGTGCTATGAAATAACAGGCGAGGGTCTTGTGGAAGCAGTTT
CGAAACTTCATTTGCTTGAAGTCCTCGAGGTCTCATACTGCTCAGTATCAGGAGAGTCTC
TTAAAGTTGTAGGCCAGTCTTGTCCAAATCTCAAGACTCTGAAGAAAAACTGCGTGGGTT
ACAAACGTCCTCGAGACGAGTGTGATGATGTTGCTCTGGCAATCGCTGAGACAATGCCCG
GACTTTGCCACCTACAGCTTTTCGGGGACAGGTTAACAGACGTTGGGTTGAACGCCATTC
TCGACGGTTGTCCTAACCTGGAACATCTTGATCTGCGCCAGTGTTTCAACGTTGACCTTG
TTGGGGATCTGGAGAAGCGGTGTCTCGAGAGGATTAAAGTTGTGAGACGCCCTAATGACT
CGGTTCATGATTACCCATTCGATGCGACGGTTAATGACGTGTGTTCATCCGACGATGAAG
ACCCTTATGGTTCATCTGATGTTGATATAATGTCAGAAGATGAGTTTTACTATGATGACC
TCTCAGATGCTAGTGACAATTCTGACTTTGACCCGTACTATTATTATTAGCATGATCTGT
GTTTGTAAACCGTTTTCAAACTCGTTAATGACCCTCCTTTAAGCATATGCTTTTACTTTC
GTTGGACTTCATGTGTCCTTGTGTAATATGTGTGTGTGACCTTTAGCAGTATTTTCTATA
TGCCTTTGTGTTTCTGGAAGGTCAGAATGATGTGATTAGTTTCACCTTCC


BQ
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AF RS1E414TF U 1
AF RS1E414JQ C 314
BS 1 622 RS1E414TF
BS 623 1130 RS1E414JQ

RD RS1E414TF 622 0 0
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ACGCAAACTGGGCGGAGCTTCCGCCGGAGCTGACGTCATCGATCCTTCACCGGCTCGGCG
CGATCGAGATAGTGGAAACCGCTCAGAAAGTGTGCAGATCGTGGCGTCGCGTCTGTAAAG
ACCCTTCGATGTGGCGCAAAATCGACATGCATAGCCTCGGAGACTGTGAAGACATGTACT
ACGAGAAATTGTGCCGTCACGCAGTTGATCTTAGCCAGGGAGGCTTGGTTGAGATCAACC
TCTGCCACTTCGCTACTGATTCTCTCCTCAATTACATCGCCGATAGTTCAAGTAACCTGA
GAAGCCCTAAAGTTGCAATGTGCTATGAAATAACAGGCGAGGGTCTTGTGGAAGCAGTTT
CGAAACTTCATTTGCTTGAAGTCCTCGAGGTCTCATACTGCTCAGTATCAGGAGAGTCTC
TTAAAGTTGTAGGCCAGTCTTGTCCAAATCTCAAGACTCTGAAGAAAAACTGCGTGGGTT
ACAAACGTCCTCGAGACGAGTGTGATGATGTTGCTCTGGCAATCGCTGAGACAATGCCCG
GACTTTGCCACCTACAGCTTTT

QA 1 622 1 622
DS 

RD RS1E414JQ 817 0 0
TACTGATTCTCTCCTCAATTACATCGCCGATAGTTCAAGTAACCTGAGAAGCCCTAAAGT
TGCAATGTGCTATGAAATAACAGGCGAGGGTCTTGTGGAAGCAGTTTCGAAACTTCATTT
GCTTGAAGTCCTCGAGGTCTCATACTGCTCAGTATCAGGAGAGTCTCTTAAAGTTGTAGG
CCAGTCTTGTCCAAATCTCAAGACTCTGAAGAAAAACTGCGTGGGTTACAAACGTCCTCG
AGACGAGTGTGATGATGTTGCTCTGGCAATCGCTGAGACAATGCCCGGACTTTGCCACCT
ACAGCTTTTCGGGGACAGGTTAACAGACGTTGGGTTGAACGCCATTCTCGACGGTTGTCC
TAACCTGGAACATCTTGATCTGCGCCAGTGTTTCAACGTTGACCTTGTTGGGGATCTGGA
GAAGCGGTGTCTCGAGAGGATTAAAGTTGTGAGACGCCCTAATGACTCGGTTCATGATTA
CCCATTCGATGCGACGGTTAATGACGTGTGTTCATCCGACGATGAAGACCCTTATGGTTC
ATCTGATGTTGATATAATGTCAGAAGATGAGTTTTACTATGATGACCTCTCAGATGCTAG
TGACAATTCTGACTTTGACCCGTACTATTATTATTAGCATGATCTGTGTTTGTAAACCGT
TTTCAAACTCGTTAATGACCCTCCTTTAAGCATATGCTTTTACTTTCGTTGGACTTCATG
TGTCCTTGTGTAATATGTGTGTGTGACCTTTAGCAGTATTTTCTATATGCCTTTGTGTTT
CTGGAAGGTCAGAATGATGTGATTAGTTTCACCTTCC

QA 1 817 1 817
DS 



AS 1 4

CO CL2075Contig1 766 4 25 U
GGAGATGGATGGGATGAACGCCAAGAAAACCGTCTTCATCATCGGAGCAACCAACAGACC
CGACATCATTGACTCTGCTCTTCTCCGACCAGGAAGGCTCGACCAGCTCATTTACATTCC
GCTGCCGGACGAGGATTCACGTCTCAATATCTTCAAGGCCGCCTTGAGGAAGTCTATCGC
TAAAGATGTAGACATCAACGCTCTCGCTAAGTACACACAGGGATTCAGTGGTGCTGATAT
AACTGAGATTTGCCAGAGGG*CTTGCAAATACGCCATCAGAGAAAACATCGAGAAGGACA
TAGAGAAGGAGAAGAGGAGGAGCGAGAACCCAGAAGCCATGGAGGAAGATGGAGTTGATG
AAGTATCAGAGATAAAAGCTGCACACTTTGAGGAGTCGATGAAGTACGCACGCAGGAGTG
TGAGCGATGCAGACATCAGGAAATACCAAGCCTTTGCTCAGACGCTGCAGCAGTCTAGAG
GGTTTGGTTCCGAGTTCAGGTTCGAGACTAATGCTGGTTCAGGTGCAACCACTGGAGTCG
CTGATCCTTTTGCCACGTCTGCAGCTGCTACTGCGGACGATGATGATCTCTACAATTAGT
GATCCAGTTTATCATACTTTGTTATTTAAGTTTTCAGTCGGATTCTCTCTTGCTTCTGGA
TACCTTGTGTTTTCTTTAAGTTATCAGAATTATGTTGGTGCTTTTAATCAATGTCCTCAA
TTG*ACTACTCTTGTTCATTCGTATTGACTACTAAATCTTCTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CE78TF U 1
AF RS1CE78JQ C 35
AF RS1AN42JQ C 159
AF RS1AN42TF U 159
BS 1 177 RS1CE78TF
BS 178 178 RS1AN42TF
BS 179 301 RS1CE78TF
BS 302 302 RS1AN42TF
BS 303 331 RS1CE78TF
BS 332 332 RS1AN42TF
BS 333 364 RS1CE78TF
BS 365 365 RS1AN42TF
BS 366 442 RS1CE78TF
BS 443 443 RS1AN42TF
BS 444 451 RS1CE78TF
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BS 453 466 RS1CE78TF
BS 467 467 RS1AN42TF
BS 468 525 RS1CE78TF
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BS 640 668 RS1CE78TF
BS 669 669 RS1AN42TF
BS 670 681 RS1CE78TF
BS 682 751 RS1AN42TF
BS 752 766 RS1AN42JQ

RD RS1CE78TF 685 0 0
GGAGATGGATGGGATGAACGCCAAGAAAACCGTCTTCATCATCGGAGCAACCAACAGACC
CGACATCATTGACTCTGCTCTTCTCCGACCAGGAAGGCTCGACCAGCTCATTTACATTCC
GCTGCCGGACGAGGATTCACGTCTCAATATCTTCAAGGCCGCCTTGAGGAAGTCTATTGC
TAAAGATGTAGACATCAACGCTCTCGCTAAGTACACACAGGGATTCAGTGGTGCTGATAT
AACTGAGATTTGCCAGAGGG*CTTGCAAATACGCCATCAGAGAAAACATCGAGAAGGACA
TTGAGAAGGAGAAGAGGAGGAGCGAGAACCCTGAAGCCATGGAGGAAGATGGAGTTGATG
AAGTGTCAGAGATAAAAGCTGCACACTTTGAGGAGTCGATGAAGTACGCACGCAGGAGTG
TGAGCGATGCAGACATCAGGAAGTACCAAGCTTTTGCTCAGACGCTTCAGCAGTCTAGAG
GGTTTGGTTCCGAGTTCAGGTTCGAGACTAATGCTGGTTCAGGTGTAACCACTGGAGTCG
CTGATCCTTTTGCCACGTCTGCAGCTGCTACTGCGGACGATGATGATCTCTACGATTAGT
GATCCAGTTTATCATACTTTGTTATTTAAGTTTTCAGTTGGATTCTCTCTTGCTTCTGGA
TACCTTGT*TTTTCTTTAAGT
ATCA

QA 1 681 1 681
DS 

RD RS1CE78JQ 730 0 0
TTCATCATCGGAGCAACCAACAGACCCGACATCATTGACTCTGCTCTTCTCCGACCAGGA
AGGCTCGACCAGCTCATTTACATTCCGCTGCCGGACGAGGATTCACGTCTCAATATCTTC
AAGGCCGCCTTGAGGAAGTCTATTGCTAAAGATGTAGACATCAACGCTCTCGCTAAGTAC
ACACAGGGATTCAGTGGTGCTGATATAACTGAGATTTGCCAGAGGG*CTTGCAAATACGC
CATCAGAGAAAACATCGAGAAGGACATTGAGAAGGAGAAGAGGAGGAGCGAGAACCCTGA
AGCCATGGAGGAAGATGGAGTTGATGAAGTGTCAGAGATAAAAGCTGCACACTTTGAGGA
GTCGATGAAGTACGCACGCAGGAGTGTGAGCGATGCAGACATCAGGAAGTACCAAGCTTT
TGCTCAGACGCTTCAGCAGTCTAGAGGGTTTGGTTCCGAGTTCAGGTTCGAGACTAATGC
TGGTTCAGGTGTAACCACTGGAGTCGCTGATCCTTTTGCCACGTCTGCAGCTGCTACTGC
GGACGATGATGATCTCTACGATTAGTGATCCAGTTTATCATACTTTGTTATTTAAGTTTT
CAGTTGGATTCTCTCTTGCTTCTGGATACCTTGT*TTTTCTTTAAGTTATCAGAATTATG
TTGGTGCTTTTAATCAATGTTCTCAATTGGACGACTCTTGTTCATTCGTAATGACTA
TGATTTACAAATC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1AN42JQ 608 0 0
GCTTGAGGAAGTCTC
CTATCGCTAAAGATGTAGACATCAATGCTCTCGCTAAGTACACACAGGGATTCAGTGGTG
CTGATATCACTGAGATTTGCCAGAGGGGCTTGCAAATACGCCATCAGAGAAAATATCGAG
AAGGACATAGAGAAGGAGAAGAGGAGGAGCGAGAACCCAGAAGCCATGGAGGAAGATGGA
GTTGATGAAGTATCAGAGATAAAAGCTGCACACTTTGAGGAGTCGATGAAGTACGCACGC
AGGAGTGTGAGCGATGCAGACATCAGGAAATACCAAGCCTTTGCTCAGACGCTGCAGCAG
TCTAGAGGGTTTGGTTCCGAGTTCAGGTTCGAGACTAATGCTGGTTCAGGTGCAACTACT
GGAGTCGCTGATCCTTTTGCCACGTCTGCAGCTGCTGCTGCGGACGATGATGATCTCTAC
AATTAGTGATCCAGTTTATCATACTTTGTTATTTAAGTTTTCAGTCGGATTCTCTCTTGC
TTCTGGATACCTTGTGTTTTCTTTAAGTTATCAGAATTATGTTGGTGCTTTTAATCAATG
TCCTCAATTG*ACTACTCTTGTTCATTCGTATTGACTACTAAATCTTCTTGCC

QA 16 608 16 608
DS 

RD RS1AN42TF 608 0 0
GCTAGAGGAAGTCTC
CTATCGCTAAAGATGTAGACATCAATGCTCTCGCTAAGTACACACAGGGATTCAGTGGTG
CTGATATCACTGAGATTTGCCAGAGGG*CTTGCAAATACGCCATCAGAGAAAATATCGAG
AAGGACATAGAGAAGGAGAAGAGGAGGAGCGAGAACCCAGAAGCCATGGAGGAAGATGGA
GTTGATGAAGTATCAGAGATAAAAGCTGCACACTTTGAGGAGTCGATGAAGTACGCACGC
AGGAGTGTGAGCGATGCAGACATCAGGAAATACCAAGCCTTTGCTCAGACGCTGCAGCAG
TCTAGAGGGTTTGGTTCCGAGTTCAGGTTCGAGACTAATGCTGGTTCAGGTGCAACTACT
GGAGTCGCTGATCCTTTTGCCACGTCTGCAGCTGCTGCTGCGGACGATGATGATCTCTAC
AATTAGTGATCCAGTTTATCATACTTTGTTATTTAAGTTTTCAGTCGGATTCTCTCTTGC
TTCTGGATACCTTGTGTTTTCTTTAAGTTATCAGAATTATGTTGGTGCTTTTAATCAATG
TCCTCAATTG*ACTACTCTTGTTCATTCGTATTGACTA
CTAAATCTTCTTGCC

QA 16 593 16 593
DS 



AS 1 4

CO CL2076Contig1 897 4 4 U
GGGAGGTTGGTCGCTCCCCTCCGTTAGGAGGCGAGGCGGTGACGTTTACACTTCCCACGG
CCTGAAACGGTCTCATTAATATCTTTCTCTTTACTCCCATTGATTCCTCTTCCCACGATC
TGTCTTCAAAGAGCTTTTGGATCTGTGAGTCGGTGTTCACACTATGCTGTTACCTGCTAA
ATTTTTAACCTGCGTCGGCGAACAGAGTCCATTAGTGAGCATAGAACGGCAAGAGGTATC
GTCTGAGCAAGTGCCTTTGTAGGATTCTGGTTGTTCGGAGTGTACGAAGAAGTGAAAAGG
GTTAAAAGGAGTTGGAAAGGTAGTCTTTGGTGGAAA*GGAGATATGGGTTTCGGAGATTG
GAGATGGAAGATAGTAGTCTGTATTCTGAGGGAGAAGAAACATGTGAGATTTTTAAAAGG
TTTAAGCTTTCATTCGCTAGACAGTTCATTATCAGTTCATTGAGGTTAAACTAGAGTGAT
GAGAGGACGAGATCCTTGTAGATGCAGTTTTGAGCGATGAGGTCTGACACGGAGGCCAAT
CTGTGGACGTGAATGGCAGCGTAGAAGCTGGAGACAGCTTCAGAGTTCAAACACAGATGT
GGTGTTTAGGACGCAGTGTTGTTGGCTGCCTCCCACCACGCAGCTGCTTTTAGTTGCAGG
AACAATTGCCGCTGAGTGACTGTTGTTGGTTTGAAGACTTTATTTCCAAGGAAGGAGGAA
GATAATGGAGCGAGACGAGGGACGGAGACCCCAGGAAGAGATGAAGGAAGAAGTAAATCT
CATTGTCGTTTTGGTGGCTCATTTGGGTTTTGATTTTGTGTTTTTCTTTTCTCTCAACAC
TAAAACTCTTTGGCAAGCAAATAATGTACACTGAGTTATTGATAGAAGAGATTTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1D879TF U 1
AF RS1D879JQ C 209
AF RS1B530JQ C 228
AF RS1B530TF U 228
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BS 877 877 RS1B530JQ
BS 878 897 RS1B530TF

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CCTGAAACGGTCTCATTAATATCTTTCTCTTTACTCCCATTGATTCCTCTTCCCACGATC
TGTCTTCAAAGAGCTTTTGGATCTGTGAGTCGGTGTTCACACTATGCTGTTACCTGCTAA
ATTTTTAACCTGCGTCGGCGAACAGAGTCCATTAGTGAGCATAGAACGGCAAGAGGTATC
GTCTGAGCAAGTGCCTTTGTAGGATTCTGGTTGTTCGGAGTGTACGAAGAAGTGAAAAGG
GTTAAAAGGAGTTGGAAAGGTAGTCTTTGGTGGAAA*GGAGATATGGGTTTCGGAGATTG
GAGATGGAAGATAGTAGTCTGTATTCTGAGGGAGAAGAAACATGTGAGATTTTTAAAAGG
TTTAAGCTTTCATTCGCTAGACAGTTCATTATCAGTTCATTGAGGTTAAACTAGAGTGAT
GAGAGGACGAGATCCTTGTAGATGCAGTTTTGAGCGATGAGGTCTGACACGGAGGCCAAT
CTGTGGACGTGAATGGCAGCGTAGA

QA 1 565 1 565
DS 

RD RS1D879JQ 672 0 0
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GGTTGTTCGGAGTGTACGAAGAAGTGAAAAGGGTTAAAAGGAGTTGGAAAGGTAGTCTTT
GGTGGAAA*GGAGATATGGGTTTCGGAGATTGGAGATGGAAGATAGTAGTCTGTATTCTG
AGGGAGAAGAAACATGTGAGATTTTTAAAAGGTTTAAGCTTTCATTCGCTAGACAGTTCA
TTATCAGTTCATTGAGGTTAAACTAGAGTGATGAGAGGACGAGATCCTTGTAGATGCAGT
TTTGAGCGATGAGGTCTGACACGGAGGCCAATCTGTGGACGTGAATGGCAGCGTAGAAGC
TGGAGACAGCTTCAGAGTTCAAACACAGATGTGGTGTTTAGGACGCAGTGTTGTTGGCTG
TCTCCCACCACGCAGCTGCTTTTAGTTGCAGGAACAATTGCCGCTGAGTGACTGTTGTTG
GTTTGAAGACTTTATTTCCAAGGAAGGAGGAAGATAATGGAGCGAGACGAGGGACGGAGA
CCCCAGGAAGAGATGAAGGAAGAAGTAAATCTCATTGTCGTTTTGGTGGCTCATTTGGGT
TTTGATTTTGTGTTTTTCTTTTCTCTCAACACTAAAACTCTTTGGCAAGCAAATAATGTA
CACTGAGT
TATT

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DS 

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GTTTCGGAGATTGGAGATGGAAGATAGTAGTCTGTATTCTGAGGGAGAAGAAACATGTGA
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CACGGAGGCCAATCTGTGGACGTGAATGGCAGCGTAGAAGCTGGAGACAGCTTCAGAGTT
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TTTTAGTTGCAGGAACAATTGCCGCTGAGTGACTGTTGTTGGTTTGAAGACTTTATTTCC
AAGGAAGGAGGAAGATAATGGAGCGAGACGAGGGACGGAGACCCCAGGAAGAGATGAAGG
AAGAAGTAAATCTCATTGTCGTTTTGGTGGCTCATTTGGGTTTTGATTTTGTGTTTTTCT
TTTCTCTCAACACTAAAACTCTTTGGCAAGCAAATAATGTACACTGAGTTATTGATAGAA
GAGATTTGCT

QA 1 670 1 670
DS 

RD RS1B530TF 670 0 0
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AGAAGTGAAAAGGGTTAAAAGGAGTTGGAAAGGTAGTCTTTGGTGGAAA*GGAGATATGG
GTTTCGGAGATTGGAGATGGAAGATAGTAGTCTGTATTCTGAGGGAGAAGAAACATGTGA
GATTTTTAAAAGGTTTAAGCTTTCATTCGCTAGACAGTTCATTATCAGTTCATTGAGGTT
AAACTAGAGTGATGAGAGGACGAGATCCTTGTAGGTGCAGTTTTGAGCGATGAGGTCTGA
CACGGAGGCCAATCTGTGGACGTGAATGGCAGCGTAGAAGCTGGAGACAGCTTCAGAGTT
CAAACACAGATGTGGTGTTTAGGACGCAGTGTTGTTGGCTGCCTCCCACCACGCAGCTGC
TTTTAGTTGCAGGAACAATTGCCGCTGAGTGACTGTTGTTGGTTTGAAGACTTTATTTCC
AAGGAAGGAGGAAGATAATGGAGCGAGACGAGGGACGGAGACCCCAGGAAGAGATGAAGG
AAGAAGTAAATCTCATTGTCGTTTTGGTGGCTCATTTGGGTTTTGATTTTGTGTTTTTCT
TTTCTCTCAACACTAAAACTCTTTGGCAAGCAAATAATGTACACTGAGT*ATTGATAGAA
GAGATTTGCT

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 4

CO CL2077Contig1 789 4 14 U
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CTCTCTCCTCCCATCCCTCTTCCTCTCCCTCCTCCTCATCGCCACCGTTGTCTTCGCATC
GGCCCCGACCGAACAAGAATGCGTCTACACATTTAAAATCAAAACCGGAACGAGAGATAG
CTCCGGCACCGATTCGATCATAGGGGCTTCAATCTCGGACAAATCCGGACAGCACATCGA
CATTGGAGACCTAGAGAAATGGGGTGGTGTAATGGGACAAGGTCACAACTACTACGAGAA
CGGCAATCTTGATATTTTCAGTGGGACAGCGCCGTGTCTTCCGAGCCCAGTATGCTTTTT
GAATCTGAACTCTGACGGCTCCGGTAATAAGCCCGGCTGGTATGTTAAATACGTGGAAGT
AAAGACGACCAGACCTGGAGTTGAGACCAAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAATGGCT
TGCCGTCGACGAGCCGCCGCATGAGCTATCTGTCGAACGGAACAACTGCCTGCAGACGGT
GAGTACCAGTGTCGGTGTTGGGTGTGAGAACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCATATGAAA
TAATGAAGGTGTCGAGGAAAGTAACACGGCAATATATAATGAACGTTCATATATAATGCA
AAATTGAATAAAATTGTCTGTCAACGCGTGATAGCAATAATGTAGATTGAATAAAACTGC
CTCCTTGTGAGTGTGGGATGGCATTGATCTAAAAGTTCCAATCGAATTAATCTGTGAGAA
TATTCAGTC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BQ54TF U 4
AF RS1AC53TF U 388
AF RS1FO13JQ C 1
AF RS1FO13TF U 1
BS 1 5 RS1FO13JQ
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RD RS1BQ54TF 712 0 0
GG
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TCCTCCCATCCCTCTTCCTCTCCCTCCTCCTCATCGCCACCGTTGTCTTCGCATCGGCCC
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GAATAAAATTGTCTGTCAACGCGTGATAGCAATAATGTAGATTGAA
AAAA

QA 3 708 3 708
DS 

RD RS1AC53TF 363 0 0
G
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AAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAATGGCTTGCCGTCGACGAGCCGCCGCATGAGCTA
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TGATAGCAATAATGTAGATTGAATAAAACTGCCTCCTTGTGAGTGTGGGATGGCATTGAT
CT

QA 2 363 2 363
DS 

RD RS1FO13JQ 789 0 0
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AAAGACGACCAGACCTGGAGTTGAGACCAAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAATGGCT
TGCCGTCGACGAGCCGCCGCATGAGCTATCTGTCGAACGGAACAACTGCCTGCAGACGGT
GAGTACCAGTGTCGGTGTTGGGTGTGAGAACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCATATGAAA
TAATGAAGGTGTCGAGGAAAGTAACACGGCAATATATAATGAACGTTCATATATAATGCA
AAATTGAATAAAATTGTCTGTCAACGCGTGATAGCAATAATGTAGATTGAATAAAACTGC
CTCCTTGTGAGTGTGGGATGGCATTGATCTAAAAGTTCCAATCGAATTAATCTGTGAGAA
TATTCAGTC

QA 1 789 1 789
DS 

RD RS1FO13TF 789 0 0
GACTC
ATTCTTACATTCATATCAACAACTAGGACATTCCAACAACTATGGCTCACACTGACTCTC
TCCTCCCATCCCTCTTCCTCTCCCTCCTCCTCATCGCCACCGTTGTCTTCGCATCGGCCC
CGACCGAACAAGAATGCGTCTACACATTTAAAATCAAAACCGGAACGAGAGATAGCTCCG
GCACCGATTCGATCATAGGGGCTTCAATCTCGGACAAATCCGGACAGCACATCGACATTG
GAGACCTAGAGAAATGGGGTGGTGTAATGGGACAAGGTCACAACTACTACGAGAACGGCA
ATCTTGATATTTTCAGTGGGACAGCGCCGTGTCTTCCGAGCCCAGTATGCTTTTTGAATC
TGAACTCTGACGGCTCCGGTAATAAGCCCGGCTGGTATGTTAAATACGTGGAAGTAAAGA
CGACCAGACCTGGAGTTGAGACCAAGCGTCAGTACTTCGATGTAGAGCAATGGCTTGCCG
TCGACGAGCCGCCGCATGAGCTATCTGTCGAACGGAACAACTGCCTGCAGACGGTGAGTA
CCAGTGTCGGTGTTGGGTGTGAGAACAGGAAGTGCATCTCTTCAATCATATGAAATAATG
AAGGTGTCGAGGAAAGTAACACGGCAATATATAATGAACGTTCATATATAATGCAAAATT
GAATAAAATTGTCTGTCAACGCGTGATAGCAATAATGTAGATTGAATAAAACTGCCTCCT
TGTGAGTGTGGGATGGCATTGATCTAAA*GTTCCAATCGAAT*AATCTGTGAGA*TATTC
AGTC

QA 6 789 6 789
DS 



AS 1 4

CO CL2078Contig1 1702 4 15 U
GGAGTCTCTTATTGTTGGCTCATTGGATTATTATAGGAGGAAACGATGGAGACAAGGAAA
ACTCAAGTGGCCGTGCCGGTTTGTTAGCGATCATGACTCTAATGGTAACTCAAGTAGTCT
TCGCCGGTAAAGACTCCCTTCATGAACGGCATATGGCAGAACTGCAAGCCGTTAAGGCAT
CTTTGGTTCGTCGAAATCTACCCGGTTTGGTATCTCCTCCTCCTACCCCTCCTCAGGCAG
TACCCGGTCCACGTGTGTATCAAGTGATATCATATGGGGCCGATCCAACAGGGAAAGCGG
ATAGCACGAATGCGATATTGAAAGCTATGGAAGATGCGTTTGATGGTCCAGATCATGGAG
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GAGGGACATTAAGGGCATCAGATGATTTTCCAGTCGACAAGTATTTAATCGAACTCAACG
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ACTGCTACATCACACGGTTTGGAGACACGAATGGGATTCTTGTCCAAAAAGGACATGAAA
CTTACATTCGAAACGTTTCTCGGCCAACACATAACCGCTGGTGGAGACAAAGGAGAGAGG
AACTTCTCCGGCACCGCCGTGAACTTGGTGGGTAACGATAATGCCGTCACGGACACCGTT
ATATTCTCAGCCGGGATTGGGGCCATGATATCAGGACAGGCAAACCTTTTGTCTGGTGTG
CATTGTTATAACAAAGCAACCGGTTTTGGTGGAACCGGGATTTATTTGAAATTACCCGGT
TTAACTCAGAACCGGATTGTGAATTCCTACTTGGATTATACCGGTATCGTTGCGGAAGAC
CCGGTTCAGCTGCAGATTTCCGGGACGTTTTTCTTAGGAGATGCGTTTATTTTGTTGAAG
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AATGGAGTCCAGATTGTGCAATTGGATCAGACGAATAAAGCGTTTGAGAATGTTGACCAG
GTGGTGGTTGACCGGAACAATGTGAACGGCATGGCGATGAGATCGACGGTTGCTAAAGCA
TCGGTCGATGGAAACGGAACGTCTTGGACCGTTGACTTTAACCCGGTTTTGTTGTTCCCG
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CACGCGGTAAGGAACGTCTCGGATAATCGAGTGGTGGTTCAGACAAACGCACCTGTTACT
GCACAAGTTTATGTAACGGTGGATCAATGAGTTTGACTGTCACGACTCATGTCCTTACCC
TAATAATGATTTAATGATCATAAAAACTACAGTCGGTGGTGGTTTCTGGTATTTTTTGTA
ATTTTTCCTAACAGGAGAAATTATATTTTTACTATCAGTAAATAAGATATTTAGAAAATT
GTGATTGCAGTTGAAGAGTTGTTGGCAGACATTCACTTACTTATTTTCCTTTGTCAAGAC
ATTTACTAGTCTCTTTGATATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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C

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DS 



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BQ
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AF RS1BJ79JQ U 83
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GCGGAGACGGTGTAGTTAGCGAGTTAGGGGGAGATTTTGAGCG

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DS 



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TATTCTTCTAGATCCACAATCCCAAGATGAAATCATTCCTTCATCTCAGTTTTCTTCATT
CTTCATCACACTGTTTTAACTTCCCAATCTCCCAACTCACCGGAGAAGATTCACAAATGA
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AGTACACGGCTCACACCCAATAGAAACATATCCTTGAGCATGCAATGCATTCACAGGAAC
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CC


BQ
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10 10 

AF RS1AT82JQ U 1
AF RS1EI88JQ U 24
AF RS1EI88TF C 776
BS 1 222 RS1AT82JQ
BS 223 223 RS1EI88JQ
BS 224 478 RS1AT82JQ
BS 479 479 RS1EI88JQ
BS 480 799 RS1AT82JQ
BS 800 800 RS1EI88JQ
BS 801 805 RS1AT82JQ
BS 806 806 RS1EI88JQ
BS 807 824 RS1AT82JQ
BS 825 852 RS1EI88JQ
BS 853 1382 RS1EI88TF

RD RS1AT82JQ 827 0 0
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TATCCTTTTCCTTCTCAAGTAAAACTCAAAAAAGAAAGAACAAAAACATATTTAACGACA
AGAAGACAGAAAAAGAGTCTATAAACCCTACAATACCATATAGAACACATAGCTTTTGCT
TATTCTTCTAGATCCACAATCCCAAGATGAAATCATTCCTTCGTCTCAGTTTTCTTCATT
CTTCATCACACTGTTTTAACTTCCCAATCTCCCAACTCACCGGAGAAGATTCACAAATGA
CATAAGCGAATCAACATCTCTATGCTCTGACGGGTACTTAATCGCCCGTGGAGCGCTTCT
CGGGAAGAGCAGGATGGTCGGGAAGCTTCCTAATTGAAGCTCTTGCTTAGCAAACTCCTT
CTGGTCACCATCCGCACGGAATTTCGCCACCTTAATCCCTTTCACCGCTAGTTTCTCAGC
CAATTCCACGTAAGATGCCTCCATAGCCTGGCAAAACGGACACCAAGGAGCGTAAAGCAC
AACCAACCACGGCTCTTTACGGTTATTACCAAGCTTCAACAGATTCCCAATCCCTCCTCT
GGTCAATGAAACCACATCGTTGCTCTCGAATATATCATGCACAATAGCAGGTGCTAAATC
CGTGGTGGAGTCGTCATCTTCCTTCTTAATGTTCCCTTTGTGGAGGCCACATTCTTTAGC
TTTAGCATCTTCCCACCACCACCTTCCTTCTCTCTCGTGCTGACCCGGAAGCACTGGCCT
AGTACACGGCTCACACCCA*TAGAA*CATATCCTTGAGCATGCA
TGC

QA 1 824 1 824
DS 

RD RS1EI88JQ 829 0 0
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ACTCAAAAAAGAAAGAACAAAAACATATTTAACGACAAGAAGACAGAAAAAGAGTCTATA
AACCCTACAATACCATATAGAACACATAGCTTTTGCTTATTCTTCTAGATCCACAATCCC
AAGATGAAATCGTTCCTTCATCTCAGTTTTCTTCATTCTTCATCACACTGTTTTAACTTC
CCAATCTCCCAACTCACCGGAGAAGATTCACAAATGACATAAGCGAATCAACATCTCTAT
GCTCTGACGGGTACTTAATCGCCCGTGGAGCGCTTTTCGGGAAGAGCAGGATGGTCGGGA
AGCTTCCTAATTGAAGCTCTTGCTTAGCAAACTCCTTCTGGTCACCATCCGCACGGAATT
TCGCCACCTTAATTCCTTTCACCGCTAGTTTCTCAACCAATTCCACGTAAGATGCCTCCA
TAGCCTGGCAAAACGGACACCAAGGAGCGTAAAGCACAACCAACCACGGCTCTTTACGGT
TATTACCAAGCTTCAACAGATTCTCAATCCCTCCTCTGGTCAATGAAACCACATCGTTGC
TCTCGAATATATCATGCACAATAGCAGGTGCTAAATCCGTGGTGGAGTCGTCATCTTCCT
TCTTAATGTTCCCTTTGTGGAGGCCACATTCTTTAGCTTTAGCATCTTCCCACCACCACC
TTCCTTCTCTCTCGTGCTGACCCGGAAGCACTGGCCTAGTACACGGCTCACACCCAATAG
AAACATATCCTTGAGCATGCAATGCATTCACAGGAACATCCATCGTCCT

QA 1 829 1 829
DS 

RD RS1EI88TF 607 0 0
GGCCTAGTACACGGCTCACACCCAATAGAAACATATCCTTGAGCATGCAATGCATTCACA
GGAACATCCATCGTCCTCAAGAAGTTCCACACATCAACACCTTCAACATTCGCCAAAGGG
TTCCACTTGACAAGACTCCCAACACCGCCATCTAACCCTTCAAACACCGAATCGACCTGA
ACGATCGGAATCTCGGATCTCGTGCCCGGAGGCTGATCTTTCCTCTGCCCTGTGATCCAA
GCTTTGAGACCCTTAAGAGCGCGACGAAGAGGTCTTACTTTCCTCACACGGCAACACTCT
TGGTGACCATCTTCGTAGAAAGAGAACAAACCCTTGTTCCTCACCAAAGCTTGAACCTCG
ACCGCATCAGGGAACGTGTACTCGATCCGAATCCCGTACTGCTTCTCCACTGCGTCGAAG
AGTCTGTAGGTTTCGGGGTTTAATCTCCCCGTGTCTAAGCTGAATACCCTGAAGGGCCTC
CCGGTTAAACGAGCGTATTCGATCAGTGCAACATCTTCAGCACCACTGAAAGCAATAGCG
ATGCTGCTTCCGAATTTCTGGAGAGCTTTGTCCATGATTTCAAGTGGTGAAGCCTCTTCG
AGCTTCC

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 4

CO CL2081Contig1 930 4 3 U
GCTAAAGTTAATTCGAAGAATGCGAGGTGGAGATGAAAACCCATTTGGAGATGACACGTC
AACACCACAGAAAATTCTACAGCTCTTAACTGAGACCGTGGAAGTTCTATCTGATGTCTC
GGCATCTGAGTTGGCATTACGACTCTACTTGCAATGTGCTCAGGCAGCAAATGACTGTGA
ATTAGAAACAGTTGCATATGAGTTCTTCACAAAGGCATACCTTCTGTATGAAGAAGAAAT
TTCAGATTCAAAGGCACAAGTAACAGCACTACGTTTAATAATAGGGACACTCCAGCGGAT
GCGTGTATTTAATGCTGAGAACAGAGAGATTTTGACTCACAAGGCGACAGGGTACTCTGC
AAAACTACTTAAGAAGCCAGATCAGTGTAGAGCTGTTTACGAGTGTGCGCATCTTTACTG
GGCTGAAGAAGGCGAGAACCTAAAAGATGGAGAGAGGGTTGTCCATTGTCTGAAGAGATC
ACAAAAAATTGCAGATGCGGTTCAACAAATGTCCAACAAATCCCGTGGTGCCAGTAGCAC
CGGGTCTGTGTCTCTGTATGTCGAACTTCTGAACAAGTATCTCTACTTCTTGGAGAAAGG
ATATCCACAAGTAACAGGCGAAACAATCCAGAGTTTAGCTGAATTAATCAGAGGCGAGAC
GAAGAAAGCTGAGTCAGGCGCAGGGTCATTCATAACCAGCACTCTGCGTTACATGGAGTT
TCAGAGACAACAGGAGGATGGTGGCATGAATGAGAAATACCAGAAAATCAAGATGGAATG
GTTTGAGTGATCACTCTTTTCTTCTGCATTATTTTAGACTCATAATGAATAGTCATGGCC
TCTTGTCTCGTTGGAGAACAATGAAAGAGTAACAAAACTTGTATCATCACTTTTCCTTTC
CCAGATCTATAAATATGTTTGCTGAGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RS1GL66TF U 1
AF RS1GL66JQ C 77
AF RS1GY18JQ C 278
AF RS1GY18TF U 278
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BS 721 926 RS1GY18TF
BS 927 930 RS1GL66JQ

RD RS1GL66TF 728 0 0
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GCGTGTATTTAATGCTGAGAACAGAGAGATTTTGACTCACAAGGCGACAGGGTACTCTGC
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GGCTGAAGAAGGCGAGAACCTAAAAGATGGAGAGAGGGTTGTCCATTGTCTGAAGAGATC
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CGGGTCTGTGTCTCTGTATGTCGAACTTCTGAACAAGTATCTCTACTTCTTGGAGAAAGG
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GAAGAAAGCTGAGTCAGGCGCAGGGTCATTCATAACCAGCACTCTGCGTTACATGGAGTT
CAGAGACA

QA 1 720 1 720
DS 

RD RS1GL66JQ 854 0 0
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TTACGACTCTACTTGCAATGTGCTCAGGCAGCAAATGACTGTGAATTAGAAACAGTTGCA
TATGAGTTCTTCACAAAGGCATACCTTCTGTATGAAGAAGAAATTTCAGATTCAAAGGCA
CAAGTAACAGCACTACGTTTAATAATAGGGACACTCCAGCGGATGCGTGTATTTAATGCT
GAGAACAGAGAGATTTTGACTCACAAGGCGACAGGGTACTCTGCAAAACTACTTAAGAAG
CCAGATCAGTGTAGAGCTGTTTACGAGTGTGCGCATCTTTACTGGGCTGAAGAAGGCGAG
AACCTAAAAGATGGAGAGAGGGTTGTCCATTGTCTGAAGAGATCACAAAAAATTGCAGAT
GCGGTTCAACAAATGTCCAACAAATCCCGTGGTGCCAGTAGCACCGGGTCTGTGTCTCTG
TATGTCGAACTTCTGAACAAGTATCTCTACTTCTTGGAGAAAGGATATCCACAAGTAACA
GGCGAAACAATCCAGAGTTTAGCTGAATTAATCAGAGGCGAGACGAAGAAAGCTGAGTCA
GGCGCAGGGTCATTCATAACCAGCACTTTGCGTTACATGGAGTTTCAGAGACAACAGGAG
GATGGTGGCATGAATGAGAAATACCAGAAAATCAAGATGGAATGGTTTGAGTGATCACTC
TTTTCTTCTGCATTATTTTAGACTCATAATGGATAGCCATGGCCTCTTGTCTCGTTGGAG
AACAATGAAAGAGTAACAAAACTTGTATCATCACTTTTC*TTTCCCAGATCTATAAATAT
GTTTGCTGAGTTTG

QA 1 854 1 854
DS 

RD RS1GY18JQ 649 0 0
G
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ACAAGGCGACAGGGTACTCTGCAAAACTACTTAAGAAGCCAGATCAGTGTAGAGCTGTTT
ACGAGTGTGCGCATCTTTACTGGGCTGAAGAAGGCGAGAATCTAAAAGATGGAGAGAGGG
TTGTCCATTGTCTGAAGAGATCACAAAAAATTGCAGATGCGGTTCAACAAATGTCCAACA
AATCCCGTGGTGCCAGTAGCACCGGGTCTGTGTCTCTGTATGTCGAACTTCTGAACAAGT
ATCTCTACTTCTTGGAGAAAGGATATCCACAAGTAACAGGCGAAACAATCCAGAGTTTAG
CTGAATTAATCAGAGGCGAGACGAAGAAAGCTGAGTCAGGCGCAGGGTCATTCATAACCA
GCACTTTGCGTTACATGGAGTTTCAGAGACAACAGGAGGATGGTGGCATGAATGAGAAAT
ACCAGAAAATCAAGATGGAATGGTTTGAGTGATCACTCTTTTCTTTTGCATTATTTTAGA
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TTGTATCATCACTTTTCCTTTCCCAGATCTATAAATATGTTTGCTGAG

QA 2 649 2 649
DS 

RD RS1GY18TF 649 0 0
G
TAATAGGGACACTCCAGCGGATGCGTGTATTTAATGCTGAGAACAGAGAGATTTTGACTC
ACAAGGCGACAGGGTACTCTGCAAAACTACTTAAGAAGCCAGATCAGTGTAGAGCTGTTT
ACGAGTGTGCGCATCTTTACTGGGCTGAAGAAGGCGAGAATCTAAAAGATGGAGAGAGGG
TTGTCCATTGTCTGAAGAGATCACAAAAAATTGCAGATGCGGTTCAACAAATGTCCAACA
AATCCCGTGGTGCCAGTAGCACCGGGTCTGTGTCTCTGTATGTCGAACTTCTGAACAAGT
ATCTCTACTTCTTGGAGAAAGGATATCCACAAGTAACAGGCGAAACAATCCAGAGTTTAG
CTGAATTAATCAGAGGCGAGACGAAGAAAGCTGAGTCAGGCGCAGGGTCATTCATAACCA
GCACTCTGCGTTACATGGAGTTTCAGAGACAACAGGAGGATGGTGGCATGAATGAGAAAT
ACCAGAAAATCAAGATGGAATGGTTTGAGTGATCACTCTTTTCTTCTGCATTATTTTAGA
CTCATAATGAATAGTCATGGCCTCTTGTCTCGTTGGAGAACAATGAAAGAGTAACAAAAC
TTGTATCATCACTTTTCCTTTCCCAGATCTATAAATATGTTTGCTGAG

QA 2 649 2 649
DS 



AS 1 4

CO CL2082Contig1 704 4 5 U
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GACCAACCATAAAGCACACCAAAGAGATGTAGTAGTATCATTAAATTTCTCTAACAAAAC
TCAGACTAAAGAAGACAGAAACAAGAAGTCTGTTTCAAAACTCCAAAAGAAAAAAAAAAG
TGACGATATAAGGATTAGATGATCCCGATTTTGTTAGCCACATCCAAAGCATCGTAATCA
GGGGTCAATCTCACGTACGCTTTCTTCGTTCCATCAGGCCTAATGAGTGTGTTGACTTTC
TTGGTCTGAATGTCGTACATTTTCTTGACAGCATCCTTGATCTTCTTCTTGTCAGCACGG
ATGTCGACGATGAAAACCAAGGTGTTGTTGTCTTCGATCTTCTTCATTGCGGACTCGGTT
ATGAGTGGGTACTTGAGGATTCCGTAGTGGTCCAACTTGCTCCTCGGAGTTGCACTGATG
CGTGGGTACTTTGGGTCTCTAGCCTTTGTCAATGTCTTTGGCCTGTGGAATGTCACCTTT
GTTCTGATCGTCTTCGCCTTCTTTTTAATGACTTGGCCTGACTTCACGGCCTTGGCAGCT
TTCAAGGCCTTGGCCTTTGGGTCAACCTTCTTAGTTACATAAACTTTAGCTGGAGACATT
GCTCAAAGTGAGATCCTTTTCCACAAAACCTCTCTGAGCGGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1F325TF C 1
AF RS1F325JQ U 6
AF RS1AB50JQ U 69
AF RS1AB50TF C 69
BS 1 9 RS1F325TF
BS 10 640 RS1F325JQ
BS 641 641 RS1AB50JQ
BS 642 672 RS1F325JQ
BS 673 704 RS1AB50JQ

RD RS1F325TF 704 0 0
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TCAGACTAAAGAAGACAGAAACAAGAAGTCTGTTTCAAAACTCCAAAAGAAAAAAAAAAG
TGACGATATAAGGATTAGATGATCCCGATTTTGTTAGCCACATCCAAAGCATCGTAATCA
GGGGTCAATCTCACGTACGCTTTCTTCGTTCCATCAGGCCTAATGAGTGTGTTGACTTTC
TTGGTCTGAATGTCGTACATTTTCTTGACAGCATCCTTGATCTTCTTCTTGTCAGCACGG
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ATGAGTGGGTACTTGAGGATTCCGTAGTGGTCCAACTTGCTCCTCGGAGTTGCACTGATG
CGTGGGTACTTTGGGTCTCTAGCCTTTGTCAATGTCTTTGGCCTGTGGAATGTCACCTTT
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GCTCAAAGTGAGATCCTTTTCCACAAAACCTCTCTGAGCGGCCC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1F325JQ 667 0 0
AACA
AGACAATGAGACTAGTATAACCGACCAGTGGTACCAAAACATTATCTTCGAGACCAACCA
TAAAGCACACCAAAGAGATGTAGTAGTATCATTAAATTTCTCTAACAAAACTCAGACTAA
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ATGTCGTACATTTTCTTGACAGCATCCTTGATCTTCTTCTTGTCAGCACGGATGTCGACG
ATGAAAACCAAGGTGTTGTTGTCTTCGATCTTCTTCATTGCGGACTCGGTTATGAGTGGG
TACTTGAGGATTCCGTAGTGGTCCAACTTGCTCCTCGGAGTTGCACTGATGCGTGGGTAC
TTTGGGTCTCTAGCCTTTGTCAATGTCTTTGGCCTGTGGAATGTCACCTTTGTTCTGATC
GTCTTCGCCTTCTTTTTAATGACTTGGCCTGACTTCACGGCCTTGGCAGCTTTCAAGGCC
TTGGCCTTTGGGTCAACCTTCTTAGTTACATCAACTTTAGCTGGAGACATTGCTCAAAGT
GAG

QA 5 667 5 667
DS 

RD RS1AB50JQ 636 0 0
CTT
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GAAAACCAAGGTGTTGTTGTCTTCGATCTTCTTCATTGCGGACTCGGTTGTGAGTGGGTA
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TGGGTCTCTAGCCTTTGTCAATGTCTTTGGCCTGTGGAATGTCACCTTTGTTCTGATCGT
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GGCCTTTGGGTCAACCTTCTTAGTTACATAAACTTTAGCTGGAGACATTGCTCAAAGTGA
GATCCTTTTCCACAAAACCTCTCTGAGCGGCCC

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DS 

RD RS1AB50TF 636 0 0
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AAGACAGAAACAAGAAGTCTGTTTCAAAACTCCAAAAGAAAAAAAAA*GTGACGATATAA
GGATTAGATGATCCCGATTTTGTTAGCCACATCCAAAGCATCGTAATCAGGGGTCAATCT
CACGTACGCTTTCTTCGTTCCATCAGGCCTAATGAGTGTGTTGACTTTCTTGGTCTGAAT
GTCGTACATTTTCTTGACAGCATCCTTGATCTTCTTCTTGTCAGCACGGATGTCGACGAT
GAAGACCAAGGTGTTGTTGTCTTCGATCTTCTTCATTGCGGACTCGGTTGTGAGTGGGTA
CTTGAGGATTCCGTAGTGGTCCAACTTGTTCCTCGGAGTTGCACTGATGCGTGGGTACTT
TGGGTCTCTAGCCTTTGTCAATGTCTTTGGCCTGTGGAATGTCACCTTTGTTCTGATCGT
CTTCGCCTTCTTTTTAATGACTTGGCCTGACTTCACGGCCTTGGCAGCTTTCAAGGCCTT
GGCCTTTGGGTCAACCTTCTTAGTTACATAAACTTTAGCTGGAGACATTGCTCAAAGTGA
GATCCTTTTCCACAAAACCTCTCTGAGCGGCCC

QA 4 636 4 636
DS 



AS 1 3

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CATATTACAAGACACGAATGTTATCTACAGAGTAGTGAGCTTTCATGAGATGACTCCTCA
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CCTTTCTCAGCTGATTGTCTGCGACCCATGCTACCGCCTTTACCCAGGTATTGCTGGTGG
TATTCTTCTGCTCTGTAGAATTTCTTGGCGGGAAGTATCTCAGTAACAATCTTCTTGTTC
AAGATCTTCTCCTGCTTCTCCAAAGATTCACGAGCTAACTTCTCTTGCTCCTCTGTGTAG
TAGTATATGCCTGACCGGTACTGCGTTCCCACATCATTCCCCTGGCGATTCAAGGTGGTG
GGATCATGGCGCTTCCAGAAAACATCAAGCAAGTTCTCAAAGCTACACTCTTTAGGATCG
TACTGAACTCTAACAACCTCGTTATGCCCCGTCATGCCCGTACAGACATCCTCGTATATC
GGATTGTGCACGAACCCATGGCTATAACCAACCTCTGTTTTCGTCACACCGGGAACTCTC
TGGTAAGCCAACTCCAGTCCCCAAAAGCAACCTGCGCCGAACTGAGCGAACTGCTGACCT
GGCGAAGGAACGTCATCGTCAGGTCCTCCGGCGATTGCGGCCGAAGACGGGTCTAGTTGG
GAAGTAGAACCGTACCCGAGTCTGTTGAAGAGGTTGTTCATCGGGGGCTTGTAGATGGAT
ACGGAACGAGCGGTTTTGGGGAAAGGACAAATGGGTTTGACTAGAGGGAGTACGGCTTTA
GAGAGGGAATGTAGAGGTTTAGAGAGAGAAGCGGCGGAGATTACCGGAGGAGAGGTGATG
AGAGCTAGCATTATCGAAGTGACGTGGCAATATGGGGAACTTTAGAGTTGTACGGCTACT
ATTTCTCTCCAAGTTTGCACGAGATTGTTCTTTCAGTTTCTAGAAATCCACTTGTTCCGT
ATTTGCAAATTTTAAGATGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DU19JQ U 1
AF RS1DH20JQ U 29
AF RS1DU19TF C 302
BS 1 60 RS1DU19JQ
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RD RS1DU19JQ 678 0 0
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TATTCTTCTGCTCTGTAGATTTTCTTGGCGGGAAGTATCTCAGTAACAATCTTCTTGTTC
AAGATCTTCTCCTGCTTCTCCAAAGATTCACGAGCTAACTTCTCTTGCTCCTCTGTGTAG
TAGTATATGCCTGACCGGTACTGCGTTCCCACATCATTCCCCTGGCGATTCAAGGTGGTG
GGATCATGGCGCTTCCAGAAAACATCAAGCAAGTTCTCAAAGCTACACTCTTTAGGATCG
TACTGAACTCTAACAACCTCGTTATGCCCCGTCATGCCCGTACAGACATCCTCGTATATC
GGATTGTGCACGAACCCATGGCTATAACCAACCTCTGTTTTCGTCACACCGGGAACTCTC
TGGTAAGCCAACTCCAGTCCCCAAAAGCAACCTGCGCCGAACTGAGCGAACTGCTGACCT
GGCGAAGGAACGTC
ATCG

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1DH20JQ 773 0 0
GG
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TAACCATAACATCGGATTGAATCGTTGCAACCTTTCTCAGCTGATTGTCTGCGACCCATG
CTACCGCCTTTACCCAGGTATTGCTGGTGGTATTCTTCTGCTCTGTAGAATTTCTTGGCG
GGAAGTATCTCAGTAACAATCTTCTTGTTCAAGATCTTCTCCTGCTTCTCCAAAGATTCA
CGAGCTAACTTCTCTTGCTCCTCTGTGTAGTAGTATATGCCTGACCGGTACTGCGTTCCC
ACATCATTCCCCTGGCGATTCAAGGTGGTGGGATCATGGCGCTTCCAGAAAACATCAAGC
AAGTTCTCAAAGCTACACTCTTTAGGATCGTACTGAACTCTAACAACCTCGTTATGCCCC
GTCATGCCCGTACAGACATCCTCGTATATCGGATTGTGCACGAACCCATGGCTATAACCA
ACCTCTGTTTTCGTCACACCGGGAACTCTCTGGTAAGCCAACTCCAGTCCCCAAAAGCAA
CCTGCGCCGAACTGAGCGAACTGCTGACCTGGCGAAGGAACGTCGTCGTCAGGTCCTCCG
GCGATTGCGGCCGAAGACGGGTCTAGTTGGGAAGTAGAACCGTACCCGAGTCTGTTGAAG
AGGTTGTTCATCGGGGGCTTGTAGATGGATACGGAACGAGCGGTTTTGGGG

QA 3 773 3 773
DS 

RD RS1DU19TF 742 0 0
CAAGATCTCTCCTGC
TCTCCAAAGATTCACGAGCTAACTTCTCTTGCTCCTCTGTGTAGTAGTATATGC*TGACC
GGTACTGCGTTCCCACATCATTCCCCTGGCGATTCAAGGTGGTGGGATCATGGCGCTTCC
AGAAAACATCAAGCAAGTTCTCAAAGCTACACTCTTTAGGATCGTACTGAACTCTAACAA
CCTCGTTATGCCCCGTCATGCCCGTACAGACATCCTCGTATATCGGATTGTGCACGAACC
CATGGCTATAACCAACCTCTGTTTTCGTCACACCGGGAACTCTCTGGTAAGCCAACTCCA
GTCCCCAAAAGCAACCTGCGCCGAACTGAGCGAACTGCTGACCTGGCGAAGGAACGTCAT
CGTCAGGTCCTTCGGCGATTGCGGCCGAAGACGGGTCTAGTTGGGAAGTAGAACCGTACC
CGAGTCTGTTGAAGAGGTTGTTCATCGGGGGCTTGTAGATGGATACGGAACGAGCGGTTT
TGGGGAAAGGACAAATGGGTTTGACTAGAGGGAGTACGGCTTTAGAGAGGGAATGTAGAG
GTTTAGAGAGAGAAGCGGCGGAGATTACCGGAGGAGAGGTGATGAGAGCTAGCATTATCG
AAGTGACGTGGCAATATGGGGAACTTTAGAGTTGTACGGCTACTATTTCTCTCCAAGTTT
GCACGAGATTGTTCTTTCAGTTTCTAGAAATCCACTTGTTCCGTATTTGCAAATTTTAAG
ATGTCCC

QA 16 742 16 742
DS 



AS 1 4

CO CL2084Contig1 959 4 6 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGAAGGTGTCTC
AAAAAGGTCAAGTCGGTATTGCTTTGAACGGGGGTTGGAACTTGCCCTATACCGAAACAG
CGGAGGATAAGTTAGCTGCGGCACGAGCCTTGGCCTTCACATTTGACTACTTCATGGAGC
CGCTCGTGACTGGTAAATATCCAGTCGACATGGTCAACAACGTAAAAGGTGGTCGGTTGC
CTACATTCACAGCAAAACAATCAAAGATGCTGAAGGGCTCATATGATTTCGTTGGCATCA
ATTACTACTCTTCTTCTTACGTAAAGAACGTCCCTTGCTCAACCGAAAACGTTACATTAT
TCTCCGATCCTTGTGCAAGCGTCACGGGTGTGAGAGAAGGAGTTCCCATCGGTCCAAAGG
CTGCCTCGGATTGGCTTTTGATATATCCAAAGGGGATTCGTGACCTTGTCCTCTATGCAA
AATACAAGTTTAAGGATCCTGTCATGTACATAACCGAGAACGGGAGAGATGAAGCTAGTG
TTTCCGGTAAAATCTTACTTAAAGATAGTGATAGAATCGATTACTACGCTCGACATCTTG
AGATGGTTCGTGAGGCTGTCTCGGTTGGAGCCAATGTGAAGGGCTTTTTCGCGTGGTCGC
TGCTAGATAACTTTGAGTGGGCAAATGGTTACACGGTCCGGTTCGGGTTGGTTTATGTGG
ATTACAACGATGGTGGTAAGAGATATCTCAAGAATTCAGCTCACTGGTTCAAGAAGTTCT
TGCATCATAAGAAAAACAATTGATAAGATATTTGGATCTGATTTCTTCTCAGGTATAGAT
AGGAGCGATGACAATAAAGTAGTTATTTTGATTGATAATTAATATTCCATTTGTTTCACA
AAAGTATCATTTGGTATTTTTTTTCTTGTTATAAAGTGCCATTTTTAGAATTTCAGGTC


BQ
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AF RS1C155TF U 1
AF RS1C745JQ C 697
AF RS1C745TF U 697
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CTCCTCTGTTTCTTCTCTCTCCTCTGTTTCTCTCTTCCGTCATCAATAACAAAACTCAGA
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CTGCGAAATCTTGCTCTCTGGGCTCACGGTTAAATCTGCTCTCCGCCGTAGAACCCATCT
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AGACCCTCAAATCTAATCCTTAAATTAAATTAATTTACATCTTATTAATTATTTTCAGAA
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AATTTTCTTTTTTAAACCTTTTTGCGACGGAGTATAATGGCGTCATCAATCAGTACGTAC
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CGTAAGAGAATGTTATCGAATCGCGAGTCTGCTCGTAGATCAAGGATGCGTAAACAAAAA
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GTGACGACGACGAA

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G
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TT

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DS 

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G
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CTTTAAACGAGATCGTCGATCTCGTGACGACGACGAACGGTGCAGGGTTCGGTGGCGGTG
TCGATCTGATCGACGGCTGTGGATTCGATGATCGTACGGTTGGGATTAGTAGCGACGGAT
ATTACGATGATATGATGAACGGCGCTAATCACTGGGGTGGTTCGGTTTATTATTCTAACC
AGCCCATCATGGCTAATGATATCAATATGTATTAAATTAAAATTAATTATGAAACTAGTA
TT

QA 2 303 2 303
DS 



AS 1 4

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CACGGATAGTTACGGCGTCAACTTCGCCGTCTCTGGAGCGACGGTGAAAACACGCTTTCT
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GGTTCGAAAAGTATCTGGAGACACTCGGAACGAGCCAGAAGGTTTCCTTGTTTGAAGATT
CTCTGTTTTGGATCGGAGAGATCGGAGTTAACGACTATGCATACACCGTTGGATCTACTG
TGTCAAGCGACACCATTAGAGAACTTAGTATTACAACCTACACAAGGTTCCTTGAGACAT
TGTTGAACAAAGGTGTGAGGCACATGGTTGTACAAGGACATCCAGCAACTGGATGCTTGA
CGTTAGCGATGTCGCTGGCTGGAGAAGACGATCGAGACTATCTTGGATGTGTTCAGAGTG
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TCAAGTATCCGAACGTTACAATAGTCTACGCAGACTACTGGAACGCGTACCGTGAGGTGA
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AGCCGTACAACTTCCAAGTATTCGAGACGTGTGGGTCGGCTACAGCCACCGCGTGTAAGG
ACCCGAGTCGGCACATTAATTGGGATGGAGTCCACTTAACCGAGGGCATGTATAAGGTTA
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GTTTTGGAGTTTTGACATTGTTTGCTGAACTATGATCACGTGAATCATTTTAGACTCCTA
CTTACTGAAGAGAATCTGACGACACCGATGAAAAAAAGTTAAAGAAGCTATCCCATGCAT
CTTTCAATCTATTATCTTTTCTTTCCAAAATATAGATAGTTGTAGTTCGATGTGATAGCA
ATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1DK25TF U 1
AF RS1DK25JQ C 278
AF RS1CD59JQ C 823
AF RS1CD59TF U 646
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RD RS1DK25TF 655 0 0
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GGTTCGAAAAGTATCTGGAGACACTCGGAACGAGCCAGAAGGTTTCCTTGTTTGAAGATT
CTCTGTTTTGGATCGGAGAGATCGGAGTTAACGACTATGCATACACCGTTGGATCTACTG
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TGTTGAACAAAGGTGTGAGGCACATGGTTGTACAAGGACATCCAGCAACTGGATGCTTGA
CGTTAGCGATGTCGCTGGCTGGAGAAGACGATCGAGACTATCTTGGATGTGTTCAGAGTG
TCAATAACCAGAGTTACACTCACAATCTTGCATTGCAATACAAACTTAAAGAACT

QA 1 655 1 655
DS 

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GAAGGTTTCCTTGTTTGAAGATTCTCTGTTTTGGATCGGAGAGATCGGAGTTAACGACTA
TGCATACACCGTTGGATCTACTGTGTCAAGCGACACCATTAGAGAACTTAGTATTACAAC
CTACACAAGGTTCCTTGAGACATTGTTGAACAAAGGTGTGAGGCACATGGTTGTACAAGG
ACATCCAGCAACTGGATGCTTGACGTTAGCGATGTCGCTGGCTGGAGAAGACGATCGAGA
CTATCTTGGATGTGTTCAGAGTGTCAATAACCAGAGTTACACTCACAATCTTGCATTGCA
ATACAAACTTAAAGAACTTAGGATCAAGTATCCGAACGTTACAATAGTCTACGCAGACTA
CTGGAACGCGTACCGTGAGGTGATAAAGAACCCTAGCAAGTACGGCATTTCAGAAAAGTT
CAAGGCGTGCTGTGGAACGGGAGAGCCGTACAACTTCCAAGTATTCGAGACGTGTGGGTC
GGCTACAGCCACCGCGTGTAAGGACCCGAGTCGGCACATTAATTGGGATGGAGTCCACTT
AACCGAGGGCATGTATAAGGTTATGGCCGATATGTTCCTTGGCGGCAGTTTCACTCGACC
TAAGTTTAGTTACTCGTTGAACAAGAAATTAAAAGGTTTATGATTAAAAGGTTTTACTGA
TTTCC

QA 1 725 1 725
DS 

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ATATATGATGATTGTATGGTTTTGGAGTTTTGACATTGTTTGCTGAACTATGATCACGTG
AATCATTTTAGACTCCTACTTACTGAAGAGAATCTGACGACACCGATGAAAAAAAGTTAA
AGAAGCTATCCCATGCATCTTTCAAT
TTAT

QA 1 326 1 326
DS 

RD RS1CD59TF 560 0 0
G
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CTGTGGAACGGGAGAGCCGTACAACTTCCAAGTATTCGAGACGTGTGGGTCGGCTACAGC
CACCGCGTGTAAGGACCCGAGTCGGCACATTAATTGGGATGGAGTCCACTTAACCGAGGG
CATGTATAAGGTTATGGCCGATATGTTCCTTGGCGGCAGTTTCACTCGACCTAAGTTTAG
TTACTTGTTGAACAAGAAATTAAAAGGTTTATGATTAAAAGGTTTTACTGATTTCCATAT
ATGATGATTGTATGGTTTTGGAGTTTTGACATTGTTTGCTGAACTATGATCACGTGAATC
ATTTTAGACTCCTACTTACTGAAGAGAATCTGACGACACCGATGAAAAAAAGTTAAAGAA
GCTATCCCATGCATCTTTCAATCTATTATCTTTTCTTTCCAAAATATAGATAGTTGTAGT
TCGATGTGATAGCAATTTC

QA 2 560 2 560
DS 



AS 1 4

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TGGTGAACCCATGGGAAGTCTCCGCCAAAGAAGGCGGCAAAATCGACTACGACAAGCTCA
TAGACCAATTCGGCTGCCAGAGACTCGGCGATTCGCTCATCGATCGCGTTCAGAGGCTCA
CTTCTCGCCAACCACACGTCTTCCTCCGCCGCGGCGTCTTCTTCGCACACAGGGACTTCA
ATGAGGTGTTGGATGCGTACGAGAGAGGAGACAAGTTCTATCTCTACACTGGGAGAGGAC
CTTCTTCTGAGGCTTTGCATTTAGGGCATTTGATTCCTTTCATGTTTACCAAATACTTGC
AAGAGGCTTTCAAGGTTCCTCTGGTTATACAGCTGACGGATGATGAGAAATGCATGTGGA
AGAACTTATCGGTTGAGGAAAGTCAGAGACTTGCTAGAGAGAATGCCAAAGATATCATTG
CTTGTGGGTTTGATGTCACTAAGACCTTCATTTTCTCTGACTTTGACTATGTTGGCGGTT
CTTTCTATAAGAACATGGTGAAGGTTGCAAAGTGTGTAACACTTAATAAGGCTATGGGAA
TCTTTGGCTTTTCTGGTGAAGATCATATTGGAAAACTCAGTTTCCCTCCTGTGCAGGCAG
TTCCATCATTTCCTAGCTCATTCCCACACTTGTTCCCTGGCAAAGACAAGCTCCGCTGCT
TGATCCCTTGTGCAATTGACCAGGATCCTTACTTCAGGATGACTCGCGATGTTGCACCTC
GGTTAGGCTATAGCAAGTCTGCACTGATTGAGTCATCATTTTTCCCTGCTCTGCAGGGAG
AGAACGGAAAAATGTCTGCGAGCGATCCTAATTCAGCGATCTATGTGACAGATACTGCTA
AAGAAATAAAAAATAAGATAAACAGGTATGCTTTCAGTGGTGGGCAAGACTCCATCGAAA
AGCACAGAGAAATTGGAGCTAATCTTGAGGTGGATATACCAGTCAAGTATCTTAGTTTCT
TCCTAGAAGATGATACTGAGCTTGAACACATAAAGAAGGAATATGGAGAAGGAAGAATAC
TAACGGGTGAAGTAAAGAAGCGGCTCACTGAAGTTTTGACAGAAATGGTGGAGAGACACA
TCATGGCTCGAGCTGCTGTTACTGATGAGATGGTGGATGCGTTCATGGCCGTGAGACCTC
TCCCAAACATGTTCGAGTAACTCAGATGAAACCCTCTTTTTGGCTGCAACTTCTCATCAG
AAACGTTGAATTGTCTTCTGTTTTATTTTGATGTTTTTGATATGATGAATCGGTTCATGA
AATGTTTAAAATAGACGTTTTATATACTTACAACAAGTTTTTTTTTTTTTTTACTTTTGT
GTTTAAAAAATACGAGACAGTATCACTCTTTATTACATTTCGGTCCTTGGACTTATAATT
CTATACCTAAAAAGCTTGAT


BQ
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CTTCTTCTGAGGCTTTGCATTTAGGGCATTTGATTCCTTTCATGTTTACCAAATACTTGC
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CTTGTGGGTTTGATGTCACTAAGACCTTCATTTTCTCTGACTTTGACTATGTTGGCGGTT
CTTTCTATAAGAACATGGTGAAG*TTGCAAAGTGTGTAACACTTAA

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G
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TAGCAAGTCTGCACTGATTGAGTCATCATTTTTCCCTGCTCTGCAGGGAGAGAACGGAAA
AATGTCTGCGAGCGATCCTAATTCAGCGATCTATGTGACAGATACTGCTAAAGAAATAAA
AAATAAGATAAACAGGTATGCTTTCAGTGGTGGGCAAGACTCCATCGAAAAGCACAGAGA
AATTGGAGCTAATCTTGAGGTGGATATACCAGTCAAGTATCTTAGTTTCTTCCTAGAAGA
TGATACTGAGCTTGAACACATAAAGAAGGAATATGGAGAAGGAAGAATACTAACGGGTGA
AGTAAAGAAGCGGCTCACTGAAGTTT*GACAGAAATGGTGGAGAGACACATCATGGCTCG
AGCTGCTGT*ACTGATGAGATGGTGGATGCGTTCATGGCCGTGAGAC*TCTCC*AAACAT
GTTCGAGTA
CT

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ATAAACAGGTATGCTTTCAGTGGTGGGCAAGACTCCATCGAAAAGCACAGAGAAATTGGA
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GAGCTTGAACACATAAAGAAGGAATATGGAGAAGGAAGAATACTAACGGGTGAAGTAAAG
AAGCGGCTCACTGAAGTTTTGACAGAAATGGTGGAGAGACACATCATGGCTCGAGCTGCT
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TAACTCAGATGAAACCCTCTTTTTGGCTGCAACTTCTCATCAGAAACGTTGAATTGTCTT
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TGTTTAAAATAGACGTTTTATATACTTACAACAAGTTTTTTTTTTTTTTTACTTTTGTGT
TTAAAAAATACGAGACAGTATCACTCTTTATTACATTTCGGTCCTTGGACTTATAATTCT
ATACCTAAAAAGCTTGAT

QA 1 258 1 258
DS 



AS 1 4

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AAAGCAAAGCGAAGAGTACAAGAGAGGATTATATGTTGATAAGTTCATAAGAAAGCAAGT
TCCATACCTTCAGACATAACAAAGCAGCGAGAAATAGAAAGAATGTACATAGTAGACCGA
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AGCTGGGACCAAGTACTTTTTCTTATCAATATCAGGGACATCACTCTTCTCGGCCCTTTC
GACAATCACGGGTATTCTATCCGGATACTTGTCCCTGATACGAGCAGCTTCAGCCTGTCT
CTTTTCGAGAGGATGCTCTTGCTTGAAGGAACTGATCGCCATAATTGCACGAGTTTCGCT
GACAAGGGAAGATGAAGAAAATTTGAGAAGGAGGGGTTTGCTAAACGTCGGATTAGGATC
C


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 0 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

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AF RS1B115TF C 9
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C

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CGAAGACATAATCGCAGCAGTAGGTGGAAGAATGTTCTTGACGAAAATGAAGATGGCTTT
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GACAAGGGA***TGAAGAGAATT*GAGAAGGAGGGGTTTGCTAAACGTCGGATTAGGATC
C

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QA 1 653 1 653
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TAATCGCAGCAGTAGGTGGAAGAATGTTCTTGACGAAAATGAAGATGGCTTTCTCAGGAC
TGAGCTTGATCCTCTTGCGGACAACATAAACAAACTGACCAACAGTCAGATCAGCTGGGA
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CGGGTATTCTATCTGGATACTTGTCCCTGATACGAGCAGCTTCAGCCTGTCTCTTTTCGA
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AAGATGAAGAAAATTTGAGGAGGAGGG*TTTGCTAAACGTCGGATTAGGATCC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 4

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CCGCTTTTCTTCTCTTCCGCCATTGTTTTTCTTCCGATTGAGTTTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DO92JQ U 1
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AF RS1BU93JQ U 29
AF RS1BU93TF C 177
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CC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RS1DO92TF 641 0 0
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TGAGCGGTGAAGAGGATGATATCGGAATCGGCGAGGCTGTCTTTGAGATACGCGAGCGTC
CATCGGAGAGCGTGTTTGCTGCAATCGCTTTCGTCGATCGCCACCATCACCTGCTTCTTC
CCGCTTTTCTTCTCTTCCGCCATTGTTTTTCTTCCGATT
CC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RS1BU93JQ 620 0 0
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QA 1 620 1 620
DS 

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CTTGGTCCCTTCATCAATCCGATTCAACGCTGCGTTTTTGTAGTTCTGCTGCATTGAGTT
TATCAGCTCTATCGGAGCGGCGCCGTAAGAGGAAGCGTAGACGGAGCTGAGATCGAGCTG
AGGCTGAGCGGTGAAGAGGATGATATCGGAATCGGCGAGGCTGTCTTTGAGATACGCGAG
CGTCCATCGGAGAGCGTGTTTGCTGCAATCGCTTTCGTCGATCGCCACCATCACCTGCTT
CTTCCCGCTTTTCTTCTCTTCCGCCATTGTTTTTCTTCCGATT
GAGTTTTCC

QA 1 463 1 463
DS 



AS 1 4

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GATCGACATCGACTACTTAGTCGAGAGCGACGGTAGGAAACTCGTCTCTGGTCTCATCCC
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CCCTATATCTATGTGGTCTGGTTCATTTGGTTATGTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EL29TF U 1
AF RS1DJ88TF U 375
AF RS1EL29JQ C 819
AF RS1DJ88JQ C 666
BS 1 607 RS1EL29TF
BS 608 1062 RS1DJ88TF
BS 1063 1067 RS1DJ88JQ
BS 1068 1068 RS1EL29JQ
BS 1069 1120 RS1DJ88JQ
BS 1121 1122 RS1EL29JQ
BS 1123 1180 RS1DJ88JQ

RD RS1EL29TF 607 0 0
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TGAAATCATCGACAGAGGACACCACAAGGAAGAGGAAGAAAAAGAAGAAGGCAAAGGAGG
CTTCCTGGACAAGGTCAAAGACTTCATCCACGACATCGGCGAGAAGATCGAAGAAACCAT
CGGCTTCGGCAAACCAACCGCCGACGTCTCCGCCATCCACATCCCCAAGATCAACCTCGA
GAGAGCCGACATCGTCGTCGACGTCCTCGTCAAGAACCCCAACCCCGTCCCCATCCCCTT
GATCGACATCGACTACTTAGTCGAGAGCGACGGTAGGAAACTCGTCTCTGGTCTCATCCC
CGACGCAGGAACCATCAAGGCCCACGGGGAAGAGACCGTCAAGATCCCCCTGACTCTCAT
CTACGACGACATCAAGAGCACTTACAACGACATCAACCCCGGGGATGATCATTCCTTACA
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AGAAGCGCGGAGAGATTCCTATACCTAAGAAGCCTGATGTAGACATTGAGAAGATCAAGT
TCCAGAA

QA 1 607 1 607
DS 

RD RS1DJ88TF 688 0 0
G
CAAGGCCCACGGGGAAGAGACCGTCAAGATCCCCCTGACTCTCATCTACGACGACATCAA
GAGCACTTACAACGACATCAACCCCGGG*ATGATCATTCCTTACAGGATCAAAGTCGATC
TCATCGTCGACGTGCCTGTCTTCGGGAGGCTGACGTTGCCTTTGGAGAAGCGCGGAGAGA
TTCCTATACCTAAGAAGCCTGATGTAGACATTGAGAAGATCAAGTTCCAGAAGTTTTCTT
TGGAGGAGACGGTTGCGATTCTCCACGTGAGGCTTGAGAACATGAATGACTTTGACTTGG
GGCTTAACGACTTGGACTGTGAGGTTTGGTTGAGTGATGTGAGTATTGGGAAAGCTGAGA
TAGCGGATTCTATTAAGCTTGATAAGAACGGGAGCGGGTTGGTTAACGTGCCGATCACGT
TTAGGCCGAAGGAATTTGGATCTGCGCTTTGGGATATGATTCGCGGTAAAGGGACGGGGT
ATACTATTAAAGTGAATGTGGATGTTGATACGCCGTTTGGTGCTATGAAGCTTCCTATTG
TCAAGGAAGGTGGTGAGACTCGTTTGAAGAAGGAAGATGATGACGATGACGATGACGAAT
GAGGAGTAAAGGAAAAGAGCTCAAGAGATCGAGTGTGTGTTGAGTACTGAATCTCTCATC
TTTAAGAATAATGTTTTTAAGTTAAAC

QA 2 688 2 688
DS 

RD RS1EL29JQ 318 0 0
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GTTGATACGCCGTTTGGTGCTATGAAGCTTCCTATTGTCAAGGAAGGTGGTGAGACTCGT
TTGAAGAAGGAAGATGATGACGATGACGATGACGAATGAGGAGTAAAGGAAAAGAGCTCA
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AAACTGAGGACTTGTTTGGTGTGTGCTTTTGATGACTGATGGATCAGACTTGACTTTTCA
CTAGTGCTGTTTGTTTGG

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DS 

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TTTGACTTGGGGCTTAACGACTTGGACTGTGAGGTTTGGTTGAGTGATGTGAGTATTGGG
AAAGCTGAGATAGCGGATTTTATTAAGCTTGATAAGAACGGGAGCGGGTTGGTTAACGTG
CCGATCACGTTTAGGCCGAAGGAATTTGGATTTGCGCTTTGGGATATGATTCGCGGTAAA
GGGACGGGGTATACTATTAAAGTGAATGTGGATGTTGATACCCCGTTTGGTGCTATGAAG
CTTCCTATTGTCAAGGAAGGTGGTGAGACTCGTTTGAAGAAGGAAGATGATGACGATGAC
GATGACGAATGAGGAGTAAAGGAAAAGAGCTCAAGAGATCGAGTGTGTGTTGAGTACTGA
ATCTTTCATCTTTAAGAATAATGTTTTTAAGTTAAACTGAGGGCTTGTTTGGTGTGTGCT
TTTGATGACTGATGGATCAGACTTGACTTTTCACT**TGCTGTTTGTTTGGATCTCCCTA
TATCTATGTGGTCTGGTTCATTTGGTTATGTTTTC

QA 1 515 1 515
DS 



AS 1 4

CO CL2091Contig1 841 4 8 U
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CCTTGGTTTCACCCATCTCTTTTGCCTCTGTTTTAGACTTTTGTGTAGCTGATCCAAAGG
GTCCTCAAAACCCATCAGGATACTCTTGCAAGAACCCTGACCAAGTCACCGAGAATGACT
TCGCGTTCTCCGGTCTCGCCAAAGCCGGAAACACTTCCAACATCATTAAAGCCGCTGTGA
CTCCAGCCTTTGCACCTGCCTTCGCAGGTCTCAATGGCCTTGATGTCTCATTGGCTCGTC
TTGACTTAGCCGGTGGAGGTGTCATCCCTCTTCATACTCACCCTGGTGCATCCGAGGTCC
TTGTAGTCATACAAGGAACCATACGCGCAGGATTTATCTCCTCTGCCAACAAGGTTTACT
TGAAGACTCTCTATCGAGGAGACTCCATGGTGTTTCCCCAAGGGCTTCTTCATTTTCAGC
TTAACTCTGGGAAAGGACCTGCGTTGGCCTTTGTTGCCTTTGGAAGCTCTTCTCCAGGGC
TTCAGATTCTACCATTTGCTCTGTTTGCAAATGATTTGCCTTCAGAACTCGTTGAAGCCA
CGACGTTCCTTAGCGATGAAGAGGTTAAGAAGCTCAAGGGTGTGCTTGGAGGAACTAATT
AAGCTTCTCTTTCTGATTCTTTTCTAAATTTTTGTGTGTGTTTATGAGTTCTTTTATTCA
AGTTCTTCTAGCAGTCTCATGTTTATTCGAATGGTTGTGTGTTCTTGTGTTGCTACTTGT
CTCATTGGTTTGAATTGTAATAAGTAATAAGCATTACATTGCAAACATCTAAAATTCCTT
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1G948TF U 30
AF RS1G948JQ C 586
AF RS1H733TF U 1
AF RS1H733JQB C 421
BS 1 259 RS1H733TF
BS 260 260 RS1G948TF
BS 261 263 RS1H733TF
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BS 265 687 RS1H733TF
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BS 689 745 RS1H733TF
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RD RS1G948TF 551 0 0
GG
AATGATAATCCATATCTTCTTCATCCTCTCCTTGGTTTCACCCATCTCTTTTGCCTCTGT
TTTAGACTTTTGTGTAGCTGATCCAAAGGGTCCTCAAAACCCATCAGGATACTCTTGCAA
GAACCCTGACCAAGTCACCGAGAATGACTTCGCGTTTTCCGGTCTCGCCAAAGCCGGAAA
CACTTCCAACATCATTAAAGCCGCTGTGACTCCAGCCTTTGCACCTGCCTTCGCAGGTCT
CAATGGCCTTGATGTCTCATTGGCTCGTCTTGACTTAGCCGGTGGAGGTGTCATCCCTCT
TCATACTCACCCTGGTGCATCCGAGGTCCTTGTAGTCATACAAGGAACCATACGCGCAGG
ATTTATCTCCTCTGCCAACAAGGTTTACTTGAAGACTCTCTATCGAGGAGACTCCATGGT
GTTTCCCCAAGGGCTTCTTCATTTTCAGCTTAACTCTGGGGAAGGACCTGCGTTGGCCTT
TGTTGCCTTTGGAAGCTCTTCTCCAGGGCTTCAGATTCTACCATTTGCTCTGTTTGCAAA
TGACTTGCC

QA 3 551 3 551
DS 

RD RS1G948JQ 108 0 0
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TTGGAGGAACTAATTAAGCTTCTCTTTCTGATTTTTTTCT
CTAAATTT

QA 1 100 1 100
DS 

RD RS1H733TF 745 0 0
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TCGCGTTCTCCGGTCTCGCCAAAGCCGGAAACACTTCCAACATCATTAAAGCCGCTGTGA
CTCCAGCCTTTGCACCTGCTTTCTCAGGTCTCAATGGCCTTGATGTCTCATTGGCTCGTC
TTGACTTAGCCGGTGGAGGTGTCATCCCTCTTCATACTCACCCTGGTGCATCCGAGGTCC
TTGTAGTCATACAAGGAACCATACGCGCAGGATTTATCTCCTCTGCCAACAAGGTTTACT
TGAAGACTCTCTATCGAGGAGACTCCATGGTGTTTCCCCAAGGGCTTCTTCATTTTCAGC
TTAACTCTGGGAAAGGACCTGCGTTGGCCTTTGTTGCCTTTGGAAGCTCTTCTCCAGGGC
TTCAGATTCTACCATTTGCTCTGTTTGCAAATGATTTGCCTTCAGAACTCGTTGAAGCCA
CGACGTTCCTTAGCGATGAAGAGGTTAAGAAGCTCAAGGGTGTGCTTGGAGGAACTAATT
AAGCTTCTCTTTCTGATTCTTTTCTAA*TTTTTGTGTGTGTTTATGAGTTCTTTTATTCA
AGTTCTTCTAGCAGTCTCATGTTTA

QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1H733JQB 421 0 0
TGAAGACTCTCTATCGAGGAGACTCCATGGTGTTTCCCCAAGGGCTTCTTCATTTTCAGC
TTAACTCTGGGAAAGGACCTGCGTTGGCCTTTGTTGCCTTTGGAAGCTCTTCTCCAGGGC
TTCAGATTCTACCATTTGCTCTGTTTGCAAATGATTTGCCTTCAGAACTCGTTGAAGCCA
CGACGTTCCTTAGCGATGAAGAGGTTAAGAAGCTCAAGGGTGTGCTTGGAGGAACTAATT
AAGCTTCTCTTTCTGATTCTTTTCTAAATTTTTGTGTGTGTTTATGAGTTCTTTTATTCA
AGTTCTTCTAGCAGTCTCATGTTTATTCGAATGGTTGTGTGTTCTTGTGTTGCTACTTGT
CTCATTGGTTTGAATTGTAATAAGTAATAAGCATTACATTGCAAACATCTAAAATTCCTT
T

QA 1 421 1 421
DS 



AS 1 3

CO CL2092Contig1 921 3 11 U
GGCGGGTGGAAAGGCTAGAGTACGTAGGAGTTATGGAACTCGCATCTGACGTGCAGTATA
TGCTAAGGGGAGCAATGCAGTTCTATGGATTCTCACACGAGGTGAGATCTGAAGCAAGGA
AGGTTCACAATCTGTTCTTTGATCTACTGAAAAGGTCTTTTCCAGACACGAATTTTCAGG
AAGCAAGGAATGCTCTTTCCTTCTCTGGTCCAACCCCAACTTTGGTGTCTACATCTTCCC
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ATAATTCTCTATCTACTTAGAAGATAAGTCCTTTTGTCTGGAGGCACTATCCCCCATCTT
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AAGATTTTGCATATTGTTGTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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G
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G
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TACTTAGAAGATAAGTCCTTTTGTCTGGAGGCACTATCCCCCATCTTTAGAGATGTTCAA
TGTATAAAAAAAATTTGAGATATGGATTCATGTTTAATTTGTTGTAAAAGATTTTGCATA
TTGTTGTC

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 4

CO CL2093Contig1 1491 4 16 U
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ATGGGCTTAGGAAGAACACAATCGCTATCGATGCGCTTTGCCATACTTTTAGCTGCGCAA
ACGCTCCTTCCGTGTCATGTTTGAAGAGTAACGCGAGAAGAGCACTGATTTGAGTGTTTA
ATATTCCATCACCGATGCCTAACACAGCCGCCATCACAAGTGGGTAAACTGTGCCAAGTA
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TCATCCTTGGAAGAGAAACCAAGGAATCAACTAAGCCCATAGAAGAACCCACAGGTTCTT
TTTTCTTCTCCGTCAATTTTTCTAATGAAGAACATTAGTATAGTTCCAAATGTCATAATG
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GATGTCGGAGTTACCTACAGTGAAAGTCAAACCATGGGGGAGAGAGAGACC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FX40JQ U 1
AF RS1FK18JQ U 2
AF RS1FX40TF C 241
AF RS1FK18TF C 789
BS 1 170 RS1FX40JQ
BS 171 171 RS1FK18JQ
BS 172 195 RS1FX40JQ
BS 196 196 RS1FK18JQ
BS 197 240 RS1FX40JQ
BS 241 241 RS1FK18JQ
BS 242 565 RS1FX40JQ
BS 566 591 RS1FK18JQ
BS 592 592 RS1FX40TF
BS 593 610 RS1FK18JQ
BS 611 611 RS1FX40TF
BS 612 738 RS1FK18JQ
BS 739 916 RS1FX40TF
BS 917 917 RS1FK18TF
BS 918 1026 RS1FX40TF
BS 1027 1491 RS1FK18TF

RD RS1FX40JQ 565 0 0
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GTTGAATTGGGGATAGTGTTTTTTTAGCTTGAGTTTGTCTTAGGACGTGAACAAATCAAA
AGCATCATCATTCGTCACGTGTAAACACACTCTCGACTTTAAGAGCTAAA*CCAAGAAAG
AGAGGAGAGAAACACGGACCATAACAAGCATCACAATGAACATGGCTTGCAATGATATAT
GTGGGCTTAGGAAGAACACAATCGCTATCGATGCGCTTTGCCATACTTTTAGCTGCGCAA
ACGCTCCTTCCGTGTCATGTTTGAAGAGTAACGCGAGAAGAGCACTGATTTGAGTGTTTA
ATATTCCATCACCGATGCCTAACACAGCCGCCATCACAAGTGGGTAAACTGTGCCAAGTA
CTCCGCTTGTTGTCCTGTAACCAAGAAGAAGCCAGAGAAACACAGAAGCTTGAGCAACAG
CTCCACCAGAAACTATGAAGGTGATTGATGACAGACCAGAGGTAAACCGTCCAGCGGTTA
TTGAACAAACTGCGTCAAGAGCTCC

QA 1 565 1 565
DS 

RD RS1FK18JQ 737 0 0
GC
GGAAACTACAGAGAATATTTATTGCACAAATTACAAAAACAAGTAGAGTTCTTTACAGTT
GAATTGGGGATAGTGTTTTTTTAGCTTGAGTTTGTCTTAGGACGTGAACAAATCAAAAGC
ATCATCATTCGTCGCGTGTAAACACACTCTCGACTTTAAGAGCTAAAACCAAGAAAGAGA
GGAGAGAAACACAGACCATAACAAGCATCACAATGACCATGGCTTGCAATGATATATATG
GGCTTAGGAAGGACACAATCGCTATCGATGCGCTTTGCCATACTTTTAGCTGCGCAAACG
CTCCTTCCGTGTCATGTTTGAAGAGTAACGCGAGAAGAGCACTGATTTGAGTGTTTAATA
TTCCATCACCGATGCCTAACACAGCCGCCATTACAAGTGGGTAAACTGTGCCAAGTACTC
CGCTAGTTGTCCTGTAACCAAGAAGAAGCCAGAGAAACACAGAAGCTTGAGCAACAGCTC
CACCAGAAACTATGAAGGTGATTGATGACAGACCAGAGGTAAACCGTCCAGCGGTTATTG
AACAAACTGCGTCAAGAGCTCCGTAGACAGCCATTGCCCCGCCAACACTTGAGACACCAA
TCGCAGGTGTGACTATTTCCTTTGTAAACTCAGCCCAAACAAATGCTTGTTGTAGTCCTG
AGTATGCAAGGAGTGGGACAATCAGTAGCATCCGTACGTCGAGCAAAGGAGTGATTATCA
TCCTTGGAAGAGAAA

QA 3 737 3 737
DS 

RD RS1FX40TF 787 0 0
TATGTGGGCTAGGAG
ACACAATCGCTATCGATGCGCTT*GCCATACTTT*AGCTGCGCAA*CGCTCTTTCCGTGT
CATGTT*GAAGAGTA*CGCGAGAAGAGCACTGATTTGAGTGTTTAATATTCCATCACCGA
TGCCTAACACAGCCGCCATCACAAGTGGGTAAACTGTGCCAAGTACTCCGCTTGTTGTCC
TGTAACCAAGAAGAAGCCAGAGAAACACAGAAGCTTGAGCAACAGCTCCACCAGAAACTA
TGAAGGTGATTGATGACAGACCAGAGGTAAACCGTCCAGCGGTTATTGAACAAACTGCGT
CAAGAGCTCCGTAGACAGCCATTGCCCCGCCAACACCTGAGACACCAATCGCAGGCGTGA
CTATTTCCTTTGTAAACTCAGCCCAAACAAATGCTTGTTGTAGTCCTGAGTGTGCAAGGA
GTGGGACAATCAGTAGCATCCGTACGTCGAGCAAAGGAGTGATTATCATCCTTGGAAGAG
AAACCAAGGAATCAACTAAGCCCATAGAAGAACCCACAGGTTCTTTTTTCTTCTCCGTCA
ATTTTTCTAATGAAGAACATTAGTATAGTTCCAAATGTCATAATGAGGAGGAACACCAAC
AACAATAAGGTTGTGCTTCCTTCCTTTCCATCTTTGAGCAATGTAAGTGTAATGAGATTC
CCAAACAGCTGGTGGCAGGCAAAGACAGCCCAAAACTCTCCATTGAAGACACCAATTATT
GATCCTTCATGCACACCATGATCTTTAGCATGACTTCTCGCAATTGATGTA
C

QA 16 786 16 786
DS 

RD RS1FK18TF 703 0 0
TCTCGTCAA
TTTTCTAATGAAGAACATTAGTATAGTTCCAAATGTCATAATGAGGAGGAACACCAACAA
CAATAAGGTTGTGCTTC*TTCCTTTCCATCTTTGAGCAATGTAAGTGTAATGAGATTCCA
AAACAGCTGGTGGCAGGCAAAGACAGCCCAAAACTCTCCATTGAAGACACCAATTATTGA
TCCTTCATGCACACCATGATCTTTAGCATGACTTCTCGCAATTGATGTAAGGTATGTTCC
CTGGCCAACCCATATTATGGAAGCTGCAAATCCAAGGTATAAAGAGGCTGGCACCATAGT
GATCCATGATGGCTTCAGATTAGCGGCAACGAAGAGCCAATACCCTGAAGTTCCTAAAAT
CAGAGCATTCTTTGATCCAATTAAGCGGACAACCAAAGAAGCAACCATGGAGCAAAACAT
GAAGGACACATACAATATCCCTAGAGAGATTGTTCCCAAATCCTTATTAATAGTCGTTTC
GAGGTTCTGAACGGCACCGAAGGCGAGGAAGATTAACAAAAAGGAGATACTAAGCATATG
AACATCTCTTGTGTAGCTCTTCCCAGCTCTTACTTTCCGATCCTCACCAGAGACCAACAC
CAACGGCGCCTCCTCGTCGTTTCGAGAATCCATCGCCGAGAACGATGTCGGAGTTACCTA
CAGTGAAAGTCAAACCATGGGGGAGAGAGAGACC

QA 10 703 10 703
DS 



AS 1 3

CO CL2094Contig1 975 3 2 U
GGCAGAAAAAAAATGGCTGGTGCTAAGAAGCTCTCATCATCAGCCAAGACTAAACCTTCG
AGTGTCTCTGAGAAAGATAAGGTTAGCAATGGTTAAGACTTGGTGGGTTCAAAGGTTAGA
GTTTGGTGGCCGATAGATCGAAAGTTCTACAATGGAGTGGTTGATTCCTTTAACTCTCGC
ACTAAGAAACATCGGGTTTTTTATGATGATGGTGAGAAAGAGATCTTGGATATGGACAAG
GAGAGGTGGGAGTTAATTGAAGATGATGATGATGATGACAATGCTGCTGATGAGGACAAA
TCTGACGATGAGATCGCTGATGTTATCCCAGAACCGCCTAACAGGAAGTCTGCTAGGACA
AATGGTGTCATGGGTGACATTGGTGGGAAGATTGTAGCAGCGGCCTCGCGTCTGAGGTCG
TGCAATAAGATTTCCGAAGCAACCAATGGGAAGAAGAAAAGGGGTTCTTCGTCTTCATCA
GAGGCTGTCTCTGAAAAAGTGACAAGACCAATGCCTTCCTCTAAGAAGAGCAAGAGGAAG
AGGACTGATGATGAAGATGAAGATGTGGGTGAGGATGAGGATGAGCAAGCATCTGACGAT
GAATCCAAGCCGCTGCAGATTTTGGTGGATAAGTTGAAGGGCAAGAAGAAGAAGAAGCAG
GAGAAGGAATCCCCCAAAGAAGAGACCAAAGAGTGAAGGACCCAAGGAAGAAGGGGAAGA
GGGTGAAGAACCCAAGGAAGAAGGGGAAGAAGGTGAAGAACCCAAGGAAGAAGAGGAAGA
GGGTGAACAGGCTTAGACAAGAGAGTTTCGCAGTCTATCTCAATGTGCAAGTATTTTAGA
AGAGTTTTAATTTATACAGCTGAGTCTTACTTGGTTAAAGTATAGGACTTGTAGGGATTT
TTAGGTTATGTTGATTCGAAAAATGTGCAGCCATAGGGGTTGAGATAAAGCTAATCTGTT
GAACTATGATTTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BD54TF U 1
AF RS1F772JQ C 593
AF RS1F772TF U 593
BS 1 652 RS1BD54TF
BS 653 975 RS1F772TF

RD RS1BD54TF 652 0 0
GGCAGAAAAAAAATGGCTGGTGCTAAGAAGCTCTCATCATCAGCCAAGACTAAACCTTCG
AGTGTCTCTGAGAAAGATAAGGTTAGCAATGGTTAAGACTTGGTGGGTTCAAAGGTTAGA
GTTTGGTGGCCGATAGATCGAAAGTTCTACAATGGAGTGGTTGATTCCTTTAACTCTCGC
ACTAAGAAACATCGGGTTTTTTATGATGATGGTGAGAAAGAGATCTTGGATATGGACAAG
GAGAGGTGGGAGTTAATTGAAGATGATGATGATGATGACAATGCTGCTGATGAGGACAAA
TCTGACGATGAGATCGCTGATGTTATCCCAGAACCGCCTAACAGGAAGTCTGCTAGGACA
AATGGTGTCATGGGTGACATTGGTGGGAAGATTGTAGCAGCGGCCTCGCGTCTGAGGTCG
TGCAATAAGATTTCCGAAGCAACCAATGGGAAGAAGAAAAGGGGTTCTTCGTCTTCATCA
GAGGCTGTCTCTGAAAAAGTGACAAGACCAATGCCTTCCTCTAAGAAGAGCAAGAGGAAG
AGGACTGATGATGAAGATGAAGATGTGGGTGAGGATGAGGATGAGCAAGCATCTGACGAT
GAATCCAAGCCGCTGCAGATTTTGGTGGATAAGTTGAAGGGCAAGAAGAAGA

QA 1 652 1 652
DS 

RD RS1F772JQ 383 0 0
GGGAC
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AGAGGGTGAACAGGCTTAGACAAGAGAGTTTCGCAGTCTATCTCAATGTGCAAGTATTTT
AGAAGAGTTTTAATTTATACAGCTGAGTCTTACTTGGTTAAAGTATAGGACTTGTAGGGA
TTTTTAGGTTATGTTGATTCGAAAAATGTGCAGCCATAGGGGTTGAGATAAAGCTAATCT
GTTGAACTATGATTTGCG

QA 6 383 6 383
DS 

RD RS1F772TF 383 0 0
GCGAC
GATGAATCCAAGCCGCTGCAGATTTTGGTGGATAAGTTGAAGGGCAAGAAGAAGAAGAAG
CAGGAGAAGGAATCCCCCAAAGAAGAGACCAAAGAGTGAAGGACCCAAGGAAGAAGGGGA
AGAGGGTGAAGAACCCAAGGAAGAAGGGGAAGAAGGTGAAGAACCCAAGGAAGAAGAGGA
AGAGGGTGAACAGGCTTAGACAAGAGAGTTTCGCAGTCTATCTCAATGTGCAAGTATTTT
AGAAGAGTTTTAATTTATACAGCTGAGTCTTACTTGGTTAAAGTATAGGACTTGTAGGGA
TTTTTAGGTTATGTTGATTCGAAAAATGTGCAGCCATAGGGGTTGAGATAAAGCTAATCT
GTTGAACTATGATTTGCG

QA 6 383 6 383
DS 



AS 1 4

CO CL2095Contig1 652 4 5 U
GTGGTCGGAAAATCGAAAAATGGGGAGGAGGATTTTGAACGATGCGTTGAGGACGATTGT
GAATGCGGAGAGGCGAGGGAAAGCTTCGGTGGAGCTTAAACCTATCTCCACCGTCATGTC
TTCCTTCCTCAGAATCATGAAGGAAAAAGGTTACATCAAGAACTTTCAAGTGTATGATCC
ACATAGAGTTGGTAGGATAACCGTTGATCTTCAAGGGAGGGTTAACGACTGCAAAGCTCT
TACTTATAGGCAAGACGTCAAGGCAAAAGAGATTGAGGAATACACTGAACGCACACTTCC
AACACGTCAGTGGGGTTATGTTGTAGTCACAACTCCGGATGGGATTTTGGACCATGAAGA
AGCTATTAAACGCAATGTTGGTGGTCAGGTTCTTGGTTTCTTTTACTGAAGAGCTTATTC
TAGCGCACACCAAGAGGCTCTAGTGTCAAAAGAATTTTAACAAATGTTCGGAAAATTTCG
ATCAGAACATGTTATTCCTCTGGTTCTTTGTTTTGTTATCTTGGATCGTCTTTGAACAAA
GTGGCAATTACAGTACACATTTGCTTGTTGAATTCAAAGATATTATGAAGCATTTTGCAG
ATTTTGTTGTTTGATGAAGCTAAAATCCATTGGTTTTACAGCCACATGTGTC


BQ
10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1H786JQB C 1
AF RS1H786TF U 1
AF RS1CG80JQ C 2
AF RS1CG80TF U 2
BS 1 2 RS1H786JQB
BS 3 92 RS1H786TF
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BS 597 652 RS1CG80TF

RD RS1H786JQB 558 0 0
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TTCCTTCCTCAGAATCATGAAGGAAAAAGGTTACATCAAGAACTTTCAAGTGTATGATCC
ACATAGAGTTGGTAGGATAACCGTTGATCTTCAAGGGAGGGTTAACGACTGCAAAGCTCT
TACTTATAGGCAAGACGTCAAGGCAAAAGAGATTGAGGAATACACTGAACGCACACTTCC
AACACGTCAGTGGGGTTATGTTGTAGTCACAACTCCGGATGGGATTTTGGACCATGAAGA
AGCTATTAAACGCAATGTTGGTGGTCAGGTTCTTGGTTTCTTTTACTGAAGAGCTTATTC
TAGCGCACACCAAGAGGCTCTAGTGTCAAAAGAATTTTAACAAATGTTCGGAAAATTTCG
ATCAGAACATGTTATTCCTCTGGTTCTTTGTTTTGTTATCTTGGATCGTCTTTGAACAAA
GTGGCAATTACAGTACAC

QA 1 558 1 558
DS 

RD RS1H786TF 598 0 0
GT
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CCTTCCTCAGAATCATGAAGGAAAAAGGTTACATCAAGAACTTTCAAGTGTATGATCCAC
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CTTATAGGCAAGACGTCAAGGCAAAAGAGATTGAGGAATACACTGAACGCACACTTCCAA
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GGCAATTACAGTACACATTTGCTTGTTGAATTCAAAGATATTATGAAGCATTTT
AC

QA 3 596 3 596
DS 

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G
GGTCGGAAAATCGAAAAATGGGGAGGAGGATTTTGAACGATGCGTTGAGGACGATTGTGA
ATGCGGAGAGGCGAGGGAAAGCTTCGGTGGAGCTTAAACCTATCTCCACCGTCATGTCTT
CCTTCCTCAGAATCATGAAGGAAAAAGGTTACATCAAGAACTTTCAAGTGTATGATCCAC
ATAGAGTTGGTAGGATAACCGTTGATCTTCAAGGGAGGGTTAACGACTGCAAAGCTCTTA
CTTATAGGCAAGACGTCAAGGCAAAAGAGATTGAGGAATACACTGAACGCACACTTCCAA
CACGTCAGTGGGGTTATGTTGTAGTCACAACTCCGGATGGGATTTTGGACCATGAAGAAG
CTATTAAACGCAATGTTGGTGGTCAGGTTCTTGGTTTCTTTTACTGAAGAGCTTATTCTA
GCGCACACCAAGAGGCTCTAGTGTCAAAAGAATTTTAACAAATGTTCGGAAAATTTCGAT
CAGAACATGTTATTCCTCTGGTTCTTTGTTTTGTTATCTTGGATCGTCTTTGAACAAAGT
GGCAATTACAGTACACATTTGCTTGTTGAATTCAAAGATATTATGAAGCATTTTGCAGAT
TTTGTTGTTTGATGAAGCTAAAATCCATTGGTTTTACAGCCACATGTGTC

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DS 

RD RS1CG80TF 651 0 0
G
GGTCGGAAAATCGAAAAATGGGGAGGAGGATTTTGAACGATGCGTTGAGGACGATTGTGA
ATGCGGAGAGGCGAGGGAAAGCTTCGGTGGAGCTTAAACCTATCTCCACCGTCATGTCTT
CCTTCCTCAGAATCATGAAGGAAAAAGGTTACATCAAGAACTTTCAAGTGTATGATCCAC
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CTTATAGGCAAGACGTCAAGGCAAAAGAGATTGAGGAATACACTGAACGCACACTTCCAA
CACGTCAGTGGGGTTATGTTGTAGTCACAACTCCGGATGGGATTTTGGACCATGAAGAAG
CTATTAAACGCAATGTTGGTGGTCAGGTTCTTGGTTTCTTTTACTGAAGAGCTTATTCTA
GCGCACACCAAGAGGCTCTAGTGTCAAAAGAATTTTAACAAATGTTCGGAAAATTTCGAT
CAGAACATGTTATTCCTCTGGTTCTTTGTTTTGTTATCTTGGATCGTCTTTGAACAAAGT
GGCAATTACAGTACACATTTGCTTGTTGAATTCAAAGATATTATGAAGCATTTTGCAGAT
TTTGTTGTTTGATGAAGCTAAAATCCATTGGTTTTACAGCCACATGTGTC

QA 2 651 2 651
DS 



AS 1 4

CO CL2096Contig1 980 4 2 U
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GCAAAATGGTTGCTCAAGGGTTCACTGTGGACCTTAATAAGCCTCTTGTATTTCAGGTTG
GTCATCTTGGTGAAGCTTACGAGGAATGGGTTCACCAACCCATTGTGACAAAGGAAGGCC
CTCGTTTTTTCCAGAGTAACTTTTGGGAGTTCTTGACCCTTACAAGATGGTGGGTGGTTC
CTGTTATTTGGTTTCCAGTTGCGGTCTGGTGCATCTCCAAGTCAGTAACCATGGGCCTTT
CACTTCCAGAAATCGTCCCGTTGATAGCCTTGGGTATCTTTATCTGGACGTTTATAGAAT
ACACTCTTCACCGCTTCCTTTTCCACATCAAGACCAAGAGTTACTGGGGAAACACGGCGC
ACTATCTTCTTCACGGATGCCATCACAAACACCCAATGGACCACCTTCGACTCGTCTTTC
CTCCTGCTGCAACAGCGGTTTTATGCTTTCCCTTCTGGAACCTTGTGAAGCTTTTCGCAA
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TTACTCACTACTACCTTCACCATGCACAACCAACTAGAGCAGTGACCAAGAATCTCAAGA
AATATCATTTGAACCATCACTTCAGGATTCAAGATAAGGGATTTGGTATAACATCGTCGC
TATGGGACATAGTGTTTGGGACACTACCCACCACAAAAGCCCCTAAAAGAGAGCAGTAGT
GTTGTACTAAGATGCAAAACTAAAAGGATATTTGCAAATTGCAACACAGTTAAATTATTG
ATCATCCCTCATGAGTTTTGAGATGTTTGACTGAGGTTTCATTTGGATCACAGTCTTTGT
AAATCAGTGTTACACATCCTACTTAATAGTTTTTTTTGGTGTGTGTTTTCACTGAAAGCA
ATCGAAAATATTTACCAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DW22TF U 1
AF RS1DW22JQ C 301
AF RS1DU15JQ C 635
AF RS1DU15TF U 635
BS 1 681 RS1DW22TF
BS 682 980 RS1DU15TF

RD RS1DW22TF 681 0 0
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GCAAAATGGTTGCTCAAGGGTTCACTGTGGACCTTAATAAGCCTCTTGTATTTCAGGTTG
GTCATCTTGGTGAAGCTTACGAGGAATGGGTTCACCAACCCATTGTGACAAAGGAAGGCC
CTCGTTTTTTCCAGAGTAACTTTTGGGAGTTCTTGACCCTTACAAGATGGTGGGTGGTTC
CTGTTATTTGGTTTCCAGTTGCGGTCTGGTGCATCTCCAAGTCAGTAACCATGGGCCTTT
CACTTCCAGAAATCGTCCCGTTGATAGCCTTGGGTATCTTTATCTGGACGTTTATAGAAT
ACACTCTTCACCGCTTCCTTTTCCACATCAAGACCAAGAGTTACTGGGGAAACACGGCGC
ACTATCTTCTTCACGGATGCCATCACAAACACCCAATGGACCACCTTCGACTCGTCTTTC
CTCCTGCTGCAACAGCGGTTTTATGCTTTCCCTTCTGGAACCTTGTGAAGCTTTTCGCAA
CGCCTTCAACCACACCTGCCTTGTTTGGAGGTGGTATGCTCGGGTACGTGATGTACGATA
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AATATCATTTGAACCATCACT

QA 1 681 1 681
DS 

RD RS1DW22JQ 630 0 0
CACTTCCAGAAATCGTCCCGTTGATAGCCTTGGGTATCTTTATCTGGACGTTTATAGAAT
ACACTCTTCACCGCTTCCTTTTCCACATCAAGACCAAGAGTTACTGGGGAAACACGGCGC
ACTATCTTCTTCACGGATGCCATCACAAACACCCAATGGACCACCTTCGACTCGTCTTTC
CTCCTGCTGCAACAGCGGTTTTATGCTTTCCCTTCTGGAACCTTGTGAAGCTTTTCGCAA
CGCCTTCAACCACACCTGCCTTGTTTGGAGGTGGTATGCTCGGGTACGTGATGTACGATA
TTACTCACTACTACCTTCACCATGCACAACCAACTAGAGCAGTGACCAAGAATCTCAAGA
AATATCATTTGAACCATCACTTCAGGATTCAAGATAAGGGATTTGGTATAACATCGTCGC
TATGGGACATAGTGTTTGGGACACTACCCACCACAAAAGCCCCTAAAAGAGAGCAGTAGT
GTTGTACTAAGATGCAAAACTAAAAGGATATTTGCAAATTGCAACACAGTTAAATTATTG
ATCATCCCTCATGAGTTTTGAGATGTTTGACTGAGGTTTCATTTGGATCACAGTCTTTGT
AAATCAGTGTTACACGTCCTACTTAATAGT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RS1DU15JQ 346 0 0
G
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GTTTCATTTGGATCACAGTCTTTGTAAATCAGTGTTACACATCCTACTTAATAGTTTTTT
TTGGTGTGTGTTTTCACTGAAAGCAATCGAAAATATTTACCAAGG

QA 2 346 2 346
DS 

RD RS1DU15TF 346 0 0
G
AGAGCAGTGACCAAGAATCTCAAGAAATATCATTTGAACCATCACTTCAGGATTCAAGAT
AAGGGATTTGGTATAACATCGTCGCTATGGGACATAGTGTTTGGGACACTACCCACCACA
AAAGCCCCTAAAAGAGAGCAGTAGTGTTGTACTAAGATGCAAAACTAAAAGGATATTTGC
AAATTGCAACACAGTTAAATTATTGATCATCCCTCATGAGTTTTGAGATGTTTGACTGAG
GTTTCATTTGGATCACAGTCTTTGTAAATCAGTGTTACACATCCTACTTAATAGTTTTTT
TTGGTGTGTGTTTTCACTGAAAGCAATCGAAAATATTTACCAAGG

QA 2 346 2 346
DS 



AS 1 3

CO CL2097Contig1 534 3 9 U
GGATATCTAACAAACAACAGTCTCACTTCTAAAATCATATATTTTTAGAATACATAAAAG
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BQ
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TCTTCTTCCTCTTCTTCTTTTGACAATACTGATGGTTTTTTTTCTCCTCCCCTGGATAAT
CATTATCATCATCAGAACCATCTAAGGATCTTGTCCGAAGCTCTTGGACCCATCATGCGT
CGTGGCCCGTCCTTCGGCTTTGATGGTGAGATTATGGGGAAAATGAGTGCACAAGAAGTC
ATGGATGCTAAGGCTTTGGCTGCTTCAAAGAGTCATAGTGAAGCCGAGAGAAGAAGGCGA
GAGAGAATCAACACTCATCTTGCTAAGTTGCGTAGCATTTTACCAAACACAACAAAAGTA
AGTTGTAATAATTTATTCACTTCCCTTTCATTATGGCTTTGATGTTTTGAAGTTTAATCA
CGTTTTGGAAAATGGAAGGAGAATTAACTTAGAGTAACGAATTTTTAAAA*TTAATCAAT
GATCTACTTCAAATGTTCCATTAATTTATTCA*GTAGTTGATGTTTTGAA*TTTAACAAC
GATTTGGAAA*TGGAA*GAGA*TTAACTTAA*GTAACGAATTTTTG**AACTAATCAATG
ATCTACT

QA 1 787 1 787
DS 

RD RS1A229TV 875 0 0
TCTTCTCCTATAATTGTCTTTCTCCTTTCTTGCTTTCTTTCTGCTTCCAAAAACAAAAAA
CCAAAAAATGTATGCAATGAAAGAAGAAGACTGTCTTCAAACGTTTCACAACTTACAAGA
CTATCAAGACCAGTTTCTTCTTCATCTCCATCCACAAAACCTCCCCTGGTCATCTTTACC
TTCTATTGACCCGACCCATTTCCCATCCAACCCGACCCGTTATTCTGACCCGGTCCACTA
CTTCAACAAGAGAGCTTCTTCTTCCTCTTCTTCTTTTGACAATACTGATGGTTTTTTTTC
TCCTCCCCTGGATAATCATTATCATCATCAGAACCATCTAAGGATCTTGTCCGAAGCTCT
TGGACCCATCATGCGTCGTGGCCCGTCCTTCGGCTTTGATGGTGAGATTATGGGGAAAAT
GAGTGCACAAGAAGTCATGGATGCTAAGGCTTTGGCTGCTTCAAAGAGTCATAGTGAAGC
CGAGAGAAGAAGGCGAGAGAGAATCAACACTCATCTTGCTAAGTTGCGTAGCATTTTACC
AAACACAACAAAAGTAAGTTGTAATAATTTATTCACTTCCCTTTCATTATGGCTTTGATG
TTTTGAAGTTTAATCACGTTTTGGAAAATGGAAGGAGAATTAACTTAGAGTAACGAATTT
TTAAAAATTAATCAATGATCTACTTCAAATGTTCCATTAATTTATTCAAGTAGTTGATGT
TTTGAAATTTAACAACGATTTGGAAAATGGAAAGAGAATTAACTTAAAGTAACGAATTTT
TTGAAACTAATCAATGATCTACTTCAA*TGTTACATTTATTCAAGTAAGTAGTTGTACTT
CTCATTTT**AAATGCAATAACTACATCATA
CATA

QA 1 871 1 871
DS 

RD RS1A229TR 821 0 0
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TAACGAATTTTTAAAAATTAATCAATGATCTACTTCAAATGTTCCATTAATTTATTCAAG
TAGTTGATGTTTTGAAATTTAACAACGATTTGGAAAATGGAAGGAGAATTAACTTAAAGT
AACGAATTTTTTGAAACTAATCAATGATCTACTTCAAATGTTACATTTATTCAAGTAAGT
AGTTGTACTTCTCATTTTTAAAATGCAATAACTACATCATAACAATATTTTCTGTATGTA
ACTATACTTCATACATGTGATGTTTTTGTAATTATAATCGTTATTATTATTATTTTCTTT
AGACCGACAAAGCTTCGTTGCTAGCGGAAGTGATCCAACACATGAAGGAGTTAAAACGAC
AGACATCACTGATCACCGAGACGTGTCAAGTCCCAACAGAGTCCGATGATCTGACCGTAG
ATTCGACTTACAACGATGAAGAAGGAAACTTGGTGATAAGAGCTTCCTTTTGTTGCGGAG
ACAGGACTGACCTCATTCATGACGTCATAAATGCCTTAAAGTCTCTTCATCTTCGAACTC
TCAAAGCCGAGATCGCGACCGTAGGTGGTCGAGTCAAGAACGTCCTTTTCTTGAGCCGAG
ATGACCATGAAGATGATGGTTTTGAATATCGTAACGATGCCGTGGAGCATGATGATGAAG
AGAAGAGATATAATCGTGTGAGTTCGATAGAAGAAGCGTTAAAGGCGGTTATAGAGAAGT
GTGTCAATAATAATGATGAAAATAATGATAACAATAACTTG

QA 1 821 1 821
DS 

RD RS1A229JQ 789 0 0
GGAAAATGGAAGGAGAATTAACTTAGAGTAACGAATTTTTAAAAATTAATCAATGATCTA
CTTCAAATGTTCCATTAATTTATTCAAGTAGTTGATGTTTTGAAATTTAACAACGATTTG
GAAAATGGAAGGAGAATTAACTTAAAGTAACGAATTTTTTGAAACTAATCAATGATCTAC
TTCAAATGTTACATTTATTCAAGTAAGTAGTTGTACTTCTCATTTTTAAAATGCAATAAC
TACATCATAACAATATTTTCTGTATGTAACTATACTTCATACATGTGATGTTTTTGTAAT
TATAATCGTTATTATTATTATTTTCTTTAGACCGACAAAGCTTCGTTGCTAGCGGAAGTG
ATCCAACACATGAAGGAGTTAAAACGACAGACATCACTGATCACCGAGACGTGTCAAGTC
CCAACAGAGTCCGATGATCTGACCGTAGATTCGACTTACAACGATGAAGAAGGAAACTTG
GTGATAAGAGCTTCCTTTTGTTGCGGAGACAGGACTGACCTCATTCATGACGTCATAAAT
GCCTTAAAGTCTCTTCATCTTCGAACTCTCAAAGCCGAGATCGCGACCGTAGGTGGTCGA
GTCAAGAACGTCCTTTTCTTGAGCCGAGATGACCATGAAGATGATGGTTTTGAATATCGT
AACGATGCCGTGGAGCATGATGATGAAGAGAAGAGATATAATCGTGTGAGTTCGATAGAA
GAAGCGTTAAAGGCGGTTATAGAGAAGTGTGTCAATAATAATGATGAAAATAATGATAAC
AATAACTTG

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 3

CO CL2099Contig1 571 3 24 U
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TGTTTGCAATCAACAAACTTTGGTTTTAGAC


BQ
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1D555TF U 1
AF RS1CQ41JQ C 1
AF RS1CQ41TF U 1
BS 1 4 RS1D555TF
BS 5 5 RS1CQ41TF
BS 6 59 RS1D555TF
BS 60 60 RS1CQ41TF
BS 61 92 RS1D555TF
BS 93 93 RS1CQ41TF
BS 94 96 RS1D555TF
BS 97 97 RS1CQ41TF
BS 98 140 RS1D555TF
BS 141 141 RS1CQ41TF
BS 142 188 RS1D555TF
BS 189 189 RS1CQ41TF
BS 190 192 RS1D555TF
BS 193 193 RS1CQ41TF
BS 194 201 RS1D555TF
BS 202 202 RS1CQ41TF
BS 203 258 RS1D555TF
BS 259 259 RS1CQ41TF
BS 260 264 RS1D555TF
BS 265 265 RS1CQ41TF
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BS 280 280 RS1CQ41TF
BS 281 336 RS1D555TF
BS 337 571 RS1CQ41TF

RD RS1D555TF 339 0 0
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GGA

QA 1 336 1 336
DS 

RD RS1CQ41JQ 569 0 0
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QA 1 569 1 569
DS 

RD RS1CQ41TF 571 0 0
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CGAGCTGCTGATGATGCACAACAGGACGTACTGCGCAGAGATTGCACACAACGTTTCGAC
AAAGAAGAGGAAGGCTATTGTGGAGAGAGCTTCTCAGTTGGATATTGTTGTTACCAACAG
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CTTGGTTGTCTTTTGGTTTGTTGCATCTTATTTTTTCAAGACGATTTTGTTTACTGTTTG
TGTTTGCAATCAACAAACTTTGGTTTTAGAC

QA 1 571 1 571
DS 



AS 1 4

CO CL2100Contig1 713 4 4 U
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TGCTTGGTGATCCAACGGCCCTTATCGCCGGAGTTGTAGGCTCCCTCATCTCCCGAGGAT
GATCCACCTTCTAATTAATGATATCTCCATCTTCCTACTTTGGGTGTTCACTTATCGTGT
TATATATAAAAACTCTTAACCAAACCATCAGACCAGTGAAGATTTATTTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BC31TF U 1
AF RS1EL92JQ C 96
AF RS1EL92TF U 96
AF RS1BC31JQ C 101
BS 1 680 RS1BC31TF
BS 681 681 RS1EL92TF
BS 682 704 RS1BC31TF
BS 705 713 RS1BC31JQ

RD RS1BC31TF 712 0 0
GTGATCATCAAAGCTGCGATTTCGATCTCCATGCACACTGCGCGTTACCTTCCGCCACCA
TAACACATCCTTTCTACAAAAAGTGTACGTTTCAGTTTTTCGCTAAGCCGCCAGGGAATG
AAAGACGGTACTGCAACGCGTGCCAGAAGGACGTGTCCGGATTCGTGTACCATTGCAGGG
CATGCGGTTTTGATCTTCACCCGTGTTGTGCTATGCTTCCTATGGTTTTGGACGATGGAG
AGACCAAGCTCTTCCTTCACCGCAAAGTTAGCTCGTCCCGTCATCGATGTGGAAGAAAAG
GCCGTAGCTGGAGTTACAGGTCGTCTTGCAAAAAGTACAATCTCCACGTAGCGTGCGTGA
GGGAGATGTTGGTGGAGAATTGGCAGGAGCTGTACAATGGACAAAGTGGTAAAAGCATAG
AAGGCAAGAGCCTGGCGTTAAAGAACACGCTCGAGCATCACCACCGTAGCAGCAGCAAAG
GCAAAGTCCAGAAGTGCTGTGAGATCGCTGGAATGGCCGTGCAGTTCGTTATCTCTGCCG
TGCTTGGTGATCCAACGGCCCTTATCGCCGGAGTTGTAGGCTCCCTCATCTCCCGAGGAT
GATCCACCTTCTAATTAATGATATCTCCATCTTCCTACTTTGGGTGTTCACTTATCGTGT
TATATATAAAAACTCTTAACTAAACCATCAGACCAGTGAAGATT
ATTTGACC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1EL92JQ 618 0 0
TTTTT
CGCTAAGCCGCCAGGGAATGAAAGACGGTACTGCAACGCGTGCCAGAAGGACGTGTCCGG
ATTCGTGTACCATTGCAGGGCATGCGGTTTTGATCTTCACCCGTGTTGTGCTATGCTTCC
TATGGTTTTGGACGATGGAGAGACCAAGCTCTTCCTTCACCGCAAAGTTAGCTCGTCCTG
TCATCGATGTGGAAGAAAAGGCCGTAGCTGGAGTTACAGGTCGTCTTGCAAAAAGTACAA
TCTCCACGTAGCGTGCGTGAGGGAGATGTTGGTGGAGAATTGGCAGGAGCTGTACAATGG
ACAAAGTGGTAAAAGCATCGAAGGCAAGAGCCTGGCGTTAAAGAACACGCTCGAGCATCA
CCACCGTAGCAGCAGCAAAGGCAAAGTCCAGAAGTGCTGTGAGATCGCTGGAATGGCCGT
GCAGTTCGTTATTTCTGCCGTGCTTGGTGATCCAACGGCCCTTATCGCCGGAGTTGTAGG
CTCCCTCATCTCCCGAGGATGATCCACCTTCTAATTAATGATATCTCCATCTTCCTACTT
TGGGTGTTCACTTATCGTGTTATATATAAAAACTCTTAACCAAATCATCAGACCAGTGAA
GATT
TATTTGACC

QA 6 609 6 609
DS 

RD RS1EL92TF 618 0 0
TTTTT
CGCTAAGCCGCCAGGGAATGAAAGACGGTACTGCAACGCGTGCCAGAAGGACGTGTCCGG
ATTCGTGTACCATTGCAGGGCATGCGGTTTTGATCTTCACCCGTGTTGTGCTATGCTTCC
TATGGTTTTGGACGATGGAGAGACCAAGCTCTTCCTTCACCGCAAAGTTAGCTCGTCCTG
TCATCGATGTGGAAGAAAAGGCCGTAGCTGGAGTTACAGGTCGTCTTGCAAAAAGTACAA
TCTCCACGTAGCGTGCGTGAGGGAGATGTTGGTGGAGAATTGGCAGGAGCTGTACAATGG
ACAAAGTGGTAAAAGCATCGAAGGCAAGAGCCTGGCGTTAAAGAACACGCTCGAGCATCA
CCACCGTAGCAGCAGCAAAGGCAAAGTCCAGAAGTGCTGTGAGATCGCTGGAATGGCCGT
GCAGTTCGTTATCTCTGCCGTGCTTGGTGATCCAACGGCCCTTATCGCCGGAGTTGTAGG
CTCCCTCATCTCCCGAGGATGATCCACCTTCTAATTAATGATATCTCCATCTTCCTACTT
TGGGTGTTCACTTATCGTGTTATATATAAAAACTCTTAACCAAATCATCAGACCAGTGAA
GATT
TATTTGACC

QA 6 609 6 609
DS 

RD RS1BC31JQ 613 0 0
CGCTAAGCCGCCAGGGAATGAAAGACGGTACTGCAACGCGTGCCAGAAGGACGTGTCCGG
ATTCGTGTACCATTGCAGGGCATGCGGTTTTGATCTTCACCCGTGTTGTGCTATGCTTCC
TATGGTTTTGGACGATGGAGAGACCAAGCTCTTCCTTCACCGCAAAGTTAGCTCGTCCCG
TCATCGATGTGGAAGAAAAGGCCGTAGCTGGAGTTACAGGTCGTCTTGCAAAAAGTACAA
TCTCCACGTAGCGTGCGTGAGGGAGATGTTGGTGGAGAATTGGCAGGAGCTGTACAATGG
ACAAAGTGGTAAAAGCATAGAAGGCAAGAGCCTGGCGTTAAAGAACACGCTCGAGCATCA
CCACCGTAGCAGCAGCAAAGGCAAAGTCCAGAAGTGCTGTGAGATCGCTGGAATGGCCGT
GCAGTTCGTTATTTCTGCCGTGCTTGGTGATCCAACGGCCCTTATCGCCGGAGTTGTAGG
CTCCCTCATCTCCCGAGGATGATCCACCTTCTAATTAATGATATCTCCATCTTCCTACTT
TGGGTGTTCACTTATCGTGTTATATATAAAAACTCTTAACTAAACCATCAGACCAGTGAA
GATTTATTTGACC

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 4

CO CL2101Contig1 740 4 12 U
GGAAAGAAATCTGCAACACTTTGGTGGTTTCGAAGCTTTGTTTTCTCCGTCGCGAACGAA
CATGAAGACATCTCTCTTCCTCATCTCTTTCCTCATCCTCTTACCTCTCTCCCTACAAGA
TCCCAGTCCAGAAGTCAAAGCAGAAATCAAAGCACCGACTCGTGCTCACGCGGAGCTCAC
CAATCATGGTTTCCCGATTGGTCTCCTCCCTCTATCCATCAAAGACTACTACATCAACAA
AACCTCCGGCGACTTCTCCCTCATCCTCCACGGCACGTGCAAAATCACGCTTCCTCCCGA
CAACTACCTCGCCACTTACTCGAACAAGGTAACGGGTCGGATCACCAAGGGTCAGATCGC
GGAGCTCCGTGGCATCCGGGTCAGAGCGTTTTTCCAGTGGTGGTCCATCACCGGGATTCG
ATCCTCCGGTGATAACCTTGTCTTCGAGGTCGGCGTCGTAACCGCTAAATACCCTTCGAA
GAACTTCGACGAGAGTCTTGATTGTGAAGGGAAACGATCTTCTTCTTGATTCAATTCAAG
AGATCTGTGAAGCCAGGACAGGAGCAACAAGTGAAAGCTACTTTGTAATATATTTATCTC
CATCCGAAAAATAAAGCTTGTAATGTAAAAACCGAATCTAAACCACTGCTCTATTCTTGT
ATTCTCTGCAAACTAAGGGCTCAATGGAGTCTTGCAAGTTGTGAACTAAGTATGGGTTAA
TGTGAGACTTTAAAACAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CK95TF U 1
AF RS1GL18TF U 16
AF RS1GY63TF U 255
AF RS1GL18JQ C 254
BS 1 69 RS1CK95TF
BS 70 70 RS1GL18TF
BS 71 262 RS1CK95TF
BS 263 263 RS1GL18TF
BS 264 321 RS1CK95TF
BS 322 322 RS1GL18TF
BS 323 647 RS1CK95TF
BS 648 648 RS1GL18TF
BS 649 668 RS1CK95TF
BS 669 678 RS1GL18TF
BS 679 679 RS1GY63TF
BS 680 740 RS1GL18TF

RD RS1CK95TF 668 0 0
GGAAAGAAATCTGCAACACTTTGGTGGTTTCGAAGCTTTGTTTTCTCCGTCGCGAACGAA
CATGAAGACCTCTCTCTTCCTCATCTCTTTCCTCATCCTCTTACCTCTCTCCCTACAAGA
TCCCAGTCCAGAAGTCAAAGCAGAAATCAAAGCACCGACTCGTGCTCACGCGGAGCTCAC
CAATCATGGTTTCCCGATTGGTCTCCTCCCTCTATCCATCAAAGACTACTACATCAACAA
AACCTCCGGCGACTTCTCCCTCTTCCTCCACGGCACGTGCAAAATCACGCTTCCTCCCGA
CAACTACCTCGCCACTTACTCCAACAAGGTAACGGGTCGGATCACCAAGGGTCAGATCGC
GGAGCTCCGTGGCATCCGGGTCAGAGCGTTTTTCCAGTGGTGGTCCATCACCGGGATTCG
ATCCTCCGGTGATAACCTTGTCTTCGAGGTCGGCGTCGTAACCGCTAAATACCCTTCGAA
GAACTTCGACGAGAGTCTTGATTGTGAAGGGAAACGATCTTCTTCTTGATTCAATTCAAG
AGATCTGTGAAGCCAGGACAGGAGCAACAAGTGAAAGCTACTTTGTAATATATTTATCTC
CATCCGAAAAATAAAGCTTGTAATGTAAAAACCGAATCTAAACCACTACTCTATTCTTGT
ATTCTCTG

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1GL18TF 725 0 0
GG
ACTTTTGTGGTTTCGAAGCTTTGTTT*CTCCGTCGCGAACGAACATGAAGATATCTCTCT
TCCTTATCTCTTTCCTCATCCTCTTACCTCTCTCCCTACAAGATCCCAGTCCAGAAGTCA
AAGCAGAAGTCAAAGCACCGACTCGTGCTCACGCGGAGCTCACCAATCATGGTTTCCCGA
TTGGTCTCCTCCCTCTATCCATCAAAGACTACTACATCAACAAAACCTCCGGCGACTTCT
CCCTCATCCTCCACGGCACGTGCAAAATCACGCTTCCTCCCGACAACTACCTCGCCACTT
ACTCGAACAAGGTAACGGGTCGGATCACCAAGGGTCAGATCGCGGAGCTCCGTGGCATCC
GGGTCAGAGCGTTTTTCCAGTGGTGGTCCATCACCGGGATTCGATCCTCCGGTGATAACC
TTGTCTTCGAGGTCGGCGTCGTAACCGCTAAATACCCTTCGAAGAACTTCGACGAGAGTC
TTGATTGTGAAGGGAAACGATCTTCTTCTTGATTCAATTCAAGAGATCTGTGAAGCCAGG
ACAGGAGCAACAAGTGAAAGCTACTTTGTAATATATTTATCTCCATCCGAAAAATAAAGC
TTGTAATGTAAAAACCGAATCTAAACCACTGCTCTATTCTTGTATTCTCTGCAAACTAAG
G*CTCAATGGAGTCTTGCAAGTTGTGAACTAAGTATGGGTTAATGTGAGACTTTAAAACA
AAA

QA 3 725 3 725
DS 

RD RS1GY63TF 482 0 0
G
CTCCCTCTTCCTCCACGGCACGTGCAAAATCACGCTTCCTCCCGACAACTACCTCGCCAC
TTACTCGAACAAGGTAACGGGTCGGATCACCAAGGGTCAGATCGCGGAGCTCCGTGGCAT
CCGGGTCAGAGCGTTTTTCCAGTGGTGGTCCATCACCGGGATTCGATCCTCCGGTGATAA
CCTTGTCTTCGAGGTCGGCGTCGTAACCGCTAAATACCCTTCGAAGAACTTCGACGAGAG
TCTTGATTGTGAAGGGAAACGATCTTCTTCTTGATTCAATTCAAGAGATCTGTGAAGCCA
GGACAGGAGCAACAAGTGAAAGCTACTTTGTAATATATTTATCTCCATCCGAAAAATAAA
GCTTGTAATGTAAAAACCGAATCTAAACCACTGCTCTATTCTTGTATTCTCTGCAAACTA
AGGGCTCAATGGAGTCTTGCAAGTTGTGAACTAAGTATGGGTTAATGTGAGACTTT
AAAAA

QA 2 477 2 477
DS 

RD RS1GL18JQ 478 0 0
TT
CTCCCTCATCCTCCACGGCACGTGCAAAATCACGCTTCCTCCCGACAACTACCTCGCCAC
TTACTCGAACAAGGTAACGGGTCGGATCACCAAGGGTCAGATCGCGGAGCTCCGTGGCAT
CCGGGTCAGAGCGTTTTTCCAGTGGTGGTCCATCACCGGGATTCGATCCTCCGGTGATAA
CCTTGTCTTCGAGGTCGGCGTCGTAACCGCTAAATACCCTTCGAAGAACTTCGACGAGAG
TCTTGATTGTGAAGGGAAACGATCTTCTTCTTGATTCAATTCAAGAGATCTGTGAAGCCA
GGACAGGAGCAACAAGTGAAAGCTACTTTGTAATATATTTATCTCCATCCGAAAAATAAA
GCTTGTAATGTAAAAACCGAATCTAAACCACTGCTCTATTCTTGTATTCTCTGCAAACTA
AGGGCTCAATGGAGTCTTGCAAGTTGTGAACTAAGTATGGGTTAATGTGAGACTTT

QA 3 478 3 478
DS 



AS 1 2

CO CL2102Contig1 1299 2 4 U
GGAACTTTGGCTGTGTTTCAAGCAGCCTCTTTCTCCATCTTCTATATCAAATCAAACATC
TTTAATTTCTTGGTGACAACTAAAGTCTTTCCCTTTCATTTACTTCTTGCACAATAAAGC
TCTATGAGCTATGTCTTTCTCTATTTCATTATCATGTCAATAAGCTCTATGTGAACACAA
ATCTATCTTGTTTTGAAACTGTCATCATGGTATCAGAGCACCAGGGATTAGATCTTGGTG
TCTCTACTCTTCTTCTCAACTTCTCACATGTTCCATCAGTCATCCCTTTCTCCAAGAGAA
ACAAGACTCGAGCTTTTCCTGTGAAGAGTCTCACACGCTTCTATTTCACAAGGGAGACCG
GTTTGTTCGTTGCCTGCAAGTGGGTTCTCTACAACTCATCAGAACGTGGGTTATCTCCAA
ACGTATCCAGGAAATCCTCAAGCTTTCTCCATCCCTACAGCGTGGTAAAGTGACTTTTTA
ATCTCAAGAAAAAAAAAAAAATGGTCGCTTGTGCTGGTTGATTATTCTCGCAAGTGGTTT
GCTGGCTGGTTTAGATGTTAGGATTGAACTTATGAAGCTATAGGATGTACTGGAACGTTT
TGGGTTTGGTAATAAAGAGATTAATGGCAGCAAGGTTCTGTTTTTGATGAGTGCACACAA
GGTGTTTGGTTAAATGCCAAAGAGAAAATGCAGATTGTAGAACTGCAGTTATAGTTGGCT
TGGCTATTGGAGAGGAATCAGAGAGTGGATAGGAGTGTTTAGTATGTATGGAAAGAGAGT
TATTTTTCATGAGACAGCTTAGGAGAATGAAAGGGTAATAGAAACCCATATTCTTATTGA
GACAAATAGGCCATAAGTACCTCTGAGAGAGATTGACTAAACTCGCCAAGTATCAAGAGA
ATACCTTTGAGTGAGTCATGCAATACTCTCCATGTACAGACCTGAATAGATCTCACACTA
AGTCTGTTCGCCATGGTGAATTCAACAATCTGCCTACATGTCAACAGTTTTCAACAACTC
TTGCTTCTGTCCAGCCATTTGCCTACTTCACAATCATCCCACTACTGCAGTTTCAAACAT
GGGGTAGCTGTCCACCCACGCCAAGTTTGCGGGGGAGTATTAGAGCCCAACTACAAGACA
AGCCTAAAGCCCAAATGATGCAACTAAACCTAAGTTCCTAGCAGATGGATTTGTATAAAT
ACTTCTCTTATGTTAACATTTCAGGGAACTTTGGCTGTGTTTCAAGCAGCCTCTTTCTCC
ATTTTTTATATCAAATCAAACATCTTTAATTTCTTGGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EM27TF U 1
AF RS1EM27JQ C 611
BS 1 736 RS1EM27TF
BS 737 737 RS1EM27JQ
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BS 780 1299 RS1EM27JQ

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TCTATGAGCTATGTCTTTCTCTATTTCATTATCATGTCAATAAGCTCTATGTGAACACAA
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ACGTATCCAGGAAATCCTCAAGCTTTCTCCATCCCTACAGCGTGGTAAAGTGACTTTTTA
ATCTCAAGAAAAAAAAAAAAATGGTCGCTTGTGCTGGTTGATTATTCTCGCAAGTGGTTT
GCTGGCTGGTTTAGATGTTAGGATTGAACTTATGAAGCTATAGGATGTACTGGAACGTTT
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TGGCTATTGGAGAGGA*TCAGAGAGTGGATAGGAGTGTTTAGTATGTATGGAAAGAGAG

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DS 

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TAAATGCCAAAGAGAAAATGCAGATTGTAGAACTGCAGTTATAGTTGGCTTGGCTATTGG
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GAGACAGCTTAGGAGAATGAAAGGGTAATAGAAACCCATATTCTTATTGAGACAAATAGG
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CCATGGTGAATTCAACAATCTGCCTACATGTCAACAGTTTTCAACAACTCTTGCTTCTGT
CCAGCCATTTGCCTACTTCACAATCATCCCACTACTGCAGTTTCAAACATGGGGTAGCTG
TCCACCCACGCCAAGTTTGCGGGGGAGTATTAGAGCCCAACTACAAGACAAGCCTAAAGC
CCAAATGATGCAACTAAACCTAAGTTCCTAGCAGATGGATTTGTATAAATACTTCTCTTA
TGTTAACATTTCAGGGAACTTTGGCTGTGTTTCAAGCAGCCTCTTTCTCCATTTTTTATA
TCAAATCAAACATCTTTAATTTCTTGGGG

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 4

CO CL2103Contig1 1264 4 9 U
GACCTCTTCATGGGAAAACTCCAGGAGCATCTCAGCCCGGACCAGCAAACGCCTCTGAGG
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CGGCCGTGATCGAGATCCTCTCTCTTCCTGTCTCAGCTTCTCAGATTGTCTCCTCTCTTG
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ACTCCATGAGCGCAAGCCGGTCTACTTGTATGAACACAGCGAGCTTTGTCTCTAGAAGCG
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AGCTCCCTCCAGATTTTCACACGCAGCTTTACATGGAGGCTTCACTTGTGGTAAGGGAAA
CGTGGTGGCTTACTGACGGGAAGAGATCACAAGGTGAGCTAGACTCGGCTGTTGGATATG
CTCTGATGGATCCTACGTGGGCTGCTCAGGACAACACCTCAACCGCCATTGGGAATATAG
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TCATCATCAAGAACCTCCGGCCTGTGACATCTGTTGCAATGCTTAGAGTCGTATTCCGTA
TTATGGGACCTCTTCTCCCCAGGCTTGCTAACACACATGCGCTCTTTAACAAGACGCTAG
CCCTTCTCTTGAGCACAATGGTAGATGTTTTCGGAAAAAACTCGCAGACACAGGTCCCTG
TTGAAGCATCCCAGATTGCAGATCTTATCGATTTCCTACACCATGTTGTTCACTACGAGG
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GAAGAGCAGCAGATTCTTTCCGACCTGATGTACAACACCTTCTCTCTCACCTCAGAACCG
ATCCCAATTCGTCTATATATGCTGCTGCTCTTCAGAATACCGCAAAGACCAACACCTCTT
AGAAAGAAAATCATATGTAATATGTTGTGTCCATGGGTGGAGGCAAAGTTGTTGTAGCGA
TAGAAAAGAGCACATAAACTGATTTTCATTTACAACTTGTTTTGGTAAGTTTGGTCCGTG
GTTACAACTAATTTTATATGTATTGTATATATGTATTATCAATGATAACTTTTTGTTTCT
CTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 

AF RS1ER77TF U 1
AF RS1ET04TF U 1
AF RS1ER77JQ C 549
AF RS1ET04JQ C 569
BS 1 614 RS1ER77TF
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BS 1078 1078 RS1ET04JQ
BS 1079 1264 RS1ER77JQ

RD RS1ER77TF 614 0 0
GACCTCTTCATGGGAAAACTCCAGGAGCATCTCAGCCCGGACCAGCAAACGCCTCTGAGG
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CTCTGATGGATCCTACGTGGGCTGCTCAGGACAACACCTCAACCGCCATTGGGAATATAG
TGGCCTTGCTTCAC

QA 1 614 1 614
DS 

RD RS1ET04TF 623 0 0
GACCTCTTCATGGGAAAACTCCAGGAGCATCTCAGCCCGGACCAGCAAACGCCTCTGAGG
GACAGAAAGCTTTCTATCAGATCCAGGACCCTGGAACTTACACTCAACTGGTTCTCGAAA
CGGCCGTGATCGAGATCCTCTCTCTTCCTGTCTCAGCTTCTCAGATTGTCTCCTCTCTTG
TCCAGATAATCGTCAACATACAGTCCACGCTTATTCAATCCGGCAACGGCTTCCACGGCG
CTGCAAACGGAGTGGGGCAAGGCTCGGTACTGCCTGCGTCTCCCTCGGGAGGGAGCACTG
ACTCCATGAGCGCAAGCCGGTCTACTTGTATGAACACAGCGAGCTTTGTCTCTAGAAGCG
GTTACGCATGTCAACAGCTGTCTTGTCTGTTGATTCAAGCTTGCGGGCTTCTGCTGGCTC
AGCTCCCTCCAGATTTTCACACGCAGCTTTACATGGAGGCTTCACTTGTGGTAAGGGAAA
CGTGGTGGCTTACTGACGGGAAGAGATCACAAGGTGAGCTAGACTCGGCTGTTGGATATG
CTCTGATGGATCCTACGTGGGCTGCTCAGGACAACACCTCAACCGCCATTGGGAATATAG
TGGCCTTGCTTCACGCTTTCTTC

QA 1 623 1 623
DS 

RD RS1ER77JQ 716 0 0
GATCCTACGTGGGCTGCTCAGGACAACACCTCAACCGCCATTGGGAATATAGTGGCCTTG
CTTCACGCTTTCTTCAGCAATCTCCCACAAGAATGGCTTGATGGCACGCATCTCATCATC
AAGAACCTCCGGCCTGTGACATCTGTTGCAATGCTTAGAGTCGTATTCCGTATTATGGGA
CCTCTTCTCCCCAGGCTTGCTAACACACATGCGCTCTTTAACAAGACGCTAGCCCTTCTC
TTGAGCACAATGGTAGATGTTTTCGGAAAAAACTCGCAGACACAGGTCCCTGTTGAAGCA
TCCCAGATTGCAGATTTTATCGATTTCCTACACCATGTTGTTCACTACGAGGGACAAGGA
GGAGCAGTTCAAAGTAGCAGCAAGCCGAGACCAGACATTTTGGCCTTAATCGGAAGAGCA
GCAGATTCTTTCCGACCTGATGTACAACACCTTCTCTCTCACCTCAGAACCGATCCCAAT
TCGTCTATATATGCTGCTGCTCTTCAGAATACCGCAAAGACCAACACCTTTTAGAAAGAA
AATCATATGTAATATGTTGTGTCCATGGGTGGAGGCAAAGTTGTTGTAGCGATAGAAAAG
AGCACATAAACTGATTTTCATTTACAACTTGTTTTGGTAAGTTTGGTCCGTGGTTACAAC
TAATTTTATATGTATTGTATATATGTATTATCAATGATAACTTTTTGTTTCTCTTT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RS1ET04JQ 696 0 0
GGACAACACCTCAACCGCCATTGGGAATATAGTGGCCTTGCTTCACGCTTTCTTCAGCAA
TCTCCCACAAGAATGGCTTGATGGCACGCATCTCATCATCAAGAACCTCCGGCCTGTGAC
ATCTGTTGCAATGCTTAGAGTCGTATTCCGTATTATGGGACCTCTTCTCCCCAGGCTTGC
TAACACACATGCGCTCTTTAACAAGACGCTAGCCCTTCTCTTGAGCACAATGGTAGATGT
TTTCGGAAAAAACTCGCAGACACAGGTCCCTGTTGAAGCATCCCAGATTGCAGATCTTAT
CGATTTCCTACACCATGTTGTTCACTACGAGGGACAAGGAGGAGCAGTTCAAAGTAGCAG
CAAGCCGAGACCAGACATCTTGGCCTTAATCGGAAGAGCAGCAGATTCTTTCCGACCTGA
TGTACAACACCTTCTCTCTCACCTCAGAACCGATCCCAATTCGTCTATATATGCTGCTGC
TTTTCAGAATACCGCAAAGACCAACACCTCTTAGAAAGAAACTCATATGTAATATGTTGT
GTCCATGGGTGGAGGCAAAGTTGTTGTAGCGATAGAAAAGAGCACATAAACTGATTTTCA
TTTACAACTTGTTTTGGTAAGTTTGGTCCGTGGTTACAACTAATTTTATATGTATTGTAT
ATATGTATTATCAATGATAACTTTTTGTTTCTCTTT

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 4

CO CL2104Contig1 908 4 10 U
GGACACAAAGAAGGGCCTCTTTGTGTGTGTGTGTTTTCAGAGAGAAGATGGCTAGTACGT
TAGATGTATCCAGAGCAGAGCTTGGTCTAGTGGTTATGTATCTTAACAAAGCAGAGGCAA
GGGATAAGTTATGCAGAGCTATACAGTATGGTTCAAAGTTCTTGAGCGGTGGACAACCTG
GTACTGCTCAAAACGTTGATAAATCCACTACCTTAGCCAGAAAAGTCTTCCGTCTTTTCA
AGTTTGTTAATGATTTACATGGTCTTATCAGTCCTGTTCCTAAAGGGACTCCACTTCCTC
TCGCTTTGCTTGGAAAGTCCAAGAACGCACTCTTGTCTACATTCTTGTTCCTGGATCAAA
TCGTCTGGCTTGGAAGATCAGGAATCTATAAGAACCAAGAGCGAGCTGAGTTACTTGGAC
GTATATCAGTTTTCTGCTGGATGGGATCATCTGTCTGTACAACTTTAGTTGAGCTTGGTG
AGATTGGAAGGCTCTCATCGTCGATGAAGAAGATCGAGAAAGGGCTTAAGAATGGCAACA
AGTATCAAGATGAGGAGTATCGTGCCAAGCTTAAACAGTCTAACGAGAGGAGTCTTGCTT
TGATCAAATCAGCCATGGACATTGTTGTAGCAGCTGGTCTTCTTCGGTTATATCCAGAGA
AGACCACTCCTCGTGTCACCGGAGCTTTTGGATTCATAACCTCCCTCATTTCTTGCTACC
AGTTGCTTCCGACACGACCCAAGATCAAGGCACCTTGAAGCTTATGGAAGAAAGCTGGCG
TTCAAGCGAAAGTTTGATTGTGTAATACTATGTTGGTCCGTTTGAGTAATTTGCTGCTGT
TATTAGTCCTTGCATAAATACTTATCTGCATGAATGATGATTATAATTAAAAAAAATAAT
GCCTCAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1DY22TF U 1
AF RS1BV48TF U 143
AF RS1DY22JQ C 216
AF RS1BV48JQ C 305
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RD RS1DY22TF 702 0 0
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TCGCTTTGCTTGGAAAGTCCAAGAACGCACTCTTGTCTACATTCTTGTTCCTGGATCAAA
TCGTCTGGCTTGGAAGATCAGGAATCTATAAGAACCAAGAGCGAGCTGAGTTACTTGGAC
GTATATCAGTTTTCTGCTGGATGGGATCATCTGTCTGTACAACTTTAGTTGAGCTTGGTG
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TGATCGAATCAGCCATGGACATTGTTGTAGCAGCTGGTCTTCTTCGGT*ATATCCAGAGA
AGACCACTCCTCGTGTCACCGGAGCTTTTGGATTCATAACCT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RS1BV48TF 744 0 0
GG
AGTATGGTTCAAAGTTCTTGAGCGGTGGACAACCTGGTACTGCTCAAAACGTTGATAAAT
CCACTACCTTAGCCAGAAAAGTCTTCCGTCTTTTCAAGTTTGTTAATGATTTACATGGTC
TTATCAGTCCTGTTCCTAAAGGGACTCCACTTCCTCTCGCTTTGCTTGGAAAGTCCAAGA
ACGCACTCTTGTCTACATTCTTGTTCCTGGATCAAATCGTCTGGCTTGGAAGATCAGGAA
TCTATAAGAACCAAGAGCGAGCTGAGTTACTTGGACGTATATCAGTTTTCTGCTGGATGG
GATCATCTGTCTGTACAACTTTAGTTGAGCTTGGTGAGATTGGAAGGCTCTCATCGTCGA
TGAAGAAGATCGTGAAAGGGCTTAAGAATGGCAACAAGTATCAAGATGAGGAGTATCGTG
CCAAGCTTAAACAGTCTAACGAGAGGAGTCTTGCTTTGATCAAATCAGCCATGGACATTG
TTGTAGCAGCTGGTCTTCTTCGGTTATATCCAGAGAAGATCACTCCTCGTGTCACCGGAG
CTTTTGGATTCATAACCTCCCTCATTTCTTGCTACCAGTTGCTTCCGACACGACCCAAGA
TCAAGGCACCTTGAAGCTTATGGAAGAAAGCTGGCGTTCAAGCGAAAGTTTGATTGTGTA
ATACTATGTTGGTCCGTTTGAGTA*TTTGCTGCTGTTATTAGTCCTTGCATAAATACTTA
TCTGCATGAATGATGATTATAA

QA 3 744 3 744
DS 

RD RS1DY22JQ 690 0 0
GCCAGAAAAGTCTTCCGTCTTTTCAAGTTTGTTAATGATTTACATGGTCTTATCAGTCCT
GTTCCTAAAGGGACTCCACTTCCTCTCGCTTTGCTTGGAAAGTCCAAGAACGCACTCTTG
TCTACATTCTTGTTCCTGGATCAAATCGTCTGGCTTGGAAGATCAGGAATCTATAAGAAC
CAAGAGCGAGCTGAGTTACTTGGACGTATATCAGTTTTCTGCTGGATGGGATCATCTGTC
TGTACAACTTTAGTTGAGCTTGGTGAGATTGGAAGGCTCTCATCGTCGATGAAGAAGATC
GAGAAAGGGCTTAAGAATGGCAACAAGTATCAAGATGAGGAGTATCGTGCCAAGCTTAAA
CAGTCTAACGAGAGGAGTCTTGCTTTGATCGAATCAGCCATGGACATTGTTGTAGCAGCT
GGTCTTCTTCGGTTATATCCAGAGAAGACCACTCCTCGTGTCACCGGAGCTTTTGGATTC
ATAACCTCCCTCATTTCTTGCTACCAGTTGCTTCCGACACGACCCAAGATCAAGGCACCT
TGAAGCTTATGGAAGAAAGCTGGCGTTCAAGCGAAAGTTTGATTGTGTAATACTATGTTG
GTCCGTTTGAGTAATTTGCTGCTGTTATTAGTCCTTGCATAAATACTTATCTGCATGAAT
GATGATTATAATTAAAAAAAATAATGCCTC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1BV48JQ 604 0 0
TTTGCTTGGAAAGTCCAAGAACGCACTCTTGTCTACATTCTTGTTCCTGGATCAAATCGT
CTGGCTTGGAAGATCAGGAATCTATAAGAACCAAGAGCGAGGTGAGTTACTTGGACGTAT
ATCAGTTTTCTGCTGGATGGGATCATCTGTCTGTACAACTTTAGTTGAGCTTGGTGAGAT
TGGAAGGCTCTCATCGTCGATGAAGAAGATCGTGAAAGGGCTTAAGAATGGCAACAAGTA
TCAAGATGAGGAGTATCGTGCCAAGCTTAAACAGTCTAACGAGAGGAGTCTTGCTTTGAT
CAAATCAGCCATGGACATTGTTGTAGCAGCTGGTCTTCTTCGGTTATATCCAGAGAAGAT
CACTCCTCGTGTCACCGGAGCTTTTGGATTCATAACCTCCCTCATTTCTTGCTACCAGTT
GCTTCCGACACGACCCAAGATCAAGGCACCTTGAAGCTTATGGAAGAAAGCTGGCGTTCA
AGCGAAAGTTTGATTGTGTAATACTATGTTGGTCCGTTTGAGTAATTTGCTGCTGTTATT
AGTCCTTGCATAAATACTTATCTGCATGAATGATGATTATAATTAAAAAAAATAATGCCT
CAGG

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 2

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GTTGATGAGTCTATTTGCAAGTTTGCGAAGAAGGGTTTGACTCCATCTCAGATTGGTGTC
ATTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTGAAGAGTGTTACCGGAAACAAGATTTTG
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TTCAGATTGATTCTTGTTGAGAGCAGAATCCACCGCCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACT
AAGAAGCTCCCTCCTGTCTGGAAATACGAGTCCACCACAGCAAGCACTCTCGTGGCTTAA
GGAAATCATAAAGCTGGTCAACCATTTCATTTGCATTGCAACTCAAGTTCTATAACAATG
GACTTTTGTATCTGGTTTTGATAGTTTTAATGCGATTTTGAATTTAGTGAAAACTCTTTT
CATTTTGCTTAGTGTTTACTTTCACTGATCTTTCCCGTTGTACTTGCAAGCTAAGAATTG
GGCCAAGAATTGGGTATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RS1F938TF U 1
AF RS1F938JQ C 119
BS 1 716 RS1F938TF
BS 717 717 RS1F938JQ
BS 718 737 RS1F938TF
BS 738 740 RS1F938JQ

RD RS1F938TF 739 0 0
GGTGGGTTTTAACACTCTTTAGCGCAGTCCTAGCCGCACGAAACCGAGTAAGACCGTTCT
CATCTCCGTTAACAGACCGTCAGCATGGGGAGGCTTCACTCGAAAGGTAAGGGAATCTCA
GCATCTGCTTTACCGTACAAGCGCTCACCCCCGAGCTGGCTCAAGACAACCTCCCAGGAT
GTTGATGAGTCTATTTGCAAGTTTGCGAAGAAGGGTTTGACTCCATCTCAGATTGGTGTC
ATTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTGAAGAGTGTTACCGGAAACAAGATTTTG
AGAATCTTGAAAGCTCATGGTCTTGCTCCTGAGATCCCTGAGGATCTCTACCACCTGATC
AAGAAAGCAGTAGCTATCCGCAAGCACCTTGAGAGGAACAGGAAAGACAAGGATTCCAAG
TTCAGATTGATTCTTGTTGAGAGCAGAATCCACCGCCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACT
AAGAAGCTCCCTCCTGTCTGGAAATACGAGTCCACCACAGCAAGCACTCTCGTGGCTTAA
GGAAATCATAAAGCTGGTCAACCATTTCATTTGCATTGCAACTCAAGTTCTATAACAATG
GACTTTTGTATCTGGTTTTGATAGTTTTAATGCGATTTTGAATTTAGTGAAAACTCTTTT
CATTTTGCTTAGTGTTTACTTTCACTGATCTTTCCCGTTGTACTTGCAAGCTAAGA*TTG
GGCCAAGAATTGGGTAT
CC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RS1F938JQ 622 0 0
CAG
CATCTGCTTTACCGTACAAGCGCTCACCCCCGAGCTGGCTCAAGACAACCTCCCAGGATG
TTGATGAGTCTATTTGCAAGTTTGCGAAGAAGGGTTTGACTCCATCTCAGATTGGTGTCA
TTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCTCAGGTGAAGAGTGTTACCGGAAACAAGATTTTGA
GAATCTTGAAAGCTCATGGTCTTGCTCCTGAGATCCCTGAGGATCTCTACCACCTGATCA
AGAAAGCAGTAGCTATCCGCAAGCACCTTGAGAGGAACAGGAAAGACAAGGATTCCAAGT
TCAGATTGATTCTTGTTGAGAGCAGAATCCACCGCCTTGCTCGTTACTACAAGAAGACTA
AGAAGCTCCCTCCTGTCTGGAAATACGAGTCCACCACAGCAAGCACTCTCGTGGCTTAAG
GAAATCATAAAGCTGGTCAACCATTTCATTTGCATTGCAACTCAAGTTCTATAACAATGG
ACTTTTGTATCTGGTTTTGATAGTTTTAATGCGATTTTGAATTTAGTGAAAACTCTTTTC
ATTTTGCTTAGTGTTTACTTTCACTGATCTTTCCCGTTGTACTTGCAAGCTAAGAATTGG
GCCAAGAATTGGGTATTCC

QA 4 622 4 622
DS 



AS 2 4

CO CL2106Contig1 802 2 16 U
GGAGATGGCGCTGGCAAGAAGAAAATTAAGCCTGTGCCATTTAAAGAGCGAGGCGAGCCT
GTTGTGGTCTCTGTTCCTTTATCTCAGATTAAGAGTTTAAGCAGTGCAATCATGAATATA
CCGAAAGATTATTTACAGCTTGAAGCTAGAGAGAATGCTCTGAAGAAGGTCTCTGAGTTA
CTCTCTAGACACCCTGATGGAATACCCCTAGATCCTGAAGTTGATATGAAGATTCGGAGC
AGCTCTTACAAAACGACTGTTCGTCGACTGGAGGCTGTGAAAAACCTATTTGAAAAATAC
AAAATTGCAAAATCTCCACTCATAGGAGAGAAACTGAAAGTTCTACACATGAAGGAAGAG
CTAACAGCCAAGATCAAATCACTTAAGAAGGCTGTCAGATCCTCAACAGCTTTAGCGTTT
AAAGATGAGCTTAAGGCCAGAAAGCGTGTTTTGCGAAGGCTAGGATACATCACCAGCGAT
GGTGTTGTGGAGTTGAAAGGGAAGGTTGCATGCGAAATCAGTAGTGCGGAAGAGTTGACA
CTAACAGAGCTAATGTTCAGTGGTGTCTTCAAGGAGGCAAAGGTGGGAGGAGTTGGTTTC
TCTCCTCTCTTGCTTTGTATGGCGAGAGAGGCTCCCTGACGCTGCCAAACCCAGAGAAGA
ACTCGACTTGCTCTTCATACAGTTACAAGACACAGCCAGGCGTGTCGCTGAATGTCAGCT
TGACTGCAAGGTTGATATCGATGTGGAGAGTTTTGTGCACTCGTTCAGACCGGATATAAT
GGAAGCGGTGTATGCGTGGGCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BV25TF U 1
AF RS1G091TF U 167
BS 1 211 RS1BV25TF
BS 212 212 RS1G091TF
BS 213 269 RS1BV25TF
BS 270 270 RS1G091TF
BS 271 332 RS1BV25TF
BS 333 333 RS1G091TF
BS 334 478 RS1BV25TF
BS 479 479 RS1G091TF
BS 480 581 RS1BV25TF
BS 582 582 RS1G091TF
BS 583 665 RS1BV25TF
BS 666 666 RS1G091TF
BS 667 730 RS1BV25TF
BS 731 731 RS1G091TF
BS 732 762 RS1BV25TF
BS 763 802 RS1G091TF

RD RS1BV25TF 762 0 0
GGAGATGGCGCTGGCAAGAAGAAAATTAAGCCTGTGCCATTTAAAGAGCGAGGCGAGCCT
GTTGTGGTCTCTGTTCCTTTATCTCAGATTAAGAGTTTAAGCAGTGCAATCATGAATATA
CCGAAAGATTATTTACAGCTTGAAGCTAGAGAGAATGCTCTGAAGAAGGTCTCTGAGTTA
CTCTCTAGACACCCTGATGGAATACCCCTAGGTCCTGAAGTTGATATGAAGATTCGGAGC
AGCTCTTACAAAACGACTGTTCGTCGACTTGAGGCTGTGAAAAACCTATTTGAAAAATAC
AAAATTGCAAAATCTCCACTCATAGGAGAGAAGCTGAAAGTTCTACACATGAAGGAAGAG
CTAACAGCCAAGATCAAATCACTTAAGAAGGCTGTCAGATCCTCAACAGCTTTAGCGTTT
AAAGATGAGCTTAAGGCCAGAAAGCGTGTTTTGCGAAGGCTAGGATACATCACCAGCGGT
GGTGTTGTGGAGTTGAAAGGGAAGGTTGCATGCGAAATCAGTAGTGCGGAAGAGTTGACA
CTAACAGAGCTAATGTTCAGTGGTGTCTTCAAGGAGGCAAATGTGGGAGGAGTTGGTTTC
TCTCCTCTCTTGCTTTGTATGGCGAGAGAGGCTCCCTGACGCTGCCAAACCCAGAGAAGA
ACTCGGCTTGCTCTTCATACAGTTACAAGACACAGCCAGGCGTGTCGCTGAATGTCAGCT
TGACTGCAAG*TTGATATCGATGTGGAGAGTTTTGTGCACTC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1G091TF 636 0 0
G
GGTCTCTGAGTTACTCTCTAGACATCCTGATGGAATACCCCTAGATCCTGAAGTTGATAT
GAAGATTCGGAGCAGCTCTTACAAAACGACTGTTCGTCGACTGGAGGCTGTGGAAAACCT
ATTTGAAAAATACAAGATTGCAAAATCTCCACTCATAGGAGAGAAACTGAAAGTTCTACA
CATGAAGGAAGAGCTAACAGCCAAGATCAAGTCACTTAAGAAGGCTGTCAGATCCTCGAC
AGCTTTGGCGTTTAAAGATGAGCTTAAGGCCAGAAAGCGTGTTTTGCGAAGGCTAGGAT*
***CACCAGCGATGGTGTTGTGGAGTTGAAAGGGAAGGTTGCATGCGAAATCAGTAGTGC
GGAAGAGTTGACACTAACAGAGCTAATGTTCAGTGGTGTCTTCAAGGAGGCAAAGGTGG*
AGGAGTTGGTTTCTCTCCTCTCTTGCTTTGTATGGCGAGAGAGGCTCCCTGACGCTGCCA
AACCCAGAGAAGAACTCGACTTGCTCTTCATACAGTTACAAGACACAGCCAGGCGTGTCG
CTGAATGTCAGCTTGACTGCAAGGTTGATATCGATGTGGAGAGTTTTGTGCACTCGTTCA
GACCGGATATAATGGAAGCGGTGTATGCGTGGGCA

QA 2 636 2 636
DS 



CO CL2106Contig2 860 2 10 U
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AATGAGCGTAAGGTACAAACGAAACTCTGAAAAAAAAACAAAATAGCATTTCACAAGTAA
AGAGACGCTGCGAATACAATGTCTCTCTTGATCTTTGAAACAGCTTCTTCTAGTTTAGCT
TCAAGCTGTGTTTCTCCAATGGATTTTGCAGCTACTATCAGCTGCTGCAGAACTTCCTCC
ATTCTCCTTATCGCTCTTATCAAGCTCCCTTCGAAAACACGAGCAATCTCCATGATCTCA
TAAAACTTCGACCCTTTTGCCCACGCATACACCGCTTCCATTATATCCGGTCTGAACGAG
TGCACAAAACTCTCCACATCGATATCAACCTTGCAGTCAAGCTGACATTCAGCGACACGC
CTGGCTGTGTCTTGTAACTGTATGAAGAGCAAGCCGAGTTCTTCTCTGGGTTTGGCAGCG
TCAGGGAGCCTCTCTCGCCATACAAAGCAAGAGAGGAGAGAAACCAACTCCTCCACATTT
GCCTCCTTGAAGACACCACTGAACATTAGCTCTGTTAGTGTCAACTCTTCCGCACTACTG
ATTTCGCATGCAACCTTCCCTTTCAACTCCACAACACCACCGCTGGTGATGTATCCTAGC
CTTCGCAAAACACGCTTTCTGGCCTTAAGCTCATCTTTAAACGCTAAAGCTGTTGAGGAT
CTGACAGCCTTCTTAAGTGATTTGATCTTGGCTGTTAGCTCTTCCTTCATGTGTAGAACT
TTCAGCTTCTCTCCTATGAGTGGAGATTTTGCAATTTTGTATTTTTCAAATAGGTTTTTC
ACAGCCTCAAGTCGACGAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G091JQ U 1
AF RS1BV25JQ U 35
BS 1 453 RS1G091JQ
BS 454 454 RS1BV25JQ
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BS 538 639 RS1G091JQ
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BS 650 653 RS1BV25JQ
BS 654 695 RS1G091JQ
BS 696 860 RS1BV25JQ

RD RS1G091JQ 695 0 0
GAAATTAAACATGCAATGGCTTCTATAGTGTTTAGTACACATTTATAAAATCTTTAATAA
AATGAGCGTAAGGTACAAACGAAACTCTGAAAAAAAAACAAAATAGCATTTCACAAGTAA
AGAGACGCTGCGAATACAATGTCTCTCTTGATCTTTGAAACAGCTTCTTCTAGTTTAGCT
TCAAGCTGTGTTTCTCCAATGGATTTTGCAGCTACTATCAGCTGCTGCAGAACTTCCTCC
ATTCTCCTTATCGCTCTTATCAAGCTCCCTTCGAAAACACGAGCAATCTCCATGATCTCA
TAAAACTTCGACCCTTTTGCCCACGCATACACCGCTTCCATTATATCCGGTCTGAACGAG
TGCACAAAACTCTCCACATCGATATCAACCTTGCAGTCAAGCTGACATTCAGCGACACGC
CTGGCTGTGTCTTGTAACTGTATGAAGAGCAAGTCGAGTTCTTCTCTGGGTTTGGCAGCG
TCAGGGAGCCTCTCTCGCCATACAAAGCAAGAGAGGAGAGAAACCAACTCCTCCACCTTT
GCCTCCTTGAAGACACCACTGAACATTAGCTCTGTTAGTGTCAACTCTTCCGCACTACTG
ATTTCGCATGCAACCTTCCCTTTCAACTCCACAACACCATCGCTGGTGA****TCCTAGC
CTTCGCAAAACACGCTTTCTGGCCTTAAGCTCATC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1BV25JQ 826 0 0
GTACACATTTATAAAATCTTTAATAAAATGAGCGTAAGGTACAAACGAAACTCTGAAAAA
AAAACAAAATAGCATTTCACAAGTAAAGAGACGCTGCGAATACAATGTCTCTCTTGATCT
TTGAAACAGCTTCTTCTAGTTTAGCTTCAAGCTGTGTTTCTCCAATGGATTTTGCAGCTA
CTATCAGCTGCTGCAGAACTTCCTCCATTCTCCTTATCGCTCTTATCAAGCTCCCTTCGA
AAACACGAGCAATCTCCATGATCTCATAAAACTTCGACCCTTTTGCCCACGCATACACCG
CTTCCATTATATCCGGTCTGAACGAGTGCACAAAACTCTCCACATCGATATCAACCTTGC
AGTCAAGCTGACATTCAGCGACACGCCTGGCTGTGTCTTGTAACTGTATGAAGAGCAAGC
CGAGTTCTTCTCTGGGTTTGGCAGCGTCAGGGAGCCTCTCTCGCCATACAAAGCAAGAGA
GGAGAGAAACCAACTCCTCCACATTTGCCTCCTTGAAGACACCACTGAACATTAGCTCTG
TTAGTGTCAACTCTTCCGCACTACTGATTTCGCATGCAACCTTCCCTTTCAACTCCACAA
CACCACCGCTGGTGATGTATCCTAGCCTTCGCAAAACACGCTTTCTGGCCTTAAGCTCAT
CTTTAAACGCTAAAGCTGTTGAGGATCTGACAGCCTTCTTAAGTGATTTGATCTTGGCTG
TTAGCTCTTCCTTCATGTGTAGAACTTTCAGCTTCTCTCCTATGAGTGGAGATTTTGCAA
TTTTGTATTTTTCAAATAGGTTTTTCACAGCCTCAAGTCGACGAAC

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 4

CO CL2107Contig1 616 4 4 U
GGTTTATATTTACGTAATTTTCTTTAAATATTTTGGCTCTGCCAATTACAGGTCCTGCTC
ACCGGACAGTATATGGTTTTAAGAACTAGGATGGTAATGCGACATGTCTCAACCTTTTAT
TGTATATATATTAAACAAGCGATGATCTGAAACTAACTATTACAATACACATTAAGCATT
TCCAAACTAGATTCAATTGGTATAATCAGTATTTAAGTAACTTTTATGATAAGGTGAAAC
GGTTTAATTGTCCTCCTGAGAGAAGAAACGATTGAGAGAAGGCATAACTTGAGGCGGACG
GGTCCTCAAATACTTGCGAAGATTGTGTTGTGCATATTTTTCTCCTTCATCTTCATTTTC
CAGAATTCCCATTTTTCTATTCTCTTTACTTATCCTGCAGTCAGGGTTTAATAATGCATT
CCTTGTGAGTTGAAACACAACCATAGATGTTACAAATCCCATTGCTCCAAGAAGAGGGTA
CACCTCAGGTCTCACCCAGCGCCCCATTTCGGTTGGTCCTTTTTCTCTCTTTTTGAGGAC
AGTGATCAAAAGCGAACTTGTACCCTACTATCAACTTTTTGTATATTCTCTTTTTTTTTG
TTTGATTATGTTGTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 

AF RS1FH91JQ U 1
AF RS1FH91TF C 1
AF RS1EX10JQ U 105
AF RS1EX10TF C 105
BS 1 137 RS1FH91JQ
BS 138 138 RS1EX10JQ
BS 139 612 RS1FH91JQ
BS 613 616 RS1EX10JQ

RD RS1FH91JQ 614 0 0
GGTTTATATTTACGTAATTTTCTTTAAATATTTTGGCTCTGCCAATTACAGGTCCTGCTC
ACCGGACAGTATATGGTTTTAAGAACTAGGATGGTAATGCGACATGTCTCAACCTTTTAT
TGTATATATATTAAACAGGCGATGATCTGAAACTAACTATTACAATACACATTAAGCATT
TCCAAACTAGATTCAATTGGTATAATCAGTATTTAAGTAACTTTTATGATAAGGTGAAAC
GGTTTAATTGTCCTCCTGAGAGAAGAAACGATTGAGAGAAGGCATAACTTGAGGCGGACG
GGTCCTCAAATACTTGCGAAGATTGTGTTGTGCATATTTTTCTCCTTCATCTTCATTTTC
CAGAATTCCCATTTTTCTATTCTCTTTACTTATCCTGCAGTCAGGGTTTAATAATGCATT
CCTTGTGAGTTGAAACACAACCATAGATGTTACAAATCCCATTGCTCCAAGAAGAGGGTA
CACCTCAGGTCTCACCCAGCGCCCCATTTCGGTTGGTCCTTTTTCTCTCTTTTTGAGGAC
AGTGATCAAAAGCGAACTTGTACCCTACTATCAACTTTTTGTATATTCTCTTTTTTTTTG
TTTGATTATGTT
CC

QA 1 612 1 612
DS 

RD RS1FH91TF 614 0 0
GGTTTATATTTACGTAATTTTCTTTAAATATTTTGGCTCTGCCAATTACAGGTCCTGCTC
ACCGGACAGTATATGGTTTTAAGAACTAGGATGGTAATGCGACATGTCTCAACCTTTTAT
TGTATATATATTAAACAGGCGATGATCTGAAACTAACTATTACAATACACATTAAGCATT
TCCAAACTAGATTCAATTGGTATAATCAGTATTTAAGTAACTTTTATGATAAGGTGAAAC
GGTTTAATTGTCCTCCTGAGAGAAGAAACGATTGAGAGAAGGCATAACTTGAGGCGGACG
GGTCCTCAAATACTTGCGAAGATTGTGTTGTGCATATTTTTCTCCTTCATCTTCATTTTC
CAGAATTCCCATTTTTCTATTCTCTTTACTTATCCTGCAGTCAGGGTTTAATAATGCATT
CCTTGTGAGTTGAAACACAACCATAGATGTTACAAATCCCATTGCTCCAAGAAGAGGGTA
CACCTCAGGTCTCACCCAGCGCCCCATTTCGGTTGGTCCTTTTTCTCTCTTTTTGAGGAC
AGTGATCAAAAGCGAACTTGTACCCTACTATCAACTTTTTGTATATTCTCTTTTTTTTTG
TTTGATTATGTT
CC

QA 1 612 1 612
DS 

RD RS1EX10JQ 512 0 0
C
GTCTCAACCTTTTATTGTATATATATTAAACAAGCGATGATCTGAAACTAGCTATTACAA
TACACATTAAGCATTTCCAAACTAGATTCAATTGGTATAATCAGTATTTAAGTAACTTTT
ATGATAAGGTGAAACGGTTTAATTGTCCTCCTGAGAGAAAAAACGATTGAAAGAAGGCAT
AACTTGAGGCGGACGGGTCCTCAAATACTTGCGAAGATTGTGTTGTGCATATTTTTCTCC
TTCATCTTCATTTTCCAAAATTCCCATTTTTCTATTCTCTTTACTTATCCTGCAGTCAGG
GTTTAATAATGCATTCCTTGTGAGTTGAAACACAACCATAGATGTTATAAATCCCATTGC
TCCAAGAAAAGGGTACACCTCAGGTCTCACCCAGCGCCCCATTTCGGTTGGTCCTTTTTC
TCTCTTTTTGAGGACAGTGATCAAAAGCGAACTTGTACCCTACTATCAACTTTTTGTATA
TTTTCTTTTTTTTTGTTTGATTATGTTGTCC

QA 2 512 2 512
DS 

RD RS1EX10TF 512 0 0
C
GTCTCAACCTTTTATTGTATATATATTAAACAAGCGATGATCTGAAACTAGCTATTACAA
TACACATTAAGCATTTCCAAACTAGATTCAATTGGTATAATCAGTATTTAAGTAACTTTT
ATGATAAGGTGAAACGGTTTAATTGTCCTCCTGAGAGAAGAAACGATTGAGAGAAGGCAT
AACTTGAGGCGGACGGGTCCTCAAATACTTGCGAAGATTGTGTTGTGCATATTTTTCTCC
TTCATCTTCATTTTCCAGAATTCCCATTTTTCTATTCTCTTTACTTATCCTGCAGTCAGG
GTTTAATAATGCATTCCTTGTGAGTTGAAACACAACCATAGATGTTATAAATCCCATTGC
TCCAAGAAGAGGGTACACCTCAGGTCTCACCCAGCGCCCCATTTCGGTTGGTCCTTTTTC
TCTCTTTTTGAGGACAGTGATCAAAAGCGAACTTGTACCCTACTATCAACTTTTTGTATA
TTTTCTTTTTTTTTGTTTGATTATGTT
GTCC

QA 2 508 2 508
DS 



AS 1 4

CO CL2108Contig1 651 4 2 U
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CTATGGCTCTTCGAGATTTGCAGAGAGACCTAGAGTCCAAGGCCAATGATCTCGCCAAAA
TCCAGAGAGATATTGCCAAGGATCACCAGCTGAGAAGAAGTATACGATCCAACTCGGTGA
GAACGAGCTCGTGCTTAAGGAGTTGGATTTGCTAGAAGAAGAAGCAAACGTCTACAAGTT
GATTGGTCCAGTGCTTGTGAAACAGGATTTGGCAGAAGCTAATGCGAATGTCGCAAACGT
ATTGAGTACATCTCTGCTGGGCTGAAACGGGTTGATGCATCTATCCAAGATAACGAAGGA
CAACAAAACAGCAAGAGAGAAGCAATGATGAAGCTACAACAACGGTTACAATCTATCCAG
GCAGGAAAAGCAAAGGCTTGATCTTCCAAGTCCTTCACTTGTGCACGGCCCTGTCATAGT
GGTTTCATATTCAGTTATTGAGTGTTCGTGTGATTTCAGTTTTGTCGGTGATTAATGTCT
CTGTTATCATTCGTCTCCTTTTTGTTGACAAACTGCACTTGAATGTGTGTAAACTTATAC
AAATCTTGTCGCCCTTTTTCAAGTTATGAATTTGGAGATTTAAACCAGTAG


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1G516JQ C 1
AF RS1G516TF U 1
AF RS1H672JQB C 1
AF RS1H672TF U 1
BS 1 618 RS1G516TF
BS 619 651 RS1H672TF

RD RS1G516JQ 651 0 0
GGAAGCAACCACGGTGTTAGAGTGAGGACTAGAAATCTCAAACGGCGAAGATGAGTTCAT
CTATGGCTCTTCGAGATTTGCAGAGAGACCTAGAGTCCAAGGCCAATGATCTCGCCAAAA
TCCAGAGAGATATTGCCAAGGATCACCAGCTGAGAAGAAGTATACGATCCAACTCGGTGA
GAACGAGCTCGTGCTTAAGGAGTTGGATTTGCTAGAAGAAGAAGCAAACGTCTACAAGTT
GATTGGTCCAGTGCTTGTGAAACAGGATTTGGCAGAAGCTAATGCGAATGTCGCAAACGT
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GCAGGAAAAGCAAAGGCTTGATCTTCCAAGTCCTTCACTTGTGCACGGCCCTGTCATAGT
GGTTTCATATTCAGTTATTGAGTGTTCGTGTGATTTCAGTTTTGTCGGTGATTAATGTCT
CTGTTATCATTCGTCTCCTTTTTGTTGACAAACTGCACTTGAATGTGTGTAAACTTATAC
AAATCTTGTCGCCCTTTTTCAAGTTATGAATTTGGAGATTTAAACCAGTAG

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1G516TF 618 0 0
GGAAGCAACCACGGTGTTAGAGTGAGGACTAGAAATCTCAAACGGCGAAGATGAGTTCAT
CTATGGCTCTTCGAGATTTGCAGAGAGACCTAGAGTCCAAGGCCAATGATCTCGCCAAAA
TCCAGAGAGATATTGCCAAGGATCACCAGCTGAGAAGAAGTATACGATCCAACTCGGTGA
GAACGAGCTCGTGCTTAAGGAGTTGGATTTGCTAGAAGAAGAAGCAAACGTCTACAAGTT
GATTGGTCCAGTGCTTGTGAAACAGGATTTGGCAGAAGCTAATGCGAATGTCGCAAACGT
ATTGAGTACATCTCTGCTGGGCTGAAACGGGTTGATGCATCTATCCAAGATAACGAAGGA
CAACAAAACAGCAAGAGAGAAGCAATGATGAAGCTACAACAACGGTTACAATCTATCCAG
GCAGGAAAAGCAAAGGCTTGATCTTCCAAGTCCTTCACTTGTGCACGGCCCTGTCATAGT
GGTTTCATATTCAGTTATTGAGTGTTCGTGTGATTTCAGTTTTGTCGGTGATTAATGTCT
CTGTTATCATTCGTCTCCTTTTTGTTGACAAACTGCACTTGAATGTGTGTAAACTTATAC
AAATCTTGTCGCCCTTTT

QA 1 618 1 618
DS 

RD RS1H672JQB 651 0 0
GGAAGCAACCACGGTGTTAGAGTGAGGACTAGAAATCTCAAACGGCGAAGATGAGTTCAT
CTATGGCTCTTCGAGATTTGCAGAGAGACCTAGAGTCCAAGGCCAATGATCTCGCCAAAA
TCCAGAGAGATATTGCCAAGGATCACCAGCTGAGAAGAAGTATACGATCCAACTCGGTGA
GAACGAGCTCGTGCTTAAGGAGTTGGATTTGCTAGAAGAAGAAGCAAACGTCTACAAGTT
GATTGGTCCAGTGCTTGTGAAACAGGATTTGGCAGAAGCTAATGCGAATGTCGCAAACGT
ATTGAGTACATCTCTGCTGGGCTGAAACGGGTTGATGCATCTATCCAAGATAACGAAGGA
CAACAAAACAGCAAGAGAGAAGCAATGATGAAGCTACAACAACGGTTACAATCTATCCAG
GCAGGAAAAGCAAAGGCTTGATCTTCCAAGTCCTTCACTTGTGCACGGCCCTGTCATAGT
GGTTTCATATTCAGTTATTGAGTGTTCGTGTGATTTCAGTTTTGTCGGTGATTAATGTCT
CTGTTATCATTCGTCTCCTTTTTGTTGACAAACTGCACTTGAATGTGTGTAAACTTATAC
AAATCTTGTCGCCCTTTTTCAAGTTATGAATTTGGAGATTTAAACCAGTAG

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1H672TF 651 0 0
GGAAGCAACCACGGTGTTAGAGTGAGGACTAGAAATCTCAAACGGCGAAGATGAGTTCAT
CTATGGCTCTTCGAGATTTGCAGAGAGACCTAGAGTCCAAGGCCAATGATCTCGCCAAAA
TCCAGAGAGATATTGCCAAGGATCACCAGCTGAGAAGAAGTATACGATCCAACTCGGTGA
GAACGAGCTCGTGCTTAAGGAGTTGGATTTGCTAGAAGAAGAAGCAAACGTCTACAAGTT
GATTGGTCCAGTGCTTGTGAAACAGGATTTGGCAGAAGCTAATGCGAATGTCGCAAACGT
ATTGAGTACATCTCTGCTGGGCTGAAACGGGTTGATGCATCTATCCAAGATAACGAAGGA
CAACAAAACAGCAAGAGAGAAGCAATGATGAAGCTACAACAACGGTTACAATCTATCCAG
GCAGGAAAAGCAAAGGCTTGATCTTCCAAGTCCTTCACTTGTGCACGGCCCTGTCATAGT
GGTTTCATATTCAGTTATTGAGTGTTCGTGTGATTTCAGTTTTGTCGGTGATTAATGTCT
CTGTTATCATTCGTCTCCTTTTTGTTGACAAACTGCACTTGAATGTGTGTAAACTTATAC
AAATCTTGTCGCCCTTTTTCAAGTTATGAATTTGGAGATTTAAACCAGTAG

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 2

CO CL2109Contig1 833 2 2 U
GTGTTCTGAACTCTCTTGAGGTCTGGAGAATGCTCAAGAACCGGGACAGTATCCTCGACA
TGGTGAAAGCTAGGATCAAAGAAGAGGCTCTAAGGACTTACCTGTTCACATACTCGAGCT
CCTATGAGTCCCTGAGCCTTGAACAGCTGGCTAAGATGTTTGACGTCACCGAAGCACAGG
TTCACAGCATTGTGAGTAAGATGATGATCAATGAAGAGCTTCACGCAAGCTGGGACCAGC
CAACACGATGCATCGTCTTCCATGAAGTGCAACACAGCAGATTACAGTCATTGGCTTTCC
AGCTAACCGAGAAACTATCGGTTTTGGCAGAGAGTAATGAAAGGGCAATGGAAGCAAGGA
CCGGTGGAGGTGGTCTTGATCTGAGTTCAAGGAGAAGGGACAACAATCAGGACTATGCAG
GAGCAGCATCAGGTGGTGGGAGATGGCAGGACAACAGCATGGGTTATGGACAAGGAAGAC
AAGGTAACAACAGATCTGGATATGGCGGAAGACCAGGACAGCCTAGAGACTGGTCGGGCC
AGAACCGAGGAGGAGGATATGCAGCAAGAGCTGGGTCGGGAAACAGAGGTGGTGGTATGC
AAATGGATGGCTCAACCCGTATGGTGAGTCTTAACCGTGGTGTTCGCGCTTAACCAAGCT
GCGGACAGTGTTGATTTTGGTCTCTTTTAAGACCTTTTGTTATGTTTTTCATTTTTGGTT
TGTCGTCGGTTAAAGTTTGGATCTGTCTTTAATAAGTTGCTTCAGAACTTTAAATTACTT
TGTTTCAGAGTTGTTAAACATTATTGTTTCTATTCAAACTCAGTTTTAAGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G570TF U 1
AF RS1G570JQ C 258
BS 1 479 RS1G570TF
BS 480 833 RS1G570JQ

RD RS1G570TF 479 0 0
GTGTTCTGAACTCTCTTGAGGTCTGGAGAATGCTCAAGAACCGGGACAGTATCCTCGACA
TGGTGAAAGCTAGGATCAAAGAAGAGGCTCTAAGGACTTACCTGTTCACATACTCGAGCT
CCTATGAGTCCCTGAGCCTTGAACAGCTGGCTAAGATGTTTGACGTCACCGAAGCACAGG
TTCACAGCATTGTGAGTAAGATGATGATCAATGAAGAGCTTCACGCAAGCTGGGACCAGC
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AGCTAACCGAGAAACTATCGGTTTTGGCAGAGAGTAATGAAAGGGCAATGGAAGCAAGGA
CCGGTGGAGGTGGTCTTGATCTGAGTTCAAGGAGAAGGGACAACAATCAGGACTATGCAG
GAGCAGCATCAGGTGGTGGGAGATGGCAGGACAACAGCATGGGTTATGGACAAGGAAGA

QA 1 479 1 479
DS 

RD RS1G570JQ 576 0 0
TT
CCATGAAGTGCAACACAGCAGATTACAGTCATTGGCTTTCCAGCTAACCGAGAAACTATC
GGTTTTGGCAGAGAGTAATGAAAGGGCAATGGAAGCAAGGACCGGTGGAGGTGGTCTTGA
TCTGAGTTCAAGGAGAAGGGACAACAATCAGGACTATGCAGGAGCAGCATCAGGTGGTGG
GAGATGGCAGGACAACAGCATGGGTTATGGACAAGGAAGACAAGGTAACAACAGATCTGG
ATATGGCGGAAGACCAGGACAGCCTAGAGACTGGTCGGGCCAGAACCGAGGAGGAGGATA
TGCAGCAAGAGCTGGGTCGGGAAACAGAGGTGGTGGTATGCAAATGGATGGCTCAACCCG
TATGGTGAGTCTTAACCGTGGTGTTCGCGCTTAACCAAGCTGCGGACAGTGTTGATTTTG
GTCTCTTTTAAGACCTTTTGTTATGTTTTTCATTTTTGGTTTGTCGTCGGTTAAAGTTTG
GATCTGTCTTTAATAAGTTGCTTCAGAACTTTAAATTACTTTGTTTCAGAGTTGTTAAAC
ATTATTGTTTCTATTCAAACTCAGTTTTAAGAGC

QA 3 576 3 576
DS 



AS 1 4

CO CL2110Contig1 720 4 6 U
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GAATCTTTTACGCCAGCTTTACAAAGAAGCGATGTCTCCATAGTATCATGGCTTTGCTCA
CAGGTGGATCTGCGTGGACTATTGGCGATGAATCCACTTCCTCTGAGCCAAGGCGTACTT
CTGTCTTTGCTGCAGCAGCTAGCCTGCGACATCAGCAAGGACACGTCCCGTAAGCTTGCG
TGGATGACTGATGTGGTTACAGCAATTAACCCATCAGACCCGATGGTAGCGGCCCACGGT
CGGCCAATCTTTGAGCAAGTGTATCAGATTCTGCACCACCACCGCAACGTACCAGGCAGC
GACGTCTCTGCCACAAGACTTATAATGCATGTGATAAACTCCATGCTTATGGCCTGCAAA
TGATCCTCTCACGCTTTTGTTCGCTGCTTATATTTAAAAAAAACACAGGAACACCAACAT
CATCTACTCGCGTCTGTGTTCTACCTTTGTCGGATTTTTGATCATCTTTTCATTTTTGAT
TTGAATTTTGCATTTTTCCCTTTTCATCAATTTTCTTTTTAAATGTAAAATCTGGTTGTT
TCATATGCGTTGCCTATATTTCCCCAAGTTGATCTTATGTAAAAGAACGGGAAACAAATG
TTTGGAGTTCTTCATTCAAAAGACACAGGCACGTATTTGCTTATGTGTTCTGTTCTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 

AF RS1G126TF U 1
AF RS1G126JQ C 184
AF RS1A716JQ C 198
AF RS1A716TF U 198
BS 1 296 RS1G126TF
BS 297 297 RS1A716TF
BS 298 687 RS1G126TF
BS 688 688 RS1A716TF
BS 689 717 RS1G126TF
BS 718 720 RS1A716JQ

RD RS1G126TF 719 0 0
GAGGTTGAAGCAGACCCAATAGCAGAACTATCCAGGTTGATATCCGAACGCAAATACGAG
GAATCTTTTACGCCAGCTTTACAAAGAAGCGATGTCTCCATAGTATCATGGCTTTGCTCA
CAGGTGGATCTGCGTGGACTATTGGCGATGAATCCACTTCCTCTGAGCCAAGGCGTACTT
CTGTCTTTGCTGCAGCAGCTAGCCTGCGACATCAGCAAGGACACGTCCCGTAAGCTTGCG
TGGATGACTGATGTGGTTACAGCAATTAACCCATCAGACCCGATGGTAGCGGCCCATGGT
CGGCCAATCTTTGAGCAAGTGTATCAGATTCTGCACCACCACCGCAACGTACCAGGCAGC
GACGTCTCTGCCACAAGACTTATAATGCATGTGATAAACTCCATGCTTATGGCCTGCAAA
TGATCCTCTCACGCTTTTGTTCGCTGCTTATATTTAAAAAAAACACAGGAACACCAACAT
CATCTACTCGCGTCTGTGTTCTACCTTTGTCGGATTTTTGATCATCTTTTCATTTTTGAT
TTGAATTTTGCATTTTTCCCTTTTCATCAATTTTCTTTTTAAATGTAAAATCTGGTTGTT
TCATATGCGTTGCCTATATTTCCCCAAGTTGATCTTATGTAAAAGAACGGGAAACAAATG
TTTGGAGTTCTTCATTCAAAAGACACACGCACGTATTTGCTTATGTGTTCTGTTCTT
AC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1G126JQ 537 0 0
TCTTTGCTGCAGCAGCTAGCCTGCGACATCAGCAAGGACACGTCCCGTAAGCTTGCGTGG
ATGACTGATGTGGTTACAGCAATTAACCCATCAGACCCGATGGTAGCGGCCCATGGTCGG
CCAATCTTTGAGCAAGTGTATCAGATTTTGCACCACCACCGCAACGTACCAGGCAGCGAC
GTTTTTGCCACAAGACTTATAATGCATGTGATAAACTCCATGCTTATGGCCTGCAAATGA
TCCTCTCACGCTTTTGTTCGCTGCTTATATTTAAAAAAAACACAGGAACACCAACATCAT
CTACTCGCGTCTGTGTTCTACCTTTGTCGGATTTTTGATCATCTTTTCATTTTTGATTTG
AATTTTGCATTTTTCCCTTTTCATCAATTTTCTTTTTAAATGTAAAATCTGGTTGTTTCA
TATGCGTTGCCTATATTTCCCCAAGTTGATCTTATGTAAAAGAACGGGAAACAAATGTTT
GGAGTTCTTCATTCAAAAGACACAGGCACGTATTTGCTTATGTGTTCTGTTCTT
TAC

QA 1 534 1 534
DS 

RD RS1A716JQ 523 0 0
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TACAGCAATTAACCCATCAGACCCGATGGTAGCGGCCCACGGTCGGCCAATCTTTGAGCA
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ACTTATAATGCATGTGATAAACTCCATGCTTATGGCCTGCAAATGATCCTCTCACGCTTT
TGTTCGCTGCTTATATTTAAAAAAAACACGGGAACACCAACATCATCTACTCGCGTCTGT
GTTCTACCTTTGTCGGATTTTTGATCATCTTTTCATTTTTGATTTGAATTTTGCATTTTT
CCCTTTTCATCAATTTTCTTTTTAAATGTAAAATCTGGTTGTTTCATATGCGTTGCCTAT
ATTTCCCCAAGTTGATCTTATGTAAAAGAACGGGAAACAAATGTTTGGAGTTTTTCATTC
AAAAGACACAGGCACGTATTTGCTTATGTGTTCTGTTCTTTAC

QA 1 523 1 523
DS 

RD RS1A716TF 523 0 0
GCTAGCCTGCGACATCAGCAAGGACACGTCCCGTAAGCTTGCGTGGATGACTGATGTGGT
TACAGCAATTAACCCATCAGACCCGATGGTAGCGGCCCACGGTCGGCCAATCTTTGAGCA
AGTGTATCAGATTCTGCACCACCACCGCAACGTACCAGGCAGCGACGTCTCTGCCACAAG
ACTTATAATGCATGTGATAAACTCCATGCTTATGGCCTGCAAATGATCCTCTCACGCTTT
TGTTCGCTGCTTATATTTAAAAAAAACACGGGAACACCAACATCATCTACTCGCGTCTGT
GTTCTACCTTTGTCGGATTTTTGATCATCTTTTCATTTTTGATTTGAATTTTGCATTTTT
CCCTTTTCATCAATTTTCTTTTTAAATGTAAAATCTGGTTGTTTCATATGCGTTGCCTAT
ATTTCCCCAAGTTGATCTTATGTAAAAGAACGGGAAACAAATGTTTGGAGTTTTTCATTC
AAAAGACACAGGCACGTATTTGCTTATGTGTTCTGTTCTT
TAC

QA 1 520 1 520
DS 



AS 1 3

CO CL2111Contig1 1024 3 12 U
GTGGAGAACTAATATAATAACAAAAACAAACTCAACATTTCTACAAGGACGTTGGTTGAT
TAGTCGTCGGTCGTTGAAGGAAGAAGAAGTCTTTTCTCCTTCTTTCTTCACCGTACGATC
GTTGTCTATACAATGAGAGAAACATCAAAGCCAATGGCTACAAGCTCTTCTTCCTCCTCC
ATCTCCTCAATTCCTCCTTCGTCTCCATCATCTTCTCCAGCCACCACGACCACGCCGCCA
CGTCAGAACAATCTCCTCAAGCCACCATCTTCAAAAAAGAAGAAAAACAAATCAAACGTG
TTCGGAGTCTTACGCACCGTGTTTCGCTCTTTCCCTATCTTCACAACATCATCCCTAGCA
TGCAAAATCCCGGTTATCAATCCCGGTTTAGGCGTAGCGGAACCTCATCACAACACGTCA
AGAGTCACCGGCACGTTGTTCGGATACCGTAAAGGCCGAGTAAGTCTCTCCATTCAAGAA
ACCCCTAAATGTCTACCTTCTTTAGTCGTAGAGCTCGCCATGCAAACCACAACGTTTCAA
AAAGAACTTAGCATGGGGATGGTTAGAATCGCTCTCGAGACCGAGAAACAACCTAACAAT
AATAACAACAAGACAGAAAAGAGCACGAATATTTTGGATGAACCGTTGTGGACAATGTTT
TGTAAAGGAGAGAAAACTGGTTACGGTGTGAGACGTGAAGCGAACGATGAAGACTTAAGC
GTGATGGAACTGTTACGACCGGTGTCTATGGGCGCAGGAGTTTTGCCTGGAAACTCGGAG
TCGGAAGGACCAGACGGTGAAATGGCGTATATGAGAGCTTACTTTGAGAGAGTTGTTGGG
TCTAAAGATTCAGAGACTTTTTATATGTTGAGTCCTGAAGGTAATAATGGACCTGAGCTT
AGTTTTTTCTTTGTAAGAGTTTGATTAATTTTGTTAATTTAACGTGCATGTAAAGGCCGG
AGACGGTGGTTGACGTTATATACATATAGTATCATTTTAGTATGATTAAATTATATTCTT
CTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 

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TGTAAAGGAGAGAAA
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DS 

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AATCCCGGTTTAGGCGTAGCGGAACCTCATCACAACACGTCAAGAGTCACCGGCACGTTG
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ATTATATTCTTCTCG

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DS 



AS 1 4

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TCAAACGCTCCATCCCTCGCTCATTCTCCTACCTCATCTGGGACATCATCATAGCCTCCT
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CCTGGCCTCTCTACTGGGCCTGCCAAGGCTGCGTCCTAACCGGCGTCTGGGTCATAGCCC
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TCTTCCACTCTTTCCTCCTCGTCCCTTACTTCTCCTGGAAGTACAGTCACCGACGCCACC
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CCTCTGAGTGGGATTGGTTGAGGGGAGCCTTGGCTACCGTGGACAGATACTACGGAATCT
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TGCCGCACTACCACGCGATGGAAGCTACCAAGGCGATAAAACCGATACTGGGGGATTATT
ACCAGTTCGATGGGACGCCAGTGTTTAAGGCGATGTGGAGGGAGGCGAAGGAGTGTATCT
ATGTAGAGCCTGACAGGCAAGGTGAGAAGAAAGGTGTGTTCTGGTACAACAATAAGTTAT
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CATTTTGACATTTTGGCT


BQ
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25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1D926TF U 446
AF RS1D926JQ C 839
AF RS1GO35JQ C 934
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BS 671 671 RS1D926TF
BS 672 765 RS1GO35TF
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RD RS1GO35TF 766 0 0
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TATTAACGTAAAATCTCTATCCCCCCTACGTCAGCTGAAGAAAACAAAATGGGTGCAGGT
GGAAGAATGCAGGTATCTCCTTCTCCCAAGAAGTCAGAAACCGAAACCCTCAAACGCGTA
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CCTGGCCTCTCTACTGGGCCTGCCAAGGCTGCGTCCTAACCGGCGTCTGGGTCATAGCCC
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TCTTCCACTCTTTCCTCCTCGTCCCTTACTTCTCCTGGAAGTACAGTCACCGACGCCACC
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TCAAGTGGTATGGCAAGTACCTCAACAACCCTCTCGGACGCACCGTCATGCTTACCGTCC
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C

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DS 

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G
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TACTTCTCCTGGAAGTACAGTCACCGACGCCACCACTCCAACACCGGCTCCCTCGAGAGA
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AACCCTCTCGGACGCACCGTCATGCTTACCGTCCAGTTCGCCCTCGGCTGGCCCTTGTAC
TTGGCCTTCAACGTCTCGGGCAGGCCTTACGACGGCGGTTTCGCTTGCCATTTCCACCCC
AACGCTCCCATCTACAACGACCGCGAACGCCTCCAGATATACGTCTCCGACGCCGGTATC
CTCGCGGTCTGCTACGGTCTCTACCGCTACGCAGCTGCTCAAGGACTGGCCTCGATGGTC
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AGCTGCTCAAGGACTGGCCTCGATGGTCTGCCTCTACGGAGTCCCGCTTCTGATAGTCAA
CGGGTTCTTAGTCTTGATCACTTACTTGCAGCACACGCATCCTTCGCTGCCTCATTACGA
CTCCTCTGAGTGGGATTGGTTGAGGGGAGCCTTGGCTACCGTGGACAGATACTACGGAAT
CTTGAACAAGGTCTTCCACAATATCACGGACACGCACGTGGCGCATCACCTGTTTTCCAC
GATGCCGCACTACCACGCGATGGAAGCTACCAAGGCGATAAAACCGCTACTGGGGGATTA
TTACCAGTTCGATGGGACGCCAGTGTTTAAGGTGATGTGGAGGGAGGCGAAGGAGTGTAT
CTATGTAGAGCCTGACAGGCAAGGTGAGAAGAAAGGTGTGTTCTGGTACAACAATAAGTT
ATGAGGAAGATGATATATGGTGGAAGAACAAAAGAAGATATTTTCCATTGATCTTTCTAT
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TCCATTTTG
GC

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DS 

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CGCATCCTTCGCTGCCTCACTACGACTCCTTTGAGTGGGATTGGTTGAGGGGAGCCTTGG
CTACCGTGGACAGAGACTACGGAATCTTGAACAAGGTTTTCCACAATATCACGGACACGC
ACGTGGCGCATCACCTGTTTTCCACGATGCCGCACTACCACGCGATGGAAGCTACCAAGG
CGATAAAACCGATACTGGGGGATTATTACCAGTTCGATGGGACGCCAGTGTTTAAGGCGA
TGTGGAGGGAGTCGAAGGAGTGTATTTATGTAGAGCCTGACAGGCAAGGTGAGAAGAAAG
GTGTGTTTTGGTACAACAATAAGTTATGAGGAAGATGATATATGGTGGAAGAACAAAAGA
AGATATTTTCCATTGATCTTTCTATTGTTGTCTCTGGTCGTCTTTGTTTTTAAGAAGCTA
TGTTTTTTTTCAATAATCTAAATTATCCATTTTGACATTTTGGCT

QA 1 525 1 525
DS 



AS 1 4

CO CL2113Contig1 923 4 22 U
GGAGGTTTCTCAAACTCCGCTGTAAAACCTTCAGGGCATTATTAGATCGAATCCTCTCTT
TGCGGGAGAAAAATGCAATCGATTCGAAGCACTACAAGGTTGCTTCAGAGGAACCGCTTC
TCCATCTCCAACACTCTCCCTCGTTTCACTTCTTCGTCTTCTTCTCCAAGCTGGTCTGAT
GATAATGAGTCGAGGAGGCCAGGTGGAGGGTTTGATTCATTCCGTTCCACCAGAGCCTTC
GATTCGCCAGCAGCGTCGTATCTCATTAGCTCGTTGACAAAGGCCGCTTCTTTCTCTTCC
GCACTACCTAAACAAAACTTTACGTATTCATCGAGATGCTTTTCCACCGTTGGAGACTCT
GTTCCTCAAGGATTTTCTCCTGATGCGCCTCCAAGAATCAAGTTCAAGCGGCTTGACAAA
ACCGCCAAGCATATCATGCAGATTGTAGACAAGGAGGCAGTTGAGGAAGTGAGAACTCGT
AGGGAGATTCCGGAGATAAGGCCCGGTTACATTGTGCAGCTGAAAGTGGAAGTGCCTGAG
AACAAGAGACGTGTTTCAATCGTTAAAGGAATTGTCATAGCAAGGCGTAATGCTGGTCTT
AACTCTACGTTCAGGATTAGAAGGCTTGTGGCTGGAGTGGGAGTCGAATCCATGTTCCCT
TTGTATTCTCCAAACCTGAGGGAGATTAAGGTTTTGGACAAGAAGAGGGTTAGAAGAGCG
AAACTCTACTACCTCAGGGACAAGATGAATGCTCTCAAAAAGCATTAACTCCTCAATAAT
CATCACCAAAAAAGAGAGAGAAAGAGAGAGAACTCTGTACTCTTAAACAAAATCTTGAGT
GTTTTTTCTTTAATGATGACTTAGCATTGAGTCATATATTGGACTGTGTAATGTTACGAA
TAATGATGGATCCAGCTTTTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1B895TF U 1
AF RS1F408TF U 31
AF RS1F408JQ C 161
AF RS1B895JQ C 255
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RD RS1B895TF 611 0 0
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AACTCTACGTT

QA 1 611 1 611
DS 

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GG
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GTTGACAAAGGCCGCTTCTTTCTCTTCCGCACTACCTAAACAAAACTTTACGTATTCATC
GAGATGCTTTTCCACCGTTGGAGACTCTGTTCCTCAAGGATTTTCTCCTGATGCGCCTCC
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TTTGGACAAGAAGAGGGTTAGAAGAGCGAAACTCTACTACCTCAGG*ACAAGATGAATGC
TCTCAAAA*GCATTAACTCCTCAATAATCATCACCAAAAA*GAGAGAGAA*GAGAGAGA*
CTCTGTACTCTTAA*CAAAATCTTGAGTGTT

QA 3 813 3 813
DS 

RD RS1F408JQ 762 0 0
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TCCGTTCCACCAGAGCCTTCGATTCGCCAGCAGCGTCGTATCTCATTAGCTCGTTGACAA
AGGCCGCTTCTTTCTCTTCCGCACTACCTAAACAAAACTTTACGTATTCATCGAGATGCT
TTTCCACCGTTGGAGACTCTGTTCCTCAAGGATTTTCTCCTGATGCGCCTCCAAGAATCA
AGTTCAAGCGGCTTGACAAAACCGCCAAGCATATCATGCAGATTGTAGACAAGGAGGCAG
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GAGTCGAATCCATGTTCCCTTTGTATTCTCCAAACCTGAGGGAGATTAAGGTTTTGGACA
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TCTTAAACAAAATCTTGAGTGTTTTTTCTTTCATGATGACTTAGCATTGAGTCATATATT
GGACTGTGTAATGTTACGAATAATGATGGATCCAGCTTTTG
G

QA 1 761 1 761
DS 

RD RS1B895JQ 669 0 0
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AAACTTTACGTATTCATCGAGATGCTTTTCCACCGTTGGAGACTCTGTTCCTCAAGGATT
TTCTCCTGATGCGCCTCCAAGAATCAAGTTCAAGCGGCTTGACAAAACCGCCAAGCATAT
CATGCAGATTGTAGACAAGGAGGCAGTTGAGGAAGTGAGAACTCGTAGGGAGATTCCGGA
GATAAGGCCCGGTTACATTGTGCAGCTGAAAGTGGAAGTGCCTGAGAACAAGAGACGTGT
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GATTAGAAGGCTTGTGGCTGGAGTGGGAGTCGAATCCATGTTCCCTTTGTATTCTCCAAA
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GATGACTTAGCATTGAGTCATATATTGGACTGTGTAATGTTACGAATAATGATGGATCCA
GCTTTTGAT

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 4

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TTTTGTGGCGTAGAAAAGCAGTTTGAGTGATTAAACTTTTTACGTCCACTTGAAAGTTTT
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CTATCCCTTGCATCCGCATCTCGATTCGTTTTTTTTCCCTTTTAAATATATTTTATTTTA
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TCCAGCACCTGGACAGCAACCCATGTACACGGGCGCAATCGATGCGGTTAAAAAGACCGT
TGCTGCTGAAGGACCTAAAGGTTTGTACAAAGGTATGGGAGCTCCTCTTGCAACCGTTGC
TGCCTTCAACGCGGTTCTGTTCACCGTGAGAGGTCAGATGGAAGGGATGTTTAGGTCTGA
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TGTCTCGTTCCTTGCTTGTCCTACCGAGTTGATCAAATGCAGGTTGCAAGCACAAGGTGC
ATTAGCTGGTGCCTCTACCACAGGCTCAGTGGTTGCAGCCGTGAAATACGGTGGACCAAT
GGACGTAGCACGTCATGTGCTACGATCAGAAGGTGGAGCTCGAGGTCTATTCAAAGGTTT
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CATGGCTAGGAGTGTCCCTGCTAATGCTGCTCGCTTCTTGGCTTATGAGATGACAAGGTC
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TCTTTTTACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C088TF U 1
AF RS1E384TF U 249
AF RS1E384JQ C 587
AF RS1C088JQ C 555
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RD RS1C088TF 668 0 0
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TTTATTTTCTTTATTTTTATTTTTTGGATTTTATCTGATCACTCGTTTGTGTCTCTGAAT
CTATCCCTTGCATCCGCATCTCGATTCGTTTTTTTTCCCTTTTAAATATATTTTATTTTA
TTTTAAGGAGAAGATTTCTGTATTCTGAGATCCATTCAATATCGATTGCCCTCTCTCTAG
TCAATCCCTGATGGCGGATGCAGCGAAAGATTTAGCTTCAGGGACTGTCGGAGGAGCGGC
TCAGCTCATTGTTGGCCACCCTTTCGACACCATCAAGGTCAAACTTCAGAGCCAACCTGC
TCCAGCACCTGGACAGCAACCCATGTACACGGGCGCAATCGATGCGGTTAAAAAGACCGT
TGCTGCTGAAGGACCTAAAGGTTTGTACAAAGGTATGGGAGCTCCTCTTGCAACCGTTGC
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TGTCTCGT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1E384TF 584 0 0
G
GAAGATTTCTGTATTCTGAGATCCATTCAATATCGATTGCCCTCTCTCTAGTCAATCCCT
GATGGCGGATGCAGCGAAAGATTTAGCTTCAGGGACTGTCGGAGGAGCGGCTCAGCTCAT
TGTTGGTCACCCTTTCGACACCATCAAGGTCAAACTTCAGAGCCAACCTGCTCCAGCACC
TGGACAGCAACCCATGTACACGGGCGCAATCGATGCGGTTAAAAAGACCGTTGCTGCTGA
AGGACCTAAATGTTTGTACAAAGGTATGGGAGCTCCTCTTGCAACCGTTGCTGCCTTCAA
CGCGGTTCTGTTCACCGTGAGAGGTCAGATGGAAGGGATGTTTAGGTCTGAACCTGGTGT
TCCTTTGACCATTAGTCAACAGTTTGTGTGCGGTGTGGGTGCTGGTTTCGCTGTCTCGTT
CCTTGCTTGTCCTACCGAGTTGATCAAATGCAGGTTGCAAGCACAAGGTGCATTAGCTGG
TGCCTCTACCACAGGCTCAGTGGTTGCAGCCGTGAAATACGGTGGACCAATGGACGTAGC
ACGTCATGTGCTACGATCAGAAAGTGGAGCTCGAGGTCTATTC

QA 2 584 2 584
DS 

RD RS1E384JQ 695 0 0
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GGTGCTGGTTTCGCTGTCTCGTTCCTTGCTTGTCCTACCGAGTTGATCAAATGCAGGTTG
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TACGGTGGACCAATGGACGTAGCACGTCATGTGCTACGATCAGAAGGTGGAGCTCGAGGT
CTATTCAAAGGTTTATTCCCTACATTTGCCCGTGAAGTTCCCGGGAACGCGACAATGTTT
GCAGCCTACGAAGGTTTCAAGAGGTTTTTAGCCGGTGGTTCAGACACTTCGAGCTTAGGA
CAAGGGTCATTGATCATGGCTGGTGGTGTCTCTGGTGCATCCTATTGGGGGTTTGTGTAC
CCAACCGATGTTGTGAAGAGTGTTCTTCAAGTTGATGATTATAGAAACCCTAAGTATGCG
GGTTCGATGGATGCTTTTAGGAAGATTTTGAAAGCTGAAGGAGTTAAAGGTTTGTATAAA
GGGTTTGGTCCAGCCATGGCTAGGAGTGTCCCTGCTAATGCTGCTTGCTTCTTGGCTTAT
GAGATGACAAGGTCTAGCTTGGGATAAACCGGTTTGGTTTGGGTTTTAACTGTTGGTTCG
ATTTGTTGTTGTTCTATTTGGTTAACCTTTCGGCT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1C088JQ 777 0 0
TTCTGTTCACCGTGAGAGGTCAGATGGAAGGGATGTTTAGGTCTGAACCTGGTGTTCCTT
TGACCATTAGTCAACAGTTTGTGTGCGGTGCGGGTGCTGGTTTCGCTGTCTCGTTCCTTG
CTTGTCCTACCGAGTTGATCAAATGCAGGTTGCAAGCACAAGGTGCATTAGCTGGTGCCT
CTACCACAGGCTCAGTGGTTGCAGCCGTGAAATACGGTGGACCAATGGACGTAGCACGTC
ATGTGCTACGATCAGAAGGTGGAGCTCGAGGTCTATTCAAAGGTTTATTCCCTACATTTG
CCCGTGAAGTTCCCGGGAACGCGACAATGTTTGCAGCCTACGAAGGTTTCAAGAGGTTTT
TAGCCGGTGGTTCAGACACTTCGAGCTTAGGACAAGGGTCATTGATCATGGCTGGTGGTG
TCGCTGGTGCATCCTATTGGGGGTTTGTGTACCCAACCGATGTTGTGAAGAGTGTTCTTC
AAGTTGATGATTATAGAAACCCTAAGTATGCGGGTTCGATGGATGCTTTTAGGAAGATTT
TGAAAGCTGAAGGAGTTAAAGGTTTGTATAAAGGGTTTGGTCCAGCCATGGCTAGGAGTG
TCCCTGCTAATGCTGCTCGCTTCTTGGCTTATGAGATGACAAGGTCTAGCTTGGGATAAA
CCGGTTTGGTTTGGGTTTTAACTGTTGGTTCGATTTGTTGTTGTTCTATTTGGTTAACCT
TTCGGCTATTAAATGATTCTTTTTAATTTTAAGAAAAAAATCATCATCTTTTTACAC

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 4

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TCTCTAAGTTAAAAACTCAGATCCAGTTTCGCATCTTTCTCCGACGCCGGCGGTCCCTTT
AGCCGGTGTCGGGGAACCTTCCGGTGTTTTTCTTCCCGTTTGCTTTGCCGCTCTCTCTTT
TCTAATCGGTCTTTGCTATCTACTCTGAATCTCGATGTGCCGCTTCTTTCTCTTTTTCTA
CTCGCGATAGATCTGTGAGAAGTAGTTTCAGCGCTAGAGGTTTTGGAGTGGCGGCGACGA
TTTAGGCAAGGGTTTGTTGGTGGAGTCGGTTTCATGGGAGGTTGGTGCTTTCAGATCTGT
TGCTGCGGTAGCTTCTGTAGAGCTGGCGGTACCAAGGCGGTGGAGAGGTGTGTGCTTGGG
ATCGGCGTCGCTACTTCTCTACCGCTTGCTCAGCTCTCGTCAGCCTCTCTCAGTTTTTTG
CAGATCTAGGGTTGCGTCCTGAACGTGGCAGTGCGTGGCGCTCTGTCTTCCTCGGCTGGG
AGATCCCGCTGTTGGTTCTCACCGGTGGGTGCGTGTGAGGAGCTCTCTTCCCTCGGAGTT
GTCGCCTGAGCGGAGTGAGTTTCTGTGGCGGCGCGTGGCGAACCACGAGACTGCATCCGC
GTCTCTTTGTGGCTTCCGTTTCCCAGCGGTTTGGTGTAGAGCGGTGGCATCGTGTTGTCT
CTTTCTCCCCCAATAAATGCATAGGTGCTCGTTCGACTCGGCGGCGGTGTCTCTGCGTGG
TGGTCTTCCCGGTTTGGAGGTTTGGGTGACTTGGCTGCTCATCTTTTGAGGCGGACACCG
GGTATGGGGCCAATCTACCGGGTTCGTGCTCCTGGGCGTAAAGCGGCCTGCTTCATTCAA
CGGCTGCAATAGGCAACTTTGCTTCCTCTCCCTTCAGTCAAGGCAATGCCCCGTATCAGA
TGTTGTGCGTGGTTGGGGTCTCCTCTGTTTTTTCAATTTCTGTTCTTTGTTGTTGTGTTT
AGATTTATTTTCTGCAAATCTGTTTCTTGTTAATCTTTGTATTTCTGTCTAAAACGAAAA
TGGTAATAAACTTAACATTTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RS1AZ95TF U 1
AF RS1AZ95JQ C 424
AF RS1DD34JQ C 845
AF RS1DD34TF U 845
BS 1 675 RS1AZ95TF
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BS 846 1102 RS1DD34TF
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TCTCTAAGTTAAAAACTCAGATCCAGTTTCGCATCTTTCTCCGACGCCGGCGGTCCCTTT
AGCCGGTGTCGGGGAACCTTCCGGTGTTTTTCTTCCCGTTTGCTTTGCCGCTCTCTCTTT
TCTAATCGGTCTTTGCTATCTACTCTGAATCTCGATGTGCCGCTTCTTTCTCTTTTTCTA
CTCGCGATAGATCTGTGAGAAGTAGTTTCAGCGCTAGAGGTTTTGGAGTGGCGGCGACGA
TTTAGGCAAGGGTTTGTTGGTGGAGTCGGTTTCATGGGAGGTTGGTGCTTTCAGATCTGT
TGCTGCGGTAGCTTCTGTAGAGCTGGCGGTACCAAGGCGGTGGAGAGGTGTGTGCTTGGG
ATCGGCGTCGCTACTTCTCTACCGCTTGCTCAGCTCTCGTCAGCCTCTCTCAGTTTTTTG
CAGATCTAGGGTTGCGTCCTGAACGTGGCAGTGCGTGGCGCTCTGTCTTCCTCGGCTGGG
AGATCCCGCTGTTGGTTCTCACCGGTGGGTGCGTGTGAGGAGCTCTCTTCCCTCGGAGTT
GTCGCCTGAGCGGAGTGAGTTTCTGTGGCGGCGCGTGGCGAACCACGAGACTGCATCCGC
GTCTCTTTGTGGCTT

QA 1 675 1 675
DS 

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ATCTAGGGTTGCGTCCTGAACGTGGCAGTGCGTGGCGCTCTGTCTTCCTCGGCTGGGAGA
TCCCGCTGTTGGTTCTCACCGGTGGGTGCGTGTGAGGAGCTCTCTTCCCTCGGAGTTGTC
GCCTGAGCGGAGTGAGTTTCTGTGGCGGCGCGTGGCGAACCACGAGACTGCATCCGCGTC
TCTTTGTGGCTTCCGTTTCCCAGCGGTTTGGTGTAGAGCGGTGGCATCGTGTTGTCTCTT
TCTCCCCCAATAAATGCATAGGTGCTCGTTCGACTCGGCGGCGGTGTCTCTGCGTGGTGG
TCTTCCCGGTTTGGAGGTTTGGGTGACTTGGCTGCTCATCTTTTGAGGCGGACACCGGGT
ATGGGGCCAATCTACCGGGTTCGTGCTCCTGGGCGTAAAGCGGCCTGCTTCATTCAACGG
CTGCAATAGGCAACTTTGCTTCCTCTCCCTTCAGTCAAGGCAATGCCCCGTATCAGATGT
TGTGCGTGGTTGGGGTCTCCTCTGTTTTTTCAATTTCTGTTCTTTGTTGTTGTGTTTAGA
TTTATTTTCTGCAAATCTGTTTCTTGTCAATCTTTGTATTTCTGTCTAAAACGAAAATGG
TAATAAACTTAACATTTTTACC

QA 1 682 1 682
DS 

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G
GGGGCCAATCTACCGGGTTCGTGCTCCTGGGCGTAAAGCGGCCTGCTTCATTCAACGGCT
GCAATAGGCAACTTTGCTTCCTCTCCCTTCAGTCAAGGCAATGCCCCGTATCAGATGTTG
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TATTTTCTGCAAATCTGTTTCTTGTTAATCTTTGTATTTCTGTCTAAAACGAAAATGGTA
ATAAACTTAACATTTTT
TC

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DS 

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G
GGGGCCAATCTACCGGGTTCGTGCTCCTGGGCGTAAAGCGGCCTGCTTCATTCAACGGCT
GCAATAGGCAACTTTGCTTCCTCTCCCTTCAGTCAAGGCAATGCCCCGTATCAGATGTTG
TGCGTGGTTGGGGTCTCCTCTGTTTTTTCAATTTCTGTTCTTTGTTGTTGTGTTTAGATT
TATTTTCTGCAAATCTGTTTCTTGTTAATCTTTGTATTTCTGTCTAAAACGAAAATGGTA
ATAAACTTAACATTTTT
TC

QA 2 258 2 258
DS 



AS 1 4

CO CL2116Contig1 956 4 2 U
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GTTCTTCAATAGTTACAAAAGACATCTAGTGATGTTTTTACAAAAGACATCTAATGATGT
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GAGAATTTTGGTCAAGTTCTTGGCTTGATTGGGGAATTGGAACAGAGGCATCACTCTCAC
GCTGAATAGGTTCAAAGGTAATAGGATCCACTCCATTCATCTTCATCAGCACCTCTAAAC
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GTGCAGTCTCACTTGGTTCATCATCAATATCCTGAATTGAACCAAGACCATAAACTCGCC
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ATGGGGTTTCATCAGTCGGACAGGAACCTTGTGATCGCTCCAATGCAAGAGCCTCGGCAG
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TACGCACTACTTCAGTGACTGGAGGTGCTACCCCACCAGCCTTAACTGTCAAGTCATAAG
CATAACGCTTGTGATTTTTTGATCCTGAAGTATGACGATGAGTGCCTAAACCATCTGGGT
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TCTCTAGCATCAAGTTCCAATCTGCTAGGCCAATGAAATCTGGCTTCTTTTTTTCTTCTG
ATCTCCTCCTCTTGCTTACAAGGTCTCTGATTGAGTTTTTCAGAATCTTTTCCCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1A317TR U 100
AF RS1DE72JQ U 16
AF RS1A317JQ U 1
AF RS1DE72TF C 296
BS 1 816 RS1A317JQ
BS 817 956 RS1DE72TF

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GCTGCTGGGTAGAGGGTGCAAATGGGGTTTCATCAGTCGGACAGGAACCTTGTG

QA 1 474 1 474
DS 

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C
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TTCTTGGCTTGATTGGGGAATTGGAACAGAGGCATCACTCTCACGCTGAATAGGTTCAAA
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TTCATCATCAATATCCTGAATTGAACCAAGACCATAAACTCGCCCTTTTCCATTGGTTGC
CACTTCAATGTAAGCAGCATTGAGCTGCTGGGTAGAGGGTGCAGATGGGGTTTCATCAGT
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AGCCCTTTTGTCAAT

QA 2 616 2 616
DS 

RD RS1A317JQ 820 0 0
AATTTAAACATTCAAATACCATTAAAATTATAAGTTTTCTTACAAAAGACATCTAATGAT
GTTCTTCAATAGTTACAAAAGACATCTAGTGATGTTTTTACAAAAGACATCTAATGATGT
TAGAGTTTACCTTACTATAAACACAAAAGACACAAAAGATCAGATGGAGTTAGTGTACTG
GAGAATTTTGGTCAAGTTCTTGGCTTGATTGGGGAATTGGAACAGAGGCATCACTCTCAC
GCTGAATAGGTTCAAAGGTAATAGGATCCACTCCATTCATCTTCATCAGCACCTCTAAAC
CTCGCTTAATACCAGTTACATCCTCCTTCACGCCAGAAACATCATCCTTCAAGCTAGTTA
CAACACCCTCCACACTGGTCAAGCGTCCATCAATTGCCACATGTGTAAATAAAGAAGCTG
GTGCAGTCTCACTTGGTTCATCATCAATATCCTGAATTGAACCAAGACCATAAACTCGCC
CTTTTCCATTGGTTGCCACTTCAATGTAAGCAGCATTGAGCTGCTGGGTAGAGGGTGCAG
ATGGGGTTTCATCAGTCGGACAGGAACCTTGTGATCGCTCCAATGCAAGAGCCTCGGCAG
CCTTCACTAAACCTTCAGCCCTTTTGTCAATGAAAGTGCCATCTTTGCGACTATGGGTCA
TACGCACTACTTCAGTGACTGGAGGTGCTACCCCACCAGCCTTAACTGTCAAGTCATAAG
CATAACGCTTGTGATTTTTTGATCCTGAAGTATGACGATGAGTGCCTAAACCATCTGGGT
TTGAGGAAGCATTCTGAGAATTTGTTTTGCTCCTCT
TTTG

QA 1 816 1 816
DS 

RD RS1DE72TF 661 0 0
TAAACCTCGCTTAATACCAGTTACATC*TCCTTCACGCCAGAAACATCATCCTTCAAGCT
AGTTACAACACCCTCCACACTGGTCAAGCGTCCATCAATTGCCACATGTGTAAATAAAGA
AGCTGGTGCAGTCTCACTTGGTTCATCATCAATATCCTGAATTGAACCAAGACCATAAAC
TCGCCCTTTTCCATTGGTTGCCACTTCAATGTAAGCAGCATTGAGCTGCTGGGTAGAGGG
TGCAGATGGGGTTTCATCAGTCGGACAGGAACCTTGTGATCGCTCCAATGCAAGAGCCTC
GGCAGCCTTCACTAAACCTTCAGCCCTTTTGTCAATGAAAGTGCCATCTTTGCGACTATG
GGTCATACGCACTACTTCAGTGACTGGAGGTGCTACCCCACCAGCCTTAACTGTCAAGTC
ATAAGCATAACGCTTGTGATTTTTTGATCCTGAAGTATGACGATGAGTGCCTAAACCATC
TGGGTTTGAGGAAGCATTCTGAGAATTTGTTTTGCTCCTCTCTTGGTGTCGCTCCTCCTG
CCAAATCTCTAGCATCAAGTTCCAATCTGCTAGGCCAATGAAATCTGGCTTCTTTTTTTC
TTCTGATCTCCTCCTCTTGCTTACAAGGTCTCTGATTGAGTTTTTCAGAATCTTTTCCCA
C

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 4

CO CL2117Contig1 1189 4 12 U
GGGAAGCTCAAGCCGCTTCTCTCCATCTCTCTCTACATTCCTCTCTCTCTTATCTCTGCA
ATGGCGAGAGTGTTGCGTGTGGCGAGATCCTCCTCCCTCTTTAGCTTCGGGAGCAGATCT
TACACAGCCGAAGCTAGCCACGCGTCCTCTCCTTCTCCTCCAACGTTTCTTCACGGCGGT
GGAGCTCGCAGGGACGTTACCAAGGAGAGAAACGTGCAGTGGGTGTTCCTCGGCTGTCCC
GGTGTCGGAAAAGGCACTTACGCTAGCAGACTCTCGACTCTTCTCGGTGTTCCTCACATC
GCCACCGGAGATCTCGTCCGCGAGGAGCTTGCTTCTTCCGGTCCTCTCTCCCAACAGCTA
AAAGAGATTGTAAACCAGGGGAAACTGGTTTCGGATGAGATCATAGTGAACCTATTATCA
AAGAGACTTGAGGCTGGTGAAGCCAAAGGTGAATCAGGTTTCATTCTCGACGGCTTTCCT
CGGACCATGAGACAAGCTGAAATACTAGGAGATGTCACTGACATCGATCTGGTGGTGAAC
TTGAAGCTACCTGAGGAGGTTTTGGTTGACAAGCGTCTAGGCAGGAGAACATGCGATCAG
TGCGGTAAAGGTTTCAACATAGCTCACATCAACTTAAAAGGTGAGAATGGGAAACCAGGG
ATCAGTATGGATCCGCTTCTACCTCCACCTCAGTGCATGTCAAAGCTCATCACTCGTGCT
GATGATACCGAAGAGGTTGTTAAAGCTAGGCTTCGTATTTACAATGAAACCAGCCAGCCT
CTTGAAGAGTACTACCGTAGCAAGGGGAAGCTGATGGAGTTTGACTTACCTGGAGGCATC
CCTGAGTCATGGCCAAGGCTATTAGAAGCCTTGAGGCTTGATGATTACGAGGAGAAACAA
TCTGCCGCGGCATAGTTCTCACTTCACCTCCGGTATTTATTTATATAATTCTTTGCATGT
GGAAGACATGCCTAATCAGTTTTGTGTTTGGAAATAAAAGAAAACCTTAGATTGTTTTTT
TAATTGCCTCGGTTCAGAATAATCATCATCATACACACTTTTGCAAACTATAATGATGTA
TCATGATTGAGTTTGCTAGTTACAGGAATGTATAAACACTTTTTACACTGCTTTTGTTAC
ACATCAGGTTTTGATTATTTTATTGTTGAATGTGATCATGATTGTTTAT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BL86TF U 1
AF RS1AR83TFB U 2
AF RS1BL86JQ C 444
AF RS1AR83JQ C 472
BS 1 573 RS1BL86TF
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BS 787 808 RS1BL86TF
BS 809 809 RS1BL86JQ
BS 810 827 RS1BL86TF
BS 828 1189 RS1BL86JQ

RD RS1BL86TF 827 0 0
GGGAAGCTCAAGCCGCTTCTCTCCATCTCTCTCTACATTCCTCTCTCTCTTATCTCTGCA
ATGGCGAGAGTGTTGCGTGTGGCGAGATCCTCCTCCCTCTTTAGCTTCGGGAGCAGATCT
TACACAGCCGAAGCTAGCCACGCGTCCTCTCCTTCTCCTCCAACGTTTCTTCACGGCGGT
GGAGCTCGCAGGGACGTTACCAAGGAGAGAAACGTGCAGTGGGTGTTCCTCGGCTGTCCC
GGTGTCGGAAAAGGCACTTACGCTAGCAGACTCTCGACTCTTCTCGGTGTTCCTCACATC
GCCACCGGAGATCTCGTCCGCGAGGAGCTTGCTTCTTCCGGTCCTCTCTCCCAACAGCTA
AAAGAGATTGTAAACCAGGGGAAACTGGTTTCGGATGAGATCATAGTGAACCTATTATCA
AAGAGACTTGAGGCTGGTGAAGCCAAAGGTGAATCAGGTTTCATTCTCGACGGCTTTCCT
CGGACCATGAGACAAGCTGAAATACTAGGAGATGTCACTGACATCGATCTGGTGGTGAAC
TTGAAGCTACCTGAGGAGGTTTTGGTTGACAAGTGTCTAGGCAGGAGAACATGCGATCAG
TGCGGTAAAGGTTTCAACATAGCTCACATCAACTTAAAAGGTGAGAATGGGAAACCAGGG
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GATGATACCGAAGAGGTTGTTAAAGCTAGGCTTCGTATTTACAATGAAACCAGCCAGCCT
CTTGA*GAGTACTACCGTAGCAAGGGGA*GCTGATGGAGTTTGACTT

QA 1 827 1 827
DS 

RD RS1AR83TFB 799 0 0
GGAAGCTCAAGCCGCTTCTCTCCATCTCTCTCTACATTTCTCTCTCTCTTATCTCTGCAA
TGGCGAGAGTGTTGCGTGTGGCGAGATCCTCCTCCCTCTTTAGCTTCGGGAGCAGATCTT
ACACAGCCGAAGCTAGCCACGCGTCCTCTCCTTCTCCTCCAACGTTTCTTCACGGCGGTG
GAGCTCGCAGGGACGTTACCAAGGAGAGAAACGTGCAGTGGGTGTTCCTCGGCTGTCCCG
GTGTCGGAAAAGGCACTTACGCTAGCAGACTCTCGACTCTTCTCGGTGTTCCTCACATCG
CCACCGGAGATCTCGTCCGCGAGGAGCTTGCTTCTTCCGGTCCTCTCTCCCAACAGCTAA
AAGAGATTGTAAACCAGGGGAAACTGGTTTCGGATGAGATCATAGTGAACCTATTATCAA
AGAGACTTGAGGCTGGTGAAGCCAAAGGTGAATCAGGTTTCATTCTCGACGGCTTTCCTC
GGACCATGAGACAAGCTGAAATACTAGGAGATGTCACTGACATCGATCTGGTGGTGAACT
TGAAGCTACCTGAGGAGGTTTTGGTTGACAAGCGTCTAGGCAGGAGAACATGCGATCAGT
GCGGTAAAGGTTTCAACATAGCTCACATCAACTTAAAAGGTGAGAATGGGAAACCAGGGA
TCAGTATGGATCCGCTTCTACCTCCACCTCAGTGCATGTCAAAGCTCATCACTCGTGCTG
ATGATACCGAAGAGGTTGTTAAAGCTAGGCTTCGTATTTACAATGAAACCAGCCAGCCTC
TTGAAGAGTACTACCGTAG

QA 1 799 1 799
DS 

RD RS1BL86JQ 746 0 0
CAAAGGTGAATCAGGTTTCATTCTCGACGGCTTTCCTCGGACCATGAGACAAGCTGAAAT
ACTAGGAGATGTCACTGACATCGATCTGGTGGTGAACTTGAAGCTACCTGAGGAGGTTTT
GGTTGACAAGTGTCTAGGCAGGAGAACATGCGATCAGTGCGGTAAAGGTTTCAACATAGC
TCACATCAACTTAAAAGGTGAGAATGGGAAACCAGGGATCAGTATGGATCCGCTTCTACC
TCCACCTCAGTGCGTGTCAAAGCTCATCGCTCGTGCTGATGATACCGAAGAGGTTGTTAA
AGCTAGGCTTCGTATTTACAATGAAACCAGCCAGCCTCTTGAAGAGTACTACCGTAGCAA
GGGGAAGCTGATGGAGTTTGACTTACCTGGAGGCATCCCTGAGTCATGGCCAAGGCTATT
AGAAGCCTTGAGGCTTGATGATTACGAGGAGAAACAATCTGCCGCGGCATAGTTCTCACT
TCACCTCCGGTATTTATTTATATAATTCTTTGCATGTGGAAGACATGCCTAATCAGTTTT
GTGTTTGGAAATAAAAGAAAACCTTAGATTGTTTTTTTAATTGCCTCGGTTCAGAATAAT
CATCATCATACACACTTTTGCAAACTATAATGATGTATCATGATTGAGTTTGCTAGTTAC
AGGAATGTATAAACACTTTTTACACTGCTTTTGTTACACATCAGGTTTTGATTATTTTAT
TGTTGAATGTGATCATGATTGTTTAT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1AR83JQ 685 0 0
GGCTTTCCTCGGACCATGAGACAAGCTGAAATACTAGGAGATGTCACTGACATCGATCTG
GTGGTGAACTTGAAGCTACCTGAGGAGGTTTTGGTTGACAAGCGTCTAGGCAGGAGAACA
TGCGATCAGTGCGGTAAAGGTTTCAACATAGCTCACATCAACTTAAAAGGTGAGAATGGG
AAACCAGGGATCAGTATGGATCCGCTTCTACCTCCACCTCAGTGCATGTCAAAGCTCATC
ACTCGTGCTGATGATACCGAAGAGGTTGTTAAAGCTAGGCTTCGTATTTACAATGAAACC
AGCCAGCCTCTTGAAGAGTACTACCGTAGCAAGGGGAAGCTGATGGAGTTTGACTTACCT
GGAGGCATCCCTGAGTCATGGCCAAGGCTATTAGAAGCCTTGAGGCTTGATGATTACGAG
GAGAAACAATTTGCCGCGGCATAGTTCTCACTTCACCTCCGGTATTTATTTATATAATTC
TTTGCATGTGGAAGACATGCCTAATCAGTTTTGTGTTTGGAAATAAAAGAAAACCTTAGA
TTGTTTTTTTAATTGCCTCGGTTCAGAATAATCATCATCATACACACTTTTGCAAACTAT
AATGATGTATCATGATTGAGTTTGCTAGTTACAGGAATGTATAAACACTTTTTACACTGC
TTTTGTTACACATCAGGTTTTGATT

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 4

CO CL2118Contig1 967 4 6 U
GGACACAGAAACAGAAAGTAGAAAGTAAGAAAACTATTGAAAGAAATTAATGAGAAGAAT
GATTCCAACAACGTTTTCAAGTAAGTTTCAAGGAGCAGTGAGTATGAATGCGTTGAGATG
TTACGTTTCTGAGTTTATCTCAACCTTCTTCTTCGTCCTTGCAGCCGTTGGATCCGTCAT
GGCTTCAAGGAAACTGACTGCGGGTGATGTTACGGGTCCGTTTAGTGTATTAATACCGGC
GATTGCAAATGCGTTTGCATTATCATCTTCAGTTTACATCTCTTGGAACGTCTCTGGTGG
CCATGTGAATCCAGCGGTTACGTTTGGAATGGCGGTTGCTGGTCGGATTAGCGTTCCAAC
CGCTATATTCTACTGGACATCACAGATGATTGCCTCTGTTATGGCTTGCCTTGTCCTTAA
AGTAACCGTTGTTGAACAGCACGTACCGATCTATAAGATTGCTGGAGAAATGACGGGATT
TGGAGCATCGGTTCTCGAGGGTGTTCTATCGTTCGTCCTTGTCTACACCGTGTTCACGGC
TAACGACCCTAGACGTGGCTTACCTTTAGCCGTGGGACCTATATTCATAGGTTTTGTTGC
GGGCGCCAATGTTTTAGCCGCTGGTCCGTTCTCTGGTGGAGCCATGAATCCTGCATGTGC
CTTTGGGTCGGCTATGATTTACGGAAGCTTCAAGAACCAAGCCGTCTACTGGGTCGGGCC
TTTGCTCGGAGGAGCCACCGCTGCGCTAGTGTATGAAAACATGGTTGTGGTTCCTGCAGC
TGAAGATGACCGTGGTTCATCTACTGGAGATGCCACTGTAGTGTGATTACTTGTGCGTCT
AATGTTTTATATATTTCTACGTTGAAGTAGAGCGTTATTTAGTTTTTTTTTTCTTTTTCA
GTTTATGAAATGTTGTCGACTTTGATGTTTAATTTCTTGAATATTAATTTAGTAAATTTT
CATTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G591TF U 1
AF RS1D314TF U 5
AF RS1G591JQ C 155
AF RS1D314JQ C 280
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GGCTTCAAGGAAACTGACTGCGGGTGATGTTACGGGTCCGTTTAGTGTATTAATACCGGC
GATTGCAAATGCGTTTGCATTATCATCTTCAGTTTACATCTCTTGGAACGTCTCTGGTGG
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TGGAGCATCGGTTCTCGAGGGTGTTCTATCGTTCGTCCTTGTCTACACCGTGTTCACGGC
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GG
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AACAACGTTTTCAGGTAAGTTTCAAGGAGCAGTGAGTATGAATGCGTTGAGGTGTTACGT
TTCTGAGTTTATCTCAACCTTCTTCTTCGTCCTTGCAGCCGTTGGATCCGTCATGGCTTC
AAGGAAACTGACTGCGGGTGATGTTACGGGTCCGTTTAGTGTATTAATACCGGCGATTGC
AAATGCGTTTGCATTATCATCTTCAGTTTACATCTCTTGGAACGTCTCTGGTGGCCATGT
GAATCCAGCGGTTACGTTTGGAATGGCGGTTGCTGGTCGGATTAGCGTTCCAACCGCTAT
ATTCTACTGGACATCACAGATGATTGCCTCTGTTATGGCTTGCCTTGTCCTTAAAGTAAC
CGTTGTTGAACAGCACGTACCGATCTATAAGATTGCTGGAGAAATGACGGGATTTGGAGC
ATCGGTTCTCGAGGGTGTTCTATCGTTCGTCCTTGTCTACACCGTGTTCACGGCTAACGA
CCCTAGACGTGGTTTACCTTTAGCCGTGGGACCTATATTCATAGGTTTTGTTGCGGGCGC
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GTCGGCTATGATT

QA 3 675 3 675
DS 

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CGTCC
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AGCCGTCTACTGGGTCGGGCCTTTGCTCGGAGGAGCCACCGCTGCGCTAGTGTATGAAAA
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QA 6 778 6 778
DS 

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TGGTCGGATTAGCGTTCCAACCGCTATATTCTACTGGACATCACAGATGATTGCCTCTGT
TATGGCTTGCCTTGTCCTTAAAGTAACCGTTGTTGAACAGCACGTACCGATCTATAAGAT
TGCTGGAGAAATGACGGGATTTGGAGCATCGGTTCTCGAGGGTGTTCTATCGTTCGTCCT
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TATATTCATAGGTTTTGTTGCGGGCGCCAATGTTTTAGCCGCTGGTCCGTTCTCTGGTGG
AGCCATGAATCCTGCATGTGCCTTTGGGTCGGCTATGATTTACGGAAGCTTCAAGAACCA
AGCCGTCTACTGGGTCGGGCCTTTGCTCGGAGGAGCCACCGCTGCGCTAGTGTATGAAAA
CATGGTTGTGGTTCCTGCAGCTGAAGATGACCGTGGTTCATCTACTGGAGATGCCACTGT
AGTGTGATTACTTGTGCGTCTAATGTTTTATATATTTCTACGTTGAAGTAGAGCGTTATT
TAGTTTTTTTTTTCTTTTTCAGTTTATGAAATGTTGTCGACTTTGATGTTTAATTTCTTG
AATATTAATTTAGTAAATTTTCATTACG

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 4

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TCATGGTACTGTTAAGATCACAGGACAATAAGAATATTGTCACACACACATTGATCTGTG
AATGATCTATTTTCCCTCCGTAGCCCACCATTGATGTATCAATCCTTCTGTTTCGACTGC
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CAGAAGCCTCAGGAGTGTCTTCCTCGCTCGGTGGAACCAGTTGCCAGAAGAAAGGTAGAT
ACTTTTCCCATTCCTTCAAGATCGTCTCTCCTTTGCTGCTTCCGGTTTTTTCCACATGGG
CTTCGATTAAGCTCTTGAGCTGCAATTCCCCTGCAGGTGCAGTTACTCTCTGGATCTTCA
CTATCTCTCGGTTAATCTTGGGAAGAAGAGTGTCGTCTTCATCAAGAAGATAAGCTAACC
CTCCTGTCATACCTGCAGCGACGTTTCTCCCCACTTTTCCAAGCACAACGACACAACCAC
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CGTACAAGCAAGTGTTCCCAACTATGGTTGCTTCCTCTGGCACAAACCCTATTTTATCCA
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CAATGAGTTTGATATTCATACCGGGAATCAAGAAGCATCCGAAGGACTGTCCTGCACTTC
CAAGGAAGGTTAGGTTCACTTGTCCGGCAAAACCAGTGTCTCCATACTTCTTTGCGATGA
CCCCAGCAACGCGTCCACATGCTGCACGGTCTATGTTGCATATCTTGACGGTCTTTTCAA
CAACTTTTTCGTTCTCTATCGCATCTATCACCC


BQ
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25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 0 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AS94TF C 68
AF RS1DD72JQ U 12
AF RS1EY55JQ U 1
AF RS1DD72TF C 239
BS 1 181 RS1EY55JQ
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CATACCTGCAGCGACGTTTCTCCCCACTTTTCC

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TATGCCGATTGAAATGTGACTTCACCGGTGGCTGTTCTTACATAAGCAGCAGAAGCCTCA
GGAGTGTCTTCCTCGCTCGGTGGAACCAGTTGCCAGAAGAAAGGTAGATACTTTTCCCAT
TCCTTCAAGATCGTCTCTCCTTTGCTGCTTCCGGTTTTTTCCACATGGGCTTCGATTAAG
CTCTTGAGCTGCAATTCCCCTGCAGGTGCAGTTACTCTCTGGATCTTCACTATCTCTCGG
TTAATCTTGGGAAGAAGAGTGTCGTCTTCATCAAGAAGATAAGCTAACCCTCCTGTCATA
CCTGCAGCGACGTTTCTCCCCACTTTTCCAAGCACAACGACACAACCACCAGTCATGTAC
TCACAGCAATGATCACCAGTGCCTTCAACTACTGCTTCAGCGAGTGAGTTTCTAACCGCA
AACCTCTCCCCAGCTTTGCCTCTAGCGAATATCTGA

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DS 

RD RS1EY55JQ 738 0 0
GGAATCTTCATGGCAGTTGAATGCAGTTATTTAACTGAATAACTGTACATCTTATAGCAA
TCATGGTACTGTTAAGATCACAGGACAATAAGAATATTGTCACACACACATTGATCTGTG
AATGATCTATTTTCCCTCCGTAGCCCACCATTGATGTATCAATCCTTCTGTTTCGACTGC
AGCATCTCCTCTATGCCGATTGAAATGTGACTTCACCGGTGGCTGTTCTTACATAAGCAG
CAAAAGCCTCAGGAGTGTCTTCCTCGCTCGGTGGAACCAGTTGCCAGAAAAAAGGTAAAT
ACTTTTCCCATTCCTTCAAGATCGTCTCTCCTTTGCTGCTTCCGGTTTTTTCCACATGGG
CTTCGATTAAGCTCTTGAGCTGCAATTCCCCTGCAGGTGCAGTTACTCTCTGGATCTTCA
CTATCTCTCGGTTAATCTTGGGAAGAAGAGTGTCGTCTTCATCAAGAAGATAAGCTAACC
CTCCTGTCATACCTGCAGCGACGTTTCTCCCCACTTTTCCAAGCACAACGACACAACCAC
CAGTCATGTACTCACAGCAATGATCAACAGTGCCTTCAACTACTGCTTCAGCGAGTGAGT
TTCTAACCGCAAACCTCTCCCCAGCTTTGCCTCTAGCGAATATCTGACCACCCGTTGCAC
CGTACAAGCAAGTGTTCCCAACTATGGTTGCTTCCTCTGGCACAAACCCTATTTTATCCA
CAGGAGTTACTACTATCT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1DD72TF 755 0 0
CAGCAGAAG
CTCAGGAGTGTCTTCCTCGCTCGGTGGAACCAGT*GCCAGAAGAGAGGTAGATACTTTTC
CCATTC*TTCAAGATCGTCTCTC*TTTGCTGCTTCCGGTTTTT*CCACATGGGCTTCGAT
TAAGCTCTTGAGCTGCAATTCCCCTGCAGGTGCAGTTACTCTCTGGATCTTCACTATCTC
TCGGTTAATCTTGGGAAGAAGAGTGTCGTCTTCATCAAGAAGATAAGCTAACCCTCCTGT
CATACCTGCAGCGACGTTTCTCCCCACTTTTCCAAGCACAACGACACAACCACCAGTCAT
GTACTCACAGCAATGATCACCAGTGCCTTCAACTACTGCTTCAGCGAGTGAGTTTCTAAC
CGCAAACCTCTCCCCAGCTTTGCCTCTAGCGAATATCTGACCACCCGTTGCACCGTACAA
GCAAGTGTTCCCAACTATGGTTGCTTCCTCTGGCACAAACCCTATTTTATCCACAGGAGT
TACTACTATCTCACCACCAGCCATTCCCTTCCCTACGTAATCATTGGACTCTCCAATGAG
TTTGATATTCATACCGGGAATCAAGAAGCATCCGAAGGACTGTCCTGCACTTCCAAGGAA
GGTTAGGTTCACTTGTCCGGCAAAACCAGTGTCTCCATACTTCTTTGCGATGACCCCAGC
AACGCGTCCACATGCTGCACGGTCTATGTTGCATATCTTGACGGTCTTTTCAACAACTTT
TTCGTTCTCTATCGCATCTATCACCC

QA 10 755 10 755
DS 



AS 2 4

CO CL2120Contig1 656 2 1 U
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GTTTCAACGTATTCGCCACTATCTGCTCTAATCAATCCTTTCTTGAACTCATTCAATGGA
TTCCTTTCACCTTCCTCTCCATTTGTGATTAACTATGAATTGGAGAGGAGAGATTGAGAC
GGTAGATGTGGAGCGTACACGAGGTGTATACAGAGAATGCCAAAAATATGGTTGCTTGCT
CCTCAGTTTGAAATCTGGCAATTGAATCTTGCCATTGCTTGGCAGAGATTGGGAAACACT
GTTGGGAAAGCTCCAAAAGAAGTAAAATGTCACTTTTGAATCGATTGGATCATTCAAACT
TTATATTTTTGTGTGAAAGGCGTACATAGATTTTGAGATAGCAGAAGGAAAATTAGAGAG
GACACGAGGATTATATGAGTGACTCTTGGACGACCCAAAGCATTACAAGGTGTGGGTTAG
TTTTGCAAAGTTTGAAGCTTCTGCTGCGGAACAAGAAGAGGACAAGGAAGAGGAAGACCA
TAAGAAATAAATGCTATTGAACTCAATAAAAAGTGCATCAGACATGCCAGAGGAAACTTT
AAAAACTACATGTTATATGAATTTTGATTATAACGTTAAGACATGTTTTAACTGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AU25JQ C 1
AF RS1AU25TF U 1
BS 1 656 RS1AU25TF

RD RS1AU25JQ 656 0 0
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GGTAGATGTGGAGCGTACACGAGGTGTATACAGAGAATGCCAAAAATATGGTTGCTTGCT
CCTCAGTTTGAAATCTGGCAATTGAATCTTGCCATTGCTTGGCAGAGATTGGGAAACACT
GTTGGGAAAGCTCCAAAAGAAGTAAAATGTCACTTTTGAATCGATTGGATCATTCAAACT
TTATATTTTTGTGTGAAAGGCGTACATAGATTTTGAGATAGCAGAAGGAAAATTAGAGAG
GACACGAGGATTATATGAGTGACTCTTGGACGACCCAAAGCATTACAAGGTGTGGGTTAG
TTTTGCAAAGTTTGAAGCTTCTGCTGCGGAACAAGAAGAGGACAAGGAAGAGGAAGACCA
TAAGAAATAAATGCTATTGAACTCAATAAAAAGTGCATCAGACATGCCAGAGGAAACTTT
AAAAACTACATGTTATATGAATTTTGATTATAACGTTAAGACATGTTTTAACTGTT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RS1AU25TF 656 0 0
GGAATTTGATCTTCTCCATCCTTTCCACTTCCACATCTTCCATTACTCCTCTCCAAATCC
GTTTCAACGTATTCGCCACTATCTGCTCTAATCAATCCTTTCTTGAACTCATTCAATGGA
TTCCTTTCACCTTCCTCTCCATTTGTGATTAACTATGAATTGGAGAGGAGAGATTGAGAC
GGTAGATGTGGAGCGTACACGAGGTGTATACAGAGAATGCCAAAAATATGGTTGCTTGCT
CCTCAGTTTGAAATCTGGCAATTGAATCTTGCCATTGCTTGGCAGAGATTGGGAAACACT
GTTGGGAAAGCTCCAAAAGAAGTAAAATGTCACTTTTGAATCGATTGGATCATTCAAACT
TTATATTTTTGTGTGAAAGGCGTACATAGATTTTGAGATAGCAGAAGGAAAATTAGAGAG
GACACGAGGATTATATGAGTGACTCTTGGACGACCCAAAGCATTACAAGGTGTGGGTTAG
TTTTGCAAAGTTTGAAGCTTCTGCTGCGGAACAAGAAGAGGACAAGGAAGAGGAAGACCA
TAAGAAATAAATGCTATTGAACTCAATAAAAAGTGCATCAGACATGCCAGAGGAAACTTT
AAAAACTACATGTTATATGAATTTTGATTATAACGTTAAGACATGTTTTAACTGTT

QA 1 656 1 656
DS 



CO CL2120Contig2 1131 2 4 U
GGGTCGACAGAACTGTGGTAAACCTAATTTGATCTTCTCTATCCTTTCCACTTCCACATC
TTCCATTACTCCTCTCCAAATCCGTTTCAACGATTAACTATGAATTGGAGAGGAGAGATT
GAGACGGAAGATGTGGAGCGTACACGAGGTGTATACAGAGAATGCCAAAAATATGGTTGC
TTGCTCCTCAGTTTGAAATCCGGCAATTGAATCTTGCCGTTGCTTGGCAGAGATTGGGAA
ACCCTGTTGGGAAAGATCCAAAAGATAAGATATTCAAGAAAAATACATTGTGATTGAGCT
CCAGCTGGGAAAAATAGATAGATGTAGAAAGCTTTATGAGCGTTATCTTCATTGATCTCC
AGAGAATTGCTACTTTGAGCTTGCAATATCTCAGCCAGCACTTGACATGCCTGAACTGCT
ATAGGCGTACATAGATTTTGAGATAGCAGAAGGAAAATTAGAGAGGACACGAGGATTATA
TGAGCGACTCTTGGACAACCCAAAGCATTACAAGGTGTGGGTTAGTTTTGCAAAGTTTGC
TGCTTCTGCTGCGGAACAAGAAGAAGACAAGGAAGAGGAAGACCAGAAGAAATAGATGCT
ATTGAACTCAAGAAAAAGTGCATCAGACATGCCAGAGGAAACTTTAAAAACTACATGTTA
TATGAATTTTGATTATAACGTTAAGACATGTTTTAACTGTTTTCTCTCTCCATTTTCTTT
CTTCTGCTCAGCTATTTTTTTTTTTTTTGTAAAATGCTCAGCTATTTTCGAGAGAGCCAA
CGGCTACTACAAAGAATGCACCAGAGTTGAAAGAAGCACGAGCTACACTATTGAAAGATT
GGAGACAAACTTTGGTAATCTCGGGGATGTGAGTGTGGTACAATCCAAAGTTCTCTGTAC
ATCGTCACTTATCCTTTGTGATTTTGCTGTTATCTTTTTGATTGTGTTAGCAAAAAAAAA
CTCAGTTTGTTATTGTTTTTGTTCTTTTTGGCATTAGACCTTTAGGTTTGTGTTTTCCGG
TTTAGAAAATATGGTACAATCGGGAATCTAAATTCCGGTTATTATTTCTGTATTTTTGGG
GGGTTGTGAGTGGTGAAACTTAAAACGGAAATGTCTAATTAAGCAAACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FP53TF U 1
AF RS1FP53JQ C 421
BS 1 753 RS1FP53TF
BS 754 754 RS1FP53JQ
BS 755 775 RS1FP53TF
BS 776 1131 RS1FP53JQ

RD RS1FP53TF 775 0 0
GGGTCGACAGAACTGTGGTAAACCTAATTTGATCTTCTCTATCCTTTCCACTTCCACATC
TTCCATTACTCCTCTCCAAATCCGTTTCAACGATTAACTATGAATTGGAGAGGAGAGATT
GAGACGGAAGATGTGGAGCGTACACGAGGTGTATACAGAGAATGCCAAAAATATGGTTGC
TTGCTCCTCAGTTTGAAATCCGGCAATTGAATCTTGCCGTTGCTTGGCAGAGATTGGGAA
ACCCTGTTGGGAAAGATCCAAAAGATAAGATATTCAAGAAAAATACATTGTGATTGAGCT
CCAGCTGGGAAAAATAGATAGATGTAGAAAGCTTTATGAGCGTTATCTTCATTGATCTCC
AGAGAATTGCTACTTTGAGCTTGCAATATCTCAGCCAGCACTTGACATGCCTGAACTGCT
ATAGGCGTACATAGATTTTGAGATAGCAGAAGGAAAATTAGAGAGGACACGAGGATTATA
TGAGCGACTCTTGGACAACCCAAAGCATTACAAGGTGTGGGTTAGTTTTGCAAAGTTTGC
TGCTTCTGCTGCGGAACAAGAAGAAGACAAGGAAGAGGAAGACCAGAAGAAATAGATGCT
ATTGAACTCAAGAAAAAGTGCATCAGACATGCCAGAGGAAACTTTAAAAACTACATGTTA
TATGAATTTTGATTATAACGTTAAGACATGTTTTAACTGTTTTCTCTCTCCATTTTCTTT
CTTCTGCTCAGCTATTTTTTTTTTTTTTGTAAA*TGCTCAGCTATTTTCGAGAGA

QA 1 775 1 775
DS 

RD RS1FP53JQ 711 0 0
AT
AGGCGTACATAGATTTTGAGATAGCAGAAGGAAAATTAGAGAGGACACGAGGATTATATG
AGCGACTCTTGGACAACCCAAAGCATTACAAGGTGTGGGTTAGTTTTGCAAAGTTTGCTG
CTTCTGCTGCGGAACAAGAAGAAGACAAGGAAGAGGAAGACCAGAAGAAATAGATGCTAT
TGAACTCAAGAAAAAGTGCATCAGACATGCCAGAGGAAACTTTAAAAACTACATGTTATA
TGAATTTTGATTATAACGTTAAGACATGTTTTAACTGTTTTCTCTCTCCATTTTCTTTTT
TCTGCTCAGCTATTTTTTTTTTTTTTGTAAAATGTTCAGCTATTTTCGAGAGAGCCAACG
GCTACTACAAAGAATGCACCAGAGTTGAAAGAAGCACGAGCTACACTATTGAAAGATTGG
AGACAAACTTTGGTAATCTCGGGGATGTGAGTGTGGTACAATCCAAAGTTCTCTGTACAT
CGTCACTTATCCTTTGTGATTTTGCTGTTATCTTTTTGATTGTGTTAGCAAAAAAAAACT
CAGTTTGTTATTGTTTTTGTTCTTTTTGGCATTAGACCTTTAGGTTTGTGTTTTCCGGTT
TAGAAAATATGGTACAATCGGGAATCTAAATTCCGGTTATTATTTCTGTATTTTTGGGGG
GTTGTGAGTGGTGAAACTTAAAACGGAAATGTCTAATTAAGCAAACTCC

QA 3 711 3 711
DS 



AS 1 4

CO CL2121Contig1 873 4 4 U
GGAAACCGGATCTCGAAGAATGGCCGACGAAGTGATTCTTCTTGATTACTGGCCAAGCAT
GTTCGGGATGAGCACGACGAAGATAGCTTTGGCTGAGAAAGGAGTGGCGTATGAGTACAA
GGAGACAGAGCCTTGGGTGCAGACATCTTTGCCTATCGAGATGAATCCAATTCACAAGAA
GATTCCGGTTCTCATCCACAATGGTAAACCGATCTATGAATCTCGTATCCAGCTCGAGTA
CATCGACGAGGTTTGGTCCGATACGTACCCTCTGCTGCCTTCCGATCCTTACCAGAAAGC
TCGAGCTAGATTCTGGGGTGATTTCATCGACAAAAAGTTTTACGACCCAGCATGGAAAGT
ATGGGGAACAGCGGGAGAAGAACAGGTTACAGCCAAGAAAGAATTGCTTGAACATTTCAA
GACACTTGAAACAGAGCTTGGAGACAAAATTTATTATGGTGGTGATGTGTTTGGATTCGT
AGACATTGCACTGATGGGATTTTACGGCTGGTTCAAAGCCATTGAGAAGTTTGGTGAGTT
CAGTATAGAAGCAGAGTTCCCAAAATTGTCTCGGTGGACCATGAGGTGTTTAGAGAGAGA
GAGCGTGGTTAATTCAATAGCTGATTCTGACAAGATTATCGAGTATGCTTCTGTTCTTAG
GAAGAAACTTGGAGCTGGGTAGATCTTTGTCATGTTGTCGCAATGAATCTGAACACATCA
GGAAAAATATGGATCGGTTTCAAGAAGACGCTGGTATGTTATGTTTTGTTTTTTTTTGTG
AAATTTGTATTTTTTAGTTTTTTATACTTTTTAATTTCCAAAAGCATGAAAATTTATAAG
CAAAACAAAAAATAAAGCATGATAATCCATGAT


BQ
10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 10 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 10 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 5 25 25 25 25 0 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AE08TF U 3
AF RS1FB38TF U 14
AF RS1A703TF U 1
AF RS1A703JQ C 310
BS 1 659 RS1A703TF
BS 660 660 RS1A703JQ
BS 661 718 RS1A703TF
BS 719 873 RS1A703JQ

RD RS1AE08TF 654 0 0
AAACTGGATCTCGAAGAATGGCCGACGAAGTGATTCTTCTTGATTATTGGCCAAGCATGT
TCGGGATGAGCACGACGAAGATAGCTTTGGCTGAGAAAGGAGTGGCGTATGAGTACAAGG
AGACAGAGCCTTGGGTGCAGACATCTTTGCCTATCGAGATGAATCCTATTCACAAGAAGA
TTCCGGCTCTTATCCACAATGGTAAACCGATCTATGAATCTCGTATCCAGCTCGAGTACA
TCGACGAGGTTTGGTCCGATACATACCCTATGCTCCCTTCCGAACCTCACCAGAAAGCTC
AAGCTAGATTCTGGGGTGATTTCATCGACAAAAAGTTTTACGACCCAGCATGGAAAGTAT
GGGGAACAGCGGGAGAAGAACAGGTTACAGCCAAGAAAGAGTTGCTTGAACACTTCAAGA
CACTTGAAACAGAGCTTGGAGACAAAACTTACTATGGTGGTGATGTGTTCGGATTCGTAG
ACATTGCACTAATAGGATTTTACGGCTGGTTCAAAGCCATTGAGAAGTTTGGTGAGTTCA
GTATAGAAGCAGAGTTCCCAAAATTGTCTCGGTGGACCATGAGGTGTTTAGAGAGAGAGA
CAGTGGTTAATTCAATAGCTGATTCTGACAAGATTATCGAGTATGCTTCTGTT
C

QA 1 653 1 653
DS 

RD RS1FB38TF 634 0 0
CGAAGAATGGCCGACGAAGTGATTCTTCTTGATTACTGGCCAAGCATGTTCGGGATGAGC
ACGACGAAGATAGCTTTGGCTGAGAAAGGAGTGGCGTATGAGTACAAGGAGACAGAGCCT
TGGGTGCAGACATCTTTGCCTATCGAGATGAATCCAATTCACAAGAAGATTCCGGTTCTC
ATCCACAATGGTAAACCGATCTATGAATCTCGTATCCAGCTCGAGTACATCGACGAGGTT
TGGTCCGATACGTACCCTCTGCTGCCTTCCGATCCTTACCAGAAAGCTCGAGCTAGATTC
TGGGGTGATTTCATCGACAAAAAGTTTTACGACCCAGCATGGAAAGTATGGGGAACAGCG
GGAGAAGAACAGGTTACAGCCAAGAAAGAATTGCTTGAACATTTCAAGACACTTGAAACA
GAGCTTGGAGACAAAACTTATTATGGTGGTGATGTGTTTGGATTCGTAGACATTGCACTG
ATGGGATTTTACGGCTGGTTCAAAGCCATTGAGAAGTTTGGTGAGTTCAGTATAGAAGCA
GAGTTCCCAAAATTGTCTCGGTGGACCATGAGGTGTTTAGAGAGAGAGCGCGTGGTTAAT
TCAATAGCTGAT*CTGACA*GATTATCGAGTATG

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1A703TF 718 0 0
GGAAACCGGATCTCGAAGAATGGCCGACGAAGTGATTCTTCTTGATTACTGGCCAAGCAT
GTTCGGGATGAGCACGACGAAGATAGCTTTGGCTGAGAAAGGAGTGGCGTATGAGTACAA
GGAGACAGAGCCTTGGGTGCAGACATCTTTGCCTATCGAGATGAATCCAATTCACAAGAA
GATTCCGGTTCTCATCCACAATGGTAAACCGATCTATGAATCTCGTATCCAGCTCGAGTA
CATCGACGAGGTTTGGTCCGATACGTACCCTCTGCTGCCTTCCGATCCTTACCAGAAAGC
TCGAGCTAGATTCTGGGGTGATTTCATCGACAAAAAGTTTTACGACCCAGCATGGAAAGT
ATGGGGAACAGCGGGAGAAGAACAGGTTACAGCCAAGAAAGAATTGCTTGAACATTTCAA
GACACTTGAAACAGAGCTTGGAGACAAAATTTATTATGGTGGTGATGTGTTTGGATTCGT
AGACATTGCACTGATGGGATTTTACGGCTGGTTCAAAGCCATTGAGAAGTTTGGTGAGTT
CAGTATAGAAGCAGAGTTCCCAAAATTGTCTCGGTGGACCATGAGGTGTTTAGAGAGAGA
GAGCGTGGTTAATTCAATAGCTGATTCTGACAAGATTATCGAGTATGCTTCTGTTCTTAT
GAAGAAACTTGGAGCTGGGTAGATCTTTGTCATGTTGTCGCAATGAATCTGAACACAT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1A703JQ 564 0 0
ATTCTGGGGTGATTTCATCGACAAAAAGTTTTACGACCCAGCATGGAAAGTATGGGGAAC
AGCGGGAGAAGAACAGGTTACAGCCAAGAAAGAATTGCTTGAACATTTCAAGACACTTGA
AACAGAGCTTGGAGACAAAATTTATTATGGTGGTGATGTGTTTGGATTTGTAGACATTGC
ACTGATGGGATTTTACGGCTGGTTCAAAGCCATTGAGAAGTTTGGTGAGTTCAGTATAGA
AGCAGAGTTCCCAAAATTGTCTCGGTGGACCATGAGGTGTTTAGAGAGAGAGAGCGTGGT
TAATTCAATAGCTGATTTTGACAAGATTATCGAGTATGCTTTTGTTTTTAGGAAGAAACT
TGGAGCTGGGTAGATTTTTGTCATGTTGTCGCAATGAATTTGAACACATCAGGAAAAATA
TGGATCGGTTTCAAGAAGACGCTGGTATGTTATGTTTTGTTTTTTTTTGTGAAATTTGTA
TTTTTTAGTTTTTTATACTTTTTAATTTCCAAAAGCATGAAAATTTATAAGCAAAACAAA
AAATAAAGCATGATAATCCATGAT

QA 1 564 1 564
DS 



AS 1 4

CO CL2122Contig1 729 4 9 U
TTAGGTTCAAGCACTCTCTACTAGCGGTTACTTTGATTTACTTCGAGTTGACACAATCAA
AATTCAGAGCAAAAAGAAAACTAATGAGGGATTTCATTCTGATGAAAGTAGAGTTTTTAT
GAGCGAAGAATCTTAGATACAACAAAATGATGACAATAAACATATGGGGGGGGGGGGAGC
TTTTATCAGTTTTTGGAAGAAGACTGGAAGATGAAAACCGCAGTCAGAACACCAACCAAT
GCTGTAACAGCCAAAGCAACGGTAGGCAATGGACTTGCTACCCCAAAGTTCTCAAGAAGT
CCTTTACCGGTAGCGATCTCAACAGAAATGGCGACAGCAAAACCAATCATAGCGCCACGA
CCAAGCCATATGTACAAACCGCTGCCTCCTTCTGAACTTTGCTCGCTTCTGATGGAAACT
GAAGCTCCTCCTCTGCTTCCACTTCTTACTCTTCCACGAGTCACTCTCAAGTTCAATGGC
AATAGAGGAGAACCAGAAGCGAAGGTGGATCGGCTTCCAGCAAGCTGCGGTACATGAACC
CTACAAGGGTTTGTGATTCTTCCTAGCTTTATGGCTCCAGGATTGGAAAGAGAAAAGGCG
AGAGACGCAGATACTTGAGATAAGGCCATGATATTCCTTCTATTGCAGAGATCTTTCGCT
GTTAATATCCAATTCGCGCCACCTTCTTACTGCTTCGTCCTCCTTATCAATTAGTCGCAG
AAATATCCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EF36JQ U 101
AF RS1F768TF C 1
AF RS1F768JQ U 3
AF RS1EF36TF C 101
BS 1 2 RS1F768TF
BS 3 174 RS1F768JQ
BS 175 176 RS1EF36JQ
BS 177 322 RS1F768JQ
BS 323 323 RS1EF36JQ
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BS 335 677 RS1F768JQ
BS 678 729 RS1EF36TF

RD RS1EF36JQ 546 0 0
GATGAAAGTAGAGTTTTTATGAGCGAAGAATCTTAGATACAACAAAATGATGACAATAAA
CATATGGGGGGGGGGGGAGCTTTTATCAGTTTTTGGAAGAAGACTGGAAGATGAAAACCG
CAGTCAGAACACCAACCAATGCTGTAACAGCCAAAGCAACGGTAGGCAATGGACTTGCTA
CCCCAAAGTTCTCAAGAAGTCCTTTACCGGTAGCGATCTCAACAGAAATGGCGACAGCAA
AACCAATCATAGCGCCACGACCAAGCCATATGTCCAAACCGCTGCCTCCTTCTGAACTTT
GCTCGCTTCTGATGGAAACTGAAGCTCCTCCTCTGCTTCCACTTCTTACTCTTCCACGAG
TCACTCTCAAGTTCAATGGCAATAGAGGAGAACCAGAAGCGAAGGTGGATCGGCTTCCAG
CAAGCTGCGGTACATGAACCCTACAAGGGTTTGTGATTCTTCCTAGCTTTATGGCTCCAG
GATTGGAAAGAGAAAAGGCGAGAGACGCAGATACTTGAGATAAGGCCATGATATTCCTTC
TATTGC

QA 1 546 1 546
DS 

RD RS1F768TF 664 0 0
TTAGGTTCAAGCACTCTCTACTAGCGGTTACTTTGATTTACTTCGAGTTGACACAATCAA
AATTCAGAGCAAAAAGAAAACTAATGAGGGATTTCATTCTGATGAAAGTAGAGTTTTTAT
GAGCGAAGAATCTTAGATACAACAAAATGATGACAATAAACATATGGGGGGGGG**GAGC
TTTTATCAGTTTTTGGAAGAAGACTGGAAGATGAAAACCGCAGTCAGAACACCAACCAAT
GCTGTAACAGCCAAAGCAACGGTAGGCAATGGACTTGCTACCCCAAAGTTCTCAAGAAGT
CCTTTACCGGTAGCGATCTCAATAGAAATGGCGGCAGCAAAACCAATCATAGCGCCACGA
CCAAGCCATATGTACAAACCGCTGCCTCCTTCTGAACTTTGCTCGCTTCTGATGGAAACT
GAAGCTCCTCCTCTGCTTCCACTTCTTACTCTTCCACGAGTCACTCTCAAGTTCAATGGC
AATAGAGGAGAACCAGAAGCGAAGGTGGATCGGCTTCCAGCAAGCTGCGGTACATGAACC
CTACAAGGGTTTGTGATTCTTCCTAGCTTTATGGCTCCAGGATTGGAAAGAGAAAAGGCG
AGAGACGCAGATACTTGAGATAAGGCCATGATATTCCTTCTATTGCAGAGATCTTTCGCT
GTTA

QA 1 664 1 664
DS 

RD RS1F768JQ 677 0 0
AGGTTCAAGCACTCTCTACTAGCGGTTACTTTGATTTACTTCGAGTTGACACAATCAAAA
TTCAGAGCAAAAAGAAAACTAATGAGGGATTTCATTCTGATGAAAGTAGAGTTTTTATGA
GCGAAGAATCTTAGATACAACAAAATGATGACAATAAACATATGGGGGGGGG**GAGCTT
TTATCAGTTTTTGGAAGAAGACTGGAAGATGAAAACCGCAGTCAGAACACCAACCAATGC
TGTAACAGCCAAAGCAACGGTAGGCAATGGACTTGCTACCCCAAAGTTCTCAAGAAGTCC
TTTACCGGTAGCGATCTCAATAGAAATGGCGGCAGCAAAACCAATCATAGCGCCACGACC
AAGCCATATGTACAAACCGCTGCCTCCTTCTGAACTTTGCTCGCTTCTGATGGAAACTGA
AGCTCCTCCTCTGCTTCCACTTCTTACTCTTCCACGAGTCACTCTCAAGTTCAATGGCAA
TAGAGGAGAACCAGAAGCGAAGGTGGATCGGCTTCCAGCAAGCTGCGGTACATGAACCCT
ACAAGGGTTTGTGATTCTTCCTAGCTTTATGGCTCCAGGATTGGAAAGAGAAAAGGCGAG
AGACGCAGATACTTGAGATAAGGCCATGATATTCCTTCTATTGCAGAGATCTTTCGCTGT
TAATATCCAATTCGC
CC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1EF36TF 629 0 0
GATGAAAGTAGAGTTTTTATGAGCGAAGAATCTTAGATACAACAAAATGATGACAATAAA
CATATGGGGGGGGGGGGAGCTTTTATCAGTTTTTGGAAGAAGACTGGAAGATGAAAACCG
CAGTCAGAACACCAACCAATGCTGTAACAGCCAAAGCAACGGTAGGCAATGGACTTGCTA
CCCCAAAGTTCTCAAGAAGTCCTTTACCGGTAGCGATCTCAACAGAAATGGCGACAGCAA
AACCAATCATAGCGCCACGACCAAGCCATATGTCCAAACCGCTGCCTCCTTCTGAACTTT
GCTCGCTTCTGATGGAAACTGAAGCTCCTCCTCTGCTTCCACTTCTTACTCTTCCACGAG
TCACTCTCAAGTTCAATGGCAATAGAGGAGAACCAGAAGCGAAGGTGGATCGGCTTCCAG
CAAGCTGCGGTACATGAACCCTACAAGGGTTTGTGATTCTTCCTAGCTTTATGGCTCCAG
GATTGGAAAGAGAAAAGGCGAGAGACGCAGATACTTGAGATAAGGCCATGATATTCCTTC
TATTGCAGAGATCTTTCGCTGTTAATATCCAATTCGCGCCACCTTCTTACTGCTTCGTCC
TCCTTATCAATTAGTCGCAGAAATATCCC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 2

CO CL2123Contig1 910 2 2 U
GGGATGAGAAAGTTCAATAAAAGCATATCACTTGACGATTTTATTCCATACGTTCATTCT
CTCTCTCACTCAGGAGTGAAACTTGCTTGCTTGAATCATGGCTTCTCGTATTGCTAAAGA
TGTTACCGAATTGATTGGGAACACCCCTTTGGTTTATCTGAACAATGTGGCTTAAGGATG
TGTTGGTCGTGTCGCCGCTAAGCTCGAGGTGATGGAACCTTGCTCCAGTGTCAAAGACAG
GATTGGTTTTAGCATGATTTCTGATGCAGAGAAAAAGGGTCTGATTAAACCAGGAGAGAG
TGTGCTGATTGAGCCAATTGAAAGTGCTATTCTCTCCGGTGGGAAGCCAGGCCCTCACAA
GATTCAAGGGATAGGTGCTGGTTTTATACCAAGCGTGTTGGAGGTTGATCTTATAGATGA
AGTTGTTCAAGTTTCAAGTGATGAATCCATCGACATGGCAAGGCTTCTTGCTCTTAAAGA
AGGTCTTCTTGTGGGAATATCATCTGGTGCAGCAGCAGCCGCAGCAATCAAACTTGCAAA
GAGGCCAGAAAATGCCGGGAAGCTTTTCGTGGCTGTGTTCCCAAGTTTTGGGGAGAGGTA
CCTGTCCACTGTACTATTCGATGCCACAAGGAAAGAAGCAGAATCAATGACCTTCGAGGC
TTGAATTGTCTCACCTGAAAATTTCATTTCTCTGTTTCTTTTCATTTGAGACGCCAAAAA
TAAAAAAGAGAGATGTTCAGTTTTCTCCTGAAGAGAATCTCTTCATCTTCAGCTTCAGTG
CGTCTTTGTGTTTGTGTTTCTGTATCTTTCTTTTGTGTGAGAATAAAAAACAATTTAGAT
TTTCTCTGTTTTTCTCTTTTGAAGAACACTTTGCTGTCAATAAGTGTGAGTCTACTTTGA
TTTGAAAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B183TF U 1
AF RS1B183JQ C 159
BS 1 617 RS1B183TF
BS 618 910 RS1B183JQ

RD RS1B183TF 617 0 0
GGGATGAGAAAGTTCAATAAAAGCATATCACTTGACGATTTTATTCCATACGTTCATTCT
CTCTCTCACTCAGGAGTGAAACTTGCTTGCTTGAATCATGGCTTCTCGTATTGCTAAAGA
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TGTTGGTCGTGTCGCCGCTAAGCTCGAGGTGATGGAACCTTGCTCCAGTGTCAAAGACAG
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TGTGCTGATTGAGCCAATTGAAAGTGCTATTCTCTCCGGTGGGAAGCCAGGCCCTCACAA
GATTCAAGGGATAGGTGCTGGTTTTATACCAAGCGTGTTGGAGGTTGATCTTATAGATGA
AGTTGTTCAAGTTTCAAGTGATGAATCCATCGACATGGCAAGGCTTCTTGCTCTTAAAGA
AGGTCTTCTTGTGGGAATATCATCTGGTGCAGCAGCAGCCGCAGCAATCAAACTTGCAAA
GAGGCCAGAAAATGCCGGGAAGCTTTTCGTGGCTGTGTTCCCAAGTTTTGGGGAGAGGTA
CCTGTCCACTGTACTAT

QA 1 617 1 617
DS 

RD RS1B183JQ 752 0 0
TGAACAATGTGGCTTAAGGATGTGTTGGTCGTGTCGCCGCTAAGCTCGAGGTGATGGAAC
CTTGCTCCAGTGTCAAAGACAGGATTGGTTTTAGCATGATTTCTGATGCAGAGAAAAAGG
GTCTGATTAAACCAGGAGAGAGTGTGCTGATTGAGCCAATTGAAAGTGCTATTCTCTCCG
GTGGGAAGCCAGGCCCTCACAAGATTCAAGGGATAGGTGCTGGTTTTATACCAAGCGTGT
TGGAGGTTGATCTTATAGATGAAGTTGTTCAAGTTTCAAGTGATGAATCCATCGACATGG
CAAGGCTTCTTGCTCTTAAAGAAGGTCTTCTTGTGGGAATATCATCTGGTGCAGCAGCAG
CCGCAGCAATCAAACTTGCAAAGAGGCCAGAAAATGCCGGGAAGCTTTTCGTGGCTGTGT
TCCCAAGTTTTGGGGAGAGGTACCTGTCCACTGTACTATTCGATGCCACAAGGAAAGAAG
CAGAATCAATGACCTTCGAGGCTTGAATTGTCTCACCTGAAAATTTCATTTCTCTGTTTC
TTTTCATTTGAGACGCCAAAAATAAAAAAGAGAGATGTTCAGTTTTCTCCTGAAGAGAAT
CTCTTCATCTTCAGCTTCAGTGCGTCTTTGTGTTTGTGTTTCTGTATCTTTCTTTTGTGT
GAGAATAAAAAACAATTTAGATTTTCTCTGTTTTTCTCTTTTGAAGAACACTTTGCTGTC
AATAAGTGTGAGTCTACTTTGATTTGAAAACG

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 4

CO CL2124Contig1 935 4 10 U
ATCAGATGTCTGGCTTCTGCTTTACGTGGAAAAAACAAGAAACAGAGACTAGACGAGGCT
TGTCTCGAAAGGTATCAGGAATACAGTCGCGCACTAATACAATCATGGATTTTACAAGGC
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TCCATTAAGATTACAGCTGAAGTTCCCAAATATGTATGTAGAGGTGGGCTGAAAGCTGGA
AGCTGCAATAGAGAAGCTAGATGTTGATGTTTCTGAGAAAGTAGTTCTTGATTCTGGTCT
TTCTACTGGAGGCTTTACAGATTGTTTGCTTCGTTATGGTGCCGCTCATGTCTATGGTGT
TGATGTTGGTTATGGTCAGGTAGCTGATAAGATTCGTAATGATAAGCATGTGACTGTTAT
AGAAAGGACAAATCTGAGATACCTTCCAGGACTC*CCCCAAAAAGTCGATGTAGTCACAC
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ACGATGCAACTTTAGTTACCCTTGTTAAACCTCAATTTGAAGCTCGGCGATCACAGGTTG
GGAGGGGTGGTATAGTGAGAGATCCTGAAGTGCATCAGGAGGTTCTTGAGAAGATAATAA
ATGGTATTGAGCGCTATGGATTCACCAACAAAGGGTTTATCGAATCTCCCATCAAGGGCG
CCGATGGAAACATAGAGTTCTTGGTTCGCTTCGACCGAGGGACAGTGAAATCCCAAGAAG
AAGACTACTAAGACATTATTGTTTCTTTCTTCTTTCACTCCATTTCCTTGATTTAACGTT
TAAGTTATGCACTTTGCTACTGTTCTTTTGTTTTGCTAATGTCTTGAATCTTCAAAGATA
ATTACCAAACCAATCCAAGACTAATCATTTCAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EF32TF U 1
AF RS1EF32JQ C 487
AF RS1A816JQ C 356
AF RS1A816TF U 413
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AAAGTGCTTGTGGATGGGAAAAGAGCTAGTAAAGCTGGAATGCCTGTAGCCAATGGTGTT
TCCATTAAGATTACAGCTGAAGTTCCCAAATATGTATGTAGAGGTGGGCTGAAAGCTGGA
AGCTGCAATAGAGAAGCTAGATGTTGATGTTTCTGAGAAAGTAGTTCTTGATTCTGGTCT
TTCTACTGGAGGCTTTACAGATTGTTTGCTTCGTTATGGTGCCGCTCATGTCTATGGTGT
TGATGTTGGTTATGGTCAGGTAGCTGATAAGATTCGTAATGATAAGCATGTGACTGTTAT
AGAAAGGACAAATCTGAGATACCTCCCGGGACTCTCCCCAAAAAGTCGATGTAGTCACAC
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ACGATGCAACTTTAGTT

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DS 

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TTTAGTTACCCTTGTTAAACCTCAATTTGAAGCTCGGCGATCACAGGTTGGGAGGGGTGG
TATAGTGAGAGATCCTGAAGTGCATCAGGAGGTTCTTGAGAAGATAATAAATGGTATTGA
GCGCTATGGATTCACCAACAAAGGGTTTATCGAATCTCCCATCAAGGGGGCCGATGGAAA
CATAGAGTTCTTGGTTCGCTTCGACCGAGGGACAGTGAAATCCCAAGAAGAAGACTACTA
AGACATTATTGTTT

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DS 

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GTTATAGAAAGGACAAATTTGAGATACCTTCCAGGACTC*CCCCAAAAAGTCGATGTAGT
CACACTAGATCTCTCTTTCATTTCCATTCTCAAGGTGATGCCAGCGGTTATGAATGTGAT
GAATGACGATGCAACTTTAGTTACCCTTGTTAAACCTCAATTTGAAGCTCGGCGATCACA
GGTTGGGAGGGGTGGTATAGTGAGAGATCCTGAAGTGCATCAGGAGGTTCTTGAGAAGAT
AATAAATGGTATTGAGCGCTATGGATTCACCAACAAAGGGTTTATCGAATCTCCCATCAA
GGGCGCCGATGGAAACATAGAGTTCTTGGTTCGCTTCGACCGAGGGACAGTGAAATCCCA
AGAAGAAGACTACTAAGACATTATTGTTTCTTTCTTCTTTCACTCCATTTCCTTGATTTA
ACGTTTAAGTTATGCACTTTGCTACTGTTCTTTTGTTTTGCTAATGTCTTGAATCTTCAA
AGATAATTACCAAACCAATCCAAGACTAATCATTTCAGAG

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AGTCACACTAGACCTCTCTTTCATTTCCATTCTCAAGGTGATGCCAGCGGTTATGAATGT
GATGAATGACGATGCAACTTTAGTTACCCTTGTTAAACCTCAATTTGAAGCTCGGCGATC
ACAGGTTGGGAGGGGTGGTATAGTGAGAGATCCTGAAGTGCATCAGGAGGTTCTTGAGAA
GATAATAAATGGTATTGAGCGCTATGGATTCACCAACAAAGGGTTTATCGAATCTCCCAT
CAAGGGCGCCGATGGAAACATAGAGTTCTTGGTTCGCTTCGACCGAGGGACAGTGAAATC
CCAAGAAGAAGACTACTAAGACATTATTGTTTCTTTCTTCTTTCACTCCATTTCCTTGAT
TTAACGTTTAAGTTATGCACTTTGCTACTGTTCTTTTGTTTTGCTAATGTCTTGAATCTT
CAAAGATAATTACCAAACCAATCCAAGACTAATCATTTCAGAG

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DS 



AS 1 4

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GTTTCTTGGGAGATCGATTTTATGTCCGAAACTTTCGTAAGATAAAAAGATCGATTGTTT
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AACCAAACAGGTCATGCTCAACGAGTCTGAGATCCGACAGCTTTGCATCGTCTCCAGAGA
GATTTTCCTCCAACAGCCTAACCTCCTTGAGCTCGAAGCTCCCATCAAGATCTGCGGTGA
TATTCATGGACAGTACTCAGATCTGTTGAGGCTATTTGAGTATGGAGGCTTACCTCCAGC
AGCTAACTATCTATTCCTAGGAGATTACGTGGACCGTGGGAAGCAGAGCCTTGAAACCAT
ATGTCTTCTCCTTGCCTACAAGATCAAATACCCTGAGAACTTCTTCCTCCTGAGAGGCAA
CCACGAGTGTGCTTCCATCAACAGAATCTACGGATTCTACGACGAATGCAAACGCAG*TT
CAGTGTCAGACTCTGGAAAGTGTTTACAGATTCTTTCAACTGTCTCCCCGTGGCTGCTGT
GATAGACGACAAGATACTGTGTATGCACGGTGGCCTTTCTCCAGATTTGACCAACGTGGA
GCAGATCAAGAACATTAAGCGGCCTACCGATGTCCCCGACTCTGGTTTGCTGTGCGATCT
GCTTTGGTCTGATCCGAGCAAAGATGTGAAAGGGTGGGGGATGAATGACCGTGGGGTTTC
TTACACTTTTGGGCCTGATAAAGTCGCTGAGTTTTTGATAAAGAACGATATGGATCTCAT
CTGTCGTGCCCACCAGGTTGTAGAGGATGGTTATGAGTTCTTTGCCGATAGACAGCTTGT
TACTATATTTTCAGCTCCTAATTACTGTGGTGAATTCGATAATGCTGGTGCTATGATGAG
TGTTGATGAGAGTTTAATGTGCTCTTTCCAAATTCTTAAGCCTGCGGATCGGAGGCCTCG
GTTCTTGTGAGTTAGTAACGGGAGAGAGAGAGACATTTGACGCTCCCTGAGACTTTATCC
TGAGGCCTTTGCAAGAAGGCAGGGAAAAAAAACACATTGTTTACATGTTATATCATAATC
TTATTTCAACTCTTGTAATTTCTTTTTCTCAAAACTTATCATCTTCTTATTCTCTGACTC
ATATTAGACAGTAAACAAAAGTCTGCAAAGTTTTATTCTTTCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FE12TF U 1
AF RS1G777TF U 25
AF RS1G777JQ C 690
AF RS1FE12JQ C 617
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BS 1111 1365 RS1FE12JQ

RD RS1FE12TF 745 0 0
GGGTCTCTAAAACGAAACTCGTTGGAAGAAAAAAAAAGATATTTGGGGAAACAAAACAAA
AGGCGAAACCTTTTTTT*CTGGTCTGAAGATCGAGAAAAGATTTTTGAAAATCAAATATG
GTTTCTTGGGAGATCGATTTTATGTCCGAAACTTTCGTAAGATAAAAAGATCGATTGTTT
AGCGATCGGCGTGGGTGTCTCTTTTGTAATAATGACGCAACAAGGGCAGGGAAGCATGGA
CCCTGCCGTTCTCGACGACATCATTCGTCGTCTGTTGGATTACAGAAACCCTAAGCCTGG
AACCAAACAGGTCATGCTG**CGAGTCTGAGATCCGACAGCTTTGCATCGTCTCCAGAGA
GATTTTCCTCCAACTGCCTAACCTCCTTGAGCTCGAAGCTCCCATCAAGATCTGCGGTGA
TATTCATGGACAGTACTCAGATCTGTTGAGGCTATTTGAGTATGGAGGCTTGCCTCCTGC
AGCTAACTATTTATTCCTAGGAGATTACGTGGACCGTGGGAAGCAGAGTCTTGAAACCAT
ATGTCTTCTCCTTGCCTACAAGATCAAATACCCTGAGAACTTCTTCCTCCTGAGAGGCAA
CCACGAGTGTGCTTCCATCAACAGAATCTACGGATTCTACGACGAATGCAAACGCAG*TT
CAGTGTCAGACTCTGGAAAGTGTTTACAGATTCTTTCA*CTGTCTCCCCGTGGCTGCTGT
GATAGACGACAAGATACTGTGTATG

QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1G777TF 721 0 0
GGGA
AAAAAAAAAGATGTTTGGGGAAACAAAACAAAAGGCGAAACCTTTTTTTTCTGGTCTGAA
GATCGAGAAAAGATTTTTGAAAATCAAATTTGGTTTCTTGGGAGATCGATTTTATGTCCG
AAACTTTCGTAAGATAAAAAGATCGATTGTTTAGCGATCGGCGTGGGTGTCTCTTTTGTA
ATAATGACGCAACAAGGGCAGGGAAGCATGGACCCTGCCGTTCTCGACGACATCATTCGT
CGTCTGTTGGATTACAGAAACCCTAAGCCTGGAACCAAACAGGTCATGCTCAACGAGTCT
GAGATCCGTCAGCTTTGCATCGTCTCCAGAGAGATTTTCCTCCAACAGCCTAACCTCCTT
GAGCTCGAAGCTCCCATCAAGATCTGCGGTGATATTCATGGACAGTACTCAGATCTGTTG
CGGCTATTTGAGTATGGAGGTTTACCTCCAGCAGCTAACTATCTATTCCTAGGAGATTAC
GTGGACCGTGGGAAGCATAGCCTTGAAACCATATGTCTTCTCCTTGCCTACAAGATCAAA
TACCCTGAGAACTTCTTCCTCCTGAGAGGCAACCACGAGTGTGCTTCCATCAACAGAATC
TACAGATTCTACGACGAATGCAAACGTAG*TTCAGCGTGAG*CTCTGGAAAGTGTTTAC*
GATTCTTTCAACTGTCTCCCCGTGGCTGCTGTGATAGACGATA*GATACTGTGTATG

QA 5 721 5 721
DS 

RD RS1G777JQ 630 0 0
ATTCTTTCAACTGTCTCCCCGTGGCTGCTGTGATAGACGATAAGATACTGTGTATGCACG
GTGGCCTTTCTCCCGATTTGACCAACGTGGAGCAGATCAAGAACATTAAGCGGCCTACCG
ATGTTCCCGACTCTGGTTTGCTGTGCGATCTGCTTTGGTCTGATCCGAGCAAAGATGTGA
AAGGGTGGGGGATGAATGACCGTGGGGTTTCTTACACTTTTGGGCCTGATAAAGTCGCTG
AGTTTTTGATAAAGAACGATATGGATCTCATCTGTCGTGCCCACCAGGTTGTAGAGGATG
GTTATGAGTTCTTTGCCGATAGACAGCTTGTTACTATATTTT*AGCTCCTAATTACTGTG
GTGAATTCGATAATGCTGGTGCTATGATGAGTGTTGATGAGAGTTTAATGTGCTCTTTCC
AAATTCTTAAGCCTGCGGATCGGAGGCCTCGGTTCTTGTGAGTTAGTAACGGGAGAGAGA
GA**CATTTGACGCTCCCTGAGACTTTATCCTGAGGCCTTTGCAAGAAGGCAGGGAAAAA
AAACACATTGTTTACATGTTATATCATAATCTTATTTCAACTCTTGTAATTTCTTTTTCT
CAAAACTTATCATCTTCTTATTCTCTGACT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RS1FE12JQ 749 0 0
ATCAACAGAATCTACGGATTCTACGACGAATGCAAACGCAGGTTCAGTGTCAGACTCTGG
AAAGTGTTTACAGATTCTTTCAACTGTCTCCCCGTGGCTGCTGTGATAGACGACAAGATA
CTGTGTATGCACGGTGGCCTTTCTCCAGATTTGACCAACGTGGAGCAGATCAAGAGCATT
AAGCGGCCTACCGATGTCCCCGACTCTGGTTTGCTGTGCGATCTGCTTTGGTCTGATCCG
AGCAAAGATGTGAAAGGGTGGGGGATGAATGCCCGTGGGGTTTCTTACACTTTTGGGCCT
GATAAAGTCGCTGAGTTTTTGATAAAGAACGATATGGATCTCATCTGTCGTGCCCACCAG
GTTGTAGAGGATGGTTATGAGTTCTTTGCCGATAGACAGCTTGTTACTATATTTTCAGCT
CCTAATTACTGTGGTGAATTCGATAATGCTGGTGCTATGATGAGTGTTGATGAGAGTTTA
ATGTGCTCTTTCCGAATTCTTAAGCCTGCGGATCGGAGGCCTCGGTTCTTGTGAGTTAGT
AACGGGAGAGAGAGAGACATTTGACGCTCCCTGAGACTTTATCCTGAGGCCTTTGCAAGA
AGGCAGGGAAAAAAAACACATTGTTTACATGTTATATCATAATCTTATTTCAACTCTTGT
AATTTCTTTTTCTCAAAACTTATCATCTTCTTATTCTCTGACTCATATTAGACAGTAAAC
AAAAGTCTGCAAAGTTTTATTCTTTCATC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 0 0

AS 1 4

CO CL2127Contig1 763 4 5 U
GCAACCTCTCGACGTAAAAGCCCCTAGAAAGAAAAAAAAATGGCTCTGGTTTTTCACTGT
ACATCTTGCAATTGGCTCCAGCGAAAGACGTTTCCGATGAATCGGAGATATTCTCCGAAC
ATCCGACGAGGAGCAACGAGGTGCGAGTTTAGAATTCCAGTAGAAATCTCCAGTCCAGCA
GATAGAGGATCCTTGGCTGTGCCTTCGCACAAGGTCACTGTGCACGATCGTCAACGAGGA
GTCGTTCACGAGTTTGAGGTTCCATAGGATCAGTACATATTGCACTCAGCTGAATCTCAG
AACATTAATCTTCCCTTTGCTTGCAGGCATGGTTGCTGTACTAGCTGTGCCGTACGTGTT
AAATCTGGAGAGTTAAGGCAGCCACAAGCATTGGGAATATCAGCTGAACTCAAGTCCCAG
GGATATGCACTTCTGTGTGTTGGTTTCCCTACATCTGATCTTGAAGTAGAAACACAAGAT
GAGGACGAGGTCTACTGGCTACAATTTGGAAGATACTTCGCTCGTGGACCAATTGAGAGA
GATGATTACGCCCTTGAACTCGCCATGGGAGACGAGTAGAAACAATAAGAGTTATAGAAG
TGAGTGTTACTTTTTTAGTCCTGGATCTCGTGGTACATCCTTGTAAACCTCTTGATGAAC
TCGACCATATTCTGAGAGAACTTCCCACCAGATCAAACATTTTATGAAAACTTATTGAAC
ATTCCCACCATGAACTCCAAATTTCAAACATAAATGTTTGCAC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1A869TF U 2
AF RS1A869JQ C 208
AF RS1ES58TF U 1
AF RS1ES58JQ C 105
BS 1 77 RS1ES58TF
BS 78 78 RS1A869TF
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BS 710 710 RS1ES58JQ
BS 711 763 RS1ES58TF

RD RS1A869TF 135 0 0
GGCT
CTCTCGACGTAAAAGCCCCTAGAAAGAAAAAAAAATGGCTCTGGTTTTTCACTGTACATC
TTGCAATTGGCTCCAGCGAAAGACGTTTCCGATGAATCGGAGATATTCTCCGAACATCCG
ACGAGGAGCAA

QA 5 135 5 135
DS 

RD RS1A869JQ 331 0 0
CACAAGGTCACTGTGCACGATCGCCAACGAGGAGTCGTTCACGAGTTTGAGGTTCCAGAG
GATCAGTACATATTGCACTCAGCTGAATTTCAGAACATTAATTTTCCCTTTGCTTGCAGG
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GCATTGGGAATATCAGCTGAACTCAAGTCCCAGGGATATGCACTTCTGTGTGTTGGTTTC
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GGAAGATACTTCGCTCGTGGACCAATTGAGA

QA 1 331 1 331
DS 

RD RS1ES58TF 763 0 0
GCAACCTCTCGACGTAAAAGCCCCTAGAAAGAAAAAAAAATGGCTCTGGTTTTTCACTGT
ACATCTTGCAATTGGCTTCAGCGAAAGACGTTTCCGATGAATCGGAGATATTCTCCGAAC
ATCCGACGAGGAGCAACGAGGTGCGAGTTTAGAATTCCAGTAGAAATCTCCAGTCCAGCA
GATAGAGGATCCTTGGCTGTGCCTTCGCACAAGGTCACTGTGCACGATCGTCAACGAGGA
GTCGTTCACGAGTTTGAGGTTCCATAGGATCAGTACATATTGCACTCAGCTGAATCTCAG
AACATTAATCTTCCCTTTGCTTGCAGGCATGGTTGCTGTACTAGCTGTGCCGTACGTGTT
AAATCTGGAGAGTTAAGGCAGCCACAAGCATTGGGAATATCAGCTGAACTCAAGTCCCAG
GGATATGCACTTCTGTGTGTTGGTTTCCCTACATCTGATCTTGAAGTAGAAACACAAGAT
GAGGACGAGGTCTACTGGCTACAATTTGGAAGATACTTCGCTCGTGGACCAATTGAGAGA
GATGATTACGCCCTTGAACTCGCCATGGGAGACGAGTAGAAACAATAAGAGTTATAGAAG
TGAGTGTTACTTTTTTAGTCCTGGATCTCGTGGTACATCCTTGTAAACCTCTTGATGAAC
TCGACCATATTCTGAGAGAACTTCCCACCAGATCAAACATTTTATGAAA*CTTATTGAAC
ATTCCCACCATGAACTCCAAATTTCAAACATAAATGTTTGCAC

QA 1 763 1 763
DS 

RD RS1ES58JQ 659 0 0
GAGATATTCTCCGAACATCCGACGAGGAGCAACGAGGTGCGAGTTTAGAATTCCAGTAGA
AATCTCCAGTCCAGCAGATAGAGGATCCTTGGCTGTGCCTTCGCACAAGGTCACTGTGCA
CGATCGTCAACGAGGAGTCGTTCACGAGTTTGAGGTTCCATAGGATCAGTACATATTGCA
CTCAGCTGAATCTCAGAACATTAATCTTCCCTTTGCTTGCAGGCATGGTTGCTGTACTAG
CTGTGCCGTACGTGTTAAATCTGGAGAGTTAAGGCAGCCACAAGCATTGGGAATATCAGC
TGAACTCAAGTCCCAGGGATATGCACTTCTGTGTGTTGGTTTCCCTACATCTGATCTTGA
AGTAGAAACACAAGATGAGGACGAGGTCTACTGGCTACAATTTGGAAGATACTTCGCTCG
TGGACCAATTGAGAGAGATGATTACGCCCTTGAACTCGCCATGGGAGACGAGTAGAAACA
ATAAGAGTTATAGAAGTGAGTGTTACTTTTTTAGTCCTGGATCTCGTGGTACATCCTTGT
AAACCTCTTGATGAACTCGACCATATTCTGAGAGAACTTCCCACCAGATCAAACATTTTA
TGAAAACTTATTGAACATTCCCACCATGAACTCCAAATTTCAAACATAAATGTTTGCAC

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 4

CO CL2128Contig1 1233 4 13 U
CACTCACTTGATTAAACAAATCGCACGATACAAAGGAGACAAAGTTAAGTTTCAATGTTT
TCAAAGAAACCTTAAGCGACACTTTTCCTCTTGCCCATCTACTTACATGGATAAGAAGAA
ACCAAACAAACTAACCATTACATAAACTTTTACCATCCCTAATACTACTACCCAAGAAGG
TGGACTGTGTGTAGATAGAAACACAGGTGAATTCACAAAAAACAAGAGAACCGGACAGGT
AAGTCAGTACAGTACAGTACATCACTTGGTGTCTCTACTACTTTATGGACAGTTCTCGTT
TTTACCGGGACCTCCATAGTAGAAGAAATGACCCCAATCATCATTGTTTCCGGGTTGAAC
ATCATAACAGTTGGACTGCTCAGTGAACGTTCCAAGTCCTTTAGGTGCCTTGAGGTTGTT
TGAAGAATCAACCACTTGAATGTTCCTGAAGTAACTTGCTTTGCTGAAGCCTTCTTCAGG
GAATCTACCACTGCCCATTTGCGTTGAAGTGTGGTGGCCATCTGCTTGTGAGTTCACAAC
TTCCCCTCCCCATTCAATCATTGAAGCACTTTCTGTTAAGTAGGAGAAGAGAAAAGATGG
CCAGTATCCTAAAACATAGCCGTTTCCAAATTGCATCCACCAATGTCCCTCTTTTGGATC
CTTCCAGATCAGAATGCTGATATCATACTGCGAGTTACGGTAGCCAGAGACCGGAGAGAT
ACTAGCTCCCATTGCTATGTCACTGTTTATTTGAATAAAACCAGAGCAAAGAAGATTGTA
GCAGCCAGTAGCTTGATATGCATCACTAGTCCAGTAAGTGAAGAGTCTTGTATTATTGTC
ACCATACAGATCCGGGCTCACCTGCCAACCAGCTTCGATGCTGTTAAGATCTTGTCCGAA
AGAGCCACCAAGAAGCCAAATCTGCGACAAGCTGAACTCGTTCTGCTGCTGTATCTTCGG
CTCCCACACATTAATAGTCGCTTTAGCTCCATAGTACTTATCCCCTTCCACATAAGCTAT
GGCATGCTGGTGACCACTTTGGTCGATGAGGTCAGGTTCAGCAGATTTAGGCAAAGGGAC
GGTTCTGTGCTTCTTCTTGCCGTATCTTTTGACAGAACTTGCCCTCAAGACATCGTCCTC
TTTAGTCCTCCTCATGGGAATGGTTCCTTCAGCGCATTTGCCATAACGATGCCATAACTG
AGGGATATGTGGTTCCTTGTCTTTTGATTTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CS16JQ U 1
AF RS1A553JQ U 183
AF RS1CS16TF C 181
AF RS1A553TF C 475
BS 1 564 RS1CS16JQ
BS 565 565 RS1A553JQ
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BS 832 859 RS1CS16TF
BS 860 860 RS1A553TF
BS 861 944 RS1CS16TF
BS 945 1233 RS1A553TF

RD RS1CS16JQ 838 0 0
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TCAAAGAAACCTTAAGCGACACTTTTCCTCTTGCCCATCTACTTACATGGATAAGAAGAA
ACCAAACAAACTAACCATTACATAAACTTTTACCATCCCTAATACTACTACCCAAGAAGG
TGGACTGTGTGTAGATAGAAACACAGGTGAATTCACAAAAAACAAGAGAACCGGACAGGT
AAGTCAGTACAGTACAGTACATCACTTGGTGTCTCTACTACTTTATGGACAGTTCTCGTT
TTTACCGGGACCTCCATAGTAGAAGAAATGACCCCAATCATCATTGTTTCCGGGTTGAAC
ATCATAACAGTTGGACTGCTCAGTGAACGTTCCAAGTCCTTTAGGTGCCTTGAGGTTGTT
TGAAGAATCAACCACTTGAATGTTCCTGAAGTAACTTGCTTTGCTGAAGCCTTCTTCAGG
GAATCTACCACTGCCCATTTGCGTTGAAGTGTGGTGGCCATCTGCTTGTGAGTTCACAAC
TTCCCCTCCCCATTCAATCATTGACGCACTTTCTGTTAAGTAGGAGAAGAGGAAAGATGG
CCAGTATCCTAAAACATAGCCGTTTCCAAATTGCATCCACCAGTGTCCCTCTTTTGGATC
CTTCCAGATCAGAATGCTGATATCATACTGCGAGTTACGGTAGCCAGAGACCGGAGAGAT
GCTAGCTCCCATTGCTATGTCACTGTTTATTTGAATAAAACCAGAGCAAAGAAGATTGTA
GCAGCCAGTAGCTTGATATGCATCACTAGTCCAGTAAGTGAAGAGTCTTGT
ATATTGT

QA 1 831 1 831
DS 

RD RS1A553JQ 657 0 0
GACTGTGTGTAGATAGAAACACAGGTGAATTCACAAAAAACAAGAGAACCGGACAGGTAA
GTCAGTACAGTACAGTACATCACTTGGTGTCTCTACTACTTTATGGACAGTTCTCGTTTT
TACCGGGACCTCCATAGTAGAAGAAATGACCCCAATCATCATTGTTTCCGGGTTGAACAT
CATAACAGTTGGACTGCTCTGTGAACGTCCCAAGTCCTTTAGGTGCCTTGAGGTTGTATG
AAGAATCAACCACTTGAATGTTCCTGAAGTAACTTGCTTTGCTGAAGCCTTCTTCAGGGA
ATCTACCACTGCCCATTTGCGTTGAAGTGTGGTGTCCATCTGCTTGTGAGTTCACAACTT
CTCCTCCCCATTCAATCATTGAAGCGCTTTCTGTTAAGTAGGAGAAGAGAAAAGATGGCC
AGTATCCTAAAACATAGCCGTTTCCAAATTGCATCCACCAATGTCCCTCTTTTGGATCCT
TCCAGATCAGAATGCTGATGTCATACTGCGAGTTACGGTAGCCAGAGACCGGAGAGATAC
TAGCTCCCATTGCTATGTCACTGTTTATTTGAATAAAACCAGAGCAAAGAAGATTGTAGC
AGCCAGTAGCTTGATATGCATCACTAGTCCAGTAAGTGAAAAGTCTTGT
GTTATTGT

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DS 

RD RS1CS16TF 765 0 0
TG
GACTGTGTGTAGATAGAAACACAGGTGAAT*CACAAAAAACAAGAGAACCGGACAGGTAA
GTCAGTACAGTACAGTACATCACTTGGTGTCTCTACTACTTTATGGACAGTTCTCGTTTT
TACCGGGACCTCCATAGTAGAAGAAATGACCCCAATCATCATTGTTTCCGGGTTGAACAT
CATAACAGTTGGACTGCTCAGTGAACGTTCCAAGTCCTTTAGGTGCCTTGAGGTTGTTTG
AAGAATCAACCACTTGAATGTTCCTGAAGTAACTTGCTTTGCTGAAGCCTTCTTCAGGGA
ATCTACCACTGCCCATTTGCGTTGAAGTGTGGTGGCCATCTGCTTGTGAGTTCACAACTT
CCCCTCCCCATTCAATCATTGACGCACTTTCTGTTAAGTAGGAGAAGAGGAAAGATGGCC
AGTATCCTAAAACATAGCCGTTTCCAAATTGCATCCACCAGTGTCCCTCTTTTGGATCCT
TCCAGATCAGAATGCTGATATCATACTGCGAGTTACGGTAGCCAGAGACCGGAGAGATGC
TAGCTCCCATTGCTATGTCACTGTTTATTTGAATAAAACCAGAGCAAAGAAGATTGTAGC
AGCCAGTAGCTTGATATGCATCACTAGTCCAGTAAGTGAAGAGTCTTGTATTATTGTCAC
CATACAGATCCGGGCTCGCCTGCCAACCAGCTTCGATGCTGTTAAGATCTTGTCCGAAAG
AGCCACCAAGAAGCCAAATCTGCGACAAGCTGAACTCGTTCT
C

QA 3 764 3 764
DS 

RD RS1A553TF 759 0 0
TTCAGGGAATCTACCACTGCCCATTTGCGTTGAAGTGTGGTGTCCATCTGCTTGTGAGTT
CACAACTTCTCCTCCCCATTCAATCATTGAAGCGCTTTCTGTTAAGTAGGAGAAGAGAAA
AGATGGCCAGTATCCTAAAACATAGCCGTTTCCAAATTGCATCCACCAATGTCCCTCTTT
TGGATCCTTCCAGATCAGAATGCTGATGTCATACTGCGAGTTACGGTAGCCAGAGACCGG
AGAGATACTAGCTCCCATTGCTATGTCACTGTTTATTTGAATAAAACCAGAGCAAAGAAG
ATTGTAGCAGCCAGTAGCTTGATATGCATCACTAGTCCAGTAAGTGAAGAGTCTTGTGTT
ATTGTCACCATACAGATCCGGGCTCACCTGCCAACCAGCTTCGATGCTGTTAAGATCTTG
TCCGAAAGAGCCACCAAGAAGCCAAATCTGCGACAAGCTGAACTCGTTCTGCTGCTGTAT
CTTCGGCTCCCACACATTAATAGTCGCTTTAGCTCCATAGTACTTATCCCCTTCCACATA
AGCTATGGCATGCTGGTGACCACTTTGGTCGATGAGGTCAGGTTCAGCAGATTTAGGCAA
AGGGACGGTTCTGTGCTTCTTCTTGCCGTATCTTTTGACAGAACTTGCCCTCAAGACATC
GTCCTCTTTAGTCCTCCTCATGGGAATGGTTCCTTCAGCGCATTTGCCATAACGATGCCA
TAACTGAGGGATATGTGGTTCCTTGTCTTTTGATTTAGC

QA 1 759 1 759
DS 



AS 2 4

CO CL2129Contig1 857 2 10 U
GATGAGGGTAAATAATCAAATTAAGATATGAAAATTGTTATATGATATCTCTCCCTCTCT
TTGCAAAAACACTTTTCAATGGATCAAAAAGTTACATTATGTTTTGATGATTACAATAAA
CTGATCCAATACAGAGAAAGTGCAGTCACAGCAGCACACGTGTACATACAGATATATTAT
TTGTTGTAGTTTTTCATGAATCAAAGGACTTGCCTATCGGCAGCATCAGCAACAATGGGC
AACCTCGGGGTCAGACCAAACAAGCAAGCAGAGAATCCATAGATCAAACAGACAAGCAAG
AAGAGGAACACTGTGCTGTCCAAACTCATCACCACATCCAAACCAAACCCATCTCTGGGA
TTAAAGCTCCTCTCAAGCAAATCCGGGAAAATCAACAGAACGTCGAGCACAATCGCCTGC
ATCGTGTTGAACCTAACGTACCTGCTGAAGTTAGAGTTCCTCACGACGACGAAGTAGAGA
GCGATGAAGATGAGGAAGCCATTGAAAGGGAAGCTCTTGAAGGCCTTGATGGCGGGAAAC
AGAGGCTGGATGAGGATCTGGAAAGGTTGGTATTGCGTGATGATGAATTTACCGTACTGA
ATCCCATCGAAGAACGGGTAGAAGTAACACACGGCTGAGATTATCCGATCTGATGCGTCG
ACGGAGTCGTCTCCCTTGGATCGGAGGACGAGTGTGGCGGCTCTTTCCCTTGAAAGTCTA
GGTTTTGAGAATTGAGAGTTGGGGTTTAGAGTGAGAGAAGAAGAACGACCGGTTAGGTTT
CTGATTTGGAAGAAGGTGAGAGATGGTAATGGAGAAAGAAGATGAGATATTGCCATTGCT
CTGTGTCTGTTTCCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FO79JQ U 1
AF RS1AJ80TF C 80
BS 1 199 RS1FO79JQ
BS 200 200 RS1AJ80TF
BS 201 398 RS1FO79JQ
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RD RS1FO79JQ 680 0 0
GATGAGGGTAAATAATCAAATTAAGATATGAAAATTGTTATATGATATCTCTCCCTCTCT
TTGCAAAAACACTTTTCAATGGATCAAAAAGTTACATTATGTTTTGATGATTACAATAAA
CTGATCCAATACAGAGAAAGTGCAGTCACAGCAGCACACGTGTACATACAGATATATTAT
TTGTTGTAGTTTTTCATGA*TCAAAGGACTTGCCTATCGGCAGCATCAGCAACAATGGGC
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AAGAGGAACACTGTGCTGTCCAAACTCATCACCACATCCAAACCAAACCCATCTCTGGGA
TTAAAGCTCCTCTCAAGCAAATCCGGGAAAATCAACAGCACGTCGAGCACAATGGCCTGC
ATCGTGTTGAACCTAACGTACCTGCTGAAGTTAGAGTTCCTCACGACGACGAAGTAGAGA
GCGATGAAGATGAGGAAGCCATTGAAAGGGAAGCTCTTGAAGGCCTTGATGGCGGGAAAC
AGAGGCTGGATGAGGATCTGGAAAGGTTGGTATTGCGTGATGATGAATTTACCGTACTGA
ATCCCATCGAAGAACGGGTAGAAGTAACAGACGGCTGAGATTATCCGATCTGATGCGTCG
ACGGAGTCGTCTCCCTTGGA

QA 1 680 1 680
DS 

RD RS1AJ80TF 778 0 0
TGGATCAAAAAGTTACATTATGTTTTGATGATTACAATAAACTGATCCAATACAGAGAAA
GTGCAGTCACAGCAGCACACGTGTACGTACAGATATATTATTTGTTGTAGTTTTTCATGA
ATCAAAGGACTTGCCTATCGGCAGCATCAGCAACAATGGGCAACCTCGGGGTCAGACCAA
ACAAGCAAGCAGAGAATCCATAGATCAAACAGACAAGCAAGAAGAGGAACACTGTGCTGT
CCAAACTCATCACCACATCCAAACCAAACCCATCTCTGGGATTGAAGCTCCTCTCAAGCA
AATCCGGGAAGATCAACAGAACGTCGAGCACAATCGCCTGCATCGTGTTGAACCTAACGT
ACCTGCTGAAGTTAGAGTTCCTCACGACGACGAAGTAGAGAGCGATGAAGATGAGGAAGC
CATTGAAAGGGAAGCTCTTGAAGGCCTTGATGGCGGGAAACAGAGGCTGGATGAGGATCT
GGAATGGTTGGTATTGCGTGATGATGAATTTACCGTACTGAATCCCATCGAAGAACGGGT
AGAAGTAACACACGGCTGAGATTATCCGATCTGATGCGTCGACGGAGTCGTCTCCCTTGG
ATCGGAGGACGAGTGTGGCGGCTCTTTCCCTTGAAAGTCTAGGTTTTGAGAATTGAGAGT
TGGGGTTTAGAGTGAGAGAAGAAGAACGACCGGTTAGGTTTCTGATTTGGAAGAAGGTGA
GAGATGGTAATGGAGAAAGAAGATGAGATATTGCCATTGCTCTGTGTCTGTTTCCACT

QA 1 778 1 778
DS 



CO CL2129Contig2 754 2 13 U
GGAAGTGAAAACAGACACAGAGCAATGGCAATATCTCATCTTGTCTCTCCATTACCATCT
CTCGCCTTCTTCCAAACCGGAAACTTAACCGGGCGTTCTTTTTCTCTCCCTCTAAACCCC
AACCCCCAATTCTCAAAATCTAGACTTTCAAGGGAAAGAGCCGCCACACTCGTCCTCCGA
TCCAAGGGAGACGACTCCGTCGACGCATCAGATCGGATAATCTCAGCCGTCTGTTACTTC
TACCCGTTCTTCGATGGGATCAAGTACGGTAAATTCATCATCACGCAATACCAACCATTC
CAGATCCTCATCCAACCTCTGTTTCCCGCCATCAAGGCCTTCAAGAGCTTCCCTTTCAAT
GGCTTCCTCATCTTCATCGCTCTCTACTTCGTCGTCGTGAGGAACTCTAACTTCAGCAGG
TACGTTAGGTCCAACACGATGCAGGCCATTGTGCTCGACGTGCTGTTGATATTCCCGGAT
TTGCTTGAGAGGAGCTTTAATCCCAGAGATGGGTTTGGTTTGGATGTGGTGATGAGTTTG
GACAGCACAGTGTTCCTCTTCTTGCTTGTCTGTTTGATCTATGGATTCTCTGCTTGCTTG
TTTGGTCTGACCCCGAGGTTGCCCATTGTTGCTGATGCTGCCGATAGGCAAGTCCTTTGA
TCATGAAAACTACAACAAATAATATATCTGTATGTACACGTGTGCTGCTGTGACTGCACT
TTCTCTGTATTGGATCAGTTTATTGTAATCATCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AY08TF U 16
AF RS1FO79TF U 1
BS 1 165 RS1FO79TF
BS 166 166 RS1AY08TF
BS 167 260 RS1FO79TF
BS 261 262 RS1AY08TF
BS 263 296 RS1FO79TF
BS 297 297 RS1AY08TF
BS 298 314 RS1FO79TF
BS 315 315 RS1AY08TF
BS 316 430 RS1FO79TF
BS 431 431 RS1AY08TF
BS 432 470 RS1FO79TF
BS 471 471 RS1AY08TF
BS 472 754 RS1FO79TF

RD RS1AY08TF 606 0 0
GGG
AGAGCAATGGCAATATCTCATCTTGTCTCTCCATTACCATCTCTCGCCTTCTTCCAAACC
GGAAACTTAACCGGGCGTTCTTTTTCTCTCCCTCTAAACCCCAACCCCCAATTCTCAAAA
TCTAGACTTTCAAGGGAAAGAGCCGCCACACTCGTCCTCCGATCCAAGGGAGACGACTCC
GTCGACGCATCAGATCGGATAATC*CAGCCGTCTGTTACTTCTACCCGTTCTTCGATGGG
ATCAAGTACGGTAAATTCATCATCACGCAATACCAACCATTCCAGATCCTCATCCAACCT
CTGTTTCCCGCCATCAAGGCCTTCAAGAGCTTCCCTTTCAATGGCTTCCTCATCTTCATC
GCTCTCTACTTCGTCGTCGTGAGGAACTCTAACTTCAGCAGGTACGTTAGGTCCAACACG
ATGCAGGCGATTGTGCTCGACGTGCTGTTGATATTCCCGGATTTGCTTGAGAGGAGCTTT
AATCCTAGAGATGGGTTTGGTTTGGATGTGGTGATGAGTTTGGACAGCACAGTGTTCCTC
TTCTTGCTTGTCTGTTTGATCTATGGATTCTCTGCTTGCTTGTTTGGTCTGACCCCGAGG
TTG

QA 4 606 4 606
DS 

RD RS1FO79TF 754 0 0
GGAAGTGAAAACAGACACAGAGCAATGGCAATATCTCATCTTGTCTCTCCATTACCATCT
CTCGCCTTCTTCCAAACCGGAAACTTAACCGGGCGTTCTTTTTCTCTCCCTCTAAACCCC
AACCCCCAATTCTCAAAATCTAGACTTTCAAGGGAAAGAGCCGCCGCACTCGTCCTCCGA
TCCAAGGGAGACGACTCCGTCGACGCATCAGATCGGATAATCTCAGCCGTCTGTTACTTC
TACCCGTTCTTCGATGGGATTCAGTACGGTAAATTCATCATCACGCAATACCAACCTTTC
CAGATCCTCATCCAGCCTCTGTTTCCCGCCATCAAGGCCTTCAAGAGCTTCCCTTTCAAT
GGCTTCCTCATCTTCATCGCTCTCTACTTCGTCGTCGTGAGGAACTCTAACTTCAGCAGG
TACGTTAGGTTCAACACGATGCAGGCCATTGTGCTCGACGTGCTGTTGATTTTCCCGGAT
TTGCTTGAGAGGAGCTTTAATCCCAGAGATGGGTTTGGTTTGGATGTGGTGATGAGTTTG
GACAGCACAGTGTTCCTCTTCTTGCTTGTCTGTTTGATCTATGGATTCTCTGCTTGCTTG
TTTGGTCTGACCCCGAGGTTGCCCATTGTTGCTGATGCTGCCGATAGGCAAGTCCTTTGA
TCATGAAAACTACAACAAATAATATATCTGTATGTACACGTGTGCTGCTGTGACTGCACT
TTCTCTGTATTGGATCAGTTTATTGTAATCATCA

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 4

CO CL2130Contig1 1015 4 24 U
GGAGAGTTTTATTTCTGGTCCAAAGAAAACGAACGAACCCTAACTCTGACATGGAAGGAG
AGCTTCAAGAAGACTGGGAAGTGGTGACCGAGAGGTCTGGAACTACTACTCAGGAGGGGG
AGGATCCGAAGAGCTTGGAGGAGATTGAAGATGGCACGCAAGGTATGGTTACCTTCGATT
ACTTCTCTATCGAGAACTCAAACTTTGTGGGTCGCGTTGATGCGATCGATGAAGATGGAT
CTGTTCAATCGGGTAGTCCAGGCTGGGTCGAACCTAGCTCCGACGCTCCCTATGGCCCTA
AGCTTTTTAGCGAGTTATGGTCGGATTCCAGCAGCGATCGGCTCGATGATCAGAAATTAG
ATGTGAACAACGAGTTGGGTTTGGAGAAATCAGAGAAAGAGAAGCACTTGGAGAAAGATC
AATATGGGTCTGAGGAAGGATTTGATACGGAGAGAGAAGAGGAATCGCCAGTTTCAGTAG
TAAAAGGAAAGTCTGTTTCTATTGATTTATCTGGTGGTGGAGGAGAAGAAAGGGTATTTG
CGTGGTGGAAGATTCCGATTGATGTTTTGAAGTATTGTGTTTTCAGAGTTAATCCTATCT
GGTCTTTCTCCATGGCAGCAGCAGTGGTGGGGTTTGTTATGTTAGGGCGCAGATTGTATA
ATATGAAGAAGAGGAAGAGCTCTACCTTGCAGCTTAAGGTCTTCCTTAATGATAAGAAGG
TGGCGAATCATGCTACTCGGTTGAATGAAGCAGCAATCTCATTAGTGAAACGTGTGCCCG
TAATCAGGCCAGCACTCCCATCATCGGTGGTGGGTATGAACCAGTGGCCTATGATGAGTT
TAAGGTGAAATATAATGCATATACATGCAAGATAAATGATTGATGTGGTTGGCATGTATC
ATATGATTGTGTTATATGACAAGTCTCAGAATGGTACAAAATATGCTTGTAAGTTTTTAC
CGTGTGTGTATATAAATACTTTTACTTGTTTGATGTACAAAATGGATGGAACGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GV28TF U 1
AF RS1AS18TF U 40
AF RS1GV28JQ C 304
AF RS1AS18JQ C 309
BS 1 87 RS1GV28TF
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BS 757 769 RS1AS18TF
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BS 801 998 RS1GV28JQ
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RD RS1GV28TF 674 0 0
GGAGAGTTTTATTTCTGGTCCAAAGAAAACGAACGAACCCTAACTCTGACATGGAAGGAG
AGCTTCAAGAAGACTGGGAAGTGGTGATCGAGAGGTCTGGAACTACTACTCAGGAGGGGG
AGGATCCGAAGAGCTTGGAGGAGATTGAAGATGGCACGCAAGGTATGGTTACCTTCGATT
ACTTCTCTATCGAGAACTCAAACTTTGTGGGTCGCGTTGATGCGATCGATGAAGATGGAT
CTGTTCGATCGGGTAGTCCAGGCTGGGTCGAACCTAGCTCCGACGCTCCCTATGGCCCTA
AGCTTTTTAGCGAGTTATGGTCGGATTCCAGCAGCGATCGGCTCGATGATCAGAAATTAG
ATGTGAACAACGAGTTGGGTTTGGAGAAATCAGAGAAAGAGAAGCACTTGGAGAAAGATC
ACTATGGGTCTGAGGAAGGATTTGATACGGAGAGAGAAGAGGAATCGCCAGTTTCAGTAG
TAAAAGGAAAGTCTGTTTCTATTGATTTATCTGGTGGTGGAGGAGAAGAAAGGGTATTTG
TGTGGTGGAAGATTCCGATTGATGTTTTGAAGTATTGTGTTTTCAGAGTTAATCCTATCT
GGTCTTTCTCCATGGCAGCAGCAGTGGTGGGGTTTGTTATGTTAGGGCGCAGATTGTATA
ATATGAAGAAGAGG

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1AS18TF 741 0 0
GG
AACTCTGACATGGAAGGAGAGCTTCAAGAAGACTGGGAAGTGGTGACCGAGAGGTCTGGA
ACTACTACTCAGGAGGGGGAGGATCCGAAGAGCTTGGAGGAGATTGAAGATGGCACGCAA
GGTATGGTTACCTTCGATTACTTCTCTATCGAGAACTCAAACTTTGTGGGTCGCGTTGAT
GCGATCGATGAAGATGGATCTGTTCAATCGGGTAGTCCAGGCTGGGTCGAACCTAGCTCC
GACGCTCCCTATGGCCCTAAGCTTTTTAGCGAGTTATGGTCGGATTCCAGCAGCGATCGG
CTCGATGATCAGAAATTAGATGTGAACAACGAGTTGGGTTTGGAGAAATCAGAGAAAGAG
AAGCACTTGGAGAAAGATCAATATGGGTCTGAGGAAGGATTTGATACGGAGAGAGAAGAG
GAATCGCCAGTTTCAGTAGTAAAAGGAAAGTCTGTTTCTATTGATTTATCTGGTGGTGGA
GGAGAAGAAAGGGTATTTGCGTGGTGGAAGATTCCGATTGATGTTTTGAAGTATTGTGTT
TTCAGAGTTAATCCTATCTGGTCTTTCTCCATGGCAGCAGCAGTGGTGGGGTTTGTTATG
TTAGGGCGCAGATTGTATAATATGAAGAAGAGGAAGAGCTCTACCTTGCAGCTTAAG*TC
TTCCTTAATGATAAGAAG*TGGCGA*TCATGCTACTCGGTG**ATGAAGCAGCA*TCTCA
TTAGTGAA
CGTGTGCCGTA

QA 3 730 3 730
DS 

RD RS1GV28JQ 695 0 0
TTTTT
AGCGAGTTATGGTCGGATTCCAGCAGCGATCGGCTCGATGATCAGAAATTAGATGTGAAC
AACGAGTTGGGTTTGGAGAAATCAGAGAAAGAGAAGCACTTGGAGAAAGATCACTATGGG
TCTGAGGAAGGATTTGATACGGAGAGAGAAGAGGAATCGCCAGTTTCAGTAGTAAAAGGA
AAGTCTGTTTCTATTGATTTATCTGGTGGTGGAGGAGAAGAAAGGGTATTTGTGTGGTGG
AAGATTCCGATTGATGTTTTGAAGTATTGTGTTTTCAGAGTTAATCCTATCTGGTCTTTC
TCCATGGCAGCAGCAGTGGTGGGGTTTGTTATGTTAGGGCGCAGATTGTATAATATGAAG
AAGAGGAAGAGCTCTACCTTGCAGCTTAAGGTCTTCCTTAATGATAAGAAGGTGGCGAAT
CATGCTACTCGGTTGAATGAAGCAGCAATCTCATTAGTGAAACGTGTGCCCGTAATCAGG
CCAGCACTCCCGTCATCGGTGGTGGGTATGAACCAGTGGCCTATGATGAGTTTAAGGTGA
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GTGTTATATGACAAGTCTCAGAATGGTACAAAATATGCTTGTAAGTTTTTACCGTGTGTG
TATATAAATACTTTTACTTGTTTGATGTAC

QA 6 695 6 695
DS 

RD RS1AS18JQ 707 0 0
AGCGAGTTATGGTCGGATTCCAGCAGCGATCGGCTCGATGATCAGAAATTAGATGTGAAC
AACGAGTTGGGTTTGGAGAAATCAGAGAAAGAGAAGCACTTGGAGAAAGATCAATATGGG
TCTGAGGAAGGATTTGATACGGAGAGAGAAGAGGAATCGCCAGTTTCAGTAGTAAAAGGA
AAGTCTGTTTCTATTGATTTATCTGGTGGTGGAGGAGAAGAAAGGGTATTTGCGTGGTGG
AAGATTCCGATTGATGTTTTGAAGTATTGTGTTTTCAGAGTTAATCCTATCTGGTCTTTC
TCCATGGCAGCAGCAGTGGTGGGGTTTGTTATGTTAGGGCGCAGATTGTATAATATGAAG
AAGAGGAAGAGCTCTACCTTGCAGCTTAAGGTCTTCCTTAATGATAAGAAGGTGGCGAAT
CATGCTACTCGGTTGAATGAAGCAGCAATCTCATTAGTGAAACGTGTGCCCGTAATCAGG
CCAGCACTCCCATCATCGGTGGTGGGTATGAACCAGTGGCCTATGATGAGTTTAAGGTGA
AATATAATGCATATATATGCAAGATAAATGATTGATGTGTTTGGCATGTATCATATGATT
GTGTTATATGACAAGTCTCAGAATGGTACAAAATATGCTTGTAAGTTTTTACCGTGTGTG
TATATAAATACTTTTACTTGTTTGATGTACAAAATGGATGGAACGGC

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 4

CO CL2131Contig1 775 4 8 U
GGGAATCAGATCAAACGCCTACGGCCAAAACAAGAGCGGGCAGAAGAAAGAGACGAGACA
TAAAAGTTTGAAGATGGGCAACACTTCCTCGATGCCGACTCAATACGACATTGAAGAAGT
CCAGAGCCATTGCCAGGATCTATTTGAGCAGCAGGAGATACTCTCTCTGTACCAAAGGTT
CTGCCAGTTAGATCGAAACGCAAAGGGGTTTATATCATCTGATGAGTTTCTCTCTGTCCC
TGAGTTCGCCATGAACCCACTCTCTCAGAGGCTGCTTAAGATGGTTGACGGTTTGAACTT
TAAAGATTTTGTGGCCTTCTTGTCTGCTTTCAGTGCCAAGGCTAGTCTTAAACAAAAGGT
TAAACTTATCTTCCAAGTCTATGATTCTGACGGCAACGGGAAGGTCTCGTTTAAAGACAT
CATGGAAGTGTTGCGGGACTTATCTGGGACATTCATGTCTGATGAGCAAAGAGAGCAAGT
ACTGAGCCAGGTTTTGAAGGAAGCAGGCTACACGAATGACTCTTTCTTAACACTGGAGGA
TTTCATTAAGGTCTTTGGGAGTGGTAAACCGGAGATGGACGTTGAAATTCCTGTGGATTA
AGGGGATTTAAAGCTGAAAATCTCAATCATGTATTTGTCCACTTTGTTAGTAGAATAATC
CAACCTTGTTGATTTTGATCAAAATACCATCTCAAGCATGTTTTTGTCAGTCCCAAAACT
GACTTCAGCTTACATGTACGAATAACTTTCATCTTAAAAGCATTTTTTTTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BH86TF U 1
AF RS1GP62JQ C 446
AF RS1GP62TF U 24
AF RS1BH86JQ C 226
BS 1 79 RS1BH86TF
BS 80 80 RS1GP62TF
BS 81 95 RS1BH86TF
BS 96 96 RS1GP62TF
BS 97 128 RS1BH86TF
BS 129 129 RS1GP62TF
BS 130 709 RS1BH86TF
BS 710 775 RS1BH86JQ

RD RS1BH86TF 709 0 0
GGGAATCAGATCAAACGCCTACGGCCAAAACAAGAGCGGGCAGAAGAAAGAGACGAGACA
TAAAAGTTTGAAGATGGGCGACACTTCCTCGATGCTGACTCAATACGACATTGAAGAAGT
CCAGAGCCGTTGCCAGGATCTATTTGAGCAGCAGGAGATACTCTCTCTGTACCAAAGGTT
CTGCCAGTTAGATCGAAACGCAAAGGGGTTTATATCATCTGATGAGTTTCTCTCTGTCCC
TGAGTTCGCCATGAACCCACTCTCTCAGAGGCTGCTTAAGATGGTTGACGGTTTGAACTT
TAAAGATTTTGTGGCCTTCTTGTCTGCTTTCAGTGCCAAGGCTAGTCTTAAACAAAAGGT
TAAACTTATCTTCCAAGTCTATGATTCTGACGGCAACGGGAAGGTCTCGTTTAAAGACAT
CATGGAAGTGTTGCGGGACTTATCTGGGACATTCATGTCTGATGAGCAAAGAGAGCAAGT
ACTGAGCCAGGTTTTGAAGGAAGCAGGCTACACGAATGACTCTTTCTTAACACTGGAGGA
TTTCATTAAGGTCTTTGGGAGTGGTAAACCGGAGATGGACGTTGAAATTCCTGTGGATTA
AGGGGATTTAAAGCTGAAAATCTCAATCATGTATTTGTCCACTTTGTTAGTAGAATAATC
CAACCTTGTTGATTTTGATCAAAATACCATCTCAAGCATGTTTTTGTCA

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1GP62JQ 252 0 0
GGGACATTCATGTCTGATGAGCAAAGAGAGCAAGTACTGAGCCAGGTTTTGAAGGAAGCA
GGCTACACGAATGACTCTTTCTTAACACTGGAGGATTTCATTAAGGTCTTTGGGAGTGGT
AAACCGGAGATGGACGTTGAAATTCCTGTGGATTAAGGGGATTTAAAGCTGAAAATCTCA
ATCATGTATTTGTCCACTTTGTTAGTAGAATAATCCAACCTTGTTGATTTTGATCAAAAT
ACCATCTCAAGC

QA 1 252 1 252
DS 

RD RS1GP62TF 678 0 0
GGA
AAAACAAGAGCGGGCAGAAGAAAGAGACGAGACATAAAAGTTTGAAGATGGGCAACACTT
CCTCGATGCCGACTCAATACGACATTGAAGAAGTCCAGAGCCATTGCCAGGATCTATTTG
AGCAGCAGGAGATACTCTCTCTGTACCAAAGGTTCTGCCAGTTAGATCGAAACGCAAAGG
GGTTTATATCATCTGATGAGTTTCTCTCTGTCCCTGAGTTCGCCATGAACCCACTCTCTC
AGAGGCTGCTTAAGATGGTTGACGGTTTGAACTTTAAAGATTTTGTGGCCTTCTTGTCTG
CTTTCAGTGCCAAGGCTAGTCTTAAACAAAAGGTTAAACTTATCTTCCAAGTCTATGATT
CTGACGGCAACGGGAAGGTCTCGTTTAAAGACATCATGGAAGTGTTGCGGGACTTATCTG
GGACATTCATGTCTGATGAGCAAAGAGAGCAAGTACTGAGCCAGGTTTTGAAGGAAGCAG
GCTACACGAATGACTCTTTCTTAACACTGGAGGATTTCATTAAGGTCTTTGGGAGTGGTA
AACCGGAGATGGACGTTGAAATTCCTGTGGATTAAGGGGATTTAAAGCTGAAAATCTCAA
TCATGTATTTGTCCACTTTGTTAGTAGAATAATCCAACCTTGTTGATTTTGATCAAAATA
CCATCTCAAGC
AAAA

QA 4 674 4 674
DS 

RD RS1BH86JQ 550 0 0
GTTTCTCTCTGTCCCTGAGTTCGCCATGAACCCACTCTCTCAGAGGCTGCTTAAGATGGT
TGACGGTTTGAACTTTAAAGATTTTGTGGCCTTTTTGTTTGCTTTCAGTGCCAAGGCTAG
TTTTAAACAAAAGGTTAAACTTATCTTCCAAGTCTATGATTCTGACGGCAACGGGAAGGT
CTCGTTTAAAGACATCATGGAAGTGTTGCGGGACTTATTTGGGACATTCATGTTTGATGA
GCAAAGAGAGCAAGTAATGAGCCAGGTTTTGAAGGAAGCAGGCTACACGAATGACTCTTT
TTTAACACTGGAGGATTTCATTAAGGTCTTTGGGAGTGGTAAACCGGAGATGGACGTTGA
AATTCCTGTGGATTAAGGGGATTTAAAGCTGAAAATCTCAATCATGTATTTGTCCACTTT
GTTAGTAGAATAATCCAACCTTGTTGATTTTGATCAAAATACCATTTCAAGCATGTTTTT
GTCAGTCCCAAAACTGACTTCAGCTTACATGTACGAATAACTTTCATCTTAAAAGCATTT
TTTTTTTATT

QA 1 550 1 550
DS 



AS 1 4

CO CL2132Contig1 1108 4 5 U
GGAGAACTCTCTCTCTCTCTCAAAGACACTCGTCTCAAAGGATCTCTGAAACCTAAAAAC
CAAGTTGGATCTGAGCTATATTTCTTAATATTCTGCTATCACGACTAAAAAATCCGGAGT
CATGTCGGTTTTACTTACTCTGTGTCTGGTTCTCTCCATGATTACCTATTCAAATGCTGC
GTATTGTGTATGCAAAGACGGGAACGAGCAAGTGCTTCAGAAAGCCATAGATTACGCATG
TGGAGCAGGAGCTGACTGTTCTCAGATCCAGCAGAACGGAGCTTGTTTCCAACCTAACAC
CATCAAAGCCCACTGCGACGTCGCTGTCAACAGTTACTACCAGAAGAAAGCTTCCTCCGG
TGCCACCTGTGACTTCAACGGCGCCGCTGTTATCTCTACCTCCCCTCCGTCAACTGCTTC
AAGCTGTTTAACTGGTTCCAGCTCTAGTGGGACACCAACCACAGGAACCCCAAGCACTGG
GACACCAAGCACAGGAACACCAACCACAGGAACCCCAAGCACTGGGACACCAACCAGTGG
CTTCCCATCCACCGGGACTCCGTCAACCGGGACACCCACTACCGGAATGCCTAGCACGGG
GACTCCTTCCACTTCAACTGGCATGCCGAACTTTGGCACGCCAGCAAACGGAATGCCAAC
TTCGTCTTCATCATCCGTGTTCCCTGGTACTACTCTTGGACCGACCGGGAGCGGTGGATT
CGCCGATCCTAACGCTGGAGAGAAGATCTCAGTCCGAACTAACGCTGCCTTCTTCTTACT
AACCGGTGTAGCTATTATGCTTGTGGTTTAGAAGAAACATCACGGTTGGGCTGAGACTTT
GCCAACGGCTTTATGAGGTTGCGCAAATCGGATAGAGCTGCTTTATCTTTTTTTTTTCCG
TTCACTTTTGCCTTTGTAGGGTTTCGAACTGGAGTTTACTATTATTAGGTTTGGCCGGGA
GACATCATGCTGGGTTAGTAGCTAGCTAGTAATATGGGATGTACAACTTAAAAGCGAGAT
CTTTTGACGTTATTTTGTAAATTCGGAGGATGAGATGCTCTTTTGTTTCTTTGAATCTTT
CTCTTTTAATACGTACCATCATGTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G365TF U 1
AF RS1G365JQ C 364
AF RS1FA64TF U 672
AF RS1DN87TF U 960
BS 1 602 RS1G365TF
BS 603 672 RS1G365JQ
BS 673 896 RS1FA64TF
BS 897 897 RS1G365JQ
BS 898 1108 RS1FA64TF

RD RS1G365TF 602 0 0
GGAGAACTCTCTCTCTCTCTCAAAGACACTCGTCTCAAAGGATCTCTGAAACCTAAAAAC
CAAGTTGGATCTGAGCTATATTTCTTAATATTCTGCTATCACGACTAAAAAATCCGGAGT
CATGTCGGTTTTACTTACTCTGTGTCTGGTTCTCTCCATGATTACCTATTCAAATGCTGC
GTATTGTGTATGCAAAGACGGGAACGAGCAAGTGCTTCAGAAAGCCATAGATTACGCATG
TGGAGCAGGAGCTGACTGTTCTCAGATCCAGCAGAACGGAGCTTGTTTCCAACCTAACAC
CATCAAAGCCCACTGCGACGTCGCTGTCAACAGTTACTACCAGAAGAAAGCTTCCTCCGG
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GACACCAAGCACAGGAACACCAACCACAGGAACCCCAAGCACTGGGACACCAACCAGTGG
CTTCCCATCCACCGGGACTCCGTCAACCGGGACACCCACTACCGGAATGCCTAGCACGGG
GA

QA 1 602 1 602
DS 

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CTGTTTAACTGGTTCCAGCTCTAGTGGGACACCAACCACAGGAACCCCAAGCACTGGGAC
ACCAAGCACAGGAACACCAACCACAGGAACCCCAAGCACTGGGACACCAACCAGTGGCTT
CCCATCCACCGGGACTCCGTCAACCGGGACACCCACTACCGGAATGCCTAGCACGGGGAC
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ATCATGCTGGGTTAGTAGCTAGCTAGTAATATGGGATGTACAACTTAAAAGCGAGATCTT
TTGACGTTATTTTGTAAATT

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DS 

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G
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CGCTGGAGAGAAGATCTCAGTCCGAACTAACGCTGCCTTCTTCTTACTAACCGGTGTAGC
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TTTTGTAAATTCGGAGGATGAGATGCTCTTTTGTTTCTTTGAATCTTTCTCTTTTAATAC
GTACCATCATGTCTCC

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DS 

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G
GACATCATGCTGGGTTAGTAGCTAGCTAGTAATATGGGATGTACAACTTAAAAGCGAGAT
CTTTTGACGTTATTTTGTAAATTCGGAGGATGAGATGCTCTTTTGTTTCTTTGAATCTTT
CTCTTTTAATACGTACC

QA 2 138 2 138
DS 



AS 1 3

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AAATAAGATAAACCAACGGCAACAACTTTTAAGAAGAACTGAAGAAGGTAAAACAAATGA
CAAATGTAGCACTTATTATTGGTCAAAACAACACACAAACAAAGTAGTCGACACTTCAAA
TGGCAAGAACCGAGTTCTTGTTAGCATTAGGAGCCTTGACATAAGCGACGAGCGAAGAAT
CTCCGGTTCTAGTCAATGTCTTGAGCTCATAACCCAACCAACACCTCGAACTCTTCCTAT
TGTAAAAAAACCCCAAACACTTACAATCTCTCGTACACTTGTCCCCACACGCTTTCTCCG
TCGCCGACGAGCCTCCGTTATACTTAGTCATAAAACTATCTGCTCCTTCGACCTTGAAAT
AATGAAACGTTTTGGGAACGCAGCTAGTCAAACTAGGAGTCTTACAAGTGACCTCGTCCC
AACCAAGAAGCCCTTTGTCGCTAGGACAAGCGTTACACTGTCCTTTGTTACACAAACCAA
ACTCACCACAATGCTCAGCGAGTCTACACTCATCATTACCGTCAGTATCAGCGTTTGTAA
ACGCCGTGTATGTGACGTCCCAAGCGGTTGAACTCGCTAACGTACTGTAACTCCAAACTC
TGACGTTTCCGTCTGATTCTAACCGAAGAAAACTCAACGTAGCGTTGTGTTTAGGCCGCG
AGAGGAAAGTGGAGACTTTGAACTGAGAACCGGAGTCCACCCCTTCCATGTGTAGACCCC
ACGTGGTGTCTGAATCCTCGACAGCTTGGAATGTCATTGACTGTAACTGAGTTATCTTCG
TAAAGAACTCATATTCGTAATAAGCGATTGGTTTCGGCGTTTTGTTTGTCGTGTAGTACA
AAACTAGCTTCTTGGCTTCCATCACGAGACTGTAAGGTCCGTTTGTGTTGACCGATGGAG
ACCTTCGGCTTACGAGCTTGTTCTGACCGTTGGCTTTCAAAGACTGTCCGACAAGAAGTG
CATCGGTCGGTGAATCAAAGCTTTGCCATAAGAACTTCCCGTTGGAATCGTATATTACCA
TATTGCCATTCTCCAAGATTTTGATACCAACGGCGTTTTTGTTAGCCGTGTTCGTCTGCC
ACACCACGCGACCATCGGCTTCGGCGAGTACTAGGTTTCCATCTTCGGCGAAAGTCAACG
TGGCGTCTTCTTTGACGGGAGAGTCTCTGTTTGCTTCCCATACCCAACGGAGAGTTGATT
CTTGGGCTCTGTTTCCAATTCTTAGAGCGAGAGTGTATGCGTTTGGAGTTGTGTTATAGA
AGCAGAGACGGAAGTTGTCGTTGAAGGGTTGGAAGCCACGTACGTCGGCATTGTATTCAA
TGGGACTGTAGTCAGTGTAGTCTCCTTCGTTCACCACTCGGAACTGCTCGTCGACGGGGA
CTTTGGCTTGTGCTCCGGTTAAGGAGAATATGGAAAGAGTGAGGAAGATGGCTAATGTGA
TTGAGGTTTTCATTTTTTTTTTGTTTATGTGGATTTGGTGTCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F287JQ U 1
AF RS1AB54JQ U 203
AF RS1AB54TF C 764
BS 1 411 RS1F287JQ
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RD RS1F287JQ 755 0 0
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AAATAAGATAAACCAACGGCAACAACTTTTAAGAAGAACTGAAGAAGGTAAAACAAATGA
CAAATGTAGCACTTATTATTGGTCAAAACAACACACAAACAAAGTAGTCGACACTTCAAA
TGGCAAGAACCGAGTTCTTGTTAGCATTAGGAGCCTTGACATAAGCGACGAGCGAAGAAT
CTCCGGTTCTAGTCAATGTCTTGAGCTCATAACCCAACCAACACCTCGAACTCTTCCTAT
TGTAAAAAAACCCCAAACACTTACAATCTCTCGTACACTTGTCCCCACACGCTTTCTCCG
TCGCCGACGAGCCTCCGTTATACTTAGTCATAAAACTATCTGCTCCTTCGATCTTGAAAT
AATGAAACGTTTTGGGATCGCAGCTAGTCAAACTAGGAGTCTTACAAGTGACCTCGTCCC
AACCAAGAAGCCCTTTGTCGCTAGGACAAGCGTTACACTGTCCTTTGTTACACAAACCAA
ACTCACCACAATGCTCAGCGAGTCTACACTCATCATTACCGTCAGTATCAGCGTTTGTAA
ACGCCGTGTATGTGACGTCCCAAGCGGTTGAACTCGCTAACGTACTGTAACTCCAAACTC
TGACGTTTCCGTCTGATTCTAACCGAAGAAAACTCAACGTAGCGTTGTGTTTAGGCCGCG
AGAGGAAAGTGGAGACTTTGAACTGAGAACCGGAG

QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1AB54JQ 784 0 0
AGCATTAGGAGCCTTGACATAAGCGACGAGCGAAGAATCTCCGGTTCTAGTCAATGTCTT
GAGCTCATAACCCAACCAACACCTCGAACTCTTCCTATTGTAGAAAAACCCTAAACACTT
ACAATCTCTCGTACACTTGTCCCCACACGCTTTCTCCGTCGCCGACGAGCCTCCGTTATA
CTTAGTCATAAAACTATCTGCTCCTTCGACCTTGAAATAATGAAACGTTTTGGGAACGCA
GCTAGTCAAACTAGGAGTCTTACAAGTGACCTCGTCCCAACCAAGAAGCCCTTTGTCGCT
AGGACAAGCGTTACACTGTCCTTTGTTACACAAACCAAACTCACCACAATGCTCAGCGAG
TCTACACTCATCATTACCGTCAGTATCAGCGTTTGTAAACGCCGTGTATGTGACGTCCCA
AGCGGTTGAACTCGCTAACGTACTGTAACTCCAAACTCTGACGTTTCCGTCTGATTCTAA
CCGAAGAAAACTCAACGTAGCGTTGTGTTTAGGCCGCGAGAGGAAAGTGGAGACTTTGAA
CTGAGAACCGGAGTCCACCCCTTCCATGTGTAGACCCCACGTGGTGTCTGAATCCTCGAC
AGCTTGGAATGTCATTGACTGTAACTGAGTTATCTTCGTAAAGAACTCATATTCGTAATA
AGCGATTGGTTTCGGCGTTTTGTTTGTCGTGTAGTACAAAACTAGCTTCTTGGCTTCCAT
CACGAGACTGTAAG*TCCGTTTGTGTTGACCGATGGAGACCTTCG*CTTACGAGCT
GTCTGACC

QA 1 776 1 776
DS 

RD RS1AB54TF 780 0 0
TC
CCATGTGTAGACCCCACGTGGTGTCTGAATCCTCGACAGCTTGGAATGTCATTGACTGTA
ACTGAGTTATCTTCGTAAAGAACTCATATTCGTAATAAGCGATTGGTTTCGGCGTTTTGT
TTGTCGTGTAGTACAAAACTAGCTTCTTGGCTTCCATCACGAGACTGTAAGGTCCGTTTG
TGTTGACCGATGGAGACCTTCGGCTTACGAGCTTGTTCTGACCGTTGGCTTTCAAAGACT
GTCCGACAAGAAGTGCATCGGTCGGTGAATCAAAGCTTTGCCATAAGAACTTCCCGTTGG
AATCGTATATTACCATATTGCCATTCTCCAAGATTTTGATACCAACGGCGTTTTTGTTAG
CCGTGTTCGTCTGCCACACCACGCGACCATCGGCTTCGGCGAGTACTAGGTTTCCATCTT
CGGCGAAAGTCAACGTGGCGTCTTCTTTGACGGGAGAGTCTCTGTTTGCTTCCCATACCC
AACGGAGAGTTGATTCTTGGGCTCTGTTTCCAATTCTTAGAGCGAGAGTGTATGCGTTTG
GAGTTGTGTTATAGAAGCAGAGACGGAAGTTGTCGTTGAAGGGTTGGAAGCCACGTACGT
CGGCATTGTATTCAATGGGACTGTAGTCAGTGTAGTCTCCTTCGTTCACCACTCGGAACT
GCTCGTCGACGGGGACTTTGGCTTGTGCTCCGGTTAAGGAGAATATGGAAAGAGTGAGGA
AGATGGCTAATGTGATTGAGGTTTTCATTTTTTTTTTGTTTATGTGGATTTGGTGTCC

QA 3 780 3 780
DS 



AS 1 4

CO CL2134Contig1 890 4 12 U
GGAGCATTTGTGGGAACTTATTACTACCCGACATTTAACTAGCGCCGCGCGGAGTCAGAG
CGAGAGCGAAAAAGGCAGAGAGAGAGAGAGAGACAAGAAGGATGTTCTTCCACATAGCGT
TGGAGCGAAACATGCAATTACATCCTCGATTCTTTGGTCGCAACCTTCGTGAAAATCTCG
TCTCTAAGCTCATGAAAGATGTCGAGGGCACTTGCAGTGGGCGACATGGGTTTGTAGTGG
CGATAACAGGAATAGAAAGCGTAGGGAAAGGATTGATCCGAGATGGGACTGCCTTCGTCA
CCTTCCCCGTTAAGTACCAGTGCGTTGTTTTCAGACCTTTCAAAGGCGAGATTTTGGAAG
CTGTTGTCACTTTGGTCAATAAGATGGGTTTCTTCGCTGAAGCTGGCCCTGTTCAGATTT
TTGTGTCCAAGCATTTGATTCCAGATGATATGGAGTTTCAGGCTGGAGACATGCCTAACT
ACACGACATCTGATGGATCAGTTAAGATCCAGAAAGAATGTGAAGTAAGGCTAAAGATTA
TTGGAACAAGAGTCGATGCCACTGAAATCTTTTGTGTGGGTACCATCAAAGACGATTTTT
TGGGAGTCATCAACGACCCTGCAGCCGCTGCATAAGCAACGGTTCCAGGCCGACTTCGCT
TTTGGTCCAGAAGATGCCATGTGATAAAAAGATGTAACATAGACCATCTACAAGTTGAAG
TTTATGGATATGTTTAATGTTTAATTTTGATTCGAGTGTAGTAGACGACTCTGTTCCTCT
ATAGTTTTCAAGAATGTATCCTCTTTAGCAAAAAGCTAGGACATGTACCTCCATGAGAAG
CTTTTGCCTACTACTCTCCAGTCATTTAAGTACAACGGCCATATTTTTGC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1GB94TF U 1
AF RS1CY05TF U 46
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TGGGAGTCATC

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DS 

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GGG
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T
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DS 



AS 1 4

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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RS1EU59JQ U 1
AF RS1AF02JQ U 10
AF RS1EU59TF C 22
AF RS1AF02TF C 32
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AGCA

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DS 

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G
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GGCTGCTGACACGTTTTGACCACTTGAACCGGACGGTCCGACCACAGTATTTTGGCTTGG
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AGTGTGTGTTAGGTTCTGGTTCGGGCTCTGAACAGAGAGCGAGGGAAGAGAGAAAGAGAG
GAGGCC

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CACATAATACATAGTATATAACTATATAATGTATGTGAATACGGGGTGGGGAGGAGGATT
ACACGGCGGCTGCAGCTCTCCCTCGGCCGGGTTTGGCTCTGGCTGGCACCGCAGATTCTT
TCGCCGGCCTAACTTTCTCTTTCCCCTCGTCCTGTGCCATTTGCTGTTCTCTGCACTCTG
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GGTTCTGGTTCGGGCTCTGAACAGAGAGCGAGGGAAGAGAGAAAGAGAGGAGG
GC

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AACTTTCTCTTTCCCCTCGTCCTGTGTCATTTGCTGTTCTCTGCACTCTGAGCTACAAAA
GGCCGTATCTCCCCTGTACATATAGATGTCACGGCCAGGAACAAGTAAGCGTTCACATAA
GGAGCAAGATCTCAAGAAATGTCCAGCGTCGGAAAACTCGCCTGAGTGTCTCCTCAGGTT
ACCTCTCGGTGGGACCATAGCTAAGAACCGTGGATCGACGGCTGCTGACACGTTTTGACC
ACTTGAACCGGACGGTCCGACCACAGTATTTTGGCTTGGACTCTGCTGAGTTGATGGTAC
CTCTGATTCGCTGGGAAGGTTCAGATTAAACTTTATCTCGGATAAACTCGTTGTTCTGTT
GATCGGTGGTCGTTGTCTCTTTCCAGGCAACATCGTGTCAGTGTGTGTTAGGTTCTGGTT
CGGGCTCTGAACAGAGAGCGAGGGAAGAGAGAAAGAGAGGAGG
CC

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 4

CO CL2136Contig1 1213 4 8 U
CCAGTAATAGATGTAACTTTTATTGGAGAAGGGATTCTCTCAGGTCGTACTCAGTACCCG
AACCATTGAGTTCCAAGTTTTAAAAAGGGTTTCAAGTGTTTTATCACAATGGATTTTTGA
GATGACCCTCTCATCTCGGCATCTCCCTCCCTTCAATAGTCTATCATCCTTCCTCTTAGT
ATCGCCTCCGCCTTACGCACCTCCTTCACGGGTCCAATCACAAATATCTTGTCAGGTGGA
CCCTTTGCCCCTCCAATTAGAATTTCAGCATTGCAAGCTTCCTTAATGGCAAGGATTGAT
GCCCCTTTCCTTCCAATCACACGTCCCATCTTTCCTGGTGGAACATCAAGCACTGACAAT
ATTTCTTCTTCAGGACATTGATCTCCGATCTTCAAGTTATCTGGAAGCGGCGGGACAGTT
GGCCAATTAGCAAAATCAGTATCATTCATGCAGCAAAAACACCTACAGTACAAAGAGCCA
AGAACTGCCAGGTGCCATAATGACCGCTGGCTCAGTTTGGCCATCATTTTGTGATAGAGA
TACAGAAGGAAGCGGACATCATCTGCGGCTGCACGGATCATGAGCTCAGTCATTAGCCTG
TATGTCCAGAACTTTGGGTCCT*GCCGCATGAGCACACGAACTTCTTCTTTCTCTTCATA
AGATATGCCGAAGTAGCGTGGATCAGCAAGGAGGGAAACAAACGATATGTAGTCATCTAG
AGGTCTCCTCCTGCCTTCTTGTTCTTCTATCAGAGAAAAAGCAATTTGAGTGTCCACAAC
ATTGTGCAACCTTATCCCAAACTGAAAGTACAAGGCCTCACTGTCACGTTTGCAATCGTG
AATGACTTTGGTGATGTAAGTAGACTCGAGTGCAGGCTTACATGCTCTCATAAGCACATC
TCCACCTTGGATGACACCAACCAGGTATATTGCATTAGGGAATGCAATCTGCATGATACA
AAGCTTGCCATGTCAGCAGAGGTCAACACCCTCGCAGTCAAAACCAACGACCAGCTTGTT
TTCAGGAGAAGGGTTTAAGAAATCAGCGGGAAGCTGCAAAGGCTCTGTCACTATGTGAAT
AGGAACAGGTGGCTCATTAGCATCTTGCGTAAATGACCTTCCTCCTGGCTCAGGAGGGAT
CGGGACGTGAGTACGCTGAGTTGGAGAAGACGACGCCATTTCGATCACAGCAGCAGCAGC
AGCATCGTTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EV48JQ U 1
AF RS1D657JQ U 8
AF RS1EV48TF C 520
AF RS1D657TF C 556
BS 1 480 RS1EV48JQ
BS 481 481 RS1D657JQ
BS 482 522 RS1EV48JQ
BS 523 632 RS1D657JQ
BS 633 916 RS1EV48TF
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BS 918 1201 RS1EV48TF
BS 1202 1213 RS1D657TF

RD RS1EV48JQ 522 0 0
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AACCATTGAGTTCCAAGTTTTAAAAAGGGTTTCAAGTGTTTTATCACAATGGATTTTTGA
GATGACCCTCTCATCTCGGCATCTCCCTCCCTTCAATAGTCTATCATCCTTCCTCTTAGT
ATCGCCTCCGCCTTACGCACCTCCTTCACGGGTCCAATCACAAATATCTTGTCAGGTGGA
CCCTTTGCCCCTCCAATTAGAATTTCAGCATTGCAAGCTTCCTTAATGGCAAGGATTGAT
GCCCCTTTCCTTCCAATCACACGTCCCATCTTTCCTGGTGGAACATCAAGCACTGACAAT
ATTTCTTCTTCAGGACATTGATCTCCGATCTTCAAGTTATCTGGAAGCGGCGGGACAGTT
GGCCAATTAGCAAAATCAGTATCATTCATGCAGCAAAAACACCTACAGTACAAAGAGCCA
CGAACTGCCAGGTGCCATAATGACCGCTGGCTCAGTTTGGCC

QA 1 522 1 522
DS 

RD RS1D657JQ 625 0 0
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GAGTTCCAAGTTTTAAAAAGGGTTTCAAGTGTTTTATCACAATGGATTTTTGAGATGACC
CTCTCATCTCGGCATCTCCCTCCCTTCAATAGTCTATCATCCTTCCTCTTAGTATCGCCT
CCGCCTTACGCACCTCCTTCACGGGTCCAATCACAAATATCTTGTCAGGTGGACCCTTTG
CCCCTCCAATTAGAATTTCAGCATTGCAAGCTTCCTTAATGGCAAGGATTGATGCTCCTT
TCCTTCCAATCACACGTCCCATCTTTCCTGGTGGAACATCAAGCACTGACAATATTTCTT
CTTCAGGACATTGATCTCCGATCTTCAAGTTATCTGGAAGCGGCGGGACAGTTGGCCAAT
TAGCAAAATCAGTATCATTCATGCAGCAGAGACACCTACAGTACAAAGAGCCAAGAACTG
CCAGGTGCCATAATGACCGCTGGCTCAGTTTGGCCATCATTTTGTGATAGAGATACAGAA
GGAAGCGGACATCATCTGCGGCTGCACGGATCATGAGCTCAGTCATTAGCCTGTATGTCC
AGAACTTTGGGTCCT*GCCGCATGA

QA 1 625 1 625
DS 

RD RS1EV48TF 691 0 0
GCCATCATTTTGTGATAGAGATACAGAAGGAAGCGGACATCATCTGCGGCTGCACGGATC
ATGAGCTCAGTCATTGGCCTGTATGTCCAGAACTTTGGGTCCT*GCCGCATGAGCACACG
AACTTCTTCTTTCTCTTCATAAGATATGCCGAAGTAGCGTGGATCAGCAAGGAGGGAAAC
AAACGATATGTAGTCATCTAGAGGTCTCCTCCTGCCTTCTTGTTCTTCTATCAGAGAAAA
AGCAATTTGAGTGTCCACAACATTGTGCAACCTTATCCCAAACTGAAAGTACAAGGCCTC
ACTGTCACGTTTGCAATCGTGAATGACTTTGGTGATGTAAGTAGACTCGAGTGCAGGCTT
ACATGCTCTCATAAGCACATCTCCACCTTGGATGACATCAACCAGGTATATTGCATTAGG
GAATGCAATCTGCATGATACAAAGCTTGCCATGTCAGCAGAGGTCAACACCCTCGCAGTC
AAAACCAACGACCAGCTTGTTTTCAGGAGAAGGGTTTAAGAAATCAGCGGGAAGCTGCAA
AGGCTCTGTCACTATGTGAATAGGAACAGGTGGCTCATTAGCATCTTGCGTAAATGACCT
TCCTCCTGGCTCAGGAGGGATCGGGACGTGAGTACGCTGAGTTGGAGAAGACGACGCCAT
TTCGATCACAGCAGCAGCAGCA
TCGTTGCCC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1D657TF 658 0 0
ACATCATCTGCGGCTGCACGGATCATGAGCTCAGTCATTAGC*TGTATGTCCAGAACTTT
GGGTCCTTGCCGCATGAGCACACGAACTTCTTCTTTCTCTTCATAAGATATGCCGCAGTA
GCGTGGATCAGCAAGGAGGGAAACAAACGATATGTAGTCATCTAGAGGTCTCCTCCTGCC
TTCTTGTTCTTCTATCAGAGAAAAAGCAATTTGAGTGTCCACAACATTGTGCAACCTTAT
CCCAAACTGAAAGTACAAGGCCTCACTGTCACGTTTGCAATCGTGAATGACTTTGGTGAT
GTAAGTAGACTCGAGTGCAGGCTTACATGCTCTCATAAGCACATCTCCACCTTGGATGAC
ACCAACCAGGTATATTGCATTAGGGAATGCAATCTGCATGATACAAAGCTTGCCATGTCG
GCAGAGGTCAACACCCTCGCAGTCAAAACCAACGACCAGCTTGTTTTCAGGAGAAGGGTT
TAAGAAATCAGCGGGAAGCTGCAAAGGCTCTGTCACTATGTGAATAGGAACAGGTGGCTC
ATTAGCATCTTGCGTCAATGACCTTCCTCCTGGCTCAGGAGGGATCGGGACGTGAGTACG
CTGAGTTGGAGAAGACGACGCCATTTCGATCACAGCAGCAGCAGCAGCATCGTTGCCC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 3

CO CL2137Contig1 434 3 6 U
ACTCTTCATGTTTTTTTCCTTAAATAACTCCTATATTTTTTTTACATTATGTATTGGTTT
TCTGCCACACCATTAGCTTTGTATTCAAATGTGGTTTGTACACAAAAGTTACAAAATAAT
GGTTACAAGCACAAATCAATGATCTTTAAGCTTCCTCTTCTCATGTTGATACAGTTGTCT
CCGACAAGTTTCGACGTCCAGACGCAGCCAATAGCTCATAATCCTGCACAATAAACTGAG
AGCAAAATTTGCCAGAAAGAACGGCGCCTTCCATGGAAGCTAAGTACTTCTGTTTAGTGT
AGTCTCCAGCTAAGTAAAAGCCTTGAATAGGAGATCTCTGTAGAGGACGACATGGTTCAC
AGTCTGGGATGGTCTTGTACACAGACCTTGGAGTTTTGACGACATGGTACTTGAGAATTT
TAGCTTTGCTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1G141JQ U 1
AF RS1E771JQ U 44
AF RS1E771TF C 44
BS 1 332 RS1G141JQ
BS 333 333 RS1E771JQ
BS 334 342 RS1G141JQ
BS 343 343 RS1E771JQ
BS 344 388 RS1G141JQ
BS 389 434 RS1E771JQ

RD RS1G141JQ 396 0 0
ACTCTTCATGTTTTTTTCCTTAAATAACTCCTATATTTTTTTTACATTATGTATTGGTTT
TCTGCCACACCATTAGCTTTGTATTCAAATGTGGTTTGTACACAAAAGTTACAAAATAAT
GGTTACAAGCACAAATCAATGATCTTTAAGCTTCCTCTTCTCATGTTGATACAGTTGTCT
CCGACAAGTTTCGACGTCCAGACGCAGCCAATAGCTCATAATCCTGCACAATAAACTGAG
AGCAAAATTTGCCAGAAAGAACGGCGCCTTCCATGGAAGCTAAGTACTTCTGTTTAGTGT
AGTCTCCAGCTAAGTAAAAGCCTTGAATAGGAAATCTCTGTAAAGGACGACATGGTTCAC
AGTCTGGGATGGTCTTGTACACAGACCT
GAGAGAGA

QA 1 388 1 388
DS 

RD RS1E771JQ 391 0 0
ACATTATGTATTGGTTTTCTGCCACACCATTAGCTTTGTATTCAAATGTGGTTTGTACAC
AAAAGTTACAAAATAATGGTTACAAGCACAAATCAATGATCTTTAAGCTTCCTCTTCTCA
TGTTGATACAGTTGTCTCCGACAAGTTTCGACGTCCAGACGCAGCCAATAGCTCATAATC
CTGCACAATAAACTGAGAGCAAAATTTGCCAAAAAGAACGGCGCCTTCCATGGAAGCTAA
GTACTTCTGTTTAGTGTAGTCTCCAGCTAAGTAAAAGCCTTGAATAGGAGATCTCTGTAG
AGGACGACATGGTTCACAGTCTGGGATGGTCTTGTACACAGACCTTGGAGTTTTGACGAC
ATGGTACTTGAGAATTTTAGCTTTGCTTTGC

QA 1 391 1 391
DS 

RD RS1E771TF 391 0 0
ACATTATGTATTGGTTTTCTGCCACACCATTAGCTTTGTATTCAAATGTGGTTTGTACAC
AAAAGTTACAAAATAATGGTTACAAGCACAAATCAATGATCTTTAAGCTTCCTCTTCTCA
TGTTGATACAGTTGTCTCCGACAAGTTTCGACGTCCAGACGCAGCCAATAGCTCATAATC
CTGCACAATAGACTGAGAGCAAAATTTGCCAGAGAGAACGGCGCCTTCCATGGAAGCTAA
GTACTTCTGTTTAGTGTAGTCTCCAGCTAAGTAAAAGCCTTGAATAGGAGATCTCTGTAG
AGGACGACATGGTTCACAGTCTGGGATGGTCTTGTACACAGACCTTGGAGTTTTGACGAC
ATGGTACTTGAGAATTTTAGCTTTGCTTTGC

QA 1 391 1 391
DS 



AS 1 4

CO CL2138Contig1 964 4 9 U
GGGTGAAAGCTCAAAGGATGAAAGTTCCAAGGGTGAAAGCTCAAAGGATGAAAGCTCCAA
GGAAGAAAGTTCCAAAGGTGAAAGCTCCAAAGATGAAAGCTCAACTGGATCAGAAGAAAG
TTCCAAGGGTGCTAGTGGTGCAAGCTCTAATGAAGAAAGCTCTACCGAGGCCCAAAGTGA
AACTGGTGCCGAAAGTGGAGCATCTGCGGGTGCCCCGAGTGGAGGTCCAACCTCTGGCGA
CGCTGGTGCTGGTGGTCCAAGCGGAAGTTCATCTGATATGTCGGCAGGAGGAGCAACCGG
AAGCACTTCAGGCAGTGGGAGTGCAACTTCGACTCAAACCTCTGCCGAAGGAGAAAGTGC
AATGAATAGCGGAGCTTCTTTCTCGGACACTACAGGTGGTAGCGGCACGGAAGCTCCCGC
CAGTAGCCCCTCTGGTTCAGCTTCAGCTTCAGGTAGTAGTGAAGCCTCCTCCTTAAGTGG
AGACTCATCTTTGCAAGCTGGAGGTTCATCCACCGGTGCCGCAAGTGGAAGTGCAACTGA
TGTCTCTGCCCAAGGAGAGAGTTCGATGAAGGGAAGCATCGCATCTAAAAAAAGTTCTGC
TAGCTACAAGAAGTCACACAAAGAATCCTCAGACCAGAGCAGCTTCAAGCATTCCTCAGA
GGAGATAAAAGCCGGCTCTTCTTCAAATTAAACTCGTCGGTTCTCGGACCAAATAGGTCA
AACACATATTAAATACAATAATTTTTAATGAAGCAATGGCCCTGCTGAATTACAGCAGCG
AGCTGTAGAATGTTTTTGCTAAATACTAGAGAATTATTGACATGCGTTAGCCTTACTGCA
TGCATAATTTTTTTCTTTACTTTAAATGCCGTTGTAAAATATGAATATGAAAGAATTGTG
AGTATATGTATACATTATACATTAAATAGTGAGAAAGTAATAATAATAAATTATATGCCA
TATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 

AF RS1GR66TF U 1
AF RS1FM12TF U 147
AF RS1GR66JQ C 462
AF RS1FM12JQ C 383
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BS 698 766 RS1FM12TF
BS 767 855 RS1FM12JQ
BS 856 857 RS1GR66JQ
BS 858 964 RS1FM12JQ

RD RS1GR66TF 697 0 0
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GGAAGAAAGTTCCAAAGGTGAAAGCTCCAAAGATGAAAGCTCAACTGGATCAGAAGAAAG
TTCCAAGGGTGCTAGTGGTGCAAGCTCTAATGAAGAAAGCTCTACCGAGGCCCAAAGTGA
AACTGGTGCCGAAAGTGGAGCATCTGCGGGTGCCCCGAGTGGAGGTCCAACCTCTGGCGA
CGCTGGTGCTGGTGGTCCAAGCGGAAGTTCATCTGATATGTCGGCAGGAGGAGCAACCGG
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AATGAATAGCGGAGCTTCTTTCTCGGACACTACAGGTGGTAGCGGCACGGAAGCTCCCGC
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AGACTCATCTTTGCAAGCTGGAGGTTCATCCACCGGTGCCGCAAGTGGAAGTGCAACTGA
TGTCTCTGCCCAAGGAGAGAGTTCGATGAAGGGAAGCATCGCATCTAAAAAAAGTTCTGC
TAGCTACAAGAAGTCACACAAAGAATCCTCAGACCAGAGCAGCTTCAAGCATTCCTCAGA
GGAGATAAAAGCCGGCTCTTCTTCAA*TTAAACTCGT

QA 1 697 1 697
DS 

RD RS1FM12TF 620 0 0
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CGAGTGGAGGTCCAACCTCTGGCGATTCTGGTGCTGGTGGTCCAAGCGGAAGTTCATCTG
ATATGTCGGCAGGAGGAGCAACCGGAAGCACTTCAGGCAGTGGGAGTGCAACTTCGACTC
AAACCTCTGCCGAAGGAGAAAGTGCAATGAATAGCGGAGCTTCTTTCTCGGACACTACAG
GTGGTAGCGGCACGGAAGCTCCCGCCAGTAGCCCCTCTGGTTCAGCTTCAGCTTCAGGTA
GTAGTGAAGCCTCCTCCTTAAGTGGAGACTCATCTTTGCAAGCTGGAGGTTCATCCACCG
GTGCCGCAAGTGGAAGTGCAACTGATGTCTCTGCCCAAGGAGAGAGTTCGATGAAGGGAA
GCATCGCATCTAAAAAAAGTTCTGCTAGCTACAAGAAGTCACACAAAGAATCCTCAGACC
AGAGCAGCTTCAAGCATTCCTCAGAGGAGATAAAAGCCGGCTCTTCTTCAAATTAAACTC
GTCGGTTCTCGGACCAAATAGGTCAAACACATATTAAATACAATAATTTTTAATGAAGCA
ATGGCCCTGCT

QA 10 620 10 620
DS 

RD RS1GR66JQ 498 0 0
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CATCTAAAAAAAGTTCTGCTAGCTACAAGAAGTCACACAAAGAATCCTCAGACCAGAGCA
GCTTCAAGCATTCCTCAGAGGAGATAAAAGCCGGCTTTTCTTCAAATTAAACTCGTCGGT
TCTCGGACCAAATAGGTCAAACACATATTAAATACAATAATTTTTAATAAAGCAATGGCC
CTGCTGAATTACAGCAGCGAGCTGTAGAATGTTTTTGCTAAATACTAGAGAATTATTGAC
ATGCGTTAGCCTTACTGTATGCATAATTTTTTTTTTTACTTTAAATGCCGTTGTAAAATA
TGAATATGAAAGAATTGTGAGTATATGTATACATTATACATTAAATAGTGAGAAAGTAAT
AATAATAAATTATATGCC

QA 1 498 1 498
DS 

RD RS1FM12JQ 582 0 0
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TCAGCTTCAGGTAGTAGTGAAGCCTCCTCCTTAAGTGGAGACTCATCTTTGCAAGCTGGA
GGTTCATCCACCGGTGCCGCAAGTGGAAGTGCAACTGATGTCTCTGCCCAAGGAGAGAGT
TCGATGAAGGGAAGCATCGCATCTAAAAAAAGTTCTGCTAGCTACAAGAAGTCACACAAA
GAATCCTCAGACCAGAGCAGCTTCAAGCATTCCTCAGAGGAGATAAAAGCCGGCTCTTCT
TCAAATTAAACTCGTCGGTTCTCGGACCAAATAGGTCAAACACATATTAAATACAATAAT
TTTTAATGAAGCAATGGCCCTGCTGAATTACAGCAGCGAGCTGTAGAATGTTTTTGCTAA
ATACTAGAGAATTATTGACATGCGTTAGCCTTACTGCATGCATAATTTTTTTC**TACTT
TAAATGCCGTTGTAAAATATGAATATGAAAGAATTGTGAGTATATGTATACATTATACAT
TAAATAGTGAGAAAGTAATAATAATAAATTATATGCCATATC

QA 1 582 1 582
DS 



AS 1 4

CO CL2139Contig1 1507 4 24 U
AGTTATAGCATCACAACATGTAACAAGTAGATGATAAAAGGTTTCGGCTGTGAGGTTACA
CATAGATTGAGAAGCAACAAGTCACGAGTTATAAAAAGAGAAAACGAGACTAGAAACAAA
GTGTGTAATCATGCTTCAACCTTCTGAGATTTGTTCCAGCGACCACCGGGGGAATCAGAT
CCCCTCTTTCTCCCGAATCTTCCTCCTCGTTTTCCTCCCCTTCCTCCACGGCCACCCTTG
TCAAACCTGTCTTTGCTGCGAAGAAGACCCCAGTACTCCTTTTCAGCTTCGCCTGTAAGA
GGTTCTAGGACAGCTATAAAATTCTTCACGGCTAGTCCGCCTTCTTTAGCTAATACTGCA
GCAGCACGGGGTTTCTGGGATGCTTCTGGTTCATCAAACCTTAGGTAACCCGTCTCAGAT
CCCATCTTGAAATCAACAAACTTGACATCACCGAATTTTCCAAAAACGGCCTTAAGATCC
TCACGCAAGACAACATCTTTATTATCCTTATGGGTAGCTAGAGCACCACCCTTTTCTTCT
TTCTCACCATCATCATCTTACCCCTCTGTTCCTTGTCCCTGTGACTTGTCAGTGTTTTCT
TTACCCGCAGCAGGATTATCTTCCGGCTTTGATTCACTTTCCTCCATTTTTTTATCAGCT
GCCTCCTCAGAACTCTTTTCTTGAGCACCTTCTTCAGTCGAGCGCTTTAGAGTGAAGGAA
ATGATCAAACCCTTGGGATAGTTTGCCTCGGATTCAGAACCGTTCCTATGATCAGAGCCG
TTCTTCTGATTTGCAGAAGC*TTTTGAGGACGGTAGTTAGCAAACTTTTCTTCATCTTTC
TCTCTTTCATCATCAAACTCTTTCTTTGTTTTCATCTCCAACTCGAGACCAGCAAAGACC
AAACTTTGCTTCATAACATTCTGGGCCTCCTCTTCAGTAGGGAACTCAACCAAGGCAACA
CCACTAAACACTCTCGTCTCAGCTACATGACGAGGCATCCTCACACTATTAACCTTTCCG
TACTGACTGAAGAATGCTTCCACGTCTTCCCTCTTAACATCATACGAGAAGGGTGAAACA
GCTACAGTTCTAGCATTAAGCTGTTCAATCAAATCTTCTAGCTTCAACAGTTCTGTACTC
CTACCCACCTTTTTCCCATCTTCAGAAACCTTGAGAGCCTTGGAGGTGCGAAGAGTATCA
GCAACAGCTTTGATGGTATCTTCAGGAACCTCATCTCCTTTGGAATCACCCAACTTCAAA
TACGCTCTCATCTTACTGAAGGAACATATCAACCCCAAACTAACCAATCCATCTTCACTC
TCTCTAACAGTCTTCTTGAGGAAATCATCAATCGGGAGATTACTATCACTGAAGTAGAAC
TCCACCTGGCGTAGCACTGATTTGGCCGTCTCTTCGGTTAGACAAGGAATCGACATTCTT
TCTTCGCTGAGAGGTTAGAGAGAGAGGCAGAAGAAGCAGAGGATATTAGGGTTTAATGCA
GCTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1CE88JQ U 1
AF RS1BD55JQ U 543
AF RS1CE88TF C 738
AF RS1BD55TF C 789
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CATAGATTGAGAAGCAACAAGTCACGAGTTATAAAAAGAGAAAACGAGACTAGAAACAAA
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CCCCTCTTTCTCCCGAATCTTCCTCCTCGTTTTCCTCCCCTTCCTCCACGGCCACCCTTG
TCAAACCTGTCTTTGCTGCGAAGAAGACCCCAGTACTCCTTTTCAGCTTCGCCTGTAAGA
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CCCATCTTGAAATCAACAAACTTGACATCACCGAATTTTCCAAAAACGGCCTTAAGATCC
TCACGCAAGACAACATCTTTATTATCCTTATGGGTAGCTAGAGCACCACCCTTTTCTTCT
TTCTCACCATCATCATCTTCCCCCTCTGTTCCTTGTCCCTGTGACTTGTCAGTGTTTTCT
TTACCCGCAGCAGGATTATCTTCCGGCTTTGATTCACTTTCCTCCATTTTTTTATCAGCT
GCCTCCTCAGAACTCTTTTCTTGAGCACCTTCTTCAGTCGAGCGCTTT

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DS 

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CTTCTGATTTGCAGAAGCCTTTTGAGGACGGTAGTTAGCAAACTTTTCTTCATCTTTCTC
TCTTTCATCATCAAACTCTTTCTTTGTTTTCATCTCCAACTCGAGACCAGCAAAGACCAA
ACTTTGCTTCATAACATTCTGGGCCTCCTCTTCAGTAGGGAACTCAACCAAGGCAACACC
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CTGACTGAAGAATGCTTCCACGTCTTCCCTCTTAACATCATACGAGAAGGGTGAAACAGC
TACAGTTCTAGCATTAAGCTGTTCAATCAAATCTTCTAGCTTCAACAGTTCTGTACTCCT
ACCCACCTTTTTCCCATCTTCAGAAACCTTGAGAGCCTTGGAGGTGCGAAGAGTATCAGC
AACAGCTTTGATGGTATCTTCAGGAACCTCATCTCCTTTGGAATCACCCAACTTCAAATA
CGCTCTCATCTTACTGAAGGA*CATATCAACCCCAAACTAACCAATCCATCTTCACTCTC
TCTA*CAGTCTTCTTGAG**AATCATCA*TCGGGAGAT*ACTATCACTGA*GTAGA*CTC
C*CCTGGCGTAGCACTGATT
GGCGTCTCT

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GGATAGTTTGCTCGGA
TCAGAACCGTTC*TATGAT*AGAGCCGTTCTTCTGATTTGCAGAAGC*TTTTGAGGACGG
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ATCTCCAACTCGAGACCAGCAAAGACCAAACTTTGCTTCATAACATTCTGGGCCTCCTCT
TCAGTAGGGAACTCAACCAAGGCAACACCACTAAACACTCTCGTCTCAGCTACATGACGA
GGCATCCTCACACTATTAACCTTTCCGTACTGACTGAAGAATGCTTCCACGTCTTCCCTC
TTAACATCATACGAGAAGGGTGAAACAGCTACAGTTCTAGCATTAAGCTGTTCAATCAAA
TCTTCTAGCTTCAACAGTTCTGTACTCCTACCCACCTTTTTCCCATCTTCAGAAACCTTG
AGAGCCTTGGAGGTGCGAAGAGTATCAGCAACAGCTTTGATGGTATCTTCAGGAACCTCA
TCTCCTTTGGAATCACCCAACTTCAAATACGCTCTCATCTTACTGAAGGAACATATCAAC
CCCAAACTAACCAATCCATCTTCACTCTCTCTAACAGTCTTCTTGAGGAAATCATCAATC
GGGAGATTACTATCACTGAAGTAGAACTCCACCTGGCGTAGCACTGATTTGGCCGTCTCT
TCGGTTAGACAAGGAATCGACATTCTTTCTTCGCTGAGAGGTT
CCCCA

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DS 

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GA
TTGCAGAAGC*TTTTGAGGACGGTAGTTAGCAA*CTTTTCTTCATCTTTCTCTCTTTCAT
CATCAAACTCTTTCTTTGTTTTCATCTCCAACTCGAGACCAGCAAAGACCAAACTTTGCT
TCATAACATTCTGGGCCTCCTCTTCAGTAGGGAACTCAACCAAGGCAACACCACTAAACA
CTCTCGTCTCAGCTACATGACGAGGCATCCTCACACTATTAACCTTTCCGTACTGACTGA
AGAATGCTTCCACGTCTTCCCTCTTAACATCATACGAGAAGGGTGAAACAGCTACAGTTC
TAGCATTAAGCTGTTCAATCAAATCTTCTAGCTTCAACAGTTCTGTACTCCTACCCACCT
TTTTCCCATCTTCAGAAACCTTGAGAGCCTTGGAGGTGCGAAGAGTATCAGCAACAGCTT
TGATGGTATCTTCAGGAACCTCATCTCCTTTGGAATCACCCAACTTCAAATACGCTCTCA
TCTTACTGAAGGAACATATCAACCCCAAACTAACCAATCCATCTTCACTCTCTCTAACAG
TCTTCTTGAGGAAATCATCAATCGGGAGATTACTATCACTGAAGTAGAACTCCACCTGGC
GTAGCACTGATTTGGCCGTCTCTTCGGTTAGACAAGGAATCGACATTCTTTCTTCGCTGA
GAGGTTAGAGAGAGAGGCAGAAGAAGCAGAGGATATTAGGGTTTAATGCAGCTTCCC

QA 3 719 3 719
DS 



AS 1 4

CO CL2140Contig1 719 4 4 U
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AAAAACTGTGAGGAAGCTTGCAAGAGTGCAGCATCTATATTCTCAATTGGCAGGGAAGCT
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TGGGCTTCCAGCTGAAGAAGCCAGGCTTTTGATTAAGGAAATAGAATCATTCGATAGAGG
AATGTACGCGGGACCTATTGGTTTCTTTGGTGGTGAAGAGAGTGAGTTTGCAGTTGGGAT
CAGATCAGCTCTAGTCGAAAAGGGTCTTGGGGCATTGATCTACGCGGGGACAGGGATAGT
AGCAGGAAGCAACCCAACCTCAGAGTGGAATGAACTTGACCTTAAGATATCTCAGTTCAC
CAAGTCAATTGAGTGTGAGGCAGCAGCAACAAGTACAACTCTGCAAACAATTAATTGAAG
AAAAGAGTAACAACATTTGTTTTTTTTT*CTTCTTTTAATTGTATGGGAATGGGGTCAGG
TTACAATATAAAAATCAGTGTGTTTGTTTGTATACGTTGTATTTTTTTTTTAAAGAAGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1GC67TF U 1
AF RS1GA04TF U 1
AF RS1GC67JQ C 35
AF RS1GA04JQ C 410
BS 1 628 RS1GA04TF
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AATGTACGCGGGACCTATTGGTTTCTTTGGTGGTGAAGAGAGTGAGTTTGCAGTTGGGAT
CAGATCAGCTCTAGTCGAAAAGGGTCTTGGGGCATTGATCTACGCGGGGACAGGGATAGT
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CAAGTCAATTGAGTGTGAGGCAGCAGCAACAAGTACAACTCTGCAAACAATTAATTGAAG
AAAAGAGTAACAACATTTGTTTTTTTTT*CTTCTTTTAATTGTATGGGAATGGGG

QA 1 655 1 655
DS 

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TGGGCTTCCAGCTGAAGAAGCCAGGCTTTTGATTAAGGAAATAGAATCATTCGATAGAGG
AATGTACGCGGGACCTATTGGTTTCTTTGGTGGTGAAGAGAGTGAGTTTGCAGTTGGGAT
CAGATCAGCTCTAGTCGAAAAGGGTCTTGGGGCATTGATCTACGCGGGGACAGGGATAGT
AGCAGGAAGCAACCCAACCTCAGAGTGGAATGAACTTGACCTTAAGATATCTCAGTTCAC
CAAGTCAATTGAGTGTGAGGCAGCAGCAACAAGTACAACTCTGCAAACAATTAATTGAAG
AAAAGAGTAACAACATTTGTTTTTTTTTTCTTCTTTTAATTGTATGGGAATGGGGTCAGG
TTACAATATAAA

QA 1 672 1 672
DS 

RD RS1GC67JQ 685 0 0
CCTAGATCTGCTTCCACCGCACGTGATATGGAGATAGAGCGTGACTTACTAACCAGCCCC
AAAGACGACCTTGAGTTCTCTATTGTACGAGAGAATATAAGAGAAAAGTTAAACTCTATA
TGTGACAAGGTGGTTGTTAAGCCTCAAAAAACTGTGAGGAAGCTTGCAAGAGTGCAGCAT
CTATATTCTCAATTGGCAGGGAAGCTCAGGAGAGAAGATGATGAGTTTGACATCTTGGCT
GCTCTGCATCCAACACCAGCTGTTTGTGGGCTTCCAGCTGAAGAAGCCAGGCTTTTGATT
AAGGAAATAGAATCATTCGATAGAGGAATGTACGCGGGACCTATTGGTTTTTTTGGTGGT
GAAGAGAGTGAGTTTGCAGTTGGGATCAGATCAGCTCTAGTCGAAAAGGGTCTTGGGGCA
TTGATTTACGCGGGGACAGGGATAGTAGCAGGAAGCAACCCAACCTCAGAGTGGAATGAA
CTTGACCTTAAGATATTTCAGTTCACCAAGTCAATTGAGTGTGAGGCAGCAGCAACAAGT
ACAACTTTGCAAACAATTAATTGAAGAAAAGAGTAACAACATTTGTTTTTTTTT*CTTCT
TTTAATTGTATGGGAATGGGGTCAGGTTACAATATAAAAATCAGTGTGTTTGTTTGTATA
CGTTGTATTTTTTTTTTAAAGAAGA

QA 1 685 1 685
DS 

RD RS1GA04JQ 310 0 0
GCAGTTGGGATCAGATCAGCTTTAGTCGAAAAGGGTCTTGGGGCATTGATTTACGCGGGG
ACAGGGATAGTAGCAGGAAGCAACCCAACCTCAGAGTGGAATGAACTTGACCTTAAGATA
TTTCAGTTCACCAAGTCAATTGAGTGTGAGGCAGCAGCAACAAGTACAACTTTGCAAACA
ATTAATTGAAGAAAAGAGTAACAACATTTGTTTTTTTTT*CTTCTTTTAATTGTATGGGA
ATGGGGTCAGGTTACAATATAAAAATCAGTGTGTTTGTTTGTATACGTTGTATTTTTTTT
TTAAAGAAGA

QA 1 310 1 310
DS 



AS 1 4

CO CL2141Contig1 971 4 6 U
GGCAGAAAAAGTAAGAGGCATTCATTCACACAAGAAGACACTTTGAGAAACGTTTAAAAA
TCAGACAGACAGACAAACAAACAAAAAAGAAGTGAGGTGATATGAAATGTTATTACATAA
TAAGATTTGATGAGGAGAGGGGGGAGCATCAGGAGTCGGGTAGTCTCATCTGTACGATCT
CAGCAGGTGGACGCAGCGTGCAAACCATCTCTCTCGTCTTGCCAAAGTAAACCTGATCAA
GTGAGTTTCTCAGTTTGCCTTCCAATTCTTCAATCATTCTCCCCATATTGCATAAATGCC
CCTCCGCTACAGCAAGCTCCATTTTCATTTGTCTTCTAATTGATCCGGATAAGCCGAATT
TGCCAGAGGGCTCGTCATCGGTGGTCAGAGAGAGCATAATAGTACTTGTTAAGCAGTACT
GTGCCATTTCCTCCTCCTCTGGACCAACCTGGATAACATGTATGGCATCCCAAGCTCCTT
CTTCCAGGCATCCCCTCCGACCATGTCCTGACTTTGACCCATCTTTCTTGATAAGGAAAC
ATGCCACAAAGCCTTCATTATCATCCTCCTCCCACATGTACACTGAAGATATTCCTCCTT
CATAATACTGGTCACGATAGATAGCAAAGATGTCGTTGGCTTCAACTTCGAGCTTTCTCA
ATTCTGATGACGGGTACAGAGCATCCTCTAGCGGAGGATGGTACTTGTTTGACCAAGGTG
ACCTGTAGGAATCAGCATCTCTGTTGTACTCACACAAGATGAAATCTTTCCTGCTTTCAG
CATCACGTAACACCTGGAGAGGGAGATCGACTTGAGAGAGGAGATCGGAAGAATGTTGAG
GCAAGAGGCTGAGTAGTGCTGACAGAGCCGTTTCCGATTGCTTCGGCGGCATTCTTCTTA
GAAGCCCCAAAGCTGCCTCCATTTTGTTTTTTCAACCTCTGTCGCGCCGGAGAAATCAAT
CTCTCCGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GM73JQ U 1
AF RS1FY47JQ U 5
AF RS1GM73TF C 263
AF RS1FY47TF C 272
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BS 663 945 RS1GM73TF
BS 946 971 RS1FY47TF

RD RS1GM73JQ 598 0 0
GGCAGAAAAAGTAAGAGGCATTCATTCACACAAGAAGACACTTTGAGAAACGTTTAAAAA
TCAGACAGACAGACAAACAAACAAAAAAGAAGTGAGGTGATATGAAATGTTATTACATAA
TAAGATTTGATGAGGAGAGGGGGGAGCATCAGGAGTCGGGTAGTCTCATCTGTACGATCT
CAGCAGGTGGACGCAGCGTGCAAACCATCTCTCTCGTCTTGCCAAAGTAAACCTGATCAA
GTGAGTTTCTCAGTTTGCCTTCCAATTCTTCAATCATTCTCCCCATATTGCATAAATGCC
CCTCCGCTACAGCAAGCTCCATTTTCATTTGTCTTCTAATTGATCCGGATAAGCCGAATT
TGCCAGAGGGCTCGTCATCGGTGGTCAGAGAGAGCATAATAGTACTTGTTAAGCAGTACT
GTGCCATTTCCTTCTCCTCTGGACCAACCTGGATAACATGTATGGCATCCCAAGCTCCTT
CTTCCAGGCATCCCCTCCGACCATGTCCTGACTTTGACCCATCTTTCTTGATAAGGAAAC
ATGCCACAAAGCCTTCATTATCATCCTCCTCCCACATGTACACTGAAGATATTCCTCC

QA 1 598 1 598
DS 

RD RS1FY47JQ 658 0 0
GAG
AAAGTAAGAGGCATTCATTCACACAAGAAGACACTTTGAGAAACGTTTAAAAATCAGACA
GACAGACAAATAAACAAAAAAGAAGTGAGGTGATATGAAATGTTATTACATAATAAGATT
TGATGAGGAGAGGGGGGAGCATCAGGAGTCGGGTAGTCTCATCTGTACGATCTCAGCAGG
TGGACGCAGCGTGCAAACCATCTCTCTCGTCTTGCCAAAGTAAACCTGATCAAGTGAGTT
TCTCAGTTTGCCTTCCAATTCTTCAATCATTCTCCCCATATTGCATAAATGCCCCTCCGC
TACAGCAAGCTCCATTTTCATTTGTCTTCTAATTGATCCGGATAAGCCGAATTTGCCAGA
GGGCTCGTCATCGGTGGTCAGAGAGAGCATAATAGTACTTGTTAAGCAGTACTGTGCCAT
TTCCTCCTCCTCTGGACCAACCTGGATAACATGTATGGCATCCCAAGCTCCTT**TCCAG
GCATCCCCTCCGACCATGTCCTGACTTTGACCCATCTTTCTTGATAAGGAAACATGCCAC
AAAGCCTTCATTATCATCCTCCTCCCACATGTACACTGAAGATATTCCTCCTTCATAATA
CTGGTCACGATAGATAGCAAAGATGTCGTTGGCTTCAACTTCGAGCTTTCTCAAT

QA 4 658 4 658
DS 

RD RS1GM73TF 685 0 0
CAATTCTTCAATCATTCTCCCCATATTGCATAAATGCCCCTCCGCTACAGCAAGCTCCAT
TTTCATTTGTCTTCTAATTGATCCGGATAAGCCGAATTTGCCAGAGGGCTCGTCATCGGT
GGTCAGAGAGAGCATAATAGTACTTGTTAAGCAGTACTGTGCCATTTCCTTCTCCTCTGG
ACCAACCTGGATAACATGTATGGCATCCCAAGCTCCTTCTTCCAGGCATCCCCTCCGACC
ATGTCCTGACTTTGACCCATCTTTCTTGATAAGGAAACATGCCACAAAGCCTTCATTATC
ATCCTCCTCCCACATGTACACTGAAGATATTCCTCCTTCATAATACTGGTCACGATAGAT
AGCAAAGATGTCGTTGGCTTCAACTTCGAGCTTTCTCAATTCTGATGACGGGTACAGAGC
ATCCTCTAGCGGAGGATGGTACTTGTTTGACCAAGGTGACCTGTAGGAATCAGCATCTCT
GTTGTACTCACACAAGATGAAATCTTTCCTGCTTTCAGCATCACGTAACACCTGGAGAGG
GAGATCGACTTGAGAGAGGAGATCGGAAGAATGTTGAGGCAAGAGGCTGAGTAGTGCTGA
CAGAGCCGTTTCCGATTGCTTCGGCGGCATTCTTCTTAGAAGCCCCAAAGCTGCCTCCAT
TTTGTTTTTTCAACCTCTGTCGC
CC

QA 1 683 1 683
DS 

RD RS1FY47TF 700 0 0
AATCATTCTCCCCATATTGCATAAATGCCC*TCCGCTACAGCAAGCTCCATTTTCATTTG
TCTTCTAATTGATCCGGATAAGCCGAATTTGCCAGAGGGCTCGTCATCGGTGGTCAGAGA
GAGCATAATAGTACTTGTTAAGCAGTACTGTGCCATTTCCTCCTCCTCTGGACCAACCTG
GATAACATGTATGGCATCCCAAGCTCCTT**TCCAGGCATCCCCTCCGACCATGTCCTGA
CTTTGACCCATCTTTCTTGATAAGGAAACATGCCACAAAGCCTTCATTATCATCCTCCTC
CCACATGTACACTGAAGATATTCCTCCTTCATAATACTGGTCACGATAGATAGCAAAGAT
GTCGTTGGCTTCAACTTCGAGCTTTCTCAATTCTGATGACGGGTACAGAGCATCCTCTAG
CGGAGGATGGTACTTGTTTGACCAAGGTGACCTGTAGGAATCAGCATCTCTGTTGTACTC
ACACAAGATGAAATCTTTCCTGCTTTCAGCATCACGTAACACCTGGAGAGGGAGATCGAC
TTGAGAGAGGAGATCGGAAGAATGTTGAGGCAAGAGGCTGAGTAGTGCTGACAGAGCCGT
TTCCGATTGCTTCGGCGGCATTCTTCTTAGAAGCCCCAAAGCTGCCTCCATTTTGTTTTT
TCAACCTCTGTCGCGCCGGAGAAATCAATCTCTCCGATCC

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 4

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GTTGGGAGCGTTGAATCTCAGAAAAAGCTAGATTTAACTAAAGATGGAGCAGTATCATTA
TCAGCAAACCATCTCCAAAAGCTGCGCCTGTCGCTCCAGTTAACTACTCCACTTGGCCAT
GTGTTTAAGCCACACCAGGCATTTCTCAAGCTGAAACATGAGTCACAGGTCGAGCATATC
TTTCTCGTGAAAACTTCTGGAAAGAAGTCTGAATTAGTTCTAGATTTTCTTGGATTGGTT
GAAAAGCTCTACTACCTTTCTGGCAAGTATGAGATCCAGTTAACTATTGGAGATGCTTCC
ATGGAAAACTCTTTATTGAGTAATATTGGCCACATCGAACTAGACCTACCACAACGTCCA
GAGAAGGCGGCTAGTCCTCCTCTACAGCCTACTGATCCTTACTCAAGATATGGGCCAAAA
GCTGAGATATCACACATCTTCAGGGTTCCAGAAAAACTTCCAGCGAAACAGCTTTCACTA
ATTTTCTTGGGTCTTATAGTTCTTCCATTCATCGGCTTCTTGATTGGGCTTACGCGGTTG
GGAGTGAACATAAAGAGCTTCCCATCATCGGTTGGAGCTGCAACATCCGCTTTACTTTTC
CATGGCGGCATTGGAGCTGTTCTGCTTCTCTATGTGCTCTTCTGGGTGAAGTTGGATCTG
TTCACGACTCTAAAGGCACTGTCATTGTTGGGAGTATTTCTGTTGTTCGTTGGACACAGA
ACACTGTCTCATCTCGCAGCAGCATCGAACAAGCTGAAATCTGCTTGAAGAATATATATT
GTCAGTATGATGGATCTTCTATGGGTTCCTGTGTCTCTGTGGAGCAGTTTCGTATTTCAG
TTTTGTAGCAGTAACTTATATAGATTATGGTAATAAGACAATTCCAAAAGATTACAGAGT
TTCAGTTTAGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E232TF U 1
AF RS1DM67TF U 148
AF RS1DM67JQ C 248
AF RS1E232JQ C 202
BS 1 675 RS1E232TF
BS 676 676 RS1DM67TF
BS 677 766 RS1E232TF
BS 767 853 RS1DM67TF
BS 854 854 RS1E232JQ
BS 855 875 RS1DM67TF
BS 876 913 RS1E232JQ

RD RS1E232TF 766 0 0
GTTGGGAGCGTTGAATCTCAGAAAAAGCTAGATTTAACTAAAGATGGAGCAGTATCATTA
TCAGCAAACCATCTCCAAAAGCTGCGCCTGTCGCTCCAGTTAACTACTCCACTTGGCCAT
GTGTTTAAGCCACACCAGGCATTTCTCAAGCTGAAACATGAGTCACAGGTCGAGCATATC
TTTCTCGTGAAAACTTCTGGAAAGAAGTCTGAATTAGTTCTAGATTTTCTTGGATTGGTT
GAAAAGCTCTACTACCTTTCTGGCAAGTATGAGATCCAGTTAACTATTGGAGATGCTTCC
ATGGAAAACTCTTTATTGAGTAATATTGGCCACATCGAACTAGACCTACCACAACGTCCA
GAGAAGGCGGCTAGTCCTCCTCTACAGCCTACTGATCCTTACTCAAGATATGGGCCAAAA
GCTGAGATATCACACATCTTCAGGGTTCCAGAAAAACTTCCAGCGAAACAGCTTTCACTA
ATTTTCTTGGGTCTTATAGTTCTTCCATTCATCGGCTTCTTGATTGGGCTTACGCGGTTG
GGAGTGAACATAAAGAGCTTCCCATCATCGGTTGGAGCTGCAACATCCGCTTTACTTTTC
CATGGCGGCATTGGAGCTGTTCTGCTTCTCTATGTGCTCTTCTGGGTGAAGTTGGATCTG
TTCACGACTCTAAAG*CACTGTCATTGTTGGGAGTATTTCTGTTGTTCGTTGGACACAGA
ACACTGTCTCATCTCGCAGCAGCATCGAACAAGCTGAAATCTGCTT

QA 1 766 1 766
DS 

RD RS1DM67TF 736 0 0
G
AGCTGAAACATGAGTCACAGGTCGAGCATATCTTTCTCGTGAAAACTTCTGGAAAGAAGT
CTGAATTAGTTCTAGATTTTCTTGGATTGGTTAAAAAGCTCTACTACCTTTCTGGCAAGT
ATGAGATCCAGTTAACTATTGGAGATGCTTCCATGGAAAACTCTTTATTGAGTAATATTG
GCCACATCGAACTAGACCTACCACAACGTCCAGAGAAGGCGGCTAGTCCTCCTCTACAGC
CTACTGATCCTTACTCAAGATATGGGCCAAAAGCTGAGATATCACACATCTTCAGGGTTC
CGGAAAAACTTCCAGCGAAACAGCTTTCACTAATTTTCTTGGGTCTTATAGTTCTTCCAT
TCATCGGCTTCTTGATTGGGCTTACGCGGTTGGGAGTGAACATAAAGAGCTTCCCATCAT
CGGTTGGAGCTGCAACATCCGCTTTACTTTTCCATGGCGGCATTGGAGCTGTTCTGCTTC
TCTATGTGCTCTTCTGGGTGAAGTTGGATCTGTTCACGACTCTAAAGGCACTGTCATTGT
TGGGAGTATTTCTGTTGTTCGTTGGACACAGAACACTGTCTCATCTCGCAGCAGCATCGA
ACAAGCTGAAATCTGCTTGAAGAATATATATTGTCAGTATGATGGATCTTCTATGGGTTC
CTGTGTCTCTGTGGAGCAGTTTCGTATTTCAGTTTTGTAGCAGTA*CTTATATAGATTAT
GGTAATA
GACATTCC

QA 2 728 2 728
DS 

RD RS1DM67JQ 638 0 0
TCTACTACCTTTCTGGCAAGTATGAGATCCAGTTAACTATTGGAGATGCTTCCATGGAAA
ACTCTTTATTGAGTAATATTGGCCACATCGAACTAGACCTACCACAACGTCCAGAGAAGG
CGGCTAGTCCTCCTCTACAGCCTACTGATCCTTACTCAAGATATGGGCCAAAAGCTGAGA
TATCACACATCTTCAGGGTTCCGGAAAAACTTCCAGCGAAACAGCTTTCACTAATTTTCT
TGGGTCTTATAGTTCTTCCATTCATCGGCTTCTTGATTGGGCTTACGCGGTTGGGAGTGA
ACATAAAGAGCTTCCCATCATCGGTTGGAGCTGCAACATCCGCTTTACTTTTCCATGGCG
GCATTGGAGCTGTTCTGCTTCTCTATGTGCTCTTCTGGGTGAAGTTGGATCTGTTCACGA
CTCTAAAGGCACTGTCATTGTTGGGAGTATTTCTGTTGTTCGTTGGACACAGAACACTGT
CTCATCTCGCAGCAGCATCGAACAAGCTGAAATCTGCTTGAAGAATATATATTGTCAGTA
TGATGGATCTTCTATGGGTTCCTGTGTCTCTGTGGAGCAGTTTCGTATTTCAGTTTTGTA
GCAGTAACTTATATAGATTATGGTAATA
AGACAATTCC

QA 1 628 1 628
DS 

RD RS1E232JQ 712 0 0
AAGAAGTCTGAATTAGTTCTAGATTTTCTTGGATTGGTTGAAAAGCTCTACTACCTTTCT
GGCAAGTATGAGATCCAGTTAACTATTGGAGATGCTTCCATGGAAAACTCTTTATTGAGT
AATATTGGCCACATCGAACTAGACCTACCACAACGTCCAGAGAAGGCGGCTAGTCCTCCT
CTACAGCCTACTGATCCTTACTCAAGATATGGGCCAAAAGCTGAGATATCACACATCTTC
AGGGTTCCAGAAAAACTTCCAGCGAAACAGCTTTCACTAATTTTCTTGGGTCTTATAGTT
CTTCCATTCATCGGCTTCTTGATTGGGCTTACGCGGTTGGGAGTGAACATAAAGAGCTTC
CCATCATCGGTTGGAGCTGCAACATCCGCTTTACTTTTCCATGGCGGCATTGGAGCTGTT
TTGCTTCTCTATGTGCTCTTCTGGGTGAAGTTGGATCTGTTCACGACTCTAAAGGCACTG
TCATTGTTGGGAGTATTTCTGTTGTTCGTTGGACACAGAACACTGTCTCATCTCGCAGCA
GCATCGAACAAGCTGAAATTTGCTTGAAGAATATATATTGTCAGTATGATGGATCTTCTA
TGGGTTCCTGTGTCTCTGTGGAGCAGTTTCGTATTTCAGTTTTGTAGCAGTAACTTATAT
AGATTATGGTAATAAGACAATTCCAAAAGATTACAGAGTTTCAGTTTAGTTT

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 2

CO CL2143Contig1 804 2 7 U
CAGCTAGTAAAGATCGATTCACTTTGGACACATTGTCAGCTAGTTCACTTTTTTATTTGA
ACATTTAAGGTAACAGTAATAGCAACTAAACAAAAATAGGTGATATTTTGCATTTTGTTT
TATGCACTTAAACGATACTAGAGCATCTTGCGAAAGTAATTCGAGAGAGAGAGAGTACAA
AATGTATTCACAGGTCGGGATACCACTAAAATCCACTTCTGGTATATATATTTTTTAACT
GTCTTCTCGTTCCAAACTAATCATTAACCTGATGAATTCCTTCTCCACCGGTTTATTCTG
AAGTACTGGCTGACCGGAGTTTCTGGAACCGGTATGCATTTTCCGATCAACGCCAATGGC
CAACTGATGGAACCAATCCCAATCGAGATGAGCCACATCTCCCAGTCAAGCTTCGTCGTT
GAGGCAAATGTTCCAAGGAACTCCACGATGACTACCTGGAGCACAATGGTGATACAGATG
ATGCCAACAAAGAGGTGATTACGAAAAACTCCTTGGAAAATGCTGAATTCATCTGGCTTT
CGTGCGTTGAACCCGTTGAAGATCTGGCAGATCACAAATGCATTGAAGATGACTGTATTC
TTCACTCTCTCGGCGTTGGGCTTATGATCCAGTTGAAGGATACTTATTCCACGGAAATTG
AGGACTAACAAGACTGTCACTTGGTATATCGCTTGTACAAACAAGTTTCTCCACATGATA
TTTGTGATGAGAGGTTCTCTTCTGCCAACAGGATCTCGATCCATCAAGTGATCGGTTGGG
TGGTTCGGTGGCTAAAGCAAGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AD30JQ U 55
AF RS1C375JQ U 1
BS 1 349 RS1C375JQ
BS 350 350 RS1AD30JQ
BS 351 522 RS1C375JQ
BS 523 523 RS1AD30JQ
BS 524 552 RS1C375JQ
BS 553 553 RS1AD30JQ
BS 554 804 RS1C375JQ

RD RS1AD30JQ 514 0 0
ATTTGAACATTTAAGGTAACAGTAATAGCAACTAAACAAAAATAGGTGATATTTTGCATT
TTGTTTTATGCACTTAAACGATACTAGAGCATCTTGCGAAAGTAATTCGAGAGAGAGAG*
*TACAAAATGTATTCACAGGTCGGGATACCACTAAAATCCACTTCTGGTATATATATTTT
TTAACTGTCTTCTCGTTCCAAACTAATCATTAACCTGATGAATTCCTTCTCCACCGGTTT
ATTCTGAAGTACTGGCTGACCGGAGTTTCTGGAACCGGTATGCATTTTCCGATCAACGCC
AATGGCCAACTGATGGAACCAATCCCAATCGAGATGAGCCACATCTCCCAGTCAAGCTTC
GTCGTTGAGGCAAATGTTCCAAGGAACTCCACGATGACTACCTGGAGCACAATGGTGATA
CAGATGATGCCAACAAAGAGGTGGTTACGAAAAACTCCTTGGAAAATGCTGAATTCATCT
GGCTTTCGTGCGTTGAACCCGTTGAAGATCTGGC

QA 1 514 1 514
DS 

RD RS1C375JQ 804 0 0
CAGCTAGTAAAGATCGATTCACTTTGGACACATTGTCAGCTAGTTCACTTTTTTATTTGA
ACATTTAAGGTAACAGTAATAGCAACTAAACAAAAATAGGTGATATTTTGCATTTTGTTT
TATGCACTTAAACGATACTAGAGCATCTTGCGAAAGTAATTCGAGAGAGAGAGAGTACAA
AATGTATTCACAGGTCGGGATACCACTAAAATCCACTTCTGGTATATATATTTTTTAACT
GTCTTCTCGTTCCAAACTAATCATTAACCTGATGAATTCCTTCTCCACCGGTTTATTCTG
AAGTACTGGCTGACCGGAGTTTCTGGAACCGGTATGCATTTTCCGATCACCGCCAATGGC
CAACTGATGGAACCAATCCCAATCGAGATGAGCCACATCTCCCAGTCAAGCTTCGTCGTT
GAGGCAAATGTTCCAAGGAACTCCACGATGACTACCTGGAGCACAATGGTGATACAGATG
ATGCCAACAAAGAGGTGATTACGAAAAACTCCTTGGAAAATGTTGAATTCATCTGGCTTT
CGTGCGTTGAACTCGTTGAAGATCTGGCAGATCACAAATGCATTGAAGATGACTGTATTC
TTCACTCTCTCGGCGTTGGGCTTATGATCCAGTTGAAGGATACTTATTCCACGGAAATTG
AGGACTAACAAGACTGTCACTTGGTATATCGCTTGTACAAACAAGTTTCTCCACATGATA
TTTGTGATGAGAGGTTCTCTTCTGCCAACAGGATCTCGATCCATCAAGTGATCGGTTGGG
TGGTTCGGTGGCTAAAGCAAGAGC

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 3

CO CL2144Contig1 1065 3 8 U
GATATAGGAAAATTGCAATAAAACAGAACCAAGAATCCGTGCGTAAATAAAACAGAGCTC
TCATCTTTAACCAACTTACTCATCAAACTAACAGAAAAAAAAAGCTAACAGATTTTCAAC
AGTAACAACGAAGAGGACACATGAGTTGTTTCAAGAAGTAGTTTTACCAAAAAGCACAGA
GATTGAATATTAATAGCCTCTTTTCTCCATTTCTCAATGGTGCCGATTCTACGGTTGAAC
CACAAACAGAGGAGTGTCGAGGCTAACAGGTTTGCCATCTTCTGCAACGATATCCACTAC
GGTTCCCGTTTGGTCAGACTCTATTTCATTCATTAACTTCATGGCTTCAACGATGCATAG
AACTTGCCCCTTCTGCACTTTATCTCCAACCTTAATAAAGGGTGGTTCGCCAGGTCCAGG
ACTACGGTAGAAAGTGCCAGCCATGGGGCTTTTAACAGTAGGAAGCGATGATTTAGCTGG
AGCAGGTGGAGGCAAAGAGGCAGGAGTAGAAGGCGCTGCTGGTGAGGCAGCAGCAGGTGC
TGCAGAAGGAGGAGGAGGAGCCAACGACTGCACATAAGACGATTGGTTTGGTTGCTGCTG
CATCATAACATATTGTGCAGGGGACTCGGGTTGCGGCAAGGCTTCCTTTTTCCGAATGAC
AAGTTCACAGTCGAGTTGTTTCAACTGCAACTCGACGATGTCTCTCGAATCAACAAGCTT
GACAAGAGTCGTTACTTGGGTGAGAAACTCAGAGATAGACTCTTCTGTAGCTAAATCAGT
TGATGAAGAAGCTGGAGGAGCATTTGATGAGGCACTGCTAACAACCTGGTTAGATTGGGC
TTTCACCACAGGGTAGCTACTGCGACTAGGCTTGGAGAGGAAGCGGAGCTTAGGCTTGGG
GGAGAGACGGAAGGAAACTCTGCGAGAGCGGGAGGTTGGTGGGGGAGGTAAGTGTGATGC
TGTTTGGGTGACGGAAGCAGCCGGAGACGTGACGGAGAGCGAAGAAGACGCCATTCTTCA
CTTCTTGTTGGGTGCAGATCGGGTTTAGGTCTCTCACTCCAGCCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B580JQ U 1
AF RS1AU63JQ U 1
AF RS1B580TF C 396
BS 1 730 RS1AU63JQ
BS 731 731 RS1B580TF
BS 732 811 RS1AU63JQ
BS 812 812 RS1B580TF
BS 813 821 RS1AU63JQ
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BS 823 835 RS1AU63JQ
BS 836 1065 RS1B580TF

RD RS1B580JQ 616 0 0
GG
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ATCTTTAACCAACTTACTCATCAAACTAACAGAAAAAAAAAGCTAACAGATTTTCAACAG
TAACAACGAAGAGGACACATGAGTTGTTTCAAGAAGTAGTTTTACCAAAAAGCACAGAGA
TTGAATATTAATAGCCTCTTTTCTCCATTTCTCAATGGTGCCGATTCTACGGTTGAACCA
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TTCCCGTTTGGTCAGACTCTATTTCATTCATTAACTTCATGGCTTCAACGATGCATAGAA
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TCATAACATATTGT

QA 3 616 3 616
DS 

RD RS1AU63JQ 840 0 0
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TCATCTTTAACCAACTTACTCATCAAACTAACAGAAAAAAAAAGCTAACAGATTTTCAAC
AGTAACAACGAAGAGGACACATGAGTTGTTTCAAGAAGTAGTTTTACCAAAAAGCACAGA
GATTGAATATTAATAGCCTCTTTTCTCCATTTCTCAATGGTGCCGATTCTACGGTTGAAC
CACAAACAGAGGAGTGTCGAGGCTAACAGGTTTGCCATCTTCTGCAACGATATCCACTAC
GGTTCCCGTTTGGTCAGACTCTATTTCATTCATTAACTTCATGGCTTCAACGATGCATAG
AACTTGCCCCTTCTGCACTTTATCTCCAACCTTAATAAAGGGTGGTTCGCCAGGTCCAGG
ACTACGGTAGAAAGTGCCAGCCATGGGGCTTTTAACAGTAGGAAGCGATGATTTAGCTGG
AGCAGGTGGAGGCAAAGAGGCAGGAGTAGAAGGCGCTGCTGGTGAGGCAGCAGCAGGTGC
TGCAGAAGGAGGAGGAGGAGCCAACGACTGCACATAAGACGATTGGTTTGGTTGCTGCTG
CATCATAACATATTGTGCAGGGGACTCGGGTTGCGGCAAGGCTTCCTTTTTCCGAATGAC
AAGTTCACAGTCGAGTTGTTTCAACTGCAACTCGACGATGTCTCTCGAATCAACAAGCTT
GACAAGAGTC*TTACTTGGGTGAGAAACTCAGAGATAGACTCTTCTGTAGCTAAATCAGT
TGATGAAGAAGCTGGAGGAGCATTTGATGAG*CACTGCTAA*AACCTGGTTAGAT
GGGCT

QA 1 835 1 835
DS 

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AATAAAGGTGG
TCGCCAGGTCCAGGACTACGGTAGAAAGTGCCAGCCATGGGGCTTTTAACAGTAGGAAGC
GATGATTTAGCTGGAGCAGGTGGAGGCAAAGAGGCAGGAGTAGAAGGCGCTGCTGGTGAG
GCAGCAGCAGGTGCTGCAGAAGGAGGAGGAGGAGCCAACGACTGCACATAAGACGATTGG
TTTGGTTGCTGCTGCATCATAACATATTGTGCAGGGGACTCGGGTTGCGGCAAGGCTTCC
TTTTTCCGAATGACAAGTTCACAGTCGAGTTGTTTCAACTGCAACTCGACGATGTCTCTC
GAATCAACAAGCTTGACAAGAGTCGTTACTTGGGTGAGAAACTCAGAGATAGACTCTTCT
GTAGCTAAATCAGTTGATGAAGAAGCTGGAGGAGCATTTGATGAGGCACTGCTAACAACC
TGGTTAGATTGGGCTTTCACCACAGGGTAGCTACTGCGACTAGGCTTGGAGAGGAAGCGG
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GACGCCATTCTTCACTTCTTGTTGGGTGCAGATCGGGTTTAGGTCTCTCACTCCAGCCC

QA 12 670 12 670
DS 



AS 1 4

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GAAAGACTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCCGAGACAAACGAGTGTCG
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AAAAATCATTTGTTCCGGTCTATTTGGTGTTGTGATATGAATACTGTCTTTGAGACTCAA
GCAGGTTATATAATTTGTAATTTTGCAAGATTCATATAATATAAAAAAGGGAGCAACACA
AAGCTCGAATTTCATT


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1G112JQ C 67
AF RS1G112TF U 1
AF RS1AT55JQ C 1
AF RS1AT55TF U 1
BS 1 18 RS1G112TF
BS 19 19 RS1AT55TF
BS 20 85 RS1G112TF
BS 86 86 RS1AT55TF
BS 87 529 RS1G112TF
BS 530 530 RS1AT55TF
BS 531 588 RS1G112TF
BS 589 616 RS1AT55TF

RD RS1G112JQ 466 0 0
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AGGTCCGGTCCGTTTAAACAATCCTTGGTATCTTTGTTCAAGAACAACGAACCGGATGGC
GACAGTTAGGCCGGTTAGAGCAACGCCAGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTTGAGAAGAG
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CTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCCGAGACAAACGAGTGTCGTACTTA
CGACAACTGAAACTGAGCTCCATCATGTTCCAGGATCCCGTCCTTATATTACACAAAAAT
CATTTGTTCCGGTCTATTTGGTGTTGTGATATGAATACTGTCT
CTG

QA 1 463 1 463
DS 

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TACTAGTCTTAACTTTGGAACCCAACGAGCCGTCATCACCAGCGAGGCTCGACCAGTTCG
TCTCGCAGGTCCGGTCCGTTTAAACAATCCTTGGTATCTTTGTTCAAGAACAACGAACCG
GATGGCGACAGTTAGGCCGGTTAGAGCAACGCCAGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTTGA
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AGCTGCGTGGGACGAGGTCGAAGAGCTTAGCGCAACAGCTAGCCACGCTAGAGACAAGAA
GAAAGACTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCCGAGACAAACGAGTGTCG
TACTTACGACAACTGAAACTGAGCTCCATCATGTTCCAGGATCCCGTCCTTATATTACAC
AAAAATCATTTGTTCCGGTCTATTTGGTGTTGTGATATGAATACTGTCTCTGAGACTCAA
GCAGGTTATATAATTTGTAATTTTGCAAGATTCATATAATATAAAAAA
AAA

QA 1 588 1 588
DS 

RD RS1AT55JQ 616 0 0
GGATCTAAAAACAAAACATTCAAAGCCTCTGCTTCATCCAACTATGGCAACTATAGCTGC
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TCTCGCAGGTCCGGTCCGTTTAAACAATCCTTGGTATCTTTGTTCAAGAACAACGAACCG
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GAAGAGCATCAAGGACGCAGAGGAGACTTGTGCTGGCGATCCTGCGAGCGGAGAGTGTGT
AGCTGCGTGGGACGAGGTCGAAGAGCTTAGCGCAGCAGCTAGCCACGCTAGAGACAAGAA
GAAAGACTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCCGAGACAAACGAGTGTCG
TACTTACGACAACTGAAACTGAGCTCCATCATGTTCCAGGATCCCGTCCTTTTATTACAC
AAAAATCATTTGTTCCGGTCTATTTGGTGTTGTGATATGAATACTGTCTTTGAGACTCAA
GCAGGTTATATAATTTGTAATTTTGCAAGATTCATATAATATAAAAAAGGGAGCAACACA
AAGCTCGAATTTCATT

QA 1 616 1 616
DS 

RD RS1AT55TF 616 0 0
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TACTAGTCTTAACTTTGGAACCCAAAGAGCCGTCATCACCAGTGAGGCTCGACCAGTTCG
TCTCGCAGGTCCGGTCCGTTTAAACAATCCTTGGTATCTTTGTTCAAGAACAACGAACCG
GATGGTGACAGTTAGGCCGGTTAGAGCAACGCCAGAAGGAGTGATATCGGATAAAGTTGA
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AGCTGCGTGGGACGAGGTCGAAGAGCTTAGCGCAGCAGCTAGCCACGCTAGAGACAAGAA
GAAAGACTCCGACCCTTTGGAGGAATACTGCAAAGACAATCCCGAGACAAACGAGTGTCG
TACTTACGACAACTGAAACTGAGCTCCATCATGTTCCAGGATCCCGTCCTTTTATTACAC
AAAAATCATTTGTTCCGGTCTATTTGGTGTTGTGATATGAATACTGTCTTTGAGACTCAA
GCAGGTTATATAATTTGTAATTTTGCAAGATTCATATAATATAAAAAAGGGAGCAACACA
AAGCTCGAATTTCATT

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 2

CO CL2146Contig1 1496 2 4 U
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GAGTTCTCCCAAAACTGAAAAGATATCAGAAGAAGGTGAAAATGATACGCTTAGATATGG
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TCTGGATGATAAGACATCCTTCTTCGGTGTGTACGATGGTCATGGAGGCAAAGTTGTGGC
AAAGTTCTGTGCAAAGTATCTACACCAGCAGGTTCTTAGTAACCAAGCATATGGAGCTGG
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TGAAGGATTCATATGGTCACCAAGAAGCGGTGGTGACGTCAATAACCAGCCTGATAATTG
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ATGACTTTCTTGTTGTTGCATGTGATGGAATCTGGGATTGTATGACAAGCCAGCAACTGG
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TCATCTTGGTCCAGTTCAAGAAGCCTAATCCATCCGAGACCACCGAAGCAGAAGCAGAAG
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ATCATTTGTTTTTGGTTCAACATTGAAAATGCTTTTGAGTGTGGGTTAGAGAAGCAGAAG
CTGGCATTTATTGGGATTTCAGTTTTTTTTTCCTCAGTTTTCACAGCTTCTCCTTACTCA
ACAGACTCTGGTTCTATCGGTTCCTGTAGTCAGAAAAAACGACTTTGTATAGTTTGTCTT
GTGATTTGTGGGAAAAATGTTGGTGTATTCTTCATTAAGGAGTTATATTGCTTCTT


BQ
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AGTTTGTCTTGTGATTTGTGGGAAAAATGTTGGTGTATTCTTCATTAAGGAGTTATATTG
CTTCTT

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DS 



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CTGATGCTAAGTACAAAGAGATCAGCGGACAGAACATCTTCGCACCGCCACCTGAGATCA
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GM50TF U 1
AF RS1CO27TF U 1
AF RS1CO27JQ C 523
BS 1 39 RS1CO27TF
BS 40 40 RS1GM50TF
BS 41 112 RS1CO27TF
BS 113 113 RS1GM50TF
BS 114 437 RS1CO27TF
BS 438 438 RS1GM50TF
BS 439 499 RS1CO27TF
BS 500 500 RS1GM50TF
BS 501 523 RS1CO27TF
BS 524 524 RS1GM50TF
BS 525 828 RS1CO27TF
BS 829 829 RS1CO27JQ
BS 830 848 RS1CO27TF
BS 849 1127 RS1CO27JQ

RD RS1GM50TF 665 0 0
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GCTCAAGAAAAAAAAAAACAAATATGGAGAGAGCCACTCCAGTGAGAAAGCCACACACAT
CAACCGCAGATCTACTCACTTGGTCGGAAGCTCCACCGTCGGATTCTCCTTCCTCCGCTT
CTCGCTCCTCCGCCGTTCGATCTCACCAGCCATCTGATGGGGTTAGCAGAGTTGTCTTTG
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TTGGTGAAGAGGAGGACGTGTCTCCCAAGAAGCCTATCACTCTACCTGAGGTTGCTAAAC
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CTGATGCTAAGTACAAAGAGATCAGCGGACAGAACATCTTCGCACCGCCGCCTGAGATCA
AACCTCGGTCCGGAGCCACTCGTGCGTCGGCTCTAAAAGACAACTTCAACCTCGGAGCTG
AATCT

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1CO27TF 848 0 0
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GCTCAAGAAAAAAAAAAACAAATATGGAGAGAACCACTCCAGTGAGAAAGCCGCACACAT
CAACCGCAGATCTACTCACTTGGTCGGAAGCTCCACCGTCGGATTCTCCTTCCTCCGCTT
CTCGCTCCTCCGCCGTTCGATCTCACCAGCCATCTGATGGGGTTAGCAGAGTTGTCTTTG
GTGGTCAAGTCACTGATGAAGAAGTTGAGAGCTTGAACAAAAGGAAGCCTTGCTCAGAAC
ATAAGATGAAGGAGATAACAGGGAGTGGGATCTTCACTCGTAATCAAGAAGATGCATCAG
AGCTCTCTAGTGCCCCAAGGGTATATCAGCAAGCACTTAGTGGTATAAGCCATATATCAT
TCGGTGAAGAGGAGGACTTGTCTCCCAAGAAGCCTATCACTCTACCCGAAGTTGCTAAAC
AGCGAGAGCTAAGCGGGACGATGGAGAGCGACTCAGCTTCTAATCTGAAGAAGCAGCTCT
CTGATGCTAAGTACAAAGAGATCAGCGGACAGAACATCTTCGCACCGCCACCTGAGATCA
AACCTCGGTCCGGAGCCACTCGTGCGTTGGCTCTAAAGGACAACTTCAACCTCGGAGCTG
AATCTCAAACCTCTGGTGAAGAAGACTCATCTGTGAAGACGGCGAAGAAGATTTACGACA
AGAAGTTTGCAGAGCTTTCAGGGAATGATATATTCAAAGGGAGATGCTGCTGCTGCTGGA
GCGACGTCGTCTTGTGGTGAGAAGCAGCTGAGTGAAGCGAAGCTGAGG*AGATAGGAGGG
AACAACAT

QA 1 848 1 848
DS 

RD RS1CO27JQ 605 0 0
AT
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CCGCCACCTGAGATCAAACCTCGGTCCGGAGCCACTCGTGCGTTGGCTCTAAAGGACAAC
TTCAACCTCGGAGCTGAATCTCAAACCTCTGGTGAAGAAGACTCATCTGTGAAGACGGCG
AAGAAGATTTACGACAAGAAGTTTGCAGAGCTTTCAGGGAATGATATATTCAA*GGGAGA
TGCTGCTGCTGCTGGAGCGACGTCGTCTTGTGGTGAGAAGCAGCTGAGTGAAGCGAAGCT
GAGGGAGATAGGAGGGAACAACATATTCGCTGATGGGAAGGTAGAGTCCAGAGACTATCT
AGGAGGTGTCCGTAAACCACCGGGTGGTGAGACAAGCATTGCTCTCGTTTAGAAGAACCA
ATCCTCTCTATTTTACAGTAACGTTTAACTCTTTAAAAAAAAAAAAAACTGAGATTTATT
GGTGTGTGTTCTTTGTTGGTATCTATCTCTCAAATACGCTTTTCAGCTCTCAAAAGTGTG
ATTTGTATTATGCAGTTTCGTTGGTTTATTTGGTTATGGTGATATAATAACTATTATTTT
ATC

QA 3 605 3 605
DS 



AS 1 3

CO CL2148Contig1 1054 3 6 U
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GACAAAGATTATGGGGAAGCGGTTACAGCGATAATTGTAGTAGAGACTGGAGCAAAGAGG
AAAAAAGAAGATGAGTCAAAACCTGTGATGACCTTAGAAGAACTCTGCGTTGATACCACT
GCTTACGGCCGGGGGACTCTTCAAAGTCTCCACCACACACTTCTTCTCCATTAAAACTCC
TTTCGCACATCTCTCATAAACACCCAAAGAGCAAAAAAGAGAGAGAGAAGAAACTCACAA
TGGCCACTCCCTTCTCTACCTTGACACCTTTTCTTTTCATACTCCTTCTCTCCATCCCTA
TCGTTCTTGGCGCTTCTCATCACCACACTGCGGCTCCAGCTCCTGCCGTAGACTGTTCGA
TGCTCATACTCAACATGGCTGATTGTTTGTCTTTCGTTTCCGCTGGAGGCACGGAGCCTA
AGCCGGCTAGTTCGTGCTGCAACGGGCTTAAGACGGTGCTCAAGACTGACGCAGAGTGTC
TCTGTGAGGCGTTTAAAAGCAGCGCTTCTCTAGGCGTTACCTTGAACATGACTAAAGCAA
CTACACTTCCCGCTGCATGCAAGCTTCACGCTCCTTCCACCGCTGCTTGTGGATTGTCCG
TCGCTCCTACTATGGCTCCAGGTCTTGCTCCAGGAGGAGCTGTTGCAGCTGCTGGACCCG
ACTTAGTTAATGTTCTAGCTCCAAACCCATCTCCAGGGAACGACGGATCTTCCTTGGTTC
CGATCTCCTTCACCACCGTACTCAGTGCTGCGTTCTTCCTATTGTTCTTGTCTCGTGTCT
GAAAAAAGCCTTATTCACCAGCTAGATTTGGTTGTATGAAATGGCTTTGGGTTTTCATGA
CTTTAGTTTTGCGTGTCTTTTGAGTCTTCTGTGTTCAGACCATGTCGGTTTCTGTTCTTA
GTTTTACTCTTAATTATGTTTCCATTGGTCCTTTATAAGAGCATCTCTGATTACTCTTAT
ATTGATGGTTATTAAATTTCTAGTTTTCCTAAGC


BQ
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AF RS1B088TF U 1
AF RS1GJ49TF U 415
AF RS1B088JQ C 330
BS 1 718 RS1B088TF
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BS 731 744 RS1B088TF
BS 745 1054 RS1B088JQ

RD RS1B088TF 758 0 0
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AAAAAAGAAGATGAGTCAAAACCTGTGATGACCTTAGAAGAACTCTGCGTTGATACCACT
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TCGTTCTTGGCGCTTCTCATCACCACACTGCGGCTCCAGCTCCTGCCGTAGACTGTTCGA
TGCTCATACTCAACATGGCTGATTGTTTGTCTTTCGTTTCCGCTGGAGGCACGGAGCCTA
AGCCGGCTAGTTCGTGCTGCAACGGGCTTAAGACGGTGCTCAAGACTGACGCAGAGTGTC
TCTGTGAGGCGTTTAAAAGCAGCGCTTCTCTAGGCGTTACCTTGAACATGACTAAAGCAA
CTACACTTCCCGCTGCATGCAAGCTTCACGCTCCTTCCACCGCTGCTTGTGGATTGTCCG
TCGCTCCTACTATGGCTCCAGGTCTTGCTCCAGGAGGAGCTGTTGCAGCTGCTGGACC*G
ACTTAGTTA*TGTTCTAGCTCCAA
CCCATCTCAGGAAC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1GJ49TF 339 0 0
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AGTGTCTCTGTGAGGCGTTTAAAAGCAGCGCTTCTCTAGGCGTTACCTTGAACATGACTA
AAGCAACTACACTTCCCGCTGCATGCAAGCTTCACGCTCCTTCCATCGCTGCTTGTGGAT
TGTCCGTCGCTCCTACTATGGCTCCAGGTCTTGCTCCAGGAGGAGCTGTTGCAGCTGCTG
GACCCGACTTAGTTAATGTTCTAGCTCCAA
ACCCATCTC

QA 1 330 1 330
DS 

RD RS1B088JQ 725 0 0
TTTC
TTTTCATACTCCTTCTCTCCATCCCTATCGTTCTTGGCGCTTCTCATCACCACACTGCGG
CTCCAGCTCCTGCCGTAGACTGTTCGATGCTCATACTCAACATGGCTGATTGTTTGTCTT
TCGTTTCCGCTGGAGGCACGGAGCCTAAGCCGGCTAGTTCGTGCTGCAACGGGCTTAAGA
CGGTGCTCAAGACTGACGCAGAGTGTCTCTGTGAGGCGTTTAAAAGCAGCGCTTCTCTAG
GCGTTACCTTGAACATGACTAAAGCAACTACACTTCCCGCTGCATGCAAGCTTCACGCTC
CTTCCACCGCTGCTTGTGGATTGTCCGTCGCTCCTACTATGGCTCCAGGTCTTGCTCCAG
GAGGAGCTGTTGCAGCTGCTGGACCCGACTTAGTTAATGTTCTAGCTCCAAACCCATCTC
CAGGGAACGACGGATCTTCCTTGGTTCCGATCTCCTTCACCACCGTACTCAGTGCTGCGT
TCTTCCTATTGTTCTTGTCTCGTGTCTGAAAAAAGCCTTATTCACCAGCTAGATTTGGTT
GTATGAAATGGCTTTGGGTTTTCATGACTTTAGTTTTGCGTGTCTTTTGAGTCTTCTGTG
TTCAGACCATGTCGGTTTCTGTTCTTAGTTTTACTCTTAATTATGTTTCCATTGGTCCTT
TATAAGAGCATCTCTGATTACTCTTATATTGATGGTTATTAAATTTCTAGTTTTCCTAAG
C

QA 5 725 5 725
DS 



AS 1 4

CO CL2149Contig1 1406 4 18 U
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GTGGCGAGTAATGGGAGTGGTTTTGCTGATCACAATATCACCGTATCAACCACTAAATTC
CCAAATACCAGTTCAGGGTTTCCTCAAAACCTTGTACAGTCAAGCAGCAGTCAGGTGCAG
TCTCCTCAGTGGAAAAACAACTCGCCCAGGACAACAAACACTTCCCAACCTCAGTCTCCT
TCCGTACTTTCGCCTTCATCATCTGTTGCTCCTTCGTCCTCCCCAAGAAATGTATCGTCG
CATAAACAGCAAAGCCGCCAGCAGCAGTCGCAGATATCTTTTGCAACAAGTCCAAAACAT
ACAGCTTCTTCTGGTTCACCAATGCAGCAGGTGCAAGGAGTTACCAACAATCATGCTCCG
TCTTCTCCAATGTTAGTTGGGTCACCTTCTACGTCTTCGGTCTCCAAAAACACCGGCGGG
AGCCCAAGAACAACTGCTCCGGCTTCTTCAGCGGTGAACAAAGCTGGACAAGCTTCCTCT
ACTACTCACTCATCATCTCAGCCGTCCAAGAACTTGCAGCCTGCTTCCGTAGCTTCTTCC
ACTGTTGGAAGGAATAGTGGTCTTTCGGTTCTCGGAAACCCCACC*ACGAGCTCTGGCTC
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ATTCTTTTCTAATCCATATATGCAATCTCAACAGCAGCAGATCACTATGTCTCCCTCTGG
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AAGAGAAGAAGCTCTGGATGGTTTGAAAAGTGACGGTGTATATAGCTTGTGCTGGCGAGA
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BQ
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TTCCTAGG
T

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DS 

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TCCCTCTGGTGGTTATTACATTCAAAGACATCAGCAACAACCAGGTTCTGCAGCTGTTAG
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GTCGGATCATCAGTTAGTGGATTATGTAGTTTGTC

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DS 



AS 1 3

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TCCTAGGGTTGATGAGTCTAGCTCCTCTTCAGGTCCTCCTCACTTGTCCAACTCAGTGGA
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CTCAGATAAAAACGCTGTTTTTTACTGCAACCGGGCTGCTGCATATACCCAGATCAGAAT
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AGTTCTCGATGCCTTTAAACCCTGATATGATGAACATGTTCATGAACATGGCGGGGAATG
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TTGTGTTTTCTAAGGTTATTATACGGTTTGAGTTTATGCTCC


BQ
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C246TF U 1
AF RS1F596TF U 7
AF RS1C246JQ C 618
BS 1 361 RS1C246TF
BS 362 362 RS1F596TF
BS 363 431 RS1C246TF
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BS 433 778 RS1C246TF
BS 779 1362 RS1C246JQ

RD RS1C246TF 778 0 0
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CAAAATTGTGCTTTCTTTCTTGGATTTTCTTGATTCCGTGGAAGTAGCTCCTGGTGTTGA
CGAGGAAGGGCTTGAGGTTGCTAAAGAATGCATAAAGGAAGCATTTAAGATCACTTCAGA
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TCCTAGGGTTGATGAGTCTAGCTCCTCTTCAGGTCCTCCTCACTTGTCCAACTCAGTGGA
TGCAACAAGCAAACAACCTCTCTTTAACGGGACTTGTAGAGATGAACTATTTGGGCAACT
CTTTGGTGCGCTTGAGAAAGTTCGGTATTTCAATACCACGCCTAACGGAGATGATGATCC
TGCTCAGCTGGTGAAAGCTACCAAGATTTTTCACGATGCTATCACTGAAATGGAGAATTC
TGGATGCCAGACATTTGATGCCAAAAGCTTGGCAGAAACATTCAAGTGCCAAGGTAACAA
GGCCATGCAGTCCCAGCAGTATCTGGAGGCGATCGAGCTGTATTCTTTTGCAATTTCACT
CTCAGATAAAAACGCTGTTTTTTACTGCAACCGGGCTGCTGCATATACCCAGATCAGAAT
GTGCTCAGAAGCAATCAAGGACTGTCTTAAATCCATTGAGATAGATCCAAACTATAGCAA
GGCTTACAGTCGTCTTGGGTTAGCATACTATGCTCAAGGAAAGTATGCTGATGCTATT

QA 1 778 1 778
DS 

RD RS1F596TF 748 0 0
ATTAAGATTCTTCTCTCCAATGGCGAAACTAACGACGGAGTCCCCTGTCTGCCGCAAAAT
TGTGCTTTCTTTCTTGGATTTTCTTGATTCCGTGGAAGTAGCTCCTGGTGTTGACGAGGA
AGGGCTTGAGGTTGCTAAAGAATGCATAAAGGAAGCATTTAAGATCACTTCAGATTCTGC
CACAGACGACTCTAACTCCAAACCCATTTCGCTTGTCAGTCTCTTCACTTCTTCTCCTAG
GGTTGATGAGTCTAGTTCCTCTTCAGGTCCTCCTCACTTGTCCAACTCAGTGGATGCAAC
AAGCAAACAACCTCTCTTTAACGGGACTTGTAGAGATGAACTATTTGGGCAACTCCTTGG
TGCGCTTGAGGAAGTTCGGTATTTCAATACCACGCCTAACGGAGATGATGATCCTGCTCA
GCTGGAGAAAGCTACCAAGATTTTTCACGATGCTATCACTGAAATGGAGAATTCTGGATG
CCAGACATTTGATGCCAAAAGCTTGGCAGAAACATTCAAGTGCCAAGGTAACAAGGCCAT
GCAGTCCCAGCAGTATCTGGAGGCGATCGAGCTGTATTCTTTTGCAATTTT*CTCTCAGA
TAAAAACGCTGTTTTTTACTGCAACCGGGCTGCTGCATATACCCAGATCAGAATGTGCTC
AGAAGCAATCAAG*ACTGTCTTAAATCCATTGAGATAGATCCAAACTATAGCAAGGCTTA
CAGTCGTCTTGGGTTAGCATACTATGCT

QA 1 748 1 748
DS 

RD RS1C246JQ 745 0 0
TTTTTTACTGCAACCGGGCTGCTGCATATACCCAGATCAGAATGTGCTCAGAAGCAATCA
AGGACTGTCTTAAATCCATTGAGATAGATCCAAACTATAGCAAGGCTTACAGTCGTCTTG
GGTTAGCATACTATGCTCAAGGAAAGTATGCTGATGCTATTGAGAAAGGATTCAAGAAAG
CTTTGGAGTTGGATCCGCATAATGAATCTGTCAAAGAAAACATCAGGGTCGGTTTTATTT
TATTAATATATAATTATCTGCGTTATCATTATTGATCCCTCCGTAACTTAAATGAGACTG
TGATAGGTGGCTGAACAAAGACTAAGAGAAGAAGAACAAGGAGGACAGAGACGTAATCAA
GATCCGGGAATGGGAGGGCAAGGAGGGCAAGGAATACCTTCTCAGTTCTCGATGCCTTTA
AACCCTGATATGATGAACATGTTCATGAACATGGCGGGGAATGGTAGTAACAGAAACGTT
GGTACAAATGAGCCTGAGATTCGTCTAGGCGGAAACATCAACATAGATCTTGGAGGTTCG
GATCAAATGCCTGAAGAGTTTTCAGGTGCGTTGCGATCAATGATGCAGATGTTTGGAGGA
GGAGGATCACAGGAAGGCAACCATAACAATAACAACAATCCTCAGGGTACTAATAATGGT
GCACATGGAAGACCATCTGGAAATTAAACTTTAAAGACTTGTGTTGTGTTTTCTAAGGTT
ATTATACGGTTTGAGTTTATGCTCC

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 4

CO CL2151Contig1 384 4 9 U
GGGATAAACACACTGAACATTTATCAAAAAAAACACACTAAACATTTATTTACAGAAAAT
TGTTACAATGTCAACATCTAAAATTACTATTTTTTGTATTGTCTTACTTTTTTTAACTAG
TTTTCATGAATGTGCCAACCTGAAAAAAACTACTGCAGCATGCCTCTCTAGACCACAACA
TAAAGATTGGTGCTGCAACGTGGGACATAAGCAGTGCCGAATCGCCAAATCTGAATGCGA
GAGAATTTGTATCCAGGGGCGCACTTGAATTTTCAGAAGAGTATTTTTATAATTATATAT
TTCAAATACTTTCATACTTCTATTATCTAACGTTAAATAATGAATAACAATCTCTACTCC
ATGTGAGGAGCTACTATTAAGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1A434JQ C 5
AF RS1E462JQ C 1
AF RS1E462TF U 1
AF RS1A434TF U 7
BS 1 13 RS1E462JQ
BS 14 32 RS1E462TF
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BS 34 82 RS1E462TF
BS 83 83 RS1A434TF
BS 84 163 RS1E462TF
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BS 165 381 RS1E462TF
BS 382 384 RS1A434TF

RD RS1A434JQ 341 0 0
GAAACACAC
TGAACATTTATCAAAAAAAACACCCTAAACATTTATTTACAGAAAATTGTTACAATGTCA
ACATCTAAAATTACTATTTTTTGTATTGTCTTACTTTTTTTAACTAGTTTTCATGAATGT
GCCAATCTGAAAAAAACTACTGCAGCATGCCTCTCTAGACCACAACATAAAGATTGGTGC
TGCAACGTGGGACATAAGCAGTGCCGAATCGCCAAATCTGAATGCGAGAGAATTTGTATC
CAGGGGCGCACTTGAATTTTCAGAAGAGTATTTTTATAATTATATATTTCAAATACTTTC
ATACTTCTATTATCTAATGTTAAATAATGAAT

QA 10 341 10 341
DS 

RD RS1E462JQ 381 0 0
GGGATAAACACACTGAACATTTATCAAAAAAA*CACACTAAACATTTATTTACAGAAAAT
TGTTACAATGTCAACATCTAAAGTTACTATTTTTTGTATTGTCTTACTTTTTTTAACTAG
TTTTCATGAATGTGCCAACCTGAAAAAAACTACTGCAGCATGCGTCTCTAGACCACAACA
TAAAGATTGGTGCTGCAACGTGGGACATAAGCAGTGCCGAATCGCCAAATCTGAATGCGA
GAGAATTTGTATCCAGGGGCGCACTTGAATTTTCAGAAGAGTATTTTTATAATTATATAT
TTCAAATACTTTCATACTTCTATTATCTAACGTTAAATAATGAATAACAATCTCTACTCC
ATGTGAGGAGCTACTATTAAG

QA 1 381 1 381
DS 

RD RS1E462TF 381 0 0
GGGATAAACACAC
TGAACATTTATCAAAAAAA*CACACTAAACATTTATTTACAGAAAATTGTTACAATGTCA
ACATCTAAAGTTACTATTTTTTGTATTGTCTTACTTTTTTTAACTAGTTTTCATGAATGT
GCCAACCTGAAAAAAACTACTGCAGCATGCGTCTCTAGACCACAACATAAAGATTGGTGC
TGCAACGTGGGACATAAGCAGTGCCGAATCGCCAAATCTGAATGCGAGAGAATTTGTATC
CAGGGGCGCACTTGAATTTTCAGAAGAGTATTTTTATAATTATATATTTCAAATACTTTC
ATACTTCTATTATCTAACGTTAAATAATGAATAACAATCTCTACTCCATGTGAGGAGCTA
CTATTAAG

QA 14 381 14 381
DS 

RD RS1A434TF 378 0 0
AAACACA
TGAACATTTATCAAAAAAAACACCCTAAACATTTATTTACAGAAAATTGTTACAATGTCA
ACATCTAAAATTACTATTTTTTGTATTGTCTTACTTTTTTTAACTAGTTTTCATGAATGT
GCCAATCTGAAAAAAACTACTGCAGCATGCCTCTCTAGACCACAACATAAAGATTGGTGC
TGCAACGTGGGACATAAGCAGTGCCGAATCGCCAAATCTGAATGCGAGAGAATTTGTATC
CAGGGGCGCACTTGAATTTTCAGAAGAGTATTTTTATAATTATATATTTCAAATACTTTC
ATACTTCTATTATCTAATGTTAAATAATGAATAACAATCTCTACTCCATGTGAGGAGCTA
GTATTAAGTGC

QA 8 378 8 378
DS 



AS 1 4

CO CL2152Contig1 889 4 8 U
GATCAAGAATCAAGATACAACCAGGTGCCAAAAAACCATTGTCGTATGAGAGCAAAACCT
TATGTTTATACGTAAGAATATATAAGGAACGTGACTTACAAAAACCCATTTGGCCATTTT
TTTTCTTCACAAATACTAAAACCTTAAAGACCTCTTTTCTATGTTTCATGAGAATGGTGT
TGCTCCGTATCATGGCCAACGCCGAGTTTCCCATTAGTAGTCTCGTCCTTTTGAACGGAT
GACTTCCCATTCACAGCGACAGAGCCAACATCAGCTGTTTCTTCCACACCTGTATCAGAT
TTCTCCTCGTGTTCATGTGCGCTGTCTGTATTTTGATTTGACAGAGCTGCTTCAGCTTTC
TGCCTCTCCTCTTCTTTCTCTCGACGTCTCTTTGCTTCTTGCTCTTTGAGCAGCCTAAAC
CTTTCACCAGGTTTGGGCCCTTCTGAGGTCACTTTCTCACCACCCTTATCTCTTGGTATT
TTCAATTCTGAAACAGGCTTCTGAACTGGCGGTAGTGAGATAGACTAGTCAACTTTTTTA
GTTTTGTCTTCCTTGGTGACCAAATTAGTGAGCTTCTCCACTGGATTTTTGGCACCGCCA
TATTTTTGAAGCCATACTTGCTGTGCTGTGCTCAAAACGTTGTTGGTCAACCAGTAAAGA
CTTAAACCAGAAGGAACTGATAGTGCAAAATAGCCAATCATCAGCGGGAGAAACTTCGTC
ACAGCTTGTGAGCTCTTCATGGCTGGATCATCACTCTGCGGCTGAGAGGATTGCATAATC
TGAATGGAGAGATACTGAGAGAAGATAAGCAATAGAGCAAGACAGATATGCTAATGTGTC
TGACATCCGAGTGGTGGGTGTCCCTCATGAAAGGAAGAGCCATGAGATT


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H002JQB U 1
AF RS1G008JQ U 48
AF RS1H002TF C 1
AF RS1CC92JQ U 48
BS 1 171 RS1H002JQB
BS 172 172 RS1CC92JQ
BS 173 297 RS1H002JQB
BS 298 298 RS1CC92JQ
BS 299 524 RS1H002JQB
BS 525 526 RS1CC92JQ
BS 527 527 RS1H002TF
BS 528 889 RS1CC92JQ

RD RS1H002JQB 524 0 0
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TATGTTTATACGTAAGAATATATAAGGAACGTGACTTACAAAAACCCATTTGGCCATTTT
TTTTCTTCACAAATACTAAAACCTTAAAGACCTCTTTTCTATGTTTCATGAAAATGGTGT
TGCTCCGTATCATGGCCAACGCCGAGTTTCCCATTAGTAGTCTCGTCCTTTTGAACGGAT
GACTTCCCATTCACAGCGACAGAGCCAACATCAGCTGTTTCTTCCACACCTGTATCAAAT
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QA 1 524 1 524
DS 

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CTTTTGAAAGGATGACTTCCCATTCACAGCGACAGAGCCAACATCAGCTGTTTCTTCCAC
ACCTGTATCAAATTTCTCCTCGTGTTCATGTGCGCTGTCTGTATTTTGATTTGACAGAAC
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TG

QA 1 466 1 466
DS 

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TATGTTTATACGTAAGAATATATAAGGAACGTGACTTACAAAAACCCATTTGGCCATTTT
TTTTCTTCACAAATACTAAAACCTTAAAGACCTCTTTTCTATGTTTCATGAGAATGGTGT
TGCTCCGTATCATGGCCAACGCCGAGTTTCCCATTAGTAGTCTCGTCCTTTTGAACGGAT
GACTTCCCATTCACAGCGACAGAGCCAACATCAGCTGTTTCTTCCACACCTGTATCAGAT
TTCTCCTCGTGTTCATGTGCGCTGTCTGTATTTTGATTTGACAGAGCTGCTTCAGCTTTC
TGCCTCTCCTCTTCTTTCTCTCGACGTCTCTTTGCTTCTTGCTCTTTGAGCAGCCTAAAC
CTTTCACCAGGTTTGGGCCCTTCTGAGGTCACTTTCTCACCACCCTTATCTCTTGGTATT
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GTTTTGTCTTCCTTGGTGACC
C

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DS 

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ATTTGGCCATTTTTTTTCTTCACAAATACTAAAACCTTAAAGACCTCTTTTCTATGTTTC
ATGAGAATGGTGTTGCTCCGTATCATGGCCAACGCCGAGTTTCCCATTAGTAGTCTCGTC
CTTTTGAACGGATGACTTCCCATTCACAGCGACAGAGCCAACATCAGCTGTTTCTTCCAC
ACCTGTATCAGATTTCTCCTCGTGTTCATGTGCGCTGTCTGTATTTTGATTTGACAGAGC
TGCTTCAGCTTTCTGCCTCTCCTCTTCTTTCTCTCGACGTCTCTTTGCTTCTTGCTCTTT
GAGCAGCCTAAACCTTTCACCAGGTTTGGGCCCTTCTGAGGTCACTTTCTCACCACCCTT
ATCTCTTGGTATTTTCAATTCTGAAACAGGCTTCTGAACTGGCGGTTGTGAGATAGACTT
GTCAACTTTTTTAGTTTTGTCTTCCTTGGTGACCAAATTAGTGAGCTTCTCCACTGGATT
TTTGGCACCGCCATATTTTTGAAGCCATACTTGCTGTGCTGTGCTCAAAACGTTGTTGGT
CAACCAGTAAAGACTTAAACCAGAAGGAACTGATAGTGCAAAATAGCCAATCATCAGCGG
GAGAAACTTCGTCACAGCTTGTGAGCTCTTCATGGCTGGATCATCACTCTGCGGCTGAGA
GGATTGCATAATCTGAATGGAGAGATACTGAGAGAAGATAAGCAATAGAGCAAGACAGAT
ATGCTAATGTGTCTGACATCCGAGTGGTGGGTGTCCCTCATGAAAGGAAGAGCCATGAGA
TT

QA 1 842 1 842
DS 



AS 1 2

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GTTCTGGAAGTAATCCAAAAAAAAAAAAAAGGCTCATGACAAAAAAAAATCAAATTTCTT
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CTCTTCAAGTACAAGCACCTCACATTTTGCCAGTTTTTCTTCAAAAGGGAAACAAGGAAG
TTGACCCTCATCTGAACATTCTGGAAAATCTGCTTCTCCTCCATGCCGAGATTTCCAACA
GCGACCCCCATGCAAAAAACCTTCTTGAGCTGGAACTTCACTATTGCCTTTGTCTCATTC
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AAACCAGGACCAAAAAAACGGGGAATCTGCTTGATGACCGATTCAAAAGCAAGGAAAGCA
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EQ12JQ U 18
AF RS1B342JQ U 1
BS 1 58 RS1B342JQ
BS 59 59 RS1EQ12JQ
BS 60 78 RS1B342JQ
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BS 80 163 RS1B342JQ
BS 164 164 RS1EQ12JQ
BS 165 534 RS1B342JQ

RD RS1EQ12JQ 226 0 0
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AAAAAAAAAAAAAGGCTCATGACAAAAAAAAATCAAATTTCTTATGATACCTTAAAAAAT
AAAACAAAAATCTTAAAAAACACGGGGGGGTGGACTCATTGTGCTCTTCAAGTACAAGCA
CCTCACATTTTGCCAGTTTTTCTTCAAAAGGGAAACAAGGAAGTTG

QA 1 226 1 226
DS 

RD RS1B342JQ 534 0 0
GAGCAATAACAATAGTAAAAATAAAAATGTCTTTAAACAAAATCTTGATCATCCTACAGA
GTTCTGGAAGTAATCCAAGAAAAAAAAAAAGGCTCATGACAAAAAAAAATCAAATTTCTT
ATGATACCTTAAAAAATAAAACAAAAATCTTAAAAAACACGGGTGGGTGGACTCATTGTG
CTCTTCAAGTACAAGCACCTCACATTTTGCCAGTTTTTCTTCAAAAGGGAAACAAGGAAG
TTGACCCTCATCTGAACATTCTGGAAAATCTGCTTCTCCTCCATGCCGAGATTTCCAACA
GCGACCCCCATGCAAAAAACCTTCTTGAGCTGGAACTTCACTATTGCCTTTGTCTCATTC
ACTTTGGATTCCAAAAACTCTTGGTGGCTGACCAAAGTTGGGAACTTTCCTGCCTTGTTG
AAACCAGGACCAAAAAAACGGGGAATCTGCTTGATGACCGATTCAAAAGCAAGGAAAGCA
TGGAACTTCTTAGCTAGCTTCTTAACAAGCTTCTTGTTCTTGTTCAGCTTCTTA

QA 1 534 1 534
DS 



AS 1 4

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GCACGAAGTTATTTCGGTTTTGCTACTCAGATCTACAGACTTAGCTCGAGTCCATAAGGT
TGTTGCCAGAATCACATGACCCACAACCGAGACGACTTTGCTCCA**TGAAAGGAGACGT
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GGCGAAAATAAGAGGCCTAGTGAACATGACTGGTCTTCCAAACACATGTGTCTGAATATG
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CAATGCAAATCTTTTCCACCTTAAAAGTGGCAAATTGATAGAGTATGCAGTACCAAGCAT
GAAACTCACAAAAAGTGCCCAGAATAGTGGCCATGAACCAACAATCCACCCCAGCCAGAA
ACTCATGATGGAGAAGGAAGCTACAATCGCAATGCCGGTTTTAACAGAATATTCCCCTGA
TGCTAACGGAAGATATGGCTTGTTAACCTTATCTATTTCAACATCAGACAACTAATTGAG
TCCAACTATGTATATGTTCATCATAAGGGCTGCAACAACAGCCTCCAAGATGCCGGTGAA
AAGTAATGGCGAGATGTCAGAAACCTTCTCTACTGCTAAGAAAGATACAGATAAAATGCT
AAGTACTGTGCCGATAACTGTATGTGGCCTTGAAAACCTGTAAAACGCATCTAAGGAGTC
TCTAAAAGAGTTTGGTTTGATCTTAGGGTCGAAAGCCTCATCGGGCTGACCCGTAGTGGT
ATTTGCTTGAAACCTTGACTTATGTCTCGAACACAAGAGCAATGATGAAGATTCTTGACC
TTAAGCCTAGTAACAAGATTGTTCCTACTCTTCAGTTTTGCAAGAACATTACTCGAATTA
CAACTCAGGACTCGGTTTCCTGGTAAAGAGTGGAGCTTTAGATTCTGCTTCTTCCAGTAA
ACTCCACCACCAGCAGCGGAGAGGAGAGAAGAACTAGAGAGCAGAGACTCCATGAAAGAT
ACTTTTTTTCTTGGTTCAGTTCAGATATCAAAGACCAAAGAGATGATCTTCGGGACGCAA
CAACATGAGAAACGATGGAATAATGAACAAGTCGGTCGAGAATTTAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DT04JQ U 1
AF RS1C715JQ U 44
AF RS1DT04TF C 176
AF RS1C715TF C 840
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RD RS1DT04JQ 728 0 0
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DS 

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DS 



AS 1 4

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CTTTTGCAC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1B574JQ C 1
AF RS1B574TF U 1
AF RS1BA63JQ C 1
AF RS1BA63TF U 1
BS 1 369 RS1B574TF

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CTTTTGCAC

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DS 



AS 1 3

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GGATTGGGGCAGTGAGGATCTACACGATATTGTCGCTCAAATGGGTTTTCTTGGATCAGA
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ATTTGAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

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ATCGTCATCGTCACCGCGACCAATGGAAGGGCTTAACGAGACAGGGCCACCGCCGTTTCT
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TTTGAT

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CL22JQ U 1
AF RS1CU54JQ U 4
BS 1 438 RS1CL22JQ
BS 439 439 RS1CU54JQ
BS 440 446 RS1CL22JQ
BS 447 447 RS1CU54JQ
BS 448 550 RS1CL22JQ
BS 551 551 RS1CU54JQ
BS 552 638 RS1CL22JQ
BS 639 639 RS1CU54JQ
BS 640 652 RS1CL22JQ
BS 653 653 RS1CU54JQ
BS 654 686 RS1CL22JQ
BS 687 770 RS1CU54JQ

RD RS1CL22JQ 686 0 0
GCTGTAATATTTCCACATCTTTATTATGAGCTGAGAATTACAAATCAACAACACAAACAT
ACATACATACAAACAGAGAACACTCCTCTGTTTTGGGATGAAATAGCTACAGAAGTCTTT
ATACTTAGCCGTAGCAACGGATAGGGTCCTTGCAGCTCTTTGCAGGAGATTGTGCATTGC
CGTACATGCCACCTTTGGCGAGGTAATTCTGATGGTATTCTTCAGCTTTGTAGAACTTCT
TCACTGGTAAGATCTCAGTCACAATCTTCTCCTCAAGCTTTTTCTGCTGATTCTCAAGAG
ACTCACGTGCTAGCTTCTCTTGCTCTGGTGTATAGAAGTATATCCCTGATCGGTATTGAG
CTCCCACAAGCTCTCCCTGACGATTCAAGGAGGTGGGATCATGCCTAGACCAGAACAAAT
CAAGCAGGGTCTCATAGCTGCACTCATTGGGATCATACTGAACCCCTACAACCTCTGCAT
GGTTCGTTTTGTTCGTGCGGACAACCTTGTATGTAGGATTATGTGAGATCCCTTGAGTGT
ACCCGACCTCGGTCTCGATCACCCCAGGGATCCTCTGGAAAGCAAGCTCCAGTCCCCAGA
AGCATCCAGCGGCGAACTCAGCAAACTGGGTTCCCGGTGCTGGAACATCGTTGTCAGGCT
CCTGTGCTATCGGAGAAGGAACTATA

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1CU54JQ 767 0 0
GTAATATTTCCACATCTTTATTATGAGCTGAGAATTACAAATCAACAACACAAACATACA
TACATACAAACAGAGAACACTCCTCTGTTTTGGGATGAAATAGCTACAGAAGTCTTTATA
CTTAGCCGTAGCAACGGATAGGGTCCTTGCAGCTCTTTGCAGGAGATTGTGCATTGCCGT
ACATGCCACCTTTGGCGAGGTAATTCTGATGGTATTCTTCAGCTTTGTAGAACTTCTTCA
CTGGTAAGATCTCAGTCACAATCTTCTCCTCAAGCTTTTTCTGCTGATTCTCAAGAGACT
CACGTGCTAGCTTCTCTTGCTCTGGTGTATAGAAGTATATCCCTGATCGGTATTGAGCTC
CCACAAGCTCTCCCTGACGATTCAAGGAGGTGGGATCATGCCTAGACCAGAACAAATCAA
GCAGGGTCTCATAGCCGCACTCACTGGGATCATACTGAACCCTTACAACCTCTGCATGGT
TCGTTTTGTTCGTGCGGACAACCTTGTATGTAGGATTATGTGAGATCCCTTGAGTGTACC
*GACCTCAGTCTCGATCACCCCAGGGATCCTCTGGAAAGCAAGCTCCAGTCCCCAGAAGC
ATCCAGCGGCGAACTCAGCAAACTGGGTTCCCGGTCCTGGAACATCGTTATCAGGCTCCT
GTGCTATCGGAGAAGGGACTATAGCAGCTGTGTCTACTAACTGAGGCTCTTCTTGAGCTA
TAGGAGAAAGGTCAGTTGCAGTGTATCTAATAACTTAGACTCTTCTT

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL2158Contig1 744 2 25 U
AATTCGGGAAGGAGAATATATATATTCATCATGTAATGGACACGAACAACATGGAAATAA
CTCAATAGAAGAAACAACTTGAACAGTCTTGACACTTAGAAGAAACTCTCGTCAAAAGAT
CAAACAAATACCGCCAGAAACAGGCACACAAACACACACACACAAACTGACTCGGGTAAG
AAACTTTAATAGCAGATGGCAAGAAAGAGTAGTGATGGGTCCCTTCCTGTTCATCTCATC
ACTTCAGTACATTGTACAAGTATGCAGCGATACCCAGAACAATACACAACAGAACAATAT
CGATGCAGAAGTTCCGACTTGACCTCAGCTGGTTCACAGTATCTTTGAGTCTAACATTGG
TGTTCTTAAGATCCGAGGTTGCTCTGTCAACCTTTGAGTCTATTTCATCCATCAAAGGAA
CTTGACGGTCCAGCTCCTCGTTCATATCAAACGCCATGTTCTTCAAAGCATCTAGACCTT
CGGAGATCATGTCCAGAACTTGGTCCTGCTTAATTTTGCGCATCTCAAACTCCTGTTTGA
ACTGGCTGGATTCATGCGACTCTTGAAAGTAATCATCATCAAAACGCCCATCTGAATCAA
ACTTGATATCAGGACGAGAGGTTGTAGAAGGAGCCCAAGCACTAGTAGTGCCTTTAGGAC
CACCCGCTGTCCCATCAGGTATAGCTTCGATCCTAGCCGGAAGCGCAAGCACCAAATCGT
TTCTCGCAGCAAGCTCTTCCGTTG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1GM12JQ U 1
AF RS1FO48JQ U 5
BS 1 75 RS1GM12JQ
BS 76 76 RS1FO48JQ
BS 77 122 RS1GM12JQ
BS 123 123 RS1FO48JQ
BS 124 280 RS1GM12JQ
BS 281 281 RS1FO48JQ
BS 282 315 RS1GM12JQ
BS 316 317 RS1FO48JQ
BS 318 388 RS1GM12JQ
BS 389 389 RS1FO48JQ
BS 390 414 RS1GM12JQ
BS 415 415 RS1FO48JQ
BS 416 449 RS1GM12JQ
BS 450 450 RS1FO48JQ
BS 451 451 RS1GM12JQ
BS 452 452 RS1FO48JQ
BS 453 497 RS1GM12JQ
BS 498 498 RS1FO48JQ
BS 499 651 RS1GM12JQ
BS 652 652 RS1FO48JQ
BS 653 692 RS1GM12JQ
BS 693 693 RS1FO48JQ
BS 694 709 RS1GM12JQ
BS 710 710 RS1FO48JQ
BS 711 744 RS1GM12JQ

RD RS1GM12JQ 744 0 0
AATTCGGGAAGGAGAATATATATATTCATCATGTAATGGACACGAACAACATGGAAATAA
CTCAATAGAAGAAACGACTTGAACAGTCTTGACACTTAGAAGAAACTCTCGTCAAAAGAT
CACACAAATACCGCCAGAAACAGGCACACAAACACACACACACAAACTGACTCGGGTAAG
AAACTTTAATAGCAGATGGCAAGAAAGAGTAGTGATGGGTCCCTTCCTGTTCATCTCATC
ACTTCAGTACATTGTACAAGTATGCAGCGATACCCAGAACGATACACAACAGAACAATAT
CGATGCAGAAGTTCCTGCTTGACCTCAGCTGGTTCACAGTATCTTTGAGTCTAACATTGG
TGTTCTTAAGATCCGAGGTTGCTCTGTCCACCTTTGAGTCTATTTCATCCATCAGAGGAA
CTTGACGGTCCAGCTCCTCGTTCATATCAGATGCCATGTTCTTCAAAGCATCTAGACCTT
CGGAGATCATGTCCAGACCTTGGTCCTGCTTAATTTTGCGCATCTCAAACTCCTGTTTGA
ACTGGCTGGATTCATGCGACTCTTGAAAGTAATCATCATCAAAACGCCCATCTGAATCAA
ACTTGATATCAGGACGAGAGGTTGTAGAAGGAGCCCAAGCACTAGTAGTGCTTTTAGGAC
CACCCGCTGTCCCATCAGGTATAGCTTCGATCTTAGCCGGAAGCGCAAGTACCAAATCGT
TTCTCGCAGCAAGCTCTTCCGTTG

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1FO48JQ 740 0 0
CGGGAAGGAGAATATATATATTCATCATGTAATGGACATGAACAACATGGAAATAACTCA
ATAGAAGAAACAACTTGAACAGTCTTGACACTTAGAAGAAACTCTCGTCAAAAGATCAAA
CAAATACCGCCAGAAACAGGCACACAAACACACACACACAAACTGACTCGGGTAAGAAAC
TTTAATAGCAGATGGCAAGAGAGAGTAGTGATGGGTCCTTTCCTGTTCATCTCATCACTT
CAGTACATTGTACAAGTATGCAGCGATACCCAGAACAATACACAACAGAACAATATCGAT
GCAGAAGTTCCGACTTGATCTCAGCTGGTTCACAGTATCTTTGAGTCTAACATTGGTGTT
CTTAAGATCCGAGGTTGCTCTGTCAACCTTTGAGTCTATTTCATCCATCAAAGGAACTTG
ACGGTCCAGCTCCTCGTTCATATCAAACGCCATGTTCTTCAAAGCATCTAGACCTTCGGA
GATCATGTCCAGAACTTGGTCCTGCTTAATTTTGCGCATCTCAAACTCCTGTTTGAACTG
GCTGGATTCGTGCGACTCTTGAAAGTAATCATCATCAAAACGCCCATCTGAATCAAACTT
GATATCAGGACGAGAGGTTGTAGAAGGAGCCCAAGCACTAGTAGTGCCTTTAGGACCACC
CGCTGTCCCATCAGGTATAGCTTCGATCCTCGCCGGAAGCGCAAGCACCAAATCGTTTCT
CGCAGCAAGCTCTTCCGTTG

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 3

CO CL2159Contig1 1131 3 7 U
GCGGCGTCAGCATTTCACACGCGGTGGTCGACGGACAAAGCGCGTTTCACTTCTTGTCGG
AATGGGGAAGAATCGCTCGCGGGGATCTCTTGAAACCATTCCAATCCTCGACCGCAAAAT
CCTCTGGACTGGTGAACCGCTTCCGCCGTTTGCCTCGCCACCTCAGTGCGAACGCAAAGG
GTTTGAACAGCCGCCGTTACTGATCGGAGAAACTGACAATGTAGAAGAAAGAAAGAAGAA
AACAACTGTAGAGATACTAAAACTTAGCAAAACACAGCTTGAAAAGCTTAGAAGCAGAGT
GAATGCAAGTGAATACGCTGATCCAGCTAGAGGGTTTACAAGGTACGAGACGGTCGCGGG
ACATGTGTGGAGGTGCGCTTCTAAAGCACGTGGGCACTCCCCAGAGCAACCCACGTCTCT
GGGAATCTGTGTAGATACTCGTAGTCGGGTGCAGCCACCTCTACCACGCGGCTACTTTGG
CAATGCCACTATTAATGCGGTCGCACGAAGCACCTCAGGTGAACTCATATCGAATGGGTT
GGGTTTCGCGGCCGAAAAAATCAGTGAAGCCATAAAGAGTGTGACAAACGAATACGTAAT
GACTGGGATAGAGTATCTAAAAAACCACGAGGATCTGAAGACGTTTCAAGATATACATGC
CTTGGGAAGCACGGAGGGTCCATTCTACGGAAACCCTAACCTTGGACTTGTGAGCTGGTT
AACCCTACCGATGTACGGCCTTGATTTCGGCTGGGGCAAGGAGGTCCACATGGGACCATG
CACGCATGACGGAGACGGGGGCTCTCTGCTACTGCCTGATAAAAATGATGACGGCTCACT
GATTCTCGCCACGTGTCTACAGGTAGCTCACATGGAGGCCTTCAAGAAACATTTATATGA
AGATATCTAGGGTTTTTTTTTTCCAAAAAAAAAAGATATCTAGGGTTCTCTTAGTAAAAA
AAAAGAAGAAGATATCTAGGGTTCTATATATACACACAAGTATTCATATATCTATGCATT
TTCATTTCCATTTGAATAAGGATTCGAGTAGGGATTCTACTACTGTTGGTGTGATTCTTG
ATTTGTATTAACAAATTTACACATATATAATTACACTTTATATTTTTGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BR95TF U 1
AF RS1AG39TF U 357
AF RS1BR95JQ C 442
BS 1 684 RS1BR95TF
BS 685 792 RS1AG39TF
BS 793 796 RS1BR95JQ
BS 797 922 RS1AG39TF
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BS 924 1130 RS1AG39TF
BS 1131 1131 RS1BR95JQ

RD RS1BR95TF 685 0 0
GCGGCGTCAGCATTTCACACGCGGTGGTCGACGGACAAAGCGCGTTTCACTTCTTGTCGG
AATGGGGAAGAATCGCTCGCGGGGATCTCTTGAAACCATTCCAATCCTCGACCGCAAAAT
CCTCTGGACTGGTGAACCGCTTCCGCCGTTTGCCTCGCCACCTCAGTGCGAACGCAAAGG
GTTTGAACAGCCGCCGTTACTGATCGGAGAAACTGACAATGTAGAAGAAAGAAAGAAGAA
AACAACTGTAGAGATACTAAAACTTAGCAAAACACAGCTTGAAAAGCTTAGAAGCAGAGT
GAATGCAAGTGAATACGCTGATCCAGCTAGAGGGTTTACAAGGTACGAGACGGTCGCGGG
ACATGTGTGGAGGTGCGCTTCTAAAGCACGTGGGCACTCCCCAGAGCAACCCACGTCTCT
GGGAATCTGTGTAGATACTCGTAGTCGGGTGCAGCCACCTCTACCACGCGGCTACTTTGG
CAATGCCACTATTAATGCGGTCGCACGAAGCACCTCAGGTGAACTCATATCGAATGGGTT
GGGTTTCGCGGCCGAAAAAATCAGTGAAGCCATAAAGAGTGTGACAAACGAATACGTAAT
GACTGGGATAGAGTATCTAAAAAACCACGAGGATCTGAAGACGTTTCAAGATATACATGC
CTTGGGAAGCACGGAGGGTCCATT
C

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1AG39TF 774 0 0
G
GGGACATGTGTGGAGGTGCGCTTCTAAAGCACGTGGGCACTCCCCAGAGCAACCCACGTC
TCTGGGAATCTGTGTAGATACTCGTAGTCGGGTGCAGCCACCTCTACCACGCGGCTACTT
TGGCAATGCCACTATTAATGCGGTCGCACGAAGCACCTCAGGTGAATTCATATCGAATTG
GTTGGGTTTCGCGGCCGAAAAAATCAGTGAAGCCATAAAGAGTGTGACAAACGAATACGT
AATGACTGGGATAGAGTATCTAAAAAACCACGAGGATCTGAAGACGTTTCAAGATATACA
TGCCTTGGGAAGCACGGAGGGTCCATTCTACGGAAACCCTAACCTTGGACTTGTGAGCTG
GTTAACCCTACCGATGTACGGCCTTGATTTCGGCTGGGGCAAGGAGGTCCACATGGGACC
ATGCACGCATGACGG****GGGGGCTCTCTGCTACTGCCTGATAAAAATGATGACGGCTC
ACTGATTCTCGCCACGTGTCTACAGGTAGCTCACATGGAGGCCTTCAAGAAACATTTATA
TGAAGATATCTAGGGTTTTTTTTTTTCAAAAAAAAAAGATATCTAGGGTTCTCTTAGTAA
AAAAAAAGAAGAAGATATCTAGGGTTCTATATATACACACAAGTATTCATATATCTATGC
ATTTTCATTTCCATTTGAATAAGGATTCGAGTAGGGATTCTACTACTGTTGGTGTGATTC
TTGATTTGTATTAACAAATTTACACATATATAATTACACTTTATATTTTTGCT

QA 2 774 2 774
DS 

RD RS1BR95JQ 690 0 0
TAGTCGGGTGCAGCCACCTCTACCACGCGGCTACTTTGGCAATGCCACTATTAATGCGGT
CGCACGAAGCACCTCAGGTGAACTCATATCGAATGGGTTGGGTTTCGCGGCCGAAAAAAT
CAGTGAAGCCATAAAGAGTGTGACAAACGAATACGTAATGACTGGGATAGAGTATCTAAA
AAACCACGAGGATCTGAAGACGTTTCAAGATATACATGCCTTGGGAAGCACGGAGGGTCC
ATTTTACGGAAACCCTAACCTTGGACTTGTGAGCTGGTTAACCCTACCGATGTACGGCCT
TGATTTCGGCTGGGGCAAGGAGGTCCACATGGGACCATGCACGCATGACGGAGACGGGGG
CTTTCTGCTACTGCCTGATAAAAATGATGACGGCTCACTGATTCTCGCCACGTGTCTACA
GGTAGCTCACATGGAGGCCTTCAAGAAACATTTATATGAAGATATCTAGGGTTTTTTTTT
TC****AAAAAAAGATATCTAGGGTTCTCTTAGTAAAAAAAAAGAAGAAGATATCTAGGG
TTCTATATATACACACAAGTATTCATATATCTATGCATTTTCATTTCCATTTGAATAAGG
ATTCGAGTAGGGATTCTACTACTGTTGGTGTGATTCTTGATTTGTATTAACAAATTTACA
CATATATAATTACACTTTATATTTTTGCTC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 2 4

CO CL2160Contig1 848 2 2 U
GGGGTCCAACTTCAATCAGATTAATTCACACAGAAGAAAAGGAGAAGAAGAAAGATTATT
TTTTCTTGGGCATTTCCCAAGTTTTCTTTTTTCTTCTACAAACTTTTTTTTTTGTGGGCA
TTTCCCAAAAATATCATTTTCCGTTTTGTTTCAAAATTTTCTTTTATATTTTATAAAAAT
GGGAAACTGTTTGAATGGAGGAAGCAACCTTAAAAGAATGGTTCAAGAAGAGAAAAAAGA
AGTGAAGAAAGATTACAACAGAAAAGATAGGAAGGTGAAGATTGTTCTAAGGAGAGACGA
GTTAGAGAAACTCATTCTCTTCCAGTTAAACGCCGGTGGTGACGTCCAAGGCAAAGGAGA
AACAACTTTGGCATCCTTCGGCGACTTTCTCAGGGAGCTAGAGGCGGAGAGATTTGCCGG
AGAAGCGGCAGCAAAGGCTGCTGAGGAAGAGGAGGAGTCTCGCCGGAGATGTCGAAAATG
GAGGCCTTCATTGGACAGAATCATTGAATGGCCTGAAGAAACACTTGCGTAATTACTTTT
CTTAATCCTTTTATTTTAGATCATTAAGTTTTTTTTTATTTGTTCAAGGGGATTTTTTTG
TGGGAGAATTTGCTTTTGCCTGATTTTTCCTACCTTTTTCCCGATGGATTTTTTTTTTCA
CTTGAGAAATGTTATGTTCTCAAAGTGAGATATATCTTCGGTGTTTTTAAACTGGCAGAC
GCTTATTTTACCACAGAAAAATTCCCAAAGAAGAAAAAGTACGAAACTATGTATTTTGTT
TTCGTCTTTCATGTGTAACGTTCAATGTGTCGAGTGTTAAAACATAAATAAACTTGTGTT
GCTTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DJ63TF U 1
AF RS1DJ63JQ C 112
BS 1 695 RS1DJ63TF
BS 696 848 RS1DJ63JQ

RD RS1DJ63TF 696 0 0
GGGGTCCAACTTCAATCAGATTAATTCACACAGAAGAAAAGGAGAAGAAGAAAGATTATT
TTTTCTTGGGCATTTCCCAAGTTTTCTTTTTTCTTCTACAAACTTTTTTTTTTGTGGGCA
TTTCCCAAAAATATCATTTTCCGTTTTGTTTCAAAATTTTCTTTTATATTTTATAAAAAT
GGGAAACTGTTTGAATGGAGGAAGCAACCTTAAAAGAATGGTTCAAGAAGAGAAAAAAGA
AGTGAAGAAAGATTACAACAGAAAAGATAGGAAGGTGAAGATTGTTCTAAGGAGAGACGA
GTTAGAGAAACTCATTCTCTTCCAGTTAAACGCCGGTGGTGACGTCCAAGGCAAAGGAGA
AACAACTTTGGCATCCTTCGGCGACTTTCTCAGGGAGCTAGAGGCGGAGAGATTTGCCGG
AGAAGCGGCAGCAAAGGCTGCTGAGGAAGAGGAGGAGTCTCGCCGGAGATGTCGAAAATG
GAGGCCTTCATTGGACAGAATCATTGAATGGCCTGAAGAAACACTTGCGTAATTACTTTT
CTTAATCCTTTTATTTTAGATCATTAAGTTTTTTTTTATTTGTTCAAGGGGATTTTTTTG
TGGGAGAATTTGCTTTTGCCTGATTTTTCCTACCTTTTTCCCGATGGATTTTTTTTTTCA
CTTGAGAAATGTTATGTTCTCAAAGTGAGATATAT
C

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1DJ63JQ 737 0 0
TTGTGGGCATTTCCCAAAAATATCATTTTCCGTTTTGTTTCAAAATTTTCTTTTATATTT
TATAAAAATGGGAAACTGTTTGAATGGAGGAAGCAACCTTAAAAGAATGGTTCAAGAAGA
GAAAAAAGAAGTGAAGAAAGATTACAACAGAAAAGATAGGAAGGTGAAGATTGTTCTAAG
GAGAGACGAGTTAGAGAAACTCATTCTCTTCCAGTTAAACGCCGGTGGTGACGTCCAAGG
CAAAGGAGAAACAACTTTGGCATCCTTCGGCGACTTTCTCAGGGAGCTAGAGGCGGAGAG
ATTTGCCGGAGAAGCGGCAGCAAAGGCTGCTGAGGAAGAGGAGGAGTCTCGCCGGAGATG
TCGAAAATGGAGGCCTTCATTGGACAGAATCATTGAATGGCCTGAAGAAACACTTGCGTA
ATTACTTTTCTTAATCCTTTTATTTTAGATCATTAAGTTTTTTTTTATTTGTTCAAGGGG
ATTTTTTTGTGGGAGAATTTGCTTTTGCCTGATTTTTCCTACCTTTTTCCCGATGGATTT
TTTTTTTCACTTGAGAAATGTTATGTTCTCAAAGTGAGATATATCTTCGGTGTTTTTAAA
CTGGCAGACGCTTATTTTACCACAGAAAAATTCCCAAAGAAGAAAAAGTACGAAACTATG
TATTTTGTTTTCGTCTTTCATGTGTAACGTTCAATGTGTCGAGTGTTAAAACATAAATAA
ACTTGTGTTGCTTTGGC

QA 1 737 1 737
DS 



CO CL2160Contig2 850 2 4 U
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ATTTTTTCTTGGGCATTTCCCAAGTTCTCTTTTTTCTTCTACAAACTTTTTTTTTGTTGT
GGGCATTTCCCAAAAATATCATTTTCCTTTTTGTTTCAAAATTTTCTTTTATTTTATAAA
AATGGGAAACTGTTTGAATGGAGGAAGCAACCTTAAAAGAATGGTTCAAGAAGAAGAAAA
AGGAGTGAAGAAAGATTACAACAGAAAAGATAGGAAGGTGAAGATTATTCTAGGGAGAGA
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AGAAACAACTTTGGCATCCTTCGGCGACTTTCTCAGGGAGCTAGAGGCGGAGAGATTTGC
CGGAGAAGCGGCAGCAAAGGCTGCTGAGGAAGAGGAGGAGTCTCGCCGGAGATGTCGAAA
ATGGAGGCCTTCATTGGACAGAATCATTGAATGGCCTGAAGAAACACTTGCGTAATTGCT
TTTCTTAATCCTTTTATTTAGATCATTAAGTTTTTTTTTTTGTCACGGACGGGATTTTTT
TGTGGGAGAATTTGTTTTTGCCTGTTTTTTCCTACCTTTTTCCCGATGGATTTTTTTTCA
CTTGAGAAATGTTATGTTCTCAAAGTGAGATATATCTTCGGTGTTTTGAAACTGGCAGAC
GCTTATTTTACCACAGAGAAATCCCAAAGAAGTAAAAAGTACGAAACTATGTATTTTGTT
TTCGTCTTTCATGTGTAACGTTCAATGTGTCGAGTGTTAAAACATAAATAAACTTGTGTT
GCTTTGTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FG85TF U 1
AF RS1FG85JQ C 384
BS 1 700 RS1FG85TF
BS 701 701 RS1FG85JQ
BS 702 742 RS1FG85TF
BS 743 850 RS1FG85JQ

RD RS1FG85TF 752 0 0
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ATTTTTTCTTGGGCATTTCCCAAGTTCTCTTTTTTCTTCTACAAACTTTTTTTTTGTTGT
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AATGGGAAACTGTTTGAATGGAGGAAGCAACCTTAAAAGAATGGTTCAAGAAGAAGAAAA
AGGAGTGAAGAAAGATTACAACAGAAAAGATAGGAAGGTGAAGATTATTCTAGGGAGAGA
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AGAAACAACTTTGGCATCCTTCGGCGACTTTCTCAGGGAGCTAGAGGCGGAGAGATTTGC
CGGAGAAGCGGCAGCAAAGGCTGCTGAGGAAGAGGAGGAGTCTCGCCGGAGATGTCGAAA
ATGGAGGCCTTCATTGGACAGAATCATTGAATGGCCTGAAGAAACACTTGCGTAATTGCT
TTTCTTAATCCTTTTATTTAGATCATTAAGTTTTTTTTTTTGTCACGGACGGGATTTTTT
TGTGGGAGAATTTGTTTTTGCCTGTTTTTTCCTACCTTTTTCCCGATGGATTTTTTTTCA
CTTGAGAAATGTTATGTTCTCAAAGTGAGATATATCTTCG*TGTTTTGAAACTGGCAGAC
GCTTATTTTACCACAGAGAAAT
CCCAAGAAGT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RS1FG85JQ 467 0 0
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TCATTGAATGGCCTGAAGAAACACTTGGGTAATTGCTTTTCTTAATCCTTTTATTTAGAT
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GTTTTTTCCTACCTTTTTCCCGATGGATTTTTTTTCACTTGAGAAATGTTATGTTCTCAA
AGTGAGATATATTTTCGGTGTTTTGAAACTGGCAGACGCTTATTTTACCACAGAGAAATC
CCAAAGAAGTAAAAAGTACGAAACTATGTATTTTGTTTTCGTCTTTCATGTGTAACGTTC
AATGTGTCGAGTGTTAAAACATAAATAAACTTGTGTTGCTTTGTCTT

QA 1 467 1 467
DS 



AS 1 4

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CAACGCTGCAACACGATCTCACAATCCGCAAGTATCTCATTGAGCTGTGCTCTCAAATTT
TTCACATTTTCATACTCGCTCTTTTTGTGACCGACCAGACCTGAAGCGGCTAGTACCAGG
GAAACACCGAGTTTGTTCTGGCTGACCTCTTCTTCCCACACACGTTTCATGGTCGAGGAC
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CGCAACGCCATCTCCAGATTTCTTCCTGCCGACACGAACCAAGCCTTTCTTTAGTGGAAT
GGAACTTTTATTGTTAAGGTTAGGGTTATTATGGATCC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1C509TF C 1
AF RS1C509JQ U 9
AF RS1C340JQ U 59
AF RS1C340TF C 59
BS 1 8 RS1C509TF
BS 9 178 RS1C509JQ
BS 179 179 RS1C340JQ
BS 180 213 RS1C509JQ
BS 214 214 RS1C340JQ
BS 215 273 RS1C509JQ
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BS 275 403 RS1C509JQ
BS 404 404 RS1C340JQ
BS 405 600 RS1C509JQ
BS 601 638 RS1C340JQ

RD RS1C509TF 602 0 0
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ACAAACGAATCTTTTCTTTTAAAGTTTAGGGAAGTTAGTTCAAAGTTTAGGGAAGTTCAT
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TTGTTGTTTGTTTTTGAGTTGAGTAATCATCATCATCATGTTTCCTTGGATAACCAAATT
TCTCTCTCCAGCTTCTTCATCTTCGCCTCCGTAGAATGAAAAGCTTGCGAATTTGCATCG
CAACGCTGCAACACGATCTCACAATCCGCAAGTATCTCATTGAGCTGTGCTCTCAAATTT
TTCACATTTTCATACTCGCTCTTTTTGTGACCGACCAGACCTGCAGCGGCTAGTACCAGG
GAAACACCGAGTTTGTTCTGGCTGACCTCTTCTTCCCACACACGTTTCATGGTCGAGGAC
AATTGGTCAACCCTAACCTGCTGCAGAGGCCGCTGTTTAGCAACGGAGGACACTAGCCTC
CGCAACGCCATCTCCAGATTTCTTCCTGCCGACACGAACCAAGCCTTTCTTTAGTGGAAT
CC

QA 1 600 1 600
DS 

RD RS1C509JQ 594 0 0
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ACAACACACACAAAGCATAAATGTAAACATGAAGCAAGTAGAGGAGCAGAAATTGTTGTT
TGTTTTTGAGTTGAGTAATCATCATCATCATGTTTCCTTGGATAACCAAATTTCTCTCTC
CAGCTTCTTCATCTTCGCCTCCGTAAAATGAAAAGCTTGCGAATTTGCATCGCAACGCTG
CAACACGATCTCACAATCCGCAAGTATCTCATTGAGCTGTGCTCTCAAATTTTTCACATT
TTCATACTCGCTCTTTTTGTGACCGACCAGACCTGCAGCGGCTAGTACCAGGGAAACACC
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AACCCTAACCTGCTGCAGAGGCCGCTGTTTAGCAACGGAGGACACTAGCCTCCGCAACGC
CATCTCCAGATTTCTTCCTGCCGACACGAACCAAGCCTTTCTTTAGTGGAAT
CC

QA 1 592 1 592
DS 

RD RS1C340JQ 580 0 0
C
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TGGAACTTTTATTGTTAAGGTTAGGGTTATTATGGATCC

QA 2 580 2 580
DS 

RD RS1C340TF 580 0 0
C
TACAAACGAATCTTTTCTTTTAAAGTTTAGGGAAGTTAGTTCAAAGTTTAGGGAAGTTCA
TACATAAAAACAACACACACAAAGCATAAATGTAAACATGAAGCAAGTAGAGGAGCAGAG
ATTGTTGTTTGTTTTTGAGTTGAGTAATCATCATAATCATGTTTCCTTGGATAACCAAAT
TTCTCTCTCCAGCTTCTTCATCTTCGCCTCCGTAGAATGAAAAGCTTGCGAATTTGCATC
GCAACGCTGCAACACGATCTCACAATCCGCAAGTATCTCATTGAGCTGTGCTCTCAAATT
TTTCACATTTTCATACTCGCTCTTTTTGTGACCGACCAGACCTGAAGCGGCTAGTACCAG
GGAAACACCGAGTTTGTTCTGGCTGACCTCTTCTTCCCACACACGTTTCATGGTCGAGGA
CAATTGGTCAACCCTAACCTGCTGCAGAGGCCGCTGTTTAGCAACGGAGGACACTAGCCT
CCGCAACGCCATCTCCAGATTTCTTCCTGCCGACACGAACCAAGCCTTTCTTTAGTGGAA
TGGAACTTTTATTGTTAAGGTTAGGGTTATTATGGATCC

QA 2 580 2 580
DS 



AS 1 2

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TAGAGAGTTGATACGCAACACCACATGGCTTTCTTAAGTAAAGTTGGAAAGATATTTAGG
CAGACCAGCACCCATGTCGCTGCCTCTAACTCAATGCTACAGGGCATCCGTTGCATGTCT
TCGTCCAAAATCTTTGTTGGAGGTATCTCCTACAGCACTGATGAGTTTGGCTTAAGAGAA
GCTTTTAGCAAATATGGAGAAGTTGTTGATGCGAAAATCATTGTGGACCGTGAAACTGGG
AGATCAAGGGGATTTGCTTTTGTCACATTTACTTCTACAGAAGAGGCTAGTAACGCCATG
CAATTGGATGGACAGGACCTTCATGGTCGAAGAATTAGGGTGAACTACGCAACTGAAAGA
GGAAGTGGATTTGGAGGAAGAGGATTCGGTGGTCCTGGTGGTGGCAATGCGGGTGGTTAC
GGAGGCGGTGGTTACGGTGCTCCAGCTGGTGGTTACGGAGGTGGCTCATCTTATGGTGGA
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AGTGACAACTTTGCTCAAGGCAGTTCCTCTAATGCTGGCTTTGATGACAAGTTTAACAGC
AACGAACCACTAGGCAACGATACGGATCATCAGCTTGAAAGCGCTGGCGATGAGCAGTTT
GGTGGCAGTGACAATCAGTTTGGTGGCTCGGAGAACGGTCAAACAGAGGTTGCCCCAGAC
GGGTTTGATCAGCTTGACGATGGTGATGATGTTGCGAAAAGAGCTTAGTCTCTACAGTAT
TTGCGCTGCCTGCGTCCTGGAAACTTTTCTTTGCAGTTTCAGAATAAACTTGTGGAAGCT
TCTTAGTTTCTGTTTTTTTCAACGTTTGGTGTTGTTATCATATATGCAGAGACCTCTCTA
TTGTTGGTCGTTTTCTTTATGTTTTGTGACATTTGAGGGCTCGCAAATAAAACTGTAGTA
ACTTCTAACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C588TF U 1
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QA 1 479 1 479
DS 

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QA 1 718 1 718
DS 



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ATTCAAAAATGAAAAAAGTTTTTCAGTGGTATAATTGTATGTCAAAGACATTTATTATTC
TATTCTTTCGTACTCCATATCGAGTAATTTTTTTCTTTCC


BQ
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AF RS1AK71TF C 1
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ATTCAAAAATGAAAAAAGTTTTTCAGTGGTGTAATTGTATGTCAAAGACATTTATTATTC
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CCTGTTGAAAGCGATTTCCCTAAAGAAATCGCTTTCAACGATGTCCAATATCCCTTCCTT
TTCCAAATTTTTTTACGAATACGCTTTTTCGAGATAGAAGTACGTTTTTTTGGAACTGCC
ATTCAAAAATGAAAAAAGTTTTTCAGTGGTATAGTTGTATGTCAAAGACATTTATTATTC
TATTCTTTCGTACTCCATATCGAGTAATTTTTTTCTTTCC

QA 1 340 1 340
DS 

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GTG
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TTCGTACTCCATATCGAGTAATTTTTTTCTTTCC

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DS 

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TCGAGATAGAAGTACGTTTTTTTGGAACTGCCATTCAAAAATGAAAAAAGTTTTTCAGTG
GTGTAATTGTATGTCAAAGACATTTATTATTCTATTCTTTCGTACTCCATATCGAGTAAT
TTTTTTCTTTCC

QA 1 192 1 192
DS 



AS 1 4

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GGGTATGCTCTGCGGCGTCTTTCCTCTCCTGCCCGGTCTTAAACTCAGCCAAGTACCTAT
GGTAATCCCCCTTCATCTTCAGG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FE70JQ U 10
AF RS1FE70TF C 20
AF RS1CK79JQ U 14
AF RS1BG32JQ U 1
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BS 611 611 RS1FE70JQ
BS 612 683 RS1BG32JQ

RD RS1FE70JQ 608 0 0
CATCA
CCTGATAAATGACATTAATAAGAAAGCAATCTTAGTTTCAGTACAAGGCACAAAGCCCGA
CAACATTCAATCAAATAAGAAGAAAAAGAAACAAGATAATAAACCCAGCAGCATCCACGA
TTAGGAAGAGCAAACAAAGGACAAGAATAGACGGCCTTAAAAGCTTCGGGGATGGCAAAC
GGAAGAGATTAAAAAAACAAACACAAGGGAAATAACATAATAGTTGGATGAGTTTAGAAT
ACTGAATAACAGACTTAAGTCTCCTTCTCCTCTTCAGCAGGCTTTGTTGCTGCCGCTTCT
TTGATCTCCTCTGTACCTTCGTCCTGCATGTCAAAAGTCCAGAGAGTAAGGTTGTCACGG
AGAAGCTGCATGATCAAAGTACTGTCCTTGTATGACTCCTCGCCTAGAGTATCCAACTCA
GCGATTGCATCATCAAATGCCTGCTTAGCGAGACTGCAAGCACGGTCTGGAGAGTTGAGA
ATCTCATAGTAAAAGACGGAGAAGTTCAAAGCCAGACCAAGACGGATCGGGTGCGTTGGA
GCCAATTCAGCGTTAGCAATGTCCTGAGCGGCTTTGTAAGCGGTTAGGGTATGCTCTGCG
GC
C

QA 6 607 6 607
DS 

RD RS1FE70TF 598 0 0
TAAATGAC
ATTAATAAGAAAGCAATCTTAGTTTCAGTACAAGGCACAAAGCCCGACAACATTCAATCA
AATAAGAAGAAAAAGAAACAAGATAATAAACCCAGCAGCATCCACGATTAGGAAGAGCAA
ACAAAGGACAAGAATAGACGGCCTTAGAAGCTTCGGGGATGGCAAACGGAAGAGATTAGA
AAAACAAACACAAGGGAAATAACATAATAGTTGGATGAGTTTAGAATACTGAATAACAGA
CTTAAGTCTCCTTCTCCTCTTCAGCAGGCTTTGTTGCTGCCGCTTCTTTGATCTCCTCTG
TACCTTCGTCCTGCATGTCAGAAGTCCAGAGAGTAAGGTTGTCACGGAGAAGCTGCATGA
TCAAAGTACTGTCCTTGTATGACTCCTCGCCTAGAGTATCCAACTCAGCGATTGCATCAT
CAAATGCCTGCTTAGCGAGACTGCAAGCACGGTCTGGAGAGTTGAGAATCTCATAGTAAA
AGACGGAGAAGTTCAAAGCCAGACCAAGACGGATCGGGTGCGTTGGAGCCAATTCAGCGT
TAGCAATGTCCTGAGCGGCTTTGTAAGCGGTTAGGGTATGCTCTGCGGC
C

QA 9 597 9 597
DS 

RD RS1CK79JQ 626 0 0
GCCTGATAAATGGT
ATTAATAAGAAAGCAATCTGAGTT*CAGTACAAGGCACAAAGCCCGACAACATTCAACCA
AATAAGAAGAAAAAGAAACAAGACAATAAACCCAGCAGCATCCACGATTAGGAAGAGCAA
ACAAAGGACAAGAATAGACGGCCTTAGAAGCTTCGGGGATGGCAAACGAAAGAGATTAGA
AAAACAAACACAAGGGAAATAACATAATAGTTGGATGAGTTTAGAATACTGAATAACAGA
CTTAAGTCTCCTTCTCCTCTTCAGCAGGCTTTGTTGCTGC*GCTTCTTTGATCTCCTCTG
TACCTTCGTCCTGCATGTCAGAAGTCCAAAGAGTAAGGTTGTCACGGAGAAGTTGCATGA
TCAAAGTACTGTCCTTGTATGACTCCTCGCCTAGAGTATCCAACTCAGCGATTGCATCAT
CAAACGCCTGCTTAGCGAGACTGCAAGCACGGTCTGGAGAGTTGAGAATCTCATAGTAAA
AGACAGAGAAGTTCAAAGCCAGACCAAGACGGATCGGGTGTGTTGGAGCCAATTCAGCGT
TAGCAATGTCCTGAGCGGCTTTGTAAGCGGTGAGTGTATGCTCAGCGGCGTCTTTCCTCT
CCTGCCCGGTC
C

QA 15 625 15 625
DS 

RD RS1BG32JQ 683 0 0
TACGGAAAACATCACCTGATAAATGGTATTAATAAGAAAGCAATCTGAGTT*CAGTACAA
GGCACAAAGCCCGACAACATTCAACCAAATAAGAAGAAAAAGAAACAAGACAATAAACCC
AGCAGCATCCACGATTAGGAAGAGCAAACAAAGGACAAGAATAGACGGCCTTAGAAGCTT
CGGGGATGGCAAACGGAAGAGATTAGAAAAACAAACACAAGGGAAATAACATAATAGTTG
GATGAGTTTAGAATACTGAATAACAGACTTAAGTCTCCTTCTCCTCTTCAGCAGGCTTTG
TTGCTGCCGCTTCTTTGATCTCCTCTGTACCTTCGTCCTGCATGTCAGAAGTCCAAAGAG
TAAGGTTGTCACGGAGAAGCTGCATGATCAAAGTACTGTCCTTGTATGACTCCTCGCCTA
GAGTATCCAACTCAGCGATTGCATCATCAAACGCCTGCTTAACGAGACTGCAAGCACGGT
CTGGAGAGTTGAGAATCTCATAGTAAAAGACAGAGAAGTTCAAAGCCAGACCAAGACGGA
TCGGGTGTGTTGGAGCCAATTCAGCGTTAGCAATGTCCTGAGCGGCTTTGTAAGCGGTGA
GTGTATGCTCAGCGGCGTCTTTCCTCTCCTGCCCGGTCTTAAACTCAGCCAAGTACCTAT
GGTAATCCCCCTTCATCTTCAGG

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

CO CL2165Contig1 853 2 2 U
GGAGCTTCGTAAGCGGGGATTACGAGCTCCGTTTATCATACTCGTCGCCATTGTGTTATT
CCTCTTTCAGTTTTGGACCGTGACGGGCCAAATTAATAACAGCGAGCCTTCTAAACAGAT
CTCCGTTAACTCTTCCTCAGGGACAAGTACTCGTTTTCTGTCATCATCACTATCATTTAC
CGGGAGACGATCCTCGTACAGGTTTTGGTGGAGAAGAAGACGACATCGTAACAAAGTAAA
CAGAGCGAGTGTTCAGTTTCTATACGCACACAACCTCATACGAGCGCGCGTGGGAGAACC
ACCGTTACAATGGGACGGACGTCTAGCGGCGTACGCGCGTGGGTGGGCGAAACAGCGCGT
TGGGGACTGCAGGCTTGTTCACTCCAACGGTCCGTACGGAGAAAGCATATTTTGGGCGGG
ACATAATCACTGGAGGACCATGAACATCGTTAAAGTGTGGGCCGATGAGAACAAGTTTTA
CGACGTGAAGGCTAACACGTGCGAGCCGGGGCAGATGTGTGGACACTACACGCAGATCGT
GTGGAGAGATAGCACCAAGGTTGGGTGTGCACGTGTGGATTGTTCAGACGTTGGCCTTTA
TGCGATTTGTGTTTATAACCCACCGGGAAATTACGAAGGTGAGAACCCGTTTGGAGTTTA
TGAAGACCAGATTGGTCTTATCCGGGAGGATCCCCCTGCGGTGGTCGTTGATCGGTTTTA
ACTTGATGGCTTGAAAAGCGGAGGAGATGATATGGTGGTGGCAGAATAGTTGTTTATTTT
TCTTTTGCTCTGATTCTTTTTATTTTTTTTTCCGAATAAACTAACTTTCAGTTTATTCAA
AAGAATTATCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BQ52TF U 1
AF RS1BQ52JQ C 200
BS 1 634 RS1BQ52TF
BS 635 853 RS1BQ52JQ

RD RS1BQ52TF 634 0 0
GGAGCTTCGTAAGCGGGGATTACGAGCTCCGTTTATCATACTCGTCGCCATTGTGTTATT
CCTCTTTCAGTTTTGGACCGTGACGGGCCAAATTAATAACAGCGAGCCTTCTAAACAGAT
CTCCGTTAACTCTTCCTCAGGGACAAGTACTCGTTTTCTGTCATCATCACTATCATTTAC
CGGGAGACGATCCTCGTACAGGTTTTGGTGGAGAAGAAGACGACATCGTAACAAAGTAAA
CAGAGCGAGTGTTCAGTTTCTATACGCACACAACCTCATACGAGCGCGCGTGGGAGAACC
ACCGTTACAATGGGACGGACGTCTAGCGGCGTACGCGCGTGGGTGGGCGAAACAGCGCGT
TGGGGACTGCAGGCTTGTTCACTCCAACGGTCCGTACGGAGAAAGCATATTTTGGGCGGG
ACATAATCACTGGAGGACCATGAACATCGTTAAAGTGTGGGCCGATGAGAACAAGTTTTA
CGACGTGAAGGCTAACACGTGCGAGCCGGGGCAGATGTGTGGACACTACACGCAGATCGT
GTGGAGAGATAGCACCAAGGTTGGGTGTGCACGTGTGGATTGTTCAGACGTTGGCCTTTA
TGCGATTTGTGTTTATAACCCACCGGGAAATTAC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1BQ52JQ 654 0 0
AGGTTTTGGTGGAGAAGAAGACGACATCGTAACAAAGTAAACAGAGCGAGTGTTCAGTTT
CTATACGCACACAACCTCATACGAGCGCGCGTGGGAGAACCACCGTTACAATGGGACGGA
CGTCTAGCGGCGTACGCGCGTGGGTGGGCGAAACAGCGCGTTGGGGACTGCAGGCTTGTT
CACTCCAACGGTCCGTACGGAGAAAGCATATTTTGGGCGGGACATAATCACTGGAGGACC
ATGAACATCGTTAAAGTGTGGGCCGATGAGAACAAGTTTTACGACGTGAAGGCTAACACG
TGCGAGCCGGGGCAGATGTGTGGACACTACACGCAGATCGTGTGGAGAGATAGCACCAAG
GTTGGGTGTGCACGTGTGGATTGTTCAGACGTTGGCCTTTATGCGATTTGTGTTTATAAC
CCACCGGGAAATTACGAAGGTGAGAACCCGTTTGGAGTTTATGAAGACCAGATTGGTCTT
ATCCGGGAGGATCCCCCTGCGGTGGTCGTTGATCGGTTTTAACTTGATGGCTTGAAAAGC
GGAGGAGATGATATGGTGGTGGCAGAATAGTTGTTTATTTTTCTTTTGCTCTGATTCTTT
TTATTTTTTTTTCCGAATAAACTAACTTTCAGTTTATTCAAAAGAATTATCATC

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 4

CO CL2166Contig1 1108 4 7 U
GGTTTGATAATTTTTTTGTGATGAGTTGAGTGTCACAATAAGCTTACAAAGAAACCAGCT
TTGATGAAACTGTAGGGGACTTGCTTTGCTTGTTGTGAGAAAGAGGGGTTAATGGCGGGA
ACGGAGGTCGCGGGTGTTGAAGTACAAGTTGCCTTGTTGATCAGGTGCAGAGACACGGAG
AGGAGTGAAGCCTTCGTAGTCACCGTTGGTTTTAGCAGAGCAAATGGCTGTCATATACCT
TAGTAGCTCATGGTTCTGTACGAATGGTTGCTTTGTGTATTCCTCCCACGGCATCCACTG
AGCAGCCTCTATCTCAGTCTCTTGTGCGTTGATCTCCAAAGAAAGGGGGTTTAACATGCG
CACGAAGAACAAATCTGACTTTTCAAAGAAAGCTTTGTGGGTCTGTCTGAAAGCCAATAC
TTGGACAAATTCTGTATCCACTCCTGTCTCTTCTTTCACCTCTCTGACCGAACCATCATG
GATATATTCACCCTCATTGACTACTCCGGTGGGGAACTTCCAAATACCTTGGCCTTGAAA
TCTTCCCGTCTTCTCTTGAACCACCAGCACCTCCTTCTTGTGGTTGAGGACAAAGGCACC
TATGCCAACACGGTGAGAAGCATTGGAAGGAATCGTATCCCCTACTATGGGAATCCAATA
GACAAGCATCAAGTAGACCTTCTCCGCGTGATGAAACCAGAATCCCTCCTTGACAGCAGC
TTCAGCAAGACCGATAAGCTGTCTCGGCAATTTGATCCACACTCCTTTCTTTCCCTGAAG
AGTCCATGTAGAGAGAGATGATTGTAGAAGTGCAGAGAAGGCAGAAGGATCCATGGGATG
GTTAACCTCCGTCATCACGCCACCGTACTTGTCTTCAACCACCGGAAGCATTGTAACGCC
TCCGTTATTCGCCTCCTCACCAGCCATCGGGTTCGTGGAGGAGGAAGAAACGGACATGGA
TCTGTTCCTCGTCACCGTTGAGACCCTGCGAAACGCAGAGAACCCATCAGCCGGAAAACA
CAGACGCCCATTAGCCGCTGGATTCATCAACAATCTGATAAAACCATAGCTTCTCGCCAA
ACGGCAACTCATAATTCGTTACTCAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CN21JQ U 174
AF RS1CN21TF C 1
AF RS1A928JQ U 97
AF RS1A928TF C 211
BS 1 96 RS1CN21TF
BS 97 173 RS1A928JQ
BS 174 242 RS1CN21JQ
BS 243 243 RS1A928JQ
BS 244 313 RS1CN21JQ
BS 314 758 RS1A928JQ
BS 759 1108 RS1A928TF

RD RS1CN21JQ 140 0 0
CACGGAGAGGAGTGAAGCCTTCGTAGTCACCGTTGGTTTTAGCAGAGCAAATGGCTGTCA
TATACCTTAATAGCTCATGGTTCTGTACGAATGGTTGCTTTGTGTATTCCTCCCACGGCA
TCCACTGAGCAGCCTCTATC

QA 1 140 1 140
DS 

RD RS1CN21TF 759 0 0
GGTTTGATAATTTTTTTGTGATGAGTTGAGTGTCACAATAAGCTTACAAAGAAACCAGCT
TTGATGAAACTGTAGGGGACTTGCTTTGCTTGTTGTGAGAAAGAGGGGTTAATGGCGGGA
ACGGAGGTCGCGGGTGTTGAAGTACAAGTTGCCTTGTTGATCAGGTGCAGAGACACGGAG
AGGAGTGAAGCCTTCGTAGTCACCGTTGGTTTTAGCAGAGCAAATGGCTGTCATATACCT
TAGTAGCTCATGGTTCTGTACGAATGGTTGCTTTGTGTATTCCTCCCACGGCATCCACTG
AGCAGCCTCTATCTCAGTCTCCTGTGCGTTGATCTCCAAAGAAAGGGGCTTTAACATGCA
CACGAAGAACAAATCTGACTTTTCAAAGAAAGCTTTGTGGGTCTGTCTGAAAGCCAATAC
TTGGACAAATTCTGTATCCACTCCAGTCTCTTCTTTCACCTCTCTGACCGAGCCATCATG
GATATATTCACCCTCATTGACTACTCCGGTGGGGAACTTCCAGATACCTTGGCCTTGAAA
CCTTCCTGTCTTCTCTTGAACCACCAGAACCTCTTTCTTGTGGTTGAGGACAAAGGCACC
TATGCCAACACGGTGAGATGCATTGGAAGGAATCGTATCGCCTACTTTGGGAATCCAATA
CACAAGCATCAAGTAGTCCTTCTCCGCGTGATGAAACCAGAACCCCTCCTTGACAGCAGC
TTCAGCAAGACCGATAAGCTGTCTCGGCAATTTGATCC
C

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1A928JQ 666 0 0
GAGAAAGAGGGGTTAATGGCGGGAACGGAGGTCGCGGGTGTTGAAGTACAAGTTGCCTTG
TTGATCAGGTGCAGAGACACGGAGAGGAGTGAAGCCTTCGTAGTCTCCTTTGGTTTTAGC
AGAGCAAATGGCTGTCATATATCTTAGTAGCTCATGGTTCTGTACGAATGGTTGCTTTGT
GTATTCCTCCCACGGCATCCACTGAGCAGCCTCTATCTCAGTCTCTTGTGCGTTGATCTC
CAAAGAAAGGGGGTTTAACATGCGCACGAAGAACAAATCTGACTTTTCAAAGAAAGCTTT
GTGGGTCTGTCTGAAAGCCAATACTTGGACAAATTCTGTATCCACTCCTGTCTCTTCTTT
CACCTCTCTGACCGAACCATCATGGATATATTCACCCTCATTGACTACTCCGGTGGGGAA
CTTCCAAATACCTTGGCCTTGAAATCTTCCCGTCTTCTCTTGAACCACCAGCACCTCCTT
CTTGTGGTTGAGGACAAAGGCACCTATGCCAACACGGTGAGAAGCATTGGAAGGAATCGT
ATCCCCTACTATGGGAATCCAATAGACAAGCATCAAGTAGACCTTCTCCGCGTGATGAAA
CCAGAATCCCTCCTTGACAGCAGCTTCAGCAAGACCGATAAGCTGTCTCGGCAATTTGAT
CC
ACAC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RS1A928TF 898 0 0
TTTAGCAGAGCAAATGGCTGTCATATATCTTAGTAGCTCATGGTTCTGTACGAATGGTTG
CTTTGTGTAT*CCTCCCACGGCATCCACTGAGCAGCCTCTATCTCAGTCTCTTGTGCGTT
GATCTCCAAAGAAAGGGGGTTTAACATGCGCACGAAGAACAAATCTGACTTTTCAAAGAA
AGCTTTGTGGGTCTGTCTGAAAGCCAATACTTGGACAAATTCTGTATCCACTCCTGTCTC
TTCTTTCACCTCTCTGACCGAACCATCATGGATATATTCACCCTCATTGACTACTCCGGT
GGGGAACTTCCAAATACCTTGGCCTTGAAATCTTCCCGTCTTCTCTTGAACCACCAGCAC
CTCCTTCTTGTGGTTGAGGACAAAGGCACCTATGCCAACACGGTGAGAAGCATTGGAAGG
AATCGTATCCCCTACTATGGGAATCCAATAGACAAGCATCAAGTAGACCTTCTCCGCGTG
ATGAAACCAGAATCCCTCCTTGACAGCAGCTTCAGCAAGACCGATAAGCTGTCTCGGCAA
TTTGATCCACACTCCTTTCTTTCCCTGAAGAGTCCATGTAGAGAGAGATGATTGTAGAAG
TGCAGAGAAGGCAGAAGGATCCATGGGATGGTTAACCTCCGTCATCACGCCACCGTACTT
GTCTTCAACCACCGGAAGCATTGTAACGCCTCCGTTATTCGCCTCCTCACCAGCCATCGG
GTTCGTGGAGGAGGAAGAAACGGACATGGATCTGTTCCTCGTCACCGTTGAGACCCTGCG
AAACGCAGAGAACCCATCAGCCGGAAAACACAGACGCCCATTAGCCGCTGGATTCATCAA
CAATCTGATAAAACCATAGCTTCTCGCCAAACGGCAACTCATAATTCGTTACTCAAAT

QA 1 898 1 898
DS 



AS 2 4

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TCTTATTTGGAGCTAAACTTGCAAGTGTCACGGTACATCTACCACACCAATGGAGCTTTC
CTGCCGCTAAACTTTGCAAGGAGAAAGTGGAGGACCGCAAAGACAGTCGTTCCCAGCAAA
CGCACTGGCCGGAAACTTTGTTGTCGGAAGCTTTCCGCAAAGGTGATTCTGACTCACGTT
CAGTGTCTGCAGTCCAGCAACCGTGGCCGGCACCTTCCCGAACACCAAGTTTCTCGACAG
ATCCAGCGTTTTCAGCGTCTTCGCAAACGTTAGCTTCCCCATATCAAACCGGAGCTTATT
CCCCGCAGCGCGGAACTCAACCAGATACTCCGTTTGGTTCAGAAACCTCGCCGGACTCCC
TGATACCTCGTTTCCAGACAGATCAATGAAATCGTAAAAGTAATATTCCGATGGCTTCCA
ATCGTCTAAGCTCATCTTGATCCCGCATCTCGCAAGCTTCAACGAGAAGATGATCGGCGA
CGACGTCACCCACTTCGGAATGGTTTTGAGATGAAACTTATTGTAGGATAGATCCAACGA
CTCAATTCCCTTAACGTACAAAGCAGGGAACGGATCGGTGAGAAGATTGTGCGAGAGATC
AAGATTAAAGATCTTGGTGAGATTCGCGAAGCTCTTCGGCACGACTCCGGAGAATTGGTT
CCGTGAGAGATCCAACGTGTCAAGCGCCTTGAACCTTGATAGATACTCTGGAATCTTCCC
GGAGAGTTTGTTATGGCCTACTTCGAGGAACCTGAGAATCGGTGCGAGCGACGCGATCGA


BQ
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AF RS1A179JQ U 1
AF RS1A179TR U 1
BS 1 835 RS1A179JQ
BS 836 840 RS1A179TR

RD RS1A179JQ 835 0 0
ATTATAAATCTAGTTTATTGTTATTAATACAAATTTTATTTGGAGTTTTATTAATACAAA
TCTTATTTGGAGCTAAACTTGCAAGTGTCACGGTACATCTACCACACCAATGGAGCTTTC
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CGCACTGGCCGGAAACTTTGTTGTCGGAAGCTTTCCGCAAAGGTGATTCTGACTCACGTT
CAGTGTCTGCAGTCCAGCAACCGTGGCCGGCACCTTCCCGAACACCAAGTTTCTCGACAG
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CCCCGCAGCGCGGAACTCAACCAGATACTCCGTTTGGTTCAGAAACCTCGCCGGACTCCC
TGATACCTCGTTTCCAGACAGATCAATGAAATCGTAAAAGTAATATTCCGATGGCTTCCA
ATCGTCTAAGCTCATCTTGATCCCGCATCTCGCAAGCTTCAACGAGAAGATGATCGGCGA
CGACGTCACCCACTTCGGAATGGTTTTGAGATGAAACTTATTGTAGGATAGATCCAACGA
CTCAATTCCCTTAACGTACAAAGCAGGGAACGGATCGGTGAGAAGATTGTGCGAGAGATC
AAGATTAAAGATCTTGGTGAGATTCGCGAAGCTCTTCGGCACGACTCCGGAGAATTGGTT
CCGTGAGAGATCCAACGTGTCAAGCGCCTTGAACCTTGATAGATACTCTGGAATCTTCCC
GGAGAGTTTGTTATGGCCTACTTCGAGGAACCTGAGAATCGGTGCGAGCGACGCG

QA 1 835 1 835
DS 

RD RS1A179TR 840 0 0
ATTATAAATCTAGTTTATTGTTATTAATACAAATTTTATTTGGAGTTTTATTAATACAAA
TCTTATTTGGAGCTAAACTTGCAAGTGTCACGGTACATCTACCACACCAATGGAGCTTTC
CTGCCGCTAAACTTTGCAAGGAGAAAGTGGAGGACCGCAAAGACAGTCGTTCCCAGCAAA
CGCACTGGCCGGAAACTTTGTTGTCGGAAGCTTTCCGCAAAGGTGATTCTGACTCACGTT
CAGTGTCTGCAGTCCAGCAACCGTGGCCGGCACCTTCCCGAACACCAAGTTTCTCGACAG
ATCCAGCGTTTTCAGCGTCTTCGCAAACGTTAGCTTCCCCATATCAAACCGGAGCTTATT
CCCCGCAGCGCGGAACTCAACCAGATACTCCGTTTGGTTCAGAAACCTCGCCGGACTCCC
TGATACCTCGTTTCCAGACAGATCAATGAAATCGTAAAAGTAATATTCCGATGGCTTCCA
ATCGTCTAAGCTCATCTTGATCCCGCATCTCGCAAGCTTCAACGAGAAGATGATCGGCGA
CGACGTCACCCACTTCGGAATGGTTTTGAGATGAAACTTATTGTAGGATAGATCCAACGA
CTCAATTCCCTTAACGTACAAAGCAGGGAACGGATCGGTGAGAAGATTGTGCGAGAGATC
AAGATTAAAGATCTTGGTGAGATTCGCGAAGCTCTTCGGCACGACTCCGGAGAATTGGTT
CCGTGAGAGATCCAACGTGTCAAGCGCCTTGAACCTTGATAGATACTCTGGAATCTTCCC
GGAGAGTTTGTTATGGCCTACTTCGAGGAACCTGAGAATCGGTGCGAGCGACGCGATCGA

QA 1 840 1 840
DS 



CO CL2167Contig2 872 2 1 U
AGTCGACGGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGACACAACA
CAACAACAACATGAACTCTTCTTCCTTCTCTTTTGATCTTCACCGTTGTTATCATCCTCC
GGTGCCTAAACCCCATCAAAGCCGCCACGTGTCATCCAGATGACGAGGCAGGTCTTCTAG
CTTTCAAATCGGGTATAACCCGAGATCCTTCGGGTATTCTCAGCTCATGGAAGAAAGGCA
CTGCTTGCTGCTCCTGGAACGGTATCACTTGCCTCACCGGCGACCGAGTCACCGCACTCA
CTGTCAGTGGACAGTCCGATGTCGCCGGAAGCTTCCTCTCCGGCACAATCTCCTCGTCGC
TAGCCAAACTCCAACACCTCGATGGTATTTACTTCATGAATCTCAAAAACATCACCGGAC
CTTTCCCACTGTTCCTTTTCCAATTACCACAGCTGAAGTACGTTTACATCGAGAACAGCC
GTCTCTCCGGTCCACTACCGGTTAACATCGGTTCGCTAAGCCAGATTGAAGCGTTTAGCC
TCGAAGGAAACCGGTTCACCGGTCCGATCCCAACTTCCATTTCAAATTTAACCAAGCTAT
CTCAGCTCAATCTTGGCGGTAATCTCTTAACCGGAACAATCCCTTCAGGGATTGCTAACC
TCAAGCTCATGTCGTATCTGAATCTCGGCGGTAACCGTCTCTCCGGAACCATCCCGGATA
TTTTCAAATCCATGCCGGAGCTCCGATCTCTCGTCCTCTCTCGCAACGGATTCTCCGGGA
ACCTTCCTCCGTCGATCGCGTCGCTCGCACCGATTCTCAGTTCCTCGAAGTAGCCATAAC
AAACTCTCCGGGAAGATTCCAGAGTATCTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A179TF U 100
AF RS1A179TV U 1
BS 1 872 RS1A179TV

RD RS1A179TF 745 0 0
TCACCGTTGTTATCATCCTCCGGTGCCTAAACCCCATCAAAGCCGCCACGTGTCATCCAG
ATGACGAGGCAGGTCTTCTAGCTTTCAAATCGGGTATAACCCGAGATCCTTCGGGTATTC
TCAGCTCATGGAAGAAAGGCACTGCTTGCTGCTCCTGGAACGGTATCACTTGCCTCACCG
GCGACCGAGTCACCGCACTCACTGTCAGTGGACAGTCCGATGTCGCCGGAAGCTTCCTCT
CCGGCACAATCTCCTCGTCGCTAGCCAAACTCCAACACCTCGATGGTATTTACTTCATGA
ATCTCAAAAACATCACCGGACCTTTCCCACTGTTCCTTTTCCAATTACCACAGCTGAAGT
ACGTTTACATCGAGAACAGCCGTCTCTCCGGTCCACTACCGGTTAACATCGGTTCGCTAA
GCCAGATTGAAGCGTTTAGCCTCGAAGGAAACCGGTTCACCGGTCCGATCCCAACTTCCA
TTTCAAATTTAACCAAGCTATCTCAGCTCAATCTTGGCGGTAATCTCTTAACCGGAACAA
TCCCTTCAGGGATTGCTAACCTCAAGCTCATGTCGTATCTGAATCTCGGCGGTAACCGTC
TCTCCGGAACCATCCCGGATATTTTCAAATCCATGCCGGAGCTCCGATCTCTCGTCCTCT
CTCGCAACGGATTCTCCGGGAACCTTCCTCCGTCGATCGCGTCGCTCGCACCGATTCTCA
GTTCCTCGAAGTAGCCATA
CAACTC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1A179TV 872 0 0
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CAACAACAACATGAACTCTTCTTCCTTCTCTTTTGATCTTCACCGTTGTTATCATCCTCC
GGTGCCTAAACCCCATCAAAGCCGCCACGTGTCATCCAGATGACGAGGCAGGTCTTCTAG
CTTTCAAATCGGGTATAACCCGAGATCCTTCGGGTATTCTCAGCTCATGGAAGAAAGGCA
CTGCTTGCTGCTCCTGGAACGGTATCACTTGCCTCACCGGCGACCGAGTCACCGCACTCA
CTGTCAGTGGACAGTCCGATGTCGCCGGAAGCTTCCTCTCCGGCACAATCTCCTCGTCGC
TAGCCAAACTCCAACACCTCGATGGTATTTACTTCATGAATCTCAAAAACATCACCGGAC
CTTTCCCACTGTTCCTTTTCCAATTACCACAGCTGAAGTACGTTTACATCGAGAACAGCC
GTCTCTCCGGTCCACTACCGGTTAACATCGGTTCGCTAAGCCAGATTGAAGCGTTTAGCC
TCGAAGGAAACCGGTTCACCGGTCCGATCCCAACTTCCATTTCAAATTTAACCAAGCTAT
CTCAGCTCAATCTTGGCGGTAATCTCTTAACCGGAACAATCCCTTCAGGGATTGCTAACC
TCAAGCTCATGTCGTATCTGAATCTCGGCGGTAACCGTCTCTCCGGAACCATCCCGGATA
TTTTCAAATCCATGCCGGAGCTCCGATCTCTCGTCCTCTCTCGCAACGGATTCTCCGGGA
ACCTTCCTCCGTCGATCGCGTCGCTCGCACCGATTCTCAGTTCCTCGAAGTAGCCATAAC
AAACTCTCCGGGAAGATTCCAGAGTATCTATC

QA 1 872 1 872
DS 



AS 1 4

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CAAAGGGGTTTCTTGCGGTGTACGTTGGTGAAGACCAGGTCCAGAAGAAGAGATATTTGG
TGCCAGTCTCATATCTAAGCCAGCCTTCTTTTCAAGCTCTACTCGGTAAATCTGAAGAAG
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TCAATGTGACATCCCGGTTTCAATAATGATGTTCCAGAAAAAGAAAAAAACTCACATTAT
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AATTATACAAATTGCAACATGTTTTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RS1B503TF U 1
AF RS1D535TF U 1
AF RS1B503JQ C 118
AF RS1D535JQ C 118
BS 1 565 RS1B503TF
BS 566 567 RS1B503JQ

RD RS1B503TF 567 0 0
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AAAAGCTTCAAATTTCAATTTTCCAGACACAAGAAATGGCTTTGCTCAGAGGTCTCTTGG
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CAAAGGGGTTTCTTGCGGTGTACGTTGGTGAAGACCAGGTCCAGAAGAAGAGATATTTGG
TGCCAGTCTCATATCTAAGCCAGCCTTCTTTTCAAGCTCTACTCGGTAAATCTGAAGAAG
AGTTTGGATTTGCTCATCCAATGGGTGGTTTAACGATTCCTTGTCCTGAAGATACCTTCA
TCAATGTGACATCCCGGTTTCAATAATGATGTTCCAGAAAAAGAAAAAAACTCACATTAT
AGTTAGAGATAGAATTATTCAATGTAAACATGTTAACTTTTTTCCTCTTTCTTGGTTGAA
GAGGGTTATTCAAGAGGTTAAATGTGTATCCCATATTTCTTTGTGAGGATAATGGTTTTT
AATTATACAAATTGCAACATGTTTT
CT

QA 1 565 1 565
DS 

RD RS1D535TF 567 0 0
GGAAATCACCAAGTAGCTAAAGCAATCCAAACCTTGAATCTGAGTGTCTAACCATTTTTC
AAAAGCTTCAAATTTCAATTTTCCAGACACAAGAAATGGCTTTGCTCAGAGGTCTCTTGG
GTGCAAAGAGGATTATTGGCCTTTCTGTAGCAGCTACAAGCAAAAAGACAGTTTCAGTGC
CAAAGGGGTTTCTTGCGGTGTACGTTGGTGAAGACCAGGTCCAGAAGAAGAGATATTTGG
TGCCAGTCTCATATCTAAGCCAGCCTTCTTTTCAAGCTCTACTCGGTAAATCTGAAGAAG
AGTTTGGATTTGCTCATCCAATGGGTGGTTTAACGATTCCTTGTCCTGAAGATACCTTCA
TCAATGTGACATCCCGGTTTCAATAATGATGTTCCAGAAAAAGAAAAAAACTCACATTAT
AGTTAGAGATAGAATTATTCAATGTAAACATGTTAACTTTTTTCCTCTTTCTTGGTTGAA
GAGGGTTATTCAAGAGGTTAAATGTGTATCCCATATTTCTTTGTGAGGATAATGGTTTTT
AATTATACAAATTGCAACATGTTTT
CT

QA 1 565 1 565
DS 

RD RS1B503JQ 450 0 0
TGGGTGCAAAGAGGATTATTGGCCTTTCTGTAGCAGCTACAAGCAAAAAGACAGTTTCAG
TGCCAAAGGGGTTTCTTGCGGTGTACGTTGGTGAAGACCAGGTCCAGAAGAAGAGATATT
TGGTGCCAGTTTCATATTTAAGCCAGCCTTCTTTTCAAGCTTTACTCGGTAAATTTGAAG
AAGAGTTTGGATTTGCTCATCCAATGGGTGGTTTAACGATTCCTTGTCCTGAAGATACCT
TCATCAATGTGACATCCCGGTTTCAATAATGATGTTCCAGAAAAAGAAAAAAACTCACAT
TATAGTTAGAGATAGAATTATTCAATGTAAACATGTTAACTTTTTTCCTCTTTTTTGGTT
GAAGAGGGTTATTCAAGAGGTTAAATGTGTATCCCATATTTCTTTGTGAGGATAATGGTT
TTTAATTATACAAATTGCAACATGTTTTTT

QA 1 450 1 450
DS 

RD RS1D535JQ 450 0 0
TGGGTGCAAAGAGGATTATTGGCCTTTCTGTAGCAGCTACAAGCAAAAAGACAGTTTCAG
TGCCAAAGGGGTTTCTTGCGGTGTACGTTGGTGAAGACCAGGTCCAGAAGAAGAGATATT
TGGTGCCAGTTTCATATTTAAGCCAGCCTTCTTTTCAAGCTTTACTCGGTAAATTTGAAG
AAGAGTTTGGATTTGCTCATCCAATGGGTGGTTTAACGATTCCTTGTCCTGAAGATACCT
TCATCAATGTGACATCCCGGTTTCAATAATGATGTTCCAGAAAAAGAAAAAAACTCACAT
TATAGTTAGAGATAGAATTATTCAATGTAAACATGTTAACTTTTTTCCTCTTTTTTGGTT
GAAGAGGGTTATTCAAGAGGTTAAATGTGTATCCCATATTTCTTTGTGAGGATAATGGTT
TTTAATTATACAAATTGCAACATGTTTT
TT

QA 1 448 1 448
DS 



AS 1 4

CO CL2169Contig1 1140 4 3 U
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GAAGATCATAAGCTACCTTCTTGTAACATTTTGATTTTCAAAAAAGAAAGATAAGAAAAT
GCAGTCGATGAAGGAAACAGCTTCCAACATTGCAGCTTCTGCAAAGTCTGGCATGGACAA
GACCAAAGCTACCTTGGAAGAGAAGGCGGAAAAGATGACGACACGAGACCCGGTTCAGAA
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AGTGCGTGAGCACAACGCTGCCATGAAAGAAGCTGCTGGAGCTGGAACCGGAACCGGAAC
CGGTCTAGGTTTGGGGTCAGCCACTCACTCAACCACTGGACACGTCGGACATGGGACTAG
GACCCACCATATGTCAGCTTTGCCTGGTCACGGTACGGGACAAGCAACCGGACACGTTGT
GGAGTGAACGACCTGTCCAGAAAAAAGTAACTAGTCATCGTCAGAGCTACAAGGACCGTT
CAAAACCTGAGGCGGATCAAGACACCATGGAGCCAGAGTACATGGACTCATCAGGAGATA
GCTCAGACGATAGTACTTATAGCCACGCTGATCGACCAATCATACAAAGTGCAATGAGAA
GGAAGCATCACAGAGCTTGGTCTCTCTCTGAGGTTAAGAAACTGGTGG*AAGGTGTGTCC
AAATATGGAGTTGGGAAATGGTCTGTGATCAAAAAGCTTACGTTTTCGTCACACTCGTAT
CGTACCCCAGTGGATCTCAAGGATAAATGGCGAAATCTACTCAGAGCAAGCTTTTCTCGG
AATCCTTTAAACAAAATGGGGAAACACGGGTCGATGGCTATTCCAAGTCAGATTCTGTCA
CAGGTAAGAGAGCTTGCTCAGAAGAAATCACATGTTTCACCGGCAAGGAAGGCTAGAATG
GTGAGGGCATCATCAAGACACGTTGCCGCGGAAAATCTGAGATGATGACATCTTTTTTAC
TTTTTTTGATTTCATAGACTTAATTCTAAGGTAGCTTTTGTGGTCTAACCGGGCCTATAA
ACCGGTGATGGAACAGACGAATATGAACGGTTTTCTAATATATTGGCCAAATGTTTAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A187TV U 1
AF RS1A187TF U 54
AF RS1A187TR C 297
AF RS1A187JQ C 305
BS 1 864 RS1A187TV
BS 865 879 RS1A187TF
BS 880 1140 RS1A187TR

RD RS1A187TV 864 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGACAAAACAC
GAAGATCATAAGCTACCTTCTTGTAACATTTTGATTTTCAAAAAAGAAAGATAAGAAAAT
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GACCAAAGCTACCTTGGAAGAGAAGGCGGAAAAGATGACGACACGAGACCCGGTTCAGAA
ACAGATGGCCACACAGAAGAAAGAAGCAAAGATCAATCAAGCTGAGATGCAGAAGAGAGA
AGTGCGTGAGCACAACGCTGCCATGAAAGAAGCTGCTGGAGCTGGAACCGGAACCGGAAC
CGGTCTAGGTTTGGGGTCAGCCACTCACTCAACCACTGGACACGTCGGACATGGGACTAG
GACCCACCATATGTCAGCTTTGCCTGGTCACGGTACGGGACAAGCAACCGGACACGTTGT
GGAGTGAACGACCTGTCCAGAAAAAAGTAACTAGTCATCGTCAGAGCTACAAGGACCGTT
CAAAACCTGAGGCGGATCAAGACACCATGGAGCCAGAGTACATGGACTCATCAGGAGATA
GCTCAGACGATAGTACTTATAGCCACGCTGATCGACCAATCATACAAAGTGCAATGAGAA
GGAAGCATCACAGAGCTTGGTCTCTCTCTGAGGTTAAGAAACTGGTGG*AAGGTGTGTCC
AAATATGGAGTTGGGAAATGGTCTGTGATCAAAAAGCTTACGTTTTCGTCACACTCGTAT
CGTACCCCAGTGGATCTCAAGGATAAATGGCGAAATCTACTCAGAGCAAGCTTTTCTCGG
AATCCTTTAAACAAAATGGGGAAA

QA 1 864 1 864
DS 

RD RS1A187TF 826 0 0
AAAACACGAAGATCATAAGCTACCTTCTTGTAACATTTTGATTTTCAAAAAAGAAAGATA
AGAAAATGCAGTCGATGAAGGAAACAGCTTCCAACATTGCAGCTTCTGCAAAGTCTGGCA
TGGACAAGACCAAAGCTACCTTGGAAGAGAAGGCGGAAAAGATGACGACACGAGACCCGG
TTCAGAAACAGATGGCCACACAGAAGAAAGAAGCAAAGATCAATCAAGCTGAGATGCAGA
AGAGAGAAGTGCGTGAGCACAACGCTGCCATGAAAGAAGCTGCTGGAGCTGGAACCGGAA
CCGGAACCGGTCTAGGTTTGGGGTCAGCCACTCACTCAACCACTGGACACGTCGGACATG
GGACTAGGACCCACCATATGTCAGCTTTGCCTGGTCACGGTACGGGACAAGCAACCGGAC
ACGTTGTGGAGTGAACGACCTGTCCAGAAAAAAGTAACTAGTCATCGTCAGAGCTACAAG
GACCGTTCAAAACCTGAGGCGGATCAAGACACCATGGAGCCAGAGTACATGGACTCATCA
GGAGATAGCTCAGACGATAGTACTTATAGCCACGCTGATCGACCAATCATACAAAGTGCA
ATGAGAAGGAAGCATCACAGAGCTTGGTCTCTCTCTGAGGTTAAGAAACTGGTGGGAAGG
TGTGTCCAAATATGGAGTTGGGAAATGGTCTGTGATCAAAAAGCTTACGTTTTCGTCACA
CTCGTATCGTACCCCAGTGGATCTCAAGGATAAATGGCGAAATCTACTCAGAGCAAGCTT
TTCTCGGAATCCTTTAAACAAAATGGGGAAACACGGGTCGATGGCT

QA 1 826 1 826
DS 

RD RS1A187TR 844 0 0
GAGAAGTGCGTGAGCACAACGCTGCCATGAAAGAAGCTGCTGGAGCTGGAACCGGAACCG
GAACCGGTCTAGGTTTGGGGTCAGCCACTCACTCAACCACTGGACACGTCGGACATGGGA
CTAGGACCCACCATATGTCAGCTTTGCCTGGTCACGGTACGGGACAAGCAACCGGACACG
TTGTGGAGTGAACGACCTGTCCAGAAAAAAGTAACTAGTCATCGTCAGAGCTACAAGGAC
CGTTCAAAACCTGAGGCGGATCAAGACACCATGGAGCCAGAGTACATGGACTCATCAGGA
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AGAAGGAAGCATCACAGAGCTTGGTCTCTCTCTGAGGTTAAGAAACTGGTGG*AAGGTGT
GTCCAAATATGGAGTTGGGAAATGGTCTGTGATCAAAAAGCTTACGTTTTCGTCACACTC
GTATCGTACCCCAGTGGATCTCAAGGATAAATGGCGAAATCTACTCAGAGCAAGCTTTTC
TCGGAATCCTTTAAACAAAATGGGGAAACACGGGTCGATGGCTATTCCAAGTCAGATTCT
GTCACAGGTAAGAGAGCTTGCTCAGAAGAAATCACATGTTTCACCGGCAAGGAAGGCTAG
AATGGTGAGGGCATCATCAAGACACGTTGCCGCGGAAAATCTGAGATGATGACATCTTTT
TTACTTTTTTTGATTTCATAGACTTAATTCTAAGGTAGCTTTTGTGGTCTAACCGGGCCT
ATAAACCGGTGATGGAACAGACGAATATGAACGGTTTTCTAATATATTGGCCAAATGTTT
AATC

QA 1 844 1 844
DS 

RD RS1A187JQ 836 0 0
CGTGAGCACAACGCTGCCATGAAAGAAGCTGCTGGAGCTGGAACCGGAACCGGAACCGGT
CTAGGTTTGGGGTCAGCCACTCACTCAACCACTGGACACGTCGGACATGGGACTAGGACC
CACCATATGTCAGCTTTGCCTGGTCACGGTACGGGACAAGCAACCGGACACGTTGTGGAG
TGAACGACCTGTCCAGAAAAAAGTAACTAGTCATCGTCAGAGCTACAAGGACCGTTCAAA
ACCTGAGGCGGATCAAGACACCATGGAGCCAGAGTACATGGACTCATCAGGAGATAGCTC
AGACGATAGTACTTATAGCCACGCTGATCGACCAATCATACAAAGTGCAATGAGAAGGAA
GCATCACAGAGCTTGGTCTCTCTCTGAGGTTAAGAAACTGGTGG*AAGGTGTGTCCAAAT
ATGGAGTTGGGAAATGGTCTGTGATCAAAAAGCTTACGTTTTCGTCACACTCGTATCGTA
CCCCAGTGGATCTCAAGGATAAATGGCGAAATCTACTCAGAGCAAGCTTTTCTCGGAATC
CTTTAAACAAAATGGGGAAACACGGGTCGATGGCTATTCCAAGTCAGATTCTGTCACAGG
TAAGAGAGCTTGCTCAGAAGAAATCACATGTTTCACCGGCAAGGAAGGCTAGAATGGTGA
GGGCATCATCAAGACACGTTGCCGCGGAAAATCTGAGATGATGACATCTTTTTTACTTTT
TTTGATTTCATAGACTTAATTCTAAGGTAGCTTTTGTGGTCTAACCGGGCCTATAAACCG
GTGATGGAACAGACGAATATGAACGGTTTTCTAATATATTGGCCAAATGTTTAATC

QA 1 836 1 836
DS 



AS 2 4

CO CL2170Contig1 804 2 11 U
AGATCCTGTAATAACACATATCATTTAATCTTCGAGACCACATGCATATATACGTAAGTA
ATTAAAACAATTATAATTGTTCGGTTAATATTATGTATGTTAATAAAACGAAAAAAAAAA
TATTTGGCATGGGCCCTGGGGGCGGTCGCACTGACCGTCCCATATCCTAAGCCGGCACTG
CATCTTCATCTGCGCAAGAGCCAAATTTTTACCCAAGCAAGCTCTTGGACCGGCATTAAA
AACGATGAACTTGTTTGAAGGTTCATGTCTTAAATCTCCACTTTCTGAAATCCATCTCTC
TGGTTTAAAATCCAATGCGTCTTTTCCCCATATAGATCTCATTCTACCCAATGCATACAT
ACAGAGTACGATCTTTGAATTTTCTTCAACTTTGTGCCCGGTTGGAAGTACATCTGGCTT
TGCAGGAAACTTATGGTTAAAGGGAAGTGGTGGGTAGAGTCTCATTGTTTCGTTCAACGT
AGCATGTAAATACACGAGCTTCTCTAGATCTGTAGGATCATACTTAGTGTTGATCTCTTG
TCGGATCTTGCTCAAAACTTGTGGATGCTTAGAAAGAAGCCAGAAGAACCAAGTGAGAAC
TGAGCTTGTGGTGTCCCTTCCCGCTAACACTAGACTGAAAGCAACGTCTCTTATAAACGT
ATCATCACTTGGTTTCAAGAGCTTATATTTGGTCGTGTCCACGTTCATATAGTACGTTAA
CGCGTCCATTGATTTCACGCCTTCCCCGCGACGTATCTCCTCTCTTTTTGTAGATATGAT
CTTCGCAAACATACGATTGACAGT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GN91JQ U 1
AF RS1D102JQ U 1
BS 1 119 RS1D102JQ
BS 120 120 RS1GN91JQ
BS 121 141 RS1D102JQ
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BS 318 318 RS1GN91JQ
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RD RS1GN91JQ 486 0 0
G
GATCCTGTAATAACACATATCATTTAATCTTCGAGACCACATGCATATATACGTAAGTAA
TTAAAACAATTATAATTGTTCGGTTAATATTATGTATGTTAATAAAACGAAAAAAAAAAT
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GCAGGAAACTTATGGTTAAAGGGAAGTGGTGGGTAGAGTCTCATTGTTTCGTTCAACGTA
GCATG

QA 2 486 2 486
DS 

RD RS1D102JQ 804 0 0
AGATCCTGTAATAACACATATCATTTAATCTTCGAGACCACATGCATATATACGTAAGTA
ATTAAAACAATTATAATTGTTCGGTTAATATTATGTATGTTAATAAAACGAAAAAAAAA*
TATTTGGCATGGGCCCTGGGG*CGGTCGCACTGACCGTCCCATATCCTAAGCCGGCACTG
CATCTTCATCTGCGCCAGAGCCAAATTTTTACCCAAGCAAGCTCTTGGACCGGCATTAAA
AGCGATGAACTTGTTTGAAGGTTCATGTCTTAAATCTCCACTTTCTGAAATCCATCTCTC
TGGTTTAAAATCCAATGTGTCTTTTCCCCATATAGATCTCATTCTACCCAATGCATACAT
ACAGAGTACGATCTTTGAATTTTCTTCAACTTTGTGCCCGGTTGGAAGTACATCTGGCTT
TGCAGGAAACTTATGGTTAAAGGGAAGTGGTGGGTAGAGTCTCATTGTTTCGTTCAACGT
AGCATGTAAATACACGAGCTTCTCTAGATCTGTAGGATCATACTTAGTGTTGATCTCTTG
TCGGATCTTGCTCAAAACTTGTGGATGCTTAGAAAGAAGCCAGAAGAACCAAGTGAGAAC
TGAGCTTGTGGTGTCCCTTCCCGCTAACACTAGACTGAAAGCAACGTCTCTTATAAACGT
ATCATCACTTGGTTTCAAGAGCTTATATTTGGTCGTGTCCACGTTCATATAGTACGTTAA
CGCGTCCATTGATTTCACGCCTTCCCCGCGACGTATCTCCTCTCTTTTTGTAGATATGAT
CTTCGCAAACATACGATTGACAGT

QA 1 804 1 804
DS 



CO CL2170Contig2 1089 2 4 U
GGGCATCCATACTCATACAACGTTTGTTCAAAATATGGCGATCATAGGCTTACTTGAAGT
CTTCGTAGCATTCCTTTTTTCCCTTGTATTCAAAAAATTCTTTCTCCACATGAAATCTCC
CGGCCATCCTGTTCTCAAAAGCTGGCCTGTCCTCGGGATGCTTCCAGGAATGCTCCCCCA
TATCCCTCGCATCTTCGACTGGACGTACGAAGTTCTCGACGCCACCAACCTCACTTTTTT
TTCAAAGGCCCATGGCTTAGTGGAACGGACATGCTATTCACCGCCGACCCAAGGAACATC
AATCACATACTAAACCTAAACTTTGGGAATTACCCCAAAGGACCTGAGTTCCAGAAGATC
TTCGATGTCTTGGGAGACGGGATCTTAAGTGTTGATATGGAGCTGTGGGAGGATCTGAGG
AAGTCGAGCTACGTCCTCTTTCATCATCCAGACTTCCTGGAGCTCTCAGTAAGTAGCAAT
ACAAGTAAGTTAAAGGAAGGTCTTGTTCCTTTTCTTGATAATGCTGCTGAGGAAAACATT
GTCGTAGACTTACAAGATTTGTTCAAGAGATTCATGTTTGATACTTCTTCGCTTTTGATG
ACTGGTTACGATCCAATGTCACTGTCCATCGAGATGCCGGAGGTCGAGTTCGGTGAAGCT
GCGGAAACCGGTGAAGAAGCGATCTATTATAGGCATTTCAAACCGGTCACCTTGTGGAGG
CTTCAAAACTGGTTGGGTATTGGACTTGAGAGGAAGATGCGGTCTTCTTTGGCGACTGTC
AATCGTATGTTTGCGAAGATCATATCTACAAAAAGAGAGGAGATACGTCGCGGGGAAGGC
GTGAAATCAATGGACGCGTTAACGTACTATATGAACGTGGACACGACCAAATATAAGCTC
TTGAAACCAAGTGATGATACGTTTATAAGAGACGTTGCTTTCAGTCTAGTGTTAGCGGGA
AGGGACACCACAAGCTCAGTTCTCACTTGGTTCTTCTGGCTTCTTTCTAGCATCCACAAG
TTTTGAGCAGATCCGACAGAGATCACACTAAGTATGATCCTACAGATCTAGAGAGCTCGT
GTATCTACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GN91TF U 1
AF RS1D102TF U 291
BS 1 301 RS1GN91TF
BS 302 302 RS1D102TF
BS 303 421 RS1GN91TF
BS 422 1089 RS1D102TF

RD RS1GN91TF 421 0 0
GGGCATCCATACTCATACAACGTTTGTTCAAAATATGGCGATCATAGGCTTACTTGAAGT
CTTCGTAGCATTCCTTTTTTCCCTTGTATTCAAAAAATTCTTTCTCCACATGAAATCTCC
CGGCCATCCTGTTCTCAAAAGCTGGCCTGTCCTCGGGATGCTTCCAGGAATGCTCCCCCA
TATCCCTCGCATCTTCGACTGGACGTACGAAGTTCTCGACGCCACCAACCTCACTTTTTT
TTCAAAGGCCCATGGCTTAGTGGAACGGACATGCTATTCACCGCCGACCCAAGGAACATC
AGTCACATACTAAACCTAAACTTTGGGAATTACCCCAAAGGACCTGAGTTCCAGAAGATC
TTCGATGTCTTGGGAGACGGGATCTTAAGTGTTGATATGGAGCTGTGGGAGGATCTGAGG
A

QA 1 421 1 421
DS 

RD RS1D102TF 799 0 0
G
AGGAACATCAATCACATACTAAACCTAAACTTTGGGAATTACCCCAAAGGACCTGAGTTC
CAGAAGATCTTCGATGTCTTGGGAGACGGGATCTTAAGTGTTGATATGGAGCTGTGGGAG
GATCTGAGGAAGTCGAGCTACGTCCTCTTTCATCATCCAGACTTCCTGGAGCTCTCAGTA
AGTAGCAATACAAGTAAGTTAAAGGAAGGTCTTGTTCCTTTTCTTGATAATGCTGCTGAG
GAAAACATTGTCGTAGACTTACAAGATTTGTTCAAGAGATTCATGTTTGATACTTCTTCG
CTTTTGATGACTGGTTACGATCCAATGTCACTGTCCATCGAGATGCCGGAGGTCGAGTTC
GGTGAAGCTGCGGAAACCGGTGAAGAAGCGATCTATTATAGGCATTTCAAACCGGTCACC
TTGTGGAGGCTTCAAAACTGGTTGGGTATTGGACTTGAGAGGAAGATGCGGTCTTCTTTG
GCGACTGTCAATCGTATGTTTGCGAAGATCATATCTACAAAAAGAGAGGAGATACGTCGC
GGGGAAGGCGTGAAATCAATGGACGCGTTAACGTACTATATGAACGTGGACACGACCAAA
TATAAGCTCTTGAAACCAAGTGATGATACGTTTATAAGAGACGTTGCTTTCAGTCTAGTG
TTAGCGGGAAGGGACACCACAAGCTCAGTTCTCACTTGGTTCTTCTGGCTTCTTTCTAGC
ATCCACAAGTTTTGAGCAGATCCGACAGAGATCACACTAAGTATGATCCTACAGATCTAG
AGAGCTCGTGTATCTACA

QA 2 799 2 799
DS 



AS 2 4

CO CL2171Contig1 758 2 3 U
CCTCAACTCCTACTAGTAATAATACTCGTCTTTGGCTGCAGGAACTTAACAAAACAAAAC
AGTCTCTGATAAATATTGGCGTATAATAAAACATTTAGAAATAGATTCTCATGGAAAAAA
AAACACACATGTTACATTGCAAAATCGTCTCATCTGTCGTTTGATGTAGTGGGTATAGTG
AGTTACTCAGACTCTTTTAGCTTTTTGGAAGCAGAGCCTTCTTCCTTATTCTTCTTCAGC
TTAACCTCTCTTCGCTCTCTCTTCACTCCCTTGGATTTATCAGCCAATGGAATTTTTCCA
ACCTCCTGCTCAGGAATATAAACCCTCCCTAACTTCCCTAGCACATCATTTTGATCAACA
TTCTTCACCTTCTTCTTGGGCTTATCTTTAGATGATCTCATGGCTTCTTTCCTTAGGCCT
TCGTTGGGAAGACGGTTACGACGGATAACCAAGTCCATGGATGGACCAACTTCAACAAGC
TCTATCCTAGGCACGATGGTCCCTGACTTTTTAAGCTTAATAGCGCAGTGAGTAAGAAAA
ACCTTAGTAGGTGATATCGCTGTGCATATGTAAGCACGGTCTAGTCCAGTAAGATTTAGA
TTCTCCACAACCTGCAGACCAAATAAATTCAACTTCTCGCCCCGAAAGAGATCAGTGAGG
ACTTCTTTAAGCTGCTTGAGCTCAGGTACATTGTCAAAACCTTCTCCAGCAAAGCAAATA
AAAGGCTTTGATCCTTCATGAGTGCAATCTTCTTGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CG66JQ U 15
AF RS1DQ27JQ U 1
BS 1 122 RS1DQ27JQ
BS 123 123 RS1CG66JQ
BS 124 758 RS1DQ27JQ

RD RS1CG66JQ 617 0 0
G
GTAATAATACTCTTCTTTGGCTGCAGGAACTTAACAAAACAAAACAGTCTCTGATAAATA
TTGGCGTATAATAAAACATTTAGAAATAGATTCTCATGGAAAAAAAAACACACATGTTAC
ATTGCAAAATCGTCTCATCTGTCGTTTGATGTAGTGGGTATAGTGAGTTACTCAGACTCT
TTTAGCTTTTTGGAAGCAGAGCCTTCTTCCTTATTCTTCTTCAGCTTACCCTCTCTTCGC
TCTCTCTTCACTCCCTTGGATTTATCAGCCAATGGAATTTTTCCAACCTCCTGCTCAGGA
ATATAAACCCTCCCTAACTTCCCTAGCACATCATTTTGATCAACATTCTTCACCTTCTTC
TTGGGCTTATCTTTAGATGATCTCATGGCTTCTTTCCTTAGGCCTTCGTTGGGAAGACGG
TTACGACGGATAACCAAGTCCATGGATGGACCAACTTCAACAAGCTCTATCCTAGGCACG
ATGGTCCCTGACTTTTTAAGCTTAATAGCGCAGTGAGTAAGAAAAACCTTAGTAGGTGAT
ATCGCTGTGCATATGTAAGCACGGTCTAGTCCAGTAAGATTTAGATTCTCCACAACCT
CGCCCCGAAAGAGATCAG

QA 2 599 2 599
DS 

RD RS1DQ27JQ 758 0 0
CCTCAACTCCTACTAGTAATAATACTCGTCTTTGGCTGCAGGAACTTAACAAAACAAAAC
AGTCTCTGATAAATATTGGCGTATAATAAAACATTTAGAAATAGATTCTCATGGAAAAAA
AA*CACACATGTTACATTGCAAAATCGTCTCATCTGTCGTTTGATGTAGTGGGTATAGTG
AGTTACTCAGACTCTTTTAGCTTTTTGGAAGCAGAGCCTTCTTCCTTATTCTTCTTCAGC
TTAACCTCTCTTCGCTCTCTCTTCACTCCCTTGGATTTATCAGCCAATGGAATTTTTCCA
ACCTCCTGCTCAGGAATATAAACCCTCCCTAACTTCCCTAGCACATCATTTTGATCAACA
TTCTTCACCTTCTTCTTGGGCTTATCTTTAGATGATCTCATGGCTTCTTTCCTTAGGCCT
TCGTTGGGAAGACGGTTACGACGGATAACCAAGTCCATGGATGGACCAACTTCAACAAGC
TCTATCCTAGGCACGATGGTCCCTGACTTTTTAAGCTTAATAGCGCAGTGAGTAAGAAAA
ACCTTAGTAGGTGATATCGCTGTGCATATGTAAGCACGGTCTAGTCCAGTAAGATTTAGA
TTCTCCACAACCTGCAGACCAAATAAATTCAACTTCTCGCCCCGAAAGAGATCAGTGAGG
ACTTCTTTAAGCTGCTTGAGCTCAGGTACATTGTCAAAACCTTCTCCAGCAAAGCAAATA
AAAGGCTTTGATCCTTCATGAGTGCAATCTTCTTGTCG

QA 1 758 1 758
DS 



CO CL2171Contig2 692 2 12 U
GGAAGTTAAAACCCTAGTCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCGTATCATTTGAATTGAAAAAC
CTCTTTCTTCCTCTGAGCCGAGCCGTCGCTTTGCAGGAAAACCACCAGTCATGATGGAAA
TACGAACTCCGAAGACCCACAAAGCCAAGCGTGTACTCGAAAAGCGAGCTCCTAAGTTGG
TTGAGAACGGGAAGAAGACATTGATACTTCACGGAACAAAGACGAGCGCTACAGTTAGCT
CTGTGTTGATGGAGCTGTACCGTTTGAAGAAGGGAGGTGCCATCAAATACTCGAGGAGGA
ATGAGAACATTAGGCCCTTTGAGAGTGGAGGTGAAACCTCTCTCGAGTTCTTCTCTCTCA
AGACCGACTGTAGCATCTTTGTGTATGGGTCTCACACAAAGAAAAGACCTGACAATCTGG
TGCTGGGCAGAATGTATGATCACCATGTCTACGATCTTATAGAAGTTGGGATTGAGAACT
TTAAATCTCTGCTTTCCTTTTCCTACGACAAGAAGATTGCACCTCATGAAGGATCAAAGC
CTTTTATTTGCTTTACTGGAGAAGGTTTTGACAATGTACCTGAGCTCAAGCAGCTTAAAG
AAGTCCTCACTGATCTCTTTCGGGGCGAGAAGGTGAAGAAACTAAATCTGACTGGACTAG
ACCGTGCTTACATATGCACAGCGATATCACCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 0 15 0 0 0 0 0 15 0 0 0 15 15 15 0 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DQ27TF U 1
AF RS1CG66TF U 32
BS 1 554 RS1DQ27TF
BS 555 555 RS1CG66TF
BS 556 632 RS1DQ27TF
BS 633 633 RS1CG66TF
BS 634 637 RS1DQ27TF
BS 638 640 RS1CG66TF
BS 641 641 RS1DQ27TF
BS 642 642 RS1CG66TF
BS 643 643 RS1DQ27TF
BS 644 646 RS1CG66TF
BS 647 650 RS1DQ27TF
BS 651 692 RS1CG66TF

RD RS1DQ27TF 650 0 0
GGAAGTTAAAACCCTAGTCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCGTATCATTTGAATTGAAAAAC
CTCTTTCTTCCTCTGAGCCGAGCCGTCGCTTTGCAGGAAAACCACCAGTCATGATGGAAA
TACGAACTCCGAAGACCCACAAAGCCAAGCGTGTACTCGAAAAGCGAGCTCCTAAGTTGG
TTGAGAACGGGAAGAAGACATTGATACTTCACGGAACAAAGACGAGCGCTACAGTTAGCT
CTGTGTTGATGGAGCTGTACCGTTTGAAGAAGGGAGGTGCCATCAAATACTCGAGGAGGA
ATGAGAACATTAGGCCCTTTGAGAGTGGAGGTGAAACCTCTCTCGAGTTCTTCTCTCTCA
AGACCGACTGTAGCATCTTTGTGTATGGGTCTCACACAAAGAAAAGACCTGACAATCTGG
TGCTGGGCAGAATGTATGATCACCATGTCTACGATCTTATAGAAGTTGGGATTGAGAACT
TTAAATCTCTGCTTTCCTTTTCCTACGACAAGAAGATTGCACCTCATGAAGGATCAAAGC
CTTTTATTTGCTTTGCTGGAGAAGGTTTTGACAATGTACCTGAGCTCAAGCAGCTTAAAG
AAGTCCTCACTGATCTCTTTCGGGGCGAGAAGTTGAATTTATTTGGTCTG

QA 1 650 1 650
DS 

RD RS1CG66TF 661 0 0
GG
CTCTTCGTATCATTTGAATTGAAAAACCTCTTTCTTCCTCTGAGCCGAGCCGTCGCTTTG
CAGGAAAACCACCAGTCATGATGGAAATACGAACTCCGAAGACCCACAAAGCCAAGCGTG
TACTCGAAAAGCGAGCTCCTAAGTTGGTTGAGAACGGGAAGAAGACATTGATACTTCACG
GAACAAAGACGAGCGCTACAGTTAGCTCTGTGTTGATGGAGCTGTACCGTTTGAAGAAGG
GAGGTGCCATCAAATACTCGAGGAGGAATGAGAACATTAGGCCCTTTGAGAGTGGAGGTG
AAACCTCTCTCGAGTTCTTCTCTCTCAAGACCGACTGTAGCATCTTTGTGTATGGGTCTC
ACACAAAGAAAAGACCTGACAATCTGGTGCTGGGCAGAATGTATGCTCACCATGTCTACG
ATCTTATAGAAGTTGGGATTGAGAACTTTAAATCTCTGCTTTCCTTTTCCTACGACAAGA
AGATTGCACCTCATGAAGGATCAAAGCCTTTTATTTGCTTTACTGGAGAAGGTTTTGACA
ATGTACCTGAGCTCAAGCAGCTTAAAGAAGTCCTCACTGATCTCTTTCGGGGCGAGGTTG
TGGAGAATCTAAATCTTACTGGACTAGACCGTGCTTACATATGCACAGCGATATCACCT

QA 3 661 3 661
DS 



AS 1 4

CO CL2172Contig1 879 4 9 U
GATCGCAAAACCCTAATCTGTGTGTGTTCAAGCGGCGTCACTTCTCATCGCAGTCTGAAA
GACAATGTCGACAGTCGGAGAACTTGCTTGCAGCTACGCTGTTATGATCCTTGAAGACGA
GGGCATTGCCATCACTTCCGACAAGATTGCGACTATCGTGAAAGCCTCATTCTTCTCCTC
CACTCTCTCTTCATCAACTTCTTCCAGGAACAACCAAATCGCATGCTCAGGAAACATCAA
GAACCTGACATCGTCTTCTCTGTCATGGAACAGACGAGAGCTGTCGCTTGGTTTTATGAG
CAGCTTTCTCGCGGTTGGTCTCGTTGGTAACGACAGAAGAAGCCGCGACGCGAATGCAGC
GATTCTCGAAGCTGATGACGACGAAGGGCTTCTCGAGAAAGTGAAGCAAGATCGGAAAAA
GAGGATTGAGAGACAAGCTGTTCTTAACTCTGCTGTTAAAGAAAAGGGGTATTTGCAGGA
TCTTGTTTACAATTTAAGCAAAGTAGGGCAAGCCATTGAGAACAATGATCTACCAGCTGC
AGGTTTGGTTTTGGGGAATGGCAGTGATACCGAATGGGTCAAAACGGCTAACTTGGCTTT
CACAAAGTTGAGTGCAAGTCCAGAAGAGAATACAGAGGTGGAAACATTTAATTCATCTCT
AGCTTCTCTTGTTACATCAGTGAACAAGAACGATCTAGAGTCATCTAAGCTCGCCTTCGT
GTCATCGGCTAGTGCACTTGAGAAATGGTCGAGCTTGACTGGTCTTTTAGGACAGCTCAA
GGGCATCTGATAGGCTGCCTACCAATTTGTTTACTTTTGTGTTGTAATTTTCTGAACATT
GTCAACAAAAGAAAGAATATCCTTTGAAAGTTATATCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BF14TF U 1
AF RS1BF14JQ C 254
AF RS1EB76JQ C 498
AF RS1EB76TF U 311
BS 1 561 RS1BF14TF
BS 562 562 RS1EB76TF
BS 563 727 RS1BF14TF
BS 728 728 RS1EB76TF
BS 729 744 RS1BF14TF
BS 745 747 RS1EB76TF
BS 748 770 RS1BF14TF
BS 771 872 RS1EB76TF
BS 873 879 RS1BF14JQ

RD RS1BF14TF 776 0 0
GATCGCAAAACCCTAATCTGTGTGTGTTCAAGCGGCGTCACTTCTCATCGCAGTCTGAAA
GACAATGTCGACAGTCGGAGAACTTGCTTGCAGCTACGCTGTTATGATCCTTGAAGACGA
GGGCATTGCCATCACTTCCGACAAGATTGCGACTATCGTGAAAGCCTCATTCTTCTCCTC
CACTCTCTCTTCATCAACTTCTTCCAGGAACAACCAAATCGCATGCTCAGGAAACATCAA
GAACCTGACATCGTCTTCTCTGTCATGGAACAGACGAGAGCTGTCGCTTGGTTTTATGAG
CAGCTTTCTCGCGGTTGGTCTCGTTGGTAACGACAGAAGAAGCCGCGACGCGAATGCAGC
GATTCTCGAAGCTGATGACGACGAAGGGCTTCTCGAGAAAGTGAAGCAAGATCGGAAAAA
GAGGATTGAGAGACAAGCTGTTCTTAACTCTGCTGTTAAAGAAAAGGGGTATTTGCAGGA
TCTTGTTTACAATTTAAGCAAAGTAGGGCAAGCCATTGAGAACAATGATCTACCAGCTGC
AGGTTTGGTTTTGGGGAATGGTAGTGATACCGAATGGGTCAAAACGGCTAACTTGGCTTT
CACAAAGTTGAGTGCAAGTCCAGAAGAGAATACAGAGGTGGAAACATTTAATTCATCTCT
AGCTTCTCTTGTTACATCAGTGAACAAGAACGATCTAGAGTCATCTAAGCTCGCCTTCGT
GTCATCG*CTAGTGCACTTGAGAA**TGTCGAGCTTGACTGGTCTTTTAG
ACAGCT

QA 1 770 1 770
DS 

RD RS1BF14JQ 626 0 0
TCTTCTCTGTCATGGAACAGACGAGAGCTGTCGCTTGGTTTTATGAGCAGCTTTCTCGCG
GTTGGTCTCGTTGGTAACGACAGAAGAAGCCGCGACGCGAATGCAGCGATTCTCGAAGCT
GATGACGACGAAGGGCTTCTCGAGAAAGTGAAGCAAGATCGGAAAAAGAGGATTGAGAGA
CAAGCTGTTTTTAACTCTGCTGTTAAAGAAAAGGGGTATTTGCAGGATCTTGTTTACAAT
TTAAGCAAAGTAGGGCAAGCCATTGAGAACAATGATCTACCAGCTGCAGGTTTGGTTTTG
GGGAATGGTAGTGATACCGAATGGGTCAAAACGGCTAACTTGGCTTTCACAAAGTTGAGT
GCAAGTCCAGAAGAGAATACAGAGGTGGAAACATTTAATTCATCTCTAGCTTCTCTTGTT
ACATCAGTGAACAAGAACGATCTAGAGTCATCTAAGCTCGCCTTCGTGTCATCGGCTAGT
GCACTTGAGAAATGGTCGAGCTTGACTGGTCTTTTAGGACAGCTCAAGGGCATCTGATAG
GCTGCCTACCAATTTGTTTACTTTTGTGTTGTAATTTTCTGAACATTGTCAACAAAAGAA
AGAATATCCTTTGAAAGTTATATCCT

QA 1 626 1 626
DS 

RD RS1EB76JQ 375 0 0
GCAAAGTAGGGCAAGCCATTGAGAACAATGATCTACCAGCTGCAGGTTTGGTTTTGGGGA
ATGGCAGTGATACCGAATGGGTCAAAACGGCTAACTTGGCTTTCACAAAGTTGAGTGCAA
GTCCAGAAGAGAATACAGAGGTGGAAACATTTAATTCATCTCTAGCTTCTCTTGTTACAT
CAGTGAACAAGAACGATCTAGAGTCATCTAAGCTCGCCTTCGTGTCATCGGCTAGTGCAC
TTGAGAAATGGTCGAGCTTGACTGGTCTTTTAGGACAGCTCAAGGGCATCTGATAGGCTG
CCTACCAATTTGTTTACTTTTGTGTTGTAATTTTCTGAACATTGTCAACAAAAGAAAGAA
TATCCTTTGAAAGTT

QA 1 375 1 375
DS 

RD RS1EB76TF 562 0 0
GCGGTTGGTCTCGTTGGTAACGACAGAAGAAGCCGCGACGCGAATGCAGCGATTCTCGAA
GCTGATGACGATGAAGAGCTTCTCGAGAAAGTGAAGCAAGATCGGAAAAAGAGGATTGAG
AGACAAGCTGTTCTTAACTCTGCTGTTAAAGAAAAGGGGTATTTGCAGGATCTTGTTTAC
AATTTAAGCAAAGTAGGGCAAGCCATTGAGAACAATGATCTACCAGCTGCAGGTTTGGTT
TTGGGGAATGGCAGTGATACCGAATGGGTCAAAACGGCTAACTTGGCTTTCACAAAGTTG
AGTGCAAGTCCAGAAGAGAATACAGAGGTGGAAACATTTAATTCATCTCTAGCTTCTCTT
GTTACATCAGTGAACAAGAACGATCTAGAGTCATCTAAGCTCGCCTTCGTGTCATCGGCT
AGTGCACTTGAGAAATGGTCGAGCTTGACTGGTCTTTTAGGACAGCTCAAGGGCATCTGA
TAGGCTGCCTACCAATTTGTTTACTTTTGTGTTGTAATTTTCTGAACATTGTCAACAAAA
GAAAGAATATCCTTTGAAAGTT

QA 1 562 1 562
DS 



AS 2 4

CO CL2173Contig1 539 2 2 U
CGTGTGTTGTCCAACTATTTTAATACAATTATTAAAACATTTTATAAAAGAAATATAATA
CAAAAACACAAATATGATTAAAACATAAATATAAAAATTAAATTTCATAATCTACTTTAT
ATTTGTATTCAGTAACATAGTGTACCTTATTATGCATGCCAAAACACCAGCATGCAACAA
TTTATTAATAATTTTATTTTTTCTATGACAAAAGCATAGTATATTATAAATATTATTCGA
GTTTCATTAACAAGGACGTGGTTTACCAGCAGATGGATAACGACATCGGCATGCCAATGG
TCTTCCGTTGATGGATACGCAAACACCTTCCCCTAGTTTATGCGTTTTGAGACATTCGGT
TTTACAATTATTGGCATTACATGTTTCACCTTTTATCGAAAAAGTATGAGAACAATATGT
GGGACCTTCGGTTGTCTGTGCAATCGCCGTTTTTCCGAACTGAAGAATTGTAAGAACAAC
GAAACCAATAAACCAAATTTTGAAAGCAACTTTCATCTTCGATAATGAAATAGTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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CC

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AAATATTATTCGAGTTTCATTAACAAGGACGTGGTTTACCAGCAGATGGATAACGACATC
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BQ
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QA 1 537 1 537
DS 

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QA 8 537 8 537
DS 



AS 1 3

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AF RS1D219JQ U 41
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ATATATTGTTTCCCCTCATTTCCCGCGATTTAGCTGAGCTATGCATCTTCTCCGAATAAC
CAGGAGGGACCTTATCGGATTTGAAGATACCGTTGCTCGTGAGTTGCTGAAACTTGGGGT
TGTTGTGTCCGTTCCTTGATGACTTCACAACATGTTCTTCACCGTTACGGCTTTGCCCTT
TAACATTGGAGGCTTTAACAGATTCCTCCATGTTGTTGTTTCCTTTAACTTGTTGTTTTG
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CCTGTGTTTGTACAGACCTTCCCAACTCCTTAAGCTTA
ACAG

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AAGAGGTTGGTTTCTTAGGAATCACAGCAGCGTTGTCTTCGCCGCTGAAAGAGATCTGAC
TATCCTGATCATGATGGTAATGGATTCTTGAAGTGTGGTTTGGATAAGCGTTGTTAGTAA
CGTTACCATTATCGGAGAAGATATCACTACCAGTCATTTCTTTTAGCTTGTGACCAGAAC
AGTTCTTCCTGTATGATACATTCTTGTTAAGCGATTCGGCTTCCTTGTTGGTGGTTCTAC
CACCACCGCCAAGGACGTCGCCGATGTCATCAGAATTCTGGTTGGAGGGATTAGCGGAGG
AGGAGTGGTGGATCTGGGACCAAGAGAGAAGATCGGCGGTGGAGTGATGGGGATCGCTTG
ATCGCTCCATTACCTCTCTTTTGATTTGATTTCGTCTTTTTTTTTCGTAACTGTAAATAG
TGCTTC

QA 1 546 1 546
DS 



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GTTTGGTAGATGAAGTTAAAATACAAGTTAAAGGAATCACTTGGACTCGTTAAGCAATGT
GTTCATGCTGCTGAACTAGTTGGCCTTTCAAAAAAAAAGCAAGAGAGAGAGAGAGAGAGA
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GAAATCAATTCTTGTTTGAGGGGATCGTGGGCTTCTGTCGCCTCCAGTCTCCTCCCCCAT
CTGTGTTTGCTCTTCTTAGCCACTATCACCGACCCATCAACCGCCATTAAACCTTCTTTG
TCGTGTACTCTGGATCTCTGCTTCGGTGGATCTAATCGGAAGCTAGAGGCGTGTGTCTCT
CTTCTCTGGAATACAGACGAGGGTGTAATGTGTGGCGTGATACTCGGTGGCCTTGATTCT
CTTTCTCCTCTGATTGTTGGCGTAAGATCTGGGTCAGATCTTAATTCAAGTTTGGTGATT
TTTCGGGAGTGTAGCTACCTCTCTTCTCATCGCCGCCTTGCCTTCCAACAGTTCAAGGGT
CTTGCAGCTTCAAAGTTCAATAGAGCCTCTCCTCTGGAACTTGTTTTCTGAGAGCGGCGG
AGCCGTGGTTCTCCGCTGAGAGCCTCTTCTCTTAGCCTCAAGTGTCAGCTTCCATGGTAT
TATCTGTTGATGCTCTGTTTCTCTCCGTTGTGTTTTGATGGTTGATGCTCAGGGTCCTTG
AGGACAGACCCAATGTGCCTCTAAAAGTCACGTTGGAAGATACTTGCTTTTGATGGATTT
CACCTGTTTTTGAGAAGTTGTATGGCTTCTCCTGATCTTCAACTCCGTCTACAAGCTCCG
ATTTGCTCCTCTTTTGAGTGTGAGCTTCCCGAGAAGCTTCTGGTTTTGGTTTCAACAGAG
CACCTCAGCCTGCACTGGAGTGGAATGCTTGGCCCTCCGTCGTCGCGGCCGAGAGAATCT
GTGGAGTCTTCCTAAGCCTGCACCGGAGTGGTAGCTGTCCCTCCGTCGTCGCGGCAAAGA
AACTCTTTGGATTTCCTCTACGTAAACCAACTCTGTATAGCCTTCTCCTCGTCACCTTCC
TTGGTACTTGGAAGCGCTTGTAAGGAATCTTCGCTGATGTTTGTTGCTAAACTGTTAGGT
CAAAGTCTTGTTCTCTTGATCAAACTTGATCTTAATTAGATGTTTAGGGCTTTTTATTTT
TTTGCGGCTCTTTTCATCTGAATGGTTTAGTTGCAGATGTTGATTGCAAATCCTTGTAAT
CAGACCTTCATTATCTTGTTAATGATATTTACCCTTTAACAAAAAAAACTGGTTGGCCTT
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 

AF RS1GD95TF U 1
AF RS1DZ54TF U 183
AF RS1GD95JQ C 667
AF RS1DZ54JQ C 650
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RD RS1GD95TF 658 0 0
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GTTTGGTAGATGAAGTTAAAATACAAGTTAAAGGAATCACTTGGACTCGTTAAGCAATGT
GTTCATGCTGCTGAACTAGTTGGCCTTTCAAAAAAAAAGCAAGAGAGAGAGAGAGAGAGA
GAGAGAGACAGTTTTCTCTCGAGCGTCTCTCCCACCAACACCTTCAAACCCTAATTCTCA
GAAATCAATTCTTGTTTGAGGGGATCGTGGGCTTCTGTCGCCTCCAGTCTCCTCCCCCAT
CTGTGTTTGCTCTTCTTAGCCACTATCACCGACCCATCAACCGCCATTAAACCTTCTTTG
TCGTGTACTCTGGATCTCTGCTTCGGTGGATCTAATCGGAAGCTAGAGGCGTGTGTCTCT
CTTCTCTGGAATACAGACGAGGGTGTAATGTGTGGCGTGATACTCGGTGGCCTTGATTCT
CTTTCTCCTCTGATTGTTGGCGTAAGATCTGGGTCAGATCTTAATTCAAGTTTGGTGATT
TTTCGGGAGTGTAGCTACCTCTCTTCTCATCGCCGCCTTGCCTTCCAACAGTTCAAGGGT
CTTGCAGCTTCAAAGTTCAATAGAGCCTCTCCTCTGGAATTTGTTTTCTGAGAGCGGC

QA 1 658 1 658
DS 

RD RS1DZ54TF 714 0 0
GGGAA
ACAGTTTTCTCTCGAGCGTCTCTCCCACCAACACCTTCAAACCCTAATTCTCAGAAATCA
ATTCTTGTTTGAGGGGATCGTGGGCTTCTGTCGCCTCCAGTCTCCTCCCCCATCTGTGTT
TGCTCTTCTTAGCCACTATCACCGACCCATCAACCGCCATTAAACCTTCTTTGTCGTGTA
CTCTGGATCTCTGCTTCGGTGGATCTAATCGGAAGCTAGAGGCGTGTGTCTCTCTTCTCT
GGAATACAGACGAGGGTGTAATGTGTGGCGTGATACTCGGTGGCCTTGATTCTCTTTCTC
CTCTGATTGTTGGCGTAAGATCTGGGTCAGATCTTAATTCAAGTTTGGTGATTTTTCGGG
AGTGTAGCTACCTCTCTTCTCATCGCCGCCTTGCCTTCCAACAGTTCAAGGGTCTTGCAG
CTTCAAGGTTCAATAGAGCCTCTCCTCTGGAACTTGTTTTCTGAGAGCGGCGGAGCCGTG
GTTCTCCGCTGAGAGCCTCTTCTCTTAGCCTCAAGTGTCAGCTTCCATGGTATTATCTGT
TGATGCTCTGTTTCTCTCCGTTGTGTTTTGATGGTTGATGCTCAGG*TCCTTGAGGACAG
ACCCAATGTGCCTCTAAAAGTCACGTTGGAAGATACTTGCTTTTGATGGATTTCACCTGT
TTTTGAGAAGTTGTATGGCTTCTCCTGATCTTCA*CTCCGTCTACA
GCT

QA 6 711 6 711
DS 

RD RS1GD95JQ 691 0 0
GGTTCTCCGCTGAGAGCCTCTTCTCTTAGCCTCAAGTGTCAGCTTCCATGGTATTATCTG
TTGATGCTCTGTTTCTCTCCGTTGTGTTTTGATGGTTGATGCTCAGGGTCCTTGAGGACG
GACCCAATGTGTCTCTAAAAGTCGCGTTGGAAGATACTTGCTTTTGATGGATTTCACCTG
TTTTTGAGAAGTTGTATGGCTTCTCCTGATCTTCAACTCCGTCTACAAGCTCCGATTTGC
TCCTCTTTTGAGTGTGAGCTTCCCGAGAAGCTTCTGGTTTTGGTTTCAACAGAGCACCTC
AGCCTGCACTGGAGTGGAATGCTTGGCCCTCCGTCGTCGCGGCCGAGAGAATCTGTGGAG
TCTTCCTAAGCCTGCACCGGAGTGGTAGCTGTCCCTCCGTCGTCGCGGCAAAGAAACTCT
TTGGATTTCCTCTACGTAAACCAACTCTGTATAGCCTTCTCCTCGTCACCTTCCTTGGTA
CTTGGAAGCGCTTGTAAGGAATCTTTGCTGATGTTTGTTGCTAAACTGTTAGGTCAAAGT
CTTGTTCTCTTGATCAAACTTGATCTTAATTAGATGTTTAGGGCTTTTTATTTTTTTGCG
GCTCTTTTCATCTGAATGGTTTAGTTGCAGATGTTGATTGCAAATCCTTGTAATCAGACC
TTCATTATCTTGTTAATGATATTTACCCTTT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1DZ54JQ 732 0 0
GAGAGCGGCGGAGCCGTGGTTCTCCGCTGAGAGCCTCTTCTCTTAGCCTCAAGTGTCAGC
TTCCATGGTATTATCTGTTGATGCTCTGTTTCTCTCCGTTGTGTTTTGATGGTTGATGCT
CAGGGTCCTTGAGGACAGACCCAATGTGCCTCTAAAAGTCACGTTGGAAGATACTTGCTT
TTGATGGATTTCACCTGTTTTTGAGAAGTTGTATGGCTTCTCCTGATCTTCAACTCCGTC
TACAAGCTCCGATTTGCTCCTCTTTTGAGTGTGAGCTTCCCGAGAAGCTTCTGGTTTTGG
TTTCAACAGAGCACCTCAGCCTGCACTGGAGTGGAATGCTTGGCCCTCCGTCGTCGCGGC
CGAGAGAATCTGTGGAGTCTTCCTAAGCCTGCACCGGAGTGGTAGCTGTCCCTCCGTCGT
CGCGGCAAAGAAACTCTTTGGATTTCCTCTACGTAAACCAACTCTGTATAGCCTTCTCCT
CGTCACCTTCCTTGGTACTTGGAAGCGCTTGTAAGGAATCTTCGCTGATGTTTGTTGCTA
AACTGTTAGGTCAAAGTCTTGTTCTCTTGATCAAACTTGATCTTAATTAGATGTTTAGGG
CTTTTTATTTTTTTGCGGCTCTTTTCATCTGAATGGTTTAGTTGCAGATGTTGATTGCAA
ATCCTTGTAATCAGACCTTCATTATCTTGTTAATGATATTTACCCTTTAACAAAAAAAAC
TGGTTGGCCTTC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 4

CO CL2176Contig1 590 4 12 U
GGGTCTTCCAAATATAATTTTTATTAAGGTATAATAATCTCGGGAACTTGGAGTTGGAGA
CGCTATAGGATCAAGTTAAGATATATAATGGAAACAGTATCTGATTGTTTCAAATGGACA
GATAATATATCTGAATATAACAAAATTTTTACATATCTCTCTACTCCTCGTTGCCGGAAA
CTCCCCCGGTCTGAGAAGCTCCTCCCCCATCTTGACCGCCTTCGGATGGAGCACATGGAG
ACTTCCTGTAACGCGTCTGTTGCTGCGTTGGCTGTAACTTGGGACGAAGAGCTTCAAGAG
GTCCCTTCGGCTTGGCAACACCTTGCTTTCCAAGAGCCCAATCAGCTGAGTCGAAGTATG
CTCGCTCATGATCCTTGGAAATGAGAGGTGGTTTCTTTGGCATGAGCCCTCCATACTTGT
TCTTCACAGCAGCCTCCTCCTGCTGCGGTGATGGCATTGACTTCTCTTCTTCATTAGCTT
TCAAATCCTCTACGCTAGACATTATGATCTCTCTCTCTCAATAACACCACCAAAATACTC
AGGAGCGAGGGAGGAAGGATTTGTGATGGCTTAGAAATTGAGATTGAAAG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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G
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TTT

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CC

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G
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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GGCGCTCTTCGTTGACCTATTTGGTACAGACGCTTTTGACGTCGCCACCGAGTTCAACGT
GTTGCCCTATATTTTCTTCCCGACAACGGCAAACGTCTTGTCGTTTTTTCTTCATTTCCC
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TAAACCACCGGTTTATCCAATTGG*ACCGTTGGTTAACATTGGTGGTAAGCAAGAGAGTA
GTTGCGGGATCCAAGAAGAGTCCGAATGTTTAAAGTGGTTAGATAACCAACCGCTCGGTT
CGGTTTTGTATGTGTCGTTTGGTAGTGGTGGTGCACTCACATGCGAGCAGTTCGATGAGC
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AAATCGCTGATGCTTCGTTTTTCAATCCGCATAGCCAAAATGATCCATTAACATTTTTAC
CACTAGGATTTTTAGAACGGACTAAAGGTAAAAGTTTTGTAATCCCTTCATGGGCTCCAC
AAGCGCAAATTCTAGCACATCCATCTACTGGAGGGTTCTTAACTCATTGTGGATGGAATT
CAACTCTAGAAAGTATAGTAAGTGGCGTTCCACTCATAGCATGGCCATTATACGCTGAGC
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TATGATGATGATTTGTATAATCAAACAGTGCGATATGTGCAAAATGTGTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1A326TF U 1
AF RS1A326TV U 96
AF RS1A326TR C 657
AF RS1A326JQ C 660
BS 1 684 RS1A326TF
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GGCGCTCTTCGTTGACCTATTTGGTACAGACGCTTTTGACGTCGCCACCGAGTTCAACGT
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CGGTTTTGTATGTGTCGTTTGG

QA 1 802 1 802
DS 

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TCGCGGCGAAAGGTCGTTTGCCGACGGCGCTCTTCGTTGACCTATTTGGTACAGACGCTT
TTGACGTCGCCACCGAGTTCAACGTGTTGCCCTATATTTTCTTCCCGACAACGGCAAACG
TCTTGTCGTTTTTTCTTCATTTCCCTAAACTTAATGAAACGATATCGTGTCCGTTCAGCG
AATTAACTGAACTGGTTAATCTACCCGGGTGTGTACCAGTCTCCGGGAAAGATGTTCTTG
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ACAAAGAAGCCGAAGGAATTCTTGTGAATACTTTTCTTGAGCTAGGGCCAAATGCTATAA
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TGGTTAGATAACCAACCGCTCGGTTCGGTTTTGTATGTGTCGTTTGG
T

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1A326TR 837 0 0
TTG
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ATATGATGATGATTTGTATAATCAAACAGTGCGATATGTGCAAAATGTGTTTGC

QA 4 837 4 837
DS 

RD RS1A326JQ 834 0 0
ATAAACCACCGGTTTATCCAATTGG*ACCGTTGGTTAACATTGGTGGTAAGCAAGAGAGT
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TCGGTTTTGTATGTGTCGTTTGGTAGTGGTGGTGCACTCACATGCGAGCAGTTCGATGAG
CTCGCTCATGGTCTTGCAGACAGCGATCAGAGGTTTCTTTGGGTCATACGGAGTCCAAGT
CAAATCGCTGATGCTTCGTTTTTCAATCCGCATAGCCAAAATGATCCATTAACATTTTTA
CCACTAGGATTTTTAGAACGGACTAAAGGTAAAAGTTTTGTAATCCCTTCATGGGCTCCA
CAAGCGCAAATTCTAGCACATCCATCTACTGGAGGGTTCTTAACTCATTGTGGATGGAAT
TCAACTCTAGAAAGTATAGTAAGTGGCGTTCCACTCATAGCATGGCCATTATACGCTGAG
CAGAGGATGAATGCGGTTTTGTTGGTAGAAGACATCCATGTTGCACTTAGGGCGCATGCA
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ATGCTGAATGATGATGGGTCTTCTACAAAGGCACTTAATCTTGTGACATTAAAGTGGAGA
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ATATGATGATGATTTGTATAATCAAACAGTGCGATATGTGCAAAATGTGTTTGC

QA 1 834 1 834
DS 



AS 1 4

CO CL2179Contig1 1073 4 3 U
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GCACCAACCCTGGCCAGAGTCCGTTTGTTATATGCAAATTGTTCAAGAAACAATACCCGA
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CCGAAGTATCAATGGTCGCTGTGAAGCCTGAGTCTTCTCTTGTAATCTCCGGTGATTCTC
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CTTTTCCAGAGCTGGAGTCCATGACAGTGTTCTCTCCTTTACACTCTCAAGTCCAATCCG
AGCTTGGATCCTTTCTTCAGCCTAGCTCTAGTGACTTCTCCGGGAACCATAACAACAACA
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TCCTCAATTCGGTTCTTGATTTCCAAGACGATCAAGACTTTGTTTTTCCGTGTGAGTTCG
ACGGTGAAGTGCCAGATCAGATTGCACCAGCGTATCAGCAACAGCGCTCGGCAGGTGACA
TGAGCGATGATGTTTCAAGAACAGGTATCAAGTTACAGCCTCGGCGTGAACAACCTGAGG
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GTATAATGTGGCTACTTCTTGACTTTGTATCGGTAGTGTTCTTATATAGATAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1EE85TF U 1
AF RS1EK46TF U 377
AF RS1EE85JQ C 376
AF RS1EK46JQ C 475
BS 1 575 RS1EE85TF
BS 576 957 RS1EK46TF
BS 958 1073 RS1EE85JQ

RD RS1EE85TF 575 0 0
GGGGAACGCGAACGAACTGGGTTATGCACGAGTATCGCGCCACCGAGCATGACCTCTGTG
GCACCAACCCTGGCCAGAGTCCGTTTGTTATATGCAAATTGTTCAAGAAACAATACCCGA
GTTTAGTGGAAGAAGAAGAAGCTGTCTCCTCTCCAACATCTTCCCTAGATAAGACTAAAT
CCGAAGTATCAATGGTCGCTGTGAAGCCTGAGTCTTCTCTTGTAATCTCCGGTGATTCTC
GTAATGGTGGTGCTTGCAACGAGGCTACTACCTCCAAGCTTGGAGATCTTGATTGGCTGT
CTTTTCCAGAGCTGGAGTCCATGACAGTGTTCTCTCCTTTACACTCTCAAGTCCAATCCG
AGCTTGGATCCTTTCTTCAGCCTAGCTCTAGTGACTTCTCCGGGAACCATAACAACAACA
ACTTCCAGATTCAGACTCAGTATGGTACAAACGACGAAGAAGATACAGATGTATCCCGCT
TCCTCAATTCGGTTCTTGATTTCCAAGACGATCAAGACTTTGTTTTTCCGTGTGAGTTCG
ACGGTGAAGTGCCAGATCAGATTGCACCAGCGTAT

QA 1 575 1 575
DS 

RD RS1EK46TF 581 0 0
G
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GATTTCCAAGACGATCAAGACTTTGTTTTTCCGTGTGAGTTCGACGGTGAAGTGCCAGAT
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AGAACAGGTATCAAGTTACAGCCTCGGCGTGAACAACCTGAGGGTGTTACCACTGACTAT
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GTTGTTGCGGTTCTGTTCTTGATATCAGTTTGCAGTCTAACCACAGACTTCAGAGCTTCA
CTGATGATCTGAAAACCGTAGAACCTTGTTGTGTATATTT

QA 2 581 2 581
DS 

RD RS1EE85JQ 698 0 0
TT
CAGCCTAGCTCTAGTGACTTCTCCGGGAACCATAACAACAACAACTTCCAGATTCAGACT
CAGTATGGTACAAACGACGAAGAAGATACAGATGTATCCCGCTTCCTCAATTCGGTTCTT
GATTTCCAAGACGATCAAGACTTTGTTTTTCCGTGTGAGTTCGACGGTGAAGTGCCAGAT
CAGATTGCACCAGCGTATCAGCAACAGCGCTCGGCAGGTGACATGAGCGATGATGTTTCA
AGAACAGGTATCAAGTTACAGCCTCGGCGTGAACAACCTGAGGGTGTTACCACTGACTAT
GTAATCCATGGGAACGCCTCAAGAAGGTTGCGTTTGCAAACTATCAAGAGAGAGGTTGAG
GATACGGACGGGGAAGCTATAAAGAAGGGGAAGCTGATGAGATCAAAGAGCAGAACAAGA
TTCTTGTTTAAGAAGATTATGCCCGTGAGATGTTCATACGGAGGACTTCTTAGGGCGGCC
GTTGTTGCGGTTCTGTTCTTGATATCAGTTTGCAGTCTAACCACAGACTTCAGAGCTTCA
CTGATGATTTGAAAACCGTAGAACCTTGTTGTGTATATTTGTTGTTGGTTTTCAGTTTTC
ATCTTATCCGGGGCCAGTTTATGAGGGTAACTTGTTGCGTACTGTATAATGTGGCTACTT
CTTGACTTTGTATCGGTAGTGTTCTTATATAGATAA

QA 3 698 3 698
DS 

RD RS1EK46JQ 599 0 0
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AGTTCGACGGTGAAGTGCCAGATCAGATTGCACCAGCGTATCAGCAACAGCGCTCGGCAG
GTGACATGAGCGATGATGTTTCAAGAACAGGTATCAAGTTACAGCCTCGGCGTGAACAAC
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AAACTATCAAGAGAGAGGTTGAGGATACGGACGGGGAAGCTATAAAGAAGGGGAAGCTGA
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ACGGAGGACTTCTTAGGGCGGCCGTTGTTGCGGTTCTGTTCTTGATATCAGTTTGCAGTC
TAACCACAGACTTCAGAGCTTCACTGATGATCTGAAAACCGTAGAACCTTGTTGTGTATA
TTTGTTGTTGGTTTTCAGTTTTCATCTTATCCGGGGCCAGTTTATGAGGGTAACTTGTTG
CGTACTGTATAATGTGGCTACTTCTTGACTTTGTATCGGTAGTGTTCTTATATAGATAA

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 4

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TCTTTGGGCATGATGGTGACTCTCTTGGCGTGAATGGCACACAGATTCGTGTCTTCGAAC
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CGGATGAGTAACTCAGTGCTCTTCTGGTACTTACGAATCTCACGGAGAGCGACGGTTCCG
GGACGGTAACGGTGAGGCTTCTTGACACCTCCGGTGGTCGGTGCAGATTTCCTCGCGGCC
TTGGTGGCGAGTTGCTTCCTGGGAGCTTTTCCTCCGGTGGATTTCCTGGCGGTCTGCTTC
GTACGAGCCATGGCTTTGAATCGGAGATGGTTGGATCGAATGTTTGTTTGTTCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RS1CK94JQ U 160
AF RS1H555TF C 1
AF RS1H555JQB U 4
AF RS1CK94TF C 37
BS 1 3 RS1H555TF
BS 4 253 RS1H555JQB
BS 254 254 RS1CK94JQ
BS 255 323 RS1H555JQB
BS 324 324 RS1CK94JQ
BS 325 589 RS1H555JQB
BS 590 594 RS1CK94TF

RD RS1CK94JQ 294 0 0
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CACAAATTCGTGTCTTCAAACAATCCCACCAAATACCCCTCTGCCGCTTCCTGAAAAGCC
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AAACGCTGGAAGGGAAGTTTACGGATGAGTAACTCAGTGCTCTTCTGGTACTTACAAATC
TCACGGAAAGCGACGGTTCCGGGACGGTAACGGTGAGGCTTCTTGACACCTCCG

QA 1 294 1 294
DS 

RD RS1H555TF 591 0 0
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CAATGACATGAAGAAAGAAAGAAGAGCAAGAAATCAAAAACCACAAAACAAACAAGCCTA
ATGGAAACTAAAGGAAAT*TCTAAGCACGCTCTCCACGAATGCGCCTAGCCAATTGAATG
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AATCCCACCAAATGCGCCTCTGCCGCTTCCTGAAGAGCCAACACTGCGTGGCTCTGGAAC
CTCAGATCCGTCTTGAAATCCTGGGCGATTTCGCGAACAAGACGCTGGAAGGGAAGTTTA
CGGATGAGTAACTCAGTGCTCTTCTGGTACTTACGAATCTCACGGAGAGCGACGGTTCCG
GGACGGTAACGGTGAGGCTTCTTGACACCTCCGGTGGTCGGTGCAGATTTCCTCGCGGCC
TTGGTGGCGAGTTGCTTCCTGGGAGCTTTTCCTCCGGTGGATTTCCTGGCGGTCTGCTTC
GTACGAGCCATGGCTTTGAATCGGAGATGGTTGGATCGAATGTTTGTTT
CC

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1H555JQB 588 0 0
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TGACATGAAGAAAGAAAGAAGAGCAAGAAATCAAAAACCACAAAACAAACAAGCCTAATG
GAAACTAAAGGAAAT*TCTAAGCACGCTCTCCACGAATGCGCCTAGCCAATTGAATGTCT
TTGGGCATGATGGTGACTCTCTTGGCGTGAATGGCACACAGATTCGTGTCTTCGAACAAT
CCCACCAAATGCGCCTCTGCCGCTTCCTGAAGAGCCAACACTGCGTGGCTCTGGAACCTC
AGATCCGTCTTGAAATCCTGGGCGATTTCGCGAACAAGACGCTGGAAGGGAAGTTTACGG
ATGAGTAACTCAGTGCTCTTCTGGTACTTACGAATCTCACGGAGAGCGACGGTTCCGGGA
CGGTAACGGTGAGGCTTCTTGACACCTCCGGTGGTCGGTGCAGATTTCCTCGCGGCCTTG
GTGGCGAGTTGCTTCCTGGGAGCTTTTCCTCCGGTGGATTTCCTGGCGGTCTGCTTCGTA
CGAGCCATGGCTTTGAATCGGAGATGGTTGGATCGAATGTTTGTTT
CC

QA 1 586 1 586
DS 

RD RS1CK94TF 558 0 0
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GCACACAGATTCGTGTCTTCGAACAATCCCACCAAATACGCCTCTGCCGCTTCCTGAAGA
GCCAACACTGCGTGGCTCTGGAGCCTCAGATCCGTCTTGAAATCCTGAGCGATTTCGCGA
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ATCTCACGGAGAGCGACGGTTCCGGGACGGTAACGGTGAGGCTTCTTGACACCTCCGGTG
GTCGGTGCAGATTTCCTCGCGGCCTTGGTGGCGAGTTGCTTCCTGGGAGCTTTTCCTCCG
GTGAATTTCCTAGCGGTCTGCTTCGTACGAGCCATGGCTTTGAATCGGAGATGGTTGGAT
CGAATGTTTGTTTGTTCC

QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 3

CO CL2181Contig1 1085 3 5 U
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CGGTGAAGATGGGTAGCAAGATGTTGTTCAGTTTGACAAGCCCCCGACTGTTCTCCGCCG
TCTCTCGAAAACCCACCACCACTTTTCTCTCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTCCTCCGTCGT
CTTCATGGACTCAGCCCAACCCTGGAAGATCGATCTCCTTGAGAAAAAGATTCTTCTTGT
TGCCTGCAAAAGCCACCACAGAGCAATCAGGTCAAGTTGGAGGAGAAGACGTTGATAGCA
ATATCATGCCTTATTGCAGCATCAACAAGGCTGAAAAGAAATCAATCGGTGAAATGGAAC
AAGAGTTTCTCCAAGCCTTGCAATCGTTCTATTACGATGGCAAAGCGGTCATGTCAAATG
AGGAGTTTGATAACCTTAAGGAAGAGTTGATGTGGGAAGGAAGCAGTGTTGTGATGCTAA
GTTCTGATGAACAAAGGTTCTTGGAAGCTTCAATGGCTTATGTTTCTGGGAATCCTATCC
TCAATGATGAAGAATTTGATAAGCTCAAACTCAAACTAAAGATTGATGGTAGCGATATTG
TGTGTGAGGGTCCAAGATGCAGTCTCCGTAGTAAAAAGGTGTACAGTGATCTCGCAGTGG
ATTATTTCAAAATGTTCTTGGAGCTTTCAGAACCATACAGTTTCATATTCACGTGGTTCG
CTGCTGTTCCTTTGATTGTATATCTGGCTTTAACAATCACCAAACTGATCGTCAAAGACT
TCTTGATCTTGAAGGGTCCTTGTCCGAATTGTGGAACGGAGAATACTTCCTTCTTTGGAA
CAATTCTGTCGATCTCTAGTGGTGGCAAAACTAACTCTGTCAAATGCACCAACTGTGGAA
CCGCGATGGAGTATGACTCGGGTACTCGGTTGATCACATTGCCAGAAGGAAGCCAAGCTT
GAACCCTGTGAGATGAGGATGGAAAAAGAAGAAGAATGGGTTTTGTCAGAGGAACAATAG
ATATGATGTTGTATACTTAAGATCTTGCATGTTCTTTCACATGTTTTCTGATATCCAAGT
ATTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RS1C123TF U 1
AF RS1EZ01TF U 197
AF RS1BG64TF U 428
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BS 669 671 RS1EZ01TF
BS 672 1085 RS1BG64TF

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TGCCTGCAAAAGCCACCACAGAGCAATCAGGTCAAGTTGGAGGAGAAGACGTTGATAGCA
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AGGAGTTTGATAACCTTAAGGAAGAGTTGATGTGGGAAGGAAGCAGTGTTGTGATGCTAA
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TGTGTGAGGGTCCAAGATGCAGTCTCCGTAGTAAAAAGGTGTACAGTGATCTCGCAGTGG
ATTATTTC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1EZ01TF 491 0 0
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CACAGAGCAATCAGGTCAAGTTGGAGGAGAAGACGTTGATAGCAATATCATGCCTTATTG
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CTTGCAATCGTTCTATTACGATGGCAAAGCGGTCATGTCAAATGAGGAGTTTGATAACCT
TAAGGAAGAGTTGATGTGGGAAGGAAGCAGTGTTGTGATGCTAAGTTCTGATGAACAAAG
GTTCTTGGAAGCTTCAATGGCTTATGTTTCTGGGAATCCTATCCTCAATGATGAAGAATT
TGATAAGCTCAAACTCAAACTAAAGATTGATGGTAGCGATATTGTGTGTGAGGGTCCAAG
ATGCAGTCTCCGTAGTAAAAAGGT**ACAGTGATCTCGCAGTGGATTATTTCAAA
TGTTCTTAAATGTTCA

QA 1 475 1 475
DS 

RD RS1BG64TF 658 0 0
G
GATAACCTTAAGGAAGAGTTGATGTGGGAAGGAAGCAGTGTTGTGATGCTAAGTTCTGAT
GAACAAAGGTTCTTGGAAGCTTCAATGGCTTATGTTTCTGGGAATCCTATCCTCAATGAT
GAAGAATTTGATAAGCTCAAACTCAAACTAAAGATTGATGGTAGCGATATTGTGTGTGAG
GGTCCAAGATGCAGTCTCCGTAGTAAAAAGGTGTACAGTGATCTCGCAGTGGATTATTTC
AAAATGTTCTTGGAGCTTTCAGAACCATACAGTTTCATATTCACGTGGTTCGCTGCTGTT
CCTTTGATTGTATATCTGGCTTTAACAATCACCAAACTGATCGTCAAAGACTTCTTGATC
TTGAAGGGTCCTTGTCCGAATTGTGGAACGGAGAATACTTCCTTCTTTGGAACAATTCTG
TCGATCTCTAGTGGTGGCAAAACTAACTCTGTCAAATGCACCAACTGTGGAACCGCGATG
GAGTATGACTCGGGTACTCGGTTGATCACATTGCCAGAAGGAAGCCAAGCTTGAACCCTG
TGAGATGAGGATGGAAAAAGAAGAAGAATGGGTTTTGTCAGAGGAACAATAGATATGATG
TTGTATACTTAAGATCTTGCATGTTCTTTCACATGTTTTCTGATATCCAAGTATTGT

QA 2 658 2 658
DS 



AS 1 2

CO CL2182Contig1 1259 2 6 U
GGAGCTCTCTGCAAAATTCTGCCGGCGTGAAGAAACAAAAGAAAAAAAAATCTCAGAATA
TTTCTTCTCTCTCAGAGAAAATGGATCAAGAATCATCTGAGTGTCCCTTCGTTGCGGAAA
GCATAATCCAAAAGTGCCCTTTCCTCAGAAACATCAACAAGCCAACCAGCTTCTCCCTCT
CCTCCTTGAGTTTTCCAGTTCCTGTGCAAGAAGGTAGCAAAGGCCCGATTTTTGAGGATG
GTCCTGCCTTTAATTCTGCTTTCAAGCTCTTCCATGGCAAAGACGGTATTGTTCCGTTAT
CTGGACATTCCAGTTTCGGAGATGATCTCCAAGACGAGACTCCACTGTTCAATCCTCTTG
CGGGGAAGGTTGCTACCATTAGCCTGTCAGCTTTTGGTCCTGGAGGACCTTTTGGGTTTG
GTCCTTTCTCTGACAAGTTCAAGAAACAAAAGAAGAACACCAAAAAACAAGAGTCTGGGG
ACTCATCCAAGCACGAGGCAGTTGGTGACGAGTGGTTAAAAACCGGCAACTGTCCGATCG
CGAAATCATACAGAGCGGCAAGCAAAGTCATGCCTCTTGTGGCGAAAGCATTACAGCCAC
CACCTGGTATGAAGTTTAGATGTCCAGCTCCTATAGTAGCTGCAAGAGCTGCGCTTTCCA
AGACCCCTTTGGTTAAAAGCCTTCGCCCTCAGCCTTTACCTGAAAAGATGCTCGCCATCG
CTCTCATGGGGATGGCTGCAAACGTGCCTCTCGGTGTTTGGAGGGAACACACCGTCAAGT
TTTCGCCTTCGTGGTTTGTGGCGGTTCATGCTGCTGTGCCTTTCATAGCTATGCTCAGGA
AATCTGTGCTCATGCCTAAAGCAGCCATGGCTTTGACTATCGGAGCGTCCATCTTGGGAC
AGGTGATTGGGTCGAGAGCTGAACGTTACCGTCTCAGAGCGTTAGCTGCGAATACGGTTG
CTGAAACATCGACTGTTACTGCGGGCGATAGACACGACAACCAGGTCTCTGATGGTGCAG
GCTTTGCTAAAGGACATTGTGGTACAGGGGAAGGAGTGAAGGAGGTTTATTACAATGTGA
ATATTGGTGAACCTGCTAAATCAACTGGACTCTGCTATTGATATATGTTCTTATTAAAAC
TACAAAATTACTATGTGACGATTGCAATGTTTTGTGTGGGAAAGTTAATCCCCTTATTAT
TAAAAAGGAAGCGATTAAAAAACATAACCTTCAATAAGTAAACTTATTACAATGTTGCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CL24TF U 1
AF RS1CL24JQ C 552
BS 1 705 RS1CL24TF
BS 706 706 RS1CL24JQ
BS 707 741 RS1CL24TF
BS 742 742 RS1CL24JQ
BS 743 757 RS1CL24TF
BS 758 1259 RS1CL24JQ

RD RS1CL24TF 757 0 0
GGAGCTCTCTGCAAAATTCTGCCGGCGTGAAGAAACAAAAGAAAAAAAAATCTCAGAATA
TTTCTTCTCTCTCAGAGAAAATGGATCAAGAATCATCTGAGTGTCCCTTCGTTGCGGAAA
GCATAATCCAAAAGTGCCCTTTCCTCAGAAACATCAACAAGCCAACCAGCTTCTCCCTCT
CCTCCTTGAGTTTTCCAGTTCCTGTGCAAGAAGGTAGCAAAGGCCCGATTTTTGAGGATG
GTCCTGCCTTTAATTCTGCTTTCAAGCTCTTCCATGGCAAAGACGGTATTGTTCCGTTAT
CTGGACATTCCAGTTTCGGAGATGATCTCCAAGACGAGACTCCACTGTTCAATCCTCTTG
CGGGGAAGGTTGCTACCATTAGCCTGTCAGCTTTTGGTCCTGGAGGACCTTTTGGGTTTG
GTCCTTTCTCTGACAAGTTCAAGAAACAAAAGAAGAACACCAAAAAACAAGAGTCTGGGG
ACTCATCCAAGCACGAGGCAGTTGGTGACGAGTGGTTAAAAACCGGCAACTGTCCGATCG
CGAAATCATACAGAGCGGCAAGCAAAGTCATGCCTCTTGTGGCGAAAGCATTACAGCCAC
CACCTGGTATGAAGTTTAGATGTCCAGCTCCTATAGTAGCTGCAAGAGCTGCGCTTTCCA
AGACCCCTTTGGTTAAAAGCCTTCGCCCTCAGCCTTTACCTGAAA*GATGCTCGCCATCG
CTCTCATGGGGATGGCTGCAA*CGTGCCTCTCGGTGT

QA 1 757 1 757
DS 

RD RS1CL24JQ 708 0 0
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AAGTTTAGATGTCCAGCTCCTATAGTAGCTGCAAGAGCTGCGCTTTCCAAGACCCCTTTG
GTTAAAAGCCTTCGCCCTCAGCCTTTACCTGAAAAGATGCTCGCCATCGCTCTCATGGGG
ATGGCTGCAAACGTGCCTCTCGGTGTTTGGAGGGAACACACCGTCAAGTTTTCGCCTTCG
TGGTTTGTGGCGGTTCATGCTGCTGTGCCTTTCATAGCTATGCTCAGGAAATCTGTGCTC
ATGCCTAAAGCAGCCATGGCTTTGACTATCGGAGCGTCCATCTTGGGACAGGTGATTGGG
TCGAGAGCTGAACGTTACCGTCTCAGAGCGTTAGCTGCGAATACGGTTGCTGAAACATCG
ACTGTTACTGCGGGCGATAGACACGACAACCAGGTCTCTGATGGTGCAGGCTTTGCTAAA
GGACATTGTGGTACAGGGGAAGGAGTGAAGGAGGTTTATTACAATGTGAATATTGGTGAA
CCTGCTAAATCAACTGGACTCTGCTATTGATATATGTTCTTATTAAAACTACAAAATTAC
TATGTGACGATTGCAATGTTTTGTGTGGGAAAGTTAATCCCCTTATTATTAAAAAGGAAG
CGATTAAAAAACATAACCTTCAATAAGTAAACTTATTACAATGTTGCC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 4

CO CL2183Contig1 1137 4 21 U
GAACATACCGGCTCTGCATCTTCCTGGAAGCAATGTCCAGCTGAGTCGTCTGAGATCTTC
TCTGAACGCTAGAGATGTGCAAGAGTTTGAAATGCACATGTCTTCCAGTCCACGCTTTAT
GAATCACTCCGCTCGTCCCAAGAACCTGGAGGAACATTTCTCAGCCGCCGAGGTCTTATC
GCCACGTTTCTCTGATCAGCTCGCTGTCTCGTCTGTTCTATCACCTTCCCACAAGTCAGC
GCTTCTTAATCACCTGCAGTCACCGCGAGGCATGGAGCCTATCTCTCCGATGAACGCTCG
GATGAAACAGCAGCTGCATTCGCGCAGCCTTAGCTCCCGTGAGTTTGGATCCAATCTTCC
ACGCGATGATGCAGGGTGGTGGTGGTGACTCTGGTTCGCCGCTGAGTCCGTGGTCGAGTA
GGGACCAGAACCATGGAAACAAGGTGGACTGGTCGGTGCAATCAGATGAGTTAGGGCGGT
TGAGAAAATCACATTCCTTGGCTAATAATAGTAACTCGAACAGGGAAGCAGATGTGACAT
GGGTTCAGCAGCTGGTGAAAGAGACTGCATCACCTAGGAACAGCAGCAGCAGCAACCTAT
CCATGAACATGAATGGTGGCGCAAGGCCATTGGTTCAAGGTGGTGGTTCGAGTGGGAACA
TTCACAGCGACGGTCGTGAGAGTGACATTCTTGATGCGTGGCTCGACCAGCTGCAGCTTG
ATCGCTAACTCAGTGTGAGAGAAAGAGAGAGAGGTTGATGTGTTCTGTGAAGATGTGAAA
CTGATGATGATTTGTTTATTTTATTATTCAAGAAAGCACAACGGAGAAGTCACACAAAAA
AAGGTCCTGGTAAGTGCTTTTTTCGAATTACTAATAACACCAAAAGGCTCAGTTTTTGTT
TTCAGACTTCTTTCTGAAATTTCATTTACTTTGTTGTTGTAATTTTTACCTCATTAAATT
GATTATTATCTCTTCTGTTGTAGCAAAGGGGAAAGTGTTCCTCTTTGTCTCTTATTATTC
TCGTTTTTTTTTT*AATTTGTATTCTCGTTTCTCAGTTGTTTCTAATAATATCTCAAGTC
ATATTGTCCATGAACGATGTATGAGAAAATAATAACATATTGTTTCAGCTTAATAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E952TF U 1
AF RS1E952JQ C 392
AF RS1B595TF U 472
AF RS1B595JQ C 472
BS 1 546 RS1E952TF
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BS 674 707 RS1E952TF
BS 708 708 RS1B595TF
BS 709 743 RS1E952TF
BS 744 744 RS1B595TF
BS 745 755 RS1E952TF
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BS 757 770 RS1E952TF
BS 771 771 RS1B595TF
BS 772 779 RS1E952TF
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BS 791 1059 RS1B595TF
BS 1060 1137 RS1B595JQ

RD RS1E952TF 790 0 0
GAACATACCGGCTCTGCATCTTCCTGGAAGCAATGTCCAGCTGAGTCGTCTGAGATCTTC
TCTGAACGCTAGAGATGTGCAAGAGTTTGAAATGCACATGTCTTCCAGTCCACGCTTTAT
GAATCACTCCGCTCGTCCCAAGAACCTGGAGGAACATTTCTCAGCCGCCGAGGTCTTATC
GCCACGTTTCTCTGATCAGCTCGCTGTCTCGTCTGTTCTATCACCTTCCCACAAGTCAGC
GCTTCTTAATCACCTGCAGTCACCGCGAGGCATGGAGCCTATCTCTCCGATGAACGCTCG
GATGAAACAGCAGCTGCATTCGCGCAGCCTTAGCTCCCGTGAGTTTGGATCCAATCTTCC
ACGCGATGATGCAGGGTGGTGGTGGTGACTCTGGTTCGCCGCTGAGTCCGTGGTCGAGTA
GGGACCAGAACCATGGAAACAAGGTGGACTGGTCGGTGCAATCAGATGAGTTAGGGCGGT
TGAGAAAATCACATTCCTTGGCTAATAATAGTAACTCGAACAGGGAAGCAGATGTGACAT
GGGTTCGGCAGCTGGTGAAAGAGACTGCATCACCTAG*AACAGCAGCAGCAGCAACCTAT
CCATGAACATGAATGGTGGCGCAAGGCCATTGGTTCAAAGTGGTGGTTCGAGTGGGAACA
TTCACAGCGACG*TCGTGAGAGTGACATTCTTGATGCGTGGCTCGAC*AGCTGCAGCTTG
ATCGCTAACTCAGTGTGAGAGAA*GAGAGAGAGGT*GATGTGTTCTGTGA*GATGTGAA*
CTGATGATGA

QA 1 790 1 790
DS 

RD RS1E952JQ 657 0 0
TGGTTCGCCGCTGAGTCCGTGGTCGAGTAGGGACCAGAACCATGGAAACAAGGTGGACTG
GTCGGTGCAATCAGATGAGTTAGGGCGGTTGAGAAAATCACATTCCTTGGCTAATAATAG
TAACTCGAACAGGGAAGCAGATGTGACATGGGTTCGGCAGCTGGTGAAAGAGACTGCATC
ACCTAGGAACAGCAGCAGCAGCAACCTATCCATGAACATGAATGGTGGCGCAAGGCCATT
GGTTCAAGGTGGTGGTTCGAGTGGGAACATTCACAGCGACGGTCGTGAGAGTGACATTCT
TGATGCGTGGCTCGACCAGCTGCAGCTTGATCGCTAACTCAGTGTGAGAGAAAGAGAGAG
AGGTTGATGTGTTCTGTGAAGATGTGAAACTGATGATGATTTGTTTATTTTATTATTCAA
GAAAGCACAACGGAGAAGTCACACAAAAAA*GGTCCTGGTAAGTGCTTTTTTCGAATTAC
TAATAACACCAAAAGGCTCAGTTTTTGTTTTCAGACTTCTTTTTGAAATTTCATTTACTT
TGTTGTTGTAATTTTTACCTCATTAAATTGATTATTATCTCTTCTGTTGTAGCAAAGGGG
AAAGTGTTCCTCTTTGTCTCTTATTATTCTCGTTTTTTTTTTCAATTTGTATTCTCG

QA 1 657 1 657
DS 

RD RS1B595TF 588 0 0
G
AGGGCGGTTGAGAAAATCACATTCCTTGGCTAATAATAGTAACTCGAACAGGGAAGCAGA
TGTGACATGGGTTCAGCAGCTGGTGAAAGAGACTGCATCACCTAGGAACAGCAGCAGCAG
CAACCTATCCATGAACATGAATGGTGGCGCAAGGCCATTGGTTCAAGGTGGTGGTTCGAG
TGGGAACATTCACAGCGACGGTCGTGAGAGTGACATTCTTGATGCGTGGCTCGACCAGCT
GCAGCTTGATCGCTAACTCAGTGTGAGAGAAAGAGAGAGAGGTTGATGTGTTCTGTGAAG
ATGTGAAACTGATGATGATTTGTTTATTTTATTATTCAAGAAAGCACAACGGAGAAGTCA
CACAAAAAAAGGTCCTGGTAAGTGCTTTTTTCGAATTACTAATAACACCAAAAGGCTCAG
TTTTTGTTTTCAGACTTCTTTCTGAAATTTCATTTACTTTGTTGTTGTAATTTTTACCTC
ATTAAATTGATTATTATCTCTTCTGTTGTAGCAAAGGGGAAAGTGTTCCTCTTTGTCTCT
TATTATTCTCGTTTTTTTTTT*AATTTGTATTCTCGTTTCTCAGTTG

QA 2 588 2 588
DS 

RD RS1B595JQ 666 0 0
G
AGGGCGGTTGAGAAAATCACATTCCTTGGCTAATAATAGTAACTCGAACAGGGAAGCAGA
TGTGACATGGGTTCAGCAGCTGGTGAAAGAGACTGCATCACCTAGGAACAGCAGCAGCAG
CAACCTATCCATGAACATGAATGGTGGCGCAAGGCCATTGGTTCAAGGTGGTGGTTCGAG
TGGGAACATTCACAGCGACGGTCGTGAGAGTGACATTCTTGATGCGTGGCTCGACCAGCT
GCAGCTTGATCGCTAACTCAGTGTGAGAGAAAGAGAGAGAGGTTGATGTGTTCTGTGAAG
ATGTGAAACTGATGATGATTTGTTTATTTTATTATTCAAGAAAGCACAACGGAGAAGTCA
CACAAAAAAAGGTCCTGGTAAGTGCTTTTTTCGAATTACTAATAACACCAAAAGGCTCAG
TTTTTGTTTTCAGACTTCTTTCTGAAATTTCATTTACTTTGTTGTTGTAATTTTTACCTC
ATTAAATTGATTATTATCTCTTCTGTTGTAGCAAAGGGGAAAGTGTTCCTCTTTGTCTCT
TATTATTCTCGTTTTTTTTTT*AATTTGTATTCTCGTTTCTCAGTTGTTTCTAATAATAT
CTCAAGTCATATTGTCCATGAACGATGTATGAGAAAATAATAACATATTGTTTCAGCTTA
ATAAC

QA 2 666 2 666
DS 



AS 1 4

CO CL2184Contig1 591 4 6 U
GGCTGATAGCTTCAGAGACAAGAATCTGTCAACTGGAATCTTCTTTCCGGAACTTCTGAC
TGCGGTAGAACCAAGAGTTGTCAACTGGAGCCTCGTTACCAGTGGAGAAACAGAGGAGGA
TAAGAAGTTGAATGCCACATACATCATCAGTGTTGCAAGGAAGCTCGGATGCTCCATATT
CTTGTTGCCTGAGGATATCATAGAGGTGAACCAGAAAATGATGCTTATTTTGGCGGCCAG
CATCATGTACTGGAGCCTTCAGCAACAATCAGACACAGAGTCTAATGTCTCAGAAGATGC
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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1E276JQ C 1
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AF RS1E276TF U 1
AF RS1B539TF U 138
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GT
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CTTTCTTGTCAATTGCATGAGATTATTGGTTTCTTGTTTTGACTGCTTCGTGGAACATTA
AT

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G
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TGATGATGAGAATAATAAAGATGCATAGTGAGTTTGAATGGTAATTTGATTTCTGCATTG
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ATA

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DS 



AS 1 4

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CGCATGTCAACATATTTTATTGTCTAGGAGGAATTACCCTTACTTGTTTTTTAGTACAAG
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AAAAATAAGACATGTATTTGGATATTTCCCTTCAACTCCACAATATTGTATTATTTTTTT
GACATAAAAAGTTGGAGGGAATTCTATGAAGAGAAAATGGATTATGGGAGTAAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A144TF U 77
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AF RS1A144JQ C 75
AF RS1A144TR C 109
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TCCCTTATAAATAATATAGATTCTAGATTTTTTTAATTACTAATTTATTTTATTACTTGG
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DS 

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AAAAATAAGACATGTATTTGGATATTTCCCTTCAAC

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TT
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TCTTACGGCTGTATTTATGTTAATGCATTTCTTAATGATACGTAAGCAAGGTATTTCTGG
TCCCTTATAAATAATATAGATTCTAGATTTTTTTAATTACTAATTTATTTTATTACTTGG
TGAAGGAACAATCGTATTTTATTGCTATAAATATGGATTATTAAAAAAATAAGACATGTA
TTTGGATATTTCCCTTCAACTCCACAATATTGTATTATTTTTTTGACATAAAAAGTTGGA
GGGAATTCTATGAAGAGAAAATGGATTATGGGAGTAAC

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TTTTAGTACAAGTAGCTACGGGATTTGCTATGACTTTTTATTACCGTCCAACTGTTACTG
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ATAGTTTACACACTTTTGTATTACCTCTTCTTACGGCTGTATTTATGTTAATGCATTTCT
TAATGATACGTAAGCAAGGTATTTCTGGTCCCTTATAAATAATATAGATTCTAGATTTTT
TTAATTACTAATTTATTTTATTACTTGGTGAAGGAACAATCGTATTTTATTGCTATAAAT
ATGGATTATTAAAAAAATAAGACATGTATTTGGATATTTCCCTTCAACTCCACAATATTG
TATTATTTTTTTGACATAAAAAGTTGGAGGGAATTCTATGAAGAGAAAATGGATT

QA 1 835 1 835
DS 



AS 1 4

CO CL2186Contig1 946 4 3 U
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TGGTAAAACTGCTCCAAAGGACGAGAAATCTATAGCTCCTAAAGACTACATGTACATGAA
AGCGCTGTACCATTCTCTTCCAATGCAATATGTGACCGTTACAAAGCTTCACAACATGTT
GGATGGTGAAGCCAACCAGACACAAGTTCGTAAGCTAATTGACCGAATGATCCAAGAGGG
CTACGTGGAGGATTCTAGCAACCGCAGGCTAGGGAATCGTGTAATTCACTCAGCTTTTAC
CGAGAATAAGCTAAATGAAGTCAGAAAAGTTCTTGCCACAGATGATGATATGGATGTGGA
TGTAGACGAAACTGTAAACAAGACCAACGGCCAAGATGCCAAACTAACCCCAGATGTATC
TACACGCGGAGGCATCCACTCCATTGGATCAGACATGACACGCACGAAAGGAAGATCTGG
GATGCAGCAGAACGGATCGGTTCTAAGTGAACAGACCATCTCTAAAGCTAATAACAACAC
TCCAGTGAGCAGCAACGCACAGCCTGTGGCTTCGAGGGAGAGTTTTGCTGTAAAAGGAAT
GGGTGCTAAAATCTTCAAGGACGCTAACTCAGACGGTAGCCAAGCCTCACAAGACAGGTG
TTACAGGAAAACTAGCATGGTGAGAGAGCCTATCCTGCAGTACTCGAAGCGCCAGAAATC
TCAGGCTAATTGATGATGGTACCACAGTCTCAGACACGAAAGCCACCATACTCAGTGGCT
ATGATAGTATCTTCTACCAATTCCCATAATCCATAATAAACTCTCCTGATACACTCGCTT
TATTCCCATGCTTAAGTATTATTATCTTTGTTACTTGTGGCGCGAGACTTGATGCATCAC
TTGCTTTATTGGTTACATTGGTTTTATGATATTCCGTCTGCCTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CS67TF U 1
AF RS1CS67JQ C 192
AF RS1CA85JQ C 468
AF RS1CA85TF U 468
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CTACGTGGAGGATTCTAGCAACCGCAGGCTAGGGAATCGTGTAATTCACTCAGCTTTTAC
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QA 1 653 1 653
DS 

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GTTACATTGGTTTTATGATATTCCGTCTGCCTCTT

QA 1 755 1 755
DS 

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G
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ATACACTCGCTTTATTCCCATGCTTAAGTATTATTATCTTTGTTACTTGTGGCGCGAGAC
TTGATGCATCACTTGCTTTATTGGTT

QA 2 447 2 447
DS 

RD RS1CA85TF 447 0 0
G
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ACAAGACAGGTGTTACAGGAAAACTAGCATGGTGAGAGAGCCTATCCTGCAGTACTCGAA
GCGCCAGAAATCTCAGGCTAATTGATGATGGTACCACAGTCTCAGACACGAAAGCCACCA
TACTCAGTGGCTATGATAGTATCTTCTACCAATTCCCATAATCCATAATAAACTCTCCTG
ATACACTCGCTTTATTCCCATGCTTAAGTATTATTATCTTTGTTACTTGTGGCGCGAGAC
TTGATGCATCACTTGCTTTATTGGTT

QA 2 447 2 447
DS 



AS 1 4

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GCATAAACTATATCATCCACTGGCTTTGCATCTTCACCACATTAACAAAAATACTGTTTA
ATCTTACACCACGACACAAAAGACAATACACAAAACAAATAAAACAATAGATATGAACTT
TATAATTAAGTGTTTTTTTAACCCCAAAAGCATATTATTGCTCACACTTCTCAACAGTTG
ATTCCACATTCGAGTATGTCCGGGCCAGTGACTCCTTTAGTGAAAGGATCGATCCTAACC
CACAACAAGGAGAAGATCGAAGCCAAGAGAACAGACCAGACCACAACAATAGTAGGAGTC
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GCGAATAAGTGAGCTGATACTCCACCGATGACCCAGAACTGCTCGTTTCTCCACCATTCG
TCTATGCCTACGCCACTCCACCTCATTTCCAGTATACCCGTGGCGAAAATAGACAGAAAG
AGAGATAGAAACCATATACTTGCAATGTTGCTAATCTGAGGAATGATGAACTGGTTGGTG
AAGAGACAAACGGCGGGCAACGTACAATAAGAGAAGAGGGACGGAGGTGAGTGGGTAGAT
GGTGGTGTTCACATACGCAAACCTCTCCAGAAATTTAAGCCTTCCACTGTAACCATACCA
TATC


BQ
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15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1H267JQB U 1
AF RS1GW90JQ U 55
AF RS1H267TF C 134
AF RS1GW90TF C 226
BS 1 421 RS1H267JQB
BS 422 422 RS1GW90JQ
BS 423 429 RS1H267JQB
BS 430 430 RS1GW90JQ
BS 431 468 RS1H267JQB
BS 469 482 RS1GW90JQ
BS 483 483 RS1H267TF
BS 484 707 RS1GW90JQ
BS 708 782 RS1H267TF
BS 783 964 RS1GW90TF

RD RS1H267JQB 468 0 0
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GCATAAACTATATCATCCACTGGCTTTGCATCTTCACCACATTAACAAAAATACTGTTTA
ATCTTACACCACGACACAAAAGACAATACACAAAACAAATAAAACAATAGATATGAACTT
TATAATTAAGTGTTTTTTTAACCCCAAAAGCATATTATTGCTCACACTTCTCAACAGTTG
ATTCCACATTCGAGTATGTCCGGGCCAGTGACTCCTTTAGTGAAAGGATCGATCCTAACC
CACAACAAGGAGAAGATCGAAGCCAAGAGAACAGACCAGACCACAACAATAGTAGGAGTC
CGGTTCTGTCTCCCCATCAAACCCTTGAGGAAAGGGTACAAGTGAACAATCACCCAAAAG
GGGAAGAACGGCTTACCAAAGAGCGGTCCCCATGACTGGTATCCACTG

QA 1 468 1 468
DS 

RD RS1GW90JQ 653 0 0
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TGTTTAATCTTACACCACGACACAACAGACAATACACAAAACAAATAAAACAATAGATAT
GAACTTTATAATTAAGTGTTTTTTTAACCCCAAAAGCATATTATTGCTCACACTTCTCAA
CAGTTGATTCCACATTCGAGTATGTCCGGGCCAGTGACTCTTTTAGTGAAAGGATCGATC
CTAACCCACAACAAGGAGAAGATCGAAGCCAAGAGAACAGACCAGACCACAACAATAGTA
GGAGTCCGGTTCTGTCTCCCCATCAAACCCTTGAGGAAAGGGTACAAGTGAACAATCACC
CAAAAGGCGAAAAACAGCTTACCAAAGAGCGGTCCCCATGACTGGTATCCACTGTTGATG
GCGTACGAAAAACCCGCAACAACTCCCACGAGGTTTACAATGAGTAGCGTCGTCGGCGGA
ATCAGAAGCGTCGTCCATTTGAACATGTAGAGCTCCGCGAAGTCTCCGTCCTCGTTCGAA
GCTTTTGACGTGACTGTGAAGTTTGTGTCGATACCAGCAAGGACTTTGAGAAGACCTTGA
AACACGGCGAATAAGTGAGCTGATACTCCACCGATGACCCAGAACTGCTCGTT

QA 1 653 1 653
DS 

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TTTTTTAACCCCAAAAGCATATTATTGCTCACACTTCTCAACAGTTGATTCCACATTCGA
GTATGTCCGGGCCAGTGACTCCTTTAGTGAAAGGATCGATCCTAACCCACAACAAGGAGA
AGATCGAAGCCAAGAGAACAGACCAGACCACAACAATAGTAGGAGTCCGGTTCTGTCTCC
CCATCAAACCCTTGAGGAAAGGGTACAAGTGAACAATCACCCAAAAGGCGAAGAACGGCT
TACCAAAGAGCGGTCCCCATGACTGGTATCCACTGTTGATGGCGTACGAGAAACCCGCAA
CAACTCCCACGAGGTTTACAATGAGTAGCGTCGTCGGCGGAATCAGAAGCGTCGTCCATT
TGAACATGTAGAGCTCCGCGAAGTCTCCGTCCTCGACCGAAGCTTTTGACGTGACTGTGA
AGTTTGTGTCGATACCAGCAAGGACTTTGAGAAGACCTTGAAACACGGCGAATAAGTGAG
CTGATACTCCACCGATGACCCAGAACTGCTCGTTTCTCCACCATTCGTCTATGCCTACGC
CACTCCACCTCATTTCCAGTATACCCGTGGCGAAAATAGACAGAAAGAG

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DS 

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TCCACATTCGAGTATGTCCGGGCCAGTGACTC*TTTAGTGAAAGGATCGATCCTAACCCA
CAACAAGGAGAAGATCGAAGCCAAGAGAACAGACCAGACCACAACAATAGTAGGAGTCCG
GTTCTGTCTCCCCATCAAACCCTTGAGGAAAGGGTACAAGTGAACAATCACCCAAAAGGC
GAAGAACAGCTTACCAAAGAGCGGTCCCCATGACTGGTATCCACTGTTGATGGCGTACGA
GAAACCCGCAACAACTCCCACGAGGTTTACAATGAGTAGCGTCGTCGGCGGAATCAGAAG
CGTCGTCCATTTGAACATGTAGAGCTCCGCGAAGTCTCCGTCCTCGTTCGAAGCTTTTGA
CGTGACTGTGAAGTTTGTGTCGATACCAGCAAGGACTTTGAGAAGACCTTGAAACACGGC
GAATAAGTGAGCTGATACTCCACCGATGACCCAGAACTGCTCGTTTCTCCACCATTCGTC
TATGCCTACGCCACTCCACCTCATTTCCAGTATACCCGTGGCGAAAATAGACAGAAAGAG
AGATAGAAACCATATACTTGCAATGTTGCTAATCTGAGGAATGATGAACTGGTTGGTGAA
GAGACAAACGGCGGGCAACGTACAATAAGAGAAGAGGGACGGAGGTGAGTGGGTAGATGG
TGGTGTTCACATACGCAAACCTCTCCAGAAATTTAAGCCTTCCACTGTAACCATACCATA
TC

QA 18 739 18 739
DS 



AS 1 4

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ATCTGCCAGAGAAGATCCACCACAAGGTCTCCGAGAATTGGATCAGCACTATTCTCCTCC
TCGCTCCCGTCATCGGAACCTACTCGTATGCTCAACGCTACCAAGAAAAAGAGAAGCTGG
AGCACAGGTTCTAAGCATGGGAAGAAGATGTTCTGATTGTTTTTATGATAATAATCCAAT
TCTTGTCTTTCACTTTTCATTCTCCAGAATGAGTGTCTGTGTTTCCAAGAGAGTTTGTGC
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CATTTTGTTGATTTTTATGAAATAAGCAAAATCGTCAAGGTGT


BQ
10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1CG83TF U 1
AF RS1C638TF U 2
AF RS1GO70JQ C 2
AF RS1GO70TF U 2
BS 1 84 RS1CG83TF
BS 85 85 RS1C638TF
BS 86 463 RS1CG83TF

RD RS1CG83TF 463 0 0
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AGGCGGTGGTGTACGCATTGTCGCTGTTTCAGCAGAAGATCATGACAGGTCTATGGAAGG
ATCTGCCAGAGAAGATCCACCACAAGGTCTCCGAGAATTGGATCAGCACTATTCTCCTCC
TCGCTCCCGTCATCGGAACCTACTCGTATGCTCAACGCTACCAAGAAAAAGAGAAGCTGG
AGCACAGGTTCTAAGCATGGGAAGAAGATGTTCTGATTGTTTTTATGATAATAATCCAAT
TCTTGTCTTTCACTTTTCATTCTCCAGAATGAGTGTCTGTGTTTCCAAGAGAGTTTGTGC
TTTCGTCAACACTCCAAAAATAGAAGCGTGAAAGTTGCTTCTCTACTGTTTCGTTGAATA
CATTTTGTTGATTTTTATGAAATAAGCAAAATCGTCAAGGTGT

QA 1 463 1 463
DS 

RD RS1C638TF 462 0 0
G
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CTGCCAGAGAAGATCCACCACAAGGTCTCCGAGAATTGGATCAGCACTATTCTCCTCCTC
GCTCCCGTCATCGGAACCTACTCGTATGCTCAACGCTACCAAGAAAAAGAGAAGCTGGAG
CACAGGTTCTAAGCATGGGAAGAAGATGTTCTGATTGTTTTTATGATAATAATCCAATTC
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TCGTCAACACTCCAAAAATAGAAGCGTGAAAGTTGCTTCTCTACTGTTTCGTTGAATACA
TTTTGTTGATTTTTATGAAATAAGCAAAATCGTCAAGGTGT

QA 2 462 2 462
DS 

RD RS1GO70JQ 462 0 0
G
GGAGGAAGAAGAAAAAGAAGAAGAAAACGAAAAATGGGGAAGCAGCCGGTGAAACTGAAG
GCGGTGGTGTACGCATTGTCGCCGTTTCAGCAGAAGATCATGACAGGTCTATGGAAGGAT
CTGCCAGAGAAGATCCACCACAAGGTTTCCGAGAATTGGATCAGCACTATTTTCCTCCTC
GCTCCCGTCATCGGAACCTACTCGTATGCTCAACGCTACCAAGAAAAAGAGAAGCTGGAG
CACAGGTTTTAAGCATGGGAAGAAGATGTTTTGATTGTTTTTATGATAATAATCCAATTC
TTGTCTTTCACTTTTCATTTTCCAGAATGAGTGTCTGTGTTTCCAAGAGAGTTTGTGCTT
TCGTCAACACTCCAAAAATAGAAGCGTGAAAGTTGCTTTTTTACTGTTTCGTTGAATACA
TTTTGTTGATTTTTATGAAATAAGCAAAATCGTCAAGGTGT

QA 2 462 2 462
DS 

RD RS1GO70TF 462 0 0
G
GGAGGAAGAAGAAAAAGAAGAAGAAAACGAAAAATGGGGAAGCAGCCGGTGAAACTGAAG
GCGGTGGTGTACGCATTGTCGCCGTTTCAGCAGAAGATCATGACAGGTCTATGGAAGGAT
CTGCCAGAGAAGATCCACCACAAGGTCTCCGAGAATTGGATCAGCACTATTCTCCTCCTC
GCTCCCGTCATCGGAACCTACTCGTATGCTCAACGCTACCAAGAAAAAGAGAAGCTGGAG
CACAGGTTCTAAGCATGGGAAGAAGATGTTCTGATTGTTTTTATGATAATAATCCAATTC
TTGTCTTTCACTTTTCATTCTCCAGAATGAGTGTCTGTGTTTCCAAGAGAGTTTGTGCTT
TCGTCAACACTCCAAAAATAGAAGCGTGAAAGTTGCTTCTCTACTGTTTCGTTGAATACA
TTTTGTTGATTTTTATGAAATAAGCAAAATCGTCAAGGTGT

QA 2 462 2 462
DS 



AS 1 2

CO CL2189Contig1 761 2 21 U
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AAAACTGTACAACATTACAGAAGATCACTCCCATCAGAAGAAATCATCAACTGCTACATT
AGATGAAGGCAGCTCACGCTCATCCTCCTTCTCCATCTCCAATTCCGGTTCGAACTCCGT
CAGTTCAACAGCCGCAAGCTTCTTCAAATCAATAACCGATAACTCATCCAACCTTCTCAC
AACCAGATCAGCCGCTCCAAGCTCATACATCGGATGCTTACTAGCCACAGCAACACACTT
CATCTCCCCATCATGAGCAGCCTCAATAGTCTGGTTCGAGTTCCCAAACACAATGCAACG
TTCCGGTATGAAATCAAGAAGCTGCGCTGCGTAAGCAAACATCTCAGGATCAGGTTTACC
TCTGTAAACATCTTCAGACGCAACAATCACACTGAAGAACTTCCTAATCCCAATCGAACC
AACAGCGTTCTCTAGCGTCTCACGAGGACGGGTCGAAACCAAAGCCATGGGGATCTTGTT
ATTCATCAAGACATTCACAAACTCCTGCGACCCGTCTCTCAGTCTATACACTCCTCCATC
TAAAGCCTTAAAGATCTCCTCTTTACGCGAAGCCATTCTCCTAACTTGACCAGGGTCTCT
CGACCAACACAGAACCTCAGAGACAGCTTGCTCGTTCTTAATCCCTTCGATAAGTCTGAG
TAAAAGGCCGGAGGAGGAGACTTGCCTTCCTCCTGAGCTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G732JQ U 17
AF RS1BU21JQ U 1
BS 1 30 RS1BU21JQ
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BS 700 700 RS1G732JQ
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RD RS1G732JQ 703 0 0
CATTTTGTGAATACCGAAATACACGATGAAGAATCCAAATCCATAAAACTGTACAACATT
ACAGAAGATCACTCCCATTAGAAGAAATCATCAACTGCTACATTAGATGAAGGCAGCTCA
CGCTCATCCTCCTTCTCCATCTCCAATTCCGGTTCGAACTCCGTCAGTTCAACAGCCGCA
AGCTTCTTCAAATCAATAACGGATAACTCATCCAACCTTCTCACCACCAGATCCGCCGCT
CCAAGCTCATACATCGGATGCTTACTAGCCACAGCCACACACTTCATCTTCCCATCATGA
GCAGCCTCAATGGTCTGGTTCGAGTTTCCAAACACAATGCAACGTTCCGGTATGAAATCA
AGAAGCTGCGCTGCGTAAGCAAACATCTCAGGATCCGGTTTACCTCTGTGGACATCTTCA
GACGCAACTATCACACTGAAGAACTTCCTTATCCCAATCGAACCAACAGCGTTCTCTAGC
GTCTCACGAGGACGGGTCGAAACCAAAGCCATGGGGATCTTGTTATTCATCAAGACATTC
ACAAACTCCTGTGACCCGTCTCTTAGTCTATACACTCCTCCATCTAAAGCCTTAAAGATC
TCCTCTTTACGCGAAGCCATTCTCCTAACTTGAGCAGGGTCTCTCGACCAACACAGAACC
TCAGAGACCGCTTGCTCGTTCTTAATCCCTTCGATACGTCTGA

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1BU21JQ 761 0 0
TACACAGAAACTATAACATTTTGTGAATAC*GAATTACATGAGGAAGAATCCAAATCCAT
AAAACTGTACAACATTACAGAAGATCACTCCCATCAGAAGAAATCATCAACTGCTACATT
AGATGAAGGCAGCTCACGCTCATCTTCCTTCTCCATCTCCAATTCCGGTTCGAACTCCGT
CAGTTCAACAGCCGCAAGCTTCTTCAAATCAATAACCGATAGCTCATCCAACCTTCTCAC
AACCAGATCAGCCGCTCCAAGCTCATACATCGGATGCTTACTAGCCACAGCAACACACTT
CATCTCCCCATCATGAGCAGCCTCAATAGTCTGGTTCGAGTTCCCAAACACAATGCACCT
TTCCGGTATGAAATCAAGAAGCTGCGCTGCGTAAGCAAACATCTCCGGATCAGGTTTACC
TCTGTAAACATCTTCAGACGCAACAATCACACTGAAGAACTTCCTAATCCCAATCGAACC
AACAGCGTTCTCTAGCGTCTCACGAGGACGGGTCGAAACCAAAGCCATGGGGATCTTGTT
ATTCATCAAGACATTCACAAACTCCTGCGACCCGTCTCTCAGTCTATACACTCCTCCATC
TAAAGCCTTAAAGATCTCCTCTTTACGCGAAGCCATTCTCCTAACTTGACCAGGGTCTCT
CGACCAACACAGAACCTCAGAGATAGCTTGCTCGTTCTTCATCCCTTCGATAAGTCTGAG
TAAAAGGCCGGAGGAGGAGACTTGCCTTCCTCCTGAGCTAA

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 4

CO CL2190Contig1 1028 4 11 U
GGAAGACGGCGATGCCACGTCATCTTCGGCGATTACGAAGGCCGGCGATCCTTACTCCCA
CACTCGTCAACGTCGTCCTTCCTCAGAATCTATGAGCAGTTCTCCTCCGGGAAGCCCAGC
TCGATCTCCTTCTCCTTTCTTATTCGCTCCTCAGGTTCCAGTGTCTCCATTGCAGAGGAC
AAACGCCCCTCCTTCGCCTAATAAAATCCAATGGAACCAATCTCAAAGAATTTTTGATAT
TCCGGAAGAGCAAGGGATCCCTATTATCATTACATGGAACCAGGGAGGTAATGATGTGGC
AGTGGAAGGATCTTGGGACAACTGGAGATCAAGGAAGAAGCTGGAGAAATCTGGAAAAGA
CCACTCAATTCTCTTTGTCCTTCCATCTGGCATATACCACTACAAGGTGATCGTCGACGG
TGAATGCAAATACATCCCAGATTTGCCCTTTGTATCAGACGAAATGGGCAATGTCTTCAA
CATTCTCGATGTTCATAACTTTGTGCCAGAAAACCCAGAAAGCATAGCTGAGTTTGAGGC
GCCTCCTTCACCTGATCATAGCTACGGACAAGCCCTCCCAACAGCAGAGGATTTCACAAA
AGATCCACTGGCGGTGCCACCTCAGCTTCGTCTAACACTTGTGGACACTAGTGACGAAAC
AGGCAAAGCCACAAAGCCTCAGCATGTGGTGCTTAACCATGTGTTCATAGAGCAAGGGTG
GAGTCCTCAATCCATCGTAGCTTTGGGTTTAACTCACAGGTTCGAGTCTAAGTACATAAC
TGTTGTCCTCTACAAACCACTCACACGGTGAACCTAAAACCCAAATCCAACCAATGCCAC
ATTGTCTTCCTTTTTTT*CTTCTTAAATCTGTCAATTCTGTGAGAACTTTTGTACTTTGA
TCATAGTGAGTGCACAACATTTCTGAGTCTAAAAACCTTTTTCGTGCCTTGTTGGTGCTG
TATGTAGTACAGAGCTTCTCAATGTAACAAAGAAAAACCTTATCTGCTGGCAATCAGACA
CTTTATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FQ39TF U 1
AF RS1AI31JQ C 460
AF RS1AI31TF U 469
AF RS1FQ39JQ C 295
BS 1 566 RS1FQ39TF
BS 567 567 RS1AI31TF
BS 568 662 RS1FQ39TF
BS 663 663 RS1AI31TF
BS 664 725 RS1FQ39TF
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BS 731 751 RS1FQ39TF
BS 752 929 RS1AI31TF
BS 930 1028 RS1FQ39JQ

RD RS1FQ39TF 754 0 0
GGAAGACGGCGATGCCACGTCATCTTCGGCGATTACGAAGGCCGGCGATCCTTACTCCCA
CACTCGTCAACGTCGTCCTTCCTCAGAATCTATGAGCAGTTCTCCTCCGGGAAGCCCAGC
TCGATCTCCTTCTCCTTTCTTATTCGCTCCTCAGGTTCCAGTGTCTCCATTGCAGAGGAC
AAACGCCCCTCCTTCGCCTAATAAAATCCAATGGAACCAATCTCAAAGAATTTTTGATAT
TCCGGAAGAGCAAGGGATCCCTATTATCATTACATGGAACCAGGGAGGTAATGATGTGGC
AGTGGAAGGATCTTGGGACAACTGGAGATCAAGGAAGAAGCTGGAGAAATCTGGAAAAGA
CCACTCAATTCTCTTTGTCCTTCCATCTGGCATATACCACTACAAGGTGATCGTCGACGG
TGAATGCAAATACATCCCAGATTTGCCCTTTGTATCAGACGAAATGGGCAATGTCTTCAA
CATTCTCGATGTTCATAACTTTGTGCCAGAAAACCCAGAAAGCATAGCTGAGTTTGAGGC
GCCTCCTTCACCTGATCATAGCTACGTACAAGCCCTCCCAACAGCAGAGGATTTCACAAA
AGATCCACTGGCGGTGCCACCTCAGCTTCGTCTAACACTTGTGGACACTAGTGACGAAAC
AG*CAAAGCCACAAAGCCTCAGCATGTGGTGCTTAACCATGTGTTCATAGAGCAAGGGTG
GAGTC*TCA*TCCATCGTAGCTTTGGGTTTA
CTC

QA 1 751 1 751
DS 

RD RS1AI31JQ 471 0 0
G
GAAATGGGCAATGTCTTTAACATTCTCGATGTTCATAACTTTGTGCCAGAAAACCCAGAA
AGCATAGCTGAGTTTGAGGCGCCTCCTTCACCTGATCATAGCTACGGACAAGCCCTCCCA
ACAGCAGAGGATTTCACAAAAGATCCACTGGCGGTGCCACCTCAGCTTCGTCTAACACTT
GTGGACACTAGTGACGAAACAGGCAAAGCCACAAAGCCTCAGCATGTGGTGCTTAACCAT
GTGTTCATAGAGCAAGGGTGGAGTCCTCAATCCATCGTAGCTTTGGGTTTAACTCACAGG
TTCGAGTCTAAGTACATAACTGTTGTCCTCTACAAACCACTCACACGGTGAACCTAAAAC
CCAAATCCAACCAATGCCACATTGTCTTCCTTTTTTT*CTTCTTAAATCTGTCAATTCTG
TGAGAACTTTTGTACTTTGATCATAGTGAGTGCACAACATTTCTGAGTC
C

QA 2 470 2 470
DS 

RD RS1AI31TF 462 0 0
CAATGTCTTTAACATTCTCGATGTTCATAACTTTGTGCCAGAAAACCCAGAAAGCATAGC
TGAGTTTGAGGCGCCTCCTTCACCTGATCATAGCTACGGACAAGCCCTCCCAACAGCAGA
GGATTTCACAAAAGATCCACTGGCGGTGCCACCTCAGCTTCGTCTAACACTTGTGGACAC
TAGTGACGAAACAGGCAAAGCCACAAAGCCTCAGCATGTGGTGCTTAACCATGTGTTCAT
AGAGCAAGGGTGGAGTCCTCAATCCATCGTAGCTTTGGGTTTAACTCACAGGTTCGAGTC
TAAGTACATAACTGTTGTCCTCTACAAACCACTCACACGGTGAACCTAAAACCCAAATCC
AACCAATGCCACATTGTCTTCCTTTTTTT*CTTCTTAAATCTGTCAATTCTGTGAGAACT
TTTGTACTTTGATCATAGTGAGTGCACAACATTTCTGAGTC
C

QA 1 461 1 461
DS 

RD RS1FQ39JQ 734 0 0
TGTGGCAGTGGAAGGATCTTGGGACAACTGGAGATCAAGGAAGAAGCTGGAGAAATCTGG
AAAAGACCACTCAATTCTCTTTGTCCTTCCATCTGGCATATACCACTACAAGGTGATCGT
CGACGGTGAATGCAAATACATCCCAGATTTGCCCTTTGTATCAGACGAAATGGGCAATGT
CTTCAACATTCTCGATGTTCATAACTTTGTGCCAGAAAACCCAGAAAGCATAGCTGAGTT
TGAGGCGCCTCCTTCACCTGATCATAGCTACGTACAAGCCCTCCCAACAGCAGAGGATTT
CACAAAAGATCCACTGGCGGTGCCACCTCAGCTTCGTTTAACACTTGTGGACACTAGTGA
CGAAACAGGCAAAGCCACAAAGCCTCAGCATGTGGTGCTTAACCATGTGTTCATAGAGCA
AGGGTGGAGTCCTCAATCCATCGTAGCTTTGGGTTTAACTCACAGGTTCGAGTCTAAGTA
CATAACTGTTGTCCTCTACAAACCACTCACACGGTGAACCTAAAACCCAAATCCAACCAA
TGCCACATTGTCTTCCTTTTTTTTCTTCTTAAATCTGTCAATTCTGTGAGAACTTTTGTA
CTTTGATCATAGTGAGTGCACAACATTTTTGAGTCTAAAAACCTTTTTCGTGCCTTGTTG
GTGCTGTATGTAGTACAGAGCTTCTCAATGTAACAAAGAAAAACCTTATCTGCTGGCAAT
CAGACACTTTATGC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 4

CO CL2191Contig1 591 4 1 U
GGAAGGCTCTCTGGATCAAAGTCAACGATGAGTGGTGGTACAGTGGCACTGCACAGTGTG
TTCGTCTACGGCAGCCTCATGGCGGACGACGTCGTTCGTCTGCTCCTCAACCGCGTCCCT
TCCACAGCCTCCGCGACCCTTCCTGATTTCCATGGATTCAGCATCAAAGGACGTGTTTAC
CCCGCGATTCTACCAGCTCAAGCCGATAAAGTCTCTGGCAAGGTACTGTTTGGGATCACA
GATGATGAACTTTACATTTTAGATGAGTTTGAAGATATCGAGTATGAAAGAGGCAACGTC
CATGTTTTTCTTACAGATAGCTCAGAGAAACTGGAAACAAAGACATACATCTGGGCCAAC
AAAGATGATCCTGATCTCTACGGTACATGGGATTTCGAGGAATGGAAGCAAGTTCACATG
GAAGGTTCCTTGAAGATGACTAAAGAGTCTGCACAAGAGATGAAGTTCCCAGAATCATCT
GAGACATGATTTGAGTCATTAGATGAGATTCGGATCTTGAAATGGAAAACGCTGGAGTTG
GGTTGATATATTTTTCTTCATGAATACAATACATATTGTGTTAAGGAATAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 

AF RS1EO27TF U 1
AF RS1FZ79TF U 1
AF RS1EO27JQ C 101
AF RS1FZ79JQ C 104
BS 1 591 RS1EO27TF

RD RS1EO27TF 591 0 0
GGAAGGCTCTCTGGATCAAAGTCAACGATGAGTGGTGGTACAGTGGCACTGCACAGTGTG
TTCGTCTACGGCAGCCTCATGGCGGACGACGTCGTTCGTCTGCTCCTCAACCGCGTCCCT
TCCACAGCCTCCGCGACCCTTCCTGATTTCCATGGATTCAGCATCAAAGGACGTGTTTAC
CCCGCGATTCTACCAGCTCAAGCCGATAAAGTCTCTGGCAAGGTACTGTTTGGGATCACA
GATGATGAACTTTACATTTTAGATGAGTTTGAAGATATCGAGTATGAAAGAGGCAACGTC
CATGTTTTTCTTACAGATAGCTCAGAGAAACTGGAAACAAAGACATACATCTGGGCCAAC
AAAGATGATCCTGATCTCTACGGTACATGGGATTTCGAGGAATGGAAGCAAGTTCACATG
GAAGGTTCCTTGAAGATGACTAAAGAGTCTGCACAAGAGATGAAGTTCCCAGAATCATCT
GAGACATGATTTGAGTCATTAGATGAGATTCGGATCTTGAAATGGAAAACGCTGGAGTTG
GGTTGATATATTTTTCTTCATGAATACAATACATATTGTGTTAAGGAATAA

QA 1 591 1 591
DS 

RD RS1FZ79TF 591 0 0
GGAAGGCTCTCTGGATCAAAGTCAACGATGAGTGGTGGTACAGTGGCACTGCACAGTGTG
TTCGTCTACGGCAGCCTCATGGCGGACGACGTCGTTCGTCTGCTCCTCAACCGCGTCCCT
TCCACAGCCTCCGCGACCCTTCCTGATTTCCATGGATTCAGCATCAAAGGACGTGTTTAC
CCCGCGATTCTACCAGCTCAAGCCGATAAAGTCTCTGGCAAGGTACTGTTTGGGATCACA
GATGATGAACTTTACATTTTAGATGAGTTTGAAGATATCGAGTATGAAAGAGGCAACGTC
CATGTTTTTCTTACAGATAGCTCAGAGAAACTGGAAACAAAGACATACATCTGGGCCAAC
AAAGATGATCCTGATCTCTACGGTACATGGGATTTCGAGGAATGGAAGCAAGTTCACATG
GAAGGTTCCTTGAAGATGACTAAAGAGTCTGCACAAGAGATGAAGTTCCCAGAATCATCT
GAGACATGATTTGAGTCATTAGATGAGATTCGGATCTTGAAATGGAAAACGCTGGAGTTG
GGTTGATATATTTTTCTTCATGAATACAATACATATTGTGTTAAAGAATAA

QA 1 591 1 591
DS 

RD RS1EO27JQ 491 0 0
TGC
TCCTCAACCGCGTCCCTTCCACAGCCTCCGCGACCCTTCCTGATTTCCATGGATTCAGCA
TCAAAGGACGTGTTTACCCCGCGATTCTACCAGCTCAAGCCGATAAAGTTTCTGGCAAGG
TACTGTTTGGGATCACAGATGATGAACTTTACATTTTAGATGAGTTTGAAGATATCGAGT
ATGAAAGAGGCAACGTCCATGTTTTTCTTACAGATAGCTCAGAGAAACTGGAAACAAAGA
CATACATCTGGGCCAACAAAGATGATCCTGATCTTTACGGTACATGGGATTTCGAGGAAT
GGAAGCAAGTTCACATGGAAGGTTCCTTGAAGATGACTAAAGAGTCTGCACAAGAGATGA
AGTTCCCAGAATCATTTGAGACATGATTTGAGTCATTAGATGAGATTCGGATCTTGAAAT
GGAAAACGCTGGAGTTGGGTTGATATATTTTTCTTCATGAATACAATACATATTGTGTTA
AGGAATAA

QA 4 491 4 491
DS 

RD RS1FZ79JQ 488 0 0
TCCTCAACCGCGTCCCTTCCACAGCCTCCGCGACCCTTCCTGATTTCCATGGATTCAGCA
TCAAAGGACGTGTTTACCCCGCGATTCTACCAGCTCAAGCCGATAAAGTTTCTGGCAAGG
TACTGTTTGGGATCACAGATGATGAACTTTACATTTTAGATGAGTTTGAAGATATCGAGT
ATGAAAGAGGCAACGTCCATGTTTTTCTTACAGATAGCTCAGAGAAACTGGAAACAAAGA
CATACATCTGGGCCAACAAAGATGATCCTGATCTTTACGGTACATGGGATTTCGAGGAAT
GGAAGCAAGTTCACATGGAAGGTTCCTTGAAGATGACTAAAGAGTCTGCACAAGAGATGA
AGTTCCCAGAATCATTTGAGACATGATTTGAGTCATTAGATGAGATTCGGATCTTGAAAT
GGAAAACGCTGGAGTTGGGTTGATATATTTTTCTTCATGAATACAATACATATTGTGTTA
AGGAATAA

QA 1 488 1 488
DS 



AS 2 4

CO CL2192Contig1 874 2 6 U
GATTCTCTACCGCACTCAATACCCTCGTCTCTTCTGGTGCTGATGCTCAGCTCTTCTTTT
GGACCGCTGACACATGGGAAAAGAAGAAATCTTCAGCGATCTCACTACCACCTGGAAAAG
CACCGGTGGGTGACACACGTTTCCAGTTCCACAACGATCAAATCCATCTGTTGGTTTCAC
ACGAGACGCAGCTCGCCATTTACGATGCTACAAAGATGGAATGTATACATAAGCGGGTGC
CACAAGAAGCTCTCTCTTCGCCCATTACCTCTGCATCTTACTCATGCAACAGCCAGCTGG
TTTACGCATCATTCTCTGATGGAAACATTGCCGTCTTTGATGCTGATTCCTTGAGACTCA
GGTGTCGCATTGCTCCATCTGCCTACATGCCTCAACCAACACCCAACAGTGCACCGATCA
TTCCACAAGTGATCACAACACATCCACAAGAACCGAATCAGTTAGCCGTTGGACTGTCTG
ACGGTTCAGTTAAAGTGATTGAGCCATCTGAAGCTTCTAGAAGATGGGGCGTGGGGGTTG
CAGGTAATGCAGATAAAGCAGGGACTGAGAATGGACGGCCATCGAGTTCATCGGCAGCTA
ATAATAATAACTCAAGTTCAGATCATCAGATGCAAAGGTAAGAAGAAAAGGAAAACAGTT
GCTGTCAGTTAAAAGTTGGTTTACAGAGTTTATTTTGGGTTGTAAAGTTGTGATAGCTTG
TACCTGTTTTTTTTTTTGTAAGTTAGATCCTTTAAATTAAATCAGTAGGGCTTATTAACA
GTTTTTTTTTTTTTTTAATTTGGTGTTTGTTGGCGCTCTACTCTTGAATGTACACCTTTT
AATATATGGCTTTGAGTGATCATACAATTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CL69TF U 1
AF RS1CL69JQ C 320
BS 1 736 RS1CL69TF
BS 737 737 RS1CL69JQ
BS 738 769 RS1CL69TF
BS 770 770 RS1CL69JQ
BS 771 794 RS1CL69TF
BS 795 874 RS1CL69JQ

RD RS1CL69TF 804 0 0
GATTCTCTACCGCACTCAATACCCTCGTCTCTTCTGGTGCTGATGCTCAGCTCTTCTTTT
GGACCGCTGACACATGGGAAAAGAAGAAATCTTCAGCGATCTCACTACCACCTGGAAAAG
CACCGGTGGGTGACACACGTTTCCAGTTCCACAACGATCAAATCCATCTGTTGGTTTCAC
ACGAGACGCAGCTCGCCATTTACGATGCTACAAAGATGGAATGTATACATAAGCGGGTGC
CACAAGAAGCTCTCTCTTCGCCCATTACCTCTGCATCTTACTCATGCAACAGCCAGCTGG
TTTACGCATCATTCTCTGATGGAAACATTGCCGTCTTTGATGCTGATTCCTTGAGACTCA
GGTGTCGCATTGCTCCATCTGCCTACATGCCTCAACCAACACCCAACAGTGCACCGATCA
TTCCACAAGTGATCACAACACATCCACAAGAACCGAATCAGTTAGCCGTTGGACTGTCTG
ACGGTTCAGTTAAAGTGATTGAGCCATCTGAAGCTTCTAGAAGATGGGGCGTGGGGGTTG
CAGGTAATGCAGATAAAGCAGGGACTGAGAATGGACGGCCATCGAGTTCATCGGCAGCTA
ATAATAATAACTCAAGTTCAGATCATCAGATGCAAAGGTAAGAAGAAAAGGAAAACAGTT
GCTGTCAGTTAAAAGTTGGTTTACAGAGTTTATTTTGGGTTGTAAAGTTGTGATAGCTTG
TACCTGTTTTTTTTTT*GTAAGTTAGATCCTTTAAATTAAATCAGTAGG*CTTATTAACA
GTTTTTTTTTTTTT
AATTTGGTGT

QA 1 794 1 794
DS 

RD RS1CL69JQ 555 0 0
TGGAAACATTGCCGTCTTTGATGCTGATTCCTTGAGACTCAGGTGTCGCATTGCTCCATC
TGCCTACATGCCTCAACCAACACCCAACAGTGCACCGATCATTCCACAAGTGATCACAAC
ACATCCACAAGAACCGAATCAGTTAGCCGTTGGACTGTCTGACGGTTCAGTTAAAGTGAT
TGAGCCATTTGAAGCTTTTAGAAGATGGGGCGTGGGGGTTGCAGGTAATGCAGATAAAGC
AGGGACTGAGAATGGACGGCCATCGAGTTCATCGGCAGCTAATAATAATAACTCAAGTTC
AGATCATCAGATGCAAAGGTAAGAAGAAAAGGAAAACAGTTGCTGTCAGTTAAAAGTTGG
TTTACAGAGTTTATTTTGGGTTGTAAAGTTGTGATAGCTTGTACCTGTTTTTTTTTTTGT
AAGTTAGATCCTTTAAATTAAATCAGTAGGGCTTATTAACAGTTTTTTTTTTTTTTTAAT
TTGGTGTTTGTTGGCGCTCTACTCTTGAATGTACACCTTTTAATATATGGCTTTGAGTGA
TCATACAATTGTTCC

QA 1 555 1 555
DS 



CO CL2192Contig2 546 2 1 U
GGAATAATTGTATGATCACTCAAAGCCATATATTAAAAGGTGTACATTCAAGAGTAGAGC
GCCAACAAACACCAAATAAAAAAAAAAACTGTTAACCCCTACTGATTTAATTTAAAGGAT
CTAATTTACAAAAAAAAAAACAGGTACAAGCTATCACAACTTTACAACCCAAAATAAACT
CTGTAAACCAACTTTTAACTGACAGCAACTGTTTTCCTTTTCTTCTTACCTTTGCATCTG
ATGATCTGAACTTGAGATATTATTATTAGCTGCCGATGAACTCGATGGCCGTCCATTCTC
AGTCCCTGCTTTATCTGCATTACCTGCAACCCCTACGCCCCTCTTCTAGAAGCTTCAAAT
GGCTCAATAACTTTAACTGAACCATCAGACAGTCCAACGGCTAACTGATTCGGTTCTTGC
GGATGTGTTGTGATCACTTGTGGAATGATCGGTGCACTGTTCGGTGTTGGCTGAGGCATG
TAAGCAGATGGAGCAATGCGACACCTCAGTCTCAAGGAATCAGCATCAAAGACAGCAATG
TTTCCA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1H539JQB U 1
AF RS1GW95JQ U 1
BS 1 546 RS1GW95JQ

RD RS1H539JQB 390 0 0
GGAATAATTGTATGATCACTCAAAGCCATATATTAAAAGGTGTACATTCAAGAGTAGAGC
GCCAACAAACACCAAATAAAAAAAAAAACTGTTAACCCCTACTGATTTAATTTAAAGGAT
CTAATTTACAAAAAAAAAAACAGGTACAAGCTATCACAACTTTACAACCCAAAATAAACT
CTGTAAACCAACTTTTAACTGACAGCAACTGTTTTCCTTTTCTTCTTACCTTTGCATCTG
ATGATCTGAACTTGAGATATTATTATTAGCTGCCGATGAACTCGATGGCCGTCCATTCTC
AGTCCCTGCTTTATCTGCATTACCTGCAACCCCTACGCCCCTCTTCTAGAAGCTTCAAAT
GGCTCAATAACTTTAACTGAACC
ATCACAC

QA 1 383 1 383
DS 

RD RS1GW95JQ 546 0 0
GGAATAATTGTATGATCACTCAAAGCCATATATTAAAAGGTGTACATTCAAGAGTAGAGC
GCCAACAAACACCAAATAAAAAAAAAAACTGTTAACCCCTACTGATTTAATTTAAAGGAT
CTAATTTACAAAAAAAAAAACAGGTACAAGCTATCACAACTTTACAACCCAAAATAAACT
CTGTAAACCAACTTTTAACTGACAGCAACTGTTTTCCTTTTCTTCTTACCTTTGCATCTG
ATGATCTGAACTTGAGATATTATTATTAGCTGCCGATGAACTCGATGGCCGTCCATTCTC
AGTCCCTGCTTTATCTGCATTACCTGCAACCCCTACGCCCCTCTTCTAGAAGCTTCAAAT
GGCTCAATAACTTTAACTGAACCATCAGACAGTCCAACGGCTAACTGATTCGGTTCTTGC
GGATGTGTTGTGATCACTTGTGGAATGATCGGTGCACTGTTCGGTGTTGGCTGAGGCATG
TAAGCAGATGGAGCAATGCGACACCTCAGTCTCAAGGAATCAGCATCAAAGACAGCAATG
TTTCCA

QA 1 546 1 546
DS 



AS 1 4

CO CL2193Contig1 1574 4 14 U
GGAACCAACTTTTGCGGAAGCACGTGAGTCTCTTAGGGTTCGTTTCGACCATACCGAAAA
CGGAGGAGGCGACAGTCTTGAGCTCTGAACAAAATCTAATCCAGTTTGTTTTTCGATTCC
GGAATCAGCAAACATGGCACCCAGAAAGAAGTCACCAAACATGGTTTGGGTTGTGAAATC
GAAACAACCAGCGAAAACGACAGAACCCTCAACGGACAAGAAGAAGACATCATCAGTCTC
GTCTCTTCTCTCAGATAGCGTTTCGAAACTGCATCTGTCTTCAAAAGACCACACATCACC
ACCCGACTGGTCCAATCTCCCCGAGGAGCTACTTCACATCATCTCCTCGAAGCTAGAAGA
CCGTTTCGATTTCATCCACGCCCGCTCCGTTTGCCGCCCGTGGCGATCCATCTTTCCCTA
CCCTTCTTCGTCGCCACGCACAACCTATTCACTTCCTTCGTTCCGCAAGTTCCCTCGCAG
AGTAACTGGAGCCTTCTGCACCCTCGAGAGGTTCCCCGTCTTCCTCTTCAGACTCCGGTC
TTCTCCCGACAACGCATCCCCTTCTCAGTTCTTCGTTGGAGGAGGAAGACCAGATAACCA
GACCCCAAGATCTGATCCAACCTTGTTGAACATTGCTGACTATCAGATCATCCCTCTGGG
ATACATGTGCAGAATGGTCGGTTACGATCCAAACTCATTGGATACCAGCTACAGAGCCGT
GGCTTTTCTTGAGGTAAACGAGGAGAATGGAGAGTTCGTTGTTCTCATCGGTTACGCTCA
TGAGATATTGGCATTGAGAAGCACTGAGATGAGGTGGAGTCGTGTTGACGACTGCTCGAG
AGCTGACTGCAGTGATATAGTAACTTTCAGAGGAAAATTCTACGCAGTCTTCATCAACGG
GGACGTATTCGCCATCGATCCGTATACTCTGAAAACCACTCCACTGAGGCCACCGAATAT
TCCGGGATGCGGGAGATGCAATTACCTCGTCCCGTACGGCGACGACGACGAACTTTACCT
TGTCGAGAGAATCATCGTTCGTAACCAAGTGTTGAGTTTCACCAAGCTGACGTGTAGAGT
GAGCGTGCTGGATGTGGAGGCTGGTGACTGGGTGGTGGTGAGTGATTTGGGAGACCGTGT
GCTGTTGGTTGGAAAACCGGGGAACAGCTCTGGGAACGGGTCGTGCTCGGCGAAGGAGCT
TCCTGAGGGTTGTGGTGTGAGTGGGGGCTCGATGGTGTTCATCAATGAGATATTCGATGA
GACTTTTCCTTATAAGTATGGAGTGGATACGGGGAACCCTGAAGACGACTTGAATGTTTG
GAGATGTTCGAGAGAGACTCGTGTGTCGATCCTCAACAAGTCTCCGATGGTGTCTCTCCA
GATCGAGCGGGCTGAGCCGTGATATATTTATTACCTGAGACATTTGTTGGCTTTGTTTTC
GTTATTTCCCTTCTGATTTCGATTTCAAGTAAAATGGTTTGTCTTGTGAACTCTTGGCCG
TATTTTTGATACTTATGTGAAGTTTACTATTGAAATGTAAATGTCAAACCGGAATCAAAG
AATTAAAACCGACT


BQ
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CCCTTCTTCGTCGCCACGCACAACCTATTCACTTCCTTCGTTCCGCAAGTTCCCTCGCAG
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TTCTCCCGACAACGCATCCCCTTCTCAGTTCTTCGTTGGAGGAGGAAGACCAGATAACCA
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ATACATGTGCAGAATGGTCGGTTACGATCCAAACTCATTGGATACCAGCTACAGAGCCGT
GGCTTTTCTTGAGG
AAA

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ACGACAGAACCCTCAACGGACAAGAAGAAGACATCATCAGTCTCGTCTCTTCTCTCAGAT
AGCGTTTCGAAACTGCATCTGTCTTCAAAAGACCACACATCACCACCCGACTGGTCCAAT
CTCCCCGAGGAGCTACTTCACATCATCTCCTCGAAGCTAGAAGACCGTTTCGATTTCATC
CACGCCCGCTCCGTTTGCCGCCCGTGGCGATCCATCTTTCCCTACCCTTCTTCGTCGCCA
CGCACAACCTATTCACTTCCTTCGTTCCGCAAGTTCCCTCGCAGAGTAACTGGAGCCTTC
TGCACCCTCGAGAGGTTCCCCGTCTTCCTCTTCAGACTCCGGTCTTCTCCCGACAACGCA
TCCCCTTCTCAGTTCTTCGTTGGAGGAGGAAGACCAGATAACCAGACCCCAAGATCTGAT
CCAACCTTTTTGAACATTGCTGACTATCAGATCATCCCTCTGGGATACATGTGCAGAATG
GTCGGTTACGATCCAAACTCATTGGATACCAGCTACAGAGCCGTGGCTTTTCTTGAGGTA
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AGAAGCACTGAGATG

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ATATTGGCATTGAGAAGCACTGAGATGAGGTGGAGTCGTGTTGACGACTGCTCGAGAGCT
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GTATTCGCCATCGATCCGTATACTCTGAAAACCACTCCACTGAGGCCACCGAATATTCCG
GGATGCGGGAGATGCAATTACCTCTTCCCGTACGGCGACGACGACGAACTTTACCTTGTC
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GTGCTGGATGTGGAGGCTGGTGACTGGGTGGTGGTGAGTGATTTGGGAGGCCGTGTGCTG
TTGGTTGGAAAACCGGGGAACAGCTCTGGGAACGGGTCGTGCTCGGCGAAGGAGCTTCCT
GAGGGTTGTGGTGTGAGTGGGGGCTCGATGGTGTTCATCAATGAGATATTCGATGAGACT
TTTCCTTATAAGTATGGAGTGGATACGGGGAACCCTGAAGACGACTTGAATGTTTGGAGA
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GAGCGGGGTGAGCCGTGATATATTTATTACCTGAGACATTTGTTGGCTTTGTTTTCGTTA
TTTCCCTTCTGATTTCGATTTCAAGTAAAATGGTTTGTCTTGTGAACTCTTGGCCGTATT
TTTGATACTT

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DS 

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CGTACGGTGATGACGACGAACTTTACCTTGTCGAGAGAATCATCGTTCGTAACCAAGTGT
TGAGTTTCACCAAGCTGACGTGTAGAGTGAGCGTGCTGGATGTGGAGGCTGGTGACTGGG
TGGTGGTGAGTGATTTGGGAGACCGTGTGCTGTTGGTTGGAAAACCGGGGAACAGCTCTG
GGAACGGGTCGTGCTCGGCGAAGGAGCTTCCTGAGGGTTGTGGTGTGAGTGGGGGCTCGA
TGGTGTTCATCAATGAGATATTCGATGAGACTTTTCCTTATAAGTATGGAGTGGATACGG
GGAACCCTGAAGACGACTTGAATGTTTGGAGATGTTCGAGAGAGACTCGTGTGTCGATCC
TCAACAAGTCTCCGATGGTGTCTCTCCAGATCGAGCGGGCTGAGCCGTGATATATTTATT
ACCTGAGACATTTGTTGGCTTTGTTTTCGTTATTTCCCTTCTGATTTCGATTTCAAGTAA
AATGGTTTGTCTTGTGAACTCTTGGCCGTATTTTTGATACTTATGTGAAGTTTACTATTG
AAATGTAAATGTCAAACCGGAATCAAAGAATTAAAACCGACT

QA 1 642 1 642
DS 



AS 2 4

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CACGAAATTAAAAGATATTCCATACGAAAATGTTGTCTAACTTAAACCTGATAACCATTT
CTGGAAGATTCAAAATGTATTCAAGTATCGAAGCAAGAGAGTAGTAAGTAACAAACAAAA
AAAAGAAAGCAGATAAGAGGAGAAAACTTAAAAGAGAGATGTTCCTTTTCCCTTCTTGTC
TCCACCAATCTCGAAGTGCTTGCACCTCTTAATCGAGTGTTGAGAGAAATGCTTGCATGT
TTGGCACTGGAGCCTCAAGACAATCTTCTTGGTTGTCTTGGCCTTCTTGTGGAAGACGGG
CTTGGTCTGACCACCGTAACCGGATTGTTTGCGGTCATAGCGACGTTTACCCTGGGCAGC
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CTTGTTCTTGCAGTAAGTCTTCTTAGTCTTTGGAATGTTCACCATTTTCGCTCTTAGGTG
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BQ
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AF RS1AN45TF C 1
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DS 

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AAAGCTCGAGCCGTCGTTGTCCTCCGCTCC

QA 1 330 1 330
DS 



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AAGAGGTGCAAGCACTTCGAGATTGGTGGAGACAAGAAGGGAAAGGGAACATCTCTCTTT
TAAGTTTTCTCCTCTTATCTGCTTTCTTTTTTTGTTTGTTACTTACTACTCTCTTGCTTC
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TTTCGTATGGAATATCTTTTAATTTCGTGAACCTTTGTTTCTACACCCGTTTGATGTTTA
AATTTCACAACTACTTGTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1AW30JQ C 1
AF RS1AW30TF U 1
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AATTTCACAACTACTTGTTT

QA 1 560 1 560
DS 

RD RS1AW30TF 560 0 0
GGAGCGGAGGACAACGACGGCTCGAGCTTCCACCTAAGAGCGAAAATGGTGAACATTCCA
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AAACAATCCGGTTACGGTGGTCAGACCAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGGCCAAGACAACC
AAGAAGATTGTCTTGAGGCTCCAGTGCCAAACATGCAAGCATTTCTCTCAACACTCGATT
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TAAGTTTTCTCCTCTTATCTGCTTTCTTTTTTTGTTTGTTACTTACTACTCTCTTGCTTC
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TTTCGTATGGAATATCTTTTAATTTCGTGAACCTTTGTTTCTACACCCGTTTGATGTTTA
AATTTCACAACTACTTGT
CT

QA 1 558 1 558
DS 



AS 2 4

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TCTTGTATTGTATAGCCATTATACGTTGGATAGTTTTCCTGAAGTTCTTTGGATCATTAG
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C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1D785JQ U 103
AF RS1B122TF C 1
BS 1 102 RS1B122TF
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RD RS1D785JQ 503 0 0
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TTACCCCACATGACCACACATCCGCGTGCTTGCCATCATATTCTTTACGGGAAAGAACTT
CAGGTGC
TATGTATGCTGGAGTT

QA 1 487 1 487
DS 

RD RS1B122TF 721 0 0
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CTTCTTCCTCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCACTTCAGCTTCAACGT
CCTCTTCCTCTTCTTCCTCAGCACCTGATCCTAAGCTTTTGATGACACTTGAAGAAGAAG
CTGGATTCCTAGCTTCTCCAACTATCTTCATTATGTCCTCTACGCTTTGAAGAGAATAGC
TCGTGTTGTCTCTCTTGTAATACACTGCTTGAGCAGACTCCAGAAGCTCCTTTGGCAGAT
TCTTTGTGTACCACGGATGATTCTTGATCTCCTTAAGAGTGATTCTCTTAGCGGGGTTAG
TGACGAATATGCGAGAGAGAAGGTGTCTGCATTCCTGAGATATGTGAACGTAGTCCGGAA
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CATCCGCGTGCTTGCCATCATATTCTTTACGGGAAAGAACTTCAGGTGCCTCATAAGGCG
AGCCACACCGAAGTTTCCAGTCCCCAGATCCTTCACAACCTCGTACTTGTCCATCTCCAA
ATCAGTGATCGAATATTATTAGATACGAACGAGCAGGATCACGGATTAGATTCTTCTCTC
C

QA 1 721 1 721
DS 



CO CL2195Contig2 864 2 4 U
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TGGCAAGCACGCGGATGTGTGGTCATGTGGTGTAACCCTATATGTGATGCTGGTTGGGGC
TTACCCATTTGAGGACCCTAATGATCCAAAGAACTTCAGAAAACTATCCAACGTATAATG
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TCTCGCATTTTCGTCACTAACCCCGCTAAGAGATCACGCTTAAGAGATCAGAATCATCCG
TGGTACACAAAGATCTGCCAAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1D785TF U 1
AF RS1AK68TF U 32
BS 1 124 RS1D785TF
BS 125 125 RS1AK68TF
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BS 608 864 RS1AK68TF

RD RS1D785TF 607 0 0
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ATCGACTGTTGGAACTCCAGCATACATAGCACCTGAAGTTCTTTCCCGTAAAGAATATGA
TGGCAAG

QA 1 607 1 607
DS 

RD RS1AK68TF 833 0 0
CT
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GGATCTGGGGACTGGAAACTTCGGTGTGGCTCGCCTTCTTAGGCACAAGGAAACCAATGA
GCTCGTCGCCATGAAATACATCGAGAGAGGCCGAAAGATAGATGAGAACGTGGCTAGAGA
GATTATCAATCACAGATCACTTAAGCATCCTAATATCATCCGCTTCAAGGAGGTGATTCT
GACCCCTACTCATCTTGCCATTGTGATGGAGTATGCTTCTGGAGGAGAGCTCTTTGAGAG
GATCTGCACTGCCGGTAGATTCAGTGAAGCTGAGGCTAAGTACTTCTTTCAACAGCTGAT
TTGTGGCGTCGACTACTGCCACTCCTTGCAAATATGCCACAGAGATCTGAAGCTTGAGAA
CACACTGCTTGATGGTAGCCCTGCTCCGCTTTTGAAAATCTGTGATTTTGGTTGCTCCAA
GTCATCTATACTACATTCCATTCCTAAATCGACTG****AACTCCAGCATACATAGCACC
TGAAGTTCTTTCCCGTAAAGAATATGATGGCAAGCACGCGGATGTGTGGTCATGTGGTGT
AACCCTATATGTGATGCTGGTTGGGGCTTACCCATTTGAGGACCCTAATGATCCAAAGAA
CTTCAGAAAACTATCCAACGTATAATGGCTATACAATACAAGATTCCGGACTACGTTCAC
ATATCTCACGAATGCAAACACCTTCTCTCTCGCATTTTCGTCACTAACCCCGCTAAGAGA
TCACGCTTAAGAGATCAGAATCATCCGTGGTACACAAAGATCTGCCAAAGA

QA 3 833 3 833
DS 



AS 1 4

CO CL2196Contig1 1102 4 4 U
GGATTGTTATATATGTCAAAAAAGAAATTGATGCCCGAGAGAGAAGCGAAGAAAGAACCC
TAGAGAAGAAAAAGTCGCCGCCTCTTTGTTTGCCGCTCCGGTGGGTGGTGTTTCTCACCG
TCGCCGGGAGCGGACCCATCTCGTCTTTCTGTTTGGATTTGTGGTTTAATTTAGGCAACT
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GTCTCAGCGCCCTTAAACTTGTTCTCAGATGGAGACTCGGAGGTGAAGGATTCTTAGGCT
TCTGGTGGTCTTGAGCTAGTCTGTGGAGCTCGGCGGTGGTGAAGTTTGAGGGTCAAGCAC
TGTGTCGAAGCTCTCCTGTTTCTGGCCACAACTTGGATGTTCTGTTCTTATTATTGTGTT
CTGAGGCGTTGACGGTTTGGGTTCTTACGGAGAAGAGGCCAGGGTGAAACTGAAGGAGTC
GGCTAGGAGTTTCGAGGTGTGTCGCTTCGCGGTGGGTGAAGTGGGGTTTGTGCGCTGAAG
CTCGTCTTTTGCAACTGTGTTGTGTCTCCTCTGATCTATTGCTAGGAGATAGATGTTATT
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GCTTCGTGTGGAGTAATGGTGCGTATGAGGCGCGTGGAGAGCCGATCAAGGTCCAATGGC
TAGTTTTAGTTGGGATTGAAAGGTGTATTCAGCAACGGTTAAGGATTCTAACCTCTCTCG
ATTCAGTTTTATACGTTGGTGATGTTCGTGTGGTTCCAGTCTATCTCCCTGATCTTTCAT
TCTGGTGTTATTTGTGGATGAGTCCTGGTTACGTAAGCTCGTCCTTGAGTGTATGGTGGT
GTTCTCTTCTCCGGTAGTGATCTGGCCTTCTTTGCTTTAGTTTATGTTAGCTTCCTCGTT
GTTGTTTTTACTCTCGATTCCGAGGGGTGTTGTTTACCTCGTCGGCTTATGATTCCGGAA
CAGATTTGTTCTTTTGCCGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BG04TF U 38
AF RS1CC55TF U 46
AF RS1CJ44TF U 1
AF RS1CC55JQ C 380
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RD RS1BG04TF 556 0 0
G
GAGAGAAGCGAAGAAAGAACCCTAGAGAAGAAAAAGTCGCCGCCTCTTTGTTTGCCGCTC
CGGTGGGTGGTGTTTCTCACCGTCGCCGGGAGCGGACCCATCTCGTCTTTCTGTTTGGAT
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AAAAAGGTTTCGTTGATTCTCTGTCTCAGCGCCCTTAAACTTGTTCTCAGATGGAGACTC
GGAGGTGAAGGATTCTTAGGCTTCTGGTGGTCTTGAGCTAGTCTGTGGAGCTCGGCGGTG
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GTTCTGTTCTTATTATTGTGTTCTGAGGCGTTGACGGTTTGGGTTCTTACGGAGAAGAGG
CCAGGGTGAAACTGAAGGAGTCGGCTAGGAGTTTCGAGGTGTGTCGCTTCGCGGTGGGTG
AAGTGGGGTTTGTGCGCTGAAGCTCGTCTTTTGCAACTGTGTTGTGTCTCCTCTGATCTA
TTGCTAG
GAGATAGA

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DS 

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GG
GAAGAAAGAACCCTAGAGAAGAAAAAGTCGCCGCCTCTTTGTTTGCCGCTCCGGTGGGTG
GTGTTTCTCACCGTCGCCGGGAGCGGACCCATCTCGTCTTTCTGTTTGGATTTGTGGTTT
AATTTAGGCAACTTGACATCCTTTTGTTGTGGTATCAGATCTGAGTCTAGGAAAAAGGTT
TCGTTGATTCTCTGTCTCAGCGCCCTTAAACTTGTTCTCAGATGGAGACTCGGAGGTGAA
GGATTCTTAGGCTTCTGGTGGTCTTGAGCTAGTCTGTGGAGCTCGGCGGTGGTGAAGTTT
GAGGGTCAAGCACTGTGTCGAAGCTCTCCTGTTTCTGGCCACAACTTGGATGTTCTGTTC
TTATTATTGTGTTCTGAGGCGTTGACGGTTTGGGTTCTTACGGAGAAGAGGCCAGGGTGA
AACTGAAGGAGTCGGCTAGGAGTTTCGAGGTGTGTCGCTTCGCGGTGGGTGAGTGGGGGT
TTGTGCGCTGAAGCTCGTCTTTTGCAACTGTGTTGTGTCTCCTCTGATCTATTGCTAG*A
GATAGATGTTATTGTCCTGGAGCGA*TGCTCCAAGTTTGGTCGATT*CCACTGATTTGGT
CGT
ATGTCTGATTTAGA

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DS 

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GGATTGTTATATATGTCAAAAAAGAAATTGATGCCCGAGAGAGAAGCGAAGAAAGAACCC
TAGAGAAGAAAAAGTCGCCGCCTCTTTGTTTGCCGCTCCGGTGGGTGGTGTTTCTCACCG
TCGCCGGGAGCGGACCCATCTCGTCTTTCTGTTTGGATTTGTGGTTTAATTTAGGCAACT
TGACATCCTTTTGTTGTGGTATCAGATCTGAGTCTAGGAAAAAGGTTTCGTTGATTCTCT
GTCTCAGCGCCCTTAAACTTGTTCTCAGATGGAGACTCGGAGGTGAAGGATTCTTAGGCT
TCTGGTGGTCTTGAGCTAGTCTGTGGAGCTCGGCGGTGGTGAAGTTTGAGGGTCAAGCAC
TGTGTCGAAGCTCTCCTGTTTCTGGCCACAACTTGGATGTTCTGTTCTTATTATTGTGTT
CTGAGGCGTTGACGGTTTGGGTTCTTACGGAGAAGAGGCCAGGGTGAAACTGAAGGAGTC
GGCTAGGAGTTTCGAGGTGTGTCGCTTCGCGGTGGGTGAAGTGGGGTTTGTGCGCTGAAG
CTCGTCTTTTGCAACTGTGTTGTGTCTCCTCTGATCTATTGCTAGGAGATAGATGTTATT
GTCCTGGAGCGAATGCTCCAAGTTTGGTCGATTTCCACTGATTTGGTCGTTATTGTCCTG
GATTTAGAGTGGTTTTTATTCAGTTACCGGCTATGCGA*TAAGACGGGA
G

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1CC55JQ 723 0 0
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GGTTCTTACGGAGAAGAGGCCAGGGTGAAACTGAAGGAGTCGGCTAGGAGTTTCGAGGTG
TGTCGCTTCGCGGTGGGTGAAGTGGGGTTTGTGCGCTGAAGCTCGTCTTTTGCAACTGTG
TTGTGTCTCCTCTGATCTATTGCTAGGAGATAGATGTTATTGTCCTGGAGCGAATGCTCC
AAGTTTGGTCGATTTCCACTGATTTGGTCGTTATTGTCCTGGATTTAGAGTGGTTTTTAT
TCAGTTCCCGGCTATGCGAATAAGACGGGAAGCTGTTATAGGCTTCGTGTGGAGTAATGG
TGCGTATGAGGCGCGTGGAGAGCCGATCAAGGTCCAATGGCTAGTTTTAGTTGGGATTGA
AAGGTGTATTCAGCAACGGTTAAGGATTCTAACCTCTCTCGATTCAGTTTTATACGTTGG
TGATGTTCGTGTGGTTCCAGTCTATCTCCCTGATCTTTCATTCTGGTGTTATTTGTGGAT
GAGTCCTGGTTACGTAAGCTCGTCCTTGAGTGTATGGTGGTGTTCTCTTCTCCGGTAGTG
ATCTGGCCTTCTTTGCTTTAGTTTATGTTAGCTTCCTCGTTGTTGTTTTTACTCTCGATT
CCGAGGGGTGTTGTTTACCTCGTCGGCTTATGATTCCGGAACAGATTTGTTCTTTTGCCG
GCC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 4

CO CL2197Contig1 1141 4 12 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGCCCTCACAG
GCAACCTTTTCAGAGAGCAACTATAATCAATAAGTCTCTCTTCTTAGATTTGTATAACAG
TTTTTTTTGTTTAAAATAGATGTGAGTATTATGTGGTAACTAGTTTTTGGTTTCAATGAA
TATACCAAACATGTAATGTAGATTAGCTGTTCGACAAAATGTTTGACCGAAGGATTTGAA
GTAGTTGTGTTTGTTGTTACTCGACTTTTTGCTCGTGTTCTTGTTTCTCATATGTAATGT
AGATTACGTGTTGGACAAAATGTCTGATTAAAGACACTACTGAGTAAATTGTATGACATA
ATTAACACAAGAATTGAGATGGTGAGCTAATTGGATGTTGGTTATCTGTTAAAAAGAATT
GATATTTTTAACAATGCTTATCTGTTCAGGTGGTGTGTAGATCAATTTAATAAATAGGTA
GACGCATTATTGGCTGGTTTGTCAATGAAACCTGCATATATTTTATAACTTGGATTGAAA
GTAACTGTGTTCCACGATTGGACCAAGTAACACAACCGGGAAAGTAACCCTCCTTCTCTT
CACATTTCAGCGTCAAACCTCACATAACGCTGAGTTGAATAGTATAAGACCGGCCTAGAG
CCTAATTTCAAGTATCAATGAGTACAGGTGGTGCATTTGGAGGAAACAGAGGATTGAGAC
CTTTCCCACCAGAAAAGGGCATCTTCCCTTTGGATCACTTACACGAATGTGATACGGAGA
AGAAAGAGTATCTTGGCTGTCTCAAATCTTCAGCCAACAAATCTGAGCAGTGTAGGCATC
TCTCAAAGAAATATCTCCAGTGTCGAATGGCCAAGAACTTGATGGCGAAGCAGGATATGT
CTGAACTTGGATTCATTGCGGTTAAAGAACTTGATTCCACTGGAGATATTAATAATGAGT
AGTATCCAACGTTGGAGGTGGACAAAACTTTTTTTTGTGTGCAAAGAAGCAAGAGGAGTG
TACGTATATCGTTCTGTGTCTGTACACTTTTTAGGCTTCAGAATGCTCGTTTTTGGACCT
GATAAACACGACCTCTACAAATCTGTAAACGTTTTAACATTATTATCTTACAGAAATACA
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 

AF RS1A277TF U 58
AF RS1A277TV U 1
AF RS1A277JQ C 217
AF RS1A277TR C 284
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BS 920 1141 RS1A277JQ

RD RS1A277TF 809 0 0
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GAAGTAGTTGTGTTTGTTGTTACTCGACTTTTTGCTCGTGTTCTTGTTTCTCATATGTAA
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ATTGATATTTTTAACAATGCTTATCTGTTCAGGTGGTGTGTAGATCAATTTAATAAATAG
GTAGACGCATTATTGGCTGGTTTGTCAATGAAACCTGCATATATTTTATAACTTGGATTG
AAAGTAACTGTGTTCCACGATTGGACCAAGTAACACAACCGGGAAAGTAACCCTCCTTCT
CTTCACATTTCAGCGTCAAACCTCACATAACGCTGAGTTGAATAGTATAAGACCGGCCTA
GAGCCTAATTTCAAGTATCAATGAGTACAGGTGGTGCATTTGGAGGAAACAGAGGATTGA
GACCTTTCCCACCAGAAAAGGGCATCTTCCCTTTGGATCACTTACACGAATGTGATACGG
AGAAGAAAGAGTATCTTGGCTGTCTCAAATCTTCAGCCAACAAATCTGAGCAGTGTAG*C
ATCTCTCAAAGAAATATCTCCAGTGTCGA

QA 1 809 1 809
DS 

RD RS1A277TV 919 0 0
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GCAACCTTTTCAGAGAGCAACTATAATCAATAAGTCTCTCTTCTTAGATTTGTATAACAG
TTTTTTTTGTTTAAAATAGATGTGAGTATTATGTGGTAACTAGTTTTTGGTTTCAATGAA
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GTAGTTGTGTTTGTTGTTACTCGACTTTTTGCTCGTGTTCTTGTTTCTCATATGTAATGT
AGATTACGTGTTGGACAAAATGTCTGATTAAAGACACTACTGAGTAAATTGTATGACATA
ATTAACACAAGAATTGAGATGGTGAGCTAATTGGATGTTGGTTATCTGTTAAAAAGAATT
GATATTTTTAACAATGCTTATCTGTTCAGGTGGTGTGTAGATCAATTTAATAAATAGGTA
GACGCATTATTGGCTGGTTTGTCAATGAAACCTGCATATATTTTATAACTTGGATTGAAA
GTAACTGTGTTCCACGATTGGACCAAGTAACACAACCGGGAAAGTAACCCTCCTTCTCTT
CACATTTCAGCGTCAAACCTCACATAACGCTGAGTTGAATAGTATAAGACCGGCCTAGAG
CCTAATTTCAAGTATCAATGAGTACAGGTGGTGCATTTGGAGGAAACAGAGGATTGAGAC
CTTTCCCACCAGAAAAGGGCATCTTCCCTTTGGATCACTTACACGAATGTGATACGGAGA
AGAAAGAGTATCTTGGCTGTCTCAAATCTTCAGCCAACAAATCTGAGCAGTGTAG*CATC
TCTCAAG**AATATCTCCAGTGTCGAATGGCCA**GACTTGATGGCGAAGCAG*ATATGT
CTGA*CTTGGATTCATTGC

QA 1 919 1 919
DS 

RD RS1A277JQ 925 0 0
AAATGTTTGACCGAAGGATTTGAAGTAGTTGTGTTTGTTGTTACTCGACTTTTTGCTCGT
GTTCTTGTT*CTCATATGTAATGTAGATTACGTGTTGGACAAAATGTCTGATTAAAGACA
CTACTGAGTAAATTGTATGACATAATTAACACAAGAATTGAGATGGTGAGCTAATTGGAT
GTTGGTTATCTGTTAAAAAGAATTGATATTTTTAACAATGCTTATCTGTTCAGGTGGTGT
GTAGATCAATTTAATAAATAGGTAGACGCATTATTGGCTGGTTTGTCAATGAAACCTGCA
TATATTTTATAACTTGGATTGAAAGTAACTGTGTTCCACGATTGGACCAAGTAACACAAC
CGGGAAAGTAACCCTCCTTCTCTTCACATTTCAGCGTCAAACCTCACATAACGCTGAGTT
GAATAGTATAAGACCGGCCTAGAGCCTAATTTCAAGTATCAATGAGTACAGGTGGTGCAT
TTGGAGGAAACAGAGGATTGAGACCTTTCCCACCAGAAAAGGGCATCTTCCCTTTGGATC
ACTTACACGAATGTGATACGGAGAAGAAAGAGTATCTTGGCTGTCTCAAATCTTCAGCCA
ACAAATCTGAGCAGTGTAGGCATCTCTCAAAGAAATATCTCCAGTGTCGAATGGCCAAGA
ACTTGATGGCGAAGCAGGATATGTCTGAACTTGGATTCATTGCGGTTAAAGAACTTGATT
CCACTGGAGATATTAATAATGAGTAGTATCCAACGTTGGAGGTGGACAAAACTTTTTTTT
GTGTGCAAAGAAGCAAGAGGAGTGTACGTATATCGTTCTGTGTCTGTACACTTTTTAGGC
TTCAGAATGCTCGTTTTTGGACCTGATAAACACGACCTCTACAAATCTGTAAACGTTTTA
ACATTATTATCTTACAGAAATACAC

QA 1 925 1 925
DS 

RD RS1A277TR 858 0 0
T
TTCTCATATGTAATGTAGATTACGTGTTGGACAAAATGTCTGATTAAAGACACTACTGAG
TAAATTGTATGACATAATTAACACAAGAATTGAGATGGTGAGCTAATTGGATGTTGGTTA
TCTGTTAAAAAGAATTGATATTTTTAACAATGCTTATCTGTTCAGGTGGTGTGTAGATCA
ATTTAATAAATAGGTAGACGCATTATTGGCTGGTTTGTCAATGAAACCTGCATATATTTT
ATAACTTGGATTGAAAGTAACTGTGTTCCACGATTGGACCAAGTAACACAACCGGGAAAG
TAACCCTCCTTCTCTTCACATTTCAGCGTCAAACCTCACATAACGCTGAGTTGAATAGTA
TAAGACCGGCCTAGAGCCTAATTTCAAGTATCAATGAGTACAGGTGGTGCATTTGGAGGA
AACAGAGGATTGAGACCTTTCCCACCAGAAAAGGGCATCTTCCCTTTGGATCACTTACAC
GAATGTGATACGGAGAAGAAAGAGTATCTTGGCTGTCTCAAATCTTCAGCCAACAAATCT
GAGCAGTGTAGGCATCTCTCAAAGAAATATCTCCAGTGTCGAATGGCCAAGAACTTGATG
GCGAAGCAGGATATGTCTGAACTTGGATTCATTGCGGTTAAAGAACTTGATTCCACTGGA
GATATTAATAATGAGTAGTATCCAACGTTGGAGGTGGACAAAACTTTTTTTTGTGTGCAA
AGAAGCAAGAGGAGTGTACGTATATCGTTCTGTGTCTGTACACTTTTTAGGCTTCAGAAT
GCTCGTTTTTGGACCTGATAAACACGACCTCTACAAATCTGTAAACGTTTTAACATTATT
ATCTTACAGAAATACAC

QA 2 858 2 858
DS 



AS 1 4

CO CL2198Contig1 719 4 3 U
CAAAAAAACAAATTAAGGAAAATTTAATATTTCATATCAAAAAGGAAGCATTTCAAAAAA
ATCTCCCAAAAGAGTTACAACATGGTATGGCAACAAATAGCCAAGGAAATAAGATGAGTG
TTACATTGATAGAAAGAACCCAAAACCCCAAAACAAAAAAGAAAAAACGAGAAAGTCTGG
AAGATTTGTCTGAGGATTTTGATAATACAACAAAACTGGTGAAGCAAAGCTGGAAAGTTT
TGTAGTCAGCAAAGTATGTGATCTCTCCAGCAAAAAAAATTCTTCACTGCATTTAAAACA
CCCTCGATTTACAGAACTCTAGGGTGTTTAGATGATACGATATGTATTATATATATTAAC
CTTTTGTTATCTTTAGCTCTTAGTGTTTTTTTGGCTCATTGGTTAGTTCTCCTTCAAGAA
AGGATCTGTTGTTCCATTGGGAGGTTCTTCTCTGTTTTCAGAAACGGAAGCGATGCTAAA
GCTGTTGTAGTTATCAGTGCTGCTGCTTCGTGGCTTTCCTGGTCTTGATCGTATGTTGGT
ACCCATTGGAAACGGCTCCTGATCACCAGCATTTGGACCATCTGTGTGGAAAAGAATAGG
CCGGCAACGTTTGTCTTCGTTCATTAAACTCGAATTCTGAAAATGAGCAATGAGAGCTAC
TTTTCCTTGGATTCGAGCATATGTAAGTGTTGCCACCTTCTCGCTGTTAAACTTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1GQ47JQ U 1
AF RS1FZ50JQ U 42
AF RS1GQ47TF C 10
AF RS1FZ50TF C 146
BS 1 576 RS1GQ47JQ
BS 577 630 RS1FZ50JQ
BS 631 719 RS1GQ47TF

RD RS1GQ47JQ 576 0 0
CAAAAAAACAAATTAAGGAAAATTTAATATTTCATATCAAAAAGGAAGCATTTCAAAAAA
ATCTCCCAAAAGAGTTACAACATGGTATGGCAACAAATAGCCAAGGAAATAAGATGAGTG
TTACATTGATAGAAAGAACCCAAAACCCCAAAACAAAAAAGAAAAAACGAGAAAGTCTGG
AAGATTTGTCTGAGGATTTTGATAATACAACAAAACTGGTGAAGCAAAGCTGGAAAGTTT
TGTAGTCAGCAAAGTATGTGATCTCTCCAGCAAAAAAAATTCTTCACTGCATTTAAAACA
CCCTCGATTTACAGAACTCTAGGGTGTTTAGATGATACGATATGTATTATATATATTAAC
CTTTTGTTATCTTTAGCTCTTAGTGTTTTTTTGGCTCATTGGTTAGTTCTCCTTCAAGAA
AGGATCTGTTGTTCCATTGGGAGGTTCTTCTCTGTTTTCAGAAACGGAAGCGATGCTAAA
GCTGTTGTAGTTATCAGTGCTGCTGCTTCGTGGCTTTCCTGGTCTTGATCGTATGTTGGT
ACCCATTGGAAACGGCTCCTGATCACCAGCATTTGG

QA 1 576 1 576
DS 

RD RS1FZ50JQ 589 0 0
AAGGAAGCATTTCAAAAAAATCTCCCAAAAGAGTTACAACATGGTATGGCAACAAATAGC
CAAGGAAATAAAATGAGTGTTACATTGATAGAAAGAACCCAAAACCCCAAAACAAAAAAG
AAAAAACGAGAAAGTCTGGAAGATTTGTCTGAGGATTTTGATAATACAACAAAACTGGTG
AAGCAAAGCTGGAAAGTTTTGTAGTCAGCAAAGTATGTGATCTCTCCAGCAAAAAAAATT
CTTCACTGCATTTAAAACACCCTCGATTTACAGAACTCTAGGGTGTTTAGATGATACGAT
ATGTATTATATATATTAACCTTTTGTTATCTTTAGCTCTTAGTGTTTTTTTGGCTCATTG
GTTAGTTCTCCTTCAAGAAAGGATCTGTTGTTCCATTGGGAGGTTCTTCTCTGTTTTCAA
AAACGGAAGCGATGCTAAAGCTGTTGTAGTTATCAGTGCTGCTGCTTCGTGGCTTTCCTG
GTCTTGATCGTATGTTGGTACCCATTGGAAACGGCTCCTGATCACCAGCATTTGGACCAT
CTGTGTGGAAAAGAATAGGCCGGCAACGTTTGTCTTCGTTCATTAAACT

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1GQ47TF 710 0 0
AAATTAAGGAAAATTTAATATTTCATATCAAAAAGGAAGCATTTCAAAAAAATCTCCCAA
AAGAGTTACAACATGGTATGGCAACAAATAGCCAAGGAAATAAGATGAGTGTTACATTGA
TAGAAAGAACCCAAAACCCCAAAACAAAAAAGAAAAAACGAGAAAGTCTGGAAGATTTGT
CTGAGGATTTTGATAATACAACAAAACTGGTGAAGCAAAGCTGGAAAGTTTTGTAGTCAG
CAAAGTATGTGATCTCTCCAGCAAAAAAAATTCTTCACTGCATTTAAAACACCCTCGATT
TACAGAACTCTAGGGTGTTTAGATGATACGATATGTATTATATATATTAACCTTTTGTTA
TCTTTAGCTCTTAGTGTTTTTTTGGCTCATTGGTTAGTTCTCCTTCAAGAAAGGATCTGT
TGTTCCATTGGGAGGTTCTTCTCTGTTTTCAGAAACGGAAGCGATGCTAAAGCTGTTGTA
GTTATCAGTGCTGCTGCTTCGTGGCTTTCCTGGTCTTGATCGTATGTTGGTACCCATTGG
AAACGGCTCCTGATCACCAGCATTTGGACCATCTGTGTGGAAAAGAATAGGCCGGCAACG
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DS 

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TACAACAAAACTGGTGAAGCAAAGCTGGAAAGTTTTGTAGTCAGCAAAGTATGTGATCTC
TCCAGCAAAAAAAATTCTTCACTGCATTTAAAACACCCTCGATTTACAGAACTCTAGGGT
GTTTAGATGATACGATATGTATTATATATATTAACCTTTTGTTATCTTTAGCTCTTAGTG
TTTTTTTGGCTCATTGGTTAGTTCTCCTTCAAGAAAGGATCTGTTGTTCCATTGGGAGGT
TCTTCTCTGTTTTCAGAAACGGAAGCGATGCTAAAGCTGTTGTAGTTATCAGTGCTGCTG
CTTCGTGGCTTTCCTGGTCTTGATCGTATGTTGGTACCCATTGGAAACGGCTCCTGATCA
CCAGCATTTGGACCATCTGTGTGGAAAAGAATAGGCCGGCAACGTTTGTCTTCGTTCATT
AAACTCGAATTCTGAAAATGAGCAATGAGAGCTACTTTTCCTTGGATTCGAGCATATGTA
AGTGTTGCCACCTTCTCGCTGTTAAACTTCTCCC

QA 1 574 1 574
DS 



AS 1 4

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GAGACCTCGAAGCCTCCGCTTCTTCCACCTACGATCTTCAGCGCAAGCTTGTTCAGGCTG
CTCTCTCCGCCGATTCCTCCGGTGGCGTTCAGTCTTCCTTCTCTCTCGTCTGCCCTACCT
CCGCCGTCTGCCAGGTGATCATTGGCGGTGGTTCTGGAGGAGGATTTGCTGCCGGAGGTG
GTGCAGCGGCTGGAGGAGGTGGTGGTGGTGAGTCCGCCGCGGCTGCTAAGGAGGAAGAGA
AGAAGAAGGAAGAATCTGAAGAGGAGGAAGGCGACTTTGGATTTGATCTCTTTGGTTAAG
ACACAGAGAGAGAAAAAAACATAAAAACTCTTTCCAAGGTGTTGTAGCTTCTGAGGTTTT
TGATCTCAGATTACTTATTTTGCTTTCTCTGTTTTTCATTTTAAAACGGTTTTGAGGTTG
TGCTCTATGATTATGCAATGTCAGAAATGTATGTTTTGTTTCTGGTTA


BQ
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AF RS1GJ96TF U 1
AF RS1AU36JQ C 6
AF RS1GJ96JQ C 232
AF RS1AU36TF U 6
BS 1 31 RS1GJ96TF
BS 32 32 RS1AU36TF
BS 33 346 RS1GJ96TF
BS 347 588 RS1AU36TF

RD RS1GJ96TF 346 0 0
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GAGTATTCACATTCGTTTGCAAAAGCAAAGGCGGAGAATGGACCGCTAAGCAACACGAGG
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CTCTCTCCGCCGATTCCTCCGGTGGCGTTCAGTCTTCCTTCTCTCTCGTCTGCCCTACCT
CCGCCGTCTGCCAGGTGATCATTGGCGGTGGTTCTGGAGGAGGATTTGCTGCCGGAGGTG
GTGCAGCGGCTGGAGGAGGTGGTGGTGGTGAGTCCGCCGCGGCTGC

QA 1 346 1 346
DS 

RD RS1AU36JQ 582 0 0
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TTCACATTCGTTTGCAAAAGCAAAGGCGGAGAATGGACCGCTAAGCAACACGAGGGAGAC
CTCGAAGCCTCCGCTTCTTCCACCTACGATCTTCAGCGCAAGCTTGTTCAGGCTGCTCTC
TCCGCCGATTCCTCCGGTGGCGTTCAGTCTTCCTTCTCTCTCGTCTGCCCTACCTCCGCC
GTCTGCCAGGTGATCATTGGCGGTGGTTCTGGAGGAGGATTTGCTGCCGGAGGTGGTGCA
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AAGGAAGAATCTGAAGAGGAGGAAGGCGACTTTGGATTTGATCTCTTTGGTTAAGACACA
GAGAGAGAAAAAAACATAAAAACTCTTTCCAAGGTGTTGTAGCTTCTGAGGTTTTTGATC
TCAGATTACTTATTTTGCTTTCTCTGTTTTTCATTTTAAAACGGTTTTGAGGTTGTGCTC
TATGATTATGCAATGTCAGAAATGTATGTTTTGTTTCTGGTT

QA 1 582 1 582
DS 

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CCGGAGGTGGTGCAGCGGCTGGAGGAGGTGGTGGTGGTGAGTCCGCCGCGGCTGCTAAGG
AGGAAGAGAAGAAGAAGGAAGAATCTGAAGAGGAGGAAGGGGACTTTGGATTTGATC*CT
TTGGTTAAGACACAGAGAGAGAAAAAAACATAAAAACTCTTTCCAAGGTGTTGTAGCTTT
TGAGGTTTTTGATTTCAGATTATTTATTTTGCTTTTTCTGTTTTTCATTTTAAAACGGTT
TTGAGGTTGTGCTCTATGATTATGCAATGTCAGAA

QA 1 335 1 335
DS 

RD RS1AU36TF 583 0 0
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CTCGAAGCCTCCGCTTCTTCCACCTACGATCTTCAGCGCAAGCTTGTTCAGGCTGCTCTC
TCCGCCGATTCCTCCGGTGGCGTTCAGTCTTCCTTCTCTCTCGTCTGCCCTACCTCCGCC
GTCTGCCAGGTGATCATTGGCGGTGGTTCTGGAGGAGGATTTGCTGCCGGAGGTGGTGCA
GCGGCTGGAGGAGGTGGTGGTGGTGAGTCCGCCGCGGCTGCTAAGGAGGAAGAGAAGAAG
AAGGAAGAATCTGAAGAGGAGGAAGGCGACTTTGGATTTGATCTCTTTGGTTAAGACACA
GAGAGAGAAAAAAACATAAAAACTCTTTCCAAGGTGTTGTAGCTTCTGAGGTTTTTGATC
TCAGATTACTTATTTTGCTTTCTCTGTTTTTCATTTTAAAACGGTTTTGAGGTTGTGCTC
TATGATTATGCAATGTCAGAAATGTATGTTTTGTTTCTGGTTA

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 4

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ATCTTCATCTTTCTAGATTCTTCTCCTCTCCTTCGTCCCTCCGTAGATCGTCAATCAGAT
CAATGGCCGATTCCGCTTTCAAGAAAATCCAAATCCAAAGAGACGACACTACATTTGATG
CGTATGTGGTCGGAAAAGACGACGCACCTGGAATCGTCGTGATTCAAGAATGGTGGGGCG
TTGACTTCGAGATCAAGAACCACGCCATCAAAATCTCACAGCTCCTCGACACCGGTTTCA
AAGCTCTCATCCCCGATTTGTATCGAGGAAAGGTTGGTCTTGACACTGCGGAGGCGCAGC
ATCTGATGGATGGACTTGACTGGCAAGGTGCTGTTAAAGATATCCGTGCTTCTGTTAACT
GGCTTAAGGCTAATGGATCAAAGAAGGTTGGTGTGACTGGGATGTGTATGGGAGGTGCGT
TGGCTATAGCTAGCTCTGTTTTGGTTCCGGAGGTTGATGCTGTTGTTGGGTTTTACGGTA
CTCCTTCCTCTGAGCTTGCGGATGTGGCGCAAGCCAAGGCGCCTGTTCAGGCACATTTTG
GAGAGCTTGATAACTTTGTCGGTTTCTCTGATGTCACGGCAGCTAAGAGTCTCGAAGAGA
AGCTGAAATCGTCTGGAGTGGCGCACGAGGTTCATATTTACGAGGGGAACGGGCACGCGT
TCTTGAACAGGAGTCCTGAAGGAGTGAGCAGAAGGAAGAGCATGGGGCTCTCTGACGAAG
ATGAAGCTGCGGTGGAGCTTGCTTGGTCTCGCTTCACTTCCTGGATGAAACATTACTTGG
CTTAATTAAGCATTATGCTTTTTTCTCTCAGATTGTGTTCTTTGTACGTCCTGAAACGTT
TTGTGATGCCCCGATCGATCTCAAATAAGGATTTCTCCTAAGGACTTGTATCAGAGTCAA
ATAAAGTGGTTTGCTTGTGGGGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1E968TF U 1
AF RS1C762TF U 39
AF RS1E968JQ C 138
AF RS1C762JQ C 615
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BS 728 922 RS1E968JQ
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CAATGGCCGATTCCGCTTTCAAGAAAGTCCAAATCCAAAGAGACGACACTACATTTGATG
CGTATGTGGTCGGAAAAGACGACGCACCTGGAATCGTCGTGATTCAAGAATGGTGGGGCG
TTGACTTCGAGATCAAGAACCACGCCATCAAAATCTCACAGCTCCTCGACACCGGTTTCA
AAGCTCTCATCCCCGATTTGTATCGAGGAAAGGTTGGTCTTGACACTGCGGAGGCGCAGC
ATCTGATGGATGGACTTGACTGGCAAGGTGCTGTTAAAGATATCCGTGCTTCTGTTAACT
GGCTTAAGGCTAATGGATCAAAGAAGGTTGGTGTGACTGGGATGTGTATGGGAGGTGCGT
TGGCTATAGCTAGCTCTGTTTTGGTTCCGGAGGTTGATGCTGTTGTTGGGTTTTACGGTA
CTCCTTCCTCTGAGCTTGCGGATGTGGCGCAAGCCAAGGCGCCTGTTCAGGCACATTTTG
GAGAGCTTGATAACTTTGTCGGTTTCTCTGATGTCACGGCAGCTAAGAGTCTCGAAGAGA
AGCTGAAATCGTCTGGAGTGGCGCA

QA 1 625 1 625
DS 

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GG
CCGTAGATCGTCAATCAGATCAATGGCCGATTCCGCTTTCAAGAAAATCCAAATCCAAAG
AGACGACACTACATTTGATGCGTATGTGGTCGGAAAAGACGACGCACCTGGAATCGTCGT
GATTCAAGAATGGTGGGGCGTTGACTTCGAGATCAAGAACCACGCCATCAAAATCTCACA
GCTCCTCGACACCGGTTTCAAAGCTCTCATCCCCGATTTGTATCGAGGAAAGGTTGGTCT
TGACACTGCGGAGGCGCAGCATCTGATGGATGGACTTGACTGGCAAGGTGCTGTTAAAGA
TATCCGTGCTTCTGTTAACTGGCTTAAGGCTAATGGATCAAAGAAGGTTGGTGTGACTGG
GATGTGTATGGGAGGTGCGTTGGCTATAGCTAGCTCTGTTTTGGTTCCGGAGGTTGATGC
TGTTGTTGGGTTTTACGGTACTCCTTCCTCTGAGCTTGCGGATGTGGCGCAAGCCAAGGC
GCCTGTTCAGGCACATTTTGGAGAGCTTGATAACTTTGTCGGTTTCTCTGATGTCACGGC
AGCTAAGAGTCTCGAAGAGAAGCTGAAATCGTCTGGAGTGGCGCACGAGGTTCATATTTA
CGAGGGGAACGGGCACGCGTTCTTGAACAG*AGTCCTGAAAGAGTGAGCAGAAG*AAGAG
CATGGGGCTCTCTGACGAAGATGAAGC

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DS 

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AACCACGCCATCAAAATCTCACAGCTCCTCGACACCGGTTTCAAAGCTCTCATCCCCGAT
TTGTATCGAGGAAAGGTTGGTCTTGACACTGCGGAGGCGCAGCATCTGATGGATGGACTT
GACTGGCAAGGTGCTGTTAAAGATATCCGTGCTTCTGTTAACTGGCTTAAGGCTAATGGA
TCAAAGAAGGTTGGTGTGACTGGGATGTGTATGGGAGGTGCGTTGGCTATAGCTAGCTCT
GTTTTGGTTCCGGAGGTTGATGCTGTTGTTGGGTTTTACGGTACTCCTTCCTCTGAGCTT
GCGGATGTGGCGCAAGCCAAGGCGCCTGTTCAGGCACATTTTGGAGAGCTTGATAACTTT
GTCGGTTTCTCTGATGTCACGGCAGCTAAGAGTCTCGAAGAGAAGCTGAAATCGTCTGGA
GTGGCGCACGAGGTTCATATTTACGAGGGGAACGGGCACGCGTTCTTGAACAGGAGTCCT
GAAGGAGTGAGCAGAAGGAAGAGCATGGGGCTCTCTGACGAAGATGAAGCTGCGGTGGAG
CTTGCTTGGTCTCGCTTCACTTCCTGGATGAAACATTACTTGGCTTAATTAAGCATTATG
CTTTTTTCTCTCAGATTGTGTTCTTTGTACGTCCTGAAACGTTTTGTGATGCCCCGATCG
ATCTCAAATAAGGATTTCTCCTAAGGACTTGTATCAGAGTCAAATAAAGTGGTTTGCTTG
TGGGG

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DS 

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GGAGTGGCGCCCGAGGTTCATATTTACGAGGGGAACGGGCACGCGTTTTTGAACAGGAGT
CCTGAAGGAGTGAGCAGAAGGAAGAGCATGGGGCTTTCTGACGAAGATGAAGCTGCGGTG
GAGCTTGCTTGGTCTCGCTTCACTTCCTGGATGAAACATTACTTGGCTTAATTAAGCATT
ATGCTTTTTTTTTTCAGATTGTGTTCTTTGTACGTCCTGAAACGTTTTGTGATGCCCCGA
TCGAT*TCAAATAAGGATTTTTCCTAAGGACTTGTATCAGAGTCAAATAAAGTGGTTTGC
TTGTGGGGTTT

QA 1 311 1 311
DS 



AS 1 3

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AAAATCATATTTTTTTTATTAAAGTAAATATTACTCAATGTAAAATCTTCGCTTAGGAAG
CAACCAAAGATTCCAAGAAATGAACAGTTAAAGACACACTCAAAGTGCAGACAGAGAAAA
TAAACAAACTTCAAACACTGAACCCAAATTCTAGCAAATGATGACTTCTGCTTCATATAT
TTGTTACCTCAATTCAATCGAGCCCGACCCGATCTTCCCGAATTCTGTATAGCCTTTTAT
ATCACAAAGGCATATCAAACCATCGAGGAATACAATTAAATCTGTAAAAGTTATACCTAC
CTCAAAACGCTTTTGACCTCTTAACAAATAACCGATGCAGATTGGGCAAAGGTCTCAAAC
TCTTAGAAAAGCTGTGTGTGGACTTGGTAGAAAGACAATTTTTTCATCTGTAATAATTTT
AACAGGTTCCAAAAGAAACACACACGGTAATAAAACTAAGGGGGATCTCACGATTCTACC
TCGCAAAGCTCCAGGCCCCAAAGACAGACAGATTATCTATCTCAAACTAGTACTGGCGAA
CGGGACTTCTCGACACCCTTCTGTGACCACCAGACCTTCCATGAGGAGAACGTGACCTGC
TTCGTTCACGACCCTCTCTCCCACTCCTGGATCTCCTGTCATACGGCTTTCTATGATCTC
TACCGCGGTCACGGTGTCTTTCTCTTTCTCTAGAACCGCTCCTCCTACTCTTGCTTTCCC
TCGGTTTCCTTTTATCATCCGTTTCTTTTCCTCTGACTAGCCTTTCCTCTTCCTTCCCTT
TATCTTTAGCAGCTTTTTGTTCAGCAAGAAAATCTCGGACCATGCCATAGCCAACATGTT
GCTTCCCAGTGATATGAGACTGAGCCCTATCTACAGCATCACTAGACACAAGGAATGAAC
CACAAACCTCACACAGTGCCATCTTCTTCTCATGTACCATCGCTAGTGCCTTCTCATTTG
GACGTTGTAACAGCACTGCCTTCTCAGTATTAAGCGCTTCCACCTTCCTCATAAGCGCTT
CAGCTTCATCAACTTTGCCTTCCTTGCCAAGTGCTTCCACTTGTTCCAGAAGGTTCTTAA
TCTTCTCCTCCAAAACAGATAACTGTTCAGCTTTTTCTGAAGATAGAGTAGGCGGTGGAG
GAGGTTCAACCTCTTGTGAAAGACGTTCCCGTCCACGCCTTACCTTCCTATCAAGATCGT
TCACCAACTTCTCGCAAAACTGAACAAGCTCAGCCTCGAATTTCGGAACATAGGAATCAT
GCCTCGGAGAGTTCTCGAAGCTCTCTTTTAACTTAGGATCATGAATTCTCGAGCATGCTC
CAAGATCACTTTTGGTGTTGACGAAGAGGTCATGAGGACAAAATCGAACCATGTAGAATG
CACAGACCTCTCTATCATCCCACTTAATCTCCTTGAACCCTCTTCTCTCTTCGTCCGTCA
GATTACGAGCAGCACCCATAAGTTCGTCCAGCAGAGCTCTTTGAGCGTCCATAGCGGATT
ACGAATTCGAGAGAGGATGACGAACAGAACAAAACAAGTGTGATGATGATTAGGGTTGGT
TTCCTTCACCACCAGATTGGCAAAGCCCCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1B921JQ U 405
AF RS1B921TF C 834
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CAACCAAAGATTCCAAGAAATGAACAGTTAAAGACACACTCAAAGTGCAGACAGAGAAAA
TAAACAAACTTCAAACACTGAACCCAAATTCTAGCAAATGATGACTTCTGCTTCATATAT
TTGTTACCTCAATTCAATCGAGCCCGACCCGATCTTCCCGAATTCTGTATAGCCTTTTAT
ATCACAAAGGCATATCAAACCATCGAGGAATACAATTAAATCTGTAAAAGTTATACCTAC
CTCAAAACGCTTTTGACCTCTTAACAAATAACCGATGCAGATTGGGCAAAGGTCTCAAAC
TCTTAGAAAAGCTGTGTGTGGACTTGGTAGAAAGACAATTTTTTCATCTGTAATAATTTT
AACAGGTTCCAAAAGAAACACACACGGTAATAAAACTAAGGGGGATCTCACGATTCTACC
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CGGGACTTCTCGACACCCTTCTGTGACCACCAGACCTTCCATGAGGAGAACGTGACCTGC
TTCGTTCACGACCCTCTCTCCCACTCCTGGATCTCCTGTCATACGGCTTTCTATGATCTC
TACCGCGGTCACGGTGTCTTTCTCTTTCTCTAGAACCGCTCCTCCTACTCTTGCTTTCCC
TCGGTTTCCTTTTATCATCCGTTTCTTTTCCTCTGACTAGCCTTTCCTCTTCCTTCCCTT
TATCTTTAGCA

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DS 

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GG
TCTGTAATAATTTTAACAGGTTCCAAAAGAAACACACACGGTAATAAAACTAAGGGGGAT
CTCACGATTCTACCTCGCAAAGCTCCAGGCCCCAAAGACAGACAGATTATCTATCTCAAA
CTAGTACTGGCGAACGGGACTTCTCGACACCCTTCTGTGACCACCAGACCTTCCATGAGG
AGAACGTGACCTGCTTCGTTCACGACCCTCTCTCCCACTCCTGGATCTCCTGTCATACGG
CTTTCTATGATCTCTACCGCGGTCACGGTGTCTTTCTCTTTCTCTAGAACCGCTCCTCCT
ACTCTTGCTTTCCCTCGGTTTCCTTTTATCATCCGTTTCTTTTCCTCTGACTAGCCTTTC
CTCTTCCTTCCCTTTATCTTTAGCAGCTTTTTGTTCAGCAAGAAAATCTCGGACCATGCC
ATAGCCAACATGTTGCTTCCCAGTGATATGAGACTGAGCCCTATCTACAGCATCACTAGA
CACAAGGAATGAACCACAAACCTCACACAGTGCCATCTTCTTCTCATGTACCATCGCTAG
TGCCTTCTCATTTGGACGTTGTAACAGCACTGCCTTCTCAGTATTAAGCGCTTCCACCTT
CCTCATAAGCGCTTCAGCTTCATCAACTTTGCCTTCCTTGCCAAGTGCTTCCACTTGTTC
CAGAAGGTTCTTAATCTTCTCCTCCAAAACAGATAACTGTTCAGCTTTTTCTGAAGATAG
AGTAGGCGGTGGAGGAGGTTCAACCTCTTGTGAAAGACGTTCCCGTCCACGCCTTACCTT
CCTATCA*GATCGTTCACCAACTTCTCGCAAA
CTGACAGCTCA

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AATGAACCACAAACCTCACACAGTGCCATCTTCTTCTCATGTACCATCGCTAGTGCTTTC
TCATTTGGACGTTGTAACAGCACTGCCTTCTCAGTATTAAGCGCTTCCACCTTCCTCATA
AGCGCTTCAGCTTCATCAACTTTGCCTTCCTTGCCAAGTGCTTCCACTTGTTCCAGAAGG
TTCTTAATCTTCTCCTCCAAAACAGATAACTGTTCAGCTTTTTCTGAGGATAGAGTAGGC
GGTGGAGGAGGTTCAACCTCTTGTGAAAGACGTTCCCGTCCACGCCTTACCTTCCTATCA
AGATCGTTCACCAACTTCTCGCAAAACTGAACAAGCTCAGCCTCGAATTTCGGAACATAG
GAATCATGCCTCGGAGAGTTCTCGAAGCTCTCTTTTAACTTAGGATCATGAATTCTCGAG
CATGCTCCAAGATCACTTTTGGTGTTGACGAAGAGGTCATGAGGACAAAATCGAACCATG
TAGAATGCACAGACCTCTCTATCATCCCACTTAATCTCCTTGAACCCTCTTCTCTCTTCG
TCCGTCAGATTACGAGCAGCACCCATAAGTTCGTCCAGCAGAGCTCTTTGAGCGTCCATA
GCGGATTACGAATTCGAGAGAGGATGACGAACAGAACAAAACAAGTGTGATGATGATTAG
GGTTGGTTTCCTTCACCACCAGATTGGCAAAGCCCCC

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DS 



AS 1 4

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GAGGGAAGAAGATCGGTGTTTTCCATATCGGAGAGGTCTTTCGTTTTCTCTGCTGATCAG
CTTCGGATTGAATACATCCCAAGATGGATCCTAGCCAGGCACCAGTTGAAAACTATGCGA
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TATCCGCTCTCTTCTTCAACAGCTTTGTCATCATCTTTGTCGTGACTGTTCTTCTTGCTG
CCCTTGACTTCTGGGTGGTTAAGAATGTGAGTGGCCGTATACTGGTTGGTCTCAGGTGGT
GGAATGAGATCAATGACTTGGGAGAAAGTGTCTGGAAATTTGAGTCTCTTGACCAGGAGT
CCTTGGCTCGGATGAACAAGAAAGACTCGTGGCTTTTCTGGTGGTCGCTTTACCTTGCAG
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TGGTTGTCGGCGTTTGCTTGTCCCTCAACGTGGCTAATATCATCGGCTTCACAAAGTGCA
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AGTCCACGGTACAATCTGCCTTCACACTTGTTTGAGAATAAAAAATGTTTTAGTGAGAGC
AAAGACAGTGTACAAAGAAGATTGTCGCCATAAGCAACACCATGTTTTTTTGACTGATTG
TTTTTCTCCACTATATATTAAGGGATTAAGGGATTTGAGAAAGAGGCTTATCATATTCGT
CTTTTTGACATGTATATTACATTTTCGACTTACCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AY30TF U 39
AF RS1GR78TF U 24
AF RS1DX05TF U 1
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GG
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TCGTTTTCTCTGCTGATCAGCTTCGGATTGAATACGTCCCAAGATGGATCCTAGCCAGGC
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RD RS1GR78TF 497 0 0
G
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TTGTCATCATCTTTGTCGTGACTGTTCTTCTTGCTGCCCTTGACTTCTGGGTGGTTAAGA
ATGTGAGTGGCCGTATACTGGTTGGTCTCAGGTGGTGGAATGAGATCAATGACTTGGGAG
AAAGTGTCTGGAAATTTGAGTCTCTTGACCAGGAGTCCTTGGCTCGGATGAACAAGAAAG
ACTCGTGGCTTTTCTGGTGGTCGCTTTACCTTGCAGCAGTTGCGTGGTTGATCCTAGGGG
CATTTTCAC
TGAAAAG

QA 2 490 2 490
DS 

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TATCCGCTCTCTTCTTCAACAGCTCTGTCATCATCTTTGTCGTGACTGTTCTTCTTGCTG
CCCTTGACTTCTGGGTGGTTAAGAATGTGAGTGGCCGTATACTGGTTGGTCTCAGGTGGT
GGAATGAGATCAATGACTTGGGAGAAAGTGTCTGGAAATTTGAGTCTCTTGACCAGGAGT
CCTTGGCTCGGATGAACAAGAAAGACTCGTGGCTTTTCTGGTGGACGCTTTACCTTGCAG
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TGGTTGTCGGCGTTTGCTTGTCCCTCAACGTGGCTAATATCATCGGCTTCACAAAGTGCA
AGAAAGATGCAAAGAAACAGTTTCAGCAGTTTGCCTCACAGACA
TCGCAT

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DS 

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TTGACCAGGAGTCCTTGGCTCGGATGAACAAGAAAGACTCGTGGCTTTTCTGGTGGTCGC
TTTACCTTGCAGCAGTTGCGTGGTTGATCCTAGGGGCATTTTCACTGATAAGGTTTCAGG
CCGACTACCTGCTGGTTGTCGGCGTTTGCTTGTCCCTCAACGTGGCTAATATCATCGGCT
TCACAAAGTGCAAGAAAGATGCAAAGAAACAGTTTCAGCAGTTTGCCTCACAGACAATCG
CATCAAGGTTCCAGTCCACGGTACAATCTGCCTTCACACTTGTTTGAGAATAAAAAATGT
TTTAGTGAGAGCAAAGACAGTGTACAAAGAAGATTGTCGCCATAAGCAACACCATGTTTT
TTTGACTGATTGTTTTTCTCCACTATATATTAAGGGATTAAGGGATTTGAGAAAGAGGCT
TATCATATTCGTCTTTTTGACATGTATATTACATTTTCGACTTACCCT

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 2

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CGGTGTGAAAGAGACACAAAGTCAAAATCTTTTCGAAAGTTAAGATAATGTTTCATGTTT
AAATTCCTTTTTTTCTTTCTTTTGACTTCACTTCACATAGAGAGTGAGAGTCACTGTGGT
TACTACTTTTATTAAAACAACTTTTAGGACACTAGTAAAGATCTTGACATCCTCCTTTTT
GCTTTGTCAGTGTTGGTTTCACCCTATCTTCACCGCGTAGTTTTCACGGAGCGTCCAACA
GAGACTCCACGTAAGAGTTCAGCAAACCCGAAGAAGCTCAATTCCCCATCTGTGTGTGTG
TCTTATCCAATCATGTAGAACCGAGTGTACTCTGTTATAACTGGTCCAACCCCAAGCTCA
GAAGCGAGTTCTCCAGTAACGATAGCTCTGTTTCAATTCATTTGAAATAGCTCATAAGCA
TGACGTATGCTCTCTTCCCAACATACAAAGAGACAAGGTAAGCATGACGTATGCTCTCTG
CCCAAACTTTTTTATCTTCAGAACCCTCCAGCAATAGGACTGTACAGTTATCAAGATATA
TAATGAAGCTAGTAGAGGTTGTCTCAAGTTCCAATTAATTAGTTATTGTGATCAATGGAC
TAGTTAACTTAATCGCTACATGAATATCCAACAGCTATTTCTGACTTTTGCATCCATCTC
TGAGTTATAAACTCATCCAATCTTAAGAGTGACTCAAGGAGACAACAATATCGTTCACTG
GTGATGATGAAAGAATCAGAAGTTGCTTGGTTCGTTAGTCAATGACTTCTTCTTTTGCAG
CGCTCTTGATTTTTGCCTTAGAAAGAAATGAGGAACATTACCCTATTTAAAGAACCTCAT
A


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 

AF RS1H475JQB U 1
AF RS1BS59JQ U 84
BS 1 134 RS1H475JQB
BS 135 135 RS1BS59JQ
BS 136 174 RS1H475JQB
BS 175 175 RS1BS59JQ
BS 176 422 RS1H475JQB
BS 423 423 RS1BS59JQ
BS 424 501 RS1H475JQB
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BS 503 529 RS1H475JQB
BS 530 530 RS1BS59JQ
BS 531 614 RS1H475JQB
BS 615 615 RS1BS59JQ
BS 616 726 RS1H475JQB
BS 727 841 RS1BS59JQ

RD RS1H475JQB 730 0 0
CGGTGTGAAAGAGACACAAAGTCAAAATCTTTTCGAAAGTTAAGATAATGTTTCATGTTT
AAATTCCTTTTTTTCTTTCTTTTGACTTCACTTCACATAGAGAGTGAGAGTCACTGTGGT
TACTACTTTTATTACAACAACTTTTAGGACACTAGTAAAGATCTTGACATCCTCTTTTTT
GCTTTGTCAGTGTTGGTTTCACCCTATCTTCACCGCGTAGTTTTCACGGAGCGTCCAACA
GAGACTCCACGTAAGAGTTCAGCAAACCCGAAGAAGCTCAATTCCCCATCTGTGTGTGTG
TCTTATCCAATCATGTAGAACCGAGTGTACTCTGTTATAACTGGTCCAACCCCAAGCTCA
GAAGCGAGTTCTCCAGTAACGATAGCTCTGTTTCAATTCATTTGAAATAGCTCATAAGCA
TGGCGTATGCTCTCTTCCCAACATACAAAGAGACAAGGTAAGCATGACGTATGCTCTCTG
CCCAAACTTTTTTATCTTCAGCACCCTCCAGCAATAGGACTGTACAGTTCTCAAGATATA
TAATGAAGCTAGTAGAGGTTGTCTCAAGTTCCAATTAATTAGTTATTGTGATCAATGGAC
TAGTTAACTTAATCTCTACATGAATATCCAACAGCTATTTCTGACTTTTGCATCCATCTC
TGAGTTATAAACTCATCCAATCTTAAGAGTGACTCAAGGAGACAACAATATCGTTCACTG
GTGATG
GTGA

QA 1 726 1 726
DS 

RD RS1BS59JQ 758 0 0
GACTTCACTTCACATAGAGAGTGAGAGTCACTGTGGTTACTATTTTTATTAAAACAACTT
TTAGTACACTAGTAAAGATCTTGACATCCTCCTTTT*GCTTTGTCAGTGTTGGTTTCACG
CTATCTTCACCGCGTAGTTTTCACGGAGCGTCCAACAGTGACTCCATGTAAGAGTTCAGC
AAACCCGAAGAAGCTCAATTCCCCATCTGTGTGTGTGTCTTATCCAATCATGTAGAACCG
AGTGTACTCTGTTATAACTGGTCCAACCCCAAGTTCAGAAGCGAGTTCTTCAGTAACGAT
AGCTCTGTTTCCATTCATTTGAAATAGCTCATAAGCATGACGTATGCTCTCTTCCCAACA
TACAAAGAGACAAGGTAAG*******TATGCTCTCTGCCCAAACTTTTTTATCTTCAGAA
CCCTCCAGCAATAGGACTGTACAGTTATCAAGATATATAATGAAGCTAGTAGAGGTTGTC
TCAAGTTCCAATTAATTAGTTATTGTGATCAATGGACTAGTTAACTTAATCGCTACATGA
ATATCCAATAGCTATTTCTGACTTTTGCATCCATCTCTGAGTTATAAACTCATCCAATCT
TAAGAGTGACTCAAGGAGACAACAATATCGTTCACTGGTGATGATGAAAGAATCAGAAGT
TGCTTGGTTCGTTAGTCAATGACTTCTTCTTTTGCAGCGCTCTTGATTTTTGCCTTAGAA
AGAAATGAGGAACATTACCCTATTTAAAGAACCTCATA

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 3

CO CL2204Contig1 981 3 13 U
GGCCTCTTCCTCAGATCAAAACATCAGCTTCGTCCCTCGTTTCCTCAAAGTCGTCGAAAA
TGCTGGGTAGGCTCGCTGCGAAGCGTCTCCTCGAGATCCGTCAAGTTCTCCGTCAACCAC
AATCTTCTTCTCAGGCGTCTCGAAGCTTCTCGACAGCCTTGAACTACCACCTGGATTCTC
CTGATAACAAACCGGATCTTCCATGGGAGTTTTCTGAGGCTAACAAATCTAAGGTTAAGG
AGATACTCTCTTACTATCCCTCAAACTACAAGCAGTCCGCAGTGATTCCTCTTCTTGATC
TTGCCCAACAACAGCATGGAGGCTGGCTCCCTGTTTCAGCAATGAATGCGGTTGCTAAAG
TTATAGAAGTGGCTCCTATCCGTGTTTATGAAGTTGCAACGTTTTACTCCATGTTCAACA
GGGCAAAGGTTGGAAAGTACCACCTGTTAGTTTGTGGCACAACACCTTGCATGATCCGTG
GTTCACGAGAGATCGAATCAGCTTTGCTAGACCATTTGGGTGTGAAGCGCGGTGAAGTCA
CAAAGGATGGTTTGTTCTCTGTTGGGGAGATGGAATGCATGGGATGCTGTGTTAATGCGC
CCATGATCACTGTGGCAGATTACTCCAATGGATCAGAAGGATATACATATAACTATTTCG
AAGATGTTACACCTGAGAAAGTTGTAGAGATTGTTGAAAAGCTGAGAAAAGGAGAAAAGC
CACCGCATGGAACTCAAAATCCAAAGAGGATCAAGTGCGGACCTGACGGAGGAAACACAA
CACTGCTTGGCGAGCCAAAGCCACCACAGTTCCGTGATCTCGACGCTTGCTAAGTTGAGT
TCTTATACGCCGACGTTTTCTTATCTTTTGAAGATCAATAACGCAAAAGGCTATAGTGAT
GTTTGAAGCCTATAGCATCAAACTGAGATTGCATACTCTTTGTAGTTTGTCTTCTTGGCT
TTAGAATTTCGCCCCCATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1DX37TF U 1
AF RS1C224TF U 5
AF RS1C224JQ C 303
BS 1 21 RS1DX37TF
BS 22 22 RS1C224TF
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BS 35 35 RS1C224TF
BS 36 120 RS1DX37TF
BS 121 121 RS1C224TF
BS 122 277 RS1DX37TF
BS 278 278 RS1C224TF
BS 279 316 RS1DX37TF
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BS 318 360 RS1DX37TF
BS 361 632 RS1C224TF
BS 633 981 RS1C224JQ

RD RS1DX37TF 364 0 0
GGCCTCTTCCTCAGATCAAAA*ATCAGCTTCGTCTCTCGTTTCCTCAAAGTCGTCGAAAA
TGCTGGGTAGGCTCGCTGCGAAGCGTCTCCTCGAGATCCGTCAAGTTCTCCGTCAACCAC
CATCTTCTTCTCAGGCGTCTCGAAGCTTCTCGACAGCCTTGAACTACCACCTGGATTCTC
CTGATAACAAACCGGATCTTCCATGGGAGTTTTCTGAGGCTAACAAATCTAAGGTTAAGG
AGATACTCTCTTACTATCCCTCAAACTACAAGCAGTCTGCAGTGATTCCTCTTCTTGATC
TTGCCCAACAACAGCAGGGAGGCTGGCTCCCTGTTTCAGCAATGAATGCGGTTGCTAAAG
CTAT

QA 1 360 1 360
DS 

RD RS1C224TF 628 0 0
GGA
TCCTCAGATCAAAACATCAGCTTCGTCCCTCGTTTCCTCAAAGTCGTCGAAAATGCTGGG
TAGGCTCGCTGCGAAGCGTCTCCTCGAGATCCGTCAAGTTCTCCGTCAACCACAATCTTC
TTCTCAGGCGTCTCGAAGCTTCTCGACAGCCTTGAACTACCACCTGGATTCTCCTGATAA
CAAACCGGATCTTCCTTGGGAGTTTTCTGAGGCTAACAAATCTAAGGTTAAGGAGATACT
CTCTTACTATCCCTCAAACTACAAGCAGTCCGCAGTGATTCCTCTTCTTGATCTTGCCCA
ACAACAGCATGGAGGCTGGCTCCCTGTTTCAGCAATGAATGCGGTTGCTAAAGTTATAGA
AGTGGCTCCTATCCGTGTTTATGAAGTTGCAACGTTTTACTCCATGTTCAACAGGGCAAA
GGTTGGAAAGTACCACCTGTTAGTTTGTGGCACAACACCTTGCATGATCCGTGGTTCACG
AGAGATCGAATCAGCTTTGCTAGACCATTTGGGTGTGAAGCGCGGTGAAGTCACAAAGGA
TGGTTTGTTCTCTGTTGGGGAGATGGAATGCATGGGATGCTGTGTTAATGCGCCCATGAT
CACTGTGGCAGATTACTCCAATGGA

QA 4 628 4 628
DS 

RD RS1C224JQ 679 0 0
GCCCAACAACAGCATGGAGGCTGGCTCCCTGTTTCAGCAATGAATGCGGTTGCTAAAGTT
ATAGAAGTGGCTCCTATCCGTGTTTATGAAGTTGCAACGTTTTACTCCATGTTCAACAGG
GCAAAGGTTGGAAAGTACCACCTGTTAGTTTGTGGCACAACACCTTGCATGATCCGTGGT
TCACGAGAGATCGAATCAGCTTTGCTAGACCATTTGGGTGTGAAGCGCGGTGAAGTCACA
AAGGATGGTTTGTTCTCTGTTGGGGAGATGGAATGCATGGGATGCTGTGTTAATGCGCCC
ATGATCACTGTGGCAGATTACTCCAATGGATCAGAAGGATATACATATAACTATTTCGAA
GATGTTACACCTGAGAAAGTTGTAGAGATTGTTGAAAAGCTGAGAAAAGGAGAAAAGCCA
CCGCATGGAACTCAAAATCCAAAGAGGATCAAGTGCGGACCTGACGGAGGAAACACAACA
CTGCTTGGCGAGCCAAAGCCACCACAGTTCCGTGATCTCGACGCTTGCTAAGTTGAGTTC
TTATACGCCGACGTTTTCTTATCTTTTGAAGATCAATAACGCAAAAGGCTATAGTGATGT
TTGAAGCCTATAGCATCAAACTGAGATTGCATACTCTTTGTAGTTTGTCTTCTTGGCTTT
AGAATTTCGCCCCCATTTT

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 3

CO CL2205Contig1 577 3 6 U
GGATCACTTCTTTTGCATTGTGCGGAAACTCTTGAGCTTTTGTCTTCACCTTACCAAAGT
AACAAACCTCATCGAATCAGATTAGAATAATTTCAACCTCGCTAAGAATGAAAATGAAAC
TCGCTGTTGTAACGTTCGTCATCATCTCCCTACTCCTCTCATCTTCTTTGTTCATGCTTT
CAGAAGCCTCACCATGCGACGGAAAATGCAATGCGAGATGTTCAAAGGCAGGAAGACAAG
ATCGGTGTCTCAAGTATTGCAATATATGTTGTGAGAAGTGTAACTTCTGTGTTCCCTCCG
GCACTTATGGAAACAAAGATGAATGCCCCTGTTACAGGGATATGAAAAACTCCAAAGGCC
ATCCCAAATGTCCTTGAACATGTCTTGAAGATAATCTTCATATACATCATATCTATTATA
CACATAAATACTACAATGGTGGTTGGCGCATGAAATAATGAGTTTGAATATGTTTGTATG
AAAAATGTGAAAGATCTTGATTATAAACGTATGTGTTGTAAAAAAAAACGAAATAATGTA
CTTTTAATTAAACTATTAAAGGTAAAGCTTTATTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1D480TF U 1
AF RS1FK94TF U 77
AF RS1CV50TF U 93
BS 1 145 RS1D480TF
BS 146 146 RS1FK94TF
BS 147 321 RS1D480TF
BS 322 322 RS1FK94TF
BS 323 527 RS1D480TF
BS 528 577 RS1FK94TF

RD RS1D480TF 527 0 0
GGATCACTTCTTTTGCATTGTGCGGAAACTCTTGAGCTTTTGTCTTCACCTTACCAAAGT
AACAAACCTCATCGAATCAGATTAGAATAATTTCAACCTCGCTAAGAATGAAAATGAAAC
TCGCTGTTGTAACGTTCGTCATCATTTCCCTACTCCTCTCATCTTCTTTGTTCATGCTTT
CAGAAGCCTCACCATGCGACGGAAAATGCAATGCGAGATGTTCAAAGGCAGGAAGACAAG
ATCGGTGTCTCAAGTATTGCAATATATGTTGTGAGAAGTGTAACTTCTGTGTTCCCTCCG
GCACTTATGGAAACAAAGATGGATGCCCCTGTTACAGGGATATGAAAAACTCCAAAGGCC
ATCCCAAATGTCCTTGAACATGTCTTGAAGATAATCTTCATATACATCATATCTATTATA
CACATAAATACTACAATGGTGGTTGGCGCATGAAATAATGAGTTTGAATATGTTTGTATG
AAAAATGTGAAAGATCTTGATTATAAACGTATGTGTTGTAAAAAAAA

QA 1 527 1 527
DS 

RD RS1FK94TF 501 0 0
GG
AGATTAGAATAATTTCAACCTCGCTAAGAATGAAAATGAAACTCGCTGTTGTAACGTTCG
TCATCATCTCCCTACTCCTCTCATCTTCTTTGTTCATGCTTTCAGAAGCCTCACCATGCG
ACGGAAAATGCAATGTGAGATGTTCAAAGGCAGGAAGACAAGATCGGTGTCTCAAGTATT
GCAATATATGTTGTGAGAAGTGTAACTTCTGTGTTCCCTCCGGCACTTATGGAAACAAAG
ATGAATGCCCCTGTTACAGGGATATGAAAAACTCCAAAGGCCATCCCAAATGTCCTTGAA
CATGTCTTGAAGATAATCTTCATATACATCATATCTATTATACACATAAATACTACAATG
GTGGTTGGCGCATGAAATAATGAGTTTGAATATGTTTGTATGAAAAATGCGAAAGATCTT
GATTATAAACGTATGTGTTGTAAAAAAAAACGAAATAATGTACTTTTAATTAAACTATTA
AAGGTAAAGCTTTATTTAT

QA 3 501 3 501
DS 

RD RS1CV50TF 484 0 0
GG
AACCTCGCTAAGAATGAAAATGAAACTCGCTGTTGTAACGTTCGTCATCATCTCCCTACT
CCTCTCATCTTCTTTGTTCATGCTTTCAGAAGCCTCACCATGCGACGGAAAATGCAATGC
GAGATGTTCAAAGGCAGGAAGACAAGATCGGTGTCTCAAGTATTGCAATATATGTTGTGA
GAAGTGTAACTTCTGTGTTCCCTCCGGCACTTATGGAAACAAAGATGAATGCCCCTGTTA
CAGGGATATGAAAAACTCCAAAGGCCATCCCAAATGTCCTTGAACATGTCTTGAAGATAA
TCTTCATATACATCATATCTATTATACACATAAATACTACAATGGTGGTTGGCGCATGAA
ATAATGAGTTTGAATATGTTTGTATGAAAAATGTGAAAGATCTTGATTATAAACGTATGT
GTTGTAAAAAAAA*CGAAATAATGTACTTTTAATTAAACTATTAAAGGTAAAGCTTTATT
T
A

QA 3 483 3 483
DS 



AS 1 4

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GACTGATAACCCTCAGACCGAACTAAAGGCTGGAATTGATCTCTTGGGTCCTGTTGATGA
GATATTCTTTGACATGTATGATAGATACGAGCCTGTCAACGAGCCAGCTTTGGACAACT*
GCTTTATATCAACGAGCTATGATGCTACAACACACTTCGAGACAACTGTTTCTGATGTGT
TGAACATGTATACCCTAATCACTGGAAAGCAACTGGACCTAAGTGTTGATCTGAGTGCAG
CAAGCGCTGCAGAGGAATGAGGGTGTATCTCTTTCTCTAGTTGCTTTTTTTCCTACTCTT
GCTTCTGTTCTCTTTGTTTGGGTTTAAACTTTAAAGACAAAATCAGACCGATGCTCGTGT
TTAGCAAACTGATGTTGAATTCTCGGTTAAGGCTTATAAAAACTCTTCAAACCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RS1G813JQ C 1
AF RS1G813TF U 1
AF RS1CW38JQ C 105
AF RS1CW38TF U 105
BS 1 350 RS1G813TF
BS 351 351 RS1CW38TF
BS 352 371 RS1G813TF
BS 372 372 RS1CW38TF
BS 373 473 RS1G813TF
BS 474 474 RS1G813JQ

RD RS1G813JQ 474 0 0
GCTACTCCCTAACGTTGCTCCCAAGGGAAAGTTCATCGCATTTGTATCTACAGATGCAGA
GACTGATAACCCTCAGACCGAACTAAAGGCTGGAATTGATCTCTTGGGTCCTGTTGATGA
GATATTCTTTGACATGTATGATAGATACGAGCCTGTCAACGAGCCAGCTTTGGACAACT*
GCTTTATATCAACGAGCTATGATGCTACAACACACTTCGAGACAACTGTTTTTGATGTGT
TGAACATGTATACCCTAATCACTGGAAAGCAACTGGACCTAAGTGTTGATCTGAGTGCAG
CAAGCGCTGCAGAGGAATGAGGGTGTATCTCTTTCTCTAGTTGCTTTTTT*CCTACTCTT
GCTTCTGTTCTTTTTGTTTGGGTTTAAACTTTAAAGACAAAATCAGACCGATGCTCGTGT
TTAGCAAACTGATGTTGAATTCTCGGTTAAGGCTTATAAAAACTCTTCAAACCG

QA 1 474 1 474
DS 

RD RS1G813TF 474 0 0
GCTACTCCCTAACGTTGCTCCCAAGGGAAAGTTCATCGCATTTGTATCTACAGATGCAGA
GACTGATAACCCTCAGACCGAACTAAAGGCTGGAATTGATCTCTTGGGTCCTGTTGATGA
GATATTCTTTGACATGTATGATAGATACGAGCCTGTCAACGAGCCAGCTTTGGACAACT*
GCTTTATATCAACGAGCTATGATGCTACAACACACTTCGAGACAACTGTTTCTGATGTGT
TGAACATGTATACCCTAATCACTGGAAAGCAACTGGACCTAAGTGTTGATCTGAGTGCAG
CAAGCGCTGCAGAGGAATGAGGGTGTATCTCTTTCTCTAGTTGCTTTTTT*CCTACTCTT
GCTTCTGTTCTTTTTGTTTGGGTTTAAACTTTAAAGACAAAATCAGACCGATGCTCGTGT
TTAGCAAACTGATGTTGAATTCTCGGTTAAGGCTTATAAAAACTCTTCAAACC
G

QA 1 473 1 473
DS 

RD RS1CW38JQ 369 0 0
G
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AGCTTTGGACAACT*GCTTTATATCAACGAGCTATGATGCTACAACACACTTCGAGACAA
CTGTTTCTGATGTGTTGAACATGTATACCCTAATCACTGGAAAGCAACTGGACCTAAGTG
TTGATCTGAGTGCAGCAAGCGCTGCAGAGGAATGAGGGTGTATCTCTTTCTCTAGTTGCT
TTTTTTCCTACTCTTGCTTCTGTTCTCTTTGTTTGGGTTTAAACTTTAAAGACAAAATCA
GACCGATGCTCGTGTTTAGCAAACTGATGTTGAATTCTCGGTTAAGGCTTATAAAAACTC
TTCAAACC

QA 2 369 2 369
DS 

RD RS1CW38TF 369 0 0
G
GGGTCCTGTTGATGAGATATTCTTTGACATGTATGATAGATACGAGCCTGTCAACGAGCC
AGCTTTGGACAACTAGCTTTATATCAACGAGCTATGATGCTACAACACACTTCGAGACAA
CTGTTTCTGATGTGTTGAACATGTATACCCTAATCACTGGAAAGCAACTGGACCTAAGTG
TTGATCTGAGTGCAGCAAGCGCTGCAGAGGAATGAGGGTGTATCTCTTTCTCTAGTTGCT
TTTTTTCCTACTCTTGCTTCTGTTCTCTTTGTTTGGGTTTAAACTTTAAAGACAAAATCA
GACCGATGCTCGTGTTTAGCAAACTGATGTTGAATTCTCGGTTAAGGCTTATAAAAACTC
TTCAAACC

QA 2 369 2 369
DS 



AS 1 4

CO CL2207Contig1 1268 4 6 U
AAAACAGAATGGAATTATTTATATATATGATTTCGCATCAGTCAATATTTAACAATTTTT
GATCAACTGATCACATAACTTGGATAGTATGATGATTTGGTTACATTAAATATGTATGCT
AAGTGTCCACAAATGATGTAGATCAAGCCCACTTAGACATGACGGCCATGCCACCGGAAC
CAAGCAAAACAGCGGCATAAGACTTTAATTGAAGCTTGATGCTCCGTTGCATCTTCTGTC
CCATAAAATCGGCAGCGAGAAGGTCGAATAGAGCCATGTAGATGAGTAGTCCAGCTGAAG
AAGCGTTGAGAAGTCCAACAGTAATGAGCGAGTCAGGGCTATTCTCTTTGTAAGTTTTAG
ATAATGCCATACCAAGAGACACTCCAAAAGGCGTTGTCACCGCAAAAAAGAAAGCCATCA
CTCCTTTTTTCAACCACCCGTATTCTGCCTGGAGGATGCAGCCACCAAGACCCATGCCTT
CGAACATTTGGTGGAAACAAAGAGCAGCGACGAGGCCTTTGATCGTGCAAGTATTGTTAG
TGGCTCCTACAGAGAGTCCTATCACTATCGAGTGCACCACTATTCCTAGCTCCAGTACAA
TGGCAATAACTCTATACCGCAGGAGCTGTAAGGAAGAACCAAGCTCCTTATCATTATCTC
CATGAACGTCATGATGAAGACCATGACCATGACCGTGGCCATGATGGGGTGAGTGAACCT
GCACGCGCCCTATCTCTTGGTCAGGAGTCTCAGCTGATGTCACCTCAGGTCGCAAGTCCT
TCCTGCCCGACTTGGTGAAAACACTGGTGGTGATAGAGTCAACCATGAGTGTGAATATGG
CGGAGATCATAGCGACGAAGCCAGTGAAAGGAAACTTGTGCCAGGGGTTATCGCCAAGAC
AAGGAGAAGAGAGCATATCAAAAGAATCAGGCAAAACGTGCATAAAACCAGTGGAGAGGA
TGATTCCAGAGGCGAATGATTTGACGATGAGGAAGTGAGATTTCTCGGGCTGAAAAGCGG
GAACGGACCGGGCGAAGAAGGGAAGGCAAACGCCGATAAGGCTAGTGATGAGGATGCTGA
AGATTGCTATAAGTTTGAGATCTAATGCTTTGTTTTTGTCGATACATGTGTTGTTGGATA
CAGGTTTGCAATCATTTTGGGATTGAGATAGAGCTCCGGGGAAGTGGCAGATGGAGAAGA
GGAGGAAGATGGCGATGGTGACAGAGAAAATGAAAGGACTTTGAGTCTGTCTCATTTTGC
GTTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H021JQB U 9
AF RS1H272JQB U 1
AF RS1H272TF C 528
AF RS1H021TF C 523
BS 1 177 RS1H272JQB
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BS 179 267 RS1H272JQB
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BS 269 739 RS1H272JQB
BS 740 1268 RS1H021TF

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GGAATCATTTA
TATATATATGATTTCGCATCGGTCAATATTTAACAATTTTTGATCAACTGATCACATAAC
TTGGATAGTATGATGATTTGGTTACATTAAATATGTATGCTAAGTGTCCACAAATGATGT
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AGACTTTAATTGAAGCTTGATGCTCCGTTGCATCTTCTGTCCCATAAAATCGGCAGCGAG
AAGGTCGAATAGAGCCATGTAGATGAGTAGTCCAGCTGAAGAAGCGTTGAGAAGTCCAAC
AGTAATGAGCGAGTCAGGGCTATTCTCTTTGTACGTTTTAGATAATGCCATACCAAGAGC
CACTCCAAAAGGCGTTGTCACCGCAAAAAAGAAAGCCATCACTCCTTTTTTCAACCACCC
GTATTCTGCCTGGAGGATGCAGCCACCAAGACCCATGCCTTCGAACATTTGGTGGAAACA
AAGAGCAGCGACGAGGCCTTTGATCGTGCAAGTATTGTTAGTGGCTCCTACAGAGAGTCC
TATCACTATCGAGTGCACCACTATTCCTAGCTCCAGTACAATGGCAATAACTCTATACCG

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DS 

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GATCAACTGATCACATAACTTGGATAGTATGATGATTTGGTTACATTAAATATGTATGCT
AAGTGTCCACAAATGATGTAGATCAAGCCCACTTAGACATGACGGCCATGCCACCGGCAC
CAAGCAAAACAGCGGCATAAGACTTTAATTGAAGCTTGATGCTCCGTTGCATCTTCTGTC
CCATAAAATCGGCAGCGAGAAGGTCGACTAGAGCCATGTAGATGAGTAGTCCAGCTGAAG
AAGCGTTGAGAAGTCCAACAGTAATGAGCGAGTCAGGGCTATTCTCTTTGTAAGTTTTAG
ATAATGCCATACCAAGAGACACTCCAAAAGGCGTTGTCACCGCAAAAAAGAAAGCCATCA
CTCCTTTTTTCAACCACCCGTATTCTGCCTGGAGGATGCAGCCACCAAGACCCATGCCTT
CGAACATTTGGTGGAAACAAAGAGCAGCGACGAGGCCTTTGATCGTGCAAGTATTGTTAG
TGGCTCCTACAGAGAGTCCTATCACTATCGAGTGCACCACTATTCCTAGCTCCAGTACAA
TGGCAATAACTCTATACCGCAGGAGCTGTAAGGAAGAACCAAGCTCCTTATCATTATCTC
CATGAACGTCATGATGAAGACCATGACCATGACCGTGGCCATGATGGGGTGAGTGAACCT
GCACGCGCCCTATCTCTTG

QA 1 739 1 739
DS 

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AGCTCCAGTACAATGGCAATAACTCTATACCGCAGGAGCTGTAAGGAAGAACCAAGCTCC
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GGTCGCAAGTCCTTCCTGCCCGACTTGGTGAAAACACTGGTGGTGATAGAGTCAACCATG
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GTGTTGTTGGATACAGGTTTGCAATCATTTTGGGATTGAGATAGAGCTCCGGGGAAGTGG
CAGAT
CC

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DS 

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TCGTG
CAAGTATTGTTAGTGGCTCCTACAGAGAGTCCTATCACTATCGAGTGCACCACTATTCCT
AGCTCCAGTACAATGGCAATAACTCTATACCGCAGGAGCTGTAAGGAAGAACCAAGCTCC
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GGTGAGTGAACCTGCACGCGCCCTATCTCTTGGTCAGGAGTCTCAGCTGATGTCACCTCA
GGTCGCAAGTCCTTCCTGCCCGACTTGGTGAAAACACTGGTGGTGATAGAGTCAACCATG
AGTGTGAATATGGCGGAGATCATAGCGACGAAGCCAGTGAAAGGAAACTTGTGCCAGGGG
TTATCGCCAAGACAAGGAGAAGAGAGCATATCAAAAGAATCAGGCAAAACGTGCATAAAA
CCAGTGGAGAGGATGATTCCAGAGGCGAATGATTTGACGATGAGGAAGTGAGATTTCTCG
GGCTGAAAAGCGGGAACGGACCGGGCGAAGAAGGGAAGGCAAACGCCGATAAGGCTAGTG
ATGAGGATGCTGAAGATTGCTATAAGTTTGAGATCTAATGCTTTGTTTTTGTCGATACAT
GTGTTGTTGGATACAGGTTTGCAATCATTTTGGGATTGAGATAGAGCTCCGGGGAAGTGG
CAGATGGAGAAGAGGAGGAAGATGGCGATGGTGACAGAGAAAATGAAAGGACTTTGAGTC
TGTCTCATTTTGCGTTCTTCC

QA 6 746 6 746
DS 



AS 1 4

CO CL2208Contig1 1271 4 9 U
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TTATTTTGTGATGTAGTACCGTACTAATAACGGCCTGAACTAAATCAAGTGGTGAGTGTC
AGTCACCGTGGAAGCAGTGACGTCTCTCGGATTCCGACACCTACCGGCTAGATCTAGCAG
AAGTAAACGCCCCCTTCACCTTTCAGGGAGAGAGATTCTATCCCTTCTTCTCTATCGCTT
GTCTCCCGTATAAGTTCAAAGACGCGCCTAATGTGTTCGATGAAAGTCCTAACTCAAATG
TCTACAACAATTCTTCCTGTACTTGGGGATGTTAAAGGCACTGAGACTACGAAAGGAGGT
CCGGATAAGCAGCTAACGGAAGATTTGATCAAGGTCGATTTTTCTGGATGCAGCAAGAAG
GCTTTAAGCCAGACGTTGTTACAGTTGCTGCCTGTTCTACCTGTTTGACCAGCGCTGAGG
GATATAAAGCAGGCAAAGGAGATTAATTGTTATGCTTTAAAGAATCTCTTCTTGCCAAAT
GTATCATTAGTCACTTCCTTGATAGTGATGTACTCAAAGTGCGGTGTTTCAGAGTATCCT
GTCAGACTGTTTGACAGGTTGGAGCAGAGGAATATGAAAGTATGATTGACTGCTATATGG
AAAACAAACAGGCCCAGATTCTTCTGTTACAAATGGGTAGGGTTTTGACTGTTTGCAGTG
ATCCTCAAAGCTTTGAAGCTGGGGAAGGAGATTCATGTGCACATTTCTGAAATTTGATCC
CTTCTGTTTCTGCAAGGATCATGAAGATATATGTATGGACAAGGTGGAGATATCACAAGT
AATTATCACTCTTTCGGTACTGTTGTTTGTCAAGGGCTTTCTGACATGGACCGCCATTTT
ATAGGCCTAAGGATGCAATAAACTGTTTTGAGCAAATGCTACCAGGAGGTATTCTCCTGA
CGCCTTCACATTTACAGCAGTTTTATTTCTCTGCCCTCGAGATGAATTTGATGCACCAGA
CATACAAATGGTCATTGAACTTCTTAATCGCGTTGGTCGTGATGAAGGGGCGCAAAGACT
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GTTTGCTTCTCTCCAAAGCATCAAGTAAGTTACTTGAAGATTGCATAAAAGTATATAATG
TTATCTTGTTTGCAATAGCTTTCATTTATTATGGAATGTATATTTTTCTTAAGATTAGTT
AGTGGTTCGTT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A118TV U 1
AF RS1A118TF U 54
AF RS1A118TR C 402
AF RS1A118JQ C 404
BS 1 795 RS1A118TV
BS 796 796 RS1A118TR
BS 797 822 RS1A118TV
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BS 880 892 RS1A118TF
BS 893 1271 RS1A118TR

RD RS1A118TV 852 0 0
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TTATTTTGTGATGTAGTACCGTACTAATAACGGCCTGAACTAAATCAAGTGGTGAGTGTC
AGTCACCGTGGAAGCAGTGACGTCTCTCGGATTCCGACACCTACCGGCTAGATCTAGCAG
AAGTAAACGCCCCCTTCACCTTTCAGGGAGAGAGATTCTATCCCTTCTTCTCTATCGCTT
GTCTCCCGTATAAGTTCAAAGACGCGCCTAATGTGTTCGATGAAAGTCCTAACTCAAATG
TCTACAACAATTCTTCCTGTACTTGGGGATGTTAAAGGCACTGAGACTACGAAAGGAGGT
CCGGATAAGCAGCTAACGGAAGATTTGATCAAGGTCGATTTTTCTGGATGCAGCAAGAAG
GCTTTAAGCCAGACGTTGTTACAGTTGCTGCCTGTTCTACCTGTTTGACCAGCGCTGAGG
GATATAAAGCAGGCAAAGGAGATTAATTGTTATGCTTTAAAGAATCTCTTCTTGCCAAAT
GTATCATTAGTCACTTCCTTGATAGTGATGTACTCAAAGTGCGGTGTTTCAGAGTATCCT
GTCAGACTGTTTGACAGGTTGGAGCAGAGGAATATGAAAGTATGATTGACTGCTATATGG
AAAACAAACAGGCCCAGATTCTTCTGTTACAAATGGGTAGGGTTTTGACTGTTTGCAGTG
ATCCTCAAAGCTTTGAAGCTGGGGAAGGAGATTCATGTGCACATTTCTGAAATTTGATCC
CTTCTGTTTCTGCAAAGATCATGAAGATATATGTATGGACAAAGTGGAGATATCACAAGT
AATTATCACTCT

QA 1 852 1 852
DS 

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GAGTGTCAGTCACCGTGGAAGCAGTGACGTCTCTCGGATTCCGACACCTACCGGCTAGAT
CTAGCAGAAGTAAACGCCCCCTTCACCTTTCAGGGAGAGAGATTCTATCCCTTCTTCTCT
ATCGCTTGTCTCCCGTATAAGTTCAAAGACGCGCCTAATGTGTTCGATGAAAGTCCTAAC
TCAAATGTCTACAACAATTCTTCCTGTACTTGGGGATGTTAAAGGCACTGAGACTACGAA
AGGAGGTCCGGATAAGCAGCTAACGGAAGATTTGATCAAGGTCGATTTTTCTGGATGCAG
CAAGAAGGCTTTAAGCCAGACGTTGTTACAGTTGCTGCCTGTTCTACCTGTTTGACCAGC
GCTGAGGGATATAAAGCAGGCAAAGGAGATTAATTGTTATGCTTTAAAGAATCTCTTCTT
GCCAAATGTATCATTAGTCACTTCCTTGATAGTGATGTACTCAAAGTGCGGTGTTTCAGA
GTATCCTGTCAGACTGTTTGACAGGTTGGAGCAGAGGAATATGAAAGTATGATTGACTGC
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TGCAGTGATCCTCAAAGCTTTGAAGCTGGGGAAGGAGATTCATGTGCACATTTCTGAAAT
TTGATCCCTTCTGTTTCTGCAA*GATCATGAAGATATATGTATGGACAA*GTGGAGATAT
CACAAGTAATTATCACTCTTTCGGTACTGTTGTTTGTCAAGGGCTCTCTGACATGGACC

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DS 

RD RS1A118TR 870 0 0
TT
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ATCTCTTCTTGCCAAATGTATCATTAGTCACTTCCTTGATAGTGATGTACTCAAAGTGCG
GTGTTTCAGAGTATCCTGTCAGACTGTTTGACAGGTTGGAGCAGAGGAATATGAAAGTAT
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GTGGAGATATCACAAGTAATTATCACTCTTTCGGTACTGTTGTTTGTCAAGGGCTTTCTG
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AGGAGGTATTCTCCTGACGCCTTCACATTTACAGCAGTTTTATTTCTCTGCCCTCGAGAT
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GAAGGGGCGCAAAGACTTGCGGTATTGAGTTCGTCATCATCCCTACAAACCTGACTGCAG
GCAGATTCAGATACTTTGTTTGCTTCTCTCCAAAGCATCAAGTAAGTTACTTGAAGATTG
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TTTTCTTAAGATTAGTTAGTGGTTCGTT

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DS 

RD RS1A118JQ 868 0 0
CTGGATGCAGCAAGAAGGCTTTAAGCCAGACGTTGTTACAGTTGCTGCCTGTTCTACCTG
TTTGACCAGCGCTGAGGGATATAAAGCAGGCAAAGGAGATTAATTGTTATGCTTTAAAGA
ATCTCTTCTTGCCAAATGTATCATTAGTCACTTCCTTGATAGTGATGTACTCAAAGTGCG
GTGTTTCAGAGTATCCTGTCAGACTGTTTGACAGGTTGGAGCAGAGGAATATGAAAGTAT
GATTGACTGCTATATGGAAAACAAACAGGCCCAGATTCTTCTGTTACAAATGGGTAGGGT
TTTGACTGTTTGCAGTGATCCTCAAAGCTTTGAAGCTGGGGAAGGAGATTCATGTGCACA
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GTGGAGATATCACAAGTAATTATCACTCTTTCGGTACTGTTGTTTGTCAAGGGCTTTCTG
ACATGGACCGCCATTTTATAGGCCTAAGGATGCAATAAACTGTTTTGAGCAAATGCTACC
AGGAGGTATTCTCCTGACGCCTTCACATTTACAGCAGTTTTATTTCTCTGCCCTCGAGAT
GAATTTGATGCACCAGACATACAAATGGTCATTGAACTTCTTAATCGCGTTGGTCGTGAT
GAAGGGGCGCAAAGACTTGCGGTATTGAGTTCGTCATCATCCCTACAAACCTGACTGCAG
GCAGATTCAGATACTTTGTTTGCTTCTCTCCAAAGCATCAAGTAAGTTACTTGAAGATTG
CATAAAAGTATATAATGTTATCTTGTTTGCAATAGCTTTCATTTATTATGGAATGTATAT
TTTTCTTAAGATTAGTTAGTGGTTCGTT

QA 1 868 1 868
DS 



AS 1 4

CO CL2209Contig1 1110 4 2 U
TTTTAGACAGAACAGTTTCTTTTGGGGGACAACAAATAATTGTACATTTTGTTCTTATAA
ACCGAAGGATGTAAACGATATTAACAGAGACAGAAACAAAAGAAAGAAATAGTAACACAA
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CCAAACACTAGAAACCAGAACACGAACAAGATTGCCCAGTAACGTGCTGGTCCATACCTG
ATTCTAGTCAGCACTACGAATCTGAAGAAGATGACTACTGTTAAAGCACAGAGTCCACCC
AGGAGTATGTGCAGTCCACTCTTTGCAGTTCTTTTTCC*AACACGTGGAGCAATGAGCCA
AGCCAAAGTAACAGTGAGTAATCCTGTAGCGAGCAGTATCCC*TGTACCTTCCACAGCCC
ATTTAGTCGCTCTGCTCTCCATAGGCAATATATCAAAACCAACTACACCCAAAGGCTGTT
CAGATGTCACCTGAGAAGCAGCAGCCACCCCCGCAGCAACAGCTGAATTACTACTATTAT
TGCTGTTGTTGTTTGTACAATGCGGACCAAACCACAACGAAATCTCACTAAGCCGCTGCC
TTCGAATGGCTGCAACCGCATCAGGATCTATCCCCGAAGAGCTCGTGTTGCTGTTGTTGT
TACTAACCGCTACAGGGTTGGGATCTCCATCCGCCGTTCTTTCTCTCAGCGCTGCGTAGT
CTTTCAACGCGATGACAACTCTGTTGAGATCAACCGTTCTTATATTCGCCGCGACGCTCC
CACAGATCTCGCAGACGGTCGATCCGTGGTTGACGAACCATTTCAACGCGCAGGCGTAGT
GCACCAGGGCGAGATCGTTTTTGCAAGAGCATCCGAGCTCCAGCAACGTGTCACGATGCT
GCCAAGCTCCCATCTCTATGTCTTCGTCTGCGCAGACGAACACTTCTCCGTCGGGACTTA
TCAGTTCGATGAAGCCGCTTTTCTTCTTCTTATCAGGGGTTTCTTGGTTTGCATTGCTTC
CACGAGGTGGTTCCTCTGAAACAACAGGAGGTGTGATGCCCCCCCGGCCGTAATGCCGAA
TTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A202TR U 1
AF RS1A202JQ U 5
AF RS1A202TV C 200
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BS 1 829 RS1A202TR
BS 830 1110 RS1A202TF

RD RS1A202TR 829 0 0
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TGCTGTTGTTGTTTGTACAATGCGGACCAAACCACAACGAAATCTCACTAAGCCGCTGCC
TTCGAATGGCTGCAACCGCATCAGGATCTATCCCCGAAGAGCTCGTGTTGCTGTTGTTGT
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CACAGATCTCGCAGACGGTCGATCCGTGGTTGACGAACCATTTCAACGC

QA 1 829 1 829
DS 

RD RS1A202JQ 825 0 0
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AAGGATGTAAACGATATTAACAGAGACAGAAACAAAAGAAAGAAATAGTAACACAACAGA
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TAGTCAGCACTACGAATCTGAAGAAGATGACTACTGTTAAAGCACAGAGTCCACCCAGGA
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AAAGTAACAGTGAGTAATCCTGTAGCGAGCAGTATCCC*TGTACCTTCCACAGCCCATTT
AGTCGCTCTGCTCTCCATAGGCAATATATCAAAACCAACTACACCCAAAGGCTGTTCAGA
TGTCACCTGAGAAGCAGCAGCCACCCCCGCAGCAACAGCTGAATTACTACTATTATTGCT
GTTGTTGTTTGTACAATGCGGACCAAACCACAACGAAATCTCACTAAGCCGCTGCCTTCG
AATGGCTGCAACCGCATCAGGATCTATCCCCGAAGAGCTCGTGTTGCTGTTGTTGTTACT
AACCGCTACAGGGTTGGGATCTCCATCCGCCGTTCTTTCTCTCAGCGCTGCGTAGTCTTT
CAACGCGATGACAACTCTGTTGAGATCAACCGTTCTTATATTCGCCGCGACGCTCCCACA
GATCTCGCAGACGGTCGATCCGTGGTTGACGAACCATTTCAACGC

QA 1 825 1 825
DS 

RD RS1A202TV 583 0 0
ACACGAACAAGAT*GCCCAGTAACGTGCTGGTCCATACGTGATTCTAGTCAGCACTACGA
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TCTTTGCAGTTCTTTTTCCCAACACGTGGAGCAATGAGCCAAGCCAAAGTAACAGTGAGT
AATCCTGTAGCGAGCAGTATCCCCTGTACCTTCCACAGCCCATTTAGTCGCTCTGCTCTC
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ATGCGGACCAAACCACAACGAAATCTCACTAAGCCGCTGCCTTCGAATGGCTGCAACCGC
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GGGATCTCCATCCGCCGTTCTTTCTCTCAGCGCTGCGTAGTCTTTCAACGCGATGACAAC
TCTGTTGAGATCAACCGTTCTTATATTCGCCGCGACGCTCCCA

QA 1 583 1 583
DS 

RD RS1A202TF 851 0 0
ATCTGAAGAAGATGACTACTGTTAAAGCACAGAGTCCACCCAGGAGTATGTGCAGTCCAC
TCTT*GCAGTTCTTTTCC**AACACGTGGAGCAATGAGCCAAGCCAAAGTAACAGTGAGT
AATCCTGTAGCGAGCAGTATCCC*TGTACCTTCCACAGCCCATTTAGTCGCTCTGCTCTC
CATAGGCAATATATCAAAACCAACTACACCCAAAGGCTGTTCAGATGTCACCTGAGAAGC
AGCAGCCACCCCCGCAGCAACAGCTGAATTACTACTATTATTGCTGTTGTTGTTTGTACA
ATGCGGACCAAACCACAACGAAATCTCACTAAGCCGCTGCCTTCGAATGGCTGCAACCGC
ATCAGGATCTATCCCCGAAGAGCTCGTGTTGCTGTTGTTGTTACTAACCGCTACAGGGTT
GGGATCTCCATCCGCCGTTCTTTCTCTCAGCGCTGCGTAGTCTTTCAACGCGATGACAAC
TCTGTTGAGATCAACCGTTCTTATATTCGCCGCGACGCTCCCACAGATCTCGCAGACGGT
CGATCCGTGGTTGACGAACCATTTCAACGCGCAGGCGTAGTGCACCAGGGCGAGATCGTT
TTTGCAAGAGCATCCGAGCTCCAGCAACGTGTCACGATGCTGCCAAGCTCCCATCTCTAT
GTCTTCGTCTGCGCAGACGAACACTTCTCCGTCGGGACTTATCAGTTCGATGAAGCCGCT
TTTCTTCTTCTTATCAGGGGTTTCTTGGTTTGCATTGCTTCCACGAGGTGGTTCCTCTGA
AACAACAGGAGGTGTGATGCCCCCCCGGCCGTAATGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGG
TACCGTCGACT

QA 1 851 1 851
DS 



AS 1 4

CO CL2210Contig1 580 4 1 U
GGGTTAAGCTAAATCTCAGAAGCTCACATTCAAAACCTTCTTCAAAGCAAATCAATGGCG
ATCACCGAGTTTCTGCCTAAAGAGTACGGATATGTCGTTCTTGTCCTCGTCTTCTACTGC
TTCATCAACTTTTGGATGGGCTTTCAAGTCGGCAAAGCTCGCAAAAGAGAGGACACCAAA
ACACTCTAGAGATGATGCCAATGTACTTTATACTAATGATACTTGGTGGGATGAAACACC
CTTGCATCTGCACTGGCTTGGGTTTGGTCTACAATATTTCTCGATTCTTCTACTTCAAAG
GTTACTCTACTGGAGATCCCACAAAGCGCCTCACCATCGGGAAATACAGTTTCATGGGAT
TGTTTGGTCTCATGATCTGTACCATCTCCTTTGGTGTCACTCTCATCCGCGGTTAGGCCA
GTTCTACTCCTTTATGAGGTTGATGATTCTATGGACTTTGGATCCGGTCCTTATGAGTTG
TCTACATGCTTATGTTATAATGTTAAGAGTTCGTCAGGTTGTTGCTTACGGAACTGTTTT
TTCAAGTTGTAATAAAACTATGGTTTTACGTAAAACAAAG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1FX26JQ C 1
AF RS1H547JQB C 16
AF RS1H547TF U 1
AF RS1FX26TF U 1
BS 1 580 RS1H547TF

RD RS1FX26JQ 580 0 0
GGGTTAAGCTAAATCTCAGAAGCTCACATTCAAAACCTTCTTCAAAGCAAATCAATGGCG
ATCACCGAGTTTCTGCCTAAAGAGTACGGATATGTCGTTCTTGTCCTCGTCTTCTACTGC
TTCATCAACTTTTGGATGGGCTTTCAAGTCGGCAAAGCTCGCAAAAGAGAGGACACCAAA
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CTTGCATCTGTACTGGCTTGGGTTTGGTCTACAATATTTCTCGATTCTTCTACTTCAAAG
GTTACTCTACTGGAGATCCCACAAAGCGCCTCACCATCGGGAAATACAGTTTCATGGGAT
TGTTTGGTCTCATGATCTGTACCATCTCCTTTGGTGTCACTCTCATCCGCGGTTAGGCCA
GTTCTACTCCTTTATGAGGTTGATGATTCTATGGACTTTGGATCCGGTCCTTATGAGTTG
TCTACATGCTTATGTTATAATGTTAAGAGTTCGTCAGGTTGTTGCTTACGGAACTGTTTT
TTCAAGTTGTAATAAAACTATGGTTTTACGTAAAACAAAG

QA 1 580 1 580
DS 

RD RS1H547JQB 565 0 0
TCAGAAGCTCACATTCAAAACCTTCTTCAAAGCAAATCAATGGCGATCACCGAGTTTCTG
CCTAAAGAGTACGGATATGTCGTTCTTGTCCTCGTCTTCTACTGCTTCATCAACTTTTGG
ATGGGCTTTCAAGTCGGCAAAGCTCGCAAAAGAGAGGACACCAAAACACTCTAGAGATGA
TGCCAATGTACTTTATACTAATGATACTTGGTGGGATGAAACACCCTTGCATCTGCACTG
GCTTGGGTTTGGTCTACAATATTTCTCGATTCTTCTACTTCAAAGGTTACTCTACTGGAG
ATCCCACAAAGCGCCTCACCATCGGGAAATACAGTTTCATGGGATTGTTTGGTCTCATGA
TCTGTACCATCTCCTTTGGTGTCACTCTCATCCGCGGTTAGGCCAGTTCTACTCCTTTAT
GAGGTTGATGATTCTATGGACTTTGGATCCGGTCCTTATGAGTTGTCTACATGCTTATGT
TATAATGTTAAGAGTTCGTCAGGTTGTTGCTTACGGAACTGTTTTTTCAAGTTGTAATAA
AACTATGGTTTTACGTAAAACAAAG

QA 1 565 1 565
DS 

RD RS1H547TF 580 0 0
GGGTTAAGCTAAATCTCAGAAGCTCACATTCAAAACCTTCTTCAAAGCAAATCAATGGCG
ATCACCGAGTTTCTGCCTAAAGAGTACGGATATGTCGTTCTTGTCCTCGTCTTCTACTGC
TTCATCAACTTTTGGATGGGCTTTCAAGTCGGCAAAGCTCGCAAAAGAGAGGACACCAAA
ACACTCTAGAGATGATGCCAATGTACTTTATACTAATGATACTTGGTGGGATGAAACACC
CTTGCATCTGCACTGGCTTGGGTTTGGTCTACAATATTTCTCGATTCTTCTACTTCAAAG
GTTACTCTACTGGAGATCCCACAAAGCGCCTCACCATCGGGAAATACAGTTTCATGGGAT
TGTTTGGTCTCATGATCTGTACCATCTCCTTTGGTGTCACTCTCATCCGCGGTTAGGCCA
GTTCTACTCCTTTATGAGGTTGATGATTCTATGGACTTTGGATCCGGTCCTTATGAGTTG
TCTACATGCTTATGTTATAATGTTAAGAGTTCGTCAGGTTGTTGCTTACGGAACTGTTTT
TTCAAGTTGTAATAAAACTATGGTTTTACGTAAAACAAAG

QA 1 580 1 580
DS 

RD RS1FX26TF 580 0 0
GGGTTAAGCTAAATCTCAGAAGCTCACATTCAAAACCTTCTTCAAAGCAAATCAATGGCG
ATCACCGAGTTTCTGCCTAAAGAGTACGGATATGTCGTTCTTGTCCTCGTCTTCTACTGC
TTCATCAACTTTTGGATGGGCTTTCAAGTCGGCAAAGCTCGCAAAAGAGAGGACACCAAA
ACACTCTAGAGATGATGCCAATGTACTTTATACTAATGATACTTGGTGGGATGAAACACC
CTTGCATCTGTACTGGCTTGGGTTTGGTCTACAATATTTCTCGATTCTTCTACTTCAAAG
GTTACTCTACTGGAGATCCCACAAAGCGCCTCACCATCGGGAAATACAGTTTCATGGGAT
TGTTTGGTCTCATGATCTGTACCATCTCCTTTGGTGTCACTCTCATCCGCGGTTAGGCCA
GTTCTACTCCTTTATGAGGTTGATGATTCTATGGACTTTGGATCCGGTCCTTATGAGTTG
TCTACATGCTTATGTTATAATGTTAAGAGTTCGTCAGGTTGTTGCTTACGGAACTGTTTT
TTCAAGTTGTAATAAAACTATGGTTTTACGTAAAACAAAG

QA 1 580 1 580
DS 



AS 1 3

CO CL2211Contig1 956 3 7 U
GCTAACTAAATTTCATTAATACGATTAACAGAAGATAAATTTATTATCCTTTTTATTTGA
TAGAACATCTGATGTACAGTACAAAGTTCCAGGCTGAACAAATTAGTGGAACAGCATTAA
CTTAAGACTAACTTCAAAGGGAATTATCGCAAATGCAACATTATTCAACACTTGTAAACG
GTCACTTTGTGCGGTTTTGCTTCTCCTCGATCCCAGACTGAGAGAAGCGTTTCCTAAAAA
TTTCAAGAACATCTTCAAACTTCACATCCCTTTTAGACAGAAGCACCATCGAATGGTACA
ACACATCAGCCATCTCCGATGCTGTTCTTGAAACGTCCTCCGTATCCTCCAGCGTTCTGC
ATAACTCGTCTGCTTCTTCCCTGATCTTTGAGCAAAGCAAAGCGTCATCCGTCAATAACC
GTCTAGTCCACGATGGTTTGCCTTCCTGAGGAACTGTTGATTCTTCTTTGCGCTTTGAAA
TAATTGATTCTAGTGAATACAATGTTGTTAATGCTAGCTTGTTTCCCGAAGCCTCATCAT
TGTTTAGTTGATCGAAAGCCGATGTGTAGTAACAAGTCTCTGCTCCTGTGTGACAAGTAG
GCCCATCAGGTGTTCTTGATCGGCTGAAGAATGTAGCTTTACGAGAAGTGAGGGTTGTGG
AGAGAGCCTCTCTGTTAACAAATCCTTGCATTAACACAGCTCCAGTGTCAACGTTTTGTG
CTATTGCCACAGCTAATCCTTTTTCATCCCATTTTATGCGGTCCAACAAGTTATCTACCT
TAGCTTGGAGAGCAATGTTGTTATCATTAGAAGCGAATACGACGCCACTGGATCTGCTGC
TTCTCTGCTTGATGCACAAGGCTTTGGGGATGAAGCAGTTACTTGTCGCCTGTAAAGACT
GTGTTAATGCATTGTACGATACCGCCATTAACGCAAAGTGAATCGTCGACGACAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AR47JQ U 1
AF RS1DN19JQ U 37
AF RS1DN19TF C 450
BS 1 237 RS1AR47JQ
BS 238 238 RS1DN19JQ
BS 239 399 RS1AR47JQ
BS 400 400 RS1DN19JQ
BS 401 512 RS1AR47JQ
BS 513 781 RS1DN19JQ
BS 782 956 RS1DN19TF

RD RS1AR47JQ 512 0 0
GCTAACTAAATTTCATTAATACGATTAACAGAAGATAAATTTATTATCCTTTTTATTTGA
TAGAACATCTGATGTACAGTACAAAGTTCCAGGCTGAACAAATTAGTGGAACAGCATTAA
CTTAAGACTAACTTCAAAGGGAATTATCGCAAATGCAACATTATTCAACACTTGTAAACG
GTCACTTTGTGCGGTTTTGCTTCTCCTCGATCCCAGACTGAGAGAAGCGTTTCCTAAGAA
TTTCAAGAACATCTTCAAACTTCACATCCCTTTTAGACAGAAGCACCATCGAATGGTACA
ACACATCAGCCATCTCCGATGCTGTTCTTGAAACGTCCTCCGTATCCTCCAGCGTTCTGC
ATAACTCGTCTGCTTCTTCCCTGATCTTTGAGCAAAGCAGAGCGTCATCCGTCAATAACC
GTCTAGTCCACGATGGTTTGCCTTCCTGAGGAACTGTTGATTCTTCTTTGCGCTTTGAAA
TAATTGATTCTAGTGAATACAATGTTGTTAAT

QA 1 512 1 512
DS 

RD RS1DN19JQ 745 0 0
AAATTTATTATCCTTTTTATTTGATAGAACATCTGATGTACAGTACAAAGTTCCAGGCTG
AACAAATTAGTGGAACAGCATTAACTTAAGACTAACTTCAAAGGGAATTATCGCAAATGC
AACATTATTCAACACTTGTAAACGGTCACTTTGTGCGGTTTTGCTTCTCCTCGATCCCAG
ACTGAGAGAAGCGTTTCCTAAAAATTTCAAGAACATCTTCAAACTTCACATCCCTTTTAG
ACAGAAGTACCATCGAATGGTACAACACATCAGCCATCTCCGATGCTGTTCTTGAAACGT
CCTCCGTATCCTCCAGCGTTCTGCATAACTCGTCTGCTTCTTCCCTGATCTTTGAGCAAA
GCAAAGCGTCATCCGTCAATAACCGTCTAGTCCACGATGGTTTGCCTTCCTGAGGAACTG
TTGATTCTTCTTTGCGCTTTGAAATAATTGATTCTAGTGAATACAATGTTGTTAATGCTA
GCTTGTTTCCCGAAGCCTCATCATTGTTTAGTTGATCGAAAGCCGATGTGTAGTAACAAG
TCTCTGCTCCTGTGTGACAAGTAGGCCCATCAGGTGTTCTTGATCGGCTGAAGAATGTAG
CTTTACGAGAAGTGAGGGTTGTGGAGAGAGCCTCTCTGTTAACAAATCCTTGCATTAACA
CAGCTCCAGTGTCAACGTTTTGTGCTATTGCCACAGCTAATCCTTTTTCATCCCATTTTA
TGCGGTCCAACAAGTTATCTACCTT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1DN19TF 507 0 0
GGAACTGTTGATTCTTCTTTGCGCTTTGAAATAATTGATTCTAGTGAATACAATGTTGTT
AATGCTAGCTTGTTTCCCGAAGCCTCATCATTGTTTAGTTGATCGAAAGCCGATGTGTAG
TAACAAGTCTCTGCTCCTGTGTGACAAGTAGGCCCATCAGGTGTTCTTGATCGGCTGAAG
AATGTAGCTTTACGAGAAGTGAGGGTTGTGGAGAGAGCCTCTCTGTTAACAAATCCTTGC
ATTAACACAGCTCCAGTGTCAACGTTTTGTGCTATTGCCACAGCTAATCCTTTTTCATCC
CATTTTATGCGGTCCAACAAGTTATCTACCTTAGCTTGGAGAGCAATGTTGTTATCATTA
GAAGCGAATACGACGCCACTGGATCTGCTGCTTCTCTGCTTGATGCACAAGGCTTTGGGG
ATGAAGCAGTTACTTGTCGCCTGTAAAGACTGTGTTAATGCATTGTACGATACCGCCATT
AACGCAAAGTGAATCGTCGACGACAGC

QA 1 507 1 507
DS 



AS 1 4

CO CL2212Contig1 1165 4 18 U
AGGGGTTAATACTAATTTTGTAAAACAATTAAGCTACACAAAAGATGATGCTCCAAACGA
ATTCAGCATAATTGTATGTAAAAACAATCACACTTTTGTCTTCACGCAACTTTTTTTACA
TAACACACTAACACACACAAGATGTTTCCAGCTTTGACATTTATCTCTCTTACAAGGCAG
GTGGATATGCAATGTTATTAAAGGCTGTTTCACTCCTCTGCACTGCCCTCTGAACCGCTC
TTCTCAAGCTCCACTCGTAACAAAACTCCAATGTCAGCCTTAGTGCTGTGCCTAGCCCTA
GCACCACTATCACTCCAATGATTATGTTAACCGGGAGTGCAGACACACCAAGTGTGATGG
ATATTAACACATCCAGCATTAGACCGCCTATCAGAATTGAGAAAGCTACCCATAGAGGAT
TGAAACATCCTCTCTCGCGCTGCTCTTGTCTATAGCTGGGATCAATCCTCCAAACCCAGT
AATTTGTAGTTGGATGGGTCTCTGGGGGTGGCACGTTGACAGCCACTGCCTGGCAGATCT
CGCACTGATTAGAGCCTTTTGTGCGAAACCAAGCATCTATGCATGACCTATGGGATTTAG
CAAGGCCACCACGACATAGGCACCCCAGTTCTATCAAAGCCTCTTCTTTCTCTTGCTGAC
AAACCCTACACTGCTCGTGAGAGCTGAAGTTTCTGGACAAACAAACCTTTTTGGGGGACT
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TTGAATCTCCATTGCAGACAACAATGGTGAGGTGGTTCACTTCCTTGGCAGATTCATTTA
CTAACTCGCTCTGCTTCTCCGGAGTCTTGTCCTGCTGCTGCTTCCCAAGGTCACCAGCGG
GGTTGGAGCTAATACTATGCATCTGATCCTTGCCTTCCACAACAAAAAGTTCCTTCTTCT
CCTAGGTACCCATACAGACCTTCAACAACAAAGTCGTTTCCTTTAACTCTCTCTCTCTCT
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CCGTTTCAGATTCAATACGTATGAAATCGGAGGAGGAGGAGTAGAGCAGAGCACACAGAT
GTTGTGAATCGAAAAAAACAAAAAA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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ATATTAACACATCCAGCATTAGACCGCCTA

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TGCAATGTTATTAAAGGCTGTTTCACTCCTCTGCACTGCCCTCTGAACCGCTCTTCTCAA
GCTCCACTCGTAGCAGAACTCCAATGTCAGCCTTAGTGCTGTGCCTAGCCCTAGCACCAC
TATCACTCCAATGATTATGTTAACCGGGAGTGCAGACACACCAAGTGTGATGGATATTAA
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CCCAGTTCTATCAAAGCCTCTTCTTTCTCTTGCTGACAAACCCTACACTGCTCGTGAGAG
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TAGATCTGAGCCAATTCTACGGTTTCACGTGCCCCACTTGAATCTCCATTGCAGACAACA
ATGGTGAGGTGGTTCACTTCCTTGGCAGATTCATTTACTAACTCGCTCTGCTTCTCCGGA
GTCTTGTCCTGCTGCTGCTTCTCAAGGTCACCAGCGGGGTTGGAGCTAATACTATGCATC
TGATCCTTGCCTTCCACAACAAAAAGTTCCTTCTTCTCCTAGGTACCCATACAGACCTTC
AACAACAAAGTCGTTTCCTTTAACTCTCTCTCTCTCTCT**CCCTTCCAGTTAACTGAAG
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TA

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TGGCAGATCTCGCACTGATTAGAGC*TTTTGTGCGAAACCAAGCATCTATGCATGACCTA
TGGGATTTAGCAAGGCCACCACGACATAGGCACCCCAGTTCTATCAAAGCCTCTTCTTTC
TCTTGCTGACAAACCCTACACTGCTCGTGAGAGCTGAAGTTTCTGGACATACAAACCTTT
TTGGGGGACTCTTCCCTCTCAGCTGCTGGCCCATAGATCTGAGCCAATTCTACGGTTTCA
CGTGCCCCACTTGAATCTCCATTGCAGACAACAATGGTGAGGTGGTTCACTTCCTTGGCA
GATTCATT*ACTAACTCGCTCTGCTTCTCCGGAGTCTTGTCCTGCTGCTGCTTCCCAAGG
TCACCAGCGGGGTTGGAGCTAATACTATGCATCTGATCCTTGCCTTCCACAACAAAAAGT
TCCTTCTTCTCCTAGGTACCCATACAGACCTTCAACAACAAAGTCGTTTCCTTTAACTCT
CTCTCTCTCTCTCTCCCTTCCAGTTAACTGAAGCTAGAACAAAACTAAAGCTTTGAACAT
AGAAGCGCTTCCGTTTCAGATTCAATACGTATGAAATCGGAGGAGGAGGAGTAGAGCAGA
GCACACAGATGTTGTGAATCGAAAAAAACAAAAAA

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 4

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AAAAGGACTCTTTTATCATTTGATCATGCCTATTGTCTTGTTCTAGGCTATATTATAGCT
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GAATTCATTCTGGTTAGACAATGCCCACGACTTATTGTTTGCAAATTTCGGGATGCGAAA
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GCTGATTAC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1CB20TF U 1
AF RS1FW94TF U 52
AF RS1FO53JQ C 171
AF RS1FO53TF U 171
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GGGGTTCAGAAATGGCGGAATCAAAGGCAAAAATGGCAGAAATCAGGGAATGGATTGTAG
AACACAAGCTTCGTACCGTTGGTTGTTTATGGCTGAGTGGGATCTCTGGTTCAATCGCCT
ACAACTGGTCTAAACCTGGTATGAAAACCAGTGTCCGAATCATCCACGCCAGGCTACATG
CTCAGGCGCTGACATTAGCCGCTCTAGCTGGAGCAGCTGCAGTGGAGTACTACGATCACA
AAACTGGAACCACCGATCGCTACCCCAAATTTCTCAAGCCCGACAACTTGACCAAAGACT
AGAAGGACTCTTTTATCATTTGATCATGCCTATTGTCTTGTTCTAGGCTATATTATAGCT
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GAATTCATTCTGGTT

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DS 

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GGATTGTAGAACACAAGCTTCGTACCGTTGGTTGTTTATGGCTGAGTGGGATCTCTGGTT
CAATCGCCTACAACTGGTCTAAACCTGGTATGAAAACCAGTGTCCGAATCATCCACGCCA
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ACGATCACAAAACTGGAACCACCGATCGCTGCCCCAAATTTCTCAAGCCCGACAACTTGA
CCAAAGACTAAAAGGACTCTTTTATCATTTGATCATGCCTATTGTCTTGTTCTAGGCTAT
ATTATAGCTACTAGTCCCATTTTTTCATGTTTTTTATATATGTCCTTCTTTTACTACTTT
GAATGAAATGAATTCATTCTGGTTAGACAATGCCCACGACTTATTGTTT

QA 1 469 1 469
DS 

RD RS1FO53JQ 437 0 0
G
CAATCGCCTACAACTGGTCTAAACCTGGTATGAAAACCAGTGTCCGAATCATCCACGCCA
GGCTACATGCTCAGGCGCTGACATTAGCCGCTCTAGCTGGAGCAGCTGCAGTGGAGTACT
ACGATCACAAAACTGGAACCACCGATCGCTACCCCAAATTTCTCAAGCCCGACAACTTGA
CCAAAGACTAAAAGGACTCTTTTATCATTTGATCATGCCTATTGTCTTGTTCTAGGCTAT
ATTATAGCTACTAGTCCCATTTTTTCATGTTTTTTATATATGTCCTTCTTTTACTACTTT
GAATGAAATGAATTCATTCTGGTTAGACAATGCCCACGACTTATTGTTTGCAAATTTCGG
GATGCGAAAATGTAAGAGGTACTTACAGAAGATTATATGAATAAAATTGGACTTACATCT
GTTTATGAAGCTGATT

QA 2 437 2 437
DS 

RD RS1FO53TF 439 0 0
G
CAATCGCCTACAACTGGTCTAAACCTGGTATGAAAACCAGTGTCCGAATCATCCACGCCA
GGCTACATGCTCAGGCGCTGACATTAGCCGCTCTAGCTGGAGCAGCTGCAGTGGAGTACT
ACGATCACAAAACTGGAACCACCGATCGCTACCCCAAATTTCTCAAGCCCGACAACTTGA
CCAAAGACTAAAAGGACTCTTTTATCATTTGATCATGCCTATTGTCTTGTTCTAGGCTAT
ATTATAGCTACTAGTCCCATTTTTTCATGTTTTTTATATATGTCCTTCTTTTACTACTTT
GAATGAAATGAATTCATTCTGGTTAGACAATGCCCACGACTTATTGTTTGCAAATTTCGG
GATGCGAAAATGTAAGAGGTACTTACAGAAGATTATATGAATAAAATTGGACTTACATCT
GTTTATGAAGCTGATTAC

QA 2 439 2 439
DS 



AS 1 4

CO CL2214Contig1 994 4 9 U
GGAGAGCGCCACAAGAAAATTTACAAAGATGGCTTTTGCCATTGCTTCTGCTCTCGCTTC
CACACTCTCTTTATCCACGAGCAGAGTACAAAATGCACGAGGAGCGTTCTCATCACGCGT
CGATGGAAGAACGACCGAGCGTTTGGTGGTGAATCGTGCCGGCAAAGAAGTTTCTAGCGT
CTGTGAACCACTTCCTCCGGACCGTCCTATGTGGTTCCCTGGTACTTCTCCTCCTGAATG
GCTCGATGGTAGTCTTCCTGGTGATTTCGGTTTCGATCCTCTTGGTCTAGGGTCTGATCC
GGAAACTCTTAGATGGTTTGCGCAAGCTGAGCTCATACACAGCCGGTGGGCCATGCTGGC
AGTAACCGGTATCTTAATACCGGAATGTCTGGAGCGGTTAGGTTTCATCGAGAATTATTC
GTGGTATGACGCAGGGCCACGCGAGTATTTCGCGGATTCCACTACCTTATTTGTGGCCCA
GTTAGTGTTAATGGGGTGGGCTGAAGGTAGACGATGGGCTGATTTTATCAAACCGGGTTC
GGTTGACATAGAGCCTCAGTATCCGCACAAGGTGAATCCTAAACCGGATGTTGGTTACCC
GGGAGGTTTGTGGTTCGACCCGATGATGTGGGGG*AGAGGTTCTCCTGATCCGGTCATGG
TTATGAGAACTAAAGAGATTAAAAACGGACGGTTAGCGATGCTTGCTTTCGTTGGGTTCT
GTTTCCAAGCTAACTACAGTGCTAGTCAAGATCCAATTGAGAATCTCATGGCTCATCTCG
CTGATCCTGGTCACTGCAACGTCTTCTCAGCATTTACATCACAGTGATCACATTGATGGA
GATTAGTTGCGGCGAATACAATTTTCTTATGGCTGTTTAAGCAACCAATGATGTTATAAC
TTTGGTGTATAGTATCAGTTACGTTACTGTTATGAATTAAATTATTTGTATATTGTTGTT
TTATAAAGAGACGAAATTCAAAAACTGTTAGCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D223TF U 1
AF RS1AE23TF U 4
AF RS1AE23JQ C 298
AF RS1D223JQ C 307
BS 1 436 RS1D223TF
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BS 800 800 RS1D223JQ
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BS 978 994 RS1D223JQ

RD RS1D223TF 615 0 0
GGAGAGCGCCACAAGAAAATTTACAAAGATGGCTTTTGCCATTGCTTCTGCTCTCGCTTC
CACACTCTCTTTATCCACGAGCAGAGTACAAAATGCACGAGGAGCGTTCTCATCACGCGT
CGATGGAAGAACGACCGAGCGTTTGGTGGTGAATCGTGCCGGCAAAGAAGTTTCTAGCGT
CTGTGAACCACTTCCTCCGGACCGTCCTATGTGGTTCCCTGGTACTTCTCCTCCTGAATG
GCTCGATGGTAGTCTTCCTGGTGATTTCGGTTTCGATCCTCTTGGTCTAGGGTCTGATCC
GGAAACTCTTAGATGGTTTGCGCAAGCTGAGCTCATACACAGCCGGTGGGCCATGCTGGC
AGTAACCGGTATCTTAATACCGGAATGTCTGGAGCGGTTAGGTTTCATCGAGAATTATTC
GTGGTATGACGCAGGGTCACGCGAGTATTTCGCGGATTCCACTACCTTATTTGTGGCCCA
GTTAGTGTTAATGGGGTGGGCTGAAGGTAGACGATGGGCTGATTTTATCAAACCGGGTTC
GGTTGACATAGAGCCTCAGTATCCGCACAAGGTGAATCCTAAACCGGATGTTGGTTACCC
GGGAGGTTTGTGGTT

QA 1 615 1 615
DS 

RD RS1AE23TF 797 0 0
GGGT
GCCACAAGAAAATTTACAAAGATGGCTTTTGCCATTGCTTCTGCTCTCGCTTCCACACTC
TCTTTATCCACGAGTAGAGTACAAAATGCACGAGGAGCGTTCTCATCACGCGTCGATGGA
AGAACGACCGAGCGTTTGGTGGTGAATCGTGCCGGCAAAGAAGTTTCTAGCGTCTGTGGA
CCACTTCCTCCGGACCGTCCTATGTGGTTCCCTGGTACTTCTCCTCCTGAATGGCTCGAT
GGTAGTCTTCCTGGTGATTTCGGTTTCGATCCTCTTGGTCTAGGGTCTGATCCGGAAACT
CTTAGATGGTTTGCGCAAGCTGAGCTCATACATAGCCGGTGGGCCATGCTGGCAGTAACC
GGTATCTTAATACCGGAATGTCTGTAGCGGTTAGGTTTCATCGAGAATTATTCGTGGTAT
GACGCAGGGCCACGCGAGTATTTCGCGGATTCCACTACCTTATTTGTGGTCCAGTTAGTG
TTAATGGGGTGGGCTGAAGGTAGACGATGGGCTGATTTTATCAAACCGGGTTCGGTTGAC
ATAGAGCCTCAGTATCCGCACAAGGTGAATCCTAAACCGGATGTTGGTTACCCGGGAGGT
TTGTGGTTCGACCCGATGATGTGGGGGGAGAGGTTCTCCTGATCCGGTCATGGTTATGAG
AACTAAAGAGATTAAAAACGGACGGTTAGCGATGCTTGCTTTCGTTGGGTTCTGTTTCCA
AGCTAACTACAGTGCTAGTCAAGATCCAATTGAGAATCTCATGGCTCATCTCGCTGATCC
TGGTCACTGCAA
T

QA 5 796 5 796
DS 

RD RS1AE23JQ 682 0 0
TCCGGAAACTCTTAGATGGTTTGCGCAAGCTGAGCTCATACATAGCCGGTGGGCCATGCT
GGCAGTAACCGGTATCTTAATACCGGAATGTCTGTAGCGGTTAGGTTTCATCGAGAATTA
TTCGTGGTATGACGCAGGGCCACGCGAGTATTTCGCGGATTCCACTACCTTATTTGTGGT
CCAGTTAGTGTTAATGGGGTGGGCTGAAGGTAGACGATGGGCTGATTTTATCAAACCGGG
TTCGGTTGACATAGAGCCTCAGTATCCGCACAAGGTGAATCCTAAACCGGATGTTGGTTA
CCCGGGAGGTTTGTGGTTCGACCCGATGATGTGGGGG*AGAGGTTCTCCTGATCCGGTCA
TGGTTATGAGAACTAAAGAGATTAAAAACGGACGGTTAGCGATGCTTGCTTTCGTTGGGT
TCTGTTTCCAAGCTAACTACAGTGCTAGTCAAGATCCAATTGAGAATCTCATGGCTCATC
TCGCTGATCCTGGTCACTGCAATGTCTTCTCAGCATTTACATCACAGTGATCACATTGAT
GGAGATTAGTTGCGGCGAATACAATTTTCTTATGGCTGTTTAAGCAACCAATGATGTTAT
AACTTTGGTGTATAGTATCAGTTACGTTACTGTTATGAATTAAATTATTTGTATATTGTT
GTTTTATAAAGAGACGAAAT
CC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RS1D223JQ 688 0 0
TCTTAGATGGTTTGCGCAAGCTGAGCTCATACACAGCCGGTGGGCCATGCTGGCAGTAAC
CGGTATCTTAATACCGGAATGTCTGGAGCGGTTAGGTTTCATCGAGAATTATTCGTGGTA
TGACGCAGGGTCACGCGAGTATTTCGCGGATTCCACTACCTTATTTGTGGCCCAGTTAGT
GTTAATGGGGTGGGCTGAAGGTAGACGATGGGCTGATTTTATCAAACCGGGTTCGGTTGA
CATAGAGCCTCAGTATCCGCACAAGGTGAATCCTAAACCGGATGTTGGTTACCCGGGAGG
TTTGTGGTTCGACCCGATGATGTGGGGG*AGAGGTTCTCCTGATCCGGTCATGGTTATGA
GAACTAAAGAGATTAAAAACGGACGGTTAGCGATGCTTGCTTTCGTTGGGTTCTGTTTCC
AAGCTAACTACAGTGCTAGTCAAGATCCAATTGAGAATCTCATGGCTCATCTCGCTGATC
CTGGTCACTGCAACGTCTTCTCAGCATTTACATCACAGTGATCACATTGATGGAGATTAG
TTGCGGCGAATACAATTTTCTTATGGCTGTTTAAGCAACCAATGATGTTATAACTTTGGT
GTATAGTATCAGTTACGTTACTGTTATGAATTAAATTATTTGTATATTGTTGTTTTATAA
AGAGACGAAATTCAAAAACTGTTAGCCG

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 4

CO CL2215Contig1 1060 4 7 U
ATTCTCACTTGTGACATAATATAAAAGACCCAAAATCTCTCTCATTAGCTATCTAGCGCG
ATAGGGAGAGAGATCGATTTACACGTTGATACGCACGCACGACCAGAAGGTATCAGGTAT
GGTGAAGGAGAATGATTATTATGACATTTTAGCAGTCAAAACTGATGCTTCCGAAGCTGA
CTTAGAATCATACGAGCCTGACATCAGAAAGCAAATGCTCCAAGACAAGATCAAAGCTCT
TCAGAAGGAGAGGGAAGACAAACTCGCCGCTACGTTGAAAAACAAACTCGAACCGTTTGT
GGAAGGACTTACCGACGAGTTCACCGAATGCTCGAACCAAGAGGCAAAGAGTCTTTCTTC
TGCTGGTTTCGGGGAGGCGATGATGCACACGATCGGTTACATATACACGAGAAAAGCCGC
TAAAGAAATAGGGAAAGGCAAACGGTTTTTGAAAGTGCCCTTCTTAGCTGAGTGGGTGCG
TGACAAAGGGCACCACATGAAGTCTCAAGTGATGGCTGCTTCTGGTGCGGTCTCGTTGCT
TCAGTTGCAGGACGAAGTGAACAGGTTGCATGAGCACCAAGGAGATAATAAAGAGGAGCA
TATTCAGAAAGCCATCGAGGCTAAAATGGATGCTTTGCTTCAATCTCTTTGGCAGATCAA
TGTTCTTGACATCGAGTCAACTCTCTCTCACGTCTGCCAATCTGTGCTTAGAGATCCAAG
TGTTTCCAAAGATGTTTTTCGAGCTAGAGCCGCAGGACTGAGGAAACTTGGAACGATCCT
CCAGGGGGCTAAGAAGCCATACACCAGAGGAAGCAGCTTACGTCACGAAGCCGTGAAACT
GGACACCGGAGGTTCTTCAAACGCGACGCCTTGAAATTCACATCACCTTTCGCCAGAAAA
AAAAGAGAGAAACCTGAATTTCATAAGCTGTTTTCTTTTCTTACATATTTTGTTTGGCTA
TTGGCTCAAGTTTGGATTTGTCTTTTGGTCTTTTATTTTTAATTAATTTCATAGTTTTGT
AGTGAGATTTTTCATAAATGAGATTTATCAGACCTATCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FL10TF U 1
AF RS1FL10JQ C 357
AF RS1EF13JQ C 493
AF RS1EF13TF U 459
BS 1 713 RS1FL10TF
BS 714 714 RS1EF13TF
BS 715 724 RS1FL10TF
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BS 738 1054 RS1EF13TF
BS 1055 1060 RS1FL10JQ

RD RS1FL10TF 724 0 0
ATTCTCACTTGTGACATAATATAAAAGACCCAAAATCTCTCTCATTAGCTATCTAGCGCG
ATAGGGAGAGAGATCGATTTACACGTTGATACGCACGCACGACCAGAAGGTATCAGGTAT
GGTGAAGGAGAATGATTATTATGACATTTTAGCAGTCAAAACTGATGCTTCCGAAGCTGA
CTTAGAATCATACGAGCCTGACATCAGAAAGCAAATGCTCCAAGACAAGATCAAAGCTCT
TCAGAAGGAGAGGGAAGACAAACTCGCCGCTACGTTGAAAAACAAACTCGAACCGTTTGT
GGAAGGACTTACCGACGAGTTCACCGAATGCTCGAACCAAGAGGCAAAGAGTCTTTCTTC
TGCTGGTTTCGGGGAGGCGATGATGCACACGATCGGTTACATATACACGAGAAAAGCCGC
TAAAGAAATAGGGAAAGGCAAACGGTTTTTGAAAGTGCCCTTCTTAGCTGAGTGGGTGCG
TGACAAAGGGCACCACATGAAGTCTCAAGTGATGGCTGCTTCTGGTGCGGTCTCGTTGCT
TCAGTTGCAGGACGAAGTGAACAGGTTGCATGAGCACCAAGGAGATAATAAAGAGGAGCA
TATTCAGAAAGCCATCGAGGCTAAAATGGATGCTTTGCTTCAATCTCTTTGGCAGATCAA
TGTTCTTGACATCGAGTCAACTCTCTCTCACGTCTGCCAATCTGTGCTTAGAGCTCCAAG
TGTT

QA 1 724 1 724
DS 

RD RS1FL10JQ 704 0 0
CTTCTGCTGGTTTCGGGGAGGCGATGATGCACACGATCGGTTACATATACACGAGAAAAG
CCGCTAAAGAAATAGGGAAAGGCAAACGGTTTTTGAAAGTGCCCTTCTTAGCTGAGTGGG
TGCGTGACAAAGGGCACCACATGAAGTCTCAAGTGATGGCTGCTTCTGGTGCGGTCTCGT
TGCTTCAGTTGCAGGACGAAGTGAACAGGTTGCATGAGCACCAAGGAGATAATAAAGAGG
AGCATATTCAGAAAGCCATCGAGGCTAAAATGGATGCTTTGCTTCAATCTCTTTGGCAGA
TCAATGTTCTTGACATCGAGTCAACTCTCTCTCACGTCTGCCAATCTGTGCTTAGAGCTC
CAAGTGTTTCCAAAGATGTTTTTCGAGCTAGAGCCGCAGGACTGAGGAAACTTGAAACGA
TCCTCCAGGGGGCTAAGAAGCCATACACCAGAGGAAGCAGCTTACGTCACGAAGCCGTGA
AACTGGACACCGGAGGTTCTTCAAACGCGACGCCTTGAAATTCACATCACCTTTCGCCAG
AAAAAAAAGAGAGAAACCTGAATTTCATAAGCTGTTTTCTTTTCTTACATATTTTGTTTG
GCTATTGGCTCAAGTTTGGATTTGTCTTTTGGTCTTTTATTTTTAATTAATTTCATAGTT
TTGTAGTGAGATTTTTCATAAATGAGATTTATCAGACCTATCCG

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DS 

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CGAAGTGAACAGGTTGCATGAGCACCAAGGAGATAATAAAGAGGAGCATATTCAGAAAGC
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CGAGTCAACTCTCTCTCACGTCTGCCAATCTGTGCTTAGAGATCCAAGTGTTTCCAAAGA
TGTTTTTCGAGCTAGAGCCGCAGGACTGAGGAAACTTGGAACGATCCTCCAGGGGGCTAA
GAAGCCATACACCAGAGGAAGCAGCTTACGTCACGAAGCCGTGAAACTGGACACCGGAGG
TTCTTCAAACGCGACGCCTTGAAATTCACATCACCTTTCGCCAGAAAAAAAAGAGAGAAA
CCTGAATTTCATAAGCTGTTTTCTTTTCTTACATATTTTGTTTGGCTATTGGCTCAAGTT
TGGATTTGTCTTTTGGTCTTTTATTTTTAATTAATTTCATAGTTTTGTAGTGAGATTTTT
CATAAATGAGATTTATCAGACC
C

QA 1 562 1 562
DS 

RD RS1EF13TF 597 0 0
CCTTCTTAGCTGAGTGGGTGCGTGACAAAGGGCACCACATGAAGTCTCAAGTGATGGCTG
CTTCTGGTGCGGTCTCGTTGCTTCAGTTGCAGGACGAAGTGAACAGGTTGCATGAGCACC
AAGGAGATAATAAAGAGGAGCATATTCAGAAAGCCATCGAGGCTAAAATGGATGCTTTGC
TTCAATCTCTTTGGCAGATCAATGTTCTTGACATCGAGTCAACTCTCTCTCACGTCTGCC
AATCTGTGCTTAGAGATCCAAGTGTTTCCAAAGATGTTCTTCGAGCTAGAGCCGCAGGAC
TGAGGAAACTTGGAACGATCCTCCAGGGGGCTAAGAAGCCATACACCAGAGGAAGCAGCT
TACGTCACGAAGCCGTGAAACTGGACACCGGAGGTTCTTCAAACGCGACGCCTTGAAATT
CACATCACCTTTCGCCAGAAAAAAAAGAGAGAAACCTGAATTTCATAAGCTGTTTTCTTT
TCTTACATATTTTGTTTGGCTATTGGCTCAAGTTTGGATTTGTCTTTTGGTCTTTTATTT
TTAATTAATTTCATAGTTTTGTAGTGAGATTTTTCATAAATGAGATTTATCAGACC
C

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 4

CO CL2216Contig1 720 4 12 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAGGGAAATG
CTTAGATCCAGGATTCTACTAAAAAAACTTTTGAATTGTATAAACACAATTTTGATGCAT
ATCAATCCGCTCACGTATTCTACAATTTACAATCTTAATTAAAGACATTAACAGATCCAG
AAAGAAGATGTCGCCAAACCAAGAATTAATCTACAAGGCCGGAGAAGCCACCGGTCAAGT
TCAGCTGAAGAAGGAAGAGTACTTGAACAAAGTATCACATGCAATGAATCAGAATGCTGA
TGATCATCACACTCACTCACAGTCACACGCAGAACATGATCAGAACAATCCTTCCCTAAT
CTCACAGGCCTCTTCTGTCATTCAACAGACAGGTGGTCAAGTGAAGAATATGGCACAAGG
AGCAGCAGACGCTGTGAAAAATACTCTTGGGATGAGCCCGGCCACCAACAATCCTAGCAG
CCCGGCCGGCAGGACTCACCCGAGCAATCCTAGCAGCCCAGCCGGTACGAACCGCCCGAG
CAACCCTAGCTCAAGGAATATATAAACGGAATAATTGAAGGAACGTTGGCTGACTTCTCA
ATATAAACAAAACTCATTAATGTTGTGTTTTAACTTTTTTTAATGCTTTGTTTGTTCAAC
TTTCTGATTTTCTGGCATTTTTGTTATGAATTGATCGTATAATAATATCATCCATTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A315TF U 1
AF RS1C803JQ C 147
AF RS1A315TV U 100
AF RS1C803TF U 147
BS 1 254 RS1A315TF
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BS 713 720 RS1C803TF

RD RS1A315TF 718 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAGGGAAATG
CTTAGATCCAGGATTCTACTAAAAAAACTTTTGAATTGTATAAACACAATTTTGATGCAT
ATCAATCCGCTCACGTATTCTACAATTTACAATCTTAATTAAAGACATTAACAGATCCAG
AAAGAAGATGTCGCCAAACCAAGAATTAATCTACAAGGCCGGAGAAGCCACCGGTCAAGT
TCAGCTGAAGAAGGGAGAGTACTTGAACAAAGTATCACATGCAATGAATCAGAATGCTGA
TGATCATCACACTCACTCACAGTCACACGCAGAACATGATCAGAACAATCCTTCCCTAAT
CTCACAGGCCTCTTCTGTCATTCAACAGACAGGTGGTCAAGTGAAGAATATGGCACAAGG
AGCAGCCGACGCTGTGAAAAACACTCTTGGGATGAGCCCGGCCACCAACAATCCTAGCAG
CCCGGCCGGCAGGACTCACCCGAGCAATCCTAGCAGCCCAGCCGGTACGAACCGCCCGAG
CAACCCTAGCTCAAGGAATATATAAACGGAATAATTGAAGGAACGTTGGCTGACTTCTCA
ATATAAACAAAACTCATTAATGTTGTGTTTTAACTTTTTT*AATGCTTTGTTTGTTCAAC
TTTCTGATTTTCTGGCATTTTTGTTATGAATTAATCGTATAATAATATCATC
CATTTC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RS1C803JQ 566 0 0
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TAATCTACAAGGCCGGAGAAGCCACCGGTCAAGTTCAGCTGAAGAAGGAAGAGTACTTGA
ACAAAGTATCACATGCAATGAATCAGAATGCTGATGATCATCACACTCACTCACAGTCAC
ACGCAGAACATGATCAGAACAATCCTTCCCTAATCTCACAGGCCTCTTCTGTCATTCAAC
AGACAGGTGGTCAAGTGAAGAATATGGCACAAGGAGCAGCAGACGCTGTGAAAAATACTC
TTGGGATGAGCCCGGCCACCAACAATCCTAGCAGCCCGGCCGGCAGGACTCACCCGAGCA
ATCCTAGCAGCCCAGCCGGTACGAACCGCCCGAGCAACCCTAGCTCAAGGAATATATAAA
CGGAATAATTGAAGGAACGTTGGCTGACTTCTCAATATAAACAAAACTCATTAATGTTGT
GTTTTAACTTTTTTTAATGCTTTGTTTGTTCAACTTTTTGATTTTCTGGCATTTTTGTTA
TGAATTGATCGTATAATAATATCATC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RS1A315TV 619 0 0
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TAAAGACATTAACAGATCCAGAAAGAAGATGTCGCCAAACCAAGAATTAATCTACAAGGC
CGGAGAAGCCACCGGTCAAGTTCAGCTGAAGAAGGGAGAGTACTTGAACAAAGTATCACA
TGCAATGAATCAGAATGCTGATGATCATCACACTCACTCACAGTCACACGCAGAACATGA
TCAGAACAATCCTTCCCTAATCTCACAGGCCTCTTCTGTCATTCAACAGACAGGTGGTCA
AGTGAAGAATATGGCACAAGGAGCAGCCGACGCTGTGAAAAACACTCTTGGGATGAGCCC
GGCCACCAACAATCCTAGCAGCCCGGCCGGCAGGACTCACCCGAGCAATCCTAGCAGCCC
AGCCGGTACGAACCGCCCGAGCAACCCTAGCTCAAGGAATATATAAACGGAATAATTGAA
GGAACGTTGGCTGACTTCTCAATATAAACAAAACTCATTAATGTTGTGTTTTAACTTTTT
T*AATGCTTTGTTTGTTCAACTTTCTGATTTTCTGGCATTTTTGTTATGAATTAATCGTA
TAATAATATCATC
CATTTC

QA 1 613 1 613
DS 

RD RS1C803TF 574 0 0
TTACAATCTTAATTAAAGACATTAACAGATCCAGAAAGAAGATGTCGCCAAACCAAGAAT
TAATCTACAAGGCCGGAGAAGCCACCGGTCAAGTTCAGCTGAAGAAGGAAGAGTACTTGA
ACAAAGTATCACATGCAATGAATCAGAATGCTGATGATCATCACACTCACTCACAGTCAC
ACGCAGAACATGATCAGAACAATCCTTCCCTAATCTCACAGGCCTCTTCTGTCATTCAAC
AGACAGGTGGTCAAGTGAAGAATATGGCACAAGGAGCAGCAGACGCTGTGAAAAATACTC
TTGGGATGAGCCCGGCCACCAACAATCCTAGCAGCCCGGCCGGCAGGACTCACCCGAGCA
ATCCTAGCAGCCCAGCCGGTACGAACCGCCCGAGCAACCCTAGCTCAAGGAATATATAAA
CGGAATAATTGAAGGAACGTTGGCTGACTTCTCAATATAAACAAAACTCATTAATGTTGT
GTTTTAACTTTTTTTAATGCTTTGTTTGTTCAACTTTCTGATTTTCTGGCATTTTTGTTA
TGAATTGATCGTATAATAATATCATCCATTTCTT

QA 1 574 1 574
DS 



AS 1 4

CO CL2217Contig1 895 4 7 U
GGAAGAACGCAAACTCGTATCTGTAACACTGTTAGGTTTAAACAAGTGTCGATCTTACTT
GTTCAGCAAGCATCACAGAGATATCTTGATTAGAAGCAGCCATGTCAATTTTGCTTTCTT
TGTTTCTTTTCTTCTCCATGGTTACTTATTCAAACGCGGCCGTTTGTGTTTGTAAGGACG
GAGACGACCAAGCGCTTCAGAAGGTAATAGATTACGCGTGTGGATCAGGCGCTGACTGTT
CGCAGATTGAGCAAAATGGTTCTTGTTTCCAACCGAACACCGTGAAAAACCACTGTGATG
TCGCCGTTAACAGCTTTTATCAGAAAAAAGTTTCCACTGGTGCAACATGTGACTTTAACG
GCGCCGCCGTCATCTCCACTTCCCCTCCTTCAAATGCTTCAAGTTGTTTATCTTCTTCTA
GCTCCACTAGTACTCCAACCACCGGAACTCCATCCACCGGCAATTTTACCACCGGAACTC
CATCCACTGGAAATTCAACCTTGGGGATGCCAACCAATCCCACCACAGGAGTGCCGACTT
CATCTGTATTCCCTGGAACTACTATGGGACCATCAGGGAGCACCGTTTTCGATCCCAGCG
GTGTAGATGGGCTCTCTGTCCGAATCAAGACAATCATCGTACTAACCACTATCGTCACTG
TGGCATTGCGAGTTTAGGTGTGAGATCATCCCAGACTGGGGTTTTACTTGCTATGGACGG
CATAGAATTTGCCAACGGTGTGTTTACGTAGGTGAAAAGCTAGAGCTGTCTCTTTTGCTT
CCCACTTTCTCTTCTGGTTTGTTTTAAAACTCTTTTTAGGGTTTGGATTTACTTCTTTAA
TTAGTATTTTGTTCTATATATAAAGTTTAAAACGAATAAAGAGCTTTTCTTGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GV96TF U 23
AF RS1FH82TF U 1
AF RS1GV96JQ C 165
AF RS1FH82JQ C 168
BS 1 346 RS1FH82TF
BS 347 347 RS1GV96TF
BS 348 611 RS1FH82TF
BS 612 612 RS1GV96TF
BS 613 726 RS1FH82TF
BS 727 868 RS1GV96JQ
BS 869 895 RS1FH82JQ

RD RS1GV96TF 598 0 0
GG
AACACTGTTAGGTTTAAACAAGTGTCGATCTTACTTGTTCAGCAAGCATCACAGAGATAT
CTTGATTAGAAGCAGCCATGTCAATTTTGCTTTCTTTGTTTCTTTTCTTCTCCATGGTTA
CTTATTCAAACGCGGCCGTTTGTGTTTGTAAGGACGGAGACGACCAAGCGCTTCAGAAGG
TAATAGATTACGCGTGTGGATCAGGCGCTGACTGTTCGCAGATTGAGCAAAATGGTTCTT
GTTTCCAACCGAACACCGTGAAAAACCACTGTGATGTCGCCGTTAACAGCTTTTATCAGA
AAAAAGTTTCCACTGGTGCAACATGTGACTTTAACGGCGCCGCCGTCATCTCCACTTCCC
CTCCTTCAAATGCTTCAAGTTGTTTATCTTCTTCTAGCTCCACTAGTACTCCAACCACCG
GAACTCCATCCACCGGCAATTTTACCACCGGAACTCCATCCACTGGAAATTCAACCTTGG
GGATGCCAACCAATCCCACCACTGGAGTGCCGACTTCATCTGTATTCCCTGGAACTACTA
TGGGACCATCAGGGAGCACCGTTTTCGATCCCAGCGGTGTAGATGGGCTCTCTGTC

QA 3 598 3 598
DS 

RD RS1FH82TF 726 0 0
GGAAGAACGCAAACTCGTATCTGTAACACTGTTAGGTTTAAACAAGTGTCGATCTTACTT
GTTCAGCAAGCATCACAGAGATATCTTGATTAGAAGCAGCCATGTCAATTTTGCTTTCTT
TGTTTCTTTTCTTCTCCATGGTTACTTATTCAAACGCGGCCGTTTGTGTTTGTAAGGACG
GAGACGACCAAGCGCTTCAGAAGGTAATAGATTACGCGTGTGGATCAGGCGCTGACTGTT
CGCAGATTGAGCAAAATGGTTCTTGTTTCCAACCGAACACCGTGAAAAACCACTGTGATG
TCGCCGTTAACAGCTTTTATCAGAAAAAAGTTTCCACTGGTGCAACGTGTGACTTTAACG
GCGCCGCCGTCATCTCCACTTCCCCTCCTTCAAATGCTTCAAGTTGTTTATCTTCTTCTA
GCTCCACTAGTACTCCAACCACCGGAACTCCATCCACCGGCAATTTTACCACCGGAACTC
CATCCACTGGAAATTCAACCTTGGGGATGCCAACCAATCCCACCACAGGAGTGCCGACTT
CATCTGTATTCCCTGGAACTACTATGGGACCATCAGGGAGCACCGTTTTCGATCCCAGCG
GTGTAGATGGGTTCTCTGTCCGAATCAAGACAATCATCGTACTAACCACTATCGTCACTG
TGGCATTGCGAGTTTAGGTGTGAGATCATCCCAGACTGGGGTTTTACTTGCTATGGACGG
CATAGA

QA 1 726 1 726
DS 

RD RS1GV96JQ 704 0 0
TGT
GTTTGTAAGGACGGAGACGACCAAGCGCTTCAGAAGGTAATAGATTACGCGTGTGGATCA
GGCGCTGACTGTTCGCAGATTGAGCAAAATGGTTCTTGTTTCCAACCGAACACCGTGAAA
AACCACTGTGATGTCGCCGTTAACAGCTTTTATCAGAAAAAAGTTTCCACTGGTGCAACA
TGTGACTTTAACGGCGCCGCCGTCATCTCCACTTCCCCTCCTTCAAATGCTTCAAGTTGT
TTATCTTCTTCTAGCTCCACTAGTACTCCAACCACCGGAACTCCATCCACCGGCAATTTT
ACCACCGGAACTCCATCCACTGGAAATTCAACCTTGGGGATGCCAACCAATCCCACCACT
GGAGTGCCGACTTCATCTGTATTCCCTGGAACTACTATGGGACCATCAGGGAGCACCGTT
TTCGATCCCAGCGGTGTAGATGGGCTCTCTGTCCGAATCAAGACAATCATCGTACTAACC
ACTATCGTCACTGTGGCATTGCGAGTTTAGGTGTGAGATCATCCCAGACTGGGGTTTTAC
TTGCTATGGACGGCATAGAATTTGCCAACGGTGTGTTTACGTAGGTGAAAAGCTAGAGCT
GTCTCTTTTGCTTCCCACTTTCTCTTCTGGTTTGTTTTAAAACTCTTTTTAGGGTTTGGA
TTTACTTCTTTAATTAGTATTTTGTTCTATATATAAAGTTT

QA 4 704 4 704
DS 

RD RS1FH82JQ 728 0 0
GTTTGTAAGGACGGAGACGACCAAGCGCTTCAGAAGGTAATAGATTACGCGTGTGGATCA
GGCGCTGACTGTTCGCAGATTGAGCAAAATGGTTCTTGTTTCCAACCGAACACCGTGAAA
AACCACTGTGATGTCGCCGTTAACAGCTTTTATCAGAAAAAAGTTTCCACTGGTGCAACG
TGTGACTTTAACGGCGCCGCCGTCATCTCCACTTCCCCTCCTTCAAATGCTTCAAGTTGT
TTATCTTCTTCTAGCTCCACTAGTACTCCAACCACCGGAACTCCATCCACCGGCAATTTT
ACCACCGGAACTCCATCCACTGGAAATTCAACCTTGGGGATGCCAACCAATCCCACCACA
GGAGTGCCGACTTCATCTGTATTCCCTGGAACTACTATGGGACCATCAGGGAGCACCGTT
TTCGATCCCAGCGGTGTAGATGGGTTCTCTGTCCGAATCAAGACAATCATCGTACTAACC
ACTATCGTCACTGTGGCATTGCGAGTTTAGGTGTGAGATCATCCCAGACTGGGGTTTTAC
TTGCTATGGACGGCATAGAATTTGCCAACGGTGTGTTTACGTAGGTGAAAAGCTAGAGCT
GTCTCTTTTGCTTCCCACTTTCTCTTCTGGTTTGTTTTAAAACTCTTTTTAGGGTTTGGA
TTTACTTCTTTAATTAGTATTTTGTTCTATATATAAAGTTTAAAACGAATAAAGAGCTTT
TCTTGCTT

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 4

CO CL2218Contig1 543 4 10 U
GGATTACAGTCGTCTTCGACTCGCTTTGATCGGAGTAAAAGCTCAGAAGAACTCATAAGG
TTCTGTCTGTCGTCAATGGGGGGAAGCTATGTGGAGCAAGCTCGTGAGAATCACGTCAAG
AAGAAGGTTGAAGAAGCGCTGCGTAGCAAGATGAAGGCAAAGGCATTAAACGAATGTGAT
CAGTACGTCTCCAAGTATGCTGAATGCGCCACGGGAAGAACCTTCTCTGTGGTGTGGACA
TGTCGTAAGCAAGCTAAAGAGCTCAACACCTGCCTCCATCAGTTCACCAATGACAAAGTG
TTGGAGGAAATGAAGAGAGAGTACATGATTCAGGAAGAGGGTAAAGTCTCTGCTTCCACC
ACATAAATTTTTTCGTTGGACAAAAGACTTCGAGTTGGACCAATATAAAGGTTGTCGCCT
TGCTTCTTGTTGATCATGGACTAAATAGATCCTTATGCTTTTCTAAAGATCCGAGTCTTG
ACTATGGCCTTTCTACAATAAAAGCGTTTATTCACTACAAGAAAAGTAATAGATTTTGTT
TGT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1AO58TFB U 1
AF RS1GD19JQ C 33
AF RS1GD19TF U 33
AF RS1BI08TF U 4
BS 1 55 RS1AO58TFB
BS 56 56 RS1GD19TF
BS 57 113 RS1AO58TFB
BS 114 114 RS1BI08TF
BS 115 301 RS1AO58TFB
BS 302 302 RS1BI08TF
BS 303 422 RS1AO58TFB
BS 423 423 RS1GD19TF
BS 424 516 RS1AO58TFB
BS 517 543 RS1BI08TF

RD RS1AO58TFB 516 0 0
GGATTACAGTCGTCTTCGACTCGCTTTGATCGGAGTAAAAGCTCAGAAGAACTCAGAAGG
TTCTGTCTGTCGTCAATGGGGGGAAGCTATGTGGAGCAAGCTCGTGAGAATCA*GTCAAG
AAGAAGGTTGAAGAAGCGCTGCGTAGCAAGATGAAGGCAAAGGCATTAAACGAATGTGAT
CAGTACGTCTCCAAGTATGCTGAATGCGCCACGGGAAGAACCTTCTCTGTGGTGTGGACA
TGTCGTAAGCAAGCTAAAGAGCTCAACACCTGCCTCCATCAGTTCACCAATGACAAAGTG
TCGGAGGAAATGAAGAGAGAGTACATGATTCAGGAAGAGGGTAAAGTCTCTGCTTCCACC
ACATAAATTTTTTCGTTGGACAAAAGACTTCGAGTTGGACCAATATAAAGGTTGTCGCCT
TGTTTCTTGTTGATCATGGACTAAATAGATCCTTATGCTTTTCTAAAGATCCGAGTCTTG
ACTATGGCCTTTCTACAATAAAAGCGTTTATTCACT

QA 1 516 1 516
DS 

RD RS1GD19JQ 464 0 0
GG
GTAAAAGCTCAGAAGAACTCATAAGGTTCTGTCTGTCGTCAATGGGGGGAAGCTATGTGG
AGCAAGCTCGTGAGAATCACGTCAAGAAGAAGGTTGAAGAAGCGCTGCGTAGCAAGATGA
AGGCAAAGGCATTAAACGAATGTGATCAGTACGTCTCCAAGTATGCTGAATGCGCCACGG
GAAGAACCTTCTCTGTGGTGTGGACATGTCGTAAGCAAGCTAAAGAGCTCAACACCTGCC
TCCATCAGTTCACCAATGACAAAGTGTTGGAGGAAATGAAGAGAGAGTACATGATTCAGG
AAGAGGGTAAAGTCTCTGCTTCCACCACATAAATTTTTTCGTTGGACAAAAGACTTCGAG
TTGGACCAATATAAAGGTTGTCGCCTTGCTTCTTGTTGATCATGGACTAAATAGATCCTT
ATGCTTTTCTAAAGATCCGAGTCTTGACTATGGCCTTTCTAC

QA 3 464 3 464
DS 

RD RS1GD19TF 464 0 0
GG
GTAAAAGCTCAGAAGAACTCATAAGGTTCTGTCTGTCGTCAATGGGGGGAAGCTATGTGG
AGCAAGCTCGTGAGAATCACGTCAAGAAGAAGGTTGAAGAAGCGCTGCGTAGCAAGATGA
AGGCAAAGGCATTAAACGAATGTGATCAGTACGTCTCCAAGTATGCTGAATGCGCCACGG
GAAGAACCTTCTCTGTGGTGTGGACATGTCGTAAGCAAGCTAAAGAGCTCAACACCTGCC
TCCATCAGTTCACCAATGACAAAGTGTTGGAGGAAATGAAGAGAGAGTACATGATTCAGG
AAGAGGGTAAAGTCTCTGCTTCCACCACATAAATTTTTTCGTTGGACAAAAGACTTCGAG
TTGGACCAATATAAAGGTTGTCGCCTTGCTTCTTGTTGATCATGGACTAAATAGATCCTT
ATGCTTTTCTAAAGATCCGAGTCTTGACTATGGCCTTTCTAC

QA 3 464 3 464
DS 

RD RS1BI08TF 540 0 0
GG
ACAGTCGTCTTCGACTCGCTTTGATCGGAGTAAAAGCTCAGAAGAACTCAGAAGGTTCTG
TCTGTCGTCAATGGGGGGAAGCTATGTGGAGCAAGCTCGTGAGAATCACGTCAAGAAGAA
GGTTGAAGAAGCGCTGCGTAGCAAGATGAAGGCAAAGGCATTAAACGAATGTGATCAGTA
CGTCTCCAAGTATGCTGAATGCGCCACGGGAAGAACCTTCTCTGTGGTGTGGACTTGTCG
TAAGCAAGCTAAAGAGCTCAACACCTGCCTCCATCAGTTCACCAATGACAAAGTGTTGGA
GGAAATGAAGAGAGAGTACATGATTCAGGAAGAGGGTAAAGTCTCTGCATCCACCACATA
AATTTTTTCGTTGGACAAAAGACTTCGAGTTGGACCAATATAAAGGTTGTCGCCTTGTTT
CTTGTTGATCATGGACTAAATATATCCTTATGCTTTTCTAAAGATCCGAGTCTTGACTAT
GGCCTTTCTACAATAAAAGCGTTTATTCACTACAAGAAAAGTAATAGATTTTGTTTGT

QA 3 540 3 540
DS 



AS 2 4

CO CL2219Contig1 1056 2 4 U
ATGTATCCACAAGATCACATTTCATGCAACTAAAACTAAAAATAAAGAATCTGTCGTTCA
AAGAAAAAAATATTTACAGGACCTCCATTCTATATTTTTTATAAACAAACTGTTGTCTTC
CAAAGAAAGAGAGAGATAGAAAAAAACTGAGTTGTTTCTACTTTAGTTTCCTTCTACCAC
GGCACACCTTTGTTTGGTCTACAACTATCACGCAACTCCACGAGGTTTTTTTTTCTTTTC
CCGGGTAACAAGAAAGGAACATTGGCGGATTTTCACTCCAGGCTATCAACTATGATATAT
GTTTTATTTGGGGGTCATATTGGACTTGCCTTTGAAACCTGGTTCTTAAAAACGGTTGTG
GCAGTCAACTGCTGCTGAGTTTGCCTTGCAACACTTTCGTAGTTGACATAAGTGATTCTT
CTCTGTTCTTCTCTTCTACTCACAATCTCTTGAGGAGGTAACTCCCTCAAAACCCATAAC
ACAAAAGCCAATGGTACGGTCGAACCTATGAAATAGTATATGATCAGAAGAACCAATGCT
TTGACACCGTGTAGTTTGCTTGGGTTCCAATGATAGAAAAGCGGAATGTGTGTGAGAAGA
GCGAGTAAAGAGCTGACGGTGAAGCATACAACTGAGACGCCTGCTAAACCTGATACCTTT
CTCATCTCTGCTGAAACTTGTTCAGACCGTACCTTCCTTAGATTAAAGAGCAGACGCATT
CCATAGAAACATATTCCTCCTCCTGTGATTAGGATTATTGAAGCGAAAATATCTACATAC
ACCTCAGCCAATGGTGAAGGATCAGCAGAGTTATCACCGGAAGCAATCCAGATAAGGATA
GCAAATGATATCATCAAGATGAACACAAGAACAACCGCCGCAACAACAAACTTCTGCCTT
GTGCCGAGATGAATTCCATGGAAAGAGCAACACTTTCTGCGGTCACTTGCACTCGAAGAG
CCTGGTTTGATCTTGGTTTTTTCAAGTAACCCTTGCTGGATGCTGTTGCTTTCTTCATCA
TCCTCATCTTCTCTTCTCATTTCCCTGATGGCAAAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DB87JQ U 1
AF RS1DX04JQ U 240
BS 1 366 RS1DB87JQ
BS 367 367 RS1DX04JQ
BS 368 523 RS1DB87JQ
BS 524 1056 RS1DX04JQ

RD RS1DB87JQ 523 0 0
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AAGAAAAAAATATTTACAGGACCTCCATTCTATATTTTTTATAAACAAACTGTTGTCTTC
CAAAGAAAGAGAGAGATAGAAAAAAACTGAGTTGTTTCTACTTTAGTTTCCTTCTACCAC
GGCACACCTTTGTTTGGTCTACAACTATCACGCAACTCCACGAGGTTTTTTTTTCTTTTC
CCGGGTAACAAGAAAGGAACATTGGCGGATTTTCACTCCAGGCTATCAACTATGATATAT
GTTTTATTTGGGGGTCATATTGGACTTGCCTTTGAAACCTGGTTCTTAAAAACGGTTGTG
GCAGTCCACTGCTGCTGAGTTTGCCTTGCAACACTTTCGTAGTTGACATAAGTGATTCTT
CTCTGTTCTTCTCTTCTACTCACAATCTCTTGAGGAGGTAACTCCCTCAAAACCCATAAC
ACAAAAGCCAATGGTACGGTCGAACCTATGAAATAGTATATGA

QA 1 523 1 523
DS 

RD RS1DX04JQ 817 0 0
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TGTTTTATTTGGGGGTCATATTGGACTTGCCTTTGAAACCTGGTTCTTAGAAACGGTTGT
GGCAGTCAACTGCTGCTGAGTTTGCCTTGCAACACTTTCGTAGTTGACATAAGTGATTCT
TCTCTGTTCTTCTCTTCTACTCACAATCTCTTGAGGAGGTAACTCCCTCAAAACCCATAA
CACAAAAGCCAATGGTACGGTCGAACCTATGAAATAGTATATGATCAGAAGAACCAATGC
TTTGACACCGTGTAGTTTGCTTGGGTTCCAATGATAGAAAAGCGGAATGTGTGTGAGAAG
AGCGAGTAAAGAGCTGACGGTGAAGCATACAACTGAGACGCCTGCTAAACCTGATACCTT
TCTCATCTCTGCTGAAACTTGTTCAGACCGTACCTTCCTTAGATTAAAGAGCAGACGCAT
TCCATAGAAACATATTCCTCCTCCTGTGATTAGGATTATTGAAGCGAAAATATCTACATA
CACCTCAGCCAATGGTGAAGGATCAGCAGAGTTATCACCGGAAGCAATCCAGATAAGGAT
AGCAAATGATATCATCAAGATGAACACAAGAACAACCGCCGCAACAACAAACTTCTGCCT
TGTGCCGAGATGAATTCCATGGAAAGAGCAACACTTTCTGCGGTCACTTGCACTCGAAGA
GCCTGGTTTGATCTTGGTTTTTTCAAGTAACCCTTGCTGGATGCTGTTGCTTTCTTCATC
ATCCTCATCTTCTCTTCTCATTTCCCTGATGGCAAAC

QA 1 817 1 817
DS 



CO CL2219Contig2 630 2 4 U
GGATCTCCTACAACCATCTGTCTCTCGGTGTGTTCTGTGATCCTCTCTCTCTCTCCACAA
ACCTAAAATCTCGGGACTTTCGATCTCAGGGGAGGAGGATCGTGAAAGAGAGGACTCGCG
ATGACGACTGGTGCGACGCTTGTCGAATCGAATACGGCTAAATGCTATGCTCCCAGCTTC
ATCACCGTCAATCTCTGTCTTGCTCTTATCGATGGCGCTCTCGCTTTCATCGCATTCCTT
CAGTTAACTCGGTTTCACCGGCGGGATAAACGAGTTGGGTGGACACGACAAAAAGTGCTT
CATCTTATGATTGGCTCCTCAAACACTGGTTCTCTCATCTATTTCGTTGCTGCCATTATA
GCAACTTGCACAAGGTGGCATCATTGGTCCACCGCATTAGGTTTTCTGCTTATGGCGTTT
CCCAAAATTCTGTTTCTCGCAACTTTTCTCCTTCTCCTCTCTTTCTGGGTAGATGTTTGC
CATCAGGGAAATGGAGAAGAGGAAGATGAGGATGATGAAGAAAGCAACAGCATCCAGCAA
GGGTTACTTGAAAAAACCAAGATCAAACCAGGCTCTTCGAGTGCAAGTGACCGCAGAAAG
TGTTGCTCTTTCCATGGAATTCATCTCGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1DB87TF U 1
AF RS1DX04TF U 37
BS 1 269 RS1DB87TF
BS 270 270 RS1DX04TF
BS 271 629 RS1DB87TF
BS 630 630 RS1DX04TF

RD RS1DB87TF 629 0 0
GGATCTCCTACAACCATCTGTCTCTCGGTGTGTTCTGTGATCCTCTCTCTCTCTCCACAA
ACCTAAAATCTCGGGACTTTCGATCTCAGGGGAGGAGGATCGTGAAAGAGAGGACTCGCG
ATGACGACTGGTGCGACGCTTGTCGAATCGAATACGGCTAAATGCTATGCTCCCAGCTTC
ATCACCGTCAATCTCTGTCTTGCTCTTATCGATGGCGCTCTCGCTTTCATCGCATTCCTT
CAGTTAACTCGGTTTCACCGGCGGGATAAGCGAGTTGGGTGGACACGACAAAAAGTGCTT
CATCTTATGATTGGCTCCTCAAACACTGGTTCTCTCATCTATTTCGTTGCTGCCATTATA
GCAACTTGCACAAGGTGGCATCATTGGTCCACCGCATTAGGTTTTCTGCTTATGGCGTTT
CCCAAAATTCTGTTTCTCGCAACTTTTCTCCTTCTCCTCTCTTTCTGGGTAGATGTTTGC
CATCAGGGAAATGGAGAAGAGGAAGATGAGGATGATGAAGAAAGCAACAGCATCCAGCAA
GGGTTACTTGAAAAAACCAAGATCAAACCAGGCTCTTCGAGTGCAAGTGACCGCAGAAAG
TGTTGCTCTTTCCATGGAATTCATCTCGG

QA 1 629 1 629
DS 

RD RS1DX04TF 594 0 0
GG
GATCCTCTCTCTCTCTCCACAAACCTAAAATCTCGGGACTTTCGATCTCAGGGGAGGAGG
ATCGTGAAAGAGAGGACTCGCGATGACGATTGGTGCGACGCTTGTCGAATCGAATACGGC
TAAATGCTATGCTCCCAGCTTCATCACCGTCAATCTCTGTCTTGCTCTTATCGATGGCGC
TCTCGCTTTCATCGCATTCCTTCAGTTAACTCGGTTTCACCGGCGGGATAAACGAGTTGG
GTGGACACGACAAAAAGTGCTTCATCTTATGATTGGCTCCTCAAACACTGGTTCTCTCAT
CTATTTCGTTGCTGCCATTATAGCAACTTGCACAAGGTGGCATCATTGGTCCACCGCATT
AGGTTTTCTGCTTATGGCGTTTCCCAAAATTCTGTTTCTCGCAACTTTTCTCCTTCTCCT
CTCTTTCTGGGTAGATGTTTGCCATCAGGGAAATGGAGAAGAGGAAGATGAGGATGATGA
AGAAAGCAACAGCATCCAGCAAGGGTTACTTGAAAAAACCAAGATCAAACCAGGCTCTTC
GAGTGCAAGTGACCGCAGAAAGTGTTGCTCTTTCCATGGAATTCATCTCGGC

QA 3 594 3 594
DS 



AS 1 2

CO CL2220Contig1 671 2 4 U
GTGATGAAAAAGTTGCAATTGCAAGACTTGTTTTATCTAAATACAAGAATACAATCAAAT
AAAACAAGGTTATATTTCTCTCAAAATCAAAAAAGTTACAACAGTTCACTTGGCTCTGAC
CATGTTACAACCCTTCTTCCTCATCTTCTTCAAATGGCTTAATTGCCAAAGAAACCTGGA
CCAGCACGCGAAAGCAGTTCTTGCCCAGCGTCTTTTCCCATCTTCACCATGTCCTCAAAC
ACATACGGACCTTTTCTTGAGGTCTCAAGAACTCGAGTACCGTCAGGGGATGCAACCAAT
CCCCTGAAATAGCAGTTGCCTTCGTCGTCCTTGGCAGCGTATCCAGCAATAGGAGTACGG
CATGAGCCATCCAACGTTTCAAGAAACGCTCTCTCGCATGCAACTGCTAGTCTCGTTTCC
TCGTGGTTCAATGAGGCTAAGTAGTTTGCCATTTTATCATCATCGGTTCTGCAGGCTATT
CCGATTGCTCCTTGAGCAACAGCTGGAAGCATCTCATCGAGAGATAAAATAGAGGCCACA
TTCTCTGTCATACTCAACCTCTTGAGACCAGCAAGAGCTAATAGAGTAGCGTGAACTTTT
CCTCCTTGAAGCTTGGATAGTCTTGTCTGCACATTACCCCTAAAGTTCTCCTCAACGCTT
AACGAAGGATA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E682JQ U 1
AF RS1FO52JQ U 1
BS 1 8 RS1E682JQ
BS 9 9 RS1FO52JQ
BS 10 586 RS1E682JQ
BS 587 671 RS1FO52JQ

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DS 

RD RS1FO52JQ 671 0 0
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AAAACAAGGTTATATTTCTCTCAAAATCAAAAAAGTTACAACAGTTCACTTGGCTCTGAC
CATGTTACAACCCTTCTTCCTCATCTTCTTCAAATGGCTTAATTGCCAAAGAAACCTGGA
CCAGCACGCGAAAGCAGTTCTTGCCCAGCGTCTTTTCCCATCTTCACCATGTCCTCAAAC
ACATACGGACCTTTTCTTGAGGTCTCAAGAACTCGAGTACCGTCAGGGGATGCAACCAAT
CCCCTGAAATAGCAGTTGCCTTCGTCGTCCTTGGCAGCGTATCCAGCAATAGGAGTACGG
CATGAGCCATCCAACGTTTCAAGAAACGCTCTCTCGCATGCAACTGCTAGTCTCGTTTCC
TCGTGGTTCAATGAGGCTAAGTAGTTTGCCATTTTATCATCATCGGTTCTGCAGGCTATT
CCGATTGCTCCTTGAGCAACAGCTGGAAGCATCTCATCGAGAGATAAAATAGAGGCCACA
TTCTCTGTCATACTCAACCTCTTGAGACCAGCAAGAGCTAATAGAGTAGCGTGAACTTTT
CCTCCTTGAAGCTTGGATAGTCTTGTCTGCACATTACCCCTAAAGTTCTCCTCAACGCTT
AACGAAGGATA

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 2

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AAAATGTATGCAGATACAGGTCCAGCGTTCCGATTCATGCAGGGCTGTTCTCCAAAACTC
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AGACTCTTGCAGACAGTCAGCCGAGGATCCGAGGAAGGTTTGCAAAAACAGAGGAGATGC
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CCTCTAAGGAGTAAGGATTAGGAAGGGGAACAAGTTGTAGTAGGGTTACTCAAATGATAT
GCTTTTATCTATGTTAGATCTTGCGAAGCTCAGTCTCTTAAGTTCTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1C333TF U 1
AF RS1C333JQ C 270
BS 1 665 RS1C333TF
BS 666 1069 RS1C333JQ

RD RS1C333TF 665 0 0
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AAAATGTATGCAGATACAGGTCCAGCGTTCCGATTCATGCAGGGCTGTTCTCCAAAACTC
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AGGCATGTGAGTATGGTTTCGGAGGAGAAGAGAGCGACCTATTCAAAGCCCCTGAGCCGA
TCATCATTGAGGAGCCAATGCTAGCCGTTGACCCACTCTCTCAAGAGATTGTCGGACTCA
GCGATCTTGGGTCGTTGCAGAGCGACCAGCAGCTTATAGAAAAGGCGTTCTACGAGTGTG
AACAGGAGGAGCTCTTGGTGAAATCAGCCATGGAGTCTCCGCTGCTCTCCGATGTACTAG
ACGCCGAGAACGTCTCTCTAGTGGCGGAAATGGACAGTAGTGGTGGTGTTGTTGTTTCTG
ATGTCGCAGTTCCTAAGAGCGTGAGCTCGGGGAACCTGAGATCGATGGATATGCCACAGC
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GAGCCTTTAGCGAAAGCGATATACAGACACTGGGGACTCGAAACGCGGGTCTAGTTCAGT
CTCAA

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DS 

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ATGGACAGTAGTGGTGGTGTTGTTGTTTCTGATGTCGCAGTTCCTAAGAGCGTGAGCTCG
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TTCGGGCGTAAAATCAAGTATGCTTGCAGGAAGACTCTTGCAGACAGTCAGCCGAGGATC
CGAGGAAGGTTTGCAAAAACAGAGGAGATGCAGAAATGAGGATTCATTTAGTTTTGGTGC
CTGAAGATAAGCAGAACAGTTTGATGCAGTGTGTTAAGCCCAACAACCTCTTTGGTGTCT
TTTTTTGTATATAAGGGTTTGTCTGAATAAGCCTCTAAGGAGTAAGGATTAGGAAGGGGA
ACAAGTTGTAGTAGGGTTACTCAAATGATATGCTTTTATCTATGTTAGATCTTGCGAAGC
TCAGTCTCTTAAGTTCTTAT

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 4

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AGGCTAATGTGGAGCCTAATGGTGTGACTTTCACTAATGTCTTCTGTGCTTGTAGCCATA
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TCCCTGAGGACAAGCATTACGCTTGCATAGTTGATGTTCTTGGCCGCTCGGGTTATCTGG
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CGCTTCTAGGAGCTTGTAAGATCCATGCCAATCTGAGTCTTGCTGAAATGGCTTGTACCC
GTTTGCTTGAGCTAGAACCTAGGAACGATGGCGCACACGTGTTGTTATCAAACATATACG
CAAAGTCTGGGAAATGGGAAAGCGTTTCTGAGCTGAGGAAGCACATGAGAGTCACCGGAC
TTAAGAAAGAGCCAGGATGCAGCTCGATTGAGATAGATGGGACGATTCACGAGTTTCTCT
CTGGAGACGATGAGCACCCGATGTGTGAGAAGGTGTACGGGAAGTTAAACGAGGTTATGG
AGAGGTTGAAAGAGAATGGCTATGAGCCAGAGATGTCACAGGTCTTGCAGATCATCGATG
AAGAAGAGATGAAGGAGCAGTCTTTGAATCTGCATAGTGAGAAGTTGGCGATTTGTTATG
GACTGATATCAACGGAGGCTCCTAAGGCGATTCGGGTGATTAAGAACCTAAGGGTGTGTG
GAGATTGTCACTCAGTTGCTAAGCTGATATCTCAGCTCTACGACAGAGAGATCATAGTCA
GGGATCGTTACCGGTTTCATCATTTCAGAAATGGGCAGTGTTCTTGTAACGATTTCTGGT
GAAAATTTCAGATTGTCTTCGTTGTCAAAATTTTGTATTGCAATCATATCATGATCATGA
CATCACTGTAGTGATATATGGACTTCCTCTCTGTACCATTAGTTACCAGAACTGTGGACA
TTTGCTGCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A224TV U 1
AF RS1A224TF U 1
AF RS1A224TR C 464
AF RS1A224JQ C 447
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BS 782 1329 RS1A224JQ

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GGGCATTGGAGTTAGGTAGATGGATCCATAGCTACATCAAAAAGCACGGCATTAGGTTGA
ATTTTTACGTTACGAGTGCTTTGATTCATATGTACTCTAAATGCGGGGATCTTGAAAAGG
CGCGTGAGGTGTTTAGCTCTGTAGAGAAGAGAGATGTGTTTGTGTGGAGCGCAATGATTG
GTGGTTTGGCGATGCACGGATGTGGAAACGAAGCCTTGGATATGTTTTATAAAATGCAAG
AGGCTAATGTGGAGCCTAATGGTGTGACTTTCACTAATGTCTTCTGTGCTTGTAGCCATA
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T

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TACCAGAACTGTG

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ATGCCGATTCCTCCAAGTGCTTCCGTCTGGGGAGCGCTTCTAGGAGCTTGTAAGATCCAT
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GATGGCGCACACGTGTTGTTATCAAACATATACGCAAAGTCTGGGAAATGGGAAAGCGTT
TCTGAGCTGAGGAAGCACATGAGAGTCACCGGACTTAAGAAAGAGCCAGGATGCAGCTCG
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GCGATTCGGGTGATTAAGAACCTAAGGGTGTGTGGAGATTGTCACTCAGTTGCTAAGCTG
ATATCTCAGCTCTACGACAGAGAGATCATAGTCAGGGATCGTTACCGGTTTCATCATTTC
AGAAATGGGCAGTGTTCTTGTAACGATTTCTGGTGAAAATTTCAGATTGTCTTCGTTGTC
AAAATTTTGTATTGCAATCATATCATGATCATGACATCACTGTAGTGATATATGGACTTC
CTCTCTGTACCATTAGTTACCAGAACTGTGGACATTTGCTGCC

QA 1 883 1 883
DS 



AS 1 4

CO CL2223Contig1 768 4 23 U
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GACATGGTTTCCACACCATTCCACTCCATCATCTTTCTCTTCCTCGTCTTCTCCGCCGGA
GTTAAAATCTCTGTCGCTGATGAACCGGAGACGCAGCCTGTTCCTGCACCATGGCCGGAG
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TACGACCTTGAATGGAACAATGGCACATCTTTCTACTATACACTTGACGCTTCCAAAACT
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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GH08TF U 1
AF RS1D057TF U 3
AF RS1D057JQ C 107
AF RS1GH08JQ C 141
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BS 150 167 RS1GH08TF
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BS 337 596 RS1GH08TF
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BS 600 600 RS1D057JQ
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RD RS1GH08TF 596 0 0
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GACATGGTTTCCACACCATTCCACTCCATCATCTTTCTCTTCTTCGTCTTCTCCGCCGGA
GTTAAAATCTCTGTCGCTGATAAGCCGGTGACGCAGCCTGTTCCTGCGCCATGGCCGGAG
CAGTTCCACGCGTTGATGTTGATGAACAAATCTGGTTCCATTGAGATTGTTGACCTATGG
TACGACTGGATCAATGGCCGTAACTTCAACATCATTCAGAAGCAGCTTGGCAAAGTAACC
TACGACCTTGAATGGAACAATGGCACATCTTTCTATTATACACTTGACGCTTCCAAAACT
TGCCGCACCGTTCATTTCGAGGTTGGAATCTTGAGGCCAAACTGGCTGGATGGAGCCACC
TATTTGGGTCAACGAAATGTGAGTGGGTTTCTCTGCAACGTATGGGAGAAGGTTGACTTC
TTATGGTACTACGAGGATGTTGTCACCAAGAGACCTGTTCAATGGATCTTCTACACAGGT
AGAGAAGCTCATGTGATGACATTTGAGGTCGGAGCTGTCCTAGAGGACGAGAAATG

QA 1 596 1 596
DS 

RD RS1D057TF 690 0 0
G
GATCTCAACAGTTACTATCATCATCTGTGTGAACCAGAGCGTGGCTTTAGACCAATCGAC
ATGGTTTCCACACCATTCCACTCCATCATCTTTCTCTTCCTCGTCTTCTCCGCCGGAGTT
AAAATCTCTGTCGCTGATGAACCGGAGACGGAGCCTGTTCCTGCACCATGGCCGGAGCAG
TTCCACGCGTTGATGTTGATGAACAAATCTGGTTCCATTGAGATTGTTGACCTATGGTAC
GATTGGATCAATGGCCGTAACTTCAACATCATCCAGAAGCAGCTTGGAAAAGTAACCTAC
GACCTTGAATGGAACAATGGCACATCTTTCTACTATACACTTGACGCTTCCAAAACTTGC
CGCACCGTTCATTTCGAGGTTGGAATCTTGAGGCCAAACTGGCTGGATGGAGCCACCTAT
TTGGGTCAACGAAATGTGAGTGGGTTTCTCTGCAACGTATGGGAGAAGGTTGACTTCTTA
TGGTACTACGAGGATGTTGTCACCAAGAGACCTGTTCAATGGATCTTCTACACAGGTAGA
TAAGCTCATGTGATGACATTTGAGGTCGGAGCTGTCCTAGAGGACGAGAAATGGCACGCT
CCAGTCTATTGTTTTCACAACGAGAAGAAGAGCAGTGAGTAATTTGATAACTTGAGACTC
TGTTTTTATTGTATGTAGACTTTTGGGAA

QA 2 690 2 690
DS 

RD RS1D057JQ 662 0 0
TCTTCTCCGCCGGAGTTAAAATCTCTGTCGCTGATGAACCGGAGACGGAGCCTGTTCCTG
CACCATGGCCGGAGCAGTTCCACGCGTTGATGTTGATGAACAAATCTGGTTCCATTGAGA
TTGTTGACCTATGGTACGATTGGATCAATGGCCGTAACTTCAACATCATCCAGAAGCAGC
TTGGAAAAGTAACCTACGACCTTGAATGGAACAATGGCACATCTTTCTACTATACACTTG
ACGCTTCCAAAACTTGCCGCACCGTTCATTTCGAGGTTGGAATCTTGAGGCCAAACTGGC
TGGATGGAGCCACCTATTTGGGTCAACGAAATGTGAGTGGGTTTCTCTGCAACGTATGGG
AGAAGGTTGACTTCTTATGGTACTACGAGGATGTTGTCACCAAGAGACCTGTTCAATGGA
TCTTCTACACAGGTAGATAAGCTCATGTGATGACATTTGAGGTCGGAGCTGTCCTAGAGG
ACGAGAAATGGCAGGCTCCAGTCTATTGTTTTCACAACGAGAAGAAGAGCAGTGAGTAAT
TTGATAACTTGAGACTCTGTTTTTATTGTATGTAGACTTTTGGGAATCTTTCAAGAAATC
AAATGTTCATCAAGGAGGCCATTTTCATCTTTTATCAAAAACTTTATTATTGTTATGAAA
CT

QA 1 662 1 662
DS 

RD RS1GH08JQ 585 0 0
TAAG
CCGGTGACGCAGCCTGTTCCTGCGCCATGGCCGGAGCAGTTCCACGCGTTGATGTTGATG
AACAAATCTGGTTCCATTGAGATTGTTGACCTATGGTACGACTGGATCAATGGCCGTAAC
TTCAACATCATTCAGAAGCAGCTTGGCAAAGTAACCTACGACCTTGAATGGAACAATGGC
ACATCTTTTTATTATACACTTGACGCTTCCAAAACTTGCCGCACCGTTCATTTCGAGGTT
GGAATCTTGAGGCCAAACTGGCTGGATGGAGCCACCTATTTGGGTCAACGAAATGTGAGT
GGGTTTTTCTGCAACGTATGGGAGAAGGTTGACTTCTTATGGTACTACGAGGATGTTGTC
ACCAAGAGACCTGTTCAATGGATCTTCTACACAGGTAGAGAAGCTCATGTGATGACATTT
GAGGTCGGAGCTGTCCTAGAGGACGAGAAATGGCAGGCTCCAGTTTATTGTTTTCACAAC
GAGAAGAAGAGCAGTGAGTAATTTGATAACTTGAGACTCTGTTTTTATTGTATGTAGACT
TTTGGGAATCTTTCAAGAAATCAAATGTTCATCAAGGAGGC

QA 5 585 5 585
DS 



AS 1 3

CO CL2224Contig1 932 3 2 U
GCTACAACAATAACAAATTTCTTTTATTTTTTGTTATTTCGTAAATATATGTGATCAAAT
CGAGATGGTTGGACATTGATACCACAACAATATAAAGTCGGTGCATTTACATACTACTTT
TTATATAAAACGAAGGTTTACGCCATAGGACACTCCCCGGAATTTAATTTCCTGCGGCTG
GCGATGGAGCATGTCTCAAGACACGGTTCATTAACATTGCCATCATCCTTCGGTGGAGCT
ACCCCAAATTTAAACTGGCGACTATAATCTTTGAAGTCTGGCTCCATCAACAGAGGAACT
CCCGTGTAGTCTTTAAAGAATGTCTGAGTTGGTAGTTTACAAGTATTGATGCATACTCCC
ACACATTTGCTCTCTTCTAGATACTGACATTTCTCCACAAAAACCCCGCTCTCCCAAAAT
TCTCCATTAGGAAGATCTATGGTATTTACTTTGCAAGGTCCCATGAGCCATTGACATGTA
AGTACAGTAACTCTCGCAACCATCAATGCAGCTATCTTCCCTTGTGCTAAAGGAGCAATA
AGAAGCTTGTAAAGCTCTAATATGAGCGGAGGAAACAACGACTTCAGTATCCGCACCGCT
GCGTCATTGGTCTGGGACCTAGTACGACCTTGCAACAAGAGAAGCTTGACAAGCTCAATA
AGACCAACGTAACCGAGTTTGTCTGAATCCGACCCGACTTCCTCCACCAGTTTGGTCCGG
AAAGAACGCATGAAGAAATCGTCGAGAGCTCCAGGCTTGTACTCCGATTTAACCTCTGAG
GAATTGGAGACGCGGCAGCAAACGCGCCGCGTGAGATCGAGAGTTCGTGTGGTGGTGGAG
CGTGGAGAAGATGAGTAGGAGAAGAGGATGGTCGTTGTCGGAGGAGGAACATGGAGAAGA
AGGATAGTCATTTCTGGGCCTCACAAGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FI72JQ U 17
AF RS1D296JQ U 1
AF RS1D296TF C 232
BS 1 776 RS1D296JQ
BS 777 932 RS1D296TF

RD RS1FI72JQ 522 0 0
ATTTCTTTTATTTTTTGTTATTTCGTAAATATATGTGATCAAATCGAGATGGTTGGACAT
TGATACCACAACAATATAAAGTCGGTGCATTTACATACTACTTTTTATATAAAACGAAGG
TTTACGCCATAGGACACTCCCCGGAATTTAATTTCCTGCGGCTGGCGATGGAGCATGTCT
CAAGACACGGTTCATTAACATTGCCATCATCCTTCGGTGGAGCTACCCCAAATTTAAACT
GGCAACTATAATCTTTGAAGTCTGGCTCCATCAACAGAGGAACTCCCATGTAGTCTTTAA
AGAATGTCTGAGTTGGTAGTTTACAAGTATTGATGCATACTCCCACACATTTGCTCTCTT
CTAGATACTGACATTTCTCCACAAAAACCCCGCTCTCCCAAGATTCTCCATTAGGAAAAT
CTATGGTATTCACTTTGCAAGGTCCCATGAGCCATTGACATGTAAGTACAGTAACTCTCG
CAACCATCAATGCAGCTATCTTCCCTTGTGCTAAAGGAGCAA

QA 1 522 1 522
DS 

RD RS1D296JQ 776 0 0
GCTACAACAATAACAAATTTCTTTTATTTTTTGTTATTTCGTAAATATATGTGATCAAAT
CGAGATGGTTGGACATTGATACCACAACAATATAAAGTCGGTGCATTTACATACTACTTT
TTATATAAAACGAAGGTTTACGCCATAGGACACTCCCCGGAATTTAATTTCCTGCGGCTG
GCGATGGAGCATGTCTCAAGACACGGTTCATTAACATTGCCATCATCCTTCGGTGGAGCT
ACCCCAAATTTAAACTGGCGACTATAATCTTTGAAGTCTGGCTCCATCAACAGAGGAACT
CCCGTGTAGTCTTTAAAGAATGTCTGAGTTGGTAGTTTACAAGTATTGATGCATACTCCC
ACACATTTGCTCTCTTCTAGATACTGACATTTCTCCACAAAAACCCCGCTCTCCCAAAAT
TCTCCATTAGGAAGATCTATGGTATTTACTTTGCAAGGTCCCATGAGCCATTGACATGTA
AGTACAGTAACTCTCGCAACCATCAATGCAGCTATCTTCCCTTGTGCTAAAGGAGCAATA
AGAAGCTTGTAAAGCTCTAATATGAGCGGAGGAAACAACGACTTCAGTATCCGCACCGCT
GCGTCATTGGTCTGGGACCTAGTACGACCTTGCAACAAGAGAAGCTTGACAAGCTCAATA
AGACCAACGTAACCGAGTTTGTCTGAATCCGACCCGACTTCCTCCACCAGTTTGGTCCGG
AAAGAACGCATGAAGAAATCGTCGAGAGCTCCAGGCTTGTACTCCGATTTAACCTC

QA 1 776 1 776
DS 

RD RS1D296TF 701 0 0
GGTGGAGCTACCCCAAATTTAAACTGGCGACTATAATCTTTGAAGTCTGGCTCCATCAAC
AGAGGAACTCCCGTGTAGTCTTTAAAGAATGTCTGAGTTGGTAGTTTACAAGTATTGATG
CATACTCCCACACATTTGCTCTCTTCTAGATACTGACATTTCTCCACAAAAACCCCGCTC
TCCCAAAATTCTCCATTAGGAAGATCTATGGTATTTACTTTGCAAGGTCCCATGAGCCAT
TGACATGTAAGTACAGTAACTCTCGCAACCATCAATGCAGCTATCTTCCCTTGTGCTAAA
GGAGCAATAAGAAGCTTGTAAAGCTCTAATATGAGCGGAGGAAACAACGACTTCAGTATC
CGCACCGCTGCGTCATTGGTCTGGGACCTAGTACGACCTTGCAACAAGAGAAGCTTGACA
AGCTCAATAAGACCAACGTAACCGAGTTTGTCTGAATCCGACCCGACTTCCTCCACCAGT
TTGGTCCGGAAAGAACGCATGAAGAAATCGTCGAGAGCTCCAGGCTTGTACTCCGATTTA
ACCTCTGAGGAATTGGAGACGCGGCAGCAAACGCGCCGCGTGAGATCGAGAGTTCGTGTG
GTGGTGGAGCGTGGAGAAGATGAGTAGGAGAAGAGGATGGTCGTTGTCGGAGGAGGAACA
TGGAGAAGAAGGATAGTCATTTCTGGGCCTCACAAGTTTCC

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 3

CO CL2225Contig1 482 3 2 U
GGAAACAAAACTTGTCGAGAAATCGATTTCAATCAAAATCCCCGACAACACCAACAGAGA
AGACATCAAAGCGGGTAAAAGGAAAAATGGTGGTGAAACCAACGGTAGCTTTGAGAGGCA
TCCTGGTAGGTGGAGTGGCGATATTCGCCAAAGTTGCAGGCGCTATGAAGGCTGCTGGGG
GTGTCAAGCTCGGTGCAGCTGCTACAGCCATGACCGTGGCTGCAACCGCAGCTGTGTCTG
GATCTAAGCAAGATCAAAAGGATGATGCCCTCAAGAAGAAGACACCACCTTCTAAGTGAA
TAATGTTACTCATCTATGTAATTCTTCTTCCTTGAACCAAGTCAATAAAATAAGAGGAAA
CTTCATGGTAGTTTTTTTTAAGTATACTTCGGTTTCTTCTGCAGAAAATTGTTTTGTTGT
TGAATATTTTATGAGTCTGCAACTTCTTACAAGCATTATTTGTATAACATAAGGATTTGT
AG


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 

AF RS1EG55TF U 1
AF RS1EG55JQ C 26
AF RS1E539TF U 5
BS 1 479 RS1EG55TF
BS 480 482 RS1E539TF

RD RS1EG55TF 480 0 0
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AGACATCAAAGCGGGTAAAAGGAAAAATGGTGGTGAAACCAACGGTAGCTTTGAGAGGCA
TCCTGGTAGGTGGAGTGGCGATATTCGCCAAAGTTGCAGGCGCTATGAAGGCTGCTGGGG
GTGTCAAGCTCGGTGCAGCTGCTACAGCCATGACCGTGGCTGCAACCGCAGCTGTGTCTG
GATCTAAGCAAGATCAAAAGGATGATGCCCTCAAGAAGAAGACACCACCTTCTAAGTGAA
TAATGTTACTCATCTATGTAATTCTTCTTCCTTGAACCAAGTCAATAAAATAAGAGGAAA
CTTCATGGTAGTTTTTTTTAAGTATACTTCGGTTTCTTCTGCAGAAAATTGTTTTGTTGT
TGAATATTTTATGAGTCTGCAACTTCTTACAAGCATTATTTGTATAACATAAGGATTTG
C

QA 1 479 1 479
DS 

RD RS1EG55JQ 455 0 0
ATTTCAATCAAAATCCCCGACAACACCAACAGAGAAGACATCAAAGCGGGTAAAAGGAAA
AATGGTGGTGAAACCAACGGTAGCTTTGAGAGGCATCCTGGTAGGTGGAGTGGCGATATT
CGCCAAAGTTGCAGGCGCTATGAAGGCTGCTGGGGGTGTCAAGCTCGGTGCAGCTGCTAC
AGCCATGACCGTGGCTGCAACCGCAGCTGTGTCTGGATTTAAGCAAGATCAAAAGGATGA
TGCCCTCAAGAAGAAGACACCCCCTTTTAAGTGAATAATGTTACTCATCTATGTAATTTT
TCTTCCTTGAACCAAGTCAATAAAATAAGAGGAAACTTCATGGTAGTTTTTTTTAAGTAT
ACTTCGGTTTCTTCTGCAGAAAATTGTTTTGTTGTTGAATATTTTATGAGTCTGCAACTT
CTTACAAGCATTATTTGTATAACATAAGGATTTG
C

QA 1 454 1 454
DS 

RD RS1E539TF 478 0 0
GA
AAAACTTGTCGAGAAATCGATTTCAATCAAAATCCCCGACAACACCAACAGAGAAGACAT
CAAAGCGGGTAAAAGGAAAAATGGTGGTGAAACCAACGGTAGCATTGAGAGGCATCCTGG
TAGGTGGAGTGGCGATATTCGCCAAAGTTGCAGGCGCTATGAAGGCTGCTGGGGGTGTCA
AGCTCGGTGCAGCTGCTACAGCCATGACCGTGGCTGCAACCGCAGCTGTGTCTGGATCTA
AGCAAGATCAAAAGGATGATGCCCTCAAGAAGAAGACACCACCTTCTAAGTGAATAATGT
TACTCATCTACGTAATTCTTCTTCCTTGAACCAAGTCAATAAAATAAGAGGAAACTTCAT
GGTAGTTTTTTTTAAGTATACTTCGGTTTCTTCTGCAGAAAATTGTTTTGTTGTTGAATA
TTTTATGAGTCTGCAACTTCTTACAAGCATTATTTGTATAACATAAGGATTTGTAG

QA 3 478 3 478
DS 



AS 1 3

CO CL2226Contig1 1246 3 8 U
AGCAGACTTGAATTTATTAAAATAAAACAACAACCACATTTGATCCAACACCGAAAGAGA
AGAAGTTCACAACCAGATGGAAAAGACTAAAGCTTGAAACATTACTTTAAAAGACAAAGG
GAAATAGTTCTAGAGGGTAAATGAAAAAGCTGAGCATTATTGAAAATAGAAGCAGATGTG
GTTGTTCAATCTGGGAAGGTGGACTCATCCCACACGTGCCTTCTTCATGGCAGTCTTCTC
GACATGGCAGTCTTCATGGCAGCCTTGGACGGTGGTGGACGTCTACCAACGGAAACATCA
TATGCTCCTGGCCTGTCTGATCCAGAGGAGGAGGTCCCAGCGTTGACATTTGTTGCCTGA
CCCACATCTTTAGGAAGTGCATCGTCGGGATCATTTGCACCTTCAGCTACGACAAAGGCG
GGCGTAGGGGCGAGCACGCGTTCCGGATAGATGCGAGAGATAGTGAAGGTTTGGTGTTTC
CAGGAAAAATTGTAATCGTTCAATTTCAGCTGGAAAGTGTAGGTGCGTCCAACAATCTCA
GCAAGGGACCGAGGAAGATCCGTGTCAATCTGAGACATACCGGGAAGCTATTTCCCCGTG
TTTGCAAGCTCAAGTATCTGGGAATATGGCATGAATCTGAAAACCTCTCTGGGGATGGGC
CTGACAGAAGTCGGGATCTTCTCAAGCTCGGTTCCTTCATTTAACCGAATCGAGAAAGGA
GCATCAGCCAAACGAAAATTGGTGTTGCAGCGTGTGACGTCAAACCCGGTCAACGTGTAC
AGAGAGCCTTCACTGGGACGATTCCTGAACCTAAGCTGTCGGTTAGCCCCAATAGAACCT
TGCATAACAGTGGAATTTTCATCAACAAATAGCATATCAACACTCATCAGCTCTCCCCCT
TCCTCACATTTCTAGCCTCCCAGAAACACAACAACCGCACCTGCGCAACGTTTGAACACC
GGCCTGCGCTGAGATCGGGGAGAAGGACTTGGGCGTTTGCCACTGTTAAAAAAAAAGTAA
ATTGAGAAGCGTGGTATTCTGGATGAAGAAGTATTTATACCCGAAGCTCTACTCAGCAAC
TTTGGAAGAGAAAGAGGTGGATTCAATGCAAATGAGTGTTGTAGTGACGAATTAACATGA
AATAAAGATGGTCAAATGAAACGGTGAAACGGCTTCAGAGTGCTCAACCGTCTTCATCAA
CATAGAGCAGCGGCCATTCCAAGATAATCAGACCTAGATGATGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H304JQB U 86
AF RS1DZ32JQ U 1
AF RS1H304TF C 578
BS 1 480 RS1DZ32JQ
BS 481 481 RS1H304JQB
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BS 591 756 RS1DZ32JQ
BS 757 1246 RS1H304TF

RD RS1H304JQB 473 0 0
ACTAAAGCTTGAAACATTACTTTAAAAGACAAAGGGAAATAGTTCTAGAGGGTAAATGAA
AAAGCTGAGCATTATTGAAAATAGAAGCAGATGTGGTTGTTCAATCTGGGAAGGTGGACT
CATCCCACACGTGCCTTCTTCATGGCAGTCTTCTCGACATGGCAGTCTTCATGGCAGCCT
TGGACGGTGGTGGACGTCTACCAACGGAAACATCATATGCTCCTGGCCTGTCTGATCCAG
AGGAGGAGGTCCCAGCGTTGACATTTGTTGCCTGACCCACATCTTTAGGAAGTGCATCGT
CGGGATCATTTGCACCTTCAGCTACGACAAAGGCGGGCGTAGGGGCGAGCACGCGTTCCG
GATAGATGCGAGAGATAGTGAAGGTTTGGTGTTTCCAGGAAAAATTGTAATCGTTCAATT
TCAGCTGGAAAGTGTAGGTGCGTCCAACAATCTCAGCAAGGGACCGAGGAAGA

QA 1 473 1 473
DS 

RD RS1DZ32JQ 756 0 0
AGCAGACTTGAATTTATTAAAATAAAACAACAACCACATTTGATCCAACACCGAAAGAGA
AGAAGTTCACAACCAGATGGAAAAGACTAAAGCTTGAAACATTACTTTAAAAGACAAAGG
GAAATAGTTCTAGAGGGTAAATGAAAAAGCTGAGCATTATTGAAAATAGAAGCAGATGTG
GTTGTTCAATCTGGGAAGGTGGACTCATCCCACACGTGCCTTCTTCATGGCAGTCTTCTC
GACATGGCAGTCTTCATGGCAGCCTTGGACGGTGGTGGACGTCTACCAACGGAAACATCA
TATGCTCCTGGCCTGTCTGATCCAGAGGAGGAGGTCCCAGCGTTGACATTTGTTGCCTGA
CCCACATCTTTAGGAAGTGCATCGTCGGGATCATTTGCACCTTCAGCTACGACAAAGGCG
GGCGTAGGGGCGAGCACGCGTTCCGGATAGATGCGAGAGATAGTGAAGGTTTGGTGTTTC
GAGGAGAAATTGTAATCGTTCAATTTCAGCTGGAAAGTGTAGGTGCGTCCAACAATCTCA
GCAAGGGACCGAGGAAGATCCGTGTCAATCTGAGACATACCGGGAAGCTGTTTCCCCGTG
TTTGCAAGCTCAAGTATCTGGGAATATGGCATGAATCTGAAAACCTCTCTGGGGATGGGC
CTGACAGAAGTCGGGATCTTCTCAAGCTCGGTTCCTTCATTTAACCGAATCGAGAAAGGA
GCATCAGCCAAACGAAAATTGGTGTTGCAGCGTGTG

QA 1 756 1 756
DS 

RD RS1H304TF 669 0 0
TACCGGGAAGCTATTTCCCCGTGTTTGCAAGCTCAAGTATCTGGGAATATGGCATGAATC
TGAAAACCTCTCTGGGGATGGGCCTGACAGAAGTCGGGATCTTCTCAAGCTCGGTTCCTT
CATTTAACCGAATCGAGAAAGGAGCATCAGCCAAACGAAAATTGGTGTTGCTGCGTGTGA
CGTCAAACCCGGTCAACGTGTACAGAGAGCCTTCACTGGGACGATTCCTGAACCTAAGCT
GTCGGTTAGCCCCAATAGAACCTTGCATAACAGTGGAATTTTCATCAACAAATAGCATAT
CAACACTCATCAGCTCTCCCCCTTCCTCACATTTCTAGCCTCCCAGAAACACAACAACCG
CACCTGCGCAACGTTTGAACACCGGCCTGCGCTGAGATCGGGGAGAAGGACTTGGGCGTT
TGCCACTGTTAAAAAAAAAGTAAATTGAGAAGCGTGGTATTCTGGATGAAGAAGTATTTA
TACCCGAAGCTCTACTCAGCAACTTTGGAAGAGAAAGAGGTGGATTCAATGCAAATGAGT
GTTGTAGTGACGAATTAACATGAAATAAAGATGGTCAAATGAAACGGTGAAACGGCTTCA
GAGTGCTCAACCGTCTTCATCAACATAGAGCAGCGGCCATTCCAAGATAATCAGACCTAG
ATGATGCCC

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 4

CO CL2227Contig1 514 4 3 U
GGGATAACGAAAAAAACAAACAATATGGGTCCAAAAACATCAAATAAGGTTGCTCTCCTT
TTATCTCTTCTCCTTTTGATTTTAACACTTTCCTCTCAAGTTAGAGTCATCGAGGCTACA
AGCCGAAAACTTGCATCCGGAAGGAACATCGTGTATACTCCATCCTCAAAATCTTGCGGA
GCGACCCACGCAACGTGGAAGAAGAAGAAACGCGGACCATGCAGACGTCCTCCAAGAACT
GCTCCAGCTTCTTACCAATCACCATAATTAAGACCATAAGACAGTTCTCCCAAAGACAGG
AAAGATCATAAGACAGTCTTTCATGATTGTGATTGAGTCCAATCTTGGAACAACACAATA
ATATTTTCAGTTATTTTCTTTGTTTTTGTTTGGGATCCTAAACAAGAAATCAAATGTTTG
ATCGTTTTTTTGATTTGGTTTCTCTTTCTAATTCAATGAATGTTCGTCATATGTGCGCTG
TACTTTAAATTAATAAAAGAAACATGGTCTAGTT


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H769JQB C 1
AF RS1H769TF U 1
AF RS1DX21TF U 16
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TTATTTCTTCTCCTTTTGATTTTAACACTTTCCTCTCAAGTTAGAGTCATCGAGGCTACA
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GCGACCCACGCAACGTGGAAGAAGAAGAAACGCGGACCATGCAGACGTCCTCCAAGAACT
GCTCCAGCTTCTTACCAATCACCATAATTAAGACCATAAGACAGTTCTCCCAAAGACAGG
AAAGATCATAAGACAGTCTTTCATGATTGTGATTGAGTCCAATCTTGGAACAACACAATA
ATATTTTCAGTTATTTTCTTTGTTTTTGTTTGGGATCCTAAACAAGAAATCAAATGTTTG
ATCGTTTTTTTGATTTGGTTTCTCTTTCTAATTCAATGAATGTTCGTC
C

QA 1 468 1 468
DS 

RD RS1H769TF 469 0 0
G
GGATAACGAAAAAAACAAACAATATGGGTCCAAAAACATCAAATAAGGTTGCTCTCCTTT
TATCTCTTCTCCTTTTGATTTTAACACTTTCCTCTCAAGTTAGAGTCATCGAGGCTACAA
GCCGAAAACTTGCATCCGGAAGGAACATCGTGTATACTCCATCCTCAAAATCTTGCGGAG
CGACCCACGCAACGTGGAAGAAGAAGAAACGCGGACCATGCAGACGTCCTCCAAGAACTG
CTCCAGCTTCTTACCAATCACCATAATTAAGACCATAAGACAGTTCTCCCAAAGACAGGA
AAGATCATAAGACAGTCTTTCATGATTGTGATTGAGTCCAATCTTGGAACAACACAATAA
TATTTTCAGTTATTTTCTTTGTTTTTGTTTGGGATCCTAAACAAGAAATCAAATGTTTGA
TCGTTTTTTTGATTTGGTTTCTCTTTCTAATTCAATGAATGTTCGTC
C

QA 2 468 2 468
DS 

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GG
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GATTTTAACACTT*CCTCTCAAGTTAGAGTCATCGAGGCTACAAGCCGAAAACTTGCATC
CGGAAGGAACATCGTGTATACTCCATCCTCAAAATCTTGCGGAGCGACCCACGCAACGTG
GAAGAAGAAGAAACGCGGACCATGCAGACGTCCTCCAAGAACTGCTCCAGCTTCTTACCA
ATCACCATAATTAAGACCATAAGACAGTTCTCTCAAAGACAGGAAAGATCATAAGACAGT
CTTTCATGATTGTGATTGAGTCCAATCTTGGAACAACACAATAATATTTTCAGTTATTTT
CTTTGTTTTTGTTTGGGATCCTAAACAAGAAATCAAATGTTTGATCGTTTTCTTGATTTG
GTTTCTCTTTCTAATTCAATGAATGTTCGTC

QA 3 453 3 453
DS 

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TATCTCTTCTCCTTTTGATTTTAACACTTTCCTCTCAAGTTAGAGTCATCGAGGCCACAA
GCCGAAAACTTGCATCCGGAAGGAACATCGTGTATACTCCATCCTCAAAATCTTGCGGAG
CGACCCACGCAACGTGGAAGAAGAAGAAACGCGGACCATGCAGACGTCCTCCAAGAACTG
CTCCAGCTTCTTACCAATCACCATAATTAAGACCATAAGACAGTTCTCTCAAAGACAGGA
AAGATCATAAGACAGTCTTTCATGATTGTGATTGAGTCCAATCTTGGAACAACACAATAA
TATTTTCAGTTATTTTCTTTGTTTTTGTTTGGGATCCTAAACAAGAAATCAAATGTTTGA
TCGTTTTCTTGATTTGGTTTCTCTTTCTAATTCAATGAATGTTCGTCATATGTGCGCTGT
ACTTTAAATTAATAAAAGAAACATGGTCTAGTT

QA 1 513 1 513
DS 



AS 2 4

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AAAAATCGAAGTGATCTTGATTGTACCTTCTGGCCCCGTACAGACCGCTACCCAAGGGAA
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TAACAGATCCGGTGAATCCACCGAAAACTGCTTCCTAAGTGAGTGATATTGCAATAAGCT
CAGAATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EW37TF C 1
AF RS1EW37JQ U 153
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RD RS1EW37TF 489 0 0
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TCCTCTTGGAGACAAACCATAAACTACAATAGCAAAAGCAATTAAACATAATAAATCTTC
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AAAGTCGGATAGCTGAGATTTAGTCACAAGTGATGTTGAGAGACAACCCTCACCAACAAG
AAAAATCGAAGTGATCTTGATTGTACCTTCTGGCCCCGTACAGACCGCTACGCAAGGTAA
CAAACCGGTGAGTAAGCTAAAACAATAACTCAGAAAAGGATCCGAAAGAACATCCCCGTT
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TAACAGATCCGGTGAATCCACCGAAAACTGCTTCCTAAGTGAGTGATATTGCAATAAGCT
CAGAATCCC

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DS 

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AAAAAGGATCCGAAAGAACATCCCCGTTCATAGGATGGAAACATGATTGTAGGATTCTGT
CTTCCACCAAGGAGGATGATGAAAATGATAACAGATCCGGTGAATCCCCCGAAAACTGCT
TCCTAAGTGAGTGATATTGCAATAAGCTCA
AAATCCC

QA 1 330 1 330
DS 



CO CL2228Contig2 1407 2 2 U
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TCCGGGGACTCCTGGATAATTGTCTCAGACAATAGCTCTTTACATCTTTTCATCCTCCAT
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AGCTTGATAAGGTCGTTTTGTCCGCTTAATAGTCTCACCTTCTCCACCCCGTTAAGTGAT
CTTCTCTCCAGTCTTGCTTGGAAGTCCGGCAAAACCTGTTATGGTGAAGAACAGTCTCCT
CCTCTGACTTGTCTCGATGGCCATTTAGCTTGTTCTGGTGAGCTCTGCAACCCACCGACC
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ACAACGTCCTTTGCCAATGAGTCAACAGCTATTGGACCAAGATTCAAATCTTCACGGGCC
TGGCCCAGTACTTTGGCTGAAGCTACCAGCCCAGTTATCAATCTACCAAAATCCAGAAAC
CTACAACACATCGTGAGTCAATCAATTTCGGTTTTGGTTTCTATGGTTAAGTTAAAGAGC
TTCGATGGATTCATTGAAGTCTCTATTCTGAGCTTATTGCAATATCACGCACTTAGGAAG
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AGAATCCTACAATCATGTCTCCATTCTATGAACGGGGATGTTCTTTCGGATCCTTTTCTG
AGTTATTGTTTCAGCTTACTCACCGGTTTGTTACCTTACGTAGCGGTCTGTACGGGGCCA
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CTTGTGACTAAATCTCAGCTATCCGACTTTGCCGGAAAGGCTTTATCGACGCATTCAGAC
TATGTCTCGAATTCGCTGTCAACTTCATATGAAGATTTATTATGTTTAATTGCTTTTGCT
GTTGTTTATGGTTTGTCTCCAAGAGGAAGCTTAATTCCCTCTTGTTATTGTAGTCTTCAA
ATTTGAGTTTAATGAAAGTTGTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FQ36TF U 1
AF RS1FQ36JQ C 653
BS 1 762 RS1FQ36TF
BS 763 1407 RS1FQ36JQ

RD RS1FQ36TF 762 0 0
GGGGGCACGGTTATCGAGTTTTCAAATTTCAAAATGCTCTCCGACGCCGGTGGTGCAGGC
GCACGCCGGCGTCGCCTCTGCCAATCTCCCCTAGTCACGACTACATCTTTAATTCACTTC
TGCCCTGTATTTCTTATGGTTTCTTTCAATTTTGCTGCTCTGGATCTACTGTCAACACTA
TCGGTAGAGATCTCCGTGGTCTCGTACTGTTGGTCGGAGATCACCAGAATGGAACTCTTC
TCCGGGGACTCCTGGATAATTGTCTCAGACAATAGCTCTTTACATCTTTTCATCCTCCAT
GTCTGCTCTCCTCCGCTCTTCAGATCTATAAACCTATTTAACTCAACCTCAGCGATGAAG
CGTCTGTCTGAAGACCCACACCGTAAACGACGGCAACCACACCTTCTCTTAACATCTTGC
GTTAATCTGGCGACCGATGTAGATGGGATTCCATTCCGGCGACCAGATCTGTTTCTTCAA
AGCTTGATAAGGTCGTTTTGTCCGCTTAATAGTCTCACCTTCTCCACCCCGTTAAGTGAT
CTTCTCTCCAGTCTTGCTTGGAAGTCCGGCAAAACCTGTTATGGTGAAGAACAGTCTCCT
CCTCTGACTTGTCTCGATGGCCATTTAGCTTGTTCTGGTGAGCTCTGCAACCCACCGACC
ACTGCTCTTTGTCTTTCAACCGGGGATCTCCTCGCCGCTTCCAACTCGTTCTCCAGATCC
ACAACGTCCTTTGCCAATGAGTCAACAGCTATTGGACCAAGA

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1FQ36JQ 755 0 0
CACCGACCACTGCTCTTTGTCTTTCAACCGGGGATCTCCTCGCCGCTTCCAACTCGTTCT
CCAGATCCACAACGTCCTTTGCCAATGAGTCAACAGCTATTGGACCAAGATTCAAATCTT
CACGGGCCTGGCCCAGTACTTTGGCTGAAGCTACCAGCCCAGTTATCAATCTACCAAAAT
CCAGAAACCTACAACACATCGTGAGTCAATCAATTTCGGTTTTGGTTTCTATGGTTAAGT
TAAAGAGCTTCGATGGATTCATTGAAGTCTCTATTCTGAGCTTATTGCAATATCACGCAC
TTAGGAAGCAGTTTTCGGTGGATTCACCGGATCTGTTATCGTTTTCATCATCCTCCTTGG
TCGAGGACAGAATCCTACAATCATGTCTCCATTCTATGAACGGGGATGTTCTTTCGGATC
CTTTTCTGAGTTATTGTTTCAGCTTACTCACCGGTTTGTTACCTTACGTAGCGGTCTGTA
CGGGGCCAGAAGGTGCAATCAAGATCACTTCGGTTTTTCTTGTTGGTGAAGGTTGTCTCT
CAACGTCACTTGTGACTAAATCTCAGCTATCCGACTTTGCCGGAAAGGCTTTATCGACGC
ATTCAGACTATGTCTCGAATTCGCTGTCAACTTCATATGAAGATTTATTATGTTTAATTG
CTTTTGCTGTTGTTTATGGTTTGTCTCCAAGAGGAAGCTTAATTCCCTCTTGTTATTGTA
GTCTTCAAATTTGAGTTTAATGAAAGTTGTGTTCC

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 4

CO CL2229Contig1 873 4 4 U
TAACACAAAACTCATCCTT*ATGGTATTGTCTGTCACACGTGTGTAAAGCTTTGTATCCT
TCTTACATTATTGCTAGAGAAAAAAATATTGAATCTAGATGAACAAACAGAGTCTTTTAC
CTTTATTCGTAACGTTTCTTCTGCTTGTCAGTAGCCTCTGGTGGCAAAGAAAGGAACTGA
GTGATTTTGTGGACCTGGGAGACGTCAATCCTGTAGTTTTTGGCAATCTCGTTCACACTC
ATTGGACCGTTGTGATACTGAGCCTTGCCCTGATAGAGAAGCATGATGTGTCTCACTTGA
GCCACGTTCAGTGTCCCTTGCGGCACCGGTTTTTCCTCGTACCTTGTTGATTCAGGGGTT
GTGTTCCGGAGCTTTGGGAGTGGCCTTTTCGAGGTTTCCACTACCGATGCCTCTCCCATC
TCAGCTTTGCCACCGGGTTTAGCCTTTATTCTCCCAACCATTTGGTTCAACATTGTATCG
TATTGCGGGTCTCTTTCTTCTAAAACAGTATCACCACTGCTTCCTCTAGCTTCATCAGAA
ACATCACTAACGGCGGGGGTGGACGGAGATTTCACGGCGCTGCTGAGTTCTTCCTTAGGA
AGAGATCTCCGATCGACGACGGGGACCCTTGATGGAAACTTTTCAACTTGTTTGACTCTC
CCAACGGCTCGACGCAGTTGCTGACCCATTTACGCACGCAGATACACAACTCTAGATGGC
TACAATGTGAGGAATATACGAATCAAATGGTTAGCTTTCACCTGCCCCTTATTCAGGAGG
AACAGAGAGAGAGAACCAAAAGTGAAGGAACGTGTTTGCTTTCCCCCGGCCGTAATGGCC
GAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT


BQ
10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
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AF RS1A031JQ U 2
AF RS1A031TF C 5
AF RS1A031TR U 3
AF RS1A031TV C 1
BS 1 4 RS1A031TV
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RD RS1A031JQ 771 0 0
AAC
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ACATTATTGCTAGAGAAAAAAATATTGAATCTAGATGAACAAACAGAGTCTTTTACCTTT
ATTCGTAACGTTTCTTCTGCTTGTCAGTAGCCTCTGGTGGCAAAGAAAGGAACTGAGTGA
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TCCGGAGCTTTGGGAGTGGCCTTTTCGAGGTTTCCACTACCGATGCCTCTCCCATCTCAG
CTTTGCCACCGGGTTTAGCCTTTATTCTCCCAACCATTTGGTTCAACATTGTATCGTATT
GCGGGTCTCTTTCTTCTAAAACAGTATCACCACTGCTTCCTCTAGCTTCATCAGAAACAT
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CGGCTCGACGCAGTTGCTGACCCATTTACGCACGCAGATACACAACTCTAGATGGCTACA
ATGTGAGGAATATACGAATCAAATGGTTAGCTTTCACCTGCCCCTTAT

QA 4 771 4 771
DS 

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ACATTATTGCTAGAGAAAAAAATATTGAATCTAGATGAACAAACAGAGTCTTTTACCTTT
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GACCGTTGTGATACTGAGCCTTGCCCTGATAGAGAAGCATGATGTGTCTCACTTGAGCCA
CGTTCAGTGTCCCTTGCGGCACCGGTTTTTCCTCGTACCTTGTTGATTCAGGGGTTGTGT
TCCGGAGCTTTGGGAGTGGCCTTTTCGAGGTTTCCACTACCGATGCCTCTCCCATCTCAG
CTTTGCCACCGGGTTTAGCCTTTATTCTCCCAACCATTTGGTTCAACATTGTATCGTATT
GCGGGTCTCTTTCTTCTAAAACAGTATCACCACTGCTTCCTCTAGCTTCATCAGAAACAT
CACTAACGGCGGGGGTGGACGGAGATTTCACGGCGCTGCTGAGTTCTTCCTTAGGAAGAG
ATCTCCGATCGACGACGGGGACCCTTGATGGAAACTTTTCAACTTGTTTGACTCTCCCAA
CGGCTCGACGCAGTTGCTGACCCATTTACGCACGCAGATACACAACTCTAGATGGCTACA
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QA 1 776 1 776
DS 

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AC
ACAAAACTCATCCTT*ATGGTATTGTCTGTCACACGTGTGTAAAGCTTTGTATCCTTCTT
ACATTATTGCTAGAGAAAAAAATATTGAATCTAGATGAACAAACAGAGTCTTTTACCTTT
ATTCGTAACGTTTCTTCTGCTTGTCAGTAGCCTCTGGTGGCAAAGAAAGGAACTGAGTGA
TTTTGTGGACCTGGGAGACGTCAATCCTGTAGTTTTTGGCAATCTCGTTCACACTCATTG
GACCGTTGTGATACTGAGCCTTGCCCTGATAGAGAAGCATGATGTGTCTCACTTGAGCCA
CGTTCAGTGTCCCTTGCGGCACCGGTTTTTCCTCGTACCTTGTTGATTCAGGGGTTGTGT
TCCGGAGCTTTGGGAGTGGCCTTTTCGAGGTTTCCACTACCGATGCCTCTCCCATCTCAG
CTTTGCCACCGGGTTTAGCCTTTATTCTCCCAACCATTTGGTTCAACATTGTATCGTATT
GCGGGTCTCTTTCTTCTAAAACAGTATCACCACTGCTTCCTCTAGCTTCATCAAAAACAT
CACTAACGGCGGGGGTGGACGGAAATTTCACGGCGCTGCTGAGTTCTTCCTTAGGAAGAG
ATCTCCGATCGACGACGGGGACCCTTGATGGAAACTTTTCAACTTGTTTGACTCTCCCAA
CGGCTCGACGCAGTTGCTGACCCATTTACGCACGCAGATACACAACTCTAGATGGCTACA
ATGTGAGGAATATACGAATCAAATGGTTAGCTTTCACCTGCCCCTTATTCAGGAGGAACA
GAGAGAGAGAACCAAAAGTGAAGGAACGTGTTTGCTTTCC

QA 3 822 3 822
DS 

RD RS1A031TV 873 0 0
TAACACAAAACTCATCTTT*ATGGTATTGTCTGTCACACGTGTGTAAAGCTTTGTATCAT
TCTTACATTATTGCTAGAGAAAAAAATATTGAATCTAGATGAACAAACAGAGTCTTTTAC
CTTTATTCGTAACGTTTCTTCTGCTTGTCAGTAGCCTCTGGTGGCAAAGAAAGGAACTGA
GTGATTTTGTGGACCTGGGAGACGTCAATCCTGTAGTTTTTGGCAATCTCGTTCACACTC
ATTGGACCGTTGTGATACTGAGCCTTGCCCTGATAGAGAAGCATGATGTGTCTCACTTGA
GCCACGTTCAGTGTCCCTTGCGGCACCGGTTTTTCCTCGTACCTTGTTGATTCAGGGGTT
GTGTTCCGGAGCTTTGGGAGTGGCCTTTTCGAGGTTTCCACTACCGATGCCTCTCCCATC
TCAGCTTTGCCACCGGGTTTAGCCTTTATTCTCCCAACCATTTGGTTCAACATTGTATCG
TATTGCGGGTCTCTTTCTTCTAAAACAGTATCACCACTGCTTCCTCTAGCTTCATCAGAA
ACATCACTAACGGCGGGGGTGGACGGAGATTTCACGGCGCTGCTGAGTTCTTCCTTAGGA
AGAGATCTCCGATCGACGACGGGGACCCTTGATGGAAACTTTTCAACTTGTTTGACTCTC
CCAACGGCTCGACGCAGTTGCTGACCCATTTACGCACGCAGATACACAACTCTAGATGGC
TACAATGTGAGGAATATACGAATCAAATGGTTAGCTTTCACCTGCCCCTTATTCAGGAGG
AACAGAGAGAGAGAACCAAAAGTGAAGGAACGTGTTTGCTTTCCCCCGGCCGTAATGGCC
GAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 873 1 873
DS 



AS 1 3

CO CL2230Contig1 1058 3 3 U
GAAGCACGATGGCGAGCTTTTAGGCAGAGATTACTACCAAGTCGTGGGGACCTGCAATGG
GTTGGTCTGTTTCCATGTAGATTACAACAAAAGCTTCTATTTGTGGAACCCGACCATCAA
GGTTCAACAAAGATTGCCTGGTTCAGATCTTGAAACGGGAGATGAGGTTGTTGTAAACTA
TGGATTTGGTTATGATGAATCTGAAGATGACTATAAGATAGTTGCATTGTTGCAACAAAG
TCACGAACTGAAGACAGAGGCAATGATTTACTCAACGAGACAAAAGCTATGGAGAAGAAG
CAACACTTGTTTTCCATCTGGAGTTGTTCTTGCTAACAAATCAAGATCCGGTATCTACAT
CAATGGAACACTAAACTGGGCAGCCACTCACTCCTCATCATCATCAGTTTCTACCACCAT
ATCATATGATATGTCACGTGATGCGTTCAAGGAGCTTCTTGGACCAGGTTACTGCAAGAG
AGGATGTTTTACATTGACGCTTGGAGATTTGAGAGGATGTCTTTCCATGGTGTGTTATTG
CAAAGGAGCAACTGCAGATGTTTGGGTGATGAAGGAGTTTGGAGAAAGAGATTCTTGGTC
TAAACTCTTGAGCATTCCCGGTTTGACCGAGTTTGTTAGACCGCTTTGGATCTCAAGAGG
TTTGGTGGTTTTGCTGGAGTTCAGATCCCGGTTTAGTTCTCTACAACTGTTCCACTGGAA
AGTTTCAGTACCCAGTTTCAGACAGCTTGAGTGGTTGTCGGGACGTTAAAGTCTATGTCA
AGACATTGGTTTCTCCGAATGACCTTTAAGATTGGCTCTTACCAGATTTGGTTCAGTTTA
TTTGCACACCATTGTTATACATTTACTTAAAAAGAGTTTTTTTTTTTTTTTGTTGGTTCT
CTCTTTAGTTGTAACGTTACATTTTCATGTGGGAAACAACATAAGAAAAGCAATCAGTCA
AATGTTCCTAACAAAATAATCACTATACCAATAACACATCATCTCTGCTTTGAGGCTTCT
TCTTCTTCTTAGGTGCTCGCATCAAACAGTGGGATGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AP95TFB U 1
AF RS1AP95JQ C 608
AF RS1B696JQ U 895
BS 1 765 RS1AP95TFB
BS 766 894 RS1AP95JQ
BS 895 1058 RS1B696JQ

RD RS1AP95TFB 766 0 0
GAAGCACGATGGCGAGCTTTTAGGCAGAGATTACTACCAAGTCGTGGGGACCTGCAATGG
GTTGGTCTGTTTCCATGTAGATTACAACAAAAGCTTCTATTTGTGGAACCCGACCATCAA
GGTTCAACAAAGATTGCCTGGTTCAGATCTTGAAACGGGAGATGAGGTTGTTGTAAACTA
TGGATTTGGTTATGATGAATCTGAAGATGACTATAAGATAGTTGCATTGTTGCAACAAAG
TCACGAACTGAAGACAGAGGCAATGATTTACTCAACGAGACAAAAGCTATGGAGAAGAAG
CAACACTTGTTTTCCATCTGGAGTTGTTCTTGCTAACAAATCAAGATCCGGTATCTACAT
CAATGGAACACTAAACTGGGCAGCCACTCACTCCTCATCATCATCAGTTTCTACCACCAT
ATCATATGATATGTCACGTGATGCGTTCAAGGAGCTTCTTGGACCAGGTTACTGCAAGAG
AGGATGTTTTACATTGACGCTTGGAGATTTGAGAGGATGTCTTTCCATGGTGTGTTATTG
CAAAGGAGCAACTGCAGATGTTTGGGTGATGAAGGAGTTTGGAGAAAGAGATTCTTGGTC
TAAACTCTTGAGCATTCCCGGTTTGACCGAGTTTGTTAGACCGCTTTGGATCTCAAGAGG
TTTGGTGGTTTTGCTGGAGTTCAGATCCCGGTTTAGTTCTCTACAACTGTTCCACTGGAA
AGTTTCAGTACCCAGTTTCAGACAGCTTGAGTGGTTGTCGGGACG
C

QA 1 765 1 765
DS 

RD RS1AP95JQ 370 0 0
TTGAGCATTCCCGGTTTGACCGAGTTTGTTAGACCGCTTTGGATCTCAAGAGGTTTGGTG
GTTTTGCTGGAGTTCAGATCC*GGTTTAGTTCTCTACAACTGTTCCACTGGAAAGTTTCA
GTACCCAGTTTCAGACAGCTTGAGTGGTTGTCGGGACGTTAAAGTCTATGTCAAGACATT
GGTTTCTCCGAATGACCTTTAAGATTGGCTCTTACCAGATTTGGTTCAGTTTATTTGCAC
ACCATTGTTATACATTTACTTAAAAAGAGTTTTTTTTTTTTTTTGTTGGTTCTCTCTTTA
GTTGTAACGTTACATTTTCATGTGGGAAACAACATAAGAAAAGCAATCAGTCAAATGTTC
CTAACAAAA
C

QA 1 369 1 369
DS 

RD RS1B696JQ 164 0 0
GGTTCTCTCTTTAGTTGTAACGTTACATTTTCATGTGGGAAACAACATAAGAAAAGCAAT
CAGTCAAATGTTCCTAACAAAATAATCACTATACCAATAACACATCATCTCTGCTTTGAG
GCTTCTTCTTCTTCTTAGGTGCTCGCATCAAACAGTGGGATGAT

QA 1 164 1 164
DS 



AS 1 2

CO CL2231Contig1 802 2 2 U
GTCCTCATTGCTACCGGTTGCATCTGTTGGGCTGGTTTTGTCAATCTCCAAGCGATCACG
CTTAAATCGTACCCGGTAGAGCTATCCTTGACCGCTTTCATATGCTTAATGGGGTCTATT
GAAAGCACCATCGTGGCACTTTTCATTGAAAGGGGAAATCCTGCTGCATGGTCCATCCAA
TTAGATTCCAAATTGCTAGCCGCTGTTTATGGTGGGGTAATATGTTCAGGTGTTGGTTAC
TACGTTCAAGGAGTGATAATGAAAACTCGAGGACCGGTGTTTGTGACTGCCTTCAATCCA
TTGAGCATGGTCATTGTTGCGATTTTGGGTTCTATAATTCTTGCTGAGGTTATGTACCTT
GGAAGGATTCTTGGAGCAATAGTGATCGTTCTTGGGCTCTATTCCGTTTTGTGGGGCAAG
AGCAAAGACGAACCAGCTAATTCATTTTCAGATATGGGCAATGAGCTCCCACTTAGTAAT
CTACAAGTTGTGACATTCTCGTTGAAAGCTAACGGAGATATGGACACAAAGGATGCAAAT
GTTATGACCTCGAGGCCTACCACCAATGATTCAGTCTAAAGTAAACAAAGCACTACGGTG
ATTATGAATTATAATAATAAACGAAAACAACGAGTACCGATTTCCAGTTTCCGGATCGGT
GCTGATTTGTAGATTCAAGAGTGATGTTATTTTAATGCTAATTTTGGCTTTGTTAAATTT
TGCATCCGGCTATAACAATATGAAATGTTTTGCACTAATAAAAGTACCTTTTTACGAATA
ATTAGTATATGGTGCGTTTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1G913TF U 1
AF RS1G913JQ C 70
BS 1 635 RS1G913TF
BS 636 802 RS1G913JQ

RD RS1G913TF 635 0 0
GTCCTCATTGCTACCGGTTGCATCTGTTGGGCTGGTTTTGTCAATCTCCAAGCGATCACG
CTTAAATCGTACCCGGTAGAGCTATCCTTGACCGCTTTCATATGCTTAATGGGGTCTATT
GAAAGCACCATCGTGGCACTTTTCATTGAAAGGGGAAATCCTGCTGCATGGTCCATCCAA
TTAGATTCCAAATTGCTAGCCGCTGTTTATGGTGGGGTAATATGTTCAGGTGTTGGTTAC
TACGTTCAAGGAGTGATAATGAAAACTCGAGGACCGGTGTTTGTGACTGCCTTCAATCCA
TTGAGCATGGTCATTGTTGCGATTTTGGGTTCTATAATTCTTGCTGAGGTTATGTACCTT
GGAAGGATTCTTGGAGCAATAGTGATCGTTCTTGGGCTCTATTCCGTTTTGTGGGGCAAG
AGCAAAGACGAACCAGCTAATTCATTTTCAGATATGGGCAATGAGCTCCCACTTAGTAAT
CTACAAGTTGTGACATTCTCGTTGAAAGCTAACGGAGATATGGACACAAAGGATGCAAAT
GTTATGACCTCGAGGCCTACCACCAATGATTCAGTCTAAAGTAAACAAAGCACTACGGTG
ATTATGAATTATAATAATAAACGAAAACAACGAGT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1G913JQ 733 0 0
TACCCGGTAGAGCTATCCTTGACCGCTTTCATATGCTTAATGGGGTCTATTGAAAGCACC
ATCGTGGCACTTTTCATTGAAAGGGGAAATCCTGCTGCATGGTCCATCCAATTAGATTCC
AAATTGCTAGCCGCTGTTTATGGTGGGGTAATATGTTCAGGTGTTGGTTACTACGTTCAA
GGAGTGATAATGAAAACTCGAGGACCGGTGTTTGTGACTGCCTTCAATCCATTGAGCATG
GTCATTGTTGCGATTTTGGGTTCTATAATTCTTGCTGAGGTTATGTACCTTGGAAGGATT
CTTGGAGCAATAGTGATCGTTCTTGGGCTCTATTCCGTTTTGTGGGGCAAGAGCAAAGAC
GAACCAGCTAATTCATTTTCAGATATGGGCAATGAGCTCCCACTTAGTAATCTACAAGTT
GTGACATTCTCGTTGAAAGCTAACGGAGATATGGACACAAAGGATGCAAATGTTATGACC
TCGAGGCCTACCACCAATGATTCAGTCTAAAGTAAACAAAGCACTACGGTGATTATGAAT
TATAATAATAAACGAAAACAACGAGTACCGATTTCCAGTTTCCGGATCGGTGCTGATTTG
TAGATTCAAGAGTGATGTTATTTTAATGCTAATTTTGGCTTTGTTAAATTTTGCATCCGG
CTATAACAATATGAAATGTTTTGCACTAATAAAAGTACCTTTTTACGAATAATTAGTATA
TGGTGCGTTTGAG

QA 1 733 1 733
DS 



AS 2 4

CO CL2232Contig1 492 2 3 U
AGGGGGTAAAAAACAAAACACTTCATCTATTTTCTAAATTTTGAACTCACTATCAATCCA
TTTCTATTATTCACGATGATAAAATCCCTTCAACTCTTGTTTACCTTCTTAACTATATTC
ATCATTCTTTCACTAGGAATGGTGACAGATGCGAAGAAAACAAAAATGTGTCCTCATAGA
CTCGCAATTAGCAGAGCATGGCCTTGCTCTGTGTTACGATGTCGAAATGAGTGTAAAAAG
AATTACCCACCTACTGGTACTGGTCTTTGTTCGGCTGAGGAAGGATTTTGCGACTGCTAG
GGTCCTTGTTAGATTTCTCGCTAAATGTTGTGAATATAATACACAACTCAAATTCTATAT
TACCTTTTTAAAAATAAATGTCTAAATAATTTTAGTGTCATTAAAATAAAGTATTAAATT
ATTTGTATCAGATCTGTCAATTTATTTATTATAAATAATAATATGAATGTTAAATAAATG
CAATTCCTAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1EE29JQ C 1
AF RS1EE29TF U 2
BS 1 8 RS1EE29JQ
BS 9 490 RS1EE29TF
BS 491 492 RS1EE29JQ

RD RS1EE29JQ 492 0 0
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ATCATTCTTTCACTAGGAATGGTGACAGATGCGAAGAAAACAAAAATGTGTCCTCATAGA
CTCGCAATTAGCAGAGCATGGCCTTGCTCTGTGTTACGATGTCGAAATGAGTGTAAAAAG
AATTACCCACCTACTGGTACTGGTCTTTGTTCGGCTGAGGAAGGATTTTGCGACTGCTAG
GGTCCTTGTTAGATTTCTCGCTAAATGTTGTGAATATAATACACAACTCAAATTCTATAT
TACCTTTTTAAAAATAAATGTCTAAATAATTTTAGTGTCATTAAAATAAAGTATTAAATT
ATTTGTATCAGATCTGTCAATTTATTTATTATAAATAATAATATGAATGTTAAATAAATG
CAATTCCTAACC

QA 1 492 1 492
DS 

RD RS1EE29TF 491 0 0
AGGGGGT
AAAAACAAAACACTTCATCTATTTTCTAAATTTTGAACTCACTATCAATCCATTTCTATT
ATTCACGATGATAAAATCCCTTCAACTCTTGTTTACCTTCTTAACTATATTCATCATTCT
TTCACTAGGAATGGTGACAGATGCGAAGAAAACAAAAATGTGTCCTCATAGACTCGCAAT
TAGCAGAGCATGGCCTTGCTCTGTGTTACGATGTCGAAATGAGTGTAAAAAGAATTACCC
ACCTACTGGTACTGGTCTTTGTTCGGCTGAGGAAGGATTTTGCGACTGCTAGGGTCCTTG
TTAGATTTCTCGCTAAATGTTGTGAATATAATACACAACTCAAATTCTATATTACCTTTT
TAAAAATAAATGTCTAAATAATTTTAGTGTCATTAAAATAAAGTATTAAATTATTTGTAT
CAGATCTGTCAATTTATTTATTATAAATAATAATATGAATGTTAAATAAATGCAATTCCT
AA
CC

QA 8 489 8 489
DS 



CO CL2232Contig2 511 2 2 U
GGGTAAAAAAAAATAAAACACTTCATCTATTTTCTAAATTTTGAACTCACTATCAATCCA
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ATCATTCTTTCACTAGGAATGATGACAGATGCGAAGAGCAAAAATGTGTCCTCATAGACT
CGCAATTAGCAGAGTATGGCCTTGCACTGCGTTACGATGTCAAATTGACTGTAAAAAGAA
TTACCCACCTACTGGTACTGGTCTTTGTTCGGTTGAGGAAGGATTTTGCGACTGCCAGGG
TCCTTGTTAGAGTTCTCGCTAATTGTTGTGAATATAATAGACAACTCAAATTCTATATTA
CATTTTTAAAAATAAATGTCTAAATAATTTTAGTGTCATTAAAATAAAGTATTATATTAT
TTGTATCAGATCTGTGAATTTATTTATTATAAATAATAATATGAATGTTAAATAAATGCA
ATTCCTAAGCATAAGAATGTACTTTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RS1GU76TF U 1
AF RS1GU76JQ C 43
BS 1 508 RS1GU76TF
BS 509 511 RS1GU76JQ

RD RS1GU76TF 511 0 0
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ATCATTCTTTCACTAGGAATGATGACAGATGCGAAGAGCAAAAATGTGTCCTCATAGACT
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TTACCCACCTACTGGTACTGGTCTTTGTTCGGTTGAGGAAGGATTTTGCGACTGCCAGGG
TCCTTGTTAGAGTTCTCGCTAATTGTTGTGAATATAATAGACAACTCAAATTCTATATTA
CATTTTTAAAAATAAATGTCTAAATAATTTTAGTGTCATTAAAATAAAGTATTATATTAT
TTGTATCAGATCTGTGAATTTATTTATTATAAATAATAATATGAATGTTAAATAAATGCA
ATTCCTAAGCATAAGAATGTACTTTTTT
ATT

QA 1 508 1 508
DS 

RD RS1GU76JQ 469 0 0
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ACCTTTTTAACTATATTCATCATTCTTTCACTAGGAATGATGACAGATGCGAAGAGCAAA
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AATTGACTGTAAAAAGAATTACCCACCTACTGGTACTGGTCTTTGTTCGGTTGAGGAAGG
ATTTTGGGACTGCCAGGGTCCTTGTTAGAGTTCTCGCTAATTGTTGTGAATATAATAGAC
AACTCAAATTTTATATTACATTTTTAAAAATAAATGTTTAAATAATTTTAGTGTCATTAA
AATAAAGTATTATATTATTTGTATCAGATCTGTGAATTTATTTATTATAAATAATAATAT
GAATGTTAAATAAATGCAATTCCTAAGCATAAGAATGTACTTTTTTTTT

QA 1 469 1 469
DS 



AS 1 4

CO CL2233Contig1 598 4 5 U
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AGCTTATGAATCGCTAGTTTTCTGTTGCTTTCCAATAAACCCTTGAAATAAAATGTATCG
TTGCATACTCTTGCTTCTCTACTTAATAATAATGCACACTATTTGGGTGTCGCTTACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 

AF RS1DT87JQ C 1
AF RS1CT15JQ C 18
AF RS1CT15TF U 18
AF RS1DT87TF U 1
BS 1 17 RS1DT87TF
BS 18 482 RS1CT15TF
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BS 598 598 RS1DT87JQ

RD RS1DT87JQ 598 0 0
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QA 1 598 1 598
DS 

RD RS1CT15JQ 580 0 0
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QA 1 580 1 580
DS 

RD RS1CT15TF 580 0 0
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GGGTCGTCTTGAGGATCACCAGGCTCATGTTCCTAACTTGATTCGCCCACTTCTTGCACC
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TTTTCTGTTGCTTTCCAATAAACCCTTGAAATAAAATGTATCGTTGCATACTCTTGCTTC
TCTACTTAATAATAATGCACACTATTTGGGTGTCGCTTAC

QA 1 580 1 580
DS 

RD RS1DT87TF 598 0 0
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GACGCAGATCCCTCAACCTTGGAGAAGGTGTTGGAAGAATTGAAATCTGACGAATCAAAC
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TGGTGTCCTGATTGCGTTAGGGCTGAGCCTGTGATTTACAAGACTCTAGAGGAATCACCG
GAGGAAGTGAATCTTATTCGGGCTTACGCCGGAGATAGACCGACGTGGAGGAATCCGATG
CATCCGTGGAGAGTCGATCCTCGATTCAAGGTCACCGGAGTGCCAACACTTGTTCGCTGG
GATGGAGACAGTGTTAAGGGTCGTCTTGAGGATCACCAG*CTCATGTTCCTAACTTGATT
CGCCCACTTCTTGCACCATCCACTTAATTCGATAAGTGACTATGGCTGGATCGATGATCA
AGCTTATGAATCGCTAGTTTTCTGTTGCTTTCCAATAAACCCTTGAAATAAAATGTATCG
TTGCATACTCTTGCTTCTCTACTTAATAATAATGCACACTATTTGGGTGTCGCTTAC
T

QA 1 597 1 597
DS 



AS 2 4

CO CL2234Contig1 696 2 3 U
TGCGGTGAGTGGGTCGACGGATATAACGATTTCGAATAACTACATGTTGAATCATAATGA
AGTCATGCTTTTGGGTCACAGTGATGAGTTTGACGGTGATCGAGACATGAGGGTTTCGAT
CGCGTTTAATTATTTTGGTGAAGGACTTGTCCAGCGAATGCCCAGGTGCAGGCATGGATA
TTTTCACATTGTGAATAATATTTATAGAGAGTGGGAGATGTATGCAATTGGTGGAAGTGC
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GGAGGTGACAAAGCGAGAGAGTATAGATGGAGACGATGAATGGAAGGAATGGAATTGGAA
ATCAGAAGGAGATGAAATGCTAAACGGTGCTTTCTTTACACCATCAGGGAACGAAGATTC
TCCTAGCTATACCAAAATGTCTAGTATGGTAGCTCGACCAGCTTCACTTCTCAAGACCAC
ACATCCATCAGTAGGTGTTCTTAGTTGCCAAATTGGCAAACCTTGTTAGAACCATTCATC
AGCTTGTAACCAAATATTGTATTGTCTTCTTCTTTATTGTGGTTAATGTTAGAGCATTAT
AGGATTTGTGATGATCATAGAGCCAATCAAAACAATTGCATAGCTCATTGTCAATTTCAT
TAAATGTTTCTATTCAAAAGTTACTGAGATTCTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DS28TF U 110
AF RS1G061JQ C 1
BS 1 110 RS1G061JQ
BS 111 655 RS1DS28TF
BS 656 696 RS1G061JQ

RD RS1DS28TF 546 0 0
G
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GGCATGGATATTTTCACATTGTGAATAATATTTATAGAGAGTGGGAGATGTATGCAATTG
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TCAAT

QA 2 546 2 546
DS 

RD RS1G061JQ 696 0 0
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TCCTAGCTATACCAAAATGTCTAGTATGGTAGCTCGACCAGCTTCACTTCTCAAGACCAC
ACATCCATCAGTAGGTGTTCTTAGTTGCCAAATTGGCAAACCTTGTTAGAACCATTCATC
AGCTTGTAACCAAATATTGTATTGTCTTCTTCTTTATTGTGGTTAATGTTAGAGCATTAT
AGGATTTGTGATGATCATAGAGCCAATCAAAACAATTGCATAGCTCATTGTCAATTTCAT
TAAATGTTTCTATTCAAAAGTTACTGAGATTCTACC

QA 1 696 1 696
DS 



CO CL2234Contig2 741 2 6 U
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TATTGTATGTACCATTTTCTTGTTTCTCTTAACCGCTTCTTCCGCGTTTGCGTCTGCGTT
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AGCCGGGGAGTTCTACACCGTAACAGATTCAGGAGACGAGGATCCTCTAAACCCATCTCC
AGGTACATTACGTTACGCCGCAACACAAGACCAACCTCTATGGATCATATTCGATAGAGA
CATGGTAATAACACTAAAAGAAGACATTCAAGTGACCTCATACAAAACCATAGACGGCAG
AGGAAATAACGTGCAGATAGCTTATGGACCGTGTTTAGCTTTGTATCAAGTAAGTAACGT
AATCATACACAATATTTATATCCACCATTGCGTTCCGGCGAAACGGTCGTTGGGAGGGTA
TTCTGATGGAGATGGGATCTCGATATTCGATTCGCGGGATGTTTGGATTGATCATTGTAC
GTTAGAGAAGTGTCACGATGGGCTTATCGATGCGGTGAGTGGGTCGACGATATAACGATT
TCGAATAACTACATGTTGAAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G061TF U 1
AF RS1H657TF U 1
BS 1 31 RS1G061TF
BS 32 32 RS1H657TF
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BS 199 713 RS1G061TF
BS 714 741 RS1H657TF

RD RS1G061TF 713 0 0
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QA 1 713 1 713
DS 

RD RS1H657TF 741 0 0
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TATTGTATGTACCATTTTCTTGTTTCTCTTAACCGCTTCTTCCGCGTTTGCGTCTGCGTT
TCCTAAACCGTCATCTCCAAGGCAATGGTCAACATCAGACGCATCAAACTCAACAGCTTC
TTGCTCAGCCACTGGAAACCCAATCGACGACTGCTGGAGATGCGACCAGAAGTGGAACTC
CAACCGCAAAAGCCTCGCGGACTGCGCGGTTGGATTCGGCCGCGACTCAATAGGCGGTAG
AGCCGGGGAGTTCTACACCGTAACAGATTCAGGAGACGAGGATCCTCTAAACCCATCTCC
AGGTACATTACGTTACGCCGCAACACAAGACCAACCTCTATGGATCATATTCGATAGAGA
CATGGTAATAACACTAAAAGAAGACATTCAAGTGACCTCATACAAAACCATAGACGGCAG
AGGAAATAACGTGCAGATAGCTTATGGACCGTGTTTAGCTTTGTATCAAGTAAGTAACGT
AATCATACACAATATTTATATCCACCATTGCGTTCCGGCGAAACGGTCGTTGGGAGGGTA
TTCTGATGGAGATGGGATCTCGATATTCGATTCGCGGGATGTTTGGATTGATCATTGTAC
GTTAGAGAAGTGTCACGATGGGCTTATCGATGCGGTGAGTGGGTCGACGATATAACGATT
TCGAATAACTACATGTTGAAT

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 4

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GGACCACACCTCACTATTTTATAACAGCTTCTTTCTCTCCCTCTTTTTCTTGAATACAAT
GGCTGAAACAACTCCATTAAAGCGCCACCGAGAAGAAGAAACCCTAGCTGAAGAAGAAAC
CAATAAAAGACAAAAGCCCTCTACATCATCCTTTTCCTCACACAACGACCAGATCCTCAG
TCTCCTCAACGATTCAGACGAACTTGACCAACCTAACAATGACCTAACTTCATTTTAAAC
TCTCTCCAGCAAGATATCTCATCAGATGACCAAAACGGTGTCCTTTCTAGAGTCTCTAAC
GTGGAAGATTCGTCGACTTCGTGTGTTTCCTCGAAGGAAGACGATGTTGATGAAGAGGCC
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AACGAATTTGGCGAGAGTAATTATGAGATGATTAAGAATGAAATTAGTCAAGATTATGTT
TGTGGGGATAATTTGTTAGATGGGTTTGGAGATGCGTTTTGGGAGCTTGAAGATGAAGCT
GCTAATTATTACGCGTTGCTCCAATCTGAACTGTTCTTGTAGAAATCTTAAGGATAAATC
TTGGGGGAAAAGGAAAAGGCCAATTAAAAAGTTAAAATAAGTGCGTCGGTTTTTTATATG
AAAATTTAATTTCATTTTTAAGGCACACTTTGGTTTCGGCGGAGCTACAAAATAGTTTCA
TTTTAAGTATTTGATTAGATATGTAGGGGACAAATGGTAATGGTATTTTTTTACTCTT


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RS1AO77TFB U 1
AF RS1AO77JQ C 1
AF RS1FL66JQ C 496
AF RS1FL66TF U 496
BS 1 496 RS1AO77TFB
BS 497 776 RS1FL66TF
BS 777 778 RS1AO77JQ

RD RS1AO77TFB 677 0 0
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TCTCTCCAGCAAGATATCTCATCAGATGACCAAAACGGTGTCCTTTCTAGAGTCTCTAAC
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TGTGGGGATAATTTGTTAGATGGGTTTGGTGATGCGTTTTGGGAGCTTGAAGATGAAGCT
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AAAATTTAATTTCATTT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RS1AO77JQ 778 0 0
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GGCTGAAACAACTCCATTAAAGCGCCACCGAGAAGAAGAAACCCTAGCTGAAGAAGAAAC
CAATAAAAGACAAAAGCCCTCTACATCATCCTTTTCCTCACACAACGACCAGATCCTCAG
TCTCCTCAACGATTCAGACGAACTTGACCAACCTAACAATGACCTAACTTCATTTTAAAC
TCTCTCCAGCAAGATATCTCATCAGATGACCAAAACGGTGTCCTTTCTAGAGTCTCTAAC
GTGGAAGATTCGTCGACTTCGTGTGTTTCCTCGAAGGAAGACGATGTTGATGAAGAGGCC
AAGGAGACAGTGATGCAGCATCTTTTGGAAGCTTCTGACGACGAACTTGGGCTCCCTAGC
AACGAATTTGGCGAGAGTAATTATGAGATGATTAAGAATGAAATTAGTCAAGATTATGTT
TGTGGGGATAATTTGTTAGATGGGTTTGGTGATGCGTTTTGGGAGCTTGAAGATGAAGCT
GCTAATTATTACGCGTTGCTCCAATCTGAACTGTTCTTGTAGAAATCTTAAGGATAAATC
TTGGGGGAAAAGGAAAAGGCCAATTAAAAAGTTAAAATAAGTGCGTCGGTTTTTTATATG
AAAATTTAATTTCATTTTTAAGGCACACTTTGGTTTCGGCGGAGCTACAAAATAGTTTCA
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QA 1 778 1 778
DS 

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G
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CT

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DS 

RD RS1FL66TF 283 0 0
G
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AGATATGTAGGGGACAAATGGTAATGGTATTTTTTTACTC
CT

QA 2 281 2 281
DS 



AS 1 2

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TCTGTTCGGTCTGAAATTCAAACTCTCGAGAGTTTGATTCGTTTGTCAAGATTTGTTTCA
GTCTTGTTTTTGGTATTTAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GH27TF U 1
AF RS1DU04TF U 39
BS 1 170 RS1GH27TF
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BS 597 741 RS1DU04TF

RD RS1GH27TF 613 0 0
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GATCAGAAGAGAAGAAGGAGAAGAAAAATGCCGCATGGAACGCTTGAAGTTGTTCTTGTC
AGCGCCAAAGATCTCGAGGATTCTGATTTTCTGAATAGCATGGATCCTTATGTGCTCCTC
ACTTGCCGGACTCAAGATCAGAAGAGCAATGTTGCATCAGGACAAGGCACAACTCCGGGA
TGGAATGAGACATTTATCTTCAATGTCTCTGAAGGAACTACAGAGTTAAAAGCCAAACTC
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AAACACCAAATGTGTGTTACTCTTTAATTTGTTGAGTCTTGGTAATAAAATGTTGA
GGGCTTCCCTCTTGAAA

QA 1 596 1 596
DS 

RD RS1DU04TF 703 0 0
GG
GAGATTCTTTTGAAGAAAAAGATCAGAAGAGAAGAAG***AAGAAAAATGCCGCATGGAA
CGCTTGAAGTTGTTCTTGTCAGCGCCAAATGTCTCGAGGATTCTGATTTTCTGAATAGCA
TGGATCCTTACGTGCTCCTCACTTGCCGGACTCAAGACCAGAAGAGCAATGTTGCATCAG
GACAAGGCACAACTCCGGAATGGAATGAGACATTTATCTTCAATGTCTCTGAAGGAACTA
CAGAGTTAAAAGCCAAACTCTTTGACACAGATGTTGGCACAGAGGATGATCCCCTTGGTG
AAGCAACTATTCCATTGGAGGCGGTTTTCCTGGAAGGGGATATCCCACCAGCTGCATACA
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CGGAAAACCGAAGCAGGGGTTTTGAAGAAGAGTCTTATGGAGGCTGGAAAAACTCTGAAG
CTTCTTACTAAAGAGTTCAAAAACACCAAATGTGTGTTACTCTTTAAGTTGTTGAGTCTT
GGGAATAAAATGTTGAAAAAGGAGTTCTGTTAAGAGAGTTTCTTCTTATTCTTATTTCTA
TTAGACTATTATTGTTCTGTTCTGTTCGGTCTGAAATTCAAACTCTCGAGAGTTTGATTC
GTTTGTCAAGATTTGTTTCAGTCTTGTTTTTGGTATTTAGA

QA 3 703 3 703
DS 



AS 1 4

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CATAATTAGAAGTTACGAAGCGGATATATTCATCACCACCACAAAAAAATGCTCAACTCC
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GTTTAATGTTGTCGTTCTTGAAAAGCTTTGCGATGCTCCATATCAAACAACTTTTACAAT
CTATTGTTAATTCTACACACTGCACCATTGCATACAATGTATTTTTCCCAAGCTTCTTTT
TCCCTT*CTGCGTAAAGTATGACGAGGTCGCCAGCCTCGCTATTTTTATCAACTTTAAGT
GTTAGCTCAGAGAAAAAATCCAACACCTTCTTAACAAACAATTTTGCATCTCCTCTCAAG
TTATTTGAGTTGTACATAGAAAAAATATTCTTGTAGTCAGTATTGATTGGCATTTCTTCA
CCGATCGCACTAACCCAGAGAAAACATTGGTCATACCATATTATTCCTCCTTTGTTTCTT
AGACATCTTCTACGAAACCCTACAACTGCAGTGTCAGCACATGAACGGCGTTTAGACCCA
TAAGAGTCACCACGACCCTGGAACATGACGGTAACAGCATCAGGAGCAGGTTCACGACCC
AAGCTTGTGCGCACAAAACCGTTGTTATAATAATTACCATTACGAACACTGCGCAAAATA
ATGTTGAGGTTGTCCTCGTACTCACTTCCAGAATTATATATCCCTTGATCAAGGAAGCAT
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TGCATAGCCAAAATAGAGGAAACAAATCTTTTGGGTAGAGAATATGAATATGTCATTCTT
TTAGATTTTATTGTTTTTCAGTAAAGGGTGATTTTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1E613JQ U 79
AF RS1ET70JQ U 1
AF RS1ET70TF C 180
AF RS1E613TF C 343
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BS 853 876 RS1ET70TF
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AA

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DS 

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GTTTAATGTTGTCGTTCTTGAAAAGCTTTGCGATGCTCCATATCAAACAACTTTTACAAT
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TCCCTT*CTGCGTAAAGTATGACGAGGTCGCCAGCCTCGCTATTTTTATCAACTTTAAGT
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ATGTTGAGGTTGTCCTCGTACTC

QA 1 743 1 743
DS 

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TAGACATCTTCTACGAAACCCTACAACTGCAGTGTCAGCACATGAACGGCGTTTAGACCC
ATAAGAGTCACCACGACCCTGGAACATGACGGTAACAGCATCAGGAGCAGGTTCACGACC
CAAGCTTGTGCGCACAAAACCGTTGTTATAATAATTACCATTACGAACACTGCGCAAAAT
AATGTTGAGGTTGTCCTCGTACTCACTTCCAGAATTATATATCCCTTGATCAAGGAAGCA
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CCC

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DS 

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TTTGCATCTCCTCTCACGTTATTTGAGTTGTACATAGAAAAAATATTCTTGTAGTCAGTA
TTGATTGGCATTTCTTCACCGATCGCACTAACCCAGAGAAAACATTGGTCATACCATATT
ATTCCTCCTTTGTTTCTTAGACATCTTCTACGAAACCCTGCAACTGCAGTGTCAGCACAT
GAACGGCATTTAGACCCATAAGAGTCACCACGACACTGGAACATGACGGTAACAGCATCA
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CGAACACTGCGCAAAATAATGTTGAGGTTGTCCTCGTACTCACTTCCAGAATTATATATC
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TATGAATATGTCATTCTTTTAGATTTTATTGTTTTTCAGTAAAGGGTGATTTTGATCC

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 4

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AAATCACTCACATGGTTTGATTATCGTCCACAAGAGAAAATGTATTTTCTTTGTTTTCTT
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TGACATATCAGTTTGCGAAACCACAATTTGTCGCTGGACATAATATGAATCATAATGGGA
TGATCAACTCATAAATATTTATTTAATATTATTCCCTTAAGAGTTTGAGTATTGTATCAA
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ATCTTGAATGGCAAATGAGCAGTAACATTCTTCGGTAGGCCACATATAGTACAAGAAAAA
GAGATATTGGTAATCAACAGCTGGTGACTATATCTCCATCAGAAAGGATACTGGTGATTG
ATTATTCGCTGCATGTAGCAGCATTTAACAAAGGTTGCTTAGTGATGTCGAGTTTCCGTG
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GAGATTGTTAACAAATTAAACCGTGGCCTGGATGCACCGTTCATTTCCCAATATTACAGC
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AGTCTACTTCATCGACTTTTTGACCGGAATGTGCTGCCGTACTCTTGTTTTTTCCAAGCT
TCCAAAAGCTTCAAGTACCTATATATATATGCTTTTGTAATTTAAAGTTTGTTTCCATGT
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TCATCAAGATTCAAGATTCAAGAAACAAGAAACC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1A314TV U 71
AF RS1A314TF U 1
AF RS1A314TR C 644
AF RS1A314JQ C 677
BS 1 813 RS1A314TF
BS 814 814 RS1A314TR
BS 815 878 RS1A314TF
BS 879 1534 RS1A314TR

RD RS1A314TV 739 0 0
CATGGTTTGATTATCGTCCACAAGAGAAAATGTATTTTCTTTGTTTTCTTCCTTTTGTTT
GCCTTTTGACAAGGGGCCTATGCAAATGGTTTAGACGAAAAGGTTGACAAATCTATGGAA
ACTACCGACATCATGATCTCCCTGCTAATTAGTATCCATTAGGGGCAAGAGAAAAGATCA
ACTCAATGAGACCATTTCCCTAAGCAAGAATCTTCACTAAGCAGAACAACAAATATACTT
TACATATGAGTTTAGTAATATAATATTGGTATACAATGGAAGATCACATATGACATATCA
GTTTGCGAAACCACAATTTGTCGCTGGACATAATATGAATCATAATGGGATGATCAACTC
ATAAATATTTATTTAATATTATTCCCTTAAGAGTTTGAGTATTGTATCAATATTGTAGAA
GTTTGATGCAGCTCCAAGAAGCCAAATAGATATTGTATACCTATTTGCAGATCCTCTTGC
TCGGTTTAGATGCAGGTTTCTCCACAGGTAAGGAGAACCCGAAAAGTTTACAGCCTGTTG
TTGACGCATTCATGTTAACTTCACCGCCTTACTGTTTTCCCATCATATCAATCTTGAATG
GCAAATGAGCAGTAACATTCTTCGGTAGGCCACATATAGTACAAGAAAAAGAGATATTGG
TAATCAACAGCTGGTGACTATATCTCCATCAGAAAGGATACTGGTGATTGATTATTCGCT
GCATGTAGCAGCATTTAAC

QA 1 739 1 739
DS 

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AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGTTGTGTTTGC
AAATCACTCACATGGTTTGATTATCGTCCACAAGAGAAAATGTATTTTCTTTGTTTTCTT
CCTTTTGTTTGCCTTTTGACAAGGGGCCTATGCAAATGGTTTAGACGAAAAGGTTGACAA
ATCTATGGAAACTACCGACATCATGATCTCCCTGCTAATTAGTATCCATTAGGGGCAAGA
GAAAAGATCAACTCAATGAGACCATTTCCCTAAGCAAGAATCTTCACTAAGCAGAACAAC
AAATATACTTTACATATGAGTTTAGTAATATAATATTGGTATACAATGGAAGATCACATA
TGACATATCAGTTTGCGAAACCACAATTTGTCGCTGGACATAATATGAATCATAATGGGA
TGATCAACTCATAAATATTTATTTAATATTATTCCCTTAAGAGTTTGAGTATTGTATCAA
TATTGTAGAAGTTTGATGCAGCTCCAAGAAGCCAAATAGATATTGTATACCTATTTGCAG
ATCCTCTTGCTCGGTTTAGATGCAGGTTTCTCCACAGGTAAGGAGAACCCGAAAAGTTTA
CAGCCTGTTGTTGACGCATTCATGTTAACTTCACCGCCTTACTGTTTTCCCATCATATCA
ATCTTGAATGGCAAATGAGCAGTAACATTCTTCGGTAGGCCACATATAGTACAAGAAAAA
GAGATATTGGTAATCAACAGCTGGTGACTATATCTCCATCAGAAAGGATACTGGTGATTG
ATTATTCGCTGCATGTAGCAGCATTTAACAAAG*TTGCTTAGTGATGTCGAGTTTCCGTG
CGACTGAAGATTCTTATACCATTCTAAGAAATATCATT

QA 1 878 1 878
DS 

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AAGGATACTGGTGATTGATTATTCGCTGCATGTAGCAGCATTTAACAAAGGTTGCTTAGT
GATGTCGAGTTTCCGTGCGACTGAAGATTCTTATACCATTCTAAGAAATATCATTGCATT
TGAGCATTTCCATGCTGCTGTGAAACCCTTTACTTCTAACTACATCAAATTCATAAATAT
CTTAAATACTTCCGAAACGAGATGTTGAGGTACTCACTTACATACATCACAAAATCAATA
ATGACGAAAAACAACAAACATGTGTTGCTGGAACACAGGGGTGTTAGACACGGATGGGTA
GTCCAAGCTTGGTGGTGGAGATTGTTAACAAATTAAACCGTGGCCTGGATGCACCGTTCA
TTTCCCAATATTACAGCATGTGCATGAATTTAACTCAGAGCTGACTATCAATTTCGCAGA
AAGAGACTCTCAGGCAAAGTCTACTTCATCGACTTTTTGACCGGAATGTGCTGCCGTACT
CTTGTTTTTTCCAAGCTTCCAAAAGCTTCAAGTACCTATATATATATGCTTTTGTAATTT
AAAGTTTGTTTCCATGTCTTCATTTTGGATTAGTCATATACTTCGTTGACTGAATGTTTA
TTTCTTGAAAAAAACTACAATTTGTTTATCAACTTTTTTTTTCCATCGGAAATGTAATCT
CAGTTGACTAATGTCAATGGGTAAATCTATTCTATAAGTAACATGTTTTATTCAAAGTTA
AAACGGTTTTACATGGATCATCAAGATTCAAGATTCAAGAAACAAGAAACC

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ACAGCTGGTGACTATATCTCCATCAGAAAGGATACTGGTGATTGATTATTCGCTGCATGT
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TACCATTCTAAGAAATATCATTGCATTTGAGCATTTCCATGCTGCTGTGAAACCCTTTAC
TTCTAACTACATCAAATTCATAAATATCTTAAATACTTCCGAAACGAGATGTTGAGGTAC
TCACTTACATACATCACAAAATCAATAATGACGAAAAACAACAAACATGTGTTGCTGGAA
CACAGGGGTGTTAGACACGGATGGGTAGTCCAAGCTTGGTGGTGGAGATTGTTAACAAAT
TAAACCGTGGCCTGGATGCACCGTTCATTTCCCAATATTACAGCATGTGCATGAATTTAA
CTCAGAGCTGACTATCAATTTCGCAGAAAGAGACTCTCAGGCAAAGTCTACTTCATCGAC
TTTTTGACCGGAATGTGCTGCCGTACTCTTGTTTTTTCCAAGCTTCCAAAAGCTTCAAGT
ACCTATATATATATGCTTTTGTAATTTAAAGTTTGTTTCCATGTCTTCATTTTGGATTAG
TCATATACTTCGTTGACTGAATGTTTATTTCTTGAAAAAAACTACAATTTGTTTATCAAC
TTTTTTTTTCCATCGGAAATGTAATCTCAGTTGACTAATGTCAATGGGTAAATCTATTCT
ATAAGTAACATGTTTTATTCAAAGTTAAAACGGTTTTACATGGATCATCAAGATTCAAGA
TTCAAGAAACAAGAAACC

QA 1 858 1 858
DS 



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AGTAGCAAAGCTGAGCTCAGAACTGTCTTCAAGATCTGAGCATGCAACCCCTTAAAGAAC
CCTAACATCCCTTCTTTTCTCCATATGTCACAGACAACCCCTGGTATCGTTTTCTTTGTC
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TTGCACCTGATTGCAGGATATGTGATGACCGTGGCAATACTTTTGGAGACCGCGCCTAAC
AAGAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 

AF RS1GV03JQ U 1
AF RS1GV03TF C 1
AF RS1DF35JQ U 36
AF RS1DF35TF C 36
BS 1 119 RS1GV03JQ
BS 120 120 RS1DF35JQ
BS 121 545 RS1GV03JQ

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AGTAGCAAAGCTGAGCTCAGAACTGTCTTCAAGATCTGAGCATGCAACCCCTTAAAGAAC
CCTAACATCCCTTCTTTTCTCCATATGTCACAGACAACCCCTGGTATCGTTTTCTTTGTC
CTACTTACGGGCTTCTTAGTTTCCTTTTCCTTCGTCTCATCAGAAGCTTGAATCATCACT
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AAGAA

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DS 

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GTACATATAACCAGAACCAAGTTTTATCCTGCGTGAATCATACATAGACATTAGAGAGAG
AACAACTTGACCGACCAGACTTGCAAGACTGTCCTTGCTTTGCTTGGAACGTGTGTGGCG
GTAGCAAACGGATTTGCTGAGTCTTAAGGACTTTTCAACTTACCATTTCTGAGAAACAGA
GCTCTACGGATAGCTAGAATGAGAATCCATGTTGTTGCACTGATTTTCTCTTTGATCATC
AGTAGCAAAGCTGAGCTCAGAACTGTCTTCAAGATCTGAGCATGCAACCCCTTAAAGAAC
CCTAACATCCCTTCTTTTCTCCATATGTCACAGACAACCCCTGGTATCGTTTTCTTTGTC
CTACTTACGGGCTTCTTAGTTTCCTTTTCCTTCGTCTCATCAGAAGCTTGAATCATCACT
TTGCACCTGATTGCAGGATATGTGATGACCGTGGCAATACTTTTGGAGACCGCGCCTAAC
AAGAA

QA 1 545 1 545
DS 

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DS 

RD RS1DF35TF 510 0 0
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AATCATACATAGACATTAGAGAGAAAACAACTTGACCGACCAGACTTGCAAGACTGTCCT
TGCTTTGCTTGGAACGTGTGTGGCGGTAGCAAACGGATTTGCTGAGTCTTAAGGACTTTT
CAACTTACCATTTCTGAGAAACAGAGCTCTACGGATAGCTAGAATGAGAATCCATGTTGT
TGCACTGATTTTCTCTTTGATCATCAGTAGCAAAGCTGAGCTCAGAACTGTCTTCAAGAT
CTGAGCATGCAACCCCTTAAAGAACCCTAACATCCCTTCTTTTCTCCATATGTCACAGAC
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QA 1 510 1 510
DS 



AS 1 4

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CATATCGCATTTGCATCTGAGTTTTCCCAATAGAAAAAAAGGAGGTAACTTTTCTTTAGT
TCGTATCAGAAGATGGCGACGAACATTGGGATGATGGACAGTGCTTACTTCGTTGGACGA
AACGAGATTCTCGGTTGGATCAATGACCGCCTTCATCTCAATCTCTCTCGCATCGAAGAG
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ATGCACAAGGTTAATTTTGCGGCGAAGAACGAGTACGAGATGATTCAAAACTACAAAGTC
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AAAGAGAAAAGCGTAAAGGGGACTAGCAAGGTCTCAAAGTCACTGCAAACAAACAATACG
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AAGCTCAGGGATATAGAGATACTCTGTCAGACTCCTGAACTCGATGATCTTCCGATAGTG
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CAAGAGTGCCTAATCGAGTCTCTAGGTCTCGAGGCTGAGGAAGAAGAAGGAAACGAAGAA
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AAAAAAAGACGAGTTTCAAAGTAGAGGACAATGACTGTACATCGCCTTGTCTTAGAAGAT
AGTGTTTGCACAATACTCAAGTTACCCTAACCGGTTATTCGGTTTTTTAAATGAAACGTC
CCAAACTCTGTTCCTTTCTTAATTTAAAAGATGGTCCAATTTGGTTTATCTTTGTATCAC
AGCGTTTTGTGTCCATCTAAATATATTGGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G372TF U 1
AF RS1D274TF U 60
AF RS1D274JQ C 303
AF RS1G372JQ C 803
BS 1 462 RS1G372TF
BS 463 717 RS1D274TF
BS 718 718 RS1D274JQ
BS 719 762 RS1D274TF
BS 763 860 RS1D274JQ
BS 861 861 RS1G372JQ
BS 862 875 RS1D274JQ
BS 876 876 RS1G372JQ
BS 877 1128 RS1D274JQ
BS 1129 1231 RS1G372JQ

RD RS1G372TF 462 0 0
CGTTTCACCTAACCCCCCATTTGATTCTCTCTTTAACCTCTTTTTTTTCCTTTCGATCAT
CATATCGCATTTGCATCTGAGTTTTCCCAATAGAAAAAAAGGAGGTAACTTTTCTTTAGT
TCGTATCAGAAGATGGCGACGAACATTGGGATGATGGACAGTGCTTACTTCGTTGGACGA
AACGAGATTCTCGGTTGGATCAATGACCGCCTTCATCTCAATCTCTCTCGCATCGAAGAG
GTTGCATCAGGTGCTGTTCAATGCCAAATGTTGGACATGACCTTTCCTGGAGTTGTGCCT
ATGCACAAGGTTAATTTTGCGGCGAAGAACGAGTACGAGATGATTCAAAACTACAAAGTC
ATGCAAGAAGTCTTCACCAAACTCAAAATCACAAAGCCATTGGAAGTCAACAGGCTTGTT
AAAGGTCGACCACTAGACAACTTGGAGTTTCTGCAATGGCTG

QA 1 462 1 462
DS 

RD RS1D274TF 706 0 0
GG
ATATCGCATTTGCATCTGAGTTTTCCCAATAGAAAAAAAGGAGGTAACTTTTCTTTAGTT
CGTATCAGAAGATGGCGACGAACATTGGGATGATGGACAGTGCTTACTTCGTTGGACGAA
ACGAGATTCTCGGTTGGATCAATGACCGCCTTCATCTCAATCTCTCTCGCATCGAAGAGG
TTGCATCAGGTGCTGTTCAATGCCAAATGTTGGACATGACCTTTCCTGGAGTTGTGCCTA
TGCACAAGGTTAATTTTGCGGCGAAGAACGAGTACGAGATGATTCAAAACTACAAAGTCA
TGCAAGAAGTCTTCACCAAACTCAAAATCACAAAGCCATTGGAAGTCAACAGGCTTGTTA
AAGGTCGACCACTAGACAACTTGGAGTTTCTGCAATGGCTGAAACGTTTTTGTGATTCTA
TCAATGGCGGCATTATGAACGAGAATTACAATCCAGTAGAAAGAAGATCAAGAGGTGGCA
AAGAGAAAAGCGTAAAGGGGACTAGCAAGGTCTCAAAGTCACTGCAAACAAACAATACGC
ATCAACCTCCTCCTCCAGTCACTACTTCCAGCAAACCAACTGGTCCCAAGCAAGCAAGAT
CACAAGCAACTGGAGGTGGGAGCAACTCATCAGCCGAAGTGCAAGCTCTGACGAAG*AGC
TTGAAGATGTCAAGGTCTCGGTGGATCTCTTGGAAAAGGAA
GAG

QA 3 703 3 703
DS 

RD RS1D274JQ 826 0 0
GCACAAGGTTAATTT*GCGGCGAAGAACGAGTACGAGATGATTCAAAACTACAAAGTCAT
GCAAGAAGTCTTCACCAAACTCAAAATCACAAAGCCATTGGAAGTCAACAGGCTTGTTAA
AGGTCGACCACTAGACAACTTGGAGTTTCTGCAATGGCTGAAACGTTTTTGTGATTCTAT
CAATGGCGGCATTATGAACGAGAATTACAATCCAGTAGAAAGAAGATCAAGAGGTGGCAA
AGAGAAAAGCGTAAAGGGGACTAGCAAGGTCTCAAAGTCACTGCAAACAAACAATACGCA
TCAACCTCCTCCTCCAGTCACTACTTCCAGCAAACCAACTGGTCCCAAGCAAGCAAGATC
ACAAGCAACTGGAGGTGGGAGCAACTCATCAGCCGAAGTGCAAGCTCTGACGAAGGAGCT
TGAAGATGTCAAGGTCTCGGTGGATCTCTTGGAAAAGGAAAGAGATTTTTACTTCTCTAA
GCTCAGGGATATAGAGATACTCTGTCAGACTCCTGAACTCGATGATCTTCCGATAGTGGT
AGCGGCTAAGAAGATATTGTATGCAACAGATGCGAATGAATCAGTACTAGAAGAAGCTCA
AGAGTGCCTAATCGAGTCTCTAGGTCTCGAGGCTGAGGAAGAAGAAGGAAACGAAGAAGA
AGAAGACGGAGCAGAAGAAGCAAAGACTCAGACTTAAAAGTTGTGACTTCTAACCGAAAA
AAAAAGACGAGTTTCAAAGTAGAGGACAATGACTGTACATCGCCTTGTCTTAGAAGATAG
TGTTTGCACAATACTCAAGTTACCCTAACCGGTTATTCGGTTTTTT

QA 1 826 1 826
DS 

RD RS1G372JQ 429 0 0
TCTGTCAGACTCCTGAACTCGATGATCTTCCGATAGTGGTAGCGGTTAAGAAGATATTAT
ATGCAACAGATGCAAATGAATCAGTACTAGAAGAAGCTCAAGAGTGCCTAATCGAGTCTT
TAGGTCTCGAGGCTGAGGAAGAAGAAGGAAACGAAGAAGAAGAAGACGGAGCAGAAGAAG
CAAAGACTCAGACTTAAAAGTTGTGATTTCTAACCGAAAAAAAAAGACGAGTTTCAAAGT
AGAGGACAATGACTGTACATTGCCTTGTCTTAGAAGATAGTGTTTGCACAATACTCAAGT
TACCCTAACCGGTTATTCGGTTTTTTAAATGAAACGTCCCAAACTCTGTTCCTTTCTTAA
TTTAAAAGATGGTCCAATTTGGTTTATCTTTGTATCACAGCGTTTTGTGTCCATCTAAAT
ATATTGGAG

QA 1 429 1 429
DS 



AS 2 4

CO CL2241Contig1 829 2 6 U
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TACATTTGAGACGACGTTAAACTTGAGAATCTTCTTCAGTTTGAGACCACACAACCATAT
ACAAGCCAAGAATGTTTCTATTGAAGAACAAGTTTCTTGCCTAGAATCATGTCGTCAGTA
GTGAAATCCGCCTCTTTTCTGAAAGTTCCACGACCGAAGTCGAGGTTGTATGAGTCAGTG
AGACCATCCACCAAGTCGAACTCCGGTGTCCATCCCAAGACATGCTTTGCTTTCTCCACC
GAGGCAAAGAAATGCTGGTCACGGAAAGGGAAGGCCTTCTTCTTCCCAAAGTCGAACTCT
TTAGGGTTGTAGTGAACAATCTCTGGCTCTGGAAACCCACCAGCCTTTGCGCAAGCTCTT
GCTAAGCCATCAAAGGTGACGTACTTCTCTCCTGAGATGTTGAATATCTCTCTGCTTGCT
TTCTCGTTACCAAGCACGGCGAGAAAGGCTGTTGCCAAGTCCTTAACGTGACCGAGTCGT
GAGATCTGGATCCCAGAGTTTGGAACTGGGATAGGTCGACCAGCTTTGAGACGGTGGAAG
AACCATTCTTCTACGGGGTTGTAGTTCAATGGACCGTAGATGTAGACAGGACGTATAGAA
GTCCAGTTTACACCTTTTGATTGCAGTAAGCTCTCTGTCTCCAGCTTCCCCTTGTGCCTG
CTCTTCGGGTCAACTGCATCCACCTCACAGTGTGGCAAGATATCAGATTTCAGTAACACC
AGCTGAAGAACAGTAGATGTACTGTTCTAGTTAGAGCGCATCTATATGG


BQ
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AF RS1GE12JQ U 1
AF RS1BB49JQ U 3
BS 1 160 RS1GE12JQ
BS 161 161 RS1BB49JQ
BS 162 537 RS1GE12JQ
BS 538 538 RS1BB49JQ
BS 539 553 RS1GE12JQ
BS 554 829 RS1BB49JQ

RD RS1GE12JQ 553 0 0
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TACATTTGAGACGACGTTAAACTTGAGAATCTTCTTCAGTTTGAGACCACACAACCATAT
ACAAGCCAAGAATGTTTCTATTGAAGAACAAGTTTCTTGCTTAGAATCATGTCGTCAGTA
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AGACCATCCACCAAGTCGAACTCCGGTGTCCATCCCAAGACATGCTTTGCTTTCTCCACC
GAGGCAAAGAAATGCTGGTCACGGAAAGGGAAGGCCTTCTTCTTCCCAAAGTCGAACTCT
TTAGGGTTGTAGTGAACAATCTCTGGCTCTGGAAACCCACCAGCCTTTGCGCAAGCTCTT
GCTAAGCCATCAAAGGTGACGTACTTCTCTCCTGAGATGTTGAATATCTCTCTGCTTGCT
TTCTCGTTACCAAGCACGGCGAGAAAGGCTGTTGCCAAGTCCTTAACGTGACCGAGTTGT
GAGATCTGGATCC

QA 1 553 1 553
DS 

RD RS1BB49JQ 827 0 0
CCAGACCGCGCGCCGCTTTTTTTTATAGAAAAAACTCGAACACAATCCATACAGAAAATA
CATTTGAGACGACGTTAAACTTGAGAATCTTCTTCAGTTTGAGATCACACAACCATATAC
AAGCCAAGAATGTTTCTATTGAAGAACAAGTTTCTTGCCTAGAATCATGTCGTCAGTAGT
GAAATCCGCCTCTTTTCTGAAAGTTCCACGACCGAAGTCGAGGTTGTATGAGTCAGTGAG
ACCATCCACCAAGTCGAACTCCGGTGTCCATCCCAAGACATGCTTTGCTTTCTCCACCGA
GGCAAAGAAATGCTGGTCACGGAAAGGGAAGGCCTTCTTCTTCCCAAAGTCGAACTCTTT
AGGGTTGTAGTGAACAATCTCTGGCTCTGGAAACCTACCAGCCTTTGCGCAAGCTCTTGC
TAAGCCATCAAAGGTGACGTACTTCTCTCCTGAGATGTTGAATATCTCTCTGCTTGCTTT
CTCGTTACCAAGCACGGCGAGAAAGGCTGTTGCCAAGTCCTTAACGTGACCGAGTCGTGA
GATCTGGATCCCAGAGTTTGGAACTGGGATAGGTCGACCAGCTTTGAGACGGTGGAAGAA
CCATTCTTCTACGGGGTTGTAGTTCAATGGACCGTAGATGTAGACAGGACGTATAGAAGT
CCAGTTTACACCTTTTGATTGCAGTAAGCTCTCTGTCTCCAGCTTCCCCTTGTGCCTGCT
CTTCGGGTCAACTGCATCCACCTCACAGTGTGGCAAGATATCAGATTTCAGTAACACCAG
CTGAAGAACAGTAGATGTACTGTTCTAGTTAGAGCGCATCTATATGG

QA 1 827 1 827
DS 



CO CL2241Contig2 835 2 6 U
GGTACGAACCATTCACAGATACTCACATAAGACCTTCTCTTCAGTTTGCTCAGAGAGTGA
ACCAACAAGCATGGCGAAGATGATGATGATGCAACAGAGCCAGCCTTCTTTATCTCTACT
TACTTCTTCTCTCTCTGACTTTAATGGCGCCAAGCTCAACCTACAAGTCCAGTACAAGAG
GAAGGTTCAACAGCCAAAAGGAGCACTCTATGTATCAGCATCGAGCGAGAAGAAGATTCT
TATAATGGGTGGCACTCGGTTCATTGGTATCTTCTTATCCAGGCTCCTTGTTAAAGAGGG
ACATCAGGTTACATTGTTCACAAGAGGTAAATCTCCTATTGCCAAACAATTGCCTGGCGA
ATCTGACCAAGACTTTGCTGATTTTTCTTCCAAGATTCTTCACTTGAAAGGAGACAGAAA
GGACTATGACTTTGTGAAGTCAAGTCTTTCAGCTGAAGGCTTCGATGTTGTTTATGATAT
CAACGGGAGGGAAGCTGAAGAAGTTGAGCCCATATTAGATGCACTTCCTAAACTAGAACA
GTACATCTACTGTTCTTCAGCTGGTGTTTACCTGAAATCTGATATCTTGCCACACTGTGA
GGTGGATGCAGTTGACCCGAAGAGCAGGCACAAGGGGAAGCTGGAGACAGAGAGCTTACT
GCAATCAAAAGGTGTAAACTGGACTTCTATACGTCCTGTCTACATCTACGTCCATTGAAC
TACAACCCCGTAGAAGAATGGTTCTTCCACCGTCTCAAAGCTGGTCGACCTATCCAGTTC
CAACTCTGGGATCAGATCTCACGACTCGGTCACGTTAAGACTTGGCACAGCCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1GE12TF U 1
AF RS1BB49TF U 57
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BS 82 82 RS1BB49TF
BS 83 305 RS1GE12TF
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BS 307 665 RS1GE12TF
BS 666 835 RS1BB49TF

RD RS1GE12TF 665 0 0
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ACCAACAAGCATGGCGAAGATTATGATGATGCAACAGAGCCAGCCTTCTTTATCTCTACT
TACTTCTTCTCTCTCTGACTTTAATGGCGCCAAGCTCAACCTACAAGTCCAGTACAAGAG
GAAGGTTCAACAGCCAAAAGGAGCACTCTATGTATCAGCATCGAGCGAGAAGAAGATTCT
TATAATGGGTGGCACTCGGTTCATTGGTATCTTCTTATCCAGGCTCCTTGTTAAAGAGGG
ACATCGGGTTACATTGTTCACAAGAGGTAAATCTCCTATTGCCAAACAATTGCCTGGCGA
ATCTGACCAAGACTTTGCTGATTTTTCTTCCAAGATTCTTCACTTGAAAGGAGACAGAAA
GGACTATGACTTTGTGAAGTCAAGTCTTTCAGCTGAAGGCTTCGATGTTGTTTATGATAT
CAACGGGAGGGAAGCTGAAGAAGTTGAGCCCATATTAGATGCACTTCCTAAACTAGAACA
GTACATCTACTGTTCTTCAGCTGGTGTTTACCTGAAATCTGATATCTTGCCACACTGTGA
GGTGGATGCAGTTGACCCGAAGAGCAGGCACAAGGGGAAGCTGGAGACAGAGAGCTTACT
GCAAT

QA 1 665 1 665
DS 

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GG
GAACCAACAAGCATGGCGAAGATGATGATGATGCAACAGAGCCAGCCTTCTTTATCTCTA
CTTACTTCTTCTCTCTCTGACTTTAATGGCGCCAAGCTCAACCTACAAGTCCAGTACAAG
AGGAAGGTTCAACAGCCAAAAGGAGCACTCTATGTATCAGCATCGAGCGAGAAGAAGATT
CTTATAATGGGTGGCACTCGGTTCATTGGTATCTTCTTATCCAGGCTCCTTGTTAAAGAG
GGACATCAGGTTACATTGTTCACAAGAGGTAAATCTCCTATTGCCAAACAATTGCCTGGC
GAATCTGACCAAGACTTTGCTGATTTTTCTTCCAAGATTCTTCACTTGAAAGGAGACAGA
AAGGACTATGACTTTGTGAAGTCAAGTCTTTCAGCTGAAGGCTTCGATGTTGTTTATGAT
ATCAACGGGAGGGAAGCTGAAGAAGTTGAGCCCATATTAGATGCGCTTCCTAAACTAGAA
CAGTACATCTACTGTTCTTCAGCTGGTGTTTACCTGAAATCTGATATCTTGCCACACTGT
GAGGTGGATGCAGTTGACCCGAAGAGCAGGCACAAGGGGAAGCTGGAGACAGAGAGCTTA
CTGCAATCAAAAGGTGTAAACTGGACTTCTATACGTCCTGTCTACATCTACGTCCATTGA
ACTACAACCCCGTAGAAGAATGGTTCTTCCACCGTCTCAAAGCTGGTCGACCTATCCAGT
TCCAACTCTGGGATCAGATCTCACGACTCGGTCACGTTAAGACTTGGCACAGCCTTT

QA 3 779 3 779
DS 



AS 1 4

CO CL2242Contig1 1056 4 17 U
GGGGTAAAGCAAACAAAATGTTGCTCCGTCGTGCAACCGCCGCACTACCCAAAACCCTAC
AAAACCTCCGGCTATTCTCTCCGGCGGCGACCTCCGCGTTAGCCCTCGACCACACCCTAG
ATACCCAACTAGACTACCTCCCCGGGTTCCCTCGACCCGATGCTAAACACGCGGAGACGA
TCCTAGCCGTTCCTCGGTCCGACTCCGGTAAGAACATATCCGCGAAAGAGCGTAAAGCGG
GTCGGGTCCCTTCGATCATATTCGAGCAGGAGGATGGTCAGCACGGAGGGAACAAGAGGC
TCGTCTCGGTTGAGACGAATCAGATCAGGAAGCTGGTGACTCATCTGGGTTACTCCTTCT
TCCTCTCGAGGCTATTCGATGTCGAGGTTAGGTCTGAGATTGGTTCCGATGAGGTCGTTG
AGAAAGTCAGGGCCTTGCCCAGATCGATTCATTTGCACTCTGGAAGTGATGCGCCGCTGA
ATGTGACGTTTATAAGAGCTCCTCCTGGTACTCTGTTGAAGGTTGATATCC*TCTTGTGT
TTATTGGAGATGATGTTTCTCCTGGGTTGAAGAAAGGAGCATCTCTGAATACGATCAAAA
GAACGGTGAAGTTCCTATGTCCGGCAGAGATCATCCCTCCATATATAGAAGTAGATCTCA
GTCTACTAGACGTTGGGCAAAAGCTAGTAGCGGGAGACCTCAAGGTTCACCCGGCGCTAA
AGCTAATAAGGCCCAGAGACGAACCAATTGTTAAGATCGCCGGAGGACGTGTCAGTGACC
AGCAAAAGGACCAGCAAAAGAAGGACCAGCCAAAGAAAGACCAAGCAAAGAAATAAACCG
GTGGTTAGTCATATTAACCGGTGCAAACCTAATGTTGATGAAAATTTTTATGGATCAATC
TTCTTAGAACTTGTGATCCTTTAGCATGAAGGTTTTTTTTGTGTGTTGTTGTTAGTGTTG
CCGGAGAGCTCTAGATTCCGGTGGAATATTCTGTCTTGATTCAACAATGCAATTTTTCAT
GGAACAGTCCTTAAATAAGATTTAACAGATTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1EI29TF U 1
AF RS1AI24TF U 45
AF RS1AI24JQ C 254
AF RS1EI29JQ C 659
BS 1 377 RS1EI29TF
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BS 830 865 RS1AI24TF
BS 866 1056 RS1AI24JQ

RD RS1EI29TF 619 0 0
GGGGTAAAGCAAACAAAATGTTGCTCCGTCGTGCAACCGCCGCACTACCCAAAACCCTAC
AAAACCTCCGGCTATTCTCTCCGGCGGCGACCTCCGCGTTAGCCCTCGACCACACCCTAG
ATACCCAACTAGACTACCTCCCCGGGTTCCCTCGACCCGATGCTAAACACGCGGAGACGA
TCCTAGCCGTTCCTCGGTCCGACTCCGGTAAGAACATATCCGCGAAAGAGCGTAAAGCGG
GTCGGGTCCCTTCGATCATATTCGAGCAGGAGGATGGTCAGCACGGAGGGAACAAGAGGC
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TCCTCTCGAGGCTATTCTATGTCGAGGTTAGGTCTGAGATTGGTTCCGATGAGGTCGTTG
AGAAAGTCAGGGCCTTGCCCAGATCGATTCATTTGCACTCTGGAAGTGATGCGCCGCTGA
ATGTGACGTTTATAAGAGCTCCTCCTGGTACTCTGTTGAAGGTTGATATCCCTCTTGTGT
TTATTGGAGATGATGTTTCTCCTGGGTTGAAGAAAGGAGCATCTCTGAATACGATCAAAA
GAACGGTGAAGTTTCTATG

QA 1 619 1 619
DS 

RD RS1AI24TF 826 0 0
GG
ACCCAAAACCCTACAAAACCTCCGGCTATTCTCTCCGGCGGCGACCTCCGCGTTAGCCCT
CGACCACACCCTAGATACCCAACTAGACTACCTCCCCGGGTTCCCTCGACCCGATGCTAA
ACACGCGGAGACGATCCTAGCCGTTCCTCGGTCCGACTCCGGTAAGAACATATCCGCGAA
AGATCGTAAAGCGGGTCGGGTCCCTTCGATCATATTCGAGCAGGAGGATGGTCAGCACGG
AGGGAACAAGAGGCTCGTCTCGGTTGAGACGAATCAGATCAGGAAGCTGGTGACTCATCT
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CGATGAGGTCGTTGAGAAAGTCAGGGCCTTGCCCAGATCGATTCATTTGCACTCTGGAAG
TGATGCGCCGCTGAATGTGACGTTTATAAGAGCTCCTCCTGGTACTCTGTTGAAGGTTGA
TATCC*TCTTGTGTTTATTGGAGATGATGTTTCTCCTGGGTTGAAGAAAGGAGCATCTCT
GAATACGATCAAAAGAACGGTGAAGTTCCTATGTCCGGCAGAGATCATCCCTCCATATAT
AGAAGTAGATCTCAGTCTACTAGACGTTGGGCAAAAGCTAGTAGCGGGAGACCTCAAGGT
TCACCCGGCGCTAAAGCTAATAAAGCCCAGAGACGAACCAATTGTTAAGATCGCCGGAG*
ACGTGTCAGTGACCAGCAAAAGGACCAGCAAAAGAAGGACCAGCCAAAGAA*GACCAAGC
AA*GAAATAAACCGGTGGTTAGTCATATTAACCGGTGCA
ACCTA

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DS 

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ATTCGATGTCGAGGTTAGGTCTGAGATTGGTTCCGATGAGGTCGTTGAGAAAGTCAGGGC
CTTGCCCAGATCGATTCATTTGCACTCTGGAAGTGATGCGCCGCTGAATGTGACGTTTAT
AAGAGCTCCTCCTGGTACTCTGTTGAAGGTTGATATCC*TCTTGTGTTTATTGGAGATGA
TGTTTCTCCTGGGTTGAAGAAAGGAGCATCTCTGAATACGATCAAAAGAACGGTGAAGTT
CCTATGTCCGGCAGAGATCATCCCTCCATATATAGAAGTAGATCTCAGTCTACTAGACGT
TGGGCAAAAGCTAGTAGCGGGAGACCTCAAGGTTCACCCGGCGCTAAAGCTAATAAGGCC
CAGAGACGAACCAATTGTTAAGATCGCCGGAGGACGTGTCAGTGACCAGCAAAAGGACCA
GCAAAAGAAGGACCAGCCAAAGAAAGACCAAGCAAAGAAATAAACCGGTGGTTAGTCATA
TTAACCGGTGCAAACCTAATGTTGATGAAAATTTTTATGGATCAATCTTCTTAGAACTTG
TGATCCTTTAGCATGAAGGTTTTTTTTGTGTGTTGTTGTTAGTGTTGCCGGAGAGCTCTA
GATTCCGGTGGAATATTCTGTCTTGATTCAACAATGCAATTTTTCATGGAACAGTCCTTA
AATAAGATTTAACAGATTTCTCC

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DS 

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AAAGCTAATAAGGCCCAGAGACGAACCAATTGTTAAGATCGCCGGAGGACGTGTCAGTGA
CCAGCAAAAGGACCAGCAAAAGAAGGACCAGCCAAAGAAAGACCAAGCAAAGAAATAAAC
CGGTGGTTAGTCATATTAACCGGTGCAGACCTAATGTTGATGAAAATTTTTATGGATCAA
TTTTTTTAGAACTTGTGATCCTTTAGCATGAAGGTTTTTTTTGTGTGTTGTTGTTAGTGT
TGCCGGAGAGCTCTAGATTCCGGTGGAATATTCTGTCTTGATTCAACAATGCAATTTTTC
ATGGAACAGTCCTTAAATAAGATTTAACAGATTTCT
TG

QA 1 396 1 396
DS 



AS 1 4

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GGAAACATAACAAACCATCTCGTAACCGGAATCAGCAACAGCTTACTGTCTCCGGCGAGA
ATCTCAATTTTTGATCATTCACGGTGGCGTCGACGTCAGGCGAACAACAAGCTCTCTCGA
GAAGAAAGCCGCCTCCATCACCATCATCTCCTCCTCCTCACTCTGTTTCGCCTCTACGAA
CTCCTCCAGCGAGGAAAGCTATCCCCGAGTTTCCCTTTTATCAGCAGAACTGGTTCATCG
CTCTTCTCTTCGCGATGGCTCTCGGATTCTTCTCCCTCGCTCTGTTCCTCTTCCTTAGCG
TCGATTCGGATTCCGCCGCCGCCGCGTCTGGTAAAGAAGGCGTCGTCGAGATAACGTATG
GAAGTGCGATTAAGCTGATGCACGAGAAGACTAAGTTCCGACTTCATTCTCACGATGTGC
CGTATGGATCCGGAAGTGGTCAGCAATCTGTCACTGGTTTTCCTGGCGTCGTTGATTCCA
ACAGCTACTGGATTGTTAAACCTGTGCCTGGGACAACAGCCAAGCAAGGTGATGCCGTCA
TGAGTGGAGCTACCGTTAGATTGCAGCACATGAAGACCCGGAAATGGCTCCACAGTCACC
TGCATGCATCCCCTATTTCAGGCAACTTAGAGGTTAGCTGCTTTGGAGATGATTCAAATT
CCGATACCGGGGATCACTGGAAGCTTATAATCGAAGGGAGCGGGAAGACATGGAAACAAG
ACCAAAGAGTCCGACTTCAACACATTGACACTAGTGGTTACCTCCATAGCCATGACAAAA
AGTACCAGCGTATAGCCGGTGGTCAGCAAGAGGTGTGTGGAATCAGGGAGAAGCGGGCAG
ATAATGTTTGGTTGGCAGCAGAAGGAGTCTACCTTCCCGTTAATGAGAGTAGCAGCAAGT
AATGTGAAGAGTTGTGTTAACTTATCTCTGAGGAGACTTTGAATCTCATCTTTTACTCTC
TTAAGAGAGCTCATGAACAAGAAAATACATATATTTTGCTGATCTTCGGTTGATGATGCT
TTTAGTCGTACGAATATACATATATTGTAGGCAATTTGCATTTTCCTTACTTTAAGAGTT
TAGTTATTGTGTGGTTATGATTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D329TF U 1
AF RS1F882TF U 236
AF RS1D329JQ C 321
AF RS1F882JQ C 471
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BS 860 1104 RS1D329JQ

RD RS1D329TF 734 0 0
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ACCAAAGAGTCCGA

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DS 

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G
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AGCGTCGATTCGGATTCCGCCGCCGCCGCGTCTGGTAAAGAAGGCGTCATCGAGATAACG
TATGGAAGTGCGATTAAGCTGATGCACGAGAAGACTAAGTTCCGACTTCATTCTCACGAT
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TCCAACAGCTACTGGATTGTTAAACCTGTGCCTGGGACAACAGCCAAGCAAGGTGATGCC
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CACCTGCATGCATCCCCTATTTCAGGCAACTTAGAGGTTAGCTGCTTTGGAGATGATTCA
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GCAGATAATGTTTGGTTGGCAGC

QA 2 624 2 624
DS 

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CAGCAATCTGTCACTGGTTTTCCTGGCGTCGTTGATTCCAACAGCTACTGGATTGTTAAA
CCTGTGCCTGGGACAACAGCCAAGCAAGGTGATGCCGTCATGAGTGGAGCTACCGTTAGA
TTGCGGCACATGAAGACCCGGAAATGGCTCCACAGTCACCTGCATGCATCCCCTATTTCA
GGTAACTTAGAGGTTAGCTGCTTTGGAGATGATTCAAATTCCGATACCGGGGATCACTGG
AAGCTTATAATCGAAGGGAGCGGGAAGACATGGAAACAAGACCAAAGAGTCCGACTTCAA
CACATTGACACTAGTGGCTACCTCCATAGCCATGACAAAAAGTACCAGCGTATAGCCGGT
GGTCAGCAAGAGGTGTGTGGAATCAGGGAGAAGCGGGCAGATAATGTTTGGTTGGCAGCA
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CTTATCTCTGAGGAGACTTTGAATCTCATCTTTTACTCTCTTAAGAGAGCTCATGAACAA
GAAAATACATATATTTTGCTGATCTTCGGTTGATGATGCTTTTAGTCGTACGAATATACA
TATATTGTAGGCAATTTGCATTTTCCTTACTTTAAGAGTTTAGTTATTGTGTGGTTATGA
TTGG

QA 1 784 1 784
DS 

RD RS1F882JQ 625 0 0
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GATGCCGTCATGAGTGGAGCTACCGTTAGATTGCAGCACATGAAGACCCGGAAATGGCTC
CACAGTCACCTGCATGCATCCCCTATTTCAGGCAACTTAGAGGTTAGCTGCTTTGGAGAT
GATTCAAATTCCGATACCGGGGATCACTGGAAGCTTA**ATCGAAGGGAGCGGGAAGACA
TGGAAACAAGACCAAAGAGTCCGACTTCAACACATTGACACTAGTGGTTACCTCCATAGC
CATGACAAAAAGTACCAGCGTATAGCCGGTGGTCAGCAAGAGGTGTGTGGAATCAGGGAG
AAGCGGGCAGATAATGTTTGGTTGGCAGCAGAAGGAGTCTACCTTCCCGTTAATGAGAGT
AGCAGCAAGTAATGTGAAGAGTTGTGTTAACTTATCTCTGAGGAGACTTTGAATTTCATC
TTTTACTCTCTTAAGAGAGCTCATGAACAAGAAAATACATATATTTTGTTGATCTTCGGT
TGATGATGCTTTTAGTCGTACGAATATACATATATTGTAGGCAATTTGCATTTTCCTTAC
TTTAAGAGTTTAGTTATTGTGTG
TT

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 4

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ATGAGAGAAGAAGAAGAAGGAGGAGAAGAAGGATCAATGAGTAGGAGAAGCAGTCTCTCG
AGTTTCCTCAGAGTCTTATCTTCTTACAACTCCAATGTCCTCTTGGCTGCTCTCGTCTTC
CTTCTATTAGTCGTCCTCTTCGTCTTGCTTCTCCATTTCTACGCCCGCTATTTCTGGTCA
CACTCCGACCAAGTATTCACCTCCGCTCGACGCCGCCGTAGTAGAAGAAGAAGAAGAAGA
ACCGTTACGAGACTCATACCTCCGGTTCCACTAGGAGGTTTAGACGGTGGAGTTTCTCCT
TCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTTCAACAAGCGATGACAAAGGTTTGGATTCTTCAGTG
ATTTCTTCGATTCCTCTGTTCGTGTACGAAGATAACGAGAAAGAAGACAAAGAAGAAGAG
GAGTGTGTGATATGTCTGGGGTTATGGGAAGTGGGAGATGTCGGAAGAAA*GTTGAGAAA
TTGCGAACATGCGTTTCACGTTGAGTGTATAGACATGTGGCTGTCTTGTCACTCTACTTG
TCCTCTCTGTAGATCCCCTGTTCTCTCAGCTTCAGGTCAAGACAACCTCAAGTCGCCGGC
CATTAATGGCGTGGACGAAGAAGAAGAAGAAGCAGAGGTTAGACTGCAACTGTTTCCACC
CGGAGGAGGAGAAGAAAACGACGCCGCCGCCGATGATGATGATCGGAGATTTTCACTGTC
GCTTACTGTGATGGAAGATAATCTCAAAACAGGGGTTGACGAGGAAGGAGGAGAGGTTAG
AATTGAAGTGTTGGATGAGGAGATAGGATCAAGAGGTGATCGGAGATCAACGTCTTCGGT
GGCGTCATCAGCATCGAGTTCGTTGATGAGGATGTTGAGTAGTAGAAGTAGACCGGAGGG
TAGCAAGTTGTTCCCGACGCAAGATTCATCTCCGTAACAATAAATATATAAACAATTGTC
TTGCAAACAGTTTTGGAAATGTAAAATAAATAAACAAAGCCCTGTAGTAATCTAGTTTAT
TAAAGCTTTGGTTGAAGAAGCTAATGATTATGATTACGACATGATTTTTTTTTGTCCATG
CAAATCAATACTTCTGC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AQ60TFB U 4
AF RS1GQ68TF U 1
AF RS1AQ60JQ C 365
AF RS1GQ68JQ C 504
BS 1 384 RS1GQ68TF
BS 385 385 RS1AQ60TFB
BS 386 466 RS1GQ68TF
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BS 540 540 RS1AQ60TFB
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GG
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CCTCAGGGTCTTATCTTCTTACAACTCCAATGTCCTCTTGGCTGCTCTCGTCTTCCTTCT
ATTAGTCGTCCTCTTCGTCTTGCTTCTCCATTTCTACGCCCGCTATTTCTGGTCACACTC
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AACATGCGTTTCACGTTGAGTGTATAGACATGTGGCTGTCTTGTCACTCTACTTGTCCTC
TCTGTAGATCCCCTGTTCTCTCA
A

QA 3 625 3 625
DS 

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CTTCTATTAGTCGTCCTCTTCGTCTTGCTTCTCCATTTCTACGCCCGCTATTTCTGGTCA
CACTCCGACCAAGTATTCACCTCCGCTCGACGCCGCCGTAGTAGAAGAAGAAGAAGAAGA
ACCGTTACGAGACTCATACCTCCGGTTCCACTAGGAGGTTTAGACGGTGGAGTTTCTCCT
TCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCAACAAGCGATGACAAAGGTTTGGATTCTTCAGTG
ATTTCTTCGATTCCTCTGTTCGTGTACGAAGATAACGAGAAAGAAGGCGAAGAAGAAGAG
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TCCTCTCTGTAGATCCCCTGTTCTCTCAGCTTCAGGTCAAGACAACCTCAAGTCGCCG*C
CATTAATGGCG

QA 1 671 1 671
DS 

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GTGTGATATGTCTGGGGTTATGGGAAGTGGGAGATGTCGGAAGAAA*GTTGAGAAATTGC
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CTCTGTAGATCCCCTGTTCTCTCAACTTCAGGTCAAGACAACCTCAAGTCGCCGGCCATT
AATGGCGTGGACGAAGAAGAAGAAGAAGCAGAGGTTAGACTGCAACTGTTTCCACCCGGA
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ACTGTGATGGAAGATAATCTCAAAACAGGGGTTGACGAGGAAGGAGGAGAGGTTAGAATT
GAAGTGTTGGATGAGGAGATAGGATCAAGAGGTGATCGGAGATCAACGTCTTCGGTGGCG
TCATCAGCATCGAGTTCGTTGATGAGGATGTTGAGTAGTAGAAGTAGACCGGAGGGTAGC
AAGTTGTTCCCGACGCAAGATTCATCTCCGTAACAATAAATATATAAACAATTGTCTTGC
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GCTTTGGTTGAAGAAGCTAATGATTATGATTACGACATGATTTTTT

QA 1 766 1 766
DS 

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AGTGTATAGACATGTGGCTGTCTTGTCACTCTACTTGTCCTCTCTGTAGATCCCCTGTTC
TCTCAGCTTCAGGTCAAGACAACCTCAAGTCGCCGGCCATTAATGGCGTGGACGAAGAAG
AAGAAGAAGCAGAGGTTAGACTGCAACTGTTTCCACCCGGAGGAGGAGAAGAAAACGACG
CCGCCGCCGATGATGATGATCGGAGATTTTCACTGTCGCTTACTGTGATGGAAGATAATC
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TGATGAGGATGTTGAGTAGTAGAAGTAGACCGGAGGGTAGCAAGTTGTTCCCGACGCAAG
ATTCATCTCCGTAACAATAAATATATAAACAATTGTCTTGCAAACAGTTTTGGAAATGTA
AAATAAATAAACAAAGCCCTGTAGTAATCTAGTTTATTAAAGCTTTGGTTGAAGAAGCTA
ATGATTATGATTACGACATGATTTTTTTTTGTCCATGCAAATCAATACTTCTGC

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 4

CO CL2245Contig1 625 4 10 U
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AAGTCAATGGGAGCTAGAGTCAGAGTGTTCATGTACCCCAGCAACATATGAGGAGGGTAG
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GAAGCTATAGTTTATCTTTTTTATTCTCATTTTGTTTTAAACTCTCGGTCGGTTTTGTTC
ATCTCTAGACGAATTAAAACATTATTTTTGATGGAATTCGAGCAGAAATATAATTATCCT
AATATGAGTTACTTTTTGTTCTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1AJ65TF U 1
AF RS1EA12JQ C 14
AF RS1EA12TF U 14
AF RS1BJ31TF U 81
BS 1 299 RS1AJ65TF
BS 300 300 RS1EA12TF
BS 301 326 RS1AJ65TF
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RD RS1AJ65TF 623 0 0
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ATCTCTAGACGAATTAAAACATTATTTTTGATGGAATTCGAGCAGAAATATAATTATCCT
AATATGAGTTATTTTTTGTTCTC

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DS 

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GG
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G

QA 3 598 3 598
DS 

RD RS1EA12TF 599 0 0
GG
GCCGGCATAAAAAGTGGAGGCAAGGAGGAGGAAGAAGACATAGTAGCATCAGGATTGAAA
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ACTACCGAGGAGGTGACGTGGTACAAGGGAAAGAGGATGGCTTACATCTACAAAGCGAAG
ACAAAGAAGAACGGTTCCCACTACCGTTGCATCTGGGGCAAAGTCGCTAGGCCTCATGGT
AACAGCGGTGTCGTCCGTGCCAAGTTCACTTCAAACCTTCCACGAAAGTCAATGGGAGCT
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CTTTTTTATTCTCATTTTGTTTTAAACTCTCGGTCGGTTTTGTTCATCTCTAGACGAATT
AAAACATTATTTTTGATGGAATTCGAGCAGAAATATAATTATCCTAATATGAGTTA
G

QA 3 598 3 598
DS 

RD RS1BJ31TF 545 0 0
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GTCGAAGTCGAACCAATACCCCAACACTTCTCTGATCCAGATTGAAGGAGTTAACACTAC
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CAGAGTGTTCATGTACCCCAGCAACATATGAGGAGGGTAGATTCAGGACCTGGGATTCAT
TTCGCAAGTATCAGAAGGAAGCTCCTATCATCATTTCTCAGAAGCTATAGTTTATCTTTT
TTATTCTCATTTTGTTTTAAACTCTCGGTCGGTTTTGTTCATCTCTAGACGAATTAAAAC
ATTATTTTTGATGGAATTCGAGCAGAAATATAATTATCCTAATATGAGTTACTTTTTGTT
CTCTC

QA 1 545 1 545
DS 



AS 1 3

CO CL2246Contig1 870 3 10 U
GGGAAGAACACTCCTCCTCTCAATGCGCCTCTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTCTCACTCTC
TCTCTTACCTCTGTAGATTTCCAGACTTCAAAGTCAAGTATCTGAATCCAAATCTCTGAC
AATGGAAGCAAACCAGTTATATGGTTTGTCTACACTTGTCCTCATTCTACTACTATCGCT
GACTTCGACAGTGACATCAAAGGACGAGGTTGTTTCCTGTACAATGTGTTCTTCCCGCGA
CAATCCTTGTAATCCAGTCCCATCATATCCTCCCCCTCCGCCGCCTTCTCGTCCACCACC
GTCGCCATCAACCACTACTGCATGTCCTCCGCCTCCTTCTCCTCCCAGCTCCGGTGGTGG
TAGCTCTTACTATTACCCTCCTCCTTCACAGTCCGGTGGCGAGAAATACCCTCCTCCTTA
CGGTGACGGCGGCCAAGGTTATTACTATCCTCCCCCGTATTCAGGAAACTATCCCACGCC
GCCTCCGCCGAACCCTATCGTCCCTTATTTCCCGTTTTACTATCATACGCCACCGCCAAG
TTCTGGTTCAGATCGGTTTATGGGTTCTGGTTCTGTTATGTTTGCTCTTTTCGCCATGTT
CCTCTGTTTAATTTAACGGTAAAATCGTCGGAGTTCGCCGGATAATACGTTCAAGACGGA
ACAGTGGGGGCAGATCGGTAGATCTACCATAGTCCTTTGAAGGTTTTAGATATCATTGAT
CATGAAAACCAGATGTTGGACCAAATGATTGATTAGCTTTTACTTTCTTGAATCTGTATA
ACTCTTTTTCTTGAAAATTTGTGTTGAAAAGTTTATTGTTAATTAACAATTTAATTACTC
GATATTCAGAAATAAATAATTGTTACTTCC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D982TF U 4
AF RS1DU84TF U 1
AF RS1D982JQ C 292
BS 1 222 RS1DU84TF
BS 223 223 RS1D982TF
BS 224 526 RS1DU84TF
BS 527 527 RS1D982TF
BS 528 538 RS1DU84TF
BS 539 539 RS1D982TF
BS 540 702 RS1DU84TF
BS 703 704 RS1D982JQ
BS 705 744 RS1DU84TF
BS 745 870 RS1D982JQ

RD RS1D982TF 616 0 0
G
AGAACACTCCTCCTCTCAATGCGCCTCTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTCTCACTCTCTCTC
TTACCTCTGTAGATTTCCAGACTTCAAAGTCAAGTATCTGAATCCAAATCTCTGACAATG
GAAGCAAACCAGTTATATGGTTTGTCTACACTTGTCCTCATTCTACTACTATCGCTGACT
TCGACAGTGACATCAAAGGACGAGGTTGTTTCCTGTACAATGTGTTCTTCCTGCGACAAT
CCTTGTAATCCAGTCCCATCATATCCTCCCCCTCCGCCGCCTTCTCGTCCACCACCGTCG
CCATCAACCACTACTGCATGTCCTCCGCCTCCTTCTCCTCCCAGCTCCGGTGGTGGTAGC
TCTTACTATTACCCTCCTCCTTCACAGTCCGGTGGCGAGAAATACCCTCCTCCTTACGGT
GACGGCGGCCAAGGTTATTACTATCCTCCCCCGTATTCAGGAAACTATCCCACGCCGCCT
CCGCCGAACCCTATCGTCCCTTATTTCCCGTTTTACTATCATACGCCACCGCCAAGTTCT
GGTTCAGATCGGTTTATGGGTTCTGGTTCTGTTATGTTTGCTCTTTTCGCCATGTTCCTC
TGTTTAATTTAACGG

QA 2 616 2 616
DS 

RD RS1DU84TF 760 0 0
GGGAAGAACACTCCTCCTCTCAATGCGCCTCTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTCTCACTCTC
TCTCTTACCTCTGTAGATTTCCAGACTTCAAAGTCAAGTATCTGAATCCAAATCTCTGAC
AATGGAAGCAAACCAGTTATATGGTTTGTCTACACTTGTCCTCATTCTACTACTATCGCT
GACTTCGACAGTGACATCAAAGGACGAGGTTGTTTCCTGTACGATGTGTTCTTCCCGCGA
CAATCCTTGTAATCCAGTCCCATCATATCCTCCCCCTCCGCCGCCTTCTCGTCCACCACC
GTCGCCATCAACCACTACTGCATGTCCTCCGCCTCCTTCTCCTCCCAGCTCCGGTGGTGG
TAGCTCTTACTATTACCCTCCTCCTTCACAGTCCGGTGGCGAGAAATACCCTCCTCCTTA
CGGTGACGGCGGCCAAGGTTATTACTATCCTCCCCCGTATTCAGGAAACTATCCCACGCC
GCCTCCGCCGAACCCTATCGTCCCTTATTTCCCGTTTTACTATCATGCGCCACCGCCAGG
TTCTGGTTCAGATCGGTTTATGGGTTCTGGTTCTGTTATGTTTGCTCTTTTCGCCATGTT
CCTCTGTTTAATTTAACGGTAAAATCGTCGGAGTTCGCCGGATAATACGTTCAAGACGGA
ACAGTGGGGGCAGATCGGTAGATCTACCATAGTCCTTTGAAG**TTTAGATATCATTGAT
CATGAAAACCAGATGTTGGACCAA
TGATTGATAGCTTTAC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1D982JQ 579 0 0
TCCACCACCGTCGCCATCAACCACTACTGCATGTCCTCCGCCTCCTTCTCCTCCCAGCTC
CGGTGGTGGTAGCTCTTACTATTACCCTCCTCCTTCACAGTCCGGTGGCGAGAAATACCC
TCCTCCTTACGGTGACGGCGGCCAAGGTTATTACTATCCTCCCCCGTATTCAGGAAACTA
TCCCACGCCGCCTCCGCCGAACCCTATCGTCCCTTATTTCCCGTTTTACTATCATACGCC
ACCGCCAAGTTCTGGTTCAGATCGGTTTATGGGTTCTGGTTCTGTTATGTTTGCTCTTTT
CGCCATGTTCCTCTGTTTAATTTAACGGTAAAATCGTCGGAGTTCGCCGGATAATACGTT
CAAGACGGAACAGTGGGGGCAGATCGGTAGATCTACCATAGTCCTTTGAAGGTTTTAGAT
ATCATTGATCATGAAAACCAGATGTTGGACCAAATGATTGATTAGCTTTTACTTTCTTGA
ATCTGTATAACTCTTTTTCTTGAAAATTTGTGTTGAAAAGTTTATTGTTAATTAACAATT
TAATTACTCGATATTCAGAAATAAATAATTGTTACTTCC

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 3

CO CL2247Contig1 1156 3 10 U
GGAACGAAAGAAAGTCTCTTCTCTTCGTCCCACTCTCAATTTCAAACACTGCGACCGACG
AGAAGACATGGACATGGAGACTGACCAAATCTACCAGGTCGATGTCGGAAATCTTCTCGC
TTTCAATCCAAATCACCGCTTCCCTGCTGCTCCTTCTTCAAGGGAGGAGCTTGTGAAGGA
ATGTGTTACAGAGGGAACAAAGCTTGTTCAGGCAATAGCTGATACTCTTTTCAACTTTCC
TTCTACTGAAACTAGTGATGGCCCTCTTGTCCAGTTGCCTCCACCTACAACCAAACTCCC
TAGAGAGAAACATCTTCCAAGGCCTAAGCCTCCTACTAAGTGGGAAGAATTTGCTCTCAA
AAAAGGTATACAAAAGCGCAAGAAGGACAAGATTGTGTACGACGAAACAACTGATAAGTT
CAAGCGTCGCCATGGTTACGACCGTGTTAACGATGATAATGATATTCCCATTATTGAGGC
AAAGGCATCA***GAGCCAGGAGAAGATCCTTTTGCCAAGAGACTGGACGATAAAAAGAA
GAGAGTTGGCAAGCAAGAAAAGAACAGACTACAGAATCTGAAGACAGCTGCAAAAGCTGG
TGCTTTACCGAGCCATGTCCAACTAGCTGCGACCGCATTGCCCATATCACGCACCAAAGC
TCAGCCACAGAAGCTCGGAAAGGATACACTGGGAGATGTTGCAGGTTTAGCTGCTACTTC
AACAGCTAGCGGTGGAAAATTCGATAAGAAGTTGCCTGGAGAAAAACCTCCTAAGAAGCA
AGGCAAACATCACAAGTATTTACCAGTTGTACCAAGGCATGGGTGGGTTGACGAGGAAAA
AGAGCAGACTAATAAAGTACTTGGCAAGTTGTTATCAAAGCATTCACATGAGATCCTCAA
TGTTGGAAAGGCGATAAACATGTACAACGACAAGAAGGGGAAAAAGAAGTCAGGGAGATC
AGATAAGTTGAAAGCTAAGAAAGACATCACCAAGAAGAAGCCTTATGCCAACAAAGCTGA
TAAGTGAAGAGACTCTTTCCACCTTGTTTTTATTTACTTCTTCGCTTATCTCATAACAAA
AAAAACATTAGAAGATTTTGTGTCGTATCTGTTTAAGAGAATTCTTTATATTTATGTTAT
ATTTAAAATCTTTCTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AY48TF U 1
AF RS1H530TF U 1
AF RS1AY48JQ C 434
BS 1 145 RS1AY48TF
BS 146 146 RS1H530TF
BS 147 180 RS1AY48TF
BS 181 181 RS1H530TF
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BS 421 421 RS1H530TF
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BS 651 684 RS1AY48TF
BS 685 1156 RS1AY48JQ

RD RS1AY48TF 700 0 0
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AGAAGACATGGACATGGAGACTGACCAAATCTACCAGGTCGATGTCGGAAATCTTCTCGC
TTTCAATCCAAATCACCGCTTCCCTTCTGCTCCTTCTTCAAGGGAGGAGCTTGTGAAGGA
TTGTGTTACAGAGGGAACAAAGCTTGTTCAGGCAATAGCTGATACTCTTTTCAACTTTCC
TTCTACTGAAACTAGTGATGGCCCTCTTGTCCAGTTGCCTCCACCTACAACCAAACTCCC
TAGAGAGAAACATCTTCCAAGGCCTAAGCCTCCTACTAAGTGGGAAGAATTTGCTCTCAA
AAAAGGTATACAAAAGCGCAAGAAGGACAAGATTGTGTACGACGAAACAACTGATAAGTT
TAAGCGTCGCCATGGTTACGACCGTGTTAACGATGATAATGATATTCCCATTATTGAGGC
AAAGGCATCA***GAGCCAGGAGAAGATCCTTTTGCCAAGAGACTGGACGATAAAAAGAA
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TGCTTTACCGAGCCATGTCCAACTAGCTGCGACCGCATTGCCCATATCG*GCACCAAAGC
TCAGCCACAGAAGCTCGGAAAGGA
TACACTGGGAGATGTT

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1H530TF 679 0 0
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ATAAGACATGGACATGGAGACTGACCAAATCTACCAGGTCGATGTCGGAAATCTTCTCGC
TTTCAATTCCAATCACCGCTTCCCTGCTGCTCCTTCTTCGAGGGAGGAGCTTGTGAAGGA
ATGTGTTACAGAGGGAACAAAGCTTGTTCAGGCAATAGCTGATACTCTTTTCAACTTTCC
TTCTACTGAAACTAGTGATGGCCCTCTTGTCCAGTTGCCTCCACCTACAACCAAACTCCC
TAGAGAGAAACATCTTCCAAGGCCTAAGCCTCCTACTAAGTGGGAAGAATTTGCTCTCAA
GAAAGGTATACAAAAGCGCAAGAAGGACAAGATTGTGTACGACGAAACAACTGATAAGTT
CAAGCGTCGCCATGGTTACGACCGTGTTAACGATGATAATGATATCCCCATTATTGAGGC
AAAGGCATCAGATGAGCCAGGTGAAGATCCTTTTGCCAAGAGACTGGACGATAAAAAGAA
GAGAGTTGGAAAGCAAGAAAAGAACCGACTACAGAATTTGAAGACAGCTGCAAAAGCTGG
TGCTTTACCGAGCCATGTCCAACTAGCTGCGACCGCATTGCCCATATCACGCACCAAAGC
TCAGCCACAGAAG
ATTGGA

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DS 

RD RS1AY48JQ 723 0 0
GGTTACGACCGTGTTAACGATGATAATGATATTCCCATTATTGAGGCAAAGGCATCA***
GAGCCAGGAGAAGATCCTTTTGCCAAGAGACTGGACGATAAAAAGAAGAGAGTTGGCAAG
CAAGAAAAGAACAGACTACAGAATCTGAAGACAGCTGCAAAAGCTGGTGCTTTACCGAGC
CATGTCCAACTAGCTGCGACCGCATTGCCCATATCAGGCACCAAAGCTCAGCCACAGAAG
CTCGGAAAGGATACACTGGGAGATGTTGCAGGTTTAGCTGCTACTTCAACAGCTAGCGGT
GGAAAATTCGATAAGAAGTTGCCTGGAGAAAAACCTCCTAAGAAGCAAGGCAAACATCAC
AAGTATTTACCAGTTGTACCAAGGCATGGGTGGGTTGACGAGGAAAAAGAGCAGACTAAT
AAAGTACTTGGCAAGTTGTTATCAAAGCATTCACATGAGATCCTCAATGTTGGAAAGGCG
ATAAACATGTACAACGACAAGAAGGGGAAAAAGAAGTCAGGGAGATCAGATAAGTTGAAA
GCTAAGAAAGACATCACCAAGAAGAAGCCTTATGCCAACAAAGCTGATAAGTGAAGAGAC
TCTTTCCACCTTGTTTTTATTTACTTCTTCGCTTATCTCATAACAAAAAAAACATTAGAA
GATTTTGTGTCGTATCTGTTTAAGAGAATTCTTTATATTTATGTTATATTTAAAATCTTT
CTC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

CO CL2248Contig1 1112 2 2 U
GGACCTCCAAAAAAATGTCGGCTCTACTTGGTATCGTCTTCCCGGTGACCTTCACCGGCC
GCGGCCAGCTCCCGGCGAAACTCCATTCGTCGCGACGGAGACTGGTGGTTAAGTCATCGA
ACTCATCCAGCGAACGTCAGATTCTATTCAACCGCATTGCTCCTGTTTACGATAACGTTT
CGAATCAGTCCCCCCCCCTCCTTTGTCTCTTTTCTTTTCTCCTCTCCTCTCCTTTGAGCT
TGAGCTTTATGTATATCCTTGTATGGCATTTTGTAGCTGAATGATCTCTTAAGCTTAGGA
CAACATCGTATCTGGAAGAACATGGCTGTTTCCTGGACCGGAGCGAGAACAGGAGATAAA
GTTCTCGACTTGTGTTGTGGAAGTGGTGATTTAGCCTTTCTCTTGTCTGAGAAAGTTGGT
CCAAGTGGAAAGGTGATGGGTTTGGATTTCTCCTCTGAACAACTAGCTGTTGCAGCTTCA
AGACAGAAGCTTAGAGGGAGGTCTTGCTACAAGTGTATAGAGTGAGCACTACTTACTGGT
GGATTGAAGGTGATGCTACTGAATTTGCCATTTGATGACTGTGAGTTCGATGCGATAACG
ATGGGTTATGGTCTTAGAAACGTTGTTGATAGGCATAGAGCCATGAGGGAGATGTATCGG
GTTCTGAAACCAGGTTCGAGAGTGTCCATACTTGATTTCAATAAGAGCAATCAGTCAGTT
ACGACGTTTATGCAGGATTGGATGATTGACAATGTAGTTGTCCCTGTGGCTACTCTTTAT
GATCTTGCAAAGGAGTATGAATATCTAAAGTATTCAATCAGTGAGTCCCTTACAGGAGAA
GAGCTGGAGACTCTTGCTCTAGAAGCTGGATTCTCAAGTGCACGCCATTATGAGATTGGT
GGTGGTTTCATGGGGAATTTGGTCGCCTTGAGGTAAACAGAACAGCATTCAACCACCAAC
ACAACTTCATTGTTGAGAAAAAGAAAAGATTTGTTTTAAAATGTTGAAGATTGATCTAAA
ATTGTTATCTATCCTTTTTCGATGTATTGAGACTTCTAATCAGATGTATTAGTTATACCA
TTGCACATCTTCATATGATAAACAAGCTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DC32TF U 1
AF RS1DC32JQ C 511
BS 1 604 RS1DC32TF
BS 605 1112 RS1DC32JQ

RD RS1DC32TF 604 0 0
GGACCTCCAAAAAAATGTCGGCTCTACTTGGTATCGTCTTCCCGGTGACCTTCACCGGCC
GCGGCCAGCTCCCGGCGAAACTCCATTCGTCGCGACGGAGACTGGTGGTTAAGTCATCGA
ACTCATCCAGCGAACGTCAGATTCTATTCAACCGCATTGCTCCTGTTTACGATAACGTTT
CGAATCAGTCCCCCCCCCTCCTTTGTCTCTTTTCTTTTCTCCTCTCCTCTCCTTTGAGCT
TGAGCTTTATGTATATCCTTGTATGGCATTTTGTAGCTGAATGATCTCTTAAGCTTAGGA
CAACATCGTATCTGGAAGAACATGGCTGTTTCCTGGACCGGAGCGAGAACAGGAGATAAA
GTTCTCGACTTGTGTTGTGGAAGTGGTGATTTAGCCTTTCTCTTGTCTGAGAAAGTTGGT
CCAAGTGGAAAGGTGATGGGTTTGGATTTCTCCTCTGAACAACTAGCTGTTGCAGCTTCA
AGACAGAAGCTTAGAGGGAGGTCTTGCTACAAGTGTATAGAGTGAGCACTACTTACTGGT
GGATTGAAGGTGATGCTACTGAATTTGCCATTTGATGACTGTGAGTTCGATGCGATAACG
ATGG

QA 1 604 1 604
DS 

RD RS1DC32JQ 602 0 0
AAGTGTATAGAGTGAGCACTACTTACTGGTGGATTGAAGGTGATGCTACTGA*TTTGCCA
TTTGATGACTGTGAGTTCGATGCGATAACGATGGGTTATGGTCTTAGAAACGTTGTTGAT
AGGCATAGAGCCATGAGGGAGATGTATCGGGTTCTGAAACCAGGTTCGAGAGTGTCCATA
CTTGATTTCAATAAGAGCAATCAGTCAGTTACGACGTTTATGCAGGATTGGATGATTGAC
AATGTAGTTGTCCCTGTGGCTACTCTTTATGATCTTGCAAAGGAGTATGAATATCTAAAG
TATTCAATCAGTGAGTCCCTTACAGGAGAAGAGCTGGAGACTCTTGCTCTAGAAGCTGGA
TTCTCAAGTGCACGCCATTATGAGATTGGTGGTGGTTTCATGGGGAATTTGGTCGCCTTG
AGGTAAACAGAACAGCATTCAACCACCAACACAACTTCATTGTTGAGAAAAAGAAAAGAT
TTGTTTTAAAATGTTGAAGATTGATCTAAAATTGTTATCTATCCTTTTTCGATGTATTGA
GACTTCTAATCAGATGTATTAGTTATACCATTGCACATCTTCATATGATAAACAAGCTAT
CC

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 4

CO CL2249Contig1 806 4 16 U
GGATGGGAAACGGAAACGGAAACGGGGCGAGGTCGAGAGAGAAAGAGAGAGGAGAGATGT
CTTCTAACTTGAGGCTCAAGTATGTGCAAGCTATCCAAGATTTGAAAGAGGAGATCACCT
TGTTACAGATTTCAAACGAGAAATTGAATGGTGTCGGTCTCGAGAGTCTGAGCTACACCG
AACTGACTTCGCTTGAAAGTAAGTTAACGGAGGGCTTACGCATTGTGGATGAACAAACAG
ATAAGGCGCACTTGGAATTATTACACCTGCAGTCTGTTGAGTGCGATGTTATGGGATCCG
ACTGGGTTAACCAAAAAGGCAAGGATGATATGGCCTACCAATCTCTTCTCGCAAAGAGAA
GAAGAGAGATAAGGAACAAGGCTAGAGAACTCCGCCTCAGCCCTCCTAAAGAAACCCAAC
AGCACTATAGCTATTACCCTGAAACCCTGATGTCGGACATCGACTCTTTGAAGATGGAGA
AAAAGAGACTACGTCTTTTAAACCAGAGAATGATTGGTCAA*GGGCTCGACGGTATGGAT
TACTACGAACTTTATGTGTTAAGCTTTCAGATTTCGCGTGCTATGAAGAATGCAGAAGAT
ATGAAGATAAACCAACGTGCAAAG*TACAGATATGATCGTGGCAGGTACAGATATGATCG
TGGCAGGTTCTTGGTTCGAGATGGAATCGTTTTGTTTTCTTTAATAAAGAGAGTCTTTGT
ACTTGGAGAACTTTGTGTTCTATGTCTCCCTATTCCAGTTTTCAATACTTATTGATACTT
ATTGTGGTTGCTAGATTCTATTTAGG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 0 0 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1BQ42JQ C 346
AF RS1DR55JQ C 200
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ATGAAGATAAACCAACGTGCAAAG*TACAGATATGATCGTGGCAG*TACAGATATGATCG
TGGCAG
TTCT

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GG
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TTT
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CAGATATGATCGTGGCAGGTTCTTGGTTCGAGATGGAATCGTTTTGTTTTCTTTAATAAA
GAGAGTCTTTGTACTTGGAGAACTTTGTGTTCTATGTCTCCCTATTCCAGTTTTCAATAC
TTATTGATACT

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DS 

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ATTACACCTGCAGTCTGTTGAGTGCGATGTTATGGGATCCGACTGGGTTAACCAAAAAGG
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GGCTAGAGAACTCCGCCTCAGCCC*CCTAAAGAAACCCAACAGCACTATAGCTATTACCC
TGAAACCCTGATGTCGGACATCGACTCTTTGAGGATGGAGAAAAAGAGACTACGTCTTTT
AAACCAGAGAATGATTGGTCAA*GGGCTCGACGGTATGGATTACTACGAACTTTATGTGT
TAAGCTTTCAGATTTCGCGTGCTATGAAGAATGCAGAAGATATGAAGATAAACCAACGTG
CAAAGGTACAGATATGATCGTGGCAGGTACAGATATGATCGTGGCAGGTTCTTGGTTCGA
GATGGAATCGTTTTGTTTTTTTTAATAAAGAGAGTCTTTGTACTTGGAGAACTTTGTGTT
CTATGTCTCCCTATTCCAGTTTTCAATACTTATTGATACTTATTGTGGTTGCTAGATTCT
ATTTAGG

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DS 



AS 1 3

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AATTAAAATATGTGATAAGAAAATGATATAAAAAAAAGTTTTCTAAAGTAAATCAAATAC
ATTTATACTTGCTCAAATACATAGAATTTATCAAGACAACGATAATGCATCCTTTATTTT
TATTTTTTAATGAGACTAATGAGGAGAGGGCAAGGTTAGAAACAATCTTCAACTAGTTGA
GCAAGTTAGATTTGTTGTCCAAGCACTCATTTTTATCTTTAGCCTTCTCTGCCTCACTGA
ATAGAGAATCCACAAAAGCCTCCATGTTCCTATCTGCTAACCCTCTTTCTCTACCCGCTT
TAATCGCTAAACGCTTCCATTTCTCGGCGTTTTCCCTCAGCTCCACAGACTTCCCTTCCA
TCACTGCTTCGAAACATCGTCTTATCTCTCCTCTCTCCACCAATCCTTCCTCGTTCTCTC
TCACCCTCACACCTGTCCTCCATAAATCCTCCAAAAGCTTTGCGTTGGTTGGTTGATCTG
ACCACATAGGAAACGCCACCACCGGAAGGCCGAGAACCAAGCTCTCAAGCGTTGAGCTCC
ATCCACAATGAGTCAAAAAGCAACCTACAGCTTTATGTCTTAAAACCTCCACCTGCGAAC
ACCATGACACAATCATACCAATCTCATCGAGCTCGTGTCTGAAACCAGCTATCTTCTCAA
TCTCCGTCTCCTCCTCTCCTTCTATTTTTGCTTCTCTGTTTGATTTATCAGTTATAACCC
ACAAAAATGGTATTTTACATTCTATCAGAGCTCTCGCTAGTTCCTCTATTTGCTTCTTGG
ACAACTCAACCATTGTTCCGAAAGAAACGTAAATAACAGAAGACTCTGTTTTCGAGTCTA
GCCAAAGTGAATAACTACTTTGATCTCTAACTGATTCGCTCTTTGTGAAAACATCTGGAG
GAAGTAAAGGGCCAACGGCCACCATTTCGATATTCGGGATAGCGGTTAAGGCTTTGGGCT
CCAGCGAATCGAATGTGTTGACGAGGACCTTCACGTTGGATTCTTCTTTGAGACACTCCA
TCAAGTCTAGATACACTGCTTGTGCCGTGTTGCTAGTGTTTGAAGGTGAGAGGAAAGAAG
GAAGATCACGGGTCTCTAGTGTAAGAAGATTCCGGAACTCGAAGAAACCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DJ54JQ U 1
AF RS1EE76JQ U 25
AF RS1DJ54TF C 442
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ATTTATACTTGCTCAAATACATAGAATTTATCAAGACAACGATAATGCATCCTTTATTTT
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TCACCTTCACACCTG*CCTCCATAAATCCTCCAAAAGCTTTGCGTTGGTTGGTTGATCTG
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CCC

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DS 

RD RS1EE76JQ 773 0 0
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AATTTATCTAGACAACGATAATGCATCCTTTATTTTTATTTTTTAATGAGACTAATGAGG
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TTTTTGCTTCTCTGTTTGATTTATCAGTTATAACCCACAAAAATGGTATTTTACATTCTA
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QA 1 773 1 773
DS 

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TCTCATCGAGCTCGTGTCTGAAACCAGCTATCTTCTCAATCTCCGTCTCCTCCTCTCCTT
CTATTTTTGCTTCTCTGTTTGATTTATCAGTTATAACCCACAAAAATGGTATTTTACATT
CTATCAGAGCTCTCGCTAGTTCCTCTATTTGCTTCTTGGACAACTCAACCATTGTTCCGA
AAGAAACGTAAATAACAGAAGACTCTGTTTTCGAGTCTAGCCAAAGTGAATAACTACTTT
GATCTCTAACTGATTCGCTCTTTGTGAAAACATCTGGAGGAAGTAAAGGGCCAACGGCCA
CCATTTCGATATTCGGGATAGCGGTTAAGGCTTTGGGCTCCAGCGAATCGAATGTGTTGA
CGAGGACCTTCACGTTGGATTCTTCTTTGAGACACTCCATCAAGTCTAGATACACTGCTT
GTGCCGTGTTGCTAGTGTTTGAAGGTGAGAGGAAAGAAGGAAGATCACGGGTCTCTAGTG
TAAGAAGATTCCGGAACTCGAAGAAACCCC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 4

CO CL2251Contig1 485 4 5 U
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AACCTAAAAAATCATGCAGAACGAGGAAGGAGTCGTCACCGAGCTTTACATTCCAAGGAA
ATGCTCGGCCACAAACAGATTGATCACCTCAAAGGATCATGCCTCTGTTCAGCTTAACAT
TGGTCATCTTGACGCCGATGGTATCTACACTGGCCAGTTCACCACTCTCGCTCTCTGCGG
CTTTGTCCGTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTTGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAA
GGTCGAAGCCAAACAACAGTGAGAGATAGAGATCATCTTTAAGCTGCCCTCTCTTGTTGT
TTTTGCCATGTTTCTTTGAATATTTTCTAGCTACGAACTCGCGTCTTTTTTTTCTTTTTT
GCTGATCTATAAAAGATATTTTAAGTTCCGGTGCCAATTGAATCAGTTCTCTTGATTATA
CATGG


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 0 0 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 

AF RS1GE16JQ C 5
AF RS1GE16TF U 5
AF RS1DE51JQ C 1
AF RS1DE51TF U 1
BS 1 5 RS1DE51JQ
BS 6 331 RS1GE16TF
BS 332 332 RS1DE51TF
BS 333 448 RS1GE16TF
BS 449 485 RS1DE51TF

RD RS1GE16JQ 444 0 0
G
GCCGCCGCACTGCTCTCTCCGATTAGATTATTCTTCTGCTCAGATCGATTTTTGCAACCT
AAAAAATCATGCAGAACGAGGAAGGAGTCGTCACCGAGCTTTACATTCCAAGGAAATGCT
CGGCCACAAACAGATTGATCACCTCAAAGGATCATGCCTCTGTTCAGCTTAACATTGGTC
ATCTTGACGCCGATGGTATCTACACTGGCCAGTTCACCACTCTCGCTCTCTGCGGCTTTG
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AAGCCAAACAACAGTGAGAGATAGAGGTCATCTTTAAGCTGCCCTCTCTTGTTGTTTTTG
CCATGTTTCTTTGAATATTTTCTAGCTACGAACTCGCGTCTTTTTTTTCTTTTTTGCTGA
TCTATAAAAGATATTTTAAGTTC

QA 2 444 2 444
DS 

RD RS1GE16TF 444 0 0
G
GCCGCCGCACTGCTCTCTCCGATTAGATTATTCTTCTGCTCAGATCGATTTTTGCAACCT
AAAAAATCATGCAGAACGAGGAAGGAGTCGTCACCGAGCTTTACATTCCAAGGAAATGCT
CGGCCACAAACAGATTGATCACCTCAAAGGATCATGCCTCTGTTCAGCTTAACATTGGTC
ATCTTGACGCCGATGGTATCTACACTGGCCAGTTCACCACTCTCGCTCTCTGCGGCTTTG
TCCGTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTTGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGTCG
AAGCCAAACAACAGTGAGAGATAGAGGTCATCTTTAAGCTGCCCTCTCTTGTTGTTTTTG
CCATGTTTCTTTGAATATTTTCTAGCTACGAACTCGCGTCTTTTTTTTCTTTTTTGCTGA
TCTATAAAAGATATTTTAAGTTC

QA 2 444 2 444
DS 

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AACCTAAAAAATCATGCAGAACGAGGAAGGAGTCGTCACCGAGCTTTACATTCCAAGGAA
ATGCTCGGCCACAAACAGATTGATCACCTCAAAGGATCATGCCTCTGTTCAGCTTAACAT
TGGTCATCTTGACGCCGATGGTATCTACACTGGCCAGTTCACCACTCTCGCTCTCTGCGG
CTTTGTCCGTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTTGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAA
GGTCGAAGCCAAACAACAGTGAGAGATAGAGATCATCTTTAAGCTGCCCTCTCTTGTTGT
TTTTGCCATGTTTCTTTGAATATTTTCTAGCTACGAACTCGCGTCTTTTTTTT******T
GCTGATCTATAAAAGATATTTTAAGTTTCGGTGCCAATTGAATCAGTTCTCTTGATTATA
CATGG

QA 1 485 1 485
DS 

RD RS1DE51TF 485 0 0
GGAAC
GCCGCCGCACTGCTCTCTCCGATTAGATTATTCTTCTGCTCAGATCGATTTTTGCAACCT
AAAAAATCATGCAGAACGAGGAAGGAGTCGTCACCGAGCTTTACATTCCAAGGAAATGCT
CGGCCACAAACAGATTGATCACCTCAAAGGATCATGCCTCTGTTCAGCTTAACATTGGTC
ATCTTGACGCCGATGGTATCTACACTGGCCAGTTCACCACTCTCGCTCTCTGCGGCTTTG
TCCGTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTTGACAGGCTCTGGCAGAAGAAGAAGGTCG
AAGCCAAACAACAGTGAGAGATAGAGATCATCTTTAAGCTGCCCTCTCTTGTTGTTTTTG
CCATGTTTCTTTGAATATTTTCTAGCTACGAACTCGCGTCTTTTTTTT******TGCTGA
TCTATAAAAGATATTTTAAGTTTCGGTGCCAATTGAATCAGTTCTCTTGATTATACATGG

QA 6 485 6 485
DS 



AS 1 3

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TATCTGTAACCGAAATAGCCTTCTAAAAATTCTGAAAGTTTCTTCTTCTCTCCAAACACC
ATTATCTCTTTCTCCATATCACCATACTGCGATGTGAGCAATCCATTCAAAACCCACGAC
GTGGGACTCAAGTAATACATCCATATCCACCATCTCGGCATGCTAGGTTTTGGAATGACA
TAACCAGCAAAGAGATTGACGATTGAGTAAAAGGACGAGCGGAGAGCAGAAGCAACGTGA
ATGTTTGGTGTTACGATGGCTAAAAGCATGCCAAAGTAGTTGAAGATGAGCAACGAGCAG
AAGATAGTGTAGAAGCTCCAAAACACTTTGTAGACTGACCAGTGGTAGCCAACCATAGGA
TATACGATTGTGACATATATAATAGACTGGAATATTGAGTATGGAACTTCAACCAGCACC
TGAGCAAGAGAATACGCCCATGAGGTGTACATCCGAGCAAATCTTTCACGGTAGAAGACA
TTTCGTTCGGTCGCAACACATAGTAACGTTGTAGAGCAATTGTTTATACCAGAGAAAAGA
ACCACCGTGAACATTGAGCCAAATATGTTGAATAGATCTTGTTGATTGTTTATTTCATTA
GCCTTTTGCCAGAACAAAATGCCACAGAGCATAGAAGTAATACTCATGAAGATGATACGA
GTGAGATTGTAGGAAGGGTTTCTCCAGTAAGAGAGATTTTGTTTCCAGAGGCATGCCTTG
AATTGTTCCCAACCCGTTTGAGCATATCCGGTATAGGAGATTGATTCTTCTGATGCCGAA
GATATCATTTGCTCAGCTACCATTTCGTTCTCCTTATACACCCCGGCCGTAATGGCCGAA
TTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A374JQ U 1
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AF RS1A374TV C 226
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QA 1 795 1 795
DS 

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ATAAGACATTACAAGAATCACTTCTTTTGGAAATTGAGTTTACCGATGAAGAATGCGAAA
AGAGATGCCAAGAGAATGGGGAAGGCAATGAGAGCGACAGCTACAAGAGCCAAAGACTCA
TATCTGTAACCGAAATAGCCTTCTAAAAATTCTGAAAGTTTCTTCTTCTCTCCAAACACC
ATTATCTCTTTCTCCATATCACCATACTGCGATGTGAGCAATCCATTCAAAACCCACGAC
GTGGGACTCAAGTAATACATCCATATCCACCATCTCGGCATGCTAGGTTTTGGAATGACA
TAACCAGCAAAGAGATTGACGATTGAGTAAAAGGACGAGCGGAGAGCAGAAGCAACGTGA
ATGTTTGGTGTTACGATGGCTAAAAGCATGCCAAAGTAGTTGAAGATGAGCAACGAGCAG
AAGATAGTGTAGAAGCTCCAAAACACTTTGTAGACTGACCAGTGGTAGCCAACCATAGGA
TATACGATTGTGACATATATAATAGACTGGAATATTGAGTATGGAACTTCAACCAGCACC
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ACCACCGTGAACATTGAGCCAAATATGTTGAATAGATCTTGTTGATTGTTTATTTCATTA
GCCTTTTGCCAGAACAAAATGCCACAGAGCATAGAAGTAATACTCATGAAGATGATACGA
GTGAGATT

QA 1 848 1 848
DS 

RD RS1A374TV 825 0 0
T
TCTCTCCAAACACCATTATCTCTTTCTCCATATCACCATACTGCGATGTGAGCAATCCAT
TCAAAACCCACGACGTGGGACTCAAGTAATACATCCATATCCACCATCTCGGCATGCTAG
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AGCCAACCATAGGATATACGATTGTGACATATATAATAGACTGGAATATTGAGTATGGAA
CTTCAACCAGCACCTGAGCAAGAGAATACGCCCATGAGGTGTACATCCGAGCAAATCTTT
CACGGTAGAAGACATTTCGTTCGGTCGCAACACATAGTAACGTTGTAGAGCAATTGTTTA
TACCAGAGAAAAGAACCACCGTGAACATTGAGCCAAATATGTTGAATAGATCTTGTTGAT
TGTTTATTTCATTAGCCTTTTGCCAGAACAAAATGCCACAGAGCATAGAAGTAATACTCA
TGAAGATGATACGAGTGAGATTGTAGGAAGGGTTTCTCCAGTAAGAGAGATTTTGTTTCC
AGAGGCATGCCTTGAATTGTTCCCAACCCGTTTGAGCATATCCGGTATAGGAGATTGATT
CTTCTGATGCCGAAGATATCATTTGCTCAGCTACCATTTCGTTCTCCTTATACACCCCGG
CCGTAATGGCCGAATTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 2 825 2 825
DS 



AS 1 3

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ATGTATCTTGGTTCCGCAATAAAATATCGAAACGCCAAAGACACAGTGATAGCCAAGAAC
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TTGTGTCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1EG88JQ U 1
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TCTTTGGCAACAATCCGTTTAATGAAAACATCAGCATCAGTGTAGCCAACTTCCTGAAGA
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TTCTTGTGTCC

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 4

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GGAAACCCTTTGTCGTTTTCTAT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B523TF U 1
AF RS1H079TF U 143
AF RS1H079JQB C 448
AF RS1B523JQ C 332
BS 1 654 RS1B523TF
BS 655 655 RS1H079TF
BS 656 676 RS1B523TF
BS 677 677 RS1H079TF
BS 678 697 RS1B523TF
BS 698 698 RS1H079TF
BS 699 704 RS1B523TF
BS 705 775 RS1H079TF
BS 776 776 RS1B523JQ
BS 777 794 RS1H079TF
BS 795 1103 RS1B523JQ

RD RS1B523TF 710 0 0
GAGGTACAAGATGACTTGAAGCGTGCTACTGGAGAGTTCACAAAGGACGAGAACGATGCG
AACAAACTCAACCGTATTCTTCAACTCACAGGATTCAGTGATCCAGTCTATGCTGAAGCA
TATGTGACAGTCCATCACTACGACATCGCACTCGAGGTTACCGTTATCAACCGTACAAAG
GAAACTCTTCAGAATCTGTGCTTGGAATTAGCAACCATGGGTGATCTCAAGCTTGTTGAG
CGTCCTCAAAATTATAGCCTTGCACCTGCAACGAGCATGCAGATAAAAGCAAACATCAAG
GTCTCGTCCACAGAGACCGGAGTCATATTCGGGAACATCGTCTATGAGACATCAAATGTT
ATGGAGCGAAACGTGGTGGTACTAAACGACATTCACATCGATATCATGGATTATATCTCC
CCTGCTGTTTGCTCGGATGTTGCTTTCAGAACCATGTGGGCAGAGTTTGAATGGGAAAAC
AAGGTTGCTGTGAACACCAAGATTGAGAACGAAAGAGAGTTCCTCGACCACATTATCAAA
TCCACAAACATGAAGTGTCTCACTGGCCCATCTGAACTAGACGGAGAATGTGGGCTCCTT
GCAGCAAACTTATACGCAAAAAGTGTGTTTGGTGAGGATGCTCTAGTGAATGTGTGTATC
GAGAAGCAAACGGACG*AGCATTGAGTGGCTACATAAAGATAAG
AGCAGA

QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1H079TF 652 0 0
G
CATCGCACTCGAGGTTACCGTTATCAACCGTACAAAGGAAACTCTTCAGAATCTGTGCTT
GGAATTAGCAACCATGGGTGATCTCAAGCTTGTTGAGCGTCCTCAAAATTATAGCCTTGC
ACCTGCAACGAGCATGCAGATAAAAGCAAACATCAAGGTCTCGTCCACAGAGACCGGAGT
CATATTCGGGAACATCGTCTATGAGACATCAAATGTTATGGAGCGAAACGTGGTGGTACT
AAACGACATTCACATCGATATCATGGATTATATCTCCCCTGCTGTTTGCTCGGATGTTGC
TTTCAGAACCATGTGGGCAGAGTTTGAATGGGAAAACAAGGTTGCTGTGAACACCAAGAT
TGAGAACGAAAGAGAGTTCCTCGACCACATTATCAAATCCACAAACATGAAGTGTCTCAC
TGGCCCATCTGAACTAGACGGAGAATGTGGGTTCCTTGCAGCAAACTTATACGCAAAAAG
TGTGTTTGGTGAGGATGCTCTAGTGAATGTGAGTATCGAGAAGCAAACGGACGGAGCATT
GAGTGGCTACATAAGGATAAGGAGCAAGACGCAAGGGATTGCGCTAAGTCTTGGAGACAA
AATCACCCTCAAACAAAAGGGTAGCAACTGAG*CTTGGAATGGTGGGGCAC

QA 2 652 2 652
DS 

RD RS1H079JQB 623 0 0
AGAACCATGTGGGCAGAGTTTGAATGGGAAAACAAGGTTGCTGTGAACACCAAGATTGAG
AACGAAAGAGAGTTCCTCGACCACATTATCAAATCCACAAACATGAAGTGTCTCACTGGC
CCATCTGAACTAGACGGAGAATGTGGGTTCCTTGCAGCAAACTTATACGCAAAAAGTGTG
TTTGGTGAGGATGCTCTAGTGAATGTGAGTATCGAGAAGCAAACGGACGGAGCATTGAGT
GGCTACATAAGGATAAGGAGCAAGACGCAAGGGATTGCGCTAAGTCTTGGAGACAAAATC
ACCCTCAAACAAAAGGGTAGCAACTGAGGCTTGGAATGGTGGGGCACAAGGTAACAGGTT
TAGACTACGTTCGTTTGTCTCTCTCTTGAGCAACTTTTTTTGTTGGTTTAACCTGTTTAC
TACGGAGGGAAGCGTTTAAGCAAAATGATGTAGAGATTTATCGTTTATCACTCTTTTCCG
GTATAGTTTCCGGTATGGTACGGATGGATTCTTACTCATACAGCTGAGTGTGTTTTTCGT
TTTATAGTACTTGGACGATCTCGTGTTATTTGTAATGTCTTTTTTTTT*CTTTATATGAT
GTCATTTTGTTGGGGAGATTAAA

QA 1 623 1 623
DS 

RD RS1B523JQ 772 0 0
GGAACATCGTCTATGAGACATCAAATGTTATGGAGCGAAACGTGGTGGTACTAAACGACA
TTCACATCGATATCATGGATTATATCTCCCCTGCTGTTTGCTCGGATGTTGCTTTCAGAA
CCATGTGGGCAGAGTTTGAATGGGAAAACAAGGTTGCTGTGAACACCAAGATTGAGAACG
AAAGAGAGTTCCTCGACCACATTATCAAATCCACAAACATGAAGTGTCTCACTGGCCCAT
CTGAACTAGACGGAGAATGTGGGCTCCTTGCAGCAAACTTATACGCAAAAAGTGTGTTTG
GTGAGGATGCTCTAGTGAATGTGTGTATCGAGAAGCAAACGGACGGAGCATTGAGTGGCT
ACATAAGGATAAGGAGCAAGACGCAAGGGATTGCGCTAAGTCTTGGAGACAAAATCACCC
TCAAACAAAAGGGTAGCAACTGAGGCTTGGAATGGTGGGGCACAAGGTAACAGGTTTAGA
CTACGTTCGTTTGTCTCTCTCTTGAGCAACTTTTTTTGTTGGTTTAACCTGTTTACTACG
GAGGGAAGCGTTTAAGCAAAATAATGTAGAGATTTATCGTTTATCACTCTTTTCCGGTAT
AGTTTCCGGTATGGTACGGATGGATTCTTACTCATACAGCTGAGTGTGTTCTTCGTCTTA
TAGTACTTGGACGATCTCGTGTTATTTGTAATGTCTTTTTTTTTTCTTTATATGATGTCA
TTTTGTTGGGGAGATTAAACCATAATTCAGGAAACCCTTTGTCGTTTTCTAT

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

CO CL2255Contig1 755 2 4 U
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GAATTTCCGGTTTAGCAAAATAAACATACAAAACCAGCTTCTGGTTCAATACTCGTCCAA
GTAAGTGTAAAGCGTATCATCCTTCTTGGCTTTGCGTCGGCTAAGCAACGCCTTAAGCAG
CCGTTTGCTCTTGCTCGGTTGTTGATGCTGCTGCTGCTCTGGCTCCTTCTGAGCTTCTTT
CTCAAACGCAACCCGAACCGAAGCTGATCTTCTCGGTTCTGACGGATATCGTTTAGGAGT
TATTGTTCTACTCTTGCTAGGAGTCGTTGGCCTGCTGACTGATGTCGGCCGAATAGCAAC
CGAACCAAATCTTAGCAGCGGAAACCGGTGCGGTGATACCGCTCTTTTACCTTGTTCTTT
CTTTGGTGCCGTGTTGGAAATAGAGGAGAACGAAAAGGTTGCTGAACGTTGCGTTTTACG
TTGAGGTGGAGGAGACGGAAGTACCGGTCTACTAAGTGGTGGTGGAGGCGTTTCCCGGAT
AGTAGTACGAACAGTATTTCTGAACTGGTTCCAGTCAGCTTCTTCACCAAAACTACTTTC
AACGCTCTTGAGCTTTGCTAGGTTACCACCTTTCTTGATTTCACCGGAAGGCAAAATGTA
ACGCTTGTGGAACTTGGGAGTGTTGATTACAAGTGATTGCTGAGAACGACCTTCATGATC
CATAAACTCTTGACACATCCTTAGCCTCTGTTCGA


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1ER91JQ U 1
AF RS1AS47JQ U 2
BS 1 348 RS1ER91JQ
BS 349 349 RS1AS47JQ
BS 350 450 RS1ER91JQ
BS 451 755 RS1AS47JQ

RD RS1ER91JQ 450 0 0
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GAATTTCCGGTTTAGCAAAATAAACATACAAAACCAGCTTCTGGTTCAATACTCGTCCAA
GTAAGTGTAAAGCGTATCATCCTTCTTGGCTTTGCGTCGGCTAAGCAACGCCTTAAGCAG
CCGTTTGCTCTTGCTCGGTTGTTGATGCTGCTGCTGCTCTGGCTCCTTCTGAGCTTCTTT
CTCAAACGCAACCCGAACCGAAGCTGATCTTCTCGGTTCTGACGGATATCGTTTAGGAGT
TATTGTTCTACTCTTGCTAGGAGTCGTTGGCCTGCTGACTGATGTCGGTCGAATAGCAAC
CGAACCAAATCTTAGCAGCGGAAACCGGTGCGGTGATACCGCTCTTTTACCTTGTTCTTT
CTTTGGTGCCGTGTTGGAAATAGAGGAGAA

QA 1 450 1 450
DS 

RD RS1AS47JQ 754 0 0
G
CACAAAGCATATATATATTGATATTATGTAACAGAAAATGCAATTAAAATTGGAAATCGA
ATTTCCGGTTTAGCAAAATAGACATACAAAACCAGCTTCTGGTTCAATACTCGTCCAAGT
AAGTGTAAAGCGTATCATCCTTCTTGGTTTTGCGTCGGCTAAGCAACGCCTTAAGCAGCC
GTTTGCTCTTGCTCGGTTGTTGATGCTGCTGCTGCTCTGGCTCCTTCTGAGCTTCTTTCT
CAAACGCAACCCGAACCGAAGCTGATCTTCTCGGTTCTGACGGATATCGTTTAGGAGTTA
TTGTTCTACTCTTGCTAGGAGTCGTTGGCCTGCTGACTGATGTCGGCCGAATAGCAACCG
AACCAGATCTTAGCAGCGGAAACCGGTGCGGTGATACCGCTCTTTTATCTTGTTCTTTCT
TTGGTGCCGTGTTGGAGATAGAGGAGAACGAAAAGGTTGCTGAACGTTGCGTTTTACGTT
GAGGTGGAGGAGACGGAAGTACCGGTCTACTAAGTGGTGGTGGAGGCGTTTCCCGGATAG
TAGTACGAACAGTATTTCTGAACTGGTTCCAGTCAGCTTCTTCACCAAAACTACTTTCAA
CGCTCTTGAGCTTTGCTAGGTTACCACCTTTCTTGATTTCACCGGAAGGCAAAATGTAAC
GCTTGTGGAACTTGGGAGTGTTGATTACAAGTGATTGCTGAGAACGACCTTCATGATCCA
TAAACTCTTGACACATCCTTAGCCTCTGTTCGA

QA 2 754 2 754
DS 



AS 1 2

CO CL2256Contig1 629 2 2 U
GGACGTTCTCTATTCTCTTCAAACATATTATCGACTTTCTATCTCTCTCTTTGCAGTGAA
GCTTGAATCATCATGGCCTCTCGTATTGCTAATGATGTGACCGAATTGATTGGGAACACT
CCGTTGGTGTATCTGAACAGTGTTGCTGAAGGATGTGTTGGTCGTGTTGCTGCTAAGCTT
GAGATGATGGAACCCTGCTCCAGCGTCAAAGACAGGATTGGTTTTAGCATGATCTCTGAT
GCAGAGAAAAAGGGTCTGATTAAACCAGGAGAGAGTGTGTTGATTGAGCCAACGAGTGGA
AACACTGGAGTTGGGTTAGCATTCACGGCGGCTGCAAAGGGCTACAAGCTTATCATTACC
ATGCCAGCTTCAATGAGTGTTGAGAGAAGAATCATCCTCTTAGCCTTTGGTGTTGAGTTG
GTTTTAACTGACCCGGCCAAGGGCATGAAAGGCGCTATCGCAAAGGCTGAGGAGATTTTG
GCCAAAACACCCAATGGTTACATGCTCCAACAGTTTGAGAACCCTGCTAACCCAAAGATC
CACTATGAGACAACTGGACCTGAGGTTTGGAAAGGCACTGGTGGAAAAATCGATGGCTTT
GTCTCTGGGATCGGTACTGGTGGTACCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D844TF U 1
AF RS1FV88TF U 407
BS 1 466 RS1D844TF
BS 467 629 RS1FV88TF

RD RS1D844TF 466 0 0
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GCTTGAATCATCATGGCCTCTCGTATTGCTAATGATGTGACCGAATTGATTGGGAACACT
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GAGATGATGGAACCCTGCTCCAGCGTCAAAGACAGGATTGGTTTTAGCATGATCTCTGAT
GCAGAGAAAAAGGGTCTGATTAAACCAGGAGAGAGTGTGTTGATTGAGCCAACGAGTGGA
AACACTGGAGTTGGGTTAGCATTCACGGCGGCTGCAAAGGGCTACAAGCTTATCATTACC
ATGCCAGCTTCAATGAGTGTTGAGAGAAGAATCATCCTCTTAGCCTTTGGTGTTGAGTTG
GTTTTAACTGACCCGGCCAAGGGCATGAAAGGCGCTATCGCAAAGG

QA 1 466 1 466
DS 

RD RS1FV88TF 223 0 0
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CTGAGGAGATTTTGGCCAAAACACCCAATGGTTACATGCTCCAACAGTTTGAGAACCCTG
CTAACCCAAAGATCCACTATGAGACAACTGGACCTGAGGTTTGGAAAGGCACTGGTGGAA
AAATCGATGGCTTTGTCTCTGGGATCGGTACTGGTGGTACCAT

QA 1 223 1 223
DS 



AS 1 4

CO CL2257Contig1 1042 4 7 U
GGACCAACATCCTCACAAATTCGCTTCTAGGGTTTTCTAAATTCTCAAACTTTCTCTCCA
AATTCGACTTCACCATGGTTCGTTGTAGTAACAACCTCGTTGGTATACCCAACTTCATCG
TCTTCCTCCTCTCTATTCCCATCTTAGCTGGAGGAATCTGGCTCAGCCAAAACGGCTCAA
CGGAGTGTGAGCGTTTCCTGGACAAACCCGTGATCGCTCTCGGAGTTTTCCTCATGGTTG
TAGCAATCGCTGGTTTGATTGGTTCCTGTTGCAGAGTCACATGGCTTCTCTGGACTTACC
TCTTTGTCATGTTCCTCTTGATTCTCCTCGTCTTCTCCGTAACGGTTTTCGCCTTTATCG
TTACTAACAAAGGCGCAGGCGAGAAGGTTTCTGGGAGAGGGTATAAAGAGTACAGACTTG
GGGATTACTCTAACTGGTTGCAGAAACGTGTGGACAGCGACAAGAACTGGAATAAGATTA
GGAGTTGTCTCGTTGACAGCAAGGTTTGTTCTAAGCTTGAAGCTAAGCTTGTTAATGTTC
CTGTCACCAACTTCTACAACGAACATTTTACTGCCCTTCAGTCTGGTTGCTGCAAACCCT
CAGAACAATGCCAATTTACTTACATAAGTGCCACAAACTGGACCAAGACGGCTGGACCAC
ATGCTAATCCAGACTGCCAAAGCTGGGACAACGCACCAAACAAGCTCTGCTTCGATTGCC
AATCTTGCAAGGCGGGTCTTCTCGACAACGTCAAGAGCGCATGGAAGAAAGTTGCAGTAG
TCAACAGCATCTTCCTTGTCTTCCTTATCATTGTCCACTCTGTTGGTTGCTGTGCTTTTA
GGAACAACAAGAGAGATGACAGTTATGGCTATGGATATAAGCCTTGAAGGCTTTTGAGTG
TTTTAGAACAGAGATTGGTTCGTTGTTCTTTATGACACGCAGTGCTGGAGTTTGCTTTTA
TGTTTTATGGATTTACATCTTGGTGTTTTGAGACCTATTGCTTGTACAGCTCTCTTATGA
TACTTGTTAGTATGTTCTGGCT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1EK10TF U 1
AF RS1AN93TF U 4
AF RS1AO13JQ C 430
AF RS1AO13TFB U 430
BS 1 383 RS1EK10TF
BS 384 384 RS1AN93TF
BS 385 566 RS1EK10TF
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BS 618 725 RS1AN93TF
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RD RS1EK10TF 617 0 0
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AATTCGACTTCACCATGGTTCGTTGTAGTAACAACCTCGTTGGTATACCCAACTTCATCG
TCTTCCTCCTCTCTATTCCCATCTTAGCTGGAGGAATCTGGCTCAGCCAAAACGGCTCAA
CGGAGTGTGAGCGTTTCCTGGACAAACCCGTGATCGCTCTCGGAGTTTTCCTCATGGTTG
TAGCAATCGCTGGTTTGATTGGTTCCTGTTGCAGAGTCACATGGCTTCTCTGGACTTACC
TCTTTGTCATGTTCCTCTTGATTCTCCTCGTCTTCTCCGTAACGGTTTTCGCCTTTATCG
TTACTAACAAAGGCGCAGGCGAGGAGGTTTCTGGGAGAGGGTATAAAGAGTACAGACTTG
GGGATTACTCTAACTGGTTGCAGAAACGTGTGGACAGCGACAAGAACTGGAATAAGATTA
GGAGTTGTCTCGTTGACAGCAAGGTTTGTTCTAAGCTTGAAGCTAAGCTTGTTAATGTTC
CTGTCACCAACTTCTACAACGAACATCTTACTGCCCTTCAGTCTGGTTGCTGCAAACCCT
CAGAACAATGCCAATTT

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DS 

RD RS1AN93TF 722 0 0
GG
AACATCCTCACAAATTCGCTTCTAGGGTTTTCTAAATTCTCAAACTTTCTCTCCAAATTC
GACTTCACCATGGTTCGTTGTAGTAACAACCTCGTTGGTATACTCAACTTCATCGTCTTC
CTCCTCTCTATTCCCATCTTAGCTGGAGGAATCTGGCTCAGCCAAAACGGCTCAACGGAG
TGTGAGCGTTTCCTGGACAAACCCGTGATCGCTCTCGGAGTTTTCCTCATGGTTGTAGCA
ATCGCTGGTTTGATTGGTTCCTGTTGCAGAGTCACATGGCTTCTCTGGACTTACCTCTTT
GTCATGTTCCTCTTGATTCTCCTCGTCTTCTCCGTAACGGTTTTCGCCTTTATCGTTACT
AACAAAGGCGCAGGCGAGAAGGTTTCTGGGAGAGGGTATAAAGAGTACAGACTTGGGGAT
TACTCTAACTGGTTGCAGAAACGTGTGGACAGCGACAAGAACTGGAATAAGATTAGGAGT
TGTCTCGTTGACAGCAAGGTTTGTTCTAAGCTTGAAGCTAAGCTTGTTAATGTTCCTGTC
ACCAACTTCTACAACGAACATCTTACTGCCCTTCAGTCTGGTTGCTGCAAACCCTCAGAA
CAATGCCAATTTACTTACATAAGTGCCACAAACTGGACCAAGACGGCTGGACCACATGCT
AATCCAGACTGCCAAAGCTGGGACAACGCACCAAACAAGCTCTGCTTCGATTGCCAATCT

QA 3 722 3 722
DS 

RD RS1AO13JQ 613 0 0
G
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AGACTGCCAAAGCTGGGACAACGCACCAAACAAGCTTTGCTTCGATTGCCAATCTTGCAA
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GAGAGATGACAGTTATGGCTATGGATATAAGCCTTGAAGGCTTTTGAGTGTTTTAGAACA
GAGATTGGTTCGTTGTTCTTTATGACACGCAGTGCTGGAGTTTGCTTTTATGTTTTATGG
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DS 

RD RS1AO13TFB 613 0 0
G
TAACTGGTTGCAGAAACGTGTGGACAGCGACAAGAACTGGAATAAGATTAGGAGTTGTCT
CGTTGACAGCAAGGTTTGTTCTAAGCTTGAAGCTAAGCTTGTTAATGTTCCTGTCACCAA
CTTCTACAACGAACATTTTACTGCCCTTCAGTCTGGTTGCTGCAAACCCTCAGAACAATG
CCAATTTACTTACATAAGTGCCACAAACTGGACCAAGACGGCTGGACCACATGCTAATCC
AGACTGCCAAAGCTGGGACAACGCACCAAACAAGCTCTGCTTCGATTGCCAATCTTGCAA
GGCGGGTCTTCTCGACAACGTCAAGAGCGCATGGAAGAAAGTTGCAGTAGTCAACAGCAT
CTTCCTTGTCTTCCTTATCATTGTCCACTCTGTTGGTTGCTGTGCTTTTAGGAACAACAA
GAGAGATGACAGTTATGGCTATGGATATAAGCCTTGAAGGCTTTTGAGTGTTTTAGAACA
GAGATTGGTTCGTTGTTCTTTATGACACGCAGTGCTGGAGTTTGCTTTTATGTTTTATGG
ATTTACATCTTGGTGTTTTGAGACCTATTGCTTGTACAGCTCTCTTATGATACTTGTTAG
TATGTTCTGGCT

QA 2 613 2 613
DS 



AS 2 4

CO CL2258Contig1 773 2 19 U
TTTTCGGCTTTAACAACTGTTTAACCTCTGCTCGTCCACAAGTATCAAAAACCCATCGGA
ATCTAACAAGACTCCGGCCAAAATAAAAATTACAGTACCATCTCTCTTGAGTGCTACGTT
CAATCTTTCCTTCTTTTATTTAGAAACAAAAAAAAAGATCAAAATATAATAACAATGAAA
TATATAGAACACAAACAAATAAAACAGATGAAGGCATATAGACGTAAAAGAAGCATCAAG
CCATCTCTCATCATCAATTTTTAAGCAAGGTTGATCGTGAAGGAGACACAAGGATGTGTC
TCGGAGTCACCGGCTAAACCAGCCATGGCTCCTCCATCCTCCTCGCTTTTCCAGTATAAA
CTGTTGGTAGAATCAGACAAGCGTTCAAGAATGGAGCGGACTTTCTTTTCACTTTTTACA
GCCGGAGATAAGACACATGCCAAGAAAGCCGGAGGAAGACCATATCTCATAATGCTCTCA
GCGAATATACGAACAGCACAGAAATGCATCCAGGAGCTGAAAACCTCTCCATAACTGGTG
TAGCACCACTGCAAAAGAGAGCTTCTCAAGCTTTCCTGATCCCGAACCAACTTTTCTAGC
TCTTGTTTGCGAGTCTCTTGTGCTTCGACGATGTGTTCAAAATCACGAACTTGGAACCCT
TTCTCGCGGGAATTTGTCCTGAAATTGTCTGCAACACGAGTGAAGAGAGTGACAGTGTAA
AGAGCATACTCATTATCCTCAAACAATTTCTTTGACGACCTGGGAACCACAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1G407JQ U 113
AF RS1EX40JQ U 1
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RD RS1G407JQ 600 0 0
ACC
ACGTTCAATCTTTCCTTCTTTTATTTAGAAACAAAAAAAAAGATCAAAATATAATAACAA
TGAAATATATAGAACACAAACAAATAAAACAGATGAAGGCATATAGACGTAAAAGAAGCA
TCAAGCCATCTCTCATCATCAATTTT*AAGCAAGGTTGATCGTGAAGGAGACATAAGGAT
GTGTCTCGGAGTCACCGGCTAAACCAGCCATGGCTCCTCCATCCTCCTCGCTTTTCCAGT
ATAAACTGTTGGTAGAATCAGACAAGCGTTCTAGAATGGAGCGGACTTTCTTTTCACTTT
TTACAGCCGGAGATAAGACACATGCCAAGAAAGCCGGAGGAAGACCATATCTCATAATGC
TCTCAGCGAATATACGAACAGCACAGAAATGCATCCAGGAGCTGAAAACCTCTCCATAAC
TGGTGTAGCACCACTGCAAAAGGGAGCTTCTCAAGCTTTCCTGATCCCGAACCAACTTTT
CTAGCTCTTGTTTGCGAGTCTCTTGTGCTTCGACGATGTGTTCAAAATCACGAACTTGGA
ACCCTTTCTCGCGGGAATTTGTCCTGAAATTGTCTGCAACACGAGTGAAGAGAGTGA

QA 4 600 4 600
DS 

RD RS1EX40JQ 773 0 0
TTTTCGGCTTTAACAACTGTTTAACCTCTGCTCGTCCACAAGTATCAAAAACCCATCGGA
ATCTAACAAGACTCCGGCCAAAATAAAAATTACAGTACCATCTCTCTTGAGTGCTACGTT
CAATCTTTCCTTCTTTTATTTAGAAACAAAAAAAAAGATCAAAATATAATAACAATGAAA
TATATAGAACACAAACAAATATAACAGATGAAGGCATATAGACGTAGAAGAAGCATCAAG
CCATCTCTCATTATCAATTTTTAAGCAAGGTTGATCGTGAAGGAGACACAAGGATGTGTC
TCGGAGTCACCGGCTAAACCAGCCATGGCTCCTCCATCCTCCTCGCTTTTCCAGTATAAA
CTGTTGGTAGAATCAGACAAGCGTTCAAGAATGGAGCGGACTTTCTTTTCACTTTTTACA
GCGGGAGATAAGACACATGCCAAGAAAGCTGGAGGTAGACCATATCTCATAATGCTCTCA
GCGAATATACGAACAGCACAGAAATGCATCCAGGAGCTGAAAACCTCTCCATAACTGGTG
TAGCACCACTGCAACAGAGAGTTTCTCAAGCTTTCCTGATCCCGAACCAACTTTTCTAGC
TCTTGTTTGCGAGTCTCTTGTGCTTCGACGCTGTGTTCAAAATCACGAACTTGGAACCCT
TTCTCGCGGGAATTTGTCCTGAAATTGTCTGCAACACGAGTGAAGAGAGTGACAGTGTAA
AGAGCATACTCATTATCCTCAAACAATTTCTTTGACGACCTGGGAACCACAAA

QA 1 773 1 773
DS 



CO CL2258Contig2 798 2 5 U
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GCATTCCTTTGACACTCCCGTTTATCGGTTCAACATTCCTAATCTTCGTGTTGGAACATT
AGATTCTCTGCTCGCTCTCGGCGATGATCTGCTAAAGTCAAACAGCTTTGTGGAAGGAGT
ATCGCAGAAGATAAGGAGACAGATCGAAGAATTGGAGAGGATCTCTGGTGTGGAGAGCAA
CGCTCTTACTGTTGATGGAGTTCCTGTTGATTCTTATCTCACCAGGTTTGTGTGGGATGA
AGCTAAGTACCCAACAATGTCACCTCTCAAGGAGGTTGTGGACAACATTCAGTCTCAGGT
TGCAAAGATTGAGGATGATCTCAAGGTTCGTGTTGCTGAGTATAACAATGTCCGCGGTCA
ACTCAACGCCATTAACCGAAAGCAAAGTGGAAGCTTAGCTGTTCACGACCTCTCAAGCTT
GGTTAAGCCAGAAGATATTGTCGCATCAGAACATCTCGAGACTCTCCTTGCAGTTGTTCC
AAAGTATTCTCAAAAAGACTGGCTAGCATGCTATGAGACACTGACCGACTTTGTGGTTCC
TAGGTCTTCGAAGAAATTGTTTGAGGATAATGAGTATGCTCTTTACACCGTCACTCTCTT
CACTCGTGTTGCAGATAATTTCAGACTAATGCGCGTGAGAAAGGGTTCCAAGTTCGTGAT
TTTGAACATAGCGTGAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EM38TF U 7
AF RS1FK35TF U 1
BS 1 343 RS1FK35TF
BS 344 345 RS1EM38TF
BS 346 524 RS1FK35TF
BS 525 525 RS1EM38TF
BS 526 798 RS1FK35TF

RD RS1EM38TF 729 0 0
G
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GTGAAGGACTCTTCTTCCACCTTGTGGAATCGTCTACAGGAGCAGATCTCCAAGCATTCC
TTTGACACTCCCGTTTATCGGTTCAACATTCCTAATCTTCGTGTTGGAACATTAGATTCT
CTGCTCGCTCTCGGCGATGATCTGCTAAAGTCAAACAGCTTTGTGGAAGGAGTATCGCAG
AAGATAAGGAGACAGATCGAAGAATTGGAGAGGATCTCTGGTGTGGAGAGCAACGCTCTT
ACTGTTGATGGAGTTCCTGTTGATTCTTATCTCACCAGGTTTGTGTGGGATGAAGCTAAG
TACCCAACAATGTCACCTCTCAAGGAGGTTGTGGACAACATTCAGTCTCAGGTTGCAAAG
ATTGAGGATGATCTCAAGGTTCGTGTTGCTGAGTATAACAATGTCCGCGGTCAACTCAAC
GCCATTAACCGAAAGCAAAGTGGAAGCTTAGCTGTTCACGACCTCTCAAGCTTGGTTAAG
CCAGAAGATATTGTCGCATCAGAACATCTCGAGACTCTCCTTGCAGTTGTTCCAAAGTAT
TCTCAAAAAGACTGGCTAGCATGCTATGAGACACTGACCGACTTTGTGGTTCCTAGGTCT
TCGAAGAAATTGTTTGAGGATAATGAGTATGCTCTTTACACCGTCACTCTCTTCACTCGT
GTTGCAGA

QA 2 729 2 729
DS 

RD RS1FK35TF 798 0 0
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TCTACCAGTGAAGGACTCTTCTTCCACCTTGTGGAATCGTCTACAGGAGCAGATCTCCAA
GCATTCCTTTGACACTCCCGTTTATCGGTTCAACATTCCTAATCTTCGTGTTGGAACATT
AGATTCTCTGCTCGCTCTCGGCGATGATCTGCTAAAGTCAAACAGCTTTGTGGAAGGAGT
ATCGCAGAAGATAAGGAGACAGATCGAAGAATTGGAGAGGATCTCTGGTGTGGAGAGCAA
CGCTCTTACTGTTGATGGAGTTCCTGTTGATTCTTATCTCACCCTGTTTGTGTGGGATGA
AGCTAAGTACCCAACAATGTCACCTCTCAAGGAGGTTGTGGACAACATTCAGTCTCAGGT
TGCAAAGATTGAGGATGATCTCAAGGTTCGTGTTGCTGAGTATAACAATGTCCGCGGTCA
ACTCAACGCCATTAACCGAAAGCAAAGTGGAAGCTTAGCTGTTCGCGACCTCTCAAGCTT
GGTTAAGCCAGAAGATATTGTCGCATCAGAACATCTCGAGACTCTCCTTGCAGTTGTTCC
AAAGTATTCTCAAAAAGACTGGCTAGCATGCTATGAGACACTGACCGACTTTGTGGTTCC
TAGGTCTTCGAAGAAATTGTTTGAGGATAATGAGTATGCTCTTTACACCGTCACTCTCTT
CACTCGTGTTGCAGATAATTTCAGACTAATGCGCGTGAGAAAGGGTTCCAAGTTCGTGAT
TTTGAACATAGCGTGAAG

QA 1 798 1 798
DS 



AS 1 2

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GGATTCGATCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACATCTCATCTCATGGCTGCTAGCT
ACAAAGTCGACGAAGAGTACGATTACCTCTTCAAGCTCGTCTTGATCGGCGACTCCGGCG
TCGGCAAATCGAATCTACTATCGAGATTCACGAAGAACGAGTTCAACCTCGAATCAAAGT
CTACTATTGGCGTTGAGTTCGCGACCAAGACGCTCAGAGTCGATAGCAAAGTCGTCAAAG
CTCAGATTTGGGATACTGCTGGTCAAGAAAGATACCGAGCAATCACAAGTGCTTACTACA
GAGGAGCTGTAGGTGCTTTACTTGTCTACGACGTGACAAGGCACTCGACGTTTGAGAACG
CAGCGAGATGGCTAAGGGAGCTACGGGGACACACGGATCCAAACATAGTGGTGATGCTTA
TAGGGAACAAGTGCGATTTGCGTCACTTGGTAGCAATAAAAACAGAGGAAGCTAAAGACT
TTGCTGAGAGAGAGTCTCTCTATTTCATGGAGACATCTGCGTTAGATGCAACCAACGTTG
AAAACGCCTTCACCGAAGTGTTGACTCAGATTCATAAGATAGTGAGCAAGAGAAGCGTGG
ATGGATCGAACAAAGAAGAAGGAGGGTCTTCGTCTGGTTTACCAAAGAAAGGAGAGACTA
TTAACGTCAAAGAAGATGGGTCTGTTCTTAAGAGAATGGGTTGCTGCTCTAACTAGAGTG
TGATTGTAGATTTGGTTTGGTCGGATTAAGGTGGCTCGTGCAATAAAATAAAAATCAACT
GTTTATGCTTTGGTAACTTTCGCCTGTAAGGGCTTTTAAAATTGAATGTACATGATCATT
ATCTTGTCTTTCCACCACTTATAAACTTGTAATAAACTAGACGAATGCAAATCTTCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GV41TF U 1
AF RS1GV41JQ C 122
BS 1 616 RS1GV41TF
BS 617 900 RS1GV41JQ

RD RS1GV41TF 616 0 0
GGATTCGATCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACATCTCATCTCATGGCTGCTAGCT
ACAAAGTCGACGAAGAGTACGATTACCTCTTCAAGCTCGTCTTGATCGGCGACTCCGGCG
TCGGCAAATCGAATCTACTATCGAGATTCACGAAGAACGAGTTCAACCTCGAATCAAAGT
CTACTATTGGCGTTGAGTTCGCGACCAAGACGCTCAGAGTCGATAGCAAAGTCGTCAAAG
CTCAGATTTGGGATACTGCTGGTCAAGAAAGATACCGAGCAATCACAAGTGCTTACTACA
GAGGAGCTGTAGGTGCTTTACTTGTCTACGACGTGACAAGGCACTCGACGTTTGAGAACG
CAGCGAGATGGCTAAGGGAGCTACGGGGACACACGGATCCAAACATAGTGGTGATGCTTA
TAGGGAACAAGTGCGATTTGCGTCACTTGGTAGCAATAAAAACAGAGGAAGCTAAAGACT
TTGCTGAGAGAGAGTCTCTCTATTTCATGGAGACATCTGCGTTAGATGCAACCAACGTTG
AAAACGCCTTCACCGAAGTGTTGACTCAGATTCATAAGATAGTGAGCAAGAGAAGCGTGG
ATGGATCGAACAAAGA

QA 1 616 1 616
DS 

RD RS1GV41JQ 779 0 0
CGGCAAATCGAATCTACTATCGAGATTCACGAAGAACGAGTTCAACCTCGAATCAAAGTC
TACTATTGGCGTTGAGTTCGCGACCAAGACGCTCAGAGTCGATAGCAAAGTCGTCAAAGC
TCAGATTTGGGATACTGCTGGTCAAGAAAGATACCGAGCAATCACAAGTGCTTACTACAG
AGGAGCTGTAGGTGCTTTACTTGTCTACGACGTGACAAGGCACTCGACGTTTGAGAACGC
AGCGAGATGGCTAAGGGAGCTACGGGGACACACGGATCCAAACATAGTGGTGATGCTTAT
AGGGAACAAGTGCGATTTGCGTCACTTGGTAGCAATAAAAACAGAGGAAGCTAAAGACTT
TGCTGAGAGAGAGTCTCTCTATTTCATGGAGACATCTGCGTTAGATGCAACCAACGTTGA
AAACGCCTTCACCGAAGTGTTGACTCAGATTCATAAGATAGTGAGCAAGAGAAGCGTGGA
TGGATCGAACAAAGAAGAAGGAGGGTCTTCGTCTGGTTTACCAAAGAAAGGAGAGACTAT
TAACGTCAAAGAAGATGGGTCTGTTCTTAAGAGAATGGGTTGCTGCTCTAACTAGAGTGT
GATTGTAGATTTGGTTTGGTCGGATTAAGGTGGCTCGTGCAATAAAATAAAAATCAACTG
TTTATGCTTTGGTAACTTTCGCCTGTAAGGGCTTTTAAAATTGAATGTACATGATCATTA
TCTTGTCTTTCCACCACTTATAAACTTGTAATAAACTAGACGAATGCAAATCTTCACCC

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 4

CO CL2260Contig1 598 4 9 U
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ACGAGAATGGAGGTCCCAGGTTCATCGAAGAAGATGATCGCAACGCAAGAAGAGATGGTT
GCAGCTAAAGTACCGCTCGGCTACAGAGACCAGTGCGCTCATCTCCTGATCCCGCTCAAC
AAATGCCGCCAGGCCGAGTTTTTCCTCCCGTGGAAGTGCGAGGACGAGCGCCACGTGTAC
GAGAAGTGCGAGTACGAGCTCGTCATGGAGAGGATGCTCGCGATGCAGAAGATCCGCGAA
GAAGAAGCCAAGGCGAAACAGAGTAAAGTGCAAGGGAACAACGGCGTTCCTCTGATCCCT
AAAACCGCTAATGCTTAGGGCTTTCCGATTAACCGATTCCAGATTTCCGGGATCCTCTGG
AACTGTGAAGAAGGGGGGGCTCTGCTTTTCAATATTTTCTTTTTGCTAGTGATGAAAAAC
TTGTTGCTACATTCCATACGTGTATGTGCAGAGATTCTCTCCCCTACCTTTCTTCCTCTT
GTTAACTTTAAAGTTGTTTCCCAAACAGAAAATAAGATGCAAACTCATCCTTTTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FG32JQ C 165
AF RS1FA09JQ C 1
AF RS1FG32TF U 6
AF RS1FA09TF U 1
BS 1 7 RS1FA09JQ
BS 8 29 RS1FG32TF
BS 30 31 RS1FA09TF
BS 32 267 RS1FG32TF
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RD RS1FG32JQ 351 0 0
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CGAGCGCCACGTGTACGAGAAGTGGGAGTACGAGCTCGTCATGTAGAGGATGCTCGCGAT
GCAGAAGATCCGGGAAGAAGAAGCCAAGGGGAAACAGAGTAAAGTGCAAGGGAACAACGG
CGTTCCTTTGATCCCTAAAACCGCTAATGCTTAGGGCTTTCCGATTAACCGATTCCAGAT
TTCCGGGATCCTCTGGAACTGTGAAGAAGGGGGGGCTTTGCTTTTCAATATTTTCTTTTT
GCTAGGGATGAAAAACTTGTTGCTACATTCCATACGTGTATGGGCAGAGAT

QA 1 351 1 351
DS 

RD RS1FA09JQ 598 0 0
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ACGAGAATGGAGGTCCCAGGTTCATCGAAGAAGATGATCGCAACGCAAGAAGAGATGGTT
GCAGCTAAAGTACCGCTCGGCTACAGAGACCAGTGCGCTCATCTCCTGATCCCGCTCAAC
AAATGCCGCCAGGCCGAGTTTTTCCTCCCGTGGAAGTGCGAGGACGAGCGCCACGTGTAC
GAGAAGTGCGAGTACGAGCTCGTCATGGAGAGGATGCTCGCGATGCAGAAGATCCGCGAA
GAAGAAGCCAAGGCGAAACAGAGTAAAGTGCAAGGGAACAACGGCGTTCCTCTGATCCCT
AAAACCGCTAATGCTTAGGGCTTTCCGGTTAACCGATTCCAGATTTCCGGGATCCTCTGG
AACTGTGAAGAAGGGGGGGCTCTGCTTTTCAATATTTTCTTTTTGCTAGTGATGAAAAAC
TTGTTGCTACATTCCATACGTGTATGTGCAGAGATTCTCTCCCCTACCTTTCTTCCTCTT
GTTAACTTTAAAGTTGTTTCCCAAACAGAAAATAAGATGCAAACTCATCCTTTTGTTT

QA 1 598 1 598
DS 

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GG
GGAGACGCCAAGAGAAGAAGGGTTTATCGAAGTTTACGTGGAGGAGATCGCGAACGAGAA
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GCCAGGCCGAGTTTTTCCTCCCGTGGAAGTGCGAGGACGAGCGCCACGTGTACGAGAAGT
GCGAGTACGAGCTCGTCATGTAGAGGATGCTCGCGATGCAGAAGATCCGCGAAGAAGAAG
CCAAGGCGAAACAGAGTAAAGTGCAAGGGAACAACGGCGTTCCTCTGATCCCTAAAACCG
CTAATGCTTAGGGCTTTCCGATTAACCGATTCCAGATTTCCGGGATCCTCTGGAACTGTG
AAGAAGGGGGGGCTCTGCTTTTCAATATTTTCTTTTTGCTAGTGATGAAAAACTTGTTGC
TACATTCCATACGTGTATGTGCAGAGATTCTCTCCCCTACCTTTCTTCCTCTTGTCAACT
TTAAAGTTGTTTCCCAAACAGAAAATAAGATGCAAACTCATCCT

QA 3 586 3 586
DS 

RD RS1FA09TF 598 0 0
GGAAATC
GGAGACGCCAAGAGAAGAAGGGAGTATCGAAGTTTACGTGGAGGAGATCGCGAACGAGAA
TGGAGGTCCCAGGTTCATCGAAGAAGATGATCGCAACGCAAGAAGAGATGGTTGCAGCTA
AAGTACCGCTCGGCTACAGAGACCAGTGCGCTCATCTCCTGATCCCGCTCAACAAATGCC
GCCAGGCCGAGTTTTTCCTCCCGTGGAAGTGCGAGGACGAGCGCCACGTGTACGAGAAGT
GCGAGTACGAGCTCGTCATGGAGAGGATGCTCGCGATGCAGAAGATCCGCGAAGAAGAAG
CCAAGGCGAAACAGAGTAAAGTGCAAGGGAACAACGGCGTTCCTCTGATCCCTAAAACCG
CTAATGCTTAGGGCTTTCCGGTTAACCGATTCCAGATTTCCGGGATCCTCTGGAACTGTG
AAGAAGGGGGGGCTCTGCTTTTCAATATTTTCTTTTTGCTAGTGATGAAAAACTTGTTGC
TACATTCCATACGTGTATGTGCAGAGATTCTCTCCCCTACCTTTCTTCCTCTTGTTAACT
TTAAAGTTGTTTCCCAAACAGAAAATAAGATGCAAACTCATCCT
TTTGTTT

QA 8 591 8 591
DS 



AS 1 4

CO CL2261Contig1 1099 4 15 U
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CTTGTTCGTGAATGGGTTGGGTTTCAGCAATTTCCAGCGGCAACCCAAGAAAAGTTAATT
GAATTCTTCTCCAAATTAAAGCAAAAGGACATGAACTCTCTGACAGTTGTTGTAATGGGT
AAAGGCGGTGTCGGAAAATCGTCCACTGTCAACTCTCTTATCGGCGAACAAGTCGTCCGT
GTCAGTCCTTTCCAGGCGGAAGGTTTGAGGCCAGTGATGGTTTCAAGAACAATGGGAGGC
TTCACTATTAACATCATTGACACCCCTGGCCTTGTGGAAGCTGGTTACGTCAATCACCAA
GCCCTCGAGTTAATCAAAGGGTTTCTTGTGAACAGAACCATAGATGTGTTGCTGTATGTT
GATCGTTTGGATGTGTATAGAGTGGATGAGCTAGATAAGCAAGTTGTTCAAGCTATCACC
CAAACCCTGGGCAAAGAGATTTGGTGCAAAACCTTGCTTGTTTTGACTCATGCTCAGTTC
TCCCCACCCGATGATCTTTCCCACGAAACATTCTCTTCCAAGAGATCAGATTCTCTCCTC
AAAACTATCCGCGCTGGTTCTAAGATGCGTAAACAACAGTTTGAGGATTCTGCAATTGAG
GTTGTATATGCAGAGAACAGTGGGAGATGCAGCAAGAATGACAAGGAAGAAAAGGCATTA
CCAAATGGTGAGGCGTGGATCCCGAACTTGGTTAAGGCCATAACCGATGTTGCTACAAAT
CAGAAGAAAGCGATTCATGTTGACAAGAAGATGGTAGATGGATCTTACTCTGATGACAAA
GGAAAGAAACTCATCCCTCTTATCATTGCCGCTCAGTGGTTCGTCGTTAAGATGATCCAA
GGAGCCATCAGAAATGACATCAAGATAAGTGGTAAGCCACTCTAAGAGCTCTGAAGACAT
GAATAAGGTTTTGTTGTGATCCAACTTGAAGGAGATGAGTTTTTTCTTTTAATCGATTTT
AGTTGCAGTATTTTCATGTTTTCCTGTTTTATCTTGTCTGTAATTTTTGGATATTTGTTG
GAATAATAAAATTGTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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GG
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CTCCCCACCCGATGATCTTTCCTACGAAACATTCTCTTCCAAGAGATCAGATTCTCTCCT
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GGATATTTGTTGGAATAA

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DS 



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ATCCTACCCGAATAAATTGATAGAAAAAGATAATAAAAGGGGGGGCTAATAGAAGAGAAT
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AGATGACATAATGAGACAGATCAACGACTCCCATTGATTCTTCCCCAACGAATCACCCGC
AAACATTATGTTCTTCCCCTTCATTCTCAACAGAAACTCAGCACCATTGAACGTGGGCAA
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TTTAACGGAAACAATCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GV10JQ U 1
AF RS1FM40JQ U 5
AF RS1GV10TF C 607
BS 1 101 RS1GV10JQ
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ATCCTACCCGAATAAATTGATAGAAAAAGATAATAAAAGGGTGGGCTAATAGAAGAGAAT
GGTATACAACAACTGATTCCATGTATCAGGGAGACCAGGCAAGCACCAATGGCTACAATC
TGACTGGCCTGGCTTGGCCAGCTGTGAACCACCGCTAACAAGACCGCTGTAAACAGAAGG
GTGTCCGTCTTTTCTGAGGGAAGAGAGGAGCGTTATGTCAAGAAGTAATGCAGGATTGTG
CATCCCGTGAAGCACTTCAACGATCACCGATCTTAGCTGATCTGTGTAGGGACTCACTGG
ATAAGCCGCTCCTGTGATTGGCTCCGTCTCTCCGTAGCAGTTCTTGGATCCCGAAAACGT
TGATGCTGCCCAGTCACTCGGATTGTCATGTGTTGGAGAAA

QA 1 461 1 461
DS 

RD RS1FM40JQ 782 0 0
CTACAATTGAATGCATTCATAAACTTGGGGATTCTCCTCGAATGCGTTAGAAAAATATCC
TACCCGAATAAATTGATAGAAAAAGATAATAGAAGGGGGGGCTAATAGAAGAGAATGGTA
TACAACAACTGATTCCATGTGTCAGGGAGACCAGGCAAGCACCAATGGCTACAATCTGAC
TGGCCTGGCTTGGCCAGCTGTGAACCACCGCTAACAAGACCGCTGTAAACAGAAGGGTGT
CCGTCTTTTCTGAGGGAAGAGAGGAGCGTTATGTCAAGAAGTAATGCAGGATTGTGCATC
CCGTGAAGCACTTCAACGATCACCGATCTTAGCTGATCTGTGTAGGGACTCACTGGATAA
GCCGCTCCTGTGATTGGCTCCGTCTCTCCGTAGCAGTTCTTGGATCCCGAAGACGTTGAT
GCTGCCCAGTCACTCGGATTGTCATGTGTTGGAGAAATGGAGAGGAAGAAGACTTGAGTT
CTGGATCTATCCACATGTGTTTCAACCCAATAAGCCCAAGTACGAAGAGCTTTCTCCATT
GCAACGAAGCGGTCCATGTCTTGGTAATAAGAATTGCCAGATTGAATCAAGTCCCATCCT
TGCTGAGACCCGATGTGGCTCCACCAGTGACCAGTATTGAAGATGAGAAGATCAGCGTCA
TGCCAAGCGTTGGCATTGCCAGAGATCTCCTCAAGTTTCAACACACGCTTGCCTTGAACA
GCGTCTATGTCCACCAAGAA*GGAGCTTTGTAAA*CGACATAGTTATCCCATAGTCCA
GATC

QA 1 778 1 778
DS 

RD RS1GV10TF 731 0 0
CTGAGACCCGGTGTGGCTCCACCAGTGACCAGTATTGAAGATGAGTAGATCAGCGTCATG
CCAAGCGTTGGCATTGCCAGAGATCTCCTCAAGTTTCAACACACGCTTGCCTTGAACAGC
GTCTATGTCCACCAAGAAAGGAGCTTTGTAAAACGACATAGTTATCCCATAGTCCAAGAA
TCTGAAGGTGGAGAGAGGGAGACCTCTGGTCATTTGAGTACGAGTGGAGGGTGCAGATGA
CATAATGAGACAGATCAACGACTCCCATTGATTCTTCCCCAACGAATCACCCGCAAACAT
TATGTTCTTCCCCTTCATTCTCAACAGAAACTCAGCACCATTGAACGTGGGCAAGTTGCA
ATTCTGGGGCTGCCATCGATACTTGAGGTAGTTGGAGTCAGGACGTCCGTACATCTGACA
ATCGAACTCACTCTCCACGACGGCGGGACAATCCGCCGGTTTGTACAGAGGGTACGAGTC
GTCGTGGACCCACGTGCCCATGAAGAGAGAGCACGTGCTTCTGTTCCCTTGGAAAGAAGA
AGGTCTGCTCGAGCTGTACTGGTTCCCACTGCTGCTGCTGCTGCCGCTGCTGCTCCCATG
GCGTTTCTTCAAGTTCAGTATAATGGCGGAGGAAGATGGCTCTTGCTGAAGCAGTAGTGG
AAGAAGAAAGAGTGAGATGTGAAGAAGAAGAACATTCATTTTTTTTTTTTTTGCTTTAAC
GGAAACAATCC

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 4

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AAAACTTCATTTATTTTGAAACGGAGGGAATACATTATAACTTTTTTTGGGTCGAAGAAC
AGAATATAATTTAAAAAAAAGAAAAAAAAAGACACCATAAAGTTAAACCCAAAAACGACC
CATGAGTTAAATACACAATAACTACTATGTTTTCTTTTTCTTTTCCAATAAAAGTGACAA
CACGATTTTACAACATTTTTTTTTATAGAAGAAGAAACAACTTCAAAGAAGGAATCATAA
TCGTGATACTAAGGGGGGGGGGGGGGGGCTCCAACCTATCTTAGTAACCTTTTGTTGTCG
TAGGTACTCCAGGAAAGACAATAAAACATAAAAAAGAAGGGAACATTGCTTTTAGATGTC
TAAGCAATGTGACTCTCTTTTTTTCTTTGCGCAGCAAACAAATCCATCTTTTAGTGTCAA
TCAAGAGTCCACAGCCGGAGACTGCATGCAGCAGAGCCACTTTTTAGGCTGAGGTTTACT
AGGATCTCCTCCTCCTCCTCCGGACTTAGCATGACCATCAGTAGATTTACCGGGCGATCC
GGGTTTGCCACCAGTCTTTTTCTCATCCCTAGCTTTGTTGAATATCACTGTGAAACCTTC
AGCTGATGCTGGATCATTCACATCCCATTCACCAAACTTCGGCAAGGGACGACCTTTGCC
CGACATGGCCTCTGCAGAAGGGAGAAAGATACCCGAGAAAAATGGAAACAAACGATTCTG
AGAAAAGAAGAAAAAAAAAGAGATGGAGCCGCCGAGAAAACCAAGGAAGGTGAGAGAGAA
AAAAGATTTGATCTCGCAGGAGGAGGAGAGAATCTGGGAGAAGAAGAAAAAAAAAAGAGA
GACTTTTCTTCTTTCTCTCTCTTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 25 25 25 10 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A982JQ U 13
AF RS1FS22JQ U 1
AF RS1FS22TF C 205
AF RS1A982TF C 298
BS 1 316 RS1FS22JQ
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RD RS1A982JQ 296 0 0
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AAAAAAAAGAAAAAAAA*GACACCATAAAGTTAAACCCAAAAAC**CCCATGAGTTAAAT
ACACAATAACTACTATGTTTTCTTTTTCTTTTCCAATAAAAGTGACAACACGATTTTACA
ACATTTTTTTTTATAGAAAAAGAAACAACTTCAAAGAAGGAATCATAATCGTGATACAAA
GGGGGGGGGGGGGGGGCTCCAACTTATCTTAATAACCTTTTGTTGTCGTCGGTACT

QA 1 296 1 296
DS 

RD RS1FS22JQ 433 0 0
AAAACTTCATTTATTTTGAAACGGAGGGAATACATTATAACTTTTTTTGGGTCGAAGAAC
AGAATATAATTTAAAAAAAAGAAAAAAAAAGACACCATAAAGTTAAACCCAAAAACGACC
CATGAGTTAAATACACAATAACTACTATGTTTTCTTTTTCTTTTCCAATAAAAGTGACAA
CACGATTTTACAACATTTTTTTTTATAGAAGAAGAAACAACTTCAAAGAAGGAATCATAA
TCGTGATACTAAGGGGGGGGGGGGGGGGCTCCAACCTATCTTAGTAACCTTTTGTTGTCG
TAGGTACTCCAGGAAAAACAATAAAACATAAAAAAAAAGGGAACATTGCTTTTAAATGTC
TAACCAATGTGACTCTCTTTTTTTCTTTGCCCAGCAAACAAATCCATCTTTTAGTGTCAA
TCAAAAGTCCACA

QA 1 433 1 433
DS 

RD RS1FS22TF 664 0 0
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GCGGCTCCAACCTATCTTAGTAACCTTTTGTTGTCGTAGGTACTCCAGGAAAGACAATAA
AACATAAAAAAGAAGGGAACATTGCTTTTAGATGTCTAAGCAATGTGACTCTCTTTTTTT
CTTTGCGCAGCAAACAAATCCATCTTTTAGTGTCAATCAAGAGTCCACAGCCGGAGACTG
CATGCAGCAGAGCCACTTTTTAGGCTGAGGTTTACTAGGATCTCCTCCTCCTCCTCCGGA
CTTAGCATGACCATCAGTAGATTTACCGGGCGATCCGGGTTTGCCACCAGTCTTTTTCTC
ATCCCTAGCTTTGTTGAATATCACTGTGAAACCTTCAGCTGATGCTGGATCATTCACATC
CCATTCACCAAACTTCGGCAAGGGACGACCTTTGCCCGACATGGCCTCTGCAGAAGGGAG
AAAGATACCCGAGAAAAATGGAAACAAACGATTCTGAGAAAAGAAGAAAAAAAAAGAGAT
GGAGCCGCCGAGAAAACCAAGGAAGGTGAGAGAGAAAAAAGATTTGATCTCGCAGGAGGA
GGAGAGAATCTGGGAGAAGAAGAAAAAAAAAAGAGAGACTTTTCTTCTTTCTCTCTCTTT
CTCC

QA 1 664 1 664
DS 

RD RS1A982TF 571 0 0
TCGTCGGTACTCCAAGAAAGACAATAAAACATAAAAAAGAAGGGAACATTGCTTTTAGAT
GTCTAAGCAATGTGACTCTCTTTTTTTCTTTGCGCAGCAAACAAATCCATCTTTTAGTGT
CAATCAAGAGTCCACAGCCGGAGACTGCATGCAGCAGAGCCACTTTTTAGGCTGAGGTTT
ACTAGGATCTCCTCCTCCTCCTCCGGACTTAGCATGACCATCAGTAGATTTACCGGGCGA
TCCGGGTTTGCCACCAGTCTTTTTCTCATCCCTAGCTTTGTTGAATATCACTGTGAAACC
TTCAGCTGATGCTGGATCATTCACATCCCATTCGCCAAACTTCGGCAAGGGACGACCTTT
GTCCGACATGGCCTCTGCAGAAGGGAGAAAGATACCCGAGAAAAATGGAAACAAACGATT
CTGAGAAAAGAAGAAAAAAAA*GAGATGGAGCCGCCGAGAAAACCAAGGAAGGTGAGAGA
GAAAAAAGATTTGATCTCGCAGGAGGAGGAGAGAATCTGGGAGAAGAAGAAAAAAAAA*G
AGAGACTTTTCTTCTTTCTCTCTCTTTCTCC

QA 1 571 1 571
DS 



AS 1 4

CO CL2264Contig1 974 4 26 U
GGCTTCGTAGAAATCGTTATTATGGCTGCACAGTCGCTATCGCTTCCTCTCGCCGGCAGA
GTAGCCATAGTCACCGGCTCTTCTCGTGGTATCGGAAGAGCCATAGCGATCCACCTCGCC
GAACTCGGTGCGAGGATCGTTGTCAATTACACAACTAAATCGGCAGACGCCGAGATTGTC
GCGGCGGAGATCAACGGCCTTCCATCCCCCGGAAATGATGGACCGAGAGCGATCGTGGTT
CAGGCCAACGTCTCAGAGGCAAGCCAGGTGAAATCGCTTTTCGATGCGGCGGAGAGCGCC
TTCGAGTCGCCGGTTCATATTCTGGTTAACTCGGCGGGAGTACTCGATCCCAAGTACCCT
TCCACCGCAAACACATCGGTCGAAGATTTTGATCGCACCTTCAGTGTCAATACAAAAGGG
GCGTTTCTTTGCAGCAAAGAAGCTGCCAATAGGCTCAAAAAGGGAGGCGGTGGTCGGATC
ATACTCCTCACATCTTCCATGACCCGAGGTTTGAAGCCGGGATTCGGTGCATATGCAGCG
TCAAAAGCAGCTGTGGAAACTATGGTTAAGATTCTAGCGAAAGAGCTCAAAGGAACAGGA
ATCACTGCAAACTGTGTAGCTCCGGGACCCATCGCCACTGAGATGTTCTTTGAAGGAAAG
AGCTCGGAGTTGGTGGAGAAGATAGCCGCGGAGAATCCTTTTGGGAGAGTCGGCGAAGTC
AAAGATGTGGTGCCTCTTGTTGGGTTCTTGGCTGGCGATGGTGGTGAATGGATCAACGGT
CAGATCATTCCTGTTAACGGGGGATATGTGTAAAAGGATTGGTCTTTAGTAGCCTCTTTG
CTGTTCTTTTGAGGCTTACTGATGATATGTTTGCAAATGTGTTGTTATATAACAATAATA
ACAAGATAATGATTTTGATTCGGTGCTCAGTTAGAAAGATAACCTAAATGTATGAGAGAA
TTGGTTCTTAGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 5 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E973TF U 50
AF RS1H447TF U 1
AF RS1E973JQ C 246
AF RS1GI50JQ C 220
BS 1 90 RS1H447TF
BS 91 91 RS1E973TF
BS 92 112 RS1H447TF
BS 113 113 RS1E973TF
BS 114 119 RS1H447TF
BS 120 120 RS1E973TF
BS 121 364 RS1H447TF
BS 365 365 RS1E973TF
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BS 682 719 RS1H447TF
BS 720 721 RS1GI50JQ
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BS 748 797 RS1GI50JQ
BS 798 798 RS1E973JQ
BS 799 800 RS1GI50JQ
BS 801 801 RS1E973JQ
BS 802 842 RS1GI50JQ
BS 843 843 RS1E973JQ
BS 844 974 RS1GI50JQ

RD RS1E973TF 667 0 0
GG
GCCGGCAGAGTAGCCATAGTCACCGGCTCTTCTCGTGGTATCGGAAGAGCCATAGCGATC
CACCTCGCCGAACTCGGTGCGAGGATCGTTGTCAATTACACAACTAAATCGGCTGACGCC
GAGATTGTCGCGGCGGAGATCAACGGCCTTCCATCCCCCGGAAATGATGGACCGAGAGCG
ATCGTGGTTCAGGCCAACGTCTCAGAGGCAAGCCAGGTGAAATCGCTTTTCGATGCGGCG
TAGAGCGCCTTCGAGTCGCCGGTTCATATTCTGGTTAACTCGGCGGGAGTACTCGATCCC
AAGTACCCTTCCACCGCAAACACATCGGTCGAAGATTTTGATTGCACCTTCAGTGTCAAT
ACAAAAGGGGCGTTTCTTTGCAGCAAAGAAGCTGCCAATAGGCTCAAAAAGGGAGGCGGT
GGTCGGATCATACTCCTCACATCTTTCATGACCCGAGGTTTGAAGCCGGGATTCGGTGCA
TATGCAGCGTCAAAAGCAGCTGTGGAAACTATGGTTAAGATTCTAGCGAAAGAGCTCAAA
GGAACAGGAATCACTGCAAACTGTGTAGCTCCGGGACCCATCGCCACTGAGATGTTCTTT
GAAGGAAAGAGCTCGGAGTTGGTGGAGAAGATAGCCGCTGAGAATCCTTTTGGGAGAGTC
GGCGA

QA 3 667 3 667
DS 

RD RS1H447TF 747 0 0
GGCTTCGTAGAAATCGTTATTATGGCTGCACAGTCGCTATCGCTTCCTCTCGCCGGCAGA
GTAGCCATAGTCACCGGCTCTTCTCGTGGTGTCGGAAGAGCCATAGCGATCCGCCTCGCT
GAACTCGGTGCGAGGATCGTTGTCAATTACACAACTAAATCGGCAGACGCCGAGATTGTC
GCGGCGGAGATCAACGGCCTTCCATCCCCCGGAAATGATGGACCGAGAGCGATCGTGGTT
CAGGCCAACGTCTCAGAGGCAAGCCAGGTGAAATCGCTTTTCGATGCGGCGGAGAGCGCC
TTCGAGTCGCCGGTTCATATTCTGGTTAACTCGGCGGGAGTACTCGATCCCAAGTACCCT
TCCATCGCAAACACATCGGTCGAAGATTTTGATCGCACTTTCAGTGTCAATACAAAAGGG
GCGTTTCTTTGCAGCAAGGAAGCTGCCAATAGGCTCAAAAAGGGAGGCGGTGGTCGGATC
ATACTCCTCACATCTTCCATGACCCGAGGTTTGAAGCCGGGATTCGGTGCATATGCAGCG
TCAAAAGCAGCTGTGGAAACTATGGTTAAGATTCTAGCGAAAGAGCTCAAAGGAACAGGA
ATCACTGCAAACTGTGTAGCTCCGGGACCCATCGCCACTGAGATGTTCTTTGAAGGAAAG
AGCTCGGAGTTGGTGGAGAATATAGCCGCGGAGAATCCTTTTGGGAGAGTCGGCGAAGTT
GAAGATGTGGTGCCTCCTGTTGGGTTC

QA 1 747 1 747
DS 

RD RS1E973JQ 667 0 0
CAACGTCTCAGAGGCAAGCCAGGTGAAATCGCTTTTCGATGCGGCGTAGAGCGCCTTCGA
GTCGCCGGTTCATATTCTGGTTAACTCGGCGGGAGTACTCGATCCCAAGTACCCTTCCAC
CGCAAACACATCGGTCGAAGATTTTGATTGCACCTTCAGTGTCAATACAAAAGGGGCGTT
TCTTTGCAGCAAAGAAGCTGCCAATAGGCTCAAAAAGGGAGGCGGTGGTCGGATCATACT
CCTCACATCTTTCATGACCCGAGGTTTGAAGCCGGGATTCGGTGCATATGCAGCGTCAAA
AGCAGCTGTGGAAACTATGGTTAAGATTCTAGCGAAAGAGCTCAAAGGAACAGGAATCAC
TGCAAACTGTGTAGCTCCGGGACCCATCGCCACTGAGATGTTCTTTGAAGGAAAGAGCTC
GGAGTTGGTGGAGAAGATAGCCGCTGAGAATCCTTTTGGGAGAGTCGGCGAAGTCAAAGA
TGTGGTGCCTCTTGTCGGGTTCTTGGCTGGCGATGGTGGTGAATGGATCAACGGTCAGAT
CATTCCTGTTAACGGGGGATATGTGTAAAAGGATTGGTCTTTAGTAGCCTCTTTGCTGTT
CTTTTGAGGCTTACTGATGATATGTTTGCAAATGTGTTGTTATATAACA*TAATAACAA
TAATAACC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RS1GI50JQ 755 0 0
GGACCGAGAGCGATCGTGGTTCAGGCCAACGTCTCAGAGGCAAGCCAGGAGAAATCGCTT
TTCGATGCGGCGGAGAGCTCCTTCGAGTCGCCGGTTCATATTCTGGTTAACTCGGCGGGA
GTACTCGATCCCAAGTACCCTTCCATCGCAAACACATCGGTCGAAGATTTTGATCGCACT
TTCAGTGTCAATACAAAAGGGGCGTTTCCTTGCAGCAAAGAAGCTGCCAATAGGCTCAAA
AAGGGAGGCGGTGGTCGGATCATACTCCTCACATCTTCCATGACCCGAGGTTTGAAGCCG
GGATTCGGTGCATATGCAGCGTCAAAAGCAGCTGTGGAAACTATGGTTAAGATTCTAGCG
AGAGAGCTCAAAGGAACAGGAATCACTGCAAACTGTGTAGCTCCGGGACCCATCGCCACT
GAGATGTTCTTTGAAGGAAAGAGTTCGGAGTTGGTGGAGAATATAGCCGCGGAGAATCCT
TTTGGGAGAGTCGGCGAAGTCAAAGATGTGGTGCCTCTTGTTGGGTTCTTGGCTGGCGAT
GGTGGTGAATGGATCAACGGTCAGATCATTCCTGTTAATGGTGGATATGTGTAAAAGGAT
TGGTCTTTAGTAGCCTCTTTGCTTTTCTTTTGAGGCTTACTGATGATATGTTTGCAAATG
TGTTGTTATATAACAATAATAACAAGATAATGATTTTGATTCGGTGCTCAGTTAGAAAGA
TAACCTAAATGTATGAGAGAATTGGTTCTTAGTTC

QA 1 755 1 755
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL2266Contig1 693 2 24 U
GATGAATTACTGAAATTGACGAAATACTGATACAATCCGATAAGGCAATATTCTCAACAA
AACAAAATACAACTTCAAGAAAATCTCAACAAGAGTTTTATTAAAGTGAAAAGAAAAACA
TGAACCAAAAACAAAATAACATAAAACATCCTTCTCCTGCATTCATCAGCAAAGGGAGTT
GCAGGCATATACTCAGTACATGCTGTACTTGTCACTGGCCCCTTCGGGTCGAATGAGCTT
GTAAATGGACATAGCAATTGGAAAAATGGCAGTGAGAGCAATCTGCAACTGATCCGAGCT
GCTGGTTCGGACTGTGATCTGCCCGCTCATCTTGTTGTTAAGCCCTGCACGAAGGGCTAT
CTTTGAGTTCCTTCCAACAAAAACTTGAGATTGGAGGTTGCCTCCGAGGGCTAAATCACC
TCTCCACTTCACCAGAAACAGTCCTAAAGAGTGTTAGTCCTGGCCTATTGGGAAATCAGC
TTCCTTGAGCCTGACCTCCAGGTTCGCACCATAAGCCGCGTCTCCCTGTGATCGCATGGT
CCCTGTACTGCCCACAAGCACAAATCTTTCACCAAGTGATATTTGGTCCTCGACTTTGAC
ACCAGTGGCAATGTTCTCGCCCAAGAAAGTCACTGAACCTCCGAGAGTTGTCTTGTTCTT
CTTCAAGTTCTTGAATTTGGTTTCTCCTCTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D884JQ U 1
AF RS1FY45JQ U 9
BS 1 43 RS1D884JQ
BS 44 44 RS1FY45JQ
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BS 220 243 RS1D884JQ
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BS 264 264 RS1FY45JQ
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BS 437 437 RS1FY45JQ
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BS 457 658 RS1D884JQ
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RD RS1D884JQ 658 0 0
GATGAATTACTGAAATTGACGAAATACTGATACAATCCGATAATGCAATATTCTCAACAG
AACAAAATACAACTTCAAGAAAATCTCAACAAGAGTTTTATTAAAGTGAAGAGAAAAACA
TGAACCAAAAACAAAATAACATAAAACATCCTTCTCCTGCATTCATCAGCAGAGGGAGTT
GCAGGCATATACTCAGTACATGCTGTACTTGTCACTGGTCCCTTCGGGTCGAATGAGCTT
GTAGATGGACATAGCAATTGGAAGAATGGCAGTGAGAGCAATCTGCAACTGATCCGAGCT
GCTGGTTCGGACTGTGATCTGCCCGCTCATCTTGTTGTTAAGCCCTGCACGAAGGGCTAT
CTTTGAGTTCCTTCCAACAGAGACTTGAGATTGGAGGTTGCCTCCGAGGGCTAAATCACC
TCTCCACTTCACCAGAGACAGTCCTAAAGAGTGTTGGTCCTGGCCTATTGGGAAATCAGC
TTCCTTGAGCCTGACCTCCAGGTTCGCACCATAAGCCGCGTCTCCCTGTGATCGCATGGT
CCCTGTACTGCCCACAAGCACAAATCTTTCACCAAGTGATATTTGGTCCTCGACTTTGAC
ACCAGTGGCAATGTTCTCGCCCAAGAAAGTCACTGAACCTCCGAGAGTTGTCTTGTTC

QA 1 658 1 658
DS 

RD RS1FY45JQ 685 0 0
CCCGAAATTGAC
GAAATACTGATACAATCCGATAGGGTAATATTCTCAACAAAACAAAATACAACTTCAAGA
AAATCTCAACAAGAGTTTTATTAAAGTGAAAAGAAAAACATGAACCAAAAACAAAATAAC
ATAAAACATCCTTCTCCTGCATTCATCAGCAAAGGGAGTTGCAGGCATATACTCAGTACA
TGCTGTACTTGTCACTGGCCCCTTCGGGTCGAATGAGCTTGTAAATGGACATAGCAATTG
GAAAAATGGCAGTGAGAGCAATCTGCAACTGATCCGAGCTGCTGGTTCGGACTGTGATCT
GCCCGCTCATCTTGTTGTTAAGCCCTGCACGAAGGGCTATCTTTGAGTTCCTTCCAACAA
AAACTTGAGATTGGAGGTTGCCTCCGAGGGCTAAATCACCTCTCCACTTCACCAGAAACA
GTCCTAAAGAGTGTTAGTCCTGGCCTATTGGGAAATCAGCTTCCTTGAGCCTGACCTCCA
GGTTCGCACCATAAGCCGCGTCTCCCTGTGATCGCATGGTCCCTGTACTGCCCACAAGCA
CAAATCTTTTACCAAGTGATATTTGGTCCTCGACTTTGACACCAGTGGCAATGTTCTCGC
CCAAGAAAGTCACTGAACCTCCGAGAGTTGTCTTGTTCTTCTTCAAGTTCTTGAATTTGG
TTTCTCCTCTGAC

QA 13 685 13 685
DS 



AS 1 4

CO CL2267Contig1 993 4 24 U
GGGCTCAGACCATGGCTTGGATTCTTGATGAGTACTCCAAGTTTCATGGTTATTCCCCTG
CTGTTGTCACCGGAAAGCCCATTGATCTTGGTGGTTCACTTGGTAGAGAAGCTGCCACAG
GACGTGGTGTTGTCTATGCTATGGAAGCTCTTCTTGCTGAGTATGGCAAATCCATTCAGG
GATTGACCTTTGTTGTTCAGGGTTTTGGGAATGTTGGAACATGGGCAGCAAAGCTGATCC
ATGAGAAAGGAGGGAAAGTGGTTGCGGTAAGTGACATTACAGGTGCAGTCAGAAACCCTG
AAGGTATTGACATCAACGCACTGCTGAGACACAAAGAGGCAACTGGAAGTCTCAATGAGT
TCAGCGGTGGAGACGCTATGAACTCGGAGGAACTGTTGCTCCATGAGTGTGATGTTCTCA
TTCCTTGTGCTCTTGGTGGTGTCCTCAACAAGGAGAATGCTGGAGATGTGAAGGCAAAGT
TCATAGTAGAGGCAGCTAACCATCCAACCGATCCAGATGCTGATGAGATTCTATCGAAGA
AAGGAGTGATAATACTACCAGATATATACGCAAACGCAGGAGGAGTGACGGTGAGTTACT
TTGAGTGGGTGCAGAACATTCAAGGGTTCATGTGGGAAGAGGAAAAAGTGAACCTGGAGC
TGCAAAAGTACATGACTCGAGCCTTTCACAACATCAAGACAATGTGCCATACTCATTCCT
GCAACCTCCGTATGGGAGCTTTCACCCTTGGAGTTAGCCGTGTCGCTCGAGCCACCCAGT
TGCGTGGTTGGGAAGCTTAGTCTTTTTGAAAATTTTCCCCATATACTCTGTTTTTTTCCT
CTGTTTTTCCTCTGTTTTTGTGTGTTTCATTGTTACTCAAAATCATTCAAATGAATTGAA
TAACCAACAGAATAAAATAAAAGATATTATTGATTTTTCAGAAAAAAGTTGTAATATTTC
CACATCTTTATTATGAACTGAGAATTACAAACC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1ER37TF U 1
AF RS1C023TF U 57
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AF RS1ER37JQ C 322
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G

QA 1 721 1 721
DS 

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CTCATTCCTTGTGCTCTTGGTGGTGTCCTCAACAAGGAGAATGCTGGAGATGTGAAGGCA
AAGTTCATAGTAGAGGCAGCTAACCATCCAACTGATCCAGATGCTGATGAGATTCTGTCG
AAGAAAGGAGTGATTATACTACCAGATATATACGCAAACGCAGGAGGAGTGACGGTGAGT
TACTTTGAGTGGGTGCAGAACATTCAAGGGTTCATGTGGGAAGAGGAAAAAGTGAACCTG
GAGCTGCAAAAGTACATGACTCGAGCCTTTCACAACATCAAGACAATGTGCCATACTCAT
TCCTGCAACCTCCGTATGGGAGCTTTCACCCTTGGAGTTAGCCGTGTCGCTCGAGCCA

QA 1 718 1 718
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TGAAGGTATTGACATCAACGCACTGCTGAGACACAAAGAGGCAACTGGAAGTCTCAATGA
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CATTCCTTGTGCTCTTGGTGGTGTCCTCAACAAGGAGAATGCTGGAGATGTGAAGGCAAA
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GAAAGGAGTGATTATACTACCAGATATATACGCAAACGCAGGAGGAGTGACGGTGAGTTA
CTTTGAGTGGGTGCAGAACATTCAAGGGTTCATGTGGGAAGAGGAAAAAGTGAACCTGGA
GCTGCAAAAGTACATGACTCGAGCCTTTCACAACATCAAGACAATGTGCCATACTCATTC
CTGCAACCTCCGTATGGGAGCTTTCACCCTTGGAGTTAGCCGTGTCGCTCGAGCCACCCA
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CTCTGTTTTTCCTCTGTTTTTGTGTGTTTCATTGTTACTCAAAATCATTCAAATGAATTG
AATAACCAACAG

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TGCTGAGACACAA*GAGGCAACTGGAAGTCTCAATGAGTTCAGCGGTGGGGACGCTATGA
ACTCGGAGGAACTGTTGCTCCATGAGTGTGA*GTTCTCATTCCTTGTGCTCTTGGTGGTG
TCCTCAACAAGGAGAATGCTGGAGATGTGAAGGCAAAGTTCATAGTAGAGGCAGCTAACC
ATCCAACCGATCCTGATGCTGATGAGATTCTATCGAAGAAAGGAGTGATAATACTACCAG
ATATATACGCAAACGCAGGGGGAGTGACGGTGAGTTACTTTGAGTGGGTGCAGAACATTC
AAGGGTTCATGTGGGAAGAGGAGAAAGTGAACCTGGAGCTGCAAAAGTACATGACTCGAG
CCTTTCACAACATCAAGACAATGTGCCATACTCATTCCTGCAACCTCCGTATGGGAGCTT
TCACCCTTGGAGTTAGCCGTGTCGCTCGAGCCACTCAGTTGCGTGGTTGGGAAGCTTAGT
CTTTTTGAAAATTTTCCCCATATACTCTGTTTTTTTCCTCTGTTTTTCCTCTGTTTTTGT
GTGTTTCATTGTTACTCAAAATCATTCAAATGAATTGAATAACCAACAGAATAAAATAAA
AGATATTATTGATTTTTCAGAAAAAAGTTGTAATATTTCCACATCTTTATTATGAACTGA
GAATTACAAACC

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

CO CL2268Contig1 709 2 2 U
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GACGAGAACGATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCACGCCCTCGCCGCTGGTAAGAAGGTC
ATCCTCTTCGGTGTCCCTGGTGCTTTCACCCCCACCTGCAGTATGAAGCATGTGCCTGGA
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TTTAATTTGCTTATTTAATAATAAACTATTGGTTTTTGTTGTTGTCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DS08TF U 1
AF RS1DS08JQ C 49
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BS 639 709 RS1DS08JQ

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ACGGACAAGGGCCTTGGTGTTAGGTCAAGGAGATTTGCTCTGTTGCTCGATAACCTCAAG
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CTCAAGGCTCTCTAAGAAACTATATCATCTGTGTGTATGTGGAACCCGCTGCATGTGCTA
GTGAAGAGTGTATCTCTGGCCTTATTTCTGACAATGAA

QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1DS08JQ 661 0 0
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ATCTCCTTCTTCGACGAGAACGATCAGCTCCAGACTGTCTCTGTTCACGCCCTCGCCGCT
GGTAAGAAGGTCATCCTCTTCGGTGTCCCTGGTGCTTTCACCCCCACCTGCAGTATGAAG
CATGTGCCTGGATTCATTGAGAAAGCAGAGGAGCTCAAGTCAAAGGGTGTTGACGAGATC
ATTTGCTTTAGTGTGAATGGTGCGTTTGTCATGAAGGCATGGGGGAAGACATACCCGGAA
AACAAGCATGTCAAGTTTGTGGCAGACGGTTCAGGAGAATACACGAAGCTTCTTGGACTC
GAGCTTGACCTCACGGACAAGGGCCTTGGTGTTAGGTCAAGGAGATTTGCTCTGTTGCTC
GATAACCTCAAGGTCACTGTTGCCAACGTTGAATCTGGCGGCGAGTTCACTGTTTCCAGC
GCCGATGATATCCTCAAGGCTCTCTAAGAAACTATATCATCTGTGTGTATGTGGAACCCG
CTGCATGTGCTAGTGAAGAGTGTATCTCTGGCCTTATTTCTGACAATGAATTAGGCATAA
TAATAAAGCGGTTTTAATTTGCTTATTTAATAATAAACTATTGGTTTTTGTTGTTGTCAC
T

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 4

CO CL2269Contig1 628 4 3 U
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GATGCTGTGGCGAAGGCCTTTGTCGAACACTACTACTCAACCTTCGACACAAACCGTGCC
GGTCTAGCCGGTCTCTACCAGGAAGCTTCCATGCTCACCTTCGAGGGTCAGAAGATCCAA
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TATCCCGTTTGTCTTCTTTTTTTT*CTTTATTCATATAATATGATTTGTCTTGGAAACAG
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GCTTTCATCAGACAATTTGAAATAGTTT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CQ21TF U 1
AF RS1BA89JQ C 1
AF RS1BA89TF U 1
AF RS1FI69TF U 1
BS 1 134 RS1CQ21TF
BS 135 591 RS1BA89TF
BS 592 628 RS1FI69TF

RD RS1CQ21TF 134 0 0
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GGTCTAGCCGGTCT

QA 1 134 1 134
DS 

RD RS1BA89JQ 591 0 0
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GATGCTGTGGCGAAGGCCTTTGTCGAACACTACTACTCAACCTTCGACACAAACCGTGCC
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AAGAAAACTCTTTGTCTGTTGGAGTATTTGCGTTGCTCATTTGTTATTTCT

QA 1 591 1 591
DS 

RD RS1BA89TF 591 0 0
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TATCCCGTTTGTCTTCTTTTTTTT*CTTTATTCATATAATATGATTTGTCTTGGAAACAG
AAGAAAACTCTTTGTCTGTTGGAGTATTTGCGTTGCTCATTTGTTATTTCT

QA 1 591 1 591
DS 

RD RS1FI69TF 628 0 0
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QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 4

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TTCCTTATTGATTACTTCATCTATATAATTATGAGTACTACATATAAGCT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1AT26JQ C 1
AF RS1C078JQ C 1
AF RS1AT26TF U 1
AF RS1C078TF U 1
BS 1 590 RS1AT26TF

RD RS1AT26JQ 590 0 0
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QA 1 590 1 590
DS 

RD RS1C078JQ 590 0 0
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QA 1 590 1 590
DS 

RD RS1AT26TF 590 0 0
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QA 1 590 1 590
DS 

RD RS1C078TF 590 0 0
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CCCGCTTCTGGAACCTCTCTGATCGTCCCGTGGAGCTTCAGATTCGAGTCGGGTCGATCC
TTAAACGCGTCCACACTCTCAAACCGGGACGTTCCAAAAGCTCAGACACAGTAACCTCCA
CAGAGCCTACGTTCCTGACCAGGAAGGACGTCGATGGTTGTACTACGATGACACGTGTTT
GCCGTACGTATGGGTTCACGAGACGGGTACAGACTTGTCGAAGATGGTGAAGCAACAGTA
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TTCCTTATTGATTACTTCATCTATATAATTATGAGTACTACATATAAGCT

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 4

CO CL2271Contig1 963 4 7 U
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ACTCAATTCCTAGGTCTGGCACATCACTCGGCTACTTGGCTTACTTCGGTTTGCACAACC
TTTCTCCTTAGGCGCATGTCTGAGCAACACAAGGCGAGGGTTTCGCTCGTTATAGGACTT
AACCAAACATCTCACGACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTATATGAAAGTCAGT
ACCATCCCGTTAAGGATAGGGTTTCTCGTTCATATGTCAAGGGCTGGTAAGGTTCTGCGC
GTAGTATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCAGGCCCCCGTCAATTCCTTTGA
GTTTCGGTCTTGCGACCGTACTCCCCAGGCGGAGTGTTTAACGCGTTAGCTGAGCCCCAG
ATCAGAATAGACCAAGGGCGAACACTCATCGTTTACGGCATGGACTACCAGGGTATCTAA
TCCCGTTAGCTCCCCATGCTTTCGCACACCAGCGTCGGTAGAGACCCAGAGAGCTGCCTT
CGCTTTTGGCGTTCCTTCGTAGATCCGTAGATTTCACCCCTCCACACGAAATTCCACTCT
CCTCTGTCTCACTCAAGTTCAGTGGTTTCGAAAGCATTCCGCCACTTTTTGACGACTTTC
ACTTTCAACCCGATGAACCGCCTACGTGCCCTTTACGCCTAGTCATTCCGAAGAACACTT
GCCCCCCCGTTTTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGGGCTTCTTCCTCGAGTCA
TGTCATGATCGCGCACTCGACGAAAGAGCTTTACGAGCGGAATTGCCCTTCTTCACTCAC
GCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 

AF RS1FP74JQ U 1
AF RS1FP74TF C 1
AF RS1DM55JQ U 34
AF RS1DM55TF C 278
BS 1 346 RS1FP74JQ
BS 347 347 RS1DM55JQ
BS 348 422 RS1FP74JQ
BS 423 423 RS1DM55JQ
BS 424 458 RS1FP74JQ
BS 459 533 RS1DM55JQ
BS 534 963 RS1DM55TF

RD RS1FP74JQ 458 0 0
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TCACCTGAATGCCGAGTCTTTCTCCGCCGACTAGTTAGGGCTTGGAAAGGCGCCGGAGGA
ACCCAGCTTCTCCCCTAAAGGAGGAACCCCTTGTTACTGAGAGCAGAGCTAGTTGCTGTC
ACTCAATTCCTAGGTCTGGCACATCACTCGGCTACTTGGCTTACTTCGGTTTGCACAACC
TTTCTCCTTAGGCGCATGTCTGAGCAACACAAGGCGAGGGTTTCGCTCGTTATAGGACTT
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ACCATCCCGTTAAGGATAGGGTTTCTCGTTCATATGTCAAGGGCTGGTAAGGTTCTGCGC
GTTGTATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGC

QA 1 458 1 458
DS 

RD RS1FP74TF 458 0 0
CGGAGCGGTTTTGTCAGGGCGTACTAAACCCACTTCCTTCGTCCCACACCACCGTTCGGC
TCACCTGAATGCCGAGTCTTTCTCCGCCGACTAGTTAGGGCTTGGAAAGGCGCCGGAGGA
ACCCAGCTTCTCCCCTAAAGGAGGAACCCCTTGTTACTGAGAGCAGAGCTAGTTGCTGTC
ACTCAATTCCTAGGTCTGGCACATCACTCGGCTACTTGGCTTACTTCGGTTTGCACAACC
TTTCTCCTTAGGCGCATGTCTGAGCAACACAAGGCGAGGGTTTCGCTCGTTATAGGACTT
AACCAAACATCTCACGACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTGTATGAAAGTCAGT
ACCATCCCGTTAAGGATAGGGTTTCTCGTTCATATGTCAAGGGCTGGTAAGGTTCTGCGC
GTTGTATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGC

QA 1 458 1 458
DS 

RD RS1DM55JQ 500 0 0
TTCCTTCGTCCCACACCACCGTTCGGCTCACCTGAATGCCGAGTCTTTCTCCGCCGACTA
GTTAGGGCTTGGAAAGGCGCCGGAGGAACCCAGCTTCTCCCCTAAAGGAGGAACCCCTTG
TTACTGAGAGCAGAGCTAGTTGCTGTCACTCAATTCCTAGGTCTGGCACATCACTCGGCT
ACTTGGCTTACTTCGGTTTGCACAACCTTTCTCCTTAGGCGCATGTCTGAACAACACAAG
GCGAGGGTTTCGCTCGTTATAGGACTTAACCAAACATCTCACGACACGAGCTGACGACAG
CCATGCAGCACCTATATGAAAGTCAGTACCATCCCGTTAAGGATAGGGTTTCTCGTTCAT
ATGTCAAGGGCTGGTAAGGTTCTGCGCGTAGTATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCT
TGTGCAGGCCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCGGTCTTGCGACCGTACTCCCCAGGCGGA
GTGTTTAACGCGTTAGCTGA

QA 1 500 1 500
DS 

RD RS1DM55TF 686 0 0
CGAGGTTCGCTCG
TATAGGACTTAACCAAACATCTCACGACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTATAT
GAAAGTCAGTACCATCCCGTTAAGGATAGGGTTTCTCGTTCATATGTCAAGGGCTGGTAA
GGTTCTGCGCGTAGTATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCAGGCCCCCGTCA
ATTCCTTTGAGTTTCGGTCTTGCGACCGTACTCCCCAGGCGGAGTGTTTAACGCGTTAGC
TGAGCCCCAGATCAGAATAGACCAAGGGCGAACACTCATCGTTTACGGCATGGACTACCA
GGGTATCTAATCCCGTTAGCTCCCCATGCTTTCGCACACCAGCGTCGGTAGAGACCCAGA
GAGCTGCCTTCGCTTTTGGCGTTCCTTCGTAGATCCGTAGATTTCACCCCTCCACACGAA
ATTCCACTCTCCTCTGTCTCACTCAAGTTCAGTGGTTTCGAAAGCATTCCGCCACTTTTT
GACGACTTTCACTTTCAACCCGATGAACCGCCTACGTGCCCTTTACGCCTAGTCATTCCG
AAGAACACTTGCCCCCCCGTTTTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGGGCTTCTT
CCTCGAGTCATGTCATGATCGCGCACTCGACGAAAGAGCTTTACGAGCGGAATTGCCCTT
CTTCACTCACGCC

QA 14 686 14 686
DS 



AS 1 2

CO CL2272Contig1 1069 2 2 U
GAGAAAGAGAGACAAAAATGGCGACGGTACCTCTGTTCACCAAGTTTCCATGCAAAACTC
TATCTCCAAGCTCCTCCAACTCTAAACTCCAATCAAAAGCTCCGACTCTAGTGCCCGTAA
ACCCAATCAACCGGCGGTCGGAGGTTAGAACCACTGTCCATCGGCCAGATTTCAAGGTCC
GAGTTAGCGACGTTAACGACGAGTGGGGTCCTGATGCATCGGAGAGAGGCTCTAACGTAT
TGGTGGCCGAGAAAGTAGCAGAAGAAGCGATTGAATCCGTGGAGGAGACGGAACGGCTGA
AGAGATCGCTAGCGGATACTTTGTATGGAACAGATCGAGGTCTTAGCGCATCGAACGAGA
CAAGAGCCGAGATCAGTGAGATGATCACGCAGCTCGAGTCCAACAACCCTAATCCAGCTC
CCAACGAAGCTCTGTTTCTCCTCAGCGGCAAATGGATTCTGGCTTACACATCGTTCGTTG
GTCTGTTCCCGTTGCTCTCACGTAGAATCTCACCGCTGGTCAAAGTGGACGAGATCTCAC
AAACCATTGACTCCGACAGCTTCACTGTACAAAACTCTGTCCGGTTCGCTGGTCCCCTTG
CCACGACATCGTTTAGCACCAACGCTAAGTTCGAAGTCCAGAGTCCTAAACGCGTCCAGA
TCAAGTTTGAGCAAGGTGTTATCGGGACTCCTCAGCTAACGGATTCGATAGAGATCCCTG
AGTTCGTGGAGGTTCTTGGTCAGAAAATCGATCTCAACCCCATTAGAGGATTACTCACGT
CTGTCCAGGACACGGCTTCTTCAGTGGCTAGAACCATTTCAAGCCAACCACCGTTGAAAT
TCTCTTTGCCTGCAGACAGAGCGCAGTCGTGGCTCCTCACGACTTATCTCGACAAAGACC
TTCGGATCTCAAGAGGCGATGGTGGAAGCATTTTTGTGCTTATCAAAGAAGGCAGCTCTC
TCTTAAACCCTTAAAAAACATTGTAAAGTAAAATCTATATAGAACCATGTCTGTATTTAA
TAGTCTTGTAAGTGTTATTGTTCGAGTTTATGATGGTTGTTGTGTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GB85TF U 1
AF RS1GB85JQ C 370
BS 1 580 RS1GB85TF
BS 581 1069 RS1GB85JQ

RD RS1GB85TF 580 0 0
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TGGTGGCCGAGAAAGTAGCAGAAGAAGCGATTGAATCCGTGGAGGAGACGGAACGGCTGA
AGAGATCGCTAGCGGATACTTTGTATGGAACAGATCGAGGTCTTAGCGCATCGAACGAGA
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GTCTGTTCCCGTTGCTCTCACGTAGAATCTCACCGCTGGTCAAAGTGGACGAGATCTCAC
AAACCATTGACTCCGACAGCTTCACTGTACAAAACTCTGT

QA 1 580 1 580
DS 

RD RS1GB85JQ 700 0 0
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CTCTGTTTCTCCTCAGCGGCAAATGGATTCTGGCTTACACATCGTTCGTTGGTCTGTTCC
CGTTGCTCTCACGTAGAATCTCACCGCTGGTCAAAGTGGACGAGATCTCACAAACCATTG
ACTCCGACAGCTTCACTGTACAAAACTCTGTCCGGTTCGCTGGTCCCCTTGCCACGACAT
CGTTTAGCACCAACGCTAAGTTCGAAGTCCAGAGTCCTAAACGCGTCCAGATCAAGTTTG
AGCAAGGTGTTATCGGGACTCCTCAGCTAACGGATTCGATAGAGATCCCTGAGTTCGTGG
AGGTTCTTGGTCAGAAAATCGATCTCAACCCCATTAGAGGATTACTCACGTCTGTCCAGG
ACACGGCTTCTTCAGTGGCTAGAACCATTTCAAGCCAACCACCGTTGAAATTCTCTTTGC
CTGCAGACAGAGCGCAGTCGTGGCTCCTCACGACTTATCTCGACAAAGACCTTCGGATCT
CAAGAGGCGATGGTGGAAGCATTTTTGTGCTTATCAAAGAAGGCAGCTCTCTCTTAAACC
CTTAAAAAACATTGTAAAGTAAAATCTATATAGAACCATGTCTGTATTTAATAGTCTTGT
AAGTGTTATTGTTCGAGTTTATGATGGTTGTTGTGTTTGC

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 4

CO CL2273Contig1 887 4 14 U
GCTCAACAGCAGCAGCAACAGCCTCATACACAGCAGGGTTATTCTCAACCACAACAGCCT
CAAGCGCACCAGGGTTATTCTCAACCACAACAGCCTCAACCACAGCAGGGTTATTCTCAA
CCACAACAGCCTCAAGCACAGCGGGGTTATCCTCAAACGCAACAGCCTCATACACCGCAG
GGTTATCCTCAAGCGCAACAGCCTCATACACAGCAGGGTTATTCTCAACCGCAACAGCAA
CAGCCTCAAGCAGCAGGGTTATTCTCAAACGCAACAGCAACAGCCTCCAGCACAGCAGGG
TTATTCTCAACCGCAACAGCAACAGCCTCAAATACAGCAGGGCTATTCTCAACCGCAACC
GCAAGCTAGACCTCAGAGTCCATTTGAATATCCGCCCCCGCCATGGGCTTCAACATCAGC
GAACGCTTACTATACTCCACGGGCTAATACGACTGCGTCATACACAGAGACAAGTGCCGG
GAGATCACTGCAGCAGTCCAACTCATTCCCCGCTAGAACCGGAGATCCCCAGGCTACTTC
AGCTGCAAGCAATCCAGGTGTCTCTGGAGGACAGAAGCCGTTTGTTCCATCGTACAGATT
GTTCGAAGATCTGGATGTGTTTGGTAGCACAGAGGGGAAGCATAATAATAAGTCTACCAA
CAGTAATAATGCTTTTCAGGCGCAGCAGAGTATGATAGGAGGGAGGAAAATGATTTAACA
TAAAGTTTGCATGCTTCGTTATTTTCTCATTTGTGAATATAGTGGTGTACAACTGAATGT
ACATTTTCTCTTTCTCCCCGTTTTTTTTTTATCTTGTTTGATTTTAGGATTTGGTATGAC
ATACTGAAACGATTTGATGAGACTATGAGATTTTTTATTTGTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RS1ER38TF U 1
AF RS1ER38JQ C 209
AF RS1B640JQ C 296
AF RS1B640TF U 296
BS 1 396 RS1ER38TF
BS 397 397 RS1B640TF
BS 398 422 RS1ER38TF
BS 423 423 RS1B640TF
BS 424 434 RS1ER38TF
BS 435 435 RS1B640TF
BS 436 613 RS1ER38TF
BS 614 614 RS1B640TF
BS 615 655 RS1ER38TF
BS 656 656 RS1B640TF
BS 657 674 RS1ER38TF
BS 675 675 RS1ER38JQ
BS 676 882 RS1B640TF
BS 883 887 RS1B640JQ

RD RS1ER38TF 677 0 0
GCTCAACAGCAGCAGCAACAGCCTCATACACAGCAGGGTTATTCTCAACCACAACAGCCT
CAAGCGCACCAGGGTTATTCTCAACCACAACAGCCTCAACCACAGCAGGGTTATTCTCAA
CCACAACAGCCTCAAGCACAGCGGGGTTATCCTCAAACGCAACAGCCTCATACACCGCAG
GGTTATCCTCAAGCGCAACAGCCTCATACACAGCAGGGTTATTCTCAACCGCAACAGCAA
CAGCCTCAAGCAGCAGGGTTATTCTCAAACGCAACAGCAACAGCCTCCAGCACAGCAGGG
TTATTCTCAACCGCAACAGCAACAGCCTCAAATACAGCAGGGCTATTCTCAACCGCAACC
GCAAGCTAGACCTCAGAGTCCATTTGAATATCCGCCTCCGCCATGGGCTTCAACATCAGC
GAGCGCTTACTATA*TCCACGGGCTAATACGACTGCGTCATACACAGAGACAAGTGCCGG
GAGATCACTGCAGCAGTCCAACTCATTCCCCGCTAGAACCGGAGATCCCCAGGCTACTTC
AGCTGCAAGCAATCCAGGTGTCTCTGGAGGACAGAAGCCGTTTGTTCCATCGTACAGATT
GTTCGAAGATCTGTATGTGTTTGGTAGCACAGAGGGGAAGCATAATAATAAGTCTGCCAA
CAGTAATAATGCTT
CTC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1ER38JQ 679 0 0
CACAGCAGGGTTATTCTCAACCGCAACAGCAACAGCCTCAAGCAGCAGGGTTATTCTCAA
ACGCAACAGCAACAGCCTCCAGCACAGCAGGGTTATTCTCAACCGCAACAGCAACAGCCT
CAAATACAGCAGGGCTATTCTCAACCGCAACCGCAAGCTAGACCTCAGAGTCCATTTGAA
TATCCGCCTCCGCCATGGGCTTCAACATCAGCGAGCGCTTACTATA*TCCACGGGCTAAT
ACGACTGCGTCATACACAGAGACAAGTGCCGGGAGATCACTGCAGCAGTCCAACTCATTC
CCCGCTAGAACCGGAGATCCCCAGGCTACTTCAGCTGCAAGCAATCCAGGTGTCTCTGGA
GGACAGAAGCCGTTTGTTCCATCGTACAGATTGTTCGAAGATCTGTATGTGTTTGGTAGC
ACAGAGGGGAAGCATAATAATAAGTCTGCCAACAGTAATAATGCTTTTCAGGCGCAGCAG
AGTATGATAGGAGGGAGGAAAATGATTTAACATAAAGTTTGCATGCTTCGTTATTTTCTC
ATTTGTGAATATAGTGGTGTACAACTGAATGTACATTTTCTCTTTCTCCCCGTTTTT***
TTATCTTGTTTGATTTTAGGATTTGGTATGACATACTGAAACGATTTGATGAGACTATGA
GATTTTTTATTTGT
TTTCT

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1B640JQ 592 0 0
G
AGGGTTATTCTCAACCGCAACAGCAACAGCCTCAAATACAGCAGGGCTATTCTCAACCGC
AACCGCAAGCTAGACCTCAGAGTCCATTTGAATATCCGCCCCCGCCATGGGCTTCAACAT
CAGCGAACGCTTACTATACTCCACGGGCTAATACGACTGCGTCATACACAGAGACAAGTG
CCGGGAGATCACTGCAGCAGTCCAACTCATTCCCCGCTAGAACCGGAGATCCCCAGGCTA
CTTCAGCTGCAAGCAATCCAGGTGTCTCTGGAGGACAGAAGCCGTTTGTTCCATCGTACA
GATTGTTCGAAGATCTGGATGTGTTTGGTAGCACAGAGGGGAATCATAATAATAAGTCTA
CCAACAGTAATAATGCTTTTCAGGCGCAGCAGAGTATGATAGGAGGGAGGAAAATGATTT
AACATAAAGTTTGCATGCTTCGTTATTTTCTCATTTGTGAATATAGTGGTGTACAACTGA
ATGTACATTTTCTCTTTCTCCCCGTTTTTTTTTTATCTTGTTTGATTTTAGGATTTGGTA
TGACATACTGAAACGATTTGATGAGACTATGAGATTTTTTATTTGTCTTCC

QA 2 592 2 592
DS 

RD RS1B640TF 592 0 0
G
AGGGTTATTCTCAACCGCAACAGCAACAGCCTCAAATACAGCAGGGCTATTCTCAACCGC
AACCGCAAGCTAGACCTCAGAGTCCATTTGAATATCCGCCCCCGCCATGGGCTTCAACAT
CAGCGAACGCTTACTATACTCCACGGGCTAATACGACTGCGTCATACACAGAGACAAGTG
CCGGGAGATCACTGCAGCAGTCCAACTCATTCCCCGCTAGAACCGGAGATCCCCAGGCTA
CTTCAGCTGCAAGCAATCCAGGTGTCTCTGGAGGACAGAAGCCGTTTGTTCCATCGTACA
GATTGTTCGAAGATCTGGATGTGTTTGGTAGCACAGAGGGGAATCATAATAATAAGTCTA
CCAACAGTAATAATGCTTCTCAGGCGCAGCAGAGTATGATAGGAGGGAGGAAAATGATTT
AACATAAAGTTTGCATGCTTCGTTATTTTCTCATTTGTGAATATAGTGGTGTACAACTGA
ATGTACATTTTCTCTTTCTCCCCGTTTTTTTTTTATCTTGTTTGATTTTAGGATTTGGTA
TGACATACTGAAACGATTTGATGAGACTATGAGATTTTTTATTTGT
CTTCC

QA 2 587 2 587
DS 



AS 1 4

CO CL2274Contig1 776 4 7 U
GGAAGGGAGTTTTCACAATCTAACACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGCTGGATCATAAG
TGCACAAAATCAATGTTTCATTTTATATAAGAGACAAAACAACTCTCTAATCTCAGTACG
CATCAAATATGTTTTACCATGAAATCTCCAGAGAGTTCAGAGGAGAGAACTTCAATAAGA
TATTTGCCGCAAATCTCGTTTAGCTTCTCCTTCTTTGGCTCTCAACGTTTTTCCTAAAAC
GATTACAATCGCGTTCTCATCTCTTCCCTGTCCTACAACAACGAAAACACAATCCCAGTT
TCATGAATAAAAAACCAGAAATAGTTTTTTTATAGTACCACAAAGCTAATTACAGATTCG
AAGAAGGTGGAGGAAGAAGAATTAAATATAACGTAGTAGAGCGAGAAGGTGGATTGTAGA
AATTAATGGAGATATGTTAGAAGTTGGTCTCCAACAGGCAGTGGAAGTTACGGTCTGGGA
GAAGACAAAGATAATGATCGTCACATATTAGAGTTGTAAGGCTAAGGAGGCCCAAATAAA
AGTAAGCAAGCGGTATATAAGAAGCCCACGAAGAAACACGCAAAGGTTAGTTGCCACGTG
TCTAAAATCCCCCAAAGGAGAAAAAAAAAAAGGCAACTTTATTAGTATAGATCCATCAAT
ATATACTAAGTATTTTCCTGCACAATATGGAGAAAAATTTGTTACTTTTTTAGATTTTAT
TATTTTCTTACAATAATTGATTTTACATTTTTATTTAATTGTATTTATATTTAGTG


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F025TF U 1
AF RS1AO60TFB U 3
AF RS1AO60JQ C 264
AF RS1F025JQ C 264
BS 1 530 RS1F025TF
BS 531 531 RS1AO60TFB
BS 532 593 RS1F025TF
BS 594 594 RS1AO60TFB
BS 595 608 RS1F025TF
BS 609 755 RS1AO60TFB
BS 756 776 RS1F025JQ

RD RS1F025TF 608 0 0
GGAAGGGAGTTTTCACAATCTAACACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGCTGGATCATAAG
TGCACAAAATCAATGTTTCATTTTATATAAGAGACAAAACAACTCTCTAATCTCAGTACG
CATCAAATATGTTTTACCATGAAATCTCCAGAGAGTTCAGAGGAGAGAACTTCAATAAGA
TATTTGCCGCAAATCTCGTTTAGCTTCTCCTTCTTTGGCTCTCAACGTTTTTCCTAAAAC
GATTACAATCGCGTTCTCATCTCTTCCCTGTCCTACAACAACGAAAACACAATCCCAGTT
TCATGAATAAAAAACCAGAAATAGTTTTTTTATAGTACCACAAAGCTAATTACAGATTCG
AAGAAGGTGGAGGAAGAAGAATTAAATATAACGTAGTAGAGCGAGAAGGTGGATTGTAGA
AATTAATGGAGATATGTTAGAAGTTGGTCTCCAACAGGCAGTGGAAGTTACGGTCTGGGA
GAAGACAAAGATAATGATCGTCACATATTAGAGTTGTAAGGCTAAGGAGGTCCAAATAAA
AGTAAGCAAGCGGTATATAAGAAGCCCACGAAGAAACACGCAAAGGTTAGTTGTCACGTG
TCTAAAAT

QA 1 608 1 608
DS 

RD RS1AO60TFB 753 0 0
G
AGGGAGTTTTCACAATCTAACACTCTCTCTCTCTCTCTCT**GTGCTGGATCATAAGTGC
ACAAAATCAATGTTTCATTTTATATAAGAGACAAAACAACTCTCTAATCTCAGTACGCAT
CAAATATGTTTTACCATGAAATCTCCAGAGAGTTCAGAGGAGAGAACTTCAATAAGATAT
TTGCCGCAAATCTCGTTTAGCTTCTCCTTCTTTGGCTCTCAACGTTTTTCCTAAAACGAT
TACAATCGCGTTCTCATCTCTTCCCTGTCCTACAACAACGAAAACACAATCCCAGTTTCA
TGAATAAAAAACCAGAAATAGTTTTTTTATAGTACCACAAAGCTAATTACAGATTCGAAG
AAGGTGGAGGAAGAAGAATTAAATATAACGTAGTAGAGCGAGAAGGTGGATTGTAGAAAT
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AAAATCCCCCAAAGGAGAAAAAAAAAAAGGCAACTTTATTAGTATAGATCCATCAATATA
TACTAAGTATTTTCCTGCACAATATGGAGAAAAATTTGTTACTTTTTTAGATTTTATTAT
TTTCTTACAATAATTGATTTTACATTTTTATT

QA 2 753 2 753
DS 

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GTTTTTTTATAGTACCACAAAGCTAATTACAGATTCGAAGAAGGTGGAGGAAGAAGAATT
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AAAAAAAAGGCAACTTTATTAGTATAGATCCATCAATATATACTAAGTATTTTCCTGCAC
AATATGGAGAAAAATTTGTTACTTTTTTAGATTTTATTATTTTCTTACAATAATTGATTT
TACATTTTTATT
T

QA 1 492 1 492
DS 

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TTCCCTGTCCTACAACAACGAAAACACAATCCCAGTTTCATGAATAAAAAACCAGAAATA
GTTTTTTTATAGTACCACAAAGCTAATTACAGATTCGAAGAAGGTGGAGGAAGAAGAATT
AAATATAACGTAGTAGAGCGAGAAGGTGGATTGTAGAAATTAATGGAGATATGTTAGAAG
TTGGTCTCCAACAGGCAGTGGAAGTTACGGTTTGGGAGAAGACAAAGATAATGATCGTCA
CATATTAGAGTTGTAAGGCTAAGGAGGTCCAAATAAAAGTAAGCAAGCGGTATATAAGAA
GCCCACGAAGAAACACGCAAAGGTTAGTTGCCACGTGTCTAAAATCCCCCAAAGGAGAAA
AAAAAAA*GGCAACTTTATTAGTATAGATCCATCAATATATACTAAGTATTTTCCTGCAC
AATATGGAGAAAAATTTGTTACTTTTTTAGATTTTATTATTTTCTTACAATAATTGATTT
TACATTTTTATTTAATTGTATTTATATTTAGTG

QA 1 513 1 513
DS 



AS 1 3

CO CL2275Contig1 970 3 7 U
CAAAACAAAGGGATATATTCTTTCCACAAAACGAATCCCAAAAACAACCCCAGAATCTCA
TATAGACTCAGCAAGTAAACATGATGACACTGACAAAACATGTATCAATTTCAAGAAAAA
AAAAGAAAAAGAAAGCCAAGTCTCTGATGGATTTAAAACATATGAGGCTGTAAATTAAGT
AGCCTTGTGTGTTTGTTGTACAAGGCATATGCATCTTACGCTGAGGGGACAGTCTCCTCG
GTTTTCTTTTCTTCAACAGCTTTCTCTACCTTCTCCACTGGTTTCTCTTCCTTCTTCTCC
TCCTCCTCCGTGTTCTTCTCTTCCACTGTTAACTTCTCAAGAAGACCAGCAGCCTCAGAA
GCGTCTTTACTCTCCTCTTTCTCTTCTTCAGATTCAGCAACTTCCTTGAACTTTTGCATG
AACGCTTTGCAGTTCTCAACATTGGCAAAGCGGATACAGAAAAGCTCATCCTTCAACTCC
CCATCGGAGAAATCACGAGCGTGCCACACACAAGACTTATCATTCCCAGCGTGCTCCTGA
ACACTCATCCCCGACGTAACGAGATGATTAGCACAGATCTTGAGAGTTTTGGATTGCCTC
ATAACGAGACGAATCTTCCCAGTCTCCTTGTGCTTCAAGAACTTGACAGTCCCAGCTCAT
CTCTCCTTCCACTGACTCCCATCTTTATCGAACCTATACAGCTTCGATTTCAGATCGAGG
ACGGTATCTTCGTTTTCTTCACCGGTGGTGACGGCGACTTCTTCGAGTTTGATGATGGGA
GCGACCTGAGCACCAGTGTCTTCGTCCTCGTTGGCTCCGGACTCTTCTTCGTCTCTGTGC
TCACGCTCTGGCTCGTTGCTGATGCTCGCCATCTTATCAGATCAGATCAGATCAAAAGCT
TTGGTGGTTGTTGTTGTTGTTGGATGCACAGTGCGTAACAGCGAGATTGGAGGAGAGAAT
GTCTGGGGAC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GL54JQ U 1
AF RS1CP72JQ U 6
AF RS1GL54TF C 310
BS 1 357 RS1GL54JQ
BS 358 358 RS1CP72JQ
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RD RS1GL54JQ 641 0 0
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GTTTTCTTTTCTTCAACAGCTTTCTCTACCTTCTCCACTGGTTTCTCTTCCTTCTTCTCC
TCCTCCTCCGTGTTCTTCTCTTCCACTGTTAACTTCTCAAGAAGACCAGCAGCCTCAAAA
GCGTCTTTACTCTCCTCTTTCTCTTCTTCAGATTCAGCAACTTCCTTGAACTTTTGCATG
AACGCTTTGCAGTTCTCAACATTGGCAAAGCGGATACAGAAAAGCTCATCCTTCAACTCC
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ACACTCATCCCCGACGTAACGAGATGATTAGCACAGATCTTGAGAGTTTTGGATTGCCTC
ATAACGAGACGAATCTTCCCAGTCTCCTTGTGCTTCAAGAA

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1CP72JQ 804 0 0
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AAA******GCCAAGTCTCTGATGGATTTAAAACATATGAGGCTGTAAATTAAGTAGCCT
TGTGTGTTTGTTGTGCAAGGCATATGCATCTTACGCTGAGGGGACAGTCTCCTCGGTTTT
CTTTTCTTCAACAGCTTTCTCTACCTTCTCCACTGGTTTCTCTTCCTTCTTCTCCTCCTC
CTCCGTGTTCTTCTCTTCCACTGTTAACTTCTCAAGAAGACCAGCAGCCTCAGAAGCGTC
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TTTGCAGTTCTCAACATTAGCAAAGCGGATACAGAAAAGCTCATCCTTCAACTCCCCATC
GGAGAAATCACGAGCGTGCCACACACAAGACTTGTCATTCCCAGCGTGTTCCTGAACACT
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CTTCCACTGACTCCCATCTTTATCGAACCTATACAGCTTCGATTTCAGATCGAGGATGGT
ATCTTCGTTTTCTTCACCGGTGGTGACGGCGACTTCTTCGAGTTTGATGATGGGAGCGAC
CTGAGCACCAGTGTCTTCGTCCTC

QA 1 804 1 804
DS 

RD RS1GL54TF 661 0 0
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CAGTTCTCAACATTGGCAAAGCGGATACAGAAAAGCTCATCCTTCAACTCCCCATCGGAG
AAATCACGAGCGTGCCACACACAAGACTTATCATTCCCAGCGTGCTCCTGAACACTCATC
CCCGACGTAACGAGATGATTAGCACAGATCTTGAGAGTTTTGGATTGCCTCATAACGAGA
CGAATCTTCCCAGTCTCCTTGTGCTTCAAGAACTTGACAGTCCCAGCTCCTCTCTCCTTC
TACTGACTCCCATCTTTATCGAACCTATACAGCTTCGATTTCAGATCGAGGACGGTATCT
TCGTTTTCTTCACCGGTGGTGACGGCGACTTCTTCGAGTTTGATGATGGGAGCGACCTGA
GCGCCGGTGTCTTCGTCCTCGTTGGCTCCGGACTCTTCTTCGTCTCTGTGCTCACGCTCT
GGCTCGTTGCTGATGCTCGCCATCTTATCAGATCAGATCAGATCAAAAGCTTTGGTGGTT
GTTGTTGTTGTTGGATGCACAGTGCGTAACAGCGAGATTGGAGGAGAGAATGTCTGGGGA
C

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 4

CO CL2276Contig1 955 4 6 U
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AACGAGACTCGAGACGCCCAAGAACACCACCACGCGGTTCTGTTGCAGACTCTAAAGAAG
AAGGAGAGATACGCAATGAAGAGGTGGTGAATGGGGCTCAGAAACAGATAGCTCCTGCTA
CTGCGACATCAGAAGAGGTGGAGCAGGCAACAGGGCACAGACATGAAGTGCCATTAGAGG
TAACTGATGTTTCTCTTGCTGTGGCGTAGATGAGGAAAAGAAGTTGGCAATGGCTGGGGG
GATTAATGGTCCTAGTGTAGAGCTAGCTAAAGAGGTGATGGAATTAGGGGAAAAGCAGGA
TGATGATGGTCTTTTGGTCTTTGATGATTCGGAACTTATTCTGGATGGGGTCGATACTCT
AATGGAAGATGATGACGAGTTCCAGGCTCTCACAGATACTGAAGTGGAGGAGATGGACAA
TAAAAATGAGGAGAAAGAAGAAATGAAGAAGGCGGGAGAACATGAACCTGTGGGTGACGA
TGAGGACAAAAAGAAGGGATCAAGAAAGGCTTTATTTAAGCCCACATCTTTGGCTGTAGG
GACTTCAAAGAAGCTGTTTGTGCAGGCGGCTTTATCACCAAGGAAAAAGGCTCAAGGTAA
GACAGGGAAGAAGCAGGGAGAAGTTGCAAGAAAGAAAGAGGAGAA*GGGACCATTAATCC
CGAAACCACCCTCTTCCAAACCTTGAAGTTTTTATGATTTTACATCCAGTGAAGAGAAAT
GATGTACTGGTCTCGGTGGGTTTGCTGTGTTGCAGTTTATTTTATGTTTTAATAAGCTCT
GTGAGCAATCTTTTATTTCTGGGTTTCAAGTTATATTGGCTGTGTATTAGCCTTCCTTTA
CTTGCTTGTAATAACCATGTATCATGGTATTGGAATAAAAGAGATGGATTGAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

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A

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AATGGAAGATGATGACGAGTTCCAGGCTCTCACAGATACTGAAGTGGAGGAGATGGACAA
TAAAAATGAGGAGAAAGAAGAAATGAAGAAGGCGGGAGAACATGAACCTGTGGGTGACGA
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GAAAAGAAGTTGGCAATGGCTGGGGGGATTAATGGTCCTAGTGTAGAGCTAGCTAAAGAG
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AAAGAGGAGAA*GGGACCATTAATCCCGAAACCACCCTCTTCCAAACCTTGAAGTTTTTA
TGATTTTACATCCAGTGAAGAGAAATGATGTACTGGTCTCGGTGGGTTTGCTGTGTTGCA
GTTTATTTTATGTTTTAATAAGCTCTGTGAGCAATCTTTTATTTCTGGGTTTCAAGTTAT
ATTGGCTGTGTATTAGCCTTCCTTTACTTGCTTGTAATAACCATGTATCATGGTATTGGA
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ATGGGGTCGATACTCTAATGGAAGATGATGACGAGTTCCAGGCTCTCACAGATACTGAAG
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CATCTTTGGCTGTAGGGACTTCAAAGAAGCTGTTTGTGCAGGCGGCTTTATCACCAAGGA
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A*GGGACCATTAATCCCGAAACCACCCTCTTCCAAACCTTGAAGTTTTTATGATTTTACA
TCCAGTGAAGAGAAATGATGTACTGGTCTCGGTGGGTTTGCTGTGTTGCAGTTTATTTTA
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TATTAGCCTTCCTTTACTTGCTTGTAATAACCATGTATCATGGTATTGGAATAAAAGAGA
TGGATTGAATT

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DS 



AS 1 4

CO CL2277Contig1 1296 4 18 U
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TCCCTCTCTTCTCATATTGTTATCATTTGTAGCCATCTCTCATACCCAGCCTCTTCTGGC
CGCTTCTTTTCCGATTTCTCCTAACTTTGCAGCAGTTTTCAACTTTGGAGACTCTAACTC
CGACACCGGAGAGATCACCTCTGGTCTTGGTTTTCGTTTCCTACCTCCTAATGGAGAATC
CTTCGTCTTTAAACCTCCATCTACCGGAAGAGCCTGTGATGGACGTCTCATCGTCGATAT
TCTAATGGAAGCAATTGGTCGACCATACTTGAGACCTTATTTGGATTCAGTTAGCACACA
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TGCATCCTATAGCCCTTTTAGTTTTGCTGTTCAAGTCTCTCAATTCGTCACCTTCAAATA
CAAAGTTCTTCAATTAATACAACAAGATAAAACTCTCGAAAACTTACCCTCGGAAGATCA
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CGGCAAGACAGTAGATCAAGCTGCTGCTGTTATTCCCACAATCATAAATACATTTAAAGA
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ACCAATTGGGTGTTTAGCTCAGATGGTGTCATTATTTGGGAAAGAGAAATCACACGTTGA
TAAGTTTGGTTGTGCAATTGGCCATAACGAAGCTGCTAAGCTTTTCAATTCACAGCTTCA
GGGTCTTGTCACAAATTTCACTCAACAATATACTGATGCTAATTTCACATACGTAGATAT
CTTCTCCATCAAATCCGACCTTATCCAGAATCATTCGACGTATGGTTTTGATCAGTCCAT
AATGGCATGTTGTGGAACCGGAGGACCGCCACTGAACTACAATGATCAGGTTGGCTGCGG
TTGGACAGGGACATCTCCAAATGGTACGACAATAACAACCAAATCATGTAATGCTAGTTC
CAAATATGTTAACTGGGATGGAATTCACTATACCGAAGCTGCAAACCGGTTCGTTTCACA
GAAAATTCTCTCCGGTAAATATTCCCAGACGGCGTCGTCTTGAAAATCAGAACCCCTAGA
GGGGTCTTTTGTTTGTTTCAAGTGTGTGATAAAACAGAGCATTCCTTTATAACTCTCCGT
TCACAATATAATAAAATGCTCTGATTCAATAATATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D261TF U 14
AF RS1CL59TF U 73
AF RS1DN74TF U 1
AF RS1DN74JQ C 533
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RD RS1D261TF 278 0 0
GG
GACCCAAAAAAAGAGAAAAATATACTAAGCAATGGAAACCGTTTTTCCCTCTCTTCTCAT
ATTGTTATCATTTGTAGCCATCTCTCATACCCAGCCTCTTCTGGCCGCTTCTTTTCCGAT
TTCTCCTAACTTTGCAGCAGTTTTCAACTTTGGAGACTCTAACTCCGACACCGGAGAGTT
CACCTCTGGTCTTGGTTTTCGTTTCCTACCTCCTAATGGAGAATCCTTCGTCTTTAAACC
TCCATCTACCGGAAGAGCCTGTGATGGCCGTCTCAT

QA 3 278 3 278
DS 

RD RS1CL59TF 326 0 0
CATATTGTTATCATTTGTAGCCATCTCTCATACCCAGCCTCTTCTGGCCGCTTCTTTTCC
GATTTCTCCTAACTTTGCAGCAGTTTTCAACTTTGGAGACTCTAACTCCGACACCGGAGA
GATCACCTCTGGTCTTGGTTTTCGTTTCCTACCTCCTAATGGAGAATCCTTCGTCTTTAA
ACCTCCATCTACCGGAAGAGCCTGTGATGGACGTCTCATCGTCGATATTCTAATGGAAGC
AATTGGTCGACCATACTTGAGACCTTATTTGGATTCAGTTAGCACACAAAGCTATCTGAG
AGGCTGTAACTTTGCTGCTGCTGGAT

QA 1 326 1 326
DS 

RD RS1DN74TF 798 0 0
GGATACTAAGCATTTGACCCAAAAAAAGAGAAAAATATACTAAGCAATGGAAACCGTTTT
TCCCTCTCTTCTCATATTGTTATCATTTGTAGCCATCTCTCATACCCAGCCTCTTCTGGC
CGCTTCTTTTCCGATTTCTCCTAACTTTGCAGCAGTTTTCAACTTTGGAGGCTCTAACTC
CGACACCGGAGAGATCACCTCTGGTCTTGGTTTTCGTTTCCTACCTCCTAATGGAGAATC
CTCCGTCTTTAAACCTCCATCTACCGGAAGAGCCTGTGATGGACGTCTCATCGTCGATAT
TCTAATGGAAGTAATTGGTCGACCATACTTGAGACCTTATTTGGATTCAGTTAGCACACA
AAGCTATCTGAGAGGCTGTAACTTTGCTGCTGCTGGATCAACCATTCAGAAGGCAACTGC
TGCATCCTATAGCCCTTTTAGTTTTGCTGTTCAAGTCTCTCAATTCGTCACCTTCAAATA
CAAAGTTCTTCAATTAATACAACAAGATAAAACTCTCGAAAACTTACCCTCGGAAGATCA
TTTCAAAAATGGATTGTATATGTTTGATATCGGACAAAATGATATAGCCGGTGCAATGTA
CGGCAAGACAGTAGATCAAGCTGCTGCTGTTATTCCCACAATCATAAATACATTTAAAGA
TGGAATAAATAGACTATATTGGGATG*TGGCGCGAGAAACTTTTGGATACACAACACAG*
ACCAATTGGGTGTTTAGCTCAGATGGTGTCATTATTTGGGAAAGAGAA*TCACACGTTGA
TA*GTTTGGTTGTGCA
TT

QA 1 796 1 796
DS 

RD RS1DN74JQ 764 0 0
GAAGATCATTTCAAAAATGGATTGTATATGTTTGATATCGGACAAAATGATATAGCCGGT
GCAATGTACGGCAAGACAGTAGATCAAGCTGCTGCTGTTATTCCCACAATCATAAATACA
TTTAAAGATGGAATAAATAGACTATATTGGGAAGGTGGCGCGAGAAACTTTTGGATACAC
AACACAGGACCAATTGGGTGTTTAGCTCAGATGGTGTCATTATTTGGGAAAGAGAAATCA
CACGTTGATAAGTTTGGTTGTGCAATTGGCCATAACGAAGCTGCTAAGCTTTTCAATTCA
CAGCTTCAGGGTCTTGTCACAAATTTCACTCAACAATATACTGATGCTAATTTCACATAC
GTAGATATCTTCTCCATCAAATCCGACCTTATCCAGAATCATTCGACGTATGGTTTTGAT
CAGTCCATAATGGCATGTTGTGGAACCGGAGGACCGCCACTGAACTACAATGATCAGGTT
GGCTGCGGTTGGACAGGGACATCTCCAAATGGTACGACAATAACAACCAAATCATGTAAT
GCTAGTTCCAAATATGTTAACTGGGATGGAATTCACTATACCGAAGCTGCAAACCGGTTC
GTTTCACAGAAAATTCTCTCCGGTAAATATTCCCAGACGGCGTCGTCTTGAAAATCAGAA
CCCCTAGAGGGGTCTTTTGTTTGTTTCAAGTGTGTGATAAAACAGAGCATTCCTTTATAA
CTCTCCGTTCACAATATAATAAAATGCTCTGATTCAATAATATT

QA 1 764 1 764
DS 



AS 2 4

CO CL2278Contig1 665 2 3 U
TTTTAAACACTAACATATTTTTCAATTATACGATCCTTAGAAAAATACTTTGTTATCAAA
CTCTCTAAAACAAGAGTTAACTTCAACCAAAACTAGATAAGATCTGTCACAAAAAAAGAA
CGGAGATAAATTGTACTGAAGAGCAAAGAGCAGCAGAAAACAAAACAACCAGAAACAAGA
AGAAGGTACGAGTATAGTAGCTCTTCTAGTCTTCTTCCTCTCCCTCGTTCTCAGCAATGT
TGAAGTACCTCAACTCATAGAGGTTACGGTCCTTGTTGGCCGCAATCACTCTAAGCCAAT
CCCTCACATTGTGCTTCTTCAAGCACTTCTTCGTCAAGTACTTGAGGTACCTCTTGGAGA
ATTGGCCATCAGAGGTGACAGTGATCTTGTTCTTCTCACGGGTAATCGTAACCGAATCAC
CGAGCGCACCAGCTTTGCCACCGACTTTGATCCTCTCCTGAAGGAACTTTTTAAGGGAAG
CAATCTCCATGATCTTGTCATCGACGGGCTTCGAGCAGTCAATGGAGAAGGACACTCCCT
TCTTCTTCCCCTTGGCAACTGCTGCACCTCCACGACTCATTTTTTTAAATCCTTTTCCTT
GAAGACGAGCGGCGTCTTTTAGCTCTTGGACGAGAGAGGGGGAGACGAGAAACAAATGTG
GCTCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1DA92JQ U 5
AF RS1DA92TF C 1
BS 1 4 RS1DA92TF
BS 5 548 RS1DA92JQ
BS 549 665 RS1DA92TF

RD RS1DA92JQ 544 0 0
AAACACTAACATATTTTTCAATTATACGATCCTTAGAAAAATACTTTGTTATCAAACTCT
CTAAAACAAGAGTTAACTTCAACCAAAACTAGATAAGATCTGTCACAAAAAAAGAACGGA
GATAAATTGTACTGAAGAGCAAAGAGCAGCAGAAAACAAAACAACCAGAAACAAGAAGAA
GGTACGAGTATAGTAGCTCTTCTAGTCTTCTTCCTCTCCCTCGTTCTCAGCAATGTTGAA
GTACCTCAACTCATAGAGGTTACGGTCCTTGTTGGCCGCAATCACTCTAAGCCAATCCCT
CACATTGTGCTTCTTCAAGCACTTCTTCGTCAAGTACTTGAGGTACCTCTTGGAGAATTG
GCCATCAGAGGTGACAGTGATCTTGTTCTTCTCACGGGTAATCGTAACCGAATCACCGAG
CGCACCAGCTTTGCCACCGACTTTGATCCTCTCCTGAAGGAACTTTTTAAGGGAAGCAAT
CTCCATGATCTTGTCATCGACGGGCTTCGAGCAGTCAATGGAGAAGGACACTCCCTTCTT
CTTC

QA 1 544 1 544
DS 

RD RS1DA92TF 665 0 0
TTTTAAACACTAACATATTTT*CAATTATACGATC*TTAGAAAAATACTTTGTTATCAAA
CTCTCTAAAACAAGAGTTAACTTCAACCAAAACTAGATAAGATCTGTCACAAAAAAAGAA
CGGAGATAAATTGTACTGAAGAGCAAAGAGCAGCAGAAAACAAAACAACCAGAAACAAGA
AGAAGGTACGAGTATAGTAGCTCTTCTAGTCTTCTTCCTCTCCCTCGTTCTCAGCAATGT
TGAAGTACCTCAACTCATAGAGGTTACGGTCCTTGTTGGCCGCAATCACTCTAAGCCAAT
CCCTCACATTGTGCTTCTTCAAGCACTTCTTCGTCAAGTACTTGAGGTACCTCTTGGAGA
ATTGGCCATCAGAGGTGACAGTGATCTTGTTCTTCTCACGGGTAATCGTAACCGAATCAC
CGAGCGCACCAGCTTTGCCACCGACTTTGATCCTCTCCTGAAGGAACTTTTTAAGGGAAG
CAATCTCCATGATCTTGTCATCGACGGGCTTCGAGCAGTCAATGGAGAAGGACACTCCCT
TCTTCTTCCCCTTGGCAACTGCTGCACCTCCACGACTCATTTTTTTAAATCCTTTTCCTT
GAAGACGAGCGGCGTCTTTTAGCTCTTGGACGAGAGAGGGGGAGACGAGAAACAAATGTG
GCTCC

QA 1 665 1 665
DS 



CO CL2278Contig2 632 2 2 U
GGAGCCACATTTGTTTCTCGTCTCCTCCTCCCTCGTCCAAGAGCTAAAAGACGCCGCTCG
TCTTCAAGGAAAAGGATTTAAAAAATGAGTCGTGGAGGTGCAGCAGTTGCCAAGGGGAAG
AAGAAGGGAGTGTCCTTCTCCATTGACTGCTCGAAGCCCGTCGATGACAAGATCATGGAG
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CTCGGTGATTCGGTTACGATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACCTCTGATGGC
CAATTCTCCAAGAGGTACCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAATGTG
AGGGATTGGCTTAGAGTGATTGCGGCCAACAAGGACCGTAACCTCTATGGGTTGAGGTAC
TTCAACATTGCTGAGAACGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAGCTACTATACTCGTACC
TTCTTGTTTCTGGTTGTTTTGTTTTCTGCTGCTCTTTGCTGTTCAGTACAATTTATCTCC
GTTCTCTTTTTTGTGACAGATCTTATCTAGTTTTGGTTGAAGTTAACTCTTGTTTAGAGA
GTTTGATAACAAAGTATTTTTCTAAGGATCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F985TF U 1
AF RS1F985JQ C 25
BS 1 626 RS1F985TF
BS 627 632 RS1F985JQ

RD RS1F985TF 632 0 0
GGAGCCACATTTGTTTCTCGTCTCCTCCTCCCTCGTCCAAGAGCTAAAAGACGCCGCTCG
TCTTCAAGGAAAAGGATTTAAAAAATGAGTCGTGGAGGTGCAGCAGTTGCCAAGGGGAAG
AAGAAGGGAGTGTCCTTCTCCATTGACTGCTCGAAGCCCGTCGATGACAAGATCATGGAG
ATTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCAGGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCTGGTGCG
CTCGGTGATTCGGTTACGATCACCCGTGAGAAGAACAAGATCACTGTCACCTCTGATGGC
CAATTCTCCAAGAGGTACCTCAAGTACTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAATGTG
AGGGATTGGCTTAGAGTGATTGCGGCCAACAAGGACCGTAACCTCTATGGGTTGAGGTAC
TTCAACATTGCTGAGAACGAGGGAGAGGAAGAAGACTAGAAGAGCTACTATACTCGTACC
TTCTTGTTTCTGGTTGTTTTGTTTTCTGCTGCTCTTTGCTGTTCAGTACAATTTATCTCC
GTTCTCTTTTTTGTGACAGATCTTATCTAGTTTTGGTTGAAGTTAACTCTTGTTTAGAGA
GTTTGATAACAAAGTATTTTTCTAAG
GATCGC

QA 1 626 1 626
DS 

RD RS1F985JQ 608 0 0
CT
CCTCCCTCGTCCAAGAGCTAAAAGACGCCGCTCGTCTTCAAGGAAAAGGATTTAAAAAAT
GAGTCGTGGAGGTGCAGCAGTTGCCAAGGGGAAGAAGAAGGGAGTGTCCTTCTCCATTGA
CTGCTCGAAGCCCGTCGATGACAAGATCATGGAGATTGCTTCCCTCGAGAAGTTCCTTCA
GGAGAGGATCAAAGTCGGTGGCAAAGCTGGTGCGCTCGGTGATTCGGTTACGATCACCCG
TGAGAAGAACAAGATCACTGTCACCTCTGATGGCCAATTTTCCAAGAGGTACCTCAAGTA
CTTGACGAAGAAGTACTTGAAGAAGCACAATGTGAGGGATTGGCTTAGAGTGATTGCGGC
CAACAAGGACCGTAACCTCTATGGGTTGAGGTACTTCAACATTGCTGAGAACGAGGGAGA
GGAAGAAGACTAGAAGAGCTACTATACTCGTACCTTCTTGTTTCTGGTTGTTTTGTTTTT
TGCTGCTCTTTGCTGTTCAGTACAATTTATCTCCGTTTTCTTTTTTGTGACAGATTTTAT
CTAGTTTTGGTTGAAGTTAACTCTTGTTTAGAGAGTTTGATAACAAAGTATTTTTTTAAG
GATCGC

QA 3 608 3 608
DS 



AS 1 4

CO CL2279Contig1 1015 4 5 U
GGGGACCGAAGAAGATTCATAAGAAGGAAGGACTCGGCGGGCTCGAGCTCTTGCACACCA
GTGATCCCAAGGCGGTGGAAGGCAAAGATGGAGGTAATCTCGATAACTTAGTGAAGAAGG
TTGAGATGAAAGGTCCTGAAATGTATATCTCTGAGGAAATTAGAACCGAGTTTAGAGAAT
CATTGCTTGCTAGAGTAAGAATGATGGGTGTGATCTATCTGAAAACGATGCCACCTAAAG
GCTCTGGTGAAGAGAAAGAGACGGAGTTCTCGTTCCGTGTTGAAGGTACTGCTGCAGTTA
AGAGATTCGCTATGCAGAGTTCTCGGATCAGTAGCTTAGGGAACGGTTTGTTTCACGTGA
GAACCGCTCCATCTGAAGAACCGATCCCTATCTTGAAGTATAGCTTGCAACCTAAGCTAA
CCCCGTTGCCTCTTAGAGTACGAATGGTGAAACGAGTTAGTGGGACATTACTCTCGCTGA
TGATACAATACGTCTCGAGCCCGGACCTACCTCAGCCTCTGAAAGACGTCGACTTTGTTC
TGAAACTCCCTGTTGACCCCACGTTGCTTAAGGTTTCTCCTAAGGCAATACTAAACAGAA
CCGATCGAGAACTGAAGTGGCAAGTCCCTGAGATTCCTCTCAGTGGAAGTCCCGGGAGGC
TAAGAGCGCGGATGCCTATAGACTCAGATAACAGCGAGGAAGAACCAGAGATCATCCGCT
ATGTGAAGTTCTCGGTTCAGGGAAAGACTTCTTTGTCTGGTATCAGTTTACGCCCAGCTG
CTGAGGGCAATACGGATTTTTATGAGGTTGATCACAGGTTCGAAACTGGAGTCTATATGT
GCAATTGATAAACGTTTCTCTCAAAGAGTGTTGAGTTTCATTTGTTTATAAATTTTTCTC
AAATGATTTGAGTTTGGCCGTTGTTGAAAGTTAATTCTGTTTTTTTTTTTCATGTAAGGT
TTTGTGTACTTGTGTATCTTGACATTTTCTCATTGTTATGTTATCTGTTTTTACC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1G461TF U 1
AF RS1GH90TF U 1
AF RS1G461JQ C 386
AF RS1GH90JQ C 522
BS 1 160 RS1G461TF
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GTGATCCCAAGGCGGTGGAAGGCAAAGATGGAGGTAATCTCGATAACTTAGTGAAGAAGG
TTGAGATGAAAGGTCCTGAAATGTATATCTCTGAGGAAAT

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DS 

RD RS1GH90TF 735 0 0
GGGGACCGAAGAAGATTCATAAGAAGGAAGGACTCGGCGGGCTCGAGCTCTTGCACACCA
GTGATCCCAAGGCGGTGGAAGGCAAAGATGGAGGTAATCTCGATAACTTAGTGAAGAAGG
TTGAGATGAAAGGTCCTGAAATGTATATCTCTGAGGAAATTAGAACCGAGTTTAGAGAAT
CATTGCTTGCTAGAGTAAGAATGATGGGTGTGATCTATCTGAAAACGATGCCACCTAAAG
GCTCTGGTGAAGAGAAAGAGACGGAGTTCTCGTTCCGTGTTGAAGGTACTGCTGCAGTTA
AGAGATTCGCTATGCAGAGTTCTCGGATCAGTAGCTTAGGGAACGGTTTGTTTCACGTGA
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TGATACAATACGTCTCGAGCCCGGACCTACCTCAGCCTCTGAAAGACGTCGACTTTGTTC
TGAAACTCCCTGTTGACCCCACGTTGCTTAAGGTTTCTCCTAAGGCAATACTAAACAGAA
CCGATCGAGAACTGAAGTGGCAAGTCCCTGAGATTCCTCTCAGTGGAAGTCCCGGGAGGC
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ATGTGAAGTTCTCGG

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DS 

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GGTGAAACGAGTTAGTGGGACATTACTCTCGCTGATGATACAATACGTCTCGAGCCCGGA
CCTACCTCAGCCTCTGAAAGACGTCGACTTTGTTCTGAAACTCCCTGTTGACCCCACGTT
GCTTAAGGTTTCTCCTAAGGCAATACTAAACAGAACCGATCGAGAACTGAAGTGGCAAGT
CCCTGAGATTCCTCTCAGTGGAAGTCCCGGGAGGCTAAGAGCGCGGATGCCTATAGACTC
AGATAACAGCGAGGAAGAACCAGAGATCATCCGCTATGTGAAGTTCTCGGTTCAGGGAAA
GACTTCTTTGTCTGGTATCAGTTTACGCCCAGCTGCTGAGGGCAATACGGATTTTTATGA
GGTTGATCACAGGTTCGAAACTGGAGTCTATATGTGCAATTGATAAACGTTTCTCTCAAA
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TTTCTCATTGTTATGTTATCTGTTTTTACC

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DS 

RD RS1GH90JQ 494 0 0
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AAGGCAATACTAAACAGAACCGATCGAGAACTGAAGTGGCAAGTCCCTGAGATTCCTCTC
AGTGGAAGTCCCGGGAGGCTAAGAGCGCGGATGCCTATAGACTCAGATAACAGCGAGGAA
GAACCAGAGATCATCCGCTATGTGAAGTTCTCGGTTCAGGGAAAGACTTCTTTGTCTGGT
ATCAGTTTACGCCCAGCTGCTGAGGGCAATACGGATTTTTATGAGGTTGATCACAGGTTC
GAAACTGGAGTCTATATGTGCAATTGATAAACGTTTCTCTCAAAGAGTGTTGAGTTTCAT
TTGTTTATAAATTTTTCTCAAATGATTTGAGTTTGGCCGTTGTTGAAAGTTAATTCTGTT
TTTTTTTTTCATGTAAGGTTTTGTGTACTTGTGTATCTTGACATTTTCTCATTGTTATGT
TATCTGTTTTTACC

QA 1 494 1 494
DS 



AS 1 3

CO CL2280Contig1 946 3 10 U
AAAAACCTCACTGAAGTAATTCATTAAAAAGAGACCAGATTCTTTTGAAACAGATCAAAA
CTGATGTTTGCAACATTGAGTCATCTATCTATATAATACACACATATACACATATAGCTA
CAAAAGACTTCATATAAGAAGCTGATGAGGCCACAATGGTTTGATCTTTGATCCAGGCAG
AAAGCTACTGCACTCTTTCTGGTAGAGGAAAGTTGCTTATGTTGGATTCCATCTTGTTGT
AAGTGAGGTTTGCGACGGCTCTATCGATTGAGTTTGTTTCTGATTCCATCTCTTCCTCTC
TACTCATCAACCTGGTATTATCACCATAGTCATATCTGGATGCTTGCATATGGAACTCTC
CTGAGTTAGTAGTGTTGTCCGAATCCAACTTCTCTTGTGAGTTTCTCGCAAGCCGGTAAA
ACGTATCTCGGAAACACTTTCTTGTCTCATCAGTTAGCTTTTCTGAAGCTCTTTGCAGAT
CCTGCAACACTAGCTCTTCAGAAGACGTTTCATCGTCCACAAACATGTTCTCTTCAGACA
GATCCGAGATTGTAAATGGAGCCCCTTCCTTTAAAGGCATGGCATGAGAATGGAACAAGG
GGACTTCACTACCACCGTACATAGACGAAAAACCGACACTGTTATTGGTGCTAGAAGCAC
GATGTACATCTCCATCACTCCCGGGAACATCCTCTAAGATTGAACTTAAGAATATATCAT
CCATCTGTTCGATTCCTTCGAAACCGTGAAGCGAAGAAGCGCCGTAGAAAGCCTTTGATC
TCTTGGACTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCATTTTCGCTCGTTCTCATACCCATCTGGGTAT
TAAAACGATCGTAGTCAAAGCATTTCTCAGCAGCTTCAGGGGAGTTCATGCTCCACCCAC
CCCACATACCATCTAAGCATGTCTCTGATGACGTTTCTTGATAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1BZ19JQ U 13
AF RS1C518JQ U 1
AF RS1BZ19TF C 364
BS 1 426 RS1C518JQ
BS 427 427 RS1BZ19JQ
BS 428 506 RS1C518JQ
BS 507 507 RS1BZ19JQ
BS 508 629 RS1C518JQ
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BS 650 650 RS1BZ19TF
BS 651 786 RS1C518JQ
BS 787 946 RS1BZ19TF

RD RS1BZ19JQ 617 0 0
TTTTTTT
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GTCATCTATCTATATAATACACACATATACACATATAGCTACAAAAGACTTCATATAAGA
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TGGTAGAGGAAAGTTGCTTATGTTGGATTCCATCTTGTTGTAAGTGAGGTTTGCGACGGC
TCTATCGATTGAGTTTGTTTCTGATTCCATCTCTTCCTCTCTACTCATCAACCTGGTATT
ATCACCATAGTCATATCTGGATGCTTGCATATGGAACTCTCCTGAGTTAGTAGTGTTGTC
CGAATCCAACTTCTCTTGTGAGTTTCTCGCAAGCCGGTAAAACGTATCTCGGAAACACTT
TCTTGTCTCATCAGTTAGCTTTTCTGAAGCTCTTTGCAGATCCTGCAACACTAGCTCTTC
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AGCCCCTTCCTTTAAAGGCATGGCATGAGAATGGAACAAGGGGACTTCACTACCACCGTA
CATAGACGAA

QA 8 617 8 617
DS 

RD RS1C518JQ 786 0 0
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CTGATGTTTGCAACATTGAGTCATCTATCTATATAATACACACATATACACATATAGCTA
CAAAAGACTTCATATAAGAAGCTGATGAGGCCACAATGGTTTGATCTTTGATCCAGGCAG
AAAGCTACTGCACTCTTTCTGGTAGAGGAAAGTTGCTTATGTTGGATTCCATCTTGTTGT
AAGTGAGGTTTGCGACGGCTCTATCGATTGAGTTTGTTTCTGATTCCATCTCTTCCTCTC
TACTCATCAACCTGGTATTATCACCATAGTCATATCTGGATGCTTGCATATGGAACTCTC
CTGAGTTAGTAGTGTTGTCCGAATCCAACTTCTCTTGTGAGTTTCTCGCAAGCCGGTAAA
ACGTATATCGGAAACACTTTCTTGTCTCATCAGTTAGCTTTTCTGAAGCTCTTTGCAGAT
CCTGCAACACTAGCTCTTCAGAAGACATTTCATCGTCCACAAACATGTTCTCTTCAGACA
GATCCGAGATTGTAAATGGAGCCCCTTCCTTTAAAGGCATGGCATGAGAATGGAACAAGG
GGACTTCACTACCACCGTACATAGACGAAGAACCGACACTGTTATTGGT*CTAGAAGCAC
GATGTACATCTCCATCACTCCCGGGAACATCCTCTAAGATTGAACTTAAGAATATATCAT
CCATCTGTTCGATTCCTTCGAAACCGTGAAGCGAAGAAGCGCCGTAGAAAGCCTTTGATC
TCTTGG

QA 1 786 1 786
DS 

RD RS1BZ19TF 583 0 0
AGTTAGTAGTGTTGTCCGAATCCAACTTCTCTTGTGAGTTTCTCGCAAGCCGGTAAAACG
TATCTCGGAAACACTTTCTTGTCTCATCAGTTAGCTTTTCTGAAGCTCTTTGCAGATCCT
GCAACACTAGCTCTTCAGAAGACGTTTCATCGTCCACAAACATGTTCTCTTCAGACAGAT
CCGAGATTGTAAATGGAGCCCCTTCCTTTAAAGGCATGGCATGAGAATGGAACAAGGGGA
CTTCACTACCACCGTACATAGACGAAAAACCGACACTGTTATTGGTGCTAGAAGCACGAT
GTACATCTCCATCACTCCCGGGAACATCCTCTAAGATTGAACTTAAGAATATATCATCCA
TCTGTTCGATTCCTTCGAAACCGTGAAGCGAAGAAGCGCCGTAGAAAGCCTTTGATCTCT
TGGACTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCATTTTCGCTCGTTCTCATACCCATCTGGGTATTAA
AACGATCGTAGTCAAAGCATTTCTCAGCAGCTTCAGGGGAGTTCATGCTCCACCCACCCC
ACATACCATCTAAGCATGTCTCTGATGACGTTTCTTGATAATT

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 4

CO CL2281Contig1 966 4 10 U
AGGGGCGACGAAAATGGGAAACACGAGAATCTCGATCTTCATATTGGCGTGTGTATCCTT
ACTCTCCCTAGTCAAAGCTCTTCCTAGCGAACCAGAACTTGGCTCAGCTCGTGTCGTCTT
CCAGACTAGTTATGGGGATATCGAGTTTGGGTTCTATCCCACGGTTGCGCCAAAGACAGT
GGATCACATCTTCAAGCTCGTTCGTTTAGGTGGATACAATACTAATCATTTCTTCAGGGT
GGATAAAGGCTTTGTTGCTCAAGTTGCTGACGTGGAGAGTGGAAGATCAGCCCCGATGAA
CGAGGAGCAAAGGAAAGAAGCCGAGAAGACTATTGTTGGAGAGTTCAGTGATGTCAAGCA
TGTAAGAGGCACTCTTTCCATGGGAAGATATGAAGATCCAAACAGTGCACAATCTTCATT
TTCAATGCTTATTGGTGACGCTCCTCATCTTGATCGTCAGTACGCAGTGTTCGGCAAAGT
AACTAAAGTTGATGAAACATTGAGGAAGCTAGAAGAAGTTCCTACTCGCCGTGAGGGGAT
CTTTGTAATGCCGACGGAGAGGATCACGATTTTGTCGACATACTACTACGACACTAAGAT
GGAGAGCTGTGAAGTGGAGAGATCTGTCCTGAAAAGAAGGCTTGAAGCATCTTTTGTTGA
GGTCGAAAGACAGAGAATGAAGTGCTTCCCGTGAAACTATGTTAATGACATTTTTTCTAA
GTAAAGAACTGTTCATAAACAGAGCCTAAAACAAAGTTAAAGCCGACATCTTTGTTTCAT
TTGGTGTAACTCACGATGCTAAGACACATATTCATTAGTTTTTAGTCTATGCCGCTGTCC
GTTTGTCCATTTGGTCATCTCGCTGTAGATGATCTTTTTATCTTCTGATCCATCCAATAG
ATCTATCTGAATATTATTTTGACTATTAGTATGATTCATTTAAATAAATCATATAATTGG
GTTTCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 

AF RS1GH52TF U 1
AF RS1G102TF U 1
AF RS1GH52JQ C 136
AF RS1G102JQ C 591
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BS 954 966 RS1GH52JQ

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CTTTGTAATGCCGACGGAGAGGATCACGATTTTGTCGACATACTACTACGACA

QA 1 593 1 593
DS 

RD RS1G102TF 748 0 0
AGGGGCGACGAAAATGGGAAACACGAGAATCTCGATCTTCATATTGGCGTGTGTATCCTT
ACTCTCCCTAGTCAAAGCTCTTCCTAGCGAACCAGAACTTGGCTCAGCTCGTGTCGTCTT
CCAGACTAGTTATGGGGATATCGAGTTTGGGTTCTATCCCACGGTTGCGCCAAAGACAGT
GGATCACATCTTCAAGCTCGTTCGTTTAGGTGGATACAATACTAATCATTTCTTCAGGGT
GGATAAAGGCTTTGTTGCTCAAGTTGCTGACGTGGAGAGTGGAAGATCAGCCCCGATGAA
CGAGGAGCAAAGGAAAGAAGCCGAGAAGACTATTGTTGGAGAGTTCAGTGATGTCAAGCA
TGTAAGAGGCACTCTTTCCATGGGAAGATATGAAGATCCAAACAGTGCACAATCTTCATT
TTCAATGCTTATTGGTGACGCTCCTCATCTTGATCGTCAGTACGCAGTGTTCGGCAAAGT
AACTAAAGTTGATGAAACATTGAGGAAGCTAGAAGAAGTTCCTACTCGCCGTGAGGGGAT
CTTTGTAATGCCGACGGAGAGGATCACGATTTTGTCGACATACTACTACGACACTAAGAT
GGAGAGCTGTGAAGTGGAGAGATCTGTCCTGAAAAGAAAGCTTGAAGCATCTTTTGTTGA
G*TCGAAAGACAGAGAATGAAGTGCTTCCCGTGAAACTATGTTAATGACATTTTTTCTAA
GTAA*GAACTGTTCATAAACAGAGCCTA

QA 1 748 1 748
DS 

RD RS1GH52JQ 831 0 0
GGATATCGAGTT*GGGTTCTATCCCACGGT*GCGCCAAAGACAGTGGATCACATCTTCAA
GCTCGTTCGTTTAGGTGGATACAATACTAATCATTTCTTCAGGGTGGATAAAGGCTTTGT
TGCTCAAGTTGCTGACGTGGAGAGTGGAAGATCAGCCCCGATGAACGAGGAGCAAAGGAA
AGAAGCCGAGAAGACTATTGTTGGAGAGTTCAGTGATGTCAAGCATGTAAGAGGCACTCT
TTCCATGGGAAGATATGAAGATCCAAACAGTGCACAATCTTCATTTTCAATGCTTATTGG
TGACGCTCCTCATCTTGATCGTCAGTACGCAGTGTTCGGCAAAGTAACTAAAGTTGATGA
AACATTGAGGAAGCTAGAAGAAGTTCCTACTCGCCGTGAGGGGATCTTTGTAATGCCGAC
GGAGAGGATCACGATTTTGTCGACATACTACTACGACACTAAGATGGAGAGCTGTGAAGT
GGAGAGATCTGTCCTGAAAAGAAGGCTTGAAGCATCTTTTGTTGAGGTCGAAAGACAGAG
AATGAAGTGCTTCCCGTGAAACTATGTTAATGACATTTTTTCTAAGTAAAGAACTGTTCA
TAAACAGAGCCTAAAACAAAGTTAAAGCCGACATCTTTGTTTCATTTGGTGTAACTCACG
ATGCTAAGACACATATTCATTAGTTTTTAGTCTATGCCGCTGTCCGTTTGTCCATTTGGT
CATCTCGCTGTAGATGATCTTTTTATCTTCTGATCCATCCAATAGATCTATCTGAATATT
ATTTTGACTATTAGTATGATTCATTTAAATAAATCATCTAATTGGGTTTCT

QA 1 831 1 831
DS 

RD RS1G102JQ 376 0 0
ACACTAAGATGGAGAGCTGTGAAGTGGAGAGATCTGTCCTGAAAAGAAGGCTTGAAGCAT
CTTTTGTTGAGGTCGAAAGACAGAGAATGAAGTGCTTCCCGTGAAACTATGTTAATGACA
TTTTTTTTAAGTAAAGAACTGTTCATAAACAGAGCCTAAAACAAAGTTAAAGCCGACATC
TTTGTTTCATTTGGTGTAACTCACGATGCTAAGACACATATTCATTAGTTTTTAGTCTAT
GCCGCTGTCCGTTTGTCCATTTGGTCATCTCGCTGTAGATGATCTTTTTATCTTCTGATC
CATCCAATAGATCTATCTGAATATTATTTTGACTATTAGTATGATTCATTTAAATAAATC
ATATAATTGGGTTTCT

QA 1 376 1 376
DS 



AS 1 4

CO CL2282Contig1 1205 4 8 U
GGACACCACACATTGAACATAGTCCTCCCAAAATATACATTGTCTCAAAAAACCACAAAT
ATAAAGATGAATTGCCAGAGAACTATTGCTCTGTCCCTCTCTCTTTTACTTGTGGGATTG
GTCGGGCCAATCCAAGCTCAGTTACAGATGAACTTCTATGCCAACACTTGTCCAAACGCC
GAAAAGATTGTTCAAGATTTTGTTTCAAACCACATTTCTAATGCTCCTTCTCTTGCCGCT
GCTCTCTTACGGATGCATTTCCACGATTGTTTTGTTCGGGGCTGTGATGGATCAGTGCTT
ATAAACTCAACGTCAGGAAATGCGGAGAGAGACGCAACGCCTAACCTAACGGTTAGAGGG
TTTGGCTTCATCGAGGCAATCAAAACTGTGCTTGAAGCTCAGTGTCCTGGAGTCGTCTCT
TGCGCTGATATTATCGCTCTAGCATCTCGAGACGCCATAGTTTTCACCGGAGGACCAAGC
TGGAGTGTGCCAACCGGAAGAAGAGATGGGAGGATATCGAACGCATCAGAGGCCTTAGCT
AACATTCCTCCTCCAACCAGTAACTTCACCAATCTTCAGACACTCTTTGCAAACCAAGGA
CTTGATCTTAAGGACCTTGTCTTACTCTCTGGGGCTCACACTATCGGTGTATCTCATTGC
TCGTCTTTCACAAACCGTCTCTACAACTTCACGGGTCGTGGAGACCAAGATCCGGCCTTA
GACAGTCAATACGCAGCCAATCTCAAGTCTAGGAAATGTCCTAGCCTCAACGATAACACG
ACCATAGTGGAGATGGATCCAGGAAGCCGTAAAACGTTTGATCTTAGTTATTACCAGCTC
CTTCTCAAGCGTAGAGGTCTTTTTCAATCAGACTCTGCTCTCACCACCAATCCCACAACG
CTCTCAAACATAAACCAGATCTTGAAAGGTTCGGTTGAGAGCTTCTTCTCTGAGTTTGCA
AAGTCAATGGAGAAAATGGGTCGGATCAATGTCAAGACTGGGTCAGCAGGAGTGGTTAGA
AGGCAATGTTCCGTTGCAATAGTTAAGTGGTGCAAAACTTAAGAGTATGGGAGTTTGTGT
GTTTATTTTGCGAAAAATAATAGGGATAATGATGATGATTGTAATGATTGTGATGTGACC
TTTACAGATCTGTGTGTATGCATTTGGTTATAGAGTTTCATCAATAAAAAAATATTAGTT
TTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1GK07TF U 1
AF RS1BO69TF U 3
AF RS1F358TF U 7
AF RS1BO69JQ C 398
BS 1 331 RS1GK07TF
BS 332 332 RS1BO69TF
BS 333 488 RS1GK07TF
BS 489 489 RS1BO69TF
BS 490 595 RS1GK07TF
BS 596 607 RS1BO69TF
BS 608 689 RS1F358TF
BS 690 1205 RS1BO69JQ

RD RS1GK07TF 595 0 0
GGACACCACACATTGAACATAGTCCTCCCAAAATATACATTGTCTCAAAAAACCACAAAT
ATAAAGATGAATTGCCAGAGAACTATTGCTCTGTCCCTCTCTCTTTTACTTGTGGGATTG
GTCGGGCCAATCCAAGCTCAGTTACAGATGAACTTCTATGCCAACACTTGTCCAAACGCC
GAAAAGATTGTTCAAGATTTTGTTTCAAACCACATTTCTAATGCTCCTTCTCTTGCCGCT
GCTCTCTTACGGATGCATTTCCACGATTGTTTTGTTCGGGGCTGTGATGGATCAGTGCTT
ATAAACTCAACGTCAGGAAATGCGGAGAGAGGCGCAACGCCTAACCTAACGGTTAGAGGG
TTTGGCTTCATCGAGGCAATCAAAACTGTGCTTGAAGCTCAGTGTCCTGGAGTCGTCTCT
TGCGCTGATATTATCGCTCTAGCATCTCGAGACGCCATAGTTTTCACCGGAGGACCAAGC
TGGAGTGTACCAACCGGAAGAAGAGATGGGAGGATATCGAACGCATCAGAGGCCTTAGCT
AACATTCCTCCTCCAACCAGTAACTTCACCAATCTTCAGACACTCTTTGCAAACC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RS1BO69TF 605 0 0
GGAC
CACACATTGAACATAGTCCTCCCAAAATATACATTGTCTCAAAAAACCACAAATATAAAG
ATGAATTGCCAGAGAACTATTGCTCTGTCCCTCTCTCTTTTACTTGTGGGATTGGTCGGG
CCAATCCAAGCTCAGTTACAGATGAACTTCTATGCCAACACTTGTCCAAACGCCGAAAAG
ATTGTTCAAGATTTTGTTTCAAACCACATTTCTAATGCTCCTTCTCTTGCCGCTGCTCTC
TTACGGATGCATTTCCACGATTGTTTTGTTCGGGGCTGTGATGGATCAGTGCTTATAAAC
TCAACGTCAGGAAATGCGGAGAGAGACGCAACGCCTAACCTAACGGTTAGAGGGTTTGGC
TTCATCGAGGCAATCAAAACTGTGCTTGAAGCTCAGTGTCCTGGAGTCGTCTCTTGCGCT
GATATTATCGCTCTAGCATCTCGAGACGCCATAGTTTTCACCGGAGGACCAAGCTGGAGT
GTGCCAACCGGAAGAAGAGATGGGAGGATATCGAACGCATCAGAGGCCTTAGCTAACATT
CCTCCTCCAACCAGTAACTTCACCAATCTTCAGACACTCTTTGCAAACCAAGGACTTGAT
C

QA 5 605 5 605
DS 

RD RS1F358TF 683 0 0
CACACATTGAACATAGTCCTCCCAAAATATACATTGTCTCAAAAAACCACAAATATAAAG
ATGAATTGCCAGAGAACTATTGCTCTGTCCCTCTCTCTTTTACTTGTGGGATTGGTCGGG
CCAATCCAAGCTCAGTTACAGATGAACTTCTATGCCAACACTTGTCCAAACGCCGAAAAG
ATTGTTCAAGATTTTGCTTCAAACCACATTTCTAATGCTCCTTCTCTTGCCGCTGCTCTC
TTACGGATGCATTTCCACGATTGTTTTGTTCGGGGCTGTGATGGATCAGTGCTTATAAAC
TCAACGTCAGGAAATGCGGAGAGAGACGCAACGCCTAACCTAACGGTTAGAGGGTTTGGC
TTCATCGAGGCAATCAAAACTGTGCTTGAAGCTCAGTGTCCTGGAGTCGTCTCTTGCGCT
GATATTATCGCTCTAGCATCTCGAGACGCCATAGTTTTCACCGGAGGACCAAGCTGGAGT
GTACCAACCGGAAGAAGAGATGGGAGGATATCGAACGCATCAGAGGCCTTAGCTAACATT
CCTCCTCCAACCAGTAACTTCACCAATCTTCAGACACTCTTTGCAAACCAAGGACTTGAT
CTTAAGGACCTTGTCTTACTCTCTGGGGCTCACACTATCGGTGTATCTCATTGCTCGTCT
TTCACAAACCGTCTCTACAACTT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RS1BO69JQ 808 0 0
CTCAGTGTCCTGGAGTCGTCTCTTGCGCTGATATTATCGCTCTAGCATCTCGAGACGCCA
TAGTTTTCACCGGAGGACCAAGCTGGAGTGTGCCAACCGGAAGAAGAGATGGGAGGATAT
CGAACGCATCAGAGGCCTTAGCTAACATTCCTCCTCCAACCAGTAACTTCACCAATCTTC
AGACACTCTTTGCAAACCAAGGACTTGATCTTAAGGACCTTGTCTTACTCTCTGGGGCTC
ACACTATCGGTGTATCTCATTGCTCGTCTTTCACAAACCGTCTCTACAACTTCACGGGTC
GTGGAGACCAAGATCCGGCCTTAGACAGTCAATACGCAGCCAATCTCAAGTCTAGGAAAT
GTCCTAGCCTCAACGATAACACGACCATAGTGGAGATGGATCCAGGAAGCCGTAAAACGT
TTGATCTTAGTTATTACCAGCTCCTTCTCAAGCGTAGAGGTCTTTTTCAATCAGACTCTG
CTCTCACCACCAATCCCACAACGCTCTCAAACATAAACCAGATCTTGAAAGGTTCGGTTG
AGAGCTTCTTCTCTGAGTTTGCAAAGTCAATGGAGAAAATGGGTCGGATCAATGTCAAGA
CTGGGTCAGCAGGAGTGGTTAGAAGGCAATGTTCCGTTGCAATAGTTAAGTGGTGCAAAA
CTTAAGAGTATGGGAGTTTGTGTGTTTATTTTGCGAAAAATAATAGGGATAATGATGATG
ATTGTAATGATTGTGATGTGACCTTTACAGATCTGTGTGTATGCATTTGGTTATAGAGTT
TCATCAATAAAAAAATATTAGTTTTTCT

QA 1 808 1 808
DS 



AS 1 2

CO CL2283Contig1 968 2 2 U
GGGTATGCAAGTGTCAACACACACCTTGGGATTGAGCAAAATAGAAGAGATGACCTTGAG
TCGCTTGGTTATGTGCTCATGTATTTTCTACGAGGAAGTCTACCATGGCAAGGTCTGAAA
GCTGGTACCAAGAAACAGAAATATGACAAGATTAGTGAAAGGAAGATGCTTACTCCAGTT
GAGCTTCTTTGCAAGTCATTTCCCTCGGAGTTCACATCGTATTTCCATTACTGCCGATCA
TTGAGGTTTGAGGACAAACCAGATTATTCTTACTTGAAAAGACTCTTCAGGGACCTTTTC
ATTCGTGAAGGTTATCAGTTCGACTATGTGTTTGATTGGACAATCTTGAAATATCCTCAG
ATGGGCTCTAGTTCTAATAGACCAAGGGCAAATCCAAAACAAGCTCAAGACCCTCCAGGA
CCATCCGCAGAAAAAAGTGAAAAGCCTTCAGAGGGGAAGGATCTGCGAGAAAGATTCTCA
GGTGCGGTTGAAGCGTTCGCCAGACGTAATGTATCCAGTCCTGGCATTCGCTCTTCCAAA
GAAGTGCTCGTGTCTGAAAAGACAAGAAACGAGAGTGTGAGGGCGGTGATGTCAAGCAGC
CGACCTGGCTCATCAGGCGAGCTGAGTGAGAACCGTTCAAGTAAACTGTTTTCAAGCGGT
ACCCAAAAGATTCAACCGGGCCAAGAATCTAAACCAACCGCAAGGCTTGGGCGTGATGAC
GCCCTGAGAAGCTTTGATTTGCTTACTATCGGTTCCGGAAAGCGGAAATGAGTCACAGAA
AGTGGAAAGTTTGGGAAGATGTTTACCCTCCTCTCTGAGTATGGGAAGAAGAAGAGAGAA
AAGAATCTCTCTCCAATTGTATGTGTTTATATAATATATGTTCGTTAAAACATCTATAGT
GGCTGTGTATATGTAACTTGTAAGTTGTAACAAGTACTTTGTTTAATTTTTATTGATGTC
ATTTGGGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B260TF U 1
AF RS1B260JQ C 227
BS 1 612 RS1B260TF
BS 613 968 RS1B260JQ

RD RS1B260TF 612 0 0
GGGTATGCAAGTGTCAACACACACCTTGGGATTGAGCAAAATAGAAGAGATGACCTTGAG
TCGCTTGGTTATGTGCTCATGTATTTTCTACGAGGAAGTCTACCATGGCAAGGTCTGAAA
GCTGGTACCAAGAAACAGAAATATGACAAGATTAGTGAAAGGAAGATGCTTACTCCAGTT
GAGCTTCTTTGCAAGTCATTTCCCTCGGAGTTCACATCGTATTTCCATTACTGCCGATCA
TTGAGGTTTGAGGACAAACCAGATTATTCTTACTTGAAAAGACTCTTCAGGGACCTTTTC
ATTCGTGAAGGTTATCAGTTCGACTATGTGTTTGATTGGACAATCTTGAAATATCCTCAG
ATGGGCTCTAGTTCTAATAGACCAAGGGCAAATCCAAAACAAGCTCAAGACCCTCCAGGA
CCATCCGCAGAAAAAAGTGAAAAGCCTTCAGAGGGGAAGGATCTGCGAGAAAGATTCTCA
GGTGCGGTTGAAGCGTTCGCCAGACGTAATGTATCCAGTCCTGGCATTCGCTCTTCCAAA
GAAGTGCTCGTGTCTGAAAAGACAAGAAACGAGAGTGTGAGGGCGGTGATGTCAAGCAGC
CGACCTGGCTCA

QA 1 612 1 612
DS 

RD RS1B260JQ 742 0 0
ATTACTGCCGATCATTGAGGTTTGAGGACAAACCAGATTATTCTTACTTGAAAAGACTCT
TCAGGGACCTTTTCATTCGTGAAGGTTATCAGTTCGACTATGTGTTTGATTGGACAATCT
TGAAATATCTTCAGATGGGCTCTAGTTCTAATAGACCAAGGGCAAATCCAAAACAAGCTC
AAGACCCTCCAGGACCATCCGCAGAAAAAAGTGAAAAGCCTTCAGAGGGGAAGGATCTGC
GAGAAAGATTCTCAGGTGCGGTTGAAGCGTTCGCCAGACGTAATGTATCCAGTCCTGGCA
TTCGCTCTTCCAAAGAAGTGCTCGTGTCTGAAAAGACAAGAAACGAGAGTGTGAGGGCGG
TGATGTCAAGCAGCCGACCTGGCTCATCAGGCGAGCTGAGTGAGAACCGTTCAAGTAAAC
TGTTTTCAAGCGGTACCCAAAAGATTCAACCGGGCCAAGAATCTAAACCAACCGCAAGGC
TTGGGCGTGATGACGCCCTGAGAAGCTTTGATTTGCTTACTATCGGTTCCGGAAAGCGGA
AATGAGTCACAGAAAGTGGAAAGTTTGGGAAGATGTTTACCCTCCTCTCTGAGTATGGGA
AGAAGAAGAGAGAAAAGAATCTCTCTCCAATTGTATGTGTTTATATAATATATGTTCGTT
AAAACATCTATAGTGGCTGTGTATATGTAACTTGTAAGTTGTAACAAGTACTTTGTTTAA
TTTTTATTGATGTCATTTGGGC

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 3

CO CL2284Contig1 700 3 21 U
TCCTGTCGGATTCTGCTCTCTATATCTCTGAAAATGGCGGACGCAAATGCCGAACCGGCC
GTTGGTTCTTCGGGATCTAATGAAAGCGTTACAAAGATTGAGCCGATCCGGATGCCAACC
ATCGAGGAGATCCGAGCACAAGATGTTTGGAACAACTGCGCCGTCAAAAGTGTAGCTAGT
GGAGTCATGGGAGGAGGGCTTGGTCTGATGATGGGTTTGTTCTTGGGAGCATTGGATAAT
CCTATAACGAATGATACCATGACTGGTAGGCAGCAGTTTGTGTTCACTGCTAAACAAATG
GGACAAAGGAGTTGGAGTTCTTGCAAGACTTTTGCTGTTATGGGTTTGGTTTTCTCTGCT
GCTGAATGCATTATCGAGAAGGCAAGGGCGAAGCATGACACAACAAACACTGCTTTTGCT
GGATGTGTGACCGGTGGCTCCGTGTCTGCCCGAGGTGGGCCAAAAGCTGCGTGTATAGGC
TGCGCTGGCTTTGCAACTTTCTCTGTACTGATAGAGAAGTTCTTCGACAGGCATACGTAA
ACCAACAATATATCTAACAAGCGCCATTGCTGCGAATTTTTTAGCTGTTTCTTATACAAG
GAGAGAGGGAAAACTAGAATTACATTTTCCAACATAGAAGAAGAAACTGAAGCTTGTTTT
GATTGAATATTTGTTCAGTTATTGTCATTATTTATCGTAG


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E020TF U 26
AF RS1H031TF U 1
AF RS1H031JQB C 1
BS 1 27 RS1H031TF
BS 28 83 RS1E020TF
BS 84 84 RS1H031TF
BS 85 151 RS1E020TF
BS 152 152 RS1H031TF
BS 153 335 RS1E020TF
BS 336 336 RS1H031TF
BS 337 359 RS1E020TF
BS 360 360 RS1H031TF
BS 361 437 RS1E020TF
BS 438 438 RS1H031TF
BS 439 440 RS1E020TF
BS 441 442 RS1H031TF
BS 443 479 RS1E020TF
BS 480 480 RS1H031TF
BS 481 566 RS1E020TF
BS 567 567 RS1H031TF
BS 568 578 RS1E020TF
BS 579 579 RS1H031TF
BS 580 595 RS1E020TF
BS 596 700 RS1H031JQB

RD RS1E020TF 585 0 0
GG
CTGAAAATGGCGGACGCAAATGCCGAACCGGCCGTTGGTTCTTCGGGATCTAATGAGAGC
GTTACAAAGATTGAGCCGATCCGGATGCCAACCATCGAGGAGATCCGAGCACAAGATGTT
TGGAGCAACTGCGCCGTCAAAAGTGTAGCTAGTGGAGTCATGGGAGGAGGGCTTGGTCTG
ATGATGGGTTTGTTCTTGGGAGCATTGGATAATCCTATAACGAATGATACCATGACTGGT
AGGCAGCAGTTTGTGTTCACTGCTAAACAAATGGGACAAAGGAGTTGGAGTTCTTGCAAG
ACTTTTGCGGTTATGGGTTTGGTTTTCTCTGCAGCTGAATGCATTATCGAGAAGGCAAGG
GCGAAGCATGACACAACAAACACTGCTTTTGCTGGATGTGTGACCGGTGGATCGATGTCT
GCCCGAGGTGGGCCAAAAGCTGCGTGTATAGGTTGCGCTGGCTTTGCAACTTTCTCTGTA
CTGATAGAGAAGTTCTTCGACAGGCATACGTAAACCAACAATATATCTAACAAGCGCCAC
TGCTGCGAATTGTTTAGCTGTTTCTTAT
TACAGTTCATCACCT

QA 3 570 3 570
DS 

RD RS1H031TF 607 0 0
TCCTGTCGGATTCTGCTCTCTATATCTCTGAAAATGGCGGACGCAAATGCCGAACCGGCC
GTTGGTTCTTCGGGATCTAATGAAAGCGTTACAAAGATTGAGCCGATCCGGATGCCAACC
ATCGAGGAGATCCGAGCACAAGATGTTTGGAACAACTGCGCCGTCAAAAGTGTAGCTAGT
GGAGTCATGGGAGGAGGGCTTGGTCTGATGATGGGTTTGTTCTTGGGAGCATTGGATAAT
CCTATAACGAATGATACCATGACTGGTAGGCAGCAGTTTGTGTTCACTGCTAAACAAATG
GGACAAAGGAGTTGGAGTTCTTGCAAGACTTTTGCTGTTATGGGTTTGGTTTTCTCTGCT
GCTGAATGCATTATCGAGAAGGCAAGGGCGAAGCATGACACAACAAACACTGCTTTTGCT
GGATGTGTGACCGGTGGCTCCGTGTCTGCCCGAGGTGGGCCAAAAGCTGCGTGTATAGGC
TGCGCTGGCTTTGCAACTTTCTCTGTACTGATAGAGAAGTTCTTCGACAGGCATACGTAA
ACCAACAATATATCTAACAAGCGCCATTGCTGCGAATTTTTTAGCTGTTTCTTAT
ACAAAGGAGAGA

QA 1 595 1 595
DS 

RD RS1H031JQB 700 0 0
TCCTGTCGGATTCTGCTCTCTATATCTCTGAAAATGGCGGACGCAAATGCCGAACCGGCC
GTTGGTTCTTCGGGATCTAATGAAAGCGTTACAAAGATTGAGCCGATCCGGATGCCAACC
ATCGAGGAGATCCGAGCACAAGATGTTTGGAACAACTGCGCCGTCAAAAGTGTAGCTAGT
GGAGTCATGGGAGGAGGGCTTGGTCTGATGATGGGTTTGTTCTTGGGAGCATTGGATAAT
CCTATAACGAATGATACCATGACTGGTAGGCAGCAGTTTGTGTTCACTGCTAAACAAATG
GGACAAAGGAGTTGGAGTTCTTGCAAGACTTTTGCTGTTATGGGTTTGGTTTTTTCTGCT
GCTGAATGCATTATCGAGAAGGCAAGGGCGAAGCATGACACAACAAACACTGCTTTTGCT
GGATGTGTGACCGGTGGCTCCGTGTCTGCCCGAGGTGGGCCAAAAGCTGCGTGTATAGGC
TGCGCTGGCTTTGCAACTTTCTCTGTACTGATAGAGAAGTTTTTCGACAGGCATACGTAA
ACCAACAATATATCTAACAAGCGCCATTGCTGCGAATTTTTTAGCTGTTTCTTATACAAG
GAGAGAGGGAAAACTAGAATTACATTTTCCAACATAGAAGAAGAAACTGAAGCTTGTTTT
GATTGAATATTTGTTCAGTTATTGTCATTATTTATCGTAG

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

CO CL2285Contig1 735 2 19 U
GGGAGAGCTACCTTCTTCGAGCCGCGGCTACAAAGTTACCTTCTTCTCTTCTAGAGCAAT
GGCCGCCACCGTAGAAATCGACGCTGAGATTCAGCAGCAGCTTACCAACGAGGTCAAGCT
CTTCAACCGTTGGAGCTTTGACGACGTCTCGGTCACAGACATTAGTCTTGTTGACTACAT
TGGTGTTCAGCCTGCAAAACACGCCACCTTCGTCCCCCACACTGCCGGAAGATACTCTGT
CAAGAGATTCAGGAAGGCTCAGTGCCCTATCGTCGAGAGGCTCACTAACTCCCTCATGAT
GCACGGCAGGAACAACGGCAAGAAGCTGATGGCTGTCAGGATCATCAAGCACACCATGGA
GATCATCCACCTCTTGACTGACGCCAACCCTATTCAAGTTATCATTGATGCCATTGTTAA
CAGTGGTCCACGTGAAGATGCTACCAGGATCGGGTCTGCTGGTGTGGTCAGGAGACAGGC
CGTTGATATCTCTCCTCTGAGACGTGTGAACCAAGCCATCTTCTTGCTCACCACTGGTGC
ACGTGAAGCTGCCTTCAGAAACATCAAGACAATCGCTGAGTGCCTCGCTGATGAGCTCAT
CAATGCTGCTAAAGGATCTTCCAACAGCTATGCCATCAAGAAGAAAGACGAGATCGAGAG
AGTTGCTAAGCCAACCGTTAAGGGCTCTTCCTTAGTTTTTTTTTTGTTCATTATCTCAAA
TAAGCTTTTGTGCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
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15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CF96TF U 58
AF RS1FF65TF U 1
BS 1 200 RS1FF65TF
BS 201 201 RS1CF96TF
BS 202 210 RS1FF65TF
BS 211 211 RS1CF96TF
BS 212 246 RS1FF65TF
BS 247 247 RS1CF96TF
BS 248 291 RS1FF65TF
BS 292 292 RS1CF96TF
BS 293 306 RS1FF65TF
BS 307 307 RS1CF96TF
BS 308 318 RS1FF65TF
BS 319 319 RS1CF96TF
BS 320 325 RS1FF65TF
BS 326 326 RS1CF96TF
BS 327 352 RS1FF65TF
BS 353 353 RS1CF96TF
BS 354 498 RS1FF65TF
BS 499 499 RS1CF96TF
BS 500 735 RS1FF65TF

RD RS1CF96TF 608 0 0
G
ATGGCCGCCACCGTAGAAATCGACGCTGAGATTCAGCAGCAGCTTACCAATGAGGTCAAG
CTCTTCAACCGTTGGAGCTTTGACGACGTCTCGGTCACAGACATTAGTCTTGTTGACTAC
ATTGGTGTTCAGCCTGCAAAACACGCCACCTTCGTCCCCCACACTGCTGGAAGATACTCT
GTCAAGAGATTCAGGAAGGCTCAGTGCCCTATTGTCGAGAGGCTCACTAACTCCCTCATG
ATGCACGGCAGGAACAACGGCAAGAAGCTGATGGCTGTCAGGATCATCAAGCACACCATG
GAGATTATCCACCTCTTGACTGACGCCAACCCTATTCAAGTTATCATTGATGCCATTGTT
AACAGTGGTCCACGTGAAGATGCTACCAGGATCGGGTCTGCTGGTGTGGTCAGGAGACAG
GCCGTTGATATCTCTCCTCTGAGACGTGTGAACCAAGCCATCTTCTTGCTCACCACTGGT
GCACGTGAAGCTGCCTTCAGAAACATCAAGACAATCGCTGAGTGCCTCGCTGATGAGCTC
ATCAATGCTGCTAAAGGATCTTCCAACAGCTATGCCATCAAGAAGAAAGACGAGATTGAG
AGAGTTG

QA 2 608 2 608
DS 

RD RS1FF65TF 735 0 0
GGGAGAGCTACCTTCTTCGAGCCGCGGCTACAAAGTTACCTTCTTCTCTTCTAGAGCAAT
GGCCGCCACCGTAGAAATCGACGCTGAGATTCAGCAGCAGCTTACCAACGAGGTCAAGCT
CTTCAACCGTTGGAGCTTTGACGACGTCTCGGTCACAGACATTAGTCTTGTTGACTACAT
TGGTGTTCAGCCTGCAAAACGCGCCACCTTTGTCCCCCACACTGCCGGAAGATACTCTGT
CAAGAGGTTCAGGAAGGCTCAGTGCCCTATCGTCGAGAGGCTCACTAACTCTCTCATGAT
GCACGGGAGGAACAACGGTAAGAAGTTGATGGCTGTCAGGATCATCAAGCACGCCATGGA
GATCATCCACCTCTTGACTGACGCCAACCCTATTCAAGTTATCATTGATGCCATTGTTAA
CAGTGGTCCACGTGAAGATGCTACCAGGATCGGGTCTGCTGGTGTGGTCAGGAGACAGGC
CGTTGATATCTCTCCTCTTAGACGTGTGAACCAAGCCATCTTCTTGCTCACCACTGGTGC
ACGTGAAGCTGCCTTCAGAAACATCAAGACAATCGCTGAGTGCCTCGCTGATGAGCTCAT
CAATGCTGCTAAAGGATCTTCCAACAGCTATGCCATCAAGAAGAAAGACGAGATCGAGAG
AGTTGCTAAGCCAACCGTTAAGGGCTCTTCCTTAGTTTTTTTTTTGTTCATTATCTCAAA
TAAGCTTTTGTGCCG

QA 1 735 1 735
DS 



AS 2 4

CO CL2286Contig1 733 2 25 U
GGGATACCAAATCTTTTATTTAGTCTTTAGTCATATATGATGGTGATAGAATTACAGTAT
TGACTTTGACAACATGAAGTCATGAACTATGGCCTCTCTTTGTTTTTTTTTTTCAGAAAG
AAACAGTTGAATCACCAGCCAACCTAACGTTGAGATGATGGATGATTTGCTGGTCGCTGT
TAGATCCAATAACAACCTTGTGGTGTCCAGGGATTAGTTTCCTTGTACCGTCAGTATCCA
CCAGACTAAGTCCTTTGCATATATCAAACTCAACAGTAACTTTCTCTGTCATGCTTCTCC
CAACTTCTACTCTCTCAAACGCCACCAGTTGCGTATGAGGCACGCCACCACCCAACAGAA
ACTTTGAAGACTCTGGGGGTATCCAGAACACGAGAACCACGTGGCTCCCGGACCTTGACC
CATGGTTCTTGACTCCGATGACAATCTTGACCTTCAGATCGTGGCAGTTAACCGTGGAGA
TATCGACAGATGTTGTCTTGTTTAGTTTCAAGATTGGGTTGGTTTTGATATGTATGGTTG
ATGGAGCTGAGAGAACAAAAGTAGAGAAAGAAGAGTAACTAAGTCCATGTCCAAACTTGT
AAATGGGTTTCCCTGTGTAGAATCTGTAAGATCTTCCAGGGAAGCCAGAAGTGGAGTTAG
GTCTCATGTTCATATCAGTCATAGCAACCTTGTCCGCAAACTCTTGTGAGTACCATGTCT
CTGGTAGTCTCCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
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15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FX85JQ U 1
AF RS1BO84JQ U 1
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BS 89 89 RS1FX85JQ
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BS 360 360 RS1FX85JQ
BS 361 376 RS1BO84JQ
BS 377 377 RS1FX85JQ
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BS 455 455 RS1FX85JQ
BS 456 486 RS1BO84JQ
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BS 556 556 RS1FX85JQ
BS 557 733 RS1BO84JQ

RD RS1FX85JQ 564 0 0
GT
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GATCCAATAACAACCTTGTGGTGTCCAGGGATTAGTTTCCTTGTACCGTCAGTATCCACC
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GGAGCTGAGAGAACAAAAGT
GG

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DS 

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AAACAGTTGAATCTCCAGCCAACCTAACGTTGAGATGATGGATGATTTGCTGGTCGCTGT
TAGATCCAATTACAAGCTTGTGGTGTCCAGGGATTAGTTTCCTTTTACCGTCAGTATCCA
CCAGACTAAGTCCTTTGCATATATCAAACTCAACAGTAACTTTCTCTGTCATGCTTCTCT
CAACTTCTACTCTCTCAAACGCCACCAGTTGCGTGTGAGGCACGCCACCACCCAACAGAG
ACTTTGAAGACTCTGGTGGTATCCAGAACACGAGAACCACGTGGCTCCCGGACCTTGACC
CATGGTTCTTGACTCCGATGACAATCTTGACCTTGAGATCGTGGCAGTTAACCGTGGAGA
TATCGATAGATGTTGTCTTGTTTAGTTTCAAGATTGGGTTGGTTTTGATATGTATGGTTG
ATGGAGCTGAGAGAAGAAAAGTAGAGAAAGAAGAGTAACTAAGTCCATGTCCAAACTTGT
AAATGGGTTTCCCTGTGTAGAATCTGTAAGATCTTCCAGGGAAGCCAGAAGTGGAGTTAG
GTCTCATGTTCATATCAGTCATAGCAACCTTGTCCGCAAACTCTTGTGAGTACCATGTCT
CTGGTAGTCTCCC

QA 1 733 1 733
DS 



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TGCCAAGAATCCGAGCAAGATTCGCGCGGTTTTATGGGTTGGTTATCCTGGTGAAGCTGG
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CTCCACGGTTAACTGCCACGATCTCAAGGTCAAGATCGTCATCGGAGTCAAGAACAATGG
GTCAAGGTCCGGGAGC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BO84TF U 1
AF RS1FX85TF U 1
BS 1 30 RS1BO84TF
BS 31 31 RS1FX85TF
BS 32 198 RS1BO84TF
BS 199 199 RS1FX85TF
BS 200 498 RS1BO84TF
BS 499 499 RS1FX85TF
BS 500 501 RS1BO84TF
BS 502 502 RS1FX85TF
BS 503 516 RS1BO84TF
BS 517 517 RS1FX85TF
BS 518 636 RS1BO84TF
BS 637 637 RS1FX85TF
BS 638 655 RS1BO84TF
BS 656 656 RS1FX85TF
BS 657 667 RS1BO84TF
BS 668 676 RS1FX85TF

RD RS1BO84TF 667 0 0
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AGAGGCTGATGTCACGGTTTTAGTGGTTGGATTGGATCAGACGGTGGAAGCAGAGGGTCT
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TGCTGCAAAGAAAACTGT*GTTCTGGTCATAATGGCTGCTGGACCTATTGATATCTCATT
TGCCAAGAATCCGAGCAAGATTCGCGCGGTTTTATGGGTTGGTTATCCTGGTGAAGCTGG
AGGAGATGCTATAGCTCAAGTCATCTTTGGTGATCACAATCCTTCTGGGAGACTACCAGA
GACATGGTACTCACAAGAGTTTGCGGACAAGGTTGCTATGACTGATATGAACATGAGACC
TAACTCCACTTCTGGCTTCCCTGGAAGATCTTACAGATTCTACACAGGGAAACCCATTTA
CAAGTTTGGACATGGACTTAGTTACTCTTCTTTCTCTACTTTTCTTCTCTCAGCTCCATC
AACCATACATATCAAAACCAACCCAATCTTGAAACTAAACAAGACAACATCTATCGATAT
CTCCACGGTTAACTGCCACGATCTCAAGGTCAAGATTGTCATCGGAGTCAAGAACCATGG
GTCAAGG

QA 1 667 1 667
DS 

RD RS1FX85TF 676 0 0
GTGTAAAGATGTCAAGTGCGGTGACCAAACACTGATCGCAGCAGCAGTTAAAGCGGCATC
AGAGGCTGATGTCACGGTTTTAGTGGTTGGATTGGATCAGACGGTGGAAGCAGAGGGTCT
TGACCGGGTTAATCTAACACTTCCGGGCTATCAAGAAAAGCTGGTTAAAGATGTGACTAA
TGCTGCTAAGAAAACTGTTGTTTTGGTCATAATGGCTGCTGGACCTATTGATATCTCATT
TGCCAAGAATCTGAGTAAGATTCGCGCGGTTTTATGGGTTGGTTATCCTGGTGAAGCTGG
AGGAGATGCTATAGCTCAAGTCATCTTTGGTGATCACAATCCTTCTGGGAGACTACCAGA
GACGTGGTACTCACAAGTGTTTGCGGACAAGGTTGCTATGACTGATATGAACATGAGACC
TAACTCCACTTCTGGCTTCCCTGGAAGATCTTACAGATTCTACACAGGGAAACCCATTTA
CAAGTTTGGACATGGACTAAGCTACTCTTCTTTCTCCACTTTTGTTCTCTCAGCTCCATC
AACCATACATATCAAAACCAACCCAATCTTGAAACTAAACAAGACAACATCTGTCGATAT
CTCCACGGTTAACTGCCACGATCTGAAGGTCAAGATCGTCATCGGAGTCAAGAACAATGG
GTCAAGGTCCGGGAGC

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 4

CO CL2287Contig1 1160 4 28 U
GGAACCACTTACTTTTCTCATGCAAACCCTAATTTCGGCATCCTCTCTCATTTCTCTCTC
TTTCATCCTCCCTAGCTCTAAGCCAATCTCCACCGCACACTCTGTAACTCCCGCCTTTCT
CCGATGGAGGGGCCACGGCTTCCTCCTTCCGCCACCTTCCATGAATCCGACGATGACAAA
CCCGACGATCCTCCCCCCACCTGGCACCGTCCAACCTCGAGTCTCTCCGCATTGCCATCT
CAAGATACTCCACCACACCATTGGCGTAATCATTCTCTTAATCTCTCCCCAATCCTGGAC
ACACCTCAACGGTCTCTTCCTCCTCCGGATTCAATCCCTGAGCTAGAGACTTACGTTGTC
CAGGTACCAAGAGATCAAATCTATTGGACTCCTCCTCCGGAACACGCAAAGTACGTCGAG
AAACTCCGTAATAACCCGGAGAGAAACAAAAAGAATGGGTGTGCTAAACGTCTTATGTGG
TTCTTTATCATCTTGGTCATCTTTGGATTCATCCTCGGTGCCATCACTCTCATCCTTCAT
CTCGTTTTCAACCCCGCTCTTCCCGTTTTCGCGGTCGAGAGATTAACTGTAAAACCAAGT
AACTTCGAGGTCACGTTGAGAGCTGAGAATCCCACATCTAACATGGGGGTAAACTATATG
ATGAAACCAAACGGTGTCGTTTCGCTAACGTACAAGAACAAGAGACTGGGACGCGGGAAG
TTCCCAAAGATGTTCCAGGCCGCGTCTGGATCCGACAAGGTCAATGTGAAGCTGGATGGA
TCAACCAAAAACGCGGTTATGCCACCTCGGGGATCGAAACAACCGGTGGGTTTGGTGCTG
AAGATGGAGCTAAAGGCGGATTATGAAGCAGGTCCAGTGAAGAAGAACAAGGAAGTGGTG
GTGACTTGTGATGTTAAGGTTAAAGGGTTATTAGATGCAAAGAAGGTGGAGATTGTGTCG
GAGAATTGTGAGAGTGAGTTTAAGGACTGACACTCTCTATATATATATTTTTTTTGTTAT
ATATATGACGTGATTATGTCGTTAGATCTACAGTGTGCCTCAATAATTTATTACTTTCGA
TATAATGCTCAATTGTTCTGTTTTTTTTTCTGCCCCAAATGTCTTTGTTTTTAGTCACTA
TTATTGAGCGACAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
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15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
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15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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TTCC
AAAGATGTC

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G
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QA 1 716 1 716
DS 



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BQ
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AF RS1DE66JQ C 1
AF RS1DE66TF U 1
BS 1 537 RS1DE66TF

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RD RS1DE66TF 537 0 0
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QA 1 537 1 537
DS 



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TTTATCTTAGTTTGTACCAGATGGCTATCTTTTTGATATTCCTGCAACTCTCAAGAGATT
TTTTTAGTTTAAATCATAATCTGTTCTCCA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1F658TF U 1
AF RS1FQ27TF U 1
BS 1 216 RS1F658TF
BS 217 217 RS1FQ27TF
BS 218 570 RS1F658TF

RD RS1F658TF 570 0 0
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TCTAAAATGAAGGTTGTCGCCGCGTACCTGCTCGCTGCTTTGAGCGGAAAAGCTTCCCCG
ACCAGTGCCGATGTCAAGAGTATCCTCGGATCTGTTGGTTGTGAATCTGAAGACTCTCAG
ATTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTGAACGGGAAAGACTTGTGCGAACTGATCGCTGCTGGT
AGGGAGAAGTTGGCTTCTGTTCCAAGCGGTGGTGGTGGTGTTGCCATGGCCTCTGCTCCA
TCAGCCGGTGGTGGAGGAGGTGCTGCTCCTGCGGCTGAGGCCAAGAAGGAAGAGAAGAAA
GAAGAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGTCTTTTCGAGTAATGCTTGTCC
GCATTCTGTTTTTGTCGTCTTTTTCAGTTTGTGTTAAACCCTTTGGAACCTCTATGTTGT
TTTATCTTAGTTTGTACCAGATGGCTATCTTTTTGATATTCCTGCAACTCTCAAGAGATT
TTTTTAGTTTAAATCATAATCTGTTCTCCA

QA 1 570 1 570
DS 

RD RS1FQ27TF 553 0 0
GGGCCGTCTTCAAAAACACTCGTGAGCTTTCCTCCTCCTTCGAGATCTCCATCAACTTCT
TCTAAAATGAAGGTTGTCGCCGCGTACCTGCTCGCTGCTTTGAGCGGAAAAGCTTCCCCG
ACCAGTGCCGATGTCAAGAGTATCCTCGGATCTGTTGGTTGTGAATCTGAAGACTCTCAG
ATTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTGAACGGGAAAGACCTGTGCGAACTGATCGCTGCTGGT
AGGGAGAAGTTGGCTTCTGTTCCAAGCGGTGGTGGTGGTGTTGCCATGGCCTCTGCTCCA
TCAGCCGGTGGTGGAGGAGGTGCTGCTCCTGCGGCTGAGGCCAAGAAGGAAGAGAAGAAA
GAAGAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGTCTTTTCGAGTAATGCTTGTCC
GCATTCTGTTTTTGTCGTCTTTTTCAGTTTGTGTTAAACCCTTTGGAACCTCTATGTTGT
TTTTTCTTAGTTTGTACCAGATGGCTATCTTTTTGATATTCCTGCAACTCTCAAGAGATT
TTTTTAGTTTAAA

QA 1 553 1 553
DS 



AS 2 4

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CAGATCTGAAAAGATGGCGACGAAAACCTCTCAGCTTGCGTGTTCCTCCTCCACCACCAA
TCGCCAATTCCACTTCCAAAACCGATCGTTTCCATGCCTTAGGTCTCGCCCCGAGTCTTT
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AGCAGCTGAAGTTTCTAAACCTTTTGTTGAGAAAACACCAGCACCGGTAGAGGAACATGT
TGCCACGGCACAGCCGAAAAGAGCAGCAAAGATCCACGACTTCTGTTTCGGCATTCCTTA
TGGTGGTCTCGTTATGAGTGGAGGGTTGCTTGGGTTTGCGTTTTCACGGAACCTAACAAG
TTTAAGTACTGGGGTCCTCTACGGTGGTGGTCTTCTAGCTCTTAGTACATTGAGCTTAAA
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TGTCGTCTTCTGGAAGAACTTCGCAGCTTATTCTATGAATAAGAAGCTGTTTCCTGCTGG
TATTTTTGCTGTCGTCAGTGCTGCCATGTTGTGTTTCTATTCATATGTGGTGCTCTCTGG
AGGAAACCCACCTCCAAAGAAATTGAAACCTTCATACTGAAGAAGCTTCCCATAGGTTAG
ATTAAAGACATGGAGATCTCAGTCCTTTACGACTGGTGTGTTGGATTACTGGTGTAATTT
TATATACTTAATAGAGACGACTCCTTCTTTACAGTGTCATAATACAAAATATTTGAAGTT
TTGTTTGCTGGTGAGATGCTATGATTGTT


BQ
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AF RS1BF62TF U 1
AF RS1BF62JQ C 241
BS 1 556 RS1BF62TF
BS 557 869 RS1BF62JQ

RD RS1BF62TF 556 0 0
GGGAAACAAAAAAAAAAAACCAATTCTGCTTTGACTTTTGCACTTCAATTTTTTGAGTCT
CAGATCTGAAAAGATGGCGACGAAAACCTCTCAGCTTGCGTGTTCCTCCTCCACCACCAA
TCGCCAATTCCACTTCCAAAACCGATCGTTTCCATGCCTTAGGTCTCGCCCCGAGTCTTT
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AGCAGCTGAAGTTTCTAAACCTTTTGTTGAGAAAACACCAGCACCGGTAGAGGAACATGT
TGCCACGGCACAGCCGAAAAGAGCAGCAAAGATCCACGACTTCTGTTTCGGCATTCCTTA
TGGTGGTCTCGTTATGAGTGGAGGGTTGCTTGGGTTTGCGTTTTCACGGAACCTAACAAG
TTTAAGTACTGGGGTCCTCTACGGTGGTGGTCTTCTAGCTCTTAGTACATTGAGCTTAAA
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TGTCGTCTTCTGGAAG

QA 1 556 1 556
DS 

RD RS1BF62JQ 629 0 0
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TGCCACGGCACAGCCGAAAAGAGCAGCAAAGATCCACGACTTCTGTTTCGGCATTCCTTA
TGGTGGTCTCGTTATGAGTGGAGGGTTGCTTGGGTTTGCGTTTTCACGGAACCTAACAAG
TTTAAGTACTGGGGTCCTCTACGGTGGTGGTCTTCTAGCTCTTAGTACATTGAGCTTAAA
GATTTGGCGTCAGGGAAGATCTAGTTTCCCTTATATACTTGGTCAAGCAGTGCTTTCAGC
TGTCGTCTTCTGGAAGAACTTCGCAGCTTATTCTATGAATAAGAAGCTGTTTCCTGCTGG
TATTTTTGCTGTCGTCAGTGCTGCCATGTTGTGTTTCTATTCATATGTGGTGCTCTCTGG
AGGAAACCCACCTCCAAAGAAATTGAAACCTTCATACTGAAGAAGCTTCCCATAGGTTAG
ATTAAAGACATGGAGATCTCAGTCCTTTACGACTGGTGTGTTGGATTACTGGTGTAATTT
TATATACTTAATAGAGACGACTCCTTCTTTACAGTGTCATAATACAAAATATTTGAAGTT
TTGTTTGCTGGTGAGATGCTATGATTGTT

QA 1 629 1 629
DS 



CO CL2289Contig2 885 2 6 U
TTTTTTGAGTCTCAGATCTGAAAAGATGGCGACGAAAATCTCTCAGCTTGCGTGTTTCTC
CTCCACCACCAATCGCCAATTCCACTTCCAAAACCGACCGTTTCCACGCCTTAGGTCTCA
CCCCGAGTCTTTTGTAGTTAGAAGCGTTGATGGGAACAGCTCACAAACACCACCTTCTCT
GAGCTATTCAGCAGCTGAAGTTTCTAAACCTTTTGTTGAGAAAACACCAGAACCGGTAGA
GGAACATGTTGCCACGGCACAGCCGAAAAGAGCAGCAAAGATCCACGACTTCTGTTTCGG
CATTCCTTATGGTGGTCTCGTAATGAGTGGAGGGTTGCTTGGATTTGCGGTTTCACGGAA
CCTAACAAGTTTAAGTACTGGGGTCCTCTACGGTGGTGGCCTTCTAGCTCTTAGTACATT
GAGCTTAAAGATTTGGCGTCAGGGACAATCTAGTTTCCCTTATATACTTGGTCAAGCAGT
GCTTTCAGCTGTCGTCTTCTGGAAGAACTTCACTGCTTATTCTATGAATAAGAAGCTGTT
TCCTGCTGGTATTTTTGCTGTCGTCAGTGCTGCCATGTTGTGTTTCTATTCATATGTGGT
GCTCTCTGGAGGAAACCCACCTCCAAAGAAATTGAAACCTTCATACTGAAGAAGCTTCAT
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GTGTGTTGGATTACTGGTTTAATTTTATATACTTAATAGAGACGACTCCTTCTTTACAGT
GTCATAATACAAAATATTTGAAGTTTTGTTTGCTGGTGAGATGCTATGATTGTTATCTTC
ATCGAATTTGAAATACTCTGATGTAAATTAAATATCTAGGTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GL02TF U 1
AF RS1GL02JQ C 73
BS 1 614 RS1GL02TF
BS 615 615 RS1GL02JQ
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GAGCTATTCAGCAGCTGAAGTTTCTAAACCTTTTGTTGAGAAAACACCAGAACCGGTAGA
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GAGCTTAAAGATTTGGCGTCAGGGACAATCTAGTTTCCCTTATATACTTGGTCAAGCAGT
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TCCTGCTGGTATTTTTGCTGTCGTCAGTGCTGCCATGTTGTGTTTCTATTCATATGTGGT
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DS 

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CACGGCACAGCCGAAAAGAGCAGCAAAGATCCACGACTTCTGTTTCGGCATTCCTTATGG
TGGTCTCGTAATGAGTGGAGGGTTGCTTGGATTTGCGGTTTCACGGAACCTAACAAGTTT
AAGTACTGGGGTCCTCTACGGTGGTGGCCTTCTAGCTCTTAGTACATTGAGCTTAAAGAT
TTGGCGTCAGGGACAATCTAGTTTCCCTTATATACTTGGTCAAGCAGTGCTTTCAGCTGT
CGTCTTCTGGAAGAACTTCACTGCTTATTCTATGAATAAGAAGCTGTTTCCTGCTGGTAT
TTTTGCTGTCGTCAGTGCTGCCATGTTGTGTTTCTATTCATATGTGGTGCTCTCTGGAGG
AAACCCACCTCCAAAGAAATTGAAACCTTCATACTGAAGAAGCTTCATACTGAAGAAGCT
TCCCATAGGTTAGATTAAAGACATGGAGATCTCAGTCTTTTACGACTGGTGTGTTGGATT
ACTGGTTTAATTTTATATACTTAATAGAGACGACTCCTTCTTTACAGTGTCATAATACAA
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ATACTCTGATGTAAATTAAATATCTAGGTTGGC

QA 1 813 1 813
DS 



AS 1 4

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TCTTCTCTTCTAGCCTCTTGCAGTGGTGACAACACCGTTAGAATCTGGCAACAGTCCGCT
CTCTCTCGCTCCTGGTCCTGCAAGGCAGTTTTAGAAGAAACGCACACAAGAACTGTGAGG
CCGTGTTCTTGGTCACCTTCTGGGAAGTTATTGGCCACTGCAAGTTTCGATGGCACCACT
GGTATTTGGGAAGACTTTGGGGATGAGTTCGAGTGTATTTCCACATTGGAGGGACATGAA
AACGAAGTCAAGAGTGTATCTTGGAATGCATCTGGTTCATACCTTGCAACATGTAGCAGA
GACAAATCTGTGTGGATTTGGGAAGTGCTAGGAGGGAATGAATATGATTGTGCTGCAGTC
TTGAATGGTCATACACAAGATGTTAAGATGGTTCAGTGGCATCCCACCATGGATGTTTTA
TTTTCTTGCAGTTATGATAACACCATCAAGGTTTGGTGGGCTGAAGATGACGATGGTGAT
TATCAATGTGTCCAGACCTTAAATGAATCTAGCAATGGTCACTCCTCTACTGTCTGGGCC
ATCTCGTTTAACGCTACTGGGGACAAGACGGTCACCTGTAGTGATGATCTAACCTTGAAG
ATATGGACCGCAGATATTTCCATGATGCACTCTGGTGAAGGATATGCACCGTGGACTCAT
CTTTGTACACTTTCTGGTTATCATGACCGTACCATATTCTCAAGTCACTGGTCAAGCGAT
GACATTATTGCCAGTGGAGCTGGTGATGATGCCATAGGGTTGTTTGTGGACAGCGAACAT
GACTCTGTTAATGGACCTTCGTATAATCTTTTACTCAAGAAGGAAAAAGCACATGAAATG
GATATAAACTCTGTTCAATGGTCACCCAGTAAGGAGAACAGGTTGCTTGCCTCGGCCAGT
GATGATGGAATGGTGAAGATTTGGCAGCTGGAAACTAAACCGTGAATGGTATTTGTTTTG
GTTAGCTTTTGAAACTTCTTTGATGTTTATTTTTCTTGAGATATAATATTATGTAACAAT
ATAATATCATAGCAACAAGAGAACTTTCTTTTCTTTTGAACAACAAGAAAACTTTAAACT
TCATCTGCCTTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GT24TF U 1
AF RS1F386TF U 78
AF RS1F386JQ C 442
AF RS1GT24JQ C 654
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GTACAGAAGCTGGAAGGCCACACCGACCGAGTTTGGAACGTGGCCTGGAACCCTGTCTCT
TCTTCTCTTCTAGCCTCTTGCAGTGGTGACAACACCGTTAGAATCTGGCAACAGTCCGCT
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CCGTGTTCTTGGTCACCTTCTGGGAAGTTATTGGCCACTGCAAGTTTCGATGGCACCACT
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TTTTCTTGCAGTTATGATAACACCATCAAGGTTTGGTGGGCTGAAGATGACGATGGTGAT
TATCAATGTGTCCAGACCTTAAATGAATCTAGCAATGGTCACTCCTCTACTGTCTGGGCC
ATCTCGTTTAACGCTAC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RS1F386TF 660 0 0
G
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TGCAGTGGTGACAACACCGTTAGAATCTGGCAACAGTCCGCTCTCTCTCGCTCCTGGTCC
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TCTGGGAAGTTATTGGCCACTGCAAGTTTCGATGGCACCACTGGTATTTGGGAAGACTTT
GGGGATGAGTTCGAGTGTATTTCCACATTGGAGGGACATGAAAACGAAGTCAAGAGTGTA
TCTTGGAATGCATCTGGTTCATACCTTGCAACATGTAGCAGAGACAAATCTGTGTGGATT
TGGGAAGTGCTAGGAGGGAATGAATATGATTGTGCTGCAGTCTTGAATGGTCATACACAA
GATGTTAAGATGGTTCAGTGGCATCCCACCATGGATGTTTTATTTTCTTGCAGTTATGAT
AACACCATCAAGGTTTGGTGGGCTGAAGATGACGATGGTGATTATCAATGTGTCCAGACC
TTAAATGAATCTAGCAATGGTCACTCCTCTACTGTCTGGGCCATCTCGTTTAACGCTACT
GGGGACAAGACGGTCACCTGTAGTGATGATCTAACCTTGAAGATATGGACCGCAGATAT

QA 2 660 2 660
DS 

RD RS1F386JQ 737 0 0
GAAGTGCTAGGAGGGAATGAATATGATTGTGCTGCAGTCTTGAATGGTCATACACAAGAT
GTTAAGATGGTTCAGTGGCATCCCACCATGGATGTTTTATTTTCTTGCAGTTATGATAAC
ACCATCAAGGTTTGGTGGGCTGAAGATGACGATGGTGATTATCAATGTGTCCAGACCTTA
AATGAATCTAGCAATGGTCACTCCTCTACTGTCTGGGCCATCTCGTTTAACGCTACTGGG
GACAAGACGGTCACCTGTAGTGATGATCTAACCTTGAAGATATGGACCGCAGATATTTCC
ATGATGCACTCTGGTGAAGGATATGCACCGTGGACTCATCTTTGTACACTTTCTGGTTAT
CATGACCGTACCATATTCTCAAGTCACTGGTCAAGCGATGACATTATTGCCAGTGGAGCT
GGTGATGATGCCATAGGGTTGTTTGTGGACAGCGAACATGACTCTGTTAATGGACCTTCG
TATAATCTTTTACTCAAGAAGGAAAAAGCACATGAAATGGATATAAACTCTGTTCAATGG
TCACCCAGTAAGGAGAACAGGTTGCTTGCCTCGGCCAGTGATGATGGAATGGTGAAGATT
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GATGTTTATTTTTCTTGAGATATAATATTATGTAACAATATAATATCATAGCAACAAGAG
AACTTTCTTTTCTTTTG

QA 1 737 1 737
DS 

RD RS1GT24JQ 563 0 0
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CTTGAAGATATGGACCGCAGATATTTCCATGATGCATTCTGGTGAAGGATATGCACCGTG
GATTCATCTTTGTACACTTTCTGGTTATCATGACCGTACCATATTCTCAAGTCACTGGTC
AAGCGATGACATTATTGCCAGTGGAGCTGGTGATGATGCCATAGGGTTGTTTGTGGACAG
CGAACATGACTCTGTTAATGGACCTTCGTATAATCTTTTACTCAAGAAGGAAAAAGCACA
TGAAATGGATATAAACTCTGTTCAATGGTCACCCAGTAAGGAGAACAGGTTTCTTGCCTC
GGCCAGTGATGATGGAATGGTGAAGATTTGGCAGCTGGAAACTAAACCGTGAATGGTATT
TGTTTTGGTTAGCTTTTGAAACTTCTTTGATGTTTATTTTTCTTGAGATATAATATTATG
TAACAATATAATATCATAGCAACAAGAGAACTTTTTTTTTTTTTGAACAACAAGAAAACT
TTAAACTTCATCTGCCTTGATCC

QA 1 563 1 563
DS 



AS 1 4

CO CL2291Contig1 1333 4 13 U
AAACATTACCAAACGGGCAGCAGTGTCATGATGTTTGAGGAAAACACACCTACTACTACT
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GGATACGGAATGGCTTGGTGATTGATTCATCATTACATTAGCAAGGATTTTTGAAGTCTT
AGTTTGCCAATAAATTCTACTTTTTGTGTTCTTACATATTCAAAACTTGTAATAAAGATG
TGTAGTGAAGAATAAACCGAGAAAGAATAAGAGTCATCATCACTCCACATTTTTTTCTTC
AGAGGCTTCTATTGTGTCACCAGCCACTTCAGGTTCTTCTTCAGAAGTATTGTTGTCTTC
TATTGTGTTACTATCTTCAGATTCACCAGCGCTTATCAAACTAAACTTAAGACTGATAGG
TCTGCCCATAAGCTCCTTCCCGTCGAGTTTAGAGATTGCATCCTCAGCTTCTTCTCTAGT
AATGAACGAGACAAAGCCATAGCCAGAAGCTCTTCCTCCAGGGTCAGCGAAAACAACACG
AGCTGAGACCAGGTTGAAGTCAGCAGCAGTGAAGAACTCACGGAGATGAGTGGATCTCGC
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CCTCCCTGAGACTTGGAAAGAATCGAACTTTTCAACAGCGGATTGAACTTCTTCTCCAGA
AGACATGGTTACGAAAGCAAAGCCTCTGTTTTTCCCATCTTTTTGCTTTATTATCTCGAC
GCTTAAGACAGTTCCGCATTGTCCGAAGAGGTTGGAGATGTCGTTGACACTCATAGACCA
GGGGAGATTGAACACAAAGAGCTTCCTTTTGAGATTCGTCGTCTGGGTGGTTTCTTCGGT
CTTCTCATCCGTAAGGGAAGTTTCTTCCTCTGCGACGGAAGAGAATACAGAGACGAGTCG
CCGAGCACGAAGAGGAATACTGAGAGGGGAGACGGGAGAGAGGTTAGTGGGAGTTCGAAT
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AGAAGAAGAGGAGGAGGATGAGGAGAAAGAGAGGATGGAGAGAGCAGCTTCGAGGACCGC
CATTGTTAGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DL67JQ C 1
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AAAA

QA 1 417 1 417
DS 

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T
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TGTTACTATCTTCAGATTCACCAGCGCTTATCAAACTAAACTTTAGATTGATAGGTCTGC
CCATTAGCTCCTTCCCGTCGAGTTTAGAGATTGCATCCTCAGCTTCTTCTCTAGTAAGGA
ACGAGACAAAGCCATAGCCAGAAGCTCTACCTCCAGGGTCAGCGAAAACAACACGAGCTG
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QA 2 247 2 247
DS 

RD RS1CP04JQ 748 0 0
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TAAAGATGTGTAGTGAAGAATAAACCGAGAAAGAATAAGAGTCATCATCACTCCACATTT
TTTTCTTCAGAGGCTTCTGTTGTGTCACTAGCCTCTTCAGGTTCTTCTTCAGAAGTATTG
TTGTCTTGTATTGTGTTACTATCTTCAGATTCACCAGCGCTTCTCAAACTAAACTTAAGA
CTGATAGGTCTGCCCATAAGCTCCTTCCCGTCGAGTTTAGAGATTGCATCCTCAGCTTCT
TCTCTAGTAATGAACGAGACAAAGCCATAGCCAGAAGCTCTTCCTCCAGGGTCAGCGAAA
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CTTATGATCCTCCCTGAGACTTGGAAAGAATCGAACTTTTCAACAGCGGATTGAACTTCT
TCTCCAGAAGACATGGTTACGAAAGCAAAGCCTCTGTTTTTCCCATCTTTTTGCTTTATT
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ATAGACCAGGGGAGATTGAACACAAAGA

QA 1 748 1 748
DS 

RD RS1CP04TF 748 0 0
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ATGAGTGGATCTCGCTTTCCAAGCGAGGTTAGAGACGTAGAGTTTGTGACGTGTTTCTCC
AGGGGAAGAAGAAGCAGAAGGAGGAAGGGGCTTAGGAGGCTTCTTGAACTTTCTTGCAAA
GCTAACCCTTATGATCCTCCCTGAGACTTGGAAAGAATCGAACTTTTCAACAGCGGATTG
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CTTTATTATCTCGACGCTTAAGACAGTTCCGCATTGTCCGAAGAGGTTGGAGATGTCGTT
GACACTCATAGACCAGGGGAGATTGAACACAAAGAGCTTCCTTTTGAGATTCGTCGTCTG
GGTGGTTTCTTCGGTCTTCTCATCCGTAAGGGAAGTTTCTTCCTCTGCGACGGAAGAGAA
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AGTGGGAGTTCGAATACTTAAGGAGATGGGTTTAGTTTGCCTAGAGAAGAGATGAGGTTT
TGAGGATGAGGAGGAAGAAGAAGAGGAGGAGGATGAGGAGAAAGAGAGGATGGAGAGAGC
AGCTTCGAGGACCGCCATTGTTAGTCCC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 4

CO CL2292Contig1 1209 4 35 U
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GAACAGGCAAACTGATTGAACTTCTGCTGAAGACTTCGAAACCATGTCTTGTCTGGGTAG
GATCTTGTCTGTTTCCTACCCACCTGATCCGTACGGCTCCCGTTTTTCAGTGTCAAAGCT
ATCTTCACTTAGGCCAAATCGAAGGCCGAGATGGCGTTTCACGGCCTTGGACTCAGACTC
TTCCTCTCTCGATTCCGACTCCTCCGACAAATTCGCTGCCGGCTTTTGTATCATAGAAGG
ACCTGAAACAGTACAGGACTTTGCCAAAATGCAATTACAAGAGATTCAAGATAACATTAG
AAGCCGACGAAACAAGATCTTCTTGCACATGGAAGAGGTACGGAGGCTAAGAATACAACA
AAGGATTAGAAACACAGAGCTTGGAATCGTAGACGAAGAGCAAGAACACGAGTTACCTAA
CTTCCCGTCTTTTATCCCATTCTTACCTCCATTGACTGCTGCCAATTTGAGAGTGTATTA
CGCAACTTGCTTCTCACTCATCGCTGGGATCATCCTATTTGGTGGCCTACTAGCTCCTAC
TCTAGAGCTGAAGCTAGGTATAGGAGGCACATCATATAAAGATTTCATTCAAAGCCTTCA
TCTACCTATGCAACTGAGTCAAGTAGACCCAATAGTAGCGTCCTTCTCCGGAGGAGCTGT
TGGTGTGATCTCAGCTTTGATGGTAGTTGAAGTCAACAACGTGAAGCAGCAAGAGCACAA
GAGATGCAAATACTGTCTAGGAACTGGGTATCTAGCATGTGCTCGTTGCTCTAGCACAGG
TGCTCTTATTGTAGCTGAACCGGTCTCAGCTATTGCTGGAGGGAATCATTCTGTGTCAAC
ATCCAAAACCGAAAGATGTTCAAACTGTTCTGGTGCTGGAAAGGTGATGTGTCCGACATG
TCTGTGCACAGGGATGGCTATGGCTAGCGAGCACGACCCTCGTATCGATCCTTTCCTTTG
ATTCCACTTCTCCAAGAAATCTATTTGTCCTTGTAACTTAAACATTGTATGTACTGATGG
AATAATGAGAACCGTATCCTTTCATCTGTATATACACACAAAATGAAGTTGTTATATAAT
TGTTATTAGATAAACACTCTCCATATACTACTTAGTAGCTTTTTGAGTAATACTTTTTAC
TGATTCTTC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D353TF U 84
AF RS1DM08TF U 1
AF RS1FX33JQ C 456
AF RS1D353JQ C 636
BS 1 96 RS1DM08TF
BS 97 97 RS1D353TF
BS 98 112 RS1DM08TF
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BS 114 148 RS1DM08TF
BS 149 149 RS1D353TF
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BS 176 291 RS1DM08TF
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BS 410 489 RS1DM08TF
BS 490 490 RS1D353TF
BS 491 689 RS1DM08TF
BS 690 690 RS1D353TF
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BS 800 864 RS1FX33JQ
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BS 866 1108 RS1FX33JQ
BS 1109 1209 RS1D353JQ

RD RS1D353TF 624 0 0
GG
GCTGAAGACTTCGAAACCATGTCTTGTCTGGGTAGGATCTTGTCTGTTTCCTACCCACCT
GATCCGTACGGCTCCCGTTTTTCAGTGTCAAAGCTGTCTTCACTTAGGCCAAATCGAAGG
CTGAGATGGCGTTTCACGGCCTTGGACTCAGACTCTTCCTCTCTCGATTCTGACTCCTCC
GACAAATTCGCTGCCGGCTTTTGTATCATAGAAGGACCTGAAACAGTATAGGACTTTGCC
AAAATGCAATTGCAAGAGATTCAAGATAACATTAGAAGCCGACGAAACAAGATCTTCTTG
CACATGGAAGAGGTACGGAGGCTAAGAATACAACAAAGGATTAGAAACACAGAGCTTGGA
ATCGTAGACGAAGAGCAAGAACACGAGTTACCTAACTTCCCGTCTTTTATCCCATTCTTA
CCTCCATTGACTGCTGCCAATTTGAGAGTGTATTACGCAACTTGCTTCTCACTCATCGCT
GGGATCATCCTATTTGGTGGCCTACTAGCTCCTACTCTAGAGCTGAAGCTAGGTATAGGA
GGCACATCATATAAAGATTTCATTCAAAGCCTTCATCTACCTATGCAACTGAGTCAAGTA
GACCCAATAGTAGCGTCCTTCT

QA 3 624 3 624
DS 

RD RS1DM08TF 801 0 0
GGGGTCTCGATTTCTGATTTCTCACTGTACGACCAAAACGATCACCACACACACATAAAA
GAACAGGCAAACTGATTGAACTTCTGCTGAAGACTTGGAAACCATGTCTTGTTTGGGTAG
GATCTTGTCTGTTTCCTACCCACCTGATTCGTACGGCTCCCGTTTTTCAGTGTCGAAGCT
ATCTTCACTTAGGCCAAATCGAAGGCCGAGATGGCGTTTCACGGCCTTGGACTCAGACTC
TTCCTCTCTCGATTCCGACTCCTCCGACAAATTCGCTGCCGGCTTTTGTATTATTGAAGG
ACCTGAAACAGTACAGGACTTTGCTAAAATGCAATTACAAGAGATTCAAGATAACATTAG
AAGCCGTCGAAACAAGATCTTCTTGCACATGGAAGAGGTACGGAGGCTGAGAATACAACA
AAGGATTAGAAACACAGAGCTTGGAATCGTAGACGAAGAGCAAGAACACGAGTTACCTAA
CTTCCCGTCCTTTATCCCATTCTTACCTCCATTGACTGCTGCCAATTTGAGAGTGTATTA
CGCAACTTGCTTCTCACTCATCGCTGGGATCATCCTATTTGGTGGCCTACTAGCTCCTAC
TCTAGAGCTGAAGCTAGGTATAGGAGGCACATCATATAAAGATTTCATTCAAAGCCTTCA
TCTACCTATGCAACTGAGTCAAGTAGACC*AATAGTAGCGTCCTTCTCCGGAG*AGCTGT
TGGTGTGATCTCAGCTTTGATGGTAGTTGAAGTCA**CACGTGAAGCAGCA*GAGCACA*
GAGATGCAAATACTGTCTA
TG

QA 1 799 1 799
DS 

RD RS1FX33JQ 654 0 0
AAGAGCAAGAACACGAGTTACCTAACTTCCCGTCTTTTATCCCATTCTTACCTCCATTGA
CTGCTGCCAATTTGAGAGTGTATTACGCAACTTGCTTCTCACTCATCGCTGGGATCATCC
TATTTGGTGGCCTACTAGCTCCTACTCTAGAGCTGAAGCTAGGTATAGGAGGCACATCAT
ATAAAGATTTCATTCAAAGCCTTCATCTACCTATGCAACTGAGTCAAGTAGACCCAATAG
TAGCGTCCTTCTCCGGAGGAGCTGTTGGTGTGATTTCAGCTTTGATGGTAGTTGAAGTCA
ACAACGTGAAGCAGCAAGAGCACAAGAGATGCAAATACTGTCTAGGAACTGGGTATCTAG
CATGTGCTCGTTGCTCTAGCACAGGTGCTCTTATTGTAGCTGAACCGGTTTCAGCTATTG
CTGGAGGGAATCATTCTGTGTCAACATCCAAAACCGAAAGATGTTCAAACTGTTCTGGTG
CTGGAAAGGTGATGTGTCCGACATGTCTGTGCACAGGGATGGCTATGGCTAGCGAGCACG
ACCCTCGTATCGATCCTTTCCTTTGATTCCACTTCTCCAAGAAATCTATTTGTCCTTGTA
ACTTAAACATTGTATGTACTGATGGAATAATGAGAACCGTATCCTTTCATCTG
C

QA 1 653 1 653
DS 

RD RS1D353JQ 574 0 0
ATAAAGATTTCATTCAAAGCCTTCATCTACCTATGCAACTGAGTCAAGTAGACCCAATAG
TAGCGTCCTTCTCCGGAGGAGCTGTTGGTGTGATCTCAGCTTTGATGGTAGTTGAAGTCA
ACAACGTGAAGCGGCAAGAGCACAAGAGATGCAAATACTGTCTAGGAACTGGGTATCTAG
CATGTGCTCGTTGCTCTAGCACAGGTGCTCTTATTGTAGCTGAACCGGTCTCAGCTATTG
CTGGAGGGAATCATTCTGTGTCAACATCCAAAACCGAAAGATGTTCAAACTGTTCTGGTG
CTGGAAAGGTTATGTGTCCGACATGTCTGTGCACAGGGATGGCTATTGCTAGCGAGCACG
ACCCTCGTATCGATCCTTTCCTTTGATTCCACTTCTCCAAGAAATCTATTTGTCCTTGTA
ACTTAAACATTGTATGTACTGATGGAATAATGAGAACCGTATCCTTTCATCTGTATATAC
ACACAAAATGAAGTTGTTATATAATTGTTATTAGATAAACACTCTCCATATACTACTTAG
TAGCTTTTTGAGTAATACTTTTTACTGATTCTTC

QA 1 574 1 574
DS 



AS 2 4

CO CL2293Contig1 635 2 4 U
GGACGAGTGAAGCTCACGATGGCGAGGATTAAGGTTCACGAACTGAGGGACAAGTCGAAG
AGCGATCTCCAGAATCAGCTTCAGGATCTTAAGGCTGAGCTCGCTCTCCTCCGTGTCGCT
AAAGTCACCGGTGGTGCTCCCAACAAGCTCTCCAAAATCAAGGTTGTCCGCAAATCCATT
GCTCAGGTCTTGACAGTGACATCTCAGAAGCAGAAGTCTGCTCTCAGGGAAGCATACAAG
AACAAGAAGTTCATTCCTCTTGATCTCCGTCCAAAGAAGACCCGTGCTATCCGCAGGCGC
CTAACCAAACATCAGCTCTCGCTGAAGACTGAACGTGAGAAGAAGAAGGAAATGTATTTC
CCAATCAGGAAGTACGCCATCAAAGTTTAAGTTACCTGTCTTTTAAAAAAAAAATCTTTC
TACTAGAAACTCTGTTTCAGCTTTGTTGTTTGATGGAAACTTGTTTTTGTTCTTCACTTG
TGTCAGCAAAATGGATCTCTGTTTCAGCCTTAATGTTTTGAAAATCCTATCTTTGCAAGT
TTTTGTTTTGCTTTAGTGAAAAAAACACGCCCGTCCTTAACTTTTCTTTTGCTATTCTGG
CTTTGATTCATTAATTTGAAACTTAACAAAGTCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EC02TF U 1
AF RS1BX42TF U 100
BS 1 508 RS1EC02TF
BS 509 509 RS1BX42TF
BS 510 534 RS1EC02TF
BS 535 635 RS1BX42TF

RD RS1EC02TF 534 0 0
GGACGAGTGAAGCTCACGATGGCGAGGATTAAGGTTCACGAACTGAGGGACAAGTCGAAG
AGCGATCTCCAGAATCAGCTTCAGGATCTTAAGGCTGAGCTCGCTCTCCTCCGTGTCGCT
AAAGTCACCGGTGGTGCTCCCAACAAGCTCTCCAAAATCAAGGTTGTCCGCAAATCCATT
GCTCAGGTCTTGACAGTGACATCTCAGAAGCAGAAGTCTGCTCTCAGGGAAGCATACAAG
AACAAGAAGTTCATTCCTCTTGATCTCCGTCCAAAGAAGACCCGTGCTATCCGCAGGCGC
CTAACCAAACATCAGCTCTCGCTGAAGACTGAACGTGAGAAGAAGAAGGAAATGTATTTC
CCAATCAGGAAGTACGCCATCAAAGTTTAAGTTACCTGTCTTTTAAAAAAAAAATCTTTC
TACTAGAAACTCTGTTTCAGCTTTGTTGTTTGATGGAAACTTGTTTTTGTTCTTCACTTG
TGTCAGCAAAATGGATCTCTGTTTCAGCTTTAATGTTTTGAAAATCCTATCTTT

QA 1 534 1 534
DS 

RD RS1BX42TF 536 0 0
CTCGCTCTCCTCCGTGTCGCTAAAGTCACCGGTGGTGCTCCCAACAAGCTCTCCAAAATC
AAGGTTGTCCGCAAATCCATTGCTCAGGTCTTGACAGTGACATCTCAGAAGCAGAAGTCT
GCTCTCAGGGAAGCATACAAGAACAAGAAGTTCATTCCTCTTGATCTCCGTCCAAAGAAG
ACCCGTGCTATCCGCAGGCGCCTAACCAAACATCAGCTCTCGTTGAAGACTGAACGTGAG
AAGAAGAAGGAAATGTATTTCCCAATCAGGAAGTACGCCGTCAAAGTTTAAGTTACCTGT
CTTTTAAAAAAAAAATCTTTCTACTAGAAACTCTGTTTCAGCTTTGTTGTTTGATGGAAA
CTTGTTTTTGTTCTTCACTTGTGTCAGCAAAATGGATCTCTGTTTCAGCCTTGATGTTTT
GAAAATCCTATCTTTGCAAGTTTTTGTTTTGCTTTAGTGAAAAAAACACGCCCGTCCTTA
ACTTTTCTTTTGCTATTCTGGCTTTGATTCATTAATTTGAAACTTAACAAAGTCAA

QA 1 536 1 536
DS 



CO CL2293Contig2 618 2 3 U
GGCCAGCCAACTTTTAAAAGAGAGTAGTAGCGGCGCAGCAAGGTGAACACGAGTGAAGCT
CACGATGGCGAGGATTAAGGTTCACGAACTGAGGGACAAGTCGAAGAGCGATCTCCAGAA
TCAGCTTCAGGATCTTAAGGCTGAGCTCGCTCTCCTCCGTGTCGCTAAAGTCACCGGTGG
TGCTCCCAACAAGCTCTCCAAAATCAAGGTTGTCCGCAAATCCATTGCTCAGGTCTTGAC
AGTGACATCTCAGAAGCAGAAGTCTGCTCTCAGAGAAGCATACAAGAACAAGAAGTTCAT
TCCTCTTGATCTCCGTCCCAAGAAGACCCGTGCTATCCGCAGGCGCCTCACCAAACATCA
GCTCTCGTTGAAGACTGAACGTGAGAAGAAGAAGGAAATGTATTTCCCAATCAGGAAGTA
CGCCATCAAAGTTTAAGTTACCTGTCCTTTCAAAAAATCGTTCTACTAGAAACTCTGTTT
CAGCTTTGTTGTTTGATGAAAACTTGTTTTTGTTCTTCACTTGTGTCAGCAAAATGGATC
TTGGTTCCTATTGATGTTTTGACAATTCTATTTTGCAAGTTTTGTGTTGCTTAGTGAAAA
AAAACACACGCTTATCCC


BQ
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20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1ES55JQ C 1
AF RS1ES55TF U 1
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AAAACACACGCTTATCCC

QA 1 618 1 618
DS 

RD RS1ES55TF 618 0 0
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CACGATGGCGAGGATTAAGGTTCACGAACTGAGGGACAAGTCGAAGAGCGATCTCCAGAA
TCAGCTTCAGGATCTTAAGGCTGAGCTCGCTCTCCTCCGTGTCGCTAAAGTCACCGGTGG
TGCTCCCAACAAGCTCTCCAAAATCAAGGTTGTCCGCAAATCCATTGCTCAGGTCTTGAC
AGTGACATCTCAGAAGCAGAAGTCTGCTCTCAGAGAAGCATACAAGAACAAGAAGTTCAT
TCCTCTTGATCTCCGTCCCAAGAAGACCCGTGCTATCCGCAGGCGCCTCACCAAACATCA
GCTCTCGTTGAAGACTGAACGTGAGAAGAAGAAGGAAATGTATTTCCCAATCAGGAAGTA
CGCCATCAAAGTTTAAGTTACCTGTCCTTTCAAAAAATCGTTCTACTAGAAACTCTGTTT
CAGCTTTGTTGTTTGATGAAAACTTGTTTTTGTTCTTCACTTGTGTCAGCAAAATGGATC
TTGGTTCCTATTGATGTTTTGACAATTCTATTTTGCAAGTTTTGTGTTGCTTAGTGAAAA
AAA*CACACGCTTATCCC

QA 1 618 1 618
DS 



AS 1 3

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TTGCATCTGAACTTAAAACTGAGCTTCTAAAGATAGTTGAGAACAATAGGAGCACAGAGG
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AGCTTTTGGATCACCCAGCTTTTGATCTGCGCAATCCAAACAAGGTTTACTCGCTCATTG
GAGGGTTCTGCGGTTCGCCAGTGAATTTCCATGCAAAAGATGGATCAGGTTACAAGTTCT
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CTGCGTTTTCGAGGTGGAAGCGCTACGATGAAACCCGACAAGCTCTGGCCAAGGCACAGT
TGGAGATGATAATGTCAGCTAATGGGTTATCTGAAAATGTATTTGAGATTGCCTCTAAGA
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GTTATGAGCTTTTTACATTCAACGCATGCACTTTTATAATAAACTGATCCTGAACGTCGC
GTGTTTTTCTTTTTATGTTATGAACTTTGTCTCCAACGAAATGATGTTTTTCTTATCTAT
CAATTAGAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F336TF U 68
AF RS1BY50TF U 1
AF RS1BY50JQ C 157
BS 1 652 RS1BY50TF
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BS 654 738 RS1BY50TF
BS 739 910 RS1BY50JQ

RD RS1F336TF 628 0 0
G
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GAGGTCCTTGCTGACTTCTATAACAAGTGGCAGGGCGATTACTTGGTCGTTAATAAATGG
TTCCTCCTTCAAGCATCATCCGACATTCCCGGGAATGTGGAGAATGTCAAGAAGCTTTTG
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TGCGGCTCGCCAGTGAATTTCCATGCAAAAGATGGATCAGGTTACAAGTTCTTGGGTGAC
ATTGTTGTCCAGTTAGACAAAATCAATCCCCAGGTTGCTTCTCGTATGGTATCTGCCTTT
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ATAATGTCAGCTAATGGGTTATCTGAA

QA 2 628 2 628
DS 

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CTTATGTATTTGACCACCCCAACATGGCTAGGCGTGCTTTGAAGAACACGGCTCTAGCTT
ATCTTGCATCGCTTGAGGATCCAGCATACGTGGAACTTGCATTGGGTGAATACAAGTCGG
CCACCAATTTGACAGACCAAATTGCTGCTTTGGCAGCTCTTGCACAAAAGCCGGGTAAAA
CCCGTGACGAGGTTCTTGCTGACTTCTATAACAAGTGGCAGGGCGATTACTTGGTCGTTA
ATAAATGGTTCCTCCTTCAAGCATCGTCCGACATTCCCGGGAATGTGGAGAATGTCAAGA
AGCTTTTGGATCACCCAGCTTTTGATCTGCGCAATCCAAACAAGGTTTACTCGCTCATTG
GAGGGTTCTGCGGTTCGCCAGTGAATTTCCATGCAAAAGATGGATCAGGTTACAAGTTCT
TGGGTGACATTGTTGTCCAATTAGACAAAATCAATCCTCAGGTTGCTTCTCGTATGGTAT
CTGCGTTTTCGAGGTGGAAGCGCTACGATGAAACCCGACAAGCTCTGGCCAAAGCACAGT
TGGAGATGATAATGTCAGCTAATGGGTTATCTGAAAATGTATTTGAGATTGCCTCTAAGA
GCTTGGCTACTTGAGAGA
CCACATCAAGAATC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1BY50JQ 754 0 0
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CTCTTGCACAAAAGCCGGGTAAAACCCGTGACGAGGTTCTTGCTGACTTCTATAACAAGT
GGCAGGGCGATTACTTGGTCGTTAATAAATGGTTCCTCCTTCAAGCATCGTCCGACATTC
CCGGGAATGTGGAGAATGTCAAGAAGCTTTTGGATCACCCAGCTTTTGATCTGCGCAATC
CAAACAAGGTTTACTCGCTCATTGGAGGGTTCTGCGGTTCGCCAGTGAATTTCCATGCAA
AAGATGGATCAGGTTACAAGTTCTTGGGTGACATTGTTGTCCAATTAGACAAAATCAATC
CTCAGGTTGCTTCTCGTATGGTATCTGCGTTTTCGAGGTGGAAGCGCTACGATGAAACCC
GACAAGCTCTGGCCAAGGCACAGTTGGAGATGATAATGTCAGCTAATGGGTTATCTGAAA
ATGTATTTGAGATTGCCTCTAAGAGCTTGGCTACTTGAGAGACCACATCAAGAATCAATT
CTACTCGTAGCTCCGGATTATCATGTTATGAGCTTTTTACATTCAACGCATGCACTTTTA
TAATAAACTGATCCTGAACGTCGCGTGTTTTTCTTTTTATGTTATGAACTTTGTCTCCAA
CGAAATGATGTTTTTCTTATCTATCAATTAGAAG

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 4

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AAGGCCGCAATTGAACAGATCGAGCAAGTTCAAATTGACGTAACATAAAACCTATTAATG
CGAAAGCACCGTGGAGAGCAACAAAAGCCCACAGACCGCCTAATTGACACCAACGAGTAA
AATCTCCTTGTGCTTCAGGACCCCACAGTAACAACAAAGAATGCGCTAAACTATTAGCAG
GAGTAGAAACTGCAGCGGTTAAAAAATTGCAACCTTCTAAATAGGAACTAGCCAATCCAT
GAGTATACCATGAAGTTACAAAGGTTGTACCTGTGAACCAACCCCCCAAAGCGAAATAGG
CACAAGGAAAGAGCAATAGACCAGACCAACCTACAAAAACGAAGCGGTCCCTCCGTAACC
AGTCATCCATAATATCAAATAAATCTTTTTCGTCTTTGGTAAATTTACCAAGGGCTATAG
TCATAGCGATCCTCCTATTCATCTACTTCAACCATTTCCGAACACCTTTATATATCTTAA
TGTTATATATTATGGCATTTTCAGGGCGCTCAAAATTCTATCATTTATTTATAATTTGAT
TTCTCGCGCACTGCCCCATAAAATTGAACCTTTAGAATTTCATTTAATTGGTTTCGAAGA
TCAAAATATTTTATTTTATTGGTCCTTACTTAGGTAAACGCATCAACTCAAATTGTTTCT
TCCTTGCTATTAGTTTATTAATAAGTAGTTGAATCTAAATCATGAATTGTCAGATGACTC
ATTACTCAGATAAAGAAATCTTTTTTTTCTATTTTATTTGATATCTACATGTCCATGCCG
GTAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BH31TF C 706
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C

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DS 



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BQ
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AF RS1DD81JQ U 1
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TACAACTTCCCAAGGTTTTATTGTAGTATGGTGTTTCTGATTTTAAACAAGTGTGTAAAC
TCGAAAACTCTTTCAACTCAAGTAACTCAACTAATAGAATACTCCCCTCCCTGTGAGAAC
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CTGAAGGAATGGCTAAGCGTATTCCATCTAGCTCTGGTTTTGCTATGACTTGACATCCCA
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GTTCTTCCAGTTTGTTGTAGTACTCCGTGTCCATAACAATCACATGGCACGTGGAACAGG
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TGTTCATTCCAACTGGGACCTTAATATGAATCTCCTCTCCATCTTTATCAACAAAGATAA
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QA 1 665 1 665
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AGTGAGGTTTTGGAACGAATCCATCAACTGCAAAATTCCTAGTGGCTGAAGGAATGGCTA
AGCGTATTCCATCTAGCTCTGGTTTTGCTATGACTTGACATCCCAATCGCGACGTTTCTG
TTAACCCAAAAGCAAGATCCAGCATATCATTCTCTTCATCTGTTGGTTCTTCCAGTTTGT
TGTAGTACTCCGTGTCCATAACAATCACATGGCACGTGGAACAGGCTAGAGAACATTCAC
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GGACCTTAATATGAATCTCCTCTCCATCTTTATCAACAAAGATAACGTTTATCTTTTCTG
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GCTGAGGTTGCCTCTGTAGTACAACAGCCGAAGAAGATTGCAGATATCGAGCATAAGACC
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TGCGAGAGCCTAATCTTGATAGCCTATGGAAGAGCATGATTCTGGCGCCCACGAAAGCCC
AGTTTATAGAAGATTCGACGAAAGGAAGAGACTTTTTCTTAAGAGTGATTGAAGATTGAT
GGAGGAAAGGGGAACAAAGAGAGGACTTAGGGCTCCTCTCC

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DS 

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CTAGCTCTGGTTTTGCTATGACTTGACATCCCAATCGCGACGTTTCTGTTAACCCAAAAG
CAAGATCCAGCATATCATTCTCTTCATCAGTTGGTTCTTCCAGTTTGTTGTAGTACTCCG
TGTCCATAACAATCACATGGCACGTGGAACAGGCTAGAGAACATTCACAAGCCCCTTCGA
GTTCGATATCGTTTTCATGAGCAGCTTCAAGGATGTTCATTCCAACTGGGACCTTAATAT
GAATCTCCTCTCCATCTTTATCAACAAAGATAACGTTTATCTTTTCTGTTTCAGAGACAG
TGCTGAACGATGTACACCGATGATGATTATTGTTTGAGAAAAAAGCTTGCTGAGGTTGCC
TCTGTAGTACAACAGCCGAAGAAGATTGCAGATATTGAGCATAAGACCTTTGTAAAACCC
GCATCCCACATACTGACAAATGCCTCTCTCTAGGAAGCTGCTTAACAATGCGAGAGCCTA
ATCTTGATAGCCTATGGAAGAGCATGATTCTGGCGCCCACGAAAGCTCAGTTTATAGAAA
ATTCGACGAAAGGAAGATACTTTTTCTTAAGAGTGATTGAAGATTGATGGAGGAAAGAGG
AACAAAGAGAGGACTTGGGGC
GTCCTCC

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 4

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GGATAATCATCAAACCTTTAGTGATGATGGCAGCTCCCTTAGTGTTTTCGTTGAGAATTT
CATCTACTCCTCATCATGGGATCAATCGAAATTTTCAACCCTTTCTCCTAACCCAAACAG
GAGCTCCTCCTAGATATCGTGCTCTTCGTTGCCAAGCAAACTCTGAATCTTCCGAACCCA
AGGAGAAATTGGTGGTAGATAATGGCTCTACTAGTGAAATTCCACCTGCGTCCAAAGTCA
CGGAACCATCACCTTCTTCTTCTTCTTCTGCGTTTCCTGAATCTCCAAACAGTGATATTA
ACAGAAGAGTCGCTGTTGGTTCTGTTGTTGCCGCTTTGGCCTTGTTTCTATCGACAAGGC
TTGATTTTGGGATCTCCTTGAAGGATTTAACTACTTCAGCCTTGCCTTACGAGGAGGTTT
TGTCGAATGGGAAGCCGACAGTGGTTGAGTTCTATGCTGATTGGTGTGAGGTTTGTCGAG
AACTAGCCCCTGATGTTTACAAAATCGAGCAACAATACAAGGACAAAGTGAACTTTGTGA
TGCTAAATGTGGACAACACGAAATGGGAGCAAGAGCTGGATGAGTTTGGTGTTGAAGGTA
TTCCTCATTTCGCTTTCCTCGATCGACAAGGGAACGAGGAAGGTAATGTGGTCGGAAGGC
TCCCGAGGCAGTATCTAGTTGAGAATGTCAATGCCCTTGCAGCCGGAAAGCAATCAATTC
CTCATGCTCGAGCCGTGGGACAGTACAGCAGCGCTGAAGCCCGCAAGGTTCATCAGGTTA
CCGATCCCTTAAGCCATGGATAGAGAGAGACATCACAAACTCTATAGTGCACAAAAGTAG
ACAGTAAGGGGAACAACTGAAAAGTAGCAATGTTTCATATTTGATCAAATTGTAACTAAA
TGTTTGGTTTCGTTTTATTACATAATAACTTATAAAACTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RS1G448TF U 7
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GG
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QA 3 511 3 511
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TTCCTCATTTCGCTTTCCTCGATCGACAAGGGAACGAGGA

QA 1 640 1 640
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G
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ATTTCGCTTTCCTCGATCGACAAGGGAACGAGGAAGGTAATGTGGTCGGAAGGCTCCCGA
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GTTTCGTTTTATTACATAATAACTTATAAAAC

QA 2 633 2 633
DS 

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ATGAGTTTGGTGTTGAAGGTATTCCTCATTTCGCTTTCCTCGATCGACAAGGGAACGAGG
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CCCGCAAGGTTCATCAGGTTACCGATCCCTTAAGCCATGGATAGAGAGAGACATCACAAA
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TTTGATCAAATTGTAACTAAATGTTTGGTTTCGTTTTATTACATAATAACTTATAAAACT
CG

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 4

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TCTCTTTAATAAACCTCTTTTTACCTTTCTCTCTTTTTTTGTTTTGTTAAACCAAAGTGT
CTGCCTTTTTTTGTTTGCAGAGATGTTTGTTGAAGTGAAGTCTCTTTCCTCTTCTTCCTC
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GAGGAGGAACCAATCTATCTTCCAAGAAAAAATCTGGTAAATTCCAAATCTCTTTATTAT
CCCCACCACAAACCAACAAATAAAAGAAGAAATGTTTCCAAAGTTCTATCCTTTTTGTCG
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GATAATGATAAGAAGCGAGAGATGATGATGATGTGCTACGACTTTCCTGATTCAGATTTA
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TCCATATCAAATTTGGCGAGGAATAAATTTGTTCTTTAATTCTCTAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1G393TF U 1
AF RS1FO04TF U 1
AF RS1FO04JQ C 264
AF RS1G393JQ C 272
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AGAGCGAAGCGACAGCTTCGGATTATCCGTCTTTTTCTTTTTTCGCAAATGTTCAAACTC
TGTGAGAGAGAGAGAGAGAGACCAGCACAAGGTTTGATTTTGATCTCTTTCCTCTAACAA
AACTCTCTGTTTTTGTTTTGGGTGCAAGCGAGAGAGAGGTTCTTCACGGGTTGTATGTTT
TAAAAAAATCCTCACTTTTTTTTGTTACACGAAGAGACACGAGAAACGAACTTTTCTTTC
TCTCTTTAATAAACCTCTTTTTACCTTTCTCTCTTTTTTTGTTTTGTTAAACCAAAGTGT
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TTGAGTGTGTGTGTTTTTTTTCAACGAAAATGGAAATAGGTCGTAGAGATACGAGACGTG
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CCCCACCACAAACCAACAAATAAAAGAAGAAATGTTTCCAAAGTTCTATCCTTTTTGTCG
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AAGAAAAAATCTGGTAAATTCCAAATCTCTTTATTATCCCCACCACAAACCAACAAATAA
AAGAAGAAATGTTTCCAAAGTTCTATCCTTTTTGTCGTTTTGTATTAAAACTCAATCGTT
TGCTCTGTTTTTTTCTCACCATCTCATCGGACTATTAGGATCTGTGGTCTCTGCAAAGCA
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TAAATTTGTTCTTTAATTCTCTAC

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TCTTTTTTTGTTTTGTTAAACCAAAGTGTCTGCCTTTTTTTGTTTGCAGAGATGTTTGTT
GAAGTGAAGTCTCTTTCCTCTTCTTCCTCTTGAGTGTGTGTGTTTTTTTTCAACGAAAAT
GGAAATAGGTCGTAGAGATACGAGACGTGGAGGAGGAACCAATCTATCTTCCAAGAAAAA
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ATGTTTCCAAAGTTCTATCCTTTTTGTCGTTTTGTATTAAAACTCAATCGTTTGCTCTGT
TTTTTTCTCACCATCTCATCGGACTATTAGGATCTGTGGTCTCTGCAAAGCACAAGAAAA
GAACGATGAGGAAACTGAGTTTAGCTGATGATAATGATAAGAAGCGAGAGATGATGATGA
TGTGCTACGACTTTCCTGATTCAGATTTAGAAAACGAAGTTGTCTCTAAGAAGAAGAAGA
AATCTTCTAAACTTCTAAAAAAGGTAACTTTCTTTTTTACTCAATAAGGAACACTAAGGG
TCTAACTGGTGACCACCTCGGGAATAGTAGGAACAAAAAGAAAAAGAATTAATGGGAATA
AAATTATGGGAATGATGAGGAACGGTTATTCCATATCAAATTTGGCGAGGAATAAATTTG
TTCTTTAATTCTCTAC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 3

CO CL2299Contig1 1027 3 11 U
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ACAAAAAAAAATCAACAATACCTACAAGATATATCATTTTCAAACCAAATCAAAATCTCT
CGGTTCAGATTTTGGTTCGCACCGGTCTAGCCGAATTGGATTTTAGTAGTCAAATAGGTA
AAAACACACTCGTTATGACCTGAGTTCTTTTGTTTTGTTACAACATACTTTTTTCCCACT
ATTTTACCTTGTTTCACAGTTTCAGCTCATTTAAAAGGCATGTGGTTGTAGGGACTATGC
ATTCACCATGAACACTAATGATCTCTTTCCCCGCGAGATCCTCGAGCAGCTCCCCTGGAT
CTTTAGCTCCTCCATGTTTGAAGAACTTCTCTCTCAGCAACGTCCCCGTGCTCAACGAAA
GCGGATCCTCTGCGCATACTGATTGCCATATGGTCGACGCAAAGCACTTGGCGTAAATGT
AGCTATAGTACCCTGCTCCATAGTTGAGTAAGTGACTGAATCGTATATGCCAATGTGTTC
CTTCGACATGGTTCCAACTACTGTGTTCTCGTTTCAGTTTAGCCACGAGTTTACTCAAGT
TTCTTGATGTCTCTGGTTGTTCCCCAAATAGCTTTTGGTCTATCAACGCATAAAACACCT
GGCGTTGCATGTCAGTTGCAGCAAACATGTTCCTGGCACCTTGTAATGAGGTCACCAACT
TCTCGGGTATTGTCTCACCGGTTGAGTAATGCCGAGCAAATCCCTTCAGGAGGCGATAGT
CCCATGCATAGTACTCAAATAGATTTGAAGGCATTTCTGCCAAGTCAAGAGCCACCCGGG
TACCGGAGAAGTGTTGGTACTCCGTTCGTGAGGGCAGAGAATGCAGAGCATGGCCGAACT
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TGCGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FS28JQ U 1
AF RS1BJ71JQ U 176
AF RS1BJ71TF C 359
BS 1 275 RS1FS28JQ
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BS 756 894 RS1BJ71JQ
BS 895 1027 RS1BJ71TF

RD RS1FS28JQ 755 0 0
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TCTCGGGTATTGTCTCACCGGTTGAGTAATGCCGA

QA 1 755 1 755
DS 

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C
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GGATCTTTAGCTCCTCCATGTTTGAAGAACTTCTCTCTCAGCAACGTCCCCGTGCTCAAC
GAAAGCGGATCCTCTGCGCATACTGATTGCCATATGGTCGACGCAAAGCACTTGGCGTAA
ATGTAGCTATAGTACCCTGCTCCATAGTTGAGTAAGTGACTGAATCGTATATGCCAATGT
GTTCCTTCGACATGGTTCCAACTACTGTGTTCTCGTTTCAGTTTAGCCACGAGTTTACTC
AAGTTTCTTGATGTCTCTGGTTGTTCCCCAAATAGCTTTTGGTCTATCAACGCATAAAAC
ACCTGGCGTTGCATGTCAGTTGCAGCAAACATGTTCCTGGCACCTTGTAATGAGGTCACC
AACTTCTCGGGTATTGTCTCACCGGTTGAGTAATGCCGAGCAAATCCCTTCAGGAGGCGA
TAGTCCCATGCATAGTACTCAAATAGATTTGAAGGCATTTCTGCCAAGTCAAGAGCCACC
CGGGTACCGGAGAAGTGTTGGTACTCCGTTCGTGAGGGCAGAGAATGCAGAGCATGGC

QA 2 719 2 719
DS 

RD RS1BJ71TF 669 0 0
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AAGCGGATCCTCTGCGCATACTGATTGCCATATGGTCGACGCAAAGCACTTGGCGTAAAT
GTAGCTATAGTACCCTGCTCCATAGTTGAGTAAGTGACTGAATCGTATATGCCAATGTGT
TCCTTCGACATGGTTCCAACTACTGTGTTCTCGTTTCAGTTTAGCCACGAGTTTACTCAA
GTTTCTTGATGTCTCTGGTTGTTCCCCAAATAGCTTTTGGTCTATCAACGCATAAAACAC
CTGGCGTTGCATGTCAGTTGCAGCAAACATGTTCCTGGCACCTTGTAATGAGGTCACCAA
CTTCTCGGGTATTGTCTCACCGGTTGAGTAATGCCGAGCAAATCCCTTCAGGAGGCGATA
GTCCCATGCATAGTACTCAAATAGATTTGAAGGCATTTCTGCCAAGTCAAGAGCCACCCG
GGTACCGGAGAAGTGTTGGTACTCCGTTCGTGAGGGCAGAGAATGCAGAGCATGGCCGAA
CTCGTGGAACAGAACTTCGACTTCAGAGTGATTAAGCTTCACCACCGCTGATGAATCACG
AGGTCGAGAAAAATTGCAAACAAGAGCCAAAACAGGAAGTTGATATTCTGATTCAGAAAT
CTTGCGACC

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 3

CO CL2300Contig1 960 3 5 U
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AAAGAATAATGGCAAGAGTTCATCTATTGTTATGCTTGGCCCTTCTATTTGCATCTGTAA
CCCTTTTTGACGTGGCTTCAGCTTTTCTGAAGCTAAAGCCATCATTGCCTCAGATTGAAG
ATCCGAAGACGGTGGGTGATGTGGAAGAATACACTGTTCAAGTAGTGATGGTATTTGTGG
GGGACCTCGAGAAAGAATGTCCTAAAATCATCGCCTCTTTTGCTATTGGAAAGATAAAGA
GGGAAATTCAAGAGGAGAAACAGGAAGCTATCGAAACCTTTAAGTTTATGAAATCCCTGG
CTGGTTGAATTTTGGGTGGCCGCGAGAAAGAAGAGAAAGCAACCACGGCACTAACAGCTG
AACAGCTGAAAGAAATCAAAGATGGGATCTTGAAGTGGCAGACTACGATTGTTAAGATCA
CAAACACTATGGCAGTTAGCACCTCAACCAGCGAAAGCTCTGAAACTACTACTACTGGAG
GCTCTTAATCTACCACTGGAGGCTCTTCGGGTCCTAATGCTGGAAGGTCTACTGGAAGTC
CATCAAACAAACCAGAAGCTGGTTCAAACCCTGGAGCTGGAACTCCCTCTGAGGATACAA
ACAATGAATCCGAAGATACCACGAACACTGCTTCTAATGCAACTGAAACTGGAGGCTCTA
AGGGTCCCAACTCCGGAAGCTCTACTGGAAGTCCATCAAACAAACCTTAGATGAAGAATA
AGATGTGGTCATCACTCTACGCAGTTTTTAGATATACACGGAAAAATGAGTATGCATAGT
TAACAAAATAAGTTAATGTCCATTTTATCGTAGAATAAGTAGGAGGCTACCGCTTCTTTG
ACAAATAATAGAGTGTTTGGCTTCTTAAAATGTGATATCCACAATTGAATTTAAGTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1F523TF U 1
AF RS1F523JQ C 206
AF RS1GW12TF U 708
BS 1 717 RS1F523TF
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BS 800 800 RS1F523JQ
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RD RS1F523TF 719 0 0
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GGGAAATTCAAGAGGAGAAACAGGAAGCTATCGAAACCTTTAAGTTTATGAAATCCCTGG
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ACAATGAATCCGAAGATACCACGAACACTGCTTCTAATGCAACTGAAACTGGAGGCT
CT

QA 1 717 1 717
DS 

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TATCGTAGAATAAGTAGGAGGCTACCGCTTCTTTGACAAATAATAGAGTGTTTGGCTTCT
TAAAATGTGATATCCACAATTGAATTTAAGTTTCG

QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1GW12TF 219 0 0
G
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AGATGAAGAATAAGATGTGGTCATCACTCTATGCAGTTTTTAGATATACACGGAAAAATG
AGTATGCATAGTTAACAAAATAAGTTAATGTCCATTTTATCGTAGAATAAGTAGGAGGCT
ACCGCTTCTTTGACAAATAATAGAGTGTTTGGCTTCTT

QA 2 219 2 219
DS 



AS 1 4

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CCTGCTACTTCCAAGGCTTCAAGCCGGGACAAGTTTTGCTGTCTCTCAAGGGAAGACGTG
ATCCGCTTCCTCATAGGTGTCCTTGGAGCATTAGCTCCTTTGCCACTCACATCAATCTCT
TCTCTTGGAATCATCAATGTAGACTACAACTTCATTGAATCCTCTTTGCCAGCCATCGAA
GCCACCAAAAGGCCACCATGTGATCCTAGTGCGATCGCCGTGTTGGAACAAACCGAGGAC
GAAAAACAGTTCAAGATAATAGGAGAAATCTCAGCTTCGAAGCTCTGGAAATGTGATTAT
CTCGCTGCAGCTTGGGCTCTAGCTAATCTATATGCAGGGCAGTTTGTGATGGGAGTTGAG
GACAACATGTCATCAAGATCATTCAGCGACTTCCTCCAAACTTCATTTGTCGGAGGAGGA
GGAGACCAGAACGGAACAGCTACGACAAAGGCCAAGAAATTCAGTAGCAGGAGCATCGGT
TTCAATCCGACAAGCCCGACAAGACTGAGCATCGGTAGGAGCATGTACAGGGGAAGAAGT
GCGCCGTTAACTTGCAAAACATCGAGCTCATTGGCTGCGGTTATGGCTCAGATGCTGTCT
CATAGAGCCACACATGTTTGGGTTACAGAGGCTGATTCAGATGATGATATTCTTGTTGGA
GTAGTGGGCTATGGAGAGATCTTAGCTGCTGTTACTAAACAGCCTTCTGCCTTTGTTCCT
TCGAGTCGTTCTTACGAAGGTTTTGGTAATGAAAATCAAAGCTAAGAAGACTACTACACA
AATCAAAAGGATAAACGACTTATTTCTGAGAGAAAGGGACACAGTTTTTTTGGGTGTGTT
TGTCAAAATTGCGTACTATTGAACTTAGTATCAGATAGCTCCAATAAGCAAAAATAAACG
AGCTATAATTTTTCTTTCTTATTCATTACTATGTGAACTGTTGTTGGTGTTTTAGTGTTT
ACAGCATATGTATAAACAGATTTGTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DX36TF U 1
AF RS1E289TF U 16
AF RS1E289JQ C 409
AF RS1DX36JQ C 423
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BS 65 65 RS1E289TF
BS 66 379 RS1DX36TF
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BS 381 522 RS1DX36TF
BS 523 589 RS1E289TF
BS 590 791 RS1E289JQ
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BS 1033 1157 RS1E289JQ
BS 1158 1168 RS1DX36JQ

RD RS1DX36TF 522 0 0
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CCGAGAAGCGTTGTTTGGAGAGGTATGAGCAAGAGATTCTCCATTCTTTACAATGGAAAA
TGGCTGAAGAACAGCGAAAACTCTAGCAGTAGCAGTGGGCTCTCCGCTGACTCCAACAGG
CCTGCTACTTCCAAGGCTTCAAGCCGGGACAAGTTTTGCTGTCTCTCAAGGGAAGACGTG
ATCCGCTTCCTCATAGGTGTCCTTGGAGCATTAGCTCCTTTGCCACTCACATCAATCTCT
TCTCTTGGAATCATCAATGTAGACTACAACTTCATTGAATCCTCTTTGCCAGCCATCGAA
GCCACCAAAAGGCCACCATTTGATCCTAGTGCGATCGCCGTGTTGGAACAAACCGAGGAC
GAAAAACAGTTCAAGATAATAGGAGAAATCTCAGCTTCGAAGCTCTGGAAATGTGATTAT
CTCGCTGCAGCTTGGGCTCTAGCTAATCTATATGCAGGGCAG

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DS 

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GATGCTTTGGAGATGATGAAACGAGGAGTGAGACGACTTCTAGTTCCGAAAAGCGTTGTT
TGGAGAGGTATGAGCAAGAGATTCTCCATTCTTTACAATGGAAAATGGCTGAAGAACAGC
GAAAACTCTAGCAGTAGCAGTGGGCTCTCCGCTGACTCCAACAGGCCTGCTACTTCCAAG
GCTTCAAGCCGGGACAAGTTTTGCTGTCTCTCAAGGGAAGACGTGATCCGCTTCCTCATA
GGTGTCCTTGGAGCATTAGCTCCTTTGCCACTCACATCAATCTCTTCTCTTGGAATCATC
AATGTAGACTACAACTTCATTGAATCCTCTTTGCCAGCCATCGAAGCCACCAAAAGGCCA
CCATGTGATCCTAGTGCGATCGCCGTGTTGGAACAAACCGAGGACGAAAAACAGTTCAAG
ATAATAGGAGAAATCTCAGCTTCGAAGCTCTGGAAATGTGATTATCTCGCTGCAGCTTGG
GCTCTAGCTAATCTATATGCAGGGCAGTTTGTGATGGGAGTTGAGGACAACATGTCATCA
AGATCATTCAGCGACTTCCTCCAAACTTCATTTG

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DS 

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AAATGTGATTATCTCGCTGCAGCTTGGGCTCTAGCTAATCTATATGCAGGGCAGTTTGTG
ATGGGAGTTGAGGACAACATGTCATCAAGATCATTCAGCGACTTCCTCCAAACTTCATTT
GTCGGAGGAGGAGGAGACCAGAACGGAACAGCTACGACAAAGGCCAAGAAATTCAGTAGC
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CAGATGCTGTCTCATAGAGCCACGCATGTTTGGGTTACAGAGGCTGATTCAGATGATGAT
ATTCTTGTTGGAGTAGTGGGCTATGGAGAGATCTTAGCTGCTGTTACTAAACAGCCTTCT
GCCTTTGTTCCTTCTAGTCGTTCTTACGAAGGTTTTGGTAATGAAAATCAAAGCTAAGAA
GACTACTACACAAATCAAAAGGATAAACGACTTATTTCTGAGAGAAAGGGACACAGTTTT
TTTGGGTGTGTTTGTCAAAATTGTGTACTATTGAACTTAGTATCAGATAGCTCCAATAAG
CAAAAATAAACGAGCTATAATTTTTCTTTCTTATTCATTACTATGTGAACTGTTGTTGGT
GTTTTAGTGTTTACAGCATATGTATAAAC
G

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DS 

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CGCTGCAGCTTGGGCTCTAGCTAATCTATATGCAGGGCAGTTTGTGATGGGAGTTGAGGA
CAACATGTCATCAAGATCATTCAGCGACTTCCTCCAAACTTCATTTGTCGGAGGAGGAGG
AGACCAGAACGGAACAGCTACGACAAAGGCCAAGAAATTCAGTAGCAGGAGCATCGGTTT
CAATCCGACAAGCCCGACAAGACTGAGCATCGGTAGGAGCATGTACAGGGGAAGAAGTGC
GCCGTTAACTTGCAAAACATCGAGCTCATTGGCTGCGGTTATGGCTCAGATGCTGTCTCA
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AGTGGGCTATGGAGAGATCTTAGCTGCTGTTACTAAACAGCCTTCTGCCTTTGTTCCTTC
GAGTCGTTCTTACGAAGGTTTTGGTAATGAAAATCAAAGCTAAGAAGACTACTACACAAA
TCAAAAGGATAAACGACTTATTTCTGAGAGAAAGGGACACAGTTTTTTTGGGTGTGTTTG
TCAAAATTGCGTACTATTGAACTTAGTATCAGATAGCTCCAATAAGCAAAAATAAACGAG
CTATAATTTTTCTTTCTTATTCATTACTATTTGAACTGTTGTTGGTGTTTTAGTGTTTAC
AGCATATGTATAAACAGATTTGTCTC

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DS 



AS 1 4

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TCATTTCATTAGAAAATATGAAAAACGCGTTTAAACTTTCGCTTATTGGTTTTGTTATGC
TCACAATTCTTCTGTTCGGAGAAATGGTGATTGCTCAGAAAGGAAAACCATGTTATTCAA
AGAAAATGGGAACATGTGAAACCAAGAGCTGCAAAGCTTACTGTGTCAAAAAGCATAAAA
AAGATCTTTTTAGTGCATGCATTACAGAAAAAGACGGGACAACGTATTGCCGATGTCAAT
ATCCTTGCCCTCCCTAATTTTTTATCTACACTAAAACTCAAATAATAATTTTAATAATAC
AACGGCTTTGTCAAATAAATGAATAAAACTTTTAATAAATTTGTGTTGGTGCTTTTGGCG
TAGTAAGGTGTATTATGTTACTGACAAAGAATTAATATTTGTGTCTTCCCTTTTTATTTT
TTGTACTGTTGCTTAAATTCACATAAAATTAATTAGAATCAATGTTAATTTCATCCAAAA
TTGAAATAAAAATGGTAAAAACTTAATTT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B173JQ C 134
AF RS1B173TF U 119
AF RS1A020TF U 1
AF RS1A020TV U 36
BS 1 254 RS1A020TF
BS 255 255 RS1B173TF
BS 256 539 RS1A020TF
BS 540 569 RS1A020TV

RD RS1B173JQ 280 0 0
GTTT
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GAAACCAAGAGCTGCAAAGCTTACTGTGTCAAAAAGCATAAAAAAGATTTTTTTAGTGCA
TGCATTACAGAAAAAGACGGGACAACGTATTGCCGATGTCAATATCCTTGCCCTCCCTAA
TTTTTTATTTACACTAAAACTCAAATAATAATTTTAATAATACAACGGCTTTGTCAAATA
AATGAATAAAACTTTTAATAAATTTGTGTTGGTG
TT

QA 5 278 5 278
DS 

RD RS1B173TF 295 0 0
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AAAGAAAATGGGAACATGTGAAACCAAGAGCTGCAAAGCTTACTGTGTCAAAAAGCATAA
AAAAGATCTTTTTAGTGCATGCATTACAGAAAAAGACGGGACAACGTATTGCCGATGTCA
ATATCCTTGCCCTCCCTAATTTTTTATCTACACTAAAACTCAAATAATAATTTTAATAAT
ACAACGGCTTTGTCAAATAAATGAATAAAACTTTTAATAAATTTGTGTTGGTG
TT

QA 1 293 1 293
DS 

RD RS1A020TF 542 0 0
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TCATTTCATTAGAAAATATGAAAAACGCGTTTAAACTTTCGCTTATTGGTTTTGTTATGC
TCACAATTCTTCTGTTCGGAGAAATGGTGATTGCTCAGAAAGGAAAACCATGTTATTCAA
AGAAAATGGGAACATGTGAAACCAAGAGCTGCAAAGCTTACTGTGTCAAAAAGCATAAAA
AAGATCTTTTTAGTACATGCATTACAGAAAAAGACGGGACAACGTATTGCCGATGTCAAT
ATCCTTGCCCTCCCTAATTTTTTATCTACACTAAAACTCAAATAATAATTTTAATAATAC
AACGGCTTTGTCAAATAAATGAATAAAACTTTTAATAAATTTGTGTTGGTGCTTTTGGCG
TAGTAAGGTGTATTATGTTACTGACAAAGAATTAATATTTGTGTCTTCCCTTTTTATTTT
TTGTACTGTTGCTTAAATTCACATAAAATTAATTAGAATCAATGTTAATTTCATCCAAA
TTG

QA 1 539 1 539
DS 

RD RS1A020TV 534 0 0
CCATTACGGCCGGGGGAAAACACTATCATTTCATTAGAAAATATGAAAAACGCGTTTAAA
CTTTCGCTTATTGGTTTTGTTATGCTCACAATTCTTCTGTTCGGAGAAATGGTGATTGCT
CAGAAAGGAAAACCATGTTATTCAAAGAAAATGGGAACATGTGAAACCAAGAGCTGCAAA
GCTTACTGTGTCAAAAAGCATAAAAAAGATCTTTTTAGTACATGCATTACAGAAAAAGAC
GGGACAACGTATTGCCGATGTCAATATCCTTGCCCTCCCTAATTTTTTATCTACACTAAA
ACTCAAATAATAATTTTAATAATACAACGGCTTTGTCAAATAAATGAATAAAACTTTTAA
TAAATTTGTGTTGGTGCTTTTGGCGTAGTAAGGTGTATTATGTTACTGACAAAGAATTAA
TATTTGTGTCTTCCCTTTTTATTTTTTGTACTGTTGCTTAAATTCACATAAAATTAATTA
GAATCAATGTTAATTTCATCCAAAATTGAAATAAAAATGGTAAAAACTTAATTT

QA 1 534 1 534
DS 



AS 1 4

CO CL2303Contig1 725 4 8 U
TAAATGAAAAAATCGAAAAAAACCTCAGTTGAGATGGAACTCTGTTTCAAGCTGCGGTCT
TTTTCATGTCCCTCCCCTGTTTCTAGTGTTAAGGATGGGAGGTTATTTAACTCAGTCTCG
TTCTTTGATATGAAAAGATCCTCACATCAAAGACCTAAGAGGAGGTCATCTTCATCATCA
TCAACAACAGCCATTCCTGCTTTAGTTGAAACAGCTGTTTCTGTAGCGATTGCAGCCACG
GTTGTTGGCACTGCAGCCACTATTCTTGTTCGGAGAAGTACCAAAGCCTCCGAAGAAGCC
GAGGCTTATATGAAAGAATGTGAAGTTTGTGGCGGTTCAGGAATCTGTTCTGAGTGCAAG
GGTGAAGGGTTTGCTCTGAAGAAACTATCTGATGAAAATGCTGAGAAGGCAAGGCTCACT
GCAAAGAACATGGCCACCAGATATACAGCCGGGCTTCCCAAGAAATGGAGCTACTGCACT
AAATGTTCTTCAACGCGATCTTGTATCACGTGTGGTGGAAGTGGAAAGATAAGCTTCTAG
CGCCTTTCCTAGATTAAACTCTTATAACATAGCTTTCTTGTAATGGTTGTTTGGAAACTC
TCATTAAACTAAAGTTTTTCACATGTCGTATTAGTTTAGTTTCTTCTTACTATATCCAGA
TGCGGTTAATGCGATATGATTCTGAGACGTAAAGAGTACTAAAGTCAATTGCTTCTTCTT
TTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1ES19TF U 96
AF RS1ES19JQ C 96
AF RS1H641TF U 1
AF RS1H641JQB C 267
BS 1 261 RS1H641TF
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BS 263 373 RS1H641TF
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BS 440 688 RS1H641TF
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G
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AAGAGGAGGTCATCTTCATCATCATCAACAACAGCCATTCCTGCTTTAGTTGAAACAGCT
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TCAGGAATCTGTTCTGAGTGCAAGGGTGAAGGGTTTGCTCTGAAGAAACTATCTGATGAA
AATGCTGAGAAGGCAAGGCTCACTGCAAAGAACATGGCCACCAGATATACAGCCGGGCTT
CCCAAGAAATGGAGCTACTGCACTAAATGTTCTTCAACGCGATCTTGTATCACGTGTGGT
GGAAGTGGAAAGATAAGCTTCTAGC
AC

QA 2 446 2 446
DS 

RD RS1ES19JQ 533 0 0
G
GGGAGGTTATTTAACTCAGTCTCGTTCTTTGATATGAAAAGATCCTCACATCAAAGACCT
AAGAGGAGGTCATTTTCATCATCATCAACAACAGCCATTCCTGCTTTAGTTGAAACAGCT
GTTTCTGTAGCGATTGCAGCCACGGGTGTTGGCACTGCAGCCACTATTCTTGTTCGGAGA
AGTACCAAAGCCTCCGAAGAAGCCGAGGCTTCTATGAAAGAATGTGAAGTTTGTGGCGGT
TCAGGAATCTGTTTTGAGTGCAAGGGTGAAGGGTTTGCTTTGAAGAAACTATTTGATGAA
AATGCTGAGAAGGCAAGGCTCACTGCAAAGAACATGGCCACCAGATATACAGCCGGGCTT
CCCAAGAAATGGAGCTACTGCACTAAATGTTTTTCAACGCGATCTTGTATCACGTGTGGT
GGAAGTGGAAAGATAAGCTTCTAGCACCTTTCATAGATTAAACTCTTATAACATAGCTTT
CTTGTAATGGTTGTTTGGAAACTCTCATTAAACTAAAGTTTTTCACATGTCG

QA 2 533 2 533
DS 

RD RS1H641TF 696 0 0
TAAATGAAAAAATCGAAAAAAACCTCAGTTGAGATGGAACTCTGTTTCAAGCTGCGGTCT
TTTTCATGTCCCTCCCCTGTTTCTAGTGTTAAGGATGGGAGGTTATTTAACTCAGTCTCG
TTCTTTGATATGAAAAGATCCTCACATCAAAGACCTAAGAGGAGGTCATCTTCATCATCA
TCAACAACAGCCATTCCTGCTTTAGTTGAAACAGCTGTTTCTGTAGCGATTGCAGCCACG
GTTGTTGGCACTGCAGCCACTCTTCTTGTTCGGAGAAGTACCAAAGCCTCCGAAGAAGCC
GAGGCTTATATGAAAGAATGTGAAGTTTGTGGCGGTTCAGGAATCTGTTCTGAGTGCAAG
GGTGAAGGGTTTGTTCTGAAGAAACTATCTGATGAAAATGCTGAGAAGGCAAGGCTCACT
GCAAAGAACATGGCCACCCGATATACAGCCGGGCTTCCCAAGAAATGGAGCTACTGCACT
AAATGTTCTTCAACGCGATCTTGTATCACGTGTGGTGGAAGTGGAAAGATAAGCTTCTAG
CGCCTTTCCTAGATTAAACTCTTATAACATAGCTTTCTTGTAATGGTTGTTTGGAAACTC
TCATTAAACTAAAGTTTTTCACATGTCGTATTAGTTTAGTTTCTTCTTACTATATCCAGA
TGCGGTTAATGCGATATGATTCTGAGAC
TTAAGAGT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RS1H641JQB 459 0 0
TGTTCGGAGAAGTACCAAAGCCTCCGAAGAAGCCGAGGCTTATATGAAAGAATGTGAAGT
TTGTGGCGGTTCAGGAATCTGTTCTGAGTGCAAGGGTGAAGGGTTTGTTCTGAAGAAACT
ATCTGATGAAAATGCTGAGAAGGCAAGGCTCACTGCAAAGAACATGGCCACCCGATATAC
AGCCGGGCTTCCCAAGAAATGGAGCTACTGCACTAAATGTTCTTCAACGCGATCTTGTAT
CACGTGTGGTGGAAGTGGAAAGATAAGCTTCTAGCGCCTTTCCTAGATTAAACTCTTATA
ACATAGCTTTCTTGTAATGGTTGTTTGGAAACTCTCATTAAACTAAAGTTTTTCACATGT
CGTATTAGTTTAGTTTCTTCTTACTATATCCAGATGCGGTTAATGCGATATGATTTTGAG
ACGTAAAGAGTACTAAAGTCAATTGCTTCTTCTTTTGCC

QA 1 459 1 459
DS 



AS 1 4

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GGGCACATAAGATATTATTGAACTATATGAGTTTTTGGAATCTCAGCATAAGAAAGAAAC
AAAACTTTTAAGAGATGATGTTTGTAAACAATAAGTAAAAAGTTGGACATGAGAAACCGA
AAGAAAACACAAGAACAATCCACTGAGAAATAACAAACTACAAATGATCAAAAGGCAGAT
TGCTCCATAGCTAAAACAGGTGAGGAGTTAGAATTACTCTTCGTCATCACCATCTGCATC
ACCACCAGAGGCTTTCTTGGAGGCAGACTTCTCATTCCTTCTCTTCACTCTACCGGGACG
GCCACCACCGAAGGGACTGGTCAGAGCAAAGTCAATATGCTTCTGAGAATCAAGTCTCAC
CATGAACGAAGGAATGTTCACCAACTGCTTCCCAACCCTGATATGCCTCTGCCTGATAAG
GACACGAGAGTGATGAATCGACTTAGCCATACCAGACTTGAACACAATGGTCTGAAGCCT
ACGCTCGAGGAAATTCTCAACGGTCAAAGCCAAGACGTAATCGAGCTTGTTCTGGCTCTC
ATCGAGAAGACCGTAACGGTTCATCTTACGGAGGAGCGCCTCACCTTCGAAGATCCTCTT
GGGGTTCTTCTCGTCGAGCGTCAGAAGATCTCTAGCGGCGTTACGGATACGGCTAAGAGA
GTACTGCACTCTCCAGAGCTCACGCTTGTTACGGAGACCGTACTCGCCGACCAGCTTCAG
CTCGGAGTCGAGACGCTCCTTCTCGAAAGGACGACGTGGTCCCTTAAATGTTTTTCCATA
GTTGCGGTAGTAGCAAACGTGCACCATACTGTCGCCTTCTCTGTGATAGAAACGGCTGTG
TGAGAAGCTAGGGCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1H704JQB U 1
AF RS1DZ44JQ U 53
AF RS1C462TF C 122
AF RS1DZ44TF C 193
BS 1 592 RS1H704JQB
BS 593 653 RS1DZ44JQ
BS 654 858 RS1C462TF

RD RS1H704JQB 592 0 0
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AAAACTTTTAAGAGATGATGTTTGTAAACAATAAGTAAAAAGTTGGACATGAGAAACCGA
AAGAAAACACAAGAACAATCCACTGAGAAATAACAAACTACAAATGATCAAAAGGCAGAT
TGCTCCATAGCTAAAACAGGTGAGGAGTTAGAATTACTCTTCGTCATCACCATCTGCATC
ACCACCAGAGGCTTTCTTGGAGGCAGACTTCTCATTCCTTCTCTTCACTCTACCGGGACG
GCCACCACCGAAGGGACTGGTCAGAGCAAAGTCAATATGCTTCTGAGAATCAAGTCTCAC
CATGAACGAAGGAATGTTCACCAACTGCTTCCCAACCCTGATATGCCTCTGCCTGATAAG
GACACGAGAGTGATGAATCGACTTAGCCATACCAGACTTGAACACAATGGTCTGAAGCCT
ACGCTCGAGGAAATTCTCAACGGTCAAAGCCAAGACGTAATCGAGCTTGTTCTGGCTCTC
ATCGAGAAGACCGTAACGGTTCATCTTACGGAGGAGCGCCTCACCTTCGAAG

QA 1 592 1 592
DS 

RD RS1DZ44JQ 601 0 0
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GAAACCGAAAGAAAACGCAAGAACAATCCACTGAGAAATAACAAACTACAAATGATCAAA
AGGCAGATTGCTCCATAGCTAAAACAGGTGAGGAGTTAGAATTACTCTTCGTCATCACCA
TCTGCATCACCACCAGAGGCTTTCTTGGAGGCAGACTTCTCATTCCTTCTCTTCACTCTA
CCGGGACGGCCACCACCGAAGGGACTGGTCAGAGCAAAGTCAATATGCTTCTGAGAATCA
AGTCTCACCATGAACGAAGGAATGTTCACCAACTGCTTCCCAACCCTGATATGCCTCTGC
CTGATAAGGACACGAGAGTGATGAATCGACTTAGCCATACCAGACTTGAACACAATGGTC
TGAAGCCTACGCTCGAGGAAATTCTCAACGGTCAAAGCCAAGACGTAATCGAGCTTGTTC
TGGCTCTCATCGAGAAGACCGTAACGGTTCATCTTACGGAGGAGCGCCTCACCTTCGAAG
ATCCTCTTGGGGTTCTTCTCGTCGAGCGTCAGAAGATCTCTAGCGGCGTTACGGATACGG
C

QA 1 601 1 601
DS 

RD RS1C462TF 737 0 0
AGAAAACACAAGAACAATCCACTGAGAAATAACAAACTACAAATGATCAAAAGGCAGATT
GCTCCATAGCTAAAACAGGTGAGGAGTTAGAATTACTCTTCGTCATCACCATCTGCATCA
CCACCAGAGGCTTTCTTGGAGGCAGACTTCTCATTCCTTCTCTTCACTCTACCGGGACGG
CCACCACCGAAGGGACTGGTCAGAGCAAAGTCAATATGCTTCTGAGAATCAAGTCTCACC
ATGAACGAAGGAATGTTCACCAACTGCTTCCCAACCCTGATATGCCTCTGCCTGATAAGG
ACACGAGAGTGATGAATCGACTTAGCCATACCAGACTTGAACACAATGGTCTGAAGCCTA
CGCTCGAGGAAATTCTCAACGGTCAAAGCCAAGACGTAATCGAGCTTGTTCTGGCTCTCA
TCGAGAAGACCGTAACGGTTCATCTTACGGAGGAGCGCCTCACCTTCGAAGATCCTCTTG
GGGTTCTTCTCGTTGAGCGTCAGAAGATCTCTAGCGGCGTTACGGATACGGCTAAGAGAG
TACTGCACTCTCCAGAGCTCACGCTTGTTACGGAGACCGTACTCGCCGACCAGCTTCAGC
TCGGAGTCGAGACGCTCCTTCTCGAAAGGACGACGTGGTCCCTTAAATGTTTTTCCATAG
TTGCGGTAGTAGCAAACGTGCACCATACTGTCGCCTTCTCTGTGATAGAAACGGCTGTGT
GAGAAGCTAGGGCACCC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RS1DZ44TF 666 0 0
AAAACAGGTGAGGAGTTAGAATTACTCTTCGTCATCACCATCTGCATCACCACCAGAGGC
TTTCTTGGAGGCAGACTTCTCATTCTTTCTCTTCACTCTACCGGGACGGCCACCACCGAA
GGGACTGGTCAGAGCAAAGTCAATATGCTTCTGAGAATCAAGTCTCACCATGAACGAAGG
AATGTTCACCAACTGCTTCCCAACCCTGATATGCCTCTGCCTGATAAGGACACGAGAGTG
ATGAATCGACTTAGCCATACCAGACTTGAACACAATGGTCTGAAGCCTACGCTCGAGGAA
ATTCTCAACGGTCAAAGCCAAGACGTAATCGAGCTTGTTCTGGCTCTCATCGAGAAGACC
GTAACGGTTCATCTTACGGAGGAGCGCCTCACCTTCGAAGATCCTCTTGGGGTTCTTCTC
GTCGAGCGTCAGAAGATCTCTAGCGGCGTTACGGATACGGCTAAGAGAGTACTGCACTCT
CCAGAGCTCACGCTTGTTACGGAGACCGTACTCGCCGACCAGCTTCAGCTCGGAGTCGAG
ACGCTCCTTCTCGAAAGGACGACGTGGTCCCTTAAATGTTTTTCCATAGTTGCGGTAGTA
GCAAACGTGCACCATACTGTCGCCTTCTCTGTGATAGAAACGGCTGTGTGAGAAGCTAGG
GCACCC

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 4

CO CL2305Contig1 632 4 21 U
GGGATTACGAGGACATAAGAAAATGGATACTTCATATTTCTGTTATCGAGACTACTACAT
CTTGCTTCTAGTTCTATTTTATTCATCTATGCTTGATTTAGCTTCAAGTACGTACATTTT
TAGTGATGCAAAAGGCATCAACACCGATAGTAACCTGAAACGTTTTCTCTCTAATTCTAA
TCATCAACATGGCAAGGAATATAAACAATGTATAAGTCTAGAAGCAGATATGGACATGAT
GAGAGTTTCACGTGATGGATCTAAAGATATTATTACAAAGATCAATTTCGCTGATTATGG
CAATCCTACCGATTGTGAAGATAATAAAGATAGTAGACACGGAAAGTGCGGTGCACCAGC
TACCTTGAGGCTCGTCAAAAAGAATTGTCTTGGAAAACACATGTGTTACATTCGTATTTC
GGACGAGATGTTTGGTCCGAGTCACTGCAAGAAAGATATTAAACTCACTGTTGAATACAC
ATGCACAAAAGCTTAGGTTTTTTTTTTTGCTCCTTAATTAAAGCCTTTGAAAAAATAATT
CTGGTTTGTTTCCTTGTATGGATCAAAGTTCTTGTTGATTTTATTTGTTATTTTCCAACA
AGGTTTTTTTTCCAACAAAGGTTGATATTAAA


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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DS 

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GG
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DS 



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BQ
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AF RS1C515TF U 1
AF RS1DB75TF U 527
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AF RS1DB75JQ C 912
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ACTTGATTGGTTTTTTCCTGTTTCTAGCACTTACTATATACACAGCTACCAAAGTCCCAA
GCGTTGTGGATCTTCAGCACCGTTTACCTCATCTCCTCAGGAAAACTGATCTTCACAAAC
TTCACTCTGACCTCATGTCTCGCCTTCCTTCTTCTCCTTCTGAGTGGCATCTCATGGAGC
TTCTCTATAACTGTCTCCCTGACAGATTCTCTCTTGCCAACTCCACCGACATGTGTGTCC
TGCATTCAGTGAAGGA*GATCTTGCAAACATGATAGCTCCTTTGATCCTCAG*CCAATCA
CTCGATGGCCCTTCTACGCCTTCCTAGGCG*CGCTATGTTCTGTCTACTAGCAAGCAGCA
C

QA 1 781 1 781
DS 

RD RS1DB75TF 636 0 0
TGATCTTCACAAACTTCACTCTGACCTCATGTCTCGCCTTCCTTCTTCTCCTTCTGAGTG
GCATCTCATGGAGCTTCTCTATAACTGTCTCCCTGACAGATTCTCTCTTGCCAACTCCAC
CGACATGTGTGTCCTGCATTCAGTGAAGGAAGATCTTGCAAACATGATAGCTCCTTTGAT
CCTCAGGCCAATCACTCGATGGCCCTTCTACGCCTTCCTAGGCGGCTCTATGTTCTGTCT
ACTAGCAAGCAGCACCTGCCACCTCCTCTCCTGTCACTCAGAGCGTGTCTCTTACATTAT
GCTTAGGCTTGACTACGCTGGAATCGCAGCTCTCATCTCCACTTCCTTCTACCCTCCGGT
CTACTACTCTTTCATGTGTGATCCCTTCTTCTGCAACCTCTACTTAGGATTCATCACAAT
CCTGGGAATCTCCACTGTCCTCGTCTCCCTCCTACCCGTCTTCCAGAGCCCTGAGTTTCG
TGTGGTGAGAGCCTCTCTCTTCTTTGGAATGGGGTTCTCCGGCGCGGCACCGATCCTGCA
TAAGCTGATCATCTTTTGGGACCAGCCCGAGGCGCTTCACACGACGGGGTATGAGGTTTT
GATGGGTTTGCTTTACGGGTTGGGAGCTTTGGTTTA

QA 1 636 1 636
DS 

RD RS1C515JQ 704 0 0
ACGCCTTCCTAGGCGGCGCTATGTTCTGTCTACTAGCAAGCAGCACCTGCCACCTCCTCT
CCTGTCACTCAGAGCGTGTCTCTTACATTATGCTTAGGCTTGACTACGCTGGAATCGCAG
CTCTCATCTCCACTTCCTTCTACCCTCCGGTCTACTACTCTTTCATGTTTGATCCCTTCT
TCTGCAACCTCTACTTAGGATTCATCACAATCCTGGGAATCTCCACTGTCCTCGTCTCCC
TCCTACCCGTCATCCAGAGCCCTGAGTTTCGTGTGGTGAGAGCCTCTCTCTTCTTTGGAA
TGGGGTTCTCCGGCGCGGCACCGATCCTGCATAAGCTGATCATCTTTTGGGACCAGCCCG
AGGCGCTTCACACGACGGGGTATGAGGTTTTGATGGGTTTGCTTTACGGGTTGGGAGCTT
TGGTTTATGCGACTAGGATCCCTGAGAGATGGATGCCTGGTAAGTTTGATATAGCTGGAC
ATAGCCATCAGTTGTTTCATGTTTTGGTGGTTGCTGGTGCCTTCACACATTATAGAGCTG
GGCTTGTGTATCTCAAGTGGAGAGACATTGAAGGATGTTGAAAGTATTTGATGGAATCTT
CTAATGTTTTGAATCAAAAATGAAAAAAATTGGGTTCTGTAAAGTCTTATGTGTAAGCAA
TGTTATTAGTTTTTCCACTTATCCTTTGTTCCTAAGCTTAACCC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1DB75JQ 503 0 0
TTCTTCTGCAACCTCTACTTAGGATTCATCACAATCCTGGGAATCTCCACTGTCCTCGTC
TCCCTCCTACCCGTCTTCCAGAGCCCTGAGTTTCGTGTGGTGAGAGCCTCTTTCTTCTTT
GGAATGGGGTTCTCCGGCGCGGCACCGATCCTGCATAAGCTGATCATCTTTTGGGACCAG
CCCGAGGCGCTTCACACGACGGGGTATGAGGTTTTGATGGGTTTGCTTTACGGGTTGGGA
GCTTTGGTTTATGCGACTAGGATCCCTGAGAGATGGATGCCTGGTAAGTTTGATATAGCT
GAACATAGCCATCAGTTGTTTCATGTTTTG*TGGTTGCTGGTGCCTTCACACATTATAGA
GCTGGGCTTGTGTATCTCAAGTGGAGAGACATTGAAGGATGTTGAAAGTATTTGATGGAA
TCTTCTAATGTTTTGAATCAAAAATGAAAAAAATTGGGTTCTGTAAAGTCTTATGTGTAA
GCAATGTTATTAGTTTTTCCACT

QA 1 503 1 503
DS 



AS 1 3

CO CL2307Contig1 944 3 6 U
GGGTTCGTCGTTAGATAAACAAATCTGGCCTTGTCGGTGGCTGTTCGGCTCAAATAGCGA
GGGGTCATTGATCGAGCAAACACAGTACCCACACCACTCGTCGTAACCAAGACAAAGTGG
ATCTGAACCGGAAGCAGCAAAAATGTTCGGGCGATCAGCGCTTCACAGAGCCGGCGGTTT
CCGTCCGGAGAACTTAGGTCAAAACGCACTTAACCTAATCGGAAACATCGGCTTCTCCCT
CTTCGTCTTCGGCGTGCTCGTCTTCACCATCATCGCCGCTACATACGAGCCCGAGGACCC
TCTCTTCCACCCTTCTGACAAGATCACCACTTTCCTCACTTCCACCTCCAACGCCACCCT
GAGATCGTCTCTGCCATTGCGTCCAGGTTAAACTGGGATTACGATGCGGTGCACATTGAG
AGAGGGGAGAAAGCAAGAAACACGGAGCTTTGGCCTAATCTTGATAAAGATACTTCTCCC
AGTGCTCTCTTGTCGACCTTGCAGGACAAAGTAGAAGAAGGAAGGAATCTCTACATCGCA
ACAAACGAAGGGGAGCTATCTTTCTTCAACCCTTTGAAAGACAAGTACGCTACTCATTTC
CTTGACGAGTACAAAGATTTGTGGGACGAGAGCAGCGAGTGGTATTCGGAGACCACGAAG
CTTAATGGAGGCAACCCGGTTGAGTTTGATGGTTACATGAGAGCATCTGTTGACACAGAA
GTTTTCTTGAGAGGGAAGAAGCAGATTGAAACATTCAATGATCTTACAAACGACTGCAAA
GATGGAGTTGGGACTTGCAATGTTGCGGCTACTTGATCTATCATTTAAGATTCCTCACTT
TGTTTGTTGTTTGAACCATCTTGTTCCACTTGTTTCTAGTTTTGTCCTTGTAGAATAGCT
GTCTTTTCCCCAGCTGTTGTTCGTTTTGTTACTTTTAGACCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GP16TF U 94
AF RS1A532TF U 1
AF RS1A532JQ C 362
BS 1 826 RS1A532TF
BS 827 827 RS1A532JQ
BS 828 831 RS1A532TF
BS 832 832 RS1A532JQ
BS 833 861 RS1A532TF
BS 862 944 RS1A532JQ

RD RS1GP16TF 256 0 0
GG
ACTCGTCGTAACCAAGACAAAGTGGATCTGAACCGGAAGCAGCAAAAATGTTCGGGCGAT
CAGCGCTTCACAGAGCCGGCGGTTTCCGTCCGGAGAACTTAGGTCAAAACGCACTTAACC
TAATCGGAAACATCGGCTTCTCCCTCTTCGTCTTCGGCGTGCTCGTCTTCACCATCATCG
CCGCTACATACGAGCCCGAGGACCCTCTCTTCCACCCTTCTGACAAGATCACCACTTTCC
TCACTTCCACCTCC

QA 3 256 3 256
DS 

RD RS1A532TF 861 0 0
GGGTTCGTCGTTAGATAAACAAATCTGGCCTTGTCGGTGGCTGTTCGGCTCAAATAGCGA
GGGGTCATTGATCGAGCAAACACAGTACCCACACCACTCGTCGTAACCAAGACAAAGTGG
ATCTGAACCGGAAGCAGCAAAAATGTTCGGGCGATCAGCGCTTCACAGAGCCGGCGGTTT
CCGTCCGGAGAACTTAGGTCAAAACGCACTTAACCTAATCGGAAACATCGGCTTCTCCCT
CTTCGTCTTCGGCGTGCTCGTCTTCACCATCATCGCCGCTACATACGAGCCCGAGGACCC
TCTCTTCCACCCTTCTGACAAGATCACCACTTTCCTCACTTCCACCTCCAACGCCACCCT
GAGATCGTCTCTGCCATTGCGTCCAGGTTAAACTGGGATTACGATGCGGTGCACATTGAG
AGAGGGGAGAAAGCAAGAAACACGGAGCTTTGGCCTAATCTTGATAAAGATACTTCTCCC
AGTGCTCTCTTGTCGACCTTGCAGGACAAAGTAGAAGAAGGAAGGAATCTCTACATCGCA
ACAAACGAAGGGGAGCTATCTTTCTTCAACCCTTTGAAAGACAAGTACGCTACTCATTTC
CTTGACGAGTACAAAGATTTGTGGGACGAGAGCAGCGAGTGGTATTCGGAGACCACGAAG
CTTAATGGAGGCAACCCGGTTGAGTTTGATGGTTACATGAGAGCATCTGTTGACACAGAA
GTTTTCTTGAGAGGGAAGAAGCAGATTGAAACATTCAATGATCTTACAAACGACTGCAAA
GATGGAGTTGGGACTTGCAATGTTGCGGCTACTTGATCTATCATTTTAGAT*CCTCACTT
TGTTTGTTGTTTGAACCATCT

QA 1 861 1 861
DS 

RD RS1A532JQ 583 0 0
AGATCGTCTCTGCCATTGCGTCCAGGTTAAACTGGGATTACGATGCGGTGCACATTGAGA
GAGGGGAGAAAGCAAGAAACACGGAGCTTTGGCCTAATCTTGATAAAGATACTTCTCCCA
GTGCTCTCTTGTCGACCTTGCAGGACAAAGTAGAAGAAGGAAGGAATCTTTACATCGCAA
CAAACGAAGGGGAGCTATCTTTCTTCAACCCTTTGAAAGACAAGTACGCTACTCATTTCC
TTGACGAGTACAAAGATTTGTGGGACGAGAGCAGCGAGTGGTATTCGGAGACCACGAAGC
TTAATGGAGGCAACCCGGTTGAGTTTGATGGTTACATGAGAGCATCTGTTGACACAGAAG
TTTTCTTGAGAGGGAAGAAGCAGATTGAAACATTCAATGATCTTACAAACGACTGCAAAG
ATGGAGTTGGGACTTGCAATGTTGCGGCTACTTGATCTATCATTTAAGATTCCTCACTTT
GTTTGTTGTTTGAACCATCTTGTTCCACTTGTTTCTAGTTTTGTCCTTGTAGAATAGCTG
TCTTTTCCCCAGCTGTTGTTCGTTTTGTTACTTTTAGACCTGC

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 4

CO CL2308Contig1 1019 4 9 U
GGCGACGGTTCCGTTAGCTTTATAACCATCGGCGTTTGGGGTCGCCGTGGCGACTACAAC
CAGTCTGTTGTGGCCTACCAGATGGGAAGGGTTGGAGAAAAGATAGGGTTAGATTTCGTG
GTGTCCACGGGAGATAACTTCTACGACAATGGATTGTTTAGCGAACACGATCCTAACTTC
AAAGAGTCTTTCTCTAACATCTACACTGCTCCAAGTCTCCAGAAACAGTGGTACAGTGTC
TTAGGGAACCATGACTACAGAGGTGACGCAGAAGCTCAGCTAAGCTCTGTCCTCAGAGAA
ATCGACAGCCGTTGGACCTGTCTCCGCTCTTTTATCGTCGACGCAGAGTTGGTCGAGCTC
TTCTTCGTTGACACGACTCCTTTCGTGAAAGAATACTACACAGAAGAAGATGGTCACACG
TACGATTGGCGTGCGGTCCCCTCTCGCAACTCTTATGTTAAGCATCTCCTCCGTGATGTC
GAAGCTTCTTTGAAGAGATCCAAAGCGACGTGGAAGATTGTGGTTGGTCATCACGCGATG
AGAAGCATTGGTCATCATGGAAACACTGTGGAGCTCGTTGAAGAGCTTTTGCCGATTATG
AAAGAGAACGGTGTTGATCTTTATATGAATGGACACGACCATTGTCTCGAACATATTAGC
GATGAAGATAGTCCTATTCAGTTTTTGACGAGCGG*TGCTGGTTCCAAGGCTTGGAGAGG
TGATGTTTACCCGACCACTAACAATCCTAAGTCTGTGAGATTTTATTATGACGGTCAAGG
GTTCATGTCTGCTAGATTCACTCACTCAGATGCAGAGATAGTCTTCTACAATGTGTTTGG
TGAGGTTTTGCACAAGTGGGTTACTTCTAAGGAGCTTCTTCATTCCTCTGTTTGATCAGA
AGTATAAATAATTTTTTGTTTCCTTGTAATTTTTGTAACATATCTTTCAAGTCCTATTGC
AGGCTAGGTAGGCTTCCTGCTTAGTTTAGCATCATTTAGCTATAGCTTATCCCTAATAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E532TF U 135
AF RS1A592TF U 1
AF RS1BB10TF U 252
AF RS1A592JQ C 634
BS 1 602 RS1A592TF
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G
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AACATCTACACTGCTCCAAGTCTCCAGAAACAGTGGTACAGTGTCTTAGGGAACCATGAC
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ACCTGTCTCCGCTCTTTTATCGTCGACGCAGAGTTGGTCGAGCTCTTCTTCGTTGACACG
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GTCCCCTCTCGCAACTCTTATGTTAAGCACCTCCTCCGTGATGTCGAAGCTTCTTTGAAG
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G*TCTTTATATGA*TGGACACGACCA

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TTCTTCGTTGACACGACTCCTTTCGTGAAAGAATACTACACAGAAGAAGATGGTCACACG
TACGATTGGCGTGCGGTCCCCTCTCGCAACTCTTATGTTAAGCATCTCCTCCGTGATGTC
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TGTGTTTG

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DS 

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G
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AAGAGATCCAAAGCGACGTGGAAGATTGTGGTTGGTCATCACGCGATGAGAAGCATTGGT
CATCATGGAAACACTGTGGAGCTCGTTGAAGAGCTTTTGCCGATTATGAAAGAGAACGGT
GTTGATCTTTATATGAATGGACACGACCATTGTCTCGAACATATTAGCGATGAAGATAGT
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DS 



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AAGGA


BQ
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30 30 30 30 30 

AF RS1H614JQB U 1
AF RS1H614TF C 1
AF RS1DB80JQ U 62
AF RS1DB80TF C 62
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BS 403 485 RS1H614JQB

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TATTAGTATTAGTATGGTAGGAATAAAAACGTAAATTCTTATTAGGAACGTGCGTTCTCA
TTTGCCCAAGCCCGTCTTTTCCTTAATTGCCTCAGTCGCACCCTGTGCTTTCTGCTTCAA
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AAGGA

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DS 

RD RS1H614TF 485 0 0
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CCTAAACGGCTTCGTTTGAAATCCTTAATCTTAGGCTTTAGATAGATAAACCTATCTAAT
TATTAGTATTAGTATGGTAGGAATAAAAACGTAAATTCTTATTAGGAACGTGCGTTCTCA
TTTGCCCAAGCCCGTCTTTTCCTTAATTGCCTCAGTCGCACCCTGTGCTTTCTGCTTCAA
CTGCTGTCCACCCTCTGACAAAGATTCCTTGGCAGATTGAGCAGCATTAGAGGCCTTGTC
CATCAGGTTGCTTGCCTTCTCCTGGGTTTGGCCTTTAGCTTGGCCAGCATTGAAGCTCAT
ACTCTGACTGTTGCTAGACATTTTCTTATCTCCTCTTAGAAAACGAACTTATAATTTGTA
AAGGA

QA 1 485 1 485
DS 

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G
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TTAGTAATAGTATGGTAGGAATAAAAACGTAAATTCTTATTAGGAACGTGCGTTCCCATT
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GCTGTCCACCCTCTGACAAAGACTCCTTGGCAGATTGAGCAGCATTAGAGGCCTTGTCCA
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TCTGACTGTTGCTAGACATTTTCTTATCTCCTCTTAGAAAACGAACTTATAATTTGTAAA
GGA

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DS 

RD RS1DB80TF 424 0 0
G
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TAAACGGCTTCGTTTGAAATCCTTAATCTTAGGCTTTAGATAGATAAACCTATCTAATTA
TTAGTAATAGTATGGTAGGAATAAAAACGTAAATTCTTATTAGGAACGTGCGTTCCCATT
TGCCCAAGCCCGTCTTTTCCTTAATTGCCTCAGTCGCACCCTGTGCTTTCTGCTTCAACT
GCTGTCCACCCTCTGACAAAGACTCCTTGGCAGATTGAGCAGCATTAGAGGCCTTGTCCA
TCAGGTTGCTTGCCCTCTCCTGGGTTTGGCCTTTAGCTTAGCCAGCGTTGAAGCTCATAC
TCTGACTGTTGCTAGACATTTTCTTATCTCCTCTTAGAAAACGAACTTATAATTTGTAAA
GGA

QA 2 424 2 424
DS 



AS 1 4

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TCGCCAGTGAACACTTAACCATACTTCATCTGTCCATGGCTGCGTTGCTAAAGTCTTTCG
TGGATGTAGCTCCAGACTCTCACTTCCCTATCCAGAACCTCCCTTATGGTGTCTTCAAGC
CTGATTCCAACTCCTCTCCCCGTCCTGCCGTCGCTATCGGCGATTCCGTCCTCGACCTCT
CTGCTATCTCCCAAGCTGGCCTTTTCGATGGTCCCATCCTCAACGCCTCCGATTGCTTCC
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CTACGCTTCAAAGACTCTTGTCATATACTGAACCCACCCTACGAGATAATGATGTTCTGA
GGAGGAAATCATTCTATGAGATGAGTAAAGTGGAAATGGTTGTTCCTATGGTGATTGGTG
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GGCCTCAGAATGCTATTAACCCAAATTGGTTTCGTCTTCCCATCGCATATCATGGACGAG
CATCATCTATCGTCATCTCTGGGACTGACATTATTCGACCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1GZ96TF U 1
AF RS1FG71TF U 18
AF RS1D385TF U 70
AF RS1DN56TF U 104
BS 1 90 RS1GZ96TF
BS 91 91 RS1FG71TF
BS 92 129 RS1GZ96TF
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BS 132 132 RS1FG71TF
BS 133 311 RS1GZ96TF
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BS 313 560 RS1GZ96TF
BS 561 689 RS1FG71TF
BS 690 690 RS1D385TF
BS 691 701 RS1FG71TF

RD RS1GZ96TF 560 0 0
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TCCTTTTCTTTTTTATCTCCTCTGTATCCGGATCTGTGGTTGGTTATAGCTTTGGAGACT
TCGCCAGTGTATACTTAACCATACTTCATCTGTCCATGGCTGCGTTGCTAAAGTCTTTCG
TGGATGTAGCTCCAGACTCTCACTTCCCTATCCAGAACCTCCCTTATGGTGTCTTCAAGC
CTGATTCCAACTCCTCTCCCCGTCCTGCCGTCGCTATCGGCGATTCCGTCCTCGACCTCT
CTGCTATCTCCGAAGCTGGCCTTTTCGATGGTCCCATCCTCAACGCCTCCGATTGCTTCC
TTCAGCCTAACCTGAATAAGTTCATGGCCATGGGACGGCCGGCATGGAAGGAAGCGCGAT
CTACGCTTCAAAGACTCTTGTCATATACTGAACCCACCCTACGAGATAATGATGTTCTGA
GGAGGAAATCATTCTATGAGATGAGTAAAGTGGAAATGGTTGTTCCTATGGTGATTGGTG
ACTATACAGACTTCTTTGCA

QA 1 560 1 560
DS 

RD RS1FG71TF 684 0 0
GG
AGTTTAAAGAAAAAATCTGTATACCATACCTACCACTGCCCTCCTTTTCTTTTTTATCTC
CTCTGTATCCGAATCTGTGGTTGGTTATAGCTTTGGAGACTTCGCCAGTGAACCCT*AAC
CATACTTCATCTGTCCATGGCTGCGTTGCTAAAGTCTTTCGTGGATGTAGCTCCAGACTC
TCACTTCCCTATCCAGAACCTCCCTTATGGTGTCTTCAAGCCTGATTCCAACTCCTCTCC
CCGTCCTGCCGTCGCTATCGGCGATTCCGTCCTCGACCTCTCTGCTATCTCCCAAGCTGG
CCTTTTCGATGGTCCCATCCTCAACGCCTCCGATTGCTTCCTTCAGCCTAACCTGAATAA
GTTCATGGCCATGGGACGGCCGGCATGGAAGGAAGCGCGATCTACGCTTCAAAGACTCTT
GTCATATACTGAACCCACCCTACGAGATAATGATGTTCTGAGGAGGAAATCATTCTATGA
GATGAGTAAAGTGGAAATGGTTGTTCCTATGGTGATTGGCGACTATACAGACTTCTTTGC
ATCCATGCATCACGCCAAGAACTGCGGTCTTATGTTTCGTGGGCCTCAGAATGCTATTAA
CCCAAATTGGTTTCGTCTTCCCATCGCATATCATGGACGAGCATCATCTATCGTCATCTC
TGGGACTGACGTTATTCGACCA

QA 3 684 3 684
DS 

RD RS1D385TF 632 0 0
TTTTTATCTCCTCTGTATCCGAATCTGTGGTTAGTTATAGCTTTGGAGACTTCGCCAGTG
AACC**TAACAATACTTCATCTGTCCATGGCTGCGTTGCTAAAGTCTTTCGTGGATGTAG
CTCCAGACTCTCACTTCCCAATCCAGAACCTCCCTTATGGTGTCTTCAAGCCTGATTCCA
ACTCCTCTCCCCGTCCTGCCGTCGCTATCGGCGATTCCGTCCTCGACCTTTCTGCTATCT
CCCAAGCTGGCCTTTTCGATGGTCCCATCCTCAACGCCTCCGATTGCTTCCTTCAGCCTA
ATCTGAATAAGTTCTTAGCCATGGGACGGCCTGCGTGGAAGGAAGCGCGATCTACGCTTC
AAAGACTCTTGTCATATACCGAACCCACCCTACGGGATAATGATGTTTTGAGGAGGAAAT
CATTCTATGAGATGAGTAAAGTGGAAATGGTTGTTTCTATGGTGATTGGTGACTATACAG
ACTTCTTTGCATCCATGCATCACGCCAAGAACTGCGGTCTTATGTTTCGTGGGCCTCAGA
ATGCGATTAACCCAAATTGGTTTCGTCTTCCCATCGCATATCATGGACGAGCATCATCTA
TCGTCATCTCTGGGACTGACATTATTCGACCA

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1DN56TF 598 0 0
GG
ATAGCTTTGGAGACTTCGCCAGTGTATACTTAACCATACTTCATCTGTCCATGGCTGCGT
TGCTAAAGTCTTTCGTGGATGTAGCTCCAGACTCTCACTTCCCTATCCAGAACCTCCCTT
ATGGTGTCTTCAAGCCTGATTCCAACTCCTCTCCCCGTCCTGCCGTCGCTATCGGCGATT
CCGTCCTCGACCTCTCTGCTATCTCCGAAGCTGGCCTTTTCGATGGTCCCATCCTCAACG
CCTCCGATTGCTTCCTTCAGCCTAACCTGAATAAGTTCATGGCCATGGGACGGCCGGCAT
GGAAGGAAGCGCGATCTACGCTTCAAAGACTCTTGTCATATACTGAACCCACCCTACGAG
ATAATGATGTTCT*AGGAGGAAATCATTCTATGAGATGAGTAAAGTGGAAATGGTTGTTC
CTATGGTGATTGGTGACTATACAGACTTCTTTGCATCCATGCATCACGCCAAGAACTGCG
GTCTTATGTTTCGTGGGCCTCAGAATGCTATTTACCCAAATTGGTTTCGTCTTCCCATCG
CATATCATGGACGAGCATCATCTATCGTCATCTCTGGGACTGACATTATTCGACCA

QA 3 598 3 598
DS 



AS 1 4

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TCTTAAAGAAAGCAAGAAAGTTTGTACTAAAAAGGATGACTTATCTGAACAAGCTTTGGA
TGGCAGCATCGTTCGTGGCTGTTCAAGGAAATCCCGATCACGGCGTCAAGTTGAAAACGA
GTCTCACCTCCGCCCACCGTCTTCAACGCCGCCTTTCATCCGATCTCCGCCCTCTCTCCG
CCGCAGATGTCCCCGCTGACGGTGTTCCCGCAGATGATAGACGACGTACCTCTTCCTCGA
CTCCTGATGAATCTCTCCGTCAGGTCATGTACCTCAACTGCTGGAGCCAAGGCTAATAAC
TCATTCCATTCATCCACGGATGATGCTGTTGACTCGCTCATGGACCCGATGAGTCGGATA
AAACGAGTCAGATTCTCTGATGATAACTGTATATATTAGTATGTAGTTTGTTTGTTGTAG
TCCCTCTTATGTGAATACTAGATTTGTTCAAAAAGATCAAAAGCAAGCGTTCGTATATTA
GAACACTGTCTCTGTTTTCATCTTCCAATTTCTCATCAGTCTTTATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1ET34JQ C 13
AF RS1ET34TF U 13
AF RS1H329TF U 1
AF RS1H329JQB C 37
BS 1 20 RS1H329TF
BS 21 21 RS1ET34TF
BS 22 217 RS1H329TF
BS 218 218 RS1ET34TF
BS 219 295 RS1H329TF
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BS 297 587 RS1H329TF
BS 588 588 RS1H329JQB

RD RS1ET34JQ 498 0 0
GG
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CACCGTTTTCAACGCCGCCTTTCATCCGATTTCCGCCCTCTTTCCGCCGTAGATTTCCCC
GTTGACGGTGTTCCCGCAGATGATAGACGACGTACCTCTTCCTCGACTCCTGATGAATCT
TTCCGTCAGGTCATGTACCTCAACTGCTGGAGCCAAGGCTAATAACTCATTCCATTCATC
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CTCTGATGATAACTGTATATATTAGTATGTAGTTTGTTTGTTGTAGTCCCTCTTATGTGA
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G

QA 3 497 3 497
DS 

RD RS1ET34TF 498 0 0
GG
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AGAAAGTTTGTACTAAAAAGGATGACTTATCTGAACAAGCTTTGGATGGCAGCATCGTTC
GTGGCTGTTCAAGGAAATCCCGATCACGGCGTCAAGTTGAAAACGAGTCTCACCTCCGCC
CACCGTCTTCAACGCCGCCTTTCATCCGATCTCCGCCCTCTCTCCGCCGTAGATTTCCCC
GTTGACGGTGTTCCCGCAGATGATAGACGACGTACCTCTTCCTCGACTCCTGATGAATCT
CTCCGTCAGGTCATGTACCTCAACTGCTGGAGCCAAGGCTAATAACTCATTCCATTCATC
CACGGATGATGCTGTTGACTCGCTCATGGACCCGATGAGTCGGATAAAACGAGTCAGATT
CTCTGATGATAACTGTATATATTAGTATGTAGTTTGTTTGTTGTAGTCCCTCTTATGTGA
ATACTAGATTTGTTC
G

QA 3 497 3 497
DS 

RD RS1H329TF 587 0 0
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TCTTAAAGAAAGCAAGAAAGTTTGTACTAAAAAGGATGACTTATCTGAACAAGCTTTGGA
TGGCAGCATCGTTCGTGGCTGTTCAAGGAAATCCCGATCACGGCGTCAAGTTGAAAACGA
GTCTCACCTCCGCCCACCGTCTTCAACGCCGCCTTTCGTCCGATCTCCGCCCTCTCTCCG
CCGCAGATGTCCCCGCTGACGGTGTTCCCGCAGATGATAGACGACGTACCTCTTCTTCGA
CTCCTGATGAATCTCTCCGTCAGGTCATGTACCTCAACTGCTGGAGCCAAGGCTAATAAC
TCATTCCATTCATCCACGGATGATGCTGTTGACTCGCTCATGGACCCGATGAGTCGGATA
AAACGAGTCAGATTCTCTGATGATAACTGTATATATTAGTATGTAGTTTGTTTGTTGTAG
TCCCTCTTATGTGAATACTAGATTTGTTCAAAAAGATCAAAAGCAAGCGTTCGTATATTA
GAACACTGTCTCTGTTTTCATCTTCCAATTTCTCATCAGTCTTTATC

QA 1 587 1 587
DS 

RD RS1H329JQB 552 0 0
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ATCACGGCGTCAAGTTGAAAACGAGTCTCACCTCCGCCCACCGTTTTCAACGCCGCCTTT
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ATAGACGACGTACCTTTTTTTCGACTCCTGATGAATCTTTCCGTCAGGTCATGTACCTCA
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CTCATGGACCCGATGAGTCGGATAAAACGAGTCAGATTTTTTGATGATAACTGTATATAT
TAGTATGTAGTTTGTTTGTTGTAGTCCCTCTTATGTGAATACTAGATTTGTTCAAAAAGA
TCAAAAGCAAGCGTTCGTATATTAGAACACTGTCTCTGTTTTCATCTTCCAATTTCTCAT
CAGTCTTTATCG

QA 1 552 1 552
DS 



AS 1 4

CO CL2312Contig1 1009 4 8 U
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GATACTGCAGAACTTGTGTGGTGGGACCAACATTGTGAAGCTGTTTGATGTTGTTAGAGA
TGAGCATTCCAAAGCTCCGAGCTTGATATTCGAGTATGTCAACAGCACTGACTTTAAACT
TCTCTATCCGACCTTTACTGATTACGACATTCGTTACTACATCTTTGAGCTCTTGAAGGC
ATTGGATTACTGCCATTCGCAAGGGATAATGCACAGAGACGTAAAGCCTCACAATGTTAT
GATTGACCATGAGCTGCGTAAGCTTAGGCTGATAGATTGGGGTCTCGCTGAGTTTTACCA
CCCTGGGAAAGAGTATAATGTCCGTGTTGCGTCGAGATACTTTAAGGGACCTGAACTTCT
TGTGGACTTGCAAGATTATGACTACTCATTGGATATGTGGAGCCTTGGCTGTATGTTTGC
TGGGATGATATTCCGTAAGGAACCTTTTTTCTACGGCCATGACAATCAGGATCAGCTAGT
GAAAATCGCCAAGGTACTTGGGACAGATGACTTAAACGCTTATCTAGATAAGTACCAGTT
AAAACTTGAACCACAACTCGAAGCACTCGTTGGACGGCATAGCAGGAAGCCTTGGTCCAA
ATTCACCAACGCAGACAATCAGCATCTAGTCTCACCCGAGGCGATTGATTTCCTGGACAA
GCTACTCCGGTATGATCATCAAGACAGATTAACTGCAAAAGAAGCCATGGCGCATGCTTA
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GAGTGAGAGAGAGAGAGATCTGGATGGTAAGTGTTTGATCTTTTCTTCAAGTATCATCTA
AACTGTGTGGTGTTTTCTTTTTTGTCCAAGGTTTAAAACACTTTGTCGTGAATTCCGAAT
GTATTAAACGTATAAAATTACTAAACATTAATGGAAGCATATTGTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1GV15TF U 1
AF RS1GV15JQ C 181
AF RS1GH67JQ C 505
AF RS1GH67TF U 505
BS 1 645 RS1GV15TF
BS 646 646 RS1GH67TF
BS 647 700 RS1GV15TF
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RD RS1GV15TF 762 0 0
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GATACTGCAGAACTTGTGTGGTGGGACCAACATTGTGAAGCTGTTTGATGTTGTTAGAGA
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TCTCTATCCGACCTTTACTGATTACGACATTCGTTACTACATCTTTGAGCTCTTGAAGGC
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GATTGACCATGAGCTGCGTAAGCTTAGGCTGATAGATTGGGGTCTCGCTGAGTTTTACCA
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TGTGGACTTGCAAGATTATGACTACTCATTGGATATGTGGAGCCTTGGCTGTATGTTTGC
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GCTACTCCGGTATGATCATCAAGACAGATTAACTGCAAA
GAG

QA 1 759 1 759
DS 

RD RS1GV15JQ 829 0 0
TCTCTATCCG*CCTTTACTGATTACGACATTCGTTACTACATCTTTGAGCTCTTGAAGGC
ATTGGATTACTGCCATTCGCAAGGGATAATGCACAGAGACGTAAAGCCTCACAATGTTAT
GATTGACCATGAGCTGCGTAAGCTTAGGCTGATAGATTGGGGTCTCGCTGAGTTTTACCA
CCCTGGGAAAGAGTATAATGTCCGTGTTGCGTCGAGATACTTTAAGGGACCTGAACTTCT
TGTGGACTTGCAAGATTATGACTACTCATTGGATATGTGGAGCCTTGGCTGTATGTTTGC
TGGGATGATATTCCGTAAGGAACCTTTTTTCTACGGCCATGACAATCAGGATCAGCTAGT
GAAAATCGCCAAGGTACTTGGGACAGATGACTTAAACGCTTATCTAGATAAGTACCAGTT
AAAACTTGAACCACAACTCGAAGCACTCGTTGGACGGCATAGCAGGAAGCCTTGGTCCAA
ATTCACCAACGCAGACAATCAGCATCTAGTCTCACCCGAGGCGATTGATTTCCTGGACAA
GCTACTCCGGTATGATCATCAAGACAGATTAACTGCAAAAGAAGCCATGGCGCATGCTTA
CTTCGCGCAAGTCAGGGCAGCAGAAACCAGCAGGATGAGAAGTCAATGAAACTCAAGAGA
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DS 

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QA 1 505 1 505
DS 

RD RS1GH67TF 505 0 0
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AGATGACTTAAACGCTTATCTAGATAAGTACCAGTTAGAACTTGAACCACAACTCGAAGC
ACTCGTTGGACGGCATAGCAGGAAGCTTTGGTCCAAATTCACCAACGCAGACAATCAGCA
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CAGATTAACTGCAAAAGAAGCCATGGCGCATGCTTACTTCGCGCAAGTCAGGGCAGCAGA
AACCAGCAGGATGAGAAGTCAATGAAACTCAAGAGAGAGTGAGAGAGAGAGAGATCTGGA
TGGTAAGTGTTTGATCTTTTCTTCAAGTATCATCTAAACTGTGTGGTGTTTTCTTTTTTG
TCCAAGGTTTAAAACACTTTGTCGTGAATTCCGAATGTATTAAACGTATAAAATTACTAA
ACATTAATGGAAGCATATTGTTTAC

QA 1 505 1 505
DS 



AS 1 4

CO CL2313Contig1 868 4 5 U
GCATCAAGCCAAATGACTACAGACATTGCTAGTAGCAGCCACAATGTAGCAGAAAGCAGC
TCTCAAGGCAATCCACCAATATCCTCGACTCCTCTTTTACTTCCACCATCACTATCAGGT
GAACCTTCTGGGTCCTCTCAAGCCAATGTACCACATCACAAACAAAACATCACAGAACCA
TCGTCCTCCGAGCCAATCATAGTTCCATCTCTTCAAGAAGATTCTGTGGTAGCAGCAGAA
CTATCTGAAGCACCAAAGCCAAGTCTAGAGGAGGTCACTGGTACGACAAGATCTGTATCG
CCAGAGAGCAAAATCTCTGAACCAAAATCTGCCAACGAGGATGGAGACTCAGATTTAGAA
ACCTGTGAGAAAAATGAGGCTGATCAACTTATGATTCATTCAGACGATAAGCATTTGGAT
GCGAAGCAAGAGGAACAACAGTCTGAGAATGCCTCAAACAAGCAATGTGAGCCCACAGAG
GCTGAAACTCCAAACATGGACACAGAACAAGAAGATAAAGGAGAATCCGTAAAGATGGTG
ATTGACATTTCTCCAGGTGACGATTGAAGTCTACAATCGAATTGCATTGAAAATATACCA
GTGTTGCTTTTGTTTAGGTCCTTGCGATCAAAATGGGTACTATATGGCTATTAAGTTTTG
TAGGTATGACGCAACTCAGTGAAGAAGCAGTATATGTACTGGGACTTTCACCATTTTTAT
CTTTTTAAATTTTTCTTGATTTGTAAAACTTGTGTAAGAGAATGACGAAGCCTATTTTAA
TGATCTAACTAGTTGGTTTGGATTGTGTAATACCAGATAATGTAGATTGTAATGCTTACT
ATAATGCTTCAGTTAGAAAAGCCTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RS1FQ06TF U 1
AF RS1FQ06JQ C 42
AF RS1DQ05JQ C 431
AF RS1DQ05TF U 431
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RD RS1FQ06TF 527 0 0
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CCAGAGAGCAAAATCTCTGAACCAAAATCTGCCAACGAGGATGGAGACTCAGATTTAGAA
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GCGAAGCAAGAGGAACAACAGTCTGAGAATGCCTCAAACAAGCAATGTGAGCCCACAGAG
GCTGAAACTCCAAACATGGACACAGAACAAGAAGATAAAGGAGAATC

QA 1 527 1 527
DS 

RD RS1FQ06JQ 795 0 0
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TCCACCATCACTATCAGGTGAACCTTCTGGGTCCTCTCAAGCCAATGTACCACATCACAA
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TTCTGTGGTAGCAGCAGAACTATCTGAAGCACCAAAGCCAAGTCTAGAGGAGGTCACTGG
TACGACAAGATCTGTATCGCCAGAGAGCAAAATCTCTGAACCAAAATCTGCCAACGAGGA
TGGAGACTCAGATTTAGAAACCTGTGAGAAAAATGAGGCTGATCAACTTATGATTCATTC
AGACGATAAGCATTTGGATGCGAAGCAAGAGGAACAACAGTTTGAGAATGCCTCAAACAA
GCAATGTGAGCCCACAGAGGCTGAAACTCCAAACATGGACACAGAACAAGAAGATAAAGG
AGAATC*GTAAAGATGGTGATTGACATTTCTCCAGGTGACGATTGAAGTCTACAATCGAA
TTGCATTGAAAATATACCAGTGTTGCTTTTGTTTAGGTCCTTGCGATCAAAATGGGTACT
ATATGGCTATTAAGTTTTGTAGGTATGACGCAACTCAGTGAAGAAGCAGTATATGTACTG
GGACTTTCACCATTTTTATCTTTTTAAATTTTTCTTGATTTGTAAAACTTGTGTAAGAGA
ATGACGAAGCCTATTTTAATGATCTAACTAGTTGGTTTGGATTGTGTAATACCAGATAAT
GTAGATTGTAATGCT

QA 1 795 1 795
DS 

RD RS1DQ05JQ 438 0 0
G
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CAACTCAGTGAAGAAGCAGTATATGTACTGGGACTTTCACCATTTTTATCTTTTTAAATT
TTTCTTGATTTGTAAAACTTGTGTAAGAGAATGACGAAGCCTATTTTAATGATCTAACTA
GTTGGTTTGGATTGTGTAATACCAGATAATGTAGATTGTAATGCTTACTATAATGCTTCA
GTTAGAAAAGCCTTTTT

QA 2 438 2 438
DS 

RD RS1DQ05TF 438 0 0
G
GGAACAACAGTCTGAGAATGCCTCAAACAAGCAATGTGAGCCCACAGAGGCTGAAACTCC
AAACATGGACACAGAACAAGAAGATAAAGGAGAATCCGTAAAGATGGTGATTGACATTTC
TCCAGGTGACGATTGAAGTCTACAATCGAATTGCATTGAAAATATACCAGTGTTGCTTTT
GTTTAGGTCCTTGCGATCAAAATGGGTACTATATGGCTATTAAGTTTTGTAGGTATGACG
CAACTCAGTGAAGAAGCAGTATATGTACTGGGACTTTCACCATTTTTATCTTTTTAAATT
CTTCTTGATTTGTAAAACTTGTGTAAGAGAATGACGAAGCCTATTTTAATGATCTAACTA
GTTGGTTTGGATTGTGTAATACCAGATAATGTAGATTGTAATGCTTACTATAATGCTTCA
GTTAGAAAAGCCTT
CTT

QA 2 435 2 435
DS 



AS 2 4

CO CL2314Contig1 889 2 12 U
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AAGAAAAAAAACAAAAAGTACAATACATCACCCATGAGAAACAACATTAAAAAAGAACAT
CGTATCAAAGTAGAAAATACTCGAGGAAGAAGTTTGTTTATGTATACCCAACAAGCAAAA
AGCAATATCATCAAGGCTTTCTTGCTACAAATTGATTCCCAGACTTGAGATTATCTTGAG
GGACGTCCATGGGCAGCTTGGTCCAGTTAAAGACGTCATCTCTGACTTTCTTCCTCCGAA
CCACAACGTAAAAGCTCATGAATATACACATAAACGCCATCATTGCGATGAATATGCTTA
GGTTTCTTCTATTTGGGCAAGAAGTGAGAATCATATCTGTTGAAACAAACCCATCAAGAC
TCCCCATCGAGTTATTCATCTTCATGATCTCAAACACCGTTCAACATCGCATCCACCCCC
ACGCTCATCAACACTGGTCTTGTTTGATGGTCCCACACTTACTCTAATCGATGATCCTGA
AGGGTCGTTGGAATCAGCGGTAAGATCCACCACGAAATCCATGTAATAAGGGGAAGCAAG
GACGTAACCAGTAGAGTCAGAGATATCGAAATCTTGATACGCCGAGTTCCCGTTGATGTA
AACGTTGAAATAGAGGAGACCGAGTGATTTGCTAGCAATGTCACAGAAATGCATCCGGAT
CAGATATTTGTAACCCGTGCTCACAGAGAAGTCCCAACTCATAACGTTGCCCACACGGGC
AGTGTTGTAGACGTTATCAGGACCAACTTCCCGGCTCGCACCTCCGGGCCTATACTTAAT
CCTACCGGTGAAGTAAGCTTTGCGAGAAGAAGACCCACCAACGGATTTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1D368JQ U 1
AF RS1AG78TF C 182
BS 1 206 RS1D368JQ
BS 207 207 RS1AG78TF
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BS 645 645 RS1AG78TF
BS 646 770 RS1D368JQ
BS 771 889 RS1AG78TF

RD RS1D368JQ 770 0 0
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AAGAAAAAAAACAAAAAGTACAATACATCACCCATGAGAAACAACATTAAAAAAGAACAT
CGTATCAAAGTAGAAAATACTCGAGGAAGAAGTTTGTTTATGTATACCCAACAAGCAAAA
AGCAATATCATCAAGGCTTTCTTGCTGCAAATTGATTCCCAGACTTGAGATTATCTTGAG
GGACGTCCATGGGCAGCTTGGTCCAGTTAAAGACGTCATCTCTGACTTTCTTCCTCTGAA
CCACAACGTAAAAGCTCATGAATATACACATAAACGCCATCATTGCGATGAATATGCTTA
GGTTTCTTCTATTTGGGCAAGAAGTGAGAATCATATCTGTTGAAACAAACCCATCAAGAC
TCCCCATCGAGTTATTCATCTTCATGATCTCAA*CACCGTTCAACATCGCATCCACCCC*
ACGCTCATCAACACTGGTCTTGTTTGATGGTCCCACACTTACTCTAATCGATGATCCTGA
AGGGTCGTTGGAATCAGCGGTAAGATCCACCACGAAATCCATGTAATAAGGGGAAGCAAG
GACGTAACCAGTAGAGTCAGAGATATCGAAATCTTGATACGCCG*GTTCCCGTTGATGTA
AACGTTGAAATAGAGGAGACCGAGTGATTTGCTAGCAATGTCACAGAAATGCATCCGGAT
CAGATATTTGTAACCCGTGCTCACAGAGAAGTCCCAACTCATAACGTTGC

QA 1 770 1 770
DS 

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GACGTCCATGGGCAGCTTGGTCCAGTTAAAGACGTCATCTCTGACTTTCTTCCTCCGAAC
CACAACGTAAAAGCTCATGAATATACACATAAACGCCATCATTGCGATGAATATGCTTAG
GTTTCTTCTATTTGGGCAAGAAGTGAGAATCATATCTGTTGAAACAAACCCATCAAGACT
CCCCATCGAGTTATTCATCTTCATGATCTCAAACACCGTTCAACATCGCATCCACCCCCA
CGCTCATCAACACTGGTCTTGTTTGATGGTCCCACACTTACTCTAATCGATGATCCTGAA
GGGTCGTTGGAATCAGCGGTAAGATCCACCACGAAATCCATGTAATAAGGGGAAGCAAGG
ACGTAACCAGTAGAGTCAGAGATATCGAAATCTTGATACGCCGAGTTCCCGTTGATGTAA
ACGTTGAAATAGAGGAGACCGAGTGATTTGCTAGCAATGTCACAGAAATGCATCCGGATC
AGATATTTGTAACCCGTGCTCACAGAGAAGTCCCAACTCATAACGTTGCCCACACGGGCA
GTGTTGTAGACGTTATCAGGACCAACTTCCCGGCTCGCACCTCCGGGCCTATACTTAATC
CTACCGGTGAAGTAAGCTTTGCGAGAAGAAGACCCACCAACGGATTTG

QA 1 708 1 708
DS 



CO CL2314Contig2 1123 2 2 U
GGAGGTCTCATTTTCCAAATTACATTTTATCATCTTGTCTGATCTACTGCAAAATTGTGC
AATCTCTTCTCCGCGGGCAATGGCGATTCTGTCCAGAAGGATCGATTTCCTCCTATTCGT
TACCTTCCTATCATCCTCAATCTCAATCTCAATCTCATCTCTCTCTTTCTCCCCCTCCGA
CGACTACCTCGTGAACTGCGGCTCGGACGTTGACTCCACCGTGGATAACCGCCGGTTCGT
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AGAAGATCTAGCTCCGAACGTCCCTCAGATCTACCGGACCGCCAGGGTATTCACGCGACA
GGCCAAGTACGAGTTCAATGTCCGCGAGAAAGGGACTCACATGGTACGTCTCCATTTCAA
TCGACTCACTTCCTCTAAAATCGATCTTAACGGCGCTGAGTTTCACGTCACCGTTAACGG
CCACGTCGTCCTTACAAATTTTAACGACACGTCGTCTAATAAAGTTAGGGAATTTCTGAT
TTGGGTCGGTGTTGGAGAGGTTGTGGTCAGGTTTGTTCCTAGTAAAGATTCGAAATTAGC
GTTCGTTAACGCTATAGAAGTTATATCCGCGCCTAAGGATTTGATCGCTGACGTGGCAAC
CTCTGTATCTGGTGATGGGACTGGGAAAGTGAATGGTTTAGCTAAGCAAGCTATGGAAGT
GATGTACAGAATCAATGTTGGTGGTAGAAAGGTCACTCCTTTCAATGACACCTTGTGGAG
AACTTGGCTGCCTGATGATGACTTGTTCAAATCCGTTGGTGGGTCTTCTTCTCGCAAGGC
TTACTTCACCGGTAGGATTAAGTATAGGCCCGGAGGTGCGAGCCGGGAAGTTGGTCCTGA
TAACGTCTACAACACTGCCCGTGTGGGCAACGTTATGAGTTGGGACTTCTCTGTGAGCAC
GGGTTACAAATATCTGATCCGGATGCATTTCTGTGACATTGCTAGCAAATCACTCGGTCT
CCTCTATTTCAACGTTTACATCAACGGGACCGGCGTATCAAGATTCGATATCTCTGACTC
TACTGGTTACGTCCTTGCTTCCCTATTACATGGATTTCGTGGT


BQ
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AF RS1DY74TF U 1
AF RS1D368TF U 356
BS 1 632 RS1DY74TF
BS 633 1123 RS1D368TF

RD RS1DY74TF 632 0 0
GGAGGTCTCATTTTCCAAATTACATTTTATCATCTTGTCTGATCTACTGCAAAATTGTGC
AATCTCTTCTCCGCGGGCAATGGCGATTCTGTCCAGAAGGATCGATTTCCTCCTATTCGT
TACCTTCCTATCATCCTCAATCTCAATCTCAATCTCATCTCTCTCTTTCTCCCCCTCCGA
CGACTACCTCGTGAACTGCGGCTCGGACGTTGACTCCACCGTGGATAACCGCCGGTTCGT
CTCCGACGCATCATCGAAAGTGAAGTTCTTCTCATCGGAAGGATCAGTCTCCCTCCAGGG
AGAAGATCTAGCTCCGAACGTCCCTCAGATCTACCGGACCGCCAGGGTATTCACGCGACA
GGCCAAGTACGAGTTCAATGTCCGCGAGAAAGGGACTCACATGGTACGTCTCCATTTCAA
TCGACTCACTTCCTCTAAAATCGATCTTAACGGCGCTGAGTTTCACGTCACCGTTAACGG
CCACGTCGTCCTTACAAATTTTAACGACACGTCGTCTAATAAAGTTAGGGAATTTCTGAT
TTGGGTCGGTGTTGGAGAGGTTGTGGTCAGGTTTGTTCCTAGTAAAGATTCGAAATTAGC
GTTCGTTAACGCTATAGAAGTTATATCCGCGC

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1D368TF 768 0 0
G
GACAGGCCAAGTACGAGTTCAATGTCCGCGAGAAAGGGACTCACATGGTACGTCTCCATT
TCAATCGACTCACTTCCTCTAAAATCGATCTTAACGGCGCTGAGTTTCACGTCACCGTTA
ACGGCCACGTCGTCCTTACAAATTTTAACGGCACGTCGTCTAATAAAGTTAGGGAATTTC
TGATTTGGGTCGGTGTTGGAGAGGTTGTGGTCAGGTTTGTTCCTAGTAAAGATTCGAAAT
TAGCGTTCGTTAACGCTATAGAAGTTATATCCGCGCCTAAGGATTTGATCGCTGACGTGG
CAACCTCTGTATCTGGTGATGGGACTGGGAAAGTGAATGGTTTAGCTAAGCAAGCTATGG
AAGTGATGTACAGAATCAATGTTGGTGGTAGAAAGGTCACTCCTTTCAATGACACCTTGT
GGAGAACTTGGCTGCCTGATGATGACTTGTTCAAATCCGTTGGTGGGTCTTCTTCTCGCA
AGGCTTACTTCACCGGTAGGATTAAGTATAGGCCCGGAGGTGCGAGCCGGGAAGTTGGTC
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GCACGGGTTACAAATATCTGATCCGGATGCATTTCTGTGACATTGCTAGCAAATCACTCG
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ACTCTACTGGTTACGTCCTTGCTTCCCTATTACATGGATTTCGTGGT

QA 2 768 2 768
DS 



AS 1 3

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TTATGTGCATTTCTCTCTTGTTAAAATAGAGACAAGATCATCAAGTAGTATTCTTGAAGT
AAACAAAGATTTTTGAGAGAACCTTTTATTAAGTGTTTGTCTGATGATGAAGAGATTAAG
AAGTTCAGATCCAGTGGGTGGTCTGATCTCTTTATGTCCTACGTCTTCTACAGATGAGCA
GAGTCCAAGAAGATACGGGAGAGAATTTCAGTCGATGCTTGAAGGTTACGAGGAGGAGGA
TGAAGAAGCGATAATTGAGGAAAGAGGCCAAACCGGTTTAGCTGAGAAAAAGAGACGGTT
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AAGAAGCTTGCGGTTTTTTCTCCGATGAGCAACCGCCGTCTCTGCACTGGTACTCCGCCG
TTGATCACTGGACTTGAAGCTTTAAACGCCGGAAGAGGTTTTTGGATTGGATTAAAATGC
TCTGTTTTTTTCTATGTGGGTTCGGAGGAGAAGATGGGAAAAGGAGAGGGCACAGTGGGA
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AATTGATTAGGGTGAATTTCTGATTATGTTTTCTCTGGCGTTTCGTGCACTTCTTGTAAT
TAAGGATTATGAGGATTGAGAAAGGGGAAAGTTAAAAGGAGTAAAATTGAACATGGAATC
TTTAATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DK56TF U 1
AF RS1E403TF U 566
AF RS1DK56JQ C 60
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RD RS1DK56TF 633 0 0
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DS 

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T
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QA 2 197 2 197
DS 

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TGTTTCTTCCAGTTTGTGAAAACGGAGCAGACGGAGGATCACGACGACTTTTTGAGTGGA
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CTCTGTTTTTTTCTATGTGGGTTCGGAGGAGAAGATGGGAAAAGGAGAGGGCACAGTGGG
AATAATGGGAAAATGGAAGGGTGAATGGGAAAATAAGGAAGGCTAGATATGGGCGGGAAA
TAATTGATTAGGGTGAATTTCTGATTATGTTTTCTCTGGCGTTTCGTGCACTTCTTGTAA
TTAAGGATTATGAGGATTGAGAAAGGGGAAAGTTAAAAGGAGTAAAATTGAACATGGAAT
CTTTAATAG

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 3

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BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CY88JQ C 1
AF RS1CY88TF U 1
AF RS1CK24TF U 1
BS 1 87 RS1CK24TF
BS 88 88 RS1CY88TF
BS 89 94 RS1CK24TF
BS 95 95 RS1CY88TF
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RD RS1CY88JQ 156 0 0
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TCCAAAACTAAAATAGAAAATTCAAGTAAATAAGT
A

QA 1 155 1 155
DS 

RD RS1CY88TF 155 0 0
TTTTTTTTGAGGGAGGGGCTCCCTGTATTTCGATTTATAAAATCGGTTACTATTCCTGAA
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TCCAAAACTAAAATAGAAAATTCAAGTAAATAAGT

QA 1 155 1 155
DS 

RD RS1CK24TF 594 0 0
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TCCAAAACTAAAATAGAAAATTCAAGTAAATAAGTAAAAAAAAAGGGGGGGGGTCTTGAA
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TGTAATTGCTATCTTATTAGGTTCCGCAGCTCTAGCGGTTCGCAATCCACAAACCATTCC
AACTGGCGGCCAAAACTTCTTTGAATTTGTCCTTGAATTCATTCGAGATGTGAGTCAACC
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TTTTGTTTCTAACTGGTCAGGAGCCCTTTTACCGTGGAAAATTATCCAGTTACC

QA 1 594 1 594
DS 



AS 1 4

CO CL2317Contig1 1453 4 30 U
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TTTACTTTGCTGAGAAATCATGGATTCTACTATGGAGATTTGCAACGGTGGGGTCTCAAA
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TGGCATCGATGATAGCATGGCGATAATGATGGCGTTTCAAACACCTGAGCTAGATATATT
AGGACTCACTACAGTGTTTGGTAATGTTCAGACACAAGATGCTACTCGCAACGCCTTACT
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AAAGGGTGGGATTCCACGTGTTGCTGACTTCGTGCACGGTAAAAACGGGCTTGGAGACGT
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GAAAGTCTCTCAATATCCTGGTGAAGTCACCGTTCTCGCTCTTGGACCTCTAACCAACTT
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TGACCCAGAAGCAGCTGATGTGGTGTTCACTTGTGGAGCTGATATCACTGTTGTTGGGAT
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GGGGAAACACGCCAAACTGTTAAGCGACATGTGCAAGTTCTACAGAGATTGGCATGTCAA
ATCTGATGGTGTTTATGGAGTGTACCTCCATGACCCGGTCAGCTTTGTGGCTGTAGTACG
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ATACTCACCAGTATCAGTGGCGTGGACGGTAGATGTAGATGGAGTACTGGAATACATCAA
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ACATTCATCATGTGTTCTGGTTCTAACCTGATTCTGAATTCAACATCTGTATTTGAACTG
TACAATTGCTAAAATTTGGTAAAGAAGTAAACGATGATAAATGGAAACTATCTATCTTTT
TCTTTTCTCTTTGGTTTATATTCCTTGTAAAAACACAGTAAGACGACATGAAAATAATGA
ATTCCTTCGGCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AATTCCTTCGGCCG

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BQ
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10 10 10 10 10 

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G
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GTTCGACTAAGCTTGAGCGATTTGCCTTTGTTATTTCTTGTTCGTAGTTGTTGGTTGATT
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AAAAGTCTTCGTTGTTTTTCTTTTTTGTGCTGAATATCACCTCTTGTACTACTCAAAGTC
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G
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CTATGCTAAGTTGATTCCATT

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CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGCGCGAAGGATCCGATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GC

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G
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DS 



AS 1 4

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CTAGAGTACATAAAACAGAGTTATGCCAATCCC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A352TF C 1
AF RS1A352JQ U 2
AF RS1A352TV C 2
AF RS1A352TR U 2
BS 1 8 RS1A352TF
BS 9 131 RS1A352JQ
BS 132 132 RS1A352TF
BS 133 573 RS1A352JQ

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AATCAGAACAAAGTGAAAGGCTCATCTGACTTTGTAGG*AATCATTCACTATCTTGCTGC
TTCTGTCTCAAAATCCGAAACTTCTCTTTCTTCCAGGGGACTCCGATTTTCTTCTGAGAC
ATGGACGTTTCTTTGACTTGTGTGAATCATAACTAAAATAACTCTTTGCTCTATTTTTTC
TTTTGTTATCTCCACCGATGTTTCTTGTGTTTATGCTGATCATCATCTTATCTTCTTCTT
TGTTTTACTGCTTTGGGAAGGGCAGACTTCGGGAATTTCTCAGCTTTCCAGGTAAAGAGT
ATGTAAAAATCCTTACTATACAGCTTCATGTTTTCCCATCTCAATCCATCCCTTCTTAGT
TGCTTTTTGTTTTCGTTTGGACAAAAGTATGATGTTGCCCCATGGGCTATGGAAGGTCTC
CTAGAGTACATAAAACAGAGTTATGC

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DS 

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CAAAATCCGAAACTTCTCTT*CTTCCAGGGGACTCCGATTT*CTTCTGAGACATGGACGT
TTCTTTGACTTGTGTGAATCATAACTAAAATAACTCTTTGCTCTATTTTTTCTTTTGTTA
TCTCCACCGATGTTTCTTGTGTTTATGCTGATCATCATCTTATCTTCTTCTTTGTTTTAC
TGCTTTGGGAAGGGCAGACTTCGGGAATTTCTCAGCTTTCCAGGTAAAGAGTATGTAAAA
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GTTTTCGTTTGGACAAAAGTATGATGTTGCCCCATGGGCTATGGAAGGTCTCCTAGAGTA
CATAAAACAGAGTTATGCCAATCCC

QA 8 572 8 572
DS 

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GCAGCAG
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GATGTAATGAAAAGAATCTTTGGGCCAAGACTGCCAGTTTTCTCGAAGGAAGAATCAGAA
CAAAGTGAAAGGCTCATCTGACTTTGTAGGGAATCATTCACTATCTTGCTGCTTCTGTCT
CAAAATCCGAAACTTCTCTT*CTTCCAGGGGACTCCGATTT*CTTCTGAGACATGGACGT
TTCTTTGACTTGTGTGAATCATAACTAAAATAACTCTTTGCTCTATTTTTTCTTTTGTTA
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QA 8 545 8 545
DS 

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GCAGCAG
AAAACCTGTGAAACTGTAGGTGAAAAATTAATGTCCATTCACAAAATAAAGGCTAATCCA
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CAA*GTGAAAGGCTCATCTGACTTTGTAGG*AATCATTCACTATCTTGCTGCTTCTGTCT
CAAAATCCGAAACTTCTCTT*CTTCCAGGGGACTCCGATTT*CTTCTGAGACATGGACGT
TTCTTTGACTTGTGTGAATCATAACTAAAATAACTCTTTGCTCTATTTTTTCTTTTGTTA
TCTCCACCGATGTTTCTTGTGTTTATGCTGATCATCATCTTATCTTCTTCTTTGTTTTAC
TGCTTTGGGAAGGGCAGACTTCGGGAATTTCTCAGCTTTCCAGGTAAAGAGTATGTAAAA
ATCCTTACTATACAGCTTCATGTTTTCCCATCTCAATCCATCCCTTCTTAGTTGCTTTTT
GTTTTCGTTTGGACAAAAGTATGATGTTGCCCCATGGGCTATGGAAGGTCTCCTAGAGTA
CATAAAACAGAGTTATGC
CAATCCC

QA 8 565 8 565
DS 



AS 1 3

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TAACTATAACAGAAAGAACAAGCAAAATACTTTGTAACCCCTATATATAAAAAAAAAACG
TATCAGTTAAAGAATGCTCTGATTGTCTGAAACACATCGATTCTGAGGTTACCTCTTATC
GATATTTTTCAGTACTTCGGGTTTTGTTTTTTTTTTTGTCCATCTCTGTGTCTCTCTCTA
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CACTGCTGCCTTCTTGATCTCATCCATGCTCACTCCCGGGTTGTAGCCTAACCCAAGCAC
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AGTGCCCAATTCCCAGAGACTTCTGTCTTCATTCAAGTTCTGCCAGTAATGGTATTGATC
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ATACCGATGAAAAGAGCCAAAGCACGTCTCAACAGCTCCATTCACCTTTCCATCCAAGTT
AATCTTCCATAAACCAGTCACGTCTTTCTGCACACAACATCGTCGTCCAAGAAGAGGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D563JQ U 71
AF RS1AX59JQ U 1
AF RS1D563TF C 279
BS 1 115 RS1AX59JQ
BS 116 116 RS1D563JQ
BS 117 169 RS1AX59JQ
BS 170 170 RS1D563JQ
BS 171 172 RS1AX59JQ
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BS 175 175 RS1D563JQ
BS 176 839 RS1AX59JQ

RD RS1D563JQ 220 0 0
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AGAATGCTCTGATTGTCTGAAACACATCGATTCTGAGGTTACCTCTTATCGATATTTTTC
AGTACTTCGGGTTTTGTTTTTTTT
GTCCATCTCTGTGTCT

QA 1 204 1 204
DS 

RD RS1AX59JQ 839 0 0
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ACGTAATAGTTTTGGAGGAAGCTTTTGCTGTCAAGTGTTACAATAACAAAAGTAAGAACA
TAACTATAACAGAAAGAACAAGCAAAATACTTTGTAACCCCTATATATAGAAGATAAACG
TATCAGTTAAAGAATGCTCTGATTGTCTGAAACACATCGATTCTGAGGTTACCTCTTATC
GATATTTTTCAGTACTTCGGGTTTTGTTTTTTTTTTTGTCCATCTCTGTGTCTCTCTCTA
GAGACCAAAATTGCACATCTGCACAAACTCCATTTCGTTATCCACGTATTTAGTCCAGAG
AGACTTGTATTGGTTCATAGCAATGTCTAGCCATGGTTTCATGTTTCCATTGTAATGTAT
CACTGCTGCCTTCTTGATCTCATCCATGCTCACTCCCGGGTTGTAGCCTAACCCAAGCAC
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AGTGCCCAATTCCCAGAGACTTCTGTCTTCATTCAAGTTCTGCCAGTAATGGTATTGATC
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ATACCGATGAAAAGAGCCAAAGCACGTCTCAACAGCTCCATTCACCTTTCCATCCAAGTT
AATCTTCCATAAACCAGTCACGTCTTTCTGCACACAACATCGTCGTCCAAGAAGAGGAT

QA 1 839 1 839
DS 

RD RS1D563TF 543 0 0
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TCATGTTTCCATTGTAATGTATCACTGCTGCCTTCTTGATCTCATCCATGCTCACTCCCG
GGTTGTAGCCTAACCCAAGCACATGCCAGGACTTGTCCAGTGATTTCGTCTTTGAATAGA
ATGTCATCAGTCCCGGAGGCAGAGTGCCCAATTCCCAGAGACTTCTGTCTTCATTCAAGT
TCTGCCAGTAATGGTATTGATCGGTGCATTTCTCGCGTCTCCAAGCGTTGAGATCAAATA
TATTCATCCCAAAGGCCCAAGCACAAGCACTGGGGTTAAACCTCTCTTTGATCAGAGGAT
GAGTGAAATTCAGGTACTGACCATACCGATGAAAAGAGCCAAAGCACGTCTCAACAGCTC
CATTCACCTTTCCATCCAAGTTAATCTTCCATAAACCAGTCACGTCTTTCTGCAC
CACAACAC

QA 1 535 1 535
DS 



AS 1 4

CO CL2322Contig1 1170 4 36 U
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AAACTGATACTCCCAAAATCTCTGATAATGGCTAACGCTATCAAAGTCTTTGAGCTCAAT
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TATGACAACGAGAAAGAGATCGGTGCAGCTTTGAAAAAATTGTTTGAAGACGAAGTACTG
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CTACGAGAGTTCCGTTAAACCAAAGGAGTTCACCTCAGTGGATACTTCCCATTGGGTTCT
CCAGGAACAACGTGGTTCAAGAGCGACGTTTTGAAGAACCCTATACTAAATACTGTTGCT
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AGTGTACTTCCCAAAAGCACCAATGAAGGAAGGATCAGAGAGAACTTAGATGTTTTCGAC
TGGTCAATACCCGAAGACTTGTTTGCCAAGTTTTCTGATATTGAACAGGCTAGGTTATTG
GATGTTTCCTTCTTTGTTCACGAGACATTGGGCTCTTATAGGTCTCTTGAAGAATTATGG
GACGGAGAGATGTGATACTTTAAATAGCCTATTTGTTTGTCAATAATGACATGTCTCTCT
ATGTTGAACTTTTAGGTTTGGTCATAAATATTACAGAAAATACATGTCACCGCATAATTT
ACAATCTTATTTATTCTTACTTTGAATTAT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GG
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CTAGCACATGGAAAGCAATGGAAGCACTCTATGATTCAGGCAAAGCACGAGCAATAGGTG
TTAGCAATTTCTCCACCAAGAAGCTATCTACTCTCTTGGAGTTATCTCGTGTTCCTCCTG
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CTCCTGCTCAAGTTGCGCTTCGCTGGGGACTACAAATGGGTAACAGTGTACTTCCCAAAA
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TTTGGTCATAAATGTTACAGAAAATACATGTCACCGCATAATTTACAATCTTATTTATTC
TTACTTTGAATTAT

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DS 



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TAGTAAATGACTTCTATTTCCATAGGTACACACATACATAATCAAAAAATGCATTTGCAT
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CTTGCTTCTTTCGAAAGCTGATTCTCAAAAGAAGACGAGTTATTATTCCAGCTCCAATAC
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AGAGGTACGTGCTCTCTGAACAACACCGTCGTAGCGATGCAACCAGGGTAAAGAGAAGCA
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CTGCAGGCCATGATCACGTGCCATTTCCCCGTGTCTGCTAAAGCCTTCGCCGTGGCTAAA
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TCCGGCGAGGCTTCGTTAGATGGAGGCGTTGCTGTAACGGTCTGTGCGCGAATAACGGTG
GAAAAACGTGGACTTTGTCTTCTCTGTTCCTTGATGGTTAACAGGTTGGAGATATTGTCG
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GCCATTTCTGTACTGAACTGAAGTTGCTAGAGTTCAGTGTCTTTCTACGTTGTTCGATTT
CC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1C271JQ U 1
AF RS1EH44JQ U 13
AF RS1EH44TF C 599
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RD RS1C271JQ 711 0 0
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CTTGCTTCTTTCGAAAGCTGATTCTCAAAAGAAGACGAGTTATTATTCCAGCTCCAATAC
ACCCCTGACTTTCCCAAACTCGGATCACTCACAACCTGTGCTAGTCTTTTCCCAGCTTCC
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TTCGAAGGATAATCAGACTGTTTCAAGTCATCAAGAAGCAACCTCGAGAGA

QA 1 711 1 711
DS 

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ACAAGCTTCTCGCTAACCTCCCACAGTTTCTTTGCCTTCTCAGCATCACTTGCTTCTTTT
GAAAGCTGATTCTCAAAGGAAGACGAGTTATTATTCCAGCTCCAATACACCCCTGACTTT
CCCAAACTCGGATCACTCACAACCTGTGCTAGTCTTTTCCCAGCTTCCTCCTCAAATACG
TAACCTTTGGTGATATACTTCTGAAAAGGCGGAAAGAGAAGCCTGAACAGAGGTACGTGC
TCTCTGAACAGTACCGTCGTAGCGATGCAACCAGGGTAAAGAGAAGCAAACGTGACTCCA
GTTTCCTCGTGGTAACGCCTGTGAAGCTCCTGCATCGTCAGCATATTGCATACTTTGCTG
TCTTTGTATGCTTTGGCTCCATCATACTCTCCTCCATCTATCATCGAACTGTTTTGCCCG
TTCAGTCCCGATGCTAAGCCTCTTAGGTCTCCGAGGTTCGCCTTTGGCGGTACATTCCCA
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GTTCCAACGCTGAGCTCAAACCCTTCGGCTGTGAA

QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1EH44TF 784 0 0
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GTTT*GAAGGATAATCAGACTGTTTCAAGTCATCAAGAAGCAATCTCGAGAGAAGAAAAT
GTC*TAAATGATTGGTTCCAACGCTGAGCTCAAACCCTTCGGCTGTGAAAGAAGGTTCCT
TAGCAGTCGGCTGGTAAACAGCTGCGTTACAGACAAGAACATCTAACGGCCGTTCTGTTC
TCCTGAAACTATCAACAAACTGCCTCACGCTTTCGAGCGAGGCGAGATCGAGATGCATCA
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TCCTGCAGGCCATGATCACGTGCCATTTCCCCGTGTCTGCTAAAGCCTTCGCCGTGGCTA
AACCTAGACCGGAGGAAGCTCCGGTGATCACTGCTGTGCCTTTTCTCTGTGTCTTCTTTT
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TGGAAAAACGTGGACTTTGTCTTCTCTGTTCCTTGATGGTTAACAGGTTGGAGATATTGT
CGGCTTTAAGATGGTTTGAAAATGAAAAACCAGTTAAAGTCGTCTCCTTTAGATAAGCAT
TGAACTTACCCTCTTTTCGGATTGAGACGGTAGAAGGAAGAAGAGAATATGCAGCCTGAA
GAGCCATTTCTGTACTGAACTGAAGTTGCTAGAGTTCAGTGTCTTTCTACGTTGTTCGAT
TTCC

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 4

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AACTCAAATAATATTTACAATAATACTACAATTTTGTCAAAAAGACTAATAATTTTAATA
ATTTTTTTCTGGTTTTTTTGACCTAGTAAGGTGTATCTATCTTATTAAAATAGGAACACT
ACAACTTCTTCTAGGTGGATTTTTAAAGGTGGACCTCATATATTTAAATTAAATGTCTCA
TTCTTTATATATAATACGTACCATAGTCTAATTTTGCATTGATGTATTTCCTTAAATACA
GTTCTTTTTTTTGTCCATATTCC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DM09JQ C 85
AF RS1DM09TF U 1
AF RS1B979JQ C 1
AF RS1B979TF U 1
BS 1 197 RS1DM09TF
BS 198 198 RS1B979TF
BS 199 521 RS1DM09TF
BS 522 563 RS1B979TF

RD RS1DM09JQ 437 0 0
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GATAACAGGAAAATGTACGGTACCGGCCCGCACAGCCCAGTGTAAAAAAAAGTTTAATTT
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ACTACAATTTTGTCAAAAAGACTAATAATTTTAATAATTTTTTTCTGGTTTTTTTGACCT
AGTAAGGTGTATCTATTTTATTAAAATAGGAACACTACAACTTTTTTTAGGTGGATTTTT
AAAGGTGGACCTCATATATTTAAATTAAATGTCTCATTCTTTATATATAATACGTACCAT
AGTCTAATTTTGCATTG

QA 1 437 1 437
DS 

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AAAACTGGACTGCGAATGTGTACATCGTTGCGCTCGTTGATTCTTTTTTGTCTACACCAG
AACTCAAATAATATTTACAATAATACTACAATTTTGTCAAAAAGACTAATAATTTTAATA
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ACAACTTCTTCTAGGTGGATTTTTAAAGGTGGACCTCATATATTTAAATTAAATGTCTCA
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QA 1 521 1 521
DS 

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CCAGTGTAAAAAAAAGTTTAATTTTGAAGCGACTGGTAGGTGCATTCGTCCAGACAAAGG
AAAACTGGACTGCGAATGTGTACATCGTTGCGCTCGTTGATTCTTTTTTGTCTACACCAG
AACTCAAATAATATTTACAATAATACTACAATTTTGTCAAAAAGACTAATAATTTTAATA
ATTTTTTTCTGGTTTTTTTGACCTAGTAAGGTGTATCTATCTTATTAAAATAGGAACACT
ACAACTTCTTCTAGGTGGATTTTTAAAGGTGGACCTCATATATTTAAATTAAATGTCTCA
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GTTCTTTTTTTTGTCCATATTCC

QA 1 563 1 563
DS 

RD RS1B979TF 563 0 0
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TTTTGTTATGCTCACAATTCTTCTGCTCGGAGAAACGGTGATTGCTAAGAAAGGAACTTA
CCCATGTTATACATCTTATCCGATGATAACAGGAAAATGTACGGTACCGGCCTGCACAGC
CCAGTGTAAAAAAAAGTTTAATTTTGAAGCGACTGGTAGGTGCATTCGTCCAGACAAAGG
AAAACTGGACTGCGAATGTGTACATCGTTGCGCTCGTTGATTCTTTTTTGTCTACACCAG
AACTCAAATAATATTTACAATAATACTACAATTTTGTCAAAAAGACTAATAATTTTAATA
ATTTTTTTCTGGTTTTTTTGACCTAGTAAGGTGTATCTATCTTATTAAAATAGGAACACT
ACAACTTCTTCTAGGTGGATTTTTAAAGGTGGACCTCATATATTTAAATTAAATGTCTCA
TTCTTTATATATAATACGTACCATAGTCTAATTTTGCATTGATGTATTTCCTTAAATACA
GTTCTTTTTTTTGTCCATATTCC

QA 1 563 1 563
DS 



AS 1 2

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CAACGGTTGATTCCATCATGAAACGTTTGGTAGATTCAACGAAACCGTACAGAACCCCGA
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TTGGGAGTCAAGGAAGACCTAAAGCTCTCGAGATTTCACATAAGCTTTCGCTTGATGGGT
ATTTAGGGTTTTTTAAATCTTGGCGGCCTCTGGTGAAGGCTAAGGAGCAAGGAGTAGAGC
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AAGATGTTGCTTACAGGGCATTTATGCTCGCTGGAAAACTTTAGAATCAGTGGCGTGAAG
ATCAAGCGCTCTCCGCCGACGGGAGACAAGTGATAAAATAACATTCGCAATTCTCCTTTG
CTTTTGGATCTGTACTTTCCAAGTCGTTGCGTCTAATACTTCTATATTAAACTCAATAAT
CT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RS1G634TF U 1
AF RS1G634JQ C 154
BS 1 698 RS1G634TF
BS 699 699 RS1G634JQ
BS 700 704 RS1G634TF
BS 705 705 RS1G634JQ
BS 706 727 RS1G634TF
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BS 729 739 RS1G634TF
BS 740 962 RS1G634JQ

RD RS1G634TF 741 0 0
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CGATGTCAGACGACGATCTAGTGGCTAAACTCGGTGGAGAAAACTCCATAGATTTCATTG
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TTCTTCGTAAAGAAGGGGGTGTGATCGCGGTTTGGGTCTACAACGACCTCGTGGTCACCC
CAACGGTTGATTCCATCATGAAACGTTTGGTAGATTCAACGAAACCGTACAGAACCCCGA
CTATGAATCTGGCGTTTGATGGTTATAAAGCAATAGAGTTTCCTTTTAAAAATATAAGAC
TTGGGAGTCAAGGAAGACCTAAAGCTCTCGAGATTTCACATAAGCTTTCGCTTGATGGGT
ATTTAGGGTTTTTTAAATCTTGGCGGCCTCTGGTGAAG*CTAAG*AGCAAGGAGTAGAGC
TTTTAAA*CCTTCGATGAT
AA

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1G634JQ 809 0 0
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AAAAAGTGGTGGCAACTGATATAAACGAAAAACAAATCAGTCTTGCAAAGCCGCACCCAA
AAGTCACATACCTTCACACTCCAGCATCGATGTCAGACGACGATCTAGTGGCTAAACTCG
GTGGAGAAAACTCCATAGATTTCATTGTAGCCGCTCAATCTCTCCACTATTTCGACCTTA
AAAGATTCTATGCCATAGTGAGACGTGTTCTTCGTAAAGAAGGGGGTGTGATCGCGGTTT
GGGTCTACAACGACCTCGTGGTCACCCCAACGGTTGATTCCATCATGAAACGTTTGGTAG
ATTCAACGAAACCGTACAGAACCCCGACTATGAATCTGGCGTTTGATGGTTATAAAGCAA
TAGAGTTTCCTTTTAAAAATATAAGACTTGGGAGTCAAGGAAGACCTAAAGCTCTCGAGA
TTTCACATAAGCTTTCGCTTGATGGGTATTTAGGGTTTTTTAAATCTTGGCGGCCTCTGG
TGAAGGCTAAGGAGCAAGGAGTAGAGCTTTTAAAACCTTCGATGATTAATGAGTTTAAGG
AGGCTTGGGGTGATCAGAATCAAGTCAAAGATGTTGCTTACAGGGCATTTATGCTCGCTG
GAAAACTTTAGAATCAGTGGCGTGAAGATCAAGCGCTCTCCGCCGACGGGAGACAAGTGA
TAAAATAACATTCGCAATTCTCCTTTGCTTTTGGATCTGTACTTTCCAAGTCGTTGCGTC
TAATACTTCTATATTAAACTCAATAATCT

QA 1 809 1 809
DS 



AS 1 4

CO CL2326Contig1 737 4 9 U
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GCAAGTTTGCTTGCGTTTCAAGACAAAGTTTATGCTCTTGACTACAGATGGGCTGTATCA
GGGCTTGGTTATGACTACTACATCAACACCCAAACGATAAAAAACGCAGCCACATTGCAC
TACAATGGGAACATGAAGCCGTGGCTAGAGCTGGGAATCCCACAGTACAAAGACTTTTGG
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GAAATTGATAGCAAATTGATTTTTTTAAGAGACTTGATCAAGATGATTTAAAATCAGCTT
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GTGTGCCAATTCTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RS1GR92TF U 1
AF RS1GR92JQ C 220
AF RS1D074TF U 241
AF RS1D074JQ C 263
BS 1 438 RS1GR92TF
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BS 736 737 RS1D074JQ

RD RS1GR92TF 711 0 0
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TCTGGATTGAATGTCATTGATCTTGCTAGATGGAGGGAACTGGGAGTTACGGAAGCCTAC
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GCAAGTTTGCTTGCGTTTCAAGACAAAGTTTATGCTCTTGACTACAGATGGGCTGTATCA
GGGCTTGGTTATGACTACTACATCAACACCCAAACGATAAAAAACGCAGCCACATTGCAC
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AACCCGAATGCATTGCAGTGAGAAATGCTGAAGGGAAGAGAGCAAGCAGAAGTGGGTTTT
GAAATTGATAGCAAATTGATTTTTTTAAGAGACTTGATCAAGATGATTTAAAATCAGCTT
TGATTTAAAAAA***GTATGTGAAGAAACTTTGATGTTGTATATGATTTT
G

QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1GR92JQ 518 0 0
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TGTAACGTGAACCCTTGATGAGAAAGTAAAAAAAAAAAA*GCTACACGGTGCCAATGCTT
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TTTTGTGGGGGTAAGTAAATAAACCCGAATGCATTGCAGTGAGAAATGCTGAAGGGAAGA
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CC

QA 1 516 1 516
DS 

RD RS1D074TF 497 0 0
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TACAATGGGAACATGAAGCCGTGGCTAGAGCTGGGAATCCCACAGTACAAAGACTTTTGG
AGAAATCATCTGAATCGAGAAGATCGATTCTTGAGTGACTGTAACGTGAACCCTTGATGA
GAAAGTAAAAAAAAAAAAAGCTACACGGGGCCAATGCTTAAGAAGCAGGTCACAGACGTA
AAGAAATGATTTAGAGTTGGTGTAGCAGAGACATCTCATTTTTGTGGGG*TAAGTAAATA
AACCCGAATGCATTGCAGTGAGAAATGCTGAAGGGAAGAGAGCAAGCAGAAGTGGGTTTT
GAAATTGATAGCAAATTGATTTTTTTAAGAGACTTGATCAAGATGATTTAAAATCAGCTT
TGATTTAAAAAAAAAGTATGTGAAGAAACTTTGATGTTGTATATGATTTTTGGCAAAGAG
GTGTGCCAATTCTTT
TC

QA 1 495 1 495
DS 

RD RS1D074JQ 475 0 0
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ATCGATTTTTGAGTGACTGTAACGTGAACCCTTGATGAGAAAGTAAAAAAAAAAAAAGCT
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AAATGCTGAAGGGAAGAGAGCAAGCAGAAGTGGGTTTTGAAATTGATAGCAAATTGATTT
TTTTAAGAGACTTGATCAAGATGATTTAAAATCAGCTTTGATTTAAAAAAAAAGTATGTG
AAGAAACTTTGATGTTGTATATGATTTTTGGCAAAGAGGTGTGCCAATTCTTTTC

QA 1 475 1 475
DS 



AS 1 4

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GTAGCATTGTGTGCTTGTCTTCAGTATGTGGGGTTGTCTCAGCTGGTTTGGTATCTATAT
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CACGTCTTGACGACAAGAAATATGCTGAAGCTATCTACTCAAGAACCCCATTAGGCCGTG
CGTGTGAGCCGGGTGAGGTTGCCTCGCTGGTTGCGTTTCTTTGTCTCCCTGCAGCTTCTT
ATATAACAGGACAAACCATTTGTATTGATGGAGGTTTCACTGTTAATGGCTTCTCCTACA
AGCCAGAGGTTTAAACCCTAGTAACACTTCCAGAACAACAATGATGTAATAATGTATCGA
AAGTTTTAGTTAATCGTAAGGGTGTTTATCTTATTTTTACTCCCACGCCATTTGTTAGCT
CGGCTGTACCATTTGTACGCTTTTACTCTATGCATTAGTTTAAGTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1G987JQ C 326
AF RS1G987TF U 326
AF RS1G786JQ C 221
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C

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TTATCTTAT
C

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DS 

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TCCCACGCCATTTGTTAGCTCGGCTGTACCATTTGTACGCTTTTACTCTATGCATTAGTT
TAAGTCCT

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DS 



AS 1 3

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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D428JQ U 1
AF RS1DP49JQ U 13
AF RS1DP49TF C 505
BS 1 140 RS1D428JQ
BS 141 141 RS1DP49JQ
BS 142 449 RS1D428JQ
BS 450 450 RS1DP49JQ
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BS 517 768 RS1D428JQ
BS 769 1279 RS1DP49TF

RD RS1D428JQ 773 0 0
GGCACCTCAAATATATAAATTCCAAGTGAACTTATAAGATCATTGTTTCAGAAGTAGTCA
TATACCAAGGAAGGTGAAGCCATTTACTAGCACGTAAAGTTATAAGACCATCTTTACTGA
TGAGAATTTTTGTAATAATAGACCCATTTCGTCCCTTTGAATCAAGAATCTGTCTTTTCT
TCTACGACAACTTGCTTTAAGGTCTTCGGATGCGCTTCGTTTGTGACGGGCAAGTCCACC
AGCGTTTGTGGAGGAGCAAAGTACATGTGAAGCGACATGATGCATATGATTATACCCAAG
AAAAGCTGGACCGTTGGTTTGAAGCTGAAGAGGTATATGGATGCTACCATAGTAAGTAGC
ATGGCCATTGAAGTAGAATATACCTTGACGATATTGTCTGCGTACTTCATTAACCAAGAG
ACGAGTAAGCCGGTGGAACCGAGATTCAGGACAACCAGCCAAGTGGTGATGCTATAGCCA
TCAAAGATACGTTGCCACCAAGGACCCTTTTCAAAACCGAGTCTGAAATCATCTGCTATA
AGCCGAGCAACGTTGAAAAGTGAACCAAACGTATACAACTGCAAGTTCTGCCAGTATAAG
CTGTCATTGTTTCTCTTCATCAGAAACTCAGTGTAGATTCCGGCTAGTGCGGACAAAGCG
GCTGAGAGAATACCCAACAAATAGCCTTGTATTGGTGCAGTGAATAGGGAATCACAGGAA
GCTTCTCCACAACCCTTAATCTGGCTGGTAGTAGTTCCAACAGCTAAA
GACAA

QA 1 768 1 768
DS 

RD RS1DP49JQ 752 0 0
G
TATAAATTCCAAGTGAACTTATAAGATCATTGTTTCAGAAGTAGTCATATACCAAGGAAG
GTGAAGCCATTTACTAGCACGTAAAGTTATAAGACCATCTTTACTGATGAGAATTTTTGT
AATAATAAACCCATTTCGTCCCTTTGAATCAAGAATCTGTCTTTTCTTCTACGACAACTT
GCTTTAAGGTCTTCGGATGCGCTTCGTTTGTGACGGGCAAGTCCACCAGCGTTTGTGGAG
GAGCAAAGTACATGTGAAGTGACATGATGCATATGATTATACCCAGGAAAAGCTGGACCG
TTGGTTTGAAGCTGAAGAGGTATATGGATGCTACCATAGTAAGTAGCATGGCCATTGAAG
TAGAATATACCTTGACGATATTGTCTGCGTACTTCATTAACCAAGAGACGAGTAAGCCGG
TGGAACCGAGATTCAGAACAACCAGCCAAGTGGTGATGCTATAGCCATCAAAGATACGTT
GCCACCAAGGACCCTTTTCAAACCCGAGTCTGAAATCATCTGCTATAAGCCGAGCAACGT
TGAAAAGTGAACCAAACGTATACAACTGCAAGTTCTGCCAGTATAAGCTGTCATTGTTTC
TCTTCATCAGAAACTCAGTGTAGATTCCGGCTAGTGCGGACAAAGCGGCTGAGAGAATAC
CCAACAAATAGCCTTGTATTGGTGCAGTGAATAGGGAATCACAGGAAGCTTCTCCACAAC
CCTTAATCTGGCTGGTAGTAGTTCCAACAGC

QA 2 752 2 752
DS 

RD RS1DP49TF 775 0 0
CCCTTTTCAAACCCGAGTCTGAAATCATCTGCTATAAGCCGAGCAACGTTGAAAAGTGAA
CCAAACGTATACAACTGCAAGTTCTGCCAGTATAAGCTGTCATTGTTTCTCTTCATCAGA
AACTCAGTGTAGATTCCGGCTAGTGCGGACAAAGCGGCTGAGAGAATACCCAACAAATAG
CCTTGTATTGGTGCAGTGAATAGGGAATCACAGGAAGCTTCTCCACAACCCTTAATCTGG
CTGGTAGTAGTTCCAACAGCTAAAAGACCAATAGCCATCCACTGAAGGTTTGACAATTTC
CTCTTCAAAAATAACCTAAAGAGAATGGCAGTGGTGACGATCTTGAGATTACCCATGATC
TGATAAGTGGATGTGTCCACATAGGTCAATGTAGCAAACTGGACATTGTTATGGATGAGA
TATATAATAGAAGGGATAACAAATAAGCGCACGCTCTTCCAATCCTTAGTAATCTTTGGA
GAAGATGTCCTCGTCTCTCTCCAGAGAAACAAACCAGAAATGATCAGCTTGAAGACTTCG
GCAAGAAAGGGAACAGTAGCGTAATCGTAGTTATAACCTCCTCCATCACTTTGAGAGAGA
GTTGTTAGAATTCCCTGAGAGCTGGTGAGAATAGTGAGAAGTAGTGCCACAAAGTACCAA
GGACTACCCATTCCTCTCTCTCTTCTTCTTCTTCTTCACTTGTTCACGCTAGAGCTCTCT
CGCTTTTGCAGCTCTTCATTTTCTTCGCATCGATCGCCTCCTTTTCCCGGTTCCC

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 4

CO CL2329Contig1 697 4 6 U
AAAATAGATTTATTTATTAATGAACTAAATTTAGAGTGATACATCTCTCAACAGTCTCGT
GATCCCCTAATCTAGCAAATTAGTCGGCATAGGTAGCGGATGTATCAACAGTTGTTCAAT
CAGTTATACTACTATGTCTTCATCTGCATCAGCCTAATCTTTACCCTCAACAACATGAAA
TTTGAAAACTAGACAACACGTAAAACTGACATTAACCTCCTTTCTGTTTTATTTGATCTT
CTTTCTTTTGATGTTTCATGAGATCGATTACATGGACAATTCAGAGGATATGACTATCAG
GATATGACTATCAGACGACGGGCTTGAAGGAAGTGAGATTCATTGATTTCAACCATTCTT
TTTCCCACACAATCGCCTCATAGTTCTTGCTCGCACCAGGGCCGGCTACGCCGTCATTAA
CCGCCACGATAAGCCGGTAACTAATGCCGGCGACTACCTTAGACTCGCCGCTAACAACCG
CCACGAACTTAAGTTCTGATTTGCTTTCCATGTCGTACTCAGAAACAGCGAATTTGCCGA
CCCCTACGACGTGAGGATCCTTAACGTTACTGATGGGAGTCCATCGGCCAGTAGGCGCCG
CTGCAGATGCGTGGAGAAGGACGAGAGAGAGGAGAAGAAGGAAGATTGCTTTGTTATTCA
TTTT*TGCTGTGTAACCGTTTGTATTTTCACGAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GW92JQ U 1
AF RS1GW92TF C 24
AF RS1E614JQ U 208
AF RS1E614TF C 208
BS 1 283 RS1GW92JQ
BS 284 284 RS1E614JQ
BS 285 313 RS1GW92JQ
BS 314 314 RS1E614JQ
BS 315 603 RS1GW92JQ
BS 604 697 RS1E614JQ

RD RS1GW92JQ 603 0 0
AAAATAGATTTATTTATTAATGAACTAAATTTAGAGTGATACATCTCTCAACAGTCTCGT
GATCCCCTAATCTAGCAAATTAGTCGGCATAGGTAGCGGATGTATCAACAGTTGTTCAAT
CAGTTATACTACTATGTCTTCATCTGCATCAGCCTAATCTTTACCCTCAACAACATGAAA
TTTGAAAACTAGACAACACGTAAAACTGACATTAACCTCCTTTCTGTTTTATTTGATCTT
CTTTCTTTTGATGTTTCATGAGATCGATTACATGGACAATTCAAAGGATATGACTATCAG
GATATGACTATCAAACGACGGGCTTGAAGGAAGTGAGATTCATTGATTTCAACCATTCTT
TTTCCCACACAATCGCCTCATAGTTCTTGCTCGCACCAGGGCCGGCTACGCCGTCATTAA
CCGCCACGATAAGCCGGTAACTAATGCCGGCGACTACCTTAGACTCGCCGCTAACAACCG
CCACGAACTTAAGTTCTGATTTGCTTTCCATGTCGTACTCAGAAACAGCGAATTTGCCGA
CCCCTACGACGTGAGGATCCTTAACGTTACTGATGGGAGTCCATCGGCCAGTAGGCGCCG
CTG

QA 1 603 1 603
DS 

RD RS1GW92TF 670 0 0
AACTAAA
TTAGAGTGATACATCTCTCAACAGTCTCGTGATCCC*TAATCTAGCAAATTAGTCGGCAT
AGGTAGCGGATGTATCAACAGTTGTTCAATCAGTTATACTACTATGTCTTCATCTGCATC
AGCCTAATCTTTACCCTCAACAACATGAAATTTGAAAACTAGACAACACGTAAAACTGAC
ATTAACCTCCTTTCTGTTTTATTTGATCTTCTTTCTTTTGATGTTTCATGAGATCGATTA
CATGGACAATTCAGAGGATATGACTATCAGGATATGACTATCAGACGACGGGCTTGAAGG
AAGTGAGATTCATTGATTTCAACCATTCTTTTTCCCACACAATCGCCTCATAGTTCTTGC
TCGCACCAGGGCCGGCTACGCCGTCATTAACCGCCACGATAAGCCGGTAACTAATGCCGG
CGACTACCTTAGACTCGCCGCTAACAACCGCCACGAACTTAAGTTCTGATTTGCTTTCCA
TGTCGTACTCAGAAACAGCGAATTTGCCGACCCCTACGACGTGAGGATCCTTAACGTTAC
TGATGGGAGTCCATCGGCCAGTAGGCGCCGCTGCAGATGCGTGGAGAAGGACGAGAGAGA
GGAGAAGAAGGAAGATTGCTTTGTTATTCATTTTCTGCTGTGTAACCGTTTGTATTTTCA
C
CC

QA 8 668 8 668
DS 

RD RS1E614JQ 490 0 0
GG
CATTAACCTCCTTTCTGTTTTATTTGATCTTCTTTCTTTTGATGTTTCATGAGATCGATT
ACATGGACAATTCAGAGGATATGACTATCAGGATATGACTATCAGACGACGGGCTTGAAG
GAAGTGAGATTCATTGATTTCAACCATTCTTTTTCCCACACAATCGCCTCATAGTTCTTG
CTCGCACCAGGGCCGGCTACGCCGTCATTAACCGCCACGATAAGCCGGTAACTAATGCCG
GCGACTACCTTAGACTCGCCGCTAACAACCGCCACGAACTTAAGTTCTGATTTGCTTTCC
ATGTCGTACTCAGAAACAGCGAATTTGCCGACCCCTACGACGTGAGGATCCTTAACGTTA
CTGATGGGAGTCCATCGGCCAGTAGGCGCCGCTGCAGATGCGTGGAGAAGGACGAGAGAG
AGGAGAAGAAGGAAGATTGCTTTGTTATTCATTTT*TGCTGTGTAACCGTTTGTATTTTC
ACGAATCC

QA 3 490 3 490
DS 

RD RS1E614TF 490 0 0
GG
CATTAACCTCCTTTCTGTTTTATTTGATCTTCTTTCTTTTGATGTTTCATGAGATCGATT
ACATGGACAATTCAGAGGATATGACTATCAGGATATGACTATCAGACGACGGGCTTGAAG
GAAGTGAGATTCATTGATTTCAACCATTCTTTTTCCCACACAATCGCCTCATAGTTCTTG
CTCGCACCAGGGCCGGCTACGCCGTCATTAACCGCCACGATAAGCCGGTAACTAATGCCG
GCGACTACCTTAGACTCGCCGCTAACAACCGCCACGAACTTAAGTTCTGATTTGCTTTCC
ATGTCGTACTCAGAAACAGCGAATTTGCCGACCCCTACGACGTGAGGATCCTTAACGTTA
CTGATGGGAGTCCATCGGCCAGTAGGCGCCGCTGCAGATGCGTGGAGAAGGACGAGAGAG
AGGAGAAGAAGGAAGATTGCTTTGTTATTCATTTT*TGCTGTGTAACCGTTTGTATTTTC
AC
GAATCC

QA 3 484 3 484
DS 



AS 1 4

CO CL2330Contig1 661 4 3 U
GCAGCTTGTTCCTGGAATGAGACCTGGTGGGGGCCATGCACCCAATTACTTCATGCCTAT
GGTTCAGCAACATCAGCAGCGTCCTGGAGGAGGAAGACGCCCTGGAGGGATCCAACAGTT
CCAGCAGCAACCTCCCATGATGCAACACCAGATGCATCCAAGGGGTAGTAGGAACATCCG
GTACTCCCAAGGGCGTGGCGGTAGTGGTGGTGATGTGCCTCAATATGACATGGGGAACAA
CGCCATGCCGATGCCCATTGGAACTTTGGCTTCAAATCTGGCTAATGCTTCTCCAGAGCA
ACAGAGGACGATACTGGGTGAGAATCTGTACCCGTTGGTGGAGAAGCTTGAGGCAGAGTC
TGCAGCCAAAGTGACTGGGATGCTTTTGGAGATGGACCAAACCGAAGTTCTCCACCTCTT
GGAGTCACCAGAAGCTCTGGAGGCGAAAGTTGCAGAGGCAATGGATGTTCTGAGGAGCGT
TGCTGCTGGTGGTGCAGCCGAGCAGCTCGCTTCCTTGAACCTCTCTTAACTTGTTTTATT
TCCAGTTTGGTCTTTTGCTTTTTTATGTCTCTCTCTCCCATACAATCACCTTTGAAGTTG
TTTCGTTGCTTTCCCTATAACTGCTTTGTGTGTGTTTTAAACTTAATTTAAGAATTTAAA
A


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1H794TF U 1
AF RS1H732TF U 60
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GGAGTCACCAGAAGCTCTGGAGGCGAAAGTTGCAGAGGCAATGGATGTTCTGAGGAGCGT
TGCTGCTGGTGGTGCAGCCGAGCAGCTCGCTTCCTTGAACCTCTCTTAACTTGTTTTATT
TCCAGTTTGGTCTTTTGCTTTTTTATGTCTCTCTCTCCCATACAATCACCTTTGAA

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DS 

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G
GGTTCAGCAACATCAGCAGCGTCCTGGAGGAGGGAGACGCCCTGGAGGGATCCAACAGTT
CCAGCAGCAACCTCCCATGATGCAACACCAGATGCATCCAAGGGGTAGTAGGAACATCCG
GTACTCCCAAGGGCGTGGCGGTAGTGGTGGTGATGTGCCTCAATATGACATGGGGAACAA
CGCCATGCCGATGCCCATTGGAACTTTGGCTTCAAATCTGGCTAATGCTTCTCCAGAGCA
ACAGAGGACGATACTGGGTGAGAATCTGTACCCGTTGGTGGAGAAGCTTGAGGCAGAGTC
TGCAGCCAAAGTGACTGGGATGCTTTTGGAGATGGACCAAACCGAAGTTCTCCACCTCTT
GGAGTCACCAGAAGCTCTGGAGGCGAAAGTTGCAGAGGCAATGGATGTTCTGAGGAGCGT
TGCTGCTGGTGGTGCAGCCGAGCAGCTCGCTTCCTTGAACCTCTCTTAACTTGTTTTATT
TCCAGTTTGGTCTTTTGCTTTTT*ATGTCTCTCTCTCCCATACAATCACCTTTGAAGTTG
TTTCGTTGCTTTCCCTATAACTGCTTTGTGTGTGTTTTAAACTTAATTTAA
GAAT

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TTTCCACCTTTTGGAGTCACCAGAAGCTTTGGAGGCGAAAGTTGCAGAGGCAATGGATGT
TTTGAGGAGCGTTGCTGCTGGTGGTGCAGCCGAGCAGCTCGCTTCCTTGAACCTCTCTTA
ACTTGTTTTATTTCCAGTTTGGTCTTTTGCTTTTTTATGTCTCTCTCTCCCATACAATCA
CCTTTGAAGTTGTTTCGTTGCTTTCCCTATAACTGCTTTGTGTGTGTTTTAAACTTAATT
TAA

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DS 

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G
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CCAAGGGGTAGTAGGAACATCCGGTACTCCCAAGGGCGTGGCGGTAGTGGTGGTGATGTG
CCTCAATATGACATGGGGAACAACGCCATGCCGATGCCCATTGGAACTTTGGCTTCAAAT
CTGGCTAATGCTTCTCCAGAGCAACAGAGGACGATACTGGGTGAGAATCTGTACCCGTTG
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CCATACAATCACCTTTGAAGTTGTTTCGTTGCTTTCCCTATAACTGCTTTGTGTGTGTTT
TAAACTTAATTTAAGAATTTAAAA

QA 2 565 2 565
DS 



AS 1 4

CO CL2331Contig1 1358 4 6 U
GACTAAATTTTTGCATTAAATTAAAAGAACAGCATACAACTTGGATCAAAACACAGAACA
ACAATACACCTAAGCTATACCACAGGCTGCAACAACATATCGTGAAAAGATAAAAGGATA
TGAATGCCAAGACTTTACCAGGAAACAAAAGCACATCCCCAAGAAGATTGTTAAGACTTC
AAGAACTAATCCAAGAGCAGCAGCATTGGGCCAGTCTCCACAAGACGAGCAAGAGCAGTT
ATGCCACCGAACAACGCTGAACCCAGAAGCAAAAACTGAAACAGCGCCCCAAGGAGACCA
AGCCTCTGCTCACAGACAAGGAATGAAGCCCGAGACGCAAAACCAGGGACAGCCTTTGCG
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CCAAGGCTTGCTACAGATGCCACTATGGGTCGACAGAAACCGTCGACACCCAGAAACAAA
GATTGCAAAGGAGAGATTGTCCTTACATTGAAGAGGAAATAGCACAGCTTCAATGCGCAA
GAAAGTGAGTATAAACCGGAGGAGAAGACTCAACACCGCTAGACACAACCTGCTACCACT
GCCTGAAGAACAGAAAGCGGATCTGTCGACAAGAGCACAACCGGAACAGCAAAACTGAAG
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CCCACCGTGCCCAGACTGCAAAGCTTTGACCACCAGAAGACAACGCCGACGGAAAAAACC
TTGCGAACACGTCGCCTCTGAAAACCAGAGAGCAAACCAAACCACCGCAAGTCAACCACT
CCTCCGTTCGCTACACCGCTTCGTAGAGATGTAGATCGAAGATGGAGAAGGACCCCCACT
GAGCCACGCGCCGCCAACAACAAGGACCACGCCGAAGATCTAGGAAAAGGAAAAACTAGA
TCCGACAGAACCTTTGATCCTAAAAGCCGGCCTCCCTCCACACTAGCCAATTCTCAGCCT
TGCTGCTTTTCCAGACAACCGAACCACCCTTTTGAACCGCAAAGATCTCCGGTGAAGCTC
AGCCAAATCCAGAATCACAGCATATTGACAGGAAGAGACAGATGTGAGGAGAGGTAAAAC
GAAAAAAGGGAAGGAGGAGAAGAAGACCTCCGGAACCGGCTGACGCCGGACCGGAGAAAG
ATAAACCGTCGGTGAAAAAAAACTAGAGGTTTTAGAGAGAGAAGGTTATAGAGAGGTTTC
GACTCAGTTTATTGATAAATCCTCAGATCATTGTTGACACCCACAACTTGCTCTCTACAT
TTGTTAGTGACTGTGATCTGCGATCAAATGTTGTCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BK09JQ U 14
AF RS1DP69JQ U 1
AF RS1DP69TF C 684
AF RS1BK09TF C 663
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RD RS1BK09JQ 570 0 0
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TTTACTAGGAAACAAAAGCACATCCCCAAGAAGATTGTTAAGACTTCAAGAACTCATCCA
AGAGCAGCAGCATTGGGCCAGTCTCCACAAGACGAGCAAGAGCAGTTATGCCACCGAACA
ACGCTGAACCCAGAAGCAAAAACTGAAACAGCGCCCCAAGGAGACCAAGCCTCTGCTCAC
AGACAAGGAATGAAGCCCGAGACGCAAAACCAGGGACAGCCTTTGCGTCAAACCGCCCAA
ATCACAACATTCACCAATCCTCAATCCACATACGAAAGGAGAGCAGTCCAAGGCTTGCTA
CAGATGCCACTATGGGTCGACAGAAACCGTCGACACCCAGAAACAAAGATTGCAAAGGAG
AGATTGTCCTTACATTGAAGAGGAAATAGCACAGCTTCAATGCGCAAGAAAGTGAGTATA
AACCGGAGGAGAAGGCTCAACACCGCTAGA

QA 1 570 1 570
DS 

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GACTAAATTTTTGCATTAAATTAAAAGAACAGCATACAACTTGGATCAAAACACAGAACA
ACAATACACCTAAGCTATACCACAGGCTGCAACAACATATCGTGAAAAGATAAAAGGATA
TGAATGCCAAGACTTTACCAGGAAACAAAAGCACATCCCCAAGAAGATTGTTAAGACTTC
AAGAACTAATCCAAGAGCAGCAGCATTGGGCCAGTCTCCACAAGACGAGCAAGAGCAGTT
ATGCCACCGAACAACGCTGAACCCAGAAGCAAAAACTGAAACAGCGCCCCAAGGAGACCA
AGCCTCTGCTCACAGACAAGGAATGAAGCCCGAGACGCAAAACCAGGGACAGCCTTTGCG
TCAAACCGCCCAAATCACAACATTCACCAATCCTCAATCCACATACGAAAGGAGAGCAGT
CCAAGGCTTGCTACAGATGCCACTATGGGTCGACAGAAACCGTCGACACCCAGAAACAAA
GATTGCAGAGGAGAGATTGTCCTTACATTGAAGAGGAAATAGCACAGCTTCAATGCGCAA
GAAAGTGAGTATAAACCGGAGGAGAAGACTCAACACCGCTAGACACAACCTGCTACCACT
GCCTGAAGAACAGAAAGCGGATCTGTCGACAAGAGCACAACCGGAACAGCAAAACTGAAG
GGTGTGGAACCCCACCACCGGAAGAAACCCAGAGCTTCCGCCGGAGTTGGGAAGAAAGAT
CCCACCGTGCCCAGACTGCAAAGCTTTGACCACCAGAAG

QA 1 759 1 759
DS 

RD RS1DP69TF 539 0 0
GAAACCCAGAGCTTCCGCCGGAGTTGGGAAGAAGGATCCCACCGTGCCCAGACTGCAAAG
CTTTGACCACCAGAAGACAACGCCGACGGAAAAAACCTTGCGAACACGTCGCCTCTGAAA
ACCAGAGAGCAAACCAAACCACCGCAAGTCAACCACTCCTCCGTTCGCTACACCGCTTCG
TAGAGATGTAGATCGAAGATGGAGAAGGACCCCCACTGAGCCACGCGCCGCCAACAACAA
GGACCACGCCGAAGATCTAGGAAAAGGAAAAACTAGATCCGACAGAACCTTTGATCCTAA
AAGCCGGCCTCCCTCCACACTAGCCAATTCTCAGCCTTGCTGCTTTTCCAGACAACCGAA
CCACCCTTTTGAACCGCAAAGATCTCCGGTGAAGCTCAGCCAAATCCAGAATCACAGCAT
ATTGACAGGAAGAGACAGATGTGAGGAGAGGTAAAACGAAAAAAGGGAAGGAGGAGAAGA
AGACCTCCGGAACCGGCTGACGCCGGACCGGAGAAAGATAAACCGTCGGTGAAAAAAAA

QA 1 539 1 539
DS 

RD RS1BK09TF 696 0 0
TGTGGAACCCCACCACCGGAAGAAACCCAGAGCTTCCGCCGGAGTTGGGAAGAAGGATCC
C*CCGTGCCCAGACTGCAAAGCTTTGACCACCAGAAGACAACGCCGACGGAAAAAACCTT
GCGAACACGTCGCCTCTGAAAACCAGAGAGCAAACCAAACCACCGCAAGTCAACCACTCC
TCCGTTCGCTACACCGCTTCGTAGAGATGTAGATCGAAGATGGAGAAGGACCCCCACTGA
GCCACGCGCCGCCAACAACAAGGACCACGCCGAAGATCTAGGAAAAGGAAAAACTAGATC
CGACAGAACCTTTGATCCTAAAAGCCGGCCTCCCTCCACACTAGCCAATTCTCAGCCTTG
CTGCTTTTCCAGACAACCGAACCACCCTTTTGAACCGCAAAGATCTCCGGTGAAGCTCAG
CCAAATCCAGAATCACAGCATATTGACAGGAAGAGACAGATGTGAGGAGAGGTAAAACGA
AAAAAGGGAAGGAGGAGAAGAAGACCTCCGGAACCGGCTGACGCCGGACCGGAGAAAGAT
AAACCGTCGGTGAAAAAAAACTAGAGGTTTTAGAGAGAGAAGGTTATAGAGAGGTTTCGA
CTCAGTTTATTGATAAATCCTCAGATCATTGTTGACACCCACAACTTGCTCTCTACATTT
GTTAGTGACTGTGATCTGCGATCAAATGTTGTCCCT

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 4

CO CL2332Contig1 799 4 6 U
GGATCCTCTCTCCCTCTGAGCAAAAATGGAAGTGGCTCTTCTCTCATTCTCTTCTTCTTT
GTCTCCTCTCTGTCACAACCGAACCTTAACCCTAACTCCCAAACACTCCAAATCCCAAAA
CTACCCTCGTCTCCCTGTCATCAGATCCGCCGTGTCTCGTTCCAAAAAGGAAGAAACCGT
CGAGACCGTCAAGTCCCACCTCGAGAATTGCCACCTCCTCGCCGCCATCAACTACAAAGG
CCTCACCGTCAAGCAGTTCCAAGACCTCAGGAGAACTCTCCCAGACACAACAAAGCTCGT
CGTCGCCAAGAACACTTTGGTCATCAAAGCCATCTAAGGCACCAAATGGGAAGCTCTCAA
GCCTTGTATGAAAGGCATGAACGCTTGGCTCTTTGTCCAGACCGATGAGATCCCTTCCGC
CATCAAACCTTACCGGAGTTTCCAAAAGGAACGCAAGCTCGAAGACAATGACTTT*GCAG
GCGCTGTCTTTGAAGGTAAGTTCTACGCTCCAGACAACTTCAAAGCTCTGGAGACCATGC
CTACTCGTGCTGAGGTCTACGCTAAGATGCTCGGAGCTCTGCAGAGTCCGGCCATTAACC
TCGTCTCTACGTTACAAGCACCAGCGATTGAGGTTATCATGGTGCTCAAGGCTTATGTCA
AGAAGCTAGAAGATGAGAGTAATGCTGCATAACTAGTTTAAAGTAAAGCTGTACTAATCT
CAGAGAATGTAATGTACTAAGGAAAAGCAATTCAACTTTTTTTTGTCTTTGTCTATGACT
CGAGCATCAATGTTATTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FX76TF U 1
AF RS1BK54JQ C 458
AF RS1FX76JQ C 90
AF RS1BK54TF U 415
BS 1 590 RS1FX76TF
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BS 651 799 RS1BK54TF

RD RS1FX76TF 658 0 0
GGATCCTCTCTCCCTCTGAGCAAAAATGGAAGTGGCTCTTCTCTCATTCTCTTCTTCTTT
GTCTCCTCTCTGTCACAACCGAACCTTAACCCTAACTCCCAAACACTCCAAATCCCAAAA
CTACCCTCGTCTCCCTGTCATCAGATCCGCCGTGTCTCGTTCCAAAAAGGAAGAAACCGT
CGAGACCGTCAAGTCCCACCTCGAGAATTGCCACCTCCTCGCCGCCATCAACTACAAAGG
CCTCACCGTCAAGCAGTTCCAAGACCTCAGGAGAACTCTCCCAGACACAACAAAGCTCGT
CGTCGCCAAGAACACTTTGGTCATCAAAGCCATCTAAGGCACCAAATGGGAAGCTCTCAA
GCCTTGTATGAAAGGCATGAACGCTTGGCTCTTTGTCCAGACCGATGAGATCCCTTCCGC
CATCAAACCTTACCGGAGTTTCCAAAAGGAACGCAAGCTCGAAGACAATGACTTT*GCAG
GCGCTGTCTTTGAAGGTAAGTTCTACGCTCCAGACAACTTCAAAGCTCTGGAGACCATGC
CTACTCGTGCTGAGGTCTACGCTAAGATGCTCGGAGCTCTGCAGAGTCCG*CCATTAACC
TCGTCTCTACGTTACAAGCACCAGCGATTGAG*TTATCATGGTGCTCAAG
CTTATGTC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RS1BK54JQ 189 0 0
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CTTCAAAGCTCTGGAGACCATGCCTACTCGTGCTGAGGTCTACGCTAAGATGCTCGGAGC
TCTGCAGAGTCCGGCCATTAACCTCGTCTCTACGTTACAAGCACCAGCGATTGAGGTTAT
CATGGTGCT

QA 1 189 1 189
DS 

RD RS1FX76JQ 684 0 0
CCCTAACTCCCAAACACTCCAAATCCCAAAACTACCCTCGTCTCCCTGTCATCAGATCCG
CCGTGTCTCGTTCCAAAAAGGAAGAAACCGTCGAGACCGTCAAGTCCCACCTCGAGAATT
GCCACCTCCTCGCCGCCATCAACTACAAAGGCCTCACCGTCAAGCAGTTCCAAGACCTCA
GGAGAACTCTCCCAGACACAACAAAGCTCGTCGTCGCCAAGAACACTTTGGTCATCAAAG
CCATCTAAGGCACCAAATGGGAAGCTCTCAAGCCTTGTATGAAAGGCATGAACGCTTGGC
TCTTTGTCCAGACCGATGAGATCCCTTCCGCCATCAAACCTTACCGGAGTTTCCAAAAGG
AACGCAAGCTCGAAGACAATGACTTT*GCAGGCGCTGTCTTTGAAGGTAAGTTTTACGCT
CCAGACAACTTCAAAGCTCTGGAGACCATGCCTACTCGTGCTGAGGTCTACGCTAAGATG
CTCGGAGCTCTGCAGAGTCCGGCCATTAACCTCGTCTCTACGTTACAAGCACCAGCGATT
GAGGTTATCATGGTGCTCAAGGCTTATGTCAAGAAGCTAGAAGATGAGAGTAATGCTGCA
TAACTAGTTTAAAGTAAAGCTGTACTAATCTCAGAGAATGTAATGTACTAAGGAAAAGCA
ATTCAACTTTTTTTTGTCTTTGTC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1BK54TF 385 0 0
TTCCGCCATCAAACCTTACCGGAGTTCCCAAAAGGAACGCAAGCTCGAAGACAATGACTT
TTGCAGGCGCTGTCTTTGAAGGTGAGTTCTACGCTCCAGACAACTTCAAAGCTCTGGAGA
CCATGCCTACTCGTGCTGAGGTCTACGCTAAGATGCTCGGAGCTCTGCAGAGTCCGGCCA
TTAACCTCGTCTCTACGTTACAAGCACCAGCGATTGAGGTTATCATGGTGCTCAAGGCTT
ATGTCAAGAAGCTAGAAGATGAGAGTAATGCTGCATAACTAGTTTAAAGTAAAGCTGTAC
TAATCTCAGAGAATGTAATGTACTAAGGAAAAGCAATTCAACTTTTTTTTGTCTTTGTCT
ATGACTCGAGCATCAATGTTATTGT

QA 1 385 1 385
DS 



AS 1 3

CO CL2333Contig1 851 3 5 U
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AACTATGGACAAAAGGGTCTAAATGATTCTGATTCTGGACCATTTCTATAGCTAGGGATG
ATAAAGTGCCTTAGTCTCCCTTCTTGTTTCTTCATGTACCCTTCACACAAGAAAGCCTTT
GAGAACTTGTCTTCCACTTCCCTATTCACATCATGCACAAACACATCGGTCTCTCCTACC
CGTTCTCTGTTCCTTGCCATCATTCCCGCGGTGTAAATGGCCGTCATCCTCCCAGGAGCC
TCATCGTAGTATCCAGTGGGTGCGTCGACCATGATTAGATCCCAACTAGTCTCATAGATT
TCATCAGGCAGACCCTTGAGTGCTAGCTGACACATTGAGTACCTTGGATCTCCAATGGCT
GTGCACTCGGGTCCTTTCCCAACTTCTATTAAATTCTCTGCTTGGTTGACTTTACTGTCG
TATGTTACATGGTACGTTTCCAGCATCGGAAACCGCCTATGTATCTGTTTTATCCACGCC
TCGTCTTCTTCGAGGAACACTGTTCGGCCTCCGTAGTTGAGAGTGTTCCACATGAGGCTG
TCATGGCCTAGACCAAACACCAAGAAGTTGCAGGGTGACTTCTTGTCGAGTACTCTACTG
CTGACCACTATTTCCTTGAGCGTTTGTTGCGGTGTGATGACTGATGTAGAGTAATGGATC
AGGGCTTGCGCGAGGGAACGTGGTAGCTTACTGCAGACACCAGAGCAACCCCCTGATCTT
GTCTCTTCCGGAGTCTGGCGTTTCTGCGAAGTTGTAATAGTTGATCTAACGATGAAGATG
AGAATGAAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EY43JQ U 1
AF RS1F766JQ U 32
AF RS1EY43TF C 286
BS 1 194 RS1EY43JQ
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BS 196 710 RS1EY43JQ
BS 711 718 RS1F766JQ
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RD RS1EY43JQ 710 0 0
GAACAAGTAGGAACATAAAGAGTTGAGATTTGGAGAAACAGAGTAAAGTAACGTGTGTCA
AACTATGGACAAAAGGGTCTAAATGATTCTGATTCTGGACCATTTCTATAGCTAGGGATG
ATAAAGTGCCTTAGTCTCCCTTCTTGTTTCTTCATGTACCCTTCACACAAGAAAGCCTTT
GAGAACTTGTCTTCTACTTCCCTATTCACATCATGCACAAACACATCGGTCTCTCCTACC
CGTTCTCTGTTCCTTGCCATCATTCCCGCGGTGTAAATGGCCGTCATCCTCCCAGGAGCC
TCATCGTAGTATCCAGTGGGTGCGTCGACCATGATTAGATCCCAACTAGTCTCATAGATT
TCATCAGGCAGACCCTTGAGTGCTAGCTGACACATTGAGTACCTTGGATCTCCAATGGCT
GTGCACTCGGGTCCTTTCCCAACTTCTATTAAATTCTCTGCTTGGTTGACTTTACTGTCG
TATGTTACATGGTACGTTTCCAGCATCGGAAACCGCCTATGTATCTGTTTTATCCACGCC
TCGTCTTCTTCGAGGAACACTGTTCGGCCTCCGTAGTTGAGAGTGTTCCACATGAGGCTG
TCATGGCCTAGACCAAACACCAAGAAGTTGCAGGGTGACTTCTTGTCGAGTACTCTACTG
CTGACCACTATTTCCTTGAGCGTTTGTTGCGGTGTGATGACTGATGTAGA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1F766JQ 687 0 0
GGAGAAACAGAGTAAAGTAACGTGTGTCAAACTATGGACAAAAGGGTCTAAATGATTCTG
ATTCTGGACCATTTCTATAGCTAGGGATGATAAAGTGCCTTAGTCTCCCTTCTTGTTTCT
TCATGTACCCTTCACACAAGAAAGCCTTTGAGAACTTGTCTTCCACTTCCCTATTCACAT
CATGCACAAACACATCGGTCTCTCCTACCCGTTCTCTGTTCCTTGCCATCATTCCCGCGG
TGTAAATGGCCGTCATCCTCCCAGGAGCCTCATCGTAGTATCCAGTGGGTGCGTCGACCA
TGATTAGATCCCAACTAGTCTCATAGATTTCATCAGGCAGACCCTTGAGTGCTAGCTGAC
ACATTGAGTACCTTGGATCTCCAATGGCTGTGCACTCGGGTCCTTTCCCAACTTCTATTA
AATTCTCTGCTTGGTTGACTTTACTGTCGTATGTTACATGGTACGTTTCCAGCATCGGAA
ACCGCCTATGTATCTGTTTTATCCACGCCTCGTCTTCTTCGAGGAACACTGTTCGGCCTC
CGTAGTTGAGAGTGTTCCACATGAGGCTGTCATGGCCTAGACCAAACACCAAGAAGTTGC
AGGGTGACTTCTTGTCGAGTACTCTACTGCTGACCACTATTTCCTTGAGCGTTTGTTGCG
GTGTGATGACTGATGTAGAGTAATGGA

QA 1 687 1 687
DS 

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CTAGTCTCATAGATTTCATCAGACAGACCCTTGAGTGCTAGCTGACACATTGAGTACCTT
GGATCTCCAATGGCTGTGCACTCGGGTCCTTTCCCAACTTCTATTAGATTCTCTGCTTGG
TTGACTTTACTGTCGTATGTTACATGGTACGTTTCCAGCATCGAAAACCGCCTATGTATC
TGTTTTATCCACGCCTCGTCTTCTTCGAGGAACACTGTTCGGCCTCCGTAGTTGAGAGTG
TTCCACATGAGGCTGTCATGGCCTAGACCAAACACCAAGAAGTTGCAGGGTGACTTCTTG
TCGAGTACTCTACTGCTGACCACTATTTCCTTGAGCGTTTGTTGCGGTGTGATGACTGAT
GTAGAGTAATGGATCAGGGCTTGCGCGAGGGAACGTGGTAGCTTACTGCAGACACCAGAG
CAACCCCCTGATCTTGTCTCTTCCGGAGTCTGGCGTTTCTGCGAAGTTGTAATAGTTGAT
CTAACGATGAAGATGAGAATGAAGGC

QA 1 566 1 566
DS 



AS 1 3

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TTTTCGCTACTATGGTTGTTGATGCTGTTATGGCCATTGGAGATGACGACAGGCTTAATT
TGATTTGCATCAAAAAGGTTCCTGGTGGTAACATGCGAGACTCTTTCCTAGTTGATGGTG
TGGCCTTCAAAAAGACATTCTCATATGCGGGTTTTGAACAACAGCCGAAGAAGTTCAATC
CCAAAATCCTTCTGCTTAACATCGAATTGGAGTTGAAATCTGAGAAGGAAAACGCTGAGA
TTAGGCTGTCAGATCCATCACAGTACCAGTCAATAGTTGATGCAGAATGGAATATCATTT
ATGACAAGCTAGACAAATGTGTCGAAAGTGGAGCAAAAGTTGTTCTTTCCCGATTGGCTA
TTGGTGATCTAGCTACTCAGTACTTTGCAGATCGTGATATCTTATGCGCTGGCCGTGTAG
CAGAAGAAGATCTTAATCGCGTGGCTGCTGCCGCCGGAGGAACAGTTCAGACAAGTGTTA
ACAATATAATACCCGAGGTTCTCGGAACTTGTGAGATATTTGAGGAAAAACAAGTTGGTG
GGGAGAGGTTTAACATATTCAGTGGTTGCCCTTCAGGGCGTACAGCAACTATTGTCCTCC
GTGGTGGAGCTGATCAGTTCATCGAAGAAGCTGAGCGGAGTTTACATGATGCGATTATGA
TTGTGAGAAGAGCTGTGAAGAACTCAACTGTTGTTCCTGGAGGTGGAGCTATAGATATGG
AGATAAGCAAGTACCTGAGGCAGCATTCACGAACAATTGCCGGGAAGTCTCAGCTTTTCA
TCAACTCGTATGCAAAGGCCCTGGAGGTTATTCCACGACAATTATGTGACAATGCTGGAT
TTGATGCGACTGATGTCCTGAATAAATTAAGACAAAAACACGCCATGCAAAGCGGTGAAG
GAGCTCCATATGGGGTGGACATTAACACTGGTGGAATAGCTGATTCATTTGCTAACTTCG
TCTGGGAGCCTGCAGTTGTAAAGATTAATGCTATAAACGCTGCGACTGAAGCAGCTTGCC
TTATCCTTGTGGATGAAACTGTGAAGAACCCAAAATCTGAGAGCGCACAGGGAGATGCCG
CAGGTGCTATGGGAAGAGGACGCGGTGGAGGTCGTGGCCGTGGTATGAGGAGGCGATAAG
TTTTCTTTATCTCAAGGCAAAACTTGCTGTCGTCTCTCTATTTAGTTTTATTGAATTTTT
TGATCTTGAAATTAAAAAGGCTAGTATGATGTTTGTGTTTGTTTGACGTATGTTCATACA
ATTTGTGACACTGGAGAAACTATATTTGCTTAACTAGATCAAGACAAGATGAATCAATCA
TTGTATCAAATTCAGTTAGTGATATATCTCTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C974TF U 1
AF RS1F894TF U 351
AF RS1DL75TF U 685
BS 1 442 RS1C974TF
BS 443 443 RS1F894TF
BS 444 460 RS1C974TF
BS 461 461 RS1F894TF
BS 462 463 RS1C974TF
BS 464 464 RS1F894TF
BS 465 589 RS1C974TF
BS 590 590 RS1F894TF
BS 591 612 RS1C974TF
BS 613 925 RS1F894TF
BS 926 926 RS1DL75TF
BS 927 938 RS1F894TF
BS 939 1414 RS1DL75TF

RD RS1C974TF 612 0 0
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TTTTCGCTACTATGGTTGTTGATGCTGTTATGGCCATTGGAGATGACGACAGGCTTAATT
TGATTTGCATCAAAAAGGTTCCTGGTGGTAACATGCGAGACTCTTTCCTAGTTGATGGTG
TGGCCTTCAAAAAGACATTCTCATATGCGGGTTTTGAACAACAGCCGAAGAAGTTCAATC
CCAAAATCCTTCTGCTTAACATCGAATTGGAGTTGAAATCTGAGAAGGAAAACGCTGAGA
TTAGGCTGTCAGATCCATCACAGTACCAGTCAATAGTTGATGCAGAATGGAATATCATTT
ATGACAAGCTAGACAAATGTGTCGAAAGTGGAGCAAAAGTTGTTCTTTCCCGATTGGCTA
TTGGTGATCTAGCTACTCAGTATTTTGCAGATCGTGATATTTTCTGCGCTGGCCGTGTAG
CAGAAGAAGATCTTAATCGCGTGGCTGCTGCCGCCGGAGGAACAGTTCAGACAAGTGTTA
ACAATATAATACCCGAGGTTCTCGGAACTTGTGAGATATTTGAGGAAAAGCAAGTTGGTG
GGGAGAGGTTTA

QA 1 612 1 612
DS 

RD RS1F894TF 588 0 0
G
ATATCATTTATGACAAGCTAGACAAATGTGTCGAAAGTGGAGCCAAAGTTGTTCTTTCTC
GATTGGCTATTGGTGATCTAGCTACTCAGTACTTTGCAGATCGTGATATCTTATGCGCTG
GCCGTGTAGCAGAAGAAGATCTTAATCGCGTGGCTGCTGCGGCTGGAGGAACAGTTCAGA
CGAGTGTTAACAATATAATACCCGAGGTTCTCGGAACTTGTGAGATATTTGAGGAAAAAC
AAGTTGGTGGGGAGAGGTTTAACATATTCAGTGGTTGCCCTTCAGGGCGTACAGCAACTA
TTGTCCTCCGTGGTGGAGCTGATCAGTTCATCGAAGAAGCTGAGCGGAGTTTACATGATG
CGATTATGATTGTGAGAAGAGCTGTGAAGAACTCAACTGTTGTTCCTGGAGGTGGAGCTA
TAGATATGGAGATAAGCAAGTACCTGAGGCAGCATTCACGAACAATTGCCGGGAAGTCTC
AGCTTTTCATCAACTCGTATGCAAAGGCCCTGGAGGTTATTCCACGACAATTATGTGACA
ATGCTGGATTTGATGCGACTGATGTCCTGAATAAGTTAAGACAAAAA

QA 2 588 2 588
DS 

RD RS1DL75TF 730 0 0
GA
GAAGCTGAGCGGAGTTTACATGATGCGATTATGATTGTGAGAAGAGCTGTGAAGAACTCA
ACTGTTGTTCCTGGAGGTGGAGCTATAGATATGGAGATAAGCAAGTACCTGAGGCAGCAT
TCGCGAACAATTGCCGGGAAGTCTCAGCTTTTCATCAACTCGTATGCAAAGGCCCTGGAG
GTTATTCCACGACAATTATGTGACAATGCTGGATTTGATGCGACTGATGTCCTGAATAAA
TTAAGACAAAAACACGCCATGCAAAGCGGTGAAGGAGCTCCATATGGGGTGGACATTAAC
ACTGGTGGAATAGCTGATTCATTTGCTAACTTCGTCTGGGAGCCTGCAGTTGTAAAGATT
AATGCTATAAACGCTGCGACTGAAGCAGCTTGCCTTATCCTTGTGGATGAAACTGTGAAG
AACCCAAAATCTGAGAGCGCACAGGGAGATGCCGCAGGTGCTATGGGAAGAGGACGCGGT
GGAGGTCGTGGCCGTGGTATGAGGAGGCGATAAGTTTTCTTTATCTCAAGGCAAAACTTG
CTGTCGTCTCTCTATTTAGTTTTATTGAATTTTTTGATCTTGAAATTAAAAAGGCTAGTA
TGATGTTTGTGTTTGTTTGACGTATGTTCATACAATTTGTGACACTGGAGAAACTATATT
TGCTTAACTAGATCAAGACAAGATGAATCAATCATTGTATCAAATTCAGTTAGTGATATA
TCTCTTAC

QA 3 730 3 730
DS 



AS 1 3

CO CL2335Contig1 985 3 20 U
GAACAAAAGTCACACAAATAGCATAAGGTTCTTCACAATACTTCACTTATTACATACCAT
ATTGTTCTCTCTAGATACTAACCAAAATCCTAAAATCTGGTTACTTAACACAAAATCATT
GAAAATCTTGTTTTTTCACTTGGACAAGCGAGGGACGATGAAGTCAACGAAAAAACCCGT
CGGCGCAATGGTCTGAAACTCGTCCCCATTGAGCGCTAGTGAGGTGAACATACGGCGCAA
AAACACATTGATGAACCGAGTCTTCTTCTTGTAGCGAATCTTCACTGTCCCAACTGCTTC
TCCATTGATCTCGTCCACTGCTACAAGGATCACGTCCCTAAGCCCAACGTAGCTTGATAC
ACCACCTGCCACATCGTAAACTCCATGTTCTCCGACAAGATCGATCTCAGGACTGAAGAC
ATGCAGCTTTGCTCCCACCGGTCCATCCTGCAACAACTTAAACGCATCCTCCAGTGTCTT
AGCCTCGACCACTTCTCCTTTCACGGGAACGCGAGGCATAAGAGCAGCAAACGGGGGAAC
CTTGGAAACACAACCCAAGTGCCCCCAGTGTTCGTATCTCGGTATCCCTTCCTTGAAAGC
ACACTCGAGGCAGTCCTTGACAGTTATCTTGGTGCGTCGCTGTCTTTCTTTCTCCATCTC
TTCCAGCTTGGCCTCTGTCTTGGGAGAAGCCATGTTCACCAGATACTCAATGCAGTCCTC
GATCTTAAGCGTGGAGGGCTGTGGACCCTGCGCTGGTTCCTTCTCGACGAGAGCGTTGTC
CACCAGGAACTGAGCTGAGTACTCCGTAAACTCACGGTCCAGCTTGAGGATCAGACGCGC
AGTGCTGATTAGGTTAGCTGCTACCGTAGCGGCTCTTTCAGCAGAATCATCTTCTTCCTT
GGCAGCGGCTGCTCTTTGGCAATCAGGATGGCAGTTGCGAGACATTTTCTGAGACGGCTA
AGGAGAGGGGAGGAGAGTTGACACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D234JQ U 78
AF RS1BZ54JQ U 1
AF RS1BZ54TF C 282
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GAAGATCTTGTTTTTTCACTTGGACAAGCGAGGGACGATGAAGTCAACGAGAAGACCCGT
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AGACACATTGATGAACCGAGTCTTCTTCTTGTAGCGAATCTTCACTGTCCCAACTGCTTC
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ACCACCTGCCACATCGTAAACTCCATGTTCTCCGACAAGATCGATCTCAGGACTGAAGAC
ATGCAGCTTTGCTCCCACCGGTCCATCCTGCAACAACTTAAACGCATCCTCCAGTGTCTT
AGCCTCGACCACTTCTCCTTTCACGGGAACGCGAGGCATAAGAGCAGCAAACGGGGGAAC
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CGATCTCAGGACTGAAGACATGCAGCTTTGCTCCCACCGGTCCATCCTGCAACAACTTAA
ACGCATCCTCCAGTGTCTTAGCCTCGACCACTTCTCCTTTCACGGGAACGCGAGGCATAA
GAGCAGCAAACGGGGGAACCTTGGAAACACAACCCAAGTGCCCCCAGTGTTCGTATCTCG
GTATCCCTTCCTTGAAAGCACACTCGAGGCAGTCCTTGACAGTTATCTTGGTGCGTCGCT
GTCTTTCTTTCTCCATCTCTTCCAGCTTGGCCTCTGTCTTGGGAGAAGCCATGTTCACCA
GATACTCAATGCAGTCCTCGATCTTAAGCGTGGAGGGCTGTGGACCCTGCGCTGGTTCCT
TCTCGACGAGAGCGTTGTCCACCAGGAACTGAGCTGAGTACTCCGTAAACTCACGGTCCA
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CAGAATCATCTTCTTCCTTGGCAGCGGCTGCTCTTTGGCAATCAGGATGGCAGTTGCGAG
ACATTTTCTGAGACGGCTAAGGAGAGGGGAGGAGAGTTGACACC

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 4

CO CL2336Contig1 1005 4 6 U
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ATGATGGCTTCACTTTCTATTAATGATCACTTGTGAGAAGCCTTGGTCTTTGAGTACTGC
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CCGTTTTGACTTGAAATGATATGCTTTTTTGGTTGGATAATCCTTTTTTTTTTGCTATTG
CAATTACAACTTTGCGATTTGCGACTGGTGAAAAGGCTTTTTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BS34TF U 1
AF RS1BS34JQ C 151
AF RS1AK80JQ C 590
AF RS1AK80TF U 365
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ATGCCCGCTGGTGCATTGGCTTCTTCCCTTGCTCAAGCCTCACCTGCTCACCAAAGAACA
ATTCTGGGTGAGACTCTGTACCCATTAGTGAACAAGATAGAGCACGAGAATGCTGCCAAA
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TTGTGAGAAGCTTTTGTCTTTGAGTACTGC
TTT

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DS 

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AGATGGATCAGACAGAAGTGCTGCATTTGATAGAGTCACCAGAGGCTTTAAATGCTAAAG
TTTTGGAGGCGTTGGATGTGTTGAGAAACGTGAATCAGCCTAGGGAAGGCAAGAGTGGTA
GCCCAAGTGATATGATGGCTTCACTTTTTATTAATGATCACTTGTGAGAAGCCTTGGTTT
TTGAGTACTGCCTTGAACT
TTTTT

QA 1 259 1 259
DS 

RD RS1AK80TF 641 0 0
G
GCCTCAGCAACCAATGCCATATATGCATCCACAGATGATGGCAGGAGGACGCGGACACCG
TTACCCTCGTGGTAGAAACATGCCAGACGGTCCAATGCCAGGAGGAATGGTTCCATTTCC
TTATGACATTAACGGAGTGCCTATTATGCCCGCTGGTGCATTGGCTTCTTCCCTTGCTCA
AGCCTCACCTGCTCTC*AAAGAACAATTCTGGGTGAGACTCTGTACCCATTAGTGAACAA
GATAGAGCACGAGAATGCTGCCAAAGTGACGGGGATGCTTCTGGAGATGGATCAGACAGA
AGTGCTGCATCTGATAGAGTCACCAGAGGCTCTAAATGCTAAAGTTTCGGAGGCGTTGGA
TGTGTTGAGAAACGTGAATCAGCCTAGCGAAGGCAAGAGTGGTAGCCCAAGTGATATGAT
GGCTTCACTTTCTATTAATGATCACTTGTGAGAAGCCTTGGTCTTTGAGTACTGCCTTGA
ACTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTGATTGACAAAATTTTTGCGGAATGGTTGTTTTCCGTT
TTGACTTGAAATGATATGCTTTTTTGGTTGGATAATCCTTTTTTTTTTGCTATTGCAATT
ACAACTTTGCGATTTGCGACTGGTGAAAAGGCTTTTTATG

QA 2 641 2 641
DS 



AS 1 3

CO CL2337Contig1 1144 3 8 U
AATATACATCTCTCAATACATTGGGCAGTAAACAAGAACTTCAAAGTTGGGGAAGACTAG
TCCCTACAACTTTCATAACTGAGAGTGAGAGAGCTATCAAGATTCTGAACCTCTCCCACC
AAAACTTTTAACTACAGTTTCAAAAAGGAAGAAGCAGCAGCTTTGATGAAGAAAAGTTTT
GAGGTACAGTAGATGGAGGTATCACCAAAACCTCCATGGATCCTTGAATGGAGGAACATA
ACTATCAGTAGGAGGAAGAAGCCTAAAGGACTCAACTGCTCTTTCTAACACCGGTCCCAT
CATGTCCCATTGCTTGCCAAGGGTTGAGGCATTCATGGTGTATAAGTACCCATCCCGTTC
AGCTGTTGAAAAAATGTAGTGTCTGTACATCTTTGATGCTTCGGCGATTTTGGTAGGTGA
TTTGCGGACAAGGTACTCGTAGTACCAGTAAGGCTCCCCATCAATATCAGTAGAATGTGC
ATCAAGAACCGAGCTCTCTTCTAGACGTTGACTTGAAGTGACACGCAGAGCTGATTTATC
AGAAAGAACAGAGTCAGCTACGTCTTTGGCAGTCCATGTTTTCTTGTCTTTTGAAGTTAG
GAAGCTTGGGTGTGGGGGACCTATGGAAATAGAAATGACTAGGTTGTCGATGAGGTCAAG
TCGTTCAGAAACAATCCGTAGACGCGCATCAGGAGAGAGTGGGGCAGCTGAAGAGTAACG
TTCAGGCTTTCTTGATTCAACCCATTTGAATACAAGCTTCTCAGATGGAAGCTCGAGGGG
GTAAGAATAAGAATAAGCATTAATGTCATCCACCATTGAACCCATTTTAACTTCTTCTCC
ACCAATTTTCACTGCTTCTTCTTCTGCAGCAAAAGTGACAGGAGACGACGACAGTGGCAA
GAGCGTAGATAAGGGAGAAGAGAGACCAATTAACACTAAATCCCTACGAGAAAGTCCCTC
TTCCGATCTCGTCGTAGAAACACGAGAAGGAGAAATGATCAGCTCATTTGATTCTCCTCC
ATGTTGATACTTGCTCGAAATGCTGTTGCTCCTCCTCCTGTGAAGACGATAGCAGGGAGA
GGAGAAAGATGGAGAGAGAAGAGCCATGGTTATTGAGCCTTTACCTTCCTTCTTCTTCCT
CTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 

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AF RS1D059JQ U 603
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TCGTTCAGAAACAATCCGTAGACGCGCATC

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GGTTATTGAGCCTTTACCTTCCTTCTTCTTCCTCTCC

QA 1 577 1 577
DS 

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AGCTTGGGTGTGGGGGACCTATGGAAATAGAAATGACTAGGTTGTCGATGAGGTCAAGTC
GTTCAGAAACAATCCGTAGACGCGCATCAGGAGAGAGTGGGGCAGCTGAAGAGTAACGTT
CAGGCTTTCTTGATTCAACCCATTTGAATACAAGCTTCTCAGATGGAAGCTCGAGGGGGT
AAGAATAAGAATAAGCATTAATGTCATCCACCATTGAACCCATTTTAACTTCTTCTCCAC
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GCGTAGATAAGGGAGAAGAGAGACCAATTAACACTAAATCCCTACGAGAAAGTCCCTCTT
CCGATCTCGTCGTAGAAACACGAGAAGGAGAAATGATCAGCTCATTTGATTCTCCTCCAT
GTTGATACTTGCTCGAAATGCTGTTGCTCCTCCTCCTGTGAAGACGATAGCAGGGAGAGG
AGAAAGATGGAGAGAGAAGAGCCATGGTTATTGAGCCTTTACCTTCCTTCTTCTTCCTCT
CC

QA 1 542 1 542
DS 



AS 1 4

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CTGTTTCTTCACGTTCCTCCTCTCTTTCTCAACCATCTCCGACGCACGGAGGTTCGGAGT
TGGAGGTAGCGGCGCGTGGGTTCCAAATCCCCCGGAAGATTATGGATCTTGGGCTGGAAA
GAGCCGCTTCCTAGTACACGACACACTCTATTTTACCTACGCCAAGGGAGCTGACTCAGT
TCTAGAGGTCAGCAAGGCTGACTACGACGGATGTAACACCAAGAATCCGATCAAGAGAGT
CGACGACGGAAACTCAGAGATCTCGCTTGATCGTTCTGGTCCGTTTTACTTCATCAGCGG
TAATGAAGATAACTGTAAGAAAGGGCAAAAACTTACCGTCGTCGTCTTGTCTGTTAGAAC
TTCGACTCCGCCTCCTCAAGCCGCCACTCCGGGTTCAATGCCTCCTAAGTCTTCTTCCTC
CATTTCTCCGGCTACTTCTCCACCAGCCCCTATGCCACCTAAATCATCTTCCTCCCCTGT
TTCTCCGTCCTCTGCTCCGGTGACTTCTCCGCCGGGATCAATGTCACCTAAGTCTTCTTC
CCCTGTTTCTCCGATGACTTCTCCTCCATCACCTCCGTCCTCTGCACCGGGCTCTTCACC
GTCTGGATCAATGGCACCCAAATCTTCTTCAGCCGTTTCTCCATCTTTGGCTCCGGGAGA
ATCTCCTTCCTCCATTTCCTCTTCCCCGTCTGGGATGGGTCCCTCCGGAGATGCTCCCTC
AGGTTCGGCGATGGGGCCATCAGGCTCGGGGATGGGTCCCTCTGGAGATGGACAGTCAAG
CTCCGGTGGTATTAATGCGCCGGCGGAAGCTCCAGGCGAGAAAAAATCCTCTGCTAATGG
TATGGCCGTTATGTCGGTAACTACAGTTTTAAGTCTCTTCCTAACCATCATCCTTATGTC
AACTTAATAACACTTCGAGGCTAATATAGATTCATGTCGGAATTGATTTTCTCGATTCTA
TTGGTCTAGTTTCATTCTAGTGTCTGCTTCTTCTTTTGTTTATTGGTTACGGCTTTACAT
CGTCAGTATAGTTTGATAACTTGGATTGTTGTAATAAATAAATAGAGACACCATATTGTG
CTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 

AF RS1DW82TF U 1
AF RS1AV35TF U 182
AF RS1AV35JQ C 354
AF RS1DW82JQ C 467
BS 1 396 RS1DW82TF
BS 397 397 RS1AV35TF
BS 398 666 RS1DW82TF
BS 667 779 RS1AV35TF
BS 780 1139 RS1AV35JQ
BS 1140 1143 RS1DW82JQ

RD RS1DW82TF 666 0 0
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CTGTTTCTTCACGTTCCTCCTCTCTTTCTCAACCATCTCCGACGCACGGAGGTTCGGAGT
TGGAGGTAGCGGCGCGTGGGTTCCAAATCCCCCGGAAGATTATGGATCTTGGGCTGGAAA
GAGCCGCTTCCTAGTACACGACACACTCTATTTTACCTACGCCAAGGGAGCTGACTCAGT
TCTAGAGGTCAGCAAGGCTGACTACGACGGATGTAACACCAAGAATCCGATCAAGAGAGT
CGACGACGGAAACTCAGAGATCTCGCTTGATCGTTCTGGTCCGTTTTACTTCATCAGCGG
TAATGAAGATAACTGTAAGAAAGGGCAAAAACTTACTGTCGTCGTCTTGTCTGTTAGAAC
TTCGACTCCGCCTCCTCAAGCCGCCACTCCGGGTTCAATGCCTCCTAAGTCTTCTTCCTC
CATTTCTCCGGCTACTTCTCCACCAGCCCCTATGCCACCTAAATCATCTTCCTCCCCTGT
TTCTCCGTCCTCTGCTCCGGTGACTTCTCCGCCGGGATCAATGTCACCTAAGTCTTCTTC
CCCTGTTTCTCCGATGACTTCTCCTCCATCACCTCCGTCCTCTGCACCGGGCTCTTCACC
GTCTGG

QA 1 666 1 666
DS 

RD RS1AV35TF 598 0 0
G
GCCGCTTCCTAGTACACGACACACTCTATTTTACCTACGCCAAGGGAGCTGACTCAGTTC
TAGAGGTCAGCAAGGCTGACTACGACGGATGTAACACCAAGAATCCGATCAAGAGAGTCG
ACGACGGAAACTCAGAGATCTCGCTTGATCGTTCTGGTCCGTTTTACTTCATCAGCGGTA
ATGAAGATAACTGTAAGAAAGGGCAAAAACTTACCGTCGTCGTCTTGTCTGTTAGAACTT
CGACTCCGCCTCCTCAAGCCGCCACTCCGGGTTCAATGCCTCCTAAGTCTTCTTCCTCCA
TTTCTCCGGCTACTTCTCCACCAGCCCCTATGCCACCTAAATCATCTTCCTCCCCTGTTT
CTCCGTCCTCTGCTCCGGTGACTTCTCCGCCGGGATCAATGTCACCTAAGTCTTCTTCCC
CTGTTTCTCCGATGACTTCTCCTCCATCACCTCCGTCCTCTGCACCGGGCTCTTCACCGT
CTGGATCAATGGCACCCAAATCTTCTTCAGCCGTTTCTCCATCTTTGGCTCCGGGAGAAT
CTCCTTCCTCCATTTCCTCTTCCCCGTCTGGGATGGGTCCCTCCGGAGATGCTCCCT

QA 2 598 2 598
DS 

RD RS1AV35JQ 786 0 0
TCAGCGGTAATGAAGATAACTGTAAGAAAGGGCAAAAACTTACCGTCGTCGTCTTGTCTG
TTAGAACTTCGACTCCGCCTCCTCAAGCCGCCACTCCGGGTTCAATGCCTCCTAAGTCTT
CTTCCTCCATTTCTCCGGCTACTTCTCCACCAGCCCCTATGCCACCTAAATCATCTTCCT
CCCCTGTTTCTCCGTCCTCTGCTCCGGTGACTTCTCCGCCGGGATCAATGTCACCTAAGT
CTTCTTCCCCTGTTTCTCCGATGACTTCTCCTCCATCACCTCCGTCCTCTGCACCGGGCT
TTTCACCGTCTGGATCAATGGCACCCAAATCTTCTTCAGCCGTTTCTCCATCTTTGGCTC
CGGGAGAATCTCCTTCCTCCATTTCCTCTTCCCCGTCTGGGATGGGTCCCTCCGGAGATG
CTCCCTCAGGTTCGGCGATGGGGCCATCAGGCTCGGGGATGGGTCCCTCTGGAGATGGAC
AGTCAAGCTCCGGTGGTATTAATGCGCCGGCGGAAGCTCCAGGCGAGAAAAAATCCTCTG
CTAATGGTATGGCCGTTATGTCGGTAACTACAGTTTTAAGTCTCTTCCTAACCATCATCC
TTATGTCAACTTAATAACACTTCGAGGCTAATATAGATTCATGTCGGAATTGATTTTCTC
GATTCTATTGGTCTAGTTTCATTCTAGTGTCTGCTTCTTCTTTTGTTTATTGGTTACGGC
TTTACATCGTCAGTATAGTTTGATAACTTGGATTGTTGTAATAAATAAATAGAGACACCA
TATTGT

QA 1 786 1 786
DS 

RD RS1DW82JQ 677 0 0
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TCTTCCTCCCCTGTTTCTCCGTCCTCTGCTCCGGTGACTTCTCCGCCGGGATCAATGTCA
CCTAAGTCTTCTTCCCCTGTTTCTCCGATGACTTCTCCTCCATCACCTCCGTCCTCTGCA
CCGGGCTCTTCACCGTCTGGATCAATGGCACCCAAATCTTCTTCAGCCGTTTCTCCATCT
TTGGCTCCGGGAGAATCTCCTTCCTCCATTTCCTCTTCCCCGTCTGGGATGGGTCCCTCC
GGAGATGCTCCCTCAGGTTCGGCGATGGGGCCATCAGGCTCGGGGATGGGTCCCTCTGGA
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TCCTCTGCTAATGGTATGGCCGTTATGTCGGTAACTACAGTTTTAAGTCTCTTCCTAACC
ATCATCCTTATGTCAACTTAATAACACTTCGAGGCTAATATAGATTCATGTCGGAATTGA
TTTTCTCGATTCTATTGGTCTAGTTTCATTCTAGTGTCTGCTTCTTCTTTTGTTTATTGG
TTACGGCTTTACATCGTCAGTATAGTTTGATAACTTGGATTGTTGTAATAAATAAATAGA
GACACCATATTGTGCTC

QA 1 677 1 677
DS 



AS 2 4

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TGAGATTTTCGGAAGATTCGATCGAATTTGGGGGTTAGGGTTTTTCGCTGCTGACGAACT
GCTTGATATTCTGATTCAATGACGCCGCCTCCTGGACTTTACTCCGGTAGCAGCACTCTT
GCCCTGGTGGCTCGTGCTTCCGCTTTCGGGCTGGGTCTCGTCTACGGCAACATCAAGCTC
AAGGCCTTGAAGATAAAGAAGAACTCACAGATTAAGGCTGAAGCCAAGGCTCATCACTAA
ACCAAACTTTCTTTCTCTCCCTTCAAAATAAGATGACGAAAGCCCAGTGAACGTTCTCCA
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TATTTCCTTTTTGGTTATGGTTGACAAAGAAGAACAAAAACTTTTGTCTGAAAAAGCAAT
CACTACCATTATGATTTAAACCTAATGCTAGAACACCCATATGTTTATC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A223TF U 1
AF RS1A223TV U 1
BS 1 529 RS1A223TF

RD RS1A223TF 529 0 0
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TGAGATTTTCGGAAGATTCGATCGAATTTGGGGGTTAGGGTTTTTCGCTGCTGACGAACT
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GCCCTGGTGGCTCGTGCTTCCGCTTTCGGGCTGGGTCTCGTCTACGGCAACATCAAGCTC
AAGGCCTTGAAGATAAAGAAGAACTCACAGATTAAGGCTGAAGCCAAGGCTCATCACTAA
ACCAAACTTTCTTTCTCTCCCTTCAAAATAAGATGACGAAAGCCCAGTGAACGTTCTCCA
CAAATGTAGCTGTTTCTTCTTGAGCTATATCTCTCCCTTGGTGACATTTTTCTGTTTTTC
TATTTCCTTTTTGGTTATGGTTGACAAAGAAGAACAAAAACTTTTGTCTGAAAAAGCAAT
CACTACCATTATGATTTAAACCTAATGCTAGAACACCCATATGTTTATC

QA 1 529 1 529
DS 

RD RS1A223TV 529 0 0
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TGAGATTTTCGGAAGATTCGATCGAATTTGGGGGTTAGGGTTTTTCGCTGCTGACGAACT
GCTTGATATTCTGATTCAATGACGCCGCCTCCTGGACTTTACTCCGGTAGCAGCACTCTT
GCCCTGGTGGCTCGTGCTTCCGCTTTCGGGCTGGGTCTCGTCTACGGCAACATCAAGCTC
AAGGCCTTGAAGATAAAGAAGAACTCACAGATTAAGGCTGAAGCCAAGGCTCATCACTAA
ACCAAACTTTCTTTCTCTCCCTTCAAAATAAGATGACGAAAGCCCAGTGAACGTTCTCCA
CAAATGTAGCTGTTTCTTCTTGAGCTATATCTCTCCCTTGGTGACATTTTTCTGTTTTTC
TATTTCCTTTTTGGTTATGGTTGACAAAGAAGAACAAAAACTTTTGTCTGAAAAAGCAAT
CACTACCATTATGATTTAAACCTAATGCTAGAACACCCATATGTTTATC

QA 1 529 1 529
DS 



CO CL2339Contig2 493 2 3 U
GGACCTACCACTCCACGCGAATCTGAGATTTTCGGGAGATTCGATCGAATTTGGGGGTTA
GGGTTTTTTCGCTGCCGACGAACTGCTTGATCAATGACGCCGCCTCCTGGACTTTACTCC
GGTAGCAGCACTCCTGCCCTGGTGGCTCGTGCTTCCGCTTTCGGGCTGGGTCTCGTCTAC
GGCAACATCAAGCTCAAGGCCTTGAAGATAAAGAAGAACTCACAGATTAAGGCTGAAGCC
AAGGCTCATCACTAAACCAAACTTTCTTTCTCTCCCTTCAAAATAAGATGACGAAGAAGC
CCAGTGAACGTTCTCCACAAATGTAGCTGTTTCTTCTTGAGCTATATCTCTCCCTTGGTG
ACATTTTTCTGTTTTTCTATTTCCTTTTTGGTTATGGTTGACAAAGAAGAACAAAAACTT
TTGTCTGAAAAAGCAATCATAGTACCATTATGATTTAAACCTAATGCTAGAACACCCATA
TGTTTATCATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RS1GR19JQ C 1
AF RS1GR19TF U 1
BS 1 13 RS1GR19JQ
BS 14 488 RS1GR19TF
BS 489 493 RS1GR19JQ

RD RS1GR19JQ 493 0 0
GGACCTACCACTCCACGCGAATCTGAGATTTTCGGGAGATTCGATCGAATTTGGGGGTTA
GGGTTTTTTCGCTGCCGACGAACTGCTTGATCAATGACGCCGCCTCCTGGACTTTACTCC
GGTAGCAGCACTCCTGCCCTGGTGGCTCGTGCTTCCGCTTTCGGGCTGGGTCTCGTCTAC
GGCAACATCAAGCTCAAGGCCTTGAAGATAAAGAAGAACTCACAGATTAAGGCTGAAGCC
AAGGCTCATCACTAAACCAAACTTTCTTTCTCTCCCTTCAAAATAAGATGACGAAGAAGC
CCAGTGAACGTTCTCCACAAATGTAGCTGTTTCTTCTTGAGCTATATCTCTCCCTTGGTG
ACATTTTTCTGTTTTTCTATTTCCTTTTTGGTTATGGTTGACAAAGAAGAACAAAAACTT
TTGTCTGAAAAAGCAATCATAGTACCATTATGATTTAAACCTAATGCTAGAACACCCATA
TGTTTATCATTTT

QA 1 493 1 493
DS 

RD RS1GR19TF 493 0 0
GGACCTACCACTC
CACGCGAATCTGAGATTTTCGGGAGATTCGATCGAATTTGGGGGTTAGGGTTTTTTCGCT
GCCGACGAACTGCTTGATCAATGACGCCGCCTCCTGGACTTTACTCCGGTAGCAGCACTC
CTGCCCTGGTGGCTCGTGCTTCCGCTTTCGGGCTGGGTCTCGTCTACGGCAACATCAAGC
TCAAGGCCTTGAAGATAAAGAAGAACTCACAGATTAAGGCTGAAGCCAAGGCTCATCACT
AAACCAAACTTTCTTTCTCTCCCTTCAAAATAAGATGACGAAGAAGCCCAGTGAACGTTC
TCCACAAATGTAGCTGTTTCTTCTTGAGCTATATCTCTCCCTTGGTGACATTTTTCTGTT
TTTCTATTTCCTTTTTGGTTATGGTTGACAAAGAAGAACAAAAACTTTTGTCTGAAAAAG
CAATCATAGTACCATTATGATTTAAACCTAATGCTAGAACACCCATATGTTTATC
ATTTT

QA 14 488 14 488
DS 



AS 1 4

CO CL2340Contig1 904 4 2 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAAAGTTTGT
GCGGTTGTGCCGTCGCTCTATCGCCGTTTCATTCGTGCTTTCTCTCTCTCTCTCAGGCGT
TTCAGTTTCCATAGAAAA*CGAGTTTCGGTCGGATAAATAAGAAGAAGGAACGAGATGAG
TAACAAAAAGGCGAGGAAGTTGTCAGAAACATGGGTGTTCTGGGACATCAACAGCTTTCC
GGTTCCCAAAGATTGCGATGCTCGTCTGGTCCGTTCGTCAATAGAATCAGCCTTGAAGAA
GGCAGGGCACTGTGTAGATGATCTCACCATCACTGCCATTGGCAACCTCAATTACACCTC
ACAACTGTACCCTGATGTACTTGAGGCCATATTTTCCACTGGAACTCGTCTTTGTCATAC
CCCCCGCGGTTTCGGGTGCCTTTTTGGTGATTTCATTTTTTACCCGCCGAGCAATCCATT
GACTGTTACATTCATAATCTTATCCCATGAGAATTTTACTCACTCAAGCTACGCAAGGAG
GGATATTCAGTAATCGATTCTGAATCGCTTCCTTGGGAAAATTTAGTTAAAGATGCAGTG
GATTTAGAAGAGACAAGAAGACATGCACATCGGGTGAAGTACACTGAATCTAACTGGTTT
TGCACATTATGCGGAGTTGGCATTGTACCCAGAATAATGCCGTGCGGAGTGTATCATAGC
GAAACGTCTGAAGGCCAAATCTTTGACGGTTTTACTAAGCATATGAAGAGTAGAGATCAT
GCGGAACATGAGATGGAGAGGGTGAGATGTCCTTTAAGCATTGATATGGAGCGTCTTTAT
TATGCTAAAGTTGTTAAAGGAAAAACTGAAGATGGTGGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
GAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 

AF RS1A169TV U 1
AF RS1A169TF U 71
AF RS1A169TR C 52
AF RS1A169JQ C 50
BS 1 857 RS1A169TV
BS 858 904 RS1A169JQ

RD RS1A169TV 857 0 0
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GGATATTCAGTAATCGATTCTGAATCGCTTCCTTGGGAAAATTTAGTTAAAGATGCAGTG
GATTTAGAAGAGACAAGAAGACATGCACATCGGGTGAAGTACACTGAATCTAACTGGTTT
TGCACATTATGCGGAGTTGGCATTGTACCCAGAATAATGCCGTGCGGAGTGTATCATAGC
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GCGGAACATGAGATGGAGAGGGTGAGATGTCCTTTAAGCATTGATATGGAGCGTCTTTAT
TATGCTAAAGTTGTTAA

QA 1 857 1 857
DS 

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ATAGAAAA*CGAGTTTCGGTCGGATAAATAAGAAGAAGGAACGAGATGAGTAACAAAAAG
GCGAGGAAGTTGTCAGAAACATGGGTGTTCTGGGACATCAACAGCTTTCCGGTTCCCAAA
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TTCGGGTGCCTTTTTGGTGATTTCATTTTTTACCCGCCGAGCAATCCATTGACTGTTACA
TTCATAATCTTATCCCATGAGAATTTTACTCACTCAAGCTACGCAAGGAGGGATATTCAG
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GCGGAGTTGGCATTGTACCCAGAATAATGCCGTGCGGAGTGTATCATAGCGAAACGTCTG
AAAGCCAAATCTTTGACGGTTTTACTAAGCATATGAAGAGTAGAGATCATGCGGAACATG
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TTGTTAA
AGGA

QA 1 787 1 787
DS 

RD RS1A169TR 849 0 0
AAAGTTTGTGCGGTTGTGCCGTCGCTCTATCGCCGTTTCATTCGTGCTTTCTCTCTCTCT
CTCAGGCGTTTCAGTTTCCATAGAAAA*CGAGTTTCGGTCGGATAAATAAGAAGAAGGAA
CGAGATGAGTAACAAAAAGGCGAGGAAGTTGTCAGAAACATGGGTGTTCTGGGACATCAA
CAGCTTTCCGGTTCCCAAAGATTGCGATGCTCGTCTGGTCCGTTCGTCAATAGAATCAGC
CTTGAAGAAGGCAGGGCACTGTGTAGATGATCTCACCATCACTGCCATTGGCAACCTCAA
TTACACCTCACAACTGTACCCTGATGTACTTGAGGCCATATTTTCCACTGGAACTCGTCT
TTGTCATACCCCCCGCGGTTTCGGGTGCCTTTTTGGTGATTTCATTTTTTACCCGCCGAG
CAATCCATTGACTGTTACATTCATAATCTTATCCCATGAGAATTTTACTCACTCAAGCTA
CGCAAGGAGGGATATTCAGTAATCGATTTTGAATCGCTTCCTTGGGAAAATTTAGTTAAA
GATGCAGTGGATTTAGAAGAGACAAGAAGACATGCACATCGGGTGAAGTACACTGAATCT
AACTGGTTTTGCACATTATGCGGAGTTGGCATTGTACCCAGAATAATGCCGTGCGGAGTG
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AGAGATCATGCGGAACATGAGATGGAGAGGGTGAGATGTCCTTTAAGCATTGATATGGAG
CGTCTTTATTATGCTAAAGTTGTTAAAGGAAAAACTGAAGATGGTGGAGAAGAAGAAGAA
GAAGAAGAA

QA 1 849 1 849
DS 

RD RS1A169JQ 855 0 0
GG
AAAGTTTGTGCGGTTGTGCCGTCGCTCTATCGCCGTTTCATTCGTGCTTTCTCTCTCTCT
CTCAGGCGTTTCAGTTTCCATAGAAAAACGAGTTTCGGTCGGATAAATAAGAAGAAGGAA
CGAGATGAGTAACAAAAAGGCGAGGAAGTTGTCAGAAACATGGGTGTTCTGGGACATCAA
CAGCTTTCCGGTTCCCAAAGATTGCGATGCTCGTCTGGTCCGTTCGTCAATAGAATCAGC
CTTGAAGAAGGCAGGGCACTGTGTAGATGATCTCACCATCACTGCCATTGGCAACCTCAA
TTACACCTCACAACTGTACCCTGATGTACTTGAGGCCATATTTTCCACTGGAACTCGTCT
TTGTCATACCCCCCGCGGTTTCGGGTGCCTTTTTGGTGATTTCATTTTTTACCCGCCGAG
CAATCCATTGACTGTTACATTCATAATCTTATCCCATGAGAATTTTACTCACTCAAGCTA
CGCAAGGAGGGATATTCAGTAATCGATTTTGAATCGCTTCCTTGGGAAAATTTAGTTAAA
GATGCAGTGGATTTAGAAGAGACAAGAAGACATGCACATCGGGTGAAGTACACTGAATCT
AACTGGTTTTGCACATTATGCGGAGTTGGCATTGTACCCAGAATAATGCCGTGCGGAGTG
TATCATAGCGAAACGTCTGAAGGCCAAATCTTTGACGGTTTTACTAAGCATATGAAGAGT
AGAGATCATGCGGAACATGAGATGGAGAGGGTGAGATGTCCTTTAAGCATTGATATGGAG
CGTCTTTATTATGCTAAAGTTGTTAAAGGAAAAACTGAAGATGGTGGAGAAGAAGAAGAA
GAAGAAGAAGAAG

QA 3 855 3 855
DS 



AS 2 4

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TTTGTAGTTTGTGGAACATGTTTTGAATGGTTTAAGACAATGGTTTGAAATTTGGTTCTT
GG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 

AF RS1BN83JQ C 1
AF RS1BN83TF U 1
BS 1 542 RS1BN83TF

RD RS1BN83JQ 542 0 0
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TGATCCTCCTCCAAGGCCGTTACGCCGGCAAGAAGGCGGTGATCATCCGCTCCTTCGACG
ACGGGAACCGCGAGCGACCTTATGGACACTGCCCCGTCGCGAGACTCAAGAAGTACCCGA
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TCATCAAGGTCGTGAACTACCAGCATCTGATGCCTACTCGTTACACGCTCGACGTGGATC
TGAAGGAGGTGGCGACACTCGAGGCTCTGTCTTCGAAGGATAAGAAGGTGGCGGCTCTTA
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CCAAGCTCAGGTTTTGAGAAGTTTTGTCGTTTTTTCTGTAATGGAATCTACAGTATGGTT
TTTGTAGTTTGTGGAACATGTTTTGAATGGTTTAAGACAATGGTTTGAAATTTGGTTCTT
GG

QA 1 542 1 542
DS 

RD RS1BN83TF 542 0 0
GGAGAGGGAGCTTGGGAGAGAGAGAAGCCATGGTTAAGTTCCTAAAGCAGAACAAAGCGG
TGATCCTCCTCCAAGGCCGTTACGCCGGCAAGAAGGCGGTGATCATCCGCTCCTTCGACG
ACGGGAACCGCGAGCGACCTTATGGACACTGCCCCGTCGCGAGACTCAAGAAGTACCCGA
GCAAGGTGATCCGCAAGGACTCGGCCAAGAAGACGGCCAAGAAGTCGAGGGTCAAGTGCT
TCATCAAGGTCGTGAACTACCAGCATCTGATGCCTACTCGTTACACGCTCGACGTGGATC
TGAAGGAGGTGGCGACACTCGAGGCTCTGTCTTCGAAGGATAAGAAGGTGGCGGCTCTTA
AGGAGGCCAAGGCTAAGCTCGAGGAGAGGTTCAAGACTGGGAAGAACAGGTGGTTCTTCA
CCAAGCTCAGGTTTTGAGAAGTTTTGTCGTTTTTTCTGTAATGGAATCTACAGTATGGTT
TTTGTAGTTTGTGGAACATGTTTTGAATGGTTTAAGACAATGGTTTGAAATTTGGTTCTT
GG

QA 1 542 1 542
DS 



CO CL2341Contig2 551 2 2 U
GGGGTGTGAGAGAGAGAGAAGAAGCCATGGTTAAGTTCCTAAAGCAGAACAAAGCGGTGA
TCCTCCTCCAAGGCCGTTACGCCGGCAAGAAGGCGGTGATCATCCGCTCCTTCGACGACG
GAAACCGCGAGCGACCATACGGACACTGCCTCGTCGCAGGACTCAAGAAGTACCCGAGCA
AGGTCATCCGCAAGGACTCAGCCAAGAAGACGGCGAAGAAGTCGAGGGTCAAGTGCTTCA
TCAAGGTCGTGAACTACCAGCATCTGATGCCTACTCGTTACACGCTCGACGTGGATCTGA
AGGAGGTGGCGACTCTCGAAGCTCTGTCTTCGAAGGATAAGAAGGTGGCGGCTCTTAAGG
AGGCCAAGGCTAAGCTCGAGGAGAGGTTCAAGACTGGGAAGAACAGGTGGTTCTTCACCA
AGCTCAGGTTTTGAGAAAGTTTTATCGTTTTTGTAACGGAATCTACAGTATGCTTTTTGT
AGTTTTGTCGGAACATGTTTTGGATGGTTTAAGACTTATGGTTTGATATTTGATTCTTGG
AATTTTTGTTC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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AATTTTTGTTC

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BQ
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AF RS1A354TF U 205
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GGTGGCCGCTCTGTTCGCGATGAGCGTTCCTTCTGGTGGGTCTTTGCTTTCTATGGATGT
TCGGGACGGTTTTTGATGTCGTGGCTCGTGGGTGGTCGGCTCTTAGGGTTGGGTTTATAT
CGGTATTGTTCTAGATTTAAGCCTTTGTTCATCGCCTTTGTCGCCGTGGTTCGGTTAGGT
TCTTCGGCTCTGTCTAGAGGTGGTTCTCTGCTATCTCTTGGGACGGGAATCTCTCTTCTT
CTTGGGATTTGGTTCATCGGTTCTGTTTGGCGTCGAACTGGCCCAACTCCTCTTCCTAGT
GGTTAGGTGAGATCCGGTGATTTGTTACCTGGAGGCGAGTCTAGAGTTTTGGTGTGTA

QA 1 538 1 538
DS 

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CTATTAAATTAAAATTTGTCACTAGTCTATATCGAATCACACAATCAAATTATATAGATA
TCAGTTAAATGATATAACCACATCGGCAGTTTTCAACCCAAACCATAACAAAGATAAAGG
AGAGGAAAAAAAGATTTTACTAGTCTCTCCTCACCTTATCTCCTTCTCGACCACAAAAAA
AAACTTTGAAGTTCTTCACCGGTGTTGGCGGCGTGCCAGCGCCGGTGTCTCCGTCTCTTC
CCCTTCCTTTTTCACTTTTTCTGCTCTTCAAGTTCATGGCGATTCTTCCGGGATACTCCA
GTTTCTGGGTTGTATATTCTCTCTGGTGGCCGCTCTGTTCGCGATGAGCGTTCCTTCTGG
TGGGTCTTTGCTTTCTATGGATGTTCGGGACGGTTTTTGATGTCGTGGCTCGTGGGTGGT
CGGCTCTTAGGGTTGGGTTTATATCGGTATTGTTCTAGATTTAAGCCTTTGTTCATCGCC
TTTGTCGCCGTGGTTCGGTTAGGTTCTTCGGCTCTGTCTAGAGGTGGTTCTCTGCTATCT
CTTGGGACGGGAATCTCTCTTCTTCTTGGGATTTGGTTCATCGGTTCTGTTTGGCGTCGA
ACTGGCCCAACTCCTCTTCCTAGTGGTTAGGTGAGATCCGGTGATTTGTTACCTGGAGGC
GAGTCTAGAGTTTTGGTGTGTAGAAAGAATTGGCACAAGACTCTGTCCAGATTTGCGTTT
GTGTTCTCGATAGTGTATCCGCTTGCTCA

QA 1 809 1 809
DS 



AS 1 2

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TCAGCAGCGGTTGCTAATGAGACCTTTGGAGCTCCTTCTTTCGTTGATGCAGTGATGAGG
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TCTTTCATCAACGGGTTTGAGGTTATGAAGCTTAAAAATGATGAGAGGAGTCTTGATGCT
TCTGATGCTGTTTCTCCGACGACGCGTAAAAAGAGTTCGAAACTGAGTGTTGGGTTGATA
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AATCTCGCCAAGGTCTAGCTGAGTTCAAGACAGAGATAGAGATGCTGTCTCAGTTCAGAC
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ATGAGAATTTCATGGCTAAAGTTGCGGATTTTGGATTGTCTAAGACTGGTCCTGATCTAG
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TGACTAGACAGCAACTGACTGAGAAGTCAGATGTTTACTCTTTTGGTGTGGTGATGCTTG
AAGTACTATGTGGGAGACCAGTGATTGATCCATCTCTTCCGAGGGAGAAAGTGAATTTGA
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ATGGGAAAGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E546JQ U 1
AF RS1DL95TF U 648
BS 1 677 RS1E546JQ
BS 678 678 RS1DL95TF
BS 679 767 RS1E546JQ
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BS 769 841 RS1E546JQ
BS 842 1390 RS1DL95TF

RD RS1E546JQ 841 0 0
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GGTTTTGACTACTTTCTACGGTTCCACTTCTGTAACATCATAGTGGATCCTTTAGGGATC
GAGCGTGAGATAAACTTTGAAATATATGTGAACTCGGAGAGAGTTGAGTCCATTGATATG
TCAGCAGCGGTTGCTAATGAGACCTTTGGAGCTCCTTCTTTCGTTGATGCAGTGATGAGG
AATGTGGATAAAGGGTCACTGAATCTATCTATTGGTGGAGTTCAGAATCTTTACCCTGTT
TCTTTCATCAACGGGTTTGAGGTTATGAAGCTTAAAAATGATGAGAGGAGTCTTGATGCT
TCTGATGCTGTTTCTCCGACGACGCGTAAAAAGAGTTCGAAACTGAGTGTTGGGTTGATA
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TGTATAAGGAGAAGAAGTAGACAAATACAGACTGGAGATGAGGAGATAAAGGAGAATGAA
ACAGGTGAGAGCTTAATCTTTTCAAGCTCAAAGATCGGTTATCGATACCCTTTGGCTTTA
ATCAAAGAAGCAACTAATGACTTCAATGAGAGTCTAGTGATTGGAGTTGGTGGGTTTGGT
AAAGTCTACAAAGGAGTCTTGAGCGACAAGACCGAGATAGCTGTGAAGCGTGCTGCTCAA
AATCTCGCCAAGGTCTAGCTGAGTTCAAGACAGAGATAGAGATGCTGTCTCAGTTCAGAC
A

QA 1 841 1 841
DS 

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G
CCTTTGGCTTTAATCAAAGAAGCAACTAACGACTTCAATGAGAGTCTAGTGATTGGAGTT
GGTGGGTTTGGTAAAGTCTACAAAGGTGTCTTGAGCGACAAGACCGAGATAGCTGTGAAA
CGTGCTGCTCAAAATCTCGCCAAGGTCTAGCTGAGTTCAAGACAGAGATAGGGATGCTGT
CTCAGTTCAGACACAGGCATTTGGTGTCTTTGATCGGGTATTGCGATGAGAACAGCGAGA
TGATCATTGTGTATGAGTATATGGAGAAAGGAACGCTTAAGGATCATCTGTATGACTCAG
AGAACCAAAGGTTGAGCTGGAGACAGAGGCTTGAGATATGTGTTGGTGCAGCTAGAGGGC
TTCACTATCTCCACACAGGCTCAGCAAGAGCGGTCATACACCGCGATGTGAAGTCTGCTA
ACATTCTGTTAGATGAGAATTTCATGGCTAAAGTTGCGGATTTTGGATTGTCTAAGACTG
GTCCTGATCTAGACCAGACACATGTGAGTACCGCGGTTAAAGGAAGCTTTGGTTATCTTG
ATCCAGAGTATTTGACTAGACAGCAACTGACTGAGAAGTCAGATGTTTACTCTTTTGGTG
TGGTGATGCTTGAAGTACTATGTGGGAGACCAGTGATTGATCCATCTCTTCCGAGGGAGA
AAGTGAATTTGATCGAATGGGGGATGAGTTGGTGAGAAAGGAAGATGGGAGAGATCTTGG
ACCCTTTTCTTGATGGGAAAGT

QA 2 743 2 743
DS 



AS 1 4

CO CL2344Contig1 800 4 9 U
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GCAGAGCCTCTGGAGCTTTGCATTGTGGTATCAACAATGGAGGATGCTGGAGAGAAACCC
GAGGCAGCTACACTTACTCTGCTTGCGTAGATGATCATTCAAATGGTTGCAAATGCCCAC
TTGGGTTCAAGGGCGATGGAGTGAAGAGCTGTGAAGATGTGGACGAGTGCAAAGAAAAAA
AGGTTTGCCAGTGCGCAGACTGTAAATGTAAAAACACATGGGGAAGTTATGAATGCAGCT
GCAAGAATGGTTTGCTCTACATGCGTGAACACGACACGTGTATAGGTTCAAACAAAGTTG
GAACTACAAAGCTCAGCTGGAGCTTTTTGTGGTTTCTTATAATCGGAGTGGGTGTTGCAG
GTCTTGCCGGATATGCCGTCTACAAATACAGGATCAGGACTTACATGGATGCGGAGATAA
GAGGCATCATGGCGCAGTACATGCCATTGGAGAGCCAACCTACCCCAAGTGGTCCTCATA
TGGATATATGAGTGAAGTTGTCAACACAAACCAAGATACTCTCTTTCCACGGGAAGCTTC
TTCTGTGTTTCTTCCATGTAAATGAATCTAATAGACTTGAGAGAAGCCACACAAAAAATA
ATAATTTAAGTGTACTCAGCGCTTTTTGTAAGGGATGTGGATTTGAAGATGGAATCACTC
TTTTGTCTGCAATTACTCTTGCAATGTAAAATAAAGACTTTAATGGATGAATAAATAAGT
AGGAGAGTTTGCATCTATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FC14TF U 1
AF RS1FC14JQ C 138
AF RS1AS17JQ C 286
AF RS1AS17TF U 286
BS 1 356 RS1FC14TF
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BS 358 401 RS1FC14TF
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BS 448 793 RS1AS17TF
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RD RS1FC14TF 447 0 0
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GAGGCAGCTACACTTACTCTGCTTGCGTAGATGATCATTCAAATGGTTGCAAATGCCCAC
TTGGGTTCAAGGGCGATGGAGTGAAGAGCTGTGAAGATGTGGACGAGTGCAAAGAAAAAA
AGGTTTGCCAGTGCGCAGACTGTAAATGTAAAAACACATGGGGAAGTTATGAATGCAGCT
GCAAGAATGGTTTGCTCTACATGCGTGAACACGACACGTGTATAGGTTCAAACAAATTTG
GAACTACAAAGCTCAGCTGGAGCTTTTTGTGGTTTCTTATA*TCGGAGTGGGTGTTGCAG
*TCTTGCCGGATATGCCGTCTACAAAT

QA 1 447 1 447
DS 

RD RS1FC14JQ 658 0 0
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GGAGTGAAGAGCTGTGAAGATGTGGACGAGTGCAAAGAAAAAAAGGTTTGCCAGTGCGCA
GACTGTAAATGTAAAAACACATGGGGAAGTTATGAATGCAGCTGCAAGAATGGTTTGCTC
TACATGCGTGAACACGACACGTGTATAGGTTCAAACAAATTTGGAACTACAAAGCTCAGC
TGGAGCTTTTTGTGGTTTTTTATAATCGGAGTGGGTGTTGCAGGTCTTGCCGGATATGCC
GTCTACAAATACAGGATCAGGACTTACATGGATGCGGAGATAAGAGGCATCATGGCGCAG
TACATGCCATTGGAGAGCCAACCTACCCCAAGTGGTCCTCATATGGATATATGAGTGAAG
TTGTCAACACAAACCAAGATACTCTCTTTCCACGGGAAGCTTTTTCTGTGTTTTTTCCAT
GTAAATGAATCTAATAGACTTGAGAGAAGCCACACAAAAAATAATAATTTAAGTGTACTC
AGCGCTTTTTGTAAGGGATGTGGATTTGAAGATGGAATCACTCTTTTGTCTGCAATTACT
CTTGCAATGTAGAATAAAGACTTTAATGGATGAATAAATAAGTAGGAGAGTTTGCA
CC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RS1AS17JQ 515 0 0
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GTTCAAACAAAGTTGGAACTACAAAGCTCAGCTGGAGCTTTTTGTGGTTTCTTATAATCG
GAGTGGGTGTTGCAGGTCTTGCCGGATATGCCGTCTACAAATACAGGATCAGGACTTACA
TGGATGCGGAGATAAGAGGCATCATGGCGCAGTACATGCCATTGGAGAGCCAACCTACCC
CAAGTGGTCCTCATATGGATATATGAGTGAAGTTGTCAACACAAACCAAGATACTCTCTT
TCCACGGGAAGCTTCTTCTGTGTTTCTTCCATGTAAATGAATCTAATAGACTTGAGAGAA
GCCACACAAAAAATAATAATTTAAGTGTACTCAGCGCTTTTTGTAAGGGATGTGGATTTG
AAGATGGAATCACTCTTTTGTCTGCAATTACTCTTGCAATGTAAAATAAAGACTTTAATG
GATGAATAAATAAGTAGGAGAGTTTGCATCTATAT

QA 1 515 1 515
DS 

RD RS1AS17TF 515 0 0
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GTTCAAACAAAGTTGGAACTACAAAGCTCAGCTGGAGCTTTTTGTGGTTTCTTATAATCG
GAGTGGGTGTTGCAGGTCTTGCCGGATATGCCGTCTACAAATACAGGATCAGGACTTACA
TGGATGCGGAGATAAGAGGCATCATGGCGCAGTACATGCCATTGGAGAGCCAACCTACCC
CAAGTGGTCCTCATATGGATATATGAGTGAAGTTGTCAACACAAACCAAGATACTCTCTT
TCCACGGGAAGCTTCTTCTGTGTTTCTTCCATGTAAATGAATCTAATAGACTTGAGAGAA
GCCACACAAAAAATAATAATTTAAGTGTACTCAGCGCTTTTTGTAAGGGATGTGGATTTG
AAGATGGAATCACTCTTTTGTCTGCAATTACTCTTGCAATGTAAAATAAAGACTTTAATG
GATGAATAAATAAGTAGGAGAGTTTGCA
TCTATAT

QA 1 508 1 508
DS 



AS 1 4

CO CL2345Contig1 931 4 5 U
GCTTGGGAGATAATACTAGAAAAATCTAAAGCATCATTCTCAACCAATGTTTTTTCTTCT
ACCAAACCAGAAGCATTGAACCATATCTCTCATGGTGTTAAAAAAAACGCAACAATCCTA
TGCAAATGCATAAGATACACACCATACACAACAACCAAACCTACGCAACCCAGAAGAAAA
GAGTCAGAAACACTCAGCGGCTTACAGATAAAGAGAGAGAATCCCAAATACTGAGAGATG
CGGAGACAACTCCCGAACCAAATGAAACACAATCAGAAACGTCTTCTCGGGCTTCTTGAA
CGCTGTGACCTCCCAGACCTCATGTTCCTTCTCCTGTAAGATCCAGCATTGGGTCCGTTG
CTGAAGGCCCAGTCAACGCTGACGTTCTGTGTAAGAAGCTCGGCACCATTCATTGCCTTG
ATAGCATTCTGTGCTTCTTCGCTCTTCTCATATTCAATCAAAGCATAGCCCTTGACAAAA
CCAGTACGGCGATCTAGATTGAGATGCAAACTCTTAATCTCCCCAAAATCACCAAAGGCA
TTGGATATATCATCTTCCTGTGCCTCCTCATGAACTCCAGTGACCAAAATGATCCACCCC
TCGATGGATCGCTGAGGGCCAGGACCACCATCGGAACCGAGTGAGTCGAAATCTCGGGAG
GAAAGGCGGCGCTGGCGATCGGAATCCTTCTCCTCGCGAAAGCCACGGCCTTTGG*TTTT
CCTCTGAGCTGAATCGTCGTTTGCTCCGGCGATTGTAGACCTAAGCCGCGGATTGGCTGC
GCGTGGGGGAGAGATCAGCTGCTGCACTGTCTTCGTCCATCAGGTCATCCTCCTCCGGCT
CGAAATCGACTGCTTCGGGTTCTAGGTTCGCCATGGCTTACTCCGCCGCCGCCGTCGTGG
ATGCCGATCAAATCTTCTCCCCTGTTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B025JQ U 1
AF RS1B025TF C 57
AF RS1AN17JQ U 42
AF RS1AN17TF C 77
BS 1 563 RS1B025JQ
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RD RS1B025JQ 732 0 0
GCTTGGGAGATAATACTAGAAAAATCTAAAGCATCATTCTCAACCAATGTTTTTTCTTCT
ACCAAACCAGAAGCATTGAACCATATCTCTCATGGTGTTAAAAAAAACGCAACAATCCTA
TGCAAATGCATAAGATACACACCATACACAACAACCAAACCTACGCAACCCAGAAGAAAA
GAGTCAGAAACACTCAGCGGCTTACAGATAAAGAGAGAGAATCCCAAATACTGAGAGATG
CGGAGACAACTCCCGAACCAAATGAAACACAATCAGAAACGTCTTCTCGGGCTTCTTGAA
CGCTGTGACCTCCCAGACCTCATGTTCCTTCTCCTGTAAGATCCAGCATTGGGTCCGTTG
CTGAAGGCCCAGTCAACGCTGACGTTCTGTGTAAGAAGCTCGGCACCATTCATTGCCTTG
ATAGCATTCTGTGCTTCTTCGCTCTTCTCATATTCAATCAAAGCATAGCCCTTGACAAAA
CCAGTACGGCGATCTAGATTGAGATGCAAACTCTTAATCTCCCCAAAATCACCAAAGGCA
TTGGATATATCATCTTCCTGTGCTTCCTCATGAACTCCAGTGACCAAAATGATCCACCCC
TCGATGGATCGCTGAGGGCCAGGACCACCATCGGAACCGAGTGAGTCGAAATCTCGGGAG
GAAAGGCGGCGCTGGCGATCGGAATCCTTCTCCTCGCGAAAGCCACGGCCTTTGG*TTTT
CCTCTGAGCTGA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1B025TF 689 0 0
C
TCTACCAAACCAGAAGCATTGAACCATATCTCTCATGGTGTTAAAAAAA*CGCAACAATC
*TATGCAAATGCATAAGATACACACCATACACAACAACCAAACCTACGCAACCCAGAAGA
AAAGAGTCAGAAACACTCAGCGGCTTACAGATAAAGAGAGAGAATCCCAAATACTGAGAG
ATGCGGAGACAACTCCCGAACCAAATGAAACACAATCAGAAACGTCTTCTCGGGCTTCTT
GAACGCTGTGACCTCCCAGACCTCATGTTCCTTCTCCTGTAAGATCCAGCATTGGGTCCG
TTGCTGAAGGCCCAGTCAACGCTGACGTTCTGTGTAAGAAGCTCGGCACCATTCATTGCC
TTGATAGCATTCTGTGCTTCTTCGCTCTTCTCATATTCAATCAAAGCATAGCCCTTGACA
AAACCAGTACGGCGATCTAGATTGAGATGCAAACTCTTAATCTCCCCAAAATCACCAAAG
GCATTGGATATATCATCTTCCTGTGCTTCCTCATGAACTCCAGTGACCAAAATGATCCAC
CCCTCGATGGATCGCTGAGGGCCAGGACCACCATCGGAACCGAGTGAGTCGAAATCTCGG
GAGGAAAGGCGGCGCTGGCGATCGGAATCCTTCTCCTCGCGAAAGCCACGGCCTTTGG*T
TTTCCTCTGAGCTGAATCGTCGTTTGC
C

QA 2 688 2 688
DS 

RD RS1AN17JQ 882 0 0
GG
CCAATGTTTTTTCTTCTACCAAACCAGAAGCATTGAACCATATCTCTCATGGTGTTAAAA
AAAACGCAACAATCCTATGCAAATGCATAAGATACACACCATACACAACAACCAAACCTA
CGCAACCCAGAAGAAAAGAGTCAGAAACACTCAGCGGCTTACAGATAAAGAGAGAGAATC
CCAAATACTGAGAGATGCGGAGACAACTCCCGAACCAAATGAAACACAATCAGAAACGTC
TTCTCGGGCTTCTTGAACGCTGTGACCTCCCAGACCTCATGTTCCTTCTCCTGTAAGATC
CAGCATTGGGTCCGTTGCTGAAGGCCCAGTCAACGCTGACGTTCTGTGTAAGAAGCTCGG
CACCATTCATTGCCTTGATAGCATTCTGTGCTTCTTCGCTCTTCTCATATTCAATCAAAG
CATAGCCCTTGACAAAACCAGTACGGCGATCTAGATTGGGATGCAAACTCTTAATCTCCC
CAAAATCACCAAAGGCATTGGATATATCATCTTCCTGTGCCTCCTCATGAACTCCAGTGA
CCAAAATGATCCACCCCTCGATGGATCGCTGAGGGCCAGGACCACCATCGGAACCGAGTG
AGTCGAAATCTCGGGAGGAAAGGCGGCGCTGGCGATCGGAATCCTTCTCCTCGCGAAAGC
CACGGCCTTTGGGTTTTCCTCTGAGCTGAATCGTCGTTTGCTCCGGCGATTGTAGACCTA
AGCCGCGGATTGGCTGCGCGTGGGGGAGAGATCAGCTGCTGCACTGTCTTCGTCCATCAG
GTCATCCTCCTCCGGCTCGAAATCGACTGCTTCGGGTTCTAGGTTCGCCATGGCTTACTC
CGCCGCCGCCGTCGTGGATGCCGATCAAATCTTCTCCCCT

QA 3 882 3 882
DS 

RD RS1AN17TF 855 0 0
TGAACCATATCTCTCATGGTGTTAAAAAAA*CGCAACAATC*TATGCAAATGCATAAGAT
ACACACCATACACAACAACCAAACCTACGCAACCCAGAAGAAAAGAGTCAGAAACACTCA
GCGGCTTACAGATAAAGAGAGAGAATCCCAAATACTGAGAGATGCGGAGACAACTCCCGA
ACCAAATGAAACACAATCAGAAACGTCTTCTCGGGCTTCTTGAACGCTGTGACCTCCCAG
ACCTCATGTTCCTTCTCCTGTAAGATCCAGCATTGGGTCCGTTGCTGAAGGCCCAGTCAA
CGCTGACGTTCTGTGTAAGAAGCTCGGCACCATTCATTGCCTTGATAGCATTCTGTGCTT
CTTCGCTCTTCTCATATTCAATCAAAGCATAGCCCTTGACAAAACCAGTACGGCGATCTA
GATTGGGATGCAAACTCTTAATCTCCCCAAAATCACCAAAGGCATTGGATATATCATCTT
CCTGTGCCTCCTCATGAACTCCAGTGACCAAAATGATCCACCCCTCGATGGATCGCTGAG
GGCCAGGACCACCATCGGAACCGAGTGAGTCGAAATCTCGGGAGGAAAGGCGGCGCTGGC
GATCGGAATCCTTCTCCTCGCGAAAGCCACGGCCTTTGG*TTTTCCTCTGAGCTGAATCG
TCGTTTGCTCCGGCGATTGTAGACCTAAGCCGCGGATTGGCTGCGCGTGGGG*AGAGATC
AGCTGCTGCACTGTCTTCGTCCATCAGGTCATCCTCCTCCGGCTCGAAATCGACTGCTTC
GGGTTCTAGGTTCGCCATGGCTTACTCCGCCGCCGCCGTCGTGGATGCCGATCAAATCTT
CTCCCCTGTTTTTCC

QA 1 855 1 855
DS 



AS 1 4

CO CL2346Contig1 567 4 1 U
CATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATCAGTCGACGGTACCGGACATATGCC
CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGATTACACAATATCATCAACAAAAAAAAAACTTT
CTCCAGGTTTCTGTTTCCCTTTTTTTTTGTAAAATGGAGTTTGAGACTTCCAAACGAGTC
CAGTCGGAGGAAGGAGACGAGAATTTAAAAGAGGAACAAGTGTGTAAGCAGCTACAACTG
AAATTGTCTGAAACGCAGCAGGCGCTGAACAAAAGAGCGGTTCTCAACCGCATCCTCAAC
CACAAATGTATTCACAAAATCAAGACTCTTCTTCACACCACCACCGCGGGTAGTAACAAG
GGATCCACCGTCGATGCTGATAACCGGTGGATTGATAGTGGGGATGTCTTCTCTTGCCCC
TGAACTCGGCTTAAAACTTGGACACGTGTATCAGTTTATGTCAACGTGTGTCGTGTTTGT
GATTCTCACTTGTGTCTTCTTGTTGTCTTGTGATGAATCATCTTTGTAGATCTCAATGTT
GATGAATTAACGATCACCGTTGATCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1A182TF U 1
AF RS1A182TR C 86
AF RS1A182TV U 83
AF RS1A182JQ C 86
BS 1 567 RS1A182TF

RD RS1A182TF 567 0 0
CATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATCAGTCGACGGTACCGGACATATGCC
CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGATTACACAATATCATCAACAAAAAAAAAACTTT
CTCCAGGTTTCTGTTTCCCTTTTTTTTTGTAAAATGGAGTTTGAGACTTCCAAACGAGTC
CAGTCGGAGGAAGGAGACGAGAATTTAAAAGAGGAACAAGTGTGTAAGCAGCTACAACTG
AAATTGTCTGAAACGCAGCAGGCGCTGAACAAAAGAGCGGTTCTCAACCGCATCCTCAAC
CACAAATGTATTCACAAAATCAAGACTCTTCTTCACACCACCACCGCGGGTAGTAACAAG
GGATCCACCGTCGATGCTGATAACCGGTGGATTGATAGTGGGGATGTCTTCTCTTGCCCC
TGAACTCGGCTTAAAACTTGGACACGTGTATCAGTTTATGTCAACGTGTGTCGTGTTTGT
GATTCTCACTTGTGTCTTCTTGTTGTCTTGTGATGAATCATCTTTGTAGATCTCAATGTT
GATGAATTAACGATCACCGTTGATCTC

QA 1 567 1 567
DS 

RD RS1A182TR 482 0 0
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TTTGTAAAATGGAGTTTGAGACTTCCAAACGAGTCCAGTCGGAGGAAGGAGACGAGAATT
TAAAAGAGGAACAAGTGTGTAAGCAGCTACAACTGAAATTGTCTGAAACGCAGCAGGCGC
TGAACAAAAGAGCGGTTTTCAACCGCATCCTCAACCACAAATGTATTCACAAAATCAAGA
CTTTTCTTCACACCACCACCGCGGGTAGTAACAAGGGATCCACCGTCGATGCTGATAACC
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GTGTATCAGTTTATGTCAACGTGTGTCGTGTTTGTGATTCTCACTTGTGTCTTCTTGTTG
TCTTGTGATGAATCATCTTTGTAGATCTCAATGTTGATGAATTAACGATCACCGTTGATC
TC

QA 1 482 1 482
DS 

RD RS1A182TV 485 0 0
GGG
GGATTACACAATATCATCAACAAAAAAAAAACTTTCTCCAGGTTTCTGTTTCCCTTTTTT
TTTGTAAAATGGAGTTTGAGACTTCCAAACGAGTCCAGTCGGAGGAAGGAGACGAGAATT
TAAAAGAGGAACAAGTGTGTAAGCAGCTACAACTGAAATTGTCTGAAACGCAGCAGGCGC
TGAACAAAAGAGCGGTTCTCAACCGCATCCTCAACCACAAATGTATTCACAAAATCAAGA
CTCTTCTTCACACCACCACCGCGGGTAGTAACAAGGGATCCACCGTCGATGCTGATAACC
GGTGGATTGATAGTGGGGATGTCTTCTCTTGCCCCTGAACTCGGCTTAAAACTTGGACAC
GTGTATCAGTTTATGTCAACGTGTGTCGTGTTTGTGATTCTCACTTGTGTCTTCTTGTTG
TCTTGTGATGAATCATCTTTGTAGATCTCAATGTTGATGAATTAACGATCACCGTTGATC
TC

QA 4 485 4 485
DS 

RD RS1A182JQ 482 0 0
GGATTACACAATATCATCAACAAAAAAAAAACTTTCTCCAGGTTTCTGTTTCCCTTTTTT
TTTGTAAAATGGAGTTTGAGACTTCCAAACGAGTCCAGTCGGAGGAAGGAGACGAGAATT
TAAAAGAGGAACAAGTGTGTAAGCAGCTACAACTGAAATTGTCTGAAACGCAGCAGGCGC
TGAACAAAAGAGCGGTTCTCAACCGCATCCTCAACCACAAATGTATTCACAAAATCAAGA
CTCTTCTTCACACCACCACCGCGGGTAGTAACAAGGGATCCACCGTCGATGCTGATAACC
GGTGGATTGATAGTGGGGATGTCTTCTCTTGCCCCTGAACTCGGCTTAAAACTTGGACAC
GTGTATCAGTTTATGTCAACGTGTGTCGTGTTTGTGATTCTCACTTGTGTCTTCTTGTTG
TCTTGTGATGAATCATCTTTGTAGATCTCAATGTTGATGAATTAACGATCACCGTTGATC
TC

QA 1 482 1 482
DS 



AS 1 4

CO CL2347Contig1 568 4 7 U
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GTATAATTAACATAATAAAATGTCGTCTATTGGAGCAAACTACGCACAACTACAAGTCAT
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CATAGATGGTGGAGAGAGAGAAAGAGTTTCTTCCTCTGCCACTGGAAAGAGTGGTAACAG
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AATTATCTGTTGAATGTTTATGTTGATGTCCGGTCTGGTTTCCCTTTACACTGTGATAAT
AAGATTTGAGCTTCACTCCATAGTATCG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CS56TF U 147
AF RS1C775TF U 1
AF RS1GE81JQ C 1
AF RS1GE81TF U 1
BS 1 179 RS1C775TF
BS 180 180 RS1GE81TF
BS 181 349 RS1C775TF
BS 350 350 RS1GE81TF
BS 351 425 RS1C775TF
BS 426 426 RS1GE81TF
BS 427 568 RS1C775TF

RD RS1CS56TF 338 0 0
G
GAAGAAGAGACTAGAGATGGAGAAAGATTGCGGCATAGATGGTGGAGAGAGAGAAAGAGT
TTCTTCCTCTGTCACTGGAAAGAGTGGTAACAGAATATTTCCCGTCAAATCTTCTCAATC
GACGACTTACGAGGAAGAAGTAGGAAAACACCTGCAAGTGTGAGATTTATCTTCTGTTTA
AGAAGACTTTGTGTCTCTTCTTCTTTTCTTTTTAGACTTTGGGTCTTTGTGTGTGTGATG
TGATATAAGTGGTTGTCTTTGTGTCTAGGTTTTAAGTTACGTAACTTGTGCAGTTTGCTT
TGTTGGATGTTGATGTTGGTAAGTTGTATTAAAAATT

QA 2 338 2 338
DS 

RD RS1C775TF 568 0 0
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AGACTTTGGGTCTTTGTGTGTGTGATGTGATATAAGTGGTTGTCTTTGTGTCTAGGTTTT
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AAGATTTGAGCTTCACTCCATAGTATCG

QA 1 568 1 568
DS 

RD RS1GE81JQ 558 0 0
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GTATAATTAACATAATAAAATGTCGTCTATTGGAGCAAACTACGCACAACTACAAGTCAT
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GCAAGTGTGAGATTTATCTTCTGTTTAAGAAGACTTTGTGTCTCTTCTTTTTTTCTTTTT
AGACTTTGGGTCTTTGTGTGTGTGATGTGATATAAGTGGTTGTCTTTGTGTCTAGGTTTT
AAGTTTCGTAACTTGTGCAGTTTGCTTTGTTGGATGTTGATGTTGGTAAGTTGTATTAAA
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AAGATTTGAGCTTCACTC

QA 1 558 1 558
DS 

RD RS1GE81TF 558 0 0
GGATAACCAAACTCATCTTTACTTAATATTTTCAACACACTTAGTTCTCTTTGGTTTTTA
GTATAATTAACATAATAAAATGTCGTCTATTGGAGCAAACTACGCACAACTACAAGTCAT
GCAGAAGAAGCAGAAGGACAAAATGATGAAGAAGAGACTAGAGATGGAGAAAGATTGCGT
CATAGATGGTGGAGAGAGAGAAAGAGTTTCTTCCTCTGCCACTGGAAAGAGTGGTAACAG
AATATTTCCCGTCAAATCTTCTCAATCGACGACTTACGAGGAAGAAGTAGGAAAACACCA
GCAAGTGTGAGATTTATCTTCTGTTTAAGAAGACTTTGTGTCTCTTCTTTTTTTCTTTTT
AGACTTTGGGTCTTTGTGTGTGTGATGTGATATAAGTGGTTGTCTTTGTGTCTAGGTTTT
AAGTTTCGTAACTTGTGCAGTTTGCTTTGTTGGATGTTGATGTTGGTAAGTTGTATTAAA
AATTATCTGTTGAATGTTTATGTTGATGTCCGGTCTGGTTTCCCTTTACACTGTGATAAT
AAGATTTGAGCTTCACTC

QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 3

CO CL2348Contig1 966 3 21 U
TTTTTTCCTCCCATCATCACTAGTCACGACCAAACACAAAAAGGAAGAAACATATCATAT
AGAGAGAGAAAGAAGCACACCAGTGGCAGAACCGTAAATAAAAGATGTCTAAAGATTGCG
GCAACCACGGTGATGGCAAAGAAGCAGCCGTCCGGCGAATCTGCGGCGCCGTGATCGCCT
TCATCATAATAGTTCTAATCACCATCTTCCTAGTTTGGGTCATACTCAGGCCAACGAAGC
CAAGATTCATCCTCCAAGACGCCACCGTCTTCGCCTTCAACCTCTCGCAACCAAACCTCC
TCACCACAAACTTTCAGATCACATTCGCATCTCGTAACCCTAACTCCAAGATCGGTATCT
ACTACGACCGTCTCCACGTCTACGCTACGTACCATAACCAGCAGATAACTCTCAGGACAG
CAATCCCTCCGACGTACCAAGGGCACAAAGAAGACAACGTCCGGTCTCCGTTTGTGTACG
GAACCGCTGTTCCGATCGCACCGTACAACTCCGTCGCTTTGGCAGACGAACAAGGTCATG
GACTCGTTCGGTTGATGATACGCGCCGATGGGCGCGTGAGATGGAAAGTAGGGACGTTGA
TCACTGGAAAATATCATATCCATGTTCGGTGTCCGGCTATCATCGATCTTGGGAACAAAG
CTTCTGGTGTTATTGTCGGTGATAACGCCGTTAAGTATACGTTGATTACTAAATGCAGTG
TGAACGTTTAGAACTTTGACGCCGTTAAGTTGCTACTATCTACTTTTTGTTATTATTATA
TAATCAAATCATTTTCTATTTACGAAAACAAATTTTACCAAACTTCTCCTTCCACCAGCA
GGATAATAAGCTTATTGCTGATTACTATAGAATCATTACAAACACGAACGTTGAAATTAT
TGGCGGATTGGGTCTAGTTCTTTGTGCTTATTTTGTACTTTCCTAATAAATTTACTGCTT
CGCATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 
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20 20 10 10 10 10 

AF RS1F103TF U 1
AF RS1F023TF U 320
AF RS1F023JQ C 383
BS 1 394 RS1F103TF
BS 395 395 RS1F023TF
BS 396 461 RS1F103TF
BS 462 462 RS1F023TF
BS 463 529 RS1F103TF
BS 530 530 RS1F023TF
BS 531 533 RS1F103TF
BS 534 534 RS1F023TF
BS 535 544 RS1F103TF
BS 545 545 RS1F023TF
BS 546 593 RS1F103TF
BS 594 594 RS1F023TF
BS 595 598 RS1F103TF
BS 599 599 RS1F023TF
BS 600 604 RS1F103TF
BS 605 605 RS1F023TF
BS 606 610 RS1F103TF
BS 611 611 RS1F023TF
BS 612 631 RS1F103TF
BS 632 962 RS1F023TF
BS 963 966 RS1F023JQ

RD RS1F103TF 631 0 0
TTTTTTCCTCCCATCATCACTAGTCACGACCAAACACAAAAAGGAAGAAACATATCATAT
AGAGAGAGAAAGAAGCACACCAGTGGCAGAACCGTAAATAAAAGATGTCTAAAGATTGCG
GCAACCACGGTGATGGCAAAGAAGCAGCCGTCCGGCGAATCTGCGGCGCCGTGATCGCCT
TCATCATAATAGTTCTAATCACCATCTTCCTAGTTTGGGTCATACTCAGGCCAACGAAGC
CAAGATTCATCCTCCAAGACGCCACCGTCTTCGCCTTCAACCTCTCGCAACCAAACCTCC
TCACCACAAACTTTCAGATCACATTCGCATCTCGTAACCCTAACTCCAAGATCGGTATCT
ACTACGACCGTCTCCACGTCTACGCTACGTACCACAACCAGCAGATAACTCTCAGGACAG
CAATCCCTCCGACGTACCAAGGGCACAAAGAAGACAACGTCTGGTCTCCGTTTGTGTACG
GAACCGCTGTTCCGATCGCACCGTACAACTCCGTCGCTTTGGCAGACGAGCAAAGTCATG
GACTAGTTCGGTTGATGATACGCGCCGATGGGCGCGTGAGATGGAAAGTAGGG*CGTTAA
TCACCGGAAA*TATCATATCCATGTTCGGTG

QA 1 631 1 631
DS 

RD RS1F023TF 645 0 0
G
ACATTCGCATCTCGTAACCCTAACTCCAAGATCGGTATCTACTACGACCGTCTCCACGTC
TACGCTACGTACCATAACCAGCAGATAACTCTCAGGACAGCAATCCCTCCGACGTACCAA
GGGCACAAAGAAGACAACGTCCGGTCTCCGTTTGTGTACGGAACCGCTGTTCCGATCGCA
CCGTACAACTCCGTCGCTTTGGCAGACGAACAAGGTCATGGACTCGTTCGGTTGATGATA
CGCGCCGATGGGCGCGTGAGATGGAAAGTAGGGACGTTGATCACTGGAAAATATCATATC
CATGTTCGGTGTCCGGCTATCATCGATCTTGGGAACAAAGCTTCTGGTGTTATTGTCGGT
GATAACGCCGTTAAGTATACGTTGATTACTAAATGCAGTGTGAACGTTTAGAACTTTGAC
GCCGTTAAGTTGCTACTATCTACTTTTTGTTATTATTATATAATCAAATCATTTTCTATT
TACGAAAACAAATTTTACCAAACTTCTCCTTCCACCAGCAGGATAATAAGCTTATTGCTG
ATTACTATAGAATCATTACAAACACGAACGTTGAAATTATTGGCGGATTGGGTCTAGTTC
TTTGTGCTTATTTTGTACTTTCCTAATAAATTTACTGCTTCG
CA

QA 2 643 2 643
DS 

RD RS1F023JQ 584 0 0
CGCTACGTACCATAACCAGCAGATAACTCTCAGGACAGCAATCCCTCCGACGTACCAAGG
GCACAAAGAAGACAACGTCCGGTCTCCGTTTGTGTACGGAACCGCTGTTCCGATCGCACC
GTACAACTCCGTCGCTTTGGCAGACGAACAAGGTCATGGACTCGTTCGGTTGATGATACG
CGCCGATGGGCGCGTGAGATGGAAAGTAGGGACGTTGATCACTGGAAAATATCATATCCA
TGTTCGGTGTCCGGCTATCATCGATTTTGGGAACAAAGCTTTTGGTGTTATTGTCGGTGA
TAACGCCGTTAAGTATACGTTGATTACTAAATGCAGTGTGAACGTTTAGAACTTTGACGC
CGTTAAGTTGCTACTATTTACTTTTTGTTATTATTATATAATCAAATCATTTTTTATTTA
CGAAAACAAATTTTACCAAACTTCTCCTTCCCCCAGCAGGATAATAAGCTTATTGCTGAT
TACTATAGAATCATTACAAACACGAACGTTGAAATTATTGGGGGATTGGGTCTAGTTCTT
TGTGCTTATTTTGTACTTTCCTAATAAATTTACTGCTTCGCATT

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 2

CO CL2349Contig1 603 2 5 U
AATTGAACAAAAAAGAATCATTCAAGATCAATGTCAAAGTCATCATCTTCAATCTTCTGA
CCGAACCCCCTTGGTCCAGCTTTGGCTCTCATTGGTTTCTTCTTGCCACTTTTCTTAGAC
TTCTTTGCTGCCTCTTCTTTCTCAAACTTCTCTCTCTCCCTCTTCCCAAGAAACTCAGTC
ACTCCTATGTAGACAGCACCAATGGTGAGAACACTGAGAGCAAGAAAAGCGACAATGAGA
AGCACTTGTATAATCAAAGCAACACCATCTTGACTACCACCACCAGAGACAATAGCTTCT
GTTGAAGAAGTATCAGAAGAAACTACCTCCTGGGATATCTCCTCTGGAGTTGCAGACAGT
CTCCATGATTGGTTTTCTTCCTGGTGAAGCAGAAGAAGAGCAGAAGCAGCTTGTAGTCTG
TCGGAAGACAAGATCTTTTTCCTCGAAACAGACCAAGAGAGTGGAGATAATTGGTGGGTT
TTAGCTGGATTTTGGAATCTTGGTCTGAAATTCGGAAGAGAGAGATATGGAGTTGTTGTC
GCAGACATCGTTCGTCCACCCTCTTATCTCTTCAGTTCCTAGACATAACCCACTTCGCTT
TCC


BQ
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10 10 10 

AF RS1CM70JQ U 39
AF RS1GI20TF C 1
BS 1 38 RS1GI20TF
BS 39 116 RS1CM70JQ
BS 117 117 RS1GI20TF
BS 118 146 RS1CM70JQ
BS 147 603 RS1GI20TF

RD RS1CM70JQ 108 0 0
GTCATCATCTTCAATCTTCTGACCGAACCCCCTTGGTCCAGCTTTGGCTCTCATTGGTTT
CTTCTTGCCACTTTTCTTGGACTTCTTTGCTGCCTCTTCTTTCTCAAA

QA 1 108 1 108
DS 

RD RS1GI20TF 603 0 0
AATTGAACAAAAAAGAATCATTCAAGATCAATGTCAAAGTCATCATCTTCAATCTTCTGA
CCGAACCCCTTTGGTCCAGCTTTGGCTCTCATTGGTTTCTTCTTGCCACTTTTCTTAGAC
TTCTTTGCTGCCTCTTCTTTCTCAAACTTCTCTCTCTCCCTCTTCCCAAGAAACTCAGTC
ACTCCTATGTAGACAGCACCAATGGTGAGAACACTGAGAGCAAGAAAAGCGACAATGAGA
AGCACTTGTATAATCAAAGCAACACCATCTTGACTACCACCACCAGAGACAATAGCTTCT
GTTGAAGAAGTATCAGAAGAAACTACCTCCTGGGATATCTCCTCTGGAGTTGCAGACAGT
CTCCATGATTGGTTTTCTTCCTGGTGAAGCAGAAGAAGAGCAGAAGCAGCTTGTAGTCTG
TCGGAAGACAAGATCTTTTTCCTCGAAACAGACCAAGAGAGTGGAGATAATTGGTGGGTT
TTAGCTGGATTTTGGAATCTTGGTCTGAAATTCGGAAGAGAGAGATATGGAGTTGTTGTC
GCAGACATCGTTCGTCCACCCTCTTATCTCTTCAGTTCCTAGACATAACCCACTTCGCTT
TCC

QA 1 603 1 603
DS 



AS 1 3

CO CL2350Contig1 876 3 9 U
GGAACTTTGAAGAGAGAGAGAGAATAGAATGGGAAGTGCTTCACTTGTCTTGTTTGCGCG
ACTCTCGGGTTTAGTAATAGCGGTTTTGGTTGTGCACTGGGCTCTGTTGCTCGTCCCTCA
TCAAGGCCTCACATACTCTACTCTTCATCCTCTGCTGATGGTGATTGGCTTCATTCTTGT
AAGTGGAGAAGCGATTCTGATACACAGATGGTTGCCTGGTTCAAGAAAAACGAAGAAAGC
AGTTCATCTATGGCTGCAAGGAATAGCATTGGTCTCTGGTGTGTTTGGGATATGGACAAA
GTTCCATTACCAATCTGGAGTTTTCTCAAACTTCTACAGTCTCCATTCTTGGATGGGTCT
ACTCTCTCTGTCTCTCTTCGCTGCTCAGTGGGTGACTGGATTCTTGAGCTTCTGGCATAG
AGGAGAAGTCCGGACAACAAGAACCACGTTTCTTCCATGGCATGTCTTCCTCGGACTTTA
CACCTACGGTCTAGCCATTGCCACCGCCGAGACCGGACTACTTGAGAAGCTCACTTTCCT
TCAGACAAAGCGAATCGTCCCAAGACGCTGTCATGAGTCAACGATCGTCAACGGTCTCGG
CCTAGGCTTGGTTCTGCTCAGTGGCGTTGTTATAACAGCCGCTGTTTTGCCAAAGTATCA
GAGCTATTCTGGTAATGAGAAACTAGTTTATTCATCTCAAGATCGTCCCAAATGTTTGAC
TTCTTAGAGTTCTTTTTTTTTCTTTTCAAATTTTAGTTTTGTATTTGATTTTGGTGACAA
CTACACACGTCTCTCTGGTTGTACAAATGAATGTATTATTACCGCATTGTGATGATGAGA
CTTGTGTCAACAAACTTGGCTCCTCCAACTTTTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BV87TF U 1
AF RS1BV13TF U 540
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G
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CG

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QA 1 824 1 824
DS 



AS 1 4

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ATGTGCCCCTGACAGTGCGACAATATCTTTATCAGACAAACCCATCCGGTAAAAGATATC
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TGAATCTTTTCTGCCAGGAACAAAACTGATGTCAGGTCCACCGGTCACTTCAACCGCTAC
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BQ
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AF RS1GZ41JQ U 1
AF RS1C517JQ U 64
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AF RS1GZ41TF C 451
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GGTGCAGTCTGTTATCGCCATAGTGACTGTAGACGTTGGTGTGAACCCGAGTTCTGAAAG
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AAGATGTTTGAAACCTTGATTAGCATCAGGAAGTCTTCCTTCGTCGGTGCAGGCATTTGA
ATCTTTTCTGCCAGGAACAAAACTG

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DS 

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CCTCTGATTCTTCTTCTTTCAGCAATTCCACAAAGTATGAGTTATCAAACTTTAGAGGAT
CTTCAGTCCATGGTCCATCGAAACCTGATCTCTCTGGATGAGCCCTTCCCAGAGTATGTG
CCCCTGACAGTGCGACAATATCTTTATCAGACAAACCCATCCGGTAAAAGATATCTTTAA
GATGTTTGAAACCTTGATTAGCATCAGGAAGTCTTCCTTCGTCGGTGCAGGCATTTGAAT
CTTTTCTGCCAGGAACAAAACTGATGTCAGGTCCACCGGTCACTTCAACCGCTACCACAC
CAGCAAGCTGGTACAGGTCCGCATAACTGATCTTGGGATGCTTAGTTTTCACGTCCTCAC
AGAGATCAAGTGCTATCTTCAAACCGCTGTTGGCACCATGACTGTACTCTGCTTCGTTCC
TAATAGAGCCATTAGGTCCACCGGTCTTGGATTCAGCATCATAGGTTCCAGCATCATGCC
ACGCCAAACGGAGCATGATCGGAGCGCAGTTCTTCTTGGCGATGAGAGCACGAAGTTCAC
GGCGAGCCTTGTCAATTTCCTTAAGGTACTCGGCGTCAACGATGAGTGCCGCCATTGTTA
GTCTTGAGTCTTTTTCC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RS1GZ41TF 591 0 0
TTCCACAAAGTATGAGTTATCAAACTTTAGAGGATCTTCAGTCCATGGTCCATCGAAAC*
TGATCTCTCTGGATGAGCCCTTCCCAGAGTATGTGCCCCTGACAGTGCCACAATATCTTT
GTCAGACAAACCCATCCGGTAGAAGACATCTTTCAGATGTTTGAAACCTTGATTAGCATC
AGGAAGTCTTCCTTCGTCGGTGCAGGCATTTGAATCTTTTCTGCCAGGAACAAAACTGAT
GTCAGGTCCACCGGTCACTTCAACCGCTACCACACCAGCAAGCTGGTACAGGTCCGCATA
ACTGATCTTGGGATGCTTAGTTTTCACGTCCTCACAAAGATCAAGTGCTATCTTCAAACC
GCTGTTGGCACCATGACTGTACTCTGCTTCGTTCCTAATAGAGCCATTAGGTCCACCGGT
CTTGGATTCAGCATCATAGGTTCCAGCATCATGCCACGCCAAACGGAGCATGATCGGAGC
GCAGTTCTTCTTGGCGATGAGAGCACGAAGTTCACGGCGAGCCTTGTCAATTTCCTTAAG
GTACTCGGCGTCAACGATGAGTGCCGCCATTGTTAGTCTTGAGTCTTTT
CC

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 4

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CAGAGAGATCGGAATGGACTCGCTGAAAGGAAAAGGCAAAGGACCGAAGGGAGCTTCCTC
CTCTTCCAAGATTGATCTCCTCAAGGAATGGACCAATTGGTCTCTGAAGAAGGCCAAAGT
CGCGACTCAATACGGATTCATCCCTCTCATCATCGTCATCGGCATGAACTCCGATCCCAA
GCCCCATCTCTTCCAGCTCCTTAGCCCTGTCTGATCCTCTTATTTCATCATCATCATCAT
CATCCTCAAAACAATCGTTTCCTATGTTTCCTGGTTTGGCTTCATATCTTCACGCGTCGT
TCTTGATTCGCCGGATCTTTGTAATGTTTTTTTAGTAGCTAAGTTTTCTTATTATACTCT
CCGCATTGGCATCAATTAGATTATGATAATTTGAGATCGAATTCATGCTATTTTGTGTTC
GCTGGGATTTTATTATTCAAAGTTTGACTTTTATATGTTCTTCTTTGAGAATTGAAAGTA
TAAGCTTGTTTTTCTAGTGTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D790JQ C 1
AF RS1CX30JQ C 81
AF RS1CX30TF U 81
AF RS1D790TF U 1
BS 1 81 RS1D790TF
BS 82 350 RS1CX30TF
BS 351 351 RS1D790TF
BS 352 554 RS1CX30TF
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RD RS1D790JQ 561 0 0
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GCCCCATCTCTTCCAGCTCCTTAGCCCTGTCTGATCCTCTTATTTCATCATCATCATCAT
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TAAGCTTGTTTTTCTAGTGTC

QA 1 561 1 561
DS 

RD RS1CX30JQ 474 0 0
G
GCTGAAAGGAAAAGGCAAAGGACCGAAGGGAGCTTCCTCCTCTTCCAAGATTGATCTCCT
CAAGGAATGGACCAATTGGTCTCTGAAGAAGGCCAAAGTCGCGACTCAATACGGATTCAT
CCCTCTCATCATCGTCATCGGCATGAACTCCGATCCCAAGCCCCATCTCTTCCAGCTCCT
TAGCCCTGTCTGATCCTCTTATTTCATCATCATCATCATCATCCTCAAAACAATCGTTTC
CTATGTTTCCTGGTTTGGCTTCATATCTTTACGCGTCGTTCTTGATTCGCCGGATCTTTG
TAATGTTTTTTTAGTAGCTAAGTTTTCTTATTATACTCTCCGCATTGGCATCAATTAGAT
TATGATAATTTGAGATCGAATTCATGCTATTTTGTGTTCGCTGGGATTTTATTATTCAAA
GTTTGACTTTTATATGTTCTTCTTTGAGAATTGAAAGTATAAGCTTGTTTTTC

QA 2 474 2 474
DS 

RD RS1CX30TF 474 0 0
G
GCTGAAAGGAAAAGGCAAAGGACCGAAGGGAGCTTCCTCCTCTTCCAAGATTGATCTCCT
CAAGGAATGGACCAATTGGTCTCTGAAGAAGGCCAAAGTCGCGACTCAATACGGATTCAT
CCCTCTCATCATCGTCATCGGCATGAACTCCGATCCCAAGCCCCATCTCTTCCAGCTCCT
TAGCCCTGTCTGATCCTCTTATTTCATCATCATCATCATCATCCTCAAAACAATCGTTTC
CTATGTTTCCTGGTTTGGCTTCATATCTTTACGCGTCGTTCTTGATTCGCCGGATCTTTG
TAATGTTTTTTTAGTAGCTAAGTTTTCTTATTATACTCTCCGCATTGGCATCAATTAGAT
TATGATAATTTGAGATCGAATTCATGCTATTTTGTGTTCGCTGGGATTTTATTATTCAAA
GTTTGACTTTTATATGTTCTTCTTTGAGAATTGAAAGTATAAGCTTGTTTTTC

QA 2 474 2 474
DS 

RD RS1D790TF 561 0 0
GAAAGAAAATTCTACGCAACCGAATCGGACATCGAAAGAGAGAGAGAGAAAGCGAAAACT
CAGAGAGATCGGAATGGACTCGCTGAAAGGAAAAGGCAAAGGACCGAAGGGAGCTTCCTC
CTCTTCCAAGATTGATCTCCTCAAGGAATGGACCAATTGGTCTCTGAAGAAGGCCAAAGT
CGCGACTCAATACGGATTCATCCCTCTCATCATCGTCATCGGCATGAACTCCGATCCCAA
GCCCCATCTCTTCCAGCTCCTTAGCCCTGTCTGATCCTCTTATTTCATCATCATCATCAT
CATCCTCAAAACAATCGTTTCCTATGTTTCCTGGTTTGGCT*CATATCTTCACGCGTCGT
TCTTGATTCGCCGGATCTTTGTAATGTTTTTTTAGTAGCTAAGTTTTCTTATTATACTCT
CCGTATTGGCATCAATTAGATTGTGATAATTTGAGATCGAATTCATGCTATTTTGTGTTC
GCTGGGATTTTATTATTCAAAGTTTGACTTTTATATGTTCTTCTTTGAGAATTGAAAGTA
TAAGCTTGTTTTTC
TAGTGTC

QA 1 554 1 554
DS 



AS 1 3

CO CL2353Contig1 945 3 10 U
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AATTTCTTCACCTCCGTCTTCTCCGACGACCCAGATCCTCCAGGAACCGAATCGGATTCC
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ATGAAAACCATAGCCGACAGATCCGAATCCGTGATCGAGACATACCGTCGAGATCTAGAA
GAGTTCGGGACAGGTCTAAAGAAAGAGATCGAAGTCGCGCAGGGATCGCTCGGCACCGTG
GGA*CACGCCATCGACGAGCTCGGCAACACGGTGATAAAAGGCACGGCTGAGATCATCGC
TCAAGGTAAAGAAGCGATCTTAACCGCCGGTGATAACGAATCCGATTCTTCTGATAACAA
CAATCTCAGTAGTAATCGTCGTGATAGCTTTAGCTCGAAGCCGTATAGTCGTTTCGATGC
TCAGGTTCGTGCCCTTCAAGGGGATGTGAGTACTTATGGCGAAGAGGCTGGTGAGGATTC
GGATGAGTATAGGAAGTGGGAAGCTGAGTTTTCAATTGGAGATAGGAGCGAGGAGATGGA
GATGTTGTTGGAAGGGAATGGAGATATGAGAGGAGTGTATAAGAGGGTTGTTCCTAGTGT
GGTTGATCACGAGACGTTTTGGTTTAGGTATTTTTATAAGGTTTATAAGCTCAAGCAAGC
TGAGGACTTGAGGGCTAATCTTGTGAAGCGAGCAGCTTTGGATGATGAGGAAGAGTTGAG
CTGGGATATTGATGATGAAGAGGAGACTGCTAGCGAAAAGTTGATGAAGTTGCCAAAGAT
GTTTCGAGATTGAACTTGAGGGATGATAGTGGAGACGTCAGCGAACTGTGACGATCAGTG
ACTGGAAGAGCGTTAAGATGATGTGACAGTGCAGATCAGTGTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ET79TF U 1
AF RS1FZ03TF U 123
AF RS1FP07TF U 123
BS 1 303 RS1ET79TF
BS 304 304 RS1FP07TF
BS 305 382 RS1ET79TF
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RD RS1ET79TF 599 0 0
GGGAATGTTCTGTTCTGTAGTAAAAGTTAAAAACCACCAAGATCTGAGCTTTCCGCCATG
AATTTCTTCACCTCCGTCTTCTCCGACGACCCAGATCCTCCAGGAACCGAATCGGATTCC
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ATGAAAACCATAGCCGACAGATCCGAATCCGTGATCGAGACATACCGTCGAGATCTAGAA
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GGAACACGCCATCGACGAGCTCGGCAACACGGTGATAAAAGGCACGGCTGAGATCATCGC
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TCAGGTTCGTGCCCTTCAAGGGGATGTGAGTACTTATAGCGAAGAGGCTGGTGAGGATTC
GGATGAGTATAGGAAGTGGGAAGCTGAGTTTTCAATTGGAGATAGGAGCGAGGAGATGG

QA 1 599 1 599
DS 

RD RS1FZ03TF 488 0 0
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GAAAACCATAGCCGACAGATCCGAATCCGTGATCGAGACATACCGTCGAGATCTAGAAGA
GTTCGGGACAGGTCTAAAGAAAGAGATCGAAGTCGCGCAGGGATCGCTCGGCACCGTGGG
A*CACGCCATCGACGAGCTCGGCAACACGGTGATAAAAGGCACGGCTGAGATCATCGCTC
AAGGTAAAGAAGCGATCTTAACCGCCGGTGATAACGAATCCGATTCTTCTGATAACAACA
ATCTCAGTAGTAATCGTCGTGATAGCTTTAGCTCGAAGCCGTATAGTCGTTTCGATGCTC
AGGTTCGTGCCCTTCAAGGGGATGTGAGTACTTATGGCGAAGAGGCTGGTGAGGATTCGG
ATGAGTATAGGAAGTGGGAAGCTGAGTTTTCAATTGGAGATAGGAGCGAGGAGATGGAGA
TGTTGTTG

QA 1 488 1 488
DS 

RD RS1FP07TF 823 0 0
GGATACAGAGCAATCTAATCCCAACGACGACGGCGGCGGATGGAGCTTCGGTGGTCTGAT
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GTTCGGGACAGGTCTAAAGAAAGAGATCGAAGTCGCGCAGGGATCGCTCGGCACCGTGGG
A*CACGCCATCGACGAGCTCGGCAACACGGTGATAAAAGGCACGGCTGAGATCATCGCTC
AAGGTAAAGAAGCGATCTTAACCGCCGGTGATAACGAATCCGATTCTTCTGATAACAACA
ATCTCAGTAGTAATCGTCGTGATAGCTTTAGCTCGAAGCCGTATAGTCGTTTCGATGCTC
AGGTTCGTGCCCTTCAAGGGGATGTGAGTACTTATGGCGAAGAGGCTGGTGAGGATTCGG
ATGAGTATAGGAAGTGGGAAGCTGAGTTTTCAATTGGAGATAGGAGCGAGGAGATGGAGA
TGTTGTTGGAAGGGAATGGAGATATGAGAGGAGTGTATAAGAGGGTTGTTCCTAGTGTGG
TTGATCACGAGACGTTTTGGTTTAGGTATTTTTATAAGGTTTATAAGCTCAAGCAAGCTG
AGGACTTGAGGGCTAATCTTGTGAAGCGAGCAGCTTTGGATGATGAGGAAGAGTTGAGCT
GGGATATTGATGATGAAGAGGAGACTGCTAGCGAAAAGTTGATGAAGTTGCCAAAGATGT
TTCGAGATTGAACTTGAGGGATGATAGTGGAGACGTCAGCGAACTGTGACGATCAGTGAC
TGGAAGAGCGTTAAGATGATGTGACAGTGCAGATCAGTGTCTG

QA 1 823 1 823
DS 



AS 1 2

CO CL2354Contig1 688 2 24 U
GGCTACCATCTCTGAATCAGATCTGATCTGTCTTGTCAGTTTCTAAACTAGTCCGATCGA
AGTGAGACTTCCTACACACACTCTCTGTCTCTCGCTCGAAACCCTATTCTTTCGTATATT
CTCAGGAGAAGTGACAAATGGATGCGTTTAGAAGACAAGCGAGTAAGCTCAGAGACCAAG
TCGCTAAGCAACAACTGGCTGTGATAAAGCAATTCAGTGGGACAGGCTACGAAAGCTCAG
ACGTAATGGTGATCGATGAGCTCGAAATGCAAAGGCATCATCAGCTCGAGAAGCTTTACC
GCTCTACTCGTTCCGCTAAGGAGTTCCAGAGAGAGCTTATCAAAGCAGCTGAGACATTTA
CTTCCATTGGGCTTAGACACATTGAAGCAGGAACCAAGTTGGCTGAAGACTGTTGTAAAT
ACGGAACAGAAAACAGTCAGAACATCGATGAGAATATTCTAGCCAAGGCTGCAGCTATAT
ACGGTGATGCTAGCAAACATGTTGAGAAAGAACAAGAAGACTTTAACAAGCTTTTGTACT
CTCAGGTTTTAGATCCTCTGAGAGCTATGGTTGCCGGTTCTCCTCTTGAAGATACTCGTC
ATTTAGCTCAACGTTACAGCCGCATGAGACAAGAAGCAGAGACTCATGCAGCGGAAGTAT
CTAGAAGGCAAGTGCGTGTAAGAGAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1D362TF U 1
AF RS1AO06TFB U 21
BS 1 82 RS1D362TF
BS 83 83 RS1AO06TFB
BS 84 253 RS1D362TF
BS 254 254 RS1AO06TFB
BS 255 313 RS1D362TF
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BS 315 335 RS1D362TF
BS 336 336 RS1AO06TFB
BS 337 340 RS1D362TF
BS 341 341 RS1AO06TFB
BS 342 421 RS1D362TF
BS 422 422 RS1AO06TFB
BS 423 493 RS1D362TF
BS 494 494 RS1AO06TFB
BS 495 537 RS1D362TF
BS 538 538 RS1AO06TFB
BS 539 573 RS1D362TF
BS 574 574 RS1AO06TFB
BS 575 593 RS1D362TF
BS 594 594 RS1AO06TFB
BS 595 637 RS1D362TF
BS 638 638 RS1AO06TFB
BS 639 663 RS1D362TF
BS 664 688 RS1AO06TFB

RD RS1D362TF 663 0 0
GGCTACCATCTCTGAATCAGATCTGATCTGTCTTGTCAGTTTCTAAACTAGTCCGATCGA
AGTGAGACTTCCTACACACACT*TCTGTCTCTCGCTCGAAACCCTATTCTTTCGTATATT
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TCGCTAAGCAACAACTGGCTGTGATAAAGCAATTCAGTGGGACAGGCTACGAAAGCTCAG
ACGTAATGGTGATTGATGAGCTCGAAATGCAAAGGCATCATCAGCTCGAGAAGCTTTACC
GCTCTACTCGTTCTGCTAAGGAGTTCCAGAGAGAGGTTATTAAAGCAGCTGAGACATTTA
CTTCCATTGGGCTTAGACACATTGAAGCAGGAACCAAGTTGGCTGAAGACTGTTGTAAAT
ATGGAACAGAAAACAGTCAGAACATCGATGAGAATATTCTAGCCAAGGCTGCAGCTATAT
ACGGTGATGCTAGGAAACATGTTGAGAAAGAACAAGAAGACTTTAACAAGCTTTTGTCCT
CTCAGGTTTTAGATCCTCTGAGAGCTATGGTTGTCGGTTCTCCTCTTGAAGATGCTCGTC
ATTTAGCTCAACGTTACAGCCGCATGAGACAAGAAGCTGAGACTCATGCAGCGGAAGTAT
CTA

QA 1 663 1 663
DS 

RD RS1AO06TFB 668 0 0
GG
CTGATCTGTTTTGTCAGTTTCTAAACTGGTCCGATCGAAGTGAGACTTCCTACACACACT
CTCTGTCTCTCGCTCGAAACCCTATTCTTTCGTATATTCTCAGGAGAAGTGACAAATGGA
TGCGTTTAGAAGGCAAGCGAGTAAGCTCAGAGACCAAGTCGCTAAGCAACAACTGGCTGT
GATAAAGCAATTCAGTGGGACAGGCTACGAAAGCTCAGACGTAATGGTGATCGATGAGCT
CGAAATGCAAAGGCATCATCAGCTCGAGAAGCTTTACCGCTCTACTCGTTCCGCTAAGGA
GTTCCAGAGAGAGCTTATCAAAGCAGCTGAGACATTTACTTCCATTGGGCTTAGACACAT
TGAAGCAGGAACCAAGTTGGCTGAAGACTGTTGTAAATACGGAACCGAAAACAGTCAGAA
CATCGATGAGAATATTCTTGCCAAGGCTGCAGCTATATACGGTGATGCTCGCAAACATGT
TGAGAAAGAACAAGAAGACTTTAACAAGCTTTTGTACTCTCAGGTTTTGGATCCTCTGAG
AGCTATGGTTGCCGGTTCTCCTCTTGAGGATACTCGTCATTTAGCTCAACGTTACAGCCG
CATGAGACAAGAAGCAGAGGCTCATGCAGCGGAAGTATCTAGAAGGCAAGTGCGTGTAAG
AGAAGC

QA 3 668 3 668
DS 



AS 1 4

CO CL2355Contig1 1575 4 8 U
GGGATTCAGTAGCCAGAGCATGAAGATGAACGATGGATATAAAGTGTTGAGCTGCTCCAA
TGCTGAGTTGATCACTATAATGCAAAGCTCTGAGGAATTCAATCTATACGATGAGATGTA
TGTGTGGGATCCTGGACAAGTGAAGCACTTCAGGGAGCTTGGACAACTTAGTGAAGTCGC
AGAGAAGGGTCCGCATATCATTCTACCTGTTACAGAAGTCTTTCCTTGGCAAGGAAAATC
AGTTCTGCAAGTGATGCTAAAGGAATTTGCTTTGGACTTGAACGGACGGTACAGTGTGAC
TAGTCTGATAACGCAGATAGCAGTGGGGTTTCTGAGAAGCTCTGAAATTCATGTTAGTGC
CAAGAGTTTACAGAGCATGAGATCAGAGCGTAGTCCCTGTAACAACGACAAATTCCCAAT
GGAGATGCTCTTATATACAGTGGGGGTTCCAAGTTGGTTCCAGAGAACAGAAGCTCAAGG
TGTAAAGGGTGCACTCACGAGTAAACAGAAACTGAGGTTGATGGCGACTATTTTCATAAA
AAGAGATGATTATATCAGATTTTTAAACCTCGTGGAGAAGAGTACTTGGTGGACACTAAA
AGGTTTGATTGGAACACACATTTTTGAGCTGACAAACAGAGTGTGGGAGCCGGGAATAGT
CAAGAGTTCAGGTCCTGCAGTTATTTCCTTTGCTCGGCCTTGCTTCATCCATGAGATGTT
CCAGCCACCAAGGCAAACGGAGCTATCAGTCAAGCTGCTTAAACAAGGTGGTGGCTGGGG
TTGGCGAAACTGGAAATGTCGCACACGTAATGGTACGAAAGGTCGTCTCTTGCAGCTTAA
ATTCTTTGTGCTATTTGTGGAGAAAAGAAAACAGCGGCGTCACATCTTTCAAAAAGAGGA
AGAGCTGACCCGAGGGATTCATTTATGTCAGAGGCTACTCGTTGATGGCGGTCTTATTCT
GGAAGAACGCGATGAGTACATGCTTGGTATTCTGATCTGGCTGCCATGGTATTGCAGTTC
TCATTTCAATGACATCAACTTGAGGACAGAATTTGAATGTTCAGGGGGTGGGAACTTGAA
GGGCTGCTACCACCATCATAAACTTTGTCTCAACCTTGAGGACAAGGTTGAATTCAAAGG
GCGCGGTAATGATACGATGGGCCACTTCGGGACTGAAGAGGTATTAGAGGAAAAGGGCTG
TGGGAAAGAAAGGTCTTCTATAGGCCCAGGAAGAGTTGCTTTTCAGGATAAGAGTTCTAG
AAGAATAAGGAATAAAGATGATGCTGAGCTGGAGGTGCTGCACATGGGATGTCGGTCATG
CTGAGAGTGTGCACGAGAGATAGCTGCTGAGTATAAGAAGAGGAGGAGATGGGTTGTTAG
GATGATCAAGAAGTTTAATCAAGTCATGTCATGGAGGAGAGTGAGAAACTCCTAAGAAAA
ACTCATTTGTAATTCTCTTTTTATCAATAAAATCGTTGGAGTTCCCTTAGCTTGATCTTT
GTTACAAGTTCGATACAGTAAAACGTATCATTTACCCGTAACTTGGGACGAAGAGCTTCT
AAGGGTCCCTTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GX61TF U 1
AF RS1AB25TF U 240
AF RS1GX61JQ C 865
AF RS1AB25JQ C 998
BS 1 358 RS1GX61TF
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BS 360 574 RS1GX61TF
BS 575 575 RS1AB25TF
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BS 930 1486 RS1GX61JQ
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RD RS1GX61TF 663 0 0
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CAA

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DS 

RD RS1AB25TF 690 0 0
G
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TAGTCTGATAACGCAGATAGCAGTGGGGTTTCTGAGAAGCTCTGAAATTCATGTTAGTGC
CAAGAGTTTACAGAGCATGAGATCAGAGCGTAGTCCCTGTAACAACGACAAATTCCCAAT
GGAGATGCTCTTATATACAGTGGGGGTTCCAAGTTGGTTCCAGAGAACAGAAGCTCAAGG
TGTAAAGGGTGCACTCACGAGTAAACAGAAACTGAGGTTGATGGCGACTATTTTCATAAA
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CAAGAGTTCAGGTCCTGCAGTTATTTCCTTTGCTCGGCCTTGCTTCATCCATGAGATGTT
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TTGGCGAAACTGGAAATGTCGCACACGTAATGGTACGAAAGGTCGTCTCTTGCAGCTTAA
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AGAGCTGACCCGAGGGATTCATTTATGTC

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DS 

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CAATAAAATCGTTGGAGTTCCC
CC

QA 1 622 1 622
DS 

RD RS1AB25JQ 578 0 0
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TGTTCAGGGGGTGGGAACTTGAAGGGCTGCTACCACCATCATAAACTTTGTCTCAACCTT
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GAGGTATTAGAGGAAAAGGGCTGTGGGAAAGAAAGGTCTTCTATAGGCCCAGGAAGAGTT
GCTTTTCAGGATAAGAGTTCTAGAAGAATAAGGAATAAAGATGATGCTGAGCTGGAGGTG
CTGCACATGGGATGTCGGTCATGCTGAGAGTGTGCACGAGAGATAGCTGCTGAGTATAAG
AAGAGGAGGAGATGGGTTGTTAGGATGATCAAGAAGTTTAATCAAGTCATGTCATGGAGG
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GGAGTTCCCTTAGCTTGATCTTTGTTACAAGTTCGATACAGTAAAACGTATCATTTACCC
GTAACTTGGGACGAAGAGCTTCTAAGGGTCCCTTTGGC

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DS 



AS 1 4

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CTGCACTGCTAAAGGCTAGGTTTGGTCGGTTCGGGCTGCTGGATCAATCAGCCATCAGGG
TGTTCTGGAAATCATCGACCTGCCGTGTTGTCTTCCTGTATAAAGCCGATGCACAGACTG
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CACCACCAACGAGCCATCGAATAGAAACGATGGACCTCTTCATCATCTTTTGGAATGGAA
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CCTCCTCCTTCAACATTGCCACCAATTCTTCCTCTCCCTCCACAATACTCAAAGCCCATT
AAAACAGTAGACCATGTTGAACCACCTATGCCACCACCACCACCTTCTAGAAGCTTTCCT
GGTCCGAGCTCAGCGGTTGGTGCCGGAGACATCTCTCACCAAATGCTCAACCTTTTGTCG
AAATGCAACGACGTTGTGTCCAACGTTACAGGCTTGTTGGGCTATGTTCCTTACCACCCA
TTGTGAAAAAACAAAGCCCGTCGAGAGATCAAAAGAAATGTTGTTTTTTGGTATTCCTCC
TGTGTTGGTTCTGGTTGATATATTGTGTGTTAGATGTTGAGTCGACTTTATTATTTGTTT
CAGTCATGTATTACAATGGATCTTTAC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1A003TF U 1
AF RS1A003TV U 1
AF RS1A003JQ C 65
AF RS1A003TR C 85
BS 1 852 RS1A003TF
BS 853 867 RS1A003TV

RD RS1A003TF 853 0 0
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CTGCACTGCTAAAGGCTAGGTTTGGTCGGTTCGGGCTGCTGGATCAATCAGCCATCAGGG
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CTTTTAGATATGCAACGGGAAACAACTCTCTCTTTAGTAACGTGAACGTAAGGTACTTCC
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CCTCCTCCTTCAACATTGCCACCAATTCTTCCTCTCCCTCCACAATACTCAAAGCCCATT
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AAATGCAACGACGTTGTGTCCAACGTTACAGGCTTGTTGGGCTATGTTCCTTACCACCCA
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TGTGTTGGTTCTGGTTGATATATTGTGTGTTAGATGTTGAGTCGACTTTATTATTTGTTT
CAGTCATGTATT
A

QA 1 852 1 852
DS 

RD RS1A003TV 867 0 0
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CTGCACTGCTAAAGGCTAGGTTTGGTCGGTTCGGGCTGCTGGATCAATCAGCCATCAGGG
TGTTCTGGAAATCATCGACCTGCCGTGTTGTCTTCCTGTATAAAGCCGATGCACAGACTG
CTTTTAGATATGCAACGGGAAACAACTCTCTCTTTAGTAACGTGAACGTAAGGTACTTCC
TCCGTGACGTTGACGCTCCTAAAGCCGAGACTCAAGAACCAGAAAACGCAAAGGAAGATG
ATGAGCCACAGAGCCAAGTGCCAGACCCAGCATCGCCACGTTACCAGCCAAAACTGCCAC
CACCACCAACGAGCCATCGAATAGAAACGATGGACCTCTTCATCATCTTTTGGAATGGAA
TTTGTAAGTAAGAAGTTTCAAAACGTTGTTCATCATCATCAACATCAACATCAACAGCTT
CCTCCTCCTTCAACATTGCCACCAATTCTTCCTCTCCCTCCACAATACTCAAAGCCCATT
AAAACAGTAGACCATGTTGAACCACCTATGCCACCACCACCACCTTCTAGAAGCTTTCCT
GGTCCGAGCTCAGCGGTTGGTGCCGGAGACATCTCTCACCAAATGCTCAACCTTTTGTCG
AAATGCAACGACGTTGTGTCCAACGTTACAGGCTTGTTGGGCTATGTTCCTTACCACCCA
TTGTGAAAAAACAAAGCCCGTCGAGAGATCAAAAGAAATGTTGTTTTTTGGTATTCCTCC
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CAGTCATGTATTACAATGGATCTTTAC

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DS 

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TAGATATGCAACGGGAAACAACTCTCTCTTTAGTAACGTGAACGTAAGGTACTTCCTCCG
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GCCACAGAGCCAAGTGCCAGACCCAGCATCGCCACGTTACCAGCCAAAACTGCCACCACC
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TAAGTAAGAAGTTTCAAAACGTTGTTCATCATCATCAACATCAACATCAACAGCTTCCTC
CTCCTTCAACATTGCCACCAATTCTTCCTCTCCCTCCACAATACTCAAAGCCCATTAAAA
CAGTAGACCATGTTGAACCACCTATGCCACCACCACCACCTTCTAGAAGCTTTCCTGGTC
CGAGCTCAGCGGTTGGTGCCGGAGACATCTCTCACCAAATGCTCAACCTTTTGTCGAAAT
GCAACGACGTTGTGTCCAACGTTACAGGCTTGTTGGGCTATGTTCCTTACCACCCATTGT
GAAAAAACAAAGCCCGTCGAGAGATCAAAAGAAATGTTGTTTTTTGGTATTCCTCCTGTG
TTGGTTCTGGTTGATATATTGTGTGTTAGATGTTGAGTCGACTTTATTATTTGTTTCAGT
CATGTATTACAATGGATCTTTAC

QA 1 803 1 803
DS 

RD RS1A003TR 768 0 0
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ACCCAGCATCGCCACGTTACCAGCCAAAACTGCCACCACCACCAACGAGCCATGGAATAG
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GTTGTTCATCATCATCAACATCAACATCAACAGCTTCCTCCTCCTTCAACATTGCCACCA
ATTCTTCCTCTCCCTCCACAATACTCAAAGCCCATTAAAACAGTAGACCATGTTGAACCA
CCTATGCCACCACCACCACCTTCTAGAAGCTTTCCTGGTCCGAGCTCAGCGGTTGGTGCC
GGAGACATCTCTCACCAAATGCTCAACCTTTTGTCGAAATGCAACGACGTTGTGTCCAAC
GTTACAGGCTTGTTGGGCTATGTTCCTTACCACCCATTGTGAAAAAACAAAGCCCGTCGA
GAGATCAAAAGAAATGTTGTTTTTTGGTATTCCTCCTGTGTTGGTTCTGGTTGATATATT
GTGTGTTAGATGTTGAGTCGACTTTATTATTTGTTTCAGTCATGTATT

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 4

CO CL2357Contig1 666 4 8 U
CCGAAAATCGGTTAAAGGTAAAATCGCATAATAATGTTTCAAAAAGAAAAAAAAACTTGG
ATGGATTCTACCTTAAATAAAACCTGACCCTGATCAAATTGGGTTTCTGAAAAAGACATG
AAATGTCTTAATTTGGAAAGATTTCATTTGGTCTAACAACATGGCAATGCAAATACAGAT
TATTATGGTCACAAATACTGTGAAAAATCTAGAAGGGGTTTGTTTTGTCATGCTCACATT
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GGAATTGGACGTACGGGCATGTGCGGCCTTTGCTCGAGCTCAGCAGACTTCATGGCAATG
GGGATGCAGACAAGGAAAACGCCGAGCATTGCGAAGGCGGTGTTCCGACGCCAGTGCTTG
GGCCTACAGTAAGGCCCACCAGACATGCTCCATACTTTGGCTCTGAAATCGCCGCCTTCA
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GAATCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 

AF RS1EZ24JQ U 1
AF RS1EZ24TF C 5
AF RS1DJ19TF C 107
AF RS1DJ19JQ U 150
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CC

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ATGCAAATACAGATTATTATGGTCACAAATACTGTGAAAAATCTAGAAGGGGTTTGTTTT
GTCATGCTCACATTGTCGTCTGCAAAATAAGAGACCAAGCCAAAGAGAGTTGTCTCAACA
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GGTTCCAAAGTTCTTGCACCAAATCTGCGAAGGAATTGGACGTACGGGCATGTGCGGCCT
TTGCTCGAGCTCGGCAGACTTCATGGCAATGGGGATGCAGACAAGGAAAACGCCGAGCAT
TGCGAAGGCGGTGTTCCGACGCCAGTGCTTGGGCCTACAGTAAGGCCCACCAGACATGCT
CCATACTTTGGCTCTGAAATCGCCGCCTTCAGGTCCTCCCATTTCTTCTTAGATTCGATC
AGTCCACTGAATACAGATTCCTCTTTTTCCTTGGCGAAATCAGCAGAATCGTAACGAACG
AAGACGATGAGACTTATGATAAGAAGACGGTGAATCC

QA 1 517 1 517
DS 



AS 1 3

CO CL2358Contig1 1161 3 2 U
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ACTACAGTGTTACAAAATACCAATGTTCAAAAAGAAATCGTTAAACAGTAATTAAGTTAT
TTGAAGAAAACTAGCGCATAAATGTCAAGCTTTCAACTCGAAGGAACCACAGACACTTGG
AGTATTCCTTTCCATTCTTTTCCAGGTTCCAGTATGATAGGTTTATGGACAGCAGCGCTT
TCCACGGCAACAAAACGCCTGTAATCTTCAACTTCCAAGTCGGACACTTTCTTTTCCCAT
GGATTCCACACCACAGCATCAATTTGTCCTTCCTTGTGTACCACGATTGTCTTCCTTTTC
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AATCCATGTGAGGGAAGCGGACCTGTGTTACTATATTTTTTTTGGTAAATAAAAAGCACA
CATACTTGTGGAAACAATACTGGAATGCCTCCACGGATCGCTTTTGGAGGCTTGAATATA
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CCTCCATATAAGTAAACCTCGAAAGATCTGCCTTGACGATCGCGGATGATGATCTTTTCT
AGACCATTGATGCCTTTAGTCCGCTCAAAGAGACGATGTTCCCTGGCCATGGCGACTACT
CCAACGAGCATAGCCCATAAGAGGATCAGATTTCCCTTATTCCACATTATCTCCTTTACT
ATTCACTCACGAGAACGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GI43JQ U 29
AF RS1BY96JQ U 1
AF RS1BY96TF C 397
BS 1 710 RS1BY96JQ
BS 711 1161 RS1BY96TF

RD RS1GI43JQ 495 0 0
G
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AAAAGAAATCGTTAAACAGTAATTAAGTTATTTGCAGAAAACTAGCGCATAAATGTCAAG
CTTTCAACTCGAAGGAACCACAGACACTTGGAGTATTCCTTTCCATTCTTTTCCAGGTTC
CAGTATGATAGGTTTATGGACAGCAGCGCTTTCCACGGCAACAAAACGCCTGTAATCTTC
AACTTCCAAGTCGGACACTTTCTTTTCCCATGGATTCCACACCACAGCATCAATTTGTCC
TTCCTTGTGTACCACGATTGTCTTCCTTTTCTTGTGGTCCACGATTCTGATTTTATTTGG
AGTGTTTAGGTAAAGCCTGTCAAGCTGGGAATTAAAAGTTATAGCTTTGTCATGATCAAT
GAAACGTGTTCTGTTCTTTTGTTGGTCAAGATAATTCAAACCATGCAATCCTTCCACCTG
GATTTGACTGATAT

QA 2 495 2 495
DS 

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TCCACGGCAACAAAACGCCTGTAATCTTCAACTTCCAAGTCGGACACTTTCTTTTCCCAT
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QA 1 710 1 710
DS 

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TCAGTGTTCGTAACACGCGATGTCAACGTCAAATCTCCTCTATGCCCCAATGCTACTCTT
AGTCGATATATAAACTTATGAGGCCAGATCTTCAAATCATCTTGGGATGATCTTATGATG
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ATTTTCCAAAACCTATTTCTAACAAATCCATGTGAGGGAAGCGGACCTGTGTTACTATAT
TTTTTTTGGTAAATAAAAAGCACACATACTTGTGGAAACAATACTGGAATGCCTCCACGG
ATCGCTTTTGGAGGCTTGAATATAGCCTTGCTACTCATGAAAAGTAACTCCTCTCCTTTC
TCATTCTTCCAAGAAGTCACTTGACCTCCATATAAGTAAACCTCGAAAGATCTGCCTTGA
CGATCGCGGATGATGATCTTTTCTAGACCATTGATGCCTTTAGTCCGCTCAAAGAGACGA
TGTTCCCTGGCCATGGCGACTACTCCAACGAGCATAGCCCATAAGAGGATCAGATTTCCC
TTATTCCACATTATCTCCTTTACTATTCACTCACGAGAACGATCC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 3

CO CL2359Contig1 1207 3 8 U
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TAACAATCTTACTACTTCAGCTAACACAACTGATGATAGGACCTTCCAAGGTTACTTGTG
ACTCAAGAAACATCATCACTTTGGTTCTCCTGCAACACTTTCTTCTCTGTGAATGGTAAA
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TCCAAGTAACCGGTGTCTTTCTCTCCAGTCTTTTGTCCTCTGTTTCTGCTCTCATCTTCT
TGCGAGGAGGAGGAGGAGCTTCCTCCTCCTTCAGGGCTACTGTTTCCGCTTCTTGCATCC
TTCTTACGCTTTCTCATGACTGTGAACTGGACACACCGTTTCTCAGAAGGCGTCACAGAC
GTATCGAATAGCTCCGTATCATTCTCCTTCTCTTCCTCTTTTCTTGCTTCTGTTTTGGAT
GACGTCAGTGATTCCACATCAAGACAATCTCCAGCGTCTCTGCGTCTACTTAGTATGGAC
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CTGGAGTCCTCACACGCTACAGAAACCGCTTCCTTTAGCTTGTTTTCCTCGTCGCTTTGA
CGACGACTATTTGCCAATCTATCGAGCTGGTAACGAGACTCTCGCAGCTCCATCCTTAGC
TCTCCAACTATATCTTCAGCTTCTCCGAGTTGAGCTTCAAGCTCTTCAATCTTTTGCTGC
TTGCTTAAAGACATCATTTCCGCCTCTTTAACCTTGGAATCATACATCTGTTTAAGCCTA
AGACAGGTACGGAGAGCCTCGTCTCTAACAGCAACAAGCTCTTGCTGAAACCCACGCGCT
CTCCTCTCGGAAACCATCACACGTGCCGCAGCCTCCTTGGCCGTGTTCAGTATCGTATCG
GCATAAGCCTTCTTCAATGCGGTTAATCTCTCTGGGTCAGTCATTAGGTCTTCTGAGAAT
GCGGTTTACCGGAGAGGCTAATTTTTTTTTTTTTGCCTCCGATAGAAGTCGCGAAGAAGA
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TCTGCCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GX18JQ U 1
AF RS1B884JQ U 1
AF RS1GX18TF C 470
BS 1 277 RS1B884JQ
BS 278 278 RS1GX18JQ
BS 279 396 RS1B884JQ
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RD RS1GX18JQ 571 0 0
GA
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CTTACGCTTTCTCATGACTGTGAACTGGACACACCGTTTCTCAGAAGGCGTCACAGACGT
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QA 3 571 3 571
DS 

RD RS1B884JQ 753 0 0
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AGCTGGCGAGCGACCTGAGCAACACGACGACTATCACGAGATGATTCAGTGTTGAAGGAG
TCCAAGTAACCGGTGTCTTTCTCTCCAGTCTTTTGTCTTCTGTTTCTGCTCTCATCTTCT
TGCGAGGAGGAGGAGGAGCTTCCTCCTCCTTCAGGGCTACTGTTTCCGCTTCTTGCATCC
TTCTTACGCTTTCTCATGACTGTGAACTGGACACACTGTTTCTCAGAAGGCGTCACAGAC
GTATCGAATAGCTCCGTATCATTCTCCTTCTCTTCCTCTTTTCTTGCTTCTGTTTTGGAT
GACGTCAGTGATTCCACATCAAGACAATCTCCAGCGTCTCTGCGTCTACTTAGTATGGAC
GGAAGAGTATGGTGGCAAGGATCTTTATTCTCTTTATAAGAAGAACACCTGTTGATACTG
TTGTCTCTGTCACTCAAATGTGGTTTGACCCCACTAGCCGCTACTGTTCTCTCGTGTTTA
CTGGAGTCCTCACACGCTACAGAAACCGCTTCCTTTAGCTTGTTTTCCTCGTCGCTTTGA
CGACGACTATTTGCCAATCTCTCGAGCTGGTAA

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1GX18TF 738 0 0
TCTG
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TATGGACGGAAGAGTATGGTGGCAAGGATCTTTATTCTCTTTATAAGAAGAACACCTGTT
GATACTGTTGTCTCTGTCACTCAAATGTGGTTTGACCCCACTAGCCGCTACTGTTCTCTC
GTGTTTACTGGAGTCCTCACACGCTACAGAAACCGCTTCCTTTAGCTTGTTTTCCTCGTC
GCTTTGACGACGACTATTTGCCAATCTATCGAGCTGGTAACGAGACTCTCGCAGCTCCAT
CCTTAGCTCTCCAACTATATCTTCAGCTTCTCCGAGTTGAGCTTCAAGCTCTTCAATCTT
TTGCTGCTTGCTTAAAGACATCATTTCCGCCTCTTTAACCTTGGAATCATACATCTGTTT
AAGCCTAAGACAGGTACGGAGAGCCTCGTCTCTAACAGCAACAAGCTCTTGCTGAAACCC
ACGCGCTCTCCTCTCGGAAACCATCACACGTGCCGCAGCCTCCTTGGCCGTGTTCAGTAT
CGTATCGGCATAAGCCTTCTTCAATGCGGTTAATCTCTCTGGGTCAGTCATTAGGTCTTC
TGAGAATGCGGTTTACCGGAGAGGCTAATTTTTTTTTTTTTGCCTCCGATAGAAGTCGCG
AAGAAGAAAGGAACGAATGAAAAAAAAAGAGAAGGGAGGTGGTTTGGTTTTTTTTTTTCA
ATCTGTTTCTGCCC

QA 5 738 5 738
DS 



AS 1 4

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TTCCGGCGAAGAAGAAGCCCTTTTCGGATTTCCATTTCGTTGACAAACGATCTCTCGGCC
GAATTGGAAAAAAACGATGTCGATGGGAAAGGCATTCTACAGCGTGGGGTTCTGGATCCG
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TGAACAACTATCCAGGCACCGTACGCTTATGAATGTTTTTGACAAATCCCCTAGTGTCGA
TAACCAGGCTTTCGTTGCTCCTAGCGCCTCTCTCATTGGCAATGTCCATGTCGGACGAGG
TTCTTCCATTTGGTATGGCTGCGTCTTGAGAGGAGACGCGAACAGCATCAGCGTCGGCGC
TGGGACCAATATCCACGATAACACCCTCGTCCACGTTGCTAAGTCCAACTTAAGCGGCAA
GGTTTTGCCCACTCTCATCGTAGACAATGTCACTGTTGGTAACAGTGCTGTTTTGCATGG
CTGCACTGTCGAAGACGAGGCCTACATTGGTGCTAGTGCTACCGTCTTGGATGGAGCTCA
TGTTGAAAAGCATGCCGTGGTTGAGTCCGGAGCTCTTGTCCGGCAGAACACTAGAATTCC
TTCCGGCGAGGTTTGGGGAGGGAATCCAGCTAGGTTTCTGAGGAAGGTGACCGAAGAAGA
AAAGGCCTTCTTCTCTAGTTCAGTTGTGGATTACTCCAGCTTAGCTCAAGTTCACGCCGC
GGAAACCACAAAAAACTTGGACGAGGCGGATTTCAAGAAGCTTCTTTACAAGAAGAACGC
TCGCGATGCAGAATACGACTCAGTTCTCGGTGATCTCAGTCTCTCTGAGAATGTACCAAA
ATCAGCTTGAGAAGTTTTGATTCGTGTTGGATTTGAAAGAAACAAAACACACACAAGAAC
TTCATTTTCATGCTTCTTCAATAAAGTTTTCAGCTTTTTTAAAGACTTTCGATTTCTCTG
TAAAACATTCTCTGAGGAGGTTTTGTTCTCTTGTAAGGAAAAAGGTTGTGGCGGCAAGGT
TGTGTAATAAGTGGTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1G628TF U 63
AF RS1GN92TF U 21
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TTCCGGCGAAGAAGAAGCCCTTTTCGGATTTCCATTTCGTTGACAAACGATCTCTCGGCC
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TGAACAACTATCCAGGCACCGTACGCTTATGAATGTTTTTGACAAATCCCCTAGTGTCGA
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TTCTTCCATTTGGTATGGCTGCGTCTTGAGAGGAGACGCGAACAGCATCAGCGTCGGCGC
TGGGACCAATATCCAAGATAACACCCTCGTCCACGTTGCTGAGTCCAACTTAAGCGGCAA
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CTGCACTGTCGAAGACGAGGCCTACATTGGTGCTAGTGCTACCGTCTTGGATGGAGCTCA
TGTTGAAAAGCATGCCGTGGTTGAGTCCGGAGCTCTTGT
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GG
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TGGAAAAAAACGATGTCGATGGGAAAGGCATTCTACAGCGTGGGGTTCTGGATCCGTGAA
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CAACTATCCAGGCACCGTACGCTTATGAATGTTTTTGACAAATCCCCTAGTGTCGATATC
CAGGCTTTCGTTGCTCCTAGCGCCTCTCTCATTGGCAATGTCCATGTCGGACGAGGTTCT
TCCATTTGGTATGGCTGCGTCTTGAGAGGAGACGCGAACAGCATCAGCGTCGGCGCTGGG
ACCAATATCCACGATAACACCCTCGTCCACGTTGCTAAGTCCAACTTAAGCGGCAAGGTT
TTGCCCACTCTCATCGTAGACAATGTCACTGTTGGTAACAGTGCTGTTTTGCATGGCTGC
ACTGTCGAAGACGAGGCCTACATTGGTGCTAGTGCTACCGTCTTGGATGGAGCTCATGTT
GAAAAGCATGCCGTGGTTGAG

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DS 

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GACACTAGTTC
TCTCTCTCTCTCTCCTCTTCCTCTACTAGTTCCGGCGAAGAAGAAGCCCTTTTCGGATTT
CCATTTCGTTGACAAACGATCTCTCGGCCGAATTGGAAAAAAACGATGTCGATGGGAAAG
GCATTCTACAGCGTAGGGTTCTGGATCCGTGAAACTGGTCAAGCACTCTATCGGCTCGGT
TGTCGCCTCCAAGGCAAAAATCACTTCCGTGAACAACTATCCAGGCACCGTACCCTTATG
AATGTTTTTGACAAATCCCCTGCTGTCGATAACCAGGCTTTCGTTGCTCCTAGCGCCTCT
CTCATTGGCAATGTCCATGTCGGACGAGGTTCTTCCATTTGGTATGGATGCGTCTTGAGA
GGAGATGCGAACAGCATCAGTGTCGGCGCTGGGACCAATATCCAAGATAACACCCTCGTC
CACGTTGCTAAGTCCAACTTAAGCGGCAAGGTTTTGCCTACTCTCATTGGAGACAATGTC
ACTGTTGGTAACAGTGCTGTTTTGCATGGCTGCACTGTCGAAGACGAGGCCTACATTGGT
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GCTCTTGT

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DS 

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CCAATATCCACGATAACACCCTCGTCCACGTTGCTAAGTCCAACTTAAGCGGCAAGGTTT
TGCCCACTCTCATCGTAGACAATGTCACTGTTGGTAACAGTGCTGTTTTGCATGGCTGCA
CTGTCGAAGACGAGGCCTACATTGGTGCTAGTGCTACCGTCTTGGATGGAGCTCATGTTG
AAAAGCATGCCGTGGTTGAGTCCGGAGCTCTTGTCCGGCAGAACACTAGAATTCCTTCCG
GCGAGGTTTGGGGAGGGAATCCAGCTAGGTTTCTGAGGAAGGTGACCGAAGAAGAAAAGG
CCTTCTTCTCTAGTTCAGTTGTGGATTACTCCAGCTTAGCTCAAGTTCACGCCGCGGAAA
CCACAAAAAACTTGGACGAGGCGGATTTCAAGAAGCTTCTTTACAAGAAGAACGCTCGCG
ATGCAGAATACGACTCAGTTCTCGGTGATCTCAGTCTCTCTGAGAATGTACCAAAATCAG
CTTGAGAAGTTTTGATTCGTGTTGGATTTGAAAGAAACAAAACACACACAAGAACTTCAT
TTTCATGCTTCTTCAATAAAGTTTTCAGCTTTTTTAAAGACTTTCGATTTCTCTGTAAAA
CATTCTCTGAGGAGGTTTTGTTCTCTTGTAAGGAAAAAGGTTGTGGCGGCAAGGTTGTGT
AATAAGTGGTTGG

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 4

CO CL2361Contig1 1194 4 5 U
GGTGATTATTTCAAGAGCACCCCAGAGTACAGTCATTTAACTGAAAGAATGGGTTCAGAA
TATCTAGGAAAGATGCTATCCAAGCATTTGGAAGTTGTTATCAAGTCTAGAATCCCTGGA
CTTCAGTCTCTTATCACAAAGACGATCTCCGAGTTAGAGACAGAGCTGAGCCGTCTTGGC
AAACCTGTAGCAGCTGATGCTGGTGGAAAACTGTATATGATCATGGAGATTTGCCGTGCG
TTTGATCAAACGTTCAAAGAACACCTTGACGGCACGCGGTCAGGTGGTGAAAAGGTAAAC
TCTGTGTTCGACAATCAATTCCCAGCTGCAATTAAAAGACTGCAGTTCGACAAGCATCTC
TCTATGGACAATGTGCGTAAACTGATCACTGAAGCAGACGGATATCAACCGCATCTCATA
GCTCCTGAACAAGGTTACCGCCGTCTCATTGAATCATGCTTAGTCTCCATTAGAGGCCCA
GCTGAAGCAGCTGTTGACGCGGTTCATTCTATTCTCAAGGATCTTATCCACAAATCCATC
AGCGAAACATCTGAGCTGAAGCAATACCCAACACTGAGAGTTGAAGTATCAGGCGCGGCA
GTGGATTCACTGGATCGAATGAGAGACGAGAGCAGGAAAGCAACTCTGTTGCTAGTGGAC
ATGGAGTCTGGCTACTTAACAGTCGAATTCTTCAGGAAGCTCCCACAAGATTCTGAGAAA
GGAGGGAATCCGACACATTCGATATTCGACAGGTACAACGACGCTTACCTCAGAAGAATC
GGTTCCAATGTTCTGTCTTACGTGAACATGGTTTGCGCTGGATTGAGAAACTCCATCCCG
AAATCCATCGTTTACTGTCAAGTCCGTGAAGCGAAAAGAAGCCTTCTTGATATCTTCTTC
ACTGAGCTTGGCCAGAAAGAGATGAGTAAGCTGTCGAAGCTGTTGGATGAGGATCCTGCG
GTTCAGCAGAGAAGGACTTCGATTGCAAAGAGGCTGGAACTGTATCGAAGTGCTCAAACA
GATATTGAAGCAGTTGCTTGGTCCAAGTAGAGAGACTGTTTCTTTATGACACGTTCTTTT
TTCCATTCTTTTTTCAAACATTATTACACGTTCTTTTATCT*TATTTTGTCACTGTTTAA
TTTTATTCGTTGTTCGAGTTAACATTGTTTCAGAATAATAAGTTTTGTCAGACG


BQ
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AF RS1B960TF U 1
AF RS1B960JQ C 430
AF RS1ED05JQ C 620
AF RS1ED05TF U 620
BS 1 588 RS1B960TF
BS 589 620 RS1B960JQ
BS 621 812 RS1ED05TF
BS 813 813 RS1B960JQ
BS 814 1194 RS1ED05TF

RD RS1B960TF 588 0 0
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TATCTAGGAAAGATGCTATCCAAGCATTTGGAAGTTGTTATCAAGTCTAGAATCCCTGGA
CTTCAGTCTCTTATCACAAAGACGATCTCCGAGTTAGAGACAGAGCTGAGCCGTCTTGGC
AAACCTGTAGCAGCTGATGCTGGTGGAAAACTGTATATGATCATGGAGATTTGCCGTGCG
TTTGATCAAACGTTCAAAGAACACCTTGACGGCACGCGGTCAGGTGGTGAAAAGGTAAAC
TCTGTGTTCGACAATCAATTCCCAGCTGCAATTAAAAGACTGCAGTTCGACAAGCATCTC
TCTATGGACAATGTGCGTAAACTGATCACTGAAGCAGACGGATATCAACCGCATCTCATA
GCTCCTGAACAAGGTTACCGCCGTCTCATTGAATCATGCTTAGTCTCCATTAGAGGCCCA
GCTGAAGCAGCTGTTGACGCGGTTCATTCTATTCTCAAGGATCTTATCCACAAATCCATC
AGCGAAACATCTGAGCTGAAGCAATACCCAACACTGAGAGTTGAAGTA

QA 1 588 1 588
DS 

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ACAAGG
TACCGCCGTCTCATTGAATCATGCTTAGTCTCCATTAGAGGCCCAGCTGAAGCAGCTGTT
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CTGAAGCAATACCCAACACTGAGAGTTGAAGTATCAGGCGCGGCAGTGGATTCACTGGAT
CGAATGAGAGACGAGAGCAGGAAAGCAACTCTGTTGCTAGTGGACATGGAGTCTGGCTAC
TTAACAGTCGAATTCTTCAGGAAGCTCCCACAAGATTCTGAGAAAGGAGGGAATCCGACA
CATTCGATATTCGACAGGTACAACGACGCTTACCTCAGAAGAATCGGTTCCAATGTTCTG
TCTTACGTGAACATGGTTTGCGCTGGATTGAGAAACTCCATCCCGAAATCCATCGTTTAC
TGTCAAGTCCGTGAAGCGAAAAGAAGCCTTCTTGATATCTTCTTCACTGAGCTTGGCCAG
AAAGAGATGAGTAAGCTGTCGAAGCTGTTGGATGAGGATCCTGCGGTTCAGCAGAGAAGG
ACTTCGATTGCAAAGAGACTGGAACCGTATCGAAGTGCTCAAACAGATATTGAAGCAGTT
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AAACATTATTACACGTTCTTTTATCTCTATTTTGTCACTGTTTAATTTTATTCGTTGTTC
GAGTTAACATTGTTTCAGAATAATAAGTTTTGTCAGACG

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DS 

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G
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CGTGAACATGGTTTGCGCTGGATTGAGAAACTCCATCCCGAAATCCATCGTTTACTGTCA
AGTCCGTGAAGCGAAAAGAAGCCTTCTTGATATTTTTTTCACTGAGCTTGGCCAGAAAGA
GATGAGTAAGCTGTCGAAGCTGTTGGATGAGGATCCTGCGGTTCAGCAGAGAAGGACTTC
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GTCCAAGTAGAGAGACTGTTTCTTTATGACACGTTCTTTTTTCCATTCTTTTTTCAAACA
TTATTACACGTTCTTTTATCT*TATTTTGTCACTGTTTAATTTTATTCGTTGTTCGAGTT
AACAT

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DS 

RD RS1ED05TF 575 0 0
G
GAGAGACGAGAGCAGGAAAGCAACTCTGTTGCTAGTGGACATGGAGTCTGGCTACTTAAC
AGTCGAATTCTTCAGGAAGCTCCCACAAGATTCTGAGAAAGGAGGGAATCCGACACATTC
GATATTCGACAGGTACAACGACGCTTACCTCAGAAGAATCGGTTCCAATGTTCTGTCTTA
CGTGAACATGGTCTGCGCTGGATTGAGAAACTCCATCCCGAAATCCATCGTTTACTGTCA
AGTCCGTGAAGCGAAAAGAAGCCTTCTTGATATCTTCTTCACTGAGCTTGGCCAGAAAGA
GATGAGTAAGCTGTCGAAGCTGTTGGATGAGGATCCTGCGGTTCAGCAGAGAAGGACTTC
GATTGCAAAGAGGCTGGAACTGTATCGAAGTGCTCAAACAGATATTGAAGCAGTTGCTTG
GTCCAAGTAGAGAGACTGTTTCTTTATGACACGTTCTTTTTTCCATTCTTTTTTCAAACA
TTATTACACGTTCTTTTATCT*TATTTTGTCACTGTTTAATTTTATTCGTTGTTCGAGTT
AACATTGTTTCAGAATAATAAGTTTTGTCAGACG

QA 2 575 2 575
DS 



AS 1 4

CO CL2362Contig1 1288 4 11 U
GGATCTCTCCTACAAAAAAAAAAAACTTTCTTGTTTCTCTTTGACATAAACAAAAAACTC
TTTCTGTATCTCCCCTCTCTTCATCTTCAACAGAAATGGATTACGAGGTATCAAGAATTT
GTGAGATCGTAGAAGATTCAGAGCAGATTGATTTGCTACCTGGATTCAGATTTCACCCAA
CAGATGAAGAACTCATAAGCCACTACCTGAGACCGAAGGTTCTAAACACCCTCTTCTCCG
CTATAGCCATTGGCGAAGTCGATCTCAACAAGGTTGAGCCTTGGGACTTGCCATGGAAGG
CTAAGATTGGCGAAAAAGAGTGGTACTTCTTCTGCGTGAGAGATCGGAAATACCCAACCG
GTTTAAGGACGAACCGGGCTACTAAGGCCGGCTATTGGAAAGCTACAGGGAAAGACAGAG
AGATCTTCAAAGAAAAAGCTCTTGTTGGTATGAAGAAAACTTTGGTTTTCTACGAAGGAA
GAGCTCCTAAAGGAGCAAAAACAAACTGGGTCATGCACGAGTATCGCTTAGAAGGCGTAT
ATTCAACCGACAATCTTCCTAAAACCGCTAAGAACGAGTGGGTTATTAGTAGGGTTTTTC
AGAAAGGTGCAGACGGTAAGAAGATGCATCTCTACCAGGGGCTCTGTTCAGGGATTAACC
AAGTCGAACCGGCTGGTTTACCTCCGCTGATGGACTCTTTCGCTGGGTCGTTGTCTAACG
TGACCTGCTTCTCCGACCAAACAACCTTTGAGGACAAGAGCCACATCTCCGAGTTAAAAG
ATGAATGTAACGTTACTATGCTCGGTTCATCATCGACTCATTTAATACCGAACATTGGTT
TTCTGCTATACTCCGATCCTCTGTTTATGCAAGATAATTTTTCGATAGTGAAGATGTTGC
CTGACGGTGAAGAAACCAAGTTTAAGAAGAGTATCCAGGATTTCGGTACTGTTGAAAACG
CATTAACCACAAGTTCTTGGGACTGTGACGGTCTGGCTGGTTCGGCCGGTTCGGTGGAGG
TCGATTGCTATTGGAACTTCTGAATGTGGAAACAGGAAATAATCGAAAATTGGGGTATAT
ATGGGGACAGCAAACAATTAGGAGGTATTTTATGGTTTATAGGTGTTATGTGTGTTGCTC
TAGATTCTAGACTCTAGGACTATTGGATTTACAAAGATATTTGAACATTTGTAAAATTTT
GTAAAAAAATGATCAACTTGTGAAAATCGATTATCATACCATTTGTAATTCATTTATAAT
TGTCATGATAATAATCTGTGAATATACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H289TF U 1
AF RS1AH24TF U 702
AF RS1AH24JQ C 1016
AF RS1H289JQB C 601
BS 1 652 RS1H289TF
BS 653 653 RS1H289JQB
BS 654 729 RS1H289TF
BS 730 778 RS1AH24TF
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BS 813 816 RS1AH24TF
BS 817 1058 RS1H289JQB
BS 1059 1059 RS1AH24JQ
BS 1060 1288 RS1H289JQB

RD RS1H289TF 729 0 0
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TTTCTGTATCTCCCCTCTCTTCATCTTCAACAGAAATGGATTACGAGGTATCAAGAATTT
GTGAGATCGTAGAAGATTCAGAGCAGATTGATTTGCTACCTGGATTCAGATTTCACCCAA
CAGATGAAGAACTCATAAGCCACTACCTGAGACCGAAGGTTCTAAACACCCTCTTCTCCG
CTATAGCCATTGGCGAAGTCGATCTCAACAAGGTTGAGCCTTGGGACTTGCCATGGAAGG
CTAAGATTGGCGAAAAAGAGTGGTACTTCTTCTGCGTGAGAGATCGGAAATACCCAACCG
GTTTAAGGACGAACCGGGCTACTAAGGCCGGCTATTGGAAAGCTACAGGGAAAGACAGAG
AGATCTTCAAAGAAAAAGCTCTTGTTGGTATGAAGAAAACTTTGGTTTTCTACGAAGGAA
GAGCTCCTAAAGGAGCAAAAACAAACTGGGTCATGCACGAGTATCGCTTAGAAGGCGTAT
ATTCAACCGACAATCTTCCTAAAACCGCTAAGAACGAGTGGGTTATTAGTAGGGTTTTTC
AGAAAGGTGCAGACGGTAAGAAGATGCATCTCTACCAGGGGCTCTGTTCAGG*ATTAACC
AAGTCGAACCGGCTGGTTTACCTCCGCTGATGGACTCTTTCGCTGGGTCGTTGTCTAACG
TGACCTGCT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RS1AH24TF 115 0 0
GCTGGGTCGTTGTCTAACGTGACCTGCTTCTCCGACCAAACAACCTTTGAGGACAAGAGC
CACATCTCCGAGTTAAA*GATGAATGTAACGTTACTATGCTCGGTTCATCGTCGA

QA 1 115 1 115
DS 

RD RS1AH24JQ 236 0 0
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TATATATGGGGACAGCAAACAATTAGGAGGTATTTTATGGTTTATAGGTGTTATGTGTGT
TGCTTTAGATTTTAGACTTTAGGACTATTGGATTTACAAAGATATTTGAACATTTGTAAA
ATTTTGTAAAAAAATGATCAACTTGTGAAAATCGATTTTCATACCATTTGTAATTC

QA 1 236 1 236
DS 

RD RS1H289JQB 688 0 0
AGAAAGGTGCAGACGGTAAGAAGATGCATCTCTACCAGGGGCTCTGTTCAGGGATTAACC
AAGTCGAACCGGCTGGTTTACCTCCGCTGATGGACTCTTTCGCTGGGTCGTTGTCTAACG
TGACCTGCTTCTCCGACCAAACAACCTTTGAGGACAAGAGCCACATTTCCGAGTTAAAAG
ATGAATGTAACGTTACTATGCTCGGTTCATCATCGACTCATTTAATACCGAACATTGGTT
TTCTGCTATACTCCGATCCTCTGTTTATGCAAGATAATTTTTCGATAGTGAAGATGTTGC
CTGACGGTGAAGAAACCAAGTTTAAGAAGAGTATCCAGGATTTCGGTACTGTTGAAAACG
CATTAACCACAAGTTCTTGGGACTGTGACGGTCTGGCTGGTTCGGCCGGTTCGGTGGAGG
TCGATTGCTATTGGAACTTCTGAATGTGGAAACAGGAACTAATCGAAAATTGGGGTATAT
ATGGGGACAGCAAACAATTAGGAGGTATTTTATGGTTTATAGGTGTTATGTGTGTTGCTC
TAGATTCTAGACTCTAGGACTATTGGATTTACAAAGATATTTGAACATTTGTAAAATTTT
GTAAAAAAATGATCAACTTGTGAAAATCGATTATCATACCATTTGTAATTCATTTATAAT
TGTCATGATAATAATCTGTGAATATACC

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 4

CO CL2363Contig1 1012 4 3 U
GGGATCAGGTTTCTTGTCTGAACGAACAATGGCGAGTCTCTCTGTACGAACTCCAAGTTC
CATTCAGCTTCTTCGTACCTCTGTTTCTCCTATGCGCTCGAAACCCTTGTTTCGATCATC
ATCTAGCTTATCATCATCCTCCATCGTTTCTGCTCCTTTCGCCAGATCAAAATCCAATTC
CCGAATCTCTAGACCTCGTGTTGTTCTCGCGAGAGCAGCTTCCACGGGAGTAGCTGATCC
CGCCACTGAGTACAGAGAAGATATCGGTGAGATACTCGGGGATGTCTCCATCTTTACTGC
TTCAGGCCAGCCCGTGAAGCTCAGCAATCTCTTGGATCAGAACGATGGAGTTTCTGCTGT
TGTGCTTTTGAGGCATTTCGGATGCGTTTGCTGTTGGGAGCTTGCCACTGCATTGAGAGA
GGCGAAACCACGGTTTGATGCGGCTGGTGTTAAACTGGTTGCGGTTGGTGTTGGAACTCC
TGATAAGGCTCGTATACTTGCATCTCGGTTGCCTTTTCCAATGGAATGTCTTTACGCCGA
TCCTGAGCGCAAGGCATATGATGTTCTTGGATTATACTACGGATTAGGCCGCACTTTCTT
CAACCCCGCTAGCACTAAGGTCTTCTCAAGATTTGACGAGATACGAGAAGCTACGAAGAA
CTACACCATACAAGCCACTCCTGAAGACAGAAGCAGTGTGTTGCAACAGGGAGGTACGTT
TGTTTTCAGAGGCAAGAAGCTCTTGTATGGTCGAAAAGACGAAGGTACTGGTGATCACCC
ATCTCTAGATGATGTTCTCAATGTCTGCTGCACAACACAAGCCACTGTTGCTTGAACATT
GGTTTAAAGTCTCTCTGGTTTGGTTTAATGCTTACATCACTGTATAATTGTAGCTATTAA
TATATGTTTTAAAGATGATAATAAATTATAAATAGTATACATTTGAACCACACAAGTTTA
TAGTGTAAAGATAAGACAATAGTTTGGTATATAATTGGAGTTTGGTTGTTTG


BQ
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10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1FW81TF U 1
AF RS1FW81JQ C 186
AF RS1FL69JQ C 441
AF RS1FL69TF U 441
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AAAGTCCCTCTGGTTTGGTTTAATGCTTTCATCACTGTATAATTGTAGCTATTAATATAT
GTTTTAAAGATGATAATAAATTATAAATAG
C

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G
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CTG

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DS 



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GCGCAACTTTTCCC


BQ
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20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F261TF U 1
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QA 1 771 1 771
DS 

RD RS1C019JQ 201 0 0
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TCATGCCATAAACCAAGCCAATAACTGGCGTGCGTTGCCAGCTACTCGCTGAGATCTCAT
CCATCTTTTGAGTACATATACAGTGAGTGGTCATAGTATTTGGCTCTTTGTAATAACAGT
TTGGTGATGCGAAATAACATA

QA 1 201 1 201
DS 

RD RS1C019TF 595 0 0
G
CAAGCTCAACCTTCAGATCCTAAGGAGGCGATGAGGTGGCTGAAACAATCTGCAGAAAAT
GGTTATGTTAGAGCACAGTATCAGATAGCTCTTTGTTTACACCAAGGCCGTGTCGCGCCG
ACCAATCTGCTAGAAGCTACTAAATGGTACCTAAAGGCAGCAGAAGGTGGGTACGTCAGA
GCCATGTACAACGTTTCGCTTTGTTACTCGGTTGGGGAAGGGTTACCACAAAACCGTAAG
CTAGCAAGAAGGTGGATGAAACGCGCAGCTGATCACGGCCATAGTAAAGCTCAGTTTGAG
CACGGCCTTGCCCTATTCTCTGAAGGAGCGCTGTTGAAAGCTGTAATGTACTTAGAACTC
GCTCAGCGTGGTGGAGAAACGGGTGCGGGTCACGTCAAGGAAGTTATACACCAACAGCTT
TCTGCAACAACTTCTCGTGATCATGCCATAAACCAAGCCAATAACTGGCGTGCGTTGCCA
GCTACTCGCTGAGATCTCATCCATCTTTTGAGTACATATACAGTGAGTGGTCATAGTATT
TGGCTCTTTGTAATAACAGTTTGGTGATGCGAAATAACATATTTGAAATTTGCG

QA 2 595 2 595
DS 

RD RS1F261JQ 478 0 0
TGCTAGAAGCTACTAAATGGTACCTAAAGGCAGCAGAAGGTGGGTACGTCAGAGCCATGT
ACAACGTTTCGCTTTGTTACTCGGTTGGGGAAGGGTTACCACAAAACCGTAAGCTAGCAA
GAAGGTGGATGAAACGCGCAGCTGATCACGGCCATAGTAAAGCTCAGTTTGAGCACGGCC
TTGCCCTATTTTCTGAAGGAGCGCTGTTGAAAGCTGTAATGTACTTAGAACTCGCTCAGC
GTGGTGGAGAAACGGGTGCGGGTCACGTCAAGGAAGTTATACACCAACAACTTTTTGCAA
CAACTTTTCGTGATCATGCCATAAACCAAGCCAATAACTGGCGTGCGTTGCCAGCTACTC
GCTGAGATTTCATCCATCTTTTGAGTACATATACAGTGAGTGGTCATAGTATTTGGCTCT
TTGTAATAACAGTTTGGTGATGCGAAATAACATATTTGAAATTTGCGCAACTTTTCCC

QA 1 478 1 478
DS 



AS 1 4

CO CL2365Contig1 1469 4 8 U
GAGAACATGAAACCGTAAGCTACCAAGCAGTGGGAGGAGCCTGGGGCTCTGACCGCGTGC
CTGTTGAAGAATGAGCCGGCGACTCATAGGCAGTGGCTTGGTTAAGGGAACCCACCGGAG
CCGTAGCGAAAGCGAGTCTCCATAGGGCAATTGTCACTGCTTATGGACCCGAACCTGGGT
GATCTATCTATGACCAGGATGAAGCTTGGGTGAAACTAAGTGGAGGTCCGAACCGACTGA
TGTTGAAAAATCAGCGGATGAGTTGTGGTTAGGGGTGAAATGCCACTCGAACCCAGAGCT
AGCTGGTTCTCCCCGACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGGCTCTTCCTTC
GGCGGATACTGTGACGATCGGTTGTCCTAGCCGTTTCTGTAACTCTGAAAGCGTTGTGAT
TTCTCCGTCTTTAATCTCATTTAATCGAGCGTTGTTCAATCGGTGATATTGTGTATAAAT
AGTCCGGTAGGTGTTCATCTGTTGGTTGAGGCCAGGCTGCTGCGATCCTGGGAGACTAGG
AATGTGAAGCGTGGTGGTGAGCTAATGTGGATTGATTTGCTTTCGTAGATGTTAACAGGA
ATGGGAAAGGCAGAGGAAACTGTAAAAACAATTCAGCGTTGTTGATGTTTTTCGCGAGGA
ATCTTTGCGCATCTACATACATATTTGCCGAATCTTTGCGAGACAGAGACCCACAGCATG
AGCAGTTTCAGCAGTCCAAGTCACGTTCACGAAGCCGTCTCGCTTAGTCCTCTCCCTCAG
TATCATACTGCTGCCCCCCGCTTTGCTGCAGGGGCCTCATCGAATGCTCCAAGGCCACCT
CTCAATCCAGCAACCAGTCACATGATCCACTCAACCTTTGATGAAAAGGTAATGCAGAAA
GGAAACAAGGCGGATCCATTGTTACACCATGCTCCTGCTCCTGCTCCGGCAGCTTTTTTT
TTGAGAGATGTGAGAAGAACATCAGTTGTTTGGGACCAAGAAGCAGGTAGATACGTATTA
GTACCTGCTACAACATTTGAGGCAAGAACCAGATTAACTTCGCATCACCAGCCAATTCCT
AGCTCACACACTCAGAATCCAAGATCAGTTCTTCCACCTCAAGATTGTTCATCAGGGAAA
GCTCCTCCTCCCCTTCCTCCACCTCAGCAAGGAGAGAGACTGATGTATACAGGTGACTCT
ATCTTCTTTGGAGGTCCGCTGGTAAATATCCCGAACAGAGATGGCCTAAGAAACGAAGGT
GACTCGGGAAGAGAGGGGCAAGACAGAATGACATTGGCATTACCTTTGAGTATTTGATTA
TTGAGAGGTATGCGGAGGACTTAATGAGGTAGAAAGTAGAAATCCTTTGTGAACATTTCT
TCCACGGGTTTAAGCCTTATCTTACTTCATTGCTTTGTATTCGCTTAAAGGACCAGTTTG
TATGACTCCATCAATCCGACCTCTTGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DM62TF U 1
AF RS1BX62TF U 18
AF RS1GM83TF U 348
AF RS1BX62JQ C 694
BS 1 139 RS1DM62TF
BS 140 140 RS1BX62TF
BS 141 312 RS1DM62TF
BS 313 458 RS1BX62TF
BS 459 459 RS1GM83TF
BS 460 807 RS1BX62TF
BS 808 905 RS1GM83TF
BS 906 1469 RS1BX62JQ

RD RS1DM62TF 312 0 0
GAGAACATGAAACCGTAAGCTACCAAGCAGTGGGAGGAGCCTGGGGCTCTGACCGCGTGC
CTGTTGAAGAATGAGCCGGCGACTCATAGGCAGTGGCTTGGTTAAGGGAACCCACCGGAG
CCGTAGCGAAAGCGAGTCTTCATAGGGCAATTGTCACTGCTTATGGACCCGAACCTGGGT
GATCTATCTATGACCAGGATGAAGCTTGGGTGAAACTAAGTGGAGGTCCGAACCGACTGA
TGTTGAAAAATCAGCGGATGAGTTGTGGTTAGGGGTGAAATGCCACTCGAACCCAGAGCT
AGCTGGTTCTCC

QA 1 312 1 312
DS 

RD RS1BX62TF 790 0 0
AGCTCCCAAGCAGTGGGAGGAGCCTGGGGCTCTGACCGCGTGCCTGTTGAAGAATGAGCC
GGCGACTCATAGGCAGTGGCTTGGTTAAGGGAACCCACCGGAGCCGTAGCGAAAGCGAGT
CTCCATAGGGCAATTGTCACTGCTTATGGACCCGAACCTGGGTGATCTATCTATGACCAG
GATGAAGCTTGGGTGAAACTAAGTGGAGGTCCGAACCGACTGATGTTGAAAAATCAGCGG
ATGAGTTGTGGTTAGGGGTGAAATGCCACTCGAACCCAGAGCTAGCTGGTTCTCCCCGAC
TCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGGCTCTTCCTTCGGCGGATACTGTGACGA
TCGGTTGTCCTAGCCGTTTCTGTAACTCTGAAAGCGTTGTGATTTCTCCGTCTTTAATCT
CATTTAATCGAGCGTTGTTCAGTCGGTGATATTGTGTATAAATAGTCCGGTAGGTGTTCA
TCTGTTGGTTGAGGCCAGGCTGCTGCGATCCTGGGAGACTAGGAATGTGAAGCGTGGTGG
TGAGCTAATGTGGATTGATTTGCTTTCGTAGATGTTAACAGGAATGGGAAAGGCAGAGGA
AACTGTAAAAACAATTCAGCGTTGTTGATGTTTTTCGCGAGGAATCTTTGCGCATCTACA
TACATATTTGCCGAATCTTTGCGAGACAGAGACCCACAGCATGAGCAGTTTCAGCAGTCC
AAGTCACGTTCACGAAGCCGTCTCGCTTAGTCCTCTCCCTCAGTATCATACTGCTGCCCC
CCGCTTTGCT

QA 1 790 1 790
DS 

RD RS1GM83TF 558 0 0
GGGCTCTTCCTTCGGCGGATACTGTGACGATCGGTTGTCCTAGCCGTTTCTGTAACTCTG
AAAGCGTTGTGATTTCTCCGTCTTTAATCTCATTTAATCGAGCGTTGTTCAATCGGTGAT
ATTGTGTATAAATAGTCCGGTAGGTGTTCATCTGTTGGTTGAGGCCAGGCTGCTGCGATC
CTGGGAGACTAGGAATGTGAAGCGTGGTGGTGAGCTAATGTGGATTGATTTGCTTTCGTA
GATGTTAACAGGAATGGGAAAGGCAGAGGAAACTGTAAAAACAATTCAGCGTTGTTGATG
TTTTTCGCGAGGAATCTTTGCGCATCTACATACATATTTGCCGAATCTTTGCGAGACAGA
GACCCACAGCATGAGCAGTTTCAGCAGTCCAAGTCACGTTCACGAAGCCGTCTCGCTTAG
TCCTCTCCCTCAGTATCATACTGCTGCCCCCCGCTTTGCTGCAGGGGCCTCATCGAATGC
TCCAAGGCCACCTCTCAATCCAGCAACCAGTCACATGATCCACTCAACCTTTGATGAAAA
GGTAATGCAGAAAGGAAA

QA 1 558 1 558
DS 

RD RS1BX62JQ 776 0 0
CTTTGCGAGACAGAGACCCACAGCATGAGCAGTTTCAGCAGTCCAAGTCACGTTCACGAA
GCCGTCTCGCTTAGTCCTCTCCCTCAGTATCATACTGCTGCCCCCCGCTTTGCTGCAGGG
GCCTCATCGAATGCTCCAAGGCCACCTCTCAATCCAGCAACCAGTCACATGATCCACTCA
ACCTTTGATGAAAAGGTAATGCAGAAAGGAAACAAGGCGGATCCATTGTTACACCATGCT
CCTGCTCCTGCTCCGGCAGCTTTTTTTTTGAGAGATGTGAGAAGAACATCAGTTGTTTGG
GACCAAGAAGCAGGTAGATACGTATTAGTACCTGCTACAACATTTGAGGCAAGAACCAGA
TTAACTTCGCATCACCAGCCAATTCCTAGCTCACACACTCAGAATCCAAGATCAGTTCTT
CCACCTCAAGATTGTTCATCAGGGAAAGCTCCTCCTCCCCTTCCTCCACCTCAGCAAGGA
GAGAGACTGATGTATACAGGTGACTCTATCTTCTTTGGAGGTCCGCTGGTAAATATCCCG
AACAGAGATGGCCTAAGAAACGAAGGTGACTCGGGAAGAGAGGGGCAAGACAGAATGACA
TTGGCATTACCTTTGAGTATTTGATTATTGAGAGGTATGCGGAGGACTTAATGAGGTAGA
AAGTAGAAATCCTTTGTGAACATTTCTTCCACGGGTTTAAGCCTTATCTTACTTCATTGC
TTTGTATTCGCTTAAAGGACCAGTTTGTATGACTCCATCAATCCGACCTCTTGATT

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 4

CO CL2366Contig1 488 4 4 U
GGGCCGTCTCTCTCGTCTCTCCTCTCTGTGTAGATGAATCTCAAAACATGAATCCAAATT
GAGAAACCTCTTTCGTTTTCTTGAATCTGTGGTGGGTCTCTTCGTTTTCTTCATTAAGAG
AAACCTCTTTCTCTCTTTCAGTCTCTGGCGCCTTCTCTTTCTTTCTCAGTCTCTCTCAGG
CGCTCTCTCTCCGGCGACCTTTCTCTCTCTCGCTCAGATTCCGGATCTAAGTAGCAACCG
TACAGCAGCTTGAGTTCATTGCAGAAGCTTGGTCTCAGGATGGATTTGGAGTCTCTTAAT
ACAATAGCAATCCTTGATGCTCAAAGGGAATACATGGACATGAATGAAGAAGATGCTTTG
AATATGGAAAATGCAATGGGGGAGGGAGAAACAGAGATGCAAAACTGTTTTGTTGTTTTT
GATGTTTTTATTTCAAACACAAGCTTGATGCAAAACTATTTTTATTGAGATTGTGCACTA
TCTAGTCC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1B590TF U 1
AF RS1BN31JQ C 1
AF RS1B590JQ C 1
AF RS1BN31TF U 1
BS 1 283 RS1B590TF
BS 284 284 RS1BN31TF
BS 285 350 RS1B590TF
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QA 1 350 1 350
DS 

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GAGAAACCTCTTTCGTTTTCTTGAATCTGTGGTGGGTCTCTTCGTTTTCTTCATTAAGAG
AAACCTCTTTCTCTCTTTCAGTTTCTGGCGCCTTCTCTTTCTTTCTCAGTCTCTCTCAGG
CGCTCTCTTTCCGGCGACCTTTCTCTCTCTCGCTCAGATTCCGGATCTAAGTAGCAACCG
TACAGCAGCTTGAGTTCATTGCAGAAGCTTGGTCTCAGGATGGATTTGGAGTCTCTTAAT
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GATGTTTTTATTTCAAA

QA 1 437 1 437
DS 

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GGGCCGTCTCTCTCGTCTCTCCTCTCTGTGTAGATGAATCTCAAAACATGAATCCAAATT
GAGAAACCTCTTTCGTTTTCTTGAATCTGTGGTGGGTCTCTTCGTTTTCTTCATTAAGAG
AAACCTCTTTCTCTCTTTCAGTTTCTGGCGCCTTCTCTTTCTTTCTCAGTCTCTCTCAGG
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TCTAGTCC

QA 1 488 1 488
DS 

RD RS1BN31TF 488 0 0
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GAGAAACCTCTTTCGTTTTCTTGAATCTGTGGTGGGTCTCTTCGTTTTCTTCATTAAGAG
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CGCTCTCTCTCCGGCGACCTTTCTCTCTCTCGCTCAGATTCCGGATCTAAGTAGCAACCG
TACAGCAGCTTGAGTTCATTGCAGAAGCTTGGTCTCAGGATGGATTTGGAGTCTCTTAAT
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GATGTTTTTATTTCAAACACAAGCTTGATGCAAAACTATTTTTATTGAGATTGTGCACTA
TCTAGTCC

QA 1 488 1 488
DS 



AS 1 4

CO CL2367Contig1 1064 4 2 U
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TTATGGAACTATGTTTCAACCTTCTCAAACCTATCAGGGGATCGACTCAATCAGATCTAC
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TCAACAGCCGGTAGGAGGCAACAAAGATTCAAAACACCAGGACCTCCGCAAGTTCACAAG
GGCATTGACACAGCAAAATTTGAAGCATGGAAAAGGAGAAAAAGAACAGAAAATTACGAT
GTTCATCATCAATCTGAGCGACCACCGATAAGTAACAGCTCTAACTCACTGGGAATACTG
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GGATTCTCAGTAGTTCGAAAAACATAGATACCCCCGGAAGATTCAATTTCTTTTTCCCAA
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GCCAAGGGATAGTACTTCATGCATAGTGCTTTGCTTAGGTGAAATAGCTGTGGATGTTAG
TCTGAACTCTATTTCTTTTATATATGTTATTACCCTTGGAATAG


BQ
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AF RS1CN41JQ C 327
AF RS1CN41TF U 327
AF RS1CA08TF U 1
AF RS1CA08JQ C 292
BS 1 766 RS1CA08TF
BS 767 1064 RS1CA08JQ

RD RS1CN41JQ 217 0 0
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QA 1 217 1 217
DS 

RD RS1CN41TF 217 0 0
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AAACCTATCAGGGGATCGACTCAATCAGATCTACTCCAAATTGAAGCAGGAGAGAGAGGA
GGAAGAAGGGGTTGGACCATCGCAACTAAATGGCTCAACAGCCGGTAGGAGGCAACAAAG
ATTCAAAACACCAGGACCTCCGCAAGTTCACAAGGGC

QA 1 217 1 217
DS 

RD RS1CA08TF 766 0 0
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CCAAAGGAGAAGGTGCTTTTCAAAGTCCGGAGATATTTGCAAATCCTTGGGAGGAGAATA
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TTATGGAACTATGTTTCAACCTTCTCAAACCTATCAGGGGATCGACTCAATCAGATCTAC
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GGCCCTCCACCATCTGATAGAAGCCATCGGGCACGCCAAGCTGGATTTCCGCCAAGATAA
GTTTACTCTGGTACTTAACCAATGCAATATGTATGCTCCGTGCAGC

QA 1 766 1 766
DS 

RD RS1CA08JQ 773 0 0
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ACAATGAGATTATGGAACTATGTTTCAACCTTCTCAAACCTATCAGGGGATCGACTCAAT
CAGATCTACTCCAAATTGAAGCAGGAGAGAGAGGAGGAAGAAGGGGTTGGACCATCGCAA
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GTTCACAAGGGCATTGACACAGCAAAATTTGAAGCATGGAAAAGGAGAAAAAGAACAGAA
AATTACGATGTTCATCATCAATCTGAGCGACCACCGATAAGTAACAGCTCTAACTCACTG
GGAATACTGGGCCCTCCACCATCTGATAGAAGCCATCGGGCACGCCAAGCTGGATTTCCG
CCAAGATAAGTTTACTCTGGTACTTAACCAATGCAATATGTATGCTCCGTGCAGCTGACG
GTGAACTCCGGATTCTCAGTAGTTCGAAAAACATAGATACCCCCGGAAGATTCAATTTCT
TTTTCCCAACACAGCAGCAATGTTTGGTTTTCTCGTTGCTCAAATTGGAGATTGGCATAC
CCGACCAGCTGATGCGGAATGATTACATAATATTATATATATCTGAGAAACTCACAAATT
TGTTATTGAGCCAAGGGATAGTACTTCATGCATAGTGCTTTGCTTAGGTGAAATAGCTGT
GGATGTTAGTCTGAACTCTATTTCTTTTATATATGTTATTACCCTTGGAATAG

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 3

CO CL2368Contig1 935 3 6 U
AAGTTATAAATCATACGAATATTGAATAGCCTCTGAGTTATAAATCATTCTTCAACCCCA
TTATTTTTTATACAAACAATTAAAACATTGGAGGGAAATCAGAATGAATAAAAAAACCGC
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AAGAAGAACACACGCACGCTTTACGAAATGTAATTCATCAGTAACTGATACTTATGTGGT
TTTGGAAATCTAGAGTGTCAGGAGATTAATGATTTTGGCTTTGTAAAAGATCTGGATCTG
TTTCATACTTGCGTGCTCCTGAGGCATCGCCATTTCCTTGATCTAGGGACCTTCTCTAGT
AGCATTTGCAGTCCCATGTTGTTTGCTGACATCCCATACATGTACTTGCTTCGACGAGCC
TTTCTTCTCCAGGAAACAAAAGATGTGATCCACTTAAAGACTGGCGTGAAAGGCAATGTC
CCATCAGCTGATGCTTTCCGTAGAGGCAACCTCCGTTGAGGGACAACTTCCTTTGACAAA
TGTTGAGCAATCTCTTTCAACAGCACCATCTGAGCCTTCTCTGTCCTCATAGAAACAAGC
GCCTGCTTCATCGATTCCCTGTCAGCTTCCAGCGCTTGAAGCCTCATGTATAGTTTCGTT
ATATCAGGATCACCACCAAGATCCTCCATCTCTTCTTCTCTCGGGAAAACCACATTCCCA
TCGGAACTCTCCGCCTCAAGCTTCTTCTGCTCGGTTCCACCACTATGATGATGGACAGAA
TCAATGGTGTAGACTCTATCACTCATGTCATCATCTCCTATATCAGACGAATTATCATTA
GCCACTTTCCTAGGAGACTCAACATAAGCATCAGTCCTGACTTCTTTAGTAGACATCCTC
CTGAAATGCCGTTGAGGCCTTGGACTCTGACCAAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AL32JQ U 286
AF RS1FJ77JQ U 1
AF RS1AL32TF C 317
BS 1 324 RS1FJ77JQ
BS 325 325 RS1AL32JQ
BS 326 590 RS1FJ77JQ
BS 591 591 RS1AL32TF
BS 592 830 RS1FJ77JQ
BS 831 935 RS1AL32TF

RD RS1AL32JQ 293 0 0
AAAA
ATCTGGATCTGTTTCATACTTGCGTGCTCCTGAGGCATCCCCATTTCCTTGATCTAGGGA
CCTTCTCTAGTAACATTTGCAGTCCCATGTTGTTTGCTGACATCCCATACATGTACTTGC
TTCCACGAACCTTTCTTCTCCAGGAAACAAAAAATGTGATCCACTTAAAGACTGGCGTGA
AAGGCAATGTCCCATCAGCTGATGCTTTCCGTAAAGGCAACCTCCGTTGAGGGACAACTT
CCTTTGACAAATGTTGAGCAATCTCTTTCAACAGCACCATCTGAGCCTT

QA 5 293 5 293
DS 

RD RS1FJ77JQ 830 0 0
AAGTTATAAATCATACGAATATTGAATAGCCTCTGAGTTATAAATCATTCTTCAACCCCA
TTATTTTTTATACAAACAATTAAAACATTGGAGGGAAATCAGAATGAATAAAAAAACCGC
ATAGGACAAACATTTTTCTTCTGCAACCCAAGAACAAGAACCCCAGTTCGAGTTGGGAGA
AAGAAGAACACACGCACGCTTTACGAAATGTAATTCATCAGTAACTGATACTTATGTGGT
TTTGGAAATCTAGAGTGTCAGGAGATTAATGATTTTGGCTTTGTAAAAGATCTGGATCTG
TTTCATACTTGCGTGCTCCTGAGGAATCGCCATTTCCTTGATCTAGGGACCTTCTCTAGT
AGCATTTGCAGTCCCATGTTGTTTGCTGACATCCCATACATGTACTTGCTTCGACGAGCC
TTTCTTCTCCAGGAAACAAAAGATGTGATCCACTTAAAGACTGGCGTGAAAGGCAATGTC
CCATCAGCTGATGCTTTCCGTAGAGGCAACCTCCGTTGAGGGACAACTTCCTTTGACAAA
TGTTGAGCAATCTCTTTCAACAGCACCATCTGAGCCTTCTCTGTCCTCATGGAAACAAGC
GCCTGCTTCATCGATTCCCTGTCAGCTTCCAGCGCTTGAAGCCTCATGTATAGTTTCGTT
ATATCAGGATCACCACCAAGATCCTCCATCTCTTCTTCTCTCGGGAAAACCACATTCCCA
TCGGAACTCTCCGCCTCAAGCTTCTTCTGCTCGGTTCCACCACTATGATGATGGACAGAA
TCAATGGTGTAGACTCTATCACTCATGTCATCATCTCCTATATCAGACGA

QA 1 830 1 830
DS 

RD RS1AL32TF 619 0 0
TCG
TGAGGCATCGCCATTTCCTTGATCTAGGGACCTTCTCTAGTAGCATTTGCAGTCCCATGT
TGTTTGCTGACATCCCATACATGTACTTGCTTCGACGAGCCTTTCTTCTCCAGGAAACAA
AAGATGTGATCCACTTAAAGACTGGCGTGAAAGGCAATGTCCCATCAGCTGATGCTTTCC
GTAGAGGCAACCTCCGTTGAGGGACAACTTCCTTTGACAAATGTTGAGCAATCTCTTTCA
ACAGCACCATCTGAGCCTTCTCTGTCCTCATAGAAACAAGCGCCTGCTTCATCGATTCCC
TGTCAGCTTCCAGCGCTTGAAGCCTCATGTATAGTTTCGTTATATCAGGATCACCACCAA
GATCCTCCATCTCTTCTTCTCTCGGGAAAACCACATTCCCATCGGAACTCTCCGCCTCAA
GCTTCTTCTGCTCGGTTCCACCACTATGATGATGGACAGAATCAATGGTGTAGACTCTAT
CACTCATGTCATCATCTCCTATATCAGACGAATTATCATTAGCCACTTTCCTAGGAGACT
CAACATAAGCATCAGTCCTGACTTCTTTAGTAGACATCCTCCTGAAATGCCGTTGAGGCC
TTGGACTCTGACCAAC

QA 4 619 4 619
DS 



AS 1 4

CO CL2369Contig1 743 4 2 U
TTTTTTTTCTCGAGACCAAACTTCATTTTTCTCCTGTCTCTTCACCGTCGGTGTGTGCGT
CATGTATTGAGAGGGCTTTACTACCTTTGCTTTGTTTTCGTAAAAGGGATTCATCGTTGT
GCTTGGATTCAAGATAGGTGTCGGAAGTTCACTCTCTTGACTGTAGAGATGTGGAATAAC
TGAAACGGCGTGGCGAGAAACAGACGGCCTCGGCAACACTGGATCTCATATCTCGACTTC
TCTGGCTAAGATCCCGTTCGAGGACGACGGGTGAGATGAGATGTTGACGGTTTCTAGGGT
TTATGCGGAATGAGGCTTGATGGCGCTCCGGTTTGTGTCGGGATGGGTTTCGAGGGTACA
CGGTGGTTTCAAGCGGACCAGCTGTAGACGTTTGTCCTAGCGTCTTAGGAGCTCTGGTGA
TGTCGTCGGATGACTTCTTCGGGTCGCGCCCCCGACGTTCTAAGGAGTTACCGCCGGAGT
GGTGTTGATTGAACAGAGATGTCGATTTAAATGCCGTTGATGGCGAGAGGTAAATTTTAA
GGTCAAGGCGGTGGGACTCTTAGAGGACGGCTGTCTGTCGTTTAGTTCTAGGGTTTTCTG
CCTAACCGGTTTAATCTGGTTTAGTTCTAGATTTTTTTTTGTAACAGGTTTAGTTCTAGA
TTATATCTGTTTTTCTCATCCAAATCTGAAATTGTAAACCAAAGAATTTTTACCCGGTTT
TGGGCAGGATCTATATATAATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1BP51TF U 1
AF RS1BP51JQ C 50
AF RS1H691JQB C 272
AF RS1H691TF U 272
BS 1 639 RS1BP51TF
BS 640 743 RS1H691TF

RD RS1BP51TF 640 0 0
TTTTTTTTCTCGAGACCAAACTTCATTTTTCTCCTGTCTCTTCACCGTCGGTGTGTGCGT
CATGTATTGAGAGGGCTTTACTACCTTTGCTTTGTTTTCGTAAAAGGGATTCATCGTTGT
GCTTGGATTCAAGATAGGTGTCGGAAGTTCACTCTCTTGACTGTAGAGATGTGGAATAAC
TGAAACGGCGTGGCGAGAAACAGACGGCCTCGGCAACACTGGATCTCATATCTCGACTTC
TCTGGCTAAGATCCCGTTCGAGGACGACGGGTGAGATGAGATGTTGACGGTTTCTAGGGT
TTATGCGGAATGAGGCTTGATGGCGCTCCGGTTTGTGTCGGGATGGGTTTCGAGGGTACA
CGGTGGTTTCAAGCGGACCAGCTGTAGACGTTTGTCCTAGCGTCTTAGGAGCTCTGGTGA
TGTCGTCGGATGACTTCTTCGGGTCGCGCCCCCGACGTTCTAAGGAGTTACCGCCGGAGT
GGTGTTGATTGAACAGAGATGTCGATTTAAATGCCGTTGATGGCGAGAGGTAAATTTTAA
GGTCAAGGCGGTGGGACTCTTAGAGGACGGCTGTCTGTCGTTTAGTTCTAGGGTTTTCTG
CCTAACCGGTTTAATCTGGTTTAGTTCTAGATTTTTTTT
G

QA 1 639 1 639
DS 

RD RS1BP51JQ 694 0 0
GGTGTGTGCGTCATGTATTGAGAGGGCTTTACTACCTTTGCTTTGTTTTCGTAAAAGGGA
TTCATCGTTGTGCTTGGATTCAAGATAGGTGTCGGAAGTTCACTCTCTTGACTGTAGAGA
TGTGGAATAACTGAAACGGCGTGGCGAGAAACAGACGGCCTCGGCAACACTGGATCTCAT
ATCTCGACTTCTCTGGCTAAGATCCCGTTCGAGGACGACGGGTGAGATGAGATGTTGACG
GTTTCTAGGGTTTATGCGGAATGAGGCTTGATGGCGCTCCGGTTTGTGTCGGGATGGGTT
TCGAGGGTACACGGTGGTTTCAAGCGGACCAGCTGTAGACGTTTGTCCTAGCGTCTTAGG
AGCTCTGGTGATGTCGTCGGATGACTTCTTCGGGTCGCGCCCCCGACGTTCTAAGGAGTT
ACCGCCGGAGTGGTGTTGATTGAACAGAGATGTCGATTTAAATGCCGTTGATGGCGAGAG
GTAAATTTTAAGGTCAAGGCGGTGGGACTCTTAGAGGACGGCTGTCTGTCGTTTAGTTCT
AGGGTTTTCTGCCTAACCGGTTTAATCTGGTTTAGTTCTAGATTTTTTTTTGTAACAGGT
TTAGTTCTAGATTATATCTGTTTTTCTCATCCAAATTTGAAATTGTAAACCAAAGAATTT
TTACCCGGTTTTGGGCAGGATCTATATATAATTT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RS1H691JQB 472 0 0
G
GAGATGAGATGTTGACGGTTTCTAGGGTTTATGCGGAATGAGGCTTGATGGCGCTCCGGT
TTGTGTCGGGATGGGTTTCGAGGGTACACGGTGGTTTCAAGCGGACCAGCTGTAGACGTT
TGTCCTAGCGTCTTAGGAGCTCTGGTGATGTCGTCGGATGACTTCTTCGGGTCGCGCCCC
CGACGTTCTAAGGAGTTACCGCCGGAGTGGTGTTGATTGAACGGAGATGTCGATTTAAAT
GCCGTTGATGGCGAGAGGTAAATTTTAAGGTCAAGGCGGTGGGACTCTTAGAGGACGGCT
GTCTGTCGTTTAGTTCTAGGGTTTTCTGCCTAACCGGTTTAATCTGGTTTAGTTCTAGAT
TTTTTTTTGTAACAGGTTTAGTTCTAGATTATATCTGTTTTTCTCATCCAAATCTGAAAT
TGTAAACCAAAGAATTTTTACCCGGTTTTGGGCAGGATCTATATATAATTT

QA 2 472 2 472
DS 

RD RS1H691TF 472 0 0
G
GAGATGAGATGTTGACGGTTTCTAGGGTTTATGCGGAATGAGGCTTGATGGCGCTCCGGT
TTGTGTCGGGATGGGTTTCGAGGGTACACGGTGGTTTCAAGCGGACCAGCTGTAGACGTT
TGTCCTAGCGTCTTAGGAGCTCTGGTGATGTCGTCGGATGACTTCTTCGGGTCGCGCCCC
CGACGTTCTAAGGAGTTACCGCCGGAGTGGTGTTGATTGAACGGAGATGTCGATTTAAAT
GCCGTTGATGGCGAGAGGTAAATTTTAAGGTCAAGGCGGTGGGACTCTTAGAGGACGGCT
GTCTGTCGTTTAGTTCTAGGGTTTTCTGCCTAACCGGTTTAATCTGGTTTAGTTCTAGAT
TTTTTTTTGTAACAGGTTTAGTTCTAGATTATATCTGTTTTTCTCATCCAAATCTGAAAT
TGTAAACCAAAGAATTTTTACCCGGTTTTGGGCAGGATCTATATATAATTT

QA 2 472 2 472
DS 



AS 1 3

CO CL2370Contig1 917 3 11 U
GGTGGGGAAGAACACTATGATGAAGAGATCTGTTAAGCTTCATGCTCAGAAGACGGGGAA
CGATGGGTTCCTCAATCTCATGCCTCTTCTTCAGGGGAACGTTGGGCTTATTTTTACCAA
GGGTGACTTGAAGGAAGTCAGTGAGGAGGTTGCTAAGTACAAGGTTGGAGCACCAGCTCG
TGTTGGCTTAGTCGCTCCAATCGATGTGGTTGTGCAACCAGGCAACACTGGCCTCGACCC
ATCGCAGACCTCTTTCTTCCAAGTGCTCAACATTCCAACCAAGATCAACAAAGGCACGGT
TGAGATCATAACCCCTGTGGAGCTCATCAAGAAAGGCGACAAAGTCGGTTCATCCGAGGC
AGCTCTTCTAGCCAAGCTCGGTATCAGGCCGTTCTCTTATGGTCTCGTCGTGGAGTCGGT
CTACGACAACGGCTCTGTGTTTGACCCTGAGGTGCTTAACCTCACTGAAGACGACCTTGT
TGAAAAGTTTGCAGCTGGTGTCTCGCTGGTGACCGCGTTTTCTCTTGCCATCTCTTACCC
AACCATAGCAGCTGCCCCTCACATGTTCCTCAATGCTTACAAGAATGTTCTTGCTATTGC
ATTGGCTACTGAGTATTCTTTCCCTCAGGCTGAGAATGTGAAGGAGTTCCTCAAGGATCC
AAGCAAGTTTGCTGTTGCTTCGGCGGTTGCACCTGTTTCAGGAGAATCTAGTGGAGCTCC
TGTGGTGGCAGCTGTGGAGGAAGAAGCTGCGGAGGAGTCTGATGGAGACATGGGATTCGA
TCTGTTCGGCTAAAATATGCCCGTCTTAAGCTTTGCACCTGTTATTTTTATGATTATCAG
TTTAAGTTTAACTTTTTATTAAAATTTACTTTCAGAATTTTGTTGTTGCAATTTATGGAT
ATTTTATTTTATCTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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DS 

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G
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TTTCTTCCAGGTGCTCAACATTCCAACCAAGATCAACAAAGGCACGGTTGAGATCATAAC
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CTCTGTGTTTGACCCTGAGGTGCTTAACCTCACTGAAGACGACCTTGTTGAAAAGTTTGC
AGCTGGTGTCTCGCTGGTGACCGCGTTTTCTCTTGCCATCTCTTACCCAACCATAGCAGC
TGCCCCTCACATGTTCCTCAATGCTTACAAGAATGTTCTTGCTATTGCATTGGCTACTGA
GTATTCTTTCCCTCAGGCTGAGAATGTGAAGGAGTTCCTCAAGGATCCAAGCAAGTTTGC
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TTTTTATTAAAATTTACTTTCAGAATTTTGTTGTTGCAATTTATGGATATTT

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DS 

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G
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GGTGCTTAACCTCACTGAAGACGACCTTGTTGAAAAGTTTGCAGCTGGTGTCTCGCTGGT
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CAATGCTTACAAGAATGTTCTTGCTATTGCATTTCCTACTGAGTATTCTTTCCCTCAGGC
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CTTTGCACCTGTTATTTTTATGATTATCAGTTTAAGTTTAACTTTTTATTAAAATTTACT
TTCAGAATTTTGTTGTTGCAATTTATGGATATTTTATTTTATCTATC

QA 2 528 2 528
DS 



AS 1 2

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TGCGATCTCGGTGAACTCGGCGATCTCCGGCAAATTCTGCGATCTCGGTGAACTCGGCGA
TCTCTCGGCGAATTTGGCAATCTTCGACAAACTCGACGCAACTCCGAGCAGGACTGAGCG
ATAGTCATGGAGATTAGTAAGTTCTCTCAGTTTAGTTCTTTTGAATCTATACCTGAACAG
AGAAGCGGAGGAGGAGAGCGAGAGCAGAAATCAAAGACATGAAGAGGGTCCAAAAGGAAC
TCGAAGAGCAGCTTTATATGGGCAATCGTCGGTTAGAGTTGGTCGAGAAAGAGAGAGACG
AAGCTATTAAAAAAATTGAAGAGCTTTTGATAGATCTATACCTGGAGAAGGGTGAGTCAT
CATCACATTCGCCTTCATCCTGGTCGCAGTGGTCTGTTTCCAACGAGCCTCCCCCATATT
TCATCTGTCCCATTTCAAAGGGTTTCTCTCAATGGATGTGGATGTGGCGATGGTGTTAGA
GGTGTGATTGGAGATCTGGTTTTGAATTGTAAAGACCAGAGTTTAGGATTCAGAGCTCCT
AAGATCTCTCTATCTCCGAGAAGGTGTCTCTTGGCAAAAGAAAGGTTACAACTTTGTTTA
GGTTCTTGAAAGGATGTGGTTTTTTTTTTCTTTTGTGGGCTTTTGATCATGTTTTTGGTG
GAAAAAAAATTCTGCTGATGGAAGAAGCAAAACAGTTTTTGGTATCTCACTTGTCACGAC
CAAGCAATAGTGTTGCATCTCCAGGTCTTTGTATGTGCATAATGAAAGAATGTTTCTGTG
GCTAATAAGTGTATTAGTAGTGAAGTTACTACTGTTAATCCAGCTGTGAGCCATTTCAGG
CCTAAGATGGTGCTCAATGGTGCTGCTTCTCAGGGCACTGGTGTTCCAGCAAATTCTTTT
GGAAATTGCAGCTGTGAAAATGAACTCCTAGGAGAAGATCGAGTCTGATCTGAGCATCTA
TATACAAAAAATTCTCAAGCACAATCCTGCTGAGAGAATTGCAGCAAAAACAGCACTCGG
TCACCCTTACTTTGACAGCCTTGACAAGTCCCAGCTCTGAAGTTTCCCTTCAATTCAAGA
ATACTACTTTATTTTTGAGTTGAGAAGTTTAATTGTTGTGTCTTGTTGTCATCGTCTCGG
TGAAACATCAACATTTGATTTCTGTTGCTTTCCAGACACATCAGTGTCCCATGATTGGAT
TGGTCTTTTCTATATTGAGTGTAAAAAATGTTAAGATTTTCATAAGATTTCTTCTTTATT
TTGT


BQ
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10 10 10 10 

AF RS1E929TF U 1
AF RS1E929JQ C 533
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TGCGATCTCGGTGAACTCGGCGATCTCCGGCAAATTCTGCGATCTCGGTGAACTCGGCGA
TCTCTCGGCGAATTTGGCAATCTTCGACAAACTCGACGCAACTCCGAGCAGGACTGAGCG
ATAGTCATGGAGATTAGTAAGTTCTCTCAGTTTAGTTCTTTTGAATCTATACCTGAACAG
AGAAGCGGAGGAGGAGAGCGAGAGCAGAAATCAAAGACATGAAGAGGGTCCAAAAGGAAC
TCGAAGAGCAGCTTTATATGGGCAATCGTCGGTTAGAGTTGGTCGAGAAAGAGAGAGACG
AAGCTATTAAAAAAATTGAAGAGCTTTTGATAGATCTATACCTGGAGAAGGGTGAGTCAT
CATCACATTCGCCTTCATCCTGGTCGCAGTGGTCTGTTTCCAACGAGCCTCCCCCATATT
TCATCTGTCCCATTTCAAAGGGTTTCTCTCAATGGATGTGGATGTGGCGATGGTGTTAGA
GGTGTGATTGGAGATCTGGTTTTGAATTGTAAAGACCAGAGTTTAGGATTCAGAGCTCCT
AAGATCTCTCTATCTCCGAGAAGGTGTCTCTTGGCAAAAGAAAG*TTACAACTTTGTTTA
G*TTCTTGAAAGGATGTGGTTTTTTTTT*CTTTTGTGGGCTTTTGATCATGTTTT*GGTG
GAAAAAAA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1E929JQ 792 0 0
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GAGCTC*TAAGATCTCTCTATCTCCGAGAAGGTGTCTCTTGGCAAAAGAAAGGTTACAAC
TTTGTTTAGGTTCTTGAAAGGATGTGGTTTTTTTTTTCTTTTGTGGGCTTTTGATCATGT
TTTTGGTGGAAAAAAAATTCTGCTGATGGAAGAAGCAAAACAGTTTTTGGTATCTCACTT
GTCACGACCAAGCAATAGTGTTGCATCTCCAGGTCTTTGTATGTGCATAATGAAAGAATG
TTTCTGTGGCTAATAAGTGTATTAGTAGTGAAGTTACTACTGTTAATCCAGCTGTGAGCC
ATTTCAGGCCTAAGATGGTGCTCAATGGTGCTGCTTCTCAGGGCACTGGTGTTCCAGCAA
ATTCTTTTGGAAATTGCAGCTGTGAAAATGAACTCCTAGGAGAAGATCGAGTCTGATCTG
AGCATCTATATACAAAAAATTCTCAAGCACAATCCTGCTGAGAGAATTGCAGCAAAAACA
GCACTCGGTCACCCTTACTTTGACAGCCTTGACAAGTCCCAGCTCTGAAGTTTCCCTTCA
ATTCAAGAATACTACTTTATTTTTGAGTTGAGAAGTTTAATTGTTGTGTCTTGTTGTCAT
CGTCTCGGTGAAACATCAACATTTGATTTCTGTTGCTTTCCAGACACATCAGTGTCCCAT
GATTGGATTGGTCTTTTCTATATTGAGTGTAAAAAATGTTAAGATTTTCATAAGATTTCT
TCTTTATTTTGT

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 4

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GGGGAACTTGTTGTGTTAAATCATCTCTCTCAACAAAACAGAGAGAAAATCACTATAAAT
CTTTAATTTTATTTGAAAAACCAATGGCGGATCGGATTAAAGGTCCATGGAGTCCTGAAG
AAGACGAGCAGCTTCGTAGGCTCGTTGTTAAATACGGTCCGAGAAACTGGACAGTGATTA
GCATCAATCCCCGGTAGATCGGGAAAATCGTGTCGGTTACGGTGGTGCAACCAGCTTTCG
CCGCAGGTCGAGCACCGGCCGTTCTCGGCGGAGGAAGACGAGACGATCGCGCGCGCGCAC
GCTCAGTTCGGTAACAAATGGGCCACGATAGCCCGTCTCCTCAACGGCCGTACGGACAAC
GCCGTGAAGAATCACTGGAACTCGACGCTCAAGAGGAAATGCGGTGGTTTCGACCACCGT
TACGAGGCTCCGGCGGAGGAGGAGGAGGAGGATCGAAGGCCGGCGAAGAGATCGGTGAGC
GACGGATGTCCACCAGTTGCTACTGGGCTTTATATGAGCCCAGGAAGCCCAACTGGATCT
GATGTCAGCGATTCGAGTACGATACCGGTTCTGCACTCTGTTGGGCTTTTCAGGCCCGTT
CCACGTGCGGGTGGTGTCGCGCTGCCGCTTCCCGTCGAAACGTCGTCGTCTTCTGGTGAC
CCCGCGACTTCGCTGAGCTTGTCGCTTCCTGGTGCTGACGTCAGCGAGGAGTCAAACCGT
AGTCACGAGTCAACTAATATCAACAACACTTGGAGCCGACAGAACAAAAAAACAGAGTCG
CTGTTACCATTTTCTGTCGGATTCCGAGGTGCGATTGAGGAAATGGGGAAGTCGTTTGCT
GGGAACGGCGGGGAGTTTATGGCGATGGTGCAGGAGATGATAAAGGCGGAGGTGAGGAGT
TACATGATGGATATGCATAGAAACCATAATGGGATGATTCCGATGAGTCAAATTGGAGTC
GGGAGAATCGAGTAGAAAAGGGAGAGTTTAGTAACTGTTACAATCAATATGTGAAACCAA
CCGCTATGGAAATCTGGAGGAAGAGAAGAAAAAACTCTTTGTTTCTCTTTCTCATTTGGG
ATTAGACATTTAAGAATTTTGGGACTTAAGAAATGTATAGAGCGGAAGTCGAATGAGCAA
AATCTCGGTTCGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1G515TF U 1
AF RS1FJ46TF U 1
AF RS1FJ46JQ C 651
AF RS1G515JQ C 651
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RD RS1G515TF 589 0 0
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TACGAGGCTCCGGCGGAGGAGGAGGAGGAGGATCGAAGGCCGGCGAAGAGATCGGTGAGC
GACGGATGTCCACCAGTTGCTACTGGGCTTTATATGAGCCCAGGAAGCCCAACTGGATCT
GATGTCAGCGATTCGAGTACGATACCGGTTCTGCACTCTGTTGGGCTTT

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1FJ46TF 762 0 0
GGGGAACTTGTTGTGTTAAATCATCTCTCTCAACAAAACAGAGAGAAAATCACTATAAAT
CTTTAATTTTATTTGAAAAACCAATGGCGGATCGGATTAAAGGTCCATGGAGTCCTGAAG
AAGACGAGCAGCTTCGTAGGCTCGTTGTTAAATACGGTCCGAGAAACTGGACAGTGATTA
GCATCAATCCCCGGTAGATCGGGAAAATCGTGTCGGTTACGGTGGTGCAACCAGCTTTCG
CCGCAGGTCGAGCACCGGCCGTTCTCGGCGGAGGAAGACGAGACGATCGCGCGCGCGCAC
GCTCAGTTCGGTAACAAATGGGCCACGATAGCCCGTCTCCTCAACGGCCGTACGGACAAC
GCCGTGAAGAATCACTGGAACTCGACGCTCAAGAGGAAATGCGGTGGTTTCGACCACCGT
TACGAGGCTCCGGCGGAGGAGGAGGAGGAGGATCGAAGGCCGGCGAAGAGATCGGTGAGC
GACGGATGTCCACCAGTTGCTACTGGGCTTTATATGAGCCCAGGAAGCCCAACTGGATCT
GATGTCAGCGATTCGAGTACGATACCGGTTCTGCACTCTGTTGGGCTTTTCAGGCCCGTT
CCACGTGCGGGTGGTGTCGCGCTGCCGCTTCCCGTCGAAACGTCGTCGTCTTCTGGTGAC
CCCGCGACTTCGCTGAGCTTGTCGCTTCCTGGTGCTGACGTCAGCGAGGAGTCAAACCGT
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QA 1 762 1 762
DS 

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GGTGAGGAGTTACATGATGGATATGCATAGAAACCATAATGGGATGATTCCGATGAGTCA
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GTGAAACCAACCGCTATGGAAATCTGGAGGAAGAGAAGAAAAAACTCTTTGTTTTTCTTT
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DS 

RD RS1G515JQ 503 0 0
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AACAGAGTCGCTGTTACCATTTTCTGTCGGATTCCGAGGTGCGATTGAGGAAATGGGGAA
GTCGTTTGCTGGGAACGGCGGGGAGTTTATGGCGATGGTGCAGGAGATGATAAAGGCGGA
GGTGAGGAGTTACATGATGGATATGCATAGAAACCATAATGGGATGATTCCGATGAGTCA
AATTGGAGTCGGGAGAATCGAGTAGAAAAGGGAGAGTTTAGTAACTGTTACAATCAATAT
GTGAAACCAACCGCTATGGAAATCTGGAGGAAGAGAAGAAAAAACTCTTTGTTTCTCTTT
CTCATTTGGGATTAGACATTTAAGAATTTTGGGACTTAAGAAATGTATAGAGCGGAAGTC
GAATGAGCAAAATCTCGGTTCGC

QA 1 503 1 503
DS 



AS 1 4

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GCAAGAAAAGACCATGTATTTAGCTTTGTATAATAAAGTGTAGATTCAGGTGCACCTAGG
GAATAAAATGGGATTTTAACAAAAACAAAAAATAAACAAATCAACTACAAAAGAATCCTC
ACAATAAAAATACAAAGAATTGAAAGGAGAAAAAGGAGAGGAAGATTTAACGTAAAACCT
AACTGTCTCTAGAGTCTTCAAAATCTTCTGCTCTTCTTTTGTGTTCAAGAGTTTTGCCCA
TACATACTACAAATACAAAATACAATCACAATCACTTTTCAACTAACTCTTGATCCTCCT
CTTCATTCATCTCTTCTAAAGCTAAAACATTCGTGCTCACTGACTCTTTCCTACTCCTCG
CAACTCTAATCACTTCAACGCTTGAAAACTGAACACCTTTCTCTGTTTTAGTCCACGCCA
ATGTAGGCATTGTTCGGAATCAAATCTTGCAGATCATTCTCTTCATTTGCGTAGCTGCAC
CTCTTGCTTCTCACTTCAGCCACCTTCTTGTGTGAGTTTGAGTGGAGAGCTGGAGTGAAT
GTTGGACTATTAGCTGGACGGTACTCCGGGAAAAGCCTTCCAGACTTGTAACGCACGCCA
CACGCGTTGAAAAGCGTCTTTGGGCCCATAGGCCCAAGCCTCCACTGTGGAGTCTTGGTA
ACCTCACAGTGCATACATTTCCTAACCGGATGCTGCTCTGAATCATAGGAATCAACGTTG
TTGCTTCCATTGGTTTCGAGATCAATCCCCGACGAAGAAGAGGAAGAAATAACCTTGGCC
TTCTTCTTCTTCTTCTTGGTGATCATCTTGCTGTGGTCAGAGAGAAACTGCTTTGGTATT
CTAACGATGAGACGCGAGTCCGCCCCGCAAACATTGGCTCTATCCATCTCCTGGACCGGT
GGACGAGGGCGTTTTGTGCGTGGACGACCGTGCTTTCCAGAGAGGACAAGCGAGGTTGTG
TTGGTCGTCTGAGACGAGGAGGAGCTGCTCTCGAGTACCGACACTGGACTTGAGCTCCTG
AAATGGCTATGAGAAGACGATGAATCCGTGTTTGTGGAAAACGTATCTTCCTTCTTCTCA
ACCAAAGACTCCTCTACAAAGCTTTCTGGCTTTTCCACCTTAACAATATCCTCAAACGGA
ACATAGAGCTCAGGTGATGAGTCAGATTTTGCGTTGGAAGAGAAGAGAGGGTCAGAAGCG
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TTGAAACCGACATCCATATCACAACCGGGAAAGTCAAGAATGTCGTCCATGTTGTCAAAG
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AF RS1EP49JQ U 172
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AF RS1EP49TF C 789
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AS 1 2

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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G727TF U 1
AF RS1FQ70TF U 1
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AATTTGAGGGAAAACTGGTTGGAGACCCTTTTTTGATAATGCGTATTATTGGTTATCCAG
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CAATGGAGTATATGAATCC

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 4

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AATGGCAGCACAAGCACTTGTGTCTTCTTCACTTACCTCCTCTGTTCAGACCGCTAGACA
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CAATGGAAGGTTCGCTATGTTGGGTGCAGCTGGAGCTATTGCCCCTGAGATTCTTGGCAA
AGCTGGTTTGATTCCAGCAGACACTGCTCTTCCCTGGTTCCAAACCGGTGTGATTCCACC
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ACGACAATGGCT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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QA 1 635 1 635
DS 

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AGCTGGTTTGATTCCAGCAGACACTGCTCTTCCCTGGTTCCAAACCGGTGTGATTCCACC
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TGGACCTTTCTTTAACCCTCTTGGGTTTGGAAAAGACGAGAAGTCAATGAAG*AGTTGAA
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GG*ACTAGTGACCGGTGTGGGGCCTTACCA

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CTTTCAGACCCAGAAGGTACTGGAGGTTTTATCGAGCCAAGATGGTTAGCCTACGGAGAG
ATCATCAATGGAAGGTTCGCTATGTTGGGTGCAGCTGGAGCTATTGCCCCTGAGATTCTT
GGCAAAGCTGGTTTGATTCCAGCAGACACTGCTCTTCCCTGGTTCCAAACCGGTGTGATT
CCACCTGCAGGGACATACAGCTACTGGGCATACCCTTACACGCTCTTTGTTCTCGAGATG
GCTTTGATGGGATTTGCTGAGCATCGGAGGTTGCAGGACTGGTACAACCCAGGATCAATG
GGAAAACAGTACTTCTTGGGCTTAGAGAAAGGTTTTGCCGGTTCAGGAGACCCGTCTTAC
CCGGGTGTACCTTTCTTTAACCCTCTTGGGTTTGGAAAAGACGAGAAGTCAATGAAGGAG
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GTGCAGGGACTAGTGACCGGTGTGGGGCCTTACCAGAACCTTCTTGATCATTTGGCGGAT
CCAGTCAACAACAATGTCTTGACCAGCCTTAAGTTCCACTGAGATGATTATCACATCATC
CCATGTGTTTTATGTTGGTCTCTCATTCTCTTGTATCCTTCAATCTTGTTGCTTTCTCTT
GGTATCACCAGCTTCGATCGTATTGTAACACCCTTTGTGGTGAACATATCCGTCTTTTGT

QA 1 780 1 780
DS 

RD RS1AP62TFB 636 0 0
G
ATTGCCCCTGAGATTCTTGGCAAAGCTGGTTTGATTCCAGCAGACACTGCTCTTCCTTGG
TTCCAAACCGGTGTGATTCCACCTGCAGGGACATACAGCTACTGGGCAGACCCTTACACA
CTCTTTGTTCTCGAGATGGCTTTGATGGGATTTGCTGAGCACCGGAGGTTGCAGGACTGG
TACAACCCAGGATCAATGGGAAAACAGTACTTCTTAGGCTTAGAGAAAGGTTTTGCCGGT
TCAGGAGACCCGTCTTACCCCGGTGGACCTTTCTTTAACCCTCTTGGGTTTGGAAAAGAC
GAGAAGTCAATGAAGGAGTTGAAACTCAAAGAGGTCAAGAACGGTAGACTGGCTATGCTC
GCAATCCTAGGCTATTTTGTGCAGGGACTAGTGACCGGTGTGGGGCCTTACCAGAACCTT
CTTGATCATTTGGCGGATCCAGTCAACAACAATGTCTTGACCAGCCTTAAGTTCCACTGA
GATGATCATCACATCATCCCATGTGTTTTATGTTGGTCTCTCATTCTCTTGTATCCTTCA
ATCTTGTTGCTTTCTTTTGTTATCACCATCTTCG*TCGTGTTGTAACACCCTTTGTGATG
AACATATCCGTCTTTTGTAAGAAACGACAATGGCT

QA 2 636 2 636
DS 



AS 1 4

CO CL2376Contig1 698 4 2 U
GGAACCTTTCCCTATATATAAGACTTGCTTTGGCTCGAGTTATAATATAATCTCTAAAGT
TATATATTTAATTACTAACTCTTTCTCTCTTCTCACAAATGGCTTCTGTGCAATATGGTT
TGGATCAGGGCATGGAGACTTTCAACGATGAGCTTATGATCATGTCGTTCTTGGAAGAAG
AATCGCCCGCTGAAAATCATATCAGCGTTAACGAAGAGGAAGAAGAGAAACTAAACCGCG
TGATTAGATCGTTAGAAGTGGAGATCAACATGAGTTCTCCGACCATAGAATCTCAAAAAA
CGGATCTGCAAGAGATCGCAAAGCCCGGTCTTGAAGATGATTTCGGGTGGCTTAACGACT
TTGATATTGGTCTGGTTTCGTCTCAGAATGATGATGAGATGACGAACTGGTGTATGGAAC
TTTCTTACATGGATGGTATGGATAGTAGTGTTCTTGAGATCGAAGGT**TGATTATTATT
CTCATGTTAACTATGGACTTACATTTGAGGAACCAAATCTTACTTTGTGGCAAGAGAATA
ATAATGATGTAGTTATGTTTTAATTGGTCTTCGAGAAGTCCTGATATAACAAAAGCTGTT
TCAATATCAGTTGATTATATAAATAATGTAATGATATGATCACTTGAGAAGACTAATTAC
CAAAACTAGCATATGTATCAACATGAGTTGGATATAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GM21TF U 1
AF RS1GM21JQ C 105
AF RS1C967TF U 47
AF RS1FY81TF U 257
BS 1 656 RS1GM21TF
BS 657 698 RS1FY81TF

RD RS1GM21TF 663 0 0
GGAACCTTTCCCTATATATAAGACTTGCTTTGGCTCGAGTTATAATATAATCTCTAAAGT
TATATATTTAATTACTAACTCTTTCTCTCTTCTCACAAATGGCTTCTGTGCAATATGGTT
TGGATCAGGGCATGGAGACTTTCAACGATGAGCTTATGATCATGTCGTTCTTGGAAGAAG
AATCGCCCGCTGAAAATCATATCAGCGTTAACGAAGAGGAAGAAGAGAAACTAAACCGCG
TGATTAGATCGTTAGAAGTGGAGATCAACATGAGTTCTCCGACCATAGAATCTCAAAAAA
CGGATCTGCAAGAGATCGCAAAGCCCGGTCTTGAAGATGATTTCGGGTGGCTTAACGACT
TTGATATTGGTCTGGTTTCGTCTCAGAATGATGATGAGATGACGAACTGGTGTATGGAAC
TTTCTTACATGGATGGTATGGATAGTAGTGTTCTTGAGATCGAAGGT**TGATTATTATT
CTCATGTTAACTATGGACTTACATTTGAGGAACCAAATCTTACTTTGTGGCAAGAGAATA
ATAATGATGTAGTTATGTTTTAATTGGTCTTCGAGAAGTCCTGATATAACAAAAGCTGTT
TCAATATCAGTTGATTATATAAATAATGTAATGATATGATCACTTGAGAAGACTAA
AAAAAAA

QA 1 656 1 656
DS 

RD RS1GM21JQ 550 0 0
TCTGTGCAATATGGTTTGGATCAGGGCATGGAGACTTTCAACGATGAGCTTATGATCATG
TCGTTCTTGGAAGAAGAATCGCCCGCTGAAAATCATATCAGCGTTAACGAAGAGGAAGAA
GAGAAACTAAACCGCGTGATTAGATCGTTAGAAGTGGAGATCAACATGAGTTTTCCGACC
ATAGAATTTCAAAAAACGGATTTGCAAGAGATCGCAAAGCCCGGTCTTGAAGATGATTTC
GGGTGGCTTAACGACTTTGATATTGGTCTGGTTTCGTCTCAGAATGATGATGAGATGACG
AACTGGTGTATGGAACTTTTTTACATGGATGGTATGGATAGTAGTGTTCTTGAGATCGAA
GGT**TGATTATTATTTTCATGTTAACTATGGACTTACATTTGAGGAACCAAATCTTACT
TTGTGGCAAGAGAATAATAATGATGTAGTTATGTTTTAATTGGTTTTCGAGAAGTCCTGA
TATAACAAAAGCTGTTTCAATATCAGTTGATTATATAAATAATGTAATGATATGATCACT
TGAGAAGACT

QA 1 550 1 550
DS 

RD RS1C967TF 592 0 0
GG
AATCTCTAAAGTTATATATTTAATTACTAACTCTTTCTCTCTTCTCACAAATGGCTTCTG
TGCAATATGGTTTGGATCAGGGTATGGAGACTTTCAACGATGAGCTTATGATCATGTCGT
TCTTGGAAGAAGAATCGCCCGCTGAAAATCATATCAGCGTTAACGAAGAGGAAGAAGAGG
AACTAAACCGCGTGATTAGATCGTTAGAAGTGGAGATCAACATGAGTTCTCCGACCATAG
AATCTCAAAAAACGGATCTGCAAGAGATCGCAAAGCCCGGTCTTGAAGATGATTTCGGGT
GGCTTAACGACTTTGATATTGGTCTGGTTTCGTCTCAGAATGATGATGAGATGACGAACT
GGTGTATGGAACTTTCTTACATGGATGGTATGGATAGTAGTGTTCTTGAGATCGAAGGTA
GTGATTATTATTCTCATGTTAACTATGGACTTACATTTGAGGAACCAAATCTTACTTTGT
GGCAAGAGAATAATAATGATGTAGTTATGTTTTAATTGGTCTTCGAGAAGTCCTGATATA
ACAAAAGCTGTTTCAATATCAGTTGATTATATAAATAATGTAATGATATG

QA 3 592 3 592
DS 

RD RS1FY81TF 442 0 0
G
GTGGAGATCAACATGAGTTCTCCGACCATAGAATCTCAAAAAACGGATCTGCAAGAGATC
GCAAAGCCCGGTCTTGAAGATGATTTCGGGTGGCTTAACGACTTTGATATTGGTCTGGTT
TCGTCTCAGAATGATGATGAGATGACGAACTGGTGTATGGAACTTTCTTACATGGATGGT
ATGGATAGTAGTGTTCTTGAGATCGAAGGTAGTGATTATTATTCTCATGTTAACTATGGA
CTTACATTTGAGGAACCAAATCTTACTTTGTGGCAAGAGAATAATAATGATGTAGTTATG
TTTTAATTGGTCTTCGAGAAGTCCTGATATAACAAAAGCTGTTTCAATATCAGTTGATTA
TATAAATAATGTAATGATATGATCACTTGAGAAGACTAATTACCAAAACTAGCATATGTA
TCAACATGAGTTGGATATAAA

QA 2 442 2 442
DS 



AS 1 4

CO CL2377Contig1 1424 4 6 U
GAGTCATCATCAATCAATGCATAGTCAAAAACTCAGTAACACAAAGTATTCAAGCTTAAA
GAAATACATAAAAATAAAATTCCAAGTCGAGGAGCTTTCACTGACGTTCTAACAAACTCT
ACAAGAGCTCATTTACATTCTCAACAAAATAAGTTCCTTCTGCTTCCACACTAACCTCTC
TAAGTCTCAACATTCGCTCTGTTTCCTGCGAGGATAATGGAGATCTCGAGTCCACGACTG
AAGGCTTGGTTGAAGAGGAGACGAGACTGGAACGTGGAGATGAGGGGAACCAGGAGAGGA
GAGCAATGGGAACAAAGATGAGCATACCCATCGCAGCATCATAGATGCGTCCAAACTCAC
GGACTGTCTCCCACAAACCAAACAGCTTGATCAACCACTTCCATGTGATGGCTAAAGACA
GTAATGCCCAACCTGTAGGGATGAATCCGAGTACACATGCAAACATGTCTGGAATGGAGA
GTTCTGTAAATGCAATGGCTAAAGCGATGAGGGCGATGACGGTGAGTGAAACCACTCCCT
GCAGGAAACGCAGAGCCAGCAGAATGTTGCTCGACTTCCTGGGGCTATACCAGAATAGCT
TAAACAGGAGCACAACTGCAACAAACAATATCCACGAATAGCCATATAACGCAAGTGAGG
TGTCTTTCCCAGTGAGATTGAGCTTGTACACAACGCCATACTGAAACATGAAGAACCTCA
AGCTCAAAATGGTCTCCAGAATCCGTCCTCTTAATGTCTGGATATGCATCTGTTCTTCCT
CCCACCACGACTCCCAACTCAGCTCTCCCTTCACTCCAACTCCGCCTTTGTACATCAGCC
AACTGACCCAGTTATCGAAATCCTCGACGGTCTTTTGCCATTCGAATCCAGATGGGTTGA
AGATGTACGGTGCAAACAGCCAGGAGATTACCAGGAACCAACTGCTGATAGTAAGCAGAA
CGAACGAAACAGCACCTCCATCCGTATACCCGTAGGCAATGTAGACGATCAGCAGTAGAG
CTACTTCAAAAGCTTTCACAAAATGACTTCTGGAATAGAGTCTGTAGTTATCCGCAAACT
TGATGTGCTGAACCACAAAGCCTCTGCCAGTAGCTCGATACTTCGCACCACCGTGAAGGA
TAGTACGTCCAAAGTAATGAGTCCTTGTCCCAAGAGAAAATGTGAAAAAGACCGAGCAAA
GCTGAAACTGCATCGTAATAAAGCTGAAAATAGCCTTCAGCAATCCAAGTTCAAGTATGA
AACCCATAACCATAGGAACGGCAGTAAAGACTCCAATCTGAACCAAAAACTGTGCATTGA
GCGCAGCATCCAATGCAGTGTTACCAGAGAGTTTGGCTACTCTTGAAATTGCACGATCGG
AACCGGAAAAGGCCAGATACACTCTTCCGTACAGAAACACATAC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D430JQ U 1
AF RS1BK95JQ U 5
AF RS1D430TF C 311
AF RS1BK95TF C 645
BS 1 173 RS1D430JQ
BS 174 174 RS1BK95JQ
BS 175 254 RS1D430JQ
BS 255 818 RS1BK95JQ
BS 819 985 RS1D430TF
BS 986 1424 RS1BK95TF

RD RS1D430JQ 258 0 0
GAGTCATCATCAATCAATGCATAGTCAAAAACTCAGTAACACAAAGTATTCAAGCTTAAA
GAAATACATAAAAATAAAATTCCAAGTCGAGGAGCTTTCACTGACGTTCTAACAAACTCT
ACAAGAGCTCATTTACATTCTCAACAAAATAAGTTCCTTCTGCTTCCACACTAGCCTCTC
TAAGTCTCAACATTCGCTCTGTTTCCTGCGAGGATAATGGAGATCTCGAGTCCACGACTG
AAGGCTTGGTTGAA
AAGG

QA 1 254 1 254
DS 

RD RS1BK95JQ 814 0 0
CATCATCAATCAATGCATAGTCAAAAACTCAGTAACACAAAGTATTCAAGCTTAGAGAAA
TACATAAAAATAAGATTCCAAGTCGAGGAGCTTTCACTGACGTTCTAACAAACTCTACAA
GAGCTCATTTACATTCTCAACAAAATAAGTTCCTTCTGCTTCCACACTAACCTCTCTAAG
TCTCAACATTCGCTCTGTTTCCTGCGAGGATAATGGAGATCTCGAGTCCACGACTGAAGG
CTTGGTTGAAGAGGAGACGAGACTGGAACGTGGAGATGAGGGGAACCAGGAGAGGAGAGC
AATGGGAACAAAGATGAGCATACCCATCGCAGCATCATAGATGCGTCCAAACTCACGGAC
TGTCTCCCACAAACCAAACAGCTTGATCAACCACTTCCATGTGATGGCTAAAGACAGTAA
TGCCCAACCTGTAGGGATGAATCCGAGTACACATGCAAACATGTCTGGAATGGAGAGTTC
TGTAAATGCAATGGCTAAAGCGATGAGGGCGATGACGGTGAGTGAAACCACTCCCTGCAG
GAAACGCAGAGCCAGCAGAATGTTGCTCGACTTCCTGGGGCTATACCAGAATAGCTTAAA
CAGGAGCACAACTGCAACAAACAATATCCACGAATAGCCATATAACGCAAGTGAGGTGTC
TTTCCCAGTGAGATTGAGCTTGTACACAACGCCATACTGAAACATGAAGAACCTCAAGCT
CAAAATGGTCTCCAGAATCCGTCCTCTTAATGTCTGGATATGCATCTGTTCTTCCTCCCA
CCACGACTCCCAACTCAGCTCTCCCTTCACTCCA

QA 1 814 1 814
DS 

RD RS1D430TF 676 0 0
AG
CAAAGATGAGCATACCCATCGCAGCATCATAGATGCGTCCAAACTCACGGACTGTCTCCC
ACAAACCAAACAGCTTGATCAACCACTTCCATGTGATGGCTAAAGACAGTAATGCCCAAC
CTGTAGGGATGAATCCGAGTACACATGCAAACATGTCTGGAATGGAGAGTTCTGTAAATG
CAATGGCTAAAGCGATGAGGGCGATGACGGTGAGTGAAACCACTCCCTGCAGGAAACGCA
GAGCCAGCAGAATGTTGCTCGACTTCCTGGGGCTATACCAGAATAGCTTAAACAGGAGCA
CAACTGCAACAAACACTATCCACGAATAGCCATATAACGCAAGTGAGGTGTCTTTCCCAG
TGAGATTGAGCTTGGACACAACGCCATACTGAAACATGAAGAACCTCAAGCTCAAAATGG
TCTCCAGAATCCGTCCTCTTAATGTCTGGATATGCATCTGTTCTTCCTCCCACCACGACT
CCCAACTCAGCTCTCCCTTCACTCCAACTCCGCCTTTGTACATCAGCCAACTGACCCAGT
TATCGAAATCCTCGACGGTCTTTTGCCATTCGAATCCAGATGGGTTGAAGATGTACGGTG
CAAACAGCCAGGAGATTACCAGGAACCAACTGCTGATAGTAAGCAGAACGAACGAAACAG
CACCTCCATCCGT
C

QA 3 675 3 675
DS 

RD RS1BK95TF 780 0 0
TATAACGCAAGTGAGGTGTCTTTCCCAGTGAGATTGAGCTTGTACACAACGCCATACTGA
AACATGAAGAACCTCAAGCTCAAAATGGTCTCCAGAATCCGTCCTCTTAATGTCTGGATA
TGCATCTGTTCTTCCTCCCACCACGACTCCCAACTCAGCTCTCCCTTCACTCCAACTCCG
CCTTTGTACATCAGCCAACTGACCCAGTTATCGAAATCCTCGACGGTCTTTTGCCATTCG
AATCCAGATGGGTTGAAGATGTACGGTGCAAACAGCCAGGAGATTACCAGGAACCAACTG
CTGATAGTAAGCAGAACGAACGAAACAGCACCTCCATCCGTATACCCGTAGGCAATGTAG
ACGATCAGCAGTAGAGCTACTTCAAAAGCTTTCACAAAATGACTTCTGGAATAGAGTCTG
TAGTTATCCGCAAACTTGATGTGCTGAACCACAAAGCCTCTGCCAGTAGCTCGATACTTC
GCACCACCGTGAAGGATAGTACGTCCAAAGTAATGAGTCCTTGTCCCAAGAGAAAATGTG
AAAAAGACCGAGCAAAGCTGAAACTGCATCGTAATAAAGCTGAAAATAGCCTTCAGCAAT
CCAAGTTCAAGTATGAAACCCATAACCATAGGAACGGCAGTAAAGACTCCAATCTGAACC
AAAAACTGTGCATTGAGCGCAGCATCCAATGCAGTGTTACCAGAGAGTTTGGCTACTCTT
GAAATTGCACGATCGGAACCGGAAAAGGCCAGATACACTCTTCCGTACAGAAACACATAC

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 3

CO CL2378Contig1 938 3 2 U
GCCAAGCAGAAGCATCATTTTTATACTTCGCAGATAAGATAAGACCAAACATATCTGCAA
CATTGTTTCGCTTCATTTACGCATATAACTCATGTACTCTTCTTAGGATCTGCACATAGA
CATAGCCGAGGAGTATAAAATGTAAAAGAACTTACATGAACAACATCAGTAGAAGATAGA
GTAAACCAAGTGGTCAGGTTTGATTGTGTGTACTGCAGGGAGATGCTATGTTGATGGAGT
GAATAGATGCAGAAGCGCAGACCAATAACCAACCAACTGAGCCAAGATACCCTTCCCAGT
TTGGGCTTCGATTATAAGGCCTATGGTGAGTCCTATGATTGCCCAGGCTCCGTTAATAGC
CTCTATTTCACGCCTTCTCTGTTGCCTCTCTCTGCCTTTGATCACTTCCATTTGCTTCGC
TGCTAATCGCTTGGCCTCAAGAGGGTCTACCATGATCACCTCCTTTTTCGCCTTTACTTT
TCCTGGAGGAGGAGATGATGCCTACACAAACACTCGGCAATGAGAAGGAACTTATAAACT
ACACTATTGAAGACTCAACAACAACAACCATTCACAATTTCCCAGACTTTACCATCCTAA
CAAAGGGTTACTATGTAACAGAGATTTTGATCCTAGTTTTACCAGGAAATGAAATGTTCT
TGTTTTGCATATAGAAAAGCTAATATATCACAGTAAAATTGTCAGAAAGGTCATACATTT
GGATTTGCTAAGACCCGAACTGCTCCACCTCTGGCTCTTGTTGCATCTTGGTGTCTTCTT
AGTCCCTTTAGTAGAGAAGAGGAAGAGGGGGTCAAATGAATCGTGAAGCGTCCACGGAGA
CTGGAAGAAGAAACTTGAGGATCAGCAGCTCCAAGGGAGGAGAAGAAGATGGGCGGCGTT
GAAGAGAAAGACGTCACCACCATTTCTAAGCCTTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DI78JQ U 119
AF RS1GD05JQ U 1
AF RS1GD05TF C 131
BS 1 629 RS1GD05JQ
BS 630 938 RS1GD05TF

RD RS1DI78JQ 327 0 0
GACATAGCCGAGGAGTATAAAATGTAAAAGAACTTACATGAACAACATCAGTAGAAGATA
GAGTAAACCAAGTGGTCAGGTTTGATTGTGTGTACTGCAGGGAGATGCTATGTTGATGGA
GTGAATAGATGCAGAGGCGCAGACCAATAACCAACCAACTGAGCCAAGATACCCTTCCCA
GTTTGGGCTTCGATTATAAGGCCTATGGTGAGTCCTATGATTGCCCAGGCTCCGTTAATA
GCCTCTATTTCACGCCTTCTCTGTTGCCTCTCTCTGCCTTTGATCACTTCCATTTGCTTC
GCTGCTAATCGCTTGGCCTCAAAAGGG

QA 1 327 1 327
DS 

RD RS1GD05JQ 629 0 0
GCCAAGCAGAAGCATCATTTTTATACTTCGCAGATAAGATAAGACCAAACATATCTGCAA
CATTGTTTCGCTTCATTTACGCATATAACTCATGTACTCTTCTTAGGATCTGCACATAGA
CATAGCCGAGGAGTATAAAATGTAAAAGAACTTACATGAACAACATCAGTAGAAGATAGA
GTAAACCAAGTGGTCAGGTTTGATTGTGTGTACTGCAGGGAGATGCTATGTTGATGGAGT
GAATAGATGCAGAAGCGCAGACCAATAACCAACCAACTGAGCCAAGATACCCTTCCCAGT
TTGGGCTTCGATTATAAGGCCTATGGTGAGTCCTATGATTGCCCAGGCTCCGTTAATAGC
CTCTATTTCACGCCTTCTCTGTTGCCTCTCTCTGCCTTTGATCACTTCCATTTGCTTCGC
TGCTAATCGCTTGGCCTCAAGAGGGTCTACCATGATCACCTCCTTTTTCGCCTTTACTTT
TCCTGGAGGAGGAGATGATGCCTACACAAACACTCGGCAATGAGAAGGAACTTATAAACT
ACACTATTGAAGACTCAACAACAACAACCATTCACAATTTCCCAGACTTTACCATCCTAA
CAAAGGGTTACTATGTAACAGAGATTTTG

QA 1 629 1 629
DS 

RD RS1GD05TF 808 0 0
GAGTATAAAATGTAAAAGAACTTACATGAACAACATCAGTAGAAGATAGAGTAAACCAAG
TGGTCAGGTTTGATTGTGTGTACTGCAGGGAGATGCTATGTTGATGGAGTGAATAGATGC
AGAAGCGCAGACCAATAACCAACCAACTGAGCCAAGATACCCTTCCCAGTTTGGGCTTCG
ATTATAAGGCCTATGGTGAGTCCTATGATTGCCCAGGCTCCGTTAATAGCCTCTATTTCA
CGCCTTCTCTGTTGCCTCTCTCTGCCTTTGATCACTTCCATTTGCTTCGCTGCTAATCGC
TTGGCCTCAAGAGGGTCTACCATGATCACCTCCTTTTTCGCCTTTACTTTTCCTGGAGGA
GGAGATGATGCCTACACAAACACTCGGCAATGAGAAGGAACTTATAAACTACACTATTGA
AGACTCAACAACAACAACCATTCACAATTTCCCAGACTTTACCATCCTAACAAAGGGTTA
CTATGTAACAGAGATTTTGATCCTAGTTTTACCAGGAAATGAAATGTTCTTGTTTTGCAT
ATAGAAAAGCTAATATATCACAGTAAAATTGTCAGAAAGGTCATACATTTGGATTTGCTA
AGACCCGAACTGCTCCACCTCTGGCTCTTGTTGCATCTTGGTGTCTTCTTAGTCCCTTTA
GTAGAGAAGAGGAAGAGGGGGTCAAATGAATCGTGAAGCGTCCACGGAGACTGGAAGAAG
AAACTTGAGGATCAGCAGCTCCAAGGGAGGAGAAGAAGATGGGCGGCGTTGAAGAGAAAG
ACGTCACCACCATTTCTAAGCCTTTCCC

QA 1 808 1 808
DS 



AS 1 4

CO CL2379Contig1 1069 4 17 U
GGACATCTTCTTGCTTCTCTTCTCTCTTCGCCCTCTCTCTCACACCTACCTATCTAAGCA
ACACAACGAACACCATTGATCTCATCTATTTTATTCCTTATATTTCTTCCGTTCATCCTT
AAGCATTCCATCTTTTTTTTTGACATCCCTTAAGCATTCCATCTATAAGATAGCAGCTAA
GCGAAAGCAGAGAAGATCTCCTTCCACTTTCCCTCCAGAGAAACACAATTCATATTAAAA
GAGGAGTTCTTTAATTTATTCGCAGGAAGAAAAATGGCATCTTCATCAACGAACTCACCA
TGCGCAGCCTGCAAATTCCTCCGTCGAAAATGCCAACCGGAGTGCGTATTCGCTCCATAT
TTCCCACCTGACCAACCACAAAAATTCGCAAACGTTCACAAAGTCTTTGGAGCAAGCAAC
GTCACAAAGCTCCTCAACGAGCTCCACCCTTCGCAACGTGAAGACGCAGTGAACTCTTTA
GCTTATGAAGCCGACATGCGTCTCCGTGATCCGGTCTACGGCTGCGTGGGAGTCATCTCT
CTCCTCCAACATCAGCTTCGCCAGCTTCAGATCGATCTCAGCTGCGCCAAATCTGAGCTT
TCCAAGTACCAAAGCCTCGGTATACTCGCCGCCACGCATCAGAGCCTTGGAATCAACTTA
CTCGCAGGCGCCAACGCAGATGGATCGACGACGGCCACAGTGAGAGACCATCATTATCAT
CACCACCAGTTTTTCCCTAGAGAACAGATGTTTGGTGGGTTAGATGTTCCTACCGGTAAC
AACTACGACGGAGGGATTCTTGCGATTGGACAGATCAGTCAGTTTCAGCAGCCGAGAGCA
GCCGCTGGAGATGATGGTCGCCGTACTGTTGATCCGTCTTGAGATTTTAGGGTTTTTGGC
GGTTCATCGTCGTTGATCCGGGCTTGATGATTACTGATGAATTATGGTTTCAGATAATAT
ATTAATGTGGAAGGAAAATCAAAATAATATTTTTAATCGAACGGTCCAGTCCGTCTCTCT
TGATGGCATTTATTTCAGTTATTATTATTATTATTACTTTCACTAAGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FU43TF U 1
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GCTTATGAAGCCGACATGCGTCTCCGTGATCCGGTCTACGGCTGCGTGGGAGTCATCTCT
CTCCTCCAACATCAGCTTCGCCAGCTTCAGATCGATCTCAGCTGTGCCAAATCTGAGCTT
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CTCGCAG*CGCCAACGCAGATGGATCGACGACG*CCACAGTGAGAGAC*ATCATTATCAT
CACCACCAGTTTT*CCCTAGAGA*CAGATGTTTGGTGGGTTAGATGTTCCTACCG

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ATTCGCTCCATATTTCCCACCTGACCAACCACAAAAATTCGCAAACGTTCACAAAGTCTT
TGGAGCAAGCAACGTCACAAAGCTCCTCAACGAGCTCCACCCTTCGCAACGTGAAGACGC
AGTGAACTCTTTAGCTTATGAAGCCGACATGCGTCTCCGTGATCCGGTCTACGGCTGCGT
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TCCTACCGGTAACAACTACGACGGAG

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CTTACTCGCAGGCGCCAACGCAGATGGATCGACGACGGCCCCAGTGAGAGACCATCATTA
TCATCACCCCCAGTTTTTCCCTAGAGAACAGATGTTTGGTGGGTTAGATGTTCCTACCGG
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GGTGGGTTAGATGTTCCTACCGGTAACAACTACGACGGAGGGATTCTTGCGATTGGACAG
ATCAGTCAGTTTCAGCAGCCGAGAGCAGCCGCTGGAGATGATGGTCGCCGTACTGTTGAT
CCGTCTTGAGATTTTAGGGTTTTTGGCGGTTCATCGTCGTTGATCCGGGCTTGATGATTA
CTGATGAATTATGGTTTCAGATAATATATTAATGTGGAAGGAAAATCAAAATAATATTTT
TAATCGAACGGTCCAGTCCGTCTCTCTTGATGGCATTTATTTCAGTTATTATTATTATTA
TTACTTTCACTAAGGT

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DS 



AS 1 4

CO CL2380Contig1 686 4 2 U
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GGGAAAGGAGGATTGGAGATTTGTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DY46JQ U 1
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AF RS1CR09JQ U 16
AF RS1CR09TF C 238
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BS 475 686 RS1CR09JQ

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C

QA 1 474 1 474
DS 

RD RS1DY46TF 475 0 0
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CCGAATTAAATAATTAAAAAAAACTAGATTTTTCTACATATACGTTCGCCAATTCTAAAC
ACAAAACACCCAACACATATAACTAAACTGGTGAATGAAACTAAAATTAAGCTTTCTTAG
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AAAGAACAGAGTTGATGTTCGGCAACACACCACCGTGAGCGATCGTGACTCCACTCAGTA
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CGAGAACGGCGGCCATGTAAACCGGAGCTCCACCACCGAGTCTCTGAGCGTACC
C

QA 1 474 1 474
DS 

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AAAAAAAACTAGATTTTTCTACATATACGTTCACCAATTCTAAACACAAAACACCCAACA
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CGTCGTTCCTGATCGCCAAAAGAAGATGCCTCGGGATGATCCTCGACTTCTTGTTGTCCC
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GCCGCTGGCTTTTCTTCCTCCGAAGGCTTTCTTCACTTTTCCGGTAGTCTCCATTGCACG
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GAGATTTGTCC

QA 1 671 1 671
DS 

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GTAGCTTCCCCAACTCTTCGTCGTTCCTGATCGCCAAAAGAAGATGCCTCGGGATGATCC
TCGACTTCTTGTTGTCCCTCGCAGCGTTACCAGCGAGCTCCAGAACTTCGGCGGCGAGGT
ACTCGAGAACGGCGGCCATGTAAACCGGAGCTCCACCACCGAGTCTCTGAGCGTACCGTC
CCTTCTTCAGGAAACGAGTGATTCTCCCGACGGGGAATTGGAGACCGGCTTTGATCGATT
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GGTAGTCTCCATTGCACGGGATGAAGGTTGTTTGCACAAGATTCCTAACTGGTGGTTATA
AGTGGGAAAGGAGGATTGGAGATTTGTCC

QA 1 449 1 449
DS 



AS 1 4

CO CL2381Contig1 1256 4 18 U
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TCAAAGAAGAGAGAGAGAGAGATGGAGAAGAACATTAAGTTTCCAGTTGTAGACTTGTCC
AAGCTCATTGGTGAAGAGAGAGACCAAACCACGGCTTCAATCAACAATGCTTGTGAGAAT
TGGGGCTTCTTTGAGATAGTGAACCATGGTGTACCACATGATTTGATGGACAACGTCGAG
AAGATGACAAAGGAACATTACAAGAAATCAATGGAACAAAAGTTCAACGACATGCTCAAG
TCCAAAGGTTTGGAAAATCTTGAGAGAGAAGTTGAGGATGTCGATTGGGAAAGCACTTTC
TACCTTCGTCATCTCCCTCAGTCCAATCTCTACGACATTCCTGATATGTCTGATGAATAC
CGGACGGCTATGAAAGATTTCGGGAAGAGATTGGAGAATCTTGCTGAGGATTTGTTGGGT
CTATTGTGTGAAAATCTAGGGTTAGAGAAAGGGTACTTGAAGAAAGTGTTTCATGGAACA
AAAGGTCCAACCTTTGGGACTAAGGTGAGCAATTATCCAACTTGTCCTAAGCCAGAGATG
ATCAAAGGTCTAAGGGCCCACACTGATGCAGGAGGCATCATCTTGTTGTTTCAAGATGAC
AAGGTTAGTGGTCTCCAGCTTCTTAAAGATGGTGACTGGATTGATGTTCCTCCACTCAAC
CACTCTATTGTCATCAATCTTGGTGACCAACTTGAGGTGATAACCAACGGCAGGTACAAG
AGTGTGATGCACCGTGTGGTGACTCAGCAAGAAGGAAACAGAATGTCCATTGCATCTTTC
TACAACCCGGGAAGCGATGCTGAGATCTCTCCAGCTTCATCGCTTGTCTGCAAAGAAACC
GAGTACCCGAGTTTTGTTTTTGATGACTACATGAAGCTCTATGCTGGGGTCAAGTTTCAG
CCTAAGGAGCCACGGTTCGAGGCAATGAAGAATGCAAATGCAGTTACAGAATTGAACCCA
ACAGCAGCCGTAGAGACTTTCTAAAAACAAAGTTGAGTTTGAGCGAAAGCAAAGAAACAA
AAACGTGTGTTGTGGTGTGTGCGTGTATACGTCAATAAGTTACAAGACTGATATTATTGT
TGATATAATTAAGATGTCTGGTGGTTAATTGTTGGTCAATGGTGTTTTAAAATGTGGTGT
GTTTATTTATGTTTATTGAAGATGATAATAATAATGAATAATATGATAACTGTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 
0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1BP17TF U 22
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AF RS1CK28JQ C 498
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RD RS1BP17TF 588 0 0
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QA 1 588 1 588
DS 

RD RS1CK28TF 764 0 0
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TCAAAGAAGAGAGAGAGAGAGATGGAGAAGAACATTAAGTTTCCAGTTGTAGACTTGTCC
AAGCTCATTGGTGAAGAGAGAGACCAAACCACGGCTTCAATCAACAATGCTTGTGAGAAT
TGGGGCTTCTTTGAGATAGTGAACCATGGTTTACCACATGATTTGATGGACAACGTCGAG
AAGATGACAAAGGAACATTACAAGAAATCAATGGAACAAAAGTTCAACGACATGCTCAAG
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CGGACGGCTATGAAAGATTTCGGGAAGATATTGGAGAATCTTGCTGAGGATTTGTTGGAT
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AAAGGTCCAACCTTTGGGACTAAGGTGAGCAATTATCCAACTTGTCCTAAGCCAGAGATG
ATCAAAGGTCTAAGGGCCCACACTGATGCAGGAGGCATCATCTTGTTGTTTCAAGATGAC
AAGGTTAGTGGTCTCCAGCTTCTTAAAGATGGTGACTGGATTGATGTTCCTCCACTCA*C
CACTCTATTGTCATCAATCTTGGTGACCAACTTGAGGT
ATAACC

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1BP17JQ 826 0 0
ATGAAAGA
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GGGTTAGAGAAAGGGTACTTGAAGAAAGTGTTTCATGGAACAAAAGGTCCAACCTTTGGG
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CTTGGTGACCAACTTGAGGTGATAACCAACGGCAGGTACAAGAGTGTGATGCCCCGTGTG
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AAGATGATAATAATAATGAATAATATGATAACTGTTCT

QA 9 826 9 826
DS 

RD RS1CK28JQ 759 0 0
AGGGTTAGAGAAAGGGTACTTGAAGAAAGTGTTTCATGGAACAAAAGGTCCAACCTTTGG
GACTAAGGTGAGCAATTATCCAACTTGTCCTAAGCCAGAGATGATCAAAGGTCTAAGGGC
CCACACTGATGCAGGAGGCATCATCTTGTTGTTTCAAGATGACAAGGTTAGTGGTCTCCA
GCTTCTTAAAGATGGTGACTGGATTGATGTTCCTCCACTCAACCACTCTATTGTCATCAA
TCTTGGTGACCAACTTGAGGTTATAACCAACGGCAGGTACAAGAGTGTGATGCACCGTGT
GGTGACTCAGCAAGAAGGAAACAGAATGTCCATTGCATCTTTCTACAACCCGGGAAGCGA
TGCTGAGATCTCTCCAGCTTCATCGCTTGTCTGCAAAGAAACCGAGTACCCGAGTTTTGT
TTTTGATGACTACATGAAGCTCTATGCTGGGGTCAAGTTTCAGCCTAAGGAGCCACGGTT
CGAGGCAATGAAGAATGCAAATGCAGTTACAGAATTTAACCCAACAGCAGCCGTAGAGAC
TTTCTAAAAACAAAGTTGAGTTTGAGCGAAAGCAAAGAAACAAAAACGTGTGTTGTGGTG
TGTG**TGTATACTTCAATAAGTTACAAGACTGATATTATTGTTGATATAATTAAGATGT
CTGGTGGTTAATTGTTGGTCAATGGTGTTTTAAAGTGTGGTGTGTTTATTTATGTTTATT
GAAGATGATAATAATAATGAATAATATGATAACTGTTC
C

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 4

CO CL2382Contig1 1373 4 16 U
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GGGATACCCTTACAATCAGCCGCCAAAGTCCCTATTATGATAACTTTCAACGTTGTCAAC
CTGATGGTGACCATAACGATGTGAAACCACAGGCTTGCATTTTCAAGGTCGGAGATGATT
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GTTTATATGAGATATTTCAACAAGACTATGGACCCGTGGGCTCAGCCACCTTTGAAACAG
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CCAAAGACAGACACAACGGAAATCTCCTCTTTGACGACGTGGGAAGACTTGTCCACATCG
ACTTTGGTTTCATATTAGAAACTTCACCAGGTGGAAACATGCGGTTCGAGAGTGCTCACT
TCAAACTGAGCCACGAAATGACTCAGTTACTAGACCCATCAGGTGTTATGAAAAGCAAAA
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ACGGAATCATAAGTACGGTGCAAATGATGCTAGACAGTGGATTGCCTTGCTTTAGCAGAG
GAGATCCAATTGGTAACCTGAGAAAAAGATTTCACCCTGAGATGAGCGAACGAGAAGCTG
CACACTTCATGATCCACGTCTGTACTGATGCGTATAACAAATGGACTACTGCTGGATACG
ACTTGATTCAGTATCTTCAACAAGGCATCGAGAAGTAAACCACAAACAAAGAAGAGGAAT
TTGATTATTGTAAACCATAGTTGCATTATCATTTGCAGGTAAAATCATCCGAATTAATAT
TCATTTAATTTTTATTTCTTTTCGTGATTTAAAAGACAATTTTCCCTTTTATTTTCTCTC
TTCTTTTTCTCTTAGGGTTTTGCTATTCACAAAAACAAAAGGTAGAAGTGTTGTGTAACG
AGTTTAAGATAACGTAAGGTGTAAGCTATTAATATATTTGATTCATTTTACGT


BQ
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G
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T

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TATTTGATTCATTTTACGT

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DS 



AS 1 4

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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GG19TF U 21
AF RS1EN76TF U 1
AF RS1GG19JQ C 211
AF RS1EN76JQ C 365
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RD RS1GG19TF 556 0 0
GG
GAAAGATCTGAAGGTCGAATGGTCGAGGAGAAGAATCTCTCTTAGATCGTTTGATCTGAT
CCGAAGAAGAAGATGGGAATCCTGTTCACGCGGATGTTCTCTTCAGTGTTCGGCAACAAA
GAAGCTCGTATCCTCGTCCTCGGTCTCGACAATGCTGGCAAAACTACTATCCTCTATCGG
CTTCAGATGGGGGAAGTTGTCTCCACGATTCCGACTATTGGGTTTAACGTGGGGACTGTG
CAGTACAACAATATCAAGTTTCAGGTCTGGGATTTAGGTGGACAAACGAGCATCAGGCCA
TACTGGCGATGCTATTTTCCGAATACACGAGCAGTGATCTATGTTGTTGACTCGAGCGAT
ACAGATCGAATCGGTGTGGCAAAAGAGGAGTTTCATGCTATTTTGGAGGAAGAGGAGCTG
AAAGGGGCGGTTGTACTCATATTTGCAAACAAGCAGGATCTTCCTGGTGCACTCGATGAT
GCCGCTGTGACAGAAGCCTTGGAGTTGCATAAGATAAAGAGTCGCCAGTGGGCAATCTTC
AAGACTTGTGCTGT

QA 3 556 3 556
DS 

RD RS1EN76TF 628 0 0
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CTCTTAGATCGTTTGATCTGATCCGAAGAAGAAGATGGGAATCCTGTTCACGCGGATGTT
CTCTTCAGTGTTCGGCAACAAAGAAGCTCGTATCCTCGTCCTCGGTCTCGACAATGCTGG
CAAAACTACTATCCTCTATCGGCTTCAGATGGGGGAAGTTGTCTCCACGATTCCGACTAT
TGGGTTTAACGTGGAAACTGTGCAGTACAACAATATCAAGTTTCAGGTCTGGGATTTAGG
TGGACAAACGAGCATCAGCCCATACTGGCGATGCTATTTTCCGAATACACAAGCAGTGAT
CTATGTTGTTGACTCGAGCGATACAGATCGAATCGGTGTGGCAAAAGAGGAGTTTCATGC
TATTTTGGAGGAAGAGGAGCTGAAAGGGGCGGTTGTTCTCATATTTGCAAACAAGCAGGA
TCTTCCTGGTGCACTCGATGATGCCGCTGTGACAGAAGCCTTGGAGTTGCATAAGATAAA
GAGTCGCCAGTGGGCAATCTTCAAGACTTGTGCTGTTAAAGGCGAGGGGCTTTTTGAGGG
TTTGGACTGGTTGAGTA*TACATTGAAG

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DS 

RD RS1GG19JQ 633 0 0
GGGGGAAGTTGTCTCCACGATTCCGACTATTGGGTTTAACGTGGGGACTGTGCAGTACAA
CAATATCAAGTTTCAGGTCTGGGATTTAGGTGGACAAACGAGCATCAGGCCATACTGGCG
ATGCTATTTTCCGAATACACGAGCAGTGATCTATGTTGTTGACTCGAGCGATACAGATCG
AATCGGTGTGGCAAAAGAGGAGTTTCATGCTATTTTGGAGGAAGAGGAGCTGAAAGGGGC
GGTTGTACTCATATTTGCAAACAAGCAGGATCTTCCTGGTGCACTCGATGATGCCGCTGT
GACAGAAGCCTTGGAGTTGCATAAGATAAAGAGTCGCCAGTGGGCAATCTTCAAGACTTG
TGCTGTTAAAGGCGAGGGGCTTTTTGAGGGTTTGGACTGGTTGAGTAATACATTGAAGTC
AGGAAGTGGGTAGAAAACTTTCTCGTCATCCGCTCAACATTGTATCTTATCTTCTTTACG
TATGTTTAGTGATTTGCTTAGTTCTTCATTTTAAAGAGTTAATATCAATGACATGTTCAC
TTATTACTCTTTTTTGTTTCCTTTTGAGAGAAAAAAAAAACTCTTCACGGATCTGTGATT
GGAACCCATAAGAGATATATCATGTTTTTCTTT

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DS 

RD RS1EN76JQ 526 0 0
GTTGTTGACTCGAGCGATACAGATCGAATCGGTGTGGCAAAAGAGGAGTTTCATGCTATT
TTGGAGGAAGAGGAGCTGAAAGGGGCGGTTGTTCTCATATTTGCAAACAAGCAGGATCTT
CCTGGTGCACTCGATGATGCCGCTGTGACAGAAGCCTTGGAGTTGCATAAGATAAAGAGT
CGCCAGTGGGCAATCTTCAAGACTTGTGCTGTTAAAGGCGAGGGGCTTTTTGAGGGTTTG
GACTGGTTGAGTAATACATTGAAGTCAGGAAGTGGGTAGAAAACTTTCTCGTCATCCGCT
CAACATTGTATCTTATCTTCTTTACGTATGTTTAGTGATTTGCTTAGTTCTTCATTTTAA
AGAGTTAATATCAATGACATGTTCACTTATTACTCTTTTTTGTTTCCTTTTGAGAGAAAA
AAAAA*CTCTTCACGGATCTGTGATTGGAACCCATAAGAGATATATCATGTTTTTCTTTA
TTAACATGTTTTCTTGTAGGATATATCCAAGAACATTTTTTGGAGT

QA 1 526 1 526
DS 



AS 1 3

CO CL2384Contig1 984 3 10 U
GGGATCTAAATCGGATCTGTGTTGGTGTGGAAAAACCCTAAAAAAGTGGAATGGATATGG
AGCAGAAGCAGGCGGAGATCATTGATCAGCTCGTTCGCCGAGCTTCTACCTGCAGCGGCG
AGGCCCTGTTGCCTATCATCATCGAAGCAACATCGCATCCTTCTCTTTTCGCCTTCTCCG
AGATTTTGGCTCTTCCCAACGTTGCCCAGCTTGAAGGAAGCACACATTCAGTGTACCTTG
ATGTTCTGCGCTTGTTTGCTCATGGCACCTGGGCTGACTACAAATACAATGCTAGCCGTA
TCCCTCAGTTGTCTCCTGACCAAACTCTGAAGCTAAAACAGCTCACTGTGCTTACCCTTG
CCGAGTCAAACAAGGTTTTGCCTTATGATACGCTCATGGACGAGTTGGATGTCACCAATG
TTCGTGAGCTCGAGGACTTTCTTATCAATGAATGCATGTACGCGGGTATAGTTAGAGGAA
AACTTGATCAGTTGAAAAGATGCTTCGAGGTTCCATTTGCAGCTGGTAGAGATCTAAGGC
CTGGACAACTAGGGAATATGTTACACACTTTGTCCAACTAGTTGAACACATCAGAAAATC
TTCTCGGTTCCATTCAAGACAAGATAAAATGGGCGGATAATATGAGCGAGATAGACAAGA
AACATCGCAAGGAAGCAGAAGAGAGAGTGGAAGAAGTGAAGAAGTCTCTGTCCATGAAGA
GGGCCTAAAGAAATGTTTGGGGAACCAAGTGGAGTGATGGACTATGAAGAAGATAGAATC
CGACCAAAGAGGAGAAGGCATCCGGTAACAAGGTAGAGAGAGAAGAGAGGAGACAGAGTA
AAAAAGGGATTTGTAATGGTGTTTAATGGACGTATCATTTACGTTTGGTGGAGGTTTTTT
GATTGTTAGCATTTTATTTCAACTTGTGTAATGAAGTATCTCGTCTCTTGTCTCTTTCTC
AAGGCACGAACAAATTCAGCGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DF31TF U 6
AF RS1CF72TF U 1
AF RS1CF72JQ C 617
BS 1 286 RS1CF72TF
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RD RS1DF31TF 601 0 0
GG
AAATCGGATCTGTGTTGGTGTGGAAAAACCCTAAAAAAGTGGAATGGATATGGAGCAGAA
GCAGGCGGAGATCATTGATCAGCT**TTCGCCGAGCTTCTACCTGCAGCGGCGAGGCCCT
GTTGCCTATCATCATCGAAGCAACATCGCATCCTTCTCTTTTCGCCTTCTCCGAGATTTT
GGCTCTTCCCAACGTTGCCCAGCTTGAAGGAAGCACACATTCAGTGTACCTTGATGTTCT
GCGCTTGTTTGCTCATGGCACCTGGGCTGACTACAAATGCAATGCTAGCCGTATCCCTCA
GTTGTCTCCTGACCAAACTCTGAAGCTAAAACAGCTCACTGTGCTTACCCTTGCCGAGTC
AAACAAGGTTTTGCCTTATGATACGCTCATGGACGAGTTGGATGTCACCAATGTTCGTGA
GCTCGAGGACTTTCTTATCAATGAATGCATGTACGCGGGTATAGTTAGAGGAAAACTTGA
TCAGTTGAAAAGATGCTTCGAGGTTCCATTTGCAGCTGGTAGAGATCTAAGGCCTGGACA
ACTAGGGAATATGTTACACACTTTGTCCAACTAGTTGAACACATCAGAAAATCTTCTCG

QA 3 601 3 601
DS 

RD RS1CF72TF 771 0 0
GGGATCTAAATCGGATCTGTGTTGGTGTGGAAAAACCCTAAAAAAGTGGAATGGATATGG
AGCAGAAGCAGGCGGAGATCATTGATCAGCTCGTTCGCCGAGCTTCTACCTGCAGCGGCG
AGGCCCTGTTGCCTATCATCATCGAAGCAACATCGCATCCTTCTCTTTTCGCCTTCTCCG
AGATTTTGGCTCTTCCCAACGTTGCCCAGCTTGAAGGAAGCACACATTCAGTGTACCTTG
ATGTTCTGCGCTTGTTTGCTCATGGCACCTGGGCTGACTACAAATATAATGCTAGCCGTA
TCCCTCAGTTGTCTCCTGACCAAACTCTGAAGCTAAAACAGCTCACTGTGCTTACCCTTG
CCGAGTCAAACAAGGTTTTGCCTTATGATACGCTCATGGACGAGTTGGATGTCACCAATG
TTCGTGAGCTCGAGGACTTTCTTATCAATGAATGCATGTACGCGGGTATAGTTAGAGGAA
AACTTGATCAGTTGAAAAGATGCTTCGAGGTTCCATTTGCAGCTGGTAGAGATCTAAGGC
CTGGACAACTAGGGAATATGTTACACACTTTGTCCAACTGGTTGAACACATCAGAAAATC
TTCTCGGTTCCATTCAAGACAAGATAAAATGGGCGGATAATATGAGCGAGATAGACAAGA
AACATCGCAAGGAAGCAGAAGAGAGAGTGGAAGA*GTGAAGAAGTCTCTGTCCATGAAGA
GGGCCTAAAGAA*TGTTTGGGGAACCAAGTGGAGTGATGGACTATGAA
AAG

QA 1 768 1 768
DS 

RD RS1CF72JQ 368 0 0
AGACAAGATAAAATGGGCGGATAATATGAGCGAGATAGACAAGAAACATCGCAAGGAAGC
AGAAGAGAGAGTGGAAGAAGTGAAGAAGTCTCTGTCCATGAAGAGGGCCTAAAGAAATGT
TTGGGGAACCAAGTGGAGTGATGGACTATGAAGAAGATAGAATCCGACCAAAGAGGAGAA
GGCATCCGGTAACAAGGTAGAGAGAGAAGAGAGGAGACAGAGTAAAAAAGGGATTTGTAA
TGGTGTTTAATGGACGTATCATTTACGTTTGGTGGAGGTTTTTTGATTGTTAGCATTTTA
TTTCAACTTGTGTAATGAAGTATCTCGTCTCTTGTCTCTTTCTCAAGGCACGAACAAATT
CAGCGGTC

QA 1 368 1 368
DS 



AS 1 4

CO CL2385Contig1 622 4 5 U
CGATCAACAACATAAACACATTATAATAATCTGATTTTAATGCTCACAAATCATTACCGT
CTTATTATCTTCCGACCATGACCTCCATTTTGATTTACATAAACTTATTACAAGACACAA
ATCCTCACATCATAATCATTATTCAAACATTAATACATCATACCATGTTCTTATAGCAAA
TCCAGGTTCTGTTGGTACATATCCTTCCTCTTCAACTAAGCCGCGCCGGAATGGTGTAAC
TTCCACATTTATAACCAGATGGAATCTTCTTGCCGCAAGAACGAGCAACGTAAACAACTT
TATCCATATCAATATAGTTAGTAACATCCCTTGAAACGTAGCGGCAAGCACAAGGTACGT
CGATAGGACGGATTAGAGCACAACATGACCGAGACGGCGGCGGAAAATTTGGTCCGGCGT
TGCTGACGTAGCGTTGACACTCATTCATCAGCCCCGACACGTTAGCTCCACAGAACTGAG
CTGTTGCCACGTTGACATTGTCGGAACCGATCATGAACAAAGCTATTGCTACCACCATGA
TAATTATTCTTCCACTTGCCATCTTTTTGTGTCGTTGTTTCTCTTTGTCAACGGTTTGTT
ATGAAATCTATATTGTGAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1FW62JQ U 1
AF RS1D168JQ U 39
AF RS1D168TF C 39
AF RS1FW62TF C 62
BS 1 287 RS1FW62JQ
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BS 289 392 RS1FW62JQ
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BS 394 622 RS1FW62JQ

RD RS1FW62JQ 622 0 0
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CTTATTATCTTCCGACCATGACCTCCATTTTGATTTACATAAACTTATTACAAGACACAA
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TCCAGGTTCTGTTGGTACATATCCTTCCTCTTCAACTAAGCCGCGCCGGAATGGTGTAAC
TTCCACATTTATAACCAGATGGAATCTTCTTGCCGCAAGAACGAGCAGCGTAAACAACTT
TATCCATATCAATATAGTTAGTAACATCCCTTGAAACGTAGCGGCAAGCACAAGGTACGT
CGATAGGACGGATTAGAGCACAACATGACCGAAACGGCGGCGGAAAATTTGGTCCGGCGT
TGCTGACGTAGCGTTGACACTCATTCATCAGCCCCGACACGTTAGCTCCACAGAACTGAG
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ATGAAATCTATATTGTGAATCC

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QA 1 584 1 584
DS 

RD RS1D168TF 584 0 0
AATGCTCACAAATCATTACCGTCTTATTATCTTCCGACCATGACCTCCATTTTGATTTAC
ATAAACTTATTACAAGACACAAATCCTCACATCATAATCATTATTCAAACATTAATACAT
CATACCATGTTCTTATAGCAAATCCAGGTTCTGTTGGTACATATCCTTCCTCTTCAACTA
AGCCGCGCCGGAATGGTGTAACTTCCACATTTATAACCAGATGGAATCTTCTTGCCGCAA
GAACGAGCAACGTAAACAACTTTATCCATATCAATATAGTTAGTAACATCCCTTGAAACG
TAGCGGCAAGCACAAGGTACGTCGATAGGACGGATTAGAGCACAACATGACCGAGACGGC
GGCGGAGAATTTGGTCCGGCGTTGCTGACGTAGCGTTGACACTCATTCATCAGCCCCGAC
ACGTTAGCTCCACAGAACTGAGCTGTTGCCACGTTGACATTGTCGGAACCGATCATGAAC
AAAGCTATTGCTACCACCATGATAATTATTCTTCCACTTGCCATCTTTTTGTGTCGTTGT
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QA 1 584 1 584
DS 

RD RS1FW62TF 561 0 0
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TCCTCACATCATAATCATTATTCAAACATTAATACATCATACCATGTTCTTATAGCAAAT
CCAGGTTCTGTTGGTACATATCCTTCCTCTTCAACTAAGCCGCGCCGGAATGGTGTAACT
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ATCCATATCAATATAGTTAGTAACATCCCTTGAAACGTAGCGGCAAGCACAAGGTACGTC
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GCTGACGTAGCGTTGACACTCATTCATCAGCCCCGACACGTTAGCTCCACAGAACTGAGC
TGTTGCCACGTTGACATTGTCGGAACCGATCATGAACAAAGCTATTGCTACCACCATGAT
AATTATTCTTCCACTTGCCATCTTTTTGTGTCGTTGTTTCTCTTTGTCAACGGTTTGTTA
TGAAATCTATATTGTGAATCC

QA 1 561 1 561
DS 



AS 1 4

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GTTTCCTTTTCATGCTTCACTTCTTCAGAAGCTCTCACAAGCAACAAGGGAAACATCACA
ATCAAATGGGATCTCATGAGCTGGACACCTGATGGCTACGCTGCTGTGGTAACAGCTTAC
AACTATCAGAAACAACGTTCCATTGGTTCACCTGGATGGAAAATGAGCTGGAGATGGACC
AGAAAAGAGGTGATCTGGAGCATGGTCGGTGCCCAAACCACAAAGGAAGGAGATTGTTCC
ATGTTCAATGAAAACATCCCTCATTCCTGCACTAGTAAACCAACAGTCATAGACTTGCCT
CTTAAGACTCCTTACAATCAGCAGATCGCTAACTGCTGCAAAGGCGGTGTCTTGAAACCC
GGTTTAGAAAGTGCATTCCAGATATCCGTTGGTAATGCTGGTGACTCGGTTAAGACCGTT
CGGATGCCGGTTAATTTCGTGTTCACAGCACCTAAACAACAGTATATTTGTGGACCGACT
AAGAACGTTAGACCGACCAGGTTTATATCCGCTGACAAAAGGAGAATGACCACAGCTCTG
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AGAAACAATCTCATAAGGAAATCTACTTCCAGTATTTATCTTGTTTTGTATTTTCATGTA
AGGTTTATGTTCTTAATAAAATTGGAAAAACACTTGTTTGATTGGTTAAGTTCTCTTCTA
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1EN24TF U 9
AF RS1D868TF U 1
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AF RS1D868JQ C 154
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GG
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TTAAT

QA 3 487 3 487
DS 

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ATCAAATGGGATCTCATGAGCTGGACACCTGATGGCTACGCTGCTGTGGTAACAGCTTAC
AACTATCAGAAACAACGTTCCATTGGTTCACCTGGATGGAAAATGAGCTGGAGATGGACC
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ATGACCTGGAACATTACTTGCGTCTTCCACAAAGCAACATAAACACATCAAGT
CT

QA 1 653 1 653
DS 

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AT
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QA 3 594 3 594
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GGATGGAAAATGAGCTGGAGATGGACCAGAAAAGAGGTGATCTGGAGCATGGTCGGTGCC
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TGCTGCAAAGGCGGTGTCTTGAAACCCGGTTTAGAAAGTGCATTCCAGATATCCGTTGGT
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AAACAACAGTATATTTGTGGACCGACTAAGAACGTTAGACCGACCAGGTTTATATCCGCT
GACAAAAGGAGAATGACCACAGCTCTGATGACCTGGAACATTACTTGCGTCTTCCACAAG
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ATTTATCTTGTTTTGTATTTTCATGTAAGGTTTATGTTCTTAATAAAATTGGAAAAACAC
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QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 4

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CCGTCTTCTGCTGCTGAGCAAAACCCCACTCCGCTGCTCACGATCACCAGCTTCTCCATC
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ATTGAGAGGTAACGACGAAAGAGATGGACGTGTTTCATGGACGCCATCTTTTTAGTGCAG
AGGAAGAGGTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AACAAGCATCTTCGAACAATCACCACCGTGTTTTCTCATCTCCGCCGTCTTCTGCTGCTG
AGCAAAACCCCACTCCGCTGCTCACGATCACCAGCTTCTCCATCATCTCCGGCCACAACT
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CTCCTCC
C

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DS 

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G
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TTATTAAGAGTAGTTGGTGCTTCAACGTTAACAGCATGCCCAATTTCCTTGATAATCTCT
AATCTTGAATTTTGCAGATGCCTTTGCAGCCGATAACCATGCTCCAATGGAAATACTTTG
TCCTTGTCTCCCCAAACGATTAACGTTTTCTGTGATATTACAGGCAACTCTGCTTCTTCT
CTTTCCAGCAAGTTCTTAGCTAGTTCGAGAAGCTCCTGTCTATTTTTCTCATACATTACA
GCTATGAATTGGGAGAGGATAAAACCTGGTACCCAATCAACAAACGTTAAACCGGTGTTA
GTAGAGATCTTAACCAACATCCTTAGATCCATCGGAGTTTTCGGAACAAGCATCTTCGAA
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GCTGCTCACGATCACCAGCTTCTCCATCATCTCCGGCCACAACTCCGCCATTTTATACGC
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ATCTGCATTCTTGGTGTATGATTTCCCGAAGAACAC

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AAACCCCACTCCGCTGCTCACGATCACCAGCTTCTCCATCATCTCCGGCCACAACTCCGC
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CCAGAAATGGACGGTGGTTTCTCCGTCGTCCAGATCGACCGTTACTGGTCGGAGATCGCA
GAAAACCATGAAATACAGAGATAGAAACGAATCGGCGATCTTGATTAGTATCGGGAAATT
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GAGATGGACGTGTTTCATGGACGCCATCTTTTTAGTGCAGAGGAAGAGGTGTCC

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DS 



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ACCACCCGAGACCGAACCTTTGTGTTTTCTTTTTCTTTCTTTAAACGGCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CZ20JQ U 1
AF RS1AM93JQ U 20
AF RS1CZ20TF C 485
AF RS1AM93TF C 390
BS 1 24 RS1CZ20JQ
BS 25 25 RS1AM93JQ
BS 26 84 RS1CZ20JQ
BS 85 85 RS1AM93JQ
BS 86 207 RS1CZ20JQ
BS 208 208 RS1AM93JQ
BS 209 325 RS1CZ20JQ
BS 326 326 RS1AM93JQ
BS 327 369 RS1CZ20JQ
BS 370 370 RS1AM93JQ
BS 371 384 RS1CZ20JQ
BS 385 385 RS1AM93JQ
BS 386 408 RS1CZ20JQ
BS 409 409 RS1AM93JQ
BS 410 411 RS1CZ20JQ
BS 412 412 RS1AM93JQ
BS 413 453 RS1CZ20JQ
BS 454 454 RS1AM93JQ
BS 455 643 RS1CZ20JQ
BS 644 819 RS1AM93JQ
BS 820 861 RS1AM93TF
BS 862 862 RS1CZ20TF
BS 863 877 RS1AM93TF
BS 878 878 RS1CZ20TF
BS 879 888 RS1AM93TF
BS 889 889 RS1CZ20TF
BS 890 906 RS1AM93TF
BS 907 907 RS1CZ20TF
BS 908 1056 RS1AM93TF
BS 1057 1057 RS1CZ20TF
BS 1058 1111 RS1AM93TF
BS 1112 1112 RS1CZ20TF
BS 1113 1190 RS1AM93TF

RD RS1CZ20JQ 643 0 0
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GTCTCTCTCAAACAACTAAGACAGGTAGTTTTAGATATATAAACAGAGTTGAGGCAATAC
ATGGAAAGATGAAATGGTTCCAAGCTTTGGATTCAATACAAACAGATTGAAGAATAGTTA
AGCAGGTTTTCCAAACACTCTTACAAA*GACAAATTGTGGTCCTTCTACCTTTCTTTTAA
GGAACTGCTGTTAGATTTTGATCGTTTGAGTTGAAAGGGAGGTAAGCAGCCTCTGAGAGG
TGACTGTAGGAATAAGGATGACGTCGAAAGCTGTTTTTGTCTCATGGAGATGGAAGACAA
GCAACTGAATGAGCTTGTAAGACTTCTCTTTTCGTTTTCTTCTTCGGGGATTTGCTCGTC
TGGATCATGGCAAACCGCTGTGATCTTGAGTGACTCAGGAAGTATGCAACTACACACGGA
ACCTATTTCCGCAAGCCGGTTCACCCATTTTGGGATCTTTTTGCCAGTAAGCTTGTAGCA
AGCGTCCTGGCAGAAGTGGTTGCAGTTCTTAACGATCAAGTGATACATATTCCCATAGTA
ACTGCAAGCCATGTTCTCCATGAACTCTCTAACTTGTGCCGGA

QA 1 643 1 643
DS 

RD RS1AM93JQ 800 0 0
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GACAGCTAGTTT*AGATATATAAACAGAGTTGAGGCAATACATGGAAAGATGAAATGGTT
CCAAGCTTTGGATTCAATACAAACAGATTGAAGAATAGTTAAGCATGTTTTCCAA*CACT
CTTACAAAAGACAAAT*GTGGTCCTTCTACCTTTCTTTTAAGGAACTGCTGTTAGATTTT
GATCGTTTGAGTTGAAATGGAGGTAAGCAGCCTCTGAGAGGTGACTGTAGGAATAAGGAT
GACGTCCAAAGCTGTTTTTGTCTCATGGAGATGGAAGACAAGCAACTGAACGAGCTTGTA
AGACTCCTCTTTTCGTTTTCTTCTTCGGGAATCTGCTCGTCTGGATCATGGCAAACCGCT
GTGATCTTGAGTGATTCAGGAAGTATGCAACTACACACGGAACCTATTTCCGCAAGCCGG
TTCACCCATTTTGGGATCTTTTTGCCTGTAAGCTTGTAGCAAGCGTCCTGGCAGAAGTGG
TTGCAGTTCTTAACGATCAAGTGATACATATTCCCATAGTAACTGCAAGCCATGTTCTCC
ATGAACTCTCTAACTTGTGCCGGATTAAGGTTCGTGGTTCCGATGAATATCGACTTCTTA
AATTTGAAGCCTGGGCATTGCCTTGGTTCAACCTCAAAAACACCACTGTTTGCATAATCA
TGTGCCCCAAAAGCATATTCTACTCCATGAACTTCTACACCAGAGTGAAATATACCGAGG
CCTGCCCAATAGATATATCC

QA 1 800 1 800
DS 

RD RS1CZ20TF 650 0 0
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TCCTGGCAGAAGTGGTTGCAGTTCTTAACGATCAAGTGATACATATTCCCATAGTAACTG
CAAGCCATGTTCTCCATGAACTCTCTAACTTGTGCCGGATTCAGGTTCGTGGTTCCGATG
AATATCGACTTCTTAAATTTGAAGCCTGGGCATTCCCTTGGTTCAACCTCAAAAACACCA
CTGTTTGCATAATCATGTGCCCCAAAAGCATATTCTACTCCATGAACTTCTACACCAGAG
TGAAATATACCGAGGCCTGCCCAATAGATATATCCGTTAATAGGAGTCAAGTCATAAACA
TTGAGATAGACTGGTGCACGGCCTGGACCGTAGCTGTTCGACTTGAGTTTCGAAAAGAAG
CAAAACCGCGCAACTGATTTGCTTTTCAGATGAAGCGGTGCAAGAGATTTCCAACGTTTC
TTTGGCTCAGTTTTCATCTTTTCCCGAAACTCTAGCAGCGACTCTGACCAGCCTTTCTTC
TGCTTAGGCTCTGCCTCTCCCTTCAACATTGGATGATGCCTCAGTAGAGGTTATCCAGAG
AAGACCATTAGGAGCAACGGCGCAAAGAAGTGAGACTCGGCATT
AACTCC

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DS 

RD RS1AM93TF 801 0 0
CTTTTCGTTTC
TCTTCGGGAATCTGCTCGTCTGGATCATGGCAAACCGCTGTGATCTTGAGTGATTCAGGA
AGTATGCAACTACACACGGAAC*TATTTCCGCAAGCCGGTTCACCCATTTTGGGATCTTT
TTGCCTGTAAGCTTGTAGCAAGCGTCCTGGCAGAAGTGGTTGCAGTTCTTAACGATCAAG
TGATACATATTCCCATAGTAACTGCAAGCCATGTTCTCCATGAACTCTCTAACTTGTGCC
GGATTAAGGTTCGTGGTTCCGATGAATATCGACTTCTTAAATTTGAAGCCTGGGCATTGC
CTTGGTTCAACCTCAAAAACACCACTGTTTGCATAATCATGTGCCCCAAAAGCATATTCT
ACTCCATGAACTTCTACACCAGAGTGAAATATACCGAGGCCTGCCCAATAGATATATCCG
TTAATAGGAGTCAAGTCATAAACATTGAGATAGACTGGTGCGCGGCCCGGACCATAGTTG
TTCGACTTTAGTTTCGAAAAGAAGCAGAACCGCGCAACTGATTTGCTTTTCAGATGAAGC
GGTGCAAGAGATCTCCAACGTTTCTTTGGCTCAGTTTTCATCTTTTCCCGAAACTCTAGC
AGCGACTCTGACCAACCTTTCCTCTGCTTAGGCTCTGCCTCTCCCTTCAACATTGGGTGA
TGCATCAGTAGAGGTTATCCAGAGAAGACCATTAGGAGCAACGGCGAAAAGGAGTGAGAC
TCGGCATTTTAACTGTCTGAACCACCCGAGACCGAACCTTTGTGTTTTCTTTTTCTTTCT
TTAAACGGCC

QA 12 801 12 801
DS 



AS 1 4

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ATTTTTTTTTAATATGTAGAAGATAAGAAATAATAATGCTAACATAAAACCCATTTTCGG
GTAATGATTTGCTTTTTTTTTGT*TTGTTTATTTACTATTACTTCATTTATCTGTATTTC
ACATACGAGTTTATACTTAACCAAATCTAAAATGAAGGGAGAGAAAGACCTTTGTAATAG
TCTTTTTCAAGATTGCACTGCTAGTTTCTGGAGATGTTGGTAGAAAACTTCAAGACTAGC
ATCGTCTGTGAAGATTACATCGGAACCAGTGTTCATCTCACTCGCGTTGTTGTAACTTGC
TGAAGGATTCAGCTTCGCTAACAAAAACCTTGCCTGACATCCATGTTGATCGCATACAAC
TAGTCTTGGGATAGGGAAACGTCCATGAGTGATCATAACTAATACAATGTTAATTGTTAA
AGTATCAATTTTATTTCGCAAATCACCC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 15 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1DP52JQ U 46
AF RS1AN10TF C 1
AF RS1H560TF C 5
AF RS1AN10JQ U 89
BS 1 45 RS1AN10TF
BS 46 142 RS1DP52JQ
BS 143 143 RS1AN10JQ
BS 144 336 RS1DP52JQ
BS 337 343 RS1AN10JQ
BS 344 344 RS1AN10TF
BS 345 376 RS1AN10JQ
BS 377 377 RS1AN10TF
BS 378 497 RS1AN10JQ
BS 498 498 RS1AN10TF
BS 499 508 RS1AN10JQ

RD RS1DP52JQ 291 0 0
GGAAATATATTCTACATTTTTTTTTAATATGTAGAAGATAAGAAATAATAATGCTAACAT
AAAACCCATTTTCGGGTAATGATTTGCTTTTTTTTTGC*TTGTTTATTTACTATTACTTC
ATTTATCTGTATTTCACATACGAGTTTATACTTAACCAAATCTAAAATGAAGGGAGAGAA
AGACCTTTGTAATAGTCTTTTTCAAGATTGCACTGCTAGTTTCTGGAGATGTTGGTAGAA
AACTTCAAGACTAGCATCGTCTGTGAAGATTACATCGGAACCAGTGTTCAT

QA 1 291 1 291
DS 

RD RS1AN10TF 508 0 0
AAATTCATGACTGAGGGACTTTCATTTATATATTTAGACCCAAAAGGAAATATATTCTAC
ATTTTTTTTTAATATGTAGAAGATAAGAAATAATAATGCTAACATAAAACCCATTTTCGG
GTAATGATTTGCTTTTTTTT*GT*TTGTTTATTTACTATTACTTCATTTATCTGTATTTC
ACATACGAGTTTATACTTAACCAAATCTAAAATGAAGGGAGAGAAAGACCTTTGTAATAG
TCTTTTTCAAGATTGCACTGCTAGTTTCTGGAGATGTTGGTAGAAAACTTCAAGACTAGC
ATCGTCTGTGAAGATTACATCGGAACCAGTGTTCATCTCACTCGCGTTGTTGTAACTTGC
TGAAGGATTCAGCTTCGCTAACAAAAACCTTGCCTGACATCCATGTTGATCGCATACAAC
TAGTCTTGGGATAGGGAAACGTCCATGAGTGATCATAACTAATACAATGTTAATTGTTAA
AGTATCAATTTTATTTCGCAAATCACCC

QA 1 508 1 508
DS 

RD RS1H560TF 504 0 0
TCATGACTGAGGGACTTTCATTTATATATTTAGACCCAAAAGGAAATATATTCTACATTT
TTTTT*AATATGTAGAAGATAAGAAATAATAATACTAACATAAAACCCATTTTCGGGTAA
TGATTTGCTTTTTTTTTTTGTTTGTTATTTACTATTACTTCATTTATCTGTATTTCACAT
ACGAGTTTATACTTAACCAAATCTAAAATGAAGGGAGAGAAAGACCTTTGTAATAGTCTT
TTTCAAGATTGCACTGCTAGTTTCTGGAGATGTTGGTAGAAAACTTCAAGGCTAGCATAG
TCTGTGAAGATTACATCGGAACCAGTGTTCATCTCACTCGCGTTGTTGTAACTTGCTGAA
GGATTCAGCTTCGCTAACAAAAACCTTGCCTGACATCCATGTTGATCGCATACAACTAGT
CTTGGGATAGGGAAACGTCCATGAGTGATCATAACTAATACAATGTTAATTGTTAAAGTA
TCAATTTTATTTCGCAAATCACCC

QA 1 504 1 504
DS 

RD RS1AN10JQ 420 0 0
AATAATAATGCTAACATAAAACCCATTTTCGGGTAATGATTTGCTTTTTTTT*GT*TTGT
TTATTTACTATTACTTCATTTATCTGTATTTCACATACGAGTTTATACTTAACCAAATCT
AAAATGAAGGGAGAGAAAGACCTTTGTAATAGTCTTTTTCAAGATTGCACTGCTAGTTTC
TGGAAATGTTGGTAAAAAACTTCAAGACTAGCATCGTCTGTGAAAATTACATCGGAACCA
GTGTTCATCTCACTCCCGTTGTTGTAACTTGCTGAAGGATTCAGCTTCCCTAACAAAAAC
CTTGCCTGACATCCATGTTGATCGCATACAACTAGTCTTGGGATAGGGAAACGTCCATGA
GTGATCATAACTAATACAATGTTAATTGTTAAAGTATCAATTTTATTTCCCAAATCACCC

QA 1 420 1 420
DS 



AS 1 2

CO CL2390Contig1 839 2 8 U
TTAAACCTCACCGGCGACAAAGAACGGCATTCTCGTATCCTTCGCTCCTCCGTCTTCTCC
CTCACCACCCCTTCGCTCTAACAACCTCAGAACGGCACCGTTTCTTATCCTTTAACCACG
AATCTTCATCTTCATCTTTTCCGGTCAGAGCTCCGTCTCTCGTAGCCGCCGTCTCCTCAA
AATCCTCCACCGGGAATGTTGATGTGTTTGTTGCTGGGATTGGAACTGGTGGGACTGTAA
CTGGTACAGGAAGTTTCTTGAAGATGATGAACAATGATATCAAGGTAGTTGGCGTTGAAC
CATCAGAAAGAAGTATGATCTCTGGAGACAATCCTGGTTATATACCGGGAATCTTGGATG
TTAAGCTACTAGATGAAGTGGTTAAGGTTAGCAATGAAGAAGCAATTGAGATGGCGAGAA
GACTAGCTTTGGAGGAAGGGTTGCTGGTTGGGATCTCGTCTGGAGCAGCTGCAGTAGCAG
CAATCAGCTTAGCTAAAAGAGCTGAGAACGCCGGGAAACTCATCACGGTTCTGTTTCCGA
GCCATGGTGAAAGGTATATCACAACGGCTCTGTTTAGTTCCATCAACAAAGAGGTTCAAG
AGATGAGCCATTAGGAGCAGAAGCTATAAGAGAAAACCCTTGAAGTATAGTGTAAACTAC
AAGTCTCTCTCTACAAACTTGGAAACGTTTTGAGATATAAGCCTCTAAAGCCTTCACAGG
GTTTTGGGAAGACCACAGCGGGGATTGAGAGATGAATCAAACAGTTTTTTTTCAGAGATT
TTGTGATGTAAATCTTAACCCAGTCTTATTACTTCTTCTTATCGCTTATATCTTGGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A552TF U 1
AF RS1EX28TF U 280
BS 1 314 RS1A552TF
BS 315 315 RS1EX28TF
BS 316 341 RS1A552TF
BS 342 342 RS1EX28TF
BS 343 397 RS1A552TF
BS 398 398 RS1EX28TF
BS 399 452 RS1A552TF
BS 453 839 RS1EX28TF

RD RS1A552TF 452 0 0
TTAAACCTCACCGGCGACAAAGAACGGCATTCTCGTATCCTTCGCTCCTCCGTCTTCTCC
CTCACCACCCCTTCGCTCTAACAACCTCAGAACGGCACCGTTTCTTATCCTTTAACCACG
AATCTTCATCTTCATCTTTTCCGGTCAGAGCTCCGTCTCTCGTAGCCGCCGTCTCCTCAA
AATCCTCCACCGGGAATGTTGATGTGTTTGTTGCTGGGATTGGAACTGGTGGGACTGTAA
CTGGTACAGGAAGTTTCTTGAAGATGATGAACAATGATATCAAGGTAGTTGGCGTTGAAC
CATCAGAAAGAAGTGTGATCTCTGGAGACAATCCTGGTTATGTACCGGGAATCTTGGATG
TTAAGCTACTAGATGAAGTGGTTAAGGTTAGCAATGAGGAAGCAATTGAGATGGCGAGAA
GACTAGCTTTGGAGGAAGGGTTGCTGGTTGGG

QA 1 452 1 452
DS 

RD RS1EX28TF 560 0 0
G
CAAGGTAGTTGGCGTTGAACCATCAGAAAGAAGTATGATCTCTGGAGACAATCCTGGTTA
TATACCGGGAATCTTGGATGTTAAGCTACTAGATGAAGTGGTTAAGGTTAGCAATGAAGA
AGCAATTGAGATGGCGAGAAGACTAGCTTTGGAGGAAGGGTTGCTGGTTGGGATCTCGTC
TGGAGCAGCTGCAGTAGCAGCAATCAGCTTAGCTAAAAGAGCTGAGAACGCCGGGAAACT
CATCACGGTTCTGTTTCCGAGCCATGGTGAAAGGTATATCACAACGGCTCTGTTTAGTTC
CATCAACAAAGAGGTTCAAGAGATGAGCCATTAGGAGCAGAAGCTATAAGAGAAAACCCT
TGAAGTATAGTGTAAACTACAAGTCTCTCTCTACAAACTTGGAAACGTTTTGAGATATAA
GCCTCTAAAGCCTTCACAGGGTTTTGGGAAGACCACAGCGGGGATTGAGAGATGAATCAA
ACAGTTTTTTTTCAGAGATTTTGTGATGTAAATCTTAACCCAGTCTTATTACTTCTTCTT
ATCGCTTATATCTTGGTGC

QA 2 560 2 560
DS 



AS 1 4

CO CL2391Contig1 780 4 9 U
GTCGGTTACAGAGCTTAGCTTTAACATGTTTGGATTCTGTGCTGCTCTCTTTGGGTGTTT
AGCTACTTCTACTAAGACCATTCTAGCTGAGTCTCTTCTTCATGGTTACAAGTTTGACAG
CATAAACACAGTGTACTACATGGCGCCTTTCGCCACCATGATTCTCGGGTTACCTGCATT
ACTACTGGAAGGCAACGGGATCTTGAGCTGGTTTGATGCACACCCGTCTCCCTGGTCAGC
ACTCATCATCATCTTCAGCTCTGGTGTGTTGGCCTTCTGTCTCAACTTCTCCATCTTCTA
CGTCATCCACTCCACAACCGCAGTCACATTCAACGTAGCTGGAAACCTCAAGGTTGCGGT
GGCTGTAATGGTGTCGTGGTTGATATTCCGGAACCCAATATCGTACATGAATGCTGTTGG
ATGTGGGATCACGCTTGTGGGCTGCACGTTCTATGGATACGTGAGGCATAAGCTTTCGCA
GCAGCAGCAGCAGCCAGGAACTCCTAGGACTCCTCGTACACCAAGAAACAAGATGGAGTT
GCTTCCTCTTGTTAATAATGATAAACTCGAAGGCAAAGTCTGATCTCATATTCAGTATCC
ACTGCTGCAAAAGAGAGATAAGAAGAAGCATTCACTCACACCAGAGGGGTGTTGAATTTT
TACTACATATGCATTTTACTTGAAACCTTAATAGAGAAAAGTAACATTTTGTTTTATGGG
CTCGTAGAAGAGATAATGGTTCATCTTATTTATAATCTCTGTGATAATGTAGAATCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1EZ81TF U 1
AF RS1BV45TF U 34
AF RS1E319JQ C 267
AF RS1EZ81JQ C 296
BS 1 48 RS1EZ81TF
BS 49 49 RS1BV45TF
BS 50 482 RS1EZ81TF
BS 483 699 RS1BV45TF
BS 700 700 RS1E319JQ
BS 701 715 RS1BV45TF
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BS 717 747 RS1BV45TF
BS 748 780 RS1E319JQ

RD RS1EZ81TF 482 0 0
GTCGGTTACAGAGCTTAGCTTTAACATGTTTGGATTCTGTGCTGCTCTGTTTGGGTGTTT
AGCTACTTCTACTAAGACCATTCTAGCTGAGTCTCTTCTTCATGGTTACAAGTTTGACAG
CATAAACACAGTGTACTACATGGCGCCTTTCGCCACCATGATTCTCGGGTTACCTGCATT
ACTACTGGAAGGCAACGGGATCTTGAGCTGGTTTGATGCACACCCGTCTCCCTGGTCAGC
ACTCATCATCATCTTCAGCTCTGGTGTGTTGGCCTTCTGTCTCAACTTCTCCATCTTCTA
CGTCATCCACTCCACAACCGCAGTCACATTCAACGTAGCTGGAAACCTCAAGGTTGCGGT
GGCTGTAATGGTGTCGTGGTTGATATTCCGGAACCCAATATCGTACATGAATGCTGTTGG
ATGTGGGATCACGCTTGTGGGCTGCACGTTCTATGGATACGTGAGGCATAAGCTTTCGCA
GC

QA 1 482 1 482
DS 

RD RS1BV45TF 716 0 0
TTTT
TGTGCTGCTCTCTTTGGGTGTTTAGCTACTTCTACTAAGACCATTCTAGCTGAGTCTCTT
CTTCATGGTTACAAGTTTGACAGCATAAACACAGTGTACTACATGGCGCCTTTCGCCACC
ATGATTCTCGGGTTACCTGCATTACTACTGGAAGGCAACGGGATCTTGAGCTGGTTTGAT
GCACACCCGTCTCCCTGGTCAGCACTCATCATCATCTTCAGCTCTGGTGTGTTAGCCTTC
TGTCTCAACTTCTCCATCTTCTACGTCATCCACTCCACAACCGCAGTCACATTCAACGTA
GCTGGAAACCTCAAGGTTGCGGTGGCTGTAATGGTGTCGTGGTTGATATTCCGGAACCCA
ATATCGTACATGAATGCTGTTGGATGTGGGATCACGCTTGTGGGCTGCACGTTCTATGGA
TACGTGAGGCATAAGCTTTCGCAGCAGCAGCAGCAGCCAGGAACTCCTAGGACTCCTCGT
ACACCAAGAAACAAGATGGAGTTGCTTCCTCTTGTTAATAATGATAAACTCGAAGGCAAA
GTCTGATCTCATATTCAGTATCCACTGCTGCAAAAGAGAGATAAGAAGAAGCATTCACTC
ACACCAGAGGGGTGTTGAATTTTTACTACATATGCATTTTACTTGAAACCTTAATAGAGA
AA*GTAACATTTTGTTTTGTGGGCTCGTAGAAGAGATAATGGTTCATCTT
TT

QA 5 714 5 714
DS 

RD RS1E319JQ 514 0 0
TGTTGGCCTTCTGTCTCAACTTCTCCATCTTCTACGTCATCCACTCCACAACCGCAGTCA
CATTCAACGTAGCTGGAAACCTCAAGGTTGCGGTGGCTGTAATGGTGTCGTGGTTGATAT
TCCGGAACCCAATATCGTACATGAATGCTGTTGGATGTGGGATCACGCTTGTGGGCTGCA
CGTTCTATGGATACGTGAGGCATAAGCTTTCGCAGCAGCAGCAGCAGCCAGGAACTCCTA
GGACTCCTCGTACACCAAGAAACAAGATGGAGTTGCTTCCTCTTGTTAATAATGATAAAC
TCGAAGGCAAAGTCTGATCTCATATTCAGTATCCACTGCTGCAAAAGAGAGATAAGAAGA
AGCATTCACTCACACCAGAGGGGTGTTGAATTTTTACTACATATGCATTTTACTTGAAAC
CTTAATAGAGAAAAGTAACATTTTGTTTTATGGGCTCGTAGAAGAGATAATGGTTCATCT
TATTTATAATCTCTGTGATAATGTAGAATCTTTT

QA 1 514 1 514
DS 

RD RS1EZ81JQ 474 0 0
TTT
TACGTCATCCACTCCACAACCGCAGTCACATTCAACGTAGCTGGAAACCTCAAGGTTGCG
GTGGCTGTAATGGTGTCGTGGTTGATATTCCGGAACCCAATATCGTACATGAATGCTGTT
GGATGTGGGATCACGCTTGTGGGCTGCACGTTCTATGGATACGTGAGGCATAAGCTTTCG
CAGCAGCAGCAGCAGCCAGGAACTCCTAGGACTCCTCGTACACCAAGAAACAAGATGGAG
TTGCTTCCTCTTGTTAATAATGATAAACTCGAAGGCAAAGTCTGATCTCATATTCAGTAT
CCACTGCTGCAAAAGAGAGATAAGAAGAAGCATTCACTCACACCAGAGGGGTGTTGAATT
TTTACTACATATGCATTTTACTTGAAACCTTAATAGAGAAAAGTAACATTTTGTTTTATG
GGCTCGTAGAAGAGATAATGGTTCATCTTATTTATAATCTCTGTGATAATG

QA 4 474 4 474
DS 



AS 1 3

CO CL2392Contig1 1058 3 13 U
GGAAACGCACAAACGACGTCATTTGGTTGTTGACTTGAAAAGAAACGGAGCTTCTCTGTT
TGAGTCGTGACGTGACCTGGGGTTGCGAAGCGGCGCCGTGATCGTAACAGTAGTTATGGA
GACCATGGAAGCTCCTCCATCACCAGCTTTTCAGTCTCCTTCTCGTTCCACCAGTCAACA
ATTATTGCATTTCTACCTAGCCGTGGACCGTCCCCAATTCAAAATGGAGACAGTTGTGGA
GCTATTAGGAGTGCTAGGACGTCGTCCATGGCTTCCCATTGTAGTCTGTTGCAGCTCGCG
CGACGAACTCGACGCCGTCTCCTCTTCCTTGTCCACTCTTCCTTTCATCTCCTTTGCTGC
TTTGTACAGTGATCTGGGAGAGAGGGACCGAGCTATGGTTTTAGAGAATTTTCGACAAGC
TACAGTAAACTGGAACCATCACCTTAACTCTGCAGTGGAAGAAGGTTTGGCAGAGAGTGA
AGTCGGAGAAGAAGAAGATGAAAAGAAATCTCATCTGGTGGTTGTGACCGATGTTTGTCT
TCCGATGCTTTCATCTGGTGAATCTTCTCTTTCCTCGCGAGTTCTCATCAACTACGAGCT
TCCTACTAAGAAGGAAACTTATACTAGGCGTCTAACATCCTGCTTAGCTTCAGGTGGGAT
TGTCATAAACATGGTTGTTGGAGGTGAAGTAACCACTCTCAAATGCCTTGAAGAAACCAG
CGGCATTATCATCGCAGAGATGCCTATCAATATTTCTGAGATTTTGTAACAAACGCATGG
CTCCTACGACCTGAAGGATACTGTCTAAGCGGGTTTAATGGCTCTGAAGCTTCAATATGT
ATGTTACATGACTTCTCTAGAAAAATCAATAGTTTGTGTTAAGCTACAGAAGCTGTTCCT
CTGCTCCACTTTTAGCTTTTGAGAGTTGATTACTTTTGCATACAACGCTGCGTTTTGACA
TTGTTGTTCATCTTGGGAGATTTTTTTTCTTCTAAAACATTTGGATAAAGGCATAAAGAG
CAACAGAGCGAGCAATAGTGGACATGTGATTGCAGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GH63TF U 1
AF RS1FG28TF U 41
AF RS1GH63JQ C 416
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TCCGAT
TCT

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DS 

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G
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CTCGTTCCACCAGTCAACAATTATTGCATTTCTACCTAGCCGTGGACCGTCCCCAATTCA
AAATGGAGACAGTTGTGGAGCTATTAGGAGTGCTAGGACGTCGTCCATGGCTTCCCATTG
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TAGAGAATTTTCGACAAGCTACAGTAAACTGGAACCATCACCTTAACTCTGCAGTGGAAG
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TTGTGACCGATGTTTGTCTTCCGATGCTTTCATCTGGTGAATCTTCTCTTTCCTCGCGAG
TTCTCATCAACTACGAGCTTCCTACTAAGAAGGAAACTTATACTAGGCGTCTAACATCTT
GCTTAGCTTCAGGTGGGATTGTCATAAACATGGTTGTTGGAGGTGAAGTAACCACTCTCA
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CTCTGAA

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DS 

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TTCCTCTGCTCCACTTTTAGCTTTTGAGAGTTGATTACTTTTGCATACAACGCTGCGTTT
TGACATTGTTGTTCATCTTGGGAGATTTTTTTTCTTCTAAAACATTTGGATAAAGGCATA
AAGAGCAACAGAGCGAGCAATAGTGGACATGTGATTGCAGTTC

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 4

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BQ
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1GI52JQ U 1
AF RS1AK02JQ U 6
AF RS1AK02TF C 282
AF RS1GI52TF C 601
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RD RS1GI52JQ 717 0 0
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TAATGAGTTTTCCATTTGAATCACCAACCTCTACCCCACCTATACGGCTATATAACTAAG
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ACCACCAACATAACCTCTATCGAGACTCTTCGACTGCTACGTTGGAGTAAGTACACTCGA
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A

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DS 

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CG
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TGCCAATGATCTTAAACACACACTATCGAAAGTAAAAGATGGATCTTACATTAACCACCA
ACATAACCTCTATCGAGACTCTTCGACTGCTACGTTGGAGTAAGTACACTCGAAGCTCTC
TTCCTCTGATCCTTTCCCTCTACTCCTCTTCCATGATATCTTCCATGTCGTATACAAGCT
AATCCTCTCGGTTTGAACGCTTCTTTTAGCGAGCATGAGGGTAAGGAAGACAGGGACCAT
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CGGCTTATCTGCAGCCTCTTCCACTTTCGCTAAGAGGTAGAATCCTGCAGCCCAGAGCCA
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CCAGACGAGGCGAGCATCGTCAGGGTGGAGATGATAGTAAGAAGATC

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TGATATC
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TAAGGAAGACAGGGACCATAGCAGCGCACAAATGCTTTATAGAATGGCCACTAAGAATAT
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ATCCTGCAGCCCAGAGCCAATAGGTGGAATGTGTATACATGGGAGGTAACAGGATAGCCA
TAAGTGGAATGACAATGCAGGGAACAAACTGGACTAAAGCATATGGACGAAGATCATCGA
AAAACCTCCAGTAGAGAATGCTAACAAGGCCAACGAGAAGCAAAGGGACGATGGAGTAAG
TGCCCTTGTGCTCATCAATCCTCTCGATCACAAATATAGCCATGATGGACGTGAAGGCAA
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AAGATCCGAAAGCAACAGCGGCCACACCGACGAAAAAGCAAGTCCATCCCAACTTCTCAC
CTCGCAAACTGAATCTGAAGTAATCATCGGGGTAAAAGCAGAGGACGAGACCGAGGAGAC
CGATGATGAGGAAAGGGAAGTTGGAGATGACGTTGAGAGCATTCGGAATCCCGAAGAAGG
AGCGTTGATCGGCGAAATCGTGATAGGCTTGAGATTGAGGGATGGTCGGAGTGACGATCA
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TCTTTCTTCTTCTGAGAGAGAGAGAGGTTCAGAGCGTTTTGACTCTTCCC

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CATCAATCCTCTCGATCACAAATATAGCCATGATGGACGTGAAGGCAATAGTCATAAGAA
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CAACAGCGGCCACACCGACGAAAAAGCAAGTCCATCCCAACTTCTCACCTCGCAAACTGA
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AAGGGAAGTTGGAGATGACGTTGAGAGCATTCGGAATCCCGAAGAAGGAGCGTTGATCGG
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AGATTACGATCGATGCTCCCCATGAGTATATCGTCCTCTTCTTCATCGTCTTTCTTCTTC
TGAGAGAGAGAGAGGTTCAGAGCGTTTTGACTCT
CC

QA 1 514 1 514
DS 



AS 1 4

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GGATGACACATCTTATACAAGGTTTCCATACTTCCTTTCATCAAAGTCTCAGTCTTTGAA
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CACACACAAAACTAGCCGAGGAGTTTGGTAATGAACAAGAATGTTATTATCCAACATCTA
CTAGTATTTCCAAAAAAAAATGGCAAGAAAGAAAACAAGGAAACAAAAAAGGGCGAAAAT
TCCTGAGAGATCAGTAGTTTTTGGTGTGAATGATCCAGTTACCAGAAAATGTTGGATTAT
ACTGGCTGTTCTTTGTGTTTTCGGAACTGTGAAAGGGATGCAGATTGATGGCGATCATGT
GGGTTACAAGAAGTGTCTGGGAATGATTTTCGTGTTTTTTTATGTGATTGACATCATCAA
ATCTATTTTCTGTGAACCTCCAACTCCAGTTGGCAAGGCTGACCGATGGGTAAGAACTTT
TGTACCTTCGGTACTCTTTCCCATCATCTATTTTACCATCTACAACTTCCAAACTTTTCA
TGCATCCCTTCTAGTTTTATCCATCGTCTTTGGATTAGTAGCTATGGTTCAGCTTCTTTG
TCCAGTGGAAGGGTTTCACTTTGCTTATGTTGTTGTGATCATCATATTAGGGTGTTATTT
AGCTCTTTTTGCATGTGACTATGACCCCAAAATCCAGCCATATTGGATCTGTTTTCTCTT
TATTTTTGTAATTCAGTGTGTCATCTATGGTCTCAATTGCCCTTCAGATGGCTTCGTATT
CTTCAGTTTCTATTGAGTTTCCATCTTCTGAAACTGTCAGATCGCTGGGTGGTTAACCTT
TTGGTCATCTTACTATGCTTCTTGTTGTTCAATCTTTTTTCTAGAACATTGTAATCAAAT
ATTGTCATATGAAAACTCTAATGTTTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1F295TF U 56
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GG
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TCATGCATCCCTTCTAGTTTTATCCATCGTCTTTGGATTAGTAGCTATGGTTCAGCTTCT
TTGTCCAGTGGAAGGGTTTCACTTTGCTTATGTTGTTGTGATCATCATATTAGGGTGTTA
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CCC

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DS 

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ATTTTCTGTGGACCTCCAACTCCAGTTGGCAAGGCTGACCGATGGGTAAGAACTTTTGTA
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TCCCTTCTAGTTTTATCCATCGTCTTTGGATTAGTAGCTATGGTTCAGCTTCTTTGTCCA
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CTTTTTGCATGTGACTATGACCCCAAAATCCAGCCATTTTGGATCTGTTTTCTCTTTATT
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AGTTTTTATTGAGTTTCCAT
TT

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DS 

RD RS1DR12JQ 716 0 0
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CAGTTACCAGAAAATGTTGGATTATACTGGCTGTTCTTTGTGTTTTCGGAACTGTGAAAG
GGATGCAGATTGATGGCGATCATGTGGGTTACAAGAAGTGTCTGGGAATGATTTTCGTGT
TTTTTTATGTGATTGACATCATCAAATCTATTTTCTGTGAACCTCCAACTCCAGTTGGCA
AGGCTGACCGATGGGTAAGAACTTTTGTACCTTCGGTACTCTTTCCCATCATCTATTTTA
CCATCTACAACTTCCAAACTTTTCATGCATCCCTTCTGGTTTTATCCATCGTCTTTGGAT
TAGTAGCTATGGTTCAGCTTCTTTGTCCAGTGGAAGGGTTTCACTTTGCTTATGTTGTTG
TGATCATCATATTAGGGTGTTATTTAGCTCTTTTTGCATGTGACTATGACCCCAAAATCC
AGCCCTATTGGATCTGTTTTCTCTTTATTTTTGTAATTCAGTGTGTCATCTATGGTCTCA
ATTGCCCTTCAGATGGCTTCGTATTCTTCAGTTTCTATTGAGTTTCCATCTTCTGAAACT
GTCAGATCGCTGGGTGGTTAACCTTTTGGTCATCTTACTATGCTTCTTGTTGTTCAATCT
TTTTTCTAGAACATTGTAATCAAATATTGTCATATGAAAACTCTAATGTTTTTTCC

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 3

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CTGTTCCGTTCTGTAAGAATTATGGACGGAGGTGGCGCGTATAACCCACGCACGGTGGAG
GAAGTCTTCAGAGACTTTAAGGGTCGTAGGAATGGCATGATTAAGGCTTTAACCACTGAT
GTTCAGGACTTCCGCCGACTTTGTGATCCCGAGAAGGAGAACTTGTGCCTTTATGGGCTC
CCTAATGAGCAATGGGAAGTGAATTTACCAGCTGAAGAGGTTCCCCCGGAGATCCCAGAG
CCTGTTTTGGGTATCAACTTTGCCCGGAACGGGATGGTGGAGAAGGATTGGCTGTCCCTT
GTTGCTGTCCACAGTGATGCATGGCTTCTTGCAGTTGCTTTCTTTTTCGGATCCAGGTTT
GGGTTTGACAAAGCTGATAGGAAACGCCTTTTCAATATGATGAATGAGCTACCATCAGTC
TTTGAGGTTGTGACTGGTACTGCTAAGAAACAATCAAAGGAGAAATCCTCTGTTTCCAAC
AATAGCAGCAACAGATCCAAATCAAACTCCAAGCGAGGAGGATCAGAACCTCGGCCTAAG
TACTCAAAGGCAGAGCCCAAAGAGGAAGAGGAAGAGGAGGAGGATGATGATGAGCAAGGT
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CTTAGGATGACATTTTAGCTATCATTGTTACAAATGGGAGGTGGTTTGATCCTTGCTCTC
TGTTAT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
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20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 

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AATAGCAGCAACAGATCCAAATCAAACTCCAAGCGAGGAGGATCAGAACCTCGGCCTAAG
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GTGAGAACTATGCAGAAAATGAGTTCTGGATCTGCTGTGACCTCTGTGAGAGCTGGTTCC
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ATATATGATGAACAGCCTAACTGTTTTTGGTTTAGATTTTTATTTGTTGATTTAAGACCT
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CATTGTTACAAATGGGAGGTGGTTTGATCCTTGCTCTCTGTTAT

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DS 



AS 1 4

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CATTTGGAATCGTCTTTCAGGCGAAGTGTTTAGAGACGGGGGAAACCGTTGCAATCAAGA
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ACCCCAATGTTGTCTCCCTCAAGCATTGCTTTTTCTCAACGACCGAGAGAGACGAGCTGT
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ATCTTCTGGTTAATCCTCATACACATCAGGTCAAGCTCTGCGACTTTGGTAGCGCTAAAG
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AGCTTATATTTGGAGCTACAGAATACACAACAGCTATTGACATATGGTCTGCAGGGTGTG
TTCTTGCTGAGTTGCTCCTTGGACAGCCTCTGTTTCCAGGTGAGAGTGGAGTCGACCAAC
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CAAACTACACTGAATTCAAGTTCCCTCAGATAAAGGCTCACCCTTGGCACAAAATATTCC
ATAAGCGTACACCTCCAGAAGCTGTAGATCTAGCCTCAAGACTTCTCCAGTATTCCCCAA
ACCTCAGATCAACCGCTATGGAGGCAATAGTTCACCCGTTCTTCGATGAGCTACGTGATC
CCAACACACGTCTACCTAATGGTCGTCCCTTGCCTCCACTTTTCAACTTCAAACCCCAAG
AGCTTAAAGGAGCAAGCGTAGAGCTGTTGTCCAAGCTTATACCTGAACACGCCCGAAAGC
AGTGTTCCTTCCTCGCTGTCTGAGTGACTAAACCTCTCTGTGTGTATGTATGTAGTATGT
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AGCTTTTCATCTTTTATGAATGTAGTCTCTGTCGTTTATTGGCAGGGTCCCACGGATGAT
CGAACATTATTAATTTATCAAAAAACGCTATGTTCTCTTTCTGGATGACTAATGTATGTA
ACGGTGTTTAACTTTGCTGCAGTTGAATGGGAGTCTATGTACAACGTGTTGATCT


BQ
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CATTTGGAATCGTCTT*CAGGCGAAGTGTTTAGAGACGGGGGAAACCGTTGCAATCAAGA
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G
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DS 



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AAATCACGTTTCCCTTGAGACAACCCGTGCAGTGACACTGGTCCCAAGATTCCAATTCCA
TGACTCC


BQ
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TGCACACACAGCTTACATCTCTCTCTCCCTCTCTGTATTGGTTGGTTATACATTTTTTTG
TAGTCAAAA

QA 1 189 1 189
DS 

RD RS1DF29JQ 664 0 0
ACAGCGTTTGAAACAAATGAGTCACACAATAAGATCTTTCTCCCAACATGAACCTTCACT
TGTTGATTACAAAGACAAACTCAGAACCAAACATTAAACCAACTTCATTCAGCCCCAACA
AATCCGGTCTCCACAACCGGTTAAAATGGTCGGTGATGACCAGTGGGCAGAACGTTTTTT
TGATAAGACCCGGAATTGCCCGAGACCCATCACAACTCTCTACAGACTTCTCTCTTACCT
AACTGAAAACTACTCTAAGCCAACAAAGTCTTCTGTTCAAACTAAACACACACATGCACA
CACAGCTTACATCTCTCTCTCCCTCTCTGTATTGTTTGGTTATACATTTTTTTGTAGTCA
AAAGAGCTCAAAGATCATCTTTTAAGGCTTCCAACTGGTTACAGATGTCTCAGGGGAACA
TACCGCTTCAACAGTCAGCCGTTTCAACACATTCGGACACGGATCTTTCCCGAAGTTACT
GTTGGATATCGTCACTGCACATCTCGCTTTCCCTACACACTTCCTCTCTAAAATAGCGTA
TGAGGTAGCTGCGTGACACTCTCCTTGCTGGTAACTCCCGCATTTTCCCAAAGGAGTCCC
AAAGCTAGCAAACTTGATAGCTGAAATAGCTTGAACAGGACTACATTTCAAATGAACTTT
CGGT

QA 1 664 1 664
DS 

RD RS1DF29TF 585 0 0
CCCAACAAATCCGGTCTCCACAACCGGTTAAAATGGTCGGTGATGACCAGTGGGCAGAAC
GTTTTTTTGATAAGACCCGGAATTGCCCGAGACCCATCACAACTCTCTACAGACTTCTCT
CTTACCTAACTGAAAACTACTCTAAGCCAACAAAGTCTTCTGTTCAAACTAAACACACAC
ATGCACACACAGCTTACATCTCTCTCTCCCTCTCTGTATTGTTTGGTTATACATTTTTTT
GTAGTCAAAAGAGCTCAAAGATCATCTTTTAAGGCTTCCAACTGGTTACAGATGTCTCAG
GGGAACATACCGCTTCAACAGTCAGCCGTTTCAACACATTCGGACACGGATCTTTCCCGA
AGTTACTGTTGGATATCGTCACTGCACATCTCGCTTTCCCTACACACTTCCTCTCTAAGA
TAGCGTATGAGGTAGCTGCGTGACACTCTCCTTGCTGGTAACTCCCGCATTTTCCCAAAG
GAGTCCCAAAGCTAGCAAACTTGATAGCTGAAATAGCTTGAACAGGACTACATTTCAAAT
GAACTTTCGGTCTACGAAACGTTTGTCCTTTCCCGTAGCTTTCG
C

QA 1 584 1 584
DS 

RD RS1CX23TF 700 0 0
CTGGTAACTCCCGCATTT*CCCAAAGGAGTCCCAAAGCTAGCAAACTTGATAGCCGAAAT
AGCTTGACCAGGACTACATTTCAAATGAACTTTCGGTCTACGAAACGTTTGTCCTTTCCC
GTAGCTTTCGATTTGCCAGTTCTTGATATTGGGATGGTATTCAGAGACTTCAGCACAGAC
TCCAGAGACCGATCTTTTGACCAAAGAAACAGCTGATGGTTTCCTCCGAGCTCCTCGAAT
ATCACCCACAGGTTTTGGCTCGGTTTTAGCCATGATCTGGGGACGTGGTAGTATCTCTGT
GTAGGCTGGCCACAGCCGGATAGGCACTTGTTCGGTTTGTATGTTCCGGTGTAGCTACAG
TGACCACAGTTGCCAGTAGCAAAGGCTGTCCAGTATCTCCCGATGCTCTCACCGTTCACC
CATATCTGACCTTTTCCCATTCCTTCCATGTCCAAAGCAAGCGACTCGTTGCCTTCAGGT
GCATCAAAGTAAGTCTTGTGCCATGTCAAAGGCTGAGGCTTTTGTACAATCAAGGAGGCG
TCCATCCACCCATTAGAGGGAGCGTTGGTTGGATATGCAAGATTCATAGCTTCTCCTTTT
AATCCCACCTGGTAAGTCCATTTTTGCCATGACAAATCACGTTTCCCTTGAGACAACCCG
TGCAGTGACACTGGTCCCAAGATTCCAATTCCATGACTCC

QA 1 700 1 700
DS 



AS 2 4

CO CL2398Contig1 829 2 16 U
GGGAACCCCCAATGGATCACCGAGACGATACCTATGCCACGTGTCATGAGCGACGCTGTC
CTCCTCCCCAACGGAGAAGTTTTAATCATTAACGGCGTGAGACGTGGAACCTCCGGATGG
GGTAACGGCAGAGACCCAATATTCACCCCGATCATTTACGCGCCGAACAAACCGTTAGGC
CAACGTTTCAAAGAACTCGCTCCTTCCCCTATCCCCCGCGTCTACCACTCCATCGCGGTC
GCTCTACCCGACGGCAAAGTCCTCGTAGGTGGAAGCAACACTAACGACGGTTACAAATAC
GACGTCATGTTCCCGACCGAGCTCCGCATCCAGAAATACTCCCCGCCTTACCTCGACCCG
GCTCTCGCCTACTTGAGACCATCCATCGTGAACACCGCCACACCGAAACAGATCAGGTAC
GGAGAGAGGTTTAACATAAGGATCAAACTTAACCAGAAAGACGTGACGAAGGAGAACGTT
ATAGTTACAATGTTGGCACCACCGTTTACCACGCACGCCGTGTCGATGAACATGAGGTTG
CTCATGTTGGGTATCTTTGATATCAAGAAAGAGGTTCGCGACCTTCATCAGATCATGCCC
TTGCTCCTCCCAGTGGAAAAGTTGCTCCTCCTGGCTATTATCTTCTCTCCGTTGTCTACC
AAGGCGTTCCTAGCGTTGGAGAATGGATCCAAATCGTCTGATTTTTTTAGTTTCCTCCCA
GGATAATTTAATAATGACCTTATTTTTTTGATACCAACCCTCACCCATAATAAATGTAAA
ATAAAACCATATTTTTGCTCATTGTGGATAAGTTTTTTGATACTCTATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BU96TF U 1
AF RS1CS42TF U 152
BS 1 176 RS1BU96TF
BS 177 177 RS1CS42TF
BS 178 341 RS1BU96TF
BS 342 342 RS1CS42TF
BS 343 365 RS1BU96TF
BS 366 366 RS1CS42TF
BS 367 391 RS1BU96TF
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BS 399 399 RS1CS42TF
BS 400 444 RS1BU96TF
BS 445 445 RS1CS42TF
BS 446 515 RS1BU96TF
BS 516 516 RS1CS42TF
BS 517 562 RS1BU96TF
BS 563 829 RS1CS42TF

RD RS1BU96TF 562 0 0
GGGAACCCCCAATGGATCACCGAGACGATACCTATGCCACGTGTCATGAGCGACGCTGTC
CTCCTCCCCAACGGAGAAGTTTTAATCATTAACGGCGTGAGACGTGGAACCTCCGGATGG
GGTAACGGCAGAGACCCAATATTCACCCCGATCATTTACGCGCCGAACAAACCGTTGGGC
CAACGTTTCAAAGAACTCGCTCCTTCCCCTATCCCCCGCGTCTACCACTCCATCGCGGTC
GCTCTACCCGACGGCAAAGTCCTCGTAGGTGGAAGCAACACTAACGACGGTTACAAATAC
GACGTCATGTTCCCGACCGAGCTCCGCATCCAGAAATACTCGCCGCCTTACCTCGACCCG
GCTCTTGCCTACTTGAGACCATCCATCGTGAGCACCGCTACACCGAAACAGATCAGGTAC
GGAGAGAGGTTTAACATAAGGATCCAACTTAACCAGAAAGACGTGACGAAGGAGAACGTT
ATAGTTACAATGTTGGCACCACCGTTTACCACGCATGCCGTGTCGATGAACATGAGGTTG
CTCATGTTGGGTATCTTTGATA

QA 1 562 1 562
DS 

RD RS1CS42TF 678 0 0
G
CATTTACGCGCCGAACAAACCGTTAGGCCAACGTTTCAAAGAGCTCGCTCCTTCCCCTAT
CCCCCGCGTCTACCACTCCATCGCGGTCGCTCTCCCCGACGGCAAAGTCCTCGTAGGTGG
AAGCAACACTAACGACGGTTACAAGTACGACGTCATGTTCCCGACCGAGCTCCGCATCCA
GAAATACTCCCCGCCTTACCTCGACCCGGCTCTCGCCTACTTGAGACCATCCATCGTGAA
CACCGCCACACCGAAACAGATCAGGTACGGAGAGAGGTTTAACATAAGGATCAACCTTAA
CCAGAAAGACGTGACGAAGGAGAACGTTATAGTTACAATGTTGGCACCACCGTTTACCAC
GCACGCCGTGTCGATGAACATGAGGTTGCTCATGTTGGGTATCTTTGATATCAAGAAAGA
GGTTCGCGACCTTCATCAGATCATGCCCTTGCTCCTCCCAGTGGAAAAGTTGCTCCTCCT
GGCTATTATCTTCTCTCCGTTGTCTACCAAGGCGTTCCTAGCGTTGGAGAATGGATCCAA
ATCGTCTGATTTTTTTAGTTTCCTCCCAGGATAATTTAATAATGACCTTATTTTTTTGAT
ACCAACCCTCACCCATAATAAATGTAAAATAAAACCATATTTTTGCTCATTGTGGATAAG
TTTTTTGATACTCTATA

QA 2 678 2 678
DS 



CO CL2398Contig2 757 2 4 U
AAAAAAATGGTACTTAAAAGTTGGGTAATAAAATTCATGCATACAACTGCTAATTTCTAC
AAATTCTTTCTCAATTTCATGGCAGCTTTTACTTCAATGCTCTTATATATCAATCAGAAA
AACTTACAGTAATTATAGAGTATCAAAAAAACTTATTCACAATGAGCAAAAATATGGTTT
TATTTTACATTTATTATGGGTGAGGGTTGGTATCAAAAAAATAAGGTCATTATTAAATTA
TCCTGGGAGGAAACTAAAAAAATCAGACGATTTGGATCCATTCTCCAACGCTAGGAACGC
CTTGGTAGACAACAGAAAGAAGATAATAGCCAGGAGGAGCAACTTTTCCACTGGGAGGAG
CAAGGGCATGGATATGATGAAGGTCGCGAACCTCTTTCTTGATATCAAAGATACCCAACA
TGAGCAACCTCATGTTCATCGACACGGCGTGCGTGGTAAACCGTCGTTAGTGTTGCTTCC
ACCTACGAGGACTTTGCCGTCGGGGAGAGCGACCGCGATGGAGTGGTAGACGCGGGGGAT
AGGGGAAGGAGCGAGCTCTTTGAAACGTTGGCCTAACGGTTTGTTCGGCGCGTAAATGAT
CGGGGTGAATATTGGGTCTCTGCCGTTACCCCATCCCGAGGTTCCACGTCTCACTCCGTT
GATGATTAAAACTTCTCCGTTGGGGAGGAGGACAGCGTCGCTCATGACACGTGGCATCGG
CATCGTCTCGGTGATCCATTGGGGGTTCCTACTGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GW82JQ U 1
AF RS1CO83TF C 94
BS 1 150 RS1GW82JQ
BS 151 151 RS1CO83TF
BS 152 390 RS1GW82JQ
BS 391 757 RS1CO83TF

RD RS1GW82JQ 390 0 0
AAAAAAATGGTACTTAAAAGTTGGGTAATAAAATTCATGCATACAACTGCTAATTTCTAC
AAATTCTTTCTCAATTTCATGGCAGCTTTTACTTCAATGCTCTTATATATCAATCAGAAA
AACTTACAGTAATTATAGAGTATCAAAAAAGCTTATTCACAATGAGCAAAAATATGGTTT
TATTTTACATTTATTATGGGTGAGGGTTGGTATCAAAAAAATAAGGTCATTATTAAATTA
TCCTGGGAGGAAACTAAAAAAATCAGACGATTTGGATCCATTCTCCAACGCTAGGAACGC
CTTGGTAGACAACAGAAAGAAGATAATAGCCAGGAGGAGCAACTTTTCCACTGGGAGGAG
CAAGGGCATGGATATGATGAAGGTCGCGAA

QA 1 390 1 390
DS 

RD RS1CO83TF 664 0 0
TCAATGCTCTTATATATCAATCAGAAAAACTTACAGTAATTATAGAGTATCAAAAAAACT
TATTCACAATGAGCAAAAATATGGTTTTATTTTACATTTATTATGGGTGAGGGTTGGTAT
CAAAAAAATAAGGTCATTATTAAATTATCCTGGGAGGAAACTAAAAAAATCAGACGATTT
GGATCCATTCTCCAACGCTAGGAACGCCTTGGTAGACAACAGAGAGAAGATAATAGCCAG
GAGGAGCAACTTTTCCACTGGGAGGAGCAAGGGCATGGATCTGATGAAGGTCGCGAACCT
CTTTCTTGATATCAAAGATACCCAACATGAGCAACCTCATGTTCATCGACACGGCGTGCG
TGGTAAACCGTCGTTAGTGTTGCTTCCACCTACGAGGACTTTGCCGTCGGGGAGAGCGAC
CGCGATGGAGTGGTAGACGCGGGGGATAGGGGAAGGAGCGAGCTCTTTGAAACGTTGGCC
TAACGGTTTGTTCGGCGCGTAAATGATCGGGGTGAATATTGGGTCTCTGCCGTTACCCCA
TCCCGAGGTTCCACGTCTCACTCCGTTGATGATTAAAACTTCTCCGTTGGGGAGGAGGAC
AGCGTCGCTCATGACACGTGGCATCGGCATCGTCTCGGTGATCCATTGGGGGTTCCTACT
GGTC

QA 1 664 1 664
DS 



AS 2 4

CO CL2399Contig1 634 2 1 U
GGGTTGTTGTTTGTTGTGGTTGGTAAAGCGAATGGCGATGGTTGGGCAGCGTCCTCCGCG
TGTCGAAGTCACGGCGGCGTACATGATACTCATAATAATAGTGGTGGTAGTCAGCGATCT
GTCGAACTGTGTGAGAGCCGAGAAGTCGGTGTCGGCATTCGTGCAGAACGCCATATTGTC
CAACAAGATTGTCATCTTCTCCAAGTCCTACTGCCCGTATTGCTTGCGCTCGAAACGAAT
TTTCAGCCAACTTAAGGAACAGCCTTTTGTTGTGGAGCTTGATCTCAGAGAGGACGGAGA
TCAAATACAGTACGAGCTTCTGGAGTTTGTTGGTCGCCGTACTGTCCCGCAAGTTTTTGT
AAACGGCAAGCATATTGGTGGATCTGATGATCTTGCAGATGCTGTGGAGAATGGTCAGTT
GCAAAAGCTTCTTGCTACTAGTTAGACTTTTTTTAAGAAGCTGGAGTGGATTTGATCATG
GAACCTTATGTGTTGTTATTTAGGGGAATCTTTGGTAGTAAACTGAATCAAGGAATTGCT
CTTCACTGACTTTTAATAGCTCCTTACTTATATAATAAAAAAGTTATGATGGTATAAACT
CTTTTTATCTTTCTGTTATTGTATTGATCTGCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CG40TF U 1
AF RS1CG40JQ C 54
BS 1 634 RS1CG40TF

RD RS1CG40TF 634 0 0
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TGTCGAAGTCACGGCGGCGTACATGATACTCATAATAATAGTGGTGGTAGTCAGCGATCT
GTCGAACTGTGTGAGAGCCGAGAAGTCGGTGTCGGCATTCGTGCAGAACGCCATATTGTC
CAACAAGATTGTCATCTTCTCCAAGTCCTACTGCCCGTATTGCTTGCGCTCGAAACGAAT
TTTCAGCCAACTTAAGGAACAGCCTTTTGTTGTGGAGCTTGATCTCAGAGAGGACGGAGA
TCAAATACAGTACGAGCTTCTGGAGTTTGTTGGTCGCCGTACTGTCCCGCAAGTTTTTGT
AAACGGCAAGCATATTGGTGGATCTGATGATCTTGCAGATGCTGTGGAGAATGGTCAGTT
GCAAAAGCTTCTTGCTACTAGTTAGACTTTTTTTAAGAAGCTGGAGTGGATTTGATCATG
GAACCTTATGTGTTGTTATTTAGGGGAATCTTTGGTAGTAAACTGAATCAAGGAATTGCT
CTTCACTGACTTTTAATAGCTCCTTACTTATATAATAAAAAAGTTATGATGGTATAAACT
CTTTTTATCTTTCTGTTATTGTATTGATCTGCTG

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1CG40JQ 581 0 0
CTCCG
CGTGTCGAAGTCACGGCGGCGTACATGATACTCATAATAATAGTGGTGGTAGTCAGCGAT
CTGTCGAACTGTGTGAGAGCCGAGAAGTCGGTGTCGGCATTCGTGCAGAACGCCATATTG
TCCAACAAGATTGTCATCTTCTCCAAGTCCTACTGCCCGTATTGCTTGCGCTCGAAACGA
ATTTTCAGCCAACTTAAGGAACAGCCTTTTGTTGTGGAGCTTGATCTCAGAGAGGACGGA
GATCAAATACAGTACGAGCTTCTGGAGTTTGTTGGTCGCCGTACTGTCCCGCAAGTTTTT
GTAAACGGCAAGCATATTGGTGGATCTGATGATCTTGCAGATGCTGTGGAGAATGGTCAG
TTGCAAAAGCTTCTTGCTACTAGTTAGACTTTTTTTAAGAAGCTGGAGTGGATTTGATCA
TGGAACCTTATGTGTTGTTATTTAGGGGAATCTTTGGTAGTAAACTGAATCAAGGAATTG
CTCTTCACTGACTTTTAATAGCTCCTTACTTATATAATAAAAAAGTTATGATGGTATAAA
CTCTTTTTATCTTTCTGTTATTGTATTGATCTGCTG

QA 6 581 6 581
DS 



CO CL2399Contig2 607 2 2 U
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AGCAGTTCCTTGATTCAGTTTACTACCAAAGATTCCCCTAAATAACAAACACATAAGGTT
CCATGATCAAATCCATTCCAGCTTCTTAAAAAAAGTCTAACTAGCAGCAAAAAGCTTTTG
CAACTGACCACTCTCCACAGCATCTGCAAAATCATCAAATCCACCAATATGTTTGCCGTT
TACAAAAACTTGCGGGACAGTACGGCGACCAACAAACTCCAAAAGCTCGTACTGTATTTG
ATCTCCGTCCTCTCTGAAATCAAGCTCCACAACAAAAGGTTGTTCCTTAAGTTGGCTGAA
AATTCGTTTCGAGCGCAAGCAATACGGGCAATACGACTTGGAAAAAATGACAATCTTGTT
GGACAATATGGCGTTCTGCACGAATGCCGACACCGACTTCTCGGCTCTCACACAGTTTGA
CAGATCGCTGACTACCACCACTATTATTACCAGTATCATGTACGCCGCCGTGACTTGGAC
ACGGCGAGGACGCTGCCCAACCATCGCCATTCCCTTCCTTACCAACCACAACAAACAACA
ACAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 

AF RS1F268TF C 1
AF RS1F268JQ U 7
BS 1 6 RS1F268TF
BS 7 607 RS1F268JQ

RD RS1F268TF 607 0 0
TTTTTTACCATCATAACTTTTTTTATTATATAAGGAAGGAGCTATTAAAAGTCAGTGAAG
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CCATGATCAAATCCATTCCAGCTTCTTAAAAAAAGTCTAACTAGCAGCAAGAAGCTTTTG
CAACTGACCACTCTCCACAGCATCTGCAAGATCATCAGATCCACCAATATGTTTGCCGTT
TACAAAAACTTGCGGGACAGTACGGCGACCAACAAACTCCAGAAGCTCGTACTGTATTTG
ATCTCCGTCCTCTCTGAGATCAAGCTCCACAACAAAAGGTTGTTCCTTAAGTTGGCTGAA
AATTCGTTTCGAGCGCAAGCAATACGGGCAATACGACTTGGAGAAGATGACAATCTTGTT
GGACAATATGGCGTTCTGCACGAATGCCGACACCGACTTCTCGGCTCTCACACAGTTTGA
CAGATCGCTGACTACCACCACTATTATTACCAGTATCATGTACGCCGCCGTGACTTGGAC
ACGGCGAGGACGCTGCCCAACCATCGCCATTCCCTTCCTTACCAACCACAACAAACAACA
AC
AACCC

QA 1 602 1 602
DS 

RD RS1F268JQ 601 0 0
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TCCTTGATTCAGTTTACTACCAAAGATTCCCCTAAATAACAAACACATAAGGTTCCATGA
TCAAATCCATTCCAGCTTCTTAAAAAAAGTCTAACTAGCAGCAAAAAGCTTTTGCAACTG
ACCACTCTCCACAGCATCTGCAAAATCATCAAATCCACCAATATGTTTGCCGTTTACAAA
AACTTGCGGGACAGTACGGCGACCAACAAACTCCAAAAGCTCGTACTGTATTTGATCTCC
GTCCTCTCTGAAATCAAGCTCCACAACAAAAGGTTGTTCCTTAAGTTGGCTGAAAATTCG
TTTCGAGCGCAAGCAATACGGGCAATACGACTTGGAAAAAATGACAATCTTGTTGGACAA
TATGGCGTTCTGCACGAATGCCGACACCGACTTCTCGGCTCTCACACAGTTTGACAGATC
GCTGACTACCACCACTATTATTACCAGTATCATGTACGCCGCCGTGACTTGGACACGGCG
AGGACGCTGCCCAACCATCGCCATTCCCTTCCTTACCAACCACAACAAACAACAACAACC
C

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 4

CO CL2400Contig1 494 4 5 U
TTTTTTTATCAATTTCTTAAATCATGAAGTATGTTATTTCAGTTGTTGTTCTGTGCGTTC
TCATGTCTCACGTTTCGAATATAGCCCAAGTGAATGGCCTAGACCCTTTGTGTAAATGGT
ACAGTCGACGTCCTGGAAAATGCAGCCCTGATGGAAACATGAAGTGCCATGCCGAAGTAC
AGGTAGAACGCACAAATCAAAAATTTGAGCGTTGCGAGTGTACAAACCATATTATTAAAA
AGAAAGACCATCATGACTGCAATTGTTTTGTTAAGCCTCCTTGTCGTCAACCGTAAAGAC
AAGAAGACTTCTTTTGTTATACAAAACCTCTCAGTCCATAATACACCATTACAAATCAAA
TAGATTTACCAATAGATAAGAGAGGAGAGTTTTTATGCTAATATATATGGTTTAAAATAT
ATTGCCAGTCTATATGATTCTAAATGTAATTGTTCTTACTATAGGAACTAATAAATTTAT
GAAGTAATTATTTC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1DC61TF U 1
AF RS1DO39JQ C 1
AF RS1DO39TF U 1
AF RS1G026TF U 1
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BS 455 455 RS1DO39TF
BS 456 494 RS1DC61TF

RD RS1DC61TF 494 0 0
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TCATGTCTCACGTTTCGAATATAGCCCAAGTGAATGGCCTAGACCCTTTGTGTAAATGGT
ACAGTCGACGTCCTGGAAAATGCAGCCCTGATGGAAACATGAAGTGCCATGCCGAAGTA*
*GGTAGAACGCACAAATCAAAAATTTGAGCGTTGCGAGTGTACAAACCATATTATTAAAA
AGAAAGACCATCATGACTGCAATTGTTTTGTTAAGCCTCCTTGTCGTCAACCGTAAAGAC
AAGAAGACTTCTTTTGTTATACAAAACCTCTCAGTCCATAATACACCATTACAAATCAAA
TAGATTTACCAATAGATAAGAGAGGAGAGTTTTTATGCTAATATATATGGTTTAAAATAT
ATTGCCAGTCTATATGATTCTAAATGTAATTGTTTTTACTATAGGAACTAATAAATTTAT
GAAGTAATTATTTC

QA 1 494 1 494
DS 

RD RS1DO39JQ 485 0 0
TTTTTTTATCAATTTCTTAAATCATGAAGTATGTTATTTCAGTTGTTGTTCTGTGCGTTC
TCATGTCTCACGTTTCGAATATAGCCCAAGTGAATGGCCTAGACCCTTTGTGTAAATGGT
ACAGTCGACGTCCTGGAAAATGCAGCCCTGATGGAAACATGAAGTGCCATGCCGAAGTAC
AGGTAGAACGCACAAATCAAAAATTTGAGCGTTGCGAGTGTACAAACCATATTATTAAAA
AGAAAGACCATCATGACTGCAATTGTTTTGTTAAGCCTCCTTGTCGTCAACCGTAAAGAC
AAGAAGACTTCTTTTGTTATACAAAACCTCTCAGTCCATAATACACCATTACAAATCAAA
TAGATTTACCAATAGATAAGAGAGGAGAGTTTTTATGCTAATATATATGGTTTAAAATAT
ATTGCCAGTCTATATGATTCTAAATGTAATTGTTCTTACTATAGGAACTAATAAATTTAT
GAAG
C

QA 1 484 1 484
DS 

RD RS1DO39TF 485 0 0
TTTTTTTATCAATTTCTTAAATCATGAAGTATGTTATTTCAGTTGTTGTTCTGTGCGTTC
TCATGTCTCACGTTTCGAATATAGCCCAAGTGAATGGCCTAGACCCTTTGTGTAAATGGT
ACAGTCGACGTCCTGGAAAATGCAGCCCTGATGGAAACATGAAGTGCCATGCCGAAGTAC
AGGTAGAACGCACAAATCAAAAATTTGAGCGTTGCGAGTGTACAAACCATATTATTAAAA
AGAAAGACCATCATGACTGCAATTGTTTTGTTAAGCCTCCTTGTCGTCAACCGTAAAGAC
AAGAAGACTTCTTTTGTTATACAAAACCTCTCAGTCCATAATACACCATTACAAATCAAA
TAGATTTACCAATAGATAAGAGAGGAGAGTTTTTATGCTAATATATATGGTTTAAAATAT
ATTGCCAGTCTATATGATTCTAAATGTAATTGTTCTTACTATAGGAACTAATAAATTTAT
GAAG
C

QA 1 484 1 484
DS 

RD RS1G026TF 493 0 0
TTTTTTTATCAATTTCTCAAATCATGAAGTATGTTATTTCAGTTGTTGTTCTGTGCGTTC
TCATGTCTCACGTTTCGAATATAGCCCAAGTGAATGGCCTAGACCCTTTGTGTAAATGGT
ACAGTCGACGTCCTGGAAAATGCAGCCCTGATGGAAACATGAAGTGCCATGCCGAAGTAC
AGGTAGAACGCACAAATCAAAAATTTGAGCGTTGCGAGTGTACAAACCATATTATTAAAA
AGAAAGACCATCATGACTGCAATTGTTTTGTTAAGCCTCCTTGTCGTCAACCGTAAAGAC
AAGAAGACTTCTTTTGTTATACAAAACCTCTCAGTCCATAATACACCATTACAAATCAAA
TAGATTTACCAATAGATAAGAGAGGAGAGTTTTTATGCTAATATATATGGTTTAAAATAT
ATTGCCAGTCTATATGATTCTAAATGTAATTGTTTTTACTATAGGAACTAATAAATTTAT
GAAGTAATTATTT

QA 1 493 1 493
DS 



AS 1 4

CO CL2401Contig1 577 4 1 U
GGAGGGTTCACCCACTCCAAAAACGATCGATCTATCTGAATCTTCTCATTTTCCCCCTTT
TCTCCGTTTCATAGCTAGCTAGGGTTTTCGAGATGGGTCAGATCCAGTACTCTGACAAAT
ACTTCGACGATACTTTCGAGTACAGGCACGTCGTACTTCCTCCTGAAGTCGCCAAGCTTC
TTCCCAAGAATCGTCTTCTCTCCGAAAATGAGTGGCGTGCGATTGGGGTGCAGCAGAGCC
GTGGATGGGTCCATTACGCCATTCATCGTCCAGAGCCACACATCATGTTGTTCAGGAGGA
CTCTCAATTACCAGCAGCAGCAGCAGCAGGAGAACCAAGCTCAAAACCTGCTCGCTAAGT
GAATCTGAGTTGTGCTGCGCTACAAACATTGGTTCTTGTTAGCTATTATGTTTCTTGTAA
ACATGGGTTTGTGAAC**CACAACCTCTAATAACTTTGTGTTCATGTTATCTATCCTTGG
TTGGAGAAAAACATGCGAGTGAATGAGTGATAATCTGACTACTTTGATGTTATGCATTGT
CTTTGTTCATCATGGATTATATCTTCTTCTTTCTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DY91TF U 12
AF RS1EE45TF U 1
AF RS1H371TF U 12
AF RS1EE45JQ C 58
BS 1 577 RS1EE45TF

RD RS1DY91TF 520 0 0
GG
ACTCCAAAAACGATCGATCAATCTGAATCTTCTCATTTTCCCCCTTT*CTCCGTTTCATA
GCTAGCTAGGGTTT*CGAGATGGGTCAGATCCAGTACTCTGACAAATACTTCGACGATAC
TTTCGAGTACAGGCACGTCGTGCTTCCTCCTGAAGTCGCTAAGCTTCTCCCGAAGAATCG
TCTTCTCTCCGAAAATGAGTGGCGTGCGATTGGGGTGCAGCAGAGCCGTGGATGGGTCCA
TTACGCCATTCATCGTCCAGAGCCACACATCATGCTGTTCAGGAGGACTCTCAATTACCA
GCAGCAGCAGCAG***GAGAACCAAGCTCAAAACCTGCTCGCTAAGTGAATCTGAGTTGT
GCTGCGCTACAAACATTGGTTCTTGTTAGCTATTATGTTTCTTGTAAACATGGGTTTGTG
AACCCCACAACCTCTAATAACTTTGTGTTCATGTTATC*ATCCTTGGTTGGCGAAAAACA
TGCGAGTGAATGAGTGATAATCTGACTACTTTGATGTT

QA 3 520 3 520
DS 

RD RS1EE45TF 577 0 0
GGAGGGTTCACCCACTCCAAAAACGATCGATCTATCTGAATCTTCTCATTTTCCCCCTTT
TCTCCGTTTCATAGCTAGCTAGGGTTTTCGAGATGGGTCAGATCCAGTACTCTGACAAAT
ACTTCGACGATACTTTCGAGTACAGGCACGTCGTACTTCCTCCTGAAGTCGCCAAGCTTC
TTCCCAAGAATCGTCTTCTCTCCGAAAATGAGTGGCGTGCGATTGGGGTGCAGCAGAGCC
GTGGATGGGTCCATTACGCCATTCATCGTCCAGAGCCACACATCATGTTGTTCAGGAGGA
CTCTCAATTACCAGCAGCAGCAGCAGCAGGAGAACCAAGCTCAAAACCTGCTCGCTAAGT
GAATCTGAGTTGTGCTGCGCTACAAACATTGGTTCTTGTTAGCTATTATGTTTCTTGTAA
ACATGGGTTTGTGAAC**CACAACCTCTAATAACTTTGTGTTCATGTTATCTATCCTTGG
TTGGAGAAAAACATGCGAGTGAATGAGTGATAATCTGACTACTTTGATGTTATGCATTGT
CTTTGTTCATCATGGATTATATCTTCTTCTTTCTGCC

QA 1 577 1 577
DS 

RD RS1H371TF 557 0 0
GG
ACTCCAAAAACGATCGATCTATCTGAATCTTCTCATTTTCCCCCTTTTCTCCGTTTCATA
GCTAGCTAGGGTTTTCGAGATGGGTCAGATCCAGTACTCTGACAAATACTTCGACGATAC
TTTCGAGTACAGGCACGCCGTACTTCCTCCTGAAGTCGCTAAGCTTCTTCCCAAGAATCG
TCTTCTCTCCGAAAATGAGTGGCGTGCGATTGGGGTGCAGCAGAGCCGTGGATGGGTCCA
TTACGCCATTCATCGTCCATAGCCACACACCATGTTGTTCAGGAGGACTCTCAATTACCA
GCAGCAGCAGCAGCAGGAGAACCAAGCTCAAAACCTGCTCGCTAAGTGAATCTGAGTTGT
GCTGCTCTACAAACATTGGTTCTTGTTAGCTATTATGTTTCTTGTAAACATGGGTTTGTG
AAC**CACAACCTCTAATAACTTTGTGTTCATGTTATCTATTCTTGGTTGGAGAAAAACA
TGCGAGTGAATGAGCGATAATCTGACTACTTTGATGTTATGCATTGTCTTTGTTCATCAT
GGATTATATCTT
CTT

QA 3 554 3 554
DS 

RD RS1EE45JQ 520 0 0
TTTTT
TCCGTTTCATAGCTAGCTAGGGTTTTCGAGATGGGTCAGATCCAGTATTTTGACAAATAC
TTCGACGATACTTTCGAGTACAGGCACGTCGTACTTCCTCCTGAAGTCGCCAAGCTTCTT
CCCAAGAATCGTTTTCTTTCCGAAAATGAGTGGCGTGCGATTGGGGTGCAGCAGAGCCGT
GGATGGGTCCATTACGCCATTCATCGTCCAGAGCCACACATCATGTTGTTCAGGAGGACT
CTCAATTACCAGCAGCAGCAGCAGCAGGAGAACCAAGCTCAAAACCTGCTCGCTAAGTGA
ATTTGAGTTGTGCTGCGCTACAAACATTGGTTCTTGTTAGCTATTATGTTTCTTGTAAAC
ATGGGTTTGTGAAC**CACAACCTCTAATAACTTTGTGTTCATGTTATCTATCCTTGGTT
GGAGAAAAACATGCGAGTGAATGAGTGATAATCTGACTACTTTGATGTTATGCATTGTCT
TTGTTCATCATGGATTATATCTTTTTCTTTCTGCC

QA 6 520 6 520
DS 



AS 1 4

CO CL2402Contig1 669 4 5 U
TTTTTATCTCTACTTCCAGACTAACGAGAGGCGTCGGCGCTGCTCCCTGCTTCAATTTCA
AGTTTGAAGAATGGTGAGAATCAGCGTCCTAAATGACGCTCTTAAGAGCATGTATAATGC
AGAGAAGAGGGGGAAGAGGCAGGTTATGATCAGGCCTTCTTCCAAAGTCATCATCAAGTT
CCTTATCGTCATGCAAAAGCACGGTTACATTGGGGAGTTTGAGTATGTTGATGACCACAG
GTCTGGTAAGATTGTTGTTGAGCTAAACGGAAGGCTCAACAAGTGTGGAGTTATCAGTCC
TCGTTTCGACGTTGGTGTTAAGGAGATTGAGGGTTGGACCGCTCGTCTTCTTCCTTCCCG
ACAGTTTGGTTACATTGTCCTGACAACCTCAGCTGGAATCATGGATCATGAAGAAGCCAG
GAGAAAGAATGTGGGTGGCAAGGTTCTTGGCTTTTTTTTACTGAAGCAGCAGCTTCACAC
GAGTTCCTGTTATATCGGGTTGTATTTCCCTACTTTTTTTGAACTCGTCAATGTACTCAG
ATGCTTTAGACCATTTAGGAGAGAAATAGACAACTTATTTCGGTTTTTGAGTTCGTCAGT
CGTCATGCAACCGTGAATTTGTATTGTACGAACTAAATTAGATTTCTTTGATCAACTCTA
GTTTTGCTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EG84TF U 1
AF RS1FW74TF U 1
AF RS1FW74JQ C 42
AF RS1EG84JQ C 161
BS 1 84 RS1EG84TF
BS 85 85 RS1FW74TF
BS 86 579 RS1EG84TF
BS 580 587 RS1FW74TF
BS 588 669 RS1EG84JQ

RD RS1EG84TF 579 0 0
TTTTTATCTCTACTTCCAGACTAACGAGAGGCGTCGGCGCTGCTCCCTGCTTCAATTTCA
AGTTTGAAGAATGGTGAGAATCAGTGTCCTAAATGACGCTCTTAAGAGCATGTATAATGC
AGAGAAGAGGGGGAAGAGGCAGGTTATGATCAGGCCTTCTTCCAAAGTCATCATCAAGTT
CCTTATCGTCATGCAAAAGCACGGTTACATTGGGGAGTTTGAGTATGTTGATGACCACAG
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TCGTTTCGACGTTGGTGTTAAGGAGATTGAGGGTTGGACCGCTCGTCTTCTTCCTTCCCG
ACAGTTTGGTTACATTGTCCTGACAACCTCAGCTGGAATCATGGATCATGAAGAAGCCAG
GAGAAAGAATGTGGGTGGCAAGGTTCTTGGCTTTTTTTTACTGAAGCAGCAGCTTCACAC
GAGTTCCTGTTATATCGGGTTGTATTTCCCTACTTTTTTTGAACTCGTCAATGTACTCAG
ATGCTTTAGACCATTTAGGAGAGAAATAGACAACTTATT

QA 1 579 1 579
DS 

RD RS1FW74TF 587 0 0
TTTTTATCTCTACTTCCAGACTAACGAGAGGCGTCGGCGCTGCTCCCTGCTTCAATTTCA
AGTTTGAAGAATGGTGAGAATCAGCGTCCTAAATGACGCTCTTAAGAGCATGTATAATGC
AGAGAAGAGGGGGAAGAGGCAGGTTATGATCAGGCCTTCTTCCAAAGTCATCATCAAGTT
CCTTATCGTCATGCAAAAGCACGGTTACATTGGGGAGTTTGAGTATGTTGATGACCACAG
GTCTGGTAAGATTGTTGTTGAGCTAAACGGAAGGCTCAACAAGTGTGGAGTTATCAGTCC
TCGTTTCGACGTTGGTGTTAAGGAGATTGAGGGTTGGACCGCTCGTCTTCTTCCTTCCCG
ACAGTTTGGTTACATTGTCCTGACAACCTCAGCTGGAATCATGGATCATGAAGAAGCCAG
GAGAAAGAATGTGGGTGGCAAGGTTCTTGGCTTTTTTT*ACTGAAGCAGCAGCTTCACAC
GAGTTCCTGTTATATCGGGTTGTATTTCCCTACTTTTTTTGAACTCGTCAATGTACTCAG
ATGCTTTAGACCATTTAGGAGAGAAATAGACAACTTATTTCGGTTTT

QA 1 587 1 587
DS 

RD RS1FW74JQ 546 0 0
GCTCCCTGCTTCAATTTCAAGTTTGAAGAATGGTGAGAATCAGCGTCCTAAATGACGCTC
TTAAGAGCATGTATAATGCAGAGAAGAGGGGGAAGAGGCAGGTTATGATCAGGCCTTCTT
CCAAAGTCATCATCAAGTTCCTTATCGTCATGCAAAAGCACGGTTACATTGGGGAGTTTG
AGTATGTTGATGACCACAGGTCTGGTAAGATTGTTGTTGAGCTAAACGGAAGGCTCAACA
AGTGTGGAGTTATCAGTCCTCGTTTCGACGTTGGTGTTAAGGAGATTGAGGGTTGGACCG
CTCGTTTTCTTCCTTCCCGACAGTTTGGTTACATTGTCCTGACAACCTCAGCTGGAATCA
TGGATCATGAAGAAGCCAGGAGAAAGAATGTGGGTGGCAAGGTTTTTGGCTTTTTTT*AC
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AACTCGTCAATGTACTCAGATGCTTTAGACCATTTAGGAGAGAAATAGACAACTTATTTC
GGTTTT

QA 1 546 1 546
DS 

RD RS1EG84JQ 509 0 0
TCCAAAGTCATCATCAAGTTCCTTATCGTCATGCAAAAGCACGGTTACATTGGGGAGTTT
GAGTATGTTGATGACCACAGGTCTGGTAAGATTGTTGTTGAGCTAAACGGAAGGCTCAAC
AAGTGTGGAGTTATCAGTCCTCGTTTCGACGTTGGTGTTAAGGAGATTGAGGGTTGGACC
GCTCGTTTTTTTCCTTCCCGACAGTTTGGTTACATTGTCCTGACAACCTCAGCTGGAATC
ATGGATCATGAAGAAGCCAGGAGAAAGAATGTGGGTGGCAAGGTTCTTGGCTTTTTTTTA
CTGAAGCAGCAGCTTCACACGAGTTCCTGTTATATCGGGTTGTATTTCCCTACTTTTTTT
GAACTCGTCAATGTACTCAGATGCTTTAGACCATTTAGGAGAGAAATAGACAACTTATTT
CGGTTTTTGAGTTCGTCAGTCGTCATGCAACCGTGAATTTGTATTGTACGAACTAAATTA
GATTTCTTTGATCAACTCTAGTTTTGCTT

QA 1 509 1 509
DS 



AS 1 4

CO CL2403Contig1 856 4 4 U
GGGAGTAGTTGAAGATAGAGAGATCAGAAAAGAGGAATATCTCTCTCCCTCTCTCCCTCA
CTCCTTTGCTGAGTTCATGTCAGAAAAACACAGAGAAACTAAGAACCCTAATTTATAATT
AACATCCAAATGGTATCTTCGAAGAAGTTCCGAGGTGTCCGCCAGCGTCAGTGGGGTTCT
TGGGTCTCCGAGATTCGTCATCCCCTCCTGAAGAGAAGGGTGTGGCTAGGAACATTCAAC
ACGGCCGAAGAAGCGGCTAGAGCCTACGACCAAGCGGCGGTTCTAATGAACGGCCAGAAC
GCAAAGACAAACTTTCCCGTCATCAAATCCAACGGTTCGGTCTCTCCGGACGTTAACTCG
CCGTTATCGGAACTCCTAAACGCTAAGCTAAGAAAGAACAGTAAAGACCAGACACCTTAT
CTGACGTGCCTCCGCCTCGACAACGACAGCTCGCACATTGGCGTCTGGCAGAAACGCGCC
GGGTCGAGTTCAAGTCAAAACTGGGTCAAGCTTGTTGAGCTCGGCGACAACGTCAACGCT
AGTGCTGGTGATGCTGGGAGTGATAAGATGAAGAAAGGAAACGACGACGTGGAGGAAGAA
GATCAGATGGCAGTGCAGATGATCGAGGAGCTCCTTAACTGGACATGTCCTGCTTCTGCA
TCCATCTCAGGTAAGATATTTATGTAACAAAACCGAAGGAAAATGGTTAAATACTTTCCG
AGTAGTAAATGGTAATCTAATGATCGAAATCAGTACACATCTGCGTAAACATTTGTTCAA
ATATATAATATTGTATGTATAAGTTTGTCTGCATGTATTCTGTACACGTTATAAATAAAC
ATTTTTATTTTATTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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DS 

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G
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AACGGTTCGGTCTCTCCGGGCGTTAACTCGCCGTTATCGGAACTCCTAAACGCTAAGCTA
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CAGTACACATCTGCGTAAACATTTGTTCAAATATATAATATTGTATGTATAAGTTTGTCT
GCATGTATTCTGTACACGTTATAAATAAACATTTTTATTTTATTTT

QA 2 587 2 587
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GCGAGCTTCATGGTTCTCCTCCTGGCTTTAACCTCACTCTTCCCCAGAATCTCCATATCT
GAAGCTACATCATCCTTCTCCTTCACAAGCTTCGATAAAAACGCGAGCTTTGGGTCCGAC
GATATTGCCCTCTTCGGCTACGCAAAGCTCGTAGACAACGGAGTTTCGGTTCAGCTGATC
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AAGCGTAGGTGGGAGGAGGAGGTGGAGAAGAGGAGAAGAGAGAAGATGTGGGGGACTGTC
ACTTGCTTCGTCATGACCTTTGGATCTATAGGGCTTGTGTTCTTCGCCATGATGCGTATA
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AGACTAAGGAGTACGAGATGATTAAGAAAGTTGAAGTTGTGACGAGTAAAGCTGAGGCGC
AACAAGGAAAGTAAAAGTAAAAGTAAAAGTAAAAGCTTGTGATGTTTGTGTGTTTAGAAT
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QA 1 748 1 748
DS 



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TTTCTTGGCTATGGTTGGTCACTCAAGTGGGACATGGTGTGTATGCAGAGAAGGATTAAG
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CATTCACCAGAACGGACCTTGCTTTAACCCAAACACAGTCAAGTCCCACTGCTCCTATGC
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AATCCCAGATTACACAGATCCAACATCCTCTGGATTCAAACTCCAAAACCCAAGAACCAC
GTTCTTTGTATCCGTAATTTTAGTTTTCTCCATCTTCACCTCCTAGGCGCTCCTACTCGT
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TTCCTAGCTGTTATCCACTTGGCTCTTTGAATCAAAAATGTACATTTTTAAGAATATGGC
AATATTGGTGCACAAAAAAAGGAAGATGGCAATATTT


BQ
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TAATACAAGACCCT

QA 1 554 1 554
DS 

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CATTAAGTTGCACGTGTTTTGTTTTCCTAGCTGTTATCCACTTGGCTCTTTGAATCAAAA
ATGTACATTTTTAAGAATATGGCAATATTGGTGCACAAAAAAAGGAAGATGGCAATATTT

QA 19 798 19 798
DS 



AS 1 3

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GCATAACAAAACATAATACACTGTATTAGACGATAATATTGAAAGAAATCTCCTACTAAA
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AAAGATGAAATATGTAAGCATTTTACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AC89JQ C 209
AF RS1H780TF U 1
AF RS1AC89TF U 9
BS 1 125 RS1H780TF
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BS 656 747 RS1AC89TF

RD RS1AC89JQ 198 0 0
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GCTCACAAGCTCAACGTAGAGAATTTTCAATTGTACAAGACAGAGTTGAGCCATACAATT
TAAGCTTTTTTCTTTACTACGGTGGTCAAGACGTATACCCTCGATCCACCACCAACCAAA
CTTACCCTACAGTTAAAA

QA 1 198 1 198
DS 

RD RS1H780TF 656 0 0
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TCTGTTTCAAAGTGAGTAGAGTGTAAGCTTTGACAATTATTAATGGAAGGTAAAGGACGA
ATTGCGTCATCAACTTCTTCTTCTTTAACCACCGAACTCTTCGGCTCCAGAGATCCGTCG
CCGCCATCTTCTTCCTCTGGAATCTTCTCCTCCATTTTCCCTCATCCCTCCAAGGGCGTT
ACAAGAGATGGTCAAAGCTCCAAACATGGCTCACAAGCTCAACGTAGAGAATCTTCAAAT
GTACAAGACAGAGTTGAGCCATGCAATCTAAGCTCTTCTCTTTACTACGGTGGTCAAGAC
GTATACCCTCGATCCACCACCAACCAAAGTTACCCTACAGTTAAAAACGAGGGTCCAAGA
AGCCAGGAAAACGATGCTAATGGACAGAACTCACAAGATGTTTCAAGAGGGAACTGGTGG
CAAGGTTCTCTTTATTACTAAAGAACCAGTTTTCTTTAGTTTCTTTGTATATCTTTGATG
AAGCTCAAGCCAACGTACTAATTATCTACTAAACCAAAACTTTTGTATAAATAAGTTTAT
GCATAACAAAAGATAATACACTGTATTAGACGATATTATTGAAAGAGATCTCCTAG

QA 1 656 1 656
DS 

RD RS1AC89TF 739 0 0
CAACTGTCTTATTCATTCTAGTTCTCTTGCATAGCAAGAATCGGAAAGATAATCTGTTTC
AAAGTGAGTAGAGTGTAAGCTTTGACAATTATTAATGGAAGGTAAAGGACGAATTGCATC
ATCAACTTCTTCTTCTTTAACCACCGAACTCTTCGGCTCCAGAGATCCGTCGCCGCCATC
TTCTTCCTCTGGAATCTTCTCCTCCATTTTCCCTCATCCCTCCAAGGACGTTACAAGAGA
TGGTCAAAGCTCCAAACATGGCTCACAAGCTCAACGTAGAGAATCTTCAATTGTACAAGA
CAGAGTTGAGCCATACAATCTAAGCTCTTCTCTTTACTACGGTGGTCAAGACGTATACCC
TCGATCCACCACCAACCAAACTTACCCTACAGTTAAAAACGAGGGTCCAAGAAGCCAAGA
AAACGATGCTAATGGACAGAACTCACAAGATGTTTCAAGAGGGAACTGGTGGCAAGGTTC
TCTTTATTACTAAAGAACCAGTTT*CTTTAGTTTCTTTGTATATCTTTCATGAAGCTCAA
GCCAACGTACTAATTATCTACTAAACCAAGACCTTTGTATAAATAAGTTTATGCATAACA
AAACATAATA*****TATTAGACGATAATATTGAAAGAAATCTCCTACTAAAGTGTGTTG
ATAATGAACTGTATCAGTATTTACTCTGCTTTTCTCTTTCTCATGTTCAACAAAAGATGA
AATATGTAAGCATTTTACC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 4

CO CL2408Contig1 818 4 2 U
GATTTTAATACTTTAGAGATAAGTGAATTAAACTTCTGAAACATTTTTTTTTTGTTGGTT
ATGAGATTTCTGATAAACAATAATTCCAGTATTTCTATTTTTTAGAACAAGTCCGAAAAC
TTGGATAAAAGATATGCAATTCTTTAAGATCCAAGTTTTTCTTGTATATACAGATGATGT
TTCTGAGGCCCGTTTGTTTATTAGGCCGCTGGCCTTTTTGCCTTTGAAAGGCCTAGATGC
CCAGATTTTTTTGAGGCCCGTTTAACTGCACGAAAGCCCTATCGCATCTGGCTTCTGAGA
TACCTTATATAAGATTTTTATGTTCTTCTATCCCTTCGTTGTCGAAAGAAGATATGAATC
ATTCCCTTTTCCAGAGACAAGTTGCCAAATTTACCAGATCTGGTGGTATGGTGACTCTTG
GCCAGGCTCGCTCCTCTTTATCTGGCAGCTCTGCTGGGGTTATGAAGACTCGCTCCGTTT
CATCTGTTGGCTCTTCTGGTTCTAAACCCTCGTTGACTTCCAAGCCCGTGTTCTGGTCTT
CAATGGCTGGTGCCTATGCCATTTATGGCTATTGGGTGTATTTCCAGATGGAAAGGCGTG
CGTTAGAGAAAAAGAAAACTTGATGTGTTGTCTCTTGTTCTAGGTCTTGTCCTAAAGGAA
GCTTGATGTGTTATCTCTTTTTCTAGTTCTTGTTCTCTCTTTGTTCTCTCTGTATTGTGT
TTGACTTCTGTGGTTAAAAGAATGACCTTTAATCTTTGGATGCTTTTGGTTGTGTTATCT
AAGGTTGCAACTTTAATCTTTATATATTCAAGTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1G707TF U 1
AF RS1G707JQ C 444
AF RS1FI09JQ C 339
AF RS1FI09TF U 339
BS 1 561 RS1G707TF
BS 562 818 RS1FI09TF

RD RS1G707TF 561 0 0
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ATGAGATTTCTGATAAACAATAATTCCAGTATTTCTATTTTTTAGAACAAGTCCGAAAAC
TTGGATAAAAGATATGCAATTCTTTAAGATCCAAGTTTTTCTTGTATATACAGATGATGT
TTCTGAGGCCCGTTTGTTTATTAGGCCGCTGGCCTTTTTGCCTTTGAAAGGCCTAGATGC
CCAGATTTTTTTGAGGCCCGTTTAACTGCACGAAAGCCCTATCGCATCTGGCTTCTGAGA
TACCTTATATAAGATTTTTATGTTCTTCTATCCCTTCGTTGTCGAAAGAAGATATGAATC
ATTCCCTTTTCCAGAGACAAGTTGCCAAATTTACCAGATCTGGTGGTATGGTGACTCTTG
GCCAGGCTCGCTCCTCTTTATCTGGCAGCTCTGCTGGGGTTATGAAGACTCGCTCCGTTT
CATCTGTTGGCTCTTCTGGTTCTAAACCCTCGTTGACTTCCAAGCCCGTGTTCTGGTCTT
CAATGGCTGGTGCCTATGCCA

QA 1 561 1 561
DS 

RD RS1G707JQ 296 0 0
GGCAGTTCTGCTGGGGTTATGAAGACTCGCTCCGTTTCATCTGTTGGCTCTTCTGGTTCT
AAACCCTCGTTGACTTCCAAGCCCGTGTTCTGGTCTTCAATGGCTGGTGCCTATGCCATT
TATGGCTATTGGGTGTATTTCCAGATGGAAAGGCGTGCGTTAGAGAAAAAGAAAACTTGA
TGTGTTGTCTCTTGTTCTAGGTCTTGTCCTAAAGGAAGCTTGATGTGTTATCTCTTTTTC
TAGTTCTTGTTCTCTCTTTGTTCTCTCTGTATTGTGTTTGACTTCTGTGGTTAAAA

QA 1 296 1 296
DS 

RD RS1FI09JQ 480 0 0
GG
GTCGAAAGAAGATATGAATCATTCCCTTTTCCAGAGACAAGTTGCCAAATTTACCAGATC
TGGTGGTATGGTGACTCTTGGCCAGGCTCGCTCCTCTTTATCTGGCAGCTCTGCTGGGGT
TATGAAGACTCGCTCCGTTTCATCTGTTGGCTCTTCTGGTTCTAAACCCTCGTTGACTTC
CAAGCCCGTGTTCTGGTCTTCAATGGCTGGTGCCTATGCCATTTATGGCTATTGGGTGTA
TTTCCAGATGGAAAGGCGTGCGTTAGAGAAAAAGAAAACTTGATGTGTTGTCTCTTGTTC
TAGGTCTTGTCCTAAAGGAAGCTTGATGTGTTATCTCTTTTTCTAGTTCTTGTTCTCTCT
TTGTTCTCTCTGTATTGTGTTTGACTTCTGTGGTTAAAAGAATGACCTTTAATCTTTGGA
TGCTTTTGGTTGTGTTATCTAAGGTTGCAACTTTAATCTTTATATATTCAAGTTTTCC

QA 3 480 3 480
DS 

RD RS1FI09TF 480 0 0
GG
GTCGAAAGAAGATATGAATCATTCCCTTTTCCAGAGACAAGTTGCCAAATTTACCAGATC
TGGTGGTATGGTGACTCTTGGCCAGGCTCGCTCCTCTTTATCTGGCAGCTCTGCTGGGGT
TATGAAGACTCGCTCCGTTTCATCTGTTGGCTCTTCTGGTTCTAAACCCTCGTTGACTTC
CAAGCCCGTGTTCTGGTCTTCAATGGCTGGTGCCTATGCCATTTATGGCTATTGGGTGTA
TTTCCAGATGGAAAGGCGTGCGTTAGAGAAAAAGAAAACTTGATGTGTTGTCTCTTGTTC
TAGGTCTTGTCCTAAAGGAAGCTTGATGTGTTATCTCTTTTTCTAGTTCTTGTTCTCTCT
TTGTTCTCTCTGTATTGTGTTTGACTTCTGTGGTTAAAAGAATGACCTTTAATCTTTGGA
TGCTTTTGGTTGTGTTATCTAAGGTTGCAACTTTAATCTTTATATATTCAAGTTTTCC

QA 3 480 3 480
DS 



AS 1 4

CO CL2409Contig1 1577 4 4 U
GGACTGTCCTATCATGCAGTGCTATAAATAGCTTTATCTTTATTATCTTTTTTTTATATG
CTTCTCCTTCAAAGGTCTTGATTTTTTTCTTGCTACATTTCACTTCATTTTCTTCCTCTT
TCATCGGTATCTCCTTGTTCTTTCTCATTTTCATTTTCTCTGTGTTTTACTTTTAAGTGT
TCTTACATCATATTTCTTACTTATACTAAGATACTTCTCATACGCATCATCAGTTTTTCA
TCTAGTGTTCTCTTAGTCGATTTTCAGTTTGCAGGGTATTAAGTTCTTTCTTTTTTCTCT
AAACCGGAAAATACAAGAAATGGGTTTGCCTTCTTATCTGAAGTCATACCTTATTTATCT
CCTCTTCTGCCTTCTCATTGTTACCTCCATAAATTCAACGAAGCCATTAAAAAAAGAGGC
CGTGCTTTTTGGTGGGAATTTTCCAGCTTTGTATGTTATTGGAGATTCATTGGTTGATCC
AGGAAACAATAATTATCTTCTGACACTAGTCAGAGCGAATTTTAAACCTTATGGTTCTAA
CTTTAAAGGAGACAAAGCTACCGGCCGTTTTAGTGATGGCAAAACAATTGCTGATTATAT
TGCTATTTATTATGGACTTCCTTTGGCTCCTGCTTACATGGAATTATCTAAAAAGGAAAA
AAATAACCTCTCAACGGGTATTAACTATGCTTCTGCTAGCTGTGGGATTTTTCCTGACAC
AGAAAGCAATTTGGAAGATGTCTCTCGATGAACGTCCAAATTCGATCTACTCAATAAAAC
CATTGAGAAGAATCTTAAGAAAAAGTTCAAGACACAGTCAGAACTTAGTAGCCACTTGGA
TAAATCGTTGTTTATGACCGCGATTGGGGTCAATGATTACGCTTTCACCTATGAAAAGAA
CACTACCGATGCAAATGAGTTTGCAAGCATGCTTCTTAATGAATTCTTGAAACAGCTCGA
GAGATTATATAACTTAGGAGCACGGAATTTCTTCGTCAACAACATTAAACCTTTAGGTTG
TTACCCAAATATCATTGCTAAGACGGTATCTCGTGGAAGCTGCAATGACTCTTTAAACCT
TGCTATCGACATTTTCAATGTTCAGCTTAGAGAAAGCCTGTCGCATATGCATCATAGACT
GTCAAACACTTCCTTCTTATATTCCGACTACTTCAACTTCATGTTGGGACTTCGTGGACC
TTCGAGCAATCAAGTTAGTTCGAATCTATTGAACACTACAAGCCCACGTTGTCCTAAAGT
TTATAATGGAGGTTCAACCACGACTTGTTTGCCATTTTCAAAGGCGTGTAAGGAACCGGA
CATGTATATCTTCTTCGATCCGCGCCATCCAACACAAATAGCGAATTTCATGTACGCTAT
TTCATGTTTCCAGAAGAGAGAAGTTTGTCATGTGGTCATAGATTGAATTTTACTTGTATA
TCAGTTGAATAGTATTACAGTGAAAAAATAATTGAAGTATGATGAAACAGTAAAAAACTA
AAGTAGATAGAGTTTATGCAGAATAATCATAAATACTGAAAATTAGCGGCTTGTAGTATA
TAACGGAATTATATTTT


BQ
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10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DA83JQ C 82
AF RS1DA83TF U 82
AF RS1AF89TF U 1
AF RS1AF89JQ C 710
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C

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TATACTAAGATACTTCTCATACGCATCATCAGTTTTTCATCTAGTGTTCTCTTAGTCGAT
TTTCAGTTTGCAGGGTATTAAGTTCTTTCTTTTTTCTCTAAACCGGAAAATACAAGAAAT
GGGTTTGCCTTCTTATCTGAAGTCATACCTTATTTATCTCCTCTTCTGCCTTCTCATTGT
TACCTCCATAAATTCAACGAAGCCATTAAAAAAAGAGGCCGTGCTTTTTGGTGGGAATTT
TCCAGCTTTGTATGTTATTGGAGATTCATTGGTTGATCCAGGAAACAATAATTATCTTCT
GACACTAGTCAGAGCGAATTTTAAACCTTATGGTTCTAACTTTAAAGGAGACAAAGCTAC
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C

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TC

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AGTAGATAGAGTTTATGCAGAATAATCATAAATACTGAAAATTAGCGGCTTGTAGTATAT
AACGGAATTATATTTT

QA 13 868 13 868
DS 



AS 1 4

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TTTTTTGG


BQ
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20 20 20 20 20 10 

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AF RS1ES39TF U 4
AF RS1AI71JQ C 13
AF RS1AI71TF U 93
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ACAACTTTTAACTTCC
AT

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AAAAAAACACTCAATAACTTATTACAATTCTCTTATCAAAAATGTGGTTGATCAACAAGT
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TCTTGGTCATAAATGTGCTATCAAACAATGTTATGTTTCTGCTTAAATAACAACTTTTAA
CTTCC

QA 9 493 9 493
DS 

RD RS1AI71JQ 595 0 0
GG
AAAACACTCAATAACTTATTACAATTCTCTTATCAAAAATGTGGTTGATCAACAAGTTTT
TATTCCTTCTGCCAGTTGCATTCATGGCCGTGTTCGGTACAGCTCAAACGTTGCCTTCAC
AGCCTATACCTGGACAGGACTCAACAGATTGTATGTCATCCATGTTTGTTATTCCCAACT
GTATCCCAGAAATTATCCAATCGTT**TAAACGGAGAAATCGGGACTGTTGGTCGTTCTT
GTTGTCATGCCTTTTTAGGTCTCAGTGCAGATTGTATTAAAGAGAGGTTTGAATTCACTC
TAGAAGAATTCCCTTCGGCTTTAAGAGACTATTGTTCCCGACAATGATGATAATAACAAT
GAATGCCATAATCCTTTCGAGTCTTTGTTTCAAGGGTGTTATTATTATCCTACATATTTT
TCTTCATAAATGTGCTATCAAACAATGTTATGTTTTTGCTTAAATAACAACTTTTAACTT
CCATATTCCATACTTCCTGTTTTTCTTTTTGTTACACAGTTACATACTTCCTGTTGATGT
AAACATCTTGCGGATAATTGAATAATAATAAGGATAATACTCTCTTTTTTTTG

QA 3 595 3 595
DS 

RD RS1AI71TF 516 0 0
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ACTCAACAGATTGTATGTCATCCATGTTTGTTATTCCCAACTGTATCCCAGAAATTATCC
AATCGTT**TAAACGGAGAAATCGGGACTGTTGGTCGTTCTTGTTGTCATGCCTTCTTAG
GTCTCAGTGCAGATTGTATTAAAGAGAGGTTTGAATTCACTCTAGAAGAATTCCCTTCGG
CTCTAAGAGACTATTGTTCCCGACAATGATGATAATAACAATGAATGCCATAATCCTTTC
GAGTCTTTGTTTCAAGGGTGTTATTATTATCCTACATATTCTTCTTCATAAATGTGCTAT
CAAACAATGTTATGTTTCTGCTTAAATAACAACTTTTAACTTCCATATTCCATACTTCCT
GTTTTTCTTTTTGTTACACAGTTACATACTTCCTGTTGATGTAAACATCTTGCGGATAAT
TGAATAATAATAAGGATAATACTCTCTTTTTTTTGG

QA 1 516 1 516
DS 



AS 1 4

CO CL2411Contig1 570 4 2 U
TTTTTTGTTTTCATCGTCTCGAGTGTTTCGCGTTTTCGATTTCTTCTTGGCAAATACAAG
TATCTCCGGTCCGGTGGAAGAAAATGGCTAGTGAAGATTTCATATACAGAATCAGTACGG
AGCAAGAGTGGCAAGAGTTCCAGAAGAATGGATCTTCTTTTGGTGGTGAGCTCGATAAGT
CAACTGGTTGCTTTCATCTCAGCAAACTCCATCAGGTGCAAATGACATTGCAGAACTTCT
TCTTGAACGCTAAGGAGGATCTTTACCTTCTTCAAATCGATCCTAAGAAGCTTGGAGATG
GATTGATCTATGAAGCAGTGGATGATGTGAATAGCTTCCCTCACTTCTACGGTCCAGACA
GAACATTTGCTCCACTTCCTCTCGACTCTGTCGTCAAAGCTGAGAAGCTAACATTCACCA
ACGGCAACTTCACCTGCAGCTTCTTCACTTGATGTATCTAATCCCTTCTTCCTATATAAT
AATCACTCCACTCTGGTTTTTATGTATTGCATTGTTCACTTGATGATTAAACACAGAGAA
TTGTTATTAATCTAATTAACTAGCTCTCGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RS1DT58JQ C 1
AF RS1DT58TF U 1
AF RS1A779JQ C 73
AF RS1A779TF U 73
BS 1 568 RS1DT58TF
BS 569 570 RS1A779JQ

RD RS1DT58JQ 570 0 0
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TATCTCCGGTCCGGTGGAAGAAAATGGCTAGTGAAGATTTCATATACAGAATCAGTACGG
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TCTTGAACGCTAAGGAGGATCTTTACCTTCTTCAAATCGATCCTAAGAAGCTTGGAGATG
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AATCACTCCACTCTGGTTTTTATGTATTGCATTGTTCACTTGATGATTAAACACAGAGAA
TTGTTATTAATCTAATTAACTAGCTCTC
GC

QA 1 568 1 568
DS 

RD RS1DT58TF 568 0 0
TTTTTTGTTTTCATCGTCTCGAGTGTTTCGCGTTTTCGATTTCTTCTTGGCAAATACAAG
TATCTCCGGTCCGGTGGAAGAAAATGGCTAGTGAAGATTTCATATACAGAATCAGTACGG
AGCAAGAGTGGCAAGAGTTCCAGAAGAATGGATCTTCTTTTGGTGGTGAGCTCGATAAGT
CAACTGGTTGCTTTCATCTCAGCAAACTCCATCAGGTGCAAATGACATTGCAGAACTTCT
TCTTGAACGCTAAGGAGGATCTTTACCTTCTTCAAATCGATCCTAAGAAGCTTGGAGATG
GATTGATCTATGAAGCAGTGGATGATGTGAATAGCTTCCCTCACTTCTACGGTCCAGACA
GAACATTTGCTCCACTTCCTCTCGACTCTGTCGTCAAAGCTGAGAAGCTAACATTCACCA
ACGGCAACTTCACCTGCAGCTTCTTCACTTGATGTATCTAATCCCTTCTTCCTATATAAT
AATCACTCCACTCTGGTTTTTATGTATTGCATTGTTCACTTGATGATTAAACACAGAGAA
TTGTTATTAATCTAATTAACTAGCTCTC

QA 1 568 1 568
DS 

RD RS1A779JQ 498 0 0
GGG
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AGGATCTTTACCTTCTTCAAATCGATCCTAAGAAGCTTGGAGATGGATTGATCTATGAAG
CAGTGGATGATGTGAATAGCTTCCCTCACTTTTACGGTCCATACAGAACATTTGCTCCAC
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GCAGCTTCTTCACTTGATGTATCTAATCCCTTCTTCCTATATAATAATCACTCCACTCTG
GTTTTTATGTATTGCATTGTTCACTTGATGATTAAACACAGAGAATTGTTATTAATCTAA
TTAACTAGCTCTCGC

QA 4 498 4 498
DS 

RD RS1A779TF 498 0 0
GGG
GGAAGAAAATGGCTAGTGAAGATTTCATATACAGAATCAGTACGGAGCAAGAGTGGCAAG
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ATCTCAGCAAACTCCATCAGGTGCAAATGACATTGCAGAACTTCTTCTTGAACGCTAAGG
AGGATCTTTACCTTCTTCAAATCGATCCTAAGAAGCTTGGAGATGGATTGATCTATGAAG
CAGTGGATGATGTGAATAGCTTCCCTCACTTCTACGGTCCATACAGAACATTTGCTCCAC
TTCCTCTCGACTCTGTCGTCAAAGCTGAGAAGCTAACATTCACCAACGGCAACTTCACCT
GCAGCTTCTTCACTTGATGTATCTAATCCCTTCTTCCTATATAATAATCACTCCACTCTG
GTTTTTATGTATTGCATTGTTCACTTGATGATTAAACACAGAGAATTGTTATTAATCTAA
TTAACTAGCTCTC
GC

QA 4 496 4 496
DS 



AS 1 3

CO CL2412Contig1 902 3 9 U
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GCATGAAAACCTTGCAGGTGGGAGGATTAAAGTCTTTTAAACTGAGCTTGGGCGTACGCA
AAAAGAAGAAACAGAAAAAGGGAAGATCGAGTAGCTTGGCTGTTAAGGCTATTTCGGAGA
AGCTCCCACCCAAGAAAAGAGCTACAGATAAAGAGCGTAAAACTTCACAGATAAGTACTA
GCGCTTCTGGCTCGGCTTGCTTGAATGGGAAGGATAACAGAGTCATTGTCAAGGAGAGAA
GTAATCAAAATAGTGCTGTTCTTACGTCAGTCCAACAGCAAACGCTGAAGAGCTCTGACA
TGTCTGAAGCAAGCCAAAACGCCAAAAGAAAGAGAGAGCTCTCAAAAAAACAAGATGAAG
AAGAGGCGACCGTTCTCACACGGGGTTTGCCAGGGACATTTGTTGGCAAATGGGATGAGG
AAGCTTCAGCTTCTAAGATGAGGAACAGTGAAGACTCAAGAATCGGATATGTAGCAGATG
AGTGGGATGAAGAATATGATAGAGGGAAGAAAAAGAAGATAAGGATGAAAGAGGAGATGT
ATGCAGGTCCGAACCCGTTCCAGCTGGTTGCATCAAAGAAACAACAAACAGATACAAAGA
AGAAATGGACGCAACGCATGAATACTGCAAAGACAGGCTTCCGAATAATAAAATAAGTGA
GCACCATCCATAACCTATAAAGAAGAAATTGTAATCCACATGTTGTTGCTGTATTTTGCC
TTTTTTTTAACAAGAGAGGAGTAGAGAGAGAGAGGCTATAGACACTAGTAGTCTTTGTTG
TGAGATCTCTTTTCCTCTCAGTTTTGTTCTGTTTATGAGATGAACAGAGAATTACACATC
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1D141TF U 1
AF RS1AT60TF U 31
AF RS1AT60JQ C 157
BS 1 262 RS1D141TF
BS 263 263 RS1AT60TF
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BS 331 331 RS1AT60TF
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GCATGAAAACCTTGCAGGTGGGAGGATTAAAGTCTTTTAAACTGAGCTTGGGCGTACGCA
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AAGCTTCAGCTTCTAAGATGAGGAACAGTGAAGACTCAAGAATCGGATATGTAGCAGATG
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ATGCAGGTCCGA

QA 1 612 1 612
DS 

RD RS1AT60TF 611 0 0
G
AACCACACCAAGAAAGACTCGCAAGGGTAGCATGAAAACCTTGCAGGTGGGAGGATTAAA
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TAGCTTGGCTGTTAAGGCTATTTCGGAGAAGCTCCCACCCAAGAAAAGAGCTACAGATAA
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GGATAACAGAGTCATTGTCAAGGAGAGAAGTAATCAAAATAGTGCTGTTCTTACGTCAGT
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ATCAAAGAAA

QA 2 611 2 611
DS 

RD RS1AT60JQ 746 0 0
TGGCTGTTAAGGCTATTTCGGAGAAGCTCCCACCCAAGAAAAGAGCTACAGATAAAGAGC
GTAAAACTTCACAGATAAGTACTAGCGCTTCTGGCTCGGCTTGCTTGAATGGGAAGGATA
ACAGAGTCATTGTCAAGGAGAGAAGTAATCAAAATAGTGCTGTTCTTACGTCAGTCCAAC
AGCAAACGCTGAAGAGCTCTGACATGTCTGAAGCAAGCCAAAACGCCAAAAGAAAGAGAG
AGCTCTCAAAAAAACAAGATGAAGAAGAGGCGACCGTTCTCACACGGGGTTTGCCAGGGA
CATTTGTTGGCAAATGGGATGAGGAAGCTTCAGCTTCTAAGATGAGGAACAGTGAAGACT
CAAGAATCGGATATGTAGCAGATGAGTGGGATGAAGAATATGATAGAGGGAAGAAAAAGA
AGATAAGGATGAAAGAGGAGATGTATGCAGGTCCGAACCCGTTCCAGCTGGTTGCATCAA
AGAAACAACAAACAGATACAAAGAAGAAATGGACGCAACGCATGAATACTGCAAAGACAG
GCTTCCGAATAATAAAATAAGTGAGCACCATCCATAACCTATAAAGAAGAAATTGTAATC
CACATGTTGTTGCTGTATTTTGCCTTTTTTTTAACAAGAGAGGAGTAGAGAGAGAGAGGC
TATAGACACTAGTAGTCTTTGTTGTGAGATCTCTTTTCCTCTCAGTTTTGTTCTGTTTAT
GAGATGAACAGAGAATTACACATCCC

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 4

CO CL2413Contig1 1123 4 6 U
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TATCGACTTTGTCCCTGACACTTCTGGTGTTTCCTTGGCCGAGTCCACCGGTTTTCTCAA
AGCCCCTGGTGGTGCTCCAGCTAACGTTGCATGTGCCATCTCCAAGCTCGGTGGCAAATC
AGCTTTCATTGGCAAGTTTGGTGATGATGAGTTTGGACACATGCTTGTCAACATATTGAA
GAAGAACGGTGTGAACAGCGAAGGAGTTTGCTTCGACAGCCATGCAAGGACTGCATTGGC
CTTTGTGACACTAAAGAAGAACGGCGAAAGAGAGTTCATGTTTTACAGGAACCCTAGTGC
GGATATGCTCTTGAAAGAATCTGAACTCAACAAGGATCTCATCAAGAAAGCCAAGATTTT
CCACTACGGTTCCATTAGCTTGATCTCTGAGCCATGTAGAGCGGCACACATGGCTGCTAT
GAAAACCGCCAAGGACGCTGGAGTGTTACTCTCTTACGACCCTAATGTTCGGTTGCCTCT
TTGGCCTTCCACTGAGGCTGCCATAGAAGGCATTAAAAGCATCTGGAATGAGGCTGATAT
TATCAAGGTAAGCGATGACGAGGTAACACTCCTCACTGGGGGAGATGCAGAGAAGGATGA
TGTTGTTTTGTCTCTAATGCATGACAAGCTCAAGCTGCTTATTGTAACTGATGGAGAGAA
AGGTTGCAGATACTACACAAAGAAATTCGAAGGGAGAGTGCCAGGTTACTCAGTGAAAAC
AGTTGATACAACTGGAGCTGGTGATTCTTTTGTCGGTGCATTTCTTTTCTCTTTGGGAAA
AGATGGCTCCATACTCGATGATGAAGGAAAGCTAAAGGAAGCTCTTGCATTTGCGAATGC
ATGTGGAGCTGTGTGTACAACTCAGAAAGGAGCTATTCCAGCACTTCCATCTCCATCTGA
TGCTCAGCAGCTCATGAAATCTAAGTCCAAATAATCTGACTTTTTGTTCCTTCTCAAATG
CTAGTCATGCTTCTTTTGTTTCTTCAATTTTGTATTGACTCTAGTCTACTTTTTGTTTTG
GTTTTTCTTTTTTAGTTATCTGAATAAATTAGTGTTGATTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1FE18TF U 1
AF RS1BH43TF U 7
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AF RS1FE18JQ C 417
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TTGGCCTTCCACTGAG
CTGCCATA

QA 1 556 1 556
DS 

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TTTT
TTTCATCAAAAGATGGCTACTCCATTGATTGTTTCCTTTGGCGAAATGCTTATCGACTTT
GTCCCTGACACTTCTGGTGTTTCCTTGGCCGAGTCCACCGGTTTTCTCAAAGCCCCTGGT
GGTGCTCCAGCTAACGTTGCATGTGCCATCTCCAAGCTCGGTGGCAAATCAGCTTTCATT
GGCAAGTTTGGTGATGATGAGTTTGGACACATGCTTGTCAACATATTGAAGAAGAACGGT
GTGAACAGCGAAGGAGTTTGCTTCGACAGCCATGCAAGGACTGCATTGGCCTTTGTGACA
CTAAAGAAGAACGGCGAAAGAGAGTTCATGTTTTACAGGAACCCTAGTGCGGATATGCTC
TTGAAAGAATCTGAACTCAACAAGGATCTCATCAAGAAAGCCAAGATTTTCCACTACGGT
TCCATTAGCTTGATCTCTGAGCCATGTAGAGCGGCACACATGGCTGCTATGAAAACCGCC
AAGGACGCTGGAGTGTTACTCTCTTACGACCCTAATGTTCGGTTGCCTCTTTGGCCTTCC
ACTGAGGCTGCCATAGAAGGCATTAAAAGCATCTGGAATGAGGCTGATATTA

QA 5 596 5 596
DS 

RD RS1BH43JQ 765 0 0
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TTTCCACTACGGTTCCATTAGCTTGATCTCTGAGCCATGTAGAGCGGCACACATGGCTGC
TATGAAAACCGCCAAGGACGCTGGAGTGTTACTCTCTTACGACCCTAATGTTCGGTTGCC
TCTTTGGCCTTCCACTGAGGCTGCCATAGAAGGCATTAAAAGCATCTGGAATGAGGCTGA
TATTATCAAGGTAAGCGATGACGAGGTAACACTCCTCACTGGGGGAGATGCAGAGAAGGA
TGATGTTGTTTTGTCTCTAATGTATGACAAGCTCAAGCTGCTTATTGTAACTGATGGAGA
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AAAAGATGGCTCCATACTCGATGATGAAGGAAAGCTAAAGGAAGCTCTTGCATTTGCGAA
TGCATGTGGAGCTGTGTGTACAACTCAGAAAGGAGCTATTCCAGCACTTCCATCTCCATC
TGATGCTCAGCAGCTCATGAAATCTAAGTCCAAATAATCTGACTTTTTGTTCCTTCTCAA
ATGCTAGTCATGCTTCTTTTGTTTCTTCAATTTTGTATTGACTCTAGTCTACTTTTTGTT
TTGGTTTTTCTTTTTTAGTTATCTGAATAAATTAGTGTTGATTT
C

QA 1 764 1 764
DS 

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CTATGAAAACCGCCAAGGACGCTGGAGTGTTACTCTCTTACGACCCTAATGTTCGGTTGC
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ATATTATCAAGGTAAGCGATGACGAGGTAACACTCCTCACTGGGGGAGATGCAGAGAAGG
ATGATGTTGTTTTGTCTTTAATGCATGACAAGCTCAAGCTGCTTATTGTAACTGATGGAG
AGAAAGGTTGCAGATACTACACAAAGAAATTCGAAGGGAGAGTGCCAGGTTACTCAGTGA
AAACAGTTGATACAACTGGAGCTGGTGATTCTTTTGTCGGTGCATTTCTTTTCTCTTTGG
GAAAAGATGGCTCCATACTCGATGATGAAGGAAAGCTAAAGGAAGCTCTTGCATTTGCGA
ATGCATGTGGAGCTGTGTGTACAACTCAGAAAGGAGCTATTCCAGCACTTCCATCTCTAT
CTGATGCTCAGCAGCTCATGAAATCTAAGTCCAAATAATCTGACTTTTTGTTCCTTCTCA
AATGCTAGTCATGCTTCTTTTGTTTCTTCAATTTTGTATTGACTCTAGTCTACTTTTTGT
TTTGGTTTTTCTTTTTTAGTTATCTGAATAAATTAGTGTTGATTTGC

QA 1 707 1 707
DS 



AS 2 4

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AAAAAAGGAAAATTACATAAAACGAAATCTGTGGCATGGTCGAAGCATGACAAAAAACCG
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TAATCATAAACATAATTACCCTATTAGCCTCTCCATGTAATCTCCAAAAACTCCATTACA
GGCGGCTTCTAAAATTCCTATTTTACCCCTATTCTTACCAAACCAGACCAAACCGATCTA
AGACAGGATCTTGTCCCAATCTATCTCGTACGACGGATACTTCTCCAACGAGAACGTCTC
GTTCCAACACTGCGGCGGCTCCTCCGTGTCGGCGAACGTTAAGTCTGACAACGGCGAAGA
GCCTGCGGACTCAACGAACTCCGTCTCCGGAGGAGATCCGGCGTTCGAGTTATCCTCCGC
CTTGACTTTCTCCGTCTCAGCTTTCTTCGAGGCACGTTTCTTGGATCCTTTCGTCGCCGC
CGATTTGCCCTGTTTCTCCGCCTCCGCCATGCTCTGACAAATAGCTTCGAGCTTGGCGTC
GACGGTGGAGTGCAGCGGTTTGTACTCGCCGAACTCGCCTCCGATGTGGGACCCGCTGTG
ACGCAGGTTCGGGAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BC52TF C 1
AF RS1BC52JQ U 3
BS 1 17 RS1BC52TF
BS 18 678 RS1BC52JQ

RD RS1BC52TF 678 0 0
TTAAATTAAAAACATCACATTAAGATTATAGAAAACGAAACTAGAGATTACATAGACCAA
AAAAAAGGAAAATTACATAAAACGAAATCTGTGGCATGGTCGAAGCATGACAAAAAACCG
CAGCTGGACCGACACAGAGACTGATACAAACATAATATTGACGTACGAGATTTAACCCAC
TAATCATAAACATAATTACCCTATTAGCCTCTCCATGTAATCTCCAAAAACTCCATTACA
GGCGGCTTCTAAAATTCCTATTTTACCCCTATTCTTACCAAACCAGACCAAACCGATCTA
AGACAGGATCTTGTCCCAATCTATCTCGTACGACGGATACTTCTCCAACGAGAACGTCTC
GTTCCAACACTGCGGCGGCTCCTCCGTGTCGGCGAACGTTAAGTCTGACAACGGCGAAGA
GCCTGCGGACTCAACGAACTCCGTCTCCGGAGGAGATCCGGCGTTCGAGTTATCCTCCGC
CTTGACTTTCTCCGTCTCAGCTTTCTTCGAGGCACGTTTCTTGGATCCTTTCGTCGCCGC
CGATTTGCCCTGTTTCTCCGCCTCCGCCATGCTCTGACAAATAGCTTCGAGCTTGGCGTC
GACGGTGGAGTGCAGCGGTTTGTACTCGCCGAACTCGCCTCCGATGTGGGACCCGCTGTG
ACGCAGGTTCGGGAAGCC

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1BC52JQ 676 0 0
AAATTAAAAACATCA
CATTAAGATTATAGAAAACGAAACTAGAGATTACATAGACCAAAAAAAAGGAAAATTACA
TAAAACGAAATCTGTGGCATGGTCGAAGCATGACAAAAAACCGCAGCTGGACCGACACAG
AGACTGATACAAACATAATATTGACGTACGAGATTTAACCCACTAATCATAAACATAATT
ACCCTATTAGCCTCTCCATGTAATCTCCAAAAACTCCATTACAGGCGGCTTCTAAAATTC
CTATTTTACCCCTATTCTTACCAAACCAGACCAAACCGATCTAAGACAGGATCTTGTCCC
AATCTATCTCGTACGACGGATACTTCTCCAACGAGAACGTCTCGTTCCAACACTGCGGCG
GCTCCTCCGTGTCGGCGAACGTTAAGTCTGACAACGGCGAAGAGCCTGCGGACTCAACGA
ACTCCGTCTCCGGAGGAGATCCGGCGTTCGAGTTATCCTCCGCCTTGACTTTCTCCGTCT
CAGCTTTCTTCGAGGCACGTTTCTTGGATCCTTTCGTCGCCGCCGATTTGCCCTGTTTCT
CCGCCTCCGCCATGCTCTGACAAATAGCTTCGAGCTTGGCGTCGACGGTGGAGTGCAGCG
GTTTGTACTCGCCGAACTCGCCTCCGATGTGGGACCCGCTGTGACGCAGGTTCGGGAAGC
C

QA 16 676 16 676
DS 



CO CL2414Contig2 606 2 1 U
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ATCCAAGAAACGTGCCTCGAAGAAAACTGAGGCGGAGAAAGTCAAGGCGGAGGATAACTC
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GTCGGACTTAACGTTCGCCGACACGGAGGAGCCGCCGCAGTGTTGGAACGAGACGTTCTC
GTTGGAGAAGTATCCGTCGTACGAGATAGATTGGGACAAGATCCTGTCTTAGATCGGTTT
GGTTTGGTTTGGTTTGGTTTGGTAAGAATAGGGGTAAAATAGGAATTTTAGAAGCCGCCT
GTAATGGAGTTTTTGGATATTACATGGAGAGGCTAATAGGGTAATTATGTTTATGATTAG
TGGGTTAAATCTCGTATGTCAATATTATGTTTGTATCAGTCTCTGTGTCGGTCCAGCTGC
GGTTTTTTGTCATGCTTCGACCATGCCACAGATTTCGTTTTATGTAATTTTCCTTTTTTT
TGGTCTATGTAATCTCTAGCTTCGTTTTCTATAATCTTAATGATGTTTTTAGTTTAGTTT
TCTAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RS1EP82TF U 1
AF RS1EP82JQ C 127
BS 1 606 RS1EP82TF

RD RS1EP82TF 606 0 0
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GTCGGACTTAACGTTCGCCGACACGGAGGAGCCGCCGCAGTGTTGGAACGAGACGTTCTC
GTTGGAGAAGTATCCGTCGTACGAGATAGATTGGGACAAGATCCTGTCTTAGATCGGTTT
GGTTTGGTTTGGTTTGGTTTGGTAAGAATAGGGGTAAAATAGGAATTTTAGAAGCCGCCT
GTAATGGAGTTTTTGGATATTACATGGAGAGGCTAATAGGGTAATTATGTTTATGATTAG
TGGGTTAAATCTCGTATGTCAATATTATGTTTGTATCAGTCTCTGTGTCGGTCCAGCTGC
GGTTTTTTGTCATGCTTCGACCATGCCACAGATTTCGTTTTATGTAATTTTCCTTTTTTT
TGGTCTATGTAATCTCTAGCTTCGTTTTCTATAATCTTAATGATGTTTTTAGTTTAGTTT
TCTAGT

QA 1 606 1 606
DS 

RD RS1EP82JQ 480 0 0
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CCGGCGACGGAGTTCGTCGAGTCCGCCGGCTCTTCGCCGTTGTCGGACTTAACGTTCGCC
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TACGAGATAGATTGGGACAAGATCCTGTCTTAGATCGGTTTGGTTTGGTTTGGTTTGGTT
TGGTAAGAATAGGGGTAAAATAGGAATTTTAGAAGCCGCCTGTAATGGAGTTTTTGGATA
TTACATGGAGAGGCTAATAGGGTAATTATGTTTATGATTAGTGGGTTAAATCTCGTATGT
CAATATTATGTTTGTATCAGTCTCTGTGTCGGTCCAGCTGCGGTTTTTTGTCATGCTTCG
ACCATGCCACAGATTTCGTTTTATGTAATTTTCCTTTTTTTTGGTCTATGTAATCTCTAG
CTTCGTTTTCTATAATCTTAATGATGTTTTTAGTTTAGTTTTCTAGT

QA 14 480 14 480
DS 



AS 2 4

CO CL2415Contig1 652 2 16 U
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TGTTCAGAGAAGAAGAAGAAGAAGACGATGGGAAGAGGAAGGATTGAGATTAAGAAGATT
GAGAATGTGAACAGTCGTCAAGTCACTTTCTCCAAAAGACGTAACGGGTTGATGAAGAAG
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TCTTCGCAAGAGAACGGTGCTGTTGTGTTGCGTAAAGATGATGCTATGAAGAACGAACTT
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AAGACTCAAATCTTGCTCAACCAGGTGGAAAGATCCCGGTTAAAGGAAAGAAGAGCATTG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CZ32TF U 1
AF RS1GK89TF U 5
BS 1 43 RS1CZ32TF
BS 44 44 RS1GK89TF
BS 45 48 RS1CZ32TF
BS 49 49 RS1GK89TF
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BS 76 82 RS1CZ32TF
BS 83 85 RS1GK89TF
BS 86 188 RS1CZ32TF
BS 189 189 RS1GK89TF
BS 190 263 RS1CZ32TF
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BS 265 642 RS1CZ32TF
BS 643 652 RS1GK89TF

RD RS1CZ32TF 642 0 0
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TGTTCAGAGAAGAATAAGAAGA***CGATGGGAAGAGGAAGGATTGAGATTAAGAAGATT
GAGAATGTGAACAGTCGTCAAGTCACTTTCTCCAAAAGACGTAACGGGTTGATGAAGAAG
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GGCAAGGTTTACGATTTCTCCAGTGGCTGCATGGAACAAACCCTTTCAAGATATGGACAC
ACTGCTGCGTCCGCCGATCATAAACCAAAAGAAGAAGAACAACAACAACTTCTACTCTGT
TCTTCGCAAGAGAACGGTGCTGTTGTGTTGCGTAAAGATGATGCTATGAAGAACGAACTT
GAGAGATTACAGCTTGCAATTCAGAGGCTGAAGGGTAAGGAGCTTGAGGGTATGAGTTTC
TCGGATCTTATCTCTCTTGAAAACCAGTTGAATGATAGCTTGCATAGTGTCAAGGATCAA
AAGACTCAAATCTTGCTCAACCAGGTGGAAAGATCCCGGTTAAAGGAAAGAAGAGCATTG
GAAGAGAACCAAATCTTGCGCAAACAGGTAGAGATGTTGGGG

QA 1 642 1 642
DS 

RD RS1GK89TF 648 0 0
GGGACACAGACTT
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GAAGAAGACGATGGGAAGAGGAAGGATTGAGATTAAGAAGATTGAGAATGTGAACAGTCG
TCAAGTCACTTTCTCCAAAAGACGTAACGGGTTGATGAAGAAGGCCAAGGAACTTTCTAT
CCTCTTCGACGCTGAGGTTGCTCTTATCATCTTCTCCAGCACCGGCAAGGTTTACGATTT
CTCCAGCGGCTGTATGGAGCAAACCCTTTCAAGATATGGACACAGTGCTGCGTCCGCCGA
TCATAAACCAAAAGAAGAAGAAGAACAAC***TTCTACTCTGTTCTTCGCAAGAGAACGG
TGCTGTTGTGTTGCGTAAAGATGATGCTATGAAGAACGAACTTGAGAGATTACAGCTTGC
AATTCAGAGGCTGAAGGGTAAGGAGCTTGAGGGTATGAGTTTCTCGGATCTTATCTCTCT
TGAAAACCAGTTGAATGATAGCTTGCATAGTGTCAAGGATCAAAAGACTCAAATCTTGCT
CAACCAGGTGGAAAGATCCCGGTTAAAGGAAAGAAGAGCATTGGAAGAGAACCAAATCTT
GCGCAAACAGGTAGAGATGTTGGGGAGAGGTTCAT

QA 14 648 14 648
DS 



CO CL2415Contig2 842 2 10 U
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AAATCTAAAATCAATCTCTACTTGGAGAAACAAGGAGAATACACATTTAAAACCTCTACT
TAAACACCATAATTAGGAGACTAACAAATTAATATTTAATCAATCAGAAGCAACTTGACT
TCCAGAGTTATAGCCACAGGGCGATTCAATCTTCGGCTTCTTTCTCTTTGTACAATACCC
CGATGACGACAACCCCAGCTGCAAGGAAGTGTCGGAATGGAGGTCATTCTCGTCGTCATC
ATCTGATGAAGAGCTCTCGGGCTCCGCTTGTGGGCTAGAAAACTGAGGTATTTCACTCAG
CCCTTTTGGTCCTGATGAACCTCTCCCCAACATCTCTACCTGTTTGCGCAAGATTTGGTT
CTCTTCCAATGCTCTTCTTTCCTTTAACCGGGATCTTTCCACCTGGTTGAGCAAGATTTG
AGTCTTTTGATCCTTGACACTATGCAAGCTATCATTCAACTGGTTTTCAAGAGAGATAAG
ATCCGAGAAACTCATACCCTCAAGCTCCTTACCCTTCAGCCTCTGAATTGCAAGCTGTAA
TCTCTCAAGTTCGTTCTTCATAGCATCATCTTTACGCAACACAACAGCACCGTTCTCTTG
CGAAGAACAGAGTAGAAGTTGTTCTTGTTCTTCTTCTTTTGGTTTATGATCGGCGGACGC
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CTTGCCGGTGCTGGAGAAGATGATAAGAGCAACCTCAGCGTCGCAGAGGATAGAAAGCTC
TT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1GK89JQ U 1
AF RS1CZ32JQ U 60
BS 1 84 RS1GK89JQ
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CGAAGAACAGAGTAGAAGTTGTTC***TTCTTCTTCTTTTGGTTTATGATCGGCGGACGC
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DS 

RD RS1CZ32JQ 783 0 0
AACACA
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AGTTATAGCCACAGGGCGATTCAATCTTCGGCTTCTTTCTCTTTGTACAATACCCCGATG
ACGACAACCCCAGCTGCAAGGAAGTGTCGGAATGGAGGTCATTCTCGTCGTCATCATCTG
ATGAAGAGCTCTCGGGCTCCGCTTGTGGGCTAGAAAACTGAGGTATTTCACTCAGCCCTT
TTGGTCCTGATGAACCTCTCCCCAACATCTCTACCTGTTTGCGCAAGATTTGGTTCTCTT
CCAATGCTCTTCTTTCCTTTAACCGGGATCTTTCCACCTGGTTGAGCAAGATTTGAGTCT
TTTGATCCTTGACACTATGCAAGCTATCATTCAACTGGTTTTCAAGAGAGATAAGATCCG
AGAAACTCATACCCTCAAGCTCCTTACCCTTCAGCCTCTGAATTGCAAGCTGTAATCTCT
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QA 7 783 7 783
DS 



AS 1 4

CO CL2416Contig1 1106 4 10 U
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CATGCCTGATCCCTCCGATGTGCCGACTCCTCAAGTCCACGTCAGCGCTTTTCCGTCGGA
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CAAGACTCAGGGAATTTCTCGCGTTCTTAATACTGTTCCTATGTGCCTGAATCTCTACAG
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CAAGTTCTTAGACCAGTGCGAGAAGGACAAGGCACGTGTTCTTGTGCACTGCATGTCAGG
GAAAAGCAGATCACCAACGGTTGTTATTGCGTACTTGATGAAACGTAAAGGGTGGGGACT
CGCTGAGAGTCATCAGTGGGTTAAGCAACGAAGACCAACTACTGACATATCTCCAGAGTT
CTACCAACAACTGGAGGCGTTTGAGCAGGCTGTATTCGGATCAAGAGAAGGAATGATGTC
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TCAAGCGCAAGTCCCTGTGTTCAACAGTGCTCCTGCTTCTTCTATATTTTCATCCCCTGC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BU75TF U 30
AF RS1FF96TF U 1
AF RS1BU75JQ C 451
AF RS1FF96JQ C 426
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GG
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QA 3 287 3 287
DS 

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QA 1 771 1 771
DS 

RD RS1BU75JQ 603 0 0
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TGGAGCTGCTCCACCAAAGCCAACAACCGGCGATGATATTTCCATGGATGGCTCTTAAAA
CCAAATCTGCAAGAACATTCCACAAAAAAAACATACCGGTTTCCTTTTTTTTTCCTTTTT
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TT
G

QA 1 602 1 602
DS 

RD RS1FF96JQ 681 0 0
CCTTCACTTACCATGGCCTCTCTGATGAAAAAGTCTTACAATTTGATGATGCTATCAAGT
TCTTAGACCAGTGCGAGAAGGACAAGGCACGTGTTCTTGTGCACTGCATGTCAGGGAAAA
GCAGATCACCAACGGTTGTTATTGCGTACTTGATGAAACGTAAAGGGTGGGGACTCGCTG
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TGAGTATCAACGATCCTCCAACGTTTGGTTTTGGTTTTCCAAAGGTTAATAGTGATCAAG
CGCAAGTCCCTGTGTTCAACAGTGCTCCTGCTTCTTCTATATTTTCATCCCCTGCTCCAA
GTATACCTCCTCAAGGGTTCACTTTTGGAGCTGCTCCACCAAAGCCAACAACCGGCGATG
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GGTACGTGAGGTGAATCTTTGTTGGTTTGGTGTTTTGCATCTATCTCTGTTTGCTGAAAG
GAAAGCATCTTTTTCTGGTTT

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 4

CO CL2417Contig1 574 4 6 U
GGCGTCTTTCTTCACATAAAGGAAGCTGACTATCTGAGAGATGGCCAATACCGGATTGAT
TCTGAGGCCACGCCGACAATGTTGAACTGCCTTATGTACAAGCTCTCTTACTACAGGTTT
GTAGAGACAGATGGCAAAGCTTATGATCGGGTTAGGCGGACGGAGATCGGGAAGAAAAAT
TTCAAGCTCACG*ATTTCGAAGAGGTTTTCACGAGTCACCATTGGATGGTTCGGATATAC
AAGCTGAAACCCCAGAAGAACAGGATTCGTGGTAGAGCAAAGAAACTGAAACTGAAAACA
AGCTCTGGATTGGACTCAAAACCAGCCAAGAAGAATCCGTGGATCTAGAAACCCTAGAAG
TATTTAATGTTGGATGGTGAGTTATATGTTTAACTCTTAGGTCACTCTTTATCCTCAGAG
GAAGTT*GTTGCAGACGCATTCAAGTTT*CTGATGTTAGGATTCGTAAACTTTTTTGTAG
ACTTGGGAGTTTTATGTTTATTGTGGAGATTTACATATATTCAGGTGGCCAGATCGAATC
TCAATCCAACAAAATGGAAACTTTAAATAGCTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RS1BK94JQ C 37
AF RS1F514JQ C 1
AF RS1F514TF U 1
AF RS1BK94TF U 210
BS 1 291 RS1F514TF
BS 292 292 RS1BK94TF
BS 293 326 RS1F514TF
BS 327 327 RS1BK94TF
BS 328 572 RS1F514TF
BS 573 574 RS1BK94TF

RD RS1BK94JQ 498 0 0
G
GAGATGGCCAATACCGGATTGATTCTGAGGCCACGCCGACAATGTTGAACTGCCTTATGT
ACAAGCTTTCTTACTACAGGTTTGTAGAGACAGATGGCAAAGCTTATGATCGGGTTAGGC
GGACGGAGATCGGGAAGAAAAATATCAAGCTCACACATTTCGAAGAGGTTTTCACGAGTC
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CAAAGAAACTGAAACTGAAAACAAGCTCTGGATTGGACTCAAAACCAGCCAAGAAGAATC
CGTGGATCTAGAAACCCTAGAAGTATTTAATGTTGGATGGTGAGTTATATGTTTAACTCT
TAGGTCACTCTTTATCCTCAGAGGAAGTT*GTTGCAGACGCATTCAAGTTT*CTGATGTT
AGGATTCGTAAACTTTTTTGTAGACTTGGGAGTTTTATGTTTATTGTGGAGATTTACATA
TATTCAGGTGGCCAGAT

QA 2 498 2 498
DS 

RD RS1F514JQ 574 0 0
GGCGTCTTTCTTCACATAAAGGAAGCTGACTATCTGAGAGATGGCCAATACCGGATTGAT
TCTGAGGCCACGCCGACAATGTTGAACTGCCTTATGTACAAGCTCTCTTACTACAGGTTT
GTAGAGACAGATGGCAAAGCTTATGATCGGGTTAGGCGGACGGAGATCGGGAAGAAAAAT
TTCAAGCTCACG*ATTTCGAAGAGGTTTTCACGAGTCACCATTGGATGGTTCGGATATAC
AAGCTGAAACCCCAGAAGAACAGGATTCGTGGTAGAGCAAAGAAACTGAAATTGAAAACA
AGCTCTGGATTGGACTCAAAACCAGCGAAGAAGAATCCGTGGATCTAGAAACCCTAGAAG
TATTTAATGTTGGATGGTGAGTTATATGTTTAACTCTTAGGTCACTCTTTATCCTCAGAG
GAAGTT*GTTGCAGACGCATTCAAGTTT*CTGATGTTAGGATTCGTAAACTTTTTTGTAG
ACTTGGGAGTTTTATGTTTATTGTGGAGATTTACATATATTCAGGTGGCCAGATCGAATC
TCAATCCAACAAAATGGAAACTTTAAATAGCT
CG

QA 1 572 1 572
DS 

RD RS1F514TF 574 0 0
GGCGTCTTTCTTCACATAAAGGAAGCTGACTATCTGAGAGATGGCCAATACCGGATTGAT
TCTGAGGCCACGCCGACAATGTTGAACTGCCTTATGTACAAGCTCTCTTACTACAGGTTT
GTAGAGACAGATGGCAAAGCTTATGATCGGGTTAGGCGGACGGAGATCGGGAAGAAAAAT
TTCAAGCTCACG*ATTTCGAAGAGGTTTTCACGAGTCACCATTGGATGGTTCGGATATAC
AAGCTGAAACCCCAGAAGAACAGGATTCGTGGTAGAGCAAAGAAACTGAAATTGAAAACA
AGCTCTGGATTGGACTCAAAACCAGCGAAGAAGAATCCGTGGATCTAGAAACCCTAGAAG
TATTTAATGTTGGATGGTGAGTTATATGTTTAACTCTTAGGTCACTCTTTATCCTCAGAG
GAAGTT*GTTGCAGACGCATTCAAGTTT*CTGATGTTAGGATTCGTAAACTTTTTTGTAG
ACTTGGGAGTTTTATGTTTATTGTGGAGATTTACATATATTCAGGTGGCCAGATCGAATC
TCAATCCAACAAAATGGAAACTTTAAATAGCT
CG

QA 1 572 1 572
DS 

RD RS1BK94TF 365 0 0
CACGAGTCACCATTGGATGGTTCGGATATACAAGCTGAAACCCCAGAAGAACAGGATTCG
TGGTAGAGCAAAGAAACTGAAACTGAAAACAAGCTCTGGATTGGACTCAAAACCAGCCAA
GAAGAATCCGTGGACCTAGAAACCCTAGAAGTATTTAATGTTGGATGGTGAGTTATATGT
TTAACTCTTAGGTCACTCTTTATCCTCAGAGGAAGTTTGTTGCAGACGCATTCAAGTTTT
CTGATGTTAGGATTCGTAAACTTTTTTGTAGACTTGGGAGTTTTATGTTTATTGTGGAGA
TTTACATATATTCAGGTGGCCAGATCGAATCCCAATCCAACAAAATGGAAACTTTAAATA
GCTTC

QA 1 365 1 365
DS 



AS 1 3

CO CL2418Contig1 1157 3 19 U
GAAAAGACACAAGTGTATTGAGATTGTAGAAGCGCAAATAAAGATCCGATGAAAAGAACA
AGAACGAAAAGCCACATAGAAAAACAGTCTCTTAGTTGTTTACAACATTAACTCAAACAT
TTGATGCACTTTCCACAATCATCATGTCTTACCCATCCTCACCATCCCTAAACCAGAGCC
ACTACCCAAATGCTTGTACTCTTTAGCCTCAAGATGATCGTCATGCTCAGCAAAACCAGT
CCCTCCTTTCTTCAGCCCAACCAAGTTCCTGTCCTTGCAAGGTTTGTCACACACAAGACA
GACTTTGTCCACAGGCATAAACTTCTCACCGCACTTCTTGCAAAAAACATGTCCGCATGA
GCTAAGCGCCACAAAAGACATCGTGTTGGTGAGAGTGACTTTGCAGCTCGGGCAAATGTA
GGTTTTGTCATAAGAGCTTGAAGACGACGATTTAGCCTTCTTCTCTTCCTCTTCGCTGTT
ATCTTCCGTGAAACGGATAGCAAATAGGTTCTTAAGCTTGAGCTTCTCTTTGCCCTCTGG
ACAGACCGTATGAGTTTCCGGAGCTTCTACTCTAACTGAAGCTCCAGGTGTAGCCGATGG
AAGCCAGAAGGCTTTCATTGTCCTAAGCGCCTCTTCTTCAAAAGAAGTCGCCTTCACACT
GTTCGCCCCATGGAAACCATTCTTGTCTTGGTTTTGGCTCTTGTCACTGTACCGAGGCAA
AGCACCATGGTTTTGCTGATCAAACTCGTCGAGCTCTCTAGCCTTTTGTAACATGAGTCT
CTCTTCTTCCTCGTCCTTATCTTGATTCTTTTGAGAAGCATGGGCAGCAAGCCTCCGCTG
GACATCTTTCTTCTGGGCGAGGAAGCATTCGAGGATGCACTCTCTGCAGAAGACATGACC
CTTGTGGCAACACATGGGATCGATGAAGGGTTTCAAGCAGAGGGAGCAAGCATCGAAGGG
CTTGATCGAGTCTTTCCCCAATCTCTCCCTCTGGGTTCCGTACCCTAGCTTCTTCTTCTC
GTCGTACGTGAAGTACGCGAGATCGTTGTTGTTCTTCGAGTGTCTTTGCGGCATCTCGGA
TGCTGAATCGAGGACGATGAGGAATCAGGTGTGTCTGTGTGAGAGAGAATTAAGGATCCA
AATCGCAAACCCTGGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DB79JQ U 1
AF RS1EC60JQ U 30
AF RS1EC60TF C 461
BS 1 80 RS1DB79JQ
BS 81 81 RS1EC60JQ
BS 82 83 RS1DB79JQ
BS 84 84 RS1EC60JQ
BS 85 105 RS1DB79JQ
BS 106 107 RS1EC60JQ
BS 108 342 RS1DB79JQ
BS 343 343 RS1EC60JQ
BS 344 366 RS1DB79JQ
BS 367 367 RS1EC60JQ
BS 368 377 RS1DB79JQ
BS 378 378 RS1EC60JQ
BS 379 482 RS1DB79JQ
BS 483 483 RS1EC60JQ
BS 484 663 RS1DB79JQ
BS 664 664 RS1EC60JQ
BS 665 674 RS1DB79JQ
BS 675 787 RS1EC60JQ
BS 788 1157 RS1EC60TF

RD RS1DB79JQ 674 0 0
GAAAAGACACAAGTGTATTGAGATTGTAGAAGCGCAAATAAAGATCCGATGAAAAGAACA
AGAACGAAAAGCCACATAGACAA*CAGTCTCTTAGTTGTTTACAATTTTAACTCAAACAT
TTGATGCACTTTCCACAATCATCATGTCTTACCCATCCTCACCATCCCTAAACCAGAGCC
ACTACCCAAATGCTTGTACTCTTTAGCCTCAAGATGATCGTCATGCTCAGCAAAACCAGT
CCCTCCTTTCTTCAGCCCAACCAAGTTCCTGTCCTTGCAAGGTTTGTCACACACAAGACA
GACTTTGTCCACAGGCATAAACTTCTCACCGCACTTCTTGCAGAAAACATGTCCGCATGA
GCTAAGTGCCACAAAAGGCATCGTGTTGGTGAGAGTGACTTTGCAGCTCGGGCAAATGTA
GGTTTTGTCATAAGAGCTTGAAGACGACGATTTAGCCTTCTTCTCTTCCTCTTCGCTGTT
ATATTCCGTGAAACGGATAGCAAATAGGTTCTTAAGCTTGAGCTTCTCTTTGCCCTCTGG
ACAGACCGTATGAGTTTCCGGAGCTTCTACTCTAACTGAAGCTCCAGGTGTAGCCGATGG
AAGCCAGAAGGCTTTCATTGTCCTAAGCGCCTCTTCTTCAAAAGAAGTCGCCTTCACACT
GTTAGCCCCATGGA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1EC60JQ 758 0 0
AAGT
GCAAATAAAGATCCGATGAAAAGAACAAGAACGAAAAGCCACATTGAAAAACAGTCTCTT
GGTTGTTTACAACATTAACTCACACATTTGATGCGCTTTCCACAATCATCATGTCTTACC
CATCCTCACCATCCCTAAACCAGAGCCACTACCCAAATGCTTGTACTCTTTAGCCTCAAG
ATGATCGTCATGCTCGGCAAAACCAGTGCCTCCTTTCTTCAGCCCAACCAAGTTCCTGTC
CTTGCAAGGTTTGTCACACACAAGACAGACTTTGTCCACGGGCATAAACTTCTCACCGCA
CTTCTTGCAAAAAACATGTCCGCATGAGCTAAGCGCCACAAGAGACATCGTGTTGGTGAG
AGTGACTTTGCAGCTCGGGCAAATGTAGGTTTTGTCATAAGAGCTTGAAGACGACGATTT
AGCCTTCTTCTCTTCCTCTTCGCTGTTATCTTCCGTGAAACGGATAGCAAATAGGTTCTT
AAGCTTGAGCTTCTCTTTGCCCTCTGGACAGACCGTATGAGTTTCCGGAGCTTCTACTCT
AACTGAAGCTCCAGGTGTAGCCGATGGAAGCCAGAAGGCTTTCATTGTCCTAAGCGCCTC
TTCTTCAAAAGAAGTCGCCTTCACACTGTTCGCCCCATGGAAACCATTCTTGTCTTGGTT
TTGGCTCTTGTCACTGTACCGAGGCAAAGCACCATGGTTTTGCTGATCAAACTCGTCGAG
CTCTCTAGCCTTTTGTAACATGAGTCTCTCTTCT

QA 5 758 5 758
DS 

RD RS1EC60TF 697 0 0
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AGCTTCTCTTTGCCCTCTGGACAGACCGTATGAGTTTCCGGAGCTTCTACTCTAACTGAA
GCTCCAGGTGTAGCCGATGGAAGCCAGAAGGCTTTCATTGTCCTAAGCGCCTCTTCTTCA
AAAGAAGTCGCCTTCACACTGTTCGCCCCATGGAAACCATTCTTGTCTTGGTTTTGGCTC
TTGTCACTGTACCGAGGCAAAGCACCATGGTTTTGCTGATCAAACTCGTCGAGCTCTCTA
GCCTTTTGTAACATGAGTCTCTCTTCTTCCTCGTCCTTATCTTGATTCTTTTGAGAAGCA
TGGGCAGCAAGCCTCCGCTGGACATCTTTCTTCTGGGCGAGGAAGCATTCGAGGATGCAC
TCTCTGCAGAAGACATGACCCTTGTGGCAACACATGGGATCGATGAAGGGTTTCAAGCAG
AGGGAGCAAGCATCGAAGGGCTTGATCGAGTCTTTCCCCAATCTCTCCCTCTGGGTTCCG
TACCCTAGCTTCTTCTTCTCGTCGTACGTGAAGTACGCGAGATCGTTGTTGTTCTTCGAG
TGTCTTTGCGGCATCTCGGATGCTGAATCGAGGACGATGAGGAATCAGGTGTGTCTGTGT
GAGAGAGAATTAAGGATCCAAATCGCAAACCCTGGAA

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 4

CO CL2419Contig1 523 4 11 U
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AAGAATAACAGACAAATAATGGCCAAAGGTGTACAATTTTTTAGCTTCATCACTTTTGTG
ATGATCTTCATGTTGATATCAACAGAAACTGTTGGAGCGAGGAGACCTTTGATTAAATGT
ACAAGTGTACATCTGCCCTGCAATCCACATGTTGTGCCTTTTTGCTTAAGAGCGTGCAAA
CAAATATATAAGAATAAAACACAAGTAAAAGGAACTTGTAAAACTGCCCCACCGCCAAGG
GAATACCTAAAAATGACTTGCGAGTGCGAATACATGGCCGTTGAATGCCCAAGAAAATAA
TAATTCAATTTACTATTCAAATTGATGATTAGATTTGGATGAAATTAATTTACATATTTA
TAATTTAAAATCCTAAAAATGGATTTAATACTAAGTTTTTATTATTTATTCTTGTACGGT
TGTACCATAAATATTTGATGTTATAGATATGGATGTTACGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1A327TF U 1
AF RS1A327TV U 130
AF RS1A817JQ C 23
AF RS1A817TF U 23
BS 1 60 RS1A327TF
BS 61 61 RS1A817TF
BS 62 164 RS1A327TF
BS 165 165 RS1A817TF
BS 166 184 RS1A327TF
BS 185 185 RS1A817TF
BS 186 253 RS1A327TF
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BS 313 313 RS1A817TF
BS 314 523 RS1A327TF

RD RS1A327TF 523 0 0
GAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAACTAAATCTCATCAAAACAAAAGAAAGAAACAATA
TAGAATAACAGACAAATAATGGCCAAAGGTGTACAATTTTTTAGCTTCATCACTTTTGTG
ATGATCTTCATGTTGATATCAACAGAAACTGTTGGAGCGAGGAGGCCTTTGATTAAATGT
ACAACTGTACATCTGCCCTGCAATCCACATGTTGTGCCTTTTTGCTTAAGAGCGTGCAAA
CAAATATATAAGA*TAAAACACAAGTAAAAGGAACTTGTAAAACTGCCCCACCGCCAAGG
GAATACCTAAAA*TGACTTGCGAGTGCGAATACATGGCCGTTGAATGCCCAAGAAAATAA
TAATTCAATTTACTATTCAAATTGATGATTAGATTTGGATGAAATTAATTTACATATTTA
TAATTTAAAATCCTAAAAATGGATTTAATACTAAGTTTTTATTATTTATTCTTGTACGGT
TGTACCATAAATATTTGATGTTATAGATATGGATGTTACGTCC

QA 1 523 1 523
DS 

RD RS1A327TV 394 0 0
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CATCTGCCCTGCAATCCACATGTTGTGCCTTTTTGCTTAAGAGCGTGCAAACAAATATAT
AAGA*TAAAACACAAGTAAAAGGAACTTGTAAAACTGCCCCACCGCCAAGGGAATACCTA
AAA*TGACTTGCGAGTGCGAATACATGGCCGTTGAATGCCCAAGAAAATAATAATTCAAT
TTACTATTCAAATTGATGATTAGATTTGGATGAAATTAATTTACATATTTATAATTTAAA
ATCCTAAAAATGGATTTAATACTAAGTTTTTATTATTTATTCTTGTACGGTTGTACCATA
AATATTTGATGTTATAGATATGGATGTTACGTCC

QA 1 394 1 394
DS 

RD RS1A817JQ 488 0 0
GGAACTAAATCTCATCAAAACAAAAGAAAGAAACAATAAAGAATAACAGACAAATAATGG
CCAAAGGTGTACAATTTTTTAGCTTCATCACTTTTGTGATGATCTTCATGTTGATATCAA
CAGAAACTGTTGGAGCGAGGAGACCTTTGATTAAATGTACAAGTGTACATCTGCCCTGCA
ATCCACATGTTGTGCCTTTTTGCTTAAGAGCGTGCAAACAAATATATAAGAATAAAACAC
AAGTAAAAGGAACTTGTAAAACTGCCCCACCGCCAAGGGAATACCTAAAAATGACTTGCG
AGTGCGAATACATGGCCGTTGAATGCCCAAGAAAATAATAATTCAATTTACTATTCAAAT
TGATGATTAGATTTGGATGAAATTAATTTACATATTTATAATTTAAAATCCTAAAAATGG
ATTTAATACTAAGTTTTTATTATTTATTCTTGTACGGTTGTACCATAAATATTTGATGTT
ATAGATAT

QA 1 488 1 488
DS 

RD RS1A817TF 476 0 0
GGAACTAAATCTCATCAAAACAAAAGAAAGAAACAATAAAGAATAACAGACAAATAATGG
CCAAAGGTGTACAATTTTTTAGCTTCATCACTTTTGTGATGATCTTCATGTTGATATCAA
CAGAAACTGTTGGAGCGAGGAGACCTTTGATTAAATGTACAAGTGTACATCTGCCCTGCA
ATCCACATGTTGTGCCTTTTTGCTTAAGAGCGTGCAAACAAATATATAAGAATAAAACAC
AAGTAAAAGGAACTTGTAAAACTGCCCCACCGCCAAGGGAATACCTAAAAATGACTTGCG
AGTGCGAATACATGGCCGTTGAATGCCCAAGAAAATAATAATTCAATTTACTATTCAAAT
TGATGATTAGATTTGGATGAAATTAATTTACATATTTATAATTTAAAATCCTAAAAATGG
ATTTAATACTAAGTTTTTATTATTTATTCTTGTACGGTTGTACCATAAATATTTGA

QA 1 476 1 476
DS 



AS 1 4

CO CL2420Contig1 1497 4 3 U
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CTGTCCAGAAGATAAGAGTTGCAATTAGAGATCAAAGGGAGATAACTGTCCAGTTGATAA
ACTACACTAAGAGCGGAAAGAAGTTCTGGAACTTATTCCACTTGCAACCTATGCGTGATC
AGAAGGGAGAGCTTCAATACTTCATCGGTGTGCAGCTTGATGGAAGTGACCATGTGGAAC
CCCTCAGAAATCGTTTGTCTGAGAGAACAGAGATGCAGAGTTCTAAACTGGTGAAAGCTA
CAGCAACAAATGTAGATGAAGCTGTCAGAGAACTTCCAGATGCTAATATGCGGCCTGAAG
ACCTGTGGGCTGCATACTCAAAGCCAGTGTATCCTCTGCCTCACAAGAAGGAGAGTACGT
CCTGGAAGGCAATACAAAAGATCCAAGCGAGTGGAGAAACAGTAGGACTTCATCATTTCA
AGCCAATAAAACCTTTAGGCTCTGGTGATACTGGCAGTGTGCATTTGGTTGAGCTAAAAG
GCACAGGTGAGTTGTATGCCATGAAGGCAATGGAGAAAACCATGATGTTGAATTCGTAAC
AAGGCGCACCGAGCATGCATCGAAAGGGAAATCATTTCCCTTTTGGATCATCCTTTCCTT
CCCACTCTGTACACTTCCTTTCAGACATCTACGCACGTTTGTTTGATCACAGACTTCTGC
CCCGGTGGAGAGTTGTTTGCACTACTTGACATTCAACCTATGAAGTTTTTGTCAGAAGAA
TCAGCAAGGTTCTATGCAGCAGAGGTTGTCATCGGTTTAGAATATCTTCACTGCTTAGGA
ATAGTATACCGAGACCTGAAGCCTGAAAACATACTGCTCAAGAAGGATGGACACATTGTA
TTAGCCGACTTTGATCTATCTTTCATGACGTCCTGCACACCCCAGCTTATTATTCCACCT
GCACCTAACAAACGGAGGAGATCATCCAATAGTCAACCATTACCCACGTTTGTTGCAGAA
CCAGCCACTCAGTCAAACTCGTTTGTAGGGACTGAAGAATACATTGCGCCTGAGATAATC
ACGGGTTCTGGTCATACGAGTGCTATTGATTGGTGGGCACTAGGTATCTTGTTGTATGAG
ATGATTTATGGTCGCACACCTTTCAGGGGTAAGAATAGACAGAAGACATTTACCAACATC
TTGCACAAAGATCTCACTTTCCCCAGCAGTATCCCTGTAAGTCTTGTAGGTAGACAACTG
ATTAACATGTTGTTAAACAGAGATCCGAGCAGTCGGTTAGGATCAAAAGGTGGGGCCAAT
GAGATAAAGCAGCATGCCTTCTTCCGCGGGATCAATTGGCCTTTCATACGGGGCATGGAG
CCTCCACCATTGGATACACCATTGCGTATAACAGAAAAAGATCCGAATGCCAAAGATATA
AAGTGGGAAGATGATGGAGTGCTTGTGAATTCAATGGACACTGACATTGATTTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1A250TF U 1
AF RS1A250TV U 37
AF RS1A250TR C 725
AF RS1A250JQ C 915
BS 1 776 RS1A250TF
BS 777 1487 RS1A250TR
BS 1488 1497 RS1A250JQ

RD RS1A250TF 783 0 0
GTGAGGAAATATTGGGAAGAAACTGTCGATTTCTTCAAGGGCCAGAGACAGATCAAGCTA
CTGTCCAGAAGATAAGAGTTGCAATTAGAGATCAAAGGGAGATAACTGTCCAGTTGATAA
ACTACACTAAGAGCGGAAAGAAGTTCTGGAACTTATTCCACTTGCAACCTATGCGTGATC
AGAAGGGAGAGCTTCAATACTTCATCGGTGTGCAGCTTGATGGAAGTGACCATGTGGAAC
CCCTCAGAAATCGTTTGTCTGAGAGAACAGAGATGCAGAGTTCTAAACTGGTGAAAGCTA
CAGCAACAAATGTAGATGAAGCTGTCAGAGAACTTCCAGATGCTAATATGCGGCCTGAAG
ACCTGTGGGCTGCATACTCAAAGCCAGTGTATCCTCTGCCTCACAAGAAGGAGAGTACGT
CCTGGAAGGCAATACAAAAGATCCAAGCGAGTGGAGAAACAGTAGGACTTCATCATTTCA
AGCCAATAAAACCTTTAGGCTCTGGTGATACTGGCAGTGTGCATTTGGTTGAGCTAAAAG
GCACAGGTGAGTTGTATGCCATGAAGGCAATGGAGAAAACCATGATGTTGAATTCGTAAC
AAGGCGCACCGAGCATGCATCGAAAGGGAAATCATTTCCCTTTTGGATCATCCTTTCCTT
CCCACTCTGTACACTTCCTTTCAGACATCTACGCACGTTTGTTTGATCACAGACTTCTGC
CCCGGTGGAGAGTTGTTTGCACTACTTGACATTCAACCTATGAAGTTTTTGTCAGA
GAATCAG

QA 1 776 1 776
DS 

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AAGGGCCAGAGACAGATCAAGCTACTGTCCAGAAGATAAGAGTTGCAATTAGAGATCAAA
GGGAGATAACTGTCCAGTTGATAAACTACACTAAGAGCGGAAAGAAGTTCTGGAACTTAT
TCCACTTGCAACCTATGCGTGATCAGAAGGGAGAGCTTCAATACTTCATCGGTGTGCAGC
TTGATGGAAGTGACCATGTGGAACCCCTCAGAAATCGTTTGTCTGAGAGAACAGAGATGC
AGAGTTCTAAACTGGTGAAAGCTACAGCAACAAATGTAGATGAAGCTGTCAGAGAACTTC
CAGATGCTAATATGCGGCCTGAAGACCTGTGGGCTGCATACTCAAAGCCAGTGTATCCTC
TGCCTCACAAGAAGGAGAGTACGTCCTGGAAGGCAATACAAAAGATCCAAGCGAGTGGAG
AAACAGTAGGACTTCATCATTTCAAGCCAATAAAACCTTTAGGCTCTGGTGATACTGGCA
GTGTGCATTTGGTTGAGCTAAAAGGCACAGGTGAGTTGTATGCCATGAAGGCAATGGAGA
AAACCATGATGTTGAATTCGTAACAAGGCGCACCGAGCATGCATCGAAAGGGAAATCATT
TCCCTTTTGGATCATCCTTTCCTTCCCACTCTGTACACTTCCTTTCAGACATCTACGCAC
GTTTGTTTGATCACAGACTTCTGCCCCGGTGGAGAGTTGTTTGCACTACTTGACATTCAA
CCTATGAAGTTTT

QA 1 733 1 733
DS 

RD RS1A250TR 763 0 0
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CAAGGTTCTATGCAGCAGAGGTTGTCATCGGTTTAGAATATCTTCACTGCTTAGGAATAG
TATACCGAGACCTGAAGCCTGAAAACATACTGCTCAAGAAGGATGGACACATTGTATTAG
CCGACTTTGATCTATCTTTCATGACGTCCTGCACACCCCAGCTTATTATTCCACCTGCAC
CTAACAAACGGAGGAGATCATCCAATAGTCAACCATTACCCACGTTTGTTGCAGAACCAG
CCACTCAGTCAAACTCGTTTGTAGGGACTGAAGAATACATTGCGCCTGAGATAATCACGG
GTTCTGGTCATACGAGTGCTATTGATTGGTGGGCACTAGGTATCTTGTTGTATGAGATGA
TTTATGGTCGCACACCTTTCAGGGGTAAGAATAGACAGAAGACATTTACCAACATCTTGC
ACAAAGATCTCACTTTCCCCAGCAGTATCCCTGTAAGTCTTGTAGGTAGACAACTGATTA
ACATGTTGTTAAACAGAGATCCGAGCAGTCGGTTAGGATCAAAAGGTGGGGCCAATGAGA
TAAAGCAGCATGCCTTCTTCCGCGGGATCAATTGGCCTTTCATACGGGGCATGGAGCCTC
CACCATTGGATACACCATTGCGTATAACAGAAAAAGATCCGAATGCCAAAGATATAAAGT
GGGAAGATGATGGAGTGCTTGTGAATTCAATGGACACTGACAT

QA 1 763 1 763
DS 

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GAGGAGATCATCCAATAGTCAACCATTACCCACGTTTGTTGCAGAACCAGCCACTCAGTC
AAACTCGTTTGTAGGGACTGAAGAATACATTGCGCCTGAGATAATCACGGGTTCTGGTCA
TACGAGTGCTATTGATTGGTGGGCACTAGGTATCTTGTTGTATGAGATGATTTATGGTCG
CACACCTTTCAGGGGTAAGAATAGACAGAAGACATTTACCAACATCTTGCACAAAGATCT
CACTTTCCCCAGCAGTATCCCTGTAAGTCTTGTAGGTAGACAACTGATTAACATGTTGTT
AAACAGAGATCCGAGCAGTCGGTTAGGATCAAAAGGTGGGGCCAATGAGATAAAGCAGCA
TGCCTTCTTCCGCGGGATCAATTGGCCTTTCATACGGGGCATGGAGCCTCCACCATTGGA
TACACCATTGCGTATAACAGAAAAAGATCCGAATGCCAAAGATATAAAGTGGGAAGATGA
TGGAGTGCTTGTGAATTCAATGGACACTGACATTGATTTCTTC

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 3

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AGGTGGAGGAGCTGAGTGCGGCGGCGAGTCACGCAAGGGACAAGAAGAAAGCAGGTGGAT
CCGATCCTTTGGAAGAATATTGCAGCGATAATCCTGAAACTGATGAGTGTCGTACTTATG
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CTTTCTTCTTCTCGTTGTTGTCGTCCGTGTTTGGTTTGTTTTGATTTGATGCTTGTAATG
TGATAATGATTATGATGAATAGTTCAATTACAATATTCATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GS79JQ C 1
AF RS1GS79TF U 1
AF RS1DA25TF U 10
BS 1 567 RS1GS79TF
BS 568 581 RS1DA25TF

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CCGCCGCCCCGGTCCGTTTGAATTACCCGTGGAAGTTCGTTTCGATGAACCGGATGGTTA
TGTCGGTGAAGGCGACATCGGAAGGAGAGATATCGGATAAGGTGGAGAAGAGTATTCAGG
AAGCGAAGGAGACTTGCGCTGACGATCCTGTGAGCGGAGAGTGTGTGGCGGCGTGGGACG
AGGTGGAGGAGCTGAGTGCGGCGGCGAGTCACGCAAGGGACAAGAAGAAAGCAGGTGGAT
CCGATCCTTTGGAAGAATATTGCAGCGATAATCCTGAAACTGATGAGTGTCGTACTTATG
ACAACTGAAAACGTTTTTGATGTTTGAAAATAATAGGTACGGTCGGTCGGATCGATCTTT
CTTTCTTCTTCTCGTTGTTGTCGTCCGTGTTTGGTTTGTTTTGATTTGATGCTTGTAATG
TGATAATGATTATGATGAATAGTTCAA
TTACG

QA 1 567 1 567
DS 

RD RS1GS79TF 572 0 0
GGACATCAAACAGAAAAAAAAATCTCTTCCACCAAAACTCTCCAAAGATGACAACCGTAG
CCGCAACAGGTCTCAACGTCGCGACTCCACGAGCGGTCGTTCTACCAGCGGCTCGTCTAT
CCGCCGCCCCGGTCCGTTTGAATTACCCGTGGAAGTTCGTTTCGATGAACCGGATGGTTA
TGTCGGTGAAGGCGACATCGGAAGGAGAGATATCGGATAAGGTGGAGAAGAGTATTCAGG
AAGCGAAGGAGACTTGCGCTGACGATCCTGTGAGCGGAGAGTGTGTGGCGGCGTGGGACG
AGGTGGAGGAGCTGAGTGCGGCGGCGAGTCACGCAAGGGACAAGAAGAAAGCAGGTGGAT
CCGATCCTTTGGAAGAATATTGCAGCGATAATCCTGAAACTGATGAGTGTCGTACTTATG
ACAACTGAAAACGTTTTTGATGTTTGAAAATAATAGGTACGGTCGGTCGGATCGATCTTT
CTTTCTTCTTCTCGTTGTTGTCGTCCGTGTTTGGTTTGTTTTGATTTGATGCTTGTAATG
TGATAATGATTATGATGAATAGTTCAA
TTACG

QA 1 567 1 567
DS 

RD RS1DA25TF 572 0 0
GGG
GAAAAAAAAATCTCTTCCACCAAAACTCTCCAAAGATGACAACCGTAGCCGCAACAGGTC
TCAACGTCGCGACTCCACGAGCGGTCGTTCTACCAGCGGCTCGTCTATCCGCCGCCCCGG
TCCGTTTGAATTACCCGTGGAAGTTCGTTTCGATGAACCGGATGGTTATGTCGGTGAAGG
CGACATCGGAAGGAGAGATATCGGATAAGGTGTAGAAGAGTATTCAGGAAGCGAAGGAGA
CTTGCGCTGACGATCCTGTGAGCGGAGAGTGTGTGGCGGCGTGGGACGAGGTGGAGGAGC
TGAGTGCGGCGGCGAGTCACTCAAGGGACAAGAGAAAAGCAGGTGGATCCGATCCTTTGG
AAGAATATTGCAGCGATAATCCTGAAACTGATGAGTGTCGTACTTATGACAACTGAAAAC
GTTTTTGATGTTTGAAAATAATAGGTACGGTCGGTCGGATCGATCTTTCTTTCTTCTTCT
CGTTGTTGTCGTCCGTGTTTGGTTTGTTTTGATTTGATGCTTGTAATGTGATAATGATTA
TGATGAATAGTTCAATTACAATATTCATC

QA 4 572 4 572
DS 



AS 1 4

CO CL2422Contig1 1568 4 8 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGAAGAACCC
AAATAACACTCCAGGTGATGCGCACACATCCAGTTTTCAATGCCCACACGCGGTGCACAT
TAGCCCCCAACCAATCAAATCCATCTCCGGCGACGAAGCTCTTCGTCTTCTTCGTCAGCC
AACCATCATGGCCACGTGGAACGCCTCCTCCTCCTCCCACCCGGCAGCGTCTCCTTCCCC
TCGTCGTTTAATCTCCTATAGGAGAAGAACCAAAGCCACACCACCGAAGCGACCCTCCTC
CGAATCTCCGCCGAGGAAGATGAGATCGATCGTCGATATAATGGCGAAATCCACGCCCGT
GGTCTTCGAACAGGAGGAGCAAGACGACGACAGCTACGGAGACGTGACCTGCGAGAAATG
CGACTCCGGAGATAGAGACGACGAGCTTCTTCTCTGCGATAAATGCGATAAAGGTTTCCA
CATGAAATGCCTCCGACCGATCGTGGTTCGTGTCCCTGTCGGACCGTGGGTCTGTGTCGA
TTGTTCCGACCAACGACCTGTAAGAAGTTTGTCTCAGAAGAAGATTATGCATTTCTTTTG
TATTGAAAAGCAAATTGATCCAACGGAGAAATCACAGCTGAGTCAAGAAGAAACTAGAAA
GCAACGGAGACGATCTTGCTCCTTGACAGTGAAGAAGAGGAGGAGAAAGCTGTTACCTAT
GGTTCCATCAGAAGATCCTGAACAGAGGCTTGCACAAATGGGCACACTTGCGTCTGCTTT
AACTGCATTGGGTATCAAATACAGCGACGACTTAACTTATGTTCCAGGAATGGCTCCTCG
GTCTGCTAATCGATCCAAGCTCGAGAAAGGTGGGATGCAGGTGCTTTCGAAAGAAGATTT
AGAGACGTTGGAACTATTTCGAGCTATGTATAGACGAGGAGAATGCCCTCCTCTTGTTGT
GGTATTCGATCCACTTGAAGGTTACACAGTTGAAGCAGATGGTCCTATTAAGGACTTAAC
ATTCATAGCTGAATACACAGGGGATGTTGATTACTTAAAAAACCGTGAAAACGACGATTG
TGACAGCATCATGACTCTCCTTTTATCTGAAGATCCATCGAAAACACTTGTTATCTGTCC
TGACAAGTATGGAAACATATCTCGATTCATCAGTGGCATTAACAATCACAATAGGTTTGG
TAAGAAGAAGCAGAACTGTAAATGCGTGAGGTATAGCGTAAATGGAGAGTGTCGGGTTCT
TCTAGTCGCTACACGCGATATAGCTAAAGGGGAAAGGCTCTATTATGACTACAATGGTTA
TGAGCATGAGTATCCTACTCACCTTTTCCTCTGATCAATTTTCACTTCAAACAGTTACAC
AAGAGGATCAATTGGTCTTTGTTTTGTTGCAAATTTACAGGTCAAAATTAGAATACTAGA
TTTAAACTGCATATGGCCTTTGAAGAGGTTATGCATTCTTGATTATGAATGTTAGTTATA
GACTAATTATAGCTTCTTTGGCAATACTTCTATTCAATTTCAAAATGAAAATTTTAACTT
TATTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1A029TF U 38
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CAATGCCCACACGCGGTGCACATTAGCCCCCAACCAATCAAATCCATCTCCGGCGACGAA
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ATAATGGCGAAATCCACGCCCGTGGTCTTCGAACAGGAGGAGCAAGACGACGACAGCTAC
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TAGCCCCCAACCAATCAAATCCATCTCCGGCGACGAAGCTCTTCGTCTTCTTCGTCAGCC
AACCATCATGGCCACGTGGAACGCCTCCTCCTCCTCCCACCCGGCAGCGTCTCCTTCCCC
TCGTCGTTTAATCTCCTATAGGAGAAGAACCAAAGCCACACCACCGAAGCGACCCTCCTC
CGAATCTCCGCCGAGGAAGATGAGATCGATCGTCGATATAATGGCGAAATCCACGCCCGT
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CGACTCCGGAGATAGAGACGACGAGCTTCTTCTCTGCGATAAATGCGATAAAGGTTTCCA
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AGAGACGTTGGAACTATTTCGAGCTATGTATAGACGAGGAGAATGCCCTCCTCTTGTTGT
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GACTAATTATAGCTTCTTTGGCAATACTTCTATTCAATTTCAAAATGAAAATTTTAACTT
TATTTTTC

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TTGTTGCAAATTTACAGGTCAAAATTAGAATACTAGATTTAAACTGCATATGGCCTTTGA
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ATACTTCTATTCAATTTCAAAATGAAAATTTTAACTTTATTTTTC

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AS 1 4

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AGATCCTGACTTTCTTTTTCATCATCAGAAAATGGCTCGTTGGCTACTTCAGATCCTGAT
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AAACTTTCTTGACCAAGAAGATCTTTATCTAGATGCTTCTGCAAAAGTACTTCCCAGTGG
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CATCTCCCTCTTCTCACGTTCTTGCTGTTGAGCTTGACACTATATGGAACCCTGAGTTCA
ATGATGTCATTACCAATCACGTGGGG*ATTGATGTGAACAGTCCTATATCTGTCGGAGTC
GCTTCAGCATCTTACTATTCCGACATGAAGGGGAAAAACGAAAGCATGAACCTGTTGAGT
GGAAAGCCTATACAGGTTTGGG*TGGATTATGAAGACACGGTGCTCAATGTTTCTATCTC
TCCACTTGAAGTCCAGAAGCCAAGTCGGCCTCTTCTGTCACAACCCATCAATCTTACAGA
AGTCTTTAGAAATAGTTCAAGACTGTTTGTTGGGTTCTCTGCAGCAACAGGTGCAGCGGT
CAGTGATCAATACATTGTTGGGTGGAGTTTCAGTACAAACAGAGGATCACTGCAGCAACT
TGATATCTCAAGACTTGTTGAAGTTCCCCATTCTTCAGCTCCTCATAAGAAGCTTCCTAC
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TTATTTTTGCTGGTAAGTGTTGAAATAAGATTCGATCATCAGAATAAATTGGTAATGAAT
GGGAATATGTAACCAAAATTGTAGTTACTATTTATTTTCTATTGGCTTAGTAATTTGCGA
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ATTATGTTTTTTTCG


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A341TF U 362
AF RS1A341TV U 1
AF RS1A341TR C 332
AF RS1A341JQ C 367
BS 1 884 RS1A341TV
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BS 886 910 RS1A341TV
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BS 942 1215 RS1A341TR

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CCTAA
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TCAATACATT

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AGATCCTGACTTTCTTTTTCATCATCAGAAAATGGCTCGTTGGCTACTTCAGATCCTGAT
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ATTACTGCAGCTGACAAACACTTCACTGAATCAAATTGGTCATGCTTTTTACAAGAAACC
AGTTGAGCTCAGTTCCTCTAAACCACTCTCTTTCTCGTCGCATTTCGTGTGTGCTCTGGT
GCCTAAGCAAGGTCGTGAAGGTGGCCATGGTATTGCC*TTCCTAGTATCTCCTTCAAGAG
ATTTCTCACACGCAGAGGCAACAAGATACTTGGGGGCTTTCAACGCATCAGCACTTGAAT
CATCTCCCTCTTCTCACGTTCTTGCTGTTGAGCTTGACACTATATGGAACCCTGAGTTCA
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GCTTCAGCATCTTACTATTCCGACATGAAGGGGAAAAACGAAAGCATGAACCTGTTGAGT
GGAAAGCCTATACAGGTTTGGG*TGGATTATGAAGACACGGTGCTCAATGTTTCTATCTC
TCCACTTGAAGTCCAGAAGCCAAGTCGGCCTCTTCTGTCACAACCCATCAATCTTACAGA
AGTCTTTAGAAATAGTTCAAGACTGTTTGTTGGGTTCTCTGCAGCAACAGGTGCAGCGGT
CAGTGATCAATACATTGTTGGGTGGAGTTTCAGTACAAACAGAG*ATCACTGCAGCAACT
TGATATCTCA*GACTTGTTGAAGTTCCC*ATTCTTCAGCTC
TCATA

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ATTGCC*TTCCTAGTATCTCCTTCAAGAGATTTCTCACACGCAGAGGCAACAAGATACTT
GGGGGCTTTCAACGCATCAGCACTTGAATCATCTCCCTCTTCTCACGTTCTTGCTGTTGA
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ATGTGAACAGTCCTATATCTGTCGGAGTCGCTTCAGCATCTTACTATTCCGACATGAAGG
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CTTCTGTCACAACCCATCAATCTTACAGAAGTCTTTAGAAATAGTTCAAGACTGTTTGTT
GGGTTCTCTGCAGCAACAGGTGCAGCGGTCAGTGATCAATACATTGTTGGGTGGAGTTTC
AGTACAAACAGAGGATCACTGCAGCAACTTGATATCTCAAGACTTGTTGAAGTTCCCCAT
TCTTCAGCTCCTCATAAGAAGCTTCCTACCCTTGTTATTGTTCTGCTTCTTTGCCTGTCT
TTTGTGGTTTTGTAAGTTCTTGCATGAGTTTATTTTTGCTGGTAAGTGTTGAAATAAGAT
TCGATCATCAGAATAAATTGGTAATGAATGGGAATATGTAACCAAAATTGTAGTTACTAT
TTATTTTCTATTGGCTTAGTAATTTGCGATTTTAACTTCTACTTAATTATAATGATTAAA
ATAAATTAGTATGTGAGTTAATAAGTTTAATTATGTTTTTTTCG

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GCAAGGTCGTGAAGGTGGCCATGGTATTGCC*TTCCTAGTATCTCCTTCAAGAGATTTCT
CACACGCAGAGGCAACAAGATACTTGGGGGCTTTCAACGCATCAGCACTTGAATCATCTC
CCTCTTCTCACGTTCTTGCTGTTGAGCTTGACACTATATGGAACCCTGAGTTCAATGATG
TCATTACCAATCACGTGGGG*ATTGATGTGAACAGTCCTATATCTGTCGGAGTCGCTTCA
GCATCTTACTATTCCGACATGAAGGGGAAAAACGAAAGCATGAACCTGTTGAGTGGAAAG
CCTATACAGGTTTGGG*TGGATTATGAAGACACGGTGCTCAATGTTTCTATCTCTCCACT
TGAAGTCCAGAAGCCAAGTCGGCCTCTTCTGTCACAACCCATCAATCTTACAGAAGTCTT
TAGAAATAGTTCAAGACTGTTTGTTGGGTTCTCTGCAGCAACAGGTGCAGCGGTCAGTGA
TCAATACATTGTTGGGTGGAGTTTCAGTACAAACAGAGGATCACTGCAGCAACTTGATAT
CTCAAGACTTGTTGAAGTTCCCCATTCTTCAGCTCCTCATAAGAAGCTTCCTACCCTTGT
TATTGTTCTGCTTCTTTGCCTGTCTTTTGTGGTTTTGTAAGTTCTTGCATGAGTTTATTT
TTGCTGGTAAGTGTTGAAATAAGATTCGATCATCAGAATAAATTGGTAATGAATGGGAAT
ATGTAACCAAAATTGTAGTTACTATTTATTTTCTATTGGCTTAGTAATTTGCGATTTTAA
CTTCTACTTAATTATAATGATTAAAATAAATTAGTATGTGAGTTAATAAGTTTAATTATG
TTTTTTTCG

QA 1 849 1 849
DS 



AS 1 4

CO CL2424Contig1 892 4 12 U
TTCAACATCAATGCTGGTATTGTCAAGAACCTTGCCTCTGCCATCGCCAAGTACTGCCCT
CATGCGCTTGTTAATATGATCAGCAACCCAGTGAACTCTACTGTTCCAATTGCGGCTGAG
GTATTCAAGAAGGCTGGTATGTACGATGAGAAGAAGTTGTTTGGTGTCACCACTCTTGAC
GTTGTTAGGGCCAAGACTTTCTACGCGGGAAAGGCTAATGTCCCTGTTGCAGAAGTGAAT
GTTCCTGTGATTGGTGGTCATGCTGGGGTTACTATTCTCCCACTCTTCTCTCAGGCTACT
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GGTACTGAAGTCGTTGAGGCAAAAGCAGGAAAAGGTTCAGCTACATTGTCAATGGCATAT
GCTGGAGCACTGTTCGCTGATGCATGCTTGAAAGGACTTAACGGAGTTCCAGATGTTGTG
GAATGCTCATACGTGCAGTCCACAATCACCGAGCTTCCTTTTTTCGCCTCAAAGGTGAGG
TTGGGGAAGAACGGCGTGGAGGAGGTTCTT*GATTTGGGGCCACTCTCAGATTTCGAGAA
AGAAGGGTTGGAAACACTGAAGCCAGAGCTCAAGTCTTCCATCGAGAAGGGTATTAAGTT
CGCCAACCAATGAGTTCAACCGATTTTTGACTCGGTTATTTTCCCAATTTTCCGGTTATA
TTATCGCCCTTCATTAGGGTTTCATCAATAAAATCCATGTGGTTTAAGGCTTTTTGGGTT
CATTCCCAAAGCACAGAGATAAGACTGTACCTTGTCAAACATATAGGTTTCTTCCTTTCG
GAACAATGATACTTCTGTCATAATCAGATCACAAGTGTGCTTGATTCGTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1BI39TF U 39
AF RS1BL15TF U 1
AF RS1BL15JQ C 139
AF RS1BI39JQ C 327
BS 1 521 RS1BL15TF
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RD RS1BI39TF 311 0 0
G
GCCATCGCCAAGTACTGCCCTCATGCGCTTGTTAATATGATCAGCAACCCAGTGAACTTT
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CCACTCTTCTCTCAGGCTACTCCTCAAGCCAACTTGTCGGGTGATGTACTCACCGCTCTC
ACCAAGCGTA

QA 2 311 2 311
DS 

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CATGCGCTTGTTAATATGATCAGCAACCCAGTGAACTCTACTGTTCCAATTGCGGCTGAG
GTATTCAAGAAGGCTGGTATGTACGATGAGAAGAAGTTGTTTGGTGTCACCACTCTTGAC
GTTGTTAGGGCCAAGACTTTCTACGCGGGAAAGGCTAATGTCCCTGTTGCAGAAGTGAAT
GTTCCTGTGATTGGTGGTCATGCTGGGGTTACTATTCTCCCACTCTTCTCTCAGGCTACT
CCTCAAGCCAACTTGTCGGGTGATGTACTCACCGCTCTCACCAAGCGTACCCAAGATGGA
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GCTGGAGCACTGTTCGCTGATGCATGCTTGAAAGGACTTAACGGAGTTCCAGATGTTGTG
GAATGCTCATACGTGCAGTCCACAATCACCGAGCTTCCTTTCTTCGCCTCAAAGGTGAGG
TTGGGGAAGAACGGCGTGGAGGAGGTTCTTTGATTTGGGGCCACTCTCAGATTTCGAGA

QA 1 599 1 599
DS 

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TTCTACGCGGGAAAGGCTAATGTCCCTGTTGCAGAAGTGAATGTTCCTGTGATTGGTGGT
CATGCTGGGGTTACTATTCTCCCACTCTTCTCTCAGGCTACTCCTCAAGCCAACTTGTCG
GGTGATGTACTCACCGCTCTCACCAAGCGTACCCAAGATGGAGGTACTGAAGTCGTTGAG
GCAAAAGCAGGAAAAGGTTCAGCTACATTGTCAATGGCATATGCTGGAGCACTGTTCGCT
GATGCATGCTTGAAAGGACTTAACGGAGTTCCAGATGTTGTGGAATGCTCATACGTGCAG
TCCACAATCACCGAGCTTCCTTTTTTCGCCTCAAAGGTGAGGTTGGGGAAGAACGGCGTG
GAGGAGGTTCTT*GATTTGGGGCCACTCTCAGATTTCGAGAAAGAAGGGTTGGAAGCACT
GAAGCCAGAGCTCAAGTCTTCCATCGAGAAGGGTATTAAGTTCGCCAACCAATGAGTTCA
ACCGATTTTTGACTCGGTTATTTTCCCAATTTTCCGGTTATATTATCGCCCTTCATTAGG
GTTTCATCAATAAAATCCATGTGTTTTAAGGCTTTTTGGGTTCATTCCCAAAGCACAGAG
ATAAGACTGTACCTTGTCAAACATGTAGGTTTCTTCCTTTCGGAACAATGATACTTCTGT
CATAATCAGATCACAAGTGTGCTTGATTCGTCGC

QA 1 754 1 754
DS 

RD RS1BI39JQ 564 0 0
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AGGAAAAGGTTCAGCTACATTGTCAATGGCATATGCTGGAGCACTGTTCGCTGATGCATG
CTTGAAAGGACTTAACGGAGTTCCAGATGTTGTGGAATGCTCATACGTGCAGTCCACAAT
CACCGAGCTTCCTTTTTTCGCCTCAAAGGTGAGGTTGGGGAAGAACGGCGTGGAGGAGGT
TCTT*GATTTGGGGCCACTCTCAGATTTCGAGAAAGAAGGGTTGGAAACACTGAAGCCAG
AGCTCAAGTCTTCCATCGAGAAGGGTATTAAGTTCGCCAACCAATGAGTTCAACCGATTT
TTGACTCGGTTATTTTCCCAATTTTCCGGTTATATTATCGCCCTTCATTAGGGTTTCATC
AATAAAATCCATGTGGTTTAAGGCTTTTTGGGTTCATTCCCAAAGCACAGAGATAAGACT
GTACCTTGTCAAACATATAGGTTTCTTCCTTTCGGAACAATGATACTTCTGTCATAATCA
GATCACAAGTGTGCTTGATTCG
CC

QA 1 562 1 562
DS 



AS 1 4

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AAAGCCAAAACAAAAACAAAACTCGGGTCTTTCAATAATCAAAACGATAACAAGTGCTCT
TTCAAGGCAAACCCGAACCAGATGGTGCTGATGCGTTGTAACCGCCTGCACCACGGCCAA
ATCCAGGCCTACCACCACCACCTCCTTGGAAAGAAGGCTGGTAATCAGCTGGAGCTCCAC
CCTTTTCACCTCCTGCATCACCACAACGTGGCCCTGCACGGTACCCATCACGGTCACCAA
ATCTGGGACGGTCTCCCTCAAAGCGAGGTCCTCTTGGACGATCACCGGGTGGGCCACCAA
AGGGACGACCAATGGGCTTAGCAGACTTCTTCAAAGTCGCGGGAACAACATCCGATGGGA
GGTTAAGGTAAGTTCTCAAGAACTCAATCCCTTCGTTGGTCAGAAACCAATAGTAGTGCA
TCCAAGCGAACGTCTCCCTAACGTACTCCTTGGACTTGAAACTCTGCATGAGCTTGATCA
CTTGCAGGTTGGGCACTGACTCAATCAACGGATGCTTTGGGAGATTGAAATCCTTCTTAG
CGAACAATACTCCTTCTTTGAAAAGGTACTTGCAGATCTCTCTGCGGTTGGTCTCTGTGA
TAATCATCTTGTTGTTGGTTGAGCTTTAACTGCAAAGAGACGCACAAAGCTTCTTCTTTC
TATGGTCAAAAGAGGCACAAAGCTATAGCACTGTCC


BQ
10 10 10 10 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 0 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E007JQ U 1
AF RS1C120JQ U 5
AF RS1C120TF C 3
AF RS1E007TF C 170
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RD RS1E007JQ 589 0 0
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QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1C120JQ 592 0 0
CG
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GACGGTCTCCCTCAAAGCGAGGTCCTCTTGGGCGATCACCGGGTGGGCCACCAAAGGGAC
GACCAATGGGCTTAGCAAACTTCTTCAAAGTCGCGGGAACAACGTCCGATGGGAGGTTAA
GGTAAGTTCTCAAGAACTCAATCCCTTCGTTGGTCAGAAACCAATAGTAGTGCATCCAAG
CGAACGTCTCCCTGACGTACTCCTTGGACTTGAAACTCTGCATGAGCTTGATCACTTGCA
GGTTGGGCACTGACTCAATCAACGGATGCTTTGGGAGATTGAA
ATCCTTC

QA 3 585 3 585
DS 

RD RS1C120TF 754 0 0
TT
CGGAGAAATAGATAGAT*ATAGATTCTGA*****TTGCGTTACACAAACAAAAACTAAAG
CCAAAACAAAAACAAAACTCGGGTCTTTCAATAATCAAAACGATAACAAGTGCTCTTTCA
AGGCAAACCCGAACCAGATGGTGCTGATGCGTTGTAACCGCCTGCACCACGGCCAAATCC
AGGCCTACCACCACCACCTCCTTGGAAAGACGGCTGGTAATCAGCTGGAGCTCCACCCTT
TTCACCTCCTGCATCACCACCACGTGGCCCTGCACGGTACCCATCACGGTCACCAAATCT
GGGACGGTCTCCCTCAAAGCGAGGTCCTCTTGGGCGATCACCGGGTGGGCCACCAAAGGG
ACGACCAATGGGCTTAGCAGACTTCTTCAAAGTCGCGGGAACAACGTCCGATGGGAGGTT
AAGGTAAGTTCTCAAGAACTCAATCCCTTCGTTGGTCAGAAACCAATAGTAGTGCATCCA
AGCGAACGTCTCCCTGACGTACTCCTTGGACTTGAAACTCTGCATGAGCTTGATCACTTG
CAGGTTGGGCACTGACTCAATCAACGGATGCTTTGGGAGATTGAAATCCTTCTTCGCGAA
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CATCTTGT***TGGTTGAGCTTTAACTGCAAA*AGAGGCACAAAGCTTCTTCTTTCTATG
GTCAAAAGAGGCACAAAGCTATAGCACTGTCC

QA 3 754 3 754
DS 

RD RS1E007TF 571 0 0
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TGGAGCTCCACCCTTTTCACCTCCTGCATCACCACAACGTGGCCCTGCACGGTACCCATC
ACGGTCACCAAATCTGGGACGGTCTCCCTCAAAGCGAGGTCCTCTTGGACGATCACCGGG
TGGGCCACCAAAGGGACGACCAATGGGCTTAGCAGACTTCTTCAAAGTCGCGGGAACAAC
ATCCGATGGGAGGTTAAGGTAAGTTCTCAAGAACTCAATCCCTTCGTTGGTGAGAAACCA
ATAGTAGTGCATCCAAGCGAACGTCTCCCTAACGTACTCCTTGGACTTGAAACTCTGCAT
GAGCTTGATCACTTGCAGGTTGGGCACTGACTCAATCAACGGATGCTTTGGGAGATTGAA
ATCCTTCTTAGCGAACAATACTCCTTCTTTGAAAAGGTACTTGCAGATCTCTCTGCGGTT
GGTCTCTGTGATAATCATCTTGTTGTTGGTTGAGCTTTCACTGCAAAGAGGCGCACAGAG
TTTCTTCTTTCTATGGTCAAAAGAGGCAC
CC

QA 1 569 1 569
DS 



AS 2 4

CO CL2426Contig1 798 2 5 U
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TATTCTCAATAATAGAAAATTAAAAACCCCCCTCATAAAATCTTATTAGATTACAAATAT
TTTGGCAAGAGACATCATTCTTCCCAATGTTTGGTTGACTCATTCAAGCAAGCGCTTCTG
CTTCCACCACCCGATGGCACCAACATAAAGGACTATACTCCCGATAAAACCTCCAATTAC
AGTCCACGCGAATCTCATCGGACCAGCTTTATCATCATTGAACAGCTCTATGTTAATGTT
CATCCCGAACACTCCAGCTACAGCGATAAATGCACTCATCACCAGAGTCGCTGTCGTTAG
CATCACACCCATTTGCAGCAAATGATTCTGTTTGTCATCTAGCATTATGTTGATGTAGTC
CTCTGTGTCATCCACGTACTCCCTTAGTGTTGATAGTTTGTTCAGTGTACCATCAATCTG
CACGAAATATGCTTCCAAAAGCATTTCAAGCTCTTCCACGTCGAACTTGTTGGTCATGGC
ACTCCTGGTTGAGCTTGTATGAGTCCCACGGCTGTTTCTGCTAAGTGCGCTATGAGCACC
CATGAGAAGATCTTGGGCGTCATCATCTGCTCGAAGATAGCTTTCATCTCTGTTAGACTC
CAAAGCAAACTCCGCAGGAATCCTGTCATCCTCATCTCCTTCAGGAAGATCAACCTCGAC
CGTATCACTCTCATTCATAGAGGAAGCTGACGAATTCTCAAGTTTCTGAGCTATTTCTCT
GTAGATACATCTCAGCCA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DD76JQ U 81
AF RS1CL16JQ U 1
BS 1 112 RS1CL16JQ
BS 113 113 RS1DD76JQ
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BS 600 600 RS1DD76JQ
BS 601 798 RS1CL16JQ

RD RS1DD76JQ 678 0 0
TAAAAACCCCCCTCATAAAATCTTATTAGATTACAAATATTTTGGCAAGAGACATCATTC
TTCCCAATGTTTGGTTGACTCATTCAAGCAAGCGCTTCTGCTTCCACCACCCGATGGCAC
CAACATAAAGGACTATACTCCCGATAAAACCTCCAATTACAGTCCACGCGAATCTCATCG
GACCAGCTTTATCATCATTGAACAGCTCTATGTTAATGTTCATCCCGAACACTCCAGCTA
CAGCGATAAATGCACTCATCACCAGAGTCGCTGTCGTTAGCATCACACCCATTTGCAGCA
GATGATTCTGTTTGTCATCTAGCATTATGTTGATGTAGTCCTCTGTGTCATCCACGTACT
CCCTTAGTGTTGATAGTTTGTTCAGTGTACCATCAATCTGCACGAAATATGCTTCCAAAA
GCATTTCAAGCTCTTCCACGTCGAACTTGTTGGTCATGGCACTCCTGGTTGAGCTTGTAT
GAGTCCCACGGCTGTTTCTGCTAAGTGCGCTATGAGCACCCATGAGAAGATCTTGGGCGT
CATCATCTGCTCGAAGATAGCTTTCATCTCTGTTAGACTCCAAAGCAAACTCCGCAGGAA
TCCTGTCGTCCTCATCTCCTTCAGGAAGATCAACCTCGACCGTATCACTCTCATTCATAG
AGGAAGCTGACGAATTCT

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1CL16JQ 798 0 0
ATGTAAATCATGTAATTTCCAATTTGCTCTGTTTTACAATTTAACTATGCAAAGGGACAT
TATTCTCAATAATAGAAAATTAAAAACCCCCCTCATAAAATCTTATTAGATTGCAAATAT
TTTGGCAAGAGACATCATTCTTCCCAATGTTTGGTTGACTCATTCAAGCAAGCGCTTCTG
CTTCCACCACCCGATGGCACCAACATAAAGGACTATACTCCCGATAAAACCTCCAATTAC
AGTCCACGCGAATCTCATCGGACCAGCTTTATCATCATTGAACAGCTCTATGTTAATGTT
CATCCCGAACACTCCAGCTACAGCGATAAATGCACTCATCACCAGAGTCGCTGTCGTTAG
CATCACACCCATTTGCAGCAAATGATTCTGTTTGTCATCTAGCATTATGTTGATGTAGTC
CTCTGTGTCATCCACGTACTCCCTTAGTGTTGATAGTTTGTTCAGTGTACCATCAATCTG
CACGAAATATGCTTCCAAAAGCATTTCAAGCTCTTCCACGTCGAACTTGTTGGTCATGGC
ACTCCTGGTTGAGCTTGTATGAGTCCCACGGCTGTTTCTGCTAAGTGCGCTATGAGCACT
CATGAGAAGATCTTGGGCGTCATCATCTGCTCGAAGATAGCTTTCATCTCTGTTAGACTC
CAAAGCAAACTCCGCAGGAATCCTGTCATCCTCATCTCCTTCAGGAAGATCAACCTCGAC
CGTATCACTCTCATTCATAGAGGAAGCTGACGAATTCTCAAGTTTCTGAGCTATTTCTCT
GTAGATACATCTCAGCCA

QA 1 798 1 798
DS 



CO CL2426Contig2 705 2 4 U
GCCGGCGCGAGATCTTCGGATCCTCGATCCGCTCCTGTCGTACCCGTCGACGGTCCTGGG
GAGAGAGAGGGCGATCGTGATCAATCTGGAGCATATCAAGGCGATCATCACGGCTCAGGA
GGTTCTGCTGCTCAACTCGAAGGATCCTTCCGTGGCGCCGTTTATCGATGAGTTGCAGAG
GCGGATTCTTTGTCACTATCGCGCCACTAAGCCTAAGGAGGAAGAGAACTATGAGGGAGA
GACTCGGATGAGTATGGATCAAGCGCAAGGAGGAGGAGGTGCTGGAACGCCACTATTGTT
TGGGGATGAAGCTAAGAAGGATGCGAAGCAAAGCCTTGAGAATCAAGATGGATCCAAGGT
TCTTCCTTTTGAGTTTGTTGCTCTTGAAGCTTGTCTTGAAGCTGCTTCCAGCAGTTTGGA
AAGTGAGGCTGTAAGATTGGAGTTAGAAGCTCATCCGGCCTTGGATAAGCTTACTTCGAA
GATCAGTACCCTCAATTTGGAGCGGGTTCGACAGATTAAGAGCAGGCTTGTTGCAATAAC
TGGACGTGTTCAGAAGGTAAGGGACGAACTAGAACATCTGCTAGACGATGATGAAGATAT
GGCTGAGATGTATCTTACAGAGAAATTAGCTCAGAAACTTGAGAATTCGTCAGCTTCCTC
TATGAATGAGAGTGATACGGTCGAGGTTGATCTTCCTGAAAGAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CL16TF U 1
AF RS1DD76TF U 93
BS 1 281 RS1CL16TF
BS 282 282 RS1DD76TF
BS 283 675 RS1CL16TF
BS 676 705 RS1DD76TF

RD RS1CL16TF 675 0 0
GCCGGCGCGAGATCTTCGGATCCTCGATCCGCTCCTGTCGTACCCGTCGACGGTCCTGGG
GAGAGAGAGGGCGATCGTGATCAATCTGGAGCATATCAAGGCGATCATCACGGCTCAGGA
GGTTCTGCTGCTCAACTCGAAGGATCCTTCCGTGGCGCCGTTTATCGATGAGTTGCAGAG
GCGGATTCTTTGTCACTATCGCGCCACTAAGCCTAAGGAGGAAGAGAACTATGAGGGAGA
GACTCGGATGAGTATGGATCAAGCGCAAGGAGGAGGAGGTGTTGGAACGCCACTATTGTT
TGGGGATGAAGCTAAGAAGGATGCGAAGCAAAGCCTTGAGAATCAAGATGGATCCAAGGT
TCTTCCTTTTGAGTTTGTTGCTCTTGAAGCTTGTCTTGAAGCTGCTTCCAGCAGTTTGGA
AAGTGAGGCTGTAAGATTGGAGTTAGAAGCTCATCCGGCCTTGGATAAGCTTACTTCGAA
GATCAGTACCCTCAATTTGGAGCGGGTTCGACAGATTAAGAGCAGGCTTGTTGCAATAAC
TGGACGTGTTCAGAAGGTAAGGGACGAACTAGAACATCTGCTAGACGATGATGAAGATAT
GGCTGAGATGTATCTTACAGAGAAATTAGCTCAGAAACTTGAGAATTCGTCAGCTTCCTC
TATGAATGAGAGTGA

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1DD76TF 613 0 0
G
TATCAAGGCGATCATCACGGCTCAGGAGGTTCTGCTGCTCAACTCGAAGGATCCTTCCGT
GGCGCCGTTTATCGATGAGTTGCAGAGGCGGATTCTTTGTCACTATCGCGCCACTAAGCC
TAAGGAGGAAGAGAACTATGAGGGAGAGACTCGGATGAGTATGGATCAAGCGCAAGGAGG
AGGAGGTGCTGGAACGCCACTATTGTTTGGGGATGAAGCTAAGAAGGATGCGAAGCAAAG
CCTTGAGAATCAAGATGGATCCAAGGTTCTTCCTTTTGAGTTTGTTGCTCTTGAAGCTTG
TCTTGAAGCTGCTTCCAGCAGTTTGGAAAGTGAGGCTGTATGATTGGAGTTAGAAGCTCA
TCCGGCCTTGGATAAGCTTACTTCGAAGATCAGTACCCTCAATTTGGAGCGGGTTCGACA
GATTAAGAGCAGGCTTGTTGCAATAACTGGACGTGTTCAGAAGGTAAGGGACGAACTAGG
ACATCTGCTAGACGATGATGAAGATATGGCTGAGATGTATCTTACAGAGAAATTAGCTCA
GAAACTTGAGAATTCGTCAGCTTCCTCTATGAATGAGAGTGATACGGTCGAGGTTGATCT
TCCTGAAAGAGA

QA 2 613 2 613
DS 



AS 1 4

CO CL2427Contig1 529 4 28 U
AAAAATAATGCCAAAAATAGTCTCATACCTCACAATTTCTCTCATTATGCGGGGAAAGCA
AGGATAAATTAACAAAAATACAAAAGAATCGACCCCATGAAAAAAAAAACGAGAAACAAG
CTTAAAAAAATAAAATTAAAACGAACAAAATATTTGAATATAAAGTCCCCTATATATATA
TAATTAAAAGAAAATTAAAAACCATGATCAAGCATATATCCTCATCTTGTTAATCACTTT
GAAAACATCATCCACATCATAGTCGTCGTCATCTTTGACCTTCTCTACACACCGCTCATT
ATCTTCCTGAAAACTGCCGTCGCCTCCACCACATCCTCCTCTGATGTCTACAGCACCAGA
CTCGACTCTCATGTAGAAAGTGCACAAAAGAAGTGTTAAGAGGCAACATATGATAAATTC
TCTGGATGCAGCCATAGATCAGACACTTTGTCTAAATCAAATTATAATAGACTAACCGAA
CTGCTTAAAAAGCTTTGGTTCTTTCTTTACTGTCTTATTTTTTTTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 0 30 30 30 30 30 0 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1H545JQB U 1
AF RS1H545TF C 1
AF RS1DE47TF C 7
AF RS1DE47JQ U 16
BS 1 85 RS1H545JQB
BS 86 86 RS1DE47JQ
BS 87 90 RS1H545JQB
BS 91 91 RS1DE47JQ
BS 92 108 RS1H545JQB
BS 109 109 RS1DE47JQ
BS 110 112 RS1H545JQB
BS 113 113 RS1DE47JQ
BS 114 180 RS1H545JQB
BS 181 182 RS1DE47JQ
BS 183 189 RS1H545JQB
BS 190 190 RS1DE47JQ
BS 191 321 RS1H545JQB
BS 322 322 RS1DE47JQ
BS 323 327 RS1H545JQB
BS 328 358 RS1DE47JQ
BS 359 359 RS1H545TF
BS 360 375 RS1DE47JQ
BS 376 376 RS1H545TF
BS 377 389 RS1DE47JQ
BS 390 390 RS1H545TF
BS 391 399 RS1DE47JQ
BS 400 400 RS1H545TF
BS 401 441 RS1DE47JQ
BS 442 442 RS1H545TF
BS 443 469 RS1DE47JQ
BS 470 470 RS1H545TF
BS 471 529 RS1DE47JQ

RD RS1H545JQB 330 0 0
AAAAATAATGCCAAAAATAGTCTCATACCTCACAATTTCTCTCATTATGCGGGGAAAGCA
AGGATAAATTAACAAAAATACAAAAAAATCCACCCCATGAAAAAAAAA*CGAAAAACAAG
CTTAAAAAAATAAAATTAAAACGAACAAAATATTTGAATATAAAGTCCCCTATATATATA
**ATTAAAAAAAAATTAAAAACCATGATCAAGCATATATCCTCATCTTGTTAATCACTTT
GAAAACATCATCCACATCATAGTCGTCGTCATCTTTGACCTTCTCTACACACCGCTCATT
ATCTTCCTGAAAACTGCCGTCCCCTCC
CCC

QA 1 327 1 327
DS 

RD RS1H545TF 491 0 0
AAAAAT
AATGCCAAAAATAGTCTCATACCTCACAATTTCTCTCATTATGCGGGGAAAGCAAGGATA
AATTAACAAAAATACAAAAGAATCGACCCCATGAAAAAAAAA*CGAGAAACAAGCTTAAG
AAAATAAAATTAAAACGAACAAAATATTTGAATATAAAGTCCCCTATATATATA**ATTA
AGAGAAAATTAAGAACCATGATCAAGCATATATCCTCATCTTGTTAATCACTTTGAAAAC
ATCATCCACATCATAGTCGTCGTCATCTTTGACCTTCTCTACACACCGCTCATTATCTTC
CTGAAAACTGCCGTCGCCTCCACCACATCCTCCTCTGATGTCTACAGCACCAGACTCGAC
TCTCATGTAGAAAGTGCACAAAAGAAGTGTTAAGAGGCAACATATGATAAATTCTCTGGA
TGCAGCCATAGATCAGACACTTTGTCTAAATCAAATTATAATAGACTAACCGAACTGCTT
AAAAA

QA 7 491 7 491
DS 

RD RS1DE47TF 523 0 0
AATGCCAAAAATAGTCTCATACCTCACAATTTCTCTCATTATGCGGGGAAAGCAAGGATA
AATTAACAAAAATACAAAAGAATCGACCCCATGAAAAAAAAAACGAGAAACAAGCTTAAG
AAAATAAAATTAAAACGAACAAAATATTTGAATATAAAGTCCCCTATATATATATAATTA
AGAGAAAATTAAGAACCATGATCAAGCATATATCCTCATCTTGTTAATCACTTTGAAAAC
ATCATCCACATCATCGTCGTCGTCATCTTTGACCTTCTCTACACACCGCTCATTATCTTC
CTGAAAACTGCCGTCGCCTCCACCACATCCTCCTCTGATGTCTACAGCACCAGACTCGAC
TCTCATGTAGAAAGTGCACAAAAGAAGTGTTAAGAGGCAACATATGATAAATTCTCTGGA
TGCAGCCATAGATCAGACACTTTGTCTAAATCAAATTATAATAGACTAACCGAACTGCTT
AAAAAGCTTTGGTTCTTTCTTTACTGTCTTATTTTTTTTATCC

QA 1 523 1 523
DS 

RD RS1DE47JQ 514 0 0
AATAGTCTCATACCTCACAATTTCTCTCATTATGCGGGGAAAGCAAGGATAAATTAACAA
AAATACAAAAGAATCGACCCCATGAAAAAAAAAACGAGAAACAAGCTTAAAAAAATAAAA
TTAAAACGAACAAAATATTTGAATATAAAGTCCCCTATATATATATAATTAAAAGAAAAT
TAAAAACCATGATCAAGCATATATCCTCATCTTGTTAATCACTTTGAAAACATCATCCAC
ATCATCGTCGTCGTCATCTTTGACCTTCTCTACACACCGCTCATTATCTTCCTGAAAACT
GCCGTCGCCTCCACCACATCCTCCTCTGATGTCTACAGCACCAAACTCGACTCTCATGTA
AAAAGTGCACAAAAAAAGTGTTAAAAGGCAACATATGATAAATTCTCTGGATGCAGCCAT
AGATCAAACACTTTGTCTAAATCAAATTATAATAAACTAACCGAACTGCTTAAAAAGCTT
TGGTTCTTTCTTTACTGTCTTATTTTTTTTATCC

QA 1 514 1 514
DS 



AS 1 4

CO CL2428Contig1 662 4 8 U
GGGGGCAAGGTAGAGAGAGAGAGAGACGACGCCATGGTTAAGTTTCTGAAGCAGAACAAA
GCTGTGATCCTCCTCCAAGGTCGTTACGCCGGCAAGAAGGCAGTGATCATCCGTTCCTTC
GACGACGGCAACCGCGAGCGTCCCTACGGACACTGTCTCGTCGCCGGGCTCAAGAAGTAT
CCGAGCAAGCTCATCCGCAAGGACTCGGCCAAGAAGACGGCGAAGAAGTCGAGAGTCAAG
TGTTTCATCAAGGTCGTGAACTACCAGCATCTGATGCCTACTCGTTACACGTTGGACGTG
GATCTGAAGGAGGTTGCGACTCTCGAGGCTCTGTCTTCGAAGGATAAGAAGGTGGCGGCT
CTTAAGGAAGCTAAGGCTAAGCTCGAGGAGAGGTTCAAGACCGGTAAGAACAGGTGGTTC
TTCACCAAGCTCAGGTTTTGAGAAATGAGTTTTCTTTTTTTATCTTCTGTAATGGAATTT
ACGGATTACTTTTGTAGTTCTAAAATGGTGATGTGGATCGTGTTTAAGACTTGTTGGTTT
GAAAGATTTTGCCTTTTTTTAACATTTATCATCATTTGCTTAGCTTGAATTTTCAAGATT
TACAGTGCTGGATTGGTAGTGAAATGTGCTTGTCTGAATTTGTGTTTCATTGCCAAAACA
AG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 

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AF RS1G725JQ C 475
AF RS1AA11TF U 3
AF RS1AA11JQ C 275
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BS 647 662 RS1AA11JQ

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GAAAGATTTTGCCTTTTTTTAACATTTATCATCATTTGCTTAGCTTGAATTTTCAAGATT
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CC

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DS 

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AAGATTTACAG

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DS 

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GGAAGGTAG
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CCTCCAAGGTCGTTACGCCGGCAAGAAGGCAGTGATCATCCGTTCCTTCGACGACGGCAA
CCGCGAGCGTCCCTACGGACACTGTCTCGTCGCCGGGCTCAAGAAGTATCCGAGCAAGCT
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CAGGTTTTGAGAAATGAGTTTTCTTTTTTTATCTTCTGTAATGGAATTTACGGATTACTT
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CCTTTTTTTAACATTTATCATCATTTGCTTAGCTTGAATTTTCAATATTTACAG
T

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CTTCGAAGGATAAGAAGGTGGCGGCTCTTAAGGAAGCTAAGGCTAAGCTCGAGGAGAGGT
TCAAGACCGGTAAGAACAGGTGGTTCTTCACCAAGCTCAGGTTTTGAGAAATGAGTTTTC
TTTTTTTATCTTCTGTAATGGAATTTACGGATTACTTTTGTAGTTCTAAAATGGTGATGT
GGATCGTGTTTAAGACTTGTTGGTTTGAAAGATTTTGCCTTTTTTTAACATTTATCATCA
TTTGCTTAGCTTGAATTTTCAATATTTACAGTGCTGGATTGGTAGTGAAATGTGCTTGTC
TGAATTTGTGTTTCATTGCCAAAACAAG

QA 1 388 1 388
DS 



AS 1 4

CO CL2429Contig1 1420 4 7 U
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TTAGTTTAAACCATTATTTGTTACATACTTGTCCTCATGGATGTTAATCGAGAGGATAAC
ACTTCAACAAGCTAAGAACTACACAACAAAGTTGTTCACTAATTCATTTCCAAAGGATAA
GGCACAGAGGCAATATGGTTATGAGCTACTGTTCCAATCCAAAGCTTCCCTTGAACCTCC
CTAACTTCACTTACAAGCTTCATTACCTTTCCTTGTCTATCCTCAAGAACCTCCAAGACC
TCACCGTCCTCGTTAAATCTTGATATCACAGTGTACATCCTCATCCCCATGGCTTTAGCC
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AGAACCTCTTGTGCCGGTGTTCTACAACAGTCTATTGCAACCCAAAACTCACCCTTCTCG
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CATTTCTATGGATGTCAAGATCGTTGGCAAAGAGTATAGGCTTTCCTTCCACATGGGTAG
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CAATGTACAAGTTCCCTGTCTCTTTATCAAACCTCAGACCAAGAGGTCTCCCACACAGCT
TCTCATGCTTCCACTGCTTGTTTGTTGTTGAATCCACACCTCTTGCGCAAGCCTCCTCTG
ACCATTTTGATGTTACAACGGAGAATGTCTCCCATCCGGTTGCTTCACCCATCCATCTAA
CCACCCTTCCAGCTTCCCATGCTGACCTAGTTGACTAAGGTTGTCTCTTGGCCAGTTCTC
CATGACTTGCTTGTATGGAGCGACCTCATGCTTCACAGGCTTGAACTCACGTCCGCCAAT
AGGACTCATGTGAAAGGGGTCTATCGCTATGAATATTGCAGACAAAGCAAGGATACAGAG
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TTGAAAGCAAGATCAGATTCACCTGGTCAATGTATATACAGCTTATATAAGAAAAAACTA
AAGAAAGTAAAAGTGTGGTTGTGGAGAAGTTGTGAAATCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CW54JQ U 1
AF RS1G293TF C 12
AF RS1AO33JQ U 56
AF RS1AO33TFB C 615
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BS 222 222 RS1AO33JQ
BS 223 392 RS1CW54JQ
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BS 394 595 RS1CW54JQ
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TTAGTTTAAACCATTATTTGTTACATACTTGTCCTCATGGATGTTAATCGAGAGGATAAC
ACTTCAACAAGCTAAGAACTACACAACAAAGTTGTTCACTAATTCATTTCCAAAGGATAA
GGCACAGAGGCAATATGGTTATGAGCTACTGTTCCAATCCAGAGCTTCCCTTGAACCTCC
CTAACTTCACTTACAAGCTTCATTACCTTTCCTTGTCTATCCTCAAGAACCTCCAAGACC
TCACCGTCCTCGTTAAATCTTGATATCACAGTGTACATCCTCATCCCCATGGCTTTAGCC
AGCAGCTTCATCGGTATGGGAAGTCTAAAGTAAATGCTCTTTATCCAAGGGTTGTTTGTA
AGAACCTCTTGTGCCGGTGTTCTACAACAGTCTATTGCAACCCAAAACTCACCCTTCTCG
TTCATTCTTACATTGTCTGGAAACCCTGGTAAATCAGCTACCACCTCCACAACACTAGTC
TTTGGACCCTCCAGCCAGTATTTCACTAACCTGCAATTGGTTGTTTCTGTGAAGA

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CATTATTTGTTACATACTTGTCCTCATGGATGTTAATCGAGAGGATAACACTTCAACAAG
CTAAGAACTACACAACAAAGTTGTTCACTAATTCATTTCCAAAGGATAAGGCACAGAGGC
AATATGGTTATGAGCTACTGTTCCAATCCAAAGCTTCCCTTGAACCTCCCTAACTTCACT
TACAAGCTTCATTACCTTTCCTTGTCTATCCTCAAGAACCTCCAAGACCTCACCGTCCTC
GTTAAATCTTGATATCACAGTGTACATCCTCATCCCCATGGCTTTAGCCAGCAGCTTCAT
CGGTATGGGAAGTCTAAAGTAGATGCTCTTTATCCAAGGGTTGTTTGTAAGAACCTCTTG
TGCCGGTGTTCTACAACAGTCTATTGCAACCCAAAACTCACCCTTCTCGTTCATTCTTAC
ATTGTCTGGAAACCCTGGTAAATCAGCTACCACCTCCACAACACTAGTCTTTGGACCCTC
CAGCCAGTATTTCACTAACCTGCAATTGGTTGTTTCTGTGAAGA
GAAGC

QA 1 584 1 584
DS 

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ATGATTTAGTTTAAACCATTATTTGTTACATACTTGTCCTCATGGATGTTAATCGAGAGG
ATAACACTTCAACAAGCTAAGAACTACACAACAAAGTTGTTCACTAATTCATTTCCAAAG
GATAAGGCACAGAGGCAATATGGTTATGAGCTACTGTTCCAATCCAAAGCTTCCCTTGAA
CCTCCCTAACTTCACTTACAAGCTTCATTACCTTTCCTTGTCTATCCTCAAGAACCTCCA
AGACCTCACCGTCCTCGTTAAATCTTGATATCACAGTGTACATCCTCATCCCCATGGCTT
TAGCCAGCAGCTTCATCGGTATGGGAAGTCTAAAGTAGATGCTCTTTATCCAAGGGTTGT
TTGTAAGAACCTCTTGTGCCGGTGTTCTACAACAGTCTATTGCAACCCAAAACTCACCCT
TCTCGTTCATTCTTACATTGTCTGGAAACCCTGGTAAATCAGCTACCACCTCCACAACAC
TAGTCTTTGGACCCTCCAGCCAGTATTTAACTAACCTGCAATTGGTTGTTTCTGTGAAGA
GAAGGAAAGATTGGTCTCTAGAGAGCTGAATGCCATTGGGAAAAGCCAAACCATCAAGCA
CAACGTGTGTTGTTTT

QA 1 616 1 616
DS 

RD RS1AO33TFB 806 0 0
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AGGTGGGTCATATCTTAGAAGCTCCCAGTTGATTCTCGTTCAAGCAATATGAAGAAATGA
TTCGCTCTGTCATATCTTGTGCTTGTGTCAGTGAAGAAGATTGAGCCATTTCTATGGATG
TCAAGATCGTTGGCAAAGAGTATAGGCTTTCCTTCCACATGGGTAGCTAAAGGTGTGGCA
ATCCCTCCTTCAGGACCAACCACTAGTAGACCATAGTAAGCGTCTGCAATGTACAAGTTC
CCTGTCTCTTTATCAAACCTCAGACCAAGAGGTCTCCCACACAGCTTCTCATGCTTCCAC
TGCTTGTTTGTTGTTGAATCCACACCTCTTGCGCAAGCCTCCTCTGACCATTTTGATGTT
ACAACGGAGAATGTCTCCCATCCGGTTGCTTCACCCATCCATCTAACCACCCTTCCAGCT
TCCCATGCTGACCTAGTTGACTAAGGTTGTCTCTTGGCCAGTTCTCCATGACTTGCTTGT
ATGGAGCGACCTCATGCTTCACAGGCTTGAACTCACGTCCGCCAATAGGACTCATGTGAA
AGGGGTCTATCGCTATGAATATTGCAGACAAAGCAAGGATACAGAGAACAGGGTGATGTG
TCAAAAAGGAATCATGTGTACTATTCTTCTGGCTTTTCTTCTCCATTTGAAAGCAAGATC
AGATTCACCTGGTCAATGTATATACAGCTTATATAAGAAAAAACTAAAGAAAGTAAAAGT
GTGGTTGTGGAGAAGTTGTGAAATCC

QA 1 806 1 806
DS 



AS 1 4

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ACGAAGACGGCTAACATGAAAGAGGTAACTACAAGCAGAAACAGGAAGAGGAAGAGACAA
CGAAATAGTAAAGAAGAGCCTTGCGAGTCACCCAAGAATAAAAACAACGACAAAAAAATG
CAAAGAGATACCAAAAACGATGGAGGATCTTCAGCTCTGTCGAAACGACCTAAACCTTCC
AACTTTCTCGACACGCTTCGAGAGAAACTATCAGGTGGGAACTTCAGGAGGCTCAATGAG
AAGCTCTACACTTGCTCTGGAAAAGAAGCTTTAGACTATTTTAATGAAGATCCAACCTTG
TTTGATATGTATCATACAGGTTATCAGCAACAAATGACAAACTGGCCTGAGCTTCCTGTT
AACTCCATTATCAATTGGTTATCGTCTAAAAGCCCTTCTTTAGTTGTCGCTGATTTTGGC
TGTGGTGATACAAGGATTGCAAAGAGTGTGAAGAACAAAGTTTTCTCCTTTGATCTTGTC
TCAAAGGACCCATCTGTTATTGTCTGCGATATGTCTAATACTCCACTTGAGTCTTCATCA
GTAGATGTTGCTGTTTTCTGTCTTTCATTAATGGGAACAAACTATTCTAGTTTCATCAAA
GAGGCACATCGTGTTCTTCGTCCAAGTGGTTGGCTTCTTATAGCGGAAGTCAAAAGCAGG
TTTGATCCAAACAATGGAGGCGCAGATCCAAAAGACTTTGTGAAAGCAGTTTTTGACCTT
GGATTTACCTCGTCTTTAAAGGACTTCTCGAACAAGATGTTCATCTTACTGCATTTTAAG
ATGAAGGAGAAGCCGAATTCAAATAAGAAGAAAATCGAGTGGCCTGAGTTGAAAGCATGT
TTATATAAACGTCGATGATGGGTTTATATGCTGCAAGATCACACACACTAAGAGTATGTT
TCAGTCACTTTTTGCTGGGTTTATATGATGGAGGGTCACACTAAGAGTGTCTCTCCAATG
TTGTTATTATCTAGACATTAGTGTTTCACCGTTCTTTATGAAGTTTTGTAAGAGTGAATC
AGTCACATTGGTCTTTGAATTAAAAATGTTTTAGAATTTTGTTAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1AQ13TFB U 1
AF RS1DY67TF U 7
AF RS1AQ13JQ C 396
AF RS1FC51JQ C 933
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BS 656 1066 RS1AQ13JQ

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AACTTTCTCGACACGCTTCGAGAGAAACTATCAGGTGGGAACTTCAGGAGGCTCAATGAG
AAGCTCTACACTTGCTCTGGAAAAGAAGCTTTAGACTATTTTAATGAAGATCCAACCTTG
TTTGATATGTATCATACAGGTTATCAGCAACAAATGACAAGCTGGCCTGAGCTTCCTGTT
AACTCCATTATCAATTGGTTATCGTCTAAAAGCTCTTCTTTAGTTGTCGCTGATTTTGGC
TGTGGTGATACAAGGATTGCAAAGAGTGTGAAGAACAAAGTTTTCTCCTTTGATCTTGTC
TCAAAGGACCCATCTGTTATTGTCTGCGATATGTCTAATACTCCACTTGAGTCTTCATCA
GTAGATGTTGCTGTTTTCTGTCTTTCATTAATGGGAACAAACTATTCTAGTTTCATCAAA
GAGGCACATCGTGTTCTTCGTCCAAGTGGTTGGCTTCTTATAGCGGAAGTCAAAA

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1DY67TF 607 0 0
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AGTAAATAAGAGCCTTGCGAGTCACCCAAGAATCAAAACAACGACAAAAAACTGCAAAGA
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CTCGACACGCTTCGAGAGAAACTATCAGGTGGGAACTTCAGGAGGCTCAATGAGAAGCTC
TACACTTGCTCTGGAAAAGAAGCTTTAGACTATTTTAATGAAGATCCAACCTTGTTTGAT
ATGTATCATACAGGTTATCAGTAACAAATGACAAACTGGCCTGAGCTTCCTGTTAACTCC
ATTATCAATTGGTTATCGTCTAAAAGCCCTTCTTTAGTTGTCGCTGATTTTGGCTGTGGT
GATGCAAGGATTGCAAAGAGTGTGAAGAACAAAGTTTTCTCCTTTGATCTTGTCTCAAAG
GACCCATCTGTTATTGCCTGCGATATGTCTAATACTCCACTTGAGTCTTCATCAGTAGAT
GTTGCTGTTTTCTGTCTTTCATTAATGGGAACAAACTATTCTAGTTTCATCAAAGAGGCA
CATCGTG

QA 1 607 1 607
DS 

RD RS1AQ13JQ 671 0 0
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CAAAGTTTTCTCCTTTGATCTTGTCTCAAAGGACCCATCTGTTATTGTTTGCGATATGTT
TAATACTCCACTTGAGTCTTCATCAGTAGATGTTGCTGTTTTCTGTCTTTCATTAATGGG
AACAAACTATTCTAGTTTCATCAAAGAGGCACATCGTGTTTTTCGTCCAAGTGGTTGGCT
TTTTATAGCGGAAGTCAAAAGCAGGTTTGATCCAAACAATGGAGGCGCAGATCCAAAAGA
CTTTGTGAAAGCAGTTTTTGACCTTGGATTTACCTCGTCTTTAAAGGACTTCTCGAACAA
GATGTTCATCTTACTGCATTTTAAGATGAAGGAGAAGCCGAATTCAAATAAGAAGAAAAT
CGAGTGGCCTGAGTTGAAAGCATGTTTATATAAACGTCGATGATGGGTTTATATGCTGCA
AGATCACACACACTAAGAGTATGTTTCAGTCACTTTTTGCTGGGTTTATATGATGGAGGG
TCACACTAAGAGTGTCTCTCCAATGTTGTTATTATCTAGACATTAGTGTTTCACCGTTCT
TTATGAAGTTTTGTAAGAGTGAATCAGTCACATTGGTCTTTGAATTAAAAATGTTTTAGA
ATTTTGTTAAG

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1FC51JQ 131 0 0
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TCTTTATGAAGTTTTGTAAGAGTGAATCAGTCACATTGGTCTTTGAATTAAAAATGTTTT
AGAATTTTGTT

QA 1 131 1 131
DS 



AS 1 4

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ACACAATTATACTACTAGACTTCAAACGAAATACATCAAACTCTAGTTAATAATAACATT
ACATGAGTGAATAATAAGGTGGTTTTAAAAAAAGTAAAACGCAAAGAAAAATAAGTACCG
CTTGAAATTGAAACATAGACAAGAAACGAAAAACAAGAGCTTCTTCAACGACTGATGATA
ACCTGGAAACAATTTCACCACATGTTTTGAGATTTTGGAGCTCTACGTCGAGAGCCACCA
TGACGACGTCTGCAGGTTTGAGATTTACGAGCTCTAAGTGGACGTAAATGATTATCAAGC
AGACGAAAACCCGTCCGGCATGCCTTCCTCATACGTTTGATATTTGGAGAACCTTTTACC
TGTCGCAATTGCTCTCGATGCTCTCGATCGTACTGGGCTAAGAGAGATAGATGCCTATTC
TTCATTTTTAATTGAACAAACGCAGTAATACTACACTCTTCTTGCAAATGTTCTTCAGTT
GAGAGATGCGTTCTTAAATTGTCAAGGCATTTGTAATCAGGGCCTTTGCCATCACGGCAC
AATTTGCAATAAAACATTGCGCTAGATCCACCACCCCTATCACTTTCACTACTGCATTTC
TGAGGAACGTGTTTCCTTTCCTCTGAAACTTCAAGTAAGCTATGCCATAGCCACTCGGCA
GAAGGGAGCAGGACTAACATTTGGTAAGGCCTAGACGAATAAGCCAGAAAAAGGTTGTGT
TTCTGCATTTGTACTAGGTCGGCAACGGCAGTTGAGAAGGCCTGATGTGCATCTGTATCA
GATATGACCATAATATTAGTCGGAGTAGGATTAGGTTCTTGCTCATCCAGCAAATCTTGA
TACATGCGCTTGTATGTGACATCGCGAACGGCATGTGTAAGACTGACTCCAGTGGAAGCG
AG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1AD61JQ U 1
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AF RS1A339TR U 17
AF RS1A339JQ U 17
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BS 80 89 RS1AD61JQ
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BS 181 603 RS1AD61JQ
BS 604 604 RS1A339JQ
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BS 697 707 RS1AD61JQ
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RD RS1AD61JQ 707 0 0
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ACATGAGTGAATAATAAGATGGTTTTAAACAAAGTAAAACGCAAAGAAAAATAAGTACCG
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DS 

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G
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G
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G
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ATGCTCTCGATCGTACTGGGCTAAGAGAGATAGATGCCTATTCTTCATTTTTAATTGAAC
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ATTGTCAAGGCATTTGTAATCAGGGCCTTTGCCATCACGGCACAATTTGCAATAAAACAT
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TTCCTCTGAAACTTCAAGTAAGCTATGCCATAGCCACTCGGCAGAAGGGAGCAGGACTAA
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QA 2 886 2 886
DS 



AS 1 2

CO CL2432Contig1 902 2 6 U
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GG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RS1F932TF U 1
AF RS1F932JQ C 313
BS 1 631 RS1F932TF
BS 632 632 RS1F932JQ
BS 633 725 RS1F932TF
BS 726 726 RS1F932JQ
BS 727 780 RS1F932TF
BS 781 902 RS1F932JQ

RD RS1F932TF 780 0 0
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TGCAA*TGTGTAAATATGGTTAGAAGTGTGCTTTTATGTTAACGAGAGATAGAGATTGTG

QA 1 780 1 780
DS 

RD RS1F932JQ 590 0 0
G
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CTTTTGGTGACAAACCCTGTTGAGTTATCAGGAAAAGGACGGCCACAAGTTTTCCACGAC
ATTGCACTTGCACTCAAGAAGATCAACACCTGCATTTTTTCGGCTGAGATTGGAAGACAC
CCTGACGGGAGACAGAGAATGGGAGGTGTACAAAGTGTTGATCAATGAAGAAGACAGCTT
ACCGGTCTCCAGAAGGAAGATAGAGGAACAAGTGTGGAGTACTTTGATGGGCTGGGAGTG
AAGCTTTAAGAAACTCAGGACCATTAGCTGACCTTCAGACACATAGCAAAAGAGTATATG
ACTGTAAGATTGTGAATTAATGATAAAACCGGATTTTTTATAACGTTTGCAAATGTGTAA
ATATGGTTAGAAGTGTGCTTTTATGTTAACGAGAGATAGAGATTGTGTAAGTTTTGTAAA
TGAGAGCGTGGTTCTGTAGAAAGGAGAAGCTAAGCCAAGTCTTTGTACTTTGTATTGTTG
TGCTGAGAGATCTTTGTCATATATATATAAAGGAAAATGGTCTTTGAGG

QA 2 590 2 590
DS 



AS 1 3

CO CL2433Contig1 724 3 15 U
CGGGACAATTATTCTTCATCCAAACTCCAAAGGTTTTATTTTTTTGGATCAAACACAACA
AAGACGGTGCTCATTTATTGTTATCCACAGGAAACTAGAAACAGAGAAGGGTACACGACG
GCATACATGTCGGTCCGGTTTTGGTTACAACCCGGTTTAACAGTTACTTTCACACATTCA
AAGGCTCACCACAGCACACGAAAAGGCATTTATGCAAGAAGCTCTACGGTGATTCTTAGC
CCCTCCACTGATCCTTCTTGTTCCTGATTTCTCTGAGAGTATCGATCGGTGATTTGCAAC
CAAGTTTCTCCTGTATCTCAGGGTTATTAACGCGCATAAACGGGTTTGTTTCGAGTTCTT
CCTCTAGCGTTGAAGGGATTGTGGGAAGATTTGCTTGGCGCTGTTGACGGGCCCATGATA
GCTTCTGCTGTATCTTCTCGTTGTTTGGTTCCACAGTCAAAGCAAACTCCAAGTT*TTCA
CCGTGTACTCGTGGCCGCAGTAAACCTGGGTGGGTTTAGGTAGTGAAGCCAGAGTCACAC
AAAAGGACTGATGCATCTGTTCAGCTGTCCCTTCGAAAAACTCCCCACAGCCAGCAACGA
AAAGTGTATCTCCAGTGAACACGGCTGGACTTTCTCCATCTTTGCCAGTGACATAGTAAC
TAATGTGACCCTTGGTGTGACAAGGGGTGTGAAGAGCTAAGATGTTGAGATCATGACCCA
AAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 

AF RS1H069JQB U 46
AF RS1H069TF C 64
AF RS1ER76JQ U 1
BS 1 105 RS1ER76JQ
BS 106 106 RS1H069JQB
BS 107 133 RS1ER76JQ
BS 134 134 RS1H069JQB
BS 135 276 RS1ER76JQ
BS 277 277 RS1H069JQB
BS 278 475 RS1ER76JQ
BS 476 476 RS1H069JQB
BS 477 541 RS1ER76JQ
BS 542 542 RS1H069JQB
BS 543 559 RS1ER76JQ
BS 560 560 RS1H069JQB
BS 561 582 RS1ER76JQ
BS 583 583 RS1H069JQB
BS 584 724 RS1ER76JQ

RD RS1H069JQB 649 0 0
GGATCAAACACAACAAAGACGGTGCTCATTTATTGTTATCCACAGGAAACTAGAAACAGA
GAAGGGTACACGACGGCATACATGTCGGTCCGGTTTTGGTTACAACCCGGTTTAACAGTT
ACTTTCACACATTCAAAGGCTCACCACAGCACACAAAAAGGCATTTATGCAAGAAGCTCT
ACGGTGATTCTTAGCCCCTCCACTGATCCTTCTTGTTCCTGATTTCTCTGAGAGTATCGA
TCGGTGATTTGCAACCAAGTTTCTCCTGTATCTCAAGGTTATTAACGCGCATAAACGGGT
TTGTTTCGAGTTCTTCCTCTAGCGTTGAAGGGATTGTGGGAAGATTTGCTTGGCGCTGTT
GACGGGCCCATGATAGCTTCTGCTGTATCTTCTCGTTGTTTGGTTCCACAGTCAAAGCAA
ACTCCAAGTT*TTCACCGTGTACTCGTGGCCGCAGTAAACCTGGGTGGGTTTAGGTAGTG
AAGCCAGAGTCACACAAAAGGACTGATGCATCTGTTCAGCTGTCCCTTCGAAAAACTCCC
CACAGCCAGCAACGAAAAGTGTATCTCCAGTGAACACGGCTGGACTTTCTCCATCTTTGC
CAGTGACATAATAACTAATGTGACCCTTGGTGTGACAAGGGGTGTGAAG

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1H069TF 655 0 0
ACGGTGCTCATTTATTGTTATCCACAGGAAACTAGAAACAGAGAAGGGTACACGACGGCA
TACATGTCGGTCCGGTTTTGGTTACAACCCGGTTTAACAGTTACTTTCACACATTCAAAG
GCTCACCACAGCACACGAAAAGGCATTTATGCAAGAAGCTCTACGGTGATTCTTAGCCCC
TCCACTGATCCTTCTTGTTCCTGATTTCTCTGAGAGTATCGATCGGTGATTTGCAACCAA
GTTTCTCCTGTATCTCAGGGTTATTAACGCGCATAAACGGGTTTGTTTCGAGTTCTTCCT
CTAGCGTTGAAGGGATTGTGGGAAGATTTGCTTGGCGCTGTTGACGGGCCCATGATAGCT
TCTGCTGTATCTTCTCGTTGTTTGGTTCCACAGTCAAAGCAAACTCCAAGTT*TTCACCG
TGTACTCGTGGCCGCAGTAAACCTGGGTGGGTTTAGGTAGTGAAGCCAGAGTCACACAAA
AGGACTGATGCATCTGTTCAGCTGTCCCTTCGAAAAACTCCCCACAGCCAGCAACGAAAA
GTGTATCTCCAGTGAACACGGCTGGACTTTCTCCATCTTTGCCAGTGACATAGTAACTAA
TGTGACCCTTGGTGTGACAAGGGGTGTGAAGAGCTAAGATGTTGAGATCATGACC

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1ER76JQ 724 0 0
CGGGACAATTATTCTTCATCCAAACTCCAAAGGTTTTATTTTTTTGGATCAAACACAACA
AAGACGGTGCTCATTTATTGTTATCCACAGGAAACTAGAAACAGAAAAGGGTACACGACG
GCATACATGTCGGCCCGGTTTTGGTTACAACCCGGTTTAACAGTTACTTTCACACATTCA
AAGGCTCACCACAGCACACGAAAAGGCATTTATGCAAGAAGCTCTACGGTGATTCTTAGC
CCCTCCACTGATCCTTCTTGTTCCTGATTTCTCTGAAAGTATCGATCGGTGATTTGCAAC
CAAGTTTCTCCTGTATCTCAGGGTTATTAACGCGCATAAACGGGTTTGTTTCGAGTTCTT
CCTCTAGCGTTGAAGGGATTGTGGGAAGATTTGCTTGGCGCTGTTGACGGGCCCATGATA
GCTTCTGCTGTATCTTCTCGTTGTTTGGTTCCACAGTCAAAGCAAACTCCAAGTTCTTCA
CCGTGTACTCGTGGCCGCAGTAAACCTGGGTGGGTTTAGGTAGTGAAGCCAGAGTCACAC
ACAAGGACTGATGCATCTGCTCAGCTGTCCCTTCGAAAAACTTCCCACAGCCAGCAACGA
AAAGTGTATCTCCAGTGAACACGGCTGGACTTTCTCCATCTTTGCCAGTGACATAGTAAC
TAATGTGACCCTTGGTGTGACAAGGGGTGTGAAGAGCTAAGATGTTGAGATCATGACCCA
AAGA

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 3

CO CL2434Contig1 1435 3 5 U
GGTATCTCAGCTAAAATCTGCTTTGGTAGTGGCTGAAGAGGAGGAGAAAGATTCGGCTAG
AAAGATGCAGGAGTACCAAGATTCAAGAACTTCAAGGACATCTAAATGCTGAGAAGGAAA
CCGCGGCAAGACAGGGTGAAGAAGCAGCCAAAAGGTTTGAAGTGATAGACATAGAAGCTA
AAGACATGCTTGCAAAGTTAAGAGCCCAAGAAGACCTGCTCAAGGAACATAGAAGGGAGA
TTCAGGAAGCATCTGAAGTTGCTAATACTAGAAAAATGAAGCTTGAAGAGTCTCTGTTGA
AGCTCAAGAATTTTGAAGATACAATCAAAGAGCTTGAGAAAGAAAATGGATCATTGGCTG
AGGTGAATTTAAAGCTGAACCAGGAACTAGCTAATCATGGATCAGAGACCAGCGATTTTC
AAGCGATGTTCTCTGCTTTAGAAGCTGAGAAAGACCAAGCAGCAAAAGAGCTTCATGCTT
CAAAGGCATCCATTAAAGAGTTAAGAAACAAGCTCACTTCTGAAAGAGAAAGATTAAGAT
CAAAGATGAGTTCTCTTGCAGAAGAGAATAACCAAGTCAATGAGATATACCAGAGCACAA
AGAGTGAGCTTGTAAAGCTTCAAGAACAACTTGAGGTAGAGAAGTCTAAAGTGGATACTA
TGGTATCAGAAATCAAGAAGCTCAGTGCTATGGCTGCTGAGAAGTCAGTCATGGAGACCA
ACCTTGAAGAAGTAGAAAAACAATTGAAAACTGCTGAAGCTAAGTTGAAAGAAGAGGTCG
AAAAGGTTGCAGAACTGACCTCACAACTGCATGAACATGAGACTAAGGCGAGTGACAGTG
ACTTGGTGAACAAGAAAGCAACTCAGCTGTATAAAGAGCTTCAAGCATCTCACACAGTCA
TTTCTGTAGAGGAAGAAGCGGTTTCTCAGAAGCATTCTGAGTTGGAAGCTATTCTAAAGA
AAGCACAAGAAGATCTTGAAGCTAAGACAAGTACGATCGTTCATCTCGAATCACAATTGA
AAGATCTTGAAAAGAAAGTGCAGCTTGCTGATGCTAAGTCTAAGGAAACCGAGACAAAGG
CAAAAGAAGAAGTAGAAGTTAAATCAAGAGACATTGATTTATCCTTCACAACTCAAAAGC
AACGTTCTCCTTCACATTCGTCTTCTTCAGGAAACGTTAAAACAACTCAGAAAGCTGAAA
CATCTCATCTCATGACATTGAAGATCGTCCTTGGAGTGGCTATCTTGTCTGTCATTATAG
GTATCCTTCTTGGGAAAAACTATTGAAGTTCTTCAATGGTGTGATTGTTTTTTCAACGTT
CTTTTCTATTTGTTTGCCAAGCAAGGCCAAATGCTGTGTTATGTAACACAAGAATCTGAT
CGACTGTTTAGATGGTTCATCTACATTCTTATATAAACCATCTAAATTGTGTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GF71TF U 1
AF RS1GW38TF U 137
AF RS1GW38JQ C 682
BS 1 739 RS1GF71TF
BS 740 740 RS1GW38TF
BS 741 772 RS1GF71TF
BS 773 776 RS1GW38TF
BS 777 1435 RS1GW38JQ

RD RS1GF71TF 772 0 0
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AAAGATGCAGGAGTACCAAGATTCAAGAACTTCAAGGACATCTAAATGCTGAGAAGGAAA
CCGCGGCAAGACAGGGTGAAGAAGCAGCCAAAAGGTTTGAAGTGATAGACATAGAAGCTA
AAGACATGCTTGCAAAGTTAAGAGCCCAAGAAGACCTGCTCAAGGAACATAGAAGGGAGA
TTCAGGAAGCATCTGAAGTTGCTAATACTAGAAAAATGAAGCTTGAAGAGTCTCTGTTGA
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AAGCGATGTTCTCTGCTTTAGAAGCTGAGAAAGACCAAGCAGCAAAAGAGCTTCATGCTT
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CAAAGATGAGTTCTCTTGCAGAAGAGAATAACCAAGTCAATGAGATATACCAGAGCACAA
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ACCTTGAAGAAGTAGAAAA*CAATTGAAAACTGCTGAAGCTAAGTTGAAAGA

QA 1 772 1 772
DS 

RD RS1GW38TF 644 0 0
G
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TTAAGAGCCCAAGAAGACCTGCTCAAGGAACATAGAAGGGAGATTCAGGAAGCATCTGAA
GTTGCTAATACTAGAAAAATGAAGCTTGAAGAGTCTCTGTTGAAGCTCAAGAATTTTGAA
GATACAATCAAAGAGCTTGAGAAAGAAAATGGATCATTGGCTGAGGTGAATTTAAAGCTG
AAC*AGGAACTAGCTAATCATGGATCAGAGACCAGCGATTTTCAAGCGATGTTCTCTGCT
TTAGAAGCTGAGAAAGACCAAGCAGCAAAAGAGCTTCATGCTTCAAAGGCATCCATTAAA
GAGTTAAGAAACAAGCTCACTTCTGAAAGAGAAAGATTAAGATCAAAGATGAGTTCTCTT
GCAGAAGAGAATAACCAAGTCAATGAGATATACCAGAGCACAAAGAGTGAGCTTGTAAAG
CTTCAAGAACAACTTGAGGTAGAGAAGTCTAAAGTGGATACTATGGTATCAGAAATCAAG
AAGCTCAGTGCTATGGCTGCTGAGAAGTCAGTCATGGAGACCAACCTTGAAGAAGTAGAA
AAACAATTGAAAACTGCTGAAGCTAAGTTGAAAGAAGAG
TCGA

QA 2 640 2 640
DS 

RD RS1GW38JQ 754 0 0
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AATTGAAAACTGCTGAAGCTAAGTTGAAAGAAGAGGTCGAAAAGGTTGCAGAACTGACCT
CACAACTGCATGAACATGAGACTAAGGCGAGTGACAGTGACTTGGTGAACAAGAAAGCAA
CTCAGCTGTATAAAGAGCTTCAAGCATCTCACACAGTCATTTCTGTAGAGGAAGAAGCGG
TTTCTCAGAAGCATTCTGAGTTGGAAGCTATTCTAAAGAAAGCACAAGAAGATCTTGAAG
CTAAGACAAGTACGATCGTTCATCTCGAATCACAATTGAAAGATCTTGAAAAGAAAGTGC
AGCTTGCTGATGCTAAGTCTAAGGAAACCGAGACAAAGGCAAAAGAAGAAGTAGAAGTTA
AATCAAGAGACATTGATTTATCCTTCACAACTCAAAAGCAACGTTCTCCTTCACATTCGT
CTTCTTCAGGAAACGTTAAAACAACTCAGAAAGCTGAAACATCTCATCTCATGACATTGA
AGATCGTCCTTGGAGTGGCTATCTTGTCTGTCATTATAGGTATCCTTCTTGGGAAAAACT
ATTGAAGTTCTTCAATGGTGTGATTGTTTTTTCAACGTTCTTTTCTATTTGTTTGCCAAG
CAAGGCCAAATGCTGTGTTATGTAACACAAGAATCTGATCGACTGTTTAGATGGTTCATC
TACATTCTTATATAAACCATCTAAATTGTGTGCG

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 4

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GCCGTCGCACAAGTCGTTTATGATCAAGAAGAAGCTGGCCAAGAAGCAGAGGCAGAACAG
GCCTATTCCTCACTGGATTCGTCTTCGTACCGACAACACCATCAGGTACAATGCCAAGCG
CAGGCACTGGCGTAGAACCAAGCTCGGATTCTAAGTGAAAAGCTTCCTCCAAAAGAGTTT
ATCTTTTCTGTTTGTTTTAGCATTTGCTCACGTTTTATGGATTTACGGTGTGACATTTTC
ATTTCTCTGTATGACTTTTGTCTCGTTATGTTTGATACCAAATTTCTATCTATAAAATGC
ACTTCGTAGC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RS1DD56TF U 48
AF RS1DL03TF U 1
AF RS1EC59TF U 1
AF RS1GH79TF U 1
BS 1 370 RS1DL03TF

RD RS1DD56TF 303 0 0
GG
GACGTCAAGATGCCGTCGCACAAGTCGTTTATGATCAAGAAGAAGCTGGCCAAGAAGCAG
AGGCAGAACAGGCCTATTCCTCACTGGATTCGTCTTCGTACCGACAACACCATCAGGTAC
AATGCCAAGCGCAGGCACTGGCGTAGAACCAAGCTCGGATTCTAAGTGAAAAGCTTCCTC
CAAAAGAGTTTATCTTTTCTGTTTGTTTTAGCATTTGCTCACGTTTTATGGATTTACGGC
GTGACATTTTCATTTCTCTGTATGACTTTTGTCTCGTTATGTTTGATACCAAATT
TCTATC

QA 3 297 3 297
DS 

RD RS1DL03TF 370 0 0
GGGCAGTAGTTCTACTCATTTAGCTTCGCTTCGCAGCTGCAATTCGCACGACGTCAAGAT
GCCGTCGCACAAGTCGTTTATGATCAAGAAGAAGCTGGCCAAGAAGCAGAGGCAGAACAG
GCCTATTCCTCACTGGATTCGTCTTCGTACCGACAACACCATCAGGTACAATGCCAAGCG
CAGGCACTGGCGTAGAACCAAGCTCGGATTCTAAGTGAAAAGCTTCCTCCAAAAGAGTTT
ATCTTTTCTGTTTGTTTTAGCATTTGCTCACGTTTTATGGATTTACGGTGTGACATTTTC
ATTTCTCTGTATGACTTTTGTCTCGTTATGTTTGATACCAAATTTCTATCTATAAAATGC
ACTTCGTAGC

QA 1 370 1 370
DS 

RD RS1EC59TF 370 0 0
T
GGCAGTAGTTCTACTCATTTAGCTTCGCTTCGCAGCTGCAATTCGCACGACGTCAAGATG
CCGTCGCACAAGTCGTTTATGATCAAGAAGAGGCTGGCCAAGAAGCAGAGGCAGAACAGG
CCTATTCCTCACTGGATTCGTCTTCGTACCGACAACACCATCAGGTACAATGCCAAGCGC
AGGCACTGGCGTAGAACCTAGCTCGGATTCTAAGTGAAAAGCTTCCTCCAAAAGAGTTTA
TCTTTTCTGTTTGTTTTAGCATTTGCTCACGTTTTATGGATTTACGGTGTGACATTTTCA
TTTCTCTGTATGACTTTTGTCTCGTTATGTTTGATACCAAATT*CTATCTATAAAATGCA
CTTCGT
AGC

QA 2 367 2 367
DS 

RD RS1GH79TF 367 0 0
G
GGCAGTAGTTCTACTCATTTAGCTTCGCTTCGCAGCTGCAATTCGCACGACGTCAAGATG
CCGTCGCACAAGTCGTTTATGATCAAGAAGAAGCTGGCCAAGAAGCAGAGGCAGAACAGG
CCTATTCCTCACTGGATTCGTCTTCGTACCGACAACACCATCAGGTACAATGCCAAGCGC
AGGCACTGGCGTAGAACCAAGCTCGGATTCTAAGTGAAAAGCTTCCTCCAAAAGAGTTTA
TCTTTTCTGTTTGTTTTAGCATTTGCTCACGTTTTATGGATTTATGGTGTGACATTTTCA
TTTCTCTGTATGACTTTTGTCTCGTTATACTTGATACCAAATTTCTATCTATAAAATGCA
CTTCGT

QA 2 367 2 367
DS 



AS 1 4

CO CL2436Contig1 729 4 13 U
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CGGGCGGGTGTGAAACTTTTTGGCGGGAAAATGTCGGGGAAAGGAGCGAAAGGATTGATA
ATGGGGAAACCTAGCGGTAGCGACAAGGACAAGGACAAGAAGAAACAACCCATCACCCGC
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TATCTGACCGCAGAAGTTCTGGAGTTGGCTGGTAACGCCAGCAAGGATCTCAAGGTGAAA
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ATCAAAGGTACTATTGCTGGTGGTGGTGTCATCCCTCACATCCACAAGTCTCTTATCAAC
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TATTACGAGAGTCTGTGTGTGTGTGTTTGATCAAGACGCTAGAGAGAGCCTCTTTTGTTA
GGAATCTCGTTTGTTATTCTTCCATCAGCCTGCCTCTACTTTGATTCCTGTCGAGTTATC
TATCTTTAATGCATATGTATTCAGTGATTATCTAAACACCCATATTTCTGACTACCTTCT
GGTTTGTTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G815TF U 1
AF RS1D591JQ C 104
AF RS1D591TF U 27
AF RS1DK30TF U 1
BS 1 46 RS1DK30TF
BS 47 50 RS1G815TF
BS 51 253 RS1DK30TF
BS 254 254 RS1G815TF
BS 255 260 RS1DK30TF
BS 261 261 RS1G815TF
BS 262 298 RS1DK30TF
BS 299 299 RS1D591TF
BS 300 559 RS1DK30TF
BS 560 560 RS1D591TF
BS 561 585 RS1DK30TF
BS 586 586 RS1G815TF
BS 587 729 RS1DK30TF

RD RS1G815TF 643 0 0
TTTTTCTTCCTCGTCTCTCTTCTGGTGCGATCTATCTCTCTCTCTCTCTCTAACTGCGCG
CGGGCGGGTGTGAAACTTTTTGGCGGGAAAATGTCGGGGAAAGGAGCGAAAGGATTGATA
ATGGGGAAACCTAGCGGTAGCGACAAGGACAAGGACAAGAAGAAACAACCCATCACCCGC
TCTGCTCGAGCTGGTCTTCAGTTCCCAGTAGGTAGGGTGCATCGACTATTGAAGACAAGG
TCCACTGCTCACGGAAGGGTTGGTGCAACCGCAGCGGTTTACACAGCAGCCATACTCGAG
TATCTGACCGCAGAAGTTCTGGAGTTGGCTGGTAACGCCAGCAAGGATCTCAAGGTGAAA
CGTATCTCCCCAAGGCACTTGCAGCTCGCCATCCGTGGAGATGAGGAGCTTGATACCCTC
ATCAAAGGTACTATTGCTGGTGGTGGTGTCATCCCTCACATCCACAAGTCTCTTATCAAC
AAATCCGCCAAGGAATAGATTTCTTCTTGCTTTTGCTTCTCATGTTTCTTTCTTTTTAAG
TATTACGAGAGTCTGTGTG**TGTGTTTGATCAAGACGCTAGAGAGAGCCTCTTTTGTTA
GGAATCTCGTTTGTTATTCTTCCATCAGCCTGCCTCTACTTTG

QA 1 643 1 643
DS 

RD RS1D591JQ 608 0 0
GAGCGAAAGGATTGATAATGGGGAAACCTAGCGGTAGCGACAAGGACAAGGACAAGAAGA
AACAACCCATCACCCGCTCTGCTCGAGCTGGTCTTCAGTTCCCAGTAGGTAGGGTGCATC
GACTATTGAAGACAAGGTCCACTGCTCACGGAAGGGTTGGTGCAACCGCAGCGGTTTACA
CAGCAGCCATACTCGGGTATCTGACCGCAGAAGTTCTGGAGTTGGCTGGTAACGCCAGCA
AGGATCTCAAGGTGAAACGTATCTCCCCAAGGCACTTGCAGCTCGCCATCCGTGGAGATG
AGGAGCTTGATACCCTCATCAAAGGTACTATTGCTGGTGGTGGTGTCATCCCTCACATCC
ACAAGTCTCTTATCAACAAATCCGCCAAGGAATAGATTTCTTCTTGCTTTTGCTTCTCAT
GTTTCTTTCTTTTTAAGTATTACGAGAGTCTGTGTGTGTGTGTTTGATCAAGACGCTAGA
GAGAGCCTCTTTTGTTAGGAATCTCGTTTGTTATTCTTCCATCAGCCTGCCTCTACTTTG
ATTCCTGTCGAGTTATCTATCTTTAATGCATATGTATTCAGTGATTATCTAAACACCCAT
ATTTCTGA

QA 1 608 1 608
DS 

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GGGATCTATCCC
TCTCTCTCTCTCTAACTGCGCGCGGGCGGGTGTGAAACTTTTTGGCGGGAAAATGTCGGG
GAAAGGAGCGAAAGGATTGATAATGGGGAAACCTAGCGGTAGCGACAAGGACAAGGACAA
GAAGAAACAACCCATCACCCGCTCTGCTCGAGCTGGTCTTCAGTTCCCAGTAGGTAGGGT
GCATCGACTATTGAAGACAAGGTCCACTGCTCACGGAAGGGTTGGTGCAACCGCAGCGGT
TTACACAGCAGCCATACTCGGGTATCTGACCGCAGAAGTTCTGGAGTTGGCTGGTAACGC
CAGCAAGGATCTCAAGGTGAAACGTATCTCCCCAAGGCACTTGCAGCTCGCCATCCGTGG
AGATGAGGAGCTTGATACCCTCATCAAAGGTACTATTGCTGGTGGTGGTGTCATCCCTCA
CATCCACAAGTCTCTTATCAACAAATCCGCCAAGGAATAGATTTCTTCTTGCTTTTGCTT
CTCATGTTTCTTTCTTTTTAAGTATTACGAGAGTCTGTGTGTGTGTGTTTGATCAAGACG
CTAGAGAGAGCCTCTTTTGTTAGGAATCTCGTTTGTTATTCTTCCATCAGCCTGCCTCTA
CTTTGATTCCTGTCGAGTTATCTATCTTTAATGCATATGTATTCAGT

QA 13 659 13 659
DS 

RD RS1DK30TF 729 0 0
TTTTTCTTCCTCGTCTCTCTTCTGGTGCGATCTATCTCTCTCTCTC****TAACTGCGCG
CGGGCGGGTGTGAAACTTTTTGGCGGGAAAATGTCGGGGAAAGGAGCGAAAGGATTGATA
ATGGGGAAACCTAGCGGTAGCGACAAGGACAAGGACAAGAAGAAACAACCCATCACCCGC
TCTGCTCGAGCTGGTCTTCAGTTCCCAGTAGGTAGGGTGCATCGACTATTGAAGACAAGG
TCCACTGCTCACGTAAGGGTGGGTGCAACCGCAGCGGTTTACACAGCAGCCATACTCGAG
TATCTGACCGCAGAAGTTCTGGAGTTGGCTGGTAACGCCAGCAAGGATCTCAAGGTGAAA
CGTATCTCCCCAAGGCACTTGCAGCTCGCCATCCGTGGAGATGAGGAGCTTGATACCCTC
ATCAAAGGTACTATTGCTGGTGGTGGTGTCATCCCTCACATCCACAAGTCTCTTATCAAC
AAATCCGCCAAGGAATAGATTTCTTCTTGCTTTTGCTTCTCATGTTTCTTTCTTTTTAAG
TATTACGAGAGTCTGTGTGCGTGTGTTTGATCAAGACGCTAGAGA*AGCCTCTTTTGTTA
GGAATCTCGTTTGTTATTCTTCCATCAGCCTGCCTCTACTTTGATTCCTGTCGAGTTATC
TATCTTTAATGCATATGTATTCAGTGATTATCTAAACACCCATATTTCTGACTACCTTCT
GGTTTGTTG

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 4

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GTAAAGTATACTCTTCTGTAAACTCAGAAGTCATGCGTCTCAAACTGACAATACAAAGCT
GCCAGAAAAGGTTTAAAGCAAAAACAAAAACCAAACAAACACCTTAGATCCTATCGATAT
CCTCGTCCTCAAAATCAATAACATCATCAGCGCCATTCTCCTCATCATCGTCAAGATCAC
CAGCAATACCTTCGTTGAGACGAGTGTTCTCGGGAAGCTCACCATAGGCCTTGAGAAGCC
TCGCCTCGTCAGACATGTACTCGAGGATGACATCAGCCTTGTCATCCTGGTAGTCTCTCA
GACCGACAAGTATGATATCACCTGCCGCGATCCAAACCTTCTTGTGCATCTTGCCGCGGA
TGTGGCAGAAACGTTTGGTGCCGTCGATGCACACGCACTCGCATCTCCCGTTGCCGAGCA
TGCGAAGGACTTGCGCGTACTCTTGTCCGTCTTCTTTGAATATAAGCTCACGCTTCTCGT
CATCAGCTTCGTTCTTTCCTCTCTTCCTGTTCTTTCCTCCCTTTCCCTTGTTCTTCGGCA
TGGTAACAGCTAAGAAGCGATCTGAGATAAAGCTGAGAAGAAAACCTCTTGGATGAGATG
AGAGATTCGGAGATTCTCTTTGAATTTGGATCAACCCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H260JQB U 1
AF RS1H260TF C 3
AF RS1DO60TF C 17
AF RS1DO60JQ U 25
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BS 263 632 RS1H260JQB
BS 633 638 RS1DO60JQ

RD RS1H260JQB 633 0 0
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GCCAGAAAAGGTTTAAAGCAAAAACAAAAACCAAACAAACACCTTAGATCCTATCGATAT
CCTCGTCCTCAAAATCAATAACATCATCAGCGCCATTCTCCTCATCATCGTCAAGATCAC
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TCGCCTCGTCAGACATGTACTTGAGGATGACATCAGCCTTGTCATCCTGGTAGTCTCTCA
GACCGACAAGTATGATATCACCTGCCGCGATCCAAACCTTCTTGTGCATCTTGCCGCGGA
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TGCGAAGGACTTGCGCGTACTCTTGTCCGTCTTCTTTGAATATAAGCTCACGCTTCTCGT
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TGGTAACAGCTAAGAAGCGATCTGAGATAAAGCTGAGAAGAAAACCTCTTGGATGAGATG
AGAGATTCGGAGATTCTCTTTGAATTTGGATC
C

QA 1 632 1 632
DS 

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TCGTCCTCAAAATCAATAACATCATCAGCGCCATTCTCCTCATCATCGTCAAGATCACCA
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GCCTCGTCAGACATGTACTTGAGGATGACATCAGCCTTGTCATCCTGGTAGTCTCTCAGA
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CGAAGGACTTGCGCGTACTCTTGTCCGTCTTCTTTGAATATAAGCTCACGCTTCTCGTCA
TCAGCTTCGTTCTTTCCTCTCTTCCTGTTCTTTCCTCCCTTTCCCTTGTTCTTCGGCATG
GTAACAGCTAAGAAGCGATCTGAGATAAAGCTGAGAAGAAAACCTCTTGGATGAGATGAG
AGATTCGGAGATTCTCTTTGAATTTGGATC
C

QA 1 630 1 630
DS 

RD RS1DO60TF 622 0 0
TGTAAACTCAGAAGTCATGCGTCTCAAACTGACAATACAAAGCTGCCAGAAAAGGTTTAA
AGCAAAAACAAAAACCAAACAAACACCTTAGATCCTATCGATATCCTCGTCCTCAAAATC
AATAACATCATCAGCGCCATTCTCCTCATCATCGTCAAGATCACCAGCAATGCCTTCGTT
GAGACGAGTGTTCTCGGGAAGCTCACCATAGGCCTTGAGAAGCCTCGCCTCGTCAGACAT
GTACTCGAGGATGACATCAGCCTTGTCATCCTGGTAGTCTCTCAGACCGACAAGTATGAT
ATCACCTGCCGCGATCCAAACCTTCTTGTGCATCTTGCCGCGGATGTGGCAGAGACGTTT
GGTGCCGTCGATGCACATGCACTCGCATCTCCCGTTGCCGAGCATGCGAAGGACTTGCGC
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GCGATCTGAGATAAAGCTGAGAAGAAAACCTCTTGGATGAGATGAGAGATTCGGAGATTC
TCTTTGAATTTGGATC
AACCCC

QA 1 616 1 616
DS 

RD RS1DO60JQ 614 0 0
CAGAAGTCATGCGTCTCAAACTGACAATACAAAGCTGCCAGAAAAGGTTTAAAGCAAAAA
CAAAAACCAAACAAACACCTTAGATCCTATCGATATCCTCGTCCTCAAAATCAATAACAT
CATCAGCGCCATTCTCCTCATCATCGTCAAGATCACCAGCAATGCCTTCGTTGAGACGAG
TGTTCTCGGGAAGCTCACCATAGGCCTTGAGAAGCCTCGCCTCGTCAGACATGTACTCGA
GGATGACATCAGCCTTGTCATCCTGGTAGTCTCTCAGACCGACAAGTATGATATCACCTG
CCGCGATCCAAACCTTCTTGTGCATCTTGCCGCGGATGTGGCAGAAACGTTTGGTGCCGT
CGATGCACATGCACTCGCATCTCCCGTTGCCGAGCATGCGAAGGACTTGCGCGTACTCTT
GTCCGTCTTCTTTGAATATAAGCTCACGCTTCTCGTCATCAGCTTCGTTCTTTCCTCTCT
TCCTGTTCTTTCCTCCCTTTCCCTTGTTCTTCGGCATGGTAACAGCTAAGAAGCGATCTG
AGATAAAGCTGAGAAGAAAACCTCTTGGATGAGATGAGAGATTCGGAGATTCTCTTTGAA
TTTGGATCAACCCC

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 4

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GGGAGAATATTTCTATATTCCATTTCAAGAAACGATAGCCCCCTATAAGAAAATGCCCAT
TCAACGATCCTAAAGTCACTTTCTCTCTACTTTTCATCTCCCCCTCTGTTTCACTGCGTG
TGTGTGTGTGTGATCAAGAAAGAAAATGTTAGCGATATTCGACAAGAACGTGGCGAAAGC
CCCCGAGGCTCTAAAGAGTCAGGAAGGTGGATCTGTTTGTGCCCTTAAAGATGGCTTCTT
ACCAAACCACTTCGCTTCCATCTACCCTGGTGCTGTCACCACCAATCTCGGATCTTCTGG
TCTCATCGCTTGCACTCTCGACAAGCAGAACCCTCTTCTTCCCAGATTGTTTGCTGTGAA
TGATGATATGTTCTGCATCTTCCAAGGACATATAGAGAACATTCCGTTCCTTAAACAGCA
ATATGGACTGACAAAAACAGCAACCGAGGTCACTGTTGTGATCGAAGCCTACAGAGCCCT
CAGAGACCGTGGTCCATACCCTGCCGACCAAGTTGTTAGAGACTTTCAAGGGAGATTTGC
GTTTATGCTCTTTGACTGCACCACCAAGAATGTCTTCCTTGCTGCGGACGCAGATGGTAG
CGTTCCTCTCTTCTGGGGAACTGATGGTGAAGGTCATCTCGTTATCTCTGAGGATGTTGA
AACCGTGAAGAAAGGTTGTGGTAAATCCTTTGCGCCATTCCCTAAAGGGTGCTTCTTTAC
CTCGTCTGGAGGGTTGAGGAGCTTTGAGTTTCCACTGAACGAGCTAAAGCCTGTACCAAG
GGTGGACAGTTCCGGTCAGGTGTGCGGTGCGACTTTCAAAGTGGATTCCGAGGCCAAGAA
AGAAAGCGCAATGCCTCGAGTCGGCAGTGTTCAGAATTGGTCTCAACAAATCTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BV37TF U 1
AF RS1H535TF U 124
AF RS1E584TF U 124
AF RS1E584JQ C 731
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RD RS1BV37TF 670 0 0
GGGAGAATATTTCTATATTCCATTTCAAGAAACGATAGCCCCCTATAAGAAAATGCCCAT
TCAACGATCCTAAAGTCACTTTCTCTCTACTTTTCATCTCCCCCTCTGTTTCACTGCGTG
TGTGTGTGTGTGATCAAGAAAGAAAATGTTAGCGATATTCGACAAGAACGTGGCGAAAGC
CCCCGAGGCTCTAAAGAGTCAGGAAGGTGGATCTGTTTGTGCCCTTAAAGATGGCTTCTT
ACCAAACCACTTCGCTTCCATCTACCCTGGTGCTGTCACCACCAATCTCGGATCTTCTGG
TCTCATCGCTTGCACTCTCGACAAGCAGAACCCTCTTCTTCCCAGATTGTTTGCTGTGAA
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ATATGGACTGACAAAAACAGCAACCGAGGTCACTGTTGTGATCGAAGCCTACAGAGCCCT
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CGTTCCTCTCTTCTGGGGAACTGATGGTGAAAGTCATCTCGTTATCTCTGAGGATGTTGA
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DS 

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GG
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TCGCTTGCACTCTCGACAAGCAGAACCCTCTTCTTCCCAGATTGTTTGCTGTGAATGATG
ATATGTTCTGCATCTTCCAAGGACATATAGAGAACATTCCGTTCCTTAAACAGCAATATG
GACTGACAAAAACAGCAACCGAGGTCACTGTTGTGATCGAAGCCTACAGAGCCCTCAGAG
ACCGTGGTCCATACCCTGCCGACCAAGTTGTTAGAGACTTTCAAGGGAGATTTGCGTTTA
TGCTCTTTGACTGCACCACCAAGAATGTCTTCCTTGCTGCGGACGCAGATGGTAGCGTTC
CTCTCTTCTGGGGAACTGATGGTGAAGGTCATCTCGTTATCTCTGAGGATGTTGAAACCG
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GG
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AGGCTCTAAAGAGTCAGGAAGGTGGATCTGTTTGTGCTCTTAAAGATGGCTTCTTACCAA
ACCACTTCGCTTCCATCTACCCTGGTGCCGTCACCACCAATCTCGGATCTTCTGGTCTCA
TCGCTTGCACTCTCGACAAGCAGAACCCTCTTCTTCCCAGATTGTTTGCTGTGAATGATG
ATATGTTCTGCATCTTCCAAGGACATATAGAGAACATACCGTTCCTTAAACAGCAATATG
GACTGACAAAAACAGCAACCGAGGTCACCGTTGTGATCGAAGCCTACAGAGCCCTCAGAG
ACCGTGGTCCATACCCTGCCGACCAAGTTGTTAGAGACTTTCAAGGGAGATTTGCGTTTA
TGCTCTTTGACTGCACCACCAAGAATGTCTTCCTTGCTGCGGACGCAGATGGTAGCGTTC
CTCTCTTCTGGGGAACTGATGGTGAAGGTCATCTCGTTATCTCTGAAGATGTTGAAACCG
TGAAGAAAGGTTGTGGTAAATCCTTTGCGCCATTCCCTAAAGGGTGCTTCTTTACCTCGT
CTGGAGGGTTGAGGAGCTTTGAGTTTCCACTGAACGAGCTAAAGCCTGTACCAAGGGTGG
ACAGT

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DS 



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TCCGAAAAAAAAAGGTAAAAAAACTAATCATTAATCATCTCTTCGATTTTCGATTCGTCT
AATTCAGATCCCCGATTCTGATCTTGATTCTCATCTCATCCGAGATTTGATCGGCGAGAT
TAATGGACTCGAATCAGACGACGACCACCACGAGCTCTAGCTCCGATCTCTCTCACCGTA
AGCGCAAGAAGAAATCTTCACCGTCTCCGCCTCCTCCATCGTTGCAGAAATGGAGATCGG
AGAAGCAGCAACAGATCTACTCGACGAAGCTCGTCCAAGCTCTCCGCGAGCTTCGAATCA
GCCAACCTTCTTCACCATCCAACCCTTGCAACGGCAGAGCCGTGCGCGAAGTCGCCGACA
GGGCCTTGGCCGTGTCGGCGAGAGGCAAAACGCTCTGGAGCCGAGCGATTCTATCCAAAG
CCGTCAAACTCAAATTCAGGAAACACAAACGGCAGAGAGTCACGGCTCCTTCGGCGTTGA
CTCACCCGGTAATCGCAACCGGGAGTGTCAGGTCAAAGAAACAGAGAGGGGCGACGGTTA
TGAGGATCAAAGGGTAAAGGATTGCCAGCTGTACAGAGGAAAGTCAAAGTTCTTAGCCGG
TTAGTTCCCGGTTGCCGTAAACAGACGTTACCGGTGGTTTTGGAAGAGACCACTGATTAT
ATAGCTGCCATGGAGATGCAGATTCGTGCCATGACTGCTCTTCTTTCCGCCGTCACCTTT
CCGACAGAACATGAAGAGGAGGGACAAACACATGTGCTTGGTTAGTTGGCCAAACTGTCT
TTTTCCTTTTTCTTTTTTTTTTCAATTTACAAAAAAAAAACCAAAAAAAAAAATGTTTCT
CGTTTATTTTTTCACTGTATCGTTTGCGGTTTGAATATTTTACTATTTGTCATTTTACCA
CTTCATCATGTATATCCATTTTTATCTTGAATCTCTCTCTGTGTTACAGTGATTGAGCTC
TGTAATCGTAATAAATTTCAGTTTATTGATAATCGTGGAAGTACATTTCAGTTTCAGTGT
TGTTTAATTAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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AF RS1EA93JQ C 361
AF RS1BF10JQ C 670
AF RS1BF10TF U 670
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TTTTCCTTTTTCTTTTTTTTT*CAATTTACAAAAAAAAAAACCAAAAAAAAA*TGTTTCT
CGTTTATTTTTTCACTGTATCGTTTGCGGTTTGAATATTTTACTATTTGTCATTTTACCA
TTTCATCATGTATATCCATTTTTATCTTGAATC

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DS 

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TTCTTTTTTTTTTCAATTTACAAAAAAAAAACCAAAAAAAAAAATGTTTCTCGTTTATTT
TTTCACTGTATCGTTTGCGGTTTGAATATTTTACTATTTGTCATTTTACCACTTCATCAT
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DS 

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CATGAAGAGGAGGGACAAACACATGTGCTTGGTTAGTTGGCCAAACTGTCTTTTTCCTTT
TTCTTTTTTTTTTCAATTTACAAAAAAAAAACCAAAAAAAAAAATGTTTCTCGTTTATTT
TTTCACTGTATCGTTTGCGGTTTGAATATTTTACTATTTGTCATTTTACCACTTCATCAT
GTATATCCATTTTTATCTTGAATCTCTCTCTGTGTTACAGTGATTGAGCTCTGTAATCGT
AATAAATTTCAGTTTATTGATAATCGTGGAAGTACATTTCAGTTTCAGTGTTGTTTAATT
AAG

QA 1 423 1 423
DS 



AS 1 4

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TCTGTTGTGACTCTATCTTCTCCCCCACCAGTTTCTCTGCCACTCTCCTCATCTCGCTCT
TCCTTATTCTCCAACTGCTTCACAGTAACGACCCGACAAAACACCACCCGGTCTCTGGTG
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CCTGAGCTTGCTGTGATTGCTGGCGTCGCTGCCTTGCTTTTCGGACCCAAGAAGCTTCCT
GAGATCGGTAAAAGTATTGGCAAGACCGTCAAGAGCTTTCAACAGGCTGCAAAAGAGTTT
GAGTCTGAGCTAAAGACCGAGCCTGAAGATTCTGTTGCTGACTCATCTACTCCCGTATCA
ATGAGCAACAAGGCAGAGGAAAAAACTGAGGTTTCGTCAAGCTCCAAGGACAATGTATGA
CAATGATGAATGAGACTTTTGGCTTTGCTTGTTTTCATGTAGCTACAAGGGTTTGTGAAA
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GGCTCCGTGGTGTTTGAATCTATCAAGCTATCCTTCTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 10 

AF RS1H131TF U 1
AF RS1ER81TF U 82
AF RS1H131JQB C 100
AF RS1ER81JQ C 164
BS 1 327 RS1H131TF
BS 328 328 RS1ER81TF
BS 329 429 RS1H131TF
BS 430 430 RS1ER81TF
BS 431 440 RS1H131TF
BS 441 441 RS1ER81TF
BS 442 637 RS1H131TF
BS 638 638 RS1ER81JQ

RD RS1H131TF 638 0 0
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TCTGTTGTGACTCTATCTTCTCCCCCACCAGTTTCTCTGCCACTCTCCTCATCTCGCTCT
TCCTTATTCTCCAACTGCTTCACAGTAACGACCCGACAAAACACCACCCGGTCTCTGGTG
GCGAGAGGAATCCGACCGAGAAAGGCACTCACTTGTAATGCCCTGTTTGGTCTCGGTGTC
CCTGAGCTTGCTGTGATTGCTGGCGTCGCTGCCTTGCTTTTCGGACCCAAGAAGCTTCCT
GAGATCGGTAAAAGTATTGGCAAGACCTTCAAGAGCTTTCAACAGGCTGCAAAAGAGTTT
GAGTCTGAGCTAAAGACCGAGCCTGAAGATTCTGTTGCTGACTCATCTACTCCCGTATCA
ATGAGCAACGAGGCAGAGGAGAAAACTGAGGTTTCGTCAAGCTCCAAGGACAATGTATGA
CAATGATGAATGAGACTTTTGGCTTTGCTTGTTTTCATGTAGCTACAAGGGTTTGTGAAA
TGAGTTTTAGATCAAATACCTTCTTTTTGAAGGAAGCAGGGTAGTCTTTCTGTAAGAATT
GGCTCCGTGGTGTTTGAATCTATCAAGCTATCCTTCT
C

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DS 

RD RS1ER81TF 557 0 0
GG
CCCACCAGTTTCTCTGCCTCTCTCCTCATCTCGCTCTTCCTTATTCTCCAACTGCTTCAC
AGTAACGACCCGACAAAACACCACCCGGTCTCTGGTGGCGAGAGGAATCCGACCGAGAAA
GGCACTCACTTGTAATGCCCTGTTTGGTCTCGGTGTCCCTGAGCTTGCTGTGATTGCTGG
CGTCGCTGCCTTGCTTTTCGGACCCAAGAAGCTTCCTGAGATCGGTAAAAGTATTGGCAA
GACCGTCAAGAGCTTTCAACAGGCTGCAAAAGAGTTTGAGTCTGAGCTAAAGACCGAGCC
TGAAGATTCTGTTGCTGACTCATCTACTCCCGTATCAATGAGCAACAAGGCAGAGGAAAA
AACTGAGGTTTCGTCAAGCTCCAAGGACAATGTATGACAATGATGAATGAGACTTTTGGC
TTTGCTTGTTTTCATGTAGCTACAAGGGTTTGTGAAATGAGTTTTAGATCAAATACCTTC
TTTTTGAAGGAAGCAGGGTAGTCTTTCTGTAAGAATTGGCTCCGTGGTGTTTGAATCTAT
CAAGCTATTCTTCT
T

QA 3 556 3 556
DS 

RD RS1H131JQB 539 0 0
CCA
CTCTCCTCATCTCGCTCTTCCTTATTCTCCAACTGCTTCACAGTAACGACCCGACAAAAC
ACCACCCGGTTTCTGGTGGCGAGAGGAATCCGACCGAGAAAGGCACTCACTTGTAATGCC
CTGTTTGGTCTCGGTGTCCCTGAGCTTGCTGTGATTGCTGGCGTCGCTGCCTTGCTTTTC
GGACCCAAGAAGCTTCCTGAGATCGGTAAAAGTATTGGCAAGACCTTCAAGAGCTTTCAA
CAGGCTGCAAAAGAGTTTGAGTTTGAGCTAAAGACCGAGCCTGAAGATTCTGTTGCTGAC
TCATCTACTCCCGTATCAATGAGCAACGAGGCAGAGGAGAAAACTGAGGTTTCGTCAAGC
TCCAAGGACAATGTATGACAATGATGAATGAGACTTTTGGCTTTGCTTGTTTTCATGTAG
CTACAAGGGTTTGTGAAATGAGTTTTAGATCAAATACCTTCTTTTTGAAGGAAGCAGGGT
AGTCTTTCTGTAAGAATTGGCTCCGTGGTGTTTGAATCTATCAAGCTATCCTTCT
C

QA 4 538 4 538
DS 

RD RS1ER81JQ 475 0 0
CCC
CCCGGTCTCTGGTGGCGAGAGGAATCCGACCGAGAAAGGCACTCACTTGTAATGCCCTGT
TTGGTCTCGGTGTCCCTGAGCTTGCTGTGATTGCTGGCGTCGCTGCCTTGCTTTTCGGAC
CCAAGAAGCTTCCTGAGATCGGTAAAAGTATTGGCAAGACCGTCAAGAGCTTTCAACAGG
CTGCAAAAGAGTTTGAGTTTGAGCTAAAGACCGAGCCTGAAGATTCTGTTGCTGACTCAT
CTACTCCCGTATCAATGAGCAACAAGGCAGAGGAAAAAACTGAGGTTTCGTCAAGCTCCA
AGGACAATGTATGACAATGATGAATGAGACTTTTGGCTTTGCTTGTTTTCATGTAGCTAC
AAGGGTTTGTGAAATGAGTTTTAGATCAAATACCTTCTTTTTGAAGGAAGCAGGGTAGTC
TTTCTGTAAGAATTGGCTCCGTGGTGTTTGAATCTATCAAGCTATTCTTCTT

QA 4 475 4 475
DS 



AS 1 4

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GAACCAGTTCGCGTTCTCGTTACCGGTGCTGCAGGACAAATTGGATACGCACTTGTTCCT
ATGATTGCAAGGGGTATCATGCTTGGTGCTGACCAGCCTGTGATCCTCCACATGTTGGAT
ATTCCTCCTACTGCTGAAGCTCTCAACGGTGTCAAGATGGAGTTGATCGATGCTGCTTTC
CCTCTTCTCAAAGGTGTTGTTGCTACAACTGATGCCGTTGAGGGATGTACTGGAGTCAAC
GTTGCTGTTATGGTTGGTGGTTTCCCCAGGAAAGAAGGTATGGAGAGGAAGGATGTCATG
TCCAAGAATGTCTCCATTTACAAGTCCCAGGCTGCTGCCTTGGAGAAGCATGCCGCTCCT
AACTGCAAGGTTCTTGTTGTTGCAAACCCTGCCAACACCAACGCATTGATCCTCAAGGAA
TTTGCACCATCCATCCCTGAGAAGAACATCACTTGTTTGACAAGGCTTGACCACAACAGG
GCCTTGGGTCAGATCTCTGAGAGGTTGAGCGTGCCTGTCTCTGATGTTAAGAACGTGATT
ATCTGGGGTAACCACTCATCCACACAGTACCCTGATGTCAACCACGCTAAGGTGCAGACA
TCTTCTGGAGAAAAGCCTGTCCGCGAGCTCGTCAAGAACGATGAGTGGTTGAATGGAGAG
TTCATCACAACGGTTCAGCAACGTGGAGCTGCAATCATCAAGGCGAGGAAGTTGTCTAGT
GCACTCTCTGCTGCTAGCTCTGCATGTGACCACATCCGTGACTGGGTCCTTGGAACTCCA
GAGGGGACATTTGTTTCCATGGGAGTATACTCAGATGGCTCTTACAACGTTCCATCAGGA
CTTATCTACTCCTTCCCTGTCACTTGCCGCAATGGAGAGTGGAGTATTGTCCAAGGGCTT
CCTATCGATGAAGTATCAAGGAAGAAGATGGATTTGACTGCAGAGGAGCTGAAGGAAGAG
AAGGACTTGGCATACTCATGCCTCTCTTAAACCAATACTTTTCGTCTCAATCAGGTGTGA
GATAAACAAAGCTTTGAGGGCTTTGTTGAAATAAAAAGTGTGTTTAAAAGATCTCCAAAC
ACTGTCCCTGAGCTGATATTCATGTACTCTGTTTTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DU06TF U 1
AF RS1C459TF U 49
AF RS1DU06JQ C 651
AF RS1C459JQ C 583
BS 1 651 RS1DU06TF
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BS 709 834 RS1C459TF
BS 835 872 RS1C459JQ
BS 873 873 RS1DU06JQ
BS 874 1179 RS1C459JQ

RD RS1DU06TF 708 0 0
ATCTCAAAAACACAGATCCATTCTCCGGCGATAATCAACGACCTAGATCAGATGGCGAAG
GAACCAGTTCGCGTTCTCGTTACCGGTGCTGCAGGACAAATTGGATACGCACTTGTTCCT
ATGATTGCAAGGGGTATCATGCTTGGTGCTGACCAGCCTGTGATCCTCCACATGTTGGAT
ATTCCTCCTACTGCTGAAGCTCTCAACGGTGTCAAGATGGAGTTGATCGATGCTGCTTTC
CCTCTTCTCAAAGGTGTTGTTGCTACAACTGATGCCGTTGAGGGATGTACTGGAGTCAAC
GTTGCTGTTATGGTTGGTGGTTTCCCCAGGAAAGAAGGTATGGAGAGGAAGGATGTCATG
TCCAAGAATGTCTCCATTTACAAGTCCCAGGCTGCTGCCTTGGAGAAGCATGCCGCTCCT
AACTGCAAGGTTCTTGTTGTTGCAAACCCTGCCAACACCAACGCATTGATCCTCAAGGAA
TTTGCACCATCCATCCCTGAGAAGAACATCACTTGTTTGACAAGGCTTGACCACAACAGG
GCCTTGGGTCAGATCTCTGAGAGGTTGAGCGTGCCTGTCTCTGATGTTAAGAACGTGATT
ATCTGGGGTAACCACTCATCCACACAGTACCCTGATGTCAACCACGCTAAG*TGCAGACA
TCTTCTGGAGAAAG**CTGTCCGCGAGCTCGTCA*GAACGATGAGTGG

QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1C459TF 787 0 0
GGGT
TGGCGAAGGAACCAGTTCGCGTTCTCGTTACCGGTGCTGCAGGACAAATTGGATACGCAC
TTGTTCCTATGATTGCAAGGGGTATCATGCTTGGTGCTGACCAGCCTGTGATCCTCCACA
TGTTGGATATTCCTCCTGCTGCTGAAGCTCTCAACGGTGTCAAGATGGAGTTGATCGATG
CTGCTTTCCCTCTTCTCAAAGGTGTTGTTGCTACAACTGATGCCGTTGAGGGATGTACTG
GAGTCAACGTTGCTGTTATGGTTGGTGGTTTCCCCAGGAAAGAAGGTATGGAGAGGAAGG
ATGTCATGTCCAGGAATGTCTCCATTTACAAGTCCCAGGCTGCTGCCTTGGAGAAGCATG
CCGCTCCTAACTGCAAGGTTCTTGTTGTTGCAAACCCTGCCAACACCAACGCATTGATCC
TCAAGGAATTTGCACCATCCATCCCTGAGAAGAACATCACTTGTTTGACAAGGCTTGACC
ACAACAGGGCCTTGGGTCAGATCTCTGAGAGGTTGAGCGTGCCTGTCTCTGATGTTAAGA
ACGTGATTATCTGGGGTAACCACTCATCCACACAGTACCCTGATGTCAACCACGCTAAGG
TGCAGACTTCTTCTGGAGAAAAGCCTGTCCGCGAGCTCGTCAAGAACGATGAGTGGTTGA
ATGGAGAGTTCATCACAACGGTTCAGCAACGTGGAGCTGCAATCATCAAGGCGAGGAAGT
TGTCTAGTGCACTCTCTGCTGCTAGCTCTGCATGTGACCACATCCGTGACTGGGTCCTTG
GA
C

QA 5 786 5 786
DS 

RD RS1DU06JQ 411 0 0
GGTGCAGACATCTTCTGGAGAAAAGCCTGTCCGCGAGCTCGTCAAGAACGATGAGTGGTT
GAATGGAGAGTTCATCACTACGGTTCAGCAACGTGGAGCTGCAATCATCAAGGCGAGGAA
GTTGTCTAGTGCACTCTCTGCTGCTAGCTCTGCATGTGACCACATCCGTGACTGGGTCCT
TGGAACTCCAGAGGGGACATTTGTTTCCATGGGAGTATACTCAGATGGCTCTTACAACGT
TCCATCAGGACTTATCTACTCCTTCCCTGTCACTTGCCGCAATGGAGAGTGGAGTATTGT
CCAAGGGCTTCCTATCGATGAAGTATCAAGGAAGAAGATGGATTTGACTGCAGAGGAGCT
GAAGGAAGAGAAGGACTTGGCATACTCATGCCTCTCTTAAACCAATACTTT

QA 1 411 1 411
DS 

RD RS1C459JQ 597 0 0
GATGTTAAGAACGTGATTATCTGGGGTAACCACTCATCCACACAGTACCCTGATGTCAAC
CACGCTAAGGTGCAGACTTCTTCTGGAGAAAAGCCTGTCCGCGAGCTCGTCAAGAACGAT
GAGTGGTTGAATGGAGAGTTCATCACAACGGTTCAGCAACGTGGAGCTGCAATCATCAAG
GCGAGGAAGTTGTCTAGTGCACTTTCTGCTGCTAGCTCTGCATGTGACCACATCCGTGAC
TGGGTCCTTGGAACTCCAGAGGGGACATTTGTTTCCATGGGAGTATACTCGGATGGCTCT
TACAACGTTCCATCAGGACTTATCTACTCCTTCCCTGTCACTTGCCGCAATGGAGAGTGG
AGTATTGTCCAAGGGCTTCCTATCGATGAAGTATCAAGGAAGAAGATGGATTTGACTGCA
GAGGAGCTGAAGGAAGAGAAGGACTTGGCATACTCATGCCTCTCTTAAACCAATACTTTT
CGTCTCAATCAGGTGTGAGATAAACAAAGCTTTGAGGGCTTTGTTGAAATAAAAAGTGTG
TTTAAAAGATCTCCAAACACTGTCCCTGAGCTGATATTCATGTACTCTGTTTTTCCC

QA 1 597 1 597
DS 



AS 1 4

CO CL2442Contig1 1636 4 6 U
ACGGCTTCGTTCATGTGTGGTCCAATTGATTTCACATCATTGTTAGCTACTATTATTACT
ACTGTATTATTTGGTTTTCTTTAAGTTGTGTGTAGTGATCAATCTCTTTTAACTTAGTAG
TAGTGTCTTTGAGCAGCCATTTGTGTTGCTGTGAAGCCATATGTGTTGTGAGTCAGAAAA
CAATGTGTACACTAGTTAATCAATTCTATGAAAGACCCCTTGTTACAAATTACAATCTTT
GCAACTCCTCTTTATACGCTTATATGGTCAACGTGACATCTTGAGAAAGTTTGTATGACT
TGCAGAGAATAAAGCAATGCCTCACTGCTGGATTGTGTGCATCTTATTTGCCTTGGGACT
ATCAAGGAAAAGTCGTCGAAAAAAATAAAGGGAACAAAGCCTACTACTAATGGAAACTAA
TGTTTTCATGCATTTATCAGAAAACACTCTGAAAATATAAAGAGAGTATGTGGACGTGAA
TGAATACAATTGCAATTATCTTTCAAATTGTATAGAATTGAACGTCGGTTGGAGAGCCGA
GTATTTTGGATCTTTATCTTCACCACCATCATCTTTCTTTTCAGCAACATCAGAAACAAC
AACCTCCATCCCTTTCTTTACTCTCTCTAGCTCCTTGTCTTTCTCTTCCAATTTGTCTTG
CAATATTATCACCGTTTCGTTTGATCTCTCAACATCGTTAGTTAGTTCGTCCATGTGTTT
GTACAGTCCTTCAAATTGCTTTCTAAGTTCTGCGTTCTGAGACTTCTGCATTGATAGCTT
CATTGCTAGTTCATGAATCTTTCCTTCGGCAGCTTGGTGACCAATCTCCTCGTTTTCCTC
TTGCAGGGTTTTGCACTTTTCCATAAGCATCTTGCCCTTTAAGCTCAGAGGGGTAAATGT
AAACGCTGTAAGACTATCCTGTAGTTCCTTGACCCTCTTGTCTTTTTCCTCAACTAGATT
CTTCAGACGTGAAAATTCTTCATGAATAGCTGGATCCAGTAACAGCCTCCTTGCCTGCAT
TGATGCCGGCTTGAGCTGAGATTTCAAATCGCGAACAGCAGACTTCAACTCAGCCATTTC
CTGTTCCCGTTTGGCATATTGTACAATGTATGAAGCTTCTTTTCTCTTTGCAATTTCCAA
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AGGCTCAGGAGATTTGCCAGCTGGTATGAAAGACTCGTTCTGAAACGCTGATTTCCACTT
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GTTTTGAAGACTCTCTCGGAGTGAGAGGATCATCCCAGTTGCAACACCAGGGGCAGCTTC
CTCCGCTTTCGTACGACCCTTTTTGGATCCGAAGATATCATCTTCATCGTCTTCAAGATC
ACCGAAACTTCTTTTAACCCTGAAGCTCTGGCGGCGTTAGTAGCGGAGAAATCGCCCCCA
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AAGCGAGCGACGGCAGTTGAGAATCTTAGGGCTTTTTGTTTTCAGAGGTCAGGCTCTGGA
TACCTTTCTTTTGGTC


BQ
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AF RS1DQ03JQ C 1
AF RS1DP11JQ U 395
AF RS1GH56JQ U 412
AF RS1DP11TF C 947
BS 1 394 RS1DQ03JQ
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TAGTGTCTTTGAGCAGCCATTTGTGTTGCTGTGAAGCCATATGTGTTGTGAGTCAGAAAA
CAATGTGTACACTAGTTAATCAATTCTATGAAAGACCCCTTGTTACAAATTACAATCTTT
GCAACTCCTCTTTATACGCTTATATGGTCAACGTGACATCTTGAGAAAGTTTGTATGACT
TGCAGAGAATAAAGCAATGCCTCACTGCTGGATTGTGTGCATCTTATTTGCCTTGGGACT
ATCAAGGAAAAGTCGTCGAAAAAAATAAAGGGAACAAAGCCTACTACTAATGGAAACTAA
TGTTTTCATGCATTTATCAGAAAACACTCTGAAAATATAAAGAGAGTATGTGGACGTGAA
TGAATACAATTGCAATTATCTTTCAAATTGTATAGAATTGAACGTCGGTTGGAGAGCCGA
GTATTTTGGATCTTTATCTTCACCACCATCATCTTTCTTTTCAGCAACATCAGAAACAAC
AACCTCCATCCCTTTCTTTACTCTCTCTAGCTCCTTGTCTTTCTCTTCCAATTTGTCTTG
CAATATTATCACCGTTTCGTTTGATCTCTCAACATCGTTAGTTAGTTCGTCCATGTGTTT
GTACAGTCCT
GCCATTCAACACC

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DS 

RD RS1DP11JQ 555 0 0
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ATATAAAGAGAGTATGTGGACGTGAATGAATACAATTGCAATTATCTTTCAAATTGTATA
GAATTGAACGTCGGTTGGAGAGCCGAGTATTTTGGATCTTTATCTTCACCACCATCATCT
TTCTTTTCAGCAACATCAGAAACAACAACCTCCATCCCTTTCTTTACTCTCTCTAGCTCC
TTGTCTTTCTCTTCCAATTTGTCTTGCAATATTATCACCGTTTCGTTTGATCTCTCAACA
TCGTTAGTTAGTTCGTCCATGTGTTTGTACAGTCCTTCAAATTGCTTTCTAAGTTCTGCG
TTCTGAGACTTCTGCATTGATAGCTTCATTGCTAGTTCATGAATCTTTCCTTCGGCAGCT
TGGTGACCAATCTCCTCGTTTTCCTCTTGCAGGGTTTTGCACTTTTCCATAAGCATCTTG
CCCTTTAAGCTCAGAGGGGTAAATGTAAACGCTGTAAGACTATCCTGTAGTTCCTTGACC
CTCTTGTCTTTTTCC

QA 1 555 1 555
DS 

RD RS1GH56JQ 753 0 0
GGAAACTAATGTTTTCATGCATTTATCAGAAAACACTCTGAAAATATAAAGAGAGTATGT
GGACGTGAATGAATACAATTGCAATTATCTTTCAAATTGTATAGAATTGAACGTCGGTTG
GAGAGCCGAGTATTTTGGATCTTTATCTTCACCACCATCATCTTTCTTTTCAGCAACATC
AGAAACAACAACCTCCATCCCTTTCTTTACTCTCTCTAGCTCCTTGTCTTTCTCTTCCAA
TTTGTCTTGCAATATTATCACCGTTTCGTTTGATCTCTCAACATCGTTAGTTAGTTCGTC
CATGTGTTTGTACAGTCCTTCAAATTGCTTTCTAAGTTCTGCGTTCTGAGACTTCTGCAT
TGATAGCTTCATTGCTAGTTCATGAATCTTTCCTTCGGCAGCTTGGTGACCAATCTCCTC
GTTTTCCTCTTGCAGGGTTTTGCACTTTTCCATAAGCATCTTGCCCTTTAAGCTCAGAGG
GGTAAATGTAAACGCTGTAAGACTATCCTGTAGTTCCTTGACCCTCTTGTCTTTTTCCTC
AACTAGATTCTTCAGACGTGAAAATTCTTCATGAATAGCTGGATCCAGTAACAGCCTCCT
TGCCTGCATTGATGCCGGCTTGAGCTGAGATTTCAAATCGCGAACAGCAGACTTCAACTC
AGCCATTTCCTGTTCCCGTTTGGCATATTGTACAATGTATGAAGCTTCTTTTCTCTTTGC
AATTTCCAACTGTTCTTTCAAAGATCTCTCGGA

QA 1 753 1 753
DS 

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CTCCTTGCCTGCATTGATGCCGGCTTGAGCTGAGATTTCAAATCGCGAACAGCAGACTTC
AACTCAGCCATTTCCTGTTCCCGTTTGGCATATTGTACAATGTATGAAGCTTCTTTTCTC
TTTGCAATTTCCAACTGTTCTTTCAAAGATCTCTCGGAAGATTTTAGATTTTGGATGTAG
TCAATCAAAAATCTAGGCTCAGGAGATTTGCCAGCTGGTATGAAAGACTCGTTCTGAAAC
GCTGATTTCCACTTGAGGATCTCAGCTTTTGCTGATTCTAGCTCATTCTGAGATGAAGCA
AGATCATCTTTACAGTTTTGAAGACTCTCTCGGAGTGAGAGGATCATCCCAGTTGCAACA
CCAGGGGCAGCTTCCTCCGCTTTCGTACGACCCTTTTTGGATCCGAAGATATCATCTTCA
TCGTCTTCAAGATCACCGAAACTTCTTTTAACCCTGAAGCTCTGGCGGCGTTAGTAGCGG
AGAAATCGCCCCCAAAATCGTCGTCTTCCATTAGCGCAACCCACAATAAGATCTCAGATT
TGTGTCAATGATGAAAGCGAGCGACGGCAGTTGAGAATCTTAGGGCTTTTTGTTTTCAGA
GGTCAGGCTCTGGATACCTTTCTTTTGGTC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 3

CO CL2443Contig1 1216 3 20 U
GGATTCAAATGAAGTTTTGATGGATTATTATTATTATTCTTCATCGTTTATCATAGTTGA
AGTCTGGAATAAAATTTGGCAAACAAAACAAAGGGATTTGACTGAAATGAGGACAAACAT
TTGTATGGAAAACACCTGAACTTAGCTTAGTAGTGAGTTCAAGGTCGACGGGAAAACTTA
GAGAAGTCTGGTGGGCGGCGTTGCATATAAGCCGTTCTTCCTTCGATACCTTCTTCGGTT
CCATAGAATAAGAGGGTCGCATTACCTCCTAGCTCCTGAAGTCCAGCATGACCATCATCG
ACCGCATTGAGTGCTGCCTTAAGCACACGGATTGCAGTAGGGCTGTTCCTTAAGATTTCT
CTGCACCATTTCACAGTTTCTTTCTCCAAACCCTCTAGCGGTACAACTGCATTGATGAGT
CCCATTTTATCTGCTTCCCAAGCTGTGTAGAATCTCGTCATGAACCACATTTCTCGTGCC
TTTTTAGGACCAACCAGACGAGACATGATGGAACTTCCATAACCAGCATCAAAACTTCCA
ACCTTAGGACCCGTCTGACCAAAAATAGCATTGCCAGCTGCAATGGTTAGACCACAGACC
ATGTGCAAGATATGTCCTCCTCCAACAGCATAACCAGCAACCATTGCAATTACTGGTTTT
GGCAGTCTCCGGATTTGAACCTGGAGATCAAGGACATTAAGTCGACCAACATCATTGGGA
TCAGCATAACCATCTGATGTCCTCAACGCTTGATCACCACCACTGCAAAACGCTTTCGTT
CCCTTGCCAGTGAGTATGATGACACCTACAGAGCTATCGTCTCTGGCGTCGTTAAACGCG
CGCATAAGCTCCTTCACAGTCTGAGGCCGGAACGCGTTTCTTCTCTCCGGCCGGTTTATA
GTAATCTTTGCAATATCTTCACCGACGGCTTTCTCGTATATGATGTCAACGAACTCTTTT
GTTTCTCCGTCGTCACCGACGAGATCAGCTTTTCTCCAAACGACTTGGTGAGTCGGCACT
TCACCGTGGACCTTATGGTACTTGTCATTCATCGACGAAGCAGTTGAGAGATCCAATGAG
TCAACGCCAGTTGGAACCGGTTCGACGGGGATGAGATGATTTGAGACGACGGAGATACGG
CGGCTCGCGGTGCCGAGTTCCTTGGAGTCTGCCATTGGAGAGGAAGAAGCTATAAACAGA
GAAAGATGATGATGAG


BQ
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CCCTT

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CCATTGCAATTACTGGTTTTGGCAGTCTCCGGATTTGAACCTGGAGATCAAGGACATTAA
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TCTCTGGCGTCGTTAAACGCGCGCATAAGCTCCTTCACAGTCTGAGGCCGGAACGCGTTT
CTTCTCTCCGGCCGGTTTATAGTAATCTTTGCAATATCTTCACCGACGGCTTTCTCGTAT
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TTTGAGACGACGGAGATACGGCGGCTCGCGGTGCCGAGTTCCTTGGAGTCTGCCATTGGA
GAGGAAGAAGCTATAAACAGAGAAAGATGATGATGAG

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AS 1 2

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TACTCTGGCTCCATACATTACCCTCGTAGCACTCCTGATGTAAATCATTTCTAAACCATT
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TGGCTAAGGGAAATTCCCGGGATCTTCTTCCGTACCGACAATAAACCATTCAAGGTATTT
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TGAAGGAAGAGAAGCTTTTTGCTTCACAAGGAGGTCCCATTATTTTAGGACAGGTACATT
GATCCCAAGAACCATTTTATGAACGAAAATTTGGAACTATGTTTAGTTTAAAAGATTTGT
ATATTAAATTAAACTTTGTTGCAGATAGAGAATGAGTATAGCGCGGTTGAACGTGCATAT
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CO52TF U 1
AF RS1CO52JQ C 686
BS 1 800 RS1CO52TF
BS 801 801 RS1CO52JQ
BS 802 820 RS1CO52TF
BS 821 1192 RS1CO52JQ

RD RS1CO52TF 820 0 0
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AAGAAAGAAGTAACTTATGATGGAACGTCTTTAATCATCAACGGAAAAAGAGAGTTACTT
TACTCTGGCTCCATACATTACCCTCGTAGCACTCCTGATGTAAATCATTTCTAAACCATT
AGTAAATCATTTGTTTAATCTTATGATTTTATTTTATGTACTGAATCATCGAGAAATTTT
TGCTTAGATGTGGCCGAAGATCATCAAGAGAGCAAAACAAGGCGGTTTGAATACGATTCA
GACATATGTTTTTTGGAATGTTCATGAGCCTGTGCAGGGGAAGGTAAGTTTGGAGATTAT
TTTAGGAAAAACAATAAAAGATAAGTTTCATCATTGTTTTAAGTTGTTTTTTAATCTTTT
GTTGGAACAGTTCAATTTTTCGGGTAGAGCAGATTTAGTGAAGTTCATAAAATTGGTTGA
GAAGAATGGTATGTATGTAACATTGAGGCCTGGACCTTTTATTCAGGCTGAATGGAATCA
TGGGTAAGTTTTATGTGTTACGTTCTTTGTTTCTCTTCATATTCATAATATATTACAGTG
TTTTGAGTTCTTATGGGACATGTTTCATGATTATGATGAAACATCAGAGGACTTCCTTAC
TGGCTAAGGGAAATTCCCGGGATCTTCTTCCGTACCGACAATAAACCATTCAAGGTATTT
TTATTTATATACTTGCATGTTTGACATGTGTGTAATGATTGAACAATCAAAAGATTTAAA
AGAATTTGACATAACTGCAG*AACATACAGAGAGGTATGT

QA 1 820 1 820
DS 

RD RS1CO52JQ 507 0 0
TCTTCCGTACCGACAATAAACCATTCAAGGTATTTTTATTTATATACTTGCATGTTTGAC
ATGTGTGTAATGATTGAACAATCAAAAGATTTAAAAGAATTTGACATAACTGCAGGAACA
TACAGAGAGGTATGTGAAGGTGATACTTGATAAGTTGAAGGAAGAGAAGCTTTTTGCTTC
ACAAGGAGGTCCCATTATTTTAGGACAGGTACATTGATCCCAAGAACCATTTTATGAACG
AAAATTTGGAACTATGTTTAGTTTAAAAGATTTGTATATTAAATTAAACTTTGTTGCAGA
TAGAGAATGAGTATAGCGCGGTTGAACGTGCATATAAAGAAGATGGAGTAAACTACATTA
AGTGGGCAGCTAAATTAGTAGATTCTATGAATTTGGGGACCCCATGGGTTATGTGTAAGC
AAAATAATGCTCCTGATCCTATGGTAAGTCATCTTCCTAACGCATTGAATGATGATTATA
ACAAGATAATAAAGAGCTTGTTTGACC

QA 1 507 1 507
DS 



AS 1 2

CO CL2445Contig1 626 2 9 U
AGTATTGAACAAAAACCTTTGATTATGTTTAGATGTCTTAGTTGCAGAGAAAATCTAATT
GCAAACAAAGAACTTTAAGATGAACATAAAAGTTCGATTATGAAGAACAGAAAATGACTG
ATACTAGCTTGTCATCTCTCACTTCTTCTTGGGATCACCAGCCTTGGTCTTCTTAACACC
ACGGATCTTCTTAGCACGGTTCTTCCTTTCCTTAATTTGTTTCCTTGATTTCTCGATCTT
GGTGTCAAGACCATTCCTGATAAGTCTGTACTTGGGTTCAAACTTCTTAGCGCTCTCGAC
ATTGTCATAGAACAAACCAAACCCGGATGATTTACCACCTCCAAAATGGGTTCTGAATTT
GAAAACAAAGATGGCGTTTGGGTCCTTGACCTCGTACATCCTTGCTAGCTTCTCCTTCAG
CTCAGCCTTTGAAACATTGGCTCTTCCAGGGTGAAGAACATCAATAACGAACTGCTTCCT
TGAGAGAAGTCTGTTGGTCATGAATTTTCGGGTTCTGATGGTCACTGCTTTTTCCGCCAT
TGTCGCGATTCCTCCAGGGGATCTAAACGAAGATCTCTCTCTCTCTCTGCAAAGCTTTTG
AGTTCGATTCGTTCGTTCCTCCGTCC


BQ
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AF RS1AC05JQ U 191
AF RS1D877JQ U 1
BS 1 234 RS1D877JQ
BS 235 235 RS1AC05JQ
BS 236 311 RS1D877JQ
BS 312 312 RS1AC05JQ
BS 313 369 RS1D877JQ
BS 370 370 RS1AC05JQ
BS 371 457 RS1D877JQ
BS 458 458 RS1AC05JQ
BS 459 626 RS1D877JQ

RD RS1AC05JQ 313 0 0
TTAGCACGGTTCTTCCTTTCCTTAATTTGTTTCCTTGATTTCTCGATCTTGGTGTCAAGA
CCATTCCTGATAAGTCTGTACTTGGGTTCAAACTTCTTAGCGCTCTCGACATTGTCATAG
AACAAACCAAACCCGGATGATTTACCACCTCCAAAATGGGTTCTGAATTTGAAAACAAAG
ATGGCGTTTGGGTCCTTGACCTCGTACATCCTTGCTAGCTTCTCCTTCAGCTCAGCCTTT
GAAACATTGGCTCTTCCAGGGTGAAGAACATCAATAACGGACTGCTTCCTTGAGAGAAGT
CTGTTGGTCATGA

QA 1 313 1 313
DS 

RD RS1D877JQ 626 0 0
AGTATTGAACAAAAACCTTTGATTATGTTTAGATGTCTTAGTTGCAGAGAAAATCTAATT
GCAAACAAAGAACTTTAAGATGAACATAAAAGTTCGATTATGAAGAACAGAAAATGACTG
ATACTAGCTTGTCATCTCTCACTTCTTCTTGGGATCACCAGCCTTGGTCTTCTTAACACC
ACGGATCTTCTTAGCACGGTTCTTCCTTTCCTTAATTTGTTTCCTTGATTTCTC*ATCTT
GGTGTCAAGACCATTCCTGATAAGTCTGTACTTGGGTTCAAACTTCTTAGCGCTCTCGAC
ATTGTCATAGATCAAACCAAACCCGGATGATTTACCACCTCCAAAATGGGTTCTGAATTT
GAAAACAAATATGGCGTTTGGGTCCTTGACCTCGTACATCCTTGCTAGCTTCTCCTTCAG
CTCAGCCTTTGAAACATTGGCTCTTCCAGGGTGAAGAGCATCAATAACGAACTGCTTCCT
TGAGAGAAGTCTGTTGGTCATGAATTTTCGGGTTCTGATGGTCACTGCTTTTTCCGCCAT
TGTCGCGATTCCTCCAGGGGATCTAAACGAAGATCTCTCTCTCTCTCTGCAAAGCTTTTG
AGTTCGATTCGTTCGTTCCTCCGTCC

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 4

CO CL2446Contig1 1332 4 4 U
ATGGAATCAAACAGATTCAATCACAAGCGTTGGTTCACTGAATGCTGCACAGAAGGGATC
ATGTTTTGAAGTTGGGACTGGGAGTAAAAATGACCAGCCGTCAAAGGGTTCACTGGCCAG
TGAAAACGGTGATACTGAATCAAAGCGTTCACTGGCTAGTGTAAATGGTGATACTGAATC
AAAGCGTTCATTGGCCTGTGTAAATGGAGATACTGAATTAGGTAGTGCTTTCAGCTCATC
AACTCATGGCTGCAGTGTTGATCACCTTGAAGAGATTTTCCAAGACGCCAAAACTAACAA
GAGAACCTTGCTCGCTGTGATGGACTTGGTTATGAATCTGATGAAAGAAGTTGAACTTGA
AGAGAAGGATGCAGATAAGTCAGAGTTAGAAGCTGCTAGGGGAGGTTTGGACACTCTTGA
AAAGGTTGAGGAGTTCAGGAAGATGCTGAAACATGCCAAGGAAGCCAATGACATGCATGC
TGGAGAAGTATATGGAGAGAAGTCAATTTTAGCAACTGAAGCAAAGGAGCTTGAAAACCG
ATTGCTCAAGTTATCAGAAGAGCGAAGCAAATCTCTTGATGTACTTGATGAGATGCGTGA
AACTCTTGAGATAAGACTAGCGGCAACATTGGAGATGAAAAAGGCTGCTGAGCAAGAAAA
GAAAGCAAAAGAAGACTCTGCGCTTAAGGCACTTGCTGAACAAGAGGCCATCATGGAGAA
AGTAGCCCAAGAATCAAAGCTTCTTCAGCAAGAGGCAGAGCAAAACTCTAAGCTTCGAGA
GTTTCTTATGGATCGTGGTGAGGTCGTTGATTCCTTACAAGGAGAAATATCTGTCATATG
TCAAGATGTGAAGCTGTTGAAAGAAAAATTTGACAAGAGTGTGTCAACAACAACAAAATC
AGTTACCTCAAGCCTGACTAGTTCACGTGGATCATCATCTATGAGGAGCTTGGTGCTTGA
GAATCCTGCTGAGCTGTTGAATGGAATTTTTGAAACCTCAAGCAAGAACAAGAGCCCAGA
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAG***CATCTTACTACATGAAGAAAGAGAAAAATGATCGTAG
AGAGCTTCTTGAAGATGGTTGGGACATCTTTGAGAAGGATATTGAACTTTAAGGTGGGGT
TGGTGGCTTGGTGATGAAGGAAAGGGCTGGTATTGAAATAGAAAACGCTATAACCTAGAG
AATAAAATGGATTTGTGACCATGTTTGGATCAGGGATTGTATGAGCTTTTGATTCTCTTG
TGTGTTTGAAACCTAAACCAGATCACTTATGAGCTTTAATAGTACTACAGTATAGCTTTG
TGCAAGATTTTT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RS1CQ10TF U 1
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AF RS1GX43JQ C 745
AF RS1GX43TF U 687
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AACTCTTGAGATAAGACTAGCGGCAAC

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G
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TATGAGCTTTAATAGTACTACAGTATAGCTTTGTGCAAGATTTT

QA 2 645 2 645
DS 



AS 1 4

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AATAAGTGAATATAATAAATTATGAAAACAATGGTTTTCGTTACTC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CR63TF U 1
AF RS1EL64TF U 3
AF RS1CR63JQ C 279
AF RS1EL64JQ C 338
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AAGAGTTTCTTTATGGCAAAGCTGAGGTTCAAATGAAGCTTGTCCCTGGTAACTCTGCTG
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ATTGGT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RS1EL64TF 696 0 0
GG
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CGCTTTCCTGGCTCTCTTCCTCTTTGCGCTACAATCTGTGTGCGTCTATGCGGGTAGCTT
CCACAAAGACGTTCAGATACATTGGGGTGATGGCCGTGGAAAGGTTCAAGACAATGAAGG
AAAGCTTCTTTCTCTTTCGCTTGACAAATCCTCTGGATCCGGTTTTCAATCCAATCAAGA
GTTTCTTTATGGCAAAGCTGAGGTTCAAATGAAGCTTGTCCCTGGTAACTCTGCTGGAAC
TGTCACAACTTTCTATCTTAAAGCGCCTGGAACTATGTGGGATGAGATCGATTTCGAGTT
CTTGGGAAACATAAGTGGTCATCCTGTTACACTTCATACTAATGTTTACTCAAAAGGCAC
AGGAGACAAAGAACAGCAGTTTCATTTATGGTTCGACCCAACTGTTGGCTTTCACACTTA
CTGCATCACATGGAATCCCCAAAGGATTATCTTTACCGTAGATGGCATTCCCATTAGAGA
ATTCAAGAACTCTGAGACAATTGGAATCCCATTCCCAAAGGACCAACCAATGAGAGTCTA
CGCGAGCCTTTGGGAGGCCGAGCATTGGGCTACAAGAGGAGGACTAGAGAAAACAGATTG
GTCCAAG*CTCCTTTTACTGCTTTCTACAGAAAC

QA 3 696 3 696
DS 

RD RS1CR63JQ 788 0 0
CTTGTCCCTGGTA*CTCTGCTGGAACTGTCACAACTTTCTATCTTAAAGCGCCTGGAACT
ATGTGGGATGAGATCGATTTCGAGTTCTTGGGAAACATAAGTGGTCATCCTGTTACACTT
CATACTAATGTTTACACAAAAGGCACAGGAGACAAAGAACAACAGTTTCATTTATGGTTC
GACCCAACTGCTGGCTTTCACACTTACTGCATCACATGGAATCCCCAAAGGATTATCTTT
ACCGTAGATGGCATTCCCATTAGAGAATTCAGGAACTCTGAGCCAATTGGAATTCCATTC
CCAAAGGACCAACCCATGAGAGTCTACGCGAGCCTTTGGGAGGCCGAGCATTGGGCTACA
AGAGGAGGATTAGAGAAAACAGATTGGTCCAAGGCTCCTTTTACTGCTTTCTACAGAAAC
TACAATGTGGAAGGATGTGTTTGGGCTAATGGAAAATCATCTTGCCCTGCGAATTCCCCA
TGGTTCACTCAGAAATTGGACCAGAGCGGTATAGATAAAGTGAAATGGGCGCAGAGTAAG
TACATGGTCTATAACTATTGCACCGATACAAAGAGGTTTCCTAAAGGTGTTCCTAAAGTG
TGCACTTAACAATTGATTCTTTGATTCGTCAATAAGTTACTGGCATTGTCTTTATAATTC
AAATAAGTTTTATTTATTCTGTTTCATTCATTTGTTTCTCATGTATGTGTGTGTGGTGGT
GTATGTGCAAGATTTTAAAATTAATAAGTGAATATAATAAATTATGAAAACAATGGTTTT
CGTTACTC

QA 1 788 1 788
DS 

RD RS1EL64JQ 692 0 0
TATGTGGGATGAGATCGATTTCGAGTTCTTGGGAAACATAAGTGGTCATCCTGTTACACT
TCATACTAATGTTTACTCAAAAGGCACAGGAGACAAAGAACAGCAGTTTCATTTATGGTT
CGACCCAACTGTTGGCTTTCACACTTACTGCATCACATGGAATCCCCAAAGGATTATCTT
TACCGTAGATGGCATTCCCATTAGAGAATTCAAGAACTTTGAGACAATTGGAATCCCATT
CCCAAAGGACCAACCAATGAGAGTTTACGCGAGCCTTTGGGAGGCCGAGCATTGGGCTAC
AAGAGGAGGACTAGAGAAAACAGATTGGTCCAAGGCTCCTTTTACTGCTTTTTACAGAAA
CTACAATGTGGAAGGATGTGTTTGGGCTAATGGAAAATCATCTCGCCCGGCGAATTCCCC
ATGGTTCACTCAGAAATTGGACCAGAGCGGTATAGATAAAGTGAAATGGGCGCAGAGTAA
GTACATGGTCTATAACTATTGCACCGATACAAAGAGGTTTCCTAAAGGTGTTCCTAAAGT
GTGCACTTAACAATTGATTCTTTGATTCGTCAATAAGTTACTGGCATTGTCTTTATAATT
CAAATAAGTTTTATTTATTCTGTTTCATTCATTTGTTTCTCATGTATGTGTGTGTGGTGG
TGTATGTGCAAGATTTTAAAATTAATAAGTGA

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 3

CO CL2448Contig1 782 3 14 U
GGACAGACGTAAAAATGGAAGATGAGAAGAGACTAGAGCTTAGGCTGGCTCCTCCCTGCC
ACCAACTCACATCCAACAACAACGTCAATGGATCTAAACAAAGAAGCCTCACCAAAGACA
CATCATTTGTTTTCAATAACAGGGTTGAGGCAGCTCCGGTGGTGGGATGGCCGCCGGTGA
GACCATCCCGGCGAAACCTAACGGCGCAGCCAAAAGAGGAGATGAAGAAGGG**TAAACG
ATGACGCGAGAGAGTTGTACGTTAAGATCAATATGGAAGGAGTTCCCATTGGAAGAAAAG
TCAACCTCTTCGCTTATAACAACTACCAACAGCTTTCATATGCCGTTGGCCAACTCTTCT
CTAAGAAAGATTCGGCTGATGTAGACAGACAATACACTTTGGTCTACGAAGACACTGAAG
GAGATATAGTTCTGGTCGGAGATGTTCCTTGGGAGATGTTTATATCGACTGTGAAGAGAT
TGCACGTTTTAAAAACCTCCCACGTCTCCATGCTCTCACCTATAAAACATGGCATGGAAT
AGAGCGAGGTTCACCAATACACCAGTTCGATGTTTTGTTTAAAATTTAATTTATGTAAAC
CATGGGGCTTGGTTTGATTTACTGAGATTTCTTTTATTGTTACTTAGATTTTGCTTTTTC
AAATTATGCTCTATGTTTTTCTTTATGCTTATGGAAGACGAATTTGTGTAAATATGATGT
TTGCTTAAGTAATCTGGGTGGTATTACTATGTTATCGTGAGTATAATCTATAAAGATAGT
AG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C880TF U 1
AF RS1ET13TF U 2
AF RS1ET13JQ C 89
BS 1 232 RS1C880TF
BS 233 234 RS1ET13TF
BS 235 235 RS1C880TF
BS 236 236 RS1ET13TF
BS 237 246 RS1C880TF
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BS 350 403 RS1C880TF
BS 404 404 RS1ET13TF
BS 405 544 RS1C880TF
BS 545 545 RS1ET13TF
BS 546 662 RS1C880TF
BS 663 782 RS1ET13JQ

RD RS1C880TF 662 0 0
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ACCAACTCACATCCAACAACAACGTCAATGGATCTAAACAAAGAAGCCTCACCAAAGACA
CATCATTTGTTTTCAATAACAGGGTTGAGGCAGCTCCGGTGGTGGGATGGCCGCCGGTGA
GACCATCCCGGCGAAACCTAACGGCGCAGCCAAAAGAGGAGATGAAGAAGGGAGTGAACG
ATGACGTGAGAGAGTTGTACGTTAAGATCAATATGGAAGGAGTTCCCATTGGAAGAAAAG
TCAACCTCTTCGCTTATAACAACTACCAACAGCTTTCATATGCCGTTGACCAACTCTTCT
CTAAGAAAGATTCGGCTGATGTAGACAGACAATACACTTTGGTTTACGAAGACACTGAAG
GAGATATAGTTCTGGTCGGAGATGTTCCTTGGGAGATGTTTATATCGACTGTGAAGAGAT
TGCACGTTTTAAAAACCTCCCACGTCTCCATGCTCTCACCTATAAAACATGGCATGGAAT
AGAGTGAGGTTCACCAATACACCAGTTCGATGTTTTGTTTAAAATTTAATTTATGTAAAC
CATGGGGCTTGGTTTGATTTACTGAGATTTCTTTTATTGTTACTTAGATTTTGCTTTTTC
AA

QA 1 662 1 662
DS 

RD RS1ET13TF 664 0 0
GGG
AGACGTAGAAATGGAAGATGAGAAGAGACTAGAGCTTAGGCTGGCTCCTCCCTGCCACCA
ACTCACATCCAACAACAACGTCAATGGATCTAAACAAAGAAGCCTCACCAAAGACACATC
ATTTGTTTTCAATAACAGGGTTGAGGCAGCTCCGGTGGTGGGATGGCCGCCGGTGAGACC
ATCCCGGCGAAACCTAACGGCGCAGCCAAAAGAGGAGATGAAGAAGGG**TAAACGATGA
CGCGAGAGAGTTGTACGTTAAGATCAATATGGAAGGAGTTCCCATTGGAAGAAAAGTCAA
CCTCTTCGCTTATAACAACTACCAACAGCTTTCATATGCCGTTGGCCAACTCTTCTCTAA
GAAAGATTCGGCTGATGTAGACAGACAATACACTTTGGTCTACGAAGACACTGAAGGAGA
TATAGTTCTGGTCGGAGATGTTCCTTGGGAGATGTTTATATCGACTGTGAAGAGATTGCA
CGTTTTAAAAACCTCCCACGTCTCCATGCTCTCACCTATAAAACATGGCATGGAATAGAG
CGAGGTTCACCAATACACCAGTTCGATGTTTTGTTTAAAATTTAATTTATGTAAACCATG
GGGCTTGGTTTGATTTACTGAGATTTCTTTTATTGTTACTTAGATTTTGCTTTTTCAA
ATT

QA 4 661 4 661
DS 

RD RS1ET13JQ 694 0 0
TGGATCTAAACAAAGAAGCCTCACCAAAGACACATCATTTGTTTTCAATAACAGGGTTGA
GGCAGCTCCGGTGGTGGGATGGCCGCCGGTGAGACCATCCCGGCGAAACCTAACGGCGCA
GCCAAAAGAGGAGATGAAGAAGGG**TAAACGATGACGCGAGAGAGTTGTACGTTAAGAT
CAATATGGAAGGAGTTCCCATTGGAAGAAAAGTCAACCTCTTCGCTTATAACAACTACCA
ACAGCTTTCATATGCCGTTGGCCAACTCTTCTCTAAGAAAGATTCGGCTGATGTAGACAG
ACAATACACTTTGGTCTACGAAGACACTGAAGGAGATATAGTTCTGGTCGGAGATGTTCC
TTGGGAGATGTTTATATCGACTGTGAAGAGATTGCACGTTTTAAAAACCTCCCACGTCTC
CATGCTCTCACCTATAAAACATGGCATGGAATAGAGCGAGGTTCACCAATACACCAGTTC
GATGTTTTGTTTAAAATTTAATTTATGTAAACCATGGGGCTTGGTTTGATTTACTGAGAT
TTCTTTTATTGTTACTTAGATTTTGCTTTTTCAAATTATGCTCTATGTTTTTCTTTATGC
TTATGGAAGACGAATTTGTGTAAATATGATGTTTGCTTAAGTAATCTGGGTGGTATTACT
ATGTTATCGTGAGTATAATCTATAAAGATAGTAG

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 4

CO CL2449Contig1 1129 4 4 U
ATTACGGCCGGGGGCCGCCTTTTGCCAGGTATTGCTGGTGGTCTTCTTCTGCTCTGTAGA
ATTTCTTGGCGGGAAGTATCTCTGTCACAATCTTCTTGTTCAAGATCTTCTGCTGTTTCT
CCAAAGATTCACGAGCTAACTTCTCTTGCTCGTCTGTGTAGTAGTATATGCCTGACCGGT
ACTGCGTTCCCACATCATTCCCCTACTCAATCAAGAAAAACTACTCAGTACGTAAAAGTC
AGTATGATGTGTAAAGAACATGTTCTGTTTCAGCATATTGGTAATGACAGTGTCACTTCC
ACATAACCCAACATGCCAAAAGAAAATGTTCTGTTTCAGCTAACATCATGATGTAATGCA
TGCAAAACAAAGTCTCGATTTTTAAGCCGAAGAAATAAAATTAAAATGAAGTTTTGATTT
TTAAGTCGAAAAAATTTAAATTAAAATAAAGCCTCGATTTTTTTTCAGTATGAAGCTATG
ACCTGGCGATTCAAGGTGGTGGGATCATGGCGCTTCCAGAAAACATCAAGCAGGTTCTCA
AAGCTGCACTCCTTCTCCTTAGGATTGTACTGAACTCTAACAACCTCGTTATGTCCCGTC
ATGCCCGTACAGACATCCTCGTATATCGGATTATGAACGAACCCATGGCTATACCCAACC
TCTGTTTTCGTCACACCGGGAACTCTCTGGTAAGCCAACTCCAGTCCCCAAAAGCAACCT
GCGCCGAACTGAGCGAACTGCTGACCTGGCGAAGGAACGTCATCGTCTGGTCCTTCGGCG
ATTGCGGCCGAAGACGGGTCTAGTTGGGAACTAGAACCGTACCCGAGTCTGTTGAAGAGG
TTGTTCATCGGGGGCTTGTAGATGGATACGGAACGAGCGGTTTTGGGGAAAGGACAGATG
GGTTTGACTAGAGGGAGTACGGCTTTAGAGAGGGAATGTAGAGGTTTAGAGAGAGAAGCG
GCGGAGATTACCGGAGGAGAGGTGATGAGAGCTAGCATTATCGAAGTGACGTGGCAATAT
GGGGAACTTTAGAGTTGTACGGCTACTATTTCTCTCCAAGTTTGCACGAGATTGTTCTTT
CAGTTTCTAGAAATCCACTTGTTCCGTATTTTCAAATTTAAGATGTAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A014TV U 119
AF RS1A014TF U 1
AF RS1A014TR C 269
AF RS1A014JQ C 338
BS 1 754 RS1A014TF
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BS 756 811 RS1A014TF
BS 812 1129 RS1A014TR

RD RS1A014TV 633 0 0
CTCCAAAGATTCACGAGCTAACTTCTCTTGCTCGTCTGTGTAGTAGTATATGCCTGACCG
GTACTGCGTTCCCACATCATTCCCCTACTCAATCAAGAAAAACTACTCAGTACGTAAAAG
TCAGTATGATGTGTAAAGAACATGTTCTGTTTCAGCATATTGGTAATGACAGTGTCACTT
CCACATAACCCAACATGCCAAAAGAAAATGTTCTGTTTCAGCTAACATCATGATGTAATG
CATGCAAAACAAAGTCTCGATTTTTAAGCCGAAGAAATAAAATTAAAATGAAGTTTTGAT
TTTTAAGTCGAAAAAATTTAAATTAAAATAAAGCCTCGATTTTTTTTCAGTATGAAGCTA
TGACCTGGCGATTCAAGGTGGTGGGATCATGGCGCTTCCAGAAAACATCAAGCAGGTTCT
CAAAGCTGCACTCCTTCTCCTTAGGATTGTACTGAACTCTAACAACCTCGTTATGTCCCG
TCATGCCCGTACAGACATCCTCGTATATCGGATTATGAACGAACCCATGGCTATACCCAA
CCTCTGTTTTCGTCACACCGGGAACTCTCTGGTAAGCCAACTCCAGTCCCCAAAAGCAAC
CTGCGCCGAACTGAGCGAACTGCTGACCTGGCG

QA 1 633 1 633
DS 

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ATTTCTTGGCGGGAAGTATCTCTGTCACAATCTTCTTGTTCAAGATCTTCTGCTGTTTCT
CCAAAGATTCACGAGCTAACTTCTCTTGCTCGTCTGTGTAGTAGTATATGCCTGACCGGT
ACTGCGTTCCCACATCATTCCCCTACTCAATCAAGAAAAACTACTCAGTACGTAAAAGTC
AGTATGATGTGTAAAGAACATGTTCTGTTTCAGCATATTGGTAATGACAGTGTCACTTCC
ACATAACCCAACATGCCAAAAGAAAATGTTCTGTTTCAGCTAACATCATGATGTAATGCA
TGCAAAACAAAGTCTCGATTTTTAAGCCGAAGAAATAAAATTAAAATGAAGTTTTGATTT
TTAAGTCGAAAAAATTTAAATTAAAATAAAGCCTCGATTTTTTTTCAGTATGAAGCTATG
ACCTGGCGATTCAAGGTGGTGGGATCATGGCGCTTCCAGAAAACATCAAGCAGGTTCTCA
AAGCTGCACTCCTTCTCCTTAGGATTGTACTGAACTCTAACAACCTCGTTATGTCCCGTC
ATGCCCGTACAGACATCCTCGTATATCGGATTATGAACGAACCCATGGCTATACCCAACC
TCTGTTTTCGTCACACCGGGAACTCTCTGGTAAGCCAACTCCAGTCCCCAAAAGCAACCT
GCGCCGAACTGAGCGAACTGCTGACCTGGCGAAG*AACGTCATCGTCTGGTCCTTCGGCG
ATTGCGGCCGAAGACGGGTCTAGTTGGGAAC

QA 1 811 1 811
DS 

RD RS1A014TR 861 0 0
TTCAGCATATTGGTAATGACAGTGTCACTTCCACATAACCCAACATGCCAAAAGAAAATG
TTCTGTTTCAGCTAACATCATGATGTAATGCATGCAAAACAAAGTCTCGATTTTTAAGCC
GAAGAAATAAAATTAAAATGAAGTTTTGATTTTTAAGTCGAAAAAATTTAAATTAAAATA
AAGCCTCGATTTTTTTTCAGTATGAAGCTATGACCTGGCGATTCAAGGTGGTGGGATCAT
GGCGCTTCCAGAAAACATCAAGCAGGTTCTCAAAGCTGCACTCCTTCTCCTTAGGATTGT
ACTGAACTCTAACAACCTCGTTATGTCCCGTCATGCCCGTACAGACATCCTCGTATATCG
GATTATGAACGAACCCATGGCTATACCCAACCTCTGTTTTCGTCACACCGGGAACTTTTT
GGTAAGCCAACTCCAGTCCCCAAAAGCAACCTGCGCCGAACTGAGCGAACTGCTGACCTG
GCGAAGGAACGTCATCGTCTGGTCCTTCGGCGATTGCGGCCGAAGACGGGTCTAGTTGGG
AACTAGAACCGTACCCGAGTCTGTTGAAGAGGTTGTTCATCGGGGGCTTGTAGATGGATA
CGGAACGAGCGGTTTTGGGGAAAGGACAGATGGGTTTGACTAGAGGGAGTACGGCTTTAG
AGAGGGAATGTAGAGGTTTAGAGAGAGAAGCGGCGGAGATTACCGGAGGAGAGGTGATGA
GAGCTAGCATTATCGAAGTGACGTGGCAATATGGGGAACTTTAGAGTTGTACGGCTACTA
TTTCTCTCCAAGTTTGCACGAGATTGTTCTTTCAGTTTCTAGAAATCCACTTGTTCCGTA
TTTTCAAATTTAAGATGTAAG

QA 1 861 1 861
DS 

RD RS1A014JQ 792 0 0
AGCTAACATCATGATGTAATGCATGCAAAACAAAGTCTCGATTTTTAAGCCGAAGAAATA
AAATTAAAATGAAGTTTTGATTTTTAAGTCGAAAAAATTTAAATTAAAATAAAGCCTCGA
TTTTTTTTCAGTATGAAGCTATGACCTGGCGATTCAAGGTGGTGGGATCATGGCGCTTCC
AGAAAACATCAAGCAGGTTCTCAAAGCTGCACTCCTTCTCCTTAGGATTGTACTGAACTC
TAACAACCTCGTTATGTCCCGTCATGCCCGTACAGACATCCTCGTATATCGGATTATGAA
CGAACCCATGGCTATACCCAACCTCTGTTTTCGTCACACCGGGAACTCTCTGGTAAGCCA
ACTCCAGTCCCCAAAAGCAACCTGCGCCGAACTGAGCGAACTGCTGACCTGGCGAAGGAA
CGTCATCGTCTGGTCCTTCGGCGATTGCGGCCGAAGACGGGTCTAGTTGGGAACTAGAAC
CGTACCCGAGTCTGTTGAAGAGGTTGTTCATCGGGGGCTTGTAGATGGATACGGAACGAG
CGGTTTTGGGGAAAGGACAGATGGGTTTGACTAGAGGGAGTACGGCTTTAGAGAGGGAAT
GTAGAGGTTTAGAGAGAGAAGCGGCGGAGATTACCGGAGGAGAGGTGATGAGAGCTAGCA
TTATCGAAGTGACGTGGCAATATGGGGAACTTTAGAGTTGTACGGCTACTATTTCTCTCC
AAGTTTGCACGAGATTGTTCTTTCAGTTTCTAGAAATCCACTTGTTCCGTATTTTCAAAT
TTAAGATGTAAG

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 3

CO CL2450Contig1 954 3 9 U
GGAAAATGCAAAATATCTAAAAAAGGATTCGGGAAACTTTTTTTTTTTTGTCGAAAAGAG
AATCCAAAACCTTTCTTTCATTCCTCAAATTCCAAGCACAAGCAATCCCACAAGATTCGT
CAATTCAACTAATCCCATTCTCTCAGTAAAAGTTTGGTTTTTTTGATTTTTTGTTGAAAC
CGAAAGGGAAACACTTTCAATCTTCCTTTTCACGTTTTTAGCGTTCTGGGTGTTTCTGTT
TGATGAGGTGCGAGGAGGAGATTCTTCCTCTGTTTGTGTCTCTGTCAGATGGAAGACAAT
GATAAGTCTCCTCCCCCTAAGGATTACTATAAGATTCTAGAAGTTGATTACGACGCAACT
GAGGAACTGATCAGAGTGAATTACCGGAAGCTTGCTTTGAAGTGGCATCCTGATAAGCAC
AAAGGAGATAGTGCAGCTTCAGAAAAGTTTATAGAGATAAATGATGCTTATAACGTGCTG
ATGGATCCTGCTGCACGTTTTGAATATGATTTAACCGGTATCTACGAGATTCACAAGTAT
ACTTTGCGGGAATATCTTGCTAGATTTAAGGGAATGATACTCACTTGCAATGGGCTCGGC
ATCAGCCAATCCTCATCACCATGGACACATCAATTGTCTGAGACCACCAGCAAAACAACA
GACTAGCAAGGATAAAGCAGAAGTTAGAGGAGAGCTGTAAAACTGTTGTCAAGATTCTCA
CCGGCTTTTAACACCGGTGTGTTTTGTGCTGTACAAAACTGGACCCCATAGCACGAAGCA
TTGATGTTATATATTGAAATGCTTTAGAATTAGATGTTGTGTTGTTTCTGAATCAATGTA
GAATTAGAGACAGCGTATATGGTCTCTTGTTTCGATTACATACATTTACTCAGTTTGTGA
TGTTTCAGGTCTTGTTCTACTACTCTCATCATCATTCATTGTTTTTTTCTCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D810TF U 1
AF RS1CG69TF U 50
AF RS1D810JQ C 492
BS 1 103 RS1D810TF
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BS 781 954 RS1D810JQ

RD RS1D810TF 348 0 0
GGAAAATGCAAAATATCTAAAAAAGGATTCGGGAAACTTTTTTTTTTTTGTCGAAAAGAG
AATCCAAAACCTTTCTTTCATTCCTCAAATTCCAAGCACAAGCGATCCCACAAGATTCGT
CAATTCAACTAATCCCATTCTCTCAGTAAAAGTTTGGTTTTTTTGATTTTTTGTTGAAAC
CGAAAGGGAAACACTTTCAATCTTCCTTTTCACGTTTTTAGCGTTCTGGGTGTTTCTGTT
TGATGAGGTGCGAGGAGGAGATTCTTCCTCTGTTTGTGTCTCTGTCAGATGGAAGACAAT
GATAAGTCTCCTCCCCCTAAGGATTACTATAAGATTCTAGAAGTTGAT

QA 1 348 1 348
DS 

RD RS1CG69TF 731 0 0
GTCG
AAAAGAGAATCCAAAACCTTTCTTTCATTCCTCAAATTCCAAGCACAAGCAATCCCACAA
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TTGAAACCGAAAGGGAAACACTTTCAATCTTCCTTTTCACGTTTTTAGCGTTCTGGGTGT
TTCTGTTTGATGAGGTGCGAGGAGGAGATTCTTCCTCTGTTTGTGTCTCTGTCAGATGGA
AGACAATGATAAGTCTCCTCCCCCTAAGGATTACTATAAGATTCTAGAAGTTGATTACGA
CGCAACTGAGGAACTGATCAGAGTGAATTACCGGAAGCTTGCTTTGAAGTGGCATCCTGA
TAAGCACAAAGGAGATAGTGCAGCTTCAGAAAAGTTTATAGAGATAAATGATGCTTATAA
CGTGCTGATGGATCCTGCTGCACGTTTTGAATATGATTTAACCGGTATCTACGAGATTCA
CAAGTATACTTTGCGGGAATATCTTGCTAGATTTAAGGGAATGATACTCACTTGCAATGG
GCTCGGCATCAGCCAATCCTCATCACCATGGACACATCAATTGTCTGAGACCACCAGCAA
AACAACAGACTAGCAAGGATAAAGCAGAAGTTAGAGGAGAGCTGTAAAACTGTTGTCAAG
ATTCTCACCGGCTTTTA*CACCGGTGTGTTTTGTGCTGTACAAAACTGGACCC*ATAGCA
CGAAGCA

QA 5 731 5 731
DS 

RD RS1D810JQ 463 0 0
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ATATCTTGCTAGATTTAAGGGAATGATACTCACTTGCAATGGGCTCGGCATCAGCCAATC
CTCATCACCATGGACACATCAATTGTCTGAGACCACCAGCAAAACAACAGACTAGCAAGG
ATAAAGCAGGAGTTAGAGGAGAGCTGTAAAACTGTTGTCAAGATTCTCACCGGCTTTTAA
CACCGGTGTGTTTTGTGCTGTACAAAACTGGACCCCATAGCACGAAGCATTGATGTTATA
TATTGAAATGCTTTAGAATTAGATGTTGTGTTGTTTCTGAATCAATGTAGAATTAGAGAC
AGCGTATATGGTCTCTTGTTTCGATTACATACATTTACTCAGTTTGTGATGTTTCAGGTC
TTGTTCTACTACTCTCATCATCATTCATTGTTTTTTTCTCAGC

QA 1 463 1 463
DS 



AS 2 4

CO CL2451Contig1 1319 2 2 U
GGGGAAATAAGAAAAAAGAAAAAAAAAAGTAAACTTGGAGGAAACAAAGGCGAAAACTTT
TATGGTCCAAAGATCGAGACACAGATCATCATCTTCTTTTTTGGCTATCTGCGCGATCGA
TTACTGTCTGAAAGGTTGAAACTTTTTGTTGTGTAGACAGAAGGGTGTTGTTTTGGACCG
TGTTCTCTTTTGAATGGCGCAGGGAAGCATGGACCCTGCCGTTCTCGACGACATCATCCG
TCGTCTGTTGGATTACAGAAACCCTAAGCCTGGAACCAAACAGGTCATGCTCAACGAGTC
TGAGATCCGACAGCTTTGTCTCGTATCCAAAGAGATTTTCCTTCAACAGCCTAACCTCCT
TGAGCTCGAAGCTCCCATCAAGATCTGCGGTGATATACATGGACAGTACGGAGGCTTCCC
TCCTACAGCCAACTACCTCTTCTTAGGAGACTACGTGGACCGCGGGAAGCAGAGCTTAGA
GACCATCTGCCTCCTCCTCGCCTACAAAATCAAATACCCTGAGAACTTCTTCCTCCTAAG
AGGCAACCACGAGTGCGCTTCCATCAACAGAATCTACGGATTCTACGACGAGTGCAAACG
CAGGTTCAGCGTGAGGCTCTGGAAAGTGTTTACGGATTCTTTCAACTGCCTCCCGGTGGC
TGCTGTGATAGACGATAAGATACTGTGTATGCACGGTGGCCTTTCTCCCGATTTGACCAG
TGTGGAGCAAATCAAGACTATTAAGAGACCTACCGATGTTCCGGACACCGGTTTGCTATG
TGATCTGCTTTGGTCTGATCCGAGCAAAGATGTAAAAGGCTGGGGGATGAACGACCGTGG
TGCCTCTTACACGTTTGGGCCTGACAAAGTTGCTGAGTTTCTTATCAAGAACGATATGGA
TCTCATCTGTCGTGCCCACCAGGTTGTAGAGGATGGCTATGAGTTCTTTGCAGATAGACA
GCTTGTTACTATATTTTCAGCTCCAAACTACTGTGGTGAATTCGACAATGCTGGTGCGAT
GATGAGTGTTGATGATAGTTTAATGTGCTCTTTCCAAATTCTTAAGCCTGCGGATCGGAG
GCCCCGGTTCTTATGATCCAAAAGAGTTAGAACCTGGCGGGAGGGACATTTGAAGCTCCC
TGAGACTTTGTTCAGAGGCCAAAAAAAGAAAAAAAGTCTAAATGTTATATTATCATCATC
TTATTTGAACTTTTACCATTTCTCTTCTTAAACCTTTTATGTTCTTATGATCTTCTTCTT
CTTCTCTGACTCATTATTAGACAGTAACAAAATAATGTCTGCAAATTTTTTTATTATCC


BQ
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DS 



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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GC07TF U 1
AF RS1GC07JQ C 610
BS 1 740 RS1GC07TF
BS 741 741 RS1GC07JQ
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BS 783 783 RS1GC07JQ
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BS 801 836 RS1GC07TF
BS 837 1344 RS1GC07JQ

RD RS1GC07TF 840 0 0
GGGGGAAATAAGAAAAAAGAAAAAAAAAGTAAACTTGGAGGAAACAAAGGCGAAAACTTT
TATGGTCCAAAGATCGAGACACAGATCATCATCTTCTTTTTTGGCTATCTGCGCGATCGA
TTACTGTCCGAAAGGTTGAAACTTTTGTTGTGTAGACAGAAGGGTGTTGTTTTGGATCGT
GTTCTTTGAATGGCGCAGGGAAGCATGGACCCTGCCGTTCTCGACGACATCATTCGCCGT
CTGTTGGATTACAGAAACCCTAAGCCTGGAACCAAACAGGTCATGCTCAACGAGTCTGAG
ATCCGACAGCTTTGTCTCGTCTCCAAAGAGATTTTCCTTCAACAGCCTAACCTCCTTGAG
CTCGGAGCTCCCATCAAGATCTGCGGTGATATACATGGACAGTACTCAGATCTACTGAGG
CTGTTTGAGTACGGAGGCTTCCCTCCTACAGCTAACTACCTCTTCTTAGGAGACTACGTG
GACCGCGGGAAGCAGAGCCTAGAGACCATCTGCCTCCTCCTCGCCTACAAAATCAAATAC
CCTGAGAACTTCTTCCTCCTAAGAGGCAACCACGAGTGCGCTTCCATCAACAGAATCTAT
GGATTCTACGACGAGTGCAAACGCAGGTTCAGCGTGAGGCTCTGGAAAGTGTTCACAGAC
TCTTTCAACTGCCTCCCGGTGGCTGCTGTGATAGACGATAAGATACTGTGTATGCACGGT
GGCTTTTCTCCCGATTTGAC*AGCGTGGAGCAGATCAAGACTATTAAGAGAC*TACCGAT
GT*CCGGACACCGGTTTGT*ATGTGATCTGCTTTGGTCTGATCCGAGCAAAGATGT
CAAA

QA 1 836 1 836
DS 

RD RS1GC07JQ 735 0 0
GACGAGTGCAAACGCAGGTTCAGCGTGAGGCTCTGGAAAGTGTTCACAGACTCTTTCAAC
TGCCTCCCGGTGGCTGCTGTGATAGACGATAAGATACTGTGTATGCACGGTGGCTTTTCT
CCCGATTTGACCAGCGTGGAGCAGATCAAGACTATTAAGAGACCTACCGATGTTCCGGAC
ACCGGTTTGTTATGTGATCTGCTTTGGTCTGATCCGAGCAAAGATGTCAAAGGCTGGGGG
ATGAACGACCGTGGTGTCTCTTACACGTTTGGGCCTGACAAAGTTGCTGAGTTTCTTATC
AAGAACGATATGGATCTCATCTGTCGTGCCCACCAGGTTGTAGAGGATGGGTATGAGTTC
TTTGCAGATAGACAGCTTGTTACTATATTTTCAGCTCCAAACTACTGTGGTGAATTCGAC
AATGCTGGTGCGATGATGAGTGTTGATGAGAGTTTGATGCGCTCTTTCCAAATTCTTAAG
CCTGCGGATCGGAGGCCCCGGTTCTTATGATCGAAAAGAGTTAGAACCTGGCGGGAGAGA
GACATTTGAAGCTCCCTGAGACTTTGTTCAGAGGCCAAAAAAAAAGAAAGTCTAAATGTT
ATATTATCATCATCTTATTTGAACTCTTACCATTTCTCTTCTTAAACCTTTTATGTTCTT
ATGATCTTCTTCTTCTCAGACTCATTATTAGACAGTAACAAAATAATGTCTGCAAATTTT
TTATTATTCATCAGC

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 4

CO CL2452Contig1 887 4 10 U
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GTATAGGATAAAACCGAAAAGGAACTCATACATCTTGTAACACGAACCACACAAATGCCA
TACAAAATAAATCATAACCAGCTTATTAATAAAATTTATCTATATATGGTTTTAAAGATA
GATATCTTCACTTATATATAAATATGATCAGACGGTTCCCCGAGATCATATAAATATACC
TAGTGAGTAATATACTTCACAATGATATAAGTAACATTTGATATATAATTTTCTTCTCAG
CACTCTGTCCCATTGTACTTCAAAGCTCCAGCACTGATTACCATACACACATTATTAAGC
TAGCTTAGCTTGCTTGTTGCTCTCCAGCATTAGACCAAAGTGAATATGAGGAAAGTGTGC
CCAATTCTTGGCGGCGGTGCTGAATGCTTCCCTGTGGCTTATGTCTGGATTATTAGCCTT
GATCCTATGAATTTCCTCTTTTATAAATTGATTGTAGGCTGAAGGTACTCGCTGCCTCTT
TTCGGGAGGACGGTTTACAACTCTTTGCTCAGAAATAGTACGAGCTGAAATTCTGGAAGA
AATTTTGGTGTGGCCTCTTGAGGAAGATCCATACTCTGGCGTTGCATAGGGTGTTGCCTG
GAAATTAGGGCGTGAAAGCGACTGAAGAGCAGCTGCCATGTTTACAGACCACAGATTGGT
GCAGTGGCCGCATCGGACGGTCACGATGTCGAACAGACTGCTGCCTGGGACACTTACCGC
AAGAACTATGTTGCAGAAGTTACAAGGAATATAGCAAAGTTGCTCAGCCGCCGTCGCGGA
GTTAGACATGATCGATAGAAGGAACCAGACTGCGCAAGTTTGTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1D680JQ U 43
AF RS1E743JQ U 1
AF RS1E743TF C 154
AF RS1D680TF C 313
BS 1 51 RS1E743JQ
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BS 836 887 RS1E743TF

RD RS1D680JQ 652 0 0
TTTTT
TTTTAGATTCAATGTATAGGATAAAACCGAAAAGGAACTCATACATCTTGTAACACGAAC
CACACAAATGCCATACAAAATAAATCATAACCAGCTTATTAATAAAATTTATCTATATAT
GGTTTTAAAGATAGATATCTTCACTTATATATAAATATGATCAGACGGTTCCCCGAGATC
ATATAAATATACCTAGTGAGTAATATACTTCACAATGATATAAATAACATTTGATATATA
ATTTTCTTCTCAGCACTCTGTCCCATTGTACTTCAAAGCTCCAGCACTGATTACCATACA
CACATTATTAAGCTAGCTTAGCTTGCTTGTTGCTCTCCAGCATTAGACCAAAGTGAATAT
GAGGAAAGTGTGCCCAATTCTTGGCGGCGGTGCTGAATGCTTCCCTGTGGCTTATGTCTG
GATTATTAGCCTTGATCCTATGAATTTCCTCTTTTATAAATTGGTTGTAGGCTGAAGGTA
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AAATTCTGGAAGAAATTTTGGTGTGGCCTCTTGAGGAAGATCCATACTCTGGCGTTGCAT
AGGGTGTTGCCTGGAAATTAGGGCGTGAAAGCGACTGAAGAGCAGCT

QA 6 652 6 652
DS 

RD RS1E743JQ 795 0 0
ATGAAACATAGAGGATTATAGTAAAAGTATTAGTACATATTGTGGACTTTTGGATTCAAT
GTATAGGATAAAACCGAAAAGGAACTCATACATCTTGTAACACGAACCACACAAATGCCA
TACAAAATAAATCATAATCAGCTTATTAATAAAATTTATCTATATATGGTTTTAAAGATA
GATATCTTCACTTATATATAAATATGATCAGACGGTTCCCCGAGATCATATAAATATACC
TAGTGAGTAATATACTTCACAATGATATAAGTAACATTTGATATATAATTTTCTTCTCAG
CACTCTGTCCCATTGTACTTCAAAGCTCCAGCACTGATTACCATACACACATTATTAAGC
TAGCTTAGCTTGCTTGTTGCTCTCCAGCATTAGACCAAAGTGAATATGAGGAAAGTGTGC
CCAATTCTTGGCGGCGGTGCTGAATGCTTCCCTGTGGCTTATGTCTGGATTATTAGCCTT
GATCCT**GAATTTCCTCTTTTATAAATTGATTGTAGGCTGAAGGTACTCGCTGCCTCTT
TTCGGGAGGACGGTTTACAACTCTTTGCTCAGAAATAGTACGAGCTGAAATTCTGGAAGA
AATTTTGGTGTGGCCTCTTGAGGAAGATCCATACTCTGGCGTTGCATAGGGTGTTGCCTG
GAAATTAGGGCGTGAAAGCGACTGAAGAGCAGCTGCCATGTTTACAGACCACAGATTGGT
GCAGTGGCCGCATCGGACGGTCACGATGTCGAACAGACTGCTGCCTGGGACACTTACCGC
AAGAACTATGTTGCA

QA 1 795 1 795
DS 

RD RS1E743TF 734 0 0
AA
TTATCTATATATGGTTT*AAAGATAGATATCTTCACTTATATATAAATATGATCAGACGG
TTCCCCGAGATCATATAAATATAC*TAGTGAGTAATATACTTCACAATGATATAAGTAAC
ATTTGATATATAATTTTCTTCTCAGCACTCTGTCCCATTGTACTTCAAAGCTCCAGCACT
GATTACCATACACACATTATTAAGCTAGCTTAGCTTGCTTGTTGCTCTCCAGCATTAGAC
CAAAGTGAATATGAGGAAAGTGTGCCCAATTCTTGGCGGCGGTGCTGAATGCTTCCCTGT
GGCTTATGTCTGGATTATTAGCCTTGATCCT**GAATTTCCTCTTTTATAAATTGATTGT
AGGCTGAAGGTACTCGCTGCCTCTTTTCGGGAGGACGGTTTACAACTCTTTGCTCAGAAA
TAGTACGAGCTGAAATTCTGGAAGAAATTTTGGTGTGGCCTCTTGAGGAAGATCCATACT
CTGGCGTTGCATAGGGTGTTGCCTGGAAATTAGGGCGTGAAAGCGACTGAAGAGCAGCTG
CCATGTTTACAGACCACAGATTGGTGCAGTGGCCGCATCGGACGGTCACGATGTCGAACA
GACTGCTGCCTGGGACACTTACCGCAAGAACTATGTTGCAGAAGTTACAAGGAATATAGC
AAAGTTGCTCAGCCGCCGTTGCGGAGTTAGACATGATCGATAGAAGGAACCAGACTGCGC
AAGTTTGTGTCC

QA 3 734 3 734
DS 

RD RS1D680TF 575 0 0
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CTTGTTGCTCTCCAGCATTAGACCAAAGTGAATATGAGGAAAGTGTGCCCAATTCTTGGC
GGCGGTGCTGAATGCTTCCCTGTGGCTTATGTCTGGATTATTAGCCTTGATCCTATGAAT
TTCCTCTTTTATAAATTGGTTGTAGGCTGAAGGTACTCGCTGCCTCTTTTCGGGAGGACG
GTTTACAACTCTTTGCTCAGAAATAGTACGAGCTGAAATTCTGGAAGAAATTTTGGTGTG
GCCTCTTGAGGAAGATCCATACTCTGGCGTTGCATAGGGTGTTGCCTGGAAATTAGGGCG
TGAAAGCGACTGAAGAGCAGCTGCCATGTTTACAGACCACAGATTGGTGCAGTGGCCGCA
TCGGACGGTCACGATGTCGAACAGACTGCTGCCTGGGACACTTACCGCAAGAACTATGTT
GCAGAAGTTACAAGGAATATAGCAAAGTTGCTCAGCCGCCGTCGCGGAGTTAGACATGAT
CGATAGAAGGAACCAGACTGCGCAAGTTTGTGTCC

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 4

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AATGTGCTTCTTCCCGCAATACGTAGCTCGCCAGATTAGAACTCCAGTATTCATTCTTAA
TACCGCATACGACTCTTGGCAGATAAAGAACATTTTGGCTCCCCGTGCTGCTGATCCTTA
TGGAAAATGGCAAAGTTGTCAACTTGACATCAAGAATTGCCAACCAAACCAGCTGAAAGT
TATGCAAGATTTCAGGTTAGAGTTCTTGAGTTGCGGTGATAGGTCTAGGTAGAT*CTTCA
TCAAGAGGGATGTTCATAGACTCTTGTTACACTCACTGCCAAACCGAGACACAAACTTCA
CGGTTCTGGCAAGATTCTCCAATTCTAAACCGAACGACAATAGCAAAAGCTGTTGGAGAT
TGGGTTTATGACAGAAAATTGTTTCAGAAGATAGATTGTCCTTATCCCTGTAACCCTACT
TGCCACCACAGGGTTTTCACTCCTCAAGATGCTCCTCCAATTTAAGAAATACATATAGAT
TTACTATTCATTATAAAAAAGAAAAAAATACTTATAACTGACTCATTTGTCATATTACAG
TGATATATTTGTAGGGTTTAGCTATAGAAAAAGAAAAAGTGGTGATTGATTCTTGATTGT
TGAGAATACGCAAAAGGAGTAATTTTCTTCAGCACATGTGTGTGCTGAAGTTGCTCTGTT
TTCTCTTCCATTCTTATTCTCATGTAAAATGCAAATTTGTTACTTGTATTCGAATAAATA
AAGTATATTCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AH46TF U 199
AF RS1AH46JQ C 1
AF RS1CN01JQ C 210
AF RS1CN01TF U 210
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TGCCACCACAGGGTTTTCACTCCTCAAGATG**CCTCCAATTTAAGAAATACATATAGAT
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AAGTATATTCTTTT

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AG
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CTCCTCCAATTTAAGAAATACATATAGATTTACTATTCATTATAAAAAAGAAAAAAATAC
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QA 3 514 3 514
DS 

RD RS1CN01TF 514 0 0
AG
TGCGGTGATAGGTCTAGGTAGAT*CTTCATCAAGAGGGATGTTCATAGACTCTTGTTACA
CTCACTGCCAAACCGAGACACAAACTTCACGGTTCTGGCAAGATTCTCCAATTCTAAACC
GAACGACAATAGCAAAAGCTGTTGGAGATTGGGTTTATGACAGAAAATTGTTTCAGAAGA
TTGATTGTCCTTATCCCTGTAACCCTACTTGCCACCACAGGGTTTTCACTCCTCAAGATG
CTCCTCCAATTTAAGAAATACATATAGATTTACTATTCATTATAAAAAAGAAAAAAATAC
TTATAACTGACTCATTTGTCATATTACAGTGATATATTTGTAGGGTTTAGCTATAGAAAA
AGAAAAAGTGGTGATTGATTCTTGATTGTTGAGAATACGCAAAAGGAGTAATTTTCTTCA
GCACATGTGTGTGCTGAAGTTGCTCTGTTTTCTCTTCCATTCTTATTCTCATGTAAAATG
CAAATTTGTTACTTGTATTCGAATAAATAAAG

QA 3 514 3 514
DS 



AS 1 3

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TCAACCTCTCCTCTCACAGAATCTCCTCTCAACGCAATCTGAGAGCGGATGCTCGTGTTC
CATCTTCTTCGTCTTGTGAGATTACTAGGACGAATCGGTCGTGGGCTTTGCCATGTTCCT
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CATCTATAAAAAGTGCCTTCAGTTTGTGTGTACAACAAGGAGCCAAACGTGTAGTTGTTA
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ATGCTGCAAAGGAGTTCTCTGACATCTCATACCTCATTACTGCACCTCTCGGCCTCCATA
ATCTCCTCATTGATGTTGTGAACGACAGAATCCAACATTGTCTGAGTCATGTTGAAAGTG
ATGCAGACGAATGTCTCGTTTGTGCTGGAACAAACAAGTGCAAGCTCTACAATAGTTCTT
AGGCTCAAATGTAAGAAGAACGTTTTTGTATATCTTCTGGTTTTCTCTAACCTTTCGGAT
GAGGAAAAAATAAAACCAATGAGGCATGTTATATTGTTCATAGTTCCTACTCATCAGTTA
TTACACGTTCTTGTTTCACACCAATTGAAAACACAACAATCATAATAAGATTTATCTGTT
AAGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1BG37TF U 33
AF RS1C496TF U 1
AF RS1C496JQ C 538
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GG
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AAGAAGAAGAGGATCGCCATCTTTGGCGAGCTTCGAGGATGGTGAGCTGCTCAGAAGTGG
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CATTACTGCACCTCTCGGTCTCCATAATCTCCTCATTGATGTTGTGAAC

QA 3 591 3 591
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CATCTTCTTCGTCTTGTGAGATTACTAGGACGAATCGGTCGTGGGCTTTGCCATGTTCCT
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CGAGCTTCGAGGATGGTGGGCTGCTCAGAAGTGGGATTGGTGGTACTGATGGGATTATAA
TCGTCGATCACGGTTCTCGTCGCCGTGAATCTAATCTCATGCTTGAGGAGTTTGTGAAGA
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CATCTATAAAAAGTGCCTTCAGTTTGTGTGTACAACAAGGAGCCAAACGTGTAGTTGTTA
GCCCATTTTTTCTCTTTCCTTGAAGACATTGGCATCAGGACATTCCTGCTTTGACGGCTG
ATGCTGCAAAGGAGTTCTCTGACATCTCATACCTCATTACTGCACCTCTCGGCCTCCATA
ATCTCCTCATTGATGTTGTGAACGACAGAATCCAACATTGTCTGAGTCATGTTGAAAGTG
ATGCAGACGAATGTCTCGTTTGTGCTGGAACAAACAAGTGCAAGCTCTACAATAGTTCTT
AG*CTCAA*TGTAAGAAGAACGTTTTTGTATATCTTCTGGTT

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1C496JQ 369 0 0
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ATAATCTCCTCATTGATGTTGTGAACGACAGAATCCAACATTGTCTGAGTCATGTTGAAG
GTGATGCAGACGAATGTCTCGTTTGTGCTGGAACAAACAAGTGCAAGCTCTACAATAGTT
CTTAGGCTCAAATGTAAGAAGAACGTTTTTGTATATCTTCTGGTTTTCTCTAACCTTTCG
GATGAGGAAAAAATAAAACCAATGAGGCATGTTATATTGTTCATAGTTCCTACTCATCAG
TTATTACACGTTCTTGTTTCACACCAATTGAAAACACAACAATCATAATAAGATTTATCT
GTTAAGTGC

QA 1 369 1 369
DS 



AS 1 4

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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1D777JQ C 1
AF RS1AW12JQ C 1
AF RS1AW12TF U 1
AF RS1D777TF U 1
BS 1 401 RS1AW12TF

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TGCATTTTCCCGGAACATCCAAGACAGAACCAAAAAAACAAAAGCTTGTGACTTTCTCAT
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QA 1 355 1 355
DS 

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CTGAAACAAAGAGATTTGGATTTGTTCTATTCTAATCTTTGCCCATTTGATCCACTTTCA
TCCTCTCAGTTCTAATACTAATTAGCCTTTAATTTGTCTCTTTCCCCTTTGTGTGTTTCC
TGCATTTTCCCGGAACATCCAAGACAGAACCAAAAAAACAAAAGCTTGTGACTTTCTCAT
CAATCCTCTAACCCATTGTTCGTACCCCGATTTGGCGCGAACCCTTTTGTTTCAATTTCG
GATTCCTGCGGCGAAGAAAAAGTTTTCGATCAGATCAGAGC

QA 1 401 1 401
DS 

RD RS1AW12TF 401 0 0
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TCCTCTCAGTTCTAATACTAATTAGCCTTTAATTTGTCTCTTTCCCCTTTGTGTGTTTCC
TGCATTTTCCCGGAACATCCAAGACAGAACCAAAAAAACAAAAGCTTGTGACTTTCTCAT
CAATCCTCTAACCCATTGTTCGTACCCCGATTTGGCGCGAACCCTTTTGTTTCAATTTCG
GATTCCTGCGGCGAAGAAAAAGTTTTCGATCAGATCAGAGC

QA 1 401 1 401
DS 

RD RS1D777TF 401 0 0
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TGCATTTTCCCGGAACATCCAAGACAGAACCAAAAAAACAAAAGCTTGTGACTTTCTCAT
CAATCCTCTAACCCATTGTTCGTACCCCGATTTGGCGCGAACCCTTTTGTTTCAATTTCG
GATTCCTGCGGCGAAGAAAAAGTTTTCGATCAGATCAGAGC

QA 1 401 1 401
DS 



AS 1 4

CO CL2456Contig1 775 4 4 U
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TCTCCCACAGACGTAGAAACGATCTCGCCATCGAATCAAAGGCCGTGGACGTGGACGCGG
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CGTCGCTCGCTTACTCGAACACGCTCCTCTTCAGCAGCTCGGGGTACAACGTGCAGGTGT
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GAACCGGAGTCATACAGGAATGCAAGAGGAGGAGGTACTTTGAGAACAAGCAGGATGAGA
AGAAGCGGAGGACTCGTGATGCTGCTAAGCGTAACAAGAAAAGGCGTCCGTTTGCAAAGT
TTACTCAAGAGACCAGAGAAGAAGCAGCAGCGGCAGCAACCAAGGGTAAGAAGAAGGATG
AACAAGAAGATAACTGGGACTGGGAGATGCCTGGTGGAGATGTACCTTCTTGAACCACGG
TTTCAGTACATAGATCTCCCCTTCCTTTTCTGTGTATTTTGATTACTCGGTGACTTT*GT
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ATCTTTTTATTATGACTAAAAGTTTAATTTCAATTTGGTTCCGGTGTTTTCTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BX46TF U 300
AF RS1ED71TF U 1
AF RS1ED71JQ C 98
AF RS1BX46JQ C 295
BS 1 534 RS1ED71TF
BS 535 535 RS1BX46TF
BS 536 727 RS1ED71TF
BS 728 775 RS1ED71JQ

RD RS1BX46TF 384 0 0
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GAACAAGAAGATAACTGGGACTGGGAGATGCCTGGTGGAGATGTACCTTCTTGAACCACG
GTTTCAGTACATAGATCTCCCCTTCCTTTTCTGTGTATTTTGATTACTCGGTGACTTTTG
TATGTTCAAATTGCGTGTAACTGG

QA 1 384 1 384
DS 

RD RS1ED71TF 731 0 0
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TCAAATCCCACACCAAACCAACCCCGCCTCCCAACCTCACTCTCCCCACTCCAACAACAG
TCTCCCACAGACGTAGAAACGATCTCGCCATCGAATCAAAGGCCGTGGACGTGGACGCGG
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CGTCGCTCGCTTACTCGAACACGCTCCTCTTCAGCAGCTCGGGGTACAACGTGCAGGTGT
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GAACCGGAGTCATACAGGAATGCAAGAGGAGGAGGTACTTTGAGAACAAGCAGGATGAGA
AGAAGCGGAGGACTCGTGATGCTGCTAAGCGTAACAAGAAAAGGCGTCCGTTTGCAAAGT
TTACTCAAGAGACCAGAGAAGAAGCAGCAGCGGCAGCAACCAAGGGTAAGAAGAGGGATG
AACAAGAAGATAACTGGGACTGGGAGATGCCTGGTGGAGATGTACCTTCTTGAACCACGG
TTTCAGTACATAGATCTCCCCTTCCTTTTCTGTGTATTTTGATTACTCGGTGACTTT*GT
ATGTTCAAATTGCGTGTAACTGGCCTCTCTGGTAATGAGTTCTTGTCAATGTTAAAAGAC
ATCTTTT
ATTA

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1ED71JQ 678 0 0
CACTCTCCCCACTCCAACAACAGTCTCCCACAGACGTAGAAACGATCTCGCCATCGAATC
AAAGGCCGTGGACGTGGACGCGGACGAGCTTCCTCCTTACAACGCTTCTCTCTCCTCCTC
GGAGCTCGCTTCGGTGATATGCCCGTCGCTCGCTTACTCGAACACGCTCCTCTTCAGCAG
CTCGGGGTACAACGTGCAGGTGTTCGTGGAGGACAACGAGTCGGAGGAGAGGCTGGTGAA
TCGGTTTAGAAGGGAGGTGATGAGAACCGGAGTCATACAGGAATGCAAGAGGAGGAGGTA
CTTTGAGAACAAGCAGGATGAGAAGAAGCGGAGGACTCGTGATGCTGCTAAGCGTAACAA
GAAAAGGCGTCCGTTTGCAAAGTTTACTCAAGAGACCAGAGAAGAAGCAGCAGCGGCAGC
AACCAAGGGTAAGAAGAGGGATGAACAAGAAGATAACTGGGACTGGGAGATGCCTGGTGG
AGATGTACCTTCTTGAACCACGGTTTCAGTACATAGATCTCCCCTTCCTTTTCTGTGTAT
TTTGATTACTCGGTGACTTT*GTATGTTCAAATTGCGTGTAACTGGCCTCTCTGGTAATG
AGTTCTTGTCAATGTTAAAAGACATCTTTTTATTATGACTAAAAGTTTAATTTCAATTTG
GTTCCGGTGTTTTCTCTC

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1BX46JQ 457 0 0
GGGTG
TTCGTGGAGGACAACGAGTCGGAGGAGAGGCTGGTGAATCGGTTTAGAAGGGAGGTGATG
AGAACCGGAGTCATACAGGAATGCAAGAGGAGGAGGT**TTTGAGAACAAGCAGGATGAG
AAGAAGCGGAGGACTCGTGATGCTGCTAAGCGTAACAAGAAAAGGCGTCCGTTTGCAAAG
TTTACTCAAGAGACCAGGGAAGAAGCAGCAGCGGCAGCAACCAAGGGTAAGAAGAAGGAT
GAACAAGAAGATAACTGGGACTGGGAGATGCCTGGTGGAGATGTACCTTCTTGAACCACG
GTTTCAGTACATAGATCTCCCCTTCCTTTTCTGTGTATTTTGATTACTCGGTGACTTT*G
TATGTTCAAATTGCGTGTAACTGGCCTCTCTGTTAATGAGTTCCTGTCAATGTTAAAAGA
CATCTTTTTATTATGACTAAAAGTTTAATTTC

QA 6 457 6 457
DS 



AS 1 4

CO CL2457Contig1 710 4 9 U
GGATCAAAATAAGCGTTTGCGTCTGGATTGTAAAGTCGAACTCATTCATCAATGGAAGAG
GTGAAGAAGAAGAAGGACGTATACTCTGTGTGGGCATTGCCCGACGAGGAAACGGAACCG
CGATTTGTAAAGCTAATGGAAGCTCTGAGATCCGAGTTCTCCGGCCCAAGATTCGATCCT
CACGTCACCGTCGTCGGAGCCACGAGCCTGACGGCAGACGAAGCGAAGAAGATGTTCGAA
GCAGCTTGCGAAAGTCTGAAAGCTTACACCGCCACCGTAGATCGCGTCTCCACCGGAACT
TTCTTCTACCAATGCGTTTTCTTGCTTCTCAAATCCACTCCAGAGGTAATGAAAGCTGGT
GAACACTGTAAGAACCATTTCAAGTGTTCCACTACAACACCTTACATGCCGCATCTGAGT
CTGCTTTACGCCGAGTTAGATGAAGAAGGGAAGAAGAAAGCGCAGGAGAAAGCTTACGTG
CTAGATAACAGCCTCGATGGCCTGAGTTTCCGGTTAACCCGACTCGCTCTCTGCAAAACC
GATACGGAAGATAAGACTCTCGAGTCATGGGAGAAAGTGGCTGTATGCAATCTCAATCCT
TAAGAAGAAAAGACTTAAAGTTCGGTTCTGTAATAAAAGGTCTCAATATACTTTATGTGT
GTACCATCTCTTCTTGCTCATCGAATAAAATTACGATACTAATTCGCGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1GK96TF U 1
AF RS1ES35TF U 36
AF RS1ES35JQ C 36
AF RS1GK96JQ C 60
BS 1 178 RS1GK96TF
BS 179 179 RS1ES35TF
BS 180 446 RS1GK96TF
BS 447 447 RS1ES35TF
BS 448 464 RS1GK96TF
BS 465 465 RS1ES35TF
BS 466 529 RS1GK96TF
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BS 710 710 RS1GK96JQ

RD RS1GK96TF 531 0 0
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GTGAAGAAGAAGAAGGACGTATACTCTGTGTGGGCATTGCCCGACGAGGAAACGGAACCG
CGATTTGTAAAGCTAATGGAAGCTCTGAGATCCGAGTTCTCCGGCCCAAGATTCGATC*T
CACGTCACCGTCGTCGGAGCCACGAGCCTGACGGCAGACGAAGCGAAGAAGATGTTCGAA
GCAGCTTGCGAAAGTCTGAAAGCTTACACCGCCACCGTAGATCGCGTCTCCACCGGAACT
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GAACACTGTAAGAACCATTTCAAGTGTTCCACTACAACACCTTACATGCCGCATCTGAGT
CTGCTTTACGCCGAGTTAGATGAAGAGGGGAAGAAGAAAGCGCACGAGAAAGCTTACGTG
CTAGATAACAGCCTCGATGGCCTGAGTTTCCGGTTAACCCGACTCGCTC
TC

QA 1 529 1 529
DS 

RD RS1ES35TF 494 0 0
GG
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TGCCCGACGAGGAAACGGAACCGCGATTTGTAAAGCTAATGGAAGCTCTGAGATCCGAGT
TCTCCGGCCCAAGATTCGATCCTCACGTCACCGTCGTCGGAGCCACGAGCCTGACGGCAG
ACGAAGCGAAGAAGATGTTCGAAGCAGCTTGCGAAAGTCTGAAAGCTTACACCGCCACCG
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CTCCAGAGGTAATGAAAGCTGGTGAACACTGTAAGAACCATTTCAAGTGTTCCACTACAA
CACCTTACATGCCGCATCTGAGTCTGCTTTACGCCGAGTTAGATGAAGAAGGGAAGAAGA
AAGCGCAGGAGAAAGCTTACGTGCTAGATAACAGCCTCGATGGCCTGAGTTTCCGGTTAA
CCCGACTCGCTC

QA 3 494 3 494
DS 

RD RS1ES35JQ 674 0 0
GG
GAACTCATTCATCAATGGAAGAGGTGAAGAAGAAGAAGGACGTATACTCTGTGTGGGCAT
TGCCCGACGAGGAAACGGAACCGCGATTTGTAAAGCTAATGGAAGCTCTGAGATCCGAGT
TCTCCGGCCCAAGATTCGATCCTCACGTCACCGTCGTCGGAGCCACGAGCCTGACGGCAG
ACGAAGCGAAGAAGATGTTCGAAGCAGCTTGCGAAAGTTTGAAAGCTTACACCGCCACCG
TAGATCGCGTCTCCACCGGAACTTTTTTCTACCAATGCGTTTTCTTGCTTCTCAAATCCA
CTCCAGAGGTAATGAAAGCTGGTGAACACTGTAAGAACCATTTCAAGTGTTCCACTACAA
CACCTTACATGCCGCATCTGAGTTTGCTTTACGCCGAGTTAGATGAAGAAGGGAAGAAGA
AAGCGCAGGAGAAAGCTTACGTGCTAGATAACAGCCTCGATGGCCTGAGTTTCCGGTTAA
CCCGACTCGCTCTCTGCAAAACCGATACGGAAGATAAGACTCTCGAGTCATGGGAGAAAG
TGGCTGTATGCAATCTCAATCCTTAAGAAGAAAAGACTTAAAGTTCGGTTCTGTAATAAA
AGGTCTCAATATACTTTATGTGTGTACCATCTCTTCTTGCTCATCGAATAAAATTACGAT
ACTAATTCGCGG

QA 3 674 3 674
DS 

RD RS1GK96JQ 651 0 0
GGTGAAGAAGAAGAAGGACGTATACTCTGTGTGGGCATTGCCCGACGAGGAAACGGAACC
GCGATTTGTAAAGCTAATGGAAGCTCTGAGATCCGAGTTCTCCGGCCCAAGATTCGATC*
TCACGTCACCGTCGTCGGAGCCACGAGCCTGACGGCAGACGAAGCGAAGAAGATGTTCGA
AGCAGCTTGCGAAAGTCTGAAAGCTTACACCGCCACCGTAGATCGCGTCTCCACCGGAAC
TTTCTTCTACCAATGCGTTTTCTTGCTTCTCAAATCCACTCCAGAGGTAATGAAAGCTGG
TGAACACTGTAAGAACCATTTCAAGTGTTCCACTACAACACCTTACATGCCGCATCTGAG
TCTGCTTTACGCCGAGTTAGATGAAGAGGGGAAGAAGAAAGCGCAGGAGAAAGCTTACGT
GCTAGATAACAGCCTCGATGGCCTGAGTTTCCGGTTAACCCGACTCGCTCTCTGCAAAAC
CGATACGGAAGATAAGACTCTCGAGTCATGGGAGAAAGTGGCTGTATGCAATCTCAATCC
TTAAGAAGAAAAGACTTAAAGTTCGGTTCTGTAATAAAAGGTCTCAATATACTTTATGTG
TGTACCATCTCTTCTTGCTCATCGAATAAAATTACGATACTAATTCGCGGC

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 4

CO CL2458Contig1 922 4 5 U
GGACTGAGATTGGTTTCTCTTTTCTCTCTGTCGTGTTTGAGAAGTTGAAAGAGAGTCCAG
GAGAGATGAGTGCCGAAGATTTTCAGAAGAAGGTTTCAATCAGTGATCCCATCGACGGGA
AAATGGAAATCGAATGTGTTGGGTCTAGTAGCTCCACGGGGGTAGCCTCTCGAACCCTGG
TTTTGCTTCGGAGATTGCTTGAGATTCAGGAGCGTCGAGCCCAGGCCTACGCCAAACTCA
AAAGAGGATTCTCAGAGTATGTGGAGACTAGTGGTGAAGCACTTTATCAGAAGCTGTGCA
GCGAGATTACTGCTGAATTCAACGAATGCTCCAAACAAGTGCGCGAAATGGAAACTCTGT
TTCTGAATCCAGAAGTTGGAAGATCGGATCTTGCTCAACTGCTCAGCGACATTCAAACTC
AGGAGAAGCAGAAACTGCATCTGACGGTCACAATACAGGTACTGAAGAAGGCAGGGAGGC
CGTCAGAACGGATGCTCACACATGAGAACTGCAAGTTCAAGAAACCGATGCAGCACGAGT
GTGTTCATCTTCATGAGATCACTGAAGCTGCAGGAACAGAGGAAGCAGAAGCGGATGCTG
AGTTCGACAACGCTTTAAAGGAAGCTATTAGAGGAGTGCAAGACGCTGTGACTTGCATCA
ATGAGTATTTGGAAGACATTAGGTACGAGATTGCAGCCCTTGAAGCCGATTAACTGTGTC
CCAATCTCTTCACTTATTTACCATTCGACAGTCAACTTGATGTTTTTAGAAGGATGTGCA
AATGGGATTTGTTATTCTCAAAGTTATCTTTTAGATTGTCAGGCTTGAAGCTCTGTCTGG
CGGATATAAATACAGAATAGCAAATTCAAAACTTACAAAAAAAAGCACACTATTTTGAAG
TGAAACAATGTTTTGATCCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BZ26TF U 1
AF RS1AX05TF U 27
AF RS1BZ26JQ C 107
AF RS1AX05JQ C 134
BS 1 381 RS1BZ26TF
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BS 383 678 RS1BZ26TF
BS 679 867 RS1BZ26JQ
BS 868 922 RS1AX05JQ

RD RS1BZ26TF 679 0 0
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GAGAGATGAGTGCCGAAGATTTTCAGAAGAAGGTTTCAATCAGTGATCCCATCGACGGGA
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AAAGAGGATTCTCAGAGTATGTGGAGACTAGTGGTGAAGCACTTTATCAGAAGCTGTGCA
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AGTTCGACAACGCTTTAAAGGAAGCTATTAGAGGAGTGCAAGACGCTGTGACTTGCATCA
ATGAGTATTTGGAAGACA
T

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1AX05TF 652 0 0
GCG
GTCGTGTTTGAGAAGTTGAAAGAGAGTCTAGGAGAGATGAGTGCCGAAGATTTTCAGAAG
AAGGTTTCAATCAGTGATCCCATCGACGGGAAAATGGAAATCGAATGTGTTGGGTCTAGT
AGCTCCACGGGGGTAGCCTCTCGAACCCTGGTTTTGCTTCGGAGATTGCTTGAGATTCAG
GAGCGTCGAGCCCAGGCCTACGCCAAACTCAAAAGGGGATTCTCAGAGTATGTGGAGACT
AGTGGTGAAGCACTTTATCAGAAGCTGTGCAGCGAGATTACTGCTGAGTTCAACGAATGC
TCCAAACAAGTGCGCGAAATGGAAACTCTGTTTCTGAATCCAGAAGTTGGAAGATCGGAT
CTTGCTCAACTGCTCAGCGACATTCAAACTCAGGAGAAGCAGAAACTGCATCTGACGGTC
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TGCAAGTTCAAGAAACCGATGCAGCACGAGTGTGTTCATCTTCATGAGATCACTGAAGCT
GCAGGAACAGAGGAAGCAGAAGCGGATGCTGAGTTCGACAACGCTTTAAAGGAAGCTATT
AGAGGAGTGCAAGACGCTGTGACTTGCATCAATGAGTATTTGGGAGACA

QA 4 652 4 652
DS 

RD RS1BZ26JQ 761 0 0
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CTCTCGAACCCTGGTTTTGCTTCGGAGATTGCTTGAGATTCAGGAGCGTCGAGCCCAGGC
CTACGCCAAACTCAAAAGAGGATTCTCAGAGTATGTGGAGACTAGTGGTGAAGCACTTTA
TCAGAAGCTGTGCAGCGAGATTACTGCTGAATTCAACGAATGCTCCAAACAAGTGCGCGA
AATGGAAACTCTGTTTCTGAATCCAGAAGTTGGAATATCGGATCTTGCTCAACTGCTCAG
CGACATTCAAACTCAGGAGAAGCAGAAACTGCATCTGACGGTCACAATACAGGTACTGAA
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TGTGACTTGCATCAATGAGTATTTGGAAGACATTAGGTACGAGATTGCAGCCCTTGAAGC
CGATTAACTGTGTCCCAATCTCTTCACTTATTTACCATTCGACAGTCAACTTGATGTTTT
TAGAAGGATGTGCAAATGGGATTTGTTATTCTCAAAGTTATCTTTTAGATTGTCAGGCTT
GAAGCTCTGTCTGGCGGATATAAATACAGAATAGCAAATTC

QA 1 761 1 761
DS 

RD RS1AX05JQ 789 0 0
AATGTGTT
GGTCTAGTAGCTCCACGGGGGTAGCCTCTCGAACCCTGGTTTTGCTTCGGAGATTGCTTG
AGATTCAGGAGCGTCGAGCCCAGGCCTACGCCAAACTCAAAAGGGGATTCTCAGAGTATG
TGGAGACTAGTGGTGAAGCACTTTATCAGAAGCTGTGCAGCGAGATTACTGCTGAGTTCA
ACGAATGCTCCAAACAAGTGCGCGAAATGGAAACTCTGTTTTTGAATCCAGAAGTTGGAA
GATCGGATCTTGCTCAACTGCTCAGCGACATTCAAACTCAGGAGAAGCAGAAACTGCATC
TGACGGTCACAATACAGGTACTGAAGAAGGCAGGGAGGCCGTCAGAACGGATGCTCACAC
ATGAGAACTGCAAGTTCAAGAAACCGATGCAGCACGAGTGTGTTCATCTTCATGAGATCA
CTGAAGCTGCAGGAACAGAGGAAGCAGAAGCGGATGCTGAGTTCGACAACGCTTTAAAGG
AAGCTATTAGAGGAGTGCAAGACGCTGTGACTTGCATCAATGAGTATTTGGGAGACATTA
GGTACGAGATTGCAGCCCTTGAAGCCGATTAACTGTGTCCCAATCTCTTCACTTATTTAC
CATTCGACAGTCAACTTGATGTTTTTAGAAGGATGTGCAAATGGGATTTGTTATTCTCAA
AGTTATCTTTTAGATTGTCAGGCTTGAAGCTCTGTCTGGCGGATATAAATACAGAATAGC
AAATTCAAAACTTACAAAAAAAAGCACACTATTTTGAAGTGAAACAATGTTTTGATCCTT
T

QA 9 789 9 789
DS 



AS 1 2

CO CL2459Contig1 776 2 18 U
GGATCAAGTCTTCAAAATCTTATCTTTATTCCTCCTTCACTTTTCTTCAAACCTTTACCT
AAAAACACCCACAAGTGGTCAGTAAGCCCAATCCGAAGGTAACCGAGGCTCGTTAACTGT
CTGCTCTATCATCATCTGGCTCGAGTACCGACCATTGTTACTCCTCTGTCTCCACGACGC
ATCGTTGAAACTAGCTGAAGATCGGACTGGAGTCTGGTGGACCACAGATTCGTTTCGGTT
AAGTACATGCGCCACTCTAGCCGGAACCAAAACCGTACCAAGACCGGGCTTGTTGCGAGT
CTGGGCGGTTACAGGGGAAGTTCGGTCAACGCTTCGAGGCAAGAACACGCCGGTTCCGGT
ACGGTCACCACCGAGGGAAACAGCACGCATGCCAAAAACACCACGCCTCTGTGGCCATGC
AGCAGATGGCGACAAATCAACATGACCGGGAGTAGTACTTTTAGTGCGACTATTAACACT
CTGATGCGCCAAATAGCGACGGTGTTCTTTCATCAACTGTAGCTGCTTTAGCTGTTGAAT
AGCTTGAAGCTTCTGATATTGAAGAGATTGGCGGCTGTAGAACCCGGAGCCGTCGTTAGA
GATTTTAGCTGCGGCGAGTCCTCTGCCACCATGACGGCTGTTGTAACCGTTCAGACTCAT
CATCGCCAGCTCCTCTGCAGCGGCACAGTACATATCCCAAGCCGATTGAGAAGAAACTCG
CGTCTGACAACCGTAACCGCCACCACAACGAGTCGACTGAGTCGGACGAGTCATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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C

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DS 



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BQ
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AF RS1F402TF U 1
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GG
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TGGTCTTCTGGTAGTTTTGTCTGCGTTTCAGTATCTGAACAACGTTGCTAGGTATAATGA
GGCTTTGGCAACAGTTAAGCGAACTCCTGCTTACAAAAACAGGCTCAAGGCCTTGGAACT
CGAACGCACTGGTGGAGTATCTAGCAAGAAGAAAGGTCCAAAGCAGATCGACCAGAAACT

QA 3 602 3 602
DS 

RD RS1F402TF 788 0 0
GGATGAAGACTAAATAAAATGCCAAAGTAAATCTCTCTCTCTCATTTCAGTTTCTCCCAA
TACGCAGCAAGAGAGAGAGAGAGATGGCGCCGCCGGCAAAGGAGCGGTGGTGCTTGGCAT
TGATTATTGTTTTGCTTTCTCTGTTCGTCCAATCCTCGACGGCCATTTATTGCGGCGAAG
ACGATTGCTATGCTCTCCTCGGAGTGGCTCAAGATGCAAACGCATCGGATATAAAGAGAT
CTTACTACAAGCTTTCTCTCGAACATCATCCAGATAAGAATCCAGATCCTGAATCCAAGA
AGCTCTTTGTCAAAATCGCCACTGCTTACGAGATATTGAAAGATAACGAGACGCGTTCAC
AGTATGATTATGCTATTGAGCATCCAAGTGAGGTGTTTTACAACACTGCTCAATACTACC
GAGCCAAATATGGACATAAGTCGGATCCTCGTGCTGTTCTTGTTGGTCTTCTGGTAGTTT
TGTCTGCGTTTCAGTATCTGAACAACGTTGCTAGGTATAATGAGGCTTTGGCAACAGTTA
AGCGAACTCCTGCTTACAAAAACAGGCTCAAGGCCTTGGAACTCGAACGCACTGGTGGAG
TATCTAGCAAGAAGAAAGGTCCAAAGCAGATCGACCAGAAACTACAGGAAGAGCTAAGCA
ATGAACTCGACCTACAAATCAAAGGAGCTGAAAA*CCATCAGTCTGGGATCTTCTCGGTG
TTCGATTCGTTCTCCTACCTTACACTATCATCAAGCTTCTAGTATGGTACAGCAGTTGGG
TATGGAGA

QA 1 788 1 788
DS 

RD RS1GH68JQ 700 0 0
AGGTATAATGAGGCTTTGGCAACAGTTAAGCGAACTCCTGCTTACAAAAACAGGCTCAAG
GCCTTGGAACTCGAACGCACTGGTGGAGTATCTAGCAAGAAGAAGGGTCCAAAGCAGATC
GACCAGAAACTACAGGAAGAGCTAAGCAATGAACTCGACCTACAAATCAAAGGAGCTGAA
AAACCATCAGTCTGGGATCTTCTCGGTGTTCGATTCGTTCTCCTACCTTACACTATCATC
AAGCTTCTAGTATGGTACAGCAGTTGGGTATGGAGATATAAGGTTAAGAAAGCTCCTTAT
TCATGGGAAGACGCATCTTACTTAACACGAAGATCACTTGGGGTGCTTCTTGACGCCTGG
ACTAATCTCGATGAATACAAAAAGGAAGATCTGGTGCAGATAAGGCTATGGGAGAAGCAG
AACCTTGAGAACTACTATGCAGAAATGCGTAAAGAATCAAAGCTGAGAAGATAGATCCAC
TTATCACTTACCATCCAAGGAGGGATACACATGGGAACTCGAGTTCCGAAGCACTTTTGT
TACCTTTATTACTTTTAATGTTATTAAGATATTTTGAACAAACAAACCAGTTACAAGAAG
AGACGGTATAATTTGTATGGTACAAGGAACCAAATCTCAATTTAGCATATACAAGTTGGG
TCATGTCTGATAATGGGCATGTTCCGGTTTTGACTCTCAT

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 3

CO CL2461Contig1 726 3 7 U
AAAACAAGAAATATGATGCGTGGTTGATATCCACTTTCGTTATTATTATTTGTTCAGATG
ATTTGGTAAAAATTAGTTAACTTTTCCAATAATAGAGCTGCAAACAAACCGAAAGTTTTG
CAAAACCGAGCTGGTCGAGACCCCTATACAGACCAACACCTTTCATGTCTCGGTATACTC
CGGTTCTGCCGCTTGGTTATTTCAATAGACTAGTATGTCCACAAACCACAAGTCTAAACA
ACAAGTTCTTAGTGGGTTTTACTAATCGTCTCTCTTCACAAACCGGCCCTTAACACGAGG
ACGTTTCTCAGCGTTGAGTTTACGAACTTCGTATCGAATCCGCTTAGAGAAAAGACGGTT
TTGTCGTTTCTCCTTATACCGGAGCAAGCTCGCTTCTCTATGCCCTCTCCACAACCTCTC
CGTCGTCTCCATCTCCGGCACCGTCCACAAACTTCCAGAATCTCCACCGCCAGTAAACAC
ATCAGCAGAAGCATGCAAGTCCGGCACCGTCTGCGGCGGTTCTCCGTCGACATAAAGAGT
ACCTTTATCCGACCAAGCCTCCATCACCTGCTCGTAATCAAGCTTCAGAGCCAGCGAACG
CCGTCTATCCTTTCCATCAGGCCGTGGAGTTCCGCTCCGACTCATCACCTCCTCCACAAC
CTCCGAATAACTCACCCACCTCTCCTCCGTCGTCTCCTCTTCCTTGCTCGCTCCTTTCCT
CATCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1DK84JQ U 1
AF RS1DJ58JQ U 25
AF RS1DJ58TF C 185
BS 1 189 RS1DK84JQ
BS 190 190 RS1DJ58JQ
BS 191 504 RS1DK84JQ
BS 505 505 RS1DJ58JQ
BS 506 664 RS1DK84JQ
BS 665 689 RS1DJ58JQ
BS 690 726 RS1DJ58TF

RD RS1DK84JQ 664 0 0
AAAACAAGAAATATGATGCGTGGTTGATATCCACTTTCGTTATTATTATTTGTTCAGATG
ATTTGGTAAAAATTAGTTAACTTTTCCAATAATAGAGCTGCAAACAAACCGAAAGTTTTG
CAAAACCGAGCTGGTCGAGACCCCTATACAGACCAACACCTTTCATGTCTCGGTATACTC
CGGTTCTGCTGCTTGGTTATTTCAATAGACTAGTATGTCCACAAACCACAAGTCTAAACA
ACAAGTTCTTAGTGGGTTTTACTAATCGTCTCTCTTCACAAACCGGCCCTTAACACGAGG
ACGTTTCTCAGCGTTGAGTTTACGAACTTCGTATCGAATCCGCTTAGAGAAAAGACGGTT
TTGTCGTTTCTCCTTATACCGGAGCAAGCTCGCTTCTCTATGCCCTCTCCACAACCTCTC
CGTCGTCTCCATCTCCGGCACCGTCCACAAACTTCCAGAATCTCCACCGCCAGTAAACAC
ATCAGCAGAAGCATGCAAGTCCGGAACCGTCTGCGGCGGTTCTCCGTCGACATAAAGAGT
ACCTTTATCCGACCAAGCCTCCATCACCTGCTCGTAATCAAGCTTCAGAGCCAGCGAACG
CCGTCTATCCTTTCCATCAGGCCGTGGAGTTCCGCTCCGACTCATCACCTCCTCCACAAC
CTCC

QA 1 664 1 664
DS 

RD RS1DJ58JQ 665 0 0
C
GATATCCACTTTCGTTATTATTATTTGTTCAGATGATTTGGTACAAATTAGTTAACTTTT
CCAATAATAGAGCTGCAAACAAACCGAAAGTTTTGCAAAACCGAGCTGGTCGAGACCCCT
ATACAGACCAACACCTTTCATGTCTCGGTATACTCCGGTTCTGCCGCTTGGTTATTTCAA
TAGACTAGTATGTCCACAAACCACAAGTCTAAACAACAAGTTCTTAGTGGGTTTTACTAA
TCGTCTCTCTTCACAAACCGGCCCTTAACACGAGGACGTTTCTCAGCGTTGAGTTTACGA
ACTTCGTATCGAATCCGCTTAGAGAAAAGACGGTTTTGTCGTTTCTCCTTATACCGGAGC
AAGCTCGCTTCTCTATGCCCTCTCCACAACCTCTCCGTCGTCTCCATCTCCGGCACCGTC
CACAAACTTCCAGAATCTCCACCGCCAGTAAACACATCAGCAGAAGCATGCAAGTCCGGC
ACCGTCTGCGGCGGTTCTCCGTCGACATAAAGAGTACCTTTATCCGACCAAGCCTCCATC
ACCTGCTCGTAATCAAGCTTCAGAGCCAGCGAACGCCGTCTATCCTTTCCATCAGGCCGT
GGAGTTCCGCTCCGACTCATCACCTCCTCCACAACCTCCGAATAACTCACCCACCTCTCC
TCCG

QA 2 665 2 665
DS 

RD RS1DJ58TF 542 0 0
TCTGCCGCTTGGTTATTTCAATAGACTAGTATGTCCACAAACCACAAGTCTAAACAACAA
GTTCTTAGTGGGTTTTACTAATCGTCTCTCTTCACAAACCGGCCCTTAACACGAGGACGT
TTCTCAGCGTTGAGTTTACGAACTTCGTATCGAATCCGCTTAGAGAAAAGACGGTTTTGT
CGTTTCTCCTTATACCGGAGCAAGCTCGCTTCTCTATGCCCTCTCCACAACCTCTCCGTC
GTCTCCATCTCCGGCACCGTCCACAAACTTCCAGAATCTCCACCGCCAGTAAACACATCA
GCAGAAGCATGCAAGTCCGGCACCGTCTGCGGCGGTTCTCCGTCGACATAAAGAGTACCT
TTATCCGACCAAGCCTCCATCACCTGCTCGTAATCAAGCTTCAGAGCCAGCGAACGCCGT
CTATCCTTTCCATCAGGCCGTGGAGTTCCGCTCCGACTCATCACCTCCTCCACAACCTCC
GAATAACTCACCCACCTCTCCTCCGTCGTCTCCTCTTCCTTGCTCGCTCCTTTCCTCATC
GC

QA 1 542 1 542
DS 



AS 2 4

CO CL2462Contig1 806 2 6 U
AATATTGTCATATTTCTTTCACTGGGAGTCCTCTAAAAGGCTCAAATACCATAGCAAGAA
TGTTGAAAGAGTTTTCCAATTCTTATATCTGAGTGCAGAGATAGAGAGTAGAGGGAGGAG
TTTAAACTAAAACTTACAAAGCCTAACAGTTTTTAATATAATAAACTGTTTGGCTTGGTT
CTGTGAAAAAATGTAGGTTGTGGAATACAATCAGCTCTGAACTTCATTGTATTTGATGAC
GCAGTCATAAAGCCGTCCTCCCAAAAACTGTGCTACCTCTGGATGCTTCACCATTCCAAT
CTTGAGGGAATCACACTTGAACTGAGCATAAAGGTTTGTCTCTATTCCACGTCCCATGCC
TTCAAAAATGACCAAGTCTGCATCGGTTGCAAGGTATGCAACCTCCTGTGATACTCTTGC
CAGATCAATAACCGGTAAGTCATTCCCAGAGTTTGCAATCAAAAAATTCGAGATATCAAC
ACCCATCAGTTGTCCATTTTCATCCTTAAGCTTAAACAAGATCTCTGCAAGCTCTGTATA
AGTGACATCATTGATAGATGGAAGCTCATTAGCAGCCAGCACCACCTGCATTCCTTGACG
TAGCATTTCTCTAGCAAACGGCAAGATACCCAAAATTATGTCTGCACCAGAGTTGTCGAC
AAATATCACAGCCTTCTTCCAAGACTTCTTGAGCCATCTAGCTTGAAAGTTGTCCAAGTC
ATCAATGACCCATGGCCGTGGAACCAAGTTTTGACAGCTAGCCAAGAATGGCATTCCATC
CTTTGAGAATACCTCCGCAAGCTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BF04JQ U 1
AF RS1EH01JQ U 104
BS 1 363 RS1BF04JQ
BS 364 364 RS1EH01JQ
BS 365 419 RS1BF04JQ
BS 420 420 RS1EH01JQ
BS 421 514 RS1BF04JQ
BS 515 806 RS1EH01JQ

RD RS1BF04JQ 514 0 0
AATATTGTCATATTTCTTTCACTGGGAGTCCTCTAAAAGGCTCAAATACCATAGCAAGAA
TGTTGAAAGAGTTTTCCAATTCTTATATCTGAGTGCAGAGATAGAGAGTAGAGGGAGGAG
TTTAAACTAAAACTTACAAAGCCTAACAGTTTTTAATATAATAAACTGTTTGGCTTGGTT
CTGTGAAAAAATGTAGGTTGTGGAATACAATCAGCTCTGAACTTCATTGTATTTGATGAC
GCAGTCATAAAGCCGTCCTCCCAAAAACTGTGCTACCTCTGGATGCTTCACCATTCCAAT
CTTGAGGGAATCACACTTGAACTGAGCATAAAGGTTTGTCTCTATTCCACGTCCCATGCC
TTCTAAAATGACCAAGTCTGCATCGGTTGCAAGGTATGCAACCTCCTGTGATACTCTTGG
CAGATCAATAACCGGTAAGTCATTCCCAGAGTTTGCAATCAAAAAATTCGAGATATCAAC
ACCCATCAGTTGTCCATTTTCATCCTTAAGCTTA

QA 1 514 1 514
DS 

RD RS1EH01JQ 703 0 0
GC
GAGTAGAGGGAGGAGTTTAAACTAAAACTTACAAAGCCTAGCAGTTTTTAATATAATAAA
CTGTTTGGCTTGGTTCTGTGAAAAAATGTAGGTTGTGGAATACAATCAGCTCTGAACTTC
ATTGTATTTGATGACGCAGTCATAAAGCCGTCCTCCCAGAAACTGTGCTACCTCTGGATG
CTTCACCATTCCAATCTTGAGGGAATCACACTTGAACTGAGCATAAAGGTTTGTCTCTAT
TCCACGTCCCATGCCTTCAGAGATGACCAAGTCTGCATCGGTTGCAAGGTATGCAACCTC
CTGTGATACTCTTGCCAGATCAATAACCGGTAAGTCATTCCCAGAGTTTGCAATCAGAAG
ATTCGAGATATCAACACCCATCAGTTGTCCATTTTCATCCTTAAGCTTAAACAAGATCTC
TGCAAGCTCTGTATAAGTGACATCATTGATAGATGGAAGCTCATTAGCAGCCAGCACCAC
CTGCATTCCTTGACGTAGCATTTCTCTAGCAAACGGCAAGATACCCAAAATTATGTCTGC
ACCAGAGTTGTCGACAAATATCACAGCCTTCTTCCAAGACTTCTTGAGCCATCTAGCTTG
AAAGTTGTCCAAGTCATCAATGACCCATGGCCGTGGAACCAAGTTTTGACAGCTAGCCAA
GAATGGCATTCCATCCTTTGAGAATACCTCCGCAAGCTGTG

QA 3 703 3 703
DS 



CO CL2462Contig2 781 2 7 U
GGGGACAGAGTCCACACATGTGTGTCTCATCGTTAAAATAACAACATCGAGGGGAGTGCT
GATTTCGTTTTAGAAAGATTCTGAGATCTCTTTCTCCCACACGCCTACGTTGTACTGCTT
TGGAGTGAAGAAGAAGAAGGATCATCAAAAAAATGGAGAGCGACTCGGTGATGGTACCGT
TGCCTCTGTTACCGATACCGATAGAATCGAACTACAGAGCGTGCACCATTCCTTATCGAT
TCCCTTCTGATAACCCCAAGAAGGCTACCCCCACTGAGATCTCTTGGATCGATCTCTTCC
TCAACTCCATCCCTTCTTTCAAGGAGCGTGCAGAGAGCGATACATCTGTTCCAGATGCTC
CTGTTCGAGCTGAAAAGTTTGCACAAAGGTATGCAGAGATTCTTGAGGACTTGAAGAAAG
ATCCGGAGAGCCATGGTGGACCACCTGATTGCATTCTTCTTTGTAGAATTCGTGAGCTAA
TACTCAGAGAATTGGGATTCAGAGACATTTTCAAGAAAGTTAAGGATGAGGAGAATGCAA
AGGCTATATCACTATTTCCTGAAGTCGTCCGTCTGAGTGATGCTATTGAAGATGAAGGCA
AGCGCGTAGAGAGTCTTGTAAGAGGGATTTTCGCTGGAAACATCTTTGATCTCGGTTCTG
CACAGCTTGCGGAGGTATTCTCAAAGGATGGAATGCCATTCTTGGCTAGCTGTCAAACTT
GGTTCACGGCATGGGTCATTGATGACTTGGACACTTTCAGCTAGATGGCTCAGAATCTTG
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1EH01TF U 70
AF RS1BF04TF U 1
BS 1 678 RS1BF04TF
BS 679 679 RS1EH01TF
BS 680 695 RS1BF04TF
BS 696 696 RS1EH01TF
BS 697 699 RS1BF04TF
BS 700 700 RS1EH01TF
BS 701 781 RS1BF04TF

RD RS1EH01TF 656 0 0
GG
AGAAAGATTCTGAGATCTCTTTCTCCCACACGCCTACGTTGTACTGCTTTGGAGTGAAGA
AGAAGAAGGATCATCAAAAAAATGGAGAGCGACTCGGTGATGGTACCTTTGCCTCTGTTA
CCGATACCGATAGAATCGAACTACAGAGCGTGCACCATTCCTTATCGATTCCCTTCTGAT
AACCCCAAGAAGGCTACCCCCACTGAGATCTCTTGGATCGATCTCTTCCTCAACTCCATC
CCTTCTTTCAAGGAGCGTGCAGAGAGCGATACATCTGTTCCAGATGCTCCTGTTCGAGCT
GAAAAGTTTGCACAAAGGTATGCGGAGATTCTTGAGGACTTGAAGAAAGATCCGGAGAGC
CATGGTGGACCACCTGATTGCATTCTTCTTTGTAGAATTCGTGAGCTAATACTCAGAGAA
TTGGGATTCAGAGACATTTTCAAGAAAGTTAAGGATGAGGAGAATGCAAAGGCTATATCA
CTATTTCCTGAAGTCGTCCGTCTGAGTGATGCTATTGAAGATGAAGGCAAGCGCGTAGAG
AGTCTTGTAAGAGGGATTTTCGCTGGAAACATCTTTGATCTCGGTTCTGCACAGCTTGCG
GAGGTATTCTCAAAGGATGGAATGCCATTCTTGGCTAGCTGTCAAA
ACTTGGTT

QA 3 648 3 648
DS 

RD RS1BF04TF 781 0 0
GGGGACAGAGTCCACACATGTGTGTCTCATCGTTAAAATAACAACATCGAGGGGAGTGCT
GATTTCGTTTTAGAAAGATTCTGAGATCTCTTTCTCCCACACGCCTACGTTGTACTGCTT
TGGAGTGAAGAAGAAGAAGGATCATCAAAAAAATGGAGAGCGACTCGGTGATGGTACCGT
TGCCTCTGTTACCGATACCGATAGAATCGAACTACAGAGCGTGCACCATTCCTTATCGAT
TCCCTTCTGATAACCCCAAGAAGGCTACCCCCACTGAGATCTCTTGGATCGATCTCTTCC
TCAACTCCATCCCTTCTTTCAAGGAGCGTGCAGAGAGCGATACATCTGTTCCAGATGCTC
CTGTTCGAGCTGAAAAGTTTGCACAAAGGTATGCAGAGATTCTTGAGGACTTGAAGAAAG
ATCCGGAGAGCCATGGTGGACCACCTGATTGCATTCTTCTTTGTAGAATTCGTGAGCTAA
TACTCAGAGAATTGGGATTCAGAGACATTTTCAAGAAAGTTAAGGATGAGGAGAATGCAA
AGGCTATATCACTATTTCCTGAAGTCGTCCGTCTGAGTGATGCTATTGAAGATGAAGGCA
AGCGCGTAGAGAGTCTTGTAAGAGGGATTTTCGCTGGAAACATCTTTGATCTCGGTTCTG
CACAGCTTGCGGAGGTAT*CTCAAAGGATGGAATGTCAT*CTTGGCTAGCTGTCAAACTT
GGTTCACGGCATGGGTCATTGATGACTTGGACACTTTCAGCTAGATGGCTCAGAATCTTG
T

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 3

CO CL2463Contig1 550 3 15 U
GGTCATCTCCATAGCCTACCTGCCGATTGTTACCCGTCTCCGTCGATAACACCATGGCGC
CAAAGAAGGATAAGGTTCCACCGCCGTCGTCAAAGCCGGCTAAATCCGGAGGTGGAAAAC
AGAAGAAGAAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCAAAAGGAGAAGGTGAACAACATGGTGTTGT
TTGATCAGACTACTTACGACAAGCTTCTCACTGAGGCTCCCAAGTTCAAGCTCATCACCC
CTTCCATTCTCTCCGACCGTATGAGGATCAACGGGTCTCTTGCAAGGAAGGCAATAAGGG
AGCTAATGGCTAAAGGTGTGATCAGGATGGTCGCTGCTCACTCGAGCCAGCAGATCTACA
CTCGTGCCACCAACACCTAAACAAAACAGATCGACCCTTGTCAATGTTTTGGTTCTCCAG
TCTTAATCTCTTTTGATGTATACGTTACTCATCAGAGCTCTTTATAGTTCTTTTATGTTT
GAACTCCTTCCTTCGTACTCGAGAAACTCTTTAGAAGGCTGTTTTGAGATATTATGTTTA
CTTAATATTC


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EV15JQ C 2
AF RS1EV15TF U 2
AF RS1CA63TF U 1
BS 1 188 RS1CA63TF
BS 189 189 RS1EV15TF
BS 190 332 RS1CA63TF
BS 333 333 RS1EV15TF
BS 334 396 RS1CA63TF
BS 397 397 RS1EV15TF
BS 398 411 RS1CA63TF
BS 412 412 RS1EV15TF
BS 413 423 RS1CA63TF
BS 424 424 RS1EV15TF
BS 425 462 RS1CA63TF
BS 463 463 RS1EV15TF
BS 464 490 RS1CA63TF
BS 491 494 RS1EV15TF
BS 495 550 RS1CA63TF

RD RS1EV15JQ 533 0 0
GGG
ATCTCCATAGCCTACCTGCCGATTGTTACCCGTCTCCGTCGATAACACCATGGCGCCAAA
GAAGGATAAGGTTCCACCGCCGTCGTCAAAGCCGGCTAAATCCGGAGGTGGAAAACAGAA
GAAGAAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCAAAAGGAGAAGGTGAACAACATGGTGTTGTTTGA
TCAGACTACTTACGACAAGCTTCTCACTGAGGCTCCCAAGTTCAAGCTCATCACCCCTTC
CATTCTCTCCGACCGTATGAGGATCAACGGGTCTCTTGCAAGGAAGGCAATAAGGGAGCT
AATGGCTAAAGGTGTGATCAGGATGGTCGCTGCTCACTCGAGCCAGCAGATCTACACTCG
TGCCACCAACACCTAAACAAAACAGATCGACCCTTGTCAATGTTTTGGTTCTCCAGTCTT
AATCTCTTTTGATGTATACGTTACTCATCAGAGCTCTTTATAGTTCTTTTATGTTTGAAC
TCCTTCCTTCGTACTCGAGAAACTCTTTAGAAGGCTGTTTTGAGATATT
C

QA 4 532 4 532
DS 

RD RS1EV15TF 533 0 0
GGG
ATCTCCATAGCCTACCTGCCGATTGTTACCCGTCTCCGTCGATAACACCATGGCGCCAAA
GAAGGATAAGGTTCCACCGCCGTCGTCAAAGCCGGCTAAATCCGGAGGTGGAAAACAGAA
GAAGAAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCAAAAGGAGAAGGTGAACAACATGGTGTTGTTTGA
TCAGACTACTTACGACAAGCTTCTCACTGAGGCTCCCAAGTTCAAGCTCATCACCCCTTC
CATTCTCTCCGACCGTATGAGGATCAACGGGTCTCTTGCAAGGAAGGCAATAAGGGAGCT
AATGGCTAAAGGTGTGATCAGGATGGTCGCTGCTCACTCGAGCCAGCAGATCTACACTCG
TGCCACCAACACCTAAACAAAACAGATCGACCCTTGTCAATGTTTTGGTTCTCCAGTCTT
AATCTCTTTTGATGTATACGTTACTCATCAGAGCTCTTTATAGTTCTTTTATGTTTGAAC
TCCTTCCTTCGTACTCGAGAAACTCTTTAGAAGGCTGTTTTGAGATATT
C

QA 4 532 4 532
DS 

RD RS1CA63TF 550 0 0
GGTCATCTCCATAGCCTACCTGCCGATTGTTACCCGTCTCCGTCGATAACACCATGGCGC
CAAAGAAGGATAAGGTTCCACCGCCGTCGTCAAAGCCGGCTAAATCCGGAGGTGGAAAAC
AGAAGAAGAAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCAAAAGGAGAAGGTGAACAACATGGTGTTGT
TTGATCAGGCTACTTACGACAAGCTTCTCACTGAGGCTCCCAAGTTCAAGCTCATCACCC
CTTCCATTCTCTCCGACCGTATGAGGATCAACGGGTCTCTTGCAAGGAAGGCAATAAGGG
AGCTAATGGCTAAAGGTGTGATCAGGATGGTCTCTGCTCACTCGAGCCAGCAGATCTACA
CTCGTGCCACCAACACCTAAACAAAACAGATCGACCTTTGTCAATGTTTTGCTTCTCCAG
TCT*AATCTCTTTTGATGTATACGTTACTCATCAGAGCTCTT*ATAGTTCTTTTATGTTT
GAACTCCTTC****GTACTCGAGAAACTCTTTAGAAGGCTGTTTTGAGATATTATGTTTA
CTTAATATTC

QA 1 550 1 550
DS 



AS 1 3

CO CL2464Contig1 633 3 6 U
GGGATGTACAAGAAAGCGAGGATGGGGCCCGAGGAATGCGAGAGAGAGATGGAGGAGAAA
GCTAAAGAAGTAGCGGAGCTGAAGATGGAGAGGCAGAAGAAACAGCAGATAGAGGAAGTG
GAGAGGATCGTGAGGCTGAAACAAGCCGAGGCGGAGATGTTTCAGCTGAAAGCGAACGAG
GCGAAAATGGAAGCGGAGAGGCTGGAGAGGATCGTGAAGGCGAAGAAGGAGAGGACTGAG
GAGGAGTATGCGAGTAACTACTTGAAACAGAGGCTGAGCGAGGCGGAGGCAGAGAAAGAG
TATCTGTTTCAGAAGTTGAAAGAGCAAGAAAAAAGTGGTGGAAATGGTGGTGGTGGTGGT
GAGGCGTCACAGTCGGTGATGTACTCAAATATCAGAGATATGCTGAGTGGATACAGTGCA
CCGTCGCCAAGAGTTGATCCAAGATCAAACCAGAGAAACCATTTTGGATCCAATCCTTGA
AATGTTTGTATTCATGTTCCAGCTTTGAATCAATTACTGTTGGATTCGCTTTGTTAACTG
TGAAGTCTTGTAGTCGTTGTAATTGCATTAATGTTTAATACTTGGTAACTTTTGTTAACT
ACATTGACTCCCTCTGTTTTTCTATTATTTGCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1EN20TF U 441
AF RS1A419JQ C 1
AF RS1A419TF U 1
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G
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GAGGCGTCACAGTCGGTGATGTACTCAAATATCAGAGATATGCTGAGTGGATACAGTGCA
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TGAAGTCTTGTAGTCGTTGTAATTGCATTAATGTTTAATACTTGGTAACTTTTGTTAACT
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DS 

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G
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CTAAAGAAGTAGCGGAGCTGAAGATGGAGAGGCAGAAGAAACAGCAGATAGAGGAAGTGG
AGAGGATCGTGAGGCTGAAACAAGCCGAGGCGGAGATGTTTCAGCTGAAAGCGAACGAGG
CGAAAATGGAAGCGGAGAGGCTGGAGAGGATCGTGAAGGCGAAGAAGGAGAGGACTGAGG
AGGAGTATGCGAGTAACTACTTGAAACAGAGGCTGAGCGAGGCGGAGGCAGAGAAAGAGT
ATCTGTTTCAGAAGTTGAAAGAGCAAGAAAAAAGTGGTGGAAATGGTGGTGGTGGTGGTG
AGGCGTCACAGTCGGTGATGTACTCAAATATCAGAGATATGCTGAGTGGATACAGTGCAC
CGTCGCCAAGAGTTGATCCAAGATCAAACCAGAGAAACCATTTTGGATCCAATCCTTGAA
ATGTTTGTATTCATGTTCCAGCTTTGAATCAATTACTGTTGGATTCGCTTTGTTAACTGT
GAAGTCTTGTAGTCGTTGTAATTGCATTAATGTTTAATACTTGGTAACTTTTGTTAACTA
CATTGACTCCCTCTGTTTTTCTATTATTTGCC

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DS 



AS 1 4

CO CL2465Contig1 1389 4 28 U
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TGACAGCTTGTCCTAAGAATGTAAATTATTTGTTGCTTAATCTAAACAACAGAGCACAGT
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GCTCGTCTTACTTTCAAGTCATCGAGATGATTCTGGTAAACATAAGAAGCGAAACCCCAA
AGAGCGATCAGCATCGCCATAACCTTAACCCCACTCATCTTATCACGGAACACAGCCAAA
GCCGCGAGTGGAGTCACAGCTAGAGAGAGCGTACTAATAACGTTTGAGAAGAGGGAGGTC
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ACCAAAGTCAGTACATAAGAGGCTTGGCCTTTATGATAACCTTCCATTTCTCCGTGCAGT
GTTCTCCATTCCCCGCTAGCAAAAAGCCCAATGACCGCAACACAAGTAGCCACTAGAGAA
GTGTAGATTTGCATTTCGAGAAACACTGAAAACGTCTCTTTCTTCAGAATCTTCTCGAAT
GAGAACTGCATGAGCGAGAGCAGCAGAGAGTAGAGAGCTGATGCAGCGAGTGTGCACACA
AACCCGACAATGTACTTAGACCTAGAGACACCAGAAGGAGCGTCTGCATCGTCGTTAAGG
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TTCTGGGCATTGATGAAATAAGAGAAGACCGCATTAAAAGCTAAATGCGTAGCGCAAATG
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GCGATGATGACACCGAGCAGAACATAGATCAAGACAATGGTCTTAAGGGAGCAAGAAGCG
GGCTCCGAAGAAGAGGAAGAACGAAGGAGCAGAAGCGGGATATAGAGGATCGGAAAAGCA
GCGGTTTGAACAAGAGTGGCCATCCATTTGCTGTTTCCACCTTCATCGTAGTAAAACCTA
CCGAGAAGGACAGAAGCAGCTTGACCACCAATGAGGAAAAAGATGTTGATGGACACAAGA
ACCCACCATTGCCAGCTTTTGAGCTTCAAGAGTGGAGATGGAATACCTTCCACACTCTCC
TCCTTCACCAAGATTGGTTCTTGATTACCTGACATAGTAATCGTCTGTAAGAAACGACGA
TATAGAGAGACGGAAGAAAAGGGTTATTGATTCAACTGAGATATATCTATCTCCGTCTTC
TCCTTGCGAACTGTGATGATTGATCACTCACCGGAGATCCGTGAATTTTAAATGAACTTT
TGCTTCGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1EK71JQ U 1
AF RS1CM50JQ U 29
AF RS1EK71TF C 635
AF RS1CM50TF C 669
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RD RS1EK71JQ 676 0 0
CTAGTAAGATTTTGTATCTTAAAATTTGACCGTACGACAAGTTTGGCTTTTTAAACAATA
TGACAGCTTGTCCTAAGAATGTAAATTATTTGTTGCTTAATCTAAACAACAGAGCACAGT
AAACCTAAACCGCAAAATCAGCAGTGCGGATCCACCTGCCCTGTTTGAGCTTGTTTTCTA
GCTCGTCTTACTTTCAAGTCATCGAGATGATTCTGGTAAACATAAGAAGCGAAACCCCAA
AGAGCGATCAGCATCGCCATAACCTTAACCCCACTCATCTTATCACGGAACACAGCCAAA
GCCGCGAGTGGAGTCACAGCTAGAGAGAGCGTACTAATAACGTTTGAGAAGAGGGAGGTC
ACCAGAAATATCAAACCCACCACTCCTACGGAACATACTTGCCACGTAACTGCTGTTCCC
ACCAAAGTCAGTACATAAGAGGCTTGGCCTTTATGATAACCTTCCATTTCTCCGTGCAGT
GTTCTCCATTCCCCGCTAGCAAAAAGCCCAATGACCGCAACACAAGTAGCCACTAGAGAA
GTGTAGATTTGCATTTCGAGAACCACTGAAAACGTCTCTTTCTTCAGAATCTTCTCGAAT
GAGAACTGCATGAGCGAGAGCAGCAGAGAGTAGAGAGCTGATGCAGCGAGTGTGCACACA
AACCCGACAATGTACT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1CM50JQ 685 0 0
AAAATTTGACCGTA
TTGGCTTTTTAAACAATATGACAGCTTGTCCTAAGAGTGTAAATTATTTGTTGCTTAATC
TAAACAACAGAGTACAGTAAACCTAAACCGCAGAATCAGCAGTGCGGATCCACCTGCCCT
GTTTGAGCTTGTTTTCTAGCTCGTCTTACTTTCAAGTCATCGAGATGATTCTGGTAAACA
TAAGAAGCGAAACCCCAAAGAGCGATCAGCATCGCCATAACCTTAACCCCACTCATCTTA
TCACGGAACACAGCCAAAGCCGCGAGTGGAGTCACAGCTAGAGAGAGCGTACTAATAACG
TTTGAGAAGAGGGAGGTCACCAGAAATATCAAACCCACCACTCCTACGGAACATACTTGC
CACGTAACCGCTGTTCCCACCAAAGTCAGTACATAAGAGGCTTGGCCTTTATGATAACCT
TCCATTTCTCCGTGCAGTGTTCTCCATTCCCCGCTAGCAAAAAGCCCAATGACCGCAACA
CAAGTAGCCATTAGAGAAGTGTAGATTTGCATTTCGAGAAACACTGAAAACGTCTCTTTC
TTCAGAATCTTCTCGAATGAGAACTGCATGAGCGAGAGCAGCAGAGAGTAGAGAGCTGAT
GCAGCGAGTGTGCACACAAACCCGACAATGTACTTAGACCTAGAGACACCAGAAGGAGCG
TCTGCATCGTC

QA 15 685 15 685
DS 

RD RS1EK71TF 753 0 0
GAGCTGATGCAGCGAGTGTGCACACAA*CCCGACAATGTACTTAGACCTAGAGGCACCAG
AAGGAGCGTCTGCATCGTCGTTAAGGGCAATCAAAGCAGCAGAGAAGGAGAGGAGCACAA
CTGAGTTGAGAATCAAAGCAGTGAACTTCTGGGCATTGATGAAATAAGAGAAGACCGCAT
TAAAAGCTAAATGCGTAGCGCAAATGAGCGAATAAGTCGATGCCGAGAGGTAGAGAAGTC
CAACAGAGTACAGCAAGTTGTCTCCGGCGATGATGACACCGAGCAGGACATAGATCAAGA
CAATGGTTTTAAGGGAGCAAGAAGCGGGCTCCGAAGAAGAGGAAGAACGAAGGAGCAGAA
GCGGGATATAGAGGATCGGAAAAGCAGCGGTTTGAACAAGAGTGGCCATCCATTTGCTGT
TTCCACCTTGATCGTAGTAAAACCTACCGAGAAGGACAGAAGCAGCTTGACCACCAATGA
GGAAAAAGATGTTGATGGACACAAGTACCCACCATTGCCAGCTTTTGAGCTTCAAGAGTG
GAGATGGAATACCTTCCACACTCTCTTCCTTCACCAAGATTGGTTCTTGATTACCTGACA
TAGTAATCGTCTGTAAGAAACGACGATATAGAGAGACGGAAGAAAAGGGTTATTGATTCA
ACTGAGATATATCTATCTCCGTCTTCTCCTTGCGGACTGTGATGA****TCACTCACCGG
AGATCCGTGAATTTTAAATGAAGTTTTGCTTC
C

QA 1 752 1 752
DS 

RD RS1CM50TF 721 0 0
AATGTACTTAGACCTAGAGACACCAGAAGGAGCGTCTGCATCGTCGTTAAGGGCAATCAA
AGCAGCAGAGAAGGAGAGGAGCACAACTGAGTTGAGAATCAAAGCGGTGAACTTCTGGGC
ATTGATGAAATAAGAGAAGACCGCATTGAAAGCTAACTGCGTAGCGCAAATGAGCGAATA
AGTCGATGCAGAGAGGTAGAGAAGTCCAACAGAGTACAGCATGTTGTCTCCAGCGATGAT
GACACCGAGCAGAACATAGATCAAGACAATGGTCTTAAGGGAGCAAGAAGCGGGCTCTGA
AGAAGAGGAAGAACGAAGGAGCAGAAGCGGGATATAGAGGATCGGAAAAGCAGCGGTTTG
AACAAGAGTGGCCATCCATTTGCTGTTTCCACCTTCATCGTAGTAAAACCTACCGAGAAG
GACAGAAGCAGCTTGACCACCAATGAGGAAAAAGATGTTGATGGACACAAGAACCCACCA
TTGCCAGCTTTTGAGCTTCAAGAGTGGAGATGGAATACCTTCCACACTCTCCTCCTTCAC
TAAGATTGGTTCTTGATTACCTGGCATAGTAATCGTCTGTAAGAAACGACGATATAGAGA
GACTGAAGAAAAGGGTTATTGATTCAACTGAGATATATCTATCTCCGTCTTCTCCTTGCG
AACTGTGATGATTGATCACTCACCGGAGATCCGTGAATTTTAAATGAACTTTTGCTTCGC
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 4

CO CL2466Contig1 811 4 3 U
AAACGATTTGGTAATTAAAAAAAAAAACATTTCAATGCAATAATCCATACAAATCAATCT
ACAAAACTCATAGTTTTACCCTCAGCTTCATATCATTTTGCTGTCACACAATAAAAAGAT
AACACCCCAAAAGTATGACAATAGTATATATCACATAGCATATAAGAAATAAAAACAATA
TTTTGTGGAATAGAAGTCCTCTAGTAAGGCATAGGGGAGGCCTGAGCAGCAGAGGAGTAA
AAGAAATAATAAAATTGAGAGACAATAGCGTTGAAGAAGACGAAAGAAGCACCCGCAGCG
AATACTCCCTTACGAAGAGTCTGACAGTCTGGAGGATTGTCCATGAACATAGTCCTATAC
TTTGTGTGGTATGCATTCTCCACTGATCCAGCTAATAGGCATGTCTCTGCTATCAAGAAG
AACATCCAGCTGACAATGAAGAGAACAAGGGCAAGACCGCGTGAACCACCAGGCTTGAGA
GGCTTCCCACAACAGAAGCAACGGCTAACGAGCATGATAAGGAGTTGACTAGCAACTGAG
AAGAAAAAGGCTCCAATTCCATACCCTGTGGCTCTGTCAGAATCATACACACAATAGTTG
TATTGCACCTCAGTGTCCTGCACAACCGTTGCAGTGCTTCTTCTTTGTTCAGCAGCAACG
GCTAGACCAAAGGCGACAAGGTTGAATACAAAGACTATGGCTGAGACAATCTTCGACGCC
ATGGGTTCACCTTACTCTCGCTCTCTTTCACAAAACGTTCCTTTAGATTAGATATAAAGA
CAACTTTGTTTGCTCAGATTTGATCATATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GG21JQ U 1
AF RS1F081JQ U 284
AF RS1GG21TF C 238
AF RS1F081TF C 18
BS 1 663 RS1GG21JQ
BS 664 743 RS1F081JQ
BS 744 811 RS1F081TF

RD RS1GG21JQ 663 0 0
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AACACCCCAAAAGTATGACAATAGTATATATCACATAGCATATAAGAAATAAAAACAATA
TTTTGTGGAATAGAAGTCCTCTAGTAAGGCATAGGGGAGGCCTGAGCAGCAGAGGAGTAA
AAGAAATAATAAAATTGAGAGACAATAGCGTTGAAGAAGACGAAAGAAGCACCCGCAGCG
AATACTCCCTTACGAAGAGTCTGACAGTCTGGAGGATTGTCCATGAACATAGTCCTATAC
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AACATCCAGCTGACAATGAAGAGAACAAGGGCAAGACCGCGTGAACCACCAGGCTTGAGA
GGCTTCCCACAACAGAAGCAACGGCTAACGAGCATGATAAGGAGTTGACTAGCAACTGAG
AAGAAAAAGGCTCCAATTCCATACCCTGTGGCTCTGTCAGAATCATACACACAATAGTTG
TATTGCACCTCAGTGTCCTGCACAACCGTTGCAGTGCTTCTTCTTTGTTCAGCAGCAACG
GCT

QA 1 663 1 663
DS 

RD RS1F081JQ 468 0 0
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AACCACCAGGCTTGAGAGGCTTCCCACAACAGAAGCAACGGCTAACGAGCATGATAAGGA
GTTGACTAGCAACTGAAAAGAAAAAGGCTCCAATTCCATACCCTGTGGCTCTGTCAGAAT
CATACACACAATAGTTGTATTGCACCTCAGTGTCCTGCACAACCGTTGCAGTGCTTCTTC
TTTGTTCAGCAGCAACGGCTAGACCAAAGGCGACAAGGTTGAATACAAAGACTATGGCTG
AGACAATCTTCGACGCCATGGGTTCACCTTACTCTCGCTC
TCTTTCAC

QA 1 460 1 460
DS 

RD RS1GG21TF 507 0 0
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GCGAATACTCCCTTACGAAGAGTCTGACAGTCTGGAGGATTGTCCATGAACATAGTCCTA
TACTTTGTGTGGTATGCATTCTCCACTGATCCAGCTAATAGGCATGTCTCTGCTATCAAG
AAGAACATCCAGCTGACAATGAAGAGAACAAGGGCAAGACCGCGTGAACCACCAGGCTTG
AGAGGCTTCCCACAACAGAAGCAACGGCTAACGAGCATGATAAGGAGTTGACTAGCAACT
GAGAAGAAAAAGGCTCCAATTCCATACCCTGTGGCTCTGTCAGAATCATACACACAATAG
TTGTATTGCACCTCAGTGTCCTGCACAACCGTTGCAGTGCTTCTTCTTTGTTCAGCAGCA
ACGGCTAGACCAAAGGCGACAAGGTTGAATACAAAGACTATGGCTGAGACAATCTTCGAC
GCCATGGGTTCACCTTACTCTCGCTC
C

QA 1 506 1 506
DS 

RD RS1F081TF 794 0 0
T
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CC*TCAGCTTCATATCATTT*GCTGTCACACAATAAAAAGATAACACCCCAAAAGTATGA
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AAGAGAACAAGGGCAAGACCGCGTGAACCACCAGGCTTGAGAGGCTTCCCACAACAGAAG
CAACGGCTAACGAGCATGATAAGGAGTTGACTAGCAACTGAGAAGAAAAAGGCTCCAATT
CCATACCCTGTGGCTCTGTCAGAATCATACACACAATAGTTGTATTGCACCTCAGTGTCC
TGCACAACCGTTGCAGTGCTTCTTCTTTGTTCAGCAGCAACGGCTAGACCAAAGGCGACA
AGGTTGAATACAAAGACTATGGCTGAGACAATCTTCGACGCCATGGGTTCACCTTACTCT
CGCTCTCTTTCACAAAACGTTCCTTTAGATTAGATATAAAGACAACTTTGTTTGCTCAGA
TTTGATCATATCC

QA 2 794 2 794
DS 



AS 1 4

CO CL2467Contig1 453 4 5 U
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CCGAGATTGATACGGATGGTGATGGATACATATCGTACCAAGAATTTTCTGATTTCGCAA
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TTCTTTTAAGGGTAAAAAGATTTGGTTCTAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BQ37JQ C 5
AF RS1GI47TF U 1
AF RS1D339TF U 2
AF RS1BQ37TF U 24
BS 1 35 RS1GI47TF
BS 36 36 RS1BQ37TF
BS 37 427 RS1GI47TF
BS 428 438 RS1D339TF
BS 439 453 RS1BQ37TF

RD RS1BQ37JQ 263 0 0
GG
ACCAAAAGAACACAAACCTATAAACAATGACTGACGCAACAGAAAGAGCTGAGCACGACC
GTGTTTTCAAGAAATTTGATGCTAACGGAGATGGAAAAATATCTGCCTCCGAGCTTGGAG
ATGCTCTCAAGAACCTTGGCTCGGTCACACACGACGACATTAAGCGTATGATGGCCGAGA
TTGATACGGATGGTGATGGATACATATCGTACCAAGAATTTTCTGATTTCGCAAGTGCCA
ACCGTGGTCTCATGAAAGATG

QA 3 263 3 263
DS 

RD RS1GI47TF 428 0 0
GGCGATACCAAAAGAACACAAACCTATAAACAATGGCTGACGCAACAGAAAGAGCTGAGC
ACGACCGTGTTTTCAAGAAATTTGATGCTAACGGAGATGGAAAAATATCTGCCTCCGAGC
TTGGAGATGCTCTCAAGAACCTTGGCTCGGTCACACACGACGACATTAAGCGTATGATGG
CCGAGATTGATACGGATGGTGATGGATACATATCGTACCAAGAATTTTCTGATTTCGCAA
GTGCCAACCGTGGTCTCATGAAAGATGTGGCCAAGATTTTCTAAACGATATTATCAAATT
TTATTTGAGAGACAATCATGTTTAATTTGTTTTCTTAATGACAATCATCTGATTAAGTAT
GTTTTTGTTATGTTTTTCTTTCATGTAATGGATTGTAATGATATAATTGAAAATTCTCGA
TTCTTTT
T

QA 1 427 1 427
DS 

RD RS1D339TF 437 0 0
GGGAT
ACCAAAAGAACACAAACCTATAAACAATGGCTGACGCGACAGAAAGAGCTGAGCACGACC
GTGTTTTCAAGAAATTTGATGCTAACGGAGATGGAAAAATATCTGCCTCCGAGCTTGGAG
ATGCTCTCAAGAACCTTGGCTCGGTCACACACGACGACATTAAGCGTATGATGGCCGAGA
TTGATACGGATGGTGATGGATACATATCGTACCAAGAATTTTCTGATTTCGCACGTGCCA
ACCGTGGTCTCATGAAAGATGTGGCCAAGATTTTCTAAACGATATTATCAAATTTTATTT
GAGAGACAATCATGTTTAATTTGTTTTCTTAATGACAATCATCTGATTAAGTATGTTTTT
GTTATGTTTTTCTTTCATGTAATGGATTGTAATGATATAATTGAAAATTCTCGATTCTTT
TAAGGGTAAAAA

QA 6 437 6 437
DS 

RD RS1BQ37TF 430 0 0
CTATAAACAATGACTGACGCAACAGAAAGAGCTGAGCACGACCGTGTTTTCAAGAAATTT
GATGCTAACGGAGATGGAAAAATATCTGCCTCCGAGCTTGGAGATGCTCTCAAGAACCTT
GGCTCGGTCACACACGACAACATTAAGCGTATGATGGCCGAGATTGATACGGATGGTGAT
GGATACATATCGTACCAAGAATTTTCTGATTTCGCAAGTGCCAACCGTGGTCTCATGAAA
GATGTGGCTAAGATTTTCTAAACGATATTATCAAATTTTATTTGAGAGACAATCATGTTT
AATTTGTTTTCTTAATGACAATCATCTGATTAAGTATGTTTTTGTTATGTTTTTCTTTCA
TGTAATGGATTGTAATGATATAATTGAAAATTCTCGATTCTTTTAAGGGTAAAAAGATTT
GGTTCTAGAC

QA 1 430 1 430
DS 



AS 1 4

CO CL2468Contig1 799 4 18 U
TTTTTATCCTGTTTCAAGAATCCTTATTATTATTTTGAGTTTGATCTTCATTTCAAAGAT
GACTCTTCATTTCAATATGAATCTGAAGCAAATGGGCAACATGGTCTATGAAGACTCAAG
GAGGACCGAAGTAGAAGAAAACATTGTTGAAGGAGTTTCAAGATCGATGTTAGCAACTGA
AACATTCTCCGAGGAAGATTCATCATCATGTTCATTATCTTCCATGTGTTCTTCATCTGA
TTTAACAGAGGATAATGATGGTGATGCTTCTTCGTCTTCTTCAAATGGACCTCTTGAAGA
TCTCTCTGACCTCATGTCACACCTTCCAATCAAGAGAGGATTGTCAAAGTTTTATGAAGG
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AGGTTTTAAAAATAGAAACTATGGAGCAAGAAGAAAGGCGAAGAGCACTGGAGGAATAAT
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AN22TF U 1
AF RS1GL04TF U 144
AF RS1GL04JQ C 1020
AF RS1AN22JQ C 490
BS 1 224 RS1AN22TF
BS 225 227 RS1GL04TF
BS 228 264 RS1AN22TF
BS 265 265 RS1GL04TF
BS 266 312 RS1AN22TF
BS 313 313 RS1GL04TF
BS 314 808 RS1AN22TF
BS 809 821 RS1GL04TF
BS 822 822 RS1AN22JQ
BS 823 867 RS1GL04TF
BS 868 868 RS1AN22JQ
BS 869 885 RS1GL04TF
BS 886 1190 RS1AN22JQ
BS 1191 1191 RS1GL04JQ
BS 1192 1228 RS1AN22JQ
BS 1229 1229 RS1GL04JQ
BS 1230 1271 RS1AN22JQ

RD RS1AN22TF 808 0 0
GGGGTAATCGGCACTAATACAGGAGGAGATTACATCGAGGGAGATACCATTTTCCTCCAC
GTCGGAGGTTTGGTACTACACGTCTCCTAAGTTTGTCCTGTCAGAATGGAAGGTTCAAGC
AGTCTATCCAACGCAGGAAATTTTGGATCTATTGGAAGACAATCACAAGCTTCCCCAAAT
AACAGGGATAATAGTATTTCTCCTCCAAGTAATATGCACCATCA***TAGTGCTTCTTTA
AATAATCTTCTCATAGATGAGCAATCAGCTTGGCTCGATGATCTCCTAAGCGAGCCAGCG
TCTCCCAAGATCGACAAAGGTCACAGGCGTTCAGCTAGTGACACATCTGCCTACTTAAAC
TCGTCTTTAATGCCTTTTAGAGAAGATGACCTTCTGAATAGTCATTTTTCTGGGCCATCT
TGGCTAGTCCAGAATATTAACCAGCATGATGATTTGTGGCATCCTAACTCTTACGACAAC
CACAGTAAATTGGGATGGGAGTTTTCTAACAAAACTGGAACTAACCTCC*AAACACATGT
GTCATGGGGAGCTGTAAATAGAGCAGGTACCTCTGCCTCGAAATCAGCTGAAATACAAGC
AAGTAAAATGAAAGAAGGCTCTTTAACAAAACCAGACGGTCCTGGATCAAAAACTGACTC
TAAACGTATCAAACACCAAAATGCTCACCGGGCACGTTTAAGGAGGCTTGAGTACATATC
AGATTTGGAAAGAACCATCCAAGTGCTACAAGCTCAAGGATGTGAAATGTCATCTGCCAT
TCACTACTTGGATCAACAGCTGGTCATG

QA 1 808 1 808
DS 

RD RS1GL04TF 742 0 0
G
GGATCTATTGGAAGACAATCACAAGCTTCCCCAAATAACAGGGATAATAGTATTTCTCCT
CCAAGTAATATGCACCATCATCATAGTGCTTCTTTAAATAATCTTCTCATAGATGAGCAA
CCAGCTTGGCTCGATGATCTCCTAAGCGAGCCAGCGTCTCCCAAGATCAACAAAGGTCAC
AGGCGTTCAGCTAGTGACACATCTGCCTACTTAAACTCGTCTTTAATGCCTTTTAGAGAA
GATGACCTTCTGAATAGTCATTTTTCTGGGCCATCTTGGCTAGTCCAGAATATTAACCAG
CATGATGATTTGTGGCATCCTAACTCTTACGACAACCACAGTAAATTGGGATGGGAGTTT
TCTAACAAAACTGGAACTAACCTCC*AAACACATGCGTCATGGGGAGCTGTAAATAGAGC
AGGTACCTCTGCCTCGAAATCAGCTGAAATACAAGCAAGTAAAATGAAAGAAGGCTCTTT
AACAAAACCAGACGGTCCTGGATCAAAAATTGACTCTAAACGCATCAAACACCAAAATGC
TCACCGGGCACGTTTAAGGAGGCTTGAGTACATATCAGATTTGGAAAGAACCATCCAAGT
GCTACAAGCTCAAG*ATGTGAAATGTCATCTGCCATTCACTATTTGGATCAACAGCTGGT
CATGCTTGGTATGGAAA*TAGAGCCTTGAAACAACGTCTGGATAGTTTAGCAGAAATCCA
AAA*CTTAAACATGTTGAGCA

QA 2 742 2 742
DS 

RD RS1GL04JQ 236 0 0
AACCCGAGTCCCAGTTTGCAGCCTTGGCGATATGATTT*AGGAAAATATGGATCCACTTC
CAGTTAAATTTCTCAGTATGCTCTATAAGGTCTTATAAACCTTTT*CTCAGTGTTCATAT
ACGATAGGTAAGTCCAGTAATGCTTGCAGTCTGGAATGAATGCCTGAGCAAAGTATAGTC
ACATATATTATAATGTGGATGTTCAAATTATTATTTTTT
ATATAATTATTTTTATT

QA 1 219 1 219
DS 

RD RS1AN22JQ 782 0 0
TTGGGATGGGAGTTTTCTAACAAAACTGGAACTAACCTCCCAAACACATGTGTCATGGGG
AGCTGTAAATAGAGCAGGTACCTCTGCCTCGAAATCAGCTGAAATACAAGCAAGTAAAAT
GAAAGAAGGCTCTTTAACAAAACCAGACGGTCCTGGATCAAAAACTGACTCTAAACGTAT
CAAACACCAAAATGCTCACCGGGCACGTTTAAGGAGGCTTGAGTACATATCAGATTTGGA
AAGAACCATCCAAGTGCTACAAGCTCAAGGATGTGAAATGTCATCTGCCATTCACTACTT
GGATCAACAGCTGGTCATGCTTGGTATGGAAAATAGAGCCTTGAAACAACGTCTGGATAG
TTTAGCAGAAATCCAAAAACTTAAACATGTTGAGCAACAATTCCTTGAAAGAGAGATAGG
AAATCTGAAATTTCGAAAGCACCAACAACAACCACAACCACAACCACAACAGAATCAGAA
ACAAACGCAGCAAAACAGATACAACAACTACCGCCCACCCACCACGCAGGAACCCGAGTC
CCAGTTTGCAGCCTTGGCGATATGATTTTAGGAAAATATGGATCCACTTCCAGTTAAATT
TCTCAGTATGCTCTATAAGGTCTTATAAACCTTTTTCTCAGTGTTCATATACGATAGGTA
AGTCCAGTAATGCTTGCAGTCTGGAATGAATGCCTGAGCAA*GTATAGTCACATATATTA
TAATGTGGATGTTCAAATTCTTATTTTTTTTTGTAACTGAAAATTCAAATTCTTATTTTT
TA

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 4

CO CL2470Contig1 868 4 3 U
GGTACCTTTTCCTATTTCTTTTCTCTGTCACCGCACAATAGCAACAAGTCACTCTACAAT
GGCGGAAACGTTCTCTAGCGGCGATGCACGGTATTGGCCCATCTACGGTAGCAGCAACAC
CACCGAAAGAACCAGCCCTTACGCTTCTTCTCTTCTCCGCCTTCTCCGATCTCATTCACC
AACCTCCTCACAGCTCTTTGGTTTCCTCGCTCTCTTCATATCCGGCGGAATCCTCCTCTT
CCTCGTGGGTGTAACCGTGACGGCCGTCGGTATCGGCTTCGTTGTGTTTCTTCCGTTGAT
CATCATCTCGAGTCCGGTATGGATCCCGGTTTTTATCGGTGTTGGCGGGTTCTTATCGGT
GGCCGGTTTTCTCGTTGGAGGGTTGGCTGTCGTATCGTGGGCGTACCGCTATTTCCGGGG
AAGGCACCCGGTTGGATCGGATCAAATGGATTATGCACGTGGTCGGATCTATGACACGGC
CTCCCACGTCAAAGATTATGCTAGAGAGTACGGTGGATATTTCCACGGTAGGGCTAAAGA
TGCAGCCCCTGGTGCTTAGCCTTTACCGGTCGATATAGTCTGGTTCAGGGAAAGCTAGTT
GGACCTGTTCGGTGTATGGAGGATAAACATGGTTCATGCATGGTAATATACTACTATAAC
TTTTTGTTATTTTGTTTCCGTTAATAAATAATATAAATGAATATATCTGGTTAAGTATAT
ATATATCTGGTTAAGTATAAGATTTTTGGTGTTTGTTTTTGTTCGTCACTTGAAATGTAT
ATTAGTATATACTTTTGTTGGAGAGTTATTTACTTGTTTTAAGACTTTTAAATGATCAAA
TGGCTTTTGGGTTATATAATATATTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EI50TF U 1
AF RS1CR70JQ C 46
AF RS1CR70TF U 191
AF RS1EI50JQ C 164
BS 1 584 RS1EI50TF
BS 585 792 RS1CR70TF
BS 793 868 RS1EI50JQ

RD RS1EI50TF 584 0 0
GGTACCTTTTCCTATTTCTTTTCTCTGTCACCGCACAATAGCAACAAGTCACTCTACAAT
GGCGGAAACGTTCTCTAGCGGCGATGCACGGTATTGGCCCATCTACGGTAGCAGCAACAC
CACCGAAAGAACCAGCCCTTACGCTTCTTCTCTTCTCCGCCTTCTCCGATCTCATTCACC
AACCTCCTCACAGCTCTTTGGTTTCCTCGCTCTCTTCATATCCGGCGGAATCCTCCTCTT
CCTCGTGGGTGTAACCGTGACGGCCGTCGGTATCGGCTTCGTTGTGTTTCTTCCGTTGAT
CATCATCTCGAGTCCGGTATGGATCCCGGTTTTTATCGGTGTTGGCGGGTTCTTATCGGT
GGCCGGTTTTCTCGTTGGAGGGTTGGCTGTCGTATCGTGGGCGTACCGCTATTTCCGGGG
AAGGCACCCGGTTGGATCGGATCAAATGGATTATGCACGTGGTCGGATCTATGACACGGC
CTCCCACGTCAAAGATTATGCTAGAGAGTACGGTGGATATTTCCACGGTAGGGCTAAAGA
TGCAGCCCCTGGTGCTTAGCCTTTACCGGTCGATATAGTCTGGT

QA 1 584 1 584
DS 

RD RS1CR70JQ 748 0 0
AAGTCACTCTACAATGGCGGAAACGTTCTCTAGCGGCGATGCACGGTATTGGCCCATCTA
CGGTAGCAGCAACACCACCGAAAGAACCAGCCCTTACGCTTCTTCTCTTCTCCGCCTTCT
CCGATCTCATTCACCAACCCCCTCACAGCTCTTTGGTTTCCTCGCTCTCTTCATATCCGG
CGGAATCCTCCTCTTCCTCGTGGGTGTAACCGTGACGGCCGTCGGTATCGGCTTCGTTGT
GTTTCTTCCGTTGATCATCATCTCGAGTCCGGTATGGATCCCGGTTTTTATCGGTGTTGG
CGGGTTCTTATCGGTGGCCGGTTTTCTCGTTGGAGGGTTGGCTGTCGTATCGTGGGCGTA
CCGCTATTTCCGGGGAAGGCACCCGGTTGGATCGGATCAAATGGATTATGCACGTGGTCG
GATCTATGACACGGCCTCCCACGTCAAAGATTATGCTAGAGAGTACGGTGGATATTTCCA
CGGTAGGGCTAAAGATGCAGCCCCTGGTGCTTAGCCTTTACCGGTCGATATAGTCTGGTT
CAGGGAAAGCTAGTTGGACCTGTTCGGTGTATGGAGGATAAACATGGTTCATGCATGGTA
ATATACTACTATAACTTTTTGTTATTTTGTTTCCGTTAATAAATAATATAAATGAATATA
TCTGGTTAAGTATATATATATCTGGTTAAGTATAAGATTTTTGGTGTTTGTTTTTGTTCG
TCACTTGAAATGTATATTAGTATATAC
C

QA 1 747 1 747
DS 

RD RS1CR70TF 603 0 0
CAGCTCTTTGGTTTCCTCGCTCTCTTCATATCCGGCGGAATCCTCCTCTTCCTCGTGGGT
GTAACCGTGACGGCCGTCGGTATCGGCTTCGTTGTGTTTCTTCCGTTGATCATCATCTCG
AGTCCGGTATGGATCCCGGTTTTTATCGGTGTTGGCGGGTTCTTATCGGTGGCCGGTTTT
CTCGTTGGAGGGTTGGCTGTCGTATCGTGGGCGTACCGCTATTTCCGGGGAAGGCACCCG
GTTGGATCGGATCAAATGGATTATGCACGTGGTCGGATCTATGACACGGCCTCCCACGTC
AAAGATTATGCTAGAGAGTACGGTGGATATTTCCACGGTAGGGCTAAAGATGCAGCCCCT
GGTGCTTAGCCTTTACCGGTCGATATAGTCTGGTTCAGGGAAAGCTAGTTGGACCTGTTC
GGTGTATGGAGGATAAACATGGTTCATGCATGGTAATATACTACTATAACTTTTTGTTAT
TTTGTTTCCGTTAATAAATAATATAAATGAATATATCTGGTTAAGTATATATATATCTGG
TTAAGTATAAGATTTTTGGTGTTTGTTTTTGTTCGTCACTTGAAATGTATATTAGTATAT
AC
C

QA 1 602 1 602
DS 

RD RS1EI50JQ 705 0 0
CTCCGATCTCATTCACCAACCTCCTCACAGCTCTTTGGTTTCCTCGCTCTCTTCATATCC
GGCGGAATCCTCCTCTTCCTCGTGGGTGTAACCGTGACGGCCGTCGGTATCGGCTTCGTT
GTGTTTCTTCCGTTGATCATCATCTCGAGTCCGGTATGGATCCCGGTTTTTATCGGTGTT
GGCGGGTTCTTATCGGTGGCCGGTTTTCTCGTTGGAGGGTTGGCTGTCGTATCGTGGGCG
TACCGCTATTTCCGGGGAAGGCACCCGGTTGGATCGGATCAAATGGATTATGCACGTGGT
CGGATCTATGACACGGCCTCCCACGTCAAAGATTATGCTAGAGAGTACGGTGGATATTTC
CACGGTAGGGCTAAAGATGCAGCCCCTGGTGCTTAGCCTTTACCGGTCGATATAGTCTGG
TTCAGGGAAAGCTAGTTGGACCTGTTCGGTGTATGGAGGATAAACATGGTTCATGCATGG
TAATATACTACTATAACTTTTTGTTATTTTGTTTCCGTTAATAAATAATATAAATGAATA
TATCTGGTTAAGTATATATATATCTGGTTAAGTATAAGATTTTTGGTGTTTGTTTTTGTT
CGTCACCTGAAATGTATATTAGTATATACTTTTGTTGGAGAGTTATTTACTTGTTTTAAG
ACTTTTAAATGATCAAATGGCTTTTGGGTTATATAATATATTTTC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 4

CO CL2471Contig1 723 4 7 U
TTTTTTACTGAATCGACCATAGAACAATCGCCCTTGTTATTTGGGAGTATTGAATACACC
CACAAGTCTGAGCTTCGTGTTACTCCTTTCAAGAGACAAGTCAGATCGAGGGCATCCCAA
ATTGATTGAAGGGGATGAGAGTTTATCATTCTTAAAAATAAAAATTTTGATCAAATCACA
CATCGCAGTATACTAGACCTTCTAATTCTTTAAGAGGTTTATCTAAAAGATTCGCAATAT
AACTAGGAAGACGTTTCAAATACCATACATGAGTTACAGGACATGTCAGTTTTATGTATC
CCATTTGATATCTTCGTATCCGAGAATCAACAAATTCAACTCCACATTGTTCACAAAATT
TCGAGTCTTCTTTTTCATCTCCGATCACTCGATAATTTCCACAAGCGCAAATTCCACTCT
TTATAGGCCCAAAAATCCTTTCACAAAATAATCCATCTTTTTCCGGTTTATTGGTTTTGT
AATGAAAAGTATAGGGTTTCGTCACCTCTCCAACTATCTCTCCATTAGGTATTTTTTTAG
TGGCCCAAGCACTTATTTGCTGAGGAGAAACTAATCCAATTCGGAGTCGTTGATGTTTAT
ACCGATCGATCATATAAGAAATTTTGTGATTCATTCCGATTAAACTTCCTTCCTATGAAT
CTGGAAATTCTTCTCAGATACAAGGAAATGATTCAGTTCCAGAGCCAAAGATCGTAGTTC
CCT


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 10 10 

AF RS1GQ16JQ U 7
AF RS1GQ16TF C 1
AF RS1DX32TF C 463
AF RS1DX32JQ U 463
BS 1 6 RS1GQ16TF
BS 7 499 RS1GQ16JQ
BS 500 500 RS1DX32JQ
BS 501 587 RS1GQ16JQ
BS 588 588 RS1DX32JQ
BS 589 628 RS1GQ16JQ
BS 629 723 RS1DX32JQ

RD RS1GQ16JQ 622 0 0
ACTGAATCGACCATAGAACAATCGCCCTTGTTATTTGGGAGTATTGAATACACCCACAAG
TCTGAGCTTCGTGTTACTCCTTTCAAGAGACAAGTCAGATCGAGGGCATCCCAAATTGAT
TGAAGGGGATGAGAGTTTATCATTCTTAAAAATAAAAATTTTGATCAAATCACACATCGC
AGTATACTAGACCTTCTAATTCTTTAAGAGGTTTATCTAAAAGATTCGCAATATAACTAG
GAAGACGTTTCAAATACCATACATGAGTTACAGGACATGTCAGTTTTATGTATCCCATTT
GATATCTTCGTATCCGAGAATCAACAAATTCAACTCCACATTGTTCACAAAATTTCGAGT
CTTCTTTTTCATCTCCGATCACTCGATAATTTCCACAAGCGCAAATTCCACTCTTTATAG
GCCCAAAAATCCTTTCACAAAATAATCCATCTTTTTCCGGTTTATTGGTTTTGTAATGAA
AAGTATAGGGTTTTGTCACCTCTCCAACTATCTCTCCATTAGGTATTTTTTTAGTGGCCC
AAGCACTTATTTGCTGAGGAGAAACTAATCCAATTCGGAGTTGTTGATGTTTATACCGAT
CGATCATATAAGAAATTTTGTG

QA 1 622 1 622
DS 

RD RS1GQ16TF 720 0 0
TTTTTTACTGAATCGACCATAGAACAATCGCCCTTGTTATTTGGGAGTATTGAATACACC
CACAAGTCTGAGCTTCGTGTTACTCCTTTCAAGAGACAAGTCAGATCGAGGGCATCCCAA
ATTGATTGAAGGGGATGAGAGTTTATCATTCTTAAAAATAAAAATTTTGATCAAATCACA
CATCGCAGTATACTAGACCTTCTAATTCTTTAAGAGGTTTATCTAAAAGATTCGCAATAT
AACTAGGAAGACGTTTCAAATACCATACATGAGTTACAGGACATGTCAGTTTTATGTATC
CCATTTGATATCTTCGTATCCGAGAATCAACAAATTCAACTCCACATTGTTCACAAAATT
TCGAGTCTTCTTTTTCATCTCCGATCACTCGATAATTTCCACAAGCGCAAATTCCACTCT
TTATAGGCCCAAAAATCCTTTCACAAAATAATCCATCTTTTTCCGGTTTATTGGTTTTGT
AATGAAAAGTATAGGGTTTTGTCACCTCTCCAACTATCTCTCCATTAGGTATTTTTTTAG
TGGCCCAAGCACTTATTTGCTGAGGAGAAACTAATCCAATTCGGAGTTGTTGATGTTTAT
ACCGATCGATCATATAAGAAATTTTGTGATTCATTCCGATTAAACTTCCTTCCTATGAAT
CTGGAAATTCTTCTCAGATACAAGGAAATGATTCAGTTCCAGAGCCAAAGATCGTAGTTC

QA 1 720 1 720
DS 

RD RS1DX32TF 261 0 0
CCGGTTTATTGGTTTTGTAATGAAAAGTATAGGGTTTCGTCACCTCTCCAACTATCTCTC
CATTAGGTATTTTTTTAGTGGCCCAAGCACTTATTTGCTGAGGAGAAACTAATCCAATTC
GGAGTCGTTGATGTTTATACCGATCGATCATATAAGAAATTTTGTGATTCATTCCGATTA
AACTTCCTTCCTATGAATCTGGAAATTCTTCTCAGATACAAGGAAATGATTCAGTTCCAG
AGCCAAAGATCGTAGTTC
CCT

QA 1 258 1 258
DS 

RD RS1DX32JQ 261 0 0
CCGGTTTATTGGTTTTGTAATGAAAAGTATAGGGTTTCGTCACCTCTCCAACTATCTCTC
CATTAGGTATTTTTTTAGTGGCCCAAGCACTTATTTGCTGAGGAGAAACTAATCCAATTC
GGAGTCGTTGATGTTTATACCGATCGATCATATAAGAAATTTTGTGATTCATTCCGATTA
AACTTCCTTCCTATGAATCTGGAAATTCTTCTCAGATACAAGGAAATGATTCAGTTCCAG
AGCCAAAGATCGTAGTTCCCT

QA 1 261 1 261
DS 



AS 1 4

CO CL2472Contig1 795 4 13 U
CAAAACCAAATCAAACTGAAATTCAATAATCTATGAGGTTTCTTACTGATACAACATCGA
AAATCACTCCCAAGGAAACAAGAAAAACAAAAATTTCTGAATCACTCAGACACACGCACA
TTAAGTTGAAAAGATATTGGTTTTAGGTGGTAAGTTCCATGATGGCAGAAACAATATCCC
CATCAGCAGCCTTAAGCGCCTTAACAGCCCTTGGCCTAGGAACTCCAGCTTGGGTCATCA
CCAACTCAATGTCCTTTGAGTCAACACCCTCCTCGTCAATCTCCTCATCATCATCTTGCA
CCACCGCAGCAGCACTTGAGGAAGATTCACCCTGCGAGACCACGTTGCTGATATCAGGAG
CCTTGAACTGCTCTGCAGCCTGGGACTGGAGCTGAAAGCTCAAGTCCTCGATCTTTGCCT
CTCCAAAGATCACATACGTGTCCGACGCCGGGCTCTTGAACACGTCAGGTTTTGATATGA
CAAACATGATGTTCTTGCTCTTTTTGACAGTGACACGGCTGACACCAGTGATAGGTTTCA
TCCCAAGCTTCAGCATGGCTTTGCGACTCTTCTTCTCACTTCTGCTTTGTTTTGACTTGC
CTCCCTCTTGTCCCTCTGCATCATCATCATTATCATCGTCTTCGGAGTCATCATCATCGT
TGTCATCAACGTCCTCAACTTCAGGCTTATCAAGATCGATCTTCTGCTCTTCCAATTTGG
CGGCGAGGATCTCTTTGTCTTCGGTAGTCATGATGAATGATTACGTGTAGTGAGGATTCG
TGAAACGGTGCGGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1GI65JQ U 1
AF RS1GG10JQ U 12
AF RS1GG10TF C 228
AF RS1GI65TF C 260
BS 1 41 RS1GI65JQ
BS 42 42 RS1GG10JQ
BS 43 57 RS1GI65JQ
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BS 526 599 RS1GG10JQ
BS 600 795 RS1GG10TF

RD RS1GI65JQ 525 0 0
CAAAACCAAATCAAACTGAAATTCAATAATCTATGAGGTTTTTTACTGATACAACATTGA
AAATCACTTTCAAGGAAACAAGAAAAACAAAAATTTCTGAATCACTCAGACACACGCACA
TTAAGTTGAAAAGATTTTGGTTTTAGGTGGTAAGTTCCATGATGGCAGAAACAATATCCC
CATCAGCAGCCTTAAGCGCCTTAACAGCCCTTGGCCTAGGAACTCCAGCTTGGGTCATCA
CCAACTAAATGTCCTTTGAGTCAACACCCTCCTCGTCAATCTCCTCATCATCATCTTGCA
CCACCGCAGCAGCACTTGAGGAAGATTCACCCTGCGAGACCACGTTGCTGATATCAGGAG
CCTTGAACTGCTCTGCAGCCTGGGACTGGAGCTGAAAGCTCAAGTCCTCGATCTTTGCCT
CTCCAAAGATCACATACGTGTCCGACGCCGGGCTCTTGAACACGTCAGGTTTTGATATGA
CAAACATGATGTTCTTGCTCTTTTTGACAGTGACACGGCTGACAC

QA 1 525 1 525
DS 

RD RS1GG10JQ 588 0 0
CG
AACTGAAATTCAATAATCTATGAGGTTTCTTACTGATACAACATCGAAAATCACTCCCAA
GGAAACATGAAAAACAAAAATTTCTGAATCACTCTGACACACGCACATTAAGTTGAAAAG
ATATTGGTTTTAGGTGGTAAGTTCCATGATGGCAGAAACAATATCCCCATCAGCAGCCTT
AAGCGCCTTCACAGCCCTTGGCCTAGGAACTCCTGCTTGGGTCATCACCAACTCAATGTC
CTTTGAGTCAACACCCTCCTCGTCAATCTCCTCATCATCATCTTGCACCACCGCAGCAGC
ACTTGAGGAAGATTCACCCTGCGAGACCACGTTGCTGATATCAGGAGCCTTGAACTGCTC
TGCAGCCTGGGACTGGAGCTGAAAGCTCAAGTCCTCGATCTTTGCCTCTCCAAAGATCAC
ATACGTGTCCGACGCCGGGCTCTTGAACACGTCAGGTTTTGATATGACAAACATGATGTT
CTTGCTCTTTTTGACAGTGACACGGCTGACACCAGTGATAGGTTTCATCCCAAGCTTCAG
CATGGCTTTGCGACTCTTCTTCTCACTTCTGCTTTGTTTTGACTTG

QA 3 588 3 588
DS 

RD RS1GG10TF 568 0 0
GCTTGGGTCATCACCAACTCAATGTCCTTTGAGTCAACACCCTCCTCGTCAATCTCCTCA
TCATCATCTTGCACCACCGCAGCAGCACTTGAGGAAGATTCACCCTGCGAGACCACGTTG
CTGATATCAGGAGCCTTGAACTGCTCTGCAGCCTGGGACTGGAGCTGAGAGCTCAAGTCC
TCGATCTTTGCCTCTCCAAAGATCACATACGTGTCCGACGCCGGGCTCTTGAACACGTCA
GGTTTTGATATGACAAACATGATGTTCTTGCTCTTTTTGACAGTGACACGGCTGACACCA
GTGATAGGTTTCATCCCAAGCTTCAGCATGGCTTTGCGACTCTTCTTCTCACTTCTGCTT
TGTTTTGACTTGCCTCCCTCTTGTCCCTCTGCATCATCATCATTATCATCGTCTTCGGAG
TCATCATCATCGTTGTCATCAACGTCCTCAACTTCAGGCTTATCAAGATCGATCTTCTGC
TCTTCCAATTTGGCGGCGAGGATCTCTTTGTCTTCGGTAGTCATGATGAATGATTACGTG
TAGTGAGGATTCGTGAAACGGTGCGGAA

QA 1 568 1 568
DS 

RD RS1GI65TF 536 0 0
GTCAACACCCTCCTCGTCAATCTCCTCATCATCATCTTGCACCACCGCAGCAGCACTTGA
GGAAGATTCACCCTGCGAGACCACGTTGCTGATATCAGGAGCCTTGAACTGCTCTGCAGC
CTGGGACTGGAGCTGAGAGCTCAAGTCCTCGATCTTTGCCTCTCCAAAGATCACATACGT
GTCCGACGCCGGGCTCTTGAACACGTCAGGTTTTGATATGACAAACATGATGTTCTTGCT
CTTTTTGACAGTGACACGGCTGACACCAGTGATAGGTTTCATCCCAAGCTTCAGCATGGC
TTTGCGACTCTTCTTCTCACTTCTGCTTTGTTTTGACTTGCCTCCCTCTTGTCCCTCTGC
ATCATCATCATTATCATCGTCTTCGGAGTCATCATCATCGTTGTCATCAACGTCCTCAAC
TTCAGGCTTATCAAGATCGATCTTCTGCTCTTCCAATTTGGCGGCGAGGATCTCTTTGTC
TTCGGTAGTCATGATGAATGATTACGTGTAGTGAGGATTCGTGAAACGGTGCGGAA

QA 1 536 1 536
DS 



AS 1 4

CO CL2473Contig1 1319 4 11 U
AGGGAGTAATGGATGGGAAGCTTACTCAAGGAGGTGGAGCTTCCTCCTTCGGAGGATTCG
ATATGAGAGTTCATCATCCAGATTCCATGAACCAGCAGCATCTCCAAGGTCTTCCCTTTA
CCATGGTTACAGGACAAACCTGTGATCATCATCATAAAGGTGAAAGAGAGAGTGACGATG
ATGAAGAACCGAGTTTTAACGAAGAAAGTGGTGGTGATGGTCACAACAACAACAACAAGT
CAGCCAAAGGGTCTCCTTGGCAGCGAGTGAAGTGGACTGATAAGATGGTGAAGCTGTTGA
TAACCGCTGTGTCTTATATAGGTGATGATTCGTGTATGGATGGTGGGAGTAGGAGAAAGT
TCGCTGCTTTGCAGAAAAAGGGCAAGTGGAAGTCTGTTTCCAAAGTCATGTCTGAGAGAG
GGTATCACGTTTCGCCTCAGCAGTGTGAGGATAAGTTTAATGATTTGAATAAACGGTATA
AGAAGCTTAACGATATGCTTGGGGAGGGGGACCTCTTGTCAGGTTGTTGAGAATCCTAAG
CTTTTGGATTCTATTGGGTTCTTGAATGATAAGGAGAAGGATGATGTTAGGAAAATCATG
AGTTCTAAGCAGTTGTTCTACGAAGAGATGTGTTCTTACCATAATGGGAATAGGTTGCAT
TTGCCTCATGACCTTGCTTTGCAGCGTTCGCTACAGCTGGCGCTTAGAAGCAGAGATGAT
CATGAGAATCATCAGGTTGAGGATCTTGATGATGAGGATCATGATGAGCATGATGATGAT
GTTGACCGTGGGGATTGTAGGGTTGTTCATTATGGAGGAGGTGGTGGTGGTCCTTTGAAG
AAGGGGAGACAGAGCCATAGCCATGAAGATGGTGACCATCAGGGCCATGTGAATTCTCTG
GAATGCAGTAAGGTCACTTTGGCTCATCAAATGCCGTTTCCTCAAGGTGGGGATGAGAGT
GTGAGGTCAGCTTCTGTCCAGAAGCAGTGGATTGAGTCTAGGACTCTGGAGTTGGAAGAG
CAGAAGCTTCAGATTCAAGTTGAGTTGCTGGAATTGGAGAAACAGAGGTTCAGGTGGGAG
AGGTTTAGTAAGAAAAGAGATCAAGAGCTTGAGAGAATGAGGATGGAGAATGAGAGGACG
AAACTTGAGAATGATAGGATGGGATTGGAGTTGAAACAAAGGGAGCTGGGTGTTGAGTTA
TAACGGAACTAGCTTCGTTTTTTTGCTTGATTGGTATATAGAGCTTTGCTAGATGAAGCC
TAGTTTTGTGTTATTGTAAGCTTTGGTTTTGACTGAAATGATCACGACACTTTGATATG


BQ
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CAGCCAAAGGGTCTCCTTGGCAGCGAGTGAAGTGGACTGATAAGATGGTGAAGCTGTTGA
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DS 

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AGTTGTTCTACGAAGAGATGTGTTCTTACCATAATGGGAATAGGTTGCATTTGCCTCATG
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A

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DS 

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CGCCTCAGCAGTGTGAGGATAAGTTTAATGATTTGAATAAACGGTATAAGAAGCTTAACG
ATATGCTTGGG*AGGGGGACCTCTTGTCAGGTTGTTGAGAATCCTAAGCTTTTGGATTCT
ATTGGGTTCTTGAATGATAAGGAGAAGGATGATGTTAGGAAAATCATGAGTTCTAAGCAG
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CAGGTTGAGGATCTTGATGATGAGGATCATGATGAGCATGATGATGATGTTGACCGTGGG
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DS 

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GCAGAGATGATCATGAGAATCATCAGGTTGAGGATCTTGATGATGGGGATCATGATGAGC
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TGAATTTTCTGGAATGCAGTAAGGTCACTTTGGCTCATCAAATGCCGTTTCCTCAAGGTG
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AGTTGGAAGGGCAGAAGCTTCAGATTCAAGTTGAGTTGCTGGAATTGGAGAAACAGAGGT
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ATGAGAGGATGAAACTTGAGAATGATAGGATGGGATTGGAGTTGAAACAAAGGGAGCTGG
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TAGATGAAGCCTAGTTTTGTGTTATTGTAAGCTTTGGTTTTGACTGAAATGATC
TCGA

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 4

CO CL2474Contig1 964 4 2 U
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TATCCTCAGGAGGATCAACAGATCGAAACCAGATTTATGAGATAAAAGATTATGGACAAG
AAAATGCAGTTTTACACTCTGAACAGCAAGATGTTCATCAAGGCTTTAGCTCTGTCTCTT
CTTTAGCTGGAGGCAAGGGATACAATCAAGATGCTGCCATTCTCCACCTGGGCTATGGAA
CAGAAGAAGGAGCGTTGTGTGGAGTGTTTGATGGCAAATCTAGGAGATTCAAGGGCTGTG
ATGATTGGAACAAGTGAGGATGGAGAAATCAGGGTGGTTCAATTAACCACTGACCTGAAG
CCAAGTGTTCCAAACGAAGCCGACAGAATAAGAAAACGCAACGGAAGGGTCTTGGCATTA
GAGTCAGAGCCACATATTCTAAGAGTATGGCTTCCACATGAAAACCGGCCCGGTCTAGCC
ATGTCTAGGTCTTTGGGTGATTTCGTTCTTAAGAGCTATGGTGTCATTGCGACTCCTCAA
GTATCTGCGCATCAAATCACTCCTGGCGACCAGTTTCTGCTCCTTGCTTCCGATGGGGTC
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GGAGCGGCCAACGCAGTGACAGAGGCGGCGGCTAATGCATGGAGACAGAAATATCCGACG
GTCAAGGTTGATGATATTTCTGTCGTGTGCCTCTTTCTCAACAAGAGGTTTCATCCTCAG
CCACGTATGTAATCAAACAAACAAACTTGCGAAGAAAACATATAACGACTAATCAAAGAT
GGATGCCACGTATGATTGTTTACTCAGACTTCTGTGTGTTGCCTTTGAGTGTGAATGTAT
GTGTGTGTATATATTACATTTGTATGTTAAGTCGTGTGATTATTAATAGAAAATAAATAG
TAGG


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30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 

AF RS1EP44TF U 1
AF RS1DX10TF U 330
AF RS1EP44JQ C 233
AF RS1FE06JQ C 341
BS 1 630 RS1EP44TF
BS 631 964 RS1EP44JQ

RD RS1EP44TF 630 0 0
CATTTGTTTGATCTCCTCTCATACATATACGGAAACTAAAAATGGGCTTTTGTTTCTGTT
TATCCTCAGGAGGATCAACAGATCGAAACCAGATTTATGAGATAAAAGATTATGGACAAG
AAAATGCAGTTTTACACTCTGAACAGCAAGATGTTCATCAAGGCTTTAGCTCTGTCTCTT
CTTTAGCTGGAGGCAAGGGATACAATCAAGATGCTGCCATTCTCCACCTGGGCTATGGAA
CAGAAGAAGGAGCGTTGTGTGGAGTGTTTGATGGCAAATCTAGGAGATTCAAGGGCTGTG
ATGATTGGAACAAGTGAGGATGGAGAAATCAGGGTGGTTCAATTAACCACTGACCTGAAG
CCAAGTGTTCCAAACGAAGCCGACAGAATAAGAAAACGCAACGGAAGGGTCTTGGCATTA
GAGTCAGAGCCACATATTCTAAGAGTATGGCTTCCACATGAAAACCGGCCCGGTCTAGCC
ATGTCTAGGTCTTTGGGTGATTTCGTTCTTAAGAGCTATGGTGTCATTGCGACTCCTCAA
GTATCTGCGCATCAAATCACTCCTGGCGACCAGTTTCTGCTCCTTGCTTCCGATGGGGTC
TGGGATGTTCTTAGTAACGAAGAAGTGGCT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RS1DX10TF 280 0 0
GAA
GGTGGTTCAATTAACCACTGACCTGAAGCCAAGTGTTCCAAACGAAGCCGACAGAATAAG
AAAACGCAACGGAAGGGTCTTGGCATTAGAGTCAGAGCCACATATTCTAAGAGTATGGCT
TCCACATGAAAACCGGCCCGGTCTAGCCATGTCTAGGTCTTTGGGTGATTTCGTTCTTAA
GAGCTATGGTGTCATTGCGACTCCTCAAGTATCTGCGCATCAAATCACTCCTGGCGACCA
GTTTCTGCTCCTTGCTTCCGATGGGGTCTGGGATGTT

QA 4 280 4 280
DS 

RD RS1EP44JQ 732 0 0
CTATGGAACAGAAGAAGGAGCGTTGTGTGGAGTGTTTGATGGCAAATCTAGGAGATTCAA
GGGCTGTGATGATTGGAACAAGTGAGGATGGAGAAATCAGGGTGGTTCAATTAACCACTG
ACCTGAAGCCAAGTGTTCCAAACGAAGCCGACAGAATAAGAAAACGCAACGGAAGGGTCT
TGGCATTAGAGTCAGAGCCACATATTCTAAGAGTATGGCTTCCACATGAAAACCGGCCCG
GTCTAGCCATGTCTAGGTCTTTGGGTGATTTCGTTCTTAAGAGCTATGGTGTCATTGCGA
CTCCTCAAGTATCTGCGCATCAAATCACTCCTGGCGACCAGTTTCTGCTCCTTGCTTCCG
ATGGGGTCTGGGATGTTCTTAGTAACGAAGAAGTGGCTACGGTGGTGATGAATTCAGAGA
ATGAGGCAGGAGCGGCCAACGCAGTGACAGAGGCGGCGGCTAATGCATGGAGACAGAAAT
ATCCGACGGTCAAGGTTGATGATATTTCTGTCGTGTGCCTCTTTCTCAACAAGAGGTTTC
ATCCTCAGCCACGTATGTAATCAAACAAACAAACTTGCGAAGAAAACATATAACGACTAA
TCAAAGATGGATGCCACGTATGATTGTTTACTCAGACTTCTGTGTGTTGCCTTTGAGTGT
GAATGTATGTGTGTGTATATATTACATTTGTATGTTAAGTCGTGTGATTATTAATAGAAA
ATAAATAGTAGG

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1FE06JQ 623 0 0
GGG
TAACCACTGACCTGAAGCCAAGTGTTCCAAACGAAGCCGACAGAATAAGAAAACGCAACG
GAAGGGTCTTGGCATTAGAGTCAGAGCCACATATTTTAAGAGTATGGCTTCCACATGAAA
ACCGGCCCGGTCTAGCCATGTCTAGGTCTTTGGGTGATTTCGTTCTTAAGGGCTATGGTG
TCATTGCGACTCCTCAAGTATTTGCGCATCAAATCACTCCTGGCGACCTGTTTTTGCTCC
TTGCTTCCGATGGGGTTTGGGATGTTCTTAGTAACGAAGAAGTGGCTACGGTGGTGATGA
ATTCAGAGAATGAGGCAGGAGCGGCCAACGCAGTGACAGAGGCGGCGGCTAATGCATGGA
GACAGAAATATCCGACGGTCAAGGTTGATGATATTTCTGTCGTGTGCCTCTTTCTCAACA
AGAGGTTTCATCCTCAGCCACGTATGTAATCAAACAAACAAACTTGCGAAGAAAACATAT
AACGACTAATCAAAGATGGATGCCACGTATGATTGTTTACTCAGACTTCTGTGTGTTGCC
TTTGAGTGTGAATGTATGTGTGTGTATATATTACATTTGTATGTTAAGTCGTGTGATTAT
TAATAGAAAATAAATAGTAG

QA 4 623 4 623
DS 



AS 1 4

CO CL2475Contig1 634 4 9 U
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GAATCGCATCTCGTTCACAGCCCGTAACATTCGGCAGCCTGTTTGAGGCTCTAAACGGCT
GAATTTGGGCTCGAAAAATGGCCAGGCCTATTCACTGACCTAGATGGTTTTGGGGGCTTT
CCGAAATGGTGCTGTGGGCGGCGTAGTTCCTCACGGTTAAAAAGTTATGGGGTTTTAAAG
ATGAGACGCGTTTCAAAATGAAGAAAAATAAATAAAAAGGGGTGCAACACGAGGACTTCC
CGGGAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGA
TGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCGTTAGTACATGACTCGCGATTCC
ATATATCCTTTTCGTCGGAGAGCACGAGTAGATTTGCGTGGAGCCCACAAGTTTTTTTTT
TTTTTTTTTTACTTTTTCCATGCATCAAAATGTATGAAATTTGATGTAGTAAACTGCAAA
AGCAACCGGAAACAGCGAATCGCATCTCGTTCACAGCCCGTAACATTCGGCAGCCTGTTT
GAGGCTCTAAACGGCTGAATTTGGGCTCGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1E277JQ U 2
AF RS1E277TF C 1
AF RS1C453TF C 2
AF RS1C453JQ U 6
BS 1 5 RS1E277TF
BS 6 244 RS1E277JQ
BS 245 245 RS1C453JQ
BS 246 268 RS1E277JQ
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BS 440 440 RS1E277TF
BS 441 634 RS1C453JQ

RD RS1E277JQ 436 0 0
CCAT
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GCATCTCGTTCACAGCCCGTAACATTCGGCAGCCTGTTTGAGGCTCTAAACGGCTGAATT
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ATGGTGCTGTGGGCGGCGTAGTTCCTCACGGTTAAAAAGTTATGGGGTTTTAAAGATGAA
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GGTCACCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGA
TCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCGTTAGTACATGACTCGCGATTCCATATA
TCCTTTTCGTCG

QA 5 436 5 436
DS 

RD RS1E277TF 582 0 0
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GAATCGCATCTCGTTCACAGCCCGTAACATTCGCCAGCCTGTTTGAGGCTCTAAACGGCT
GAATTTGGGCTCGAAAAATGGCCAGGCCTATTCACTGACCTAGATGGTTTTGGGGGCTTT
CCGAAATGGTGCTGTGGACGGCGTAGTTCCTCACGGTTAAAAAGTTATGGGGTTTTAAAG
GTGAGACGCGTTTCAAAATGAAGAAAAATAAATAAAAAGGGGTGCAACACGAGGACTTCC
CGGGAGGTCGCCCATCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTGA
TGGGATCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCGTTAGTACATGACTCGCGATTCC
ATATATCCTTTTCGTCGGAGAGCACGAGTAGATTTGCGTGGAGCCCACAAGTTTTTTTTT
TTTTTTT***ACTTTTTCCATGCATCAAAATGTATGAAATTTGATGTAGTAAACTGCAAA
AGCACCCGGAAACAGCGAATCGCATCTCGTTCACAGCCCGT
C

QA 1 581 1 581
DS 

RD RS1C453TF 633 0 0
CCAT
GCATCAAAATGTATGAAATTTGATGTAGTAAACTGCAAAAGCACCCGGAAACAGCGAGTC
GCATCTCGTTCACAGCCCGTAACATTCGGCAGCCTGTTTGAGGCTCTAAACGGCTGAATT
TGGGCTCGAAAAATGGCCAGGCCTATTCACTGACCTAGATGGTTTTGGGGGCTTTCCGAA
ATGGTGCTGTGGGCGGCGTAGTTCCTCACGGTTTAAAAGTTATGGGGTTTTAAAGATGAG
ACGCGTTTCAAAATGAAGAAAAATAAATAAAAAGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCGGGA
GGTCACCCGTCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCGCGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGA
TCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCGTTAGTACATGACTCGCGATTCCATATA
TCCTTTTCGTCGGAGAGCACGAGTAGATTTGCGTGGAGCCCACAAGTTTTTTTTTTTTTT
TTTTTACTTTTTCCATGCATCAAAATGTATGAAATTTGATGTAGTAAACTGCAAAAGCAA
CCGGAAACAGCGAATCGCATCTCGTTCACAGCCCGTAACATTCGGCAGCCTGTTTGAGGC
TCTAAACGGCTGAATTTGGGCTCGAAAAA

QA 5 633 5 633
DS 

RD RS1C453JQ 629 0 0
GCATCAAAATGTATGAAATTTGATGTAGTAAACTGCAAAAGCACCCGGAAACAGCGAGTC
GCATCTCGTTCACAGCCCGTAACATTCGGCAGCCTGTTTGAGGCTCTAAACGGCTGAATT
TGGGCTCGAAAAATGGCCAGGCCTATTCACTGACCTAAATGGTTTTGGGGGCTTTCCGAA
ATGGTGCTGTGGGCGGCGTAGTTCCTCACGGTTTAAAAGTTATGGGGTTTTAAAGATGAG
ACGCGTTTCAAAATGAAGAAAAATAAATAAAAAGGGGTGCAACACGAGGACTTCCCGGGA
GGTCACCCGTCCTAGTACTACTCTCGCCCAAGCGCGCTTAACTGCGGAGTTCTGATGGGA
TCCGGTGCATTAGTGCTGGTATGATCGCACCCGTTAGTACATGACTCGCGATTCCATATA
TCCTTTTCGTCGGAAAGCACGAGTAGATTTGCGTGGAGCCCACAAGTTTTTTTTTTTTTT
TTTTTACTTTTTCCATGCATCAAAATGTATGAAATTTGATGTAGTAAACTGCAAAAGCAA
CCGGAAACAGCGAATCGCATCTCGTTCACAGCCCGTAACATTCGGCAGCCTGTTTGAGGC
TCTAAACGGCTGAATTTGGGCTCGAAAAA

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 4

CO CL2476Contig1 1424 4 15 U
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TGTAAAAACAATATACTAAGAAAAAACATGACCTGGTCAAGAAAAATACAAGACTCAGGC
AAACATTGGTTGCAATGCTTTATTCAAATAACTGTGATAAACTGAAAAAAAAAAAAAGAT
GTAATATTTGGAGATTGAAATGTGTGTTTGATGCTTGTACACAATCCATCTATCTCTAAC
GAGCGTCCTTGGACAAATAGCCTTGAGCGTCAACTTTCCTTGCGTTGCGAAGCTCATCAA
CTCCATCTCCTCTCTCAAACACAGCCGCTGCACCCATCCCCGTCCCAATGCACATCGACA
CTACCCCAAAACGACAGTCTTTTCCACGGCGTTTCATCTCGTGCAACAAAGTAGCAACGC
AACGTGCTCCTGTAGCGCCTAAAGGATGTCCTATGGCCATTGCGCCACCGTTGACATTGA
TTTTCTCTGCGTCTAGTCCCAATTTGTTACGGCAATAAACAAACTGAGATGCAAATGCCT
CGTTGATCTCAAACAAGTCGATATCATCGAGTTCTAAACCAGCAGCCTTAACTGCAGCCG
GAATGGCAACTGCTGGACCGACACCCATGATTGCTGGATCAACACCAACTGCAGCAAATG
TCCTGAACACACCAAGAACGGGAAGTCCTTTTTGCGTAGCAACACTTCTCCTCATGAGGA
GAACCGCTCCTGCACCATCACTTACTTGGCTGGAGTTTCCAGCAGTTGTGGTGCCATCCT
TTTTAAACACCGGCTTCAGCTTTCCAAGAGTAGCAAGGGTTGTACATGGTCGGATCCCAT
CATCAACAGAAACTGTAATGGGTGTCTCATCACCTGTCTTTGGGTCAACAAGCTTGGTTT
TAACAGGAATAATCTCATCCTTGAATTTACCAGCAGCAGTAGCAGCAGCTGCCTTTCTGT
GCGAGTCAACAGCAGCTTGGTCTTGCTCTTGCCTTGAGACACCAAAGCGGTGTGCTACAT
TTTCGGAAGTAACACCCATAGGGAGAAGACAATTCTGTGCTTGCTCAAACTTCTTCACCG
CTGGGTTGAATGACCCTTCCCATGCCATAGGATTGGTAGTCATGGACTCCAATCCCGCCC
CAATACCAATATCATAAAATCCAGCTTTGATGGCAGCAGCAACGTCAGCAACAGCCTGAA
GCCCAGAGGAGCACTGTCTATTCACGGTCCTCACCGCCACAGTTTCAGGGAAACCAGCAT
AGAAAGCAGACATCCTGCACTCACTGGCTCTCTGAGATCCGGGTGCCAAAACGGTACCCA
CAACAATGTCACCAACTTCACTTGGGTCTAGATTCGTCTTCTCTATCAAAGCCCTCAAAA
CAGGTGCAAGGAGGTCATCAGGATAAGTATCCTTGAAGTTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AAACACAGCCGCTGCACCCATCCCCGTCCCAATGCACATCGACACTACCCCAAAACGACA
GTCTTTTCCACGGCGTTTCATCTCGTGCAACAAAGTAGCAACGCAACGTGCTCCTGTAGC
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C

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CAAGGAGGTCATCAGGATAAGTATCCTTGAAGTTGCCC

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DS 



AS 1 4

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TGGCGAGGATAAAACCTCAGGCTCTTCTTAATCAAAGCAAGAAGAAGAAAGGTCCAAGTC
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CGTTTCATCGGGTTATAAAAAACTACCTGGTACAAGCTGGTCACTCCCAGAGCTCGATAC
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TCTCATCACAACGGCGCCAATCCCTGATCTGAATGATCAGCTTATAGTGTTTGGAAGAGT
CCCTAAGGGAGAGGATGTAGTACAGGAGATTGAGGAAGTGGATACAGATGAGCATTACCA
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TCTTTTGAGGTTTTTTTTCTTTAAACTGATTATTTCCTTTTTTGTAATTTTATATGATCT
TCTTGAGGAAATAGAATCTTTGTTCAAGTCC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1E404TF U 1
AF RS1G672TF U 1
AF RS1G672JQ C 515
AF RS1E404JQ C 579
BS 1 620 RS1E404TF
BS 621 708 RS1G672TF
BS 709 709 RS1G672JQ
BS 710 729 RS1G672TF
BS 730 908 RS1G672JQ
BS 909 909 RS1E404JQ
BS 910 1051 RS1G672JQ

RD RS1E404TF 620 0 0
GGGAACACGCGGTTGATCAGAAGAATCTCTGCAGAGAGAATTCAAAACCAGCTTTCCATC
GAGACGACGATACAAAACGACCAATTCTCCTCACGGTTCCTGTCGTAAAAAACTCTTTCT
TCTTACTATCTTTCCAAGAAAAGTTGTATCAGTCTTTTGCTGTGGGATAAAGGTTTGCAA
TGGCGAGGATAAAACCTCAGGCTCTTCTTAATCAAAGCAAGAAGAAGAAAGGTCCAAGTC
GTATAAGTATCTCCACGATTGTCGTGTGTAATCTTGTAGTTGCTGTAGTCGTACTATCCT
TGGTCACTACTTATCGTCATTGGTCCCAGAGGTCAAGAAACACACTTGAAACCCAGAGCC
AGAGTCATAGATTTGAGGATACGAATGCTGCATCAGAACAAAAGAGTTACGATCTTCCTG
GTTATGCTGATATAAACACATCAAAAGGTCTCATAACTGTGGAACTCTTTAAAGATGCTT
CCCCTGAAGCTGTCGACCGGTTTCTAGATCTATGTCAAAAAGATCATTTCAAGGGAATGC
CGTTTCATCGGGTTATAAAAAACTACCTGGTACAAGCTGGTCACTCCCAGAGCTCGATAC
CTGTTGAAGAATGGACATCT

QA 1 620 1 620
DS 

RD RS1G672TF 729 0 0
GGGAACACGCGGTTGATCAGAAGAATCTCTGCAGAGAGAATTCAAAACCAGCTTTCCATC
GAGACGACGATACAAAACGACCAATTCTCCTCACGGTTCCTGTCGTAAAAAACTCTTTCT
TCTTACTATCTTTCCAAGAAAAGTTGTATCAGTCTTTTGCTGTGGGATAAAGGTTTGCAA
TGGCGAGGATAAAACCTCAGGCTCTTCTTAATCAAAGCAAGAAGAAGAAAGGTCCAAGTC
GTATAAGTATCTCCACGATTGTCGTGTGTAATCTTGTAGTTGCTGTAGTCGTACTATCCT
TGGTCACTACTTATCGTCATTGGTCCCAGAGGTCAAGAAACACACTTGAAACCCAGAGCC
AGAGTCATAGATTTGAGGATACGAATGCTGCATCAGAACAAAAGAGTTACGATCTTCCTG
GTTATGCTGATATAAACACATCAAAAGGTCTCATAACTGTGGAACTCTTTAAAGATGCTT
CCCCTGAAGCTGTCGACCGGTTTCTAGATCTATGTCAAAAAGATCATTTCAAGGGAATGC
CGTTTCATCGGGTTATAAAAAACTACCTGGTACAAGCTGGTCACTCCCAGAGCTCGATAC
CTGTTGAAGAATGGACATCTAAAGGAAAGCTCCGTGGCCGCCTTAACACAAGCCCAAAAC
ATGAGCATTCATGTTGGGGACACCAAAAACAAAAGGGAACAACAAGAAAGACTTCGAGCT
TCTCATCAC

QA 1 729 1 729
DS 

RD RS1G672JQ 537 0 0
TCAAAAAGATCATTTCAAGGGAATGCCGTTTCATCGGGTTATAAAAAACTACCTGGTACA
AGCTGGTCACTCCCAGAGCTCGATACCTGTTGAAGAATGGACATCTAAAGGAAAGCTCCG
TGGCCGCCTTAACACAAGCCCAAAACATGAGCATTCATGTTGGGGACACCAAAAACAAAA
GGGAACAACAAGAAGGACTTCGAGCTTCTCATCACAACGGCGCCAATCCCTGATCTGAAT
GATCAGCTTATAGTGTTTGGAAGAGTCCCTAAGGGAGAGGATGTAGTACAGGAGATTGAG
GAAGTGGATACAGATGAGCATTACCAGCCGAAATCACAAATAGGGATCATTAGCGTTATA
CTGAAACGAGAATTATGAAAAAAAATGAAAATCTTTCTTCCTCTGTGTATGAGGTCCATC
TTCATACTCACTGTTTGTCAAAATCCTCTTTTGAGGTTTTTTTTCTTTAAACTGATTATT
TCCTTTTTTGTAATTTTATATGATCTTCTTGAGGAAATAGAATCTTTGTTCAAGTCC

QA 1 537 1 537
DS 

RD RS1E404JQ 473 0 0
GGTCACTCCCAGAGCTCGATACCTGTTGAAGAATGGACATCTAAAGGAAAGCTCCGTGGC
CGCCTTAACACAAGCCCAAAACATGAGCATTCATGTTGGGGACACCAAAAACAAAAGGGA
ACAACAAGAAGGACTTCGAGCTTCTCATCACAACGGCGCCAATCCCTGATCTGAATGATC
AGCTTATAGTGTTTGGAAGAGTCCCTAAGGGAGAGGATGTAGTACAGGAGATTGAGGAAG
TGGATACAGATGAGCATTACCAGCCGAAATCACAAATAGGGATCATTAGCGTTATACTGA
AACGAGAATTATGAAAAAAAATGAAAATCTCTCTTCCTCTGTGTATGAGGTCCATCTTCA
TACTCACTGTTTGTCAAAATCCTCTTTTGAGGTTTTTTTTCTTTAAACTGATTATTTCCT
TTTTTGTAATTTTATATGATCTTCTTGAGGAAATAGAATCTTTGTTCAAGTCC

QA 1 473 1 473
DS 



AS 1 3

CO CL2478Contig1 960 3 3 U
GGAGTGAGTGAGGGAGAGAGAGAGATGAACCACATGCACACCACCAAATGTCTGCTTCTT
CTTTATTTATTAATTTCCCATTGATTCGCCTCAGATCTCTCTCCCATCTCCCTCTGTCAT
CGCTCCGATCCGTTTCTCAGAGAAAGTTACCGACTTTTCGAGCTTTCTCCGGTACTACCA
CAATGACAGATGCTGGAATGGATGCTGTTCAGAGACGCCTCATGTTCGAAGACGAATGCA
TTCTTGTTGACGAAACTGATCGTGTTGTTGGGCATGACAGCAAATATAATTGTCATCTGA
TGGAAAATATTGAAGCTAAGAATCTACTTCACAGGGCCTTTAGTGTATTTTTATTCAACT
CCAACTATGAGTTGCTTCTCCAGCAAAGGTCGAAATCAAAGGTGACCTTCCCTCTAGTGT
GGACAAACACTTGCTGCAGCCATCCTCTTTACCGTGAATCTGAGCTTATCGAGGAAAATA
CTCTTGGTGTGAGGA*TGCTGCACAGAGAAAGCTTCTTGACGAGCTCGGTATTGTAGCTG
AAGATGTACCAGTCGATGAGTTCACCGCCTTGGGACGTATACTTTACAAGGCTCCTTCTG
ATGGCAAATGGGGAGAGCACGAACTGGACTACTTGCTGTTCATTGTGAGGGATGTTAAGG
TCCAACCAAATCCAGATGAAGTGGCGGATATCAAGTATGTGAGCAGGGAAGAGCTGAAGG
AGCTGGTGAAGAAAGCAGATGCAGGGGAGGAAGGTCTGAAACTATCTCCATAGTTCAGAT
TGGTGGTGGATAACTTCTTGATGAAGTGGTGGGATCATGTTGAGAAAGGCACTCTGAGTG
AAGCTGTAGACATGAAAACCATCCACAAGCTCTGAACTCTTCTTCTCTAAGTTTTTTTGG
ATAACCTCTCTGTTTTTGATATTTTTGATGATAATAATTGGGAGAAGAGATATTCCAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1D996TF U 1
AF RS1GH07TF U 99
AF RS1D996JQ C 301
BS 1 645 RS1D996TF
BS 646 715 RS1GH07TF
BS 716 960 RS1D996JQ

RD RS1D996TF 645 0 0
GGAGTGAGTGAGGGAGAGAGAGAGATGAACCACATGCACACCACCAAATGTCTGCTTCTT
CTTTATTTATTAATTTCCCATTGATTCGCCTCAGATCTCTCTCCCATCTCCCTCTGTCAT
CGCTCCGATCCGTTTCTCAGAGAAAGTTACCGACTTTTCGAGCTTTCTCCGGTACTACCA
CAATGACAGATGCTGGAATGGATGCTGTTCAGAGACGCCTCATGTTCGAAGACGAATGCA
TTCTTGTTGACGAAACTGATCGTGTTGTTGGGCATGACAGCAAATATAATTGTCATCTGA
TGGAAAATATTGAAGCTAAGAATCTACTTCACAGGGCCTTTAGTGTATTTTTATTCAACT
CCAACTATGAGTTGCTTCTCCAGCAAAGGTCGAAATCAAAGGTGACCTTCCCTCTAGTGT
GGACAAACACTTGCTGCAGCCATCCTCTTTACCGTGAATCTGAGCTTATCGAGGAAAATA
CTCTTGGTGTGAGGA*TGCTGCACAGAGAAAGCTTCTTGACGAGCTCGGTATTGTAGCTG
AAGATGTACCAGTCGATGAGTTCACCGCCTTGGGACGTATACTTTACAAGGCTCCTTCTG
ATGGCAAATGGGGAGAGCACGAACTGGACTACTTGCTGTTCATTG

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1GH07TF 617 0 0
GG
CTCCCATCTCCCTCTGTCATCGCTCCGATCCGTTTCTCAGAGAAAGTTACCGACTTTTCG
AGCTTTCTCCGGTACTACCACAATGACAGATGCTGGAATGGATGCTGTTCAGAGACGCCT
CATGTTCGAAGACGAATGCATTCTTGTTGACGAAACTGATCGTGTTGTTGGGCATGACAG
CAAATATAATTGTCATCTGATGGAAAATATTGAAGCTAAGAATCTACTTCACAGGGCCTT
TAGTGTATTTTTATTCAACTCCAACTATGAGTTGCTTCTCCAGCAAAGGTCGAAATCAAA
GGTGACCTTCCCTCTAGTGTGGACAAACACTTGCTGCAGCCATCCTCTTTACCGTGAATC
TGAGCTTATCGAGGAAAATACTCTCGGTGTGAGGAATGCTGCACAGAGAAAGCTTCTTGA
CGAGCTCGGTATTGTAGCTGAAGATGTACCAGTCGATGAGTTCACCGCCTTGGGACGTAT
ACTTTACAAGGCTCCTTCTGATGGCAAATGGGGAGAGCACGAACTGGACTACTTGCTGTT
CATTGTGAGGGATGTTAAGGTCCAACCAAATCCAGATGAAGTGGCGGATATCAAGTATGT
GAGCAGGGAAGAGCT

QA 3 617 3 617
DS 

RD RS1D996JQ 660 0 0
TGGAAAATATTGAAGCTAAGAATCTACTTCACAGGGCCTTTAGTGTATTTTTATTCAACT
CCAACTATGAGTTGCTTCTCCAGCAAAGGTCGAAATCAAAGGTGACCTTCCCTCTAGTGT
GGACAAACACTTGCTGCAGCCATCCTCTTTACCGTGAATCTGAGCTTATCGAGGAAAATA
CTCTTGGTGTGAGGA*TGCTGCACAGAGAAAGCTTCTTGACGAGCTCGGTATTGTAGCTG
AAGATGTACCAGTCGATGAGTTCACCGCCTTGGGACGTATACTTTACAAGGCTCCTTCTG
ATGGCAAATGGGGAGAGCACGAACTGGACTACTTGCTGTTCATTGTGAGGGATGTTAAGG
TCCAACCAAATCCAGATGAAGTGGCGGATATCAAGTATGTGAGCAGGGAAGAGCTGAAGG
AGCTGGTGAAGAAAGCAGATGCAGGGGAGGAAGGTCTGAAACTATCTCCATAGTTCAGAT
TGGTGGTGGATAACTTCTTGATGAAGTGGTGGGATCATGTTGAGAAAGGCACTCTGAGTG
AAGCTGTAGACATGAAAACCATCCACAAGCTCTGAACTCTTCTTCTCTAAGTTTTTTTGG
ATAACCTCTCTGTTTTTGATATTTTTGATGATAATAATTGGGAGAAGAGATATTCCAAGC

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 3

CO CL2479Contig1 1406 3 9 U
GGGAAAAAGCTCTTCGGCTGGCGATGAAACACATACATTACGAAGACGAGAATAGCCATT
ATATCACCATCGGTTGTGTTGAGAAGGTACTGTGCATGCTTGCATGTTGGATTGAAAACC
CGAATGGGGACTACTTCAAGAAGCATCTTGCTAGAATTCCAGATTACATGTGGGTCGCCG
AAGATGGAATGAAAATGCAGAGCTTTGGAAGTCAACTATGGGATACTGGGTTTGCGGTTC
AAGCTATACTTGCTAGTGATCTCTTTGATGAAACTGGCAATGTATTGAAGAAAGGACATG
ATTATATTAAGAAATCTCAGGTTAGAGAAAACCCTTCTGGTGACTTTAAGAGCATGTACC
GCCATACCTCCAAAGGCGCATGGACTTTATCTGATCGAGATCATGGATGGCAAGTTTCAG
ATTGTACGGCTGAAGCTTTAAAGTGTTGCCTGCTGCTCTCCACCATGCCAGCTGAGGTTG
TTGGCCAGAAGATAGATCCTGAACAAATATACGACTCTGTTAATCTCTTGCTATCTTTTC
AGAGTGAGAATGGAGGTATGACTGCATGGGAGCCTGTCCGTGCTTATGAATGGATTGAAT
TCCTCAATCCCACGGAATTTCTCGCTAATCTCGTGGCCGAGCGTGAGTATGTGGAATGCA
CCTCATCTGTTATACAAGCTTTGATTCTGTTCAAGCAACTCTATCCAGATCACAGGACAA
AAGAGATAAACAAGTCCATCGAGAAAGCTGTGCAATTCATAGAAAACGAACAGACGCCAG
ATGGTTCATGGTATGGGAACTGGGGAGTTTGTTTCATTTACGGAACATGGTTCGCTCTTG
CCGGCCTAGCAGCCGCTGGTGAAACATATAAAAACAGTCTGGCTATGCGTAAAGGTGTTG
CGTTTTTACTCAGGACACAGAAAGACGATGGAGGCTGGGGCGAAAGCTATCTCTCATGCC
CTGAACAGAGATACATACCATCAGAAGGGAAAAGATCCAACTTGGTGCAAACAGCTTGGG
CAGTAATGGGTCTGATTCACGCTGGACAGGCTGAGAGAGATCCAGTACCTCTTCACCGTG
CTGCAAAACTTATCATCAATTCGCAAATGGAGAATGGAGATTTCCCTCAACAGGAGATAG
TAGGAGTGTTCATGAGGAATTGCTTGATACACTATGCTACCTACAGAAACACTTTCCCAT
TATGGGCACTTGCTGAGTACCGGAAAGCTACCTTCCCAATCCAAACTCAACAACATCATC
TTCAGCTTCCTTAGTAAATGTTTACAGATTATAGATAAAAAGAACAAAACAATGTCTACA
TATGGATGAAATCTCCTGCGTCTTTGGCTACTTATTCAGATGTATGTTTATTCAGCAAAA
GTAAACGAATAATAATATAATATGTC


BQ
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G
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BS 500 563 RS1A260TF
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CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGAACAAGACACATCTTTCACTAAAGTCTTTAACAT
TTATAAATCTCTTTGTTCTATTTTCGTCTCTTTTCATTATTAAATTATATTATTCCAAAA
AACTTGTTTCCTGTGATTTTCTAGATTGATCGAACATGTCGCTAGACGGATCAGGACTAG
GAGGGATGGCTATGGCGGAGGCTTACACGGCAAGGAAGTTTCACAGAGAAAACATGAAGA
TTTTAACGGCAAGCACAGCCACAACGGTCGGTGGAAGAATAGGAGACACCGGTGGAGGAT
ATTGCCGGTGGTTCTGGGGAAAGCTGAGCACCAAGAAAAACTCGCCCAAAGTTTGTGATC
TTATAACTATAGAATAGTAAGCTAAGATGGTCACATCCAATATTAATCTAAGAAATAAAA
ATTTAGGTCTTTCTTTTTGTATCGGTCTTTGTTTTACGTTTTTTCTGCTTTATGTTTGGT
AAGACTATCATATGAATTTATTTGTGAATGTTGGTTTTACGAAAATATTTAGAGTGGAGG
TTTTTTATAAATTTGGACGTAGTTTTCTTCTATAAATATTCAGAGTGGAGGTTTCTG

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DS 

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ATCTTTCACTAAAGTCTTTAACATTTATAAATCTCTTTGTTCTATTTTCGTCTCTTTTCA
TTATTAAATTATATTATTCCAAAAAACTTGTTTCCTGTGATTTTCTAGATTGATCGAACA
TGTCGCTAGACGGATCAGGACTAGGAGGGATGGCTATGGCGGAGGCTTACACGGCAAGGA
AGTTTCACAGAGAAAACATGAAGATTTTAACGGCAAGCACAGCCACAACGGTCGGTGGAA
GAATAGGAGACACCGGTGGAGGATATTGCCGGTGGTTCTGGGGAAAGCTGAGCACCAAGA
AAAACTCGCCCAAAGTTTGTGATCTTATAACTATAGAATAGTAAGCTAAGATGGTCACAT
CCAATATTAATCTAAGAAATAAAAATTTAGGTCTTTCTTTTTGTATCGGTCTTTGTTTTA
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TTACGAAAATATTTAGAGTGGAGGTTTTTTATAAATTTGGACGTAGTTTTCTTCTATAAA
TATTCAGAGTGGAGGTTTCTG
TAAC

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DS 

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GG
AAGACACATCTTTCACTAAAGTCTTTAACATTTATAAATCTCTTTGTTCTATTTTCGTCT
CTTTTCATTATTAAATTATATTATTCCAAAAAACTTGTTTCCTGTGATTTTCTAGATTGA
TCGAACATGTCGCTAGACGGATCAGGACTAGGAGGGATGGCTATGGCGGAGGCTTACACG
GCAAGGAAGTTTCACAGAGAAAACATGAAGATTTTAACGGCAAGCACAGCCACAACGGTC
GGTGGAGGAATAGGAGACACCGGTGGAGGATATTGCCGGTGGTGGTGGGGAAAGCTGAGC
ACCAAGAAAAACTCGCCCAAAGTTTGTGATCTTATAACTATAGAATAGTAAGCTAAGATG
GTCACATCCAATATTAATCTAAGAGATAAAAATTTAGGTCTTTCTTTTTATATCGGTCTT
TGTTTTACGTTTTTTCTGCTTTATGTTTGGTAAGACTATCATATGAATTTATTTATGAAT
GTTGGTTTTACGAAAATATTTAGAGTGGAGGTTTTTTATAAATTTGGACGTAGTTTTCTT
CTATAAATATTCAGAGTGGAGGTTTCTGTAAAGCTATGAAATTTTCTTTAACTTCTGTAG
CTCGTTGCCATGTGTTGTTTTAGTGAT

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DS 

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GGTGGAGGATATTGCCGGTGGTTCTGGGGAAAGCTGAGCACCAAGAAAAACTCGCCCAAA
GTTTGTGATCTTATAACTATAGAATAGTAAGCTAAGATGGTCACATCCAATATTAATCTA
AGAGATAAAAATTTAGGTCTTTCTTTTTATATCGGTCTTTGTTTTACGTTTTTTCTGCTT
TATGTTTGGTAAGACTATCATATGAATTTATTTATGAATGTTGGTTTTACGAAAATATTT
AGAGTGGAGGTTTTTTATAAATTTGGACGTAGTTTTCTTCTATAAATATTCAGAGTGGAG
GTTTCTGTAAAGCTATGAAATTTTCTTTAACTTCTGTAGCTCGTTGCCATGTGTTGTTTT
AGTGATGAAACAAAGAAACATGCACCC

QA 1 507 1 507
DS 



AS 1 4

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AAATTTGTAGACAAATTTAGTGTTAGCAAAACAAACAGTTTTAACACAAAGCATGGAAAA
TTAGAACGCATGGAGGATTGTTTTGATTAGCTAAACTGTTCTATAACTTAAATACACATA
GGATTGATTCAAACATTTGACCGTTCCAAACATATCTCGAGCCTTTTGATTCCCCCAAAA
CTCAAAAAGGATTGCAAAGTCAAGACTCGTCGTCTTCACAGGCCTCTGCAGCTGAAATCT
TAAAATCAAGATTGTTCATCAAAGTCTCTGACACATGCTTAGCCACAGAGATCATGTCAA
GGATGACGCTCGGGTCTAAACCAGACCCTCCTCTTTTGGTTAACCCACAGATATGTCCCG
CCCGGTTCACGGATATAGACACGGCTGAGCTCATCTGAAACTCCTCTTCCGCTGTTGCAT
CAACTATGTAATGATTCCCCACTTTAGTTAACGTGACTATGACCGGGACACTGGAAGTGT
CAAACTGTTGATACTCTTCGTAGCTGATGTCAATCTCTGGCTGCTCATCATCGGCTACTT
CAGCTGAAACTTGGACTTTTGGTATAGCTGTGTTGGTTAAAGCAGCCTTGATGGCAGCAC
CAAGTGCATCCAATAGATTCCCATCGGAGCTAATGACAAGGCCATCTATGTAAAGGTCCC
AGCAGACTCTTCCTTCTTTGATCAAAAGCGAAGATAGATTTATACCAGCCCCTGCTCCAC
TTTTGCCACCAAGAAGACAGATTTGAAGAGCCAAAGCAAGCTCAGAAGACAACTCCTCAC
CTCCTCTCCCCCCGAATGTTGGTTCTGCTGTTGGACTGCAATCGATGAAAACAGCAACTT
TCCCTTTATCAGGCTGAAGAGAACTTGGCCTCCCAAGCTCAGCCTTTACACTGACAATCA
CATCAGTTCCACCTATCCTAACTCTAGCTGAACCATTAGCCTGAGGAATAACACCGGTTT
CGACATAGACGTCACGGTAAGTCAATCTTTTCCGACCATCAGTTCGAAGATCTTGAGCGA
TCCCACCTTTAATGAAGTTTTGCTCCCCAAACGAAACCCCCACCATTACTTCCTTGAGAA
TTCGATAGAAGACAGCACTCTGAAGTTCCCCGGCGAACCGTAGCGGCGAGTTTTGGATTG
GTTTAGGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G785JQ U 1
AF RS1EL44JQ U 63
AF RS1G785TF C 502
AF RS1EL44TF C 592
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RD RS1G785JQ 514 0 0
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TTAGAACGCATGGAGGATTGTTTTGATTAGCTAAACTGTTCTATAACTTAGATACACATA
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TAAAATCAAGATTGTTCATCAGAGTCTCTGACACATGCTTAGCCACAGAGATCATGTCAA
GGATGACGCTCGGGTCTAAACCAGACCCTCCTCTTTTGGTTAACCCACAGATATGTCCCG
CCCGGTTCACTGATATAGACACGGCTGAGCTCATCTGAGACTCCTCTTCCGCTGTTGCAT
CAACTATGTAATGATTCCCCACTTTAGTTAACGTGACTATGACCGGGACACTGGAGGTGT
CAAACTGTTGATACTCTTCGTAGCTGATGTCAAT

QA 1 514 1 514
DS 

RD RS1EL44JQ 641 0 0
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ATTGATTCAAACATTTGGCCGTTCCAAACATATCTCGAGCCTTTTGATTCCCCCAAAACT
CAAAAAGGATTGCAAAGTCAAGACTCGTCGTCTTCACAGGCCTCTGCAGCTGAAATCTTA
GGATCAAGATTGTTCATCAAAGTCTCTGACACATGCTTAGCCACAGAGATCATGTCAAGG
ATGACGCTCGGGTCTAAACCAGACCCTCCTCTTTTGGTTAACCCACAGATATGTCCCGCC
CGGTTTACGGATATAGACACGGCTGAGCTCATCTGAAACTCCTCTTCCGCTGTTGCATCA
ACTATGTAATGATTCCCCACTTTAGTTAACGTGACTATGACCGGGACACTGGAAGTGTCA
AACTGTTGATACTCTTCGTCGCTGATGTCAATCTCTGGCTGCTCATCATCGGCTACTTCA
GCTGAAACTTGGACTTTTGGTATAGCTGTGTTGGTTAAAGCAGCCTTGATGGCAGCACCA
AGTGCATCCAATAGATTCCCATCGGAGCTAATGACAAGGCCATCTATGTAAAGGTCCCAG
CAGACTCTTCCTTCTTTGATCAAAAGCGAAGATAGATTTAT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1G785TF 645 0 0
A
GCTGATGTCAATCTCTGGCTGCTCATCATCGGCTACTTCAGCTGAAACTTGGACTTTTGG
TATAGCTGTGTTGGTTAAAGCAGCCTTGATGGCAGCACCAAGTGCATCCAATAGATTCCC
ATCGGAGCTAATGACAAGGCCATCTATGTAAAGGTCCCAGCAGACTCTTCCTTCTTTGAT
CAAAAGCGAAGATAGATTTATACCAGCCCCTGCTCCACTTTTGCCACCAAGAAGACAGAT
TTGAAGAGCCAAAGCAAGCTCAGAAGACAACTCCTCACCTCCTCTCCCCCCGAATGTTGG
TTCTGCTGTTGGACTG*AATCGATGAAAACAGCAACTTTCCCTTTATCAGGCTGAAGAGA
ACTTGGCCTCCCAAGCTCAGCCTTTACACTTACAATCACATCAGTTCCACCTATCCTAAC
TCTAGCTGAACCATTAGCCTGAGGAATAACACCGGTTTCGACATAGACGTCACGGTAAGT
CAATCTTTTCCGACCATCAGTTCGAAGATCTTGAGCGATCCCACCTTTAATGAAGTTTTG
CTCCCCAAACGAAACCCCCACCATTACTTCCTTGAGAATTCGATAGAAGACAGCACTCTG
AAGTTCCCCGGCGAACCGTAGCGGCGAGTTTTGGATTGGTTT
CC

QA 2 643 2 643
DS 

RD RS1EL44TF 560 0 0
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CTGCTCCACTTTTGCCACCAAGAAGACAGATTTGAAGAGCCAAAGCAAGCTCAGAAGACA
ACTCCTCACCTCCTCTCCCCCCGAATGTTGGTTCTGCTGTTGGACTGCAATCGATGAAAA
CAGCAACTTTCCCTTTATCAGGCTGAAGAGAACTTGGCCTCCCAAGCTCAGCCTTTACAC
TGGCAATCGCATCAGTTCCACCTATCCTAACTCTAGCTGAACCATTAGCCTGAGGAATAA
CACCGGTTTCGACATAGACGTCACGGTAAGTCAATCTTTTCCGACCATCAGTTCGAAGAT
CTTGAGCGATCCCACCTTTAATGAAGTTTTGCTCCCCAAACGAAACCCCCACCATTACTT
CCTTGAGAATTCGATAGAAGACAGCACTCTGAAGTTCCCCGGCGAACCGTAGCGGCGAGT
TTTGGATTGGTTTAGGTTCC

QA 1 560 1 560
DS 



AS 1 3

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GGAAAAGAGAACACATTACTTGTGCCCCCTTCCATCCAATACTTGTATTTGCTTCCATCT
GATCTAACTATGGCTTATTCAGCTCCATCCCTATCCCTATCCGTCTCCAAAACCCCACAA
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GCAGAGAAGCAGCAGAAGAAGAGATACCCGGGAGAATCGAAAGGGTTTGTGGAGGAGATG
AGGTTTGTGGCGATGAGACTTCACACGAGAGAGCAGGCCAAGGAAGGAGAGAAAGAGACG
AAAGCTCCCGAGGAACGTCCCGTCGCTAAATGGGAACCCACCGTTGAAGGCTACTTGAGG
TTTTTGGTGGATAGTAAGTTGGTTTATGACACCCTTGAAGGGATTATTCACCAATCCACT
TTCCCTACTTATGCTGAATTCAAGAACACGGGGCTGGAAAGGGCAGAGAGTTTGGCAACT
GATTTGAAGTGGTTTGAAGAACAAGGATACGAGATTCCGGAACCAACTGATTCTGGTAAA
ACATATGCTCAGTATCTAAAGGATTTAGCAGAGAAGGATCCTCCTTCATTCATTTGTCAC
TTCTACAACATCTACTTCGCCCACAGCGCTGGTGGCCGAATGATTGGAAGAAAGGTAGCC
GAGAGGATTCTGGACAATAGAGAACTGGAGTTTTACAAATGGGACGGCGAGCTTTCTCAG
TTGTTGCAGAACGTGAGGGAGAAACTGAACAAAGTTGCCGAGGAGTGGACGAGAGAAGAA
AAGAATCATTGTTTGGAAGAGACTGAGAAATCGTTCAAGTATTCTGGTGAGATACTTCGT
CTCATTTTGTCCTGATTTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTATAAAAGAGCTTGTGGCAAAAC
TAAAATCCCCTGCTCAAAGTTTTTAAAATTCCTGTATCATATTTAAGCAACTCGCTTCTG
CTTGTTTGTATCAAACTCTTTATTTGCATAAAAGCTATTACGACGTTGGAAGTTCAGCGT
TAATGTATCATAGTCAGATTTATTAAGTCT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1FO70TF U 3
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GATTTGAAGTGGTTTGAAGAACAAGGATACGAGATTCCGGAACCAACTGATTCTGGTAAA
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TTCT

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DS 

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GG
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TAACTATGGCTTATTCAGTTCCATCCCTATCCCTATCCGTCTCCAAAACCCCACAACTCG
CCAGATTCTCGTTCGCTTTCTCCCCGCTATTCTCTCGCCGCCCTAGGATTCAGAATCTAA
GGATGCCCACCAACAAGACGTGGTCGTCCTCTGTGGTGGTGGTGGCGGCGACGGCGGCAG
AGAAGCAGCAGAAGAAGAGATACCCGGGAGAATCGAAAGGGTTTGTGGAGGAGATGAGGT
TTGTGGCGATGAGACTTCACACGAGAGAGCAGGCCAAGGAAGGAGAGAAAGAGACGAAAG
CTCCCGAGGAACGTCCCGTCGCTAAATGGGAACCCACCGTTGAAGGCTACTTGAGGTTTT
TGGTGGATAGTAAGTTGGTTTATGACACCCTTGAAGGGATTATTCACCAATCCACTTTCC
CTACTTATGCTGAATTCAAGAACACGGGGCTGGAAAGGGCAGAGAGTTTGGCAACTGATT
TGAAGTGGTTTGAAGAACAAGGATACGAGATTCCGGAACCAACTGATTCTGGTAAAACAT
ATGCTCAGTATCTAAAGGATTTAGCAGAGAAGGATCCTCCTTCATTCATTTGTCACTTCT
ACAACATCTACTTCGCCCACAGCGCTGGTGGCCGAATGATTGGAAGAAAG*TAGCCGAGA
GGATTCTGGACA*TAGAGAACTGGAGTTT*ACAAATGGGACG*CGAGCTTTCTCAGTTGT
TGCAGAACGTGAGGGAGAAACTGAACAAAGT
T

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DS 

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GTTTGTGGCGATGAGACTTCACACGAGAGAGCAGGCCAAGGAAGGAGAGAAAGAGACGAA
AGCTCCCGAGGAACGTCCCGTCGCTAAATGGGAACCCACCGTTGAAGGCTACTTGAGGTT
TTTGGTGGATAGTAAGTTGGTTTATGACACCCTTGAAGGGATTATTCACCAATCCACTTT
CCCTACTTATGCTGAATTCAAGAACACGGGGCTGGAAAGGGCAGAGAGTTTGGCAACTGA
TTTGAAGTGGTTTGAAGAACAAGGATACGAGATTCCGGAACCAACTGATTCTGGTAAAAC
ATATGCTCAGTATCTAAAGGATTTAGCAGAGAAGGATCCTCCTTCATTCATTTGTCACTT
CTACAACATCTACTTCGCCCACAGCGCTGGTGGCCGAATGATTGGAAGAAAGGTAGCCGA
GAGGATTCTGGACAATAGAGAACTGGAGTTTTACAAATGGGACGGCGAGCTTTTTCAGTT
GTTGCAGAACGTGAGGGAGAAACTGAACAAAGTTGCCGAGGAGTGGACGAGAGAAGAAAA
GAATCATTGTTTGGAAGAGACTGAGAAATCGTTCAAGTATTCTGGTGAGATACTTCGTCT
CATTTTGTCCTGATTTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTATAAAAGAGCTTGTGGCAAAACTA
AAATCCCCTGCTCAAAGTTTTTAAAATTCCTGTATCATATTTAAGCAACTCGCTTCTGCT
TGTTTGTATCAAACTCTTTATTTGCATAAAAGCTATTACGACGTTGGAAGTTCAGCGTTA
ATGTATCATAGTCAGATTTATTAAGTCT

QA 1 868 1 868
DS 



AS 1 3

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GGATCGAAATTGGGATAAAAAAGATCTAAGTAACTGAAGAAATCTTGGCGAGCAGATCTG
AAGATGGAGTGCGTGTTCGGTCTCGTTGGTAATGGATTCGCAATCGTGGCGGCGGATACA
TCGGCAGTTCACAGCATACTTGTCCACAAGA*CAACGAGGACAAGATCATGGTCCTTGAC
TCACACAAGCTCATCGCCGCAAGCGGAGAGCCTGGTGACCGGGTTCAGTTTACGGAGTAT
GTACAGAAGAATGTGTCGCTGTATCAGTTCCGAAACGGGATCCCTTTGACTACAGCCGCT
GCTGCCAACTTCACTCGTGGAGAGCTCGCCACTGCTTTGAGAAAGAACCCGTACTCAGTA
AACATCCTGATGGCTGGCTACGACAAAGAAGCAGGCGCATCTCTATACTATATCGACTAC
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TCCACAATGGACAGGCACTACCGCAGCGACATGTCAGTTGAAGAAGCCATTGAACTGGTC
GACAAATGCATACTCGAGATCAGGTCAAGGCTGGTCATTGCACCACCCAACTTTGTGATC
AAGATCGTCGACAAGGATGGAGCTCGTGTGCACGCTTGGCGTCAGTCTGTGCAAGATGTC
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AAATTTGAAACTAAAACATTTTTCTAATAAGAGAAAAAGCTATGCTTTTGT


BQ
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AF RS1GH36TF U 1
AF RS1EO41TF U 9
AF RS1EO41JQ C 155
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BS 321 349 RS1GH36TF
BS 350 619 RS1EO41TF
BS 620 891 RS1EO41JQ

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GGATCGAAATTGGGATAAAAAAGATCTAAGTAACTGAAGAAATCTTGGCGAGCAGATCTG
AAGATGGAGTGCGTGTTCGGTCTCGTTGGTAATGGATTCGCAATCGTGGCGGCGGATACA
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TCACACAAGCTCATCGCCGCAAGCGGAGAGCCTGGTGACCGGGTTCAGTTTACGGAGTAT
GTACAGAAGAATGTGTCACCGTATCAGTTCCGAAACGGGATCCCTTTGA

QA 1 349 1 349
DS 

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GG
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TGGGATAAAAAAGATCTAAGTAACTGAAGAAATCTTGGCGAGCAGATCTGAAGATGGAGT
GCGTGTTCGGTCTCGTTGGTAATGGATTCGCAATCGTGGCGGCGGATACATCGGCAGTTC
ACAGCATACTTGTCCACAAGA*CAACGAGGACAAGATCATGGTCCTTGACTCACACAAGC
TCATCGCCGCAAGCGGAGAGCCTGGTGACCGGGTTCAGTTTACGGAGTATGTACAGAAGA
ATGTGTCGCTGTATCAGTTCCGAAACGGGATCCCTTTGACTACAGCCGCTGCTGCCAACT
TCACTCGTGGAGAGCTCGCCACTGCTTTGAGAAAGAACCCGTACTCAGTAAACATCCTGA
TGGCTGGCTACGACAAAGAAGCAGGCGCATCTCTATACTATATCGACTACATTGCAACTC
TTCACAAGGTTGACAAGGGAGCATTCGGTTACGGCTCCTACTTCTCTCTCTCCACAATGG
ACAGGCACTACCGCAGCGACATGTCAGTTGAAGAAGCCATTGAACTGGTCGACAAATGCA
TACTCGAGA

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DS 

RD RS1EO41JQ 737 0 0
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ACGAGGACAAGATCATGGTCCTTGACTCACACAAGCTCATCGCCGCAAGCGGAGAGCCTG
GTGACCGGGTTCAGTTTACGGAGTATGTACAGAAGAATGTGTCGCTGTATCAGTTCCGAA
ACGGGATCCCTTTGACTACAGCCGCTGCTGCCAACTTCACTCGTGGAGAGCTCGCCACTG
CTTTGAGAAAGAACCCGTACTCAGTAAACATCCTGATGGCTGGCTACGACAAAGAAGCAG
GCGCATCTCTATACTATATCGACTACATTGCAACTCTTCACAAGGTTGACAAGGGAGCAT
TCGGTTACGGCTCCTACTTCTCTCTCTCCACAATGGACAGGCACTACCGCAGCGACATGT
CAGTTGAAGAAGCCATTGAACTGGTCGACAAATGCATACTCGAGATCAGGTCAAGGCTGG
TCATTGCACCACCCAACTTTGTGATCAAGATCGTCGACAAGGATGGAGCTCGTGTGCACG
CTTGGCGTCAGTCTGTGCAAGATGTCACCACTGCTTCTGTCTAACTCTGTTATGTTTACT
AAGCTGTAATTTGCTTTTTTTATGTCCAAACTTTAAAAGCTTCATGGAAAATTAGTTCCC
AGATATGATATTATATGACATTGTTGAAATTTGAAACTAAAACATTTTTCTAATAAGAGA
AAAAGCTATGCTTTTGT

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 3

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AGGGAAGCTCAAGATAGAGATCAAGAAACCAAAGTCTAGCACTGGTACTAAGGATAATTG
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GTGTTGGCATTGTGTAACCAAGATCAATCAATTTTCTGATCAACATTTTCTCAGCTTTTG
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TCATCACTAATCTACGGGCAATGCCAGACCCAGTGTTATCAGATGTTCCACCAAGTACGG
AAGTAACACTTACTGTATTACTCGGTCGGGTTGAAGCGGCTGCGTATAGATTCCCAAATT
TGGTGGAATTATAACCGATCCATACATAAATCTGTTTTGCGAGACGGATGATCTGGAAGT
GAAGAGTGACGTCATCGAGGACTTCAGTGAAGCACGAAACCTTTACGCCGTCCTCGTCTT
GGTTCACATCGGCGGAATCACAGGTTTTGTCGGCGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BY31JQ U 1
AF RS1DD18JQ U 255
AF RS1DD18TF C 255
BS 1 512 RS1BY31JQ
BS 513 878 RS1DD18JQ

RD RS1BY31JQ 512 0 0
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QA 1 512 1 512
DS 

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G
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QA 2 624 2 624
DS 

RD RS1DD18TF 624 0 0
G
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AGAGATCAAGAAACCAAAGTCTAGCACTGGTACTAAGGATAATTGACATCATTTAACAAC
CAAACAATCATCAAGATTCTGTAAATAAACCGGAAGAAAAAAGGAGAAACAAACTGAAGA
AACTGGCTAAAACCATTCCCTCTTCCGGTTATGTTGCTCGTAAAGGTGTTGGCATTGTGT
AACCAAGATCAATCAATTTTCTGATCAACATTTTCTCAGCTTTTGCCTCAAGCAAGGGAT
TGTTTTTAGGGATGTTGCAAGCCATGATTATATTGAGACCAGTCTTCATCACTAATCTAC
GGGCAATGCCAGACCCAGTGTTATCAGATGTTCCACCAAGTACGGAAGTAACACTTACTG
TATTACTCGGTCGGGTTGAAGCGGCTGCGTATAGATTCCCAAATTTGGTGGAATTATAAC
CGATCCATACATAAATCTGTTTTGCGAGACGGATGATCTGGAAGTGAAGAGTGACGTCAT
CGAGGACTTCAGTGAAGCACGAAACCTTTACGCCGTCCTCGTCTTGGTTCACATCGGCGG
AATCACAGGTTTTGTCGGCGATC

QA 2 624 2 624
DS 



AS 1 3

CO CL2485Contig1 788 3 21 U
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ATAACCATAGAGATAGCTTCATAGTACACCATGTAATATCATACTCATTATTAAAGTCTA
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AAAAGGGGGTTTTAGATCACTTCCACTTCTTGAACTTACCTCCTCCAAACATCCCATGCC
TCCCATGTTTACCTCCATGATGCTTGAACTTCCCGTGCTTGAACTTACCATGACCATAAC
CATAACCATAGCCAGGACCATGACCATGGCCAAATCCGTGACCATATGCAGCGTGTCCGT
AAGGGCCGTGAGAGCTATGAGCTATGTGGTGAGCTCCATAGGCAGCTGCAGCACCTGCAA
TCATACCCCCTATTCCAGCTGCGTGTCCTGAGTGATGAGCAGAATAGCCAGCAGGAGGAT
AACCAGCATGACCAGGCGCAGGAGGATACCCACCGTAGCCAGGAGCAGGAGGGTAGGCAC
CAGGTGGAGGTGGGTAAGAACCCGGAGGATAACCAGGTGCAGGTGGGTAGGCACCAGGTG
GTGGTGGTGGAGGAGGGTAAGCTTGATGTGGTGGGTATCCAGCTGGTGGATAAGCCCCAT
GACCCGACGGGTATCCAGCGGGTGGGTACCCAAAAAAACCTTTGTCTTTATCTTCGTCAC
CTCCCATGTTTTCTCTCAATCAACAAAACAAAACCCGAGACGAATCGCGAGACATGTCGA
AACTGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D357JQ U 24
AF RS1D357TF C 140
AF RS1CJ18JQ U 1
BS 1 250 RS1CJ18JQ
BS 251 251 RS1D357JQ
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BS 463 463 RS1D357JQ
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BS 739 739 RS1D357TF
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BS 753 753 RS1D357TF
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GTACACCATGTAATATCATACTCATTATTAAAGTCTCCCGACGAAAGTTAACCTTTTGGG
GTTTATTTGAAACATTTCGTCAGACGAGAGGTAGATCAAAAGGGGGTTTTAGATCACTTC
CACTTCTTGAACTTACCTCCTCCAAACATCCCATGCCTCCCATGTTTACCTCCATGATGC
TTGAACTTCCCGTGCTTGAACTTACCATGACCATAACCATAACCATAGCCAGGACCATGA
CCATGGCCAAATCCGTGACCATATGCAGCGTGTCCGTAAGGGCCGTGAGAGCTATGAGCT
ATGTGGTGAGCTCCATAGGCAGCTGCAGCACCTGCAATCATACCCCCTATTCCAGCTGCG
TGTCCTGAGTGATGAGCAGAATAGCCAGCAGGAGGATAACCAGCATGACCAGGCGCAGGA
GGATACCCACCGTAGCCAGGAGCAGGAGGGTAGGCACCAGGTGGAGGTGGGTAAGAACCC
GGAGGATAACCAGGTGCAGGTGGGTAGGCACCAGGTGGTGGTGGTGGAGGAGGGTAAGCT
TGATGTGGTGGGTATCCAGCTGGTGGATAAGCCCCATGACCCGACGGGTATCCAGCGGGT
GGGTACCCAAAAAA
A

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DS 

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CTTCCACTTCTTGAACTTACCTCCTCCAAACATCCCATGCCTCCCATGTTTACCTCCATG
ATGCTTGAACTTCCCGTGCTTGAACTTACCATGACCATAACCATAACCATAGCCAGGACC
ATGACCATGGCCAAATCCGTGACCATATGCAGCGTGTCCGTAAGGGCCGTGAGAGCTATG
AGCTATGTGGTGAGCTCCATAGGCAGCTGCAGCACCTGCAATCATACCCCCTATTCCAGC
TGCGTGTCCTGAGTGATGAGCAGAATAGCCAGCAGGAGGATAACCAGCATGACCAGGCGC
AGGAGGATACCCACCGTAGCCAGGAGCAGGAGGGTAGGCACCAGGTGGAGGTGGGTAAGA
ACCCGGAGGATAACCAGGTGCAGGTGGGTAGGCACCAGGTGGTGGTGGTGGAGGAGGGTA
AGCTTGATGTGGTGGGTATCCAGCTGGTGGATAAGCCCCATGACCCGACGGGTATCCAGC
GGGTGGGTACCCAAAAAAACCTTTGTCTTTTTCTTCGTCACCTCCCATGTTTTCTCTCAA
TCAACAAAACAAAACCCGAGACGAATTGCGAGACA
ATCCC

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DS 

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CCATGCCTTCTAGAACAGCTTAAGCAATGTCAATTATATTAAAACAGAGTTTGTCATCAT
ATAACCATAGAGATAGCTTCATAGTACACCATGTAATATCATACTCATTATTAAAGTCTA
CCGACGAAAGTTAACCTTTTGGGGTTTATTTGAAACATTTCGTCAGACGAGAGGTAGATC
AAAAGGGGGTTTTAGATCACTTCCACTTCTTGAACTTACCTCCTCCAAACATCCCATGCC
TCCCATGTTTGCCTCCATGATGCTTGAACTTCCCGTGCTTGAACTTACCATGACCATAAC
CATAACCATAGCCAGGACCATGACCATGGCCAAATCCGTGACCATATGCAGCGTGTCCGT
AAGGGCCGTGAGAGCTATGAGCTATGTGGTGAGCTCCATAGGCAGCTGCAGCACCTGCAA
TCATACCCCCTATTCCAGCTGCGTGTCCTGAGTGATGAGCAGGATAGCCAGCAGGAGGAT
AACCAGCATGACCAGGCGCAGGAGGATAACCTCCGTAGCCAGGAGCAGGAGGGTAGGCAC
CAGGTGGAGGTGGGTAAGCACCAGGAGGATAACCAGGTGCAGGTGGGTAGGCACCATGTG
GTGGTGGTGGAGGAGGGTAAGCTTGATGTGGTGGGTATCCAGCTGGTGGATAAGCCCCAT
GACCCGACGGGTATCCAGCGGGTGGGTACCCAAAAAA*CCTTTGTCTTTATCTTCGTCAC
CTCCCATGTTTTCTCTCA*TCAACAAAACAAA*CCCGAGACGAATCGCGAGACATGTCGA
AACTGATT

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 4

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GGGTCTTCTCACTCCTCATCGTTCGTATCGTCGTTACACTCTGTAATCTCATTCTTAGAC
CTAAACTCTCTGTTCTCGAATCCTCAGTCCTCCCTCCATGGCTTCGTGTAGCCTAGGAGT
TCCGAAGATTAAAATCTCAGCGGTGGAACTGAGTAGACTAAGATCTGGAAGCTTACAGAT
TCCTCACAGTCAAAGATCTTTGTTTGTTCAAAGGCCGGTTAAGTACTTGAGTCTGAGGAC
AAGTGTTGGATCTTTGAAAGCTGTCCAACTGTCTACTGTCACAGCTGCGGAAACAGCTGC
TATTGTGGAAGTAGAAGACGCTGAGAAGACCAATTCATCTCCTTTGAATGCTCAGCTTGT
TCCCAACCCCTCCGAGGTGGAAGCTCTTGTCACTGAGATATGTGATTCCTCATCAATTGC
AGAGTTTGAACTGAAACTGGGAGGTTTCCGCCTATATGTAGCAAGGGACTTAGCTGACAA
CAACATTAGTCAACCACAACCTCAGCCAGTTCCGGCTACCGTTGCTGCAAATGCAGTTAC
CGAGAGTGCTGATTCCAATGGATCAGCTTCCTCTACTTCATTAGCCATCACAAAACCAGC
ATCTTCAGCTGCTGATCAGGGTTTGATTATCCTCCAATCTCCTAAAGTAGGATTCTTCAG
GAGATCTAAAACCATAAAGGGTAAACGCACTCCTTCCTCCTGTAAAGAGAAAGACCAGGT
GAAAGAAGGTCAAGTTCTTTGCTACATTGAACAACTCGGTGGCCAGTTTCCAATCGAGTC
TGATGTTACCGGAGAGGTTGTCAAAATACTCCGAGAGGATGGAGAGCCTGTAGGATACAA
TGATGCTCTCATCTCCATCCTTCCTTCCTTCCCTGGGATCAAGAAGCTTCAGTAAAACCA
AAAATCCAAGCTTGGTTTTGAGTTGTGAAACTATGTCTTGTGTGTATGTTTTTAGAACAA
AATAAACTTCATTCATACCTCTCTGTGTTTCTGTTTTGTCTTTTTTTACTTGTCTGAAAG
TTCCTCAAGACATTGTTTTATTATGTTCTTTTATATATAAAAACATTCTGATACCTTTTT
CT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1CB53TF U 9
AF RS1F382TF U 1
AF RS1F382JQ C 253
AF RS1CB53JQ C 308
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BS 1076 1082 RS1CB53JQ

RD RS1CB53TF 638 0 0
GG
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TGTTCTCGAATCCTCAGTCCTCCCTCCATGGCTTCGTGTAGCCTAGGAGTTCCGAAGATT
AAAATCTCAGCGGTGGAACTGAGTAGACTAAGATCTGGAAGCTTACAGATTCCTCACAGT
CAAAGATCTTTGTTTGTTCAAAGGCCGGTTAAGTACTTGAGTCTGAGGACAAGTGTTGGA
TCTTTGAAAGCTGTCCAACTGTCTACTGTCACAGCTGCGGAAACAGCTGCTATTGTGGAA
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CTGAAACTGGGAGGTTTCCGCCTATATGTAGCAAGGGACTTAGCTGACAACAACATTAGT
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GATTCCAATGGATCAGCTTCCTCTACTTCATTAGCCATCACAAAACCAGCATCTTCAGCT
GCTGATCAGG*TTTGATTATCCTCCA*TCTCCTAAA

QA 3 638 3 638
DS 

RD RS1F382TF 675 0 0
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TCCGAAGATTAAAATCTCAGCGGTGGAACTGAGTAGACTAAGATCTGGAAGCTTACAGAT
TCCTCACAGTCAAAGATCTTTGTTTGTTCAAAGGCCGGTTAAGTACTTGAGTCTGAGGAC
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TATTGTGGAAGTAGAAGACGCTGAGAAGACCAATTCATCTCCTTTGAATGCTCAGCTTGT
TCCCAACCCCTCCGAGGTGGAAGCTCTTGTCACTGAGATATGTGATTCCTCATCAATTGC
AGAGTTTGAACTGAAACTGGGAGGTTTCCGCCTATATGTAGCAAGGGACTTAGCTGACAA
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CGAGAGTGCTGATTCCAATGGATCAGCTTCCTCTACTTCATTAGCCATCACAAAACCAGC
ATCTTCAGCTGCTGATCAGGGTTTGATTATCCTCCAATCTCCTAAAGTAGGAT*CTTCAG
GAGATCTAAAACCAT

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1F382JQ 823 0 0
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AGAAGACGCTGAGAAGACCAATTCATCTCCTTTGAATGCTCAGCTTGTTCCCAACCCCTC
CGAGGTGGAAGCTCTTGTCACTGAGATATGTGATTCCTCATCAATTGCAGAGTTTGAACT
GAAACTGGGAGGTTTCCGCCTATATGTAGCAAGGGACTTAGCTGACAACAACATTAGTCA
ACCACAACCTCAGCCAGTTCCGGCTACCGTTGCTGCAAATGCAGTTACCGAGAGTGCTGA
TTCCAATGGATCAGCTTCCTCTACTTCATTAGCCATCACAAAACCAGCATCTTCAGCTGC
TGATCAGGGTTTGATTATCCTCCAATCTCCTAAAGTAGGATTCTTCAGGAGATCTAAAAC
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AGTTCTTTGCTACATTGAACAACTCGGTGGCCAGTTTCCAATCGAGTCTGATGTTACCGG
AGAGGTTGTCAAAATACTCCGAGAGGATGGAGAGCCTGTAGGATACAATGATGCTCTCAT
CTCCATCCTTCCTTCCTTCCCTGGGATCAAGAAGCTTCAGTAAAACCAAAAATCCAAGCT
TGGTTTTGAGTTGTGAAACTATGTCTTGTGTGTATGTTTTTAGAACAAAATAAACTTCAT
TCATACCTCTCTGTGTTTCTGTTTTGTCTTTTTTTACTTGTCTGAAAGTTCCTCAAGACA
TTGTTTTATTATGTTCTTTTATATATAAAAACATTCTGATACC

QA 1 823 1 823
DS 

RD RS1CB53JQ 775 0 0
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CCCTCCGAGGTGGAAGCTCTTGTCACTGAGATATGTGATTCCTCATCAATTGCAGAGTTT
GAACTGAAACTGGGAGGTTTCCGCCTATATGTAGCAAGGGACTTAGCTGACAACAACATT
AGTCAACCACAACCTCAGCCAGTTCCGGCTACCGTTGCTGCAAATGCAGTTACCGAGAGT
GCTGATTCCAATGGATCAGCTTCCTCTACTTCATTAGCCATCACAAAACCAGCATCTTCA
GCTGCTGATCAGGGTTTGATTATCCTCCAATCTCCTAAAGTAGGATTCTTCAGGAGATCT
AAAACCATAAAGGGTAAACGCACTCCTTCCTCCTGTAAAGAGAAAGACCAGGTGAAAGAA
GGTCAAGTTCTTTGCTACATTGAACAACTCGGTGGCCAGTTTCCAATCGAGTCTGATGTT
ACCGGAGAGGTTGTCAAAATACTCCGAGAGGATGGAGAGCCTGTAGGATACAATGATGCT
CTCATCTCCATCCTTCCTTCCTTCCCTGGGATCAAGAAGCTTCAGTAAAACCAAAAATCC
AAGCTTGGTTTTGAGTTGTGAAACTATGTCTTGTGTGTATGTTTTTAGAACAAAATAAAC
TTCATTCATACCTCTCTGTGTTTCTGTTTTGTCTTTTTTTACTTGTCTGAAAGTTCCTCA
AGACATTGTTTTATTATGTTCTTTTATATATAAAAACATTCTGATACCTTTTTCT

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 4

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GGGATCACTTTTAGATCGATAAAAAGCCATAAGAAAAAAAAAAAAGGAAAAGATGGCTCA
GAATGATACGGTGAAGCTCCTAGGTTCTTGGTCGAGCCCTTATGCCCTTAGGGCTCGAGT
GGCTCTACACTTGAAATCAGTCAAGTACGAGTACTTGGACGAACCTGATGTTCTCAACGC
AAAGAGCGAACTCCTCCTCAAGTCCAACCCCATCTTCAAGAAAGTCCCTGTTCTCATCCA
CGGCGATGTTTCCATCTGCGAGTCACTCAACATCGTTCAGTACGTCGATGAAGCTTGGTC
CTCTGCTCCTTCCATCCTTCCTTCTCACCCTTACGAACGGGCCAACGCTCGCTTCTGGGC
TCTCTTCGTTGACGACAAGATCTTTGGATCGTTGGATGCGGTGGGAGGAGCAAAAGACGA
CGAAGGGAGGATGGCGGCGGCGGGGAAGCTGATGGAGTGTTTGGCGATGCTTGAAGAGGC
GTTTCAGAAGGGCAGCAAAGGGTTAGGGTTCTTTGGAGGAGAGGACATTAACTTCCTCGA
CATAGCTTGTGGGACCATCTTGGGACCAGTCTCTGTGATCGAGGCGTTTTCCGGCGTCAA
ATTTCTCCGGGAAGAAACGACACCTGGGTTGATCCAGTGGGCCGAGAAGTTTAGGGCCCA
TGAAGCTGTCAAGCCTTACATGCCTACCGTGGAAGAGTTCATTGCATTTGCGAAGAAGAA
GTTTGGTGTTGAGTGATATGGT**TTTATGTTTATGCAAAATATTAAATGGGATGAAATA
ATGAATGAATGATGTTTTGTCGTCTTTGAGAACTTTTTTTCTTTTTATAAGTTTTCCGTA
TGTGCCGAAACTTTGTCTTTGTTCTTTCATCTAATGTGATAAAATTTTATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GM52TF U 1
AF RS1GM52JQ C 204
AF RS1G925TF U 175
AF RS1G925JQ C 171
BS 1 306 RS1GM52TF
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BS 308 650 RS1GM52TF
BS 651 799 RS1G925TF
BS 800 893 RS1G925JQ

RD RS1GM52TF 650 0 0
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GGCTCTACACTTGAAATCAGTCAAGTACGAGTACTTGGACGAACCTGATGTTCTCAACGC
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ATTTCTCCGGGAAGAAACGACACCTGGGTTGATCCAGTGGGCCGAGAAGT

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DS 

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CACTCAACATCGTTCAGTACGTCGATGAAGCTTGGTCCTCTGC*CCTTCCATCCTTCCTT
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GGAAGCTGATGGAGTGTTTGGCGATGCTTGAAGAGGCGTTTCAGAAGGGCAGCAAAGGGT
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CTGGGTTGATCCAGTGGGCCGAGAAGTTTAGGGCCCATGAAGCTGTCAAGCCTTACATGC
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GTTTATGTTTATGCAAAATATTAAATGGGATGAAATAATGAATGAATGATGTTTTG
TCGCC

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DS 

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CATCCACGGCGATGTTTCCATCTGCGGGTCACTCAACATCGTTCAGTACGTCGATGAAGC
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CTGGGCTCTCTTCGTTGACGACAAGATCTTTGGATCGTTGGATGCGGTGGGAGGAGCAAA
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AGAGGCGTTTCAGAAGGGCAGCAAAGGGTTAGGGTTCTTTGGAGGAGAGGACATTAACTT
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GGCCCATGAAGCTGTCAAGCCTTACATGCCTACCGTGGAAGAGTTCATTGCATTTGCGAA
GAAGAAGTTTGGTGTTGAGTGATATGGT**TTTATGTTTATGCAAAATATTAAATGGGAT
GAAATAATGAATGAATGATGTTTTG

QA 1 625 1 625
DS 

RD RS1G925JQ 723 0 0
TTCT
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CATCCACGGCGATGTTTCCATCTGCGGGTCACTCAACATCGTTCAGTACGTCGATGAAGC
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CTGGGCTCTCTTCGTTGACGACAAGATCTTTGGATCGTTGGATGCGGTGGGAGGAGCAAA
AGACGACGAAGGGAGGATGGCGGCGGCGGGGAAGCTGATGGAGTGTTTGGCGATGCTTGA
AGAGGCGTTTCAGAAGGGCAGCAAAGGGTTAGGGTTCTTTGGAGGAGAGGACATTAACTT
CCTCGACATAGCTTGTGGGACCATCTTGGGACTAGTCTCTGTGATCGAGGCGTTTTCCGG
CGTCAAATTTCTCCGGGAAGAAACGACACCTGGGTTGATCCAGTGGGCCGAGAAGTTTAG
GGCCCATGAAGCTGTCAAGCCTTACATGCCTACCGTGGAAGAGTTCATTGCATTTGCGAA
GAAGAAGTTTGGTGTTGAGTGATATGGT**TTTATGTTTATGCAAAATATTAAATGGGAT
GAAATAATGAATGAATGATGTTTTGTCGTCTTTGAGAACTTTTTTTCTTTTTATAAGTTT
TCCGTATGTGCCGAAACTTTGTCTTTGTTCTTTCATCTAATGTGATAAAATTTTATTTG

QA 5 723 5 723
DS 



AS 1 3

CO CL2488Contig1 1083 3 10 U
GCCGTGTTCACTGCCTCTTGGGTGATTACCATACTGGTCTCAAGTGGCTGCAGCCCATTG
ACGTCACTCAGCAAGGTGTTTACACCAGTGTCATTGGGTGCCACATCGCTACTATCTATC
ACTATGGATTCGCCAACCTCATGTTGAGGAGGTACGTGGATGCGGTTCGTGAGTTCAACA
AGATCCTCCTCTACATTTACAAGACGAAGCAGTACCATCAGAAGTCGCCTCAGTATGAGC
AGTTGCTGAAGAAGAACGAGCAGATGTATGCTTTGCTTGCGGTTTGCCTTTCTCTCTGCC
CTCAGACGAAGCCCGTTGACGAGTCTGTTAACTCTCAGTTGCGTGAGAAGTACGGCGAGA
AGATGATGAGGATGCAGAGGTACGACGATGAGGCGTTTGGTATCTATGACGAGCTCTTCT
CTTACGCGTGCCCCAAGTTCATCACCCCTTCCGCACCAAGTTTCGAGGAGCCTCTTGTCA
ATTACAATCAGGATGCTTACAGGCTTCAGTTGAAGATGTTCCTTTATGAGGTGAAGCAGC
AGCAGCTGTTGTCAGGAGTGAGGACGTTCCTTAAAGTTTACTCCTCCATCTCTCTTGCTA
AGCTCGCAAACTACATGGAAGTTGATGAACCAACTCTAAGGACCATATTGCTAACATACA
AGCACAAGACACATTCAGTTGGTTCTGATGGGAAGATCATCTCCAATGCAGACATTGATT
TCTACATCAACAATGACATGATCTACGTTGTGGAATCAAAACCTGCAAAGCGTTATGGAG
ATTTCTTCTTGCGGCAGATTGCAAAGGTATGCAAACTGAATCTAAGATGTGTGTGCACAC
TGCATAGGCACATATACATAGCAGGCATGATAAGAATCCAACTTTTTTTTTATTTTTTGT
TCTTACTGTGCAGCTTGAAGGTGTGATAAACGACATGGACCGCGTCAAGCTGGAATGAGG
AAATGTCTGTTACCTTCAGCTCTCTTTATCTAGTGAAACGGTGTTTTTGGTGTTATCGTC
TATCTTTTCTTATGAAATACTGTCATTTTTCCATTGTGGCATTGCAAGGATATCCCAAAT
GAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1FI70TF U 1
AF RS1B564TF U 109
AF RS1B821TF U 398
BS 1 312 RS1FI70TF
BS 313 313 RS1B564TF
BS 314 355 RS1FI70TF
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BS 722 760 RS1FI70TF
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RD RS1FI70TF 763 0 0
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ACGTCACTCAGCAAGGTGTTTACACCAGTGTCATTGGGTGCCACATCGCTACTATCTATC
ACTATGGATTCGCCAACCTCATGTTGAGGAGGTACGTGGATGCGGTTCGTGAGTTCAACA
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AGTTGCTGAAGAAGAACGAGCAGATGTATGCTTTGCTTGCGGTTTGCCTTTCTCTCTGCC
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AGATGATGAGGATGCAGAGGTACGACGATGAGGCGTTTGGTATCTATGACGAGCTCTTCT
CTTACGCGTGCCCCAAGTTCATCACCCCTTCCGCACCAAGTTTCGAGGAGCCTCTTGTCA
ATTACAATCAGGATGCTTACAGGCTTCAGTTGAAGATGTTCCTTTATGAGGTGAAGCAGC
AGCAGCTGTTGTCAGGAGTGAGGACGTTCCTTAAAGTTTACTCCTCCATCTCTCTTGCTA
AGCTCGCAAACTACATGGAAGTTGATGAACCAACTCTAAGTACCATATTGCTAACATACA
AGCACAAGACACATTCAGTTGGTTCTGATGGGAAGATCATCTCCAATGCAGACATTGATT
*CTACATCAACAATGACATGATCTACGTTGTGGAATCAAA
CCT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1B564TF 655 0 0
G
TACTATCTATCACTATGGATTCGCCAACCTCATGTTGAGGAGGTACGTGGATGCGGTTCG
TGAGTTCAACAAGATCCTCCTCTACATTTACAAGACGAAGCAGTACCATCAGAAGTCGCC
TCAGTATGAGCAGTTGCTGAAGAAGAACGAGCAGATGTATGCTTTGCTTGCGGTTTGCCT
TTCTCTCTGCCCTCAGACGAAGCCCGTTGACGAGTCTGTTAACTCTCAGTTGCGTGAGAA
GTACGGCGAGAAGATGATGAGGATGCAGAGGTACGACGATGAGGCGTTTGGTATCTATGA
CGAGCTCTTCTCTTACGCGTGCCCCAAGTTCATCACCCCTTCCGCACCAAGTTTCGAGGA
GCCTCTTGTCAATTACAATCGGGATGCTTACAGGCTTCAGTTGAAGATGTTCCTTTATGA
GGTGAAGCAGCAGCAGCTGTTGTCAGGAGTGAGGACGTTCCTTAAAGTTTACTCCTCCAT
CTCTCTTGCTAAGCTCGCAAA*TACATGGAAGTTGATGAACCAACTCTAAGGACCATATT
GCTAACATACAAGCACAAGACACATTCAGTTGGTTCTGATGGGAAGATCATCTCCAATGC
AGACATTGATTTCTACATCAACA*TGACATGATCTACGTTGTGGAATCAAA
CCT

QA 2 652 2 652
DS 

RD RS1B821TF 686 0 0
G
GGTATCTATGACGAGCTCTTCTCTTACGCGTGCCCCAAGTTCATCACCCCTTCCGCACCA
AGTTTCGAGGAGCCTCTTGTCAATTACAATCAGGATGCTTACAGGCTTCAGTTGAAGATG
TTCCTTTATGAGGTGAAGCAGCAGCAGCTGTTGTCAGGAGTGAGGACGTTCCTTAAAGTT
TACTCCTCCATCTCTCTTGCTAAGCTCGCAAACTACATGTAAGTTGATGAACCAACTCTA
AGGACCATATTGCTAACATACAAGCACAAGACACATTCAGTTGGTTCTGATGGGAAGATT
ATCTCCAATGCAGACATTGATTTCTACATCAACAATGACATGATCTACGTTGTGGAATCA
AAACCTGCAAAGCGTTATGGAGATTTCTTCTTGCGGCAGATTGCAAAGGTATGCAAACTG
AATCTAAGATGTGTGTGCACACTGCATAGGCACATATACATAGCAGGCATGATAAGAATC
CAACTTTTTTTTTATTTTTTGTTCTTACTGTGCAGCTTGAAGGTGTGATAAACGACATGG
ACCGCGTCAAGCTGGAATGAGGAAATGTCTGTTACCTTCAGCTCTCTTTATCTAGTGAAA
CGGTGTTTTTGGTGTTATCGTCTATCTTTTCTTATGAAATACTGTCATTTTTCCATTGTG
GCATTGCAAGGATATCCCAAATGAT

QA 2 686 2 686
DS 



AS 1 4

CO CL2489Contig1 1213 4 12 U
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TCTGGAAACCGTGCTCAGCAGGAGAAGGTAAAGGACAAGGCCAAGTTTACTGCGGCGAAA
GAAGCATCCAAGAGTAAGGGAAAAGGTAAGGCGGTGGATGAGGATGGCCCAGCACCTGAA
GCTCCGAGAAAGTGGAGAGACTATAGCGTTGAGTTTCATTTCCCGGAACCAACCGAGCTC
ACTCCTCCTCTCCTGCAGTTGATCGAGGTTAGCTTCTGCTACCCGAACAGACCAGACTTC
AGGCTCTCGGATGTTGATGTGGGTATCGATATGGGTACAAGGGTCGCTATAGTTGGGCCT
AACGGAGCTGGAAAGTCCACTCTTTTGAACCTTCTTGCTGGAGATTTAGTTCCGAGTGAA
AGTGAAGTGAGAAGAAGCCAGAAGCTGAGGATTGGGAGATACTCTCAGCACTTTGTTGAC
CTGTTAACAATGGGGGAAACATCAGTTCAGTATCTGCTCCGCCTTCATCCTGACCAAGAG
GGATTTAGCAAACAGGAAGCTGTGCGTGCCAAGCTAGGCAAGTTTGGGCTACCGAGTCAC
AACCACTTGACTCCGATCATGAAACTGTCCGGTGGACAAAAAGCTAGAGTTGTGTTCACT
TCGATCTCAATGTCTAAGCCACACATTTTGCTTCTTGACGAGCCTACGAATCACTTAGAC
ATGCAGAGCATAGATGCGTTGGCTGATGCGCTAGAGGAGTTCAGTGGAGGAGTTGTGCTG
GTGAGTCACGACTCTAGGCTTATATCACGCGTCTGTGAGGATGAGGAGAAGAGTCAGATT
TGGGTTGTGGAAGACGGAACTGTGTCTTTCTTCGATGGCACGTTTGAAGAGTACAAGGAA
GATCTGCAAAGAGAGATCAGAGCAGAGGTCGATGAGTGATGTCTTGTTGGCTTTTAAAGG
TAAAACTGAAAGCTCTTTATATTTTCAGACTTGGAAAAAGTTTTGGACTAAAGTTTATTT
TATAGACATTGTGTGTGTTTCCTTCATCATATATACGTTAATGGCATGAAACCATATACG
TTTTTCCCATGTTACATAGTCGAGTGTAGTATTATGTTTTGGGGGAAGCAAGGATATGTC
TTTCATTTTTTATTTCATGAATGTGTGTTTCATTGAGCATAATAAACAACAATTCTCTTA
ATTTTGCTGTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FL82TF U 1
AF RS1GZ80TF U 845
AF RS1GZ80JQ C 845
AF RS1FL82JQ C 531
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BS 1005 1039 RS1GZ80TF
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BS 1041 1058 RS1GZ80TF
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BS 1078 1213 RS1FL82JQ

RD RS1FL82TF 636 0 0
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TCTGGAAACCGTGCTCAGCAGGAGAAGGTAAAGGACAAGGCCAAGTTTACTGCGGCGAAA
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CTGTTAACAATGGGGGAAACATCAGTTCAGTATCTGCTCCGCCTTCATCCTGACCAAGAG
GGATTTAGCAAACAGGAAGCTGTGCGTGCCAAGCTAGGCAAGTTTGGGCTACCGAGTCAC
AACCACTTGACTCCGATCATGAAACTGTCCG
TGGAC

QA 1 631 1 631
DS 

RD RS1GZ80TF 233 0 0
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GACATTGTGTGTGTT*CCTTCATCATATATACGT*AATGGCATGAAACCATAT

QA 1 233 1 233
DS 

RD RS1GZ80JQ 355 0 0
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TGCAAAGAGAGATCAGAGCAGAGGTCGATGAGTGATGTCTTGTTGGCTTTTAAAGGTAAA
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GACATTGTGTGTGTTTCCTTCATCATATATACGTTAATGGCATGAAACCATATACGTTTT
TCCCATGTTACATAGTCGAGTGTAGTATTATGTTTTGGGGGAAGCAAGGATATGTCTTTC
ATTTTTTATTTCATGAATGTGTGTTTCATTGAGCATAATAAACAACAATTCTCTT

QA 1 355 1 355
DS 

RD RS1FL82JQ 683 0 0
TGACCAAGAGGGATTTAGCAAACAGGAAGCTGTGCGTGCCAAGCTAGGCAAGTTTGGGCT
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TGTGTTCACTTCGATCTCAATGTCTAAGCCACACATTTTGCTTCTTGACGAGCCTACGAA
TCACTTAGACATGCAGAGCATAGATGCGTTGGCTGATGCGCTAGAGGAGTTCAGTGGAGG
AGTTGTGCTGGTGAGTCACGACTCTAGGCTTATATCACGCGTCTGTGAGGATGAGGAGAA
GAGTCAGATTTGGGTTGTGGAAGACGGAACTGTGTCTTTTTTCGGTGGCACGTTTGAAGA
GTACAAGGAAGATCTGCAAAGAGAGATCAGAGCAGAGGTCGATGAGTGATGTCTTGTTGG
CTTTTAGAGGTAAAACTGAAAGCTCTTTATATTTTCAGACTTGGAAAAAGTTTTGGACTA
AAGTTTATTTTATAGACATTGTGTGTGTTTTTTTCATCATATATACGTTAATGGCATGAA
ACCATATACGTTTTTCCCATGTTACATAGTCGAGTGTAGTATTATGTTTTGGGGGAAGCA
AGGATATGTCTTTCATTTTTTATTTCATGAATGTGTGTTTCATTGAGCATAATAAACAAC
AATTCTCTTAATTTTGCTGTCCG

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 4

CO CL2490Contig1 502 4 9 U
GGAAAACCAATTACACTAGAAAAACCCTAGATACAGAAAATTTGATCTATATCTTTCTCT
TTTTTTTAAAGTTTTTCTTGATCTGATTCGGTGAAGTGACGGTGCACAGGCATCTGATGA
AGCTGCCAGCACGATCTAATTAACTTTCTTTCTCCGTTTGTTTTCATGACGATGGAAAGA
GATGAGTGTAGATTAGATCATGTTTGCAGTTTCACCCGTTGACTATCGCACCCTTAAACC
CTAATTTTCATCTTTGATTCCCATCTCAGATTTCACAGTAGCTAGGGTTGATTTCTATAT
TTTGGTGTTTGAATCCAAATGACCTGTGTTTCTCTTTTTACCTTACTTAATTGAGAGATC
TCTCTTTTTGTGTGGTTATATTTCTGTTCATCTGAATTTTTCATTTTCTACATTTGTATT
TGTTGTTCATATGGACTCCGAGATTCTGTAATATTTTTAGGGTTATAGAGTTGCACGACT
ACATAAAAGATCAAATTTATCC


BQ
10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DS52JQ C 2
AF RS1DS52TF U 2
AF RS1CC51JQ C 1
AF RS1CC51TF U 1
BS 1 1 RS1CC51JQ
BS 2 67 RS1DS52TF
BS 68 69 RS1CC51TF
BS 70 216 RS1DS52TF
BS 217 217 RS1CC51TF
BS 218 314 RS1DS52TF
BS 315 315 RS1CC51TF
BS 316 409 RS1DS52TF
BS 410 502 RS1CC51TF

RD RS1DS52JQ 410 0 0
GAAAACCAATTACACTAGAAAAACCCTAGATACAGAAAATTTGATCTATATCTTTCTCTT
TTTTTTTTAGTTTTTCTTGATCTGATTCGGTGAAGTGACGGTGCACAGGCATCTGATGAA
GCTGCCAGCACGATCTAATTAACTTTCTTTCTCCGTTTGTTTTCATGACGATGGAAAGAG
ATGAGTGTAGATTAGATCATGTTTGCAGTTTCACCTGTTGACTATCGCACCCTTAAACCC
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TTGGTGTTTGAATTCAAATGACCTGTGTTTCTCTTTTTACCTTACTTAATTGAGAGATCT
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TC

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TC

QA 1 408 1 408
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ACATAAAAGATCAAATTTATCC

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G
GAAAACCAATTACACTAGAAAAACCCTAGATACAGAAAATTTGATCTATATCTTTCTTTT
TTTTTTAAAGTTTTTCTTGATCTGATTCGGTGAAGTGACGGTGCACAGGCATCTGATGAA
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ATGAGTGTAGATTAGATCATGTTTGCAGTTTCACCCGTTGACTATCGCACCCTTAAACCC
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TTGGTGTTTGAATCCAAATGACCTGTGTTTCTCTTTTTACCTTATTTAATTGAGAGATCT
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GTTGTTCATATGGACTCCGAGATTCTGTAATATTTTTAGGGTTATAGAGTTGCACGACTA
CATAAAAGATCAAATTTATCC

QA 2 502 2 502
DS 



AS 1 4

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GATGACGCTTCCTCCAAACCGATCGCGCCGCTTCAGCTTGAGTCTCCCGCTGGTCAGTTC
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BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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TCAT
TCTCCCGAGATGTAC

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GATCTAGGTTCCGTACAGCCAGCAGCCCTGGGTTCACACCTTCTGGTTCAAAACTTCAAC
TTCGTTTAAGTCAAAACGCGTTCACTAGATTCTCAAAACCATTATTGCAAAGCAGCTCAT
CAACAACAGCTTCCAAAACTCGGAGAAGTTTTGCGGTTAGAGCTTCGGCAGCATCTGATG
ACGCTTCCTCCAAACCGATCGCGCCGCTTCAGCTTGAGTCTCCCGCTGGTCAGTTCCTGT
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DS 



AS 1 3

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ATGTCATCGTTTGGATTTGCTGTAATGTTTGTCCCTCCTTCGAATTCTCTGAAAGAAAAT
AAAGATTGATTCTTCTTAAAAAAAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F083TF U 1
AF RS1F083JQ C 175
AF RS1ER39TF U 223
BS 1 709 RS1F083TF
BS 710 710 RS1ER39TF
BS 711 786 RS1F083TF
BS 787 837 RS1ER39TF
BS 838 840 RS1F083JQ
BS 841 925 RS1ER39TF

RD RS1F083TF 786 0 0
GGAGCCGTCCCAAGGCAATGACCGTCTTCTGGTCCGCAATGGCTCAGAGCATGACCTCTC
GCCCAATGAAGGGTATGCTTACCGGCCCTGTCACCATTCTTAACTGGTCCTTCGTCAGAA
ACGACCAGCCCAGGCACGAAACCTGTTACCAGATCGCTTTGGCCATCAAGGACGAAGTTG
AGGATCTTGAGAAAGGTGGAATTAATGTCATTCAGATCGATGAGGCTGCACTCAGAGAAG
GATTACCACTCAGGAAATCCGAACATGCTTTCTACTTGGACTGGGCTGTTCACTCCTTCA
GAATCACCAACTGTGGCGTCCAAGACACCACCCAGATCCACACTCACATGTGCTACTCTC
ACTTCAATGACATCATACACTCCATCATCGACATGGATGCTGATGTGATCACCATCGAGA
ACTCCCGATCCGATGAGAAGCTTCTCTCTGTCTTCCGTGAGGGAGTGAAGTACGGTGCTG
GAATTGGTCCAGGTGTCTACGACATCCACTCTCCGAGAATACCACCTTCTGAGGAAATCG
CGGACAGAGTGAACAAGATGCTTGCTGTCCTAGAGCAGAACATCCTTTGGGTGAACCCTG
ACTGTGGTCTCAAGACCCGCAAGTACACAGAGGTCAAGCCAGCATTGAAGAACATGGTTG
ATGCCGCTAAGCTCATCCGTTCCCAGCTCGCCAGTGCCAAGTGAAGAAA*GCTTGAAATG
AGATGATGAATGATTGATGTGGTCTTTGCTATAATGGTTTGTGTTTTTTATTTTGCTTTG
ATTACT

QA 1 786 1 786
DS 

RD RS1F083JQ 711 0 0
AAGTTGAGGATCTTGAGAAAGGTGGAATTAATGTCATTCAGATCGATGAGGCTGCACTCA
GAGAAGGATTACCACTCAGGAAATCCGAACATGCTTTCTACTTGGACTGGGCTGTTCACT
CCTTCAGAATCACCAACTGTGGCGTCCAAGACACCACCCAGATCCACACTCACATGTGCT
ACTCTCACTTCAATGACATCATACACTCCATCATCGACATGGATGCTGATGTGATCACCA
TCGAGAACTCCCGATCCGATGAGAAGCTTCTCTCTGTCTTCCGTGAGGGAGTGAAGTACG
GTGCTGGAATTGGTCCAGGTGTTTACGACATCCACTCTCCGAGAATACCACCTTTTGAGG
AAATCGCGGACAGAGTGAACAAGATGCTTGCTGTCCTAGAGCAGAACATCCTTTGGGTGA
ACCCTGACTGTGGTCTCAAGACCCGCAAGTACACAGAGGTCAAGCCAGCATTGAAGAACA
TGGTTGATGCCGCTAAGCTCATCCGTTCCCAGCTCGCCAGTGCCAAGTGAAGAAAAGCTT
GAAATGAGATGATGAATGATTGATGTGGTCTTTGCTATAATGGTTTGTGTTTTTTATTTT
GCTTTGATTACTTTTTCTTATAAAAATATTTAGTCGAAGTTAGTTTTGATGCATATTGTT
TATGATATGTCATCGTTTGGATTTGCTGTAATGTTTGTCCCTCCTTCGAAT

QA 1 711 1 711
DS 

RD RS1ER39TF 703 0 0
G
GGCTGCACTCAGAGAAGGATTACCACTCAGGAAATCCGAACATGCTTTCTACC**GACTG
GGCTGTTCACTCCTTCAGAATCACCAACTGTGGCGTCCAAGACACCACCCAGATCCACAC
TCACATGTGCTACTCTCACTTCAATGACATCATACACTCCATCATCGACATGGATGCTGA
TGTGATCACCATCGAGAACTCCCGATCCGATGAGAAGCTTCTCTCTGTCTTCCGTGAGGG
AGTGAAGTACGGTGCTGGAATTGGTCCAGGTGTCTACGACATCCACTCTCCGAGAATACC
ATCTTCTGAGGAAATCGCGGACAGAGTGAACAAGATGCTTGCTGTCCTAGAGCAGAACAT
CCTTTGGGTGAACCCTGACTGTGGTCTCAAGACCCGCAAGTACACAGAGGTCAAGCCAGC
ATTGAAGAACATGGTTGATGCCGCTAAGCTCATCCGTTCCCAGCTCGCCAGTGCCAAGTG
AAGAAAAGCTTGAAATGAGATGATGAATGATTGATGTGGTCTTTGCTATAATGGTTTGTG
TTTTTTATTTTGCTTTGATTACTTTTTCTTATAAAAATATTTAGTCGAAGTTAGTTTTGA
TGCATATTGTTTAT***ATGTCATCGTTTGGATTTGCTGTAATGTTTGTCCCTCCTTCGA
ATTCTCTGAAAGAAAATAAAGATTGATTCTTCTTAAAAAAAA

QA 2 703 2 703
DS 



AS 1 4

CO CL2493Contig1 881 4 14 U
GGATATCACTCTCACTAGCAGCTTTCAATATAAGATTAACACAACCCTCAAG****AGGT
TCTTTGAAGCTAGAAGATGGAAACAATGTCTGAAAAAGTGGGAGCGGTGGGTGGTAACAA
GGGCGGACCATTTGACGACGGGGTTTACGATGGTGTGAAGAAAATAACGGTGGGAAAAGA
CTGGGACTGTGTTTCTTATATCAAGATTGAGTACGAAAAGGATGGAAAATTTGAAACCCG
TGAACATGGAATCATTCGTGGAGAACTTCAAGAGTTCTCGGTGGATTACCCGAACGAATA
TATCACATCTGTTGGTGGAAGCTACGAACGCGATTCCAGCTATGGAGCAGTGCTGATCAA
ATCTTTACGCTTCAAAACCTCACATGGAAGGACCTCTCCGATACTCGGTCATACGACGTT
GTTTGGAAACCCAGATGGGAGAGAATTCTTGCTAGAGGGTAAAGATGGTGGAAAGCTTCT
TGGTTTCCATGGACGTTCTGGTCAAGCTCTTGATGCCATTGGTCCTCACTTCTTCGCTGT
GAAATCTCCTCTTAAGCACTTTAACCGTGAAGGTGGAAACGGAGGGAGTGCTTGGGACGA
TGGGGCTTTTGACGGTGTTAGAAAAATACTTGTAGGGCGTGGTGGTAAATCTGTGAGTTA
CGTCAGGTTTGAGTATGCAAAAGGCCAAGGAATGGTGCCACATGTTCATGGGAAGAGACA
AGAGGTTCCACAGGAGTTTGTGGTCGATTATCCTAATGAACATATTACCTCAGTGGAGGG
AACCATCGATGGCTATCTTACATCGCTTAGGTTTAAGACATCAAAAGGAAGAACCTCCCC
TGCTTTTGGCAATGTGGCTGGTAGGAAATTTGTGTTCGAGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E742TF U 1
AF RS1AV51TF U 1
AF RS1C471TF U 1
AF RS1E742JQ C 57
BS 1 251 RS1AV51TF
BS 252 252 RS1E742TF
BS 253 322 RS1AV51TF
BS 323 323 RS1C471TF
BS 324 346 RS1AV51TF
BS 347 347 RS1C471TF
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BS 583 583 RS1C471TF
BS 584 648 RS1AV51TF
BS 649 649 RS1C471TF
BS 650 666 RS1AV51TF
BS 667 667 RS1E742JQ
BS 668 679 RS1AV51TF
BS 680 881 RS1E742JQ

RD RS1E742TF 405 0 0
GGATATCACTCTCACTAGCAGCTTTCAATATAAGATTAACACAACCCTCAAG****AGGT
TCTTTGAAGCTAGAAGATGGAAACAATGTCTGAAAAAGTGGGAGCGGTGGGTGGTAACAA
GGGCGGACCATTTGACGACGGGGTTTACGATGGTGTGAAGAAAATAACGGTGGGAAAAGA
CTGGGACTGTGTTTCTTATATCAAGATTGAGTACGAAAAGGATGGAAAATTTGAAACCCG
TGAACATGGAATCATTCGTGGAGAACTTCAAGAGTTCTCGGTGGATTACCCGAACGAATA
TATCACATCTGTTG*TGGAAGCTACGAACGCGATTCCAGCTATGGAGC*GTGCTGATCAA
ATCTTTACGCTTCAAA*CCTCACATGGAAGGACCTCTCCGATACT

QA 1 405 1 405
DS 

RD RS1AV51TF 679 0 0
GGATATCACTCTCACTAGCAGCTTTCAATATAAGATTAACACAACCCTCAAG****AGGT
TCTTTGAAGCTAGAAGATGGAAACAATGTCTGAAAAAGTGGGAGCGGTGGGTGGTAACAA
GGGCGGACCATTTGACGACGGGGTTTACGATGGTGTGAAGAAAATAACGGTGGGAAAAGA
CTGGGACTGTGTTTCTTATATCAAGATTGAGTACGAAAAGGATGGAAAATTTGAAACCCG
TGAACATGGAACCATTCGTGGAGAACTTCAAGAGTTCTCGGTGGATTACCCGAACGAATA
TATCACATCTGTTGGTGGAAGCCACGAACGCGATTCCAGCTATGGATCAGTGCTGATCAA
ATCTTTACGCTTCAAAACCTCACATGGAAGGACCTCTCCGATACTCGGTCATACGACGTT
GTTTGGAAACCCAGATGGGAGAGAATTCTTGCTAGAGGGTAAAGATGGTGGAAAGCTTCT
TGGTTTCCATGGACGTTCTGGTCAAGCTCTTGATGCCATTGGTCCTCACTTCTTCGCTGT
GAAATCTCCTCTTAAGCACTTTAACCGTGAAGGTGGAAACGGTGGGAGTGCTTGGGACGA
TGGGGCTTTTGACGGTGTTAGAAAAATACTTGTAGGGCGTGGTGGTAA*TCTGTGAGTTA
CGTCAG*TTTGAGTATGCA

QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1C471TF 662 0 0
GGATATCACTCTCACTAGCAGCTTTTAATATAAGATTAACACAACCCTCAAGAGTTAGGT
TCTTTGAAGCTAGAAGATGGAAACAATGTCTGAAAAAGTGGGAGCGGTGGGTGGTAACAA
GGGCGGACCATTTGACGACGGGGTTTACGATGGTGTGAAGAAAATAACGGTGGGAAAAGA
CTGGGACTGTGTTTCTTATATCAAGATTGAGTACGAAAAGGATGGAAAATTTGAAACCCG
TGAACATGGAACCATTCGTGGAGAACTTCAAGAGTTCTCGGTGGATTACCCGAACGAATA
TATCACATCTGTTGGTGGAAGCTACGAACGCGATTCCAGCTATGGAGCAGTGCTGATCAA
ATCTTTACGCTTCAAAACCTCACATGGAAGGACCTCTCCGATACTCGGTCATACGACGTT
GTTTGGAAACCCAGATGGGAGAGAATTCTTGCTAGAGGGTAAAGATGGTGGAAAGCTTCT
TGGTTTCCATGGACGTTCTGGTCAAGCTCTTGATGCCATTGGTCCTCACTTCTTCGCTGT
GAAATCTCCTCTTAAGCACTTTAACCGTGAAGGTGGAAACGGAGGGAGTGCTTGGGACGA
TGGGGCTTTTGACGGTGTTAGAAAAATACTTGTAGGGCGTGGTGGTAAATCTGTGAGTTA
CG

QA 1 662 1 662
DS 

RD RS1E742JQ 825 0 0
GAGG
TCTTTGAAGCTAGAAGATGGAAACAATGTCTGAAAAAGTGGGAGCGGTGGGTGGTAACAA
GGGCGGACCATTTGACGACGGGGTTTACGATGGTGTGAAGAAAATAACGGTGGGAAAAGA
CTGGGACTGTGTTTCTTATATCAAGATTGAGTACGAAAAGGATGGAAAATTTGAAACCCG
TGAACATGGAATCATTCGTGGAGAACTTCAAGAGTTCTCGGTGGATTACCCGAACGAATA
TATCACATCTGTTGGTGGAAGCTACGAACGCGATTCCAGCTATGGAGCGGTGCTGATCAA
ATCTTTACGCTTCAAAACCTCACATGGAAGGACCTCTCCGATACTCGGTCATACGACGTT
GTTTGGAAACCCAGATGGGAGAGAATTCTTGCTAGAGGGTAAAGATGGTGGAAAGCTTCT
TGGTTTCCATGGACGTTCTGGTCAAGCTCTTGATGCCATTGGTCCTCACTTTTTCGCTGT
GAAATCTCCTCTTAAGCACTTTAACCGTGAAGGTGGAAACGGAGGGAGTGCTTGGGACGA
TGGGGCTTTTGACGGTGTTAGAAAAATACTTGTAGGGCGTGGTGGTAAATCTGTGAGTTA
CGTCAGGTTTGAGTATGCAAAAGGCCAAGGAATGGTGCCACATGTTCATGGGAAGAGACA
AGAGGTTCCACAGGAGTTTGTGGTCGATTATCCTAATGAACATATTACCTCAGTGGAGGG
AACCATCGATGGCTATCTTACATCGCTTAGGTTTAAGACATCAAAAGGAAGAACCTCCCC
TGCTTTTGGCAATGTGGCTGGTAGGAAATTTGTGTTCGAGG

QA 5 825 5 825
DS 



AS 1 2

CO CL2494Contig1 716 2 2 U
GGCTGTCTGTGTGTTGCACAGATTCTTTCCCCGGAAAAAGAAATCTTACAGCTCGGAGCT
TCCAGGAAGTAATATCAATGGGTGGTGAAGATGAATCGATAGAGCAGAAGTCAGCTGCTC
GCAAAGAGGCGCTTAGAGCTTTAAGGGCAGCTCGGGAACTTACTGAGAGCAAAGAAGAGG
GAGAAGGTGATGCTTCTGTTGAAGAAGATGGTCCAGCCATGAAGTTTAGAAACTATGTAC
CCCAAGCTGAGGAGCTTCAGAACAGTAAAGTTGCACCACCAGAGCTGCCCAAATTCGAAG
ATCCAATCGCTGCACTTCCACCTGCTGTGGAGAAGAAAGAGGACCCATTTGTCAACATTG
CTCCAAAGAAACCGAACTGGGACCTCCGAAGAGATGTCCAGAAGAAGCTTGACAAGCTCG
AAAGGCGGACCCAAAAGGCAATGTATAAACTCATGGAGGAGCGTGAGAAAGAACGTGAGA
CGGCCGAAGCTGCTGAAAACGCAATAGAAAGTTAAAGACCACGATGATACGACTTGAAAG
AAGCCACAGAACACTCTACTCAGTTTTTTTTTTGTATTACTGCTCTATCCGAAGAGAGTA
GCTCTTAGTGCCTTATTTCAACTCTTCTTCGGAACAAACCTTGCCAAACATGGTTTGATT
GAACTTCAGTTTATAACCGGTTTGATCTAAAATGCAATGCAATTTCAGTTCAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1EK79TF U 1
AF RS1EK79JQ C 36
BS 1 675 RS1EK79TF
BS 676 716 RS1EK79JQ

RD RS1EK79TF 675 0 0
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GAGAAGGTGATGCTTCTGTTGAAGAAGATGGTCCAGCCATGAAGTTTAGAAACTATGTAC
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GAACTTCAGTTTATA

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DS 

RD RS1EK79JQ 681 0 0
AAAAGAAATCTTAC
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AAACTATGTACCCCAAGCTGAGGAGCTTCAGAACAGTAAAGTTGCACCACCAGAGCTGCC
CAAATTCGAAGATCCAATCGCTGCACTTCCACCTGCTGTGGAGAAGAAAGAGGACCCATT
TGTCAACATTGCTCCAAAGAAACCGAACTGGGACCTCCGAAGAGATGTCCAGAAGAAGCT
TGACAAGCTCGAAAGGCGGACCCAAAAGGCAATGTATAAACTCATGGAGGAGCGTGAGAA
AGAACGTGAGACGGCCGAAGCTGCTGAAAACGCAATAGAAAGTTAAAGACCACGATGATA
CGACTTGAAAGAAGCCACAGAACACTCTACTCAGTTTTTTTTTTGTATTACTGCTCTATC
CGAAGAGAGTAGCTCTTAGTGCCTTATTTCAACTCTTCTTCGGAACAAACCTTGCCAAAC
ATGGTTTGATTGAACTTCAGTTTATAACCGGTTTGATCTAAAATGCAATGCAATTTCAGT
TCAGACC

QA 15 681 15 681
DS 



AS 1 4

CO CL2495Contig1 934 4 4 U
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CTATGGTTGTCATCAGAGAATCCCCAATTTTCGCCAAGGACGACCGTCTCGTCTTCCCGC
CGGTCAACCACGAGAATCTCCAGCTCGCTTCTTCCATCTCCGAATTCGATAACAGATACC
TCGAATCCCCGTCGGAATCCGACTCCCCGTCATCTTCCTCGAGAGGCTCCGCTTCCTCTT
TCTCCTTCCCGTCTGATTCAGACGGACAACCTCCACTCGCTCCCTGCGAATTTTACCAGA
ATTCTCCGTCGGAAAACGAAGAAAAATCTCCGCCGTTCGATGCAGATAGACAATCGCCGC
CGTTGATAGGTTCTAAACGAGGCGGCGGAGAGTCTCCACCGCCGAGGAAGGTCTTGTATC
GTGAGGCTGATGATGTGCTCCAGCATTGGTGGGAGCTTCTTCTCGTACGAACATACCCCA
AGTTCAAAAATCTGATGACGTGGTTCTCGACGACTCTACGGCCGTTTTATCCCGTCCTCG
CCGTTGTGGTATGGTGGTGGATGCGTGTACGAGCTCGCCGGAGGCGTGTCGATGAAGAAA
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ATCAGATTGCTCAAATGAATGAGTTACTCATAAAACACCACAAGGAGATCGTATCAAGAT
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GACAAGACGTAGACTCTCCCTGTTCTAACTTTACGATGAAAGGTACTTGAACAGAATGAT
ATATTATTATATTATATATTTCATCCCTGAGCCA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1GJ95TF U 1
AF RS1EU94TF U 1
AF RS1EU94JQ C 230
AF RS1GJ95JQ C 294
BS 1 694 RS1EU94TF
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TCTCCTTCCCGTCTGATTCAGACGGACAACCTCCACTCGCTCCCTGCGAATTTTACCAGA
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CCGTTGTGGTATGGTGGTGGATGCG

QA 1 565 1 565
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CTATGGTTGTCATCAGAGAATCCCCAATTTTCGCCAAGGACGACCGTCTCGTCTTCCCGC
CGGTCAACCACGAGAATCTCCAGCTCGCTTCTTCCATCTCCGAATTCGATAACAGATACC
TCGAATCCCCGTCGGAATCCGACTCCCCGTCATCTTCCTCGAGAGGCTCCGCTTCCTCTT
TCTCCTTCCCGTCTGATTCAGACGGACAACCTCCACTCGCTCCCTGCGAATTTTACCAGA
ATTCTCCGTCGGAAAACGAAGAAAAATCTCCGCCGTTCGATGCAGATAGACAATCGCCGC
CGTTGATAGGTTCTAAACGAGGCGGCGGAGAGTCTCCACCGCCGAGGAAGGTCTTGTATC
GTGAGGCTGATGATGTGCTCCAGCATTGGTGGGAGCTTCTTCTCGTACGAACATACCCCA
AGTTCAAAAATCTGATGACGTGGTTCTCGACGACTCTACGGCCGTTTTATCCCGTCCTCG
CCGTTGTGGTATGGTGGTGGATGCGTGTACGAGCTCGCCGGAGGCGTGTCGATGAAGAAA
CCGCGTGTCGCCTTCGAGGTGCGATCAAAGAGAGAGACGAGAGGATAGTTCAGCTATTGC
ATCAGATTGCTCAAATGAATGAGTTACTCATAAA*CACCACAAGGAGATCGTATCAAGAT
AGATGATGATTCAGAAA
CTCTTTT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RS1EU94JQ 705 0 0
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TCCCGTCCTCGCCGTTGTGGTATGGTGGTGGATGCGTGTACGAGCTCGCCGGAGGCGTGT
CGATGAAGAAACCGCGTGTCGCCTTCGAGGTGCGATCAAAGAGAGAGACGAGAGGATAGT
TCAGCTATTGCATCAGATTGCTCAAATGAATGAGTTACTCATAAAACACCACAAGGAGAT
CGTATCAAGATAGATGATGATTCAGAAAACTCTTTTAGCTTGATTCTTTGTTTCTTGTTT
TATATTCTTTATTACCAAAGTCCACTCTGTTTCTGTCAATTTCTTTACATTTCAATCTCT
CTAATAAATAAGACAAGACGTAGACTCTCCCTGTTCTAACTTTACGATGAAAGGTACTTG
AACAGAATGATATATTATTATATTATATATTTCATCCCTGAGCCA

QA 1 705 1 705
DS 

RD RS1GJ95JQ 641 0 0
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TTGTATCGTGAGGCTGATGATGTGCTCCAGCATTGGTGGGAGCTTCTTTTCGTACGAACA
TACCCCAAGTTCAAAAATCTGATGACGTGGTTCTCGACGACTCTACGGCCGTTTTATCCC
GTCCTCGCCGTTGTGGTATGGTGGTGGATGCGTGTACGAGCTCGCCGGAGGCGTGTCGAT
GAAGAAACCGCGTGTCGCCTTCGAGGTGCGATCAAAGAGAGAGACGAGAGGATAGTTCAG
CTATTGCATCAGATTGCTCAAATGAATGAGTTACTCATAAAACACCACAAGGAGATCGTA
TCAAGATAGATGATGATTCAGAAAACTCTTTTAGCTTGATTCTTTGTTTCTTGTTTTATA
TTCTTTATTACCAAAGTCCACTCTGTTTCTGTCAATTTCTTTACATTTCAATCTCTCTAA
TAAATAAGACAAGACGTAGACTCTCCCTGTTCTAACTTTACGATGAAAGGTACTTGAACA
GAATGATATATTATTATATTATATATTTCATCCCTGAGCCA

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 3

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GCTGATCTTACCCGTTACTTACTTGTATATTACAATCGCCGTTTAAGAATATTTGGAAGC
CCTTCTCTCTCTCCTTGAACACACACACACACACA**CGACACGCGTGAATACAATCTCC
CATGGCTGCATTTGCAACAGCAGAAGCGTGTGACAGCAACGCAGAACTAATATCAAACGG
AGACCTACGGGCTCTCCAACCAACCTTCAAGATCTATGGACAAAGAAGATGCTTCTCCGG
ACCAATCGTGACACTCAAGGTCTTTGAAGACAACGTCCTAGTCAGAAACCAACTAGAGAC
AAAAGGAGAAGGCGCGGTCTTAGTTATAGACGGTGGTGGAAGCATGAGGTGCGCACTTGT
TGGAGGAAACCTCGGACAGTTAGCTCGGAACAACGGGTGGGTAGGGATTTTGGTGAATGG
GTGCGTTAGAGATGTGGATGAGATCAATGACTGTGATGTTGGGGTTAGGGCATTGGGTTC
TAACCCGTTGAAGTCTAGTAAGAAAGGTCAGGGTGAGAAGAATGTGCCGGTTTATATTGG
AGGGACTTTGATTAGGGATGGTGAATGGCTTTATGCTGATAGTGATGGTATCTTGATCTC
CAAGACCGAACTCTCCGTCTGATCCAGAATGTTCTTCTGCTAAGAGATTACTGTTGGAGC
TGGTTTATGTGGAATTAGTAATATTCGGTTTAATATTCTCAGATGAAAACGTTTTCTGCA
ATTTGTGAAACAATATAATAATTACAAAATGTTGTTATTTTTTCTTATTCGAAACGAGCT
GAAACCTTTATTTATTTTGTTACTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BS96TF U 1
AF RS1G958TF U 5
AF RS1BS96JQ C 125
BS 1 562 RS1BS96TF
BS 563 869 RS1BS96JQ

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DS 

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GG
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CTTACCCGTTACTTACTTGTATATTACAATCGCCGTTTAAGAATATTTGGAAGCCCTTCT
CTCTCTCCTTGAACACACACACACACACACACGACACGCGTGAATACAATCTCCCATGGC
TGCATTTGCAACAGCAGAAGCGTGTGACAGCAACGCAGAACTAATATCAAACGGAGACCT
ACGGGCTCTCCAACCAACCTTCAAGATCTATGGACAAAGAAGGTGCTTCTCCGGACCAAT
CGTGACACTCAAGGTCTTTGAAGACAACGTCCTAGTCAGAAACCAACTAGAGACAAAAGG
AGAAGGCGCGGTCTTAGTTATAGACGGTGGTGGAAGCATGAGATGCGCACTTGTTGGAGG
AAACCTCGGACAGTTAGCTCAGAACAACGGGTGGGTAGGGATTTTGGTGAATGGGTGCGT
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GTTGAAGTCTAGTAAG
AAAGG

QA 3 558 3 558
DS 

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CTACGGGCTCTCCAACCAACCTTCAAGATCTATGGACAAAGAAGATGCTTCTCCGGACCA
ATCGTGACACTCAAGGTCTTTGAAGACAACGTCCTAGTCAGAAACCAACTAGAGACAAAA
GGAGAAGGCGCGGTCTTAGTTATAGACGGTGGTGGAAGCATGAGGTGCGCACTTGTTGGA
GGAAACCTCGGACAGTTAGCTCGGAACAACGGGTGGGTAGGGATTTTGGTGAATGGGTGC
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ACCGAACTCTCCGTCTGATCCAGAATGTTCTTCTGCTAAGAGATTACTGTTGGAGCTGGT
TTATGTGGAATTAGTAATATTCGGTTTAATATTCTCAGATGAAAACGTTTTCTGCAATTT
GTGAAACAATATAATAATTACAAAATGTTGTTATTTTTTCTTATTCGAAACGAGCTGAAA
CCTTTATTTATTTTGTTACTTCTCC

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 4

CO CL2497Contig1 1288 4 6 U
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GCTTACTGAGATACTGGTTTCTTGATCACACCTGGTTTGGTTATAGAATGTCATCAAGTG
CCGATTCAGCTCGTGAGCCCTTGTTACCAAAGGATCAGATAGATCCCGTGCTTCAAGACT
TCAACACAAAATCAAGAACCTCTTCAAGCAAAAGAAGACTGCGTCGCTCAAGAAGCGCTC
CTCGTGGTGATTGTACCTACGACGATAACGATAACGATGTCAAAACCGACGAACCCCCTC
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CCGGTCACAAGACCAACGGTGTGTTGGATGCCGTCTACTTCTGCGTTGTAACGATGACAA
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TTGTCTTCTCCGGAATGGTCCTAGTGGGTCACCTTTTAAGCCGAGCAGCGGATCACCTAG
TGGAGAAGCAAGAGACTTTACTCGTCAGGCTTTCCATCTGCGTCAAAGCTCCGGTCCACT
AGACGTTCTCAAGGAGTTGCAAACCAACAAACTGAGATACAAATGCTACGTCACGTTCAT
TGTCTTTGTAGTCCTCGTCCTTGCTGACAAAAGCTTTAACTCTGGAACCGGACGCCTTTT
CGCTGTGTTTTGGATCTTGACGAGTACTATATGTTTGGCTCAGTTTTTACTCTATGTAGC
TGAGTTAAATGCGGAAACTAAGCAGAGGGAGTTGGTGAAATGGGTTTTGACAAGGAGGAT
CACAAACAATGATCTTGAAGCTGCTGATCTTGATGAAGATAGAGTTGTCGAAGCTGCAGA
GTTTATTGTATATAAGCTGAAAGAAATGGGGAAGATAGATGAGAAAGATATATCTGGGAT
CATGGAAGAGTTTGAGCAACTTGATTATGATGAATCTGGAAACCTGACCAATTCTGACAT
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TGTTTGTACTGTAATGCCATAGACTCTCTCTCTCTATGAACTGTTTTGTGATGTCTTGAG
TGTATAATATACATGGATTTACACGTGT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1G625TF U 1
AF RS1EU34TF U 1
AF RS1EU34JQ C 626
AF RS1G625JQ C 727
BS 1 682 RS1EU34TF
BS 683 683 RS1EU34JQ
BS 684 751 RS1EU34TF
BS 752 752 RS1EU34JQ
BS 753 790 RS1EU34TF
BS 791 1288 RS1EU34JQ

RD RS1G625TF 623 0 0
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GCTTACTGAGATACTGGTTTCTTGATCACACCTGGTTTGGTTATAGAATGTCATCAAGTG
CCGATTCAGCTCGTGAGCCCTTGTTACCAAAGGATCAGATAGATCCCGTGCTTCAAGACT
TCAACACAAAATCAAGAACCTCTTCAAGCAAAAGAAGACTGCGTCGCTCAAGAAGCGCTC
CTCGTGGTGATTGTACCTACGACGATAACGATAACGATGTCAAAACCGACGAACCCCCTC
TTCATCCAAGTCAACTACTGTTCAGGGATCTAAACCCGAACCTCAGGCGAGTGATCATGT
TCTTGGCTCTATATCTAATCATAGGAACTCTCTGTTTCTACCTCGTCAGAAACCAGATCT
CCGGTCACAAGACCAACGGTGTGTTGGATGCCGTCTACTTCTGCGTTGTAACGATGACAA
CCGTTGGATACGGTGACCTTGTCCCTAGTAGCTCTGCATCTAGACTACTCGCTTGTGCCT
TTGTCTTCTCCGGAATGGTCCTAGTGGGTCACCTTTTAAGCCGAGCAGCGGATCACCTAG
TGGAGAAGCAAGAGACTTTACTC

QA 1 623 1 623
DS 

RD RS1EU34TF 796 0 0
GGATTATGTGTGAAGTGGTAACATCGCTAAAGAACGATTGCTGTGAGATCCAAGTAAACC
GCTTACTGAGATACTGGTTTCTTGATCACACCTGGTTTGGTTATAGAATGTCATCAAGTG
CCGATTCAGCTCGTGAGCCCTTGTTACCAAAGGATCAGATAGATCCCGTGCTTCAAGACT
TCAACACAAAATCAAGAACCTCTTCAAGCAAAAGAAGACTGCGTCGCTCAAGAAGCGCTC
CTCGTGGTGATTGTACCTACGACGATAACGATAACGATGTCAAAACCGACGAACCCCCTC
TTCATCCAAGTCAACTACTGTTCAGGGATCTAAACCCGAACCTCAGGCGAGTGATCATGT
TCTTGGCTCTATATCTAATCATAGGAACTCTCTGTTTCTACCTCGTCAGAAACCAGATCT
CCGGTCACAAGACCAACGGTGTGTTGGATGCCGTCTACTTCTGCGTTGTAACGATGACAA
CCGTTGGATACGGTGACCTTGTCCCTAGTAGCTCTGCATCTAGACTACTCGCTTGTGCCT
TTGTCTTCTCCGGAATGGTCCTAGTGGGTCACCTTTTAAGCCGAGCAGCGGATCACCTAG
TGGAGAAGCAAGAGACTTTACTCGTCAGGCTTTCCATCTGCGTCAAAGCTCCGGTCCACT
AGACGTTCTCAAGGAGTTGCAA*CCAACAAACTGAGATACAAATGCTACGTCACGTTCAT
TGTCTTTGTAGTCCTCGTCCTTGCTGACAAA*GCTTTAACTCTGGAACCGGACGCCTTTT
CGCTGTGTTT
GGATCT

QA 1 790 1 790
DS 

RD RS1EU34JQ 663 0 0
AG
GGCTTTCCATCTGCGTCAAAGCTCCGGTCCACTAGACGTTCTCAAGGAGTTGCAAACCAA
CAAACTGAGATACAAATGCTACGTCACGTTCATTGTCTTTGTAGTCCTCGTCCTTGCTGA
CAAAAGCTTTAACTCTGGAACCGGACGCCTTTTCGCTGTGTTTTGGATCTTGACGAGTAC
TATATGTTTGGCTCAGTTTTTACTCTATGTAGCTGAGTTAAATGCGGAAACTAAGCAGAG
GGAGTTGGTGAAATGGGTTTTGACAAGGAGGATCACAAACAATGATCTTGAAGCTGCTGA
TCTTGATGAAGATAGAGTTGTCGAAGCTGCAGAGTTTATTGTATATAAGCTGAAAGAAAT
GGGGAAGATAGATGAGAAAGATATATCTGGGATCATGGAAGAGTTTGAGCAACTTGATTA
TGATGAATCTGGAAACCTGACCAATTCTGACATCGTTCTAGCTCAGATCCAAAGGTAAAG
CATTCATTTAAGTTACTATACCTGCACACAACTATAAGAAGTAAAGAGAGTGAACAGTTC
TTTTTTTGGAAATGTTGTTTGTTTCTGTATGTGTGTTTGTACTGTAATGCCATAGACTCT
CTCTCTCTATGAACTGTTTTGTGATGTCTTGAGTGTATAATATACATGGATTTACACGTG
T

QA 3 663 3 663
DS 

RD RS1G625JQ 562 0 0
TGTAGTCCTCGTCCTTGCTGACAAAAGCTTTAACTCTGGAACCGGACGCCTTTTCGCTGT
GTTTTGGATCTTGACGAGTACTATATGTTTGGCTCAGTTTTTACTCTATGTAGCTGAGTT
AAATGCGGAAACTAAGCAGAGGGAGTTGGTGAAATGGGTTTTGACAAGGAGGATCACAAA
CAATGATCTTGAAGCTGCTGATCTTGATGAAGATAGAGTTGTCGAAGCTGCAGAGTTTAT
TGTATATAAGCTGAAAGAAATGGGGAAGATAGATGAGAAAGATATATCTGGGATCATGGA
AGAGTTTGAGCAACTTGATTATGATGAATCTGGAAACCTGACCAATTCTGACATCGTTCT
AGCTCAGATCCAAAGGTAAAGCATTCATTTAAGTTACTATACCTGCACACAACTATAAGA
AGTAAAGAGAGTGAACAGTTCTTTTTTTGGAAATGTTGTTTGTTTCTGTATGTGTGTTTG
TACTGTAATGCCATAGACTCTCTCTCTCTATGAACTGTTTTGTGATGTCTTGAGTGTATA
ATATACATGGATTTACACGTGT

QA 1 562 1 562
DS 



AS 1 4

CO CL2498Contig1 676 4 8 U
CTCCAATGTAAACACTTCAACATATTTTTCAAACATAAGATCTTTAGAAAAATATTTTTT
TTTTATCAAACTCTCAAAAACAAGAGTTATAACTTCAACCAAAACTAGATAAGATCTGTC
ACAAAAAAAGAACGGAGATAAATTGTACTGAACAGCAAAGAAAGAGCAGAAAACAAAACA
ATCAGAAACAAGAAGTACGAGCATAGCTCTTCTAGTCTTCTTCCTCTCCCTCATTCTCAG
CAATGTTGAAGTACCTCAACTCGTAGAGGTTACGGTCCTTGTTGGCCGCAATAACTCTAA
GCCAATCCCTCACATTGTGCTTCTTCAAGTACTTCTTTGTCAAGTACTTGAGGTACCTCT
TGGAGAACTGGCCATCAGAAGTGACAGTGATTTTGTTCTTCTCACGGGTGATTGTGACAG
AGTCACCGAGCGCACCAGCTTTGCCACCGACTTTGATCCTCTCCTGAAGGAACTTCTCGA
GGGAAGCAATCTCCATGATCTTGTCATCGACGGGCTTGGAGCAGTCAATGGAGAAGGACA
CTCCCTTCTTCTTTCCCTTTGCAACGGCTGCACCTCCACGACTCATTTTCTCAACCTTTT
CCTCTTGAAGACGAGCGGCGTCTATTAGCTCTTGAACGAGAGAGAGAGGAGGAGACGATA
AACAAAATGTGGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1DA47JQ U 1
AF RS1AA33TF C 42
AF RS1DA47TF C 95
AF RS1AA33JQ U 286
BS 1 63 RS1DA47JQ
BS 64 64 RS1AA33TF
BS 65 299 RS1DA47JQ
BS 300 300 RS1AA33JQ
BS 301 534 RS1DA47JQ
BS 535 535 RS1AA33JQ
BS 536 604 RS1DA47JQ
BS 605 676 RS1AA33JQ

RD RS1DA47JQ 604 0 0
CTCCAATGTAAACACTTCAACATATTTTTCAAACATAAGATCTTTAGAAAAATATTTTTT
TTT*ATCAAACTCTCAAAAACAAGAGTTATAACTTCAACCAAAACTAGATAAGATCTGTC
ACAAAAAAAGAACGGAGATAAATTGTACTGAACAGCAAAGAAAGAGCAGAAAACAAAACA
ATCAGAAACAAGAAGTACGAGCATAGCTCTTCTAGTCTTCTTCCTCTCCCTCATTCTCAG
CAATGTTGAAGTACCTCAACTCGTAGAGGTTACGGTCCTTGTTGGCCGCAATAACTCTAG
GCCAATCCCTCACATTGTGCTTCTTCAAGTACTTCTTTGTCAAGTACTTGAGGTACCTCT
TGGAGAACTGGCCATCAGAAGTGACAGTGATTTTGTTCTTCTCACGGGTGATTGTGACAG
AGTCACCGAGCGCACCAGCTTTGCCACCGACTTTGATCCTCTCCTGAAGGAACTTCTCGA
GGGAAGCAATCTCCATGATCTTGTCATCGACGGGCTTGGAGCAGTCAATGGAGAGGGACA
CTCCCTTCTTCTTTCCCTTTGCAACGGCTGCACCTCCACGACTCATTTTCTCAACCTTTT
CCTC

QA 1 604 1 604
DS 

RD RS1AA33TF 635 0 0
G
TTTAGAAAAATATTTTTTTTTTATCAAACTCTCAAAAACAAGAGTTATAACTTCAACCAA
AACTAGATAAGATCTGTCACAAAAAAAGAACGGAGATAAATTGTACTGAACAGCAAAGAA
AGAGCAGAAAACAAAACAATCAGAAACAAGAAGTACGAGCATAACTCTTCTAGTCTTCTT
CCTCTCCCTCATTCTCAGCAATGTTGAAGTACCTCAACTCGTAGAGGTTACGGTCCTTGT
TGGCCGCAATAACTCTAAGCCAATCCCTCACATTGTGCTTCTTCAAGTACTTCTTTGTCA
AGTACTTGAGGTACCTCTTGGAGAACTGGCCATCAGAAGTGACAGTGATTTTGTTCTTCT
CACGGGTGATTGTGACAGAGTCACCGAGCGCACCAGCTTTGCCACCGACTTTGATCCTCT
CCTGAAGGAACTTCTCGAGGGAAGCAATCTCCATGATCTTGTCATCGACGGGCTTGGAGC
AGTCAATGGAGAAGGACACTCCCTTCTTCTTTCCCTTTGCAACGGCTGCACCTCCACGAC
TCATTTTCTCAACCTTTTCCTCTTGAAGACGAGCGGCGTCTATTAGCTCTTGAACGAGAG
AGAGAGGAGGAGACGATAAACAAAATGTGGCTCC

QA 2 635 2 635
DS 

RD RS1DA47TF 582 0 0
TCAACCAAAACTAGATAAGATCTGTCACAAAAAAAGAACGGAGATAAATTGTACTGAACA
GCAAAGAAAGAGCAGAAAACAAAACAATCAGAAACAAGAAGTACGAGCATAGCTCTTCTA
GTCTTCTTCCTCTCCCTCATTCTCAGCAATGTTGAAGTACCTCAACTCGTAGAGGTTACG
GTCCTTGTTGGCCGCAATAACTCTAGGCCAATCCCTCACATTGTGCTTCTTCAAGTACTT
CTTTGTCAAGTACTTGAGGTACCTCTTGGAGAACTGGCCATCAGAAGTGACAGTGATTTT
GTTCTTCTCACGGGTGATTGTGACAGAGTCACCGAGCGCACCAGCTTTGCCACCGACTTT
GATCCTCTCCTGAAGGAACTTCTCGAGGGAAGCAATCTCCATGATCTTGTCATCGACGGG
CTTGGAGCAGTCAATGGAGAGGGACACTCCCTTCTTCTTTCCCTTTGCAACGGCTGCACC
TCCACGACTCATTTTCTCAACCTTTTCCTCTTGAAGACGAGCGGCGTCTATTAGCTCTTG
AACGAGAGAGAGAGGAGGAGACGATAAACAAAATGTGGCTCC

QA 1 582 1 582
DS 

RD RS1AA33JQ 391 0 0
CCGCAATAACTCTAAGCCAATCCCTCACATTGTGCTTCTTCAAGTACTTCTTTGTCAAGT
ACTTGAGGTACCTCTTGGAGAACTGGCCATCAGAAGTGACAGTGATTTTGTTCTTCTCAC
GGGTGATTGTGACAGAGTCACCGAGCGCACCAGCTTTGCCACCGACTTTGATCCTCTCCT
GAAGGAACTTCTCGAGGGAAGCAATCTCCATGATCTTGTCATCGACGGGCTTGGAGCAGT
CAATGGAGAAGGACACTCCCTTCTTCTTTCCCTTTGCAACGGCTGCACCTCCACGACTCA
TTTTCTCAACCTTTTCCTCTTGAAGACGAGCGGCGTCTATTAGCTCTTGAACGAGAGAGA
GAGGAGGAGACGATAAACAAAATGTGGCTCC

QA 1 391 1 391
DS 



AS 1 4

CO CL2499Contig1 1506 4 2 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGATCGCTAAA
CCTCAGAGCAGCAAAATCCTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGTCAGGCTTAGCATG
TAACTCGTGTAACAAGGACTTCGAAGACGACTCTGACCAGAAGCTCCACTACAAGTCCGA
GTGGCACCGTTACAATCTCAAACGCAAGATCGCTGGTGTTCCTGGAGTGACAGAAGCTTT
GTTTGAAGCCAGACAAGCTGCTATCGCTCAGGCGAAGGTCAAATCAAACGAAGCACCTCT
GCTTTACAGCTGTGGAGTCTGTAATAAATCTTACAGGAGCTCCAAAGCTCACGAGCAACA
TCTCAAGTCAAAGAGCCACGTTCTCAAGGCTTCTTCTTCAAGCAACGGAGAGGAGGATAA
AGCCATCATTAAGCAGCTTCCTACTCCTCCTCCTCGCCGTGTTGAGAAGAAGGTCAATCC
TCAGCTAAAGGGTTTGATTGAGGAAGAAGAGAGTGAAGAGAGTGAGGATGAGTGGGTTGA
GGTTGATTCTGACGAGGATTTGGAGGGTGAAGAAGAAGATATGGATGAGGATGAGGAGGA
TGGGTCTGGTGAAGAAGATATGGATGAGGATGATGAGGATAACGAGTTTGAGTTGGATCC
GAGTTGTTGTTTGATGTGTGGTAAGAAGCATAAGACGATAGAGAAGTGTATGGTTCATAT
GCATAAGTTCCATGGCTTCTTCATTCCTGACATCGAGTACCTCAAGGATCCTAAAGGGTT
TCTAACCTACGTTGGTCTAAAGGTGAAGAGAGACTTCATTTGTCTGTACTGCAATGAACT
GTGCCATCCTTTCAGCAGTTTGGAAGCTGTTCGGAAGCATATGGAAGCCAAGAGTCACTG
CAAAGTGCATTACGGTGATGGTGGTGACGAAGAAGATGCAGAGCTAGAAGAGTTCTATGA
CTACAGCAGCAGTTACGCTAATGAAGGCAGCGAAAACCAGATGGTCGTAGCTGGGGAAAC
AGTGAATACAGTAGAGCTTTTTGGTGGGTTTGAGCTTGTGATTACCAAGAGAGGGGAGAA
CAAAGTAACGTCCAGGACTCTTGGGTCTCGAGAGTTCATGCGTTACTACAAGCAGAAGCC
ACCCCCATCTTTTCAGAAACACGTAGTCAACTCTCTAGCCATGAGGTACAAGAGCATGGG
TTTGGCGACGGTGCAGTCGAAGGAGGATATAGTGAGGATGAAGGTGATGAGAGAGATGAA
CAAGAGAGGAGCTAGGAGTCGTGTTAAGCTGGGAATGAAGAGCAACGTCATCAGAAACTT
GCCCAACAACGTCACCTATTAGTCTCTCTAAAACTAGTGTGCTGTTTGATTTTATAACGC
TTCTTTATGGAACCTTGTGTTGGTGACTGAAGTCTAGAACCTATATGAGAGATAAGGCTT
TGTATACGCTGGAAGCTCTTTTAAGGCCGATTTTGTCCTAGTTGGTATACTTTATTTCTA
TTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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GTGCCATCCTTTC

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DS 



AS 1 3

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TCCAGTTTTGCCGTCTCTGAGACGAGCTTTCTCCCTCTACGACCAGATCAATCTCATTGA
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TCCAGAGCTCTTAATTGTTGGTTGTGGAAGAAACATCCACCCGGTAACTCCCGAGCTCCG
TCAGTTTGTCAAGTCTATTGGGATGAAGCTAGAAACCGTCGATTCTAGAAATGCTGCATC
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CTCACCTTTCAATATATTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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TTTTACATCTTAAGAAAAAAAACCTAGCAACTCGACCTCGATCTGTATAATTGTTGATGA
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TTTGCTTCTCGAGCTTAATAACAGACGCTGTAGCAA*TATGAAACCTTGTCATTACATTT
CTCACCTT

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DS 

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GG
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TCTGAGACGAGCTTTCTCCCTCTACGACCAGATCAATCTCATTGACAATGTCCCCGAAGA
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AGGTAGCTTGCTCTGTGTTGGGAACTTGCTTATGTCATGGACCCCTCGTCAATTCTCCGA
CATCAC***TGATAGTTTGTCTATCTTCCAGACAATTCGTCCCATTCCAGAGCTCTTAAT
TGTTGGTTGTGGAAGAAACATCCACCCGGTAACTCCCGAGCTCCGTCAGTTTGTCAAGTC
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GAATGAAGAAGGAAGGGTCGTTGCTGCTGCATTGCTTCCGTATGGTGTTACATCTTAAGA
AAAAAAACCTAGCAACTCGACCTCGATCTGTATAATTGTTGATGAATGTCATGTCCAGAC
TTCATCTCTTGTGAACATAAACCGAAACCCCATCGGCTTTTTATCTTTGCTTCTCGAGCT
TAATAACAGACGCTGTAGCAAATATGAAACCTTGTCATTACATTTCTCACCTTTCAATAT
ATTTTCC

QA 3 729 3 729
DS 



AS 1 4

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GGAAAATTCATTTTATCATTTCTCACCCTCTCTTTTCTTACAAGAAGCCAAGAAGGGTAG
AGTAGAGTAGATATATGTCGCTGTTGTCTTACCTCAGCCCAACACGCCTTCTAGAAGGCT
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AAACAACCATCCACTTCTGGGGTCCACCACCTCTAGACCACGGCACCGACGAAAGACCAG
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AAGCCTTCTCTCCGTCCGCTTTCCGGCTATATTGTCCCGATCTTGTTTTCTTCGGTGACT
CTACTAGTTCCTCCACCAATCGCTCCGAGGTCTTCCAGGCGGAGTGCATGGAAAACCTAA
TGGAGAAAATAGGAATACAGAAGTTTAATGTGGTTGGAACAAGCTACGGAGGATTTGTGG
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CTTCTTCGAGGCTAGTTCGTGTGTTTCCTGATGCTCTCTGGAAC*ACGTTATTAGTAATT
TATATCAGAAGAATAGAAAGGAGAAAGTAGAACTATTGAAAGGGGTGACTCTTGGGAGGG
ACGAGAAACTAAACATCGATCCTCTTTCTCAGGAAGTCCTTATAATTTGGGGAGACAAAG
ATCAAATATTTCCGGTGAAGATGGCCTACGAACTAAAAGAGATTCTTGGAGATAAAACAA
AACTGGAAATCATTGAGAACACTTCACATGTTCCCCAGATCAAATGTGCTCAAGAGTTCA
ACAATATCGTTTTGAAATTTCTGAAGGGATCTCAATAACAATATTTATACATTTACTACA
TGATATTTGATTAAGCGCGGTTAGTAGCAAACATATAAACTATTTAGTAATTTACGTAAC
ATTGCTACTTGCTCATGTTTTCATGTAACTTTATAATATTGGTAAGATGAAATTGAAGAT
CATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1AU56TF U 23
AF RS1FP93TF U 1
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AF RS1FP93JQ C 665
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GG
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CACCACCTCTAGACCACGGCACCGACGAAAGACCAGTGATGCTTCTCCTCCACGGCTTCG
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TTAATGTGGTTGGAACAAGCTACGGAGGATTTGTGGCGTACCATATGGC

QA 3 471 3 471
DS 

RD RS1FP93TF 726 0 0
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CTTCTTCGAGGCTAGTTCGTGTGTTTCCTGATGCTCTCTGGAAC*ACGTTATTAGTA
ATTTATATC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1AU56JQ 659 0 0
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TCAAATATTTCCGGTGAAGATGGCCTACGAACTAAAAGAGATTCTTGGAGATAAAACAAA
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DS 

RD RS1FP93JQ 480 0 0
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GGAAATCATTGAGAACACTTCACATGTTCCCCAGATCAAATGTGCTCAAGAGTTCAACAA
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ATTTGATTAAGCGTGGTTAGTAGCAAACATATAAACTATTTAGTAATTTACGTAACATTG
CTACTTGCTCATGTTTTCATGTAACTTTATAATATTGGTAAGATGAAATTGAAGATCATT

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DS 



AS 1 4

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TGCCTCCGTTGTAAAAGAGGAAAGCAAATACCATGAAAGAAGAAGAAGAAAAATCAAAGC
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CTAGTGTGACCGTTTCTTTACTTGATCTTTCCACCACTACTCGGATCCGCTGCCCAACTC
TATCGTCCATTATCTCTATTAACTCTTTGATGGTCTCCACCGGCTTCCCATCAAATCTCA
CAACAACATCCCCTGGTTTGAATCCAGCTCGATCAGCCGGTGATCCTGGAATCACCGTAG
GGACAAGAATGCCTTTCTCCACATCAGGAAACATCGGGTATCGTTCTTTAAGCTGAGCAA
TGATCATTTTGTTGAGTTCTATCATTTTTAGCCCAATCCATGGACGAATCACTCTACCGC
TTTTCTTGAAATGCTCGATGATTTTAGAGACTGAATCAATCGGCACAGAAAATCCGAGCC
CATCTGCAGCTAAGACTTTCATGATGTTAACACCAACCACTTCTCCGTCCAAATTCACAA
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TCCCTCTTAAACCCAAATCACTGCTTTTGCGATCAACACAACTAACGATACCGGCGGTAA
TTGTATTCTGAAGAGAAAGAGGACAGCCCACAGCTATAACCCAGTCCCCTGGACGAAGCT
TATTGGAGAAACCAAGTTTAGCAGTTGGCAATGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 0 20 
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AF RS1D655JQ U 20
AF RS1BQ59JQ U 1
AF RS1C243JQ U 41
AF RS1D655TF C 285
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TAACTCTTTGATGGTCTCCACCGGCTTCCCATCAAATCTCACAACAACATCCCCTGGTTT
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GATTTTAGAGACTGAATCAATCGGCA

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DS 

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CTAGTGTGACCGTTTCTTTACTTGATCTTTCCACCACTACTCGGATCCGCTGCCCAACTC
TATCGTCCATTATCTCTATTAACTCTTTGATGGTCTCCACCGGCTTCCCATCAAATCTCA
CAACAACATCCCCTGGTTTGAATCCAGCTCGATCAGCCGGTGATCCTGGAATCACCGTAG
GGACAAGAATGCCTTTCTCCACATCAGGAAACGTCGGGTATCGTTCTTTAAGCTGAGCAA
TGATCATTTTGTTGAGTTCTATCATTTTTAGCCCAATCCATGGACGAATCACTCTACCGC
TTTTCTTGAAATGCTCGATGATTTTAGAGACTGAATCAATCGGCACAGAAAATCCGAGCC
CATCTGCAGCTAAGACTTTCATGATGTTAACACCAACCACTTCTCCGTCCAAATTCACAA
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ACCCTCTTAAACCCAAATCACTGCTTTTGCGATCAACACAACTAACGATACC

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DS 

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AGAAGAAGAAAAATCAAAGCAGCTTAAGTAATACATCTGTAAATCTCACATGTCTAGATT
GGCCTCCTCAGGAATGACTTCTAGTGTGACCGTTTCTTTACTTGATCTTTCCACCACTAC
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CGGCTTCCCATCAAATCTCACAACAACATCCCCTGGTTTGAATCCAGCTCGATCAGCCGG
TGATCCTGGAATCACCGTAGGGACAAGAATGCCTTTCTCCACATCAGGAAACATCGGGTA
TCGTTCTTTAAGCTGAGCAATGATCATTTTGTTGAGTTCTATCATTTTTAGCCCAATCCA
TGGACGAATCACTCTACCGCTTTTCTTGAAATGCTCGATGATTTTAGAGACTGAATCAAT
CGGCACAGAAAATCCGAGCCCATCTGCAGCTAAGACTTTCATGATGTTAACACCAACCAC
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CCAGTCCCCTGGACGAAGCTTATTGGAGA

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DS 

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CCTGGAATCACCGTAGGGACAAGAATGCCTTTCTCCACATCAGGAAACATCGGGTATCGT
TCTTTAAGCTGAGCAATGATCATTTTGTTGAGTTCTATCATTTTTAGCCCAATCCATGGA
CGAATCACTCTACCGCTTTTCTTGAAATGCTCGATGATTTTAGAGACTGAATCAATCGGC
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AGGTATTCTCTACCTGTGCCTCTTAAACCCAAATCACTGCTTTTGCGATCAACACAACTA
ACGATACCGGCGGTTATTGTATTCTGAAGAGAAAGAGGACAGCCCACAGCTATAACCCAG
TCCCCTGGACGAAGCTTATTGGAGAAACCAAGTTTAGCAGTTGGCAATGGAC

QA 1 532 1 532
DS 



AS 1 4

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GGGAAATATATTAACCGATCTATAATACCCACTACCAAAGGCTATCTACCTAAAAGAAAG
TTACTAAATAGGATCAGTCAAAGCCATGCAATGTTGATATGTTAAAGTTCCCATAAAATG
CCGCCGGTTTAAAAGATTTGTTTTCTTTTGATTTACACAAGAAGGCATGAACTTCTTGTT
TCTTCATCTCTCATCTACGAAGGCCATTATTCTCAATTCCCATCACTACTTGCAAGGGCC
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TGTTTGTATGCGCCATACATAGAAGATCATATTCGGAGAATCCGGATCAACTTATAAACT
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CTAATCGACCGTTGAAGATACTGGTCCTCCGCTAGAAGTCCTTGACCCCCATATTTCGCT
TCATCAGAGTTCAGTATCATGGTATATTCACCAGCTTCCTCTACGCCGACACCGTACTTT
TCATATGAATTCGATGGGTGGAAGTTAAAGATAAACAGGAAAGGACCCCTCGAGAATGAA
ATTACCATATTTGTATCATTAACATGGTGGATGCTGGGGAGACCTCTTGAAAGGATGCCC
TTGCTTTTATCCAAGTCCATTAGGTCCTTGTCAAAGGAAAACAACTGATGATGGATTCCA
CTTTCCAGCAGGTCCCAACGGCGGTTAGCCAGTGAAAACGAGAATTTATTGCTCTGTGTA
GGAAACTCAACCCTCTCAGGATGTCCAAATTCGTTTCCCATGAAGTTGAGGTATGCACGG
CCACCAATTGTAAACGTAAGAAGTCTAATCATCTTATGTAGTGAAACGCCCCTGTCTAGC
AACTTTATCTCCTTTTGGACTCCACCAAGCAAGATTTCGGCAAATGAACGCCCTCCTGAT
ATGGATTGGTTGTGACTTTCGGCATAGCTGAGCATCTTGTCCGTATACTCTTTGTTAGCC
ACCAATGTACTGACAATCTTGCTCACGCTCCATTCACTATCCGGTACGCTGTCAAGGAGA
GAAACCCACATTTCTGTCGCAGAAAGGTTCACATAATAATCAAATCCTAGTCCACCTTGA
GAAACTGGCTCACACAACCCAGGGTAATATGTTGCATCCTCAGCAATTGTTATTATATCT
GGATGTAGATCGTGTAGGATTTCATTGGCCATAATGAGGTACATCAGCGCATCTCGGTCA
ACATACTGATTGCAATAGTCATCAAAACCGCTATTAAAGGGAGCAAAACCATTGTGCGTG
TAGATCATCGAGGCAAGCGAGTGAAATTGGTAACCATCAACTTGATACTCTGTGATCCAC
CAGTTCAGATTTGAAATGAGAAAATGAAAAACATCCAAGTCGCCGTATTTGAACATCCGT
GTGCCCCAGTGTTTGTGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DO34JQ U 1
AF RS1DL45JQ U 13
AF RS1DO34TF C 392
AF RS1DL45TF C 766
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BS 67 67 RS1DL45JQ
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BS 111 116 RS1DO34JQ
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BS 389 389 RS1DL45JQ
BS 390 669 RS1DO34JQ
BS 670 795 RS1DL45JQ
BS 796 987 RS1DO34TF
BS 988 988 RS1DL45TF
BS 989 1133 RS1DO34TF
BS 1134 1458 RS1DL45TF

RD RS1DO34JQ 669 0 0
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TTACTACATAGGATCAGTCAAAGCCATGCAATGTTGATATGTTAAAGTTTCCATAACATG
CCGCCGGTTTAAAGGATTTGTTTTCTTTTGATTTACACAAGAAGGCATGAACTTCTTGTT
TCTTCATCTCTCATCTACGAAGGCCATTATTCTCAATTCCCATCACTACTTGCAAGGGCC
ATGTCTATATATCACCTCTGGTACTGACGTTGGGTTCAGAGCTAGCTTCAAACATGTTGA
TGTTTGTATGCGCCATACATAGAAGATCATATTCGGAGAATCCGGATCAACTTATAAACT
TGTGCAGTCCTGCTAGGTAAAGACACCTCTAAGCAATTTCTTTGACCATCAATTCTCCTG
CTAATCGACCGTTGAAGATACTGGTCCTCCGCTAGAAGTCCTTGACCCCCATATTTCGCT
TCATCAGAGTTCAGTATCATGGTATATTCACCAGCTTCCTCTACGCCGACACCGTACTTT
TCATATGAATTCGATGGGTGGAAGTTAAAGATAAACAGGAAAGGACCCCTCGAGAATGAA
ATTACCATATTTGTATCATTAACATGGTGGATGCTGGGGAGACCTCTTGAAAGGATGCCC
TTGCTTTTA

QA 1 669 1 669
DS 

RD RS1DL45JQ 783 0 0
AACCGATCTATAATACCCACTACCAAAGGCTATCTACCTAAAAGAAAGTTACTAAATAGG
ATCAGTCAAAGCCATGCAATGTTGATATGTTAAAGTTCCCATAAAATGCCGCCGGTTTAA
AAGATTTGTTTTCTTTTGATTTACACAAGAAGGCATGAACTTCTTGTTTCTTCATCTCTC
ATCTACGAAGGCCATTATTCTCAATTCCCATCACTACTTGCAAGGGCCATGTCTATATAT
CACCTCTGGTACTGACGTTGGGTTCAGAGCTAGCTTCAAACATGTTGATGTTTGTATGCG
CCATACATAGAAGATCATATTCGGAGAATCCGGGTCAACTTATAAACTTGTGCAGTCCTG
CTAGGTAAAGACACCTATAAGCAATTTCTTTGACCATCAATTCTCCTGCTAATCGACCGT
TGAAGATACTGGTCCTCCGCTAGAAGTCCTTGACCCCCATATTTCGCTTCATCAGAGTTC
AGTATCATGGTATATTCACCAGCTTCCTCTACGCCGACACCGTACTTTTCATATGAATTC
GATGGGTGGAAGTTAAAGATAAACAGGAAAGGACCCCTCGAGAATGAAATTACCATATTT
GTATCATTAACATGGTGGATGCTGGGGAGACCTCTTGAAAGGATGCCCTTGCTTTTATCC
AAGTCCATTAGGTCCTTGTCAAAGGAAAACAACTGATGATGGATTCCACTTTCCAGCAGG
TCCCAACGGCGGTTAGCCAGTGAAAACGAGAATTTATTGCTCTGTGTAGGAAACTCAACC
CTC

QA 1 783 1 783
DS 

RD RS1DO34TF 742 0 0
AGCAATTTCTTTGACCATCAATTCTC*TGCTAATCGACCGTTGAAGATACTGGTC*TCCG
CTAGAAGTCCTTGACCCCCATATTTCGCTTCATCAGAGTTCAGTATCATGGTATATTCAC
CAGCTTCCTCTACGCCGACACCGTACTTTTCATATGAATTCGATGGGTGGAAGTTAAAGA
TAAACAGGAAAGGACCCCTCGAGAATGAAATTACCATATTTGTATCATTAACATGGTGGA
TGCTGGGGAGACCTCTTGAAAGGATGCCCTTGCTTTTATCCAAGTCCATTAGGTCCTTGT
CAAAGGAAAACAACTGATGATGGATTCCACTTTCCAGCAGGTCCCAACGGCGGTTAGCTA
GTGAAAACGAGAATTTATTGCTCTGTGTAGGAAACTCAACCCTCTCAGGATGTCCAAATT
CGTTTCCCATGAAGTTGAGGTATGCACGGCCACCAATTGTAAACGTAAGAAGTCTAATCA
TCTTATGTAGTGAAACGCCCCTGTCTAGCAACTTTATCTCCTTTTGGACTCCACCAAGCA
AGATTTCGGCAAATGAACGCCCTCCTGATATGGATTGGTTGTGACTTTCGGCATAGTTGA
GCATCTTGTCCGTATACTCTTTGTTAGCCACCAATGTACTGACAATCTTGCTCACGCTCC
ATTCACTATCCGGTACGCTGTCAAGGAGAGAAACCCACATTTCTGTCGCAGAAAGGTTCA
CATAATAATCAAATCCTAGTCC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RS1DL45TF 693 0 0
TTTA
TGCTCTGTGTAGGAAACTCAACCCTCTCAGGATGTCCAAATTCGTTTCCCATGAAGTTGA
GGTATGCACGGCCACCAATTGTAAACGTAAGAAGTCTAATCATCTTATGTAGTGAAACGC
CCCTGTCTAGCAACTTTATCTCCTTTTGGACTCCACCAAGCAAGATTTCGGCAAATGAAC
GCCCTCCTGATATGGATTGGTTGTGACTTTCGGCATAGCTGAGCATCTTGTCCGTATACT
CTTTGTTAGCCACCAATGTACTGACAATCTTGCTCATGCTCCATTCACTATCCGGTACGC
TGTCAAGGAGAGAAACCCACATTTCTGTCGCAGAAAGGTTCACATAATAATCAAATCCTA
GTCCACCTTGAGAAACTGGCTCACACAACCCAGGGTAATATGTTGCATCCTCAGCAATTG
TTATTATATCTGGATGTAGATCGTGTAGGATTTCATTGGCCATAATGAGGTACATCAGCG
CATCTCGGTCAACATACTGATTGCAATAGTCATCAAAACCGCTATTAAAGGGAGCAAAAC
CATTGTGCGTGTAGATCATCGAGGCAAGCGAGTGAAATTGGTAACCATCAACTTGATACT
CTGTGATCCACCAGTTCAGATTTGAAATGAGAAAATGAAAAACATCCAAGTCGCCGTATT
TGAACATCCGTGTGCCCCAGTGTTTGTGC

QA 5 693 5 693
DS 



AS 1 2

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GGATGCAAAGATTAAAGTCCAAATCACGGAGGAGAAAGGAAGGAGAGAAAGAATGGAGTA
TCTAGGGATCGACCTGAGCTGTGCGATGGGATCTCTCCGGAACGGTGAATTCCCGGAGAG
AGATTGTCTTCTTCCTCTAATTTCCAAGCTTCTCGGTTACATCCTTGTCGCTGCTTCCAT
CACCGTCAAGCTCCCCCAGATAATGAAAATCGTGCACCATAAAAGCGTACGAGGCCTAAG
TGTTGTGGCATTTGAGCTCGAAGTGGTTGGTTATACAATTTCTCTTGCCTATTGCCTTCA
CAAAGGTCTTCCCTTTTCTGCCTTTGGTGAAATGGCTTTTCTTTTGATTCAAGCTTTAAT
CTTGGTTGCTTGTATCTATTATTACTCTCAACCTGTCCCTATGACAACTTGGGCCAGAGC
ACTCCTATATTGTGCTGTAGCACCAACTGTGCTTGCTGGGCAGATTAATCCAACGCTTTT
CGACGCTCTTTATGCTTCACAACATGCGATATTTCTGTTTGCAAGGCTCCCTCAGATATG
GAAGAACTTCAAAAACAAAAGCACTGGAGAACTCAGTTTCTTAACTTTCTTCATGAACTT
CGCTGGGTCCATTGTGAGAGTTTTCACCAGTATCCAGGAAAATGCCCCAGTTAGCATTCT
TACGGGATTTGCTCTTGGAGTCTTCACCAACGGAACCATCCTGAGTCAGATTCTCCTGTA
TCACAAGGCTGCTGCAGTAAAGGAGAAGAAAACCAATTGAAACCTAGAAAGATAATCCTA
AATCAAATACTTCTGTTGATGGCTCCAAAAACAAAAGAGATTAATCAGTGTTGCAGTTTT
TTTTTTCAATATCCCTTTTCAAGGATGACCAGACTTTGTTCACTGA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B635TF U 1
AF RS1B635JQ C 153
BS 1 727 RS1B635TF
BS 728 886 RS1B635JQ

RD RS1B635TF 739 0 0
GGATGCAAAGATTAAAGTCCAAATCACGGAGGAGAAAGGAAGGAGAGAAAGAATGGAGTA
TCTAGGGATCGACCTGAGCTGTGCGATGGGATCTCTCCGGAACGGTGAATTCCCGGAGAG
AGATTGTCTTCTTCCTCTAATTTCCAAGCTTCTCGGTTACATCCTTGTCGCTGCTTCCAT
CACCGTCAAGCTCCCCCAGATAATGAAAATCGTGCACCATAAAAGCGTACGAGGCCTAAG
TGTTGTGGCATTTGAGCTCGAAGTGGTTGGTTATACAATTTCTCTTGCCTATTGCCTTCA
CAAAGGTCTTCCCTTTTCTGCCTTTGGTGAAATGGCTTTTCTTTTGATTCAAGCTTTAAT
CTTGGTTGCTTGTATCTATTATTACTCTCAACCTGTCCCTATGACAACTTGGGCCAGAGC
ACTCCTATATTGTGCTGTAGCACCAACTGTGCTTGCTGGGCAGATTAATCCAACGCTTTT
CGACGCTCTTTATGCTTCACAACATGCGATATTTCTGTTTGCAAGGCTCCCTCAGATATG
GAAGAACTTCAAAAACAAAAGCACTGGAGAACTCAGTTTCTTAACTTTCTTCATGAACTT
CGCTGGGTCCATTGTGAGAGTTTTCACCAGTATCCAGGAAAATGCCCCAGTTAGCATTCT
TACGGGATTTGCTCTTGGAGTCTTCACCAACGGAACCATCCTGAGTCAGATTCTCCTGTA
TCACAAG
CTGCTGCAGTAA

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1B635JQ 734 0 0
TCGGTTACATCCTTGTCGCTGCTTCCATCACCGTCAAGCTCCCCCAGATAATGAAAATCG
TGCACCATAAAAGCGTACGAGGCCTAAGTGTTGTGGCATTTGAGCTCGAAGTGGTTGGTT
ATACAATTTCTCTTGCCTATTGCCTTCACAAAGGTCTTCCCTTTTCTGCCTTTGGTGAAA
TGGCTTTTCTTTTGATTCAAGCTTTAATCTTGGTTGCTTGTATCTATTATTACTCTCAAC
CTGTCCCTATGACAACTTGGGCCAGAGCACTCCTATATTGTGCTGTAGCACCAACTGTGC
TTGCTGGGCAGATTAATCCAACGCTTTTCGACGCTCTTTATGCTTCACAACATGCGATAT
TTCTGTTTGCAAGGCTCCCTCAGATATGGAAGAACTTCAAAAACAAAAGCACTGGAGAAC
TCAGTTTCTTAACTTTCTTCATGAACTTCGCTGGGTCCATTGTGAGAGTTTTCACCAGTA
TCCAGGAAAATGCCCCAGTTAGCATTCTTACGGGATTTGCTCTTGGAGTCTTCACCAACG
GAACCATCCTGAGTCAGATTCTCCTGTATCACAAGGCTGCTGCAGTAAAGGAGAAGAAAA
CCAATTGAAACCTAGAAAGATAATCCTAAATCAAATACTTCTGTTGATGGCTCCAAAAAC
AAAAGAGATTAATCAGTGTTGCAGTTTTTTTTTTCAATATCCCTTTTCAAGGATGACCAG
ACTTTGTTCACTGA

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 4

CO CL2505Contig1 796 4 11 U
GGGCAAAGCAAGCCGTTGATAGAGATCCTAACTGCCGCAACAAAGTCTCATGTGCTGACA
TTTTAGCTCTCGCTACACGTGAAGTCGTTGTTTTGACAGGAGGACCGAGCTACCCGGTTG
AGCTAGGGAGGAGAGATGGCAGATTATCTACGAAGGCAAGCGTACAACACAGTTTGCCAC
AACCTGGTTTTAACCTAAACCAGCTCAACACCATGTTCAACCGTCACGGTCTCTCTCAAA
CCGACATGATCGCCCTCTCAGGAGCGCACACTATCGGATTCGCACATTGTGGGAAATTCT
CAAAGCGAATTTACAACTTTAGCCCTAGAACCCGTATCGACCCGAGTTTGAACCGTGGCT
ACGCGTTTCAGCTTAGGCAGATGTGTCCCATTCGTGTTGACCCAAGGATAGCGATCAACA
TGGACCCAACATCGCCACGTACTTTCGACAACGCTTACTTCAAGAATCTCCAACAAGGGA
GGGGTTTGTTTACGTCTGATCAAGTCTTGTTCACGGACCAACGGTCTAGAGCTACGGTTA
ACTTGTTTGCCAATAGTGAAGGAGCTTTTAGGCAGGCTTTTATCACGGCCATCACGAAAC
TTGGTCGTGTCGGGGTTAAAACTGGTAATGCTGGTGAGATTCGAAGGGATTGTTCACGTG
TTAATTAGTGTGATTTTAGGGCTTTTGGTTTGTTTATCTTATTCCTTAAAAAATAAAATT
TCGTATTGTTTTTGTAATAAGGAGTTCAAATGTGTCAAATGGAAAATTCAATTAATAATA
AGATGGTTTTATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RS1CE71TF U 1
AF RS1CE71JQ C 103
AF RS1E466JQ C 160
AF RS1E466TF U 160
BS 1 191 RS1CE71TF
BS 192 192 RS1E466TF
BS 193 234 RS1CE71TF
BS 235 235 RS1E466TF
BS 236 712 RS1CE71TF
BS 713 715 RS1E466TF
BS 716 736 RS1CE71TF
BS 737 737 RS1E466TF
BS 738 764 RS1CE71TF
BS 765 793 RS1E466TF
BS 794 796 RS1CE71JQ

RD RS1CE71TF 764 0 0
GGGCAAAGCAAGCCGTTGATAGAGATCCTAACTGCCGCAACAAAGTCTCATGTGCTGACA
TTTTAGCTCTCGCTACACGTGAAGTCGTTGTTTTGACAGGAGGACCGAGCTACCCGGTTG
AGCTAGGGAGGAGAGATGGCAGATTATCTACGAAGGCAAGCGTACAACACAGTTTGCCAC
AACCTGGTTTTGACCTAAACCAGCTCAACACCATGTTCAACCGTCACGGTCTCTTTCAAA
CCGACATGATCGCCCTCTCAGGAGCGCACACTATCGGATTCGCACATTGTGGGAAATTCT
CAAAGCGAATTTACAACTTTAGCCCTAGAACCCGTATCGACCCGAGTTTGAACCGTGGCT
ACGCGTTTCAGCTTAGGCAGATGTGTCCCATTCGTGTTGACCCAAGGATAGCGATCAACA
TGGACCCAACATCGCCACGTACTTTCGACAACGCTTACTTCAAGAATCTCCAACAAGGGA
GGGGTTTGTTTACGTCTGATCAAGTCTTGTTCACGGACCAACGGTCTAGAGCTACGGTTA
ACTTGTTTGCCAATAGTGAAGGAGCTTTTAGGCAGGCTTTTATCACGGCCATCACGAAAC
TTGGTCGTGTCGGGGTTAAAACTGGTAATGCTGGTGAGATTCGAAGGGATTGTTCACGTG
TTAATTAGTGTGATTTTAGGGCTTTTGGTTTGTTTATCTTATTCCTTAAAAA**TAAATT
TCGTATTGTTTTTGTA*TAAGGAGTTCAAATGTGTCAAATGGAA

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1CE71JQ 694 0 0
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TACAACACAGTTTGCCACAACCTGGTTTTGACCTAAACCAGCTCAACACCATGTTCAACC
GTCACGGTCTCTTTCAAACCGACATGATCGCCCTCTCAGGAGCGCACACTATCGGATTCG
CACATTGTGGGAAATTCTCAAAGCGAATTTACAACTTTAGCCCTAGAACCCGTATCGACC
CGAGTTTGAACCGTGGCTACGCGTTTCAGCTTAGGCAGATGTGTCCCATTCGTGTTGACC
CAAGGATAGCGATCAACATGGACCCAACATCGCCACGTACTTTCGACAACGCTTACTTCA
AGAATCTCCAACAAGGGAGGGGTTTGTTTACGTCTGATCAAGTCTTGTTCACGGACCAAC
GGTCTAGAGCTACGGTTAACTTGTTTGCCAATAGTGAAGGAGCTTTTAGGCAGGCTTTTA
TCACGGCCATCACGAAACTTGGTCGTGTCGGGGTTAAAACTGGTAATGCTGGTGAGATTC
GAAGGGATTGTTCACGTGTTAATTAGTGTGATTTTAGGGCTTTTGGTTTGTTTATCTTAT
TCCTTAAAAAATAAAATTTCGTATTGTTTTTGTAATAAGGAGTTCAAATGTGTCAAATGG
AAAATTCAATTAATAATAAGATGGTTTTATTTCC

QA 1 694 1 694
DS 

RD RS1E466JQ 637 0 0
GCGTACAACACAGTTTGCCACAACCTGGTTTTAACCTAAACCAGCTCAACACCATGTTCA
ACCGTCACGGTCTCTCTCAAACCGACATGATCGCCCTCTCAGGAGCGCACACTATCGGAT
TCGCACATTGTGGGAAATTCTCAAAGCGAATTTACAACTTTAGCCCTAGAACCCGTATCG
ACCCGAGTTTGAACCGTGGCTACGCGTTTCAGCTTAGGCAGATGTGTCCCATTCGTGTTG
ACCCAAGGATAGCGATCAACATGGACCCAACATCGCCACGTACTTTCGACAACGCTTACT
TCAAGAATCTCCAACAAGGGAGGGGTTTGTTTACGTCTGATCAAGTCTTGTTCACGGACC
AACGGTCTAGAGCTACGGTTAACTTGTTTGCCAATAGTGAAGGAGCTTTTAGGCAGGCTT
TTATCACGGCCATCACGAAACTTGGTCGTGTCGGGGTTAAAACTGGTAATGCTGGTGAGA
TTCGAAGGGATTGTTCACGTGTTAATTAGTGTGATTTTAGGGCTTTTGGTTTGTTTATCT
TATTCCTTAAAAAATAAAATTTCGTATTGTTTTTGTAATAAGGAGTTCAAATGTGTCAAA
TGGAAAATTCAATTAATAATAAGATGGTTTTATT
TCG

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1E466TF 634 0 0
GCGTACAACACAGTTTGCCACAACCTGGTTTTAACCTAAACCAGCTCAACACCATGTTCA
ACCGTCACGGTCTCTCTCAAACCGACATGATCGCCCTCTCAGGAGCGCACACTATCGGAT
TCGCACATTGTGGGAAATTCTCAAAGCGAATTTACAACTTTAGCCCTAGAACCCGTATCG
ACCCGAGTTTGAACCGTGGCTACGCGTTTCAGCTTAGGCAGATGTGTCCCATTCGTGTTG
ACCCAAGGATAGCGATCAACATGGACCCAACATCGCCACGTACTTTCGACAACGCTTACT
TCAAGAATCTCCAACAAGGGAGGGGTTTGTTTACGTCTGATCAAGTCTTGTTCACGGACC
AACGGTCTAGAGCTACGGTTAACTTGTTTGCCAATAGTGAAGGAGCTTTTAGGCAGGCTT
TTATCACGGCCATCACGAAACTTGGTCGTGTCGGGGTTAAAACTGGTAATGCTGGTGAGA
TTCGAAGGGATTGTTCACGTGTTAATTAGTGTGATTTTAGGGCTTTTGGTTTGTTTATCT
TATTCCTTAAAAAATAAAATTTCGTATTGTTTTTGTAATAAGGAGTTCAAATGTGTCAAA
TGGAAAATTCAATTAATAATAAGATGGTTTTATT

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 4

CO CL2506Contig1 707 4 3 U
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AGCTACTTGTGTTGTGCATATACTTAAAAGTGTTTTTTTAGCTGTATAAATATGAAGAAG
CAGATTGTGGATGAGTCTGAGAATTTTTGTTTCAAGAAGCCACTGATGTCGCCTCCTTCT
CCTCCACCGCTTCCTCCATCTCCAGGATATGGATCAAGAAAGATCGATGGAGACAGCATA
ACCAATATACAGATCAAGAAGTTCTGGAGGCAGAAGCAGATCATTGAAGAGGAGCATCTT
TTTGCTGCTATTAAGGCCGCAGCTCGTGTCAGAGCCCGTAATCTCTCTGATGAGGACTAC
AAACGCTTTGAAGAAAACTTGGACATGGAGGACCCGGAAATCGAAGTTCATGAGGGAATA
AAAGACTGGTGGATGAAGAGCAAGTACGCATACTTGAACCAGCCTGCTCTTGGATCTTCT
GATTCACTGAAGAGAAAAAGGTTTTCGTCTTATGTACCAAACTATTTCTCATTCAAGCCT
TGCATTCCACTCTATGCAACGTCGCTCAATGTCTTTTAGATATGAGCAAAATCTCTTTCA
AGATCAATTGCTTGTGTATATGTCTACATATATGTGCGTGTTTGTGTCTATGTACATTCA
TTTGTTACTGTTTCCTTGTTAATGGATATGGACTTTGTTGTGTGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GJ69TF U 1
AF RS1D260JQ C 36
AF RS1D260TF U 36
AF RS1GJ69JQ C 93
BS 1 581 RS1GJ69TF
BS 582 670 RS1D260TF
BS 671 707 RS1GJ69JQ

RD RS1GJ69TF 581 0 0
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AGCTACTTGTGTTGTGCATATACTTAAAAGTGTTTTTTTAGCTGTATAAATATGAAGAAG
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CCTCCACCGCTTCCTCCATCTCCAGGATATGGATCAAGAAAGATCGATGGAGACAGCATA
ACCAATATACAGATCAAGAAGTTCTGGAGGCAGAAGCAGATCATTGAAGAGGAGCATCTT
TTTGCTGCTATTAAGGCCGCAGCTCGTGTCAGAGCCCGTAATCTCTCTGATGAGGACTAC
AAACGCTTTGAAGAAAACTTGGACATGGAGGACCCGGAAATCGAAGTTCATGAGGGAATA
AAAGACTGGTGGATGAAGAGCAAGTACGCATACTTGAACCAGCCTGCTCTTGGATCTTCT
GATTCACTGAAGAGAAAAAGGTTTTCGTCTTATGTACCAAACTATTTCTCATTCAAGCCT
TGCATTCCACTCTATGCAACGTCGCTCAATGTCTTTTAGAT

QA 1 581 1 581
DS 

RD RS1D260JQ 635 0 0
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TTT*AGCTGTATAAATATGAAGAAGCAGATTGTGGATGAGTCTGAGAATTTTTGTTTCAA
GAAGCCACTGATGTCGCCTCCTTCTCCTCCACCGCTTCCTCCATCTCCAGGATATGGATC
AAGAAAGATCGATGGAGACAGCATAACCAATATACAGATCAAGAAGTTCTGGAGGCAGAA
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CCGTAATCTCTCTGATGAGGACTACAAACGCTTTGAAGAAAGCTTGGACATGGAGGACCC
GGAAATCGAAGTTCATGAGGGAATAAAAGACTGGTGGATGAAGAGCAAGTACGCATACTT
GAACCAGCCTGCTCTTGGATCTTCTGATTCACTGAAGAGAAAAAGGTTTTCGTCTTATGT
ACCAAACTATTTCTCATTCAAGCCTTGCATTCCACTCTATGCAACGTCGCTCAATGTCTT
TTAGATATGAGCAAAATCTCTTTCAAGATCAATTGCTTGTGTATATGTCTACATATATGT
GCGTGTTTGTGTCTATGTACATTCATTTGTTACTG

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1D260TF 635 0 0
TTTTTTCTCCTCTTTGTGATCTTTGAGCTACTTGTGTTGTGCATATACTTAAAAGTGTTT
TTT*AGCTGTATAAATATGAAGAAGCAGATTGTGGATGAGTCTGAGAATTTTTGTTTCAA
GAAGCCACTGATGTCGCCTCCTTCTCCTCCACCGCTTCCTCCATCTCCAGGATATGGATC
AAGAAAGATCGATGGAGACAGCATAACCAATATACAGATCAAGAAGTTCTGGAGGCAGAA
GCAGATCATTGAAGAGGAGCATCTTTTTGCTGCTATTAAGGCCGCAGCTCGTGTCAGAGC
CCGTAATCTCTCTGATGAGGACTACAAACGCTTTGAAGAAAGCTTGGACATGGAGGACCC
GGAAATCGAAGTTCATGAGGGAATAAAAGACTGGTGGATGAAGAGCAAGTACGCATACTT
GAACCAGCCTGCTCTTGGATCTTCTGATTCACTGAAGAGAAAAAGGTTTTCGTCTTATGT
ACCAAACTATTTCTCATTCAAGCCTTGCATTCCACTCTATGCAACGTCGCTCAATGTCTT
TTAGATATGAGCAAAATCTCTTTCAAGATCAATTGCTTGTGTATATGTCTACATATATGT
GCGTGTTTGTGTCTATGTACATTCATTTGTTACTG

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1GJ69JQ 615 0 0
T
TTTTTTAGCTGTATAAATATGAAGAAGCAGATTGTGGATGAGTCTGAGAATTTTTGTTTC
AAGAAGCCACTGATGTCGCCTCCTTCTCCTCCACCGCTTCCTCCATCTCCAGGATATGGA
TCAAGAAAGATCGATGGAGACAGCATAACCAATATACAGATCAAGAAGTTCTGGAGGCAG
AAGCAGATCATTGAAGAGGAGCATCTTTTTGCTGCTATTAAGGCCGCAGCTCGTGTCAGA
GCCCGTAATCTCTCTGATGAGGACTACAAACGCTTTGAAGAAAACTTGGACATGGAGGAC
CCGGAAATCGAAGTTCATGAGGGAATAAAAGACTGGTGGATGAAGAGCAAGTACGCATAC
TTGAACCAGCCTGCTCTTGGATCTTCTGATTCACTGAAGAGAAAAAGGTTTTCGTCTTAT
GTACCAAACTATTTTTCATTCAAGCCTTGCATTCCACTCTATGCAACGTCGCTCAATGTC
TTTTAGATATGAGCAAAATCTCTTTCAAGATCAATTGCTTGTGTATATGTCTACATATAT
GTGCGTGTTTGTGTCTATGTACATTCATTTGTTACTGTTTCCTTGTTAATGGATATGGAC
TTTGTTGTGTGGTC

QA 2 615 2 615
DS 



AS 1 4

CO CL2507Contig1 1143 4 7 U
GGGAAGCGTCGTCGTTTGGGGGATTCGAACAAGAAAGGCATACAAAGGTGGTCGTCTCTC
TCTTGTTCCTTCAGCTGTCGTCTGCGTGCGTCCACCACCATGTTTACTCAATCTTCAGCT
GAGCTTGTGCGACCTAACCTCAGGTTTATGGTTCCGCCCTCTCAGAAACCGTCGATTGTT
CCCCCTTCACTTCCCCGATTTTTGCGGATGGAGTCTCAATCTCAATCTCAGCCTCGCCAA
TCTATCTCCTGCGCTTCTTCACCAATCAATAATAACCTTTCCCAGGCAACTCTTTCTTCT
TCCTCCTTAATCGAATCAGCTCGAATAGGAGAAGTGAAGAGAGTGACAAAGGAGACGAAT
GTATCAGTGAAGATAAACTTGGATGGCACTGGAATTGCAGATAGCTCCACTGGAATCCCT
TTCCTTGACCATATGTTAGATCAACTTGCTTCACATGGCTTGTTTGATGTGCACGTTAGA
GCTACTGGCGATGTTCACATCGATGATCATCACACTAATGAAGATATAGCTCTTGCCATT
GGAACTGCTTTGTTAAAGGCACTTGGTGAGCGTAAAGGGATTAATCGGTTTGGTGACTTC
ACTGCTCCTCTAGATGAAGCGCTCATACATGTTTCCCTGGACTTGTCTGGTAGACCATAT
CTTGGTTACAATTTGGAGATTCCAACTCGGAGAGTTGGAAACTATGACACTCAGTTGGTG
GAGCACTTTTTCCAGTCTTTGGTGAATACTTCCGGTATGACACTTCACATCCGTCAGCTT
GCTTGCGAAAACTCTCATCACATAATAGAGGCCACCTTTAAAGCCTTTGCCAGGGCTTTA
AGACAAGCAACGGAGAATGATCCTCGCCGTGGTGGGACCATACCAAGTTCAAAAGGAGTC
TTGTCAAGGTCCTGAGAGCTAAGTAATCAGAAGAAAAGCTCCCAGATTCACTCTTTATCA
TCGAGTTCATCATCAGTTAGAAAGTGAATGAGGTGAAGATCACACACTTTAGAAGATGAT
GCCTTCATCTTTATAATTAATCTGTTGATCAAAGAGTGTTTTGTTTCTCTGCATTTTGGA
AAAATGTCTTACCATTGCTGTATCAAACTCAAACTGCAACTTCAAAGGACTGAACAATTT
GCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1GY10TF U 1
AF RS1C148TF U 72
AF RS1GY10JQ C 787
AF RS1C148JQ C 530
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BS 580 803 RS1C148TF
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BS 1068 1143 RS1C148JQ

RD RS1GY10TF 579 0 0
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TCTTGTTCCTTCAGCTGTCGTCTGCGTGCGTCCACCACCATGTTTACTCAATCTTCAGCT
GAGCTTGTGCGACCTAACCTCAGGTTTATGGTTCCGCCCTCTCAGAAACCGTCGATTGTT
CCCCCTTCACTTCCCCGATTTTTGCGGATGGAGTCTCAATCTCAATCTCAGCCTCGCCAA
TCTATCTCCTGCGCTTCTTCACCAATCAATAATAACCTTTCCCAGGCAACTCTTTCTTCT
TCCTCCTTAATCGAATCAGCTCGAATAGGAGAAGTGAAGAGAGTGACAAAGGAGACGAAT
GTATCAGTGAAGATAAACTTGGATGGCACTGGAATTGCAGATAGCTCCACTGGAATCCCT
TTCCTTGACCATATGTTAGATCAACTTGCTTCACATGGCTTGTTTGATGTGCACGTTAGA
GCTACTGGCGATGTTCACATCGATGATCATCACACTAATGAAGATATAGCTCTTGCCATT
GGAACTGCTTTGTTAAAGGCACTTGGTGAGCGTAAAGGG

QA 1 579 1 579
DS 

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GG
GCTGTCGTCTGCGTGCGTCCACCACCATGTTTACTCAATCTTCAGCTGAGCTTGTGCGAC
CTAACCTCAGGTTTATGGTTCCGCCCTCTCAGAAATCGTCGATTGTTCCCCCTTCACTTC
CCCGATTTTTGCGGATGGAGTCTCAATCTCAATCTCAGCCTCGCCAATCTATCTCCTGCG
CTTCTTCACCAATCAATAATAACCTTTCCCAGGCAACTCTTTCTTCTTCCTCCTTAATCG
AATCAGCTCGAATAGGAGAAGTGAAGAGAGTGACAAAGGAGACGAATGTATCAGTGAAGA
TAAACTTGGATGGCACTGGAATTGCAGATAGCTCCACTGGAATCCCTTTCCTTGACCATA
TGTTAGATCAACTTGCTTCACATGGCTTGTTTGATGTGCACGTTAGAGCTACTGGCGATG
TTCACATCGATGATCATCACACTAATGAAGATATAGCTCTTGCCATTGGAACTGCTTTGT
TAAAGGCACTTGGTGAGCGTAAAGGGATTAATCGGTTTGGTGACTTCACTGCTCCTCTAG
ATGAAGCGCTCATACATGTTTCCCTGGACTTGTCTGGTAGACCATATCTTGGTTACAATT
TGGAGATTCCAACTCGGAGAGTTGGAAACTATGACACTCAGTTGGTGGAGCACTTTTTCC
AGTCTTTGGTGAATACTTCCGGTATGACACTTCACATCCGTCAGCTTGCTTGCGAAAACT
CTCATCACAT

QA 3 732 3 732
DS 

RD RS1GY10JQ 298 0 0
GAAAACTCTCATCACATAATAGAGGCCACCTTTAAAGCCTTTGCCAGGGCTTTAAGACAA
GCAACGGAGAATGATCCTCGCCGTGGTGGGACCATACCAAGTTCAAAAGGAGTCTTGTCA
AGGTCCTGAGAGCTAAGTAATCAGAAGAAAAGCTCCCAGATTCACTCTTTATCATCGAGT
TCATCATCAGTTAGAAAGTGAATGAGGTGAAGATCACACACTTTAGAAGATGATGCCTTC
ATCTTTATAATTAATCTGTTGATCAAAGAGTGTTTTGTTTCTCTGCATTTTGGAAAAA

QA 1 298 1 298
DS 

RD RS1C148JQ 614 0 0
CTCTTGCCATTGGAACTGCTTTGTTAAAGGCACTTGGTGAGCGTAAAGGGATTAATCGGT
TTGGTGACTTCACTGCTCCTCTAGATGAAGCGCTCATACATGTTTCCCTGGACTTGTCTG
GTAGACCATATCTTGGTTACAATTTGGAGATTCCAACTCGGAGAGTTGGAAACTATGACA
CTCAGTTGGTGGAGCACTTTTTCCAGTCTTTGGTGAATACTTCCGGTATGACACTTCACA
TCCGTCAGCTTGCTTGCGAAAACTCTCATCACATAATAGAGGCCACCTTTAAAGCCTTTG
CCAGGGCTTTAAGACAAGCAACGGAGAATGATCCTCGCCGTGGTGGGACCATACCAAGTT
CAAAAGGAGTCTTGTCAAGGTCCTGAGAGCTAAGTAATCA*AAGAAAAGCTCCCAGATTC
ACTCTTTATCATCGAGTTCATCATCAGTTAGAAAGTGAATGAGGTGAAGATCACACACTT
TAGAAGATGATGCCTTCATCTTTATAATTAATCTGTTGATCAAAGAGTGTTTTGTTTTTC
TGCATTTTGGAAAAATGTCTTACCATTGCTGTATCAAACTCAAACTGCAACTTCAAAGGA
CTGAACAATTTGCT

QA 1 614 1 614
DS 



AS 2 4

CO CL2508Contig1 661 2 2 U
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CCCACTTTTCCCGGAAAATAAAAAGAAAAAAAAAAGCTCGAGAAAATGCATGATTTCTGC
TTTACAATCCCGTACGGGCTACTCCTAATCGGCGGTGGGTTCATCGGGTACATGAAGAAA
GGAAGCATCACATCATTCGCCGGAGGTGCAGGCACTGGTCTATTACTCATCCTCGCTGGA
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AAGATCGCTACTGGTGGCAATAAAATCCCATTAAAAGCTGCAGAGTGATGATGCAACTCT
GTTGGATGAAGACGATACTCTCCTTTGTTTGAATTTGTCGATTAGAAATCTCTTGTGTGT
CTCTGAGATTAGTTTGTATGGTTAAAGAACTTTCATATGGTCTTGTGTTGTGTGTTTCAG
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T


BQ
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10 

AF RS1AD11TF U 1
AF RS1AD11JQ C 1
BS 1 641 RS1AD11TF
BS 642 661 RS1AD11JQ

RD RS1AD11TF 641 0 0
GGACAAGTCAGATCATCAAATTCGGCACCACGATCCATCGCTTTCTTCTTCATTCATCCT
CCCACTTTTCCCGGAAAATAAAAAGAAAAAAAAAAGCTCGAGAAAATGCATGATTTCTGC
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GGAAGCATCACATCATTCGCCGGAGGTGCAGGCACTGGTCTATTACTCATCCTCGCTGGA
TATCTCAGTCTCAATGCTTTCCATAAGAAGAAGACTTCCTCCATCGCTGTTGTTCTTCAG
ACAGTCATTGCAGCTGCTCTGACACTAGTCATGGGACAGCGTTACTTGCTCACTCAGAAG
ATTATGCCTGCTGGTTTAGTTACTGTGATCAGTGCTCTCATGACCTGTTTTTACGTATAC
AAGATCGCTACTGGTGGCAATAAAATCCCATTAAAAGCTGCAGAGTGATGATGCAACTCT
GTTGGATGAAGACGATACTCTCCTTTGTTTGAATTTGTCGATTAGAAATCTCTTGTGTGT
CTCTGAGATTAGTTTGTATGGTTAAAGAACTTTCATATGGTCTTGTGTTGTGTGTTTCAG
AGATTAGTTTCATTTGGTCTTGTGTGTCTCTGACTCTGAGA

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1AD11JQ 661 0 0
GGACAAGTCAGATCATCAAATTCGGCACCACGATCCATCGCTTTCTTCTTCATTCATCCT
CCCACTTTTCCCGGAAAATAAAAAGAAAAAAAAAAGCTCGAGAAAATGCATGATTTCTGC
TTTACAATCCCGTACGGGCTACTCCTAATCGGCGGTGGGTTCATCGGGTACATGAAGAAA
GGAAGCATCACATCATTCGCCGGAGGTGCAGGCACTGGTCTATTACTCATCCTCGCTGGA
TATCTCAGTCTCAATGCTTTCCATAAGAAGAAGACTTCCTCCATCGCTGTTGTTCTTCAG
ACAGTCATTGCAGCTGCTCTGACACTAGTCATGGGACAGCGTTACTTGCTCACTCAGAAG
ATTATGCCTGCTGGTTTAGTTACTGTGATCAGTGCTCTCATGACCTGTTTTTACGTATAC
AAGATCGCTACTGGTGGCAATAAAATCCCATTAAAAGCTGCAGAGTGATGATGCAACTCT
GTTGGATGAAGACGATACTCTCCTTTGTTTGAATTTGTCGATTAGAAATCTCTTGTGTGT
CTCTGAGATTAGTTTGTATGGTTAAAGAACTTTCATATGGTCTTGTGTTGTGTGTTTCAG
AGATTAGTTTCATTTGGTCTTGTGTGTCTCTGACTCTGAGAATAGAAATCATGTTTCTGC
T

QA 1 661 1 661
DS 



CO CL2508Contig2 634 2 2 U
GGAAATCAAGTCGTCTCTTTCACAGATCAGATCATCAAATTCGGCACCACGATCCATAAA
CATTTCTTTCGTTCATTCCCCACTTTTCTCGGAAAATAAAAAGAATAAAAAAGCTCGAGA
AAATGCATGATTTCTGCTTCACAATCCCGTACGGGCTACTCCTGATCGGCGGTGGGTTCA
TCGGGTACATGAAGAAAGGAAGCATCACATCATTCGCCGGAGGTGCAGGCACTGGCCTAT
TACTCATCCTCGCTGGATATCTCAGTCTCAATGCTTTCCATAAGAAGAAGACTTCCTCTA
TCGCTGTTGTTCTTCAGACAGTCATTGCAGCTGCTCTGACACTAGTCATGGGACAGCGTT
ACTTGCTCACTCAGAAGATTATGCCTGCTGGTTTAGTTACTGTGATCAGTGCTCTCATGA
CCTGTTTTTACGTATACAAGATAGCTACGGGTGGCAATAAAATCCCATTAAAAGCTGCAG
CGTGATGATGGTTATGCAACTCTGTTGGATGCAGACGATACTCTCCTTTGTTTGAATTTG
TCGATTAGAAATCTCTTGTGTGTCTCTGAGATTAGTTTGTATGGTTAAACAACTTTCATA
TGGTCTTGTGTTGTGTGTTTCTGAGATTAGTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1DM85JQ C 1
AF RS1DM85TF U 1
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BS 633 634 RS1DM85JQ

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TGGTCTTGTGTTGTGTGTTTCTGAGATTAGTTCC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1DM85TF 634 0 0
GGAAATCAAGTCGTCTCTTTCACAGATCAGATCATCAAATTCGGCACCACGATCCATAAA
CATTTCTTTCGTTCATTCCCCACTTTTCTCGGAAAATAAAAAGAATAAAAAAGCTCGAGA
AAATGCATGATTTCTGCTTCACAATCCCGTACGGGCTACTCCTGATCGGCGGTGGGTTCA
TCGGGTACATGAAGAAAGGAAGCATCACATCATTCGCCGGAGGTGCAGGCACTGGCCTAT
TACTCATCCTCGCTGGATATCTCAGTCTCAATGCTTTCCATAAGAAGAAGACTTCCTCTA
TCGCTGTTGTTCTTCAGACAGTCATTGCAGCTGCTCTGACACTAGTCATGGGACAGCGTT
ACTTGCTCACTCAGAAGATTATGCCTGCTGGTTTAGTTACTGTGATCAGTGCTCTCATGA
CCTGTTTTTACGTATACAAGATAGCTACGGGTGGCAATAAAATCCCATTAAAAGCTGCAG
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TGGTCTTGTGTTGTGTGTTTCTGAGATTAGTT
CC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 3

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ACGAGGCCCAAAAAAAGATACAACATAAATAATATGAAATTAAGCCCAGTTTTAGGTCGG
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CTCTGCCGCATGGTTGGATCCTCGAAGCCCAAGTTCCATACTTCACTCTCCTGCGCGCCT
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ATAACTTTAATGACAAAGATTGACTTCATCTGGAAATAGAAATTGAGCATAACCAAAAGA
ACAGAAGATGATCAAAAGAGACAGCCGGTATTGTAGTTTAAGAGGAGAGTCAAAGGAAAA
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TTACAAAACAAAATCTCTCTCTTTCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G735JQ U 1
AF RS1CE38JQ U 1
AF RS1G735TF C 295
BS 1 54 RS1CE38JQ
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QA 1 477 1 477
DS 

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CACGTGTCTCTCATGCAATTACAACTTTTCTGGTCACCGTGGGAGCTTCTCCGCCGTATG
CTCTGCCGCATGGTTGGATCCTCGAAGCCCAAGTTCCATACTTCACTCTCCTGCGCGCCT
CTATCTTCAATCTCTTCCTTGGATGTGATGATCTCCAAATAGTTTCAGAAGATTTGAGAA
CAGTCGTTGTCAAAACACTTGAAACACAATCAAGCTTTGACTCTTCTTGAACTGATTCAA
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CAGATTCGATTTGAGTTTGAAAGCAACACAAAATCGCCAAAGCGAAAGAGTAAAATCGCC
AAACGAAGCTAGAGGATCGCCA

QA 1 742 1 742
DS 

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CCCAGAATAACTTTAATGGCAAAGATTGACTTCATCTGGAAATAGAAATTGAGCATAACC
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GAAGAACAGATTCGATTTGAGTTTGAAAGCAACACAAAATCGCCAAAGCGAAAGAGTAAA
ATCGCCAAGCGAAGCTAGAGGATCGCCAAAGCGAAACAAAAAAATCGATCCATCGGATCG
AATATATTACAAAACAAAATCTCTCTCTTTCC

QA 1 512 1 512
DS 



AS 1 4

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CGCTGCTGCTTCTCTTTCCGTCATGGCTTCCACTTCCGATTTCCCTTCCGTCACCGCCTT
CTGCTACCTAGTTGCAGCCACTGGACTGCAGAGCTTGTGGAGTCTTTCACTAGCCGCCGT
TGATGTCTATGCCATTATGGTCAAACGTTCACTACAGAATCGACGGCTTGTGAGCGTGTT
TGCAATTGGTGATGGGGTGACGTCGACCCTGACTTTTGCAGCGGCTTGTGCATCGGCAGG
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TGAAACATCAACAGCATTAGCCTTCATAAGCTGGTTTGCTGCTTTGCCTTCTTTTCTCTT
CAACTTCTGGTCTCTCGCATCCCGTTGATTAAAAAAAAAAAGACAGATACAAGATGATGT
TGCTGCTCCACGAGCATGCGTTTCCACGGTGTGTTAAATGTGTGTGGGGGTTTTTTCACG
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AGGAAAGTTCAGTTCTTGTAGC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F538TF U 1
AF RS1DV60TF U 2
AF RS1DV60JQ C 34
AF RS1F538JQ C 176
BS 1 108 RS1F538TF
BS 109 509 RS1DV60TF
BS 510 690 RS1DV60JQ
BS 691 922 RS1F538JQ

RD RS1F538TF 108 0 0
TCCCCTTTTCAACGAAAACCATCTTCTTCCTCTTTAGCTTAATAGGGTTTCCTCATTCCC
AGGCTCCATCCATGGCTTCCTGCGATTTCTCTCCCTCTGCTTGATTCT

QA 1 108 1 108
DS 

RD RS1DV60TF 508 0 0
GG
CCTTTTCAACGAAAACCATCTTCTTCCTCTTTAGCTTAATAGGGTTTCCTCATTCCCAGG
CTCCATCCATGGCTTCCTGCGATTTCTCTCCCTCTGCTTGATTCTCTCTCTCTCAGAAGA
AGAAGAGATGAATGTGAGTCATGCATCGGTGCATCCGGTGGAAGATCCTCCTCCAGCTAC
AGCAGCCACACAACAACAAGTAGAGAATAATCATCCGCCACGTGTTAGGATGGATGATAT
AGAAGGCATGCCTGGCACTTTACTCGGCGTCGCTCTTCGTTTCTTCCAGTTCTTCCTCGC
TGCTGCTTCTCTTTCCGTCATGGCTTCCACTTCCGATTTCCCTTCCGTCACCGCCTTCTG
CTACCTAGTTGCAGCCACTGGACTGCAGAGCTTGTGGAGTCTTTCACTAGCCGCCGTTGA
TGTCTATGCCATTATGGTCAAACGTTCACTACAGAATCGACGGCTTGTGAGCGTGTTTGC
AATTGGTGATGGGGTGACGTCGACCC

QA 3 508 3 508
DS 

RD RS1DV60JQ 657 0 0
TTAGCTTAATAGGGTTTCCTCATTCCCAGGCTCCATCCATGGCTTCCTGCGATTTCTCTC
CCTCTGCTTGATTCTCTCTCTCTCAGAAGAAGAAGAGATGAATGTGAGTCATGCATCGGT
GCATCCGGTGGAAGATCCTCCTCCAGCTACAGCAGCCACACAACAACAAGTAGAGAATAA
TCATCCGCCACGTGTTAGGATGGATGATATAGAAGGCATGCCTGGCACTTTACTCGGCGT
CGCTCTTCGTTTCTTCCAGTTCTTCCTCGCTGCTGCTTCTCTTTCCGTCATGGCTTCCAC
TTCCGATTTCCCTTCCGTCACCGCCTTTTGCTACCTAGTTGCAGCCACTGGACTGCAGAG
CTTGTGGAGTCTTTCACTAGCCGCCGTTGATGTCTATGCCATTATGGTCAAACGTTCACT
ACAGAATCGACGGCTTGTGAGCGTGTTTGCAATTGGTGATGGGGTGACGTCGACCCTGAC
TTTTGCAGCGGCTTGTGCATCGGCAGGCATAACGGTGCTGATAGACAATGATCTGAATAG
CTGCTCACAAAACCACTGTGTTCAGTTTGAAACATCAACAGCATTAGCCTTCATAAGCTG
GTTTGCTGCTTTGCCTTCTTTTCTCTTCAACTTCTGGTCTCTCGCATCCCGTTGATT

QA 1 657 1 657
DS 

RD RS1F538JQ 747 0 0
CCAGCTACAGCAGTCACACAACAACAAGTAGAGAATAATCATCCGCCACGTGTTAGGATG
GATGATATAGAAGGCATGCCTGGCACTTTACTCGGCGTCGCTCTTCGTTTCTTCCAGTTC
TTCTTCGCTGCTGCTTCTCTTTCCGTCATGGCTTCCACTTCCGATTTCCCTTCCGTCACC
GCCTTCTGCTACCTAGTTGCAGCCACTGGACTACAGAGCTTGTGGAGTCTTTCACTAGCC
GCCGTTGATGTCTATGCCATTATGGTCAAACGTTCACTACAGAATCGACGGCTTGTGAGC
GTGTTTGCAATTGGTGATGGGGTGACGTCGACCCTGACTTTTGCAGCGGCTTGTGCATCG
GCAGGCATAACGGTGCTGATAGACAATGATCTGAATAGCTGCTCACAAAACCACTGTGTT
CAGTTTGAAACATCAACAGCATTAGCCTTCATAAGCTGGTTTGCTGCTTTGCCTTCTTTT
CTCTTCAACTTCTGGTCTCTCGCATCCCGTTGATTAAAAAAAAAAAGACAGATACAAGAT
GATGTTGCTGCTCCACGAGCATGCGTTTCCACGGTGTGTTAAATGTGTGTGGGGGTTTTT
TCACGGTGTATAGTGACTGCTTTTTCTTCTTATTCGGGTTTGGATCCAACATTCTTCTAA
ACCCATTACCAGGAAATTGGGAATTGTTGTTCGTTTTGTTAAACACTTTGGTATCTATGA
TTGAAAGGAAAGTTCAGTTCTTGTAGC

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

CO CL2511Contig1 841 2 14 U
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CCACATCCCCGGAGGCTACAATGGGTATCGATTTGATCGCTGGAGGTAAGAGCAAGAAGA
CCAAAAGGACAGCTCCTAAGTCTGACGATGTCTACCTCAAGCTCACTGTCAAGCTTTACC
GGTTTCTGGTGAGGAGAACCCAGAGCAAGTTCAATGCAGTGATCTTGAAGAGGCTTTTCA
TGAGCAAAGTCAACAAAGCTCCTCTTTCTCTATCTAGACTCGTCGAGTTCATGGCTGGCA
AGGAAGATAAGATTGCTGTCTTGGTTGGAACCATCACCGATGATTTGAGAGTACACGAGA
TCCCAGCTATCAAAGTCACAGCCTTGAGGTTCACAGAGAGAGCCAGAGCTCGCATTGAGA
AAGCTGGTGGTGAATGCTTAACATTTGACCAGCTTGCTCTCAGAGCTCCTCTGGGACAGA
ACACGGTTCTTCTTAGAGGACCTAAGAACTCACGTGAGGCTGTGAAGCATTTTGGTCCCG
CACCTGGTGTGCCACACAGTCACTCGAAGCCATATGTTCGGTCCAAGGGAAGGAAGTTCG
AGAAGGCCAGAGGAAAGAGGAAGAGCCGTGGTTTCAAGGTTTAAGAACATTGTCTGTGTC
GTTGAACTTGATCCTATTGTGTTGTTGCTTCTTCGTCTCTTTCATAATCGGATTTTTGTT
AGACAATTGTGTTTTTTTCAGACAATATCTAAAGTTTGTGACTACTGTTGAGCTTATTCC
AACACTGAGCTTTACTATGTTTATCAAACTTCACATTCTTTCTTCAAAAGTTCTTAACGG
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1D135TF U 1
AF RS1AT87JQ C 50
BS 1 195 RS1D135TF
BS 196 196 RS1AT87JQ
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BS 632 841 RS1AT87JQ

RD RS1D135TF 633 0 0
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CCACATCCCCGGAGGCTACAATGGGTATCGATTTGATCGCTGGAGGTAAGAGCAAGAAGA
CCAAAAGGACAGCTCCTAAGTCTGACGATGTCTACCTCAAGCTCACTGTCAAGCTTTACC
GGTTTCTGGTGAGGATAACCCAGAGCAAGTTCAATGCAGTGATCTTGAAGAGGCTTTTCA
TGAGCAAAGTCAACAAAGCTCCTCTTTCTCTATCTAGACTCGTCGAGTTCATGGCTGGCA
AGGAAGATAAGATTGCTGTCTTGGTTGGAACCATCACTGATGATTTGAGAGTACACGAGA
TTCCAGCTATCAAAGTCACTGCCTTGAGGTTCACGGAGAGAGCCAGAGCTCGCATTGAGA
AAGCTGGTGGTGAATGCTTAACATTTGACCAGCTTGCTCTCAGAGCTCCTCTGGGACAGA
ACACGGTTCTTCTTAGAGGACCTAAGAACTCACGTGAGGCTGTGAAGCATTTTGGTCCCG
CACCTGGTGTGTCACACAGTCACTCGAAGCCATATGTTCGGTCCAAGGGAAGGAAGTTCG
AGAAGGCCAGAGGAAAGAGGAAGAGCCGTGG
AT

QA 1 631 1 631
DS 

RD RS1AT87JQ 792 0 0
CA
GCGGCGGCACCACATCCCCGGAGGCTACAATGGGTATCGATTTGATCGCTGGAGGTAAGA
GCAAGAAGACCAAAAGGACAGCTCCTAAGTCTGACGATGTCTACCTCAAGCTCACTGTCA
AGCTTTACCGGTTTCTGGTGAGGAGAACTCAGAGCAAGTTCAATGCAGTGATCTTGAAGA
GGCTTTTCATGAGCAAAGTCAACAAAGCTCCTCTTTCTCTATCTAGACTCGTCGAGTTCA
TGGCTGGCAAGGAAGATAAGATTGCTGTCTTGGTTGGAACCATCACCGATGATTTGAGAG
TACACGAGATCCCAGCTATCAAGGTTACAGCGTTGAGGTTCACAGAGAGAGCCAGAGCTC
GCATTGAGAAAGCTGGTGGTGAATGCTTAACCTTTGACCAGCTTGCTCTCAGAGCTCCTT
TGGGACAGAACACTGTTCTTCTTAGAGGACCTAAGAACTCACGTGTGGCTGTTAAGCATT
TTGGTCCCGCACCTGGTGTGCCACACAGTCACTCGAAGCCGTATGTTCGGTCCAAGGGAA
GGAAGTTCGAGAAGGCCAGAGGAAAGAGGAAGAGCCGTGGTTTCAAGGTTTAAGAACATT
GTCTGTGTCGTTGAACTTGATCCTATTGTGTTGTTGCTTCTTCGTCTCTTTCATAATCGG
ATTTTTGTTAGACAATTGTGTTTTTTTCAGACAATATCTAAAGTTTGTGACTACTGTTGA
GCTTATTCCAACACTGAGCTTTACTATGTTTATCAAACTTCACATTCTTTCTTCAAAAGT
TCTTAACGGC

QA 3 792 3 792
DS 



AS 1 4

CO CL2512Contig1 537 4 19 U
AATAAGTTAAAATGCATTTTTATTTGAAAACAGAAGATCTTGTTCGATTCATAGAAAGTT
TTCAGATTCCCTTTGGAGCCACACCAACGGATTTCAATGTCTCTGCATTTCGAGGCGTGG
TGAATGGGTTAGGTCTGCTGGTATCAGGTAAGATGGCACTAGACTTATCTTGAATCTGAC
CTACTTTCCGTAGCCAAGACCTGTTGATATATTTGTCGGCGGAGGAAACACAATTGTCCG
GATCATCGACTTCCGCGACAGCCGCTCTTCTGTTCTTCCTTGTACTGACCCCTGGAGCAT
GCATTAGCTGCTGCTTGAGGCTATGTCCGGCCATAGCAACAGCTAGAGCAACAAAACCTC
CTATTATAGCCACTGGTGCAAACTCTCCCGTTACTGAAAACTTATTATATGTTCCTTTGG
CACCATGGGCGACTGTGGTCGCGAAGCGACGAGAGCCACCAATTTGTTTGCCAGTCGAGC
GCAATTGGCTAGCGATTCTGAAAGCCATCTTCGTTTAACTTTGTGACTAGAGTTCCT


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

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AF RS1DN24TF C 5
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RD RS1FX44JQ 415 0 0
AA
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CACTAAACTTATCTTGAATCTGACCTACTTTCCGTAGCCAAAACCTGTTGATATATTTGT
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QA 3 415 3 415
DS 

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G
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DS 

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G
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TTCCGTAGCCAAGACTTGTTGATATATTTGTCGGCGGAGGAAACACAATTGTCCGGATCA
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QA 2 531 2 531
DS 



AS 2 4

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1B314TF U 1
AF RS1B314JQ C 14
BS 1 625 RS1B314TF
BS 626 626 RS1B314JQ
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BS 661 679 RS1B314TF
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CTTTTTTTAATCTTGAGGGTGTTTGGAAGAGAGAAACACACAAAATGATGATGATGATGA
TGATGATGATGATTGTGTCTCTAACCAAACAACAAGGAGAGGTAGGGTAATGTCTGTAAA
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ATCTTTCACTTCTCCACTT
CT

QA 1 679 1 679
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TGAGGGTGTTTGGAAGAGAGAAACCCACAAAATGATGATGATGATGATGATGATGATGAT
TGTGTCTCTAACCAAACAACAAGGAGAGGTAGGGTAATGTCTGTAAAGTGATTAGGATGT
TGCCATTGTTCATGTACCATCATCTTTCTGTTTTCCCAACGTCCTTGTATCTGTGTAGGC
CTTTGCTTTGTACCCTCATGTTCCTTAGACTCTCTTTTGCTGCTTATTTTATTTGGTGTT
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CCACTTTT

QA 1 668 1 668
DS 



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ACAACTTATGAAAGCTAGCAAGTGGTGGTGAGTTTGTTTGTCGTGTGTGTTCCATGGATA
TTTTCTTTTAATCTCTAAGGGTGTTTGGAGGAGAGAAACACACAAAAATGATGATGATGA
TGATTGTGTCTCTAACCAAACAACAAGGAGAGGTAGGGTAATGTCTGTAAAGTGATTAGG
ATGTTGCCATTGTTCATGTACCATCATCTCTCTGTTTTTCCAGCGTCCGTGTCTGTGTAG
GCTTTTGCTTTGTACCCTCATGTTCCTTAGACTCTCTTTTGCTACTTATTTTATTTGGTG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CL91TF U 1
AF RS1CL91JQ C 92
BS 1 340 RS1CL91TF
BS 341 832 RS1CL91JQ

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GGATCCTCTGTTTTCCTCTCTCTAAATCCATGGATCCTTCACTTCCTCCACAGTTCACAG
CTTTCCCTCCTTTCAACAACTCCAACCCTTACGCCCCTCCCCAACACCCCTTATATGGCG
GCGCCGTTAACTCCCCCGCCGTCGCGCCGCCGCCTAACAACAACAACCAGTTCTTCCGGA
CAACAAGATATTAGCTATGGAGAACTCAAGAAGAAGTTTGAATTGTTTCAAGAGAAAGCT
AAGGAAATTGTTAATGTGTTGAAAGCCGAGGTCGGGGGAAGTTATAATCAAGCTGTGGTT
CAAGCTATACATGACCTGGAAGAGCTAACAGTAACAAAAA

QA 1 340 1 340
DS 

RD RS1CL91JQ 741 0 0
CGCCCCTCCCCAACACCC*TTATATGGCGGCGCCGTTAACTCCCCCGCCGTCGCGCCGCC
GCCTAACAACAACAACCAGTTCTTCCGGACAACAAGATATTAGCTATGGAGAACTCAAGA
AGAAGTTTGAATTGTTTCAAGAGAAAGCTAAGGAAATTGTTAATGTGTTGAAAGCCGAGG
TCGGGGGAAGTTATAATCAAGCTGTGGTTCAAGCTATACATGACCTGGAAGAGCTAACAG
TAACAAAAAGGGAGGCAACGGAGGAGCCACGCCACGTGCAGCCAGATGAACATCACTTTG
AAAATGAACCCCAGCCTGAGGGACACGGATATGGGCAGGTGCAGACAGAAACAGAGGCTA
TGCAAGAAGCTCTGTTCTGAAAAGAGCGCACAACTTATGAAAGCTAGCAAGTGGTGGTGA
GTTTGTTTGTCGTGTGTGTTCCATGGATATTTTCTTTTAATCTCTAAGGGTGTTTGGAGG
AGAGAAACACACAAAAATGATGATGATGATGATTGTGTCTCTAACCAAACAACAAGGAGA
GGTAGGGTAATGTCTGTAAAGTGATTAGGATGTTGCCATTGTTCATGTACCATCATCTCT
CTGTTTTTCCAGCGTCCGTGTCTGTGTAGGCTTTTGCTTTGTACCCTCATGTTCCTTAGA
CTCTCTTTTGCTACTTATTTTATTTGGTGTCTTAGCCTTGTAGGAGTTCATGTTTCTAAT
AAACGTTATGTAATTTTTATC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 3

CO CL2514Contig1 1160 3 3 U
GGGTTTCACTTAGTAAGAACCGTCGAAGAAAAGTTTTGTAGAGAGAGAGAGAGATGGATA
AGGAAGTTATAGCAGTTTCGGCGATGGACGCTTTCGAGAAGCTCGAGAAAGTCGGGGAAG
GCACCTACGGGAAAGTCTACAGAGCCAGAGAGAAATCCACCGGCAAAATCGTCGCGCTAA
AGAAGACGCGTCTCCACGAGGACGAAGAAGGCGTTCCTTCCACCACTCTCCGCGAGATCT
CCATCTTACGCATGCTCGCTCGCGATCCTCACATCGTCAAGTTGATGGATGTGAAGCAGG
GATTGAGCAAAGATGGGAAGACAGTGCTGTACTTGGTGTTTGAGTACATTGACACCGACG
TCAAGAAGTACATCAGAAGTTTCCGCCAGACTGGAGCCAACATTCCTCCCCACATCGTCA
AGAGTTTGATGTACCAACTTTGCAAAGGAATCGCCTTCTGCCATGGCCACGGTGTGCTCC
ACAGAGATCTCAAGCCTCACAATCTCTTGATGGACCCCAAGACAATGAGGCTTAAGATAG
CTGATCTTGGTTTAGCCAGAGCCTTTACTCTCCCTATGAAGAAGTATACTCATGAGATAT
TGACTCTATGGTATAGAGCACCAGAGGTGCTTCTTGGGGCCACTCATTACTCTACTGCTG
TGGATATGTGGTCTGTTGGCTGCGTCTTTGCTGAGCTTGTGACCAACCAAGCGATCTTTG
CTGGAGACTCTGAGCTCCAACAGCTTCTCCATATTTTCAGGGTGCTCGGGACACCCAATG
AAGAAATGTGGCCAGGTGTGAGCACACTCAAGAACTGGCACGAATACCCACAGTGGAAGC
CCTTGAGTCTCTCCACATCTGTTCCCAAACTCGACCAGGCTGGACTTGATCTTCTCTCTA
AAATGCTGCAGTACGAGCCAGCAAAACGAATCTCAGCGAAGATGGCTATGGAGCATCCTT
ACTTTGATGATCTCCCGGACAAGTCCTCTCTCTGACGATTTTGATCTTTTGAGTTACTGC
TTCTTTCAAGCATATCTCTAGTGTGCTTCTCACTCTCTTCGCTTTTTAGCTTATTATCAT
CACCTCTGTTTGTGTTTCTTTCTGTTCCCAAGTTTGTATCAAATGTTCAACGTTTTTAAG
TAAGAAAACTTATCTATTCT


BQ
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AF RS1E774TF U 1
AF RS1GJ45TF U 579
AF RS1E774JQ C 481
BS 1 622 RS1E774TF
BS 623 978 RS1GJ45TF
BS 979 1160 RS1E774JQ

RD RS1E774TF 622 0 0
GGGTTTCACTTAGTAAGAACCGTCGAAGAAAAGTTTTGTAGAGAGAGAGAGAGATGGATA
AGGAAGTTATAGCAGTTTCGGCGATGGACGCTTTCGAGAAGCTCGAGAAAGTCGGGGAAG
GCACCTACGGGAAAGTCTACAGAGCCAGAGAGAAATCCACCGGCAAAATCGTCGCGCTAA
AGAAGACGCGTCTCCACGAGGACGAAGAAGGCGTTCCTTCCACCACTCTCCGCGAGATCT
CCATCTTACGCATGCTCGCTCGCGATCCTCACATCGTCAAGTTGATGGATGTGAAGCAGG
GATTGAGCAAAGATGGGAAGACAGTGCTGTACTTGGTGTTTGAGTACATTGACACCGACG
TCAAGAAGTACATCAGAAGTTTCCGCCAGACTGGAGCCAACATTCCTCCCCACATCGTCA
AGAGTTTGATGTACCAACTTTGCAAAGGAATCGCCTTCTGCCATGGCCACGGTGTGCTCC
ACAGAGATCTCAAGCCTCACAATCTCTTGATGGACCCCAAGACAATGAGGCTTAAGATAG
CTGATCTTGGTTTAGCCAGAGCCTTTACTCTCCCTATGAAGAAGTATACTCATGAGATAT
TGACTCTATGGTATAGAGCACC

QA 1 622 1 622
DS 

RD RS1GJ45TF 400 0 0
G
AGAAGTATACTCATGAGATATTGACTCTATGGTATAGAGCACCAGAGGTGCTTCTTGGGG
CCACTCATTACTCTACTGCTGTGGATATGTGGTCTGTTGGCTGCGTCTTTGCTGAGCTTG
TGACCAACCAAGCGATCTTTGCTGGAGACTCTGAGCTCCAACAGCTTCTCCATATTTTCA
GGGTGCTCGGGACACCCAATGAAGAAATGTGGCCAGGTGTGAGCACACTCAAGAACTGGC
ACGAATACCCACAGTGGAAGCCCTTGAGTCTCTCCACATCTGTTCCCAAACTCGACCAGG
CTGGACTTGATCTTCTCTCTAAAATGCTGCAGTACGAGCCAGCAAAACGAATCTCAGCGA
AGATGGCTATGGAGCATCCTTACTTTGATGATCTCCCGG

QA 2 400 2 400
DS 

RD RS1E774JQ 680 0 0
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CTGATCTTGGTTTAGCCAGAGCCTTTACTCTCCCTATGAAGAAGTATACTCATGAGATAT
TGACTCTATGGTATAGAGCACCAGAGGTGCTTCTTGGGGCCACTCATTACTCTACTGCTG
TGGATATGTGGTCTGTTGGCTGCGTCTTTGCTGAGCTTGTGACCAACCAAGCGATCTTTG
CTGGAGACTCTGAGCTCCAACAGCTTCTCCATATTTTCAGGTTGCTCGGGACACCCAATG
AAGAAATGTGGCCAGGTGTGAGCACACTCAAGAACTGGCACGAATACCCACAGTGGAAGC
CCTTGAGTCTCTCCACATCTGTTCCCAAACTCGACCAGGCTGGACTTGATCTTCTCTCTA
AAATGCTGCAGTACGAGCCAGCAAAACGAATCTCAGCGAAGATGGCTATGGAGCATCCTT
ACTTTGATGATCTCCCGGACAAGTCCTCTCTCTGACGATTTTGATCTTTTGAGTTACTGC
TTCTTTCAAGCATATCTCTAGTGTGCTTCTCACTCTCTTCGCTTTTTAGCTTATTATCAT
CACCTCTGTTTGTGTTTCTTTCTGTTCCCAAGTTTGTATCAAATGTTCAACGTTTTTAAG
TAAGAAAACTTATCTATTCT

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 4

CO CL2515Contig1 1044 4 5 U
GCTTAAGTGAAATCATTATAATCTGATTGTTCCAATATTTTACAATACTGATTAGACTAT
TTTACAATACAAAAAAAAAAATAAAGCAAAACATTTTGAGAAGACTTCCGCTGGCCGACC
CAAAATCCAAAATAAAACCTGCCCACGACCCACATTCTCAATTTTCTCGGTTTATAAACG
CTTTATTAGCCAGCAAACTTGGTTTTTGAGATAATGAAACAAAATCATATCACTGAAACT
TCAAAAACATCAAAAATTCTACATTGAGACTTCCCCTGGTCTCTATGAAAAAATCACTGA
AACGGAATTCACTCGTTCTTCACATCACACTCAGTAGGAGGCTCATCATTCTTAGACACA
ACGGCCGATTCTTGCTTGGTTACATGAGCGTCTTTCTCACCAGTCTCTGCGGGTTCAGAC
GCAGATGGGGTTTCTTCGGCTTCTGAACCGGTCACTTTGACGGTGCCAACGGTAGCATAC
TTGCTCTTGAACTTGTACTCCCAGTCCTGAAGAGCTTCTAGCTCAAAGGGACCAAGACCA
GAGATATCCCAAGTCAAATCTTTCTCCTCAAAAGACATCTTTGCAAGAGCTCGGCTTGCG
TCTTTCCCTGCAAACAAAGCATACGGTCCTCCGGGTCCATAGAACATCCTGCTTTGAGTT
ACATCATAGATCTGATGTTTGATGGCCATAAGAAGGGGCTTTTGAGGGTCGGAGCCATCG
TACTGCTTAAGCTCCTCCTCTGTGATCTCGCCGACCTGAACAGGCTGAGGAATCGGTGGT
TCTTCCTCTGCAGCTGACGATCTAGCCCTCTGATGTCGGCGAACATCATCGAAAGGCGAA
GCAAACCAGCCTGAGACGACTTGGTAAATGGCGAAGGCGAGAGCGAGGGCGGTGAAGAAG
ACCACCGGGGAGAGACCTGTGTAAGCATGTATCGCTTCTTTCAGTGTTTGCCATAGGTGT
AGCGCCATGGTTTCGCCTGGAGAGAAGAAGGAAAGGAAAGCAGATCAGTCTTGAAAAGAT
TTTCTCACTTTAGTCTTTCTTTCC


BQ
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CC

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CATGGTTTCGCTTGGAGAGAAGAAGGAAAGGAAAGCAGATCAGTCTTGAAAAGATTTTCT
CACTTTAGTCTTTCTTTCC

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GGCAACTATTGTTATGTGATGATAATAGTGTTGGTATTGGGAAAAGAAGTGAGAAGCCAG
TCTTTAAAAAATGGTTATTATTCAGCTTCATGTCCAAGAGCTGAGTCCATAGTAAGATCC
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CTTGGTGCACACACAATAGGACAAACGGATTGTCTCTTTTTCCGTTACCGTTTATACAAC
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EJ66TF U 1
AF RS1A837TF U 1
AF RS1EJ66JQ C 379
AF RS1A837JQ C 559
BS 1 143 RS1A837TF
BS 144 144 RS1EJ66TF
BS 145 752 RS1A837TF
BS 753 753 RS1EJ66JQ
BS 754 785 RS1A837TF
BS 786 786 RS1EJ66JQ
BS 787 805 RS1A837TF
BS 806 806 RS1EJ66JQ
BS 807 816 RS1A837TF
BS 817 1212 RS1EJ66JQ
BS 1213 1250 RS1A837JQ

RD RS1EJ66TF 667 0 0
GGATTGTATTTTCACTGACCATTGAAATTTAAAGAGAGAGAAAAAATGGGAGTGTACTTA
GGCAACTATTGTTATGTGATGATAATAGTGTTGGTATTGGGAAAAGAAGTGAGAAGCCAG
TCTTTAAAAAATGGTTATTATTCAGCTTCATGTCCAAGAGCTGAGTCCATAGTAAGATCC
ACAGTTGAATCTCACTTTGATTCTGATCCCACCATCTCTCCTGGCTTGCTTAGGCTTCAT
TTCCATGACTGTTTTGTTCAGGGTTGTGATGGATCGGTTTTAATCAAAGGAAAAACTGCG
GAGCAAACCGCTCTAGCTAATGGTGGTCTTAGAGGGTTCGAAGTGATTGATGATGCCAAA
TCACAACTTGAGTTAGAGTGTCCAGGAATTGTGTCATGTGCAGATATACTTGCACTTGCT
GCTCGTGACGCTGTTGACTTGAGTTCTGGACCAAGCTGGCGAGTTCCAACGGGTCGTAAA
GACGGTAGAATCTCGTTGGCATCGGAAGCATCGAATCTACCTTCACCATTTGACACTGTT
GCTGTTCAAAAGCAAAAGTTCGAAGCTAAAGGGCTGGATGCTCATGATCTTGTTACTCTG
CTTGGTGCACACACAATAGGACAAACGGATTGTCTCTTTTTCCGTTACCGTTTATACAAC
TACACCG

QA 1 667 1 667
DS 

RD RS1A837TF 816 0 0
GGATTGTATTTTCACTGACCATTGAAATTTAAAGAGAGAGAAAAAATGGGAGTGTACTTA
GGCAACTATTGTTATGTGATGATAATAGTGTTGGTATTGGGAAAAGAAGTGAGAAGCCAG
TCTTTAAAAAATGGTTATTATTCGGCTTCATGTCCAAGAGCTGAGTCCATAGTAAGATCC
ACAGTTGAATCTCACTTTGATTCTGATCCCACCATCTCTCCTGGCTTGCTTAGGCTTCAT
TTCCATGACTGTTTTGTTCAGGGTTGTGATGGATCGGTTTTAATCAAAGGAAAAACTGCG
GAGCAAACCGCTCTAGCTAATGGTGGTCTTAGAGGGTTCGAAGTGATTGATGATGCCAAA
TCACAACTTGAGTTAGAGTGTCCAGGAATTGTGTCATGTGCAGATATACTTGCACTTGCT
GCTCGTGACGCTGTTGACTTGAGTTCTGGACCAAGCTGGCGAGTTCCAACGGGTCGTAAA
GACGGTAGAATCTCGTTGGCATCGGAAGCATCGAATCTACCTTCACCATTTGACACTGTT
GCTGTTCAAAAGCAAAAGTTCGAAGCTAAAGGGCTGGATGCTCATGATCTTGTTACTCTA
CTTGGTGCACACACAATAGGACAAACGGATTGTCTCTTTTTCCGTTACCGTTTATACAAC
TACACCGTCACCGGAAACTCCGACCCAACCATAAGCCGATCGTTTCTTACGCAGCTCAAG
ACTCTTTGTCCTCCCAATGGAGACCCATCAAA*CGTGTTGCTCTTGACATTGGCAGTCCA
TCAAA*TTCGATGTAAGCTTCTTCA*GAACCTAAGA

QA 1 816 1 816
DS 

RD RS1EJ66JQ 834 0 0
GTGTCCA
GAATTGTGTCATGTGCAGATATACTTGCACTTGCTGCTCGTGACGCTGTTGACTTGAGTT
CTGGACCAAGCTGGCGAGTTCCAACGGGTCGTAAAGACGGTAGAATCTCGTTGGCATCGG
AAGCATCGAATCTACCTTCACCATTTGACACTGTTGCTGTTCAAAAGCAAAAGTTCGAAG
CTAAAGGGCTGGATGCTCATGATCTTGTTACTCTGCTTGGTGCACACACAATAGGACAAA
CGGATTGTCTCTTTTTCCGTTACCGTTTATACAACTACACCGTCACCGGAAACTCCGACC
CAACCATAAGCCGATCGTTTCTTACGCAGCTCAAGACTCTTTGTCCTCCCAATGGAGACC
CATCAAAACGTGTTGCTCTTGACATTGGCAGTCCATCAAAATTCGATGTAAGCTTCTTCA
AGAACCTAAGAGACGGTAACGGCATTTTGGAGTCGGACCAACGTCTTTGGTCGGACTTTG
AGACGAATGACGTTGTGAGGAAGTATGCTAGTACTACTAGAGGTTTGTTAGGGTTAAGGT
TTGATAAGGAGTTCGGTCAAGCTATGGTTAAGATGAGTTCCATTGAGGTAAAGACAGACG
TTGATGGTGAGGTCAGGAAAGTTTGTTCTAAGATCAACTATTGAGTAGAACATACAAATA
TATATAAATAATATCAAATGCATGGAGGTAGTTGAGATCTTGTCGTTAACAAGGAGTGTT
TTGTATAGATGTCGACAAGTTCGAGCCTCATGCATGTAATATTTCAACGGCTGATCGCAG
GCCAAATAAAATTTTGGACCCAAGGTCTGAAAAATCATGTCATAATT

QA 8 834 8 834
DS 

RD RS1A837JQ 692 0 0
TTCGAAGCTAAAGGGCTGGATGCTCATGATCTTGTTACTCTACTTGGTGCACACACAATA
GGACAAACGGATTGTCTCTTTTTCCGTTACCGTTTATACAACTACACCGTCACCGGAAAC
TCCGACCCAACCATAAGCCGATCGTTTCTTACGCAGCTCAAGACTCTTTGTCCTCCCAAT
GGAGACCCATCAAAACGTGTTGCTCTTGACATTGGCAGTCCATCAAAATTCGATGTAAGC
TTCTTCAAGAACCTAAGAGACGGTAACGGCATTTTGGAGTCGGACCAACGTCTTTGGTCG
GACTTTGAGACGAATGACGTTGTGAGGAAGTATGCTAGTACTATTAGAGGTTTGTTAGGG
TTAAGGTTTGATAAGGAGTTCGGTCAAGCTATGGTTAAGATGAGTTCCATTGAGGTAAAG
ACAGACGTTGATGGTGAGGTCAGGAAAGTTTGTTTTAAGATCAACTATTGAGTAGAACAT
ACAAATATATATAAATAATATCAAATGCATGGAGGTAGTTGAGATCTTGTCGTTAACAAG
GAGTGTTTTGTATAGATGTCGACAAGTTCGAGCCTCATGCATGTAATATTTCAACGGCTG
ATCGCAGGCCAAATAAAATTTTGGACC*AAGGTTTGAAAAATCATGTCATAATTAAAAAT
ATATAGAAATGTTTTCTCTGGTTTAAGTTTTT

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 2

CO CL2517Contig1 878 2 4 U
GAGGGTCTACTCTGTCTCTCTCTCTCTCCCAACGAAGGAACTAATCTCTCTCTAGATTGT
TTTCCTTCCGGGGCTTGATAATGGCGAATCCAGCACAATCAAAGGGATGGGTTAAGAACT
TTTCGTCGATAGCTTCATGGGTTTACTTCTTCTTGATCATCCTCCAGATCCCTCTCTTCA
GGGTACCATGTAGATCTGGAATGTGTATGTCACCGATCCATGTGACATCCTCTCAGTTGA
TTTCTAGTGACGTCTTTCCCGTTTCGGTTATCAAGGCTCTCTTATACCCTGGTGCTATTG
TCCATGGTCTCGCCACCAACATGACGTTTCCAAAGTGGGAGAATGTGTTAGACATTTACA
ATCTCACCAACGTCAAAGAGGCATCCGCAGTTCCCGATCTTCAACGCCTAGAGGTTCTTG
CAGGGAGCTACTTCTCTGTAGCTGGGGCCTTTATCGGTTTGCTGAAGCCTGGTAGGATGG
GCATGTTTGGGTCGTTGCTGCTGGTTTGGGGTCTTGTCAAAGAAGGGATCTTGAAGAAGC
CAGCTAATACCGACCCAGCTAGAACCGTTTATGTGTACCCGACCATGGTGGTTGTGGTGA
TCTGCGCTTTCTCTATGATAAATTATAACTTGAAGAAAGCCACGAGGGCTGCTGCTCCTG
CTCGTCCCATTGCTAAACCTCTCATGAGCTCTTCGAAATCTAAGCTCAAGTGAGTTTTTT
TTTTTTTTGAGACTTTTTAGGGCTTGCGTCCTGTCTTTGTTGTCAATGACAGAAATGAAA
ATGACATTGTAGTTGTGTTATATTCTCTCGTTTACCTTGTGTGTTTTCGTTGTTTTCTGG
AACTCTGCTCAGCTGTCAGTGTCTTTCAATATCAACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E915TF U 1
AF RS1GC44TF U 312
BS 1 402 RS1E915TF
BS 403 403 RS1GC44TF
BS 404 719 RS1E915TF
BS 720 878 RS1GC44TF

RD RS1E915TF 720 0 0
GAGGGTCTACTCTGTCTCTCTCTCTCTCCCAACGAAGGAACTAATCTCTCTCTAGATTGT
TTTCCTTCCGGGGCTTGATAATGGCGAATCCAGCACAATCAAAGGGATGGGTTAAGAACT
TTTCGTCGATAGCTTCATGGGTTTACTTCTTCTTGATCATCCTCCAGATCCCTCTCTTCA
GGGTACCATGTAGATCTGGAATGTGTATGTCACCGATCCATGTGACATCCTCTCAGTTGA
TTTCTAGTGACGTCTTTCCCGTTTCGGTTATCAAGGCTCTCTTATACCCTGGTGCTATTG
TCCATGGTCTCGCCACCAACATGACGTTTCCAAAGTGGGAGAATGTGTTAGACATTTACA
ATCTCACCAACGTCAAAGAGGCATCCGCAGTTCCCGATCTTCGACGCCTAGAGGTTCTTG
CAGGGAGCTACTTCTCTGTAGCTGGGGCCTTTATCGGTTTGCTGAAGCCTGGTAGGATGG
GCATGTTTGGGTCGTTGCTGCTGGTTTGGGGTCTTGTCAAAGAAGGGATCTTGAAGAAGC
CAGCTAATACCGACCCAGCTAGAACCGTTTATGTGTACCCGACCATGGTGGTTGTGGTGA
TCTGCGCTTTCTCTATGATAAATTATAACTTGAAGAAAGCCACGAGGGCTGCTGCTCCTG
CTCGTCCCATTGCTAAACCTCTCATGAGCTCTTCGAAATCTAAGCTCAAGTGAGTTTTT
T

QA 1 719 1 719
DS 

RD RS1GC44TF 567 0 0
GGCACCA
ACATGACGTTTCCAAAGTGGGAGAATGTGTTAGACATTTACAATCTCACCAACGTCAAAG
AGGCATCCGCAGTTCCCGATCTTCAACGCCTAGAGGTTCTTGCAGGGAGCTACTTCTCTG
TAGCTGGGGCCTTTATCGGTTTGCTGAAGCCTGGTAGGATGGGCATGTTTGGGTCGTTGC
TGCTGTTTTGGG*TCTTGTCAAAGAAGGGATCTTGAAGAAGCCAGCTAATACCGACCCAG
CTAGAACCGTTTATGTGTACCCGACCATGGTGGTTGTGGTGATCTGCGCTTTCTCTATGA
TAAATTATAACTTGAAGAAAGCCACGAGGGCTGCTGCTCCTGCTCGTCCCATTGCTAAAC
CTCTCATGAGCTCTTCGAAATCTAAGCTCAAGTGAGTTTTTTTTTTTTTTGAGACTTTTT
AGGGCTTGCGTCCTGTCTTTGTTGTCAATGACAGAAATGAAAATGACATTGTAGTTGTGT
TATATTCTCTCGTTTACCTTGTGTGTTTTCGTTGTTTTCTGGAACTCTGCTCAGCTGTCA
GTGTCTTTCAATATCAACAC

QA 8 567 8 567
DS 



AS 1 4

CO CL2518Contig1 1130 4 25 U
GGGACCGTGATTGGTCTCGTTGAGAGGCCGAGGCCGAGGGTGAGAGGAGAGAAGAAACGA
CGATGATGACGATGATGCGAAGAATCTCGGAGAGAGCTACTGGTTTCTCTAAGAAGTTGA
TTCTCAAATCATCGGCGTCGCGATTTCACGGCGAGTCTCTCGATTCCTCCGTCTCACCCG
TTCTCATTCCCGGCGTCCATGTCTTCCATTGCCAGGACACAGTTGGAATCGTGGCAAAGC
TATCAGATTGTATCGCAGCTAAAGGCGGAAACATTCTCGGCTACGATGTCTTTGTTCCCG
AGAACAACAACGTCTTCTACTCTCGCAGTGAGTTTATATTTGATCCTGTAAAATGGCCGA
GACACCAAGTGGGTGAAGATTTTCAAGCTATTGCGCAAACATTCCGTGCCATGAACTCGG
TTGTTCGTGTTCCTTCTATAGATCCCAAGTATAAGATTGCTCTTCTTCTTTCTAAACAGG
ATCATT*GTTTGGTCGAGATGTTGCATAGATGGCAAGATGGAAAACTCCC*TGTGGATAT
AACCTGTGTGATAAGTAATCATGAGAGAGCTTCAAACACTCATGTT*ATGCGGTTTCTTG
AGAGGCATGGCATTCCGTATCATTATGTAGCTACAACTAAAGATAATAAACGAGAAGATG
AGATTTTGGAATTGGTCAAAGACACTGACTTCTTAGTTCTCGCTAGATACATGCAGATTC
TATCTGGTGACTTCTTGAAAGGTTATGGAAAGGATGTAATCAACATCCACCATGGTCTTT
TGCCATCATTCAAGGGCGGATATCCAGCCAAACAGGCTTTTGATGCAGGTGTGAAGCTGA
TTGGAGCAACTAGTCACTTTGTTACAGAGGAACTTGATGCAGGGCCTATCATTGAACAAA
TGGTTGAGAGTGTTTCCCACCGAGACAATCTAAGGAGCTTTGTCCAGAAATCTGAGGACC
TCGAGAAAAAATGCCTCACAAAAGCTATAAAGTCATACTGCGAACTACGGGTGCTACCTT
ATGGAACAAACAAAACTGTTGTATTCTAATAGAACAAAGCAAAGACTATTTGTTGTATGA
ATTAACTCAAAAAGAAGGTTATAACAATTCTCTTGAAGATTTCTGATTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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TTC

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G
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AAAAATGCCTCACAAAAGCTATAAAGTCATACTGCGAACTACGGGTGCTACCTTATGGAA
CAAACAAAACTGTTGTATTCTAATAGAACAAAGCAAAGACTATTTGTTGTATGAATTAAC
TC

QA 2 483 2 483
DS 



AS 1 4

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TTCTCTCTTCTTCCTTGATGGGTTTCATCTCCTGCACCTCATTTCCGACGATCAACTCGA
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CACTCTTATTCACATCTAGCTCTGCACCTTATGATTGCTTTGATAATGGGGAATGCAATG
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TATACTCCAAGATCGCTATTGGTTTGGTCATGTCAACCGAGCATGCCTGTTTGCGTAATC
AACGAGATCTTAGGTCTGATCATATCTGGCCATGCTCATCGTATT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EL95TF U 1
AF RS1CZ35TF U 23
AF RS1EL95JQ C 687
AF RS1CZ35JQ C 767
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CATTCTTATTCACATCTAGCTCTGCACCTTATGATTGCTTTGATAATGGGGAATGCAATG
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GG
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AGCAATCGACTTTACCATCTTTGTATACACCAAAGTTTGCTCTGAGACGCAAGGATAAGC
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CTTCCTCCTCCACCATTGGTGAGACCAGTGATGGCTTGAAGGTCCAGTCTCATGTTTCAA
TTGGGGCAAACGATTTGCTGATTGTTGGACCAGGTGTTCTTGGACGCTTAGTTGCAGAAA
AATGGAGAGAGGAACATACAGATTGCCAAATCTTTGGGCAGACAGCAACAACAAACCATC
ATGATGAGTTGGAGAAGTTGGGTATCAAACCATCTCTTAAAGAAACCGAGTTTGATGGCA
AGTTCTCCTATGTGATCTTTTGTGCTCCTCCCTCACAAAGCCCAGATTACGCCGCTGAGC
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TGATAAGAAGTTCAAAGGTTTCACAAGCACCAGTGGTCCTTTAGGGAAGAAGCTGAACAA
CTTTCGGACACGAGAGGAAATTGGATGGGAGCCGAAGTATCCAAGCTTTGCTCAGTTTCT
TGGAATATCCAAGTAATGTTTTAATCTGGTCGAAGATTGTGAAGGAAGGAGAAGAGAGCA
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TTTAC
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AAGAAGAAAGCTGGTGGTCGGATTTTCTTGGGTTGTGACAACCATCCTTTGTCAAGGCAA
GAAGTGATGGACCTGATGGATCAAAGCGGAAAATATGATAAGAAGTTCAAAGGTTTCACA
AGCACCAGTGGTCCTTTAGGGAAGAAGCTGAACAACTTTCGGACACGAGAGGAAATTGGA
TGGGAGCCGAAGTATCCAAGCTTTGCTCAGTTTCTTGGAATATCCAAGTAATGTTTTAAT
CTGGTCGAAGATTGTGAAGGAAGGAGAAGAGAGCAAGAAGTGTAGAAAATTTCTTTAGAA
AATAACTCTAGAGCTGTGAAGTATTTACAAATGTGAAGCATTTTTTTATGCTTGGTTCAA
ACTTATATGTATACTCCAAGATCGCTATTGGTTTGGTCATGTCAACCGAGCATGCCTGTT
TGCGTAATCAACGAGATTTTAGGTCTGATCATATCTGGCCATGCTCATCGTATT

QA 6 599 6 599
DS 



AS 1 4

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AAGAGGAAGACCCGCAAATATTTTTTGATCCTTTACTCAAACCAATAATACGACCAGAGA
GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAACGAACGAGTATT
AATGATGAAAACGGTTTAATACTACTATGCGACCATGAGCCTTGCGATCATCCCTTGAGT
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CCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A063TF C 56
AF RS1A063JQ U 3
AF RS1A063TR U 3
AF RS1A063TV C 1
BS 1 2 RS1A063TV
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DS 

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AAAAAAAAAGATTTCCAAAACCCCTCTTAACCAATATCCCACAACATTCGGCAGAAAAAA
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GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAACGAACGAGTATTAA
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CCATCC

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DS 

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AAAAAAAAAGATTTCCAAAACCCCTCTTAACCAATATCCCACAACATTCGGCAGAAAAAA
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GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAACGAACGAGTATTAA
TGATGAAAACGGTTTAATACTACTATGCGACCATGAGCCTTGCGATCATCCCTTGAGTCC
AGCGTGCAGTGTCCTTGAGGTCTTCATCCTCTGAGTCGAGACATTCATTGAGGAACTCCC
CGCAAAAGGTGAAGTTGCTGAACAAAGGCTTCGTCTTGTCTCCAACAACATCCGCAAGAT
CACCCAATGCTGCCACCGCTGCTTTCGTCACGCTCTCATCCCTGAGGGAGTCTTTGGAAA
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CCTTGAACCCTTGTAGTATCCCAGAGTAAGCCTCAAAGATGCTTCTCCTGAGTTGGTTTC
CATAATCCATAAGCTCCTCGTCGAGGGTGT
CCATCC

QA 1 630 1 630
DS 

RD RS1A063TV 687 0 0
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GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAACGAACGAGTATT
AATGATGAAAACGGTTTAATACTACTATGCGACCATGAGCCTTGCGATCATCCCTTGAGT
CCAGCGTGCAGTGTCCTTGAGGTCTTCATCCTCTGAGTCGAGACATTCATTGAGGAACTC
CCCGCAGAAGGTGAAGTTGCTGAACAAAGGCTTCGTCTTGTCTCCAACAACATCCGCAAG
ATCACCCAATGCTGCCACCGCTGCTTTCGTCACGCTCTCATCCCTGAGGGAGTCTTTGGA
AACAAGTTCGACAAACTGCAAGAGATGTTGAGCGTAGGGCACCATGAGCTCAGCCTTGGC
GTCCTTGAACCCTTGTAGTATCCCAGAGTAAGCCTCAAAGATGCTTCTCCTGAGTTGGTT
TCCATAATCCATAAGCTCCTCGTCGAGGGTGTCCATCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTC
CCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACT

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 3

CO CL2521Contig1 750 3 2 U
TTTTTGTTAAGTAATATAAAACTGCTTCTATAGAGATGGTCAAACGCACACAAGATTCAT
GATGTTGTATATGTGATCTAAATCGCAAATGAAAGGAAAAACTAATGAAAAATGATGGTC
TGGCTAAACGCTGATAACAGTGGTTCCAAGGATAACTGTTAGTAATATTGTAAAGACTCA
AATAGAAATAGAGTAGCTTCTCCTCAACGGATCATTTATTTTTGGTCGAACCAAAGTAAG
GACTGGAGCTGGCAGTAACTTTTCTTTTTGTATCCATGGAACCTGTTTGATTGTATATTG
GACACTATTACAGTGGCGTTTCAAATGAAATCCTCGGCCACAAGTTTCTAATTAGTTTGA
TATAAACATAAGTGCGAATTGTTGAAAACGATCTCAAAACTAGTTTTTTGCCTTTCTCCC
ATTCTGTCCTTTGCTCCCTAAGTGGCACCGACGATAATGTTGTTGATTGGAATAAAGATG
AGCTTCACAAAGAAGCCCACGAATCCCATCACAACGAACCCAATCGCTGTACGGACAGCA
ACTTTCGTGAATTCTTTGCGATCTGGTTTGTGACAACGCTTAACGAGACGAATGCTATCC
TTAGCGAAGTCTCTGAGAGGATCGACGACGGAATCAATAGCATCCATGGCTTTGCTTTGC
TTTGCTTTCGATGATCTCAAATCTCAATCTCACAGCTCTTTTATTTATTTATTTTTGTTG
GGCTTTCTTCGGAGGAAGCGATGAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BL06TF C 9
AF RS1BL06JQ U 1
AF RS1CP81JQ U 449
BS 1 678 RS1BL06JQ
BS 679 750 RS1CP81JQ

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CTTTGCTCCCTAAGTGGCACCGACGATAATGTTGTTGATTGGAATAAAGATGAGCTTCAC
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QA 1 636 1 636
DS 

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GATGTTGTATATGTGATCTAAATCGCAAATGAAAGGAAAAACTAATGAAAAATGATGGTC
TGGCTAAACGCTGATAACAGTGGTTCCAAGGATAACTGTTAGTAATATTGTAAAGACTCA
AATAGAAATAGAGTAGCTTCTCCTCAACGGATCATTTATTTTTGGTCGAACCAAAGTAAG
GACTGGAGCTGGCAGTAACTTTTCTTTTTGTATCCATGGAACCTGTTTGATTGTATATTG
GACACTATTACAGTGGCGTTTCAAATGAAATCCTCGGCCACAAGTTTCTAATTAGTTTGA
TATAAACATAAGTGCGAATTGTTGAAAACGATCTCAAAACTAGTTTTTTGCCTTTCTCCC
ATTCTGTCCTTTGCTCCCTAAGTGGCACCGACGATAATGTTGTTGATTGGAATAAAGATG
AGCTTCACAAAGAAGCCCACGAATCCCATCACAACGAACCCAATCGCTGTACGGACAGCA
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TTAGCGAAGTCTCTGAGAGGATCGACGACGGAATCAATAGCATCCATGGCTTTGCTTTGC
TTTGCTTTCGATGATCTC
CC

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1CP81JQ 302 0 0
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TCACAACGAACCCAATCGCTGTACGGACAGCAACTTTCGTGAATTCTTTGCGATCTGGTT
TGTGACAACGCTTAACGAGACGAATGCTATCCTTAGCGAAGTCTCTGAAAGGATCGACGA
CGGAATCAATAGCATCCATGGCTTTGCTTTGCTTTGCTTTCGATGATCTCAAATCTCAAT
CTCACAGCTCTTTTATTTATTTATTTTTGTTGGGCTTTCTTCGGAGGAAGCGATGAAAAA
AA

QA 1 302 1 302
DS 



AS 1 4

CO CL2522Contig1 1025 4 27 U
AACTATACAAGATTTGCTGTGTTCTTGGCAAGCCTGACTGGACCACGTTTCCTGAAGCAA
AAAGCATATCTCGGATCATGAGTACTAGTCACACAGAGTTTCCACAGACAAGGATTGCTG
ATCTACTCCCCAATGCTTCTCCTGAAGCTATTGATTTGATCACTAGACTTTGCTCATGGG
ATCCACTGAAACGACCAACTGCTGACCAGGCGCTAAACCATCCATTCTTCAATATGGCTA
CGCAGGCTTCTTATCCTCTACATGACCTTGAGCTGAGGCTTAACACCATTGCAGCGGAGA
TGCCTAATCTTGAGCTAAACCTCTGGGACTTTAACACAAAACAAGATGAATGTTTTCTTG
GCTTGACGTTGGCTGTAAAACCAAGCGCTCCTAAACTAGAAATGGTCTGCAATGCATCTC
AGGATATGAGTGAGAACTTTCTCTTTTGCCCTATGGTTAACAATGATCGTGAACCATCAG
TTTTCTGGTCTCTGCTCTCTCCTGATGAAAGCCGCGGCCACGCACCTGTTGAATCATGTC
CTCTATCTCTGTCCTTCAGTCCGATGCAGCAACACACAAGTGTGGGACCTCCACCACAGT
CAACAACAGGGTTCACAGTGGGATCATCAATGCAACCGAACATGTTGGACCGCCCATGGA
TGGCTGTGTTTGCGCCGTTTCAACAGACTCATTACCTCTGATCTTCTTACTTAATCCATT
AAATACCTACTAAAAAAAGTAAATAACACAGAGGTTTGTCAGATTTGAATTAAAAGAAGA
TAGAGAAGAAGAAAAAAAAAAAAACAGAGGAGGTTGTAGATTTTGCATGTCACCTTATTG
TTCTCTAATTTGCAAAGATTGGGGGAGGGTTTAGGTGACGTTAATTTTCTCAGAGCTTGA
ACTTAAATCATTAACTATTATCCATTCTTGAGAACAGAACAAGTCTCCCTTTTGTGTAAT
ATATATATATAAATGAGATAATTGCTTTTTTTTTAACACAATGAGATAATTGTTTATGTT
GTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1BM81TF U 1
AF RS1DY72TF U 49
AF RS1DY72JQ C 502
AF RS1BM81JQ C 276
BS 1 67 RS1BM81TF
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RD RS1BM81TF 348 0 0
AACTATACAAGATTTGCTGTGTTCTTGGCAAGCCTGACTGGACCACGTTTCCTGAAGCAA
AAAGCATTTCTCGGATCATGAGTATTAGTCACACAGAGTTTCCACAGACAAGGATTGCTG
ATCTACTCCCCAATGCTTCTCCTGAAGCTATTGATTTGATCACTAGACTTTGCTCATGGG
ATCCACTGAAACGACCAACTGCTGATCAG*CGTTAAACCATCCATTCTTCAATATGGCTA
CGCAG*CTTCTTATCCTCTACATGACCTTGAGTTGAG*CTTAACACCATTGCAGCGGAGA
TGCCTAATCTTGAGCTAAACCTCTGGGACTTTAACACAAA
CAAGATGA

QA 1 340 1 340
DS 

RD RS1DY72TF 543 0 0
G
TCCTGAAGCAAAAAGCATATCTCGGATCATGAGTACTAGTCACACAGAGTTTCCACAGAC
AAGGATTGCTGATCTACTCCCCAATGCTTCTCCTGAAGCTATTGATTTGATCACTAGACT
TTGCTCATGGGATCCACTGAAACGACCAACTGCTGACCAGGCGCTAAACCATCCATTCTT
CAATATGGCTACGCAGGCTTCTTATCCTCTACATGACCTTGAGCTGAGGCTTAACACCAT
TGCAGCGGAGATGCCTAATCTTGAGCTAAACCTCTGGGACTTCAACACAAAACAAGATGA
ATGTTTTCTTGGCTTGACGTTGGCTGTAAAACCAAGCGCTCCTAAACTAGAAATGGTCTG
CAATGCATCTCAGGATATGAGTGAGAACTTTCTCTTTTGCCCTATGGTTACCAATGATCG
TGAACCATCAGTTTTCTGGTCTCTGCTCTCTCCTGATGAAAGCCGCGGCCACGCACCTGT
TGAATCATGTCCTCTATCTCTGTCCTTCAGTCCGATGCAGCAACACACAAGTGTGGGACC
TC

QA 2 543 2 543
DS 

RD RS1DY72JQ 422 0 0
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CGATGCAGCAACACACAAGTGTGGGACCTCCACCACAGTCAACAACAGGGTTCACAGTGG
GATCATCAATGCAACCGAACATGTTGGACCGCCCATGGATGGCTGTGTTTGCGCCGTTTC
AACAGACTCATTACCTCTGATCTTCTTACTTAATCCATTAAATACCTACTAAAAAAAGTA
AATAACACAGAGGTTTGTCAGATTTGAATTAAAAGAAGATAGAGAAGAAGAAAAAAAAAA
AAACAGAGGAGGTTGTAGATTTTGCATGTCACCTTATTGTTCTCTAATTTGCAAAGATTG
GGGGAGGGTTTAGGTGACGTTAATTTTCTCAGAGCTTGAACTTAAATCATTAACTATTAT
CC

QA 1 422 1 422
DS 

RD RS1BM81JQ 750 0 0
AG
GCTTAACACCATTGCAGCGGAGATGCCTAATCTTGAGCTAAACCTCTGGGACTTTAACAC
AAAACAAGATGAATGTTTTCTTGGCTTGACGTTGGCTGTAAAACCAAGCGCTCCTAAACT
TGAAATGGTCTGCAATGCATCTCAGGATATGAGTGAGAACTTTCTCTTTTGCCCTATGGT
TAACAATGATCGTGAGCCATCAGTTTTCTGGTCTTTGCTCTCTCCTGATGAAAGCCGCGG
CCACGCACCTGTTGAATCATGTCCTCTATCTCTGTCCTTCAGTCCGATGCAGCAACACAC
AAGCGTGGGACCTCCACCACAGTCAACAACAGGGTTCACAGTGGGATCATCAATGCAACC
GAACATGTTGGACCGCCCATGGATGGCTGTGTTTGCGCCGTTTCAACAGACTCATTACCT
CTGATCTTCTTACTTAATCCAT*AAATACCTACTAAAAAAAGTAAATAACACAGAGGTTT
GTCAGATTTGAATTAAAAGAAGATAGAGAAGAAGAAAAAAAA****ACAGAGGAGGTTGT
AGATTTTGCATGTCACCTTATTGTTCTCTAATTTGTAAAGATTGGGGGAGGGTTTAGGTG
ACGTTAATTTTCTCAGAGCTTGAACTTAAATCATTAACTATTATCCATTCTTGAGAACAG
AACAAGTCTCCCTTTTGTGTAATATATATATATAAATGAGATAATTGCTTTTTTTTTAAC
ACAATGAGATAATTGTTTATGTTGTCTC

QA 3 750 3 750
DS 



AS 1 4

CO CL2523Contig1 990 4 9 U
GGGCCGGTGGCGGTGTGCACGCAAGGACGGCCCTGACAGGAGTTACGGTCGGAGTTGATG
TTACTGGTTCTGAGAAAGTTTGGAGAACATTCCAAGCGGTTGGAGATATCGCATTTGCTT
ATGCCTACTCAACCGTACTTATTGAGATACAGGACACCTTAAAAGCAAGTCCACCATCAG
AAAACAAAGCCATGAAAAGAGCAAGCCTTGTGGGTGTATTCACAACGACCTTCTTTTACA
TGTTATGCGGGTGTGTGGGTTATGCAGCCTTTGGAAATAATGCGCCTGGAAATTTCCTAA
CCGGTTTTGGTTTTTATGAGCCCTTCTGGCTAATCGACTTTGCCAATGTCTGCATCGCCG
TGCATCTCGTTGGGGCCTATCAGGTCTTTTGCCAGCCAATCTTCCAATTTGTAGAGAGCC
AGAGTGCAAAACGTTGGCCAGATAACAAGTTTATTACAGGAGAGTACAAAATGAACGTCC
CTTGCGGTGGTGATTTCGGTATCAGTTTGTTCAGATTGGTTTGGAGGACTTCATACGTTG
TAGTCACCGCGGTCGTAGCAATGATCTTCCCTTTCTTCAACGATTTCTTGGGTCTTATTG
GAGCAGCTTCCTTCTGGCCTTTGACTGTTTACTTTCCCATTGAGATGCATATTGCTCAGA
AAAAGATGAAGAAATTTTCTTTCACTTGGACATGGCTGAAAATCTTGAGCTGGGCTTGTT
TCCTCGTCTCCCTCGTTGCTGCTGCTGGATCTGTGCAAGGACTCATACAAAGTCTTAAGG
ATTTCAAGCCTTTCCAGGCTCCCGAGTAGAAACTGTGTTTTGTCTAATGTCTTCAAGAAC
ACAACTCCCTTGCACTCTCTTTTCTCCAATAACAGTGTATGTTCGTTTGTAATATATTTG
TGTGTTTTGTTTCACTACGAAATGTTCAAACTATATTTGCTTGTCTGAAACAAATCTATC
GTCAATAAGTCGCTCTTTCTTTTCTTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GB83TF U 1
AF RS1D166TF U 125
AF RS1GB83JQ C 414
AF RS1D166JQ C 166
BS 1 133 RS1GB83TF
BS 134 134 RS1D166TF
BS 135 201 RS1GB83TF
BS 202 202 RS1D166TF
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BS 221 602 RS1GB83TF
BS 603 811 RS1D166TF
BS 812 990 RS1D166JQ

RD RS1GB83TF 602 0 0
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TTACTGGTTCTGAGAAAGTTTGGAGAACATTCCAAGCGGTTGGAGATATCGCATTTGCTT
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AAAACAAAGCCATGAAAAGAGTAAGCCTTGTGGGTGTATCCACAACGACCTTCTTTTACA
TGTTATGCGGGTGTGTGGGTTATGCAGCCTTTGGAAATAATGCGCCTGGAAATTTCCTAA
CCGGTTTTGGTTTTTATGAGCCCTTCTGGCTAATCGACTTTGCCAATGTCTGCATCGCCG
TGCATCTCGTTGGGGCCTATCAGGTCTTTTGCCAGCCAATCTTCCAATTTGTAGAGAGCC
AGAGTGCAAAACGTTGGCCAGATAACAAGTTTATTACAGGAGAGTACAAAATGAACGTCC
CTTGCGGTGGTGATTTCGGTATCAGTTTGTTCAGATTGGTTTGGAGGACTTCATACGTTG
TAGTCACCGCGGTCGTAGCAATGATCTTCCCTTTCTTCAACGATTTCTTGGGTCTTATTG
GA

QA 1 602 1 602
DS 

RD RS1D166TF 687 0 0
G
TACTCAACCGTACTTATTGAGATACAGGACACCTTAAAAGCAAGTCCACCATCAGAAAAC
AAAGCCATGAAAAGAGCAAGCCTTGTGGGTGTATTCACAACGACCTTCTTTTACATGTTA
TGCGGGTGTGTGGGTTATGCAGCCTTTGGAAATAATGCGCCTGGAAATTTCCTAACCGGT
TTTGGTTTTTATGAGCCCTTCTGGCTAATCGACTTTGCCAATGTCTGCATCGCCGTGCAT
CTCGTTGGGGCCTATCAGGTCTTTTGCCAGCCAATCTTCCAATTTGTAGAGAGCCAGAGT
GCAAAACGTTGGCCAGATAACAAGTTTATTACAGGAGAGTACAAAATGAACGTCCCTTGC
GGTGGTGATTTCGGTATCAGTTTGTTCAGATTGGTTTGGAGGACTTCATACGTTGTAGTC
ACCGCGGTCGTAGCAATGATCTTCCCTTTCTTCAACGATTTCTTGGGTCTTATTGGAGCA
GCTTCCTTCTGGCCTTTGACTGTTTACTTTCCCATTGAGATGCATATTGCTCAGAAAAAG
ATGAAGAAATTTTCTTTCACTTGGACATGGCTGAAAATCTTGAGCTGGGCTTGTTTCCTC
GTCTCCCTCGTTGCTGCTGCTGGATCTGTGCAAGGACTCATACAAAGTCTTAAGGATTTC
AAGCCTTTCCAGGCTCCCGAGTAGAA

QA 2 687 2 687
DS 

RD RS1GB83JQ 525 0 0
GAGAGCCAGAGTGCAAAACGTTGGCCAGATAACAAGTTTATTACAGGAGAGTACAAAATG
AACGTCCCTTGCGGTGGTGATTTCGGTATCAGTTTGTTCAGATTGGTTTGGAGGACTTCA
TACGTTGTAGTCACCGCGGTCGTAGCAATGATCTTCCCTTTCTTCAACGATTTCTTGGGT
CTTATTGGAGCAGCTTCCTTCTGGCCTTTGACTGGTTACTTTCCCATTGAGATGCATATT
GCTCAGAAAAAGATGAAGAAATTTTCTTTCACTTGGACATGGCTGAAGATCTTGAGCTGG
GCTTGTTTCCTCGTCTCCCTTGTTGCTGCTGCTGGATCTGTGCAAGGACTCATACAAAGT
CTTAAGGATTTCAAGCCTTTCCAGGCTCCCGAGTAGAAACTGTGTTTTGTCTAATGTCTT
CATGAACACAACTCCCTTGCACTCTCTTTTCTCCAATAACAGTGTATGTTCGTTTGTAAT
ATATTTGTGTGTTTTGTTTCACTACGAAATGTTCAAACTATATTT

QA 1 525 1 525
DS 

RD RS1D166JQ 825 0 0
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CGACTTTCTTTTACATGTTATGCGGGTGTGTGGGTTATGCAGCCTTTGGAAATAATGCGC
CTGGAAATTTCCTAACCGGTTTTGGTTTTTATGAGCCCTTCTGGCTAATCGACTTTGCCA
ATGTCTGCATCGCCGTGCATCTCGTTGGGGCCTATCAGGTCTTTTGCCAGCCAATCTTCC
AATTTGTAGAGAGCCAGAGTGCAAAACGTTGGCCAGATAACAAGTTTATTACAGGAGAGT
ACAAAATGAACGTCCCTTGCGGTGGTGATTTCGGTATCAGTTTGTTCAGATTGGTTTGGA
GGACTTCATACGTTGTAGTCACCGCGGTCGTAGCAATGATCTTCCCTTTCTTCAACGATT
TCTTGGGTCTTATTGGAGCAGCTTCCTTCTGGCCTTTGACTGTTTACTTTCCCATTGAGA
TGCATATTGCTCAGAAAAAGATGAAGAAATTTTCTTTCACTTGGACATGGCTGAAAATCT
TGAGCTGGGCTTGTTTCCTCGTCTCCCTCGTTGCTGCTGCTGGATCTGTGCAAGGACTCA
TACAAAGTCTTAAGGATTTCAAGCCTTTCCAGGCTCCCGAGTAGAAACTGTGTTTTGTCT
AATGTCTTCAAGAACACAACTCCCTTGCACTCTCTTTTCTCCAATAACAGTGTATGTTCG
TTTGTAATATATTTGTGTGTTTTGTTTCACTACGAAATGTTCAAACTATATTTGCTTGTC
TGAAACAAATCTATCGTCAATAAGTCGCTCTTTCTTTTCTTTGCC

QA 1 825 1 825
DS 



AS 1 2

CO CL2524Contig1 801 2 2 U
GGATCTCTTCACCACAAAACAAGAAAATGGCTTTGCAAATACAGACCTCAACGACGATCT
TCAAAACCCCCACGCCATCTACTGCCGCCGATGCGCTCACCGGAAAGTTCTTTCCAGGAA
CCGTCGCGGTTCGCCGGGAAATGTTAACGGTGTGGAGAGGAGTCAGATGCAGCAGCGGTG
GAATTGGTGGAGACGCCGGGAAGAAAAAGACTGTTCCTAACTCGAACTATGTAGTGCCTT
TGGACAAGTTCTCCTCCTCTTCTTCCATCACTCGTCCTCTGATTGAGATACTTCGAGATC
TCAACAAGAAGATCCCTGATAACATCGTCAAGAGCCATGATCCTGGATCCAGTGCAGCTT
CCTCTGGTTTCATCCCTTGGTTTCATGCAAACCGGATGCTCAGCTTCTACGCACCTGGTT
GGTGTGGGGAGGTTCGTGACGTCATTTTCTCAGAGAATGGTAATGTCACTGTTGTTTATC
GTCTTACCATTCGTGGCTCTGATGGTGAGGCACACCGAGAATCGACTGGGACATTAACAA
TCACTGATGATCACATCGAGGATCCGGTTGCTGCAGCTGAGGAAATAGCATTTTGCAGAG
CTTGTGCTCGATTTGGTCTCGGCTTGTATCTCTATCACGAAGAGTAGGCCAAGTGTGCTT
ACCTTTTTTGGTTGAACAAGTCTCTATCAACTTGTTGAGAGACCCTTATGAGTTCTAGAG
TGCTAAATATATGTAATGATGTCTACAAACAAAATTATAATAATATATATAAGCAAATAA
TAATTCTATCAACTTTTATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CG92TF U 1
AF RS1CG92JQ C 92
BS 1 638 RS1CG92TF
BS 639 801 RS1CG92JQ

RD RS1CG92TF 638 0 0
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GAATTGGTGGAGACGCCGGGAAGAAAAAGACTGTTCCTAACTCGAACTATGTAGTGCCTT
TGGACAAGTTCTCCTCCTCTTCTTCCATCACTCGTCCTCTGATTGAGATACTTCGAGATC
TCAACAAGAAGATCCCTGATAACATCGTCAAGAGCCATGATCCTGGATCCAGTGCAGCTT
CCTCTGGTTTCATCCCTTGGTTTCATGCAAACCGGATGCTCAGCTTCTACGCACCTGGTT
GGTGTGGGGAGGTTCGTGACGTCATTTTCTCAGAGAATGGTAATGTCACTGTTGTTTATC
GTCTTACCATTCGTGGCTCTGATGGTGAGGCACACCGAGAATCGACTGGGACATTAACAA
TCACTGATGATCACATCGAGGATCCGGTTGCTGCAGCTGAGGAAATAGCATTTTGCAGAG
CTTGTGCTCGATTTGGTCTCGGCTTGTATCTCTATCAC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1CG92JQ 710 0 0
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GTGGAGAGGAGTCAGATGCAGCAGCGGTGGAATTGGTGGAGACGCCGGGAAGAAAAAGAC
TGTTCCTAACTCGAACTATGTAGTGCCTTTGGACAAGTTCTCCTCCTCTTCTTCCATCAC
TCGTCCTCTGATTGAGATACTTCGAGATCTCAACAAGAAGATCCCTGATAACATCGTCAA
GAGCCATGATCCTGGATCCAGTGCAGCTTCCTCTGGTTTCATCCCTTGGTTTCATGCAAA
CCGGATGCTCAGCTTCTACGCACCTGGTTGGTGTGGGGAGGTTCGTGACGTCATTTTCTC
AGAGAATGGTAATGTCACTGTTGTTTATCGTCTTACCATTCGTGGCTCTGATGGTGAGGC
ACACCGAGAATCGACTGGGACATTAACAATCACTGATGATCACATCGAGGATCCGGTTGC
TGCAGCTGAGGAAATAGCATTTTGCAGAGCTTGTGCTCGATTTGGTCTCGGCTTGTATCT
CTATCACGAAGAGTAGGCCAAGTGTGCTTACCTTTTTTGGTTGAACAAGTCTCTATCAAC
TTGTTGAGAGACCCTTATGAGTTCTAGAGTGCTAAATATATGTAATGATGTCTACAAACA
AAATTATAATAATATATATAAGCAAATAATAATTCTATCAACTTTTATGC

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 4

CO CL2525Contig1 1061 4 14 U
AGAAGAGAAGCCACTGAGAGTTCTCAGGATAAAAAGTAGCAGGCCTCAAGATTCAGATAG
CGAGAAACTCGGAAAACACTCTAAAGAGCTGAGCCCTGCGAAGACGAAAAAATTGGTTAT
AAGCATAGGCCCTAGAAAGGCAGGGGTTACAAAACCGATGAGCTGCGATTCCTCAAAGCT
TGCCTCCAAATCCAACGGGAAGCATGTGAGAGTACAATCAGAAGAAACGGCTTCCCAAGA
AGAGCAGCAACGGAGCTTATTGAGAAAGAGTAGTGAAGAAAAGAGAGGGTCTCAAGTTGA
GGTAGGCACTTCAAAGGGTGAGCGCGGAGGAGATTCAAAGGGTGAGCGCGGAGGAGATTC
AAATGGTGGCCAACAAGAGTTGCAGAAAGATTCAAGAAGGCTGCTGAAACTGAAAATAAA
AACGCATAATCCGGAGAGCCAAGAACGTGAAGCCCCTAGAATTGTGTATGAAAGAAGCAA
ATCCGGTAAAGGACATAGGTCCAAGAGAAAGAGAGCACCACCTCCAGCAGAAAAATCAGC
TTTCAATGAAGATGAAGATGTGTCACTGTCACGTGAAGACAGTTTGTTAGACGAGATGCT
GGATGCTAGTTGGATTCTGAAGAAGTTGGGGAAGGATGCAAAAGGAAAACAGGTTCAAAT
ACACGAGGCCTCGGATAATACATGGGAGAAAGGGGTGGTAAGTGAAGTAGGAGGAGGAGG
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TAAAATATATACATTTTTGAAACAAATTTAGCTTTTGAAAATTTAAGAAAGGGTTAACAA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DQ18TF U 1
AF RS1DH81TF U 205
AF RS1DH81JQ C 208
AF RS1DQ18JQ C 263
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ATCCGGTAAAGGACATAGGTCCAAGAGAAAGAGAGCACCACCTCCAGCAGAAAAATCAGC
TTTCAATGAAGATGAAGATGTGTCACTGTCACGTGAAGACAGTTTGTTAGACGAGATGCT
GGATGCTAGTTGGATTCTGAAGAAGTTGGGGAAG*ATGCAAAAG
AAA

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1DH81TF 784 0 0
GGT
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CCTTTAGATTAG*CCTACTTTAGATGTTGTATGTAAAATATATACATTTCTGAAACAAAT
T

QA 4 784 4 784
DS 

RD RS1DH81JQ 846 0 0
GAGAGTACAATCAGAAGAAACGGCTTCCCAAGAAGAGCAGCAACGGAGCTTATTGAGAAA
GAGTAGTGAAGAAAAGAGAGGGTCTCAAGTTGAGGTAGGCACTTCAAAGGGTGAGCGCGG
AGGAGATTCAAAGGGTGAGCGCGGAGGAGATTCAAATGGTGGCCAACAAGAGTTGCAGAA
GGATTCAAGAAGGCTGCTGAAACTGAAAATAAAAACGCATAATCCGGAGAGCCAAGAACG
TGAAGCCCCTAGAATTGTGTATGAAAGAAGCAAATCCGGTAAAGGACATAGGTCCAAGAG
AAAGAGAGCATCACCTCCAGCAGAAAAATCAGCTTTCAATGAAGATGAAGATGTGTCACT
GTCACGTGAAGACAGTTTGTTAGACGAGATGCTGGATGCTAGTTGGATTCTGAAGAAGTT
GGGGAAGGATGCAAAAGGAAAACAGGTTCAAATACACGAGGCCTCGGATAATACATGGGA
GAAAGGGGTGGTAAGTGAAGTAGGAGGAGGAGGGACATCAAAGTTGATGGTGACGCTTGG
GAATGGAAAGGTGAAGACGGTGGAGCTAGGAAAGCAAGGGGTTAGATTTGTTGCTCAGAA
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CCTTTAGATTAGGCCTACTTTAGATGTTGTATGTAAAATATATACATTTTTGAAACAAAT
TTAGCTTTTGAAAATTTAAGAAAGGGTTAACAACAGCTGAATGAAATAAGAGATTCTAAG
AATTTT

QA 1 846 1 846
DS 

RD RS1DQ18JQ 799 0 0
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AAGAGAAAGAGAGCACCACCTCCAGCAGAAAAATCAGCTTTCAATGAAGATGAAGATGTG
TCACTGTCACGTGAAGACAGTTTGTTAGACGAGATGCTGGATGCTAGTTGGATTCTGAAG
AAGTTGGGGAAGGATGCAAAAGGAAAACAGGTTCAAATACACGAGGCCTCGGATAATACA
TGGGAGAAAGGGGTGGTAAGTGAAGTAGGAGGAGGAGGGACATCAAAGTTGATGGTGACG
CTTGGGAATGGAAAGGTTAAGACGGTGGAGCTAGGAAAGCAAGGGGTTAGATTTGTTGCT
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GATGAGCAGAAGACTTCGAGGAGGGGTTGGTATGTGAAGCAGTGCTAGCTTCTTTATCAT
CGATGCCTTTAGATTAGGCCTACTTTAGATGTTGTATGTAAAATATATACATTTTTGAAA
CAAATTTAGCTTTTGAAAATTTAAGAAAGGGTTAACAACAGCTGAATGAAATAAGAGATT
CTAAGAATTTTAAAAGAGG

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 2

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TTTTAGGAGGGAGGGGCATGATTGTTTGATTTTGGATTTGTATTGGGAAGAGAGACGGTG
ATTGTTTGGTGGATCTGTGTAAAATGCGTGTGCTTGGATTGAGCTCAAGCTTATGCTCAT
CTGAGGAGAAGGAGGTTGAAGAGATGGTTGTAGACGCCAGTTTAACACCCGTGTACCTCA
ACGTCTATGATCTAACACCTGTCAACAATTATCTCTATTGGTTTGGTCTTGGCATCTTTC
ACTCTGGTATTGAAGCTCATGGTTTCGAATATGGATATGGTGCTCACGAGTACTCAAGCA
GTGGGGTGTTTGAAGTTGAACCTAGGAACTGTCCTGGTTTCATCTTTAGGAGGTCAGTTT
TGTTGGGAACCACAAGCATGTCTCCCTCAGATTTCCGCTCGTTCATGGAGAAGCTTTCGA
GGAAGTATCATGGGGACACGTACCATTTGATTGCCAAGAACTGTAACCATTTCACTGAAG
AAGTGTGCTTGCAGGTAACAGGAAAGCCTATTCCCGGATGGATTAACCGGATGGCTCGTG
TAGGTTCGTTCTGTAACTGTATCCTTCCAGAAAGCATACAGCTCTCAACTGTTGGACAGC
CAGAAGCCCTTGAGTCTCTGATGATGATGATGGATCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CG38TF U 1
AF RS1D112TF U 3
BS 1 561 RS1CG38TF
BS 562 562 RS1D112TF
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BS 621 621 RS1D112TF
BS 622 698 RS1CG38TF

RD RS1CG38TF 698 0 0
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ATTGTTTGGTGGATCTGTGTAAAATGCGTGTGCTTGGATTGAGCTCAAGCTTATGCTCAT
CTGAGGAGAAGGAGGTTGAAGAGATGGTTGTAGACGCCAGTTTAACACCCGTGTACCTCA
ACGTCTATGATCTAACACCTGTCAACAATTATCTCTATTGGTTTGGTCTTGGCATCTTTC
ACTCTGGTATTGAAGCTCATGGTTTCGAATATGGATATGGTGCTCACGAGTACTCAAGCA
GTGGGGTGTTTGAAGTTGAACCTAGGAACTGTCCTGGTTTCATCTTTAGGAGGTCAGTTT
TGTTGGGAACCACAAGCATGTCTCCCTCAGATTTCCGCTCGTTCATGGAGAAGCTTTCGA
GGAAGTATCATGGGGACACGTACCATTTGATTGCCAAGAACTGTAACCATTTCACTGAAG
AAGTGTGCTTGCAGGTAACAG*AAAGCCTATTCCCGGATGGATTAACCGGATGGCTCGTG
TAG*TTCGTTCTGTAACTGTGTCCTTCCAGAAAGCATACAGCTCTCAACTGTTGGACAGC
CAGAAGCCCTTGAGTCTCTGATGATGATGATGGATCAG

QA 1 698 1 698
DS 

RD RS1D112TF 662 0 0
GGGGGG
AAAAAAGAGACCGTCCTTTTCCCCTAATCTCCGATCCCCAGATTCGTACAGATTTTAGGA
GGGAGGGGCT**ATTGTTTGATTTTGGATTTGTATTGGGAAGAGAGACGGTGATTGTTTG
GTGGATCTGTGTAAAATGCGTGTGCTTGGATTGAGCTCAAGCTTATGCTCATCTGAGGAG
AAGGAGGTTGAAGAGATGGTTGTAGACGCCAGTTTAACACCCGTGTACCTCAACGTCTAT
GATCTAACACCTGTCAACAATTATCTCTATTGGTTTGGTCTTGGCATCTTTCACTCTGGT
ATTGAAGCTCATGGTTTCGAATATGGATATGGTGCTCACGAGTACTCAAGCAGTGGGGTG
TTTGAAGTTGAACCTAGGAACTGTCCTGGTTTCATCTTTAGGAGGTCAGTTTTGTTGGGA
ACCACAAGCATGTCTCCCTCAGATTTCCGCTCGTTCATGGAGAAGCTTTCGAGGAAGTAT
CATGGGGACACGTACCATTTGATTGCCAAGAACTGTAACCATTTCACTGAAGAAGTGTTC
TTGCAGGTAACAGGAAAGCCTATTCCCGGATGGATTAACCGGATGGCTCGTGTAGGTTCG
TTCTGTAACTGTATCCTTCCAGAAAGCATACAGCTCTCAACTGTTGGACAGCCAGA

QA 7 662 7 662
DS 



AS 1 3

CO CL2527Contig1 1000 3 5 U
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GTCGTTACCTCAAGGAGAAAGGTAGCTTCGGAGATCTGAGCTTGGGGATGACATGCAACC
CCGACATCAATGGAGTTTTTGCTGTGTCACGTCAGCCAACGATGATGAATCTCTTCCCTT
GTGAAGAAGGTTCGTCTCCTCCTGAAGACGTTAAACCAAAGCATATGGTTCCTCCTCGCC
AGTCAAGCTTTTCTTCCTCCTCTTCCTCTCAAGTTAAGGAGGAAGTGGAGAAGACCGTGG
AGTCTCAATCGTCTCCGTTGACCATATTCTACGGTGGTCAAGTTATGGTGTTCGATGATT
TCCCTGCTGAGAAAGCCAAACAAGTCATTGACTTGGCTAACAAAGGAAGTGCTTATACTC
AAAACTTAGCCAAGAACCAAAAGGAAGTTCCTAGCCCTGCAATAACCGCAGCAGCACCAG
AGCCAATCCAGACCAACACGTCCTCTTTAGCTTGCGAACTCCCAATTGCTAGAAGAGCTT
CGCTTCATCGATTCCTGGAGAAGAGAAAGGATAGGATTACATCAAAGGCACCGTACCAGG
TAGACGGTTCAACCGAAGCGTCTTCAAAGCCTAACACATCTTGGCTCGGTTCTCAGTAAT
CTTGACCATATCTCTAAAGACTCTATTGATGCTCCATCGTTTTCAAATTACCAAGCTCCT
CCCTTGTTCATATTGTTTATATAAAATTGATATTTTTCACGTTTGTTCAAATGCACCATC
AGTAATATCTGTTGTATGAGTGTGGTCTTATAGTGTTCTTTTTTTGGGGCTTAAACCTAT
CTGCCGGTGTCAACATTTGCTTGCAACTTTTGTAAGAAACATCAGTTCTGTTGTTGTTCA
TTTTCTTTGTTGACGGCTTTAATATCATCTTAGTTTAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A370TF U 1
AF RS1A370TV U 7
AF RS1F843JQ C 255
BS 1 646 RS1A370TF
BS 647 647 RS1A370TV
BS 648 791 RS1A370TF
BS 792 811 RS1A370TV
BS 812 1000 RS1F843JQ

RD RS1A370TF 791 0 0
CACAGAGAGGCAGAGAGAGAGAGAGATCAAAGAAAGAAAGAAAACCGTAATTTTAAGGCA
GAAGAACGATGTCGAGCTTACAGAAGAAGCCGAGCTTCTCAGAAACATGTAGTCGTTTGA
GTCGTTACCTCAAGGAGAAAGGTAGCTTCGGAGATCTGAGCTTGGGGATGACATGCAACC
CCGACATCAATGGAGTTTTTGCTGTGTCACGTCAGCCAACGATGATGAATCTCTTCCCTT
GTGAAGAAGGTTCGTCTCCTCCTGAAGACGTTAAACCAAAGCATATGGTTCCTCCTCGCC
AGTCAAGCTTTTCTTCCTCCTCTTCCTCTCAAGTTAAGGAGGAAGTGGAGAAGACCGTGG
AGTCTCAATCGTCTCCGTTGACCATATTCTACGGTGGTCAAGTTATGGTGTTCGATGATT
TCCCTGCTGAGAAAGCCAAACAAGTCATTGACTTGGCTAACAAAGGAAGTGCTTATACTC
AAAACTTAGCCAAGAACCAAAAGGAAGTTCCTAGCCCTGCAATAACCGCAGCAGCACCAG
AGCCAATCCAGACCAACACGTCCTCTTTAGCTTGCGAACTCCCAATTGCTAGAAGAGCTT
CGCTTCATCGATTCCTGGAGAAGAGAAAGGATAGGATTACATCAAACGCACCGTACCAGG
TAGACGGTTCAACCGAAGCGTCTTCAAAGCCTAACACATCTTGGCTCGGTTCTCAGTAAT
CTTGACCATATCTCTAAAGACTCTATTGATGCTCCATCGTTTTCAAATTACCAAGCTCCT
CCCTTGTTCAT

QA 1 791 1 791
DS 

RD RS1A370TV 805 0 0
GAGG
CAGAGAGAGAGAGAGATCAAAGAAAGAAAGAAAACCGTAATTTTAAGGCAGAAGAACGAT
GTCGAGCTTACAGAAGAAGCCGAGCTTCTCAGAAACATGTAGTCGTTTGAGTCGTTACCT
CAAGGAGAAAGGTAGCTTCGGAGATCTGAGCTTGGGGATGACATGCAACCCCGACATCAA
TGGAGTTTTTGCTGTGTCACGTCAGCCAACGATGATGAATCTCTTCCCTTGTGAAGAAGG
TTCGTCTCCTCCTGAAGACGTTAAACCAAAGCATATGGTTCCTCCTCGCCAGTCAAGCTT
TTCTTCCTCCTCTTCCTCTCAAGTTAAGGAGGAAGTGGAGAAGACCGTGGAGTCTCAATC
GTCTCCGTTGACCATATTCTACGGTGGTCAAGTTATGGTGTTCGATGATTTCCCTGCTGA
GAAAGCCAAACAAGTCATTGACTTGGCTAACAAAGGAAGTGCTTATACTCAAAACTTAGC
CAAGAACCAAAAGGAAGTTCCTAGCCCTGCAATAACCGCAGCAGCACCAGAGCCAATCCA
GACCAACACGTCCTCTTTAGCTTGCGAACTCCCAATTGCTAGAAGAGCTTCGCTTCATCG
ATTCCTGGAGAAGAGAAAGGATAGGATTACATCAAAGGCACCGTACCAGGTAGACGGTTC
AACCGAAGCGTCTTCAAAGCCTAACACATCTTGGCTCGGTTCTCAGTAATCTTGACCATA
TCTCTAAAGACTCTATTGATGCTCCATCGTTTTCAAATTACCAAGCTCCTCCCTTGTTCA
TATTGTTTATATAAAATTGAT

QA 5 805 5 805
DS 

RD RS1F843JQ 746 0 0
TCTCCTCCTGAAGACGTTAAACCAAAGCATATGGTTCCTCCTCGCCAGTCAAGCTTTTCT
TCCTCCTCTTCCTCTCAAGTTAAGGAGGAAGTGGAGAAGACCGTTGAGTCTCAATCGTCT
CCGTTGACCATATTCTACGGTGGTCAAGTTATGGTGTTCGATGATTTCCCTGCTGAGAAA
GCCAAACAAGTCATTGACTTGGCTAACAAAGGAAGTGCTTATACTCAAAACTTAGCCAAG
AACCAAAAGGAAGTTCCTAGCCCTGCAATAACCGCAGCAGCACCAGAGCCAATCCAGACC
AACACGTCCTCTTTAGCTTGCGAACTCCCAATTGCTAGAAGAGCTTCGCTTCATCGATTC
CTGGAGAAGAGAAAGGATAGGATTACATCAAAGGCACCGTACCAGGTAGACGGTTCAACC
GAAGCGTCTTCAAAGCCTAACACATCTTGGCTCGGTTCTCAGTAGTCTTGACCATATCTC
TAAAGACTCTATTGATGCTCCATCGTTTTCAAATTACCAAGCTCCTCCCTTGTTCATATT
GTTTATATAAAATTGATATTTTTCACGTTTGTTCAAATGCACCATCAGTAATATCTGTTG
TATGAGTGTGGTCTTATAGTGTTCTTTTTTTGGGGCTTAAACCTATCTGCCGGTGTCAAC
ATTTGCTTGCAACTTTTGTAAGAAACATCAGTTCTGTTGTTGTTCATTTTCTTTGTTGAC
GGCTTTAATATCATCTTAGTTTAATT

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 4

CO CL2528Contig1 1089 4 6 U
CCTAAAAAGTCAACTATAATCTTTAAAATCAGCAATTATGATTAAATAACCCACTCAAAT
TGTTTTAGAGTTATCCTTCTCTGTTATACTGCAACACAAGAATGCCACAAATCATTTGTG
TGTAAGCTAAAAGATACACAAAAAAAAGCCAGAACACATGAATCTAGAACACAGAAGAAG
TTGATAAAACAAAATATAGTAAGCCAAATCACAAAGATATGAACAAATATCCCTAGTACT
GAGATTCACTTTTCTCCGCTGCTTTGATCATCCTCTTATAGCAAGCAAGCAATCAAGTCA
TACCAATTTCTTGTGTGTTAAAAAAGCTGCTGTAATTAGTCTGGTGAAACAAACCGGCAG
TTTTTTTCCACCTGCAGCTACTGATACTTCTTTTCTTTGCTTACGGGCATTGGAATCTTC
CTTGAGATATTTCGAATGACTTTAGAAGTTGAATTCAGCTTATCATCGATGTGATCTTGG
TACTTCTCGTACACAACAGGAAGAGAAAGACTGAGAAGAATCACAATGTAGACAAGAGTG
AGGGAGTTGATTAAAGTCCCAACATAGGATATAGCCCACAAGACAAATGAAACCTGAAGG
AGACGAATTGGATTTCTAGCAATGGTGATATCACTTGCAATTGAGAGCACATGATTAATC
AAAACCAGAATATCATCAGCAGCCTTGATTGCAAACCCCTCAGGGATTTCCATATTGGGT
ACTGGAGGTAGAGGTCGGTTGAGTAGTGAAGCAGACTTGGCCCATAAGAAGAGGATGGCG
ACAAGAAGAAGCAGAACATTGGAGACGAAAGACAAGAGATTGTAACCAGCTCTCTCGAAC
AGAAACCAAAACACAGTAGAAGAGACTAGCAAAATGGCAGCACCTGTCCGGTTTCTCCAT
AGCAGCAAATCAGCAACTGAGCCACCACCAAGAGATTTGTGAACATATGAAGAAGACGCG
GAATCTCCCATAGCGTATTCAGCTAGGGTTCTTCCGCATATAAAGCAAAAAGTAATTCAA
CGAATCGATACTCTCTTTGATTCGAAAGATCAACGGATCAATTGTGCCTGCTCTCTCTTT
CTACATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1BA57JQ U 40
AF RS1E061TF C 362
AF RS1BA57TF C 394
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TGTTTTAGAGTTATCCTTCTCTGTTATACTGCAACACAAGAATGCCACAAATCATTTGTG
TGTAAGCTAAAAGATACACAAAAAAAAGCCAGAACACATGAATCTAGAACACAGAAGAAG
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GAGATTCACTTTTCTCCGCTGCTTTGATCATCCTCTTATAGCAAGCAAGCAATCAAGTCA
TACCAATTTCTTGTGTGTTAAAAAAGCTGCTGTAATTAGTCTGGTGAAACAAACCGGCAG
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CTTGAGATATTTCGAATGACTTTAGAAGTTGAATTCAGCTTATCATCGATGTGATCTTGG
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AGACGAATTGGATTTCTAGCAATGGTGATATCACTTGCAATTGAGAGCACATGATTAATC
AAAACCAGAATATCATCAGCAGCCTTGATTGCAAACC

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DS 

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GAATGCCACAAATCATTTGTGTGTAAGCTAAAAGATACACAAAAAAAAGCCAGAACACAT
GAATCTAGAACACAGAAGAAGTTGATAAAACAAAATATAGTAAGCCAAATCACAAAGATA
TGAACAAATATCCCTAGTACTGAGATTCACTTTTCTCCGCTGCTTTGATCATCCTCTTAT
AGCAAGCAAGCAATCAAGTCATACCAATTTCTTGTGTGTTAAAAAAGCTGCTGTAATTAG
TCTGGTGAAACAAACCGGCAGTTTTTTTCCACCTGCAGCTACTGATACTTCTTTTCTTTG
CTTACGGGCATTGGAATCTTCCTTGAGATATTTCGAATGACTTTAGAAGTTGAATTCAGC
TTATCATCGATGTGATCTTGGTACTTCTCGTACACAACAGGAAGAGAAAGACTGAGAAGA
ATCACAATGTAGACAAGAGTGAGGGAGTTGATTAAAGTCCCAACATAGGATATAGCCCAC
AAGACAAATGAAACCTGAAGGAGACGAATTGGATTTCTAGCAATGGTGATATCACTTGCA
ATTGAGAGCACATGATTGATCAAAACCAGAATATCATCAGCAGCCTTGATTGCAAACCCC
TCAGGGATTTCCATATTGGGTACTGGAGGTAGAGGTCGGTTGAGTAGTGAAGCAGACTTG
GCCCATAAGA

QA 1 730 1 730
DS 

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TTTTTTCCAC*TGCAGCTACTGATACTTCTTTTCTTTGCTTACGGGCATTGGAATCTTCC
TTGAGATATTTCGAATGACTTTAGAAGTTGAATTCAGCTTATCATCGATGTGATCTTGGT
ACTTCTCGTACACAACAGGAAGAGAAAGACTGAGAAGAATCACAATGTAGACAAGAGTGA
GGGAGTTGATTAAAGTCCCAACATAGGATATAGCCCACAAGACAAATGAAACCTGAAGGA
GACGAATTGGATTTCTAGCAATGGTGATATCACTTGCAATTGAGAGCACATGATTAATCA
AAACCAGAATATCATCAGCAGCCTTGATTGCAAACCCCTCAGGGATTTCCATATTGGGTA
CTGGAGGTAGAGGTCGGTTGAGTAGTGAAGCAGACTTGGCCCATAAGAAGAGGATGGCGA
CAAGAAGAAGCAGAACATTGGAGACGAAAGACAAGAGATTGTAACCAGCTCTCTCGAACA
GAAACCAAAACACAGTAGAAGAGACTAGCAAAATGGCAGCACCTGTCCGGTTTCTCCATA
GCAGCAAATCAGCAACTGAGCCACCACCAAGAGATTTGTGAACATATGAAGAAGACGCGG
AATCTCCCATAGCGTATTCAGCTAGGGTTCTTCCGCATATAAAGCAAAAAGTGATTCAAC
GAATCGATACTCTCTTTGA

QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1BA57TF 696 0 0
TCTTTGCTTACGGGCATTGGAATCTTCCTTGAGATATTTCGAATGACTTTAGAAGTTGAA
TTCAGCTTATCATCGATGTGATCTTGGTACTTCTCGTACACAACAGGAAGAGAAAGACTG
AGAAGAATCACAATGTAGACAAGAGTGAGGGAGTTGATTAAAGTCCCAACATAGGATATA
GCCCACAAGACAAATGAAACCTGAAGGAGACGAATTGGATTTCTAGCAATGGTGATATCA
CTTGCAATTGAGAGCACATGATTGATCAAAACCAGAATATCATCAGCAGCCTTGATTGCA
AACCCCTCAGGGATTTCCATATTGGGTACTGGAGGTAGAGGTCGGTTGAGTAGTGAAGCA
GACTTGGCCCATAAGAAGAGGATGGCGACAAGAAGAAGCAGAACATTGGAGACGAAAGAC
AAGAGATTGTAACCAGCTCTCTCGAACAGAAACCAAAACACAGTAGAAGAGACTAGCAAA
GTGGCAGCACCTGTCCGGTTTCTCCATAGCAGCAAATCAGCAACTGAGCCACCACCAAGA
GATTTGTGAACATATGAAGAAGACGCGGAATCTCCCATAGCGTATTCAGCTAGGGTTCTT
CCGCATATAAAGCAAAAAGTAATTCAACGAATCGATACTCTCTTTGATTCGAAAGATCAA
CGGATCAATTGTGCCTGCTCTCTCTTTCTACATCCC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 4

CO CL2529Contig1 991 4 7 U
GGAAGAGTCCTCAGATCGTGTTTGATTCTCTCAAGAGCCAAGAGAGAAGGGATCTCACAA
GTAGGGGAGAAGATAACTAGGGTATGGCGGAGGATCTGGTTCTAGATACGGCGATTAGAG
ATTGGGTTCTGATCCCTCTCTCTGTTGTGATGATTCTCATCGGTATCCTCCGATACTTGG
TCTCCAAGCTCATGCGTTCTTCTCCATCTCCTGATGCTAAGATGGTCAAAGAAGGTCAAG
TCATTATCAGAGCTCGGAATCTAAAAGCCGCCGCCAATTTCATCCCGTTGAGATCATTCC
GCACTCGTAGACTCTACTTTAGCAACGAGGAGAATGGTTTGCTACACGTTCCCAAGGGCC
AAGCCACAAACCCTCAAGCTCAGATGTTTTCTGATCCTAACATGGCCATGGATATGATGA
AGAAGAACCTTTCCATGATTATTCCCCAGACGCTCACTTTTGCATGGGTCAACTTCTTCT
TCTCTGGATTTGTCGCAGCCAAAATACCGTTCCCACTGACCCAGAGGTTCAGATCAATGT
TACAAAATGGCATCGACTTGAGTACTGTCGATGTTAGCTATGTGAGTAGTCGTTCCTGGT
ACTTTTTAAACTTGTTTGGATTAAGAGGCCTGTTCAGTCTCATTCTCGGGGATGAAAATG
CCATTGATGACACGCAACGTATGATGCAAATGGGTGGGTTTGGATTTGATGCATCAAAGA
GCTTGGGTGCGGAGAAAGATGGTCTGGACATAATTCAGCACGATTGGGCTCTAC*TCGAT
TCGAGCAGCGTGCAGAGTCCGTATTGAGAAAACTCGTGAAGTAGACGATATTAGTTTTTT
GACACAAAACGTTGAGACAAACTCTGTAGAAGCTTCCACATAAACCCAAATCTTCTGTTT
TCCTTTTGCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTTAAAACTGTGATCTCTGTAAAATCTT
CTTCGGAACAGTTCCAGTTTATTTTTGTACG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GI14TF U 1
AF RS1CD75TF U 2
AF RS1CD75JQ C 499
AF RS1GI14JQ C 480
BS 1 733 RS1GI14TF
BS 734 752 RS1CD75TF
BS 753 753 RS1GI14JQ
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BS 937 937 RS1CD75JQ
BS 938 991 RS1GI14JQ

RD RS1GI14TF 733 0 0
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GTAGGGGAGAAGATAACTAGGGTATGGCGGAGGATCTGGTTCTAGATACGGCGATTAGAG
ATTGGGTTCTGATCCCTCTCTCTGTTGTGATGATTCTCATCGGTATCCTCCGATACTTGG
TCTCCAAGCTCATGCGTTCTTCTCCATCTCCTGATGCTAAGATGGTCAAAGAAGGTCAAG
TCATTATCAGAGCTCGGAATCTAAAAGCCGCCGCCAATTTCATCCCGTTGAGATCATTCC
GCACTCGTAGACTCTACTTTAGCAACGAGGAGAATGGTTTGCTACACGTTCCCAAGGGCC
AAGCCACAAACCCTCAAGCTCAGATGTTTTCTGATCCTAACATGGCCATGGATATGATGA
AGAAGAACCTTTCCATGATTATTCCCCAGACGCTCACTTTTGCATGGGTCAACTTCTTCT
TCTCTGGATTTGTCGCAGCCAAAATACCGTTCCCACTGACCCAGAGGTTCAGATCAATGT
TACAAAATGGCATCGACTTGAGTACTGTCGATGTTAGCTATGTGAGTAGTCGTTCCTGGT
ACTTTTTAAACTTGTTTGGATTAAGAGGCCTGTTCAGTCTCATTCTCGGGGATGAAAATG
CCATTGATGACACGCAACGTATGATGCAAATGGGTGGGTTTGGATTTGATGCATCAAAGA
GCTTGGGTGCGGA

QA 1 733 1 733
DS 

RD RS1CD75TF 815 0 0
GGG
GAGTCCTCAGATCGTGTTTGATTCTCTCAAGAGCCAAGAGAGAAGGGATCTCACAAGTAG
GGGAGAAGATAACTAGGGTATGGCGGAGGATCTGGTTCTAGATACGGCGATTAGAGATTG
GGTTCTGATCCCTCTCTCTGTTGTGATGGTTCTCATCGGTATCCTCCGATACTTGGTCTC
CAAGCTCATGCGTTCTTCTCCATCTCCTGATGCTAAGATGGTCAAAGAAGGTCAAGTCAT
TATCAGAGCTCGGAATCTAAAAGCCGCCGCCAATTTCATCCCGTTGAGATCATTCCGCAC
TCGTAGACTCTACTTTAGCAACGAGGAGAATGGTTTGCTACACGTTCCCAAGGGCCAAGC
CACAAACCCTCAAGCTCAGATGTTTTCTGATCCTAACATGGCCATGGATATGATGAAGAA
GAACCTTTCCATGATTATTCCCCGGACGCTCACTTTTGCATGGGTCAACTTCTTCTTCTC
TGGATTTGTTGCAGCCAAAATACCGTTCCCACTGACCCAGAGGTTCAGATCAATGTTACA
AAATGGCATCGACTTGAGTACTGTCGATGTTAGCTATGTGAGTAGTCGTTCCTGGTACTT
TTTAGACTTGTTTGGATTAAGAGGCTTGTTCAGTCTCATTCTCGGGGATGAAAATGCCAT
TGATGACACGCAACGTATGATGCAAATGGGTGGGTTTGGATTTGATGCATCAA*GAGCTT
GGGTGCGGAGAAAGATGGTCTGGACATA*TTCAGCACGATTGGGCTCTAC*TCGATTCGA
GCAGCGTGCAGAGTCCGTATTGAGAAAACTCG

QA 4 815 4 815
DS 

RD RS1CD75JQ 444 0 0
CCAAAATACCGTTCCCACTGACCCAGAGGTTCAGATCAATGTTACAAAATGGCATCGACT
TGAGTACTGTCGATGTTAGCTATGTGAGTAGTCGTTCCTGGTACTTTTTAGACTTGTTTG
GATTAAGAGGCTTGTTCAGTTTCATTTTCGGGGATGAAAATGCCATTGATGACCCGCAAC
GTATGATGCAAATGGGGGGGTTTGGATTTGATGCATCAAAGAGCTTGGGGGCGGAGAAAG
ATGGTCTGGACATAATTCAGCCCGATTGGGCTTTACCTCGATTCGAGCAGCGTGCAGAGT
CCGTATTGAGAAAACTCGTGAAGTAGACGATATTAGTTTTTTGACACAAAACGTTGAGAC
AAACTCTGTAGAAGCTTCCCCATAAACCCAAATTTTTTGTTTTGCTTTTGCTTTTTCTTT
TTTTTTTTCTTTTTGTTAAAACTG

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DS 

RD RS1GI14JQ 512 0 0
TTCTCTGGATTTGTCGCAGCCAAAATACCGTTCCCACTGACCCAGAGGTTCAGATCAATG
TTACAAAATGGCATCGACTTGAGTACTGTCGATGTTAGCTATGTGAGTAGTCGTTCCTGG
TACTTTTTAAACTTGTTTGGATTAAGAGGCCTGTTCAGTTTCATTTTCGGGGATGAAAAT
GCCATTGATGACACGCAACGTATGATGCAAATGGGTGGGTTTGGATTTGATGCATCAAAG
AGCTTGGGTGCGGAGAAAGATGGTCTGGACATAATTCAGCACGATTGGGCTCTAC*TCGA
TTCGAGCAGCGTGCAGAGTCTGTATTGAGAAAACTCGTGAAGTAGACGATATTAGTTTTT
TGACACAAAACGTTGAGACAAACTCTGTAGAAGCTTCCACATAAACCCAAATCTTCTGTT
TTCCTTTTGCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGTTATAACTGTGATCTCTGTAAAATCT
TCTTCGGAACAGTTCCAGTTTATTTTTGTACG

QA 1 512 1 512
DS 



AS 1 2

CO CL2530Contig1 1097 2 4 U
GGAAACTAGGTTTATCTAGTGGAACCTCCCCCGCACAGATTCAAATCAGTCGCCTGCTCA
CCTGAATCATCTTCTCAAGCTCAATTTTTGATTTTTGAAGGAAAGATGGTGAGGCCGTAC
GGGATTAAGGTGAACAAGAGAAGGAGAGAAGAGAGAGGTACGATAAGGAAGAAGATGAAG
AAGATGAGCAGCCTAAGTTTGAGCAGAAACGAAAAGAAGTGAAGAAAGCTAAGAGAGAAG
AAGCCACCTCAAATGCAGAGGAGGAAGATGATGAAGAGAACGAGATAGCTGAGGAAGCAG
CAGATGAGCTTGATGTGGGAATACCTATTGTCGTGTCTGGTAATAAGAAGGACCAGACTG
GTGTTATTTTTGTGCTTGAGAAGGCTTCTCTCGAAGTTGCCAAAGTTGGAAAGACTTACC
AGCTACTGAACTCTGATGATCATGCTAATTTCTTGAGGAAGAATGGAAGAGATCCTGCTC
ATTACAGGCCAGACATCACTCATCAGGCTCTTTTGATGATTTTGGATAGTCCGGTCAACA
AGGCTGGGAGGTTGAAAGCGGCGTATGTTAGAACAGAGCAAGGTGTTCTTTTTGAAGTTA
AGCCACATGTTCGTATACCAAGAACTTTCAAGCGTTTCGCTGGAATCATGTTGCAATTGC
TACAGAAGCTTAGCATTAGTGCATCTGGGAAGCGTGAGAAACTTATGAGGGTGATCAAGA
ACCCTGTTACAAGCCACCTTCCGCCTAACTGTAGAAAAATAGGGTTCTCGTATAGCTCTG
AGAAGCTGGTCAACATGCAGAAGCACCTATCTACTGTCTGTAATGAGACCGACACTGTTT
TTGTGCTCGGTGCGATGTCACACGGGAAAATTGAGTGCGACTATATTGATGATTTTGTGG
CCATTTCAGGGTATCCTCTTAGCGCAGCTTACTGTATCTCAAGAATCTGCGAGGCTTTAT
CGACAAATTGGAATATTATATAAACACATGTATTTGCAAGAAGGTCCCTTTTGTTTTACT
CCCTACTGTTCTAATGATGGAACCACTTTAAGTTTGTGTTTATGCACATTGTTCTATCTA
TTATCGGATTTTTAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AJ15TF U 1
AF RS1AA84JQ C 449
BS 1 466 RS1AJ15TF
BS 467 467 RS1AA84JQ
BS 468 790 RS1AJ15TF
BS 791 1097 RS1AA84JQ

RD RS1AJ15TF 790 0 0
GGAAACTAGGTTTATCTAGTGGAACCTCCCCCGCACAGATTCAAATCAGTCGCCTGCTCA
CCTGAATCATCTTCTCAAGCTCAATTTTTGATTTTTGAAGGAAAGATGGTGAGGCCGTAC
GGGATTAAGGTGAACAAGAGAAGGAGAGAAGAGAGAGGTACGATAAGGAAGAAGATGAAG
AAGATGAGCAGCCTAAGTTTGAGCAGAAACGAAAAGAAGTGAAGAAAGCTAAGAGAGAAG
AAGCCACCTCAAATGCAGAGGAGGAAGATGATGAAGAGAACGAGATAGCTGAGGAAGCAG
CAGATGAGCTTGATGTGGGAATACCTATTGTCGTGTCTGGTAATAAGAAGGACCAGACTG
GTGTTATTTTTGTGCTTGAGAAGGCTTCTCTCGAAGTTGCCAAAGTTGGAAAGACTTACC
AGCTACTGAACTCTGATGATCATGCTAATTTCTTGAGGAAGAATGGCAGAGATCCTGCTC
ATTACAGGCCAGACATCACTCATCAGGCTCTTTTGATGATTTTGGATAGTCCGGTCAACA
AGGCTGGGAGGTTGAAAGCGGCGTATGTTAGAACAGAGCAAGGTGTTCTTTTTGAAGTTA
AGCCACATGTTCGTATACCAAGAACTTTCAAGCGTTTCGCTGGAATCATGTTGCAATTGC
TACAGAAGCTTAGCATTAGTGCATCTGGGAAGCGTGAGAAACTTATGAGGGTGATCAAGA
ACCCTGTTACAAGCCACCTTCCGCCTAACTGTAGAAAAATAGGGTTCTCGTATAGCTCTG
AGAAGCTGGT

QA 1 790 1 790
DS 

RD RS1AA84JQ 649 0 0
TTTCTTGAGGAAGAATGGAAGAGATCCTGCTCATTACAGGCCAGACATCACTCATCAGGC
TCTTTTGATGATTTTGGATAGTCCGGTCAACAAGGCTGGGAGGTTGAAAGCGGTGTATGT
TAGAACAGAGCAAGGTGTTCTTTTTGAAGTTAAGCCACATGTTCGTATACCAAGAACTTT
CAAGCGTTTCGCTGGAATCATGTTGCAATTGCTACAGAAGCTTAGCATTAGTGCATCTGG
GAAGCGTGAGAAACTTATGAGGGTGATCAAGAACCCTGTTACAAGCCACCTTCCGCCTAA
CTGTAGAAAAATAGGGTTCTCGTATAGCTCTGAGAAGCTGGTCAACATGCAGAAGCACCT
ATCTACTGTCTGTAATGAGACCGACACTGTTTTTGTGCTCGGTGCGATGTCACACGGGAA
AATTGAGTGCGACTATATTGATGATTTTGTGGCCATTTCAGGGTATCCTCTTAGCGCAGC
TTACTGTATCTCAAGAATCTGCGAGGCTTTATCGACAAATTGGAATATTATATAAACACA
TGTATTTGCAAGAAGGTCCCTTTTGTTTTACTCCCTACTGTTCTAATGATGGAACCACTT
TAAGTTTGTGTTTATGCACATTGTTCTATCTATTATCGGATTTTTAGAT

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 4

CO CL2531Contig1 649 4 10 U
GGACTTTAGCAACAACAACAAGGAGATAAGTCTTTATTGTGTGTTTGATCTGAGAAACAT
GGCATCGTCTGCAACCATGGCCGCGGTTCAACCATCCTCCGCTGTGAAAGGACTCGGAGG
AAGCTCTCTCACCGGAGCTAAGCTCTTCATCAAGCCTTCTCGCCAAAGCTTCAAACCCAA
ATCCACAAGAGCTGGTGCCGTGGTGGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTATACTTTGATTT
AGAAGATTTGGGTAACACAACAGGACAATGGGATTTGTATGGATCTGATGCTCCTTCTCC
TTACAACCCACTTCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTTGCTGCTCCTTTCACAAAGAGGGG
TTTGCTTCTCAAGTTTTTGATTCTTGGAGGAGGCCCTCTGCTTACTTATGTCAGTGCTTC
CTCAACTGGTGATGTTCTTCCTATCAAGAGAGGCCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTCGGTCC
ACGCGGCAAGCTTTAAATTAGCTTTCTAAATCCCTTGAAAACATCAGAAACTTTCTTCCC
AAGTCTCTGGACTCCTGTTACTGATCTATGTATATTGTGTTGTGTTAATTGCTTTGCAAG
CTGCTGAATTGTAATGAATCAATGAAAAAAATTGCATTTCAAGTCTGCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1BO71JQ C 1
AF RS1FL74JQ C 11
AF RS1FL74TF U 11
AF RS1BO71TF U 1
BS 1 13 RS1BO71TF
BS 14 317 RS1FL74TF
BS 318 318 RS1BO71TF
BS 319 344 RS1FL74TF
BS 345 345 RS1BO71TF
BS 346 423 RS1FL74TF
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BS 459 459 RS1BO71TF
BS 460 649 RS1FL74TF

RD RS1BO71JQ 649 0 0
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TTTGCTTCTCAAGTTTTTGATTCTTGGAGGAGGCTCTCTGCTTACTTATGTCAGTGCTTC
CTCAACTGGTGATGTTCTTCCTATCAAGAGAGGCCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTCGGTCC
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AAGTCTCTGGACTCCTGTTACTGATCTATGTATATTGTGTTGTGTTAATTGCTTTGCAAG
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QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1FL74JQ 639 0 0
GGG
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ACCATGGCCGCGGTTCAACCATCCTCCGCTGTGAAAGGACTCGGAGGAAGCTCTCTCACC
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TTTTTGATTCTTGGAGGAGGCCCTCTGCTTACTTATGTCAGTGCTTCCTCGACTGGTGAT
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TAAATTAGCTTTCTAAATCCCTTGAAAACATCAGAAACTTTCTTCCCAAGTCTCTGGACT
CCTGTTACTGATCTATGTATATTGTGTTGTGTTAATTGCTTTGCAAGCTGCTGAATTGTA
ATGAATCAATGAAAAAAATTGCATTTCAAGTCTGCT

QA 4 639 4 639
DS 

RD RS1FL74TF 639 0 0
GGG
AACAACAAGGAGATAAGTCTTTATTGTGTGTTTGATCTGAGAAACATGGCATCGTCTGCA
ACCATGGCCGCGGTTCAACCATCCTCCGCTGTGAAAGGACTCGGAGGAAGCTCTCTCACC
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GGTGCCGTGGTGGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTATACTTTGATTTAGAAGATTTGGGT
AACACAACAGGACAATGGGATTTGTATGGATCTGATGCTCCTTCTCCTTACAACCCACTT
CAGATCAAGTTCTTTGAGACATTTGCTGCTCTTTTCACAAAGAGGGGTTTGCTTCTCAAG
TTTTTGATTCTTGGAGGAGGCCCTCTGCTTACTTATGTCAGTGCTTCCTCGACTGGTGAT
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TAAATTAGCTTTCTAAATCCCTTGAAAACATCAGAAACTTTCTTCCCAAGTCTCTGGACT
CCTGTTACTGATCTATGTATATTGTGTTGTGTTAATTGCTTTGCAAGCTGCTGAATTGTA
ATGAATCAATGAAAAAAATTGCATTTCAAGTCTGCT

QA 4 639 4 639
DS 

RD RS1BO71TF 630 0 0
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GGCATCGTTTGCAACCATGGCCGCGGTTCAACCATCCTCCGCTGTGAAAGGACTCGGAGG
AAGCTCTCTCACCGGAGCTAAGCTCTTCATCAAGCCTTCTCGCCAAAGCTTCAAACCCAA
ATCCACAAGAGCTGGTGCCGTGGTGGCCAAGTATGGAGACAAAAGTGTATACTTTGATTT
AGAAGATTTGGGTAACACAACAGGACAATGGGATTTGTATGGATCTGATGCTCCTTCTCC
TTACAACCCACTTCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTTGCTGCTCCTTTCACAAAGAGGGG
TTTGCTTCTCAAGTTTTTGATTCTTGGAGGAGGCTCTCTGCTTACTTATGTCAGTGCTTC
CTCAACTGGTGATGTTCTTCCTATCAAGAGAGGCCCTCAAGAGAAGCCTAAGCTCGGTCC
ACGTGGCAAGCTTTAAATTAGCTTTCTAAATCCCTTGAAAACATCAGAAACTTTCTTCCC
AAGTCTCTGGACTCCTGTTACTGATCTATGTATATTGTGTTGTGTTAATTGCTTTGCAAG
CTGCTGAATTGTAATGAATCAATGAAAAAA

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 4

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ATCCTCTAGATGCGTCTTCTTCCTACAGCTTCTTCTGATTTGTCTCTTCATTTTCAGTTT
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GTTTTTTTGTCTTGATTATGATCATGGATTCATGATGATGATTACTCCTGGAGATTGAAT
CTCTGTTGTTTACCATCAGATTATGATGATGATGATGATGATTCCTTTTCTTCCATATTC
AATTTATTCATATATTATTC


BQ
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DJ13TF U 1
AF RS1DW15JQ C 1
AF RS1DW15TF U 1
AF RS1DL43TF U 1
BS 1 132 RS1DJ13TF
BS 133 133 RS1DW15TF
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DS 

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CGTCAAGGAGTTGCGTTACTGGTTTCGCGTTATTCACATTTGTTTTCGCCGTCATCTCGT
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ATCCTCTAGATGCGTCTTCTTCCTACAGCTTCTTCTGATTTGTCTCTTCATTTTCAGTTT
TTGTTTTTTTT*GTGTGGATAAAATTCCCGAGTATGGTTATTAATTTGCTCATGATTTAT
GTTTTTTTGTCTTGATTATGATCATGGATTCATGATGATGATTACTCCTGGAGATTGAAT
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TCC

QA 1 510 1 510
DS 

RD RS1DW15TF 513 0 0
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CTCTCGCCAGCGCTCAATCTCTAGCTCCCGCTCCTGCTCCGACCAGTGATGGGACATCGA
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ATCCTCTAGATGCGTCTTCTTCCTACAGCTTCTTCTGATTTGTCTCTTCATTTTCAGTTT
TTGTTTTTTTT*GTGTGGATAAAATTCCCGAGTATGGTTATTAATTTGCTCATGATTTAT
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TCC

QA 1 510 1 510
DS 

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CGTCAAGGAGTTACGTTACTGGTTTCGCGTTATTCACATTTGTTTTCGCCGTCATCTCGT
CTCTCGCCAGCGCTCAATCTCTAGCTCCCGCTCCTGCTCCGACCAGTGATGGGACATCGA
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ATCCTCTAGATGCGTCTTCTTCCTACAGCTTCTTCTGAGTTGTCTCTTTATTTTCAGTTT
TTGTTTTTTTTTGTGTGGATAAAAATCCCGAGTATGGTTATTAATTTGCTCATGATTTAT
GTTTTTT*GTCTTGATTATGATCATGGATTCATGATGATGATGACTCCTGGAGATTGAAT
CTCTGTTGTTTTCCATCAGATTATGATGATGATGATGATGATTCCTTTTCTTCCATATTC
AATTTATTCATATATTATTC

QA 1 560 1 560
DS 



AS 1 3

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TCATGCCATTATTTCTGTCAAGGACGGCCAAGAGGGAGGTTGGAAACACGAGGCCTTCTT
GCTGTTTCCTGTTCACCTCGATGGGACCTTGCTGGATAATTCAACATCCATGAAGGCTAA
AAAGGAAACATTCTCAACAACTGATGTTTTGCATATATTTCGTCAGCTTTGTGATGGACT
CAGACACATGCACTCTCTGGAGCCGCCGTATGCACACAATGATGTCAAACCTGGAAACGT
GCTTTTAACACGTCGAAAAGGACAGCCTCCTCTTGCGATATTGATGGATTTTGGGAGTGC
TCGTCCTTCACGCAAGCAAATCCGCTCCCGTCAAGATGCCTTACAGTTACAGGAGTGGAC
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TGGTGTGTCTCCATTTGAATATGCACTTGGGGAATCTGGTGGAAGTCTTCAGCTCGCGAT
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TCACCAGTTTGTGACTTGGATGCTGCAACCGCAGGCTGCCGTTCGGCCAAGCATTGACGC
TATCATCATCCACGTCGACAGACTGATCGCAAAGTTCACCAAATGATTCCTAGTTTTTGG
TGGTTTTCTAAAGAGGTGAGAGAAAAGAACAGAACATAAAAGGGTTTTTTACACATTGCC
TTGTCTTGTTTTTTTATATGTTAGTTATTTTGAAAAATCACATTAAAAATCCCAAACTAG
ATGCATATTTCAAAACAGTCTTGATTACTCTTCGTAATTTATTTTGAACAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
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AF RS1EG10TF U 1
AF RS1FP30TF U 52
AF RS1EG10JQ C 565
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DS 

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GG
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TTATCGTGAGGCAGCTCGGCGAAGGAGGTTTCGCGTTCGTCTTTTTGGTCAAGGAGATCG
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TCTCTGCTGATGGAACTTATGCTATGAAGAAAATTCTGATTCAGAACAAGGAGCAACTGG
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DS 

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TCGAGCTCCTGAGCTTTGGGATTGTCCAAGCCATGCAGATATCGATGAGAGAACAGATAT
ATGGTCACTAGGCTGCACACTATACGCAATCATGTATGGTGTGTCTCCATTTGAATATGC
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AAACGCGGGACCAAAGGCTTCTTATCCTGAAGCTCTTCACCAGTTTGTGACTTGGATGCT
GCAACCGCAGGCTGCCGTTCGGCCAAGCATTGACGCTATCATCATCCACGTCGACAGACT
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AAGAACAGAACATAAAAGGGTTTTTTACACATTGCCTTGTCTTGTTTTTTTATATGTTAG
TTATTTTGAAAAATCACATTAAAAATCCCAAACTAGATGCATATTTCAAAACAGTCTTGA
TTACTCTTCGTAATTTATTTTGAACAATC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 4

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TTAGACAAGGCCTCTGGTTCTGGTTTTCAGTCCAAAGCAGAGTATTTGTTCGGAAAGATC
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AAGTCAGAAGGATCAACTTGGGATGAGATTGATTTTGAGTTCTTGGGTAATATGAGTGGA
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CTCGGTGTTTTGTTTCCAAAGAGCAAGCCGATGAGAATGTACGCGAGTTTATGGAACGCA
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AGGCTCGGGTGGGTCCAGAAGAATTACATGATCTACAATTATTGTACGGATAGTAAGAGG
TTCCCACAGGGAATCCCTCGGGAATGTGCAACAAGCGCATAGACTTTAAAATTGTTCTAT
AGTAGTATATATTATCTATTTGCTTTTTTATTTCTTCTATGTTAATGCTCTGTTACTTAT
TTTGTTACGTTGTGTTTGATTCTTTTGAATGTATATCTTTGTCCAATAAAGCAAAGGGTT
TGTCTACATATGTAAGAGATGTCTGTGAAAAAAAAATGATTCATGAAAATGATAGTTCTT
TTTTTTTGATAAAAATGATGATTTGCTTC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FY72TF U 1
AF RS1EH56TF U 1
AF RS1FY72JQ C 535
AF RS1EH56JQ C 472
BS 1 671 RS1EH56TF
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BS 673 710 RS1EH56TF
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BS 712 733 RS1EH56TF
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BS 735 765 RS1EH56TF
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BS 777 777 RS1EH56JQ
BS 778 795 RS1EH56TF
BS 796 796 RS1EH56JQ
BS 797 802 RS1EH56TF
BS 803 803 RS1EH56JQ
BS 804 819 RS1EH56TF
BS 820 1109 RS1EH56JQ

RD RS1FY72TF 644 0 0
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TCAGCTCTACTCGCGGCTGCGTTTTCAGCCTCGGCAGCTGACTTCAACGTCGACGTCAAC
GTAGCATGGGGAAACGGCCGTGGGAAGATACTCAACAACGGCCAGCTTCTTACTCTCACC
TTAGACAAGGCCTCTGGTTCTGGTTTTCAGTCCAAAGCAGAGTATTTGTTCGGAAAGATC
GATATGCAGATTAATCTAGTTCCCGGTAACTCGGCAGGAACAGTAACAACTTTCTACCTG
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GATCCTTATACTTTACATACTAATGTTTACACTCAAGGTAAAGGTGACAAAGAACAACAG
TTCCATCTCTGGTTTGACCCAACCGCAAACTTCCACACTTACTCAATCCTCTGGAACCCT
CAAAGAATCATATGGACCGTCGATGATACACCGATTAGAGAGTTCAAGAACTCTGAGCCG
CTCGGTGTTTTGTTTCCAAAGAGCAAGCCGATGAGAATGTACGCGAGTTTATGGAACGCA
GATGATTGGGCAACTAGAG*TGGTCTGGTTAAAACAGATTGGTC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1EH56TF 820 0 0
GACATTCCTCACCAAACACACGCACACACAAAGATGTCTTCTTTCAAAATATACTTCTTC
TCAGCTCTACTCGCGGCTGCGTTTTCAGCCTCGGCAGCTGACTTCAACGTCGACGTCAAC
GTAGCATGGGGAAACGGCCGTGGGAAGATACTCAACAACGGCCAGCTTCTTACTCTCACC
TTAGACAAGGCCTCTGGTTCTGGTTTTCAGTCCAAAGCAGAGTATTTGTTCGGAAAGATC
GATATGCAGATTAAGCTAGTTCCCGGTAACTCGGCAGGAACAGTAACAACTTTCTACCTG
AAGTCAGAAGGATCAACTTGGGATGAGATTGATTTTGAGTTCTTGGGTAATATGAGTGGA
GATCCTTATACTTTACATACTAATGTTTACACTCAAGGTAAAGGTGACAAAGAACAACAG
TTCCATCTCTGGTTTGACCCAACCGCAAACTTCCACACTTACTCAATCCTCTGGAACCCT
CAAAGAATCATATGGACCGTCGATGATACACCGATTAGAGAGTTCAAGAACTCTGAGCCG
CTCGGTGTTTTGTTTCCAAAGAGCAAGCCGATGAGAATGTACGCGAGTTTATGGAACGCA
GATGATTGGGCAACTAGAGGTGGTCTGGTTAAAACAGATTGGTCCAAAGCTCCTTTCGTG
GCTTCTTACAG*AAAATTAAGTGCGACGGGTGTGTTCATGCCAACGGAAG*TCGTCTTGT
AGCTCGACGAGAC*AACCTCTAATTGGTACACTCAACAAATGGAT*CGACGAGCCA*GCT
AGGCTCGGGTGGGTC*AGAAGA*TTACATGATCTACAAT
A

QA 1 819 1 819
DS 

RD RS1FY72JQ 493 0 0
GAGCCGCTCGGTGTTTTGTTTCCAAAGAGCAAGCCGATGAGAATGTACGCGAGTTTATGG
AACGCAGATGATTGGGCAACTAGAGGTGGTCTGGTTAAAACAGATTGGTCCAAAGCTCCT
TTCGTGGCTTCTTACAGGAAAATTAAGTGCGACGGGTGTGTTCATGCCAACGGAAGGTCG
TCTTGTAGCTCGACGAGACCAACCTTTAATTGGTACACTCAACAAATGGATTCGACGAGC
CAAGCTAGGCTCGGGTGGGTCCAGAAGAATTACATGATCTACAATTATTGTACGGATAGT
AAGAGGTTCCCACAGGGAATCCCTCGGGAATGTGCAACAAGCGCATAGACTTTAAAATTG
TTCTATAGTAGTATATATTATCTATTTGCTTTTTTATTTCTTCTATGTTAATGCTCTGTT
ACTTATTTTGTTACGTTGTGTTTGATTCTTTTGAATGTATATCTTTGTCCAATAAAGCAA
AGGGTTTGTCTAC

QA 1 493 1 493
DS 

RD RS1EH56JQ 638 0 0
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TCTGAGCCGCTCGGTGTTTTGTTTCCAAAGAGCAAGCCGATGAGAATGTACGCGAGTTTA
TGGAACGCAGATGATTGGGCAACTAGAGGTGGTCTGGTTAAAACAGATTGGTCCAAAGCT
CCTTTCGTGGCTTCTTACAGGAAAATTAAGTGCGACGGGTGTGTTCATGCCAACGGAAGG
TCGTCTTGTAGCTCGACGAGACCAACCTCTAATTGGTACACTCAACAAATGGATTCGACG
AGCCAAGCTAGGCTCGGGTGGGTCCAGAAGAATTACATGATCTACAATTATTGTACGGAT
AGTAAGAGGTTCCCACAGGGAATCCCTCGGGAATGTGCAACAAGCGCATAGACTTTAAAA
TTGTTCTATAGTAGTATATATTATCTATTTGCTTTTTTATTTCTTCTATGTTAATGCTCT
GTTACTTATTTTGTTACGTTGTGTTTGATTCTTTTGAATGTATATCTTTGTCCAATAAAG
CAAAGGGTTTGTCTACATATGTAAGAGATGTCTGTGAAAAAAAAATGATTCATGAAAATG
ATAGTTCTTTTTTTTTGATAAAAATGATGATTTGCTTC

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 4

CO CL2535Contig1 1068 4 11 U
GGACCCATCGTTCCTCCTAAAGCAAGAGAAAAAAAAATAAACTTTCCCAGGCAGTGGCAG
TGACGAATCACTGGTCGCCGTTTCTCGCCTCAACGAAGGAGAATCTTTTGTGTAGTTCAG
AGGATCTGAGTAACGAAGCGCACTTGGACTTGGAAAATGGGAGATACAACTACGGATTCA
GAACATGGTGGCATCATGCTCGGTTTTGAAGATCCCATGAGGATTGATCCCGGAAGAGAT
CGTTTCCCATGCTGCATCGTCTGGACACCTCTCCCCTTCGTTACATGGCTGGTTCCCTTC
ATCGGCCACGCTGGTATCTGCAGAGAAGACGGTGTCATTCTCGACTTCGCTGGACCTAAC
TTCGTTTGTGTTGACAATTTTGCTTTTGGAGCTGTCTCTCGTTACATCCAGATCAACAAG
GCTAAGGAATCATCTCTTTCTTCCGGCTCATGTTTGTTCAATGAGGAAGGAGACACTCAT
GAGAAAGAGCCAACATGGGATGATGCACTGAGAAAAGGCACACAAGAGTACCAACGCTAT
TCTTATAACATATTGACATGCAACTGTCATTCCTTTGTGGCCAACAACCTGAACTGTCTA
GCGATAAGATCAGGTGGATGGAACGTGGCGAACCTCGCGGCGCTAGTGTTCCTCAAGGGA
CGTTGGGTGAGCAAAACGGCGATGGTCAAGTCCTTGCTGCCTACAGTCATAATCTACGCT
ATTGGAATGTTACTGGGTGGCTGGACATTCATAGCTTCCTGTTGTGTTCTAGCGTTTTTG
CTTACGGGTTGGTTCATCATGGGAACGTATTGTTTCAAGAAATTGATCCAGCTGTAGTCA
TTATGTTTGTGATCCAAGGATCTGGTTATGAAGGTTATATAGACCATGTATGGTTGATAT
GGCTGGGAATTTTCTTGTCGTAATGGGACAGACCAAGACTGTTGTAATATAAAAAACATT
ACATCATCTTGCTTGTTTGACTGCAAGGTCTTTGTGTGTACTGTGTATTCTTTGGTTGCT
TTCATAGTATGATCTGTCTCATCTTCACATAGAGTGCGTGATCTTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DZ85TF U 1
AF RS1BE24TF U 47
AF RS1DZ85JQ C 377
AF RS1B340TF U 542
BS 1 649 RS1DZ85TF
BS 650 720 RS1BE24TF
BS 721 873 RS1B340TF
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BS 884 946 RS1B340TF
BS 947 947 RS1DZ85JQ
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BS 956 956 RS1DZ85JQ
BS 957 1068 RS1B340TF

RD RS1DZ85TF 649 0 0
GGACCCATCGTTCCTCCTAAAGCAAGAGAAAAAAAAATAAACTTTCCCAGGCAGTGGCAG
TGACGAATCACTGGTCGCCGTTTCTCGCCTCAACGAAGGAGAATCTTTTGTGTAGTTCAG
AGGATCTGAGTAACGAAGCGCACTTGGACTTGGAAAATGGGAGATACAACTACGGATTCA
GAACATGGTGGCATCATGCTCGGTTTTGAAGATCCCATGAGGATTGATCCCGGAAGAGAT
CGTTTCCCATGCTGCATCGTCTGGACACCTCTCCCCTTCGTTACATGGCTGGTTCCCTTC
ATCGGCCACGCTGGTATCTGCAGAGAAGACGGTGTCATTCTCGACTTCGCTGGACCTAAC
TTCGTTTGTGTTGACAATTTTGCTTTTGGAGCTGTCTCTCGTTACATCCAGATCAACAAG
GCTAAGGAATCATCTCTTTCTTCCGGCTCATGTTTGTTCAATGAGGAAGGAGACACTCAT
GAGAAAGAGCCAACATGGGATGATGCACTGAGAAAAGGCACACAAGAGTACCAACGCTAT
TCTTATAACATATTGACATGCAACTGTCATTCCTTTGTGGCCAACAACCTGAACTGTCTA
GCGATAAGATCAGGTGGATGGAACGTGGCGAACCTCGCGGCGCTAGTGT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1BE24TF 674 0 0
GG
AGGCAGTGGCAGTGACGAATCACTGGTCGCCGTTTCTCGCCTCAACGAAGGAGAATCTTT
TGTGTAGTTCAGAGGATCTGAGTAACGAAGCGCACTTGGACTTGGAAAATGGGAGATACA
ACTACGGATTCAGAACATGGTGGCATCATGCTCGGTTTTGAAGATCCCATGAGGATTGAT
CCCGGAAGAGATCGTTTCCCATGCTGCATCGTCTGGACACCTCTCCCCTTCGTTACATGG
CTGGTTCCCTTCATCGGCCACGCTGGTATCTGCAGAGAAGACGGTGTCATTCTCGACTTC
GCTGGACCTAACTTCGTTTGTGTTGACAATTTTGCTTTTGGAGCTGTCTCTCGTTACATC
CGGATCAACAAGGCTAAGGAATCATCTCTTTCTTCCGGCTCATGTTTGTTCAATGAGGAA
GGAGACACTCATGAGAAAGAGCCAACATGGGATGATGCACTGAGAAAAGGCACACAAGAG
TACCAACACTATTCTTATAACATATTGACATGCAACTGTCATTCCTTTGTGGCCAACAAC
CTGAACCGTCTAGCGATAAGATCAGGTGGATGGAACGTGGTGAACCTCGCGGCGCTAGTG
TTCCTCAAGGGACGTTGGGTGAGCAAAACGGCGATGGTCAAGTCCTTGCTGCCTACAGTC
ATAATCTACGCT

QA 3 674 3 674
DS 

RD RS1DZ85JQ 589 0 0
ATTTTGCTTTTGGAGCTGTCTCTCGTTACATCCAGATCAACAAGGCTAAGGAATCATCTC
TTTCTTCCGGCTCATGTTTGTTCAATGAGGAAGGAGACACTCATGAGAAAGAGCCAACAT
GGGATGATGCACTGAGAAAAGGCACACAAGAGTACCAACGCTATTCTTATAACATATTGA
CATGCAACTGTCATTCCTTTGTGGCCAACAACCTGAACTGTCTAGCGATAAGATCAGGTG
GATGGAACGTGGCGAACCTCGCGGCGCTAGTGTTCCTCAAGGGACGTTGGGTGAGCAAAA
CGGCGATGGTCAAGTCCTTGCTGCCTACAGTCATAATCTACGCTATTGGAATGTTACTGG
GTGGCTGGACATTCATAGCTTCCTGTTGTGTTCTAGCGTTTTTGCTTACGGGTTGGTTCA
TCATGGGAACGTATTGTTTCAAGAAATTGATCCAGCTGTAGTCATTATGTTTGTGATCCA
AGGATCTGGTTATGAAGGTTATATAGACCATGTATGGTTGATATGGCTGGGAATTTTCTT
GTCGTAATGGGACAGACCAAGACTGTTGTAATATAAAAAACATTACATC

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1B340TF 527 0 0
CTTATAACATATTGACATGCAACTGTCATTCCTTTGTGGCCAACAACCTGAACCGTCTAG
CGATAAGATCAGGTGGATGGAACGTGGTGAACCTCGCGGCGCTAGTGTTCCTCAAGGGAC
GTTGGGTGAGCAAAACGGCGATGGTCAAGTCCTTGCTGCCTACAGTCATAATCTACGCTA
TTGGAATGTTACTGGGTGGCTGGACATTCATAGCTTCCTGTTGTGTTCTAGCGTTTTTGC
TTACGGGTTGGTTCATCATGGGAACGTATTGTTTCAAGAAATTGATCCAGCTGTAGTCAT
TATGTTTGTGATCCAAGGATCTGGTTATGAAG*TTATATAG*CCATGTATGGTTGATATG
GCTGGGAATTTTCTTGTCGTAATGGGACAGACCAAGACTGTTGTA*TATAAAAA*CATTA
CATCATCTTGCTTGTTTGACTGCAAGGTCTTTGTGTGTACTGTGTATTCTTTGGTTGCTT
TCATAGTATGATCTGTCTCATCTTCACATAGAGTGCGTGATCTTCTG

QA 1 527 1 527
DS 



AS 1 3

CO CL2536Contig1 912 3 7 U
TGTCGCCGCTTAAGGATATCCTAGCAAGGGAAGCCAAGAGGGAAGCCGAGAGGGAAGCCG
AGAGGGAAGCCGATCTTCTCAGTTCGCCTCCGGCGGACAGTCCCAAGAGGATGAGAATCA
GTGGGCTGGAATGGGACGACCCTCGTACTCTTGTATACAAATTCAAAACCCGTGAGGTTG
GGAGGGTTTTCGTAACGGGGTATGACACCAAGCTTCCACATGATGATGTCGATGGAGCGT
TGAGAAATCACTTCTCATCATGTGGAAGGATCACTGATATTCTTATCCGCCAAACAGATG
AAGAACTCGAAAGCCGTGCAATCATTTTTTTCCTGGCAGAAGGCGCAGTAGACAAGGCGT
TGCAACTTAGTGGAAGTGACGTTGGAGGATGGACGGCCATTGTTGAGCCCTTTCCTTTTC
TGAAATATGAAGGCCGTTCCATTACCGTAAATGTTACTGGGTATGACATCTCGCGTAGTG
AGATTGATTTCAAGAGTGCAATTCGTCAACATTTCTCTTCATGTGGAGAGATAAGCCACT
TCAAAATTTCCAAGAAGGTTGCTTCAGCTAAATTTGATGTTGATGGAGAAGATGCGCAAG
ACAAAGTGATGGAACTTGATGAAAGCATCATGTGTGGAAGCAAAATACATGTTGATGTTA
TTTCTGGGGCAATAACCACTGTTCACACCAGGCGTCATCTTTCCCGCAAGATGATTTAAG
GTGCTTTGGAGGAGCCTTTCTATCTATGCTTTTCTTTTTTCTTGTGTTTCTTGCTCTTTA
TCTATGTAGGAGCCTTTCTATCTATGTTGTGTGTGAATCGCTGGATGTTTAATTATCATT
GTCCTTTTATGGGAACAAAGTTGATGATTTTCCTTCCATGGAAAATCGCATCTTTTAAAA
ACACTTGAACCC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C852TF U 1
AF RS1G675TF U 4
AF RS1G675JQ C 181
BS 1 23 RS1C852TF
BS 24 24 RS1G675TF
BS 25 112 RS1C852TF
BS 113 113 RS1G675TF
BS 114 644 RS1C852TF
BS 645 681 RS1G675TF
BS 682 912 RS1G675JQ

RD RS1C852TF 651 0 0
TGTCGCCGCTTAAGGATATCCTA*CAAGGGAAGCCAAGAGGGAAGCCGAGAGGGAAGCCG
AGAGGGAAGCCGATCTTCTCAGTTCGCCTCCGGCGGACAGTCCCAAGAGGATTAGAATCA
GTGGGCTGGAATGGGACGACCCTCGTACTCTTGTATACAAATTCAAAACCCGTGAGGTTG
GGAGGGTTTTCGTAACGGGGTATGACACCAAGCTTCCACATGATGATGTCGATGGAGCGT
TGAGAAATCACTTCTCATCATGTGGAAGGATCACTGATATTCTTATCCGCCAAACAGATG
AAGAACTCGAAAGCCGTGCAATCATTTTTTTCCTGGCAGAAGGCGCAGTAGACAAGGCGT
TGCAACTTAGTGGAAGTGACGTTGGAGGATGGACGGCCATTGTTGAGCCCTTTCCTTTTC
TGAAATATGAAGGCCGTTCCATTACCGTAAATGTTACTGGGTATGACATCTCGCGTAGTG
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ACAAAGTGATGGAACTTGATGAAAGCATCATGTGTGGAAGCAAA
TACATGT

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1G675TF 678 0 0
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GGGAAGCCGATCTTCTCAGTTCGCCTCCGGCGGACAGTCCCAAGAGGATGAGAATCAGTG
GGCTGGAATGGGACGACCCTCGTACTCTTGTATACAAATTCAAAACCCGTGAGGTTGGGA
GGGTTTTCGTAACGGGGTATGACACCAAGCTTCCACATGATGATGTCGATGGAGCGTTGA
GAAATCACTTCTCATCATGTGGAAGGATCACTGATATTCTTATCCGCCAAACAGATGAAG
AACTCGAAAGCCGTGCAATCATTTTTTTCCTGGCAGAAGGCGCAGTAGACAAGGCGTTGC
AACTTAGTGGAAGTGACGTTGGAGGATGGACGGCCATTGTTGAGCCCTTTCCTTTTCTGA
AATATGAAGGCCGTTCCATTACCGTAAATGTTACTGGGTATGACATCTCGCGTAGTGAGA
TTGATTTCAAGAGTGCAATTCGTCAACATTTCTCTTCATGTGGAGAGATAAGCCACTTCA
AAATTTCCAAGAAGGTTGCTTCAGCTAAATTTGATGTTGATGGAGAAGATGCGCAAGACA
A*GTGATGGAACTTGATGAAAGCATCATGTGTGGAAGCAAAATACATGTTGATGTTATTT
CTGGGGCAATAACCACTG

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1G675JQ 732 0 0
GGAGGGTTTTCGTAACGGGGTATGACACCAAGCTTCCACATGATGATGTCGATGGAGCGT
TGAGAAATCACTTCTCATCATGTGGAAGGATCACTGATATTCTTATCCGCCAAACAGATG
AAGAACTCGAAAGCCGTGCAATCATTTTTTTCCTGGCAGAAGGCGCAGTAGACAAGGCGT
TGCAACTTAGTGGAAGTGACGTTGGAGGATGGACGGCCATTGTTGAGCCCTTTCCTTTTC
TGAAATATGAAGGCCGTTCCATTACCGTAAATGTTACTGGGTATGACATCTCGCGTAGTG
AGATTGATTTCAAGAGTGCAATTCGTCAACATTTCTCTTCATGTGGAGAGATAAGCCACT
TCAAAATTTCCAAGAAGGTTGCTTCAGCTAAATTTGATGTTGATGGAGAAGATGCGCAAG
ACAAGGTGATGGAACTTGATGAAAGCATCATGTGTGGAAGCAAAATACATGTTGATGTTA
TTTCTGGGGCAATAACCACTGTTCACACCAGGCGTCATCTTTCCCGCAAGATGATTTAAG
GTGCTTTGGAGGAGCCTTTCTATCTATGCTTTTCTTTTTTCTTGTGTTTCTTGCTCTTTA
TCTATGTAGGAGCCTTTCTATCTATGTTGTGTGTGAATCGCTGGATGTTTAATTATCATT
GTCCTTTTATGGGAACAAAGTTGATGATTTTCCTTCCATGGAAAATCGCATCTTTTAAAA
ACACTTGAACCC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 4

CO CL2537Contig1 827 4 9 U
GGAATTCGAAATCTCCAGCGAAGAAGAAGAACCAAAAATGGCGAATTCATCAATGGCTAC
GCTTTCGCGAAGACTCTATCGATCTCTTCTCTCAAACCCCAGACTCTCTCAGCAGGCCTC
CATGTCATTCAGCACCACCACCACCAACAACAACAACATCTCCGACTTATCGGACACCGA
GTCTCCCTTCGAAACGAAGGCTTCAGGTCCAAAAGATCGAGAAGAACGCGTGATGGAGGA
GCGTCCACTCGAGAACGGCCTTGACTATGGCTTCTTCAAGGCGATATTGGTGGGGCAAGT
GGGGCAGCTTCCTCTGCAAAAGAAGCTGAAGAACGGTAGAACTGTCACTCTCTTCTCTGT
AGGTACCGGTGGGATGAGGAATAACAGGAGACCGTTGATCAACGAAGATCCGAGAGAGTA
TACTAACCGCTCTGAGGTGCAGTGGCACCGTGTCTCTGTTTACCCTGAGCGTTTGGCTGA
GCTTGTCTTGAAGAACGTTGAACCCGGCACACTTGTTTACTTGGAGGGTAATCTTGAGAC
GAAGATTTTCAGTGATCCTGTCACTGGTTTGGTTCGACGTATTCGAGAAGTAGCCATTCG
TAGAAACGGGCGAGTTGTGTTTCTAGGAAAAGCCGGTGATATGCAGCCGCCTAGTTCTGC
TGAGCTTAGAGGCGTCGGCTACTACTGATTGTTGGTATTGTAGCTTTACTGTTTTTCTCT
TTTTGGTATCTTGAGGGTTTTTTCTCAGTGTTTCTACTGCCATTGGTCCTTTTACTTTTT
GTGGCAAATAAACCGAACCAAAAAACCCAACAAATACATTTTTCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1C590TF U 1
AF RS1CW52TF U 6
AF RS1C590JQ C 88
AF RS1CW52JQ C 437
BS 1 667 RS1C590TF
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BS 679 715 RS1CW52TF
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BS 725 756 RS1CW52TF
BS 757 827 RS1C590JQ

RD RS1C590TF 667 0 0
GGAATTCGAAATCTCCAGCGAAGAAGAAGAACCAAAAATGGCGAATTCATCAATGGCTAC
GCTTTCGCGAAGACTCTATCGATCTCTTCTCTCAAACCCCAGACTCTCTCAGCAGGCCTC
CATGTCATTCAGCACCACCACCACCAACAACAACAACATCTCCGACTTATCGGACACCGA
GTCTCCCTTCGAAACGAAGGCTTCAGGTCCAAAAGATCGAGAAGAACGCGTGATGGAGGA
GCGTCCACTCGAGAACGGCCTTGACTATGGCTTCTTCAAGGCGATATTGGTGGGGCAAGT
GGGGCAGCTTCCTCTGCAAAAGAAGCTGAAGAACGGTAGAACTGTCACTCTCTTCTCTGT
AGGTACCGGTGGGATGAGGAATAACAGGAGACCGTTGATCAACGAAGATCCGAGAGAGTA
TACTAACCGCTCTGAGGTGCAGTGGCACCGTGTCTCTGTTTACCCTGAGCGTTTGGCTGA
GCTTGTCTTGAAGAACGTTGAACCCGGCACACTTGTTTACTTGGAGGGTAATCTTGAGAC
GAAGATTTTCAGTGATCCTGTCACTGGTTTGGTTCGACGTATTCGAGAAGTAGCCATTCG
TAGAAACGGGCGAGTTGTGTTTCTAGGAAAAGCCGGTGATATGCAGCCGCCTAGTTCTGC
TGAGCTT

QA 1 667 1 667
DS 

RD RS1CW52TF 751 0 0
GG
GAAATCTCCAGCGAAGAAGAAGAACCAAAAATGGCGAATTCATCAATGGCTACGCTTTCG
CGAAGACTCTATCGATCTCTTCTCTCAAACCCCAGACTCTCTCAGCAGGCCTCCATGTCA
TTCAGCACCACCACCACCAACAACAACAACATCTCCGACTTATCGGACACCGAGTCTCCC
TTCGAAACGAAGGCTTCAGGTTCAAAAGATCGAGAAGAACGCGTGATTGAGGAGCGTCCA
CTCGAGAACGGCCTTGACTATGGCGTCTTCAAGGCGATATTGGTGGGGCAATTGGGGCAG
CTTCCTCTGCAAAAGAAGCTGAAGAACGGTAGAACTGTCACTCTCTTCTCTGTAGGTACC
GGTGGGATGAGGAATAACAGGAGACCGTTGATCAACGAAGATCCGAGAGAGTATTCTAAC
CGCTCTGAGGTGCAGT**CACCGTGTCTCTGTTTACCCTGAGCGTTTGGCTGAGCTTGTC
TTGAAGAACGTTGAACCCGGCACACTTGTTTACTTGGAGGGTAATCTTGAGACGAAGATT
TTCAGTGATCCTGTCACTGGTTTGGTTCGACGTATTCGAGAAGTAGCCATTCGTAGAAAC
GGGCGAGTTGTGTTTCTAGGAAAAGCCGGTGATATGCAGCCGCCTAGTTCTGCTGAGCTT
AGAGGCGTCG*CTACTACTGATTGTTGGTATTGTAGCTTTACTGTTTT*CTCTTTT*GGT
ATCTTGAGGGTTTTTTCTCAGTGTTTCTA

QA 3 751 3 751
DS 

RD RS1C590JQ 740 0 0
TCTCTCAAACCCCAGACTCTCTCAGCAGGCCTCCATGTCATTCAGCACCACCACCACCAA
CAACAACAACATCTCCGACTTATCGGACACCGAGTCTCCCTTCGAAACGAAGGCTTCAGG
TCCAAAAGATCGAGAAGAACGCGTGATGGAGGAGCGTCCACTCGAGAACGGCCTTGACTA
TGGCTTCTTCAAGGCGATATTGGTGGGGCAAGTGGGGCAGCTTCCTCTGCAAAAGAAGCT
GAAGAACGGTAGAACTGTCACTTTCTTCTCTGTAGGTACCGGTGGGATGAGGAATAACAG
GAGACCGTTGATCAACGAAGATCCGAGAGAGTATACTAACCGCTCTGAGGTGCAGTGGCA
CCGTGTCTCTGTTTACCCTGAGCGTTTGGCTGAGCTTGTCTTGAAGAACGTTGAACCCGG
CACACTTGTTTACTTGGAGGGTAATCTTGAGACGAAGATTTTCAGTGATCCTGTCACTGG
TTTGGTTCGACGTATTCGAGAAGTAGCCATTCGTAGAAACGGGCGAGTTGTGTTTCTAGG
AAAAGCCGGTGATATGCAGCCGCCTAGTTCTGCTGAGCTTAGAGGCGTCGGCTACTACTG
ATTGTTGGTATTGTAGCTTTACTGTTTTTCTCTTTTTGGTATCTTGAGGGTTTTTTCTCA
GTGTTTCTACTGCCATTGGTCCTTTTACTTTTTGTGGCAAATAAACCGAACCAAAAAACC
CAACAAATACATTTTTCACT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RS1CW52JQ 391 0 0
AGGTGCAGT
CACCGTGTCTCTGTTTACCCTGAGCGTTTGGCTGAGCTTGTCTTGAAGAACGTTGAACCC
GGCACACTTGTTTACTTGGAGGGTAATCTTGAGACGAAGATTTTCAGTGATCCTGTCACT
GGTTTGGTTCGACGTATTCGAGAAGTAGCCATTCGTAGAAACGGGCGAGTTGTGTTTTTA
GGAAAAGCCGGTGATATGCAGCCGCCTAGTTCTGCTGAGCTTAGAGGCGTCGGCTACTAC
TGATTGTTGGTATTGTAGCTTTACTGTTTTTCTCTTTTTGGTATCTTGAGGGTTTTTTCT
CAGTGTTTCTACTGCCATTGGTCCTTTTACTTTTTGTGGCAAATAAACCGAACCAAAAAA
CCCAACAAATACATTTTTCACT

QA 10 391 10 391
DS 



AS 2 4

CO CL2538Contig1 846 2 2 U
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GTCTCATACTAGTATCACCAGAAGAATCAAAAACAACAACAAAAACACTTTGGAGGATCA
ACAGTGTTACAAAAGTTTCCTCAGGTTTCATGAATCACCAAAAACACTAGCACAGCTTCA
GAGTCTGATAAAAAGACTTCAAAGCTTAACTGCTCAGTATTCTTATTGATTCGTTTCTGG
TTCATCTCAAGCTGTGACCAATTCTCATTTCTCAAGAACTACACTTACTTTGCTCTAGGA
TGCTTGGTCACTTTCCTTGTAAACGCAAACTCTCCAAACTTATGCCCAACTTTCCCTTCA
GTGATCTTACAACGCACATGAGTTTTGCCATTGTAGATTCTCACCGACGGATCAACATAC
TCTGGCAGAATTGTCGATCTCCTTGACCATATCTTCCTGTTCAGAGCTGCGTTTTTCTTC
TTCATCAAGAAAGCATCAACGAATGGATCTCTCCATACAGATCGGCTCACCATCTTATTG
CTTTTCTTCTCATCTTCTATAGCTCCCTGATCCAAAGACAATGGCAAGCTTGGCCATTCT
TTTGCAACGTTCACATGGATGTTACACCCATTCAACTCCTGCCCATCCATAGCTGAAATA
GCGGACTTGGCAGAATCCTCACTGATGAAGTTAACAAATCCATAACCTCTAGACCTCCCA
GTCACTTTGTTAGTCATGACTCTTGCCTCTGTAACTCCGTTGAAGGTAGAGAAAGCATCC
TTCAAGGAGTGGTCGTCAGTTCCGGGCGATAGGCCACCAATGAAAAGCTTTGTGGACATG
TACCGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1A077JQ U 1
AF RS1A077TR U 1
BS 1 783 RS1A077JQ
BS 784 846 RS1A077TR

RD RS1A077JQ 783 0 0
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TCTGGCAGAATTGTCGATCTCCTTGACCATATCTTCCTGTTCAGAGCTGCGTTTTTCTTC
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GTCACTTTGTTAGTCATGACTCTTGCCTCTGTAACTCCGTTGAAGGTAGAGAAAGCATCC
TTC

QA 1 783 1 783
DS 

RD RS1A077TR 846 0 0
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GTCTCATACTAGTATCACCAGAAGAATCAAAAACAACAACAAAAACACTTTGGAGGATCA
ACAGTGTTACAAAAGTTTCCTCAGGTTTCATGAATCACCAAAAACACTAGCACAGCTTCA
GAGTCTGATAAAAAGACTTCAAAGCTTAACTGCTCAGTATTCTTATTGATTCGTTTCTGG
TTCATCTCAAGCTGTGACCAATTCTCATTTCTCAAGAACTACACTTACTTTGCTCTAGGA
TGCTTGGTCACTTTCCTTGTAAACGCAAACTCTCCAAACTTATGCCCAACTTTCCCTTCA
GTGATCTTACAACGCACATGAGTTTTGCCATTGTAGATTCTCACCGACGGATCAACATAC
TCTGGCAGAATTGTCGATCTCCTTGACCATATCTTCCTGTTCAGAGCTGCGTTTTTCTTC
TTCATCAAGAAAGCATCAACGAATGGATCTCTCCATACAGATCGGCTCACCATCTTATTG
CTTTTCTTCTCATCTTCTATAGCTCCCTGATCCAAAGACAATGGCAAGCTTGGCCATTCT
TTTGCAACGTTCACATGGATGTTACACCCATTCAACTCCTGCCCATCCATAGCTGAAATA
GCGGACTTGGCAGAATCCTCACTGATGAAGTTAACAAATCCATAACCTCTAGACCTCCCA
GTCACTTTGTTAGTCATGACTCTTGCCTCTGTAACTCCGTTGAAGGTAGAGAAAGCATCC
TTCAAGGAGTGGTCGTCAGTTCCGGGCGATAGGCCACCAATGAAAAGCTTTGTGGACATG
TACCGG

QA 1 846 1 846
DS 



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AGCTTTTCATTGGTGGCCTATCACCCGGAACTGACGACCACTCCTTGAAGGATGCTTTCT
CTACCTTCAACGGAGTTACAGATGCAAGAGTCATGACTAACAAAGTGACTGGGAGGTCTA
GAGGTTATGGATTTGTTAACTTCATCAGTGAGGATTCTGCCAAGTCTGCTATTTCAGCTA
TGGATGGACAGGAGTTGAATGGGTTTAACATCCATGTGGACGTTGCAAAAGAATGGCCAA
GCTTGTCATTGTCTTTGGATCTGGGAGCTATAGAAGATGAGAGGAAAGGCAGTAAGATGG
TGAACCGATCTGTATGGAAAGATCCATTTGTTGATGCGTTCTTGATGAAGAAGAAAAACG
CGGCTCTTAACAGGAAGATATGGTCAAGGAGATCGACAATTCTGCCAGAGTATGTTGATT
CGTCGGTGAGAATCTACAATGGCAAAACTCATGTGCGTTGTAAGATCACTGAAGGGAAAG
TTGGGCATAAGTTTGGAGAGTTTGCGTTTACAAGGAAAGTGACCAAGCATCCTAGAGCAA
AGTAAGTGTAGTTCTTGAGAAATGAGAATTGGTCAGAGCTTGAGATGAACCAGAAACGAA
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AAGTGTTTTCGATGATTCATGGAACCTGAGGAAACTTTTGCAACACTGTTGATCCTCCAA
AGTGTTTTTTGTAGTTGTTTTTGATTCTTCTGGTGATACGAGTATGAGACATTTGATCCA
CTTTAAGGCCAAGATAGCCATTTACAATGTGGAAGATCAATTTAAAGTCCATCGCTTTGC
TATGCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DW24TF U 1
AF RS1DW24JQ C 268
BS 1 650 RS1DW24TF
BS 651 1027 RS1DW24JQ

RD RS1DW24TF 650 0 0
GGGCCACATGCCCTAAAGAGTTTGTTCTTGTTCATCTTCTCTGCGTAACCATCAGCAAAA
TCGACGACAAGGACGTCCCCTCCAGACAACTTCAACAAATGTCTTTCTGCACCAAACTTG
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AGCTTTTCATTGGTGGCCTATCACCCGGAACTGACGACCACTCCTTGAAGGATGCTTTCT
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CGGCTCTTAACAGGAAGATATGGTCAAGGAGATCGACAATTCTGCCAGAGTATGTTGATT
CGTCGGTGAGAATCTACAATGGCAAAACTCATGTGCGTTGTAAGATCACT

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DS 

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TTCTGGTGATACGAGTATGAGACATTTGATCCACTTTAAGGCCAAGATAGCCATTTACAA
TGTGGAAGATCAATTTAAAGTCCATCGCTTTGCTATGCCG

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 4

CO CL2539Contig1 1642 4 11 U
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TCTTCTTCTTCTTCTCCGACCTTTAACCAAGCAAAAAAGAAACCCTAAAATCTCCAAATC
CATACTATCAGTTCTTACAATGATGCTTCAAAGAAGCTGCATTGTACTTTTCTCACTTTC
TCTGTTTGTTCCACACATGGGTTTCGCCATGCTCAACAAAACTCTTCTTCTCATCCCACA
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ACGTCAAGCTATGGATACGACGGACCAGGCCGGTTCAAGCCCGTGCTTTACCGGAAATCC
AATCGATGACTGTTGGAAATGTGACCCAAACTGGCCCAATAACCGACAAAGGCTGGCCGA
TTGTGGAATCGGGTTCGGTCAGTACGCCTTGGGAGGCAAAGGCGGTCGGTTCTACTTCGT
CACTGATTCTTCCGACGACGATGTCGTCGAACCTAAACCGGGCACTCTCAGATATGCAGT
GATACAAGTAGAGCCACTGTGGATAGTGTTCCCAAGCAACATGATGATAAAATTAAAGCA
TGAGCTAATATTCAACAGTTACAAGACTCTTGATGGAAGAGGAGCTAATGTTCATATTGT
TGGTGGTGGTTGCATCACTCTTCAATATGTCTCCAATGTCATCATTCACAACATCCATAT
CCACCATTGTCACCCATCCGGGAATACTAACATAAGGTCAAGTCCAACGCACTACGGATT
AAGAACGGAATCGGACGGTGACGGTATCTCCATCTTCGGATCAAAGGACATATGGATCGA
CCATTGTTCTCTATCAAGATGTAGAGATGGTTTGATAGATGCTGTGATGGGGTCCACAGG
GATTACAATATCGAACAACTTCTTCTCACACCACAATGAAGTCATGCTTCTTGGTCACAG
CGATCACTACGAGCCAGACAGTGGCATGCAGGTAACCATTGCGTTTAATCACTTCGGAGA
GAAGTTGGTACAAAGGATGCCTAGATGTAGACGTGGTTATATCCATGTGGTTAACAATGA
TTTTACTCAATGGGAAATGTATGCGATTGGCGGTAGCGGTAACCCAACCATTAATAGTCA
GGGTAACCGCTATACCGCCCCAACCAACCCGTTTGCCAAAGAGGTGACTAAAAGAGTAGA
AACGCCAGATGGTGATTGGAAAGGGTGGAACTGGAGATCGGAGGGAGACATTTTGGTTAA
CGGAGCGTTCTTCGTGGCATCTGGAGAAGGTGCGGAGATGAGGTACGAGAAGGCGTACAG
CGTCGACCCTAAATCTGCCTCGTTCATCGACCAAATCACACTTCATTGCGGCGTTCTTGG
CGTTGGTGGCAGGAATAACAATTTGGGGATGTGGACTACTACTGGATCCGAAGGTAGTGG
CGGTTTAGATTCTTATAATGACTACACCGATGAAATGTCTGGCACCGGTTTAACTAACCG
GTTATCTTTCTCGGTTATTGTTATAGCTTTCATGTTCGATATGATATTATATTTGTCCAT
GTTGTTGTAACGTGAACTTACCAATTTTTAATCAAGGAACAAGAAAAAAGATTCGACTCA
CTTTTATGTATTAGTTTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EM82TF U 1
AF RS1AK14TF U 452
AF RS1AK14JQ C 954
AF RS1EM82JQ C 925
BS 1 734 RS1EM82TF
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BS 1336 1642 RS1EM82JQ

RD RS1EM82TF 761 0 0
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TCTTCTTCTTCTTCTCCGACCTTTAACCAAGCAAAAAAGAAACCCTAAAATCTCCAAATC
CATACTATCAGTTCTTACAATGATGCTTCAAAGAAGCTGCATTGTACTTTTCTCACTTTC
TCTGTTTGTTCCACACATGGGTTTCGCCATGCTCAACAAAACTCTTCTTCTCATCCCACA
TCCCGACCCAGAGCTAGTCGCTCATGATGTTCATAGGAGGGTAAATGCCTCTTTATGGAG
ACGTCAAGCTATGGATACGACGGACCAGGCCGGTTCAAGCCCGTGCTTTACCGGAAATCC
AATCGATGACTGTTGGAAATGTGACCCAAACTGGCCCAATAACCGACAAAGGCTGGCCGA
TTGTGGAATCGGGTTCGGTCAGTACGCCTTGGGAGGCAAAGGCGGTCGGTTCTACTTCGT
CACTGATTCTTCCGACGACGATGTCGTCGAACCTAAACCGGGCACTCTCAGATATGCAGT
GATACAAGTAGAGCCACTGTGGATAGTGTTCCCAAGCAACATGATGATAAAATTAAAGCA
TGAGCTAATATTCAACAGTTACAAGACTCTTGATGGAAGAGGAGCTAATGTTCATATTGT
TGGTGGTGGTTGCATCACTCTTCAATATGTCTCCAATGTCATCATTCACAACATCCATAT
CCACCATTGTCACC*ATCCGGGA*TACTAACATAAG
TCAAG

QA 1 756 1 756
DS 

RD RS1AK14TF 769 0 0
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CCTAAACCGGGCACTCTCAGATATGCAGTGATACAAGTAGAGCCACTGTGGATAGTGTTC
CCAAGCAACATGATGATAAAATTAAAGTATGAGCTAATATTCAACAGTTACAAGACTCTT
GATGGAAGAGGAGCTAATGTTCATATTGTTGGTGGTGGTTGCATCACTCTTCAATATGTC
TCGAATGTCATCATTCACAACATCCATATCCACCATTGTCACCCATCCGGGAATACTAAC
ATAAGGTCAAGTCCAACGCACTACGGATTAAGAACGGAATCGGACGGTGACGGTATCTCC
ATCTTCGGATCAAAGGACATATGGATCGACCATTGTTCTCTATCAAGATGTAGAGATGGT
TTGATAGATGCTGTGATGGGGTCCACAGGGATTACAATATCGAACAACTTCTTCTCACAC
CACAATGAAGTCATGCTTCTTGGTCACAGCGATCACTACGAGCCAGACAGTGGCATGCAG
GTAACCATTGCGTTTAATCACTTCGGAGAGAAGTTGGTACAAAGGATGCCTAGATGTAGA
CGTGGTTATATCCATGTGGTTAACAATGATTTTACTCAATGGGAAATGTATGCGATTGGC
GGTAGCGGTAACCCAACCATTAATAGTCAGGGTAACCGCTATACCGCCCCAACCAACCCG
TTTGCCAAAGAGGTGACTAAAAGAGTAGAAACGCCAGATGGTGATTGGA

QA 1 769 1 769
DS 

RD RS1AK14JQ 666 0 0
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TCGGAGAGAAGTTGGTACAAAGGATGCCTAGATGTAGACGTGGTTATATCCATGTGGTTA
ACAATGATTTTACTCAATGGGAAATGTATGCGATTGGCGGTAGCGGTAACCCAACCATTA
ATAGTCAGGGTAACCGCTATACCGCCCCAACCAACCCGTTTGCCAAAGAGGTGACTAAAA
GAGTAGAAACGCCAGATGGTGATTGGAAAGGGTGGAACTGGAGATCGGAGGGAGACATTT
TGGTTAACGGAGCGTTCTTCGTGGCATCTGGAGAAGGTGCGGAGATGAGGTACGAGAAGG
CGTACAGCGTCGACCCTAAATCTGCCTCGTTCATCGACCAAATCACATTTCATTGCGGCG
TTCTTGGCGTTGGTGGCAGGAATAACAATTTGGGGATGTGGACTACTGCTGGATCCGAAG
GTAGTGGCGGTTTAGATTCTTATAATGACTACACCGATGAAATGTCTGGCACCGGTTTAA
CTAACCGGTTATCTTTCTCGGTTATTGTTATAGCTTTCATTTTCGATATGATATTATATT
TGTCCATGTTGTTGTAACGTGAACTTACCAATTT**AATCAAGGAACAAGAAAAAAGATT
CGAC
CC

QA 1 664 1 664
DS 

RD RS1EM82JQ 718 0 0
CTCACACCACAATGAAGTCATGCTTCTTGGTCACAGCGATCACTACGAGCCCGACAGTGG
CATGCAGGTAACCATTGCGTTTAATCACTTCGGAGAGAAGTTGGTACAAAGGATGCCTAG
ATGTAGACGTGGTTATATCCATGTGGTTAACAATGATTTTACTCAATGGGAAATGTATGC
GATTGGCGGTAGCGGTAACCCAACCATTAATAGTCAGGGTAACCGCTATACCGCCCCAAC
CAACCCGTTTGCCAAAGAGGTGACTAAAAGAGTAGAAACGCCAGATGGTGATTGGAAAGG
GTGGAACTGGAGATCGGAGGGAGACATTTTGGTTAACGGAGCGTTTTTCGTGGCATCTGG
AGAAGGTGCGGAGATGAGGTACGAGAAGGCGTACAGCGTCGACCCTAAATTTGCCTCGTT
CATCGACCAAATCACACTTCATTGCGGCGTTCTTGGCGTTGGTGGCAGGAATAACAATTT
GGGGATGTGGACTACTACTGGATCCGAAGGTAGTGGCGGTTTAGATTCTTATAATGACTA
CACCGATGAAATGTCTGGCACCGGTTTAACTAACCGGTTATCTTTCTCGGTTATTGTTAT
AGCTTTCATGTTCGATATGATATTATATTTGTCCATGTTGTTGTAACGTGAACTTACCAA
TTTTTAATCAAGGAACAAGAAAAAAGATTCGACTCACTTTTATGTATTAGTTTCTTCC

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 4

CO CL2540Contig1 1229 4 15 U
CTCAAATCGCACCTAATAGTTTCGATATCTACCAGATCGCGGTAAACCAAAAGCTTTTCA
AGAATTAGAAAGAGAGACAGAGGATGGATAATAACAATAATCAGTTTTGGCAGTTCAGCG
ACCAATTAAGAGTCCAGACGCCTCACAATCTGGCGAATCTGTCTCTAAACGACTCCATCT
GGACCACCAAGCGCACCTTCGACGACCGTAGAAACTTCGACATCCCCACCTCCGACAAAC
AAAACCCAATCGAGTATCACAACAACAGCAACAACAACAAGGCTTCTTCCGACATCAACA
CCAACTGGAACAACTGGAAGCACTCCACCCCCAACGGTTTCGGACCCGTCGGCTCAAAAT
CCACCAACGTCAATTTCAACCACAGCCCTTTCAACGACACGTGGAAATTCAACTCCGACG
ACTTCAACGGCGGTTTCAACAAAGGCATCTATTCTTCTCCTTCTCCTTCCCCCGCGCAGC
CCAAGAGCTATGGCTTCACCTCCAAGAACAAAGGGATGATCGTCGTCGATGAAGATCATC
ATCATCAGATCCGAGGAGGAGCGAAGAAGAACAACAGGAAGAATCATAATCATCAGAAGA
ACAACAACAAGAAAGAAGACAACGATGGTTCGGTGGACAAGAGGTTCAAAACCCTCCCTC
CCGCGGAGGCTCTCCCGAGGAACGAGACCATCGGCGGTTACGTCTTCGTCTGCAACAACG
ACACCATGGAGGAGAATCTCAAGCGCCAGCTCTTCGGTTTGCCTCCGAGATACAGGGACT
CGGTCAGAGCCATCACTCCGGGACTTCCTCTCTTCCTCTACAACTACTCCACTCACCAGC
TCCACGGTATCTACGAGGCCGCGAGCTTCGGTGGAACCAACATCGAGCTCAGCGCTTTCG
AAGACAGGAAATGTCCTGGAGAATCGAGGTTCCCTGCTCAGGTGAGGGCTGTGACGAGGA
AGGTGTGTTTGCCGCTGGAGGAAGACTCTTTCAGGCCCATTCTGCATCACTACGACGGCC
CTAAGTTCCGCCTCGAACTCAGCGTCCCTGAGGTGCTTTCTCTTTTGGACGTTTTTGCTG
AGCAGAACCCTTAGAATTCGTCTGGATGAAAAAACAACAAAAGAGTTGGGAGTTGATGAT
GCCTTGTATTATTAAGTAATACCCGTTTTACTAATGTAAAGAGTATTAATAATTTGTCTC
CAGAAGATAAAAATGGTGGTATTTTATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DL14TF U 1
AF RS1GD73TF U 181
AF RS1GD73JQ C 1016
AF RS1DL14JQ C 523
BS 1 643 RS1DL14TF
BS 644 644 RS1GD73TF
BS 645 668 RS1DL14TF
BS 669 669 RS1GD73TF
BS 670 681 RS1DL14TF
BS 682 682 RS1GD73TF
BS 683 698 RS1DL14TF
BS 699 699 RS1GD73TF
BS 700 714 RS1DL14TF
BS 715 715 RS1GD73TF
BS 716 731 RS1DL14TF
BS 732 813 RS1GD73TF
BS 814 1154 RS1DL14JQ
BS 1155 1155 RS1GD73JQ
BS 1156 1229 RS1DL14JQ

RD RS1DL14TF 749 0 0
CTCAAATCGCACCTAATAGTTTCGATATCTACCAGATCGCGGTAAACCAAAAGCTTTTCA
AGAATTAGAAAGAGAGACAGAGGATGGATAATAACAATAATCAGTTTTGGCAGTTCAGCG
ACCAATTAAGAGTCCAGACGCCTCACAATCTGGCGAATCTGTCTCTAAACGACTCCATCT
GGACCACCAAGCGCACCTTCGACGACCGTAGAAACTTCGACATCCCCACCTCCGACAAAC
AAAACCCAATCGAGTATCACAACAACAGCAACAACAACAAGGCTTCTTCCGACATCAACA
CCAACTGGAACAACTGGAAGCACTCCACCCCCAACGGTTTCGGACCCGTCGGCTCAAAAT
CCACCAACGTCAATTTCAACCACAGCCCTTTCAACGACACGTGGAAATTCAACTCCGACG
ACTTCAACGGCGGTTTCAACAAAGGCATCTATTCTTCTCCTTCTCCTTCCCCCGCGCAGC
CCAAGAGCTATGGCTTCACCTCCAAGAACAAAGGGATGATCGTCGTCGATGAAGATCATC
ATCATCAGATCCGAGGAGGAGCGAAGAAGAACAACAGGAAGAATCATAATCATCAGAAGA
ACAACAACAAGAAAGAAGACAACGATGGTTCGGTGGACAAGAG*TTCAAAACCCTCCCTC
CCGCGGAG*CTCTCCCGAGGA*CGAGACCATCGGCGGT*ACGTCTTCGTCTGCA*CAACG
ACACCATGGAG
AGATCTCAGCGCCAGCTC

QA 1 731 1 731
DS 

RD RS1GD73TF 633 0 0
GGACCACCAAGCGCACCTTCGACGACCGTAGAAACTTCGACATCCCCACCTCCGACAAAC
AAAACCCAATCGAGTATCACAACAACAGCAACAACAACAAGGCTTCTTCCGACATCAACA
CCAACTGGAACAACTGGAAGCACTCCACCCCCAACGGTTTCGGACTCGTCGGCTCAAAAT
CCACCAACGTCAATTTCAACCACAGCCCTTTCAACGACACGTGGAAATTCAACTCCGACG
ACTTCAACGGCGGTTTCAACAAAGGCATCTATTCTTCTCCTTCTCCTTCCCCCGCGCAGC
CCAAGAGCTATGGCTTCACCTCCAAGAACAAAGGGATGATCGTCGTCGATGAAGATCATC
ATCATCAGATCCGAGGAGGAGCGAAGAAGAACAACAGGAAGAATCATAATCATCAGAAGA
ACAACAACAAGAAAGAAGACAACGATGGTTCGGTGGACAAGAGGTTCAAAACCCTCCCTC
CCGCGGAGGCTCTCCCGAGGAACGAGACCATCGGCGGTTACGTCTTCGTCTGCAACAACG
ACACCATGGAGGAGAATCTCAAGCGCCAGCTCTTCGGTTTGCCTCCGAGATACAGGGACT
CGGTCAGAGCCATCACTCCGGGACTTCCTCTCT

QA 1 633 1 633
DS 

RD RS1GD73JQ 172 0 0
CGGCCCTAAGTTCCGCCTCGAACTCAGGGTCCCTGAGGTGCTTTCTCTTTTGGACGTTTT
TGCTGAGCAGAACCCTTAGAATTCGTCTTGATGAAAAAACAACAAAAGAGTTGGGAGTTG
ATGATGCCTTGTATTATTAAGTAATACCCGTTTTACTAATGTAAAGAGTATT

QA 1 172 1 172
DS 

RD RS1DL14JQ 707 0 0
TCGTCGATGAAGATCATCATCATCAGATCCGAGGAGGAGCGAAGAAGAACAACAGGAAGA
ATCATAATCATCAGAAGAACAACAACAAGAAAGAAGACAACGATGGTTCGGTGGACAAGA
GGTTCAAAACCCTCCCTCCCGCGGAGGCTCTCCCGAGGAACGAGACCATCGGCGGTTACG
TCTTCGTCTGCAACAACGACACCATGGAGGAGAATCTCAAGCGCCAGCTCTTCGGTTTGC
CTCCGAGATACAGGGACTCGGTCAGAGCCATCACTCCGGGACTTCCTCTCTTCCTCTACA
ACTACTCCACTCACCAGCTCCACGGTATCTACGAGGCCGCGAGCTTCGGTGGAACCAACA
TCGAGCTCAGCGCTTTCGAAGACAGGAAATGTCCTGGAGAATCGAGGTTCCCTGCTCAGG
TGAGGGCTGTGACGAGGAAGGTGTGTTTGCCGCTGGAGGAAGACTCTTTCAGGCCCATTC
TGCATCACTACGACGGCCCTAAGTTCCGCCTCGAACTCAGCGTCCCTGAGGTGCTTTCTC
TTTTGGACGTTTTTGCTGAGCAGAACCCTTAGAATTCGTCTGGATGAAAAAACAACAAAA
GAGTTGGGAGTTGATGATGCCTTGTATTATTATGTAATACCCGTTTTACTAATGTAAAGA
GTATTAATAATTTGTCTCCAGAAGATAAAAATGGTGGTATTTTATAC

QA 1 707 1 707
DS 



AS 2 4

CO CL2541Contig1 518 2 3 U
CCTTGATATCTTCATATATAAATGAAAATAGGAACAGTTATGATATTTTCATCTTCGTTC
ATATAAACTTGACACACACGACACGAAGCAGCATACAACTTAGGTACAATTAAAAACTTC
AACAATAGCCGTTTTAGGCCTTATTATACAGAGTATTTGCGTACTTATTACCACATGCAT
ATATGTTGAAAATATATAGTCTCTTGCGAGTTATATATGACAGTTCACTCAGTGGCCTTT
ACGCTCCACATAGATATAATTTTACGGTAAATAGCCACCACCGCCTTCTCCGCTACCAGC
ACCGCCACCGTGTCCAGATCCAGCAGCTGCATAACCTCAACCAACATGCAAACTACTTTT
CTCGCCATAGCCAGCGACTTCATCCTCGGGTTCATAGGAGGAGAGAAGTACTCGTCTTGC
AGAACATAACCCTAAACCTATTAAGAAACATAGAAAGAAAATATTTTTGTGAGTAGCCAT
GTTTCAATCTTTCTTATGACTATTTTGTTGTGTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D406JQ U 46
AF RS1D406TF C 1
BS 1 45 RS1D406TF
BS 46 298 RS1D406JQ
BS 299 518 RS1D406TF

RD RS1D406JQ 262 0 0
TTTTCATCTTCGTTCATATAAACTTGACACACACGACACGAAGCAGCATACAACTTAGGT
ACAATTAAAAACTTCAACAATAGCCGTTTTAGGCCTTATTATACAGAGTATTTGCGTACT
TATTACCACATGCATATATGTTGAAAATATATAGTCTCTTGCGAGTTATATATGACAGTT
CACTCAGTGGCCTTTACGCTCCACATAGATATAATTTTACGGTAAATAGCCACCACCGCC
TTCTCCGCTACCA
GCACCGCCA

QA 1 253 1 253
DS 

RD RS1D406TF 518 0 0
CCTTGATATCTTCATATATAAATGAAAATAGGAACAGTTATGATATTTTCATCTTCGTTC
ATATAAACTTGACACACACGACACGAAGCAGCATACAACTTAGGTACAATTAAAAACTTC
AACAATAGCCGTTTTAGGCCTTATTATACAGAGTATTTGCGTACTTATTACCACATGCAT
ATATGTTGAAAATATATAGTCTCTTGCGAGTTATATATGACAGTTCACTCAGTGGCCTTT
ACGCTCCACATAGATATAATTTTACGGTAAATAGCCACCACCGCCTTCTCCGCTACCAGC
ACCGCCACCGTGTCCAGATCCAGCAGCTGCATAACCTCAACCAACATGCAAACTACTTTT
CTCGCCATAGCCAGCGACTTCATCCTCGGGTTCATAGGAGGAGAGAAGTACTCGTCTTGC
AGAACATAACCCTAAACCTATTAAGAAACATAGAAAGAAAATATTTTTGTGAGTAGCCAT
GTTTCAATCTTTCTTATGACTATTTTGTTGTGTGATCC

QA 1 518 1 518
DS 



CO CL2541Contig2 477 2 4 U
GGATCACACAACAAAATAGTCATAAGAAAGATTGAAACATGGCTACTCACAAAAATATTT
TCTTTCTATGTTTCTTAATAGGTTTAGGGTTATGTTCTGCAAGACGAGTACTTCTCTCCT
CCTATGAACCCGAGGATGAAGTCGCTGGCTATGGCGAGAAAAGTAGTTTGCATGTTGGTT
ATGGTATTGGAGCTGATGCTGGTGCTGGTGGTAGCGGAGAAGGCGGTGGTGGCTATTTAC
CGTAAAATTATATCTATGTGGAGCGTAAAGGCCACTGAGTGAACTGTCATATATAACTCG
CAAGAGACTATATATTTTCAACATATATGCATGTGGTAATAAGTACGCAAATACTCTGTA
TAATAAGGCCTAAAACGGCTATTGTTGAAGTTTTTAATTGTACCTAAGTTGTATGCTGCT
TCGTGTCGTGTGTGTCAAGTTTATATGAACGAAGATGAAAATATCATAACTGTTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EO94TF U 1
AF RS1FI23TF U 4
BS 1 209 RS1EO94TF
BS 210 212 RS1FI23TF
BS 213 451 RS1EO94TF
BS 452 477 RS1FI23TF

RD RS1EO94TF 451 0 0
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TCTTTCTATGTTTCTTAATAGGTTTAGGGTTATGTTCTGCAAGACGAGTACTTCTCTCCT
CCTATGAACCCGAGGATGAAGTCGCTGGCTATGGCGAGAAAAGTAGTTTGCATGTTGGTT
ATGGTATTGGAGCTGATGCTGGTGCTGGT***AGCGGAGAAGGCGGTGGTGGCTATTTAC
CGTAAAATTATATCTATGTGGAGCGTAAAGGCCACTGAGTGAACTGTCATATATAACTCG
CAAGAGACTATATATTTTCAACATATATGCATGTGGTAATAAGTACGCAAATACTCTGTA
TAATAAGGCCTAAAACGGCTATTGTTGAAGTTTTTAATTGTACCTAAGTTGTATGCTGCT
TCGTGTCGTGTGTGTCAAGTTTATATGAACG

QA 1 451 1 451
DS 

RD RS1FI23TF 474 0 0
GGACAT
AACAAAATAGTCATAAGAAAGATTGAAACATGGCTACTCACAAAAATATTTTCTTTCTAT
GTTTCTTAATAGGTTTAGGGTTATGTTCTGCAAGACGAGTACTTCTCTCCTCCTATGAAC
CCGAGGATGAAGTCGCTGGCTATGGCGAGAAAAGTAGTTTGCATGTTGGTTATGGTATTG
GAGCTGATGCTGGTGTTGGTGGTAGCGGAGAAGGCGGTGGTGGCTATTTACCGTAAAATT
ATATCTATGTGGAGCGTAAAGGCCACTGAGTGAACTGTCATATATAACTCGCAAGAGACT
ATATATTTTCAACATATATGCATGTGGTAATAAGTACGCAAATACTCTGTATAATAAGGC
CTAAAACGGCTATTGTTGAAGTTTTTAATTGTACCTAAGTTGTATGCTGCTTCGTGTCGT
GTGTGTCAAGTTTATATGAACGAAGATGAAAATATCATAACTGTTCCT

QA 7 474 7 474
DS 



AS 1 4

CO CL2542Contig1 1198 4 5 U
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TGAACCTTTTGTCATTGCCACGAACAGACAGCTAAGCGTTCTTCACCCGGTTTTCAAGCT
CCTCGAACCTCACTACCGTGATACGATGAACATTAATGCGCTTGCTAGGCAAATCTTGAT
CAATGGAGGGGTATCTTTGAGATCACAGTCTTCCCTTCTAAATATGCCATGGAGATGTCA
TCTTTCATCTACAAGAACCACTGGACCTTCCCTGACCAAGCCTTACCAGCATAACTTAAA
AAGAGAGGGATGGCTGTTGAGGATCCAGAAGCACCACACGGATTACATCTGAAGATAGAA
GACTATCCTTACGCTGTGGATGGGCTTGAGGTTTGGTACGCTATCGAGTCATGGGTCCAA
GACTACATTCCCTTGTATTACAAGACGGACGAGGATGTCCAAAACGACACGGAGCTCCAA
GCTTGGTGGAAGGAGGTGCGTGAGGAAGGTCACGGAGACAAAAAGTCAGAACCTTGGTGG
TCCAAAATGCAAACCCGCAAAGAACTGATTGACTCTTGCACTATAATAATATGGGTGGCT
TCTGCTCTTCATGCAGCTGTTAACTTCGGACAGTATCCCTTTGCTGGGTATCTCCCCAAC
AGGCCGACCATAAGCCGACAGTTCATGCCAAAGGAAAACACTCCGGAGTTTGAAGAGCTT
GAGAAGAATCCGGAGAAAGTGTTTTTGAAGACGATCACGGCTCAGCTTCAGACGCTTCTT
GGGATATCTCTGATTGAGATTCTGTCTACTCATTCGAGCGACGAGGTGTATTTGGGGCAG
AGAGATTCTAAGGAATGGGCAGCTGAGAAAGAGGCGTTGGAAGCGTTTGAGAAGTTTGGA
GAGAAAGTAAAAGAGATTGAGAAGAAGATTGATGAAAGGAACGAAGACGAGAATCTCAAG
AACAGGACTGGGCCAGTTAAGATGCCATACACTTCTTTGTTTCCGACCAGTGTAGCGGGA
GTCACTGGCAGGGGAATCCCGAACAGTGTCTCCATCTGAAACATGTCTCAAGGTTGTTGT
TTGTTTTCTGCTTATTGTGTTTGTGTGTGTGTGTTGCACTCCGTTTGTGTTCTCCCATGG
TTTGCCTTTTTTCACATGTTAACAGTTGATTCTTGCCGGTTTTCGGGATCGGTTTATC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A044TF U 1
AF RS1A044TV U 1
AF RS1A044JQ C 436
AF RS1A044TR C 436
BS 1 849 RS1A044TF
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RD RS1A044TF 849 0 0
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TGAACCTTTTGTCATTGCCACGAACAGACAGCTAAGCGTTCTTCACCCGGTTTTCAAGCT
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GACTACATTCCCTTGTATTACAAGACGGACGAGGATGTCCAAAACGACACGGAGCTCCAA
GCTTGGTGGAAGGAGGTGCGTGAGGAAGGTCACGGAGACAAAAAGTCAGAACCTTGGTGG
TCCAAAATGCAAACCCGCAAAGAACTGATTGACTCTTGCACTATAATAATATGGGTGGCT
TCTGCTCTTCATGCAGCTGTTAACTTCGGACAGTATCCCTTTGCTGGGTATCTCCCCAAC
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GAGAAGAATCCGGAGAAAGTGTTTTTGAAGACGATCACGGCTCAGCTTCAGACGCTTCTT
GGGATATCTCTGATTGAGATTCTGTCTACTCATTCGAGCGACGAGGTGTATTTGGGGCAG
AGAGATTCT

QA 1 849 1 849
DS 

RD RS1A044TV 890 0 0
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TGAACCTTTTGTCATTGCCACGAACAGACAGCTAAGCGTTCTTCACCCGGTTTTCAAGCT
CCTCGAACCTCACTACCGTGATACGATGAACATTAATGCGCTTGCTAGGCAAATCTTGAT
CAATGGAGGGGTATCTTTGAGATCACAGTCTTCCCTTCTAAATATGCCATGGAGATGTCA
TCTTTCATCTACAAGAACCACTGGACCTTCCCTGACCAAGCCTTACCAGCATAACTTAAA
AAGAGAGGGATGGCTGTTGAGGATCCAGAAGCACCACACGGATTACATCTGAAGATAGAA
GACTATCCTTACGCTGTGGATGGGCTTGAGGTTTGGTACGCTATCGAGTCATGGGTCCAA
GACTACATTCCCTTGTATTACAAGACGGACGAGGATGTCCAAAACGACACGGAGCTCCAA
GCTTGGTGGAAGGAGGTGCGTGAGGAAGGTCACGGAGACAAAAAGTCAGAACCTTGGTGG
TCCAAAATGCAAACCCGCAAAGAACTGATTGACTCTTGCACTATAATAATATGGGTGGCT
TCTGCTCTTCATGCAGCTGTTAACTTCGGACAGTATCCCTTTGCTGGGTATCTCCCCAAC
AGGCCGACCATAAGCCGACAGTTCATGCCAAAGGAAAACACTCCGGAGTTTGAAGAGCTT
GAGAAGAATCCGGAGAAAGTGTTTTTGAAGACGATCACGGCTCAGCTTCAGACGCTTCTT
GGGATATCTCTGATTGAGATTCTGTCTACTCATTCGAGCGACGAGGTGTATTTGGGGCAG
AGAGATTCTAAAGAATGGGCAGCTGAGAAAGAGGCGTTGGAAGCGTTTGA

QA 1 890 1 890
DS 

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GTGCGTGAGGAAGGTCACGGAGACAAAAAGTCAGAACCTTGGTGGTCCAAAATGCAAACC
CGCAAAGAACTGATTGACTCTTGCACTATAATAATATGGGTGGCTTCTGCTCTTCATGCA
GCTGTTAACTTCGGACAGTATCCCTTTGCTGGGTATCTCCCCAACAGGCCGACCATAAGC
CGACAGTTCATGCCAAAGGAAAACACTCCGGAGTTTGAAGAGCTTGAGAAGAATCCGGAG
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GAGATTCTGTCTACTCATTCGAGCGACGAGGTGTATTTGGGGCAGAGAGATTCTAAGGAA
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ATTGAGAAGAAGATTGATGAAAGGAACGAAGACGAGAATCTCAAGAACAGGACTGGGCCA
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ATCCCGAACAGTGTCTCCATCTGAAACATGTCTCAAGGTTGTTGTTTGTTTTCTGCTTAT
TGTGTTTGTGTGTGTGTGTTGCACTCCGTTTGTGTTCTCCCATGGTTTGCCTTTTTTCAC
ATGTTAACAGTTGATTCTTGCCGGTTTTCGGGATCGGTTTATC

QA 1 763 1 763
DS 

RD RS1A044TR 763 0 0
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BQ
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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FK81JQ U 23
AF RS1FS38JQ U 1
AF RS1AN25TF C 271
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AAGCAACACAGAAACCTCCTTTACCTTACACGACTTGCATCTCATCCCAGTGTTTGGCAC
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CCCTTCTTTCACTTGGTG***ATGATGATGATGATCAGCTAATACACCACTTGCATTGAT
GTTGTTTCCATGTGACATCATCACTTGTTGCAAATTTACCTTCAAGGCATTAACCACAGA
TTCATTGTACTTTGCCCTGTAATGCCAGTTCTGAGATTCCACCGCCACTTGTTTTATCTT
CTCCACGAGTTCTCGGTTCTTCTTGTTCATGTTTTTGATCTCCTGGTCTTTCTCTTCAAG
CTTCTTGCTAACCTCCTTCTCTATGGCCGTGACAAAAGACGTGACATGTCTCTGTTTTAT
ATCTCTCACACCCTTAGCTAGTTGGTCCCCCTGGAATTTGATAAACTGATCAAGCTCCTC
TTTCTGTCTATCAAAGTCCAATCTGATACCGTCACCGAGTGACTGAAACATTGGAGTTGT
GATGTTTCCATTTGCAGAAGTTACAGAAGAGTTTCGCTCATCGTCGTCATAAGATAGTCT

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DS 

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AAGTTTTCAAAGACTGACAAACAGGACAAACACCAGTGAACGCATCACAGTCTTTACACA
AACTCAAGTGCCTACACGGTACAAGCAACACAGAAACCTCCTTTACCTTACACGACTTGC
ATCTCATCCCAGTGTTTGGTACCCGCGGGATGTTCATGTGGTTGTATGAAGCTGCTCCAT
CATCAATCTCGCTATCCCCGAACCCTTCTTTCACTTGGTGCTGATGATGATGATGATCAG
CTAATACACCACTTGCATTGATGTTGTTTCCATGTGACATCATCACTTGTTGCAGATTTA
CCTTTAAGGCATTAACCA*AGATTCATTGTACTTTGCCCTGTAATGCCAGTTCTGAGATT
CCACCGCCACTTGTTTTATCTTCTCCACGAGTTCCCGGTTCTTCTTGTTCATGTTTTTGA
TCTCCTCGTCTTTCTCTTGCAGCTTCTTGCTCACCTCCTTCTCTAAGGCCGTGACAAAAG
ACGTGATATGTCTCTGTTTTATATCTCTCACACCCTTCGCCAGTTGGTCCCCCTGGAATT
TGATAAACTGATCAAGCTCTTCTTTTTGTCTATCAAAGTCCAATCTGATACCGTCACCGA
GTGACTGAAACATTGGAGTTGTGATGTTTCCATTTGCAGAAGTTACAGAAGAGTTTCGCT
CATCGTCGTCATAAGATAGTCTCAGACCAGTTGACACTAAGTTATGCTTTGTGACTTCAT
TT

QA 1 782 1 782
DS 

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TCACTTGGTGC
TGATGATGATGGTGATCAGCTAATACACCACTTGCATTGATGTTGTTTCCATGTGACATC
ATCACTTGTTGCAGATTTACCTTTAAGGCATTAACCACAGATTCATTGTACTTTGCCCTG
TAATGCCAGTTCTGAGATTCCACCGCCACTTGTTTTATCTTCTCCACGAGTTCCCGGTTC
TTCTTGTTCATGTTTTTGATCTCCTCGTCTTTCTCTTGCAGCTTCTTGCTCACCTCCTTC
TCTAAGGCCGTGACAAAAGACGTGATATGTCTCTGTTTTATATCTCTCACACCCTTCGCC
AGTTGGTCCCCCTGGAATTTGATAAACTGATCAAGCTCTTCTTTTTGTCTATCAAAGTCC
AATCTGATACCGTCACCGAGTGACTGAAACATTGGAGTTGTGATGTTTCCATTTGCAGAA
GTTACAGAAGAGTTTCGCTCATCGTCGTCATAAGATAGTCTCAGACCAGTTGACACTAAG
TTATGCTTTGTGACTTCATTTTGAACACCACTATTGTTCTTGTTGTTGTAGTTATAGTCC
AAAGAGATCTGCTGTCTCTGTATGCTATTGATGATCTCGGTATCCCTAGCGCGTTTGTTA
ATATTCGGAATCATTGGAGCACGGCTATCATTAGCAAAGTAGTTAACAGGATCAATAGTG
CAACCAGCGTTCATGGTTCCAAGCAAGTGAGGCTGATTCAGGGAAGTGTTTGATTGGTAG
TGAAACTGGCTACCCTGCGGTAAGGGGTTGATGTCATTGTTGCCTCCTCCCAACATCTTC
TCAATTGCTTAACCGTT

QA 12 808 12 808
DS 



AS 1 4

CO CL2545Contig1 978 4 9 U
GATCATGAAGTTATTCTCTACTTCTTTATATAATATTTTTCTCTCATTGTATAAGGGGGG
CCGTCTTATTCTCAAGGGGACAATTTATATCACCCACTTTAGTTACAGAGAGGCAATCAT
CTCATTTCCCCAAATTCAAACACTCGAATCCAAAACACTCAATTTAAAAAACACTGCCTA
ACACACTAAATATTGTCGTCTCCATTCTCATCGTTCTTCTTTCATTATTGAGGACACATA
TCTACATCAAGCCCTTTACTCCCGGTTTAAACCGTAAATCACGAGCTCAACATCGGACTG
TAACACTCCATGTCTTGCCCCTATCAAAGCTTTGCCTGGGAATACAAGAAGGTTCCAAGG
ATAGCAATGGCAGCTCCAAGAGCATTAACGGGCTGGACAGGAGTGCGGAAGATAATGATG
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ATTTGGTCTAAAGACATGTAAGACACTTGGTTGTAGAGGTGATAGAACACACTCTGAGCA
GTCACCCACCCGACAAACTGAGGTCCGATGTCGGAGAGAGCCTTTTGCCAGCCATCAGCC
CACATCTGAGGTCCTTCAACCGCAAATGCAAAGGGGGTGAGGATCAAGAGTGATAGCATT
GAGAGACATGCGTAGTAGTTCATCCCGCTCACAGACTTTCCCTTCGTCCCCTTCTTTGAG
AAGATGTTACGGAAGACAAATGCCAAGTTCGAGATCATCGCTCCCATGAAACCAGTCATG
TTGAAGTTAAGCTCAGTGAGGACAGAGAGAGCACAACCACCAATAATCGGGATGAGGGAG
AGGTAAACGGAAGCAGGGAAGGTTTCACCCAAAAGAAACCTGGAGACAAGGACGCTAAAC
GCCGGCTCACCACTCTTGATGATGTGAGTGAAGGAAACCGCAACCTTTGACATACTCACC
GTTGCAGCCACATGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GZ62JQ U 1
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AF RS1F529JQ U 41
AF RS1F529TF C 232
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CTCATTTCCCCAAATTCAAACACTCGAATCCAAAACACTCAATTTAAAAAACACTGCCTA
ACACACTAAATATTGTCGTCTCCATTCTCATCGTTCTTCTTTCATTATTGAGGACACATA
TCTACATCAAGCCCTTTACTCCCGGTTTAAACCGTAAATCACGAGCTCAACATCGGACTG
TAACACTCCATGTCTTGCCCCTATCAAAGCTTTGCCTGGGAATACAAGAAGGTTCCAAGG
ATAGCAATGGCAGCTCCAAGAGCATTAACGGGCTGGACAGGAGTGCGGAAGATAATGATG
GAGGAGACGA

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DS 

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CTAC
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ATTTATATCACCCACTTTAGTTACAGAGAGGCAATCATCTCATTTCCCCAAATTCAAACA
CTCGAATCCAAAACACTCAATTTAAAAAACACTGCCTAACACACTAAATATTGTCGTCTC
CATTCTCATCGTTCTTCTTTCATTATTGAGGACACATATCTACATCAAGCCCTTTACTCC
CGGTTTAAACCGTAAATCACGAGCTCAACATCGGACTGTAACACTCCATGTCTTGCCCCT
ATCAAAGCTTTGCCTGGGAATACAAGAAGGTTCCAAGGATAGCAATGGCAGCTCCAAGAG
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CAAATGCAAAGGGGGTGAGGATCAAGAGTGATAGCATTGAGAGACATGCGTAGTAGTTCA
TCCCGCTCACAGACTTTCCCTTCATCCCC
C

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DS 

RD RS1F529JQ 800 0 0
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AGTTACAGAGAGGCAATCATCTCATTTCCCCAAATTCAAACACTCGAATCCAAAACACTC
AATTTAAAAAACACTGCCTAACACACTAAATATTGTCGTCTCCATTCTCATCGTTCTTCT
TTCATTATTGAGGACACATATCTACATCAAGCCCTTTACTCCCGGTTTAGACCGTAAATC
ACGAGCTCAACATCGGACTGTAACACTCCATGTCTTGCCCCTATCAAAGCTTTGCCTGGG
AATACAAGAAGGTTCCAAGGATAGCAATGGCAGCTCCAAGAGCATTAACGGGCTGGACAG
GAGTGCGGAAAATAATGATGGAGGAGACGATGACTGAAATACGCTTCATGATGTTCCCCA
CACTAAACGTCAAGGGAGAGATTTGGTCTAAAGACATGTAAAACACTTGGTTGTAGAGGT
GATAGAACACACTCTGAGCAGTCACCCACCCGACAAACTGAGGTCCGATGTCGGAAAGAG
CCTTTTGCCAGCCATCAGCCCACATCTGAGGTCCTTCAACCGCAAATGCAAAGGGGGTGA
GGATCAAGAGTGATAGCATTGAGAGACATGCGTAGTAGTTCATCCCGCTCACAGACTTTC
CCTTCGTCCCCTTCTTTGAGAAGATGTTACGGAAGACAAATGCCAAGTTCGAGATCATCG
CTCCCATGAAACCAGTCATGTTGAAGTTAAGCTCAGTGAGGACAGAGAGAGCACAACCAC
CAATAATCGGGATGAGGGAG

QA 1 800 1 800
DS 

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A
GACACATATCTACATCAAGCCCTTTACTCCCGGTT*AGAC*GTAA*TCACGAGCTCAACA
TCGGACTGTAACACTCCATGTCTG**CCCTATCAAAGCTTTGCCTGGGAATACAAGAAGG
TTCCAAGGATAGCAATGGCAGCTCCAAGAGCATTAACGGGCTGGACAGGAGTGCGGAAGA
TAATGATGGAGGAGACGATGACTGAGATACGCTTCATGATGTTCCCCACACTAAACGTCA
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TCTGAGCAGTCACCCACCCGACAAACTGAGGTCCGATGTCGGAGAGAGCCTTTTGCCAGC
CATCAGCCCACATCTGAGGTCCTTCAACCGCAAATGCAAAGGGGGTGAGGATCAAGAGTG
ATAGCATTGAGAGACATGCGTAGTAGTTCATCCCGCTCACAGACTTTCCCTTCGTCCCCT
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CAGTCATGTTGAAGTTAAGCTCAGTGAGGACAGAGAGAGCACAACCACCAATAATCGGGA
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TACTCACCGTTGCAGCCACATGACCC

QA 2 747 2 747
DS 



AS 1 3

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GGCTTCTCTTTGTGCTTCTTCTGCCATTGCCGCCATATCTTCTCCTAGCTTCTTGGGAGG
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AGAGTGGCTCGACGGTAGCCTCCCTGGTGACTTCGGATTCGATCCTCTTGGTCTTTCATC
TGACCCGGATAGTCTAAAATGGAACGTACAAGCAGAGATAGTTCACTGCAGGTGGGCAAT
GCTAGGCGCCGCCGGGATTTTTATCCCGGAGTTTCTAACCAAGATCGGGATCCTCAACAC
TCCCTCCTGGTACACCGCCGGAGAGCAAGAGTATTTCACGGACAAGACCACACTCTTCGT
TGTTGAGCTCATCTTAATAGGATGGGCCGAGGGTCGTAGATGGGCCGATATCATTAAGCC
CGGTAGCGTCAACACTGACCCAATCTTCCCAAACAACAAACTGACGGGTACAGACGTTGG
ATACCCGGGTGGGTTATGGTTCGACCCGTTGGGTTGGGGATCTGGTAGCCCGGCTAAGAT
CAAGGAGCTGAGGACTAAAGAGATCAAGAACGGAAAGTTGGCTATGTTGGCAGTGATGGG
TGCTTGGTTCCAACATATATACACTGGGACTGGTCCTATCGATAACCTTTTTGCACATCT
TGCTGATCCTGGTCATGCTACTATCTTCGCTGCTTTCACACCCAAGTGAGACGTCAAGAA
AGGAGGATTTGGGAGGGAGAATGCGTTTATTGATCATGTTTGTACAAATATGGTTTTTGA
ACTTAAAATATTATGTATTTAAGCAAATGGTGGTCGAATGGAAGTTAGGGTTCGCCGTGA
CACTACTCTTTTCCTGACTAAATGCTCATACATTGTGATTCGTGGTATGAGAGTCAATCT
TTTCTATTCTTTGTTGGTTAATGCATCTCATGAGAATCATACGCACTTCTAACAACTGCT
AATTACAACACCAAACATATCTTCAAATGTAGAGATTTGGAAAATGTAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G655TF U 1
AF RS1BK63TF U 97
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AGAGTGGCTCGACGGTAGCCTCCCTGGTGACTTCGGATTTGATCCTCTTGGTTTTTCATC
TGACCCGGATAGTCTAAAATGGAACGTACAAGCAGAGATAGTTCACTGCCGGTGGGCAAT
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CGTTGAGCTCATCTTAATCGGATGGGCCGAGGGTCGTAGATGGGC
TGAGGA

QA 1 525 1 525
DS 

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AGCTGTTTCCAAATCAGCTGGGTCTGTGCGGGCCGTTGCAGCGGATCCCGAGAGACCAAT
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ATTCGATCCTCTTGGTCTTTCATCTGACCCGGATAGTCTAAAATGGAACGTACAAGCAGA
GATAGTTCACTGCAGGTGGGCAATGCTAGGCGCCGCCGGGATTTTTATCCCGGAGTTTCT
AACCAAGATCGGGATCCTCAACACTCCCTCCTGGTACACCGCCGGAGAGCAAGAGTATTT
CACGGACAAGACCACACTCTTCGTTGTTGAGCTCATCTTAATAGGATGGGCCGAGGGTCG
TAGATGGGCCGATATCATTAAGCCCGGTAGCGTCAACACTGACCCAATCTTCCCAAACAA
CAAACTGACGGGTACAGACGTTGGATACCCGGGTGGGTTATGGTTCGACCCGTTGGGTTG
GGGATCTGGTAGCCCGGCTAAGATCAAGGAGCTGAGGACTAAAGAGATCAAGAACGGAAA
GTTGGCTATGTTGGCAGTGATGGGTGCTTGGTTCCAACATATATACACTGGGACTGGTCC
TATCGATAACCTTTTTGCACATCTTGCTGATCCTGGTCATGCTACTATCT

QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1BK63JQ 716 0 0
ACACTCCCTCCTGGTACACCGCCGGAGAGCAAGAGTATTTCACGGACAAGACCACACTCT
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AGCCCGGTAGCGTCAACACTGACCCAATCTTCCCAAACAACAAACTGACGGGTACAGACG
TTGGATACCCGGGTGGGTTATGGTTCGACCCGTTGGGTTGGGGATCTGGTAGCCCGGCTA
AGATCAAGGAGCTGAGGACTAAAGAGATCAAGAACGGAAGGTTGGCTATGTTGGCAGTGA
TGGGTGCTTGGTTCCAACATATATACACTGGGACTGGTCCTATCGATAACCTTTTTGCAC
ATCTTGCTGATCCTGGTCATGCTACTATCTTCGCTGCTTTCACACCCAAGTGAGACGTCA
AGAAAGGAGGATTTGGGAGGGAGAATGCGTTTATTGATCATGTTTGTACAAATATGGTTT
TTGAACTTAAAATATTATGTATTTAAGCAAATGGTGGTCGAATGGAAGTTAGGGTTCGCC
GTGACACTACTCTTTTCCTGACTAAATGCTCATACATTGTGATTCGTGGTATGAGAGTCA
ATCTTTTCTATTCTTTGTTGGTTAATGCATCTCATGAGAATCATACGCACTTCTAACAAC
TGCTAATTACAACACCAAACATATCTTCAAATGTAGAGATTTGGAAAATGTAAAAA

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 4

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GGGTGAACGCGGAGACTTTTGAGGGATCATCCGAATTCTCAGTGCAACTTGACAAGTTAT
CACCATCATCTTCTCCCAGATCACAATCAAATCAAACCACATCATCTGAGAAGAAAAAAG
ATGGCGGTTACTATGAAACAGATGTCGTTGATCGTGTCTTTGTTTGGTGTCTTGTCGTTT
ATTCTCGGAGTCATCGCTGAGAACAAGAAGCCTGCGTCTGGAACTCCAATAAATGGAAAG
GGAGTAGTCATCTGCAAATATCCATCTGATCCAACTGTTGCCTTGGGTTACCTTTCTGCC
GCTTTTCTCCTTGCCTGCACCGTTGCAGGATACAAATCCTTGTTCATCTCTTACAAGGGA
AGGTCTGTTCCCAACTCTGTCTTGTTCAAAAGCACCAGCTTCTCTGTCTTCTTCAACATT
GCCTTGATAACATCTGGACTGGCACTGTCTCTGTTGCTATGGCCAACCATCACAGAGCAA
CTTCACTTGACCCGTAATGTACACAGGAACTTAGAGACCAGCTGCCCCACGGCTAAGACT
GGTCTGCTAGGTGGAGGTGCATTTGTGTCATTGGACTCGTGTCTTTTCTGGCTGGTGGCT
CTGATGCTAGCTGATAACGCCCGTGAAGACCATTTGGATGAAGCTGAAAACAGAAACGGC
GATGGGAACTCTTCCTCCAGGGATGTTAACCTCAAGATTGATGCTTGAGAGAATGAATGA
TCTGCATCTGCATCTGCTTATTGGTATTGGGGTGTAGTAAGGGGGTTTTATGTTATTCTA
CTGCTTGTTTGATTAGGAAAATACAAATAGTTTTTTTTTAAGTACATTTGATTTTAAAGA
TGCTATGAATTGCTTGTGAAGCTTAAATTCTTAATGCACTGTGATTCTCAAAGTTGTATA
TATCTACTCAGTCAGATTCTTGCTTAAATAATATTTTGATTTGGATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1GL22TF U 1
AF RS1GV17TF U 87
AF RS1GL22JQ C 410
AF RS1GV17JQ C 412
BS 1 192 RS1GL22TF
BS 193 193 RS1GV17TF
BS 194 238 RS1GL22TF
BS 239 239 RS1GV17TF
BS 240 658 RS1GL22TF
BS 659 659 RS1GV17TF
BS 660 712 RS1GL22TF
BS 713 713 RS1GV17TF
BS 714 716 RS1GL22TF
BS 717 717 RS1GV17TF
BS 718 741 RS1GL22TF
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BS 743 751 RS1GL22TF
BS 752 752 RS1GV17JQ
BS 753 948 RS1GL22JQ

RD RS1GL22TF 756 0 0
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CACCATCATCTTCTCCCAGATCACAATCAAATCAAACCACATCATCTGAGAAGAAAAAAG
ATGGCGGTTACTATGAAACAGATGTCGTTGATCGTGTCTTTGTTTGGTGTCTTGTCGTTT
ATTCTCGGAGTCGTCGCTGAGAACAAGAAGCCTGCGTCTGGAACTCCAATAAATGGAAGG
GGAGTAGTCATCTGCAAATATCCATCTGATCCAACTGTTGCCTTGGGTTACCTTTCTGCC
GCTTTTCTCCTTGCCTGCACCGTTGCAGGATACAAATCCTTGTTCATCTCTTACAAGGGA
AGGTCTGTTCCCAACTCTGTCTTGTTCAAAAGCACCAGCTTCTCTGTCTTCTTCAACATT
GCCTTGATAACATCTGGACTGGCACTGTCTCTGTTGCTATGGCCAACCATCACAGAGCAA
CTTCACTTGACCCGTAATGTACACAGGAACTTAGAGACCAGCTGCCCCACGGCTAAGACT
GGTCTGCTAGGTGGAGGTGCATTTGTGTCATTGGACTCGTGTCTTTTCTGGCTGGTGGCT
CTGATGCTAGCTGATAACGCCCGTGAAGACCATTTGGATGAAGCTGAAAACAGAAACG*C
GATGGGAACTCTTCCTCCAGGGATGTTAACCTCAAGATTGATGCTTGAGAGA*TGA*TGA
TCTGCATCTGCATCTGCTTAT*GGTATTGGG
TGTAG

QA 1 751 1 751
DS 

RD RS1GV17TF 671 0 0
GG
AAATCAAACCACATCATCTGAGAAGAAAAAAGATGGCGGTTACTATGAAACAGATGTCGT
TGATCGTGTCTTTGTTTGGTGTCTTGTCGTTTATTCTCGGAGTCATCGCTGAGAACAAGA
AGCCTGCGTCTGGAACTCCAATAAATGGAAAGGGAGTAGTCATCTGCAAATATCCATCTG
ATCCAACTGTTGCCTTGGGTTACCTTTCTGCCGCTTTTCTCCTTGCCTGCACCGTTGCAG
GATACAAATCCTTGTTCATCTCTTACAAGGGAAGGTCTGTTCCCAACTCTGTCTTGTTCA
AAAGCACCAGCTTCTCTGTCTTCTTCAACATTGCCTTGATAACATCTGGACTGGCACTGT
CTCTGTTGCTATGGCCAACCATCACAGAGCAACTTCACTTGACCCGTAATGTACACAGGA
ACTTAGAGACCAGCTGCCCCACGGCTAATACTGGTCTGCTAGGTGGAGGTGCATTTGTGT
CATTGGACTCGTGTCTTTTCTGGCTGGTGGCTCTGATGCTAGCTGATAACGCCCGTGAAG
ACCATTTGGATGAAGCTGAAAACAGAAACGGCGATGGGAACTCTTCCTCCTGGGATGTTA
ACCTCAAGATTGATGCTTGAGAGAATGAATGATCTGCATCTGCATCTGCTTATTGGTATT
GGG
GTGTAG

QA 3 665 3 665
DS 

RD RS1GL22JQ 539 0 0
TC
TTCAACATTGCCTTGATAACATCTGGACTGGCACTGTCTCTGTTGCTATGGCCAACCATC
ACAGAGCAACTTCACTTGACCCGTAATGTACACAGGAACTTAGAGACCAGCTGCCCCACG
GCTAAGACTGGTCTGCTAGGTGGAGGTGCATTTGTGTCATTGGACTCGTGTCTTTTCTGG
CTGGTGGCTCTGATGCTAGCTGATAACGCCCGTGAAGACCATTTGGATGAAGCTGAAAAC
AGAAACGGCGATGGGAACTCTTCCTCCAGGGATGTTAACCTCAAGATTGATGCTTGAGAG
AATGAATGATCTGCATCTGCATCTGCTTATTGGTATTGGG*TGTAGTAAGGGGGTTTTAT
GTTATTCTACTGCTTGTTTGATTAGGAAAATACAAATAGTTTTTTTTTAAGTACATTTGA
TTTTAAAGATGCTATGAATTGCTTGTGAAGCTTAAATTCTTAATGCACTGTGATTCTCAA
AGTTGTATATATCTACTCAGTCAGATTCTTGCTTAAATAATATTTTGATTTGGATTT

QA 3 539 3 539
DS 

RD RS1GV17JQ 537 0 0
TTCAACATTGCCTTGATAACATCTGGACTGGCACTGTCTCTGTTGCTATGGCCAACCATC
ACAGAGCAACTTCACTTGACCCGTAATGTACACAGGAACTTAGAGACCAGCTGCCCCACG
GCTAATACTGGTCTGCTAGGTGGAGGTGCATTTGTGTCATTGGACTCGTGTCTTTTCTGG
CTGGTGGCTCTGATGCTAGCTGATAACGCCCGTGAAGACCATTTGGATGAAGCTGAAAAC
AGAAACGGCGATGGGAACTCTTCCTCCTGGGATGTTAACCTCAAGATTGATGCTTGAGAG
AATGAATGATCTGCATCTGCATCTGCTTATTGGTATTGGGGTGTAGTAAGGGGGTTTTAT
GTTATTTTACTGCTTGTTTGATTAGGAAAATACAAATAGTTTTTTTTTAAGTACATTTGA
TTTTAAAGATGCTATGAATTGCTTGTGAAGCTTAAATTCTTAATGCACTGTGATTCTCAA
AGTTGTATATGTCTACTCAGTCAGATTCTTGCTTAAATAATATTTTGATTTGGATTT

QA 1 537 1 537
DS 



AS 1 4

CO CL2548Contig1 908 4 16 U
GGTGGAACTTACGGGGGAGAGGAAAGAGATTGTGGAGAAGCAGTGCGCTGCGTATTGGAC
GACTTTAGCTCCGAATGTGGAGGATTACAGCGGGAAGACGGCGCAGCTGATTGCAGCTGG
CTCCGGGCATCTGATCAAAGGGATTCTCTGGTGTGGGGATGTGACTATGGATCGGCTCAA
GTGGGGGAATGATTTCATGAAACGGAGGTTGAGTAAGGCCGAGAAGGAGCGTGATGTTCA
CCCTGACACCTTGAAAAGAATCCAGAGGGTTAAGAAGATGACCAAGATGACAGAGGATGT
GGCAAATGGTATTCTCTCTGGAGTCATTAAGGTTTCAGGGTTCTTCACCAGTTCAGTGGC
AAACACCAAAGTAGGAAGGAAATTCTTTAGCCTTCTTCCCGGAGAAATCGTCCTTGCAAC
TCTTGACGGATTCAACAAGGTATGTGACGCTTTTGAAGTAGCTGGAAGGAACGTAATGTC
AACCTCGTCCACTGTTGCAACCGAGCTTGTTGATCACAGGCATGGTGGTAAAACGGCTGA
GGCGACAAACGAAGGGCTAGAGGCAGTGGGACATGCTTTTGGGACAGCATGGGCTGCTTT
CAAAATCAGAAAGGCGATTAATCCCAAGAGCGTTCTCAAACCTTCAACACTTGCCAAGTC
CGCCATTAAATCTGCAGCTTCACAAAAGAAAGCCCAGTGAAGGGTTCCTGATGAAGCAAA
AAAA*CAGACTCTCTGATGATGGCTGCTTGTTTGTGTTGTTTATTGTCTATTGTCTTTTA
ATATATATAAGTGAAACTGAACACTTGTTTGGATTAGTTGGTGGTGTGAGTATTTTGTGT
GTTTCTCTGAGAAATCATATGCTGTGATGTACTGAAAAAAATCAATAGAGTTTACAATAT
CACATTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
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25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BG17TF U 1
AF RS1FA42TF U 152
AF RS1BK57JQ C 179
AF RS1BG17JQ C 247
BS 1 384 RS1BG17TF
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BS 846 901 RS1BK57JQ
BS 902 908 RS1BG17JQ

RD RS1BG17TF 555 0 0
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GACTTTAGCTCCGAATGTGGAGGATTACAGCGGGAAGACGGCGCAGCTGATTGCAGCTGG
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GTGGGGGAATGATTTCATGAAACGGAGGTTGAGTAAGGCCGAGAAGGAGCGTGATGTTCA
CCCTGACACCTTGAAAAGAATCCAGAGGGTTAAGAAGATGACCAAGATGACAGAGGATGT
GGCAAATGGTATTCTCTCTGGAGTCATTAAGGTTTCAGGGTTCTTCACCAGTTCAGTGGC
AAACACCAAAGTAGGAAGGAAATTTTTTAGCCTTCTTCCCGGAGAAATCGTCCTTGCAAC
TCTTGACGGATTCAACAAGGTATGTGACGCTTTTGAAGTAGCTGGAAGGAACGTAATGTC
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GGCGACAAACGAAGG

QA 1 555 1 555
DS 

RD RS1FA42TF 698 0 0
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AGTAAGGCCGAGAAGGAGCGTGATGTTCACCCTGACACCTTGAAAAGAATCCAGAGGGTT
AAGAAGATGACCAAGATGACAGAGGATGTGGCAAATGGTATTCTCTCTGGAGTCATTAAG
GTTTCAGGGTTCTTCACCAGTTCAGTGGCAAACGCCAAAGTAGGAAGGAAATTCTTTAGC
CTTCTTCCCGGAGAAATCGTCCTTGCAACTCTTGACGGATTCAACAAGGTGTGTGACGCT
TTTGAAGTAGCTGGAAGGAACGTAATGTCAACCTCGTCCACTGTTGCAACCGAGCTTGTT
GATCACAGGCATGGTGGTAAAGCGGCTGAGGCGACAAACGAAGGGCTAGAGGCAGTGGGA
CATGCTTTTGGGACAGCATGGGCTGCTTTCAAAATCAGAAAGGCGATTAATCCCAAGAGC
GTTCTCAAACCTTCAACACTTGCCAAGTCCGCCATTAAATCTGCAGCTTCACAAAAGAAA
GCCCAGTGAAGGGTTCCTGATGAAGCAAAAAAAACAGACTCTCTGATGATGGCTGCTTGT
TTGTGTTGTTTATTGTCTATTGTCTTT**ATATATATAAGTGAA*CTGAACACTTGTTTG
GAT*AGTTGGTGGTGTGAGTATTTTGTGTGTT
CTCTGA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RS1BK57JQ 723 0 0
AAGTGGGGGAATGATTTCATGAAACGGAGGTTGAGTAAGGCCGAGAAGGAGCGTGATGTT
CACCCTGACACCTTGAAAAGAATCCAGAGGGTTAAGAAGATGACCAAGATGACAGAGGAT
GTGGCAAATGGTATTCTCTCTGGAGTCATTAAGGTTTCAGGGTTCTTCACCAGTTCAGTG
GCAAACACCAAAGTAGGAAGGAAATTCTTTAGCCTTCTTCCCGGAGAAATCGTCCTTGCA
ACTCTTGACGGATTCAACAAGGTATGTGACGCTTTTGAAGTAGCTGGAAGGAACGTAATG
TCAACCTCGCCCACTGTTGCAACCGAGCTTGTTGATCACAGGCATGGTGGTAAAGCGGCT
GAGGCGACGAACGAAGGGCTAGAGGCAGTGGGACATGCTTTTGGGACAGCATGGGCTGCT
TTCAAAATCAGAAAGGCGATTAATCCCAAGAGCGTTCTCAAACCTTCAACACTTGCCAAG
TCCGCCATTAAATCTGCAGCTTCACAAAAGAAAGCCCAGTGAAGGGTTCCTGATGAAGCA
AAAAAA*CAGACTCTCTGATGATGGCTGCTTGTTTGTGTTGTTTATTGTCTATTGTCTTT
TAATATATATAAGTGAAACTGAACACTTGTTTGGATTAGTTGGTGGTGTGAGTATTTTGT
GTGTTTTTCTGAGAAATCATATGCTGTGATGTACTGAAAAAAATCAATAGAGTTTACAAT
ATC

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1BG17JQ 662 0 0
CACCTTGAAAAGAATCCAGAGGGTTAAGAAGATGACCAAGATGACAGAGGATGTGGCAAA
TGGTATTCTCTCTGGAGTCATTAAGGTTTCAGGGTTCTTCACCAGTTCAGTGGCAAACAC
CAAAGTAGGAAGGAAATTTTTTAGCCTTCTTCCCGGAGAAATCGTCCTTGCAACTCTTGA
CGGATTCAACAAGGTATGTGACGCTTTTGAAGTAGCTGGAAGGAACGTAATGTCAACCTC
GTCCACTGTTGCAACCGAGCTTGTTGATCACAGGCATGGTGGTAAAACGGCTGAGGCGAC
AAACGAAGGGCTAGAGGCAGTGGGACATGCTTTTGGGACAGCATGGGCTGCTTTCAAAAT
CAGAAAGGCGATTAATCCCAAGAGCGTTCTCAAACCTTCAACACTTGCCAAGTCCGCCAT
TAAATCTGCAGCTTCACAAAAGAAAGCCCAGTGAAGGGTTCCTGATGAAGCAAAAAAA*C
AGACTCTCTGATGATGGCTGCTTGTTTGTGTTGTTTATTGTCTATTGTCTTTTAATATAT
ATAAGTGAAACTGAACACTTGTTTGGATTAGTTGGTGGTGTGAGTATTTTGTGTGTTTCT
TTGAGAAATCATATGCTGTGATGTACTGAAAAAAATCAATAGAGTTTACAATATCACATT
GT

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 4

CO CL2549Contig1 510 4 1 U
GGGGTGTACTGATGGGACAGTCAGGATGTGAAAATACCCCGCAGACTGTCCTGAACGTCC
GTGAAGACAAAAAAAAAAAAAAAACTCATGTACTGATCACCCACTGATCACCCACGGCTG
GGTGTACTGATGGGACAGTCATGGTGTGAAAATACCCCGTAGACTGTCCTGAACGTTCGT
GAAGGCAAAAAAAAAAAATCTCACGTACTGATTCACCCACTGATCACCCACGGCTGGGTG
TACTGATGGGACAGTCAGGGTGTGAAAATACCCCGTAGACTGTGTCCTGAACGTCCGTGA
AGGCAAAAAAAAAAAAAATCTCATGTACTGATCACCCACGGCTGGGTGTACTGATGGGAC
AGTCAGGATGTGAAAATACCCCGCAAACTGTCCTGAACGTCCGTGAAGGCAAAAAAAAAC
TCATGTACTGATCACCCACGGCTGGGTGTACTGATGGGACAGTCAGGGTGTGAAAATACC
CCGTAGACTGTCCTGAACGTTCGTGAAGGC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1CN74TF U 1
AF RS1D364JQ C 69
AF RS1D364TF U 1
AF RS1CN74JQ C 169
BS 1 510 RS1CN74TF

RD RS1CN74TF 510 0 0
GGGGTGTACTGATGGGACAGTCAGGATGTGAAAATACCCCGCAGACTGTCCTGAACGTCC
GTGAAGACAAAAAAAAAAAAAAAACTCATGTACTGATCACCCACTGATCACCCACGGCTG
GGTGTACTGATGGGACAGTCATGGTGTGAAAATACCCCGTAGACTGTCCTGAACGTTCGT
GAAGGCAAAAAAAAAAAATCTCACGTACTGATTCACCCACTGATCACCCACGGCTGGGTG
TACTGATGGGACAGTCAGGGTGTGAAAATACCCCGTAGACTGTGTCCTGAACGTCCGTGA
AGGCAAAAAAAAAAAAAATCTCATGTACTGATCACCCACGGCTGGGTGTACTGATGGGAC
AGTCAGGATGTGAAAATACCCCGCAAACTGTCCTGAACGTCCGTGAAGGCAAAAAAAAAC
TCATGTACTGATCACCCACGGCTGGGTGTACTGATGGGACAGTCAGGGTGTGAAAATACC
CCGTAGACTGTCCTGAACGTTCGTGAAGGC

QA 1 510 1 510
DS 

RD RS1D364JQ 442 0 0
AAAAAAAAAAAAAAAACTCATGTACTGATCACCCACTGATCACCCACGGCTGGGTGTACT
GATGGGACAGTCATGGTGTGAAAATACCCCGTAGACTGTCCTGAACGTTCGTGAAGGCAA
AAAAAAAAAATCTCACGTACTGATTCACCCACTGATCACCCACGGCTGGGTGTACTGATG
GGACAGTCAGGGTGTGAAAATACCCCGTAGACTGTGTCCTGAACGTCCGTGAAGGCAAAA
AAAAAAAAAATCTCATGTACTGATCACCCACGGCTGGGTGTACTGATGGGACAGTCAGGA
TGTGAAAATACCCCGCAGACTGTCCTGAACGTCCGTGAAGGCAAAAAAAAACTCATGTAC
TGATCACCCACGGCTGGGTGTACTGATGGGACAGTCAGGGTGTGAAAATACCCCGTAGAC
TGTCCTGAACGTTCGTGAAGGC

QA 1 442 1 442
DS 

RD RS1D364TF 510 0 0
GGGGTGTACTGATGGGACAGTCAGGATGTGAAAATACCCCGCAGACTGTCCTGAACGTCC
GTGAAGACAAAAAAAAAAAAAAAACTCATGTACTGATCACCCACTGATCACCCACGGCTG
GGTGTACTGATGGGACAGTCATGGTGTGAAAATACCCCGTAGACTGTCCTGAACGTTCGT
GAAGGCAAAAAAAAAAAATCTCACGTACTGATTCACCCACTGATCACCCACGGCTGGGTG
TACTGATGGGACAGTCAGGGTGTGAAAATACCCCGTAGACTGTGTCCTGAACGTCCGTGA
AGGCAAAAAAAAAAAAAATCTCATGTACTGATCACCCACGGCTGGGTGTACTGATGGGAC
AGTCAGGATGTGAAAATACCCCGCAAACTGTCCTGAACGTCCGTGAAGGCAAAAAAAAAC
TCATGTACTGATCACCCACGGCTGGGTGTACTGATGGGACAGTCAGGGTGTGAAAATACC
CCGTAGACTGTCCTGAACGTTCGTGAAGGC

QA 1 510 1 510
DS 

RD RS1CN74JQ 342 0 0
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CACGGCTGGGTGTACTGATGGGACAGTCAGGGTGTGAAAATACCCCGTAGACTGTGTCCT
GAACGTCCGTGAAGGCAAAAAAAAAAAAAATCTCATGTACTGATCACCCACGGCTGGGTG
TACTGATGGGACAGTCAGGATGTGAAAATACCCCGCAGACTGTCCTGAACGTCCGTGAAG
GCAAAAAAAAACTCATGTACTGATCACCCACGGCTGGGTGTACTGATGGGACAGTCAGGG
TGTGAAAATACCCCGTAGACTGTCCTGAACGTTCGTGAAGGC

QA 1 342 1 342
DS 



AS 1 2

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TGGCCAAAGCTCTTCACATAACCATCACTCTCTTCCTCATATCCGCCAGCTTCCTCCCAT
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TCCCCAACGTGGTGGCTCCAGCAGAAGCTGAGGAAGAACCAGCAACTACACTCCCAGCTG
TTCCAGCAGGGCCTGAACACGAGCCTTCACTAGACTTCTTTATGCACGACGTGCTAGGCG
GATCACACCCATCAGCACGTGTGGTCACTGGAATAGTAGCACAAACCGAGGTGAACAGTA
TACCATTCTCAAAGGCCAGCAACAGCATCTTCCCTGTAGACAACGGAGTCCCACCGGTGA
ACTCAAACAACATCAACAGCGTCATTAACCCAAACACAGCCCCACTTCTCACAGGCCTAG
GCGGCGCCCAGACCAGCACAGTGATCCAAAACACCAACGGAAACTCCAACGATGCCCTCA
GCACCAACAGTCTCCCCTTTGTGACCGCGGGAAACCTCCCTCCCGGTGCTGCACTCCAGC
ATCTCATGTTTGGAACCATAACCGTTGTAGACGATGAGCTAACCGAAAGCCACGAGCT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1FG15TF U 1
AF RS1CK35TF U 4
BS 1 414 RS1FG15TF
BS 415 415 RS1CK35TF
BS 416 516 RS1FG15TF
BS 517 517 RS1CK35TF
BS 518 658 RS1FG15TF

RD RS1FG15TF 658 0 0
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TGGCCAAAGCTCTTCACATAACCATCACTCTCTTCCTCATATCCGCCAGCTTCCTCCCAT
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TCCCCAACGTGGTGGCTCCAGCAGAAGCTGAGGAAGAACCAGCAACTACACTCCCAGCTG
TTCCAGCAGGGCCTGAACACGAGCCTTCACTAGACTTCTTTATGCACGACGTGCTAGGCG
GATCACACCCATCAGCACGTGTGGTCACTGGAATAGTAGCACAAACCGAGGTGAACAGTA
TACCATTCTCAAAGGCCAGCAACAGCATCTTCCCTGTAGACAACGGAGTCCCACTGGTGA
ACTCAAACAACATCAACAGCGTCATTAACCCAAACACAGCCCCACTTCTCACAGGCCTAG
GCGGCGCCCAGACCAGCACAGTGATCCAAAACACCAGCGGAAACTCCAACGATGCCCTCA
GCACCAACAGTCTCCCCTTTGTGACCGCGGGAAACCTCCCTCCCGGTGCTGCACTCCAGC
ATCTCATGTTTGGAACCATAACCGTTGTAGACGATGAGCTAACCGAAAGCCACGAGCT

QA 1 658 1 658
DS 

RD RS1CK35TF 653 0 0
GG
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AAAGCTCTTCACATAACCATCACTCTCTTCCTCATATCCGCCAGCTTCCTCCCATTTATC
AACTCCGCTAGACATCTTGATGAGATCCAACCTCAGTTAGTCCCAGCTGGCCAAATCCCC
AACGTGGTGGCTCCAGCAGAAGCTGAGGAAGAACCAGCAACTACACTCCCAGCTGTTCCA
GCAGGGCCTGAACACGAGCCTTCACTAGACTTCTTTATGCACGACGTGCTAGGCGGATCA
CACCCATCAGCACGTGTGGTCACTGGAATAGTAGCACAAACCGAGGTGAACGGTATACCA
TTCTCAAAGGCCAGCAACAGCATCTTCCCTGTAGACAACGGAGTCCCACCGGTGAACTCA
AACAACATCAACAGCGTCATTAACCCAAACACAGCCCCACTTCTCACAGGCCTAGGCGGC
GCTCAGACCAGCACAGTGATCCAAAACACCAACGGAAACTCCAACGATGCCCTCAGCACC
AACAGTCTCCCCTT*GTGACCGCGGGAAACCTCCCTCCCGGTGCTGCACTCCAGCATCTC
ATGTTTGGAACCATAACCGTTGTAGACGATGAGCTAACCGAAAGCCACGAG

QA 3 653 3 653
DS 



AS 1 4

CO CL2551Contig1 1065 4 13 U
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AGATTAAACGCTAACTACCCTTTCTTTCCCAAGAAACCTCATCGGGTTTGCAACAGAAAG
CTCGGGAATTACTATGATTCTTGGTCCATCTTTAAACATGGCGGTGTTGGCGATGATGGT
AATAAGATGAAGAAGGAGCAGATGTTTCTAAGCGTTTCAGTGAAAGCAATGAAGGAAGAA
GGTAACGGAAGTGGAAGCATGAGTTTCTCTGGACAAAGCTGGGATCCCAGTTCTGAGATA
CAAGTCCCTTCCGACCAAAGACCTGTGAATGAGTATTCGTCTTTGAAGGAAGGGATGTTG
TATTCATGGGGAGAATTGAGTCCAACTCAATTCTTTCTTCGTATAGGTGGTCTTTGGTTG
GTCACTTTCACTGTTCTGGGTGTTCCCATCGCAGCTGCTAGCTTTAATCCTTCCAGAGAG
CCTTTGAGGTTTGTTATAGCTGCCGGGACTGGAACCTTATTCCTGGTTTCATTGATTGTC
TTGAGAATTTACCTGGGATGGAGCTATGTTGGAGATAGGTTACTTTCTGCAGTTATTCCA
TACGAAGAGAGCGGATGGTATGATGGCCAAATGTGGGTGAAGCCACCTGAGGTATTGGCT
CGGGACAGGTTGTTAGGTTCTTACAAGGTGAAGCCGGTAATCAAAATGCTCAAACGAACA
TTAATTGGAACAGGAGCTTTACTCGTTTCAGCATTCGTACTATTTGTCTTTGCAACACCA
GTCGAGGATTTCTTTAAAACCACTCTAAGTTCTAAGGATGAGGTTTTTATTTCAAGAACC
AACAACAACAAATTCAGTATGAGGAAAGAACAATTGCTTCGGTTACCCACAGATGTAGTG
ACCAATGACGACTTGGCAGCCGCTGCGGCTGAGGCTGCTGACGGAAGACCAGTCTATTGC
AGAGACCGTTACTACCGTGCATTGGCCGGTGGTCAGTACTGCAAATGGGACGATCTTGTT
AAATAGTTGTCAAAATATAGTATAACAACACTATCCGTTTTCTCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1DS19TF U 1
AF RS1GY78TF U 1
AF RS1GY78JQ C 398
AF RS1DS19JQ C 773
BS 1 365 RS1DS19TF
BS 366 366 RS1GY78TF
BS 367 634 RS1DS19TF
BS 635 651 RS1GY78TF
BS 652 652 RS1GY78JQ
BS 653 668 RS1GY78TF
BS 669 804 RS1GY78JQ
BS 805 805 RS1DS19JQ
BS 806 811 RS1GY78JQ
BS 812 812 RS1DS19JQ
BS 813 941 RS1GY78JQ
BS 942 942 RS1DS19JQ
BS 943 1065 RS1GY78JQ

RD RS1DS19TF 634 0 0
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AGATTAAACGCTAACTACCCTTTCTTTCCCAAGAAACCTCATCGGGTTTGCAACAGAAAG
CTCGGGAATTACTATGATTCTTGGTCCATCTTTAAACATGGCGGTGTTGGCGATGATGGT
AATAAGATGAAGAAGGAGCAGATGTTTCTAAGCGTTTCAGTGAAAGCAATGAAGGAAGAA
GGTAACGGAAGTGGAAGCATGAGTTTCTCTGGACAAAGCTGGGATCCCAGTTCTGAGATA
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TATTCGTGGGGAGAATTGAGTCCAACTCAATTCTTTCTTCGTATAGGTGGTCTTTGGTTG
GTCACTTTCACTGTTCTGGGTGTTCCCATCGCAGCTGCTAGCTTTAATCCTTCCAGAGAG
CCTTTGAGGTTTGTTATAGCTGCCGGGACTGGAACCTTATTCCTGGTTTCATTGATTGTC
TTGAGAATTTACCTGGGATGGAGCTATGTTGGAGATAGGTTACTTTCTGCAGTTATTCCA
TACGAAGAGAGCGGATGGTATGATGGCCAAATGT

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1GY78TF 671 0 0
GGACCTTTAATCTTCTTCAGTCAACGCCACTCTCAACTCGCAAACTCATTCGCAATGCTC
AGATTAAACGCTAACTACCCTTTCTTTCCCAAGAAACCTCATCGGGTTTGCAACAGAAAG
CTCGGGAATTACTATGATTCTTGGTCCATCTTTAAACATGGCGGTGTTGGCGATGATGGT
AATAAGATGAAGAAGGAGCAGATGTTTCTAAGCGTTTCAGTGAAAGCAATGAAGGAAGAA
GGTAACGGAAGTGGAAGCATGAGTTTCTCTGGACAAAGCTGGGATCCCAGTTCTGAGATA
CAAGTCCCTTCCGACCAAAGACCTGTGAATGAGTATTCGTCTTTGAAGGAAGGGATGTTG
TATTCATGGGGAGAATTGAGTCCAACTCAATTCTTTCTTCGTATAGGTGGTCTTTGGTTG
GTCACTTTCACTGTTCTGGGTGTTCCCATCGCAGCTGCTAGCTTTAATCCTTCCAGAGAG
CCTTTGAGGTTTGTTATAGCTGCCGGGACTGGAACCTTATTCCTGGTTTCATTGATTGTC
TTGAGAATTTACCTGGGATGGAGCTATGTTGGAGATAGGTTACTTTCTGCAGTTATTCCA
TACGAAGAGAGCGGATGGTATGATGGCCAAATGTGGGTGAAGCCACCTGAG*TATTGGCT
CGGGACAG
TTG

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1GY78JQ 668 0 0
TTCGTATAGGTGGTCTTTGGTTGGTCACTTTCACTGTTCTGGGTGTTCCCATCGCAGCTG
CTAGCTTTAATCCTTCCAGAGAGCCTTTGAGGTTTGTTATAGCTGCCGGGACTGGAACCT
TATTCCTGGTTTCATTGATTGTCTTGAGAATTTACCTGGGATGGAGCTATGTTGGAGATA
GGTTACTTTCTGCAGTTATTCCATACGAAGAGAGCGGATGGTATGATGGCCAAATGTGGG
TGAAGCCACCTGAGGTATTGGCTCGGGACAGGTTGTTAGGTTCTTACAAGGTGAAGCCGG
TAATCAAAATGCTCAAACGAACATTAATTGGAACAGGAGCTTTACTCGTTTCAGCATTCG
TACTATTTGTCTTTGCAACACCAGTCGAGGATTTCTTTAAAACCACTTTAAGTTTTAAGG
ATGAGGTTTTTATTTCAAGAACCAACAACAACAAATTCAGTATGAGGAAAGAACAATTGC
TTCGGTTACCCACAGATGTAGTGACCAATGACGACTTGGCAGCCGCTGCGGCTGAGGCTG
CTGATGGAAGACCAGTCTATTGCAGAGACCGTTACTACCGTGCATTGGCCGGTGGTCAGT
ACTGCAAATGGGACGATCTTGTTAAATAGTTGTCAAAATATAGTATAACAACACTATCCG
TTTTCTCG

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1DS19JQ 293 0 0
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CAAGAACCAACAACAACAAATTCAGTATGAGGAAAGAACAATTGCTTCGGTTACCCACAG
ATGTAGTGACCAATGACGACTTGGCAGCCGCTGCGGCTGAGGCTGCTGACGGAAGACCAG
TCTATTGCAGAGACCGTTACTACCGTGCATTGGCCGGTGGTCAGTACTGCACATGGGACG
ATCTTGTTAAATAGTTGTCAAAATATAGTATAACAACACTATCCGTTTTCTCG

QA 1 293 1 293
DS 



AS 1 4

CO CL2552Contig1 640 4 12 U
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TGTTTTGAAACAAATATCATAATTTCTTGGATACCATTCTCTTTGTAACGACAGAGGATT
CGGTTCATTGAATCAATGCTTTTGCTGTCGGAAAATCTCAACCCCTAAGTAATCAATAGT
AGTCTTGACAAGTGCAACATTTGGCTTCGATACCTTCACCCGGACAGCGGTTATACGAGG
AAACGTTTCAAGAGTTCTGGACGCGATGAGTTCCGCGACTGTCTCCAGAAGGTTTCTTGG
AGACCCTTCTACAATTTCTTTAGCTATGCTGAAAATGTCAACGTAGCTGATAGTGTCATC
TAAGTTGTCTGATTCACCAGCCCTTTTAAGACTCACCCACGCATCAATGTCAACGAGAAA
CATCTGCCCCAAAGTCTTCTCTTCTGGAATCGCTCCATGGTAACCGTAGAACTTTAGCCC
TTTTAGTATCAGTTTGTCTCCTCCAGTCATTGACATGTCTTTCTCCGATGATTCTCTTCC
AATAACTCGCGGTGACAACGTCGCCAGAGCCGTCGTTTCAAGTGAGCTGTACATCTCTCC
TCCGTTCGCGGCAACAGATTTTAAGATTAGACGAGTGTCC


BQ
10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1EV37JQ U 1
AF RS1EO83TF C 2
AF RS1EO83JQ U 4
AF RS1EV37TF C 4
BS 1 113 RS1EV37JQ
BS 114 114 RS1EO83JQ
BS 115 178 RS1EV37JQ
BS 179 179 RS1EO83JQ
BS 180 345 RS1EV37JQ
BS 346 346 RS1EO83JQ
BS 347 414 RS1EV37JQ
BS 415 415 RS1EO83JQ
BS 416 416 RS1EV37JQ
BS 417 417 RS1EO83JQ
BS 418 500 RS1EV37JQ
BS 501 640 RS1EO83JQ

RD RS1EV37JQ 500 0 0
TTTGATACGAAAGAAA*TATCATTATTTAATTCTTCAAATTCCTAAAAGTTTTGAAGTTT
TGTTTTGAAACAAATATCATAATTTCTTGGATACCATTCTCTTTGTAACGACAAAGGATT
CGGTTCATTGAATCAATGCTTTTGCTGTCGGAAAATCTCAACCCCTAAGTAATCAATATT
AGTCTTGACAAGTGCAACATTTGGCTTCGATACCTTCACCCGGACAGCGGTTATACGAGG
AAACGTTTCAAGAGTTCTGGACGCGATGAGTTCCGCGACTGTCTCCAGAAGGTTTCTTGG
AGACCCTTCTACAATTTCTTTAGCTATGCTGAAAATGTCAACGTACCTGATAGTGTCATC
TAAGTTGTCTGATTCACCAGCCCTTTTAAGACTCACCCACGCATCAATGTCAACAAAAAA
CATCTGCCCCAAAGTCTTCTCTTCTGGAATCGCTCCATGGTAACCGTAGAACTTTAGCCC
TTTTAGTATCAGTTTGTCTC

QA 1 500 1 500
DS 

RD RS1EO83TF 639 0 0
TT
GATACGAAAGAAAATATCATTATTTAATTCTTCAAATTCCTAAAAGTTTTGAAGTTTTGT
TT*GAAACAAATATCATAATTTCTTGGATACCATTCTCTTTGTAACGACAGAGGATTCGG
TTCATTGAATCAATGCTTTTGCTGTCGGAAAATCTCAACCCCTAAGTAATCAATAGTAGT
CTTGACAAGTGCAACATTTGGCTTCGATACCTTCACCCGGACAGCGGTTATACGAGGAAA
CGTTTCAAGAGTTCTGGACGCGATGAGTTCCGCGACTGTCTCCAGAAGGTTTCTTGGAGA
CCCTTCTACAATTTCTTTAGCTATGCTGAAAATGTCAACGTAGCTGATAGTGTCATCTAA
GTTGTCTGATTCACCAGCCCTTTTAAGACTCACCCACGCATCAATGTCAACGAGAAACAT
CTGCCCCAAAGTCTTCTCTTCTGGAATCGCTCCATGGTAACCGTAGAACTTTAGCCCTTT
TAGTATCAGTTTGTCTCCTCCAGTCATTGACATGTCTTTCTCCGATGATTCTCTTCCAAT
AACTCGCGGTGACAACGTCGCCAGAGCCGTCGTTTCAAGTGAGCTGTACATCTCTCCTCC
GTTCGCGGCAACAGATTTTAAGATTAGACGAGTGTCC

QA 3 639 3 639
DS 

RD RS1EO83JQ 637 0 0
GATACGAAAGAAA*TATCATTATTTAATTCTTCAAATTCCTAAAAGTTTTGAAGTTTTGT
TTTGAAACAAATATCATAATTTCTTGGATACCATTCTCTTTGTAACGACAGAGGATTCGG
TTCATTGAATCAATGCTTTTGCTGTCGGAAAATCTCAACCCCTAAGTAATCAATAGTAGT
CTTGACAAGTGCAACATTTGGCTTCGATACCTTCACCCGGACAGCGGTTATACGAGGAAA
CGTTTCAAGAGTTCTGGACGCGATGAGTTCCGCGACTGTCTCCAGAAGGTTTCTTGGAGA
CCCTTCTACAATTTCTTTAGCTATGCTGAAAATGTCAACGTAGCTGATAGTGTCATCTAA
GTTGTCTGATTCACCAGCCCTTTTAAGACTCACCCACGCATCAATGTCAACGAGAAACAT
CTGCCCCAAAGTCTTCTCTTCTGGAATCGCTCCATGGTAACCGTAAAACTTTAGCCCTTT
TAGTATCAGTTTGTCTCCTCCAGTCATTGACATGTCTTTCTCCGATGATTCTCTTCCAAT
AACTCGCGGTGACAACGTCGCCAGAGCCGTCGTTTCAAGTGAGCTGTACATCTCTCCTCC
GTTCGCGGCAACAGATTTTAAGATTAGACGAGTGTCC

QA 1 637 1 637
DS 

RD RS1EV37TF 637 0 0
GATACGAAAGAAA*TATCATTATTTAATTCTTCAAATTCCTAAAAGTTTTGAAGTTTTGT
TTTGAAACAAATATCATAATTTCTTGGATACCATTCTCTTTGTAACGACAGAGGATTCGG
TTCATTGAATCAATGCTTTTGCTGTCGGAAAATCTCAACCCCTAAGTAATCAATAGTAGT
CTTGACAAGTGCAACATTTGGCTTCGATACCTTCACCCGGACAGCGGTTATACGAGGAAA
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CCCTTCTACAATTTCTTTAGCTATGCTGAAAATGTCAACGTAGCTGATAGTGTCATCTAA
GTTGTCTGATTCACCAGCCCTTTTAAGACTCACCCACGCATCAATGTCAACGAGAAACAT
CTGCCCCAAAGTCTTCTCTTCTGGAATCGCTCCATGGTAACCGTAGAACTTTAGCCCTTT
TAGTATCAGTTTGTCTCCTCCAGTCATTGACATGTCTTTCTCCGATGATTCTCTTCCAAT
AACTCGCGGTGACAACGTCGCCAGAGCCGTCGTTTCAAGTGAGCTGTACATCTCTCCTCC
GTTCGCGGCAACAGATTTTAAGATTAGACGAGTGTCC

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 3

CO CL2553Contig1 1035 3 7 U
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TGATCCCTAACAATTCCATATGATTAAAATGATAATAAAGGATAACAATAACCAATATAA
CAAAAGAAGAGTTTTTAAGAGTTGTTCATCACTTGATTTGTATTTAGTCCTCATTTGCTG
CTACTACATCATCCCCAGCGGGAGTGTCCTCAGGGTGATAATCTTTAGGATTGTTCTCCA
TGCATTTGATTAAAAACTTGAAAGTCTCGACCTCGCAAGGGATGGTGAGTGCACCACTCT
GATCAAACCCAAACTCTTCCTCTGCCTTCTCGAGCAACACCTTGAACAAAGAGTGGCTAA
AATAAGTTGTTGGTATGATAAACCTCCTTAGCTCCGGTCCAACATAAACCGCTAGATACC
CTTTGGGAACATCAACGGGAGGCTCGGGGCTTTGGCAGTTTTCCTCATCCGAGTCACAAT
TCTTGACAGCAAATAGCCTCTTGTTGATAACCGGTGAGATCATTGCCGCTGCTTGCTTTC
CAGCTGCTAATGGAGCGATATCTGACTTGGGGCCAATGGTTGCAGTTTGCCATTTCTGCA
AAATCTCCTTTAGTCTCACGATCTGCCTGATTCCGCCTAGCTTTGCAGCATTGTTTTCAT
CCATCTGCTCTGCCTAATAATAAAAAGACCAGCAACGTTTTCTTTAGTGAGAGATTGAAC
GTCTCATAAGACCTTCTTCTCTCCTCGTAGCTGAAGAGGAAAACGAATAAAATCACTCTT
AGCTCTAACTCGATGAGGAACACCAGAACAAAAGAGAGAGGAGGAGGCTCCCAAAGATTT
GTTTCTTTCTTTTTCTGTCGCTTCGTTCTTATTAGGGTTTTTTTTCTGTTCCAATACGAT
GATGAGGAAGGATGTATATATTCAAGTTCTGAAACTAAAACTAAAAAAACAAATTAAAAT
CAAATTAAAATTAATAGAATCTAAAATTTATTTGGTGGGGGCAAACGAATAGAGAAGCGA
ATTTTGGGAGATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EW73JQ U 1
AF RS1BA02JQ U 22
AF RS1BA02TF C 393
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G
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TGGTGGGGGCAAACGAATAGAGAAGCGAATTTTGGGAGATCCC

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DS 



AS 1 4

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BQ
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AF RS1C281JQ U 3
AF RS1AU20TF C 175
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AGCG

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TCATGAACAACAGCTTCCACGGACGGTCTCTCAATGGGAGATTCATGAGTACACAACCAC
GCGATCCTCGCTAGCTTCGTGGCTTCGTATTCAAAGAACTTCCCCTGAAGATTTGGGTCA
ATGTAATCATGGAACCTACACGCTTCAGTTCCAAGCTTAACCAGACTCCTAACCTCATGT
TTCCCAGATAGTATCTGAAACACAAGAACCCCAAAAGCATAGACATCTGATTTCTCAGTG
AATCTTCCTGTCGTGGTGTATTCTGGGGCGAGATAGCCCATTGCTGCACTGTCTTTGACT
GCTGAGAAGACAATGTCGTTTGTGAGAAGTGTGTGTAGACCGGAGTTTGAGAGCAAGGGA
CTGTATCGCTGGTCGACCAAGACTTTCTCAGCTGAGA

QA 1 637 1 637
DS 

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CAA
AACCAAATTCAAAATATGATTTAAAAGGATCCTAATAAAACAAACAATTGGCTAAAACAA
ACAACACACTGAACAGTTTCAAAAACATCAACAAGAAGGGAAAAAGCATCTTTTTTCAGC
CCTCAACACAAGAAAAGGCGACTAAACAAACCCTTGCTTGATTCCTAAAAGGTACATCAC
AACAGTTGAACAACTCATATGGTGTTCTCAGAGACAGCTACTGCAGTTCCCAAGCTCATG
AACAACAGCTTCCACGGACGGTCTCTCAATGGGAGATTCATGAGTACACAACCACGCGAT
CCTCGCTAGCTTCGTGGCTTCGTATTCAAAGAACTTCCCCTGAAGATTTGGGTCAATGTA
ATCATGGAACCTACACGCTTCAGTTCCAAGCTTAACCAGACTCCTAACCTCATGTTTCCC
AGATAGTATCTGAAACACAAGAACCCCAAAAGCATAGACATCTGATTTCTCAGTGAATCT
TCCTGTCGTGGTGTATTCTGGGGCGAGATAGCCCATTGCTGCACTGTCTTTGACTGCTGA
GAAGACAATGTCGTTTGTGAGAAGTGTGTGTAGACCGGAGTTTGAGAGCAAGGGACTGTA
TCGCTGGTCGACCAAGACTTTCTCAGCTGAGA

QA 4 635 4 635
DS 

RD RS1AU20TF 716 0 0
AGGTACATCACAACAGT*GAACAACTCATATGGTGT*CTCAGAGACAGCTACTGCAGTTC
CCAAGCTCATGAACAACAGCTTCCACGGACGGTCTCTCAATGGGAGATTCATGAGTACAC
AACCACGCGATCCTCGCTAGCTTCGTGGCTTCGTATTCAAAGAACTTCCCCTGAAGATTT
GGGTCAATGTAATCATGGAACCTACACGCTTCAGTTCCAAGCTTAACCAGACTCCTAACC
TCATGTTTCCCAGATAGTATCTGAAACACAAGAACCCCAAAAGCATAGACATCTGATTTC
TCAGTGAATCTTCCTGTCGTGGTGTATTCTGGAGCGAGATAGCCCATTGCTGCACTGTCT
TTGACTGCTGAGAAGACAATGTCGTTTGTGAGAAGTGTGTGTAGACCGGAGTTTGAGAGC
AAGGGACTGTATCGCTGGTCGACCAAGACTTTCTCAGCTGAGATGTTTTGGTGAACTAAA
GCCGGTTTGTTTCCTTTGTACGAATGCAGGTAAGCAATTCCCTTTGCGATGCCTTTGGCG
ATGGAAACTCTTGTAGACCAATCAAGAACATGAGAATCTCCCTCTTTGAGATCAAGATAG
CTAAGTAGGTTTCCATTGGAAGCATAATCATAGATGAGAAAGCATTCTCCACGGCCTCTT
GAACAGCAGAAACCTCTAAGCCTCGCCAAATTCTCATGTTTCAGAGACGCCAGCAC

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 4

CO CL2555Contig1 953 4 6 U
GATGTGCGTGTTTGGCTTTTCTTATATATTCTTTTTATTCCTCTGCAAATCTCTTCTCCA
TCTACCTTGTTCGCTTAGGGGTTTTCAGACAGATCAGAGGATGGCTTCAGCAGGTTCAGA
GAAAACTCTTCCTTGTCCAGCAAGTAAAACTACCTCGCCTGCCCTTGCCCTTAAATTCGA
TGCTTTAGATTTCCCAGCCATGAAGGCTATGGAAGATTTCCAGACTTGTATCAGTGAACT
TGGTGAGAAAATGCGTGAGGATCCTGCATATATCCAGGAGCTTCGCAGATGTAATCCAGC
CGCCAAGTTTGACGTGAAAAATACAATGCAAATGTTTCAGCGCCTTCGGGATAACGCACG
GCAGGATCCTCGTGCGTCTCTGGAAAATCTCGTGAAACCTGGAGCACTGGAGGAATTTGC
TGAGCGTGTTACCCAACTGAGAAAAGATCCTGAAGTTGAGCTCATTCTAGCCGAGTTAGA
CGCTTGTCCTGCTGCTGCTCTCTTGAAGTTTGCGGATGACAAACAAGTTTTGAAAAAACT
TGGAAACTCAATGCTTAGATCTCAGGGTCTGAACTATGATGCTGATGATGAAGAACTTTT
CTCTGAGGGAAGAAAAGCCCTCGAGATTGCTTTTGGATATGCCAAGATGAAATGCTACAA
AATTCTTGTGGATGCTCAAAGAAAAAAGGCTAATAAGGTTGAGGGGAAAAAGAAGACAAG
TGGAAAAAAGACAAAGCGTTCAAGCCTTCTTTCCAACAAGTGTGATGCTGTGTAAGATTG
CAACATAACAAATAACACTCTGTTTCAAACCGCTCTGTTTTTCGTTCCATACTCTCGAAA
GATTGTTTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTCCTTTGTGTTAAAGTTCCAATGTTG
TAGCTCAGTCATATCAGAACCTTCCGCAAGTGAGAAAATCGCCCAACTCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EO38TF U 1
AF RS1BT30TF U 42
AF RS1BT30JQ C 710
AF RS1EO38JQ C 377
BS 1 338 RS1EO38TF
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BS 663 686 RS1EO38TF
BS 687 953 RS1EO38JQ

RD RS1EO38TF 686 0 0
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TCTACCTTGTTCGCTTAGGGGTTTTCAGACAGATCAGAGGATGGCTTCAGCAGGTTCAGA
GAAAACTCTTCCTTGTCCAGCAAGTAAAACTACCTCGCCTGCCCTTGCCCTTAAATTCGA
TGCTTTAGATTTCCCAGCCATGAAGGCTATGGAAGATTTCCAGACTTGTATCAGTGAACT
TGGTGAGAAAATGCGTGAGGATCCTGCATATATCCAGGAGCTTCGCAGATGTAATCCAGC
CGCCAAGTTTGACGTGAAAAATACAATGCAAATGTTTCGGCGCCTTCGGGATAACGCACG
GCAGGATCCTCGTGCGTCTCTGGAAAATCTCGTGAAACCTGGAGCACTGGAGGAATTTGC
TGAGCGTGTTACCCAACTGAGAAAAGATCCTGAAGTTGAGCTCATTCTAGCCGAGTTAGA
CGCTTGTCCTGCTGCTGCTCTCTTGAAGTTTGCGGATGACAAACAAGTTTTGAAAAAACT
TGGAAACTCAATGCTTAGATCTCAGGGTCTGAACTATGATGCTGATGATGAAGAACTTTT
CTCTGAGGGAAGAAAAGCCCTCGAGATTGCTTTTGGATATGCCAAGATGAAATGCTACAA
A*TTCTTGTGGATGCTCAAAGAAAAA

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1BT30TF 645 0 0
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TGGCTTCAGCAGGTTCAGAGAAAACTCTTCCTTGTCCAGCAAGTAAAACTACCTCGCCTG
CCCTTGCCCTTAAATTCGATGCTTTAGATTTCCCAGCCATGAAGGCTATGGAAGATTTCC
AGACTTGTATCAGTGAACTTGGTGAGAAAATGCGTGAGGATCCTGCATATATCCAGGAGC
TTCGCAGATGTAATCCAGCCGCCAAGTTTGACGTGAAAAATACAATGCAAATGTTTCAGC
GCCTTCGGGATAACGCACGGCAGGATCCTCGTGCGTCTCTGGAAAATCTCGTGAAACCTG
GAGCACTGGAGGAATTTGCTGAGCGTGTTACCCAACTGAGAAAAGATCCTGAAGTTGAGC
TCATTCTAGCCGAGTTAGACGCTTGTCCTGCTGCTGCTCTCTTGAAGTTTGCGGATGACA
AACAAGTTTTGAAAAAACTTGGAAACTCAATGCTTAGATCTCAGGGTCTGAACTATGATG
CTGATGATGAAGAACTTTTCTCTGAGGGAAGAAAAGCCCTCGAGATTGCTTTTGGAGATG
CCAAGATGAAATGCTACAAAATTCTTGTGGATGCTCAAAGAAAAA

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1BT30JQ 136 0 0
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GTGTAAGATTGCAACATAACAAATAACACTTTGTTTCAAACCGCTCTGTTTTTCGTTCCA
TACTCTCGAAAGATTG

QA 1 136 1 136
DS 

RD RS1EO38JQ 577 0 0
TT
TCTGGAAAATCTCGTGAAACCTGGAGCACTGGAGGAATTTGCTGAGCGTGTTACCCAACT
GAGAAAAGATCCTGAAGTTGAGCTCATTCTAGCCGAGTTAGACGCTTGTCCTGCTGCTGC
TCTCTTGAAGTTTGCGGATGACAAACAAGTTTTGAAAAAACTTGGAAACTCAATGCTTAG
ATCTCAGGGTTTGAACTATGATGCTGATGATGAAGAACTTTTTTTTGAGGGAAGAAAAGC
CCTCGAGATTGCTTTTGGATATGCCAAGATGAAATGCTACAAAATTCTTGTGGATGCTCA
AAGAAAAAAGGCTAATAAGGTTGAGGGGAAAAAGAAGACAAGTGGAAAAAAGACAAAGCG
TTCAAGCCTTCTTTCCAACAAGTGTGATGCTGTGTAAGATTGCAACATAACAAATAACAC
TCTGTTTCAAACCGCTCTGTTTTTCGTTCCATACTCTCGAAAGATTGTTTCTCTCTCTTT
TTTTTTTTTTTTTTGTTCCTTTGTGTTAAAGTTCCAATGTTGTAGCTCAGTCATATCAGA
ACCTTCCGCAAGTGAGAAAATCGCCCAACTCCTCC

QA 3 577 3 577
DS 



AS 1 4

CO CL2556Contig1 1168 4 3 U
ATTACGGCCGGGGGTAGCTCTCACTTCTCACCAACACATTTAAGAAATGCTGTGTGCGTC
AAACCAAAACCAGCGATCTTAAACTCATAACCACCAAACCTCTGACAATGTCGAACGCTC
TCAGATTCTTCGAGCTCAACACCGGTGCTAAGATCCCGTCTGTGGGTCTTGGAACATGGC
AGGCCTCTCCTGGCGTTGTTGGTGATGCCGTAGCAGCTGCTGTTAAGATCGGCTCTCGTC
ATATTGATTGTGCTCAGTTGTATGGCAACGAAAAAGAGATTGGGACAGCTTTGAAAAAAC
TGTGTGAAAAAGGTGTAGTGAAACGCGAGGAGTTGTTCATCACCTCCAAGCTCTGGTGTA
CTGATCATGACCCTCAAGATGTACCAGAGGCACTAAACAGAACTATACAGAGTCTGCAGC
TTGACTACGTTGATCTGTATTTGATTCACTGGCCTGTACGGATGAAGAAAGGTTCTGTTG
GAGTGAGTCCAGAGAACCTTTTGCCTGTAGATATTCCTAACACATGGAAATCGATGGAGG
CACTCTATGATTCGGGTAAGGCACGAGCCATAGGAGTAAGCAACTTCTCCACCAAGAAAC
TAGGCAATCTCTTGGATCTAGCTCGTGTTCCTCCTGCTGTTAATCAGGTCGAATGTCATC
CTTCTTGGCGACAAGCTAAGCTACGAGAGTTTTGCAAATCCAATGGAGTTCACCTCAGTG
CATACTTCCCATTGGGTTCTCCAGGATGGTTCAAGATCGATGTTCTGAAGAACCCAATAC
TGAATATGGTTGCGGAAAAGCTTGGGAAATCTCCAGCTCAAGTTGCACTTCGTTGGGGAC
TCCAAATGGGCCACAGTGTACTTCCCAAAAGTACCAATGAAGGAAGGAATAGAGAGAACT
TAGATGTTTTCGACTGGTCTATACCCAGTGCCTTGTTTGCCAAGTTTTTTGATATTGAAC
AGACGAGGCTATTGAATGCTTCCTTCTTTGCTCACGAGACACTGAGCCCTTATAAGTCTG
TGGAAGAATTATGGGACGGCGAGGTATGATTTCAGCTGATTTAATTCGTTTCTTCTATGG
GAGATTTTTCCCTGTTGAACTTGTCCGTTTGTTCATGAATGTTACTGAAAGACATGTCTC
TATATAATTTACAATCATATTTGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1A037TF U 1
AF RS1F525TF U 11
AF RS1A037TV U 60
AF RS1F525JQ C 543
BS 1 643 RS1A037TF
BS 644 796 RS1A037TV
BS 797 1168 RS1F525JQ

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ATTACGGCCGGGGGTAGCTCTCACTTCTCACCAACACATTTAAGAAATGCTGTGTGCGTC
AAACCAAAACCAGCGATCTTAAACTCATAACCACCAAACCTCTGACAATGTCGAACGCTC
TCAGATTCTTCGAGCTCAACACCGGTGCTAAGATCCCGTCTGTGGGTCTTGGAACATGGC
AGGCCTCTCCTGGCGTTGTTGGTGATGCCGTAGCAGCTGCTGTTAAGATCGGCTCTCGTC
ATATTGATTGTGCTCAGTTGTATGGCAACGAAAAAGAGATTGGGACAGCTTTGAAAAAAC
TGTGTGAAAAAGGTGTAGTGAAACGCGAGGAGTTGTTCATCACCTCCAAGCTCTGGTGTA
CTGATCATGACCCTCAAGATGTACCAGAGGCACTAAACAGAACTATACAGAGTCTGCAGC
TTGACTACGTTGATCTGTATTTGATTCACTGGCCTGTACGGATGAAGAAAGGTTCTGTTG
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CACTCTATGATTCGGGTAAGGCACGAGCCATAGGAGTAAGCAACTTCTCCACCAAGAAAC
TAGGCAATCTCTTGGATCTAGCTCGTGTTCCTCCTGCTGTTAA

QA 1 643 1 643
DS 

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CAGCGATCTTAAACTCATAACCACCAAACCTCTGACAATGTCGAACGCTCTCAGATTCTT
CGAGCTCAACACCGGTGCTAAGATCCCGTCTGTGGGTCTTGGAACATGGCAGGCCTCTCC
TGGCGTTGTTGGTGATGCCGTAGCAGCTGCTGTTAAGATCGGCTCTCGTCATATTGATTG
TGCTCAGTTGTATGGCAACGAAAAAGAGATTGGGACAGCTTTGAAAAAACTGTGTGAAAA
AGGTGTAGTGAAACGCGAGGAGTTGTTCATCACCTCCAAGCTCTGGTGTACTGATCATGA
CCCTCAAGATGTACCAGAGGCACTAAACAGAACTATACAGAGTCTGCAGCTTGACTACGT
TGATCTGTATTTGATTCACTGGCCTGTACGGATGAAGAAAGGTTCTGTTGGAGTGAGTCC
AGAGAACCTTTTGCCTGTAGATATTCCTAACACATGGAAATCGATGGAGGCACTCTATGA
TTCGGGTAAGGCACGAGCCATAGGAGTAAGCAACTTCTCCACCAAGAAACTAGGCAATCT
CTTGGATCTAGCTCGTGTTCCTCCTGCTGTTAA

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DS 

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CAAACCAAAACCAGCGATCTTAAACTCATAACCACCAAACCTCTGACAATGTCGAACGCT
CTCAGATTCTTCGAGCTCAACACCGGTGCTAAGATCCCGTCTGTGGGTCTTGGAACATGG
CAGGCCTCTCCTGGCGTTGTTGGTGATGCCGTAGCAGCTGCTGTTAAGATCGGCTCTCGT
CATATTGATTGTGCTCAGTTGTATGGCAACGAAAAAGAGATTGGGACAGCTTTGAAAAAA
CTGTGTGAAAAAGGTGTAGTGAAACGCGAGGAGTTGTTCATCACCTCCAAGCTCTGGTGT
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CTTGACTACGTTGATCTGTATTTGATTCACTGGCCTGTACGGATGAAGAAAGGTTCTGTT
GGAGTGAGTCCAGAGAACCTTTTGCCTGTAGATATTCCTAACACATGGAAATCGATGGAG
GCACTCTATGATTCGGGTAAGGCACGAGCCATAGGAGTAAGCAACTTCTCCACCAAGAAA
CTAGGCAATCTCTTGGATCTAGCTCGTGTTCCTCCTGCTGTTAATCAGGTCGAATGTCAT
CCTTCTTGGCGACAAGCTAAGCTACGAGAGTTTTGCAAATCCAATGGAGTTCACCTCAGT
GCATACTTCCCATTGGGTTCTCCAGGATGGTTCAAGATCGATGTTCTGAAGAACCCAATA
CTGAATATGGTTGCGGA

QA 1 737 1 737
DS 

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CTCTATGATTCGGGTAAGGCACGAGCCATAGGAGTAAGCAACTTCTCCACCAAGAAACTA
GGCAATCTCTTGGATCTAGCTCGTGTCCCTCCTGCTGTTAATCAGGTCGAATGTCATCCT
TCTTGGCGACAAGCTAAGCTACGAGAGTTTTGCAAATCCAATGGAGTTCACCTCAGTGCA
TACTTCCCATTGGGTTCTCCAGGATGGTTCAAGATCGATGTTCTGAAGAACCCAATACTG
AATATGGTTGCGGAAAAGCTTGGGAAATCTCCAGCTCAAGTTGCACTTCGTTGGGGACTC
CAAATGGGCCACAGTGTACTTCCCAAAAGTACCAATGAAGGAAGGAATAGAGAGAACTTA
GATGTTTTCGACTGGTCTATACCCAGTGCCTTGTTTGCCAAGTTTTTTGATATTGAACAG
ACGAGGCTATTGAATGCTTCCTTCTTTGCTCACGAGACACTGAGCCCTTATAAGTCTGTG
GAAGAATTATGGGACGGCGAGGTATGATTTCAGCTGATTTAATTCGTTTCTTCTATGGGA
GATTTTTCCCTGTTGAACTTGTCCGTTTGTTCATGAATGTTACTGAAAGACATGTCTCTA
TATAATTTACAATCATATTTGTTTCC

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 4

CO CL2557Contig1 1388 4 5 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGCGCACAGCTA
CCATCACGTGTCACAATCTTATCGAACGAGTCCACGTGGATCCACTTAGTTGCTGACCAT
TTCTCTCCTTCAATCACAGGACAACCTCCGTGAAGGCTCAATACATCTGGAGTTGCGTCT
TCGTGGAGGTTAAAGAACAACAGTGCATCTCCTTTCCTCGGTTTCACTATATAAAACATG
TTTTTACAACATTCTTGATTAGGATAAATAGTTCTAGAGGAACTTGTGAACAATTCTGTA
GTAGCTAGCTTACCAGCGATTCCTTTCTTTGCACAATCAGAAAGATCGTCTTTGTTTACA
GAAAGCTTACGGCGAGAGGATTCCTACAGCACAAATGTTCATTAAGACCAAACTAGAGTG
TTCATTGTGTATATATGTTAAGTGGGGGAAGTGATGGTTTAGTGTGAATACTAACCACTG
CATTAGGGAAGACAGTTTCTCCACCCTTTGTGACATTGGATAGATACATGAGAACCGTTG
CTATACGGTGTCCACCACGGGCGATGTTGACTTTGTCGTGAAAGTAGTCAAAGTGTGCGT
CATATTTCTGACCGTGCTCATATCTCAACACCTGAAGGTCTTCTCCATTTTCTGTCACCA
GAGAGTGTAAGAACTCAGAAACAATAACAATATCTTCTGAAAAAAGCTCGTCCTAAGAGT
TAAGGTTCCTTGTAAAAAAACCTGATCTTCTGAGATAAAGATTGATACACTAATTATTAT
TACCATTTTAGATTGTCTTGTTACCTTTAGGGAGGAATGTCCATGTGGAAAGCTTGTCCT
CTATACCAGAAACAATAGGATCCTGTTGTTGTTTACATGAAGATTGTAATCATTACTAAG
TAACAACATGATTGATCATTATAGACATATACTTCGATTGATGCATATTCTGTTGACTAG
GAACTAACTAGCTATTAAATTGTTTAGTTGAAGTAGTAAGCATCAATGACAAAATCTATC
AAGATCCAAGAGGCTTATATAGAAAGCTCCATGAACATGATCAGTGTAAACTAGAGATCT
AATTAGAGCCGGATTTAGTCACAACCTAGTGAAACATTGTTCTTGACCCCTTTATCATAA
ACGCAGGCTCCCAAATTATGAATTTAAAAAAAAAAAATTCTTGATAAATGTTTAACATCC
CCTAAATCTCAGATCCAACCCTCAACCCAATCCTAATCCATCAAACATGGAAGCGGAACA
GAACAACATGTCACCTTTCCTTTGGAGATAAACGTGCCGGAGCTGGCCCGAACATCACTA
ACTTGACTCTCTCCATTGTCGTTATCAGCAACCGCAGATCTCTGCAGATTCTCTTTTGCC
TTATTTTC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A079TF U 1
AF RS1A079TV U 1
AF RS1A079JQ C 636
AF RS1A079TR C 752
BS 1 723 RS1A079TF
BS 724 724 RS1A079TV
BS 725 806 RS1A079TF
BS 807 854 RS1A079TV
BS 855 1388 RS1A079JQ

RD RS1A079TF 806 0 0
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CCATCACGTGTCACAATCTTATCGAACGAGTCCACGTGGATCCACTTAGTTGCTGACCAT
TTCTCTCCTTCAATCACAGGACAACCTCCGTGAAGGCTCAATACATCTGGAGTTGCGTCT
TCGTGGAGGTTAAAGAACAACAGTGCATCTCCTTTCCTCGGTTTCACTATATAAAACATG
TTTTTACAACATTCTTGATTAGGATAAATAGTTCTAGAGGAACTTGTGAACAATTCTGTA
GTAGCTAGCTTACCAGCGATTCCTTTCTTTGCACAATCAGAAAGATCGTCTTTGTTTACA
GAAAGCTTACGGCGAGAGGATTCCTACAGCACAAATGTTCATTAAGACCAAACTAGAGTG
TTCATTGTGTATATATGTTAAGTGGGGGAAGTGATGGTTTAGTGTGAATACTAACCACTG
CATTAGGGAAGACAGTTTCTCCACCCTTTGTGACATTGGATAGATACATGAGAACCGTTG
CTATACGGTGTCCACCACGGGCGATGTTGACTTTGTCGTGAAAGTAGTCAAAGTGTGCGT
CATATTTCTGACCGTGCTCATATCTCAACACCTGAAGGTCTTCTCCATTTTCTGTCACCA
GAGAGTGTAAGAACTCAGAAACAATAACAATATCTTCTGAAAAAAGCTCGTCCTAAGAGT
TAAAGTTCCTTGTAAAAAAACCTGATCTTCTGAGATAAAGATTGATACACTAATTATTAT
TACCATTTTAGATTGTCTTGTTACCT

QA 1 806 1 806
DS 

RD RS1A079TV 854 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGCGCACAGCTA
CCATCACGTGTCACAATCTTATCGAACGAGTCCACGTGGATCCACTTAGTTGCTGACCAT
TTCTCTCCTTCAATCACAGGACAACCTCCGTGAAGGCTCAATACATCTGGAGTTGCGTCT
TCGTGGAGGTTAAAGAACAACAGTGCATCTCCTTTCCTCGGTTTCACTATATAAAACATG
TTTTTACAACATTCTTGATTAGGATAAATAGTTCTAGAGGAACTTGTGAACAATTCTGTA
GTAGCTAGCTTACCAGCGATTCCTTTCTTTGCACAATCAGAAAGATCGTCTTTGTTTACA
GAAAGCTTACGGCGAGAGGATTCCTACAGCACAAATGTTCATTAAGACCAAACTAGAGTG
TTCATTGTGTATATATGTTAAGTGGGGGAAGTGATGGTTTAGTGTGAATACTAACCACTG
CATTAGGGAAGACAGTTTCTCCACCCTTTGTGACATTGGATAGATACATGAGAACCGTTG
CTATACGGTGTCCACCACGGGCGATGTTGACTTTGTCGTGAAAGTAGTCAAAGTGTGCGT
CATATTTCTGACCGTGCTCATATCTCAACACCTGAAGGTCTTCTCCATTTTCTGTCACCA
GAGAGTGTAAGAACTCAGAAACAATAACAATATCTTCTGAAAAAAGCTCGTCCTAAGAGT
TAAGGTTCCTTGTAAAAAAACCTGATCTTCTGAGATAAAGATTGATACACTAATTATTAT
TACCATTTTAGATTGTCTTGTTACCTTTAGGGAGGAATGTCCATGTGGAAAGCTTGTCCT
CTATACCAGAAACA

QA 1 854 1 854
DS 

RD RS1A079JQ 753 0 0
AGGTCTTCTCCATTTTCTGTCACCAGAGAGTGTAAGAACTCAGAAACAATAACAATATCT
TCTGAAAAAAGCTCGTCCTAAGAGTTAAGGTTCCTTGTAAAAAAACCTGATCTTCTGAGA
TAAAGATTGATACACTAATTATTATTACCATTTTAGATTGTCTTGTTACCTTTAGGGAGG
AATGTCCATGTGGAAAGCTTGTCCTCTATACCAGAAACAATAGGATCCTGTTGTTGTTTA
CATGAAGATTGTAATCATTACTAAGTAACAACATGATTGATCATTATAGACATATACTTC
GATTGATGCATATTCTGTTGACTAGGAACTAACTAGCTATTAAATTGTTTAGTTGAAGTA
GTAAGCATCAATGACAAAATCTATCAAGATCCAAGAGGCTTATATAGAAAGCTCCATGAA
CATGATCAGTGTAAACTAGAGATCTAATTAGAGCCGGATTTAGTCACAACCTAGTGAAAC
ATTGTTCTTGACCCCTTTATCATAAACGCAGGCTCCCAAATTATGAATTTAAAAAAAAAA
AATTCTTGATAAATGTTTAACATCCCCTAAATCTCAGATCCAACCCTCAACCCAATCCTA
ATCCATCAAACATGGAAGCGGAACAGAACAACATGTCACCTTTCCTTTGGAGATAAACGT
GCCGGAGCTGGCCCGAACATCACTAACTTGACTCTCTCCATTGTCGTTATCAGCAACCGC
AGATCTCTGCAGATTCTCTTTTGCCTTATTTTC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1A079TR 637 0 0
GAGATAAAGATTGATACACTAATTATTATTACCATTTTAGATTGTCTTGTTACCTTTAGG
GAGGAATGTCCATGTGGAAAGCTTGTCCTCTATACCAGAAACAATAGGATCCTGTTGTTG
TTTACATGAAGATTGTAATCATTACTAAGTAACAACATGATTGATCATTATAGACATATA
CTTCGATTGATGCATATTCTGTTGACTAGGAACTAACTAGCTATTAAATTGTTTAGTTGA
AGTAGTAAGCATCAATGACAAAATCTATCAAGATCCAAGAGGCTTATATAGAAAGCTCCA
TGAACATGATCAGTGTAAACTAGAGATTTAATTAGAGCCGGATTTAGTCACAACCTAGTG
AAACATTGTTCTTGACCCCTTTATCATAAACGCAGGCTCCCAAATTATGAATTTAAAAAA
AAAAAATTCTTGATAAATGTTTAACATCCCCTAAATCTCAGATCCAACCCTCAACCCAAT
CCTAATCCATCAAACATGGAAGCGGAACAGAACAACATGTCACCTTTCCTTTGGAGATAA
ACGTGCCGGAGCTGGCCCGAACATCACTAACTTGACTCTCTCCATTGTCGTTATCAGCAA
CCGCAGATCTCTGCAGATTCTCTTTTGCCTTATTTTC

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 4

CO CL2558Contig1 704 4 12 U
GGAAGCTAATCTTCTCGCAATTCTTCACCATCTCTCTCTCTCTAGAAAAAAACCTGAAGA
AATTAAAAAACACATCACAAGTTTGATCAAGAAAGATGACTAAAGACAGGAAGATCGGAG
TCGCCATGGACTTCTCGGAGAGCAGCAAGAACGCACTGAGATGGGCCATCGACAACTTAG
CTGATAAAGGAGACACGTTTTACATCATTCACGCGTTACCAACCTCAGAAGCTGGACCTC
GTAACTCCCTCTGGCTCAAATCCGGTTCTCCTCTCATACCGTTGGTGGAGTTTAGAGAAC
CAGAGACTATGGAGAAATACGGCGTCAAAATCGATATACCAGTTCTTGACATGCTCGACA
CTGGTTCGAGGCAGAAAGAGATTCATGTAGTGACGAAAATATACTGGGGAGATGCAAGAG
AGAAGCTGGTTGATGCTGCTAAATCTCTCAAACTTGATTCTATTGTCATGGGAAGCAGAG
GACTCAGTGCCCTTCAAAGGATAATAATGGGAAGCGTAAGCAGCTTTGTGATTCAACACG
CCCCTTGCCCGGTCACCGTTGTCAAGGACTAAACAAAAGGCTGTAATCTCATATGTTCGA
TAAAAAATAATAATCGCAACTTATGCTTTTAATAAAATGAACTCTTTTCTTTCTTTGTTG
TATTTGTATTTGAAATCATATCAATATATTAAGTTCAATAAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 

AF RS1BC67TF U 1
AF RS1BC67JQ C 71
AF RS1BB92JQ C 136
AF RS1BB92TF U 136
BS 1 226 RS1BC67TF
BS 227 227 RS1BB92TF
BS 228 256 RS1BC67TF
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BS 258 335 RS1BC67TF
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BS 337 438 RS1BC67TF
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BS 440 517 RS1BC67TF
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BS 519 700 RS1BC67TF
BS 701 704 RS1BB92JQ

RD RS1BC67TF 703 0 0
GGAAGCTAATCTTCTCGCAATTCTTCACCATCTCTCTCTCTCTAGAAAAAAACCTGAAGA
AATTAAAAAACACATCACAAGTTTGATCAAGAAAGATGACTAAAGACAGGAAGATCGGAG
TCGCCATGGACTTCTCGGAGAGCAGCAAGAACGCACTGAGATGGGCCATCGACAACTTAG
CTGATAAAGGAGACACGTTTTACATCATTCACGCGTTACCAACCTCTGAAGCTGGACCTC
GTAACTCCCTCTGGCTTAAATCCGGTTCTCCTCTCATACCGTTGGTGGAGTTTAGAGAAC
CAGAGACTATGGAGAAATACGGCGTCAAAATCGATGTACCAGTTCTTGACATGCTCGACA
CTGGTTCGAGGCAGAAAGAGATTCATGTAGTGACGAAAATATACTGGGGAGATGCAAGAG
AGAAGCTGGTTGATGCTGTTAAATCTCTCAAACTTGATTCTATTGTCATGGGAAGCAGAG
GACTCAGTGCCCTTCAAAGGATAATAATGGGAAGCGTGAGCAGCTTTGTGATTCAACACG
CCCCTTGCCCGGTCACCGTTGTCAAGGACTAAACAAAAGGCTGTAATCTCATATGTTCGA
TAAAAAATAATAATCGCAACTTATGCTTTTAATAAAATGAACTCTTTTCTTTCTTTGTTG
TATTTGTATTTGAAATCATATCAATATATTAAGTTCAATA
GCA

QA 1 700 1 700
DS 

RD RS1BC67JQ 632 0 0
CACATCACAAGTTTGATCAAGAAAGATGACTAAAGACAGGAAGATCGGAGTCGCCATGGA
CTTCTCGGAGAGCAGCAAGAACGCACTGAGATGGGCCATCGACAACTTAGCTGATAAAGG
AGACACGTTTTACATCATTCACGCGTTACCAACCTCTGAAGCTGGACCTCGTAACTCCCT
CTGGCTTAAATCCGGTTCTCCTCTCATACCGTTGGTGGAGTTTAGAGAACCAGAGACTAT
GGAGAAATACGGCGTCAAAATCGATGTACCAGTTCTTGACATGCTCGACACTGGTTCGAG
GCAGAAAGAGATTCATGTAGTGACGAAAATATACTGGGGAGATGCAAGAGAGAAGCTGGT
TGATGCTGTTAAATCTCTCAAACTTGATTCTATTGTCATGGGAAGCAGAGGACTCAGTGC
CCTTCAAAGGATAATAATGGGAAGCGTGAGCAGCTTTGTGATTCAACACGCCCCTTGCCC
GGTCACCGTTGTCAAGGACTAAACAAAAGGCTGTAATCTCATATGTTCGATAAAAAATAA
TAATCGCAACTTATGCTTTTAATAAAATGAACTCTTTTCTTTCTTTGTTGTATTTGTATT
TGAAATCATATCAATATATTAAGTTCAATA
GC

QA 1 630 1 630
DS 

RD RS1BB92JQ 569 0 0
G
GGAGAGCGGCAAGAACGCACTGAGATGGGCCATCGACAACTTAGCTGATAAAGGAGACAC
GTTTTACATCATTCACGCGTTACCAACCTCAGAAGCTGGACCTCGTAACTCCCTCTGGCT
CAAATCCGGTTCTCCTCTCATACCGTTGGTGGAGTTTATAGAACCAGAGACTCTGGATAA
ATACGGTGTCAAAATCGATATACCAGTTCTTGACATGCTCGACACTGGTTCGAGGCAGAA
AGAGATTCATGTAGTGACGAAAATATACTGGGGAGATGCAAGAGAGAAGCTGGTTGATGC
TGCTAAATCTCTCAAACTTGATTCTATTGTCATGGGAAGCAGAGGACTCAGTGCCCTTCA
AAGGATAATAATGGGAAGCGTAAGCAGCTTTGTGATTCAACACGCCCCTTGCCCGGTCAC
CGTTGTCAAGGACTAAACAAAAGGCTGTGATCTCATATGTTCGATAAAA**TAATAATCG
CAATTTATGCTTTTAATAAAGTGAACTCTTTTCTTTCTTTGTTGTATTTGTATTTGAAAT
CATATCAATATATTAAGTTCAATAAAAC

QA 2 569 2 569
DS 

RD RS1BB92TF 569 0 0
G
GGAGAGCGGCAAGAACGCACTGAGATGGGCCATCGACAACTTAGCTGATAAAGGAGACAC
GTTTTACATCATTCACGCGTTACCAACCTCAGAAGCTGGACCTCGTAACTCCCTCTGGCT
CAAATCCGGTTCTCCTCTCATACCGTTGGTGGAGTTTATAGAACCAGAGACTCTGGATAA
ATACGGTGTCAAAATCGATATACCAGTTCTTGACATGCTCGACACTGGTTCGAGGCAGAA
AGAGATTCATGTAGTGACGAAAATATACTGGGGAGATGCAAGAGAGAAGCTGGTTGATGC
TGCTAAATCTCTCAAACTTGATTCTATTGTCATGGGAAGCAGAGGACTCAGTGCCCTTCA
AAGGATAATAATGGGAAGCGTAAGCAGCTTTGTGATTCAACACGCCCCTTGCCCGGTCAC
CGTTGTCAAGGACTAAACAAAAGGCTGTGATCTCATATGTTCGATAAAA**TAATAATCG
CAATTTATGCTTTTAATAAAGTGAACTCTTTTCTTTCTTTGTTGTATTTGTATTTGAAAT
CATATCAATATATTAAGTTCAATA
AAAC

QA 2 565 2 565
DS 



AS 1 2

CO CL2559Contig1 1045 2 6 U
GAGAAGAAGTTATATACCATGTTGAGACCTATGACGTGACTACTATAAGAGCAAGCACTC
CCATGTTTCTCATGTCGAGAAAAATCAAATCGCTTGGTGTGAAGATGGCTCTCTCTGGTG
AAGGCTCTGATGAAATCTTTGGAGGATATTTGTACTTCCATAAGGCACCTAACAAGAAAG
AATTACATGAGGAAACATGCCGTAAGATCAAAGCTCTTTATCAATATGATTGCTTGAGGG
CTAACAAATCAACTTCTGCATGGGGTGTTGAGGCTCGTGTACCTTTCCTCGACAAAGAGT
TCTTAGATGTAGCAATGAGCATTGATCCAGAGTGGAAAATGATCAGGCCTGATTTAGGAA
GGATCGAGAAATGGGTGTTACGCAATGCCTTTGATGATGAGAAGAACCCTTATCTACCAA
AGCACATTCTATACAGGCAGAAAGAACAGTTCAGTGATGGAGTTGGGTACAGCTGGATTG
ATGGTCTGAAAGATCATGCCAACAAACATGTCTCCGACGCAATGCTGACGAACGCAAACT
TTGTCTTCCCTGATAACACACCTTTGACAAAAGAAGCTTATTACTACAGAGCCATCTTTG
AAAAGTTCTTCCCTAAGAGCGCTGCTAGAGCTACTGTACCAGGAGGTCCAAGTGTAGCAT
GTAGTACAGCAAAAGCTGTGGAGTGGGACGCAGCTTGGAAAGGGAACCTTGACCCGTCGG
GTCGTGCAGCTCTTGGAGTTCATGTTGCAGCTTATGAAGGAGATAAGGCTGAAGATACTC
GTCCTGAGAAGGTACAGAAGCTGGCAGAGAAAACTGCAGAAGCCATTGTTTAAGGGATAA
AACAAGGTTTTAAAACGAATGTTTGCTACGCATTTCTCTTTTATTTTCTCAAAAAAGACA
ATTTTTCTCTTCTTTCGTAGGATCAATAAGTACAATAAGTTGTCTCTTTAACTGAATTGA
GTTAGGAGTTTCTGAGGATGTACCTAAGTTGCTGGCGATTATGAACGTTGTTTTCATGAA
TGTGGTTCTTTCTTCTTCTGTCACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TCTGTCACG

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DS 



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CTTTCTTTGCCACCAAATAATTTTCAGTCTTTGTAATAATGTCTCCAATACTCAAACTTT
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BQ
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AAACTCGGCAAGCAGATAACGAGAATCAAACCGTCTCTAACTTACAT

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DS 

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G
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AAACTGAGAACATTTCAGTAGATGATGAGCTCGAAATTCGTAAGCAATCAAGGCTAGAGA
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ATTCGAAACTCGGCAAGCAGATAACGAGAATCAAACCGTCTCTAACTTACATAGCGGTAG
AGGAAGTGATGAGCCTTGTATCAGCACAAGTTGCTGGAAACAG

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ATTCGTGTCTATATATGTTATCAATGAAATAGAAGTCATGATGCATGTAATGCAAAATGG
TTTTTGTTCCTACCT

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DS 

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CGAATTGAACGAGGTGTGGAAGGACATTCTAAATGCAGAAGGCGATGAGATTTACATAAA
GGACATTGAGCTATACATGAAAGATGGAGAGAACCCTTCATTCACTGAGCTATCAGAGCG
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AGAGCTTGAAGGAGACCAACCCACCACACTGTGATAAATCCATTCTCTTATATATATCTT
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CAAAACAAGGAGGCTTTTAATTCTTTCTTTGCCACCAAATAATTTTCAGTCTTTGTAATA
ATGTCTCCAATACTCAAACTTTATTCGTGTCTATATATGTTATCAATGAAATAGAAGTCA
TGATGCATGTAATGCAAAATGGTTTTTGTTC
GT

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DS 



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CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAGGAGGGCTGAGTCATCTTTTTTCTTTTCCCGC
CAACCCTTTCTCCGATGGGCAAAGAGAATCCGGCAGAGAAAGCCCTAAATCTGATTCGCG
GGAGGCTCTGCGATCCTACTTTCGTCTTCAGACCACTTTCCGGTTCTTCTGACAGCAACT
ACAGCAAGTTGAAGTTCATTGTATCGACCTCTATCACGGAAGGATGCAACAATTCGATCT
TGCTTCTGGGCCCTCGTGGCTCTGGAAAAGCTGCTGTCTTGGATCTTGTTGTTGGTGATT
TAATGGAAGAGTATCCAGATTCAGTAACACTAATAAGATTGAATGGACTCTTGCATAGTG
AGGATAATTGTGCATTCAAGGAAATTGCTAGACAGTTGTGTATGGAACACCACCTGCTCT
TCTCCAAAATGGCATCATTCGATGAGAATTCGCAGTTCATAATAGCTATGCTTCGGGAAT
GTGGACTAGCAAAGCTCATACAACTTCATCAGTGTGATGAAAGAGTATAAGACGATACAC
GATTCTTTTCAGACCTCAGACTACTACGCACAAAATGTCTGCCTACGTGCATTTGAGCAC
CTCAGAGAGCGAGAAGTTATATGCTACGCAGAGAATAGAGGACAGTCTCAGGCAGGTGAA
TACCGTCCAATGAAGCTTTTAATATCGGCCTCTGAGCTCCATCAAGGAATGAGATCTCAT
GCGTGTTGCCCTGCGATTCTTCTCAAGTTATTGGACCATTGATCTCTGTGTTTCTGTCCC
TCCGTTCTTTAGTGACCATGTATGTGTATGTTTATTCAATGTTGAAGCTACAAGCTACTT
TCTTTAGAACCAGTCTTTTCAGTTTTGATATAGAGTGAGAGACTATGTCAACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

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CAATGTTGAAGCTACAAGCTACTTTCT

QA 1 867 1 867
DS 

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GATTTAATGGAAGAGTATCCAGATTCAGTAACACTAATAAGATTGAATGGACTCTTGCAT
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ACACGATTCTTTTCAGACCTCAGACTACTACGCACAAAATGTCTGCCTACGTGCATTTGA
GCACCTCAGAGAGCGAGAAGTTATATGCTACGCAGAGAATAGAGGACAGTCTCAGGCAGG
TGAATACCGTCCAATGAAGCTTTTAATATCGGCCTCTGAGCTCCATCAAGGAATGAGATC
TCATGCGTGTTGCCCTGCGATTCTTCTCAAGTTATTGGACCATTGATCTCTGTGTTTCTG
TCCCTCCGTTCTTTAGTGACCATGTATGTGTATGTTTATTCAATGTTGAAGCTACAAGCT
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QA 1 837 1 837
DS 

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TCTTGCTTCTGGGCCCTCGTGGCTCTGGAAAAGCTGCTGTCTTGGATCTTGTTGTTGGTG
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GTGAGGATAATTGTGCATTCAAGGAAATTGCTAGACAGTTGTGTATGGAACACCACCTGC
TCTTCTCCAAAATGGCATCATTCGATGAGAATTCGCAGTTCATAATAGCTATGCTTCGGG
AATGTGGACTAGCAAAGCTCATACAACTTCATCAGTGTGATGAAAGAGTATAAGACGATA
CACGATTCTTTTCAGACCTCAGACTACTACGCACAAAATGTCTGCCTACGTGCATTTGAG
CACCTCAGAGAGCGAGAAGTTATATGTTACGCAGAGAATAGAGGACAGTTTCAGGCAGGT
GAATACCGTCCAATGAAGCTTTTAATATCGGCCTCTGAGCTCCATCAAGGAATGAGATTT
CATGCGTGTTGCCCTGCGATTCTTCTCAAGTTATTGGACCATTGATCTCTGTGTTTCTGT
CCCTCCGTTCTTTAGTGACCATGTATGTGTATGTTTATTCAATGTTGAAGCTACAAGCTA
CTTTCTTTAGAACCAGTCTTTTCAGTTTTGATATAGAGTGAGAGACTATGTCAACGC

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 4

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AATCCTTTCCTGATCTATGCTACTAAGACAGAAGAGTGTTTACATATAGGCTTAAGCTTT
GTCTTGGAAGAAATAAAGAATCTAGTTTCTTTAGAATCTTTATA*GGAGCAAGAGGAGTC
TCCACACAACTCAAATCTAGTTTCTTTAGAATCTTAATAGGAGCAAGAGTCTCACACAAC
TCAACTCAAGGTATATGTGTTGCCATGAACTAAACGATGTACCGCCGCCACTTCTTGGTT
TGTGTCCCTTAGTATCTAATTGGTCCGTCAAGGCTACCTGTAGCAAACTGTTGAACTATA
GGATTTGTTGAAGTTGTAAATTCATGAGTCATGCCTTGCCAGACGATTTTTCCTTCATAC
AGAAACAATAACCTGTCTACAGCTCTTTGAATGGTGCTATGTTGATGGGTAACAACCAAA
TAAGAGGCGATCTTCCCAGGTTTCCCAAGTGAATCCTCCTCGCCCGTCAAGTGAACAGAT
CGTATAAGATCTTCAACTACAGTTGATGCAATGGGATCAAGTCCAGCTGTTGGCTCATCG
TACAAGAGCACCTCTGGCTCTATGACCTCCTTTGTTGTATCGAAAACAAGGGAACGAGCT
AAAGCAACCCTTTTCTTCATCCCACCAGATAGCTCAGAAGGTAGTCGATTCTCAACACCC
TTCAAACCAACAGCTGCCAAGGTCTGTGTCACAAGCTCAGATATTTGATTCTCAGACATT
TTTGAATTTTCATAGAGTAGAAAACCAACATTTTCACGAACTGTAAGAGAATCAAAGAGA
GCCGCACTCTGAAAAACAAGGCCAATACGAAGCCCTGATATCTCCTCATCACTAATCAAA
CCAGCTCGTTTTTTCCCTCGTATATAAACCTCTCCCTTGTCGGGAGCAAGAAGACCAGCC
ATGATCTTTAAAATGGTTGATTTTCCAGTCCCAGAAGGACCAATCACCCCAACAGCCTCG
CCATGTCTAATCTTAAAGGAAACACCTTTCAAGATATGTTTATCCCCAAATGATTTGTAG
ACATCACGACATTCTATAAGAACATCAGAATCATCCCCAGGCTCTCGCAAACCTCCTCCT
GACTTTGATAGACTATTGAATTTGGTGGCGGTGGAACAGCAAAAGACTTTCCGATGGAAC
GAGCTAATGCTTCTTCTGGACATAGCGACGGATTGGTGGGAAGAAGCATGGAAGTGTAAA
CTTGGACGAAGCAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGATAAAGAAAGCATGATTATGGGTTTT
GGGATCTTGAAGAATCGATCGAAGATGCACCAATTGGGTACCGATTGGGAGAAATCGACA
CAGAAGAATCAAAAGTGCGGGCTTTGCAGCGTCACACTTCTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AQ42JQ U 34
AF RS1FK78JQ U 1
AF RS1FI48JQ U 48
AF RS1AQ42TFB C 636
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BS 501 697 RS1FK78JQ
BS 698 715 RS1FI48JQ
BS 716 1425 RS1AQ42TFB

RD RS1AQ42JQ 571 0 0
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ATGTAGGCTTAATCTTTGTCTTGGAAGAAATAAAGAATCTAGTTCCTTTAGAATCTTTAT
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GCCGCCGCTTCTTGGTTTCTGTCCCTTAGTATCTAATTGGTCCGTCAAGGCTACCTGTAG
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CCGTCAAGTGAACAGATCGTATAAGATCTTCAACTACAGTTGATGCAATGGGATCAAGTC
CAGCTGTTGGCTCATCGTACA

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DS 

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AATCCTTTCCTGATCTATGCTACTAAGACAGAAGAGTGTTTACATATAGGCTTAAGCTTT
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TCCACACAACTCAAATCTAGTTTCTTTAGAATCTTAATAGGAGCAAGAGTCTCACACAAC
TCAACTCAAGGTATATGTGTTGCCATGAACTAAACGATGTACCGCCGCCACTTCTTGGTT
TGTGTCCCTTAGTATCTAATTGGTCCGTCAAGGCTACCTGTAGCAAACTGTTGAACTATA
GGATTTGTTGAAGTTGTAAATTCATGAGTCATGCCTTGCCAGACGATTTTTCCTTCATAC
AGAAACAATAACCTGTCTACAGCTCTTTGAATGGTGCTATGTTGATGGGTAACAACCAAA
TAAGAGGCGATCTTCCCAGATTTCCCAAGTGAATCCTCCTCGCCCGTCAAGTGAACAGAT
CGTATAAGATCTTCAACTACAGTTGATGCAATGGGATCAAGTCCAGCTGTTGGCTCATCG
TACAAGAGCACCTCTGGCTCTATGACCTCCTTTGTTGTATCGAAAACAAGGGAACGAGCT
AAAGCAACCCTTTTCTTCATCCCACCAGATAGCTCAG

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DS 

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AC
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CAAGAGGAGTCTCCACACAACTCAAATCTAGTTTCTTTAGAATCTTAATAGGAGCAAGAG
TCTCACAAAACTCAACTCAAGGTATATGTGTTGCCATGAACTAAACGATGTACCGCCGCC
ACTTCTTGGTTTGTGTCCCTTAGTATCTAATTGGTCCGTCAAGGCTACCTGTAGCAAACT
GTTGAACTATGGGATTTGTTGAAGTTGTAAATTCATGAGTCATGCCTTGCCAGACGATTT
TTCCTTCATACAGAAACAATAACCTGTCTACAGCTATTTGAATGGTGCTATGTTGATGGG
TAACAACCAAATAAGAGGCGATCTTCCCAGGTTTCCCAAGTGAATCCTCCTCGCCCGTCA
AGTGAACAGATCGTATAAGATCTTCAACTACAGTTGATGCAATGGGATCAAGTCCAGCTG
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GGGAACGAGCTAAAGCAACCCTTTTCTTCATCCCACCAGATAGCTCAGAAGGTAGTCGAT
TCTCAA

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DS 

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ACGAACTGTAAGAGAATCAAAGAGAGCCGCACTCTGAAAAACAAGGCCAATACGAAGCCC
TGATATCTCCTCATCACTAATCAAACCAGCTCGTTTTTTCCCTCGTATATAAACCTCTCC
CTTGTCGGGAGCAAGAAGACCAGCCATGATCTTTAAAATGGTTGATTTTCCAGTCCCAGA
AGGACCAATCACCCCAACAGCCTCGCCATGTCTAATCTTAAAGGAAACACCTTTCAAGAT
ATGTTTATCCCCAAATGATTTGTAGACATCACGACATTCTATAAGAACATCAGAATCATC
CCCAGGCTCTCGCAAACCTCCTCCTGACTTTGATAGACTATTGAATTTGGTGGCGGTGGA
ACAGCAAAAGACTTTCCGATGGAACGAGCTAATGCTTCTTCTGGACATAGCGACGGATTG
GTGGGAAGAAGCATGGAAGTGTAAACTTGGACGAAGCAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGA
TAAAGAAAGCATGATTATGGGTTTTGGGATCTTGAAGAATCGATCGAAGATGCACCAATT
GGGTACCGATTGGGAGAAATCGACACAGAAGAATCAAAAGTGCGGGCTTTGCAGCGTCAC
ACTTCTTTCC

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 4

CO CL2563Contig1 654 4 3 U
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GTTGGTTGCTCATGCCTTGTAGTCAAGGACTACGGTGAGGATACAACTGCCCTCAATATC
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GTTTGGAACATGATCAAGTTTTGCTGTTATCTATATTCTACTCTTCCAAAGCCC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FR02TF U 1
AF RS1D378JQ C 2
AF RS1D378TF U 2
AF RS1FR02JQ C 37
BS 1 314 RS1FR02TF
BS 315 315 RS1D378TF
BS 316 654 RS1FR02TF

RD RS1FR02TF 654 0 0
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GAGCCAGCGGCAATCCCAGAGGACATGGACTTGTTGACTGCATTGGAGTTGACTCTAAGG
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GTTGGTTGCTCATGCCTTGTAGTCAAGGACTACGGTGAGGATACAACTGCCCTCAATATC
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CAATGCTGTTTTATCTTGGTTTTGATACTTGATATTTTAGCAGACACCTCTCTGAGATTT
GTTTGGAACATGATCAAGTTTTGCTGTTATCTATATTCTACTCTTCCAAAGCCC

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DS 

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GG
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GCCCGTGCTCATGGTGGTGTTGTCCGTGGTCTCCATGAGAGCGCTAAGCTTATTGAGAAG
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GGTTGCTCATGCCTTGTAGTCAAGGACTACGGTGAGGATACAACTGCCCTCAATATCGTC
AAGAAGCACATTGAATCTAACTAAGTTTAAGAAGCATTCTCCAATGTTTTTCCATCTCAA
TGCTGTTTTATCTTGGTTTTGATACTTGATATTTTAGCAGACACCTCTCTGAGATTTGTT
TGGAACATGATCAAGTTTTGCTGTTATCTATATTCTACTC

QA 3 642 3 642
DS 

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GG
GAAGCCGTCATCGTCTCTGAGAGAACAACAAAGTTTTTTTCGGAAGTTAAAAGCATTTAA
AGACACAACATGTCGGGTGATGAGGCTGCTGCTCCCGTTGTTGTTCCTCCCGTTGCTGAG
CCAGCGGCAATCCCAGAGGACATGGACTTGTTGACTGCATTGGAGTTGACTCTAAGGAAA
GCCCGTGCTCATGGTGGTGTTGTCCGTGGTCTCCATGAGAGCGCTAAGCTTATTGAGAAG
CGTGTTGCTCAGCTCTGTGTCTTGGCTGAAGGCTGCAACCAACCTGACTACGTCAAGCTT
GTTAAGGCTCTT**CACCGATCACAGCATCAACTTGCTTACTGTTCCAAGCGCCAAGACC
CTCGGCGAGTGGGCTTGTCTCTGCAAGATTGACTCTGAGGGTAATGCCAGGAAGGTTGTT
GGTTGCTCATGCCTTGTAGTCAAGGACTACGGTGAGGATACAACTGCCCTCAATATCGTC
AAGAAGCACATTGAATCTAACTAAGTTTAAGAAGCATTCTCCAATGTTTTTCCATCTCAA
TGCTGTTTTATCTTGGTTTTGATACTTGATATTTTAGCAGACACCTCTCTGAGATTTGTT
TGGAACATGATCAAGTTTTGCTGTTATCTAT

QA 3 633 3 633
DS 

RD RS1FR02JQ 618 0 0
TTTTTTTCGGAAGTTAAAAGCATTTAAAGACACAACATGTCGGGTGATGAGGCTGCTGCT
CCCGTTGTTGTTCCTCCCGTTGCTGAGCCAGCGGCAATCCCAGAGGACATGGACTTGTTG
ACTGCATTGGAGTTGACTTTAAGGAAAGCCCGTGCTCATGGTGGTGTTGCCCGTGGTCTC
CATGAGAGCGCTAAGCTTATTGAGAAGCGTGTTGTTCAGCTCTGTGTCTTGGCTGAAGAC
TGCAACCAACCTGACTACGTCAAGCTTGTTAAGGCTTTTTGCACCGATCACAGCATCAAC
TTGCTTACTGTTCCAAGCGCCAAGACCCTCGGCGAGTGGGCTGGTTTCTGCAAGATTGAC
TCTGAGGGTAATGCCAGGAAGGTTGTTGGTTGCTCATGCCTTGTAGTCAAGGACTACGGT
GAGGATACAACTGCCCTCAATATCGTCAAGAAGCACATTGAATCTAACTAAGTTTAAGAA
GCATTTTCCAATGTTTTTCCATCTCAATGCTGTTTTATCTTGGTTTTGATACTTGATATT
TTAGCAGACACCTTTTTGAGATTTGTTTGGAACATGATCAAGTTTTGCTGTTATCTATAT
TCTACTCTTCCAAAGCCC

QA 1 618 1 618
DS 



AS 1 4

CO CL2564Contig1 564 4 8 U
GGGTATTTCATAGGAGTGTAAGACAAATAATAATTCTTTTTTTAAAGTATTTCCTCATTT
TCAGCCATGAGACACAGTGTTATGCTAGTGGTTTCTTGTGTTCTCACATTTCTCATTTTA
AATAATGTTAAAGTAGAGGTGGAAGCCGGTATGAAAAAGCTTTTCTGCAAAACATTACCA
AGCAATTATGAGGGAACATGCGGAAAAAATGGAATTAATGTATGTGTAGAGGGCGTAAAA
AAGATGATTGTAACAAATACTGGAGGAAAACCTTTGCCAAAAGGTTTTGGAGTACAATGT
ACCAAATGTATTGATGATCCTCCCAAGCCAGGTTATATTCGCATGCATCAATGTGAATGT
CGATATGATTGCTAAATTTTAAATAGCTATAGGAATAATCTCTTTACTAATAAAGACATG
AGATCAATGTAATCGAGATTTTTTGGCGTATATCTGGCAGGAAAAACAGCTCATGTCTTA
CTAATAATTTTCCGAGTTAGATTTGTTATGGGTCAAAATAAATATAAAGTTGATCTAATA
ATATCCAAATTCTAGTTACATTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1DT48TF U 1
AF RS1C901JQ C 37
AF RS1C901TF U 37
AF RS1AJ08TF U 459
BS 1 47 RS1DT48TF
BS 48 48 RS1C901TF
BS 49 75 RS1DT48TF
BS 76 76 RS1C901TF
BS 77 227 RS1DT48TF
BS 228 228 RS1C901TF
BS 229 535 RS1DT48TF
BS 536 564 RS1C901TF

RD RS1DT48TF 536 0 0
GGGTATTTCATAGGAGTGTAAGACAAATAATAATTCTTTTTTTAAAGAATTTCCTCATTT
TCAGCCATGAGACACGGTGTTATGCTAGTGGTTTCTTGTGTTCTCACATTTCTCATTTTA
AATAATGTTAAAGTAGAGGTGGAAGCCGGTATGAAAAAGCTTTTCTGCAAAACATTACCA
AGCAATTATGAGGGAACATGCGGAAAAAATGGAATTAATGTATGTGTCGAGGGCGTAAAA
AAGATGATTGTAACAAATACTGGAGGAAAACCTTTGCCAAAAGGTTTTGGAGTACAATGT
ACCAAATGTATTGATGATCCTCCCAAGCCAGGTTATATTCGCATGCATCAATGTGAATGT
CGATATGATTGCTAAATTTTAAATAGCTATAGGAATAATCTCTTTACTAATAAAGACATG
AGATCAATGTAATCGAGATTTTTTGGCGTATATCTGGCAGGAAAAACAGCTCATGTCTTA
CTAATAATTTTCCGAGTTAGATTTGTTATGGGTCAAAATAAATATAAAGTTGATC
C

QA 1 535 1 535
DS 

RD RS1C901JQ 528 0 0
TTTTTTTAAAGTATTTCCTCATTTTCAGCCATGAGACACAGTGTTATGCTAGTGGTTTCT
TGTGTTCTCACATTTCTCATTTTAAATAATGTTAAAGTAGAGGTGGAAGCCGGTATGAAA
AAGCTTTTTTGCAAAACATTACCAAGCAATTATGAGGGAACATGCGGAAAAAATGGAATT
AATGTATGTGTAGAGGGCGTAAAAAAGATGATTGTAACAAATACTGGAGGAAAACCTTTG
CCAAAAGGTTTTGGAGTACAATGTACCAAATGTATTGATGATCCTCCCAAGCCAGGTTAT
ATTCGCATGCATCAATGTGAATGTCGATATGATTGCTAAATTTTAAATAGCTATAGGAAT
AATCTCTTTACTAATAAAGACATGAGATCAATGTAATCGAGATTTTTTGGCGTATATCTG
GCAGGAAAAACAGCTCATGTCTTACTAATAATTTTCCGAGTTAGATTTGTTATGGGTCAA
AATAAATATAAAGTTGATCTAATAATATCCAAATTCTAGTTACATTCT

QA 1 528 1 528
DS 

RD RS1C901TF 528 0 0
TTTTTTTAAAGTATTTCCTCATTTTCAGCCATGAGACACAGTGTTATGCTAGTGGTTTCT
TGTGTTCTCACATTTCTCATTTTAAATAATGTTAAAGTAGAGGTGGAAGCCGGTATGAAA
AAGCTTTTCTGCAAAACATTACCAAGCAATTATGAGGGAACATGCGGAAAAAATGGAATT
AATGTATGTGTAGAGGGCGTAAAAAAGATGATTGTAACAAATACTGGAGGAAAACCTTTG
CCAAAAGGTTTTGGAGTACAATGTACCAAATGTATTGATGATCCTCCCAAGCCAGGTTAT
ATTCGCATGCATCAATGTGAATGTCGATATGATTGCTAAATTTTAAATAGCTATAGGAAT
AATCTCTTTACTAATAAAGACATGAGATCAATGTAATCGAGATTTTTTGGCGTATATCTG
GCAGGAAAAACAGCTCATGTCTTACTAATAATTTTCCGAGTTAGATTTGTTATGGGTCAA
AATAAATATAAAGTTGATCTAATAATATCCAAATTCTAGTTACATTCT

QA 1 528 1 528
DS 

RD RS1AJ08TF 106 0 0
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TAAATATAAAGTTGATCTAATAATATCCAAATTCTAGTTACATTCT

QA 1 106 1 106
DS 



AS 1 4

CO CL2565Contig1 727 4 10 U
GGATCACAGCTCTTTACAATCACCTTAAAAGCAAGTTAAAGCTCTCCTTTTCTCTGTTTA
TCACTTCTCGTTAACTGTTCCGTTAATCAAGAGTAACTAACAATGGCCGAAGAGTACAAG
AACGCTACTGAGGAGTTCAAAAACGTCCCCGAACACGAGACCCCAAAGATCACCACCACG
GAAGAACCGTCGGCTACGACGGGAGAGGTTAAGGACCGTGGATTGTTCGATTTCTTGGGG
AAAAAGGAGGAAGTGAAACCTCAAGAAACGACCACACCGCTAGCTTCGGAGGTCGAGCAT
AAAGCCCAGATCACGGGAGAGCAGGCGTTTGTGGCGAAGCACGAAGAAGAGAAGGAGCAT
AAGCCTACTCTCCTCGAGCAGCTTCACCAGAAGCATGAGGAGGAGGAAGAGAACAAGCCA
AGTCTCTTCCAGAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAG
GGTGAAGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAGAAGAAGAAGATCGTTGAAGGAGACGAGAAG
AAGGGAGTGATGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTCACAGTGAAAAACCTGATGAT
TCTCAAGTCGTCAACACGGAGGCTGCAGTACCAGTGACGGAGGAAAAGGCGGAGCATCCA
GAGGAGAAGAAAGGGATTCTTGAAAAGATCAAAGAGAAGCTTCCAGGTTATCACGCTAAG
AGCACTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D743JQ C 467
AF RS1CV95TF U 1
AF RS1D743TF U 1
AF RS1D523TF U 1
BS 1 19 RS1CV95TF
BS 20 20 RS1D523TF
BS 21 325 RS1CV95TF
BS 326 326 RS1D523TF
BS 327 479 RS1CV95TF
BS 480 480 RS1D743TF
BS 481 606 RS1CV95TF
BS 607 607 RS1D523TF
BS 608 644 RS1CV95TF
BS 645 727 RS1D523TF

RD RS1D743JQ 125 0 0
CAAGCGAGGAAGAGGGTGAAGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAGAAGAAGAAAATCGTTG
AAGGAGACGAGAAGAAGGGAGTGATGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTCCCAGTG
AAAAA

QA 1 125 1 125
DS 

RD RS1CV95TF 644 0 0
GGATCACAGCTCTTTACAACCACCTTAAAAGCAAGTTAAAGCTCTCCTTTTCTCTGTTTA
TCACTTCTCGTTAACTGTTCCGTTAATCAAGAGTAACTAACAATGGCCGAAGAGTACAAG
AACGCTACTGAGGAGTTCAAAAACGTCCCCGAACACGAGACCCCAAAGATCACCACCACG
GAAGAACCGTCGGCTACGACGGGAGAGGTTAAGGACCGTGGATTGTTCGATTTCTTGGGG
AAAAAGGAGGAAGTGAAACCTCAAGAAACGACCACACCGCTAGCTTCGGAGGTCGAGCAT
AAAGCCCAGATCACGGGAGAGCAGGTGTTTGTGGCGAAGCACGAAGAAGAGAAGGAGCAT
AAGCCTACTCTCCTCGAGCAGCTTCACCAGAAGCATGAGGAGGAGGAAGAGAACAAGCCA
AGTCTCTTCCAGAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAA
GGTGAAGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAGAAGAAGAAGATCGTTGAAGGAGACGAGAAG
AAGGGAGTGATGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTCACAGTGAAAAACCTGATGAT
TCTCAATTCGTCAACACGGAGGCTGCAGTACCAGTGACGGAGGA

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1D743TF 633 0 0
GGATCACAGCTCTTTACAATCACCTTAAAAGCAAGTTAAAGCTCTCCTTTTCTCTGTTTA
TCACTTCTCGTTAACTGTTCCGTTAATCAAGAGTAACTAACAATGGCCGAAGAGTACAAG
AACGCTACTGAGGAGTTCAAAAACGTCCCCGAACACGAGACCCCAAAGATCACCACCACG
GAAGAACCGTCGGCTACGACGGGAGAGGTTAAGGACCGTGGATTGTTCGATTTCTTGGGG
AAAAAGGAGGAAGTGAAACCTCAAGAAACGACCACACCGCTAGCTTCGGAGGTCGAGCAT
AAAGCCCAGATCACGGGAGAGCAGGCGTTTGTGGCGAAGCACGAAGAAGAGAAGGAGCAT
AAGCCTACTCTCCTCGAGCAGCTTCACCAGAAGCATGAGGAGGAGGAAGAGAACAAGCCA
GGTCTCTTCCAGAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAG
GGTGAAGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAGAAGAAGAAGATCGTTGAAGGAGACGAGAAG
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TCTCAAGTCGTCAACACG
AGCTGCAGTACCAGT

QA 1 618 1 618
DS 

RD RS1D523TF 727 0 0
GGATCACAGCTCTTTACAATCACCTTAAAAGCAAGTTAAAGCTCTCCTTTTCTCTGTTTA
TCACTTCTCGTTAACTGTTCCGTTAATCAAGAGTAACTAACAATGGCCGAAGAGTACAAG
AACGCTACTGAGGAGTTCAAAAACGTCCCCGAACACGAGACCCCAAAGATCACCACCACG
GAAGAACCGTCGGCTACGACGGGAGAGGTTAAGGACCGTGGATTGTTCGATTTCTTGGGG
AAAAAGGAGGAAGTGAAACCTCAAGAAACGACCACACCGCTAGCTTCGGAGGTCGAGCAT
AAAGCCCAGATCACGGGAGAGCAGGCGTTTGTGGCGAAGCACGAAGAAGAGAAGGAGCAT
AAGCCTACTCTCCTCGAGCAGCTTCACCAGAAGCATGAGGAGGAGGAAGAGAACAAGCCA
AGTCTCTTCCAGAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAA
GGTGAAGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAGAAGAAGAAGATCGTTGAAGGAGACGAGAAG
AAGGGAGTGATGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTCACAGTGAAAAACCTGATGAT
TCTCAAGTCGTCAACACGGAGGCTGCAGTACCAGTGACGGAGGAAAAGGCGGAGCATCCA
GAGGAGAAGAAAGGGATTCTTGAAAAGATCAAAGAGAAGCTTCCAGGTTATCACGCTAAG
AGCACTG

QA 1 727 1 727
DS 



AS 2 4

CO CL2566Contig1 824 2 4 U
GGACACTTGACATCATTCACTACTAATCAACAAAAGAAAAACAAGATGTGGGATGAAACT
GTAGCTGGACCTAAGCCGGAGCATGGCCTTGGCCGCCTCCGCAACAAGATTAACGCCCAA
CCCATTGACATCAAAGGTATACAAATATATTCATGCATGCATATGTATGCTTTTGGTGAT
TATATAACGAGTCAAGCTCTGAACCTTTGTATGCAGTTTTTTGCATATAATAATTAAAAG
TTAATTATGTGATCATGAAAAGGTGCAGGAGAAGGGAGCAGCAGCAAGGCTATGCCTGCG
GTGGCCGGGAGTCCTGGAACTCCAACGACGCCAGGATCGGCACGTAAAGAGAACGTGTGG
AGGAGTGTGTTTCATCCAGGAAGTAACATCGCCACCAGAGGAATGGGCACCAACCTTTTC
GACAAGCCCTCTCACCCAAACGCTCCCACCGTCTACGACTGGTACAATAACTTTGTTATA
AATATCTAGAGTTTTCTTGTCGTTGCCCGGACAGTTCAGATCAGATCTAAGATGTCTTAA
CCGTTTTGCTTCGCAGGTTGTACAGCGACGATACTAGGAGCCAGCACCGTTGAGCCGAGA
CCGAGAGGGTGAAGTGCATGCCGGTGATGTAGTATATCCTGTTTCCATTAGCCACGTGTT
TAATTTCAGTTTATGGCTGTATTCGCAACCTTTTTTCTTTGTTTGTTGTTGTTAGTGACC
GTTTGATTTCCACCATCTGGGTTGGTTTTTAACGGTGGTAATGCGTCCTCTTGTCTCTTT
TAATGTTTCTACTGTTTCATAATAGATATATTTAACTTTTAGCC


BQ
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BQ
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A

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AS 1 4

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BQ
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BQ
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AF RS1BA73TF U 1
AF RS1BA73JQ C 532
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AATCTATTTCTTTAGTTAAACTTTCAATTGTCGTCGCTTGATTCTTGACGGAAATAACGT
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QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 4

CO CL2569Contig1 1619 4 16 U
GGGGTGGCGGCTCAATTCTATCGTCAAGCTCTCAGGTGTCGTTACTAAATTTGGCTGGTA
ATTTTATCATGGGGGATTCAATTAGCAGTTTGCCAGATGAGATTCTTGGCAAAATCCTGT
CTTTAGTTCCGACAAAAGTGGCTGCTTCCACATCGGTTCTGTCCAAGAGGTGGAGGAATC
TGCTGTCTCTTGTAGACAGCCTTAGTTTCGATGAGTCCATGGTTGTCTATCCCAACGAAG
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GCTATCTCCAAATGATGAGTGCTTGTCCTGTGCTGGAAGAGTTAACCATACGCGACTGCG
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GTCTTGTGATTGTTACGCCTCTTCCTGATCTTACAGACTACTATGCCGCGGCAGCTTATT
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CTAGTTTTGTCTTTTCAGATTATGAGGTTGATGATTTGGATTCTCTTGTCGAAGCAAGGC
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CATGCGCTTGCAACCCTCAGAATCCAAATAAAAGAAAGAATAAGAAGATGAAAAAAAATA
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CTAATGTAATGACTCTTCCCAAACTTTCATCAAAGTGCACCATTCAGTTCATCTAAGCTT
GTTATGTAATAACATATTACTATTATTATCTCTTTCATATTGGTTACATTTTTGAAAAT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RS1GH85TF U 2
AF RS1A951TF U 1
AF RS1A951JQ C 749
AF RS1GH85JQ C 857
BS 1 228 RS1A951TF
BS 229 229 RS1GH85TF
BS 230 454 RS1A951TF
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BS 456 465 RS1A951TF
BS 466 466 RS1GH85TF
BS 467 866 RS1A951TF
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BS 878 1072 RS1A951JQ
BS 1073 1073 RS1GH85JQ
BS 1074 1181 RS1A951JQ
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BS 1183 1438 RS1A951JQ
BS 1439 1439 RS1GH85JQ
BS 1440 1619 RS1A951JQ

RD RS1GH85TF 554 0 0
GGGTGGCGGCTCAATTCTATCGTCAAGCTCTCAGGTGTCGTTACTAAATTTGGCTGGTAA
TTTTATCATGGGGGATTCAATTAGCAGTTTGCCAGATGAGATTCTTGGCAAAATCCTGTC
TTTAGTTCCGACAAAAGTGGCTGCTTCCACATCGGTTCTGTCCAAGAGGTGGAGGAATCT
GCTGTCTCTTGTAGACAGCCTTAGTTTCGATGAGTCCATGGTTGTCTATCCCAACGAAGA
AGAAGCAAAAAACGGTTCACAACGGTTCTCTGATTTCGTAGAAAAGACACTTGCTCTGCT
ACACAACTCTCCCGCCATCAAGACATTCTATCTGTGTCGTATGGTTATGACTGAGAGTTA
CAAAGATGAATCTGCCCGCGTCAACCGTTGGATTTGGACTGCAATGGAAAAAGGTCTATT
GGAACTACACTTGTACGCCCCAAACCCTGGTACCGATGTTAGTAGAGAACCTAGGTTACT
AAGGAGTACCACACTGGTTAAGCTCACAATCTGCGGTCATTATGCTATTCGTCGCTTTCA
GCGTGTGTTTTTCC

QA 1 554 1 554
DS 

RD RS1A951TF 877 0 0
GGGGTGGCGGCTCAATTCTATCGTCAAGCTCTCAGGTGTCGTTACTAAATTTGGCTGGTA
ATTTTATCATGGGGGATTCAATTAGCAGTTTGCCAGATGAGATTCTTGGCAAAATCCTGT
CTTTAGTTCCGACAAAAGTGGCTGCTTCCACATCGGTTCTGTCCAAGAGGTGGAGGAATC
TGCTGTCTCTTGTAGACAGCCTTAGTTTCGATGAGTCCATGGTTGTCTCTCCCAACGAAG
AAGAAGCAAAAAACGGTTCACAACGGTTCTCTGATTTCGTAGAAAAGACACTTGCTCTGC
TACACAACTCTCCCGCCATCAAGACATTCTATCTGTGTCGTATGGTTATGACTGAGAGTT
ACAAAGATGAATCTGCCCGCGTCAACCGTTGGATTTGGACTGCAATGGAAAAAGGTCTAT
TGGAACTACACTTGTACGCCCCAAACCCTGGTACTGATGTTAGTATAGAACCTAGGTTAC
TAAGGAGTACCACACTGGTTAAGCTCACAATCTGCGGTCATTATGCTATTCGTCGCTTTC
AGCGTGTGTTTTTCCCAGCCCTCAGATCACTTTCTCTGATCGCTGCGTTCTCTCATTTTT
GCTATCTCCAAATGATGAGTGCTTGTCCTGTGCTGGAAGAGTTAACCATACGCGACTGCG
AATTTCCAGATATGAGGAAAACCACTGGTGGTGCGGATGTGATACATGCATCCATCAAGC
GTCTTGTGATTGTTACGCCTCTTCCTGATCTTACAGACTACTATGCCGCGGCAGCTTATT
TCGAATTTACTCGCTCAATTGTTCATATCCAAGCACCAAGTCTAGTCTACCTTGACTATT
CTAGTTTTGTCTTTTCAGATTATGAG*TTGATGATTT

QA 1 877 1 877
DS 

RD RS1A951JQ 871 0 0
ATC
TACAGACTACTATGCCGCGGCAGCTTATTTCGAATTTACTCGCTCAATTGTTCATATCCA
AGCACCAAGTCTAGTCTACTTTGACTATTCTAGTTTTGTCTTTTCAGATTATGAGGTTGA
TGATTTGGATTCTCTTGTCGAAGCAAGGCTGGATCTCAAGTTATGGATGTCAACTAGTCA
TTTTGACTACGATGATGATTATTTTTACGATCATCATGGTTATCTTTGTCCTCCTGATGA
TCCAAGCCCGCATATATTCGGTGATGTTACATGTCTAGTTGCGGCTATAAGAAACATTAC
GACCCTTCACTTGTCTCCTGATTCCCTTGAGGTGTTTCATTTCTGTTGTGAACCCATGCC
TATGTTCAACAACCTTGTTAATTTATCTATTGAGAGTAACAAGCAAAAAGGTTGGCAAGT
AATGCCACTTTTACTCAAATCTTGTCCAAATCTACAAACTTTAGTCTTCAAGGGTCTTGT
TCACAGAGTAACAAATAGATGTGGAGATTCATGCGCTTGCAACCCTCAGAATCCAAATAA
AAGAAAGAATAAGAAGATGAAAAAAAATAAAATAGTAAAAGTAAATTGTCTTCAGAAATG
TCGAGTGAAGGTGCTAGAGATTTCAGACTATGGAGGTTGTTTTCAAGAGCTGGAACAGAT
GAGACATTTCTTGGGAAATTTGGAATGTCTTGAAACTGTTAAAGTTAGCCTTCACCCGGA
CAACAAAGGTAACGCTGAGTTCGTGCGAGCTAATGTAATGACTCTTCCCAAACTTTCATC
AAAGTGCACCATTCAGTTCATCTAAGCTTGTTATGTAATAACATATTACTATTATTATCT
CTTTCATATTGGTTACATTTTTGAAAAT

QA 4 871 4 871
DS 

RD RS1GH85JQ 758 0 0
AGATTATGAGGTTGATGATTTGGATTCTCTTGTCGAAGCAAGGCTGGATCTCAAGTTATG
GATGTCAACTAGTCATTTTGACTACGATGATGATTATTTTTACGATCATCATGGTTATCT
TTGTCCTCCTGATGATCCAAGCCCGCATATATTCGGTGATGTTACATGTCTAGTTGCGGC
TATAAGAAACATTACGACCCTTCACTTGTCTCCTGACTCCCTTGAGGTGTTTCATTTCTG
TTGTGAACCCATGCCTATGTTCAACAACCTTGTTAATTTATCTATTGAGAGTAACAAGCA
AAAAGGTTGGCAAGTAATGCCACTTCTACTCAAATCTTGTCCAAATCTACAAACTTTAGT
CTTCAAGGGTCTTGTTCACAGAGTAACAAATAGATGTGGAGATTCATGCGCTTGCAACCC
TCAGAATCCAAATAAAAGAAAGAATAAGAAGATGAAAAAAAATAAAATAGTAAAAGTAAA
TTGTCTTCAGAAATGTCGAGTGAAGGTGCTAGAGATTTCAGACTATGGAGGTTGTTTTCA
AGAGCTGGAACAGATGAGACATTTCTTGGGAAATTTGGAATGCCTTGAAACTGTTAAAGT
TAGCCTTCACCCGGACAACAAAGGTAACGCTGAGTTCGTGCGAGCTAATGTAATGACTCT
TCCCAAACTTTCATCAAAGTGCACCATTCAGTTCATCTAAGCTTGTTATGTAATAACATA
TTACTATTATTATCTCTTTCATATTGGTTACATTTTTG

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 4

CO CL2570Contig1 1049 4 4 U
GGAGCCCGAGGTCGATGAACGTTCGCGAGCAGGATAGGTTCCTCCCGATCGCTAACATAA
GCCGAATCATGAAGAGGGGTTTGCCTGCTAACGGGAAGATCGCTAAGGATGCTAAAGAGA
CGATGCAGGAATGCGTCTCTGAGTTCATCAGCTTCGTCACCAGCGAAGCGAGTGATAAGT
GTCAGAGAGAGAAGAGGAAGACTATTAATGGAGATGATTTGCTTTGGGCTATGACCACTT
TGGGATTCGAAGAGTACGTTGAGCCCCTCAAGTTTTACCTGACGAGATACAGGGAGATGG
AGGGTGACAACAAGGGATCAGGAAAAGGCGGGGAATCGAGTGCTAAGAGAGATGGTCAAC
CAAGCCAATTTCTGCAGCATGGTCAGCAGCAAGGCTCTTTCTCACAGGGTCATTATGGAA
ACTCTCAAGGCTCTTCGCATATGATGGTTCAAATGCCGAACGCAGAGTAGTAGTAGAAGA
ATATTCATCACAATCTCTGGAGATTCATCTATTCATGTTCTTGTGTCTGAGATCATATAT
TTGAATTGTGGTATCTCTGTACATGATTGTGTTGTAGTAGTTTGCTCAAAAGATGAGAAT
TGAGAAGCAACTTTGTTTCTACATTTGATTGTTTTAGTTTCTTTAACTTTCGGTCTTAAG
AAGAAAGCCTTATTGATTTATTTGCACTTGCTTTGGCTTTGTTTCATTAAAAAAAAACAA
TTAGTTTTATATTTGTTCTACACTTGAATTCAGTGGTGTGGTGTCTACGGGGGGAGTGAA
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CCTCGATCTCTTGAGATAGGTGGGAAGAAAAGGAATCACTTGTTCATTCAAAATCTCAAA
ATCACTGGGGGGATCTGGGGTCATTTCGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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G
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DS 



AS 1 3

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AI77TF U 1
AF RS1AI77JQ C 174
AF RS1AK16TF U 718
BS 1 731 RS1AI77TF
BS 732 732 RS1AK16TF
BS 733 809 RS1AI77TF
BS 810 810 RS1AK16TF
BS 811 834 RS1AI77TF
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RD RS1AI77TF 840 0 0
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TCCTCCTAGCTGATTTGAAAGCTGGGCGCTTGGATCCTCTGCAATGAGATATTGTGAATT
CCTAAGCGTTGTACACCGTCACTTATGGTCCGACAGATAACAACCATGTTTTTAAACCTC
TCTGCATTGCCACAAAATAAAAATCTATCTAAGGCTTTATCTTCGTAATAGGTTGCTGCA
GGTCGTTCCAGTGTTCAAGGTCCTGAAAGTTTCTGTCTTATGGCTGTGGAACCATTTCGT
AATGTGGCTCTTGAAGAAGATGGGAGGCTCTTTGCAGAACCCCTCATCATGTCCCAGTCC
AAGGCTTTGATGATCTCTCACTTTGGTTTGTTTCTTTCTCTCCTTTTATTGATTTATTTT
CTACTCATCAAAACCTTCAAAAATGGATCTGTTGTCAAATGGAACCACCGTCTCCAGATG
CTTGATCTACAACTTATCTCTCTATCTCTCTTTATAGTTAAACTCATTTTTAGGTTGATA
TTAATGCGGATTTGCTTTCAACTCCTTTAAACTGGTAAAGGAGAAATATTAAAACGTGTT
CTCATTAAAGTATATTTCCTTCTCATTTTCGCCATGTGCTAGAACCTCCTTTTGATCAAG
AATAATTATTTGTTTGGTCTTCTAATTTTAAAGTGGATGGTTGGGGAAGAGGAGAACGAG
GAAGAGTTTAG*TGACAGTGACAAGATCAGCAAAATATTCCGCAGAAAGTTAATCTTCTC
CATGACAAAGATATCCTTGAGGTTGTAAG*CCTTAAACTTTAATTATCTTGAGA
CTCTAA

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DS 

RD RS1AI77JQ 762 0 0
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CCAGTCCAAGGCTTTGATGATCTCTCACTTTGGTTTGTTTCTTTCTCTCCTTTTATTGAT
TTATTTTCTACTCATCAAAACCTTCAAAAATGGATCTGTTGTCAAATGGAACCACCGTCT
CCAGATGCTTGATCTACAACTTATCTCTCTATCTCTCTTTATAGTTAAACTCATTTTTAG
GTTGATATTAATGCGGATTTGCTTTCAACTCCTTTAAACTGGTAAAGGAGAAATATTAAA
ACGTGTTCTCATTAAAGTATATTTCCTTCTCATTTTCGCCATGTGCTAGAACCTCCTTTT
GATCAAGAATAATTATTTGTTTGGTCTTCTAATTTTAAGGTGGATGGTTGGGGAAGAGGA
GAACGAGGAAGAGTTTAGGTGACAGTGACAAGATCAGCAAAATATTCCGCAGAAAGTTAA
TCTTCTCCATGACAAAGATATCCTTGAGGTTGTAAGGCCTTAAACTTTAATTATCTTGAG
AACTCTAAAAGAGGTTCTCATTTATTATTATTTTTTTAAACCGGCCAGAACATCTCATTT
ATGTAAAGAAGCATTAAAATTTAAAGATCATTACCCTTTTAC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1AK16TF 611 0 0
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CTCCATGACAAAGATATCCTTGAGGTTGTAAAGCCTTAAACTTTAATTATCTTGAGAACT
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AAAGAAGCATTAAAATTTAAAGATCATTAACCTTTTACAAATACGTTGGGTATTGGAGAA
TATTGACCATAGATAGATATTGGAATTTATAGGGCGTGATGGCACAAGCAGTAGCTCTAT
TGTCCTCATCTTGCCGCATGATAAGCACAATTGTCCTCATCTTTTCATTGAGAACTTATT
AAGGCACAAATTACTATCAAGCAAATCTTATATTAATATGACATATCCAAATATACAGTC
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ATGAGATCTTC

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DS 



AS 1 3

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TCGATTATTGTTGCAGCATCACACCTGTTGGTCTTAGTTGGACCAAAGTTGTTCACGATT
GGGTTTGAGCCCATAGAGACTAACAGCCCCTGCTGTCATATCATCATCTGTATGGTACTT
ACCACTCTGGAGTGCAAAATTAGCAAGTGGTGGGTGCTGGTACTCATTCACATAGAGAAC
AACGTTGGCAAGCCCATTAAATTAGTGGGAATGACTTCAGAAGAGGCTTCTTCTTGATCT
TAGCTCGGTTTCAAAGTCATAAGTACATCTTTTTGAGATAAATAGCTTTCTCAGAATTGT
TAATAC


BQ
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20 20 20 20 20 10 

AF RS1AJ29JQ U 39
AF RS1BC50JQ U 1
AF RS1BC50TF C 1
BS 1 606 RS1BC50JQ

RD RS1AJ29JQ 271 0 0
CCC
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CCCATCTGTTGGTTCTTCCTTTGTGTTGACCGGGGGATCAGTTTGCGGAGGAATTGGTTG
GGGCACTTGTGAACAGCCTTCGATTATT

QA 4 271 4 271
DS 

RD RS1BC50JQ 606 0 0
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TTTGTGTTGACCGGTGGATCAGTTTGCGGAGGAATTGGTTGGGGCACTTGTGAACAGCCT
TCGATTATTGTTGCAGCATCACACCTGTTGGTCTTAGTTGGACCAAAGTTGTTCACGATT
GGGTTTGAGCCCATAGAGACTAACAGCCCCTGCTGTCATATCATCATCTGTATGGTACTT
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TAGCTCGGTTTCAAAGTCATAAGTACATCTTTTTGAGATAAATAGCTTTCTCAGAATTGT
TAATAC

QA 1 606 1 606
DS 

RD RS1BC50TF 606 0 0
ACGAAACCAAAATTCGGGTTAATAAAGAAGTTTCAGAACCACTACATATATAATAAAAAT
TATCAGGAGTACCAATTATCCTTAAACTAATGAAAACCAAAACTGAATAATTAAAACGTT
GCAAGACAACAAATTACTGAGTGAAGCGCAAAAACTTCAACCGGAAATGGAATTGGAAAA
TTTTTCGCCAGCTTCATTGTCTTAAGATTTCGACCCTTGTCACCATCTGTTGTTTCTTCC
TTTGTGTTGACCGGTGGATCAGTTTGCGGAGGAATTGGTTGGGGCACTTGTGAACAGCCT
TCGATTATTGTTGCAGCATCACACCTGTTGGTCTTAGTTGGACCAAAGTTGTTCACGATT
GGGTTTGAGCCCATAGAGACTAACAGCCCCTGCTGTCATATCATCATCTGTATGGTACTT
ACCACTCTGGAGTGCAAAATTAGCAAGTGGTGGGTGCTGGTACTCATTCACATAGAGAAC
AACGTTGGCAAGCCCATTAAATTAGTGGGAATGACTTCAGAAGAGGCTTCTTCTTGATCT
TAGCTCGGTTTCAAAGTCATAAGTACATCTTTTTGAGATAAATAGCTTTCTCAGAATTGT
TAATA
C

QA 1 605 1 605
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GCTCCGACGGCGAATCCGTCTTCTCCCGCCGATGGTCAGCTTACAATAACAGAGTACATC
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CGTATTCAGAGGAAGTAGAGGAGATTTAGAGAGCGGATTCTCAGGATTCATACCCGAGAG
ACGAGCTATGCGTGTTCATGGAGCTCGACCTGTGAACTCTAACTCCCTCGCTTTTCTTGT
CACTGTTCTTTTGCTGTTTATGATTCTCAACTCGCATCAGATGCCTCCTAATTTCCTGCT
CTGGCTTGTGCTTGGGGTGTTTTTGATGGCGACGACTCTTAGGATGTATGCGACTTGCCA
GCAACTTCAAGCTCAGGCTCAGGCTCATGTTGCCGCAGCTAGCGGTCTCTTCAGCCACAC
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AAGAGCACTTGATTCTGATAATGTCCCCACAAATTCTATGAGCGAGGAAGAGATAAATGC
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GGCATCAACCTCATCCTCAGCGGAGAAGAAGCAGGATTCTGTCGGTGCGAGTAAAAAAGG
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TCGCACCCTACCTTGCCTGCATCAGTTTCATGCAGTCTGTATCGATCCATGGCTTAGACA
GCAAGGAACATGTCCTGTCTGTAAATTCAAGGCGCACTCAGGATGGCAAGAACAAGACGA
CGGGACAGATGATGATGATGATGATGATGATGATGCCTCCGTCATGGTCTGAGAGTTCGG
TTTTTGGACACTTGTTATGTTATTAATATGTGTATTGAAAAATGGAGACCCCAAAACAAA
TCATGTAATGGTTGATGAGTTTTTAACTGTTTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E259TF U 1
AF RS1E259JQ C 407
BS 1 545 RS1E259TF
BS 546 1113 RS1E259JQ

RD RS1E259TF 545 0 0
GGAAAACTATACCGTCGACAAAAATTAAATAGCGAGCGATAACTCGTCCCGAGTCCTCTC
GCTCCGACGGCGAATCCGTCTTCTCCCGCCGATGGTCAGCTTACAATAACAGAGTACATC
CGTGATTCTGTAGATTCTCCAAATCCAGGAGGCAAAGAAGAAGAAGAAGAAGATGAGTTT
CGTATTCAGAGGAAGTAGAGGAGATTTAGAGAGCGGATTCTCAGGATTCATACCCGAGAG
ACGAGCTATGCGTGTTCATGGAGCTCGACCTGTGAACTCTAACTCCCTCGCTTTTCTTGT
CACTGTTCTTTTGCTGTTTATGATTCTCAACTCGCATCAGATGCCTCCTAATTTCCTGCT
CTGGCTTGTGCTTGGGGTGTTTTTGATGGCGACGACTCTTAGGATGTATGCGACTTGCCA
GCAACTTCAAGCTCAGGCTCAGGCTCATGTTGCCGCAGCTAGCGGTCTCTTCAGCCACAC
TGAGCTCAGGTTGCATGTGCCTCCCTCCATTTCTCTTGCTACCAGAGGGCGTCTTCAAGG
ACTTA

QA 1 545 1 545
DS 

RD RS1E259JQ 707 0 0
TATGCGACTTGCCAGCAACTTCAAGCTCAGGCTCAGGCTCATGTTGCCGCAGCTAGCGGT
CTCTTCAGCCACACTGAGCTCAGGTTGCATGTGCCTCCCTCCATTTCTCTTGCTACCAGA
GGGCGTCTTCAAGGACTTAGGCTTCAGCTGGCTCTTCTTGATCGGGAGTTTGATGACTTA
GATTATGAAACTCTAAGAGCACTTGATTCTGATAATGTCCCCACAAATTCTATGAGCGAG
GAAGAGATAAATGCACTTCCAGTACACAAGTACAAAGTGTTGGATCCTGAAAATGGTTCC
TCTTTGACAAAGCAGGCATCAACCTCATCCTCAGCGGAGAAGAAGCAGGATTCTGTCGGT
GCGAGTAAAAAAGGAACGGAAGATGAGCTCACTTGTAGTGTTTGCCTCGAACAAGTTACC
GTTGGGGAGGTTGTTCGCACCCTACCTTGCCTGCATCAGTTTCATGCAGTCTGTATCGAT
CCATGGCTTAGACAGCAAGGAACATGTCCTGTCTGTAAATTCAAGGCGCACTCAGGATGG
CAAGAACAAGACGACGGGACAGATGATGATGATGATGATGATGATGATGCCTCCGTCATG
GTCTGAGAGTTCGGTTTTTGGACACTTGTTATGTTATTAATATGTGTATTGAAAAATGGA
GACCCCAAAACAAATCATGTAATGGTTGATGAGTTTTTAACTGTTTG

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 4

CO CL2575Contig1 1001 4 11 U
GGATCACATCACCCATTCTCATAATAACTTCTCATCTTCTCTCAAAGCATTACATTTACG
GTTTGAAATGACGAGTCCAGTGGTCGATCAAGAGAATATTCCTCCTCCTGTGGACGGAAT
CAACACGACGGTTACGACGGAGCCTGCTGTGAAGAAAGGCAAGACGACGAAGAAAGCTAA
GGAAGTGAAGGGGAAGAAGAAGCCTGCTACTGCTGCGGCCGCGAAGAAGAAGTCTGTTTC
AACTCATCCTACTTACGAGATGATCAAGGATGCGATTGTATCGTTGAAGGAGAGGACTGG
ATCTAGCCAATACGCGATTCAGAAGTTCATCGAGGAGAAGCACAAGGTGCTCTCGCCTTC
GTTCAGGAAGCTCCTGCTTCTCAACCTCAAGAGACTCGTGGCCTCCGAGAAGCTCGTGAA
GGTGAAAGCCTCGTTTAAGATTCCGTCTGCTGCTGCTAAGCCGTCGTCTCCGAAGGCGGT
TACGGAGAAGAAGAAACCTGCAACCACCGCAGCGGCGGTTAAACCCAAGGCGAAGGGGAA
GAAGGTTACCACCGCAGCAGCTTCGAAATCGAAGGTAGCGAAGAAATCC*GCGGCGGTTA
AACCCAAGCCGAAGCCGAAGGCGACTGTTGCCCCCAAGAGGAAAGCTGTTGCTGCTGCTG
CGAAGCCCAAGGCTAAGGCGGCTAAGACATCGACGGTGACATCTCCGAGTAAAAAGGCGG
CTGCAGCTAAGAAGAAGGCTACGAAGGTGGTGGCGACGAAGAAGAAGACTCCAGTGAAGA
AGGTTGTGAAGCCAAAGACGGTGAAGTCTCCAGCGAAGAGGGCTTCGAAGAGGGCGGTGA
AGTGAAAACTAGGGTTTTAGGAATACATGCTTGTAGCTTTCTCTGTCGTGTAGGTGGTAG
TGTTGTATAATCCGATCTTTCCTGTTGTTTGCTATGATGTTCTTGTAATCCATGGTTTAC
TTGAGAACTATCCTTTGAATCATATATAATAGCTTAATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1E059TF U 1
AF RS1BC47TF U 254
AF RS1BC47JQ C 470
AF RS1E059JQ C 361
BS 1 315 RS1E059TF
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BS 591 616 RS1E059TF
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BS 703 703 RS1BC47JQ
BS 704 983 RS1BC47TF
BS 984 1001 RS1E059JQ

RD RS1E059TF 616 0 0
GGATCACATCACCCATTCTCATAATAACTTCTCATCTTCTCTCAAAGCATTACATTTACG
GTTTGAAATGACGAGTCCAGTGGTCGATCAAGAGAATATTCCTCCTCCTGTGGACGGAAT
CAACACGACGGTTACGACGGAGCCTGCTGTGAAGAAAGGCAAGACGACGAAGAAAGCTAA
GGAAGTGAAGGGGAAGAAGAAGCCTGCTACTGCTGCGGCCGCGAAGAAGAAGTCTGTTTC
AACTCATCCTACTTACGAGATGATCAAGGATGCGATTGTATCGTTGAAGGAGAGGACTGG
ATCTAGCCAATACGCTATTCAGAAGTTCATCGAGGAGAAGCACAAGGTGCTCTCGCCTTC
GTTCAGGAAGCTCCTGCTTCTCAACCTCAAGAGACTCGTGGCCTCCGAGAAGCTCGTGAA
GGTGAAAGCCTCGTTTAAGATTCCGTCTGCTGCTGCTAAGCCGTCGTCTCCGAAGGCGGT
TACGGAGAAGAAGAAACCTGCAACCACCGCAGCGGCGGTTAAACCCAAGGCGAAGGGGAA
GAAGGTTACCACCGCAGCAGCTTCGAAATCGAAGGTATCGAAGAAATCCCGCGGCGGTTA
AACCCAAGCCGAAGCC

QA 1 616 1 616
DS 

RD RS1BC47TF 732 0 0
GAA
GAGATGATCAAGGATGCGATTGTATCGTTGAAGGAGAGGACTGGATCTAGCCAATACGCG
ATTCAGAAGTTCATCGAGGAGAAGCACAAGGTGCTCTCGCCTTCGTTCAGGAAGCTCCTG
CTTCTCAACCTCAAGAGACTCGTGGCCTCCGAGAAGCTCGTGAAGGTGAAAGCCTCGTTT
AAGATTCCGTCTGCTGCTGCTAAGCCGTCGTCTCCGAAGGCGGTTACGGAGAAGAAGAAA
CCTGCAACCACCGCAGCGGCGGTTAAACTCAAGGCGAAGGGGAAGAAGGTTACCACCGCA
GCAGCTTCGAAATCGAAGGTAGCGAAGAAATCC*GCGGCGGTTAAACCCAAGCCGAAGCC
GAAGGCGACTGTTGCCCCCAAGAGGAAAGCTGTTGCTGCTGCTGCGAAGCCCAAGGCTAA
GGCGGCTAAGACATCGACGGTGACATTTCCGAGTAAAAAGGCGGCTGCAGCTAAGAAGAA
GGCTACGAAGGTGGTGGCGACGAAGAAGAAGACTCCAGTGAAGAAGGTTGTGAAGCCAAA
GACGGTGAAGTCTCCAGCGAAGAGGGCTTCGAAGAGGGCGGTGAAGTGAAAACTAGGGTT
TTAGGAATACATGCTTGTAGCTTTCTCTGTCGTGTAGGTGGTAGTGTTGTATAATCCGAT
CTTTCCTGTTGTTTGCTATGATGTTCTTGTAATCCATGGTTTACTTGAGAACTATCCTTT
GAATCAT
AA

QA 4 730 4 730
DS 

RD RS1BC47JQ 514 0 0
CCGAAGGCGGTTACGGAGAAGAAGAAACCTGCAACCACCGCAGCGGCGGTTAAACTCAAG
GCGAAGGGGAAGAAGGTTACCACCGCAGCAGCTTCGAAATCGAAGGTAGGGAAGAAATCC
*GCGGCGGTTAAACCCAAGCCGAAGCCGAAGGCGACTGTTGCCCCCAAGAGGAAAGCTGT
TGCTGCTGCTGCGAAGCCCAAGGCTAAGGCGGCTAAGACATCGACGGTGACATCTCCGAG
TAAAAAGGCGGCTGCAGCTAAGAAGAAGGCTACGAAGGTGGTGGCGACGAAGAAGAAGAC
TCCAGTGAAGAAGGTTGTGAAGCCAAAGACGGTGAAGTCTCCAGCGAAGAGGGCTTCGAA
GAGGGCGGTGAAGTGAAAACTAGGGTTTTAGGAATACATGCTTGTAGCTTTTTCTGTCGT
GTAGGTGGTAGTGTTGTATAATCCGATCTTTCCTGTTGTTTGCTATGATGTTCTTGTAAT
CCATGGTTTACTTGAGAACTATCCTTTGAATCAT

QA 1 514 1 514
DS 

RD RS1E059JQ 641 0 0
GTTCAGGAAGCTCCTGCTTCTCAACCTCAAGAGACTCGTGGCCTCCGAGAAGCTCGTGAA
GGTGAAAGCCTCGTTTAAGATTCCGTCTGCTGCTGCTAAGCCGTCGTCTCCGAAGGCGGT
TACGGAGAAGAAGAAACCTGCAACCACCGCAGCGGCGGTTAAACCCAAGGCGAAGGGGAA
GAAGGTTACCACCGCAGCAGCTTCGAAATCGAAGGTATCGAAGAAATCC*GCGGCGGTTA
AACCCAAGCCGAAGCCGAAGGCGACTGTTGCCCCCAAGAGGAAAGCTGTTGCTGCTGCTG
CGAAGCCCAAGGCTAAGGCGGCTAAGACATCGACGGTGACATCTCCGAGTAAAAAGGCGG
CTGCAGCTAAGAAGAAGGCTACGAAGGTGGTGGCGACGAAGAAGAAGACTCCAGTGAAGA
AGGTTGTGAAGCCAAAGACGGTGAAGTCTCCAGCGAAGGGGGCTTCGAAGAGGGCGGTGA
AGTGAAAACTAGGGTTTTAGGAATACATGCTTGTAGCTTTCTCTGTCGTGTAGGTGGTAG
TGTTGTATAATCCGATCTTTCCTGTTGTTTGCTATGATGTTCTTGTAATCCATGGTTTAC
TTGAGAACTATCCTTTGAATCATATATAATAGCTTAATCCC

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 3

CO CL2576Contig1 1040 3 8 U
ACATAATCTTTGTTTATAGAGAACAACCCTTTTACACTAATTCCAAAACAGCTTAATATG
TTTTGGACAAAGTTGTTAAAGTTTACAAAACTAGAGATAATGTTAAAACAAGTAGGTTTT
CATTTTACCTAAGTCTTCTCTACCACTTAGCTGCCAAATTTGACTTGGTCTGATTTAGTA
GTAGCTTCTCCTCTCTCTTCACCGAACTCTTTACTCTTTCTCAGTTCCATAACCTTCCTA
TGAAGATTTGAGTGGATCTCATTTGAGAACGTCGGACTATCCGCCGGTCTGTACTCCGGG
CAGAGCCTACCGGACTTAAACCGGACTCCACATGCATTGCATAAGGTTTTTGGACCGGCC
GGACCGGTTCTCCACTGAGGTGTGGTGTTTGTGCCACAATGGCTGCATCTTCTTTGAAAC
ACAAGCGCCGTTTCTAGTTTCTTCTTCTTACACTGATCTCCTGCTGCATGTTGGTTGATT
GAAACTAGTGGCCACACCCGGTCACCGGTTAAGCTGTTCCGAGACCGTTTGGTTCTTGGT
TTAACCGGAATCGAAGATGAAAAGCTTGGTTTGGTTTTGTGGGGTTGTGTGAAGAGAAGT
GAGACTTCTGGTGAAGAACAATCATCCACAACACGAGATACCCATTCAAGCTCTTCCACA
TCTTCATCCGGCAAGGAAGGAAGTTGATCAAAGATGCGAGGTTGTGAACTAGAGATACAA
CAATCTTGTTCTTCTTGTGAAGAACAAACAGAGACAAGTCCTTCTCCTTCTTCTTGTTCT
TGTTCTTGACCTTCTTCTGAGAAATCGAGGAAACACTCAGCGGAGAAATCTTCAGCAGAA
GAAGTTCGGCTTAGTTCCTCAGACACAATCACCTGGTGCTTTATTGCTTCTCCTCTTAGA
CTTGCCTTTAGGGCTCTACCTTCTGTCCACAGCTCCATTCACTCTGATAGAACAAGAAAG
GCTGAGAGAAGGCGTAGAAACAGAGGAGTAGGAGATAGGCAAAGTAAGAGAGGCACTGAA
AAGTAAAGGACGATTCTTCC


BQ
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AF RS1H629JQB U 43
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QA 1 759 1 759
DS 

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CTTA
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GAAGAACAAACAGAGACAAGTCCTTCTCCTTCTTCTTGTTCTTGTTCTTGACCTTCTTCT
GAGAAATCGAGGAAACACTCAGCGGAGAAATCTTCAGCAGAAGAAGTTCGGCTTAGTTCC
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AACAGAGGAGTAGGAGATAGGCAAAGTAAGAGAGGCACTGAAAAGTAAAGGACGATTCTT
CC

QA 5 726 5 726
DS 



AS 1 3

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AATCCCTGGTGGGCTTGGTCCTCCTCATGAGCTCAGTAAGGTTGAGATCATCAAGAGTAA
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BC36TF U 1
AF RS1C633TF U 295
AF RS1C633JQ C 672
BS 1 698 RS1BC36TF
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BS 1066 1074 RS1C633TF
BS 1075 1388 RS1C633JQ

RD RS1BC36TF 773 0 0
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AATCCCTGGTGGGCTTGGTCCTCCTCATGAGCTCAGTAAGGTTGAGATCATCAAGAGTAA
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CCTGAATCCAGACCACTTGGAACCATGGAAACCGGTTTCTTCACTGAACAAATCTAGCCA
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TGAAGTATTAACACCAGTTACAGTATTAGCACCTTTGAAGAGTCCTGAGAAAA

QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1C633TF 780 0 0
G
AAGGCACCAGAGTCTCTGGTTCTGAGCTTTGGAATCGCCGAGAAGTACGCGAGACAAGAG
AAAGTGATGGAGTTTCTACTCTCTCGGTCAGAGGAATTCAAGGAAAGAGGGTTTGATATG
TCTATGCTATCAGAACTGATGGAGCTAGAGGCTATGAAATCAAGTTCTCAGCTGCTTCCA
TACGGTGCTTCCTCTGTTCTTTACTTGAATCAAGATTTGGAGAAACCGGTTTTGGATCTC
GTTAGGGATATGATGGAGAATCCAGAGTTCTCTCTGAAACCAAATGATCACCTTCTCTTC
TCCTCAAGTAGCAATGCTGAGCTGAATGATATACTTTCGGTCGCTTCTGAGTACAGTTTG
TCGAGAGATTCAACAAAATGGAGACAGCTCTCACCGCTTATCCCACACTTCCAGAGGTTT
GGCAGTGAAGTATTAACACCAGTTACAGTATTAGCACCTTTGAGGAGTCCTGAGAAAACC
AGACTCAAGCCTTCACCAAAGAAACAAAACACAAAGCGGAAAGCCAAAGAGAGAGACCTC
TACAAAAGAAACCATCTCCATGCATACGAGAGCCTTCTGTCATTAATGATAGGCAATGAT
CTTCAAAACAAACAGACTACAATACTCACTTTACAGAGATCATGCGGAGAGCTCTCAGAG
CTTCTTACTCAGTTTTCAGTCACCGCTGCTGGAACAGGA*TGGCTGTGCTCTTCTCTGTG
CTATGTAGCCTTGCTTCAATGCGTGTGCCCTTTTGCGCAAACAAGTTTT*CGACACTGG

QA 2 780 2 780
DS 

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CACCAGTTACAGTATTAGCACCTTTGAGGAGTCCTGAGAAAACCAGACTCAAGCCTTCAC
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TCCATGCATACGAGAGCCTTCTGTCATTAATGATAGGCAATGATCTTCAAAACAAACAGA
CTACAATACTCACTTTACAGAGATCATGCGGAGAGCTCTCAGAGCTTCTTACTCAGTTTT
CAGTCACCGCTGCTGGAACAGGAATGGCTGTGCTCTTCTCTGTGCTATGTAGCCTTGCTT
CAATGCGTGTGCCCTTTTGCGCAAACAAGTTTTTCGACACTGGACTTGGTTTCAGTTTGG
TAATACTGTCTTGGGCTGTGAATAGACTGAGGGAAGTGATTGTTCATGTCAACAGGAAAG
CAAACAAGCCATGCTCAAGTTTGAAGGGTGATGAGATCATTAGCAATGTGGAGAGGAGTA
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GTTGAGGACTCAGCGGTAACGGTTTCAGAATCTTGATTTTTACTACTCGATGGAAAGCTT
GAAAGGTCGTTTGTAAATGACTAAAACTTGTTCGGTACTGAGCATATAAATGTGAAG

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 4

CO CL2578Contig1 929 4 16 U
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AGAGTCTGAAACTGCATCTTGGAGAAGTGAACTCGCAAAGGTTGATGTCTGGTATGCATC
TTTCGGATCCAACATGTGGAAACCGAGGTTCCTTTGCTATATCCAAGGAGGACAAGCGGC
GGGAATGAAGAAGGCATGTGTTGGTGCAATGGATAAAACTCCACCGAAGGAAACAACGTG
GAGAACGTTTCCAAACAGGTTGTTCTTTGGCCGTGAATCCACAGTTACTTGGGGTAAAGG
AGGATCTGCTTTCCTAAACCCTCTTACTAGTCCCAGTGATCAATCTCACATGTGTTTCTA
CAGAATCACGCTTGAGCAGTTCAACGATGTTCTGTTTCAGGAAAACGGCATGAAAGTGGA
TTCTGAGACTCCCCTCTTTGATCTATCTGCTCTGCAGTTAGTACAGAACAATGGATCCAT
CCCACTTGCTAAATCTGGTTGGTATGGTAACGTTGTCTGCGTGGGAAAAGAATCAGGCAT
ACCTATACTTACAATGACATGCACACTTTCTGTTCTTGAGAAGTTTATATCAGGTGAGGT
GCCATTAAGACCTCCTGCAAAAGCCTATGCCAACAGTTTGGTAATGGGACTTGTTGAAGG
AGGAAGACTCTCTGAAGAAGAGGCTTGGGCTTACATAGACAATGCTGCTTCTAAACCTCT
CTATGATTGTTTGGAGCTTTCAGGTTTCTGAGTTGTTTGTTTACTTACTACTAAAACCAC
ATGGTTTAATAAAAGATTGTGTCTTTCTCTTTGAGTGTGGTGTTATGCAAACTATGTATG
TATCTTTGTTGTCATATCAGACCACAACAGTAGCTGAAACAATCTCAAGCTACAAAATTT
ATTTTATGCAAAAAGCAGATTGTTTCTAC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GH19TF U 23
AF RS1GH19JQ C 148
AF RS1A668TF U 1
AF RS1A668JQ C 3
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RD RS1GH19TF 633 0 0
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TTCTGTTCTTGAGAAGTTTATATCAG*TGAGGTGCCATTAAGACCTCCTGCAAAAGCCTA
TGCCAACAGTTTGGTAATGGGACTTGTT

QA 6 633 6 633
DS 

RD RS1GH19JQ 664 0 0
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TAGTCCCAGTGATCAATCTCACATGTGTTTCTACAGAATCACGCTTGAGCAGTTCAACGA
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TGCTCTGCAGTTAGTACAGAACAATGGATCCATCCCACTTGCTAAATCTGGTTGGTATGG
TAACGTTGTCTGCGTGGGAAAAGAATCAGGCATACCTATACTTACAATGACATGCACACT
TTCTGTTCTTGAGAAGTTTATATCAGGTGAGGTGCCATTAAGACCTCCTGCAAAAGCCTA
TGCCAACAGTTTGGTAATGGGACTTGTTGAAGGAGGAAGACTCTCTGAAGAAGAAGCTTG
GGCTTACATAGACAATGCTGCTTCTAAACCTCTTTAAGATTGTTTGGAGCTTTCAGGTTT
TTGAGTTGTTTGTTTACTTACTACTAAAACCACATGGTTTAATAAAAGATTGTGTCTTTC
TCTT

QA 1 664 1 664
DS 

RD RS1A668TF 885 0 0
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TTTCGGATCCAACATGTGGAAACCGAGGTTCCTTTGCTATATCCAAGGAGGACAAGCGGC
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GAGAACGTTTCCAAACAGGTTGTTCTTTGGCCGTGAATCCACAGTTACTTGGGGTAAAGG
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TTCTGAGACTCCCCTCTTTGATCTATCTGCTCTGCAGTTAGTACAGAACAATGGATCCAT
CCCACTTGCTAAATCTGGTTGGTATGGTAACGTTGTCTGCGTGGGAAAAGAATCAGGCAT
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TATCTTTGT*GTCATATCAGACCACA*CAGTAGCTGAAACA
TCTC

QA 1 881 1 881
DS 

RD RS1A668JQ 927 0 0
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AGTCTGAAACTGCATCTTGGAGAAGTGAACTCGCAAAGGTTGATGTCTGGTATGCATCTT
TCGGATCCAACATGTGGAAACCGAGGTTCCTTTGCTATATCCAAGGAGGACAAGCGGCGG
GAATGAAGAAGGCATGTGTTGGTGCAATGGATAAAACTCCACCGAAGGAAACAACGTGGA
GAACGTTTCCAAACAGGTTGTTCTTTGGCCGTGAATCCACAGTTACTTGGGGTAAAGGAG
GATCTGCTTTCCTAAACCCTCTTACTAGTCCCAGTGATCAATCTCACATGTGTTTCTACA
GAATCACGCTTGAGCAGTTCAACGATGTTCTGTTTCAGGAAAACGGCATGAAAGTGGATT
CTGAGACTCCCCTCTTTGATCTATCTGCTCTGCAGTTAGTACAGAACAATGGATCCATCC
CACTTGCTAAATCTGGTTGGTATGGTAACGTTGTCTGCGTGGGAAAAGAATCAGGCATAC
CTATACTTACAATGACATGCACTCTTTCTGTTCTTGAGAAGTTTATATCAGGTGAGGTGC
CATTAAGACCTCCTGCAAAAGCCTATGCCAACAGTTTGGTAATGGGACTTGTTGAAGGAG
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ATGATTGTTTGGAGCTTTCAGGTTTCTGAGTTGTTTGTTTACTTACTACTAAAACCACAT
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TCTTTGTTGTCATATCAGACCACAACAGTAGCTGAAACAATCTCAAGCTACAAAATTTAT
TTTATGCAAAAAGCAGATTGTTTCTAC

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DS 



AS 1 4

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CTTATTTTGAAGACAATATTCAACCAGAGCTTGCATTAGGGAACAATGTGTTGATTGCTG
CTCATGGGAACTCGTTGCGGTCTATCATTATGTATCTTGATAAATTAACTTCTCAGGAGG
TTACGAGTTTAGAGCTGTCTACTGGTTTACCGTTGCTCTACATCTTCAAAGACAGGAAGT
TCATGAGACGTGGAAGCCCTGTTGGTCCTACAGAAGCTGGTGTCTATGCTTATACTAAGA
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TTTTTTTGTTGTTTTTTCACTTTAGCAAGAACAGTTTTTAAGATATGTATTAGATCACAC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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CC

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GG
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ATTCACCTTCCAATTCCAAACATTCTCTCTTTCCAACGGACTCTTTCAATGTCCCTATCA
AATTCAGACAGAACCGTTTCAAACTGGAAGCAACCGCATCTCAAACTCCTGTCCTCGACC
CTCTCTTGTCTCCTTCAAAAACCACCACCCTTTCCAAGAAAAAATCAAATGAAGCATCAC
TGATACTGATTAGGCATGGAGAGTCGTTATGGAACGAGAAGAACCTCTTCACAGGCTGCG
TCGATGTTCCTTTAACCGAGAAAGGTGTGGCCGAAGCTATCCAAGCGGGGAAGAGGATCA
GCACCATACCCGTTGATCTGATCTTCACTTCCTCTCTGATCCGCGCTCAGATGACCGCTA
TGCTCGCCATGACTCAGCACCGCTGCAAGAAGGTTCCTATCATCTTGCACGACGAGAGCG
AGAAGGCTCAGACTTGGAGTCATGTTTTCAGCGAAGAGACTAGGAAGCAATCCATCCCTG
TTGTAGCTGCTTGGCAACTGAATGAGAGAATGTATGGAGAGCTGCAGGGTTTAAA

QA 3 657 3 657
DS 

RD RS1GY59JQ 654 0 0
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ATTTTGAAGACAATATTCAACCGGAGCTTGCATTAGGGAACAATGTGTTGATTGCTGCTC
ATGGGAACTCGTTGCGGTCTATCATTATGTATCTTGATAAATTAACTTCTCAGGAGGTTA
CGAGTTTAGAGCTGTCTACTGGTTTACCGTTGCTCTACATCTTCAAAGACAGGAAGTTCA
TGAGACGTGGAAGCCCTGTTGGTCCTACAGAAGCTGGTGTCTATGCTTATACTAAGAGAT
TGGCTCAATACAGACAGAAGCTTGATGAGACCCTTAACTAAAATATGTCCCCTTTTGTTT
TTTTGTTGTTTTTTCACTTTAGCAAGAACAGTTTTTAAGATATGTATTAGATCACACAAA
TCACTCATTATTTTCAATCCACCCAAAAGCCAATCCAGAAGGAAGTTTTCTTAC

QA 1 654 1 654
DS 

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TGCTTGGCAACTGAATGAGAGAATGTATGGAGAGCTGCAGGGTTTAAACAAGGAAGAAAC
AGCTGAGAGATACGGAACACAGCAAGTTCATGAGTGGCGTAGGAGTTACCACATCCCTCC
ACCTAAAGGAGAGAGCTTGGAGATGTGTGCTGAGAGAGCTGTGGCTTATTTTGAAGACAA
TATTCAACCAGAGCTTGCATTAGGGAACAATGTGTTGATTGCTGCTCATGGGAACTCGTT
GCGGTCTATCATTATGTATCTTGATAAATTAACTTTTCAGGAGGTTACGAGTTTAGAGCT
GTTTACTGGTTTACCGTTGCTTTACATTTTCAAAGACAGGAAGTTCATGAGACGTGGAAG
CCCTGTTGGTCCTACAGAAGCTGGTGTTTATGCTTATACTAAGAGATTGGCTCAATACAG
ACAGAAGCTTGATGAGACCCTTAACTAAAATATGTCCCCTTTTGTTTTTTTGTTGTTTTT
TCACTTTAGCAAGAACAGTTTTTAAGATATGTATTAGATCACACAAATCACTCATTATTT
TCAATCCACCCAAAAGCCAATCCAGAAGGAAGTTTTC
CG

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DS 



AS 1 4

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CTACATGTTTTGGATTGAGTGAAGCTTGCGCAGAAAGTCGTGTAGTATTCACGAACGAAC
TCGGTAATGGTAGTACTATTTTTCATGTCAAGTGTCAATCTTACAACCCATCCATTAATC
ATCCACAAATAGATATACAACCCGGCAAGAATCATATTTTCCGATTCGTCTCGGCTAAAG
AAAGAACAACGTATTATTGTACAGTCTTTTACCAGCTTCCGCCCGTTCCAGGTAATACTC
GTCCTCGAATAAGACAGTTTCATGAACTCGAAGCATTTCGAGCAGGCACGCAGTCGAATA
AATGTGGTCAGTACCGTGAATGGAGTGCCAGACGTGATGGGATTTATTTCAGAAGAAATC
CTAATGAACCACTGGGGCATGCGCTTAAATGGACTACCAGAACCTAAATATGTTTTTTCC
TAAATGCTATAACAATATTTATGTACGTTGATTATTTTTATTTGTAAATAAAAATCCCTA
AATTGTATAAATAAATAAAGTGCTACAGTATGTAGCAAAATAATAAAATGAACTATATTT
TTGTTTCCG


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 10 10 

AF RS1H680JQB C 1
AF RS1FO20JQ C 64
AF RS1FO20TF U 64
AF RS1H680TF U 1
BS 1 64 RS1H680TF
BS 65 167 RS1FO20TF
BS 168 168 RS1H680TF
BS 169 607 RS1FO20TF
BS 608 609 RS1H680JQB

RD RS1H680JQB 609 0 0
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CTACATGTTTTGGATTGAGTGAAGCTTGCGCAGAAAGTCGTGTAGTATTCACGAACGAAC
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ATCCACAAATAGATATACAACCCGGCAAGAATCATATTTTCCGATTCGTTTCGGCTAAAG
AAAGAACAACGTATTATTGTACAGTCTTTTACCAGCTTCCGCCCGTTCCAGGTAATACTC
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CTAATGAACCACTGGGGCATGCGCTTAAATGGACTACCAGAACCTAAATATGTTTTTTCC
TAAATGCTATAACAATATTTATGTACGTTGATTATTTTTATTTGTAAATAAAAATCCCTA
AATTGTATAAATAAATAAAGTGCTACAGTATGTAGCAAAATAATAAAATGAACTATATTT
TTGTTTCCG

QA 1 609 1 609
DS 

RD RS1FO20JQ 544 0 0
G
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AACAACGTATTATTGTACAGTCTTTTACCAGCTTCCGCCCGTTCCAGGTAATACTCGTCC
TCGAATAAGACAGTTTCATGAACTCGAAGCATTTCGAGCAGGCACGCAGTCGAATAAATG
TGGTCAGTACCGTGAATGGAGTGCCAGACGTGATGGGATTTATTTCAGAAGAAATCCTAA
TGAACCACTGGGGCATGCGCTTAAATGGACTACCAGAACCTAAATATGTTTTTTCCTAAA
TGCTATAACAATATTTATGTACGTTGATTATTTTTATTTGTAAATAAAAATCCCTAAATT
GTATAAATAAATAAAGTGCTACAGTATGTAGCAAAATAATAAAATGAACTATATTTTTGT
TTC

QA 2 544 2 544
DS 

RD RS1FO20TF 544 0 0
G
ATGTTTTGGATTGAGTGAAGCTTGCGCAGAAAGTCGTGTAGTATTCACGAACGAACTCGG
TAATGGTAGTACTATTTTTCATGTCAAGTGTCAATCTTACAACTCATCCATTAATCATCC
ACAAATAGATATACAACCCGGCAAGAATCATATTTTCCGATTCGTCTCGGCTAAAGAAAG
AACAACGTATTATTGTACAGTCTTTTACCAGCTTCCGCCCGTTCCAGGTAATACTCGTCC
TCGAATAAGACAGTTTCATGAACTCGAAGCATTTCGAGCAGGCACGCAGTCGAATAAATG
TGGTCAGTACCGTGAATGGAGTGCCAGACGTGATGGGATTTATTTCAGAAGAAATCCTAA
TGAACCACTGGGGCATGCGCTTAAATGGACTACCAGAACCTAAATATGTTTTTTCCTAAA
TGCTATAACAATATTTATGTACGTTGATTATTTTTATTTGTAAATAAAAATCCCTAAATT
GTATAAATAAATAAAGTGCTACAGTATGTAGCAAAATAATAAAATGAACTATATTTTTGT
TTC

QA 2 544 2 544
DS 

RD RS1H680TF 609 0 0
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CTACATGTTTTGGATTGAGTGAAGCTTGCGCAGAAAGTCGTGTAGTATTCACGAACGAAC
TCGGTAATGGTAGTACTATTTTTCATGTCAAGTGTCAATCTTACAACCCATCCATTAATC
ATCCACAAATAGATATACAACCCGGCAAGAATCATATTTTCCGATTCGTCTCGGCTAAAG
AAAGAACAACGTATTATTGTACAGTCTTTTACCAGCTTCCGCCCGTTCCAGGTAATACTC
GTCCTCGAATAAGACAGTTTCATGAACTCGAAGCATTTCGAGCAGGCACGCAGTCGAATA
AATGTGGTCAGTACCGTGAATGGAGTGCCAGACGTGATGGGATTTATTTCAGAAGAAATC
CTAATGAACCACTGGGGCATGCGCTTAAATGGACTACCAGAACCTAAATATGTTTTTTCC
TAAATGCTATAACAATATTTATGTACGTTGATTATTTTTATTTGTAAATAAAAATCCCTA
AATTGTATAAATAAATAAAGTGCTACAGTATGTAGCAAAATAATAAAATGAACTATATTT
TTGTTTC
CG

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 4

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TTGCCATCGTCTTATTTTTGAAAATGTTAACATTCATTTCTTCTCAATATGATTTTGTTA
TAAGCAACTATCCATATTATAATTCATGTAACTGAACACTGGAGTAGTATATCTCTCAAT
AAATCTCTCGAGTGTTTTTAAT


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RS1B185TF U 1
AF RS1AU09TF U 3
AF RS1C765TF U 3
AF RS1GY82TF U 3
BS 1 20 RS1B185TF
BS 21 21 RS1AU09TF
BS 22 335 RS1B185TF
BS 336 336 RS1AU09TF
BS 337 424 RS1B185TF
BS 425 425 RS1AU09TF
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BS 434 434 RS1AU09TF
BS 435 442 RS1B185TF

RD RS1B185TF 442 0 0
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GATGGCTAAAATCGATACTGATGGTGATGGAAACATATCGTTTCAAGAATTCACTGATTT
TGCAGCTGCCAATCCTGGACTTATGAAGGATGTTGCCAAAGTTTTCTAAAATGGTAGTAT
TTGCCATCGTCTTATTTTTGAAAATGTTAACATTCTTTTCTTCTCAATATGATTTTGTTA
TAAGCAACTATCCATATTATAATTCATGTAACTGAACACTGGAGTAGTATATCTCTCAAT
AAATGTCTCGAGTATTTTTAAT

QA 1 442 1 442
DS 

RD RS1AU09TF 437 0 0
G
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QA 2 437 2 437
DS 

RD RS1C765TF 437 0 0
G
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TCTCTCGAGTGTTTTT

QA 2 437 2 437
DS 

RD RS1GY82TF 437 0 0
G
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GGCTAAAATCGATACTGATGGTGATGGAAACATATCGTTTCAAGAATTCACTGATTTTGC
AGCTGCCAATCCTGGACTTATGAAGGATGTTGCCAAAGTTTTCTAAAATGGTAGTATTTG
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GCAACTATCCATATTATAATTCATGTAACTGAACACTGGAGTAGTATATCTCTCAATAAA
TCTCTCGAGTGTTTTT

QA 2 437 2 437
DS 



AS 1 3

CO CL2582Contig1 974 3 12 U
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TCAAACATCGGGATAGGTATTCTTCTATCATGAAAGACAACATCAGATACAAGGAATACA
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TGCAGCCCTTGATAGAGAACCCAGGGCAATCCTTTTCCAAGCGGAGAATCAGAAGTTTCG
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ACAATACAGAAAAA


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CC44JQ U 4
AF RS1DA76JQ U 1
AF RS1DA76TF C 691
BS 1 11 RS1DA76JQ
BS 12 12 RS1CC44JQ
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BS 654 753 RS1DA76JQ
BS 754 974 RS1DA76TF

RD RS1CC44JQ 678 0 0
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GTTGGAATGCATTTTTAAGGAATCACGGTTGGTTTATAAAAAGGAGCACAAGTACAGAGT
TAGAGGTCTGAAAGGGTTTTCCCATGGATGAAGTTGATCACTTTAGTGGCAGTTTCCTCT
AGCGCAGAGGTCACCATTGCCAAGTTCTGTAAGAATTCCTCTGCAGCCGGTTTGTCTCCG
TCTATCAGATCCGTCACTGCTTTTAAGAAGATTACTGGTACCTTCAGAAGCTCAGCAACG
TAGGCCACCGCAGCACCCTCCATGTCCTTTAGCGTAGCATCATTGGAAATGATGAGTGAT
TCATCTTGTGTGGACATATCCAAGGAGTCACCAGTAGATAACCTGCCAATCTTCAAATTG
AGTTCCTTGAGTAGATTGGGGGTTGAGAAGGCCCGACGAAGACCAACTCCATAGAGATCA
AACATCGGTATTGGTATTCTTCTATCATGGAAGACAACATCAGATACAAGGAATACATCT
CCAATGTTGGCTCCTTTAACCTTAAAGGCACCGCAGGTTCCAGCATTGATGAGAATGTCA
GGTTGTAAAGCTTGGATAGAAGCAAATGTAATGAGAGAAGCTGGAACAGCTCCAACACTA
TCAATCCCTAGAGTAGCA

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1DA76JQ 753 0 0
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GATGTTGGAATGCATTTTTAAGGAATCACGGTTGGTTTATAAAAAGGAGCACAAGTACAG
AGTTAGAGGTCTGAAAGGGTTTTCCCATGGATGAAGTTGATCACTTTAGTGGCAGTTTCC
TCTAGCGCAGAGGTCACCATTGCCAAGTTCTGTAAGAATTCCTCTGCAGCCGGTTTGTCT
CCGTCTATCAGATCCGTCACTGCTTTTAAGAAGATTACTGGTACCTTCAGAAGCTCAGCA
ACGTAGGCCACAGCAGCACCCTCCATGTCCTTTAGCGTAGCATCATTGGAAATGATCAGT
GACTCATCTTGTGTGGACATATCCAAAGAGTCACCAGTAGACAACCTGCCAATCTTTAAA
TTGAGTTCCTTGAGGAGATTGGGGGTTGAGAAGGCCTGACGAAGACCAACTCCATACAGA
TCAAACATCGGGATAGGTATTCTTCTATCATGAAAGACAACATCAGATACAAGGAATACA
TCTCCTATGTTGGCTCCTTTAACCTTAAAGGCACCGCAGGTTCCAGCATTGATGAGAATG
TCAGGTTGTAAAGCTTGGATAGAAGCAAAGGTAATGAGAGAAGCTGGAACAGTTCCAACA
CTATCAATCCCTAGAGCAGCATCTTTTCCGGGGCAGACAACATAGATCCGAAGATCTTTG
TGCAGCCCTTGATAGAGAACCCAGGGCAATCCT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1DA76TF 284 0 0
GGGCAGACAACATAGATCCGAAGATCTTTGTGCAGCCCTTGATAGAGAACCCAGGGCAAT
CCTTTTCCAAGCGGAGAATCAGAAGTTTCGGAGAGTCCGAACTTGTTGACCAAAGGTTGA
GCCTCCGCTTGCATAGCGATGACGAAGACGACTGTGGAGATGGGTCGATGACTCTCCGAT
TCAACTTTCTCCATGTCACCATCTCCATGAGGACCCATACTTCTCTCGATTCCTCTTTGG
CTCTTCACTCGCTCGATTTCCAGAAAGACGACAATACAGAAAAA

QA 1 284 1 284
DS 



AS 1 4

CO CL2583Contig1 770 4 5 U
GGATCTGCGAGCCAACCCAACCCTCTCCGAAGATCAAACCAAAAACCCTAGCTAAGCACA
GGCAGCAGCGAGGAGGACTAATCTCACGCTATGGCTTCGAGAAGAATTAACAAGGAGCTT
AGGGACCTGCAAAATGACCCTCCTGTCTCTTGCAGCGCCGGTCCTGTGGGTGATGATATG
TACCACTGGCAAGCAACTATTATGGGTCCCACTGATAGCCCATTCGCCGGAGGTGTCTTT
CTTGTTTCCATTCACTTCCCTCCAGATTACCCCTTCAAGCCACCTAAGGTTTCTTTCCGC
ACCAAGGTTTATCACCCGAATGTCAACAGTAATGGCAGCATCTGTCTTGACATTCTGAAA
GAGCAATGGAGCCCTGCACTTACCCTATCCAAGGTTCTTCTGTCGATATGCTCATTGCTG
ACAGATCCAAACCCTGATGATCCTCTTGTTCCTGAAATAGCTAACATCTACAAGACAGAC
CGTACCAAGTACGAGAACACTGCCCGATCCTGGACCCAGAAGTATGCAATGGGATGATGA
TGGTTGGCAATAATGGATCCGCACCAGTAAATTGCGCATTTGTTCTAAGAATTGGAGAAA
TAATAAAGAAAAAAACATGAATTTGGCTTTTGCTTGGTTGCTTGATTTAATTAGCTTTAT
TATCTTCTTATTAAGCCATGTTTTGGTTGTGTACATGAGCTTCTATAAAAACCTTATTGA
AACATTTGATATTTGCAATGCTTTTAAGCAAGTGGTTGGCTATTATAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1BX60TF U 234
AF RS1F436TF U 1
AF RS1BX60JQ C 53
AF RS1F436JQ C 56
BS 1 444 RS1F436TF
BS 445 445 RS1BX60TF
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BS 699 770 RS1F436JQ

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TTTCCGCACCAAGGTTTATCACCCGAATGTCAACAGTAATGGCAGCATCTGTCTTGACAT
TCTGAAAGAGCAATGGAGCCCTGCACTTACCCTATCCAAGGTTCTTCTGTCGATATGCTC
ATTGCTGACAGATCCAAACCCTGATGATCCTCTTGTTCCTGAAATAGCTAACATCTACAA
GACAGACCGTAC

QA 1 252 1 252
DS 

RD RS1F436TF 682 0 0
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GGCAGCAGCGAGGAGGACTAATCTCACGCTATGGCTTCGAGAAGAATTAACAAGGAGCTT
AGGGACCTGCAAAATGACCCTCCTGTCTCTTGCAGCGCCGGTCCTGTGGGTGATGATATG
TACCACTGGCAAGCAACTATTATGGGTCCCACTGATAGCCCATTCGCCGGAGGTGTCTTT
CTTGTTTCCATTCACTTCCCTCCAGATTACCCCTTCAAGCCACCTAAGGTTTCTTTCCGC
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GAGCAATGGAGCCCTGCACTTACCCTATCCAAGGTTCTTCTGTCGATATGCTCATTGCTG
ACAGATCCAAACCCTGATGATCCT*TTGTTCCTGAAATAGCTAACATCTACAAGACAGAC
CGTACCAAGTACGAGAACACTGCCCGATCCTGGACCCAGAAGTATGCAATGGGATGATGA
TGGTTGGCAATAATGGATCCGCACCAGTAAATTGCGCATTTGTTCTAAGAATTGGAGAAA
TAATAAAGAAAAAAACATGAATTTGGCTTTTGCTTGGTTGCTTGATTTAATTAGCTTTAT
TATCTTCTTATTAAGCCATGTT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1BX60JQ 646 0 0
TAA
GCACAGGCAGCAGCGAGGAGGACTAATCTCACGCTATGGCTTCGAGAAGAATTAACAAGG
AGCTTAGGGACCTGCAAAAGGACCCTCCTGTCTCTTGCAGCGCCGGTCCTGTGGGTGATG
AT**GTACCACTGGCAAGCAACTATTATGGGTCCCACTGATAGCCCATTCGCCGGAGGTG
TCTTTCTTGTTTCCATTCACTTCCCTCCAGATTACCCCTTCAAGCCACCTAAGGTTTCTT
TCCGCACCAAGGTTTATCACCCGAATGTCAACAGTAATGGCAGCATCTGTCTTGACATTT
TGAAAGAGCAATGGAGCCCTGCACTTACCCTATCCAAGGTTCTTCTGTCGATATGCTCAT
TGCTGACAGATCCAAACCCTGATGATCCTCTTGTTCCTGAAATAGCTAACATCTACAAGA
CAGACCGTACCAAGTACGAGAACACTGCCCGATCCTGGACCCAGAAGTATGCAATGGGAT
GATGATGGTTGGCAATAATGGATCCGCACCAGTAAATTGCGCATTTGTTCTAAGAATTGG
AGAAATAATAAAGAAAAAAACATGAATTTGGCTTTTGCTTGGTTGCTTGATTTAATTAGC
TTTATTAACTTCTTATTAAGCCATGTTTTGGTTGTGTACATGA

QA 4 646 4 646
DS 

RD RS1F436JQ 715 0 0
GCACAGGCAGCAGCGAGGAGGACTAATCTCACGCTATGGCTTCGAGAAGAATTAACAAGG
AGCTTAGGGACCTGCAAAATGACCCTCCTGTCTCTTGCAGCGCCGGTCCTGTGGGTGATG
ATATGTACCACTGGCAAGCAACTATTATGGGTCCCACTGATAGCCCATTCGCCGGAGGTG
TCTTTCTTGTTTCCATTCACTTCCCTCCAGATTACCCCTTCAAGCCACCTAAGGTTTCTT
TCCGCACCAAGGTTTATCACCCGAATGTCAACAGTAATGGCAGCATCTGTCTTGACATTT
TGAAAGAGCAATGGAGCCCTGCACTTACCCTATCCAAGGTTTTTCTGTCGATATGCTCAT
TGCTGACAGATCCAAACCCTGATGATCCT*TTGTTCCTGAAATAGCTAACATTTACAAGA
CAGACCGTACCAAGTACGAGAACACTGCCCGATCCTGGACCCAGAAGTATGCAATGGGAT
GATGATGGTTGGCAATAATGGATCCGCACCAGTAAATTGCGCATTTGTTTTAAGAATTGG
AGAAATAATAAAGAAAAAAACATGAATTTGGCTTTTGCTTGGTTGCTTGATTTAATTAGC
TTTATTATTTTCTTATTAAGCCATGTTTTGGTTGTGTACATGAGCTTCTATAAAAACCTT
ATTGAAACATTTGATATTTGCAATGCTTTTAAGCAAGTGGTTGGCTATTATAATG

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 4

CO CL2584Contig1 951 4 6 U
CCAAGATTTATATGTTCATTATTCAAAACACAAAAAGCAGTAAAAGTAGCATCTTAGCAC
ATGAAACATTAGAGAGAATGAAAAAAAACAACCTCTCTCAAAGTACCCTCGGGTACTATA
GTAGGATATACAATAGCAGTTTTCTTGTTCTCCAAACAAAAAACAAGAAAAAGCCCTAAC
TTAAAAGTCATTAAAAAGAAGTGGTTCATTTCCACTGCTAGCCATAAAGATAGTGTCATA
AACAATAGCTGCGATTGCTGCACCAATAAATGGACCGAACCAATAGACCCAATGGTTCGT
CCAAGTCCAGCTCACCACAGCCGGACCAAATGAAACCGCCGGGTTCATCGACGCACCGTC
GAAAGCACCACCAACCAGAATATTAGCTCCAACTATCAACCCAATTGCCAATGGAGCAAT
GATTCCTATATCACCTTTCTTGGGATCCACGGCAGTAGCGTAAACGGTGTACACTAACCC
AAACGTCATCACAATCTCGAAAACCACTGCGTTCCACGGCTCAACTCCATGGGAAAGAGA
AAACGCTGCTGTTTCCATCCCACCAGTGCTTACCTTGAGCAACAAGCAAGCTACGACCGC
TCCGAGTAATTGAGCGATCCAGTAAAGTATAGCTCTTAACAACGTTATGTTTCCACCCAC
GAAAGCTCCGAATGTAACCGCAGGGTTTACATGGCCGCCTGAAACGTTTGCACCGAAAGA
AACCGCCACGAACAATGCAAATGCATGAGACAAAGACGCGGCCACTAAACCGGAAGGTGT
AGCTGGACCATCTCCTGTTAGCTTTCCGTAAGCCATACCGGAACCTTGACCCGCAAAAAC
GAATATAACCATGGAGAAAAACTCCGCCAAAGCCGCTCTGATCGCATCTGGATGGCTAGC
TTCTCCTGGCGTTCCAATCGCGATTCTGTTGATAGCCATTGTTACAAAAAA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AAAGCACCACCAACCAGAATATTAGCTCCAACTATCAACCCAATTGCCAATGGAGCAATG
ATTCCTATATCACCTTTCTTGGGATCCACGGCAGTAGCGTAAACGGTGTACACTAACCCA
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GATAGCCATTGTTACAAAAAA

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DS 

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TCCACGGCTCAACTCCATGGGAAAGAGAAAACGCTGCTGTTTCCATCCCACCAGTGCTTA
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AAGACGCGGCCACTAAACCGGAAGGTGTAGCTGGACCATCTCCTGTTAGCTTTCCGTAAG
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CCGCTCTGATCGCATCTGGATGGCTAGCTTCTCCTGGCGTTCCAATCGCGATTCTGTTGA
TAGCCATTGTTACAAAAAA

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DS 



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GGAGATGTAGAGGAAGTTGTAGAACACGTTGATCTCGTTCCTCTGCCTCACGACTTTCTT
CTCTCTTATTGAATACACAAACACAAGGGAGACCAGAGCGGGTAACCAAGCGATCAGCAG
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ACTTAACCCC


BQ
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CATTACAGACTCGGACTCATGACTCTCCCTAAACTTCTTGTAAATATCACCTTTGTAAAA
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CAAAACCAAAAACGGCAGTTTATAGCATTGGCTCCCTAGGCAAGTCAAGTCTTTCACATC
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CGTGACACGAACGTTCAGGATGTACGATCCAAGCGGGCTAGCAAGCTGTCCGCAGTTGAA
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CTGCGCGCCGAAAGAGAATCCCATTAGAATGGACGCAATGTATACCGAGCCTGGTACCGG
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TCGGGGTAGTTTATGCTTGGCGAGCAAGTATTCAGAGACAAAACCAGAGAACACTCGACC
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DS 

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GAAATGAACTTGCTTCTCGGCGATGTTCATAGCCATGAGGAAGAGAGCCAAGAAGATGGA
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TCTTATTGAATACACAAACACAAGGGAGACCAGAGCGGGTAACCAAGCGATCAGCAGAAT
CAAAGACTTGGAATCGTTACCGTAGATCGCAAAGTAAAGCTGCGTGAATATCGCTCCACT
TAACCCC

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 4

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CACAGGTGTGGAGGAGCCACTACGCTTACTGGACTGACCTGTAATAGTTCTACCCATAAA
CCTCCCTGCTTTGCTCAATCCACTACCCATGGCTCCAAAACCGCTACCAACCATCCCAAC
ACCCGAGGTCACCCCAGTTCCGACCAAACCGACTCCTGCACCAATGCCAGACCCAACCAT
ACCTACACCAGCACCGAGCCCACTTCCCACCATCCCTACTGCATCCATTGTGCTACCTAT
CACTCCTGCTTCCTTCAATCTCTTCCTCTCTTCCATGATTTTCTTCTCTTCTTCTAACGC
AGCCATTTGCTCCTCTTTGTTGAACTCCTGGTAATGTACCTTTAGGGTTATACTTCCTCT
ATCTTTCTTATCTTTTACTTTCAGAGTATCAAGTGAAGACAACAGGTTTAGCTCCATTTC
CTTTGTTACCCCGACTTCCAAACTGCTTAAAGGAAGTTTCACAAGTCCTAGACGCTCGTC
TTGGCCTACGTCTTTATCAAATACCTCAATAGTGAGCGACTGGGTTTCTTTGTCCTCTGC
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ATACTTGAACACAGGACGAATGTGGATGGTAGCATAAGGGTCTGATTTTCCAATCAGTTC
CTTATTCTTCAAGTTAGTTGCTTTCATAACTGTTACTATAAGCTTTCCCTGTGGCTTAAG
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CTGAAGCATGTCTTGGACAATAGTCTCAACCGTGTCATCGATCATATCAGATAGTCCAGG
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AACACGTGCAACTGTGAAAACTTGAAGATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FJ89JQ U 1
AF RS1CS61JQ U 34
AF RS1FJ89TF C 337
AF RS1CS61TF C 466
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RD RS1FJ89JQ 663 0 0
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TTG

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DS 

RD RS1CS61JQ 734 0 0
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ATGTACCTTTAGGGTTATACTTCCTCTATCTTTCTTATCTTTTACTTTCAGAGTATCAAG
TGAAGACAACAGGTTTAGCTCCATTTCCTTTGTTACCCCGACTTCCAAACTGCTTAAAGG
AAGTTTCACAAGTCCTAGACGCTCGTCTTGGCCTACGTCTTTATCAAATACCTCAATAGT
GAGCGACTGGGTTTCTTTGTCCTCTGCAATCAATTCAAATGTTTGGTCCCAAACAGGATT
TAGATTGTTCTCGA

QA 1 734 1 734
DS 

RD RS1FJ89TF 574 0 0
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TACTGCATCCATTGTGCTACCTATCACTCCTGCTTCCTTCAATCTCTTCCTCTCTTCCAT
GATTTTCTTCTCTTCTTCTAACGCAGCCATTTGCTCCTCTTTGTTGAACTCCTGGTAATG
TACCTTTAGGGTTATACTTCCTCTATCTTTCTTATCTTTTACTTTCAGAGTATCAAGTGA
AGACAACAGGTTTAGCTCCATTTCCTTTGTTACCCCGACTTCCAAACTGCTTAAAGGAAG
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CGACTGGGTTTCTTTGTCCTCTGCAATCAATTCAAATGTTTGGTCCCAAACAGGATTTAG
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AGGGTCTGATTTTCCAATCAGTTCCTTATTCTTCAAGTTAGTTGCTTTCATAACTGTTAC
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C

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DS 

RD RS1CS61TF 707 0 0
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GGTTATACTTCCTCTATCTTTCTTATCTTTTACTTTCAGAGTATCAAGTGAAGACAACAG
GTTTAGCTCCATTTCCTTTGTTACCCCGACTTCCAAACTGCTTAAAGGAAGTTTCACAAG
TCCTAGACGCTCGTCTTGGCCTACGTCTTTATCAAATACCTCAATAGTGAGCGACTGGGT
TTCTTTGTCCTCTGCAATCAATTCAAATGTTTGGTCCCAAACAGGATTTAGATTGTTCTC
GATTGCCTTTGTTTTATACTTGAACACAGGACGAATGTGGATGGTAGCATAAGGGTCTGA
TTTTCCAATCAGTTCCTTATTCTTCAAGTTAGTTGCTTTCATAACTGTTACTATAAGCTT
TCCCTGTGGCTTAAGTTCTAAATCACTGAGATCAACAGGAATACCACCAATGGGAACAAC
TATTCTATGAGGCCACTGAAGCATGTCTTGGACAATAGTCTCAACCGTGTCATCGATCAT
ATCAGATAGTCCAGGAATAGCTGTCAAGCTTCCACCGACAGCCTTCAAAGTGTAATCGAT
TCTTGGTTTTGGCTCGGCAAGTAGAGCTACAACAACAGCAGATATACAAGGAATCTCATT
CGCAAGTTGAAAGATAACACGTGCAACTGTGAAAACTTGAAGATCCC

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 4

CO CL2587Contig1 1079 4 6 U
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ATATATAATATTAATGCGACCACACTTGCATACAAAAGCATAACATATCACAACCCCGAC
GCGAGCGTTCCAGATTTAGTTTATCTATCAATCCCTTGATAGGATCTGAGCTTTGAGAGA
GTTCTTCATCACGACCGTAAACGCGTAAGTTTCGGTCGGGTCGGGTAGAGAATCCGGAAC
AGGGATCCATTTAAACGAATGGATCATCCTAGCAAGCATCAAGTTGATGTGTAGAATCCC
AAGAGACCAAGCCGGGCAGATCCGACGACCCGCGCCAAAAGGCAACATTGTCACGCCACG
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TTTACCAGGATCCGACCAAATCTCCGGGTTCTCAGTAACCCAAGCAGTGTAAAATTCCAC
ATATGCCCCTGACGGTATATCATAGCCTCCAAGCTCCATATCTTTAACGGCGGCGTGAGA
GAGAAGAAAATGTCCCGGGGGATGTCTCCGGAGAGTCTCTTTCACTATTGCTTCCAAGTA
AGGCATTTTCGCCACGTCATCCTCTTCAACGACGCCGTTTTTGCCAACAACTCCGACAAC
TTCCTCGTACAGTTTCTCTTGAATGTTTTGGTCCGTCACTAGATGGAGTAACGCCCATTC
AAGCGTAGTAGCGCTCGTGTCCGTACCCGCCGAGACAATCTCCGAACATAGAGTCACAAT
CTCTTCATCTTTAAGCTCACCGCCTCTCTCAGCAGGCTTCAAAGCAAAAAGAGAATCCAC
GTAAGCTGCACCAATAGGACTCACCATCTCTTCGTTAGGACTCTCTTTCGCGTCAACAAA
TACACGACGGTTTCTTATCAATGGCACTAGACACTCGAGCTGCGTCTTCCTTAGCTCTCT
CGCTTCTCTAACTTGACGACGAAACAACGGAGTGAAAACCGGTAAAAAGTCCGGTAACGT
CGGAGAAGTTATCAGCATGTCGTCCTTAAGAACATTTTCTATGTTCTTGATCTTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1EZ05JQ U 1
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AF RS1BB38TF C 405
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ATATATAATATTAATGCGACCACACTTGCATACAAAAGCATAACATATCACAACCCCGAC
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GTTCTTCATCACGACCGTAAACGCGTAAGTTTCGGTCGGGTCGGGTAGAGAATCCGGAAC
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AAGAGACCAAGCCGGGCAGATCCGACGACCCGCGCCAAAAGGCAACATTGTCACGCCACG
TGTTCCGGTCCAGTCAGCATTGACACCGTCCCCACCTGCTAAAAACCTATCGGGTCTAAA
TTTACCAGGATCCGACCAAATCTCCGGGTTCTCAGTAACCCAAGCAGTGTAAAATTCCAC
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AGGCATTTTCGCCACGTCATCCTCTTCAACGACGCCGTTTTTGCCAACAACTCCGACAAC
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CCACACTTGCATACAAAAGCATAACATATCACCACCCCGACGCGAGCGTTCCAGATTTAG
TTTATCTATCAATCCCTTGATAGGATCTGAGCTTTGAGAGAGTTCTTCATCACGACCGTA
AACGCGTAAGTTTCGGTCGGGTCGGGTAGAGAATCCGGAACAGGGATCCATTTAAACGAA
TGGATCATCCTAGCGAGCATCAAGTTGATGTGTAGAATCCCAAGAGACCAAGCCGGGCAG
ATCCGACGACCCGCGCCAAAAGGCAACATTGTCACGCCACGTGTTCCGGTCCAGTCAGCA
TTGACACCGTCCCCACCTGCTAAAAACTTATCGGGTCTAAATTTACCAGGATCCGACCAA
ATCTCCGGGTTCTCAGTAACCCAAGCAGTGTAAAATTCCACATATGCCCCTGACGGTATA
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GGATGTCTCCGGAGAGTCTCTTTCACTATTGCTTCCAAGTAAGGCATTTTCGCCACGTCA
TCCTCTTCAACGACGCCGTTTTTGCCTACAACTCCGACAACTTCCTCGTACAGTTTCTCT
TGAATGTTTTGGTCCGTCACTAGATGGAGTAACGCCCATTCAAGCGTAGTAGCGCTCGTG
TCCGTACCCGCCGAGACAATCTCCGAACATAGAGTCACAATCTCTTCATCTTTAAGCTCA
CCGCCTCTCTCA

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DS 

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GCA
AGCATCAAGTTGATGTGTAGAATCCCAAGAGACCAAGCCGGGCAGATCCGACGACCCGCG
CCAAAAGGCAACATTGTCACGCCACGTGTTCCGGTCCAGTCAGCATTGACACCGTCCCCA
CCTGCTAAAAACCTATCGGGTCTAAATTTACCAGGATCCGACCAAATCTCCGGGTTCTCA
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TCCATATCTTTAACGGCGGCGTGAGAGAGAAGAAAATGTCCCGGGGGATGTCTCCGGAGA
GTCTCTTTCACTATTGCTTCCAAGTAAGGCATTTTCGCCACGTCATCCTCTTCAACGACG
CCGTTTTTGCCAACAACTCCGACAACTTCCTCGTACAGTTTCTCTTGAATGTTTTGGTCC
GTCACTAGGTGGAGTAACGCCCATTCAAGCGTAGTAGCGCTCATGTCCGTACCCGCCGAG
ACAATCTCCGAACATAGAGTCACAATCTCTTCATCTTTAAGCTCACCGCCTCTCTCAGCA
GGCTTCAAAGCAAAAAGAGAATCCACGTAAGCTGCACCAATAGGACTCACCATCTCTTCG
TTAGGACTCTCTTTCGCGTCAACAAATACACGACGGTTTCTTATCAATGGCACTAGACAC
TCGAGCTGCGTCTTCCTTAGCTTTCTCGCTTCTC
C

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DS 

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ACT
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TGTAAAATTCCACATATGCCCCTGACGGTATATCATAGCCTCCAAGCTCCGTATCTTTAA
CGGCGGCGTGAGAGAGAAGAAAATGTCCCGGGGGATGTCTCCGGAGAGTCTCTTTCACTA
TTGCTTCCAAGTAAGGCATTTTCGCCACGTCATCCTCTTCAACGACGCCGTTTTTGCCTA
CAACTCCGACAACTTCCTCGTACAGTTTCTCTTGAATGTTTTGGTCCGTCACTAGATGGA
GTAACGCCCATTCAAGCGTAGTAGCGCTCGTGTCCGTACCCGCCGAGACAATCTCCGAAC
ATAGAGTCACAATCTCTTCATCTTTAAGCTCACCGCCTCTCTCAGCAGGCTTCAAAGCAA
AAAGAGAATCCACGTAAGCTGCACCAATAGGACTCACCATCTCTTCGTTAGGACTCTCTT
TCGCGTCAACAAATACACGACGGTTTCTTATCAATGGCACTAGACACTCGAGCTGCGTCT
TCCTTAGCTCTCTCGCTTCTCTAACTTGACGACGAAACAACGGAGTGAAAACCGGTAAAA
AGTCCGGTAACGTCGGAGAAGTTATCAGCATGTCGTCCTTAAGAACATTTTCTATGTTCT
TGATCTTCTCCC

QA 4 675 4 675
DS 



AS 1 2

CO CL2588Contig1 1065 2 2 U
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GTTCGTCACCGAGCTTTGAAGAAGAGTGAAAGAAAGATGGTGATGGATTCATCAAAATGG
TGGTGGATTGGGAAACACAACACTACTAATTTCTCTCCATGGCTTCATTCTACTCTCTCT
GAGTTGGATGAGAAGACAAAGGAGATGCTGAGAGTGATCGATGAGGATGCGGATTCATTC
GCGGCACGAGCTGAGATGTATTACAAGAAGAGGCCTGAGCTCGTTGCTATGGTCGAAGAT
TTCTACCGTTCCCATCGCTCCTTAGCCGAGAGGTACGACTTGTTGAGACCCTCTTCTGTT
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TGGTCCGAGGCTTGTGAGACTCATGAAGAGTACTACGCTGAGTCCGAAGTGGATGACGGT
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ATGTCTCAGAGGAAGCAACAGATGTGGAAGCCATTCGAGTTCAAGAAGCTTGAAGGGTTG
TTTGGGAGAGTAGTGGGCAATTGGGTCGTCCCAAAGACAGAGTCTACTACTTCCAGAGAG
CTAATGACTCTTTAGAGAAAAAACAGAGAGGTCTGTATGATCAATAAGAGTAACTGAACA
ACTTTCTATGACTATCTTTGTACTCTGTGACAGGTAAGGGGTATACTCAAGTAGTTAGTG
GCAAGGCTTCGTATGATTATAGTTATAGCCCAAGTCCATGCATGTTTGTTTTTTACATTT
GTTGTAGTTCGTTCTTTAGCTTATTTATTCGTTCTTTTATTGTGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F303TF U 1
AF RS1F303JQ C 386
BS 1 531 RS1F303TF
BS 532 1065 RS1F303JQ

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GGAAGCCATTCGAGTTCAAGAAGCTTGAAGGGTTGTTTGGGAGAGTAGTGGGCAATTGGG
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GAGAGGTCTGTATGATCAATAAGAGTAACTGAACAACTTTCTATGACTATCTTTGTACTC
TGTGACAGGTAAGGGGTATACTCAAGTAGTTAGTGGCAAGGCTTCGTATGATTATAGTTA
TAGCCCAAGTCCATGCATGTTTGTTTTTTACATTTGTTGTAGTTCGTTCTTTAGCTTATT
TATTCGTTCTTTTATTGTGC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 4

CO CL2589Contig1 848 4 4 U
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AGCTCACAACCATAATTCTAAACCTGGGAAGGGATACAAAAAATGACATCTTCACCAGAA
AGAGCAGCACTAAGCAGAGGATCCCACTTTCTCACTGTCAAATAGCCTCGTGAGCCATCT
CGGATGACTTACAGCTTCATACGACTGAGCAAAAGAGATATTAGTCGCACTTTTGGCAAT
GAGAAAAGCTCCTTTGTTAGTCTCCTTTACTTCAAGGTTAGTTCTCCATCTTGGAAGATT
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ATCCAAAAAACCACACACCACAGGGTCTTCAATCCCAAAAATCACTTTCTCAACTCTATG
AGCCACCATGCTTTCTATAGCCCAGCACATAGCCCGCCTCTTTGCATCAGACAAATTTGC
AATGTCTGCAAAGGATCTCCTGCTGTGCCAAATAGCATTGCCATTAGCATCTCGAACTAC
CCACGCACATCCCAAGCAGTGAGTTTTCTTGATCCAGTACCAACCAATATTGTGTTTATA
CTCGTGAATCTTGTGCGTTTCCAAAAAAAAACTAGAAAATGAGAGACTCAAAATACCAAA
ATAATTCAAGATAATACATACGCATGCTAGCAATTGAAAGAAAGAAGTAATATTCAATGT
AAGAATGATTAAAGAAAACAAGTTGTGCTTCGTATTTGG*AAGAAGACAACCACTCATTT
AAAGTCATTTCGGCTCCTTTTGTGGTGCTCCTAATGGCTCCACTTCTAGATATAGGCAAA
GCCTCCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 10 10 

AF RS1A220TR C 300
AF RS1A220TF U 1
AF RS1A220TV U 38
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TATCCAAAAAACCACACACCACAGGGTCTTCAATCCCAAAAATCACTTTTTCAACTCTAT
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TAAAGTCATTTCGGCTCCTTTTGTG
TGCT

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DS 

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CGGATGACTTACAGCTTCATACGACTGAGCAAAAGAGATATTAGTCGCACTTTTGGCAAT
GAGAAAAGCTCCTTTGTTAGTCTCCTTTACTTCAAGGTTAGTTCTCCATCTTGGAAGATT
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AATGTCTGCAAAGGATCTCCTGCTGTGCCAAATAGCATTGCCATTAGCATCTCGAACTAC
CCACGCACATCCCAAGCAGTGAGTTTTCTTGATCCAGTACCAACCAATATTGTGTTTATA
CTCGTGAATCTTGTGCGTTTCCAAAAAAAAACTAGAAAATGAGAGACTCAAAATACCAAA
ATAATTCAAGATAATACATACGCATGCTAGCAATTGAAAGAAAGAAGTAATATTCAATGT
AAGAATGATTAAAGAAAACAAGTTGTGCTTCGTATTTGG*AAGAAGACAACCACTCATTT
AAAGTCATTTCG*CTCCTTTTGTGGTGCTCCTAATGGCTCCACTTCTAGATATAGGCAAA
GCCTC

QA 1 845 1 845
DS 

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AAAAAATGACATCTTCACCAGAAAGAGCAGCACTAAGCAGAGGATCCCACTTTCTCACTG
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ATATTAGTCGCACTTTTGGCAATGAGAAAAGCTCCTTTGTTAGTCTCCTTTACTTCAAGG
TTAGTTCTCCATCTTGGAAGATTACTCAAAAGGTCTAGCAACACAGAACTTTCATACCAG
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CTCTTTGCATCAGACAAATTTGCAATGTCTGCAAAGGATCTCCTGCTGTGCCAAATAGCA
TTGCCATTAGCATCTCGAACTACCCACGCACATCCCAAGCAGTGAGTTTTCTTGATCCAG
TACCAACCAATATTGTGTTTATACTCGTGAATCTTGTGCGTTTCCAAAAAAAAACTAGAA
AATGAGAGACTCAAAATACCAAAATAATTCAAGATAATACATACGCATGCTAGCAATTGA
AAGAAAGAAGTAATATTCAATGTAAGAATGATTAAAGAAAACAAGTTGTGCTTCGTATTT
GGGAAGAAGACAACCACTCATTTAAAGTCATTTCGGCTCCTTTTGTGGTGCTCCTAATGG
CTCCACTTCTAGATATAGGCAAAGCCTC
CGC

QA 1 808 1 808
DS 

RD RS1A220JQ 799 0 0
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CTTCACCAGAAAGAGCAGCACTAAGCAGAGGATCCCACTTTCTCACTGTCAAATAGCCTC
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CTTTTGGCAATGAGAAAAGCTCCTTTGTTAGTCTCCTTTACTTCAAGGTTAGTTCTCCAT
CTTGGAAGATTACTCAAAAGGTCTAGCAACACAGAACTTTCATACCAGAAAGATGGCCAA
GCCTTAGGCCTATCCAAAAAACCACACACCACAGGGTCTTCAATCCCAAAAATCACTTTT
TCAACTCTATGAGCCACCATGCTTTCTATAGCCCAGCACATAGCCCGCCTCTTTGCATCA
GACAAATTTGCAATGTCTGCAAAGGATCTCCTGCTGTGCCAAATAGCATTGCCATTAGCA
TCTCGAACTACCCACGCACATCCCAAGCAGTGAGTTTTCTTGATCCAGTACCAACCAATA
TTGTGTTTATACTCGTGAATCTTGTGCGTTTCCAAAAAAAAACTAGAAAATGAGAGACTC
AAAATACCAAAATAATTCAAGATAATACATACGCATGCTAGCAATTGAAAGAAAGAAGTA
ATATTCAATGTAAGAATGATTAAAGAAAACAAGTTGTGCTTCGTATTTGG*AAGAAGACA
ACCACTCATTTAAAGTCATTTCGGCTCCTTTTGTGGTGCTCCTAATGGCTCCACTTCTAG
ATATAGGCAAAGCCTCCGC

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 4

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GGATTGTTCTCTAGATAGCACAACCCTAAAACTCTCCTGTCGAATCTCTCTTTTCCTCCT
TGATCAACAATGGAATTTTGGGGAGTTGAAGTTAAGGCTGGGATGCCACTTAAAGTGAGG
CCTCAAGTAGACCATGTCATCCACCTTTCTCAGGCTACAGTCGATGCCAAAAAGGGAGAA
TCTGGTCTCTTGTACGTGACTATTGATTGGAAGAAATATGTCATTGGAACGCTCTCTCAA
GACCACATTCCTCAGATGACCTTTGACCTTGTCTTCGAGCAGGAGTTTGAGCTTTCTCAC
TCTTTGGAGAGTGGAAGCGTCCACTTTGTTGGCTACAGATCTCCCAACATCGATCAAGAG
GAGGACTACCCTTCTGATTCCGAGGAGGAGGAGGAGGTTGTTCCTGCTACTTCAACTGTC
ACTTCCGTTGGGAATGCTGCTGCTGCTTCCAAGGCTGCTGGCTCAAAACCAAAAGCCAAG
CCTGCTGAAGTGAAGCCTGAGTCAGAGTCTGATGATGATGATGAGTCTGAGGAGGAGAAG
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GCAAAGAAGACCAAAACTGCAGTAGCACCCACTCAGAACACTGAAGAGAAGAAGAAGAAG
GGCGGGCACACAGCTACACAACACCCCGCTAAAAAGGGTGGAAAGAGTCCTAACCAGAGC
CCAGGTCAATCATCCAATGGAAACAAGAAGCAATTCAATTCTGGCAAGCAGTCTGGTTCT
AACAACAAGGGCAAGGGAAAAGGAAAGGGCAGAGCCTAAGCTTGATGTGTGAACAACAAT
AAGTAGTTTTTGGTTTTTACTCTGTCTTAAGATTTTATCTATTATCGGAAAAGTTATCTA
ACAATGATGAAGAACTTTGTCTACTACTACTACTACTACTAGTAAGGGTATTGAAAAATA
CCATCATCTTCAAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1GX74JQ C 489
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GG
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GAATTTTGGGGAGTTGAAGTTAAGGCTGGGATGCCACTTAAAGTGAGGCCTCAAGTAGAC
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TACGTGACTATTGATTGGAAGAAATATGTCATTGGAACGCTCTCTCAAGACCACATTCCT
CAGATGACCTTTGACCTTGTCTTCGAGCAGGAGTTTGAGCTTTCTCACTCTTTGGAGAGT
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TCTGATTCCGAGGAGGAGGAGGAGGTTGTTCCTGCTACTTCAACTGTCACTTCCGTTGGG
AATGCTGCTGCTGCTTCCAAGGCTGCTGGCTCAAAACCAAAAGCCAAGCCTGCTGAAGTG
AAGCCTGAGTCAGAGTCTGATGATGATGATGAGTCTGAGGAGGAGAAGGATGAAGAAGAT
GACTCTGAGGAGGAGGATGAAGAGGAAGAGGAGGAGACCCCTAAGCAGCCTTTGGAGCCG
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AAAACTGCAGTAGCACCCACTCAGAACACTGAAGAGA
GAG

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TATCTATTATCGGAAAAGTTATCTAACAATGATGAAGAACTTTGTCTAC

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AGATGACTCTGAGGAGGAGGATGAAGAGGAAGAGGAGGAGACCCCTAAGCAGCCTTTGGA
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GACCAAAACTGCAGTAGCACCCACTCAGAACACTGAAGAGAAGAAGAAGAAGGGCGGGCA
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TTTGGTTTTTACTCTGTCTTAAGATTTTATCTATTATCGGAAAAGTTATCTAACAATGAT
GAAGAACTTTGTCTACTACTACTACTACTACTAGTAAGGGTATTGAAAAATACCATCATC
TTCAAGTC

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DS 



AS 0 0

AS 1 4

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CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAGGTGAAGCTCTGTTTCTTCATCCCCTTCTTCT
TCTCTCTCTCTCTCTAGGGTACCTTCATTTTGTTTTTGAAGCAAAACTGTGATAACAATG
TCGTCGTCTTCCTCCCACGAACAACCGCGAGTCATAACCTGCAAAGCCGCGGTGGCGTGG
CGAGCTGGTGAGCCACTGGTTATAGAGGAGATAGAAGTGAGTCCACCTCAACCTCTTGAG
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CAGTCTCTTTTGCCCCGTATCTTTGGCCATGAAGCTGCAGGTATAGTGGAGAGTATAGGG
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GGGTCATGTCGGCATTGCATCTCTGGTAAAAGTAACATGTGTCAGGTTCTTGGAATGGAG
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TACCATTACTGCGCGGTTTCGAGTTTCAGTGAGTACACTGTGGTTCACTCTGGCTGTGCT
GTCAAAGTCCATCCTCTTGCACCTCTCCACAAAATATGTCTCCTCAGCTGTGGAGCAGCC
GCAGGTCTTGGTGCAGCATGGAACGTTGCTGATGTACAAAGAGGTTCAAGTGTTGTGATA
TTTGGTCTAGGAACTGTGGGTCTTTCGGTTGCTCAAGGAGCCAAACTCAGAGGTGCAGCT
CAAATTATTGGTGTTGATATCAACTCCTCTAAGGCTGAACAAGCAAAGACATTTGGCGTC
ACAGATTTCATCAACTCAAGTGACATCTTTGAGCCCATACACCAGGTAATCAAGAGAATG
ACTGGAGGAGGTGCAGATTTTTCATTTGAATGTGTTGGTGATACAGGAGTAGCTACAACT
GCTTTACAATCATGTTCAGATGGATGGGGCATGACCGTTACTCTAGGTGTACCGAAAGTG
AAGCCTGAAGTTTCAGCTCACTACGGACTCTTTCTTTCAGGGAAGTCGTTGAAAGGGACT
CTCTTTGGTGGGTGGAAGCCTAAGTTTGATCTTCCTTCACTCATTGAAAAGTACATGAAC
AAGGAAATTATGATTGATGAGTTGGTCACTCATGATCTAGCGTTTGATGATATTAACGAA
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TTCGGTTTGTGTTACCTATGTAGTGACCTACCATTTGAAATTATAAAGCAAATCACTTTG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A236TF U 1
AF RS1A236TV U 37
AF RS1A236TR C 804
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BS 1 720 RS1A236TF
BS 721 863 RS1A236TV
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BS 1142 1500 RS1A236TR

RD RS1A236TF 720 0 0
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CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAGGTGAAGCTCTGTTTCTTCATCCCCTTCTTCT
TCTCTCTCTCTCTCTAGGGTACCTTCATTTTGTTTTTGAAGCAAAACTGTGATAACAATG
TCGTCGTCTTCCTCCCACGAACAACCGCGAGTCATAACCTGCAAAGCCGCGGTGGCGTGG
CGAGCTGGTGAGCCACTGGTTATAGAGGAGATAGAAGTGAGTCCACCTCAACCTCTTGAG
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CAGTCTCTTTTGCCCCGTATCTTTGGCCATGAAGCTGCAGGTATAGTGGAGAGTATAGGG
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GGGTCATGTCGGCATTGCATCTCTGGTAAAAGTAACATGTGTCAGGTTCTTGGAATGGAG
AGGAGAGGTTTGATGCATAGTGATCAGAAGACACGCTTCTCCATCAAAGGCAAACCTGTT
TACCATTACTGCGCGGTTTCGAGTTTCAGTGAGTACACTGTGGTTCACTCTGGCTGTGCT
GTCAAAGTCCATCCTCTTGCACCTCTCCACAAAATATGTCTCCTCAGCTGTGGAGCAGCC

QA 1 720 1 720
DS 

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TCTGTTTCTTCATCCCCTTCTTCTTCTCTCTCTCTCTCTAGGGTACCTTCATTTTGTTTT
TGAAGCAAAACTGTGATAACAATGTCGTCGTCTTCCTCCCACGAACAACCGCGAGTCATA
ACCTGCAAAGCCGCGGTGGCGTGGCGAGCTGGTGAGCCACTGGTTATAGAGGAGATAGAA
GTGAGTCCACCTCAACCTCTTGAGATCAGAATCAAAGTTGTCTGTACATCTCTCTGTCGC
AGCGACCTATCCGCTTGGGAGTCTCAGTCTCTTTTGCCCCGTATCTTTGGCCATGAAGCT
GCAGGTATAGTGGAGAGTATAGGGGAAGGCGTGACAGAGTTTGAGAAAGGAGATCACGTG
CTCGCTGTCTTCACTGGAGAATGCGGGTCATGTCGGCATTGCATCTCTGGTAAAAGTAAC
ATGTGTCAGGTTCTTGGAATGGAGAGGAGAGGTTTGATGCATAGTGATCAGAAGACACGC
TTCTCCATCAAAGGCAAACCTGTTTACCATTACTGCGCGGTTTCGAGTTTCAGTGAGTAC
ACTGTGGTTCACTCTGGCTGTGCTGTCAAAGTCCATCCTCTTGCACCTCTCCACAAAATA
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GGAGCCAAACTCAGAGGTGCAGCTCAAATTATTGGTGTTGATATCAA

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DS 

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CATCTTTGAGCCCATACACCAGGTAATCAAGAGAATGACTGGAGGAGGTGCAGATTTTTC
ATTTGAATGTGTTGGTGATACAGGAGTAGCTACAACTGCTTTACAATCATGTTCAGATGG
ATGGGGCATGACCGTTACTTTAGGTGTACCGAAAGTGAAGCCTGAAGTTTCAGCTCACTA
CGGACTCTTTTTTTCAGGGAAGTCGTTGAAAGGGACTTTCTTTGGTGGGTGGAAGCCTAA
GTTTGATCTTCCTTCACTCATTGAAAAGTACATGAACAAGGAAATTATGATTGATGAGTT
GGTCACTCATGATCTAGCGTTTGATGATATTAACGAAGCTTTTGAGCTTATGAGAGAGGG
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DS 

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TCAGGGAAGTCGTTGAAAGGGACTCTCTTTGGTGGGTGGAAGCCTAAGTTTGATCTTCCT
TCACTCATTGAAAAGTACATGAACAAGGAAATTATGATTGATGAGTTGGTCACTCATGAT
CTAGCGTTTGATGATATTAACGAAGCTTTTGAGCTTATGAGAGAGGGGAAGTGTTTGCGT
TGTGTTCTTCATATGTCAAAGTAATGTGTTTGAGAGAACATGTGTACAGTTTCAAGAAAG
AATTTGTTTTTATTACAGCTGGTGTATCGATCTCTCTTGTTATGTGAAACAACAATTGAT
TTTGTTGTGAAGACGCAGTTTTGATTCGGTTTGTGTTACCTATGTAGTGACCTACCATTT
GAAATTATAAAGCAAATCACTTTG

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DS 



AS 1 3

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ATTTCAATAAAAAGCATATTGGAAGAGACTTATTATACACTAAAAAAGAGTCTAAAACAC
AGCTTCAACAAGTATGTGTCTCTTATTAGAGCCAAACCCAACAATGTGGTTTAGATAAAC
TCTTCCTCCCTTCACAGTAGCTGACGAGACTAACCGATGAACCATACCGGTGTTGAACCA
TCCTGTCACTGAAGCCGTCCTCCACCCGTCTGAGCTCTCCACCAACTTCGCTGAAGGGCT
ACCTGCGACAACAATCTTAGTAGGAGACAACAACTCAAGCCCATCACCAAACCTCAAAGT
GCCACCACCAACTTCAATGACACTGACCTTGTTACTACTATCATCCCCATCGGCTGTTAG
GTCGATTTTGTACAAAAAACCGGAGAAAGTGTGGATAACGATGAGGAAACCGTCAGGGTG
ATAAACAATGCCGTTAAGAGCGACGAGGTTATTGTACCATCCAGGTGGAGTGAAGAGAGG
GCTCTCAATGGTCGACACAAGCTCTCCACTGACATCAACTTTCCATATTTTACTGCCTTT
TGCATCAGTAACATAAGCATTGCCACGTGCATCAATAGCTACATCGTCCGCAAATGATTT
CTCCTTACCTACATTTTCATCAAAACATATTAACAAAACAAGAAACAGAGAGACAGAGCT
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CTCGGTCGATAGGACTACAGTGACTTCTTGGAGAACGTCGCTGTTACCGTCTCTAGGAGG
AACAAGCTCTCCGATTCCGCCTCCGTCCATGAAGGATACGAGGAATCTCCGACCTATGCC
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GAGAGCGACGGAGAAACGGCCGGAGCAAAACGATGGCGACATTTTTGAAAAGGAAGAAGA
GAGGCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GD18JQ U 1
AF RS1DF46JQ U 1
AF RS1DF46TF C 475
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BS 458 776 RS1DF46JQ
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RD RS1GD18JQ 683 0 0
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CTCCTTAC
TCTGGCCGCTGAGCT

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DS 

RD RS1DF46JQ 781 0 0
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TCTTCCTTCCTTCACAGTAGCTGACGAGACTAACCGATGAACCATACCGGTGTTGAACCA
TCCTGTCACTGAAGCCGTCCTCCACCCGTCTGAGCTCTCCACCAACTTCGCTGAAGGGCT
ACCTGCGACAACAATCTTGGTAGGAGACAACAACTCAAGCCCATCACCAAACCTCAAAGT
GTCACCACCAACTTCAATGACACTGACCTTGTTACTACTATCATCCCCATCGGCTGTTAG
GTCGATTTTGTATAAGAGACCGGAGAAAGTGTGGATGACGATGAGGAAACCGTCAGGGTG
ATAAACAATGCCGTTAAGAGCGACGAGGTTATTGTACCATCCAGGTGGAGTGAAGAGAGG
GCTCTCAATGGTCGACACAAGCTCTCCACTGACATCAACTTTCCATATTTTACTGCCTTT
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CTCCTTACCTACATTTTCATCAAAACATATTAACAAAACAAGAAACAGAGAGACAGAGCT
TACTCTGGCCGCTGAGCTCAGCGACGAAGACACGACGCCACGTGGACAGCTCATAG
CAGCT

QA 1 776 1 776
DS 

RD RS1DF46TF 673 0 0
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GAGAGGGCTCTCAATGGTCGACACAAGCTCTCCACTGACATCAACTTTCCATATTTTACT
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TGATTTCTCCTTACCTACATTTTCATCAAAACATATTAACAAAACAAGAAACAGAGAGAC
AGAGCTTACTCTGGCCGCTGAGCTCAGCGACGAAGACACGACGCCACGTGGACAGCTCAT
AGGCAGCTAAAGCGCTGTAGCGGTTTCCAAGCAAATCGGCGACAGCGACGAGGAGACGGT
TCCTGTCTCGGTCGATAGGACTACAGTGACTTCTTGGAGAACGTCGCTGTTACCGTCTCT
AGGAGGAACAAGCTCTCCGATTCCGCCTCCGTCCATGAAGGATACGAGGAATCTCCGACC
TATGCCGTCCCATTTAGCACACTCGCGGAAGAAGCCTGAGCTGTGGTAAGAGAAGACGTG
CGTCGAGGGAGCGGCTCGCTCTAGGCAAATGAGGTAAGCTATGGGAACGGCGGAGATGAC
GAGGAAGAGAGCGACGGAGAAACGGCCGGAGCAAAACGATGGCGACATTTTTGAAAAGGA
AGAAGAGAGGCCC

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 4

CO CL2594Contig1 1351 4 8 U
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BQ
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QA 2 545 2 545
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AS 1 4

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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1DR36TF U 4
AF RS1GB16TF U 1
AF RS1DR36JQ C 83
AF RS1GB16JQ C 540
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RD RS1DR36TF 615 0 0
GG
AACCAAAGAACCAAACCGAAAAAACACACACACTTTACTCACAACACAAAGAAGATAAGA
GAGAGATGGCGACGTCGGGAACATATGTGACTGAGGTACCGTTGAAAGGATCGGCGGAGA
AACACTACAAGCGATGGATAAATGAGAACCACGTCTTTCCCGACGCCATTGGCCACCACA
TCCAAAGTGTCACCGTCCACGACGGTGATTGGGACTCTCATGGGGCCATCAAGATTTGGA
ACTACACATGCGATGGGAAACCGGAGGTGTACAAGGAGAGGAGAGAAATCGACGACGAGA
ACAATGCTGTCATTTTTAGAGGTCTTGAAGGACACCCGATGGAAACTCTTAAGGTGTATG
ATGCCATCTTACAGTTCATTCAAAAGTCGCCTGATGATATCATCTGCAAGATCACTATGA
TCTGGGAGAAGCGAACCGATGACTCGCCTGAGCCCATCAACTACATGAAGTTTGTCAAGA
GCATGGTTGCTGATATGGACAACCATGTCGTCAAAGCTTAAAAAAATCCCATCCTCCCCT
ATGACCCTATCTTTCGAACCATCATCGTCATATATGGCTCCATTCGTGTATGTGTGTGTC
GGTTTATCTGTTG

QA 3 615 3 615
DS 

RD RS1GB16TF 705 0 0
GGATCAACCAAAGAACCAAACCGAAAAAACACACACACTTTACTCACAACACAAAGAAGA
TAAGAGAGAGATGGCGACGTCGGGAACATATGTGACTGAGGTACCGTTGAAAGGATCGGC
GGAGAAACACTACAAGCGATGGAGAAATGAGAACCACGTCTTTCCCGACGCCATCGGCCA
CCACATCCAAAGTGTCACCGTCCACGACGGTGAATGGGACTCTCATGGGGCCATCAAGAT
TTGGAACTACACATGCGATGGGAAACCGGAGGTGTACAAGGAGAGGAGAGAAATCGACGA
CGAGAACAATGCTGTCATTTTTAGAGGTCTTGAAGGACACCCGATGGAAACTCTTAAGGT
GTATGATGCCATCTTACAGTTCATTCAAAAGTCGCCTGATGATATCATCTGCAAGATCAC
TATGATCTGGGAGAAGCGAACCGATGACTCGCCTGAGCCCATCAACTACATGAAGTTTGT
CAAGAGCATGGTTGCTGATATGGACAACCATGTCGTCAAAGCTTAAAAAAATCCCATCCT
CCCCTATGACCCTATCTTTCGAACCATCATCGTCATATATGGCTCCATTCGTGTATGTGT
GTGTCGGTTTATCTGTTGAAATCAATATAATAAATAAAGAGGCTCATGTATGGTATTATT
AATTACGATTACTGCTTGCGGTTTGTAATATGCTTTCATGTTGTT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RS1DR36JQ 675 0 0
GGAACATATGTGACTGAGGTACCGTTGAAAGGATCGGCGGAGAAACACTACAAGCGATGG
ATAAATGAGAACCACGTCTTTCCCGACGCCATTGGCCACCACATCCAAAGTGTCACCGTC
CACGACGGTGATTGGGACTCTCATGGGGCCATCAAGATTTGGAACTACACATGCGATGGG
AAACCGGAGGTGTACAAGGAGAGGAGAGAAATCGACGACGAGAACAATGCTGTCATTTTT
AGAGGTCTTGAAGGACACCCGATGGAAACTCTTAAGGTGTATGATGCCATCTTACAGTTC
ATTCAAAAGTCGCCTGATGATATCATCTGCAAGATCACTATGATCTGGGAGAAGCGAACC
GATGACTCGCCTGAGCCCATCAACTACATGAAGTTTGTCAAGAGCATGGTTGCTGATATG
GACAACCATGTCGTCAAAGCTTAAAAAAATCCCATCCTCCCCTATGACCCTATCTTTCGA
ACCATCATCGTCATATATGGCTCCATTCGTGTATGTGTGTGTCGGTTTATCTGTTGAAAT
CAATATAATAAATAAGGAGGCTCATGTATGGTATTATTAATTACGATTACTGCTTGCGGT
TTGTAATATGCTTTCATGTTGTTTAAAAAAAGGTTTATATGCTTTCATGTTTAATTATGC
TTAACCATTGATGGC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1GB16JQ 199 0 0
TCCCCTATGACCCTATCTTTCGAACCATCATCGTCATATATGGCTCCATTCGTGTATGTG
TGTGTCGGTTTATCTGTTGAAATCAATATAATAAATAAGGAGGCTCATGTATGGTATTAT
TAATTACGATTACTGCTTGCGGTTTGTAATATGCTTTCATGTTGTTTAAAAAAAGGTTTA
TATGCTTTCATGTTTAATT

QA 1 199 1 199
DS 



AS 2 4

CO CL2596Contig1 774 2 3 U
TTTTTTTAGCTGTAAATGAATACATTATGTTAATAATAATAATCTACACCCTTTGTAAAT
TAGCAAGTAGTAACTTCATCATAAGATTACACAGATCTCAGGGACATCTCTCGACCCAAT
TTTTTCAACAACAGTACACACATTTATTCAGCATAGGTCCTAATATATTCACACAAACCA
GCTTACAAAAGGAATACTGAACCGGCGACAATAAACCCCATGAGCACGAGCACGACCCTC
CCCAGACCAGTGGCTAGTACACTAGAACCCGAGGCGCTGTTGCAGTAATTGAAACCATAC
CATATATTCTCAGGGACTAGCGTGTTATACGGGAAGGTGACGACTTTGGAGCCATGGGTA
GATATCTTAACGCTATCAGGGATCCAGCCATCGGGACCAGACCTGTAGAGATAGACGTAG
CATATCTGGTAAGTGCATGGTCCGTTTATCTGGAACGTGTCGGATGAACATTGCTCGAAC
GTCTTTGTAGCTGGATCGTCAAGCCTTGGTGCGTATATCTGGTTTCCGTATGCATCGCCG
AAAGCGAGGCTGATTTGATCGCGCGTGTACCTCGACGACGAACAGCTCGTCGAGATGATC
ACTGTGTACGAACAACTAGTCCTCAATTTCTGGATGAGGCTGACATTGAAAGACTCAGCG
GCGTGAGGAGTCTCCAAGAGTTTGGATTCGGTCACTGAGACGGAGATTGACAAGACGAAG
ATGAGGTGAGTGAAGAGACGTGTTGACACCATTTTTTTTTCTTTTGCTTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CL52JQ U 7
AF RS1CL52TF C 1
BS 1 10 RS1CL52TF
BS 11 577 RS1CL52JQ
BS 578 774 RS1CL52TF

RD RS1CL52JQ 571 0 0
AGCT
TGTAAATGAATACATTATGTTAATAATAATAATCTACACCCTTTGTAAATTAGCAAGTAG
TAACTTCATCATAAGATTACACAGATCTCAGGGACATCTCTCGACCCAATTTTTTCAACA
ACAGTACACACATTTATTCAGCATAGGTCCTAATATATTCACACAAACCAGCTTACAAAA
GGAATACTGAACCGGCGACAATAAACCCCATGAGCACGAGCACGACCCTCCCCAGACCAG
TGGCTAGTACACTAGAACCCGAGGCGCTGTTGCAGTAATTGAAACCATACCATATATTCT
CAGGGACTAGCGTGTTATACGGGAAGGTGACGACTTTGGAGCCATGGGTAGATATCTTAA
CGCTATCAGGGATCCAGCCATCGGGACCAGACCTGTAGAGATAGACGTAGCATATCTGGT
AAGTGCATGGTCCGTTTATCTGGAACGTGTCGGATGAACATTGCTCGAACGTCTTTGTAG
CTGGATCGTCAAGCCTTGGTGCGTATATCTGGTTTCCGTATGCATCGCCGAAAGCGAGGC
TGATTTGATCGCGCGTGTACCTCGACG

QA 5 571 5 571
DS 

RD RS1CL52TF 774 0 0
TTTTTTTAGCTGTAAATGAATACAT*ATGT*AATAATAATAATCTACACC*TTTGTAAAT
TAGCAAGTAGTAACTTCATCATAAGATTACACAGATCTCAGGGACATCTCTCGACCCAAT
TTTT*CAACAACAGTACACACATTTATTCAGCATAGGTCCTAATATATTCACACAAACCA
GCTTACAAAAGGAATACTGAACCGGCGACAATAAACCCCATGAGCACGAGCACGACCCTC
CCCAGACCAGTGGCTAGTACACTAGAACCCGAGGCGCTGTTGCAGTAATTGAAACCATAC
CATATATTCTCAGGGACTAGCGTGTTATACGGGAAGGTGACGACTTTGGAGCCATGGGTA
GATATCTTAACGCTATCAGGGATCCAGCCATCGGGACCAGACCTGTAGAGATAGACGTAG
CATATCTGGTAAGTGCATGGTCCGTTTATCTGGAACGTGTCGGATGAACATTGCTCGAAC
GTCTTTGTAGCTGGATCGTCAAGCCTTGGTGCGTATATCTGGTTTCCGTATGCATCGCCG
AAAGCGAGGCTGATTTGATCGCGCGTGTACCTCGACGACGAACAGCTCGTCGAGATGATC
ACTGTGTACGAACAACTAGTCCTCAATTTCTGGATGAGGCTGACATTGAAAGACTCAGCG
GCGTGAGGAGTCTCCAAGAGTTTGGATTCGGTCACTGAGACGGAGATTGACAAGACGAAG
ATGAGGTGAGTGAAGAGACGTGTTGACACCATTTTTTTTTCTTTTGCTTCTCCC

QA 1 774 1 774
DS 



CO CL2596Contig2 757 2 2 U
GGGAGAAGCAAAAGAAAAGAACATGGTGTCAACACGTCTCTTCACTCATCTCATCTTCGT
CTTGTCAATCACCGTCTCAGTTACCGAATCCAAACTCTTGGAGACTCCTCACGCCGCTGA
GTCTTTCAATGTCAGCCTCATCCAGAAATTGAGGACTAGTTGTTCGTACACAGTGATCAT
CTCGACGAGCTGTTCGTCGTCGAGGTACACGCGCGATCAAATCAGCGTCGCTTTCGGAGA
TGCATACGGAAACCAGATATACGCACCAAGGCTTGACGATCCAGCTACAAAGACTTTCGA
GCAATGTTCATCCGACACGTTCGAGATAAAAGGACCATGCACATACCAGATATGCTACGT
CTATCTCTACAGGTCTGGTCCCGATGGCTGGATCCCTGATAGCGTTAAGATATCTACCCA
TGGCTCCAAACCCGTCGCCTTCCCGTATAACACGCTTGTCCCTGAGAACATATGGTATGG
TTTCAATTACTGCAACAGCGCCTCGGGTTCTAGTGTCGTAGCCACTGGTCTCGGAAGGGT
CGTGCTCGTGCTCATGGGGTTTGTTGTCGTCGGTTTGACATTGCTTTTGTAAGCTGGTTT
GTGTGAATATATTTAGGACTTATGCTGAATAAATGTGTGTACTGTTGTTGAAAAAATTGG
GTCAAGAGATGTCCCTGAGATCTGTGTAATCTTATGATGAAGTTACTACTTGCTAATTTA
CCAAGTGTGTAGATTATTATTAACGTAACGTATCCAG


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CY04TF U 1
AF RS1CY04JQ C 2
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BS 398 757 RS1CY04JQ

RD RS1CY04TF 397 0 0
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CTTGTCAATCACCGTCTCAGTTACCGAATCCAAACTCTTGGAGACTCCTCACGCCGCTGA
GTCTTTCAATGTCAGCCTCATCCAGAAATTGAGGACTAGTTGTTCGTACACAGTGATCAT
CTCGACGAGCTGTTCGTCGTCGAGGTACACGCGCGATCAAATCAGCGTCGCTTTCGGAGA
TGCATACGGAAACCAGATATACGCACCAAGGCTTGACGATCCAGCTACAAAGACTTTCGA
GCAATGTTCATCCGACACGTTCGAGATAAAAGGACCATGCACATACCAGATATGCTACGT
CTATCTCTACAGGTCTGGTCCCGATGGCTGGATCCCT

QA 1 397 1 397
DS 

RD RS1CY04JQ 756 0 0
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TTGTCAATCACCGTCTCAGTTACCGAATCCAAACTCTTGGAGACTCCTCACGCCGCTGAG
TCTTTCAATGTCAGCCTCATCCAGAAATTGAGGACTAGTTGTTCGTACACAGTGATCATC
TCGACGAGCTGTTCGTCGTCGAGGTACACGCGCGATCAAATCAGCGTCGCTTTCGGAGAT
GCATACGGAAACCAGATATACGCACCAAGGCTTGACGATCCAGCTACAAAGACTTTCGAG
CAATGTTCATCCGACACGTTCGAGATAAAAGGACCATGCACATACCAGATATGCTACGTC
TATCTCTACAGGTCTGGTCCCGATGGCTGGATCCCTGATAGCGTTAAGATATCTACCCAT
GGCTCCAAACCCGTCGCCTTCCCGTATAACACGCTTGTCCCTGAGAACATATGGTATGGT
TTCAATTACTGCAACAGCGCCTCGGGTTCTAGTGTCGTAGCCACTGGTCTCGGAAGGGTC
GTGCTCGTGCTCATGGGGTTTGTTGTCGTCGGTTTGACATTGCTTTTGTAAGCTGGTTTG
TGTGAATATATTTAGGACTTATGCTGAATAAATGTGTGTACTGTTGTTGAAAAAATTGGG
TCAAGAGATGTCCCTGAGATCTGTGTAATCTTATGATGAAGTTACTACTTGCTAATTTAC
CAAGTGTGTAGATTATTATTAACGTAACGTATCCAG

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 3

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TAAAAAAAGAAAGCTTCACAAAAATGTCAACTGGTCCAGAAAACAAGAAGGCAGAAAAAT
AAACTGATTCCATTATCCTAAAACCCCACCCAAGCATAAACTTTTTAGTTACACAACCAC
CCAAGCATCACTGTCGGATCCTGCATCTTCATTGCCGGGTCCTGCATCTTCGAGGTCCAA
CTCTTCAACACCTTTTGCGAGTTCCATCATTTGAATCGCGCCTGCTCTCTCAGTTTTAGG
AGTTTCAACATCGTCCACAACCACGTATTCTTCATCAGTCAGCGAACCCGCAGATGCTGT
TTCGGATAAATCGACTTTCTCCAGAGAGGTTCTAACAGCCTTGACAGATGATTCTTCGTC
ATCACTCTCAGAGTCGAACCCATCCTCGAGAGATGAATAGGCAATGAAATCGTTGTAGAG
CGCGTAGGTGTCGTAAACGGGCTGTCTCTTAAAGGGTCGGATCAAATACGGTAAAGGAAT
CCTCCTCTTGCGAGATTCCATGGATTTGAACGAAGTTGCATGAACTGGTGCCAGTGTTGC
CATGATCTTGGACGATTAAGGGGATATCGATAATCAAGAAACTTTCAAATCAGGGAAGAA
GAAGAAGAAGAGATTAGCGTTGATGTAAACCCC


BQ
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AF RS1H541JQB U 6
AF RS1ES73JQ U 2
AF RS1ES73TF C 1
BS 1 6 RS1ES73TF
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BS 452 624 RS1ES73JQ
BS 625 693 RS1ES73TF

RD RS1H541JQB 446 0 0
GAAAA
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AA*CTTCACAAAAATGTCAACTGGTCCAGAAAACAAGAAGGCAGAAAAATAAACTGATTC
CATTATCCTAAAACCCCACCCAAGCATAAACTTGTTAGTTACACAACCACCCAAGCATCA
CTGTCGGATCCTGCATCTTCATTGCCGGATCTTGCATCTTCGAGGTCCAACTCTTCAACA
CCTTTTGCGAGTTCCATCATTTGAATCGCGCCTGCTCTCTCAGTTTTAGGAGTTTCGACA
TCGTCCACAACCACGTATTCTTCATCAGTCAGCGAACCCGCAGATGCAGTTTCGGATAAA
TCGACTTTCTCCAGAGAGGTTCTAACAGCCTTGACAGATGATTCTTCGTCATCACTCTCA
GAGTCGAACCCATCCTCGAGA

QA 6 446 6 446
DS 

RD RS1ES73JQ 623 0 0
CGAAA
AAAACAAAGGATCAATTATTCAATCGGAAACCATCTTGTTATATGTACTGATCATAAAAA
AAGAAAGCTTCACAAAAATGTCAACTGGTCCAAAAAACAAGAAGGCAGAAAAATAAACTG
ATTCCATTATCCTAAAACCCCACCCAAGCATAAACTTTTTAGTTACACAACCACCCAAGC
ATCACTGTCGGATCCTGCATCTTCATTGCCGGGTCCTGCATCTTCGAGGTCCAACTCTTC
AACACCTTTTGCGAGTTCCATCATTTGAATCGCGCCTGCTCTCTCAGTTTTAGGAGTTTC
AACATCGTCCACAACCACGTATTCTTCATCAGTCAGCGAACCCGCAAATGCTGTTTCGGA
TAAATCGACTTTCTCCAGAGAGGTTCTAACAGCCTTGACAGATGATTCTTCGTCATCACT
CTCAGAGTCGAACCCATCCTCGAGAGATGAATAGGCAATGAAATCGTTGTAGAGCGCGTA
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CTTGCGAGATTCCATGGATTTGAACGAAGTTGCATGAACTGGTGCCAGTGTTGCCATGAT
CTTGGACGATTAAGGGGA

QA 6 623 6 623
DS 

RD RS1ES73TF 693 0 0
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TAAAAAAAGAAAGCTTCACAAAAATGTCAACTGGTCCAGAAAACAAGAAGGCAGAGAAAT
AAACTGATTCCATTATCCTAAAACCCCACCCAAGCATAAACTTTTTAGTTACACAACCAC
CCAAGCATCACTGTCGGATCCTGCATCTTCATTGCCGGGTCCTGCATCTTCGAGGTCCAA
CTCTTCAACACCTTTTGCGAGTTCCATCATTTGAATCGCGCCTGCTCTCTCAGTTTTAGG
AGTTTCAACATCGTCCACAACCACGTATTCTTCATCAGTCAGCGAACCCGCAGATGCTGT
TTCGGATAAATCGACTTTCTCCAGAGAGGTTCTAACAGCCTTGACAGATGATTCTTCGTC
ATCACTCTCAGAGTCGAACCCATCCTCGAGAGATGAATAGGCAATGAAATCGTTGTAGAG
CGCGTAGGTGTCGTAAACGGGCTGTCTCTTAAAGGGTCGGATCAAATACGGTAAAGGAAT
CCTCCTCTTGCGAGATTCCATGGATTTGAACGAAGTTGCATGAACTGGTGCCAGTGTTGC
CATGATCTTGGACGATTAAGGGGATATCGATAATCAAGAAACTTTCAAATCAGGGAAGAA
GAAGAAGAAGAGATTAGCGTTGATGTAAACCCC

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 4

CO CL2598Contig1 927 4 14 U
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CGCTCATCTACTACTCCTGGACCGAAGGTTCCAGGGGAGGCAACGAAAACAGGCACCTCC
ATAGTTGACACCGCCACCTCCGCCGTGCAAAGTTTTGCTCCGGTTAACCAAATCCACCAA
CATCTCTGCGCGTTCCATTTCTATGCTTACGACATGACACGACAAGTGGAGGCTCACCAT
TTCTGCAGTCACGTGAACGAAGAGATGCGTCAATGTCTGATCTACGACGGTCCGGATGCA
AACGCTCGTCTGATCGGATTGGAGTACATCGTAACAGAGAAATTGTTCATGACTTTGCCT
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ATGCCTGGTGTTCCTGGTCCCATTCAGCGTCAAGATCTTGACAAAGTCGCCAAGACTTAT
GGAAAAGTTTTCCATTTTTGGCAAGTTGATTTGGGCCATGATCTTCCCATTGGCTTACCT
AATGTCATGATGGCCGTTACCCGCGATGGCCAACTTTTCCACGAGATGATTCAGGAGACA
GAAAAGCGGTTTGGGGTATCGATCGAGGGAGAGAGGGAGGCCAGGGCGTACATGTCAGAG
CCAGAGCTCGGGATCCATCCATTGGCGAATGGAGGAGGTAAAGGGCTAAAACTAGAGTTG
CGAGAGGTCGATATCAAGTCGGTTGAGTCTGTCGCGGAAGCCGTTGTCTGAGTTTAGTTA
GACCTTTAATGTCAAATAATGCCATAAATCAAGCAACTTATGTTTTGGATAACAGTCATA
AGACTTATAGTTTGTCTTTTTTAATATATTTTGGATCTTAAATATTTATAAGTAGTAACA
AAATAAGAAATAACATCTTGTTAGCAG


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EL10TF U 115
AF RS1FH76TF U 1
AF RS1EL10JQ C 314
AF RS1FH76JQ C 167
BS 1 658 RS1FH76TF
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BS 660 697 RS1FH76TF
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BS 699 726 RS1FH76TF
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BS 728 743 RS1FH76TF
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BS 780 788 RS1FH76TF
BS 789 927 RS1FH76JQ

RD RS1EL10TF 623 0 0
GG
CTCCATAGTTGACACCGCCACCTCCGCCGTGCAAAGTTTTGCTCCGGTTAACCAAATCCA
CCAACATCTCTGCGCGTTCCATTTCTATGCTTACGACATGACACGACAAGTGGAGGCTCA
CCATTTCTGCAGTCACGTGAACGAAGAGATGCGTCAATGTCTGATCTACGACGGTCCGGA
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GCCTGACGAAGAGAAGAAACTTTGGCACACGCACGAGTGGGAAGTGAAAGGAGGGTTCTT
GTTCATGCCTGGTGTTCCTGGTCCCATTCAGCGTCAAGATCTTGACAAAGTCGCCAAGAC
TTATGGAAAAGTTTTCCATTTTTGGCAAGTTGATTTGGGCCATGATCTTCCCATTGGCTT
ACCTAATGTCATGATGGCCGTTACCCGCGATGGCCAACTTTTCCACGAGATGATTCAGGA
GACAGAAAAGCGGTTTGGGGTATCGATCGAGGGAGAGAGGGAGGCCAGGGCGTACATGTC
AGAGCCAGAGCTCGGGATCCATCCATTGGCGAATGGAGGAGGTAAAGGGCTAAAACTAGA
GTTGCGAGAGGTCGATATCAA

QA 3 623 3 623
DS 

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CGCTCATCTACTACTCCTGGACCGAAGGTTCCAGGGGAGGCAACGAAAACAGGCACCTCC
ATAGTTGACACCGCCACCTCCGCCGTGCAAAGTTTTGCTCCGGTTAACCAAATCCACCAA
CATCTCTGCGCGTTCCATTTCTATGCTTACGACATGACACGACAAGTGGAGGCTCACCAT
TTCTGCAGTCACGTGAACGAAGAGATGCGTCAATGTCTGATCTACGACGGTCCGGATGCA
AACGCTCGTCTGATCGGATTGGAGTACATCGTAACAGAGAAATTGTTCATGACTTTGCCT
GACGAAGAGAAGAAACTTTGGCACACGCACGAGTGGGAAGTGAAAGGAGGGTTCTTGTTC
ATGCCTGGTGTTCCTGGTCCCATTCAGCGTCAAGATCTTGACAAAGTCGCCAAGACTTAT
GGAAAAGTTTTCCATTTTTGGCAAGTTGATTTGGGCCATGATCTTCCCATTGGCTTACCT
AATGTCATGATGGCCGTTACCCGCGATGGCCAACTTTTCCACGAGATGATTCAGGAGACA
GAAAAGCGGTTTGGGGTATCGATCGAGGGAGAGAGGGAGGCCAGGGCGTACATGTCAG*G
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CGAGAG*TCGATATCAAGTCGGT*GAGTCTGTCGCGGAAGC*GTTGTCTGAGTTTAGT*A
GACCTTTA
TGTCAATAATGCATAAATC

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DS 

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AACTTTGGCACACGCACGAGTGGGAAGTGAAAGGAGGGTTCTTGTTCATGCCTGGTGTTC
CTGGTCCCATTCAGCGTCAAGATCTTGACAAAGTCGCCAAGACTTATGGAAAAGTTTTCC
ATTTTTGGCAAGTTGATTTGGGCCATGATCTTCCCATTGGCTTACCTAATGTCATGATGG
CCGTTACCCGCGATGGCCAACTTTTCCACGAGATGATTCAGGAGACAGAAAAGCGGTTTG
GGGTATCGATCGAGGGAGAGAGGGAGGCCAGGGCGTACATGTCAGAGCCAGAGCTCGGGA
TCCATCCATTGGCGAATGGAGGAGGTAAAGGGCTAAAACTAGAGTTGCGAGAGGTCGATA
TCAAGTCGGTTGAGTCTGTCGCAGAAGCCGTTGTCTGAGTTTAGTTAGACCTTTAATGTC
AAATAATGCCATAAATCAAGCAACTTATGTTTTGGATAACAGTCATAAGACTTATAGTTT
G

QA 1 541 1 541
DS 

RD RS1FH76JQ 761 0 0
ACCAAATCCACCAACATCTCTGCGCGTTCCATTTCTATGCTTACGACATGACACGACAAG
TGGAGGCTCACCATTTCTGCAGTCACGTGAACGAAGAGATGCGTCAATGTCTGATCTACG
ACGGTCCGGATGCAAACGCTCGTCTGATCGGATTGGAGTACATCGTAACAGAGAAATTGT
TCATGACTTTGCCTGACGAAGAGAAGAAACTTTGGCACACGCACGAGTGGGAAGTGAAAG
GAGGGTTCTTGTTCATGCCTGGTGTTCCTGGTCCCATTCAGCGTCAAGATCTTGACAAAG
TCGCCAAGACTTATGGAAAAGTTTTCCATTTTTGGCAAGTTGATTTGGGCCATGATCTTC
CCATTGGCTTACCTAATGTCATGATGGCCGTTACCCGCGATGGCCAACTTTTCCACGAGA
TGATTCAGGAGACAGAAAAGCGGTTTGGGGTATCGATCGAGGGAGAGAGGGAGGCCAGGG
CGTACATGTCAGGGCCAGAGCTCGGGATCCATCCATTGGCGAATGGAGGAGGTAAAGGGC
TAAAACTAGAGTTGCGAGAGGTCGATATCAAGTCGGTTGAGTCTGTCGCGGAAGCCGTTG
TTTGAGTTTAGTTAGACCTTTAATGTCAAATAATGCCATAAATCAAGCAACTTATGTTTT
GGATAACAGTCATAAGACTTATAGTTTGTCTTTTTTAATATATTTTGGATCTTAAATATT
TATAAGTAGTAACAAAATAAGAAATAACATCTTGTTAGCAG

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 4

CO CL2599Contig1 1198 4 15 U
GGGAGCAAATCTCACGGATGTTTTAGCTCTCGAGAGATTCCGCCATGGATGTCGCTTCTG
CTCGGGGCATCATCTCTTCACATCCTCCATATTATAGTAAACCAATTTGTTCATCACAGT
CATCGTCGATTCGCATTACGATCAATAAAGGATGTCTATTTGGTCGTGTTTCGAGCTTGA
GTACTACTTCCCTTCATGCTGCTCCTAGAGGAGAAACAAGGCGTACTGGTTGTGTACAGT
TGTGTAACCGCTCTATAAGATGCGACAAGAACTCACGGAGGTTAGTTAGTGTGAGGTCGG
ATCTTTCAGGAGCTGCTGCAACCCCTGAATCTACTACTTATCCAGAACCAGAGATTAAGT
TGAGCTCAAGACTCAGAGGGATATGCTTTTGCCTCGTCGCTGGCGTTTCCGCCATCGTTC
TCATCGTCCTGATGATTATCGGCCATCCTTTTGTACTTCTCTTTGACCGCTACAGGAGAA
AGTTCCATCACTTTATTGCTAAACTCTGGGCTTCCATAAGCATCTACCCGTTCTACAAAA
CCGAGATCCAAGGCTTGGAGAATCTGCCGTCACCCGACACTCCTTGTGTTTATGTTTCAA
ACCATCAGAGTTTTCTGGATATATACACGCTTCTCAGCCTTGGCCAAAGCTATAAGTTCA
TCAGCAAGACGGGGATATTCGTTATTCCTGTTATTGGTTGGGCCATGTCCATGATGGGCG
TTGTTCCCTTGAAGCGGATGGACCCAAGAAGCCAAGTGGATTGCTTGAAACGATGCATGG
AGCTAGTGAAGAAGGGAGCATCTGTGTTTTTCTTCCCGGAAGGAACGCGGAGTAAGGATG
GTCGGTTAGGTCCTTTCAAGAAAGGTGCGTTTACGGTAGCAGCTAAGACAGGAGTTCCAG
TAGTGCCAATAACGCTGATGGGAACAGGGAAGATCATGCCGACGGGTAGTGAAGGTATAC
TGAATCATGGGAATGTGAGAGTGATCATCCACAAGCCGATATACGGAAGCAAAGCTGATG
TTCTTTGTGACGAGGCCAGGAACAAGATAGCTGAATCTATAAATCTCTTGAGCTGAAACC
TTGTTTTTTTAATCAGTGGCTCTGATGAAACAATGAGAAAGGCTATGTCAATTTTTACAT
GTGGAAGAACAAAACATGTTCGGAATTATTGTTTAAAAAATAAAATTTAGGCTTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 10 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1D888TF U 1
AF RS1BI81TF U 30
AF RS1BI81JQ C 460
AF RS1D888JQ C 635
BS 1 40 RS1D888TF
BS 41 41 RS1BI81TF
BS 42 262 RS1D888TF
BS 263 263 RS1BI81TF
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BS 731 731 RS1D888JQ
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RD RS1D888TF 661 0 0
GGGAGCAAATCTCACGGATGTTTTAGCTCTCGAGAGATTCTGCCATGGATGTCGCTTCTG
CTCGGGGCATCATCTCTTCACATCCTCCATATTATAGTAAACCAATTTGTTCATCACAGT
CATCGTCGATTCGCATTACGATCAATAAAGGATGTCTATTTGGTCGTGTTTCGAGCTTGA
GTACTACTTCCCTTCATGCTGCTCCTAGAGGAGAAACAAGGCGTACTGGTTGTGTACAGT
TGTGTAACCGCTCTATAAGATGTGACAAGAACTCACGGAGGTTAGTTAGTGTGAGGTCGG
ATCTTTCAGGAGCTGCTGCAACCCCTGAATCTACTACTTATCCAGAACCAGAGATTAAGT
TGAGCTCAAGACTCAGAGGGATATGCTTTTGCCTCGTCGCTGGCGTTTCCGCCATCGTTC
TCATCGTCCTGATGATTATCGGCCATCCTTTTGTACTTCTCTTTGACCGCTACAGGAGAA
AGTTCCATCACTTTATTGCTAAACTCTGGGCTTCCATAAGCATCTACCCGTTCTACAAAA
CCGAGATCCAAGGCTTGGAGAATCTGCCGTCATCCGACACTCCTTGTGTTTATGTTTCAA
ACCATCAGAGTTTTCTGGATATATACACGCTTCTCAGCCTTGGCCAAAGCTATAAGTTCA
T

QA 1 661 1 661
DS 

RD RS1BI81TF 675 0 0
TCGAGAGATTCCGCCATGGATGTCGCTTCTGCTCGGGGCATCATCTCTTCACATCCTCCA
TATTATAGTAAACCAATTTGTTCATCACAGTCATCGTTGATTCGCATTACGATCAATAAA
GGATGTTTATTTGGTCGTGTTTCGAGCTTGAGTACTACTTCCCTTCATGCTGCTCCTAGA
GGAGAAACAAGGCGTACTGGTTGTGTACAGTTGTGTAACCGCTCTATAAGATGCGACAAG
AACTCACGGAGGTTAGTTAGTGTGAGGTCGGATCTTTCAGGAGCTGCTGCAACCCCTGAA
TCTACTACTTATCCAGAACCAGAGATTAAGTTGAGCTCAAGACTCAGAGGGATATGCTTT
TGCCTCGTCGCTGGCGTTTCCGCCATCGTTCTCATCGTCCTGATGATTATTGGCCATCCT
TTTGTACTTCTCTTTGACCGCTACAGGAGAAAGTTCCATCACTTTATTGCTAAACTCTGG
GCTTCCATAAGCATCTACCCGTTCTACAAAACCGAGATCCAAGGCTTGGAGAATCTGCCG
TCACCCGACACTCCTTGTGTTTATGTTTCAAACCATCAGAGTTTTCTGGATATATACACG
CTTCTCAGCCTTGGCCAAAGCTATAAGTTCATCAGCAAGACAGGGATATTCGTTATTC*T
GTTATTGGTTGGGCC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1BI81JQ 739 0 0
TCTTTGACCGCTACAGGAGAAAGTTCCATCACTTTATTGCTAAACTCTGGGCTTCCATAA
GCATCTACCCGTTCTACAAAACCGAGATCCAAGGCTTGGAGAATCTGCCGTCACCCGACA
CTCCTTGTGTTTATGTTTCAAACCATCAGAGTTTTCTGGATATATACACGCTTCTCAGCC
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ATTGCTTGAAACGATGCATGGAGCTAGTGAAGAAGGGAGCATCTGTGTTTTTCTTCCCGG
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CAGCTAAGACAGGAGTTCCAGTAGTGCCAATAACGCTGATGGGAACAGGGAAGATCATGC
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ATAAAATTTAGGCTTTTCT

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DS 

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CCCGGAAGGAACGCGGAGTAAGGATGGTCGGTTAGGTCCTTTCAAGAAAGGTGCGTTTAC
GGTAGCAGCTAAGACAGGAGTTCCAGTCGTGCCAATAACGCTGATGGGAACAGGGAAGAT
CATGCCGACGGGTAGTGAAGGTATACTGAATCATGGGAATGTGAGAGTGATCATCCACAA
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ATCTATAAATTTCTTGAGCTGAAACCTTGTTTTTTTAATCAGTGGCTTTGATGAAACAAT
TAGAAAGGCTATGTCAATTTTTACATGTGGAAGAACAAAACATGTTCGGAATTATTGTTT
AAAAAATAAAATTTAGGCTTTT
TT

QA 1 562 1 562
DS 



AS 1 4

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TGAGTATCGGATCCGACGAGCAACAGCTTCGTATCTGAGGGAAAAAGGAGAAGTTTTGGA
GGAAGAGAGTATAACACGGGAGTACGGTTTGTACACTGCAATGAATAATGTGATGAGATG
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TACTGGTCTTGGCGTTGGACCAGTCACCCCTGGGGATATAAGGAAGGCCACTCAACTGAG
GAAGAAACATACCACCGTCTTGGCGTTTCAAGTCGAGGTGACTCCGAAGGCGTCTCAACA
AGCTCAAACTTTGGGAGTCAAAATCATCTGTGGCGACACCATCCAACACCTGTGCCAACA
GTTTCGGGAGTTTAACAAGGAACTGGGAGAGGATAAGAAGGAGTCAGAGAGTGATGTAGC
ACAAGTCTCCCCATGCCTCCTTTCCATTTTACCCAAGTGCGTGCTCAACAAGGAAGACCC
AATTGTTTTGGGAGTTTATGTTGTTGAGGGTTTTGTTAAGGTAGGGACTCCCTTATGCAT
TCCAAACCGAGCTTTTGTCAATATAGGACGGGTTGCATGGATTCAGAAGGACCAGCGACC
CGTCGAGTTTGCCAGGGAAGGGGATATGGTGATTATCAAGATTGTTGCTGCTGACCCCAA
AACACAACAAGGGATGTTGCTGGGAATAGATTTTGACGAAACAGATGTGCTCGTCAGTCG
CACCTCCAGGGTAGCTGTTTACCAGGTCGAGATCAACCCGTCAAATGGAGAAAAAAAATA
GAACAAACAAACGAAATGCCCTCATCATTTGAGTGATCAAATCTTTTTGTCATTTATTTC
CTCTTGTTTTAAAGCTTCAATTTAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCGTCCTTGTAATATT
TACATGTGCCCCCTCTTTAATGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TCTGAAGAAGCCGCAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGGGGTTTATGCTATAGCTTCTAC
TTTTGGTTACTTGTACGAGTTGGTCCTACATTTGACATCACCGGAGGTGAATATTCCTGT
TACTGGTCTTGGCGTTGGACCAGTCACCCCTGGGGATATAAGGAAGGCCACTCAACTGAG
GAAGAAACATACCACCGTCTTGGCGTTTCAAGTCGAGGTGACTCCGAAGGCGTCTCAACA
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DS 

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A
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ACAGTTTCGGGAGTTTAACAAGGAACTGGGAGAGGATAAGAAGGAGTCAGAGAGTGATGT
AGCACAAGTCTCCCCATGCCTCCTTTCCATTTTACCCAAGTGCGTGCTCAACAAGGAAGA
CCCAATTGTTTTGGGAGTTTATGTTGTTGAGGGTTTTGTTAAGGTAGGGACTCCCTTATG
CATTCCAAACCGAGCTTTTGTCAATATAGGACGGGTTGCATGGATTCAGAAGGACCAGCG
ACCCGTCGAGTTTGCCAGGGAAGGGGATATGGTGATTATCAAGATTGTTGCTGCTGACCC
CAAAACACAACAAGGGATGTTGCTGGGAATAGATTTTGACGAAACAGATGTGCTCGTCAG
TCGCACCTCCAGGGTAGCTGTTTACCAGGTCGAGATCAACCCGTCAAATGGAGAAAAAAA
ATAGAACAAACAAACGAAATGCCCTCATCATTTGAGTGATCAAATCTTTTTGTCATTTAT
TTCCTCTTGTTTTAAAGCTTCAATTTAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCGTCCTTGTAAT
ATTTACATGTGCCCCCTCTTTAATGTT

QA 2 628 2 628
DS 



AS 2 4

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ATTCTCCTTCGTTCCTCCTTGGAGAATCAGATCTTGGAAGGTCCTCAGCTCAAGGAGAGG
AGGAGAAGAAGAAGGGTGAGGAGAGAGAGAGAGACTTTGAATTGAAGGATGTCTTCTTTC
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TCAGCTGATGGTGTTAGCTATCACAAGTCTTGCTTCAAATGCACTCACTGCAAATCCAGG
CTTCAGCTGAGTAGATATTCATCAATGGAAGGTGTGTTGTACTGTAAGCCTCATTATGAG
CAGCTCTTCAAGGAGTCTGGTAGCTTCACCAAGAACTTTCAGTCACCTGTTAAACCGGCT
GAGAAATCAAGTCCTGAGCTGACAAGGACCCCTAGCCGAGTTGCTGGTATGTTCTCAGGC
ACACAAGAAAAATGCGCCACTTGCAGTAAAACTGTCTATCCTATCGAAAAGGTAACAGTG
GAGAGCCAGACATATCACAAGTCCTGCTTCAAATGCTCACACGGAGGCTGCCCTATCTCA
CCATCAAACTACGCAGCTCTTGAAGGGATTCTCTACTGCAAGCACCATTTCGCTCAGCTT
TTCAAGGAAAAGGGAAACTACAACCACTTAATCAGATCTGCTTCCATCAAACGCTCTGCG
GCAGCCGCAGTCGCTGCTGGTACACCTGCAGCCGCCGTTCCTGAATCTTAAAAAACTCAA
TAATCCTCTCTCCTCCCTAGTCTAAATTGAAACTCAATGCCAACTGATTCAGTTTGTTTT
CTCTTTTATGCCTTTGTGTATGAGTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FI61TF U 48
AF RS1AM40TF U 1
BS 1 868 RS1AM40TF

RD RS1FI61TF 627 0 0
GGG
CAGATCCTCCATTCTCCTTCGTTCCTCCTTGGAGGATCAGATCTTGGAAGGTCCTCAGCT
CAAGGAGAGGAGGAGAAGAAGAAGGGTGAGGAGAGAGAGAGA**CTTTGAATTGAAGGAT
GTCTTCTTTCACAGGAACTCAGCAGAAATGCAAGGCTTGCGAGAAGACGGTGTACCCTGT
GGAGCTTCTCTCAGCTGATGGTGTTAGCTATCACAAGTCTTGCTTCAAATGCGCTCACTG
CAAATCCAGGCTTCAGCTGAGTAGATATTCATCAATGGAAGGTGTGTTGTACTGTAAGCC
TCATTATGAGCAGCTCTTCAAGGAGTCTGGTAGCTTCACCAAGAACTTTCAGTCACCTGT
TAAACCGGCTGAGAAATCAAGTCCTGAGCTGACAAGGACCCCTAGCCGAGTTGCTGGTAT
GTTCTCAGGCACACAAGAAAAATGCGCCACTTGCAGTAAAACTGTCTATCCTATCGAAAA
GGTAACAGTGGAGAGCCAGACATATCACAAGTCCTGCTTCAAATGCTCACACGGAGGCTG
CCCTATCTCACCATCAAACTACGCAGCTCTTGAAGGGATTCTCTACTGCAAGCACCATTT
CGCTCAGCTTTTCAAGGAAAAGGG

QA 4 627 4 627
DS 

RD RS1AM40TF 868 0 0
GGAATCTTCCGATCTTTTATTCTTCCTTCATCGCTTTGATCGTCATCACCCAGATCCTCC
ATTCTCCTTCGTTCCTCCTTGGAGAATCAGATCTTGGAAGGTCCTCAGCTCAAGGAGAGG
AGGAGAAGAAGAAGGGTGAGGAGAGAGAGAGAGACTTTGAATTGAAGGATGTCTTCTTTC
ACAGGAACTCAGCAGAAATGCAAGGCTTGCGAGAAGACGGTGTACCCTGTGGAGCTTCTC
TCAGCTGATGGTGTTAGCTATCACAAGTCTTGCTTCAAATGCACTCACTGCAAATCCAGG
CTTCAGCTGAGTAGATATTCATCAATGGAAGGTGTGTTGTACTGTAAGCCTCATTATGAG
CAGCTCTTCAAGGAGTCTGGTAGCTTCACCAAGAACTTTCAGTCACCTGTTAAACCGGCT
GAGAAATCAAGTCCTGAGCTGACAAGGACCCCTAGCCGAGTTGCTGGTATGTTCTCAGGC
ACACAAGAAAAATGCGCCACTTGCAGTAAAACTGTCTATCCTATCGAAAAGGTAACAGTG
GAGAGCCAGACATATCACAAGTCCTGCTTCAAATGCTCACACGGAGGCTGCCCTATCTCA
CCATCAAACTACGCAGCTCTTGAAGGGATTCTCTACTGCAAGCACCATTTCGCTCAGCTT
TTCAAGGAAAAGGGAAACTACAACCACTTAATCAGATCTGCTTCCATCAAACGCTCTGCG
GCAGCCGCAGTCGCTGCTGGTACACCTGCAGCCGCCGTTCCTGAATCTTAAAAAACTCAA
TAATCCTCTCTCCTCCCTAGTCTAAATTGAAACTCAATGCCAACTGATTCAGTTTGTTTT
CTCTTTTATGCCTTTGTGTATGAGTGTG

QA 1 868 1 868
DS 



CO CL2601Contig2 226 2 2 U
GTGTACCAAAAGCGACTGCGGCTGCCGCAAAACGTTTGATGGAAGCAAATTTGATTAAGT
GGTTGTAGCTTCCCTTTTCCTTGAAAAGCTGAACGAAATGGTGCTTGCAGTAAAAAATCC
CTTCAAGAACTGCGTAATTTGATGGGGAGATAGGGCAGCCTCCGTGTGAGCATTTGAAGC
AGGACTTGTGATATGTCTGGCTCTCCACTGTTACCTTTTCCATAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FI61JQ U 1
AF RS1AM40JQ U 53
BS 1 200 RS1FI61JQ
BS 201 226 RS1AM40JQ

RD RS1FI61JQ 200 0 0
GTGTACCAAAAGCGACTGCGGCTGCCGCAAAACGTTTGATGGAAGCAAATTTGATTAAGT
GGTTGTAGCTTCCCTTTTCCTTGAAAAGCTGAACGAAATGGTGCTTGCAGTAAAAAATCC
CTTCAAGAACTGCGTAATTTGATGGGGAGATAGGGCAGCCTCCGTGTGAGCATTTGAAGC
AGGACTTGTGATATGTCTGG

QA 1 200 1 200
DS 

RD RS1AM40JQ 174 0 0
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AAAAATCCCTTCAAGAACTGCGTAATTTGATGGTGAGATAGGGCAGCCTCCGTGTGAGCA
TTTGAAGCAGGACTTGTGATATGTCTGGCTCTCCACTGTTACCTTTTCCATAGG

QA 1 174 1 174
DS 



AS 1 4

CO CL2602Contig1 1096 4 16 U
GGAAAAGCGTTTGTCTTATCCTGAGACTGAGAGAGAAAGAGCTTCAGCCATGGCGGCGAT
CATCGGGTGCTGCTCCTCCTTTTCCGATACTTCCCGTGGGGAACCTCCGTTGCTAGAACC
ATCTCGAGTTCCAGTTAAATCTGTTGGCTGCTCCTTAGTCAGTCATCCTATCTCCAAGAT
TAAACCTTTGTCTACCACTAAGCCCAAGGAGCGAGAAAGCAAGGGAATCTTCTTTCAAAC
ACCATTTGTCACCGTGGAAACTTTTGACAAGTTATCAGATTTTGAGATGTTGCAGGGAAT
TGGGAGGCTGAAACTACCGGTGATGGCAGTTGTTTTGACAAACTCGATTCTGATGTGTAA
ACCACTTGACGCTTTTGCTGCTGAGGTTTGCCAGCCAGAGTTCAACTCCATGTTCAGCAT
GCCTATATTGTCGCTTGTAGCTCTTGTTGGAGCCACTGTTGGAGGGTTGCTTGCTCGGCA
GAGGAGAGGCGAGTTACAGAGGTTGAACGAACAGCTACGGCAGATCAACGCAGCTCTTAG
GAGAACAGCGAAAATCGAGTCTTACGCACCAGCATTAAGTTACGCACCAGCAGCAGTAGG
AGCTAGAATCCCAGAGAGCGAGATGGTCATGATGGAGCCAAAGAAACATGAGTTGATTTC
CAAGTTGAAAACTGGAAAGACCTATCTGAGGAACCAAGAGCCAGAGAAAGCCTTTGAAGA
GTTCAAGACAGCTTTGGAACTTGCCCAGAATCTCAGAGACCCCATCGAAGAAAAGAAGGC
TGCCAGAGGGTTAGGGGCTTCGCTGCAACGTCAGGGGAAGTACAGAGATGCCACACAGTA
TCACAACATGGTCCTAGCCATCTCGAAGAGGGAAGGAGAAGATTCTGGAAGCACTGAAGC
TTATGGTGCTATAGCGGATTGTTACACTGAGCTGGGAGATCTCGAGAAAGCCGGGAAGTA
CTATGACATCTACATTGCTCGGTTAGAGACGGACTGATTCATCCGTCTTTTTGTCTGTTT
GTTGTGTTCGTGTCAAATCACATAAAATGGAGTATCTGAATCCCTTTTATTGAATCCTTT
TGTTTTTTTGTCTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D149TF U 1
AF RS1A601TF U 5
AF RS1A601JQ C 265
AF RS1D149JQ C 450
BS 1 49 RS1D149TF
BS 50 50 RS1A601TF
BS 51 119 RS1D149TF
BS 120 120 RS1A601TF
BS 121 285 RS1D149TF
BS 286 294 RS1A601TF
BS 295 685 RS1D149TF
BS 686 686 RS1D149JQ
BS 687 960 RS1A601JQ
BS 961 961 RS1D149JQ
BS 962 987 RS1A601JQ
BS 988 988 RS1D149JQ
BS 989 1055 RS1A601JQ
BS 1056 1056 RS1D149JQ
BS 1057 1072 RS1A601JQ
BS 1073 1096 RS1D149JQ

RD RS1D149TF 688 0 0
GGAAAAGCGTTTGTCTTATCCTGAGACTGAGAGAGAAAGAGCTTCAGCCGTGGCGGCGAT
CATCGGGTGCTGCTCCTCCTTTTCCGATACTTCCCGTGGGGAACCTCCGTTGCTAGAACG
ATCTCGAGTTCCAGTTAAATCTGTTGGCTGCTCCTTAGTCAGTCATCCTATCTCCAAGAT
TAAACCTTTGTCTACCACTAAGCCCAAGGAGCGAGAAAGCAAGGGAATCTTCTTTCAAAC
ACCATTTGTCACCGTGGAAACTTTTGACAAGTTATCAGATTTTGA*********GGGAAT
TGGGAGGCTGAAACTACCGGTGATGGCAGTTGTTTTGACAAACTCGATTCTGATGTGTAA
ACCACTTGACGCTTTTGCTGCTGAGGTTTGCCAGCCAGAGTTCAACTCCATGTTCAGCAT
GCCTATATTGTCGCTTGTAGCTCTTGTTGGAGCCACTGTTGGAGGGTTGCTTGCTCGGCA
GAGGAGAGGCGAGTTACAGAGGTTGAACGAACAGCTACGGCAGATCAACGCAGCTCTTAG
GAGAACAGCGAAAATCGAGTCTTACGCACCAGCATTAAGTTACGCACCAGCAGCAGTAGG
AGCTAGAATCCCAGAGAGCGAGATGGTCATGATGGAGCCAAAGAAACATGAGTTGATTTC
CAAGTTGAAAACTGGAAAGACCTAT
CTG

QA 1 685 1 685
DS 

RD RS1A601TF 663 0 0
GG
GCGTTTGTCTTATCCTGAGACTGAGAGAGAAAGAGCTTCAGCCATGGCGGCGATCATCGG
GTGCTGCTCCTCCTTTTCCGATACTTCCCGTGGGGAACCTCCGTTGCTAGAACCATCTCG
AGTTCCAGTTAAATCTGTTGGCTGCTCCTTAGTCAGTCATCCTATCTCCAAGATTAAACC
TTTGTCTACCACTAAGCCCAAGGAGCGAGAAAGCAAGGGAATCTTCTTTCAAACACCATT
TGTCTCCGTGGAAACTTTTGACAAGTTATCAGATTTTGAGATGTTGCAGGGAATTGGGAG
GCTGAAACTACCGGTGATGGCAGTTGTTTTGACAAACTCGATTCTGATGTGTAAACCACT
TGACGCTTTTGCTGCTGAGGTTTGCCAGCCAGAGTTCAACTCCATGTTCAGCATGCCTAT
ATTGTCGCTTGTAGCTCTTGTTGGAGCCACTGTTGGAGGGTTGCTTGCTCGGCAGAGGAG
AGGCGAGTTACAGAGGTTGAACGAACAGCTACGGCAGATCAACGCAGCTCTTAGGAGAAC
AGCGAAAATCGAGTCTTACGCACCAGCATTAAGTTACGCACCAGCAGCAGTAGGAGCTAG
AATCCCAGAGAGCGAGATGGTCATGATGGAGCCAAAGAAACATGAGTTGATTTCCAAGTT
G

QA 3 663 3 663
DS 

RD RS1A601JQ 808 0 0
TGACAAGTTATCAGATTTTGAGATGTTGCAGGGAATTGGGAGGCTGAAACTACCGGTGAT
GGCAGTTGTTTTGACAAACTCGATTCTGATGTGTAAACCACTTGACGCTTTTGCTGCTGA
GGTTTGCCAGCCAGAGTTCAACTCCATGTTCAGCATGCCTATATTGTCGCTTGTAGCTCT
TGTTGGAGCCACTGTTGGAGGGTTGCTTGCTCGGCAGAGGAGAGGCGAGTTACAGAGGTT
GAACGAACAGCTACGGCAGATCAACGCAGCTTTTAGGAGAACAGCGAAAATCGAGTCTTA
CGCACCAGCATTAAGTTACGCACCAGCAGCAGTAGGAGCTAGAATCCCAGAGAGCGAGAT
GGTCATGATGGAGCCAAAGAAACATGAGTTGATTTCCAAGTTGAAAACTGGAAAGACCTA
TTTGAGGAACCAAGAGCCAGAGAAAGCCTTTGAAGAGTTCAAGACAGCTTTGGAACTTGC
CCAGAATCTCAGAGACCCCATCGAAGAAAAGAAGGCTGCCAGAGGGTTAGGGGCTTCGCT
GCAACGTCAGGGGAAGTACAGAGATGCCACACAGTATCACAACATGGTCCTAGCCATCTC
GAAGAGGGAAGGAGAAGATTCTGGAAGCACTGAAGCTTATGGTGCTATAGCGGATTGTTA
CACTGAGCTGGGAGATCTCGAGAAAGCCGGGAAGTATTATGACATCTACATTGCTCGGTT
AGATACGGACTGATTCATCCGTCTTTTTGTCTGTTTGTTGTGTTCGTGTCAAATCACATA
AAATGGAGTATTTGAATCCCTTTTATTG

QA 1 808 1 808
DS 

RD RS1D149JQ 647 0 0
GAGCCACTGTTGGAGGGTTGCTTGCTCGGCAGAGGAGAGGCGAGTTACAGAGGTTGAACG
AACAGCTACGGCAGATCAACGCAGCTCTTAGGAGAACAGCGAAAATCGAGTCTTACGCAC
CAGCATTAAGTTACGCACCAGCAGCAGTAGGAGCTAGAATCCCAGAGAGCGAGATGGTCA
TGATGGAGCCAAAGAAACATGAGTTGATTTCCAAGTTGAAAACTGGAAAGACCTATCTGA
GGAACCAAGAGCCAGAGAAAGCCTTTGAAGAGTTCAAGACAGCTTTGGAACTTGCCCAGA
ATCTCAGAGACCCCATCGAAGAAAAGAAGGCTGCCAGAGGGTTAGGGGCTTCGCTGCAAC
GTCAGGG*AAGTACAGAGATGCCATACAGTATCACAACATGGTCCTAGCCATCTCGAAGA
GGGAAGGAGAAGATTCTGGAAGCACTGAAGCTTATGGTGCTATAGCGGATTGTTACACTG
AGCTGGGAGATCTCGAGAAAGCCGGGAAGTACTATGACATCTACATTGCTCGGTTAGAGA
CGGACTGATTCATCCGTCTTTTTGTCTGTTTGTTGTGTTCGTGTCAAATCACATAAAATG
GAGTATCTGAATCCCTTTTATTGAATCCTTTTGTTTTTTTGTCTTAC

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 4

CO CL2603Contig1 985 4 9 U
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AGTCACCTTCATTCTCGCCCTCATTTTCAGGCTTGAGACAGTGAACTTTAGAAAGATACA
TAGTGTTGCAAAAGTGGTAGGAACGGTAATAACGTTGGCAGGAGCAATGGTGATGACTTT
GTACAAAGGTCCAGCCATCGAGATCGTGAAAGCTGCACATTCTTCCTTCCACGGTGGCTC
CAACACGGCCACCGGCCAGCACTGGGTCACCGGAACTTTAGCCATCATGGGAAGTATCTC
CACTTGGGCTGCTTTCTTTATTTTACAGTCGTTCACATTGAAAATTTATCCGGCTGAGTT
ATCCCTCGTGACGTTGATATGTGGGATTGGATCGATCCTAAACTTCGGCGTTTCGATGAT
ATTTGTCCGCGACTTGAGCGCCTGGAAAATCGGCATGGACTCTGGCACACTGGCCGCAGT
TTACTCTGGAGTGGTTTGTTCGGGCATTGCTTATTACATACAAAGCATTGTGATTAAGCA
ACGTGGCCCCGTGTTTACGACGTCGTTTAGTCCTATGTGTATGGTCATTACAGCTTTCCT
CGGTGCCCTTGTTTTGGCTGAGAAAATCCACCTCGGAAGTATAATCGGGGCAATTTTCAT
CGTCATTGGACTATATAGTGTAGTATGGGGAAAAAGTAAAGACGTGGTGAATCCATTGGA
TGAGAAAATCGTTGTAGCTCAAGAGCTTCCGATCACTAACTCAGTCAAACAAACGAACGG
TCATGATGCCTCGGGAGCACAAGTTAATGGCGTGGCTACAAGTATCTAATCAGTCCCGAA
GAAAAAGAAAGATACAGAGACAAAGATGCATCTCCTTTGGGGTTGAAATTTTGATATCTT
TCTTGTTGTTTTTGTGTTTTCTTCTTTGTGTCTTTTTACGTTCTCTAATATTGCCCTACT
CTTAAATCTTAGCATCTTTACTCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EN79TF U 1
AF RS1BR13TF U 87
AF RS1BR13JQ C 229
AF RS1EN79JQ C 623
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GTACAAAGGTCCAGCCATCGAGATCGTGAAAGCTGCACATTCTTCCTTCCACGGTGGCTC
CAACACGGCCACCGGCCAGCACTGGGTCACCGGAACTTTAGCCATCATGGGAAGTATCTC
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TTACTCTGGAGTGGTTTGTTCGGGCATTGCTTATTACATACAAAGCATTGTGATTAAGCA
ACGTGGCCC*GTGTTTACGACGTCGTTTAGTCCTATGTGTATGGTCATTACAGCTTTCCT
CGGTGCCCTTGTTTTGGCTGAGAAAATCCACCTCGGAAGTATA

QA 1 643 1 643
DS 

RD RS1BR13TF 749 0 0
G
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TGGATCGATCCTAAACTTCGGCGTTTCGATGATATTTGTCCGCGACTTGAGCGCCTGGAA
AATCGGCATGGACTCTGGCACACTGGCCGCAGTTTACTCTGGAGTGGTTTGTTCGGGCAT
TGCTTATTACATACAAAGCATTGTGATTAAGCAACGTGGCCCCGTGTTTACGACGTCGTT
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CCACCTCGGAAGTATAATCGGGGCAATTTTCATCGTCATTGGACTATATAGTGTAGTATG
GGGAAAAAGTAAAGACGTGGTGAATCCATTGGATGAGAAAATCGTTGTAGCTCAAGAGCT
TCCGATCACTAACTCAGTCAAACAAACGAACGGTCATGATGCCTCGGGAGCACAAGTTAA
TGGCGTGGCTACA*GTATCTAATCAGTC

QA 2 749 2 749
DS 

RD RS1BR13JQ 757 0 0
CCACGGTGGCTCCAACACGGCCACCGGCCAGCACTGGGTCACCGGAACTTTAGCCATCAT
GGGAAGTATCTCCACTTGGGCTGCTTTCTTTATTTTACAGTCGTTCACATTGAAAATTTA
TCCGGCTGAGTTATCCCTCGTGACGTTGATATGTGGGATTGGATCGATCCTAAACTTCGG
CGTTTCGATGATATTTGTCCGCGACTTGAGCGCCTGGAAAATCGGCATGGACTCTGGCAC
ACTGGCCGCAGTTTACTCTGGAGTGGTTTGTTCGGGCATTGCTTATTACATACAAAGCAT
TGTGATTAAGCAACGTGGCCCCGTGTTTACGACGTCGTTTAGTCCTATGTGTATGGTCAT
TACAGCTTTCCTCGGTGCCCTTGTTTTGGCTGAGAAAATCCACCTCGGAAGTATAATCGG
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ACAAACGAACGGTCATGATGCCTCGGGAGCACAAGTTAATGGCGTGGCTACAAGTATCTA
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TATTGCCCTACTCTTAAATCTTAGCATCTTTACTCAA

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DS 

RD RS1EN79JQ 344 0 0
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GTATGGGGAAAAAGTAAAGACGTGGTGAATCCATTGGATGAGAAAATCGTTGTAGCTCAA
GAGCTTCCGATCACTAACTCAGTCAAGCAAACGAACGGTCATGATGCCTCGGGAGCACAA
GTTAATGGCGTGGCTACAAGTATCTAATCAGTCCCGAAGAAAAAGAAAGATACAGAGACA
AAGATGCATCTCCTTTGGGGTTGAAATTTTGATATCTTTCTTGTTGTTTTTGTGTTTTCT
TCTTTGTGTCTTTTTACGTTCTCTAATATTGCCCTACTTTTAAA

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DS 



AS 1 4

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ATTTATAAAAAAAAACAAGTCTCTGCAGGTAAACGTTTATGAATACAAGAGCTAAGGCCT
ACAAAAGGCAGAAACTCATGCAACTTTAGGAACGAAGGCGGATTCGGAGTTGGGTACTGT
CACGGATCGCAACAGCTCTAAGGAACAAACAAGGCCTAAAAAATGAGAAAGCAAGGTGTT
CGCCGATGCCTGAACGAGGAAGACATCAAGAGCAAGAACGGGACTGTATCCTTGAGAGAC
TCCTTGGTAGAAAGGGTTTGCTGAGGTTGTCAAAGCCCTTGCAACTAAAAACCCAACCGT
TGCTTGCATCCCGAGAATTGCAGCTCCCATTCCAAGAAGATTTACCATAATCCCACTTCT
CAACCCTTTCACAACATCTGCACGAGGCGGGGCCTTGGCAGGGTCAGCGGCAGTTCGACG
GAGCCTGTCAGAGAGGCGAATATAACCAAAGGACCAGAAGACAGAGACAAAAGCAGCAGC
GAGGCCAGTTGCGGTAGCGTAGAAAGTAGCAGGTGAAGTGGGTTTCCCAGTTACAACAAT
GGAAAAGGATAGAATGACAGCAGCCACAACAGTTGACACAAGCTGCCCCCAGAAACCAAT
ACTCCCAAGCCTCTTGAAGTACCTTGAAGTCTTCTCTAGTCTCTTTGCAACCTGAGCGAG
TTTCGCCTTGTCGACTTCATTATCAGCCGAAACTGAAGCAGGAGACGTGGGAGAGGAAAA
AGCCACCGTGAAACTAGGTTTAGATCCTCGAATTTGGAAACCGTAGACGGGTAGAGAGGA
CGGAGACTGGTAAGAAGATATGGTCGATCTCCTCTTCGGCGAGATAAGCTGGGTTGGAGC
CAAGCCGAGTGGATTGAACAATGGCAGGTGGCGGGTTGAGAGGCGTTGTTGGAAACCTGG
CCGCAGCGCAACGGCGGATACGCCGGGAGAGCTCGCCGGCGGCAAGAGTAGTGACCGCAT
CTTTACGCTTGGGGTTAAAGAGTAAAGTTGCGAGTTGGCCTTTTTTAAGGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FH30JQ U 1
AF RS1D134JQ U 43
AF RS1FH30TF C 110
AF RS1D134TF C 310
BS 1 130 RS1FH30JQ
BS 131 131 RS1D134JQ
BS 132 226 RS1FH30JQ
BS 227 227 RS1D134JQ
BS 228 261 RS1FH30JQ
BS 262 262 RS1D134JQ
BS 263 309 RS1FH30JQ
BS 310 310 RS1D134JQ
BS 311 398 RS1FH30JQ
BS 399 399 RS1D134JQ
BS 400 492 RS1FH30JQ
BS 493 493 RS1D134JQ
BS 494 519 RS1FH30JQ
BS 520 757 RS1D134JQ
BS 758 902 RS1FH30TF
BS 903 1073 RS1D134TF

RD RS1FH30JQ 519 0 0
GGCAAAAAAGCATGTTCTTAGGCAGTAATAAAGCGGTTGAGTCTACAACAGTTGGTTCTC
ATTTATAAAAAAAAACAAGTCTCTGCAGGTAAACGTTTATGAATACAAGAGCTAAGGCCT
ACAAAAGGCAAAAACTCATGCAACTTTAGGAACGAAGGCGGATTCGGAGTTGGGTACTGT
CACGGATCGCAACAGCTCTAAGGAACAAACAAGGCCTAAAAAATGAAAAAGCAAGGTGTT
CGCCGATGCCTGAACGAGGAAAACATCAAGAGCAAGAACGGGACTGTATCCTTGAGAGAC
TCCTTGGTAAAAAGGGTTTGCTGAGGTTGTCAAAGCCCTTGCAACTAAAAACCCAACCGT
TGCTTGCATCCCGAGAATTGCAGCTCCCATTCCAAGAAAATTTACCATAATCCCACTTCT
CAACCCTTTCACAACATCTGCACGAGGCGGGGCCTTGGCAGGGTCAGCGGCAGTTCGACG
GAGCCTGTCAGAAAGGCGAATATAACCAAAGGACCAGAA

QA 1 519 1 519
DS 

RD RS1D134JQ 715 0 0
CA
ACAACAGTTGGTTCTCATTTATAAAAGAAAACAAGTCTCTGCAGGTAGACGTTTATGAAT
ACAAGAGCTACGGCCTACAAAAGGCAGAAACTCATGCAACTTTAGGAACGAAGGCGGATT
CGGAGTTGGGTACTGTCACGGATCGCAGCAGCTCTAAGGAACAAACAAGGCCTAAAAAAT
GAGAAAGCAAGGTGTTCGCCGATGCCTGAACGAGGAAGACATCAAGAGCAAGAACGGGAC
TGTATCCTTGAGAGACTCCTTGGTAGAAAGGGTTTGCTGAGGTTGTCAAAGCCCTTGCAA
CTAAAAACCCAACCGTTGCTTGCATCCCGAGAATTGCAGCTCCCATTCCAAGAAGATTTA
CCATAATCCCACTTCTCAACCCTTTCACAACATCTGCACGAGGCGGGGCCTTGGCAGGGT
CAGCGGCAGTTCGACGGAGCCTGTCAGAGAGGCGAATATAACCAAAGGACCAGAAGACAG
AGACAAAAGCAGCAGCGAGGCCAGTTGCGGTAGCGTAGAAAGTAGCAGGTGAAGTGGGTT
TCCCAGTTACAACAATGGAAAAGGATAGAATGACAGCAGCCACAACAGTTGACACAAGCT
GCCCCCAGAAACCAATACTCCCAAGCCTCTTGAAGTACCTTGAAGTCTTCTCTAGTCTCT
TTGCAACCTGAGCGAGTTTCGCCTTGTCGACTTCATTATCAGCCGAAACTGAA

QA 3 715 3 715
DS 

RD RS1FH30TF 794 0 0
GAGCTAAGG
CTACAAAAGGCAGAAACTCATGCAACTT*AGGAACGAAGGCGGATTCGGAGTTGG*TACT
GTCACGGATCGCAACAGCTCTAAGGA*CAAACAAGGC*TAGAAAATGAGAAAGCAAGGTG
TTCGCCGATGCGTGAACGAGGAAGACATCAAGAGCAAGAACGGGACTGTATCCTTGAGAG
ACTCCTTGGTAGAAAGGGTTTGCTGAGGTTGTCAAAGCCCTTGCAACTAAAAACCCAACC
GTTGCTTGCATCCCGAGAATTGCAGCTCCCATTCCAAGAAGATTTACCATAATCCCACTT
CTCAACCCTTTCACAACATCTGCACGAGGCGGGGCCTTGGCAGGGTCAGCGGCAGTTCGA
CGGAGCCTGTCAGAGAGGCGAATATAACCAAAGGACCAGAAGACAGAGACAAAAGCAGCA
GCGATGCCAGTTGCGGTAGCGTAGAAAGTAGCAGGTGAAGTGGGTTTCCCGGTTACAACA
ATGGAAAAGGATAGAATGACAGCAGCCACAACAGTTGACACAAGCTGCCCCCAGAAACCA
ATACTCCCAAGCCTCTTGAAGTACCTTGAAGTCTTCTCTAGTCTCTTTGCAACCTGAGCG
AGTTTCGCCTTGTCGACTTCATTATCAGCCGAAACTGAAGCAGGAGACGTGGGAGAGGAA
AAAGCCACCGTGAAACTAGGTTTAGATCCTCGAATTTGGAAACCGTAGACGGGTAGAGAG
GACGGAGACTGGTAAGAAGATATGGTCGATCTCCTCTTCGGCGAGATAAGCTGGGTTGGA
GCCA
C

QA 10 793 10 793
DS 

RD RS1D134TF 764 0 0
G
AAAGGGTTTGCTGAG**TGTCAAAGCC*TTGCAACTAAAA*CCCAACCGTTGCTTGCATC
CCGAGAATTGCAGCTCCCATTCCAAGAAGATTTACCATAATCCCACTTCTCAACCCTTTC
ACAACATCTGCACGAGGCGGGGCCTTGGCAGGGTCAGCGGCAGTTCGACGGAGCCTGTCA
GAGAGGCGAATATAACCAAAGGACCAGAAGACAGAGACAAAAGCAGCAGCGAGGCCAGTT
GCGGTAGCGTAGAAAGTAGCAGGTGAAGTGGGTTTCCCAGTTACAACAATGGAAAAGGAT
AGAATGACAGCAGCCACAACAGTTGACACAAGCTGCCCCCAGAAACCAATACTCCCAAGC
CTCTTGAAGTACCTTGAAGTCTTCTCTAGTCTCTTTGCAACCTGAGCGAGTTTCGCCTTG
TCGACTTCATTATCAGCCGAAACTGAAGCAGGAGACGTGGGAGAGGAAAAAGCCACCGTG
AAACTAGGTTTAGATCCTCGAATTTGGAAACCGTAGACGGGTAGAGAGGACGGAGACTGG
TAAGAAGATATGGTCGATCTCCTCTTCGGCGAGATAAGCTGGGTTGGAGCCAAGCCGAGT
GGATTGAACAATGGCAGGTGGCGGGTTGAGAGGCGTTGTTGGAAACCTGGCCGCAGCGCA
ACGGCGGATACGCCGGGAGAGCTCGCCGGCGGCAAGAGTAGTGACCGCATCTTTACGCTT
GGGGTTAAAGAGTAAAGTTGCGAGTTGGCCTTTTTTAAGGCCC

QA 2 764 2 764
DS 



AS 1 3

CO CL2605Contig1 653 3 4 U
GGCTCCGATCTCGGCGATAGAGAGAGAGATCTAGAGAGAATGGATCAGATCTTGAACAAG
GTGGGATCGTACTGGCTAGGGAAGAAGGCGAACAAGCAGCTCGATTCCGTCGGTGACGAT
ATCAACTCTCTGTCTACGAGCATCGAAGGTGGAGCAAAATGGCTAGTGAACAAAATCAAA
GGGAAAATGCAGAAGCCATTACCGGAGTTACTAAAGGAGTTCGGTTTACCCGTTGGGATC
TTTCCACGCGACGCAACCAACTACGAGTTCAACGAGCAGACGAGGAAACTCACCGTCTTC
ATCCCAACGGTCTGCGAGGTCGGCTACAAAGACTCGTCGGTCTTGAGGTTCACCACGACG
GTCACGGGGTTCTTGGAGAAAGGGAAGCTAGCCGATGTCGAAGGGATGAAAACAAAAGTA
ATGATTTGGGTGAAGGTCACGAGCGTCTCTGCTGACTCTTCCAAGGTGCATTTCACTGCA
GGGATGAAGAAAAGCAGAAGCCGTGATGCTTATGAGGTTTTGAGAGATGGCGTTGAGATT
GATAAATTCTAAGCCTCTCTGTTTCTGTTTGTCCTTACCTCTATCTTTATATGTCTTTTG
CATATGCAATTAAACTTTGGTGTTCATGAATCTCATGAATTTGAATTGGTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D593TF U 1
AF RS1D593JQ C 50
AF RS1G526TF U 289
BS 1 571 RS1D593TF
BS 572 608 RS1G526TF
BS 609 609 RS1D593JQ
BS 610 653 RS1G526TF

RD RS1D593TF 571 0 0
GGCTCCGATCTCGGCGATAGAGAGAGAGATCTAGAGAGAATGGATCAGATCTTGAACAAG
GTGGGATCGTACTGGCTAGGGAAGAAGGCGAACAAGCAGCTCGATTCCGTCGGTGACGAT
ATCAACTCTCTGTCTACGAGCATCGAAGGTGGAGCAAAATGGCTAGTGAACAAAATCAAA
GGGAAAATGCAGAAGCCATTACCGGAGTTACTAAAGGAGTTCGGTTTACCCGTTGGGATC
TTTCCACGCGACGCAACCAACTACGAGTTCAACGAGCAGACGAGGAAACTCACCGTCTTC
ATCCCAACGGTCTGCGAGGTCGGCTACAAAGACTCGTCGGTCTTGAGGTTCACCACGACG
GTCACGGGGTTCTTGGAGAAAGGGAAGCTAGCCGATGTCGAAGGGATGAAAACAAAAGTA
ATGATTTGGGTGAAGGTCACGAGCGTCTCTGCTGACTCTTCCAAGGTGCATTTCACTGCA
GGGATGAAGAAAAGCAGAAGCCGTGATGCTTATGAGGTTTTGAGAGATGGCGTTGAGATT
GATAAATTCTAAGCCTCTCTGTTTCTGTTTG

QA 1 571 1 571
DS 

RD RS1D593JQ 576 0 0
TCTTGAACAAGGTGGGATCGTACTGGCTAGGGAAGAAGGCGAACAAGCAGCTCGATTCCG
TCGGTGACGATATCAACTCTCTGTCTACGAGCATCGAAGGTGGAGCAAAATGGCTAGTGA
ACAAAATCAAAGGGAAAATGCAGAAGCCATTACCGGAGTTACTAAAGGAGTTCGGTTTAC
CCGTTGGGATCTTTCCACGCGACGCAACCAACTACGAGTTCAACGAGCAGACGAGGAAAC
TCACCGTCTTCATCCCAACGGTCTGCGAGGTCGGCTACAAAGACTCGTCGGTCTTGAGGT
TCACCACGACGGTCACGGGGTTCTTGGAGAAAGGGAAGCTAGCCGATGTCGAAGGGATGA
AAACAAAAGTAATGATTTGGGTGAAGGTCACGAGCGTTTCTGCTGACTCTTCCAAGGTGC
ATTTCACTGCAGGGATGAAGAAAAGCAGAAGCCGTGATGCTTATGAGGTTTTGAGAGATG
GCGTTGAGATTGATAAATTCTAAGCCTCTCTGTTTCTGTTTGTCCTTACTTCTATCTTTA
TATGTCTTTTGTATATGCAATTAAACTTTGGTGTTC

QA 1 576 1 576
DS 

RD RS1G526TF 365 0 0
GG
CACCGTCTTTATCCCAACGGTCTGCGAGGTCGGCTACAAAGACTCGTCGGTCTTGAGGTT
CACCACGACGGTCACGGGGTTTCTGGAGAAAGGGAAGCTAGCCGATGTCGAAGGGATGAA
AACAAAAGTAATGATTTGGGTGAAGGTCACGAGCGTCTCTGCTGACTCTTCCAAGGTGCA
TTTCACTGCAGGGATGAAGAAAAGCAGAGGCCGTGATGCTTATGAGGTTTTGAGAGATGG
CGTTGAGATTGATAAATTCTAAGCCTCTCTGTTTCTGTTTGTCCTTACCTCTATCTTTAT
ATGTCTTTTGCATATGCACTTAAACTTTGGTGTTCATGAATCTCATGAATTTGAATTGGT
ATC

QA 3 365 3 365
DS 



AS 2 4

CO CL2606Contig1 924 2 2 U
GGAGGAGACACTTCGGAGAGAATGGAACAACCACAGTCGCCGGGAACGAAGTCAGTGGAG
ATCGGAGAAACCATGGAACCACTTTTAAGGTTTACACTGCGCTCTCATTGGGATGAAACA
GCTCAAAGTCTCGATCTTGAGCTGCCTCGAGATCTCTGCATCCATCTCCTGGAGGAGGAG
GAAGATACAGATTCAACAGAAAAACCTGCGATGTACAAGATTCTAGCAAGGGCTTTGTCT
GAATGTCTTACTTCCGAGGAGCAGAGTTTCTCTGTTGATAAAGGTTCAAACTTTGAAAAG
TATAGCAACTTGTTTCATGGTCTGGGACATGATTTGGTAAATATGTTGGAGAAGGTAAAC
TTTGAGCTTCATGTCCAGGAGCCTTACTTCACACAGCTGAAAGATGGTCTGAAAACTACT
GAAGGAAGGTGTGCAGTAGGAGACTACATGAGGATTGGTTCAGGAGATTTTATTTTGTTT
AATAAATGCTTGCTGCTTAAAGTTCAGGACGTTTGCTATTATACTTCATTCTCAGAAATG
CTGAGAGGTGAGGGTCTTGCAAAAGTTCTTCCTGGAGTTGAGAGTATAGAAGAAGGTGTT
GGAGTTTACCGAAACTTTTACTCTGAAGAGAAGGAAAGAATGAACGGTGTTGTCGCAATT
CGTGTTGTGAAACCAGTTGATCAGCCGTATGCAGCTTTGGCAGGAGTATTGTCTGAACTC
AAGTCCACTGGGATCAAAGGTTTGTTGGATGACTATACAGGACGAGTTACATCTGAACAT
CTTTGAGAGCAGATAATTTACTAAGTGCTAAGTAAAATGAGTTGCGTTTCTAAGATCAAT
CTTTTTTTTTTTTAAACTCTGATAGTGTCAAATAATTTTCGATGTTATGTTGCTCAAAGC
AGAGTAATGAAGAACTCTTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DG26TF U 1
AF RS1DG26JQ C 125
BS 1 592 RS1DG26TF
BS 593 924 RS1DG26JQ

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GAAGATACAGATTCAACAGAAAAACCTGCGATGTACAAGATTCTAGCAAGGGCTTTGTCT
GAATGTCTTACTTCCGAGGAGCAGAGTTTCTCTGTTGATAAAGGTTCAAACTTTGAAAAG
TATAGCAACTTGTTTCATGGTCTGGGACATGATTTGGTAAATATGTTGGAGAAGGTAAAC
TTTGAGCTTCATGTCCAGGAGCCTTACTTCACACAGCTGAAAGATGGTCTGAAAACTACT
GAAGGAAGGTGTGCAGTAGGAGACTACATGAGGATTGGTTCAGGAGATTTTATTTTGTTT
AATAAATGCTTGCTGCTTAAAGTTCAGGACGTTTGCTATTATACTTCATTCTCAGAAATG
CTGAGAGGTGAGGGTCTTGCAAAAGTTCTTCCTGGAGTTGAGAGTATAGAAG

QA 1 592 1 592
DS 

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A
AAGTCTCGATCTTGAGCTGCCTCGAGATCTCTGCATCCATCTCCTGGAGGAGGAGGAAGA
TACAGATTCAACAGAAAAACCTGCGATGTACAAGATTCTAGCAAGGGCTTTGTCTGAATG
TCTTACTTCCGAGGAGCAGAGTTTCTCTGTTGATAAAGGTTCAAACTTTGAAAAGTATAG
CAACTTGTTTCATGGTCTGGGACATGATTTGGTAAATATGTTGGAGAAGGTAAACTTTGA
GCTTCATGTCCAGGAGCCTTACTTCACACAGCTGAAAGATGGTCTGAAAACTACTGAAGG
AAGGTGTGCAGTAGGAGACTACATGAGGATTGGTTCAGGAGATTTTATTTTGTTTAATAA
ATGCTTGCTGCTTAAAGTTCAGGACGTTTGCTATTATACTTCATTTTCAGAAATGCTGAG
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TTACCGAAACTTTTACTCTGAAGAGAAGGAAAGAATGAACGGTGTTGTCGCAATTCGTGT
TGTGAAACCAGTTGATCAGCCGTATGCAGCTTTGGCAGGAGTATTGTCTGAACTCAAGTC
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AGAGCAGATAATTTACTAAGTGCTAAGTAAAATGAGTTGCGTTTCTAAGATCAATCTTTT
TTTTTTTTAAACTCTGATAGTGTCAAATAATTTTCGATGTTATGTTGCTCAAAGCAGAGT
AATGAAGAACTCTTTTACC

QA 2 800 2 800
DS 



CO CL2606Contig2 919 2 2 U
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CCATGGAACCACTTTTACGGTTTACCCTGCGCTCACATTTGGATGAAACAGTTCCAAGTC
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CAACTGATAAACCTGCGAGGTACAAGATTCTAGCGAGGGCTTTGTCTGAGTGTCTTACTT
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TTCATGGTTTGGGACATGACTTGGTAAATATGTTGAAGAAGGTAAACTTTGAGCTTCATG
TCCAGGAGTCTTATTTCACACAGTTGAAAGATGGTCTGAAAACTACTGAAGGAAGACGTG
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TGCTTGAAGTTCAGGACGTTTGCTATTATACTTCATTCTCAGAAATGCTGAGAGGTGAGG
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TTAAACTCTGATAGTGTCAAATAATTTTCGATGTTATGTTGCTCACAAAGCAGAGTAATG
AAGAACTCTTTTACCACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GL31TF U 1
AF RS1GL31JQ C 198
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BS 630 919 RS1GL31JQ

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TTCATGGTTTGGGACATGACTTGGTAAATATGTTGAAGAAGGTAAACTTTGAGCTTCATG
TCCAGGAGTCTTATTTCACACAGTTGAAAGATGGTCTGAAAACTACTGAAGGAAGACGTG
CAGTAGGAGACTACATGAGGATTGGTTCAGGAGATTTTATTTTGTTTAATAAATGCTTGC
TGCTTGAAGTTCAGGACGTTTGCTATTATACTTCATTCTCAGAAATGCTGAGAGGTGAGG
GTCTTGCCAAAGTTCTTCCTGGAGTTGAGAGTATAGAAGAAAGTGTTGGAGTTTACCGAA
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QA 1 629 1 629
DS 

RD RS1GL31JQ 722 0 0
AG
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CGTTGATAAAGGCTCAAACTTTGAAAAGTACAGTAACCTGTTTCATGGTTTGGGACATGA
CTTGGTAAATATGTTGAAGAAGGTAAACTTTGAGCTTCATGTCCAGGAGTCTTATTTCAC
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AGCTTTGGCAGGAGTATTGTCTGAACTCAAGTCCACTGGGATCAAAGGTTTGTTGGATGA
CTATGCAGGACGAGTTACATCTGAACATCTTTGAGAGCAGATAATTTACTAAGTGTTGCT
AAGTAATATGAGTTGTGTTTCTAAGATCAATCTTTTTTTTTTTAAACTCTGATAGTGTCA
AATAATTTTCGATGTTATGTTGCTCACAAAGCAGAGTAATGAAGAACTCTTTTACCACTC

QA 3 722 3 722
DS 



AS 1 4

CO CL2607Contig1 1316 4 9 U
AAACCAAAAAAATCAAACACGAATTCTTTCTTAGTCATCAGTGTAATGAAGACAACAATC
AACAAGTATGAAAAAAAAAAAAAAGTATGAAACAAAGGAGCAAACCAATCAATGCGTTAG
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GTCCAGTTATGAATCCAGTACAGACCACAATCTTCCTTATTTATATTATTTTCAACATAT
GTAAAAAAAAGAGTATTAGTGAAACCAATACATAACACAAAACAAACACGTATGCTCTTC
TGGTTAGTTCTTGTCCCAAACAGGTGAAGTATCAGCTTTGATATGTCAGTATCCAGTTTA
AGAAAATCCAATTTTCCTGATCATCTGAACAGGAACCATCTAACCATGATTGTTGGATGT
GCATCCAAGTCAGCTTTTCCTTTTCCTCCTGACAACTTAGTAAGACTCTCGTCGAACATG
ACCGTACTTTTCCATCAAATAACTCATGCTTGTCAAATTTTACAATCCATGTCTCTGGGC
TGATAAGAGAAGACGAGACTCTATCCAGCCAAACGCGAAACTGCTTCTCCTTCCCTTCCT
CCCCATGTAAATTGTCCAAATCATCTATCCACTCATGTATCAGTTTCTCCACTCCAGACG
GATGAACAAACATACCAAGTGGACTGGAGAGCGATTTCAAGTTCTGAAGATACTTATCAG
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CGCTTGGTCCCAGATTAAACCTCTGTAAGGCTTCTATCATCCCAGCTCCACATCTCTCGG
ACGCAAGAATTATCTTCGGGTTGTCCTTTGCATTCTCCTCGTGCCATTGCAGTAGTTCTT
TGTGCGAATTGCTAACCATTACACCATATGCTTGAGGAATGTTGAAGAGCTCGGCATCGT
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CAAGTAGATAAGTCAGAGCACCTCCTTTGCCAGATCCTTTTGGTAAAACATCGAAAGCAT
AGTCGTTGCTGTAGACCAGCTTCACATCCACCCCACGCTCCAATAATCTCCCAGGAAGAA
CCTTCATAATTTCCACAGCATGTTCTCTTCCCACAAAGAAACTCACTTTGTGCTCCTCTT
GGCTCTTAACTGGCTGCGGTTCGAGTTCAGGGAACTTGGAAGTTTCCTCGAGGACC


BQ
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AF RS1AO47JQ U 1
AF RS1AO47TFB C 586
AF RS1AA96JQ U 98
AF RS1AA96TF C 621
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GTCCAGTTATGAATCCAGTACAGACCACAATCTTCCTTATTTATATTATTTTCAACATAT
GTAAAAAAAAGAGTATTAGTGAAACCAATACATAACACAAAACAAACACGTATGCTCTTC
TGGTTAGTTCTTGTCCCAAAGAGGTGAAGTATCAGCTTTGATATGTCAGTGTCCAGTTTA
AGAAAATCCAATTTTCCTGATCATCTGGACAGGAACCATCTAACCATGATTGTTGGATGT
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ACCGTACTTTTCCATCAAATAACTCATGCTTGTCAAATTTTACAATCCATGTCTCTGGGC
TGATAA

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DS 

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TCTCCACTCCAGACGGATGAACAAACATACCAAGTGGACTGGAGAGCGATTTCAAGTTCT
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ACTG
C

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DS 

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GC
GCAAACCAATCAATGCGTTAGCAGATTACATGAACCAAATAAATGTAGGGTTTTGTTGTA
GAGACCCCAGGAACTCTCCCTGTCCAGTTATGAATCCAGTACAGACCACAATCTTCCTTA
TTTAT**TATTTTCAACATATGTAAAAAAAAGAGTATTAGTGAAACCAATACATAACACA
AAACAAACACGTATGCTCTTCTGGTTAGTTCTTGTCCCAAACAGGTGAAGTATCGGCTT*
GATATGTCAGTATCCAGTTTCAGAAAATCCATTTTTCCTGATCATCTGAACAGGAACCAT
CTAACCATGATTGTTGGATGTGCATCCAAGTCAGCTTTTCCTTTTCCTCCTGACAACTTA
GTAAGACTCTCGTCGAACATGACCGTACTTTTCCATCAGATAACTCATGCTTGTCAAATT
TTACAATCCATGTCTCTGGGCTGATAAGAGAAGACGAGACTCTATCCAGCCAAACGCGAA
ACTGCTTCTCCTTCCCTTCCTCCCCATGTAAATTGTCCAAATCATCTATCCACTCATGTA
TCAGTTTCTCCACTCCAGACGGATGAACAAACATACCAAGTGGACTGGAGAGCGATTTCA
AGTTCTGAAGATACTTATCAGACTTCTCCACCTCTCCACGGCGCCATTTCTCGTAAAGCA
AATAAAACTGAACCACCTCATGAGCAGGATCCAAAACTTCCACGTGGAAGTTTTCAGTAT
CCAAATCATCTCTCGGAGAGACGCTTGGTCCCAGATTAAACCTCTG

QA 3 768 3 768
DS 

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GGACTGGAGAGCGATTTCAAGTTCTGAAGATACTTATCAGACTTCTCCACCTCTCCACGG
CGCCATTTCTCGTAAAGCAAATAAAACTGAACCACCTCATGAGCAGGATCCAAAACTTCC
ACGTGGAAGTTTTCAGTATCCAAATCATCTCTCGGAGAGACGCTTGGTCCCAGATTAAAC
CTCTGTAAGGCTTCTATCATCCCAGCTCCACATCTCTCGGACGCAAGAATTATCTTCGGG
TTGTCCTTTGCATTCTCCTCGTGCCATTGCAGTAGTTCTTTGTGCGAATTGCTAACCATT
ACACCATATGCTTGAGGAATGTTGAAGAGCTCGGCATCGTTTCCAGAGTCACCACAAACA
AGTATGTTACAAGGCTGCTTCCCTTCGCTCTCCAGCTTTTCAAGTAGATAAGTCAGAGCA
CCTCCTTTGCCAGATCCTTTTGGTAAAACATCGAAAGCATAGTCGTTGCTGTAGACCAGC
TTCACATCCACCCCACGCTCCAATAATCTCCCAGGAAGAACCTTCATAATTTCCACAGCA
TGTTCTCTTCCCACAAAGAAACTCACTTTGTGCTCCTCTTGGCTCTTAACTGGCTGCGGT
TCGAGTTCAGGGAACTTGGAAGTTTCCTCGAGGACC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 4

CO CL2608Contig1 1528 4 8 U
AATAACAGATTTCTTAAACATTAATGGTATAATAGTACATCAATAATCCTCAAAACAAAA
CTTGAACTACTCATCATCACCAATATGGTGTTTCTACTTTCAAAAATCCTAACAAAACTT
CAGATTGCTCTTACTGTCTCTTCTGAAACAACCTAACAAACAGATGAATAAAAAATGACC
AACCACATTACAAGCATGTCCTTACCTCTCTATCTCTGTGTAAGTCTTTTACTTTATCTC
ACTGAAACTAATCTCAAATTAGAGATATCATCGCTGCACTGGTCTAAAACCCATCCATTT
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AGCTCGAGCTTCATCAGAAACAGAGAATCTGCACCTTCTCCTCTGCGGTTGTTGAGGTGA
AGACGGGACCGAGGAGAAGCAGATGACGACAACCGTCAGATTATCTGATGAGTTAAGCCT
CGCTGCTTCTTTCCCAAGTTCCATCGCGCATTTTCTCGGGTCACCGTGCCTCCTAAGCCC
TTGCCTAACGTTACTCACTGCATTCTGGCTTGACAACACGTCCCATATACCATCACATGC
CAAAATCAAGAACTCGTCGTCCTCTGTTAGGATGAGTTGCTGAATCTCCGGGTCTGAGAT
GAGAGGTGAAGAAGAGCCAGCGAAAGGAGTCTTCAGTTCCCAGTCACCAATGGCCCGAGT
GACAGCTAGGACTCCGTTGAGGTACCCGTCCCCAAAGTATCCTCCAAGATCCTCAATCCG
CCTACGTTCCGGCTCATAAGTTGACCTGTGATCGAAAGACATATCAATAGCCACTCCTCT
CCGGCATAGCACAGCGCGGCAATCTCCAGCGTTAGCAACCAGAAGATGTCGTCCGATAAC
GAGAGCCGTCAAGGCGGTTGTCCCGCACGAAGCCCTGACAATGCTTTCGTCAGCCATGGC
GACATCAGCCAAAGCAAACGCCTTCCGGTGAGAGTTCTCGACTTCTTGTAAGAAAAAGTT
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GTTCTTCATGTAAAGTGATGCCTCAGGTCCACCATGGCCATCAAAGACGCCATAGAAAGC
ACTAGGAAGCGAGGATCTAAGATGAGTTGATAAGTCGTCAATGCAGAAGTGTTCATCCTC
CATGGTGTCTCGGCCTCGAATGTCAGCAAAGCTCCCTGAACGTATAGTCGGGAAAAACTC
ACAGGTGGGTTCTTCAATGGTGGTAGTTGCAAAACTCATGCCCGATCCAAATTGAGGAAT
CTCAGCACGCACAGAGTCAGAAACACGGACCTTGATATCAGACTCAGCAACCATGGTTTG
ACTTAGAATCATGACTTTCGGTTATAATTAAAAATCGAGCGAGATCCGATTGCGAATTCC
ACCGAAAGGCGCTTTGCTTGTACGCAATTGAAAATTCGCCCAAAAAGAATAAAGAAGAAA
GGTATAATGAAATTCAATTAGGGTTTCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H507JQB U 1
AF RS1CS03JQ U 143
AF RS1H507TF C 535
AF RS1CS03TF C 845
BS 1 365 RS1H507JQB
BS 366 547 RS1CS03JQ
BS 548 548 RS1H507TF
BS 549 909 RS1CS03JQ
BS 910 1051 RS1H507TF
BS 1052 1052 RS1CS03TF
BS 1053 1203 RS1H507TF
BS 1204 1528 RS1CS03TF

RD RS1H507JQB 365 0 0
AATAACAGATTTCTTAAACATTAATGGTATAATAGTACATCAATAATCCTCAAAACAAAA
CTTGAACTACTCATCATCACCAATATGGTGTTTCTACTTTCAAAAATCCTAACAAAACTT
CAGATTGCTCTTACTGTCTCTTCTGAAACAACCTAACAAACAGATGAATAAAAAATGACC
AACCACATTACAAGCATGTCCTTACCTCTCTATCTCTGTGTAAGTCTTTTACTTTATCTC
ACTGAAACTAATCTCAAATTAGAGATATCATCGCTGCACTGGTCTAAAACCCATCCATTT
TTATATGCAATGCCCAAAAAAAAATTGGCTTCAGTCGCCACCAAGCATCGCTTGTAACCG
AGCTC

QA 1 365 1 365
DS 

RD RS1CS03JQ 767 0 0
CTGAAACAACCTAACAAACAGATGAATAAAAAATGACCAACCACATTACAAGCATGTCCT
TACCTCTCTATCTCTGTGTAAGTCTTTTATTTTATCTCACTGAAACTAATCTCAAATTAG
AGATATCATCGCTGCACTGGTCTAAAACCCATCCATTTTTATATGCAATGCCCAAAAAAA
AATTGGCTTCAGTCGCCACCAAGCATCGCTTGTAACCGAGCTCGAGCTTCATCAGAAACA
GAGAATCTGCACCTTCTCCTCTGCGGTTGTTGAGGTGAAGACGGGACCGAGGAGAAGCAG
ATGACGACAACCGTCAGATTATCTGATGAGTTAAGCCTCGCTGCTTCTTTCCCAAGTTCC
ATCGCGCATTTTCTCGGGTCACCGTGCCTCCTAAGCCCTTGCCTAGCGTTACTCACTGCA
TTCTGGCTTGACAACACGTCCCATATACCATCACATGCCAAAATCAAGAACTCGTCGTCC
TCTGTTAGGATGAGTTGCTGAATCTCCGGGTCTGAGATGAGAGGTGAAGAAGAGCCAGCG
AAAGGAGTCTTCAGTTCCCAGTCACCAATGGCCCGAGTGACAGCTAGGACTCCGTTGAGG
TACCCGTCCCCAAAGTATCCTCCAAGATCCTCAATCCGCCTACGTTCCGGCTCATAAGTT
GACCTGTGATCGAAAGACATATCAATAGCCACTCCTCTCCGGCATAGCACAGCGCGGCAA
TCTCCAGCGTTAGCAACCAGAAGATGTCGTCCGATAACGAGAGCCGT

QA 1 767 1 767
DS 

RD RS1H507TF 670 0 0
AAGCCCTTGCCTAACGTTACTCACTGCATTCTGGCTTGACAACACGTCCCATATACCATC
ACATGCCAAAATCAAGAACTCGTCGTCCTCTGTTAGGATGAGTTGCTGAATCTCCGGGTC
TGAGATGAGAGGTGAAGAAGAGCCAGCGAAAGGAGTCTTCAGTTCCCAGTCACCAATGGC
CCGAGTGACAGCTAGGACTCCGTTGAGGTACCCGTCCTCAAAGTATCCTCCAAGATCCTC
AATCCGCCTACGTTCCGGCTCATAAGTTGACCTGTGATCGAAAGACATATCAATAGCCAC
TCCTCTCCGGCATAGCACAGCGCGGCAATCTCCAGCGTTAGCAACCAGAAGATGTCGTCC
GATAACGAGAGCCGTCAAGGCGGTTGTCCCGCACGAAGCCCTGACAATGCTTTCGTCAGC
CATGGCGACATCAGCCAAAGCAAACGCCTTCCGGTGAGAGTTCTCGACTTCTTGTAAGAA
AAAGTTGTCCACAGTGGATGGCATCTCTGGAAACACGGCATCTTGGAAGAAGAGTCTCGT
CAAGTTGTTCTTCATGTAAAGTGATGCCTCAGGTCCACCATGGCCATCAAAGACGCCATA
GAAAGCACTAGGAAGCGAGGATCTAAGATGAGTTGATAAGTCGTCAATGCAGAAGTGTTC
ATCCTCCAT
C

QA 1 669 1 669
DS 

RD RS1CS03TF 684 0 0
CATAGCACAGCGCGGCAATCTCCAGCGTTAGCAACCAGAAGATGTCGTCCGATAACGAGA
GCCGTCAAGGCGGTTGTCCCGCACGAAGCCCTGACAATGCTTTCGTCAGCCATGGCGACA
TCAGCCAAAGCAAACGCCTTCCGGTGAGAGTTCTCGACTTCTTGTAAGAAAAAGTTGTCC
ACAGTGGATGGCATCTCTGGAAACACGACATCTTGGAAGAAGAGTCTCGTCAAGTTGTTC
TTCATGTAAAGTGATGCCTCAGGTCCACCATGGCCATCAAAGACGCCATAGAAAGCACTA
GGAAGCGAGGATCTAAGATGAGTTGATAAGTCGTCAATGCAGACGTGTTCATCCTCCATG
GTGTCTCGGCCTCGAATGTCAGCAAAGCTCCCTGAACGTATAGTCGGGAAAAACTCACAG
GTGGGTTCTTCAATGGTGGTAGTTGCAAAACTCATGCCCGATCCAAATTGAGGAATCTCA
GCACGCACAGAGTCAGAAACACGGACCTTGATATCAGACTCAGCAACCATGGTTTGACTT
AGAATCATGACTTTCGGTTATAATTAAAAATCGAGCGAGATCCGATTGCGAATTCCACCG
AAAGGCGCTTTGCTTGTACGCAATTGAAAATTCGCCCAAAAAGAATAAAGAAGAAAGGTA
TAATGAAATTCAATTAGGGTTTCC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 3

CO CL2609Contig1 690 3 5 U
GGAAGCTCAACATTTTTACTTCATTATAAATGTCATAAAAACTCAGAGATGATTTGATAA
TACAAAACGAAACAAGAATGTTTCATGCGGTATTGTTGACATAGAAGTAAAGAGCTGCTA
AAGCTAGAGCCCCAACAGCAATTGCTATAGGCAAAGCCTTCCCAACGGCTTCATCCCGTT
GGAGCTCAGCTTTTCTAGCCTTTCTCACATCCTTGTCATTAACGTTCTTGCTCACATCAG
GCATGTACGGTCTGAACCGCCGTTTAGGAGCAGCACACACTGGACAGAAGTAATTATCAG
GCAACTTATCGAATGGAGTTCTGTCATTGTATATATACCCGCAATCACGGCAGATATAGG
CCTGCTTGGAGGAGACACGCATGGAGAATCTTGGAGCAGAGGAGGAAGATGAAGATTTCG
AAAGGGACTTCTTCCTGTTGTTGCCGAGAATCCTCAGCGAGTAATACGGCAAGAAAGATG
ACGATCTCTGGAGGTTTGAAGTCACCGGGGCTGACGGTTTTCCGGCGTAAAGCGTCGCCG
GAGTAACGTACATCGTCGTCATTGAGAAAGGAAGTGTGGTTGGTGGGATCAGTGGAGAGA
TAGAGAAGATGAAAGTGATGATTGAGAGGAAGAATATAGAAAGAGCGAGAGGATGTGGAA
GAGTGTGCTCCTCACAAGCCCATTTCCATT


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1E363JQ U 1
AF RS1BK60JQ U 1
AF RS1BK60TF C 147
BS 1 34 RS1BK60JQ
BS 35 35 RS1E363JQ
BS 36 38 RS1BK60JQ
BS 39 39 RS1E363JQ
BS 40 690 RS1BK60JQ

RD RS1E363JQ 553 0 0
GA
AAGCTCAACATTTTTACTTCATTATAAATGTCATAAAAACTCAGAGATGATTTGATAATA
CAAAACGAAACAAGAATGTTTCATGCGGTATTGTTGACATAGAAGTAAAGAGCTGCTAAA
GCTAGAGCCCCAACAGCAATTGCTATAGGCAAAGCCTTCCCAACGGCTTCATCCCGTTGG
AGCTCAGCTTTTCTAGCCTTTCTCACATCCTTGTCGTTGACGTTCTTGCTCACATCAGGC
ATGTACGGTCTGAACCGCCGTTTAGGAGCAGCACACACTGGACAGAAGTAATTGTCAGGC
AACTTATCGAATGGAGTTCTGTCATTGTATATATACCCGCAATCACGGCAGATATAGGCT
TGCTTGGAGGAGACACGCATGGAGAATCTTGGAGCAGAGGAGGATGATGAAGATTTCGAA
AGGGACTTCTTCCTGTTGTTGCCGAGAATCCTCAGCGAGTAATACGGCAAGAAAGATGAC
GATCTCTGGAGGTTTGAAGTCACCGGGGCTGACGGTTTGCCCGCGTAAAGCGTTGCCGGA
GTAACGTACAT

QA 3 553 3 553
DS 

RD RS1BK60JQ 690 0 0
GGAAGCTCAACATTTTTACTTCATTATAAATGTC*TAACAACTCAGAGATGATTTGATAA
TACAAAACGAAACAAGAATGTTTCATGCGGTATTGTTGACATAGAAGTAAAGAGCTGCTA
AAGCTAGAGCCCCAACAGCAATTGCTATAGGCAAAGCCTTCCCAACGGCTTCATCCCGTT
GGAGCTCAGCTTTTCTAGCCTTTCTCACATCCTTGTCATTAACGTTCTTGCTCACATCAG
GCATGTACGGTCTGAACCGCCGTTTAGGAGCAGCACACACTGGACAGAAGTAATTATCAG
GCAACTTATCGAATGGAGTTCTGTCATTGTATATATACCCGCAATCACGGCAGATATAGG
CCTGCTTGGAGGAGACACGCATGGAGAATCTTGGAGCAGAGGAGGAAGATGAAGATTTCG
AAAGGGACTTCTTCCTGTTGTTGCCGAGAATCCTCAGCGAGTAATACGGCAAGAAAGATG
ACGATCTCTGGAGGTTTGAAGTCACCGGGGCTGACGGTTTTCCGGCGTAAAGCGTCGCCG
GAGTAACGTACATCGTCGTCATTGAGAAAGGAAGTGTGGTTGGTGGGATCAGTGGAGAGA
TAGAGAAGATGAAAGTGATGATTGAGAGGAAGAATATAGAAAGAGCGAGAGGATGTGGAA
GAGTGTGCTCCTCACAAGCCCATTTCCATT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1BK60TF 535 0 0
ATAGGCAAAGCCTTCCCAACGGCTTCATCCCGTTGGAGCTCAGCTTTTCTAGCCTTTCTC
ACATCCTTGTCATTAACGTTCTTGCTCACATCAGGCATGTACGGTCTGAACCGCCGTTTA
GGAGCAGCACACACTGGACAGAAGTAATTATCAGGCAACTTATCGAATGGAGTTCTGTCA
TTGTATATATACCCGCAATCACGGCAGATATAGGCCTGCTTGGAGGAGACACGCATGGAG
AATCTTGGAGCAGAGGAGGAAGATGAAGATTTCGAAAGGGACTTCTTCCTGTTGTTGCCG
AGAATCCTCAGCGAGTAATACGGCAAGAAAGATGACGATCTCTGGAGGTTTGAAGTCACC
GGGGCTGACGGTTTTCCGGCGTAAAGCGTCGCCGGAGTAACGTACATCGTCGTCATTGAG
AAAGGAAGTGTGGTTGGTGGGATCAGTGGAGAGATAGAGAAGATGAAAGTGATGATTGAG
AGGAAGAATATAGAAAGAGCGAGAGGATGTGGAAGAGTGTGCTCCTCACAAGCCC

QA 1 535 1 535
DS 



AS 1 4

CO CL2610Contig1 814 4 16 U
GAAGCCCCCAAATCTGCAGCAGGAGCAGCCATGGTGTGCATCAGGCGAGCGACAGTGGAC
GATCTGCTGGCTATGCAGGCCTGCAACCTCATGTGCCTCCCCGAGAACTACCAGATGAAG
TACTACCTTTACCACATCCTCTCTTGGCCTCAGCTTCTCTACGTCGCCGAGGACTACAAC
GGTCGCATCGTAGGCTACGTCCTCGCCAAGATGGAAGAGGAGAGCAACGAGTGCCACGGC
CACATCACTTCCCTCGCCGTTCTCCGCACTCATCGCAAGCTCGGCCTCGCCACTAAGCTC
ATGACCGCCGCCCAAGCTGCCATGGAACAGGTTTATGGGGCAGAGTATGTTTCATTGCAT
GTGAGGAGGAGTAACCGAGCAGCCTTCAATCTCTACACGGAGACATTAGGCTACCAGATT
AACGATGTGGAAGCCAAGTATTACGCCGATGGAGAGGATGCCTATGATATGCGAAAGAAT
CTCAAGGGTAAGCAGATTCATCAGCACCACAGCGCCGGCCACGCTCATCATCACCATGGA
GGTGGTTGTTGTTCAGCTGATGCTAAACCTGTTGAAACAACAACTCAAGCTGAAGCTACA
AGTTCCAAGTGAGACTCCACTCTGTGAGTAGATTGGGCTTTAGCTCTAATACTGCTCACT
CTTTTTCCATTCATATGATTTTTGTTTGAGTGTCTAAAATACATTTGTGTTTGTTTTCCA
TTGTCTTCTCCAATCTTTTTTCTATGTATCAATGTTTCTTTCAGAAGTACCAACCTTGTT
TTCTCCTTTTAAGGCTTTACAACTTTAGATTGAC


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EB44TF U 1
AF RS1EB44JQ C 1
AF RS1AM03JQ C 2
AF RS1AM03TF U 27
BS 1 1 RS1EB44JQ
BS 2 193 RS1EB44TF
BS 194 194 RS1AM03TF
BS 195 667 RS1EB44TF
BS 668 668 RS1AM03TF
BS 669 698 RS1EB44TF
BS 699 699 RS1EB44JQ
BS 700 761 RS1EB44TF
BS 762 765 RS1AM03TF
BS 766 766 RS1EB44JQ
BS 767 781 RS1AM03TF
BS 782 782 RS1EB44JQ
BS 783 793 RS1AM03TF
BS 794 794 RS1EB44JQ
BS 795 805 RS1AM03TF
BS 806 814 RS1EB44JQ

RD RS1EB44TF 761 0 0
G
AAGCCCCCAAATCTGCAGCAGGAGCAGCCATGGTGTGCATCAGGCGAGCGACAGTGGACG
ATCTGCTGGCTATGCAGGCCTGCAACCTCATGTGCCTCCCCGAGAACTACCAGATGAAGT
ACTACCTTTACCACATCCTCTCTTGGCCTCAGCTTCTCTACGTCGCCGAGGACTACAACG
GTCGCATCGTAG*CTACGTCCTCGCCAAGATGGAAGAGGAGAGCAACGAGTGCCACGGCC
ACATCACTTCCCTCGCCGTTCTCCGCACTCATCGCAAGCTCGGCCTCGCCACTAAGCTCA
TGACCGCCGCCCAAGCTGCCATGGAACAGGTTTATGGGGCAGAGTATGTTTCATTGCATG
TGAGGAGGAGTAACCGAGCAGCCTTCAATCTCTACACGGAGACATTAGGCTACCAGATTA
ACGATGTGGAAGCCAAGTATTACGCCGATGGAGAGGATGCCTATGATATGCGAAAGAATC
TCAAGGGTAAGCAGATTCATCAGCACCACAGCGCCGGCCACGCTCATCATCACCATGGAG
GTGGTTGTTGTTCAGCTGATGCTAAACCTGTTGAAACAACAACTCAAGCTGAAGCTACAA
GTTCCAAGTGAGACTCCACTCTGTGAGTAGATTGGGCTTTAGCTCTAATACTGCTCACTC
TTTTTC*ATTCATATGATTTTTGTTTGAGTGTCTAAA*TACATTTGTGTTTGTTTTCCAT
TGTCTTCTCCAATCTTTTTTCTATGTATCAATGTTTCTTT

QA 2 761 2 761
DS 

RD RS1EB44JQ 814 0 0
GAAGCCCCCAAATCTGCAGCAGGAGCAGCCATGGTGTGCATCAGGCGAGCGACAGTGGAC
GATCTGCTGGCTATGCAGGC*TGCAACCTCATGTGCCTCCCCGAGAACTACCAGATGAAG
TACTACCTTTACCACATCCTCTCTTGGCCTCAGCTTCTCTACGTCGCCGAGGACTACAAC
GGTCGCATCGTAG*CTACGTCCTCGCCAAGATGGAAGAGGAGAGCAACGAGTGCCACGGC
CACATCACTTCCCTCGCCGTTCTCCGCACTCATCGCAAGCTCGGCCTCGCCACTAAGCTC
ATGACCGCCGCCCAAGCTGCCATGGAACAGGTTTATGGGGCAGAGTATGTTTCATTGCAT
GTGAGGAGGAGTAACCGAGCAGCCTTCAATCTCTACACGGAGACATTAGGCTACCAGATT
AACGATGTGGAAGCCAAGTATTACGCCGATGGAGAGGATGCCTATGATATGCGAAAGAAT
CTCAAGGGTAAGCAGATTCATCAGCACCACAGCGCCGGCCACGCTCATCATCACCATGGA
GGTGGTTGTTGTTCAGCTGATGCTAAACCTGTTGAAACAACAACTCAAGCTGAAGCTACA
AGTTCCAAGTGAGACTCCACTCTGTGAGTAGATTGGGCTTTAGCTCTAATACTGCTCACT
CTTTTTCCATTCATATGATTTTTGTTTGAGTGTCTAAAATACATTTGTGTTTGTTTTCCA
TTGTCTTCTCCAATCTTTTTTCTATGTATCAATGTTTCTTTCAGAAGTACCAACCTTGTT
TTCTCCTTTTAAGGCTTTACAACTTTAGATTGAC

QA 1 814 1 814
DS 

RD RS1AM03JQ 811 0 0
AAGCCCCCAAATCTGCAGCAGGAGCAGCCATGGTGTGCATCAGGCGAGCGACAGTGGACG
ATCTGCTGGCTATGCAGGCCTGCAACCTCATGTGCCTCCCCGAGAACTACCAGATGAAGT
ACTACCTTTACCACATCCTCTCTTGGCCTCAGCTTCTCTACGTCGCCGAGGACTACAACG
GTCGCATCGTCGGCTACGTCCTCGCCAAGATGGAAGTGGAGAGCAACGAGTGCCACGGCC
ACATCACTTCCCTCGCCGTTCTCCGCACTCATCGCAAGCTCGGCCTCGCCACTAAGCTCA
TGACCGCCGCCCAAGCTGCCATGGAACAGGTTTATGGGGCAGAGTATGTTTCATTGCATG
TGAGGAGGAGTAACCGAGCAGCCTTCAATCTCTACACGGAGACATTAGGCTACCAGATTA
ACGATGTGGAAGCCAAGTATTACGCCGATGGAGAGGATGCCTATGATATGCGAAAGAATC
TCAAGGGTAAGCAGATTCATCAGCACCACAGCGCCGGCCACGCTCATCATCACCATGGAG
GTGGTTGTTGTTCAGCTGATGCTAAACCTGTTGAAACAACAACTCAAGCTGAAGCTACAA
GTTCCAAGTGAGACTCCACTCTGTGAGTAGATTGGGCTTTAGCTCTAATACTGCTCACTC
TTTTTCCATTCATATGATTTTTGTTTGAGTGTCTAAAATACATTTGTGTTTGTTTTCCAT
TGTCTTCTCCAATCTTTTTTCTATGTATCAATGTTTCTTTCAGAAGTACCAACCTTGTTT
TCTCCTTTTAAGGCTTTACAACTT
TAGATTG

QA 1 804 1 804
DS 

RD RS1AM03TF 779 0 0
AGCCATGGTGTGCATCAGGCGAGCGACAGTGGACGATCTGCTGGCTATGCAGGCCTGCAA
CCTCATGTGCCTCCCCGAGAACTACCAGATGAAGTACTACCTTTACCACATCCTCTCTTG
GCCTCAGCTTCTCTACGTCGCCGAGGACTACAACGGTCGCATCGTCGGCTACGTCCTCGC
CAAGATGGAAGTGGAGAGCAACGAGTGCCACGGCCACATCACTTCCCTCGCCGTTCTCCG
CACTCATCGCAAGCTCGGCCTCGCCACTAAGCTCATGACCGCCGCCCAAGCTGCCATGGA
ACAGGTTTATGGGGCAGAGTATGTTTCATTGCATGTGAGGAGGAGTAACCGAGCAGCCTT
CAATCTCTACACGGAGACATTAGGCTACCAGAATAACGATGTGGAAGCCAAGTATTACGC
CGATGGAGAGGATGCCTATGATATGCGAAAGAATCTCAAGGGTAAGCAGATTCATCAGCA
CCACAGCGCCGGCCACGCTCATCATCACCATGGAGGTGGTTGTTGTTCAGCTGATGCTAA
ACCTGTTGAAACAACAACTCAAGCTGAAGCTACAAGTTCCAAGTGAGACTCCACTCTGTG
AGTAGATTGGGCTTTAGCTCTAATACTGCTCACTCTTTTTCCATTCATATGATTTTTGTT
TGAGTGTCTAAA*TACATTTGTGTTTGTTTTCCATTGTCTTCTCCAATCTTTTTTCTATG
TATCAATGTTTCTTTCAGA*GTACCAACCTTGTTT*CTCCTTTTAAG*CTTTACAACTT

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

CO CL2611Contig1 749 2 6 U
GAAACATGATACATTCTTCTTGTTTCCACTCGAATACATAACAATATACCCAAAAAAATG
TTTTAAAAAAAATATTACTATGTAAAATAGTCGAGTGGACTAAGTAGCAGCAATGTACAC
AAATAATGACAACAAGTCGTAAAAAAAAAATTAATAAATCAAAAAAAAAAATTTTAATGG
AAGGAACTAAAAAAAGTCTAATAACACAACAACCTTTGTGAACAGTTATTGTAATCATTT
GCCAATGTTGGTGGCGTTACCTCAATTAGGCATGGGGATTCAGCTGCCATCGTTGCTCTC
TGTAAAGTAATGTTAAAAGTAAAATGTTTTGAATCATATGTCTTTCTTTTCAAACAAAGC
TTGAGGCTGTTGAGTTTGAGTGTATGAGGAAGTTAGCTGAAAAGGTTGCTGTATTGTGGT
TTGTGAAACTCCATTCGCCACTGCTCCTTGCTCAACCACTGGCTCAATTTTCACAGCAGC
GTGTACAGGTGACTATATATCCATCCTTGACAAAAAACACTTTGATTCTTTTAGTTCTGC
GTATGAAATGATTCGGTTAAGGCAGTCACGGAACTTGGTTAATACTATTTTCTCCTGCTC
TGCATAAACCAGTTCTTGCCCTTTTGGTGGCTCCACCGAACAATTAGATGAAGCTGCAAC
CATTAACATAGTGTCCTGTTCATCACACATCAATGCCAAAGTTTCTGGAGACAATGACTT
TCCTTTAGAGCCATCTGAACTGGACTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CM44JQ U 1
AF RS1F006JQ U 65
BS 1 485 RS1CM44JQ
BS 486 486 RS1F006JQ
BS 487 494 RS1CM44JQ
BS 495 495 RS1F006JQ
BS 496 643 RS1CM44JQ
BS 644 749 RS1F006JQ

RD RS1CM44JQ 643 0 0
GAAACATGATACATTCTTCTTGTTTCCACTCGAATACATAACAATATACCCAAAAAAATG
TTTTAAAAAAAATATTACTATGTAAAATAGTCGAGTGGACTAAGTAGCAGCAATGTACAC
AAATAATGACAACAAGTCGTAAAAAAAAAATTAATAAATCAAAAAAAAAAATTTTAATGG
AAGGAACTAAAAAAAGTCTAATAACACAACAACCTTTGTGAACAGTTATTGTAATCATTT
GCCAATGTTGGTGGCGTTACCTCAATTAGGCATGGGGATTCAGCTGCCATCGTTGCTCTC
TGTAAAGTAATGTTAAAAGTAAAATGTTTTGAATCATATGTCTTTCTTTTCAAACAAAGC
TTGAGGCTGTTGAGTTTGAGTGTATGAGGAAGTTAGCTGAAAAGGTTGCTGTATTGTGGT
TTGTGAAACTCCATTCGCCACTGCTCCTTGCTCAACCACTGGCTCAATTTTCACAGCAGC
GTGTATAGGTGACTCTATATCCATCCTTGACAAAAAACACTTTGATTCTTTTAGTTCTGC
GTATGAAATGATTCGGTTAAGGCAGTCACGGAACTTGGTTAATACTATTTTCTCCTGCTC
TGCATAAACCAGTTCTTGCCCTTTTGGTGGCTCCACCGAACAA

QA 1 643 1 643
DS 

RD RS1F006JQ 685 0 0
AAAAGAAATATTACTATGTAAAATAGTCGAGTGGACTAAGTAGCAGCAATGTACACAAAT
AATGACAACAAGTCGTAAAGAAAACATTAATAAATCAAAAAGAAAAATTTTAATGGAAGG
AACTAAAAAAAGTCTAATAACACAACAACCTTTGTGAACAGTTATTGTAATCATTTGCCA
ATGTTGGTGGCGTTACCTCAATTAGGCATGGGGATTCAGCTGCCATCGTTGCTCTCTGTA
AAGTAATGTTAGAAGTAAAATGTTTTGAATCATATGTCTTTCTTTTCAAACAGAGCTTGA
GGCTGTTGAGTTTGAGTGTATGAGGAAGTTAGCTGAAAAGGTTGCTGTATTGTGGTTTGT
GAAACTCCATTCGCCACTGCTCCTTGCTCAACCACTGGCTCAATTTTCACAGCAGCGTGT
ACAGGTGACTATATATCCATCCTTGACAAAGAACACTTTGATTCTTTTAGTTCTGCGTAT
GAAATGATTCGGTTAAGGCAGTCACGGAACTTGGTTAATACTATTTTCTCCTGCTCTGCA
TAAACCAGTTCTTGCCCTTTTGGTGGCTCCACCGAACAATTAGATGAAGCTGCAACCATT
AACATAGTGTCCTGTTCATCACACATCAATGCCAAAGTTTCTGGAGACAATGACTTTCCT
TTAGAGCCATCTGAACTGGACTCCT

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 3

CO CL2612Contig1 459 3 11 U
GGAAAGCAGAACAAGCAACACAAAACACACACAAGACCTGAAACAACTTCAGTTAAGAAA
AGAAAAAAGAAAACAAATCATGTCGGACAAGTGCGGAAGCTGCGATTGTGCTGACAAGAC
CCAGTGCGTGAAGAAGGGAACCAGCTACACATTCGACATCGTCGAGACTCAGGAGAGCTA
CAAGGAAGCCATGTTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAGCGGTTGCCAATGCAAGTGTGG
CTCTACCTGCAGTTGCGTCAACTGCACTTGCAACTAGAATCAAAATGTAATATGAATAAA
TGTTGATGTGAGCTCATCTAGTAAGCTCATATCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTT
CACTAAGCTCATATCTTTCTTATGACTCTGTATTATGGTTTATGGTGTGTGATGTAATCG
GTTTATGGCCCTTATAATCTAATACTCCCTCCGTTTCAC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 10 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RS1CP33TF U 1
AF RS1FT41JQ C 1
AF RS1FT41TF U 1
BS 1 105 RS1CP33TF
BS 106 106 RS1FT41TF
BS 107 137 RS1CP33TF
BS 138 138 RS1FT41TF
BS 139 218 RS1CP33TF
BS 219 219 RS1FT41TF
BS 220 354 RS1CP33TF
BS 355 357 RS1FT41TF
BS 358 380 RS1CP33TF
BS 381 456 RS1FT41TF
BS 457 459 RS1FT41JQ

RD RS1CP33TF 380 0 0
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CACTAAGCTCATATCTTTCT

QA 1 380 1 380
DS 

RD RS1FT41JQ 459 0 0
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AGAAAAAAGAAAACAAATCATGTCGGACAAGTGCGGAAGCTGCGATTGTGCTGACAAGAC
CCAGTGCGTGAAGAAGGGAACCAGCTACACATTCGACATCGTCGAGACTCAGGAGAGCTA
CAAGGAAGCCATGTTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAGCGGTTGCCAATGCAAGTGTGG
CTCTACCTGCAGTTGCGTCAACTGCACTTGCAACTAGAATCAAAATGTAATATGAATAAA
TGTTGATGTGAGCTCATTTAGTAAGCTCATATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTT
CACTAAGCTCATATCTTTCTTATGACTCTGTATTATGGTTTATGGTGTGTGATGTAATCG
GTTTATGGCCCTTATAATCTAATACTCCCTCCGTTTCAC

QA 1 459 1 459
DS 

RD RS1FT41TF 459 0 0
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AGAAAAAAGAAAACAAATCATGTCGGACAAGTGCGGAAGCTGCGATTGTGCTGACAAGAC
CCAGTGCGTGAAGAAGGGAACCAGCTACACATTCGACATCGTCGAGACTCAGGAGAGCTA
CAAGGAAGCCATGTTCATGGACGTTGGTGCAGAAGAGAGCGGTTGCCAATGCAAGTGTGG
CTCTACCTGCAGTTGCGTCAACTGCACTTGCAACTAGAATCAAAATGTAATATGAATAAA
TGTTGATGTGAGCTCATCTAGTAAGCTCATATCTTTCTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTGTT
CACTAAGCTCATATCTTTCTTATGACTCTGTATTATGGTTTATGGTGTGTGATGTAATCG
GTTTATGGCCCTTATAATCTAATACTCCCTCCGTTT
CAC

QA 1 456 1 456
DS 



AS 1 4

CO CL2613Contig1 738 4 2 U
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AATAAAACCAAATAATCAATTATGAAAACTATGAATCAAATATGGTAATAACCATTGAGA
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CTTAGACCGTGATTTCTTGACACCAGCAGTGAACCAGAGCTTGTCGGACTTCGAGCTCTC
GACTGAGACTGTCGTGACTTTAACCCAAACCAACACTCTCGTCTTCATCCCTTCCACGCC
CATCAGTTTCCCTCTAAGCAAGATCCCTTTAACACGTGTCGCATACCTTATCGCTGATCC
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ATCGAATTCGTAGCAGATTATGTTTTGTGGGAAGAGTCCTGGTGGTAAGTTGTACTCTTT
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CTTCTCCATTTTTCTTCTCTCTCGATTCCCTCAGCGTGAAGACAAATAGAGAGCTCTCCG
CTAACAAAAGTGACAGTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CT82JQ U 165
AF RS1EQ57JQ U 1
AF RS1EQ57TF C 1
AF RS1CT82TF C 56
BS 1 603 RS1EQ57JQ
BS 604 738 RS1CT82TF

RD RS1CT82JQ 268 0 0
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ACCTTATCGCTGATCCGTCTTTGAATGTGACTTCCCAGGGTGTAGCAAAAAAGACAGTGA
GTTTGTTCTTGGTCTCATCGAATTCGTA

QA 1 268 1 268
DS 

RD RS1EQ57JQ 605 0 0
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CTT
CC

QA 1 603 1 603
DS 

RD RS1EQ57TF 605 0 0
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AATAAAACCAAATAATCAATTATGAAAACTATGAATCAAATATGGTAATAACCATTGAGA
AGAACGCATTTAGAACTCTCCAACGACTTTGATAGCGTCGTGAGGTGTGTCGTAAACATT
CTTAGACCGTGATTTCTTGACACCAGCAGTGAACCAGAGCTTGTCGGACTTCGAGCTCTC
GACTGAGACTGTCGTGACTTTAACCCAAACCAACACTCTCGTCTTCATCCCTTCCACGCC
CATCAGTTTCCCTCTAAGCAAGATCCCTTTAACACGTGTCGCATACCTTATCGCTGATCC
GTCTTTGAATGTGACTTCGCAGGGTGTAGCAAAAAAGACAGTGAGTTTGTTCTTGGTCTC
ATCGAATTCGTAGCAGATTATGTTTTGTGGGAAGAGTCCTGGTGGTAAGTTGTACTCTTT
GAGTAGTTCTGGTAAGCTTTTGAGCGGC*****TTTAAGCTTGTTGAAAACCCATTTGGC
TTTCTCTTCAACGGTACTAGAGAAAGTGGTGAGGTCATTGGTGATGTTGGAGAGCTCTTC
CTT
CC

QA 1 603 1 603
DS 

RD RS1CT82TF 683 0 0
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TGAGAAGAACGCATTTAGAACTCTCCAACGACTTTGATAGCGTCGTGAGGTGTGTCGTAA
ACATTCTTAGACCGTGATTTCTTGACACCAGCAGTGAACCAGAGCTTGTCGGACTTCGAG
CTTTCGACTGAGACTGTCGTGACTTTAACCCAAACCAACACTTTCGTCTTCATCCCTTCC
ACGCCCATCAGTTTCCCTCTAAGCAAGATCCCTTTAACACGTGTCGCATACCTTATCGCT
GATCCGTCTTTGAATGTGACTTCGCAGGGTGTAGCAAAAAAGACAGTGAGTTTGTTCTTG
GTCTCATCGAATTCGTAGCAGATTATGTTTTGTGGGAAGAGTCCTGGTGGTAAGTTGTAC
TCTTTGAGTAGTTCTGGTAAGCTTTTGAGCGGCTTTCCTTTAAGCTTGTTGAAAACCCAT
TTGGCTTTCTCTTCAACGGTACTAGAGAAAGTGGTGAGGTCATTGGTGATGTTGGAGAGC
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AACACCTTCTCCATTTTTCTTCTCTCTCGATTCCCTCAGCGTGAAGACAAATAGAGAGCT
CTCCGCTAACAAAAGTGACAGTC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 4

CO CL2614Contig1 934 4 7 U
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TATTTCACCTGATTCCCCATATACTAAAGCCAAAAAAAAAAAAGAATAAAAGCAACAAAT
GCCAGAAATGCCCTTGTATTATTCTAAGAGGGTTTGAAGGTAATTAAAATTGAGTTTCCA
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TCAAAGTCTTTATTCTTATCATAGTCTCCGTTATCAGAATCTTCTCCCTCGGATTCCTCA
ACTTCATCATCACCTTCTCCTTCTTCATTCTCTTCCTTGCCATCAGCCTTAAGCTTCGCT
TCAAGTTTCTCCAAGGCCTCCAGCTTCTGCAGATCTGCGTCTTGAGTCCATCTAGCTCTC
TTCACAGGCCGTTCTCTTCGACTATCTCCAAGAAGTTCTTTAGGGAAGTTATCAGGTCTA
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GTATCGTCTGAGATTGATTTACGGTCAGGTAACGTAATGTCAGGGAAGATAACGAAAGGT
TCGGCCTTTGCGTACTCAACGCCAAACCCACCAAACCCACCTCTTCCTCTTCCTCGTCCT
CCTCTGTAAGCCATCTACGACCGATTGTGGCGGTACAACGCAACGTCGATTCGGCACAGC
GGCGGCGGGGAGAAGAAACAATTTAGGGGTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D645JQ U 92
AF RS1E068JQ U 1
AF RS1E068TF C 171
AF RS1D645TF C 276
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BS 300 614 RS1E068JQ
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BS 893 934 RS1D645TF

RD RS1D645JQ 562 0 0
CC
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GGCTCGTTATAATCGTCATCATCATAGTCAAAGTCTTTATTCTTATCATAGTCTCCGTTA
TCAGAATCTTCTCCCTCGGATTCCTCAACTTCATCATCACCTTCTCCTTCTTCATTCTCT
TCCTTGCCATCAGCCTTAAGCTTCGCTTCAAGTTTCTCCAAGGCCTCCAGCTTCTGCAGA
TCTGCGTCTTGAGTCCATCTAGCTCTCTTCACAGGCCGTTCTCTTCGACTATCTCCAAGA
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TTAGACTTCGTCTTCTTCGGCTTCAACGTGTCTGAGAACCTCTCAATGTCTAAACTCTCA
CTCTCTTTCTTTGAAAC
ACC

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DS 

RD RS1E068JQ 739 0 0
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TATTTCACCTGATTCCCCATATACTAAAGCCAAAAAAAAAAAAGAATAAAAGCAACAAAT
GCCAGAAATGCCCTTGTATTATTCTAAGAGGGTTTGAAGGTAATTAAAATTGAGTTTCCA
CCATCTCTTGCACTCAAAACTTGATCCTTTTTTTGGGAAGACATAAAGAAAAAGAAGCCT
TAAATATACACTTCTTCATTATCGTTATCCTCCGGCTCGTTATAATCGTCATCATCATCG
TCAAAGTCTTTATTCTTATCATAGTCTCCGTTATCAGAATCTTCTCCCTCGGATTCCTCA
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TCAAGTTTCTCCAAGGCCTCCAGCTTCTGCAGATCTGCGTCTTGAGTCCATCTAGCTCTC
TTCACAGGCCGTTCTCTTCGACTATCTCCAAGAAGTTCTTTAGGGAAGTTATCAGGTCTA
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GTATCGTCTGAGATTGATT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1E068TF 722 0 0
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AAGCTTCGCTTCAAGTTTCTCCAAGGCCTCCAGCTTCTGCAGATCTGCGTCTTGAGTCCA
TCTAGCTCTCTTCACAGGCCGTTCTCTTCGACTATCTCCAAGAAGTTCTTTAGGGAAGTT
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CGGCTTCAACGTGTCTGAGAACCTTTCAATGTCTAAACTCTCACTCTCTTTCTTTGAAAC
*CCATCGCCTAAGTGGTAAGGCGAACTTTTCCAGAACCTCTCAAAATAATTGAAGTTCTT
AAGTAATTGGGTATCGTCTGAGATTGATTTACGGTCAGGTAACGTAATGTCAGGGAAGAT
AACGAAAGGTTCGGCCTTTGCGTACTCAACGCCAAACCCACCAAACCCACCTCTTCCTCT
TCCTCGTCCTCCTCTGTAAGCCATCTACGACCGATTGTGGCGGTACAACGCAACGTCGAT
TC

QA 1 722 1 722
DS 

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CTCGTTATAATCGTCATCATCATAGTCAAAGTCTTTATTCTTATCATAGTCTCCGTTATC
AGAATCTTCTCCCTCGGATTCCTCAACTTCATCATCACCTTCTCCTTCTTCATTCTCTTC
CTTGCCATCAGCCTTAAGCTTCGCTTCAAGTTTCTCCAAGGCCTCCAGCTTCTGCAGATC
TGCGTCTTGAGTCCATCTAGCTCTCTTCACAGGCCGTTCTCTTCGACTATCTCCAAGAAG
TTCTTTAGGGAAGTTATCAGGTCTAAGAACAAGAAAGTCATAGAAAGATCCCCTCGCATT
AGACTTCGTCTTCTTCGGCTTCAACGTGTCTGAGAACCTCTCAATGTCTAAACTCTCACT
CTCTTTCTTTGAAACACCATCGCCTAAGTGGTAAGGCGAACTTTTCCAGAACCTCTCAAA
ATAATTGAAGTTCTTAAGTAATTGGGTATCGTCTGAGATTGATTTACGGTCAGGTAACGT
AATGTCAGGGAGGATAACGAAAGGTTCGGCCTTTGCGTACTCAACGCCAAACCCACCAAA
CCCACCTCTTCCTCTTCCTCGTCCTCCTCTGTAAGCCATCTACGACCGATTGTGGCGGTA
CAACGCAACGTCGATTCGGCACAGCGGCGGCGGGGAGAAGAAACAATTTAGGGGTTCCC

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

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AGCTATCTGCAACGGCATTGCCCTTCACAGTCCTGGTTTCATCCCTTACTGCGCAACGTT
CTTTGTGTTTACTGACTACATGAGAGCTGCGTTGAGAATCTCTGCTCTGTCTGAAGCTGG
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ACCTATCGAACACTTGTCCAGTTTCCGCGCCATGCCTAATATCATGATGTTCCGTCCTGC
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AGGGAAGACTGTGAGAGTCGTTTCTTTTGTGTGTTGGGAACTGTTTGATGAGCAAACGGA
TGAATACAAGGAAAGTGTGTTGCCATCAGATGTGTCAGCTAGAGTTAGTATTGAAGCTGG
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GAAGTGAGAGATGTTCTTCCTTAAACATTTGTCTTCTTTGTCCAAGTAGTAAAATGTAAA
GAAGACGGAAAATAAAATAAAAAATTGTCTCATAAGTTAAGTTGTAACTGAAACCATAAA
CACAAATATTAATACATTATGTTCG


BQ
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AF RS1DS89TF U 1
AF RS1DS89JQ C 301
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RD RS1DS89TF 769 0 0
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GATTGGGACTGGTTCGGAGCTAGAGATTGCTGCTCAAGCTGGAGAGGAGTTGAGGAAAGA
AGGGAAGACTGTGAGAGTCGTTTCTTTTGTGTGTTGGGAACTGTTTGATGAGCAAACGGA
TGAATACAAGGAAAGTGTGTTGCCATCAGATGTGTCAGCTAGAGTTAGTATTGAAGCTGG
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GTTTGGGGCA*GTGCACCAGCAGG**AGCTTTATAAAGAGTT
GGTATCA

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1DS89JQ 685 0 0
T
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GTTTTAGCCTTGTCTAGACAAAAGCTGCCTCAACTTCCAGGAACGTCTATTGAAAACGTC
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ATTGGGACTGGTTCGGAGCTAGAGATTGCTGCTCAAGCTGGAGAGGAGTTGAGGAAAGAA
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AAGTGAGAGATGTTCTTCCTTAAACATTTGTCTTCTTTGTCCAAGTAGTAAAATGTAAAG
AAGACGGAAAATAAAATAAAAAATTGTCTCATAAGTTAAGTTGTAACTGAAACCATAAAC
ACAAATATTAATACATTATGTTCG

QA 2 685 2 685
DS 



AS 1 4

CO CL2616Contig1 606 4 2 U
TTTTTAGGGAAAGGATTCTCTTTACAATATTAATGAAACTGTGTTCTATTGATATGGAAC
ATTTTATGTTCTTTATTGCTTGCTTACATCAAGTAACTTTATAAGTTACTCCTCTTTTTC
TGATTTATATCAACCCTCGATCTGAAATGCTGAAACGTTAAATGTTCGTGACAGGCCGGT
GTTATTAGCAAATGTGATCTTCTCAGGCTCTTTCCCTTTGATGAAGATATCATGCACAGG
AATCCAGATCATGAGTTCCTTGCTTTTAACTCCGGTAACTCTCTTAAACCTACGGTCTTC
AACAAAAGCAGATATCTCCGTGTCATATACCACTTTACGACCTATAGCAGCGAATGTATG
CTCAATCTTGTTTATCATCCTCATCCACACAAACCCTTTTGTTTTGTTGTGCCCAACTTC
TATCATGTCCTTCAATGGCAACAGTCCTGTAGGTAAATTGAAGAGTGCAAGAAGCTCCTT
GGCTTTATCCAGACAAAGGGATGGCTCACTGTAGCTCTCTATATCATCACAATCACTTAT
CACCATCTCTCTTAACGCCATGATAGGTAGATCCTTTCTTTTTGATGGTCGTACGTATGC
CTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1DA39TF C 1
AF RS1AH15JQ U 24
AF RS1AH15TF C 24
AF RS1DA39JQ U 6
BS 1 5 RS1DA39TF
BS 6 606 RS1DA39JQ

RD RS1DA39TF 606 0 0
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ATTTTATGTTCTTTATTGCTTGCTTACATCAAGTAACTTTATAAGTTACTCCTCTTTTTC
TGATTTATATCAACCCTCGATCTGAAATGCTGAAACGTTAAATGTTCGTGACAGGCCGGT
GTTATTAGCAAATGTGATCTTCTCAGGCTCTTTCCCTTTGATGAAGATATCATGCACAGG
AATCCAGATCATGAGTTCCTTGCTTTTAACTCCGGTAACTCTCTTAAACCTACGGTCTTC
AACAAAAGCAGATATCTCCGTGTCATATACCACTTTACGACCTATAGCAGCGAATGTATG
CTCAATCTTGTTTATCATCCTCATCCACACAAACCCTTTTGTTTTGTTGTGCCCAACTTC
TATCATGTCCTTCAATGGCAACAGTCCTGTAGGTAAATTGAAGAGTGCAAGAAGCTCCTT
GGCTTTATCCAGACAAAGGGATGGCTCACTGTAGCTCTCTATATCATCACAATCACTTAT
CACCATCTCTCTTAACGCCATGATAGGTAGATCCTTTCTTTTTGATGGTCGTACGTAT
GCCTCTCC

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DS 

RD RS1AH15JQ 577 0 0
C
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TACATCAAGTAACTTTATAAGTTACTCCTCTTTTTCTGATTTATATCAACCCTCGATCTG
AAATGCTGAAACGTTAAATGTTCGTGACAGGCCGGTGTTATTAGCAAATGTGATCTTCTC
AGGCTCTTTCTCTTTGATGAAAATATCATGCACAGGAATCCAGATCATGAGTTCCTTGCT
TTTAACTCCGGTAACTCTCTTAAACCTACGGTCTTCAACAAAAGCAAATATCTCCGTGTC
ATATACCACTTTACGACCTATAGCAGCGAATGTATGCTCAATCTTGTTTATCATCCTCAT
CCACACAAACCCTTTTGTTTTGTTGTGCCCAACTTCTATCATGTCCTTCAATGGCAACAG
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CTCACTGTAGCTCTCTATATCATCACAATCACTTATCACCATCTCTCTTAACGCCATGAT
AGGTAGATCCTTTCTTTTTGATGGTCGTACGTAT
CC

QA 2 575 2 575
DS 

RD RS1AH15TF 577 0 0
C
CAATATTAATGAAACTGTGTTCTATTGATATGGAACATTTTATGTTCTTTATTGCTTGCT
TACATCAAGTAACTTTATAAGTTACTCCTCTTTTTCTGATTTATATCAACCCTCGATCTG
AAATGCTGAAACGTTAAATGTTCGTGACAGGCCGGTGTTATTAGCAAATGTGATCTTCTC
AGGCTCTTTCTCTTTGATGAAGATATCATGCACAGGAATCCAGATCATGAGTTCCTTGCT
TTTAACTCCGGTAACTCTCTTAAACCTACGGTCTTCAACAAAAGCAGATATCTCCGTGTC
ATATACCACTTTACGACCTATAGCAGCGAATGTATGCTCAATCTTGTTTATCATCCTCAT
CCACACAAACCCTTTTGTTTTGTTGTGCCCAACTTCTATCATGTCCTTCAATGGCAACAG
TCCTGTAGGTAAATTGAAGAGTGCAAGAAGCTCCTTGGCTTTATCCAGACAAAGGGATGG
CTCACTGTAGCTCTCTATATCATCACAATCACTTATCACCATCTCTCTTAACGCCATGAT
AGGTAGATCCTTTCTTTTTGATGGTCGTACGTAT
CC

QA 2 575 2 575
DS 

RD RS1DA39JQ 601 0 0
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ATGTTCTTTATTGCTTGCTTACATCAAGTAACTTTATAAGTTACTCCTCTTTTTCTGATT
TATATCAACCCTCGATCTGAAATGCTGAAACGTTAAATGTTCGTGACAGGCCGGTGTTAT
TAGCAAATGTGATCTTCTCAGGCTCTTTCCCTTTGATGAAGATATCATGCACAGGAATCC
AGATCATGAGTTCCTTGCTTTTAACTCCGGTAACTCTCTTAAACCTACGGTCTTCAACAA
AAGCAGATATCTCCGTGTCATATACCACTTTACGACCTATAGCAGCGAATGTATGCTCAA
TCTTGTTTATCATCCTCATCCACACAAACCCTTTTGTTTTGTTGTGCCCAACTTCTATCA
TGTCCTTCAATGGCAACAGTCCTGTAGGTAAATTGAAGAGTGCAAGAAGCTCCTTGGCTT
TATCCAGACAAAGGGATGGCTCACTGTAGCTCTCTATATCATCACAATCACTTATCACCA
TCTCTCTTAACGCCATGATAGGTAGATCCTTTCTTTTTGATGGTCGTACGTATGCCTCTC
C

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 4

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CCTTCAAGAAAGTGGTGGTCTCTGTTTGAAACTTCAATACAAGTTATTATGCAAATATAA
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TATGATCTGCCTTTTTTCCACAATGATAGAAAAAAGGAAATGTGATGTAAAATAGTAACC
AGGGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 

AF RS1BL22JQ C 39
AF RS1BL22TF U 39
AF RS1CX61JQ C 1
AF RS1CX61TF U 1
BS 1 39 RS1CX61TF
BS 40 47 RS1BL22TF
BS 48 48 RS1CX61TF
BS 49 61 RS1BL22TF
BS 62 62 RS1CX61TF
BS 63 73 RS1BL22TF
BS 74 74 RS1CX61TF
BS 75 474 RS1BL22TF
BS 475 545 RS1CX61TF

RD RS1BL22JQ 438 0 0
G
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ATTCTGTATTACATC
CG

QA 2 436 2 436
DS 

RD RS1BL22TF 438 0 0
G
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TTGCTAGGTTGAGGGAGCTTCACACGCTCAAAGGTCACGTTGAATCTGTAGTGAGACTTA
AAGGTCTTGACATTGAAACCATTCAACAGTCTTACACAGTCTGATAGAAGCCTAGAGATA
GCTCAGGAACCGTCTCAAAGTCCTTCAAGAAAGTGGTGGTCTCTGTTTGAAACTTCAATA
CAAGTTATTATGCAAATATAAGTATCAAATTCCTAAGTAGTGTTTTTGTTGTGTTTGCTT
TCCTTTTTTAAGTTTGTTCTGTTGTATGACAAAGAATGACCAGAAGTAGAAAACATATAT
ATTCTGTATTACATC
CG

QA 2 436 2 436
DS 

RD RS1CX61JQ 545 0 0
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CCTTCAAGAAAGTGGTGGTCTCTGTTTGAAACTTCAATACAAGTTATTATGCAAATATAA
GTATCAAATTCCTAAGTAGTGTTTTTGTTGTGTTTGCTTTCCTTTTTTAAGTTTGTTCTG
TTGTATGAGAAAGAATGACCAGAAGTAGAAAACATATA**TTCTGTATTACATCTGAAGT
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AGGGG

QA 1 545 1 545
DS 

RD RS1CX61TF 545 0 0
GGAAGAAGGATTTTGGGAAAGAACAAAGGTAGTTACAATGGGCGCATGCACAGAGGACTC
TACATGGCCTGCAAGCACCAGATGCAAAGATGTTCCCGGAGCGAACCCATTTCAACGAGC
TTTCTCAAATGGCTGAAGAAGCTAAGAGAAGAGCTGAGATTGCTAGGTTGAGGGAGCTTC
ACACGCTCAAAGGTCACGTTGAATCTGTAGTGAGACTTAAAGGTCTTGACATTGAAACCA
TTCAACAGTCTTACACAGTCTGATAGAAGCCTAGAGATAGCTCAGGAACCGTCTCAAAGT
CCTTCAAGAAAGTGGTGGTCTCTGTTTGAAACTTCAATACAAGTTATTATGCAAATATAA
GTATCAAATTCCTAAGTAGTGTTTTTGTTGTGTTTGCTTTCCTTTTTTAAGTTTGTTCTG
TTGTATGAGAAAGAATGACCAGAAGTAGAAAACATATA**TTCTGTATTACATCTGAAGT
TATGATCTGCCTTTTTTCCACAATGATAGAAAAAAGGAAATGTGATGTAAAATAGTAACC
AGGGG

QA 1 545 1 545
DS 



AS 1 4

CO CL2618Contig1 544 4 7 U
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ACTTACAAATCGTAAAAGAAATCAAAATAAAAGAGCCTAAAATGATGAAGGGAAGCAAGT
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AAAGAGTCGCTTCTTATAACCTCTTTGCCACGGAGGAAAAGCTCAAAAGCACTTTTAAGA
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TCTAAGACTACTCCACTTATCTTCTGATCTTTTTTCTTTTTCTTCACTTTTAATTATAAT
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AGTGTATTTCAAAGTTTGTATCGGGTTGTGTTACTCACATGGAAATGCAGATGTTATGTT
CTTG


BQ
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0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 

AF RS1BA21JQ C 1
AF RS1EP28JQ C 1
AF RS1EP28TF U 1
AF RS1BA21TF U 1
BS 1 20 RS1EP28TF
BS 21 21 RS1BA21TF
BS 22 60 RS1EP28TF
BS 61 61 RS1BA21TF
BS 62 110 RS1EP28TF
BS 111 111 RS1BA21TF
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CTTG

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CTTG

QA 1 544 1 544
DS 



AS 1 4

CO CL2619Contig1 1362 4 10 U
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AATCTCTTCACCTTCGTTTTCACTCCTCCCCGACACCTCCAAGAAGAGAGTCTCTGACTC
CATCAATTACCTCTTCACTTACTTTCTCCTTTTGCTCGTTCCGACCAAACAAAACCCAGA
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TGATGGCTCTTGATTACATGATTCAACTCGCTGACAGAGACCAAGACGATAAAAGGAAGG
CTTTGTTAGAGGTCGTCAAGGAGACTGTCTTATCTCATCTCACTAAAAAATGTCCTCCTC
ATGTACAAGTGATTGGTCTACTCTGTAGAACACCTAAAAAAGAGAGTAGACAAGAGCTGC
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AATAATTGTAACTTGGTTGGTTGATATGACGAATGTTGAGCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GG59TF U 1
AF RS1H332TF U 1
AF RS1H332JQB C 508
AF RS1GG59JQ C 730
BS 1 261 RS1GG59TF
BS 262 262 RS1H332TF
BS 263 514 RS1GG59TF
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BS 1342 1362 RS1GG59JQ

RD RS1GG59TF 514 0 0
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AATCTCTTCACCTTCGTTTTCACTCCTCCCCGACACCTCCAAGAAGAGAGTCTCTGACTC
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AACCGAACCGGCGGCTAGTTCAATTCTGCGCCCCTTACGAGGTTGGAGGCGGATACACCG
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TGGAATTGGCTGCGCAAGGAGTTATAGGGAAAAGAGTTGATGAAATGGAGTCTGGGTTCA
TGATGGCTCTTGATTACATGATTCAACTCGCTGA

QA 1 514 1 514
DS 

RD RS1H332TF 638 0 0
GGACACTTCATCGTATCTCCTTCTCCCCTTGCTTAAACCCAGAACCTCAAAGCATGTTAC
AATCTCTTCACCTTCGTTTTCACTCCTCCCCGACACCTCCAAGAAGAGAGTCTCTGACTC
CATCAATTACCTCTTCACTTACTTTCTCCTTTTGCTCGTTCCGACCAAACAAAACCCAGA
AACCGAACCGGCGGCTAGTTCAATTCTGCGCCCCTTACGAGGTTGGAGGCGGATACACCG
ACGAGGAGCTTTTCGAAAGATACGGAACCCATCAGAGTAAAACCAACGCCGACGACAAGC
TTGACGCATCTGAGTACGAGGCGTTGCTTAAAGGAGGCGAACAAGTAACCTCAGTTCTCG
AAGAGATGATAACCCTCCTGCAAGATATGAAGATGAATGAAGCATCTGAGAACGTTGCTG
TGGAATTGGCTGCGCAAGGAGTTATAGGGAAAGGAGTTGATGAAATGGAGTCTGGGTTCA
TGATGGCTCTTGATTACATGATTCAACTCGCTGACAGAGACCAAGACGATAAAAGGAAGG
CTTTGTTAGAGGTCGTCAAGGAGACTGTCTTATCTCATCTCACTAAAAAATGTCCTCCTC
ATGTACAAGTGATTGGTCTACTCTGTAGA
CACTAAAAA

QA 1 629 1 629
DS 

RD RS1H332JQB 836 0 0
TCGCTGACAGAGACCAAGACGATAAAAGGAAGGCTTTGTTAGAGGTCGTCAAGGAGACTG
TCTTATCTCATCTCACTAAAAAATGTCCTCCTCATGTACAAGTGATTGGTCTACTCTGTA
GAACACCTAAAAAAGAGAGTAGACAAGAGCTGCTGCGTAGGGTGGCTGCAGGTGGTGGGG
CTTTTGAAGGCAAGGACGGTACTAAGCTTCATTTACCCGGAGCTAATCTGAATGACATAG
CTAATCAAGCTGATGATTTGCTAGAGACTATGGAGACAAGGCCGGCTGTTCCTGATCGGA
AACTACTAGCGAGGCTTGTTTTGATCAGAGAGGAAGCGAGGAACATGATGGGAGGTGGTA
TACTTGATGAGAGAAATGACCGTGGTTTCTCCACTCTGCCTGAATCAGAGGTGAATTTTT
TAACCAAATTGGTAGCTTTGAAACCTGGAAAGACAGTGCAGCAAATGATCAAGAATGTCA
TGCAAGGGAAAGATGAAGGTGCAGATGATTTTAGCAATGAGGAGGATGGTTCTGGCCAAG
GAAGAAGACAAAGTGGATTAAACGGAAGGGGAAGCTTTACAGGGAAAAAACCATTACCTG
TAAGGCCAGGAATGTTTCTAGAGACTGTCACAAAGGTAATGGGAAGCATATACTCGGGTA
ATTCATCCGGTATCAAGGCACAACATCTAGAATGGGTACACGAGAAAACTCTCCAAGTTC
TTGAAGAAATTGCGTATTAACTTGTATCTTCATTGTTACCAAACCAACAAGGAAAGTAGA
TGTTGTGTCCTCCATAGATGTTGTTCACTATATAATAATTGTAACTTGGTTGGT
GG

QA 1 834 1 834
DS 

RD RS1GG59JQ 633 0 0
CTAATCTGAATGACATAGCTAATCAAGCTGATGATTTGCTAGAGACTATGGAGACAAGGC
CGGCTGTTCCTGATCGGAAACTACTAGCGAGGCTTGTTTTGATCAGAGAGGAAGCGAGGA
ACATGATGGGAGGTGGTATACTTGATGAGAGAAATGACCGTGGTTTCTCCACTCTGCCTG
AATCAGAGGTGAATTTCTTAACCAAATTGGTAGCTTTGAAACCTGGAAAGACAGTGCAGC
AAATGATCAAGAATGTCATGCAAGGGAAAGATGAAGGTGCAGATGATCTTAGCAATGAGG
AGGATGGTTCTGGCCAAGGAAGAAGACAAAGTGGATTAAACGGAAGGGGAAGCTTTACAG
GGAAAAAACCATTACCTGTAAGGCCAGGAATGTTTCTAGAGACTGTCACAAAGGTAATGG
GAAGCATATACTCGGGTAATTCATCCGGTATCACGGCACAACATCTAGAATGGGTACACG
AGAAAACTCTCCAAGTTCTTGAAGAAATTGCGTATTAACTTGTATCTTCATTGTTACCAA
ACCAACAAGGAAAGTAGATGTTGTGTCCTCCATAGATGTTGTTCACTATATAATAATTGT
AACTTGGTTGGTTGATATGACGAATGTTGAGCG

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 4

CO CL2620Contig1 571 4 1 U
GGAGCGAGAGAGAGAGAGAGAAGAAATGGCTGCTTCAGTGATGCTTTCATCGGTGACGTT
GAAACCGGCGGGTTTCACGGTGGAGAAGATGTCGGCCAGAGGTTTACCGTCGCTCGCAAG
AGCTTCTCCTTATTCCTTCAAAATCGTCGCGAGCGGTGTCAAGAAGATCAAGACCGACAA
GCCCTTTGGAGTTAACGGCAGCATGGACTTGAGGGACGGCGTCGACGCCTCCGGCAGAAA
GGGCAAGGGTTATGGTGTTTACAAGTTTGTTGACAAGTATGGAGCTAACGTTGATGGATA
CAGTCCTATCTACAACGAGGAGGAGTGGTCAGCGAGTGGTGATGTGTACAAGGGAGGAGT
CACCGGATTGGCTATTTGGGCAGTGACGCTTGCCGGAATTCTCGCCGGAGGAGCTCTTCT
TGTGTACAACACAAGCGCTTTGGCTCAGTAAATCTTTTAAAAGACATGTTTCTCTCTATG
TTTTGTGTTCTCTGTTTCTCTTTTCTCTGTAATGCTCAGAACATACTTTTGAAATTTATA
AAAGAACTCTAGTGTTTGTGCCAAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E051TF U 1
AF RS1E051JQ C 38
AF RS1G841TF U 16
AF RS1BT69TF U 6
BS 1 571 RS1E051TF

RD RS1E051TF 571 0 0
GGAGCGAGAGAGAGAGAGAGAAGAAATGGCTGCTTCAGTGATGCTTTCATCGGTGACGTT
GAAACCGGCGGGTTTCACGGTGGAGAAGATGTCGGCCAGAGGTTTACCGTCGCTCGCAAG
AGCTTCTCCTTATTCCTTCAAAATCGTCGCGAGCGGTGTCAAGAAGATCAAGACCGACAA
GCCCTTTGGAGTTAACGGCAGCATGGACTTGAGGGACGGCGTCGACGCCTCCGGCAGAAA
GGGCAAGGGTTATGGTGTTTACAAGTTTGTTGACAAGTATGGAGCTAACGTTGATGGATA
CAGTCCTATCTACAACGAGGAGGAGTGGTCAGCGAGTGGTGATGTGTACAAGGGAGGAGT
CACCGGATTGGCTATTTGGGCAGTGACGCTTGCCGGAATTCTCGCCGGAGGAGCTCTTCT
TGTGTACAACACAAGCGCTTTGGCTCAGTAAATCTTTTAAAAGACATGTTTCTCTCTATG
TTTTGTGTTCTCTGTTTCTCTTTTCTCTGTAATGCTCAGAACATACTTTTGAAATTTATA
AAAGAACTCTAGTGTTTGTGCCAAAAAAAAA

QA 1 571 1 571
DS 

RD RS1E051JQ 525 0 0
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AGAGGTTTACCGTCGCTCGCAAGAGCTTCTCCTTATTCCTTCAAAATCGTCGCGAGCGGT
GTCAAGAAGATCAAGACCGACAAGCCCTTTGGAGTTAACGGCAGCATGGACTTGAGGGAC
GGCGTCGACGCCTCCGGCAGAAAGGGCAAGGGTTATGGTGTTTACAAGTTTGTTGACAAG
TATGGAGCTAACGTTGATGGATACAGTCCTATCTACAACGAGGAGGAGTGGTCAGCGAGT
GGTGATGTGTACAAGGGAGGAGTCACCGGATTGGCTATTTGGGCAGTGACGCTTGCCGGA
ATTCTCGCCGGAGGAGCTCTTCTTGTGTACAACACAAGCGCTTTGGCTCAGTAAATCTTT
TAAAAGACATGTTTCTCTCTATGTTTTGTGTTCTCTGTTTCTCTTTTCTCTGTAATGCTC
AGAACATACTTTTGAAATTTATAAAAGAACTCTAGTGTTTGT
GCC

QA 1 522 1 522
DS 

RD RS1G841TF 546 0 0
GG
GAGAAGAAATGGCTGCTTCAGTGATGCTTTCATCGGTGACGTTGAAACCGGCGGGTTTCA
CGGTGGAGAAGATGTCGGCCAGAGGTTTACCGTCGCTCGCAAGAGCTTCTCCTTATTCCT
TCAAAATCGTCGCGAGCGGTGTCAAGAAGATCAAGACCGACAAGCTCTTTGGAGTTAACG
GCAGCATGGACTTGAGGGACGGCGTCGACGCCTCCGGCAGAAAGGGCAAGGGTTATGGTG
TTTGCAAGTTTGTTGACAAGTATGGAGCTAACGTTGATGGATACAGTCCTATCTACAACG
AGGAGGAGTGGTCAGCGAGTGGTGATGTGTACAAGGGAGGAGTCACCGGATTGGCTATTT
GGGCAGTGACGCTTGCCGGAATTCTCGCCGGAGGAGCTCTTCTTGTGTACAACACAAGCG
CTTTGGCTCAGTAAATCTTTTAAAAGACATGTTTCTCTCTATGTTTTGTGTTCTCTGTTT
CTCTCTTCTCTGTAATGCTCAGAACATACTTTTGAAATTTATAAAAGAACTCTAGTGTTT
GT
GT

QA 3 544 3 544
DS 

RD RS1BT69TF 556 0 0
GG
GAGAGAGAGAGAGAAGAAATGGCTGCTTCAGTGATGCTTTCATCGGTGACGTTGAAACCG
GCGGGTTTCACGGTGGAGAAGATGTCGGCCAGAGGTTTACCGTCGCTCGCAAGAGCTTCT
CCTTATTCCTTCAAAATCGTCGCGAGCGGTGTCAAGAAGATCAAGACCGACAAGCCCTTT
GGAGTTAACGGCAGCATGGACTTGAGGGACGGCGTCGACGCCTCCGGCAGAAAGGGCAAG
GGTTATGGTGTTTACAAGTTTGTTGACAAGTATGGAGCTAACGTTGATGGATACAGTCCT
ATCTACAACGAGGAGGAGTGGTCAGCGAGTG*TGATGTGTACAAGGGAGGAGTCACCGGA
TTGGCTATTTGGGCAGTGACGCTTGCCGGAATTCTCGCCGGAGGAGCTCTTCTTGTGTAC
AACACAAGCGCTTTGGCTCAGTAAATCTTTTAAAAGACATGTTTCTCTCTATGTTTTGTG
TTCTCTGTTTCTCTCTTCTCTGTAATGCTCAGAACATACTTTTGAAATTTATAAAAGAAC
TCTAGTGTTTGT
TC

QA 3 554 3 554
DS 



AS 1 2

CO CL2621Contig1 698 2 11 U
GAAGATCCGAGGCGTCTTCCCTTCTCCATCATCAGATTCTCTCAGCCTACCCGACGCTTC
TACTTCATCTTCAGATTCTCTCTTTTATTAGGGTTATACCGATTATCAGAGATCAAAAGT
CGATGGCTACACTCGATTCAGACGTGAACATGGTTCCCGCAGGAGAACCCTCAGCCCCTT
CGTCGTCGTGTGCGAAGAAGGCGAAGAGATCCGAAGTGAAGAAGTGGAGTGCCGTGGCTC
TCTGGGCTTGGGATATCGTTATTGATAATTGCGCCATCTGCAGAAACCACATCATGGATC
TCTGCATTGAATGTCAGGCTAATCAGGCTAGTGCGACGAGTGAGGAGTGCACTGTTGCTT
GGGGGGTTTGCAACCACGCCTTCCACTTTCACTGCATCAGTAGATGGCTAAAGACTCGTC
AAGTTTGTCCATTGGATAACAGCGAGTGGGAGTTCCAGAAGTATGGTCACTAAACCCCAC
TACTAGACGTACCAGCAAATATGTGTCTAATCGAAGATATCAGAGGTCATTTGGTTGCCG
CATATGAGATGCTGATATCGCTCAAAGTTCTTTGGTTTTTTTTTTTATTTGGTTTGTCGC
AAGTTGTCAAAAACATAGATATTACTCTTCACTAAACCTATTATGTTTTGCTTTGGGCGA
CGTCTTTAATTTCAAGAAAATATATAGTTACTGCGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FD66JQ C 1
AF RS1AJ61TF U 43
BS 1 45 RS1FD66JQ
BS 46 74 RS1AJ61TF
BS 75 75 RS1FD66JQ
BS 76 160 RS1AJ61TF
BS 161 161 RS1FD66JQ
BS 162 260 RS1AJ61TF
BS 261 261 RS1FD66JQ
BS 262 660 RS1AJ61TF
BS 661 661 RS1FD66JQ
BS 662 674 RS1AJ61TF
BS 675 698 RS1FD66JQ

RD RS1FD66JQ 698 0 0
GAAGATCCGAGGCGTCTTCCCTTCTCCATCATCAGATTCTCTCAGCCTACCCGACGCTTC
TTCTTCATCTTCAGATTCTCTCTTTTATTAGGGTTATACCGATTATCAGAGATCAAAAGT
CGATGGCTACACTCGATTCAGACGTGAACATGGTTCCCGCAGGAGAACCCTCAGCCCCTT
CGTCGTCGTGTGCGAAGAAGGCGAAGAGATTCGAAGTGAAGAAGTGGAGTGCCGTGGCTC
TCTGGGCTTGGGATATCGTTATTGATAATTGCGCCATCTGCAGAAACCACATCATGGATC
TCTGCATTGAATGTCAGGCTAATCAGGCTAGTGCGACGAGTGAGGAGTGCACTGTTGCTT
GGGGGGTTTGCAACCACGCCTTCCACTTTCACTGCATCAGTAGATGGCTAAAGACTCGTC
AAGTTTGTCCATTGGATAACAGCGAGTGGGAGTTCCAGAAGTATGGTCACTAAACCCCAC
TACTAGACGTACCAGCAAATATGTGTCTAATCGAAGATATCAGAGGTCATTTGGTTGCCG
CATATGAGATGCTGATATCGCTCAAAGTTCTTTGGTTTTTTTTTT*ATTTGGTTTGTCGC
AAGTTGTCAAAAACATAGATATTACTCTTCACTAAACCTATTATGTTTTGCTTTGGGCGA
CGTCTTTAATTTCAAGAAAATATATAGTTACTGCGGAC

QA 1 698 1 698
DS 

RD RS1AJ61TF 638 0 0
CAG
CCTACCCGACGCTTCTACTTCATCTTCAGGTTCTCTCTTTTATTAGGGTTATACCGATTA
TCAGAGATCAAAAGTCGATGGCTACACTCGATTCAGACGTGAACATGGTTCCCGCGGGAG
AACCCTCAGCCCCTTCGTCGTCGTGTGCGAAGAAGGCGAAGAGATCCGAAGTGAAGAAGT
GGAGTGCCGTGGCTCTCTGGGCTTGGGATATCGTTGTTGATAATTGCGCCATCTGCAGAA
ACCACATCATGGATCTCTGCATTGAATGTCAGGCTAATCAGGCTAGTGCGACGAGTGAGG
AGTGCACTGTTGCTTGGGGGGTTTGCAACCACGCCTTCCACTTTCACTGCATCAGTAGAT
GGCTAAAGACTCGTCAAGTTTGTCCATTGGATAACAGCGAGTGGGAGTTCCAGAAGTATG
GTCACTAAACCCCACTACTAGACGTACCAGCAAATATGTGTCTAATCGAAGATATCAGAG
GTCATTTGGTTGCCGCATATGAGATGCTGATATCGCTCAAAGTTCTTTGGTTTTTTTTTT
TATTTGGTTTGTCGCAAGTTGTCAAAAACATAGATATTACTCTTCACTAAACCTATTATG
TTTTGCTTTGGGCGATGTCTTTAATTTCA
GAAATA

QA 4 632 4 632
DS 



AS 1 4

CO CL2622Contig1 738 4 7 U
GATACATAGATGATATTATTATTATTATTATTACTAATTGAAGATAAAAGAGGTTGAATA
CACAAATGGTCCAATGTATTTAAGATATCTAGAAATAACATATACAGGAAGGAAGAATGA
GAAACAAGATAGAAGATTGAGAGACGAGAAGAAGAACAACACTCTTTTATTATTCCAAGT
CTATAATGCCGAAATTGGAGAGAAGGATTTTAACTTGGTCGACAAGGTCTGAGCCTGTTG
CATACTCTGTAAGCATCCCCACCGCAAAACCAAACATAGCCCACCTTCCATTGGAGATTT
CGTTTTTGGGTTGGAAACCAAAGAAGGGACCTTGACCAGCAGCTTCAAGCTTCTTCTGCT
TAAAGTATTCCTGAAGCTCTTTAGCCTTCTGCCTCTGAAACTCCACCGTAACTACACTCT
TACCATCAACAGCCACCGTTTGCTGCAGCGGTGGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGG
AAGTAGGAGGAACAGGTTTTTGCGGAGGCGTAGGCTCCCGGAGAGTAGGAGGAGCAGATG
GCCTTCTCAATGGACCTTCGGCCTGAGAACATCTGATGACGAAGACACATGGCTTACTCC
TAGAGAATCTGAAAGACGATGAAGTTGTAGAAGAAGAAGAATATGGATTAAGGATCCTAA
TACATTGAATCGGCGAAGACACTGACATCTTTCGTTAATGGGGGTTTGCTAGTTGAATTG
TCTGATGTTCGAAGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GD36JQ U 1
AF RS1A879JQ U 8
AF RS1GD36TF C 233
AF RS1A879TF C 576
BS 1 469 RS1GD36JQ
BS 470 579 RS1GD36TF
BS 580 580 RS1A879TF
BS 581 678 RS1GD36TF
BS 679 679 RS1A879TF
BS 680 730 RS1GD36TF
BS 731 738 RS1A879TF

RD RS1GD36JQ 469 0 0
GATACATAGATGATATTATTATTATTATTATTACTAATTGAAGATAAAAGAGGTTGAATA
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GAAACAAGATAGAAGATTGAGAGACGAGAAGAAGAACAACACTCTTTTATTATTCCAAGT
CTATAATGCCGAAATTGGAGAGAAGGATTTTAACTTGGTCGACAAGGTCTGAGCCTGTTG
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CGTTTTTGGGTTGGAAACCAAAGAAGGGACCTTGACCAGCAGCTTCAAGCTTCTTCTGCT
TAAAGTATTCCTGAAGCTCTTTAGCCTTCTGCCTCTGAAACTCCACCGTAACTACACTCT
TACCATCAACAGCCACCGTTTGCTGCAGCGGTGGAGAAGAAGAAGAAGA

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DS 

RD RS1A879JQ 447 0 0
CTTAGATGA
TATTATTATTATTATTACTAATTGAAGATAAAAGAGGTTGAATACACAAATGGTCCAATG
TATTTAAGATATCTAGAAATAACATATACAGGAAGGAAGAATGAGAAACAAGATAGAAGA
TTGAGAGACGAGAAGAAGAACAACACTCTTTTATTATTCCAAGTCTATAATGCCGAAATT
GGAGAGAAGGATTTTAACTTGGTCGACAAGGTCTGAGCCTGTTGCATACTCTGTAAGCAT
CCCCACCGCAAAACCAAACATAGCCCACCTTCCATTGGAGATTTCGTTTTTGGGTTGGAA
ACCAAAGAAGGGACCTTGACCAGCAGCTTCAAGCTTCTTCTGCTTAAAGTATTCCTGAAG
CTCTTTAGCCTTCTGCCTCTGAAACTCCACCGTAACTACACTCTTACCATCAACAGCCAC
CGTTTGCTGCAGCGGTGG

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DS 

RD RS1GD36TF 500 0 0
GCCTGTTGCATACTCTGTAAGCATCCCCACCGCAAAACCAAACATAGCCCACCTTCCATT
GGAGATTTCGTTTTTGGGTTGGAAACCAAAGAAGGGACCTTGACCAGCAGCTTCAAGCTT
CTTCTGCTTAAAGTATTCCTGAAGCTCTTTAGCCTTCTGCCTCTGAAACTCCACCGTAAC
TACACTCTTACCATCAACAGCCACCGTTTGCTGCAGCGGTGGAGAAGAAGAAGAAGAAGA
AGAAGAGGAAGTAGGAGGAACAGGTTTTTGCGGAGGCGTAGGCTCCCGGAGAGTAGGAGG
AGCAGATGGCCTTCTCAATGGACCTTCGGCCTGAGAACATCTGATGATGAAGACACATGG
CTTACTCCTAGAGAATCTGAAAGACGATGAAGTTGTAGAAGAAGAAGAATATGGATTAAG
GATCCTAATACATTGAATCGGCGAAGCCACTGACATCTTTCGTTAATGGGGGTTTGCTAG
TTGAATTGTCTGATGTTC
CC

QA 1 498 1 498
DS 

RD RS1A879TF 163 0 0
ATGACGAAGACACATGGCTTACTCCTAGAGAATCTGAAAGACGATGAAGTTGTAGAAGAA
GAAGAATATGGATTAAGGATCCTAATACATTGAATCGGCGAAGACACTGACATCTTTCGT
TAATGGGGGTTTGCTAGTTGAATTGTCTGATGTTCGAAGCTCC

QA 1 163 1 163
DS 



AS 1 4

CO CL2623Contig1 968 4 11 U
TACGGATAAGCTGACAATCATCCCTGAGGACGACTGGAAGTATTTCTGTGAGGAGTGGGG
AGGGATCGTGGAGAAAGGGGTCTCTGCTCTTATTGAGGATGGTAGTAATACAAATCGAAG
TGCATCATCCCAGGACGTTATTGACCTTGATCAGGATTCTTCTCCTGATGTTAATATGGA
GATTGATAATCAGCAGCTTATTATCAGGACATCCCCAGAGGTTTGTGAGGAATGCATAGG
AGAGAGGGAGAGCTGTGAGTTGATGCAGAAGCTCACTTATTCTGAAGGAGATGTATATGT
CTGCCTGGTGCGCGGAAAGGAAGCTCCAAAGTCAATGTTAAATGCATCTGACACGAGCTT
TGAGGTGGACCGTCGTACTTCAAAGCGTTCTCGGAGAACTAACTATGGGAAGCATACCAG
CCTGAAAGTTTCTGCAACGACCACTGTATACCAGCTAAAGATGATGATATGGCAACTACT
TGGGGTGATGAAGGAGAACCAAGAACTTCACAAAGGCACACAAGTGATTGATCAGGAATC
TGCAACCCTTGCAGACATGAACATATTCCCTGGCGACAAACTTTGGGTGAGAGATACCGA
GATGCATGAACACCGCGATATTGCTGATGAGCTTTGCGATACAAATTCAGGGCCTCAAGA
TATAGAGGAAGGTTTCCGCGGCACACTTTTGACTGGAGATATCACTTTTGAAGCCTGCTA
GTTATTCTCAGTTAGTTGTGCAGGAGATGATGGATGACAGTTTTTTTTTTGTAAAGGCAA
GGGGCTTTGAAGCTTTATTTTGTGCGCAAA*GATATT*GATGAAAGCTTGCAAATGCCTG
AATCCGTAGATGTTTAGGCGTGGATGGATTTGAAGCTTTTT*CTGTGTGTGTTTCTGGTG
TACGGTTTATTTTAATGTGACATTTGTGTTACAAAACTTCTTTTAAGTGCATATTGAAAG
TTCATTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RS1BK21TF U 1
AF RS1BK21JQ C 205
AF RS1EU62JQ C 338
AF RS1EU62TF U 338
BS 1 670 RS1BK21TF
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BS 964 968 RS1BK21JQ

RD RS1BK21TF 778 0 0
TACGGATAAGCTGACAATCATCCCTGAGGACGACTGGAAGTATTTCTGTGAGGAGTGGGG
AGGGATCGTGGAGAAAGGGGTCTCTGCTCTTATTGAGGATGGTAGTAATACAAATCGAAG
TGCATCATCCCAGGACGTTATTGACCTTGATCAGGATTCTTCTCCTGATGTTAATATGGA
GATTGATAATCAGCAGCTTATTATCAGGACATCCCCAGAGGTTTGTGAGGAATGCATAGG
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TGAGGTGGACCGTCGTACTTCAAAGCGTTCTCGGAGAACTAACTATGGGAAGCATACCAG
CCTGAAAGTTTCTGCAACGACCACTGTATACCAGCTAAAGATGATGATATGGCAACTACT
TGGGGTGATGAAGGAGAACCAAGAACTTCACAAAGGCACACAAGTGATTGATCAGGAATC
TGCAACCCTTGCAGACATGAACATATTCCCTGGCGACAAACTTTGGGTGAGAGATACCGA
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GTTATTCTCAGTTAGTTGTGCAG*AGATGATGGATGACAGTTTTTTTTT
GTAAAGTCA

QA 1 769 1 769
DS 

RD RS1BK21JQ 764 0 0
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TCCAAAGTCAATGTTAAATGCATCTGACACGAGCTTTGAGGTGGACCGTCGTACTTCAAA
GCGTTCTCGGAGAACTAACTATGGGAAGCATACCAGCCTGAAAGTTTTTGCAACGACCAC
TGTATACCAGCTAAAGATGATGATATGGCAACTACTTGGGGTGATGAAGGAGAACCAAGA
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ATTCCCTGGCGACAAACTTTGGGTGAGAGATACCGAGATGCATGAACACCGCGATATTGC
TGATGAGCTTTGCGATACAAATTCAGGGCCTCAAGATATAGAGGAAGGTTTTCGCGGCAC
ACTTTTGACTGGAGATATCACTTTTGAAGCCTGCTAGTTATTCTCAGTTAGTTGTGCAGG
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CGCAAAAGATATTTGATGAAAGCTTGCAAATGCCTGAATCCGTAGATGTTTAGGCGTGGA
TGGATTTGAAGCTTTTTTCTGTGTGTGTTTCTGGTGTGCGGTCTATTTTAATGTGACATT
TGTGTTACAAAACTTCTTTTAAGTGCATATTGGAAGTTCATTCG

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1EU62JQ 627 0 0
G
TAAATGCATCTGACTCGAGCTTTGAGGTGGACCGTCGTACTTCAAAGCGTTCTCGGAGAA
CTAACTATGGGAAGCATACCAGCCTGAAAGTTTTTGCAACGACCACTGTCTACCAGCTAA
AGATGATGATATGGCAACTACTTGGGGTGATGAAGGAGAACCAAGAACTTCACAAAGGCA
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AGCTTTGGGTGAGAGATACCGAGATGCATGAACACCGCGATATTGCTGATGAGCTTTGCG
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ATATCACTTTTGAAGCCTGCTAGTTATTTTCAGTTAGTTGTGCAGGAGATGATGGATGAC
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GATGAAAGCTTGCAAATGCCTGAATCCGTAGATGTTTAGGCGTGGATGGATTTGAAGCTT
TTT*CTGTGTGTGTTTTTGGTGTACGGTTTATTTTAATGTGACATTTGTGTTACAAAACT
TCTTTTAAGTGCATATTGAAAGTTC
T

QA 2 626 2 626
DS 

RD RS1EU62TF 627 0 0
G
TAAATGCATCTGACTCGAGCTTTGAGGTGGACCGTCGTACTTCAAAGCGTTCTCGGAGAA
CTAACTATGGGAAGCATACCAGCCTGAAAGTTTCTGCAACGACCACTGTCTACCAGCTAA
AGATGATGATATGGCAACTACTTGGGGTGATGAAGGAGAACCAAGAACTTCACAAAGGCA
CCCAAGTGATTGATCAGGAATCTGCAACCCTTGCAGACATGAACATATTCCCTGGCGACA
AGCTTTGGGTGAGAGATACCGAGATGCATGAACACCGCGATATTGCTGATGAGCTCTGCG
ATACAAATTCAGGGCCTCAAGATATAGAGGAAGGTTTCCGCGGCACACTTTTGACTGGAG
ATATCACTTTTGAAGCCTGCTAGTTATTCTCAGTTAGTTGTGCAGGAGATGATGGATGAC
AGTTTTTTTTTTGTAAAGGCAAGGGGCTTTGAAGCTTTATTTTGTGCGCAAA*GATATT*
GATGAAAGCTTGCAAATGCCTGAATCCGTAGATGTTTAGGCGTGGATGGATTTGAAGCTT
TTT*CTGTGTGTGTTTCTGGTGTACGGTTTATTTTAATGTGACATTTGTGTTACAAAACT
TCTTTTAAGTGCATATTGAAAGTTC
T

QA 2 626 2 626
DS 



AS 1 3

CO CL2624Contig1 847 3 8 U
GCTGAAACCAAAATATTATATTTCTGCCAAAATGCTTCTTTGTTTTGGTTACATAACGAA
TGGAGTGTTTGAAACAGTACACTCAAAATTTTGATAAAATGAAGCAAAAGATTTAGAACT
AATGGGTGTGTTCTTATTTCTTGGCAAAACTCAACTTCTCAGGGATAACCTCATCAACAC
GAATCATCATCACGAGGCCATTATCTTCTTCAGACCAAGCAATGGATTCTCCCGCAAGCA
ACTTGGCAATTGCCGTAAGCCTTCGTTTGCATTTGGAATCCTCCTTGTTGTCACCCAATT
TGACTCTGAGGTACTTGATAGATGGAATGCCAGAAAAGTTCCTAAGTTGGAGCTTGAGAA
GACGAAGAGCTTCCCTTGGTTCATGTTCATTCACATTTACTGTCACGACCTCGTCTTCCT
TGTAAGCCGAACCATCGTCTTCCTTGACTTGAAGCATCTTTGCCATGGATCTGTCATCTG
CCTCCCTAGCTTTTTGTCCGAAAAAGTGTCCCTTCTCCACGAGCCTGTGTGCTCGCTCGG
TTTCCCCTTTGGAGAATGCTTCTACAGCAGCTCCGTAGTATTCTTTCATCTCCTGCAAAT
TCTCGTGCACTGCTTTACGATGTGCCTTGTATTCATTTTCGTCATCTTCATCTTCTTTAG
CTGTATTAGACGATTGTATCACAGTAACTACTCTCTCTTGTAAAGGGTCTTCCAGAGGTT
CAAAAACAGGAGGACCAGCAACTCTTGCTCTCCTCTCTCTAATTCGCCTAGTTATTTTTG
GTACTTCTTCATGTTTTTCAGCACCAGAGAACCAAGCTTCTAAGACTTCCTTTTCAAGAC
CGTTATT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
10 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BI03JQ U 2
AF RS1CI52JQ U 1
AF RS1BI03TF C 95
BS 1 96 RS1CI52JQ
BS 97 97 RS1BI03JQ
BS 98 280 RS1CI52JQ
BS 281 281 RS1BI03JQ
BS 282 544 RS1CI52JQ
BS 545 545 RS1BI03TF
BS 546 716 RS1CI52JQ
BS 717 847 RS1BI03TF

RD RS1BI03JQ 504 0 0
CTGAAACCAAAATATTATATTTCTGCCAAAATGCTTCTTTGTTTTGGTTACATAACGAAT
GGAGTGTTTGAAACAGTACACTCAAAATTTTGATAAAATGAAGCAAAAAATTTAAAACTA
ATGGGTGTGTTCTTATTTCTTGGCAAAACTCAACTTCTCAGGGATAACCTCATCAACACA
AATCATCATCACGAGGCCATTATCTTCTTCAAACCAAGCAATGGATTCTCCCGCAAGCAA
CTTGGCAATTGCCGTAAGCCTTCGTTTGCATTTGGAATCCTCCTTGTTGTCACCCAATTT
GACTCTGAGGTACTTGATAAATGGAATGCCAAAAAAGTTCCTAAGTTGGAGCTTGAAAAA
ACAAAAAGCTTCCCTTGGTTCATGTTCATTCACATTTACTGTCACGACCTCGTCTTCCTT
GTAAGCCGAACCATCGTCTTCCTTGACTTGAAGCATCTTTGCCATGGATCTGTCATCTGC
CTCCCTAGCTTTTTGTCCGAAAAA

QA 1 504 1 504
DS 

RD RS1CI52JQ 716 0 0
GCTGAAACCAAAATATTATATTTCTGCCAAAATGCTTCTTTGTTTTGGTTACATAACGAA
TGGAGTGTTTGAAACAGTACACTCAAAATTTTGATAGAATGAAGCAAAAGATTTAGAACT
AATGGGTGTGTTCTTATTTCTTGGCAAAACTCAACTTCTCAGGGATAACCTCATCAACAC
GAATCATCATCACGAGGCCATTATCTTCTTCAGACCAAGCAATGGATTCTCCCGCAAGCA
ACTTGGCAATTGCCGTAAGCCTTCGTTTGCATTTGGAATCTTCCTTGTTGTCACCCAATT
TGACTCTGAGGTACTTGATAGATGGAATGCCAGAAAAGTTCCTAAGTTGGAGCTTGAGAA
GACGAAGAGCTTCCCTTGGTTCATGTTCATTCACATTTACTGTCACGACCTCGTCTTCCT
TGTAAGCCGAACCATCGTCTTCCTTGACTTGAAGCATCTTTGCCATGGATCTGTCATCTG
CCTCCCTAGCTTTTTGTCCGAAAAAGTGTCCCTTCTCCACGAGCCTGTGTGCTCGCTCGG
TTTCTCCTTTGGAGAATGCTTCTACAGCAGCTCCGTAGTATTCTTTCATCTCCTGCAAAT
TCTCGTGCACTGCTTTACGATGTGCCTTGTATTCATTTTCGTCATCTTCATCTTCTTTAG
CTGTATTAGACGATTGTATCACAGTAACTACTCTCTCTTGTAAAGGGTCTTCCAGA

QA 1 716 1 716
DS 

RD RS1BI03TF 753 0 0
TAG
AATGAAGCAAAAGATTTAGAACTAATGGGTGTGTTCTTATTTCTTGGCAAAACTCAACTT
CTCAGGGATAAC*TCATCAACACGAATCATCATCACGAGGCCATTATCTTCTTCAGACCA
AGCAATGGATTCTCCCGCAAGCAACTTGGCAATTGCCGTAAGCCTTCGTTTGCATTTGGA
ATCCTCCTTGTTGTCACCCAATTTGACTCTGAGGTACTTGATAGATGGAATGCCAGAGAA
GTTCCTAAGTTGGAGCTTGAGAAGACGAAGAGCTTCCCTTGGTTCATGTTCATTCACATT
TACTGTCACGACCTCGTCTTCCTTGTAAGCCGAACCATCGTCTTCCTTGACTTGAAGCAT
CTTTGCCATGGATCTGTCATCTGCCTCCCTAGCTTTTTGTCCGAAAAAGTGTCCCTTCTC
CACGAGCCTGTGTGCTCGCTCGGTTTCCCCTTTGGAGAATGCTTCTACAGCAGCTCCGTA
GTATTCTTTCATCTCCTGCAAATTCTCGTGCACTGCTTTACGATGTGCCTTGTATTCATT
TTCGTCATCTTCATCTTCTTTAGCTGTATTAGACGATTGTATCACAGTAACTACTCTCTC
TTGTAAAGGGTCTTCCAGAGGTTCAAAAACAGGAGGACCAGCAACTCTTGCTCTCCTCTC
TCTAATTCGCCTAGTTATTTTTGGTACTTCTTCATGTTTTTCAGCACCAGAGAACCAAGC
TTCTAAGACTTCCTTTTCAAGACCGTTATT

QA 4 753 4 753
DS 



AS 1 2

CO CL2625Contig1 833 2 12 U
GGGACCTTCCCACTAACAAACAACAGATCCACAACAAGCGAATCGGCGAAGAAGCCTAGA
GAGAGAGAGAGATGGTGACGAAGACGGAGGAGAGGGAGCTAAACCAACTCGAGAATCAAG
TCGAGAACGGAGGAGGAGGTGTTTGGGAGTATCTGTGCCTCGTTCGTAAGCTCAAGGTTC
GCCGATCAGAGCTTGTGCTCAAGCACGGTCTCTCGATCTTGAACGATCCGGGAAAGCGAT
CCGCTCTTGGTCCTGATGAATGGACCCTTTATGAGCAGGTAGCAATTGCAGCTATGGACT
GTCAATCTCTTGCTGTTGCACAGAATTGCATCAAGGTTCTGCAGAAGAAGTTTCCGGAGA
GCAAACGTGTGGGAAAGCTGGAAGCGTTGCTTCTAGAAGCAAAGGGAATGTGGGAAGAGG
CTGAAAAAGCCTATTCAATCCTTTTGGAGGATAATCCACTCGATCAAGTAATACACAAAA
GAAAGGTGGCTATGGCCAAGGCTCAGGGAAAACCATCCTTAGCCATTGAACATCTTAACA
AATATCTTGAAGTATTCATGGCTGATCATGATGCCTGGAGAGAACTTGCAGAAATTTATG
TTTCCTTGCAAATGTACAAACAAGCAGCTTTCTGCTACGAGGAGCTCATATTATCTCAGC
CTACTCTTCCACTGTACCACTTAGCATATGCCGAGGTACTCTATACGATTGGTGGACATG
AAACCTCATTGCAGCAAGAAAGTACTATGCATCACCATAGACCTTACAGTGGTAAAGCAC
GAGAGCCCTGTTGGATTATGCTTGTGTGGATCAGCATAGCACAGCTCTCAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C622TF U 1
AF RS1CL18TF U 24
BS 1 385 RS1C622TF
BS 386 386 RS1CL18TF
BS 387 392 RS1C622TF
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BS 638 683 RS1C622TF
BS 684 833 RS1CL18TF

RD RS1C622TF 683 0 0
GGGACCTTCCCACTAACAAACAACAGATCCACAACAAGCGAATCGGCGAAGAAGCCTAGA
GAGAGAGAGAGATGGTGACGAAGACGGAGGAGAGGGAGCTAAACCAACTCGAGAATCAAG
TCGAGAACGGAGGAGGAGGTGTTTGGGAGTATCTGTGCCTCGTTCGTAAGCTCAAGGTTC
GCCGATCAGAGCTTGTGCTCAAGCACGGTCTCTCGATCTTGAACGATCCGGGAAAGCGAT
CCGCTCTTGGTCCTGATGAATGGACCCTTTATGAGCAGGTAGCAATTGCAGCTATGGACT
GTCAATCTCTTGCTGTTGCACAGAATTGCATCAAGGTTCTGCAGAAGAAGTTTCCGGAGA
GCAAACGTGTGGGAAAGCTGGAAGCTTTGCTTTTAGAAGCAAAGGGAATGTGGGAAGAGG
CTGAAAAGGCCTATTCAATCCTTTTGGAGGATAATCCACTCGATCAAGTAATACACAAAA
GAAAGGTGGCTATGGCCAAGGCTCAGGGAAAAC*ATCCTTAGCCATTGAACATCTTAACA
AATATCTTGAAGTATTCATGGCTGATCATGATGCCTGGAGAGAACTTGCAGAAATTTATG
TTTCCTTGCAAATGTACAAACAAGCAGCTTTCTGCTGCGAGGAGCTCATATTATCTCAGC
CTACTCTTCCACTGTACCACTTA

QA 1 683 1 683
DS 

RD RS1CL18TF 810 0 0
CAGATCCACAACAAGCGAATCGGCGAAGAAGCCTAGAGAGAGAGA****TGGTGACGAAG
ACGGAGGAGAGGGAGCTAAACCAACTCGAGAATCAAGTCGAGAACGGAGGAGGAGGTGTT
TGGGAGTATCTGTGCCTCGTTCGTAAGCTCAAGGTTCGCCGATCAGAGCTTGTGCTCAAG
CACGGTCTCTCGATCTTGAACGATCCGGGAAAGCGATCCGCTCTTGGTCCTGATGAATGG
ACCCTTTATGAGCAGGTAGCAATTGCAGCTATGGACTGTCAATCTCTTGCTGTTGCACAG
AATTGCATCAAGGTTCTGCAGAAGAAGTTTCCGGAGAGCAAACGTGTGGGGAAGCTGGAA
GCGTTGCTTCTAGAAGCAAAGGGGATGTGGGAAGAGGCTGAAAAAGCCTATTCGATCCTT
TTGGAGGATAATCCACTCGATCAAGTAATACACAAAAGAAAGGTGGCTATGGCCAAGGCT
CAGGGAAAACCATCCTTAGCCATTGAACATCTTAACAAATATCTTGAAGTATTCATGGCT
GATCATGATGCCTGGAGAGAACTTGCAGAAATTTATGTTTCCTTGCAAATGTATAAACAA
GCAGCTTTCTGCTACGAGGAGCTCATATTATCTCAGCCTACTCTTCCACTGTACCACTTA
GCATATGCCGAGGTACTCTATACGATTGGTGGACATGAAACCTCATTGCAGCAAGAAAGT
ACTATGCATCACCATAGACCTTACAGTGGTAAAGCACGAGAGCCCTGTTGGATTATGCTT
GTGTGGATCAGCATAGCACAGCTCTCAAAG

QA 1 810 1 810
DS 



AS 2 4

CO CL2626Contig1 504 2 2 U
GGGCTCACTTGTTTGTTGAGGTCTGTAGAAAATGAAGCCGGTGATAGGTACGGTGGTGTC
GAACAAGATGCAGAAGTCGGTGGTAGTAGCCGTGGACAGACTCTTCCACAACAAGCTATA
CAATCGCTACGTCAAGCGTACTTCCAAGTTCATGGCTCACGACGAGAAGAACGCCTGTAA
CATCGGCGATCGAGTGAAATTGGATCCTTCGAGACCTTTAAGCAAGCATAAGAATTGGAT
TGTTGCTGAAATCATAAAGAAAGCAAGAATCTATTCTCCACAGGCTGCTGCTGCTCTCAA
TTTCTCAGCTGCGAAAGCTCCATCCGAGTCTTCGGTTCCCCCTGTTTCATCTTCTTAAGC
CGATTGCTATGTGTGTGGATTGTATCAGACTTGGTTTTGAGTCTCATTTGCAAGTTCAGT
ATGGTGTCTCTTGGCACCTTAGGTAGTTTCATTGTTGAGGAACGTTATGTGACTTTGCTG
TTTCTGAAAAATAAGTTATCTGAC


BQ
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AF RS1F808JQ C 1
AF RS1F808TF U 1
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CATCGGCGATCGAGTGAAATTGGATCCTTCGAGACCTTTAAGCAAGCATAAGAATTGGAT
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TTTCTGAAAAATAAGTTATCTGAC

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DS 

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ATCGAGTGAAATTGGATCCTTCGAGACCTTTAAGCAAGCATAAGAATTGGATTGTTGCTG
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TCTTGGCACCTTAGGTAGTTTCATTGTTGAGGAACGTTATGTGACTTTGCTGTTTCTGAA
AAATAAGTTATCTGAC

QA 9 504 9 504
DS 



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GGTGGTGTCGAACAAGATGCAGAAGTCGGTGGTGGTAGCCGTGGACAGACTCTTCCACAA
CAAGCTGTACAATCGCTACGTCAAGCGTACTTCCAAGTTCATGGCTCACGACGAGAAGAA
CGCCTGTAACATCGGCGATCGAGTGAAATTGGATCCTTCGAGACCTTTGAGCAAGCATAA
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TGCTCTCAATTTCTCAGCTGCGAAGGCTCCCTCTGAGTCTTCGATTCCCCCTGTTTCATC
TTCTTAAGCTGATTGCTATGTGTGTGGATTGTATCAGACTTCTTCTTGGTTTTGAGTCTT
ATTTGCAAGTTCAGTATGGTGTGTCTCTTGGCACCTTAGGTAGTTCCATTGTTGAGGAAC
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GAAGCTTTGTTGGGCATTTCGGTTTTACGTTTTTGAAGTTGTTAGAACCATTTTGCTGGT
GGCTTGGTCTTGCCGCTTACTAT


BQ
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AF RS1FP31TF U 26
AF RS1G579TF U 1
BS 1 623 RS1G579TF

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GG
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TTGGCACCTTAGGTAGTTCCATTGTTGAGGAACGTCATGTGACTTTGCTGTTTCTGAAAA
ATAAGTTATCTGACATTCGGCAT

QA 3 505 3 505
DS 

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GGCTTGGTCTTGCCGCTTACTAT

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 3

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GGATGCAATCTTAAATACATGGGGAAAGAGGAGCTCTACACAACACAACAGGATGTTCTT
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CTTTTGCTGTGTTTTGCAGAGCACGATCAAATTTCATTTTTAACTTGTTTTTTTCTTTTA
ATCACCATCTTTCCAAGCCACACGTATGAGAAATTTGGAAGCTTTGTTGCATGGTTTTCA
TGAACGAAATTGTACTCCC


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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D165TF U 1
AF RS1DQ95TF U 678
AF RS1D165JQ C 1098
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ATGGTCCCCGTCTCTCTCACCATGACTGCTACTTTGTTCGCTTGGGTTGTCATGCCTAAG
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TACTTAATGACCTTCATTTCTTT
GCAC

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DS 

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TGGACAAAGTTTCATCAGTTGGTCTCTTTACAATCGGTTTAATGGCTTCTGCCGAAGCTT
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TTGCTGCAAGAGATATCCTTGGTAATGTGCTGAGTGGTCTCTCCATGCAATTCTCAAGGC
CTTTCTCTATGGGAGATACTATCAAAGCTGGATCGGTAGAAGGTCAAGTGGTTGAGATGG
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TGTTTTCCAGTCAGGTGATTGTGAACAAGTCACGAGCTCAGTGGCGTGCTATAGCATCCA
AGATCCCACTGCAGATAGATGACTTGGACAAGATCCCTCAAATA

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DS 

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TATAAAGAAGCATGGTGCGTCATTGGGTACCACCTGGGACAATGAGGGGAAGGAAGTACG
CTGAACCTATTACCTTTTGATTGTAGAGAGGGTTACAAAAACATTTGTGTGGAGCCAAAA
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CCACACGTATGAGAAATTTGGAAGCTTTGTTGCATGGTTTTCATGAACGAAATTGTACTC
CC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 4

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TGTGGACATAGATTCACTGAAGGCTGAGAATATTACATTCTCCAGTATGAGATTCGATTC
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TTTCTTTTGCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EB34TF U 1
AF RS1EB34JQ C 53
AF RS1E949JQ C 22
AF RS1E949TF U 22
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TCAAAACTGTGTGTTGATTCTTCACTAATCAATGTCATAATCAAAACCTTGAT
AC

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DS 

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CTTGTTCTGTAATTTGTGTGGGACGATGCTGATCTTGAAGTCGAGCAAATATGCTGAATG
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T
AC

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DS 

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G
ACCGTTCGAAACCCTAACCTCCTTCGTCTCTCTGCTTATAAACTTTGTGTTTCAGTTGTT
TGTAATGGAGAAGTCACGTGAAAGCGGTTTCTTGTTCTGTAATTTGTGTGGAACGATGCT
GATCTTGAAGTCAAGCAAGTATGCTGAATGTCCACTATGCAAAACAACTCGTAACGCAAA
AGAAATCGTTGACAAGCAAATAGCTTACACAGTTTCTGATGAGGATATCAGAAGAGAACT
AGGAATCTCTCTGTTTGGTGAAAAAA*CTCAGGAAGACGCTGAGCTACCAAAGATCAAAA
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QA 2 591 2 591
DS 

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G
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GATCTTGAAGTCAAGCAAGTATGCTGAATGTCCACTATGCAAAACAACTCGTAACGCAAA
AGAAATCGTTGACAAGCAAATAGCTTACACAGTTTCTGATGAGGATATCAGAAGAGAACT
AGGAATCTCTCTGTTTGGTGAAAAAA*CTCAGGAAGACGCTGAGCTACCAAAGATCAAAA
AGGCGTGTGAAAAATGCCAGCATCCTGAGCTTGTATACACAACCAGACAGACAAGATCAG
CAGACGAAGGCCAAACAACATATTATACTTGCCCCAATTGTGGACATAGATTCACTGAAG
GCTGAGAATATTACATTCTCCAGTATGAGATTCGATTCACTGGGAATACCAGTTTTGTTT
CTTACATTTATGTTACGAACTCAATGTCTATGTCATCATCAAAACTGTGTGCTGATTCTT
CACTAATCAATGTCATAATCAAAACCTTGATGTAATTGTTTCTTTTGCAC

QA 2 591 2 591
DS 



AS 1 3

CO CL2629Contig1 1062 3 5 U
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GTTCACTCGCTTTCTGGTAACTGGTCTGCCTCTGCCAATTCTTGTGCGCCACGGTGGAGT
TTGTGCAACAGGAACCCCAAGCACACGCTTGTCGTGTTGCGTGCAGAGTCCTCTAAATCT
TCCACAACAACTACCAAAACTGACGAATCATGTGATACTTCAACGGGGAAGAGTTCCGTT
CGACGCACAACGTTCCCGAAAGAAGTGGAGGCACTGGTTCACGAGATGTGTGATGAGACT
GAGGTTGCTGTGCTCAAACTTAAGGTTGGAGATTTCGAGATGAACTTGAAGCGGAAGATT
GGACAGACCGCAACTCCCACTCCCATGCCTGATATTTCTCCATCAGTAGCTCCTCCCATT
CCTTCTGAGCCCATGAACAAATCAATTTCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTAGCCCATCCAAA
GCAAAACCCGCCTCTGAAAAAGTGTCTCCATTTATTAATGCTGCATACCGAAAATCATCA
AAGTTGGCTGCTTTGGATGCATCTGGATCTAACAACTATGTCCTAGTCACCTCTCCCTCA
GTGGGCAAGTTTCAGAGAAGCAGAACTGTAAAGGGAAAGAAACAAGGTCCTAGCTGCAAA
GAGGGTGATGCAATAAAGGAAGGGCAAGTGATTGGATACGTACATCAGCTGGGAAAAGAA
CTTCCAGTAACGTCTGATGTAGCTGGTGAAGTTCTCAAGCTTCTTTCAGATGATGGAGAC
TCTATAGGGTATGGGGAGCCTCTGGTTGCGGTCTTGCCATCGTTCCATGATATCAACATC
CAGTGATGATGTCAGGGCCCAGTTCCACAATAAATTAGTAGCATCTTCATCTGGAGACTG
TACTCTTCTTCCTCTTTCCTTTTATGGAGTTTGAGATTCTATTTTGATCTTCATCTTGAT
CACATGATTTGTGTGGAGATTTAATTCCTGAACATGTGACACGCAGCTATATTGTTTTTG
TCACTCTTTGGAATTTTGGTTCATCTTAATATGGGATCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GN63TF U 1
AF RS1DG75TF U 302
AF RS1GN63JQ C 498
BS 1 499 RS1GN63TF
BS 500 500 RS1DG75TF
BS 501 624 RS1GN63TF
BS 625 1040 RS1DG75TF
BS 1041 1062 RS1GN63JQ

RD RS1GN63TF 639 0 0
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TCCACAACAACTACCAAAACTGACGAATCATGTGATACTTCAACGGGGAAGAGTTCCGTT
CGACGCACAACGTTCCCGAAAGAAGTGGAGGCACTGGTTCACGAGATGTGTGATGAGACT
GAGGTTGCTGTGCTCAAACTTAAGGTTGGAGATTTCGAGATGAACTTGAAGCGGAAGATT
GGACAGACCGCAACTCCCACTCCCATGCCTGATATTTCTCCATCAGTAGCTCCTCCCATT
CCTTCTGAGCCCATGAACAAATCAATTTCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTAGCCCATCCAAA
GCAAAACCCGCCTCTGAAAGAGTGTCTCCATTTATTAATGCTGCATACCGAAAATCATCA
AAGTTGGCTGCTTTGGATGCATCTGGATCTAACAACTATGTCCTAGTCACCTCTCCCTCA
GTGGGCAAGTTTCAGAGAAGCAGA
ACTGTAAAGGGAAAG

QA 1 624 1 624
DS 

RD RS1DG75TF 748 0 0
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CTTCTGAGCCCATGAACAAATCAGTTTCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTAGCCCATCCAAAG
CAAAACCCGCCTCTGAAAAAGTGTCTCCATTTATTAATGCTGCATACCGAAAATCATCAA
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TGGGCAAGTTTCAGAGAAGCAGAACTGTAAAGGGAAAGAAACAAGGTCCTAGCTGCAAAG
AGGGTGATGCAATAAAGGAAGGGCAAGTGATTGGATACGTACATCAGCTGGGAAAAGAAC
TTCCAGTAACGTCTGATGTAGCTGGTGAAGTTCTCAAGCTTCTTTCAGATGATGGAGACT
CTATAGGGTATGGGGAGCCTCTGGTTGCGGTCTTGCCATCGTTCCATGATATCAACATCC
AGTGATGATGTCAGGGCCCAGTTCCACAATAAATTAGTAGCATCTTCATCTGGAGACTGT
ACTCTTCTTCCTCTTTCCTTTTATGGAGTTTGAGATTCTATTTTGATCTTCATCTTGATC
ACATGATTTGTGTGGAGATTTAATTCCTGAACATGTGACACGCAGCTATATTGTTTTTGT
CACTCTTTGGAATTTTGGT
CATCTTATA

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1GN63JQ 565 0 0
AAG
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AGGGCAAGTGATTGGATACGTACATCAGCTGGGAAAAGAACTTCCAGTAACGTCTGATGT
AGCTGGTGAAGTTCTCAAGCTTCTTTCAGATGATGGAGACTCTATAGGGTATGGGGAGCC
TCTGGTTGCGGTCTTGCCATCGTTCCATGATATCAACATCCAGTGATGATGTCAGGGCCC
AGTTCCACAATAAATTAGTAGCATCTTCATCTGGAGACTGTACTCTTCTTCCTCTTTCCT
TTTATGGAGTTTGAGATTCTATTTTGATCTTCATCTTGATCACATGATTTGTGTGTAGAT
TTAATTCCTTAACATGTGACACGCAGCTATATTGTTTTTGTCACTCTTTGGAATTTTGGT
TCATCTTAATATGGGATCATCC

QA 4 565 4 565
DS 



AS 1 4

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TTAC


BQ
10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 

AF RS1DR05JQ C 1
AF RS1DR05TF U 1
AF RS1BC25JQ C 6
AF RS1BC25TF U 6
BS 1 5 RS1DR05JQ
BS 6 63 RS1DR05TF
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BS 65 473 RS1DR05TF
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BS 475 604 RS1DR05TF

RD RS1DR05JQ 604 0 0
TTTTTCAGAGGAGTCCATCACGCAATCAAACCAATTGATTGATCTTATTAATAAATCGAT
GTCTTACTCCATGACTTTTTTTTAGGAAAAAGAGGAGAACAATAGCCTGACATTAGGTCC
TATTAAAGTACCCCATTTAGGTAGGGAATTAATAGAACCCATCATTGATTTGAGATATTG
ATAGGGTGAATACCCAGTCTACTTAATGCTAGGCAGAATGAGTATAAGGAACTCAAAAAT
GATCTTTTCGTCCTATGAACCTTAAGGTGTAGCAAGTTTCATATTTGATTTTTTAATCAG
GATGTTAGAGACTATATTTAACTTAAGTTGATCTAGACCAAAAGCAAACCTACGTCAAGA
GAACCCAACCCTTCTTTGAAACACTTTGGTAGTTCTTCTGTATTGTATTAGAATTATAGA
ATTAAAAAATAATCAATCAGAGTACTTGGAACCATTTCTTATCTTTTTTTTTT*AAGAAA
AAATATGGTAGACTAACTGATCTTTCTATCAGTTAATGAAAGAGCCCAATGCAAAAAAAA
ATGCATGTTGGGTCTTTGAAAGAGTTCGAATCATTTTGATAATAATAAGTTCGAGCTCTT
TTAC

QA 1 604 1 604
DS 

RD RS1DR05TF 604 0 0
TTTTT
CAGAGGAGTCCATCACGCAATCAAACCAATTGATTGATCTTATTAATAAATCGATGTCTT
ACTCCATGACTTTTTTTTAGGAAAAAGAGGAGAACAATAGCCTGACATTAGGTCCTATTA
AAGTACCCCATTTAGGTAGGGAATTAATAGAACCCATCATTGATTTGAGATATTGATAGG
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TTTCGTCCTATGAACCTTAAGGTGTAGCAAGTTTCATATTTGATTTTTTAATCAGGATGT
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CAACCCTTCTTTGAAACACTTTGGTAGTTCTTCTGTATTGTATTAGAATTATAGAATTAA
AAAATAATCAATCAGAGTACTTGGAACCATTTCTTATCTTTTTTTTTT*AAGAAAAAATA
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TTTCGTCCTATGAACCTTAAGGTGTAGCAAGTTTCATATTTGATTTTTTAATCAGGATGT
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CAACCCTTTTTTGAAACACTTTGGTAGTTTTTCTGTATTGTATTAGAATTATAGAATTAA
AAAATAATCAATCAGAGTACTTGGAACCATTTTTTATCTTTTTTTTTTTAAGAAAAAATA
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DS 

RD RS1BC25TF 599 0 0
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AAGTACCCCATTTAGGTAGGGAATTAATAGAACCCATCATTGATTTGAGATATTGATAGG
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TTTCGTCCTATGAACCTTAAGGTGTAGCAAGTTTCATATTTGATTTTTTAATCAGGATGT
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CAACCCTTCTTTGAAACACTTTGGTAGTTCTTCTGTATTGTATTAGAATTATAGAATTAA
AAAATAATCAATCAGAGTACTTGGAACCATTTCTTATCTTTTTTTTTTTAAGAAAAAATA
TGGTAGACTAACTGATCTTTCTATCAGTTAATGAAAGAGCCCAATGCAAAAAAAAATGCA
TGTTGGGTCTTTGAAAGAGTTCGAATCATTTTGATAATAATAAGTTCGAGCTCTTTTAC

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 4

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TCACTTTGTGCTCTTTCTTATGTAGTTAAATGCTAACATCAAACTTCTTTCAAGTGCTTT
TGTTTTTCCGCTTCTTCTTCTTAGGCTTGACAGCATCTCTGAGTGTCTTCTCTCCATCCT
TGTGTTTAGTAACCTCAGGGGTATCTTCCATCTCTACATCTCCGGTTACTTCTTTCTGAG
CATCTCCAGAGTCGTTCGCCTTTCCCTTGATCGCTGGATCAAAAAAAACAAAACAAGTTT
CAGGTCCTTTGAAAGTGGCAGGAAAGGCAACAGCTTCTTGTTCCTTGCTGTTCTTTAATT
CGACATGTTCCTGAAATATCTCTGCAAATTTATCCTCATCTGAAAACTTCTTATGTCCCT
CCTTCACAACCACAATAGGTCCAAAAACTTCAAATTTAGCCAAAGTAAAATGTCCCTTCA
CCTTCTGTAAGTTCTTCTCACGGTTATATGCTTCAACCTCTTCTCTAATAATCTTTGTTG
TTGCAGCTGCTCTTGAAGAAGCAAGACGTAAGCAATGAAGGATTACACTCTGGTTCACGC
CTTCCTCTCCTGGTTTTTGGATTGCACATATATCGCCATTAGCATTGACAGTCACAGTCA
TTCTCCCACACATAACCTCTTCTTCTACGTAAGTTGGGTCCATTACCACAATGTTGCCGT
TGTTGAAAAATCCAAACGTAAAGGCTATGGGGAGATGATGTATTATCAGTGGGAGTGGCT
CCCGTTCCTCTAGTGAATGTATGATAACTTCTTGACTGTTCTCCCCTCCTACAGTGCAGT
CTGGTCTCCTAAACGTCATGAGCGCTGCTAACGCAGCAATATTTGCAGCATCAACCAAGT
TCCCTCCATTGTCCAAAATGTGAAGATCAATGCGAACAGACCAGACCTTCTTTCCAGCTA
GAACGCAGAGTGACTCTGTATCTACCGCACGGCTTTCTCTTAGACCACGGTCTATAATAC
GTCCCAGCTCCACTGCAGATTCTCCAGGGCGACCAGGCTCAAACGATGGATCAGCCATAG
GAGAAAACTCAGTGAAGATAGAGAGAGATCCTTCGTTAGGTCAGTCTTTGTAAGGTTGTA
CCAACTGAACAGTCACAAAACCCATCACATGAGTCTGACCAAGATGAACTTCTGAGCTAC
CATACTCTTTTCCAAACTTAATAGTAAGCTTGCGGTAATCATAAAGACCACGACCATCGA
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ACATATTAGCCAATCTCCCCTCCATTATTTGCTATGTCTACCTTTGAAAGCGAGAGAAGC
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 20 0 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CW53JQ U 1
AF RS1AB45JQ U 6
AF RS1CW53TF C 684
AF RS1AB45TF C 625
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RD RS1CW53JQ 679 0 0
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TCACTTTGTGCTCTTTCTTATGTAGTTAAATGCTAACATCAAACTTCTTTCAAGTGCTTT
TGTTTTTCCGCTTCTTCTTCTTAGGCTTGACAGCATCTCTGAGTGTCTTCTCTCCATCCT
TGTGTTTAGTAACCTCAGGTGTATCTTCCATCTCTACATCTCCGGTTACTTCTTTCTGAG
CATCTCCAGAGTCGTTCGCCTTTCCCTTGATCGCTGGATCAGAAGAAACAGAACAAGTTT
CAGGTCCTTTGAAAGTGGCAGGAGAGGCAACAGCTTCTTGTTCCTTGCTGTTCTTTAATT
CGACATGTTCCTGAAATATCTCTGCAGATTTATCCTCATCTGAAGACTTCTTATGTCCCT
CCTTCACAACCACAATAGGTCCAAAAACTTCAGATTTAGCCAAAGTAGAATGTCGCTTCA
CCTTCTGTAAGTTCTTCTCACGGTTATATGCTTCAACCTCTTCTCTAATAATCTTTGTTG
TTGCAGCTGCTCTTGAAGAAGCAAGACGTAAGCAATGAAGGATTACACTCTGGTTCACGC
CTTCCTCTCCTGGTTTTTGGATTGCACATATATCGCCATTAGCATTGACAGTCACAGTCA
TTCTCCCACACATAACCTC

QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1AB45JQ 719 0 0
TTT
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CGCTTCTTCTTCTTAGGCTTGACAGCATCTCTGAGTGTCTTCTCTCCATCCTTGTGTTTA
GTAAGCTCAGGGGTATCTTCCATCTCTACATCTCCGGTTACTTCTTTCTGAGCATCTCCA
GAGTCGTTCGCCTTTCCCTTGATCGCTGGATCAAAAAAAACAAAACAAGTTTCAGGTCCT
TTGAAAGTGGCAGGAAAGGCAACAGCTTCTTGTTCCTTGCTGTTCTTTAGTTCGACATGT
TCCTGAAATATCTCTGCAAATTTATCCTCATCTGAAAACTTCTTATGTCCCTCCTTCACA
ACCACAATAGGTCCAAAAACTTCAAATTTAGCCAAAGTAAAATGTCCCTTCACCTTCTGT
AAGTTCTTCTCACGGTTATATGCTTCAACCTCTTCTCTAATAATCTTTGTTGTTGCAGCT
GCTCTTGAAGAAGCAAGACGTAAGCAATGAAGGATTACACTCTGGTTCACGCCTTCTTCT
CCTGGTTTTTGGATTGCACATATATCGCCATTAGCATTGACAGTCACAGTCATTCTCCCA
CACATAACCTCTTCTTCTACGTAAGTTGGGTCCATTACCACAATGTTGCCGTTGTT

QA 4 719 4 719
DS 

RD RS1CW53TF 643 0 0
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GCTATGGGGAGATGATGTATTATCAGTGGGAGTGGCTCCCGTTCCTCTAGTGAATGTATG
ATAACTTCTTGACTGTTCTCCCCTCCTACAGTGCAGTCTGGTCTCCTAAACGTCATGAGC
GCTGCTAACGCAGCAATATTTGCAGCATCAACCAAGTTCCCTCCATTGTCCAAAATGTGA
AGATCAATGCGAACAGACCAGACCTTCTTTCCAGCTAGAACGCAGAGTGACTCTGTATCT
ACCGCACGGCTTTCTCTTAGACCACGGTCTATAATACGTCCCAGCTCCACTGCAGATTCT
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GTAAGCTTGCGGTAATCATAAAGACCACGACCATCGACTCTGAGCTCAGATTGCAACGCA
GTTTCCACGAACTTACTTTCGTTCACTGTCAACCTCCACAT
CC

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1AB45TF 841 0 0
CACATATATCGCCATTAGCATTGACAGTCACAGTCATTCTCCCACACATA*CCTCT*CTT
CTACGTAAGTTGGGTCCATTACCACAATGTTGCCGTTGTTGAAAAATCCAAACGTAAAGG
CTATGGGGAGATGATGTATTATCAGTGGGAGTGGCTCCCGTTCCTCTAGTGAATGTATGA
TAACTTCTTGACTGTTCTCCCCTCCTACAGTGCAGTCTGGTCTCCTAAACGTCATGAGCG
CTGCTAACGCAGCAATATTTGCAGCATCAACCAAGTTCCCTCCATTGTCCAAAATGTGAA
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CCGCACGGCTTTCTCTTAGACCACGGTCTATAATACGTCCCAGCTCCACTGCAGATTCTC
CAGGGCGACCAGGCTCAAACGATGGATCAGCCATAGGAGAAAACTCAGTGAAGATAGAGA
GAGATCCTTCGTTAGGTCTGTCTTTGTAAGGTTGTACCAACTGAACAGTCACAAAACCCA
TCACATGAGTCTGACCAAGCTGAACTTCTGAGCTACCATACTCTTTTCCAAACTTAATAG
TAAGCTTGCGGTAATCATAAAGACCACGACCATCGACTCTGAGCTCAGATTACAACGCAG
TTTCCA***ACTTACTTTCGTTCACTGTCAACCTCCACATATTAGCCAATCTCCCCTCCA
TTATTTGCTATGTCTACCTTTGAAAGCGAGAGAAGCTCTTATAATGCTCGACCCGTCCGA
GGAAAGAAAGAAGACGCGAAGAAGAATGAGACTTTTCTACAACAAGACGGGCGGTGCTCC
C

QA 1 841 1 841
DS 



AS 2 4

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TAACAAGAGAAGACAGGAAGAAACTGTACTCCAACTTTGGTCTCCTCTATCCATATGGTC
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CTCCTTACCAAGCAATATTCTCAAAGATGTCTTATGGGGAGAGCCAGATGCTTGACAAAG
CATTTTATGAAGAAGAAGTCAGAAGGCTTTGCTTAACCTTTGAGCAGCAGTTCCATTACG
GGGCTTTCTTTGCGTACATGAGATTGAGGGAGCAGGAGATCAGGAACCTGATGTGGATAT
CTGAGTGTGTTGCACAGAACCAGAAGTCGAGGATCCACGACAGTGTGGTCTACATGTTCT
GAGTCCGGTAAGAAGTGAGAAAAAGCACATTAAAATGTGTAAATGTGTTTTTAACATTGG
AGAACAAGAAGAAAGAACCTATTTGATTGCTGTTGGTTTTCTTCATTGCTCCGATTTGCC
AGAGAAATCTGCGGTTTTTACATTTGACTGTGTACCCAAATCAGAATCTCTCCAATTTGT
TTGTTTTGGCC


BQ
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AF RS1AU23JQ C 1
AF RS1AU23TF U 1
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DS 

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G
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AACAAGAGAAGACAGGAAGAAACTGTACTCCAACTTTGGTCTCCTCTATCCATATGGTCA
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TCCTTACCAAGCAATATTCTCAAAGATGTCTTATGGGGAGAGCCAGATGCTTGACAAAGC
ATTTTATGAAGAAGAAGTCAGAAGGCTTTGCTTAACCTTTGAGCAGCAGTTCCATTACGG
GGCTTTCTTTGCGTACATGAGATTGAGGGAGCAGGAGATCAGGAACCTGATGTGGATATC
TGAGTGTGTTGCACAGAACCAGAAGTCGAGGATCCACGACAGTGTGGTCTACATGTTCTG
AGTCCGGTAAGAAGTGAGAAAAAGCACATTAAAATGTGTAAATGTGTTTTTAACATTGGA
GAACAAGAAGAAAGAACCTATTTGATTGCTGTTGGTTTTCTTCATTGCTCCGATTTGCCA
GAGAAATCTGCGGTTTTTACATTTGACTGTGTACCCAAATCAGAATCTCTCCAATTTGTT
TGTTTTGGCC

QA 2 611 2 611
DS 



CO CL2632Contig2 1408 2 2 U
GGGCTTGGATATTTTCTCTCCAGATCTCTCTCCCCGTGTCAACCTTCGAGATCTGAATAT
CTCCTCCTGAATCCTGAAGGGGGAAGGATGTACGGATTCGAGGCGCTCACCTCCAACATC
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CTAACAAGAGAAGACAGGAAGAAACTGTACTCCAACTTTGGTCTCCTCTATCCATATGGT
CACGAGGAGCTTGCTATCTGCGAAGACATAGATCAGGTTCGTGGTGTCATGGAGAAGTAC
CCTCCTTACCAAGCAATATTCTCAAAGATGTTTTATGGAGAGAGCCAGATGCTTGACAAA
GCATTTTATGAAGAAGAAGTCAGAAGGCTTTGCTTAGCCTTTGAGCAGCAGTTCCATTAC
GGGGTGTTCTTTGCGTACATGAGATTGAGGGAGCAGGAGATCAGGAACCTGATGTGGATA
TCCGAGTGTGTTGCACAGAACCAGAAGTCGAGGATCCACGACAGTGTGGTCTACATGTCC
TGAGTCCGGTAAGAAGTGAGAGAAAGCACATTAAAATGTGTAAATTTGTTTTAACATTGG
AGAACAAGAAGAAAGAACCTATTTGATTGCTGTTGGTTTTCTTCGTTGCTCCGATTTGCC
AGAGAAATCTGCGGTACAATCTGCGGTTTTTACATTTTACTGTCTACCCAAATCAGAATC
TCTCCAATTTGTTTGTTTTGGCCATATTTTGTTTGGTTATATATTTACCAATAAAACTCT
TGTAATAATATGAAACTACTTATTTACC


BQ
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AF RS1FV05TF U 1
AF RS1FV05JQ C 608
BS 1 687 RS1FV05TF
BS 688 1408 RS1FV05JQ

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GGGCTTGGATATTTTCTCTCCAGATCTCTCTCCCCGTGTCAACCTTCGAGATCTGAATAT
CTCCTCCTGAATCCTGAAGGGGGAAGGATGTACGGATTCGAGGCGCTCACCTCCAACATC
CATGGCGGATACCTGGAGGCGATCGTGAGGGGCCACCGTGCTGGTCTCCTCACCACCGCG
GATTACAACAATCTGTGCCAATGTGAAAACCTGGACGACATCAAAATGCACCTCTCCGCC
ACCAAATACGGCTCTTACCTCCAGAACGAACCGTCACCTCTGCATACGACGACAATCGTG
GAGAAGTGTACGCTCAAGCTTGTGGATGATTACAAGCATATGCTTTGCCAAGCTACTGAG
CCTATGTCCACCTTCTTAGAGTACATCAGATACGGCCACATGATTGACAATGTGGTGCTG
ATTGTTACTGGAACTTTGCACGAGAGAGATGTTCAAGAGTTGATTGAGAAATGTCACCCT
TTAGGCATGTTTGACAGCATTGCCACACTGGCTGTTGCTCAGAACATGAGGGAGCTCTAT
AGGTTGGTGCTTGTTGATACTCCTCTCGCTCCATATTTTTCTGAGTGCTTGACATCTGAG
GATTTGGATGACATGAACATAGAGATTATGAGGAACACCCTCTACAAAGCATACCTTGAG
GATTTTTACAAGTTCTGTCAGAAACTT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1FV05JQ 801 0 0
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AGCTTGCTATCTGCGAAGACATAGATCAGGTTCGTGGTGTCATGGAGAAGTACCCTCCTT
ACCAAGCAATATTCTCAAAGATGTTTTATGGAGAGAGCCAGATGCTTGACAAAGCATTTT
ATGAAGAAGAAGTCAGAAGGCTTTGCTTAGCCTTTGAGCAGCAGTTCCATTACGGGGTGT
TCTTTGCGTACATGAGATTGAGGGAGCAGGAGATCAGGAACCTGATGTGGATATCCGAGT
GTGTTGCACAGAACCAGAAGTCGAGGATCCACGACAGTGTGGTCTACATGTCCTGAGTCC
GGTAAGAAGTGAGAGAAAGCACATTAAAATGTGTAAATTTGTTTTAACATTGGAGAACAA
GAAGAAAGAACCTATTTGATTGCTGTTGGTTTTCTTCGTTGCTCCGATTTGCCAGAGAAA
TCTGCGGTACAATCTGCGGTTTTTACATTTTACTGTCTACCCAAATCAGAATCTCTCCAA
TTTGTTTGTTTTGGCCATATTTTGTTTGGTTATATATTTACCAATAAAACTCTTGTAATA
ATATGAAACTACTTATTTACC

QA 1 801 1 801
DS 



AS 1 3

CO CL2633Contig1 1317 3 6 U
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ACATGCTCACTTAGGGAGAACTGCTAGCAGAAGGGATGATCTTGAATCATTGGCATATAC
ACTGATTTTCCTTCACCGGGGTCGATTGCCATGGCAAGGATATCAGGGAGATAACAAGTC
ATTCCTCGTTTGCAAAAAGAAGATGGCAACATCGCCGGATATGCTTTGTTGTTTCTGTCC
CCCTCCTTTCAAGCAGTTCCTTGAGATTGTGGTAAATATGAAATTTGACGAGGAACCTAA
CTACGGGAAGTTAGTATCTCTGCTTCAAGAGCTCTTGGGGGAAAATCCGGCAATTAGGCC
CATAAACACAGAGGGCGCTCAAAAGATCATTTTTCAAGTTGGACAGAAGCGAGGTAGGTT
AAGCATTGGGGAAGAAGAAGATGATGCCCCTAGGAAAAAAGTCCGTCTAGGTGTCCCTGC
AACGCAATGGATATCGATTTACAATGCCAGGCAACCAATGAAGCAGAGGTATCATTACAA
TGTGGCTGATACAAGACTGTCACAGCATATTGAGAGAGGTACCGCAGATGGGTTGTCAAT
AAGCTGTGTATCATCATGTTCGAATCTATGGGCATTAATAATGGATGCTGGAACTGGCTT
CACAAACCAAGTCTACGAACTCCCTCCTGTCTTCTTGCATAAGGAATGGATAATGGAACA
GTGGGAGAAGAATTACTACATAAGTTCTATTGCTGGTGCAGCCAATGGAAGCTCCTTAGT
TGTCATGTCAAAAGGTACGGCGTTTACACAGCAGTCTTACAAAGTAAGCGATTCATTTCC
ATTCAAGTGGATAAACAAGAAGTGGAGAGAAGGCTTCCATGTAACCTCCATGGCAACAGC
TGGAACTCGATGGGGTGTTGTTATGTCCCGCAATTCTGGCTACAGTGAACAGGTTGTTGA
ACTGGATTTTCTGTATCCGAGTGAAGGCATCCACAGGCGTTGGGATGGTGGATTCAGAAT
CACATCAACAGCAGCAACAACCGATCAAGCTGCTCTAATCCTAAGCATCCCACGGCGTAG
GCTGGTCGATGAGACACAAGAGACATTGCGTACCTCTCAATTCCCCAGCACACATGTCAA
GGAAAAATGGGGAAAGAATCTCTACCTTGCATCATTAAGCTATGGGCGAACTGTATCTTA
AAACCTTAAAGAAGCCTCTGTTGTGAAGTAGTGAAGACATAATCACTTATTTAACTTGAC
ATTTCCCTTAAAAACTGCTATTTATTTTTTGTACCAAGAGGTTATTTTGTTGCGAGT


BQ
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10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1C918TF U 1
AF RS1C918JQ C 603
AF RS1AX85TF U 720
BS 1 705 RS1C918TF
BS 706 706 RS1C918JQ
BS 707 728 RS1C918TF
BS 729 1066 RS1AX85TF
BS 1067 1067 RS1C918JQ
BS 1068 1317 RS1AX85TF

RD RS1C918TF 728 0 0
GCATGTTGAATATGATCAACGTCCCGATATGTTTAGGGGGACAGTTAGATACGCAAGTGC
ACATGCTCACTTAGGGAGAACTGCTAGCAGAAGGGATGATCTTGAATCATTGGCATATAC
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ATTCCTCGTTTGCAAAAAGAAGATGGCAACATCGCCGGATATGCTTTGTTGTTTCTGTCC
CCCTCCTTTCAAGCAGTTCCTTGAGATTGTGGTAAATATGAAATTTGACGAGGAACCTAA
CTACGGGAAGTTAGTATCTCTGCTTCAAGAGCTCTTGGGGGAAAATCCGGCAATTAGGCC
CATAAACACAGAGGGCGCTCAAAAGATCATTTTTCAAGTTGGACAGAAGCGAGGTAGGTT
AAGCATTGGGGAAGAAGAAGATGATGCCCCTAGGAAAAAAGTCCGTCTAGGTGTCCCTGC
AACGCAATGGATATCGATTTACAATGCCAGGCAACCAATGAAGCAGAGGTATCATTACAA
TGTGGCTGATACAAGACTGTCACAGCATATTGAGAGAGGTACCGCAGATGGGTTGTCAAT
AAGCTGTGTATCATCATGTTCGAATCTATGGGCATTAATAATGGATGCTGGAACTGGCTT
CACAAACCAAGTCTACGAACTCCCTCCTGTCTTCTTGCATAAGGA*TGGATAATGGAACA
GTGGGAGA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1C918JQ 622 0 0
GCTGTGTATCATCATGTTCGAATCTATGGGCATTAATAATGGATGCTGGAACTGGCTTCA
CAAACCAAGTCTACGAACTCCCTCCTGTCTTCTTGCATAAGGAATGGATAATGGAACAGT
GGGAGAAGAATTACTACATAAGTTCTATTGCTGGTGCAGCCAATGGAAGCTCCTTAGTTG
TCATGTCAAAAGGTACGGCGTTTACACAGCAGTCTTACAAAGTAAGCGATTCATTTCCAT
TCAAGTGGATAAACAAGAAGTGGAGAGAAGGCTTCCATGTAACCTCCATGGCAACAGCTG
GAACTCGATGGGGTGTTGTTATGTCCCGCAATTCTGGCTACAGTGAACAGGTTGTTGAAC
TGGATTTTCTGTATCCGAGTGAAGGCATCCACAGGCGTTGGGATGGTGGATTCAGAATCA
CATCAACAGCAGCAACAACCGATCAAGCTGCTCTAATCCTAAGCATCCCACGGCGTAGGC
TGGTCGATGAGACACAAGAGACATTGCGTACCTCTCAATTCCCCAGCACACATGTCAAGG
AAAAATGGGGAAAGAATCTCTACCTTGCATCATTAGGCTATGGGCGAACTGTTTCTTAAA
ACCTTAAAGAAGCCTCTGTTGT

QA 1 622 1 622
DS 

RD RS1AX85TF 598 0 0
G
GTGGGAGAAGAATTACTACATAAGTTCTATTGCTGGTGCAGCCAATGGAAGCTCCTTAGT
TGTCATGTCAAAAGGTACGGCGTTTACACAGCAGTCTTACAAAGTAAGCGATTCATTTCC
ATTCAAGTGGATAAACAAGAAGTGGAGAGAAGGCTTCCATGTAACCTCCATGGCAACAGC
TGGAACTCGATGGGGTGTTGTTATGTCCCGCAATTCTGGCTACAGTGAACAGGTTGTTGA
ACTGGATTTTCTGTATCCGAGTGAAGGCATCCACAGGCGTTGGGATGGTGGATTCAGAAT
CACATCAACAGCAGCAACAACCGATCAAGCTGCTCTAATCCTAAGCTTCCCACGGCGTAG
GCTGGTCGATGAGACACAAGAGACATTGCGTACCTCTCAATTCCCCAGCACACATGTCAA
GGAAAAATGGGGAAAGAATCTCTACCTTGCATCATTAAGCTATGGGCGAACTGTATCTTA
AAACCTTAAAGAAGCCTCTGTTGTGAAGTAGTGAAGACATAATCACTTATTTAACTTGAC
ATTTCCCTTAAAAACTGCTATTTATTTTTTGTACCAAGAGGTTATTTTGTTGCGAGT

QA 2 598 2 598
DS 



AS 1 3

CO CL2634Contig1 636 3 1 U
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TTCGCTCTTTCAACAATGGCTTACTCTAAGATTGCTCTTCTCCTTGTTTTGAATGTCATC
TTCTTCACTTTGGTCAGTTCTACGGCCCCTTGTTCACCACCACCGCCCAAAAGCCACAAC
AAGAAACCCGCACCGTCGTCTCCTTACACCAAACCCAGTTGCAAAGATGCTCTTAAACTC
AAGGTATGTGCCAACGTGTTGAATTTGGTTAAGGTTTCTCTACCAGAAAAGGCCGAATGT
TGCGCCCTTATCAAAGGTCTAGTTAATCTTGATGCCGGAGTGTGTCTCTGCACCGCTTTG
AAGGCTAATGTCCTTGGCATTAATCTTCGTGTTCCTATTTCACTGAGTGTTCTCCTTAAT
CAGTGTGGTACGAAGGTTCCATCTGGTTTCCAATGTGCTTAGAGATAGCACGTTATTAAA
TCGATGTTCTAAATTATCACTAAAATACGATTGTTGTTTCAAAATTTCGTGTAATTTCAA
TTTTTTTTGTTTGATTCTACTATTATCTGTTGTTTGTAATCCGTTACATGTTTTATTGAT
GAAATAATTAAAGTGTTTTGGTTTAAGATAAAAAAA


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DM69JQ C 1
AF RS1DM69TF U 1
AF RS1EQ65TF U 1
BS 1 636 RS1DM69TF

RD RS1DM69JQ 629 0 0
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TTCTTCACTTTGGTCAGTTTTACGGCCCCTTGTTCACCACCACCGCCCAAAAGCCACAAC
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TGCGCCCTTATCAAAGGTCTAGTTAATCTTGATGCCGGAGTGTGTCTTTGCACCGCTTTG
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TCGATGTTTTAAATTATCACTAAAATACGATTGTTGTTTCAAAATTTCGTGTAATTTCAA
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GAAATAATTAAGGTGTTTTGGTTTAAGAT

QA 1 629 1 629
DS 

RD RS1DM69TF 636 0 0
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TTCTTCACTTTGGTCAGTTCTACGGCCCCTTGTTCACCACCACCGCCCAAAAGCCACAAC
AAGAAACCCGCACCGTCGTCTCCTTACACCAAACCCAGTTGCAAAGATGCTCTTAAACTC
AAGGTATGTGCCAACGTGTTGAATTTGGTTAAGGTTTCTCTACCAGAAAAGGCCGAATGT
TGCGCCCTTATCAAAGGTCTAGTTAATCTTGATGCCGGAGTGTGTCTCTGCACCGCTTTG
AAGGCTAATGTCCTTGGCATTAATCTTCGTGTTCCTATTTCACTGAGTGTTCTCCTTAAT
CAGTGTGGTACGAAGGTTCCATCTGGTTTCCAATGTGCTTAGAGATAGCACGTTATTAAA
TCGATGTTCTAAATTATCACTAAAATACGATTGTTGTTTCAAAATTTCGTGTAATTTCAA
TTTTTTTTGTTTGATTCTACTATTATCTGTTGTTTGTAATCCGTTACATGTTTTATTGAT
GAAATAATTAAAGTGTTTTGGTTTAAGATAAAAAAA

QA 1 636 1 636
DS 

RD RS1EQ65TF 608 0 0
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TTCTTCACTTTGGTCAGTTCTACGGCCCCTTGTTCACCACCACCGCCCAAAAGCCACAAC
AAGAAACCCGCACCGTCGTCTCCTTACACCAAACCCAGTTGCAAAGATGCTCTTAAACTC
AAGGTATGTGCCAACGTGTTGAATTTGGTTAAGGTTTCTCTACCAGAAAAGGCCGAATGT
TGCGCCCTTATCAAAGGTCTAGTTAATCTTGATGCCGGAGTGTGTCTCTGCACCGCTTTG
AAGGCTAATGTCCTTGGCATTAATCTTCGTGTTCCTATTTCACTGAGTGTTCTCCTTAAT
CAGTGTGGTACGAAGGTTCCATCTGGTTTCCAATGTGCTTAGAGATAGCACGTTATTAAA
TCGATGTTCTAAATTATCACTAAAATACGATTGTTGTTTCAAAATTTCGTGTAATTTCAA
TTTTTTTTGTTTGATTCTACTATTATCTGTTGTTTGTAATCCGTTACATGTTTTATTGAT
GAAATAAT

QA 1 608 1 608
DS 



AS 1 3

CO CL2635Contig1 456 3 5 U
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CGGGTTTGTCCGTGCTCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTCTGGCAGAAGAA
GAAGGTCGAGACCAAACAACAGTGAAGGGGGTACAGAGAGAGTCTATGCTTCTGCCTGTT
GTTATTTTTGTTATGTTTCATTTGAATTTTCTCTAGTTGCGAACTCGTGTTTGTCTTTTC
TGGTTTATGAAAGATAATTACCAAGTTTTTTGGTTC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EJ92TF U 1
AF RS1H132JQB C 1
AF RS1H132TF U 1
BS 1 309 RS1EJ92TF
BS 310 310 RS1H132TF
BS 311 369 RS1EJ92TF
BS 370 370 RS1H132TF
BS 371 456 RS1EJ92TF

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QA 1 456 1 456
DS 

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QA 1 442 1 442
DS 

RD RS1H132TF 442 0 0
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TGGTTTATGAAAGATAATTACC

QA 1 442 1 442
DS 



AS 1 4

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TTTGACAATCGTGCTATGCTTATCTTTCTTATTCAAGACGCTGTTACATTTAGCCATGAA
TCTATGTTTTATTGGAGTT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1C002JQ C 1
AF RS1FK90JQ C 1
AF RS1C002TF U 1
AF RS1FK90TF U 1
BS 1 439 RS1C002TF

RD RS1C002JQ 439 0 0
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ATCGAGGGTTAAAAAAATCTTCATATGATTTGTCGTCATTCAATTGGCTTCTTCGCTTTT
TTTGACAATCGTGCTATGCTTATCTTTCTTATTCAAGACGCTGTTACATTTAGCCATGAA
TCTATGTTTTATTGGAGTT

QA 1 439 1 439
DS 

RD RS1FK90JQ 439 0 0
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ACCATGAACACCGCCAGTGCCGTCACCGTTAGAAGCACCATCAGGAGGTTGAGGGAGCAG
ATCGAGGGTTAAAAAAATCTTCATATGATTTGTCGTCATTCAATTGGCTTCTTCGCTTTT
TTTGACAATCGTGCTATGCTTATCTTTCTTATTCAAGACGCTGTTACATTTAGCCATGAA
TCTATGTTTTATTGGAGTT

QA 1 439 1 439
DS 

RD RS1C002TF 439 0 0
TTTTTCACATTCGGCGTTGGTGCTCGTTTCGAAATGGCGAAGAGAACGAAGAAGGTTGGA
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ACCATGAACACCGCCAGTGCCGTCACCGTTAGAAGCACCATCAGGAGGTTGAGGGAGCAG
ATCGAGGGTTAAAAAAATCTTCATATGATTTGTCGTCATTCAATTGGCTTCTTCGCTTTT
TTTGACAATCGTGCTATGCTTATCTTTCTTATTCAAGACGCTGTTACATTTAGCCATGAA
TCTATGTTTTATTGGAGTT

QA 1 439 1 439
DS 

RD RS1FK90TF 439 0 0
TTTTTCACATTCGGCGTTGGTGCTCGTTTCGAAATGGCGAAGAGAACGAAGAAGGTTGGA
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ACCATGAACACCGCCAGTGCCGTCACCGTTAGAAGCACCATCAGGAGGTTGAGGGAGCAG
ATCGAGGGTTAAAAAAATCTTCATATGATTTGTCGTCATTCAATTGGCTTCTTCGCTTTT
TTTGACAATCGTGCTATGCTTATCTTTCTTATTCAAGACGCTGTTACATTTAGCCATGAA
TCTATGTTTTATTGGAGTT

QA 1 439 1 439
DS 



AS 1 4

CO CL2637Contig1 879 4 3 U
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CTGCTGAGTTTGTGCACAAGCATCTCAAGCTCAAACATGCTGAGCTTGTAGTGGACCAGA
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CGGCTGATATAAATGCACCACCGATGCTGATGCCTGTTCCTGGTGCCGGGCCACTAGGAC
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GACCGTTATTGATTACAGGAGCTTGTAGACAGGGAGGAGAGAGAGTGGGATGCCCGGTCT
AGCCAGCCGATTGGAACAACAATCTACATGCTCTTTGATGTCTGTATCTTTTCTTTCTTG
TTTCATCCTAATTTTTACTCAGTAAAGGCGTAAGACACGCACTCTATATATTTTTGTTGA
TTGCTTTTCATGTGTTTTAGTTATCGTTTCTTTGTACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A092TV U 1
AF RS1A092TF U 73
AF RS1A092TR C 67
AF RS1A092JQ C 68
BS 1 803 RS1A092TV
BS 804 840 RS1A092TF
BS 841 879 RS1A092TR

RD RS1A092TV 803 0 0
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CTGCTGAGTTTGTGCACAAGCATCTCAAGCTCAAACATGCTGAGCTTGTAGTGGACCAGA
CTGCCAAAGTGCGGGAAGAACTTTATTTTCAAAACTATATGAATGATCCTAATGCTCCAG
GAGGACAACCAGCCACGCAGCAACCTGGCCCGAGAGATAGAGTTATGATGAGACGCAAGC
CAGGCATGGAGAACAGATTGAGGGATGATCGAGGTGGACGCAGAGACGGACGAGCTTATG
GAAATGACAGAATTGATCGGTCAGAGGATCAACAGAGAGGTGATGGAAACGGTCCAAATC
CGGAGGAAGGTGGTTTCGATGCATTTGGTGGGCAAGGCAGTTTTCAGGTTCCTTCCTACT
CGGCTGATATAAATGCACCACCGATGCTGATGCCTGTTCCTGGTGCCGGGCCACTAGGAC
CATTTGTACCAGCACCACCTGAGGTTGCGATGCAGATGTTCAGGGACCCGAGCGGGCCCA
ACCCTTCTTTTGAAGGTGGGGGCAGAGGTGGACCAGCCCTTTTCTGTTGTCTCCGGCCTT
TAGACAGGATCCTAGACGGCTACGCAGCTACCAAGACCTAGATGCGCCAGAGGAAGAGGT
GACCGTTATTGATTACAGGAGCTTGTAGACAGGGAGGAGAGAGAGTGGGATGCCCGGTCT
AGCCAGCCGATTGGAACAACAATCTACATGCTCTTTGATGTCTGTATCTTTTCTTTCTTG
TTTCATCCTAATTTTTACTCAGT

QA 1 803 1 803
DS 

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GTTTCGATGCATTTGGTGGGCAAGGCAGTTTTCAGGTTCCTTCCTACTCGGCTGATATAA
ATGCACCACCGATGCTGATGCCTGTTCCTGGTGCCGGGCCACTAGGACCATTTGTACCAG
CACCACCTGAGGTTGCGATGCAGATGTTCAGGGACCCGAGCGGGCCCAACCCTTCTTTTG
AAGGTGGGGGCAGAGGTGGACCAGCCCTTTTCTGTTGTCTCCGGCCTTTAGACAGGATCC
TAGACGGCTACGCAGCTACCAAGACCTAGATGCGCCAGAGGAAGAGGTGACCGTTATTGA
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GGAACAACAATCTACATGCTCTTTGATGTCTGTATCTTTTCTTTCTTGTTTCATCCTAAT
TTTTACTCAGTAAAGGCGTAAGACACGCACTCTATATATTTTTGTTGA

QA 1 768 1 768
DS 

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AGTTTG
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GGGAAGAACTTTATTTTCAAAACTATATGAATGATCCTAATGCTCCAGGAGGACAACCAG
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TTGATCGGTCAGAGGATCAACAGAGAGGTGATGGAAACGGTCCAAATCCGGAGGAAGGTG
GTTTCGATGCATTTGGTGGGCAAGGCAGTTTTCAGGTTCCTTCCTACTCGGCTGATATAA
ATGCACCACCGATGCTGATGCCTGTTCCTGGTGCCGGGCCACTAGGACCATTTGTACCAG
CACCACCTGAGGTTGCGATGCAGATGTTCAGGGACCCGAGCGGGCCCAACCCTTCTTTTG
AAGGTGGGGGCAGAGGTGGACCAGCCCTTTTCTGTTGTCTCCGGCCTTTAGACAGGATCC
TAGACGGCTACGCAGCTACCAAGACCTAGATGCGCCAGAGGAAGAGGTGACCGTTATTGA
TTACAGGAGCTTGTAGACAGGGAGGAGAGAGAGTGGGATGCCCGGTCTAGCCAGCCGATT
GGAACAACAATCTACATGCTCTTTGATGTCTGTATCTTTTCTTTCTTGTTTCATCCTAAT
TTTTACTCAGTAAAGGCGTAAGACACGCACTCTATATATTTTTGTTGATTGCTTTTCATG
TGTTTTAGTTATCGTTTCTTTGTACCC

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DS 

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GTTTG
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TTGATCGGTCAGAGGATCAACAGAGAGGTGATGGAAACGGTCCAAATCCGGAGGAAGGTG
GTTTCGATGCATTTGGTGGGCAAGGCAGTTTTCAGGTTCCTTCCTACTCGGCTGATATAA
ATGCACCACCGATGCTGATGCCTGTTCCTGGTGCCGGGCCACTAGGACCATTTGTACCAG
CACCACCTGAGGTTGCGATGCAGATGTTCAGGGACCCGAGCGGGCCCAACCCTTCTTTTG
AAGGTGGGGGCAGAGGTGGACCAGCCCTTTTCTGTTGTCTCCGGCCTTTAGACAGGATCC
TAGACGGCTACGCAGCTACCAAGACCTAGATGCGCCAGAGGAAGAGGTGACCGTTATTGA
TTACAGGAGCTTGTAGACAGGGAGGAGAGAGAGTGGGATGCCCGGTCTAGCCAGCCGATT
GGAACAACAATCTACATGCTCTTTGATGTCTGTATCTTTTCTTTCTTGTTTCATCCTAAT
TTTTACTCAGTAAAGGCGTAAGACACGCACTCTATATATTTTTGTTGATTGCTTTTCATG
TGTTTTAGTTATCGTTTCTTTGTACCC

QA 6 812 6 812
DS 



AS 0 0

AS 1 4

CO CL2639Contig1 1061 4 31 U
GGGCATCATCATCGTTTGTTGTTTCGTCACTGAGAAAAACCCTAAACATTTTACCGGCGA
GAGATGAGTATCATCCGTAACGCGATCAGATCGAGTCTGAGCCTCCGGACGTTGGATCCG
GCGATCAGTCGTAGCTCTCTTCCATTTCTTCAGGAATCGCGGAAACGTCTATCTACCGTC
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ACGGTTGAAGGAGGAGTAAAGAAGCCTGCGGGAGAAGGGAAGTCGTATGGGAAGTTTTCA
GGCTTCTCAAAACATACGCTGAAGAGTGATGTGATGAACATACTTGAAGGTTGCAATGCG
ACACCTGATGATCTCAGATTCAGCTACATGCGTGGTGGAAACTTGAATCCTTCTGGAGTT
TATGTGCAATTCCCTTCCCGTTCATCTTATGATAGTGCAATGCGAGCAATTGCGAAGAAG
GGAAGGCTATATAGATTAGAAAGGGCTACTCAGTCTCAGTGGGATCCCGTTGTTCCTTAT
GAAGGCAAAGTGGTTGCGCTACATGGACTTCCGCCGAATGCTATAATAGAAGACATTGAT
AGGTTCTTATCCGGCTGTCTCTATCATCCTGGATCCATCCAGTTCCTCACCATTCAAGGA
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CAGTAATTTCTTAGTTGGTGTATTCCGATGGCAAGAAATCCTGTGTCTTTCCTGTTTGGA
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AGTTGGTGTCTGTTTTCTCCGGTTCAGTTGGATGTTCACAAATAAAAAAAAATCTTGGTG
TCTAAGCAGATTACAGCTACTGCATGTGATTGTTTTTTTTTTCGTCCTTGTATTTGACCA
ACTTTGGATGCCCCTGTGATGAAGTGATCCAGCTTGCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DM78TF U 48
AF RS1AS88TF U 1
AF RS1DM78JQ C 157
AF RS1AS88JQ C 369
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BS 844 967 RS1DM78JQ
BS 968 1061 RS1AS88JQ

RD RS1DM78TF 606 0 0
T
TTTTACCGGCGAGAGATGAGTATCATCCGTAACGCGATCAGATCGAGTCTGAGCCTCCGG
ACGTTGGATCCGGCGATCAGTCGTAGCTCTCTTCCATTTCTTCAGGAATCGCGGAAACGT
CTATCTACCGTCACAGAGCAGCCTCCTCCTCCT***TCCTCTCCGTTACCACCACCGCCT
CCGGGAGGTTCCACGGTTGAAGGAGGAGTAAAGAAGCCTGCGGGAGAAGGGAAGTCGTAT
GGGAAGTTTTCAGGCTTCTCAAAACATACGCTGAAGAGTGATGTGATGAACATACTTGAA
GGTTGCAATGCGACACCTGATGATCTCAGATTCAGCTACATGCGTGGTGGAAGCTTGAAT
CCTTCTGGAGTTTATGTGCAATTCCCTTCCCGTTCATCTTATGATAGTGCAATGCGGGCA
ATTGCGAAGAAGGGAAGGCTTTATAGATTAGAAAGGGCTACTCAGTCTCAGTGGGATCCC
GTTGTTCCTTATGAAGGCAAAGTGGTTGCGCTACATGGACTTCCGCCGAATGCTATAATA
GAAGACATTGATAGGTTCTTATCCGGCTGTCTCTATCATCCTGGATCCATCCAGTTCCTC
ACCAT

QA 2 606 2 606
DS 

RD RS1AS88TF 704 0 0
GGGCATCATCATCGTTTGTTGTTTCGTCACTGAGAAAAACCCTAAACATTTTACCGGCGA
GAGATGAGTATCATCCGTAACGCGATCCGATCGAGTTTGAGCCTCCGGACGTTGGATCCG
GCGATCAGTCGTAGCTCTCTTCCATTTCTTCAGGAATCGCGGAAACGTCTATCTACCGTC
ACAGAGCAGCCTCCTCCTCCTCCTTCCTCTCCGTTACCACCACCGCCTCCGGGAGGTTCC
ACGGTTGAAGGAGGAGTAAAGAAGGCTGCAGGAGAAGGGAAGTCGTATGGGAAGTTTTCA
GGCTTCTCAAAACATACGCTGAAGAGTGATGTGATGAGCGTACTTGAAGGATGCAATGTG
ACACCTGATGATCTCAGATTCAGCTACATGCGTGGTGGTAACTTGAATCCTTCTGGAGTT
TATGTGCAATTCCCTTCCCGTTCATCTTATGATAGTGCAATGCGAGCGATTGCGAAGAAG
GGAAGGCTATATAGATTAGAAAGGGCTACTCAGTCTCAGTGGGATCCCGTTGTTCCTTAT
GAAGGCAAAGTGGTTGCGCTACATGGACTTCCGCCGAATGCTATAATAGAAGACATTGAT
AGGTTCTTATCCGGCTGTCTCTATCATCCTGGATCCATCCAGTTCCTCACCATTCAAGGA
CTCGGAAGTCCTAAGAGG*TGGCACTGGTGCGTTTCACTTCACA

QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1DM78JQ 812 0 0
TCGCGGAAACGTCTATCTACCGTCACAGAGCAGCCTCCTCCTCCT***TCCTCTCCGTTA
CCACCACCGCCTCCGGGAGGTTCCACGGTTGAAGGAGGAGTAAAGAAGCCTGCGGGAGAA
GGGAAGTCGTATGGGAAGTTTTCAGGCTTCTCAAAACATACGCTGAAGAGTGATGTGATG
AACATACTTGAAGGTTGCAATGCGACACCTGATGATCTCAGATTCAGCTACATGCGTGGT
GGAAGCTTGAATCCTTCTGGAGTTTATGTGCAATTCCCTTCCCGTTCATCTTATGATAGT
GCAATGCGGGCAATTGCGAAGAAGGGAAGGCTTTATAGATTAGAAAGGGCTACTCAGTCT
CAGTGGGATCCCGTTGTTCCTTATGAAGGCAAAGTGGTTGCGCTACATGGACTTCCGCCG
AATGCTATAATAGAAGACATTGATAGGTTCTTATCCGGCTGTCTCTATCATCCTGGATCC
ATCCAGTTCCTCACCATTCAAGGACTCGGAAGTCCTAAGAGGGTGGCACTGGTGCGTTTC
ACTTCACAGACCCAGGCGATGAACGCATACATTACGAAGAACAGGAACTTCCTTCTCAAC
CAACGAATCACGTTGCAAGTTCCGCAGTAATTTCTTAGTTGGTGTATTCCGATGGCAAGA
AATCCTGTGTCTTTCCTGTTTGGATGTTCTATGTCAGTTTGCTCCTCTGAGATTTTATCT
GCAAACTCCATGGTTCTGAAATTTAGTTGGTGTCTGTTTTCTCCGGTTCAGTTGGATGTT
CACAAATAAAAAAAAATCTTGGTGTCTAAGC
G

QA 1 811 1 811
DS 

RD RS1AS88JQ 693 0 0
TGATCTCAGATTCAGCTACATGCGTGGTGGTAACTTGAATCCTTCTGGAGTTTATGTGCA
ATTCCCTTCCCGTTCATCTTATGATAGTGCAATGCGAGCGATTGCGAAGAAGGGAAGGCT
ATATAGATTAGAAAGGGCTACTCAGTCTCAGTGGGATCCCGTTGTTCCTTATGAAGGCAA
AGTGGTTGCGCTACATGGACTTCCGCCGAATGCTATAATAGAAGACATTGATAGGTTTTT
ATCCGGCTGTCTCTATCATCCTGGATCCATCCAGTTCCTCACCATTCAAGGACTCGGAAG
TCCTAAGAGGGTGGCACTGGTGCGTTTCACTTCACAGACCCAGGCGATGAATGCATACAT
TACGAAGAACAGGAACTTCCCTCTCAACCAACGAATCACGTTGCAAGTTTTGCAGTAATT
TTTTAGTTGGTGTATTCCGATGGCAAGAAATTCTGTGTCTTTCCTGTTTGGATGGTCTAT
GTCAGTTTGCTCCTCTGAGATTTTATCTGCAAACTCCATGGTTTTGAAATTTAGTTGTTG
TCTGTTTTCTCCGGTTCAGTTGGATGTTCACAAATAAAAAAAAATCTTGGTGTCTAAGCA
GATTACAGCTACTGCATGTGATTGTTTTTTTTTTCGTCCTTGTATTTGACCAACTTTGGA
TGCCCCTGTGATGAAGTGATCCAGCTTGCTTTT

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 4

CO CL2640Contig1 584 4 2 U
GGATTCTACTAAGAGGGAGGTGAGAAAGCTGCGACTGTGAAGAAGATGGCGAAATACAAC
GAGATAGCGAAGAAGAAGAGAGAGGCGAAAGCGGATAGGAAGCGAGCTATCCACGGCGAT
CCACTCACCAATAAATTGAAGACCAGAGCTCCGGTTGTCTCCGTCTCCGGTAAACGTCAG
AAGAAACTCCTTCGCAAATGGCGCAGAGAGCAGAAAGATATGGTGGAGAAAGGTCTTGTT
ACCATGGAGGATGTTGAGATGGCTTCTGCTGAAGCTGCATCAGAAGACTCCAAGAAACCC
TCTAGAAAATTTAGCGTGAAGAAGACGTTGAAGCTCAATAAACTAAAGAACAAAGGCAAC
AAGAAGAAAAGTCAGAAAGCCGGTGGCCAAGTATCCGCTGATCAGATGCTAGAATGATCA
GAATGATTTTACAGGACTTCATATTTTTCTACTGCTCAAGTGTTTTTTTTCTTTCTAATA
TGTTGTATTCTAGCGGGATTGCTGATTCGGTTCTTTTATACAAGAAGTTTGTTGCATTTA
ACATTTGTAATATCACAATTTCAGTATCCCAACCTTTTCTACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1ER84JQ C 1
AF RS1ER84TF U 1
AF RS1CR31JQ C 7
AF RS1CR31TF U 17
BS 1 7 RS1ER84JQ
BS 8 584 RS1ER84TF

RD RS1ER84JQ 584 0 0
GGATTCTACTAAGAGGGAGGTGAGAAAGCTGCGACTGTGAAGAAGATGGCGAAATACAAC
GAGATAGCGAAGAAGAAGAGAGAGGCGAAAGCGGATAGGAAGCGAGCTATCCACGGCGAT
CCACTCACCAATAAATTGAAGACCAGAGCTCCGGTTGTCTCCGTCTCCGGTAAACGTCAG
AAGAAACTCCTTCGCAAATGGCGCAGAGAGCAGAAAGATATGGTGGAGAAAGGTCTTGTT
ACCATGGAGGATGTTGAGATGGCTTTTGCTGAAGCTGCATCAGAAGACTCCAAGAAACCC
TCTAGAAAATTTAGCGTGAAGAAGACGTTGAAGCTCAATAAACTAAAGAACAAAGGCAAC
AAGAAGAAAAGTCAGAAAGCCGGTGGCCAAGTATCCGCTGATCAGATGCTAGAATGATCA
GAATGATTTTACAGGACTTCATATTTTTTTACTGCTCAAGTGTTTTTTTTCTTTCTAATA
TGTTGTATTCTAGCGGGATTGCTGATTCGGTTCTTTTATACAAGAAGTTTGTTGCATTTA
ACATTTGTAATATCACAATTTCAGTATCCCAACCTTTTCTACCG

QA 1 584 1 584
DS 

RD RS1ER84TF 584 0 0
GGATTCT
ACTAAGAGGGAGGTGAGAAAGCTGCGACTGTGAAGAAGATGGCGAAATACAACGAGATAG
CGAAGAAGAAGAGAGAGGCGAAAGCGGATAGGAAGCGAGCTATCCACGGCGATCCACTCA
CCAATAAATTGAAGACCAGAGCTCCGGTTGTCTCCGTCTCCGGTAAACGTCAGAAGAAAC
TCCTTCGCAAATGGCGCAGAGAGCAGAAAGATATGGTGGAGAAAGGTCTTGTTACCATGG
AGGATGTTGAGATGGCTTCTGCTGAAGCTGCATCAGAAGACTCCAAGAAACCCTCTAGAA
AATTTAGCGTGAAGAAGACGTTGAAGCTCAATAAACTAAAGAACAAAGGCAACAAGAAGA
AAAGTCAGAAAGCCGGTGGCCAAGTATCCGCTGATCAGATGCTAGAATGATCAGAATGAT
TTTACAGGACTTCATATTTTTCTACTGCTCAAGTGTTTTTTTTCTTTCTAATATGTTGTA
TTCTAGCGGGATTGCTGATTCGGTTCTTTTATACAAGAAGTTTGTTGCATTTAACATTTG
TAATATCACAATTTCAGTATCCCAACCTTTTCTACCG

QA 8 584 8 584
DS 

RD RS1CR31JQ 564 0 0
G
ACTAAGAGGGAGGTGAGAAAGCTGCGACTGTGAAGAAGATGGCGAAATACAACGAGATAG
CGAAGAAGAAGAGAGAGGCGAGAGCGGATAGGAAGCGAGCTATCCACGGCGATCCACTCA
CCAATAAATTGAAGACCAGAGCTCCGGTTGTCTCCGTCTCCGGTAAACGTCAGAAGAAAC
TCCTTCGCAAATGGCGCAGAGAGCAGAAAGATATGGTGGAGAAAGGTCTTGTTACCATGG
AGGATGTTGAGATGGCTTCTGCTGAAGCTGCATCAGAAGACTCCAAGAAACCCTCTAGAA
AATTTAGCGTGAAGAAGACGTTGAAGCTCAATAAACTAAAGAACAAAGGCAACAAGAAGA
AAAGTCAGAAAGCCGGTGGCCAAGTATCCGCTGATCAGATGCTAGAATGATCAGAATGAT
TTTACAGGACTTCATATTTTTCTACTGCTCAAGTGTTTTTTTTCTTTCTAATATGTTGTA
TTCTAGCGGGATTGCTGATTCGGTTCTTTTATACAAGAAGTTTGTTGCATTTAACATTTG
TAATATCACAATTTCAGTATCCC

QA 2 564 2 564
DS 

RD RS1CR31TF 554 0 0
GAGGTGAGAAAGCTGCGACTGTGAAGAAGATGGCGAAATACAACGAGATAGCGAAGAAGA
AGAGAGAGGCGAGAGCGGATAGGAAGCGAGCTATCCACGGCGATCCACTCACCAATAAAT
TGAAGACCAGAGCTCCGGTTGTCTCCGTCTCCGGTAAACGTCAGAAGAAACTCCTTCGCA
AATGGCGCAGAGAGCAGAAAGATATGGTGGAGAAAGGTCTTGTTACCATGGAGGATGTTG
AGATGGCTTCTGCTGAAGCTGCATCAGAAGACTCCAAGAAACCCTCTAGAAAATTTAGCG
TGAAGAAGACGTTGAAGCTCAATAAACTAAAGAACAAAGGCAACAAGAAGAAAAGTCAGA
AAGCCGGTGGCCAAGTATCCGCTGATCAGATGCTAGAATGATCAGAATGATTTTACAGGA
CTTCATATTTTTCTACTGCTCAAGTGTTTTTTTTCTTTCTAATATGTTGTATTCTAGCGG
GATTGCTGATTCGGTTCTTTTATACAAGAAGTTTGTTGCATTTAACATTTGTAATATCAC
AATTTCAGTATCCC

QA 1 554 1 554
DS 



AS 1 4

CO CL2641Contig1 605 4 2 U
GGGGGGAAAAAACAGGGAAAGACAGAAATGGCGACGGGATCGGAGAACGCAAGAGGAGGT
GATAAAACGGCGAAGGCAGTAGTCGCCGATCAGATATCGCAGGCTGTTAATTCTACTGCT
AACCTTCTCCATCTCATGCGTCAGTCGTCTTCTGCTCAGGCCCAGTTGGCAAAGCTCCCA
AAGAATCTTTTGGCCAAAGCTTCTTTAACTAAGGCCACTGGACAAGCCTTGGCGCAGCTT
CCTCAAGTGATTTCATCCTTGGATGCCCATATAGAAAGCGGCTTGAACAGTGGAGTTCAT
TTAAACACAGTAACCCAATTACTTGAAAACATGGAAAGCACGCAGCTTCGTGCTCTTCGA
CAATCTAACTTATCCCCTGTCGTGGTATAAACTCAAATCTCTTATTTTTGCAATAATGAA
TTTTCTTCATTCTGTTACTTTCTCTTTTATTGGCAAAGCGATCTGAGATTATCATGTAAT
ATGTTGTGTTGTTTTTACTCGGTTTCCTCATTTAGGACAACAATCAATCTCCAGAGCAGA
GTTGACCGTTTCAGACAAATGTTTCCTCAGTAGTACATATGTTTATCTCCAATAAATTTT
TTCAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 

AF RS1CM01JQ C 1
AF RS1CM01TF U 1
AF RS1AV37JQ C 18
AF RS1AV37TF U 18
BS 1 577 RS1CM01TF
BS 578 605 RS1AV37TF

RD RS1CM01JQ 577 0 0
GGGGGGAAAAAACAGGGAAAGACAGAAATGGCGACGGGATCGGAGAACGCAAGAGGAGGT
GATAAAACGGCGAAGGCAGTAGTCGCCGATCAGATATCGCAGGCTGTTAATTCTACTGCT
AACCTTCTCCATCTCATGCGTCAGTCGTCTTCTGCTCAGGCCCAGTTGGCAAAGCTCCCA
AAGAATCTTTTGGCCAAAGCTTCTTTAACTAAGGCCACTGGACAAGCCTTGGCGCAGCTT
CCTCAAGTGATTTCATCCTTGGATGCCCATATAGAAAGCGGCTTGAACAGTGGAGTTCAT
TTAAACACAGTAACCCAATTACTTGAAAACATGGAAAGCACGCAGCTTCGTGCTCTTCGA
CAATCTAACTTATCCCCTGTCGTGGTATAAACTCAAATCTCTTATTTTTGCAATAATGAA
TTTTCTTCATTCTGTTACTTTCTCTTTTATTGGCAAAGCGATCTGAGATTATCATGTAAT
ATGTTGTGTTGTTTTTACTCGGTTTCCTCATTTAGGACAACAATCAATCTCCAGAGCAGA
GTTGACCGTTTCAGACAAATGTTTCCTCAGTAGTACA

QA 1 577 1 577
DS 

RD RS1CM01TF 577 0 0
GGGGGGAAAAAACAGGGAAAGACAGAAATGGCGACGGGATCGGAGAACGCAAGAGGAGGT
GATAAAACGGCGAAGGCAGTAGTCGCCGATCAGATATCGCAGGCTGTTAATTCTACTGCT
AACCTTCTCCATCTCATGCGTCAGTCGTCTTCTGCTCAGGCCCAGTTGGCAAAGCTCCCA
AAGAATCTTTTGGCCAAAGCTTCTTTAACTAAGGCCACTGGACAAGCCTTGGCGCAGCTT
CCTCAAGTGATTTCATCCTTGGATGCCCATATAGAAAGCGGCTTGAACAGTGGAGTTCAT
TTAAACACAGTAACCCAATTACTTGAAAACATGGAAAGCACGCAGCTTCGTGCTCTTCGA
CAATCTAACTTATCCCCTGTCGTGGTATAAACTCAAATCTCTTATTTTTGCAATAATGAA
TTTTCTTCATTCTGTTACTTTCTCTTTTATTGGCAAAGCGATCTGAGATTATCATGTAAT
ATGTTGTGTTGTTTTTACTCGGTTTCCTCATTTAGGACAACAATCAATCTCCAGAGCAGA
GTTGACCGTTTCAGACAAATGTTTCCTCAGTAGTACA

QA 1 577 1 577
DS 

RD RS1AV37JQ 588 0 0
GG
AGACAGAAATGGCGACGGGATCGGAGAACGCAAGAGGAGGTGATAAAACGGCGAAGGCAG
TAGTCGCCGATCAGATATCGCAGGCTGTTAATTCTACTGCTAACCTTCTCCATCTCATGC
GTCAGTCGTCTTCTGCTCAGGCCCAGTTGGCAAAGCTCCCAAAGAATCTTTTGGCCAAAG
CTTCTTTAACTAAGGCCACTGGACAAGCCTTGGCGCAGCTTCCTCAAGTGATTTCATCCT
TGGATGCCCATATAGAAAGCGGCTTGAACAGTGGAGTTCATTTAAACACAGTAACCCAAT
TACTTGAAAACATGGAAAGCACGCAGCTTCGTGCTCTTCGACAATCTAACTTATCCCCTG
TCGTGGTATAAACTCAAATCTCTTATTTTTGCAATAATGAATTTTCTTCATTCTGTTACT
TTCTCTTTTATTGGCAAAGCGATCTGAGATTATCATGTAATATGTTGTGTTGTTTTTACT
CGGTTTCCTCATTTAGGACAACAATCAATCTCCAGAGCAGAGTTGACCGTTTCAGACAAA
TGTTTCCTCAGTAGTACATATGTTTATCTCCAATAAATTTTTTCAT

QA 3 588 3 588
DS 

RD RS1AV37TF 588 0 0
GG
AGACAGAAATGGCGACGGGATCGGAGAACGCAAGAGGAGGTGATAAAACGGCGAAGGCAG
TAGTCGCCGATCAGATATCGCAGGCTGTTAATTCTACTGCTAACCTTCTCCATCTCATGC
GTCAGTCGTCTTCTGCTCAGGCCCAGTTGGCAAAGCTCCCAAAGAATCTTTTGGCCAAAG
CTTCTTTAACTAAGGCCACTGGACAAGCCTTGGCGCAGCTTCCTCAAGTGATTTCATCCT
TGGATGCCCATATAGAAAGCGGCTTGAACAGTGGAGTTCATTTAAACACAGTAACCCAAT
TACTTGAAAACATGGAAAGCACGCAGCTTCGTGCTCTTCGACAATCTAACTTATCCCCTG
TCGTGGTATAAACTCAAATCTCTTATTTTTGCAATAATGAATTTTCTTCATTCTGTTACT
TTCTCTTTTATTGGCAAAGCGATCTGAGATTATCATGTAATATGTTGTGTTGTTTTTACT
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DS 



AS 1 3

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TGGATCTTTGCCTGGACTCAGACGAGGTTTCACTTGCCGGTCTGGCTAGGCTTCGGAGCT
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AACCAGTGGCCTTTCTTTCGTGTCACAATCGATCTAGTCGAAATGGTTTTCGCCAAAGGA
GACCCTGGGATCGCTGCTCTCTACGACCGTCTCCTTGTCTCTGAAGAGCTTCAGCCTTTT
GGTGAACAGCTTCGTGTTAACTACCAAGAGACCAGACGCCTCCTCCTCCAGGTGGCTGGT
CACAAAGACATTCTTGAAGGTGATCCTTACCTGAGGCAAAGGCTGCAGCTGCGTGACCCA
TACATCACGACACTGAACGTGTGTCAAGCCTACACGCTTAAGCAGATACGTGACCCGAGC
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TTCTTGTTAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EP96TF U 1
AF RS1BK18TF U 494
AF RS1BK18JQ C 661
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GCTACGCTCGAGCATGGGATGCATCCGCCTGTTTCTCCCAAACCTGAGTGGCGTGTACTC
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TGGATCTTTGCCTGGACTCAGA

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TCTTTCGTGTCACAATCGATCTAGTCGAAATGGTTTTCGCCAAAGGAGACCCTGGGATCG
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DS 

RD RS1BK18JQ 730 0 0
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AACCAGTGGCCTTTCTTTCGTGTCACAATCGATCTAGTCGAAATGGTTTTCGCCAAAGGA
GACCCTGGGATCGCTGCTCTCTACGACCGTCTCCTTGTTTCTGAAGAGCTTCAGCCTTTT
GGTGAACAGCTTCGTGTTAACTACCAAGAGACCAGACGCCTCCTCCTCCAGGTGGCTGGT
CACAAAGACATTCTTGAAGGTGATCCTTACCTGAGGCAAAGGCTGCAGCTGCGTGACCCA
TACATCACGACACTGAACGTGTGTCAAGCCTACACGCTTAAGCAGATACGTGACCCGAGC
TTCCACGTCAAAGTGAGGCCACACTTGTCTAAAGACTACATGGAGTCTAGCAAACCAGCT
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AAAACCGGCTCTGTACCATTCCCTAAAAATCTTATCTCTGCTATGTAATATTATTTCTAC
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TTCTTGTTAC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 4

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TCTCTCACCGAAGCTCTTTGTGGCTTCTCATTTGTCCTTACCCACTTGGATGGCAGAAAC
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TTTCATTGTATTAGAGTCTTATGGAGTTTGGTATGGTTTAAGACTTCGCCCACTTCGGTG
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ATTTTAAATTTGTAGTAATCTCAAAATATTGGAGGAGTAAAA


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RS1A091TV U 1
AF RS1A091TF U 28
AF RS1A091JQ C 57
AF RS1A091TR C 58
BS 1 877 RS1A091TV
BS 878 938 RS1A091JQ
BS 939 942 RS1A091TR

RD RS1A091TV 877 0 0
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GAGACCATCAACGATCGGGATAGGTGTCCACAATGCAAAGGAGACAAGGTCGTCCCCGAG
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GAAGGACAAGCTGATGAAGCGCCTGACACTGTCACTGGGGATATAGTCTTCGTCATTCAG
CAGAAAGAGCATCCAAAGTTCAAAAGAAAGGGAGAAGACCTCTTTGTCGAGCACACACTT
TCTCTCACCGAAGCTCTTTGTGGCTTCTCATTTGTCCTTACCCACTTGGATGGCAGAAAC
CTTCTCATCAAATCTAATCCCGGGGAGGTCGTGAAACCTGATTCATACAAGGCCATCAGC
GATAAGGGAATGCCGATATACCGGAGGCCATTCATGAAGGGTAAGCTTTACATCCACTTC
ACCGTGGAGTTCCCGGACTCGCTGAGCCCTGACCAGACCAAAGCGCTTGAATCTGTTCTG
CCTAAGCCTTCGACTACTCAGCTGAGCGACATGGAGATCGATGAGTGCGAGGAAACTACG
CTACACGATGTCAACATCGAAGATGAGATGAGAAGGAAAGCGCAAGCTCAAAGGGAGGCT
TATGATGATGAAGACGACGATGATGACCATCCTGGAGGCGCGCAAAGGGTGCAATGTGCT
CAGCAGTAACCTTAGAGAGAGAGAGACTTTGGTCACATGGTTTTTGGTTCCTTTTCTTAT
TTTCATTGTATTAGAGTCTTATGGAGTTTGGTATGGTTTAAGACTTCGCCCACTTCGGTG
GAAAACCTACTTGTTTTTCGTTCTCATAAACTGATTC

QA 1 877 1 877
DS 

RD RS1A091TF 822 0 0
GAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGGCACGGGTGAGACCATCAACGATCGGGATAGGTGT
CCACAATGCAAAGGAGACAAGGTCGTCCCCGAGAAGAAGGTGCTTGAAGTGAACGTGGAG
AAAGGAATGCTACACAGTCAGAAGATCACTTTCGAAGGACAAGCTGATGAAGCGCCTGAC
ACTGTCACTGGGGATATAGTCTTCGTCATTCAGCAGAAAGAGCATCCAAAGTTCAAAAGA
AAGGGAGAAGACCTCTTTGTCGAGCACACACTTTCTCTCACCGAAGCTCTTTGTGGCTTC
TCATTTGTCCTTACCCACTTGGATGGCAGAAACCTTCTCATCAAATCTAATCCCGGGGAG
GTCGTGAAACCTGATTCATACAAGGCCATCAGCGATAAGGGAATGCCGATATACCGGAGG
CCATTCATGAAGGGTAAGCTTTACATCCACTTCACCGTGGAGTTCCCGGACTCGCTGAGC
CCTGACCAGACCAAAGCGCTTGAATCTGTTCTGCCTAAGCCTTCGACTACTCAGCTGAGC
GACATGGAGATCGATGAGTGCGAGGAAACTACGCTACACGATGTCAACATCGAAGATGAG
ATGAGAAGGAAAGCGCAAGCTCAAAGGGAGGCTTATGATGATGAAGACGACGATGATGAC
CATCCTGGAGGCGCGCAAAGGGTGCAATGTGCTCAGCAGTAACCTTAGAGAGAGAGAGAC
TTTGGTCACATGGTTTTTGGTTCCTTTTCTTATTTTCATTGTATTAGAGTCTTATGGAGT
TTGGTATGGTTTAAGACTTCGCCCACTTCGGTGGAAAACCTA

QA 1 822 1 822
DS 

RD RS1A091JQ 882 0 0
G
GGTGAGACCATCAACGATCGGGATAGGTGTCCACAATGCAAAGGAGACAAGGTCGTCCCC
GAGAAGAAGGTGCTTGAAGTGAACGTGGAGAAAGGAATGCTACACAGTCAGAAGATCACT
TTCGAAGGACAAGCTGATGAAGCGCCTGACACTGTCACTGGGGATATAGTCTTCGTCATT
CAGCAGAAAGAGCATCCAAAGTTCAAAAGAAAGGGAGAAGACCTCTTTGTCGAGCACACA
CTTTCTCTCACCGAAGCTCTTTGTGGCTTCTCATTTGTCCTTACCCACTTGGATGGCAGA
AACCTTCTCATCAAATCTAATCCCGGGGAGGTCGTGAAACCTGATTCATACAAGGCCATC
AGCGATAAGGGAATGCCGATATACCGGAGGCCATTCATGAAGGGTAAGCTTTACATCCAC
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GCTCAGCAGTAACCTTAGAGAGAGAGAGACTTTGGTCACATGGTTTTTGGTTCCTTTTCT
TATTTTCATTGTATTAGAGTCTTATGGAGTTTGGTATGGTTTAAGACTTCGCCCACTTCG
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TCCATTTTAAATTTGTAGTAATCTCAAAATATTGGAGGAGT

QA 2 882 2 882
DS 

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GGTGAGACCATCAACGATCGGGATAGGTGTCCACAATGCAAAGGAGACAAGGTCGTCCCC
GAGAAGAAGGTGCTTGAAGTGAACGTGGAGAAAGGAATGCTACACAGTCAGAAGATCACT
TTCGAAGGACAAGCTGATGAAGCGCCTGACACTGTCACTGGGGATATAGTCTTCGTCATT
CAGCAGAAAGAGCATCCAAAGTTCAAAAGAAAGGGAGAAGACCTCTTTGTCGAGCACACA
CTTTCTCTCACCGAAGCTCTTTGTGGCTTCTCATTTGTCCTTACCCACTTGGATGGCAGA
AACCTTCTCATCAAATCTAATCCCGGGGAGGTCGTGAAACCTGATTCATACAAGGCCATC
AGCGATAAGGGAATGCCGATATACCGGAGGCCATTCATGAAGGGTAAGCTTTACATCCAC
TTCACCGTGGAGTTCCCGGACTCGCTGAGCCCTGACCAGACCAAAGCGCTTGAATCTGTT
CTGCCTAAGCCTTCGACTACTCAGCTGAGCGACATGGAGATCGATGAGTGCGAGGAAACT
ACGCTACACGATGTCAACATCGAAGATGAGATGAGAAGGAAAGCGCAAGCTCAAAGGGAG
GCTTATGATGATGAAGACGACGATGATGACCATCCTGGAGGCGCGCAAAGGGTGCAATGT
GCTCAGCAGTAACCTTAGAGAGAGAGAGACTTTGGTCACATGGTTTTTGGTTCCTTTTCT
TATTTTCATTGTATTAGAGTCTTATGGAGTTTGGTATGGTTTAAGACTTCGCCCACTTCG
GTGGAAAACCTACTTGTTTTTCGTTCTCATAAACTGATTCCGTGTTACAATTTTGTATTT
TCCATTTTAAATTTGTAGTAATCTCAAAATATTGGAGGAGTAAAA

QA 1 885 1 885
DS 



AS 1 4

CO CL2644Contig1 792 4 4 U
GGGATTCAGCCCTAGCCTATACGGCTGCTTCCCCCAGATTGCCTCATCTTAATTAGAAAA
AGAACCAAAAAAACCCTAATCACAATCTCTGTCTCAAACCTTCATTTTACAACTCGGAAT
CTCGATCAATATATTTGAAATTCTCCCTTTGTTTTTAGATCTCTTTGTCCATTTGTTTAT
CCGTGTAGACTTGTCCGAAGAAGCCTGTTTGTTATTTTACTGTTGTTTTTTTGTCTGAAT
CGAAAACAAGTTTGGGGAAGAAGATAAGATGGCTGGAGGAGGTGGAAACAGGAGAGACGA
AGGGTCGATTACGATCCAGAGCACCAATTTGTTTGCAGCTTTGGACACTCGCAAGAAGAA
GAAGAAGAACAGTGGTAAGAGCAAAGAAGGTTCCTCCTCTAAGAGCACAAAGCTACAGAA
GGAGCCTGAGCCACAGGTTTTCTGGGCGCCTACGCCTTTGAAAGTTAAGTCTTGGGCTGA
TATCGATGATGACGATGAAGATGATGACTATTACGCCACCACCGCTCCTCCCTCCTCTGG
TTGGGCCACTTCCGAGCCTAAAGACACTCATGTTGAGGAAAGCGAAAGTGAGGAAGATGT
TCTTGATGAAGGTGATGATGATGTGGATGAAGAGCAGGAGCATGAAACAGAGGTACAAGT
TCATCCGGAGCCAGAGCCTGAGGTGAAGAAAGCACCTGAAGCTCCTGCGCCTCCTAAGAG
GCAGAGAGGCAACTGTCCAAGAAGAGAGGAAAAGAGACTTGCTGAGCTTGAGCTTGTTGG
CTGATTTGGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GW81TF U 25
AF RS1CF67TF U 1
AF RS1GX53TF U 32
AF RS1DS71TF U 49
BS 1 637 RS1CF67TF
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BS 649 792 RS1DS71TF

RD RS1GW81TF 489 0 0
GGGCTTCCCCC
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AAACCTTCATTTTACAACTCGGAATCTCGATCAATATATTTGAAATTCTCCCTTTGTTTT
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QA 12 489 12 489
DS 

RD RS1CF67TF 648 0 0
GGGATTCAGCCCTAGCCTATACGGCTGCTTCCCCCAGATTGCCTCATCTTAATTAGAAAA
AGAACCAAAAAAACCCTAATCACAATCTCTGTCTCAAACCTTCATTTTACAACTCGGAAT
CTCGATCAATATATTTGAAATTCTCCCTTTGTTTTTAGATCTCTTTGTCCATTTGTTTAT
CCGTGTAGACTTGTCCGAAGAAGCCTGTTTGTTATTTTACTGTTGTTTTTTTGTCTGAAT
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AGGGTCGATTACGATCCAGAGCACCAATTTGTTTGCAGCTTTGGACACTCGCAAGAAGAA
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GGAGCCTGAGCCACAGGTTTTCTGGGCGCCTACGCCTTTGAAAGTTAAGTCTTGGGCTGA
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TTGGGCCACTTCCGAGCCTAAAGACACTCATGTTGAGGAAAGCGAAAGTGAGGAAGATGT
TCTTGATGAAGGTGATGATGATGTGGATGAAGAGCAG*AGCATGAAAC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1GX53TF 576 0 0
AGGG
AGATTGCCTCATCTTAATTAGAAAAAGAACCAAAAAAACCCTAATCACAATCTCTGTCTC
AAACCTTCATTTTACAACTCGGAATCTCGATCAATATATTTGAAATTCTCCCTTTGTTTT
TAGATCTCTTTGTCCATTT*TTTATCCGTGTAGACTTGTCCGAAGAAGCCTGTTTGTTAT
TTTACTGTTGTTTTTTTGTCTGAATCGAAAACAAGTTTGGGGAAGAAGATAAGATGGCTG
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CAGCTTTGGACACTCGCAAGAAGAAGAAGAAGAACAGTGGTAAGAGCAAAGAAGGTTCCT
CCTCTAAGAGCACAAAGCTACAGAAGGAGCCTGAGCCACAGGTTTTCTGGGCGCCTACGC
CTTTGAAAGTTAAGTCTTGGGCTGATATCGATGATGACGATGAAGATGATGACTATTACG
CCACCACCGCTCCTCCCTCCTCTGGTTGGGCCACTTCCGAGCCTAAAGACACTCATGTTG
AGGAAAGCGAAAGTGAGGAAGATGTTCTTGAT

QA 5 576 5 576
DS 

RD RS1DS71TF 744 0 0
GG
AATTAGAAAAAGAACCAAAAAAACTCTAATCACAATCTCTGTCT*AAACCTTCATTTTAC
AACTCGGAATCTCGATCAATATATTTGAAATTCTCCCTTTGTTTTTAGATCTCTTTGTCC
ATTTGTTTATCCGTGTAGACTTGTCCGAAGAAGCCTGTTTGTTATTTTACTGTTGTTTTT
TTGTCTGAATCGAAAACAAGTTTGTGGAAGAAGATAAGATGGCTGGAGGAGGTGGAAACA
GGAGAGACGAAGGGTCGATTACGATCCAGAGCACCGATTTGTTTGCAGCTTTGGACACTC
GCAAGAAGAAGAAGAAGAACAGTGGTAAGAGCAAAGAAGGTTCCTCCTCTAAGAGCACAA
AGCTACAGAAGGAGCCTGAGCCACAGGTTTTCTGGGCGCCTACGCCTTTGAAAGTTAAGT
CTTGGGCTGATATCGATGATGACGATGAAGATGATGACTATTACGCCACCACCGCTCCTC
CCTCCTCTGGTTGGGCCACTTCCGAGCCTAAAGACACTCATGTTGAGGAAAGCGAAAGTG
AGGAAGATGTTCTTGATGAAGGTGATGATGATGTGGATGAAGAGCAGGAGCATGAAACAG
AGGTACAAGTTCATCCGGAGCCAGAGCCTGAGGTGAAGAAAGCACCTGAAGCTCCTGCGC
CTCCTAAGAGGCAGAGAGGCAACTGTCCAAGAAGAGAGGAAAAGAGACTTGCTGAGCTTG
AGCTTGTTGGCTGATTTGGAGT

QA 3 744 3 744
DS 



AS 1 4

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AAAAGACAATAACACATTCATACACAATTTTAAACGAAAACACAACCTTCAGAAAGTGAT
AAAAACAAAATGTATTAAAATGACATTGCCGAACCAAATTACACTAAAATGCTATGTAAA
GAAGTCTGAATGTTTTTTGCTCATTTTCTTTGTTGTTCTCTTTTTAAAAGGCTGAACATT
AGTGTAAACCCCAGATTAATCGAGAGGTAACTCTGTAAAACATGGAGGAGAGAGTACACA
ATTGATTGAGCAGAGGTTGATCTCAACTCAAGGATGAAACAGTAGTGGCTGCATCTACCT
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CCTTCCGAAACTCATCGTAATGTACTCTTCTAAGTTCGTTGAAACGTGCGTTTTTCTCAT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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BQ
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TAGTGATCAACATCTGTAATGGGAAGGCCACGGAGAGCGCGTTCGACGTTGAGAGCGGAG
ATTAAAGATGGACTCTCTTTCGGCGCTTCATCGACGGCAGTAGTGCTAGATCCTCCACCG
TCGGTTTCTCCGTCCGTCGACGTCTCACCGGAACTCCTTGCCGGCGAACAGATAATCCGT
T

QA 1 721 1 721
DS 

RD RS1DN71JQ 742 0 0
GCATAAACATACGTTTATTACAATCACGTAGCTTGAACATTTGTCAGATAATTAATACAC
TTAAGTATATAATCGACTACTAAAAATATACATTTTCTCGAAATGATTTAATTTAAGGTG
AGGAAGAAGATGGTGAAAGAAACGAAAGTGGCTAACGATTGAATGCAACAGAAAGGACGA
CACCAAGGACAAGCCACGCTCCAATGAAGTATCCAAGAATCCTCGTTGGTCCTACATCTT
CTGGTTCCTGAGGAGGAGGCTCTTCCCTGGAGGGTTCCATGATGTCAACTTCGAACGGCC
AAATGTACCGCTCTGCTTTTTCGCTTCTGGCTAGACTCCAATCGTACATCCTTCTCTCTT
CCACCGACGACAAGATCGTATATGAATCTTTGACAAGCTCCATCTTGTTCTTGAGCTGTT
CTTCGTCTAGCCCTTGTCCCATTAGCTCCTTAACTCTATCTTGGTAACCAAGTCTTACCT
GATCATACGAACAGTTTCTGGGAAGTCCAAGCCGACCGTAGTGATCAACATCTGTAATGG
GAAGGCCACGGAGAGCGCGTTCGACGTTGAGAGCGGAGATTAAAGATGGACTCTCTTTCG
GCGCTTCATCGACGGCAGTAGTGCTAGATCCTCCACCGTCGGTTTCTCCGTCCGTCGACG
TCTCACCGGAACTCCTTGCCGGCGAACAGATAATCCGTTTCGTGGTTGTTGGCTTCCGCG
GGAAAGAGCACGTGCTTGGTAC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RS1DN71TF 597 0 0
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CGGCCAAATGTACCGCTCTGCTTTTTCGCTTCTGGCTAGACTCCAATCGTACATCCTTCT
CTCTTCCACCGACGACAAGATCGTATATGAATCTTTGACAAGCTCCATCTTGTTCTTGAG
CTGTTCTTCGTCTAGCCCTTGTCCCATTAGCTCCTTAACTCTATCTTGGTAACCAAGTCT
TACCTGATCATACGAACAGTTTCTGGGAAGTCCAAGCCGACCGTAGTGATCAACATCTGT
AATGGGAAGGCCACGGAGAGCGCGTTCGACGTTGAGAGCGGAGATTAAAGATGGACTCTC
TTTCGGCGCTTCATCGACGGCAGTAGTGCTAGATCCTCCACCGTCGGTTTCTCCGTCCGT
CGACGTCTCACCGGAACTCCTTGCCGGCGAACAGATAATCCGTTTCGTGGTTGTTGGCTT
CCGCGGGAAAGAGCACGTGCTTGGTACTAGTACGTGATGATGGGGGACGGATTCGCCGGG
AATGTGTACTAACGACGGCTGAGTCATCGGAGATAAGGAAGCCATGGCGCTCAAAAA

QA 1 597 1 597
DS 

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GAGGAGGAGGCTCTTCCCTGGAGGGTTCCATGATGTCAACCTCGAACGGCCAAATGTACC
GCTCTGCTTTTTCGCTTCTGGCTAGACTCCAATCGTACATCCTTCTCTCTTCCACCGACG
ACAGGATCGTATATGAATCTTTGACAAGCTCCATCTTGTTCTTGAGCTGTTCTTCGTCTA
GCCCTTGTCCCATTAGCTCCTTAACTCTATCTTGGTAACCAAGTCTTACCTGATCATACG
AACAGTTTCTGGGAAGTCCAAGCCGACCGTAGTGATCAACATCTGTAATGGGAAGGCCAC
GGAGAGCGCGTTCGACGTTGAGAGCGGAGATTAAAGATGGACTCTCTTTCGGCGCTTCAT
CGACGGCAGTAGTGCTAGATCCTCCACCGTCGGTTTCTCCGTCCGTCGACGTCTCACCGG
AACTCCTTGCCGGCGAACAGATAATCCGTTTCGTGGTTGTTGGCTTCCGCGGGAAAGAGC
ACGTGCTTGGTACTAGTACGTGATGATGGGGGACGGATTCGCCGGGAATGTGTACTAACG
ACGGCTGAGTCATCGGAGATAAGGAAGCCATGGCGCTCAAAAA

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 4

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CAGGATTACACATAAAAATTCATCATTTCTTTATTTGCCCTAATCTCTTCTCCTAAACCA
TTCCGACCAAAAAAAAGGAGTTGAGACAAAAAAAA*GCTCAACCACAAGAAAGAGCCATG
AGAAGCTCTGCTGCTCGTTCCTCTTCACCCAGCTTCATCCATACCCTCTTCTTCTCCACC
ACCGATCTCCTCATCACCGGCACTTTAAATCCCAAATCCAAAAATCTACCACCC*TTTTC
ACACTCTTCTTGTCATTACAATCCTCACTCTCCGTCTTCTTGATCTTGTTCTTGACGCTT
CCTGAATCGCCTTTTCCGTTTTTGACGGTCTGATTGTCGGGAGCGAGACAGCTATCGTTA
CTTTTGTTGTTCTTCATCTTATTATCCTCTTGTTTAATCCCAAGAGCTGCTTGTCTCTTC
TTCCTGCTCTTGATCCCACACGCATTGCACAATGATTTAGGACCAGCAGGGCCACCACGC
CAGAGAGGAGTCTTGTTCGTTCCGCAATCAACGCAAGTCTTCTTAGTATCGCCTCCTCCT
CCTCCTCCGCTACTGCTACAGTTCCCGTTCTCGACATCCGAAGAGTCTCCCGCCGATTCG
AGCTTCGTCGTCTTACTCTCTTCCGTCATTGACATATTGATCGACTTGGAGCTTAAGCTG
AAAGTATCAACCAGAAGCAGAAACAACAGAGACGAATCAGAAAGCTCTTCTTGTGAAGCA
GAGAGTGTGTGTGATGATGATAAGTGAGAGAGAGAGAGTGTAGAGACGGCGGAGAGGAGT
CT


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1CZ57JQ U 1
AF RS1BH37JQ U 4
AF RS1BH37TF C 129
AF RS1CZ57TF C 379
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RD RS1CZ57JQ 370 0 0
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ACACTCTTCTTGTCATTACAATCCTCACTCTCCGTCTTCTTGATCTTGTTCTTGACGCTT
CCTGAATCGC

QA 1 370 1 370
DS 

RD RS1BH37JQ 707 0 0
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CGACCAAAAAAAAGGAGTTGAGACAAAAAAAAAGCTCAACCACAAGAAAGAGCCATGAGA
AGCTCTGCTGCTCGTTCCTCTTCACCCAGCTTCATCCATACCCTCTTCTTCTCCACCACC
GATCTCCTCATCACCGGCACTTTAAATCCCAAATCCAAAAATCTACCACCC*TTTTCACA
CTCTTCTTGTCATTACAATCCTCACTCTCCGTCTTCTTGATCTTGTTCTTGACGCTTCCT
GAATCGCCTTTTCCGTTTTTGACGGTCTGATTGTCGGGAGCGAGACAGCTATCGTTACTT
TTGTTGTTCTTCATCTTATTATCCTCTTGTTTAATCCCAAGAGCTGCTTGTCTCTTCTTC
CTGCTCTTGATCCCACACGCATTGCACAATGATTTAGGACCAGCAGGGCCACCACGCCAG
AGAGGAGTCTTGTTCGTTCCGCAATCAACGCAAGTCTTCTTAGTATCGCCTCCTCCTCCT
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TTCGTCGTCTTACTCTCTTCCGTCATTGACATATTGATCGACTTGGA

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1BH37TF 714 0 0
C
AAAAAAAGGAGTTGAGACAAAAAAAA*GCTCAACCACAAGAAAGAGCCATGAGAAGCTCT
GCTGCTCGTTCCTCTTCACCCAGCTTCATCCATACCCTCTTCTTCTCCACCACCGATCTC
CTCATCACCGGCACTTTAAATCCCAAATCCAAAAATCTACCACCC*TTTTCACACTCTTC
TTGTCATTACAATCCTCACTCTCCGTCTTCTTGATCTTGTTCTTGACGCTTCCTGAATCG
CCTTTTCCGTTTTTGACGGTCTGATTGTCGGGAGCGAGACAGCTATCGTTACTTTTGTTG
TTCTTCATCTTATTATCCTCTTGTTTAATCCCAAGAGCTGCTTGTCTCTTCTTCCTGCTC
TTGATCCCACACGCATTGCACAATGATTTAGGACCAGCAGGGCCACCACGCCAGAGAGGA
GTCTTGTTCGTTCCGCAATCAACGCAAGTCTTCTTAGTATCGCCTCCTCCTCCTCCTCCG
CTACTGCTACAGTTCCCGTTCTCGACATCCGAAGAGTCTCCCGCCGATTCGAGCTTCGTC
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QA 2 714 2 714
DS 

RD RS1CZ57TF 464 0 0
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TTATTATCCTCTTGTTTAATCCCAAGAGCTGCTTGTCTCTTCTTCCTGCTCTTGATCCCA
CACGCATTGCACAATGATTTAGGACCAGCAGGGCCACCACGCCAGAGAGGAGTCTTGTTC
GTTCCGCAATCAACGCAAGTCTTCTTAGTATCGCCTCCTCCTCCTCCTCCGCTACTGCTA
CAGTTCCCGTTCTCGACATCCGAAGAGTCTCCCGCCGATTCGAGCTTCGTCGTCTTACTC
TCTTCCGTCATTGACATATTGATCGACTTGGAGCTTAAGCTGAAAGTATCAACCAGAAGC
AGAAACAACAGAGACGAATCGGAAAGCTCTTCTTGTGAAGCAGAGAGTGTGTGTGATGAT
GATAAGTGAGAGAGAGAGAGTGTAGAGACGGCGGAGAGGAGTC
C

QA 1 463 1 463
DS 



AS 1 4

CO CL2648Contig1 472 4 4 U
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AATGTGATAACAAACTTTGCTATGTTTCGCTTAATAAAAAAAACATCTCTCT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C703JQ C 1
AF RS1GE17JQ C 1
AF RS1GE17TF U 1
AF RS1C703TF U 1
BS 1 285 RS1GE17TF
BS 286 286 RS1C703TF
BS 287 462 RS1GE17TF
BS 463 472 RS1C703JQ

RD RS1C703JQ 472 0 0
GGATATTCAGATAGACAAACTCAACGACTCATTTTCAATTGTCTTATCAAAATGTGGATC
AACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGTGTGCATGGCCGTGTTCAGTACAGCTCAAACG
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ATTCCCGACTGCATCCCAGAGATATTGAGATCGATAATAAGTGGACAAATCGGGAGTATT
GGACATTCTTGCTGCCATGCCTTTTTGGGTGTCAGTACCGAATGTACCACTCATGTGTTT
GTCTTCGCTCCCTTCTTCCCTCCGACTCTAAGGGATCACTGTTCCCGACAACATTAGTGC
CAAACTCCTTTGGAAGGGGTTTCTTATTATCAGTCTACATGTTCTAAGGCCATACATACT
AATGTGATAACAAACTTTGCTATGTTTCGCTTAATAAAAAAAACATCTCTCT

QA 1 472 1 472
DS 

RD RS1GE17JQ 471 0 0
GGATATTCAGATAGACAAACTCAACGACTCATTTTCAATTGTCTTATCAAAATGTGGATC
AACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGTGTGCATGGCCGTGTTCAGTACAGCTCAAACG
GTTCCTTCGCAACCCCCAGCTACACAGGGCCCATCAGATTGTTTGTCATCGCTGGAAGAT
ATTCCCGACTGCATCCCAGAGATATTGAGATCGATAATAAGTGGACAAATCGGGAGTATT
GGACATTCTTGCTGCCATGCCTTTTTGGGTATCAGTACCGAATGTGCCACTCATGTGTTT
GTCTTCGCTCCCTTCTTCCCTCCGACTCTAAGGGATCACTGTTCCCGACAACATTAGTGC
CAAACTCCTTTGGAAGGGGTTTCTTATTATCAGTCTACATGTTCTAAGGCCATACATACT
AATGTGATAACAAACTTTGCTATGTTTCGCTTAATAAAAAAA
CATCTCTCC

QA 1 462 1 462
DS 

RD RS1GE17TF 471 0 0
GGATATTCAGATAGACAAACTCAACGACTCATTTTCAATTGTCTTATCAAAATGTGGATC
AACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGTGTGCATGGCCGTGTTCAGTACAGCTCAAACG
GTTCCTTCGCAACCCCCAGCTACACAGGGCCCATCAGATTGTTTGTCATCGCTGGAAGAT
ATTCCCGACTGCATCCCAGAGATATTGAGATCGATAATAAGTGGACAAATCGGGAGTATT
GGACATTCTTGCTGCCATGCCTTTTTGGGTATCAGTACCGAATGTGCCACTCATGTGTTT
GTCTTCGCTCCCTTCTTCCCTCCGACTCTAAGGGATCACTGTTCCCGACAACATTAGTGC
CAAACTCCTTTGGAAGGGGTTTCTTATTATCAGTCTACATGTTCTAAGGCCATACATACT
AATGTGATAACAAACTTTGCTATGTTTCGCTTAATAAAAAAA
CATCTCTCC

QA 1 462 1 462
DS 

RD RS1C703TF 472 0 0
GGATATTCAGATAGACAAACTCAACGACTCATTTTCAATTGTCTTATCAAAATGTGGATC
AACAAGTTTTTCTTCCTTCTTCCAGTTGTGTGCATGGCCGTGTTCAGTACAGCTCAAACG
GTTCCTTCGCAACCTCCAGCTACACAGGGCCCATCAGATTGTTTGTCATCGCTGGAAGAT
ATTCCCGACTGCATCCCAGAGATATTGAGATCGATAATAAGTGGACAAATCGGGAGTATT
GGACATTCTTGCTGCCATGCCTTTTTGGGTGTCAGTACCGAATGTACCACTCATGTGTTT
GTCTTCGCTCCCTTCTTCCCTCCGACTCTAAGGGATCACTGTTCCCGACAACATTAGTGC
CAAACTCCTTTGGAAGGGGTTTCTTATTATCAGTCTACATGTTCTAAGGCCATACATACT
AATGTGATAACAAACTTTGCTATGTTTCGCTTAATAAAAAAA
ACATCTCTCT

QA 1 462 1 462
DS 



AS 1 4

CO CL2649Contig1 646 4 18 U
AGGGGACATCCAACAGCAAAACACAAGCTTAAAAACACAAAGCAACTAAGTCTCCTTCTT
ATCTTCTTCTCACAAAAAAAAAAGCAAAAGACAATGGCTTCGGCTCTGAAGTTCTTCACA
TGCCTTGTTTTAACGGTGTGCATAGTTGCATCAGTTGATGCAGCAATCTCATGTGGCACA
GTGGGGAGTAGCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAACGGCGGGGCGGTGCCAGCT
CCATGCTGCGCAGGAGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCTAAAACCACACCAGACCGCCAA
CAAGCATGTAAATGCCTAAAGGCCGCTGCAAAGGGCATCAATCCAAGTCTAGCCTCTAGC
CTTCCTGGAAAGTGCCGTGTTAGCATTCCCTATCCCATCTCCATGAACACTAACTGCGAC
ACCGTCAAGTGAAGTGGGAACTCATATATAATCGTGAAGATGAACAGTATGGTCTAGCAT
AAATAAAAGAGGGTCTATCTACGTTGACCTCAGCGTGTCCTAGTTTGTCTGGTTTTTATT
TGGTCGTTGAAAAGTTTGCCATGTTACTTTGTAATCTTTTGCTTCTTATTGTGTCTTAGT
TATGTTTAAGATATGATAATATTACCTTATTAATCATCTTCTCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BN76JQ C 1
AF RS1BN76TF U 61
AF RS1BL04TF U 15
AF RS1BL04JQ C 56
BS 1 14 RS1BN76JQ
BS 15 31 RS1BL04TF
BS 32 32 RS1BN76JQ
BS 33 66 RS1BL04TF
BS 67 73 RS1BN76TF
BS 74 74 RS1BL04TF
BS 75 179 RS1BN76TF
BS 180 180 RS1BL04TF
BS 181 251 RS1BN76TF
BS 252 252 RS1BL04TF
BS 253 290 RS1BN76TF
BS 291 291 RS1BL04TF
BS 292 296 RS1BN76TF
BS 297 297 RS1BL04TF
BS 298 624 RS1BN76TF
BS 625 625 RS1BL04TF
BS 626 635 RS1BN76TF
BS 636 646 RS1BL04TF

RD RS1BN76JQ 635 0 0
AGGGGACATCCAACAGCAAAACACAAGCTTAAAGACACAAAGCAACTAAGTCTCCTTCTT
ATCTTCTTCTCACCAAAAAAAAAGCAAAAGACAATGGCTTCGGCTCTGAAGTTCTTCACA
TGCCTTGTTTTAACGGTGTGCATAGTTGCATCAGTTGATGCAGCAATCTCATGTGGCACG
GTGGGGAGTAGCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAACGGCGGGGCGGTGCCAGCT
CCATGCTGCGCCGGAGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCTAAAACCACACCGGACCGTCAA
CAAGCATGTAAATGCCTAAAGGCCGCTGCAAAGGGCATCAATCCAAGTCTAGCCTCTAGC
CTTCCTGGAAAGTGCCGTGTTAGCATTCCCTATCCCATCTCCATGAACACTAACTGCGAC
ACCGTCAAGTGAAGTGGGAACTCATATATAATCGTGAAGATGAACAGTATGGTCTAGCAT
AAATAAAAGAGGGTCTATCTACGTTGACCTCAGCGTGTCCTAGTTTGTCTGGTTTTTATT
TGGTCGTTGAAAAGTTTGCCATGTTACTTTGTAATCTTTTGCTTCTTATTGTGTCTTAGT
TATGTTTAAGATATGATAATATTATCTTATTAATC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1BN76TF 575 0 0
ATCTTC
TTCTCACCAAAAAAAAAGCAAAAGACAATGGCTTCGGCTCTGAAGTTCTTCACATGCCTT
GTTTTAACGGTGTGCATAGTTGCATCAGTTGATGCAGCAATCTCATGTGGCACGGTGGGG
AGTAGCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAACGGCGGGGCGGTGCCAGCTCCATGC
TGCGCCGGAGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCTAAAACCACACCGGACCGTCAACAAGCA
TGTAAATGCCTAAAGGCCGCTGCAAAGGGCATCAATCCAAGTCTAGCCTCTAGCCTTCCT
GGAAAGTGCCGTGTTAGCATTCCCTATCCCATCTCCATGAACACTAACTGCGACACCGTC
AAGTGAAGTGGGAACTCATATATAATCGTGAAGATGAACAGTATGGTCTAGCATAAATAA
AAGAGGGTCTATCTACGTTGACCTCAGCGTGTCCTAGTTTGTCTGGTTTTTATTTGGTCG
TTGAAAAGTTTGCCATGTTACTTTGTAATCTTTTGCTTCTTATTGTGTCTTAGTTATGTT
TAAGATATGATAATATTATCTTATTAATC

QA 7 575 7 575
DS 

RD RS1BL04TF 632 0 0
AGCAAAACACAAGCTTAGAAACACAAAGCAACTAAGTCTCCTTCTTATCTTCTTCTCACA
AAAAAGAAAGCAAAAGACAATGGCTTCGGCTCTGAAGTTCTTCACATGCCTTGTTTTGAC
GGTGTGCATAGTTGCATCAGTTGATGCAGCAATCTCCTGTGGCACAGTGGGGAGTAGCTT
GGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAACGGCGGGGCGGTGCCAGCTCCATGCTGCGCAGG
AGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCTAAAACCACACCAGACCGCCAACAAGCATGTAAATG
CCTAAAGGCCGCTGCAAAGGGCATCAATCCAAGTCTAGCCTCTAGCCTTCCTGGAAAGTG
CCGTGTTAGCATTCCCTATCCCATCTCCATGAACACTAACTGCGACACCGTCAAGTGAAG
TGGGAACTCATATATAATCGTGAAGATGAACAGTATGGTCTAGCATAAATAAAAGAGGGT
CTATCTACGTTGACCTCAGCGTGTCCTAGTTTGTCTGGTTTTTATTTGGTCGTTGAAAAG
TTTGCCATGTTACTTTGTGATCTTTTGCTTCTTATTGTGTCTTAGTTATGTTTAAGATAT
GATAATATTACCTTATTAATCATCTTCTCTCT

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1BL04JQ 585 0 0
TTTTTATTTTT
TTCTCACAAAAAAGAAAGCAAAAGACAATGGCTTCGGCTTTGAAGTTCTTCACATGCCTT
GTTTTGACGGTGTGCATAGTTGCATCAGTTGATGCAGCAATTTCCTGTGGCACAGTGGGG
AGTAGCTTGGCTCCATGTGCCGGCTACCTAGTGAACGGCGGGGCGGTGCCAGCTCCATGC
TGCGCAGGAGTTTCAAAATTGAACAGTATGGCTAAAACCACACCAGACCGCCAACAAGCA
TGTAAATGCCTAAAGGCCGCTGCAAAGGGCATCAATCCAAGTTTAGCCTCTAGCCTTCCT
GGAAAGTGCCGTGTTAGCATTCCCTATCCCATCTCCATGAACACTAACTGGGACACCGTC
AAGTGAAGTGGGAACTCATATATAATCGTGAAGATGAACAGTATGGTCTAGCATAAATAA
AAGAGGGTCTATTTACGTTGACCTCAGCGTGTCCTAGTTTGTTTGGTTTTTATTTGGTCG
TTGAAAAGTTTGCCATGTTACTTTGTGATCTTTTGCTTCTTATTGTGTTTTAGTTATGTT
TAAGATATGATAATATTACCTTATTAATC
ATTTT

QA 12 580 12 580
DS 



AS 1 2

CO CL2650Contig1 774 2 7 U
GAACTCTACTGTGGCCATTGCAGCTGAGGTTTTCAAGAAAGCTGGAACTTATGATCCTAA
GAAGCTCCTTGGAGTTACTACACTCGATGTTGCTCGTGCCAACACATTTGTGGCTGAAGT
TCTTGGACTTGATCCGAGAGAAGTCGATGTACCAGTCGTTGGTGGACACGCGGGAGTCAC
AATCTTGCCACTGTTGTCACAGGTGAAACCTCCTAGTAGTTTTACACCTTCAGAAATAGA
GTACCTCACGAACCGGATTCAAAACGGTGGAACTGAAGTTGTGGAGGCAAAAGCTGGAGC
TGGATCAGCAACACTTTCAATGGCATATGCTGCAGCCAAGTTTGCAGATGCTTGCCTTCG
AGGGTTAAGAGGAGATGCCAATGTCGTTGAATGCTCTTTTGTAGCTTCACAGGTAACAGA
GTTACCTTTCTTTGCAACCAAAGTGCGTCTTGGACGTACAGGAGCAGAGGAAGTGTATCA
GCTTGGCCCCTTGAACGAATACGAAAGGGTTGGTCTGGAGAAAGCAAAAGAAGAATTAGC
AGGGAGTATTCAAAAAGGTGTCGACTTCATCAGGAGGAAATGATAGTTGGGAATATATCA
AATCAATGAGACAGACAATATAAAAGATGGTCTTTTTGAAATCCTATATATGATCATGTA
CTATACTTACTCATCATGTCCTTTGTGCCTCTTCTACAGCTTTGTAAATTTCCTTTTTAT
CAGTTTGTGTAACTCTGTGGCTTCCTCTTAAACGTACTTTTCTATGGGTTTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GZ11TF U 95
AF RS1AW14JQ C 1
BS 1 95 RS1AW14JQ
BS 96 154 RS1GZ11TF
BS 155 155 RS1AW14JQ
BS 156 414 RS1GZ11TF
BS 415 415 RS1AW14JQ
BS 416 529 RS1GZ11TF
BS 530 774 RS1AW14JQ

RD RS1GZ11TF 435 0 0
G
GTGCCAACACATTTGTGGCTGAAGTTCTTGGACTTGATCCGAGAGAAGTCGATGTACCAT
TCGTTGGTGGACACGCGGGAGTCACAATCTTGCCACTGTTGTCACAGGTGAAACCTCCTA
GTAGTTTTACACCTTCAGAAATAGAGTACCTCACGAACCGGATTCAAAACGGTGGAACTG
AAGTTGTGGAGGCAAAAGCTGGAGCTGGATCAGCAACACTTTCAATGGCATATGCTGCAG
CCAAGTTTGCAGATGCTTGCCTTCGAGGGTTAAGAGGAGATGCCAATGTCGTTGAATGCT
CTTTTGTAGCTTCACAGGTGACAGAGTTACCTTTCTTTGCAACCAAAGTGCGTCTTGGAC
GTACAGGAGCAGAGGAAGTGTATCAGCTTGGCCCCTTGAACGAATACGAAAGGGTTGGTC
TGGAGAAAGCAAAA

QA 2 435 2 435
DS 

RD RS1AW14JQ 774 0 0
GAACTCTACTGTGGCCATTGCAGCTGAGGTTTTCAAGAAAGCTGGAACTTATGATCCTAA
GAAGCTCCTTGGAGTTACTACACTCGATGTTGCTCGTGCCAACACATTTGTGGCTGAAGT
TCTTGGACTTGATCCGAGAGAAGTCGATGTACCAGTCGTTGGTGGACACGCGGGAGTCAC
AATCTTGCCACTGTTGTCACAGGTGAAACCTCCTAGTAGTTTTACACCTTCAGAAATAGA
GTACCTCACGAACCGGATTCAAAACGGTGGAACTGAAGTTGTGGAGGCAAAAGCTGGAGC
TGGATCAGCAACACTTTCAATGGCATATGCTGCAGCCAAGTTTGCAGATGCTTGCCTTCG
AGGGTTAAGAGGAGATGCCAATGTCGTTGAATGCTCTTTTGTAGCTTCACAGGTAACAGA
GTTACCTTTCTTTGCAACCAAAGTGCGTCTTGGACGTACAGGAGCAGAGGAAGTGTATCA
GCTTGGCCCCTTGAACGAATACGAAAGGGTTGGTCTGGAGAAAGCAAAAGAAGAATTAGC
AGGGAGTATTCAAAAAGGTGTCGACTTCATCAGGAGGAAATGATAGTTGGGAATATATCA
AATCAATGAGACAGACAATATAAAAGATGGTCTTTTTGAAATCCTATATATGATCATGTA
CTATACTTACTCATCATGTCCTTTGTGCCTCTTCTACAGCTTTGTAAATTTCCTTTTTAT
CAGTTTGTGTAACTCTGTGGCTTCCTCTTAAACGTACTTTTCTATGGGTTTTTG

QA 1 774 1 774
DS 



AS 2 4

CO CL2651Contig1 719 2 1 U
ACAGAAAATATATATTATATAGCTTATAAGATGGAACAAAATTTTACAAAGGAAAAAAAA
GAAAGAGAAAAGCTAAAACAACATTTTATGCTGGGGCTTTCAAATATTTTCACCCTTATA
TTTACAAACACACATATGTGAATGTTATTTGTTGCATAAACAAAAAAGTTTTTCTTCTTC
TTTTTTTTTTTCTCCTTGCTTTTTTTAGTACTTATCTAAACAATACAAAACTCTTCATCT
TTTTGGTTCCTCCTCTGTCTCGCAATGAAAGACTCGATCTTGTACCTGAGTTCCTCATCA
AAAACCTCAGCAGGTCTCTCAGTCTCCGATCTCTTCGATCTTCCACAACAAGAACTCTTC
TTCGAGCCCTCGAGCTTCTCGCACCCACTCCTTTCGTAACTCCTCCTCGGGCTTTCCTGT
TTTTGGGTGATGACTTGTTTGTGTCTCTTTACACTTATGTCCTTCTTGTCAGTACTCTGT
TTCTCTCTGTTATCTTCAGTACTCTGTTTTGCCCTGTTCTTCTCCAACATGCTCTGTTTT
GATATGTCTTCTTCGCTGCTCTGTTTTTCTCTGCATGTCACATCTGCATGTAAACTCTGC
TCTCTTCTCGAGCTCTCCTCCTGAACAAACTCGTCGTAAAAATCATTGCTGTTTCTCCGT
GCGTCTGGTTCTTGATTCGCAAAGAGACCGCACTTGGCGACTACAGCGATGACTATCGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1FM53JQ U 1
AF RS1GX29JQ U 1
BS 1 719 RS1FM53JQ

RD RS1FM53JQ 719 0 0
ACAGAAAATATATATTATATAGCTTATAAGATGGAACAAAATTTTACAAAGGAAAAAAAA
GAAAGAGAAAAGCTAAAACAACATTTTATGCTGGGGCTTTCAAATATTTTCACCCTTATA
TTTACAAACACACATATGTGAATGTTATTTGTTGCATAAACAAAAAAGTTTTTCTTCTTC
TTTTTTTTTTTCTCCTTGCTTTTTTTAGTACTTATCTAAACAATACAAAACTCTTCATCT
TTTTGGTTCCTCCTCTGTCTCGCAATGAAAGACTCGATCTTGTACCTGAGTTCCTCATCA
AAAACCTCAGCAGGTCTCTCAGTCTCCGATCTCTTCGATCTTCCACAACAAGAACTCTTC
TTCGAGCCCTCGAGCTTCTCGCACCCACTCCTTTCGTAACTCCTCCTCGGGCTTTCCTGT
TTTTGGGTGATGACTTGTTTGTGTCTCTTTACACTTATGTCCTTCTTGTCAGTACTCTGT
TTCTCTCTGTTATCTTCAGTACTCTGTTTTGCCCTGTTCTTCTCCAACATGCTCTGTTTT
GATATGTCTTCTTCGCTGCTCTGTTTTTCTCTGCATGTCACATCTGCATGTAAACTCTGC
TCTCTTCTCGAGCTCTCCTCCTGAACAAACTCGTCGTAAAAATCATTGCTGTTTCTCCGT
GCGTCTGGTTCTTGATTCGCAAAGAGACCGCACTTGGCGACTACAGCGATGACTATCGC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RS1GX29JQ 708 0 0
ACAGAAAATATATATTATATAGCTTATAAGATGGAACAAAATTTTACAAAGGAAAAAAAA
GAAAGAGAAAAGCTAAAACAACATTTTATGCTGGGGCTTTCAAATATTTTCACCCTTATA
TTTACAAACACACATATGTGAATGTTATTTGTTGCATAAACAAAAAAGTTTTTCTTCTTC
TTTTTTTTTTTCTCCTTGCTTTTTTTAGTACTTATCTAAACAATACAAAACTCTTCATCT
TTTTGGTTCCTCCTCTGTCTCGCAATGAAAGACTCGATCTTGTACCTGAGTTCCTCATCA
AAAACCTCAGCAGGTCTCTCAGTCTCCGATCTCTTCGATCTTCCACAACAAGAACTCTTC
TTCGAGCCCTCGAGCTTCTCGCACCCACTCCTTTCGTAACTCCTCCTCGGGCTTTCCTGT
TTTTGGGTGATGACTTGTTTGTGTCTCTTTACACTTATGTCCTTCTTGTCAGTACTCTGT
TTCTCTCTGTTATCTTCAGTACTCTGTTTTGCCCTGTTCTTCTCCAACATGCTCTGTTTT
GATATGTCTTCTTCGCTGCTCTGTTTTTCTCTGCATGTCACATCTGCATGTAAACTCTGC
TCTCTTCTCGAGCTCTCCTCCTGAACAAACTCGTCGTAAAAATCATTGCTGTTTCTCCGT
GCGTCTGGTTCTTGATTCGCAAAGAGACCGCACTTGGCGACTACAGCG

QA 1 708 1 708
DS 



CO CL2651Contig2 779 2 1 U
GGAAGCTAAAACTCAAAACAAAGAAGCAAAGCGAGAAAAAAAAACCTCAGTCTCTCCTTT
TTTTTTTTCTCCTACCATAAACTGAATATCAACTCTCCTTTTTTTTGCTCTACAACATAT
AATTTGTAAGCCAATCATTTCCTCTTCAAGGCCGATGGATTCGTCTAGAACCCAAAAGAC
TAAACCGAGAAAGATGAAGGCTGTTGTGAAGAAGTCTCGAGTCCAAAAACTCTTGGATTT
GTTTTACCGAGTGGTCGAGATAACTGTAGTTATGGTTACAGTGGCCAAGCTCTGTTACCA
ACTAGCCATCATGTTCGAGGACTCTGGTCTCACACGTTTTTTCATCAACCGTCACCTTGC
TTTCCTCTTGGGGAACGCGATAGTCATCGCTGTAGTCGCCAAGTGCGGTCTCTTTGCGAA
TCAAGAACCAGACGCACGGAGAAACAGCAATGATTTTTACGACGAGTTTGTTCAGGAGGA
GAGCTCGAGAAGAGAGCAGAGTTTACATGCAGATGTGACATGCAGAGAAAAACAGAGCAG
CGAAGAAGACATATCAAAACAGAGCATGTTGGAGAAGAACAGGGCAAAACAGAGTACTGA
AGATAACAGAGAGAAACAGAGTACTGACAAGAAGGACATAAGTGTAAAGAGACACAAACA
AGTCATCACCCAAAACAGGAAAGCCCGAGGAGGAGTACGAAGGAGTGGGTGCGAGAAGCT
CGAGGGCTCGAGAGAGTTCTTGTTGTGGAGATCGAGAGATCGGAGACTGAGAGACTGCT


BQ
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AF RS1GX29TF U 1
AF RS1FM53TF U 1
BS 1 779 RS1FM53TF

RD RS1GX29TF 576 0 0
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TTTTTTTTCTCCTACCATAAACTGAATATCAACTCTCCTTTTTTTTGCTCTACAACATAT
AATTTGTAAGCCAATCATTTCCTCTTCAAGGCCGATGGATTCGTCTAGAACCCAAAAGAC
TAAACCGAGAAAGATGAAGGCTGTTGTGAAGAAGTCTCGAGTCCAAAAACTCTTGGATTT
GTTTTACCGAGTGGTCGAGATAACTGTAGTTATGGTTACAGTGGCCAAGCTCTGTTACCA
ACTAGCCATCATGTTCGAGGACTCTGGTCTCACACGTTTTTTCATCAACCGTCACCTTGC
TTTCCTCTTGGGGAACGCGATAGTCATCGCTGTAGTCGCCAAGTGCGGTCTCTTTGCGAA
TCAAGAACCAGACGCACGGAGAAACAGCAATGATTTTTACGACGAGTTTGTTCAGGAGGA
GAGCTCGAGAAGAGAGCAGAGTTTACATGCAGATGTGACATGCAGAGAAAAACAGAGCAG
CGAAGAAGACATATCAAAACAGAGCATGTTGGAGAA

QA 1 576 1 576
DS 

RD RS1FM53TF 779 0 0
GGAAGCTAAAACTCAAAACAAAGAAGCAAAGCGAGAAAAAAAAACCTCAGTCTCTCCTTT
TTTTTTTTCTCCTACCATAAACTGAATATCAACTCTCCTTTTTTTTGCTCTACAACATAT
AATTTGTAAGCCAATCATTTCCTCTTCAAGGCCGATGGATTCGTCTAGAACCCAAAAGAC
TAAACCGAGAAAGATGAAGGCTGTTGTGAAGAAGTCTCGAGTCCAAAAACTCTTGGATTT
GTTTTACCGAGTGGTCGAGATAACTGTAGTTATGGTTACAGTGGCCAAGCTCTGTTACCA
ACTAGCCATCATGTTCGAGGACTCTGGTCTCACACGTTTTTTCATCAACCGTCACCTTGC
TTTCCTCTTGGGGAACGCGATAGTCATCGCTGTAGTCGCCAAGTGCGGTCTCTTTGCGAA
TCAAGAACCAGACGCACGGAGAAACAGCAATGATTTTTACGACGAGTTTGTTCAGGAGGA
GAGCTCGAGAAGAGAGCAGAGTTTACATGCAGATGTGACATGCAGAGAAAAACAGAGCAG
CGAAGAAGACATATCAAAACAGAGCATGTTGGAGAAGAACAGGGCAAAACAGAGTACTGA
AGATAACAGAGAGAAACAGAGTACTGACAAGAAGGACATAAGTGTAAAGAGACACAAACA
AGTCATCACCCAAAACAGGAAAGCCCGAGGAGGAGTACGAAGGAGTGGGTGCGAGAAGCT
CGAGGGCTCGAGAGAGTTCTTGTTGTGGAGATCGAGAGATCGGAGACTGAGAGACTGCT

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 3

CO CL2652Contig1 1180 3 3 U
GAATAATAATCGTATTGAAATCGTGGTAGACTTTTGGTCCAACAAAACTATATTGATTAC
TCTATGTGGTTCTTTCGTGTGTCTGGAGAGAACCACAACAAAGTCTAAGCAACATCAGTA
CTTGATATGGCTCAATCAAGCACACAAAAAAACAAGTAACATTTGGATTTCAATTCTCAT
CACAAAGCCCTTAACGAACCAACGTAAACAATAAGTCAGAAAGCAATACTGTCTCTCTCT
ATTGCTCTGAAGCACCGGCTCGACGATAGGGCATGTACCTATGATCCTTCGTTGCATTCT
TCTTCCTCCGTTTGTCAAGAAACGATGAAAGCTTACCAGATTCCTTGAGACTGTTGTACT
TTTCGATGAGTTCTTGTTTACGGATCTCAGATTGTTTGAGATAGTAAGGCTTTTTGCCCA
TCTTAGCGGCTTCTCTTTCTCTCTTTTTGTGTTCTGTTAGTATTGACTTTCCTTTGCTAT
TTGTTGACGGATCATACTTCAACAACTTCTCAACATAAGTTAACTGGTCCTTGAGTTCGT
CGACCTCTTCTGGATTCTTTGTTTTCTTTAGCTTCTTTTTCAGTTCCTCTCTTTCTACAG
GAAGTTTCTCCTCGAAAAAGAAACTGTATCGCTTCCTAAACCCCTCAGGATCAGCGTTTC
CAGCCAATGAGTCAAAACGAGGATCCCGAACCACCTTCTTTGGAGCTTGAATAACCTCTC
TATAACGACTCACGGGTCTTCTGGAACTTAACTCTACCGGTCTATTCTTGTTTGCACGAA
CAGGTTTCTTCGCTTCAGAGAAGGTAATGTTCTTGTCTGCAGCACGACCAGTGTTCTTCT
TCACTTGAGAAAACGATGGCTTTAAGGGAGCAGCAGGACGAGACCCATCAGCACGCAATC
TATGTATTTCCTCCAATGTTAACTCTTCCCCTTTCTCTTCTTCTTCTTCCTCATCTGAAG
AAGACAGAGACGATAAGGATTGATCTTCATCATCGTCTTCACTGTCGTCAAACACAATCT
TACTCGAGCTCGGTTCAAACTTAATATCTCCCTTCATTGTCAAACTCTGAACCAGACACA
GTCTGTAAAAGTAACGACGGTTAACGAGAACGATGAAGAACGGCGCGACAAGTTGAGGAC
GAAGGAGGAGGAGTGATGAAAATAACAAACTGGGGAATCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FO90JQ U 1
AF RS1G927JQ U 449
AF RS1G927TF C 590
BS 1 741 RS1FO90JQ
BS 742 799 RS1G927JQ
BS 800 1180 RS1G927TF

RD RS1FO90JQ 741 0 0
GAATAATAATCGTATTGAAATCGTGGTAGACTTTTGGTCCAACAAAACTATATTGATTAC
TCTATGTGGTTCTTTCGTGTGTCTGGAGAGAACCACAACAAAGTCTAAGCAACATCAGTA
CTTGATATGGCTCAATCAAGCACACAAAAAAACAAGTAACATTTGGATTTCAATTCTCAT
CACAAAGCCCTTAACGAACCAACGTAAACAATAAGTCAGAAAGCAATACTGTCTCTCTCT
ATTGCTCTGAAGCACCGGCTCGACGATAGGGCATGTACCTATGATCCTTCGTTGCATTCT
TCTTCCTCCGTTTGTCAAGAAACGATGAAAGCTTACCAGATTCCTTGAGACTGTTGTACT
TTTCGATGAGTTCTTGTTTACGGATCTCAGATTGTTTGAGATAGTAAGGCTTTTTGCCCA
TCTTAGCGGCTTCTCTTTCTCTCTTTTTGTGTTCTGTTAGTATTGACTTTCCTTTGCTAT
TTGTTGACGGATCATACTTCAACAACTTCTCAACATAAGTTAACTGGTCCTTGAGTTCGT
CGACCTCTTCTGGATTCTTTGTTTTCTTTAGCTTCTTTTTCAGTTCCTCTCTTTCTACAG
GAAGTTTCTCCTCGAAAAAGAAACTGTATCGCTTCCTAAACCCCTCAGGATCAGCGTTTC
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TATAACGACTCACGGGTCTTC

QA 1 741 1 741
DS 

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GTGTTCTGTTAGTATTGACTTTCCTTTGCTATTTGTTGACGGATCATACTTCAACAACTT
CTCAACATAAGTTAACTGGTCCTTGAGTTCGTCGACCTCTTCTGGATTCTTTGTTTTCTT
TAGCTTCTTTTTCAGTTCCTCTCTTTCTACAGGAAGTTTCTCCTCGAAAAAGAAACTGTA
TCGCTTCCTAAACCCCTCAGGATCAGCGTTTCCAGCCAATGAGTCAAAACGAGGATCCCG
AACCACCTTCTTTGGAGCTTGAATAACCTCTCTATAACGACTCACGGGTCTTCTGGAACT
TAACTCTACCGGTCTATTCTTGTTTGCACGAACAGGTTTCTTCGCTTCAGA
AAA

QA 1 351 1 351
DS 

RD RS1G927TF 591 0 0
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ATCAGCGTTTCCAGCCAATGAGTCAAAACGAGGATCCCGAACCACCTTCTTTGGAGCTTG
AATAACCTCTCTATAACGACTCACGGGTCTTCTGGAACTTAACTCTACCGGTCTATTCTT
GTTTGCACGAGCAGGTTTCTTCGCTTCAGAGAAGGTAATGTTCTTGTCTGCAGCACGACC
AGTGTTCTTCTTCACTTGAGAAAACGATGGCTTTAAGGGAGCAGCAGGACGAGACCCATC
AGCACGCAATCTATGTATTTCCTCCAATGTTAACTCTTCCCCTTTCTCTTCTTCTTCTTC
CTCATCTGAAGAAGACAGAGACGATAAGGATTGATCTTCATCATCGTCTTCACTGTCGTC
AAACACAATCTTACTCGAGCTCGGTTCAAACTTAATATCTCCCTTCATTGTCAAACTCTG
AACCAGACACAGTCTGTAAAAGTAACGACGGTTAACGAGAACGATGAAGAACGGCGCGAC
AAGTTGAGGACGAAGGAGGAGGAGTGATGAAAATAACAAACTGGGGAATCC

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 4

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TGAAGAACATGGATCCCGATCAAGTGCTTCTCAACGCAACGAGGCTTAGGAACTCTCTTG
GAAGGAAAGTCGTGAAGCTGAGGACTAGGCATGTGACCAAGCACCCCAGTGTTCAAGGCA
CCTGGACAACCGCTGTCAGATTCTGACAAACTTTGCCTTCCTAAACATATATACTTTGCG
TATGGTTTCTCCTTCTTTTTGCTTGCTGTTGAATCGAGGTGTGGCTCGAATGTTGCAAGT
ATTGTGGTTATCTATCTTTGTAGTCTCAAAGTTGTTTCTACTGTTAACTTGAATCTTGTT
TTCTCTTGAATAAGATCTTCGGAAAAGTTTATTGAT


BQ
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AF RS1BQ09JQ C 1
AF RS1EV07JQ C 173
AF RS1EV07TF U 9
AF RS1BQ09TF U 1
BS 1 21 RS1BQ09TF
BS 22 158 RS1EV07TF
BS 159 159 RS1BQ09TF
BS 160 166 RS1EV07TF
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RD RS1BQ09JQ 576 0 0
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TGAAGAACATGGATCCCGATCAAGTGCTTCTCAACGCAACGAGGCTTAGGAACTCTCTTG
GAAGGAAAGTCGTGAAGCTGAGGACTAGGCATGTGACCAAGCACCCCAGTGTTCAAGGCA
CCTGGACAACCGCTGTCAGATTCTGACAAACTTTGCCTTCCTAAACATATATACTTTGTG
TATGGTTTCTCCTTCTTTTTGCTTGCTGTTGAATCGAGGTGTGGCTCGAATGTTGCAAGT
ATTGTGGTTATCTATCTTTGTAGTCTCGAAGTTGTTTCTACTGTTAACTTGAATCTTGTT
TTCTCTTGAATAAGATCTTCGGAAAAGTTTATTGAT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RS1EV07JQ 404 0 0
GCTC
TCAAGGGGACAACATCCTTACCTCAAGGGCATTTACAGGAATAGAAATGAAAGAGTGGTG
TGTGTGAAGAACATGGATCCTGATCAAGTGCTTCTCAATGCAACGAGGCTTAGGAACTCT
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GGCACTTGGACAACCGCTGTCAGATTCTGACAAACTTTGCCTTCCTAAACATATATACTT
TGCGTATGGTTTCTCCTTCTTTTTGCTTGCTGTTGAATCGAGGTGTGGCTCGAATGTTGC
AAGTATTGTGGTTATCTATCTTTGTAGTCTCAAAGTTGTTTCTACTGTTAACTTGAATCT
TGTTTTCTCTTGAATAAGATCTTCGGAAAAGTTTATTGAT

QA 5 404 5 404
DS 

RD RS1EV07TF 568 0 0
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TTGAGATGGCGCTAAGAGGAGTATGGCAGCTCCAGAAGCTCGTGGTGAGCTACTGTAACT
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AGGGCATTTACAGGAATAGAAATGAAAGAGTGGTGTGTGTGAAGAACATGGATCCTGATC
AAGTGCTTCTCAATGCAACGAGGCTTAGGAACTCTCTTGGAAGGAAAGTCGTGAAGCTGA
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TCTGACAAACTTTGCCTTCCTAAACATATATACTTTGCGTATGGTTTCTCCTTCTTTTTG
CTTGCTGTTGAATCGAGGTGTGGCTCGAATGTTGCAAGTATTGTGGTTATCTATCTTTGT
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GAAAAGTTTATTGAT

QA 14 568 14 568
DS 

RD RS1BQ09TF 576 0 0
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TCGTGGTGAGCTACTGTAACTGGGGAGGTAGCAGTAGAGGCATAAGAGCCTTTATGGAAT
CAGAGTTGCCTGCTCTGATAGAGAAGAATCCGCAGCTCTAAGTGGTGACGGAGCTTTCAA
GGGGACAACATCCTTACCTCAAGGGCATTTACAGGAACAGAAATGAAAGAGTGGTGTGTG
TGAAGAACATGGATCCCGATCAAGTGCTTCTCAACGCAACGAGGCTTAGGAACTCTCTTG
GAAGGAAAGTCGTGAAGCTGAGGACTAGGCATGTGACCAAGCACCCCAGTGTTCAAGGCA
CCTGGACAACCGCTGTCAGATTCTGACAAACTTTGCCTTCCTAAACATATATACTTTGTG
TATGGTTTCTCCTTCTTTTTGCTTGCTGTTGAATCGAGGTGTGGCTCGAATGTTGCAAGT
ATTGTGGTTATCTATCTTTGTAGTCTCGAAGTTGTTTCTACTGTTAACTTGAATCTTGTT
TTCTCTTGAATAAGATCTTCGGAAAAGTTTATTGAT

QA 1 576 1 576
DS 



AS 1 4

CO CL2654Contig1 1089 4 3 U
GGGCGCGACGGGGCTCTCCGCGTCCAGGCACGTCCCAACGTGGGAGCTGATCTGGTTCTC
AATCGTCGCCAACGTCTCCATAGCCGCCATGAATTTCAGCCTCATGCTCAACTCCGTCGG
ATTCTACCAGATCTCGAAGCTCAGCATGATCCCCGTCGTCTGCGTCATGGAATGGATCCT
CCACAGCAAACGCTACTCCAGGGAAGTTAAAGTGTCTGTTGTGGTTGTTGTGGTCGGCGT
TGGGATTTGCACCGTCACTGACGTCAAAGTTAACGCCAAAGGGTTTATATGCGCGTGTGT
AGCTATTTTCTCCTCCTCTTTGCAACAGATTTTAATAGGTTCCTTGCAGAAGAAATATTC
GATTGGATCTTTCGAGTTGCTGAGTAAAACAGCGCCGATTCAAGCTGTTTCGCTTCTCGT
TGTTGGTCCTTTTGTTGATTATCTCCTCAGTGGCAAGTTCATCTTGAGCTACAACATGTC
TTCTGGTTGCTTTGTATTCATCCTTCTCTCATGTGCCTTGGCTGTGTTCTGCAACATAAG
CCAGTACCTTTGCATCGGGCGATTTTCAGCAGTATCATTCCAGGTTATAGGCCACATGAA
AACCGTGTGTATCTTGACGCTGGGATGGCTCCTCTTTGATTCTGCTATGACTTTCAAAAA
CGTGTCCGGCATGTTTGTTGCCATTGTTGGGATGGTGATCTATAGCTGGGCCATGGAATT
GGAGAAACAGTCTAATCTCGCGGCAAAGGCTTTGAACAGTGTGAAACACAGCTTGACTGA
AGAGGAGTTTCAGCTTTTAAAGGAAGGTGTGGAAACTACACAGTCCAAAGATGTTGAGCT
TGGCGGCGGCTACACAAAAGCTTAGTAAGAGATGATGGATAGTAAACATAGTTTTCTGGT
ACAAGTTCTTCTGTGTTAAAGTTGTTATGTTTTTGTGTTATTTAAACCAAAAGGGTGGTG
GTCGAAATAAAGCAAAGATCAAATCCTCCCCATAAAGGATTCTAGGAGATTAGTCTACGC
TTCGAACTATGTCCCTTTGTTATAAAAAGATGTTTTGTGTTATTTATATATTTACTAGCC
AAAAAAAAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1CS86TF U 1
AF RS1GQ30TF U 169
AF RS1GQ30JQ C 434
AF RS1CS86JQ C 213
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BS 577 848 RS1GQ30TF
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RD RS1CS86TF 578 0 0
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CCAGTACCTTTGCATCGGGCGATTTTCAGCAGTATC
GT

QA 1 576 1 576
DS 

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CTAC

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GGCTGTGTTCTGCAACATAAGCCAGTACCTTTGCATCGGGCGATTTTCAGCAGTATCGTT
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TTATTTATATATTTACTAGCCAAAAAAAAA

QA 8 877 8 877
DS 



AS 1 4

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CCTCTTGTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCTCCTCTTCTCCTC
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CTCCGAGACCAACCATCGCCGCAGCTATCTTCTCCCTCTTTGATCCCTCTTTCTTCTTGT
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1EQ41TF C 1
AF RS1EQ41JQ U 4
AF RS1BZ49JQ U 68
AF RS1BZ49TF C 343
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RD RS1EQ41TF 625 0 0
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CTTCTTCCTGGTTCCCACCGCCTCCATGGTGGCCCTTAGGCTTAATCTTCTTGAGGGTGG
CTCCGAGACCAACCATCGCCGCAGCTATCTTCTCCCTCTTTGATCCCTCTTTCTTCTTGT
CTTCCTCTTTCTCATCTTTTGAGTGATGGTGGAGGTGGAATATTCCTCTATGTTTATGGG
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CCACGGTTTCATCCAACTGCTTCTCCATCTTCTCTTACTCTTTTTTGCCTTTGTGTTTTT
TTTTTGTTCTGCTTCTAAATCGT
CC

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CGGTTTCATCCAACTGCTTCTCCATCTTCTCTTACTCTTTTTTGCCTTTGTGTTTTTTTT
TTGTTCTGCTTCTAAATCGT
CC

QA 1 620 1 620
DS 

RD RS1BZ49JQ 563 0 0
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CTGGTTCCCACCGCCTCCATGGTGGCCCTTAGGCTTAATCTTCTTGAGGGTAGCTCCGAG
ACCAACCATCGCCGCAGCTATCTTCTCTCTCTTTGATCCCTCTTTCTTCTTGTCTTCCTC
TTTCTCATCTTTTGAGTGATGGTGGAGGTGGAATATTCCTCTATGTTTATGGGATTTTTC
TTTCTTTTTCTCGGGTGATGACTCTCGGATGCCTCGTTCCACATGAGCAGTCTCCACGGT
TTCATCCAACTGCTTCTCCATCTTCTCTTACTCTTTTTTGCCTTTGTGTTTTTTTTT*GT
TCTGCTTCTAAATCGTTGTTTCC

QA 1 563 1 563
DS 

RD RS1BZ49TF 288 0 0
TAATCTTCTTGAGGGTAGCTCCGAGACCAACCATCGCCGCAGCTATCTTCTCTCTCTTTG
ATCCCTCTTTCTTCTTGTCTTCCTCTTTCTCATCTTTTGAGTGATGGTGGAGGTGGAATA
TTCCTCTATGTTTATGGGATTTTTCTTTCTTTTTCTCGGGTGATGACTCTCGGATGCCTC
GTTCCACATGAGCAGTCTCCACGGTTTCATCCAACTGCTTCTCCATCTTCTCTTACTCTT
TTTTGCCTTTGTGTTTTTTTTT*GTTCTGCTTCTAAATCGT
TGTTTCC

QA 1 281 1 281
DS 



AS 1 3

CO CL2656Contig1 1099 3 9 U
GGGTAAACGTTTTCACAAGCTGCGTTACGAACGCTATTTACTTGTAAGGCTTTATAAAGA
TATTGTTTAAGTTGTATATTAATACAATGACGATAATTAGCTAAGTCTTTAACTGATATA
ATAATCTAGAGTTAGAGAACCCCGAAAGCTTCTTTGATAGCGTGTATAACACGCGAAGAA
ACTTCTTCTCCAAACATTCTCGGAAACTGTAAATCCAAATCTTCCTCTATGCTCTTCTTT
CTGAAGCTTTTGTCTCTTCTTTCCAACTCTAACTTCTCTTCTTCTCCCAACACTCTCTTC
TCTTCCTCCCTCGCGCAACGCTCCAGCCAAACCTCAAGGACTTGCTTAGCAGCTGGACTC
ACATGCTCCCTCAAAATCTCCTCCAACCTCTCCCCTTCCTCCGCGTCGATTTTAAGCATG
GAAGCTGTTGGAGAGAAAGCAGAGCGGACAAAGAGAGAAGGCGAGACGTAGGGTTTGACC
TCGGGAAGCTTGAGGAGTGACTGGCGATGAGTATCGAGAGCGGTGTCTTGGTAATATGTC
TCGAGATAGCCAGGGTGACGAACGAGGTCTTTGCGATGAGGGAGGTCGAGGATGAGAACG
AGCGACGTGGGACTGCTCTGTATCAGTTCGACCACAAAGTTTGGAGCTTCTGCTGATGTG
TTTAGGAATGCAGAGATGCTTGTAATGTTGAGTGACACTCCTGTCGGAATCTTGACGTGT
ATCCAACTTCATATAACAAAATCAATCGGAGAAGATTTCTCGCCGGATCTGATGTGAAGA
GACGCTTCGGCGGAACCGTTAGGGTTCTTGAAGTTCCTTACATCAGGCGGGAGGGTACAG
GGAAGGAGTTGCGAGTGGAGGCGATCCTCCAACGTCGACATGAGATCAACCATTAGAGCC
CTGCGCGTGGGCGAGACGTATGGAAACTCCATGAATTTCTGACGGAGAAGATCGTTTTGA
TGATCATCCATGGACTGGAATTGAGCTCGGACAGTGAGTGTCTTTGGGAATCGCGACGGT
TTTGATCGTATCGAAGTTAACGGCGAGAGAAAGGGCGGAGAAGAAGAGTAGAGAGTGTTG
CATAATATAATCGCCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G032JQ U 1
AF RS1B175JQ U 41
AF RS1G032TF C 401
BS 1 99 RS1G032JQ
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BS 806 1099 RS1G032TF

RD RS1G032JQ 555 0 0
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TATTGTTTAAGTTGTATATTAATACAATGACGATAATTATCTAAGTCTTTAACTGATATA
ATAATCTAGAGTTAGAGAACCCCGAAAGCTTCTTTGATAGCGTGTATAACACGCGAAGAA
ACTTCTTCTCCAAACATTCTCGGAAACTGTAAATCCAAATCTTCCTCTATGCTCTTCTTT
CTGAAGCTTTTGTCTCTTCTTTCCAACTCTAACTTCTCTTCTTCTCCCAACACTCTCTTC
TCTTCCTCCCTCGCGCAACGCTCCAGCCAAACCTCAAGGACTTGCTTAGCAGCTGGACTC
ACATGCTCCCTCAAAATCTCCTCCAACCTCTCCCCTTCCTCCGCGTCGATTTTAAGCATG
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TCGAGATAGCCAGGG

QA 1 555 1 555
DS 

RD RS1B175JQ 767 0 0
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CGTGTATAACACGCGAAGAAACTTCTTCTCCAAACATTCTCGGAAACTGTAAATCCAAAT
CTTCCTCTATGCTCTTCTTTCTGAAGCTTTTGTCTCTTCTTTCCAACTCTAACTTCTCTT
CTTCTCCCAACACTCTCTTCTCTTCCTCCCTCGCGCAACGCTCCAGCCAAACCTCAAGGA
CTTGCTTAGCAGCTGGACTCACCTGCTCCCTCAAAATCTCCTCCAACCTCTCCCCTTCCT
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CGGTGTCTTGGTAATATGTCTCGAGATAGCCAGGGTGACGAACGAGGTCTTTGCGATGAG
GGAGGTCGAGGATGAGAACGAGCGACGTGGGACTGCTCTGTATCAGTTCGACCACAAAGT
TTGGAGCTTCTGTTGATGTGTTTAGGAATGCAGAGATGCTTGTAATGTTGAGTGACACTC
CTGTCGGAATCTTGACGTGTATCCAACTTCATATAACAAAATCAATCGGAGAAGATTTCT
CGCCGGATCTGATGTGAAGAGACGCTTCGGCGGAACCGTTAGGGT
CT

QA 1 765 1 765
DS 

RD RS1G032TF 699 0 0
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GCGAGACGTAGGGTTTGACCTCGGGAAGCTTGAGGAGTGACTGGCGATGAGTATCGAGAG
CGGTGTCTTGGTAATATGTCTCGAGATAGCCAGGGTGACGAACGAGGTCTTTGCGATGAG
GGAGGTCGAGGATGAGAACGAGCGACGTGGGACTGCTCTGTATCAGTTCGACCACAAAGT
TTGGAGCTTCTGCTGATGTGTTTAGGAATGCAGAGATGCTTGTAATGTTGAGTGACACTC
CTGTCGGAATCTTGACGTGTATCCAACTTCATA**ACAAAATCAATCGGAGAAGATTTCT
CGCCGGATCTGATGTGAAGAGACGCTTCGGCGGAACCGTTAGGGTTCTTGAAGTTCCTTA
CATCAGGCGGGAGGGTACAGGGAAGGAGTTGCGAGTGGAGGCGATCCTCCAACGTCGACA
TGAGATCAACCATTAGAGCCCTGCGCGTGGGCGAGACGTATGGAAACTCCATGAATTTCT
GACGGAGAAGATCGTTTTGATGATCATCCATGGACTGGAATTGAGCTCGGACAGTGAGTG
TCTTTGGGAATCGCGACGGTTTTGATCGTATCGAAGTTAACGGCGAGAGAAAGGGCGGAG
AAGAAGAGTAGAGAGTGTTGCATAATATAATCGCCATCC

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 4

CO CL2657Contig1 1210 4 5 U
CCAGGGTTGAACCGTCCCACAAAAATGCTTGTTGAAGCCCTTCAGAACCAAAATGAAGTG
GTGGCAATGACTGGTGATGGCGTAAGCGATGCTCCTGCATTAAAGAAAGCTGATATTGGG
ATTGCCATGGGTTCTGGAACAGCTGTAGCAAAGAGTGCTTCAGATATGGTTTTGGCTGAT
GATAACTTCGCTTCAATAGTTGCGGCTGTTGCGGAAGGAAGAGCTATATATAATAACACT
AAGCAATTCATTAGATACATGATCTCTTCAAATATCGGAGAAGTAGTGTGTATATTTGTA
GCAGCTGTACTGGGAATCCCTGATACCTTGGCGCCTGTTCAACTATTGTGGGTCAATTTG
GTAACGGATGGATTGCCTGCCACTGCCATTGGCTTCAATAAACAAGATTCCGATGTTATG
AAGGCAAAACCCCGAAAGGTTGGTGAAGCAGTGGTTACTGGGTGGTTATTCTTCCGCTAT
CTGGTTATCGGAGTTTATGTGGGCCTGGCAACTGTTGCTGGCTTTATATGGTGGTTTGTT
TACTCTGAAGGTGGTCCAAAACTTACTTACAGTGAACTGATGAACTTTGAAACGTGCGCA
CTCAGAGAGACAAGTTATCCCTGCAGCATATTTGAGGATCGGCATCCGTCGACCGTGGCT
ATGACAGTACTTGTTGTTGTAGAGATGTTTAATGCGCTAAATAACCTCAGTGAAAATCAG
TCCCTTCTGGTTATAACCCCAAGGAGTAATCTATGGCTTGTTGGTTCAATTATCCTAACG
ATGGTTCTGCACATGCTGATACTATATGTTCATCCACTGGCAGTCTTGTTTTCTGTTACG
CCATTGTCCTGGGGCGAATGGACCGCCGTTCTGTATCTTTCGTTTCCTGTTATCATCATC
GATGAGGTTCTGAAGTTCCTCTCTAGAAATACCGGCTTGAGGTTCAGGTTCAGACTGAGG
AAGACGGATTTACTCCCCAAGGACCGGCGTGACAAGTAAGGTTGAGAAAACATGAGTCAT
GACATGGCCTTTTTGGTGGTGCACAGAGTTTTGGCTCTCAATAGATACACACCGACAGAG
AGAGATAGGTAATCTTAATTGATTGTAATGCAATCCTGAAGGTCCCAACACCATTATTAG
ACTTTCGGATTTTGTTTTTGTTGTAACCAGTTTCACTGTACTCTTTCCAACAAAACAACG
TTAGTTTACT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A488TF U 1
AF RS1A914TF U 1
AF RS1A488JQ C 382
AF RS1A914JQ C 549
BS 1 743 RS1A488TF
BS 744 744 RS1A488JQ
BS 745 811 RS1A488TF
BS 812 853 RS1A914TF
BS 854 1210 RS1A488JQ

RD RS1A488TF 811 0 0
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GATAACTTCGCTTCAATAGTTGCGGCTGTTGCGGAAGGAAGAGCTATATATAATAACACT
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AAGGCAAAACCCCGAAAGGTTGGTGAAGCAGTGGTTACTGGGTGGTTATTCTTCCGCTAT
CTGGTTATCGGAGTTTATGTGGGCCTGGCAACTGTTGCTGGCTTTATATGGTGGTTTGTT
TACTCTGAAGGTGGTCCAAAACTTACTTACAGTGAACTGATGAACTTTGAAACGTGCGCA
CTCAGAGAGACAAGTTATCCCTGCAGCATATTTGAGGATCGGCATCCGTCGACCGTGGCT
ATGACAGTACTTGTTGTTGTAGAGATGTTTAATGCGCTAAATAACCTCAGTGAAAATCAG
TCCCTTCTGGTTATAACCCCAAG*AGTAATCTATGGCTTGTTGGTTCAATTATCCTAACG
ATGGTTCTGCACATGCTGATACTATATGTTC

QA 1 811 1 811
DS 

RD RS1A914TF 853 0 0
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GTGGCAATGACTGGTGATGGCGTAAGCGATGCTCCTGCATTAAAGAAAGCTGATATTGGG
ATTGCCATGGGTTCTGGAACAGCTGTAGCAAAGAGTGCTTCAGATATGGTTTTGGCTGAT
GATAACTTCGCTTCAATAGTTGCGGCTGTTGCGGAAGGAAGAGCTATATATAATAACACT
AAGCAATTCATTAGATACATGATCTCTTCAAATATCGGAGAAGTAGTGTGTATATTTGTA
GCAGCTGTACTGGGAATCCCTGATACCTTGGCGCCTGTTCAACTATTGTGGGTCAATTTG
GTAACGGATGGATTGCCTGCCACTGCCATTGGCTTCAATAAACAAGATTCCGATGTTATG
AAGGCAAAACCCCGAAAGGTTGGTGAAGCAGTGGTTACTGGGTGGTTATTCTTCCGCTAT
CTGGTTATCGGAGTTTATGTGGGCCTGGCAACTGTTGCTGGCTTTATATGGTGGTTTGTT
TACTCTGAAGGTGGTCCAAAACTTACTTACAGTGAACTGATGAACTTTGAAACGTGCGCA
CTCAGAGAGACAAGTTATCCCTGCAGCATATTTGAGGATCGGCATCCGTCGACCGTGGCT
ATGACAGTACTTGTTGTTGTAGAGATGTTTAATGCGCTAAATAACCTCAGTGAAAATCAG
TCCCTTCTGGTTATAACCCCAAG*AGTAATCTATGGCTTGTTGGTTCAATTATCCTAACG
ATGGTTCTGCACATGCTGATACTATATGTTCATCCACTGGCAGTCTTGTTTTCTGTTACG
CCATTGTCCTGGG

QA 1 853 1 853
DS 

RD RS1A488JQ 829 0 0
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GGTGAAGCAGTGGTTACTGGGTGGTTATTCTTCCGCTATCTGGTTATCGGAGTTTATGTG
GGCCTGGCAACTGTTGCTGGCTTTATATGGTGGTTTGTTTACTCTGAAGGTGGTCCAAAA
CTTACTTACAGTGAACTGATGAACTTTGAAACGTGCGCACTCAGAGAGACAAGTTATCCC
TGCAGCATATTTGAGGATCGGCATCCGTCGACCGTGGCTATGACAGTACTTGTTGTTGTA
GAGATGTTTAATGCGCTAAATAACCTCAGTGAAAATCAGTCCCTTCTGGTTATAACCCCA
AGGAGTAATCTATGGCTTGTTGGTTCAATTATCCTAACGATGGTTCTGCACATGCTGATA
CTATATGTTCATCCACTGGCAGTCTTGTTTTCTGTTACGCCATTGTCCTGGGGCGAATGG
ACCGCCGTTCTGTATCTTTCGTTTCCTGTTATCATCATCGATGAGGTTCTGAAGTTCCTC
TCTAGAAATACCGGCTTGAGGTTCAGGTTCAGACTGAGGAAGACGGATTTACTCCCCAAG
GACCGGCGTGACAAGTAAGGTTGAGAAAACATGAGTCATGACATGGCCTTTTTGGTGGTG
CACAGAGTTTTGGCTCTCAATAGATACACACCGACAGAGAGAGATAGGTAATCTTAATTG
ATTGTAATGCAATCCTGAAGGTCCCAACACCATTATTAGACTTTCGGATTTTGTTTTTGT
TGTAACCAGTTTCACTGTACTCTTTCCAACAAAACAACGTTAGTTTACT

QA 1 829 1 829
DS 

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GACAAGTTATCCCTGCAGCATATTTGAGGATCGGCATCCGTCGACCGTGGCTATGACAGT
ACTTGTTGTTGTAGAGATGTTTAATGCGCTAAATAACCTCAGTGAAAATCAGTCCCTTCT
GGTTATAACCCCAAGGAGTAATTTATGGCTTGTTGGTTCAATTATCCTAACGATGGTTCT
GCACATGCTGATACTATATGTTCATCCACTGGCAGTCTTGTTTTCTGTTACGCCATTGTC
CTGGGGCGAATGGACCGCCGTTCTGTATCTTTCGTTTCCTGTTATCATCATCGATGAGGT
TCTGAAGTTCCTCTCTAGAAATACCGGCTTGAGGTTCAGGTTCAGACTGAGGAAGACGGA
TTTACTCCCCAAGGACCGGCGTGACAAGTAAGGTTGAGAAAACATGAGTCATGACATGGC
CTTTTTGGTGGTGCACAGAGTTTTGGCTCTCAATAGATACACACCGACAGAGAGAGATAG
GTAATCTTAATTGATTGTAATGCAATCCTGAAGGTCCCAACACCATTATTAGACTTTCGG
ATTTTGTTTTTGTTGTAACCAGTTTCACTGTACTCTTTCCAACAAAACAACGTTAGTTTA
CT

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 3

CO CL2658Contig1 774 3 11 U
GCAATGACTAGTTCCGATCAATCTCCTTCGCACAATGTCTTTGTCTACGGCAGTTTCCAA
GAACCATCCGTCGTCAGTTTGATCCTCGAATGCAGTCCTGTCACCGTCTCCGCTCAGCTC
CACGGCTTTCATGTGTATAGGCTGAAAGGGCGTTTGCACGCATGTATCTCTCCTTCTGAG
AACGGACTTATCAACGGAAAGATACTAATTGGATTAACAGATGCTCAGCTAGAGAACTTA
GATATGATTGAAGGAGATGACTACGTGAGGAAGACTGTTGAAGTTGTATTAACTGACACT
TCTGAGAAGATGAAAGTGGAAACCTATGTATGGGCTAACAAGGATGATCCTGATATGTAT
GGAGAACGGGATTTCGAGGAATGGAAGAGGCTTCACATGGAGAAATTCATAGAAGCGGCC
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TTTGTACATGAAGATCCTCATGTGGCCTGAAGAATCTATGTGCTTTTCTTTTGTTTCCCA
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TTTTATGAGTGGAGAACAAAACAAACAAAGAAAAAAGTATATGTTGTATAATTGAGTTAG
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AAATAAAAATATGTACTAGAACAGATTTGAACTTATCATTATTATTTTAGTAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AB92TF U 229
AF RS1A491TF U 103
AF RS1A491JQ C 1
BS 1 102 RS1A491JQ
BS 103 228 RS1A491TF
BS 229 264 RS1AB92TF
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BS 637 717 RS1A491TF
BS 718 774 RS1A491JQ

RD RS1AB92TF 177 0 0
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TTAACTGACACTTCTGAGAAGATGAAAGTGGAAACCTATGTATGGGCTAACAAGGATGAT
CCTGATATGTATGGAGAATGGGATTTCGAGGAATGGAAGAGGCTTCACATGGAGAAA

QA 1 177 1 177
DS 

RD RS1A491TF 615 0 0
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QA 1 615 1 615
DS 

RD RS1A491JQ 774 0 0
GCAATGACTAGTTCCGATCAATCTCCTTCGCACAATGTCTTTGTCTACGGCAGTTTCCAA
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GATATGATTGAAGGAGATGACTACGTGAGGAAGACTGTTGAAGTTGTATTAACTGACACT
TCTGAGAAGATGAAAGTGGAAACCTATGTATGGGCTAACAAGGATGATCCTGATATGTAT
GGAGAACGGGATTTCGAGGAATGGAAGAGGCTTCACATGGAGAAATTCATAGAAGCGGCC
AAGAAATTTACGGAATGGAAGAAGAATCCGGATGGGCAATCAAGGGAGGAGTTTGAGAAA
TTTGTACATGAAGATCCTCATGTGGCCTGAAGAATCTATGTGCTTTTCTTTTGTTTCCCA
TCGACATGTGTGTTGAAATCACTCTCGTTATCTATATCTTCTACTGGCTGCAGGTAAGAG
TTTTATGAGTGGAGAACAAAACAAACAAAGAAAAAAGTATATGTTGTATAATTGAGTTAG
TTAGTCGTATGCAGCTGTCTTTATCTTTTTTTTTTTTTTT*ATGAAATAAAAGGAAACAA
AAATAAAAATATGTACTAGAACAGATTTGAACTTATCATTATTATTTTAGTAGT

QA 1 774 1 774
DS 



AS 2 4

CO CL2659Contig1 768 2 1 U
GAGCCAATAGATTCATACTGTAACTTATAAAAGCTTACTTTTCTAAGCAAGACGATCCCC
AATGAGAATATACTTGACTAAAAATCGAATCTGTATCGAACTAAACTTATCAATAAACAA
CCGGAACCCCTCAGGTAACTAGATGGCTTTTGCACTTGGTGAGAAAACCCGTTCATGGAT
TCTCTTGTCTTCAACATCAGCTTTGGCAAAAAAAATTCCCTCATCAATGAGACCAGAGAA
GTTCAGCAAAAGCATGAATACGCCAAGTGGTTCTTCTTTAAGATGTAGGGAGAGATGTAA
TCAGTAGAAAGACCAGACGTTCCTGAGATCTCTGCTGGAACCAAGACTTGAGGCTTGCCT
AAAGCTATCCTTTTACCAACTGTATTAGCGTAAAACAGACCGGGAATGGCCGGCACAAAT
ACATCACTCCTTGAACTTATGTAGAAGTCAATAACATTTTCATACTCTGAGTTTTCCAAC
TCAAGATACTTCGACTTCTTGTCTTCCGGTACTATAGCCTCCTTAGTAAACGTTTTAGGG
AAAATGTCCTTAAGAATGTTGAGGCTGCTCTCCCATCTTGGCTGAATCAAGTATATAGTT
GTATCACCGCCAAATCCAAGCTTCCTCAAGAACAATGCGATCTCTTGTGCGTTGTAACAT
GTTTTGGATCCAGCTGCACCTGTTTCACGGCAGTTTTTCTTCTCAAGTATCTCAAATCTC
AAGTCTATGGCTACGAAACGGCCACCAGAGTTCTTGCCATGCGTCTAA


BQ
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AF RS1GD15JQ U 43
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AAGTCTATGGCTACGAAACGGCCACCAGAGTTCTTGCCATGCGTCTAA

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DS 

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AAGACTTGAGGCTTGCCTAAAGCTATCCTTTTACCAACTGTATTAGCGTAAAACAGACCG
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TACTCTGAGTTTTCCAACTCAAGATACTTCGACTTCTTGTCTTCCGGTACTATAGCCTCC
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TCTTGTGCGTTGTAACATGTTTTGGATCCAGCTGCACCTGTTTCACGGCAGTTTTTCTTC
TCAAGTATCTCGACTCTCAAGTCTATGGCTATGAAACGGCCACCAGAGTTCTTGC

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DS 



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TAATGCTCGGACAAATGCTTCATAGAGACTACTTTGATGCTGTTCAGGTTCAAGGAGATG
CACATGATATTGTATTCCATGGATCAAAAGTAGCTCTTGAAGAAGATGGGCTTGTTAGAT
CAAGTGAAGGGCCTTGGATGGAGAATAGCCATCAACTTAAACCTTGTTGGTCAATATCTC
AACCTGATGAAGAGGTATCGTCAAAGGGTTATGTTACATTCTCCTTAACCAATGGTCCTG
AGTACCATATCTCTCAGCTTACTGATGCCGTGATGGTGGCGAAGCATCTTGGAGCAACGC
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CAAGCCACGTTTCTTTAAGAGACATCGCCATTGTTAAGGTCCCTACTCGAGTTGCAGAAG
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CTTGTTTGGCAATGTTTGGTTCCCTGGAGCTGCAACCTGGAGTGAATGATCTGGTTGAGT
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TATATACTTGACTCAGCCAAGATGGGAGAGCAGCCT


BQ
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AF RS1E666TF U 1
AF RS1GD15TF U 287
BS 1 540 RS1E666TF
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GAAGAATGGGTGTGGATTTGAGACAAGTGGTGGCTGGAATCCTCACCATTACCATGTTTG
TAATGCTCGGACAAATGCTTCATAGAGACTACTTTGATGCTGTTCAGGTTCAAGGAGATG
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AGTACCATATCTCTCAGCTTACTGATGCCGTGATGGTGGCGAAGCATCTTGGAGCAACGC
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CAAGCCACGTTTCTTTAAGAGACATCGCCATTGTTAAG*TCCCTACTCGAGT

QA 1 712 1 712
DS 

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AACCAATGGTCCTGAGTACCATATCTCTCAGCTTACTGATGCCGTGATGGTGGCGAAGCA
TCTTGGAGCAACGCCTGTGCTCCCTGATATAAGAGGAAGCAAACCTGGTGATGAAATGAA
CTTTGAAGATATCTATGATGTGGACAAACTCGTTAAAAGCTTGGAAAGCGTAGTCAAAGT
TGTGAAGAAACTCCCAAGCCACGTTTCTTTAAGAGACATCGCCATTGTTAAGGTCCCTAC
TCGAGTTGCAGAAGACTACATCAAGGAGCATATTGATCCCATCTTCAAATCAAAAGGCAA
CATCAGAGTCACAACCTATTTCCCTTCCGTGAATCTGAGGAAATCATCTCTGGACGGTGA
GACCGACCCGGTTTCTTGTTTGGCAATGTTTGGTTCCCTGGAGCTGCAACCTGGAGTGAA
TGATCTGGTTGAGTCGATGATTCAGCGGCTTAAGACGCATGGCAAGAACTCTGGTGGCCG
TTTCATAGCCATAGACTTGAGAGTCGAGATACTTGAGAAGAAAACTGCCGTGAAACAGTG
CAGCTGGATCCAAACATGTACACGCACAAGAGATCGCATTGTTCTTGAGGAGCTGGATTT
GGCGGTGATACAACTATATACTTGACTCAGCCAAGATGGGAGAGCAGCCT

QA 1 830 1 830
DS 



AS 1 4

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GGCTCTCTCCTCCGATCTCTAACTAAAAGTGATCACAGATTCACACAACCACCATGGAGA
AGATCTCGCCTTCCTCTCTACTTTGCTGCATCATCGTCTTTCTCCTGATCTCGAACTTCC
ACGAATCCGTGGAAGCAGGGAAGCGACGGATCGAGATCACCGACGATCTAGACGACGTGG
AAGACAACGAAGAAGACGAATCATGGAAGCATTGGGGGAACAAAGCAGCCATGCCGGAGT
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AACGCACTTTCGCACCCGTCGTCGGTTTCGTCAAGCTCCGGTTAGGCGTTAACCGTACTA
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GAGTGAGATTCATGGCCGTGGATCGGAGCACGTTGATGTTCAATTTGCAAAACGGCAAGA
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AAGCTAACCAGAGCAAGGATGATGTTAACAAGGATGAGTTATGACTTATGAGATTGAAAA
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TCTTTCTCCGTGTTGTAGCCCCAGTTACTTAGGTATAGATTCCATTTGTCTAGTTCAGGC
TCTTTGATGACATTCTTCAGCGTTGCGAGTCTGTCTTCCACGAAATGCAGCTTCAAGCCC
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AACCGGCCCTGTTTCGTGGTAACAATGTAAATCTTTGAGCTGGCAAACTTCAATGCATCT
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TCTGCAACTGAAGATTTCCGAATAGAGGGCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BM27TF C 768
AF RS1BM27JQ U 650
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RD RS1F384TF 774 0 0
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AGGATATGGTGGTGGAGACTGCTATGAAATGGACCAAGGTTCTGAGGACAGGTGGGTTAG
GAGTGAGATTCATGGCCGTGGATCGGAGCACGTTGATGTTCAATTTGCAAAACGGCAAGA
AAGTAACTGAGCTAAGGGAGTTTGTGCTGAGCCAAGAAGAGGCTTATGAGGTTAAGATAG
GGAAACAAGAGTTTCGAAGACCTGGTGATCCTCCACTTGATGATGTCGTTGACAAACTTA
AAGCTAACCAGAGCAAGGATGATGTTAACAAGGATGAGTTATGACTTATGAGATTGAAAG
**TTTATCTCTTT*AGCTGA*TCTTAGCTACA*TGTTTGGCTTGTAGA*TACA*TGAAA*
GGGAAGCTTGTTT**CTTTCTTTTTTTCTTTCTGATGAGTATGCCACTCATT
AA

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DS 

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TAGACGACGTGGAAGACAACGAAGAAGACGAATCATGGAAGCATTGGGGGAACAAAGCAG
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AGGAGATGGCTAAACGCACTTTCGCACCCGTCGTCGGTTTCGTCAAGCTCCGGTTAGGCG
TTAACCGTACTAAGGATATGGTGGTGGAGACTGCTATGAAATGGACCAAGGTTCTGAGGA
CAGGTGGGTTAGGAGTGAGATTCATGGCCGTGGATCGGAGCACGTTGATGTTCAATTTGC
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AGGTTAAGATAGGGAAACAAGAGTTTCGAAGACCTGGTGATCCTCCACTTGATGATGTCG
TTGACAAACTTAAAGCTAACCAGAGCAAGGATGATGTTAACAAGGATGAGTTATGACTTA
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ATACAATGAAAAGGGAAGCTTGTTTTCTTTTCTTTTTTTCTTTCTGATGAGTATGCCACT
CATTTAAGCTTATTGCTAAACGTGGAAAGCTCGATAACCTGAATTCTTGGAATGCTCTCT
GCCTCTGCTCTTTC

QA 1 734 1 734
DS 

RD RS1BM27TF 428 0 0
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TGCCTCTGCTCTTTCTTTCTCCGTGTTGTAGCCCCAGTTACTTAGGTATAGATTCCATTT
GTCTAGTTCAGGCTCTTTGATGACATTCTTCAGCGTTGCGAGTCTGTCTTCCACGAAATG
CAGCTTCAAGCC*TGATGCTCTGGTTTGTTCTGAAGTAGCTTTAGCACTTCCACCTTTGG
GCCTGTACCCAGACCATAGATCCTTTCTGGTGGTATGATCACACCTGCTATTTCACGTAG
TAACGCTTCTGCAAACCGGCCCTGTTTCGTGGTAACAATGTAAATCTTTGAGCTGGCAAA
CTTCAATGCATCTGATACTCCTGGATAGAATCTATTGGCACCAATCCAAGTAGTTAAGTC
ATTGTTAA

QA 1 428 1 428
DS 

RD RS1BM27JQ 704 0 0
GG
GATTGAAAAGTTTTATCTCTTTTAGCTGAATCTTAGCTACAATGTTTGGCTTGTAGAATA
CAATGAAAAGGGAAGCTTGTTTTCTTTTCTTTTTTTCTTTCTGATGAGTATGCCACTCAT
TTAAGCTTATTGCTAAACGTGGAAAGCTCGATAACCTGAATTCTTGGAATGCTCTCTGCC
TCTGCTCTTTCTTTCTCCGTGTTGTAGCCCCAGTTACTTAGGTATAGATTCCATTTGTCT
AGTTCAGGCTCTTTGATGACATTCTTCAGCGTTGCGAGTCTGTCTTCCACGAAATGCAGC
TTCAAGCCCTGATGCTCTGGTTTGTTCTGAAGTAGCTTTAGCACTTCCACCTTTGGGCCT
GTACCCAGACCATAGATCCTTTCTGGTGGTATGATCACACCTGCTATTTCACGTAGTAAC
GCTTCTGCAAACCGGCCCTGTTTCGTGGTAACAATGTAAATCTTTGAGCTGGCAAACTTC
AATGCATCTGATACTCCTGGATAGAATCTATTGGCACCAATCCAAGTAGTTAAGTCATTG
TTAATCCAATCATCTCTAACTTTACCAAACAAATCGATCAAAGCTTCTTTATCTTCTTCA
CCCCAAGCTTCCATGATAACCGGCTTAATCTTTCCCCAGCTCTCCAATATCCCATCAACA
GTCAATCCCTCTGCAACTGAAGATTTCCGAATAGAGGGCATC

QA 3 704 3 704
DS 



AS 2 4

CO CL2661Contig1 650 2 3 U
AGTAGCCAACAAGTTGATGCAAGAGTCTCGTAGACGGAGACAGAGAAAAAAAAAAGCAAA
AGGAAAAAATAGAAAGCATTCTAAAAGAAAGCATCTCTGGACAAGTCCATACAAAGCTTC
AAAAACTAAATCAAAGACCTTAACGGTAGAAGAAGAATCATAACCCTCAAACTCCCCCAA
ACACACACTAAGATCTCACTGATCGTTAACGTTAATCAGTTCATATTCAACAAGAGAGAG
ATTGTTATCCTCTTTGACAGTGAAAGATGCAGGTTCAGTGGCTTCGATGCGTCCCCATTT
ATCAACCCCTAGCCTCATCGTACCCTTGAACATGTCTATCCTCGAATTGCGCAGTATCAC
CGTTTGTCCAGGCTTCATAAGATCAACTTGATCGTTACGAGCAGTGAAGAGAATACACCC
GGTCTCGTCTCCGATGAGACACTCAGCGATTCGACTAGGCTGAGACGGGCGACTCATAGA
ACTCCCCGGACGAGCCTTCCGAGCTGTCGGAAGCACAGGGTTGGAATCAACGACCTTAAC
AGTCAACGTGTGACCGGTCGTCCCAGGCTTCAGCTGTTCAACCTTCACGAACACCGGTTT
CCTCTTCGCCGTCGCAGTTCCTGTAGTCGCCATCGCTCAGATAAAATCCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DY40JQ U 200
AF RS1DY40TF C 1
BS 1 199 RS1DY40TF
BS 200 407 RS1DY40JQ
BS 408 650 RS1DY40TF

RD RS1DY40JQ 208 0 0
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AGATCAACTTGATCGTTACGAGCAGTGA

QA 1 208 1 208
DS 

RD RS1DY40TF 650 0 0
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AGGAAAAAATAGAAAGCATTCTAAAAGAAAGCATCTCTGGACAAGTCCATACAAAGCTTC
AAAAACTAAATCAAAGACCTTAACGGTAGAAGAAGAATCATAACCCTCAAACTCCCCCAA
ACACACACTAAGATCTCACTGATCGTTAACGTTAATCAGTTCATATTCAACAAGAGAGAG
ATTGTTATCCTCTTTGACAGTGAAAGATGCAGGTTCAGTGGCTTCGATGCGTCCCCATTT
ATCAACCCCTAGCCTCATCGTACCCTTGAACATGTCTATCCTCGAATTGCGCAGTATCAC
CGTTTGTCCAGGCTTCATAAGATCAACTTGATCGTTACGAGCAGTGAAGAGAATACACCC
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AGTCAACGTGTGACCGGTCGTCCCAGGCTTCAGCTGTTCAACCTTCACGAACACCGGTTT
CCTCTTCGCCGTCGCAGTTCCTGTAGTCGCCATCGCTCAGATAAAATCCC

QA 1 650 1 650
DS 



CO CL2661Contig2 674 2 1 U
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CACTGAGTGTCTCATCGGAGACGAAACTGGTTGTATTCCTTTCACTGCTCGTAACGATCA
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ATCTTTCACTGTCAAAGAGGATAACAATCTGTCTCTTGTTGAATATGAACTGATTAACGT
TAACGATCAGTGAGATCTTCTTTGGTGTGTGTTTGGGGGAGTTAAGAGGGTTTATGATTC
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GAAACTCTTGCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FE61TF U 1
AF RS1FE61JQ C 52
BS 1 674 RS1FE61TF

RD RS1FE61TF 674 0 0
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CACTGAGTGTCTCATCGGAGACGAAACTGGTTGTATTCCTTTCACTGCTCGTAACGATCA
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CAAGGGTACGATGAGGCTAGGGGTTGATAAGTGGGGACGCATCGAAGCCACTGAACCAGC
ATCTTTCACTGTCAAAGAGGATAACAATCTGTCTCTTGTTGAATATGAACTGATTAACGT
TAACGATCAGTGAGATCTTCTTTGGTGTGTGTTTGGGGGAGTTAAGAGGGTTTATGATTC
TTCTTCTACCGTTAAGGTCTTTGATTTAGTTGTTGAAGCTTTGTATGGACTTGTCCAGAG
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GAAACTCTTGCACC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1FE61JQ 623 0 0
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TAGTCGAATCACTGAGTGTCTCATCGGAGACGAAACTGGTTGTATTCCTTTCACTGCTCG
TAACGATCAAGTTGATCTTATGAAGCCTGGAGAAACGGTGATACTGCGCAACTCGAGGAT
AGACATGTTCAAGGGTACGATGAGGCTAGGGGTTGATAAGTGGGGACGCATCGAAGCCAC
TGAACCAGCATCTTTCACTGTCAAAGAGGATAACAATCTGTCTCTTGTTGAATATGAACT
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TTATGATTCTTCTTCTACCGTTAAGGTCTTTGATTTAGTTGTTGAAGCTTTGTATGGACT
TGTCCAGAGACGCTTTCTTTTAGGAATGCTTTCTATTTCTTTTTTGTTTTTTTTTCTGTC
TCCATTTACGAAACTCTTGCACC

QA 1 623 1 623
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL2663Contig1 616 3 10 U
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CCGGATTTTTGATTTC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EH71TF U 1
AF RS1BL66JQ C 6
AF RS1BL66TF U 105
BS 1 122 RS1EH71TF
BS 123 123 RS1BL66TF
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RD RS1EH71TF 615 0 0
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GAGAAAGGTGATGGTCAAAGAGAAGAGATTGTTTCACAGCAAGAGCTAAGAATGATCAAA
TGGAGCAGCCTTGAATTCC*TCTAAATCTGTATTTTTCAAAAAAAATCAAAATCTGTTCT
CTCTACAAAAAGGCCTCTTGAATAAGAATGTACACAAAAAAAAA*GGCTGGGTGAAAGAA
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CCGGATTTT
GATTTC

QA 1 609 1 609
DS 

RD RS1BL66JQ 610 0 0
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TTTTGTTCCAAAGACAGTAAGATCAAAGACTTTGATGCTTCAACAGAGTCACGTTCAGGT
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TGAAGATCCAGTACAAGGGATCATATGCTACACGGATGATAGCGGAGAGGTTATATGTGA
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AGGTGATGGTCAAAGAGAAGAGATTGTTTCACAGCAAGAGCTAAGAATGATCAAGTGGAG
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CAAAAAGGCCTCTTGAATAAGAATGTACACAAAAAAAAAAGGCTGGGTGAAAGAAGCAGC
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TTTT
GATTTC

QA 1 604 1 604
DS 

RD RS1BL66TF 512 0 0
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GCTAAGAATGATCAAGTGGAGCAGCCTTGAATTCCCTCTAAATCTGTATTTTTCAAAGAA
AATCAAAATCTGTTCTCTCTACAAAAAGGCCTCTTGAATAAGAATGTACACAAAAAAAAA
AGGCTGGGTGAAAGAAGCAGCCATTTTGCTTCTTTCTTGTATCTCTTTTTGTAAGAACAC
AAACATGAATATATGTCCGGATTTTTGATTTC

QA 1 512 1 512
DS 



AS 1 3

CO CL2664Contig1 1049 3 6 U
AAACCAAAAAAGGAGCATCCTTTATTTCAAACATCAAAAGGTTTTATTTGGTTCTTCCCA
AAATGTGATCTCAGCATAGTCATAAGAAAACAAACAAACATTAAAGAAAGCAGAGTAATC
AAAAGAACAAATATAGCTCCTTCTGATACAACTTGATTAAAGTTTTAACATTCACCCATT
CAACACGAATACATTACCTTCTTCTCCTTCTGAAGTAGCTTTGCAATCCCAAAACTCTAA
TATTGTTCTTCAGGTTTTATTTCCATTGAGAATAATAGCAAACTCCCTGTGGTTAGCAAG
GACTTCTAAGCAGCAGCCTGTAGCAACTCCCTTTCAGCGCGTTCCTTGATCCTTCTCTCA
AGCTCCGGCCTAAAGTGCCTAATCAGACCTTGCACGGGCCACGCAGCTGCATCACCCAAG
GCACAGATTGTGTGTCCTTCGATCTGTTTGGCCACCTCGTGAAGCATATCAATCTCTTCC
AGCTTTGCATTGCCAACCTTCATTCTCTCCATGATCATCCAGAGCCAACCAGTCCCCTCT
CTGCAAGGAGTGCACTGCCCACAGCTTTCATGCTTGTAGAAGTACGAGAGCCTCGCAATT
GCATCCACAACATCGGTTGATTTATCCATCACAATCACCGCCGCAGTTCCTAGCCCTGAT
TGGACGGCTTTGAGCGCATCGAAATCCATAAGCACATCCTCGCATATGTTCTTAGGAATC
AAAGGGACAGAGGAACCTCCAGGAATGATGGCAAGCAGGTTGTCCCATCCACCCCTAACG
CCTCCGCAATGCCTCTCAATCAGCTCCTTGAGAGGTATACTCATCTCCTCTTCAACGGTA
CACGGCTTGTTCACATGCCCTGAAACACAAAACAGCTTTGTCCCAGCGTTATTCTTCCTA
CCGAAACTCGAAAACCACTCAGGTCCACGCCTTAGAATCGTAGGAGAAACAGCAACCGTT
TCCACATTGGTGACAGTCGTGGGACAACCATACAAACCAGCATTAGCAGGGAACGGTGGC
TTCAACCTGGGCTTCCCTTGCTTCCCTTC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1FK03JQ U 1
AF RS1DE22JQ U 1
AF RS1DE22TF C 374
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G
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DS 

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AGCTTTGCATTGCCAACCTTCATTCTCTCCATGATCATCCAGAGCCAACCAGTCCCCTCT
CTGCAAGGAGTGCACTGCCCACAGCTTTCATGCTTGTAGAAGTACGAGAGCCTCGCAATT
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AAAGGGAC

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1DE22TF 676 0 0
AGTGCG
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CGATCTGTTTGGCCACCTCGTGAAGCATATCAATCTCTTCCAGCTTTGCATTGCCAACCT
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ATTTATCCATCACAATCACCGCCGCAGTTCCTAGCCCTGATTGGACGGCTTTGAGCGCAT
CGAAATCCATAAGCACATCCTCGCATATGTTCTTAGGAATCAAAGGGACAGAGGAACCTC
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TCAGCTCCTTGAGAGGTATACTCATCTCCTCTTCAACGGTACACGGCTTGTTCACATGCC
CTGAAACACAAAACAGCTTTGTCCCAGCGTTATTCTTCCTACCGAAACTCGAAAACCACT
CAGGTCCACGCCTTAGAATCGTAGGAGAAACAGCAACCGTTTCCACATTGGTGACAGTCG
TGGGACAACCATACAAACCAGCATTAGCAGGGAACGGTGGCTTCAACCTGGGCTTCCCTT
GCTTCCCTTC

QA 7 676 7 676
DS 



AS 1 4

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TACTTCTTCAAGAAAACTGCTGACCTTATTGACTTCAAGGAGAAACGGAGTGTGAGTTTC
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TTGGCTTTGGTTCCTGCTGGTGGCCACATTGTCACTACTACTGATTGTTACAGGAAGACT
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GCTGACGTCGCGGGGCTTGAAGCTGCTGTGAATAAGTACCAAGTTTCTCTGTTCTTCACC
GAGTCACCGACAAACCCATTCCTTAGATGTGTCGACATTGAGCTAGTTTCGGAAATATGC
CACAAAAGGGGAACTCTTGTTTGCATCGATGGTACCTTTGCAACACCCCTGAATCAGAAA
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CTGCATCATGTGTTGGGAGGCATACTTAATCCGAACGCTGCGTACCTAATGATCCGAGGC
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GAGCATCACATTGCCAAGCGACAAATGACTGGTTTTGGAGGCGTGTTCAGTTTCGAGATT
GATGGAGACATTGAAAGAACGATAAAGTTTGTGGATTCACTAAAGATTCCTTACATCGCA
CCATCTTTTGGTGGCTGCGAAAGCATCGTGGACCAACCGGCCATCATGTCTTACTGGGAT
CTGACACAGGAGGAGAGGCTAAAGTATGGAATCAAAGACAACTTGGTACGTTTCAGCTTT
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ATAATGTTGTCTTTGAACTATTGTTCGGCGACATTTACCGTTTCGTAATAACGATGAACT
ATTTATGTTTGTTGGTTT


BQ
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1CA09TF U 1
AF RS1F127TF U 298
AF RS1CA09JQ C 581
AF RS1F127JQ C 764
BS 1 539 RS1CA09TF
BS 540 540 RS1F127TF
BS 541 638 RS1CA09TF
BS 639 639 RS1F127TF
BS 640 736 RS1CA09TF
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BS 994 994 RS1CA09JQ
BS 995 1029 RS1F127TF
BS 1030 1032 RS1CA09JQ
BS 1033 1050 RS1F127TF
BS 1051 1338 RS1CA09JQ

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TACTTCTTCAAGAAAACTGCTGACCTTATTGACTTCAAGGAGAAACGGAGTGTGAGTTTC
GAGTATGGTCGTTATGGAAACCCTACGACTATCGTTCTTGAGGAGAAGATAAGTGCACTT
GAAGGTTCTGAATCAACCTTGGTTATGGCTTCTGGGATGTGTGCAAGCACTGTTATGCTT
TTGGCTTTGGTTCCTGCTGGTGGCCACATTGTCACTACTACTGATTGTTACAGGAAGACT
AGAATCCTCATGGAGAATTTTCTTCCCAAGATGGGGATCACTGTCACTGTGATTGATCCT
GCTGACGTCGCGGGGCTTGAAGCTGCTGTGAATAAGTACCAAGTTTCTCTGTTCTTCACC
GAGTCACCGACAAACCCATTCCTTAGATGTGTCGACATTGAGCTAGTTTCGGAAATATGC
CACAAAAGGGGAACTCTTGTTTGCATCGATGGTACCTTTGCAACACCCCTGAATCAGAA*
GCCCTTGCTTTTGGTGCTGATCTTGTCGTCCACTCTCTTACAAAGTACATCGGAGGACAC
AACGATGTTCTTGGTGGATGCATCTGTGGCCCACTGAAAGTGGTTTCAGAAATTCGCAAT
CTGCATCATGTGTTGGGAGGCATACTTAATCCGAACGCTGCGTACCTAATGATCCGAGGC
ATGAAGACAATGCATC

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DS 

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G
CTAGAATCTTCATGGAGAATTTTCTTCCCAAGATGGGGATCACTGTCACTGTGATTGATC
CTGCTGACGTCGCGGGGCTTGAAGCTGCTGTGAATAAGTACCAAGTTTCTCTGTTCTTCA
CCGAGTCACCGACAAACCCATTCCTTAGATGTGTCGACATTGAGCTAGTTTCGGAAATAT
GCCACAAAAGGGGAACTCTTGTTTGCATCGATGGTACCTTTGCAACACCCCTGAATCAGA
AAGCCCTTGCTTTTGGTGCTGATCTTGTCGTCCACTCTCTTACAAAGTACATCGGAGGAC
ACAACGATGTTCTTGGTGGATGCATCTGTGGCCCACTGAAGGTGGTTTCAGAAATTCGCA
ATCTGCATCATGTGTTGGGAGGCACACTTAATCCGAACGCTGCATACCTAATGATCCGAG
GCATGAAGACAATGCATCTTCGTGTAAAGCAACAGAATTCTACTGCCTCAAGGATGGCCG
AAATTTTAGAGGCACATCCTAAGGTGAGTCATGTGTACTATCCAGGCCTTGCAAGTCATC
CCGAGCATCACATTGCCAAGCGACAAATGACTGGTTTTGGAGGCGTGTTCAGTTTCGAGA
TTGATGGAGACATTGAAAGAACGATAAAGTTTGTGGATTCACTAAAGATTCCTTACATCG
CACCATCTTTTGGTGGCTGCGAAAGCATCGTGGAC*AACCGGCCATCATGTCTTACTGGG
ATCTGACACAGA**GAGAGGCTAAAGTATGGA
TCAAGACA

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DS 

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TGGTTTCAGAAATTCGCAATCTGCATCATGTGTTGGGAGGCATACTTAATCCGAACGCTG
CGTACCTAATGATCCGAGGCATGAAGACAATGCATCTTCGTGTAAAGCAACAGAATTCTA
CTGCCTCAAGGATGGCCGAAATTTTAGAGGCACATCCTAAGGTGAGTCATGTGTACTATC
CAGGCCTTGCA*GTCATCCCGAGCATCACATTGCCAAGCGACAAATGACTGGTTTTGGAG
GTGTGGTCAGTTTCGAGATTGATGGAGACATTGAAAGAACGATAAAGTTTGTGGATTCAC
TCAAGATTCCTTACATCGCACCATCTTTTGGTGGCTGCGAAAGCATCGTGGACCAACCGG
CCATCATGTCTTACTGGGATCTGACACAGGAGGAGAGGCTAAAGTATGGAATCAAAGACA
ACTTGGTACGTTTCAGCTTTGGAGTTGAAGACTTTGAAGATGTCAAAGCTGACATTCTTC
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TTGAACGGTTGGTCATTGTAATAATGTTGTCTTTGAACTATTGTTCGGCGACATTTACCG
TTTCGTAATAACGATGAACTATTTATGTTTGTTGGTTT

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DS 

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GCCTTGCAAGTCATCCCGAGCATCACATTGCCAAGCGACAAATGACTGGTTTTGGAGGCG
TGTTCAGTTTCGAGATTGATGGAGACATTGAAAGAACGATAAAGTTTGTGGATTCACTAA
AGATTCCTTACATCGCACCATCTTTTGGTGGCTGCGAAAGCATCGTGGACCAACCGGCCA
TCATGTCTTACTGGGATTTGACACAGGAGGAGAGGCTAAAGTATGGAATCAAAGACAACT
TGGTACGTTTCAGCTTTGGAGTTGAAGACTTTGAAGATGTCAAAGCTGACATTCTTCAAG
CTCTCGAAGCCATTTGAAATTCCCAATTATTTCACCCCCAAAAACACAATGTCGTTTCTG
TCATCTTTTGAATTATTGTCTGTTTCCTTTGTCTCTTTTCTTTTTATCGCTCTCTATTTG
AACGGTTGGTCATTGTAATAATGTTGTCTTTGAACTATTGTTCTTTGACATTTACCGTTT
CGTAATAACGATGAACTATTTATGTTTGTTGGTTT

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 4

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CTTCTGTCTTTCTGTCTTCGACTCTCTCTTCTTCAGCTATGGGGATCTCCTTCAGCAACC
GTAGACGAAACAACCACCACCGCCGCTACCACCATCACCTCCCTCCTCCTCCGCCCTACT
ATTACTCCGATCAACCACAACAACCGCCGCCTCAACCACCACCGAACAACGAGTACAGCT
ACACTCACAACCACCTCGTCTCAGCTCCGCAATACTCTCTTCCTCCCCCACCCTCTCAGC
CTCATCCTCCGCCGCAGATTAATTACGGATCCTACGGCTATAACTACAATCCAAACCCGC
AGCAGCAACAGCCTCCTCCGTATTTCTACAATGGGTGGAATAACACGATGATGAGACCGG
TTTTCTACGGTCCAGCTCCCGTGGTGGTTGACCAACAGCCTCCTCAGGCGTTGGTGGAGC
ATCAGAGCGCCAAGAAGGTGAGGAACGATGTCAATGTCCATAAAGATACGGTGAGGCTCG
AATCAGACGATCTTAACCCTGGCTATCACCTAGTTTCCTTCCTCTTCGATGCCGTATTCG
ATGGCAGTTTTACTATCATATTTTTCGCAAAGGAGGAAGAAAACTGCACAATCGTCCCTC
ATTATCCAGAAGCTTTCAGACCAACCAAAGTCCCATTCCAAAAAGGCACAGCACAGAAGT
TTATACAACCTTCAGGGACAGGAACAGACCTAGGTTTCTTTTCGCTCGACGATCTATCGA
GCCCGTCACCAGAAGAGGTTTACCCACTTGTGATATCAGCAGAGACTGTGATCTCACCGA
GCTCGGGCTCAGAGGAACCGTTAGTTCACAAGCAAGTCACGCATGCGTGTCTGGAGAAGG
CTGATGGCGATGGATCTTTCAAAGTGAAAGTCGTGAAACAGATCCTATGGATCGAAGGAG
CTAGGTATGAGCTGCGTGAGCTGTATGGTATCGATAACTCGACGGCTCAAGATGATGTTG
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ACACCGCCGTGATGCCTTGTAGACATTTGTGTTTGTGCAGTGACTGCGCTAAAGAGCTGA
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AAGTGGAAAGTAGCAATGAACAACACTGAAAAAGAGGTTTCTTCTTTGTTGCTTCACTCT
TAAGTTTGTTTCTGTTTATCTCTAAAGCCTCAAATCAATTCTTTTGCTTTTTTCTTTTGT
CCCTTATACAAACCTTTGTCTTTGTTTTCTCATTTCATACTCTGCACAGATTTGTTGGTC
TTAGTTTGAAAATTTGAAAAGAAACACATCAGTATTGTATATATCTTTAATGGCTTTTAG
AGAAACTCTCTCTGTGTTTCTTTCTGCGTGTAACTCTCATCAATTGCTTGTGTTAAATCT
GTTAATAAATGCTTTTGTGTTTGCT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RS1AX89TF U 1
AF RS1C223TF U 501
AF RS1C223JQ C 834
AF RS1AX89JQ C 918
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CTTCTGTCTTTCTGTCTTCGACTCTCTCTTCTTCAGCTATGGGGATCTCCTTCAGCAACC
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ATTACTCCGATCAACCACAACAACCGCCGCCTCAACCACCACCGAACAACGAGTACAGCT
ACACTCACAACCACCTCGTCTCAGCTCCGCAATACTCTCTTCCTCCCCCACCCTCTCAGC
CTCATCCTCCGCCGCAGATTAATTACGGATCCTACGGCTATAACTACAATCCAAACCCGC
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G
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TTTTCGCAAAGGAGGAAGAAAACTGCACAATCGTCCCTCATTATCCAGAAGCTTTCAGAC
CAACCAAAGTCCCATTCCAAAAAGGCACAGCACAGAAGTTTATACAACCTTCAGGGACAG
GAACAGACCTAGGTTTCTTTTCGCTCGACGATCTATCGAGCCCGTCACCAGAAGAGGTTT
ACCCACTTGTGATATCAGCAGAGACTGTGATCTCACCGAGCTCGGGCTCAGAGGAACCGT
TAGTTCACAAGCAAGTCACGCATGCGTGTCTGGAGAAGGCTGATGGCGATGGATCTTTCA
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TGTATGGTATCGATAACTCGACGGCTCAAGATGATGTTGCGTCAGGGTTAGAGGATAGTG
GTGACAAAGAATGCGTCATTTGCTTGACTGAACCTAAGGACACCGCCGTGATGCCTTGTA
GACATTTGTGTTTGTGCAGTGACTGCGCTAAAGAGCTGAG*TTTCAGTCAAACAAGTGTC
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AACACTGAAAA
GAGTTTCTTCTTTGT

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GAAGGAGCTAGGTATGAGCTGCGTGAGCTGTATGGTATCGATAACTCGACGGCTCAAGAT
GATGTTGCGTCAGGGTTAGAGGATAGTGGTGACAAAGAATGCGTCATTTGCTTGACTGAA
CCTAAGGACACCGCCGTGATGCCTTGTAGACATTTGTGTTTGTGCAGTGACTGCGCTAAA
GAGCTGAGGTTTCAGTCAAACAAGTGTCCCATATGTCGACAACCTATCGATGAGCTTTTA
ATGATTAAAGTGGAAAGTAGCAATGAACAACACTGAAAAAGAGGTTTCTTCTTTGTTGCT
TCACTCTTAAGTTTGTTTCTGTTTATCTCTAAAGCCTCAAATCAATTCTTTTGCTTTTTT
CTTTTGTCCCTTATACAAACCTTTGTCTTTGTTTTCTCATTTCATACTCTGCACAGATTT
GTTGGTCTTAGTTTGAAAATTTGAAAAGAAACACATCAGTATTGTATATATCTTTAATGG
CTTTTAGAGAAACTCTCTCTGTGTTTCTTTCTGCGTGTAACTCTCATCAATTGCTTGTGT
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CCG

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DS 

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GAGCTGTATGGTATCGATAACTCGACGGCTCAAGATGATGTTGCGTCAGGGTTAGAGGAT
AGTGGTGACAAAGAATGCGTCATTTGCTTGACTGAACCTAAGGACACCGCCGTGATGCCT
TGTAGACATTTGTGTTTGTGCAGGGACTGCGCTAAAGAGCTGAGGTTTCAGTCAAACAAG
TGTCCCATATGTCGACAACCTATCGATGAGCTTTTAATGATTAAAGTGGAAAGTAGCAAT
GAACAACACTGAAAAAGAGGTTTTTTTTTTGTTGCTTCACTTTTAAGTTTGTTTCTGTTT
ATCTTTAAAGCCTCAAGTCAATTTTTTTGCTTTTTTTTTTTGTCCCTTATACAAACCTTT
GTTTTTGTTTTTTCATTTCATACTTTGCACAGATTTGTTGGTTTTAGTTTGAAAATTTGA
AAAGAAACACATCAGTATTGTATATATCTTTAATGGCTTTTAGAGAAACTCTTTCTGTGT
TTCTTTTTGCGTGTAACTTTCATCAATTGCTTGTGTTAAATCTGTTAATAAATGCTTTTG
TGTTTGCT

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DS 



AS 1 3

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CATCACAGTTTCGTACTAACTCGAGAGCCCAAGAAATAAGAAAGAAGAAAGAAGAAACAC
GAAACAATGGAGAATCTATTGGGACTTCTCAGAATTCATGTGAAGAGAGGTGTGAATCTC
GCCATCAGAGATATCGCAAGCAGCGATCCCTACATCGTTTTTAACTTCGGAAACAAGAAG
CTGAAAACTCACGTGGTCAAACATAATGTAAACCCAGAGTGGAACGATGATTTGACTCTT
TCTGTGACTGATCCAAATCTCCCTGTTAAACTTACGGTTTACGACAAGGACATACTCTCT
GCGGATGATAAGATGGGAGAAGCAGAGTTTAGCATTGCTCCATATCTTGAAGCCATTAAG
TTTCGCCCTAAGATCGAAAGAGGACTTCCCAATGGAACCATAATAATGAAGATACAGCCA
AACAGACAGAACTGTCTGTCTGAAGAGAGCCACATTGTGTGGAACCAAGGCAAGCTTCTT
CAGAATATGTTCATTAGGCTCCAGAACGTAGAGTCC*GGAGAGGTTGAGCTACAGCTCGA
GTGGATCGATGTCCCCGGTTCAAAGGGTATTTAAGTCACTTCATATCACTCTGACCCGAT
CCTTATCCCTCGTGCTCGTGCATATATGGTTTATTTGGCATTGAAGAATCTCAAACTGGT
TATGCAATAAGCTCTCTTTTCTTTTGTTCTTTTCGAGCTCAATAAGTGTGCAAGTCCAGG
AGGACTGACTTAGTAAGTGTAACATTTGGATACCAGTTATATTCCTCTCTCGTTTGCTTG
AATAGGCAACAAATCAACCAACCAAACTTCTGTAAGATGCTAAATTTACCATTGTAACTT
AGATGGGGTAAAGTTTCGATCGTACAAAGAATCCTGCAACTTTGTTTCCTATCCTCTCAA
GTTTCTAGATCTAGATGTGTTCTTCTGTAAAAGAATTTCTTGTACAAGGGAATATCGCGA
TGTATATGTATCAGGGATCCTATTGTGATAATTATCAATAGAATATTTCTATTATTAAGT
CT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RS1B915TF U 1
AF RS1BZ38JQ C 464
AF RS1BZ38TF U 464
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CATCACAGTTTCGTACTAACTCGAGAGCCCAAGAAATAAGAAAGAAGAAAGAAGAAACAC
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CTGAAAACTCACGTGGTCAAACATAATGTAAACCCAGAGTGGAACGATGATTTGACTCTT
TCTGTGACTGATCCAAATCTCCCTGTTAAACTTACGGTTTACGACAAGGACATACTCTCT
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CAGAATATGTTCATTAGGCTCCAGAACGTAGAGTCCCGGAGAGGTTGAGCTACAGCTCGA
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CCTTATCCCTCGTGCTCGTGCATATATGGTTTATTTGGCATTGAG**ATCTCAA*CTGGT
TATGCA*TAAGCTCTCTTTTCTTTTGTTCTTT
CGAGCTC

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DS 

RD RS1BZ38JQ 619 0 0
G
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TTTACCATTGTAACTTAGATGGGGTAAAGTTTCGATCGTACAAAGAATCCTGCAACTTTG
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DS 

RD RS1BZ38TF 619 0 0
G
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ATCACTCTGACCCGATCCTTATCCCTCGTGCTCGTGCATATATGGTTTATTTGGCATTGA
AGAATCTCAAACTGGTTATGCAATAAGCTCTCTTTTCTTTTGTTCTTTTCGAGCTCAATA
AGTGTGCAAGTCCAGGAGGACTGACTTAGTAAGTGTAACATTTGGATACCAGTTATATTC
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TTTACCATTGTAACTTAGATGGGGTAAAGTTTCGATCGTACAAAGAATCCTGCAACTTTG
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CAAGGGAATATCGCGATGTATATGTATCAGGGATCCTATTGTGATAATTATCAATAGAAT
ATTTCTATTATTAAGTCT

QA 2 619 2 619
DS 



AS 1 4

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ATTCCTCGTCTCCGTTTCGTTTTGCGATAACGACGACGGCGATGATATTTTGATCCGGCA
AGTGGTTAACGGATCGGAGCCGAAAGTATTATTATCATCGGAGGATCACTTTTCTCTGTT
CAAGAGGAGATTCGGAAAGGTTTACGGTTCTCTCGAGGAGCACCGCCACAGATTCTCTGT
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TCTTCCTGAGGATTTTGATTGGAGAGATCGTGGAGCGGTTACTCCCGTCAAGAATCAGGG
ATCATGTGGATCGTGCTGGAGTTTCAGTACTACAGGCGCGCTTGAAGGCGCTCACTTCCT
CTCAACTGGCCAACTTGTTAGTCTCAGTGAACAACAGCTCGTAGATTGTGATCACGAGTG
TGATCCTGAACAGGAAGGTTCATGTGACTCTGGTTGCAACGGCGGCCTAATGAACAGCGC
CTTTGAGTACACCCTCAAAACCGGAGGGCTTATGCGAGAGGAAGACTATCCCTACACAGG
TACCGATGGTGGGACCTGTAAGTTGGACAAGTCTAAGATTGTTGCCTCTGTCTCCAACTT
CAGTGTTGTCTCTATTAACGAAGACCAAATCGCTGCAAATCTTGTCAAAAAACGGTCCTC
TTGCTGTGGCTTTAAATGCAGCTTACATGCAAACCTACATTGGAGGAGTCTCGTGCCCTT
ACATATGCTCGAAGCGGCTCAACCATGGTGTGTTGTTGGTGGGTTATGGCTCGGCCGGTT
TTTCTCAGGCAAGGTTCAAGGAAAAGCCGTATTGGATCATCAAAAACTCATGGGGAGAAA
CCTGGGGCGAGAATGGTTTCTATAAGTTATGTAAAGGCCGTAATGTTTGCGGCATTGACA
GTATGGTTTCCACCGTCGCTGCCGCTGTCTAGAGGGTTTTTATTATTATTAAGCAATCTG
AGCTCTTTAGCATTTGTCTCTTGTTCCAGTTATAAAACCTGTAAATAAATTAAAAGAAAC
GCATTTCTCGGT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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GG
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G

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DS 

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CTTTGAGTACACCCT

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DS 

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TTGATTGGAGAGATCGTGGAGCGGTTACTCCCGTCAAGAATCAGGGATCATGTGGATCGT
GCTGGAGTTTCAGTACTACAGGCGCGCTTGAAGGCGCTCACTTCCTCTCAACTGGCCAAC
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AATGCAGCTTACATGCAAACCTACATTGGAGGAGTCTCGTGCCCTTACATATGCTCGAAG
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TGTCTCTTGTTCCAGTTATAAAACCTGTAAATAAATTAAAAGAAATGCATTTCTCGGT

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GCTCACTTCCTCTCAACTGGCCAACTTGTTAGTCTCAGTGAACAACAGCTCGTAGATTGT
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ATGAACAGCGCCTTTGAGTACACCCTCAAAACCGGAGGGCTTATGCGAGAGGAAGACTAT
CCCTACACAGGTACCGATGGTGGGACCTGTAAGTTGGACAAGTCTAAGATTGTTGCCTCT
GTCTCCAACTTCAGTGTTGTCTCTATTAACGAAGACCAAATCGCTGCAAATCTTGTCAAA
AA*CGGTCCTCTTGCTGTGGCTTTAAATGCAGCTTACATGCAAACCTACATTGGAGGAGT
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ATGGGGAGAAACCTGGGGCGAGAATGGTTTCTATAAGTTATGTAAAGGCCGTAATGTTTG
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TAAGCAATTTGAGCTCTTTAGCATTTGTCTCTTGTTCCAGTTATAAAACCTGTAAATAAA
TTAAAAGAAACGCATTTCTCGGT

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 3

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TGACTTCCATATGGCTTCATCCGTCTCTGAACAGTCCGCAAAACCTCAAGATGTTTGTGT
TGTGGGAGTGGCGAGAACGCCTATGGGAGACTTCCTAGGCTCCCTCTCTTCTTTGACCGC
CACAAGACTCGGCTCCATAGCCATTGAAGCCGCACTTAAGAGAGCAAACGTTGAACCGGC
TCTTGTGGAAGAGGTTTTCTTTGGTAATGTCTTAACCGCCAATCTTGGACAAGCGCCAGC
AAGACAGGCTGCACTCGGTGCTGGGATTCCTTATTCAGTGATCTGCACCACTGTCAACAA
AGTCTGTGCTGCTGGAATGAAAGCTGTAATGTTAGCTGCTCAAAGTATCCAGCTCGGTTT
GAATGACGTTGTTGTGGCTGGTGGAATGGAGAGCATGTCAAACGTCCCCAAGTACCTCCC
AAACGCAAGGAGGGGTTCACGGTTAGGACATGATATTGTTGTCGACGGTATGACGAAAGA
TGGACTCTGGGGATGTGTACAATGACTTTGGAATGGGAGCTTGTGGAGAAATATGCGCTG
AGCAGTACCGTATTACAAGAGAAGAACAGGATGCTTATGCTATACAGAGCTTTGAGCGTG
GCATTGCTGCACAAAACACTCGGTTGTTCGCTTGGGAAATTGTTCCGGTAGAAGTTTCTT
CTGGAAGAGGGAAGCCATCTGTTGTTATTGACAAGGATGATGGACTGAGGAAGTTTGATG
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GCAATGCATCAAGTATAAGTGATGGTGCGGCGGCGTTAGTGCTAGTTAGTGGAAAGAAGG
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TGGCCAATCAGAAACTGCTGGGATTAGATCCTGAACGGCTGAATGCACATGGAGGGGCTG
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TGTTGAGAGCAAAGAAGGGAAAGTATGGAGTGGCATCAATATGCAACGGAGGAGGAGGAG
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CAATCGGATATTCAGCACTCTGAAGCTTGTTATAGAACGCAAAGCATGTAATGTGTACAT
TGTTTTAAGTTTGTGTGTCATGAGATGCAATAAAAGTGTGTTAGAAATAAAACTAATATT
AATACACACATAAAAGTAAACTTGTTATGCCATGGAGTTGAGAGGTACATTTTCCTTTTT
TTTTTGAACAACAGAGAGGTACATTTTCCAAAACTACAAATAGATTTGCTGC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CY83TF U 1
AF RS1FH02TF U 618
AF RS1CY83JQ C 863
BS 1 675 RS1CY83TF
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RD RS1CY83TF 686 0 0
GAGTGATCTTTCTCTTTTGATCCTCATCTCTGAATTCTCAGGCTCGACATAATTTCTTGG
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TGTGGGAGTGGCGAGAACGCCTATGGGAGACTTCCTAGGCTCCCTCTCTTCTTTGACCGC
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TCTTGTGGAAGAGGTTTTCTTTGGTAATGTCTTAACCGCCAATCTTGGACAAGCGCCAGC
AAGACAGGCTGCACTCGGTGCTGGGATTCCTTATTCAGTGATCTGCACCACTGTCAACAA
AGTCTGTGCTGCTGGAATGAAAGCTGTAATGTTAGCTGCTCAAAGTATCCAGCTCGGTTT
GAATGACGTTGTTGTGGCTGGTGGAATGGAGAGCATGTCAAACGTCCCCAAGTACCTCCC
AAACGCAAGGAGGGGTTCACGGTTAGGACATGATATTGTTGTCGACGGTATGACGAAAGA
TGGACTCTGGGGATGTGTACAATGACTTTGGAATGGGAGCTTGTGGAGAAATATGCGCTG
AGCAGTACCGTATTACAAGAGAAGAACAGGATGCTTATGCTATACAGAGCTTTGAGCGTG
GCATTGCTGCACAAA*CACTCGGTTG

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1FH02TF 615 0 0
G
GAGAAGAACAGGATGCTTATGCTATACAGAGCTTTGAGCGTGGCATTGCTGCACAAAACA
CTCGGTTGTTCGCTTGGGAAATTGTTCCGGTAGAAGTTTCTTCTGGAAGAGGGAAGCCAT
CTGTTGTTATTGACAAGGATGATGGACTGAGGAAGTTTGATGCTGCCAAGTTAAAGAAGC
TTAGACCAAGCTTCAAGGAGGATGGTGGATCAGTCACTGCTGGCAATGCATCAAGTATAA
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CCACGCCGGCACTTGCTATTCCTAAAGCTATAACGCGTGCTGGTTTAGATGCATCTCAAG
TGGATTACTATGAAATCAACGAAGCTTTCTCTGTTGTAGCTCTGGCCAATCAGAAACTGC
TGGGATTAGATCCTGAACGGCTGAATGCACATGGAGGGGCTGTTGCACTGGGACATCCAC
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GAAAGTATGGAGTG

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DS 

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TATTGCTAGGATTAGAGGATACGCTGATGCTGCTCAGGCACCTGAGTTGTTCACAACCAC
TCCGGCACTTGCTATTCCTAAAGCTATAATGCGTGCTGGTTTAGACGCATCTCAAGTGGA
TTACTATGAAATAAATGAAGCTTTCTCTGTTGTAGCTCTGGCCAATCAGAAACTGCTGGG
ATTAGATCCTGAACGGCTGAATGCACATGGAGGGGCTGTTGCACTGGGACATCCACTAGG
ATGCAGCGGTGCTCGTATTTTAGTCACATTATTAGGGGTGTTGAGAGCAAAGAAGGGAAA
GTATGGAGTGGCATCAATATGCAACGGAGGAGGAGGAGCATCAGCACTTGTTCTTGAGTT
CATGTAAGCTCCTTCTTTTTAACTCTGGTCGGAGAAGACAATCGGATATTCAGCACTCTG
AAGCTTGTTATAGAACGCAAAGCATGTAATGTGTACATTGTTTTAAGTTTGTGTGTCATG
AGATGCAATAAAAGTGTGTTAGAAATAAAACTAATATTAATACACACATAAAAGTAAACT
TGTTATGCCATGGAGTTGAGAGGTACATTTTCCTTTTTTTTTTGAACAACAGAGAGGTAC
ATTTTCCAAAACTACAAATAGATTTGCTGC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 3

CO CL2670Contig1 785 3 9 U
GGGTCCCAGATTTAAGTAAATATCGAATTGTATTCCGAGCTTGCTGGAGGAGGAAGAAAG
AGCAGCGATTTCCGTTCATTAGTTATCGTAGTTAACTCTATTTTCACGGTTGTTT*AGAG
CTTT*GTATTCGAGAATGGCTGAGGAAGCGCACAAGGTTACGTTGAATGTCTACGACCTA
AGCCGAGGCTTGGCTCGCCAGCTCTCTGCTTCATTTTTGGGGAAGGTTATCGAAGGTGTC
TGGCATACGGGAGTGGTTGTGTATGGAAGTGAATACTTTTTCGGAGGAGGCATCCAGCAT
CTGCCTGCTGGAACCACCCCATACGGAGCACCGCTGCGAACGGTAGAGCTGGGTGAAACA
CATGTTCCTAAAGATGTGTTCGAGATGTACTTGGAGGAGATCAGTCCACGTTACACTGCT
GAATCATACAATCTGCTGGCTCACAACTGTAACAACTTCAGCAACGAGGTCGCTCAGTTT
CTGGTCGGTAAAGGGATTCCAGAGTACATTCTCGACCTTCCGAACGAGGTCATGAACAGC
CCCATGGGTGGTCTTATAATGCCTATGATTCAAAACCTCGAGACGACTCTGAGAGCCGGC
GCTGTTCCTAACGCTCCCCAGTTTAGGCCTCAGGCACAGCCTTTTGGTGCTTTTGGCAAG
GATGAAAGTCCGAAACTACCGAGCAAGTCCAAAGAGAATCACTCTAAATCTGAGATGCCA
AAACCTCGGTTCCAGCTGAGAAAGTTGCACCTGCTATTGCTCAAGCTTCTTCTAGTAAAG
AGAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 

AF RS1DE61TF U 1
AF RS1AR89TFB U 12
AF RS1A762TF U 82
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RD RS1DE61TF 569 0 0
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AGCAGCGATTTCCGTTCATTAGTTATCGTAGTTAACTCTATTTTCACGGTTGTTT*AGAG
CTTT*GTATTCGAGAATGGCTGAGGAAGCGCACAAGGTTACGTTGAATGTCTACGACCTA
AGCCGAGGCTTGGCTCGCCAGCTCTCTGCTTCATTTTTGGGGAAGGTTATCGAAGGTGTC
TGGCATACGGGAGTGGTTGTGTATGGAAGTGAATACTTTTTCGGAGGAGGCATCCAGCAT
CTGCCTGCTGGAACCACCCCATACGGAGCACCGCTGCGAACGGTAGAGCTGGGTGAAACA
CATGTTCCTAAAGATGTGTTCGAGATGTACTTGGAGGAGATCAGTCCACGTTACACTGCT
GAATCATACAATCTGCTGGCTCACAACTGTAACAACTTCAGCAACGAGGTC*CTCAGTTT
CTGGTCGGTAAAGGGATTCCAGAGTACATTCTCGACCTTCCGAACGAGGTCATGAACAGC
ACCATGGGTGGTCTTATAATGCCTATGAT

QA 1 569 1 569
DS 

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GGAAGC
AAATATCGAATTGTATTCCGAGCTTGCTGGAGGAGGAAGAAAGAGCAGCGATTTCCGTTC
ATTAGTTATCGTAGTTAACTCTATTTTCACGGTTGTTT*AGAGCTTT*GTATTCGAGAAT
GGCTGAGGAAGCGCACAAGGTTACGTTGAATGTCTACGACCTAAGCCGAGGCTTGGCTCG
CCAGCTCTCTGCTTCATTTTTGGGGAAGGTTATCGAAGGTGTCTGGCATACGGGAGTGGT
TGTGTATGGAAGTGAATACTTTTTCGGAGGAGGCATCCAGCATCTGCCTGCTGGAACCAC
CCCATACGGAGCACCGCTGCGAACGGTAGAGCTGGGTGAAACACATGTTCCTAAAGATGT
GTTCGAGATGTACTTGGAGGAGATCAGTCCACGTTACACTGCTGAATCATACAATCCGCT
GGCTCACAACTGTAACAACTTCAGCAACGAGGTCGCTCAGTTTCTGGTCGGTAAAGGGAT
TCCAGAGTACATTCTCGACCTTCCGAACGAGGTCATGAACAGCCCCATGGGTGGTCTTAT
AATGCCTATGATTCAAAACCTGGAGACGACTCTGAGAGCCGGCGCTGTTCCTAACGCTCC
CCAGTTTAGGCCTCAGGCACAGCCTTTTGGTGCTTTTGGCAAGGAT

QA 7 652 7 652
DS 

RD RS1A762TF 704 0 0
GTTATCGTAGTTAACTCTATTT*CACGGTTGTTTTAGAGCTTTTGTTTCCGAGAATGGCT
GAGGAAGCGCACAAGGTCACGTTGAATGTCTACGACCTAAGCCGAGGCTTGGCACGCCAG
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TATGGAAGTGAATACTTTTTCGGAGGAGGAATCCAGCATCTGCCTGCTGGAACCACCCCG
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GAGATATACTTGGAGGAGATCAGTCCACGTTACACTGCTGAATCGTACAACCTGCTGGCT
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GACTACATTCTTGACCTTCCGAACGAGGTCATGAACAGCCCCATGGGTGGTCTTATAATG
CCTATGATTCAAAACCTCGAGACGACTCTGAGAGCCGGCGCTGTTCCTAACGCTCCCCAG
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AGCAAGTCCAAAGAGAATCACTCTAAATCTGAGATGCCAAAACCTCGGTTCCAGCTGAGA
AAGTTGCACCTGCTATTGCTCAAGCTTCTTCTAGTAAAGAGAAG

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 4

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AGAAAGAAAGAGGGATGTCATGGACGGTGAGGTTAGCCTTCAAAGAATGCAACTCCAATA
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AACAACATCTTACAAATTTGGCTCAAGCGACGAGGAGTTCATGGACTCAGATGACTACAC
TAGCACTCACGTACGCACAAGACCTTCCGTTATCCCCAACCTCGTTTCACGAACTCAAAT
CTTAATGCATCTCAACACGGAGGCATCAAACAAGAAGTTAGAAGAAGACACTCGCATCAC
AATTGGCTTCAAAAACTGGATCCTAACGAACCGGTGATGCTGTTCACAAGACCGCTGGTT
CCTGAGAAACTAGCAGCGGCAGGGATCGTTCCACCAGCACCTGATTCAACAACCTCGGGT
CAACCTCCAAGGCGGTTTCAGGGGAGGATTGGGCGTGGTGGACGGATAATATTCGACAGA
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AATCACCGTTCTGCCAACTTCAACTGAAATAAGTAATAATCATATTTCATAATCTTTTTT
TGTAAAGAATCTTCAGTGATGTGGAGGAGATGTGTAATGTAATAACTATCAAAGCACTTT
GTAACTAACCGGTTATGTCACCGGTTTAGAAAAACTTTGTAACATCTAGACAATTCGGTT
TAAATTATAATCCGGTTATGTAACCGGTTCATAAAAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1A328TV U 81
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QA 1 869 1 869
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CCGGTTTAGAAAA*CTTTGTA*CATCTAGACA
T

QA 1 812 1 812
DS 

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AAAAG

QA 1 845 1 845
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AACTCCAATACAGGCATGAAACAGAGCTCTTGGAAGAGAGCTTGGGTCTGCCTGGATTTC
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ATGACTACACTAGCACTCACGTACGCACAAGACCTTCCGTTATCCCCAACCTCGTTTCAC
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CAATTCGGTTTAAATTATAATCCGGTTATGTAACCGGTTCA

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DS 



AS 1 4

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TGTCATGTATTTTTTTGTATTCTATAGTTTGGTTATTTGTGCACACTGATGTTTCATGTA
CGTAAGTTATATGTTGTATGAATTCTTTGAAGCAAAAAATAAAGAAGTATGTGTGTTTT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1CX93JQ C 27
AF RS1CX93TF U 27
AF RS1AV77JQ C 172
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TCACATTTCTCTCTTTTATCTTATATCCTTCCTCTTCTTGTTTCATTTCACATTTAGAAG
AAAGTTTGGGGAGGAACACATACACACACACACACGATTCTCGACATATCTCCAGATCTG
ACCCCCTTCATAGATTCAAGAGCTTCTCTATGATACATCACAGAACCGAGCTGCTCGTGG
AGCTGATGTTTATATCCATGTTTCTCGCAAGCATTACGTTAGTAATCAAGTTGTGATCAA
ACATTCAAAGGAAGTCGTGTATTTTGACAAGACAAGTGGGTGAAACAATTGCTGCTATGG
TGATTTGCTGCTATTCAAAGGAAGTCTTGCATTCAAAGGAAGTCTTGCATTGTGATCAAA
CATTTGCTGCTATGGTATAATAATAGTTTTTATGTAAGTAATATTCAGAGTCATTTGCTT
CTCTGCATAGCCAAAATTGGATTGAACGAAGCAATAACATTATAATCAAGTTTGATAGAC
TGTCATGTATTTTTTTGTATTCTATAGTTTGGTTATTTGTGCACACTGATGTTTCATGTA
TGTAAGTTATATGTTGTATGAATTCTTTGAAGC

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DS 

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CCTTCCTCTTCTTGTTTCATTTCACATTTAGAAGAAAGCTTGGGGAGGAACACATACACA
CACACACACGATTCTCGACATATCTCCAGATCTGACCCCCTTCATAGATTCAAGAGCTTC
TCTATGATACATCACAGAACCGATCTGCTCGTGGAGCTGATGTTTATATCCATGTTTCTC
GCAAGCATTACGTTAGTAATCAAGTTGTGATCAAACATTCAAAGGAAGTCGTGTATTTTG
ACAAGACAAGTGG*TGAAACAATTGCTGCTATGGTGATTTGCTGCTATTCAAAGGAAGTC
TTGCATTCAAAGGAAGTCTTGCATTGTGATCAAACATTTGCTGCTATGGTATAATAATAG
TTTTTATGTAAGTAATATTCAGAGTCATTTGCTTCTCTGCATAGCCAAAATTGGATTGAA
CGAAGCAATAACATTATAATCAAGTTTGATAGACTGTCATGTATTTTTTTGTATTCTATA
GTTTGGTTATTTGTGCACACTGATGTTTCATGTACGTAAGTTATATGTTGTATGAATTCT
TTGAAGC
AAAAAA

QA 1 607 1 607
DS 

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CCTTCCTCTTCTTGTTTCATTTCACATTTAGAAGAAAGCTTGGGGAGGAACACATACACA
CACACACACGATTCTCGACATATCTCCAGATCTGACCCCCTTCATAGATTCAAGAGCTTC
TCTATGATACATCACAGAACCGATCTGCTCGTGGAGCTGATGTTTATATCCATGTTTCTC
GCAAGCATTACGTTAGTAATCAAGTTGTGATCAAACATTCAAAGGAAGTCGTGTATTTTG
ACAAGACAAGTGG*TGAAACAATTGCTGCTATGGTGATTTGCTGCTATTCAAAGGAAGTC
TTGCATTCAAAGGAAGTCTTGCATTGTGATCAAACATTTGCTGCTATGGTATAATAATAG
TTTTTATGTAAGTAATATTCAGAGTCATTTGCTTCTCTGCATAGCCAAAATTGGATTGAA
CGAAGCAATAACATTATAATCAAGTTTGATAGACTGTCATGTATTTTTTTGTATTCTATA
GTTTGGTTATTTGTGCACACTGATGTTTCATGTACGTAAGTTATATGTTGTATGAATTCT
TTGAAGCAAAAA*TAAAGAAGTATGTGTGT
CT

QA 1 630 1 630
DS 

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TGCTCGTGGAGCTGATGTTTATATCCATGTTTTTCGCAAGCATTACGTTAGTAATCAAGT
TGTGATCAAACATTCAAAGGAAGTCGTGTATTTTGACAAGACAAGTGGGTGAAACAATTG
CTGCTATGGTGATTTGCTGCTATTCAAAGGAAGTTTTGCATTCAAAGGAAGTCTTGCATT
GTGATCAAACATTTGCTGCTATGGTATAATAATAGTTTTTATGTAAGTAATATTCAGAGT
CATTTGCTTTTTTGCATAGCCAAAATTGGATTGAACGAAGCAATAACATTATAATCAAGT
TTGATAGACTGTCATGTATTTTTTTGTATTTTATAGTTTGGTTATTTGTGCACACTGATG
TTTCATGTATGTAAGTTATATGTTGTATGAATTCTTTGAAGCAAAAAATAAAGAAGTATG
TGTGTTTT

QA 1 488 1 488
DS 



AS 1 3

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CTTAAGACCAAAGTACAATGCTTTTGTTAGCCACGTGCCAACTCATACCGGCCAGCAATT
GCCACCAGTTGATATGAAGATTCTTGTTGCTGCTGCTATAGCCTTGAAGGGCATTGGTGG
ACTTTTGTTCGTCTTTGGCAGCTCTCTGGGAGCTTATCTCTTGCTTCTGCATCAAGCCGT
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AATGAAGAATTCGGGGAGACATGGTAGGCAACTCCGGAAGAAGGCTCCAAAAGCTAAAGC
AAACTGATAAAAAATGATGTTTTCATCGGGTTATTCAAGCTTTTGTCTGTATTTTTATTT
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BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1E136TF U 2
AF RS1GN52TF U 1
AF RS1GN52JQ C 96
BS 1 705 RS1GN52TF

RD RS1E136TF 608 0 0
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AGAGCTTCAATGGAGTTAGCTTCCTTTGTTGGTAGAGCTCTGTTCGTTTCCGTGTTCCTT
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ATGAAGAATTCGAGGAGACATGGTAGGCAACTCCGAAAGAAGGCTCCAAAAGCTAAAGCA
AACTGATAAAAAATGATGTTTTCATCGGGTTGTTCAAGCTTTTGTCTGTATTTTTATTTT
T
ATTTTGG

QA 1 601 1 601
DS 

RD RS1GN52TF 705 0 0
GGGAACTCTCGCTTCCTGTCTCTGCCTTGGATTCGTGAGAAGCAAAGAAAGAGAGAGACA
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TCTCTCCGCATGGCAAGAGTTCAATGGGTTTGGAGATGATGGAGGTCGAGCAGCTAAATC
CTTAAGACCAAAGTACAATGCTTTTGTTAGCCACGTGCCAACTCATACCGGCCAGCAATT
GCCACCAGTTGATATGAAGATTCTTGTTGCTGCTGCTATAGCCTTGAAGGGCATTGGTGG
ACTTTTGTTCGTCTTTGGCAGCTCTCTGGGAGCTTATCTCTTGCTTCTGCATCAAGCCGT
TGCCACCCCGATTCTGTGTGATTTCTACAACTACGATGTTGACAAAAAGGAATTCAGCCA
ACTGTTTTCCAAGTTTACTCAGAGCTTGGCACTCCTTGGGGCACTACTCTTCTTCATTGG
AATGAAGAATTCGGGGAGACATGGTAGGCAACTCCGGAAGAAGGCTCCAAAAGCTAAAGC
AAACTGATAAAAAATGATGTTTTCATCGGGTTATTCAAGCTTTTGTCTGTATTTTTATTT
TTTATTTTGGAAACCATGAGGAGAGGCAAAATCTTTGCTTATTTCCTTGATCTTATTGAC
AGTTTTTGTAGACACTTTTTGGTTCTCTAGAGAAAATACTATTCC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RS1GN52JQ 610 0 0
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CTATAGCCTTGAAGGGCATTGGTGGACTTTTGTTCGTCTTTGGCAGCTCTCTGGGAGCTT
ATCTCTTGCTTCTGCATCAAGCCGTTGCCACCCCGATTCTGTGTGATTTCTACAACTACG
ATGTTGACAAAAAGGAATTCAGCCAACTGTTTTCCAAGTTTACTCAGAGCTTGGCACTCC
TTGGGGCACTACTCTTCTTCATTGGAATGAAGAATTCGGGGAGACATGGTAGGCAACTCC
GGAAGAAGGCTCCAAAAGCTAAAGCAAACTGATAAAAAATGATGTTTTCATCGGGTTATT
CAAGCTTTTGTCTGTATTTTTATTTTTTATTTTGGAAACCATGAGGAGAGGCAAAATCTT
TGCTTATTTCCTTGATCTTATTGACAGTTTTTGTAGACACTTTTTGGTTCTCTAGAGAAA
ATACTATTCC

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 4

CO CL2674Contig1 843 4 9 U
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GAAGATCCATGGCCATCTCCTTAGCTAAGCTTCTGATCTCCGCCATGGCGGTTTTCACGC
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AAGGATCTGCGACGGCGTATGATGTGACTCTGGTTGATAAAACCTGGATTAAGAAAACTT
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TCGTTACTTTCCGCATCCCCACAAAGACTGCTCTTCAGCAAGCCTTCTCAAATCCAATAC
TACCTTTAAACATTCTCGCAGACCTCCCTCCAACTGACCCGCTTGCCGTGGCTAAGAGGA
TTCTGGCGAAATATGGATCACTTGTTTCAGTGATATCGATGGTGGTTTTGTTCATATACT
TGGTAGCAACACCTTCAAAGTCCAATTTAGCAAAGGCTGGCAGCAAGAAGAAGCGCTAAG
TTATTTGAAAATGAAGCTAAGAATGGTTGTTACGTTGCTTTTTTTTGTGTTTAGCAGTTA
AAACACAGTTTGAAAACTTGTAAGAAACGTAGAACACACTTTCACTTTGGTGTTTTGCAG
AGGACTATGTTAAAGAGTTATTTTGGTTTTGCGTCATAACGTCTTTTTGACAGCGTTGAA
GCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1EB13TF U 1
AF RS1GK90TF U 18
AF RS1GK90JQ C 364
AF RS1EB13JQ C 226
BS 1 452 RS1EB13TF
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RD RS1EB13TF 455 0 0
GGGGGAGGGTTCACGAGCTGAGGAAACCAATCGCAGATCTGTGACATACCAAATTCCAAC
GAAGATCCATGGCCATCTCCTTAGCTAAGCTTCTGATCTCCGCCATGGCGGTTTTCACGC
TCGTCACCGCTTCGTTCGCGACCTCGGAAATGCCGTTCATGGTGGTTCACAAGAAAGTTA
CTCTCAACAGGCTCAAATCCGGCGCCGAGCGCGTCCTCGTCTCCTTCGACATCTACAACC
AAGGATCTGCGACGGCGTATGATGTGACTCTGGTTGATAAAACCTGGATTAAGAAAACTT
TTGATCTTGTTAATGGAAACACTTCAAGGTCATGGGAGAGACTTGATGCAGGAGGTATTC
TGTCTCACTCTTTCGAACTTGAGGCTAAGGTTAAAGGGCCCTTCTATGGTAACCCTGCTG
TCGTTACTTTCCGCATCCCCACAAAGACTGCT
CTT

QA 1 452 1 452
DS 

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GG
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CTTAGCTAAGCTTCTGATCTCCGCCATGGCGGTTTTCACGCTCGTCACCGCTTCGTTCGC
GACCTCGGAAATGCCGTTCATGGTGGTTCACAAGAAAGTTACTCTCAACAGGCTCAAATC
CGGCGCCGAGCGCGTCCTCGTCTCCTTCGACATCTACAACCAAGGATCTGCGACGGCGTA
TGATGTGACTCTGGTTGATAAAACCTGGATTAAGAAAACTTTTGATCTTGTTAATGGAAA
CACTTCAAGGTCATGGGAGAGACTTGATGCAGGAGGTATTCTGTCTCACTCTTTCGAACT
TGAGGCTAAGGTTAAAGGGCCCTTCTATGGTAACCCTGCTGTCGTTACTTTCCGCATCCC
CACAAAGACTGCTCTTCAGCAAGCCTTCTCAAATCCAATACTACCTTTAAACATTCTCGC
AGACCTCCCTCCAACTGACCCGCTTGCCGTGGCTAAGAGGATTCTGGCGAAATATGGATC
ACTTGTTTCAGTGATATCGATGGTGGTTTTGTTCATATACTTGGTAGCAACACCTTCAAA
GTCCAATTTAGCAAAGGCTGGCAGCAAGAAGAAGCGCTAAGTTATTTGAAAATGAAGCTA
AGAATGGTTGTTACGTTGCTTTTTTT*GTGTTTAGCAGTTAAAACACAGTTTGAAA*CTT
GTAAGAAACGTAGA*CACACTTTCACTTTGGTGTTTTGCAGAGGACTATGTT

QA 3 774 3 774
DS 

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TTACTTTCCGCATCCCCACAAAGACTGCTCTTCAGCAAGCCTTCTCAAATCCAATACTAC
CTTTAAACATTCTCGCAGACCTCCCTCCAACTGACCCGCTTGCCGTGGCTAAGAGGATTC
TGGCGAAATATGGATCACTTGTTTCAGTGATATCGATGGTGGTTTTGTTCATATACTTGG
TAGCAACACCTTCAAAGTCCAATTTAGCAAAGGCTGGCAGCAAGAAGAAGCGCTAAGTTA
TTTGAAAATGAAGCTAAGAATGGTTGTTACGTTGCTTTTTTTTGTGTTTAGCAGTTAAAA
CACAGTTTGAAAACTTGTAAGAAACGTAGAACACACTTTCACTTTGGTGTTTTGCAGAGG
ACTATGTTAAAGAGTTATTTTGGTTTTGCGTC

QA 1 452 1 452
DS 

RD RS1EB13JQ 618 0 0
TCGACATCTACAACCAAGGATCTGCGACGGCGTATGATGTGACTCTGGTTGATAAAACCT
GGATTAAGAAAACTTTTGATCTTGTTAATGGAAACACTTCAAGGTCATGGGAGAGACTTG
ATGCAGGAGGTATTCTGTCTCACTCTTTCGAACTTGAGGCTAAGGTTAAAGGGCCCTTCT
ATGGTAACCCTGCTGTCGTTACTTTCCGCATCCCCACAAAGACTGCTTTTCAGCAAGCCT
TCTCAAGTCCAATACTACCTTTAAACATTCTCGCAGACCTCCCTCCAACTGACCCGCTTG
CCGTGGCTAAGAGGATTCTGGCGAAATATGGATCACTTGTTTCAGTGATATCGATGGTGG
TTTTGTTCATATACTTGGTAGCAACACCTTCAAAGTCCAATTTAGCAAAGGCTGGCAGCA
AGAAGAAGCGCTAAGTTATTTGAAAATGAAGCTAAGAATGGTTGTTACGTTGCTTTTTTT
TGTGTTTAGCAGTTAAAACACAGTTTGAAAACTTGTAAGAAACGTAGAACACACTTTCAC
TTTGGCGTTTTGCAGAGGACTATGTTAAAGAGTTATTTTGGTTTTGCGTCATAACGTCTT
TTTGACAGCGTTGAAGCC

QA 1 618 1 618
DS 



AS 2 4

CO CL2675Contig1 951 2 14 U
GATAAAATAACATCACATATTCACATAAAATAGTTCTTAATCAAGGTTTGTTTCCCCCTA
CATCTAACATGATAAAGCTTAACAATAAATAAAATAAACATAAAGTAGACAAAACACAAA
CAGAGAGACAAACATGTTGATTAGTTATTTTTCTTCTTCCTAACACTTAGAAGGCCTCTC
ATAATGAGGAGGCAAAGAAGGGCAATTCTCGTTCATGTTTGGATAAGGGTCAATGGTATT
ATAACCAGGCAACTCCATTCTGTACTCACCCAGAATCTGACAGAACTCAAGCTTCCCTTT
CTCCGTGTTACACCAACTCGGCAACCTCGTCTGATTATCTTCAAACATCCTCAGAGTATA
CGCATCTCGAATAGTGAACTCAGTGACTTGGATGTGATCAGCGAGAGGACCAAACACACC
AGCGGCTTTGTACATCGCAAGGATGAAAGCAACGCATGTCGTTGACTTCCCGTCGCTGTA
AACCCACTCATCCCGTTCAGGGATGGTGAGCAGCTCATCAAACGACATCCCACGCCTCGC
TGTTTCTTCAAGAACCCCATACAAATCAAGATCCTCAGTACCGAGCCGTTTATTGAGTGC
CTCGTTCCACATATTAGCAGCATACGCAGGTTGAACACGAGTCCACATAGACATGACAGA
AATAACCAAGTGAGCATCAAGGGGAGGCGGGTAGTTATCGGCAAGAGTATCGATCCAGCT
GAATATCATGTTGTGATATCCATAAGGCTTTCCCAGCATGCTCCGTGCGTACTCCCACGC
AGCGGTGTTATTAAACTTCCCTCGAACATCCGGATGCAAAGGAAGCAAAGCTACCTGCGG
GTTCGAACTATCCTTCAACGTTAGATCCCACCAATCATCCCAAGGAATCACAACGATGAT
CTCTTCACCCTTCTCGTTCTCATGACCAGACTCACCAACCCAAAGCCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DW70JQ U 1
AF RS1FB06JQ U 159
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BS 304 304 RS1FB06JQ
BS 305 368 RS1DW70JQ
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BS 495 522 RS1DW70JQ
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BS 524 676 RS1DW70JQ
BS 677 951 RS1FB06JQ

RD RS1DW70JQ 676 0 0
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ATAATGAGGAGGCAAAGAAGGGCAATTCTCGTTCATGTTTGGATAAGGGTCAATGGTATT
ATAACCAGGCAACTCCATTCTGTACTCACCCAGAATCTGACAGAACTCAAGCTTCCCTTT
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CGCATCTCTGATAGTGAATTCAGTGACTTGGATGTGATCAGCGAGAGGACCAAACACACC
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TGTTTCTTCAAGAACCCCATACAAATCAAGATCCTCAGTACCGAGCCGTTTATTGAGTGC
CTCGTTCCACATATTAGCAGCATACGCAGGTTGAACACGAGTCCACATAGACATGACAGA
AATAACCAAGTGAGCA

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1FB06JQ 793 0 0
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TTGGATAAGGGTCAATGGTATTATAACCAGGCAACTCCATTCTGTACTCACCCAGAATCT
GACAGAACTCAAGCTTCCTTTTCTCCGTGTTACACCAACTCGGCAGCCTCGTCTGATTAT
CTTCAAACATCCTCAGAGTATACGCATCTCGAATGGTGAACTCAGTGACTTGGATGTGAT
CAGCGAGAGGACCAAACACACCAGCGGCTTTGTACATTGCAAGGATGAAAGCAACGCATG
TCGTTGACTTCCCGTCGCTGTAAACCCACTCATCCCGTTCAGGGATGGTGAGCAGCTCAT
CAAACGACATTCCACGCCTCGCTGTTTCTTCAAGAACCCCATACAAATCAAGATCCTCAG
TACCGAGCCGTTTATTGAGTGCCTCGTTCCACATATTAGCAGCATACGCAGGTTGCACAC
GAGTCCACATAGACATGACAGAAATAACCAAGTGAGCATCAAGGGGAGGCGGGTAGTTAT
CGGCAAGAGTATCGATCCAGCTGAATATCATGTTGTGATATCCATAAGGCTTTCCCAGCA
TGCTCCGTGCGTACTCCCACGCAGCGGTGTTATTAAACTTCCCTCGAACATCCGGATGCA
AAGGAAGCAAAGCTACCTGCGGGTTCGAACTATCCTTCAACGTTAGATCCCACCAATCAT
CCCAAGGAATCACAACGATGATCTCTTCACCCTTCTCGTTCTCATGACCAGACTCACCAA
CCCAAAGCCTCCC

QA 1 793 1 793
DS 



CO CL2675Contig2 1148 2 12 U
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GGATTACTATTTCTCTGCTAGAGAACATACTTTGAGCTTTGGTTCTTGGGAAGAGACAGC
TGAGTTGGATTATGTGAAGGAGCATGGAGTTTCGGTGTTTCTTATGCCGTCGGGGATGCT
AGGGACGTTGCTTTCTTTGATCGATGTGTTGCCTCTCTTCTCCAACACGGGTTGGGGCCA
GAACGCGAACTTGGCCTTCTTGACGAAGCACATGGGCGCTACTTTCGAGAAGCGGCCTCG
GCCTTGGCGGTCCGTGATCGACCCGGAAGATGTACATTCTGGAGACTTCTTGGCCGTGTC
CAAGATTAGAGGAAGGTGGGGTGGGTTTGAGACTTTGGAGAAATGGGTGACCGGTGCTTT
CGCTGGTCACACCGCTGTTTGTTTGAAGGATGATTCTGGGAGGCTTTGGGTTGGTGAGTC
TGGTCATGAGAACGAGAAGGGTGAAGAGATCATCGTTGTGATTCCTTGGGATGAATGGTG
GGATCTAACGTTGAAGGATAGTTCAAACCCGCAGGTAGCTTTGCTTCCTCTGCATCCGGA
TGTTCGAGGGAAGTTTAATAACACCGCTGCGTGGGAGTACGCACGGAGCATGCTGGGAAA
GCCTTATGGATATCACAACATGATATTCAGCTGGATCGATACTCTTGCCGATAACTACCC
GCCTCCCCTTGATGCTCACTTGGTTATTTCTGTCATGTCTATGTGGACTCGTGTTCAACC
TGCGTATGCTGCTAATATGTGGAACGAGGCACTCAATAAACGGCTCGGTACTGAGGATCT
TGATTTGTATGGGGTTCTTGAAGAAACAGCGAGGCGTGGGATGTCATTTGATGAGCTGCT
CACCATCCCTGAACAGGATGAGTGGGTTTACAGCGACGGGAAGTCAACGACATGCGTTGC
GTTCATCCTTGCGATGTACAAAGCCGCTGGTGTGTTTGGTCCTCTCGCTGATCACATCCA
AGTCACTGAATTCACTATCAGAGATGCGTATACTCTGAGGATGTTTGAAGATAATCAGAC
GAGTTGCCGAGTTGGTGTAACACAGAGAAAGGAAGCTTGAGTTCTGTCAGATTCTGGGTG
AGTACAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FB06TF U 1
AF RS1DW70TF U 398
BS 1 432 RS1FB06TF
BS 433 433 RS1DW70TF
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BS 724 724 RS1DW70TF
BS 725 739 RS1FB06TF
BS 740 1148 RS1DW70TF

RD RS1FB06TF 739 0 0
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GCCTTATGGATATCACAACATGATATTCAGCTGGATCGATACTCTTGCCGATAACTACCC
GCC*CCCCTTGATGCTCAC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1DW70TF 751 0 0
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GGGAGGCTTTGGGTTGGTGAGTCTGGTCATGAGAACGAGAAGGGTGAAGAGATCATCGTT
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TACGCGCGGAGCATGTTGGGAAAGCCTTATGGATATCACAACATGATATTCAGCTGGATC
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TCTATGTGGACTCGTGTTCAACCTGCGTATGCTGCTAATATGTGGAACGAGGCACTCAAT
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GGGATGTCATTTGATGAGCTGCTCACCATCCCTGAACAGGATGAGTGGGTTTACAGCGAC
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TGAGTTCTGTCAGATTCTGGGTGAGTACAGA

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 4

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GGTGATAAATCTTGGTGATGTTGTGAGTAACCGGAGAATCAATGATAAATATCATCTGAT
TGATTCCAAAAATGGTCGGATTCAGATTGAGCTTCAGTGGTGAACTTCTTCTTGATACCA
AAGGTTTGTGTTTCCTTCTCCGAGGCCTGGATGATGAGTGATGACAGAACACTTTTTTTG
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GTTTATCTTTTGGTACTCCTATTTAATTAACAGACCCAATAAACATTCTGATTTAGCTTG
CAGCTTATTGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1DU66TF U 1
AF RS1B437TF U 1
AF RS1B437JQ C 90
AF RS1DU66JQ C 91
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RD RS1DU66TF 612 0 0
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AATGAACGTGATCCTACTAAAAGACCTTACTCCAGAGGAACCAAAGCTCATGACACTTGA
GCTTTTAAAATCCATGGAACCAAATGAACCAGTTAGCGAGAAATCCCGTGGGCAACTCGT
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TGTTCACGAAGCTGAAGATTTAGAAGGCAAATATCACACAAACCCTTCTGTTCGTTTGAT
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TGAAGATTTTCAGTTTCCATTAGATGAGCCTCCCATAAACGATAAGCTTCACGTTGAAGT
CATAAGTACTACTTCACGAATAGGTTTAAATATGCATCCTAAGGAAACTCTTGGATATGT
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TGATTCCAAAAA

QA 1 612 1 612
DS 

RD RS1B437TF 680 0 0
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AATGAACGTGATCCTACTAAAAGACCTTACTCCAGAGGAACCAAAGCTCATGACACTTGA
GCTTTTAAAATCCATGGAACCAAATGAACCAGTTAGCGAGAAATCCCGTGGGCAACTCGT
TGTTGAAGTTGAATATAAACCCTTTAAAGAAGATGACATTCCAGACAACTTAGAGGATCC
AAATGCAGTAGAGAAAGCACCTGAAGGCACACCTTCTGGTGGTGGATTGCTTGTGGTTAT
TGTTCACGAAGCTGAAGATTTAGAAGGCAAATATCACACAAACCCTTCTGTTCGTTTGAT
GTTTAAAGGAGAAGAGCGTAAAACAAAGCGTGTGAAGAAAAACAGAGAACCAAGATGGGA
TGAAGATTTTCAGTTTCCATTAGATGAGCCTCCCATAAACGATAAGCTTCACGTTGAAGT
CATAAGTACTACTTCACGAATAGGTTTAAATATGCATCCTAAGGAAACTCTTGGATATGT
GGTGATAAATCTTGGTGATGTTGTGAGTAACCGGAGAATCAATGATAAATATCATCTGAT
TGATTCCAAAAATGGTCGGATTCAGATTGAGCTTCAGTGGTGAACTTCTTCTTGATACCA
AAG*TTTGTGTTTCCTT
CTC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RS1B437JQ 762 0 0
C
TCCAGAGGAACCAAAGCTCATGACACTTGAGCTTTTAAAATCCATGGAACCAAATGAACC
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AGATGACATTCCAGACAACTTAGAGGATCCAAATGCAGTAGAGAAAGCACCTGAAGGCAC
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TCTAGTTTCATGGAAATTACTGGGACAACTGTTTATCTTTTGGTACTCCTATTTAATTAA
CAGACCCAATAAACATTCTGATTTAGCTTGCAGCTTATTGG

QA 2 762 2 762
DS 

RD RS1DU66JQ 761 0 0
TCCAGAGGAACCAAAGCTCATGACACTTGAGCTTTTAAAATCCATGGAACCAAATGAACC
AGTTAGCGAGAAATCCCGTGGGCAACTCGTTGTTGAAGTTGAATATAAACCCTTTAAAGA
AGATGACATTCCAGACAACTTAGAGGATCCAAATGCAGTAGAGAAAGCACCTGAAGGCAC
ACCTTCTGGTGGTGGATTGCTTGTGGTTATTGTTCACGAAGCTGAAGATTTAGAAGGCAA
ATATCACACAAACCCTTCTGTTCGTTTGATGTTTAAAGGAGAAGAGCGTAAAACAAAGCG
TGTGAAGAAAAACAGAGAACCAAGATGGGATGAAGATTTTCAGTTTCCATTAGATGAGCC
TCCCATAAACGATAAGCTTCACGTTGAAGTCATAAGTACTACTTCACGAATAGGTTTAAA
TATGCATCCTAAGGAAACTCTTGGATATGTGGTGATAAATCTTGGTGATGTTGTGAGTAA
CCGGAGAATCAATGATAAATATCATTTGATTGATTCCAAAAATGGTCGGATTCAGATTGA
GCTTCAGTGGTGAACTTTTTCTTGATACCAAAGGTTTGTGTTTCCTTTTCCGAGGCCTGG
ATGATGAGTGATGACAGAACACTTTTTTTGTTTCGAGTTCGTTGCGGTGTCCGTAGCATC
TCTAGTTTCATGGAAATTACTGGGACAACTGTTTATCTTTTGGTACTCCTATTTAATTAA
CAGACCCAATAAACATTTTGATTTAGCTTGCAGCTTATTGG

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 4

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CACTGATACAAATCAGTTTATAAATAATGTTTAGGGGACTAATTTATTTTAATTGTTTAA
TTCAATTACACCATAAAAATCAAATTGCACAATAAACAAACTCGACATTTTCTCTGTCAG
TTAAAAAAAAAAAAAATCTTAAAATATTCAGGCAACCTTTTAAATTTTCATATTCCAGCA
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GCCGGGCTATCAAACTCTTTTGCTTTACCTGCGTCTATGACCAAAACTCGATCACAGTCC
ATCACCGTTGGAATCCTGTGAGCTATGCTGATTATAGTACATGACTCAAAGTCTTCTCTG
ATAATCTTCTGAATCACGGCATCGGTTTGTGAATCTACAGATGCTGTCGCTTCGTCTAGG
AATAAAAGTCTGCTTCGTTTCAACATAACCCTGCCTAAACACAGAAGCTGTCTTTGTCCT
ACGCTCCAGTTCTCTCCACTATCAACCACCAACGAATCGAGCTTCTCAGGTTTTGTGGCA
ACAACATCCTTGAGTTGGCATCGTTCGAGGCTCTTCCAGATTTCTTCATCAGTGTATTGA
TCTGTTGGGTCGATGTTGCTCCTTACGGTTCCTTCAAAGAGGACTGGTTCTTGTGGAATG
ATTCCGAATCTTGACCTGAGATCATGTAACCCTAGAGTGCATATATCGATCCCATCGATG
ACTATCTTTCCAACTGATGGTTCTACAAGCCTGAACAAGACTTGGATCAACGTAGATTTC
CCGCTTCCTGTTCGTCCAACCACACCGACTTTCTCTCCTCATTTGATGTCCAGAGTGATT
CCTTTGAGCACAAGTGGAGTGTTTGGTCTGTACCGTACCTTGAGGTCTTCGAGATGTACA
TTGCCATGGACGGGCCAGTTAGAAGGTGGGGAGTTTTCTTTGCTCACCCACTCAGCTTCA
GCAGGAATATCAGTGAACTGTTTGATCCTTTCAACGGAAACCATATTGTTCTCGACAAAG
CAGCTCATATATATTGCCCAAAACAGAACCGAGTTCAAAGACAATCCATAAGAAAGAGAC
AAGCCGACATCTTCTGGTTCGATTACGTTGCTTGGTAACATTACCATAAACAGAGCCGAG
ATGCAGAGCACCCAGCTCCCAATAAGCTCTAGACGAAACCCAAGCCACTCGTTTGAACCA
TAGTTGTGGAAGTCCATCCTAAGATTGGCGTTAACACGCTTCACGTTCTCTTGCCTAAAC
AACTCATGTTTCCTGAATGATCTGATTGTCATCACTCCAGCTATACTTTCCGAGAAATGG
TGGATGACAGGAGCCTTAGTTATCGAGTCTAGGCGCGTCAGTTCACGGGAAGATGTGAGG
TAATAGTTCCGGTACCAGATGTTGAGCCATCCAAGAGGTATCACAAAGAATATAGTTGGC
CAAGCGTACTGACAAGTAACTATGAAAATGCTCAGCAGAGTAGTGTACATTGAGGCCACA
AGTCCAAGCATGAACGGTATGAAGATATCGACATTGGTCTGATCAGTCGATGCCCGACTG
AGGATTCTTCCAGATGGTGTGGTGTCGAAGAACGACATGGGAGCATGTAAGATACTGTTA
AGAATCTGTCGGAAGAAGATCTGAGCGGTCTTGAGTCCCAAGTGGGTGACGTAATATGAG
CGTAAGCTCACCAAAACGATGGAAACAAGAGCAATAATGACGTAGACACGAATAAAAACA
GAGGCGTCAAACGAAACAGCATTCTTGGATGATGTTTCGTATGCGAGCCAGTAATCC


BQ
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CCGCTTCCTGTTCGTCCAACCACACCG

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AAGA***TCTTAAAATATTCAGGCAACCTTTTAAATTTTCATATTCCAGCAGAACTGAGA
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TCAAACTCTTTTGCTTTACCTGCGTCTATGACCAAGACTCGATCACAGTCCATCACCGTT
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TGAATCACGGCATCGGTTTGTGAATCTACAGATGCTGTCGCTTCGTCTGGGAATAGAAGT
CTGCTTCGTTTCAACATAACCCTGCCTAAACACAGAAGCTGTCTTTGTCCTACGCTCCAG
TTCTCTCCACTATCAACCACCAACGAATCGAGCTTCTCAGGTTTTGTGGCAACAACATCC
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TCGATGTTGCTCCTTACGGTTCCTTCAAAGAGGACTGGTTCTTGTGGAATGATTCCGAAT
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ACAAGTGGAGTGTTTGGTCTGTACCGTACC

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CTAGGCGCGTCAGTTCACGGGAAGATGTGAGGTAATAGTTCCGGTACCAGATGTTGAGCC
ATCCAAGAGGTATCACAAAGAAT
CC

QA 9 751 9 751
DS 

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CCTGAATGATCTGATTGTCATCACTCCAGCTATACTTTCCGAGAAATGGTGGATGACAGG
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CGAAACAGCATTCTTGGATGATGTTTCGTATGCGAGCCAGTAATCC

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 2

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AAGTTTTAATTTTTAAATCGCTTTGATTTGGTCTCTCAATGGTTTGTATCCTAATGGTGA
CAGACACTTTGGTCTTTTAGCAAAGATTGCTAACTCTTGTCAGAAAAAAAAGCTAATCTC
TTTCAACAACCCAGATCGAAAGTTTGATCCTTTTTTTTCAGAAATCTTGGAGTTTAATTC
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TTGCTGCTGGGGATGGGCCTGAGTGGTCTGTTGGATGGACTGAGCCACATGGACCTGGTT
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CTGTCGTTGAAGGCTCTGGTAATAATAACCAGTTCTTGTCTGCTGTTAAGAATCTCCCCA
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TTTGACCAGGTCTCCTTCCTTTTGTATTTAGTTAAGTAGTTTTAGTTCTCTAATTCCATT
TTGGTTACTACATTAACCCTGAAAACTC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E529TF U 1
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DS 

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GG
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TTTTGGTTACTACATTAACCCTGAAAACTC

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DS 



AS 1 3

CO CL2679Contig1 1095 3 17 U
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GTTCCGGCGTCCTCATGTGCAAAATCGTTTATGACTTGACTGGTTTCATAAGTCCTTTAC
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ATTTTCCTACTCTTGGTGGTGTTGAATATGTTTTCCATCACTGCTTATCGATGTTCTCCA
TCATTCTTTCTGTCACAAGTGGACAAGCGCAGTTCTACATATTCATGGTTCTCTTGTCTG
AGGTCACTACCCCGTTTGTCAACCTACGGTGGTACTTGGATGCTAGTGGTCAAAAGGCTC
TAAGGCTTACACACTCAATGGGATTGCCCTGTTCTTGGGTTGGCTGGTCGCGAGGATCCT
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TTGGTTCTGGAAAATCACCAAAGGATTGATCAAAACAATCTCCAAGGCGACGGGAAAGAA
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AGGTATTCAACTTGTAAAGTTTTAAGCAGAATCAGTGTTTAAGTTCACTTGGATTTTAGT
GATGCTTGTTTTATC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DW36TF U 1
AF RS1EB48TF U 180
AF RS1EB48JQ C 363
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TCTCAACGTTCCATGCTGTTTTTGTTTCTGTGGCATCAATCTATCTCCTGGTGATTTCAG
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TCATTCTTTCTGTCACAAGTGGACAAGCGCAGTTCTACATATTCATGGTTCTCTTGTCTG
AGGCCACTACCCCGTTTGTCAGCCTACGGTGGT

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DS 

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GG
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TCAGTTTGATGAGAGTGGTCATGGTGATTCGGTCATCAATAGTACAACGAGGTTATCCGA
ATCTGTAATGGGGATCTCCTTAGGCTATTTTGTAGCAGACTTAATGATGATCTTTTGGCA
TTTTCCTACTCTTGGTGGTGTTGAATATGTTTTCCATCACTGCTTATCGATGTTCTCCAT
CATTCTTTCTGTCACAAGTGGACAAGCGCAGTTCTACATATTCATGGTTCTCTTGTCTGA
GGTCACTACCCCGTTTGTCAACCTACGGTGGTACTTGGATGCTAGTGGTCAAAAGGCTCT
AAGGCTTACACACTCAATGGGATTGCCCTGTTCTTGGGTTGGCTGGTCGCGAGGATCCTT
TTGTTTATCTACTTCTTTCTACACATGTACTCCCATTTCCACCAGGTGAAGCAAGTGTTT
CCACTGGGGTTTTACAGCCTTATTGCGGTTGGACCGGTCCTGTCGGCGATGAATCTTCTT
TGGTTCTGGAAAATCAC

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DS 

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TCTGTAATGGGGATCTCTTTAGGCTATTTTGTAGCAGACTTAATGATGATCTTTTGGCAT
TTTCCTACTCTTGGTGGTGTTGAATATGTTTTCCATCACTGCTTATCGATGTTCTCCATC
ATTCTTTCTGTCACAAGTGGACAAGCGCAGTTCTACATATTCATGGTTCTCTTGTCTGAG
GTCACTACCCCGTTTGTCAACCTACGGTGGTACTTGGATGCTAGTGGTCAAAAGGCTCTA
AGGCTTACACACTCAATGGGATTGCCCTGTTCTTGGGTTGGCTGGTCGCGAGGATCCTTT
TGTTTATCTACTTCTTTCTACACATGTACTCCCATTTCCACCAGGTGAAGCAAGTGTTTC
CACTGGGGTTTTACAGCCTTATTGCGGTTGGACCGGTCCTGTCGGCGATGAATCTTCTTT
GGTTCTGGAAAATCACCAAAGGATTGATCAAAACAATCTCCAAGGCGACGGGAAAGAAAA
AACAGTGATGGTCTCTGCTTGACATGGAAAAAAAAGATTGGGATTGCATTGACTTTGATC
TGTTCATGAAAAAAAGATCGATTGATATCATATTGGGACGTGTCTTTGAAGCCTTTTCGG
TTTTTAAGACTTGCCTTTATATGGGAATTGTATATTCACAACCTTTCAGCTGTTTCTTAG
GTATTCAACTTGTAAAGTTTTAAGCAGAATCAGTGTTTAAGTTCACTTGGATTTTAGTGA
TGCTTGTTTTATC

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 4

CO CL2680Contig1 1193 4 11 U
GGATCGCAAAAGTTTAAGATCAAAGCAAAACCAGATTTTTTTTCTCTCTGCATTATTTCT
CACCGTTCTTGGAAGATGACAATCTCTATTGAGAAGCCGATGTTTGTAGAGGAAGTTTCT
GCATTCCAGAAGAAGAGCGAGAACAACTTAAGAACTGCCAGCGAACACGATGACGCGTTC
TTGGCACCTGAGATGAATGCATTCGGCCGTCAATTCAGGGACTATGATGTTGAGAGTGAG
AGGCAGAAGGGCGTCGAAGAGTTTTACAGATTACAACACATTAACCAGACCGTCGATTTT
GTGAAAAAAATGAGGGCAGAATACGGAAAATTAGATAAAATGGTGATGAGCATTTGGGAA
TGTTGTGAGCTTCTTAACGAGGTGGTGGACGAGAGTGATCCAGATCTCGACGAGCCTCAG
ATTCAGCATTTGCTTCAATCTGCGGAAGCTATCCGCAAAGATTATCCTAATGAAGATTGG
CTTCATCTAACAGCTCTTATTCATGATCTTGGGAAGGTTATTACACTCCCACAGTTCGGA
GGACTTCCTCAATGGGCTACTGTTGGTGACACATTTCCTGTTGGGTGTGCATTTGATGAA
TCTAACGTGCACCACAAGTATTTTTCGGAAAATCCTGATTTTCACAACCAAGCCTACAAC
ACCAAATCTGGTATTTACACAGAAAGATGTGGCTTAAACAATGTCATGATGTCATGGGGC
CATGACGACTACATGTATCTGGTGGCTAAGGAGAATGGAAGCACCTTACCGTCGGCCGGC
CAATTCATAATCCGATATCACTCATTTTACCCATTGCACACGGCTGGAGAATACACACAC
CTTATGAACGAGGAAGACAAAGAGAACCTCAAGTGGCTACACGTTTTCAACAAGTATGAC
TTGTATAGCAAGAGCAAAGTTCATGTTGATGTCGAGAAGGTCAAACCTTACTACATGTCC
CTTATCAGAAAATATTTTCCGGAGAGCTTGAGGTGGTGAAAATGTGGAGAGAAAAAAAAA
AGTCTGGCTATGAAGTAATTAGTCCTGTGATTCACTTACAAATGTTTACATATCTATATC
TTATGTTAATGTTATTTTCAGGTCGTCTCTAAATGTAATCACAATCATCCTAGCGATTAA
GAGTATGTACGCTGGGGTTGATTTATTATAAAATAATAAAATTTATTTATATT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AC46TF U 2
AF RS1E080TF U 1
AF RS1E080JQ C 463
AF RS1AC46JQ C 741
BS 1 106 RS1E080TF
BS 107 109 RS1AC46TF
BS 110 746 RS1E080TF
BS 747 944 RS1E080JQ
BS 945 945 RS1AC46JQ
BS 946 1020 RS1E080JQ
BS 1021 1021 RS1AC46JQ
BS 1022 1135 RS1E080JQ
BS 1136 1136 RS1AC46JQ
BS 1137 1157 RS1E080JQ
BS 1158 1193 RS1AC46JQ

RD RS1AC46TF 400 0 0
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ACCGTTCTTGGAAGATGACAATTTCTATTGAGAAGCCGATGTTTGTAGAGGAAGTTTCTG
CATTCCAGAAGAAGAGCGAGAACAACTTAAGAACTGCCAGCGAACACGATGACGCGTTCT
TGGCACCTGAGATGAATGCATTCGGCCGTCAATTCAGGGACTATGATGTTGAGAGTGAGA
GGCAGAAGGGCGTCGAAGAGTTTTACAGATTACAACACATTAACCAGACCGTCGATTTTG
TGAAAAAAATGAGGGCAGAATACGGAAAATTAGATAAAATGGTGATGAGCATTTGGGAAT
GTTGTGAGCTTCTTAACGAGGTGGTGGACGAGAGTGATCC

QA 1 400 1 400
DS 

RD RS1E080TF 746 0 0
GGATCGCAAAAGTTTAAGATCAAAGCAAAACCAGATTTTTTTTCTCTCTGCATTATTTCT
CACCGTTCTTGGAAGATGACAATCTCTATTGAGAAGCCGATGTTTG***AGGAAGTTTCT
GCATTCCAGAAGAAGAGCGAGAACAACTTAAGAACTGCCAGCGAACACGATGACGCGTTC
TTGGCACCTGAGATGAATGCATTCGGCCGTCAATTCAGGGACTATGATGTTGAGAGTGAG
AGGCAGAAGGGCGTCGAAGAGTTTTACAGATTACAACACATTAACCAGACCGTCGATTTT
GTGAAAAAAATGAGGGCAGAATACGGAAAATTAGATAAAATGGTGATGAGCATTTGGGAA
TGTTGTGAGCTTCTTAACGAGGTGGTGGACGAGAGTGATCCAGATCTCGACGAGCCTCAG
ATTCAGCATTTGCTTCAATCTGCGGAAGCTATCCGCAAAGATTATCCTAATGAAGATTGG
CTTCATCTAACAGCTCTTATTCATGATCTTGGGAAGGTTATTACACTCCCACAGTTCGGA
GGACTTCCTCAATGGGCTACTGTTGGTGACACATTTCCTGTTGGGTGTGCATTTGATGAA
TCTAACGTGCACCACAAGTATTTTTCGGAAAATCCTGATTTTCACAACCAAGCCTACAAC
ACCAAATCTGGTATTTACACAGAAAGATGTGGCTTAAACAATGTCATGATGTCATGGGGC
CATGACGACTACATGTATCTGGTGGC

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1E080JQ 695 0 0
TATCCTAATGAAGATTGGCTTCATCTAACAGCTCTTATTCATGATCTTGGGAAGGTTATT
ACACTCCCACAGTTCGGAGGACTTCCTCAATGGGCTACTGTTGGTGACACATTTCCTGTT
GGGTGTGCATTTGATGAATCTAACGTGCACCACAAGTATTTTTCGGAAAATCCTGATTTT
CACAACCAAGCCTACAACACCAAATCTGGTATTTACACAGAAGGATGTGGCTTAAACAAT
GTCATGATGTCATGGGGCCATGACGACTACATGTATCTGGTGGCTAAGGAGAATGGAAGC
ACCTTACCGTCGGCCGGCCAATTCATAATCCGATATCACTCATTTTACCCATTGCACACG
GCTGGAGAATACACACACCTTATGAACGAGGAAGACAAAGAGAACCTCAAGTGGCTACAC
GTTTTCAACAAGTATGACTTGTATAGCAAGAGCAAAGTTCATGTTGATGTCGAGAAGGTC
AAGCCTTACTACATGTCCCTTATCAGAAAATATTTTCCGGAGAGCTTGAGGTGGTGAAAA
TGTGGAGAGAAAAAAAAA*GTCTGGCTATGAAGTAATTAGTCCTGTGATTCACTTACAAA
TGTTTACATATCTATATCTTATGTTAATGTTATTTTCAGGTCGTCTCTAAATGTAATCAC
AATCATCCTAGCGTTTAAGAGTATGTACGCTGGGG

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1AC46JQ 453 0 0
GGTGGCTAAGGAGAATGGAAGCACCTTACCGTCGGCCGGCCAATTCATAATCCGATATCA
CTCATTTTACCCATTGCACACGGCTGGAGAATACACACACCTTATGAACGAGGAAGACAA
AGAGAACCTCAAGTGGCTACACGTTTTCAACAAGTATGACTTGTATAGCAAGAGCAAAGT
TCATGTTGATGTCGAGAAGGTCAAACCTTACTACATGTCCCTTATCAGAAAATATTTTCC
GGAGAGCTTGAGGTGGTGAAAATGTGGAGAGAAAAAAAAAAGTCTGGCTATGAAGTAATT
AGTCCTGTGATTCACTTGCAAATGTTTACATATCTATATCTTATGTTAATGTTATTTTCA
GGTCGTCTCTAAATGTAATCACAATCATCCTAGCGATTAAGAGTATGTACGCTGGGGTTG
ATTTATTATAAAATAATAAAATTTATTTATATT

QA 1 453 1 453
DS 



AS 1 4

CO CL2681Contig1 819 4 1 U
CCATTACGGCCGGGGCCGGCGAAACTCCGGGAGAAACTTGAAGAGAAGACTAAGAAGAAA
GTCGATTTGATTTCTCCTCAACCCAAAAAGGAGAAAGAAAAGGAGAAAGACAACAACAAG
GACAAAACTAAAACCGATGAAGACAAGAACAAAGAAAAGAAACCAGATGAGAAGAAACCC
AAAGAGGCGGCGGCGACAACGGCGGTGCTGAAGGTGGACTTCCACTGTCAAGGTTGTATC
GGGAAGATCCAAAAGACTGTCACTAAAACCAAAGGTGTGAATGGGCCGACAATGGACAAA
GAGAAGCAGCTACTGACGGTGAAAGGAACAATGGATGCGAAGAAGCTCGCCGACGCTTTG
TCCGAGAAGCTGAAACGTAAGGTGGAGGTCGTGCCGCCGGCGAAGAAAGACAAAGAGAGT
GGTGACGGGAAAGAGAAGGAGTCTGGGGACAAGAAGAAAGGAGGAGACGGCGGAGGAAAG
GATAGCAATGGTGGTAACAAAGGCGGCGAGGGGGTGAATGCGATGGAGTACGTGGCGGCT
CAGCCTGCTTACGGGGCAGCGTATTATCCGGGTGGGCCGTATGGATACCCGATTCAGTCC
CACGCGCCGCAGATGTTCAGCGATGAGAACGTGAATGCTTGCGTCGTTATGTAAGGCGGC
GGAAGAAATTGTAAATATGCTATAATTTGGGGTACTTCCGGGGAATACTAGTTTTTTATT
TTTGGGTTTTCTACGACAGTTTCGGTTTTGAATTTCTCCTTTTTGTTTTTTGTTCGTTTC
TAATTTTTAATTTAAAACATGCAAATATTTCCTACGTTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1G288TF U 1
AF RS1FQ48TF U 210
AF RS1FQ48JQ C 302
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DS 

RD RS1FQ48JQ 762 0 0
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TTTTCTTTGAAGATTTATGTATCAATTGAAAATTTTAAATTT

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 3

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AAGTTAGACACAATGGCGACTTTCACACCCGCTTCTTTAATAGCCTTGAACACTTTCTCT
GCCTCCGGATCACATAGCTTCCACGCCTGTTCTGTAGTGAAATAGTCGTAAAGCTCTTCA
AAGTATTGAGAATTCGAACAGCCTGTTGATGCGCTCACTATATATTGCCAGAAAGGTCTC
GCATCGTTCACATATCTGAGATGGGATTGGCCCCATGGCTTCTGATAAGCTCTTCTGTAC
CTAGTAAGTATCTCAGCCTCCGAGTACTCAACTCCATACTTCTCTCCAATGTTCTTGTAT
ATCTGAGCCGTAGGTTGGGCGGGAACAAGGAGAGTCCCAACAGCGTCGACGAGCAACGCC
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CCTCCCAATCCGTAGATCCCTCCCGATTCATCTTCATCATCATCCGCCACGACAACAGCA
GATGACGAAGCGGAGGAGATCCGTCGACGGCCGCCGCTGCTGAGCAATGCTCCCGTTCTC
GCGATGATACGTTCCGATGATGATCCGTGAGAGACCTTACCGCCGGAGATCGAGGAGAGA
AGTGTCGCTAACATCCTGCTTCGTGACGCCATCGCTCTCTCTGTGATTGATTGATTGTTC
C


BQ
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10 

AF RS1GC26JQ U 9
AF RS1C040JQ U 1
AF RS1C040TF C 529
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CACATATCTGAGATGGGA

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TCATTCCTACGGTCATCTCCTACATGAACCGAATCCTCAGGATTCACTCCTAACAACTCA
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AAAGCATCAAACCAGTCTTCACATCTCAGTGCTCTTAGGAGAGGTCTTAAACGAGTGTCG
AAGTTAGACACAATGGCGACTTTCACACCCGCTTCTTTAATAGCCTTGAACACTTTCTCT
GCCTCCGGATCACATAGCTTCCACGCCTGTTCTGTAGTGAAATAGTCGTAAAGCTCTTCA
AAGTATTGAGAATTCGAACAGCCTGTTGATGCGCTCACTATATATTGCCAGAAAGGTCTC
GCATCGTTCACATATCTGAGATGGGATTGGCCCCATGGCTTCTGATAAGCTCTTCTGTAC
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TTGTGAGTGA
CTCACA

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TCCTTCAACGCGCCTCCCAATCCGTAGATCCCTCCCGATTCATCTTCATCATCATCCGCC
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GCTCCCGTTCTCGCGATGATACGTTCCGATGATGATCCGTGAGAGACCTTACCGCCGGAG
ATCGAGGAGAGAAGTGTCGCTAACATCCTGCTTCGTGACGCCATCGCTCTCTCTGTGATT
GATTGATTGTTCC

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 4

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GGGAAACAAAGCAACAGAAAGAAGCAAAAAAAAATGGCTATTCCTATAAGATTTTTAACT
ATAGCTCTCGTGATCCTCTCCGCGTTACTACTTTCCTCGTCTCTCGGCGGCGTTACAGCG
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AACTTGAAGTTGATAGAAGCACACAACTCGGTCCCGGACCGGACTTACGAACTCGGATTG
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AACGATGGTATTGTAACGGATAAAGTTTACCCTTATACTGAGAATGATACCGCCGCGTGC
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AATTATTT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AACGATGGTATT

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CGGAGACGAAAGGCAATGAGGCGGAAGTGCGCCGGATGTACGAGCAGTGGCTTGTGGAGA
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CCCGGTTTGCAGATCTAACCGACGATGAGTTTCGAGCTATTCACTTAAGGGGGAAGATGG
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CGGGAAACTTTGGATGTTTAGGAGGTAACGCAGCCGATGCTTTTGAGTTCATTGTGGATA
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ATACTGAGAATGATACCGCCGCGTGCAAGGCCATTGAGATGGTTACCACTCGGTATGTTA
CCATTGATAGTTATGAGGATGCTCCACATAACGATGAGATGTCTTTGAAGAAGGCTGTCG
CACATCAACCTATTAGTGTTATGATTGAAGCCGAAAATATGAAACTCTACAAATCTGGTG
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GAACGACAGAAAGAGGTGAAGACTACTGGATTATCCGTAACTCATGGGGAGCAAACTGGG
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GTTGCCAAGCTCTATCCGAAAGCCGGATGTCTTGTGTTGTTTGTTATCTTTAATTTAGTT
CAATTCTCTCATCGAGGGTTTTTGAGAATTATTT

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DS 



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CATCTCCTGTCCAAGAGGCATCAGGAATCTGAGCAGTGGTCCATTCTCCACCGGCAGCTC
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CAGGACGGATGGTTCCACGCATCTGAAGAACCATGCGAGCAAGAAGCCAGAAAAGACAAC
CAATGCTGTGCTTTCCCTTGTTGTTAGCAGGGATCCCAATGTCGACAAATCTCATGGGAG
AGTCAGTGTCACAGAAAGCAATGATTGGGATGTCTCCCAAAGCACCTTCCTTGATTGGCT
GATGGTCAGTCCTAGGGTCAGTAAGAATGAGCAACCTAGGCTCACTGAAGGAAGTCTGCA
TCTGATTGGTGAAAGTACCAGGAGTGTGTCTTCCAGCAATGGCGTTAGCACCAGTGTACT
GAGCAAACTTGAGAACAGCTCTCTGTCCATAAGGTCTAGCAGACTGAACAATAATGTCTT
GTGGGTTCTCAATAGCAACGATAACCCTAGCAGCCATCTGCAACTTCTCCCATGTCTTCC
CAAGGTTGAAGATATATATACCATCGTTGCGACGCTTGAAGACGTAACGCTCCATTTGGT
AATTGCAGTTTTTGGTACCGAGGTGAACCTCAGCGGCACACATCATTTTGATATCAGATT
CCTTCTGGGAGAGCTGTACGTTAGTCGCCATTTTTGTTACTCTCTTCTTCTTTTCTCCGG
GGAGTAACTTTAGATCACGGAGCGGCGTCTAAGTCTTCC


BQ
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AF RS1AG63JQ U 75
AF RS1GB57TF C 328
AF RS1AG63TF C 425
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CAATGCTGTGTTTTCCCTTGTTGTTAGCAGGGATCCCAATGTCGACAAATCTCATGGGAG
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QA 1 704 1 704
DS 

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AGCTACAACTCTTGAATCTCAAACATAAACCAAAAAAATTAATCCCAACCAGCAGCTGGA
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GGGAGTCCAAAATCTGCCAGAGGTGCAGCCTCTTCGTCTTCAGATTGCTTAGCCTCTTCG
GGCTCTCTGTAAAAGAACAGGTCCACCATGACATCCCACTTTTGTGCAGGACGGATGGTT
CCACGCATCTGAAGGACCATGCGAGCGAGAAGCCAGAAAAGACAACCAATGCTGTGCTTT
CCCTTGTTGTTAGCAGGGATCCCAATGTCGACAAATCTCATTGGAGAGTCAGTGTCACAG
AAAGCAATGATTGGGATGTCTCCCAAAGCACCTTCCTTGATTGGCTGATGGTCAGTCCTA
GGGTCAGTAAGAATGAGCAACCTAGGCTCACTGAAGGAAGTCTGCATCTGATTGGTGAAA
GTACCAGGAGTGTGTCTTCCAGCAATGGCGTTAGCACCAGTGTACTGAGCAAACTTGAGA
ACAGCTCTCTGTCCATAAAGTCTAGCAGACTGAACAATAATGTCTTGTGGGTTCTCAATA
GCAACGATAACCCTAGCAGCCATCTGCA*CTTCTCCCATGT

QA 1 881 1 881
DS 

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TCTGAGCAGTGGTCCATTCTCCACCGGCAGCTCCGTATTCAGGTGCAGGGAGTCCAAAAT
CTGCCAGAGGTGCAGCCTCTTCGTCTTCAGATTGCTTAGCCTCTTCGGGCTCTCTGTAAA
AGAACAGGTCCACCATGACATCCCACTTTTGTGCAGGACGGATGGTTCCACGCATCTGAA
GAACCATGCGAGCAAGAAGCCAGAAAAGACAACCAATGCTGTGTTTTCCCTTGTTGTTAG
CAGGGATCCCAATGTCGACAAATCTCATGGGAGAGTCAGTGTCACAGAAAGCAATGATTG
GGATGTTTCCCAAAGCACCTTCCTTGATTGGCTGATGGTCAGTCCTAGGGTCAGTAAGAA
TGAGCAACCTAGGCTCACTGAAGGAAGTCTGCATCTGATTGGTGAAAGTACCAGGAGTAT
GCCTTCCAGCAATGGCGTTAGCACCAGTGTACTGAGCAAACTTGAGAACAGCTCTCTGTC
CATAAGGTCTAGCAGACTGAACAATAACGTCTTGTGGGTTCTCA
C

QA 1 584 1 584
DS 

RD RS1AG63TF 755 0 0
TTCAGGTGCAGGGAGTCCAAAATCTGCCAGAGGTGCAGCCTCTTCGTCTTCAGATTGCTT
AGCCTCTTCGGGCTCTCTGTAAAAGAACAGGTCCACCATGACATCCCACTTTTGTGCAGG
ACGGATGGTTCCACGCATCTGAAGGACCATGCGAGCGAGAAGCCAGAAAAGACAACCAAT
GCTGTGCTTTCCCTTGTTGTTAGCAGGGATCCCAATGTCGACAAATCTCATTGGAGAGTC
AGTGTCACAGAAAGCAATGATTGGGATGTCTCCCAAAGCACCTTCCTTGATTGGCTGATG
GTCAGTCCTAGGGTCAGTAAGAATGAGCAACCTAGGCTCACTGAAGGAAGTCTGCATCTG
ATTGGTGAAAGTACCAGGAGTGTGTCTTCCAGCAATGGCGTTAGCACCAGTGTACTGAGC
AAACTTGAGAACAGCTCTCTGTCCATAAGGTCTAGCAGACTGAACAATAATGTCTTGTGG
GTTCTCAATAGCAACGATAACCCTAGCAGCCATCTGCAACTTCTCCCATGTCTTCCCAAG
GTTGAAGATATATATACCATCGTTGCGACGCTTGAAGACGTAACGCTCCATTTGGTAATT
GCAGTTTTTGGTACCGAGGTGAACCTCAGCGGCACACATCATTTTGATATCAGATTCCTT
CTGGGAGAGCTGTACGTTAGTCGCCATTTTTGTTACTCTCTTCTTCTTTTCTCCGGGGAG
TAACTTTAGATCACGGAGCGGCGTCTAAGTCTTCC

QA 1 755 1 755
DS 



AS 2 4

CO CL2686Contig1 688 2 2 U
GGATCACAAATCTCATAACCTCTTCCCCGCATTAGAATCATCTCACTCGTCTAAATCGAT
CTTCGTTCGCAATGGAAACCACCGGAAAAGTGAAGAAGGCATTCGGAGGAAGGAAAGCCG
GCGGACTAAAAACCAAATCGGTTTCGAAATCGATCAAAGCCGGCCTCCAATTCCCGGTCG
GAAGAATCACTCGTTTCCTGAAGAAGGGACGGTACGCGCAGAGACTCGGCGGCGGAGCTC
CGGTTTACATGGCCGCCGTGCTCGAGTACCTCGCAGCCGAAGTTTTGGAGCTTGCTGGTA
ACGCGGCGAGAGACAACAAGAAGTCGAGGATCATCCCGAGGCATCTTCTTTTGGCGATTC
GGAACGATGAGGAGTTGGGGAAGCTTCTGAGTGGTGTCACGATCGCTCACGGTGGTGTGT
TGCCTAACATCAACTCTGTTTTGCTGCCTAAGAAGTCTTCTGCTAAGTCGACCGAGGAAC
CTGCGTCCAAGTCACCGGCTAAGTCTCCTAAGAAGGCTTAAGCCACACGATGTTGCTTTT
TTATTTATGTTCTTTGTGTTGAGATTGGTTAATGCATATGTAGAAAATCTCTAGCTGTTT
TTATAAGTTTTAATTGTGTAATTTGGGGTTGGTTTCTCTTCAGATCCAACTTTCTAAGTT
TGATGATTTATAAAATCTTAAAGTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GP61TF U 1
AF RS1GP61JQ C 191
BS 1 669 RS1GP61TF
BS 670 688 RS1GP61JQ

RD RS1GP61TF 688 0 0
GGATCACAAATCTCATAACCTCTTCCCCGCATTAGAATCATCTCACTCGTCTAAATCGAT
CTTCGTTCGCAATGGAAACCACCGGAAAAGTGAAGAAGGCATTCGGAGGAAGGAAAGCCG
GCGGACTAAAAACCAAATCGGTTTCGAAATCGATCAAAGCCGGCCTCCAATTCCCGGTCG
GAAGAATCACTCGTTTCCTGAAGAAGGGACGGTACGCGCAGAGACTCGGCGGCGGAGCTC
CGGTTTACATGGCCGCCGTGCTCGAGTACCTCGCAGCCGAAGTTTTGGAGCTTGCTGGTA
ACGCGGCGAGAGACAACAAGAAGTCGAGGATCATCCCGAGGCATCTTCTTTTGGCGATTC
GGAACGATGAGGAGTTGGGGAAGCTTCTGAGTGGTGTCACGATCGCTCACGGTGGTGTGT
TGCCTAACATCAACTCTGTTTTGCTGCCTAAGAAGTCTTCTGCTAAGTCGACCGAGGAAC
CTGCGTCCAAGTCACCGGCTAAGTCTCCTAAGAAGGCTTAAGCCACACGATGTTGCTTTT
TTATTTATGTTCTTTGTGTTGAGATTGGTTAATGCATATGTAGAAAATCTCTAGCTGTTT
TTATAAGTTTTAATTGTGTAATTTGGGGTTGGTTTCTCTTCAGATCCAACTTTCTAAGTT
TGATGATTT
ATAAAATCTTAAAGTTTAC

QA 1 669 1 669
DS 

RD RS1GP61JQ 498 0 0
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GGCCGCCGTGCTCGAGTACCTCGCAGCCGAAGTTTTGGAGCTTGCTGGTAACGCGGCGAG
AGACAACAAGAAGTCGAGGATCATCCCGAGGCATCTTCTTTTGGCGATTCGGAACGATGA
GGAGTTGGGGAAGCTTCTGAGTGGTGTCACGATCGCTCACGGTGGTGTGTTGCCTAACAT
CAACTCTGTTTTGCTGCCTAAGAAGTCTTCTGCTAAGTCGACCGAGGAACCTGCGTCCAA
GTCACCGGCTAAGTCTCCTAAGAAGGCTTAAGCCACACGATGTTGCTTTTTTATTTATGT
TCTTTGTGTTGAGATTGGTTAATGCATATGTAGAAAATCTCTAGCTGTTTTTATAAGTTT
TAATTGTGTAATTTGGGGTTGGTTTCTCTTCAGATCCAACTTTCTAAGTTTGATGATTTA
TAAAATCTTAAAGTTTAC

QA 1 498 1 498
DS 



CO CL2686Contig2 698 2 3 U
TAAGCAAACAGAAAAGATCTTATAAAATTATCAAACTTAGAAAGTTGGATCTGAAGATCC
ACCAAACCCCAAATTACATAAATAAAACTTAAAAGAAAAAAAGCTAAGAGATTTTCTACA
TATGCATTCACCAATCTTCAACACAAAGAACACAAATAAAAAGCAACATCGTGTGGCTTA
AGCCTTCTTAGGAGACTTAGCCGGTGACTTGGACGCAGGTTCCTCGGTCGACTTAGCAGA
AGACTTCTTAGGCAGCAAAACAGAGTTGATGTTAGGAAACACACCACCGTGAGCGATCGT
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CGGAATAATCCTCGACTTCTTGTTGTCTCTCGCAGCGTTACCAGCAAGCTCCAAAACTTC
GGCTGCGAGGTACTCGAGCACGGCGGCCATGTAAACCGGAGCTCCACCGCCGAGTCTCTG
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ATTCTAATGCAGGGAAGAGGTTATGAGATTTGTGATCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H089JQB U 2
AF RS1H089TF C 1
BS 1 1 RS1H089TF
BS 2 610 RS1H089JQB
BS 611 698 RS1H089TF

RD RS1H089JQB 609 0 0
AAGCAAACAGAAAAGATCTTATAAAATTATCAAACTTAGAAAGTTGGATCTGAAGATCCA
CCAAACCCCAAATTACATAAATAAAACTTAAAAGAAAAAAAGCTAAGAGATTTTCTACAT
ATGCATTCACCAATCTTCAACACAAAGAACACAAATAAAAAGCAACATCGTGTGGCTTAA
GCCTTCTTAGGAGACTTAGCCGGTGACTTGGACGCAGGTTCCTCGGTCGACTTAGCAGAA
GACTTCTTAGGCAGCAAAACAGAGTTGATGTTAGGAAACACACCACCGTGAGCGATCGTG
ACTCCACTCAGAAGCTTCCCCAACTCCTCATCGTTCCTAATCGCCAAAAGAAGATGCCTC
GGAATAATCCTCGACTTCTTGTTGTCTCTCGCAGCGTTACCAGCAAGCTCCAAAACTTCG
GCTGCGAGGTACTCGAGCACGGCGGCCATGTAAACCGGAGCTCCACCGCCGAGTCTCTGT
GCGTACCGTCCCTTCTTCAGGAAACGAGTGATTCTTCCGACCGGGAATTGGAGGCCGGCT
TTGATCGATTTCGAAACCGATTTGGTTTTTGGTCCGCTGGCTTTCCTTCCTCCGAATGCC
TTCTTCACT

QA 1 609 1 609
DS 

RD RS1H089TF 698 0 0
TAAGCAAACAGAAAAGATCTTATAAAATTATCAAACTTAGAAAGTTGGATCTGAAGATCC
ACCAAACCCCAAATTACATAAATAAAACTTAAAAGAAAAAAAGCTAAGAGATTTTCTACA
TATGCATTCACCAATCTTCAACACAAAGAACACAAATAAAAAGCAACATCGTGTGGCTTA
AGCCTTCTTAGGAGACTTAGCCGGTGACTTGGACGCAGGTTCCTCGGTCGACTTAGCAGA
AGACTTCTTAGGCAGCAAAACAGAGTTGATGTTAGGAAACACACCACCGTGAGCGATCGT
GACTCCACTCAGAAGCTTCCCCAACTCCTCATCGTTCCTAATCGCCAAAAGAAGATGCCT
CGGAATAATCCTCGACTTCTTGTTGTCTCTCGCAGCGTTACCAGCAAGCTCCAAAACTTC
GGCTGCGAGGTACTCGAGCACGGCGGCCATGTAAACCGGAGCTCCACCGCCGAGTCTCTG
TGCGTACCGTCCCTTCTTCAGGAAACGAGTGATTCTTCCGACCGGGAATTGGAGGCCGGC
TTTGATCGATTTCGAAACCGATTTGGTTTTTGGTCCGCTGGCTTTCCTTCCTCCGAATGC
CTTCTTCACTTTTCCGGTGGTTTCCATTGCGAACGAAGATCGATTTAGACGAGTGATATG
ATTCTAATGCAGGGAAGAGGTTATGAGATTTGTGATCC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 3

CO CL2687Contig1 863 3 42 U
AATGAAAAAAAGATTTCCACTATTCTAATATTTTATTTGATCTCAGGCCAACCAATTATT
CAGCAACAAATGATATGATCTAATTCAATGTAAGATGGCAACTGCAAACAGTTCAAATTG
AGAAAGACTTGAATAAATTAAAACAAAAGAAGAGTGGAAGAGGCAATGTTTAGAGGTTGA
AGATGGCAGCACCACTTGAAGGCTTGGAGGCAAAAAGGTAAAGCTCCATGTCTTCTTCCT
TCACCACTCCTTTCTCTATCCTCTTCTTGTAGTATTTATCCTTAACAGCAGCGATGAACT
GAGAGACGCCAGATTCTTTAACCAAGGCCACAGTGCAACCGCCCCATCCAGCTCCTGTCA
GCCTTGCTCCAAGTGCTCCATTCTCTCTGCTCACTTTAACTAGCTCTTCTAGTTCCGGGC
AACTGCACTCGTATAGGACACTGCAGCTGTAATGGCTCTCGTTCATGAGATCACCAAGTT
TCTTTAACTTCTCTTCGTCACTTAAGTTTGAATCAACTGTGTCCTTGAAACCATGAACTC
GCCGTGCTTCGGAGTAAACATGTGCAGCTCTCTGGTGCAGTTTGAAGTGCGTTGCAGCGT
TAAGTACAGCTAAAGATGTTGGATCGTTGTTCAAGATCGATGGTAGTTTCTCCTGGACGA
TTTTCTCAATCTCCTCGGCCGTGTACGGTTCTTCTTTCAGATATTCTTTAACAGCCATAA
CAGGATCAGAGGAGCCACGATCACCAGCAAACGAGACACATAATCCTTCCACGTCAGAGA
GAGTCTTAACTTTTGATATTGCTTCTTTCGGTTCCATTCCGAGCTTAATGCCGAGTATGA
TCGAAGCAAGTCGACACTCAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DT72JQ U 1
AF RS1CF91JQ U 18
AF RS1CF91TF C 105
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BS 708 715 RS1DT72JQ
BS 716 863 RS1CF91TF

RD RS1DT72JQ 725 0 0
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AGAAAGACTTGAATAAATTAAAACAAAAGAAGAGTGGAAGAGGCAATGTTTAGAGGTTGA
AGATGGCAGCACCACTTGAAGGCTTGGAAGCAAAAAGGTAAAGCTCCATGTCTTCTTCCT
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TTTTCTCAATCTCCTCGGCCGTGTATGGTTCTTCTTTCAGATATTCCTTAACAGC
TAGAACAGGA

QA 1 715 1 715
DS 

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TTAAAACAAAAGAAGAGTGGAAGAGGCAATGTTTAGAGGTTGAAGATGGCAGCACCACTT
GAAGGCTTGGAGGCAAAAAGGTAAAGCTCCATGTCTTCTTCCTTCACCACTCCTTTCTCT
ATCCTCTTCTTGTAGTATTTATCCTTAACAGCAGCGATGAACTGAGAGACGCCAGATTCT
TTAACCAAGGCCACAGTGCAACCGCCCCATCCAGCTCCTGTCAGCCTTGCTCCAAGTGCT
CCATTCTCTCTGCTCACTTTAACTAGCTCTTCTAGTTCCGGGCAACTGCACTCGTATAGG
ACACTGCAGCTGTAATGGCTCTCGTTCATGAAATCACCAAGTTTCTTTAACTTCTCTTCG
TCACTTAAGTTTGAATCAACTGTGTCCTTGAAACCATGAACTCGCCGTGCTTCGGAGTAA
ACATGTGCAGCTCTCTGGTGCAGTTTGAAGTGCGTTGCAGCGTTAAGTACAGCTAAAGAT
GTTGGATCGTTGTTCAAGATCGATGGTAGTTTCTCCTGGACGATTTTCTCAATCTCCTCG
GCCGTGTACGGTTCTTCTTTCAGATATTCTTTAACAGC
CATA

QA 1 698 1 698
DS 

RD RS1CF91TF 759 0 0
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AATGTTTAGAGGTTGAAGATGGCAGCACCACTTGAAGGCTTGGAGGCAAAAAGGTAAAGC
TCCATGTCTTCTTCCTTCACCACTCCTTTCTCTATCCTCTTCTTGTAGTATTTATCCTTA
ACAGCAGCGATGAACTGAGAGACGCCAGATTCTTTAACCAAGGCCACAGTGCAACCGCCC
CATCCAGCTCCTGTCAGCCTTGCTCCAAGTGCTCCATTCTCTCTGCTCACTTTAACTAGC
TCTTCTAGTTCCGGGCAACTGCACTCGTATAGGACACTGCAGCTGTAATGGCTCTCGTTC
ATGAGATCACCAAGTTTCTTTAACTTCTCTTCGTCACTTAAGTTTGAATCAACTGTGTCC
TTGAAACCATGAACTCGCCGTGCTTCGGAGTAAACATGTGCAGCTCTCTGGTGCAGTTTG
AAGTGCGTTGCAGCGTTAAGTACAGCTAAAGATGTTGGATCGTTGTTCAAGATCGATGGT
AGTTTCTCCTGGACGATTTTCTCAATCTCCTCGGCCGTGTACGGTTCTTCTTTCAGATAT
TCTTTAACAGCCATAACAGGATCAGAGGAGCCACGATCACCAGCAAACGAGACACATAAT
CCTTCCACGTCAGAGAGAGTCTTAACTTTTGATATTGCTTCTTTCGGTTCCATTCCGAGC
TTAATGCCGAGTATGATCGAAGCAAGTCGACACTCAACC

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 4

CO CL2688Contig1 641 4 12 U
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TTTGAAGAGGGCAAGGAGTGAAACACCAGAAACCTTGACAACCTTGAACCTAACTCCGGG
AATATCTCCCACAGCATGACCCTTACGACCAAATCCAGCGATCAACACCTCGTCATTTTC
CTCAATGTAGTTCAAGCAACCATCGTTGGGGACAAAAGCGGCAATCTTCTTTCCGTTTTT
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AATTTTCTCAAGAACGATGCCCTTGGCATGGGAAGAGCCAGCGAAAGGCTTCTTCCACTC
ATTACCCTGATGGGACTTCTTGTACTGCTTGTCAGCCCACCTCTGATTAATCCTAAGCCT
TTTGAGCTTGCGCCCAGCTCCCATTCCCCTTGTCTTACCCATGTTTCGTCGATGGAAGGA
GAGAGAGAATCAACAGCAAAGAG**GTACTTGCGGCGACCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1EN75JQ U 1
AF RS1EN75TF C 1
AF RS1DW84JQ U 66
AF RS1DW84TF C 66
BS 1 115 RS1EN75JQ
BS 116 116 RS1DW84JQ
BS 117 153 RS1EN75JQ
BS 154 154 RS1DW84JQ
BS 155 169 RS1EN75JQ
BS 170 170 RS1DW84JQ
BS 171 210 RS1EN75JQ
BS 211 211 RS1DW84JQ
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BS 323 393 RS1EN75JQ
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RD RS1EN75JQ 393 0 0
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TTTGAAGAGGGCAAGGAGTGAAACACCAGAGACCTTGACAACCTTGAACCTAACTCCGGG
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CTCAATGTAGTTCAAGCAACCGTCGTTGGGGACAAAAGCGGCAATCTTCTTTCCGTTTTT
GATAAGCTGGACTCTAGCACACTTACGGATAGC

QA 1 393 1 393
DS 

RD RS1EN75TF 641 0 0
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AAGTAGAGAAAGATAAAGATAGTATTCTTTAAAACTGAACTAGCAAAAAGTGATT*ATAA
CATCAAAATGAATGCAAAAGCTTGGCGCATTGTTTAAGATCTAGGCTTCTCCTTCTTCTC
TTTGAAGAGGGCAAGGAGTGAAACACCAGAGACCTTGACAACCTTGAACCTAACTCCGGG
AATATCTCCCACAGCATGACCCTTACGACCAAATCCAGCGATCAACACCTCGTCATTTTC
CTCAATGTAGTTCAAGCAACCGTCGTTGGGGACAAAAGCGGCAATCTTCTTTCCGTTTTT
GATAAGCTGGACTCTAGCACACTTACGGATAGCAGAGTTAGGCTGCTTAGCCTCAATACC
AATTTTCTCAAGAACGATGCCCTTGGCGTGAGAAGAACCAGCGAAAGGCTTCTTCCACTC
ATTACCCTGATGAGACTTCTTGTACTGCTTGTCAGCCCACCTCTGATTAATCCTAAGCCT
TTTGAGCTTGCGCCCAGCTCCCATTCCCCTTGTCTTACCCATGTTTCGTCGATGGAAGGA
GAGAG**AATCAACAGCAAAGAGAGGTACTTGCGGCGACCC

QA 1 641 1 641
DS 

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AGAG
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TCAACAGCAAAGAG**GTACTTGCGGCGACCC

QA 5 576 5 576
DS 

RD RS1DW84TF 576 0 0
AGAG
AAGATAAAGATAGTATTCTTTGAAACTGAACTAGCAAAAAGTGATTTATAACATCAAAAT
GAATGCAAAAGCTTGGCGCATTGTCTATGATCTAGGCTTCCCCTTCTTCTCTTTGAAGAG
GGCAAGGAGTGAAACACCAGAAACCTTGACAACCTTGAACCTAACTCCGGGAATATCTCC
CACAGCGTGACCCTTACGACCAAATCCAGCGATCAACACCTCGTCATTTTCCTCAATGTA
GTTCAAGCAACCATCGTTGGGGACAAAAGCGGCAATCTTCTTTCCGTTTTTGATAAGCTG
GACTCTTGCACACTTACGGATAGCAGAGTTAGGCTGCTTAGCCTCAATACCAATTTTCTC
AAGAACGATGCCCTTGGCATGGGAAGAGCCAGCGAAAGGCTTCTTCCACTCATTACCCTG
ATGGGACTTCTTGTACTGCTTGTCAGCCCACCTCTGATTAATCCTAAGCCTTTTGAGCTT
GCGCCCAGCTCCCATTCCCCTTGTCTTACCCATGTTTCGTCGATGGAAGGAGAGAGAGAA
TCAACAGCAAAGAG**GTACTTGCGGCGACCC

QA 5 576 5 576
DS 



AS 1 3

CO CL2689Contig1 1237 3 17 U
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CAACGGCGATGATGTAAGATACCTGCACTTTGATTTTCATCACATCTGTGGGCATATTCA
CTTTGAACGCTTAGCAATTCTGTATGAGCAGATGGAGGATTTCCTTGACAAAAGCGGGTA
CTTTTTGTTGAATGAAAAGGGTGAGAAAATGAAGGAGCAGTCTGGTATTGTGCTCACTAA
CTGCATTGATTGTTTAGACCGTACAAATGTCACGCAGAGCATGATAGGCCGCAAGATGCT
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TAATTTTGACGAGCGCTATAAAAT**TATGGGCTAATCACGGTGACGACATTAGCATTCA
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AGGGATCCTTAATAATGGCTGGAATGCCCTCGCACGCTACTACCTGAACAACTTTGCTGA
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AGACATGGCTCCTGTGCCCCGAAAGGGAGGTCTCGAGGCTGTAGCCAACTTTCCAGTGGC
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CGATTACAAGCACTTGTTTTTTTCATTGGTGTGGGCGGGCATCAGTGTGGCTGTAGCAGC
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ACCTCAACCAAATAAAAAGGGCCGGAATATGCTTATT


BQ
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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CACTTGCT

QA 1 767 1 767
DS 

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GCATGGAGGTGAGGGGCGCTTAAGCGAGAGGTTTGCAGGTGCTATGCAGCACATCAACGG
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ACGCTTAGCAATTCTGTATGAGCAGATGGAGGATTTCCTTGACAAAAGCGGGTACTTTTT
GTTGAATGAAAAGGGTGAGAAAATGAAGGAGCAGTCTGGTATTGTGCGCACTAACTGCAT
TGATTGTTTAGACCGTACAAATGTCACGCAGAGCATGATAGGCCGCAAGATGCTGGAACT
TCAACTCAGAAGGATTGGCGTTTTTGGGGCCGAAGAAGTTATAAGCTCGCATCCTAATTT
TGACGAGCGCTATAAAATATTATGGGCTAATCACGGTGACGACATTAGCATTCAGTACTC
CGGCACTCCTGCACTTAAAGGAGATTTTGTCAGGTATGGTCGAAGGACTGTTCAAGGGAT
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GGCTCCTGTGCCCCGAAAG

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1FQ57JQ 854 0 0
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GTGTTTTTGGGGCCGAAGAAGTTATAAGCTCGCATCCTAATTTTGACGAGCGCTATAAAA
T**TATGGGCTAATCACGGTGACGACATTAGCATTCAGTACTCCGGCACTCCTGCACTTA
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ATGCCCTCGCCCGCTACTACCTGAACAACTTTGCTGATGGAACTAAGCAGGATGCGATTG
ATCTTGTGCAAGGACACTATATAGTTGCTGTGAACCGAGACATGGCTCCTGTGCCTCGAA
AGGGAGGTCTCGAGGCTGTAGCCAACTTTCCAGTGGCATTGGCCGTGGTTCTGATCAGTT
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CATTGGTGTGGGCGGGCATCAGTGTGGCTGTAGCAGCATTCATGAGGGCCAATGGCCGGA
TTTTTTGCAACAGGCCTTGTTTGCACAAGCCCAGACCTTGAGGCTTGCCTTTGTTTCCTC
TCATGGACCATTCACATTAATCATCGATCCATTCCAGTTTTTGAATGGGACTAGAGTTTG
AGTGAGATTTCTGTTGGATATAATAAATTTTTATTGGACCTCAACCAAATAAAAAGGGCC
GGAATATGCTTATT

QA 1 854 1 854
DS 



AS 1 4

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GACGTTTCTTCTCTTCACCACATTTCTCTTCATTTCCCGGTCAATCTCAGCCGTTCGTTC
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TACTCTCTATCAAGACCTCTGTTTCAACTCTCTCGCCGGCTACGCCCCCGTCGTCCAAGA
CAGTCCGGCGAGGCTAGCAAAGATCGCAACCGGAGTGTCCCTCTCAAAAGCTAAATCCAC
GTTGGCCTTTCTCTCCAAACTCTCACGCTCCGCAGTCCAGGTCCAAGACTGCGTTTCGTA
CTTAGATGAAGCAGTTGGTTCCATTAGAGACTCTCTTCAAACACTACGCAACTTGAGCCG
TAGAGGCGGCGTTGCCGCGTCTGCTTCATCGGACGAGACGTTTAGTTCGCAGGTGAATGA
CGTGCAGACGTGGATGAGTGCAGCATTGACGTATGAGGATACGTGTACGGACGAATATGA
AGAAATGAATGAAGAAGGAGGTATCAAGACGACCGCTTATGATCGAGTGAACACACTTAA
AAGGTTTACTAGTAATGCTCTTGCGCTTGTTAACACTTATGGCAACACTGGAGCCCCATG
AGATGGGATTATTAAGAGTTCTTTAATTTAAATATTTTTTGATAGATTTTTACTTTGTTT
AAGGTTTCTTTTGATTTTTCAATATGTTATGGGTTTTAATTTGAAATATAGTGGTGTGTG
AAAAAATGAAAGTTTAGTGCAGGCTTCGGAAAAGGTAGAAGTACGGATTTCATGTTTCAT
TGCTTTGACTGATCTCTGTGGATATGCTTATGATTTGATGAATCGTTGTATTAATTTTGG
GATTTTGTTTTAATATGACTCATATTATATGAGTTTAACGTGGGTTTAGAT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DO82TF U 1
AF RS1EZ66TF U 2
AF RS1EZ66JQ C 442
AF RS1DO82JQ C 129
BS 1 575 RS1DO82TF
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BS 577 599 RS1DO82TF
BS 600 723 RS1EZ66TF
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BS 725 731 RS1EZ66TF
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BS 733 738 RS1EZ66TF
BS 739 741 RS1DO82JQ
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BS 759 759 RS1DO82JQ
BS 760 773 RS1EZ66TF
BS 774 774 RS1DO82JQ
BS 775 785 RS1EZ66TF
BS 786 786 RS1DO82JQ
BS 787 802 RS1EZ66TF
BS 803 951 RS1DO82JQ

RD RS1DO82TF 599 0 0
GGACTGGAGCACCAAACTCGAACAAAAAACTGTGAAAATGGTAAGCCAAAGTCGTACGAC
GACGTTTCTTCTCTTCACCACATTTCTCTTCATTTCCCGGTCAATCTCAGCCGTTCGTTC
CCCTCCACGACTAAACGCAACAACCAACGATCTAGATTTCATCCGAACAAGCTGCAACGC
TACTCTCTATCAAGACCTCTGTTTCAACTCTCTCGCCGGCTACGCCCCCGTCGTCCAAGA
CAGTCCGGCGAGGCTAGCAAAGATCGCAACCGGAGTGTCCCTCTCAAAAGCTAAATCCAC
GTTGGCCTTTCTCTCCAAACTCTCACGCTCCGCAGTCCAGGTCCAAGACTGCGTTTCGTA
CTTAGATGAAGCAGTTGGTTCCATTAGAGACTCTCTTCAAACACTACGCAACTTGAGCCG
TAGAGGCGGCGTTGCCGCGTCTGCTTCATCGGACGAGACGTTTAGTTCGCAGGTGAATGA
CGTGCAGACGTGGATGAGTGCAGCATTGACGTATGAGGATACGTGTACGGACGAATATGA
AGAAATGAATGAAGAAGGAGGTATCAAGACGACCGTTTATGATCGAGTGAACACACTTA

QA 1 599 1 599
DS 

RD RS1EZ66TF 817 0 0
GACTGGAGCACCAAACTCGAACAAAAAACTGTGAAAATGGTAAGCCAAAGTCGTACGACG
ACGTTTCTTCTCTTCACCACATTTCTCTTCATTTCCCGGTCAATCTCAGCCGTTCGTTCC
CCTCCACGACTAAACGCAACAACCAACGATCTAGATTTCATCCGAACAAGCTGCAACGCT
ACTCTCTATCAAGACCTCTGTTTCAACTCTCTCGCCGGCTACGCCCCCGTCGTCCAAGAC
AGTCCGGCGAGGCTAGCAAAGATCGCAACCGGAGTGTCCCTCTCAAAAGCTAAATCCACG
TTGGCCTTTCTCTCCAAACTCTCACGCTCCGCAGCCCAAGTCCAAGACTGCGTTTCGTAC
TTAGATGAAGCAGTTGGTTCCATTAGAGACTCTCTTCAAACACTACGCAACTTGAGCCGT
AGAGGCGGCGTTGCCGCGTCTGCTTCATCGGACGAGACGTTTAGTTCGCAGGTGAATGAC
GTGCAGACGTGGATGAGTGCAGCATTGACGTATGAGGATACGTGTACGGACGAATATGAA
GAAATGAATGAAGAAGGAGGTATCAAGACGACCGCTTATGATCGAGTGAACACACTTAAA
AGGTTTACTAGTAATGCTCTTGCGCTTGTTAACACTTATGGCAACACTGGAGCCCCATGA
GATGGGATTATTAAGAGTTCTTTAATTTAAATATTTTTTGATAGATTTTTACTTTGTTTA
AG*TTTCTTT*GATTTT**CATATGTTATGGGTTTTA*TTTGAAATATAGTG*TGTGTGA
AAAA*TGAAAGTTTAGTGCAG
CTTCGAAAAGTAGAGT

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DS 

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AGCATTGACGTATGAGGATACGTGTACGGACGAATATGAAGAAATGAATGAAGAAGGAGG
TATCAAGACGACCGCTTATGATCGAGTGAACACACTTAAAAGGTTTACTAGTAATGCTCT
TGCGCTTGTTAACACTTATGGCAACACTGGAGCCCCATGAGATGGGATTATTAAGAGTTC
TTTAATTTAAATATTTTTTGATAGATTTTTACTTTGTTTAAGGTTTCTTTTGATTTTTCA
ATATGTTATGGGTTTTAATTTGAAATATAGTGGTGTGTGAAAAAATGAAAGTTTAGTGCA
GGCTTCGGAAAAGGTAGAAGTACGGATTTCATGTTTC

QA 1 397 1 397
DS 

RD RS1DO82JQ 823 0 0
ACGACTAAACGCACACCC
ACGATCTAGATTTCATCCGAACAAGCTGCAACGCTACTCTCTATCAAGAC*TCTGTTTCA
ACTCTCTCGCCGGCTACGCCCCCGTCGTCCAAGACAGTCCGGCGAGGCTAGCAAAGATCG
CAACCGGAGTGTCCCTCTCAAAAGCTAAATCCACGTTGGCCTTTCTCTCCAAACTCTCAC
GCTCCGCAGTCCAGGTCCAAGACTGCGTTTCGTACTTAGATGAAGCAGTTGGTTCCATTA
GAGACTCTCTTCAAACACTACGCAACTTGAGCCGTAGAGGCGGCGTTGCCGCGTCTGCTT
CATCGGACGAGACGTTTAGTTCGCAGGTGAATGACGTGCAGACGTGGATGAGTGCAGCAT
TGACGTATGAGGATACGTGTACGGACGAATATGAAGAAATGAATGAAGAAGGAGGTATCA
AGACGACCGTTTATGATCGAGTGAACACACTTAAAAGGTTTACTAGTAATGCTCTTGCGC
TTGTTAACACTTATGGCAACACTGGAGCCCCATGAGATGGGATTATTAAGAGTTTTTTAA
TTTAAATATTTTTTGATAGATTTTTACTTTGTTTAAGGTTTCTTTTGATTTTTCAATATG
TTATGGGTTTTAATTTGAAATATAGTGGTGTGTGAAAAAATGAAAGTTTAGTGCAGGCTT
CGGAAAAGGTAGAAGTACGGATTTCATGTTTCATTGCTTTGACTGATCTCTGTGGATATG
CTTATGATTTGATGAATCGTTGTATTAATTTTGGGATTTTGTTTTAATATGACTCATATT
ATATGAGTTTAACGTGGGTTTAGAT

QA 19 823 19 823
DS 



AS 2 4

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GGGCAACCGCTGCCTGCGACACCACCGATGAGTCGGCTCTTGCTGCCTACGCTTTTCTCA
ATCTCTAGAAAACAGGTTCTAGCTGCGTCATCGTTCCACAATCTGTACGGACGACGTCAC
AGGAGCTTTGTTCATTGGACGAGCGCTGCTATGTCGCAAGATAGTGCAATTGGTGACTCT
GCTTCTTCTGGGTCTAGAACTTTCTGCTCCTCCCTACAAGATTTATCAGCAAAAAAGTGT
GTCCCATGCAACGCTAAGGATCTACACCCCATGACTGAACAAAGTGCCCAAGAACTACTT
CAGAAGGTTGCTGGATGGGATATGGCTAATGACAATGGCACATTAAAGCTGCATCGATCG
TGGACGGTGAAAAGTTTTACAAAAGGACTAGACTTCTTCAAACGTGTAGCTGATATCGCT
GAATCAGAAGGTCATCACCCAGATTTGCATCTGGTAGGCTGGAATAATGTGAAGATCGAT
ATATGGACACATGCCATAGGTGGTTTGACCGAGAACGACTTCATTCTAGCTGCCAAGATC
AACGAGCTTCAAGTGGAAGATCTTCTGAGGAAGAAGAAAGTTGCCAAATGAGGAATGTGT
TGTTCGTCCACAAACTCTGTCAAAACAAGCGTTAGATGTTTCTTCAGCGTTTAGAGTTCT
TGTAAAGCTGTTTCTGTTCTTACAATCACAAAACTCACAAATAAGGCAGTTTGGAAGCAA
GTACCGTTTATTATATAGCAAATTAATAATTTCATATATACAATAATTATTTTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D694TF U 1
AF RS1D694JQ C 118
BS 1 692 RS1D694TF
BS 693 777 RS1D694JQ

RD RS1D694TF 699 0 0
GGGCAACCGCTGCCTGCGACACCACCGATGAGTCGGCTCTTGCTGCCTACGCTTTTCTCA
ATCTCTAGAAAACAGGTTCTAGCTGCGTCATCGTTCCACAATCTGTACGGACGACGTCAC
AGGAGCTTTGTTCATTGGACGAGCGCTGCTATGTCGCAAGATAGTGCAATTGGTGACTCT
GCTTCTTCTGGGTCTAGAACTTTCTGCTCCTCCCTACAAGATTTATCAGCAAAAAAGTGT
GTCCCATGCAACGCTAAGGATCTACACCCCATGACTGAACAAAGTGCCCAAGAACTACTT
CAGAAGGTTGCTGGATGGGATATGGCTAATGACAATGGCACATTAAAGCTGCATCGATCG
TGGACGGTGAAAAGTTTTACAAAAGGACTAGACTTCTTCAAACGTGTAGCTGATATCGCT
GAATCAGAAGGTCATCACCCAGATTTGCATCTGGTAGGCTGGAATAATGTGAAGATCGAT
ATATGGACACATGCCATAGGTGGTTTGACCGAGAACGACTTCATTCTAGCTGCCAAGATC
AACGAGCTTCAAGTGGAAGATCTTCTGAGGAAGAAGAAAGTTGCCAAATGAGGAATGTGT
TGTTCGTCCACAAACTCTGTCAAAACAAGCGTTAGATGTTTCTTCAGCGTTTAGAGTTCT
TGTAAAGCTGTTTCTGTTCTTACAATCACAAA
CTCACAA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RS1D694JQ 660 0 0
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TCTGCTTCTTCTGGGTCTAGAACTTTCTGCTCCTCCCTACAAGATTTATCAGCAAAAAAG
TGTGTCCCATGCAACGCTAAGGATCTACACCCCATGACTGAACAAAGTGCCCAAGAACTA
CTTCAGAAGGTTGCTGGATGGGATATGGCTAATGACAATGGCACATTAAAGCTGCATCGA
TCGTGGACGGTGAAAAGTTTTACAAAAGGACTAGACTTCTTCAAACGTGTAGCTGATATC
GCTGAATCAGAAGGTCATCACCCAGATTTGCATCTGGTAGGCTGGAATAATGTGAAGATC
GATATATGGACACATGCCATAGGTGGTTTGACCGAGAACGACTTCATTCTAGCTGCCAAG
ATCAACGAGCTTCAAGTGGAAGATCTTCTGAGGAAGAAGAAAGTTGCCAAATGAGGAATG
TGTTGTTCGTCCACAAACTCTGTCAAAACAAGCGTTAGATGTTTCTTCAGCGTTTAGAGT
TCTTGTAAAGCTGTTTCTGTTCTTACAATCACAAAACTCACAAATAAGGCAGTTTGGAAG
CAAGTACCGTTTATTATATAGCAAATTAATAATTTCATATATACAATAATTATTTTTGTT

QA 1 660 1 660
DS 



CO CL2691Contig2 1312 2 6 U
TTTCTGAGTTTCTCCCCCAAACGAAAGGAACTGAAAATCGTAAGAAGAATCCAAGGCGAA
AGAGAAGGATCAAATCTAAAAAAGATGGATGGTACCGCTCGTGATTCTTATGGGCATTCT
GATACTAATAATGTCGTAAGTCAAAGCATCAGAGAGACTAAAGAAGAAGAAGAAGATTCT
ACTTTTCGTGAAAGCGATAGCAAAAGACTTGGACCAGATCATGTGTTCGCGTCATCACTG
TCGATACTGCGGAGGGTTGTTCTGTGGAGACTGTTCTAAAGGGAGAAGCTTGCTTCCGGT
GAAGTTCCGCGTTTCGGATCCTCAGAGGGTCTGTGATGCGTGTTGTGTGAGGTTGGAGAC
CGTGCAGCCTTACCTGATGGACCAAGTGAGTCCTGCTGCTCAGTTGCCAACTCATGACTT
GACGGATCTCAGTACGTTGAGGTCTAGGGTGAACTTTCCATGGGGACAGTCAATGGAGTA
TGAGATTTATAAAGCGACAAACACTATTCGGGGTTATATATCCAAGGTTGGTTCTTCGAG
GACTGAGAGGTCCATCCCAGATGCCATTCTAAGACAAGCAAAAGGTCTTGCAGTAATCAC
TGTTGCCAGAGTTGGAGTAATGGTTACGTATAGAATCGGGACTGGACTTGTGGTTGCTCG
TAGAGATGATGGCTCCTGGTCTCCACCTTCAGCTATCTCTTCGTTTGGTTTGGAATGGGG
TGCTCAGGCAGGGGGAGAGTTCATAGACTTTATCATTGTCTTAAGAACTCGAGAGGCCAT
CCGGACGTTTGGGAGTAACACCCATTTTGTTGTTGGAGCTGGTTTAAGCGCTGCGGTTGG
TGTGACTGGACGAGCTGTTGAAGCAGATATCCGAGCAGGTAGTGGTGGTTATGCCGCTTG
CTATACCTACAGCTGCAGCAAAGGTGCATTTGTTGGATGCTCGCTTGAAGGAAGCATATT
CACAACACGTACAAGTGAGAACTCAAGGTTCTACGGGAGCCAGTCCCTAGCTGCGTCTGA
CATCCTCCTTGGCTCTTTGCCTAAACCGCCGGCTGCTGCTCCACTCTACCGTGCGCTTGG
TGATCTCTTTCAGAAGATGGGGAGTGAAACTACTCGGTCATCGACAACTTCATCGTTTTT
TGAAGACTGAACTTGCTTTTATCTATTTCGAAGTATAACAATGTCTTTTGTATAGATTCA
CGCAAATTCTTGAATGTAAATAGATTATGGAGATTTGGTTGGATAGTTTGTGGTTGTAAA
TAAACAAAAATAATTATTGTATATATGAAATTATTAATTTGCTATATAATAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FA82TF U 1
AF RS1FA82JQ C 535
BS 1 556 RS1FA82TF
BS 557 557 RS1FA82JQ
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RD RS1FA82TF 702 0 0
TTTCTGAGTTTCTCCCCCAAACGAAAGGAACTGAAAATCGTAAGAAGAATCCAAGGCGAA
AGAGAAGGATCAAATCTAAAAAAGATGGATGGTACCGCTCGTGATTCTTATGGGCATTCT
GATACTAATAATGTCGTAAGTCAAAGCATCAGAGAGACTAAAGAAGAAGAAGAAGATTCT
ACTTTTCGTGAAAGCGATAGCAAAAGACTTGGACCAGATCATGTGTTCGCGTCATCACTG
TCGATACTGCGGAGGGTTGTTCTGTGGAGACTGTTCTAAAGGGAGAAGCTTGCTTCCGGT
GAAGTTCCGCGTTTCGGATCCTCAGAGGGTCTGTGATGCGTGTTGTGTGAGGTTGGAGAC
CGTGCAGCCTTACCTGATGGACCAAGTGAGTCCTGCTGCTCAGTTGCCAACTCATGACTT
GACGGATCTCAGTACGTTGAGGTCTAGGGTGAACTTTCCATGGGGACAGTCAATGGAGTA
TGAGATTTATAAAGCGACAAACACTATTCGGGGTTATATATCCAAGGTTGGTTCTTCGAG
GACTGAGAGGTCCATCTCAGATGCCATTCTAAGACAAGCAAAAG*TCTTGCAGTAATCAC
TGTTGCCAGAGTTGGAGTAATGGTTACGTATAGAATCGGGACTGGACTTGTGGTTGCTCG
TAGAGATGATGGCTCCTGGTCTCCACCTTCAGCTATCTCTTC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RS1FA82JQ 778 0 0
TTCGAGGACTGAGAGGTCCATCCCAGATGCCATTCTAAGACAAGCAAAAGGTCTTGCAGT
AATCACTGTTGCCAGAGTTGGAGTAATGGTTACGTATAGAATCGGGACTGGACTTGTGGT
TGCTCGTAGAGATGATGGCTCCTGGTCTCCACCTTCAGCTATCTCTTCGTTTGGTTTGGA
ATGGGGTGCTCAGGCAGGGGGAGAGTTCATAGACTTTATCATTGTCTTAAGAACTCGAGA
GGCCATCCGGACGTTTGGGAGTAACACCCATTTTGTTGTTGGAGCTGGTTTAAGCGCTGC
GGTTGGTGTGACTGGACGAGCTGTTGAAGCAGATATCCGAGCAGGTAGTGGTGGTTATGC
CGCTTGCTATACCTACAGCTGCAGCAAAGGTGCATTTGTTGGATGCTCGCTTGAAGGAAG
CATATTCACAACACGTACAAGTGAGAACTCAAGGTTCTACGGGAGCCAGTCCCTAGCTGC
GTCTGACATCCTCCTTGGCTCTTTGCCTAAACCGCCGGCTGCTGCTCCACTCTACCGTGC
GCTTGGTGATCTCTTTCAGAAGATGGGGAGTGAAACTACTCGGTCATCGACAACTTCATC
GTTTTTTGAAGACTGAACTTGCTTTTATCTATTTCGAAGTATAACAATGTCTTTTGTATA
GATTCACGCAAATTCTTGAATGTAAATAGATTATGGAGATTTGGTTGGATAGTTTGTGGT
TGTAAATAAACAAAAATAATTATTGTATATATGAAATTATTAATTTGCTATATAATAA

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 4

CO CL2692Contig1 803 4 8 U
GGACGACTGATCCATACCATTCCATTACATTCCATTCCTCAAAGCTCTCTATCATATCAA
ATCAACAATGGCGTTCCCTAAGGTGTTCTTCGACATGACCGTAGGTGGCCAGCCTGCTGG
AAGGATCGTGATGGAGCTGTACACAGACAAGACTCCCAAGACCGCCGAGAATTTCAGAGC
TCTATGCACAGGAGAGAAAGGAGTCGGACGTGACGGGAAGCCTCTCCACTTCAAGGGGTC
TTCCTTCCACCGCGTGATCCCTAACTTCATGTGCCAGGGAGGTGACTTCACGGCGGGGAA
CGGGACGGGTGGCGAGTCCATCTACGGTGATAAGTTCGCCGACGAGAATTTCGAGAGGAA
GCACACCGGTCCTGGGATCCTCTCCATGGCCAACGCTGGTCCAAACACCAACGGATCTCA
GTTCTTTATCTGCACTGTTAAAACCGATTGGCTTGATGGTAAGCACGTGGTGTTCGGTCA
GGTGGTGGAAGGGTTGGACGTGGTGAAGGCCATCGAGAAGGTGGGATCGGCGTCTGGAAA
GACGTCGAAGCCTGTGGTTGTGGCAGACTGTGGTCAGCTCTCTTAGATCGCATGAGATCT
GTCCTCGGTTAAAATTAGCGTGTCATCTTCATCCTTTAGTGAGTGGTGTTGGGTCCTCAT
CGTGTGTCTCTCTCTGCTTTTGCTTTTGTGTGTCTTTTCATTTGGTGTAGTCATGAAAGC
TTGGTTTGTGTTCGGTCTCATGTCACCCTGATTAGTAGCTAGTCCCATAAATAATGAATG
AGCTTGTGTTTACCCTTTTCATT


BQ
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AF RS1DA54TF U 1
AF RS1D305TF U 1
AF RS1D305JQ C 135
AF RS1DA54JQ C 231
BS 1 613 RS1D305TF
BS 614 614 RS1D305JQ
BS 615 686 RS1D305TF
BS 687 687 RS1D305JQ
BS 688 697 RS1D305TF
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BS 699 723 RS1D305TF
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RD RS1DA54TF 511 0 0
A
GACGACTGGTCCATACCATTCCATTACATTCCATTCCTCAAAGCTCTCTATCATATCAAA
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TCCTTCCACCGCGTGATCCCTAACTTCATGTGCCAGGGAGGTGACTTCACGGCGGGGAAC
GGGACGGGTGGCGAGTCCATCTACGGTGATAAGTTCGCCGACGAGAATTTCGAGAGGAAG
CACACCGGTCCTGGGATCCTCTCCATGGCCAACGCTGGTCCAAACACCAACGGATCTCAG
TTCTTTATCTGCACTGTTAAAACCGATTGGCTTGATGGTAAGCACGTGGTGTTCGGTCAG
GTGGTGGAAGGGTTGGACGTGGTGAAGGCC

QA 2 511 2 511
DS 

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GGACGACTGATCCATACCATTCCATTACATTCCATTCCTCAAAGCTCTCTATCATATCAA
ATCAACAATGGCGTTCCCTAAGGTGTTCTTCGACATGACCGTAGGTGGCCAGCCTGCTGG
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TCTATGCACAGGAGAGAAAGGAGTCGGACGTGACGGGAAGCCTCTCCACTTCAAGGGGTC
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CGGGACGGGTGGCGAGTCCATCTACGGTGATAAGTTCGCCGACGAGAATTTCGAGAGGAA
GCACACCGGTCCTGGGATCCTCTCCATGGCCAACGCTGGTCCAAACACCAACGGATCTCA
GTTCTTTATCTGCACTGTTAAAACCGATTGGCTTGATGGTAAGCACGTGGTGTTCGGTCA
GGTGGTGGAAGGGTTGGACGTGGTGAAGGCCATCGAGAAGGTGGGATCGGCGTCTGGAAA
GACGTCGAAGCCTGTGGTTGTGGCAGACTGTGGTCAGCTCTCTTAGATCGCATGAGATCT
GTCCTCGGTTAAA*TTAGCGTGTCATCTTCATCCTTTAGTGAGTGGTGTTGGGTCCTCAT
CGTGTGTCTCTCTCTGCTTTTGCTTT*GTGTGTCTTT*CATTTGGTGTAGTCATGAAAGC
TTG

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1D305JQ 669 0 0
AGCTGTACACAGACAAGACTCCCAAGACCGCCGAGAATTTCAGAGCTCTATGCACAGGAG
AGAAAGGAGTCGGACGTGACGGGAAGCCTCTCCACTTCAAGGGGTCTTCCTTCCACCGCG
TGATCCCTAACTTCATGTGCCAGGGAGGTGACTTCACGGCGGGGAACGGGACGGGTGGCG
AGTCCATCTACGGTGATAAGTTCGCCGACGAGAATTTCGAGAGGAAGCACACCGGTCCTG
GGATCCTCTCCATGGCCAACGCTGGTCCAAACACCAACGGATCTCAGTTCTTTATCTGCA
CTGTTAAAACCGATTGGCTTGATGGTAAGCACGTGGTGTTCGGTCAGGTGGTGGAAGGGT
TGGACGTGGTGAAGGCCATCGAGAAGGTGGGATCGGCGTCTGGAAAGACGTCGAAGCCTG
TGGTTGTGGCAGACTGTGGTCAGCTCTCTTAGATCGCATGAGATCTGTCCTCGGTTAAAA
TTAGCGTGTCATCTTCATCCTTTAGTGAGTGGTGTTGGGTCCTCATCGTGTGTCTCTCTC
TGCTTTTGCTTTTGTGTGTCTTTTCATTTGGTGTAGTCATGAAAGCTTGGTTTGTGTTCG
GTCTCATGTCACCCTGATTAGTAGCTAGTCCCATAAATAATGAATGAGCTTGTGTTTACC
CTTTTCATT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RS1DA54JQ 570 0 0
TCAAGGGGTCTTCCTTCCACCGCGTGATCCCTAACTTCATGTGCCAGGGAGGTGACTTCA
CGGCGGGGAACGGGACGGGTGGCGAGTCCATCTACGGTGATAAGTTCGCCGACGAGAATT
TCGAGAGGAAGCACACCGGTCCTGGGATCCTCTCCATGGCCAACGCTGGTCCAAACACCA
ACGGATCTCAGTTCTTTATCTGCACTGTTAAAACCGATTGGCTTGATGGTAAGCACGTGG
TGTTCGGTCAGGTGGTGGAAGGGTTGGACGTGGTGAAGGCCATCGAGAAGGTGGGATCGG
CGTCTGGAAAGACGTCGAAGCCTGTGGTTGTGGCAGACTGTGGTCAGCTCTCTTAGATCG
CATGAGATCTGTCCTCGGTTAAAATTAGCGTGTCATCTTCATCCTTTAGTGAGTGGTGTT
GGGTCCTCATCGTGTGTCTCTCTCTGCTTTTGCTTTTGTGTGTCTTTTCATTTGGTGTAG
TCATGAAAGCTTGGTTTGTGTTCGGTCTCATGTCACCCTGATTAGTAGCTAGTCCCATAA
ATAATGAATGAGCTTGTGTTTACCCTTT
CG

QA 1 568 1 568
DS 



AS 1 4

CO CL2693Contig1 1208 4 11 U
GGCCTCTCCATTATTCATTCCCCTAGAAAAAAAAGTTGTTCAACAAGAAAGAAACCTAAA
AAGAAGAAAGGATATCTAGAAATGTCGGTAACAACTACGGTGGAGGAGAACCACCGGAAA
GATCCTTCATCACCGGATAAAGAGGCGGAGAAGAGGAAGCAGAGATGGGTGTTTTGGGAA
AGAAAGTGGAGAAGATTAGATTATTTCAAACTCACGGCTTCATTGTTTGTGCATTCTATG
GCTCTCTTGGCTCCGTTTTATTTCAGCTGGTCGGCACTTTGGGTTACCTTTTTGTTTTAT
ACGATTGGTGGTCTCGGTATTACGGTGTCGTATCACCGGAACTTGGCTCACCGGAGTTTC
AAAGTCCCTAAATGGCTGGAGTATCTCTTAGCCTATTGTGCCCTTCTCGCCATTCAGGGA
GATCCGATTGATTGGGTGAGTACTCATCGATATCATCACCAATTCACGGATTCAGAACGA
GATCCACATAGCCCTAAGGAAGGCTTTTGGTTTAGTCATCTCCTATGGATTTATGATTCC
GCATATCTAGTTACAAAGTGTGGAAGAAGGACAAACGTGGACGATTTGAAGAGGCAATGG
TTCTATAGGTTTCTTCAAAAGACAGTGCTGTTTCACATTCTAGGACTTGGTATAATTCTC
TTCTACCTCGGTGGGATGTCCTTCGTTACTTGGGGAATGGGGGTAGGAGCAGCACTGGAG
GTGCACGTGACTTGTCTAATAAACTCACTGTGTCATGTCTGGGGCACTCGAACTTGGAAG
ACAAATGACACTTCTCGTAATGTTTGGTGGCTATCTGTATTTTCATTTGGAGAAAGCCGG
CACAACAACCACCATGCGTTCGAGTCGTCAGCTAGACAAGGTCTCGAATGGTGGCAAATC
GACATTTCTTGGTACATTGTCCGGTTTCTTGAGATTATCGGTTTAGCATATGACGTAAAA
CTGCCAACGGAATCTCAGCGACGTCGTATGGCTATTGTTCGTTGAACTGCGGGAAAACAA
AAAGAGGAGAGATTAATTCTATGTAATTAGAATAATTTCTAGTCCTAAAAAGAGTTTATT
GTTTTTATAGTCCTAAAAAGAGTTTATTGTTTTTATTTTATTTATTTTACTTTGAAGTTT
TGGGTAAACTCAATGAACGTTTCCGATGTGTTTGTGTTGGAACAAGTTGATTAATATATT
TGTCGTAA


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CV18TF U 1
AF RS1FL55TF U 3
AF RS1FL55JQ C 665
AF RS1CV18JQ C 439
BS 1 567 RS1CV18TF
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BS 721 721 RS1CV18JQ
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BS 740 774 RS1FL55TF
BS 775 837 RS1CV18JQ
BS 838 838 RS1FL55JQ
BS 839 1208 RS1CV18JQ

RD RS1CV18TF 591 0 0
GGCCTCTCCATTATTCATTCCCCTAGAAAAAAAAGTTGTTCAACAAGAAAGAAACCTAAA
AAGAAGAAAGGATATCTAGAAATGTCGGTAACAACTACGGTGGAGGAGAACCACCGGAAA
GATCCTTCATCACCGGATAAAGAGGCGGAGAAGAGGAAGCAGAGATGGGTGTTTTGGGAA
AGAAAGTGGAGAAGATTAGATTATTTCAAACTCACGGCTTCATTGTTTGTGCATTCTATG
GCTCTCTTGGCTCCGTTTTATTTCAGCTGGTCGGCACTTTGGGTTACCTTTTTGTTTTAT
ACGATTGGTGGTCTCGGTATTACGGTGTCGTATCACCGGAACTTGGCTCACCGGAGTTTC
AAAGTCCCTAAATGGCTGGAGTATCTCTTAGCCTATTGTGCCCTTCTCGCCATTCAGGGA
GATCCGATTGATTGGGTGAGTACTCATCGATATCATCACCAATTCACGGATTCAGAACGA
GATCCACATAGCCCTAAGGAAGGCTTTTGGTTTAGTCATCTCCTATGGATTTATGATTCC
GCATATCTAGTTACAAAGTGTGGAAGA*GGACAAACGTGGACGATTTGAAG

QA 1 591 1 591
DS 

RD RS1FL55TF 784 0 0
G
CTCTCCATTATTCATTCCCCTAGAAAAAAAAGTTGTTCAACAAGAAAGAAACCTAAAAAG
AAGAAAGGATATCTAGAAATGTCGGTAACAACTACGGTGGAGGAGAACCACCGGAAAGAT
CCTTCATCACCGGATAAAGAGGCGGAGAAGAGGAAGCTGAGATGGGTGTTTTGGGAAAGA
AAGTGGAGAAGATTAGATTATTTCAAACTCACGGCTTCATTGTTTGTGCATTCTATGGCT
CTCTTGGCTCCGTTTTATTTCAGCTGGTCGGCACTTTGGGTTACCTTTTTGTTTTATACG
ATTGGTGGTCTCGGTATTACGGTGTCGTATCACCGGAACTTGGCTCACCGGAGTTTCAAA
GTCCCTAAATGGCTGGAGTATCTCTTAGCCTATTGTGCCCTTCTCGCCATTCAGGGAGAT
CCGATTGATTGGGTGAGTACTCATCGATATCATCACCAATTCACGGATTCAGAACGAGGT
CCACATAGCCCTAAGGAAGGCTTTTGGTTTAGTCATCTCCTATGGATTTATGATTCCGCA
TATCTAGTTACAAAGTGTGGAAGAAGGACAAACGTGGACGATTTGAAGAGGCAATGGTTC
TATAGGTTTCTTCAAAAGACAGTGCTGTTTCACATTCTAGGACTTGGTATAATTCTCTTC
TACCTCGGTGGGATGTCCTTCGTTACTTGGGGAATGGGGGTAGGAGCAGCACTGGAG*TG
CACGTGACTTGTCTA*TAAACTCACTGTGTCATGTCTGGGGCACTCGAACT
GGGAGACAATGA

QA 2 772 2 772
DS 

RD RS1FL55JQ 528 0 0
ACCTCGGTGGGATGTCCTTCGTTACTTGGGGAATGGGGGTAGGAGCAGCACTGGAGGTGC
ACGTGACTTGTCTAATAAACTCACTGTGTCATGTCTGGGGCACTCGAACTTGGAAGACAA
ATGACACTTCTCGTAATGTTTGGTGGCTATCTGTATTTTCATTTGGAGAAAGCCGGCACA
ACAACCACCATGCGTTCGAGTCGTCAGCTAGACAAGGTCTCGAATGGTGGCAAATCGACA
TTTCTTGGTACATTGTCCGGTTTCTTGAGATTATCGGTTTAGCATATGACGTAAAACTGC
CAACGGAATTTCAGCGACGTCGTATGGCTATTGTTCGTTGAACTGCGGGAAAACAAAAAG
AGGAGAGATTAATTCTATGTAATTAGAATAATTTCTAGTCCTAAAAAGAGTTTATTGTTT
TTATAGTCCTAAAAAGAGTTTATTGTTTTTATTTTATTTATTTTACTTTGAAGTTTTGGG
TAAACTCAATGAACGTTTCCGATGTGTTTGTGTTGGAACAAGTTGATT

QA 1 528 1 528
DS 

RD RS1CV18JQ 770 0 0
AGTACTCATCGATATCATCACCAATTCACGGATTCAGAACGAGATCCACATAGCCCTAAG
GAAGGCTTTTGGTTTAGTCATCTCCTATGGATTTATGATTCCGCATATCTAGTTACAAAG
TGTGGAAGAAGGACAAACGTGGACGATTTGAAGAGGCAATGGTTCTATAGGTTTCTTCAA
AAGACAGTGCTGTTTCACATTCTAGGACTTGGTATAATTCTCTTCTACCTCGGTGGGATG
TCCTTCGTTACTTGGGGAATGGGGGTAGGAGCAGCACTGGAGGTGCACGTGACTTGTTTA
ATAAACTCACTGTGTCATGTCTGGGGCACTCGAACTTGGAAGACAAATGACACTTCTCGT
AATGTTTGGTGGCTATCTGTATTTTCATTTGGAGAAAGCTGGCACAACAACCACCATGCG
TTCGAGTCGTCAGCTAGACAAGGTCTCGAATGGTGGCAAATCGACATTTCTTGGTACATT
GTCCGGTTTCTTGAGATTATCGGTTTAGCATATGACGTAAAACTGCCAACGGAATCTCAG
CGACGTCGTATGGCTATTGTTCGTTGAACTGCGGGAAAACAAAAAGAGGAGAGATTAATT
CTATGTAATTAGAATAATTTCTAGTCCTAAAAAGAGTTTATTGTTTTTATAGTCCTAAAA
AGAGTTTATTGTTTTTATTTTATTTATTTTACTTTGAAGTTTTGGGTAAACTCAATGAAC
GTTTCCGATGTGTTTGTGTTGGAACAAGTTGATTAATATATTTGTCGTAA

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 4

CO CL2694Contig1 574 4 1 U
GGAATATCGGCTAGGGATGACGACGAGGATGGCAGGATTCGGCGAGGAAGAAAGTGGGAT
CTCAGACAGTGGGATCATAGAGGGTTTTCTGCGGCCAAAGATTGAAGGAGAAGCAGTGGC
GATTCCAGGATTGATAGTGGAATTGGGGGAGGAGTTGTACACTCGAGAGCCATGGCTCCT
TCCGCAGACACCCCATCCCATCCTTAACCCTCGAGAGTGGCTCTACTTGGGGAAACCGAA
TCGAAATAATGTCCCCGTTGAAGGAGTTGATCACGAAGGGTGTTGGGTTCGCATTGGAAG
TGCCGTCTTGATCCGATCCGAGGAGACTGATGAAATCATTGGGGGAACGTCGAGATTCAG
ATATCGCTTCAGGAACAAGGGGGACAAACATGCTCCTCTGAGGTAGAGTAATTGGTTCAT
GAAAGAGTATCGTCTCTTTAACCCAACCCCTCATGTTATTTGCAAGATTACTGAAAAGCT
GTCCTAAGATAGATAAATTTGTTTCTGTTTTAATTATTTTTATTTATGCAATGGACTCGG
ATGAATTTTAATAAATCAATAAGTTTTACTCAAT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1AQ16JQ C 1
AF RS1AQ16TFB U 1
AF RS1AQ26JQ C 1
AF RS1AQ26TFB U 1
BS 1 574 RS1AQ16TFB

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GTCCTAAGATAGATAAATTTGTTTCTGTTTTAATTATTTTTATTTATGCAATGGACTCGG
ATGAATTTTAATAAATCAATAAGTTTTACTCAAT

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DS 

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GAAAGAGTATCGTCTCTTTAACCCAACCCCTCATGTTATTTGCAAGATTACTGAAAAGCT
GTCCTAAGATAGATAAATTTGTTTCTGTTTTAATTATTTTTATTTATGCAATGGACTCGG
ATGAATTTTAATAAATCAATAAGTTTTACTCAAT

QA 1 574 1 574
DS 

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GTCCTAAGATAGATAAATTTGTTTCTGTTTTAATTATTTTTATTTATGCAATGGACTCGG
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GAAAGAGTATCGTCTCTTTAACCCAACCCCTCATGTTATTTGCAAGATTACTGAAAAGCT
GTCCTAAGATAGATAAATTTGTTTCTGTTTTAATTATTTTTATTTATGCAATGGACTCGG
ATGAATTTTAATAAATCAATAAGTTTTACTCAAT

QA 1 574 1 574
DS 



AS 1 3

CO CL2695Contig1 1325 3 17 U
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CGTAACAACCAATCGACGGCACATGTCCGTGGAAAACGCGGGAACAAGGAGGAGGAGGAT
TCTTCTACTCTTGTTGAAATCTCGTGCTCGATATGCCTCGAGTTGGTGATCGACGACGGT
TCCAGATCCATGGCTAAGCTCCAATGTGGTCACCAATTCCATTTGGACTGCATTGGATCC
GCTTTCAACATGAAAGGAACCATGCAATGCCCTAACTGTCGTAATGTTGAAAAGGGTCAG
TGGCTCTTTGCCAATGCTTCTTCTACTCGTCTCTTTCCTGAGTTTGTCATGGGAGATTGG
ATCCCTGATGAAGATTTGTATGCTTTAAGCTACCCTGAAATGCAATATCGGGTCCATTGG
TGCCCCTTTGGTGAGCTCTCTCAAGCTGCTTCATTCGAGGAACTGGAACCTTCAGCCACT
ACATATCATAATGAGTTCCATGGGCACCATGCCATTGCTATGAACCATTCATATCCTGCA
TACGTTGCACCAGGCCCAGCCTCCACTCCAAGAACTACGGATAACAGCAACAACGCAGAT
GACCATCCCTGGAACAACAGCCACTCTACTGACCACTTTCACCAGCTCTCTGTTGCTCCC
CACTATCACTATCACCATCACCATCATCATTCTACATCGTTTTCTCTTCCAGCTGCTCAT
GTAATTGATGGTGAAATCGACTCTTCAGCAACACGGGGCATTTCTCATCCACACCCATTT
CTCTTTAGTTATCGGTCTAGTCCAAGAACCTCACCAGCAGCTAACACTCAACAAGGAAGC
AGCAGCGCTGTGCAAATGCGTGAACACCTTCACACGCAGCAGCATCATGTTTATAGTAAC
CAGAGGCAACATCATCATGTTAATGGTCCCAATCTCGCACCACCTCCTCTGGTCTCTGTG
ACAAGAAGGGGACTACAGCCACTACCAACGCCAGATCAGAACGTTGGATTCTTCATTTAT
CCACCACCACAAGCACCGAGCACCTCAGGTGAACGAGAAAGCGATCAGTTTCATCCTTGG
GAGAGAGATGGGTTTCCACATTTCCCTCTCCCCTCGATTCACCGCACAATCTCTAGCTTC
TGGCACAGACACTTTTGAGAGAAGAAATCTTACCAGGTGTATGAACAATGTATAAAAAGA
TGAAAACTGGGGACTTGTTTGATGAATCAAAACTTGTTTATGATGTAACTATAACTTGGT
TTTCCAATGTACATTTGTGGCCTTGCCAAGAATCGTTGGTTATTAAACAGAAAGATTCAA
CCCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1FE73TF U 1
AF RS1EF22TF U 358
AF RS1FU66JQ C 710
BS 1 392 RS1FE73TF
BS 393 393 RS1EF22TF
BS 394 505 RS1FE73TF
BS 506 506 RS1EF22TF
BS 507 525 RS1FE73TF
BS 526 941 RS1EF22TF
BS 942 942 RS1FU66JQ
BS 943 1048 RS1EF22TF
BS 1049 1049 RS1FU66JQ
BS 1050 1052 RS1EF22TF
BS 1053 1053 RS1FU66JQ
BS 1054 1112 RS1EF22TF
BS 1113 1113 RS1FU66JQ
BS 1114 1118 RS1EF22TF
BS 1119 1119 RS1FU66JQ
BS 1120 1150 RS1EF22TF
BS 1151 1325 RS1FU66JQ

RD RS1FE73TF 525 0 0
CGATCGAGGCTAGGCTAGGTGGAGATAGAGATGGCCGGAGCTAATGATGATGATGATGAT
CGTAACAACCAATCGACGGCACATGTCCGTGGAAAACGCGGGAACAAGGAGGAGGAGGAT
TCTTCTACTCTTGTTGAAATCTCGTGCTCGATATGCCTCGAGTTGGTGATCGACGACGGT
TCCAGATCCATGGCTAAGCTCCAATGTGGTCACCAATTCCATTTGGACTGCATTGGATCC
GCTTTCAACATGAAAGGAACCATGCAATGCCCTAACTGTCGTAATGTTGAAAAGGGTCAG
TGGCTCTTTGCCAATGCTTCTTCTACTCGTCTCTTTCCTGAGTTTGTCATGGGAGATTGG
ATCCCTGATGAAGATTTGTATGCTTTAAGCTATCCTGAAATGCAATATCGGGTCCATTGG
TGCCCCTTTGGTGAGCTCTCTCAAGCTGCTTCATTCGAGGAACTGGAACCTTCAGCCACT
ACATATCATAATGAGTTCCATGGGCCCCATGCCATTGCTATGAAC

QA 1 525 1 525
DS 

RD RS1EF22TF 793 0 0
G
GGATCCCTGATGAAGATTTGTATGCTTTAAGCTACCCTGAAATGCAATATCGGGTCCATT
GGTGCCCCTTTGGTGAGCTCTCTCAAGCTGCTTCATTCGATGAACTGGAACCTTCAGCCA
CTACATATCATAATGAGTTCCATGGTCACCATGCCGTTGCTATGAACCATTCATATCCTG
CATACGTTGCACCAGGCCCAGCCTCCACTCCAAGAACTACGGATAACAGCAACAACGCAG
ATGACCATCCCTGGAACAACAGCCACTCTACTGACCACTTTCACCAGCTCTCTGTTGCTC
CCCACTATCACTATCACCATCACCATCATCATTCTACATCGTTTTCTCTTCCAGCTGCTC
ATGTAATTGATGGTGAAATCGACTCTTCAGCAACACGGGGCATTTCTCATCCACACCCAT
TTCTCTTTAGTTATCGGTCTAGTCCAAGAACCTCACCAGCAGCTAACACTCAACAAGGAA
GCAGCAGCGCTGTGCAAATGCGTGAACACCTTCACACGCAGCAGCATCATGTTTATAGTA
ACCAGAGGCAACATCATCATGTTAATGGTCCCAATCTCGCACCGCCTCCTCTGGTCTCTG
TGACAAGAAGGGGACTACAGCCACTACCAACGCCAGATCAGAACGTTGGATTCTTCATTT
ATCCACCACCACAAGCACCGAGCACCTCAG*TGAGCGAGAAAGCGATCAGTTTCATCCTT
GGGAGAGAGATGGGTTTCCACATTTCCCTCTCCC*TCGAT*CACCGCACAATCTCTAGCT
TCTGGCACAGAC

QA 2 793 2 793
DS 

RD RS1FU66JQ 616 0 0
CAGCTGCTCATGTAATTGATGGTGAAATCGACTTTTCAGCAACACGGGGCATTTTTCATC
CACACCCATTTTTCTTTAGTTATCGGTTTAGTCCAAGAACCTCACCAGCAGCTAACACTC
AACAAGGAAGCAGCAGCGCTGTGCAAATGCGTGAACACCTTCACACGCAGCAGCATCATG
TTTATAGTAACCAGAGGCAACATCATCATGTTAATGGTCCCAATCTCGCACCACCTCCTT
TGGTTTTTGTGACAAGAAGGGGACTACAGCCACTACCAACGCCAGATCAGAACGTTGGAT
TTTTCATTTATCCACCACCACAAGCACCGAGCACCTCAGGTGAACGAGAAAGCGATCAGT
TTCATCCTTGGGAGAGAGATTGGTTTCCACATTTCCCTCTCCCCTCGATTCACCGCACAA
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GTATAAAAAGATGAAAACTGGGGACTTGTTTGATGAATCAAAACTTGTTTATGATGTAAC
TATAACTTGGTTTTCCAATGTACATTTGTGGCCTTGCCAAGAATCGTTGGTTATTAAACA
GAAAGATTCAACCCCG

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 4

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TCACTCATGGTGTGCTCAACACTGACAATATGAGCATTTTGGGTCAGACCATAGACTATG
GTCCGTTTGGGTTCTTGGATGCTTTTGATCCGAGTTTCACCCCGAACACGACAGACCTCC
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TTGCTAAGTCTCTGGCTGTTGCTGAGCTGATAAATCAAAAGGAGGCTAATTACGCCATGG
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TTTCCAAGTATAACAAGGACATCATTAGTAAACTTCTGAACAATATGGCTGTTTATAAAG
TCGATTACACAAACTTCTTCCGGCTTCTTTCAAATGTCAAAGCAAACCCGGACACACCTG
AAAATGAGTTGTTGAAGCCCTTGAAAGCTGCGCTCTTGGACATTGGAAAGGAGAGAAAAA
AAGCTTGGATCAAATGGGTGCAAGCGTATATACAGGAGGTGAGCGGTGATGACACATCAG
ATGAAGAAAGAAAGGCAA*GGATGGATTCAGTGAACCCAAAGTACATTCTGAGGAACTAT
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ATCCGTCTCATGAAAAATCCTTACGAGGAACAGCCAGGGATGGAGAAATATGCTCGGTTG
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TCCTTTCCTACTTTTGTTTTTTTCCCTTGTAGAAAGGAAGAGGAAAACTAAAAACACTCT
TTATGTGTATGGTTTTGTAATGCATTACATTGTCAAGATAAGTTCTATGTTTTGTTTTAC
GTTGAATAAAGATTTGAGTCAAGAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1A355TF U 1
AF RS1A355TV U 1
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A*GCTTGGATCAAATGGGTGCAAGCGTATATACAGGAGGTGAGCGGTGATGACACATCA

QA 1 779 1 779
DS 

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GCTTATCTTTCAGAACCAGCAAAGAAGAAGTGGATCTAACATCGAACAAGTATGCAGCAT
GGGTTGTTGAGATTGCGGAGCGTACAGCTACCTTAGTGGCAAGATGGCAAGGTGTAGGCT
TCACTCATGGTGTGCTCAACACTGACAATATGAGCATTTTGGGTCAGACCATAGACTATG
GTCCGTTTGGGTTCTTGGATGCTTTTGATCCGAGTTTCACCCCGAACACGACAGACCTCC
CTGGAAGAAGATACTGTTTTGCAAACCAGCCTGACATCGGCTTGTGGAATATTGCTCAGT
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TCGATTACACAAACTTCTTCCGGCTTCTTTCAAATGTCAAAGCAAACCCGGACACACCTG
AAAATGAGTTGTTGAAGCCCTTGAAAGCTGCGCTCTTGGACATTGGAAAGGAGAGAAAAA
AAGCTTGGATCAAATGGGTGCAAGCGTATATACAGGAGGTGAGCGGTGATGACACATCAG
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CTCTGCCAAAGCGCGATAGATGCAGCTGAACAAGGGGACTTCTCAGAGGTC

QA 1 891 1 891
DS 

RD RS1A355TR 899 0 0
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GATCCGAGTTTCACCCCGAACACGACAGACCTCCCTGGAAGAAGATACTGTTTTGCAAAC
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CTGATAAATCAAAAGGAGGCTAATTACGCCATGGAGAGGTACGGTGATAAATTCATGGAC
GAGTATCAAGCCATAATGTCAAAGAAGCTTGGTCTTTCCAAGTATAACAAGGACATCATT
AGTAAACTTCTGAACAATATGGCTGTTTATAAAGTCGATTACACAAACTTCTTCCGGCTT
CTTTCAAATGTCAAAGCAAACCCGGACACACCTGAAAATGAGTTGTTGAAGCCCTTGAAA
GCTGCGCTCTTGGACATTGGAAAGGAGAGAAAAAAAGCTTGGATCAAATGGGTGCAAGCG
TATATACAGGAGGTGAGCGGTGATGACACATCAGATGAAGAAAGAAAGGCAA*GGATGGA
TTCAGTGAACCCAAAGTACATTCTGAGGAACTATTTCTGCCAAAGCGCGATAGATGCAGC
TGAACAAGGGGACTTCTCAGAGGTCAACAACTTGATCCGTCTCATGAAAAATCCTTACGA
GGAACAGCCAGGGATGGAGAAATATGCTCGGTTGCCTCCAGCTTGGGCTTATAGGCCAGG
CGTCTGCATGCTTTCTTGCTCCTCCTAGTTCTTCTCCTTTCCTACTTTTGTTTTTTTCCC
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ACATTGTCAAGATAAGTTCTATGTTTTGTTTTACGTTGAATAAAGATTTGAGTCAAGAT

QA 1 899 1 899
DS 

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ACGCCATGGAGAGGTACGGTGATAAATTCATGGACGAGTATCAAGCCATAATGTCAAAGA
AGCTTGGTCTTTCCAAGTATAACAAGGACATCATTAGTAAACTTCTGAACAATATGGCTG
TTTATAAAGTCGATTACACAAACTTCTTCCGGCTTCTTTCAAATGTCAAAGCAAACCCGG
ACACACCTGAAAATGAGTTGTTGAAGCCCTTGAAAGCTGCGCTCTTGGACATTGGAAAGG
AGAGAAAAAAAGCTTGGATCAAATGGGTGCAAGCGTATATACAGGAGGTGAGCGGTGATG
ACACATCAGATGAAGAAAGAAAGGCAA*GGATGGATTCAGTGAACCCAAAGTACATTTTG
AGGAACTATTTCTGCCAAAGCGCGATAGATGCAGCTGAACAAGGGGACTTCTCAGAGGTC
AACAACTTGATCCGTCTCATGAAAAATCCTTACGAGGAACAGCCAGGGATGGAGAAATAT
GCTCGGTTGCCTCCAGCTTGGGCTTATAGGCCAGGCGTCTGCATGCTTTCTTGCTCCTCC
TAGTTCTTCTCCTTTCCTACTTTTGTTTTTTTCCCTTGTAGAAAGGAAGAGGAAAACTAA
AAACACTCTTTATGTGTATGGTTTTGTAATGCATTACATTGTCAAGATAAGTTCTATGTT
TTGTTTTACGTTGAATAAAGATTTGAGTCAAGAT

QA 1 814 1 814
DS 



AS 1 4

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CACTCTCTCTCTCTTGTGTTCTCTCCACTTTCTCTTCTTCTTGCTCTCTAGAGATCTCTC
TATCTCTATCTCCACACTGTGACATTTTCTCTGAACGCATCTATGGCTGCTCTGGTTCTC
TCACTTCTCCTTCTAGTTCTAGCCATGGCTGACCATTCTAGTGCCTCATGGTGTGTGTGC
AAAGGCCTGAGTGATGATGTGTTACAGAAGACCATAGACTATGCTTGTGGAAATGGAGCA
GACTGTAACCCCATTCACCCAAAAGCACCTTGCTTTAACCCTGACAATGTTAGGTCTCAT
TGCAACTATGCAGTCAACAGCTTCTTCCAAAAGAAGCGTCAAGCTTCAGGCACTTGTGAT
TTCAGTGGCACTGCCACTCCTACTAACTCCGATCCAAGTTATTCAGGATGTACCTTCCCT
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AATGGAGTTTTTGGGAACAATAGCACAGGAGCCAACGGGACAGGAGTTAACCCGGACTAC
ACGACGGAAAGCAGCGCGTTTGGTCTCAAGAACTCAAGCAAACTGCTCACCTTCCTTGTC
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GGTTTTGTTGTTGCAACTTATTGTATTAAGGACATTGGTCTAGCTTAGTTGGTAATCTAT
CTGTCTGTGTGTTCTGAGTCTCTCTCTCTATGTTATGTTCTTGTTGTAAGAAGATTTCAG
CTCTTGCTTGTACTCTTACCACGTGATGGTTTCTGGTAGATTTGATCGTAGTTAAAAACT
TATATATAAATGTATCTTGTCTCCTGGT


BQ
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AF RS1DG86TF U 1
AF RS1DG86JQ C 292
AF RS1AW62JQ C 465
AF RS1AW62TF U 465
BS 1 414 RS1DG86TF
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BS 982 988 RS1DG86JQ

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TCACTTCTCCTTCTAGTTCTAGCCATGGCTGACCATTCTAGTGCCTCATGGTGTGTGTGC
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GACTGTAACCCCATTCACCCAAAAGCACCTTGCTTTAACCCTGACAATGTTAGGTCTCAT
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QA 1 414 1 414
DS 

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ACCTTCCCTACTAGTGCCAGTGGCTCTGGAGGCAGCACAACAGTGACACCTGGGACAACC
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ACCTCAACCAATGGAGTTTTTGGGAACAATAGCACAGGAGCCAACGGGACAGGAGTTAAC
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DS 

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G
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ACAACCAATCCAAAAGGCAGCTCAAGCACCACCACACTTCCTGGTGGCAACAGTCCTTAT
TCAGGAACCTCAACCAATGGAGTTTTTGGGAACAATAGCACAGGAGCCAACGGGACAGGA
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CC

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DS 

RD RS1AW62TF 519 0 0
G
GGATGTACCTTCCCTACTAGTGCCAGTGGCTCTGGAGGCAGCACAACAGTGACACCTGGG
ACAACCAATCCAAAAGGCAGCTCAAGCACCACCACACTTCCTGGTGGCAACAGTCCTTAT
TCAGGAACCTCAACCAATGGAGTTTTTGGGAACAATAGCACAGGAGCCAACGGGACAGGA
GTTAACCCGGACTACACGACGGAAAGCAGCGCGTTTGGTCTCAAGAACTCAAGCAAACTG
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GTAAGAAGATTTCAGCTCTTGCTTGTACTCTTACCACGTGATGGTTTCTGGTAGATTTGA
TCGTAGTTAAAAACTTATATATAAATGTATCTTGTC
CC

QA 2 517 2 517
DS 



AS 1 4

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GCCGTTTCCATTTCCAAGGACCAGATCGTCTCCTCTCTCACCGAAGTGGAGAAGACAATC
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ATGGAGACGATATCTTCAGCTGATCCTAGTGTCATTGTTGTTGCTGCTGGCGCTGCGTTC
ATTGCTTACCTTCTCCTTCCTCCTGTTTGGTCTGCTATATCTTTTAACTTCCGCG*TTAC
AAAGGTGACCTCACACCGGCACAAACACTTGATCTCCTCTGTTCCAAGAACTACATAATG
GTGGATATAAGATCAGAGAAAGAGAAGGAAAAAGCTGGGATTCCTCGTCTCCCTTCAAAT
GCTAAGAACAGTATGATCGCTATTCCAATAGAAGAGCTGCCGAACAAAGTAAAAGGAATT
GTGAGGAACTCGAAACGTGTTGAAGCAGAAATAGCAGCGTTAAAGATATCTTACCTCAAG
AGAATCAACAAAGGCTCCAACATCATCATCATGGACTCGTACTCGGACTCTGCTAAAATT
GTGGCGAAAACCTTAAAGGTTCTCGGGTATAAGAACTGCTGGATCGTGACAGATGGATTC
TCTGGTGGCAGAGGATGGTTGCAGAGCCGGTTAGGCACTGATTCTTACAACTTCTCGTTC
GCACAGGTCTTGTCTCCATCGAGGATTATCCCGGCAGCTTCTAGGTTCGGTACTAGATCA
GGAACCAAGTTCCTTCCTAGCTCGGACTGAAAACAAAGAAAAACAAGAGAATGTGTATCA
TTAGCTAAAGTGTTGTTTTTATATTCCTTTTTATATCTCAACTTTGAGAGATCTTTCGAT
AAGATTTTCGAATTATTGTTTTGTCTTTAACATTGATGATCAGAAGTGGAACTAGCAAAT
TAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 

AF RS1CQ32TF U 1
AF RS1AY52TF U 405
AF RS1CQ32JQ C 517
AF RS1AY52JQ C 573
BS 1 651 RS1CQ32TF
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BS 653 703 RS1CQ32TF
BS 704 1025 RS1AY52TF
BS 1026 1026 RS1CQ32JQ
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BS 1053 1053 RS1CQ32JQ
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BS 1100 1201 RS1CQ32JQ
BS 1202 1205 RS1AY52JQ

RD RS1CQ32TF 703 0 0
GCAACAACCTCAATCTCTCTTCTATCTGTCTTCTCATCTCCTCCTCCTGAGGCCAAAGCT
GCCGTTTCCATTTCCAAGGACCAGATCGTCTCCTCTCTCACCGAAGTGGAGAAGACAATC
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GAAGAGGCTTTGAAGCTTGCCACTCCCGCTTTCTCAGAGGCTTCCAAGAAAGCTCAAGAA
GCAATGCAAAGCTCTGGTATCGATGCGGAGCCCGTCTTTAATGCTGCAAAGACAGTAACA
GATGTGGCCCAACAGACAACAAAAGCTATCGAAGTTGCTAAGCCCATTGCTTCATCGACC
ATGGAGACGATATCTTCAGCTGATCCTAGTGTCATTGTTGTTGCTGCTGGCGCTGCGTTC
ATTGCTTACCTTCTCCTTCCTCCTGTTTGGTCTGCTATATCTTTTAACTTCCGCG*TTAC
AAAGGTGACCTCACACCGGCACAAACACTTGATCTCCTCTGTTCCAAGAACTACATAATG
GTGGATATAAGATCAGAGAAAGAGAAGGAAAAAGCTGGGATTCCTCGTCTCTCTTCAAAT
GCTAAGAACAGTATGATCGCTATTCCAATAGAAGAGCTGCCGA

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1AY52TF 700 0 0
G
ATTGCTTCATCGACCATGGAGACGATATCTTCAGCTGATCCTAGTGTCATTGTTGTTGCT
GCTGGCGCTGCGTTCATTGCTTACCTTCTCCTTCCTCCTGTTTGGTCTGCTATATCTTTT
AACTTCCGCGGTTACAAAGGTGACCTCACACCGGCACAAACACTTGATCTTCTCTGTTCC
AAGAACTACATAATGGTGGATATAAGATCAGAGAAAGAGAAGGAAAAAGCTGGGATTCCT
CGTCTCCCTTCAAATGCTAAGAACAGTATGATCGCTATTCCAATAGAAGAGCTGCCGAAC
AAAGTAAAAGGAATTGTGAGGAACTCGAAACGTGTTGAAGCAGAAATAGCAGCGTTAAAG
ATATCTTACCTCAAGAGAATCAACAAAGGCTCCAACATCATCATCATGGACTCGTACTCG
GACTCTGCTAAAATTGTGGCGAAAACCTTAAAGGTTCTCGGGTATAAGAACTGCTGGATC
GTGACAGATGGATTCTCTGGTGGCAGAGGATGGTTGCAGAGCCGGTTAGGCACTGATTCT
TACAACTTCTCGTTCGCACAGGTCTTGTCTCCATCGAGGATTATCCCGGCAGCTTCTAGG
TTCGGTACTAGATCAGGAACAAAGTTCCTTCCTAGCTCGGACTGAAA*CAAAGAAAA*CA
AGAGAATGTGTATCATTAGCTAAAGTGTTGTTTT
ATTTC

QA 2 695 2 695
DS 

RD RS1CQ32JQ 685 0 0
ATATCTTTTAACTTCCGCG*TTACAAAGGTGACCTCACACCGGCACAAACACTTGATCTC
CTCTGTTCCAAGAACTACATAATGGTGGATATAAGATCAGAGAAAGAGAAGGAAAAAGCT
GGGATTCCTCGTCTCCCTTCAAATGCTAAGAACAGTATGATCGCTATTCCAATAGAAGAG
CTGCCGAACAAAGTAAAAGGAATTGTGAGGAACTCGAAACGTGTTGAAGCAGAAATAGCA
GCGTTAAAGATATCTTACCTCAAGAGAATCAACAAGGGCTCCAACATCATCATCATGGAC
TCGTACTCGGACTCTGCTAAAATTGTGGCGAAAACCTTAAAGGTTCTCGGGTATAAGAAC
TGCTGGATCGTGACAGATGGATTCTCTGGTGGCAGAGGATGGTTGCAGAGCCGGTTAGGC
ACTGATTCTTACAACTTCTCGTTCGCACAGGTCTTGTCTCCATCGAGGATTATCCCGGCA
GCTTCTAGGTTCGGTACTAGATCAGGAACCAAGTTCCTTCCTAGCTCGGACTGAAAACAA
AGAAAAACAAGAGAATGCGTATCATTAGCTAAAGTGTTGTTTTTATATTCCTTTTTATAT
CTCAACTTTGAGAGATCTTTCGATAAGATTTTCGAATTATTGTTTTGTCTTTAACATTGA
TGATCAGAAGTGGAACTAGCAAATT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RS1AY52JQ 633 0 0
TCTT
CTCTGTTCCAAGAACTACATAATGGTGGATATAAGATCAGAGAAAGAGAAGGAAAAAGCT
GGGATTCCTCGTCTCCCTTCAAATGCTAAGAACAGTATGATCGCTATTCCAATAGAAGAG
CTGCCGAACAAAGTAAAAGGAATTGTGAGGAACTCGAAACGTGTTGAAGCAGAAATAGCA
GCGTTAAAGATATCTTACCTCAAGAGAATCAACAAAGGCTCCAACATCATCATCATGGAC
TCGTACTCGGACTCTGCTAAAATTGTGGCGAAAACCTTAAAGGTTCTCGGGTATAAGAAC
TGCTGGATCGTGACAGATGGATTCTCTGGTGGCAGAGGATGGTTGCAGAGCCGGTTAGGC
ACTGATTCTTACAACTTCTCGTTCGCACAGGTCTTGTCTCCATCGAGGATTATCCCGGCA
GCTTCTAGGTTCGGTACTAGATCAGGAACCAAGTTCCTTCCTAGCTCGGACTGAAAACAA
AGAAAAACAAGAGAATGTGTATCATTAGCTAAAGTGTTGTTTTTATATTCCTTTTTATAT
CTCAACTTTGAGAGATCTTTCGATAAGATTTTCGAATTATTGTTTTGTCTTTTACATTGA
TGATCAGAAGTGGAACTAGCAAATTAAAC

QA 5 633 5 633
DS 



AS 1 4

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ACGGTCGGTCACCACTATCGCTCGTCATAACCACCTCCGATTGAACCTTGTCACCTCCTC
CTCTATCAAACCCCTCTGAATCTCTAACCCTTGTCACCACCGTCGCTACTCAGATCCATA
TTGACCGGAGTCGCTACCACCACCACTCGTCATAACCACCGCTCGTCACATCTCTGTCTC
TCACTTCGATTTGGAGTATTGTCTCACGTGGGATGTTGGTTCATGAGCGGTTCGAGGATA
GAAGAATGTTACTATGTTTCTGCTAGCTTCTCAGACGTAAGAATTCCAAGAGGGATGAGT
ATGCCAAAACTATCTCCTAAGAGGGATGAACACGTCAATCTCAATATGGGACTTGAGGAA
GCATAAACCAATAATTAAATTTGCAGAGCTGAGATGGAGGTGGTGGCAGCGGAGGAGGCA
GAAGCGGAGGAGGCAGAGCGGAGGAGGCGGTGCCAAAGTAGTTAGGGTTATTTTTGTGTG
TTTTTCGATTTAGTAAACCAAAGTTGTAAATCGGTTTACTTTATAAACCAAAATCAATTG
TAAACCAAAGTTAAAT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 

AF RS1BA58JQ C 1
AF RS1BA58TF U 1
AF RS1CR18TF U 57
AF RS1CR18JQ C 1
BS 1 612 RS1BA58TF
BS 613 616 RS1BA58JQ

RD RS1BA58JQ 616 0 0
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TAAACCAAAGTTAAAT

QA 1 616 1 616
DS 

RD RS1BA58TF 616 0 0
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ACGGTCGGTCACCACTATCGCTCGTCATAACCACCTCCGATTGAACCTTGTCACCTCCTC
CTCTATCAAACCCCTCTGAATCTCTAACCCTTGTCACCACCGTCGCTACTCAGATCCATA
TTGACCGGAGTCGCTACCACCACCACTCGTCATAACCACCGCTCGTCACATCTCTGTCTC
TCACTTCGATTTGGAGTATTGTCTCACGTGGGATGTTGGTTCATGAGCGGTTCGAGGATA
GAAGAATGTTACTATGTTTCTGCTAGCTTCTCAGACGTAAGAATTCCAAGAGGGATGAGT
ATGCCAAAACTATCTCCTAAGAGGGATGAACACGTCAATCTCAATATGGGACTTGAGGAA
GCATAAACCAATAATTAAATTTGCAGAGCTGAGATGGAGGTGGTGGCAGCGGAGGAGGCA
GAAGCGGAGGAGGCAGAGCGGAGGAGGCGGTGCCAAAGTAGTTAGGGTTATTTTTGTGTG
TTTTTCGATTTAGTAAACCAAAGTTGTAAATCGGTTTACTTTATAAACCAAAATCAATTG
TAAACCAAAGTT
AAAT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RS1CR18TF 556 0 0
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CCTCCTCTATCAAACCCCTCTGAATCTCTAACCCTTGTCACCACCGTCGCTACTCAGATC
CATATTGACCGGAGTCGCTACCACCACCACTCGTCATAACCACCGCTCGTCACATCTCTG
TCTCTCACTTCGATTTGGAGTATTGTCTCACGTGGGATGTTGGTTCATGAGCGGTTCGAG
GATAGAAGAATGTTACTATGTTTCTGCTAGCTTCTCAGACGTAAGAATTCCAAGAGGGAT
GAGTATGCCAAAACTATCTCCTAAGAGGGATGAACACGTCAATCTCAATATGGGACTTGA
GGAAGCATAAACCAATAATTAAATTTGCAGAGCTGAGATGGAGGTGGTGGCAGCGGAGGA
GGCAGAAGCGGAGGAGGCAGAGCGGAGGAGGCGGTGCCAAAGTAGTTAGGGTTATTTTTG
TGTGTTTTTCGATTTAGTAAACCAAAGTTGTAAATCGGTTTACTTTATAAACCAAAATCA
ATTGTAAACCAAAGTT

QA 1 556 1 556
DS 

RD RS1CR18JQ 612 0 0
GGACGAGAGACGAGAGAGAGAGAGAGATGGACTTCGATGGGTAAGAAAGGAGGAGACGCG
ACGGTCGGTCACCACTATCGCTCGTCATAACCACCTCCGATTGAACCTTGTCACCTCCTC
CTCTATCAAACCCCTCTGAATCTCTAACCCTTGTCACCACCGTCGCTACTCAGATCCATA
TTGACCGGAGTCGCTACCACCACCACTCGTCATAACCACCGCTCGTCACATCTCTGTCTC
TCACTTCGATTTGGAGTATTGTCTCACGTGGGATGTTGGTTCATGAGCGGTTCGAGGATA
GAAGAATGTTACTATGTTTCTGCTAGCTTCTCAGACGTAAGAATTCCAAGAGGGATGAGT
ATGCCAAAACTATCTCCTAAGAGGGATGAACACGTCAATCTCAATATGGGACTTGAGGAA
GCATAAACCAATAATTAAATTTGCAGAGCTGAGATGGAGGTGGTGGCAGCGGAGGAGGCA
GAAGCGGAGGAGGCAGAGCGGAGGAGGCGGTGCCAAAGTAGTTAGGGTTATTTTTGTGTG
TTTTTCGATTTAGTAAACCAAAGTTGTAAATCGGTTTACTTTATAAACCAAAATCAATTG
TAAACCAAAGTT

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 4

CO CL2700Contig1 1245 4 6 U
GGGGCGGCCGGAAGGTTGCCGCGAATAAGTCAGTTTGGAGGACCGAAGGCAGTTCTCCGT
GCACCGGACACGTAGCTTACCGAATCAGTTGCGACACCGATGGGAATGCATGCTACGAAA
GATAGGGTCGAGTCTGATACATCAACTGTCTACTCAATATCCTTAGTAGAGTCCACAATC
ACTACACGAGATGAACCTTGGTTTGGTGAATTGAAGTTCGCCTTAGGTGTAATAGGACTC
CCAGTTACTGCGCGCGATCGTATACTGAGGTGCTCCCCGCCGGTTGTTGGAACGACGCGA
GCCGGGACGGGCCTGGATTCAGAAAGATGAAGGGCCCCAAAGTATAAATAGGGGGTTACA
AATTCCCCATCTCATTGGGGGCGGAAAACGAATCGACATCTCGATGTGATACAGCCTTTT
CTTTTTTAGTTGGGAAAGAACGGCGAAGTCCATCCGAACCGAACCGTCCAATGAAGAATA
AGAGGAGAGCAAAGCGCCAATGGCGCGCGAAGCGCATGCGGAGCAGGCACGAAGAAAAAT
CAGTGTGGAGGAGAAGCAGCCGAGCTCATTCCCTTCGCATCCTGGGCCCAAAGCAGTGCA
GTCTTTCCTGGCCAAATCAAGGATTTGGGGCTTCTTGCTACGCTACTTAACTATATAAAT
CCTTTAGTAATATATAAATGGAAAGATAGATCCATCCATCTATCCTATCCGATTTCCATT
TTGATATCTAAAAAAGAATCGATTTCATTCAACGTTTGATTCAAAGAACTGCGCTTAGCC
CCCCCGCTCATGAAACGGCTCTGCTGCAATGGATGGCAGAGGGTCCGTAGTACCCAAAGC
ACTGGAGTGATCCAGTATAGGGAAGGGGCCTAGAAGTGCCTACTACTACACCATACTACA
CTTGGCTCTACACATTTACCGAGCTAACCCCTGTTCAGTGCCTGGCAGAGCTAAGGGGCT
TCAATCCTTATTCCTTATCCCCATCTTCGCCCAGGCTAACGGGGCCTTACTTATTCAGGG
GGGAGCCTCGAGAAGCACTGTTGAGAAGAAGATCCTAGGCCCCTCTTCATTCTCTACAGG
GTTTCTTTCTTCAATATATATAGGTGACAACGAGCGAGGCAGAGATGGAAGAGATCAAAG
ACGAGAATAAGAAGCCAGTAAACTTCCTTTTTGATCATTTTGTTTGATAGAGGGGGATAG
AAAAAATGGACAAAACTGACTCGCATTTCTCATCGAACAAATACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1D854TF U 1
AF RS1A783TF U 323
AF RS1A783JQ C 480
AF RS1D854JQ C 620
BS 1 523 RS1D854TF
BS 524 951 RS1A783TF
BS 952 1060 RS1A783JQ
BS 1061 1061 RS1D854JQ
BS 1062 1244 RS1A783JQ
BS 1245 1245 RS1D854JQ

RD RS1D854TF 523 0 0
GGGGCGGCCGGAAGGTTGCCGCGAATAAGTCAGTTTGGAGGACCGAAGGCAGTTCTCCGT
GCACCGGACACGTAGCTTACCGAATCAGTTGCGACACCGATGGGAATGCATGCTACGAAA
GATAGGGTCGAGTCTGATACATCAACTGTCTACTCAATATCCTTAGTAGAGTCCACAATC
ACTACACGAGATGAACCTTGGTTTGGTGAATTGAAGTTCGCCTTAGGTGTAATAGGACTC
CCAGTTACTGCGCGCGATCGTATACTGAGGTGCTCCCCGCCGGTTGTTGGAACGACGCGA
GCCGGGACGGGCCTGGATTCAGAAAGATGAAGGGCCCCAAAGTATAAATAGGGGGTTACA
AATTCCCCATCTCATTGGGGGCGGAAAACGAATCGACATCTCGATGTGATACAGCCTTTT
CTTTTTTAGTTGGGAAAGAACGGCGAAGTCCATCCGAACCGAACCGTCCAATGAAGAATA
AGAGGAGAGCAAAGCGCCAATGGCGCGCGAAGCGCATGCGGAG

QA 1 523 1 523
DS 

RD RS1A783TF 629 0 0
G
AAGATGAAGGGCCCCAAAGTATAAATAGGGGGTTACAAATTCCCCATCTCATTGGGGGCG
GAAAACGAATCGACATCTCGATGTGATACAGCCTTTTCTTTTTTAGTTGGGAAAGAACGG
CGAAGTCCATCCGAACCGAACCGTCCAATGAAGAATAAGAGGAGAGCAAAGCGCCAATGG
CGCGCGAAGCGCATGCGGAGCAGGCACGAAGAAAAATCAGTGTGGAGGAGAAGCAGCCGA
GCTCATTCCCTTCGCATCCTGGGCCCAAAGCAGTGCAGTCTTTCCTGGCCAAATCAAGGA
TTTGGGGCTTCTTGCTACGCTACTTAACTATATAAATCCTTTAGTAATATATAAATGGAA
AGATAGATCCATCCATCTATCCTATCCGATTTCCATTTTGATATCTAAAAAAGAATCGAT
TTCATTCAACGTTTGATTCAAAGAACTGCGCTTAGCCCCCCCGCTCATGAAACGGCTCTG
CTGCAATGGATGGCAGAGGGTCCGTAGTACCCAAAGCACTGGAGTGATCCAGTATAGGGA
AGGGGCCTAGAAGTGCCTACTACTACACCATACTACACTTGGCTCTACACATTTACCGAG
CTAACCCCTGTTCAGTGCCTGGCAGAGC

QA 2 629 2 629
DS 

RD RS1A783JQ 765 0 0
AAGAGGAGAGCAAAGCGCCAATGGCGCGCGAAGCGCATGCGGAGCAGGCACGAAGAAAAA
TCAGTGTGGAGGAGAAGCAGCCGAGCTCATTCCCTTCGCATCCTGGGCCCAAAGCAGTGC
AGTCTTTCCTGGCCAAATCAAGGATTTGGGGCTTCTTGCTACGCTACTTAACTATATAAA
TCCTTTAGTAATATATAAATGGAAAGATAGATCCATCCATCTATCCTATCCGATTTCCAT
TTTGATATCTAAAAAAGAATCGATTTCATTCAACGTTTGATTCAAAGAACTGCGCTTAGC
CCCCCCGCTCATGAAACGGCTCTGCTGCAATGGATGGCAGAGGGTCCGTAGTACCCAAAG
CACTGGAGTGATCCAGTATAGGGAAGGGGCCTAGAAGTGCCTACTACTACACCATACTAC
ACTTGGCTCTACACATTTACCGAGCTAACCCCTGTTCAGTGCCTGGCAGAGCTAAGGGGC
TTCAATCCTTATTCCTTATCCCCATCTTCGCCCAGGCTAACGGGGCCTTACTTATTCAGG
GGGGAGCCTCGAGAAGCACTGTTGAGAAGAAGATCCTAGGCTCCTCTTCATTCTCTACAG
GGTTTCTTTCTTCAATATATATAGGTGACAACGAGCGAGGCAGAGATGGAAGAGATCAAA
GACGAGAATAAGAAGCCAGTAAACTTCCTTTTTGATCATTTTGTTTGATAGAGGGGGATA
GAAAAAATGGACAAAACTGACTCGCATTTCTCATCGAACAAATAC

QA 1 765 1 765
DS 

RD RS1D854JQ 626 0 0
AGGATTTGGGGCTTCTTGCTACGCTACTTAACTATATAAATCCTTTAGTAATATATAAAT
GGAAAGATAGATCCATCCATCTATCCTATCCGATTTCCATTTTGATATCTAAAAAAGAAT
CGATTTCATTCAACGTTTGATTCAAAGAACTGCGCTTAGCCCCCCCGCTCATGAAACGGC
TCTGCTGCAATGGATGGCAGAGGGTCCGTAGTACCCAAAGCACTGGAGTGATCCAGTATA
GGGAAGGGGCCTAGAAATGCCTACTACTACACCATACTACACTTGGCTCTACACGTTTAC
CGAGCTAACCCCTGTTCAGTGCCTGGCAGAGCTAAGGGGCTTCAATCCTTATTCCTTATC
CCCATCTTCGCCCAGGCTAACGGGGCCTTACTTATTCAGGGGGGAGCCTCGAGAAGCACT
GTTGAGAAGAAGATCCTAGGCCCCTCTTCATTCTCTACAGGGTTTCTTTCTTCAATATAT
ATAGGTGACAACGAGCGAGGCAGAGATGGAAGAGATCAAAGACGAGAATAAGAAGCCAGT
AAACTTCCTTTTTGATCATTTTGTTTGATAGAGGGGGATAGAAAAAATGGACAAAACTGA
CTCGCATTTCTCATCGAACAAATACG

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 4

CO CL2701Contig1 551 4 2 U
GGGGAGCAGCCGCATTTTAGAGGTGATCTATCTTCGTCTAGGGTTTCACCAAGCCGTCGT
CTTCGTCGCATTTCCTCAACGCAAACCATGGTTCTCCAAAACGACATCGATCTGCTCAAC
CCTCCAGCTGAGCTTGAGAAGAGAAAGCACAAGCTCAAGCGTCTCGTGCAATCTCCTAAC
TCTTTCTTCATGGACGTTAAGTGCCAGGGATGCTTTAACATAACGACGGTGTTCAGCCAC
TCTCAAACAGTTGTAGTGTGCGGTAACTGTCAGACGGTTCTGTGCCAGCCCACTGGTGGT
AAAGCCAGGCTCACTGAGGGATGCTCTTTCAGGAAGAAGTGAGAGAATGATATTTCTCAC
GTTAATCATCCTTTCACAAATGTTGCTGTGAGAGAGAAGTCGGATCTTTTTCAGTTTGCT
TTAGTACTCTACTTATTGTCTTATTTTGACTGTCTTTCTTTTTTTGATTATGAGAAGATT
TTGAAACCATCATCAAACTACTAGTTCGGTTCCTCTACTTTCGTTTATTTATAAATCATT
TCTCGAACCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FR06TF U 1
AF RS1F184JQ C 11
AF RS1F184TF U 11
AF RS1FR06JQ C 60
BS 1 545 RS1FR06TF
BS 546 551 RS1FR06JQ

RD RS1FR06TF 551 0 0
GGGGAGCAGCCGCATTTTAGAGGTGATCTATCTTCGTCTAGGGTTTCACCAAGCCGTCGT
CTTCGTCGCATTTCCTCAACGCAAACCATGGTTCTCCAAAACGACATCGATCTGCTCAAC
CCTCCAGCTGAGCTTGAGAAGAGAAAGCACAAGCTCAAGCGTCTCGTGCAATCTCCTAAC
TCTTTCTTCATGGACGTTAAGTGCCAGGGATGCTTTAACATAACGACGGTGTTCAGCCAC
TCTCAAACAGTTGTAGTGTGCGGTAACTGTCAGACGGTTCTGTGCCAGCCCACTGGTGGT
AAAGCCAGGCTCACTGAGGGATGCTCTTTCAGGAAGAAGTGAGAGAATGATATTTCTCAC
GTTAATCATCCTTTCACAAATGTTGCTGTGAGAGAGAAGTCGGATCTTTTTCAGTTTGCT
TTAGTACTCTACTTATTGTCTTATTTTGACTGTCTTTCTTTTTTTGATTATGAGAAGATT
TTGAAACCATCATCAAACTACTAGTTCGGTTCCTCTACTTTCGTTTATTTATAAATCATT
TCTCG
AACCGC

QA 1 545 1 545
DS 

RD RS1F184JQ 536 0 0
CGCATTTTAGAGGTGATCTATCTTCGTCTAGGGTTTCACCAAGCCGTCGTTTTCGTCGCA
TTTCCTCAACGCAAACCATGGTTTTCCAAAACGACATCGATCTGCTCAACCCTCCAGCTG
AGCTTGAGAAGAGAAAGCACAAGCTCAAGCGTCTCGTGCAATCTCCTAACTCTTTCTTCA
TGGACGTTAAGTGCCAGGGATGCTTTAACATAACGACGGTGTTCAGCCACTCTCAAACAG
TTGTAGTGTGTGGTAACTGTCAGACGGTTCTGTGCCAGCCCACTGGTGGTAAAGCCAGGC
TCACTGAGGGATGCTCTTTCAGGAAGAAGTGAGAGAATGATATTTCTCACGTTAATCATC
TTTTCACAAATGTTGCTGTGAGAGAGAAGTCGGATCTTTTTCAGTTTGCTTTAGTACTCT
ACTTATTGTCTTATTTTGACTGTCTTTCTTTTTTTGATTATGAGAAGATTTTGAAACCAT
CATCAAACTACTAGTTCGGTTCCTCTACTTTCGTTTATTTATAAATCATTTCTCG
C

QA 1 535 1 535
DS 

RD RS1F184TF 536 0 0
CGCATTTTAGAGGTGATCTATCTTCGTCTAGGGTTTCACCAAGCCGTCGTCTTCGTCGCA
TTTCCTCAACGCAAACCATGGTTCTCCAAAACGACATCGATCTGCTCAACCCTCCAGCTG
AGCTTGAGAAGAGAAAGCACAAGCTCAAGCGTCTCGTGCAATCTCCTAACTCTTTCTTCA
TGGACGTTAAGTGCCAGGGATGCTTTAACATAACGACGGTGTTCAGCCACTCTCAAACAG
TTGTAGTGTGTGGTAACTGTCAGACGGTTCTGTGCCAGCCCACTGGTGGTAAAGCCAGGC
TCACTGAGGGATGCTCTTTCAGGAAGAAGTGAGAGAATGATATTTCTCACGTTAATCATC
TTTTCACAAATGTTGCTGTGAGAGAGAAGTCGGATCTTTTTCAGTTTGCTTTAGTACTCT
ACTTATTGTCTTATTTTGACTGTCTTTCTTTTTTTGATTATGAGAAGATTTTGAAACCAT
CATCAAACTACTAGTTCGGTTCCTCTACTTTCGTTTATTTATAAATCATTTCTCG
C

QA 1 535 1 535
DS 

RD RS1FR06JQ 492 0 0
TT
TTCGTCGCATTTCCTCAACGCAAACCATGGTTCTCCAAAACGACATCGATCTGCTCAACC
CTCCAGCTGAGCTTGAGAAGAGAAAGCACAAGCTCAAGCGTTTCGTGCAATCTCCTAACT
CTTTCTTCATGGACGTTAAGTGCCAGGGATGCTTTAACATAACGACGGTGTTCAGCCACT
CTCAAACAGTTGTAGTGTGCGGTAACTGTCAGACGGTTCTGTGCCAGCCCACTGGTGGTA
AAGCCAGGCTCACTGAGGGATGCTCTTTCAGGAAGAAGTGAGAGAATGATATTTCTCACG
TTAATCATCCTTTCACAAATGTTGCTGTGAGAGAGAAGTCGGATCTTTTTCAGTTTGCTT
TAGTACTCTACTTATTGTCTTATTTTGACTGTCTTTCTTTTTTTGATTATGAGAAGATTT
TGAAACCATCATCAAACTACTAGTTCGGTTCCTCTACTTTCGTTTATTTATAAATCATTT
CTCGAACCGC

QA 3 492 3 492
DS 



AS 1 4

CO CL2702Contig1 986 4 20 U
GGAAGCAAAATCGGATCTCGTCTTTGTCCGGAGAAGAAGAAAAGAAGATGGGATTGTTGT
CGAACAAGATCTCTAGAGATGAACTCAAGGCAGGAGATTACATCTATTCATGGCGTTCTT
ACATCTACACCCATCACGGAATCTATGTAGGAGATGGGAAAGTCATCCATTTCACACGTG
GAGGTGGTCTAGAGATCGAAACGGGGACTATCCTGGACAAGATCATCGTTAGTTCAGTTC
CTCATCACGGAGGAGACAACCCGTGTCCTGATTGCGGAGACCAAACCAATCTAAACGGCG
TTATCTCCTCTTGCCTCGACTGTTTCCTCTCCGGAGGAAACCTCTATCTCTTCCAGTACA
ACGTCTCCAAGGCCATCTTTCTCGCCAAGCAGCGAGGCGGTACCTGCACTATAGCGACTT
CGGATCCTCCCGAAGACGTCGTCGCCCGCGCGAAGTTCCTCTTGTCGCGAAACGGGTTCG
GTGAGTACCATCTCTTGGACAACAACTGCGAAGATTTCGCCATCTATTGCAAAACCGGTT
TGCTCGTGTTGTCGGTGACCAAGTCCGGGAGTAGTAGCCAGGTCAACTCGGTGTGTGCAG
CGGG*CGGTGTTGTTTCTTTGACGCTCAGGGCTTTAGGAGTTGGAACGAGTGGTCAAGCA
GCTTCGTTGGCTACGTCTTCTCCAGCTTTGACGGTTTCTGCTTCAACCAGTGCTCTTTTT
ACGACGATTGGAGCTGTAGCTACGGGTGTTGGAGCTATTGCTTTGACGGGATATGGTAAC
TACTGTGTTAGTCGTCTGGCTTACGATGTTGGTGTGAGGAAAGATGTTCGCAAGGTCCCT
GTGGATGAGCTCGTTGCACTTATGGCTGTTATACAAGGGAAATCAGACGACGACAACAAA
GATTGTAAACTTAGTTAGCACACTCTGTTTCCGTTAATGAGTCGGTTACTGATTTGTTAT
GTATTTGTGTAAACTGTGTTTTAACC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 5 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B858TF U 1
AF RS1DD43TF U 1
AF RS1GL41TF U 93
AF RS1GL41JQ C 406
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BS 416 417 RS1GL41TF
BS 418 430 RS1B858TF
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BS 452 452 RS1GL41TF
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BS 470 526 RS1B858TF
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BS 558 604 RS1B858TF
BS 605 605 RS1DD43TF
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BS 640 654 RS1B858TF
BS 655 689 RS1GL41TF
BS 690 986 RS1GL41JQ

RD RS1B858TF 655 0 0
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CGGGGTGGTGTTGTTTCTTTGACGCTCAGGGCTTTAGGGGTTGGAACGAGTGGT
A

QA 1 654 1 654
DS 

RD RS1DD43TF 619 0 0
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CGAACAAGATCTCTAGAGATGAACTCAAGGCAGGAGATTACATCTATTCATGGCGTTCTT
ACATCTACACCCATCACGGAATCTATGTAGGAGATGGGAAAGTCATCCATTTCACACGTG
GAGGTGGTCTAGAGATCGAAACGGGGACTATCCTGGACAAGATCATCGTTAGTTCAGTTC
CTCATCACGGAGGAGACAACCCGTGTCCTGATTGCGGAGACCAAACCAATCTAAACGGCG
TTATCTCCTCTTGCCTCGACTGTTTCCTCTCCGGAGGAAACCTCTATCTCTTCCAGTACA
ACGTCTCCAAGGCCATCTTTCTCGCCAAGCAGCGAGGCGGTACCTGCACTATAGCATCTT
CGGATCCTCCAGAAGACGTCGTCGCCCGCGCAAAGTTCCTCTTGTCGCAAAACGGGTTCG
GTGAGTACCATCTCTTGGACAACAACTGCGAAGATTTCGCCATCTACTGCAAAACCGGTT
TGCTCGTGTTGTCGGTCACCAAGTCCGGGAGTAGTAGCCAGGTCAACTCGGTGTGTGCAG
CGGG*TGGTGTTGTTTCTT

QA 1 619 1 619
DS 

RD RS1GL41TF 597 0 0
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GATGGGAAAGTCATTCATTTCACACGTGGAGGTGGTTTAGAAATCGGAACGGGGACTATC
CTGGACAAGATCATCGTTAGTTCGGTTCCTCATCACGGAGGAGACAACCCGTGTCCTGAT
TGCGGAGACCAAACCAATCTAAACGGTGTTATCTCCTCTTGCCTCGACTGTTTCCTCTCC
GGAGGAAACCTCTATCTCTTCCAGTACAACGTCTCCAAGGCCATCTTTCTCGCCAAGCAG
CGAGGAGGTACCTGCACTATAGCGACTTCGGATCCTCCCGAAGACGTCGTCGCCCGCGCG
AAGTTCCTCTTGTCGCGAAACGGGTTCGGTGAGTACCATCTCTTGGACAACAACTGCGAA
GATTTCGCCATCTATTGCAAAACCGGTTTGCTCGTGTTGTCGGTGACCAAGTCCGGGAGT
AGTAGCCAGGTCAACTCGGTGTGTGCAGCGGG*CGGTGTTGTTTCTTTGACGCTCAGGGC
TTTAGGAGTTGGAACGAGTGGTCAAGCAGCTTCGTTGGCTACGTCTTCTCCAGCTTT

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DS 

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CGCGAAACGGGTTCGGTGAGTACCATCTCTTGGACAACAACTGCGAAGATTTCGCCATCT
ATTGCAAAACCGGTTTGCTCGTGTTGTCGGTGACCAAGTCCGGGAGTAGTAGCCAGGTCA
ACTCGGTGTGTGCAGCGGG*CGGTGTTGTTTCTTTGACGCTCAGGGCTTTAGGAGTTGGA
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ACCAGTGCTCTTTTTACGACGATTGGAGCTGTAGCTACGGGTGTTGGAGCTATTGCTTTG
ACGGGATATGGTAACTACTGTGTTAGTCGTCTGGCTTACGATGTTGGTGTGAGGAAAGAT
GTTCGCAAGGTCCCTGTGGATGAGCTCGTTGCACTTATGGCTGTTATACAAGGGAAATCA
GACGACGACAACAAAGATTGTAAACTTAGTTAGCACACTCTGTTTCCGTTAATGAGTCGG
TTACTGATTTGTTATGTATTTGTGTAAACTGTGTTTTAACC

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 4

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TAAACATATTTGTATATATATCAAGAACCTGAATATGTTCTTGGTACCATACTTTTGTCC
CCAAACGTATGTGTAAACAACACAAGGAAAATTTGTAAAATCCACGCATCACAGAACTGT
TAATGCAAGAGGCTACGAACAGCCTGTTCAAGTTAACAGATCTGTTAATTCGGAACAGGA
TACCACTTATTCAAGATAACCAAGATATGTCTAATAAGGAAATGAAGACACCAGAGTGGC
GCTTAAATGCATTTTGCATGATCAAGGCTGGTAAACCTCGGGAAGACGAAAACCTACACT
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GAAATGAGACTTGTGGTCTTCTTTGCCAACATGTTTCACCACTGCTTTAAGAAGGTCACG
GTATACTCTACCAACTTCACTGCTCATCTTATCTTTTATCCAAAAGGTTCCGAGAGCAAA
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TTCAAGAGTGGAACGAGGTCGAGATCAACAAACTCTCTCCTGTGTTTGCACGACACTGGT
TCAAGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EA34JQ U 1
AF RS1DZ01JQ U 251
AF RS1EA34TF C 93
AF RS1DZ01TF C 119
BS 1 255 RS1EA34JQ
BS 256 256 RS1DZ01JQ
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RD RS1EA34JQ 463 0 0
CGAAATGAAGATCTTTATTATATCGAGTTTGTCATCACTTCTTTCACATTGGTTGTTTGA
TAAACATATTTGTATATATATCAAGAACCTGAATATGTTCTTGGTACCATACTTTTGTCC
CCAAACGTATGTGTAAACAACACAAGGAAAATTTGTAAAATCCACGCATCACAGAACTGT
TAATGCAAGAGGCTACGAACAGCCTGTTCAAGTTAACAGATCTGTTAATTCGGAACAGGA
TACCACTTATTCAAGTTAACCAAGATATGTCTAATAAGGAAATGAAGACACCAGAGTGGC
GCTTAAATGCATTTTGCATGATCAAGGCTGGTAAACCTCGGGAAGACGAAAACCTACACT
AGCTGCAGACTTCCCGAGAACTCGTTTCATTTCTTCAGTTCTGTCAACTGCAATGTTGTA
CGAAAACAACAGATCCTTGTGAGAGTGAATGCTATTAA
AAAAA

QA 1 458 1 458
DS 

RD RS1DZ01JQ 173 0 0
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ATTTTGCATGATCAAGGCTGGTAAACCTCGGGAAGACGAAAACCTACGCTAGCTGCAGAC
TTCCCGAGAACTCGTTTCATTTCTTCAGTTCTGTCAACTGCAATGTTGTACGA

QA 1 173 1 173
DS 

RD RS1EA34TF 651 0 0
ATATGTTCTTGGTACCATACTTTTGTCCCCAAACGTATGTGTAAACAACACAAGGAAAAT
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TTAACAGATCTGTTAATTCGGAACAGGATACCACTTATTCAAGTTAACCAAGATATGTCT
AATAAGGAAATGAAGACACCAGAGTGGCGCTTAAATGCATTTTGCATGATCAAGGCTGGT
AAACCTCGGGAAGACGAAGACCTACACTAGCTGCAGACTTCCCGAGAACTCGTTTCATTT
CTTCAGTTCTGTCAACTGCAATGTTGTACGAGAACAACAGATCCTTGTGAGAGTGAATGC
TATTAAGAAGATAAGCGTAGTTGCGGGCAAGGTTGATTTTGTCGAGTGAGTTTGGGTTCT
TGCGAAACTCGTGCTTGACAAAGTCTGTGAAATGAGACTTGTGGTCTTCTTTGCCAACAT
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CTTTTATCCAAAAGGTTCCGAGAGCAAAGCGGGAAGGAGGAGAGTGGCGCTGATTCTTTC
GGAACTTTAGTGACCCTTATAGTTCTCTTTCAAGAGTGGAACGAGGTCGAG

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1DZ01TF 671 0 0
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GATACCAATTATTCAAGATAACCAAGATATGTCTAATAAGGAAATGAAGACACCAGAGTG
GCGCTTAAATGCATTTTGCATGATCAAGGCTGGTAAACCTCGGGAAGACGAAGACCTACG
CTAGCTGCAGACTTCCCGAGAACTCGTTTCATTTCTTCAGTTCTGTCAACTGCAATGTTG
TACGAGAACAACAGATCCTTGTGAGAGTGAATGCTATTAAGAAGATAAGCGTAGTTGCGG
GCAAGGTTGATTTTGTCGAGTGAGTTTGGGTTCTTGCGAAACTCGTGCTTGACAAAGTCT
GTGAAATGAGACTTGTGGTCTTCTTTGCCAACATGTTTCACCACTGCTTTAAGAAGGTCA
CGGTATACTCTACCAACTTCACTGCTCATCTTATCTTTTATCCAAAAGGTTCCGAGAGCA
AAGCGGGAAGGAGGAGAGTGGCGCTGATTCTTTCGGAACTTTAGTGACCCTTATAGTTCT
CTTTCAAGAGTGGAACGAGGTCGAGATCAACAAACTCTCTCCTGTGTTTGCACGACACTG
GTTCAAGACCC

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 4

CO CL2704Contig1 1027 4 6 U
GAGATTGCATCTTTCGCATTTGAAACCAAACAAAAAGATTAGTCTTAATCATGTTTTAGA
CATTATTATAATAGTGTATATAATATTGCTCCATCATCTAAGAACTCAAGAGTGTATTCA
AATCCGTAACTAGAAAAATGGGTTTTGATTTTCCTCATACGGAGATACCATAGTTGCTGA
TCTTGTTCACTTCCTTTGTCAAAGCCTTTCTCTCTTGCTTTACCTCAGAAGCACGGTTTG
ATATTTGAGAACGGAACCTAGAAGCTTCTCTCGTGGGTAATTCTTTAAGTACATCTTTTA
AACCTGCTGCTTGTTTTTCAATCTTATAAGCTGAGCTAACCACACCTCGTATCTGTTTGC
CTGCTTGTCTGAGTTTCATCCTTCCTCTGATCAGCTCATCTTCTGCCACAGTTGCAACAC
GCTCTAACTTTTCACTTTCGGCTGTAAGACGATCCAGTGATTGCCTTAGCTCTTTAACTC
TAAGATCAGCTTTAGAAAGCAAAGCCTCTTCGCTTGAGAACATACGTACAGTATTGTAGT
ATACAAACCTTCTCGTCTTTTTCAGAGCAAAGATCCCAACACCAAAGGCTAAACCTCCTG
ATATAAGAGGATGAGATGCAGCAACGTTTACACCATCTTTGATCTTCGCAAACACCATAT
GCTCGTATACGTTATACTCAGAAGCAATCTCTCTAATAGAATCGATTGATTGGCTGGTGT
GAGCGATTGAAGTATCACGAATCTGACTCAATCGAGATTTCGAGGCGTCGATTGTGGAAT
CCAGCGTCTCCAGGATCGTGTTCTGGTACACGAGCGCCTGACGCATCGCGTCTTCGATCC
AGGAAGCTGCGTTTTCAACCGTCGTCGTCGTTGCGATCTTAGCGGTTGGAATCGAAGAGA
GGAGATGAGCCGGTGACGGTGGTGGAAATTGTGGAGGCGCCGGTGAGTGTGTGTCTTCCA
TCGTCTCTGAGGGTGATTCTCCTGAAGTTGCCATACCAAAAGATCTCTCTCCTTTGCTCA
AAGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1D830JQ U 1
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G
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AGGA*GCTGCGTTT
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DS 

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TACCCC

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DS 

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C
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TAACTTTTCACTTTCGGCTGTAAGACGATCCAGTGATTGCCTTAGCTCTTTAACTCTAAG
ATCAGCTTTAGAAAGCAAAGCCTCTTCGCTTGAGAACATACGTACAGTATTGTAGTATAC
AAACCTTCTCGTCTTTTTCAGAGCAAAGATCCCAACACCAAAGGCTAAACCTCCTGATAT
AAGAGGATGAGATGCAGCAACGTTTACACCATCTTTGATCTTCGCAAACACCATATGCTC
GTATACGTTATACTCAGAAGCAATCTCTCTAATAGAATCGATTGATTGGCTGGTGTGAGC
GATTGAAGTATCACGAATCTGGCTCAATCGAGATTTCGAGGCGTCGATTGTGGAATCCAG
CGTCTCCAGGATCGTGTTCTGGTACACGAGCGCCTGACGCATCGCGTCTTCGATCCAGGA
AGCTGCGTTTTCAACCGTCGTCGTCGTTGCGATCTTAGCGGTTGGAATCGAAGAGAGGAG
ATGAGCCGGTGACGGTGGTGGAAATTGTGGAGGCGCCGGTGAGTGTGTGTCTTCCATCGT
CTCTGAGGGTGATTCTCCTGAAGTTGCCATACCAAAAGATCTCTCTCCTTTGCTCAAAGT
TCC

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DS 



AS 1 3

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TAAGAAGTTGGGTTCAGTATCAGTACAAGAGACAACATAAACCCAGACAGAATAAAGAGG
CTTAGCAACAAATAACACTCTTGTTCAAATCACTTCATGTATCTGTGTAGGAACTTTCTG
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GCCTGATTCTTGAACACCACATCATCATCCCACCTTCTTTTGACACTAAACGAAGTGGGA
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ATCTGCTGCTGTTTTTCCTTCCTGAGCCTCTCCTCAATTCTTTCTTTCTTTATTTGGTCG
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TCTCTATCATCACTGTAGGATTTGTCTTTGGAAGCTAAGTGTCTCCTCTCACGCTCTTCA
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GATTGATCGAGAGAGAGAAGCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FY03JQ U 1
AF RS1F951JQ U 19
AF RS1F951TF C 144
BS 1 471 RS1FY03JQ
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BS 473 477 RS1FY03JQ
BS 478 478 RS1F951JQ
BS 479 666 RS1FY03JQ
BS 667 787 RS1F951JQ
BS 788 922 RS1F951TF

RD RS1FY03JQ 666 0 0
AGTAGAAATCTGAGAAATAGCATTAAATTCAAACGCATAAGCTTTTTTTATATTAAACAA
TAAGAAGTTGGGTTCAGTATCAGTACAAGAGACAACATAAACCCAGACAGAATAAAGAGG
CTTAGCAACAAATAACACTCTTGTTCAAATCACTTCATGTATCTGTGTAGGAACTTTCTG
TGGAAGTCATTCCTGATTGTATCATTGATGAAGCGCTTTGGTGCTTTCATTTCTCCACGT
GCCTGATTCTTGAACACCACATCATCATCCCACCTTCTTTTGACACTAAACGAAGTGGGA
GTGGTGTTAAGCAGTGGGTTTCCTTTGAGAAGCTCCTCTTCTTTGGCGTTTAGCTCTTCC
ATCTGCTGCTGTTTTTCCTTCCTGAGCCTCTCCTCAATTCTTTCTTTCTTTATTTGGTCG
AGTTCAGCCATAAGAGCTTCAGTGTCATCCTCATCATCGTCACTTTCGTCACCACTATCA
TCCTCATCGTCACTTTTGATATCAACATCAGAATCATCAGCGTCTACACTGCGAGGAACA
ATCCGATCTTCAGGGTCCCTTTTAGAGCCTTCCAGTAATAGCTGATTCCCTCTCCTGCGG
TCTCTATCATCACTGTAGGATTTGTCTTTGGAAGCTAAGTGTCTCCTCTCACGCTCTTCA
AGCTCG

QA 1 666 1 666
DS 

RD RS1F951JQ 769 0 0
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ATCAGTACAAGAGACAACATAAACCCAGACAGAATAAAGAGGCTTAGCAACAAATAACAC
TCTTGTTCAAATCACTTCATGTATCTGTGTAGGAACTTTCTGTGGAAGTCATTCCTGATT
GTATCATTGATGAAGCGCTTTGGTGCTTTCATTTCTCCACGTGCCTGATTCTTGAACACC
ACATCATCATCCCACCTTCTTTTGACACTAAACGAAGTGGGAGTGGTGTTAAGCAGTGGG
TTTCCTTTGAGAAGCTCCTCTTCTTTGGCGTTTAGCTCTTCCATCTGCTGCTGTTTTTCC
TTCCTGAGCCTCTCCTCAATTCTTTCTTTCTTTATTTGGTCGAGTTCAGCCATAAGAGCT
TCAGTGTCATCCTCATCATCGTCACTTTCGTCATCACTACCATCCTCATCGTCACTTTTG
ATATCAACATCAGAATCATCAGCGTCTACACTGCGAGGAACAATCCGATCTTCAGGGTCC
CTTTTAGAGCCTTCCAGTAATAGCTGATTCCCTCTCCTGCGGTCTCTATCATCACTGTAG
GATTTGTCTTTGGAAGCTAAGTGTCTCCTCTCACGCTCTTCAAGCTCGTCACGAAGATTC
TTCTTCTGCACTTCCTCCTGAGTGTGTTGCCCTTCCCTCCTAGGCTTTAGAGTTGTATGA
GCGGCGACATCACGAGACGAATACTTCTGAGAGGCGCCGAAGATACGAG

QA 1 769 1 769
DS 

RD RS1F951TF 779 0 0
G
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TTGATGAAGCGCTTTGGTGCTTTCATTTCTCCACGTGC*TGATTCTTGAACACCACATCA
TCATCCCAC*TTCTTTTGACACTAAACGAAGTGGGAGTGGTGTTAAGCAGTGGGTTTCCT
TTGAGAAGCTCCTCTTCTTTGGCGTTTAGCTCTTCCATCTGCTGCTGTTTTTCCTTCCTG
AGCCTCTCCTCAATTCTTTCTTTCTTTATTTGGTCGAGTTCAGCCATAAGAGCTTCAGTG
TCATCCTCATCATCGTCACTTTCGTCATCACTACCATCCTCATCGTCACTTTTGATATCA
ACATCAGAATCATCAGCGTCTACACTGCGAGGAACAATCCGATCTTCAGGGTCCCTTTTA
GAGCCTTCCAGTAATAGCTGATTCCCTCTCCTGCGGTCTCTATCATCACTGTAGGATTTG
TCTTTGGAAGCTAAGTGTCTCCTCTCACGCTCTTCAAGCTCGTCACGAAGATTCTTCTTC
TGCACTTCCTCCTGAGTGTGTTGCCCTTCCCTCCTAGGCTTTAGAGTTGTATGAGCGGCG
ACATCACGAGACGAATACTTCTGAGAGGCGCCGAAGATACGAGCACCACCCTGCTCGTTA
CCTCCCTTGGCCGGTGCCCACGTTGGCCTTGCTGCAGTCGTCATCTTCGGATAATAACCC
TAATTCCCAAATCAAGGAGACGAATCAACCAAAATCGATTGATCGAGAGAGAGAAGCC

QA 2 779 2 779
DS 



AS 1 4

CO CL2706Contig1 724 4 9 U
TTTTTTTTTGCACTCTCGAAGTTTGATTTATATTCATATTCTTGTTTTGTGATTTTCTCT
TGAGATCTCTATTACAAGTTTTATCTTAACATCAAAACCACATATCCAACATTGCCAAAG
TGTTTTATCCGTATACATTAAAGATCTCTCTCTCCCAAAAACTGATAAGCTGCTTACTTG
TACTTGTCCATAATTTTCTTTGCTTCTTCAAGTGGATCATCCATTGGTTTGTTGGAAGCA
AAAATAGTATCCTCTCCTCTCTGTTTAAAAGCTTCGTCTTTGTTCAAGGCTATGAATAAA
AAATATGCAAATCCCATTGTACCCAATACAAAGAAAGCAGTTGATACAAACGACTTGAGA
ACAAACAATGAAACCGCCAATGCTGCAATTGTCACTGAGATCCTAGCAACAGGTCTAGGC
ACAGAAACAGGTACTAGGTTGGTTCCTGCTTCGATGCCATCTTTCCCAATATTCCACGCG
ATTCTAAGAACTTTCAGGAGACTAGTCTGGGCAGACACAACAACGAGTGTTTTTGTCCGC
ACACGACGAGAGGAGATTCGAATCCTCGATTTAAGGAGCGAAGATGCGTGTTTTAGGTTC
AAAACAGAACAAGGGGCGAGGAAATGAGAACTTAGGGTTTGTGAGAATCTTGGAGTATGA
GGCGATGGAAACGCAGAGATAGAAGAAGAAGAAGAAGCCATGACCATGTAAAAACGCTTA
AAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 

AF RS1B952JQ U 11
AF RS1F879JQ U 10
AF RS1B952TF C 11
AF RS1F879TF C 1
BS 1 10 RS1F879TF
BS 11 251 RS1F879JQ
BS 252 252 RS1B952JQ
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BS 399 399 RS1B952JQ
BS 400 455 RS1F879JQ
BS 456 456 RS1B952JQ
BS 457 674 RS1F879JQ
BS 675 724 RS1F879TF

RD RS1B952JQ 473 0 0
CACTCTCGAAGTTTGATTTATATTCATATTCTTGTTTTGTGATTTTCTCTTGAGATCTCT
ATTACAAGTTTTATCTTAGCATCAAAACCACATATCCAACATTGCCAAAGTGTTTTATCC
GTATACATTAAAGATCTCTCTCTCTCAAAAACTGATAAGCTGCTTACTTGTACTTGTCCA
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ATCCCATTGTACCCAATACAAAGAAAGCAGTTGATACAAACGACTTGAGAACAAACAATG
AAACCGCCAATGCTGCAATTGTCACTGAGATCCTAGCAACAGGTCTAGGCACAGAAACAG
GTACTAGGTTGGTTCCTGCTTCGATGCCATCTTTCCCAATATTCCACGCGATT

QA 1 473 1 473
DS 

RD RS1F879JQ 665 0 0
G
CACTCTCGAAGTTTGATTTATATTCATATTCTTGTTTTGTGATTTTCTCTTGAGATCTCT
ATTACAAGTTTTATCTTAACATCAAAACCACATATCCAACATTGCCAAAGTGTTTTATCC
GTATACATTAAAGATCTCTCTCTCCCAAAAACTGATAAGCTGCTTACTTGTACTTGTCCA
TAATTTTCTTTGCTTCTTCAAGTGGATCATCCATTGGTTTGTTGGAAGCAAAAATAGTAT
CTTCTCCTCTCTGTTTAAAAGCTTCGTCTTTGTTCAAGGCTATGAATAAAAAATATGCAA
ATCCCATTGTACCCAATACAAAGAAAGCAGTTGATACAAACGACTTGAGAACAAACAATG
AAACCGCCAATGCTGCAATTGTCACTGAAATCCTAGCAACAGGTCTAGGCACAGAAACAG
GTACTAGGTTGGTTCCTGCTTCGATTCCATCTTTCCCAATATTCCACGCGATTCTAAGAA
CTTTCAGGAGACTAGTCTGGGCAGACACAACAACGAGTGTTTTTGTCCGCACACGACGAG
AGGAGATTCGAATCCTCGATTTAAGGAGCGAAGATGCGTGTTTTAGGTTCAAAACAGAAC
AAGGGGCGAGGAAATGAGAACTTAGGGTTTGTGAGAATCTTGGAGTATGAGGCGATGGAA
ACGC

QA 2 665 2 665
DS 

RD RS1B952TF 709 0 0
CACTCTCGAAGTTTGATTTATATTCATATTCTTGTTTTGTGATTT*CTCTTGAGATCTCT
ATTACAAGTTTTATCTTAGCATCAAAACCACATATCCAACATTGCCAAAGTGTTTTATCC
GTATACATTAGAGATCTCTCTCTCTCAAAAACTGATAAGCTGCTTACTTGTACTTGTCCA
TAATTTTCTTTGCTTCTTCAAGTGGATCATCCATTGGTTTGTTGGAAGCAGAAATAGTAT
CCTCTCCTCTCTGTTTAGAAGCTTCGTCTTTGTTCAAGGCTATGAATAAGAAATATGCAA
ATCCCATTGTACCCAATACAAAGAAAGCAGTTGATACAAACGACTTGAGAACAAACAATG
AAACCGCCAATGCTGCAATTGTCACTGAGATCCTAGCAACAGGTCTAGGCACAGAAACAG
GTACTAGGTTGGTTCCTGCTTCGATGCCATCTTTCCCAATATTCCACGCGATTCTAAGAA
CTTTCAGGAGACTAGTCTGGGCAGACACAACAACGAGTGTTTTTGTCCGCACACGACGAG
AGGAGATTCGAATCCTCGATTTAAGGAGCGAAGATGCGTGTTTTAGGTTCAAAACAGAAC
AAGGGGCGAGGAAATGAGAACTTAGGGTTTGTGAGAATCTTGGAGTGTGAGGCGATGGAA
ACGCAGAGATAGAGGAAGAAGAAGAAGCCATGACCATGTAAAAACGCTT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1F879TF 724 0 0
TTTTTTTTTGCACTCTCGAAGTTTGATT*ATATTCATATTCTTGTTTTGTGATTT*CTCT
TGAGATCTCTATTACAAGTTTTATCTTAACATCAAAACCACATATCCAACATTGCCAAAG
TGTTTTATCCGTATACATTAGAGATCTCTCTCTCCCAAAAACTGATAAGCTGCTTACTTG
TACTTGTCCATAATTTTCTTTGCTTCTTCAAGTGGATCATCCATTGGTTTGTTGGAAGCA
GAAATAGTATCTTCTCCTCTCTGTTTAGAAGCTTCGTCTTTGTTCAAGGCTATGAATAAG
AAATATGCAAATCCCATTGTACCCAATACAAAGAAAGCAGTTGATACAAACGACTTGAGA
ACAAACAATGAAACCGCCAATGCTGCAATTGTCACTGAGATCCTAGCAACAGGTCTAGGC
ACAGAAACAGGTACTAGGTTGGTTCCTGCTTCGATTCCATCTTTCCCAATATTCCACGCG
ATTCTAAGAACTTTCAGGAGACTAGTCTGGGCAGACACAACAACGAGTGTTTTTGTCCGC
ACACGACGAGAGGAGATTCGAATCCTCGATTTAAGGAGCGAAGATGCGTGTTTTAGGTTC
AAAACAGAACAAGGGGCGAGGAAATGAGAACTTAGGGTTTGTGAGAATCTTGGAGTATGA
GGCGATGGAAACGCAGAGATAGAAGAAGAAGAAGAAGCCATGACCATGTAAAAACGCTTA
AAAA

QA 1 724 1 724
DS 



AS 2 4

CO CL2707Contig1 793 2 5 U
ATATATAACTTTTGACAATTTTGGGTTTGACTTTCCTTTCATTAACATCTATAGAAAACT
TTGTCAGTTCTCTCCCTTGTAATACAATATTTCTCATTCTAACTCCATCAAATAACAGGG
CAACCTTTAGAGGGCAACAAAAGGGAGTAAAAACCCATTGTGGATACCGAATCTAAAAAT
ATGCAAGGAGCTGAAATAGTCATCAACAAAATCCAATCGTGATGTTGCTATTGATTTGGG
TCAGAAGATGATGCAGAATCTGTGGGAGCCGTTGTCTCTGACAAAGCTGGTCGTAAGAAA
AGATACAGAAAAGGTCCCAAGAATGGCACCACGGATACAGGTAACAGCCAACGGCCTTTA
TCAAACCATTTTCTGGCGGTCATGTCATTATAAACCCAAAACGGAGCAAAAGCAGAGAGT
AAGCAGAAATCTAGACTCGTGACATGTATGAATTTGCTCTCACGAAAGTACTGATAAAAC
TCTTTCAAGTCACCGGGGTTACCAACTACTGAGTAAAGAATTAAACCCAGGCCTGCAACA
AGAGTAACCCCAGCAGTTACTTTTGATTCCAGAACATTGAAAGGCCATTTTCTAAGATCA
GACTCTGAGATAGGAGGAGAAGGTGGATTCCACAGTGCAAAATAAGGTAGCAAAGCGTAG
ACGCCACCAAAGAAGGAAAGCACCACGAAAGGCCACGCCTGAGTTTTACTTCGACCAGTG
GGAAGCAAGAGCATAGCGTATACCACAGCCATAAACCCATTATATACCATAAACCAACAA
GATCTGGTTCATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BF36JQ U 246
AF RS1BC88JQ U 1
BS 1 298 RS1BC88JQ
BS 299 299 RS1BF36JQ
BS 300 309 RS1BC88JQ
BS 310 310 RS1BF36JQ
BS 311 793 RS1BC88JQ

RD RS1BF36JQ 408 0 0
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CAGAAAAGGTCCCAAGAATGGCACCACGGATACAGGTAACAGCCAACGGCCTTTATCAAA
CCATTTTCTGGCGGTCATGTCATTATAAACCCAAAACGGAGCAAAAGCAGAGAGTAAGCA
GAAATCTAGACTCGTGACATGTATGAATTTGCTCTCACGAAAGTACTGATAAAACTCTTT
CAAGTCACCGGGGTTACCAACTACTGAGTAAAGAATTAAACCCAGGCCTGCAACAAGAGT
AACCCCAGCAGTTACTTTTGATTCCAGAACATTGAAAGGCCATTTTCTAAGCTCGGACTC
TGAGATAGGAGGAGAAGGTGGATTCCACAGTGCAAAATAAGGTAGCAA

QA 1 408 1 408
DS 

RD RS1BC88JQ 793 0 0
ATATATAACTTTTGACAATTTTGGGTTTGACTTTCCTTTCATTAACATCTATAGAAAACT
TTGTCAGTTCTCTCCCTTGTAATACAATATTTCTCATTCTAACTCCATCAAATAACAGGG
CAACCTTTAGAGGGCAACAAAAGGGAGTAAAAACCCATTGTGGATACCGAATCTAAAAAT
ATGCAAGGAGCTGAAATAGTCATCAACAAAATCCAATCGTGATGTTGCTATTGATTTGGG
TCAGAAGATGATGCAGAATCTGTGGGAGCCGTTGTCTCTGACAAAGCTGGTCGTAAGAGA
AGATACAGAGAAGGTCCCAAGAATGGCACCACGGATACAGGTAACAGCCAACGGCCTTTA
TCAAACCATTTTCTGGCGGTCATGTCATTATAAACCCAAAACGGAGCAAAAGCAGAGAGT
AAGCAGAAATCTAGACTCGTGACATGTATGAATTTGCTCTCACGAAAGTACTGATAAAAC
TCTTTCAAGTCACCGGGGTTACCAACTACTGAGTAAAGAATTAAACCCAGGCCTGCAACA
AGAGTAACCCCAGCAGTTACTTTTGATTCCAGAACATTGAAAGGCCATTTTCTAAGATCA
GACTCTGAGATAGGAGGAGAAGGTGGATTCCACAGTGCAAAATAAGGTAGCAAAGCGTAG
ACGCCACCAAAGAAGGAAAGCACCACGAAAGGCCACGCCTGAGTTTTACTTCGACCAGTG
GGAAGCAAGAGCATAGCGTATACCACAGCCATAAACCCATTATATACCATAAACCAACAA
GATCTGGTTCATT

QA 1 793 1 793
DS 



CO CL2707Contig2 822 2 23 U
GGATGGTCGAGACTCGAGACGAAAGTCTTACCACATGAAAGGATTTGGGTTAAGGCGTTT
CATGTAAGCCTTATCGTTAGAAGAAAAAAAAATGTTGGAGAGTGCTAACCTCATCTCCTG
CAACTTCTCTCGCTTTCCTCATCTAAAACCCTCCAGAAAAGCCCAATCCCAAAGGCAACC
CCGAAACCTCACCCTTGTCCAATCAAGAGCTCATAGAATTCTCCTTGGCAACAACAACAG
ATGGCAATTCACGAAACACGAGAAGAAGAAAGGTCTCTTCCATTTCCATGTGTGCAGAAG
CTCACTAAACAACCCAGATCCAGACAAGACTGAAATTCAAGGTGAGGGAAGAGACTGGAC
GAGCTCTGTATTGCTTTTCGCTCTCTGGGGTGCTCTTCTTTACTATTGCTTCAACCTTGC
TCCTGATCAAACACCAACACAAGACTTGTACTTTCTGAAAAAGCTGTTGAATTTGAAAGG
CGATGATGGTTTTAGAATGAACCAGATCCTTGTTGGTTTATGGTATATAATGGGTTTATG
GCCTGTGGTATACGCTATGCTCTTGCTTCCCACTGGTCGAAGTAAAACTCAGGCGTGGCC
TTTCGTGGTGCTTTCCTTCTTTGGTGGCGTCTACGCTTTGCTACCTTATTTTGCACTGTG
GAATCCACCTTCTCCTCCTATCTCAGAGTCCGAGCTTAGAAAATGGCCTTTCAATGTTCT
GGAATCAAAAGTAACTGCTGGGGTTACTCTTGTTGCACGCCTGGGTTTAATTCTTTACTC
AGTAGTTGGTAACCCCGGTGACTTGAAGAGTTTATCAGTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BC88TF U 1
AF RS1BF36TF U 77
BS 1 690 RS1BC88TF
BS 691 691 RS1BF36TF
BS 692 693 RS1BC88TF
BS 694 694 RS1BF36TF
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BS 787 787 RS1BF36TF
BS 788 791 RS1BC88TF
BS 792 792 RS1BF36TF
BS 793 822 RS1BC88TF

RD RS1BC88TF 822 0 0
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CATGTAAGCCTTATCGTTAGAAGAAAAAAAAATGTTGGAGAGTGCTAACCTCATCTCCTG
CAACTTCTCTCGCTTTCCTCATCTAAAACCCTCCAGAAAAGCCCAATCCCAAAGGCAACC
CCGAAACCTCACCCTTGTCCAATCAAGAGCTCATAGAATTCTCCTTGGCAACAACAACAG
ATGGCAATTCACGAAACACGAGAAGAAGAAAGGTCTCTTCCATTTCCATGTGTGCAGAAG
CTCACTAAACAACCCAGATCCAGACAAGACTGAAATTCAAGGTGAGGGAAGAGACTGGAC
GAGCTCTGTATTGCTTTTCGCTCTCTGGGGTGCTCTTCTTTACTATTGCTTCAACCTTGC
TCCTGATCAAACACCAACACAAGACTTGTACTTTCTGAAAAAGCTGTTGAATTTGAAAGG
CGATGATGGTTTTAGAATGAACCAGATCCTTGTTGGTTTATGGTATATAATGGGTTTATG
GCCTGTGGTATACGCTATGCTCTTGCTTCCCACTGGTCGAAGTAAAACTCAGGCGTGGCC
TTTCGTGGTGCTTTCCTTCTTTGGTGGCGTCTACGCTTTGCTACCTTATTTTGCACTGTG
GAATCCACCTTCTCCTCCTATCTCAGAGTCTGATCTTAGAAA*TGGCCTTTCA*TGTTCT
GGAATCAAA*GTAACTGCTGGGGT*ACTCTTGTTGCA*GCCTGGGTTTA*TTCTT*ACTC
AGTAGT*GGTA*CCCCGGTGACTTGAAGAGTTTATCAGTACT

QA 1 822 1 822
DS 

RD RS1BF36TF 722 0 0
GG
AGAAGAAAAAAAAATGTTGGAGAGTGTTAACCTCATCTCCTGCAACTTCTCTCGCTTTCC
TCATCTAAAACCCTCCAGAAAAGCCCAATCCCAAAGGCAACCCCGAAACCTCACCCTTGT
CCAATCAAGAGCTCATAGAATTCTCCTTGGCAACAACAACAGATGGCAATTCACGAAACA
CGAGAAGAAGAAAGGTCTCTTCCATTTCCATGTGTGCAGAAGCTCACTAAACAACCCAGA
TCCAGACAAGACTGAAATTCAAGGTGAGGGAAGAGACTGGACGAGCTCTGTATTGCTTTT
CGCTCTCTGGGGTGCTCTTCTTTACTATTGCTTCAACCTTGCTCCTGATCAAACACCAAC
ACAAGACTTGTACTTTCTGAAAAAGCTGTTGAATTTGAAAGGCGATGATGGTTTTAGAAT
GAACCAGATCCTTGTTGGTTTATGGTATATAATGGGTTTATGGCCTGTGGTATACGCTAT
GCTCTTGCTTCCCACTGGTCGAAGTAAAACTCAGGCGTGGCCTTTCGTGGTGCTTTCCTT
CTTTGGTGGCGTCTACGCTTTGCTACCTTATTTTGCACTGTGGAATCCACCTTCTCCTCC
TATCTCAGAGTCCGAGCTTAGAAAATGGCCTTTCAATGTTCTGGAATCAAAAGTAACTGC
TGGGGTTACTCTTGTTGCACGCCTGGGTTTAATTCTTTACTCAGTAGTTGGTAACCCCGG

QA 3 722 3 722
DS 



AS 2 4

CO CL2708Contig1 969 2 2 U
GGAGTCGAGAGAAAAAATAAAACAAACGAAAATGGAGAAACTGACTTACCTCTCGCTCCT
CTTGCACTTCGTCGTCTTCATCGCTAGCACATCTCAGTCATCTTCTATTATACTGAACGA
TCGCAGCTTCGAGATACCGAGCTTGCCTTCATCCCGAGCCGAGAAGCTGATCCGGGAGCT
AAACCTCTTTCCGAATCTGGAGGTGAACGTGATCGATGTCTCGACTCTCGCTTCCGACGT
GGAGGAGGTAGCATCGATTGTCGAACGGAGATTCATCTTCCCGAATATTCTTTCCGATGT
CGGCGGCGGCAGCCCTTCCCTCGAGGATCTAGGTCATCATGCTGGTTACTACAAGCTCCC
CAAATCTCAAGGCGCAAGGATGTTCTACTTATTCTTCGAGTCACGCAACAAGAAGGATGC
TCCTCTCGTGATTTGGTTGACGGGAGGGCCTGGATGTAGCAGTGAATTGGCTATGTTCTA
TGAGAACGGTCCTTTCAAGCTCAATAATAACATGTCTCTTACTTGGAATGAGTATGGATG
GGACCAGGCTTCCAATCTCCTGTATGTAGACCAGCCTGTTGGAACTGGTTTCAGCTACAC
CAGTGACAAAACTGATATCCGTCATGACCAAACAGGAGTTAGCGATGATCTCTATGATTT
TCTGCACGCTTTCTTGGCGGAGCACCCTAAGCTGGCAAATAACGACTTTCACATGGTTCC
AATGGACCAGCCAAAAGCTGCGTTGAAAATGTTGGAGGGATGGATGAAGAAGTCGCTTGG
TGGAGAACAACCTGTGGCTACTACAGAAGGCGATGATCTGGTTGCTCAGATGTAATAGCA
GAAAACAAAGAAACTGTGTAGACTGTGTGTTGTGGCAAACACTTTACGTTTCCTTCTGTA
ATTTGATCTCTAAAGACAACTATATGTAGGGGTTGTACAGGTTCGTGTAAGTCAAAACGC
TTATGAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A547TF U 1
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CTTGCACTTCGTCGTCTTCATCGCTAGCACATCTCAGTCATCTTCTATTATACTGAACGA
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AAACCTCTTTCCGAATCTGGAGGTGAACGTGATCGATGTCTCGACTCTCGCTTCCGACGT
GGAGGAGGTAGCATCGATTGTCGAACGGAGATTCATCTTCCCGAATATTCTTTCCGATGT
CGGCGGCGGCAGCCCTTCCCTCGAGGATCTAGGTCATCATGCTGGTTACTACAAGCTCCC
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TCCTCTCGTGATTTGGTTGACGGGAGGGCCTGGATGTAGCAGTGAATTGGCTATGTTCTA
TGAGAACGGTCCTTTCAAGCTCAATAATAACATGTCTCTTACTTGGAATGAGTATGGATG
GGACCAGGCTTCCAATCTCCTGTATGTAGACCAGCCTGTTGGAACTGGTTTCAGCTACAC
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TCTGCACGCTTTCTTGGCGGAGCACCCTAAGCTGGCAAATAACGACTTTCACATGGTTCC
AATGGACCAGCCAAAAGCTGCGTTGAAA
TGTT

QA 1 748 1 748
DS 

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CTACTTATTCTTCGAGTCACGCAACAAGAAGGATGCTCCTCTCGTGATTTGGTTGACGGG
AGGGCCTGGATGTAGCAGTGAATTGGCTATGTTCTATGAGAACGGTCCTTTCAAGCTCAA
TAATAACATGTCTCTTACTTGGAATGAGTATGGATGGGACCAGGCTTCCAATCTCCTGTA
TGTAGACCAGCCTGTTGGAACTGGTTTCAGCTACACCAGTGACAAAACTGATATCCGTCA
TGACCAAACAGGAGTTAGCGATGATCTCTATGATTTTCTGCAGGCTTTCTTGGCGGAGCA
CCCTAAGCTGGCAAATAAGGACTTTCACATGGTTCCAATGGACCAGCCAAAAGCTGCGTT
GAAAATGTTGGAGGGATGGATGAAGAAGTCGCTTGGTGGAGAACAACCTGTGGCTACTAC
AGAAGGCGATGATCTGGTTGCTCAGATGTAATAGCAGAAAACAAAGAAACTGTGTAGACT
GTGTGTTGTGGCAAACACTTTACGTTTCCTTCTGTAATTTGATCTCTAAAGACAACTATA
TGTAGGGGTTGTACAGGTTCGTGTAAGTCAAAACGCTTATGAACC

QA 1 645 1 645
DS 



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GAGGGAAGTTTGTGCTACGACTTCTCAGACATGGAGAAATTCTTGAACCTGAACTCGGTG
AGAAAGTCGCTTGGTGTTGGGGAGATAGAGTTCGTGTCCTGTAGTACTAGTGTCTATCAG
GCAATGCTACAAGACTTGATGAGGAATCTCGAGGTTGGAATTCCCGCGCTCCTGGAAGAT
GGAATCAACCTTCTTGTGTACGCAGGAGAATATGATTTCATCTGCAACTGGCTCGGTAAC
TCGAGGTGGGTGAATGCAATGGAGTGGTCAGGTAAATAGAACTTTAAGGCGGCTAAGGAA
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TTCCTCAAGGTGCACGATGCGGGACACATGGTGCCAATGGACCAGCCAAAAGCTGCGTTG
AAAATGTTGGAGGGATGGATGAAGAAGCCGCTTGGTGGAGAACAACCTGTGGCTACTACA
GAAGGCGATGATCTGGTTGCTCAGATGTAATAGCAGAAAACAAAGAAACTGCGTAGACTG
TGTGTTGTGGCAAACACTTTACGTTTCCTTCTGTAATTTGATCTCTAAAGACAACTATAT
GTAGGGGTTGTACAGGTTCGTGTAAGTCAAAACGCTTATGAACCAAAAACATATTCTAAA
AGAAAAAGACAATAAAAGATTAACCACCAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1E753JQ C 1
AF RS1DR69TF U 606
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QA 1 748 1 748
DS 

RD RS1DR69TF 146 0 0
G
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AGACAATAAAAGATTAACCACCAGT

QA 2 146 2 146
DS 



AS 1 4

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CTGAACTCACTCTAGCTTGGTCTTATCTAAAACACCGTCCTGTCCCAAACCCAATGCCTT
GTGGGGACAACTGTGGAGTGAGCATCAACTGGCATTTGGCTACAGACTACAGAGGAGGAT
GGACAGCCCGGGTCACAATCTTTAACTGGGGAGAGACAAACTTTCCAGATTGGTTCACAG
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CACTTGATATCAACGGGGAGAACAACGCTATTTTCATGGAAGGTCTACCTGGCTTGAACT
ATCTTGTAGCGGAAAGAGACGGCGACAATCCGTTAAAGAACCCTCGTGTTCCCGGGAAAC
AACAGTCTGTTATTTCCTTCACCAAGAAGCTGACTCCTGGTATCAATGTCCCTGGCGGAG
ACGGCTTCCCGAGCAAAGTGTTCTTCAACGGTGAGGAGTGCTCACTACCATCTATTTTCC
CCACGAGCAACAGCAACAAACGGAGGCACATCTCTGCTATCCTCTTGGCATTACCGGTTT
TGGCACTCTTAATTTTGCGGGTGTAGGTAGTAGCAGTGGAGCCTCCCATACATGTTGGTG
ATACGGTTTCTTGAATGTTTACCGGATAACAAGTCAGTTCCCAAGGGTTCCCCGATGGAG
AATCAATAGCAATCAATATGATGAGTGTTGGAAGAAGCTTTTATATAGGCACTATGAACT
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TTGTTACACTTTCTCAGTCATTGATTTTGCTCCTTTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GGACAGCCCGGGTCACAATCTTTAACTGGGGAGAGACAAACTTTCCAGATTGGTTCACAG
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ATC

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DS 

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G
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TGCGCTTGTGGATGTTCCAGCAGCAGAGCTTCTCGCACTTGTAGCACAACATCCCCAGCG
CTTCTTCTACCACAGCAGGCTCTTCTGGTCCCATTTGAGAACCGAACTGAACTCACTCTA
GCTTGGTCTTATCTAAAACACCGTCCTGTCCCAAACCCAATGCCTTGTGGGGACAACTGT
GGAGTGAGCATCAACTGGCATTTGGCTACAGACTACAGAGGAGGATGGACAGCCCGGGTC
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GGTTTCTTGAATGTTTACCGGATAACAAGTCAGTTCCCGAGGGTTCCCCGATGGAGAATC
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DS 

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TATTCAGATGAAAAAAGCTGCCCCAGGTTTCGAGAAAGCCTACTCGTTCAACGCAACTGC
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TCTTGTAGCGGAAAGAGACGGCGACAATCCGTTAAAGAACCCTCGTGTTCCCGGGAAACA
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TGTTACACTTTCTCAGTCATTGATTTTGCTCCTTTTATC

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 3

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GCATGCTCCAGCTACCATTAAATGCCTCGGGGAAGAAAACACCATATGCAATCTCCCTTC
TGCGATATTGTCAACATAGAATATTAAAATGATCCCGAAAACAATGGTGCCAAGGAAAGC
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CTTTTGCTGGTTCTTAAGAGAAACACGCCTTGCAATAACTCGCCTTAATGCTGATAAGAT
TCCAGCAACAACGGGTATCATCATTCCCATCAGTCCTAGTGCTTGCTCTGTTACTAATTC
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TCCTTGAGATAAGAAAAAAAGAGCTACCAGCATAGCAACAAGGCCACCTACCTTTTTCCA
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CTCTGACAAGATCGCTCTAAGAGGTCCACAAGACTTAAGACCCTTCCCCCACAAGATGAA
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AACTTAAAGATTTAGTATGCTGTTAAATCTAGAATCCTTCTACTAAGAGCTCGATCTCAG
AATCTAAAAGACGCTGTAACTTGTGATCGAAGAAGAAGAACCCCAATCTCCGTCAAGGTC
CCGAAGGTGACCC


BQ
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AF RS1E036JQ U 110
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TGAGAACTGGTGAACAGGTAAAGATTTAACATCGTCACTAACCTATATGGGAAGAACGGG
AGAAGTATCAAAGTCGTTACCAAGGATTCCATCTGGTCCATCTTCTGATTTAATCGAAGA
GTCCTTTTTGCTGCGTTCTAGAGATGTTGCTTCGTATATTCCAAAGCCTAACACTAAGCA
ACAGACGATGAAACCAGGAAGAGAAAAATCCATCTCGTAAGCAATCTCCATGACGATTAT
GCATGCTCCAGCTACCATTAAATGCCTCGGGGAAGAAAACACCATATGCAATCTCCCTTC
TGCGATATTGTCAACATAGAATATTAAAATGATCCCGAAAACAATGGTGCCAAGGAAAGC
CCACGCAGAAAATGGCAACTCCACAGCTTTCCCAGAAGACGACCCTGTGACAAGGTCCCA
CATGGCCAAAGGAAACAGAAAACAGGTTGCAGAAGTAATGGTTATCGCATGGAGTCGTTT
CTTTTGCTGGTTCTTAAGAGAAACACGCCTTGCAATAACTCGCCTTAATGCTGATAAGAT
TCCAGCAACAACGGGTATCATCATTCCCATCAGTCCTAGTGCTTGCTCTGTTACTAATTC
TTCCTCTTTGGTGTCAGTACTATCTTTCGATGAGA*TGGGGAGAGAGATGATGTTG

QA 1 836 1 836
DS 

RD RS1E036JQ 684 0 0
G
GAGAAAAAAACAGACAAAGATTTACATCGTCCAGGACAAGAACATTTCAAAAGTAACCTT
GTTAGTATGGTGAGAACTGGTGAACAGGTAAAGATTTAACATCGTCACTAACCTATATGG
GAAGAACGGGAGAAGTATCAAAGTCGTTACCAAGGATTCCATCTGGTCCATCTTCTGATT
TAATCGAAGAGTCCTTTTTGCTGCGTTCTAGAGATGTTGCTTCGTATATTCCAAAGCCTA
ACACTAAGCAACAGACGATGAAACCAGGAAGAGAAAAATCCATCTCGTAAGCAATCTCCA
TGACGATTATGCATGCTCCAGCTACCATTAAATGCCTCGGGGAAGAAAACACCATATGCA
ATCTCTCTTCTGCGATATTGTCAACATAGAATATTAAAATGATCCCGAAAACAATGGTGC
CAAGGAAAGCCCACGCAGAAAATGGCAACTCCACAGCTTTCCCAGAAGACGTCCCTGTGA
CAAGGTCCCACATGGCCAAAGGAAACAGAAAACAGGTTGCAGAAGTAATGGTTATCGCAT
GGAGTCGTTTCTTTTGCTGGTTCTTAAGAGAAACACGCCTTGCAATAACTCGCCTTAATG
CTGATAAGATTCCAGCAACAACGGGTATCATCATTCCCATCAGTCCTAGTGCTTGCTCTG
TTACTAATTCTTCCTCTTTGG
GG

QA 2 682 2 682
DS 

RD RS1E036TF 706 0 0
CATCAGTC
CTAGTGCTTGCTCTGTTACTAATTCTTCCTCTTTGGTGTCAGTACTATCTTTCGATGAGA
ATGGGGAGAGAGATGATGTTGCCCATCCTTGAGATAAGAAAAAAAGAGCTACCAGCATAG
CAACAAGGCCACCTACCTTTTTCCACACGTGGCCTCTCCGTCCATATAGTACTCCAGAAA
GCACTCCAAGAACAGCACCAGAGTACTCTGACAAGATCGCTCTAAGAGGTCCACAAGACT
TAAGACCCTTCCCCCACAAGATGAAGTACAGAGCAGTGATGACTCCATTGATAAGAGAAG
GTACAATCTGCTGATTAGAAAGGGCCCTTCCTTTCCACGGTTTCTGAAGGATCAAGAAGA
CCAAGGATGAGGGCACCAGACAGCAGAAGAGAAAGAGAACAACAGGCGCTCCAGTCTGAT
TCAAGTAGCGGTACATGGAATAGACTGACCATATCCTAAAGAAGTTCCCAATGACATGGA
TTATCTGGAAAGGGGTATGCCGGAAATGTGAGGATCCTCGATCGTCGGAGACTTGCTTCG
GCGACATCATCGGGGGATGACGTGGAACTTAAAGATTTAGTATGCTGTTAAATCTAGAAT
CCTTCTACTAAGAGCTCGATCTCAGAATCTAAAAGACGCTGTAACTTGTGATCGAAGAAG
AAGAACCCCAATCTCCGTCAAGGTCCCGAAGGTGACCC

QA 9 706 9 706
DS 



AS 1 4

CO CL2711Contig1 703 4 6 U
GGGCAACACATATATCATAACATTATCATAAAGCTCATAACATATATTTTAAAGAGATGG
CTGAATCTTTTAGAGCTACTCATCACTTCCTCACGTCTCTTCTCATAACGGTAGCCATAA
CCATAACCACACTCAAGTCGGTCCATACACAGCAACAAACACAGAGTTCGTAAAATCATC
ATGCACAGTCACAACATATCCAAGACTCTGTGTCACTTCACTCTCGACTCATGCCAGTCT
CATCCAAACCAGCCCCAAGCTTATGGCTGACGCGGCTCTCAACATCACATTAGCCTCGGC
AAAAGCTACATCAGTAATGATGGTGCGTCTCTCGAGTAGTAGACGGCTCAAGCCAAGAGA
AGTCTCGGCCATGAGAGACTGCGTCGAGGAGTTAGGTGACACGTTGGATGAGCTTAGGAA
ATCAATTGGTGAGATGGGTCAGCTAAGTGGCTCGAGCTATGAGGTATACATGAGTGATAT
TCAGACATGGGTTAGTGCGGCTCTGACCGATGAGAACGTGCACCGACGGATTTGAAGGAG
ATGACATGAATGGGAAGGTTAAGGTTTTTGTTAGAGAAAGGATTTTGGTTATTGCTCATT
TAACGAGTAATGCTTTAGCTTTGATTAATCACTTTGCTTCTCTTCATGGTAAGAGAGACT
GAGATATTTCTAGTTTCGTTTTTATTGAAAATTTCTGTTTGAG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1EC29JQ C 1
AF RS1EC29TF U 87
AF RS1H268TF U 1
AF RS1H268JQB C 1
BS 1 86 RS1H268TF
BS 87 563 RS1EC29TF
BS 564 564 RS1H268TF
BS 565 682 RS1EC29TF
BS 683 683 RS1H268TF
BS 684 703 RS1EC29TF

RD RS1EC29JQ 703 0 0
GGGCAACACATATATCATAACATTATCATAAAGCTCATAACATATATTTTAAAGAGATGG
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TAACGAGTAATGCTTTAGCTTTGATTAATCACTTTGCTTCTCTTCATGGTAAGAGAGACT
GAGATATTTCTAGTTTCGTTTTTATTGAAAATTTCTGTTTGAG

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1EC29TF 617 0 0
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TCTGTGTCACTTCACTCTCGACTCATGCCAGTCTCATCCAAACCAGCCCCAAGCTTATGG
CTGACGCGGCTCTCAACATCACATTAGCCTCGGCAAAAGCTACATCAGTAATGATGGTGC
GTCTCTCGAGTAGTAGACGGCTCAAGCCAAGAGAAGTCTCGGCCATGAGAGACTGCGTCG
AGGAGTTAGGTGACACGTTGGATGAGCTTAGGAAATCAATTGGTGAGATGGGTCAGCTAA
GTGGCTCGAGCTATGAGGTATACATGAGTGATATTCAGACATGGGTTAGTGCGGCTCTGA
CCGATGAGAACGTGCACCGACGGATTTGAAGGAGATGACATGAATGGGAAGGTTAAG*TT
TTTGTTAGAGAAAGGATTTTGGTTATTGCTCATTTAACGAGTAATGCTTTAGCTTTGATT
AATCACTTTGCTTCTCTTCATGGTAAGAGAGACTGAGATATTTCTAGTTTCGTTTT*ATT
GAAAATTTCTGTTTGAG

QA 1 617 1 617
DS 

RD RS1H268TF 703 0 0
GGGCAACACATATATCATAACATTATCATAAAGCTCATAACATATATTTTAAAGAGATGG
CTGAATCTTTTAGAGCTACTCATCACTTCCTCACGTCTCTTCTCATAACGGTAGCCATAA
CCATAACCACACTCAAGTCGGTCCATACACAGCAACAAACACAGAGTTCGTAAAATCATC
ATGCACAGTCACAACATATCCAAGACTCTGTGTCACTTCACTCTCGACTCATGCCAGTCT
CATCCAAACCAGCCCCAAGCTTATGGCTGACGCGGCTCTCAACATCACATTAGCCTCGGC
AAAAGCTACATCAGTAATGATGGTGCGTCTCTCGAGTAGTAGACGGCTCAAGCCAAGAGA
AGTCTCGGCCATGAGAGACTGCGTCGAGGAGTTAGGTGACACGTTGGATGAGCTTAGGAA
ATCAATTGGTGAGATGGGTCAGCTAAGTGGCTCGAGCTATGAGGTATACATGAGTGATAT
TCAGACATGGGTTAGTGCGGCTCTGACCGATGAGAACGTGCACCGACGGATTTGAAGGAG
ATGACATGAATGGGAAGGTTAAGGTTTTTGTTAGAGAAAGGATTTTGGTTATTGCTCATT
TAACGAGTAATGCTTTAGCTTTGATTAATCACTTTGCTTCTCTTCATGGTAAGAGAGACT
GAGATATTTCTAGTTTCGTTTTTATTGAAAATTTCTGTTTGAG

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1H268JQB 703 0 0
GGGCAACACATATATCATAACATTATCATAAAGCTCATAACATATATTTTAAAGAGATGG
CTGAATCTTTTAGAGCTACTCATCACTTCCTCACGTCTCTTCTCATAACGGTAGCCATAA
CCATAACCACACTCAAGTCGGTCCATACACAGCAACAAACACAGAGTTCGTAAAATCATC
ATGCACAGTCACAACATATCCAAGACTCTGTGTCACTTCACTCTCGACTCATGCCAGTTT
CATCCAAACCAGCCCCAAGCTTATGGCTGACGCGGCTCTCAACATCACATTAGCCTCGGC
AAAAGCTACATCAGTAATGATGGTGCGTCTCTCGAGTAGTAGACGGCTCAAGCCAAGAGA
AGTTTCGGCCATGAGAGACTGCGTCGAGGAGTTAGGTGACACGTTGGATGAGCTTAGGAA
ATCAATTGGTGAGATGGGTCAGCTAAGTGGCTCGAGCTATGAGGTATACATGAGTGATAT
TCAGACATGGGTTAGTGCGGCTCTGACCGATGAGAACGTGCACCGACGGATTTGAAGGAG
ATGACATGAATGGGAAGGTTAAGGTTTTTGTTAGAGAAAGGATTTTGGTTATTGCTCATT
TAACGAGTAATGCTTTAGCTTTGATTAATCACTTTGCTTCTCTTCATGGTAAGAGAGACT
GAGATATTTCTAGTTTCGTTTTTATTGAAAATTTCTGTTTGAG

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 4

CO CL2712Contig1 698 4 4 U
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AATATATATTCTAAGGTCGGTCTTTCTAGTACTTGGAGCTGAATCAAATCCTTCTAGAAG
CTAGAAAAGGCGAACTCAAAAAATCTTTCTAGTTACTTCGTTCTTTATTTCTATTTAACG
GAATCCTTAGGAAAAGTATTTTGTTTCCACCGAGCTAAAACAATATAATATGTCGATGTC
TTTAGTAAACCAAAGTTCTCGTTTAATAGCTATTTTGCTTCAATTTTTTCTATACCAAAC
AAAAAATAGAACTGAAGATTTAGTTACGATTAGAAATAAACTTTTCTGGCTTTATCCATG
GATCCTCTTGTTATACTTATTGAATTGTAAATAGTCATCCAATTCAAAAATTATGTTTCG
AAATTTCATAATCCAAATTGACAATTAATTAGAGTCCTTGGATACAAATTACGAGAATCT
ATAATCTTCCTTGAATTTTTCATTGAAAGGTAAAGGACTAAATCCTTTTCAGAAATAAAG
TTTTTGATCGGAAGATTAATCAAACCGAGAGACCCTTTAACTATTAAAGGGGTTAAAGGA
ACGAATCACACTTTTACCACTAAACTATACCCGCTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1CY76TF C 1
AF RS1CY76JQ U 5
AF RS1BH11JQ U 369
AF RS1BH11TF C 369
BS 1 7 RS1CY76TF
BS 8 516 RS1CY76JQ
BS 517 517 RS1BH11JQ
BS 518 698 RS1CY76JQ

RD RS1CY76TF 698 0 0
TTTTTGCAAAAAATCTTTCCCGTATTATTTAAGGTAGGCGTAATAGAGCCAGGCATTCTA
CAGCTTGCTGTTGTGAATGTTAGCAGGGCCGTTTTCTTATTTAAGCAAACATAATTATCA
AATATATATTCTAAGGTCGGTCTTTCTAGTACTTGGAGCTGAATCAAATCCTTCTAGAAG
CTAGAAAAGGCGAACTCAAAAAATCTTTCTAGTTACTTCGTTCTTTATTTCTATTTAACG
GAATCCTTAGGAAAAGTATTTTGTTTCCACCGAGCTAAAACAATATAATATGTCGATGTC
TTTAGTAAACCAAAGTTCTCGTTTAATAGCTATTTTGCTTCAATTTTTTCTATACCAAAC
AAAAAATAGAACTGAAGATTTAGTTACGATTAGAAATAAACTTTTCTGGCTTTATCCATG
GATCCTCTTGTTATACTTATTGAATTGTAAATAGTCATCCAATTCAAAAATTATGTTTCG
AAATTTCATAATCCAAATTGACAATTAATTAGAGTCTTTGGATACAAATTACGAGAATCT
ATAATCTTCCTTGAATTTTTCATTGAAAGGTAAAGGACTAAATCCTTTTCAGAAATAAAG
TTTTTGATCGGAAGATTAATCAAACCGAGAGACCCTTTAACTATTAAAGGGGTTAAAGGA
ACGAATCACACTTTTACCACTAAACTATACCCGCTACC

QA 1 698 1 698
DS 

RD RS1CY76JQ 694 0 0
GCA
AAAAAATCTTTCCCGTATTATTTAAGGTAGGCGTAATAGAGCCAGGCATTCTACAGCTTG
CTGTTGTGAATGTTAGCAGGGCCGTTTTCTTATTTAAGCAAACATAATTATCAAATATAT
ATTCTAAGGTCGGTCTTTCTAGTACTTGGAGCTGAATCAAATCCTTCTAGAAGCTAGAAA
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AACCAAAGTTCTCGTTTAATAGCTATTTTGCTTCAATTTTTTCTATACCAAACAAAAAAT
AGAACTGAAGATTTAGTTACGATTAGAAATAAACTTTTCTGGCTTTATCCATGGATCCTC
TTGTTATACTTATTGAATTGTAAATAGTCATCCAATTCAAAAATTATGTTTCGAAATTTC
ATAATCCAAATTGACAATTAATTAGAGTCTTTGGATACAAATTACGAGAATCTATAATCT
TCCTTGAATTTTTCATTGAAAGGTAAAGGACTAAATCCTTTTCAGAAATAAAGTTTTTGA
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ACACTTTTACCACTAAACTATACCCGCTACC

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CCTTGAATTTTTCATTGAAAGGTAAAGGACTAAATCCTTTTCAAAAATAAAGTTTTTGAT
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CACTTTTACCACTAAACTATACCCGCTACC

QA 1 330 1 330
DS 

RD RS1BH11TF 298 0 0
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TGTTATACTTATTGAATTGTAAATAGTCATCCAATTCAAAAATTATGTTTCGAAATTTCA
TAATCCAAATTGGCAATTAATTAGAGTCCTTGGATACAAATTACGAGAATCTATAATCTT
CCTTGAATTTTTCATTGAAAGGTAAAGGACTAAATCCTTTTCAGAAATAAAGTTTTTGAT
CGGAAGATTAATCAAACCGAGAGACCCTTTAACTATTAAAGGGGTTAAAGGAACGAAT

QA 1 298 1 298
DS 



AS 1 4

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TTCTGAAAGCAATGTAGATAATAGCTCTCCACGCTCACACTTATTTGAGATTTGAGATCA
AATTACAAATCAACGAGACATGAGACTTAAACCTCACATGAATCACACAGAACTCCCACT
AAAAGCATCAGAACACAAACTCAAACACCTCACAGAGTCTAAACTACTGAGAGCATTTCT
CCACGTATGCTTTCCAGCCTTCATCTCGATACTCACGAGCCGTCACTGCAGGGTTCTCCG
ACTTTATGATCCCCCTTCCCACGATTATAATGTCACTTCCCCTCTCAGTGATCACGGAGT
GTGGAGTGTTGTACTGTTGACCAAGTGCATCACCACCTTTCACCATTTGAACACCAGGCG
TCGCATGGATCATAGACGGACTCACATTTCCGTATTTCCATGACGCTGGATTAACCGAGA
TGAACCCCATCACGAAATCTGAATGAGCCTCTGCGATTTTCACCGCTGCTGCAGTGTAGT
CTCCTGTGGCTAGGTTACCAGCAGAGCTCATCTCAGCTAACAAAAGCAGACCCTTACCAC
GTGGCAAACCCTTCAACTTGAGGCCGTCAACGATCCCTGGCCCTGATATGATGTGAGCGT
TTATGATATCAGCCCACTCTAATATCTTAAAGACACCTCCTTCATACTGCATCGTGACCG
TGTTACCAATGTCTGCAAACTTACGATCCTCAAATATGACAAAGTTGTGCTTGTCTGCAA
TCGCACGGAGTTTAGAGCCAAAATCAGAGGTGAAATCAGGGAGGATATCAACATGTGTCT
TCAACATACATATCTCTGGTCCCACCTTGTCAGCAATGTCAAGCAACTCAGCAGCAGTAC
CAACATCAGCAGCTAAGCAAAGATTAGTTTTTTTCACCATCATAACCTCAAACAGCTTCT
TCCCCATCAGATTCTTACACATCTCAGACCTCTCCTTAAACCCTAAAGCCTTACTCTTAA
CCTTCTCCACAGACGGAACACTAACCCTACGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1E449JQ U 1
AF RS1DB03JQ U 89
AF RS1DB03TF C 477
AF RS1E449TF C 793
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RD RS1E449JQ 852 0 0
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TTCTGAAAGCAATGTAGATAATAGCTCTCCACGCTCACACTTATTTGAGATTTGAGATCA
AATTACAAATCAACGAGACATGAGACTTAAACCTCACATGAATCACACAGAACTCCCACT
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GTGGAGTGTTGTACTGTTGACCAAGTGCATCACCACCTTTCACCATTTGAACACCAGGCG
TCGCATGGATCATAGACGGACTCACATTTCCGTATTTCCATGACGCTGGATTAACCGAGA
TGAACCCCATCACGAAATCTGAATGAGCCTCTGCGATTTTCACCGCTGCTGCAGTGTAGT
CTCCTGTGGCTAGGTTACCAGCAGAGCTCATCTCAGCTAACAAAAGCAGACCCTTACCAC
GTGGCAAACCCTTCAACTTGAGGCCGTCAACGATCCCTGGCCCTGATATGATGTGAGCGT
TTATGATATCAGCCCACTCTAATATCTTAAGGACACCTCCTTCATACTGCATCGTGACCG
TGTTACCAATGTCTGCAAACTTACGATCCTCAAATATGACAAAGTTGTGCTTGTCTGCA*
TCGCACGGAGTT

QA 1 852 1 852
DS 

RD RS1DB03JQ 786 0 0
AAACCGGTAACGTTTTCTTTATCAAAGAGACATTCTGAAAGCAATGTAGATAATAGCTCT
CCACGCTCACACTTATTTGAGATTTGAGATCAAATTACAAATCAACGAGACATGAGACTT
AAACCTCACATGAATCACACAGAACTCCCACTAAAAGCATCAGAACACAAACTCAAACAC
CTCACAGAGTCTAAACTACTGAGAGCATTTCTCCACGTATGCTTTCCAGCCTTCATCTCG
ATACTCACGAGCCGTCACTGCAGGGTTCTCCGACTTTATGATCCCCCTTCCCACGATTAT
AATGTCACTTCCCCTCTCAGTGATCACGGAGTGTGGAGTGTTGTACTGTTGACCAAGTGC
ATCACCACCTTTCACCATTTGAACACCAGGCGTCGCATGGATCATAGACGGACTCACATT
TCCGTATTTCCATGACGCTGGATTAACCGAGATGAACCCCATCACGAAATCTGAATGAGC
CTCTGCGATTTTCACCGCTGCTGCAGTGTAGTCTCCTGTGGCTAGGTTACCAGCAGAGCT
CATCTCAGCTAACAAAAGCAGACCCTTACCACGTGGCAAACCCTTCAACTTGAGGCCGTC
AACGATCCCTGGCCCTGATATGATGTGAGCGTTTATGATATCAGCCCACTCTAATATCTT
AAAGACACCTCCTTCATACTGCATCGTGACCGTGTTACCAATGTCTGCAAACTTACGATC
CTCAAATATGACAAAGTTGTGCTTGTCTGCAATCGCACGGAGTTTAGAGCCAAA*TCAGA
GGTGAA

QA 1 786 1 786
DS 

RD RS1DB03TF 637 0 0
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GAGATGAACCCCATCACGAAATCTGAATGAGCCTCTGCGATTTTCACCGCTGCTGCAGTG
TAGTCTCCTGTGGCTAGGTTACCAGCAGAGCTCATCTCAGCTAACAAAAGCAGACCCTTA
CCACGTGGCAAACCCTTCAACTTGAGGCCGTCAACGATCCCTGGCCCTGATATGATGTGA
GCGTTTATGATATCAGCCCACTCTAATATCTTAAAGACACCTCCTTCATACTGCATCGTG
ACCGTGTTACCAATGTCTGCAAACTTACGATCCTCAAATATGACAAAGTTGTGCTTGTCT
GCAATCGCACGGAGTTTAGAGCCAAAATCAGAGGTGAAATCAGGGAGGATATCAACATGT
GTCTTCAACATACATATCTCTGGTCCCACCTTGTCAGCAATGTCAAGCAACTCAGCAGCA
GTACCAACATCAGCAGCTAAGCAAAGATTAGTTTTTTTCACCATCATAACCTCAAACAGC
TTCTTCCCCATCAGATTCTTACACATCTCAGACCTCTCCTTAAACCCTAAAGCCTTACTC
TTAACCTTCTCCACAGACGGAACACTAACCCTACGAT

QA 1 637 1 637
DS 

RD RS1E449TF 321 0 0
CTGCACACTTACGATCCTCAAATATGACAAAGTTGTGCTTGTCTGCAATCGCACGGAGTT
TAGAGCCAAAATCAGAGGTGAAATCAGGGAGGATATCAACATGTGTCTTCAACATACATA
TCTCTGGTCCCACCTTGTCAGCAATGTCAAGCAACTCAGCAGCAGTACCAACATCAGCAG
CTAAGCAAAGATTAGTTTTTTTCACCATCATAACCTCAAACAGCTTCTTCCCCATCAGAT
TCTTACACATCTCAGACCTCTCCTTAAACCCTAA*GCCTTACTCTTAACCTTCTCCACAG
ACGGAACACTAACCCTACGAT

QA 1 321 1 321
DS 



AS 1 4

CO CL2714Contig1 819 4 18 U
ACCCAAAAGCAAAGACCTTAACTTTTTATTACATCAAACCAAAAGACGGTTTAGTGGTAT
TGTTTCAACCCATTATCTTACATAATACAACTTATTAAACAACATCGAAGTATAACTCAA
AAGGAAGGGAACATCCTAAGACCCTTCGCAAACACATTCTCTGTGGACGTGTCAACCTCA
CGGAACTTAACAGGGAAAACATTTTTATCATTATTGTCATCTTCAAGAACAAGATAAGGT
GCTCCGAATAAACCGGTGGTCGCACCAATACCTTTTATAGCCGAGTCACTCTCGTAGTGA
ACTAGCTTGTAAGTGTTGTCATCGTTTCCATATTTCTGAATCCTGAAAAAGCTCTCCCTC
GTGCTGGAGCTACCACCAGTGGTTACATAGTTCTTGTCAGAACTTGAGGAGGTATCGACC
TTCCATATCTTTGAAGAAGGGCAAAGCCATATCGAAGACTGGAACTCGATAACTAGATCG
GTGTTTGTTGTCAATACATCACCATTTTGGGAAGATGGATTGGAGAAATTTACAGGAAGG
CCTGGCTGATATGGAAGGAGTGTTTGGGAAATACCTAATGGACACAAGCGAGTAAAGTCA
GTGCTTGCTGGGACAAGACCACCTCCTTTCTTGTTTGAACCTGGTTGGATGAAGTACTGG
GTCTGACTCTTAAGTGGGTTTCCATTTGTGTCCTTGACGGGCTCCACTTCATCTCCAGCT
GATATTGCAACAGCTGACACGAGAAGGATCAAAGAGATGAATGACAATGGCTTATTGTTA
CCCATGGTGTTTGTGTTTCTTGTGTGACTTGAGACTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DW11JQ U 1
AF RS1A561JQ U 9
AF RS1DW11TF C 307
AF RS1A561TF C 140
BS 1 76 RS1DW11JQ
BS 77 77 RS1A561JQ
BS 78 86 RS1DW11JQ
BS 87 87 RS1A561JQ
BS 88 122 RS1DW11JQ
BS 123 123 RS1A561JQ
BS 124 215 RS1DW11JQ
BS 216 216 RS1A561JQ
BS 217 281 RS1DW11JQ
BS 282 282 RS1A561JQ
BS 283 317 RS1DW11JQ
BS 318 318 RS1A561JQ
BS 319 323 RS1DW11JQ
BS 324 324 RS1A561JQ
BS 325 617 RS1DW11JQ
BS 618 618 RS1A561JQ
BS 619 694 RS1DW11JQ
BS 695 819 RS1A561JQ

RD RS1DW11JQ 694 0 0
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TGTTTCAACCCATTATTTTACATAATTCAACTTATTAAACAACATCGAAGTATAACTCAA
AATGAAGGGAACATCCTAAGACCCTTCGCAAACACATTCTCTGTGGACGTGTCAACCTCA
CGGAACTTAACAGGGAAAACATTTTTATCATTATTATCATCTTCAAGAACAAGATAAGGT
GCTCCGAATAAACCGGTGGTCGCACCAATACCTTTTATAGCGGAGTCACTCTCGTAGTGA
ACTAGCTTGTAAGTGTTTTCATCTTTTCCATATTTCTGAATCCTGAAAAAGCTCTCCCTC
GTGCTGGAGCTACCACCAGTGGTTACATAGTTCTTGTCAGAACTTGAGGAGGTATCGACC
TTCCATATCTTTGAAGAAGGGCAAAGCCATATCGAAGACTGGAACTCGATAACTAGATCG
GTGTTTGTTGTCAATACATCACCATTTTGGGAAGATGGATTGGAGAAATTTACAGGAAGG
CCTGGCTGATATGGAAGGAGTGTTTGGGAAATACCTAATGGACACAAGCGAGTAAAGTCA
GTGCTTGCTGGGACAAGGCCACCTCCTTTCTTGTTTGAACCTGGTTGGATGAAGTACTGG
GTCTGACTCTTAAGTGGGTTTCCATTTGTGTCCT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RS1A561JQ 811 0 0
CAAAGAC
CCTTAACTTTTTATTACATCAAACCAAAAGATGGTTTAGTGGTATTGTTTCAACCCATTA
TCTTACATAATACAACTTATTAAACACCATCGAAGTATAACTCAGAAGGAAGGGAACATC
CTAAGACCCTTCGCAAACACATTCTCTGTGGACGTGTCAACCTCACGGAACTTAACAGGG
AAAACATTTTTATCATTATTGTCATCTTCAAGAACAAGATAAGGTGCTCCGAATAAACCG
GTGGTCGCACCAATACCTTTTATAGCCGAGTCACTCTCGTAGTGAACTAGCTTGTAAGTG
TTGTCATGGTTTCCATATTTCTGAATCCTGAAAAAGCTCTCCCTCGTGCTGGAGCTACCA
CCAGTGGTTACATAGTTCTTGTCAGAACTTGAGGAGGTATCGACCTTCCATATCTTTGAA
GAAGGGCAAAGCCATATCGAAGACTGGAACTCGATAACTAGATCGGTGTTTGTTGTCAAT
ACATCACCATTTTGGGAAGATGGATTGGAGAAATTTACAGGAAGGCCTGGCTGATATGGA
AGGAGTGTTTGGGAAATACCTAATGGACACAAGCGAGTAAAGTCAGTGCTTGCTGGGACA
AGACCACCTCCTT*CTTGTTTGAACCTGGTTGGATGAAGTACTGGGTCTGACTCTTAAGT
GGGTTTCCATTTGTGTCCTTGACGGGCTCCACTTCATCTCCAGCTGATATTGCAACAGCT
GACACGAGAAGGATCAAAGAGATGAATGACAATGGCTTATTGTTACCCATGGTGTTTGTG
TTTCTTGTGTGACTTGAGACTCCC

QA 8 811 8 811
DS 

RD RS1DW11TF 506 0 0
TTGTAAGTGTTTTCATCTTTTCCATATTTCTGAATCCTGAAAAAGCTCTCCCTCGTGCTG
GAGCTACCACCAGTGGTTACATAGTTCTTGTCAGAACTTGAGGAGGTATCGACCTTCCAT
ATCTTTGAAGAAGGGCAAAGCCATATCGAAGACTGGAACTCGATAACTAGATCGGTGTTT
GTTGTCAATACATCACCATTTTGGGAAGATGGATTGGAGAAATTTACAGGAAGGCCTGGC
TGATATGGAAGGAGTGTTTGGGAAATACCTAATGGACACAAGCGAGTAAAGTCAGTGCTT
GCTGGGACAAGGCCACCTCCTTTCTTGTTTGAACCTGGTTGGATGAAGTACTGGGTCTGA
CTCTTAAGTGGGTTTCCATTTGTGTCCTTGACGGGCTCG*CTTCATCTCCAGCTGATATT
GCAACAGCTGACACGAGAAGGATCAAAGAGATGAATGACAATGGCTTATTGTTACCCATG
GTGTTTGTGTTTCTTGTGTGACTT
CC

QA 1 504 1 504
DS 

RD RS1A561TF 680 0 0
GACCCTTCGCAAACACATTCTCTGTGGACGTGTCAACCTCACGGAACTTAACAGGGAAAA
CATTTTTATCATTATTGTCATCTTCAAGAACAAGATAAGGTGCTCCGAATAAACCGGTGG
TCGCACCAATACCTTTTATAGCCGAGTCACTCTCGTAGTGAACTAGCTTGTAAGTGTTGT
CATGGTTTCCATATTTCTGAATCCTGAAAAAGCTCTCCCTCGTGCTGGAGCTACCACCAG
TGGTTACATAGTTCTTGTCAGAACTTGAGGAGGTATCGACCTTCCATATCTTTGAAGAAG
GGCAAAGCCATATCGAAGACTGGAACTCGATAACTAGATCGGTGTTTGTTGTCAATACAT
CACCATTTTGGGAAGATGGATTGGAGAAATTTACAGGAAGGCCTGGCTGATATGGAAGGA
GTGTTTGGGAAATACCTAATGGACACAAGCGAGTAAAGTCAGTGCTTGCTGGGACAAGAC
CACCTCCTT*CTTGTTTGAACCTGGTTGGATGAAGTACTGGGTCTGACTCTTAAGTGGGT
TTCCATTTGTGTCCTTGACGGGCTCCACTTCATCTCCAGCTGATATTGCAACAGCTGACA
CGAGAAGGATCAAAGAGATGAATGACAATGGCTTATTGTTACCCATGGTGTTTGTGTTTC
TTGTGTGACTT
GAGACTCCC

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 4

CO CL2715Contig1 818 4 8 U
AGTTAAGAGAGATGCACAGTATTATGCATAAACGATCCTGAGATTCAGGATTCTTGATCA
GACAAAAGTAAATTAAAAAGGAAAAAGAAACAATTGTACTGGAGAGTATTTATTGGTAGA
ATACTGGTGAAAGCTCATATTTTGTACTACATTCACTTGACGAAATAGGGAAGGTCAAGA
ACGTAGAGGAGAAAGTAAGCCCAAGTCACACCAGAGATCCCTCCGAAGAAGAACCCTCCC
GTAAATTTTGCCCATCCCTCAGCTGTCTGAAGCTGGTCAGGCTGCTTCTTCCGCCCAGTC
AACGTCAAACTCGGAGCAATCGAGGGCTCTCCTTCCTTGAACGAAGAGATTCCGTAGATG
GTGAGGCACATGCTGAGGATGACTACAAGCCCAGCGGCGGCTAAGGAGCCGGCGGAACCA
GCGTAAGCAGTGTTCCTTAATGGGCCAGCTTTGACAAATGGGCCCACTAAGAGGAAACCA
TGTGCCAAGCCCACTTCAACACCACGAAGGAGAGGGTTGACGGCGGTGCGGTAAGCCGGG
AGGTTGGAAAGATACCACGCAATCAAAGGGCTTGACGTTACAGGAGTCTCCAAACTTCCG
ATGAATGGATCGCCGTTGATTGGTTGGATCACTTGAAACGTTGGCTTGTCGGTCTGAGCA
GCTCGGACAGTGAAGGAAGAGATTCTCTTGGTCGGATATACGCCGAAAGAAGGGCCGGAG
ATTCCCTTAGGGACGGCTAGACGCCTAGCAATTGTAGCGGAGGATAAGCTGCTCCTTAGC
TGGCTCGCCATTGGAGATGCACTTGCTGCCATTGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RS1FT60JQ U 1
AF RS1BJ83JQ U 98
AF RS1BJ83TF C 124
AF RS1FT60TF C 382
BS 1 356 RS1FT60JQ
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RD RS1FT60JQ 647 0 0
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AACGTCAAACTCGGAGCAATCGAGGGCTCTCCTTCCTTGAACGAAGAGATTCCGTAAATA
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GCGTAAGCAGTGTTCCTTAATGGGCCAGCTTTGACAAATGGGCCCACTAAGAGGAAACCA
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ATGAATGGATCGCCGTTGATTGGTTGGATCACTTGAAACGTTGGCTT

QA 1 647 1 647
DS 

RD RS1BJ83JQ 721 0 0
G
CTGGAGAGTATTTATTGGTAGAATACTGGTGAAAGCTCATATTTTGTACTACATTCACTT
GACGAAATAGGGAAGGTCAAGAACGTAGAGGAGAAAGTAAGCCCAAGTCACACCAGAGAT
CCCTCCGAAGAAGAACCCTCCCGTAAATTTTGCCCATCCCTCAGCTGTCTGAAGCTGGTC
AGGCTGCTTCTTCCGCCCAGTCAACGTCAAACTCGGAGCAATCGAGGGCTCTCCTTCCTT
GAACGAAGAGATTCCGTAGATGGTGAGGCACATGCTGAGGATGACTACAAGCCCAGCGGC
GGCTAAGGAGCCGGCGGAACCAGCGTAAGCAGTGTTCCTTAATGGGCCAGCTTTGACAAA
TGGGCCCACTAAGAGGAAACCATGTGCCAAGCCCACTTCAACACCACGAAGGAGAGGGTT
GACGGCGGTGCGGTAAGCCGGGAGGTTGGAAAGATACCACGCAATCAAAGGGCTTGACGT
TACAGGAGTCTCCAAACTTCCGATGAATGGATCGCCGTTGATTGGTTGGATCACTTGAAA
CGTTGGCTTGTCGGTCTGAGCAGCTCGGACAGTGAAGGAAGAGATTCTCTTGGTCGGATA
TACGCCGAAAGAAGGGCCGGAGATTCCCTTAGGGACGGCTAGACGCCTAGCAATTGTAGC
GGAAGATAAGCTGCTCCTTAGCTGGCTCGCCATTGGAGATGCACTTGCTGCCATTGTTTT

QA 2 721 2 721
DS 

RD RS1BJ83TF 695 0 0
CTGGTGAAAGCTCATATTTTGTACTACATTCACTTGACGAAATAGGGAAGGTCAAGAACG
TAGAGGAGAAAGTAAGCCCAAGTCACACCAGAGATCCCTCCGAAGAAGAACCCTCCCGTA
AATTTTGCCCATCCCTCAGCTGTCTGAAGCTGGTCAGGCTGCTTCTTCCGCCCAGTCAAC
GTCAAACTCGGAGCAATCGAGGGCTCTCCTTCCTTGAACGAAGAGATTCCGTAGATGGTG
AGGCACATGCTGAGGATGACTACAAGCCCAGCGGCGGCTAAGGAGCCGGCGGAACCAGCG
TAAGCAGTGTTCCTTAATGGGCCAGCTTTGACAAATGGGCCCACTAAGAGGAAACCATGT
GCCAAGCCCACTTCAACACCACGAAGGAGAGGGTTGACGGCGGTGCGGTAAGCCGGGAGG
TTGGAAAGATACCACGCAATCAAAGGGCTTGACGTTACAGGAGTCTCCAAACTTCCGATG
AATGGATCGCCGTTGATTGGTTGGATCACTTGAAACGTTGGCTTGTCGGTCTGAGCAGCT
CGGACAGTGAAGGAAGAGATTCTCTTGGTCGGATATACGCCGAAAGAAGGGCCGGAGATT
CCCTTAGGGACGGCTAGACGCCTAGCAATTGTAGCGGAGGATAAGCTGCTCCTTAGCTGG
CTCGCCATTGGAGATGCACTTGCTGCCATT
GTTTT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1FT60TF 434 0 0
ACTACAAGCCCAGCGGCGGCTAAGGAGCCGGCGGAACCAGCGTAAGCAGTGTTCCTTAAT
GGGCCAGCTTTGACAAATGGGCCCACTAAGAGGAAACCATGTGCCAAGCCCACTTCAACA
CCACGAAGGAGAGGGTTGACGGCGGTGCGGTAAGCCGGGAGGTTGGAAAGATACCACGCA
ATCAAAGGGCTTGACGTTACAGGAGTCTCCAAACTTCCGATGAATGGATCGCCGTTGATT
GGTTGGATCACTTGAAACGTTGGCTTGTCGGTCTGAGCAGCTCGGACAGTGAAGGAAGAG
ATTCTCTTGGTCGGATATACGCCGAAAGAAGGGCCGGAGATTCCCTTAGGGACGGCTAGA
CGCCTAGCAATTGCAGCGGAGGATAAGCTGCTCCTTAGCTGGCTCGCCATTGGAGATGCA
CTTGCTGCCATT
CC

QA 1 432 1 432
DS 



AS 1 3

CO CL2716Contig1 1348 3 3 U
CGTGTACATTTTGCATTGGTTCAATGATTATTCTTGCAAAAGACATCAAAAATTCAAAAG
GACTAATCCTTAGTATGCACATGTACAAAAAAGTGATTTTGCCTCCAAGCTACAAAGAAG
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GGAATAACAGGTACTCTGCATAGAAGAGATTCCATATAAATCGGTAATATCCTGCAATAG
CTTCCTTTGTGTAGTTTGCTTTTTCTAGCACCCATGTCTGGAAAATCAAGCATGAAGCCA
AGATCATATGTGCAGGAATCATCAAGCTACCTCTAAAAACCTGAGGCATGTAGAAAGCTA
GTGATACGGCAGAAATATAGTTAACTAGCAGAAGTCCGGAACCGAGGAATGCAATGTTCC
TCACTCCAAGCTTTGTTGCTAGAGTTGATATTTGGAACTTGCGATCTCCTTCAACATCAG
GAAGATCTTTTGTGATAGCAATGACCAGTGCAAACAATGTCACAAATGACGTTATGAAAG
CCACAGGTGCACTCCACTGAAACGAAAGTCCAAGGGCAGCTCTAGTAGCATGATACACAC
CAAAATTAAGAAGGAAACCTCGTACCGTGGCAATAATAAGAAACGCTGCAACTGGAAATC
TCTTCATTCTAAATGGTGGAACAGAATAGATGGTCCCCAGAAAAAGACCAAGAGAGTATA
GGCATGTAATGAACGGACCAAAGTTGAATCCAACAACCGTTAGCCCTGCAACAGCGAAAA
ATATCACCAACAGCCAAGCCGACTGCACTGAGAGATCTCCTGCTGCTATTGGCAAGTACG
GCTTGTTCACTTTGTCAATACCAATGTCGTAGATCTGATTGATGCCAACTATATAACCGT
TTCCACATATAAGCGCAAGAAGACCTGAGAGCGCCTTGAGTACCAGGCTCCATTTAATCA
GATGACTGTTCTCTATCAAAGCTCTTGCTACCAAGGCAGTGGATCCTAAAGCCGTTCCAC
GGATGGTATGCGGCCTAAGAAATCTCCAGCAAGCGTTCTGGAAACGCGCGATTCTATCAA
GAACTGGATCGGAACCAGCAGCACCTACCTGAGAACATGCCCTGATCGAGATTTTTCTGT
AGTTAGTTGAAACAAATTTGGACCGCATACATGAACTTGATAAGCTCGTGAAGCCAACAT
CTTGGGACCGGCTTAGAAGCTTCCCAGCTAAATGCACAGAAGGCCGATGGTGATGATGAG
AAGCTGCTAAGAAACGAGGTGATACAGACGAGAACCGAAGAGAAGGTGGTTGAGAGATTG
AGAGCTCCATTGATGCCACTAGCCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GI13JQ U 1
AF RS1BS85JQ U 18
AF RS1BS85TF C 624
BS 1 124 RS1GI13JQ
BS 125 816 RS1BS85JQ
BS 817 1348 RS1BS85TF

RD RS1GI13JQ 124 0 0
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GACTAATCCTTAGTATGCACATGTACAAAAAAGTGATTTTGCCTCCAAGCTACAAAGAAG
AAGA

QA 1 124 1 124
DS 

RD RS1BS85JQ 799 0 0
GGTTCAATGATTATTCTTGCAAAAGACATCAAAAATTCAAAAGGACTAATCCTTAGTATG
CACATGTACAAAAAAGTGATTTTGCCTCCAAGCTACAAAGAAGAAGAAGAACAGAGGTAT
ACAAAGAAAACTGCAAATGATCACCATGAAAGCTAGAAGAAGGGGAATAACAGGTACTCT
GCATAGAAGAGATTCCATATAAATCGGTAATATCCTGCAATAGCTTCCTTTGTGTAGTTT
GCTTTTTCTAGCACCCATGTCTGGAAAATCAAGCATGAAGCCAAGATCATATGTGCAGGA
ATCATCAAGCTACCTCTAAAAACCTGAGGCATGTAGAAAGCTAGTGATACGGCAGAAATA
TAGTTAACTAGCAGAAGTCCGGAACCGAGGAATGCAATGTTCCTCACTCCAAGCTTTGTT
GCTAGAGTTGATATTTGGAACTTGCGATCTCCTTCAACATCAGGAAGATCTTTTGTGATA
GCAATGACCAGTGCAAACAATGTCACAAATGACGTTATGAAAGCCACAGGTGCACTCCAC
TGAAACGAAAGTCCAAGGGCAGCTCTAGTAGCATGATACACACCAAAATTAAGAAGGAAA
CCTCGTACCGTGGCAATAATAAGAAACGCTGCAACTGGAAATCTCTTCATTCTAAATGGT
GGAACAGAATAGATGGTCCCCAGAAAAAGACCAAGAGAGTATAGGCATGTAATGAACGGA
CCAAAGTTGAATCCAACAACCGTTAGCCCTGCAACAGCGAAAAATATCACCAACAGCCAA
GCCGACTGCACTGAGAGAT

QA 1 799 1 799
DS 

RD RS1BS85TF 725 0 0
TACCGT
GCAATAATAAGAAACGCTGCAACTGGAA*TCTCTTCATTCTAAATGGTGGAACAGAATAG
ATGGTCCCCAGAAAAAGACCAAGAGAGTATAGGCATGTAATGAACGGACCAAAGTTGAAT
CCAACAACCGTTAGCCCTGCAACAGCGAAAAATATCACCAACAGCCAAGCCGACTGCACT
GAGAGATCTCCTGCTGCTATTGGCAAGTACGGCTTGTTCACTTTGTCAATACCAATGTCG
TAGATCTGATTGATGCCAACTATATAACCGTTTCCACATATAAGCGCAAGAAGACCTGAG
AGCGCCTTGAGTACCAGGCTCCATTTAATCAGATGACTGTTCTCTATCAAAGCTCTTGCT
ACCAAGGCAGTGGATCCTAAAGCCGTTCCACGGATGGTATGCGGCCTAAGAAATCTCCAG
CAAGCGTTCTGGAAACGCGCGATTCTATCAAGAACTGGATCGGAACCAGCAGCACCTACC
TGAGAACATGCCCTGATCGAGATTTTTCTGTAGTTAGTTGAAACAAATTTGGACCGCATA
CATGAACTTGATAAGCTCGTGAAGCCAACATCTTGGGACCGGCTTAGAAGCTTCCCAGCT
AAATGCACAGAAGGCCGATGGTGATGATGAGAAGCTGCTAAGAAACGAGGTGATACAGAC
GAGAACCGAAGAGAAGGTGGTTGAGAGATTGAGAGCTCCATTGATGCCACTAGCCACCC

QA 7 725 7 725
DS 



AS 1 3

CO CL2717Contig1 1260 3 15 U
AAAGAAAGAGCAAGAAAATTTGACAAAAAGCGTGAAAAACTGTATGTTGAAAAAAACAAA
ACAGAAAAGATTAGAGGATATAATAAACCAAGGAAAAGACCAAAGACGTAGAACAATGGA
ACTAAGAACATAAAAGCTCACGTGTAATGTAACTGAGGCTGTAAGAAGACTCAACCAAGG
CTTTGAATGTCAGAATCATTCAAGCATGAAGGCGCAATCTTGACCGGCTCAAGTATGAAT
CCCGATTTGCGGCATTCTTCTTCCAGAAGCTTCACCTGAGATGGACCGTCAGGACAGAAA
ACCACCACTGCTCCTCCACTTCCAGTGAACTTTGAAGCTGCACCAACCCTCCTTGCAATT
TCCACCATCTCTATGTTCATCGCTCCTAAGCATTCGTCCCCAAACATCTTCCTCCGAAAG
TCGAAGTTACGGTTCATGAGTTCGAGGAGCTTGGGATGGTCCTTTTTGAGCAATGCAGTT
CGACCTTGTTCTGCTAGGTTTCCAACTTCTTCCATTGATTTAATTATCAACTCATCGCCA
TCTAACCATCTTTGTCGAACCCTACTATGTACCTTGCCGGAGTCGCTAGGATTCTGAGCA
TAGATGAGATGCAAAGGGGGAAGGAGAGTGATATCCATGGGAGTGTAGATCCCATGTCCA
AGTTTATCCATGTGCTCCTTACTAAAATCCATGTGAACAAGACCACCATAGACCTGAGTA
ACTCGGTCCTGAAGACCAGCGACAATGCCAAGTTCTTTCTCAGCATTGAGAACAAGGTTA
GGGCGAACTTGTAGTTTGATGAGATGCCTGACGTTGTAGAAGTCAAGAAGGCAGCTAAGA
GCAGCGGAGACAATGGCGCTGGAACCAGAAAGCCCTGTCTGCCTAGGGATATTGGTGTCG
TAGGAAAGAGAGAAGTTACGGTGATGAAGGTGAATGGAATTATGTTTGCAATAGTTACGG
AACACTTTACAAATTGCCATTAGCAGCCTTACACCACCGTAATACCCTTCATTTTCCAAC
CGTTTCACAAGATGGTCAAGAGAGGTGAATTGGACGAGATCGTGGAATGGATGTGGCTTT
ATTATCATATGTTCCGATGCCTCCAGCTTTACTGACGCCCAGAAGTTTCCTATTGTGAAT
GAGATTGTACGCCCCAAGTATACATCGCTTGGATTCCCCAGAAACCCGATCCGAGCGAAC
GACCTATGCTCGATCGCCGCCGTTGCCGTGGATCTCGGATCCTGATCCATCTTCTCCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C995JQ U 1
AF RS1AP23JQ U 8
AF RS1AP23TFB C 493
BS 1 20 RS1C995JQ
BS 21 21 RS1AP23JQ
BS 22 62 RS1C995JQ
BS 63 63 RS1AP23JQ
BS 64 347 RS1C995JQ
BS 348 348 RS1AP23JQ
BS 349 418 RS1C995JQ
BS 419 419 RS1AP23JQ
BS 420 504 RS1C995JQ
BS 505 505 RS1AP23JQ
BS 506 718 RS1C995JQ
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BS 732 760 RS1AP23JQ
BS 761 1260 RS1AP23TFB

RD RS1C995JQ 731 0 0
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ACGGAAAAGATTAGAGGATATAATAAACCAAGGAAAAGACCAAAGACGTAGAACAATGGA
ACTAAGAACATAAAAGCTCACGTGTAATGTAACTGAGGCTGTAAGAAGACTCAACCAAGG
CTTTGAATGTCAGAATCATTCAAGCATGAAGGCGCAATCTTGACCGGCTCAAGTATGAAT
CCCGATTTGCGGCATTCTTCTTCCAGAAGCTTCACCTGAGATGGACCGTCAGGACAGAAA
ACCACCACTGCTCCTCCACTTCCAGTGAACTTTGAAGCTGCACCAACTCTCCTTGCAATT
TCCACCATCTCTATGTTCATCGCTCCTAAGCATTCGTCCCCAAACATCTTCCTCCGAAGG
TCGAAGTTACGGTTCATGAGTTCGAGGAGCTTGGGATGGTCCTTTTTGAGCAATGCAGTT
CGACCTTGTTCTGCTAGGTTTCCA*CTTCTTCCATTGATTTAATTATCAACTCATCGCCA
TCTAACCATCTTTGTCGAACCCTACTATGTACCTTGCCGGAGTCGCTAGGATTCTGAGCA
TAGATGAGATGCAAAGGGGGAAGGAGAGTGATATCCATGGGAGTGTAGATCCCATGTCCA
AGTTTATCCATGTGCTCCTTACTAAAATCCATGTGAACAAGACCACCATAGACCTGAGCA
ACTCGGTCCTG

QA 1 731 1 731
DS 

RD RS1AP23JQ 753 0 0
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AGATTAGAGGATATAATAAACCAAGGAAAAGACCAAAGACGTAGAACAATGGAACTAAGA
ACATAAAAGCTCACGTGTAATGTAACTGAGGCTGTAAGAAGACTCAACCAAGGCTTTGAA
TGTCAGAATCATTCAAGCATGAAGGCGCAATCTTGACCGGCTCAAGTATGAATCCCGATT
TGCGGCATTCTTCTTCCAGAAGCTTCACCTGAGATGGACCGTCAGGACAGAAAACCACCA
CTGCTCCTCCACTTCCAGTGAACTTTGAAGCTGCACCAACCCTCCTTGCAATTTCCACCA
TCTCTATGTTCATCGCTCCTAAGCATTCGTCCCCTAACATCTTCCTCCGAGAGTCGAAGT
TACGGTTCATGAGTTCGAGGAGCTTGGGATGGTCCTTTTTGAGCAATGCAGTTCGACCTT
GTTCTGCTAGGTTTCCAACTTCTTCCATTGATTTAATTATCAACTCATCGCCATCTAACC
ATCTTTGTCGAACCCTACTATGTACCTTGCCGGAGTCGCTAGGATTCTGAGCATAGATGA
GATGCAAAGGGGGAAGGAGAGTGATATCCATGGGAGTGTAGATCCCATGTCCAAGTTTAT
CCATGTGCTCCTTACTAAAATCCATGTGAACAAGACCACCATAGACCTGAGTAACTCGGT
CCTGAAGACCAGCGACAATGCCAAGTTCTTTCT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1AP23TFB 768 0 0
GCTAGGTTTCCAACTTCTTCCATTGATTTAATTATCAACTCATCGCCATCTAACCATCTT
TGTCGAACCATACTATGTACCTTGCCGGAGTCGCTAGGATTCTGAGCATAGATGAGATGC
AAAGGGGGAAGGAGAGTGATATCCATGGGAGTGTAGATCCCATGTCCAAGTTTATCCATG
TGCTCCTTACTAAAATCCATGTGAACAAGACCACCATAGACCTGAGTAACTCGGTCCTGA
AGACCAGCGACAATGCCAAGTTCTTTCTCAGCATTGAGAACAAGGTTAGGGCGAACTTGT
AGTTTGATGAGATGCCTGACGTTGTAGAAGTCAAGAAGGCAGCTAAGAGCAGCGGAGACA
ATGGCGCTGGAACCAGAAAGCCCTGTCTGCCTAGGGATATTGGTGTCGTAGGAAAGAGAG
AAGTTACGGTGATGAAGGTGAATGGAATTATGTTTGCAATAGTTACGGAACACTTTACAA
ATTGCCATTAGCAGCCTTACACCACCGTAATACCCTTCATTTTCCAACCGTTTCACAAGA
TGGTCAAGAGAGGTGAATTGGACGAGATCGTGGAATGGATGTGGCTTTATTATCATATGT
TCCGATGCCTCCAGCTTTACTGACGCCCAGAAGTTTCCTATTGTGAATGAGATTGTACGC
CCCAAGTATACATCGCTTGGATTCCCCAGAAACCCGATCCGAGCGAACGACCTATGCTCG
ATCGCCGCCGTTGCCGTGGATCTCGGATCCTGATCCATCTTCTCCCCC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 4

CO CL2718Contig1 823 4 8 U
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TAAAAGAAGAGAGAAGAGAGAAAAGAGCGATCTTTGTGGACTACAGTTCTCCGGCCGACG
GAGTGGGCTACCACAGCCACCGTCGGTCCGGTCATGATGTTTCTTCCTTGTTTTATTTCT
TCTGTTGATGTGCGGGGAGGATCTTTGTGCTGCTTCCCAGATGGGTTTTCCGATCAGTGT
CTTTCTAACTCCGGGAGGTGGAGGCTCTCATAGCTCTACCGACGCCGGTTTTGACTCCGG
GGAGTGGTGGTGTATTGCGCCTCACGCCGCCGGCTTTTGTGGATGTCGACCCTTCCTTTC
TGGGTGTGACTCATAGTTCAGGTGCTATTATGGTCTCTAGCGATTTCTCTGTCTTGTCTC
TCGATGAGATCCCGACTTCATCGGTTGAAGCTTTCAGAGGAAGCGCATGCGATGTAAACA
AATATATGGAGGTTTGGGATTTGTAATCCCGTGTTTGGCGGTTGAGGGCTTTGGATGAGA
TCTCGGTGCTTATCGATGGAAGCTCTCTGTGATGGAGCTCAGCCGTGCAAGGTGGTGGTG
ATAGATCGAGTGCGTTTCCGGTGGTGTGCCGCATGGCGGCGGAGGGAAGGATTAGGGTTA
GGGCGTCAAGTGTGTCTGTCGTTCCTTTTGTTGGGCTTCAGTAGTTGGGCTTCGTCCCTT
TGTTATTGGTTCAGTTAATCTGAGTTTTCTTGGACTCTATTGTAACTGTTTTTGGGCTTT
CTGTTTTGAGCCTCAGTTTTTTAATAAAATATTTAGATGGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CL65TF U 41
AF RS1ED24TF U 1
AF RS1ED24JQ C 16
AF RS1CL65JQ C 38
BS 1 507 RS1ED24TF
BS 508 508 RS1CL65TF
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RD RS1CL65TF 606 0 0
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CTACAGTTCTCCGGCCGACGGAGTGGGCTACCACAGCCACCGTCGGTCCGGTCATGATGT
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GGATGTCGACCCTTCCTTTCTGGGTGTGACTCATAGTTCAGGTGCTATTATGGTCTCTAG
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GTTGAGGGCTTTGGATGAGATCTCGGTGCTTATCGATGGAAGCTCTCTGTGATGGAGCTC
AGCCGTGCAAGGTGGTGGTGATAGATCGAGTGCGTTTCCGGTGGTGTGCCGCATGGCGGC
GGAGGG

QA 1 606 1 606
DS 

RD RS1ED24TF 682 0 0
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TAAAAGAAGAGAGAAGAGAGAAAAGAGCGATCTTTGTGGACTACAGTTCTCCGGCCGACG
GAGTGGGCTACCACAGCCACCGTCGGTCCGGTCATGATGTTTCTTCCTTGTTTTATTTCT
TCTGTTGATGTGCGGGGAGGATCTTTGTGCTGCTTCCCAGATGGGTTTTCCGATCAGTGT
CTTTCTAACTCCGGGAGGTGGAGGCTCTCATAGCTCTACCGACGCCGGTTTTGACTCCGG
GGAGTGGTGGTGTATTGCGCCTCACGCCGCCGGCTTTTGTGGATGTCGACCCTTCCTTTC
TGGGTGTGACTCATAGTTCAGGTGCTATTATGGTCTCTAGCGATTTCTCTGTCTTGTCTC
TCGATGAGATCCCGACTTCATCGGTTGAAGCTTTCAGAGGAAGCGCATGCGATGTAAACA
AATATATGGAGGTTTGGGATTTGTAATTCCGTGTTTGGCGGTTGAGGGCTTTGGATGAGA
TCTTGGTGCTTATCGATGGAAGCTCTCTGTGATGGAGCTCAGCCGTGCAAGGTGGTGGTG
ATAGATCGAGTGCGTTTCCGGTGGTGTGCCGCATGGCGGCGGAGGGAAGGATTAGGGTTA
GGGCGTCAAGTGTGTCTGTCGT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1ED24JQ 808 0 0
AAAAAAAGCAAGTCCAGAACTACACAGGTCCATAAGGAGATAATATAAAAGAAGAGAGAA
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GGAGGATCTTTGTGCTGCTTCCCAGATGGGTTTTCCGATCAGTGTCTTTCTAACTCCGGG
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TGCGCCTCACGCCGCCGGCTTTTGTGGATGTCGACCCTTCCTTTCTGGGTGTGACTCATA
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CTTCATCGGTTGAAGCTTTCAGAGGAAGCGCATGCGATGTAAACAAATATATGGAGGTTT
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CTGTCGTTCCTTTTGTTGGGCTTCAGTAGTTGGGCTTCGTCCCTTTGTTATTGGTTCAGT
TAATCTGAGTTTTCTTGGACTCTATTGTAACTGTTTTTGGGCTTTCTTTTTTGAGCCTCA
GTTTTTTAATAAAATATTTAGATGGGAC

QA 1 808 1 808
DS 

RD RS1CL65JQ 771 0 0
CAC
AGGTCCATAAGGAGATAATATAAA*GAAGAGAGAAGAGAGAAAAGAGCGATCTTTGTGGG
CTACAGTTCTCCGGCCGACGGAGTGGGCTACCACAGCCACCGTCGGTCCGGTCATGATGT
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ATGGGTTTTCCGATCAGTGTCTTTCTAACTCCGGGAGGTGGAGGCTCTCATAGCTCTACC
GACGCCGGTTTTGACTCCGGGGAGTGGTGGTGTATTGCGCCTCACGCCGCCGGCTTTTGT
GGATGTCGACCCTTCCTTTCTGGGTGTGACTCATAGTTCAGGTGCTATTATGGTCTCTAG
CGATTTCTCTGTCTTGTCTCTCGATGAGATCCCGATTTCATCGGTTGAAGCTTTCAGAGG
AAGCGCATGCGATGTAAACAAATATATGGAGGTTTGGGATTTGTAATCCCGTGTTTGGCG
GTTGAGGGCTTTGGATGAGATCTCGGTGCTTATCGATGGAAGCTCTCTGTGATGGAGCTC
AGCCGTGCAAGGTGGTGGTGATAGATCGAGTGCGTTTCCGGTGGTGTGCCGCATGGCGGC
GGAGGGAAGGATTAGGGTTAGGACGTCAAGTGTGTCTGTCGTTCCTTTTGTTGGGCTTCA
GTAGTTGGGCTTCGTCCCTTTGTTATTGGTTCAGTTAATCTGAGTTTTCTTGGACTCTAT
TGTAACTGTTTTTGGTCTTTCTGTTTTGAGCCTCAGTTTTTTAATAAA

QA 4 771 4 771
DS 



AS 1 4

CO CL2719Contig1 665 4 3 U
GGAACTCACATCTCTTCTCGCCTCTTTTCCTTTAACAAATTATTTGGAATCTAACAAATT
TCAAACTGATTGTTAAGGGAAAATTGAGCTCTATAGTCATGGCAAAGATCTCTTTATTGC
TTTTGGTCCTTGTCCTTTTCGCCTTTCTCCACGCTTATGAAGCTCACCGCATTGGAAAAT
TCGATGAAGGACTTCAAAAAGACTTGCAAGCCGAGGCCATGATGGAGGAAGACTTGAAGG
CCAAGAAAACGAGCATTCAAGGTTTGAATTCTGAGATGAAAACGTTGAGCAAATCCGAAC
AGACGCTGAAACAACTTGGAAATGATTACAAAAAGGATACGGATGCAGCGCCTTACGGAA
AGAAACTCAAAAAATTCAGCAGGTTAGTAAAAGCCAAGGGAGTACTTGGGAAAAAAAAGA
AATCTGCATCCGTAATCCAAAAGATCTTAAAGGATCTTGGGCTAAACGGAGGGAGGGAAT
GACAAAAGATAACCCTTAGGGTTTGATTACTATTCAAAGAAGGTTTGAACTCGTTCATTG
AGTTTAGCTTTACAAGTGAGAGGAGAAAATAATTTCCCCCATAGTATACTAGTTGCATTA
TAATGTAATTAATATTGTTAAATGAAATATTACTACTTATGATATCATAATATGTTTCTA
TGCGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 

AF RS1AM35TF U 6
AF RS1B755TF U 6
AF RS1EL40TF U 1
AF RS1EL40JQ C 279
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BS 251 251 RS1AM35TF
BS 252 665 RS1EL40TF

RD RS1AM35TF 638 0 0
GG
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T

QA 3 637 3 637
DS 

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GG
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GATTGTTAAGGGAAAATTGAGCTCTATAGTCATGGCAAAGATCTCTTTATTGCTTTTGGT
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GAAACAACTTGGAAATGATTACAAAAAGGATACGGATGAAGCGCCTTACGGAAAGAAACT
CAAAAAATTCAGCAGGTTAGTAAAAGCCAAGGGAGTACTTGGGAAAAAAAAGAAATCTGC
ATCCGTAATCCAAAAGATCTTAAAGGATCTTGGGCTAAACGGAGGGAGGGAATGACAAAA
GATAACCCTTAGGGTTTGATTACTATTCAAAGAAGGTTTGAACTTGTTCATTGAGTTTAG
CTTTACAAGTGAGAGGAGAAAATAATTTCCCCCATAGTATACTAGTTGCATTATAATGTA
ATTAATATTGTTAAATGAA*TATTACTACTTATGA

QA 3 637 3 637
DS 

RD RS1EL40TF 665 0 0
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TCAAACTGATTGTTAAGGGAAAATTGAGCTCTATAGTCATGGCAAAGATCTCTTTATTGC
TTTTGGTCCTTGTCCTTTTCGCCTTTCTCCACGCTTATGAAGCTCACCGCATTGGAAAAT
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GACAAAAGATAACCCTTAGGGTTTGATTACTATTCAAAGAAGGTTTGAACTCGTTCATTG
AGTTTAGCTTTACAAGTGAGAGGAGAAAATAATTTCCCCCATAGTATACTAGTTGCATTA
TAATGTAATTAATATTGTTAAATGAAATATTACTACTTATGATATCATAATATGTTTCTA
TGCGA

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DS 

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GGGCTAAACGGAGGGAGGGAATGACAAAAGATAACCCTTAGGGTTTGATTACTATTCAAA
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CCATAGTATACTAGTTGCATTATAATGTAATTAATATTGTTAAATGAAATATTACTACTT
ATGATATCATAATATGTTTCTATGCGA

QA 1 387 1 387
DS 



AS 1 4

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AAATTCC


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 

AF RS1F305JQ C 1
AF RS1F305TF U 1
AF RS1CG17JQ C 1
AF RS1CG17TF U 1
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BS 681 722 RS1CG17TF
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RD RS1F305JQ 622 0 0
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ATCTCAAGATTTGTTCTTATT
G

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DS 

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ATCGATTTTCTAGCAATATAATTTGGGGATTCAGATTTGATTCTACAATTGCGGGATTAT
ATCTCAAGATTTGTTCTTATT
G

QA 1 621 1 621
DS 

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AAATTCC

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1CG17TF 726 0 0
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GACATATTCGAGAAACTGGCGCAGGAATCTTCGAAGCTCGCTAGGTACAACAAGAAGCCG
ACGATCACGTCGAGGGAGATCCAGACGGCGGTTAGGCTCGTGTTGCCCGGAGAGCTCGCG
AAGCACGCCGTCTCTGAGGGGACCAAGGCGGTTACCAAATTCACAAGCACTTAGGGTTTG
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ATCTCAAGATTTGTTCTTATTATGTTTCTGAAATCTCTTGCTATTCTCTTGGTTTGTTTC
ATGATCCCACTGGGAGGTT*CTGTAACGGTTTGAACAGACTATCCTGCTATTGGGCTTTA
AA
TTCC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 3

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TCAGCACTCTTATAAT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D973JQ U 5
AF RS1CR19JQ U 1
AF RS1CR19TF C 97
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QA 1 512 1 512
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TATTATTAATCATATACATATTTCCCCATGAACATATATAATATCAAGGAGAGAAGTGAT
CATCAGGATCTCCATGGCAATCCACCTTACACTTCTCCTTATTGCTCGACGAAAACACAA
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QA 1 652 1 652
DS 

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TTCGTAGTGTTTGTACAGCTAAGATGTTCTTCTTATCGTTGTCCTTCATGATGGCGGCAA
CCCAAGATCGACGAGCACGAGAATTAGTCCCGACGATGGTAGAGAAAGGTTCGGTTCGAA
CTTTATACCACAGGTAGATGTGGTAACTAAACATCAAAAGTAGAGCACATGGAACAAGAA
CTGCATCTAAGTACCATTTCCTCCACTCCATTTCTATGCAATAATGATCTTCTCTTTCTT
TCTGGCTCTTTTTTTTTGTTGTCTTCAGCACTCTTATAAT

QA 1 880 1 880
DS 



AS 1 3

CO CL2722Contig1 857 3 7 U
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GCATAAGAGCAGCAAAGGCGCAGAACTTGTAACGACCTCTTCCAAACAAGACCGAATCGG
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TCTCAACGGTTTTATTTAACATACTCTAATCAATCACTTTGCGTGGTGGTGAGGATTAGA
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AGTACACACTCTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EL48JQ U 1
AF RS1BG53JQ U 93
AF RS1EL48TF C 260
BS 1 326 RS1EL48JQ
BS 327 327 RS1BG53JQ
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RD RS1EL48JQ 665 0 0
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GACGACTGTTAGTGTACACATCCCAAATATGCTTCACCACTTTCTCCCTCTCCTCCATTT
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GCATAAGAGCAGCAAAGGCGCAGAACTTGTAACGACCTCTTCCAAACAAGACCGAATCGG
AGCTA

QA 1 665 1 665
DS 

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C
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CTGGCTTGTGTAGAATCTTCTTGAAGCTTCTTCCCAGTTCCCTTGCACTCATTGATCGGG
TAGGAGTTGGATCAAGAGAAATTTTCTGAGCCACCGACATCTTGGCGATTTCAGAAATTG
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TTTGCCAGAACTCAGGCAACTTGATCCGACGACTGTTAGTGTACACATCCCAAATATGCT
TCACCACTTTCTCCCTCTCCTCCATTTCCAGAACGTCGAGATTCTCATGGTTTGTTGGGA
TCCCGATATCTTCCGATAACCGGTTTAAATTTTCAGTGGATAACCGGAAAGTGACTGTAC
CGGTGAACATCGACCAAAAAGCAAGAAGCATAAGAGCAGCAAAGGCGCAGAACTTGTAAC
GACCTCTTCCAAACAAGACCGAATCGGAGCTATCCCTCTTCGGATTTGTCGCCGTCGCCG
GCAAGACATCGTCCTCCTTCATCTCGATCTCAACGGTTTTATTTAACATACTCTAATCAA
TCACTTTGCGTGGTGGTGAGGATTAGAGC

QA 2 690 2 690
DS 

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GATTTCAGAAATTGCAGCGTCTCTAACCCCAGGAACATCACTGGTAAGTTCTTCGTAAGC
AGCAACAAACGCCTTTTGCCAGAACTCAGGCAACTTGATCCGACGACTGTTAGTGTACAC
ATCCCAAATATGCTTCACCACTTTCTCCCTCTCCTCCATTTCCAGAACGTCGAGATTCTC
ATGGTTTGTTGGGATCCCGATATCTTCCGATAACCGGTTTAGATTTTCAGTGGATAACCG
GAGAGTGACTGTACCGGTGAACATCGACCAAAAAGCAAGAAGCATAAGAGCAGCAAAGGC
GCAGAACTTGTAACGACCTCTTCCAAACAAGACCGAATCGGAGCTATCCTTCTTCGGATT
TGTCGCCGTCGCCGGCAAGACATCGTCCTCCTTCATCTCGATCTCAACGGTTTTATTTAA
CATACTCTAATCAATCACTTTGCGTGGTGGTGAGGATTAGAGCAAAAACCTGAGCTCAGT
TTCAGTACATTCAGTGTCGGCTCGATTTTGATCTGAGCACAAGTACACACTCTCTCCC

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 4

CO CL2723Contig1 967 4 4 U
TTTTTGTTTTCTTCTTCCTCTGCGTGATTTCTCGATAGATTCTAGGGTTTCTATCTGGGA
ACACTTTCGCTTCCTGGGTTCTCTTGATCTAGGAGGGTTAAGCATATAAAAAGTCTGTAT
CTTTCGTCGAATAAAAGATGTATGCTGATAGATTGGAGTCAGAGTCTGGAACCAGGAAAC
TCGTAAAGGATCGAATCAATGGCGGTTCTAGCGACAACTCTACTCCCTCCCGAAAAGTGA
CTGGGAAAAGGCAAAGGCAGGAAGATGACAAATGGGAGCATGATCTTTTCAGTAGTGACA
AGCCTCAACTCTCAAATCGCAGAGTTGATTCTAGAGACCTTCGCGTGAAGCTCCAGAAGA
GACATCATGTGTCTCAAGGCGGGCGAGAAGGTGGCTCAGGCGTGCGGGATTTAAGGGAAA
AGCTCTCTGGGACAATGAATACGCAACACCCGCCAAAATCGAAAGTGGAGACTGCTAGAC
CAAGCTTGAAGAGTGTAGTGACTGAAACTGCAACAGAGACTACTAGAAAAACTCCCAGTC
AAGCTACCAGGAAGAAATCGCAGCAGATGGGCGCATCTGTTGATAACTTTCTGGAATCAT
TGGGTCTTGAGAAATATTCAACAGCTTTTCAAGTAGAAGAAGTTGATATGGATGCTCTCA
TGCATATGACAGATGATGACCTCAAGGCTATGCTTATACCAATGGGCCCGAGGAAGAAGA
TACTTCTTGCTTTGGGATCCAAACGCTAATAGTTTAGTGTCTTTCGCTTGATGGCTTTCA
AGCTTAGCTGAACGGTCTCAGTCTACATTAAGATATTGTCGAAATTATTCCGGATTTGGC
TTTATTTTTTTCTCGTATTCTTTCAAGAAGGTCAGAATTTTGGTGGTTGACATGTGTAAT
GTTAAATATAGTGTGACAAACACTACCAGTTTGCACCACTTTTGATGTGAGATAAGTTTC
TAAGTAC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1ET39TF U 1
AF RS1BI50TF U 4
AF RS1ET39JQ C 221
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TGGGTCTTGAGAAATATTCAACAGCTTTTC

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DS 

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GG
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AAGGATCGAATCAATGGCGGTTCTAGCGACAACTCTACTCCCTCCCGAAAAGTGACTGGG
AAAAGGCAAAGGCAGGAAGATGACAAATGGGAGCATGATCTTTTCAGTAGTGACAAGCCT
CAACTCTCAAATCGCAGAGTTGATTCTAGAGACCTTCGCGTGAAGCTCCAGAAGAGACAT
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TCTGGGACAATGAATACGCAACACCCGCCAAAATCGAAAGTGGAGACTGCTAGACCAAGC
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CTTGAGAAATATTCAACAGCTTTTCAAGTAGAAGAAGTTGATATGGATGCTCTCATGCAT
ATGACAGATGATGACCT

QA 3 679 3 679
DS 

RD RS1ET39JQ 747 0 0
TACTCCC
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TTCAGTAGTGACAAGCCTCAACTCTCAAATCGCAGAGTTGATTCTAGAGACCTTCGCGTG
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AAAACTCCCAGTCAAGCTACCAGGAAGAAATCGCAGCAGATGGGCGCATCTGTTGATAAC
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ATGGATGCTCTCATGCATATGACAGATGATGACCTCAAGGCTATGCTTATACCAATGGGC
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TGAGATAAGTTTCTAAGT
TC

QA 8 745 8 745
DS 

RD RS1BI50JQ 740 0 0
TCCCGAAAAGTGACTGGGAAAAGGCAAAGGCAGGAAGATGACAAATGGGAGCATGATCTT
TTCAGTAGTGACAAGCCTCAACTCTCAAATCGCAGAGTTGATTCTAGAGACCTTCGCGTG
AAGCTCCAGAAGAGACATCATGTGTCTCAAGGCGGGCGAGAAGGTGGCTCAGGCGTGCGG
GATTTAAGGGAAAAGCTCTCTGGGACAATGAATACGCAACACCCGCCAAAATCGAAAGTG
GAGACTGCTAGACCAAGCTTGAAGAGTGTAGTGACTGAAACTGCAACAGAGACTACTAGA
AAAACTCCCAGTCAAGCTACCAGGAAGAAATCGCAGCAGATGGGCGCATCTGTTGATAAC
TTTCTGGAATCATTGGGTCTTGAGAAATATTCAACAGCTTTTCAAGTAGAAGAAGTTGAT
ATGGATGCTCTCATGCATATGACAGATGATGACCTCAAGGCTATGCTTATACCAATGGGC
CCGAGGAAGAAGATACTTCTTGCTTTGGGATCCAAACGCTAATAGTTTAGTGTCTTTCGC
TTGATGGCTTTCAAGCTTAGCTGAACGGTCTCAGTCTACATTAAGATATTGTCGAAATTA
TTCCGGATTTGGCTTTATTTTTTTCTCGTATTCTTTCAAGAAGGTCAGAATTTTGGTGGT
TGACATGTGTAATGTTAAATATAGTGTGACAAACACTACCAGTTTGCACCACTTTTGATG
TGAGATAAGTTTCTAAGTAC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 4

CO CL2724Contig1 811 4 8 U
CAACGTTCATCTATAACTCCAATAAATACAGCTAATTATAGATTTACGTAACTTGAACTG
AAGCCAAAAACAAGCATCTTCAGTTTTGTTTTTTTTT*ATCACTTTTGAGTAGACAACTA
CAAAAACACAATTACAAAACTCACACATCTTCCAACATACTTACAGTTCTTGTTGGTGAC
TCTCTCTCTTACGCAATAGACAAAACCCCCAACTCTGCCCACCAAAGAGGCGATAGTGAC
GGTGTCGCATCGCTAGGTGAGATGCCCGTAATCTCCCGTAACCATCCAGTGACTTCTTTC
ATTGTAGGTCTCTCTTTCGGGTCGGTTCTAATGCATGACTTGATCACCTCACCTATATTC
TCAATCTTGTCATCACAAGACTCCAGCGCTGGATCAACCATCTTGGCTAGACTCTCTCCT
CTCAAGAAATCAACTAGCCCGGTATCTACCGAGTCTGGTTTGTTAACCGAGTCCACGAGT
TTCCCGGTTATCATTTCGAATAATAGTAAACCGAAGCTGTAAACATTGTCTGAGATGTCT
GTGTCTTTGTTTGCGTTGTTGCACGTCTCTGTCTCGGACGGACCAAAACTGAAGTCAGCT
AGTTTTACAGCGTAATCTTCAGTGAGGTGAAGTGATGATGAGACGAGGTTTGTGTGAGCT
ATCGGTGGGCTGAGTTGGTGCATATGGTCAAGGCAATATGTTAACCCCATTAAGATTCTT
AACCTCATTCCCCAGTCCAAGTGTTCTGATTCTTTACTGTGTAGATGTTCAAAGAGTGAA
CCGTTTGGAGCATATTCAAAGATCAAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H234JQB U 1
AF RS1D891JQ U 24
AF RS1H234TF C 28
AF RS1D891TF C 98
BS 1 198 RS1H234JQB
BS 199 199 RS1D891JQ
BS 200 207 RS1H234JQB
BS 208 208 RS1D891JQ
BS 209 374 RS1H234JQB
BS 375 782 RS1D891JQ
BS 783 792 RS1H234TF
BS 793 811 RS1D891TF

RD RS1H234JQB 374 0 0
CAACGTTCATCTATAACTCCAATAAATACAGCTAATTATAGATTTACGTAACTTGAACTG
AAGCCAAAAACAAGCATCTTCAGTTTTGTTTTTTTTT*ATCACTTTTGAGTAGACAACTA
CAAAAACACAATTACAAAACTCACACATCTTCCAACATACTTACAGTTCTTGTTGGTGAC
TCTCTCTCTTACGCAATAAACAAAACCTCCAACTCTGCCCACCAAAGAGGCGATAGTGAC
GGTGTCGCATCGCTAGGTGAGATGCCCGTAATCTCCCGTAACCATCCAGTGACTTCTTTC
ATTGTAGGTCTCTCTTTCGGGTCGGTTCTAATGCATGACTTGATCACCTCACCTATATTC
TCAATCTTGTCATC

QA 1 374 1 374
DS 

RD RS1D891JQ 759 0 0
AAATACAA
CTAATTATAGATTTACGTAACTTGAACTGAAGCCAAAAACAAGCATCTTCAGTTTTGTTT
TTTTTTTATCACTTTTGAGTAGACAACTACAAAAACACAATTACAAAACTCACACATCTT
CCAACATACTTACAGTTCTTGTTGGTGACTCTCTCTCTTACGCAATAGACAAAACCCCCA
ACTCTGCCCACCAAAGAGGCGATAGTGACGGTGTCGCATCGCTAGGTGAGATGCCCGTAA
TCTCCCGTAACCATCCAGTGACTTCTTTCATTGTAGGTCTCTCTTTCGGGTCGGTTCTAA
TGCATGACTTGATCACCTCACCTATATTCTCAATCTTGTCATCACAAGACTCCAGCGCTG
GATCAACCATCTTGGCTAGACTCTCTCCTCTCAAGAAATCAACTAGCCCGGTATCTACCG
AGTCTGGTTTGTTAACCGAGTCCACGAGTTTCCCGGTTATCATTTCGAATAATAGTAAAC
CGAAGCTGTAAACATTGTCTGAGATGTCTGTGTCTTTGTTTGCGTTGTTGCACGTCTCTG
TCTCGGACGGACCAAAACTGAAGTCAGCTAGTTTTACAGCGTAATCTTCAGTGAGGTGAA
GTGATGATGAGACGAGGTTTGTGTGAGCTATCGGTGGGCTGAGTTGGTGCATATGGTCAA
GGCAATATGTTAACCCCATTAAGATTCTTAACCTCATTCCCCAGTCCAAGTGTTCTGATT
CTTTACTGTGTAGATGTTCAAAGAGTGAACC

QA 9 759 9 759
DS 

RD RS1H234TF 766 0 0
ACAG
CTAATTATAGATTTACGTAACTTGAACTGAAGCCAAAAACAAGCATCTTCAGTTTTGTTT
TTTTTT*ATCACTTTTGAGTAGACAACTACAAAAACACAATTACAAAACTCACACATCTT
CCAACATACTTACAGTTCTTGTTGGTGACTCTCTCTCTTACGCAATAGACAAAACCTCCA
ACTCTGCCCACCAAAGAGGCGATAGTGACGGTGTCGCATCGCTAGGTGAGATGCCCGTAA
TCTCCCGTAACCATCCAGTGACTTCTTTCATTGTAGGTCTCTCTTTCGGGTCGGTTCTAA
TGCATGACTTGATCACCTCACCTATATTCTCAATCTTGTCATCACAAGACTCCAGCGCTG
GATCAACCATCTTGGCTAGACTCTCTCCTCTCAAGAAATCAACTAGCCCGGTATCTACCG
AGTCTGGTTTGTTAACCGAGTCCACGAGTTTCCCGGTTATCATTTTGAATAATAGTAAAC
CGAAGCTGTAAACATTGTCTGAGATGTCTGTGTCTTTGTTTGCGTTGTTGCACGTCTCTG
TCTCGGACGGACCAAAACTGAAGTCAGCTAGTTTTACAGCGTAATCTTCAGTGAGGTGAA
GTGATGATGAGACGAGGTTTGTGTGAGCTATCGGTGGGCTGAGTTGGTGCATATGGTCAA
GGCAATATGTTAACCCCATTAAGATTCTTAACCTCATTCCCCAGTCCAAGTGTTCTGATT
CTTTACTGTGTAGATGTTCAAAGAGTGAACCGTTTGGAGCA
C

QA 5 765 5 765
DS 

RD RS1D891TF 714 0 0
TTATCAC
TTTGAGTAGACAACTACAAAAACACAATTACAAAACTCACACATCTTCCAACATACTTAC
AGTTCTTGTTGGTGACTCTCTCTCTTACGCAATAGACAAAACCCCCAACTCTGCCCACCA
AAGAGGCGATAGTGACGGTGTCGCATCGCTAGGTGAGATGCCCGTAATCTCCCGTAACCA
TCCAGTGACTTCTTTCATTGTAGGTCTCTCTTTCGGGTCGGTTCTAATGCATGACTTGAT
CACCTCACCTATATTCTCAATCTTGTCATCACAAGACTCCAGCGCTGGATCAACCATCTT
GGCTAGACTCTCTCCTCTCAAGAAATCAACTAGCCCGGTATCTACCGAGTCTGGTTTGTT
AACCGAGTCCACGAGTTTCCCGGTTATCATTTCGAATAATAGTAAACCGAAGCTGTAAAC
ATTGTCTGAGATGTCTGTGTCTTTGTTTGCGTTGTTGCACGTCTCTGTCTCGGACGGACC
AAAACTGAAGTCAGCTAGTTTTACAGCGTAATCTTCAGTGAGGTGAAGTGATGATGAGAC
GAGGTTTGTGTGAGCTATCGGTGGGCTGAGTTGGTGCATATGGTCAAGGCAATATGTTAA
CCCCATTAAGATTCTTAACCTCATTCCCCAGTCCAAGTGTTCTGATTCTTTACTGTGTAG
ATGTTCAAAGAGTGAACCGTTTGGAGCATATTCAAAGATCAAGATCC

QA 8 714 8 714
DS 



AS 1 2

CO CL2725Contig1 209 2 1 U
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CTTACATTATTCTTATTATTACATCTTCAAACACTTTAAACAAAGTTCACCTCGTTTGAA
TCTGAAAACAGGCATTCATGCCCACTTTGTTTGGGTCTGTTTGGCTTCAATATCCTTGAG
TCTGAAAGTGACGGCTCTCTTGTGTGCAT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E438JQ U 1
AF RS1FW70JQ U 1
BS 1 209 RS1E438JQ

RD RS1E438JQ 209 0 0
GAAAGGATTCAAATTTCAATAATGAAAAAAAATCCAAATTATGACAAGAGTGTAACATCT
CTTACATTATTCTTATTATTACATCTTCAAACACTTTAAACAAAGTTCACCTCGTTTGAA
TCTGAAAACAGGCATTCATGCCCACTTTGTTTGGGTCTGTTTGGCTTCAATATCCTTGAG
TCTGAAAGTGACGGCTCTCTTGTGTGCAT

QA 1 209 1 209
DS 

RD RS1FW70JQ 203 0 0
GAAA
GGATTCAAATTTCAATAATGAAAAAAAATCCAAATTATGACAAGAGTGTAACATCTCTTA
CATTATTCTTATTATTACATCTTCAAACACTTTAAACAAAGTTCACCTCGTTTGAATCTG
AAAACAGGCATTCATGCTCACTTTGTTTGGGTCTGTTTGGCTTCAATATCCTTGAGTCTG
AAAGTGACGGCTCTCTTGT

QA 5 203 5 203
DS 



AS 1 3

CO CL2726Contig1 752 3 15 U
CGAAACATAAATATAAGTCTTGAAAATTAAAACTGAACACACATCAGAGCAAGTGTATTT
GTTCTTAACAAACACAAAAGAGATTCCGAAGTCTTA*CAAACACAGATTAGTAAAAGACT
AGATGATAAGAGTTTTCAAACACACATCAGTTTAAGAAGACTGAAACATTGGAGGAACTG
TGCATAATGTTTTGTTTTGAGCCTC**AATCTTTGTTCTTCGATTTCTCCACTGCACTTG
GAGCTAAACCAATAGAATCAGAGCCCCTCATGATCTTCAATTTCCTACACGTTTCAGTAA
ATATCTCCCAAGGGACATCTCCAACAAGCATCCAGTCACCATCTTTGTCTTCATAAGTAA
GCACAAACTCTGATCTGTGAAGAAGATCCTTCAACTTCACCTCACTCATTCTTTCCTTCC
CATGAGCTCCATGAAGTCCACATTGACCAAGAGTGAAGCAGCTGAACATCTTCTCAAGTG
CAGAAGACAAGTGTTGATAGCAAGTGTAGGTTCCCAAATCAACTTTCCTCAGATAGGGAG
CACCATCCATGCTCACCTTCACAAACAGAGCGCCGAGACCAGGTTTCCCATCAACCTCAT
TAGTGTTCTTGGAAGTAGAAGAAGCCATTGTGTTCTTCCTGAAGGATCTGATTGGAGGCC
AACCAACAACCTGTGCCTTGGCAGCAGGTGCATTGTTGGAGCCACTCTTAGCAAGATATC
CTCTTTTGTTGCCTGAAGCGGAATGGTCTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GP95JQ U 15
AF RS1GP95TF C 15
AF RS1BT35JQ U 1
BS 1 65 RS1BT35JQ
BS 66 66 RS1GP95JQ
BS 67 71 RS1BT35JQ
BS 72 72 RS1GP95JQ
BS 73 96 RS1BT35JQ
BS 97 97 RS1GP95JQ
BS 98 126 RS1BT35JQ
BS 127 127 RS1GP95JQ
BS 128 205 RS1BT35JQ
BS 206 207 RS1GP95JQ
BS 208 243 RS1BT35JQ
BS 244 244 RS1GP95JQ
BS 245 266 RS1BT35JQ
BS 267 267 RS1GP95JQ
BS 268 752 RS1BT35JQ

RD RS1GP95JQ 283 0 0
GG
GTCTTGAAAATTAAAACTGAACACACATCAGAGCAAGTGTATTTGTTCTTAACAAACACA
AAAGAGATTCCGAAGTCTTA*CAAACACAGATTAGTAAAAGACTAGATGATAAGAGTTTT
CAAACACACATCAGTTTAAGAAGACTGAAACATTGGAGGAACTGTGCATAATGTTTTGTT
TTGAGCCTC**AATCTTTGTTCTTCGATTTCTCCACTGCACTTGGAGCTAAACCAATAGA
ATCAGAGCCCCTCATGATCTTCAATTTCCTACACGTTTCA
C

QA 3 282 3 282
DS 

RD RS1GP95TF 283 0 0
GG
GTCTTGAAAATTAAAACTGAACACACATCAGAGCAAGTGTATTTGTTCTTAACAAACACA
AAAGAGATTCCGAAGTCTTA*CAAACACAGATTAGTAAAAGACTAGATGATAAGAGTTTT
CAAACACACATCAGTTTAAGAAGACTGAAACATTGGAGGAACTGTGCATAATGTTTTGTT
TTGAGCCTC**AATCTTTGTTCTTCGATTTCTCCACTGCACTTGGAGCTAAACCAATAGA
ATCAGAGCCCCTCATGATCTTCAATTTCCTACACGTTTCA
C

QA 3 282 3 282
DS 

RD RS1BT35JQ 752 0 0
CGAAACATAAATATAAGTCTTGAAAATTAAAACTGAACACACATCAGAGCAAGTGTATTT
GTTCTAAACAAGCACAAAAGAGATTCCGAAGTCTTAACAAACACAGATTAGTAAAAGACT
AGATGACAAGAGTTTTCAAACACACATCAGTTTAAGAAGACTGAAACATTGGAGGAACTG
TGCATAATGTTTTGTTTTGAGCCTCTCAATCTTTGTTCTTCGATTTCTCCACTGCACTTG
GAGTTAAACCAATAGAATCAGAGCCCTTCATGATCTTCAATTTCCTACACGTTTCAGTAA
ATATCTCCCAAGGGACATCTCCAACAAGCATCCAGTCACCATCTTTGTCTTCATAAGTAA
GCACAAACTCTGATCTGTGAAGAAGATCCTTCAACTTCACCTCACTCATTCTTTCCTTCC
CATGAGCTCCATGAAGTCCACATTGACCAAGAGTGAAGCAGCTGAACATCTTCTCAAGTG
CAGAAGACAAGTGTTGATAGCAAGTGTAGGTTCCCAAATCAACTTTCCTCAGATAGGGAG
CACCATCCATGCTCACCTTCACAAACAGAGCGCCGAGACCAGGTTTCCCATCAACCTCAT
TAGTGTTCTTGGAAGTAGAAGAAGCCATTGTGTTCTTCCTGAAGGATCTGATTGGAGGCC
AACCAACAACCTGTGCCTTGGCAGCAGGTGCATTGTTGGAGCCACTCTTAGCAAGATATC
CTCTTTTGTTGCCTGAAGCGGAATGGTCTTTG

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 4

CO CL2727Contig1 802 4 46 U
GGGCCATCAATAATTTGACAAAACAAAACTCCTTCCACTCTGTTTCAAGCTGTCAGCAAA
ATGTCTTCTTCTTCCCCATAACGAAACAAACAGATCAGCAAGACAAAAATAAAAAAGAAG
AATCCTAATCGTGAGTTCTGAAACAGAACGAAATGATTCGTTTAGTTCAAGTAGCGATTC
TCTGTCTCTCCATCGCCGCCGTGATCTCGATCTCCACCACCGATGACGAGTCTATATACG
AGATCCTCAAGGAGAACGGATTGCCGTCAGGTATATTCCCTAAAGGCGTGACGGAGTTCA
ACTTCGACGTCAAAACGGGACGGTTCTCTGTTTATTTGAACCGCCCCTGCGATGCCAAGT
ACGAGACAGAGCTGCGCTACGAGGCGAATGTTACGGGGACGATAAGCGACGCTCACATCG
GTGATTTGTCGGGGATATCGGCGCAAGACCTGTTCCTGTGGTTTCCGGTTAAAGGAATCA
GAGTCGACGTGCCGAGCTCTGGCCTTATATACTTCGACGTTGGTGTTGTCCGCAAGCAAT
ACTCGCTGTCTTTGTTCGATACTCCTAGAGATTGCGTTGCGGTTCGCGGTGAAAATGAGG
TTCAGGCTTCTATGTTGTCATTGTATCAAGTAGATGAAACTACTGGGAGAAACATTATCT
AGCCGGAGAGTTTTAAGAAATGTCTTCATATACTATACCAGAAAGATAGACAGATGTTCT
CATCAATTCTTGAAAATACTTTGTACTGTTTTTTTGGTCTCAAATCTTAAAGCATGATTC
AAGGTCAAATGCTTCCCATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 0 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A679TF U 1
AF RS1FO93TF U 47
AF RS1FO93JQ C 80
AF RS1A679JQ C 257
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BS 102 109 RS1A679TF
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BS 785 796 RS1A679TF
BS 797 802 RS1A679JQ

RD RS1A679TF 801 0 0
GGGCCATCAATAATTTGACAAAACAAAACTCCTTCCACTCTGTTTCAAGCTGTCAGCAAA
ATGTCTTCTTCTTCCTCATAACGAAACAAACAGATCAGCACGACAAAAA***AGAAGAAG
AATCCTAATCGTGAGTTCTCAAACAGAACG**ATGATTCATATTGTTCAAGTAGTGATTC
TCTGTCTCTCCATCGCCGCCGTGATCTCGATCTCCACCGCCGATGACGAGTCTATATACG
AGATCCTCAAGGAGAACGGATTGCCTTCTGGTATATTCCCTAAAGGCGTGACGGAGTTCA
ACTTCGACGTCAAAACGGGACGGTTCTCTGTTTATTTGAACCGCCCCTGCGATGCCAAGT
ACGAGACGGAGCTGCGCTACGAGGCGAATGTTACGGGGACGATAAGTGACGCTCACATCG
GTGATTTGTCGGGGATATCGGCGCAAGACCTGTTCCTGTGGTTTCCGGTTAAAGGAATCA
GAGTCGACGTGCCGAGCTCTGGCCTTAT*TACTTCGACGTTGGTGTTGTTCGCAAGCAAT
ACTCGCTGTCTTTGTTCGATACTCCTAGAGATTGCGTTGCGGTTCGCGGTGAAAATGAGG
TTCAGGCTTCTATGTTGTCATTGTATCAAGTAGATGAAACTACTGGGAGAAATATTATCT
AGC**GAGATTTTTAAGAAATGTCTTCATATACTATACCAGAAAGATAGACAGATGTTCT
CATCAATTCTTGAAA*TACTTTGTACTGTTTTTTTGGTCTCAAATCTTAAAGCATGATTC
AAG*TCAAATGCTTCC
ATTCC

QA 1 796 1 796
DS 

RD RS1FO93TF 742 0 0
GGGTCAGCAAAATGTCT
TCTTCTTCTTCCCCATAACGAAACAAACAGATCAGCAAGACAAAAATAAAAAAGAAGAAT
CCTAATCGTGAGTTCTGAAACAGAACGAAATGATTCGTTTAGTTCAAGTAGCGATTCTCT
GTCTCTCCATCGCCGCCGTGATCTCGATCTCCACCACCGATGACGAGTCTATATACGAGA
TCCTCAAGGAGAACGGATTGCCGTCAGGTATATTCCCTAAAGGCGTGACGGAGTTCAACT
TCGACGTCAAAACGGGACTGTTCTCTGTTTATTTGAACCGCCCCTGCGATGCCAAGTACG
AGACAGAGCTGCGCTACGAGGCGAATGTTACGGGGACGATAAGCGACGCTCACATCGGTG
ATTTGTCGGGGATATCGGCGCAAGACCTGTTCCTGTGGTTTCCGGTTAAAGGAATCATAG
TCGACGTGCCGAGCTCTGGCCTTATATACTTCGACGTTGGTGTTGTCCGCAAGCAATACT
CGCTGTCTTTGTTCGATACTCCTAGAGATTGCGTTGCGGTTCGCGGTGAAAATGAGGTTC
AGGCTTCTATGTTGTCATTGTATCAAGTAGATGAAACTACTGGGAGAAACATTATCTAGC
CGGAGAGTTTTAAGAAATGTCTTCATATACTATACCAGAAAGATAGACAGATGTTCTCAT
CAATTCTTGAAA*TACTTTGTACTGTTTTTTTG*TCTCAAATCTTAAAGCATGATTCAAG
GGCAA

QA 18 737 18 737
DS 

RD RS1FO93JQ 707 0 0
AACGAAACAAACAGATCAGCAAGACAAAAATAAAAAAGAAGAATCCTAATCGTGAGTTCT
GAAACAGAACGAAATGATTCGTTTAGTTCAAGTAGCGATTCTCTGTCTCTCCATCGCCGC
CGTGATCTCGATCTCCACCACCGATGACGAGTCTATATACGAGATCCTCAAGGAGAACGG
ATTGCCGTCAGGTATATTCCCTAAAGGCGTGACGGAGTTCAACTTCGACGTCAAAACGGG
ACTGTTCTCTGTTTATTTGAACCGCCCCTGCGATGCCAAGTACGAGACAGAGCTGCGCTA
CGAGGCGAATGTTACGGGGACGATAAGCGACGCTCACATCGGTGATTTGTCGGGGATATC
GGCGCAAGACCTGTTCCTGTGGTTTCCGGTTAAAGGAATCATAGTCGACGTGCCGAGCTC
TGGCCTTATATACTTCGACGTTGGTGTTGTCCGCAAGCAATACTCGCTGTCTTTGTTCGA
TACTCCTAGAGATTGCGTTGCGGTTCGCGGTGAAAATGAGGTTCAGGCTTCTATGTTGTC
ATTGTATCAAGTAGATGAAACTACTGGGAGAAACATTATCTAGCCGGAGAGTTTTAAGAA
ATGTCTTCATATACTATACCAGAAAGATAGACAGATGTTCTCATCAATTCTTGAAAATAC
TTTGTACTGTTTTTTTTGTCTCAAATCTTAAAGCATGATTCAAG
GGC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1A679JQ 546 0 0
CGGATTGCCTTCTGGTATATTCCCTAAAGGCGTGACGGAGTTCAACTTGGACGTCAAAAC
GGGACGGTTTTCTGTTTATTTGAACCGCCCCTGCGATGCCAAGTACGAGACGGAGCTGCG
CTACGAGGCGAATGTTACGGGGACGATAAGTGACGCTCACATCGGTGATTTGTCGGGGAT
ATCGGCGCAAGACCTGTTCCTGTGGTTTCCGGTTAAAGGAATCAGAGTCGACGTGCCGAG
CTCTGGCCTTATATACTTCGACGTTGGTGTTGTTCGCAAGCAATACTCGCTGTCTTTGTT
CGATACTCCTAGAGATTGCGTTGCGGTTCGCGGTGAAAATGAGGTTCAGGCTTCTATGTT
GTCATTGTATCAAGTAGATGAAACTACTGGGAGAAATATTATCTAGC**GAGATTTTTAA
GAAATGTCTTCATATACTATACCAGAAAGATAGACAGATGTTCTCATCAATTCTTGAAAA
TACTTTGTACTGTTTTTTTGGTCTCAAATCTTAAAGCATGATTCAAGGTCAAATGCTTCC
CATTCC

QA 1 546 1 546
DS 



AS 1 4

CO CL2728Contig1 692 4 1 U
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CGCTGTAATCAATCAAGACAGAGACCACCGGATACACCGGAAGTAGACACACGACCATCG
AGATCCACCCCCAACGATAATATTGAGGGTAACGGATTCGAGGCCAGACACGTACAGCCC
GAGTCTAAGAGAGAAACGATCTCCTCCTATCTCGGCCACCACCACCGAAAGGAACCCCCT
TTCCACACAGCTCGAAACCTTCTCCGAGAAACAGAAGCCGGCGACCGCTACCAAAGAAGC
TGTGGTGGAACCACCCTCTCCCGGAAACTAAAGTCGTAAAACACCCCGAATGAATGTACG
ACGTCGAAAACAAAACTAAAAAACTAAAAAACGAGAAAAAGAGAGAAGAGCCGGACCGAC
GAGGGCAAGGAAAACCCTTCCGTCGGCCGGAAACACAGAAAACCGCCAGATGCATCCGTG
AGAAATCGAGTCACCAAGACTAAGAGTAAAAGACGTTGAAATCCATGTTTTATTTAAAGC
AGGGCTCTCTGTGTTCTTAACTGCTTTTTAGTCTATATGAATATGTACAAGCTTGTTGAT
TTGGGTTTTTAATCTATAAAAGACATTTAGTGTACATTGTTTGACAAAGCTTCGGACAGT
TTCTCCTGATTTATGTAAGCTTCTTGGCTCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1G631TF U 1
AF RS1GL77JQ C 298
AF RS1GL77TF U 1
AF RS1G631JQ C 260
BS 1 692 RS1G631TF

RD RS1G631TF 692 0 0
GCCGAAACCGAGAACTTCACCGGAATCGCACTCACCAACTCCTTTTCACCGAGAGGACGA
CGCTGTAATCAATCAAGACAGAGACCACCGGATACACCGGAAGTAGACACACGACCATCG
AGATCCACCCCCAACGATAATATTGAGGGTAACGGATTCGAGGCCAGACACGTACAGCCC
GAGTCTAAGAGAGAAACGATCTCCTCCTATCTCGGCCACCACCACCGAAAGGAACCCCCT
TTCCACACAGCTCGAAACCTTCTCCGAGAAACAGAAGCCGGCGACCGCTACCAAAGAAGC
TGTGGTGGAACCACCCTCTCCCGGAAACTAAAGTCGTAAAACACCCCGAATGAATGTACG
ACGTCGAAAACAAAACTAAAAAACTAAAAAACGAGAAAAAGAGAGAAGAGCCGGACCGAC
GAGGGCAAGGAAAACCCTTCCGTCGGCCGGAAACACAGAAAACCGCCAGATGCATCCGTG
AGAAATCGAGTCACCAAGACTAAGAGTAAAAGACGTTGAAATCCATGTTTTATTTAAAGC
AGGGCTCTCTGTGTTCTTAACTGCTTTTTAGTCTATATGAATATGTACAAGCTTGTTGAT
TTGGGTTTTTAATCTATAAAAGACATTTAGTGTACATTGTTTGACAAAGCTTCGGACAGT
TTCTCCTGATTTATGTAAGCTTCTTGGCTCCC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RS1GL77JQ 395 0 0
AGCTGTGGTGGAACCACCCTCTCCCGGAAACTAAAGTCGTAAAACACCCCGAATGAATGT
ACGACGTCGAAAACAAAACTAAAAAACTAAAAAACGAGAAAAAGAGAGAAGAGCCGGACC
GACGAGGGCAAGGAAAACCCTTCCGTCGGCCGGAAACACAGAAAACCGCCAGATGCATCC
GTGAGAAATCGAGTCACCAAGACTAAGAGTAAAAGACGTTGAAATCCATGTTTTATTTAA
AGCAGGGCTCTCTGTGTTCTTAACTGCTTTTTAGTCTATATGAATATGTACAAGCTTGTT
GATTTGGGTTTTTAATCTATAAAAGACATTTAGTGTACATTGTTTGACAAAGCTTCGGAC
AGTTTCTCCTGATTTATGTAAGCTTCTTGGCTCCC

QA 1 395 1 395
DS 

RD RS1GL77TF 692 0 0
GCCGAAACCGAGAACTTCACCGGAATCGCACTCACCAACTCCTTTTCACCGAGAGGACGA
CGCTGTAATCAATCAAGACAGAGACCACCGGATACACCGGAAGTAGACACACGACCATCG
AGATCCACCCCCAACGATAATATTGAGGGTAACGGATTCGAGGCCAGACACGTACAGCCC
GAGTCTAAGAGAGAAACGATCTCCTCCTATCTCGGCCACCACCACCGAAAGGAACCCCCT
TTCCACACAGCTCGAAACCTTCTCCGAGAAACAGAAGCCGGCGACCGCTACCAAAGAAGC
TGTGGTGGAACCACCCTCTCCCGGAAACTAAAGTCGTAAAACACCCCGAATGAATGTACG
ACGTCGAAAACAAAACTAAAAAACTAAAAAACGAGAAAAAGAGAGAAGAGCCGGACCGAC
GAGGGCAAGGAAAACCCTTCCGTCGGCCGGAAACACAGAAAACCGCCAGATGCATCCGTG
AGAAATCGAGTCACCAAGACTAAGAGTAAAAGACGTTGAAATCCATGTTTTATTTAAAGC
AGGGCTCTCTGTGTTCTTAACTGCTTTTTAGTCTATATGAATATGTACAAGCTTGTTGAT
TTGGGTTTTTAATCTATAAAAGACATTTAGTGTACATTGTTTGACAAAGCTTCGGACAGT
TTCTCCTGATTTATGTAAGCTTCTTGGCTCCC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RS1G631JQ 433 0 0
TTCTCCGAGAAACAGAAGCCGGCGACCGCTACCAAAGAAGCTGTGGTGGAACCACCCTCT
CCCGGAAACTAAAGTCGTAAAACACCCCGAATGAATGTACGACGTCGAAAACAAAACTAA
AAAACTAAAAAACGAGAAAAAGAGAGAAGAGCCGGACCGACGAGGGCAAGGAAAACCCTT
CCGTCGGCCGGAAACACAGAAAACCGCCAGATGCATCCGTGAGAAATCGAGTCACCAAGA
CTAAGAGTAAAAGACGTTGAAATCCATGTTTTATTTAAAGCAGGGCTCTCTGTGTTCTTA
ACTGCTTTTTAGTCTATATGAATATGTACAAGCTTGTTGATTTGGGTTTTTAATCTATAA
AAGACATTTAGTGTACATTGTTTGACAAAGCTTCGGACAGTTTCTCCTGATTTATGTAAG
CTTCTTGGCTCCC

QA 1 433 1 433
DS 



AS 1 4

CO CL2729Contig1 816 4 2 U
GGGCTCCTTCTGATCTTTCTTCTCAGCTTCGATCTCCGAAACCGAAACAAACAATGCAGT
TCTTCGGCGGATCCGAGATAAGCCCGTCGCCTCCCGTCCCAACGGCGAGTGGGAACAACG
CGCACATGATGTACGTGTTCAACCGCAACGGCGTGTGTCTCCTCTACAAGGAATGGAACC
GGCCTCTCCACACGCTCAACCCTCAGCAAGATCACAAGCTCATGTTCGGTCTCCTCTTCT
CCCTCAAATCCCTAACCGCCAAAATGGACCCCACCAATGCGGATAAGGGGAATCTAGGGG
TCCCACAGTTGCCGGGGCAAGGATGCTCTTTCCACAGTTTCAGAACCAACACTTACAAGC
TTAGCTTCATGGAGACTCCCTCTGGTATTAAGATTATCTTGGTAACTCATCCAAGGACGG
GAGATTTACGCGAATCCCTCAAGTACATCTACGGTTTATACGTTGAGTATGTGGTAAAAA
ACCCTATCTACAGCCCAGGATCTCCAATCAAGTCAGAGTTGTTCAACACTGCACTTGACC
AATATGTGAGGAGCATCTCATAGTGTCTGCATTACAAGATTTGGCCATTGGAACTTCTGC
TTCACAAAACTTTCTTCTGAACAATCTCCTAGATAAGAGAGAATTGTAATAGAAAGATCA
AATCTCGAATACACTGCTTTCCTCTGCATATATATGTTTCGTTCTCTTTTTTAAAATCAA
TGTATTTGCTTGTTTTTTTATCTTTGATAAGTTACTGTATTGGCTTGTTTTCAAAGATGT
TTATGGTTAACGCAAATCTTGAGATACCATTTGAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G834TF U 38
AF RS1DO12TF U 1
AF RS1AY55TF U 36
AF RS1DO12JQ C 113
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BS 712 816 RS1DO12JQ

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CTTAGTAACTCATCCAAAGACGGGAGATTTACGCGAATCCCTCAAGTACATCTACGGTTT
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QA 1 444 1 444
DS 

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CGCACATGATGTACGTGTTCAACCGCAACGGCGTGTGTCTCCTCTACAAGGAATGGAACC
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CCCTCAAATCCCTAACCGCCAAAATGGACCCCACCAATGCGGATAAGGGGAATCTAGGGG
TCCCACAGTTGCCGGGGCAAGGATGCTCTTTCCACAGTTTCAGAACCAACACTTACAAGC
TTAGCTTCATGGAGACTCCCTCTGGTATTAAGATTATCTTGGTAACTCATCCAAGGACGG
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AATATGTGAGGAGCATCTCATAGTGTCTGCATTACAAGATTTGGCCATTGGAACTTCTGC
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AATCTCGAATACACTGCTTTCCTCTGCATATATATGTTTCGTTCTCTTTTT
TAAAATCA

QA 1 711 1 711
DS 

RD RS1AY55TF 677 0 0
GG
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CCCAACGGCGAGTGGGAACAACGCGCACATGATGTACGTGTTCAACCGCAACGGCGTGTG
TCTCCTCTACAAGGAATGGAACCGGCCTCTCCACACGCTCAACCCTCAGCAAGATCACAA
GCTCATGTTCGGTCTCCTCTTCTCCCTCAAATCCCTAACCGCCAAAATGGACCCCACCAA
TGCGGATAAGGGGAATCTAGGGGTCCCACAGTTGCCGGGGCAAGGATGCTCTTTCCACAG
TTTCAGAACCAACACTTACAAGCTTAGCTTCATGGAGACTCCCTCTGGTATTAAGATTAT
CTTGGTAACTCATCCAAGGACGGGAGATTTACGCGAATCCCTCAAGTACATCTACGGTTT
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TTCGTTCTCTTTTT
A

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DS 

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AAAGATGTTTATGGTTAACGCAAATCTTGAGATACCATTTGAGG

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 4

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GGTCAGAGGTAGAGTTTCATGGCTTCATCCTCCTAGCTTTCTCGGTTTCGTCATCCATTG
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CTTATTAACTTGATGCATATACAGTGAAATAAGTGGATATAATAATAACCATTTTTGTGT
GTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1F496TF U 1
AF RS1FU56JQ C 80
AF RS1FU56TF U 80
AF RS1F496JQ C 87
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QA 1 742 1 742
DS 

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TAATGTAACT

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GGGGTTC
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TAATGTAACT

QA 8 677 8 677
DS 

RD RS1F496JQ 759 0 0
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AACAGAGATCAGAGAACTCGAAGCAGTGTTCAAAAAGTTCGACGTGAATGGAGACGGTAA
GATCTCCTCCAAAGAGCTCGGTGCAATAATGACAAGCCTAGGTCACGAGGTTCCAGAGGA
AGTGCTGCAGAAGGCCATAACGGATATCGACCGTAAAGGAGACGGTTACATAAACTTCGA
GGAGTTCGTTGAGCTGAACACGAAAGGGATGGATCAGAACGAGGTGTTGGAGAATCTGAA
AGATGCGTTCTCTGTTTATGATATCGACGGGAACGGGTCGATCTCGGCGGAGGAGCTGCA
TGAGGTTTTGAGGAGTCTTGGAGATGAGTGTTCGATCGCGGAGTGTAGGAAGATGATTGG
TGGTGTGGATAAGGATGGTGATGGGACGATTGATTTTGAGGAGTTTAAGATTATGATGAC
GTTGGGATCAAGGCGTGACAATGTTATGGGAGGTGGTCAGAGGTAGAGTTTCATGGCTTC
ATCCTCCTAGCTTTCTCGGTTTCGTCATCCATTGTTGATTATTCCACCATTGTTTCAGTC
TTTTTTT***CTTGTTCTTTGGGATTTTTCATGCTAAAGTTATTCTTTTATAAAAACATT
TAATGTAACTCTTTTTGTTTTATCTTCAATTCTGCTTATTAACTTGATGCATATACAGTG
AAATAAGTGGATATAATAATAACCATTTTTGTGTGTTTT

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 4

CO CL2731Contig1 1119 4 5 U
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TGGTGTATGACTACATGGCGCACGGGACGATGAGGGAGCATCTCTACAAGACTCAGAACG
CTCCTCTTTCTTGGAAGCAGCGTCTCGAGATTTGCATCGGTGCGGCGAGAGGGTTGCATT
ATCTACACACCGGTGCTAAACACACCATTATACACAGAGACGTGAAGACGACTAACATTT
TGCTTGATGAGAAATGGGTGGCGAAGGTCTCTGACTTCGGTCTTTCGAAGACCGGTCCTA
CGCTCGACCACACGCATGTGAGCACTGTGGTGAAAGGGAGTTTCGGTTACCTCGACCCTG
AGTACTTCAGAAGACAGCAGCTGACTGGTAAGTCCGATGTCTACTCCTTTGGTGTAGTTC
TCTTCGAAGCGCTTTGTGCGAGACCTGCCTTGAACCCCACGCTAGCTAAAGAGTAAGTGA
GCTTAGCTGAGTGGGCACCTTACTGCTACAAGAAAGGCATGCTTGATCAGATCGTTGATC
CTTACCTCAAGGGCAAGATCACGCCGGAATGCTTCAAGAAGTTTGCTGAGACGGCAATGA
AGTGTGTGCTGGACCAGGGCATTGAGAGACCGTCCATGGGAGATGTTCTGTGGAACTTAG
AGTTCGCGTTGCAGCTTCAGGAGAGCGCGGAGGAGAGCGGGAAGGGGATAGGCGGTGAGA
TGGACATGGGCGAGATCAAGTATGATGATGACAACTGCAAAGGGAAGAACAGTGACAAGG
GCTTTGATGTGTTGTATGAAGGGAATGTCACTGACTCGAGGAGCAGTGGAATAGACATGA
GCATTGGTGGTAGGAGTTTGGCTAGCGATGATTCAGATGGACTCACTCCAAGTGCTGTGT
TTTCGCAGATCATGAATCCTAAGGGACGTTAGAGAGAGAGAGAAGAGTCTTTAAAACTGG
TTCGTTTCCTCTTTTCTCTTTGCTACTTATTTACTATTGTTCTCTTTACTGTTATTTATT
TGTGTATTTGATACTTTGCCACAATCATAAATGAGTGTAAAAATTAATGTGTTTTGATTT
TCTTTTACAAAACATGAAACATATGATTTCCTTCGATGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A957TF U 1
AF RS1AP49TFB U 1
AF RS1AP49JQ C 213
AF RS1A957JQ C 284
BS 1 680 RS1A957TF
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BS 704 775 RS1AP49TFB
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RD RS1A957TF 708 0 0
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TGGTGTATGACTACATGGCGCACGGGACGATGAGGGAGCATCTCTACAAGACTCAGAACG
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AGGGG

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1AP49TFB 775 0 0
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TGGTGTATGACTACATGGCGCACGGGACGATGAGGGAGCATCTCTACAAGACTCAGAACG
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ATCTACACACCGGTGCTAAACACACCATTATACACAGAGACGTGAAGACGACTAACATTT
TGCTTGATGAGAAATGGGTGGCGAAGGTCTCTGACTTCGGTCTTTCGAAGACCGGTCCTA
CGCTCGACCACACGCATGTGAGCACTGTGGTGAAAGGGAGTTTCGGTTACCTCGACCCTG
AGTACTTCAGAAGACAGCAGCTGACTGGTAAGTCCGATGTCTACTCCTTTGGTGTAGTTC
TCTTCGAAGCGCTTTGTGCGAGACCTGCCTTGAACCCCACGCTAGCTAAAGAGTAAGTGA
GCTTAGCTGAGTGGGCACCTTACTGCTACAAGAAAGGCATGCTTGATCAGATCGTTGATC
CTTACCTCAAGGGCAAGATCACGCCGGAATGCTTCAAGAAGTTTGCTGAGACGGCAATGA
AGTGTGTGCTGGACCAGGGCATTGAGAGACCGTCCATGGGAGATGTTCTGTGGAACTTAG
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TGGACATGGGCGAGATCAAGTATGATGATGACAACTGCAAAGGGAAGAACAGTGA

QA 1 775 1 775
DS 

RD RS1AP49JQ 907 0 0
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TCCGATGTCTACTCCTTTGGTGTAGTTCTCTTCGAAGCGCTTTGTGCGAGACCTGCCTTG
AACCCCACGCTAGCTAAAGAGTAAGTGAGCTTAGCTGAGTGGGCACCTTACTGCTACAAG
AAAGGCATGCTTGATCAGATCGTTGATCCTTACCTCAAGGGCAAGATCACGCCGGAATGC
TTCAAGAAGTTTGCTGAGACGGCAATGAAGTGTGTGCTGGACCAGGGCATTGAGAGACCG
TCCATGGGAGATGTTCTGTGGAACTTAGAGTTCGCGTTGCAGCTTCAGGAGAGCGCGGAG
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TCAGATGGACTCACTCCAAGTGCTGTGTTTTCGCAGATCATGAATCCTAAGGGACGTTAG
AGAGAGAGAGAAGAGTCTTTAAAACTGGTTCGTTTCCTCTTTTCTCTTTGCTACTTATTT
ACTATTGTTCTCTTTACTGTTATTTATTTGTGTATTTGATACTTTGCCACAATCATAAAT
GAGTGTAAAAATTAATGTGTTTTGATTTTCTTTTACAAAACATGAAACATATGATTTCCT
TCGATGT

QA 1 907 1 907
DS 

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TTCGAAGACCGGTC*TACGCTCGACCACACGCATGTGAGCACTGTGGTGAAAGGGAGTTT
CGGTTACCTCGACCCTGAGTACTTCAGAAGACAGCAGCTGACTGGTAAGTCCGATGTCTA
CTCCTTTGGTGTAGTTCTCTTCGAAGCGCTTTGTGCGAGACCTGCCTTGAACCCCACGCT
AGCTAAAGAGTAAGTGAGCTTAGCTGAGTGGGCACCTTACTGCTACAAGAAAGGCATGCT
TGATCAGATCGTTGATCCTTACCTCAAGGGCAAGATCACGCCGGAATGCTTCAAGAAGTT
TGCTGAGACGGCAATGAAGTGTGTGCTGGACCAGGGCATTGAGAGACCGTCCATGGGAGA
TGTTCTGTGGAACTTAGAGTTCGCGTTGCAGCTTCAGGAGAGCGCGGAGGAGAGCGGGAA
GGGGATAGGCGGTGAGATGGACATGGGCGAGATCAAGTATGATGATGACAACTGCAAAGG
GAAGAACAGTGACAAGGGCTTTGATGTGTTGTATGAAGGGAATGTCACTGACTCGAGGAG
CAGTGGAATAGACATGAGCATTGGTGGTAGGAGTTTGGCTAGCGATGATTCAGATGGACT
CACTCCAAGTGCTGTGTTTTCGCAGATCATGAATCCTAAGGGACGTTAGAGAGAGAGAGA
AGAGTCTTTAAAACTGGTTCGTTTCCTCTTTTCTCTTTGCTACTTATTTACTATTGTTCT
CTTTACTGTTATTTATTTGTGTATTTGATACTTTGCCACAATCATAAATGAGTGTAAAAA
TTAATGTGTTTTGATTTTCTTTTACAAAACATGAAACATATGATTTCCTTCGATGT

QA 1 836 1 836
DS 



AS 1 4

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AGTCAAAAGACTTCTTTTATTCAGCATCTGATAATGTTACTGTTCGGAACAAGTAAAAGA
CAATCCAAAACACAACAACTTTTGACAACCTTATTAAAACCAACAACCACTTCGACACCC
GAAACACTTTATCTCATCCTCTACGAAGAAGAATTCGTCTGCACCCATTCGACAAGCGTC
GCAACACCAAACCCAGTTCCAGACTTCTTTTTCTCGTTCCACACCGGTCCAGCCATGTCT
ATATGCATCCATTGCACCTTCTCGCTCACAAACTGCTTCAAGAAGAGAGCTGCGGTGATG
GAACCTCCTGCACGCCCACCTGTGTTGACCATATCAGCACATCCAGACTTCATCATCTCC
CAGTAGCTCTCTTCTAATGGCATCCTCCACAGCTTCTCTCCACTCTTCTCTGACGCAGCA
ATCACTTCTTTTGCAAGCTCGTCGTTAGGTGTGTAGATCCCTGCCACTGATGTTCCAAGA
GCAATAACGCAGGCTCCGGTCAACGTAGCGAGGTCAACAATCTTGTCAACGCCTTGGTTA
CAAGCATACACTAGAGCATCAGCAAGTGTTAAACGTCCTTCAGCATCTGTGTTGTTCACC
TCAATGGTCTTTTCGTTTGAGGCTGTGATGACATCCCCAGGTCTCATTCCAGTTCCACTA
ATCATATTCTCACAGGCTGCAACGATGAAATGAACCTCAACACCAGGAGGCTTAATCTCA
CCAATGGCTTTTGCAGCGCCAAGGACAGCAGCTGAACCACCCATGTCGAATTTCATGAGC
TCAATGGAGCAGCCAGGTCCGGTCTTAATGTTGTAGCCACCACTGTCAAAGGTCAATCCT
TTTCCAACAAGAGCAAGCTTGCTCTTAACACCTCCACTCGAAGGTTTATACACAAGGTGA
ATGAAGAAAGGAGGATTAGCCGACGCAGCAGCAACGGCTAGC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GD50JQ U 1
AF RS1DM15JQ U 3
AF RS1EX43JQ U 1
AF RS1GD50TF C 158
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BS 637 783 RS1EX43JQ
BS 784 784 RS1GD50TF
BS 785 818 RS1EX43JQ
BS 819 819 RS1GD50TF
BS 820 831 RS1EX43JQ
BS 832 942 RS1GD50TF

RD RS1GD50JQ 671 0 0
CGT
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ATATTCTC

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DS 

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A
CAAAAGACTTCTTTTATTCAGCATCTGATAATGTTACTGTTCGGAACAAGTAAAAGACAA
TCCAAAACACAACAACTTTTGACAACCTTATTAAAGCCAACAACCACTTCGACACCCGAA
ACACTTTATCTCATCCTCTACGAAGAAGAATTCGTCTGCACCCATTCGACAAGCGTCGCA
ACACCAAACCCAGTTCCAGACTTCTTTTTCTCGTTCCACACCGGTCCAGCCATGTCTATA
TGCATCCATTGCACCTTCTCGCTCACAAACTGCTTCAAGAAGAGAGCTGCGGTGATGGAA
CCTCCTGCACGCCCACCTGTGTTGACCATATCAGCACATCCAGACTTCATCATCTCCCAG
TAGCTCTCTTCTAATGGCATCCTCCAAAGCTTCTCTCCACTCTTCTCTGACGCAGCAATC
ACTTCCTTAGCAAGCTCGTCGTTAGGTGTGTAGATCCCTGCCACTGATGTTCCAAGAGCA
ATAACACAGGCTCCGGTCAATGTAGCGAGGTCAACAATCTTGTCGACGCCTTGGTTACAA
GCATACACTAGAGCATCGGCAAGTGTTAAACGTCCTTCAGCATCTGTGTTGTTCACCTCA
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ATGGCTTTGGCAGCGC

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DS 

RD RS1EX43JQ 834 0 0
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GAAACACTTTATCTCATCCTCTACGAAGAAGAATTCGTCTGCACCCATTCGACAAGCGTC
GCAACACCAAACCCAGTTCCAGACTTCTTTTTCTCGTTCCACACCGGTCCAGCCATGTCT
ATATGCATCCATTGCACCTTCTCGCTCACAAACTGCTTCAAGAAGAGAGCTGCGGTGATG
GAACCTCCTGCACGCCCGCCTGTGTTGACCATATCAGCACATCCAGACTTCATCATCTCC
CAGTAGCTCTCTTCTAATGGCATCCTCCACAGCTTCTCTCCACTCTTCTCTGACGCAGCA
ATCACTTCTTTTGCAAGCTCGTCGTTAGGTGTGTAGATCCCTGCCACTGATGTTCCAAGA
GCAATAACGCAGGCTCCGGTCAACGTAGCGAGGTCAACAATCTTGTCAACGCCTTGGTTA
CAAGCATACACTAGAGCATCAGCAAGTGTTAAACGTCCTTCAGCATCTGTGTTGTTCACC
TCAATGGTCTTTCCGTTTGAGGCTGTGATGACATCTCCAGGTCTCATTCCAGTTCCACTA
ATCATATTCTCACAGGCTGCAACGATGAAATGAACCTCAACACCAGGAGGCTTAATCTCA
CCAATGGCTTTTGCAGCGCCAAGGACAGCAGCTGAACCACCCATGTCGAATTTCATGAGC
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TCA

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DS 

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TCCACACCGGTCCAGCCATGTCTATATGCATCCATTGCAC*TTCTCGCTCACAAACTGCT
TCAAGAAGAGAGCTGCGGTGATGGAAC*TCCTGCACGCCCACCTGTGTTGACCATATCAG
CACATCCAGACTTCATCATCTCCCAGTAGCTCTCTTCTAATGGCATCCTCCACAGCTTCT
CTCCACTCTTCTCTGACGCAGCAATCACTTCTTTTGCAAGCTCGTCGTTAGGTGTGTAGA
TCCCTGCCACTGATGTTCCAAGAGCAATAACGCAGGCTCCGGTCAACGTAGCGAGGTCAA
CAATCTTGTCAACGCCTTGGTTACAAGCATACACTAGAGCATCAGCAAGTGTTAAACGTC
CTTCAGCATCTGTGTTGTTCACCTCAATGGTCTTTTCGTTTGAGGCTGTGATGACATCCC
CAGGTCTCATTCCAGTTCCACTAATCATATTCTCACAGGCTGCAACGATGAAATGAACCT
CAACACCAGGAGGCTTAATCTCACCAATGGCTTTTGCAGCGCCAAGGACAGCAGCTGAAC
CACCCATGTCGAATTTCATGAGCTCAATGGAGCAGCCAGGTCCGGTCTTAATGTTGTAGC
CACCACTGTCAAAGGTCAATCCTTTTCCAACAAGAGCAAGCTTGCTCTTAACACCTCCAC
TCGAAGGTTTATACACAAGGTGAATGAAGAAAGGAGGATTAGCCGACGCAGCAGCAACGG
CTAGC

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 4

CO CL2733Contig1 1070 4 9 U
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AGCTTATCTTGAGAAACCTAATGTTAGGCATCGTCCTAACTCTAGGTTTCTCACTGCTAC
TGTTCTTGGTGTTCAGCAAGCAAACAAAGCTGTAGAGACCGATGAGATGTGGAGGCTTCG
TCGCACAGAGATTGAGTTTGATCAGAGTCTCAAAAGAAAATCAAGAGATGAGAGCGGTAG
TAATGTCCAAAGTGAACAGAACAATAGGAGGGGTTTTGTTAAGAGATGCACTTCAGTTGA
TGAGAATGATGCTCGTTCTTCACCATCGTCAAGTCAGAGCAGAGACAAAAGGTGGCAACC
CGATTATGATGATCATGATGATGGGAAAGGGTTAGGAGATGTCGAGGTTGAGACTTTTCT
CCAATCAAGGGTCAAGCGTGGCAGAGGCTCTGTTGGTCCTAAGATGGATGAACCATTTCC
TTGTCTTCCTATCACGGAACTGCCAACAACTTCTGATACAGGAGATCGCAAGTTAGCTGT
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CTTCTTCGGACAAAAGTTATTTGCACACGTTGTGTTGAGGAAGTTATACCGTTGGGTCGA
ATGGGAGAGAAAGTGGATGTTGCTGTATTTGAAAATGTTACACTAGAGATGGACACAGAG
TTTGTTTACTCCTACGATAATGTATGTTCAATATATAAACTTTTCACGTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1EY75TF U 1
AF RS1GR29TF U 1
AF RS1EY75JQ C 222
AF RS1GR29JQ C 450
BS 1 476 RS1EY75TF
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BS 725 752 RS1GR29TF
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RD RS1EY75TF 705 0 0
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AGAGCCAGATAGATGGCCTCTACTGAGACATAACACGGATTCATC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RS1GR29TF 771 0 0
GGGCGCCCTGCTGGAGAAGGAGCCCCGAGGAGGAATCAATCAGACGATTCTGCGAAACTT
GATATCTGACTGCTGCTTCTGTGGGAGTTGGATGGATCTGGAGACTGAGAATAGAATAGC
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AGCTTATCTTGAGAAACCTAATGTTAGGCATCGTCCTAACTCTAGGTTTCTCACTGCTAC
TGTTCTTGGTGTTCAGCAAGCAAACAAAGCTGTAGAGACCGATGAGATGCGGAGGCTTCG
TCGCACAGAGATTGAGTTTGATCAGAGTCTCAAAAGAAAATCAAGAGATGAGAGCGGTAG
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TGAGAATGATGCTCGTTCTTCACCATCGTCAAGTCAGAGCAGAGACAAAAGGTGGCAACC
CGATTATGATGATCATGATGATGGGAAAGGGTTAGGAGATGTCGAGGTTGAGACTTTTCT
CCAATCAAGGGTCAAGCGTGGCAGAGGCTCTGTTGGTCCTAAGATGGATGAACCATTTCC
TTGTCTTCCTATCACGGAACTGCCAACAACTTCTGATACAG*AGATCGCAAGTTAGCTGT
AGAGCCAGATAGATGGCCTCTACTGAGACATAACACGGATTCATCTTCT*CTTCCGAGGA
GA**GATGCTCATGGGCGTATTTATAGAAAAG
AAAGATCATAGCAGAACTA

QA 1 752 1 752
DS 

RD RS1EY75JQ 849 0 0
TCTA
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AGATGAGAGCGGTAGTAATGTCCAAAGTGAACAGAACAATAGGAGGGGTTTTGTTAAGAG
ATGCACTTCAGTTGATGAGAATGATGCTCGTTCTTCACCATCGTCAAGTCAGAGCAGAGA
CAAAAGGTGGCGACCCGATTATGATGATCATGATGATGGGAAAGGGTTAGGAGATGTCGA
GGTTGAGACTTTTCTCCAATCAAGGGTCAAGCGTGGCAGAGGCTCTGTTGGTCCTAAGAT
GGATGAACCATTTCCTTGTCTTCCTATCACGGAACTGCCAACAACTTCTGATACAGGAGA
TCGCAAGTTAGCTGTAGAGCCAGATAGATGGCCTCTACTGAGACATAACACGGATTCATC
TTCTTCTTCCGAGGAGGAGGATGCTCATGGGCGTATTTATAGAAAAGGAAAAGATCATAA
GCAGAAACTTAGTAAGAGGCACAAGTCAAAAGAGAAGAAAAGAGATCACAAGTCAAAAGA
GAAGAAAAAAGATAGGAAGGAGAAGAAGAAGAGAAGGGATGAGAAGAAGAGAAAACATGG
TAGGGACTAGGTCTTCTTCTTCGGACAAAAGTTATTTGCACACGTTGTGTTGAGGAAGTT
ATACCGTTGGGTCGAATGGGAGAGAAAGTGGATGTTGCTGTATTTGAAAATGTTACACTA
GAGATGGACACAGAGTTTGTTTACTCCTACGATAATGTATGTTCAATATATAAACTTTTC
ACGTC

QA 5 849 5 849
DS 

RD RS1GR29JQ 621 0 0
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GGTTAGGAGATGTCGAGGTTGAGACTTTTCTCCAATCAAGGGTCAAGCGTGGCAGAGGCT
CTGTTGGTCCTAAGATGGATGAACCATTTCCTTGTCTTCCTATCACGGAACTGCCAACAA
CTTCTGATACAGGAGATCGCAAGTTAGCTGTAGAGCCAGATAGATGGCCTCTACTGAGAC
ATAACACGGATTCATCTTCTTCTTCCGAGGAGGAGGATGCTCATGGGCGTATTTATAGAA
AAGGAAAAGATCATAAGCAGAAACTTAGTAAGAGGCACAAGTCAAAAGAGAAGAAAAGAG
ATCACAAGTCAAAAGAGAAGAAAAAAGATAGGAAGGAGAAGAAGAAGAGAAGTGATGAGA
AGAAGAGAAAACATGGTAGGGACTAGGTCTTCTTCTTCGGACAAAAGTTATTTGCACACG
TTGTGTTGAGGAAGTTATACCGTTGGGTCGAATGGGAGAGAAAGTGGATGTTGCTGTATT
TGAAAATGTTACACTAGAGATGGACACAGAGTTTGTTTACTCCTACGATAATGTATGTTC
AATATATAAACTTTTCACG
CG

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 2

CO CL2734Contig1 1113 2 8 U
GGAAGAGCCTCTCCCAAACATCCATCGTCGAACGCGACGCAGACAGTAAGCAAAGAAACC
CAGAAACAATCTTCTCACATGGCTGAAATCTCGGCGACTTCGTTTCCTTCTGCTTCGTCC
TCTGCTCTTGCGCTTCGCAGCTCACCCAATGCTAGCTTAAGATGTCAGAATGTAGCTTGT
CCAAGAACCACTTCCTCCTCTTTTCAAGAGTTGTCTGTGAGACGAAGCCAGCTTGTTGGC
AATGCTATTGCTACTAGTCATGTTCCCGCAACCCGCGTCTGCAAGAATCAAGCTATTCGA
GCTGTTATGTCTGGTGATGGACAGACTGTCGTGGCTGCTGATTCAAAGGGTGCCGAAGCA
GGGCTTCGTGGCAAACTGAAGAAAGTCGTTCTAGCTTACAGTGGAGGCTTAGACACCTCT
GTCATCGTGCCATGGCTTAAGGAAAACTATGGCTGTGAAGTTGTGTGTTTCACCGCAGAT
GTTGGTCAGGGAATAAAAGAGTTGGATGGTTTGGAACAAAAGGCTAAGGCTAGTGGTGCT
TCTCAGTTGGTTGTTAAGGATCTCACCGAGGAGTTTGTTAAAGATTACATATTCCCTTGT
CTCAGAGCTGGTGCCATCTACGAACGAAAATACTTGCTTGGTACCTCCATGGCTCGACCT
GTCATTGCTAAGGCCATGGTAGATGTAGCTGCTGAGGTTGGAGCTGATGCTGTTGCTCAT
GGGTGTACTGGTAAAGGAAATGACCAGGTTCGGTTTGAGCTCACCTTCTTTTCGTTAAAC
CCTGAACTTAAAGTCGTGGCACCATGGAGAGAATGGGAGATCCAAGGCAGAGAAGACGCT
ATCGAGTATGCGAAGAAGCACAACGTTCCTGTCCCCGTGACAAAGAAATCTATTTACAGC
CGATATAGGAACCTCTGGCACCTTAGTCACGAGGGTGATATATTGGAAGATCCAGCTAAC
GAGCCCAAGAAAGATATGTACATGATGAGTGTAGACCCCGAAGATGCTCCTGATCAGCCT
GAATACATTGAGATCGGGATAGAATCCGGACTTCCAGTGGCACTAAACGGGAAGGCTCTC
TCTCCAGCAACCCTTCTCTCTGAGCTAAACACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GO29TF U 1
AF RS1C993TF U 477
BS 1 672 RS1GO29TF
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RD RS1GO29TF 732 0 0
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TCTGCTCTTGCGCTTCGCAGCTCACCCAATGCTAGCTTAAGATGTCAGAATGTAGCTTGT
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AATGCTATTGCTACTAGTCATGTTCCCGCAACCCGCGTCTGCAAGAATCAAGCTATTCGA
GCTGTTATGTCTGGTGATGGACAGACTGTCGTGGCTGCTGATTCAAAGGGTGCCGAAGCA
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GTCATCGTGCCATGGCTTAAGGAAAACTATGGCTGTGAAGTTGTGTGTTTCACCGCAGAT
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TCTCAGTTGGTTGTTAAGGATCTCACCGAGGAGTTTGTTAAAGATTACATATTCCCTTGT
CTCAGAGCTGGTGCCATCTACGAACGAAAATACTTGCTTGGTACCTCCATGGCTCGACCT
GTCATTGCTAAG*CCATGGTAGATGTAGCTGCTGAG*TTGGAGCTGATGCTGT*GCTCAT
GGGTGTACTGG
T

QA 1 731 1 731
DS 

RD RS1C993TF 637 0 0
G
GATGTTGGTCAGGGAATAAAAGAGTTGGATGGTTTGGAACAAAAGGCTAAGGCTAGTGGT
GCTTCTCAGTTGGTTGTTAAGGATCTCACCGAGGAGTTTGTTAAAGATTACATATTCCCT
TGTCTCAGAGCTGGTGCCATCTACGAACGAAAATACTTGCTTGGTACCTCCATGGCTCGA
CCTGTCATTGCTAAGGCCATGGTAGATGTAGCTGCTGAGGTTGGAGCTGATGCTGTTGCT
CATGGGTGTACTGGTAAAGGAAATGACCAGGTTCGGTTTGAGCTCACCTTCTTTTCGTTA
AACCCTGAACTTAAAGTCGTGGCACCATGGAGAGAATGGGAGATCCAAGGCAGAGAAGAC
GCTATCGAGTATGCGAAGAAGCACAACGTTCCTGTCCCCGTGACAAAGAAATCTATTTAC
AGCCGATATAGGAACCTCTGGCACCTTAGTCACGAGGGTGATATATTGGAAGATCCAGCT
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CCTGAATACATTGAGATCGGGATAGAATCCGGACTTCCAGTGGCACTAAACGGGAAGGCT
CTCTCTCCAGCAACCCTTCTCTCTGAGCTAAACACA

QA 2 637 2 637
DS 



AS 1 4

CO CL2735Contig1 1004 4 7 U
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TTGCAAGACAAGAGTAAATGAAGAGAAGTATTCTACATGCTCTTGCATTGTTACACTCAT
CAGCAAAGAAAAGAGAGAGAGAAGAGGAGAAGCTTTCGAGAGGTAATTAAGTAGAGCAGC
AACCTCTATTGGCAGCTCCAGATGTGTCATCAACGTTAATCGTTGTTCCTTGACCAGGAA
TCGCAAAATTAGCACCCGCTGCTTCTTGAGCAGCCAAAGCTTTTTTGCTGATGATCTTGT
AAATCTCTGTCAACACGGTTTGAAATGATTTCTCGACACTTGTTGATTCAAGAGCAGACG
TCTCCAAGAAAGAAAGTCCTTCTGTCTCAGCTAGACTCCTACCATCTTCCTCAGCAACCG
ACCTCAAGTGGTTTAGATCGGATTTGTTCCCAGCCATCATGATCACAATGTTGGAATCTG
CATGGTCTCTTAGCTCGCGTAGCCACCTTAGGGCATTGTCAAAGGTCTGGCGTTTGGTGA
TGTCATAGACAAGAAATGCACCTACTGCGCCTCTGTAATAAGCGCTTGTGATGGCTCTGT
ACCGCTCTTGACCTGCAGTGTCCCATATTTGGGCCTTTACTGTCTTTCCTTCAACCTGAA
GAGTTCTTGTGGCGAATTCAACACCAATAGTGGACTTGGATTCCAAGCAAAACTCATTCC
TGGTGAATCTAGACAATATGTTTGATTTCCCGACACCAGAATCACCTATCAACACGATCT
TGAACAAGTAGTCGTAATCCTGTTCTACTCTATGCGCCATTATTCTTCTTCTATCCACCA
AAGAAACAAACGCTTTTTTATATTCTGGGAGAAGATTGCGGATTAATAATGAAAAGCGAG
TTTCACCCTCTTCAGATCTGCTTAAGGATGAAACTTCTCTGGCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BN01JQ U 1
AF RS1BN01TF C 3
AF RS1AJ11JQ U 99
AF RS1AJ11TF C 166
BS 1 118 RS1BN01JQ
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RD RS1BN01JQ 612 0 0
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AACCTCTATTGGCAGCTCCAGATGTGTCATCAACGTTAATCGTTGTTCCTTGACCAGGAA
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TGTCATAGACAA

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DS 

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GCAAGACAAGAGTAAATGAAGAGAAGTATTCTACATGCTCTTGCATTGTTACACTCATCA
GCAAAGAAAAGAGAGAGAGAAGAGGAGAAGCTTTCGAGAGGTAATTAAGTAGAGCAGCAA
CCTCTATTGGCAGCTCCAGATGTGTCATCAACGTTAATCGTTGTTCCTTGACCAGGAATC
GCAGAATTAGCACCCGCTGCTTCTTGAGCAGCCAAAGCTTTTTTGCTGATGATCTTGTAA
ATCTCTGTCAACACGGTTTGAAATGATTTCTCGACACTTGTTGATTCAAGAGCAGACGTC
TCCAAGAAAGAAAGTCCTTCTGTCTCAGCTAGACTCCTACCATCTTCCTCAGCAACCGAC
CTCAAGTGGTTTAGATCGGATTTGTTCCCAGCCATCATGATCACAATGTTGGAATCTGCA
TGGTCTCTTAGCTCGCGTAGCCACCTTAGGGCATTGTCAAAGGTCTGGCGTTTGGTGATG
TCATAGACAAGAAATGCACCTACTGCGCCTCCGTAATAAGCGCTTGTGATGGCTCTGTAC
CGCTCTTGACCTGCAGTGTCCCATATTTGGGCCTTTACTGTCTTTCCTTCAACCTGAAGA
GTTCTTGTGGCGAATTCAACACCAATAGTGGACTTGGATTCCAAGCAAAACTCATTCCTG
GTGAATCTAGACAATATGTTTGATTTCCCGACAC
CAGAATC

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DS 

RD RS1AJ11JQ 718 0 0
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ATCGTTGTTCCTTGACCAGGAATCGCAAAATTAGCACCCGCTGCTTCTTGAGCAGCCAAA
GCTTTTTTGCTGATGATCTTGTAAATCTCTGTCAACACGGTTTGAAATGATTTCTCGACA
TTTGTTGATTCAAGAGCAGACGTCTCCAAGAAAGAAAGTCCTTCTGTCTCAGCTAGACTC
CTACCATCTTCCTCAGCAACCGACCTCAAGTGGTTTAGATCGGATTTGTTCCCAGCCATC
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TCAAAGGTCTGGCGTTTGGTGATGTCATAGACAAGAAATGCACCTACTGCGCCTCTGTAA
TAAGCGCTTGTGATGGCTCTGTACCGCTCTTGACCTGCAGTGTCCCATATTTGGGCCTTT
ACTGTCTTTCCTTCAACCTGAAGAGTTCTTGTGGCGAATTCAACACCAATAGTGGACTTG
GATTCCAAGCAAAACTCATTCCTGGTGAATCTAGACAATATGTTTGATTTCCCGACAC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1AJ11TF 839 0 0
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ATTAAGTAGAGCAGCAACCTCTATTGGCAGCTCCAGATGTGTCATCAACGTTAATCGTTG
TTCCTTGACCAGGAATCGCAGAATTAGCACCCGCTGCTTCTTGAGCAGCCAAAGCTTTTT
TGCTGATGATCTTGTAAATCTCTGTCAACACGGTTTGAAATGATTTCTCGACATTTGTTG
ATTCAAGAGCAGACGTCTCCAAGAAAGAAAGTCCTTCTGTCTCAGCTAGACTCCTACCAT
CTTCCTCAGCAACCGACCTCAAGTGGTTTAGATCGGATTTGTTCCCAGCCATCATGATCA
CAATGTTGGAATCTGCATGGTCTCTTAGCTCGCGTAGCCACCTTAGGGCATTGTCAAAGG
TCTGGCGTTTGGTGATGTCATAGACAAGAAATGCACCTACTGCGCCTCTGTAATAAGCGC
TTGTGATGGCTCTGTACCGCTCTTGACCTGCAGTGTCCCATATTTGGGCCTTTACTGTCT
TTCCTTCAACCTGAAGAGTTCTTGTGGCGAATTCAACACCAATAGTGGACTTGGATTCCA
AGCAAAACTCATTCCTGGTGAATCTAGACAATATGTTTGATTTCCCGACACCAGAATCAC
CTATCAACACGATCTTGAACAAGTAGTCGTAATCCTGTTCTACTCTATGCGCCATTATTC
TTCTTCTATCCACCAAAGAAACAAACGCTTTTTTATATTCTGGGAGAAGATTGCGGATTA
ATAATGAAAAGCGAGTTTCACCCTCTTCAGATCTGCTTAAGGATGAAACTTCTCTGGCC

QA 1 839 1 839
DS 



AS 1 4

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GCGACGTCAGGAACATACGTGACGGAGGTTCCGTTAAAAGGGACGGTGGAGAAACATTAC
AGGAGGTGGAGGAGCGAGAACCATGCCTTCCCGGAAGCCATCGGCCACCACATCCAAAAT
GTTACCATTCACGACGGCGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTTGGAACTACACA
TGCGATGGGAAGCCAGAGGTATTCAAAGAAAGGAGAGAGATAGACGATGAGAAGAAAACG
GTGACGTTTAGAGGACTTGAAGGTCACGTGATGGAACAGCTCAAGGTGTATGACGTCATC
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AAGCGCAACGATGAGTTCCCCGAACCAGGCAACTACATGAAATTTGCCAAGAGCATGGTT
GCTGACATGGACGACCATGTTCTCAAAGCTTAATTGTCATCATCATCACCAGCATCACCA
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AAGTTTCATTTCTTTACAAGATCATGCTTTGATATGTTCTTGTGGTCATCGACCGGTTTG
ATATGTTATGCTTTGATATATTCCAGTGTTATTAAGTTTGTCGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F950TF U 1
AF RS1F950JQ C 31
AF RS1AI47TF U 4
AF RS1AK87TF U 4
BS 1 768 RS1F950TF

RD RS1F950TF 768 0 0
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GCGACGTCAGGAACATACGTGACGGAGGTTCCGTTAAAAGGGACGGTGGAGAAACATTAC
AGGAGGTGGAGGAGCGAGAACCATGCCTTCCCGGAAGCCATCGGCCACCACATCCAAAAT
GTTACCATTCACGACGGCGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTTGGAACTACACA
TGCGATGGGAAGCCAGAGGTATTCAAAGAAAGGAGAGAGATAGACGATGAGAAGAAAACG
GTGACGTTTAGAGGACTTGAAGGTCACGTGATGGAACAGCTCAAGGTGTATGACGTCATC
TTGGAGTTTATTCCCAAGTCCGAGGATGGCTGTGCCTGCAAAGTTACTATGATATGGGAG
AAGCGCAACGATGAGTTCCCCGAACCAGGCAACTACATGAAATTTGCCAAGAGCATGGTT
GCTGACATGGACGACCATGTTCTCAAAGCTTAATTGTCATCATCATCACCAGCATCACCA
TCATCATCATAATCGCCATCCAAATCATCACCATCACAATCACTCTCACCATGATCAATA
TCATCTCCATTACGAAATACTTATTAAGATGCTTTTCAATTCAATAAATGTGGTCTTGTG
AAGTTTCATTTCTTTACAAGATCATGCTTTGATATGTTCTTGTGGTCATCGACCGGTTTG
ATATGTTATGCTTTGATATATTCCAGTGTTATTAAGTTTGTCGAAAAA

QA 1 768 1 768
DS 

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TGTGCCTGCAAAGTTACTATGATATGGGAGAAGCGCAACGATGAGTTCCCCGAACCAGGC
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GCTTTTCAATTCAATAAATGTGGTCTTGTGAAGTTTCATTTCTTTACAAGATCATGCTTT
GATATGTTCTTGTGGTCATCGACCGGTTTGATATGTTATGCTTTGATATATTCCAGTGTT
ATTAAGTTTGTC
G

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1AI47TF 759 0 0
GG
AACCTAAACAAACAAATAAAAAACAGTCGAGGCTTTGTAATGAGAGAGAGAAATGGCGAC
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CATGGACGACCATGTTCTCAAAGCTTAATTGTCATCATCATCACCAGCATCACCATCATC
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TCATTTCTTTACAAGATCATGCTTTGATATGTTCTTGTGGTCATCGACCGGTTTGATATG
TTATGCTTTGATATATTCCAGTGTTATTAAGTTTGTC

QA 3 759 3 759
DS 

RD RS1AK87TF 749 0 0
GG
AACCTAAACAAACAAATAAAAAACAGTCGAGGCTTTGTAATGAGAGAGAGAAATGGCGAC
GTCAGGAACATACGTGACGGAGGTTCCGTTAAAAGGGACGGTGGAGAAACATTACAGGAG
GTGGAGGAGCGAGAACCATGCCTTCCCGGAAGCCATCGGCCACCACATCCAAAATGTCAC
CATTCACGACGGCGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTCGGAACTACACATGCGA
TGGGAAGCCAGAGGTATTCAAAGAAAGGAGAGAGATAGACGATGAGAAGAAAACGGTGAC
GTTTAGAGGACTTGAAGGTCACGTGATGGAACAGCTCAAGGTGTATGACGTCATCTTGGA
GTTTATTCCCAAGTCCGAGGATGGCTGTGCCTGCAAAGTTACTATGATATGGGAGAAGCG
CAACGATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAATTTGCCAAGAGCATGGTTGCTGA
CATGGACGACCATGTTCTCAAAGCTTAATTGTCATCATCATCACCAGCATCACCATCATC
ATCATAATCGCCATCCAAATCATCACCATCACAATCACTCTCACCATGATCAATATCATC
TCTATCACGAAATACTTATTAAGATGCTTTTCAATTCAATAAATGTGGTCTTGTGAAGTT
TCATTTCTTTACAAGATCATGCTTTGATATGTTCTTGTGGTCATCGACCGGTTTGATATG
TTATGCTTTGATATATTCCAGTGTTAT

QA 3 749 3 749
DS 



AS 1 3

CO CL2737Contig1 873 3 12 U
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CTCTAATACTTGGGAGGCTAATATATATTTTTCCAGTCTTTTACCACTTCTCTAACCCAA
AGGATTTTAAACTTATGCAGTCTCAAACCCCAAACTACATTACCTTTTTTTTTTCTTTTT
CTTTCTAGAAATAGAGAATATTAAGAAGAAAAGAAATAGAAATGCTCAAATACAATGATT
ACATTCCACAAGCTGTTGCTCTCAACCGGTTGAACAAGTAGGCCTCCTCCTCCTCTGTCA
TCGTTTGTCATCTTTTTCAGGGATCTATATTGCAGCCGAACACTGTCTCCACTCTCCATA
ATCTTTAACAGATACCAGCCATTGAGACATTGAGATGTAACAATTGTTTCTTTTCCAACA
AACTTTTCCGGTGTTCTCCTGTTACCCTTGATAAGTACTTTCTCGTTTACAGCAAATGGA
TAATGAACCACTCGCTGCTGTAATCTATCATCCGTAGCTGGATCTCCATGTTCCTGCAAC
ACATCCATTTGATCACTCATTTCTTTTCGACGCCTCCGCATGGCTGCGTTGTGGAAAAGT
CTTTTATCATCTTGTTGCTTTATAGCTGAAGCGGCAGCTCTAAGAGCATGGTTAGGAACC
AGAGACCCGGTCTCAATTTCTGCATTGCAAAGCGTACATCTAGACATTTCAAGGACTCTT
CTAAGCATGAGGCCACCAAATGAATGTCCACAAGAGACCACAATAGCATCTTCAAGAAAC
GCACCGGAAATGGGATCCGAGAGAACACTTCTTAAGGAAGGCTCTTTGCAAACATCATCC
CGTGAAACATTGGTCTTAACAGGCGGAGTAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1BR64JQ U 1
AF RS1AZ06JQ U 187
AF RS1AZ06TF C 187
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BS 534 539 RS1AZ06JQ
BS 540 754 RS1BR64JQ
BS 755 873 RS1AZ06JQ

RD RS1BR64JQ 754 0 0
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CTCTAATACTTGGGAGGCTAATATATATTTTTCCAGTCTTTTACCACTTCTCTAACCCAA
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CTTTCTAGAAATAGAGAATATTAAGAAGAAAAGAAATAGAAATGCTCAAATACAATGATT
ACATTCTACAAGCTGTTGCTCTCAACCGGTTGAACAAGTAGGCCTCCTCCTCCTCTGTCA
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AACTTTTCCGGTGTTCTCCTGTTACCCTTGATAAGTACTTTCTCGTTTACAGCAAATGGA
TAATGAACCACTCGCTGCTGTAATCCATCATCCGTAGCTGGATCTCCATGTTC******C
ACATCCATTTGATCACTCATTTCTTTTCGACGCCTCCGCATGGCTGCGTTGTGGAAAAGT
CTTTTATCATCTTGTTGCTTTATAGCTGAAGCGGCAGCTCTAAGAGCATGGTTAGGAACC
AGAGACCCGGTCTCAATTTCTGCATTGCAAAGCGTACATCTAGACATTTCAAGGACTCTT
CTAAGCATGAGGCCACCAAATGAATGTCCACAAG

QA 1 754 1 754
DS 

RD RS1AZ06JQ 687 0 0
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CACAAGCTGTTGCTCTCAACCGGTTGAACAAGTAGGCCTCCTCCTCCTCTGTCATCGTTT
GTCATCTTTTTCAGGGATCTATATTGCAGCCGAACACTGTCTCCACTCTCCATAATCTTT
AACAGATACCAGCCATTGAGACATTGAGATGTAACAATTGTTTCTTTTCCAACAAACTTT
TCCGGTGTTCTCCTGTTACCCTTGATAAGTACTTTCTCGTTTACAGCAAATGGATAATGA
ACCACTCGCTGCTGTAATCTATCATCCGTAGCTGGATCTCCATGTTCCTGCAACACATCC
ATTTGATCACTCATTTCTTTTCGACGCCTCCGCATGGCTGCGTTGTGGAAAAGTCTTTTA
TCATCTTGTTGCTTTATAGCTGAAGCGGCAGCTCTAAGAGCATGGTTAGGAACCAGAGAC
CCGGTCTCAATTTCTGCATTGCAAAGCGTACATCTAGACATTTCAAGGACTCTTCTAAGC
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ACATTGGTCTTAACAGGCGGAGTAACC

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DS 

RD RS1AZ06TF 687 0 0
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CACAAGCTGTTGCTCTCAACCGGTTGAACAAGTAGGCCTCCTCCTCCTCTGTCATCGTTT
GTCATCTTTTTCAGGGATCTATATTGCAGCCGAACACTGTCTCCACTCTCCATAATCTTT
AACAGATACCAGCCATTGAGACATTGAGATGTAACAATTGTTTCTTTTCCAACAAACTTT
TCCGGTGTTCTCCTGTTACCCTTGATAAGTACTTTCTCGTTTACAGCAAATGGATAATGA
ACCACTCGCTGCTGTAATCTATCATCCGTAGCTGGATCTCCATGTTCCTGCAACACATCC
ATTTGATCACTCATTTCTTTTCGACGCCTCCGCATGGCTGCGTTGTGGAAAAGTCTTTTA
TCATCTTGTTGCTTTATAGCTGAAGCGGCAGCTCTAAGAGCATGGTTAGGAACCAGAGAC
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GAAATGGGATCCGAGAGAACACTTCTTAAGGAAGGCTCTTTGCAAACATCATCCCGTGAA
ACATTGGTCTTAACAGGCGGAGTAAC
C

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 4

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GCTTCACCCTCATATTAATAGGAACAGCTACTCTTCAGAAATTTGAAGCAGTCAACCTAC
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ACAGATGTGTTACT*******GTAGATATCTATATATGACAGAGAAGGGGTATGCTTTGT
TCGACGTATTGTTCAACGATTTTATTTTTTTGATTGGTCGTTCAGAGCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F322TF U 1
AF RS1A517JQ C 14
AF RS1A517TF U 14
AF RS1F322JQ C 73
BS 1 239 RS1F322TF
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GCTTCCATGTATCAACCGAGGCATCACTTGGTATCGTGGCACTGTCTCTCAGCACCGGAG
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AGATGTAGTCAATCAAAA
GTGCG

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1A517JQ 769 0 0
G
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ACAAATAAATCCGGCGACAGCTAACTAAGAACGTGGAACAGATTACAGATGTAGTCAATC
AAAAAAGTTCGTTAGAAAAAAATGGCAATGTTCATTAAATCATTTCACAGATGTGTTACT
*******GTAGATATCTATATATGACAGAGAAGGGGTATGCTTTGTTC

QA 2 769 2 769
DS 

RD RS1A517TF 769 0 0
G
CAGAATCGGGTGCTTTCCTATGGTGTAGCTGGTGCAGTTATCTTTCGCTTCACCCTCATA
TTAATAGGAACAGCTACTCTTCAGAAATTTGAAGCAGTCAACCTACTGCTTGCAGCAGTT
CTCTTATATTCGTCTTTCAAGTTGTTTTCAAGTGAAGAGGGTGATACAGATCTATCGGAC
AACTTCGTTGTGAAGACATGCCAGAGATTTATTCCTGTCACGTCAACTTACGATGGGAAC
CGGTTTTTCACAAAGCATGATGGCATTTGGAAAGCGACACCATTGCTTCTCACAGTAGCA
GTGATCGAGCTCAGTGACATAGCATTTGCTGTTGACTCAATACCAGCTGTTTTTGGAGTT
ACAAGGGATCCTTTTATTGTCTTGACCTCTAATCTCTTTGCAATCCTAGGACTAAGGTCT
CTCTATACCCTGATTTCTGAAGGAATGGACGACCTGGAATACTTGCAGCCATCAATAGCA
GTGGTTCTTGGGTTCATCGGATGCAAGATGATCCTCGATTTCTTTGGCTTCCATGTATCA
ACCGAGGCATCACTTGGTATCGTGGCACTGTCTCTCAGCACCGGAGTTCTATTGAGCCTA
ACAAATAAATCCGGCGACAGCTAACTAAGAACGTGGAACAGATTACAGATGTAGTCAATC
AAAAAAGTTCGTTAGAAAAAA*TGGCAATGTTCATTAAATCATTTCACAGATGTGTTACT
*******GTAGATATCTATATATGACAGAGAAAGGGTATGCTTTGTTC

QA 2 769 2 769
DS 

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ACAACTTCATTGTGAAGACATGCCAGAGATTTATTCCTGTCACATCATCTTACGATGGGA
ACCGGTTTTTCACAAAGCATGATGGCATTTGGAAAGCGACACCATTGCTTCTCACAGTAG
TAGTGATCGAACTCAGTGACATAGCATTTGCTGTTGACTCACTACCAGCTGTTTTTGGAG
TCACAAGGGATCCTTTTATTGTCTTGACCTCTAATCTCTTTGCAATCCTAGGACTAAGGT
CTCTCTATACCCTGATTTCTGAAGGAATGGACGACCTGGAATACTTGCAGCCATCAATAG
CAGTGGTTCTTGGGTTCATCGGATGCAAGATGATCCTCGATTTCTTTGGCTTCCATGTAT
CAACCGAGGCATCACTTGGTATCGTGGCACTGTCTCTCAGCACCGGAGTTCTATTGAGCC
TAACAAATAAATCCGGCGACAGCTAACTAAGAACGTGGAACAGATTACAGATGTAGTCAA
TCAAAAA*GTGCGTTAGAACAAAATGGCAATGTTCATTAAATCATTTCACAGGTGTGTTA
CTTACTACTGTAGATAT*TATATATGACAGAGAAGGGGTTTGCTTTGTAAGACGTATTGT
TCAACGATTTTATTTTTTTGATTGGTCGTTCAGAGCTGC

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 4

CO CL2739Contig1 916 4 5 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGCATTATCAAA
TACTCGAGCAGACAACTTGCCAACTGATACCAACAGCTGTTTTGTCCAGAACCTGAAGAA
ATCTGTTAGAGAAGCGGCCTTATTGATACCATCTTCAGCAGGATCATCACGGGACAGTCA
ATCCGATGAAGGCTCCGAGCATTACTTCGTACCTCTTTCAGGAGCTGGCTTTTCTCGATT
TCCATCAGAAACCAAAAGCTTGCCTCTCAGAGGGTCGAGGTTACAGACCTCTCTGAGCGA
GCCTTCCTTTCTTGAACACAATGTTCCCCATAGCCTCGCGCCAAGCAAGTACAGCGACAT
ACCCGACACGTTTGATGATCTAGATTCCTTCAAAGATTACGATAACGGGAATGGGTTTCT
TTCAGTTGCTGGATCAAACAGTGTAGCTTCTGATCCGCAACAATCGTTTTACGACGTTGA
AGATCAAGTGTTTTCACCACCTTTACTAATGGACTCGTCCCTATTATCAGATACCTACGA
AGACTTGCTAGCTCCTTTGTCAGAAACGGAAGCCGCCTTGATGGAGCATTAGGATGAAGA
AGCCATGGATCAGACAAAACGATGAAACTTCTGTTTCTCCAAAGATTCTTCTTGGGG*TG
ATTGAAGCATGTGGGTCTCATCACAGGTGTTTCAGTTATGGTTTCTAGTTAACAAGGGTG
TTTCTTAATTTATCTTGGATTTGTTGGTAATGGGATTTATCTTGATGAATGAATGATCTG
ACTTTGTTTGTGTGTCAAGTGTGTGTAAACAACCTCCAGATCCGGTAGAAGCGTCGTTCT
CTAATCCTTGGGTTTCCACTAAAAAAGATTGATTCTTGTTTAAAAATTTAGATGTAAAGT
AAAGAAAATAGTGAAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A080TV U 1
AF RS1A080TF U 1
AF RS1A080TR C 55
AF RS1A080JQ C 144
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BS 882 916 RS1A080JQ

RD RS1A080TV 508 0 0
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TTCAGTTGCTGGATCAAACAGTGTAGCTTCTGATCCGCAACAATCGTTTTACGACGTTGA
*GATCAAGTGTTTTCACCACCTTTACTA

QA 1 508 1 508
DS 

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TACTCGAGCAGACAACTTGCCAACTGATACCAACAGCTGTTTTGTCCAGAACCTGAAGAA
ATCTGTTAGAGAAGCGGCCTTATTGATACCATCTTCAGCAGGATCATCACGGGACAGTCA
ATCCGATGAAGGCTCCGAGCATTACTTCGTACCTCTTTCAGGAGCTGGCTTTTCTCGATT
TCCATCAGAAACCAAAAGCTTGCCTCTCAGAGGGTCGAGGTTACAGACCTCTCTGAGCGA
GCCTTCCTTTCTTGAACACAATGTTCCCCATAGCCTCGCGCCAAGCAAGTACAGCGACAT
ACCCGACACGTTTGATGATCTAGATTCCTTCAAAGATTACGATAACGGGAATGGGTTTCT
TTCAGTTGCTGGATCAAACAGTGTAGCTTCTGATCCGCAACAATCGTTTTACGACGTTGA
AGATCAAGTGTTTTCACCACCTTTACTAATGGACTCGTCCCTATTATCAGATACCTACGA
AGACTTGCTAGCTCCTTTGTCAGAAACGGAAGCCGCCTTGATGGAGCATTAGGATGAAGA
AGCCATGGATCAGACAAAACGATGAAACTTCTGTTTCTCCAAAGATTCTTCTTGGGGGTG
ATTGAAGCATGTGGGTCTCATCACAGGTGTTTCAGTTATGGTTTCTAGTTAACAAGGGTG
TTTCTTAATTTATCTTGGATTTGTTGGTAATGGGATTTATCTTGATGAATGAATGATCTG
ACTTTGTTTGTGTGTCAAGTGTGTGTAAACAACCTC

QA 1 816 1 816
DS 

RD RS1A080TR 827 0 0
ATCAAATACTCGAGCAGACAACTTGCCAACTGATACCAACAGCTGTTTTGTCCAGAACCT
GAAGAAATCTGTTAGAGAAGCGGCCTTATTGATACCATCTTCAGCAGGATCATCACGGGA
CAGTCAATCCGATGAAGGCTCCGAGCATTACTTCGTACCTCTTTCAGGAGCTGGCTTTTC
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GAGCGAGCCTTCCTTTCTTGAACACAATGTTCCCCATAGCCTCGCGCCAAGCAAGTACAG
CGACATACCCGACACGTTTGATGATCTAGATTCCTTCAAAGATTACGATAACGGGAATGG
GTTTCTTTCAGTTGCTGGATCAAACAGTGTAGCTTTTGATCCGCAACAATCGTTTTACGA
CGTTGAAGATCAAGTGTTTTCACCACCTTTACTAATGGACTCGTCCCTATTATCAGATAC
CTACGAAGACTTGCTAGCTCCTTTGTCAGAAACGGAAGCCGCCTTGATGGAGCATTAGGA
TGAAGAAGCCATGGATCAGACAAAACGATGAAACTTCTGTTTCTCCAAAGATTCTTCTTG
GGG*TGATTGAAGCATGTGGGTCTCATCACAGGTGTTTCAGTTATGGTTTCTAGTTAACA
AGGGTGTTTCTTAATTTATCTTGGATTTGTTGGTAATGGGATTTATCTTGATGAATGAAT
GATCTGACTTTGTTTGTGTGTCAAGTGTGTGTAAACAACCTCCAGATCCGGTAGAAGCGT
CGTTCTCTAATCCTTGGGTTTCCACTAAAAAAGATTGATTCTTGTTT

QA 1 827 1 827
DS 

RD RS1A080JQ 773 0 0
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ACTTCGTACCTCTTTCAGGAGCTGGCTTTTCTCGATTTCCATCAGAAACCAAAAGCTTGC
CTCTCAGAGGGTCGAGGTTACAGACCTCTCTGAGCGAGCCTTCCTTTCTTGAACACAATG
TTCCCCATAGCCTCGCGCCAAGCAAGTACAGCGACATACCCGACACGTTTGATGATCTAG
ATTCCTTCAAAGATTACGATAACGGGAATGGGTTTCTTTCAGTTGCTGGATCAAACAGTG
TAGCTTTTGATCCGCAACAATCGTTTTACGACGTTGAAGATCAAGTGTTTTCACCACCTT
TACTAATGGACTCGTCCCTATTATCAGATACCTACGAAGACTTGCTAGCTCCTTTGTCAG
AAACGGAAGCCGCCTTGATGGAGCATTAGGATGAAGAAGCCATGGATCAGACAAAACGAT
GAAACTTCTGTTTCTCCAAAGATTTTTCTTGGGG*TGATTGAAGCATGTGGGTCTCATCA
CAGGTGTTTCAGTTATGGTTTCTAGTTAACAAGGGTGTTTTTTAATTTATCTTGGATTTG
TTGGTAATGGGATTTATCTTGATGAATGAATGATCTGACTTTGTTTGTGTGTCAAGTGTG
TGTAAACAACCTCCAGATCCGGTAGAAGCGTCGTTCTTTAATCCTTGGGTTTCCACTAAA
AAAGATTGATTCTTGTTTAAAAATTTAGATGTAAAGTAAAGAAAATAGTGAAG

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 3

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AAAATGGCGACCATGTCTGCTCTTCAGAGCTCTTTCACTTCTCTTTCAATAACCTCCAAC
TCCTCCTTCCTCGGCCAGCGTCTCCTTTCCCCGATTCCCCTCTCCCTCGCTTCTCCGGTC
AAACTCGTTAAGAACCCATGTCTTGTCTTTGCAAAGCTAAAGCGTTGGGAACGGAAGAAA
TGCAAACCAAACAGTCTTCCCATTCTTCACAAGATGCATGTCAAGTTCGGGGATACGGTC
AAAGTTATCTCTGGACGCGACAAGGGTAAGATTGGAGTAGTCACTAAGATCTTTACCCAC
AACAGCACCGTTGTCATCAAAGATGTCAACCTCAAGACCAAACACATGAAGAGCCGTGAA
GAGGGTGAGCCTGGCCAAATTGTCAAGATCGAAGCACCGATCCACAGCTCAAATGTGATG
CTGTATTCGAAAGAAAAGGAGGTGGTAAGCCGGGTGGGTCACAAGGTCCTTGAAGATGGG
CAGAAGGTAAGATATCTGATCAAAACTGGGGAACTTATCGACACCATCGAGAAGTGGAAG
CAACTTAAGGAGGCTAAAGATAAAGAAAATACTCAAGTTGCAGTTGCCTCTTCATCTTAA
CGTCTCCACTTTTGATATATTTGTCTGATGAATGTATTAAGTTGCTTCCTTAAATTATGC
TTAGAATGGTGTTCTATTCTAAAGATACATTTTTTACAAATTTTTTTCT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GW77TF U 3
AF RS1DF91TF U 1
AF RS1GW77JQ C 220
BS 1 290 RS1DF91TF
BS 291 291 RS1GW77TF
BS 292 337 RS1DF91TF
BS 338 338 RS1GW77TF
BS 339 478 RS1DF91TF
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BS 480 609 RS1DF91TF
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BS 611 713 RS1DF91TF
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RD RS1GW77TF 611 0 0
GG
GAAGAAGAATAAACAAGTGTTAGCGCTCCACTTGGAGAGGCGAGAACAAAGTTGAAAAAA
TGGCGACCATGTCTGCTCTTCAGAGCTCTTTCACTTCTCTTTCAATAACCTCCAACTCCT
CCTTCCTCGGCCAGCGTCTCCTTTCCCCGATTCCCCTCTCCCTCGCTTCTCCGGTCAAAC
TCGTTGGGAACCCATGTCTTGTCTTTGCAAAGCTAAAGCGTTGGGAACGGAAGAAATGCA
AACCAAACAGTCTTCCCATTCTTCACAAGATGCATGTCAAGTTCGGGGATACGGTCAAAG
TTATCTCTGGACGCGACAAGGGTAAGATTGGAGTAGTCACTAAGATCTTTACCCACAACA
GCACCGTTGTCATCAAAGATGTCAACCTCAAGACCAAACACATGAAGAGCCGTGAAGAGG
GTGAGCCTGGCCAAATTGTCAAGATCGAAGCACCGATCCACAGCTCAAATGTGATGCTGT
ATTCGAAAGAAAAGGAGGTGGTAAGCCGGGTGGGTCACAAGGTCCTTGAAGATGGGCAGA
AGGTAAGATATCTGATCAAAACTGGGGAACTTATCGACACCATCGAGAAGTGGAAGCAAC
TTAAG
GAGG

QA 3 607 3 607
DS 

RD RS1DF91TF 713 0 0
GGAAGAAGAAGAAGAAACAAGTGTTAGCGCTCCACTTGGAGAGGCGAGAACAAAGTTGAA
AAAATGGCGACCATGTCTGCTCTTCAGAGCTCTTTCACTTCTCTTTCAATAACCTCCAAC
TCCTCCTTCCTCGGCCAGCGTCTCCTTTCCCCGATTCCCCTCTCCCTCGCTTCTCCGGTC
AAACTCGTTAAGAACCCATGTCTTGTCTTTGCAAAGCTAAAGCGTTGGGAACGGAAGAAA
TGCAAACCAAACAGTCTTCCCATTCTTCACAAGATGCATGTCAAGTTCGGAGATACGGTC
AAAGTTATCTCTGGACGCGACAAGGGTAAGATTGGAGAAGTCACTAAGATCTTTACCCAC
AACAGCACCGTTGTCATCAAAGATGTCAACCTCAAGACCAAACACATGAAGAGCCGTGAA
GAGGGTGAGCCTGGCCAAATTGTCAAGATCGAAGCACCGATCCACAGCTCAAATGTGACG
CTGTATTCGAAAGAAAAGGAGGTGGTAAGCCGGGTGGGTCACAAGGTCCTTGAAGATGGG
CAGAAGGTAAGATATCTGATCAAAACTGGGGAACTTATCGACACCATCGAGAAGTGGAAG
CAACTTAAG*AGGCTAAAGATAAAGAAAATACTCAAGTTGCAGTTGCCTCTTCATCTTAA
CGTCTCCACTTTTGATATATTTGTCTGATGAATGTATTAAGTTGCTTCCTTAA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RS1GW77JQ 550 0 0
AAG
CGTTGGGAACGGAAGAAATGCAAACCAAACAGTCTTCCCATTCTTCACAAGATGCATGTC
AAGTTCGGGGATACGGTCAAAGTTATCTCTGGACGCGACAAGGGTAAGATTGGAGTAGTC
ACTAAGATCTTTACCCACAACAGCACCGTTGTCATCAAAGATGTCAACCTCAAGACCAAA
CACATGAAGAGCCGTGAAGAGGGTGAGCCTGGCCAAATTGTCAAGATCGAAGCACCGATC
CACAGCTCAAATGTGATGCTGTATTCGAAAGAAAAGGAGGTGGTAAGCCGGGTGGGTCAC
AAGGTCCTTGAAGATGGGCAGAAGGTAAGATATCTGATCAAAACTGGGGAACTTATCGAC
ACCATCGAGAAGTGGAAGCAACTTAAGGAGGCTAAGGATAAAGAAAATACTCAAGTTGCA
GTTGCCTCTTCATCTTAACGTCTCCACTTTTGATATATTTGTCTGATGAATGTATTAAGT
TGCTTCCTTAAATTATGCTTAGAATGGTGTTCTATTCTAAAGATACATTTTTTACAAATT
TTTTTCT

QA 4 550 4 550
DS 



AS 1 3

CO CL2741Contig1 783 3 14 U
AAGGGGTCACGATAATACATCTTTTTTTTTTGTAAAAGGGCATAATACATCATATTTTTG
CTTTTATTATATATTTCTTGCAATCATTTTACAAATTGGTGATATTCTATTTGCAATGTT
ATCAATGAAACTTTGTTTTCCCACATTATCAACTTTGGTTTAATCAATGGAGTAAAAAAA
TTGCTTCTAATTAAAAGCTATTGATAGAAAATTGAAAGATTACATTGCAATTTTATTACT
GTGAATGAACTTGCATGAAACAGAAGGTATTATATGAGTTATTGTTATTGAAGTTGCATG
AATATTTTAAGATCCCCAACCTCTGATAACGGTAGCTTGAGCCACACGGTTGACACCGAG
GGTGAAAGCTCCCATACGGAGATCACAAGAGTGTGTCTTGCACATCTCTTTCAAGTCTTT
GAAGCCGCGAGTCATGTAGTTTTGTAGCTCCTTGTTCACCTTTTCCTCATCCCACATGAA
TCCTTGCATGTTCTGAACCCACTCGAAGTAACTTACAGTAACTCCTCCAAAGTTTGCGTA
TATGTCTGGGAGGATCACAACACCTTTCTTCCTCAATATCTGCAGAGAAGGATAGTACTC
GTCAGCCTCAGGATCAGTTGGATGATTAGCACCTTCAATTATAAACTTTGCTTTAATCTC
ATTTGCATTTCCCCTGTTGATGACACCTCCTAGAGCTGCAGGGATCAGGATATCACAATC
TTCAACAAGAATCGAATCAGCATCGATAGAATCAGCACCATCAAACCCTTTGATTCCTCT
GTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1B338JQ U 1
AF RS1B338TF C 188
AF RS1BS02JQ U 55
BS 1 206 RS1B338JQ
BS 207 207 RS1BS02JQ
BS 208 262 RS1B338JQ
BS 263 263 RS1BS02JQ
BS 264 310 RS1B338JQ
BS 311 311 RS1BS02JQ
BS 312 380 RS1B338JQ
BS 381 381 RS1BS02JQ
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BS 390 426 RS1B338JQ
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BS 428 462 RS1B338JQ
BS 463 783 RS1BS02JQ

RD RS1B338JQ 463 0 0
AAGGGGTCACGATAATACATCTTTTTTTTTTGTAAAAGGGCATAATACATCATATTTTTG
CTTTTATTATATATTTCTTGCAATCATTTTACAAATTGGTGATATTCTATTTGCAATGTT
ATCAATGAAACTTTGTTTTCCCACATTATCAACTTTGGTTTAATCAATGGAGTAAAAAAA
TTGCTTCTAATTAAAAGCTATTGATAAAAAATTGAAAGATTACATTGCAATTTTATTACT
GTGAATGAACTTGCATGAAACAAAAGGTATTATATGAGTTATTGTTATTGAAGTTGCATG
AATATTTTAAAATCCCCAACCTCTGATAACGGTAGCTTGAGCCACACGGTTGACACCGAG
GGTGAAAGCTCCCATACGGAAATCACAAAAGTGTGTCTTGCACATCTCTTTCAAGTCTTT
GAAGCCCCGAGTCATGTAGTTTTGTAGCTCCTTGTTCACCTT
C

QA 1 462 1 462
DS 

RD RS1B338TF 276 0 0
TAATTAGAAG
CTATTGATAGAAAATTGAAAGATTACATTGCAATTTTATTACTGTGAATGAACTTGCATG
AAACAGAAGGTATTATATGAGTTATTGTTATTGAAGTTGCATGAATATTTTAAGATCCCC
AACCTCTGATAACGGTAGCTTGAGCCACACGGTTGACACCGAGGGTGAAAGCTCCCATAC
GGAGATCACAAGAGTGTGTCTTGCACATCTCTTTCAAGTCTTTGAAGCCGCGAGTCATGT
AGTTTTGTAGCTCCTTGTTCACCTT
C

QA 11 275 11 275
DS 

RD RS1BS02JQ 729 0 0
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AATGTTATCAATGAGACTTTGTTTTCCCACATTATCAACTTTGGTTTAATCAATGGAGTA
AAAAAATTGCTTCTAATTAGAAGCTATTGATAGAAAATTGAAAGATTACATTGCAATTTT
ATTACTGTGAATGAACTTGCATGAAACAGAAGGTATTATATGAGTTATTGTTATTGAAGT
TGCATGAATATTTTAAGATCCCCAACCTCTGATAACGGTAGCTTGAGCCACACGGTTGAC
ACCGAGGGTGAAAGCTCCCATACGGAGATCACAAGAGTGTGTCTTGCACATCTCTTTCAA
GTCTTTGAAGCCGCGAGTCATGTAGTTTTGTAGCTCCTTGTTCACCTTTTCCTCATCCCA
CATGAATCCTTGCATGTTCTGAACCCACTCGAAGTAACTTACAGTAACTCCTCCAAAGTT
TGCGTATATGTCTGGGAGGATCACAACACCTTTCTTCCTCAATATCTGCAGAGAAGGATA
GTACTCGTCAGCCTCAGGATCAGTTGGATGATTAGCACCTTCAATTATAAACTTTGCTTT
AATCTCATTTGCATTTCCCCTGTTGATGACACCTCCTAGAGCTGCAGGGATCAGGATATC
ACAATCTTCAACAAGAATCGAATCAGCATCGATAGAATCAGCACCATCAAACCCTTTGAT
TCCTCTGTT

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 4

CO CL2742Contig1 1516 4 7 U
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CCCTCCCTGCCGCTATCTCCTCCATAGGCGTCAACTACGGAACTCTAGGAAACCTCCCAC
CTCCGACTCAGGTGGCGAACTTCCTCAAGACTCAGACTACCATAGACAGCGTCAAGATCT
TCAACGTGAATCCAGATATCATCCGTGCCTTCGCCGGAACGGGAATCTCTGTGGTCGTCA
CCGTCCCTAACGGTGATATTCCGGCGTTAGCTAACGGGATAGAAGCTCGTCGGTGGGTTT
CTGCTAATATTCAACCTTTTCACCCTCAGACAAAGATCAAGTACATCTCTGTCGGAAATG
AGATTCTTCTCTCCGGAGATGATAACATGATCAAGAATCTTTTACCGGCGATGAAGAATC
TTAACGCTGCTTTGGTTCGTGCTGGTGTCAAAGATGTTAAGGTCACAACCGCACACTCAC
TTAACATCATAGCCTATGAGCTTAACGGTGCACCAAGCAGCGGTCGATTCAGACCTGGCT
GGGACACAGGCGTATTGGCTCCAATCCTAGCTTACCATCGCCAGACCAAGTCTCCTTTCA
TGGTTAACCCTTACCCTTACTTTGGTTTCGACCCCAAAAACGTCAACTTCGCCATTTTCC
GTTCACCGTACAAGGCGGTCCGTGACCCGTTAACCGGCAAAGTCTACACAAACATGTATG
ATACTCTCATGGACTCGACTTACTCAGCCATGAAAGCACTCGGCTACGACGATGTTGACA
TCGTCGTTGGTGAGACGGAATGGCCGTCTGCCTGCGATGCACCTTGGTGCTCTCTTGAAA
ACGCGGCTTGGTTCAACCTCAACATTATTAAACGTGCACAAGGCCAAGGAACACCTCTCA
TGCCTAACCGACGGTTCGAGACTTACATTTTCGGCCTGTTCAACGAAGAAGGCAAACCCG
GTCCAACCGCAGAGCGAAACTGGGGGCTTTTCCGGTCAGATTTTTCCCCGGTTTACGACG
TTGGCCTCCTCAAAAACAAACAAGGTGGTGGTGGTGGCCGTCCAGCACCAGCGTTGCCAG
CGCCTAGTGGTGGTGGTGGTAAATGGTGTGTGGCCAAGTCGGAAGCTACCGATGCGCAGT
TGCAAGGGAATATTGACTGGGTGTGTAGTCAAGGAGGTGTTGACTGTAAACCGATCCAAA
CCGGTGGTTCGTGCTTTAACCCTGGCAGTGTGAGGTCGCAAGCTTCTTTTGTGATGAACG
CTTATTTCCAGAAAAACGGTCGCACTGACGGGTCATGTAATTTCAGTGGAACCGGAGTCA
TCGCTGGGAACAACCCAAGCAATGGTGCGTGTAAGTACTAAGTGAGACATCTCTTTAAGA
GATTTGTCTATGTAGCATTTGTTCGGATAGACTTAACATTATGTTTTCTGGATATTCTTC
TGATTTTAAGGTTTCTTTATTCATTTCCCTTTCTTTAAATCCTTTTTATTTGAATAAATG
AAGAGGAACTTCTCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DL63TF U 1
AF RS1DL63JQ C 949
AF RS1AK63TF U 661
AF RS1AK63JQ C 698
BS 1 674 RS1DL63TF
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GGGACACAGGCGTATTGGCTCCAATCCTAGCTTACCATCGCCAGACCAAGTCTCCTTTCA
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ACACTCTCATGGACTCGACTTACTCAGCCATGAAAGCA

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TTGTGATGAACGCTTATTTCCAGAAAAACGGTCGCACTGACGGGTCATGTAATTTCAGTG
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GC
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ATT

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AATCCTTTTTATTTGAATAAATGAAGAGGAACTTCTCGT

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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GS94TF U 1
AF RS1GS94JQ C 259
AF RS1F492TF U 1
AF RS1F492JQ C 158
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TCAATTCTCCAACATTAGCTCCTTTTCTTTGTTTTTT*AATTCCCATACTAAGTTTGTTC
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CCAAAAA

QA 1 710 1 710
DS 

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CTATGTTTTTTAGTTGCTCAGGCCTAGTAGACACAAAGTATCAGTTCCAATACCAAGGAT
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T*CCTCAAACTCTTTTCTTAGTTCCCCTCTTCTTGTTTCATTTTCTTTCTTTGGCTTGAT
GGAGGATGCAGAAGAAGCACAAACAGCAAGGGTTTGGTTTGATCAATTCTCCAACATTAG
CTCCTTTTCTTTGTTTTTTTAATTCCCATACTAAGTTTGTTCCTCCCATGTAAGAAGATT
ATTATTTACAATGCATTCAAGGGTAATTTAAC
CC

QA 1 452 1 452
DS 

RD RS1F492TF 742 0 0
GGAGATTTCTTTGTTTCTGTGGAAGGAAGAAAGAAAAAGATGGAGGAGGAGAAGAAGAAG
CAAAAATCAGAGATTTCGTCAACGGAAGCTGTTCTTCTCGGAGCTCTAGCTCCAGGCGTC
AATGCTCCAACATGGAACACTCTGAGATTCGCGTTTCTTCTGCTGGGTCTCTGTCTCACT
TTCATGCTCTCCATAGCTTTCGCCAGTGGCCAATCCATGTTACTTGTTCACGTTGGCTTC
CTCATTCTAATCGCATCTTCTCTCTTTGTCCTCCTCAATTGGTTTCTTGCTCAGACAGGG
TTAGTACCAGTTGAGACACAGATGCAGGAGTTGAACTTGGCACCTACCACTGATAATAGC
AATTGATCAAGGACGACGCTATGTTTTTTAGTTGCTCAGGCCTAGTAGACACAAAGTATC
AGTTCCAATACCAAGGATTTGATTTGGTGCAACCAGAAAAATCCTGTTTCTGTTAAAAGT
ATACAATCAGCTTTTGCTTTCCTCAAACTCTTTTCTTAGTTCCCCTCTTCTTGTTTCATT
TTCTTTCTTTGGCTTGATGGAGGATGCAGAAGAAGCACAAACGGCAAGGGTTTGGTTTGA
TCAATTCTCCAACATTAGCTCCTTTTCTTTGTTTTTT*AATTCCCATACTAAGTTTGTTC
CTCCCATGTAAGAAGATTATTATTTACAATGCATTCAAGGGTAATTTAACTCAGATCCAT
CCCTCAGT
AGAACCAATGACTG

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1F492JQ 590 0 0
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TGTTACTTGTTCACGTTGGCTTCCTCATTCTAATCGCATTTTCTCTCTTTGTCCTCCTCA
ATTGGTTTCTTGCTCAGACAGGGTTAGTACCAGTTGAGACACAGATGCAGGAGTTGAACT
TGGCACCTACCACTGATAATAGCAATTGATCAAGGACGACGCTATGTTTTTTAGTTGCTC
AGGCCTAGTAGACACAAAGTATCAGTTCCAATACCAAGGATTTGATTTGGTGCAACCAGA
AAAATCCTGTTTCTGTTAAAAGTATACAATCAGCTTTTGCTTTCCTCAAACTCTTTTTTT
AGTTCCCCTCTTCTTGTTTCATTTTCTTTCTTTGGCTTGATGGAGGATGCAGAAGAAGCA
CAAACGGCAAGGGTTTGGTTTGATCAATTCTCCAACATTAGCTCCTTTTCTTTGTTTTTT
TAATTCCCATACTAAGTTTGTTCCTCCCATGTAAGAAGATTATTATTTACAATGCATTCA
AGGGTAATTTAACTCAGATCCATCCCTCAGTTAAGAAACCAATGAACTTG

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 3

CO CL2744Contig1 478 3 15 U
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CAACTCTTTATACATGTGTTTCTTCTAAGCCTGTGGAAACAGAATTTTCAAGTACTGTGT
AGCCATCCATCCGAGAATGTAGAAGTAAACAATGACCAAACACGCACGCTTCACTTGTAC
CAAGAGATTCACTTTAGACAGCTGGCTCTTAACCGAACAACACGCTCGAGGGAACCAAGA
TTTTGCATTACTTAAGATCCGTACGATGAAGACTGTGATTATGGAAGTAAAAAAGCCAGA
TACAACGCCAGCTATCACATCATATCTCCAGAACTTTGGTCTTCCTTTTCCATTGAACCA
GGACTGTATTAAATTGGAAACTAAAACAGCGTATTGTTTAAAAATGTCGGTGAAAGAAAG
ATCATTTGGTTGGCAGCCAAAAAAGCCGTCCTGATAAAGCTTGATTTTTGGAATCCCT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GM85JQ U 1
AF RS1GM85TF C 1
AF RS1D860JQ U 1
BS 1 101 RS1D860JQ
BS 102 102 RS1GM85JQ
BS 103 141 RS1D860JQ
BS 142 142 RS1GM85JQ
BS 143 185 RS1D860JQ
BS 186 186 RS1GM85JQ
BS 187 196 RS1D860JQ
BS 197 197 RS1GM85JQ
BS 198 238 RS1D860JQ
BS 239 239 RS1GM85JQ
BS 240 255 RS1D860JQ
BS 256 256 RS1GM85JQ
BS 257 270 RS1D860JQ
BS 271 271 RS1GM85JQ
BS 272 478 RS1D860JQ

RD RS1GM85JQ 281 0 0
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CAACTCTTTATACATGTGTTTCTTCTAAGCCTGTGGAAACAGAATTTTCAAGTACTGTGT
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CAAGAGATTCACTTTAGACAGCTGGCTCTTAACCGAACAACACGCTCGAGGGAACCAAGA
TTTTGCATTACTTAAGATCCGTACGATGAAGACTGTGATT
C

QA 1 280 1 280
DS 

RD RS1GM85TF 281 0 0
CTAAAACTGTTCCTCTGCATTGCTTACTTTTGCTGTAAATGGTTTAAAGATTACATCACA
CAACTCTTTATACATGTGTTTCTTCTAAGCCTGTGGAAACAGAATTTTCAAGTACTGTGT
AGCCATCCATCCGAGAATGTAGAAGTAAACAATGACCAAACACGCACGCTTCACTTGTAC
CAAGAGATTCACTTTAGACAGCTGGCTCTTAACCGAACAACACGCTCGAGGGAACCAAGA
TTTTGCATTACTTAAGATCCGTACGATGAAGACTGTGATT
C

QA 1 280 1 280
DS 

RD RS1D860JQ 478 0 0
CTAAAACTGTTCCTCTGCATTGCTTACTTTTGCTGTAAATGGTTTAAAGATTACATCACA
CAACTCTTTATACATGTGTTTCTTCTAAGCCTGTGGAAACAAAATTTTCAAGTACTGTGT
AGCCATCCATCCGAGAATGTAAAAGTAAACAATGACCAAACACGCACGCTTCACTTGTAC
CAAGAAATTCACTTTAAACAGCTGGCTCTTAACCGAACAACACGCTCGAGGGAACCAAAA
TTTTGCATTACTTAAAATCCGTACGATGAAAACTGTGATTATGGAAGTAAAAAAGCCAGA
TACAACGCCAGCTATCACATCATATCTCCAGAACTTTGGTCTTCCTTTTCCATTGAACCA
GGACTGTATTAAATTGGAAACTAAAACAGCGTATTGTTTAAAAATGTCGGTGAAAGAAAG
ATCATTTGGTTGGCAGCCAAAAAAGCCGTCCTGATAAAGCTTGATTTTTGGAATCCCT

QA 1 478 1 478
DS 



AS 1 4

CO CL2745Contig1 1036 4 8 U
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AACATAATCCCATCGGAGAAACGATCGATCGTCACCTTCGTTTTACTTGCCGGTCTTATC
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ATCCAGCTCCAAGCCATCGTCCACTACGCGACCTCCACCATAACCCCACAACAAAACATC
CACGAGATCTCAATCTCTTTCAACGTCTTGAAAGAGCTAGCTCCGGCCAACTTCCTCGTC
TTCGGTCTGGGCCTCGACTCGCTCATGTGGGCTTCTCTTAACCCACGTGGCAAAACCATG
TTCCTCGAAGAAGATCTCGAGTGGTTTCAGAAAGTAACCAAAGACTCTCCTTTCCTCCAC
GCCCATCACGTGCGCTACAGAACGCAGCTACAAGAAGCCGACAAGCTTCTGCGTTCTTAC
AAAACCGAACCTAGCTGTTTCCCTGCGAAGGCGTATCTCAGAGGAAACGAACGTTGTAAG
CTCGCTCTCACGGGGCTTCCGGACGAGTTCTACGACACGGAGTGGGATCTGATCATGCTC
GATGCTCCTAAAGGTTACTTCGCCGAAGCTCCGGGAAGAATGGCGGCGATTTACTCGGCG
GCGGTTATGGCTAGGAGCCGGAAGAAACCTGGAGTCACTCACGTGTTCTTGCACGACGTT
AACCGGAGGGTTGAGAAGACTTTCGCGGAGGAGTTTCTATGCGCAAAATACAGAGTTCAT
GCCGCCGGGAGGTTATGGCATTTCGCGATTCCTCCGGGGGCTGCAAACGCTACAATCGAC
GGTGGGGATTACAGGTTTTGTTAAAGATTGTGACACGTCACACAGCTTTTGTCATTTCCA
CTTTTGCCCCTTTTCACTTTTCGGATCTTATTACATAGGATTCACTTATTATTTGATTTA
ATGCCGACAGTTTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AA09JQ C 438
AF RS1AI01TF U 1
AF RS1AA09TF U 38
AF RS1AI01JQ C 436
BS 1 121 RS1AI01TF
BS 122 122 RS1AA09TF
BS 123 449 RS1AI01TF
BS 450 450 RS1AA09TF
BS 451 796 RS1AI01TF
BS 797 797 RS1AI01JQ
BS 798 824 RS1AA09TF
BS 825 1036 RS1AI01JQ

RD RS1AA09JQ 207 0 0
CGAGTGGTTTCAGAAAGTAACCAAAGACTCTCCTTTCCTCCACGCCCATCACGTGCGCTA
CAGAACGCAGCTACAAGAAGCCGACAAGCTTCTGCGTTCTTACAAAACCGAACCTAGCTG
TTTCCCTGCGAAGGCGTATCTCAGAGGAAACGAACGTTGTAAGCTCGCTCTCACGGGGCT
TCCGGACGAGTTTTACGACACGGAGTG

QA 1 207 1 207
DS 

RD RS1AI01TF 805 0 0
GGGACAAAACACACAAAAAGAAACAGTCAGATCTGAAATAAAGAAACAAACAGGATGAGC
AACATAATCCCATCGGAGAAACGATCGATCGTCACCTTCGTTTTACTTGCCGGTCTTATC
GGCAGCGCTCTACTCTTCACAGCCTTCATACGATCAGCCGACGACGCTTTCTTCCTCTGC
TCCACCGCAAGCGCCAAAAGCCGAGCGGTGGCCGCAGCGGCAGATTACTCAGCGACACCG
ATCCAGCTCCAAGCCATCGTCCACTACGCGACCTCCACCATAACCCCACAACAAAACATC
CACGAGATCTCAATCTCTTTCAACGTCTTGAAAGAGCTAGCTCCGGCCAACTTCCTCGTC
TTCGGTCTGGGCCTCGACTCGCTCATGTGGGCTTCTCTTAACCCACGTGGCAAAACCATG
TTCCTCGAAGAAGATCTCGAGTGGTTTCATAAAGTAACCAAAGACTCTCCTTTCCTCCAC
GCCCATCACGTGCGCTACAGAACGCAGCTACAAGAAGCCGACAAGCTTCTGCGTTCTTAC
AAAACCGAACCTAGCTGTTTCCCTGCGAAGGCGTATCTCAGAGGAAACGAACGTTGTAAG
CTCGCTCTCACGGGGCTTCCGGACGAGTTCTACGACACGGAGTGGGATCTGATCATGCTC
GATGCTCCTAAAGGTTACTTCGCCGAAGCTCCGGGAAGAATGGCGGCGATTTACTCGGCG
GCGGTTATGGCTAGGAGCCGGAAGAAACCTGGAGTCACTCACGTGTTCTTGCACGACGTT
AACCGGAGGGTTGAGA
AGACTTTCG

QA 1 796 1 796
DS 

RD RS1AA09TF 787 0 0
GG
AAAGAAACAAACAGGATGAGCAACATAATCCCATCGGAGAAACGATCGATCGTCACCTTC
GTTTTACTTGCCGGTCTTATCGACAGCGCTCTACTCTTCACAGCCTTCATACGATCAGCC
GACGACGCTTTCTTCCTCTGCTCCACCGCAAGCGCCAAAAGCCGAGCGGTGGCCGCAGCG
GCAGATTACTCAGCGACACCGATCCAGCTCCAAGCCATCGTCCACTACGCGACCTCCACC
ATAACCCCACAACAAAACATCCACGAGATCTCAATCTCTTTCAACGTCTTGAAAGAGCTA
GCTCCGGCCAACTTCCTCGTCTTCGGTCTGGGCCTCGACTCGCTCATGTGGGCTTCTCTT
AACCCACGTGGCAAAACCATGTTCCTCGAAGAAGATCTCGAGTGGTTTCAGAAAGTAACC
AAAGACTCTCCTTTCCTCCACGCCCATCACGTGCGCTACAGAACGCAGCTACAAGAAGCC
GACAAGCTTCTGCGTTCTTACAAAACCGAACCTAGCTGTTTCCCTGCGAAGGCGTATCTC
AGAGGAAACGAACGTTGTAAGCTCGCTCTCACGGGGCTTCCGGACGAGTTCTACGACACG
GAGTGGGATCTGATCATGTTCGATGCTCCTAAAGGTTACTTCGCCGAAGCTCCGGGAAGA
ATGGCGGCGATTTACTCGGCGGCGGTTATGGCTAGGAGCCGGAAGAAACCTGGAGTCACT
CACGTGTTCTTGCACGACGTTAACCGGAGGGTTGAGA*GACTTTCGCGGAGGAGTTTCTA
TGCGC

QA 3 787 3 787
DS 

RD RS1AI01JQ 601 0 0
CT
CGAGTGGTTTCATAAAGTAACCAAAGACTCTCCTTTCCTCCACGCCCATCACGTGCGCTA
CAGAACGCAGCTACAAGAAGCCGACAAGCTTTTGCGTTCTTACAAAACCGAACCTAGCTG
TTTCCCTGGGAAGGCGTATTTCAGAGGAAACGAACGTTGTAAGCTCGCTCTCACGGGGCT
TCCGGACGAGTTTTACGACACGGAGTGGGATCTGATCATGCTCGATGCTCCTAAAGGTTA
CTTCGCCGAAGCTCCGGGAAGAATGGCGGCGATTTACTCGGCGGCGGTTATGGCTAGGAG
CCGGAAGAAACCTGGAGTCACTCACGTGTTCTTGCACGACGTTAACCGGAGGGTTGAGAA
GACTTTCGCGGAGGAGTTTTTATGCGCAAAATACAGAGTTCATGCCGCCGGGAGGTTATG
GCATTTCGCGATTCCTCCGGGGGCTGCAAACGCTACAATCGACGGTGGGGATTACAGGTT
TTGTTAAAGATTGTGACACGTCACACAGCTTTTGTCATTTCCACTTTTGCCCCTTTTCAC
TTTTCGGATCTTATTACATAGGATTCACTTATTATTTGATTTAATGCCGACAGTTTTGG

QA 3 601 3 601
DS 



AS 1 4

CO CL2746Contig1 692 4 9 U
GGTTATCGAGTGGGTAAGAAGAGAAACAGAAACAGAAGATATGGCGAATTCAATCTGCTT
CTTCTCTTCTCCTCCTCCTCCTACCTTTTGCCTTCTTCAGTCTCCCGGAAAAAGTGTTAA
ACCTCCTCTCTTCTTCCCCATTGGTAATAAGAAGAGTGAAGTGTTTAAGACTTGCAAATC
CAAAAGCTTCGAGATTCAGGCAACCAACGGTACTCAGACTCCTAAAGTCAGCAGCATAGT
TTGTCAAAAGTGTGAAGGGAATGGTGCTGTGGCATGTTCACAATGCAAAGGAGGTGGTGT
GAATTTGACTGATCATTTTAATGGGCAGTTTAAAGCTGGTGGCCTCTGTTGGCTTTGCAG
AGGTAAAAAGGAGGTTTTGTGTGGAGAATGCAACGGAGCTGGTTTCATTGGTGGTTTCTT
GAGCACCTTCGATGAGTAATGCAGAAAAGCTTCTTCTTTGTGCTATTATTATTATCCATT
CAAAAACGTCAGAAGAAGTTTTCTTTCTCTATCAATGCTGAATGTGTTGCTTTTTCTTGT
TGAACACTATCTTTGATCGTTTTGTTGTTTTTTTTTCATGTCTCTCTCACATTTCATGTT
CTTCATCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCATGTCTCGAGTTCTTGTAACCAAAACGGTCATA
AAGATTGTTATCGTAACTACTTTTTAAGATCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1EW90JQ C 1
AF RS1EW90TF U 1
AF RS1AJ63JQ C 8
AF RS1AJ63TF U 8
BS 1 9 RS1EW90JQ
BS 10 25 RS1EW90TF
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BS 27 405 RS1EW90TF
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BS 467 467 RS1AJ63TF
BS 468 678 RS1EW90TF
BS 679 692 RS1AJ63TF

RD RS1EW90JQ 678 0 0
GGTTATCGAGTGGGTAAGAAGAGAATCAGAAACAGAAGATATGGCGAATTCAATCTGCTT
CTTCTCTTCTCCTCCTCCTCCTACCTTTTGCCTTCTTCAGTCTCCCGGAAAAAGTGTTAA
ACCTCCTCTCTTCTTCCCCATTGGTAATAAGAAGAGTGAAGTGTTTAAGACTTGCAAATC
CAAAAGCTTCGAGATTCAGGCAACCAACGGTACTCAGACTCCTAAAGTCAGCAGCATAGT
TTGTCAAAAGTGTGAAGGGAATGGTGCTGTGGCATGTTCACAATGCAAAGGAGGTGGTGT
GAATTTGACTGATCATTTTAATGGGCAGTTTAAAGCTGGTGGCCTCTGTTGGCTTTGCAG
AGGTAAAAAGGAGGTTTTGTGTGGAGAATGCAACGGAGCTGGTTTTATTGGTGGTTTCTT
GAGCACCTTCGATGAGTAATGCAGAAAAGCTTCTTCTTTGTGCTAT*ATTATTATCCATT
CAAAAACGTCAGAAGAAGTTTTCTTTCTCTATCAATGCTGAATGTGTTGCTTTTTCTTGT
TGAACACTATCTTTGATCGTTTTGTTGTTTTTTTTTCATGTCTCTCTCACATTTCATGTT
CTTCATCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCATGTCTCGAGTTCTTGTAACCAAAACGGTCATA
AAGATTGTTATCGTAACT

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1EW90TF 678 0 0
GGTTATCGA
GTGGGTAAGAAGAGAATCAGAAACAGAAGATATGGCGAATTCAATCTGCTTCTTCTCTTC
TCCTCCTCCTCCTACCTTTTGCCTTCTTCAGTCTCCCGGAAAAAGTGTTAAACCTCCTCT
CTTCTTCCCCATTGGTAATAAGAAGAGTGAAGTGTTTAAGACTTGCAAATCCAAAAGCTT
CGAGATTCAGGCAACCAACGGTACTCAGACTCCTAAAGTCAGCAGCATAGTTTGTCAAAA
GTGTGAAGGGAATGGTGCTGTGGCATGTTCACAATGCAAAGGAGGTGGTGTGAATTTGAC
TGATCATTTTAATGGGCAGTTTAAAGCTGGTGGCCTCTGTTGGCTTTGCAGAGGTAAAAA
GGAGGTTTTGTGTGGAGAATGCAACGGAGCTGGTTTTATTGGTGGTTTCTTGAGCACCTT
CGATGAGTAATGCAGAAAAGCTTCTTCTTTGTGCTAT*ATTATTATCCATTCAAAAACGT
CAGAAGAAGTTTTCTTTCTCTATCAATGCTGAATGTGTTGCTTTTTCTTGTTGAACACTA
TCTTTGATCGTTTTGTTGTTTTTTTTTCATGTCTCTCTCACATTTCATGTTCTTCATCTC
CCTCTCTCTCTCTCTCTCATGTCTCGAGTTCTTGTAACCAAAACGGTCATAAAGATTGTT
ATCGTAACT

QA 10 678 10 678
DS 

RD RS1AJ63JQ 684 0 0
GG
GTGGGTAAGAAGAGAAACAGAAACAGAAGATATGGCGAATTCAATCTGCTTCTTCTCTTC
TCCTCCTCCTCCTACCTTTTGCCTTCTTCAGTCTCCCGGAAAAAGTGTTAAACCTCCTCT
CTTCTTCCCCATTGGTAATAAGAAGAGTGAAGTGTTTAAGACTTGCAAATCCAAAAGCTT
CGAGATTCAGGCAACCAACGGTACTCAGACTCCTAAAGTCAGCAGCATAGTTTGTCAAAA
GTGTGAAGGGAATGGTGCTGTGGCATGTTCACAATGCAAAGGAGGTGGTGTGAATTTGAC
TGATCATTTTAATGGTCAGTTTAAAGCTGGTGGCCTCTGTTGGCTTTGCAGAGGTAAAAA
GGAGGTTTTGTGTGGAGAATGCAACGGAGCTGGTTTCATTGGTGGTTTCTTGAGCACCTT
CGATGAGTAATGCAGAAAAGCTTCTTCTTTGTGCTATTATTATTATCCATTCAAAAACGT
CAGAAGAAGTTTTCTTTCTCTATCAATGCTGAATGTGTTGCTTTTTCTTGTTGAACACTA
TCTTTGATCGTTTTGTTGTTTTTTTTTCATGTCTCTCTCACATTTCATGTTCTTCATCTC
CCTCTCTCTCTCTCTCTCATGTCTCGAGTTCTTGTAACCAAAACGGTCATAAAGATTGTT
ATCGTAACTACTTTTTAAGATC

QA 3 684 3 684
DS 

RD RS1AJ63TF 685 0 0
GG
GTGGGTAAGAAGAGAAACAGAAACAGAAGATATGGCGAATTCAATCTGCTTCTTCTCTTC
TCCTCCTCCTCCTACCTTTTGCCTTCTTCAGTCTCCCGGAAAAAGTGTTAAACCTCCTCT
CTTCTTCCCCATTGGTAATAAGAAGAGTGAAGTGTTTAAGACTTGCAAATCCAAAAGCTT
CGAGATTCAGGCAACCAACGGTACTCAGACTCCTAAAGTCAGCAGCATAGTTTGTCAAAA
GTGTGAAGGGAATGGTGCTGTGGCATGTTCACAATGCAAAGGAGGTGGTGTGAATTTGAC
TGATCATTTTAATGGTCAGTTTAAAGCTGGTGGCCTCTGTTGGCTTTGCAGAGGTAAAAA
GGAGGTTTTGTGTGGAGAATGCAACGGAGCTGGTTTCATTGGTGGTTTCTTGAGCACCTT
CGATGAGTAATGCAGAAAAGCTTCTTCTTTGTGCTATTATTATTATCCATTCAAAAACGT
CAGAAGAAGTTTTCTTTCTCTATCAATGCTGAATGTGTTGCTTTTTCTTGTTGAACACTA
TCTTTGATCGTTTTGTTGTTTTTTTTTCATGTCTCTCTCACATTTCATGTTCTTCATCTC
CCTCTCTCTCTCTCTCTCATGTCTCGAGTTCTTGTAACCAAAACGGTCATAAAGATTGTT
ATCGTAACTACTTTTTAAGATCA

QA 3 685 3 685
DS 



AS 2 4

CO CL2747Contig1 637 2 1 U
GGGCTCCTTCATTTGCTTGCCGCCGCATCATCTCCCTCGCAGGTAAGTAAGCAAGTCACA
GGCAAACCGAAAAGATGGGGCGTGTCAGAACCAAGACGGTGAAGAAATCATCTCGCCAGG
TGATCGAGAAATACTACTCTCGCAAGACACTCGACTTCCACACCAACAAGAAAATCCTCG
AGGAAGTGGCAATCTCCCTTCGAAGCGTCTCCGCAACAAGATCGCCGGGTTCTCCACCCA
TCTCATGAAGAGGATCCAGAAGGGACCGGTGCGTGGCATCTCACTCAAGCTCCAAGAGGA
GGAGCGTGAGCGCCGCATGGACTTTGTCCCCGACGAGTCTGCTATCAGGACCGATGTGAT
CAAGGTCGACAAAGAGACTCTCGAGATGCTTGCCTCCCTTGGAATGGGTGACACTCCCGG
CGTCTCTATAGTCGAGACACAGGCTCCGGCAACTACTTTTAACAGGCCACCCAGAAGGTT
CTGAGGAGTGTGTGTTTGGCTGTTGTTTTTTTTTCTTCATTGTTAGGGACAAAAGAGTTG
CATTTCGAGTGTTTATGTCTTTTGATTCTAGACTTATGTCTGAAACTGAATGTTAAGACT
CTTTTTCTATTCCATGCTTTTTTGAGTTTTGATGATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1F237JQ C 1
AF RS1F237TF U 1
BS 1 637 RS1F237TF

RD RS1F237JQ 637 0 0
GGGCTCCTTCATTTGCTTGCCGCCGCATCATCTCCCTCGCAGGTAAGTAAGCAAGTCACA
GGCAAACCGAAAAGATGGGGCGTGTCAGAACCAAGACGGTGAAGAAATCATCTCGCCAGG
TGATCGAGAAATACTACTCTCGCAAGACACTCGACTTCCACACCAACAAGAAAATCCTCG
AGGAAGTGGCAATCTCCCTTCGAAGCGTTTCCGCAACAAGATCGCCGGGTTCTCCACCCA
TTTCATGAAGAGGATCCAGAAGGGACCGGTGCGTGGCATCTCACTCAAGCTCCAAGAGGA
GGAGCGTGAGCGCCGCATGGACTTTGTCCCCGACGAGTTTGCTATCAGGACCGATGTGAT
CAAGGTCGACAAAGAGACTCTCGAGATGCTTGCCTCCCTTGGAATGGGTGACACTCCCGG
CGTCTCTATAGTCGAGACACAGGCTCCGGCAACTACTTTTAACAGGCCACCCAGAAGGTT
TTGAGGAGTGTGTGTTTGGCTGTTGTTTTTTTTTTTTCATTGTTAGGGACAAAAGAGTTG
CATTTCGAGTGTTTATGTCTTTTGATTCTAGACTTATGTCTGAAACTGAATGTTAAGACT
CTTTTTCTATTCCATGCTTTTTTGAGTTTTGATGATC

QA 1 637 1 637
DS 

RD RS1F237TF 637 0 0
GGGCTCCTTCATTTGCTTGCCGCCGCATCATCTCCCTCGCAGGTAAGTAAGCAAGTCACA
GGCAAACCGAAAAGATGGGGCGTGTCAGAACCAAGACGGTGAAGAAATCATCTCGCCAGG
TGATCGAGAAATACTACTCTCGCAAGACACTCGACTTCCACACCAACAAGAAAATCCTCG
AGGAAGTGGCAATCTCCCTTCGAAGCGTCTCCGCAACAAGATCGCCGGGTTCTCCACCCA
TCTCATGAAGAGGATCCAGAAGGGACCGGTGCGTGGCATCTCACTCAAGCTCCAAGAGGA
GGAGCGTGAGCGCCGCATGGACTTTGTCCCCGACGAGTCTGCTATCAGGACCGATGTGAT
CAAGGTCGACAAAGAGACTCTCGAGATGCTTGCCTCCCTTGGAATGGGTGACACTCCCGG
CGTCTCTATAGTCGAGACACAGGCTCCGGCAACTACTTTTAACAGGCCACCCAGAAGGTT
CTGAGGAGTGTGTGTTTGGCTGTTGTTTTTTTTTCTTCATTGTTAGGGACAAAAGAGTTG
CATTTCGAGTGTTTATGTCTTTTGATTCTAGACTTATGTCTGAAACTGAATGTTAAGACT
CTTTTTCTATTCCATGCTTTTTTGAGTTTTGATGATC

QA 1 637 1 637
DS 



CO CL2747Contig2 710 2 2 U
GATTTGAATTTATGAAAGTATAAACTCCAGTGGCAATCACATAGACAACTGTTATTACCA
AGACTTACTCAAAGATCATCAAAACTCAAAAAGCATGGAATAGAAAAAGAGTCTTAACTT
TCAGTTTCAGACATAAGTCTAGAATCAAAAGACATAAACACTCGAAATGCAACTCTTTTG
TCCCTAACAGTGAAGAAATAAAAACAACAGTCAAACAAACTCTCCTCAGAACCTTCTGGG
TGGCCTGTTAAAAGTAGGTGCCGGAGCCTGTGTCTCGACTATAGAGACGCCAGGAGTGTC
ACCCATTCCAAGGGAAGCAAGCATCTAGAGAGTCTCTTTGTCGACCTTGATCACATCGGT
CCTGATAGCAGACTCGTCGGGGACAAAGTCCATGCGGCGCTCACGCTCTTCCTCTTGGAG
CTTGAGTGAGATGCCACGCACTGGTCCCTTCTGGATCCTCTTCATGAGATGGGTGGAGAA
TCCGGCGATCTTATTGCGGAGACGCTTCGAAGGGATGATTGCGACTTCTTCGAGGATCTT
CTTGTTGGTGTGGAAGTCGAGTGTCATGCGAGAGTAGTATTTCTCGATCACCTGACGAGA
TGATTTCTTCACCGTCTTGGTTCGGACACGCCCCATCTTTTCGGTTTGCCTGTGACTTGC
TTACTTACCTGCGAGGAAGATGATGCGGCGGTAAACAAATGAAGGAGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1F394TF C 1
AF RS1F394JQ U 17
BS 1 18 RS1F394TF
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RD RS1F394TF 710 0 0
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TCAGTTTCAGACATAAGTCTAGAATCAAAAGACATAAACACTCGAAATGCAACTCTTTTG
TCCCTAACAGTGAAGAAATAAAAACAACAGTCAAACAAACTCTCCTCAGAACCTTCTGGG
TGGCCTGTTAAAAGTAGGTGCCGGAGCCTGTGTCTCGACTATAGAGACGCCAGGAGTGTC
ACCCATTCCAAGGGAAGCAAGCATCTAGAGAGTCTCTTTGTCGACCTTGATCACATCGGT
CCTGATAGCAGACTCGTCGGGGACAAAGTCCATGCGGCGCTCACGCTCTTCCTCTTGGAG
CTTGAGTGAGATGCCACGCACTGGTCCCTTCTGGATCCTCTTCATGAGATGGGTGGAGAA
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CTTGTTGGTGTGGAAGTCGAGTGTCATGCGAGAGTAGTATTTCTCGATCACCTGACGAGA
TGATTTCTTCACCGTCTTGGTTCGGACACGCCCCATCTTTTCGGTTTGCCTGTGACTTGC
TTACTTACCTGCGAGGAAGATGATGCGGCGGTAAACAAATGAAGGAGCCC

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DS 

RD RS1F394JQ 694 0 0
GT
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TCAAAACTCAAAAAGCATGGAATAGAAAAAGAGTCTTAACTTTCAGTTTCAGACATAAGT
CTAGAATCAAAAGACATAAACACTCGAAATGCAACTCTTTTGTCCCTAACAGTGAAGAAA
TAAAAACAACAGTCAAACAAACTCTCCTCAGAACCTTCTGGGTGGCCTGTTAAAAGTAGG
TGCCGGAGCCTGTGTCTCGACTATAGAGACGCCAGGAGTGTCACCCATTCCAAGGGAAGC
AAGCATCTAGAGAGTCTCTTTGTCGACCTTGATCACATCGGTCCTGATAGCAGACTCGTC
GGGGACAAAGTCCATGCGGCGCTCACGCTCTTCCTCTTGGAGCTTGAGTGAGATGCCACG
CACTGGTCCCTTCTGGATCCTCTTCATGAGATGGGTGGAGAATCCGGCGATCTTATTGCG
GAGACGCTTCGAAGGGATGATTGCGACTTCTTCGAGGATCTTCTTGTTGGTGTGGAAGTC
GAGTGTCATGCGAGAGTAGTATTTCTCGATCACCTGACGAGATGATTTCTTCACCGTCTT
GGTTCGGACACGCCCCATCTTTTCGGTTTGCCTGTGACTTGCTTACTTACCTGCGAGGAA
GATGATGCGGCGGTAAACAAATGAAGGAGCCC

QA 3 694 3 694
DS 



AS 1 3

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CAAGTAAAAAAGCAGAAGAACCAACCAACAACAATACTAAAACCAGAGAAGCAGAACACC
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AACGCACCATCACACTGCCTTTAACGCCAACAACCATAGCGTTCCAGTCGATCTCAGGGA
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GCAGGTAAGCAAACGGCTCACCAAGACACCCGTGCCTTCCTCCACCGAACGAAATGTACG
AAAACGCTCCCGCAGCTTTGTCCTCTTCTCTTCCAGGAGAGAATCTATCCGGGTCATAGC
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TATGACCCTTGGGGATGTCAAAGGTCTTCCCATCACGAGCCGTCACGCTGAAGTCACTGT
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TCAGCTTCCTCTGCTCATCCTGAGCCTCCGAGAAGTACTCTTTGTACTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
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25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D490JQ U 1
AF RS1C425TF C 36
AF RS1D803JQ U 34
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RD RS1D490JQ 644 0 0
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TATGACCTTTCGGGATGTCAAAGGTCTTCCCATCACGTGCCGTCACGCTGAAGTCACTGT
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QA 1 644 1 644
DS 

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TCAATCTTGTCTCCGTG
C

QA 1 677 1 677
DS 

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GT
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AAATGACTCCATATGGCTTTGATCTGCAGGTAAGCAAACGGCTCACCAAGACACCCGTGC
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GCAAACGCAGGCGAGGTAGCAACGATATGACCCTTGGGGATGTCAAAGGTCTTCCCATCA
CGAGCCGTCACGCTGAAGTCACTGTGAGAGGCTCTCATGAGCATGATCAACGGAGGGTGA
AGCCTCAGCGCTTCCTTGATACATCTGTAAAGCACATCCATCTCGGACAAGATATCGTGA
TCAATCTTGTCTCCGTGTTTCTCCATCAGCTTCCTCTGCTCATCCTGAGCCTCCGAGAAG
TACTCTTTGTACTTC

QA 3 737 3 737
DS 



AS 1 4

CO CL2749Contig1 1085 4 12 U
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TATTAGTTCTCTCTTCTTCTTAAAACCTCTGCCTCCATCAGAACAGAACAGAGGAACGAA
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TGGTTGCGTTGATTGTAGCTGGAAGTTTGCAGATACCTGACAAGGTCACACGATGGTACT
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TTAACTTAGTGATTAAGACAAAGAGCGTTGAGTTTATGCCGTTTTATCTCTCTCTATCTA
CTTTCTTGATGAGTGCTTCCTTCTTCATGTTCGGACTATTCAACAGTGACGCCTTTGTTT
ATACACCAAATGGGATAGGAACGATTCTTGGTATTGTACAGCTATCTTTGTACTGTTACT
ACCACAGAAACTCTCTAGAGGAAGAAACAAAAGAGCCTTTGATTGTTTCTTATGCGTGAG
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AAAGATTCACTGATGTGGATTTTGTTTTTTTGTGTGTGTGATGGAGATTTCTGGTGGGTT
GATTTTGAAGAACATTTGTCCGTATATTGTTTTTTTTAAAAGAAGATTATTCTATTTGTT
TGTAC


BQ
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BQ
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TCATCAATGGCAGAAACAGCAGCTACTTCAACTCTCTCTGGTAAAACAACTTCTGTTTTA
ATGGTTCTAGGACCAAAAATGGATTCAACGAATCTGTGTCCCATCGCATTTCCAGCTCCC
CAATTAAACCCATCAGCTATGGATGAAAAAA**ACTTCCGCGACTAGATTCACAATGAAC
CGTCTCAACTTTAGGGGAAACTTTAGCAGGAGGAGGCGCTTTTTCATCTTTCTCATCTTT
GGCAGGCTT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RS1BJ58JQ 715 0 0
CTAGCAAAACACAAAACTAAAAGACTTTATTTTATCCAAGACATACGATAATTCATACAC
TTGGTTGGTCAAATTAACCAAGAAACACAGCCACATGATAAACGATTTAATCAACGAGAG
TTTTTAAATCTTAATTTATTGGAAAACACTAACTAAGAAAGAAAAAGAGAATTATAAAAT
CCCAACTTAAAAGTTGAAGGAACTAGAGTTCTTCCTGCACTCGAAGAGCGAATCCATGAA
TACGTGACATTTGCTTAGTTTATTCCCTTCCACGTTCAAGCATTCTTGAAATGCATTATA
GCTTATGCTACATGATTCAGTGTAGTCCTTGTATTTATCGTTATCATCAATGGCAGAAAC
AGCAGCTACTTCAACTCTCTCTGGTAAAACAACTTCTGTTTTAATGGTTCTAGGACCAAA
AATGGATTCAACGAATCTGTGTCCCATCGCATTTCCAGCTCCCCAATTAAACCCATCAGC
TATGGATGAAAAAAAAACTTCCGCGACTAGATTCACAATGAACCGTATCAACTTTAGGGG
AAACTTTAGCAGGAGGAGGCGCTTTTTCATCTTTCTCATCTTTGGCAGGCTTAGCTTTCT
TATGAAAAAATGATGTAGATCGAACTTTAGGCCGAGTTGAGTATGATCTGCGTCCTCCAC
CACCGTATCCGCGGCGACCCATTCTCGAATCTGAATATCTGATCGAATGATATCC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1BJ58TF 707 0 0
ACACAAAACTAAAAGACTTTATTTTATCCAAGACATACGATAATTCATACACTTGGTTGG
TCAAATTAACCAAGAAACACAGCCACATGATAAACGATTTAATCAACGAGAGTTTTTAAA
TCTTAATTTATTGGAAAACACTAACTAAGAAAGAAAAAGAGAATTATAAAATCCCAACTT
AGAAGTTGAAGGAACTAGAGTTCTTCCTGCACTCGAAGAGCGAATCCATGAATACGTGAC
ATTTGCTTAGTTTATTCCCTTCCACGTTCAAGCATTCTTGAAATGCATTATAGCTTATGC
TACATGATTCAGTGTAGTCCTTGTATTTATCGTTATCATCAATGGCAGAGACAGCAGCTA
CTTCAACTCTCTCTGGTAAAACAACTTCTGTTTTAATGGTTCTAGGACCAAAAATGGATT
CAACGAATCTGTGTCCCATCGCATTTCCAGCTCCCCAATTAAACCCATCAGCTATGGATG
AAAAAAAAACTTCCGCGACTAGATTCACAATGAACCGTATCAACTTTAGGGGAAACTTTA
GCAGGAGGAGGCGCTTTTTCATCTTTCTCATCTTTGGCAGGCTTAGCTTTCTTATGAAAA
AATGATGTAGATCGAACTTTAGGCCGAGTTGAGTATGATCTGCGTCCTCCACCACCGTAT
CCGCGGCGACCCATTCTCGAATCTGAATATCTGATCGAATGATAT
CC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 4

CO CL2751Contig1 924 4 14 U
GGACCAAAAATTAGGGTTCGGCATCGAAAGACCAAAAATTAAGGTTTCGATAGGAGCGAG
CGATGGTGGGTATGGAAGGAGCGTCGGTGGGTGAAGAATGCGATGATTGGTGTTGGTATC
TGGAAGATGTATATTTTCTGTATACATCTGATCAGCCTGACTGGGTGAAACCAAAGCATG
TCCTCGAGAACGAGAAAGACAAGACGCTTCAGCTCACACCTAATCAAGAATATGATTTGA
TTAATGGACAGATTCAAGCCAGCGAGGGCTTCGATGTTGATTGGACCAAGGCCCGCTGCC
TTTACACGTACCATCCTGTTGAATTCGATGATGATGATTTTGTTGATGAGCCTCGATCTG
AAACCAATCTTGATCTACTCAACAAGCTCTGTGATAAATCCATTGGTCACTACAATCAGG
AAAACAATACAGCATATGAATTTGTCAAGACTCTTTATGCCAATTTTCACGGGTGTATTG
GGATCATGTTTCTCATAACTTTCCAAGTCAAGGATCCTGTTGATAACTTAACAAAAGACT
TCCAAACTAGGATTCATTACTCTTATTGTAGCAAGAGCCAGTTCATCATGTGCCGGCCTA
AACACCACCAATCAGATAGCCTTGGAGTTGACGAGAGTGACCCCAAGAAACGAAGGCTGG
AGTAGGATTCCCACCCCCTCATAATCTCTACTCGCAGCAAAACTTACCATCGACTCTTGG
TTAGGTTTTTATTTACTTATCTCTAGACTGTTCTTGTTATCTTCTTGTAAGAAAAGCTAC
TATCTCTCTACTCTCTGCTATAGACTCTTCGTTATGTTCTATTTAATTACTGTATCGCGA
AAATTGTTTTTAATTTTCCTAGCAACCTGTGATAACTTTATCGCCTCTTTTTGTTCAACA
TGAATGTTCATCAACTTCTCGCCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CR96TF U 1
AF RS1C479TF U 1
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AF RS1C479JQ C 167
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RD RS1CR96TF 720 0 0
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AGTAGGATTCCCACCCCCTCATAATCTCTACTCGCAGCAAAACTTACCATCGACTCTTGG

QA 1 720 1 720
DS 

RD RS1C479TF 734 0 0
GGACCAAAAATTAGGGTTCGGCATCGAAAGACCAAAAATTAAGGTTTCGATAGGAGCGAG
CGATGGTGGGTATGGAAGGAGCGTCGGTGGGTGAAGAATGCGATGATTGGTGTTGGTATC
TGGAAGATGTATATTTTCTGTATACATCTGATCAGCCTGACTGGGTGAAACCAAAGCATG
TCCTCGAGAACGAGAAAGACAAGACGCTTCAGCTCACACCTAATCAAGAATATGATTTGA
TTAATGGACAGATTCAAGCCAGCGAGGGCTTCGATGTTGATTGGACCAAGGCCCGCTGCC
TTTACACGTACCATCCTGTTGAATTCGATGATGATGATTTTGTTGATGAGCCTCGATCTG
AAACCAATCTTGATCTACTCAACAAGCTCTGTGATAAATCCATTGGTCACTACAATCAGG
AAAACAATACAGCATATGAATTTGTCAAGACTCTTTATGCCAATTTTCACGGGTGTATTG
GGATCATGTTTCTCATAACTTTCCAAGTCAAGGATCCTGTTGATAACTTAACAAAAGACT
TCCAAACTAGGATTCATTACTCTTATTGTAGCAAGAGCCAGTTCATCATGTGCCGGCCTA
AACACCACCAATCAGATAGCCTTGGAGTTGACGAGAGTGACCCCAAGAAACGAAG*CTGG
AGTAG*ATTCCCACCCCCTCATAGTCTCTACTCGCAGCAAA*CTTAC*ATCGACTCTTGG
TTAGGTTTT
ATTTA

QA 1 729 1 729
DS 

RD RS1CR96JQ 326 0 0
CATTACTCTTATTGTAGCAAGAGCCAGTTCATCATGTGCCGGCCTAAACACCACCAATCA
GATAGCCTTGGAGTTGACGAGAGTGACCCCAAGAAACGAAGGCTGGAGTAGGATTCCCAC
CCCCTCATAATCTCTACTCGCAGCAAAACTTACCATCGACTCTTGGTTAGGTTTTTATTT
ACTTATCTCTAGACTGTTCTTGTTATCTTCTTGTAAGAAAAGCTACTATCTCTCTACTCT
CTGCTATAGACTCTTCGTTATGTTCTATTTAATTACTGTATCGCGAAAATTGTTTTTAAT
TTTCCTAGCAACCTGTGATAACTTTA

QA 1 326 1 326
DS 

RD RS1C479JQ 758 0 0
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AGAATATGATTTGATTAATGGACAGATTCAAGCCAGCGAGGGCTTCGATGTTGATTGGAC
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TGAGCCTCGATCTGAAACCAATCTTGATCTACTCAACAAGCTCTGTGATAAATCCATTGG
TCACTACAATCAGGAAAACAATACAGCATATGAATTTGTCAAGACTCTTTATGCCAATTT
TCACGGGTGTATTGGGATCATGTTTCTCATAACTTTCCAAGTCAAGGATCCTGTTGATAA
CTTAACAAAAGACTTCCAAACTAGGATTCATTACTCTTATTGTAGCAAGAGCCAGTTCAT
CATGTGCCGGCCTAAACACCACCAATCAGATAGCCTTGGAGTTGACGAGAGTGACCCCAA
GAAACGAAGGCTGGAGTAGGATTCCCACCCCCTCATAGTCTCTACTCGCAGCAAAACTTA
CCATCGACTCTTGGTTAGGTTTTTATTTACTTATCTCTAGACTGTTCTTGTTATCTTCTT
GTAAGAAAAGCTACTATCTCTCTACTCTCTGCTATAGACTCTTCGTTATGTTCTATTTAA
TTACTGTATCGCGAA**TTGTTTTTAATTTTCCTAGCAACCTGTGATAACTTTATCGCCT
CTTTTTGTTCAACATGAATGTTCATCAACTTCTCGCCG

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 4

CO CL2752Contig1 1077 4 7 U
GAAGATTTACTCATTTGGTGGCGAGCTTATACCAAATCAGCCTATCGACAAAGACCTTTA
CGTCTTTGACCTTGAGACCCGGACATGGTCCATTTCTCCAGCCACAGGAGACATTCCCCA
CCTTTCTTGCTTAGGCGTCCGCATGGTGTCTATTGGATCAAACCTATATGTCTTCGGAGG
CCGAGACGCTTCCAGAAAATACAACGGGTTCTACTCTTTTGACACGACCAAGAACGAGTG
GAAATTGCTAACTCCGGTCGAAGAAGGACCCATTCCTCGTAGTTTCCACTCTATGGCAGC
CGATGAGAACAACGTTTATGTTTTTGGTGGAGTGAGTGCTACGGAGCGGCTCAAGAACCT
AGACGCTTACAACATCGTTGATCAGAAGTGGATGACGTGTTCGACTCCTGGAGAATTGGT
TAGCATAAGAGGAGGAGCCGGGCTTGAAGTGGTGCAAGGGAAGGTTTGGGTGGTTTATGG
ATTCAACGGGTGTGAAGTAGATGATGTTCATTACTACGATCCTGTTGAAGACAAGTGGAC
ACAGGTGGAAACGTTCGGAGAGAAACCTTCAGCGAGGAGTGTTTTCGCTAGTGCGGTTGC
TGGCAAACACATTGTGATATTTGGAGGTGAGGTTGCGATGGATCCAAAAGCTCACGTAGG
CCCGGGACAATTGATAGGTGGGACCTTTGCGCTGGACACAGAGACATTGAAGTGGG*AGA
GGTTGGATAAGTTAGGTGAAGACGAGGAGACTCCAGATATTAGGGGATGGTCGGCTTCCA
CAAGTGGAACCATTGATGGTAAGAAAGGGCTGGTGATGCACGGTGGGAAAGCTCAGACCA
ATGGCCGTTTTGATGATCTGTTCTTTTATGGGATTGAGTCTGCTTAAACGCTTTAAAAAG
TCGTTTGGTGATAACTCTTTGCGTTGTGCTGTGTGTATGTGATTCAATAAGGGAGGAGCG
TGATGGTTGCTACTATATGATCCTTTATCAGCTTGTTTGTTACTTTATATTTACTTTTCA
GTCTCTGCGTGTTTGTTTCATGGTTCGTGTTGTATCAATAAATTGCTTATTTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RS1AN32TF U 1
AF RS1AN32JQ C 197
AF RS1CP96JQ C 393
AF RS1CP96TF U 393
BS 1 700 RS1AN32TF
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BS 702 716 RS1AN32TF
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BS 732 1074 RS1CP96TF
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RD RS1AN32TF 731 0 0
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CGTCTTTGACCTTGAGACCCGGACATGGTCCATTTCTCCAGCCACAGGAGACATTCCCCA
CCTTTCTTGCTTAGGCGTCCGCATGGTGTCTATTGGATCAAACCTATATGTCTTCGGAGG
CCGAGACGCTTCCAGAAAATACAACGGGTTCTACTCTTTTGACACGACCAAGAACGAGTG
GAAATTGCTAACTCCGGTCGAAGAAGGACCCATTCCTCGTAGTTTCCACTCTATGGCAGC
CGATGAGAACAACGTTTATGTTTTTGGTGGAGTGAGTGCTACGGAGCGGCTCAAGAACCT
AGACGCTTACAACATCGTTGATCAGAAGTGGATGACGTGTTCGACTCCTGGAGAATTGGT
TAGCATAAGAGGAGGAGCCGGGCTTGAAGTGGTGCAAGGGAAGGTTTGGGTGGTTTATGG
ATTCAACGGGTGTGAAGTAGATGATGTTCATTACTACGATCCTGTTGAAGACAAGTGGAC
ACAGGTGGAAACGTTCGGAGAGAAACCTTCAGCGAGGAGTGTTTTCGCTAGTGCGGTTGC
TGGCAAACACATTGTGATATTTGGAGGTGAGGTTGCGATGGATCCAAAAGCTCACGTAGG
CCCGGGACAATTGATAGGTGGGACCTTTGCGCTGGACACATAGACATTGAAGTGGGGAGA
GGTTGGATAAG

QA 1 731 1 731
DS 

RD RS1AN32JQ 881 0 0
AAATACAACGGGTTCTACTCTTTTGACACGACCAAGAACGAGTGGAAATTGCTAACTCCG
GTCGAAGAAGGACCCATTCCTCGTAGTTTCCACTCTATGGCAGCCGATGAGAACAACGTT
TATGTTTTTGGTGGAGTGAGTGCTACGGAGCGGCTCAAGAACCTAGACGCTTACAACATC
GTTGATCAGAAGTGGATGACGTGTTCGACTCCTGGAGAATTGGTTAGCATAAGAGGAGGA
GCCGGGCTTGAAGTGGTGCAAGGGAAGGTTTGGGTGGTTTATGGATTCAACGGGTGTGAA
GTAGATGATGTTCATTACTACGATCCTGTTGAAGACAAGTGGACACAGGTGGAAACGTTC
GGAGAGAAACCTTCAGCGAGGAGTGTTTTCGCTAGTGCGGTTGCTGGCAAACACATTGTG
ATATTTGGAGGTGAGGTTGCGATGGATCCAAAAGCTCACGTAGGCCCGGGACAATTGATA
GGTGGGACCTTTGCGCTGGACACATAGACATTGAAGTGGG*AGAGGTTGGATAAGTTAGG
TGAAGACGAGGAGACTCCAGATATTAGGGGATGGTCGGCTTCCACAAGTGGAACCATTGA
TGGTAAGAAAGGGCTGGTGATGCACGGTGGGAAAGCTCAGACCAATGGCCGTTTTGATGA
TCTTTTCTTTTATGGGATTGAGTCTGCTTAAACGCTTTAAAAAGTCGTTTGGTGATAACT
GTTTGCGTTGTGCTGTGTGTATGTGATTCAATAAGGGAGGATCGTGATGGTTGCTACTAT
ATGATCCTTTATCAGCTTGTTTGTTACTTTATATTTAATTTTCAGTCTCTGCGTGTTTGT
TTCATGGTTCGTGTTGTATCAATAAATTGCTTATTTTCTCC

QA 1 881 1 881
DS 

RD RS1CP96JQ 684 0 0
G
GACGTGTTCGACTCCTGGATAATTGGTTAGCATAAGAGGAGGAGCCGGGCTTGAAGTGGT
GCAAGGGAAGGTTTGGGTGGTTTATGGATTCAACGGGTGTGAAGTAGATGATGTTCATTA
CTACGATCCTGTTGAAGACAAGTGGACACAGGTGGAAACGTTCGGAGAGAAACCTTCAGC
GAGGAGTGTTTTCGCTAGTGCGGTTGCTGGCAAACACATTGTGATATTTGGAGGTGAGGT
TGCGATGGATCCAAAAGCTCACGTAGGCCCGGGACAATTGATAGGTGTGACCTTTGCGCT
GGACACAGAGACATTGAAGTGGG*AGAGGTTGGATAAGTTAGGTGAAGACGAGGAGACTC
CAGATATTAGGGGATGGTCGGCTTCCACAAGTGGAACCATTGATGGTAAGAAAGGGCTGG
TGATGCACGGTGGGAAAGCTCAGACCAATGGCCGTTTTGATGATCTGTTCTTTTATGGGA
TTGAGTCTGCTTAAACGCTTTAAAAAGTCGTTTGGTGATAACTCTTTGCGTTGTGCTGTG
TGTATGTGATTCAATAAGGGAGGAGCGTGATGGTTGCTACTATATGATCCTTTATCAGCT
TGTTTGTTACTTTATATTTACTTTTCAGTCTCTGCGTGTTTGTTTCATGGTTCGTGTTGT
ATCAATAAATTGCTTATTTTC
CT

QA 2 682 2 682
DS 

RD RS1CP96TF 683 0 0
G
GACGTGTTCGACTCCTGGATAATTGGTTAGCATAAGAGGAGGAGCCGGGCTTGAAGTGGT
GCAAGGGAAGGTTTGGGTGGTTTATGGATTCAACGGGTGTGAAGTAGATGATGTTCATTA
CTACGATCCTGTTGAAGACAAGTGGACACAGGTGGAAACGTTCGGAGAGAAACCTTCAGC
GAGGAGTGTTTTCGCTAGTGCGGTTGCTGGCAAACACATTGTGATATTTGGAGGTGAGGT
TGCGATGGATCCAAAAGCTCACGTAGGCCCGGGACAATTGATAGGTGTGACCTTTGCGCT
GGACACAGAGACATTGAAGTGGG*AGAGGTTGGATAAGTTAGGTGAAGACGAGGAGACTC
CAGATATTAGGGGATGGTCGGCTTCCACAAGTGGAACCATTGATGGTAAGAAAGGGCTGG
TGATGCACGGTGGGAAAGCTCAGACCAATGGCCGTTTTGATGATCTGTTCTTTTATGGGA
TTGAGTCTGCTTAAACGCTTTAAAAAGTCGTTTGGTGATAACTCTTTGCGTTGTGCTGTG
TGTATGTGATTCAATAAGGGAGGAGCGTGATGGTTGCTACTATATGATCCTTTATCAGCT
TGTTTGTTACTTTATATTTACTTTTCAGTCTCTGCGTGTTTGTTTCATGGTTCGTGTTGT
ATCAATAAATTGCTTATTTTC
C

QA 2 682 2 682
DS 



AS 1 4

CO CL2753Contig1 842 4 9 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGACGTGCTCC
AGCTCTCAAGATCGCCGCTTCTCACTAAGAAGACCAAAACATGGTGCACGTTTGCTACTA
CCGTAACTATGGAAAGGGGCGCCAGAGAGG*****GTCCTTTCGAGAAGGAGCGTCTCGA
CTCGGAGCTGAAGCTGGTCGGCGAGTACGGTCTCCGCAACAAGCGTGAGCTCTGGAGAGT
CCAGTACTCTCTTAGCCGCATCCGTAACGCGGCCAGAGATCTTCTGACTCTCGACGAGAA
GAATCCCAAGAGGATCTTCGAAGGAGAGGCGCTGCTAAGGAAGATGAACCGGTACGGGCT
TCTCGACGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCCTTGACGGTTGAGAACTTTCT
CGAGCGTCGTCTTCAGACTATTGTGTTTAAGTCTGGTATGGCTAAGTCTATCCATCACTC
CCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAATTGGTGAACATTCCTTC
GTTCATGGTGAGACTTGACTCGCAGAAACACATCGACTTTGCATTGACCAGTCCCTTCGG
TGGTGGCCGTCCAGGAAGAGTGAAGAGAAGGAACGAGAAGTCTGCGTCCAAGAAAGCCTC
TGGTGGCGACGCTGACGGTGATGACGAAGAGTAAACCCCCAACTCTCACCGCCTGCTTTT
AGCTATGAAGCACTCTGCTTTTTGATATCTTTAGTTTTGAATTTCGGTTCTTTTCAGACG
ATTGTTTTGTGGTTTCTTTGTGTGTCGAACCTTTCCCGAGTTATATTTTTATTTTGAGAC
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 5 5 20 5 20 20 5 20 20 5 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A261TV U 1
AF RS1GW41TF U 45
AF RS1A261TF U 83
AF RS1GW41JQ C 143
BS 1 579 RS1A261TV
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RD RS1A261TV 769 0 0
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AGCTCTCAAGATCGCCGCTTCTCACTAAGAAGACCAAAACATGGTGCACGTTTGCTACTA
CCGTAACTATGGAAAGGGGCGCCAGAGAGG*****GTCCTTTCGAGAAGGAGCGTCTCGA
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CCAGTACTCTCTTAGCCGCATCCGTAACGCGGCCAGAGATCTTCTGACTCTCGACGAGAA
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TCTCGACGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCCTTGACGGTTGAGAACTTTCT
CGAGCGTCGTCTTCAGACTATTGTGTTTAAGTCTGGTATGGCTAAGTCTATCCATCACTC
CCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAATTGGTGAACATTCCTTC
GTTCATGGTGAGACTTGACTCGCAGAAACACATCGACTTCGCATTGACCAGTCCCTTCGG
GGGTGGCCGTCCAGGAAGAGTGAAGAGAAGGAACGAGAAGTCTGCGTCCAAGAAAGCCTC
TGGTGGCGACGCTGACGGTGATGACGAAGAGTAAACCCCCAACTCTCACCGCCTGCTTTT
AGCTATGAAGCACTCTGCTTTTTGATATCTTTAGTTTTGAATTTCGGTT

QA 1 769 1 769
DS 

RD RS1GW41TF 702 0 0
GGTCTCT
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TTGCTACTACCGTAACTATGGAAAGACCTTCAAGGGACCAAGACGTCCTTTCGAGAAGGA
GCGTCTCGACTCGGAGCTGAAGCTGGTCGGCGAGTACGGTCTCCGCAACAAGCGTGAGCT
CTGGAGAGTCCAGTACTCTCTTAGCCGCATCCGTAACGCGGCCAGAGATCTTCTGACTCT
CGACGAGAAGAATCCCAAGAGGATCTTCGAAGGAGAGGCGCTGCTAAGGAAGATGAACCG
GTACGGGCTTCTCGACGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCCTTGACGGTTGA
GAACTTTCTCGAGCGTCGTCTTCAGACTATTGTGTTTAAGTCTGGTATGGCTAAGTCTAT
CCATCACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAATTGGTGAA
CATTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGACTCGCAGAAACACATCGACTTTGCATTGACCAG
TCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCAGGAAGAGTGAAGAGAAGGAACGAGAAGTCTGCGTCCAA
GAAAGCCTCTGGTGGCGACGCTGACG*TGATGACGAAGAGTAAACCCCCAACTCTCACCG
CCTGCTTTTAGCTATGAAGCACTCTGCTTTT
GATA

QA 8 698 8 698
DS 

RD RS1A261TF 727 0 0
CACTAAGAAGACCAAAACATGGTGCACGTTTGCTACTACCGTAACTATGGAAAGGGGCGC
CAGAGAGG*****GTCCTTTCGAGAAGGAGCGTCTCGACTCGGAGCTGAAGCTGGTCGGC
GAGTACGGTCTCCGCAACAAGCGTGAGCTCTGGAGAGTCCAGTACTCTCTTAGCCGCATC
CGTAACGCGGCCAGAGATCTTCTGACTCTCGACGAGAAGAATCCCAAGAGGATCTTCGAA
GGAGAGGCGCTGCTAAGGAAGATGAACCGGTACGGGCTTCTCGACGAGAGCCAGAACAAG
CTCGATTACGTCTTGGCCTTGACGGTTGAGAACTTTCTCGAGCGTCGTCTTCAGACTATT
GTGTTTAAGTCTGGTATGGCTAAGTCTATCCATCACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGG
CATATCAGGGTTGGAAAGCAATTGGTGAACATTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGACTCG
CAGAAACACATCGACTTCGCATTGACCAGTCCCTTCGGGGGTGGCCGTCCAGGAAGAGTG
AAGAGAAGGAACGAGAAGTCTGCGTCCAAGAAAGCCTCTGGTGGCGACGCTGACGGTGAT
GACGAAGAGTAAACCCCCAACTCTCACCGCCTGCTTTTAGCTATGAAGCACTCTGCTTTT
TGATATCTTTAGTTTTGAATTTCGGTTCTTTTCAGACGATTGTTTTGTGGTT*CTTTGTG
TGTCGA
C

QA 1 726 1 726
DS 

RD RS1GW41JQ 700 0 0
AAGGGACCAAGAC
GTCCTTTCGAGAAGGAGCGTCTCGACTCGGAGCTGAAGCTGGTCGGCGAGTACGGTCTCC
GCAACAAGCGTGAGCTCTGGAGAGTCCAGTACTCTCTTAGCCGCATCCGTAACGCGGCCA
GAGATCTTCTGACTCTCGACGAGAAGAATCCCAAGAGGATCTTCGAAGGAGAGGCGCTGC
TAAGGAAGATGAACCGGTACGGGCTTCTCGACGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCT
TGGCCTTGACGGTTGAGAACTTTCTCGAGCGTCGTCTTCAGACTATTGTGTTTAAGTCTG
GTATGGCTAAGTCTATCCATCACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTG
GAAAGCAATTGGTGAACATTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGACTCGCAGAAACACATCG
ACTTTGCATTGACCAGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCAGGAAGAGTGAAGAGAAGGAACG
AGAAGTCTGCGTCCAAGAAAGCCTCTGGTGGCGACGCTGACGGTGATGACGAAGAGTAAA
CCCCCAACTCTCACCGCCTGCTTTTAGCTATGAAGCACTCTGCTTTTTGATATCTTTAGT
TTTGAATTTCGGTTCTTTTCAGACGATTGTTTTGTGGTTTCTTTGTGTGTCGAACCTTTC
CCGAGTTATATTTTTATTTTGAGACCC

QA 14 700 14 700
DS 



AS 1 4

CO CL2754Contig1 1003 4 6 U
GGACGCTACAACATTGCGTCAAAAAACGGTTACTCACTAAACCGGGAGAGGAGGGGAGAA
ACAGAAACGGAGAAGCAGTTCAGTTTGGTGATGAGGCCGCAGATAGTTCTGTTCGGCGAT
TCAATAACTGCGCAGTCGTTCAGATCCGGCGGATGGGGATCTGCTCTCGCCGACGCCTAC
TCTCGCAAAGCTGATGTCGTTGTGCGTGGCTACGGAGGCTACAATACCCGATGGGCTCTC
TTCTTGCTTCACCACATTTTCCCTCTCGGATCTTTGACTCCACCTGTTGCTACGACCATA
TTCTTCGGTGCAAACGATGCAGCTCTCAAAGGAAGGACCAGTGATAGGCAGCATGTGCCC
GTGGAAGAGTACACGGATAACATCAGAACAATGGTTCAGCATCTCAAGAAATGTTCACCT
ACCATGCTAATTGTGCTTGTAACTCCACCACCAATTGATGAAGCTGGACGCCAGAGCTAT
GCAGAATCAATCTATGGTGAGAAAGCTATGAAGGAGCCTGAGAGAACAAACGAAACCACT
GGTATCTACGCACAACATTGTGTTGCATTAGCAGAGGAACTCGGTCTGCGATCTATCAAC
CTTTGGTCCAAAATGCAGGAGACTGATGATTGGCAGAAAAAATACCTCAGTGATGGACCC
CATCTCACGCCTGAAGGCAATGGAGTTGTTTATGAAGAAGTTTCAAGAGTGTTTAGAGAA
GCTTGGCTCTCTCCTGAAGAAATGCCTTTTGATTTCCCTCACCATTCTCAGATCGACGGG
GATAACCCATCCAAAGCTTTCCAAGAGCGTTGCTTATAAGAGATTTGATCGATTACAGCT
CTTCTTTTGTGTTCTTATGCCATGTTTTTATTACACCGACACATTTATACTCTCTTATGT
TCTCCTGTTTCAAAATGATTTATAATTTTTTTCAAAAAAATATTTGTTTTACAATACATT
TTTTACATTTTTAATGCGTTTTATTAGATAAGAATTAATGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C010TF U 1
AF RS1C344TF U 37
AF RS1C344JQ C 288
AF RS1C010JQ C 307
BS 1 658 RS1C010TF
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BS 934 1003 RS1C010JQ

RD RS1C010TF 746 0 0
GGACGCTACAACATTGCGTCAAAAAACGGTTACTCACTAAACCGGGAGAGGAGGGGAGAA
ACAGAAACGGAGAAGCAGTTCAGTTTGGTGATGAGGCCGCAGATAGTTCTGTTCGGCGAT
TCAATAACTGCGCAGTCGTTCAGATCCGGCGGATGGGGATCTGCTCTCGCCGACGCCTAC
TCTCGCAAAGCTGATGTCGTTGTGCGTGGCTACGGAGGCTACAATACCCGATGGGCTCTC
TTCTTGCTTCACCACATTTTCCCTCTCGGATCTTTGACTCCACCTGTTGCTACGACCATA
TTCTTCGGTGCAAACGATGCAGCTCTCAAAGGAAGGACCAGTGATAGGCAGCATGTGCCC
GTGGAAGAGTACACGGATAACATCAGAACAATGGTTCAGCATCTCAAGAAATGTTCACCT
ACCATGCTAATTGTGCTTGTAACTCCACCACCAATTGATGAAGCTGGACGCCAGAGCTAT
GCAGAATCAATCTATGGTGAGAAAGCTATGAAGGAGCCTGAGAGAACAAACGAAACCACT
GGTATCTACGCACAACATTGTGTTGCATTAGCAGAGGAACTCGGTCTGCGATCTATCAAC
CTTTGGTCCAAAATGCAGGAGACTGATGATTGGCAGAAAAAATACCTCAGTGATGGACTC
CATCTCACGCCTGAAGGCAATGGAGTTGTTTATGAAGAAGTTTCAAGAGTGTTTAGAGAA
GCTTGGCTCTCTCCTGAAGAAATGCC

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1C344TF 724 0 0
GG
AAACCGGGAGAGGAGGGGAGAAACAGAAACGGAGAAGCAGTTCAGTTTGGTGATGAGGCC
GCAGATAGTTCTGTTCGGCGATTCAATAACTGCGCAGTCGTTCAGATCCGGCGGATGGGG
ATCTGCTCTCGCCGACGCCTACTCTCGCAAAGCTGATGTCGTTGTGCGTGGCTACTGAGG
CTACAATACCCGATGGGCTCTCTTCTTGCTTCACCACATTTTCCCTCTCGGATCTTTGAC
TCCACCTGTTGCTACGACCATATTCTTCGGTGCAAACGATGCAGCTCTCAAAGGAAGGAC
CAGTGATAGGCAGCATGTGCCCGTGGAAGAGTACACGGATAACATCAGAACAATGGTTCA
GCATCTCAAGAAATGTTCACCTACCATGCTAATTGTGCTTGTAACTCCACCACCAATTGA
TGAAGCTGGACGCCAGAGCTATGCAGAATCAATCTATGGTGAGAAAGCTATGAAGGAGCC
TGAGAGAACAAACGAAACCACTGGTATCTACGCACAACATTGTGTTGCATTAGCAGAGGA
ACTCGGTCTGCGATCTATCAACCTTTGGTCCAAAATGCAGGAGACTGATGATTGGCAGAA
AAA*TACCTCAGTGATGGACCCCATCTCGCGCCTGAAGGCAATGGAGTTGTTTATGAAGA
AGTTTCAAGAGTGTTTAGAGAAGCTTGGCTCTCTCCTGAAGAAATGCCTTTTGATTTCCC
TC

QA 3 724 3 724
DS 

RD RS1C344JQ 646 0 0
TGCTACGACCATATTCTTCGGTGCAAACGATGCAGCTCTCAAAGGAAGGACCAGTGATAG
GCAGCATGTGCCCGTGGAAGAGTACACGGATAACATCAGAACAATGGTTCAGCATCTCAA
GAAATGTTCACCTACCATGCTAATTGTGCTTGTAACTCCACCACCAATTGATGAAGCTGG
ACGCCAGAGCTATGCAGAATCAATCTATGGTGAGAAAGCTATGAAGGAGCCTGAGAGAAC
AAACGAAACCACTGGTATCTACGCACAACATTGTGTTGCATTAGCAGAGGAACTCGGTCT
GCGATCTATCAACCTTTGGTCCAAAATGCAGGAGACTGATGATTGGCAGAAAAAATACCT
CAGTGATGGACCCCATCTCGCGCCTGAAGGCAATGGAGTTGTTTATGAAGAAGTTTCAAG
AGTGTTTAGAGAAGCTTGGCTCTCTCCTGAAGAAATGCCTTTTGATTTCCCTCACCATTC
TCAGATCGACGGGGATAACCCATCCAAAGCTTTCCAAGAGCGTTGCTTATAAGAGATTTG
ATCGATTACAGCTCTTCTTTTGTGTTCTTATGCCATGTTTTTATTACACCGACACATTTA
TACTCTCTTATGTTCTCCTGTTTCAAAATGATTTATAATTTTTTTC

QA 1 646 1 646
DS 

RD RS1C010JQ 697 0 0
GGTGCAAACGATGCAGCTCTCAAAGGAAGGACCAGTGATAGGCAGCATGTGCCCGTGGAA
GAGTACACGGATAACATCAGAACAATGGTTCAGCATCTCAAGAAATGTTCACCTACCATG
CTAATTGTGCTTGTAACTCCACCACCAATTGATGAAGCTGGACGCCAGAGCTATGCAGAA
TCAATTTATGGTGAGAAAGCTATGAAGGAGCCTGAGAGAACAAACGAAACCACTGGTATC
TACGCACAACATTGTGTTGCATTAGCAGAGGAACTCGGTTTGCGATCTATCAACCTTTGG
TCCAAAATGCAGGAGACTGATGATTGGCAGAAAAAATACCTCAGTGATGGACTCCATCTC
ACGCCTGAAGGCAATGGAGTTGTTTATGAAGAAGTTTCAAGAGTGTTTAGAGAAGCTTGG
CTCTCTCCTGAAGAAATGCCTTTTGATTTCCCTCACCATTCTCAGATCGACGGGGATAAC
CCATCCAAGGCTTTCCAAGAGCGTTGCTTATAAGAGATTTGATCGATTACAGCTCTTCTT
TTGTGTTCTTATGCCATGTTTTTATTACACCGACACATTTATACTCTCTTATGTTCTCCT
GTTTCAAAATGATTTATAATTTTTTTCAAAAAAATATTTGTTTTACAATACATTTTTTAC
ATTTTTAATGCGTTTTATTAGATAAGAATTAATGACG

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 3

CO CL2755Contig1 864 3 11 U
ATAAGCTTTATGAGATGGTAGCTCTTAGAAATGTTCACAAACATATACGTTGTAGAATTT
ACAAAAAAATCCCACCGATATGCAGTTATATATTAATATATGTAGATTTTATCACATACA
CGCCAATATGTACACACATCAAGCAAATATATTCAAGATGGGTACATATATAAATAAACA
CCACCAAATTTACAAGGATGTTTTTATAAGATATGCTCGTCATTCAGAAGCGACCCTGAA
AGTTAGCCAACATGGAAATAGGAACGACGCATAATCCTTTACTCCTTAAGTCCATATTAT
TGTTGTTTCCTTCTCTGAGATTCCTCATCATCGTCATATTTTGTTCATCCCCTTCTTGGA
TTTGGATCTGATTATCCCCCATGCCTCTCGTAGTTCTCATTACGAAACTAGACCAGACAT
AGTCCTCATTTTTTCTAGGAGGCGTCTGAATATGTTCAACCTGACTGACCTTAGGGCTAT
TAACCGGGGAGCTTGCCGTGTCCTCCAGAGAATCATCTTCACAAATCTTCTTGGTTCTTG
CTTTCCCAAACTTTAACTTCACCGGAAAATTAACTGGAAAATCCTGTCCGGAAAAGGCGT
CGTCAGTAGCAGCGTCGGAGACCAGAGGAGAGACGCCAAGAAGCGAACAAGAACTCTTGT
CTTGATGATCACTATCTTCTCGATGAGTTCTGTATTGATTCGAGAAATCGTCGAGATAAG
TTGTCCATCCACTCTCTTCTTGACAATCACCAGCATAATCATCAATATCATCAATATCAA
CAACATCATCGCGATGGTCGAAAGGGGCGTGATTTTGTTCGTAAGTATTACAAGAGAATG
TATCCATCATGTGGAGAAAGGAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RS1FA41JQ U 1
AF RS1BH09JQ U 80
AF RS1BH09TF C 125
BS 1 394 RS1FA41JQ
BS 395 395 RS1BH09JQ
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BS 598 779 RS1FA41JQ
BS 780 780 RS1BH09JQ
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BS 839 859 RS1BH09JQ
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RD RS1FA41JQ 791 0 0
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ACAAAAAAATCCCACCGATATGCAGTTATATATTAATATATGTAGATTTTATCACATACA
CGCCAATATGTACACACATCAAGCAAATATATTCAAGATGGGTACATATATAAATAAACA
CCACCAAATTTACAAGGATGTTTTTATAAGATATGCTCGTCATTCAGAAGCGACCCTGAA
AGTTAGCCAACATGGAAATAGGAACGACGCATAATCCTTTACTCCTTAAGTCCATATTAT
TGTTGTTTCCTTCTCTGAGATTCCTCATCATCGTCATATTTTGTTCATCCCCTTCTTGGA
TTTGGATCTGATTATCCCCCATGCCTCTCGTAGTCCTCATTACGAAACTAGACCAGACAT
AGTCCTCATTTTTTCTAGGAGGCGTCTGAATATGTTCAACCTGACTGACCTTAGGGCTAT
TAACCGGGGAGCTTGCCGTGTCCTCCAGAGAATCATCTTCACAAATCTTCTTGGTTCTTG
CTTTCCCAAACTTTAACTTCACCGGAAAATTAACTGGAAAATCCTGTCCGGAAAAGACGT
CGTCAGTAGCAGCGTCGGAGACCAGAGGAGAGACGCCAAGAAGCGAACAAGAACTCTTGT
CTTGATGATCACTATCTTCTCGATGAGTTCTGTATTGATTCGAGAAATCGTCGAGATAAG
TTGTCCATCCACTCTCTTCTTGACAATCACCAGCATAATCATCAATATCATCAATATCA*
CAACATCATCG

QA 1 791 1 791
DS 

RD RS1BH09JQ 780 0 0
CC
GCAGTTATATATTAATATATGTAGATTTTATCACATACACGCCAATATGTACACACATCA
AGCAAATATATTCAAGATGGGTACATATATAAATAAACACCACCAAATTTACAAGGATGT
TTTTATAAGATATGCTCGTCATTCAGAAGCGACCCTGAAAGTTAGCCAACATGGAAATAG
GAACGACGCATAATCCTTTACTCCTTAAGTCCATATTATTGTTGTTTCCTTCTCTGAGAT
TCCTCATCATCGTCATATTTTGTTCATCCCCTTCTTGGATTTGGATCTGATTATCCCCCA
TGCCTCTCGTAGTTCTCATTACGAAACTAGACCAGACATAGTCCTCATTTTTTCTAGGAG
GCGTCTGAATATGTTCAACCTGACTGACCTTAGGGCTATTAACCGGGGAGCTTGCCGTGT
CCTCCAGAGAATCATCTTCACAAATCTTCTTGGTTCTTGCTTTCCCAAACTTTAACTTCA
CCGGAAAATTAACTGGAAAATCCTGTCCGGAAAAGGCGTCGTCAGTAGCAGCGTCGGAGA
CCAGAGGAGAGACGCCAAGAAGCGAACAAGAACTCTTGTCTTGATGATCACTATCTTCTC
GATGAGTTCTGTATTGATTCGAGAAATCGTCGAGATAAGTTGTCCATCCACTCTCTTCTT
GACAATCACCAGCATAATCATCAATATCATCAATATCAACAACATCATCGCGATGGTCGA
AAGGGGCGTGATTTTGTTCGTAAGTATTACAAGAGA*TGTATCCATCATGTGGAGAAA

QA 3 780 3 780
DS 

RD RS1BH09TF 740 0 0
AATATGTACACACATCAAGCAAATATATTCAAGATGGGTACATATATAAATAAACACCAC
CAAATTTACAAGGATGTTTT*ATAAGATATGCTCGTCATTCAGAAGCGACCCTGAAAGTT
AGCCAACATGGAAATAGGAACGACGCATAATCCTTTACTCCTTAAGTCCATATTATTGTT
GTTTCCTTCTCTGAGATTCCTCATCATCGTCATATTTTGTTCATCCCCTTCTTGGATTTG
GATCTGATTATCCCCCATGCCTCTCGTAGTTCTCATTACGAAACTAGACCAGACATAGTC
CTCATTTTTTCTAGGAGGCGTCTGAATATGTTCAACCTGACTGACCTTAGGGCTATTAAC
CGGGGAGCTTGCCGTGTCCTCCAGAGAATCATCTTCACAAATCTTCTTGGTTCTTGCTTT
CCCAAACTTTAACTTCACCGGAAAATTAACTGGAAAATCCTGTCCGGAAAAGGCGTCGTC
AGTAGCAGCGTCGGAGACCAGAGGAGAGACGCCAAGAAGCGAACAAGAACTCTTGTCTTG
ATGATCACTATCTTCTCGATGAGTTCTGTATTGATTCGAGAAATCGTCGAGATAAGTTGT
CCATCCACTCTCTTCTTGACAATCACCAGCATAATCATCAATATCATCAATATCAACAAC
ATCATCGCGATGGTCGAAAGGGGCGTGATTTTGTTCGTAAGTATTACAAGAGAATGTATC
CATCATGTGGAGAAAGGAAG

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 3

CO CL2756Contig1 1013 3 4 U
GCACAACAACATATATAGACTTGGGTTTTTCATTACAGTTTTACAACACAACTTCATTCG
AACTTTTGAGTTATGTGATTATATCTTACTTTAAGCTCCGGCACTAAATGCATTTACTCC
AGCAAAATTAAAAGCAGCATCAAAGGGAGCTGATGATGGAGAGAAAAGATTCTGACTCAT
ACACATTAGTCCCCCCTCGGCTTTATCATTTTCGATAAACCCTAAATCCGGGAGGATATC
TCTATGATCTGAAAAGGAACGGTTGAAATTGGCATTTAAAAGGTTGCCGGTTGTGATGTC
ATGGATGCTTGGCCGGCGCTTATCCTTGGCTCCTGAAAGCTGTCTCTGGTAATACTTTTG
GGCATGGCTTGCCACTTGCGTTGGGGTCTTCGACACCACGAAGTTTCTCGATATGTTTCT
CCAGTCACCTTTCCCGTACTTGAAAAGCCCTAGCAAGAATCTCCTGTGTTCTTCCTCTGT
CCAAGGGACTCCTTTCTTACGTTCGTGATCAGATCCTCTGGCTCCATTAGGTCGCTTTCG
ACACGTGTCCTGGGTAAACCCTAAGGGAGAAGGGTAACCAGGAATGGGGACACGTCCTTC
TTCAATATCGAAAACGTCTTCCTCGAGCTTACTGTATTGCTTCATTACATCAAAAACAGT
CTTTCCAGGGATCATGGAAGCAATCTTGAACCAGCGATCGGGTGAGTCTTCAGGGTAGAT
GGCAAGGGCTCGTTCGAACATCTTGTTCTCTTCTTTAGTCCAGATGCTGCTAGAGCTTTG
TAAGCTCACCATATCTTGACCCACAGACCGGTAATCAGAGATAGGCACGTGAGAGAGTGG
ATTCAGAGTCTCCATAGCTGATTTGGGTGAGAGATTTCAAGCATATGAAACCGACCCTCG
AATCTGGACTAAAGCTTTGAAGAATCTATGAGAATCTGCAAAAGCAAGTCGTCCAAGGAA
GACAAAAGACAGCAAAGCCACCAGATGAGAATAATGAGAAGTTGAAGCTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AQ65JQ U 31
AF RS1ES47JQ U 1
AF RS1AQ65TFB C 336
BS 1 53 RS1ES47JQ
BS 54 54 RS1AQ65JQ
BS 55 656 RS1ES47JQ
BS 657 1013 RS1AQ65TFB

RD RS1AQ65JQ 125 0 0
CATTACAGTTTTACAACACAACTTCATTCGAACTTTTGAGTTATGTGATTATATCTTACT
TTAAGCTCCGGCACTAAATGCATTTACTCCAGCAAAGTTAAAAGCAGCATCAAAGGGAGC
TGA
AG

QA 1 123 1 123
DS 

RD RS1ES47JQ 656 0 0
GCACAACAACATATATAGACTTGGGTTTTTCATTACAGTTTTACAACACAACT*CATTCG
AACTTTTGAGTTATGTGATTATATCTTACTTTAAGCTCCGGCACTAAATGCATTTACTCC
AGCAAAATTAAAAGCAGCATCAAAGGGAGCTGATGATGGAGAGAAAAGATTCTGACTCAT
ACACATTAGTCCCCCCTCGGCTTTATCATTTTCGATAAACCCTAAATCCGGGAGGATATC
TCTATGATCTGAAAAGGAACGGTTGAAATTGGCATTTAAAAGGTTGCCGGTTGTGATGTC
ATGGATGCTTGGCCGGCGCTTATCCTTGGCTCCTGAAAGCTGTCTCTGGTAATACTTTTG
GGCATGGCTTGCCACTTGCGTTGGGGTCTTCGACACCACGAAGTTTCTCGATATGTTTCT
CCAGTCACCTTTCCCGTACTTGAAAAGCCCTAGCAAGAATCTCCTGTGTTCTTCCTCTGT
CCAAGGGACTCCTTTCTTACGTTCGTGATCAGATCCTCTGGCTCCATTAGGTCGCTTTCG
ACACGTGTCCTGGGTAAACCCTAAGGGAGAAGGGTAACCAGGAATGGGGACACGTCCTTC
TTCAATATCGAAAACGTCTTCCTCGAGCTTACTGTATTGCTTCATTACATCAAAAA

QA 1 656 1 656
DS 

RD RS1AQ65TFB 678 0 0
AGAGT
TGTCTCTGGTAATACTTTTGGGCATGGCTTGCCACTTGCGTTGGGGTCTTCGACACCACG
AAGTTTCTCGATATGTTTCTCCAGTCACCTTTCCCGTACTTGAGAAGCCCTAGCAAGAAT
CTCCTGTGTTCTTCCTCTGTCCAAGGGACTCCTTTCTTACGTTCGTGATCAGATCCTCTG
GCTCCATTAGGTCGCTTTCGACACGTGTCCTGGGTAAACCCTAAGGGAGAAGGGTAACCA
GGAATGGGGACACGTCCTTCTTCAATATCGAAAACGTCTTCCTCGAGCTTACTGTATTGC
TTCATTACATCAAAAACAGTCTTTCCAGGGATCATGGAAGCAATCTTGAACCAGCGATCG
GGTGAGTCTTCAGGGTAGATGGCAAGGGCTCGTTCGAACATCTTGTTCTCTTCTTTAGTC
CAGATGCTGCTAGAGCTTTGTAAGCTCACCATATCTTGACCCACAGACCGGTAATCAGAG
ATAGGCACGTGAGAGAGTGGATTCAGAGTCTCCATAGCTGATTTGGGTGAGAGATTTCAA
GCATATGAAACCGACCCTCGAATCTGGACTAAAGCTTTGAAGAATCTATGAGAATCTGCA
AAAGCAAGTCGTCCAAGGAAGACAAAAGACAGCAAAGCCACCAGATGAGAATAATGAGAA
GTTGAAGCTGTCC

QA 6 678 6 678
DS 



AS 1 4

CO CL2757Contig1 1305 4 10 U
GGCGACGACGTTGTGGGAGTATTAGGTCAGAAACGTTTCTGGAGAGCAAGGAAAGCTATT
GCCAATCAACAAAGAGTATTTGCCGTTCAACTGTTTGAGCTGCACAGATTGATTAAGGTT
CAAAGACTAATTGCTGCATCACCGGATGTTTTGCTGGATGACATCAGTTATCTTGGAAAA
GTTGCTGCTCCAGTGAAGAAGCTCCTTCCGTCAGGGTTTATAGTAAAGCCTCCTCTACCA
CAGGCTATCAAACGCAGAAGCAGCGGCGACTCGGAGAAGACTGACCAAAACAAAATGGAA
TGCTCAGCTGAGAACGTAGTTGGGAGGCTGTCAAACCAAGGTGATCATCATCATCATCAA
CCTTCCAACTACATGCATTTTGCGACCAACCAACCCACTGCAAATGGATGTTACTATCCT
CCTCCTCCTCAGCATCAGCCTCAGCCTCTTCCTTCCGGAGGAAACCAGCAATGGCTGATC
CCTGTAATGTCTCCCTCCGAAGGGCTGATATACAAGCCGCACCCAGGTCCGGGACACACA
GGGCCTGTCTGTGGAGGGTATTATGGTCATTTCATGCCTGCACCGATGGTCATGGGTAAT
TTCATGGGTGGTGGTGGTCAGCCTCCTCCGTTTCACCCGGGCATGGGATTCCCATCTCAT
GGTAATAATGGCTACTTTCCTCCATATGGTTTCATGATGAACCCTTACTATTCCGGACAA
CAACAACAACCACCCAGTGAGCAAATGAACAACAGCATCCAACAACAACAACAACAGAGC
TCAGTGAACGAAGCGGCTTCACAACAACAACAACAACAGCCGACGAAATCTTATCCTCGG
GCTAGAAAGAGCAGGCAAGGGAGCACGGGAAGTAGTCCAGAGGGAATAATTTCTGGTAAG
AAGAACTCCTTTCGACCATTCTCAGCGGCGGACAAGATCAACAATGCACCACCTGAGGAA
ATGATGACGACGACCACAACCACAACAACAACCGTTACTCAGACAACAAGAGATGGAGCA
GGAGTGACGAGAGTGATCAAGGTGGTTCCCCACAACGCGAATCTGGCGAGTGAGAACGCT
GCAAGAATTTTCAGGTCAATACAAGAAGAGCGTAAACAGTATGACGACGCTTTCGCTGAC
TACTCTTAAGCCTCTCTCTTTTCTTCTTCTATCCTATTTTTAGTAAAATTGTGTTGTTAA
TGCATTTTAAACTGTGATAGAGATGTTATTCTCCAAATTTGTATAATATTAACGTATGAA
AAGCTTGGACGTCTATTATATTAAAGTCTTGCAACCATTTGGAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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BQ
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AF RS1C165TF C 294
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TCTCGAAAGAAAGAAGTTTTAGTTTACAGAATTCATCTCTTCTTTAAACTTAACCATTGC
AGCTCTTGGCAACGTAATCATGACTTGAACCCCTCCGGCCATAGAAGGTTCTAACCTCGA
CGCTGGCATGACTATACTAAGAATTCTAGCTATCTCTGGTGGGACCATCGGAACAATATT
CACCGGCTCACCCCACCCGAAATCCATCGGTCCAAAAATCCCAATGTTCCTCCAGTCCGT
CAAACAAAATCTTCCCTTGATCGTTAAATTCATACTGATGATACTTTCAGTGTTGGTAAG
CTCTTCTTGGAGATAATCTTTATCGTGAGCCTTTCTTTTTGCTTGTTTTAAGAGTTTCAC
GATGTCAGAGATGGTTAACTCTTCCACTTCCTTAACGGTTAATGATACATACATGTCTAT
GTATGCATTACCGTAGTATCCGTCTGGTAAAGGTGGATTCACTGCGTTTCGGATTCCTAC
GGCTAAACCCAAAGATGTGACTCCATCTCGATCCAGACTCAGAGCTTTAACTCTTGACTT
CCACAAATAAGCTCCTATAACTTCGAAAGTAGTGAGCGCCTCATTAGAGAAATCATACTC
TTTCAGTGTAGCTTCTTT

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CTCGAAAGAAAGAAGTTTTAGTTTACAGAATTCATCTCTTCTTTAAACTTAACCATTGCA
GCTCTTGGCAACGTAATCATGACTTGAACCCCTCCGGCCATAGAAGGTTCTAACCTCGAC
GCTGGCATGACTATACTAAGAATTCTAGCTATCTCTGGTGGGACCATCGGAACAATATTC
ACCGGCTCACCCCACCCGAAATCCATCGGTCCAAAAATCCCAATGTTCCTCCAGTCCGTC
AAACAAAATCTTCCCTTGATCGTTAAATTCATACTGATGATACTTTCAGTGTTGGTAAGC
TCTTCTTGGAGATAATCTTTATCGTGAGCCTTTCTTTTTGCTTGTTTTAAGAGTTTCACG
ATGTCAGAGATGGTTAACTCTTCCACTTCCTTAACGGTTAATGATACATACATGTCTATG
TATGCATTACCGTAGTATCCGTCTGGTAAAGGTGGATTCACTGCGTTTCGGATTCCTACG
GCTAAACCCAAAGATGTGACTCCATCTCGATCCAGACTCAGAGCTTTAACTCTTGACTTC
CACAAATAAGCTCCTATAACTTCGAAAGTAGTGAGCGCCTCATTAGAGAAATCATACTCT
TTCAGTGTAGCTTCTTTCAGTCTTCTTATGCTCTCAGCTCTGATACTTATTTTTT

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AACAATATCA
CGGCTCACCCCACCCGAAATCCATCGGTCCAAAAATCCCAATGT*CCTCCAGTC*GTCAA
ACAAAATCTTCCCTTGATCGTTAAATTCATACTGATGATACTTTCAGTGTTGGTAAGCTC
TTCTTGGAGATAATCTTTATCGTGAGCCTTTCTTTTTGCTTGTTTTAAGAGTTTCACGAT
GTCAGAGATGGTTAACTCTTCCACTTCCTTAACGGTTAATGATACATACATGTCTATGTA
TGCATTACCGTAGTATCCGTCTGGTAAAGGTGGATTCACTGCGTTTCGGATTCCTACGGC
TAAACCCAAAGATGTGACTCCATCTCGATCCAGACTCAGAGCTTTAACTCTTGACTTCCA
CAAATAAGCTCCTATAACTTCGAAAGTAGTGAGCGCCTCATTAGAGAAATCATACTCTTT
CAGTGTAGCTTCTTTCAGTCTTCTTATGCTCTCAGCTCTGATACTTATTTTTTCAGTTAC
CCAATCATCAGTAGGTGAGTAGGGTGAAGTAGCCGTGTCACCTTCGGGAACGAAGGGAAC
TTGATCGTTTTCTATAGGCCTTCCCACGAGTCTCTCTCTTTCCCAAACCGGTGTCACCGT
CGGCATATTCTTCCCGCCGGCCAACTCTGTCAAGGCACACATGATATGTCCCTCTCCATA
TCCATCGCACATTGAATGCGGCAGAGCAACCCCTAAGATAAATCCTCCACATTCAAAGTT
GGTCACCGTATTAGGGACGACCTTC

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DS 

RD RS1C165TF 695 0 0
AGTC
CGTCAAACAAAATCTTCCCTTGATCGTTAAATTCATACTGATGATACTTTCAGTGTTGGT
AAGCTCTTCTTGGAGATAATCTTTATCGTGAGCCTTTCTTTTTGCTTGTTTTAAGAGTTT
CACGATGTCAGAGATGGTTAACTCTTCCACTTCCTTAACGGTTAATGATACATACATGTC
TATGTATGCATTACCGTAGTATCCGTCTGGTAAAGGTGGATTCACTGCGTTTCGGATTCC
TACGGCTAAACCCAAAGATGTGACTCCATCTCGATCCAGACTCAGAGCTTTAACTCTTGA
CTTCCACAAATAAGCTCCTATAACTTCGAAAGTAGTGAGCGCCTCATTAGAGAAATCATA
CTCTTTCAGTGTAGCTTCTTTCAGTCTTCTTATGCTCTCAGCTCTGATACTTATTTTTTC
AGTTACCCAATCATCAGTAGGTGAGTAGGGTGAAGTAGCCGTGTCACCTTCGGGAACGAA
GGGAACTTGATCGTTTTCTATAGGCCTTCCCACGAGTCTCTCTCTTTCCCAAACCGGTGT
CACCGTCGGCATATTCTTCCCGCCGGCCAACTCTGTCAAGGCACACATGATATGTCCCTC
TCCATATCCATCGCACATTGAATGCGGCAGAGCAACCCCTAAGATAAATCCTCCACATTC
AAAGTTGGTCACCGTATTAGGGACGACCTTC

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DS 



AS 1 4

CO CL2759Contig1 1428 4 13 U
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GATGGGTTTGGGTCCTTTTCCGGCGGCGGAGAAAGTCAAGCTGGCGGTGGCGATGGTGAC
GCTCGTTCCTGTTCGGTTTGTTCTGGCGATGAGCATACTGGTTCTGTATTACTTGGTGTG
TAGGGTGTTTACTCTGTTCTCGTCTCCGTACCGTGGAGCAGAGGAGGAAGAGGAAGAAGG
TGGGAGGGGTTGTTCAGGAAGATTATGCTCATATGGGTGGGTGGAGACGGAGTGTGATCG
TTGGGAGTGGGGAGGTTTCTCTCTAGGGTTTTACTTTTCGTGTTTGGGTTTTATTGGATT
CCTGAGAGCCGTCCGGATCCTGAAACCACTTCTTCTTCTGAGGAAGTGATACGGAGGAAC
CTGAAAGACCTGGAGTGATTGTGTCTAATCACGTTTCCTACCTGGACATTTTGTATCATA
TGTCTGCTTCTTTCCCAAGCTTTGTTGCCAAGAGATCAGTGGGCAAACTTCCTCTTGTTG
GCCTCATCAGCAAATGTCTTGGTTGCGTCTATGTTCAGCGAGAAGCAAAATCACCTGATT
TCAAGGGTGTATCTGGCACAGTAAATGAAAGAGTTCGAGAAGCTCATAGGAATAAATCTG
CTCCAACTATTATGCTTTTTCCAGAAGGAACAACCACCAACGGAGACTACTTGCTGACAT
TCAAGACAGGTGCATTTTTGGCAGGAACTCCGGTTCTTCCTGGTATTTTAAAATATCCGT
ACGAGCGTTTCAGTGTGGCGTGGGATACAATATCCGGAGCACGTCACGTTCTCTTCCTTC
TCTGTCAATTTGTAAACCACTTGGAGGTGATACGGTTACCTGTATACTACCCTTCACAAG
AAGAGAAAGATAATCCCAAACTCTATGCTAGCAATGTCCGGAGACTAATGGCCAGCGAGG
GTAACATGATACTGTCGGATTTGGGACTTGGAGACAAAAGGATATATCACGCGACCCTCA
ATGGTAATCTTAGTCAACTCCGTGTTTTCCATCAGAAAGAAGAATGATAAATTTTTACTG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 0 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1E858TF U 1
AF RS1BD33TF U 68
AF RS1BD33JQ C 664
AF RS1E858JQ C 665
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BS 1077 1077 RS1E858JQ
BS 1078 1428 RS1BD33JQ

RD RS1E858TF 649 0 0
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CGGATTACGAATGATAGATCCGCAATCAGACAAGAACCCTCCACTCTTTCCGATACTCGA
AACCATAAAAAGACTAGATTTTTAGGTAATAATGGAATCGGAGCTAAAGGATATGAATTC
GAATCCACCGTCGAGCAAAGAGGAGCGCCCCTTGCTCAAATCAGAATCCGATGTAACCGC
CGCCATTGAAGAGCTCGACAAAAAGTTCGCGCCTTACGCGAGGACGGATTTGTACGGGAC
GATGGGTTTGGGTCCTTTTCCGGCGGCGGAGAAAGTCAAGCTGGCGGTGGCGATGGTGAC
GCTCGTTCCTGTTCGGTTTGTTCTGGCGATGAGCATACTGGTTCTGTATTACTTGGTGTG
TAGGGTGTTTACTCTGTTCTCGTCTCCGTACCGTGGAGCAGAGGAGGAAGAGGAAGAAGG
TGGGAGGGGTTGTTCAGGAAGATTATGCTCATATGGGTGGGTGGAGACGGAGTGTGGTCG
TTGGGAGTGGG*AGGTTTCTCTCTAGGGTTTTACTTTTCGTGTTTGGGTTTTATTGGATT
CCTGAGAGCCGTCCGGATCCTGAAACCACTTCTTCTTCTGAGGAAGTGA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1BD33TF 698 0 0
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CCGTCGAGCAAAGAGGAGCGCCCCTTGCTCAAATCAGAATCCGATGTAACCGCCGCCATT
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TTGGGTCCTTTTCCGGCGGCGGAGAAAGTCAAGCTGGCGGTGGCGATGGTGACGCTCGTT
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TTTACTCTGTTCTCGTCTCCGTACCGTGGAGCAGAGGAGGAAGAGGAAGAAGGTGGGAGG
GGTTGTTCAGGAAGATTATGCTCATATGGGTGGGTGGAGACGGAGTGTGATCGTTGGGAG
TGGGGAGGTTTCTCTCTAGGGTTTTACTTTTCGTGTTTGGGTTTTATTGGATTCCTGAGA
GCCGTCCGGATCCTGAAACCACTTCTTCTTCTGAGGAAGTGATACGGAGGAACCTGAAAG
ACCTGGAGTGATTGTGTCTAATCACGTTTCCTACCTGGACATTTTGTATCATATGTCTGC
TTCTTTCCCAAGCTTTGTTGCCAAGAGATCAGTGGGCA

QA 1 698 1 698
DS 

RD RS1BD33JQ 765 0 0
A
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GGGTGTATCTGGCACAGTAAATGAAAGAGTTCGAGAAGCTCATAGGAATAAATCTGCTCC
AACTATTATGCTTTT*CCAGAAGGAACAACCACCAACGGAGACTACTTGCTGACATTCAA
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GCGTTTCAGTGTGGCGTGGGATACAATATCCGGAGCACGTCACGTTCTCTTCTTTCTCTG
TCAATTTGTAAACCACTTGGAGGTGATACGGTTACCTGTATACTACCCTTCACAAGAAGA
GAAAGATAATCCCAAACTCTATGCTAGCAATGTCCGGAGACTAATGGCCAGCGAGGGTAA
CATGATACTGTCGGATTTGGGACTTGGAGACAAAAGGATATATCACGCGACCCTCAATGG
TAATCTTAGTCAACTCCGTGTTTTCCATCAGAAAGAAGAATGATAAATTTTTACTGGCTT
TGACAGTATCTGTATTTGTAGTAAGTCATTTACCAAAGAATAAAACCATGACCATGACTG
AATAATGAATGGATCTGTGAGAATAATAAAACAAAAGTTTGGCT

QA 2 765 2 765
DS 

RD RS1E858JQ 764 0 0
AAGACCTGGAGTGATTGTGTCTAATCACGTTTCCTACCTGGACATTTTGTATCATATGTC
TGCTTCTTTCCCAAGCTTTGTTGCCAAGAGATCAGTGGGCAAACTTCCTCTTGTTGGCCT
CATCAGCAAATGTCTTGGTTGCGTCTATGTTCAGCGAGAAGCAAAATCACCTGATTTCAA
GGGTGTATCTGGCACAGTAAATGAAAGAGTTCGAGAAGCTCATAGGAATAAATCTGCTCC
AACTATTATGCTTTTTCCAGAAGGAACAACCACCAACGGAGACTACTTGCTGACATTCAA
GACAGGTGCATTTTTGGCAGGAACTCCGGTTCTTCCTGTTATTTTAAAATATCCGTACGA
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TCAATTTGTAAACCACTTGGAGGTGATACGGTTACCTGTATACTACCCTTCACAAGAAGA
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TGACAGTATCTGTATTTGTAGTAAGTCATTTACCAAAGAATAAAACCATGACCATGACTG
AATAATGAATGGATCTGTGAGAATAATAAAACAAAAGTTTGG
TC

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 4

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TTAAACGACACACACTCCTCACAAGCTTTTGGCGATAAGCCTTTCGTACACTGCACCATT
CCATACAGCATATCACCCTTGTACCGAGTCTCTCCCACAGAGTACAGTGTGTAATTATCT
CCACTGGTGGCAAAAGTCGTCAGATCTTGAATAAGATTATTCCAAGCAATTATAAACGAG
CCTATATCTCCTCCCACCTTCTTCGCGTTGGACATACAAAAGTTATTGTCGTAATCGATC
TTCCCAATAGTATTGAAGGTTGAAATCGCGAGAAGACACTGATCATACCATATTATCCTC
CCCTTGTACCAAGGACATCGCCTACCAAGCGCAGAGAGTGCGGTGGCAAAGCAGTCATGG
CACTTGGGCCCGTAGGAGTCGCCGCGGCACTGGAGGATAGCGGAAAAAGTGGGATCGCCG
ATCCCGTCATAACCTCTGTTACTGCCTGAATAGATCATTTTCACGGTTCTTTTTAAACGG
TCCTCGTACTCACTTCCCGGCTTGTATTTTCCTTGATTAACCAAGCATTTGTGGTTGAGA
TAGGCATTGGTCGTGTTTAAGGACAAGTCGCTGTTTGTCAGAAGTAGTTGTATGGCAAAT
ACGTGGATCAAAATGAGGCGTTTTATTACAGACGATGCTGAGTACATTGTTTTGGATGGT
TTTTCGTTGGGATTGATGGTGTGAGCGACACCGAGGGATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

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RD RS1EO10JQ 779 0 0
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QA 1 779 1 779
DS 

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TTTTCCTTG

QA 1 729 1 729
DS 

RD RS1EJ05TF 771 0 0
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GCAAGCTATTAAACGACACACACTCCTCACAAGCTTT*GGCGATAAGCCTTTCGTACACT
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TAAACGAGCCTATATCTCCTCCCACCTTCTTCGCGTTGGACATACAAAAGTTATTGTCGT
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TGGATGGTTTTTCGTTGGGATTGATGGTGTGAGCGACACCGAGGGATTTCC

QA 1 771 1 771
DS 

RD RS1EO10TF 749 0 0
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CTCCCACCTTCTTCGCGTTGGACA**CAAAAGTTATTGTCGTAATCGATCTTCCTAATAG
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CACTTCCCGGCTTGTATTTTCCTTGATTAACCAAGCATTTGTGGTTGAGATAGGCATTGG
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AAATGAGGCGTTTTATTACAGACGATGCTGAGTACATTGTTTTGGATGGTTTTTCGTTGG
GATTGATGGTGTGAGCGACACCGAGGG
CC

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 4

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GAAACGAAGAGAGAGAAACAATCAAATGGATGTAACAACAACCGACGAGGTAATTTTTGA
TCGGAACGAAGCGGTGGAGACGCCTCCAGAGGATGATGGTTGCCCGATCTGTTTCAGCTC
CTTCACGGTCCCCTGTCGAGGCAACTGTGGCCATTGGTATTGCGGAAGCTGCATATTGCA
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CACCACGCTGTCACCGGAAGCATCCTTGCAACAGCGGCAAGAGCAAGAGGTGAAGGAGGT
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CAAAACAAGGCTACACAGATCTATCGTTGAAGGACGAGAAACTAAGTTTCTTCAGGTGTT
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TTGTACTGGGTTG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AV21TF U 1
AF RS1DM14TF U 7
AF RS1DM14JQ C 193
AF RS1AV21JQ C 250
BS 1 148 RS1AV21TF
BS 149 149 RS1DM14TF
BS 150 157 RS1AV21TF
BS 158 158 RS1DM14TF
BS 159 273 RS1AV21TF
BS 274 274 RS1DM14TF
BS 275 427 RS1AV21TF
BS 428 428 RS1DM14TF
BS 429 452 RS1AV21TF
BS 453 453 RS1DM14TF
BS 454 574 RS1AV21TF
BS 575 575 RS1DM14TF
BS 576 589 RS1AV21TF
BS 590 590 RS1DM14TF
BS 591 669 RS1AV21TF
BS 670 670 RS1DM14JQ
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BS 694 700 RS1AV21TF
BS 701 701 RS1DM14TF
BS 702 715 RS1AV21TF
BS 716 716 RS1DM14JQ
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BS 760 764 RS1DM14TF
BS 765 765 RS1DM14JQ
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BS 773 1068 RS1DM14JQ
BS 1069 1093 RS1AV21JQ

RD RS1AV21TF 778 0 0
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GAAACGAAGAGAGAGAAACAATCAAATGGATGTAACAACAACCGACGAGGTAATTTTTGA
TCGGAACGAAGCGGTGGAGACGCCTCCATAGGATGATTGTTGCCCGATCTGTTTCAGCTC
CTTCACGGTCCCCTGTCGAGGCAACTGTGGCCATTGGTATTGCGGAAGCTGCATATTGCA
GTATTGGAACTATGCTGCAGTCTCTAAGCCTTGTAAGTGTCCTATGTGTGTTCGACACAT
CACCACGCTGTCACCGGAAGCATCCTTGCAACAGCGGCAAGAGCAAGAGGTGAAGGAGGT
TCTTGCTAAGATCCGTAGGTATAACCGTCTCTTTGTTGGAGGTTTAACTGGCTTTCTTCA
GAAGTTGCAGGAGCTGCCTTTGCTGATAAAGAGATTGGTGTGGCACATGATGGATCCAGA
TACAAACACTTTGTATTTTCATGAAGTTCGCATCTTTGCAGTTAAGAACATCTTACCTTT
ATTAAAGTTTCAATCTTGTTTATAGTGCAGTATCTGACGCCTTACTCTTTATAGTTTAGT
GTTTAGTTACTATCTCTGCCCACTAAGTATTTGTTGTCATTTGTTGTATGTACTAATGAC
CAAAACAAG*CTACACAGATCTATCGTTGAAG*ACGAGAA*CTAAGTTTCTTCAG*TGT*
GCAGATGTTGATGAGTACC*TTTATACTGCGGCAGAGTT
AGCTCATCCCACGGAGGTC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RS1DM14TF 778 0 0
G
GGTTTCAATTTTCTCATTTCGTAAAAAAAAA**GAATCTTCTAAGAAAGTGACGAAACGA
AGAGAGAGAAACAATCAAATGGATGTAACAACAACCGCCGAGGTGATTTTTGATCGGAAC
GAAGCGGTGGAGACGCCTCCAGAGGATGATGGTTGCCCGATCTGTTTCAGCTCCTTCACG
GTCCCCTGTCGAGGCAACTGTGGCCATTGGTATTGCGGAAGCTGCATATTGCAGTATTGG
AACTATGCTGCAGTCTCTAAGCCTTGCAAGTGTCCTATGTGTGTTCGACACATCACCACG
CTGTCACCGGAAGCATCCTTGCAACAGCGGCAAGAGCAAGAGGTGAAGGAGGTTCTTGCT
AAGATCCGTCGGTATAACCGTCTCTTTGTTGGAGGTTTAACTGGCTTTCTTCAGAAGTTG
AAGGAGCTGCCTTTGCTGATAAAGAAATTGGTGTGGCACATGATGGATCCAGATACAAAC
ACTTTGTATTTTCATGAAGTTCGCATCTTTGCAGTTAAGAACATCTTACCTTTATTAAAG
TTTCAATCTTGTTTATAGTGCAGTATCGGACGCCTTACTCTTCATAGTTTAGTGTTTAGT
TACTATCTCTGCCCACTAAGTATTTGTTGTCATTTGTTGTATGTACTAATGACCAAAACA
AG*CTACACAGATCTATCGTTGAAG*ACGAGAAACTAAGTTTCTTCAG*TGTTGCAGATG
TTGATGAGTACCCTTTACACTGCGGCAGAGTTTAGCT*CATCCCA
ACGGGAGGTCAG

QA 2 766 2 766
DS 

RD RS1DM14JQ 876 0 0
CTGTCGAGGCAACTGTGGCCATTGGTATTGCGGAAGCTGCATATTGCAGTATGGGA*CTA
TGCTGCAGTCTCTAAGCCTTGCAAGTGTCCTATGTGTGTTCGACACATCACCACGCTGTC
ACCGGAAGCATCCTTGCAACAGCGGCAAGAGCAAGAGGTGAAGGAGGTTCTTGCTAAGAT
CCGTCGGTATAACCGTCTCTTTGTTGGAGGTTTAACTGGCTTTCTTCAGAAGTTGAAGGA
GCTGCCTTTGCTGATAAAGAAATTGGTGTGGCACATGATGGATCCAGATACAAACACTTT
GTATTTTCATGAAGTTCGCATCTTTGCAGTTAAGAACATCTTACCTTTATTAAAGTTTCA
ATCTTGTTTATAGTGCAGTATCGGACGCCTTACTCTTCATAGTTTAGTGTTTAGTTACTA
TCTCTGCCCACTAAGTATTTGTTGTCATTTGTTGTATGTACTAATGACCAAAACAAGGCT
ACACAGATCTATCGTTGAAGGACGAGAAACTAAGTTTCTTCAGGTGTTGCAGATGTTGAT
GAGTACCCTTTACACTGCGGCAGAGTTTAGCTTCATCCCAACGGGAGGGTTCAGAATAGT
GACGGTGTTCGACTACACTGCTATTGCAATGATCTTGATTCTGCGCGTGGTGGGGTTATA
TCGGAGGAGACGTCTTGCTCAGCGTGTTAGGCATATTGCAGCTACAGAATTTGAACCAGA
ATAGAGTTCAAAATGAATGTATTATCATGTGAATGAGCAAGCGTTTGTTTGTTGTAGATT
TGGTTTGGTAGATCATACAGAAGCCAAGAGTCTTATGACCACTGTAAAAAAAGTGAGATG
CGATCTTTTTATAAATAAATGTAATTACATGAACTT

QA 1 876 1 876
DS 

RD RS1AV21JQ 844 0 0
CTATGCTGCAGTCTCTAAGC*TTGTAAGTGTCCTATGTGTGT*CGACACATCACCACGCT
GTCACCGGAAGCATCCTTGCAACAGCGGCAAGAGCAAGAGGTGAAGGAGGTTCTTGCTAA
GATCCGTAGGTATAACCGTCTCTTTGTTGGAGGTTTAACTGGCTTTCTTCAGAAGTTGCA
GGAGCTGCCTTTGCTGATAAAGAGATTGGTGTGGCACATGATGGATCCAGATACAAACAC
TTTGTATTTTCATGAAGTTCGCATCTTTGCAGTTAAGAACATCTTACCTTTATTAAAGTT
TCAATCTTGTTTATAGTGCAGTATCTGACGCCTTACTCTTTATAGTTTAGTGTTTAGTTA
CTATCTCTGCCCACTAAGTATTTGTTGTCATTTGTTGTATGTACTAATGACCAAAACAAG
GCTACACAGATCTATCGTTGAAGGACGAGAAACTAAGTTTCTTCAGGTGTTGCAGATGTT
GATGAGTACCCTTTATACTGCGGCAGAGTTTAGCTTCATCCCAACGGGAGGGTTCAGAAT
AGTGACGGTGTTCGACTACACTGCTATTGCAATGATCTTGATTCTGCGCGTGGTGGGGTT
ATATCGGAGGAGACTTCTTGCTCAGCGTGTTAGGCATATTGCAGCTACAGAATTTGAACC
AGAATAGAGTTCAAAATGAATGTATTATCATGTGAATGAGCAGGCGTTTGTTTGTTGTAG
GTTTGGTTTGGTAGATCATACAGAAGCCAAGAGTCTTATGACCACTGTAAAAAAAGTGAG
ATGCGATCTTTTTATAAATAAATGTAATTACATGAACTTAATAAGATGGGCTTGTACTGG
GTTG

QA 1 844 1 844
DS 



AS 1 2

CO CL2762Contig1 771 2 2 U
GGACAATAAAGGCAAATAAACACTTCATATAATCTTAAATTAAATCTCTCTCCTCTCTCT
CTCTTTCTGAACAAAGCGTTTATTACAGAGCAGAGAGAGAGAGTAAAAAGAGGAAACGAG
TGGTAGTAGACATGTCGGACGACGAGAGATGCGAAGAGTACCTCTTCAAGATCGTCATCA
TCGGAGACTCCGCCGTCGGAAAGTCCAATCTCCTCACTCTGATACAACAGTAGCAAAGAT
GCTGATTGGGAACAAGTGTGATCTCGAGAGCATAAGAGCGGTGAGCATCGAGGAAGGCAA
GAGCCTTGCAGAGTCTCAAGGCTTGTTTTTCATAGAGACATCAGCTTTGGATTCGACCAA
TGTAAGCACGGCTTTCGAGATGGTTATCCGCGACATCTATAGCAACATGAGTCGGAAGCA
GCTCAACTCTGATTCTTACAAAGAGGAACCAACCGGGAACCGGGTCAGCTTGGCCAAGAA
CGAGAGTGAAGGGACAAAGACATTTTCTTGCTGTTCGAGGTAAGCAAGCGCCTGTCTGTA
ACCGGGTTTCTCTTTGTTCCTGAGGGGTTTGGTTGGTTGGTTTTTGGTGGTGTGTTCGCC
GGTGTAACTTATATACTAGTCAAAAGACAGATACATTCTTTTTGGTTCTCGATTGAAAGC
TTAAAGCTAAAAAGAGAAAGGTTTGTGTTTTGAGTTTCTTTGTTACATTACAGATACAGA
AGATATGTAAGCAAAAAAAGAAGTTTGGTCAATGTATAAGTTTATGTTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GA45TF U 1
AF RS1GA45JQ C 431
BS 1 489 RS1GA45TF
BS 490 771 RS1GA45JQ

RD RS1GA45TF 489 0 0
GGACAATAAAGGCAAATAAACACTTCATATAATCTTAAATTAAATCTCTCTCCTCTCTCT
CTCTTTCTGAACAAAGCGTTTATTACAGAGCAGAGAGAGAGAGTAAAAAGAGGAAACGAG
TGGTAGTAGACATGTCGGACGACGAGAGATGCGAAGAGTACCTCTTCAAGATCGTCATCA
TCGGAGACTCCGCCGTCGGAAAGTCCAATCTCCTCACTCTGATACAACAGTAGCAAAGAT
GCTGATTGGGAACAAGTGTGATCTCGAGAGCATAAGAGCGGTGAGCATCGAGGAAGGCAA
GAGCCTTGCAGAGTCTCAAGGCTTGTTTTTCATAGAGACATCAGCTTTGGATTCGACCAA
TGTAAGCACGGCTTTCGAGATGGTTATCCGCGACATCTATAGCAACATGAGTCGGAAGCA
GCTCAACTCTGATTCTTACAAAGAGGAACCAACCGGGAACCGGGTCAGCTTGGCCAAGAA
CGAGAGTGA

QA 1 489 1 489
DS 

RD RS1GA45JQ 341 0 0
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GGGACAAAGACATTTTCTTGCTGTTCGAGGTAAGCAAGCGCCTGTCTGTAACCGGGTTTC
TCTTTGTTCCTGAGGGGTTTGGTTGGTTGGTTTTTGGTGGTGTGTTCGCCGGTGTAACTT
ATATACTAGTCAAAAGACAGATACATTCTTTTTGGTTCTCGATTGAAAGCTTAAAGCTAA
AAAGAGAAAGGTTTGTGTTTTGAGTTTCTTTGTTACATTACAGATACAGAAGATATGTAA
GCAAAAAAAGAAGTTTGGTCAATGTATAAGTTTATGTTTTG

QA 1 341 1 341
DS 



AS 1 3

CO CL2763Contig1 1131 3 3 U
CGGGAAAAGAACTGTCCAACTTTTTGACAGCCTTTATTAGTGACCAAAAGGAAAACAATT
TACACTCATCTGAAGACGAGATCAAATCAAACCAGAAGAATGAATGCTTTTCAATAAGTT
CAGTGTACAACTGAATCAACACTGTGAAAAAAGGTGATCCAACAAGTTCGCTAAAAATTT
TCTTCTCCAGTGCGCGAAGGGAATCCAGAAAGCGAATAAAAGAGGATATATCGGTGTGGT
TGTAGTTATTTTCTGCAAGCCACTGCTGATAGGAAAGCCGAAAAACACCAACAGAGCTAA
AAGACTCAAAGAGGGTTTTGCTAAGGGGTTTTGACTGTTCATTCGATGCTGCTAAATCAA
TCAACTTCGAGGACATCATCGGGATTGGAACAGCATCTGGATCCACTTTGCAAAGGGATT
TCAGGTTTTTTCGACATCTGGATATGTGACTCCAGATTGGATGCTGCAACTCATCTTTCA
ACATATTGAGAAAACACAGGAAAAAGGGACAGTATTGTTGCAGCGTGGAACCAAACCAAC
TAATCCACACCAGATAGAGTTGAATATCCTCTTCGGTTGCCTGTTCCATTGTCCAGTTGG
CAGCATACAATAGCTTCTTTGATGCCAAATTCTGGTCGACTTTTGCTGTATCTGCCACAC
GAGTTGACCCAATTAAGGCTCTAGGAAACAAGATTTTGTTTATCGTCCAAGAATCGGCAG
TATAAATTATTCTACGTTCCCCAGCAGCTAACTCCCTATCTCTCAACTTGACATTGTAGC
TTATTTCAGACTGTTGTGATGTGTATTGGGCTCCTAGAAACTCCAGATACATGCAATTCT
GCCTGACAGTTGTTTCTCTTGAGTACCACATCAAGTCTCTCAAATTGAAAGGCTTTGGCC
ATCCCCCAGACAGGCACATATTCCCACCCATAAATGATTCAGTATCTGACAAATACGTAT
CACGCCCAAGATCAACAATATCTTTTCCGTCAGTTACTCCAAGGGAAGAGAGATAGATGT
GCTCCCAACTTAGCTGTGAGCTCCACAGAAGTTGGTTACCATTCATGAGCAGAAGTTGGA
AGAGGTGAACCCACTGTTCAAGCTCAAGATACGTTATCCGTACACCAATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1ET73JQ U 1
AF RS1GY67JQ U 21
AF RS1ET73TF C 433
BS 1 551 RS1ET73JQ
BS 552 584 RS1GY67JQ
BS 585 1131 RS1ET73TF

RD RS1ET73JQ 551 0 0
CGGGAAAAGAACTGTCCAACTTTTTGACAGCCTTTATTAGTGACCAAAAGGAAAACAATT
TACACTCATCTGAAGACGAGATCAAATCAAACCAGAAGAATGAATGCTTTTCAATAAGTT
CAGTGTACAACTGAATCAACACTGTGAAAAAAGGTGATCCAACAAGTTCGCTAAAAATTT
TCTTCTCCAGTGCGCGAAGGGAATCCAGAAAGCGAATAAAAGAGGATATATCGGTGTGGT
TGTAGTTATTTTCTGCAAGCCACTGCTGATAGGAAAGCCGAAAAACACCAACAGAGCTAA
AAGACTCAAAGAGGGTTTTGCTAAGGGGTTTTGACTGTTCATTCGATGCTGCTAAATCAA
TCAACTTCGAGGACATCATCGGGATTGGAACAGCATCTGGATCCACTTTGCAAAGGGATT
TCAGGTTTTTTCGACATCTGGATATGTGACTCCAGATTGGATGCTGCAACTCATCTTTCA
ACATATTGAGAAAACACAGGAAAAAGGGACAGTATTGTTGCAGCGTGGAACCAAACCAAC
TAATCCACACC

QA 1 551 1 551
DS 

RD RS1GY67JQ 564 0 0
TTTTTGACAGCCTTTATTAGTGACCAAAAGGAAAACAATTTACACTCATCTGAAGACGAG
ATCAAATCAGACCAGAAGAATGAATGCTTTTCAATAAGTTCAGTGTACAACTGAATCAAC
ACTGTGAAAAAAGGTGATCCAACAAGTTCGCTAAAAATTTTCTTCTCCAGTGCGCGAAGG
GAATCCAGAAAGCGAATAAAAGAGGATATATCGGTGTGGTTGTAGTTATTTTCTGCAAGC
CACTGCTGATAGGAAAGCCGAAAAACACCAACAGAGCTAAAAGACTCAAAGAGGGTTTTG
CTAAGGGGTTTTGACTGTTCATTCGATGCTGCTAAATCAATCAACTTCGAGGACATCATC
GGGATTGGAACAGCATCTGGATCCACTTTGCAGAGGGATTTCAGGTTTTTTCGACATCTG
GATATGTGACTCCAGATTGGATGCTGCAACTCATCTTTCAACATATTGAGAAAACACAGG
AAAAAGGGACAGTATTGTTGCAGCGTGGAACCAAACCAACTAATCCACACCAGATAGAGT
TGAATATCCTCTTCGGTTGCCTGT

QA 1 564 1 564
DS 

RD RS1ET73TF 699 0 0
GACATCTGGATATGTGACTCCAGATTGGATGCTGCAACTCATCTTTCAACATATTGAGAA
AACACAGGAAAAAGGGACAGTATTGTTGCAGCGTGGAACCAAACCAACTAATCCACACCA
GATAGAGTTGAATATCCTCTTCGGTTGCCTGTTCCATTGTCCAGTTGGCAGCATACAATA
GCTTCTTTGATGCCAAATTCTGGTCGACTTTTGCTGTATCTGCCACACGAGTTGACCCAA
TTAAGGCTCTAGGAAACAAGATTTTGTTTATCGTCCAAGAATCGGCAGTATAAATTATTC
TACGTTCCCCAGCAGCTAACTCCCTATCTCTCAACTTGACATTGTAGCTTATTTCAGACT
GTTGTGATGTGTATTGGGCTCCTAGAAACTCCAGATACATGCAATTCTGCCTGACAGTTG
TTTCTCTTGAGTACCACATCAAGTCTCTCAAATTGAAAGGCTTTGGCCATCCCCCAGACA
GGCACATATTCCCACCCATAAATGATTCAGTATCTGACAAATACGTATCACGCCCAAGAT
CAACAATATCTTTTCCGTCAGTTACTCCAAGGGAAGAGAGATAGATGTGCTCCCAACTTA
GCTGTGAGCTCCACAGAAGTTGGTTACCATTCATGAGCAGAAGTTGGAAGAGGTGAACCC
ACTGTTCAAGCTCAAGATACGTTATCCGTACACCAATGC

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 2

CO CL2764Contig1 764 2 7 U
GGACAGACAACTTCGAGAAGAAAAAAAAACACGTTCGATTGCAAAATCTGTTACTTGACG
AGTTTCGGGCGTTGCCTGTCTTCGTGAATAACGGTTTTATATTTGGCCGTTAACAAGTAT
CGTTACGCATCTCCCCCCCCCCTCTGGTGAATAAAGATGGCGACTTCGTCACCGTCTCTG
AGTAACAATGGTTTCTCCGCCGCTACTACGCCTCCCAAAACTCTCCGTGGTCTCAACAAA
CCCAAGTGTATCCAATGCGGCAACGTGGCTCGCTCCAGATGCCCGTTTCAATCTTGCAAG
GGATGCTGTTCAAGAGCCGAGAACCCCTGCCCGATTCACGTTCTTAAAGGAGTTGTTACG
TCCGCTGAGAAGACGGCACCAAGTACTCCATCATCAGAGCAGAAAGCATCAGAGGGCACC
CCCGGGAGTAGAGTTTCATCAATCCGCCAACTTTCCAGCAACTTTGCTCAGTTTAATAAC
CTGAATGCTGTTCCTCGCCAGAGAAAGCCTTTGACCATAAAGGATGCTCAAGCGTTAAAC
GCGTGGCGGTTTACGAAGCTAAAAGAGCACAGAGACAGAAACATTGAGGTGGAGAATGAA
GCTTTTGATCGGTACATGAGTAATGTGAACTTGCTCGAAGAACCCTTTTCACTGGCATCT
GTTTCTGAAGAGGAAACATCAGCTTCTGAGAGTAGTAACAACGAGGAAAGAACTGTTTCT
GAGCTTAACTGAGCTGAGATCAATTCCGCGAGAGCAGAGGGCTT


BQ
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AF RS1E016TF U 1
AF RS1CE64TF U 29
BS 1 204 RS1E016TF
BS 205 205 RS1CE64TF
BS 206 362 RS1E016TF
BS 363 363 RS1CE64TF
BS 364 642 RS1E016TF
BS 643 643 RS1CE64TF
BS 644 764 RS1E016TF

RD RS1E016TF 764 0 0
GGACAGACAACTTCGAGAAGAAAAAAAAACACGTTCGATTGCAAAATCTGTTACTTGACG
AGTTTCGGGCGTTGCCTGTCTTCGTGAATAACGGTTTTATATTTGGCCGTTAACAAGTAT
CGTTACGCATCTCCCCCCCCCCTCTGGTGAATAAAGATGGCGACTTCGTCACCGTCTCTG
AGTAACAATGGTTTCTCCGCCGCTGCTACGCCTCCCAAAACTCTCCGTGGTCTCAACAAA
CCCAAGTGTATCCAATGCGGCAACGTGGCTCGCTCCAGATGCCCGTTTCAATCTTGCAAG
GGATGCTGTTCAAGAGCCGAGAACCCCTGCCCGATTCACGTTCTTAAAGGAGTTGTTACG
TCTGCTGAGAAGACGGCACCAAGTACTCCATCATCAGAGCAGAAAGCATCAGAGGGCACC
CCCGGGAGTAGAGTTTCATCAATCCGCCAACTTTCCAGCAACTTTGCTCAGTTTAATAAC
CTGAATGCTGTTCCTCGCCAGAGAAAGCCTTTGACCATAAAGGATGCTCAAGCGTTAAAC
GCGTGGCGGTTTACGAAGCTAAAAGAGCACAGAGACAGAAACATTGAGGTGGAGAATGAA
GCTTTTGATCGGTACATGAGTAATGTGAACTTGCTCGAAGAAGCCTTTTCACTGGCATCT
GTTTCTGAAGAGGAAACATCAGCTTCTGAGAGTAGTAACAACGAGGAAAGAACTGTTTCT
GAGCTTAACTGAGCTGAGATCAATTCCGCGAGAGCAGAGGGCTT

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1CE64TF 703 0 0
GG
ACGTTCGATTGCAAAATCTGTTACTTGACGAGTTTCGGGCGTTGCCTGTCTTCGTGAATA
ACGGTTTTATATTTGGCCGTTAACAAGTATCGTTACGCATCTCCCCCCCCCCTCTGGTGA
ATAAAGATGGCGACTTCGTCACCGTCTCTGAGTAACAATGGTTTCTCCGCCGCTACTACG
CCTCCCAAAACTCTCCGTGGTCTCAACAAACCCAAGTGTATCCAATGCGGCAACGTGGCT
CGCTCCAGATGCCCGTTTCAATCTTGCAAGGGATGCTGTTCAAGAGCCGAGAACCCCTGC
CCGATTCACGTTCTTAAAGGAGTTGTTACGTCCGCTGAGAAGACGGCACCAAGTACTCCA
TCATCAGAGCAGAAAGCATTAGAGGGCACCCCCGGGAGTAGAGTTTCATCAATCCGCCAA
CTTTCCAGCAACTTTGCTCAGTTTAATAACCTGAATGCTGTTCCTCGCCAGAGAAAGCCT
TTGACCATAAAGGATGCTCAAGCGTTAAACGCGTGGCGGTTTACGAAGCTAAAAGAGCAC
AGAGACAGAAACATTGAGGTGGAGAATGAAGCTTTTGATCGGTACATGAGTAATGTGAAC
TTGCTCGAAGAACCCTTTTCACTGGCATCTGTTTCTGAAGAGGAAACATCAGCTTCTGAG
AGTAGTAACAACGAGGAAAGAACTGTTTCTGAGCTTAA
ACT

QA 3 700 3 700
DS 



AS 1 4

CO CL2765Contig1 833 4 10 U
GAGAGATTTGCTCACTTGCAAAAGCAACTTTTACTAGCTGCTATTGATATGGTGGATGCC
ACTTCCAAAACTGGTGGATATATTGTTTACTCAACATGTTCACTTATGGTTGCAGAGAAC
GAAGCCGTAATTGACTATGCGTTGAAGAAAAGGAATGTTCAACTCGTTAAAACTGGACTC
GATTTTGGCCAAGATGGATATAGCAAATTTAGAGAACACCGGTTTCATCCATCTTTAAAG
CAGACTAAACGTTTTTATCCTCATGTACACAACATGGACGGATTCTTCGTGGCAAAGCTG
AAGAAAATGAGCAACATGAAACAAACGTCAGAGGATGATGACGAGGCGGTAGAAACTGTA
GAACAAGCTGATGTGTCTAGTGATGATGATGATGATGAAGCTGAGGCGATGGAAGAGATG
GAGAAGGTTTCTGTTCCCAGTAAGCAACCCAAGGAAACTAAAGAGAACAAGGAGAGACTT
GCAAAATCAAAGGAGAAGAAGAAGGGCAAAAAGGATGCGAAATCAAAATCTAAAAACGTT
GAGAGGAAGCCAAAGAAGAAGAGATCTGATTGGAAGAAGGAGATTGCTCAAGCTAGGGAA
GAGAAAAGAAGAGCCATGAGAGAGAAGTCGAAGGAGAAGCAATGATTAAGTGGTAATGCA
TCAAACACTATCATCTATGCTCATGGGGAAGTCTAAGGAGGTGCCAATGCTTGTTTTCTT
TATTATTCGTTCGCGAACTATTTGTTTAACATTAAAATTTGAAAGCCAAAGAGTGACAGT
AACATGTCCAAAAGTTTTGTTTCAATTACTTTCAAAAATGTCTTTTTAGAGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1H246TF U 9
AF RS1EN67TF U 1
AF RS1H246JQB C 26
AF RS1EN67JQ C 164
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BS 381 697 RS1EN67TF
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BS 765 792 RS1EN67TF
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RD RS1H246TF 686 0 0
G
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ACTTCCAAAACTGGTGGATATATTGTTTACTCAACATGTTCACTTATGGTTGCAGAGAAC
GAAGCCGTAATTGACTATGCGTTGAAGAAAAGGAATGTTCAACTCGTTAAAACTGGACTC
GATTTTGGCCAAGATGGATATAGCAAATTTAGAGAACACCGGTTTCATCCATCTTTAAAG
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AAGAAAATGAGCAACATGAAACAAACGTCAGAGGATGATGACGAGGCGGTAGAAACTGTA
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GAGAAAAGAAGAGCCATGAGAGAGAAGTCGAAGGAGAAGCAATGATTAAGTGGTAATGCA
TCAAACACTATCATCTATGCTCATGGGGAAGTCTAAG**AGTGCCAATGCTTGTTTTCTT
TATTATTCGTTCGCGAACTATTTGTTTAACATTAAA*TTTGAA*GCCAAAGAGTGACAGT
AACATGTCCAAA
GTTTTGTTC

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AGAAAAGGAATGTTCAACTCGTTAAAACTGGACTCGATTTTGGCCAAGATGGATATAGCA
AATTTAGAGAACACCGGTTTCATCCATCTTTAAAGCAGACTAAACGTTTTTATCCTCATG
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TTAACATTAAAATTTGAAAGCCAAAGAGTGACAGTAACATGTCCAAA
AGTTTTGTTTC

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DS 

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TCTTCGTGGCAAAGCTGAAGAAAATGAGCAACATGAAACAAACGTCAGAGGATGATGACG
AGGCGGTAGAAACTGTAGAACAAGCTGATGTGTCTATTGATGATGATGATGATGAAGCTG
AGGCGATGGAAGAGATGGAGAAGGTTTCTGTTCCCAGTAAGCAACCCAAGGAAACTAAAG
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CAAAATCTAAAAACGTTGAGAGGAAGCCAAAGAAGAAGAGATCTGATTGGAAGAAGGAGA
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GATTAAGTGGTAATGCATCAAACACTATCATCTATGCTCATGGGGAAGTCTAAGGAGGTG
CCAATGCTTGTTTTCTTTATTATTCGTTCGCGAACTATTTGTTTAACATTAAAATTTGAA
AGCCAAAGAGTGACAGTAACATGTCCAAAAGTTTTGTTTCAATTACTTTCAAAAATGTCT
TTTTAGAGGT

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 4

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CTTTTGTGTGCCGACACACAACATTTTTATCATAATGAGAGGGAAGAACCAGCAAAGGAT
AATAAGATTTAACCAAATGTAATGTTTATTTGGATGAGCGAGATCTTTTTAACCCTCCAA
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CTGCCTCATTACTCTTCCAATGCTTAGCGATGTTCTCAGACAAGGGATCATCAGGGTTTG
GTGCACTCAGAAGAGCTTGGATACTTAAAAGCACTGTTCGTATTTGTAGAGCAGGGCTCC
ATTTGTCTTTCAGAATATCAAGACATATTCTTCCAAGCTTATCAATGTTAGGATGGTATA
TCTTGGTGGGAAACCTAACCTTGGGAGCTGACATAGGGTATTCTTCAGGCAGAAAGAGCT
CCAACTTGAAAACTCCTCCTTCATAAGGTGATTGAGAAGGACCAAGAACCATAACGTTGA
AGTAACGCATGTTCTCCTCAGATGGAGACGCACTTATACCAGGAGCAGGTTCACTGAGCA
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GCTAACCTCAATCGATCGATAATAGTTAGGGTTTCGAGAGAGAAGATCCGCACGCCGAGA
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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1CH34JQ U 3
AF RS1CH34TF C 1
AF RS1CH08TF C 12
AF RS1CH08JQ U 312
BS 1 2 RS1CH34TF
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RD RS1CH34JQ 699 0 0
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TAACCTCAATCGATCGATAATAGTTAGGGTTTCGAGAGA

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DS 

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TCTTGGTGGGAAACCTAACCTTGGGAGCTGACATAGGGTATTCTTCAGGCAGAAAGAGCT
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GCTAACCTCAATCGATCGATAATAGTTAGGGTTTCGAGAGAGAAGATCCGCACGCCGAGA
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ACC

QA 1 770 1 770
DS 

RD RS1CH08TF 762 0 0
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ACCAAATGTAATGTTTATTTGGATGAGCGAGATCTTTTTAACCCTCCAACACTGCATCAT
TCGCCACTTGCGTAAAGACGGGTCCATTCCTTAGCTGTCTCCACAGCTTCTGCCTCATTA
CTCTTCCAATGCTTAGCGATGTTCTCAGACAAGGGATCATCAGGGTTTGGTGCACTCAGA
AGAGCTTGGATACTTAAAAGCACTGTTCGTATTTGTAGAGCAGGGCTCCATTTGTCTTTC
AGAATATCAAGACATATTCTTCCAAGCTTATCAATGTTAGGATGGTATATCTTGGTGGGA
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ACTCCTCCTTCATAAGGTGATTGAGAAGGACCAAGAACCATAACGTTGAAGTAACGCATG
TTCTCCTCAGATGGAGACGCACTTATACCAGGAGCAGGTTCACTGAGCAGTCGTTGAGTT
TCCTTGATGATTCTTCGGGGAAGATTACTGTTGGCCACTATCGCTCGCTGCTAACCTCAA
TCGATCGATAATAGTTAGGGTTTCGAGAGAGAAGATCCGCACGCCGAGAATCGAGAACAC
TTCGTCGTCGTCGTCGTCGTCGTCGGTCAGATTAATGAATCC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1CH08JQ 441 0 0
AA
AGCTTGGATACTTAAAAGCACTGTTCGTATTTGTAGAGCAGGGCTCCATTTGTCTTTCAA
AATATCAAGACATATTCTTCCAAGCTTATCAATGTTAGGATGGTATATCTTGGTGGGAAA
CCTAACCTTGGGAGCTGACATAGGGTATTCTTCAGGCAGAAAGAGCTCCAACTTGAAAAC
TCCTCCTTCATAAGGGGATTGAGAAGGACCAAGAACCATAACGTTGAAGTAACGCATGTT
CTCCTCAGATGGAGACGCACTTATACCAGGAGCAGGTTCACTGAGCAGTCGTTGAGTTTC
CTTGATGATTCTTCGGGGAAGATTACTGTTGGCCACTATCGCTCGCTGCTAACCTCAATC
GATCGATAATAGTTAGGGTTTCGAGAGAGAAGATCCGCACGCCGAGAATCGAGAACACTT
CGTCGTCGTCGTCGTCGTC

QA 3 441 3 441
DS 



AS 1 4

CO CL2767Contig1 640 4 18 U
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TGCTTTCATCGGTGACGTTGAAACCGGCGGGTTTCACGGTGGAGAAGATGTCGGCGAGAG
GATTACCGTCGCTCGCAAGAGCTCCTTCCTCCTTCAAAATCGTCGCTAGTGGCGTTAAGA
AGATCAAGACCGACAAACCCTTTGGAGTTAACGGCAGCATGGACTTGAGGGACGGCCTCG
ACGCCTCCGGCAGAAAGGGCAAGGGATACGGTGTTTACAAATTCGTCGACAAGTACGGAG
CTAACGTTGATGGATACAGTCCTAACTACAACGAGGACGAGTGGTCAGCGAGTGGTGATG
TCTACAAGGGAGGAGTCACCGGGTTAGCAATCTGGGCGGTGACACTCGCCGGAATTCTCG
CCGGAGGAGCTCTTCTTGTGTACAACACAAGTGCGCTAGCTCAGTAAATCTATAAGATAT
GCGTGTAACTCATGTTTCTCTAAATGCTTTTGTGTTATTGTTCTCAATGAGTTAATGTTG
TTGAAAAACTCATAACATACTTTGAATCTATAAGAATTCTAGCTAATGTTGGTATACATA
TTCATCTATAGCACAAGAACTTGAATACAAACATTATACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 0 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CP20JQ C 1
AF RS1CP20TF U 1
AF RS1C131TF U 20
AF RS1C131JQ C 123
BS 1 151 RS1CP20TF
BS 152 152 RS1C131TF
BS 153 253 RS1CP20TF
BS 254 254 RS1C131TF
BS 255 286 RS1CP20TF
BS 287 287 RS1C131TF
BS 288 324 RS1CP20TF
BS 325 325 RS1C131TF
BS 326 418 RS1CP20TF
BS 419 419 RS1C131TF
BS 420 481 RS1CP20TF
BS 482 482 RS1C131TF
BS 483 524 RS1CP20TF
BS 525 525 RS1C131TF
BS 526 583 RS1CP20TF
BS 584 590 RS1C131TF
BS 591 591 RS1C131JQ
BS 592 640 RS1C131TF

RD RS1CP20JQ 584 0 0
GGGCACTAGTTCGAGAAACAGAGAGAGAGAGAGAAGAAGAAGAAATGGCTGCTTCAGTGA
TGCTTTCATCGGTGACGTTGAAACCGGCGGGTTTCACGGTGGAGAAGATGTCGGCGAGAG
GATTACCGTCGCTCGCAAGAGCTCCTTCCTCGTTCAAAATCGTCGCTAGTGGCGTTAAGA
AGATCAAGACCGACAAACCCTTTGGAGTTAACGGCAGCATGGACTTGAGGGACGGCCTCG
ACGCCTCCGGCAGGAAGGGCAAGGGATACGGTGTTTACAAATTCGTTGACAAGTACGGAG
CTAACGTTGATGGATACAGTCCTATCTACAACGAGGACGAGTGGTCAGCGAGTGGTGATG
TCTACAAGGGAGGAGTCACCGGGTTAGCAATCTGGGCGGTGACACTCGCCGGAATTCTTG
CCGGAGGAGCTCTTCTTGTGTACAACACAAGTGCGCTAGCTCAGTAAATCTATAAGATAT
GTGTGTAACTCATGTTTCTCTAAATGCTTTTGTGTTATTGTTCTTAATGAGTTAATGTTG
TTGAAAAACTCATAACATACTTTGAATCTATAAGAATTCTAGC
C

QA 1 583 1 583
DS 

RD RS1CP20TF 584 0 0
GGGCACTAGTTCGAGAAACAGAGAGAGAGAGAGAAGAAGAAGAAATGGCTGCTTCAGTGA
TGCTTTCATCGGTGACGTTGAAACCGGCGGGTTTCACGGTGGAGAAGATGTCGGCGAGAG
GATTACCGTCGCTCGCAAGAGCTCCTTCCTCGTTCAAAATCGTCGCTAGTGGCGTTAAGA
AGATCAAGACCGACAAACCCTTTGGAGTTAACGGCAGCATGGACTTGAGGGACGGCCTCG
ACGCCTCCGGCAGGAAGGGCAAGGGATACGGTGTTTACAAATTCGTTGACAAGTACGGAG
CTAACGTTGATGGATACAGTCCTATCTACAACGAGGACGAGTGGTCAGCGAGTGGTGATG
TCTACAAGGGAGGAGTCACCGGGTTAGCAATCTGGGCGGTGACACTCGCCGGAATTCTTG
CCGGAGGAGCTCTTCTTGTGTACAACACAAGTGCGCTAGCTCAGTAAATCTATAAGATAT
GTGTGTAACTCATGTTTCTCTAAATGCTTTTGTGTTATTGTTCTTAATGAGTTAATGTTG
TTGAAAAACTCATAACATACTTTGAATCTATAAGAATTCTAGC
C

QA 1 583 1 583
DS 

RD RS1C131TF 621 0 0
GGGCGAAAAGACAGAGAGT
GAAGAAATGGCTGCTTCAGTGATGCTTTCATCGGTGACGTTGAAACCGGCGGGTTTCACG
GTGGAGAAGATGTCGGCGAGAGGATTACCGTCGCTCGCAAGAGCTCCTTCCTCCTTCAAA
ATCGTCGCTAGTGGCGTTAAGAAGATCAAGACCGACAAACCCTTTGGAGTTAACGGCAGC
ATGGACTTGAGGGACGGCCTCGACGCCTCCGGCAGAAAGGGCAAGGGATACGGTGTTTAC
AAATTCGTCGACAAGTACGGAGCTAACGTTGATGGATACAGTCCTAACTACAACGAGGAC
GAGTGGTCAGCGAGTGGTGATGTGTACAAGGGAGGAGTCACCGGGTTAGCAATCTGGGCG
GTGACACTCGCCGGAATTCTCGCGGGAGGAGCTCTTCTTGTGTACAACACAAGTGCTCTA
GCTCAGTAAATCTATAAGATATGCGTGTAACTCATGTTTCTCTAAATGCTTTTGTGTTAT
TGTTCTC******TTAATGTTGTTGAAGAACTCATAACATACTTTGAATCTATAAGAATT
CTAGCTAATGTTTGTATACATATTCATCTATAGCACAAGAACTTGAATACAAACATTATA
CC

QA 20 621 20 621
DS 

RD RS1C131JQ 518 0 0
TTACCGTCGCTCGCAAGAGCTCCTTCCTCCTTCAAAATCGTCGCTAGTGGCGTTAAGAAG
ATCAAGACCGACAAACCCTTTGGAGTTAACGGCAGCATGGACTTGAGGGACGGCCTCGAC
GCCTCCGGCAGAAAGGGCAAGGGATACGGTGTTTACAAATTCGTCGACAAGTACGGAGCT
AACGTTGATGGATACAGTCCTAACTACAACGAGGACGAGTGGTCAGCGAGTGGTGATGTG
TACAAGGGAGGAGTCACCGGGTTAGCAATCTGGGCGGTGACACTCGCCGGAATTCTCGCG
GGAGGAGCTCTTCTTGTGTACAACACAAGTGCTCTAGCTCAGTAAATCTATAAGATATGC
GTGTAACTCATGTTTCTCTAAATGCTTTTGTGTTATTGTTCTC******TTAATGTTGTT
GAAGAACTCATAACATACTTTGAATCTATAAGAATTCTAGCTAATGTTGGTATACATATT
CATCTATAGCACAAGAACTTGAATACAAACATTATACC

QA 1 518 1 518
DS 



AS 1 3

CO CL2768Contig1 1465 3 5 U
GTTGTAGCAACGACTTTATATTAAACTCTTTAGTTGCTTGCTTGGCAAGTTAAAGTATTC
ATGTTGATTAGTATGCACATACAAACTTCTCCTTCCTTCACAAACCTCAAAAACTTCACT
CACAATGATTTGATCACATATGTAACAATCTTATGGAGTTTATGGTACACAGTCACAGAA
GTCGGTAATCTAAAAATACGTTTGCATCAAGCGAAACCAACAAGCTTCTCGCTAACCTCC
CATAGTTTCTTGGCCTTCTCGGCATCACTTGCTTCTTTAGATAGCTGATTCTCAAACGAA
GACGAGTTGTTGTTCCAGCTCCAATACACCCCTGACTTCCCTAGACTCGGATCACTCACC
ACCTGTGCAAGTCTTTTCCCAGCTTCCTCTTCAGATACATAACCTTTGGTGATATACTTC
TGAAAAGGCGGGAAGAGAAGCCTGAACAGGGGTATGTGTTCTCTGAACAACCCTGTTGTA
GCGATGCAACCAGGATAAAGAGAAGCAAACGTGACACCTGTTTCCTCGTGGTAACGTCTG
TGAAGCTCCTGCATCGTCAGCATATTGCACACTTTGCTGTCTTTGTAAGCTTTGGCTCCA
TCGTACTATCCTCCATCTATCATCGAACTGTTCTGCCCGTTCAAACCTGACGCTAAGACT
CTCAGGTCTCCAAGGTTTGCCTTGGGCGGCACATTCCCAGCCAAAGTGTTTGTGTTTCCT
GTTATAGATCCTACGATGATCATACGTTTTGACGGATAATCAGATTTTTTCAGGTCATCA
AGAAGCATCCTCGAAAGAAGGAAATGACCGAGATGGTTGGTTCCAACGCTTAGCTCAAAC
CCTTCAGCTGTAAATGAAGGTTCTTTAGCCGTTGGTTGGTGAACCGCAGCGTTGCAGACG
AGAACATCCAGTAGACGTTCTGTTCTCCTGTAGCTATCGACGAACTGCTTCACGCTCTCG
AGGGAAGCGAGATCGAGATGCATCACCGTGTAGTCTTCCTTGGACATTCCTACGGATTTA
GCTGCTTTCTCGGCCTTGAGAAAGTTCCTGCACGCCATGATCACGTGCCATTTCCCCGTG
TCTGCTAAAGCCTTGGCTGTTGCTAAACCTAAACCAGAGGAAGCTCCGGTGATCACTGCT
GTGCCTTTTCTCAGCGTCTTCTTTTGCTGCGGAGAGGCCTCGTTCGCTGGCGGCGTTGCT
GTAACTGTCTGTGCACGAATGCTAGTGGAAAACCGCGGACTTTGTCTTCTCTGCTCCTTT
ATGGTTAACCGGTTTGAGATCTTGTCGGCTCTAAGGCTGTTGGAAAATGAAAAACTAGTT
ACGGTCGTCTCCTTCGGAGAAGCAACGAATCTACCCTCTTTGTGGATTGAAACGGTGGAA
GGAAGAAGCGAATAGGCAGCCTGAAGAGCCATGAATGTGCGGAGCTGATGAAGTTGCTAG
TAGAGTTCAGTACCTTCGACGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B083JQ U 1
AF RS1BE92JQ U 95
AF RS1B083TF C 723
BS 1 198 RS1B083JQ
BS 199 199 RS1BE92JQ
BS 200 672 RS1B083JQ
BS 673 853 RS1BE92JQ
BS 854 1465 RS1B083TF

RD RS1B083JQ 672 0 0
GTTGTAGCAACGACTTTATATTAAACTCTTTAGTTGCTTGCTTGGCAAGTTAAAGTATTC
ATGTTGATTAGTATGCACATACAAACTTCTCCTTCCTTCACAAACCTCAAAAACTTCACT
CACAATGATTTGATCACATATGTAACAATCTTATGGAGTTTATGGTACACAGTCACAGAA
GTCGGTAATCTAAAAATATGTTTGCATCAAGCGAAACCAACAAGCTTCTCGCTAACCTCC
CATAGTTTCTTGGCCTTCTCGGCATCACTTGCTTCTTTAGATAGCTGATTCTCAAACGAA
GACGAGTTGTTGTTCCAGCTCCAATACACCCCTGACTTCCCTAGACTCGGATCACTCACC
ACCTGTGCAAGTCTTTTCCCAGCTTCCTCTTCAGATACATAACCTTTGGTGATATACTTC
TGAAAAGGCGGGAAGAGAAGCCTGAACAGGGGTATGTGTTCTCTGAACAACCCTGTTGTA
GCGATGCAACCAGGATAAAGAGAAGCAAACGTGACACCTGTTTCCTCGTGGTAACGTCTG
TGAAGCTCCTGCATCGTCAGCATATTGCACACTTTGCTGTCTTTGTAAGCTTTGGCTCCA
TCGTACTATCCTCCATCTATCATCGAACTGTTCTGCCCGTTCAAACCTGACGCTAAGACT
CTCAGGTCTCCA

QA 1 672 1 672
DS 

RD RS1BE92JQ 760 0 0
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GGAGTTTATGGTACACAGTCACAGAAGTCGGTAATCTAAAAATACGTTTGCATCAAGCGA
AACCAACAAGCTTCTCGCTAACCTCCCATAGTTTCTTGGCCTTCTCGGCATCGCTTGCTT
CTTTAGATAGCTGATTCTCAAACGAAGACGAGTTGTTGTTCCAGCTCCAATACACCCCTG
ACTTCCCTAGACTCGGATCACTCACCACCTGTGCAAGTCTTTTCCCAGCTTCCTCTTCAG
ATACATAACCTTTGGTGATATACTTCTGAAAAGGCGGGAAGAGAAGCCTGAACAGGGGTA
TGTGTTCTCTGAACAACCCTGTTGTAGTGATGCAACCAGGATAAAGAGAAGCAAACGTGA
CACCTGTTTCCTCGTGGTAACGTCTGTGAAGCTCCTGCATCGTCAGCATATTGCACACTT
TGCTGTCTTTGTAAGCTTTGGCTCCATCGTACTCTCCTCCATCTATCATCGAACTGTTCT
GCCCGTTCAAACCTGACGCTAAGCCTCTCAGGTCTCCAAGGTTTGCCTTGGGCGGCACAT
TCCCAGCCAAAGTGTTTGTGTTTCCTGTTATAGATCCTACGATGATCATACGTTTTGACG
GATAATCAGATTTTTTCAGGTCATCAAGAAGCATCCTCGAAAGAAGGAAATGACCGAGAT
GGTTGGTTCCAACGCTTAGCTCAAACCCTTCAGCTGTAA
T

QA 1 759 1 759
DS 

RD RS1B083TF 743 0 0
GTATAGAT
CTACGATGATCATACGTTT*GACGGATAATCAGATTTTT*CAGGTCATCAAGAAGCATCC
TCGAAAGAAGGAAATGACCGAGATGGTTGGTTCCAACGCTTAGCTCAAACCTTTCAGTTG
TAAATGAAGGTTCTTTAGCCGTTGGTTGGTGAACCGCAGCGTTGCAGACGAGAACATCCA
GTAGACGTTCTGTTCTCCTGTAGCTATCGACGAACTGCTTCACGCTCTCGAGGGAAGCGA
GATCGAGATGCATCACCGTGTAGTCTTCCTTGGACATTCCTACGGATTTAGCTGCTTTCT
CGGCCTTGAGAAAGTTCCTGCACGCCATGATCACGTGCCATTTCCCCGTGTCTGCTAAAG
CCTTGGCTGTTGCTAAACCTAAACCAGAGGAAGCTCCGGTGATCACTGCTGTGCCTTTTC
TCAGCGTCTTCTTTTGCTGCGGAGAGGCCTCGTTCGCTGGCGGCGTTGCTGTAACTGTCT
GTGCACGAATGCTAGTGGAAAACCGCGGACTTTGTCTTCTCTGCTCCTTTATGGTTAACC
GGTTTGAGATCTTGTCGGCTCTAAGGCTGTTGGAAAATGAAAAACTAGTTACGGTCGTCT
CCTTCGGAGAAGCAACGAATCTACCCTCTTTGTGGATTGAAACGGTGGAAGGAAGAAGCG
AATAGGCAGCCTGAAGAGCCATGAATGTGCGGAGCTGATGAAGTTGCTAGTAGAGTTCAG
TACCTTCGACGTTCC

QA 9 743 9 743
DS 



AS 1 4

CO CL2769Contig1 972 4 9 U
GGAGAGTACGCCCTCCGCCATTAAAACACCTCTCCAAGAAAAGCTCCCCCACAGATCAGC
AAACATAGGGTTACTCGAAGAACCCCACCGTGACTCCACCGAGGATTCGAGTTCTTGCTT
TGGTTTGAGGAAGAAGAAGAGCAAAAACCACAAGGAGAAACCGAAGATGACTCAGACCAA
CGCCGGAGCTGGAACCGGACCCCCGGAACCTCCTCAGCCGCAGAGCAACGAGATGGTTTT
GCATACTGGAAGCTTGAGCTTCAGCAGCCATATGTCTAAAGAAGACGAAGAGATGACTCG
TTCTGCCCTTTCTGCGTTTAGGGCTAAAGAAGAGGAGATTGATAAGAGGAGGATGGAAGT
TCGTGAGCGGATCCAGGCTCAGTTGGGTCGGGTCGAAGAAGAAACCCGACGACTCTCAAC
CATTCGCGAGGAGCTTGAGACTATGGCAGATCCTATGAGGAAGGAAGTGTCTATGGTTCG
TAAAAAGATTGATAGTGTTAACAAAGAACTCAAACCTTTAGGTTCCACTGTTCAAAAGAA
GGAGAGGGAATACAAAGAAGCACTTGATACATTCAATGAGAAGAATAGAGAGAAAGTGCA
ACTGATCACCAAACTCATGGAGTTGGTAGGAGAAAGCGAGAAATTGAGGTTGAAAAAGCT
GGAGGAGCCGAGCAAGAGCATTGAAACCGTCTAAATGTGGTTCAAGAACTAATTTGGATT
TAGGATCTTCTGGTTCGTTGTGTGAATGTACCTAGTTTACATTTTGTGAGATGTGTGTAT
TTTAAGATTGTGGGTGTTTTTTGTTAGTTTTGAAAATTCTTGGGGTTGGTTTGTAAAATT
AACAAACTAGGGAGTGAATGTGAGATTATTAGGATACTGAAACTTTTCACATTGATTTTT
TTTTTTCTGTTCTTGCTTCTCTGTAATGTTTATGTATTTGTCTTTTTGAAGAATTTAATT
TATTTTATTCCG


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1DA53TF U 1
AF RS1ES52TF U 3
AF RS1ES52JQ C 222
AF RS1DA53JQ C 456
BS 1 521 RS1DA53TF
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RD RS1DA53TF 658 0 0
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AAACATAGGGTTACTCGAAGAACCCCACCGTGACTCCACCGAGGATTCGAGTTCTTGCTT
TGGTTTGAGGAAGAAGAAGAGCAAAAACCACAAGGAGAAACCGAAGATGACTCAGACCAA
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GCATACTGGAAGCTTGAGCTTCAGCAGCCATATGTCTAAAGAAGACGAAGAGATGACTCG
TTCTGCCCTTTCTGCGTTTAGGGCTAAAGAAGAGGAGATTGATAAGAGGAGGATGGAAGT
TCGTGAGCGGATCCAGGCTCAGTTGGGTCGGGTCGAAGAAGAAACCCGACGACTCTCAAC
CATTCGCGAGGAGCTTGAGACTATGGCAGATCCTATGAGGAAGGAAGTGTCTATGGTTCG
TAAAAAGATTGATAGTGTTAACAAAGAACTCAAACCTTTAGTTTCCACTGTTCAAAAGAA
GGAGAGGGAATACAAAGAAGCACTTGATACATTCAATGAGAAGAATAGAGAGAAAGTGCA
ACTGATCACCAAACTCATGGAGTTGGTAGGAGAAAGCGAGAAATTGAG
TTGAAAAGCT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1ES52TF 629 0 0
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ACATAGGGTTACTCGAAGAACCCCACCGTGACTCCACCGAGGATTCGAGTTCTTGCTTTG
GTTTGAGGAAGAAGAAGAGCAAAAACCACAAGGAGAAACCGAAGATGACTCAGACCAACG
CCGGAGCTGGAACCGGACCCCCGGAACCTCCTCAGCCGCAGAGCAACGAGATGGTTTTGC
ATACTGGAAGCTTGAGCTTCAGCAGCCATATGTCTAAAGAAGACGAAGAGATGACTCGTT
CTGCCCTTTCTGCGTTTAGGGCTAAAGAAGAGGAGATTGATAAGAGGAGGATGGAAGTTC
GTGAGCGGATCCAGGCTCAGTTGGGTCGGGTCGAAGAAGAAACCCGACGACTCTCAACCA
TTCGCGAGGAGCTTGAGACTATGGCAGATCCTATGAGGAAGGAAGTGTCTATGGTTCGTA
AAAAGATTGATAGTGTTAACAAAGAACTCAAACCTTTAGGTTCCACTGTTCAAAAGAAGG
AGAGGGAATACAAAGAAGCACTTGATACATTCAATGAGAAGAATAGAGAGAAAGTGCAAC
TGATCACCAAACTCATGGAGTTGGTAGGA

QA 1 629 1 629
DS 

RD RS1ES52JQ 750 0 0
AGAGCAACGAGATGGTTTTGCATACTGGAAGCTTGAGCTTCAGCAGCCATATGTCTAAAG
AAGACGAAGAGATGACTCGTTCTGCCCTTTCTGCGTTTAGGGCTAAAGAAGAGGAGATTG
ATAAGAGGAGGATGGAAGTTCGTGAGCGGATCCAGGCTCAGTTGGGTCGGGTCGAAGAAG
AAACCCGACGACTCTCAACCATTCGCGAGGAGCTTGAGACTATGGCAGATCCTATGAGGA
AGGAAGTGTCTATGGTTCGTAAAAAGATTGATAGTGTTAACAAAGAACTCAAACCTTTAG
GTTCCACTGTTCAAAAGAAGGAGAGGGAATACAAAGAAGCACTTGATACATTCAATGAGA
AGAATAGAGAGAAAGTGCAACTGATCACCAAACTCATGGAGTTGGTAGGAGAAAGCGAGA
AATTGAGGTTGAAAAAGCTGGAGGAGCTGAGCAAGAGCATTGAAACCGTCTAAATGTGGT
TCAAGAACTAATTTGGATTTAGGATCTTCTGGTTCGTTGTGTGAATGTACCTAGTTTACA
TTTTGTGAGATGTGTGTATTTTAAGATTGTGGGTGTTTTTTGTTAGTTTTGAAAATTCTT
GGGGTTGGTTTGTAAAATTAACAAACTAGGGAGTGAATGTGAGATTATTAGGATACTGAA
ACTTTTCACATTGATTTTTTTTTT*CTGTTCTTGCTTCTCTGTAATGTTTATGTATTTGT
CTTTTTGAAGAATTTAATTTATTTTATT
TC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RS1DA53JQ 517 0 0
TGAGGAAGGAAGTGTCTATGGTTCGTAAAAAGATTGATAGTGTTAACAAAGAACTCAAAC
CTTTAGTTTCCACTGTTCAAAAGAAGGAGAGGGAATACAAAGAAGCACTTGATACATTCA
ATGAGAAGAATAGAGAGAAAGTGCAACTGATCACCAAACTCATGGAGTTGGTAGGAGAAA
GCGAGAAATTGAGGTTGAAAAAGCTGGAGGAGCCGAGCAAGAGCATTGAAACCGTCTAAA
TGTGGTTCAAGAACTAATTTGGATTTAGGATCTTCTGGTTCGTTGTGTGAATGTACCTAG
TTTACATTTTGTGAGATGTGTGTATTTTAAGATTGTGGGTGTTTTTTGTTAGTTTTGAAA
ATTCTTGGGGTTGGTTTGTAAAATTAACAAACTAGGGAGTGAATGTGAGATTATTAGGAT
ACTGAAACTTTTCACATTGATTTTTTTTTTTCTGTTCTTGCTTCTCTGTAATGTTTTTGT
ATTTGTCTTTTTGAAGAATTTAATTTATTTTATTCCG

QA 1 517 1 517
DS 



AS 1 4

CO CL2770Contig1 933 4 5 U
TTCCTCCTTTCTCCACATAATGGATACATTCTCTTGTAATTCTTGTGAACAAAATCACGC
CCCTTTCCACCGTCATGATAATGATATTGATATTGATGATTCCGATCACGATCATCATGA
TGGTGTTCAGCAAGAGGAGAGTGGATGGACAACTTATCTTGAAGATTTCTCAAATCAATA
CGGAGCTCATCCTGAAGATAACGAACATCAATATAAGAGTTCGTGCTCGATTCTGGACGC
CTCTCCTTCTCTGGTCTCCGACGCCGCCACTGATGCCTTTTCTGGCCGGAGCTTTCCAGT
TAATTTTCCGGTGAAGTTGAAGTTTGGGAAGGCAAGAACCAAAAAGATTTGTGAGGATGA
TTCTTTGGAGGATACGGCTAGCTCTCCGGTTAATAGCCCTAAGATCAGTCAGATGGAGCA
TATTCAGACGCCTCCTAGAAAACACGAGGACTATGTATCTTCTAGTTTCGTTATGGGAAA
TATGAGGGGCGTGGCGGATCATCAAATCCAAATCCAAGAAGGAGATGAACAAAAGATGAC
GATGATGAGGAATCTCAGAGAAGGAAACAACAAAAGCAACATCAATAATATGGACTTGAG
GAGTAGAGGATTATGTGTCGTCCCTATTTCCATGTTGGGTAATTTCAATTGCCGCTTCTG
AATGATGAGAAATACTAGTAAAACCCTTGTAACTTTTGGTGGTGTTTATGTATGTACCCA
TCTTGCATATATTCACATGATGTGTGTACGTCTTGATGTGTATGTGCTTAATTAGATATG
TAGTTTGTGTACGTTTGTATAAGTGCATATCGGTGGGATATTTGTGAAGTACACAGCGTA
TATGTTTGTTGTAAACATATTTTTTTCTTTTTTGGACAACGTTGTAAACATATTTAAGAG
ATACTATTTCATAAAGATTACGATAGCTTTGGC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E644TF U 1
AF RS1AO68TFB U 1
AF RS1E644JQ C 78
AF RS1AO68JQ C 461
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BS 299 840 RS1AO68TFB
BS 841 852 RS1E644JQ
BS 853 933 RS1AO68JQ

RD RS1E644TF 638 0 0
TC
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CTTTCCACCGTCATGATAATGATATTGATATTGATGATTCCGATCACGATCATCATGATG
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GAGCTCATCCTGAAGATAACGAACATCAATATAAGAGTTCGTGCTCGATTCTGGACGCCT
CTCCTTCTCTGGTCTCCGACGCCGCCACTGATGCCTTTTCTGGCCGGAGCTTTCCAGTTA
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CTTTGGAGGATACGGCTAGCTCTCCGGTTAATAGCCCTAAGATCAGTCAGATGGAGCATA
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TGATGAGGAATCTCAGAGAAG*AAACAACAAAAGCAACATCAATAATATGGACTTGAGGA
GTAGAGGAT*ATGTGTCGTCCCTATTTCCATGTTGG

QA 3 638 3 638
DS 

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CCCTTTCCACCGTCATGATAATGATATTGATATTGATGATTCCGATCACGATCATCATGA
TGGTGTTCAGCAAGAGGAGAGTGGATGGACAACTTATCTTGAAGATTTCTCAAATCAATA
CGGAGCTCATCCTGAAGATAACGAACATCAATATAAGAGTTCGTGCTCGATTCTGGACGC
CTCTCCTTCTCTGGTCTCCGACGCCGCCACTGATGCCTTTTCTGGCCGGAGCTTTCCGGT
TAATTTTCCGGTGAAGTTGAAGTTTGGGAAGGCAAGAACCAAAAAGATTTGTGAGGATGA
TTCTTTGGAGGATACGGCTAGCTCTCCGGTTAATAGCCCTAAGATCAGTCAGATGGAGCA
TATTCAGACGCCTCCTAGAAAACACGAGGACTATGTATCTTCTAGTTTCGTTATGGGAAA
TATGAGGGGCGTGGCGGATCATCAAATCCAAATCCAAGAAGGAGATGAACAAAAGATGAC
GATGATGAGGAATCTCAGAGAAGGAAACAACAAAAGCAACATCAATAATATGGACTTGAG
GAGTAGAGGATTATGTGTCGTCCCTATTTCCATGTTGGGTAATTTCAATTGCCGCTTCTG
AATGATGAGAAATACTAGTAAAACCCTTGTAACTTTTGGTGGTGTTTATGTATGTACCCA
TCTTGCATATATTCACATGATGTGTGTACGTCTTGATGTGTATGTGCTTAATTAGATATG
TAGTTTGTGTACGTTTGTATAAGTGCATATCGGTGGGATATTTGTGAAGTACACAGCGTA

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DS 

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AGAGTGGATGGACAACTTATCTTGAAGATTTCTCAAATCAATACGGAGCTCATCCTGAAG
ATAACGAACATCAATATAAGAGTTCGTGCTCGATTCTGGACGCCTCTCCTTCTCTGGTCT
CCGACGCCGCCACTGATGCCTTTTCTGGCCGGAGCTTTCCAGTTAATTTTCCGGTGAAGT
TGAAGTTTGGGAAGGCAAGAACCAAAAAGATTTGTGAGGATGATTCTTTGGAGGATACGG
CTAGCTCTCCGGTTAATAGCCCTAAGATCAGTCAGATGGAGCATATTCAGACGCCTCCTA
GAAAACACGAGGACTATGTATCTTCTAGTTTCGTTATGGGAAATATGAGGGGCGTGGCGG
ATCATCAAATCCAAATCCAAGAAGGAGATGAACAAAAGATGACGATGATGAGGAATCTCA
GAGAAGGAAACAACAAAAGCAACATCAATAATATGGACTTGAGGAGTAGAGGATTATGTG
TCGTCCCTATTTCCATGTTGGGTAATTTCAATTGCCGCTTCTGAATGA***GAAATACTA
GTAAAACCCTTGTAACTTTTGGTGGTGTTTATGTATGTACCCATCTTGCATATATTCACA
TGATGTGTGTACGTCTTGATGTGTATGTGCTTAATTAGATATGTAGTTTGTGTACGTTTG
TATAAGTGCATATCGGTGGGATATTTGTGAAGTACACAGCGTATATGTTTGTTGT

QA 1 775 1 775
DS 

RD RS1AO68JQ 473 0 0
TCTAGTTTCGTTATGGGAAATATGAGGGGCGTGGCGGATCATCAAATCCAAATCCAAGAA
GGAGATGAACAAAAGATGACGATGATGAGGAATTTCAGAGAAGGAAACAACAAAAGCAAC
ATCAATAATATGGACTTGAGGAGTAGAGGATTATGTGTCGTCCCTATTTCCATGTTGGGT
AATTTCAATTGCCGCTTTTGAATGATGAGAAATACTAGTAAAACCCTTGTAACTTTTGGT
GGTGTTTATGTATGTACCCATCTTGCATATATTCACATGATGTGTGTACGTCTTGATGTG
TATGTGCTTAATTAGATATGTAGTTTGTGTACGTTTGTATAAGTGCATATCGGTGGGATA
TTTGTGAAGTACACAGCGTATATGTTTGTTGTAAACATATTTTTTTCTTTTTTGGACAAC
GTTGTAAACATATTTAAGAGATACTATTTCATAAAGATTACGATAGCTTTGGC

QA 1 473 1 473
DS 



AS 1 4

CO CL2771Contig1 944 4 3 U
CACACACAAAGCAATCGATCATATCAATCTCAGGTGTTTACGATTCTGATTAAAAGAATT
CGATTCGGTTGAAAAGAAAAAAAATCCACAGACCACAATCCTTTCCTTTGATCCTTTCCG
TCATGGTGGATCACTACCAAGTCCTAGGCGTTAACAGAAACGCGACCAAGCAAGAGGTCA
AAGAAGCGTTCCGGAGATTAGCGGTGAAGTACCATCCCGACAAGCACGCGCAGTCTCCCG
ACCACGTTCGGTTAAACGCCACCGTGCGGTTTAAGCTCGTGTCGGAAGCGTACGAGGTGT
TGAACGACGATCGGAAACGTGCGTCTTATAACGCTGTCGGCGATTCCGATCGCTTTCGTC
GCCGTACCGGCGGTGGTTCGTATAGCAATCCGTACGGAAACCGCGGTTCTGGTTATGGTT
ACGGTTACGGTTACGGTTACTCTGCGAGGAACAGTCGTCAAGCTTCTAGTTTCAGTAGCG
GGTTTGAGTCGACGTTTCGGTACTTGACTACACGCGCGTTTCTACTTAACCTCGCGTTAA
CTGGGTATTGGTATACTCTGTGCCTTTACTGCGATTGATTCAAGCGGAGAAACATTATGG
AAAATGCGTAACTCAGGGAAATCATTCGAAGAAGCGATGGATTCACTTGAGAAGACAAAG
GCACATAAGAATGAAGGGTGAATGAAAGTAGCCAGAGGTACTACTAAGACTTGTATATTT
TTTTTATGTTTTTTCTCTCTTATAATTGGTTGAAAGGTTATTAAAAGTGTAATAGTTCAA
AATGCACTTGTATTAATCGATTTATGAGAGTTAATACCTCACGCAATTGGCATTTGAGTG
CATAACGGCAAGCAAAGATGGGATGTTGTAATAAAACAAATAAAACTTTTGGCTTTTGTA
TCTGTAATGGAGAGACATAATTGTAGTGGTAGGTTACTTGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A158TF U 1
AF RS1A158TR C 106
AF RS1A158TV U 39
AF RS1A158JQ C 123
BS 1 613 RS1A158TF
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BS 870 944 RS1A158JQ

RD RS1A158TF 613 0 0
CACACACAAAGCAATCGATCATATCAATCTCAGGTGTTTACGATTCTGATTAAAAGAATT
CGATTCGGTTGAAAAGAAAAAAAATCCACAGACCACAATCCTTTCCTTTGATCCTTTCCG
TCATGGTGGATCACTACCAAGTCCTAGGCGTTAACAGAAACGCGACCAAGCAAGAGGTCA
AAGAAGCGTTCCGGAGATTAGCGGTGAAGTACCATCCCGACAAGCACGCGCAGTCTCCCG
ACCACGTTCGGTTAAACGCCACCGTGCGGTTTAAGCTCGTGTCGGAAGCGTACGAGGTGT
TGAACGACGATCGGAAACGTGCGTCTTATAACGCTGTCGGCGATTCCGATCGCTTTCGTC
GCCGTACCGGCGGTGGTTCGTATAGCAATCCGTACGGAAACCGCGGTTCTGGTTATGGTT
ACGGTTACGGTTACGGTTACTCTGCGAGGAACAGTCGTCAAGCTTCTAGTTTCAGTAGCG
GGTTTGAGTCGACGTTTCGGTACTTGACTACACGCGCGTTTCTACTTAACCTCGCGTTAA
CTGGGTATTGGTATACTCTGTGCCTTTACTGCGATTGATTCAAGCGGAGAAACATTATGG
AAAATGCGTAACT

QA 1 613 1 613
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CCAAGCAAGAGGTCAAAGAAGCGTTCCGGAGATTAGCGGTGAAGTACCATCCCGACAAGC
ACGCGCAGTCTCCCGACCACGTTCGGTTAAACGCCACCGTGCGGTTTAAGCTCGTGTCGG
AAGCGTACGAGGTGTTGAACGACGATCGGAAACGTGCGTCTTATAACGCTGTCGGCGATT
CCGATCGCTTTCGTCGCCGTACCGGCGGTGGTTCGTATAGCAATCCGTACGGAAACCGCG
GTTCTGGTTATGGTTACGGTTACGGTTACGGTTACTCTGCGAGGAACAGTCGTCAAGCTT
CTAGTTTCAGTAGCGGGTTTGAGTCGACGTTTCGGTACTTGACTACACGCGCGTTTCTAC
TTAACCTCGCGTTAACTGGGTATTGGTATACTCTGTGCCTTTACTGCGATTGATTCAAGC
GGAGAAACATTATGGAAAATGCGTAACTCAGGGAAATCATTCGAAGAAGCGATGGATTCA
CTTGAGAAGACAAAGGCACATAAGAATGAAGGGTGAATGAAAGTAGCCAGAGGTACTACT
AAGACTTGTATATTTTTTTTATGTTTTTTCTCTCTTATAATTGGTTGAAAGGTTATTAAA
AGTGTAATAGTTCAAAATGCACTTGTATTAATCGATTTATGAGAGTTAATACCT

QA 1 714 1 714
DS 

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TCCTTTCCTTTGATCCTTTCCGTCATGGTGGATCACTACCAAGTCCTAGGCGTTAACAGA
AACGCGACCAAGCAAGAGGTCAAAGAAGCGTTCCGGAGATTAGCGGTGAAGTACCATCCC
GACAAGCACGCGCAGTCTCCCGACCACGTTCGGTTAAACGCCACCGTGCGGTTTAAGCTC
GTGTCGGAAGCGTACGAGGTGTTGAACGACGATCGGAAACGTGCGTCTTATAACGCTGTC
GGCGATTCCGATCGCTTTCGTCGCCGTACCGGCGGTGGTTCGTATAGCAATCCGTACGGA
AACCGCGGTTCTGGTTATGGTTACGGTTACGGTTACGGTTACTCTGCGAGGAACAGTCGT
CAAGCTTCTAGTTTCAGTAGCGGGTTTGAGTCGACGTTTCGGTACTTGACTACACGCGCG
TTTCTACTTAACCTCGCGTTAACTGGGTATTGGTATACTCTGTGCCTTTACTGCGATTGA
TTCAAGCGGAGAAACATTATGGAAAATGCGTAACTCAGGGAAATCATTCGAAGAAGCGAT
GGATTCACTTGAGAAGACAAAGGCACATAAGAATGAAGGGTGAATGAAAGTAGCCAGAGG
TACTACTAAGACTTGTATATTTTTTTTATGTTTTTTCTCTCTTATAATTGGTTGAAAGGT
TATTAAAAGTGTAATAGTTCAAAATGCACTTGTATTAATCGATTTATGAGAGTTAATACC
TCACGCAATTGGCATTTGAGTGCATAACGGCAAGCAAAGATGGGATGTTGT

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DS 

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GAAGCGTTCCGGAGATTAGCGGTGAAGTACCATCCCGACAAGCACGCGCAGTCTCCCGAC
CACGTTCGGTTAAACGCCACCGTGCGGTTTAAGCTCGTGTCGGAAGCGTACGAGGTGTTG
AACGACGATCGGAAACGTGCGTCTTATAACGCTGTCGGCGATTCCGATCGCTTTCGTCGC
CGTACCGGCGGTGGTTCGTATAGCAATCCGTACGGAAACCGCGGTTCTGGTTATGGTTAC
GGTTACGGTTACGGTTACTCTGCGAGGAACAGTCGTCAAGCTTCTAGTTTCAGTAGCGGG
TTTGAGTCGACGTTTCGGTACTTGACTACACGCGCGTTTCTACTTAACCTCGCGTTAACT
GGGTATTGGTATACTCTGTGCCTTTACTGCGATTGATTCAAGCGGAGAAACATTATGGAA
AATGCGTAACTCAGGGAAATCATTCGAAGAAGCGATGGATTCACTTGAGAAGACAAAGGC
ACATAAGAATGAAGGGTGAATGAAAGTAGCCAGAGGTACTACTAAGACTTGTATATTTTT
TTTATGTTTTTTCTCTCTTATAATTGGTTGAAAGGTTATTAAAAGTGTAATAGTTCAAAA
TGCACTTGTATTAATCGATTTATGAGAGTTAATACCTCACGCAATTGGCATTTGAGTGCA
TAACGGCAAGCAAAGATGGGATGTTGTAATAAAACAAATAAAACTTTTGGCTTTTGTATC
TGTAATGGAGAGACATAATTGTAGTGGTAGGTTACTTGTTTG

QA 1 822 1 822
DS 



AS 1 4

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TTCT


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 

AF RS1C290JQ C 1
AF RS1DK02JQ C 1
AF RS1C290TF U 1
AF RS1DK02TF U 1
BS 1 364 RS1C290TF

RD RS1C290JQ 364 0 0
GGGATGGTGAAGAACAACAATCTCTTCCACTTTTCTTCTTATTTTTCTTCTCATTTTTCA
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ATTCAGATTGTGCCCCTTTGTAAATTAAGGTCCTACATATACTGCCATGTTTCCACTCGT
TTCT

QA 1 364 1 364
DS 

RD RS1DK02JQ 364 0 0
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TTCT

QA 1 364 1 364
DS 

RD RS1C290TF 364 0 0
GGGATGGTGAAGAACAACAATCTCTTCCACTTTTCTTCTTATTTTTCTTCTCATTTTTCA
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ATTCAGATTGTGCCCCTTTGTAAATTAAGGTCCTACATATACTGCCATGTTTCCACTCGT
TTCT

QA 1 364 1 364
DS 

RD RS1DK02TF 364 0 0
GGGATGGTGAAGAACAACAATCTCTTCCACTTTTCTTCTTATTTTTCTTCTCATTTTTCA
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AGAAAGATGCAGTTTTATCCTGGGACTCTAATCGTCATGCAATCGTCACACTACGGGGCG
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ATTCAGATTGTGCCCCTTTGTAAATTAAGGTCCTACATATACTGCCATGTTTCCACTCGT
TTCT

QA 1 364 1 364
DS 



AS 1 4

CO CL2773Contig1 909 4 6 U
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TTATACCAAGACCTGAGCTTTTGCCAGGCTTGCATGTTCAAAGCACCTACAATTACAGCC
AAAAATGGTTCTTCCTCTCAGAAACAGGTCCATGGTAACACTGCAACCATTTTCCTCAAT
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CTTCTTCCTTAAGCTAAAGCCCGATTGTTCTTCACTCACTGACATGCCCCTCACGCCGTA
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CATCAGATACATCGTCATCATCCTCAGATGAAAACGCACAGAGCTTCATGCTCTGAGCTC
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CTGTCTTCTTCTTTGACCACCAGCCTCAGCCATTCTGATCCTACTGACACCAAAAAGAAG
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AACTATAAACATGTTTGGGACCGCGTAAGATAGATTGAACTGTAATGAGTTTTCTTTTTT
ATATATGAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1DY03TF U 1
AF RS1E090TF U 1
AF RS1E090JQ C 82
AF RS1DY03JQ C 440
BS 1 715 RS1DY03TF
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RD RS1DY03TF 755 0 0
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ACTCATTTAGCATTGAGTCTAAGACTTCGAC
GTAA

QA 1 751 1 751
DS 

RD RS1E090TF 751 0 0
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AAAAATGGTTCTTCCTCTCAGAAACAGGTCCATGGTAACACTGCAACCATTTTCCTCAAT
GTGTGATTGGCAAGTTTGGGCATACCTGCAAATTTGATCACTCCATGAGCTGCTCTTCTT
CTTCTTCCTTAAGCTAAAGCCCGATTGTTCTTCACTCACTGACATGCCCCTCACGCCGTA
CCCTCTTGAGTCCTCATTGCTCAGCACGTTAGTACCCTCTTGAGTCCTCATTGCTCAGCA
CATCAGATACATCGTCATCATCCTCAGATGAAAACGCACAGAGCTTCATGCTCTGAGCTC
CAAGCAAACTCAAACCCACAACACAAGTGGTGGCTCTGAACCGTTGCTGCTGAAGTCTCT
CTGTCTTCTTCTTTGACCACCAGCCTCAGCCATTCTGATCCTACTGACACCAAAA*GAAG
ACTCATTTAGCATTGAGTCTAAGACTTCGAC

QA 1 751 1 751
DS 

RD RS1E090JQ 828 0 0
TCTGCTCAGGTTTAGTGTTCAACATGTC**TTTTCTTACAATAAAGGACAGAGACCATGA
TCAAGAAGAGAATCAGAAAATAATTCTATATCAAGCTTTGAGTCTAAAGACCCTCCTTGC
AGATTATCTGCTTCTGGTAGCTTACGAAGGTCAGAGTAGTTATACCAAGAC*TGAGCTTT
TGCCAGGCTTGCATGTTCAAAGCACCTACAATTACAGCCAAAAATGGTTCTTCCTCTCAG
AAACAGGTCCATGGTAACACTGCAACCATTTTCCTCAATGTGTGATTGGCAAGTTTGGGC
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CCTCAGATGAAAACGCACAGAGCTTCATGCTCTGAGCTCCAAGCAAACTCAAACCCACAA
CACAAGTGGTGGCTCTGAACCGTTGCTGCTGAAGTCTCTCTGTCTTCTTCTTTGACCACC
AGCCTCAGCCATTCTGATCCTACTGACACCAAAAAGAAGACTCATTTAGCATTGAGTCTA
AGACTTCGACGTTAAAGATACAAAGCTCAAAGGAGAGAACCTCCCTTTACTTCTATTGTT
ATCTCTCTATCGATCTTTTCTTTTTATCAAACTTGCATAAACTATAAACATGTTTGGGAC
CGCGTAAGATAGATTGAACTGTAATGAGTTTTCTTTTTTATATATGAG

QA 1 828 1 828
DS 

RD RS1DY03JQ 470 0 0
CCCGATTGTTCTTCACTCACTGACATGCCCCTCACGCCGTACCCTCTTGAGTCCTCATTG
CTCAGCACGTTAGTACCCTCTTGAGTCCTCATTGCTCAGCACATCAGATACATCGTCATC
ATCCTCAGATGAAAACGCACAGAGCTTCATGCTCTGAGCTCCAAGCAAACTCAAACCCAC
AACACAAGTGGTGGCTCTGAACCGTTGCTGCTGAAGTCTCTCTGTCTTCTTCTTTGACCA
CCAGCCTCAGCCATTCTGATCCTACTGACACCAAAAAGAAGACTCATTTAGCATTGAGTC
TAAGACTTCGACGTTAAAGATACAAAGCTCAAAGGAGAGAACCTCCCTTTACTTCTATTG
TTATCTCTCTATCGATCTTTTCTTTTTATCAAACTTGCATAAACTATAAACATGTTTGGG
ACCGCGTAAGATAGATTGAACTGTAATGAGTTTTCTTTTTTATATATGAG

QA 1 470 1 470
DS 



AS 1 4

CO CL2774Contig1 779 4 3 U
GCAAACACTCCGTAACATAGTAATGGGAGCTACACTGATGGCTACGACCTGCATCCTCCT
CTGCGCCGGTTTAGCCGCAGTCATAAGCAGCACTTACAGCATCAAGAAGCCCCTAAACGA
CGCCGTTTACGGTGCTCATGGAGATATCGCCATAGCCGTCAAGTACCTAACGATTCTCAC
AATCTTCATCTTTTCTTTCTTCTCTCATTCTCTCTCTATCCGCTTCCTTAACCAAGTCGC
CATGCTCGTTAACATCCCTAACCTATACCCTAATCCTTCTGGTGACTTGTTCCTCACGTC
CGAGTACGTCAGCGAGTTGTTTGACAAGAGTTTCTTTCTCAGCACGGTAGGCAACAGGTT
GTTCTACGCAGGGTTTTCTCTGATGCTATGGATCTTTGGTCCCATACTCGTGTTCTTGAG
CGTTTTGGTAATGATTCTTACTCTTTATCACGTGGATTTTGTGTCACTCGGCAACAATAA
AGAAAAACAACGTATCGTGGATTGTCCACGCGCCTCTGAGACTCCAAACGGTGGTGGTGA
TGATGCATAATACAATTCCATATGTGAAATTTTGAAAAACAATATGAAAATGATAATATA
CACATTTTTCAAATGTGAAAATGGTATATCTATCATCACCTAAATTAAACATGGTGATTT
TAAGCATCACTACTTATTTTGTTATTCATAATGCATGTCTTAACAAGAACTGAGTTCGAG
TTGTATTATTTACTATAGTGAATCAGTACTGTAGATCGTAAATTTAAGAAAAATAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CQ61TF U 1
AF RS1GV94JQ C 65
AF RS1GV94TF U 65
AF RS1CQ61JQ C 116
BS 1 461 RS1CQ61TF
BS 462 727 RS1GV94TF
BS 728 779 RS1CQ61JQ

RD RS1CQ61TF 461 0 0
GCAAACACTCCGTAACATAGTAATGGGAGCTACACTGATGGCTACGACCTGCATCCTCCT
CTGCGCCGGTTTAGCCGCAGTCATAAGCAGCACTTACAGCATCAAGAAGCCCCTAAACGA
CGCCGTTTACGGTGCTCATGGAGATATCGCCATAGCCGTCAAGTACCTAACGATTCTCAC
AATCTTCATCTTTTCTTTCTTCTCTCATTCTCTCTCTATCCGCTTCCTTAACCAAGTCGC
CATGCTCGTTAACATCCCTAACCTATACCCTAATCCTTCTGGTGACTTGTTCCTCACGTC
CGAGTACGTCAGCGAGTTGTTTGACAAGAGTTTCTTTCTCAGCACGGTAGGCAACAGGTT
GTTCTACGCAGGGTTTTCTCTGATGCTATGGATCTTTGGTCCCATACTCGTGTTCTTGAG
CGTTTTGGTAATGATTCTTACTCTTTATCACGTGGATTTTG

QA 1 461 1 461
DS 

RD RS1GV94JQ 663 0 0
GCCGGTTTAGCCGCAGTCATAAGCAGCACTTACAGCATCAAGAAGCCCCTAAACGACGCC
GTTTACGGTGCTCATGGAGATATCGCCATAGCCGTCAAGTACCTAACGATTCTCACAATC
TTCATCTTTTCTTTCTTCTCTCATTCTCTCTCTATCCGCTTCCTTAACCAAGTCGCCGTG
CTCGTTAACATCCCTAACCTATACCCTAATCCTTCTGGTGACTTGTTCCTCACGTCCGAG
TACGTCAGCGAGTTGTTTGACAAGGGTTTCTTTCTCAGCACGGTAGGCAACAGGTTGTTC
TACGCAGGGTTTTCTCTGATGCTATGGATCTTTGGTCCCATACTCGTGTTCTTGAGCGTT
TTGGTAATGATTCTTACTCTTTATCACGTGGATTTTGTGTCACTCGGCAACAATAAAGAA
AAACAACGTATCGTGGATTGTCCACGCGCCTCTGAGACTCCAAACGGTGGTGGTGATGAT
GCATAATACAATTCCATATGTGAAATTTTGAAAAACAATATGAAAATGATAATATACACA
TTTTTCAAATGTGAAAATGGTATATCTATCATCACCTAAATTAAACATGGTGATTTTAAG
CATCACTACTTATTTTGTTATTCATAATGCATGTCTTAACAAGAACTGAGTTCGAGTTGT
ATT

QA 1 663 1 663
DS 

RD RS1GV94TF 670 0 0
GCCGGTTTAGCCGCAGTCATAAGCAGCACTTACAGCATCAAGAAGCCCCTAAACGACGCC
GTTTACGGTGCTCATGGAGATATCGCCATAGCCGTCAAGTACCTAACGATTCTCACAATC
TTCATCTTTTCTTTCTTCTCTCATTCTCTCTCTATCCGCTTCCTTAACCAAGTCGCCGTG
CTCGTTAACATCCCTAACCTATACCCTAATCCTTCTGGTGACTTGTTCCTCACGTCCGAG
TACGTCAGCGAGTTGTTTGACAAGGGTTTCTTTCTCAGCACGGTAGGCAACAGGTTGTTC
TACGCAGGGTTTTCTCTGATGCTATGGATCTTTGGTCCCATACTCGTGTTCTTGAGCGTT
TTGGTAATGATTCTTACTCTTTATCACGTGGATTTTGTGTCACTCGGCAACAATAAAGAA
AAACAACGTATCGTGGATTGTCCACGCGCCTCTGAGACTCCAAACGGTGGTGGTGATGAT
GCATAATACAATTCCATATGTGAAATTTTGAAAAACAATATGAAAATGATAATATACACA
TTTTTCAAATGTGAAAATGGTATATCTATCATCACCTAAATTAAACATGGTGATTTTAAG
CATCACTACTTATTTTGTTATTCATAATGCATGTCTTAACAAGAACTGAGTTCGAGTTGT
ATT
AAAAAAA

QA 1 663 1 663
DS 

RD RS1CQ61JQ 664 0 0
AACGACGCCGTTTACGGTGCTCATGGAGATATCGCCATAGCCGTCAAGTACCTAACGATT
CTCACAATCTTCATCTTTTCTTTCTTCTCTCATTCTCTCTCTATCCGCTTCCTTAACCAA
GTCGCCATGCTCGTTAACATCCCTAACCTATACCCTAATCCTTCTGGTGACTTGTTCCTC
ACGTCCGAGTACGTCAGCGAGTTGTTTGACAAGAGTTTCTTTCTCAGCACGGTAGGCAAC
AGGTTGTTCTACGCAGGGTTTTCTCTGATGCTATGGATCTTTGGTCCCATACTCGTGTTC
TTGAGCGTTTTGGTAATGATTCTTACTCTTTATCACGTGGATTTTGTGTCACTCGGCAAC
AATAAAGAAAAACAACGTATCGTGGATTGTCCACGCGCCTCTGAGACTCCAAACGGTGGT
GGTGATGATGCATAATACAATTCCATATGTGAAATTTTGAAAAACAATATGAAAATGATA
ATATACACATTTTTCAAATGTGAAAATGGTATATCTATCATCACCTAAATTAAACATGGT
GATTTTAAGCATCACTACTTATTTTGTTATTCATAATGCATGTCTTAACAAGAACTGAGT
TCGAGTTGTATTATTTACTATAGTGAATCAGTACTGTAGATCGTAAATTTAAGAAAAATA
AAAA

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 4

CO CL2775Contig1 668 4 3 U
GGACGCGCCGCCGCGAAAACAGTTTAGAAAGAAGAAAAAATCCAAAACGCGGCGAAGGTT
GAGAAAGGAGAGAGAGATGCAATCCCAAGGAATTTGGAGCACACTATGGAGGAAATACGC
AGATTATAAGTACAACAAGTTCGAGAGGTTCGCTGTCTGGGAGATGATCGAGCCTTACCG
TCGACCCAAAACCTTCACAGCCTTGATTACTATCTACGTCGCCGCCTTTTACACCGGCGT
CATCGGCGCTGCGGTTACGGAGCAGCTTTACAAGGAGAAGTTTTGGGAAGAGCACCCAGG
CAAAACGGTGCCTCTGATGAAGCCATTGTTCTATCGAGGACCATGGAGGGTTTATCGTGG
TGAAGCTATTGCTTCCGATGCTAGCAGCAGCCAGTGAAGTTAACGATCCAGAGACTATGG
GCGAAGGATATATCTCCCATCATTAGTTGGTTTATGCTGGTTCGCTGGTATATATACGCG
TTCAGTAGAATGCGTGTGTGTCAAGAGCTGTTTAAATGTCTTCTAGGTTTCTATGGATTA
AAGCTGGCTGGTGTATTTTCCTTGTAGACAATAAGGTTAAGAATATGATTCTTAAAACTC
GTGTAATGGCAGAGTCTCTGTTATAACATTAATGTTTTGTTATGAGAAGTTTAAAGGGTT
TCCATCCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EY46TF U 66
AF RS1EY46JQ C 171
AF RS1CG19JQ C 1
AF RS1CG19TF U 1
BS 1 65 RS1CG19TF
BS 66 654 RS1EY46TF
BS 655 668 RS1CG19TF

RD RS1EY46TF 593 0 0
AGGAGAGAGAGATGCAATCCCAAGGAATTTGGAGCACACTATGGAGGAAATACGCAGATT
ATAAGTACAACAAGTTCGAGAGGTTCGCTGTCTGGGAGATGATCGAGCCTTACCGTCGAC
CCAAAACCTTCACAGCCTTGATTACTATCTACGTCGCCGCCTTTTACACCGGCGTCATCG
GCGCTGCGGTTACGGAGCAGCTTTACAAGGAGAAGTTTTGGGAAGAGCACCCAGGCAAAA
CGGTGCCTCTGATGAAGCCATTGTTCTATCGAGGACCATGGAGGGTTTATCGTGGTGAAG
CTATTGCTTCCGATGCTAGCAGCAGCCAGTGAAGTTAACGATCCAGAGACTATGGGCGAA
GGATATATCTCCCATCATTAGTTGGTTTATGCTGGTTCGCTGGTATATATACGCGTTCAG
TAGAATGCGTGTGTGTCAAGAGCTGTTTAAATGTCTTCTAGGTTTCTATGGATTAAAGCT
GGCTGGTGTATTTTCCTTGTAGACAATAAGGTTAAGAATATGATTCTTAAAACTCGTGTA
ATGGCAGAGTCTCTGTTATAACATTAATGTTTTGTTATGAGAAGTTTAA
AAAA

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1EY46JQ 452 0 0
AGCCTTACCGTCGACCCAAAACCTTCACAGCCTTGATTACTATTTACGTCGCCGCCTTTT
ACACCGGCGTCATCGGCGCTGCGGTTACGGAGCAGCTTTACAAGGAGAAGTTTTGGGAAG
AGCACCCAGGCAAAACGGTGCCTCTGATGAAGCCATTGTTCTATCGAGGACCATGGAGGG
TTTATCGTGGTGAAGCTATTGCTTCCGATGCTAGCAGCAGCCAGTGAAGTTAACGATCCA
GAGACTATGGGCGAAGGATATATCTCCCATCATTAGTTGGTTTATGCTGGTTCGCTGGTA
TATATACGCGTTCAGTAGAATGCGTGTGTGTCAAGAGCTGTTTAAATGTCTTCTAGGTTT
CTATGGATTAAAGCTGGCTGGTGTATTTTCCTTGTAGACAATAAGGTTAAGAATATGATT
CTTAAAACTCGTGTAATGGCAGAGTCTCTGTT

QA 1 452 1 452
DS 

RD RS1CG19JQ 668 0 0
GGACGCGCCGCCGCGAAAACAGTTTAGAAAGAAGAAAAAATCCAAAACGCGGCGAAGGTT
GAGAAAGGAGAGAGAGATGCAATCCCAAGGAATTTGGAGCACACTATGGAGGAAATACGC
AGATTATAAGTACAACAAGTTCGAGAGGTTCGCTGTCTGGGAGATGATCGAGCCTTACCG
TCGACCCAAAACCTTCACAGCCTTGATTACTATCTACGTCGCCGCCTTTTACACCGGCGT
CATCGGCGCTGCGGTTACGGAGCAGCTTTACAAGGAGAAGTTTTGGGAAGAGCACCCAGG
CAAAACGGTGCCTCTGATGAAGCCATTGTTCTATCGAGGACCATGGAGGGTTTATCGTGG
TGAAGCTATTGCTTCCGATGCTAGCAGCAGCCAGTGAAGTTAACGATCCAGAGACTATGG
GCGAAGGATATATCTCCTATCATTAGTTGGTTTATGCTGGTTCGCTGGTATATATACGCG
TTCAGTAGAATGCGTGTGTGTCAAGAGCTGTTTAAATGTCTTCTAGGTTTCTATGGATTA
AAGCTGGCTGGTGTATTTTCCTTGTAGACAATAAGGTTAAGAATATGATTCTTAAAACTC
GTGTAATGGCAGAGTCTCTGTTATAACATTAATGTTTTGTTATGAGAAGTTTAA*GGGTT
TCCATCCG

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1CG19TF 668 0 0
GGACGCGCCGCCGCGAAAACAGTTTAGAAAGAAGAAAAAATCCAAAACGCGGCGAAGGTT
GAGAAAGGAGAGAGAGATGCAATCCCAAGGAATTTGGAGCACACTATGGAGGAAATACGC
AGATTATAAGTACAACAAGTTCGAGAGGTTCGCTGTCTGGGAGATGATCGAGCCTTACCG
TCGACCCAAAACCTTCACAGCCTTGATTACTATCTACGTCGCCGCCTTTTACACCGGCGT
CATCGGCGCTGCGGTTACGGAGCAGCTTTACAAGGAGAAGTTTTGGGAAGAGCACCCAGG
CAAAACGGTGCCTCTGATGAAGCCATTGTTCTATCGAGGACCATGGAGGGTTTATCGTGG
TGAAGCTATTGCTTCCGATGCTAGCAGCAGCCAGTGAAGTTAACGATCCAGAGACTATGG
GCGAAGGATATATCTCCTATCATTAGTTGGTTTATGCTGGTTCGCTGGTATATATACGCG
TTCAGTAGAATGCGTGTGTGTCAAGAGCTGTTTAAATGTCTTCTAGGTTTCTATGGATTA
AAGCTGGCTGGTGTATTTTCCTTGTAGACAATAAGGTTAAGAATATGATTCTTAAAACTC
GTGTAATGGCAGAGTCTCTGTTATAACATTAATGTTTTGTTATGAGAAGTTTAAAGGGTT
TCCATCCG

QA 1 668 1 668
DS 



AS 2 4

CO CL2776Contig1 816 2 2 U
GGACAAAAGAGGACAAAAACAAAACAAAACAAAACAAGAAGTCCCATCTCCCTAACCTCT
TTGTTGTCTAAGGTTTACCTCCATCAACCAAACGCAATGGCGAACGCAGCGTCGGGAATG
GCGGTGGTAGACGAATGTAAGCTCAAGTTTTTGGAGCTAAAAGCGAAAAGAAACTATAGG
TTCATAATATTCAGGATAGATGGACAACAAGTGGTGGTCGAAAAACTTGGAAGTCCCGAG
GAGAACTACGACGATTTCTCCAATTCTCTTCCGGCCAACGAGTGCCGCTATGCCGTCTAT
GACTTCGACTTCACCACTGTTGAGAATTGCCAGAAGAGCAAAATCTTCTTCATAGCATGG
TCACCGGATTCTTCGAGTGTGAGGATGAAGATGGTGTATGCCAGCTCAAAGGACAGGTTC
AAGAGAGAATTAGATGGTATTCAGGTGGAATTACAAGCCACGGATCCGAGTGAGATGAGT
TTTGACATCATCAAAAGTCGTGCTCTCTAGATTCATATGTGCCTGATTTCTTATCATATA
TCCATAAGTGCTCCATCATCATTATTCAAAGAACTTCTCCATGTTGTGTAACTTTTGTTG
GTTTCATTCTTTCTTCTTCCTCTTGGCTCTTTTTAATCTTTTTTTATTTGCATTTAAAGA
CGTGGGTTTTATACTCTGGCTTGGGATAAGCTGTAAAACCGTGTAGTTTATCGTGTAATT
GCTGGCATAAAAAAATAAAACATATTACTTTTCCAATGCAGCAATATGTAAGCTCACTTA
GAACATAATTATAACCATCACGATTTTTCTCGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AP96TFB U 1
AF RS1AP96JQ C 58
BS 1 722 RS1AP96TFB
BS 723 816 RS1AP96JQ

RD RS1AP96TFB 722 0 0
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GACTTCGACTTCACCACTGTTGAGAATTGCCAGAAGAGCAAAATCTTCTTCATAGCATGG
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CGTGGGTTTTATACTCTGGCTTGGGATAAGCTGTAAAACCGTGTAGTTTATCGTGTAATT
GC

QA 1 722 1 722
DS 

RD RS1AP96JQ 759 0 0
TC
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GGCGGTGGTAGACGAATGTAAGCTCAAGTTTTTGGAGCTAAAAGCGAAAAGAAACTATAG
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TGACTTCGACTTCACCACTGTTGAGAATTGCCAGAAGAGCAAAATTTTTTTCATAGCATG
GTCACCGGATTTTTCGAGTGTGAGGATGAAGATGGTGTATGCCAGCTCAAAGGACAGGTT
CAAGAGAGAATTAGATGGTATTCAGGTGGAATTACAAGCCACGGATCCGAGTGAGATGAG
TTTTGACATCATCAAAAGTCGTGCTCTCTAGATTCATATGTGCCTGATTTCTTATCATAT
ATCCATAAGTGCTCCATCATCATTATTCAAAGAACTTCTCCATGTTGTGTAACTTTTGTT
GGTTTCATTCTTTTTTTTTCCTCTTGGCTCTTTTTAATCTTTTTTTATTTGCATTTAAAG
ACGTGGGTTTTATACTCTGGCTTGGGATAAGCTGTAAAACCGTGTAGTTTATCGTGTAAT
TGCTGGCATAAAAAAATAAAACATATTACTTTTCCAATGCAGCAATATGTAAGCTCACTT
AGAACATAATTATAACCATCACGATTTTTCTCGTTTG

QA 3 759 3 759
DS 



CO CL2776Contig2 766 2 1 U
GGGTTGTGCGTTTCACAAAAGAGGACAAAAACAAAACAAAACAAGAAGAAGTCACATCTC
TCTAATCTATTTGCTGTCTTAGGTTTACCTCCATCAACCAAACACAATGGCGAACGCAGC
GTCAGGAATGGCGGTGGTAGACGAATAAGCTCAAGTTTTTGGAGCTAAAAGCGAAAAGAA
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GTCCCGAGGAGAACTACGACGATTTCTCCAATTCTCTTCCGGCCAACGAGTGCCGCTATG
CCGTCTATGACTTCGACTTCACCACTGTTGAGAATTGCCAGAAGAGCAAAATCTTCTTCA
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ACAGGTTCAAGAGAGAATTGGATGGTATTCAGGTGGAATTACAAGCCACGGATCCGAGTG
AGATGAGTTTTGACATCATCAAAAGTCGTGCTCTCTAGATTCATATGTGCCTGATTCCTT
ATCATATATCCATAAGTGCTCCATCATCATTATTTCAAAGAACTTCTCCATGTTGTGTAA
CTTTTGTTGGTTTCATTCTTTCTTCTTCCTCTTGGCTCTTTTTAATCTTTTTTTATTTGT
ATTTAAACTTGACGTGGGTTTTATACTCTGGCTTGGGATAAGCTGTAAAACCATGTAGTT
TATCGTATAATTGCTGGCATAAAAAAATAAAACGTATTACTTTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CR25JQ C 1
AF RS1CR25TF U 1
BS 1 766 RS1CR25TF

RD RS1CR25JQ 766 0 0
GGGTTGTGCGTTTCACAAAAGAGGACAAAAACAAAACAAAACAAGAAGAAGTCACATCTC
TCTAATCTATTTGCTGTCTTAGGTTTACCTCCATCAACCAAACACAATGGCGAACGCAGC
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AGATGAGTTTTGACATCATCAAAAGTCGTGCTCTCTAGATTCATATGTGCCTGATTCCTT
ATCATATATCCATAAGTGCTCCATCATCATTATTTCAAAGAACTTCTCCATGTTGTGTAA
CTTTTGTTGGTTTCATTCTTTCTTCTTCCTCTTGGCTCTTTTTAATCTTTTTTTATTTGT
ATTTAAACTTGACGTGGGTTTTATACTCTGGCTTGGGATAAGCTGTAAAACCATGTAGTT
TATCGTATAATTGCTGGCATAAAAAAATAAAACGTATTACTTTTCC

QA 1 766 1 766
DS 

RD RS1CR25TF 766 0 0
GGGTTGTGCGTTTCACAAAAGAGGACAAAAACAAAACAAAACAAGAAGAAGTCACATCTC
TCTAATCTATTTGCTGTCTTAGGTTTACCTCCATCAACCAAACACAATGGCGAACGCAGC
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ACTATAGGTTCATAATATTCAGGATAGATGGACAACAAGTGGTGGTCGAAAAGCTTGGAA
GTCCCGAGGAGAACTACGACGATTTCTCCAATTCTCTTCCGGCCAACGAGTGCCGCTATG
CCGTCTATGACTTCGACTTCACCACTGTTGAGAATTGCCAGAAGAGCAAAATCTTCTTCA
TAGCATGGTCACCGGATTCTTCGAGTGTGAGGATGAAGATGGTGTATGCCAGCTCAAAGG
ACAGGTTCAAGAGAGAATTGGATGGTATTCAGGTGGAATTACAAGCCACGGATCCGAGTG
AGATGAGTTTTGACATCATCAAAAGTCGTGCTCTCTAGATTCATATGTGCCTGATTCCTT
ATCATATATCCATAAGTGCTCCATCATCATTATTTCAAAGAACTTCTCCATGTTGTGTAA
CTTTTGTTGGTTTCATTCTTTCTTCTTCCTCTTGGCTCTTTTTAATCTTTTTTTATTTGT
ATTTAAACTTGACGTGGGTTTTATACTCTGGCTTGGGATAAGCTGTAAAACCATGTAGTT
TATCGTATAATTGCTGGCATAAAAAAATAAAACGTATTACTTTTCC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 0 0

AS 2 4

CO CL2778Contig1 725 2 6 U
CGAATGTTAAAACATTACATTTGTATATATAATAAAGTGAATAATCATAGGCCAGTGTTA
AACCTTAAGTCAACGTTTTATATTAACATTAAAAATGACGTTTGCACAAGTCGATAAAAC
ATGAAGCACCAGTTGTCTTGTCTTCGTAATTTTCCCGGTTAACTTGTCTTATCGCCCTCC
GGTTTAGTTTCCATCCCAGCCATATCATCCATATCAGCAACAAGTCTCTCCACAGGTACC
TTGCTCACATCCCATCGCATGCCAACGTCTGAAACCAACCGACTAGAGCAGTACATGCCA
TATCCAGCCACAGCCAAACTACCAAAACCCGCTACAAACCTGAGTGGTGAAAAAAGCACA
ACGCTGGCAGCTGCAACTATCGAAGCGGCTTGACCGCTCCTTCCCACGTCAGTGTTCGCC
ACCAGCAACCCCGTTTTGCAGTAAATGGCGAAATCCTCACAGTTGTTCTTGAAAACATTG
TAGACACCGAAACCGTTTCGCAGGAGGAAGTTGGCACGGTGGATGACTTCTTCCGGAGGA
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ACGCTGTACTCGAAGACGTAGAGATCGCCTCCGGCGAGGAAGCAGTCGAGACAGGAAGAG
ATGACACCACCAACCTTGGTTTTATCACCACAATTAGGACATGGGGTGTCTACATGATTA
GGGGC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 

AF RS1EJ67JQ U 1
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DS 

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ACCAACCTTGGTTTTATCACCACAATTAGGACATGGGGTGTCTACATGATTAGGGGC

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DS 



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GATGGGATGTGAGCA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FP25TF U 107
AF RS1EJ67TF U 1
BS 1 795 RS1EJ67TF

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QA 1 167 1 167
DS 

RD RS1EJ67TF 795 0 0
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ACCAAGGTTGGTGGTGTCATCTCTTCCTGTCTCGACTTCTTCCTCGCCGGAGGCGATCTC
TACGTCTTCGAGTACAGCGTCTCCCCTGCTATCTTTCTCGCCAAGCCTCGAGGCGGCACA
TGCACCATAGGAGCTTCGGATCCTCCGGAAGAAGTCATCCACCGTGCCAACTTCCTCCTG
CGAAACGGTTTCGGTGTCTACAATGTTTTCAAGAACAACTGTGAGGATTTCGCCATCTAC
TGCAAAACGGGGTTGCTGGTGGCGAACACTGACGTGGGAAGGAGCGGTCAAGCCGCTTCG
ATAGTTGCAGCTGCCAACGTTGTGCTCTCTTCACCACTCAGTTTGTAGCGGGTTTGGTAG
TTTGGCTGTGGCTGGATATGGCATGTACTGCGCTAGTCGGTGGTTCAGACGTTGGCATGC
GATGGGATGTGAGCA

QA 1 795 1 795
DS 



AS 1 3

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TTCATGATCTGACTTTGGTCTCTTCTTCTCTGCCCCTTCTTTTTTGTTCTTTCTTTTACT
TGGTCACTGTTATTACTTCTGAACATGCCACCCCCTTTCTTCCACAAGCTGATTTTCTCA
TCCACTATCCAAGAAATACGTCTGAGAGTTCCAGATAAGTTTGCGAGTAAATTCAAGGAC
GAGCTATCGGTTGCAGTTGCACTCACAGTACCAGACGGTCATGTTTGGCGTGTAGGACTC
AGGAAAGCTGACAGCAACAAAATCTGGTTTCAAGATGGTTGGCAAGAGTTCGTTGACCGT
TACTCCATCCGCATTGGCTATCTTTTGGTTTTCAGATACGAAGGCAACTCTGCCTTCAGC
GTCTACATTTACAACTTATCACACTCCGAGATCAACTACCATTCCTCCGGTCTCATGGAC
ACTCCACACAACCACCTCAAACGCGCCCGTTTGTTTGAAGACCTTGAAGACGAAGACGCC
GCCGCCGCCGAGGTTGTTGTTTACTCTTCTTCTTCTTCGGTGTATCCACCGTCATCACAT
CATCCTGGAGTTACTGTAGCCGTTAACAAAGGGTATGCTACTAGTCCAGCTATCCAGAGC
TTCTTCGCTGGACCTGTTAAAGCTGAAGAGACAACACCAACTCCTAAAGTTGCTAAAAGA
GAGGGAGGAAGAGAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AW07TF U 1
AF RS1F130TF U 48
AF RS1GQ78TF U 48
BS 1 115 RS1AW07TF
BS 116 116 RS1F130TF
BS 117 151 RS1AW07TF
BS 152 152 RS1F130TF
BS 153 196 RS1AW07TF
BS 197 197 RS1F130TF
BS 198 245 RS1AW07TF
BS 246 246 RS1F130TF
BS 247 253 RS1AW07TF
BS 254 254 RS1F130TF
BS 255 313 RS1AW07TF
BS 314 314 RS1F130TF
BS 315 680 RS1AW07TF
BS 681 681 RS1F130TF
BS 682 693 RS1AW07TF
BS 694 694 RS1GQ78TF
BS 695 719 RS1F130TF
BS 720 736 RS1GQ78TF

RD RS1AW07TF 702 0 0
GGACTTCAGATCTGAAAGGGCTTCTCTCGCCAGTCTCTGTCGCGTATTCTCTGGCGTCGT
TTCATGATCTGACTTTGGTCTCTTCTTCTCTGCCCCTTCTTTTTTGTTCTTTCTTCTACT
TGGTCACTGTTATTACTTCTGAACATGCCACGCCCTTTCTTCCACAAGCTGATTTTCTCA
TCCACTATCCAAGAAAAACGTCTGAGAGTTCCAGATAAGTTTGCGAGTAAATTCAAGGAC
GAGCTGTCGGTTGTAGTTGCACTCACAGTACCAGACGGTCATGTTTGGCGTGTAGGACTC
AGGAAAGCTGACAACAACAAAATCTGGTTTCAAGATGGTTGGCAAGAGTTCGTTGACCGT
TACTCCATCCGCATTGGCTATCTTTTGGTTTTCAGATACGAAGGCAACTCTGCCTTCAGC
GTCTACATTTACAACTTATCACACTCCGAGATCAACTACCATTCCTCCGGTCTCATGGAC
ACTCCACACAACCACCTCAAACGCGCCCGTTTGTTTGAAGACCTTGAAGACGAAGACGCC
GCCGCCGCCGAGGTTGTTGTTTACTCTTCTTCTTCTTCGGTGTATCCACCGTCATCACAT
CATCCTGGAGTTACTGTAGCCGTTAACAAAGGGTATGCTACTAGTCCAGCTATCCAGAGC
TTCTTCGCTGGACCTGTTAA*GCTGAAGAGACA
CACACTCTA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RS1F130TF 672 0 0
GCTCC
GGCGTCGTTTCATGATCTGACTTTGGTCTCTTCTTCTCTGCCCCTTCTTTTTTGTTCTTT
CTTTTACTTGGTCACTGTTATTACTTCTGAACATGCCACCCCCTTTCTTCCACAAGCTGA
TTTTCTCATCCACTATCCAAGAAATACGTCTGAGAGTTCCAGATAAGTTTGCGAGTAAAT
TCAAGGACGAGCTATCGGTTGCAGTTGCACTCACAGTACCAGACGGTCATGTTTGGCGTG
TAGGACTCAGGAAAGCTGACAGCAACAAAATCTGGTTTCAAGATGGTTGGCAAGAGTTCG
TTGACCGTTACTCCATCCGCATTGGCTATCTTTTGGTTTTCAGATACGAAGGCAACTCTG
CCTTCAGCGTCTACATTTACAACTTATCACACTCCGAGATCAACTACCATTCCTCCGGTC
TCATGGACACTCCACACAACCACCTCAAACGCGCCCGTTTGTTTGAAGACCTTGAAGACG
AAGACGCCGCCGCCGCCGAGGTTGTTGTTTACTCTTCTTCTTCTTCGGTGTATCCACCGT
CATCACATCATCCTGGAGTTACTGTAGCCGTTAACAAAGGGTATGCTACTAGTCCAGCTA
TCCAGAGCTTCTTCGCTGGACCTGTTAAAGCTGA*GAGACA*CACCAACTCCTAAAGTTG
CTAAAAG

QA 6 672 6 672
DS 

RD RS1GQ78TF 689 0 0
GCTCC
GGCGTCGTTTCATGATCTGACTTTGGTCTCTTCTTCTCTGCCCCTTCTTTTTTGTTCTTT
CTTTTACTTGGTCACTGTTATTACTTCTGAACATGCCACCCCCTTTCTTCCACAAGCTGA
TTTTCTCATCCACTATCCAAGAAATACGTCTGAGAGTTCCAGATAAGTTTGCGAGTAAAT
TCAAGGACGAGCTATCGGTTGCAGTTGCACTCACAGTACCAGACGGTCATGTTTGGCGTG
TAGGACTCAGGAAAGCTGACAGCAACAAAATCTGGTTTCAAGATGGTTGGCAAGAGTTCG
TTGACCGTTACTCCATCCGCATTGGCTATCTTTTGGTTTTCAGATACGAAGGCAACTCTG
CCTTCAGCGTCTACATTTACAACTTATCACACTCCGAGATCAACTACCATTCCTCCGGTC
TCATGGACACTCCACACAACCACCTCAAACGCGCCCGTTTGTTTGAAGACCTTGAAGACG
AAGACGCCGCCGCCGCCGAGGTTGTTGTTTACTCTTCTTCTTCTTCGGTGTATCCACCGT
CATCACATCATCCTGGAGTTACTGTAGCCGTTAACAAAGGGTATGCTACTAGTCCAGCTA
TCCAGAGCTTCTTCGCTGGACCTGTTAAAGCTGAAGAGACAACACCAACTCCTAAAGTTG
CTAAAAGAGAGGGAGGAAGAGAAG

QA 6 689 6 689
DS 



AS 1 2

CO CL2780Contig1 864 2 3 U
TGGATGCTCATGTCGGTAGACTGGTGATAACTCGTCTCACACAGCTTGGTAGTGATAAGG
CTCACAAGTCCTAGCTGGCCAAGTCTTGTATGCTATGTAGATGACCGCAGCTTCAGACTT
GAGACTTGGGGGCTCCTTATCATCTAGAGACTCAATGGCTACTTGGACAATCTCCAAGTC
AAACTTGGAGAAATCCCCTAGCAGTAATCCTATGGGAAGTACAGATTGCAAGTTCTACGT
ACAAAGAAATCCAATCACATTGCAACTCAGATTCATTCAACATGTAAAAGCGCTTTGTGT
CACTGAAAGCAATCTCAGAGGAGGGCCATGGAATTACTGACTCGGTCCAGTCAAGCAATC
TGTCTTGGTAGGTTGAATGTGGACGTAAGAAAGGAGTTGACTCCTTTGAACTCTCGGTTC
CTTGAGGTCTAGAGATGGTGCATGTCAAATCCAAAATTCCAAGATCTTCTTCCTCTACGA
GAACCTGAAAGATCTGCTGGAAACCGGTAGATGGAAGACGCGCAACCAGGGTCATGTAGT
AAGGAGATGCAGCACCACGCATGCTGAATTTCATTAAGCTATCTAGCTCAAAGTTTGTCC
CCTCTAACCAGTTGTAGCGATGAAGGCCGAGCTTGGCATAAAGATTCGCCAAGGCGTAGT
TAGGGTATACACGCCCTTCACCACATTCCACACGTATCCAGCCAAAGTCCCAACGTCATG
GTGGAAACCCCTCCGGGAAGTTGAAAAAATCCAGCTCTTCCCTTCGTACACAACTCTGAC
TCATCTCCTTAGTATGTTCTCCAGCGAACGACTCGTTTTCCTCAAGTCGGAAGGTTGCTG
GTTACATACAATGCGGCTATCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A821JQ U 104
AF RS1A821TF C 1
BS 1 103 RS1A821TF
BS 104 363 RS1A821JQ
BS 364 864 RS1A821TF

RD RS1A821JQ 260 0 0
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TGGACAATCTCCAAGTCAAACTTGGAGAAATCCCCTAGCAGTAATCCTATGGGAAGTACA
GATTGCAAGTTCTACGTACAAAGAAATCCAATCACATTGCAACTCAGATTCATTCAACAT
GTAAAAGCGCTTTGTGTCACTGAAAGCAATCTCAGAGGAGGGCCATGGAATTACTGACTC
GGTCCAGTCAAGCAATCTGT

QA 1 260 1 260
DS 

RD RS1A821TF 864 0 0
TGGATGCTCATGTCGGTAGACTGGTGATAACTCGTCTCACACAGCTTGGTAGTGATAAGG
CTCACAAGTCCTAGCTGGCCAAGTCTTGTATGCTATGTAGATGACCGCAGCTTCAGACTT
GAGACTTGGGGGCTC*TTATCATCTAGAGACTCAATGGCTACTTGGACAATCTCCAAGTC
AAACTTGGAGAAATCCC*TAGCAGTAATC*TATGGGAAGTACAGATTGCAAGTTCTACGT
ACAAAGAAATCCAATCACATTGCAACTCAGATTCATTCAACATGTAAAAGCGCTTTGTGT
CACTGAAAGCAATCTCAGAGGAGGGCCATGGAATTACTGACTCGGTCCAGTCAAGCAATC
TGTCTTGGTAGGTTGAATGTGGACGTAAGAAAGGAGTTGACTCCTTTGAACTCTCGGTTC
CTTGAGGTCTAGAGATGGTGCATGTCAAATCCAAAATTCCAAGATCTTCTTCCTCTACGA
GAACCTGAAAGATCTGCTGGAAACCGGTAGATGGAAGACGCGCAACCAGGGTCATGTAGT
AAGGAGATGCAGCACCACGCATGCTGAATTTCATTAAGCTATCTAGCTCAAAGTTTGTCC
CCTCTAACCAGTTGTAGCGATGAAGGCCGAGCTTGGCATAAAGATTCGCCAAGGCGTAGT
TAGGGTATACACGCCCTTCACCACATTCCACACGTATCCAGCCAAAGTCCCAACGTCATG
GTGGAAACCCCTCCGGGAAGTTGAAAAAATCCAGCTCTTCCCTTCGTACACAACTCTGAC
TCATCTCCTTAGTATGTTCTCCAGCGAACGACTCGTTTTCCTCAAGTCGGAAGGTTGCTG
GTTACATACAATGCGGCTATCTCC

QA 1 864 1 864
DS 



AS 1 4

CO CL2781Contig1 1102 4 15 U
GAAAAAAACTTTAAAGAGAAGAGGAAGAAGCAAAGGGAGGAGGTAGCCGAAGAAGAATAT
CAAAATACACTCAAATGCTTTCATTTGTTATTTTATTTTGAGAAAACATATAATTCTCCA
ACCTTTCGAACCACTACTACGTTTGGCTCACGTCGCTTGGTCCAGAGAATGAATCCGTTT
AACGTATCCTCCACAAGCTCACCTCCTCCTGTTGCTAATCAACTCGCGGCGAAGCGAAAG
AGAGGCCGTCCACGTAAGGATGCATCCATGACTCAGCCAGAAAGTTCTCGAGGGACGACT
CCAAAGGAGGACGTTAATCTGGTTGGTAAGACCATTTCTGGTGTGGTCGAAGGATCTTTC
GAAGCGGGGTTCATCATCAATGTGAAGGTGAAAGAAAGTGACACGAGACTGAGAGGTCTT
GTGTTCGCACGGGGGAAAGTCGTTCCTGTGACTCCAGAAAACGACGTGGCTCCTCATGTC
AAAATGATCGTAAGAGAAGAGATTAAGAATCACACTGATGATCGTGATCAATCTCCTAAT
GATCAGACAGTGAAAGATGCTGTCGCTGACTCGGAGATGTCTGAATGTGCTCGAGCATTG
TTTTTACTGCCACATGGAATAAATGGAGAAGCCCCCAAGGAAGTTACGGAAGAAAGAGAA
GCTGCTACTTGTTTGGTGGAGTTTTTTAAAACTCCAGAGACGACCATAGGGACTGCTCAA
CATAGTCTTGTCATGGCACGGAAAGAGACCAACGAGCAACATAAATCTCCTGGTGAGGCT
CGTGGGTTTGATCTTATGGCGGAGGAACCGGTTCATCCGGTAGAGGAAGTACCGCCAGAG
CTTCAGCTAGGACTTGGGAACAAGACAATATTGAGGGGAGACGACAACAAAAACGGCACC
GCAATGGAGATAGATCCTAAAAGTTCTGTGTCTAGGAGTGGCTTCATAGCGAACTTGTTT
AAAGGAAAAGAAAAGGTCGACTATTAGTTTAAAACTCTCTTTTATATTTCAGACTCTCCA
ATACATTTCTTCTCTCTTTTGTTTCAGTACTTTGTATTATCATGCTTCAGTGTTTGTTGT
AAAACCTTTTTTTTCTTGTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FE68TF U 78
AF RS1FR81TF U 1
AF RS1FR81JQ C 353
AF RS1FE68JQ C 491
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BS 786 1091 RS1FR81JQ
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TCTGGTTGGTAAGACCATTTCTGGTGTGGTCGAAGGATCTTTCGAAGCGGGGTTCATCAT
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AGAGATTAAGAATCACACTGATGATCGTGATCAATCTCCTAATGATCAGACAGTGAAAGA
TGCTGTCGCTGACTCGGAGATGTCTGAATGTGCTCGAGCATTGTTTTTACTGCCACATGG
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GGAGTTTTTTAAA*CTCCAGAGACGACCATAGGGACTGCTCAACATAGTCTTGTCATGGC
ACGGAA
GAGACAACGAGCAC

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DS 

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GAAAAAAACTTTAAAGAGAAGAGGAAGAAGCAAAGGGAGGAGGTAGCCGAAGAAGAATAT
CAAAATACACTCAAATGCTTTCATTTGTTATTTTATTTTGAGAAAACATATAATTCTCCA
ACCTTTCGAACCACTACTACGTTTGGCTCACGTCGCTTGGTCCAGAGAATGAATCCGTTT
AACGTATCCTCCACAAGCTCACCTCCTCTTGTTGCTAATCAACTCGCGGCGAAGCGAAAG
AGAGGCCGTCCACGTAAGGATGCATCCATGACTCAGCCAGAAAGTTCTCGAGGGACGACT
CCAAAGGAGGACGTTAATCTGGTTGGTAAGACCATTTCTGGTGTGGTCGAAGGATCTTTC
GAAGCGGGGTTCATCATCAATGTGAAGGTGAAAGAAAGTGACACGAGACTGAGAGGTCTT
GTGTTCGCACGGGGGAAAGTCGTTCCTGTGACTCCAGAAAACGACGTGGCTCCTCATGTC
AAAATGATCGTAAGAGAAGAGATTAAGAATCACACTGATGATCGTGATCAATCTCCTAAT
GATCAGACAGTGAAAGATGCTGTCGCTGACTCGGAGATGTCTGAATGTGCTCGAGCATTG
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GCTGCTACTTGTTTGGTGGAGTTTTTTAAA*CTCCAGAGACGACCATAGGGACTGCTCAA
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CGTGG
TTTGATCTTAT

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GAGGTCTTGTGTTCGCACGGGGGAAAGTCGTTCCTGTGACTCCAGAAAACGACGTGGCTC
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CTCCTAATGATCAGACAGTGAAAGATGCTGTCGCTGACTCGGAGATGTCTGAATGTGCTC
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TTTGTTGTAAAACCTTTTT
CTC

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TGAAAGATGCTGTCGCTGACTCGGAGATGTCTGAATGTGCTCGAGCATTGTTTTTACTGC
CACATGGAATAAATGGAGAAGCCCCCAAGGAAGTTACGGAAGAAAGAGAAGCTGCTACTT
GTTTGGTGGAGTTTTTTAAAACTCCAGAGACGACCATAGGGACTGCTCAACATAGTCTTG
TCATGGCACGGAAAGAGACCAACGAGCAACATAAATCTCCTGGTGAGGCTCGTGGGTTTG
ATTTTATGGCGGAGGAACCGGTTCATCCGGTAGAGGAAGTACCGCCAGAGCTTCAGCTAG
GACTTGGGAACAAGACAATATTGAGGGGAGACGACAACAAAAACGGCACCGCAATGGAGA
TAGATCCTAAAAGTTCTGTGTTTAGGAGTGGCTTCATAGCGAACTTGTTTAAAGGAAAAG
AAAAGGTCGACTATTAGTTTAAAACTCTCTTTTATATTTCAGACTCTCCAATACATTTTT
TCTCTCTTTTGTTTCAGTACTTTGTATTATCATGCTTCAGTGTTTGTTGTAAAACCTTTT
TTTTCTTGTTAT

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 4

CO CL2782Contig1 800 4 13 U
AGATTTAAAGCTACGCTTTCATTATTAAAATTTCAATACCGATTAAATATTACAAGTTTG
CACTCTCATGCATACATAATCATATGCATGCACATGCATATATAAATTTAGATGTAACTG
AGAACATTATAAAACTAATATAGCATATTCAAAGCAAAAGAACATTAAATAAAGGAAGAT
ACTGGAGAAGAGATAATGAAAAGAAGATGAGAGAACAGAGCCAACATTAAAAGCTCAACA
GCCAACCAACTCTTCTTCTCTCCAGTACTCTTTACTTGTTCAGCTTTTCCTCCTCCTGTC
CCATCTTTAACATGTGGGGAAGGAGATGTGGAGTTGGTCTTTCCTTCATATTCAATCATT
CCCAAACTCTCGAACTCTTTAGCCAATGTCGAGTTTGGAGATAAATGCAGAAGCGAAATA
CACTTGGTGATGTTAGGAGCCGTAATATGACAAAGGGTGGGAATATGAGCGGCTAGTGTT
GCGTTAAACTTTAGGCCAAGATTAGGATCATCTTTGTCTTTGACCAAAATGCAAACACAC
TTCTCACTCTTTGTTATCACCTGATCAAAACCTCCACAACAATCTTTTGTTGGAGCCTTT
GCGTTTCCTCCCACGTATGGGAGACACGGTGAGAGTGCTATCAACTGGTCCGTACACTCT
TCTCTGTCTTGATCCAGATCTGAGCTTCCAAAACCTACCAACATGGATGTTATCACGATG
GTTATGATCATTAGGGTTCTCGTTGATTTCTCCATGGTTCGATGTTTTTGATCTTTTCTC
TCTCTATATATATGTATATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 25 25 25 
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25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CN93TF C 58
AF RS1EY64JQ U 1
AF RS1AY90JQ U 20
AF RS1AY90TF C 123
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QA 1 450 1 450
DS 

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CCCAAACTCTCGAACTCTTTAGCCAATGTCGAGTTTGGAGATAAATGCAGAAGCGAAATA
CACTTGGTGATGTTAGGAGCCGTAATATGACAAAGGGTGGGAATATGAGCGGCTAGTGTT
GCGTTAAACTTTAGGCCAAGATTAGGATCATCTTTGTCTTTGACCAAAATGCAAACACAC
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GCGTTTCCTCCCACGTATGGGAGACACAGTGAGAGTGCTATCAACTGGTCCGTACACTCT
TCTCTGTCTTGATCCAGATCTGAGCTTCCAAACCCTACCAACATGGATGTTATCACGATG
GTTATGATCA

QA 1 730 1 730
DS 

RD RS1AY90JQ 726 0 0
CATTATTAAAATTTCAATACCGATTAAATATTACAAGTTTGCACTCTCATGCATACATAA
TCATATGCATGCACATGCATATATAAATTTAGATGTAACTGAGAACATTATAAAACTAAT
ATAGCATATTCAAAGCAAAAGAACATTAAATAAAGGAAGATACTGGAGAAGAGATAATGA
AAAGAAGATGAGAGAACAGAGCCAACATTAAAAGCTCAACAGCCAACCAACTCTTCTTCT
CTCCAGTACTCTTTACTTGTTCAGCTTTTCCTCCTCCTGTCCCATCTTTAACATGTGGGG
AAGGAGATGTGGAGTTGGTCTTTCCTTCATATTCAATCATTCCCAAACTCTCGAACTCTT
TAGCCAATGTCGAGTTTGGAGATAAATGCAGAAGCGAAATACACTTGGTGATGTTAGGAG
CCGTAATATGACAAAGGGTGGGAATATGAGCGGCTAGTGTTGCGTTAAACTTTAGGCCAA
GATTAGGATCATCTTTGTCTTTGACCAAAATGCAAACACACTTCTCACTCTTTGTTATCA
CCTGATCAAAACCTCCACAACAATCTTTTGTTGGAGCCTTTGCGTTTCCTCCCACGTATG
GGAGACACGGTGAGAGTGCTATCAACTGGTCCGTACACTCTTCTCTGTCTTGATCCAGAT
CTGAGCTTCCAAAACCTACCAACATGGATGTTATCACGATGGTTATGATCATTAGGGTTC
TCGTTG

QA 1 726 1 726
DS 

RD RS1AY90TF 678 0 0
AACATTATAAAACTAATATAGCATAT*CAAAGCAAAAGAACATTAAATAAAGGAAGATAC
TGGAGAAGAGATAATGAAAAGAAGATGAGAGAACAGAGCCAACATTAAAAGCTCAACAGC
CAACCAACTCTTCTTCTCTCCAGTACTCTTTACTTGTTCAGCTTTTCCTCCTCCTGTCCC
ATCTTTAACATGTGGGGAAGGAGATGTGGAGTTGGTCTTTCCTTCATATTCAATCATTCC
CAAACTCTCGAACTCTTTAGCCAATGTCGAGTTTGGAGATAAATGCAGAAGCGAAATACA
CTTGGTGATGTTAGGAGCCGTAATATGACAAAGGGTGGGAATATGAGCGGCTAGTGTTGC
GTTAAACTTTAGGCCAAGATTAGGATCATCTTTGTCTTTGACCAAAATGCAAACACACTT
CTCACTCTTTGTTATCACCTGATCAAAACCTCCACAACAATCTTTTGTTGGAGCCTTTGC
GTTTCCTCCCACGTATGGGAGACACGGTGAGAGTGCTATCAACTGGTCCGTACACTATTC
TCTGTCTTGATCCAGATCTGAGCTTCCAAAACCTACCAACATGGATGTTATCACGATGGT
TATGATCATTAGGGTTCTCGTTGATTTCTCCATGGTTCGATGTTTTTGATCTTTTCTCTC
TCTATATATATGTATATC

QA 1 678 1 678
DS 



AS 2 4

CO CL2783Contig1 802 2 5 U
GTAAAGACAGAAACTCAAACATGCGTAGCAACATGAATTATTTGGAATAGAAAAATATGA
TTCGAGAGTTTCGACGAGTTAACGTCTAAAGAATGTAAAAACTCTTAAGGTACAAAACCA
GACACCGTGGATTATACCCATATACTTTTTGGCAACAGTAGCACCAAGGAACCTTGATGA
ATTTTTGCAGAGAGGGAAGAGATGGAACATGTAAGTTTGTTCAAATGTCACTCAAGATTT
GCAATGACGGCATCAACCACCTCTTGAGTAGTGCTTTGCCCACCAAGATCTTTAGTCCGG
CACTTTCCCTCAGAGATGACTCTTTTCACCGCTGTTTCAAGCCGGTCAGCAAATGAAGGA
AACTGAAGGTGTCTTAGCATCATGGCTGATGAGAGAAGCAACGCCACTGGGTTTGCTTTG
TTTTCTCTTACTATCTTGTCTTTCCCCACGTTTCCTGCTGATGCACCTTGCTCAAAGACC
GCATGGTCAGCCCCAACATTTCCTCCAGGCATGACTCCGGTGCCTCCAGCAATACCAGCA
GCAGTGTTTGCAACTAAATTACCATAGAGATTGGGTGTCACCATGACGTCGAATTGTTCT
GGTTTCGCTACAAGTTGCATGCAGCAGTTATCAACAATAATCTCATTGTAAGTGATGCCC
GGATACTTTTTAGCTACCTCTCGGCAAGACTCCAAGAACAAACCATCAGCAAGTTTCATA
ATATTAGCCTTGTGCACTGCCGTCACTTTCTTCCTGTTGTTAAGGTACGCATACTCGAAC
GCATACTTTGCTATACGCTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H603JQB U 21
AF RS1E768JQ U 1
BS 1 199 RS1E768JQ
BS 200 200 RS1H603JQB
BS 201 308 RS1E768JQ
BS 309 309 RS1H603JQB
BS 310 802 RS1E768JQ

RD RS1H603JQB 543 0 0
T
TGCGTAGCAACATGAATTATTTGGAATAGAAAAATATGATTCGAGAGTTTCGACGAGTTA
ACGTCTAAAGAATGTAAAAACTCTTAAGGTACAAAACCAGACACCGTGGATTATACCCAT
ATACTTTTTGGCAACAGTAGCACCAAGGAACCTTGATGAATTTTTGCAGAGAGGGAAGAG
ATGGAACATGTAAGTTTGTTCAAATGTCACTCAAGATTTGCAATGACGGCATCAACCACC
TCTTGAGTAGTGCTTTGTCCACCAAGATCTTTAGTCCGGCACTTTCCCTCAGAGATGACT
CTTTTCACCGCTGTTTCAAGCCGGTCAGCAAATGAAGGAAACTGAAGGTGTCTTAGCATC
ATGGCTGATGAGAGAAGCAACGCCACTGGGTTTGCTTTGTTTTCTCTTACTATCTTGTCT
TTCCCCACGTTTCCTGCTGATGCACCTTGCTCAAAGACCGCATGGTCAGCCCCAACATTT
CCTCCAGGCATGACTCCGGTGCCTCCAGCAATACCAGCAGCAGTGTTTGCAACTAAATTA
CC

QA 2 543 2 543
DS 

RD RS1E768JQ 802 0 0
GTAAAGACAGAAACTCAAACATGCGTAGCAACATGAATTATTTGGAATAGAAAAATATGA
TTCGAGAGTTTCGACGAGTTAACGTCTAAAGAATGTAAAAACTCTTAAGGTACAAAACCA
GACACCGTGGATTATACCCATATACTTTTTGGCAACAGTAGCACCAAGGAACCTTGATGA
ATTTTTGCAGAGAGGGAAGGGATGGAACATGTAAGTTTGTTCAAATGTCACTCAAGATTT
GCAATGACGGCATCAACCACCTCTTGAGTAGTGCTTTGCCCACCAAGATCTTTAGTCCGG
CACTTTCCTTCAGAGATGACTCTTTTCACCGCTGTTTCAAGCCGGTCAGCAAATGAAGGA
AACTGAAGGTGTCTTAGCATCATGGCTGATGAGAGAAGCAACGCCACTGGGTTTGCTTTG
TTTTCTCTTACTATCTTGTCTTTCCCCACGTTTCCTGCTGATGCACCTTGCTCAAAGACC
GCATGGTCAGCCCCAACATTTCCTCCAGGCATGACTCCGGTGCCTCCAGCAATACCAGCA
GCAGTGTTTGCAACTAAATTACCATAGAGATTGGGTGTCACCATGACGTCGAATTGTTCT
GGTTTCGCTACAAGTTGCATGCAGCAGTTATCAACAATAATCTCATTGTAAGTGATGCCC
GGATACTTTTTAGCTACCTCTCGGCAAGACTCCAAGAACAAACCATCAGCAAGTTTCATA
ATATTAGCCTTGTGCACTGCCGTCACTTTCTTCCTGTTGTTAAGGTACGCATACTCGAAC
GCATACTTTGCTATACGCTCCG

QA 1 802 1 802
DS 



CO CL2783Contig2 786 2 13 U
GGAAAGGCCAAAAAAAAGGATCAAACTTTCACAGCTCTCAGACATGTCTCGTCGATCGCT
GACTCTCCTGAAGAACCTCGCCAGAAACTCAAACGCCTCCTCATCATGCCTCCTCCAAAC
CCGATCCGTGACCTACATGCCCAGACCCGGCGACGGATCCCCACGCGCCGTGACTCTGAT
CCCCGGAGACGGGATCGGTCCTCTCGTGACCGACGCGGTTGAGCAGGTGATGGAGGCGAT
GCACGCGCCGATCTACTTCGAGAAGTACGATGTCCACGGGGAGATGAGCCGCGTTCCCGT
GGAGGTGATGGAGTCGATAAGGAAGAACAAGGTGTGCCTGAAGGGAGGGCTGAAGACACC
CGTGGGAGGAGGTGTGAGCTCGCTCAACGTGCAGCTGAGGAAGGAGCTTGATCTGTTTGC
TTCTCTGGTTAACTGCTTTAACTTGCCTGGTTTGCCCACGAGGCATGAGAACGTTGACAT
CGTTGTGATTAGGGAGAATACTGAGGGAGAGTATGCTGGGCTTGAGCATGAGGTTGTTCC
TGGGGTCGTCGAGAGTCTTAAGGTGATCACGAAGTTTTGTTCGGAGCGTATAGCAAAGTA
TGCGTTCGAGTATGCGTACCTTAACAACAGGAAGAAAGTGACGGCAGTGCACAAGGCTAA
TATTATGAAACTTGCTGATGGTTTGTTCTTGGAGTCTTGCCGAGAGGTAGCTAAAAAGTA
TCCGGCATCACTTACAATGAGATTATTGTTGATAACTGCTGCATGCACTTGTAGCGAAAC
AGAACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1H603TF U 29
AF RS1E768TF U 1
BS 1 223 RS1E768TF
BS 224 224 RS1H603TF
BS 225 549 RS1E768TF
BS 550 550 RS1H603TF
BS 551 655 RS1E768TF
BS 656 656 RS1H603TF
BS 657 706 RS1E768TF
BS 707 707 RS1H603TF
BS 708 716 RS1E768TF
BS 717 717 RS1H603TF
BS 718 754 RS1E768TF
BS 755 755 RS1H603TF
BS 756 786 RS1E768TF

RD RS1H603TF 753 0 0
GG
ACAGCTCTCAGACATGTCTCGTCGATCGCTGACTCTCCTGAAGAACCTCGCCAGAAACTC
AAACGCCTCCTCATCATGCCTCCTCCAAACCCGATCCGTGACCTACATGCCCAGACCCGG
CGACGGATCCCCACGCGCCGTGACTCTGATCCCCGGAGACGGGATCGGTCCTCTCGTGAC
CGACGCGGTTGAGCAGGTGATGGAGGCGATGCACGCGCCGATCTACTTCGAGAAGTACGA
TGTCCACGGGGAGATGAGCCGCGTTCCCGTGGAGGTGATGGAGTCGATAAGGAAGAACAA
GGTGTGCCTGAAGGGAGGGCTGAAGACACCCGTGGGAGGAGGTGTGAGCTCGCTCAACGT
GCAGCTGAGGAAGGAGCTTGATCTGTTTGCTTCTCTGGTTAACTGCTTTAACTTGCCTGG
TTTGCCCACGAGGCATGAGAACGTTGACATCGTTGTGATTAGGGAGAATACTGAGGGAGA
GTATGCTGGGCTTGAGCATGAGGTTGTTCCTGGGGTCGTCGAGAGTCTTAAGGTGATCAC
GAAGTTTTGTTCGGAGCGTATAGCAAAGTATGCGTTCGAGTATGCGTACCTTAACAACAG
GAAGAAAGTGACGGCAGTGCACAAGGCTAATATTATGAAACTTGCTGATGGTTTGTTCTT
GGAGTCTTGCCGAGAGGTAGCTAAAAAGTATCCGGCATCACTTACA*TGAGATTATTGTT
GATAACTGCTGCATGCACTTGTAGCGAA
CCA

QA 3 750 3 750
DS 

RD RS1E768TF 786 0 0
GGAAAGGCCAAAAAAAAGGATCAAACTTTCACAGCTCTCAGACATGTCTCGTCGATCGCT
GACTCTCCTGAAGAACCTCGCCAGAAACTCAAACGCCTCCTCATCATGCCTCCTCCAAAC
CCGATCCGTGACCTACATGCCCAGACCCGGCGACGGATCCCCACGCGCCGTGACTCTGAT
CCCCGGAGACGGGATCGGTCCTCTCGTGACCGACGCGGTTGAGTAGGTGATGGAGGCGAT
GCACGCGCCGATCTACTTCGAGAAGTACGATGTCCACGGGGAGATGAGCCGCGTTCCCGT
GGAGGTGATGGAGTCGATAAGGAAGAACAAGGTGTGCCTGAAGGGAGGGCTGAAGACACC
CGTGGGAGGAGGTGTGAGCTCGCTCAACGTGCAGCTGAGGAAGGAGCTTGATCTGTTTGC
TTCTCTGGTTAACTGCTTTAACTTGCCTGGTTTGCCCACGAGGCATGAGAACGTTGACAT
CGTTGTGATTAGGGAGAATACTGAGGGAGAGTATGCTGGGCTTGAGCATGAGGTTGTTCC
TGGGGTCGTTGAGAGTCTTAAGGTGATCACGAAGTTTTGTTCGGAGCGTATAGCAAAGTA
TGCGTTCGAGTATGCGTACCTTAACAACAGGAAGAAAGTGACGGCAGTGCACAAG*CTAA
TATTATGAAACTTGCTGATGGTTTGTTCTTGGAGTCTTGCCGAGAG*TAGCTAAAA*GTA
TCCGGCATCACTTACAATGAGATTATTGTTGATA*CTGCTGCATGCACTTGTAGCGAAAC
AGAACA

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 3

CO CL2784Contig1 1030 3 2 U
ACATATTTTCAAAACGTCTCACATATTTAACTTAATAAGTCCATTACACATAATAGCATT
TAAAATGTATCTATATACCACATATAATTCAGATCAAAACAGACAATTAAAAAGAGTAGA
TATTGAATAATGTTTTTCACTGTAAAAACACACACAATTAGCACTCATCATTGTGTTAAC
AAAATATATGATCATTACCACTTAAGTCTCTTAACTTCAAGCTTTGCTCTTGCACTTCTC
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AAAATTGATTTTTATAAAAACTCACAAATAATACAAAATGTGATGAGTCTCTATTATATC
TCTCTCTCTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FL70JQ U 1
AF RS1EV77JQ U 1
AF RS1EV77TF C 236
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ATTGATTTTTATAAAAACTCACAAATAATACAAAATGTGATGAGTCTCTATTATATCTCT
CTCTCTC

QA 9 795 9 795
DS 



AS 1 4

CO CL2785Contig1 933 4 9 U
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ATTTTGCCACCACCCCCTTTCTTTTGCCTTTTGTCATCTTGTACTATATTATATCACTAT
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TGCTTTTAACCATTTATGGTGCTATAACGGAGCATCTCGGAAAGGTAGAAAGAAGAGTTT
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CCATTGGGCTTAATCAATGATACCCGAGTTGAC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CM51TF U 1
AF RS1BG52TF U 3
AF RS1BG52JQ C 225
AF RS1CM51JQ C 225
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BS 787 787 RS1CM51JQ
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CTCCAACTTCTTTCTAGAAAAGTTTTCTTCATCAAAGTTAATCACCGGTGGCCGGTGAGT
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GGCTACTTGTTCTAAGAATTCACGGCTTTAAAGTGGAAAGGTTTCAAGTTTGGTATCGGA
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GG
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TGCCACCACCCCCTTTCTTTTGCCTTTTGTCATCTTGTACTATATTATATCACTATCGCT
TGGTGTCTTCCGACTAGCGGATCTGTGTTTCCCTAGGGGATTTTTGTAGTGTTCTTCAAC
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ACTTGTTCTAAGAATTCACGGCTTTAAAGTGGAAAGGTTTCAAGTTTGGTATCGGAGTCA
G*ATCTTGCGATG

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GCGCTTTGAAGCGGTCTGGCAAAAGTCTTTCTTCTACTTGGTTTAAGTTTCCATGGGTAT
AACTACGGTGAATCAAGGCTACTTGTTCTAAGAATTCACGGCTTTAAAGTGGAAAGGTTT
CAAGTTTGGTATCGGAGTCAGGATCTTGCGATGGAGGAAAGGAGATGCGGCCAGGAGCTT
CCGGTGGTGCTGCTCAGAGACACGGCCGAGATTGCCGCTCAAGGCATGTGTGACGCGTGG
CCAAGTGACGTGGCTTCTGCAGTTCCACTTCCTATCACGTTGAAGGTTTCTGGATTCTTC
TTTCAATTGGGCTGATTAGTGTAAAATCTAGTGAGTTTCTTTATGTTGTTAATTCTGATA
TCAAATGTATCGATGCCCATTGGGCTTAATCAATGATACCCGA

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CGTTTGAATCTTTAGATCAAATACTTTTTTCATCGCTTACTCTGATTTCTAAATAAGAGA
ATCAGGCTTCGTTCTTTGCTTTTAACCATTTATGGTGCTATAACGGAGCATTTCGGAAAG
GTAGAAAGAAGAGTTTTATGGATGTCTTGAATCATGCTTGAAGAGGATTTAGATGAGTCG
GCGCTTTGAAGCGGTCTGGCAAAAGTCTTTCTTCTACTTGGTTTAAGTTTCCATGGGCAT
AACTACGGTGAATCAAGGCTACTTGTTCTAAGAATTCACGGCTTTAAAGTGGAAAGGTTT
CAAGTTTGGTATCGGAGTCAGGATCTTGCGATGGAGGAAAGGAGATGCGGCCAGAAGCTT
CCGGTGGTGCTGCTCAGAGACACGGCCGAGATTGCCGCTCAAGGCATGTGTGACGCGTGG
CCAAGTGACGTGGCTTCTGCAGATCCACTTCCTATCACGTTGAAGGTTTCTGGATTCTTC
TTTCAATTGGGCTGATTAGTGTAAAATCTAGTGAGTTTCTTTATGTTGTTAATTCTGATA
TCAAATGTATCGATGCCCATTGGGCTTAATCAATGATACCCGAGTTGAC

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 4

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GTTGATCTCATAGCACACAACAATACAATTGAAAAATCCTTACATATCTGTCCGAGTAAA
ATGGGATACTCGTTACTACTAGCGGGGGGTAGTTTAACTCCATCTCTGCATCAGTAATAC
AATAACTACTACTATGTGTTTCTTTTCTCCTCCCTTTGTATAAAACTACATTTCAAGAAA
GAAAATAAATAAAGAGGTTCAAAAAGGTAGATGTCATCAAGGCCTTCTGCAAAACCAAGC
CCTCGACGCATCACTCTCTCAGCAATAACCCATTTATCAATATACCTCTACACACCACAC
AAACAAGTTTACTTTTTAGATATAAAAATAGTATAGAATGACCAAACTGCTCCTTTTAGC
GGAACTGTCCACCGGTGAATGTCTGGCCGAAGGACCAGCCAGAAGGAGCTGCGTTGTAGG
AAACAACGGTACGGCCGTCACTAGTGGTGACTTTGAAAGAAAGCGCTTGACCGTTGAGGT
AAGAGTTGCTTTGCCAGTTTTGCCCCCAGTTTCTTGACATCGCTTGCCAACCTGTTCTTG
AACCCTTGATCGCCGCCGAGTGAACGTCTCCGGCGCCGCCGACGTTTGTTATCAGAACGA
GGTTGAAGTATGAGTGACCGTTGATAGTAAACCTAATTCCTCCCCTTCTCATACACGGAA
CCCTTCTGTAGGAGACAGGGACGATGCCAGCTCTGTATTGAGCAATGCGTTGAAACACAG
GCTGAGCGAGATCAAAGTGTTGAAGAGGAGGATTACACCAACCACCATTGTTGTTAGGTA
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ATTTACCATCGTTTTCACATCTTATCTCAAAGCAAGAACCGCAGCTAAGTCCGTTATTGA
ACAGAGCCGTACTCAAAGCCGCCGTGTTTGTCCCGTAGCCTTGGCTATATAGGTTGCCGT
ATCCACAAGCACCACCCATTGTGCCAGAAGCATCGCCACCGCCGTAGAATGTGGCGTGTG
CATTGACCCAGCCGCCTCCATAGCCGTTCACGGAAGAAGCCATTACCCCTATGAAAGCCA
TGACTAAAAATCCAACAGGACCCATGTTTACTTCTTGCGTTAACTTGGAACTTGGAGACT
CTTCTTTCCTAGAAGAGAAACGAAACGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGTGAG
GATATGTTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1FQ72JQ U 1
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AF RS1FQ72TF C 508
AF RS1EE83TF C 658
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BS 1252 1253 RS1EE83TF
BS 1254 1273 RS1FQ72TF

RD RS1FQ72JQ 651 0 0
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GTTGATCTCATAGCACACAACAATACAATTGAAAAATCCTTACATATCTGTCCGAGTAAA
ATGGGATACTCGTTACTACTAGCGGGTGGTAGTTTAACTCCATCTCTGCATCAGTAATAC
AATAACTACTACTATGTGTTTCTTTTCTCCTCCCTTTGTATAAAACTACATTTCAAGAAA
GAAAATAAATAAAGAGGTTCAAAAAGGTAGATGTCATCAAGGCCTTCTGCAAAACCAAGC
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AAACAAGTTTACTTTTTAGATATAAAAATAGTATAGAATGACCAAACTGCTCCTTTTAGC
GGAACTGTCCACCGGTGAATGTCTGGCCGAAGGACCAGCCAGAAGGAGCTGCGTTGTAGG
AAACAACGGTACGGCCGTCACTAGTGGTGACTTTGAAAGAAAGCGCTTGACCGTTGAGGT
AAGAGTTGCTTTGCCAGTTTTGCCCCCAGTTTCTTGACATCGCTTGCCAACCTGTTCTTG
AACCCTTGATCGCCGCCGAGTGAACGTCTCCGGCGCCGCCGACGTTTGTTA

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1EE83JQ 737 0 0
G
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TACATATCTGTCCGAGTAAAATGGGATACTCGTTACTACTAGCGGGGGGTAGTTTAACTC
CATCTCTGCATCAGTAATACAATAACTACTACTATGTGTTTCTTTTCTCCTCCCTTTGTA
TAAAACTACATTTCAAGAAAGGAAATAAATAAAGAGGTTCAAAAAGGTAGATGTCATCAG
GGCCTTCTGCAAAACCAAGCCCTCGACGCATCACTCTCTCAGCAATAACCCATTTATCAA
TATACCTCTACACACCACACAAACAAGTTTACTTTTTAGATATAAAAATAGTATAGAATG
ACCAAACTGCTCCTTTTAGCGGAACTGTCCACCGGTGAATGTCTGGCCGAAGGACCAGCC
AGAAGGAGCTGCGTTGTAGGAGACAACGGTACGGCCGTCACTAGTGGTGACTTTGAAAGA
AAGCGCTTGACCGTTGAGGTAAGAGTTGCTTTGCCAGTTTTGCCCCCAGTTTCTTGACAT
CGCTTGCCAACCTGTTCTTGAACCCTTGATCGCCGCCGAGTGAACGTCTCCGGCGCCGCC
GACGTTTGTTATCAGAACGAGGTTGAAGTATGAGTGACCGTTGATAGTAAACCTAATTCC
TCCCCTTCTCATACACGGAACCCTTCTGTAGGAGACAGGGACGATGCCAGCTCTGTATTG
AGCAATGCGTTGAAAC

QA 2 737 2 737
DS 

RD RS1FQ72TF 766 0 0
GTGAC
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CTTGACATCGCTTGCCAACCTGTTCTTGAACCCTTGATCGCCGCCGAGTGAACGTCTCCG
GCGCCGCCGACGTTTGTTATCAGAACGAGGTTGAAGTATGAGTGACCGTTGATAGTAAAC
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CTGTATTGAGCAATGCGTTGAAACACAGGCTGAGCGAGATCAAAGTGTTGAAGAGGAGGA
TTACACCAACCACCATTGTTGTTAGGTAAGGCGTTGTTTGGTGGGCAAAAGTTTGTAGCG
GTTACAACGATTGAGCCAGGGAGACACCATTTACCATCGTTTTCACATCTTATCTCAAAG
CAAGAACCGCAGCTAAGTCCGTTATTGAACAGAGCCGTACTCAAAGCCGCCGTGTTTGTC
CCGTAGCCTTGGCTATATAGGTTGCCGTATCCACAAGCACCACCCATTGTGCCAGAAGCA
TCGCCACCGCCGTAGAATGTGGCGTGTGCATTGACCCAGCCGCCTCCATAGCCGTTCACG
GAAGAAGCCATTACCCCTATGAAAGCCATGACTAAAAATCCAACAGGACCCATGTTTACT
TCTTGCGTTAACTTGGAACTTGGAGACTCTTCTTTCCTAGAAGAGAAACGAAACGAAAGA
GAGAGAGAGAGAGAGAGAG**ATGTGAGGATATGTTGTTCC

QA 6 766 6 766
DS 

RD RS1EE83TF 616 0 0
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GAACCCTTCTGTAGGAGACAGGGACGATGCCAGCTCTGTATTGAGCAATGCGTTGAAACA
CAGGCTGAGCGAGATCAAAGTGTTGAAGAGGAGGATTACACCAACCGCCATTGTTGTTAG
GTAAGGCGTTGTTTGGTGGGCAAAAGTTTGTAGCGGTTACAACGATTGAGCCAGGGAGAC
ACCATTTACCATCGTTTTCACATCTTATCTCAAAGTAAGAACCGCAGCTAAGTCCGTTAT
TGAACAGAGCCGTACTCAAAGCCGCCGTGTTTGTCCCGTAGCCTTGGCTATATAGGTTGC
CGTATCCACAAGCACCACCCATTGTGCCAGAAGCATCGCCACCGCCGTAGAATGTGGCGT
GTGCATTGACCCAGCCGCCTCCATAGCCGTTCACGGAAGAAGCCATTACCCCTATGAAAG
CCATGACTAAAAATCCAACAGGACCCATGTTTACTTCTTGCGTTAACTTGGAACTTGGAG
ACTCTTCTTTCCTAGAAGAGAAACGAAACGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGT
GAGGATATGTTGTTCC

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 4

CO CL2787Contig1 666 4 2 U
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CATGAAAATACTGAGGAGGTTGACATCAAATATTCATCTATTCTAGCAAACATATAAAGA
AGACTTGAAAAATGATTTTACATGCTCGTTAGATCATTTAAACATGAGTAACAATCCAAG
GATGAGGTTCAAACTCTGCTTCCACACCCTTGGCCAGAGTAATGATAACAGGAGTTATAA
CCCTCTTCTTCCAGTACTTACTAATCTCATTGAACACGTAGAATGACTCAGTCGATGGAA
TACCATTCAAGTCAATATCATCATCCCTAACAGCTTCCTGAGATACGTACGCCTTCTCAT
CAACGTCCTAAGCACATCATCTCTCGAGCTGATCACTTCGAACAAATGTTCATTTCTGGA
TTATCAATGTTCAGTGAAGGCTAAAGTGACAGAGACTATCAATTTCTTCCATAAGGAGTA
CTCAAAACTCACTGAAGCAGCAAATAACAATCACTGTTTATATGCAACCTTCTAATCACT
TGCACAGAAGCAAAAAGATTATTTCCTCTCTTCTTTGAGTCTTTCAATTTTCGGATTCAG
GAAGCGGTGGAGTAATTGAGAAGTCATAATATCCTCTTCAGTTTTCAGAATTGATTTCGA
TTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1BK86TF C 10
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DS 



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BQ
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DS 



AS 1 4

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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BD60TF U 1
AF RS1BQ32TF U 581
AF RS1BQ32JQ C 804
AF RS1BD60JQ C 826
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GAAAATATGGGGAAAGGTCAGATATGGGTGAACGGTGAGAGCATTGGGAGATACTGGACG
GCTTTTGCAACCGGTGACTGTGATCACTGTAGCTACACCGGTACATACAAACAGAACA
GTGCCTA

QA 1 718 1 718
DS 

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G
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GTTTCATAGACCAAAGGTTCATTTGAAGTGTAGTCCTGGTCAGGCCATCTCAGCTATCAA
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A

QA 2 745 2 745
DS 

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QA 1 766 1 766
DS 

RD RS1BD60JQ 751 0 0
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GAGTACCGTCCGAATATCAAGAACTGGCAACTGGAAAGCTATGGTAAAGGACAAACGTTT
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QA 1 751 1 751
DS 



AS 2 4

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TGGCCAAGAGAAGAGGCAGTGCATCATGGTCGGCTCGAGCCGTAGTGGCTTTGGTATTCG
TCTCCCTGTTGGTGCTTCAAGCTGACTACGTTCGAGCTGCGACTTACACAGTCGGCGAAT
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ATGTTCTAGTGTTTAACTATAATCCGAGATTCCACAACGTGGTGGCGGTAGATAGTGCAG
GGTACAACAATTGCAAAACGCCGGCACGTGCAAGAACATACACTTCAGGCAAAGATCGTA
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CTATGAAAATAGCAGTCACGGCCGTTTGATCTTGATCGATCATGCAATCAAAATAGTACT
ATGATCGTCACTTCGTTATGTTCTAAAAAAAATATTAAGTATTCTAATAAAGTTTACATT
GTTGTAGTGTTCCCCTTTTTCTTTTTTGGTGATGTGTGTTGTGTGTTTCCTTTTTCATTT
TGTTGTTTTCCTGCTACTAGATTTTCTTTATAAATTAAGTCAACACCAAAAA


BQ
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GG
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BQ
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AGCTTGAAGCACCAACACGGAGACCAATACCAAAGCCACTACGGCTCGAGCCGACCATGA
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DS 



AS 1 2

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TCCTTATAGCTTGATGAACATGTGGGACTCTCTGCGTCTACG


BQ
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15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F679TF U 1
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TCTCTTATCACCGATCCGATCAAGAAAAATGAGTTGGTGGTGGGCAGGCGCCATCGGAGC
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CATCGGCGTCACGGGCATCGTCGGGAACAGCCTAGCGGAGATCCTTCCTCTCTCCGACAC
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GGAGGTGGACAACTGTGAGGTTAACGGCTCTATGCTCCGTAACGTCCTCCGCGCGGTTGT
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TC*TTATAGCTTGATGAACATGTGGGACTCTCTGCGTCTACG

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DS 

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GGG
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GAAAAAGTATGACGAAGATGAACCTACACAAACCTACGAGAGCGTCGCACTCATCATCGG
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TCCCATCGATTACATCCAGTGCGATGTCTCCGACGAAGAAGACGCGAGATCCAAGCTTTC
GCCTCTGAGAGACGTCACGCACGTGTTCTACGTCACGTGGAGCAACCGATCTGTGGAGGT
GGACAACTGTGAGGTTAACGGCTCTATGCTCCGTAACGTCCTCCGCGCGGTTGTTCCAAA
CGCGCCGAATCTCCGGCACGTTTGTCTCCAGACGGGGACGAAGCATTACCTTGGCCCTTT
CGATAGTCTTGGTAAAGATGTTCAACGTCACGAGCCGCCTTTCACGGAGGACATGCCGAG
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TAGCTTGATGAACAT
TGTGGGGACTCTCTGC

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DS 



AS 1 4

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CCATAAAAGAGTACATGACTGGATTACAAGACAAGTGATAGAGTGTAGTAGTTGCAACAG
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TTTATCACATGTCGACACTGAAACCATATTAGATCATTTGTGTCAGTGTTGAACGGAACA
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TTGTATCTGAAGTCACGTTTAGGAAGGAAATGTTGGGGAAGATTCAGAGAAGCTGGAGCT
TGAACCAATATAAAGAGCCTCATTGGGCCTGGGCACGAAGTTGATCCAGCACCCGTCGAG
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ACCTT*GAAAGCTCAAAACATTATCACC*GTGTGTGAATAACAGTTCATAAGCTTTTTGA
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ATCAATAACTGGAGGGCACTTCGGAGAGTAGAGATGGTGGTCATCAGCTTCTGGAGTTTC
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AGAATGTCATTGATGACGTGGAAGACGCCGGAGCCGCCGAGTGAAGAAGCCGTGGTCGCG
ATGTCTACGTCGTACTTCTCCTCTGTAGTTCCCTCTCCTTCCTCCATCTCCATCTCCATC
GTGATCGAAGATTTAACCTACCTGCGTAACTGTGTTTCTCAGTAAATTTGAATAAAAGTC
AGTAGGCGGGGGAGAGATGAAGAAGAAGAACGACGGCTAGATTGAATTTCCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1AA15JQ U 457
AF RS1D050JQ U 1
AF RS1AA15TF C 218
AF RS1D050TF C 488
BS 1 769 RS1D050JQ
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RD RS1AA15JQ 143 0 0
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AGGAGCTT
TCAC

QA 12 139 12 139
DS 

RD RS1D050JQ 828 0 0
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CCATAAAAGAGTACATGACTGGATTACAAGACAAGTGATAGAGTGTAGTAGTTGCAACAG
ACAGAAACAAAAACTCAAAAGTCTTATTATTCTTCGACTGGTTGCTGGAAAGCTAAGCCC
TTTATCACATGTCGACACTGAAACCATATTAGATCATTTGTGTCAGTGTTGAACGGAACA
TTTGTCTCATTATCTTGAGTTTTGCACTTGAACCGCAGCTTTAGAGGCACAAACTTTCTG
TTGTATCTGAAGTCACGTTTAGGAAGGAAATGTTGGGGAAGATTCAGAGAAGCTGGAGCT
TGAACCAATATAAAGAGCCTCATTGGGCCTGGGCACGAAGTTGATCCAGCACCCGTCGAG
ATCAGTGCTCGGATAGTCTTTTTGGAAAGTGATTCAGTAGCTTTGCATTTGGAAAA*GTC
ACCTT*GAAAGCTCAAAACATTATCACC*GTGTGTGAATAACAGTTCATAAGCTTTTTGA
GGACGTAAAGGACTACCACCAAGAATCAACACAACTCTGTGAATGTGAGGAGCTTCACGG
ATCAATAACTGGAGGGCACTTCGGAGAGTAGAGATGGTGGTCATCAGCTTCTGGAGTTTC
TTAATTTCAAGCTTCACCTCTCTTTTCCTACTCAATAGTTTTCTCCTGACCAGTGGCTTC
ACATCTGGTTGTGTAAGATGCGCCTCCAGATCAGTAAACTCAGTTTGCA*TCCATCAAAG
TCAAGAGTCATGTCTTGCA*TACCGAAGG*ATCTGCTGATGCATATAG

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DS 

RD RS1AA15TF 857 0 0
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GCTTTAGAGGCACAA*CTTTCTGTTGTATCTGAAGTCACGTTTAGGAAGGAAATGTTGGG
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AAGTTGATCCAGCACCCGTCGAGATCAGTGCTCGGATAGTCTTTTTGGAAAGTGATTCAG
TAGCTTTGCATTTGGAAAAAGTCACCTT*GAAAGCTCAAAACATTATCACC*GTGTGTGA
ATAACAGTTCATAAGCTTTT*GAGGACGTAAAGGACTACCACCAAGAATCAACACAACTC
TGTGAATGTGAGGAGCTTCACGGATCAATAACTGGAGGGCACTTCGGAGAGTAGAGATGG
TGGTCATCAGCTTCTGGAGTTTCTTAATTTCAAGCTTCACCTCTCTTTTCCTACTCAATA
GTTTTCTCCTGACCAGTGGCTTCACATCTGGTTGTGTAAGATGCGCCTCCAGATCAGTAA
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GATGCATATAGAGGACGAAACCGAGAATGTCATTGATGACGTGGAAGACGCCGGAGCCGC
CGAGTGAAGAAGCCGTGGTCGCGATGTCTACGTCGTACTTCTCCTCTGTAGTTCCCTCTC
CTTCCTCCATCTCCATCTCCATCGTGATCGAAGATTTAACCTACCTGCGTAACTGTGTTT
CTCAGTAAATTTGAATAAAAGTCAGTAGGCGGGGGAGAGATGAAGAAGAAGAACGACGGC
TAGATTGAATTTCCCCC

QA 1 857 1 857
DS 

RD RS1D050TF 578 0 0
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AAGGACTACCACCAAGAATCAACACAACTCTGTGAATGTGAGGAGCTTCACGGATCAATA
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GTTGTGTAAGATGCGCCTCCAGATCAGTAAACTCAGTTTGCAATCCATCAAAGTCAAGAG
TCATGTCTTGCAATACCGAAGGGATCTGCTGATGCATATAGAGGACGAAACCGAGAATGT
CATTGATGATGTGGAAGACGCCGGAGCCGCCGAGTGAAGAAGCCGTGGTCGCGATGTCTA
CGTCGTACTTCTCCTCTGTAGTTCCCTCTCCTTCCTCCATCTCCATCTCCATCGTGATCG
AAGATTTAACCTACCTGCGTAACTGTGTTTCTCAGTAAATTTGAATAAAAGTCAGTAGGC
GGGGGAGAGATGAAGAAGAAGAACGACGGCTAGATT
CC

QA 1 576 1 576
DS 



AS 1 3

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AACTTATATCTTCCGTGCTTCATTCAGGAGGGTTTTGAAACAAATGCAGAAACATGTATT
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TTTTCTTCACCACCCTCATCCCTCATCATCCCTGCTGTCCCTCTCAGAATGTTCGAATCA
ACGCCTCATGGAAGCATGTTCTATGCGCGGACGGTTGACTCTCTTCTTGCTTCTTGACAC
CACCCCCATCCCATTTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTAGTTGTATATTTTTAGCTCTTT
ATTACCCCTATTGCTCTTAGCATTACTAGTAGTGAAGCTCAATCCTATGGAGAAGAAAGA
GACAGTGCTGATGCTCCGTTACGAGGTCGGCAAGTTACTTGGCCAGGGTACCTTTGCCAA
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AGATAAAATCGTCAATGTTACTGGTATGACCGACCAGATCAAGCGTGAGATCTCTGTCAT
GAGACTCCTGTCACACCCAAACATCGTCCACCTCCATGAAGTCATGGCCACTAAATCTAA
AATCTACTTCGTCATGGAGCACGTTAAGGGCGGTGAGCTTTTCAACCAAGTCTCCGCCGG
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AGACGGCTTGCTCCACACCACATGTGGGACCCCTGCTTATGTTGCACCTGAGGTTATGAG
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GCTCCTTGCCGGTTATCTCCCTTTCCGTGACTCCAACCTCATTGACTTGTATAAGAAGAT
TGGTAAAGCCGAGTTCAAGTTCCCCAACTGGTTTGCTCCCGGGGTGAGGAGATTGCTCAA
GAAGATCTTGGATCCTAACCCCAACACGAGGATATCTACTGAGAAGATCATGCAGAGTTC
TTGGTTCAGGAAAGGCCTAGAAAAGGAGAAAGACGATGCTGATGATGCAGAGACAGACGA
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CAACCTGAATGCTTTTGAGATCATTTCGCTGTCCACCGGGTTTGATCTCTCGGGACTGTT
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AGGATGGAGGGTGGAGATAGAAGGTAGAAAAGAGGGTGCAGGGGTGGAAGCGGAGGTGTT
TGAGATTGCGCCAAGCTTCCACATGGTGGTGATGAAGAAGAACGGTGGAGATACTGCGGA
GTATAAGAGATTGATGAAGGAGAGTATAAGGCCAGCTTTGATGGACATTGCATTGGCTTG
GCATTGAAACTGTTAAACTACTACTATCTTTTTTTTATGTTTCTTTCGTACTAAAATGTT
TAGTTTCGTTCTTGATTCCGAAGATCTTTAAGACGTTTGTTTCTTGTTTTCGAGGTGTAA
CAATAATAAACTCATTTCACT


BQ
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AF RS1CH04TF U 616
AF RS1CH04JQ C 1168
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AACTTATATCTTCCGTGCTTCATTCAGGAGGGTTTTGAAACAAATGCAGAAACATGTATT
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TTTTCTTCACCACCCTCATCCCTCATCATCCCTGCTGTCCCTCTCAGAATGTTCGAATCA
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ATTACCCCTATTGCTCTTAGCATTACTAGTAGTGAAGCTCAATCCTATGGAGAAGAAAGA
GACAGTGCTGATGCTCCGTTACGAGGTCGGCAAGTTACTTGGCCAGGGTACCTTTGCCAA
GGTCTATCATGCCAGGAATCTCATCTCTGGTGATAGTGTCGCTGTTAAGGTCATCGATAA
AGATAAAATCGTCAATGTTACTGGTATGACCGACCAGATCAAGCGTGAGATCTCTGTCAT
GAGACTCCTGTCACACCCAAACATCGTCCACCTCCATGAAGTCATGGCCACTAAATCTAA
AATCTACTTCGTCATGGAGCACGTTAAGGGCGGTGAGCTTTTCA*CCAAGTCTCCGCCG*
CAAGCTCAAAGAAG*CGTCGCCAGGAAGTATTTCCAGCAGCTTGTCCGCGCCGTACACTA
CTGC

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DS 

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AAACATCGTCCACCTCCATGAAGTCATGGCCACTAAATCTAAAATCTACTTCGTCATGGA
GCACGTTAAGGGCGGTGAGCTTTTCAACCAAGTCTCCGCCGGCAAGCTCAAAGAAGGCGT
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CTCTGATTTTGGACTCAGCGCTCTTTCTGACTCTGGACGCCAAGACGGCTTGCTCCACAC
CACATGTGGGACCCCTGCTTATGTTGCACCTGAGGTTATGAGCAGGAATGGGTACGATGG
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CCCTTTCCGTGACTCCAACCTCATTGACTTGTATAAGAAGATTGGTAAAGCCGAGTTCAA
GTTCCCCAACTGGTTTGCTCCCGGGGTGAGGAGATTGCTCAAGAAGATCTTGGATCCTAA
CCCCAACACGAGGATATCTACTGAGAAGATCATGCAGAGTTCTTGGTTCAGGAAAGGCCT
AGAAAAGGAGAAAGACGATGCTGATGATGCAGAGACAGACGACGCAGAGCCA*CAGAGCC
AACGGTGCATGAGGACTGTGACA**GCAAAGAAGCAGTGTATCA
CCTGATGCTTTGAGAT

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DS 

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GAAAGACGATGCTGATGATGCAGAGACAGACGACGCAGAGCCAACAGAGCCAACGGTGCA
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GCTGTCCACCGGGTTTGATCTCTCGGGACTGTTTGAGAAAGGCGAAGAGAAAGAGGAGAT
GAGGTTTACGTCCAACCGAGAGGCGTCAGAGATCACGGAGAAGCTGGTGGAGGTTGGGAG
GGAACTTAAGATGAAAGTGAAGAAGAAGGAAGAAGGATGGAGGGTGGAGATAGAAGGTAG
AAAAGAGGGTGCAGGGGTGGAAGCGGAGGTGTTTGAGATTGCGCCAAGCTTCCACATGGT
GGTGATGAAGAAGAACGGTGGAGATACTGCGGAGTATAAGAGATTGATGAAGGAGAGTAT
AAGGCCAGCTTTGATGGACATTGCATTGGCTTGGCATTGAAACTGTTAAACTACTACTAT
CTTTTTTTTATGTTTCTTTCGTACTAAAATGTTTAGTTTCGTTCTTGATTCCGAAGATCT
TTAAGACGTTTGTTTCTTGTTTTCGAGGTGTAACAATAATAAACTCATTTCACT

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DS 



AS 2 4

CO CL2794Contig1 579 2 5 U
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TACATGTTAGTTGATATTTTTGATTGCTTCGCTGAAAAACACACCAAAACTAGTAAACAC
ATGACATAAAAGCATTGATTTACAAAGACAGTGGTTCAAATGAAACCCCAGACAAACATC
TCAAAACTCATGAGGGATGATTAATAAATTTAAGATTCAACTGTATTGCAAATAATCTTT
TTCGTTTTGCGTTTTAGTACACTACTATTGATATCTTTTAGGGGCTTTTGTGGTGGGAAG
CGTCCCAAACACTATGTCCCATAGCGACGATGTTATACCAAAACCCTTGTCCTGAATCCT
GAAGTGATGGTTCAAATGGTATTTCTTGAGGTTTTTGGTCACTGCTTTAGTTGGTTGGGC
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CAACGCTGGTGTGACTGCAGGAGTAGTGAATAGCTTCACAAGGTTCCAGAAAGGAAAGCA
TAAAATAGCTGTTGCAGTAGGAGGAAAGACGAGCCGAAG


BQ
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1AD27JQ U 1
AF RS1DF47JQ U 20
BS 1 300 RS1AD27JQ
BS 301 301 RS1DF47JQ
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BS 471 579 RS1AD27JQ

RD RS1AD27JQ 579 0 0
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TACATGTTAGTTGATATTTTTGATTGCTTCGCTGAAAAACACACCAAAACTAGTAAACAC
ATGACATAAAAGCATTGATTTACAAAGACAGTGGTTCAAATGAAACCCCAGACAAACATC
TCAAAACTCATGAGGGATGATTAATAAATTTAAGATTCAACTGTATTGCAAATAATCTTT
TTCGTTTTGCGTTTTAGTACACTACTATTGATATCTTTTAGGGGCTTTTGTGGTGGGAAG
TGTCCCAAACACTATGTCCCATAGCGACGATGTTATACCAAAACCCTTGTCCTGAATCCT
GAAGTGATGGTTCAAATGGTATTTCTTGAGGTTTTTGGTCACTGCTTTAGTTGGTTGGGC
ATGATGAAGGTAGTAGTGAGTAACATCGTACATCACGTACCCGAGCATGTCGCCTCCAAA
CAACGCTGGTGTGACTGCAGGAGTAGTGAATAGCTTCACAAGGTTCCAGAAAGGAAAGCA
TAAAATAGCTGTTGCAGTAGGAGGAAAGACGAGCCGAAG

QA 1 579 1 579
DS 

RD RS1DF47JQ 550 0 0
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TTGATTGCTTCGCTGAAAAACACACCAAAACTAGTAAACACATGACATAAAAGCATTGAT
TTACAAAGACAGTGGTTCAAATGAAACCCCAGACGAACATCTCAAAACTCATGAGGGGTG
ATTAATAAATTTAAGATTCAACTGTATTGCAAATAATCTTTTTCGTTTTGCGTTTTAGTA
CACTACTATTGCTCTCTTTTAGGGGCTTTTGTGGTGGGAAGCGTCCCAAACACTATGTCC
CATAGCGACGATGTTATACCAAAACCCTTGTCCTGAATCCTGAAGTGATGGTTCAAATGG
TATTTCTTGAGGTTTTTGGTCACTGCTTTAGTTGGTTGGGCATGATGAAGGTAGTAGTGA
GTAACATCGTACATCACGTACCCGAGCATGCCGCCTCCAAACAACGCTGGTGTGACTGCA
GGAGTAGTGAATAGCTTCACAAGGTTCCAGAAAGGAAAGCATAAAATAGCTGTTGCAGTA
GGAGGAAAGA

QA 1 550 1 550
DS 



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TCTCCCCCGACGGCTGTCGCTTCGTCAGAGTCGCCTTGAGATCCTGCATTCTCAATTAGT
TGAGTAAAAAAAGGTCTGCAAAATGGTTGCTCAGGGATTCACTGTGGATCTTAACAAGCC
CCTTGTACTTCAGGTTGGCCATCTTGGTGAAGAGTACGAGGAGTGGGTTCACCAACCCAT
TGTTTCAAAGGAAGGCCCTCGGTTTTTCCACAGTGACTTTTGGGAGTTCTTGACCCTTAC
AAGATGGTGGGTGGTTCCTGTAATTTGGTTGCCAGTTTCACTCAGGTGCATCTCCATGTC
AGTAAGCAGGGGCCTTTCACTTCCAGAAATCGTCCCATTGATACCCTTGGGAATATTCAT
CTGGACGTTTATTGAATATACTCTCCACCGGTTCCTTTTCCATATAAAGACCAAGAGTTA
CTGGGGAAACACGGCACACTATCTTCTTCACGGATGCCATCACAAGCACCCCATGGACCA
CCTTCGGCTCGTCTTTCCTCCTACTGCAACAGCTATTTTATGCTTTCCTTTCTGGAACCT
TGTGAAGCTATTCACTACTCCTGCAGTCACACCAGCGTTGTTTGGAGGCGACATGCTCGG
GTACGTGATGTACGATGTTACTCACTACTACCTTCATCATGCCCAACCAACTAAAGCAGT
GACCAAAAACCTCAAGAAATACCATTTGAACCATCACTTCAGATTCACGACAAGGGTTTT
GGTATAACATCGTCGCTATGGGACATAGTGTTTGGGACACTTCCCACACAAAGCCCTAAA
AGATATCAATAGTAGTGTACTAAAACGCAAACGAAAAGATTATTTGCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DF47TF U 1
AF RS1AD27TF U 10
BS 1 187 RS1DF47TF
BS 188 188 RS1AD27TF
BS 189 343 RS1DF47TF
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BS 345 650 RS1DF47TF
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BS 652 705 RS1DF47TF
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BS 707 725 RS1DF47TF
BS 726 888 RS1AD27TF

RD RS1DF47TF 725 0 0
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TCTCCCCCGACGGCTGTCGCTTCGTCAGAGTCGCCTTGAGATCCTGCATTCTCAATTAGT
TGAGTAAAAAAAGGTCTGCAAAATGGTTGCTCAGGGATTCACTGTGGATCTTAACAAGCC
CCTTGTATTTCAGGTTGGCCATCTTGGTGAAGAGTACGAGGAGTGGGTTCACCAACCCAT
TGTTTCAAAGGAAGGCCCTCGGTTTTTCCACAGTGACTTTTGGGAGTTCTTGACCCTTAC
AAGATGGTGGGTGGTTCCTGTAATTTGGTTGCCAGTTTCACTCTGGTGCATCTCCATGTC
AGTAAGCAGGGGCCTTTCACTTCCAGAAATCGTCCCATTGATACCCTTGGGAATATTCAT
CTGGACGTTTATTGAATATACTCTCCACCGGTTCCTTTTCCATATAAAGACCAAGAGTTA
CTGGGGAAACACGGCACACTATCTTCTTCACGGATGCCATCACAAGCACCCCATGGACCA
CCTTCGGCTCGTCTTTCCTCCTACTGCAACAGCTATTTTATGCTTTCCTTTCTGGAACCT
TGTGAAGCTATTCACTACTCCTGCAGTCACACCAGCGTTGTTTGGAGGCGGCATGCTCGG
GTACGTGATGTACGATGTTACTCACTACTACCTTCATCATGCCCA*CCAACTAAAGCAGT
GACCA

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1AD27TF 879 0 0
GG
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AGGTCTGCAAAATGGTTGCTCAGGGATTCACTGTGGATCTTAACAAGCCCCTTGTACTTC
AGGTTGGCCATCTTGGTGAAGAGTACGAGGAGTGGGTTCACCAACCCATTGTTTCAAAGG
AAGGCCCTCGGTTTTTCCACAGTGACTTTTGGGAGTTCTTGACCCTTACAAGATGGTGGG
TGGTTCCTGTAATTTGGTTGCCAGTTTCACTCAGGTGCATCTCCATGTCAGTAAGCAGGG
GCCTTTCACTTCCAGAAATCGTCCCATTGATACCCTTGGGAATATTCATCTGGACGTTTA
TTGAATATACTCTCCACCGGTTCCTTTTCCATATAAAGACCAAGAGTTACTGGGGAAACA
CGGCACACTATCTTCTTCACGGATGCCATCACAAGCACCCCATGGACCACCTTCGGCTCG
TCTTTCCTCCTACTGCAACAGCTATTTTATGCTTTCCTTTCTGGAACCTTGTGAAGCTAT
TCACTACTCCTGCAGTCACACCAGCGTTGTTTGGAGGCGACATGCTCGGGTACGTGATGT
ACGATGTTACTCACTACTACCTTCATCATGCCCAACCAACTAAAGCAGTGACCAAAAACC
TCAAGAAATACCATTTGAACCATCACTTCAGATTCACGACAAGGGTTTTGGTATAACATC
GTCGCTATGGGACATAGTGTTTGGGACACTTCCCACACAAAGCCCTAAAAGATATCAATA
GTAGTGTACTAAAACGCAAACGAAAAGATTATTTGCA

QA 3 879 3 879
DS 



AS 1 3

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TCTCCAACTTCGATATCGCTTTAAGACTTATGAAACCCACTAAAATAAGAGCTAAAACAG
GTCTGTTTCTCCCTAATGAACAACAATGTTAACAACATGAAGTTGGTGGTGCATCAAAGA
AACACAAGAGTTGCATCTTGAGCTGAAGCTTGTTTAAATGTCTTCTCCAACTTTCAACAT
CAAAGCAGCCTTGAGCTGATCATGATTGAAAAACTGGCTTCCCATCTTCACAGTAGCTTG
TTGAATCATCAAATCATTCACCACAGATAAGCTAGCATGATTCACTTCCAAATCCAACTC
CTTGAGCGCTTCCATGGACCTCGCACCAGGATGATTCTTCTTGCCGCATTGTACACGTAT
CATCACATCCCAACCTATGATCTTCACATCAATCTCCATTTCCACAGAACTCTCCGAATC
TCGATTCGATTTTCGCTCTTTCGCCCTCCTCGACCCGCCACCTTCCTTCCCCATCCCATC
CAGCTGCTTCTGAACCTCTTCCTTATCCGCCTCCGCTTGCTGCAGCTTCGTCTTAAGCTC
GTTGATGTACGAGATGGCGTCTCCCAGAAGAGAAGCCTTGTCCATTTTCGACACGTTGGG
AACCACAGCTCTCAAAGAGTAGAATCTCTGGTTCAGCTTCTCCCTTCTCTGCCTCTCTGC
TTCCACGTGGTTCAAAGGCTCTTCTCGTCCGTTAGCCGGTTTCCTCCCACGTTTCCTCGG
TTTCTTCTCCGGTTCGACGATGATCGCCTCCTTAACCACCGACGCCTCGATGTCGGAATG
ATCAGAGTCCACCGACTTCGCCGCGGATCGAACCACCGTGGTGAAAGAAAGCATCTCTTC
GTCTTTCGAAACAACCGGAGACCTCTTCTTGCTGCTCGACGACCCTTGCTTAAAGTTCCC
GCTCTGATTCAACCCCGAGCTCGAGAAGTTCAAATCTCCTCCCGCGTTTTCAATCGCCCC
CGGCGGCGGCGTTTCCTGAACCACCGGTTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D931JQ U 33
AF RS1BL76JQ U 1
AF RS1BL76TF C 287
BS 1 130 RS1BL76JQ
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AAACCCACTAAAATAAGAGCTAAAACAGGTCTGTTTCTCCCTAATGAACAACAATGTTAA
CAACATGAAGTTGGTGGTGCATCAAAGAAACACAAGAGTTGCATCTTGAGCTGAAGCTTG
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TAGCATGATTCACTTCCAAATCCAACTCCTTGAGCGCTTCCATGAACCTCGCACCAGGAT
GATTCTTCTTGCCGCATTGTACACGTATCATCGCATCCCAACCTATGATCTTCACATCAA
TCTCCATTTCCACAGAACTC
CC

QA 1 500 1 500
DS 

RD RS1BL76JQ 708 0 0
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ACTCCATACATATACAAACAAGTACAGTACAAGATTTCTTATATTACTACATCTCTCTGG
TCTCCAACTTGGATATCGCTTTAAGATTTATGAAACCCACTAAACTAAGAGCTAAAACAG
GTCTGTTTCTCC*TAATGAGCAACAATGTTAACAACATGAAGTTGGTGGTGCATCAAAGA
AACACAAGAGTTGCATCTTGAGCTGAAGCT*GTTTAAATGTCTTCTCCAACTTTCAACAT
CAAAGCAGCCTTGAGCTGATCATGATTGAAAAACTGGCTTCCCATCTTCACAGTAGCTTG
TTGAATCATCAAATCATTCACCACAGATAAGCTAGCATGATTCACTTCCAAATCCAACTC
CTTGAGCGCTTCCATGGACCTCGCACCAGGATGATTCTTCTTGCCGCATTGTACACGTAT
CATCACATCCCAACCTATGATCTTCACATCAATCTCCATTTCCACAGAACTCTCCGAATC
TCGATTCGATTTTCGCTCTTTCGCCCTCCTCGACCCGCCACCTTCCTTCCCCATCCCATC
CAGCTGCTTCTGAACCTCTTCCTTATCCGCCTCCGCTTGCTGCAGCTTCGTCTTAAGCTC
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QA 1 708 1 708
DS 

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TTCACAGTAGCTTGTTGAATCATCAAATCATTCACCACAGATAAGCTAGCATGATTCACT
TCCAAATCCAACTCCTTGAGCGCTTCCATGGACCTCGCACCAGGATGATTCTTCTTGCCG
CATTGTACACGTATCATCACATCCCAACCTATGATCTTCACATCAATCTCCATTTCCACA
GAACTCTCCGAATCTCGATTCGATTTTCGCTCTTTCGCCCTCCTCGACCCGCCACCTTCC
TTCCCCATCCCATCCAGCTGCTTCTGAACCTCTTCCTTATCCGCCTCCGCTTGCTGCAGC
TTCGTCTTAAGCTCGTTGATGTACGAGATGGCGTCTCCCAGAAGAGAAGCCTTGTCCATT
TTCGACACGTTGGGAACCACAGCTCTCAAAGAGTAGAATCTCTGGTTCAGCTTCTCCCTT
CTCTGCCTCTCTGCTTCCACGTGGTTCAAAGGCTCTTCTCGTCCGTTAGCCGGTTTCCTC
CCACGTTTCCTCGGTTTCTTCTCCGGTTCGACGATGATCGCCTCCTTAACCACCGACGCC
TCGATGTCGGAATGATCAGAGTCCACCGACTTCGCCGCGGATCGAACCACCGTGGTGAAA
GAAAGCATCTCTTCGTCTTTCGAAACAACCGGAGACCTCTTCTTGCTGCTCGACGACCCT
TGCTTAAAGTTCCCGCTCTGATTCAACCCCGAGCTCGAGAAGTTCAAATCTCCTCCCGCG
TTTTCAATCGCCCCCGGCGGCGGCGTTTCCTGAACCACCGGTTCGC

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 2

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TCTTATGTAAGATAGAGAGTGATATGTTGTTACTTGTTAGAGATTGTGAAATTGAGAAGA
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BQ
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AF RS1F112TF U 1
AF RS1FA52TF U 1
BS 1 707 RS1F112TF
BS 708 709 RS1FA52TF

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AAGATCCCCTCTCTCTCTTGGCTCCTGTTCTGAAGAATCTATGGAGATTCTGTTGATACA
AAGTCTCTCTTTTTTTAGGATATAATTTATGAGTTAGTTTCTAATTTTAGATTTGTCCAG
ACAGACTTATGTCTGAGCTCTAATTCATACATACACCTTAAGTCGAAGCTGTTTTTTTTT
TCTTATGTAAGATAGAGAGTGATATGTTGTTACTTGTTAGAGATTGTGAAATTGAGAAGA
GCAAACAATCATTAGTTCGTGACATTCTGTAAAACAAGTATGCTTTG

QA 1 707 1 707
DS 

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ATTAGCTCACGATGGCGTTCCGAAACTGTCGGTGGGAGCTCCTCGCGGCTTCTCTAGCCC
TGACTTTAGCTCTGATTCACCACCCGGTGGATGCGAACTCGGAAGGAGATGCCCTTTACG
CTCTTCGCAGGAGCTTATCGGATCCAGACCATGTGCTCCAGAGCTGGGATCCAACTCTTG
TTAACCCTTGTACCTGGTTCCATGTCACCTGTAACCAAGACAGCCGCGTCACTCGTGTGT
AAGATCCCCTCTCTCTCTTGGCTCCTGTTCTGAAGAATCTATGGAGATTCTGTTGATACA
AAGTCTCTCTTTTTTTAGGATATAATTTATGAGTTAGTTTCTAATTTTAGATTTGTCCAG
ACAGACTTATGTCTGAGCTCTAATTCATACATACACCTTAAGTCGAAGCTGTTTTTTTTT
TCTTATGTAAGATAGAGAGTGATATGTTGTTACTTGTTAGAGATTGTGAAATTGAGAAGA
GCAAACAATCATTAGTTCGTGACATTCTGTAAA*CAAGTATGCTTTGAT

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 4

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GTTCAACCCCACGCCTTCTCTATCCGCTATGATTGTGAATCACTATAAGCTCCGTGGCAA
CATACTCAGCTACAACTTGGGTGGGATGGGCTGCAGCGCGGGGTTGATCTCGATAGATCT
CGCCAAGCATCTTCTCCACACCATTCCCAACACTTATGCTATGGTGATCAGCATGGAGAA
CATCACGTTGAACTGGTACTTCGGGAACGATAGGTCGAAGCTCGTCTCTAACTGTCTGTT
CAGAATGGGAGGTGCGGCGATTCTTCTCTCTAACAAACGATGGGACAGGAGGAGATCCAA
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CGTAACTCAAGAAGAGGACTCCACGAGTAAGGTTGGTGTGACACTGTCCAAAGATCTAAT
GGCTGTTGCCGGTGATGCTCTGAAGACGAACATCACGACGTTGGGACCGCTGGTTCTGCC
CACGTCTGAACAGCTTCTGTTCTTTGCGACGTTAGTGGGAAGGAAACTGTTCAAGATGGA
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GCCTTCGAGGATTACGCTCTACCGTTTTGGTAACACGTCGAGTAGCTCTTTGTGGTATGA
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TTTTGGCTCAGGGTTTAAGTGCAACAGCTCGGTTTGGAGAGCGGTGAGGTCTGTAAATCC
TAAAAAGGAGAAGAACCCATGGATGGATGAGATCCATGAGTTCCCGGTTGATGTCCCCAC
ACACGCAACAATCTAGAAACCACTCAGCCAGCATTGTGTACTCTTCAGAAGAGACCTCTC
TTGTTTTTTGTTTTGTTTCCATGTTCTCTTGAGTTTTCTTATCTTTTGAGATTCTGCTCT
TGTTCCACTTTCTCTTCCTAATGAGCTTAGCTTGTCCTTGATTGGTTGACAAATTTACCA
ACCTTTTTTTAACATTATTTCCTCCTTTTTTGGGTTAAAAATAAATTTCAGAACAATTTT
GC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1F495TF U 1
AF RS1GF54TF U 1
AF RS1GF54JQ C 624
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CATACTCAGCTACAACTTGGGTGGGATGGGCTGCAGCGCGGGGTTGATCTCGATAGATCT
CGCCAAGCATCTTCTCCACACCATTCCCAACACTTATGCTATGGTGATCAGCATGGAGAA
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CAGAATGGGAGGTGCGGCGATTCTTCTCTCTAACAAACGATGGGACAGGAGGAGATCCAA
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ATGGATGAGATCCATGAGTTCCCGGTTGATGTCCCCACACACGCAACAATCTAGAAACCA
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GTTCTCTTGAGTTTTCTTATCTTTTGAGATTCTGCTCTTGTTCCACTTTCTCTTCCTAAT
GAGCTTAGCTTGTCCTTGATTGGTTGACAAATTTACCAACCTTTTTTTAACATTATTTCC
TCCTTTTTTGGGTTAAAAATAAATTTCAGAACAATTTTGC

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DS 



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AAGCGCTAGAACCATCTACTACTTTCTATCTTTTTTTTTT*ATGTTCTTTTGTAAACTCT
CATCAATAACCTTTTTTTTGG*TTAAGTCTTCGTTAAGCTTTACATGGCTGCCATTTTTT
TTTTTTTGTTAAGGAATTTATAGTTTCATGAACTATGCAACTCACAAATACAAGTTAGAA
ATA


BQ
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10 

AF RS1DA46TF U 1
AF RS1DA46JQ C 29
AF RS1A627TF U 111
AF RS1C158TF U 111
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GGCTGCAGCTTTGGCTTCCAGATTATCTCGTGGACGCTCATTGCTTGGAGGTCTTAAAAA
TGATTTCTCCGGTTCAATGATTACTTCCACTGGAATGATGAATGAGAGTATCCTCTCTCA
GCAGCAACAGCGAAGGACGTTCATTCAAATGGGAACGGTTCTGAAAGTGGTGGACAACTC
AGGAGCCAAGAAAGTGATGTGTATCCAAGCGCTAAAGGGTAAAAAGGGAGCTAGGCTTGG
GGACACGATAGTTGCTTCGGTGAAAGAAGCGATGCCAAACGGTAAAGTGAAGAAAGGAGC
GGTTGTGTATGGTGTGGTTGTGCGAGCTGCGATGCAGAGAGGTCGTGTTGATGGAAGCGA
AGTTAGGTTCGATGATAACGCCGTTGTTCTCGTTGATAATAAAGACAAGAAGACTAAAAC
CGATCGCCAGCCGATTGGTACTCGAGTATTTGGTCCTGTTCCTCATGAGCTCCGTAAGAA
GAAGCATCTCAAGATTCTCGCTTTGGCTCAACACATTGCTTGAGACAACCAACCAACATC
AAGCGCTAGAACCATCTACTACTTTCTATCTTTTTTTTTT*ATGTTCTTTTGTAAACTCT
CATCAATAACCTTTTTTTTGG*TTAAGTCTTCGTTAAGCTT
C

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DS 

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CGTGGACGCTCATTGCTTGGAGGTCTTAAAAATGATTTCTCCGGTTCAATGATTACTTCC
ACTGGAATGATGAATGAGAGTATCCTCTCTCAGCAGCAACAGCGAAGGACGTTCATTCAA
ATGGGAACGGTTCTGAAAGTGGTGGACAACTCAGGAGCCAAGAAAGTGATGTGTATCCAA
GCGCTAAAGGGTAAAAAGGGAGCTAGGCTTGGGGACACGATAGTTGCTTCGGTGAAAGAA
GCGATGCCAAACGGTAAAGTGAAGAAAGGAGCGGTTGTGTATGGTGTGGTTGTGCGAGCT
GCGATGCAGAGAGGTCGTGTTGATGGAAGCGAAGTTAGGTTCGATGATAACGCCGTTGTT
CTCGTTGATAATAAAGACAAGAAGACTAAAACCGATCGCCAGCCGATTGGTACTCGAGTA
TTTGGTCCTGTTCCTCATGAGCTCCGTAAGAAGAAGCATCTCAAGATTCTCGCTTTGGCT
CAACACATTGCTTGAGACAACCAACCAACATCAAGCGCTAGAACCATCTACTACTTTCTA
TCTTTTTTTTTT*ATGTTCTTTTGTAAACTCTCATCAATAACCTTTTTTTTGG*TTAAGT
CTTCGTTAAGCTT
C

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DS 

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TCCTCTCTCAGCAGCAACAGCGAAGGACATTCATTCAAATGGGAACGGTTCTGAAAGTGG
TGGACAACTCAGGAGCCAAGAAAGTGATGTGTATCCAAGCGCTAAAGGGTAAAAAGGGAG
CTAGGCTTGGGGACACGATAGTTGCTTCGGTGAAAGAAGCGATGCCAAACGGTAAAGTGA
AGAAAGGAGCGGTTGTGTATGGTGTGGTTGTGCGAGCTGCGATGCAGAGAGGTCGTGTTG
ATGGTGGCGAAGTTAGGTTCGATGATAACGCCGTTGTTCTCGTTGATAATAAAGACAAGA
AGACTAAAACTGATCGCCAGCCGATTGGTACTCGAGTGTTTGGTCCCGTTCCTCATGAGC
TCCGTAAGAAGAAGCATCTCAAGATTCTTGCTTTGGCTCAACACATTGCTTGAGACAACC
AACCAACATCAAGCGCTAGAACCAGCTACTACTGTCTATCTTTTTTTTTTTATGTTCTTT
TGTAAACTCTCATCAATAACCTTTTTTTTTGCTTAAGTCTTCGTTAAGCTTTACATGGCT
GCCATTTTTTTTTTTTTGTTAAGGAATTTATAGTTTCATGAACTATGCAACTC

QA 1 653 1 653
DS 

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TCCTCTCTCAGCAGCAACAGCGAAGGACATTCATTCAAATGGGAACGGTTCTGAAAGTGG
TGGACAACTCAGGAGCCAAGAAAGTGATGTGTATCCAAGCGCTAAAGGGTAAAAAGGGAG
CTAGGCTTGGGGACACGATAGTTGCTTCGGTGAAAGAAGCGATGCCAAACGGTAAAGTGA
AGAAAGGAGCGGTTGTGTATGGTGTGGTTGTGCGAGCTGCGATGCAGAGAGGTCGTGTTG
ATGGTGGCGAAGTTAGGTTCGATGATAACGCCGTTGTTCTCGTTGATAATAAAGACAAGA
AGACTAAAACTGATCGCCAGCCGATTGGTACTCGAGTGTTTGGTCCCGTTCCTCATGAGC
TCCGTAAGAAGAAGCATCTCAAGATTCTTGCTTTGGCTCAACACATTGCTTGAGACAACC
AACCAACATCAAGCGCTAGAACCAGCTACTACTGTCTATCTTTTTTTTTTTATGTTCTTT
TGTAAACTCTCATCAATAACCTTTTTTTTTGCTTAAGTCTTCGTTAAGCTTTACATGGCT
GCCATTTTTTTTTTTTTGTTAAGGAATTTATAGTTTCATGAACTATGCAACTCACAAATA
CAAGTTAGAAATA

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 4

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AAATAGATGGATCCTTACTGCAACAACATAATATCCATGCATTCTAGGAATGCATTCCAA
CCAAAGGCTACTTCGGCTTCATGGAACTTCAACTACGGGCCAGCAGGAACAGCTATCTGT
TTCTACGGCCTCAACGCACCACAAGGCGGTACTGGACCAACAGAGTCCAACTCGTTCTTC
CTCAAGGCTTTGGTGCAACAATCCGCGCCATCAACTGTGCTTTGGAGTGTGATGAAGCCA
ACAGAGCCACCGTTGAAGCTAGGGTTCGTTACTATAATCGTCAGTTTGGTGTTGACCCCG
GTAACAACCTCACATACTAACACAATAACATCATCTAGTAATACTAATAATAATAAAAGA
CAATGTGTAACGTTCGAAACAGAGCAGACTCTCTAGTCTAGTAACATTAGATCCTACTTT
TTAGAAAGACATGGAAACGCTTTGTTGTGATCAACACCATAGTAATGAAGAAAGCCTCTG
AAGACATGACCGTTTATGGTTACTGTCGCTTGATAGCCGATCTCTGATTGTTCTTCGTTG
CTTATCGCTGTTACTCTCGTCCGTTTGAAAACCGCCGGAGCTTCGATCTTTCCCGGTAAC
CCTTCTTTGAATCTCGTCTCTTGACGGCGAGAAGTGGTTGTCGGAACGGTATAAACACTG
GGTTTGTCGGAAGGATCGATTTTGAGCTTCTTTTTGTACCTGTCGGAAGAGGAAGAAGAA
GAGTGATGATGCTGAGAAGAAGAAGAAGAAGGGATCCACGTGCTCTTCACGTGAGTGGCA
CAGTTGTATCCTCTGCTTTTGCAGCAAGTTCTACACCTTTCGAACAAAAACTCTTTCTTA
GCTCTGTTTCCACAGTCTCTGCACACTTTTTCTTCAACATTACTGTTCCTTGGCTTGTTG
TGATCTGCTTCCACCGAGGGGTGAGTAATCTGCGACGGTGGTGGTAAGAGGATGACGTTT
CTTAGGCCTAGCATGTAGTCTGGTGTACTGATTCCAACGGCGGCAGAGGAAGAGGAGTGG
TGGTGGTCAGGGATGGTGGAGGATGGTTGATGCGGTGGTGGCCATGAAAGGAGAGAAGGT
GGATTTGCCACTGTGGAAGTAATTATAAGCGCGTGGAGACAGCTATAGATGTAGTAGAAG
CTTTTAGCTATGGAGTCTAGTGAGTCTAGTGAGAGATAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D516JQ U 1
AF RS1A662JQ U 376
AF RS1A662TF C 376
AF RS1D516TF C 488
BS 1 583 RS1D516JQ
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RD RS1D516JQ 764 0 0
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AAATAGATGGATCCTTACTGCAACAACATAATATCCATGCATTCTAGGAATGCATTCCAA
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AAGACATGACCGTTTATGGTTACTGTCGCTTGATAGCCGATCTTTGATTGTTCTTCGTTG
CTTATCGCTGTTACTCTCGTCCGTTTGAAAACCGCCGGAGCTTCGATCTTTCCCGGTAAC
CCTTCTTTGAATCTCGTCTCTTGACGGCGAGAAGTGGTTGTCGGAACGGTATAGACACTG
GGTTTGTCGGAAGGATCGATTTTGAGCTTCTTTTTGTACCTGTC

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1A662JQ 701 0 0
G
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ACGCTTTGTTGTGATCAACACCATAGTAATGAAGAAAGCCTCTGAAGACATGACCGTTTA
TGGTTACTGTCGCTTGATAGCCGATCTCTGATTGTTCTTCGTTGCTTATCGCTGTTACTC
TCGTCCGTTTGAAAACCGCCGGAGCTTCGATCTTTCCCGGTAACCCTTCTTTGAATCTCG
TCTCTTGACGGCGAGAAGTGGTTGTCGGAACGGTATAAACACTGGGTTTGTCGGAAGGAT
CGATTTTGAGCTTCTTTTTGTACCTGTCGGAAGAGGAAGAAGAAGAGTGATGATGCTGAG
AAGAAGAAGAAGAAGGGATCCACGTGCTCTTCACGTGAGTGGCACAGTTGTATCCTCTGC
TTTTGCAGCAAGTTCTACACCTTTCGAACAAAAACTCTTTCTTAGCTCTGTTTCCACAGT
CTCTGCACACTTTTTCTTCAACATTACTGTTCCTTGGCTTGTTGTGATCTGCTTCCACCG
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AGTCTGGTGTACTGATTCCAACGGCGGCAGAGGAAGAGGA

QA 2 701 2 701
DS 

RD RS1A662TF 865 0 0
G
CTAACACAATAACATCATCTAGTAATACTAATAATAATAAAAGACAATGTGTAACGT*CG
AAACAGAGCAGACTCTCTAGTCTAGTAACATTAGATCATACTTTTTAGAAAGACATGGAA
ACGCTTTGTTGTGATCAACACCATAGTAATGAAGAAAGCCTCTGAAGACATGACCGTTTA
TGGTTACTGTCGCTTGATAGCCGATCTCTGATTGTTCTTCGTTGCTTATCGCTGTTACTC
TCGTCCGTTTGAAAACCGCCGGAGCTTCGATCTTTCCCGGTAACCCTTCTTTGAATCTCG
TCTCTTGACGGCGAGAAGTGGTTGTCGGAACGGTATAAACACTGGGTTTGTCGGAAGGAT
CGATTTTGAGCTTCTTTTTGTACCTGTCGGAAGAGGAAGAAGAAGAGTGATGATGCTGAG
AAGAAGAAGAAGAAGGGATCCACGTGCTCTTCACGTGAGTGGCACAGTTGTATCCTCTGC
TTTTGCAGCAAGTTCTACACCTTTCGAACAAAAACTCTTTCTTAGCTCTGTTTCCACAGT
CTCTGCACACTTTTTCTTCAACATTACTGTTCCTTGGCTTGTTGTGGTCTGCTTCCACCG
AGGGGTGAGTAATCTGCGACGGTGGTGGTAAGAGGATGACGTTTCTTAGGCCTAGCATGT
AGTCTGGTGTACTGATTCCAACGGCGGCAGAGGAAGAGGAGTGGTGGTGGTCAGGGATGG
TGGAGGATGGTTGATGCGGTGGTGGCCATGAAAGGAGAGAAGGTGGATTTGCCACTGTGG
AAGTAATTATAAGCGCGTGGAGACAGCTATAGATGTAGTAGAAGCTTTTAGCTATGGAGT
CTAGTGAGTCTAGTGAGAGATAGA

QA 2 865 2 865
DS 

RD RS1D516TF 724 0 0
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GACCGTTTATGGTTACTGTCGCTTGATAGCCGATCTTTGATTGTTCTTCGTTGCTTATCG
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TGAATCTCGTCTCTTGACGGCGAGAAGTGGTTGTCGGAACGGTATAGACACTGGGTTTGT
CGGAAGGATCGATTTTGAGCTTCTTTTTGTACCTGTCGGAAGAGGAAGAAGAAGAGTGAT
GATGCTGAGAAGAAGAAGAAGAAGGGATCCACGTGCTCTTCACGTGAGTGGCACAGTTGT
ATCCTCTGCTTTTGCAGCAAGTTCTACACCTTTCGAACAAACACTCTTTCTTAGCTCTGT
TTCCACAGTCTCTGCACACTTTTTCTTCAACATTACTGTTCCTTGGCTTGTTATGATCTG
CTTCCACCGAGGGGTGAGTAATCTGCGACGGTGGTGGTAAGAGGATGACGTTTCTTAGGC
CTAGCATGTAGTCTGGTGTACTGATTCCAACGGCGGCAGAGGAAGAGGAGTGGTGGTGGT
CAGGGATGGTGGAGGATGGTTGATGCGGTGGTGGCCATGAGAGGAGAGAAGGTGGATTTG
CCACTGTGGAAGTAATTATAAGCGCGTGGAGACAGCTATAGATGTAGTAGAAGCTTTTAG
C
CCC

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 3

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AAAAAAATATCGGCCCAAGCCTTGGCTTTGAGAGGCGTAGGTGCCCAGAAAACCTGTGGC
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GCGTTCTCCTTCTTCTCTCCCTCTCCATTGACTTCTTTCTTTTCCTGCTTATCTTGAGTG
TTCTCTTGAACATTATTAGTATCCTTGGGCGCAATTCCAAAATCAGCTAACAAAGCATCA
ATCTCAGCAAGTTCCTTCTGTCTCCTCTCTTTCTTGGAAAGCTGCCTCTCTGCCTCCTTA
GGTGGTGCAGCAACTTCAGGAGCCTTCTTTACCTCAGGCTCTGCTGCTTGTGGATGAACT
TGCGTCTCATGCTCTTCCTCCCAAATCATCATCATCATCATCATCACCTTCACCAAGAAC
ATCTTCATCACTTTCACTTTCCTCAACGTGAGTCTCTTTCGCATCCGAAGCATTCCACAA
GGACTGGGGAGGAGCGGTGGTAGCGAAATAGTCACCGTCTTCATCGTCGCTGTCGATATC
GGCCCAAGCCTTAGCTTTGAGAGGCGTAGGTGCCCAGAAGACCTGTGGCTCAGGCTCCTT
GTGCTGCGAGGAGGAGCCCTTGCTCTTACCAGCACCAGCCTTAATCTTCTTCTTACGAGT
ATCCAACGCAGCGAACAAGTTGGTGTTCTGAATCGGCATCATCGATCCTTCGTCTCTCCT
GTTTCCACCACCGACCATCTTTTGCTTCTCTCTCTCAAACAATCAATCGAAGATTCAGAC
AACAACAGCTCAAAAAGGTGCGATCTTTACAAAACGATCTGGAGATGAATCGAGCAATGG
ATAAGGGATACAATCGTCACTAATTTTCTACGAGAGAGAGAGAGATAGGAGAAAAATTCG
ATCTTTCTATGAACTTTGATGGGCGGTGATTCTGGAAAGCGATTGATAATTTAGGGTTCC
CAGATATACAGATTGTGGATTGATATATAGAGGTAGAAAACAAGAGAAGGTAGGAAGCTT
CGGGAAGCTGGTTTCTGAAGGGATGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GP54JQ U 1
AF RS1AQ04JQ U 126
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RD RS1GP54JQ 305 0 0
AAAAAAATATCGGCCCAAGCCTTGGCTTTGAGAGGCGTAGGTGCCCAGAAAACCTGTGGC
TCAGGCTCCTTGTGTTTATCCTTCTTTTTCTTCTTCTTTGATGCCTTTGATTCTCCCGTT
GCGTTCTCCTTCTTCTCTCCCTCTCCATTGACTTCTTTCTTTTCCTGCTTATCTTGAGTG
TTCTCTTGACCATTATTAGTATCCTTGGGTGCAATTCCAAAATCAGCTAACAAAGCATCA
ATCTCAGCAAGTTCCTTCTGTCTCCTCTCTTTCTTGGAAAGCTGCCTCTCTGCCTCCTTA
GGTGG

QA 1 305 1 305
DS 

RD RS1AQ04JQ 716 0 0
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TTGAAGATTATTAGTATCCTTGGGCGCAATTCCAAAATCAGCTAACAAAGCATCAATCTC
AGCAAGTTCCTTCTGTCTCCTCTCTTTCTTGGAAAGCTGCCTCTCTGCCTCCTTAGGTGG
TGCAGCAACTTCAGGAGCCTTCTTTACCTCAGGCTCTGCTGCTTGTGGATGAACTTGCGT
CTCATGCTCTTCCTCC*AAATCATCATCATCATCATCATCACCTTCACCAAGAACATCTT
CATCACTTTCACTTTCCTCAACGTGAGTCTCTTTCGCATCCGAAGCATTCCACAAGGACT
GGGGAGGAGCGGTGGTAGCGAAATAGTCACCGTCTTCATCGTCGCTGTCGATATCGGCCC
AAGCCTTAGCTTTGAGAGGCGTAGGTGCCCAGAAGACCTGTGGCTCAGGCTCCTTGTGCT
GCGAGGAGGAGCCCTTGCTCTTACCAGCACCAGCCTTAATCTTCTTCTTACGAGTATCCA
ACGCAGCGAACAAGTTGGTGTTCTGAATCGGCATCATCGATCCTTCGTCTCTCCTGTTTC
CACCACCGACCATCTTTTGCTTCTCTCTCTCAAACAATCAATCGAAGATTCAGACAACAA
CAGCTCAAAAAGGTGCGATCTTTACAAAACGATCTGGAGATGAATCGAGCAATGGA

QA 1 716 1 716
DS 

RD RS1AQ04TFB 861 0 0
GAAG
ATTATTAGTATC*TTGGGCGCAATTCCAAAATCAGCTAACAAAGCATCAATCTCAGCAAG
TTC*TTCTGTCTCCTCTCTTTCTTGGAAAGCTGCCTCTCTGCCTCTTTAGGTGGTGCAGC
AACTTCAGGAGCCTTCTTTACCTCAGGCTCTGCTGCTTGTGGATGAACTTGCGTCTCATG
CTCTTCCTCCCAAATCATCATCATCATCATCATCACCTTCACCAAGAACATCTTCATCAC
TTTCACTTTCCTCAACGTGAGTCTCTTTCGCATCCGAAGCATTCCACAAGGACTGGGGAG
GAGCGGTGGTAGCGAAATAGTCACCGTCTTCATCGTCGCTGTCGATATCGGCCCAAGCCT
TAGCTTTGAGAGGCGTAGGTGCCCAGAAGACCTGTGGCTCAGGCTCCTTGTGCTGCGAGG
AGGAGCCCTTGCTCTTACCAGCACCAGCCTTAGTCTTCTTCTTACGAGTATCCAACGCAG
CGAACAAGTTGGTGTTCTGAATCGGCATCATCGATCCTTCGTCTCTCCTGTTTCCACCAC
CGACCATCTTTTGCTTCTCTCTCTCAAACAATCAATCGAAGATTCAGACAACAACAGCTC
AAAAAGGTGCGATCTTTACAAAACGATCTGGAGATGAATCGAGCAATGGATAAGGGATAC
AATCGTCACTAATTTTCTACGAGAGAGAGAGAGATAGGAGAAAAATTCGATCTTTCTATG
AACTTTGATGGGCGGTGATTCTGGAAAGCGATTGATAATTTAGGGTTCCCAGATATACAG
ATTGTGGATTGATATATAGAGGTAGAAAACAAGAGAAGGTAGGAAGCTTCGGGAAGCTGG
TTTCTGAAGGGATGTCC

QA 5 861 5 861
DS 



AS 1 2

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TTTTCACCCAAATCATAAAACTTTTGTCCCAATTCAAGATATCTATGATCAAAAGTCAAA
AGGCGAGATTTTAGTGGAGTCCAAAGTCTATACGAAACACAACACAATTACTGAAAAGTC
GATGGGAATCCCAAACTAATTTTTACATGCAAAGACAGAACAGAACGAAGAAGAAATCTC
GTGTCATAGGCATTGTTTAGTTCACCTTTTTGAATATATATGAATTCAATGTTCCATGAA
CTGCGACGAAGGCGGACTTATTTTCGTCTTCTCCGTACCATAAGCTCCACGTATCTCAAC
TTCTCGCAGTTCTTGGACTAGAGCACAGCAACAACACATCAAATGAGATAGAAAATCGTC
AATGAACCCTCCCGTAATATTGAGTGTTTTGCGGAGTTTCCTCCTTACACAACAAGTGTA
GCAGCAACACGAAAGTATCAAAGAATATGCCATTAGCTCATTACATGCTTCCGCTGAAGA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AD18JQ U 51
AF RS1ET32TF C 1
BS 1 50 RS1ET32TF
BS 51 468 RS1AD18JQ
BS 469 529 RS1ET32TF

RD RS1AD18JQ 418 0 0
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CTGAAAAGTCGATGGGAATCCCAAACTAATTTTTACATGCAAAGACAGAACAGAACGAAG
AAGAAATCTCGTGTCATAGGCATTGTTTAGTTCACCTTTTTGAATATATATGAATTCAAT
GTTCCATGAACTGCGACGAAGGCGGACTTATTTTCGTCTTCTCCGTACCATAAGCTCCAC
GTATCTCAACTTCTCGCAGTTCTTGGACTAGAGCACAGCAACAACACATCAAATGAGATA
GAAAATCGTCAATGAACCCTCCCGTAATATTGAGTGTTTTGCGGAGTTTCCTCCTTACAC
AACAAGTGTAGCAGCAACACGAAAGTATCAAAGAATATGCCATTAGCTCATTACATGC

QA 1 418 1 418
DS 

RD RS1ET32TF 529 0 0
TTTTCACCCAAATCATAAAACTTTTGTCCCAATTCAAGATATCTATGATCAAAAGTCAAA
AGGCGAGATTTTAGTGGAGTCCAAAGTCTATACGAAACACAACACAATTACTGAAAAGTC
GATGGGAATCCCAAACTAATTTTTACATGCAAAGACAGAACAGAACGAAGAAGAAATCTC
GTGTCATAGGCATTGTTTAGTTCACCTTTTTGAATATATATGAATTCAATGTTCCATGAA
CTGCGACGAAGGCGGACTTATTTTCGTCTTCTCCGTACCATAAGCTCCACGTATCTCAAC
TTCTCGCAGTTCTTGGACTAGAGCACAGCAACAACACATCAAATGAGATAGAAAATCGTC
AATGAACCCTCCCGTAATATTGAGTGTTTTGCGGAGTTTCCTCCTTACACAACAAGTGTA
GCAGCAACACGAAAGTATCAAAGAATATGCCATTAGCTCATTACATGCTTCCGCTGAAGA
GATATGCCTGTTAGTTGCTGCGGTGGCAATCTTTGCCAAAGTACCACAC

QA 1 529 1 529
DS 



AS 1 2

CO CL2802Contig1 646 2 1 U
GGACTCACTTTAGATTCTTCTACTCTCAAACCCTACTTCTCAAGCTGAGTGTACCGCTGA
ACAGGCTTACACATGGACCGAGGGACGTGCAATCTTTGGTAGTGGAAGCCCGTTTGATCC
CGTTGAGTACAACGGCAAAACTTACTTGCCTGGCCAGGCAAACAACTGTTACATTTTCCC
GGGTCTGGGACTTGGTTTGATCATGTCGGGTGCCATTCGTGTCCGTGATGACATGCTTCT
CGCAGCTTCTGAAGCGTTGGCAGCTCAAGTCACAGAAGAGAATTTTGCCAACGGTCTGAT
CTACCCGCCATTCTCAAACATCAGAGAGATCTCTGCTAACATTGCGGCCAGTGTCGCCGC
AACAACCTATGACCTCGGATTGGCGTCGAACCTGCCACGTGCAAAGGATCTGGTGAAGTT
TGCAGAGAGCTGCATGTACAGCCCTGTCTACAGAAACTACCGTTAAAAAAAGAAGTGGTG
ATGCAGAAACCTGAAAATTCTTCTTGCATTCACAACCTTGTTGAGGCTTTGTATAAGTGT
TGTTTGTTTGTTTTCTCACTTTCTACTACACTATGATGCTTCGAGCACTCTCTCTTTTGT
CTTTGCTTCTTTGTTTCTGGAATAAATAAAATCCAATCTACCAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D609TF U 1
AF RS1AI65TF U 434
BS 1 646 RS1D609TF

RD RS1D609TF 646 0 0
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CGCAGCTTCTGAAGCGTTGGCAGCTCAAGTCACAGAAGAGAATTTTGCCAACGGTCTGAT
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CTTTGCTTCTTTGTTTCTGGAATAAATAAAATCCAATCTACCAATT

QA 1 646 1 646
DS 

RD RS1AI65TF 213 0 0
G
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AAATTCTTCTTGCATTCACAACCTTGTTGAGGCTTTGTATAAGTGTTGTTTGTTTGTTTT
CTCACTTTCTACTACACTATGATGCTTCGAGCACTCTCTCTTTTGTCTTTGCTTCTTTGT
TTCTGGAATAAATAAAATCCAATCTACCAATT

QA 2 213 2 213
DS 



AS 1 4

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CTGGCTGGAGAGATGCTATCTCCTTTGGTCTCACTCGTCTCTCCCTCTCTTGGTGCAAGA
AGAACATGAACGGTTTGGTTCTGTCTCTAGCTCCAAAACTCGTCAAGCTGCAGACTCTAG
TACTTGACAAAGTTTTGCAGGAAGCTCAAAGTTCTGAATCTTTGTGGTTGTGTGGAAGCT
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TTGGGGTGGTGTGAGAAGATAAGTGATGATGGAGTCATGAGTTTAGCTGATGGCTGTCCT
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TTGGCGAATCGCTGTGTACACTTGAGGTCATTAGGGCTATACTACTGCAGAAACATAACC
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ACTTACCTCACACCTTCAGCGGTTCAAGCGGTCTGCGATACTTTCCCTGCGCTCCACACT
TGTTCAGGCAGGCATTCACTTGTTATGAGTGGTTGTCTGAACTTAACCTCGGTTCATTGT
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TGAACTTGTGTGTAAAGACAAGAGAGACCTCTCTCTCTCACTGGGCATGTGTAAATACAA
GCCCACCCAGAGGTTAAATAAATAAAAGTTTGTTTGTTTGAGTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1ED22TF U 1
AF RS1EW01TF U 1
AF RS1ED22JQ C 366
AF RS1EW01JQ C 505
BS 1 686 RS1ED22TF
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BS 873 873 RS1EW01JQ
BS 874 1124 RS1ED22JQ

RD RS1ED22TF 691 0 0
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CATTACAGAGTCGCAAATAATTCGAAACCCAGAAAAAGAGGCACGAAAGAACACTTTATT
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TCATGAGGATCCTTAACCTTGTTGATGATCGGACGATCATCATTGCTTCTGGTGTTTGCT
CTGGCTGGAGAGATGCTATCTCCTTTGGTCTCACTCGTCTCTCCCTCTCTTGGTGCAAGA
AGAACATGAACGGTTTGGTTCTGTCTCTAGCTCCAAAACTCGTCAAGCTGCAGACTCTAG
TACTTGACAAAGTTTTGCAGGAAGCTCAAAGTTCTGAATCTTTGTGGTTGTGTGGAAGCT
GTATCGGATAATGCATTGCAGGCTATTGGAGAGAACTGTAGTCAAATGCAGTCACTAAAC
TTGGGGTGGTGTGAGAAGATAAGTGATGATGGAGTCATGAGTTTAGCTGATGGCTGTCCT
GATCTAAGAAGCCTTGATCTTTGTGGCTGTGTACTTATTACAGATGAGAGTGTGGTGGCT
TTGGCGAATCGCTGTGTACACTTGAG
TCATT

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1EW01TF 678 0 0
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CATTACAGAGTCGCAAATAATTCGAAACCCAGAAAAAGAGGCACGAAAGAACACTTTATT
CAGAGAATCAAGAAACCGCTTAATAGAGTCAAGTATATAACCGAGGCTCACTTAACCGAG
GCTTTGAGAAGATGGAAGGCATCATGATCACCGAGTGGAAAGACATCCCTGTGGAGCTTC
TCATGAGGATCCTTAACCTTGTTGATGATCGGACGATCATCATTGCTTCTGGTGTTTGCT
CTGGCTGGAGAGATGCTATCTCCTTTGGTCTCACTCGTCTCTCCCTCTCTTGGTGCAAGA
AGAACATGAACGGTTTGGTTCTGTCTCTAGCTCCAAAACTCGTCAAGCTGCAGACTCTAG
TACTTGACAAAGTTTTGCAGGAAGCTCAAAGTTCTGAATCTTTGTGGTTGTGTGGAAGCT
GTATCGGATAATGCATTGCAGGCTATTGGAGAGAACTGTAGTCAAATGCAGTCACTAAAC
TTGGGGTGGTGTGAGAAGATAAGTGATGATGGAGTCATGAGTTTAGCTGATGGCTGTCCT
GATCTAAGAAGCCTTGATCTT*GTGGCTGTGTACTTATTACAGATGAGAGTGTGGTGGCT
TTGGCGAATCGCTGTGTA

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1ED22JQ 759 0 0
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GGATAATGCATTGCAGGCTATTGGAGAGAACTGTAGTCAAATGCAGTCACTAAACTTGGG
GTGGTGTGAGAAGATAAGTGATGATGGAGTCATGAGTTTAGCTGATGGCTGTCCTGATCT
AAGAAGCCTTGATCTTTGTGGCTGTGTACTTATTACAGATGAGAGTGTGGTGGCTTTGGC
GAATCGCTGTGTACACTTGAGGTCATTAGGGCTATACTACTGCAGAAACATAACCGACAG
GGCCGTGTACTCGCTGGCTCAGAGCGGAGTGAAGAACAAACACGAGTTGTGGAGATCAGT
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CCTCACACCTTCAGCGGTTCAAGCGGTTTGCGATACTTTCCCTGCGCTCCACACTTGTTC
AGGCAGGCATTCACTTGTTATGAGTGGTTGTCTGAACTTAACCTCGGTTCATTGTGCTTG
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TTGTGTGTAAAGACAAGAGAGACCTCTCTCTCTCACTGGGCATGTGTAAATACAAGCCCA
CCCAGAGGTTAAATAAATAAAAGTTTGTTTGTTTGAGTT

QA 1 759 1 759
DS 

RD RS1EW01JQ 620 0 0
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GGCTGTGTACTTATTACAGATGAGAGTGTGGTGGCTTTGGCGAATCGCTGTGTACACTTG
AGGTCATTAGGGCTATACTACTGCAGAAACATAACCGACAGGGCCGTGTACTCGCTGGCT
CAGAGCGGAGTGAAGAACAAACACGAGTTGTGGAGATCAGTTAAGAAAGGCAAATTCGAT
GAAGAAGGACTAAGAAGCCTTAACATTAGCCAGTGCACTTACCTCACACCTTCAGCGGTT
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ATGAGTGGTTGTCTGAACTTAACCTCGGTTCATTGTGCTTGCATCCTCCAGGCTCACCGC
GCACACACACACTCTGCTTTACCTCACCCTGCTCATTGAACTTGTGTGTAAAGACAAGAG
AGACCTCTCTCTCTCACTGGGCATGTGTAAATACAAGCCCACCCAGAGGTTAAATAAATA
AAAGTTTGTTTGTTTGAGTT

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 4

CO CL2804Contig1 1224 4 8 U
CGGGAAATTTATATGCATACTATGACCGAAAATTGAAAACAATTTAATGAAACCAACCAA
TTATTACACCATTTTAAAGTTTTATGCTTAGAAGAAAAGGCATCTGATCTGAAAACGCTG
GATCGGAATACTTCCCAGTTAAGATCTGATCCGAAACGAAATGGTTTGCGGCTTCAGTAT
AGTGAATTCCATCCCAGTTTATGTATTCGGAACTGTCGTTGCATGCTTTGGCCGTCACGG
TTGTCCCGTCTAAAACTTTAGTTTGGCCACACGAAATGCGACTATCATAGTTTAAAGGCG
CTCCACCAATTCCACAACATACCATTATAGGGTTTCCAAAACCGAATTGAGAATAGTTAG
CAATAAGATTGGATTTGATCGAGAATATATCAACGTAAGTAACATTTGAATCAGGGAACT
GGGCTTGAAATTTGTTCGAGAGAGCATGCAGTTGAAGATTGAATAGTTTGGCTGCTTGGT
TATGGGAACTAACACATCCAAACTCATCAAGCTTTGTTGAATCTGTCCCAAATTTGGCAA
TATTTTGAGCCAAACATCCTAAAGGTCCTGTGTTGTGTATCCAAAAGTTTCTAGCTCCTT
CTTCATACAGCCTCTTGAGCCCAGCCTCAAAAGTTTCAAGAGTGGAAGGAATAGAGGCAA
GAACTTGGTCAAGAGTCTTGGAGTAAAAGGCACCAGCAAGATCATTTTGCCCTATGTCAA
TCATGTATAGTCCTTTTGCATAATAATCAGATGGTGGCAAGTACCTTTCATATCTCTTTC
CTGTTTTAGCAAGTAGTTCAAGTGCCCGAGATTTGAACCGGATAAATTGAGAGATTTGAA
GATCAAAGGAGAAGGGAGAAACAGAGGTGGGGTTAGCGGGAAGGATGGTGGATCCGGCTG
CTGCAAAGTTACACCCTTTTTTGAAATTTGGTAAACCAAGTGAATCCAAATACGGATTTA
GAAATGGCATGTCCATTGCATCCAATAGAAAATCTACAATAAGGCGCCCGTCACAATATC
TTCCTGAGGGAAGCTTGAAGTAAGTCTGGCCATACGGCGGATAGACACTTTCAATCCCCG
CGGAGATAAGATTGCCCGTATCAGAATTTGAATCCCCAAAGTTGATGATTGCCGGGTATT
TTAGGATTATAGACAGAGTTGAGGGAAAAAAAGAGATGAAGACGAAGAGAGCAACTGAAA
GATTGTTTACAGTGGGAGCCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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ATGCTTAGAAGAAAAGGCATCTGATCTGAAAACGCTGGATCGGAATACTTCCCAGTTAAG
ATCTGATCCGAAACGAAATGGTTTGCGGCTTCAGTATAGTGAATTCCATCCCAGTTTATG
TATTCGGAACTGTCGTTGCATGCTTTGGCCGTCACGGTTGTCCCGTCTAAGACTTTAGTT
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GCATGCAGTTGAAGATTGAATAGTTTGGCTGCTTGGTTATGGGAACTAACACATCCAAAC
TCATCAAGCTTTGTTGAATCTGTCCCAAATTTGGCAATATTTTGAGCCAAACATCCTAAA
GGTCCTGTGTTGTGTATCCAAAAGTTTCTAGCTCCTTCTTCATACAGCCTCTTGAGCCCA
GCCTCAAAAGTTTCAAGAGTGGAAGGAATAGAGGCAAGAACTTGGTCAAGAGTCTTGGAG
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TAATCAGATGGTGG

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DS 

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TTATTACACCATTTTAAAGTTTTATGCTTAGAAGAAAAGGCATCTGATCTGAAAACGCTG
GATCGGAATACTTCCCAGTTAAGATCTGATCCGAAACGAAATGGTTTGCGGCTTCAGTAT
AGTGAATTCCATCCCAGTTTATGTATTCGGAACTGTCGTTGCATGCTTTGGCCGTCACGG
TTGTCCCGTCTAAAACTTTAGTTTGGCCACACGAAATGCGACTATCATAGTTTAAAGGCG
CTCCACCAATTCCACAACATACCATTATAGGGTTTCCAAAACCGAATTGAGAATAGTTAG
CAATAAGATTGGATTTGATCGAGAATATATCAACGTAAGTAACATTTGAATCAGGGAACT
GGGCTTGAAATTTGTTCGAGAGAGCATGCAGTTGAAGATTGAATAGTTTGGCTGCTTGGT
TATGGGAACTAACACATCCAAACTCATCAAGCTTTGTTGAATCTGTCCCAAATTTGGCAA
TATTTTGAGCCAAACATCCTAAAGGTCCTGTGTTGTGTATCCAAAAGTTTCTAGCTCCTT
CTTCATACAGCCTCTTGAGCCCAGCCTCAAAAGTTTCAAGAGTGGAAGGAATAGAGGCAA
GAACTTGGTCAAGAGTCTTGGAGTAAAAGGCACCAGCAAGATCATTTTGCCCTATGTCAA
TCATGTATAGTCCTTTTGCATAATAATCAGATGGTGGCAAGTACCTTTCATATCTCTTTC
CTGTTTTAGCAAGTAGTTCAAGTGCCCGAGATTTGAACCGGATAAATTGAGAGATTTGAA
GATCAAAGGA

QA 1 850 1 850
DS 

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AGGT
CTGTGTTGTGTATCCAAAAGTTTCTAGCTC*TTCTTCATACAGCCTCTTGAGCCCAGCCT
CAAAAGTTTCAAGAGTGGAAGGAATAGAGGCAAGAACTTGGTCAAGAGTCTTGGAGTAAA
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CAGATGGTGGCAAGTACCTTTCATATCTCTTTCCTGTTTTAGCAAGTAGTTCAAGTGCCC
GAGATTTGAACCGGATAAATTGAGAGATTTGAAGATCAAAGGAGAAGGGAGAAACAGAGG
TGGGGTTAGCGGGAAGGATGGTGGATCCGGCTGCTGCAAAGTTACACCCTTTTTTGAAAT
TTGGTAAACCAAGTGAATCCAAATACGGATTTAGAAATGGCATGTCCATTGCATCCAATA
GGAAATCTACAATAAGGCGCCCGTCACAATATCTTCCTGAGGGAAGCTTGAAGTAAGTCT
GGCCATACGGTGGATAGACACTTTCAATCCCCGCGGAGATAAGATTGCCCGTATCAGAAT
TTGAATCCCCAAAGTTGATGATTGCCGGGTATTTTAGGATTATAGACGGAGTTGAGGGAA
AAAAAGAGATGAAGACGAAGAGAGCAACTGAAAGATTGTTTACAGTGGGAGCCATCC

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DS 

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TCTTGGAGTAAAAGGCACCAGCAAGATCATTTTGCCCTATGTCAATCATGTATAGTCCTT
TTGCATAATAATCAGATGGTGGCAAGTACCTTTCATATCTCTTTCCTGTTTTAGCAAGTA
GTTCAAGTGCCCGAGATTTGAACCGGATAAATTGAGAGATTTGAAGATCAAAGGAGAAGG
GAGAAACAGAGGTGGGGTTAGCGGGAAGGATGGTGGATCCGGCTGCTGCAAAGTTACACC
CTTTTTTGAAATTTGGTAAACCAAGTGAATCCAAATACGGATTTAGAAATGGCATGTCCA
TTGCATCCAATAGAAAATCTACAATAAGGCGCCCGTCACAATATCTTCCTGAGGGAAGCT
TGAAGTAAGTCTGGCCATACGGCGGATAGACACTTTCAATCCCCGCGGAGATAAGATTGC
CCGTATCAGAATTTGAATCCCCAAAGTTGATGATTGCCGGGTATTTTAGGATTATAGACA
GAGTTGAGGGAAAAAAAGAGATGAAGACGAAGAGAGCAACTGAAAGATTGTTTACAGTGG
GAGCCATCC

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 4

CO CL2805Contig1 821 4 4 U
GAAACTAACCTTTAGCCAGAAGATCAAACTACATGCAGGTGTCAACAAGCTTGCTTTGTT
GAGTGTTGCCGTTGGTCTTCCGAATGTTGGTCAACACTTTGAGACGTGGAATAAAGGGGT
TCTTGGACCGGTCACACTGAAGGGAGTTAACTCGGGAACATGGGACATGTCGAAATGGAA
ATGGTCCTATAAGATTGGTGTGAAGGGTGAAGCTATGAGTCTTCATACGGACAGTTCCTC
TGTGAGATGGAATCAAGGATCATACGTGGTCAAGAAGCAACCATTGACCTGGTACAAGTC
TATTTTTGCCGCACCAGCAGGAAACGAACCGTTGGCCATAGACATGAACACTATGGGAAA
AGGTCTAGTTTGGATAAACGGTAGAAACATTGGACGTCATTGGCCTGCTTATAAAGCTCA
AGGAAACTGTGGACGTTGCAACTACGCTGGAACATTCGACGCAAAGAAATGCTTGAGTAA
TTGTGGTGAAGCTTCTCAAAGATGGTACCATGTACCACGTTCATGGCTCAAGTCTCAGAA
CGCTATAGTTGTGTTTGAAGAATGGGGTGGTGATCCTTATGGAATCTCACTGGTGAAAAG
AACCTGAAAGCTTCTTCTTGATTTTATCCTGAGTTTTCAAGACAAGTAAGATTGTTCGTC
TCTCTTGGCTCTGCTTTGAAGATAGAGACAGAGCTGGACAACTACAATAATTGAATTGTG
CAGTTACTACAGCATATTATACAACATGTACATTACTGTTTTTTTCTTTTTTGGTCAACT
AAATGTACATTACTGATCATCATAAATACTATTTGAACAGC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EA86TF U 2
AF RS1AN02TF U 1
AF RS1EA86JQ C 232
AF RS1AN02JQ C 71
BS 1 542 RS1AN02TF
BS 543 543 RS1EA86TF
BS 544 815 RS1AN02TF
BS 816 821 RS1AN02JQ

RD RS1EA86TF 752 0 0
G
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TGAGATGGAATCAAGGATCATACGTGGTCAAGAAGCAACCATTGACCTGGTACAAGTCTA
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GTCTAGTTTGGATAAACGGTAGAAACATTGGACGTCATTGGCCTGCTTATAAAGCTCAAG
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GTGGTGAAGCTTCTCAAAGATGGTACCATGTACCACGTTCATGGCTCAAGTCTCAGAACG
CTATATTTGTGTTTGAAGAATGGGGTGGTGATCCTTATGGAATCTCACTGGTGAAAAGAA
CCTGAAAGCTTCTTCTTGATTTTATCCTGAGTTTTCAAGACAAGTAAGATTGTTCGTCTC
TCTTGGCTCTGCTTTGAAGATAGAGACAGAGCTGGACAACTACAATAATTGAATTGTGCA
GTTACTACAGCATATTATACAACATGTACAT

QA 2 752 2 752
DS 

RD RS1AN02TF 821 0 0
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GAGTGTTGCCGTTGGTCTTCCGAATGTTGGTCAACACTTTGAGACGTGGAATAAAGGGGT
TCTTGGACCGGTCACACTGAAGGGAGTTAACTCGGGAACATGGGACATGTCGAAATGGAA
ATGGTCCTATAAGATTGGTGTGAAGGGTGAAGCTATGAGTCTTCATACGGACAGTTCCTC
TGTGAGATGGAATCAAGGATCATACGTGGTCAAGAAGCAACCATTGACCTGGTACAAGTC
TATTTTTGCCGCACCAGCAGGAAACGAACCGTTGGCCATAGACATGAACACTATGGGAAA
AGGTCTAGTTTGGATAAACGGTAGAAACATTGGACGTCATTGGCCTGCTTATAAAGCTCA
AGGAAACTGTGGACGTTGCAACTACGCTGGAACATTCGACGCAAAGAAATGCTTGAGTAA
TTGTGGTGAAGCTTCTCAAAGATGGTACCATGTACCACGTTCATGGCTCAAGTCTCAGAA
CGTTATAGTTGTGTTTGAAGAATGGGGTGGTGATCCTTATGGAATCTCACTGGTGAAAAG
AACCTGAAAGCTTCTTCTTGATTTTATCCTGAGTTTTCAAGACAAGTAAGATTGTTCGTC
TCTCTTGGCTCTGCTTTGAAGATAGAGACAGAGCTGGACAACTACAATAATTGAATTGTG
CAGTTACTACAGCATATTATACAACATGTACATTACTGTTTTTTTCTTTTTTGGTCAACT
AAATGTACATTACTGATCATCATAAATACTATTTG
AACAGC

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DS 

RD RS1EA86JQ 584 0 0
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GTACAAGTCTATTTTTGCCGCACCAGCAGGAAACGAACCGTTGGCCATAGACATGAACAC
TATGGGAAAAGGTCTAGTTTGGATAAACGGTAGAAACATTGGACGTCATTGGCCTGCTTA
TAAAGCTCAAGGAAACTGTGGACGTTGCAACTACGCTGGAACATTCGACGCAAAGAAATG
CTTGAGTAATTGTGGTGAAGCTTTTCAAAGATGGTACCATGTACCACGTTCATGGCTCAA
GTCTCAGAACGCTATATTTGTGTTTGAAGAATGGGGTGGTGATCCTTATGGAATCTCACT
GGTGAAAAGAACCTGAAAGCTTCTTCTTGATTTTATCCTGAGTTTTCAAGACAAGTAAGA
TTGTTCGTCTCTCTTGGCTCTGCTTTGAAGATAGAGACAGAGCTGGACAACTACAATAAT
TGAATTGTGCAGTTACTACAGCATATTATACAACATGTACATTACTGTTTTTTTCTTTTT
TGGTCAACTAAATGTACATTACTGATCATCATAAATACTATTTG

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DS 

RD RS1AN02JQ 751 0 0
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GTCACACTGAAGGGAGTTAACTCGGGAACATGGGACATGTCGAAATGGAAATGGTCCTAT
AAGATTGGTGTGAAGGGTGAAGCTATGAGTCTTCATACGGACAGTTCCTCTGTGAGATGG
AATCAAGGATCATACGTGGTCAAGAAGCAACCATTGACCTGGTACAAGTCTATTTTTGCC
GCACCAGCAGGAAACGAACCGTTGGCCATAGACATGAACACTATGGGAAAAGGTCTAGTT
TGGATAAACGGTAGAAACATTGGACGTCATTGGCCTGCTTATAAAGCTCAAGGAAACTGT
GGACGTTGCAACTACGCTGGAACATTCGACGCAAAGAAATGCTTGAGTAATTGTGGTGAA
GCTTCTCAAAGATGGTACCATGTACCACGTTCATGGCTCAAGTCTCAGAACGTTATAGTT
GTGTTTGAAGAATGGGGTGGTGATCCTTATGGAATCTCACTGGTGAAAAGAACCTGAAAG
CTTTTTCTTGATTTTATCCTGAGTTTTCAAGACAAGTAAGATTGTTCGTCTCTCTTGGCT
CTGCTTTGAAGATAGAGACAGAGCTGGACAACTACAATAATTGAATTGTGCAGTTACTAC
AGCATATTATACAACATGTACATTACTGTTTTTTTCTTTTTTGGTCAACTAAATGTACAT
TACTGATCATCATAAATACTATTTGAACAGC

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 4

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CATTGTCTTATTGGATCTCCAATGAAGATCTCAACAGTGGAGTGTACTTATTCAAGAAAA
AAAAATCACAGTACAAGAAAAAAGAGAGATAGTTTAGTTTCTTTTCAAGGCCGGAGATGC
AAGAAACGTGATGATCATCAGTATCCCCAGTAGTCGTTACGGATTTCGTCATCAAACTTC
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CTGCGAGCCTCGTCGGTGACAAGGACCTTAGCCATCCCTTCCCAATCTATAGTCCTCGAC
GCTTTGAATGCCACATCCGCTACTTTCTTTCCTGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 

AF RS1E805TF C 1
AF RS1E805JQ U 21
AF RS1BO87TF C 23
AF RS1BO87JQ U 31
BS 1 29 RS1E805TF
BS 30 208 RS1E805JQ
BS 209 209 RS1BO87JQ
BS 210 693 RS1E805JQ
BS 694 698 RS1BO87JQ

RD RS1E805TF 697 0 0
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AAAAATCACAGTACAAGAAAAAAGAGAGATAGTTTAGTTTCTTTTCAAGGCCGGAGATGC
AAGAAACGTGATGATCATCAGTATCCCCGGTAGTCGTTACGGATTTCGTCATCAAACTTC
TTTTTGAGTTCTGGGTGCTTCTCAAAGTACTCATCTGCAGTCATCGTGCTGAGCTTTTTG
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CTGCGAGCCTCGTCGGTGACAAGGACCTTAGCCATCCCTTCCCAATCTATAGTCCTCGAC
GCTTTGAATGCCACATCCGCTACTTTCTTTCCT
GCCC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RS1E805JQ 673 0 0
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TAGTTTAGTTTCTTTTCAAGGCCGGAGATGCAAGAAACGTGATGATCATCAGTATCCCCG
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AGCATCAAATTTTGGCTTGTATTCAGGGGTAACATTGTCCACGTACTTGGGAATCTCAAC
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TCCT

QA 10 673 10 673
DS 

RD RS1BO87TF 676 0 0
TTTTTTT
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TAGTTTAGTTTCTTTTCAAGGCCGGAGATGCAAGAAACGTGATGATCATCAGTATCCCCA
GTAGTCGTTACGGATTTCGTCATCAAACTTCTTTTTGAGTTCTGGGTGCTTCTCAAAGTA
CTCATCTGCAGTCATCGTGCTGAGCTTTTTGCTTATCTCTTGGACATCAATAATTTCTTT
CTCCAGCCGTTCAGACTCCTTGAGCGACTTCTGTTCTGCTTCTTTCAGTTCCACCAACAA
AGCATCAAATTTTGGCTTGTATTCAGGGGTAACATTGTCCACGTACTTGGGAATCTCAAC
GCTGTCATAAGCTTCCTTGTACATGTCAACAATGCCAGATCCAATACCCTTTCTGTAGAA
ATCCCAATCAATAGGTTCAGGCTCCTGGCTGAACTTGGTTTGGAGCTGAGTGTTGACCTC
GTCGAAAGCGCGACGGAGGTTGGAGAACTCTCTGCGAGCCTCGTCGGTGACAAGGACCTT
AGCCATCCCTTCCCAATCTATAGTCCTCGACGCTTTGAATGCCACATCCGCTACTTTCTT
TCCT
GCTCC

QA 8 671 8 671
DS 

RD RS1BO87JQ 668 0 0
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TCAACAGTGGAGTGTACTTATTCAAGAAAAAAAAATCACAGTACAAGAAAAAAGAGAGAT
AGTTTAGTTTCTTTTCAAGGCCGGAGATGCAAGAAACGTGATGATCATCAGTATCCCCAG
TAGTCGTTACGGATTTCGTCATCAAACTTCTTTTTGAGTTCTGGGTGCTTCTCAAAGTAC
TCATCTGCAGTCATCGTGCTGAGCTTTTTGCTTATCTCTTGGACATCAATAATTTCTTTC
TCCAGCCGTTCAGACTCCTTGAGCGACTTCTGTTCTGCTTCTTTCAGTTCCACCAACAAA
GCATCAAATTTTGGCTTGTATTCAGGGGTAACATTGTCCACGTACTTGGGAATCTCAACG
CTGTCATAAGCTTCCTTGTACATGTCAACAATGCCAGATCCAATACCCTTTCTGTAGAAA
TCCCAATCAATAGGTTCAGGCTCCTGGCTGAACTTGGTTTGGAGCTGAGTGTTGACCTCG
TCGAAAGCGCGACGGAGGTTGGAGAACTCTCTGCGAGCCTCGTCGGTGACAAGGACCTTA
GCCATCCCTTCCCAATCTATAGTCCTCGACGCTTTGAATGCCACATCCGCTACTTTCTTT
CCTGCTCC

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 4

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ACAGATGGCCTAAGTCTGTTATCGACAGACTCGATCTCGTGTTCCTAGACACGCCTTTTC
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AATTCAACAAGGAGTTCACTGAGTATGAGAATTTTGAGAACTGTTTAGAGTATTTGGAAG
ATCGTATGATCAAGCTTGGTCCCTTTGATGGTCTCATTGGCTTCTCTCAGGGGGGAATGT
TGTCTGGGGGCTTACCAGGACTGCAAGCTAAGGGACTTGCACTCCAGAAAGTGCCAAAGA
TCAAGTTTATCATCATTATTGGAGGAGCTATGTTTAGATCTACCGAGGTTGTGGAGGATG
CTCATTCGCCTTCCATTGATACTCCCTCCCTACACTTTCTAGGAGAGACTGATTTCTTGA
AACCTTACGGAATCAAGCTGATAGAGTCGTTCAAGAATCCGGTGGTAGTCCATCATCCCA
AAGGCCACACGGTCCCCAGGCTTGATGAGAAGAGCTTGGTGAAAGTCACGGCGTTCCTCG
AGACCATAGAGAACCTGGTGATGATGGAGGATGAAGACAAGGATGGTGAAGAAATCAATT
GTACGCCAATATAGAACTTATCTTATACTGCTATAAGATATAACGAATAATTCTTTACGA
AATAATTCTTTAGAATATAATCCGTAAAATGACTGTAAATGATTGTTAAAAGTCATTATT
ACCACACACACAATAATAATATATATAGACATTTCATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DA34TF U 1
AF RS1AD36JQ C 183
AF RS1AD36TF U 183
AF RS1DA34JQ C 287
BS 1 230 RS1DA34TF
BS 231 231 RS1AD36TF
BS 232 247 RS1DA34TF
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BS 463 463 RS1AD36TF
BS 464 542 RS1DA34TF
BS 543 543 RS1AD36TF
BS 544 657 RS1DA34TF
BS 658 876 RS1AD36TF
BS 877 939 RS1DA34JQ

RD RS1DA34TF 657 0 0
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CTTATTCGCCTTCCATTGATACTCCCTCCCTACACTTTCTAGGAGAGACTGATTTCTTGA
AACCTTACGGAATCAAGCTGATAGAGTCGTTCAAGAATCCGGTGGTAGTCCATCATC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RS1AD36JQ 694 0 0
G
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AGTTTATCATCATTATTGGAGGAGCTATGTTTAGATCTACCGAGGTTGTGGCGGATGCTC
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CTTACGGAATCAAGCTGATAGAGTCGTTCAAGAATCCGGTGGTAGTCCATCATCCCAAAG
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DS 

RD RS1AD36TF 694 0 0
G
GATGGCCTAAGTCTGTTATCGACAGACTCGATCTCGTGTTCCTAGACACGCCTTTTCCTT
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TCAACAAGGAGTTCACTGAGTATGAGAATTTTGAGAACTGTTTAGAGTATTTGGAAGATC
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CTGGGGGCTTACCAGGACTGCAAGCTAAGGGACTTGCACTCCAGAAAGTGCCAAAGATCA
AGTTTATCATCATTATTGGAGGAGCTATGTTTAGATCTACCGAGGTTGTGGCGGATGCTC
ATTCGCCTTCCATTGATACTCCCTCCCTACACTTTCTAGGAGAGACTGATTTCTTGAAAC
CTTACGGAATCAAGCTGATAGAGTCGTTCAAGAATCCGGTGGTAGTCCATCATCCCAAAG
GCCACACGGTCCCCAGGCTTGATGAGAAGAGCTTGGTGAAAGTCACGGCGTTCCTCGAGA
CCATAGAGAACCTGGTGATGATGGAGGATGAAGACAAGGATGGTGAAGAAATCAATTGTA
CGCCAATATAGAACTTATCTTATACTGCTATAAGATATAACGAATAATTCTTTACGAAAT
AATTCTTTAGAATATAATCCGTAAAATGACTGT

QA 2 694 2 694
DS 

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TGAAGAAATCAATTGTACGCCAATATAGAACTTATCTTATACTGCTATAAGATATAACGA
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TAAAAGTCATTATTACCACACACACAATAATAATATATATAGACATTTCATTC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 4

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TTATTTGTTAAGGGAAAAATTAAACTGAGCTCTAGTCATGGCAAAGATCTCCTTATTGCT
TTTCGTCATGGCCCTTGTTGCCTCTCTCCACGCTTATGAAGCTCACCGCATGGGAAAATT
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AAA*CAAGAAACCTGCACCACCTGCAAAAAACAAGAAACCTGCACCACCTGCAAAAAA*C
AAGAAACCTGCATCACCTGCAAAAGACAAGAAACCTGCATCCGTAATCCAAACGATCTTG
CAGGATTTTGGGCTAAACGGAGGGAGGGATTGACAAAACATAATAATCAGGGTCTGATTA
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AGAGGAGCAAATAATTCCCCACATAGTATATAAGTTGCGTTGCTGTCATTTTGTAATTAA
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ATTTTTT


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1BW45TF U 331
AF RS1GH84TF U 4
AF RS1GD04TF U 1
AF RS1CC71TF U 1
BS 1 169 RS1CC71TF
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BS 171 346 RS1CC71TF
BS 347 347 RS1GD04TF
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RD RS1BW45TF 400 0 0
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AAAAAATGTCACGAAAGCACAACCTGCAAAAAA*CAATAAACCTGCACCACCTGCAAAAA
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TTATATACGACTAAA

QA 1 385 1 385
DS 

RD RS1GH84TF 702 0 0
G
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QA 2 702 2 702
DS 

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CAAGAAACCTGCACCACCTGCAAAAAACAAGAAACCTGCACCACCTGCAAAAAA*CAAGA
AACCTGCATCACCTGCAAAAGACAAGAAACCTGCATCCGTAATCCAAACGATCTTGCAGG
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QA 5 745 5 745
DS 

RD RS1CC71TF 787 0 0
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AAA*CAAGAAACCTGCACCACCTGCAAAAAACAAGAAACCTGCACCACCTGCAAAAAA*C
AAGAAACCTGCATCACCTGCAAAAGACAAGAAACCTGCATCCGTAATCCAAACGATCTTG
CAGGATTTTGGGCTAAACGGAGGGAGGGATTGACAAAACATAATAATCAGGGTCTGATTA
GTGTTTTGAGTGAGTTTTAAGGAGTATTGAACTTGTTCATGGAGTTTAGCTTTACAAGTG
AGAGGAGCAAATAATTCCCCACATAGTATATAAGTTGCGTTGCTGTCATTTTGTA*TTAA
TAATACGACTAAATGAAATATTATAACTACTTATGATATCATAATATGTTTTTATGCGAT
ATTTTTT

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 3

CO CL2809Contig1 1059 3 6 U
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AATCAAACTTATTAGGTGAAGACACAAAAATCAAACATAAAGTGATATGGATCAATATCT
CATATATATGTGTATATTCTGTGCGTGCGTGTGTGTCTCTTCCTCAGTACTCTCTGGCCT
TATTTTGTAAGACCAAGCATAAAGAGAACAAGCTTGAAGTAAGCTTCACGAAACGCGAGT
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AAGCTTCCTTCCATTATTGCCTTCTCGTGACTGAAACATTCGAATGAGTATTTCCCGTGA
TACCTTCCTATTCCACTCTCTCCCACTCCTCCAAAGGGTAACGCATCACACATATACTGG
ATCATGACGTCGTTGAAAGTAACACTTCCGGAAGATGTTTCTGACAAGATTCTAGTTTTA
AGGTTCTCGTCTTTGGTGAATGCATAAATGGCAAGTGGTTTTGGTTTTGACTTGATGAAC
CCTATGCTTTCTTGGATGTCACGTAATGTGATAATAGGGAGAATTGGGCCAAATATTTCT
CCATTCATTATCTCAGAATCAAGAGGAGGATTCGACAAGATCGTTGGCTCAATATACAGC
TTCTCTTCATCCATGGAGCCGCCATAAACGATTGAAGCTTGAACACCAGGATCATTAAGA
AGACGAGCCAATCTCTGAAAGTGTTTCTTGGTAACAATCCTAGAGAGACATCCAGATTCT
TTAGGGTTTTCCCCAAAGAAAGACCTTATCATCGGCTTCAACATTTCAATCAGAGAAGAC
GCAAAACTCTGTTCTACAAGAACGTAATCTACGGAGATACAAGCTTGTCCACTGCAAGAA
CCCCACTTCCCTCCAGAGATTCTCTTCACAACAGACTTCATGTCCTTTAAAACAGAGTGG
TGATCAACAATGGTGGGACATTTTCCACCAAGCTCTAATGTCACTGGAGTCAAATGCTCT
GCAGCTGCAGCCATTATGATTTTTCCAATCCTTGGACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FQ86JQ U 1
AF RS1GA91JQ U 35
AF RS1GA91TF C 545
BS 1 110 RS1FQ86JQ
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RD RS1FQ86JQ 622 0 0
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AATCAAACTTATTAGGTGAAGACACAAAAATCAAACATAAAGTGATATGGGTCAATATCT
CATATATATGTGTATATTCTGTGCGTGCGTGTGTGTCTCTTCCTCAGTACTCTCTGGCCT
TATTTTGTAAGACCAAGCATAAAGAGAACAAGCTTGAAGTAAGCTTCACGAAACGCGAGT
CTAAAAAAGGTGAGCTTGAAGCTGTTCCATGGAGGGTATCGAGCTTCAAGATCCGCTGCT
AAGCTTCCTTCCATTATTGCCTTCTCGTGACTGAAACATTCGAATGAGTATTTCCCGTGA
TACCTTCCTATTCCACTCTCTCCCACTCCTCCAAAGGGTAACGCATCACACATATACTGG
ATCATGACGTCGTTGAAAGTAACACTTCCGGAAGATGTTTCTGACAAGATTCTAGTTTTA
AGGTTCTCGTCTTTGGTGAATGCATAAATGGCAAGTGGTTTTGGTTTTGACTTGATGAAC
CCTATGCTTTCTTGGATGTCACGTAATGTGATAATAGGGAGAATTGGGCCAAATATTTCT
TCATTCATTATCTCAGAATCAA

QA 1 622 1 622
DS 

RD RS1GA91JQ 571 0 0
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ACATAAAGTGATATGGATCAATATCTCATATATATGTGTATATTCTGTGCGTGCGTGTGT
GTCTCTTCCTCAGTACTCTCTGGCCTTATTTTGTAAGACCAAGCATAAAGAGAACAAGCT
TGAAGTAAGCTTCACGAAACGCGAGTCTAAGAAAGGTGAGCTTGAAGCTGTTCCATGGAG
GGTATCGAGCTTCAAGATCCGCTGCTAAGCTTCCTTCCATTATTGCCTTCTCGTGACTGA
AACATTCGAATGAGTATTTCCCGTGATACCTTCCTATTCCACTCTCTCCCACTCCTCCAA
AGGGTAACGCATCACACATATACTGGATCATGACGTCGTTGAAAGTAACACTTCCGGAAG
ATGTTTCTGACAAGATTCTAGTTTTAAGGTTCTCGTCTTTGGTGAATGCATAGATGGCAA
GTGGTTTTGGTTTTGACTTGATGAACCCTATGCTTTCTTGGATGTCACGTAATGTGATAA
TAGGGAGAATTGGGCCAAATATTTCTCCATT

QA 1 571 1 571
DS 

RD RS1GA91TF 515 0 0
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TCATTATCTCAGAATCAAGAGGAGGATTCGACAAGATCGTTGGCTCAATATACAGCTTCT
CTTCATCCATGGAGCCGCCATAAACGATTGAAGCTTGAACACCAGGATCATTAAGAAGAC
GAGCCAATCTCTGAAAGTGTTTCTTGGTAACAATCCTAGAGAGACATCCAGATTCTTTAG
GGTTTTCCCCAAAGAAAGACCTTATCATCGGCTTCAACATTTCAATCAGAGAAGACGCAA
AACTCTGTTCTACAAGAACGTAATCTACGGAGATACAAGCTTGTCCACTGCAAGAACCCC
ACTTCCCTCCAGAGATTCTCTTCACAACAGACTTCATGTCCTTTAAAACAGAGTGGTGAT
CAACAATGGTGGGACATTTTCCACCAAGCTCTAATGTCACTGGAGTCAAATGCTCTGCAG
CTGCAGCCATTATGATTTTTCCAATCCTTGGACTC

QA 1 515 1 515
DS 



AS 2 4

CO CL2810Contig1 477 2 2 U
AAAAAGCTTTATCTAACTATTCATTTGCATCCAAGTTCACCTTTAATATAATAACTGTTA
AATTCCCCCAAAAAATACAAATGATGGCCTTACACGGCATAATTTACATAGTCCCAGGGG
AAAAAAAAAAAAAGGGGCAAACCCTGTGATTCTACCACACCTTAAAACCTACAAAAAATA
TTTCATTCTTTCGTCTCTCCTCATTGCATTATACACCGCTTGTACCTGTTCGCTAGAAAC
AACTCGAATAGGGCCAATATTCACCGACACATATTTGCCTTTGCTTGATAATGTCTGCTT
TACACAATCCAAAGGGATTTGACGTTCAATAACAGACTCAACAGCAACAACCATAGCATG
CACAAAGTCATCGCCACCAGTCCCGATCGCAGTAAACCCTCGATCTGTTGGGTAAGTATT
GACCTTTTGGTCAAGTAGGAGCCAGTCTCGAGCAGAATCGTCAGCCACAGTGCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1BH17JQ U 1
AF RS1D391JQ U 112
BS 1 474 RS1BH17JQ
BS 475 477 RS1D391JQ

RD RS1BH17JQ 474 0 0
AAAAAGCTTTATCTAACTATTCATTTGCATCCAAGTTCACCTTTAATATAATAACTGTTA
AATTCCCCCAAAAAATACAAATGATGGCCTTACACGGCATAATTTACATAGTCCCAGGGG
AAAAAAAAAAAAAGGGGCAAACCCTGTGATTCTACCACACCTTAAAACCTACAAAAAATA
TTTCATTCTTTCGTCTCTCCTCATTGCATTATACACCGCTTGTACCTGTTCGCTAGAAAC
AACTCGAATAGGGCCAATATTCACCGACACATATTTGCCTTTGCTTGATAATGTCTGCTT
TACACAATCCAAAGGGATTTGACGTTCAATAACAGACTCAACAGCAACAACCATAGCATG
CACAAAGTCATCGCCACCAGTCCCGATCGCAGTAAACCCTCGATCTGTTGGGTAAGTATT
GACCTTTTGGTCAAGTAGGAGCCAGTCTCGAGCAGAATCGTCAGCCACAGTGCC

QA 1 474 1 474
DS 

RD RS1D391JQ 366 0 0
TCC
CAGTGGAAAAAAAAGAAAAGGGGCAAACCCTGTGATTCTACCACACCTTAAAACCTACAA
AAAATATTTCATTCTTTCGTCTCTCCTCATTGCATTATACACCGCTTGTACCTGTTCGCT
AGAAACAACTCGAATAGGGCCAATATTCACCGACACATATTTGCCTTTGCTTGATAATGT
CTGCTTTACACAATCCAAAGGGATTTGACGTTCAATAACAGACTCAACAGCAACAACCAT
AGCATGCACAAAGTCATCGCCACCAGTCCCGATCGCAGTAAACCCTCGATCTGTTGGGTA
AGTATTGACCTTTTGGTCAAGTAGGAGCCAGTCTCGAGCAGAATCGTCAGCCACAGTGCC
TCC

QA 4 366 4 366
DS 



CO CL2810Contig2 767 2 1 U
GGAAGCTTTGAATTAAAAAAGGGAATGGCTTGCAAAACGATCCTGCGCTCTGTTTTCCCA
TCGACTTCCGCCGCAACCAGATGCTTCTTCTTCTTCTTCCCTCCTTGTCTCTCGACGGTC
CGTGGTTTGTTCCCGGCGGCAAAGAGTCTAAGTTTCAATAGTTTTGCCTCTGTCCCTCGT
CTCAACTGCACTCTCAATAACGATGAATCCGAGCAAGGCCCGCCTCAAGAAGCTGTTCTC
AAGGCCATTTCAGAAGTGTCCAAGACTGATGGCAGAGTTGGGAAAACAACTAACATGATT
ATCGGAGGCACTGTGGCTGACGATTCTGCTCGAGACTGGCTCCTACTTGACCAAAAGGTC
AATACTTACCCAACAGATCGAGGGTTTACTGCGATCGGGACTGGTGGCGATGACTTTGTG
CATGCTATGGTTGTTGCTGTTGAGTCTGTTATTGAACGTCAAATCCCTCTGGATTGTGTA
AAGCAGACATTATCAAGCAAAGGCAAATATGTGTCGGTGAATATTGGCCCTATTCGAGTT
GTCTCTAGCGAACAGGTACAAGCGGTGTATAATGCAATGAGGAGAGACGAAAGAATGAAA
TATTTCTTGTAGGTTTTAAGGTGTGGTAGAATCACAGGGTCTGCCCCTCTTCTCTCTTTT
CCACTGCGACTATGTAAATTATGCCGTGTAAGCCATCATTTGTATTTTCTGGGAGAATTT
AACAGTTATTATATTAAAGTGAACTTGGATGCAAATGAATAGTTAGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1BH17TF U 1
AF RS1D391TF U 1
BS 1 767 RS1BH17TF

RD RS1BH17TF 767 0 0
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TCGACTTCCGCCGCAACCAGATGCTTCTTCTTCTTCTTCCCTCCTTGTCTCTCGACGGTC
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CTCAACTGCACTCTCAATAACGATGAATCCGAGCAAGGCCCGCCTCAAGAAGCTGTTCTC
AAGGCCATTTCAGAAGTGTCCAAGACTGATGGCAGAGTTGGGAAAACAACTAACATGATT
ATCGGAGGCACTGTGGCTGACGATTCTGCTCGAGACTGGCTCCTACTTGACCAAAAGGTC
AATACTTACCCAACAGATCGAGGGTTTACTGCGATCGGGACTGGTGGCGATGACTTTGTG
CATGCTATGGTTGTTGCTGTTGAGTCTGTTATTGAACGTCAAATCCCTCTGGATTGTGTA
AAGCAGACATTATCAAGCAAAGGCAAATATGTGTCGGTGAATATTGGCCCTATTCGAGTT
GTCTCTAGCGAACAGGTACAAGCGGTGTATAATGCAATGAGGAGAGACGAAAGAATGAAA
TATTTCTTGTAGGTTTTAAGGTGTGGTAGAATCACAGGGTCTGCCCCTCTTCTCTCTTTT
CCACTGCGACTATGTAAATTATGCCGTGTAAGCCATCATTTGTATTTTCTGGGAGAATTT
AACAGTTATTATATTAAAGTGAACTTGGATGCAAATGAATAGTTAGA

QA 1 767 1 767
DS 

RD RS1D391TF 764 0 0
GGAAGCTTTGAATTAAAAAAGGGAATGGCTTGCAAAACGATCCTGCGCTCTGTTTTCCCA
TCGACTTCCGCCGCAACCAGATGCTTCTTCTTCTTCTTCCCTCCTTGTCTCTCGACGGTC
CGTGGTTTGTTCCCGGCGGCAAAGAGTCTAAGTTTCAATAGTTTTGCCTCTGTCCCTCGT
CTCAACTGCACTCTCAATAACGATGAATCCGAGCAAGGCCCGCCTCAAGAAGCTGTTCTC
AAGGCCATTTCAGAAGTGTCCAAGACTGATGGCAGAGTTGGGAAAACAACTAACATGATT
ATCGGAGGCACTGTGGCTGACGATTCTGCTCGAGACTGGCTCCTACTTGACCAAAAGGTC
AATACTTACCCAACAGATCGAGGGTTTACTGCGATCGGGACTGGTGGCGATGACTTTGTG
CATGCTATGGTTGTTGCTGTTGAGTCTGTTATTGAACGTCAAATCCCTCTGGATTGTGTA
AAGCAGACATTATCAAGCAAAGGCAAATATGTGTCGGTGAATATTGGCCCTATTCGAGTT
GTCTCTAGCGAACAGGTACAAGCGGTGTATAATGCAATGAGGAGAGACGAAAGAATGAAA
TATTTCTTGTAGGTTTTAAGGTGTGGTAGAATCACAGGGTCTGCCCCTCTTCTCTCTTTT
CCACTGCGACTATGTAAATTATGCCGTGTAAGCCATCATTTGTATTTTCTGGGAGAATTT
AACAGTTATTATATTAAAGTGA*CTTGGATGCAA*TGAATAGTT

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 3

CO CL2811Contig1 925 3 2 U
TCTTGAGAAGTTTTATAAGATAATAAGCATCAGATCACAAGCACCAGCATAACCAGATCA
GCTAAAACAAAGTAATGGTCGTAATAATGCTACAGACAGACAACGACTTGAACCAAATCA
TACAAAATCAAAATCAGGGGTACAAATGTCGTCTCTTTACTGCACGAGTTTTCTCAAAAC
GGACTCTGCGCGGTGCTCGAATCCGGGTAAAGCCCATTCATGTCGAATAATGTCGAGACC
ATCCTTCTCAGCGCCCAAGCTCTTTGATGCATCAAAACCAAATCCACCACCCATTTGCAT
CATTCGTTGTGTATCATCAATAGCATTTTCATCTCCAAGAATGAGACTAAATAAGCCTCT
TAGTCCGAACAAGTTCAAGAAGTACCATGAGCGGCTGCTGACATAGCTAACATCAACAGT
GCTCAAGTCAATCCCGTTCTGTAGCATAGACCTGAACCTCTGAGTCAGTGGAAATGGTAT
TTTGGCTGCCACAAACCCAGAGAAGAAGAAGTTGACCCATGCATAAGTGAGTGTCTGTGG
AATAATCATAGAAAGATTTTTCTTCATCATATCCATGGCCATGTTGGGATCAGAAAACAT
CTGAGCTTGTGGGTTTTGAGCTTGGTCCTTAGGCACATGTAGCAATCCATTTTCCTCGTT
GCTGAAGTAGAATCTCCGAGCTCGGAAGGACTTGGGCGGGATGAAATTGGCGCCGGCCTT
CAGATTCCGAGCCCTAATTACAACTTGCCCTTCTTTGACGATTTTCGCGTCGGGAGTTGG
AGACGAACGCATGAACTTGGAGACGAAGTATCGGAGAACACCGATCAGAACCATCACTAC
GGAGAGAGGGATCAGAACCCAGTCTCTGATCGCCGTGTCTAGTATCAGATCTTCCGCCAT
TTGAGTAATTCTCTTGAGTTTTCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1F414JQ U 1
AF RS1DV59JQ U 1
AF RS1DV59TF C 190
BS 1 670 RS1DV59JQ
BS 671 925 RS1DV59TF

RD RS1F414JQ 314 0 0
TCTTGAGAAGTTTTATAAGATAATAAGCATCAGATCACAAGCACCAGCATAACCAGATCA
GCTAAAACAAAGTAATGGTCGTAATAATGCTACAGACAGACAACGACTTGAACCAAATCA
TACAAAATCAAAATCAGGGGTACAAATGTCGTCTCTTTACTGCACGAGTTTTCTCAAAAC
GGACTCTGCGCGGTGCTCGAATCCGGGTAAAGCCCATTCATGTTGAATAATGTCGAGACC
ATCCTTCTCAGCGCCCAAGCTCTTTGATGCATCAAAACCAAATCCACCACCCATTTGCAT
CATTCGTTGTG
GAT

QA 1 311 1 311
DS 

RD RS1DV59JQ 670 0 0
TCTTGAGAAGTTTTATAAGATAATAAGCATCAGATCACAAGCACCAGCATAACCAGATCA
GCTAAAACAAAGTAATGGTCGTAATAATGCTACAGACAGACAACGACTTGAACCAAATCA
TACAAAATCAAAATCAGGGGTACAAATGTCGTCTCTTTACTGCACGAGTTTTCTCAAAAC
GGACTCTGCGCGGTGCTCGAATCCGGGTAAAGCCCATTCATGTCGAATAATGTCGAGACC
ATCCTTCTCAGCGCCCAAGCTCTTTGATGCATCAAAACCAAATCCACCACCCATTTGCAT
CATTCGTTGTGTATCATCAATAGCATTTTCATCTCCAAGAATGAGACTAAATAAGCCTCT
TAGTCCGAACAAGTTCAAGAAGTACCATGAGCGGCTGCTGACATAGCTAACATCAACAGT
GCTCAAGTCAATCCCGTTCTGTAGCATAGACCTGAACCTCTGAGTCAGTGGAAATGGTAT
TTTGGCTGCCACAAACCCAGAGAAGAAGAAGTTGACCCATGCATAAGTGAGTGTCTGTGG
AATAATCATAGAAAGATTTTTCTTCATCATATCCATGGCCATGTTGGGATCAGAAAACAT
CTGAGCTTGTGGGTTTTGAGCTTGGTCCTTAGGCACATGTAGCAATCCATTTTCCTCGTT
GCTGAAGTAG

QA 1 670 1 670
DS 

RD RS1DV59TF 736 0 0
GCG
GTGCTCGAATCCGGGTAAAGCCCATTCATGTCGAATAATGTCGAGACCATC*TTCTCAGC
GCCCAAGCTCTTTGATGCATCAAAACCAAATCCACCACCCATTTGCATCATTCGTTGTGT
ATCATCAATAGCATTTTCATCTCCAAGAATGAGACTAAATAAGCCTCTTAGTCCGAACAA
GTTCAAGAAGTACCATGAGCGGCTGCTGACATAGCTAACATCAACAGTGCTCAAGTCAAT
CCCGTTCTGTAGCATAGACCTGAACCTCTGAGTCAGTGGAAATGGTATTTTGGCTGCCAC
AAACCCAGAGAAGAAGAAGTTGACCCATGCATAAGTGAGTGTCTGTGGAATAATCATAGA
AAGATTTTTCTTCATCATATCCATGGCCATGTTGGGATCAGAAAACATCTGAGCTTGTGG
GTTTTGAGCTTGGTCCTTAGGCACATGTAGCAATCCATTTTCCTCGTTGCTGAAGTAGAA
TCTCCGAGCTCGGAAGGACTTGGGCGGGATGAAATTGGCGCCGGCCTTCAGATTCCGAGC
CCTAATTACAACTTGCCCTTCTTTGACGATTTTCGCGTCGGGAGTTGGAGACGAACGCAT
GAACTTGGAGACGAAGTATCGGAGAACACCGATCAGAACCATCACTACGGAGAGAGGGAT
CAGAACCCAGTCTCTGATCGCCGTGTCTAGTATCAGATCTTCCGCCATTTGAGTAATTCT
CTTGAGTTTTCCC

QA 4 736 4 736
DS 



AS 1 2

CO CL2812Contig1 1219 2 8 U
ATATAAAACTGTATTGAATATTGATTGTATGATTGTATACCTCTGATCCCACTACAATGG
ACAAAAACGTAGAAACATGAATTCACGAGCCATATAAATGATAAAACAAACGCAAGTCCC
CGCCTGCAGGGGTCTCCCAAAGTTAAACCTTTATGAGACGTAGTAGCATTACGAAATGAT
CTTTTCAACACACAACAACTGCAACAAAATTATGGAGATGGTCATTAGTCATCACCAAAC
AGACCGGTTTTTAACAGCAATCCCAGTGCCTTCTTTCTTGCCTCTGCTTCCTCCATAATC
AACGGTCCATTTCTCAAATGTACAGTTCACAAAATCATAGTACCCACCATGGAGGGACAG
TGATCCCTTCAGCACTTTCTCTTCTATCCACGGATAACCAAGCAGTCTTTCTAATGAATG
ATTAATCGACGTCTTTTCACAATGTTGACACTGATGATCAAAATGGAGGTTTGAAGCAAC
AGCTTTTGTGCTTTCCTTTGCCTTTTTCCCCACGATTACCCAGTTATGTATGAAACTTCT
GGAATCTACTTCTTCCATGCCCATTAAAGCTTGAATTCCACCACAGCGGCTATGACCAAC
AACTAAGATGTTCTCCACTTCAAGAGTATTCACAGAAAACTGGAGAGCAGCTTTTGTTTC
AGTAGGTCCAGACTCATATGGAGGTACTAAATTAGCAATGTTACGAACAGTGAATGCTTC
ACCAGGTTGAAATCCCAGGACGGCAGAAGGACAGACCCTAGAGTCTGCACAAGCAATCAC
CAGAAACTTTGGAGCTTGAGCATCTGCTAGTTTCTTGAAGTGCTCTAAGTTATCCATGTA
ATTAAGCTTCTTGAAGGCGAGGAACCGCTGTTTCATGTCGTCGAATACGTCGTCAGTGTT
GTTTTCTCTGTCAATTACAGCCTCATAACTAGTGAAGCCATTAGCTTCCTGAGTCAGTCC
AGGTGTCTTTCCTGATGCCATCGTTTGCAAGTTTGCAGCTTTTCTTCTGAAAGAAGAGGG
AATTCTCAACTGGGCTTTCTCAAAGTCCTTTACTTTTTCACTGGAGCGGAAGATCAATTG
TTGGGTGTGGAGAGACGTGGAGGAAGAAGGATCATAGGAGATGGGGAAGTGTGATGCCAT
TAAAGGAAAGTTTGGTATTTCGAATATGGTACAAGCATCTCGAGAGCATTCATCTCAAAG
AGAGAGAGAGACAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E140JQ U 1
AF RS1BQ62TF C 583
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AGTAGGTCCAGACTCATATGGAGGTACTAAATTTGCAATGTTACGAACAGTGAATGCTTC
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GCACAAGCAATCACCAGAAACTTTGGAGCTTGAGCATCTGCTAGTTTCTTGAAGTGCTCT
AAGTTATCCATGTAATTAAGCTTCTTGAAGGCGAGGAACCGCTGTTTCATGTCGTCGAAT
ACGTCGTCAGTGTTGTTTTCTCTGTCAATTACAGCCTCATAACTAGTGAAGCCATTAGCT
TCCTGAGTCAGTCCAGGTGTCTTTCCTGATGCCATCGTTTGCAAGTTTGCAGCTTTTCTT
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AAGTGTGATGCCATTAAAGGAAAGTTTGGTATTTCGAATATGGTACAAGCATCTCGAGAG
CATTCATCTCAAAGAGAGAGAGAGACAAAAAAA

QA 5 637 5 637
DS 



AS 1 4

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ATGCTTTCGCTTTGGCGATGTATTTTGTTGTGTTTTTTTTAGTTAATTCATCGAAACTTA
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GGAAAGTGTCTTCAGATCGGGAAGAACGTGGTGCCAAATCTGAGATCGGATTTCAAGACG
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CAGTCGAT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A583TF U 1
AF RS1BK07TF U 14
AF RS1BK07JQ C 145
AF RS1A583JQ C 264
BS 1 657 RS1A583TF
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GGAAAGTGTCTTCAGATCGGGAAGAACGTGGTGCCAAATCTGAGATCGGATTTCAAG

QA 1 657 1 657
DS 

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GG
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CGATGTATTTTGTTGTGTTTTTTTTAGTTAATTCATCGAAACTTATGTTCAATCTATATC
TTTTATCTTCGCTGAGGAATGTTTTAAATCACTTTCCACTGAGGCTTATATGGATCCCAA
TGACCAATTGATCGTATATCTCTTTTTAACCATTTCACTTTAATCAATTCTCCAGAAAAT
CAGTCTTCCTTTGTTTGATTTAGCCAGTTATGGCGTAAGAGGATAGCATCTCTAGTAGAG
AAGTGGATGGGTTTGATGGATTTTTTCAGTTTCTTCGGAAGAAATCAAGAAGAGTTGGTG
CTATAGCAGTCCAACAAATGTTCTCTCTTCAAGCAAACTGAAGCTTCCCTGGACTTAATC
AATGGTGAAAGAAGATATCTCTGTTCAGGAGGTTGCGGTTGGAGTGGAAAGTGTCTTCAG
ATCGGGAAGAACGTGGTGCCAAATCTGAGATCGGATTTCAAGACGGAGGAGCATTGCAAC
GGAAGTGGCAGAGGAATCGTGCGGCGGCCGAGATTGTCGTTTGACGCATTAGCGACGCGT
GTTGTTTGACGTGGCTACAGTCAAGCATTTTGAAGACGCGTAGATCGTAGAACTATCCCG
ATGCTTTCTCCAAA*CTGGGCTGTAA*CTTTCTAATGTCTCTTGGGCCTCGTTTGTAAAC
TGATCAATTGTATCAAAGCCCATTTGGACT

QA 3 872 3 872
DS 

RD RS1BK07JQ 764 0 0
C
TCGGGTTAGCCGATTTACTTTTCCATTGCGGATCAATGCTTTCGCTTTGGCGATGTATTT
TGTTGTGTTTTTTT*AGTTAATTCATCGAAACTTATGTTCAATCTATATCTTTTATCTTC
GCTGAGGAATGTTTTAAATCACTTTCCACTGAGGCTTATATGGATCCCAATGACCAATTG
ATCGTATATCTCTTTTTAACCATTTCACTTTAATCAATTCTCCAGAAAATCAGTCTTCCT
TTGTTTGATTTAGCCAGTTATGGCGTAAGAGGATAGCATCTCTAGTAGAGAAGTGGATGG
GTTTGATGGATTTTTTCAGTTTCTTCGGAAGAAATCAAGAAGAGTTGGTGCTATAGCAGT
CCAACAAATGTTCTCTCTTCAAGCAAACTGAAGCTTCCCTGGACTTAATCAATGGTGAAA
GAAGATATCTCTGTTCAGGAGGTTGCGGTTGGAGTGGAAAGTGTCTTCAGATCGGGAAGA
ACGTGGTGCCAAATCTGAGATCGGATTTCAAGACGGAGGAGCATTGCAACGGAAGTGGCA
GAGGAATCGTGCGGCGGCCGAGATTGTCGTTTGACGCATTAGCGACGCGTGTTGTTTGAC
GTGGCTACAGTCAAGCATTTTGAAGACGCGTAGATCGTAGAACTATCCCGATGCTTTCTC
CAAAACTGGGCTGTAAACTTTCTAATGTCTCTTGGGCCTCGTTTGTAAACTGATCAATTG
TATCAAAGCCCATTTGGACTAAGTTAATGAAATTTCAGTCGAT

QA 2 764 2 764
DS 

RD RS1A583JQ 645 0 0
TCGCTGAGGAATGTTTTAAATCACTTTCCACTGAGGCTTATATGGATCCCAATGACCAAT
TGATCGGAGATCTCTTTTTAACCATTTCACTTTAATCAATTCTCCAGAAAATCAGTCTTC
CTTTGTTTGATTTAGCCAGTTATGGCGTAAGAGGATAGCATCTCTAGTAGAGAAGTGGAT
GGGTTTGATGGATTTTTTCAGTTTTTTCGGAAGAAATCAAGAAGAGTTGGTGCTATAGCA
GTCCAACAAATGTTCTCTTTTCAAGCAAACTGAAGCTTCCCCGGACTTAATCAATGGTGA
AAGAAGATATCTCTGTTCAGGAGGTTGCGGTTGGAGTGGAAAGTGTCTTCAGATCGGGAA
GAACGTGGTGCCAAATTTGAGATTGGATTTCAAGACGGAGGAGCACTGCAACGGAAGTGG
CAGAGGAATCGTGCGGCGGCCGAGATTGTCGTTTGACGCATGAGCGACGCGTGTTGTTTG
ACGTGGCTACAGTCAAGCATTTGGAAGACGCGTAGATCGTAGAACTATCCCGATGCTTTC
TCCAAAACTGGGCTGTAAACTTTTTAATGTCTCTTGGGCCTCGTTTGTAAACTGATCAAT
TGTATCAAAGCCCATTTGGACTAAGTTAATGAAATTTCAGTCGAT

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 2

CO CL2814Contig1 739 2 7 U
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GCACTTACGCCTTGGAGTGGGCCCTCGATCGTTTCTTCGTTCCCTTCTCTCCTAATTTTC
CCTTTAAGCTCTTCATCGTCCATGCCAAACCTAACACCGTCTCTGCCGTTGGTCTCGCTG
GTCCCGGAACTGCGGAGGTTGTGCCTTATGTTGATTCCAATTTGAAGCATATGGCTGCTA
GGGTTATCGAGATGGCCAAAGGAATCTGTCAGAGCAAATCTGTTCATGGCGCTAAATTTG
AAGTTTTTGAAGGTGATGCAAGAAGTATCCTGTGCGATGTTGTGGATAAACACCATGCTT
CTCTTCTTGTCGTGGGAAGCCACGGTTATGGAGCTATCAAGAGGGCGGTTCTGGGGAGCG
TGAGCGACTACTGTGCGCATCATGCTCATTGCTCGGTGATGATCGTGAAGAAGCCAAAGA
TAAAGGGCTGATGATCACCTAACAACCCAAGCTGTTTATCTCAGTCAAATTAAGCTAAGG
TCTCATCTGCATAGTCAAATAAAATGTGAAACGATCCAAAGACAAAATCATGTATCATTT
ATATATCATCTTCTACATTTTGTACGTATGTGCGTGACATCAAATATTTGTGTGTAAAAT
TGTTTTATTGCATGGCATGTACTCTTGAATCCATTAAACTATTTTTCTTTTAAAAAAATT
ATATAATACAACTGTGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BE85TF U 1
AF RS1BE85JQ C 8
BS 1 688 RS1BE85TF
BS 689 689 RS1BE85JQ
BS 690 705 RS1BE85TF
BS 706 706 RS1BE85JQ
BS 707 710 RS1BE85TF
BS 711 712 RS1BE85JQ
BS 713 739 RS1BE85TF

RD RS1BE85TF 739 0 0
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CCTTTAAGCTCTTCATCGTCCATGCCAAACCTAACACCGTCTCTGCCGTTGGTCTCGCTG
GTCCCGGAACTGCGGAGGTTGTGCCTTATGTTGATTCCAATTTGAAGCATATGGCTGCTA
GGGTTATCGAGATGGCCAAAGGAATCTGTCAGAGCAAATCTGTTCATGGCGCTAAATTTG
AAGTTTTTGAAGGTGATGCAAGAAGTATCCTGTGCGATGTTGTGGATAAACACCATGCTT
CTCTTCTTGTCGTGGGAAGCCACGGTTATGGAGCTATCAAGAGGGCGGTTCTGGGGAGCG
TGAGCGACTACTGTGCGCATCATGCTCATTGCTCGGTGATGATCGTGAAGAAGCCAAAGA
TAAAGGGCTGATGATCACCTAACAACCCAAGCTGTTTATCTCAGTCAAATTAAGCTAAGG
TCTCATCTGCATAGTCAAATAAAATGTGAAACGATCCAAAGACAAAATCATGTATCATTT
ATATATCATCTTCTACATTTTGTACGTATGTGCGTGACATCAAATATTTGTGTGTAAAAT
TGTTTTATTGCATGGCATGTACTCTTGA*TCCATTAAACTATTTT*CTTT**AAAAAATT
ATATAATACAACTGTGGTC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1BE85JQ 732 0 0
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CGCCTTGGAGTGGGCCCTCGATCGTTTCTTCGTTCCCTTCTCTCCTAATTTTCCCTTTAA
GCTCTTCATCGTCCATGCCAAACCTAACACCGTCTCTGCCGTTGGTCTCGCTGGTCCCGG
AACTGCGGAGGTTGTGCCTTATGTTGATTCCAATTTGAAGCATATGGCTGCTAGGGTTAT
CGAGATGGCCAAAGGAATCTGTCAGAGCAAATCTGTTCATGGCGCTAAATTTGAAGTTTT
TGAAGGTGATGCAAGAAGTATCCTGTGCGATGTTGTGGATAAACACCATGCTTCTCTTCT
TGTCGTGGGAAGCCACGGTTATGGAGCTATCAAGAGGGCGGTTCTGGGGAGCGTGAGCGA
CTACTGTGCGCATCATGCTCATTGCTCGGTGATGATCGTGAAGAAGCCAAAGATAAAGGG
CTGATGATCACCTAACAACCCAAGCTGTTTATCTCAGTCAAATTAAGCTAAGGTCTCATC
TGCATAGTCAAATAAAATGTGAAACGATCCAAAGACAAAATCATGTATCATTTATATATC
ATCTTCTACATTTTGTACGTATGTGCGTGACATCAAATATTTGTGTGTAAAATTGTTTTA
TTGCATGGCATGTACTCTTGAATCCATTAAACTATTTTTCTTTTAAAAAAATTATATAAT
ACAACTGTGGTC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 3

CO CL2815Contig1 831 3 11 U
AATTTCAAACAACTACTGTATACTTTTTAGATCTTTTCTTTTTACACTGTGGAAATATCT
CCATAGGATTTATTACATTAACATGAAAATTATTTTGCTCTATAAACCGAAAAAGCTAAC
AACTACAAAGGAAGTTAAACTCCAACTAACACTAAACCTCATTGTCAACAACATCATTAC
TAAGCCAAATAAGACTTAGCAATTTCTCCATCAGCTCCTTTAGGGTAAAATCCACCGGGC
ACCCTTTCATTTCCACTTCCATACACAATCCGCAGAATATCCTCCGGAGTTCGATCAAAC
GCAAGCGATAACTCGTCACCAACCAATACATTCCCGGCCACATGTCCCTCCGCACCCATG
GCTTTAGGCACTACTAACCCCTCATCTTTCACACCCATTTTCCCCAATTTGTTCCTTAGA
CACGAGATCCTATCAGTGAAAGCCGCAACCGTGATACCATAAGGATGAACTATAAGTGTC
GCCCTCGCATATAGCATTGTTCTTATCACAGCGTCCTGACCTGATTCTACTCCTAAAAGT
CCTGCTACTAACTTTCTTGATGCGGGACATTGCAGTTTGGGGTTAGCGCCAACGTAGCCG
GTGAGGCCAACATACGGGACCAAATAAGAAGCAATGAGGTAATTGTAAGAATTGGCATAG
GGGTTAAATGGTGGCACAAATTTTCGTCCGAATGCATCATCCATCACTTTCGCAAATGAT
TTTATACTCAAATCAAGTAGCGGCCTTGCAAACCCTGTCACCGTTTTCTTGATTGCCCTC
AAGTGGCCAACCTCTTGCCAAGCAAATTGCAATACAATATCTCTTGTCAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BZ03JQ U 1
AF RS1C438JQ U 7
AF RS1BZ03TF C 30
BS 1 274 RS1BZ03JQ
BS 275 275 RS1C438JQ
BS 276 418 RS1BZ03JQ
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BS 782 831 RS1BZ03TF

RD RS1BZ03JQ 625 0 0
AATTTCAAACAACTACTGTATACTTTTTAGATCTTTTCTTTTTACACTGTGGAAATATCT
CCATAGGATTTATTACATTAACATGAAAATTATTTTGCTCTATAAACCGAAAAAGCTAAC
AACTACAAAGGAAGTTAAACTCCAACTAACACTAAACCTCATTGTCAACAACATCATTAC
TAAGCCAAATAAGACTTAGCAATTTCTCCATCAGCTCCTTTAGGGTAAAATCCACCGGGC
ACCCTTTCATTTCCACTTCCATACACAATCCGCAAAATATCCTCCGGAGTTCGATCAAAC
GCAAGCGATAACTCGTCACCAACCAATACATTCCCGGCCACATGTCCCTCCGCACCCATG
GCTTTAGGCACTACTAACCCCTCATCTTTCACACCCATTTTCCCCAATTTGTTCCTTAAA
CACGAGATCCTATCAGTGAAAGCCGCAACCGTGATACCATAAGGATGAACTATAAGTGTC
GCCCTCCCATATAGCATTGTTCTTATCACAGCGTCCTGACCTGATTCTACTCCTAAAAGT
CCTGCTACTAACTTTCTTGATGCGGGACATTGCAGTTTGGGGTTAGCGCCAACGTAGCCG
GTGAGGCCAACATACGGGACCAAAT

QA 1 625 1 625
DS 

RD RS1C438JQ 775 0 0
C
AACAACTACTGTATACTTTTTAGATCTTTTCTTTTTACACTGTGGAAATATCTCCATAGG
ATTTATTACATTAACATGAAAATTATTTTGCTCTATAAACCGAAAAAGCTAACAACTACA
AAGGAAGTTAAACTCCAACTAACACTAAACCTCATTGTCAACAACATCATTACTAAGCCA
AATAAGACTTAGCAATTTCTCCATCAGCTCCTTTAGGGTAAAATCCACCGGGCACCCTTT
CATTTCCACTTCCATACACAATCCGCAGAATATCCTCCGGAGTTCGATCAAACGCAAGCG
ATAACTCGTCACCAACCAATACATTCCCGGCCACATGTCCCTCCGCACCCATGGCTTTAG
GCACTACTAACCCCTCATCTTTCACACCCATTTTCCCCAATTTGTTCCTTAGACACGAGA
TCCTATCAGTGAAAGCCGCAACCGTGATACCATAAGGATGAACTATATGTGTCGCCCTCG
CATATAGCATTGTTCTTATCACAGCGTCCTGACCTGATTCTACTCCTAAAAGTCCTGCTA
CTAACTTTCTTGATGCGGGACATTGCAGTTTGGGGTTAGCGCCAACGTAGCCGGTGAGGC
CAACATACGGGACCAAATAAGAAGCAATGAGGTAATTGTAAGAATTGGCATAGGGGTTAA
ATGGTGGCACAAATTTTCGTCCGAATGCATCATCCATCACTTTCGCAAATGATTTTATAC
TCAAATCAAGTAGCGGCCTTGCAA*CCCTGTCACCGTTTTCTTGATTGCCCTCA

QA 2 775 2 775
DS 

RD RS1BZ03TF 802 0 0
TAGATCTTTC
TTTTACACTGTGGAAATATCTCCATAGGATTTATTACATTA*CATGAAAATTATTT*GCT
CTATAAACCGAAAAAGCTAACAACTACAAAGGAAGTTAAACTCCAACTAACACTAAACCT
CATTGTCAACAACATCATTACTAAGCCAAATAAGACTTAGCAATTTCTCCATCAGCTCCT
TTAGGGTAAAATCCACCGGGCACCCTTTCATTTCCACTTCCATACACAATCCGCAGAATA
TCCTCCGGAGTTCGATCAAACGCAAGCGATAACTCGTCACCAACCAATACATTCCCGGCC
ACATGTCCCTCCGCACCCATGGCTTTAGGCACTACTAACCCCTCATCTTTCACACCCATT
TTCCCCAATTTGTTCCTTAGACACGAGATCCTATCAGTGAAAGCCGCAACCGTGATACCA
TAAGGATGAACTATAAGTGTCGCCCTCGCATATAGCATTGTTCTTATCACAGCGTCCTGA
CCTGATTCTACTCCTAAAAGTCCTGCTACTAACTTTCTTGATGCGGGACATTGCAGTTTG
GGGTTAGCGCCAACGTAGCCGGTGAGGCCAACATACGGGACCAAATAAGAAGCAATGAGG
TAATTGTAAGAATTGGCATAGGGGTTAAATGGTGGCACAAATTTTCGTCCGAATGCATCA
TCCATCACTTTCGCAAATGATTTTATACTCAAATCAAGTAGCGGCCTTGCAAACCCTGTC
ACCGTTTTCTTGATTGCCCTCAAGTGGCCAACCTCTTGCCAAGCAAATTGCAATACAATA
TCTCTTGTCAAA

QA 11 802 11 802
DS 



AS 1 4

CO CL2816Contig1 855 4 6 U
GGGAGCTGGAAGCTGGAAACAGTCGGGGATTTAGGGTTTCAACGGGGACTCAGAGTACTC
GACTCTCCGAAGTCCGATCCCTTCTTCTCCGGCTCGAAAATTCTCCTCCTTTGCATTTGA
TCGACTCGTCTCAGCTCAATTCTCTGCCGTTTTCACGTTACAGCTTCGTTTAGTTAAAGG
CGTTGGCCAAAAGACTTGGGATTAAGTACTCTGGCTTGCGGGAGAGATGAATCACGGCCA
ACATTCTGGCGAAGCAAAGCATGAAGATGATGCTGCTCTTACTGAGTTCCTTGCGTCTCT
CATGGATTATACTCCTACTATTCCTGATGATCTAGTGGAGCACTACTTGGCTAAGAGTGG
GTTTCAGCGCCCCGACGTACGATTAATAAGGCTAGTTGCTGTGGCTACACAAAAGTTTGT
TGCAGATGTTGCCAGCGATGCTCTTCAGCACTGCAAGGCTAGACCAGCACCAGTTGTGAA
AGACAAAAAACAGCAGAAGGATAATCGTTTAGTATTGACAATGGAAGACCTTTCAAAAGC
TTTGCGTGAGTATGGTGTGAACGTGAAGCATCCAGAATATTTTGCTGATAGCCCTTCGAC
CGGAATGGATCCTGCGACAAGAGACGAATAGCAACCAGGAAGTCTCGATCGTCTTTCCCA
GTATGGATGATCGTGTGTGAGTTACTTGATTTTCTATTGTGTTTTAGTTGAAACAAAACT
CTCTTCTCCTCTTCGTAGTCATCGATTACTTGTATACCATTCCTCCTGTTGTTTGTTTCT
TGACTTACGTCCTTGTGTTATTGAGTTTCATACGATACTTTTATCAACGCATTTTCTTAT
ATTGATCAGAAGTTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1FM60TF U 1
AF RS1EQ80TF U 1
AF RS1EQ80JQ C 94
AF RS1FM60JQ C 213
BS 1 44 RS1EQ80TF
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BS 834 855 RS1EQ80JQ

RD RS1FM60TF 488 0 0
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TGCAGATGTTGCCAGCGATGCTCTTCAGCACTGCAAGGCTAGACCAGCACCAGTTGTGAA
AGACAAAA

QA 1 488 1 488
DS 

RD RS1EQ80TF 833 0 0
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GACTCTCCGAAGTCCGATCCCTTCTTCTCCGGCTCGAAAATTCTCCTCCTTTGCATTTGA
TCGACTCGTCTCAGCTCAATTCTCTGCCGTTTTCACGTTACAGCTTCGTTTAGTTAAAGG
CGTTGGCCAAAAGACTTGGGATTAAGTACTCTGGCTTGCGGGAGAGATGAATCACGGCCA
ACATTCTGGCGAAGCAAAGCATGAAGATGATGCTGCTCTTACTGAGTTCCTTGCGTCTCT
CATGGATTATACTCCTACTATTCCTGATGATCTAGTGGAGCACTACTTGGCTAAGAGTGG
GTTTCAGCGCCCCGACGTACGATTAATAAGGCTAGTTGCTGTGGCTACACAAAAGTTTGT
TGCAGATGTTGCCAGCGATGCTCTTCAGCACTGCAAGGCTAGACCAGCACCAGTTGTGAA
AGACAAAAAACAGCAGAAGGATAATCGTTTAGTATTGACAATGGAAGACCTTTCAAAAGC
TTTGCGTGAGTATGGTGTGAACGTGAAGCATCCAGAATATTTTGCTGATAGCCCTTCGAC
CGGAATGGATCCTGCGACAAGAGACGAATAGCAACCAGGAAGTCTCGATCGTCTTTCCCA
GTATGGATGATCGTGTGTGAGTTACTTGATTTTCTATTGTGTTTTAGTTGAAACAAA*CT
CTCTTCTCCTCTTCGTAGTCATCGATTACTTGTATACCATTCCTCCTGTTGTTTGTTTCT
TGACTTACGTCCTTGTGTTATTGAGTTTCATACGATACTTTTATCAACGCATT

QA 1 833 1 833
DS 

RD RS1EQ80JQ 762 0 0
TCGAAAATTCTCCTCCTTTGCATTTGATCGACTCGTCTCAGCTCAATTCTCTGCCGTTTT
CACGTTACAGCTTCGTTTAGTTAAAGGCGTTGGCCAAAAGACTTGGGATTAAGTACTCTG
GCTTGCGGGAGAGATGAATCACGGCCAACATTCTGGCGAAGCAAAGCATGAAGATGATGC
TGCTCTTACTGAGTTCCTTGCGTCTCTCATGGATTATACTCCTACTATTCCTGATGATCT
AGTGGAGCACTACTTGGCTAAGAGTGGGTTTCAGCGCCCCGACGTACGATTAATAAGGCT
AGTTGCTGTGGCTACACAAAAGTTTGTTGCAGATGTTGCCAGCGATGCTCTTCAGCACTG
CAAGGCTAGACCAGCACCAGTTGTGAAAGACAAAAAACAGCAGAAGGATAATCGTTTAGT
ATTGACAATGGAAGACCTTTCAAAAGCTTTGCGTGAGTATGGTGTGAACGTGAAGCATCC
AGAATATTTTGCTGATAGCCCTTCGACCGGAATGGATCCTGCGACAAGAGACGAATAGCA
ACCAGGAAGTCTCGATCGTCTTTCCCAGTATGGATGATCGTGTGTGAGTTACTTGATTTT
TTATTGTGTTTTAGTTGAAACAAAACTCTCTTCTCCTCTTCGTAGTCATCGATTACTTGT
ATACCATTCCTCCTGTTGTTTGTTTCTTGACTTACGTCCTTGTGTTATTGAGTTTCATAC
GATACTTTTATCAACGCATTTTCTTATATTGATCAGAAGTTC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1FM60JQ 643 0 0
GGT
TTGCGGGAGAGATGAATCACGGCCAACATTCTGGCGAAGCAAAGCATGAAGATGATGCTG
CTCTTACTGAGTTCCTTGCGTCTCTCATGGATTATACTCCTACTATTCCTGATGATCTAG
TGGAGCACTACTTGGCTAAGAGTGGGTTTCAGTGCCCCGACGTACGATTAATAAGGCTAG
TTGCTGTGGCTACACAAAAGTTTGTTGCAGATGTTGCCAGCGATGCTTTTCAGCACTGCA
AGGCTAGACCAGCACCAGTTGTGAAAGACAAAAAACAGCAGAAGGATAAGCGTTTAGTAT
TGACAATGGAAGACCTTTCAAAAGCTTTGCGTGAGTATGGTGTGAACGTGAAGCATCCAG
AATATTTTGGTGATAGCCCTTCGACCGGAATGGATCCTGCGACAAGAGACGAATAGCAAC
CAGGAAGTCTCGATCGTCTTTCCCAGTATGGATGATCGTGTGTGAGTTACTTGATTTTCT
ATTGTGTTTTAGTTGAAACAAAACTCTCTTCTCCTCTTCGTAGTCATCGATTACTTGTAT
ATCATTCCTCCTGTTGTTTGTTTCTTGACTTACGTCCTTGTGTTATTGAGTTTCATACGA
TACTTTTATCAACACATTTTCTTATATTGATCAGAAGTTC

QA 4 643 4 643
DS 



AS 1 3

CO CL2817Contig1 1254 3 17 U
GGATCATCATCGAGTGTCTCGCCCAAGTGCTTCACCACAAAAACTAAAAAACAAAAAAAG
ACATCTTCTCTCCTCGCAAATCCCCCAAAAATGTTCAGATCTATGCTTGTCCGATCCTCC
GCCTCGGCGAAGCAGTCGGTTCTCCGCCGCAACTTCTCATCCGGATCCGTCCCCGAGCGA
AAAGTCGCAATCTTGGGAGCCGCCGGTGGAATCGGTCAGCCTCTCGCTCTCCTCATGAAA
CTCAACCCTCTCGTCTCCAGCCTCTCCCTCTTCGATATCGCAAACACACCTGGAGTCGCC
GCTAATGTCGGTCACATCAACACCAGATCTCAGGTAGTTGGATACATGGGAGATGATGAG
TTGGCGAAAGCTCTCGAAGGAGCTGACCTCGTTATCATCCCAGCTGGTGTCCCCAGGAAG
CCTGGTATGACCCGTGATGATCTTTTCAACATCAATGCTGGCATTGTCAAGAACCTTGCC
TCTGCCATCGCCAAGTACTGCCCTCATGCACTTGTTAATATGATCAGCAACCCAGTGAAC
TCCACTGTTCCAATTGCAGCTGAGATATTTAAGAAGGCTGGTATGTACGATGAAAAGAAG
TTGTTTGGTGTTACCACTCTTGACGTTGTTAGGGCCAAGACTTTCTATGCTGGCAAAGCT
AATGTCCCCGTTGCAGAAGTGAATGTTCCGGTGATTGGTGGTCATGCTGGAGTTACAATT
CTCCCACTCTTCTCTCAGGCCACTCCTCAAGCTAACTTGTCAGGTGACGTGCTCACTGCC
CTCACCAAGCGTACTCAAGATGGAGGTACAGAAGTCGTAGAGGCTAAAGCAGGAAAAGGT
CAGCTACATTGTCAATGGCCTATGCTGGAGCACTATTCGCTGATGCATGCTTGAAGGGAC
TTAACGGTGTTCCAGATGTTGTTGAATGCTCATACGTGCAATCCACAATCACTGAGCTTC
CTTTCTTTGCCTCCAAGGTGAGGTTGGGGAAGAACGGCGTGGAGGAGGTTCTTGATTTGG
GCCCACTCTCAGACTCTGAGAAGGAAGGCTTGGAGGCATTGAAGCCTGAACTCAAGTCTT
CCATTGAGAAGGGAGTTAAGTTTGCCAACCAATGATCAAACCGGTTTGACTCGGTTGTTG
TTTTTTCCAAATTTTCCGGCTAGAGTTCACCTTCCATAAGATACTACATGATTTGAGTCT
TGCTTTTGTTTTCAAACAATCTGTTTTGCTGGTAATAAATGTCACACACACCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EL17TF U 1
AF RS1EM93TF U 195
AF RS1EM93JQ C 493
BS 1 224 RS1EL17TF
BS 225 225 RS1EM93TF
BS 226 331 RS1EL17TF
BS 332 332 RS1EM93TF
BS 333 335 RS1EL17TF
BS 336 336 RS1EM93TF
BS 337 398 RS1EL17TF
BS 399 399 RS1EM93TF
BS 400 710 RS1EL17TF
BS 711 711 RS1EM93TF
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BS 739 739 RS1EM93TF
BS 740 763 RS1EL17TF
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BS 765 779 RS1EL17TF
BS 780 828 RS1EM93TF
BS 829 1254 RS1EM93JQ

RD RS1EL17TF 780 0 0
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TCTGCCATCGCCAAGTACTGCCCTCATGCACTTGTTAATATGATCAGCAACCCAGTGAAC
TCCACTGTTCCAATTGCAGCTGAGATATTTAAGAAGGCTGGTATGTACGATGAAAAGAAG
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AATGTCCCCGTTGCAGAAGTGAATGTTCCGGTGATTGGTGGTCATGCTGGGGTTACAATT
CTCCCACTCTTCTCTCAG*CCACTCCTCAAGCTAACTTGTCAG*TGACGTGCTCACTGC
T

QA 1 779 1 779
DS 

RD RS1EM93TF 634 0 0
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TGATGATCTTTTCAACATCAATGCTGGTATTGTCAAGAACCTTGCCTCTGCCATCGCCAA
GTACTGCCCTCATGCACTTGTTAATATGATCAGCAACCCAGTGAACTCCACTGTTCCAAT
TGCAGCTGAGATATTTAAGAAGGCTGGTATGTACGATGAAAAGAAGTTGTTTGGTGTTAC
CACTCTTGACGTTGTTAGGGCCAAGACTTTCTATGCTGGCAAAGCTAATGTCCCCGTTGC
AGAAGTGAATGTTCCGGTGATTGGTGGTCATGCTGGAGTTACAATTCTCCCACTCTTCTC
TCAGGCCACTCCTCAAGCTAACTTGTCAGGTGACGTGCTCACTGCCCTCACCAAGCGTAC
TCAAGATGGAGGTACAGAAGTCGTAGAGGCTAAA

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1EM93JQ 762 0 0
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ATTGCAGCTGAGATATTTAAGAAGGCTGGTATGTACGATGAAAAGAAGTTGTTTGGTGTT
ACCACTCTTGACGTTGTTAGGGCCAAGACTTTCTATGCTGGCAAAGCTAATGTCCCCGTT
GCAGAAGTGAATGTTCCGGTGATTGGTGGTCATGCTGGAGTTACAATTCTCCCACTCTTC
TCTCAGGCCACTCCTCAAGCTAACTTGTCAGGTGACGTGCTCACTGCCCTCACCAAGCGT
ACTCAAGATGGAGGTACAGAAGTCGTAGAGGCTAAAGCAGGAAAAGGTCAGCTACATTGT
CAATGGCCTATGCTGGAGCACTATTCGCTGATGCATGCTTGAAGGGACTTAACGGTGTTC
CAGATGTTGTTGAATGCTCATACGTGCAATCCACAATCACTGAGCTTCCTTTCTTTGCCT
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ACTCTGAGAAGGAAGGCTTGGAGGCATTGAAGCCTGAACTCAAGTCTTCCATTGAGAAGG
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TTTCCGGCTAGAGTTCACCTTCCATAAGATACTACATGATTTGAGTCTTGCTTTTGTTTT
CAAACAATCTGTTTTGCTGGTAATAAATGTCACACACACCAT

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 4

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AAGAAAATAAAACATAAAAAAATCTTATATCACTAGTGACTAGAATCAATCCCAATAATG
GGTGTACATTTTGGAGTATCCACATTCTTTGTCTTTTGTTTGCTGGTTTTATCAGCAAAT
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TTCAGGCTTGGGGAAATAGAGATGATGGGTCCATGCAAAGCCCCTATAGTAATTGTTCTT
CAAGGCACTGTGAGAGCTGATGGGAACGTGAATGGGAAGGACTATTGGATCGCTTTCCGC
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TGGAGGGCTAATAATTGTCACAAGACGTCATTAACTCAGTGCAAAAGACTCCCTATCAGC
ATAAGGTTTGATTACATAACTGACGGCAAGGTAAGAGACATAACCTCGTTAGACGCAAAG
AACTTCCACATCAACGTGATCGGGGCAAAGAACTTGACATTCGAAGACGTCAGGATCATA
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ATCATCAACACCA*CATCAAA*CGGGAGACGACTGCATCTCTGTCGGGACGGATGAAAAC
TTCTTGTCGAA


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DE10TF U 1
AF RS1BM84TF U 1
AF RS1D630TF U 1
AF RS1F251TF U 4
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RD RS1DE10TF 357 0 0
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AATAAAACATAAAAAAATCTTATATCACTAGTGACTAGAATCAATCCCAATAATGGGTGT
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QA 6 357 6 357
DS 

RD RS1BM84TF 762 0 0
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GGTGTACATTTTGGAGTATCCACATTCTTTGTCTTTTGTTTGCTGGTTTTATCAGCAAAT
GCGAGAGAATTCAGAATCACTGCTCGCCCAGGTTCTGATATCACCGGCGAATTGTCGAAA
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CAAGGCACTGTGAGAGCTGATGGGAACGTGAATGGGAAGGACTATTGGATCGCTTTCCGC
AGGATTACTAACTTCAGATTGAACGGAGGTGGTGTCTTTGATGGTGAAGGTAACGCTTCA
TGGAGGGCTAATAATTGTCACAAGACGTCATTAACTCAGTGCAAAAGACTCCCTATCAGC
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GCCCCTGATGAGAGTCCCAACACCTATGGAATCCACGTGGGAAGGAGTGACGGAATCAAG
ATCATCAACACCAACATCAAAACGGGAGACGACTGCATCTCT

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1D630TF 768 0 0
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AATAAAACATAAAAAAATCTTATATCACTAGTGACTAGAATCAATCCCAATAATGGGTGT
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CA*CACCA*CATCAAA*CGGGAGACGACTGCATCTCT
GTCGGG

QA 6 762 6 762
DS 

RD RS1F251TF 788 0 0
GG
AATAAGAAAAATAAAATTTCAAACACAAAAAAAAATAAAACCTAGTGGTTTACGAAAGAA
AATAAAACATAAAAAAATCTTATACCACTAGTGACTAGAATCAATCCCAATAGTGGGTGT
ACATTTTGGAGTATCCACATTCTTTGTCTTTTGTTTGCTGGTTTTATCAGCAAATGCAAG
AGAATTCAGAATCACTGCTCGCCCAGGTTCTGATATCACCGGCGAATTGTCAAAACTATT
CAAGGAGGCATGTGCGTGCGTGGACAGGAGCACCGTTTTGATCCCAAAAGGTGAATTCAG
GCTTGGGGAAATAGAGATGATGGGTCCATGCAAAGCCCCTATAGTAATTGTTCTTCAAGG
CACTGTGAGAGCTGATGGGAACGTGAATGGGAAGGACTATTGGATCGCTTTCCGCAGGAT
TACTAACTTCAGATTGAACGGAGGTGGTATCTTTGATGGTGAAGGTAACGCTTCATGGAG
GGCTAATAATTGTCACAAGACGTCATTAACTCAGCGCAAAAGACTCCCTATCAGCGTAAG
GTTTGATTACATAACTGACGGCAAGGTAAGAGACATAACCTCGTTAGACGCAAAGAACTT
CCACATCAACGTGATCGGGGCAAAGAACTTGACATTCGAAGACGTCAG*ATCATAGCCCC
TGATGAGAGTCC*AACACCGACG*AATCCACGTGGGAAG*AGTGACGGA*TCA*GATCAT
CAACACCA*CATCAAA*CGGGAGACGACTGCATCTCTGTCGGGACGGATGAAAACTTCTT
GTCGAA

QA 3 788 3 788
DS 



AS 1 2

CO CL2819Contig1 675 2 2 U
GGGTCAGTGAGAATCATCAAATCTCTCCTTCTTCCTCCGTCGGTGTTGCTCTTCTTCTTT
CGAAGCAATCTCAATCCACAAAAGCTTGATTCCAAGATGGATAGTGGAGCGCTGAACATC
AAGAAGTGGGTAGTGATGTACCCAGTCTATATGAATTCCAAGAAAACTGTGGCGGAGGGG
AGGAGAATCAGTTTGAGTAAAGCTTGTGAGAACCCTAACTGCATTGAGATTAGTGACTGC
TGCAAGCATCTCAAACTCCCTGCCGCCGTCGAGATTGACAAAGCGTACCCGCGTGATTTC
ATGCAAGTAGGGAGAGTCAGAGTTCAGTTGAAAAAAGAGGATGGGACTTTTGTTAATCCT
GCCATTACTTCAAGGAAGCAGTTGATGCAGAAAATTGCGGAATTGGTACCCAGACATCCA
GAGAGGATGAAGAAGCAGGAATCTCAGAAGGCGAAGAAGCAAGAACCTCAGGCAACAACA
TCAACCTCTGGGACTTCTTCAAAGTCAGGCAAAGGTGGCAAGAAGAAGAGATAACTTAAC
AAGCTCTCTCACTCTTTTTTTCTCCTTCGTATCAGATTCTATGGTTTTTAATTTCATAAA
CTCACAAGAACGTGTTTGCAAATGTAAAAGATTTTGTTGGTTTTGATCACTGTGCTCTAC
CTTTTTGGCATCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1EJ89TF U 1
AF RS1EJ89JQ C 65
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RD RS1EJ89TF 675 0 0
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CGAAGCAATCTCAATCCACAAAAGCTTGATTCCAAGATGGATAGTGGAGCGCTGAACATC
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AGGAGAATCAGTTTGAGTAAAGCTTGTGAGAACCCTAACTGCATTGAGATTAGTGACTGC
TGCAAGCATCTCAAACTCCCTGCCGCCGTCGAGATTGACAAAGCGTACCCGCGTGATTTC
ATGCAAGTAGGGAGAGTCAGAGTTCAGTTGAAAAAAGAGGATGGGACTTTTGTTAATCCT
GCCATTACTTCAAGGAAGCAGTTGATGCAGAAAATTGCGGAATTGGTACCCAGACATCCA
GAGAGGATGAAGAAGCAGGAATCTCAGAAGGCGAAGAAGCAAGAACCTCAGGCAACAACA
TCAACCTCTGGGACTTCTTCAAAGTCAGGCAAAGGTGGCAAGAAGAAGAGATAACTTAAC
AAGCTCTCTCACTCTTTTTTTCTCCTTCGTATCAGATTCTATGGTTTTTAATTTCATAAA
CTCACAAGAACGTGTTTGCAAATGTAAAAGATTTTGTTGGTTTTGATCACTGTGCTCTAC
CTTTTTGGCATCA
CC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RS1EJ89JQ 611 0 0
GCAA
TCTCAATCCACAAAAGCTTGATTCCAAGATGGATAGTGGAGCGCTGAACATCAAGAAGTG
GGTAGTGATGTACCCAGTCTATATGAATTCCAAGAAAACTGTGGCGGAGGGGAGGAGAAT
CAGTTTGAGTAAAGCTTGTGAGAACCCTAACTGCATTGAGATTAGTGACTGCTGCAAGCA
TCTCAAACTCCCTGCCGCCGTCGAGATTGACAAAGCGTACCCGCGTGATTTCATGCAAGT
AGGGAGAGTCAGAGTTCAGTTGAAAAAAGAGGATGGGACTTTTGTTAATCCTGCCATTAC
TTCAAGGAAGCAGTTGATGCAGAAAATTGCGGAATTGGTACCCAGACATCCAGAGAGGAT
GAAGAAGCAGGAATCTCAGAAGGCGAAGAAGCAAGAACCTCAGGCAACAACATCAACCTC
TGGGACTTCTTCAAAGTCAGGCAAAGGTGGCAAGAAGAAGAGATAACTTAACAAGCTCTC
TCACTCTTTTTTTTTCCTTCGTATCAGATTTTATGGTTTTTAATTTCATAAACTCACAAG
AACGTGTTTGCAAATGTAAAAGATTTTGTTGGTTTTGATCACTGTGCTCTACCTTTTTGG
CATCACC

QA 5 611 5 611
DS 



AS 1 4

CO CL2820Contig1 878 4 4 U
GGGCTTCTGTGGCTTACAAAGAGCAGAAACTTAGCAGAAAATTAAGACTATTCTCATAAC
TTTGGCTTTCTACGACCGTGTCATCATGCCTTTTTGGAAGAAATGGAAAGGAAAACCAGG
ATTCTCTAGCCTGCAAAAAATAGCTATTGGATTGGTCTTATCAACCGCTGAAATGGCAGC
TGCGGCCATAGTTGAGCAAGAGCGTCTATCAGTGGCGAAAACTAGTACACAGAAAACATT
GCCCATAAGTGTGTTCCTACTCGTTCCACAATTCTTCCTAGTAGGAGCTGGGGAAGCCTT
TATATACACTGGCCAACTTGATTTCTTCATAACCCAATCGCCCAAGGGAATGAAAACAAT
GAGCACTGGACTTTTCTTGACTACTTTGTCACTAGGCTTCTTCGTCAGCAGTTTCTTGGT
TTCAATCGTCAAAAAGGTCACTGCGACTTCTGTAAGTGAGGGATGGTTGGCTGATAACAT
CAACCATGGCCGGCTCGATCTCTTTTATTGGCTTTTGGTCATTCTCAGCGGAATCAACTT
TGTTGTTTATGTCATATGTGCCTTATGGTTCAAGCCAACAAAGGGTAAAGACTCGGAGGA
GAAGGAAAATGGTAAGAGTTTTTCAGTTGAAGACTGCTAGTTTTCTTTTTCAGTCACGTT
TCTGGTGTATCATATTATCATGCAACAAAGCCGCTCCCCCATCATGTTTCTTGTATTCCA
CGTAATTCGGCTGTGTGACTTGTATCTAAATTCCTACTTGTCAAAATTATTGTGCCTTCG
CCAGTTACGTTTGTAACGTTTGTAACCTTTGTCACCTTTTCTCTTCTTGTATTGGTATCC
ATCAGATTGAAAAGAGAAAATAGTTTTAATTAAGCTCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A925TF U 1
AF RS1F547TF U 1
AF RS1A925JQ C 95
AF RS1F547JQ C 152
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BS 824 878 RS1A925JQ

RD RS1A925TF 765 0 0
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TGCGGCCATAGTTGAGCAAGAGCGTCTATCAGTGGCGAAAACTAGTACACAGAAAACATT
GCCCATAAGTGTGTTCCTACTCGTTCCACAATTCTTCCTAGTAGGAGCTGGGGAAGCCTT
TATATACACTGGCCAACTTGATTTCTTCATAACCCAATCGCCCAAGGGAATGAAAACAAT
GAGCACTGGACTTTTCTTGACTACTTTGTCACTAGGCTTCTTCGTCAGCAGTTTCTTGGT
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CAACCATGGCCGGCTCGATCTCTTTTATTGGCTTTTGGTCATTCTCAGCGGAATCAACTT
TGTTGTTTATGTCATATGTGCCTTATGGTTCAAGCCAACAAAGGGTAAAGACTCGGAGGA
GAAGGAAAATGGTAAGAGTTTTTCAGTTGAAGACTGCTAGTTTTCTTTTTCAGTCACGTT
TCTGGTGTATCATATTATCATGCAACAAAGCCGCTCCCCCATCATGTTTCTTGTATTCCA
CGTAATTCGGCTGTGTGACTTGTATCTAAATTCCTACTTG
TCAAA

QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1F547TF 760 0 0
GGGCTTCTGTGGCTTACAAAGAGCAGAAACTTAGCAGAAAATTAAGACTATTCTCATAAC
TTTGGCTTTCTACGACCGTGTCATCATGCCTTTTTGGAAGAAATGGAAAGGAAAACCAGG
ATTCTCTAGCCTGCAAAAAATAGCTATTGGATTGGTCTTATCAACCGCTGGAATGGCAGC
TGCGGCCATAGTTGAGCAAGAGCGTCTATCAGTGGCGAAAACTAGTACACAGAAAACATT
GCCCATAAGTGTGTTCCTACTCGTTCCACAATTCTTCCTAGTAGGAGCTGGGGAAGCCTT
TATATACACTGGCCAACTTGATTTCTTCATAACCCAATCGCCCAAGGGAATGAAAACAAT
GAGCACTGGACTTTTCTTGACTACTTTGTCACTAGGCTTCTTCGTCAGCAGTTTCTTGGT
TTCAATCGTCAAAAAGGTCACTGCGACTTCTGTAAGTGAGGGATGGTTGGCTGATAACAT
CAACCATGGCCGGCTCGATCTCTTTTATTGGCTTTTGGTCATTCTCAGCGGAATCAACTT
TGTTGTTTATGTCATATGTGCCTTATGGTTCAAGCCAACAAAGGGTAAAGACTCGGAGGA
GAAGGAAAATGGTAAGAGTTTTTCAGTTGAAGACTGCTAGTTTTCTTTTTCAGTCACGTT
TCTGGTGTATCATATTATCATGCAACAAAGCCGCTCCCCCATCATGTTTCTTGTATTCCA
CGTAATTCGGCTGTGTGACTTGTATCTAAATTCCTACTTG

QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1A925JQ 784 0 0
TGGAAGAAATGGAAAGGAAAACCAGGATTCTCTAGCCTGCAAAAAATAGCTATTGGATTG
GTCTTATCAACCGCTGAAATGGCAGCTGCGGCCATAGTTGAGCAAGAGCGTCTATCAGTG
GCGAAAACTAGTACACAGAAAACATTGCCCATAAGTGTGTTCCTACTCGTTCCACAATTC
TTCCTAGTAGGAGCTGGGGAAGCCTTTATATACACTGGCCAACTTGATTTCTTCATAACC
CAATCGCCCAAGGGAATGAAAACAATGAGCACTGGACTTTTTTTGACTACTTTGTCACTA
GGCTTTTTCGTCAGCAGTTTCTTGGTTTCAATCGTCAAAAAGGTCACTGCGACTTCTGTA
AGTGAGGGATGGTTGGCTGATAACATCAACCATGGCCGGCTCGATCTCTTTTATTGGCTT
TTGGTCATTTTCAGCGGAATCAACTTTGTTGTTTATGTCATATGTGCCTTATGGTTCAAG
CCAACAAAGGGTAAAGACTCGGAGGAGAAGGAAAATGGTAAGAGTTTTTCAGTTGAAGAC
TGCTAGTTTTCTTTTTCAGTCACGTTTCTGGTGTATCATATTATCATGCAACAAAGCCGC
TCCCCCATCATGTTTCTTGTATTCCACGTAATTCGGCTGTGTGACTTGTATCTAAATTCC
TACTTGTCAAAATTATTGTGCCTTCGCCAGTTACGTTTGTAACGTTTGTAACCTTTGTCA
CCTTTTCTTTTCTTGTATTGGTATCCATCAGATTGAAAAGAGAAAATAGTTTTAATTAAG
CTCG

QA 1 784 1 784
DS 

RD RS1F547JQ 720 0 0
TTGGTCTTATCAACCGCTGGAATGGCAGCTGCGGCCATAGTTGAGCAAGAGCGTCTATCA
GTGGCGAAAACTAGTACACAGAAAACATTGCCCATAAGTGTGTTCCTACTCGTTCCACAA
TTCTTCCTAGTAGGAGCTGGGGAAGCCTTTATATACACTGGCCAACTTGATTTCTTCATA
ACCCAATCGCCCAAGGGAATGAAAACAATGAGCACTGGACTTTTCTTGACTACTTTGTCA
CTAGGCTTCTTCGTCAGCAGTTTCTTGGTTTCAATCGTCAAAAAGGTCACTGCGACTTCT
GTAAGTGAGGGATGGTTGGCTGATAACATCAACCATGGCCGGCTCGATCTCTTTTATTGG
CTTTTGGTCATTCTCAGCGGAATCAACTTTGTTGTTTATGTCATATGTGCCTTATGGTTC
AAGCCAACAAAGGGTAAAGACTCGGAGGAGAAGGAAAATGGTAAGAGTTTTTCAGTTGAA
GACTGCTAGTTTTCTTTTTCAGTCACGTTTCTGGTGTATCATATTATCATGCAACAAAGC
CGCTCCCCCATCATGTTTCTTGTATTCCACGTAATTCGGCTGTGTGACTTGTATCTAAAT
TCCTACTTGTCAAAATTATTGTGCCTTCTCCAGTTACGTTTGTAACGTTTGTAATCTTTG
TCACCTTTTCTCTTCTTGTATTGGTATCCATCAGATTGAAAAGAGAAAATAGTTTTAAT
C

QA 1 719 1 719
DS 



AS 2 4

CO CL2821Contig1 602 2 2 U
GGAAAGAAGAAGATAATATGGCGACGACAAGCGCATCTGCTTTGCTCTCACCCACAACAA
CCTTCTCCAAAGCAATCTCTCAGAAAAACCCAAACTCCATCTCATTCCACGGCCTCCGTC
CTCTCCGCCTCGGTGGCTCCTCCTCCGCCTTACCCAAGCTATCCACCACATCCGGAAGGA
GATCTTCCTCCTCCGCCATCGTGAGAGCCGAGCTCAGCCCATCCGTGGTCATAAGCCTCA
GCACCGGTCTCTCCCTCTTTCTAGGACGGTTCGTCTTCTTCAACTTCCAGAGAGAGAACG
TGGCGAAGCAGGTGCCGGAGCAGAACGGGAAAACCCACTTCGAAGCCGGAGATGATCGTG
CTAAGGAGTACGTTAGCCTCCTGAAGTCGAACGATCCAGTTGGATTCAACATTGTGGATG
TTCTTGCTTGGGGTTCCATTGGTCACATCGTTGCTTACTATGTCTTAGCCACTTCTAGCA
ATGGCTATGACCCCAGCTTCTTTGGCTGATTCATTTCCATATTCTGTCTCGTTATATGTA
CGTATATCTTTGACTTGTATGGCAAGTTACCTCCTCTCTTGTTGTTTGTCTATTGGCTTC
TC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 

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TC

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TG


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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 

AF RS1E550TF U 1
AF RS1EK44TF U 1
AF RS1E550JQ C 124
AF RS1EK44JQ C 220
BS 1 283 RS1E550TF
BS 284 558 RS1EK44TF
BS 559 559 RS1E550JQ
BS 560 663 RS1EK44TF
BS 664 664 RS1E550JQ
BS 665 697 RS1EK44TF
BS 698 962 RS1E550JQ

RD RS1E550TF 283 0 0
GATTTATGGGGGCGTTCGTTTGTATTCTAACCTTTCTGATGGTAAGAACAAGATGAAGTG
GACCATTGTGTTGGACACTTCTTCCCTCCTCAACAAGGAATCTAGGAAGCCATTGCACCT
ACTACAAGGTCTCAAGGGGACACATATGGTCGTACCAAGAACAGTGTTAAGAGAGCTAAA
TGAGATGAAGCGCGCTCGCTGTCTGCTGTTTAGTAGAACAGCTGAGATGGCTTCCTCCTC
TCTGGATTGGATCGAAGAGTGTAAAGTTAGTACCAAATGGTGG

QA 1 283 1 283
DS 

RD RS1EK44TF 697 0 0
GATTTATGGGGGCGTTCGTTTGTATTCTAACCTTTCTGATGGTAAGAACAAGATGAAGTG
GACCATTGTGTTGGACACTTCTTCCCTCCTCAACAAGGAATCTAGGAAGCCATTGCACCT
ACTACAAGGTCTCAAGGGGACACATATGGTCGTACCAAGAACAGTGTTAAGAGAGCTAAA
TGAGATGAAGCGCGCTCGCTGTCTGCTGTTTAGTAGAACAGCTGAGATGGCTTCCTCCTC
TCTGGATTGGATCGAAGAGTGTAAAGTTAGTACCAAATGGTGGATTCAACTCCAAAACCC
ATCAGAGGAAACTAAAGCAACTGCATCAACACCACCGGTCACTTCTCAGTCAAATGGAGA
TTCATTTCCGTTTTCACTTGACTGCAATAGTTATGCACCGGAGATCGATTCTCCTACATC
AGAAGATCAAGTTCTCGAATGTGCACTTCTTCACAGAAACCGTAACATAGATGCCCAACT
CGTTGTTCTTAGCAACGACGTAACTCTCAAGATCAAAGCCATGGCAAAGGGTGTAATGTG
CGAGACGGCACATGAGTTCTACGAGAGTCTGAAGAATCCGTTCTCGGAGAGGTTTATGTG
GCCAGAGAGTTTGCCGAGAGGAAGGACTTGGAGTCATGCAGACGACAATGTGTTGAGAGA
AAG*TACGACAACCGAAAGCTAACGTTAAATGGAAGA

QA 1 697 1 697
DS 

RD RS1E550JQ 839 0 0
ACAAGGTCTCAAGGG*ACACATATGGTCGTACCAAGAACAGTGTTAAGAGAGCTAAATGA
GATGAAGCGCGCTCGCTGTCTGCTGTTTAGTAGAACAGCTGAGATGGCTTCCTCCTCTCT
GGATTGGATCGAAGAGTGTAAAGTTAGTACCAAATGGTGGATTCAACTCCAAAACCCATC
AGAGGAAACTAAAGCAACTGCATCAACACCACCGGTCACTTCTCAGTCAAATGGAGATTC
ATTTCCGTTTTCACTTGACTGCAATAGTTATGCACCGGAGATCGATTCTCCTACATCAGA
AGATCAAGTTCTCGAATGTGCACTTCTTCACAGAAACCGTAACATAGATGCCCAACTCGT
TGTTCTTAGCAACGACGTAACTCTCAAGATCAAAGCCATGGCAAAGGGTGTAATGTGCGA
GACGGCACATGAGTTTTACGAGAGTCTGAAGAATCCGTTCTCGGAGAGGTTTATGTGGCC
AGAGAGTTTGCCGAGAGGAAGGACTTGGAGTCATGCAGACGACAATGTGTTGAGAGAAAG
GTACGACAACCGAAAGCTAACGTTAAATGGAAGAAGAAGAGGAGAGAGTGGTGCAACAGC
AGCAAAAGGCTTGAAGCTCATACTGCCCTATAACTCTCACTATGGCCACATTCGTTGATG
CATCTCTCTTTTTTCGTTCTCAAATTTCCTGGAAGCCAAATCATTTCAACTCTATTAGAC
ATGGGATATTTTTTTTTCTCAGAATAATGACATTTTCGTATCATCGTGACCTTTTGTTGT
TGTGGAATTACATTTGTCTTCCAGCTATGGCTATTTTTATACCGACGAAAATTAGAATG

QA 1 839 1 839
DS 

RD RS1EK44JQ 743 0 0
AGCTGAGATGGCTTCCTCCTCTCTGGATTGGATCGAAGAGTGTAAAGTTAGTACCAAATG
GTGGATTCAACTCCAAAACCCATCAGAGGAAACTAAAGCAACTGCATCAACACCACCGGT
CACTTCTCAGTCAAATGGAGATTCATTTCCGTTTTCACTTGACTGCAATAGTTATGCACC
GGAGATCGATTCTCCTACATCAGAAGATCAAGTTCTCGAATGTGCACTTCTTCACAGAAA
CCGTAACATAGATGCCCAACTCGTTGTTTTTAGCAACGACGTAACTCTCAAGATCAAAGC
CATGGCAAAGGGTGTAATGTGCGAGACGGCACATGAGTTTTACGAGAGTTTGAAGAATCC
GTTCTCGGAGAGGTTTATGTGGCCAGAGAGTTTGCCGAGAGGAAGGACTTGGAGTCATGC
AGACGACAATGTGTTGAGAGAAAGGTACGACAACCGAAAGCTAACGTTAAATGGAAGAAG
AAGAGGAGAGAGTGGTGCAACAGCAGCAAAAGGCTTGAAGCTCATACTGCCCTATAACTC
TCACTATGGCCACATTCGTTGATGCATCTCTCTTTTTTCGTTCTCAAATTTCCTGGAAGC
CAAATCATTTCAACTCTATTAGACATGGGATATTTTTTTTTCTCAGAATAATGACATTTT
CGTATCATCGTGACCTTTTGTTGTTGTGGAATTACATTTGTTTTCCAGCTATGGCTATTT
TTATACCGACGAAAATTAGAATG

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 4

CO CL2823Contig1 783 4 14 U
GGCACAATATTCGTATCATTGCAATATTCATTTTAAGCTTTTACCTCATCCATTAAACTT
TCTATTGCATCAAATAAAAGGTTGTCTTCGTCTCATTTTTCCATATGATATTTACGAATA
CAAGCAGACCATACAGGCAGAGATAACTTCATCTACATATAAGGACACTCTGATATGACT
TAAGAGATCTTCGAAAAAAGTTTCACTCCTACACATGCGAGACTTAAATCTTCATCAAAA
AAAGAAAAGTACATACTACTTGATATTTAACATGGTTGTTCCATATCTAGCTAGATAGGG
CTGGTAACATGGAAAATCAGGCTGATCTCATGATCTACTTAGCCCCAAAGGGGAACCACA
TCTCGTGGATGTCTGACTGGTACGAGACCATGAACAAGATGACCACGAGCACGGCTGCTA
CGCCCCAAGGTGATGAACCGGCATGGTGAATGGAGTCTTGTTCAGGAAAGGGGACGTACA
AGGAGAGTCCCCCAGAGAAGAAGTGGACGATGAGGAGGAGGAAGAGAGGGGAGAGGATGA
TGAAGAACTTGAGATTACTCATGGTGTCTTCGAGGATGGACTCGTAGTTCAAGTACCATG
TGAAGGAGAACACGAAGAAGACGACCATGAAGAAGAAACAGAGGTGTGGGTTTGGGAGAG
AGATGTAGTCCAAGAAGGATGAGCCGTAGTATGGTGATCTCGCCATATGTTTGTTCTTCT
TGATCTTCTCTGGCTTTGATAAAGGTCTAGAGTTCTTAGAATGTGTTAGTGAAATATAGA
TCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 

AF RS1DI11JQ U 35
AF RS1DZ02JQ U 1
AF RS1DI11TF C 54
AF RS1DZ02TF C 160
BS 1 135 RS1DZ02JQ
BS 136 136 RS1DI11JQ
BS 137 242 RS1DZ02JQ
BS 243 243 RS1DI11JQ
BS 244 466 RS1DZ02JQ
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BS 523 557 RS1DZ02JQ
BS 558 558 RS1DI11JQ
BS 559 754 RS1DZ02JQ
BS 755 759 RS1DI11TF
BS 760 760 RS1DZ02TF
BS 761 783 RS1DI11TF

RD RS1DI11JQ 632 0 0
G
AGCTTTTACCTCATCCATTAAACTTTCTATTGCATCAAATAAAAGGTTGTCTTCGTCTCA
TTTTTCCATATGATATTTACGAATACAAGCAGACCATACAGGCAGAGATAACTTCATCTA
CATATAAGGACACTCTGATATGACTTAAGAGATCTTCGAAAAAAGTTTCACTCCTACACA
TGCGAGACTTAAATCTTCATCAAAAAAAGAAAAGTACATACTACTTGATATTTAACATG*
TTGTTCCATATCTAGCTAGATAGGGCTGGTAACATGGAAAATCAGGCTGATCTCATGATC
TACTTAGCCCCAAAGGGGAACCACATCTCGTGGATGTCTGACTGGTACGAGACCATGAAC
AAGATGACCACGAGCACGGCTGCTACGCCCCAAGGTGATGAACCGGCATGGTGAATGGAG
TCTTGTTCAGGAAAGGGGACGTACAAGGAGAGTCCCCCAGAGAAGAAGTGGACGATGAGG
AGGAGGAAGAGAGGGGAGAGGATGATGAAGAACTTGAGATTACTCATGGTGTCTTCGAGG
ATGGACTCGTAGTTCAAGTACCATGTGAAGGAGAACACGAAGAAGACGACCATGAAGAAG
AAACAGAGGTGTGGGTTTGGGAGAGAGATGT

QA 2 632 2 632
DS 

RD RS1DZ02JQ 755 0 0
GGCACAATATTCGTATCATTGCAATATTCATTTTAAGCTTTTACCTCATCCATTAAACTT
TCTATTGCATCAAATAAAAGGTTGTCTTCGTCTCATTTTTCCATATGATATTTACGAATA
CAAGCAGACCATACAAGCAGAGATAACTTCATCTACATATAAGGACACTCTGATATGACT
TAAGAGATCTTCGAAAAAAGTTTCACTCCTACACATGCGAGACTTAAATCTTCATCAAAA
AA*GAAAAGTACATACTACTTGATATTTAACATGGTTGTTCCATATCTAGCTAGATAGGG
CTGGTAACATGGAAAATCAGGCTGATCTCATGATCTACTTAGCCCCAAAGGGGAACCACA
TCTCGTGGATGTCTGACTGGTACGAGACCATGAACAAGATGACCACGAGCACGGCTGCTA
CGCCCCAAGGTGATGAACCGGCATGGTGAATGGAGTCTTGTTCAGGCAAGGGGACGTACA
AGGAGAGTCCCCCAGAGAAGAAGTGGACGATGAGGAGGAGGCAGAGAGGGGAGAGGATGA
TGAAGAACTTGAGATTATTCATGGTGTCTTCGAGGATGGACTCGTAGTTCAAGTACCATG
TGAAGGAGAACACGAAGAAGACGACCATGAAGAAGAAACAGAGGTGTGGGTTTGGGAGAG
AGATGTAGTCCAAGAAGGATGAGCCGTAGTATGGTGATCTCGCCATATGTTTGTTCTTCT
TGATCTTCTCTGGCTTTGATAAAGGTCTAGAGTT
T

QA 1 754 1 754
DS 

RD RS1DI11TF 730 0 0
TAAACTTTCTATTGCATCAAATAAAAGGTTGTCTTCGTCTCATTTTTCCATATGATATTT
ACGAATACAAGCAGACCATACAGGCAGAGATAACTTCATCTACATATAAGGACACTCTGA
TATGACTTAAGAGATCTTCGAAAAAAGTTTCACTCCTACACATGCGAGACTTAAATCTTC
ATCAAAAAAAGAAAAGTACATACTACTTGATATTTAACATG*TTGTTCCATATCTAGCTA
GATAGGGCTGGTAACATGGAAAATCAGGCTGATCTCATGATCTACTTAGCCCCAAAGGGG
AACCACATCTCGTGGATGTCTGACTGGTACGAGACCATGAACAAGATGACCACGAGCACG
GCTGCTACGCCCCAAGGTGATGAACCGGCATGGTGAATGGAGTCTTGTTCAGGAAAGGGG
ACGTACAAGGAGAGTCCCCCAGAGAAGAAGTGGACGATGAGGAGGAGGAAGAGAGGGGAG
AGGATGATGAAGAACTTGAGATTACTCATGGTGTCTTCGAGGATGGACTCGTAGTTCAAG
TACCATGTGAAGGAGAACACGAAGAAGACGACCATGAAGAAGAAACAGAGGTGTGGGTTT
GGGAGAGAGATGTAGTCCAAGAAGGATGAGCCGTAGTATGG*GATCTCGCCATATGTTTG
TTCTTCTTGATCTTCTCTGGCTTTGATAAAGGTCTAGAGTTCTTAGGATGTGTTAGTGAA
ATATAGATCC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RS1DZ02TF 624 0 0
TAAGGACACTCTGATATGACTTAAGAGATCTTCGAAAAAAGTTTCACTCCTACACATGCG
AGACTTAAATCTTCATCAAAAAA*GAAAAGTACATACTACTTGATATTTAACATGGTTGT
TCCATATCTAGCTAGATAGGGCTGGTAACATGGAAAATCAGGCTGATCTCATGATCTACT
TAGCCCCAAAGGGGAACCACATCTCGTGGATGTCTGACTGGTACGAGACCATGAACAAGA
TGACCACGAGCACGGCTGCTACGCCCCAAGGTGATGAACCGGCATGGTGAATGGAGTCTT
GTTCAGGCAAGGGGACGTACAAGGAGAGTCCCCCAGAGAAGAAGTGGACGATGAGGAGGA
GGCAGAGAGGGGAGAGGATGATGAAGAACTTGAGATTATTCATGGTGTCTTCGAGGATGG
ACTCGTAGTTCAAGTACCATGTGAAGGAGAACACGAAGAAGACGACCATGAAGAAGAAAC
AGAGGTGTGGGTTTGGGAGAGAGATGTAGTCCAAGAAGGATGAGCCGTAGTATGGTGATC
TCGCCATATGTTTGTTCTTCTTGATCTTCTCTGGCTTTGATAAAGGTCTAGAGTTTTTAG
AATGTGTTAGTGAAATATAGATCC

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 3

CO CL2824Contig1 844 3 27 U
GGAAAGATAAATCCCAAGGGAGGTGGGGTGCATCGTCGTCCCTAAAGCTTTTACAAGCAG
CCCAAGCAAACAGTTGACTCCTTATCTGACGAAGATGGTCTCCACAAGCAAGATCAAATC
CGTCGATTTCTACAGGAAAATCCCGAGGGATTTGACAGAGGCGACTCTGTCTGGAGCGGG
ATTGTCCATTGTAGCAGCACTCTGTATGCTCTTTTTATTTGGAATGGAGTTAAATAATTA
TTTGGCTGTAAGCACTACAACGTCCGTCATCGTTGACCGGAGCTCTGATGGGGACTTCCT
GCGCATGGATTTTAACATAAGCTTCCCATCACTTTCATGTGAATTTGCATCTGTGGATGT
CAGTGACGTATTAGGAACTAATAGGCTAAATGTAACAAAGACAATTCGGAAATTTTCTAT
CGATCCGAATTTGAGACCTACTGGTTCTGAGTTTCACTCTGGGGAAGTTCTATCGCAAGT
TAATCACGATGAAGCAGGTGAAGAAGTAGTTGAAGATTCTGTATCCCTTACTAGCCGCAA
CTTCGACACACTGCTACATCAATATCCTATCTCGGTTGTTAATTTCTATGCTCCGTGGTG
CTATTGGTGTAATCTCCTGAAACCATCATGGGAGAAAGCAGCAAAACAAATAAAGGAGAG
ATATGATCCAGAAATGGACGGACGTGTCATTTTGGCAAAAGTTGACTGCACCCAAGAAAC
TGATCTCTGTCGGAAGAATCACATTCAAGGGTATCCATCCATTCGCATTTTCCGCCAAGG
CAGTGATCTTAGGGATGACAAGGCACACCATGATCATGAATCGTACTATGGAGATCGTGA
TACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
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10 10 10 10 

AF RS1DK18TF U 1
AF RS1DM72TF U 39
AF RS1FV29TF U 637
BS 1 105 RS1DK18TF
BS 106 106 RS1DM72TF
BS 107 156 RS1DK18TF
BS 157 157 RS1DM72TF
BS 158 177 RS1DK18TF
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BS 179 372 RS1DK18TF
BS 373 373 RS1DM72TF
BS 374 409 RS1DK18TF
BS 410 410 RS1DM72TF
BS 411 477 RS1DK18TF
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RD RS1DK18TF 713 0 0
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CCCAAGCAAACAGTTGACTCCTTATCTGACGAAGATGGTCTCCACGAGCAAGATCAAATC
CGTCGATTTCTACAGGAAAATCCCGAGGGATTTGACTGAGGCGACTCTGTCTGGAGCTGG
ATTGTCCATTGTAGCAGCACTCTGTATGCTCTTTTTATTTGGAATGGAGTTAAATAATTA
TTTGGCTGTAAGCACTACAACGTCCGTCATCGTTGACCGGAGCTCTGATGGGGACTTCCT
GCGCATGGATTTTAACATAAGCTTCCCATCACTTTCATGTGAATTTGCATCTGTGGATGT
CAGTGACGTATTGGGAACTAATAGGCTAAATGTAACAAAGACAATTCGGGAATTTTCTAT
CGATCCGAATTTGAGACCTACTGGTTCTGAGTTTCACTCTGGGGAAGTTCTATCGCACGT
TAATCACGATGAAGCAGGTGAAGAAGTAGTTGAAGATTCTGTATCCCTTACTAGCCGCAA
CTTCGACACATTGTTACATCAATATCCTATCTCGGTTGTTAATTTCTATGCTCCGTGGTG
CTATTGGTGTAATCTCCTGAAACCATCATGGGAGAAAGCAGCAA*ACAAATAAAG*AGAG
ATATGATCCAGAA*TGGACGGACGTGTCATTTTGGCAAA
GTGACTGCACCAAG

QA 1 699 1 699
DS 

RD RS1DM72TF 723 0 0
GGCCCT
AAGCTTTTACAAGCAGCCGAAGCAAGCAGTTGACTCCTTATCTGACGAAGATGGTCTCCA
CAAGCAAGATCAAATCCGTCGATTTCTACAGGAAAATCCCGAGGGATTTGACAGAGGCGA
CTCTGTCTGGAGCGGGATTGTCCATTGTAGCAGCACTCTGTATGCTCTTTTTATTTGGAA
TGGAGTTAAATAATTATTTGGCTGTCAGCACTACAACGTCCGTCATCGTTGACCGGAGCT
CTGATGGGGACTTCCTGCGCATGGATTTTAACATAAGCTTCCCATCACTTTCATGTGAAT
TTGCATCTGTGGATGTCAGTGACGTATTAGGAACTAATAGGCTAAATGTAACAAAGACAA
TTCGGAAATTTTCTATTGATTCGAATTTGAGACCTACTGGTTCTGAGTTTCACTCTGGGG
AAGTTTTATCGCAAGTTAATCACGATGAAGCAGGTGAAGAAGTAGTTGAAGATTCTGTAT
CCCTTACTAGCCGCAACTTCGACACACTGCTACATCAATATCCTATCTCGGTTGTTAATT
TCTATGCTCCGTGGTGCTATTGGTGTAATCTCCTGAAACCATCATGGGAGAAAGCAGCAA
GACAAATAAAGGAGAGATATGATCCAGAAATGGACGGACGTGTCATTTTGGCAAAAGTTG
ACTGCACCCAAGAAGCTGATCTCTGTCGGAAGAATCACATTCAAGGGTATCCATCCA

QA 7 723 7 723
DS 

RD RS1FV29TF 208 0 0
GC
CAGCAAAACAAATAAAGGAGAGATATGATCCAGAAATGGACGGACGTGTCATTTTGGCAA
AAGTTGACTGCACCCAAGAAACTGATCTCTGTCGGAAGAATCACATTCAAGGGTATCCAT
CCATTCGCATTTTCCGCCAAGGCAGTGATCTTAGGGATGACAAGGCACACCATGATCATG
AATCGTACTATGGAGATCGTGATACC

QA 3 208 3 208
DS 



AS 1 2

CO CL2825Contig1 684 2 2 U
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CGAATTGAGCCCTTTCCAGACTAG


BQ
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AF RS1EZ51JQ C 1
AF RS1EZ51TF U 1
BS 1 683 RS1EZ51TF
BS 684 684 RS1EZ51JQ

RD RS1EZ51JQ 684 0 0
GGAAGTTTCAAAAAAACACGAAGGAAGAAGATAGATAGAGAGAGAACAATGGCGCAGATG
GTTGCGATGCCCGTAGCGCACTCCCTCTCCCTCATTTGCAATTGGACTAAATCAAATCCT
CTCACTCGCAACACTCTCGCTTTGCCACCTACTAACGCTCCCAGTAAGCAGAGCCTGAGC
ATCAGATGTGCTGTTGGAGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAGTACTCTCTC
CAGTACATTCATGGGATTGGACGAACCAGAGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTCCAGATG
GAGAACAAAATCACCAAAGACATGGCTGAGGAAGAGCTCATCATTTTTCGTGATGAAGTC
TCCAAGTACATGATCGAGGGTGATTTGAGGAGATTCAATGCGCTTGCTATCAAGAGGTTG
AAGGAGATACAGTGTTACCGTGGTGTAAGGCACATCCAAGGGTTACCATGTCGTGGACAG
AGAACCAAGAACAACTGTAGAACTTTTAAAGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGTAAGAAG
AAAGTTTCCAAGTAACCAACTCATTTGAATCTTGGATGTCCTGTAATAATACTCTTTTGT
TCTGTCTCTAGTTTTTCCTCTGTTTTAAAATGTGATTTTGTAATGTCCTGAAACTTGGTT
CGAATTGAGCCCTTTCCAGACTAG

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1EZ51TF 684 0 0
GGAAGTTTCAAAAAAACACGAAGGAAGAAGATAGATAGAGAGAGAACAATGGCGCAGATG
GTTGCGATGCCCGTAGCGCACTCCCTCTCCCTCATTTGCAATTGGACTAAATCAAATCCT
CTCACTCGCAACACTCTCGCTCTGCCACCTACTAACGCTCCCAGTAAGCAGAGCCTGAGC
ATCAGATGTGCTGTTGGAGGTGTGGAGATTCCGAGTAACAAGAGGATTGAGTACTCTCTC
CAGTACATTCATGGGATTGGACGAACCAGAGCTCGCCAGATCCTCGTTGATCTCCAGATG
GAGAACAAAATCACCAAAGACATGGCTGAGGAAGAGCTCATCATTCTTCGTGATGAAGTC
TCCAAGTACATGATCGAGGGTGATCTGAGGAGATTCAATGCGCTTGCTATCAAGAGGTTG
AAGGAGATACAGTGTTACCGTGGTGTAAGGCACATCCAAGGGTTACCATGTCGTGGACAG
AGAACCAAGAACAACTGTAGAACTCTTAAAGGCAAGAAAATTGCTATTGCTGGTAAGAAG
AAAGTTTCCAAGTAACCAACTCATCTGAATCTTGGATGTCCTGTAATAATACTCTTTTGT
TCTGTCTCTAGTTTTTCCTCTGTTTTAAAATGTGATTTTGTAATGTCCTGAAACTTGGTT
CGAATTGAGCCCTTTCCAGACTA
G

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

CO CL2826Contig1 1212 2 2 U
GGGTCTGAAAAAATGATTAGCCGTGTGGCCAAAAGCTATGGTTTAATCAGATTCTTGATG
AAACCGCGGGGTGATGGTGGATATCTACGTTTTCCCCAGTCTCTCCGTTGTTTTCCTGCT
GATGGGTTCTCTGCCTTTCGCAGTTGTTGCAACACGACGAGGAACAGATTCATGTCCGCC
TCCTCAACGGATCCGATGGCTGGAGGAGAGGAGGCAAACGGCGGCGTTACGCTGCTTCTT
CCGGCTGTCGAAGACAAGTACGGTGGCGTGATGGCTGAGATGAGTCGTCCTATGGATCCT
TCTGCCTTCTCTGCTCTTCTCCGTTCCTCTCTCTCTACCTGGACTCTTCAGGGAAAGAAG
GGAGTGTGGATCAAATTGCCTAGGCACCTCATTGGTCTTGCTGAAACTGTTGTTAAGGAA
GGATTCTGGTTCCATCACGCGGAGCAAAACTACTTGATGCTTGTGTATTGGATTCCCAAA
CAAGACCATACCCTTCCTTCCAATGCCTCTCACCGTGTTGGCATAGCTGCCTTTGTCATC
AACCACAAGAAAGAGGTGCTTGTTGTTCAAGAGAAGACAGGAAGATTTAAAGGCCAAGGT
ATCTGGAAGTTCCCCACAGGAGTAGTCAATGAGGGGGAATACATCCATGATGGTTCTGTC
AGAGAGGTGAAAGAAGAGACAGGAGTGGATACAGAGTTTGTCCAAGTATTGGCTTTCAGA
CAGACCCACAAAGCTTTTTTTGAAAAGTCAGATTTGTTCCTTGTTTGCATGATGAAGCCT
CTTTTTTTGGAGATCAATGCACAGGAGACTGAGATAGAGGCAGCTCAGTGGATGCCATGT
AAGAATACAAGAAGCAACCATTTGTACAGAACCACGAGCTGTTAAGGTATATGACAGACA
TTTGTTCAGCTAAAACCAACGGAGACTACGAAGGCTTCACCCCTCTCCTTGTTTTTGCAC
CTGATTTACAAGGCAACTTGTACTTCAACAACCGCGACCTCAGTTCCCGCCATTAGCAAT
TTTTTTTCACAACCAAAGGCAAAGCATTTCAAACCCTTTTAGCTTTCTCACATACCAAAA
TAAACATTTTGCATTTCAATGCTATTCAAATCCAATAGTTAAATTACAAAGACCAAACAG
AGCAGATCCTATTGTTTTTTCAAACACACTTAGATCCTCTTTACACAAGCCGCAAAACCT
AATTTTACATTG


BQ
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DS 

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GGTGAAAGAAGAGACAGGAGTGGATACAGAGTTTGTCCAAGTATTGGCTTTCAGACAGAC
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TTTGGAGATCAATGCACAGGAGACTGAGATAGAGGCAGCTCAGTGGATGCCATGTAAGAA
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TCAGCTAAAACCAACGGAGACTACGAAGGCTTCACCCCTCTCCTTGTTTTTGCACCTGAT
TTACAAGGCAACTTGTACTTCAACAACCGCGACCTCAGTTCCCGCCATTAGCAATTTTTT
TTCACAACCAAAGGCAAAGCATTTCAAACCCTTTTAGCTTTCTCACATACCAAAATAAAC
ATTTTGCATTTCAATGCTATTCAAATCCAATAGTTAAATTACAAAGACCAAACAGAGCAG
ATCCTATTGTTTTTTCAAACACACTTAGATCCTCTTTACACAAGCCGCAAAACCTAATTT
TACATTG

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 3

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GACAATGAGCCCAATACAAAAATAACAGAAACCAGAGGATCAGACACACTGGTCTTTGCA
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TCTATCACATAGCATAAACTATCTCTCCGCTACTGTCAATATCGATTTCAGACTCGGAAT
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CGGGATCAGCAACGAAGATTCTTGAAATGAGATGACAGCATTCAGGTGAGATCCGTACGT
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GCTGAAAGAAGAATCGAGCCTCATCCTCGCTAAACCGTCCAGCATTGCAAATCCGCTCAT
AAAGCTCACCACCAGAAGCATACTCCATAATAATAGCCAAATGAGTCGGTGTTAAAATGA
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AGTCGTAAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A176JQ U 1
AF RS1A176TR U 1
AF RS1A176TV C 487
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BS 681 802 RS1A176TR
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TCTATCACATAGCATAAACTATCTCTCCGCTACTGTCAATATCGATTTCAGACTCGGAAT
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GCATCGGTTGCTCAGGCTCTTGAAACTGGCTTCCCGTGTTGCTCTCCTCTATCAAATCAG
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CGGGATCAGCAACGAAAATTCTTGAAATGAGATGACAGCATTCAGGTGAGATCCGTACGT
CTTCGGGGATAGCGTATTTAACGCTGAGGATTCTCTGTATAGTCTTGCGATAGTCTCTTG
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GCGAGGTG

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CACCACCAGAAGCATACTCCATAATAATAGCCAAATGAGTCGGTGTTAAAATGACCTCTC
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TATCTCTCATGAGACGAGCTACTCCGAAGTTACCAGACCCAATATCCTTAACGAAGTCGT
AAC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 4

CO CL2828Contig1 1118 4 24 U
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TTGATTCCCCTGAGGCTCAACAACTGAACAAAGACATATTTGAAACCATATGCTATCATG
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GGGACTGGGCTGCTCTAAGAGATATGATTTCAAAGAACGGAATTCGAAACTCTCTTCTAG
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CGTATACGTCAAACATTTATAGTCGCAGAGTCTTGAGTGGTGAGTTCGTAGTTGTGAACA
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TAATATATGAGAATGGTTCTGTTATAAATGTCGCGGAGATTCCTGACGACTTGAAAGCAA
TTTACAAGACTGTGTGGGAGATTAAGCAGAGAACAGTGGTTGATATGGCAGTTGATCGTG
GATGCTTTATCGATCAAAGTCAAAGTTTGAATATACACATGGACAAACCCAACTTTGCCA
AACTCACCTCTTTACACTTCCACACCTGGAAGAAGGGTTTGAAAACGGGAATGTACTACC
TGCGATCGCGTGCTGCAGCAGATGCAATTAAGTTTACAGTAGACACAGCAATGCTAAAGG
AGAAGCCAGATGTAACCAAAGAAGATGAAGTAACAGAAGAAGACAATGAGAGGAAGATGG
CAGAGATGGTTTGCTCTTTGACAAACCGTGAGGACTGTCTCTCTTGTGGGAGTTAAAACA
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GTTGATGTGTGTAGTGTTAAGTACAACATAACTTAAATCTAGTTTCTGGTATAAGATTGT
GGTGTGTGAAAGTTGAACAAGTCTCTTTTCAAACTATGTAATATTAAGAAGCTGCTTTAA
GGTTTTTTATTAAATTCTATGGTTTAAAGGATTTCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DP70TF U 1
AF RS1B516TF U 117
AF RS1B516JQ C 237
AF RS1DP70JQ C 365
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RD RS1DP70TF 691 0 0
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TTTACAAGACTGTGTGGGAGATTAAGCAGAGAACAGTGGTTGATATGGCAGTTGATCGTG
GATGCTTTATCGATCAAAGTCAAAGTTTGAATATACACATGGACAAACCCAACTTTGCCA
AACTCACTTCTTTACACTTCCACACCTGGAA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1B516TF 763 0 0
G
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CCAAACTCACCTCTTTACACTTCCACACCTGGAAGAAGGGTTTGAAAACGGGAATGTACT
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TGGCAGAGATGGTT*GCTCTTTGACAA*CCGTGAGGACTGTC

QA 2 763 2 763
DS 

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ACCGCTGGACT
GGCTGCTCTA*GAGATATGATTTCAAAGAACGGAAT*CGAAACTCTCTTCTAGTAGCACC
AATGCCAACTGCTTCAACTATCCAGATTCTTGGGAATAATGAATGTTTTGAGCCGTATAC
GTCAAACATTTATAGTCGCAGAGTCTTGAGTGGTGAGTTCGTAGTTGTGAACAAGCATCT
TCTTCACGACTTGACTGATATGGGACTCTGGTCTCCTACTCTGAAAAACAAGATAATATA
TGAGAATGGTTCTGTTATAAATGTCGCGGAGATTCCTGACGACTTGAAAGCAATTTACAA
GACTGTGTGGGAGATTAAGCAGAGAACAGTGGTTGATATGGCAGTTGATCGTGGATGCTT
TATCGATCAAAGTCAAAGTTTGAATATACACATGGACAAACCCAACTTTGCCAAACTCAC
CTCTTTACACTTCCACACCTGGAAGAAGGGTTTGAAAACGGGAATGTACTACCTGCGATC
GCGTGCTGCAGCAGATGCAATTAAGTTTACAGTAGACACAGCAATGCTAAAGGAGAAGCC
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GGTTTGCTCTTTGACAAACCGTGAGGACTGTCTCTCTTGTGGGAGTTAAAACAAACAGTA
GAAGAAACAACAAAATTAATCACAAAACGTGCCTGCGTCTCTCGTTTAAGTCTGTTGATG
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GAAAGTTGAACAAGTCTCTTTTCAAACTATGTAATATTAAGAAGCTGCTTTAAGGTTTTT
TATT

QA 12 855 12 855
DS 

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TACGTCAAACATTTATAGTCGCAGAGTCTTGAGTGGTGAGTTCGTAGTTGTGAACAAGCA
TCTTCTTCACGACTTGACTGATATGGGACTCTGGTCTCCTACTCTGAAAAACAAGATAAT
ATATGAGAATGGTTCTGTTATAAATGTCGCGGAGATTCCTGACGACTTGAAAGCAATTTA
CAAGACTGTGTGGGAGATTAAGCAGAGAACAGTGGTTGATATGGCAGTTGATCGTGGATG
CTTTATCGATCAAAGTCAAAGTTTGAATATACACATGGACAAACCCAACTTTGCCAAACT
CACTTCTTTACACTTCCACACCTGGAAGAAGGGTTTGAAAACGGGAATGTACTACCTGCG
ATCGCGTGCTGCAGCAGATGCAATTAAGTTTACAGTAGACACAGCAATGCTAAAGGAGAA
GCCAGATGTAACCAAAGAAGATGAAGTAACAGAAGAAGACAATGAGAGGAAGATGGCAGA
GATGGTTTGCTCTTTGACAAACCGTGAGGACTGTCTCTCTTGTGGGAGTTAAAACAAACA
GTAGAAGAAACAATAAAATTAATCACAAAACGTGCCTGCGTCTCTCGTTTAAGTCTGTTG
ATGTGTGTAGTGTTAAGTACAACATAACTTAAATCTAGTTTCTGGTATAAGATTGTGGTG
TGTGAAAGTTGAACAAGTCTCTTTTCAAACTATGTAATATTAAGAAGCTGCTTTAAGGTT
TTTTATTAAATTCTATGGTTTAAAGGATTTCACT

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 4

CO CL2829Contig1 761 4 2 U
ACACAAAAACTCTGAGAGCTTATAAGATTCAGATTCACGAAAAGCTCGTCTTTTAAAGAC
GGAAACAACAAGCAAGCAGCACAAACAAAATCCATAATAATCCGACAGCTAAAAAGAAAC
ACAAACCCCAGGTAAATAATAGTTTGGTCATAAACCCTACTGAGGACTAGTAACAAAAAA
ACCCTT*ACTTGCCACCAAATCTCATGCTGCTCCATGGAAACTTAGCCCCGGAAGCAGCA
GCAGCAGAAGCTCTCGCCGTCGAAGTCGACCTCTCACCGCCGCCGCCGCGACGACTTTTA
CCATTACCATAGCCACCGACCTCCCTCTTCTCCTTCTGATCAAGCCAGTGACTCTTCTTA
TCATCTTCCTCCTCCACAAAGCTAGATCCTTTCACTTTACTCTTCCTATCTTCCTCGATG
TACTTCACCGGGAACAGATCCTTGGAGATCGACAAAGGGTTTTTGAGCGTGACGTAAGCT
TTCTTGTAGTCAGCCTTGGCTATCAACAGACCACCGCGCTTCTTCTTCTTCCCGTCCATG
TTCAAAGTGTTCACCTTTTCCACCTCGAATCCGTAGAGTGACTCGAGGACTCGCTTGATC
TCGATCTTCGTCGCTGAAGGTATCGTTTTCAGCGCGAACTCGTGGATGTTCGTCAGCTTC
GTAGGCATCAGAAGCTTGATCGGAAGATTCGCGAAATGAACAACTCGTCTTCCTAATCGA
CTCCCCATTTTTGATCGGAGTTTCTCTTCTTTCTCTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1GF44JQ U 1
AF RS1DW54JQ U 14
AF RS1GF44TF C 161
AF RS1DW54TF C 14
BS 1 560 RS1GF44JQ
BS 561 761 RS1DW54JQ

RD RS1GF44JQ 560 0 0
ACACAAAAACTCTGAGAGCTTATAAGATTCAGATTCACGAAAAGCTCGTCTTTTAAAGAC
GGAAACAACAAGCAAGCAGCACAAACAAAATCCATAATAATCCGACAGCTAAAAAGAAAC
ACAAACCCCAGGTAAATAATAGTTTGGTCATAAACCCTACTGAGGACTAGTAACAAAAAA
ACCCTT*ACTTGCCACCAAATCTCATGCTGCTCCATGGAAACTTAGCCCCGGAAGCAGCA
GCAGCAGAAGCTCTCGCCGTCGAAGTCGACCTCTCACCGCCGCCGCCGCGACGACTTTTA
CCATTACCATAGCCACCGACCTCCCTCTTCTCCTTCTGATCAAGCCAGTGACTCTTCTTA
TCATCTTCCTCCTCCACAAAGCTAGATCCTTTCACTTTACTCTTCCTATCTTCCTCGATG
TACTTCACCGGGAACAGATCCTTGGAGATCGACAAAGGGTTTTTGAGCGTGACGTAAGCT
TTCTTGTAGTCAGCCTTGGCTATCAACAGACCACCGCGCTTCTTCTTCTTCCCGTCCATG
TTCAAAGTGTTCACCTTTTC

QA 1 560 1 560
DS 

RD RS1DW54JQ 748 0 0
GAGAGCTTATAAGATTCAGATTCACGAAAAGCTCGTCTTTTAAAGACGGAAACAACAAGC
AAGCAGCACAAACAAAATCCATAATAATCCGACAGCTAAAAAGAAACACAAACCCCAGGT
AAATAATAGTTTGGTCATAAACCCTACTGAGGACTAGTAACAAAAAAACCCTT*ACTTGC
CACCAAATCTCATGCTGCTCCATGGAAACTTAGCCCCGGAAGCAGCAGCAGCAGAAGCTC
TCGCCGTCGAAGTCGACCTCTCACCGCCGCCGCCGCGACGACTTTTACCATTACCATAGC
CACCGACCTCCCTCTTCTCCTTCTGATCAAGCCAGTGACTCTTCTTATCATCTTCCTCCT
CCACAAAGCTAGATCCTTTCACTTTACTCTTCCTATCTTCCTCGATGTACTTCACCGGGA
ACAGATCCTTGGAGATCGACAAAGGGTTTTTGAGCGTGACGTAAGCTTTCTTGTAGTCAG
CCTTGGCTATCAACAGACCACCGCGCTTCTTCTTCTTCCCGTCCATGTTCAAAGTGTTCA
CCTTTTCCACCTCGAATCCGTAGAGTGACTCGAGGACTCGCTTGATCTCGATCTTCGTCG
CTGAAGGTATCGTTTTCAGCGCGAACTCGTGGATGTTCGTCAGCTTCGTAGGCATCAGAA
GCTTGATCGGAAGATTCGCGAAATGAACAACTCGTCTTCCTAATCGACTCCCCATTTTTG
ATCGGAGTTTCTCTTCTTTCTCTCTCCC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RS1GF44TF 601 0 0
TGAGGACTAGTAACAAAAAAACCCTTTACTTGCCACCAAATCTCATGCTGCTCCATGGAA
ACTTAGCCCCGGAAGCAGCAGCAGCAGAAGCTCTCGCCGTCGAAGTCGACCTCTCACCGC
CGCCGCCGCGACGACTTTTACCATTACCATAGCCACCGACCTCCCTCTTCTCCTTCTGAT
CAAGCCAGTGACTCTTCTTATCATCTTCCTCCTCCACAAAGCTAGATCCTTTCACTTTAC
TCTTCCTATCTTCCTCGATGTACTTCACCGGGAACAGATCCTTGGAGATCGACAAAGGGT
TTTTGAGCGTGACGTAAGCTTTCTTGTAGTCAGCCTTGGCTATCAACAGACCACCGCGCT
TCTTCTTCTTCCCGTCCATGTTCAAAGTGTTCACCTTTTCCACCTCGAATCCGTAGAGTG
ACTCGAGGACTCGCTTGATCTCGATCTTCATCGCTGAAGGTATCGTTTTCAGCGCGAACT
CGTGGATGTTCGTCAGCTTCGTAGGCATCAGAAGCTTGATCGGAAGATTCGCGAAATGAA
CAACTCGTCTTCCTAATCGACTCCCCATTTTTGATCGGAGTTTCTCTTCTTTCTCTCTCC
C

QA 1 601 1 601
DS 

RD RS1DW54TF 736 0 0
GAGAGCTTATAAGAT*CAGATTCACGAAAAGCTCGTCTTT*AAAGACGGAAACAACAAGC
AAGCAGCACAAACAAAATCCATAATAATCCGACAGCTAAAAAGAAACACAAACCCCAGGT
AAATAATAGTTTGGTCATAAACCCTACTGAGGACTAGTAACAAAAAAACCCTT*ACTTGC
CACCAAATCTCATGCTGCTCCATGGAAACTTAGCCCCGGAAGCAGCAGCAGCAGAAGCTC
TCGCCGTCGAAGTCGACCTCTCACCGCCGCCGCCGCGACGACTTTTACCATTACCATAGC
CACCGACCTCCCTCTTCTCCTTCTGATCAAGCCAGTGACTCTTCTTATCATCTTCCTCCT
CCACAAAGCTAGATCCTTTCACTTTACTCTTCCTATCTTCCTCGATGTACTTCACCGGGA
ACAGATCCTTGGAGATCGACAAAGGGTTTTTGAGCGTGACGTAAGCTTTCTTGTAGTCAG
CCTTGGCTATCAACAGACCACCGCGCTTCTTCTTCTTCCCGTCCATGTTCAAAGTGTTCA
CCTTTTCCACCTCGAATCCGTAGAGTGACTCGAGGACTCGCTTGATCTCGATCTTCGTCG
CTGAAGGTATCGTTTTCAGCGCGAACTCGTGGATGTTCGTCAGCTTCGTAGGCATCAGAA
GCTTGATCGGAAGATTCGCGAAATGAACAACTCGTCTTCCTAATCGACTCCCCATTTTTG
ATCGGAGTTTCTCTTC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 4

CO CL2830Contig1 968 4 7 U
GACAAATCAATATTTGATTAAAAAACCCATCCAGAAGAAAGAAGTAATGTTATTAAAACC
AAAACAAAACACAAAAGCTGCAAAGATAAACTCCTAATACATACACAAATGTGTATGAAA
ATGTATAGAAGAGGAGATCCAAACATCAAGAAGTCGAAACTCAGGCCGTCCCTGGAATTT
CAATCTCCGGCTTCGTTTTACTCTCATCCTTCGGGGTAGCGTTGCGGTACATTAAGTAAA
CAATTAGCTGAGATGCACACAAGGTCGTTCCAAGACCATTGCTTATGAGAACGTAGAGAT
CGAGTTTGTAGATCAAAGAGTAGGCAGTCCAAATCCCAGCGTTAACGAAACTAACGAAAG
ATAAGAGAAAGGGCATGTACTCTACACTCCTTGCCCTTATCACTTTTTTGATGACAAGTG
AAGGAGCCCCATACATAGCAATGTTGAAGATATCGCAGATGACACCAACGAAGGTCTGTT
TGGCAAAGGCATTTTGAATAGCGAAAAGGGTAATCAAAACAATCCCTGCAACGGCAATAA
CCTCAGCCACAAGGTACAGCCCAATCTTCCTCCTGATGTTTTTCGTGCCGCCACAGTAGA
TTAAGAAGATGGTAATGTAGATGGCTTCGAAACCCATGCCGACCGCATTAATGGTGGTAA
CAAGTAGACTATCCTTGTGAACAACAGGGAGTCCGTAGAAAACACAAAGCATACAGTTCA
TCATGGTTGCCACGTAAGGCCACGGCTGAAACTCCTCTACAGACTTGTTCTTGTAGATCC
TCCAAAACGTTGGCGCTGGCGAGAAGAATAGACCGAAAGAGATCACGTTCCCGATAACTC
CGACGATGAAGCGGACTTGTTTAGCGTCAACCATTGTTAAAATCGAAACGAGAGAGAGCG
AGTTTGGTGAAGAAGAAGACGAAGTGTAGAAGGAAACCTAATCGAGAGAGCGTTTAAGGG
TGTAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BS14JQ U 203
AF RS1BX43JQ U 1
AF RS1BX43TF C 192
AF RS1BS14TF C 250
BS 1 393 RS1BX43JQ
BS 394 394 RS1BS14JQ
BS 395 457 RS1BX43JQ
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BS 459 768 RS1BX43JQ
BS 769 961 RS1BX43TF
BS 962 968 RS1BS14TF

RD RS1BS14JQ 254 0 0
CTCATCCTTCGGGGTAGCGTTGCGGTACATTAAGTAAACAATTAGCTGAAAAGCACACAA
GGTCGTTCCAAGACCATTGCTTATGAGAACGTAGAGATCGAGTTTGTAGATCAAAGAGTA
GGCAGTCCAAATCCCAGCGTTAACGAAACTAACGAAAGATAAGAGAAAGGGCATGTACTC
TACACTCCTTGCCCTTATCACTTTTTTGATGACAAGTGAAGGAGCCCCATACATAGCAAT
GTTGAAGATATCGC

QA 1 254 1 254
DS 

RD RS1BX43JQ 768 0 0
GACAAATCAATATTTGATTAAAAAACCCATCCAGAAGAAAGAAGTAATGTTATTAAAACC
AAAACAAAACACAAAAGCTGCAAAGATAAACTCCTAATACATACACAAATGTGTATGAAA
ATGTATAGAAGAGGAGATCCAAACATCAAGAAGTCGAAACTCAGGCCGTCCCTGGAATTT
CAATCTCCGGCTTCGTTTTACTCTCATCCTTCGGGGTAGCGTTGCGGTACATTAAGTAAA
CAATTAGCTGAGATGCACACAAGGTCGTTCCAAGACCATTGCTTATGAGAACGTAGAGAT
CGAGTTTGTAGATCAAAGAGTAGGCAGTCCAAATCCCAGCGTTAACGAAACTAACGAAAG
ATAAGAGAAAGGGCATGTACTCTACACTCCTTGTCCTTATCACTTTTTTGATGACAAGTG
AAGGAGCCCCATACATAGCAATGTTGAAGATATCGCAAATGACACCAACGAAGGTCTGTT
TGGCAAAGGCATTTTGAATAGCGAAAAGGGTAATCAAAACAATCCCTGCAACGGCAATAA
CCTCAGCCACAAGGTACAGCCCAATCTTCCTCCTGATGTTTTTCGTGCCGCCACAGTAGA
TTAAGAAGATGGTAATGTAGATGGCTTCGAAACCCATGCCGACCGCATTAATGGTGGTAA
CAAGTAGACTATCCTTGTGAACAACAGGGAGTCCGTAGAAAACACAAAGCATACAGTTCA
TCATGGTTGCCACGTAAGGCCACGGCTGAAACTCCTCTACAGACTTGT

QA 1 768 1 768
DS 

RD RS1BX43TF 774 0 0
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ATCAAAGAGTAGGCAGTCCAAATCCCAGCGTTAACGAAACTAACGAAAGATAAGAGAAAG
GGCATGTACTCTACACTCCTTGTCCTTATCACTTTTTTGATGACAAGTGAAGGAGCCCCA
TACATAGCAATGTTGAAGATATCGCAGATGACACCAACGAAGGTCTGTTTGGCAAAGGCA
TTTTGAATAGCGAAAAGGGTAATCAAAACAATCCCTGCAACGGCAATAACCTCAGCCACA
AGGTACAGCCCAATCTTCCTCCTGATGTTTTTCGTGCCGCCACAGTAGATTAAGAAGATG
GTAATGTAGATGGCTTCGAAACCCATGCCGACCGCATTAATGGTGGTAACAAGTAGACTA
TCCTTGTGAACAACAGGGAGTCCGTAGAAAACACAAAGCATACAGTTCATCATGGTTGCC
ACGTAAGGCCACGGCTGAAACTCCTCTACAGACTTGTTCTTGTAGATCCTCCAAAACGTT
GGCGCTGGCGAGAAGAATAGACCGAAAGAGATCACGTTCCCGATAACTCCGACGATGAAG
CGGACTTGTTTAGCGTCAACCATTGTTAAAATCGAAACGAGAGAGAGCGAGTTTGGTGAA
GAAGAAGACGAAGTGTAGAAGGAAACCTAATCGAGAGAGCGTTTAAGGGT
TAAT

QA 1 770 1 770
DS 

RD RS1BS14TF 719 0 0
GAGAT
GCACACAAGGTCGTTCCAAGACCATTGCTTATGAGAACGTAGAGATCGAGTTTGTAGATC
AAAGAGTAGGCAGTCCAAATCCCAGCGTTAACGAAACTAACGAAAGATAAGAGAAAGGGC
ATGTACTCTACACTCCTTGCCCTTATCACTTTTTTGATGACAAGTGAAGGAGCCCCATAC
ATAGCAATGTTGAAGATATCGCAGATGACACCAACGAAGGTCTGTTTGGCAAAGGCATTT
TGAATAGCGAAAAGGGTAATCAAAACAATCCCTGCAACGGCAATAACCTCAGCCACAAGG
TACAGCCCAATCTTCCTCCTGATGTTTTTCGTGCCGCCACAGTAGATTAAGAAGATGGTA
ACGTAGATGGCTTCGAAACCCATGCCGACCGCATTAATGGTGGTAACAAGTAGACTATCC
TTGTGAACAACAGGGAGTCCGTAGAAAACCCAAAGCATACAGTTCATCATGGTTGCCACG
TAAGGCCACGGCTGAAACTCCTCTACAGACTTGTTCTTGTAGATCCTCCAAAACGTTGGC
GCTGGCGAGAAGAATAGACCGAAAGAGATCACGTTCCCGATAACTCCGACGATGAAGCGG
ACTTGTTTAGCGTCAACCATTGTTAAAATCGAAACGAGAGAGAGCGAGTTTGGTGAAGAA
GAAGACGAAGTGTAGAAGGAAACCTGATCGAGAGAGCGTTTAAGGGTGTAATCC

QA 6 719 6 719
DS 



AS 1 4

CO CL2831Contig1 881 4 10 U
GGACTCGGATCCTTAAACCCTAGTTTCCTCACCGCTGACCATTTCCGGCAATCGCACCAG
TCCCATGGCGAAATCCCTATCACGCTCCGCTCTCTCCCGAGTCGCTGCTCGTTTCTTTCC
CACCTCCAGGGCCGCCTCTCCTTCTCACCTCATCTCCCGTCGATCCTCACCGACGCTTTT
TCACGCCGTCGGATTCATCCCCACTTCGTCCCACCTAACTACGATCCGAACCCGGATGGA
TAGATCCGGTGGATCTTATTCCCCCCTAAACTCCGGATCCAACTTCAACGACCGGCCACC
TACTGAAATGGCGCCGCTATTCCCAGGTTGCGACTACGACCATTGGCTTATCGTCATGGA
AAAGCCCGGCGGCGAAAACGCTAGTCGACAGCAAATGATCGATTGCTATGTTCAAACCCT
AGCCAAAATTGTAGGCAGTGAGGAAGAAGCTAAGAGAAAGATCTACAATGTCTCTTGCGA
GAGGTATTTCGGTTTTGGCTGTGAGATTGATGAGGAGACATCAAACAAACTGGAAGGGAT
TCCTGGTGTTCTCTTCGTTCTTCCCGACTCTTATGTTGATCCTGAGTACAAAGATTACGG
AGCTGAGTTGTTTGTGAACGGGGAAGTAGTTCCTCGTCCACCAGAGAGGCAGCGGAGGAT
GACAGAGTTAACGACTCAGAGAAGCTCTGATAAACCAAAGTACCATGACAAAACTAGATA
TGTCCGACGGAGAGAAAACATGCGTTGACTCTAATTATCAAAGTCTAAGCTAGACATCTT
TCTCTTTGAACTCGTATCTAGTTGCCTCCTTAATATTCTATTTTCTCCAATCTGTGCGAA
CAATGTGAATGATAATCATGATGATGATGTCTGTTGGTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1CV86TF U 1
AF RS1CV86JQ C 177
AF RS1GS76JQ C 211
AF RS1GS76TF U 211
BS 1 292 RS1CV86TF
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RD RS1CV86TF 725 0 0
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TCCTGGTGTTCTCTTCGTTCTTCCCGACTCTTATGTTGATCCTGAGTACAAAGATTACGG
AGCTGAGTTGTTTGTGAACGGGGAAGTAGTTCCTCGTCCACCAGAGAGGTAGCGGAGGAT
GACAGAGTTAACGACTCAGAGAAGCTCTGATAAACCAAAGTACCATGACAAA*CTAGATA
TGTCC

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1CV86JQ 705 0 0
TTTTTCACGCCGTCGGATTCATCCCCACTTCGTCCCACCTAACTACGATCCGAACCCGGA
TGGATAGATCCGGTGGATCTTATTCCCCCCTAAACTCCGGATCCAACTTCAACGACTGGC
CACCTACTGAAATGGCGCCGCTATTCCCAGGTTGCGACTACGACCATTGGCTTATCGTCA
TGGAAAAGCCCGGCGGCGAAAACGCTAGTCGACAGCAAATGATCGATTGCTATGTTCAAA
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GCGAGAGGTATTTCGGTTTTGGCTGTGAGATTGATGAGGATACATCAAACAAACTGGAAG
GGATTCCTGGTGTTCTCTTCGTTCTTCCCGACTCTTATGTTGATCCTGAGTACAAAGATT
ACGGAGCTGAGTTGTTTGTGAACGGGGAAGTAGTTCCTCGTCCACCAGAGAGGTAGCGGA
GGATGACAGAGTTAACGACTCAGAGAAGCTCTGATAAACCAAAGTACCATGACAAAACTA
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TCTTTCTCTTTGAACTCGTATCTAGTTGCCTCCTTAATATTCTATTTTCTCCAATCTGTG
CGAACAATGTGAATGATAATCATGATGATGATGTCTGTTGGTTCT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RS1GS76JQ 671 0 0
AGGG
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TACGACCATTGGCTTATCGTCATGGAAAAGCCCGGCGGCGAAAACGCTAGTCGACAGCAA
ATGATCGATTGCTATGTTCAAACCCTAGCCAAAATTGTAGGCAGTGAGGAAGAAGCTAAG
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GAGACATCAAACAAACTGGAAGGGATTCCTGGTGTTCTCTTCGTTCTTCCCGACTCTTAT
GTTGATCCTGAGTACAAAGATTACGGAGCTGAGTTGTTTGTGAACGGGGAAGTAGTTCCT
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ATTCTATTTTCTCCAATCTGTGCGAACAATGTGAATGATAATCATGATGATGATGTCTGT
TGGTTCT

QA 5 671 5 671
DS 

RD RS1GS76TF 671 0 0
AGGG
CTAACTACGATCCGAACCCGGATGGATAGATCCGGTGGATCTTATTCCCCCCTAAACTCC
GGATCCAACTTCAACGACCGGCCACCTACTGAAATGGCGCCGCTATTCCCAGGTTGCGAC
TACGACCATTGGCTTATCGTCATGGAAAAGCCCGGCGGCGAAAACGCTAGTCGACAGCAA
ATGATCGATTGCTATGTTCAAACCCTAGCCAAAATTGTAGGCAGTGAGGAAGAAGCTAAG
AGAAAGATCTACAATGTCTCTTGCGAGAGGTATTTCGGTTTTGGCTGTGAGATTGATGAG
GAGACATCAAACAAACTGGAAGGGATTCCTGGTGTTCTCTTCGTTCTTCCCGACTCTTAT
GTTGATCCTGAGTACAAAGATTACGGAGCTGAGTTGTTTGTGAACGGGGAAGTAGTTCCT
CGTCCACCAGAGAGGCAGCGGAGGATGACAGAGTTAACGACTCAGAGAAGCTCTGATAAA
CCAAAGTACCATGACAAAACTAGATATGTCCGACGGAGAGAAAACATGCGTTGACTCTAA
TTATCAAAGTCTAAGCTAGACATCTTTCTCTTTGAACTCGTATCTAGTTGCCTCCTTAAT
ATTCTATTTTCTCCAATCTGTGCGAACAATGTGAATGATAATCATGATGATGATGTCTGT
TGGTTCT

QA 5 671 5 671
DS 



AS 1 3

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AAGGATTCTGCCTTGGATATTACACAAAAGCATATAGAGAAAGAAATCTTGATTTCGAAA
AACAATGGCGTACGAGAAAGTCAATGAGATTAACCTTAAGGACACAGAGCTTCGTCTTGG
ATTACCTGGAACAGAGCAAGTTAAGGAAGAACAAGAGGTTTCTTGTGTTAGAAGCATCAA
GCGTCAATATCAAAGCGATAACGAGGAAGAATCTACACCTCCTACGAAAACTCAAATCGT
TGGTTGGCCTCCGGTGAGATCTTACCGTAAGAACAACAACAGTATGAGCTATGTGAAAGT
GAGTATGGACGGAGCTCCATACCTACGTAAAATCGATCTCAAAACATATAAAAACTATCC
AGAGCTTCTCAGGGAGTTAGAGAACATGTTCAAGATCACAATAGGTGAATACAACGAAAG
AGAAGGGTACAGAGGATCTGAAGTTGTACCAACGTACGAGGATAAAGATGGAGACTGGAT
GTTGGTTGGTGATGTTCCATGGGATATGTTCTCTTCCTCTTGTAAGAGACTCAGAATCAT
GAAAGGACCTGATGCTCTCGCTTTAGACTCTGGCTTATGATGAATACCACACCAAACACG
AAACTATTCAGGGTTTTGTTCAATGAGTTAGATCCATTTCCACGTGATTTTATCTGTTCA
TTTTTATTTGTTTTTGGTTTTTAGATTTAGAATTTGATGTAAAGATACATGAAATTTATG
TATAATACGGATACATACACAATATAGATGCATATGTAGCAATGTTCTTGACGAAAAAAA
AA


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1F684TF U 1
AF RS1DS68JQ C 76
AF RS1DS68TF U 4
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BS 344 344 RS1DS68TF
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RD RS1F684TF 668 0 0
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AAGGATTCTGCCTTGGATATTACACAAAAGCATATAGAGAAAGAAATCTTGATTTCGAAA
AACAATGGCGTACGAGAAAGTCAATGAGATTAACCTTAAGGACACAGAGCTTCGTCTTGG
ATTACCTGGAACAGAGCAAGTTAAGGAAGAACAAGAGGTTTCTTGTGTTAGAAGCATCAA
GCGTCAATATCAAAGCGATAACGAGGAAGAATCTACACCTCCTACGAAAACTCAAATCGT
TGGTTGGCCTCCGGTGAGATCTTACCGTAAGAACAACAACAGTGTGAGCTATGTGAAAGT
GAGTATGGACGGAGCTCCATACCTACGTAAAATCGATCTCAAAACATATAAAAACTATCC
AGAGCTTCTCAGGGAGTTAGAGAACATGTTCGAGATCACAATAGGTGAATACAACGAAAG
AGAAGGGTACAGAGGATCTGAAGTTGTACCAACGTACGAGGATAAAGATGGAGACTGGAT
GTTGGTTGGTGATGTTCCATGGGATATGTTCTCTTCCTCTTGTAAGAGACTCAGAATCAT
GAAAGGACCTGATGCTCTCGCTTTAGACTCTGGCTTATGATGAATACCACACCAAACACA
AAACTATT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1DS68JQ 758 0 0
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GAAAGTCAATGAGATTAACCTTAAGGACACAGAGCTTCGTCTTGGATTACCTGGAACAGA
GCAAGTTAAGGAAGAACAAGAGGTTTCTTGTGTTAGAAGCATCAAGCGTCAATATCAAAG
CGATAACGAGGAAGAATCTACACCTCCTACGAAAACTCAAATCGTTGGTTGGCCTCCGGT
GAGATCTTACCGTAAGAACAACAACAGTATGAGCTATGTGAAAGTGAGTATGGACGGAGC
TCCATACCTACGTAAAATCGATCTCAAAACATATAAAAACTATCCAGAGCTTCTCAGGGA
GTTAGAGAACATGTTCAAGATCACAATAGGTGAATACAACGAAAGAGAAGGGTACAGAGG
ATCTGAAGTTGTACCAACGTACGAGGATAAAGATGGAGACTGGATGTTGGTTGGTGATGT
TCCATGGGATATGTTCTCTTCCTCTTGTAAGAGACTCAGAATCATGAAAGGACCTGATGC
TCTCGCTTTAGACTCTGGCTTATGATGAATACCACACCAAACACGAAACTATTCAGGGTT
TTGTTCAATGAGTTAGATCCATTTCCACGTGATTTTATCTGTTCATTTTTATTTGTTTTT
TGTTTTTAGATTTAGAATTTGATGTAAAGATACATGAAATTTATGTATAATACGGATACA
TACACAATATAGATGCATATGTAGCAATGTTCTTGACG

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1DS68TF 839 0 0
GG
ATCATTCATCAACCAAACTTACCAACAAGAACAATAACAATAGCAAGAACAAGAGAAGGA
TTCTGCCTTGGATATTACACAAAAGCATATAGAGAAAGAAATCTTGATTTCGAAAAACAA
TGGCGTACGAGAAAGTCAATGAGATTAACCTTAAGGACACAGAGCTTCGTCTTGGATTAC
CTGGAACAGAGCAAGTTAAGGAAGAACAAGAGGTTTCTTGTGTTAGAAGCATCAAGCGTC
AATATCAAAGCGATAACGAGGAAGAATCTACACCTCCTACGAAAACTCAAATCGTTGGTT
GGCCTCCGGTGAGATCTTACCGTAAGAACAACAACAGTATGAGCTATGTGAAAGTGAGTA
TGGACGGAGCTCCATACCTACGTAAAATCGATCTCAAAACATATAAAAACTATCCAGAGC
TTCTCAGGGAGTTAGAGAACATGTTCAAGATCACAATAGGTGAATACAACGAAAGAGAAG
GGTACAGAGGATCTGAAGTTGTACCAACGTACGAGGATAAAGATGGAGACTGGATGTTGG
TTGGTGATGTTCCATGGGATATGTTCTCTTCCTCTTGTAAGAGACTCAGAATCATGAAAG
GACCTGATGCTCTCGCTTTAGACTCTGGCTTATGATGAATACCACACCAAACACGAAACT
ATTCAGGGTTTTGTTCAATGAGTTAGATCCATTTCCACGTGATTT*ATCTGTTCATTTTT
ATTTGTTTTTG**TTTTAGATTTAGAATTTGATGTAA*GATACATGAAATTTATGTATAA
TACG*ATACATACACA*TATAGATGCATATGTAGCA*TGTTCTTGACGAAAAAAAAA

QA 3 839 3 839
DS 



AS 1 3

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AATAAAACCCTAACTAAGAGGTGATGGCGTGGGAAACACACTCAAATTCTCTTACAGAGT
TACAACCAAAACAAAGTACAGATCAAAAGCAAAGCACTGACTCCACCCTGGCTCTCTAAA
CCATTCACATCCACAAACCATAACCCAAAACCATCGAGACTCCGACCAAAACGTAACTCA
TCACTCCCTTTGAGGCACCACTTGCCTTCGGTGGTGGAGGAGAAGTTGACCCTGAAGCCG
GTGTACCTGGAGTTCCGGCATCCGGCGTTGAGCCCGGTATGGAAGGAGTTCCGGGAGTTG
TAAACGGCGGCGTGGGGGCGGCTGGAGTTCCGGAAGAGGCGGCTACGACAACCGCTAGCT
TCATGCCACCTTGACAGTGACCAATTGTCGGACAGTAGAAGTACCTTGGACCTACTTTGT
CGAGATCAATCGTGGTGTCTCCACCAGAATGAGTATCGATCGCTGTGCCTCCACAGCTAT
CATAACCTGCTTTGTTCACTTCGTTCACTGAGTGTGAAGGGCCATACTTGAACTCTAGAG
TGTCACCAACTCTGAAAGTCTTTCCTTTGACCCAAGCTGTGTAGTCCACACCACTATCCC
ATTGAGCAGCGTCTCCGACCGTGTACGTCACAGCAAGTGCAGCTGGGACAATGGCCAGGA
CTAGGAGAAGAGCGGTTGCAGCCATCTTGACAAACCACTAATTGCCATATGTTGTTAAGA
AGAGAAATATAATTGGAAAGATTGTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G933JQ U 36
AF RS1BJ16JQ U 1
AF RS1BJ16TF C 75
BS 1 724 RS1BJ16JQ
BS 725 725 RS1BJ16TF
BS 726 742 RS1BJ16JQ
BS 743 810 RS1BJ16TF

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ACACACTCAAATTCTCTTACAGAGTTACAACCAAAACAAGGTACAGATCAAAAGCAAAGC
ATTGACTCCACCCTGGCTCTCTAAACCATTCACATCCACAAACCATAACCC

QA 1 171 1 171
DS 

RD RS1BJ16JQ 755 0 0
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AATAAAACCCTAACTAAGAGGTGATGGCGTGGGAAACACACTCAAATTCTCTTACAGAGT
TACAACCAAAACAAAGTACAGATCAAAAGCAAAGCACTGACTCCACCCTGGCTCTCTAAA
CCATTCACATCCACAAACCATAACCCAAAACCATCGAGACTCCGACCAAAACGTAACTCA
TCACTCCCTTTGAGGCACCACTTGCCTTCGGTGGTGGAGGAGAAGTTGACCCTGAAGCCG
GTGTACCTGGAGTTCCGGCATCCGGCGTTGAGCCCGGTATGGAAGGAGTTCCGGGAGTTG
TAAACGGCGGCGTGGGGGCGGCTGGAGTTCCGGAAGAGGCGGCTACGACAACCGCTAGCT
TCATGCCACCTTGACAGTGACCAATTGTCGGACAGTAGAAGTACCTTGGACCTACTTTGT
CGAGATCAATCGTGGTGTCTCCACCAGAATGAGTATCGATCGCTGTGCCTCCACAGCTAT
CATAACCTGCTTTGTTCACTTCGTTCACTGAGTGTGAAGGGCCATACTTGAACTCTAGAG
TGTCACCAACTCTGAAAGTCTTTCCTTTGACCCAAGCTGTGTAGTCCACACCACTATCCC
ATTGAGCAGCGTCTCCGACCGTGTACGTCACAGCAAGTGCAGCTGGGACAATGGCCAGGA
CTAG*AGAAGAGCGGTTGCAGC
CATCTTGACAAAC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RS1BJ16TF 736 0 0
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AGTACAGATCAAAAGCAAAGCACTGACTCCACCCTGGCTCTCTAAACCATTCACATCCAC
AAACCATAACCCAAAACCATCGAGACTCCGACCAAAACGTAACTCATCACTCCCTTTGAG
GCACCACTTGCCTTCGGTGGTGGAGGAGAAGTTGACCCTGAAGCCGGTGTACCTGGAGTT
CCGGCATCCGGCGTTGAGCCCGGTATGGAAGGAGTTCCGGGAGTTGTAGACGGCGGCGTG
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GTGTCTCCACCAGAATGAGTATCGATCGCTGTGCCTCCACAGCTATCATAACCTGCTTTG
TTCACTTCGTTCACTGAGTGTGAAGGGCCATACTTGAACTCTAGAGTGTCACCAACTCTG
AAAGTCTTTCCTTTGACCCAAGCTGTGTAGTCCACACCACTATCCCATTGAGCAGCGTCT
CCGACCGTGTACGTCACAGCAAGTGCAGCTGGGACAATGGCCAGGACTAGGAGAAGAGCG
GTTGCAGCCATCTTGACAAACCACTAATTGCCATATGTTGTTAAGAAGAGAAATATAATT
GGAAAGATTGTGATCC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 3

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AAAGATAAAACAATGGACCAAAGAGCTATCTCTTATGATTCTGAATCAAACCACTTTATT
ACAAAACATCTGCTTGAGTACTAAAACGAATGAAGAAGAAAATATTATTTTACCACACAG
AAAAAGAAAAAAAACTCTCCTAATTAGAAAGACCATCATGATGATGATTAACCCTTGAAA
CGTTCCCAAAAGGTGGCCAAGAAGATCAAGAGGTGAGAGATGAGAAGAAGAATGGAGATG
ACTATCAAGAAGACACCTAGCTGCCACCATTTCCTTCTTACAGATCTTACGAATCCTAAC
TTGCAAGACCTACAATCATAACACAACACGCTCCAATCGTTTCTCCACAGCTGACAGTCA
CTTAGTCTTCCGACCATGCCCCCGTACAGAACCTCCGTCTTCAATGGTTGTCCCTCGTCT
TTTCTTCTATACCAAAACGTCGCGTTTAAAGTGTCCATGTTGCATGTCTCTGGCGGCATA
CAACATCCATTCTTTATAGGTGGCATTTTTCTTCTATTATAAGGTTTATCGTTTGGAGAT
CCGTAAGCAAGCTCGTTGCATGCGCCTTTGTCGTAGACACACGATTTGATATTGTTCCAG
TTCACATTATCCATCACTTTGAGCTTAAACCACGTCCCAGTCGCCGGAAACCTCATGGTC
TGCATCTCATTGACTCCGGCGTACGCCAAACCGATGAACAGCATTAACAAAAGAATCACG
AACATCACCACGAGTGCCGGCATCGGAAACTTCCGTCGGAGAAACAGAGCCACATTGCTG
ACGACGAACACGGCAAGGAGACCGACGCTAGCGATGGTCTGGATACGTGGAAGACCGAGG
ATATCTTCGCAGTCGTAGCTGCGCATGTAGAGGAGCCACACAGCGTAGCCTAGGAGTGTA
AGGGATAGAAAGAAGGTGAAGATGGGAAGTACACCGATGGCGAAAAGGTTCATGATTGTG
ACCAACGTTCCAACGGGTGGCTTAACGCTCTGTGACTCCATTTGGTCGGAGGTTTTGGCT
TCTGGTTCAGTCGTTGTTGTTGTTGTTACTACGGTTGCCGTGGCGGTGGCGGTTGCAGCT
GGTTCCTCGACGGGTACTACTTGAGCACTATCAGCCATGAAGGAAGTGAAGGAAAGGTCT
CTATGGAGGTGTTTTGTTTGACGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1ES72JQ U 1
AF RS1DJ25JQ U 15
AF RS1ES72TF C 458
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AAAAAGAAAAAAA*CTCTCCTAATTAGAAAGACCATCATGATGATGATTAACCCTTGAAA
CGTTCCCAAAAGGTGGCCAAGAAGATCAAGAGGTGAGAGATGAGAAGAAGAATGGAGATG
ACTATCAAGAAGACACCTAGCTGCCACCATTTCCTTCTTACAGATCTTACGAATCCTAAC
TTGCAAGACCTACAATCATAACACAACACGCTCCAATCGTTTCTCCACAGCTGACAGTCA
CTTAGTCTTCCGACCATGCCCCCGTACAGAACCTCCGTCTTCAATGGTTGTCCCTCGTCT
TTTCTTCTATACCAAAACGTCGCGTTTAAAGTGTCCATGTTGCATGTCTCTGGCGGCATA
CAACATCCATTCTTTATAGGTGGCATTTTTCTTCTATTATAAGGTTTATCGTTTGGAGAT
CCGTAAGCAAGCTCGTTGCATGCGCCTTTGTCGTAGACACACGATTTGATATTGTTCCAG
TTCACATTATCCATCACTTTGAGCTTAAACCACGTCCCAGTCGCCGGAAACCTCATGGTC
TGCATCTCATTGACTCCGGCGTACGCCAAACCGATGAACAGCATTAACAAAAGAAT

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DS 

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CTCTCCTAATTAGAAAGACCATCATGATGATGATTAACCCTTGAAACGTTCCCAAAAGGT
GGCCAAGAAGATCAAGAGGTGAGAGATGAGAAGAAGAATGGAGATGACTATCAAGAAGAC
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ATCATAACACAACACGCTCCAATCGTTTCTCCACAGCTGACAGTCACTTAGTCTTCCGAC
CATGCCCCCGTACAGAACCTCCGTCTTCAATGGTTGTCCCTCGTCTTTTCTTCTATACCA
AAACGTCGCGTTTAAAGTGTCCATGTTGCATGTCTCTGGCGGCATACAACATCCATTCTT
TATAGGTGGCATTTTTCTTCTATTATAGGGTTTATCGTTTGGAGATCCGTAAGCAAGCTC
GTTGCATGCGCCTTTGTCGTAGACACACGATTTGATATTGTTCCAGTTCACATTATCCAT
CACTTTGAGCTTAAACCACGTCCCAGTCGCCGGAAACCTCCTGGTCTGCATCTCATTGAC
TCCGGCGTACGCCAAACCGATGAACAGCATTAACAAAAGAATCACGAACATCACCACGAG
TGCCGGCATCGGAAACTTC

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DS 

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TATAAGGTTTATCGTTTGGAGATCCGTAAGCAAGCTCGTTGCATGCGCCTTTGTCGTAGA
CACACGATTTGATATTGTTCCAGTTCACATTATCCATCACTTTGAGCTTAAACCACGTCC
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ACAGCATTAACAAAAGAATCACGAACATCACCACGAGTGCCGGCATCGGAAACTTCCGTC
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TCTGGATACGTGGAAGACCGAGGATATCTTCGCAGTCGTAGCTGCGCATGTAGAGGAGCC
ACACAGCGTAGCCTAGGAGTGTAAGGGATAGAAAGAAGGTGAAGATGGGAAGTACACCGA
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CCATTTGGTCGGAGGTTTTGGCTTCTGGTTCAGTCGTTGTTGTTGTTGTTACTACGGTTG
CCGTGGCGGTGGCGGTTGCAGCTGGTTCCTCGACGGGTACTACTTGAGCACTATCAGCCA
TGAAGGAAGTGAAGGAAAGGTCTCTATGGAGGTGTTTTGTTTGACGG

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 3

CO CL2835Contig1 1059 3 3 U
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ATCCGGTATCGTCATCAACGGAATCGAACTCACTAACGTGTCACTCGTTGGGCTAGTGTG
TGACAAAGACATCTCTAAAGTCACTGAAGTTAAGTTCACTCTTGATGATGGCACTGGTCG
CATCGACTGTAAAAGATGGGTGAATGAAAGTTTCGACGCTAGAGAAATGGAGTCTGTTCA
AGATGGAACCTATGTGCGTCTCAATGGTCATTTGAAGACTTTTCAGGGGAATCAGCAGCT
TCTTGTTTTCTCTGTCAGACCTATTGTGGATTTCAACGAGGTGACCTTTCACTATATTGA
GTGTATTCACTTCTATTCCAAGAACTCTGAATCACAGTTGGGACAGCAAGTTGGTGATGC
CACTCAATCCCATACGGTCAATGCAAACCAGCCAACCACATTGAACCCTGTGATGCCCTC
TCAAAACAGTGATGGAAATGGGCGCAAGAACTTGGATGATATGATTCTGGACTATCTGAA
GCAACCTGCTTGCACTGCAAGACAACAGGGGATACACCTGGATGAAATTGCCCAGCAGTT
GAAGGTTCCAAAGAACAAGCTTGAGGGTGTTATTCAGTCACTGGAAGGGGATGGTCTTAT
ATACTCAACTATCGATGAGTATCACTTCAAGCATGTCGAGCTTTGATCAATCTATACTGC
GGTTAGGGAAGAGTCGGTTGAATCTTCTTTTCATCTAGTATCATTCTGCAACTACTTTAG
CTTATGTACCTGCTGCCTGCTTAAAAACTGAAAATGGATTGATTTTCCTAATCATGTTCT
TTGGTTTAGTTTTCCATTTTCTTTCAAGTTCCATATTCTCTAGCCTGCATTATGTTGCTA
CGAGTGGTTTAGTATTTCGGCTTCAGCCATATCATAACAGTTTGCATACGATGAAGTAAA
ACTTGGTTTGATAGGTAAGTTGTTTTGTCAGTTCCGCACCAGAAACAAGGCTTGTAATGA
AAAATTGATAATGCGATGAATTTAAAACGAGTACGTGTC


BQ
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AF RS1AC73TF U 1
AF RS1CX03TF U 156
AF RS1AC73JQ C 111
BS 1 732 RS1AC73TF
BS 733 850 RS1CX03TF
BS 851 1059 RS1AC73JQ

RD RS1AC73TF 732 0 0
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GCAACCTGCTTGCACTGCAAGACAACAGGGGATACACCTGGATGAAATTGCCCAGCAGTT
GAAGGTTCCAAAGAACAAGCTTGAGGGTGTTATTCAGTCACTGGAAGGGGATGGTCTTAT
ATACTCAACTATCGATGAGTATCACTTCAAGCATGTCGAGCTTTGATCAATCTATACTGC
GGTTAGGGAAGA

QA 1 732 1 732
DS 

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G
CACTCTTGATGATGGCACTGGTCGCATCGACTGTAAAAGATGGGTGAATGAAAGTTTCGA
CGCTAGAGAAATGGAGTCTGTTCAAGATGGAACCTATGTGCGTCTCAATGGTCATTTGAA
GACTTTTCAGGGGAATCAGCAGCTTCTTGTTTTCTCTGTCAGACCTATTGTGGATTTCAA
CGAGGTGACCTTTCACTATATTGAGTGTATTCACTTCTATTCCAAGAACTCTGAATCACA
GTTGGGACAGCAAGTTGGTGATGCCACTCAATCCCATACGGTCAATGCAAACCAGCCAAC
CACATTGAACCCTGTGATGCCCTCTCAAAACAGTGATGGAAATGGGCGCAAGAACTTGGA
TGATATGATTCTGGACTATCTGAAGCAACCTGCTTGCACTGCAAGACAACAGGGGATACA
CCTGGATGAAATTGCCCAGCAGTTGAAGGTTCCAAAGAACAAGCTTGAGGGTGTTATTCA
GTCACTGGAAGGGGATGGTCTTATATACTCAACTATCGATGAGTATCACTTCAAGCATGT
CGAGCTTTGATCAATCTATACTGCGGTTAGGGAAGAGTCGGTTGAATCTTCTTTTCATCT
AGTATCATTCTGCAACTACTTTAGCTTATGTACCTGCTGCCTGCTTAAAAACTGAAAATG
GATTGATTTTCCTAATCATGTTCTTTGGTTTAGT

QA 2 695 2 695
DS 

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GCACTGGTCGCATCGACTGTAAAAGATGGGTGAATGAAAGTTTCGACGCTAGAGAAATGG
AGTCTGTTCAAGATGGAACCTATGTGCGTCTCAATGGTCATTTGAAGACTTTTCAGGGGA
ATCAGCAGCTTCTTGTTTTCTCTGTCAGACCTATTGTGGATTTCAACGAGGTGACCTTTC
ACTATATTGAGTGTATTCACTTCTATTCCAAGAACTCTGAATCACAGTTGGGACAGCAAG
TTGGTGATGCCACTCAATCCCATACGGTCAATGCAAACCAGCCAACCACATTGAACCCTG
TGATGCCCTCTCAAAACAGTGATGGAAATGGGCGCAAGAACTTGGATGATATGATTCTGG
ACTATCTGAAGCAACCTGCTTGCACTGCAAGACAACAGGGGATACACCTGGATGAAATTG
CCCAGCAGTTGAAGGTTCCAAAGAACAAGCTTGAGGGTGTTATTCAGTCACTGGAAGGGG
ATGGTCTTATATACTCAACTATCGATGAGTATCACTTCAAGCATGTCGAGCTTTGATCAA
TCTATACTGCGGTTAGGGAAGAGTCGGTTGAATCTTCTTTTCATCTAGTATCATTCTGCA
ACTACTTTAGCTTATGTACCTGCTGCCTGCTTAAAAACTGAAAATGGATTGATTTTCCTA
ATCATGTTCTTTGGTTTAGTTTTCCATTTTCTTTCAAGTTCCATATTCTCTAGCCTGCAT
TATGTTGCTACGAGTGGTTTAGTATTTCGGCTTCAGCCATATCATAACAGTTTGCATACG
ATGAAGTAAAACTTGGTTTGATAGGTAAGTTGTTTTGTCAGTTCCGCACCAGAAACAAGG
CTTGTAATGAAAAATTGATAATGCGATGAATTTAAAACGAGTACGTGTC

QA 1 949 1 949
DS 



AS 1 4

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TCACTGAGATCTAAAGAAACATGGCGGATGTCGAGCCAGAGGTTGCTGCTGCTGCAGGAG
TCCCGAAGAAGAGGACGTTCAAGAAGTTTGCCTTCAAAGGAGTCGATCTCGATGCTCTTC
TTGACATGTCTACTGATGATCTCGTCAAGCTCTTCCCTTCTCGTATTCGCAGAAGGTTCT
CGAGAGGTTTGACCAGGAAGCCAATGGCTCTGATTAAGAAGCTGCGTAAGGCGAAAAGGG
AGGCACCACAAGGTGAGAAGCCTGAGCCAGTGAGAACCCATTTGAGGAACATGATCATCG
TCCCTGAGATGATCGGAAGCATCATTGGTGTCTACAATGGGAAGACTTTCAACCAGGTCG
AGATCAAGCCCGAGATGATTGGTCACTACCTGGCTGAGTTCTCCATCTCATACAAGCCGG
TTAAGCACGGTAGGCCTGGTGTTGGTGCTACCCACTCCTCCAGATTCATTCCTCTCAAGT
GAAGATCTTGCGGGAATGCGTTCCATCTCTTTACATGGTCTCTTGCCTTGATTTCTCAAA
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TCAACTATTATGTGACCAGGATCTTAAAAATCAAATCCTTTTGAGTTTTATTTTAAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CH59TF U 1
AF RS1CH59JQ C 1
AF RS1B003JQ C 10
AF RS1B003TF U 10
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BS 691 708 RS1B003TF
BS 709 717 RS1B003JQ

RD RS1CH59TF 641 0 0
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TCCCTGAGATGATCGGAAGCATCATTGGTGTCTACAATGGGAAGACTTTCAACCAGGTCG
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GAAGATCTTGCGGGAATGCGTTCCATCTCTTTACATGGTCTCTTGCCTTGATTTCTCAAA
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QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1CH59JQ 709 0 0
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TCACTGAGATCTAAAGAAACATGGCGGATGTCGAGCCAGAGGTTGCTGCTGCTGCAGGAG
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CGAGAGGTTTGACCAGGAAGCCAATGGCTCTGATTAAGAAGCTGCGTAAGGCGAAAAGGG
AGGCACCACAAGGTGAGAAGCCTGAGCCAGTGAGAACCCATTTGAGGAACATGATCATCG
TCCCTGAGATGATCGGAAGCATCATTGGTGTCTACAATGGGAAGACTTTCAACCAGGTCG
AGATCAAGCCCGAGATGATTGGTCACTACCTGGCTGAGTTCTCCATCTCATACAAGCCGG
TTAAGCACGGTAGGCCTGGTGTTGGTGCTACCCACTCCTCCAGATTCATTCCTCTCAAGT
GAAGATCTTGCGGGAATGCGTTCCATCTCTTTACATGGTCTCTTGCCTTGATTTCTCAAA
GTTTGTTGACCCTTTTTTTGTTGTTGCTTCATGATTAAAAATTTCTTTAGATACTATCTC
TCAACTATTATGTGACCAGGATCTTAAAAATCAAATCCTTTTGAGTTT
T

QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1B003JQ 708 0 0
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CTACTGATGATCTCGTCAAGCTCTTCCCTTCTCGTATTCGCAGAAGGTTCTCGAGAGGTT
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GCGGGAATGCGTTCCATCTCTTTACATGGTCTCTTGCCTTGATTTCTCAAAGTTTGTTGA
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ATGTGACCAGGATCTTAAAAATCAAATCCTTTTGAGTTTTATTTTAAG

QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1B003TF 708 0 0
ATCGCCTCCAAAA*GACTTAACGCAGACCATCGTCTTGTAACCGTATCCTTTCACTGAGA
TCTAAAGAAACATGGCGGATGTTGAGCCAGAGGTTGCTGCTGC***AGGAGTCCCGAAGA
AGAGGACGTTCAAGAAGTTTGCCTTCAAAGGAGTCGATCTCGATGCTCTTCTTGACATGT
CTACTGATGATCTCGTCAAGCTCTTCCCTTCTCGTATTCGCAGAAGGTTCTCGAGAGGTT
TGACCAGGAAGCCAATGGCTCTGATTAAGAAGCTGCGTAAGGCGAAAAGGGAGGCACCAC
AAGGTGAGAAGCCTGAGCCAGTGAGAACCCATTTGAGGAACATGATCATCGTCCCTGAGA
TGATCGGAAGCATCATTGGTGTCTACAATGGGAAGACTTTCAACCAGGTCGAGATCAAGC
CCGAGATGATTGGTCACTACCTGGCTGAGTTCTCCATCTCATACAAGCCGGTTAAGCACG
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GCGGGAATGCGTTCCATCTCTTTACATGGTCTCTTGCCTTGATTTCTCAAAGTTTGTTGA
CCCTTTTTTTGTTGTTGCTTCATGATTAAAAACTTCTTTAGATACTATCTCTCAACTATT
ATGTGACCAGGATCTTAAAA*TCAAATCCTTTTGAGTTT
ATTTTAGAA

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 4

CO CL2837Contig1 1075 4 7 U
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AGGGTATCGGTTGGGGATGGGCTGGTGTTATTTGGATTTACAGTATTGTAACATACTTCC
CACAAGACCTTTTGAAGTTTGCCATTCGATACATCTTGAGTGGAAAGGCTTGGACCAGCA
TGTTTGACAACAGGACTGCTTTCACGACCAAGAAAGATTACGGTATTGGAGAAAGAGAAG
CTCAATGGGCACAAGCTCAGAGGACACTGCACGGTCTGCAGCCAAAAGAAGAGGTCAATA
TCTTCCCAGAGAAAGGAGGTTACAGAGAGCTGTCTGAGATTGCCGAGCAAGCCAAGAGAA
GGGCCGAGATAGCTAGGCTTAGGGAGCTTCACACACTGAAGGGACATGTTGAATCAGTTG
CAAAGCTTAAGGGCTTGGACATTGATACAGCAGGACATCACTACACCGTGTAGTTACAAG
TTGAACAACACAGACTGTACCAAAACCAACAACCCATCATGACTCCGCTTTTAAAAACAA
AATTTCTTCACAAGTCTTTTTTTT*CTTTTTAAGATCGTAGTAGAGGGAAGAGAACTCTT
TGTGTATTGCCATAACTCTTCCCAAA*TAACTCTTTTCATCGTAGTCATTGTTCTTAAAC
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TGGTACTTTGGCTACACCTTTTTTCTAATGGCCTAATCTGAGCTTAATCTGAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1BI80TF U 234
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CACAAGACCTTTTGAAGTTTGCCATTCGATACATCTTGAGTGGAAAGGCTTGGACCAGCA
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TCTTCCCAGAGAAAGGAGGTTACAGAGAGCTGTCTGAGATTGCCGAGCAAGCCAAGAGAA
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CAAAGCTTAAGGGCTT

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GTCAATATCTTCCCAGAGAAAGGAGGTTACAGAGAGCTGTCTGTGATTGCCGAGCAAGCC
AAGAGAAGGGCCGAGATAGCTAGGCTTAGGGAGCTTCACACACTGAAGGGACATGTTGAA
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AAAACAAAATTTCTTCACAAGTCTTTTTTTT*CTTTTTAAGATCGTAGTAGAGGGAAGAG
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CTTAAACTTCTACTT

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TTGATTGCAGTGTATGCGGACTGGACATTTGCAAAGGTGAAGGGTATCGGTTGGGGATGG
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TTTTTCTTTTTAAGATCGTAGTAGAGGGAAGAGAACTCTTTGTGTATTGCCATAACTCTT
CCCAAAATAACTCTTTTCATCGTAGTCATTGTTCTTAAACTTCTACTTCGAGCTTTGCAA
AATTCGCCTTTGAAGAAACAAGGCTCTTGCCTTTGTATTTTGGTACTTTGGCTACACCTT
TTTTCTAATGGCCTAATCTGAGCTTAATCTGAACT

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CCCACAATACCTTTTGAAGTTTGCCATTCGATACATCTTGAGTGGAAAGGCTTGGACCAG
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AGCTCAATGGGCACAAGCTCAGAGGACACTGCACGGTCTGCAGCCAAAAGAAGAGGTCAA
TATCTTCCCAGAGAAAGGAGGTTACAGAGAGCTGTCTGTGATTGCCGAGCAAGCCAAGAG
AAGGGCCGAGATAGCTAGGCTTAGGGAGCTTCACACACTGAAGGGACATGTTGAATCAGT
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AGTTGAACAACACAGACTGTACCAAAACCAACAACCCATCATGACTCCGCTTTTAAAAAC
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TTTGGTACTTTGGCTACACCTTTTTTCTAATGGCCTAA

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DS 



AS 2 4

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ATTCTTCATAACTCTTCTGATGCATCCAGTTCTAGCAATCCAAAACCTTCTTCTCATCGA
AGCAAAGGCAAAAACGTTAAACCAATCCAATCCTTATATGCCACTCAGAGATTTGGTTTG
GTCGAGGAAGGGATTACAGCTCCTTCTTCATCTTCCAAGATTCTTCCTTACTCATCGTCA
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CCATTGGCTTTTGGGACTGATCTTGTTCTTGCAGAGAAGGCGACTCCACTAATGTCTGAG
TTTCATATTGCTAATCAGCAAGCGGTTAACTCTAACTCTTTCTCTTCAGAAAGCATAGAG
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AGCCGTTTTTTGAGCCGTCTCCCACGCCAAGAAGATGCAGCAGACACGTTTCGAAGGATG
ATGAAGCTGATGTTTTCTTAGATGATTTCCCCGCGGACATGTTTGATCAAGTCGACTATT
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ATGTGTGTGTTTAGGTCTAATTTAACGCAGACTCTAACTAGCTTTGTTTTTAGATGTGCT
TCACAAGCAACACTCTTAACTACTTTGTTATGTAATGACAATCCTTGTTTCTCTGTTATT
GTTCTTTTGTTGCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C210TF U 1
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AGCCGTT
TTT

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TCTCTGTTATTGTTCTTTTGTTGCC

QA 1 685 1 685
DS 



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ACTCATCATCAGACCAAAATGATCATGAAGCCTTGAGGTTGCCTGAATTGGGTATTAAGT
TAGAACATAAGCCATTGAATCTTGTTCTTGCAGAGACGGCGGCGACTCCACTAATGTCTG
AGTTTCATATTGCTAATCAGCAAGCGGTTAACTCTAACTCTTTCTCTTCAGAAAGCATAG
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CCGAGCCGTTGTTCGTTCTTCCCCAGCCGGTTTTCGAGCCGTCTCCCATGCCAAGAAGTT
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GTTATTTTTCTTTTGTTGCCAGAAATGTAATTATCTTATTTGAC


BQ
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AF RS1GF09JQ C 427
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AC


BQ
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10 

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C

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GACGGCAACACCACCAGAGAGTTTGGCTATTCTCTCAGCGAGCTTCTCCGAGTCGTACAC
AGAGTCAGTCTCGAACAGCTCCTTCTTCA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RS1FD11TF 713 0 0
CAAG
TTTATTATGCAAAATCAGAACAATCCTTACTCAAAAAAAAAAAGATAATTATTTCTCATT
AAACAAACTCATTTCCCCCAGAGAAAAAATAACTTAAAAACATTGCAGATCGATAGATGG
GGAACAAGAGATACACATGTGCAACTTCATTACACCATGAGGCCCTCAGGTGCAGCAGCA
GCAGCAGCCTTAGGTTTAGGCTTGTCAACAACGATAGCCTGAGTGGTCAGCACCATCCCT
GCAACCGAAGCAGCGTTCTGAAGCGCACATCTCGTCACTTTAGCCGGATCAATCACTCCA
GCTTCCAACAGATTCTCATAGGTATCAGTCATGGCGTTGTACCCTAGCTCCCATTCACTG
AACATAATCTTCTCCACCACAACTTCTCCTTCAATCCCAGCGTTCTGCGCAATAAGTGCT
GCTGGTGCCACCAATGCCTTCTGTACTATATCAGCTCCCAAACGTTCATCAGCGTCCTCA
AACGTCTCCTTAATGGCAGGGATAACAGTGGAGAGATGCACCAGAGTCGCACCACCACCA
GGGACTATCCCTTCCTCGATAGCAGCAAACGTCGCGTTCTTCGCGTCCTCGATACGAAGC
TTACGGTCCTCCAGCTCGGTTTCAGTCGCTGCTCCGACTTTAATGACGGCAACACCACCA
GAGAGTTTGGCTATTCTCTCAGCGAGCTTCTCCGAGTCGTACACAGAG
C

QA 5 712 5 712
DS 

RD RS1E991JQ 811 0 0
CAGAACAATCCTTACTCAAAAAAAAAA*GATAATTATTTCTCATTAAACAAACTCATTTC
CCCCAGAGAAAAAATAACTTAAAAACATTGCAGATCGATAGATGGGGAACAAGAGATACA
CATGTGCAACTTCATTAC**CATGAGGCCCTCAGGTGCAGCAGCAGCAGCAGCCTTAGGT
TTAGGCTTGTCAACAACGATAGCCTGAGTGGTCAGCACCATCCCTGAAACCGAAGCAGCG
TTCTGAAGCGCACATCTCGTCACTTTAGCCGGATCAATCACTCCAGCTTCCAACAGATTC
TCATAGGTATCAGTCATGGCGTTGTACCCTAGCTCCCATTCACTGAACATAATCTTCTCC
ACCACAACTTCTCCTTCAATCCCAGCGTTCTGCGCAATAAGTGCTGCTGGTGCCACCAAT
GCCTTCTGTACTATATCAGCTCCCAAACGTTCATCAGCGTCCTCAAACGTCTCCTTAATG
GCAGGGATAACAGTGGAGAGATGCACCAGAGTCGCACCACCACCAGGGACTATCCCTTCC
TCGATAGCAGCAAACGTCGCGTTCTTCGCGTCCTCGATACGAAGCTTACGGTCCTCCAGC
TCGGTTTCAGTCGCTGCTCCGACTTTAATGACGGCAACACCACCAGAGAGTTTGGCTATT
CTCTCAGCGAGCTTCTCCGAGTCGTACACAGAGTCAGTCTCGAACAGCTCCTTCTTCAGC
TGGGAGATACGAGCTTGCAACTCGTCCTTGGAAGCTGCATCTGCGATAAGCGTAGTCGAG
TCTTTGCTTATGGTCACTTTACGAGCGATAC

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 3

CO CL2840Contig1 782 3 18 U
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GGTTTCAAAGAAAAACAAAATCAAAAGATAAAAACATCAACAAAAGAAGTGTAAGTACAA
TTTATTCTCGAATTACATTAAAAAAAAGTCCCAAACAATTACTGCCAAGTGTTTGAACGA
TTCAGCGTTATTGGTTACTTTCATTTACTCTAGTCCTCACGTGCGTGCCAAGTTCGATAT
TTGTCTTTCATCATCATTTAGTGCGAAATGAAAACATTATACTCGACCACGGCATCCAAA
CCACTAATCGAGTAAGTCTCGGCCTGTGCATAGCCTCTAGCGAGCCTGAACGCACCGGTA
CCTCCTATGATCGGAAACTCTCTCACTTTTGAGAATATAGGATTCCGTCCGTACATAGAG
ACGGTGCTGCCGTTAAACTCACCTTCCGTGAACACCAAGTTAAACACCATGGTGAAGCTT
AAGGTGTTCATATCCGTCGACGCATACATCCCCTGAGCCCTCCCGATTTCCTTGGAACTC
CGGTCGGGTCCCTCAGTCAAAGGGTTGTCGGCTATCACAACCACACCAAATGATGAGACG
GCGGAGGAGTTTACGACGGGGGGCACTGTGACTCTTATGGCGGTGGGTTTGTCACCGGAT
ATGACGTCATGGAAGTAGAAGCGGAGGTGCGTGAGTTTCTCTGGCTTGTATTCTTGAAAC
GGAGTCGTTTTGGAGTAAGAGTTGGATTCTGCAGCAGTGACGGCAAGAAGAAGAATCGTT
GC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1FR01JQ U 16
AF RS1H456JQB U 3
AF RS1FR01TF C 1
BS 1 3 RS1FR01TF
BS 4 15 RS1H456JQB
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BS 70 70 RS1H456JQB
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BS 486 581 RS1FR01JQ
BS 582 782 RS1FR01TF

RD RS1FR01JQ 566 0 0
TTTTATTGAACTTTAGTCGACACAACAACAACAACAACAACATCAGGTTTCAAAAAAAAA
CAAAATCAAAAGATAAAAACATCAACAAAAGAAGTGTAAGTACAATTTATTCTCGAATTA
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AACTCACCTTCCGTGAACACCAAGTTAAACACCATGGTGAAGCTTAAGGGGTTCATATCC
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GTCAAAGGGTTGTCGGCTATCACAAC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RS1H456JQB 566 0 0
A
TACTCACACACCTTTTATTGAACTTTAGTCGACACAACAACAACAATAACAACATCAGGT
TTCAAAGAAAAACAAAATCAAAAGATAAAAACATCAACAAAAGAAGTGTAAGTACAATTT
ATTCTCGAATTACATTAAAAAAAAGTCCCAAACAATTACTGCCAAGTGTTTGAACGATTC
AGCGTTATTGGTTACTTTCATTTACTCTAGTCCTCACGTGCGTGCCAAGTTCGATATTTG
TCTTTCATCATCATTTAGTGCGAAATGAAAACATTATACTCGACCACGGCATCCAAACCA
CTAATCGAGTAAGTCTCGGCCTGTGCATAGCCTCTAGCGAGCCTGAACGCACCGGTACCT
CCTATGATCGGAAACTCTCTCACTTTTGAGAATATAGGATTCCGTCCGTACATAGAGACG
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GTGTTCATATCCGTTGACGCATACATCCCCTGAGCCCCCCCGATTTCCTTGGAACTCCGG
TCGGGTCCCTCAGTCAAAGGGTTGT

QA 2 566 2 566
DS 

RD RS1FR01TF 782 0 0
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GGTT*CAAAGAAAAACAAAATCAAAAGATAAGAACATCAACAAAAGAAGTGTAAGTACAA
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TTCAGCGTTATTGGTTACTTTCATTTACTCTAGTCCTCACGTGCGTGCCAAGTTCGATAT
TTGTCTTTCATCATCATTTAGTGCGAAATGAAGACATTATACTCGACCACGGCATCCAAA
CCACTAATCGAGTAAGTCTCGGCCTGTGCATAGCCTCTAGCGAGCCTGAACGCACCGGTA
CCTCCTATGATCGGAAACTCTCTCACTTTTGAGAATATAGGATTCCGTCCGTACATAGAG
ACGGTGCTGCCGTTAAACTCACCTTCCGTGAACACCAAGTTAAACACCATGGTGAAGCTT
AAGGTGTTCATATCCGTCGACGCATACATCCCCTGAGCCCTCCCGATTTCCTTGGAACTC
CGGTCGGGTCCCTCAGTCAAAGGGTTGTCGGCTATCACAACCACACCAAATGATGAGACG
GCGGAGGAGTTTACGACGGGGGGCACTGTGACTCTTATGGCGGTGGGTTTGTCACCGGAT
ATGACGTCATGGAAGTAGAAGCGGAGGTGCGTGAGTTTCTCTGGCTTGTATTCTTGAAAC
GGAGTCGTTTTGGAGTAAGAGTTGGATTCTGCAGCAGTGACGGCAAGAAGAAGAATCGTT
GC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 3

CO CL2841Contig1 777 3 2 U
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GGACCTTTACCAGTAACAATTGCTTGAACAAAGAATCCAAACATGGAGAACATGGCAAGA
CGTCCGTTCTTGAGCTCCTTAACCTTCAGCTCAGCGAAGGCCTCCGGGTCCTCTGCCAAA
TTCAACGGGTCGAACGCACCTCCGGGGTAAAGCGGGTCAAGACCTTCTCCGAGAGGACCA
CCTCCGATTCTGTACCCTTCTATCAAACCCATGAGCACAACTTGACAAGCCCATATGGCT
AAAATGCTTTGCGCGTGGATCAAGTTAGGGTTTCCGAGGTAGTCAAGACCTCCTTCTGAA
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AGGATCTCGGGGAACGTGCAGCCTAGAGCTCCCAACATTGCCCATCTGCTGTGGATTACA
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AAGTACTTGGGACGGTCTGGTCCGTACCAAATGCTTTGAGGAGTAGACTTAACGGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AP03JQ U 1
AF RS1AP03TFB C 7
AF RS1FS44JQ U 3
BS 1 740 RS1AP03JQ
BS 741 777 RS1FS44JQ

RD RS1AP03JQ 741 0 0
ACCCCAAGTACCAAATTCACATAAAACACGACCAATACATTGATGCTTTTACAAAGTAAG
ATAAGACGGTGAAGCAAATCCATAAGATAGATAAATCACTTTCCGGGGACAAAGTTGGTA
GCGAAAGACCAGGCGTTGTTAGCCACAGGATCTGCCAAGTGATCAAACAAGTTCTCGATG
GGACCTTTACCAGTAACAATTGCTTGAACAAAGAATCCAAACATGGAGAACATGGCAAGA
CGTCCGTTCTTGAGCTCCTTAACCTTCAGCTCAGCGAAGGCCTCCGGGTCCTCTGCCAAA
TTCAACGGGTCGAACGCACCTCCGGGGTAAAGCGGGTCAAGACCTTCTCCGAGAGGACCA
CCTCCGATTCTGTACCCTTCTATCAAACCCATGAGCACAACTTGACAAGCCCATATGGCT
AAAATGCTTTGCGCGTGGATCAAGTTAGGGTTTCCGAGGTAGTCAAGACCTCCTTCTGAA
AAGATCTGGGATCCTGCCTTGAACCACACGGCTTCTCCGAATTTGACTCCGTTCTTGGAG
AGGATCTCGGGGAACGTGCAGCCTAGAGCTCCCAACATTGCCCATCTGCTGTGGATTACA
**GAGCTCACGGTTCTTAGCGAATGTCTCTGGGTCGGCGGAAAGTCCCGCGGTGTCCCAG
CCGTAGTCTCCGGGGTATTCTCCGGTTAGGTAGGACGGTGTGTTCTCGGAGAACGGTCCC
AAGTACTTGGGACGGTCTGG
C

QA 1 740 1 740
DS 

RD RS1AP03TFB 735 0 0
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GACCAGGCGTTGTTAGCCACAGGATCTGCCAAGTGATCAAACAAGTTCTCGATGGGACCT
TTACCAGTAACAATTGCTTGAACAAAGAATCCAAACATGGAGAACATGGCAAGACGTCCG
TTCTTGAGCTCCTTAACCTTCAGCTCAGCGAAGGCCTCCGGGTCCTCTGCCAAATTCAAC
GGGTCGAACGCACCTCCGGGGTAAAGCGGGTCAAGACCTTCTCCGAGAGGACCACCTCCG
ATTCTGTACCCTTCTATCAAACCCATGAGCACAACTTGACAAGCCCATATGGCTAAGATG
CTTTGCGCGTGGATCAAGTTAGGGTTTCCGAGGTAGTCAAGACCTCCTTCTGAGAAGATC
TGGGATCCTGCCTTGAACCACACGGCTTCTCCGAATTTGACTCCGTTCTTGGAGAGGATC
TCGGGGAACGTGCAGCCTAGAGCTCCCAACATTGCCCATCTGCTGTGGATTACA**GAGC
TCACGGTTCTTAGCGAATGTCTCTGGGTCGGCGGAAAGTCCCGCGGTGTCCCAGCCGTAG
TCTCCGGGGTATTCTCCGGTTAGGTAGGACGGTGTGTTCTCGGAGAACGGTCCCAAGTAC
TTGGGACGGTCTGG
C

QA 1 734 1 734
DS 

RD RS1FS44JQ 775 0 0
ACTA
AGTACCAAATTCACATAAAACAAGAACAATACATTGATGCTTTTACAAAGTAAGATAAGA
CGGTGAAGCAAATCCATAAGATAGATAAATCACTTTCCGGGGACAAAGTTGGTAGCGAAA
GACCAGGCGTTGTTAGCCACAGGATCTGCCAAGTGATCAAACAAGTTCTCGATGGGACCT
TTACCAGTAACAATGGCTTGAACAAAGAATCCAAACATCGAGAACATGGCAAGACGTCCG
TTCTTGAGCTCCTTCACCTTCAACTCAGCGAAGGCCTCCGGGTCTTCTGCCAAATTCAAC
GGGTCGAACGCACCTCCGGGGTAAAGCGGGTCAAGACCTTCACCGAGAGGACCACCTCCG
ATTCTGTACCCTTCGATCAAACCCATGAGCACGACCTGACAAGCCCAGATGGCTAAAATG
CTTTGCGCGTGGATCAAGTTAGGGTTTCCGAGGTAGTCAAGACCTCCTTCTGAAAAGATC
TGGGATCCTGCCTTGAACCACACGGCTTCTCCGAATTTGACTCCGTTCTTGGAGAGGATC
TCGGGGAACGTGCAGCCTAGAGCTCCCAACATTGCCCATCTGCTGTGGATTACTTCGAGC
TCACGGTTCTTAGCGAATGTCTCTGGGTCAGCGGAAAGTCCCGCGGTGTCCCAGCCGTAG
TCTCCGGGGTATTCTCCGGTTAGGTAGGACGGTGTGTTCTCGGAGAACGGTCCCAAGTAC
TTGGGACGGTCTGGTCCGTACCAAATGCTTTGAGGAGTAGACTTAACGGTG

QA 5 775 5 775
DS 



AS 1 4

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TGCTACGAAGGGACAGGAGGAGTCGAAGAAGCAGATCAGAGACGAAGAACTATTCAAAGC
GGCGGAATCGGAAGATTCTTCGGTGTTCATGTCTTTATCTCCTCAGCAGCTAGCGAAATC
TCTCAGTTTTAGAAACGAAGACGGTCGCTCCCTCCTCCACGTCTCTGCTTCTTTCGGTCA
TTCCCAGATAGTGAAGTTGCTGTCAAGTGTAGATGAATCAAAGACGGTAATCAATAGTAA
GGATGATGAAGGATGGGCTCCTCTACATTCTGCTGCTAGCATCGGCAAGGCTGAGCTCGT
TGAAATCTTATTGACTAGAGGTGCTGATGTAAATGTCAAGAACAATGGTGGTCGCACTGC
TCTTCACTATGCTGCTAGCAAGGGATGGTTAGAGATCGCTCAGCTTTTACTAACACATGG
CGCAAAGATAAACATCACCGACAAGGTGGGTTGCACTCCGCTTCACAGGGCAGCAAGCAC
CGGAAAGTCTGAAGTTTGTGAGTTCCTGATCGAGGAAGGAGCAGAGATCGATGCTACGGA
TAAAATGGGCCAAACTCCACTCATGCATTCAGTGATCTGCGATGACAGACAAGTTGCGTT
TCTCCTTGTAAGACATGGTGCAGATGTGGATGTAGAAGACAAGGAAGGCTACACTGTTCT
AGGCCGAGCTTCCACCGATTTCAGACCAGCACTTATCGATGCTGCCAAGGCTATGCTTGA
ATGAGAAATTTTTTCTTAAACGGATTGAACATAAAAAGGATTGTTCTTTTATTTGTTCAA
GTTTGCAAGATTTTTCAGCTGATTTGTTCCTGAAGATAATGTTTATCAATCCATTTTCTT
CTCTACAAATTTTCAATTGTGTATTAAATCTCCAATTAATTGCTCTTTTCCTTCAGTTGA
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1CQ86TF U 1
AF RS1CG93TF U 6
AF RS1CG93JQ C 144
AF RS1CQ86JQ C 117
BS 1 218 RS1CQ86TF
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RD RS1CQ86TF 699 0 0
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CGCAAAGATAAACATCACCGACAAGGTGGGTTGCACTCCGCTTCACAGGGCAGCAAGCAC
CGGAAAGTCTGAAGTTTGTGAGTTCCTGATCGAGGAAGGAGCAGAGATCGATGCTACGGA
TAAAATGGGCCAAACTCCACTCATGCATTCAGTGATCTGCGATGACAGACAAGTTGCGTT
TCTCCTTGTAAGACATGGTGCAGATGTGGGTGTA
GAAGA

QA 1 694 1 694
DS 

RD RS1CG93TF 689 0 0
GG
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ATAGTGAAGTTGCTGTCAAGTGTAGATGAATCAAAGACGGTAATCAATAGTAAGGATGAT
GAAGGATGGGCTCCTCTACATTCTGCTGCTAGCATCGGCAAGGCTGAGCTCGTTGAAATC
TTATTGACTAGAGGTGCTGATGTAAATGTCAAGAACAATGGTGGTCGCACTGCTCTTCAC
TATGCTGCTAGCAAGGGATGGTTAGAGATCGCTCAGCTTTTACTAACACATGGCGCAAAG
ATAAACATCACCGACAAGGTGGGTTGCACTCCGCTTCACAGGGCAGCAAGCACCGGAAAG
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GGCCAAACTCCACTCATGCATTCAGTGATCTGCGATGACAGACAAGTTGCGTTTCTCCTT
GTAAGACATGGTGCAGATGTGGATGTA

QA 3 689 3 689
DS 

RD RS1CG93JQ 811 0 0
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AGCTTTTACTAACACATGGCGCAAAGATAAACATCACCGACAAGGTGGGTTGCACTCCGC
TTCACAGGGCAGCAAGCACCGGAAAGTCTGAAGTTTGTGAGTTCCTGATCGAGGAAGGAG
CAGAGATCGATGCTACGGATAAAATGGGCCAAACTCCACTCATGCATTCAGTGATCTGCG
ATGACAGACAAGTTGCGTTTCTCCTTGTAAGACATGGTGCAGATGTGGATGTAGAAGACA
AGGAAGGCTACACTGTTCTAGGCCGAGCTTCCACCGATTTCAGACCAGCACTTATCGATG
CTGCCAAGGCTATGCTTGAATGAGAAATTTTTTCTTAAACGGATTGAACATAAAAAGGAT
TGTTCTTTTATTTGTTCAAGTTTGCAAGATTTTTCAGCTTATTTGTTCCTGAAGATAATG
TTTATCAATCCATTTTCTTCTCTACAAATTTTCAATTGTGTATTAAATCTCCAATTAATT
GCTCTTTTCCTTC

QA 19 811 19 811
DS 

RD RS1CQ86JQ 845 0 0
AAGCGGCGGA*TCGGAAGAT*CTTCGGTGTTCATGTCTTTTTCTC*TCAGCAGCTAGCGA
A*TCTCTCAGTTT*AGAAACGAAGACGGTCGCTCCCTCCTCCGCGTCTCTGCTTCTTTCG
GTCATTCCCAGATAGTGAAGTTGCTGTCAAGTGTAGATGAATCAAAGACGGTAATCAATA
GTAAGGATGATGAAGGATGGGCTCCTCTACATTCTGCTGCTAGCATCGGCAAGGCTGAGC
TCGTTGAAATCTTATTGACTAGAGGTGCTGATGTAAATGTCAAGAACAATGGTGGTCGCA
CTGCTCTTCACTATGCTGCTAGCAAGGGATGGTTAGAGATCGCTCAGCTTTTACTAACAC
ATGGCGCAAAGATAAACATCACCGACAAGGTGGGTTGCACTCCGCTTCACAGGGCAGCAA
GCACCGGAAAGTCTGAAGTTTGTGAGTTCCTGATCGAGGAAGGAGCAGAGATCGATGCTA
CGGATAAAATGGGCCAAACTCCACTCATGCATTCAGTGATCTGCGATGACAGACAAGTTG
CGTTTCTCCTTGTAAGACATGGTGCAGATGTGGGTGTAGAAGACAAGGAAGGCTACACTG
TTCTAGGCCGAGCTTCCACCGATTTCAGACCAGCACTTATCGATGCTGCCAAGGCTATGC
TTGAATGAGAAATTTTTTCTTAAACGGATTGAACATAAAAAGGATTGTTCTTTTATTTGT
TCAAGTTTGCAAGATTTTTCAGCTGATTTGTTCCTGGAGATAATGTTTATCAATCCATTT
TCTTCTCTACAAATTTTCAATTGTGTATTAAATCTCCAATTAATTGCTCTTTTCCTTCAG
TTGAG

QA 1 845 1 845
DS 



AS 1 3

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CTTTAAATCCTCATTCAGAAGAGAAGTTTTTTACTTGGGTTTCTTTCTCTAGTTCTAAAA
CTGAAGACATTATTACGCCATGAAATCAGCGAAATATTATGTAACTCATAGTCTTATTAA
AGATATAAAGCAAAGCAAAGCAAACTCCTTTACTCTTTGATCCCAGAAGGCTCTCCGACC
GTGTTCTCCATTCGAGAATACCATTCACCTATGCGCGTGTTGTCAACCATATCCTTACCC
GATCTAAGGTACATTATAGGCCTCAAAACACCAAATACAGCGAGATCGGCTAAGTTTGGT
CTTGACCCACCTAGGAATGGACGCCCATTCAGGGCATCGACCCATGTCTCAGCAGCATCA
TAAAGAGCTGCACGTTCATCAGTTATGTTATATTTCTTCTTCAGTTTCTTCGATACAAAG
TACATTGCCGTTGCTCCTGCATACTTTGCCACTAATCTTTCCGTGAAACCAAGATTTCCA
TGGGTGGTGATGTAGTCAAAGGACTCCAGAGCCTCTGAAGTACTCCTGTATATGTTCGGT
GACAAAATATGCACAAGGTGATTGTCAACCCACTTGCGCCATTTCATCTCTTCATCATCT
TCAGACTTTGAAATTTCAGGGTGCATCCTTTGGAATAAGCTATCGATTATCACTGAAGAA
TCAACTAATTGTTCACCATCAACAGTAAGGATGGGCACCTTCTTGTAATCAGACCATTTA
ATTTCTTTCTTAAACAAGGGATTCACTTCAACAATCTTGTACGGAATCTTGTTGAAATCC
AAGAAGGCTTTGACCTTATTGCAGAAAGGGCAAGCCTCGTACTGATACAGAACCACCTCT
TTAGGGTTGAACTTATGGGACATGTCCTTGGCGTGGACTTCTTGACCAAGGGACGATGCG
GCGGCGGCGGAAAAGAAAACAATCCCAGCGACTCCGCCGGCAAAAGTCGGCGTGGGTAGA
CCACCAAATCTCGGGGACGGAGGCTCGGAAGAAGGAATCGTGGTCATCATCGCTGTGGTA
AGACCGAGCCGTGGATGGACGGCGACGGAGGATGAGATAGTGCGCGCAGCGAGTCCGGTA
ACTCTCCTCATAGATGCTGGGCGAAAATGAGATGAGATCTTTGATTGTTCGCTTTGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CJ58JQ U 17
AF RS1B329JQ U 1
AF RS1B329TF C 547
BS 1 35 RS1B329JQ
BS 36 36 RS1CJ58JQ
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BS 786 1199 RS1B329TF

RD RS1CJ58JQ 499 0 0
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DS 

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CTTTAAATCCTCATTCAGAAGAGAAGTTTTTTACTTGGGTTTCTTTCTCTAGTTCTAAAA
CTGAAGACATTATTACGCCATGAAATCAGCGAAATATTATGTAATTCATAGTCTTATTAA
AGATATAAAGCAAAGCAAAGCAAACTCCTTTACTCTTTGATCCCAGAAGGCTCTCCGACC
GTGTTCTCCATTCGAGAATACCATTCACCTATGCGCGTGTTGTCAACCATATCCTTACCC
GATCTAAGGTACCTTATAGGCCTCAAAACACCAAATACAGCGAGATCGGCTAAGTTTGGT
CTTGACCCACCTAGGAATGGACGCCCATTCAGGGCATCGACCCATGTCTCAGCAGCATCA
TAAAGAGCTGCACGTTCATCTGTTATGTTATATTTCTTCTTCAGTTTCTTCGATACAAAG
TACATTGCCGTTGCTCCTGCATACTTTGCCACTAATCTTTCCGTGAAACCAAGATTTCCA
TGGGTGGTGATGTAGTCAAAGGACTCCAGAGCCTCTGAAGTACTCCTGTATATGTTCGGT
GACAAAATATGCACAAGGTGATTGTCAACCCACTTGCGCCATTTCATCTCTTCATCATCT
TCAGACTTTGAAATTTCAGGGTGCATCCTTTGGAATAAGCTATCGATTATCACTGAAGAA
TCAACTAATTGTTCACCATCAACAGTAAG*ATGGGCACCTTCTTGTAATCAGACCATTTA
ATTTC

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DS 

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TTGAACTTATGGGACATGTCCTTGGCGTGGACTTCTTGACCAAGGGACGATGCGGCGGCG
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CTCATAGATGCTGGGCGAAAATGAGATGAGATCTTTGATTGTTCGCTTTGGTC

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DS 



AS 1 4

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TTTGCATCTCCTTTTGTTGAATCTACTGAACTTTGTTTGCTACTCTCTCATAAGCTACTT
TTGCAACGATGCGT


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1F524JQ C 1
AF RS1GF36JQ C 60
AF RS1F524TF U 1
AF RS1GF36TF U 1
BS 1 494 RS1F524TF

RD RS1F524JQ 494 0 0
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GCTCGACGACGGTGCCGATGTTGAAAAGATGACTCCCGACGGCGCAGCCACTTCCTCCGC
CGCAGATGGTAAAGACGATATCTACTCTATCGACGCCGCGAAGAAGAGGAAGTACGATGA
GCTTTTCCCCGTGGAGGCAAAGAAGTTCGGTTACGTTCCCAAATCGAACTTCGATTCGGT
TGTAGAGGCTCTCGACGATCGAGTCAAGAAGAAGGCCGATCGCTACTGTAAATAGAATCT
TTTGCATCTCCTTTTGTTGAATCTACTGAACTTTGTTTGCTACTCTCTCATAAGCTACTT
TTGCAACGATGCGT

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DS 

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ATCTAGCCACGATCAAAAAGAATAAGAAGCAAAAGCAAAAGAAGAACAAGAACAAGGATA
AGCTCGACGACGGTGCCGATGTTGAAAAGATGACTCCCGACGGCGCAGCCACTTCCTCCG
CCGCAGATGGTAAAGACGATATCTACTCTATCGACGCCGCGAAGAAGAGGAAGTACGATG
AGCTTTTCCCCGTGGAGGCAAAGAAGTTCGGTTACGTTCCCAAATCGAACTTCGATTCGG
TTGTAGAGGCTCTCGACGATCGAGTCAAGAAGAAGGCCGATCGCTACTGTAAATAGAATC
TTTTGCATCTCCTTTTGTTGAATCTACTGAACTTTGTTTGCTACTCTCTCATAAGCTACT
TTTGCAACGATGCGT

QA 1 435 1 435
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CGCAGATGGTAAAGACGATATCTACTCTATCGACGCCGCGAAGAAGAGGAAGTACGATGA
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TTTGCATCTCCTTTTGTTGAATCTACTGAACTTTGTTTGCTACTCTCTCATAAGCTACTT
TTGCAACGATGCGT

QA 1 494 1 494
DS 

RD RS1GF36TF 494 0 0
GGAAAAGACAAAATTCCGGAGAGAGAGAGAGAGATAGAGAGAGTAGCGGTAGTGAATCTA
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TCTAGCCACGATCAAAAAGAATAAGAAGCAAAAGCAAAAGAAGAACAAGAACAAGGATAA
GCTCGACGACGGTGCCGATGTTGAAAAGATGACTCCCGACGGCGCAGCCACTTCCTCCGC
CGCAGATGGTAAAGACGATATCTACTCTATCGACGCCGCGAAGAAGAGGAAGTACGATGA
GCTTTTCCCCGTGGAGGCAAAGAAGTTCGGTTACGTTCCCAAATCGAACTTCGATTCGGT
TGTAGAGGCTCTCGACGATCGAGTCAAGAAGAAGGCCGATCGCTACTGTAAATAGAATCT
TTTGCATCTCCTTTTGTTGAATCTACTGAACTTTGTTTGCTACTCTCTCATAAGCTACTT
TTGCAACGATGCGT

QA 1 494 1 494
DS 



AS 1 4

CO CL2845Contig1 673 4 12 U
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CGTACCCTTCCGCCGGATTTTTCATCTCGTGAAACCGGAAAGCCAGCAGTTAACCGGAGT
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CTAGACGGACCGTTCGTTAAGATAAGTCTAAGAGGCAAGTTTTGGCACACACGTGCAATG
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ATTGAAGATGAGAAGCAACCCGATGATAGCCCTGCAAATTTCTAAACTTCATTACTTGAA
AACTAGTATCCATCTTTTATTTCTTGCTTAATGTGACGACGATGATGTATGTTTATGAGT
TGCGTAAGGTTTAAAAAAGATTTACAAACATGATTTATAACCAGATAATTTGAAAGAAAG
CATACTTATTTAT


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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AF RS1DL57JQ C 147
AF RS1DL57TF U 147
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G
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G
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TTGATACCGTGCCTAGTGCGGTGGTGCTCCCCGGTTCAATGTTCTCATCTGGCTTAACCG
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CGACCGGGCCAATGATTACAGAGCAGCAACCTCAAGAGAGTAACTACAACAATTCGACAT
TCTTTGGAACTGGGAATCTGAATTGGGGATTAACCATGGAAGAAAATCAATTTACAGTAT
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TGGTTTGTGTATATAAAGTTTCTGTCAT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1E427TF U 1
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AF RS1DL12JQ C 557
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TTGAGAC

QA 1 607 1 607
DS 

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AGCTGACTTCAAAGCCTTTTCTAAAGCAAACAAGCCGATCCTTCTCTGATTGATATTTTA
TTTATATATAAAAAAAAATTAAAAGATGGGAAGACATTCATGCTGTTACAAACAGAAGCT
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CGGCCATGGCTGCTGGAGCTCTGTCCCTAAACAAGCTGGTTTGCAGAGATGTGGAAAGAG
CTGTAGATTAAGATGGATAAACTATTTAAGACCAGATTTGAAGCGAGGAGCATTTTCACA
GGATGAAGAAAATCTTATTATTGAACTCCATGCCGTTCTTGGCAACCGGTGGTCTCAGAT
TGCTGTACAGCTTCCTGGTAGAACCGACAATGAAATCAAGAATCTATGGAACTCTTCCTT
AAAGAAGAAACTGAGGCTGAGAGGAATTGATCCGGTTACACACAAGATCTTAACCGAAAT
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TGAGACAGAAG*CTCCTCTAGTACCACCACTGGAAGTACTAACCACAACAACAGCAACAC
CGATCATCTTTATACCGGAAATTTTGGTTTCCAACGGTTAACTCTTGAGACTGGTTCAAG
AATACAAACCGGTTCAGACCTTGGCATCTGGATTTCC

QA 1 757 1 757
DS 

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GAAGAAACTGAGGCTGAGAGGAATTGATCCGGCTACACACAAGATCTTAACCGAAATTGA
AACCGGTACAGATGACAATACCACACCGGTTGAGAAGTGTCAAACGACCTGCCTCGTTGA
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AACAACCGGCTACAGATCATCCAATCTCGGTTTAATTGAATTGGATAACTCATTCTCGAC
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CTCTAGTACCACCACTGGAAGTACTAACCACAACAACAGCAACACCGATCATCTTTATAC
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TACAGAGCAGCAACCTCAAGAGAGTAACTACAACAATTCGACATTCTTTGGAACTGGGAA
TCTGAATTGGGGATTAACCATGGAAGAAAATCAATTTACAGTATCGAATAATTCGTTACA
GAATCACTCAAACTCGTCGTTGTATAGTGAAATCAAATCCGAGAACATTTTTTTCGGTAC
GGAGGCTACAAATGTTGGTATGTGGCCATGTAACCAGCTTCAGCCTCAGCAACATGCATA
TGGCCATATTTAAAAACTTCTTGTATATTATAAGGTGTGTGGGATCTTCTTTTTTCTTCT
TCAAGTTATTTTTCTTTATTCCAAATATCGAATTTTCTTTATAATGGTTTGTGTATATAA
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QA 1 732 1 732
DS 



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AACTGACCAGGGTAGAACTGGTCGTTTTCTCCCTGATCAATTAAAATTGTGGCAGAGAGA
TTGTTGAACTTTGAAATGAGACAAGTAGCATCATATTCCTCCCAAGCAGTCTTGTTGTCA
CCAAGATAGTTGGTGAATGCTTTCTGTCCCCATGGACAATTAATGGGATTGGCAATTGGT
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TCACCTTCAATATTGAGTCCTCTTGGAGAAGTATCGGGAACAGCAAGAGCAATGCCGTGA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1AH84JQ U 52
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DS 

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CC

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ATTTTGTCTCTCACACACTGTAAGGAACAAGGAATGACAGATGCAGCGAAGAGCC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 4

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TCTCTCTTTCGCTCTTTTGATTTCCCAAGCTTCAACCAAGAGAAACAATGGTTGTATATC
AGTCAAATTCCACCAACAAAAGATCCAGAGGGTTCAGAGTCAGGAGCCTCTCTCATTTCG
CTGAAAGAAGGGTTCAAAGCCAAAAGTTGCCGAGCCACGAGGACACTTACCCGGGGCCCG
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ATGATATGAATGTTAGTTTCATTTATGAGAGGGTTTGTAGTTAGTTAAAAAAAATTATAA
CCAGTTAAG


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1EQ60TF U 1
AF RS1FR85TF U 1
AF RS1FR85JQ C 218
AF RS1EQ60JQ C 281
BS 1 676 RS1EQ60TF
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BS 682 732 RS1FR85TF
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AGTGGCGTGCGGTCAA

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CAAAGAAACGTAGGTATTAGTCATTTTATAAGAGTAATACAGTCTTTTTCTTTAAATTCT
AGTTTTGATGTTTCAGATCTCACTAGTTGACTATATATTTATATTGGAGGCATTTATGAC
AATCACAACTTTAACCAATACTACATACAAGTTGCTTTAACATTTGACAATTACTGTCTC
TCTCTCTTTCGCTCTTTTGATTTCCCAAGCTTCAACCAAGAGAAACAATGGTTGTATATC
AGTCAAATTCCACCAACAAAAGATCCAGAGGGTTCAGAGTCAGGAGCCTCTCTCATTTCG
CTGAAAGAAGGGTTCAAAGCCAAAAGTTGCCGAGCCACGAGGACACTTACCCGGGGCCCG
GTAAAATCAAAGTGACTGAAGAGAAGCCAAGAGAGACACGAGATGAATGGGTGATCTCGA
TCAAAGAAAAGGTGAATAAAGCACGTGGAGACGTCACTGCCTCTACCTGGGACAAGCTCT
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TCTCGAGG

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RD RS1EQ60JQ 749 0 0
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CAGGAGCCTCTCTCATTTCGCTGAAAGAAGGGTTCAAAGCCAAAAGTTGCCGAGCCACGA
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AGATGAATGGGTGATCTCGATCAAAGAAAAGGTGAATAAAGCACGTGGAGACGTCACTGC
CTCTACCTGGGACAAGCTCTGTATCTACCGAGTTCCACATTACCTGCAAGAAGATGACAA
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CCTTCCCATGGAGTGTCACAAGTGGCGTGCGGTCAATAAGGTCTTGGAGCATACCAAGAA
AGGTATCGAAACATATATTGATGCCATGAAAAATCTCGAGGAGTCGGCTCGAGCTTGCTA
CCAAGGTCCCATTTGTATGAGTAGTAATGAGTTCACTGAAATGCTTTTTCTTGATGGTTG
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GATCAATTTTCTAATGTTACCGGTTATCTCTAAACCAGTTTCATTTCAGATCGGACTATA
TAAACTAGTATGTTTTTTTTATGATATGAATGTTAGTTTCATTTATGAGAGGGTTTGTAG
TTAGTTAAAAAAAATTATAACCAGTTAAG

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 4

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TTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1CX05TF U 1
AF RS1C084TF U 31
AF RS1CX05JQ C 279
AF RS1C084JQ C 282
BS 1 626 RS1CX05TF
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ACTATAAGTATGTGTTGGAGACGCCATTTGCGCTAACGGGAAGTCATAACCTTGCGAAAG
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RS1C084TF 692 0 0
GGATAAC
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TCTTGGTCCCTTTGTCACTGGAAACTCTTACGATTCTGATGAGCTTGTGAATACATCAGT
CGAAAAGATCGGCGATCAAACGTACTATAAGTATGTGTTGGAGACGCCATTTGCGCTAAC
GGGAAGTCATAACCTTGCGAAAGC
G

QA 8 691 8 691
DS 

RD RS1CX05JQ 627 0 0
GAG
TCTGACCCTTCATTCGTCCTCTTCAAAGCCAAACCTTCTGATACTCCTGCCCTCCGCGCA
GGAAACGTGCAGCCGTATCAGTTTGTTCTACCACCGAACTGGAAACAGCTCCGAATAGCC
AACATCTTGTCAGGCAACTACTGCCAGCCGAAATGCGCAGAGCCATGGATAGAAGTGAAG
TTCGAGAACGAGAAGCAAGGCAAAGTTCAAGTAGTTGCATCTCCTTTGATTCGCTTAACC
AACAGGCCGAATGCAACTATTGAAGATCTCGGTGAGCCTGAGAGAGTGATCGCTTCTCTT
GGTCCCTTTGTCACTGGAAACTCTTACGATTTTGATGAGCTTGTGGATACATCAGTCGAA
AAGATCGGTGATCAAACGTACTATAAGTATGTGTTGGAGACGCCATTTGCGCTAACGGGA
AGTCATAACCTTGCGAAAGCGACGGCAAAGGGGAACACGGTGGTTCTGTTTGTGGTGAGT
GCTACTGAGAAGCAATGGCAGAGCTCGCAGAAGACTCTTCAAGCCATTCTTGATTCTTTT
CAGCTGTAAATTATTGTTATGACTCTTAAAAACTATAGAGCAAAACGGTTTGTATTGAGT
TGGATTAACATTTCATCCTCTTG
G

QA 4 626 4 626
DS 

RD RS1C084JQ 682 0 0
TCTGACCCTTCATTCGTCCTCTTCAAAGCCAAACCTTCTGATACTCCTGCCCTCCGCGCA
GGAAACGTGCAGCCGTATCAGTTTGTTCTACCACCGAACTGGAAACAGCTCCGAATAGCC
AACATCTTGTCAGGCAACTACTGCCAGCCGAAATGCGCAGAGCCATGGATAGAAGTGAAG
TTCGAGAACGAGAAGCAAGGCAAAGTTCAAGTAGTTGCATCTCCTTTGATTCGCTTAACC
AACAGGCCGAATGCAACTATTGAAGATCTCGGTGAGCCTGAGAGAGTGATCGCTTCTCTT
GGTCCCTTTGTCACTGGAAACTCTTACGATTCTGATGAGCTTGTGAATACATCAGTCGAA
AAGATCGGCGATCAAACGTACTATAAGTATGTGTTGGAGACGCCATTTGCGCTAACGGGA
AGTCATAACCTTGCGAAAGCGACGGCAAAGGGGAACACGGTGGTTCTGTTTGTGGTGAGT
GCTACTGAGAAGCAATGGCAGAGCTCGCAGAAGACTCTTCAAGCCATTCTTGATTCTTTT
CAGCTGTAAATTATTGTTATGACTCTTAAAAACTATAGAGCAAAACGGTTTGTATTGAGT
TGGATTAACATTTCATCCTCTTGTATCTGCCTCTAGTGTTTCAAACATGTGACATTGAAT
AGACCTGATGGTTATTACTTTC

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 4

CO CL2850Contig1 710 4 8 U
GGAACGCCTCCTTTGTGTTTTCTCTTCAACCCTCCTCTCCACTTTTCCTCCATTCCTTTC
ATTGTTTTGATCCAACCATCAATCCCGGGTTAGGATTTCCATCTCAACAAAGAAGGCATG
GCTAACTCGGCATTTGGGATGCACGTAAGTGATGAATGCAAGGTCAAATTTTTGGAGTTG
AAAGCAAAGAGGACTTACAGGTATATCGTATTCAAGATTGATGAGAAGGCTCAGCAAGTT
GGAATAGAAAAGTTTGGGAATCCACAAGAGACCTACGATGATTTCACAAACTCTATCCCT
GAAAATGAGTGCCGATATGCAATCTATGATTTTGATTTCACCACCGAGGATAACTGCCAG
AAGAGCGAGATCTTTTTCATTGCATGGTCACCTGATACAGCAAGAGTACGGAGTAAGA*T
GTT*GTATGCAAGCTCAAAGG*ATAGGTTCAAGAGAGAAATGGATGGAATCCAAGTTGAA
CTACAAGCAACTGATCC*TAGCGAGATGAGCCTCGACATCATCAAAGACCGAGCTCTCTG
AACAAAACCCATCAATCATTATTCTAAATGAACCACTGCATCTTTATTCATTACTATTTC
GTATGTTAAGCTTTCTTAATTTGTTTCAGTGACATCTCCCATTTCCCTTTGGG*TATTTC
TGCTCTTTGGAAACAGTTTGTGTGGATCTAAAGTTGTTTTGTTCTTGAAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EZ80JQ C 1
AF RS1EZ80TF U 1
AF RS1AG34JQ C 45
AF RS1AG34TF U 379
BS 1 133 RS1EZ80TF
BS 134 134 RS1EZ80JQ
BS 135 430 RS1EZ80TF
BS 431 431 RS1AG34TF
BS 432 687 RS1EZ80TF
BS 688 688 RS1AG34TF
BS 689 689 RS1EZ80TF
BS 690 710 RS1AG34TF

RD RS1EZ80JQ 689 0 0
GGAACGCCTCCTTTGTGTTTTCTCTTCAACCCTCCTCTCCACTTTTCCTCCATTCCTTTC
ATTGTTTTGATCCAACCATCAATCCCGGGTTAGGATTTCCATCTCAACAAAGAAGGCATG
GCTAACTCGGCATTTGGGATGCACGTAAGTGATGAATGCAAGGTCAAATTTTTGGAGTTG
AAAGCAAAGAGGACTTACAGGTATATCGTATTCAAGATTGATGAGAAGGCTCAGCAAGTT
GGAATAGAAAAGTTTGGGAATCCACAAGAGACCTACGATGATTTCACAAACTCTATCCCT
GAAAATGAGTGCCGATATGCAATCTATGATTTTGATTTCACCACCGAGGATAACTGCCAG
AAGAGCGAGATCTTTTTCATTGCATGGTCACCTGATACAGCAAGAGTACGGAGTAAGA*T
GTT*GTATGCGAGCTCAAAGG*ATAGGTTCAAGAGAGAAATGGATGGAATCCAAGTTGAA
CTACAAGCAACTGATCC*TAGCGAGATGAGCCTCGACATCATCAAAGACCGAGCTCTTTG
AACAAAACCCATCAATCATTATTCTAAATGAACCACTGCATCTTTATTCATTACTATTTC
GTATGTTAAGCTTTCTTAATTTGTTTCAGTGACATCTCCCATTTCCCTTTGGG*TATTTC
TGCTCTTTGGAAACAGTTTGTGTGGAT
TT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1EZ80TF 696 0 0
GGAACGCCTCCTTTGTGTTTTCTCTTCAACCCTCCTCTCCACTTTTCCTCCATTCCTTTC
ATTGTTTTGATCCAACCATCAATCCCGGGTTAGGATTTCCATCTCAACAAAGAAGGCATG
GCTAACTCGGCATCTGGGATGCACGTAAGTGATGAATGCAAGGTCAAATTTTTGGAGTTG
AAAGCAAAGAGGACTTACAGGTATATCGTATTCAAGATTGATGAGAAGGCTCAGCAAGTT
GGAATAGAAAAGTTTGGGAATCCACAAGAGACCTACGATGATTTCACAAACTCTATCCCT
GAAAATGAGTGCCGATATGCAATCTATGATTTTGATTTCACCACCGAGGATAACTGCCAG
AAGAGCGAGATCTTTTTCATTGCATGGTCACCTGATACAGCAAGAGTACGGAGTAAGA*T
GTT*GTATGCGAGCTCAAAGG*ATAGGTTCAAGAGAGAAATGGATGGAATCCAAGTTGAA
CTACAAGCAACTGATCC*TAGCGAGATGAGCCTCGACATCATCAAAGACCGAGCTCTCTG
AACAAAACCCATCAATCATTATTCTAAATGAACCACTGCATCTTTATTCATTACTATTTC
GTATGTTAAGCTTTCTTAATTTGTTTCAGTGACATCTCCCATTTCCCTTTGGG*TATTTC
TGCTCTTTGGAAACAGTTTGTGTGGATTT
AAAAAAA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1AG34JQ 658 0 0
GG
CCTCCATTCCTTTCATTGTTTTGATCCAACCATCAATCCCGGGTTAGGATTTCCATCTCA
ACAAAGAAGGCATGGCTAACTCGGCATTTGGGATGCACGTAAGTGATGAATGCAAGGTCA
AATTTTTGGAGTTGAAAGCAAGGAGGACTTACAGGTATATCGTATTCAAGATTGATGAGA
AGGCTCAGCAAGTTGGAATAGAAAAGTTTGGGAATCCACAAGAGACCTACGATGATTTCA
CAAACTCTATCCCTGAAAATGAGTGCCGATATGCAATCTATGATTTTGATTTCACCACCG
AGGATAACTGCCAGAAGAGCAAGATCTTTTTCATTGCATGGTCACCTGATACAGCAAGAG
TACGGAGTAAGA*TGTT*GTATGCAAGCTCAAAGG*ATAGGTTCAAGAGAGAAATGGATG
GAATCCAAGTTGAACTACAAGCAACTGATCC*TAGCGAGATGAGCCTCGACATCATCAAA
GACCGAGCTCTTTGAACAAAACCCATCAATCATTATTCTAAATGAACCACTGCATCTTTA
TTCATTACTATTTCGTATGTTAAGCTTTCTTAATTTGTTTCAGTGACATCTCCCATTTCC
CTTTGGG*TATTTCTGCTCTTTGGAAACAGTTTGTGTGGATCTAAA
GTTGTTTTGT

QA 3 648 3 648
DS 

RD RS1AG34TF 332 0 0
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AGGGATAGGTTCAAGAGAGAAATGGATGGAATCCAAGTTGAACTACAAGCAACTGATCCC
TAGCGAGATGAGCCTCGACATCATCAAAGACCGAGCTCTCTGAACAAAACCCATCAATCA
TTATTCTAAATGAACCACTGCATCTTTATTCATTACTATTTCGTATGTTAAGCTTTCTTA
ATTTGTTTCAGTGACATCTCCCATTTCCCTTTGGGGTATTTCTGCTCTTTGGAAACAGTT
TGTGTGGATCTAAAGTTGTTTTGTTCTTGAAG

QA 1 332 1 332
DS 



AS 1 4

CO CL2851Contig1 705 4 12 U
GTCCCTTTCCCGGCTTGAGCTTTCTTCTGTGGATCTCTATCAACTCCATTGGCCAGGATT
ATGGGGAAATGAAGGATATCTGGATGGTCTTGGGGATGCTGTTGAGCAAGGACTTGTGAA
GGCTGTTGGTGTTTCTAACTACAGTGAGAAGCGGCTACGTGATGCTTATGAGAGACTGAA
AAAGAGAGGAATCCCTCTGGCCTCAAATCAAGTTAACTACAGTTTGATATACAGAGCTCC
AGAGCAGACTGGTGTGAAGGCTGCCTGTGATGAGCTTGGAGTCACTTTGATTGCATATTC
CCCCATTGCTCAAGGTGCTCTAACTGGTAAATACACCCCAGAGAACCCACCCTCAGGTCC
TCGGGGTCGCATTTATACTCGTGAATTTTTAACAAAGCTTCAACCCCTGCTTAATAGAAT
CAAACAAATAGGCGAAATCTACACCAAAACTCCCACACAGGTAGCATTGAACTGGTTGGA
GGCACAAGGGAACGTGATACCGATCCCAGGAGCCAAGAATGCGGAACAAGCCAAAGAGTT
TGCGGGAGCTATAGGTTGGAGTCTGACAGACGATGAAGTGGCTGAGCTACGGTCTCTGGC
CTCTGAGATTAACCCCGTCGTTGGTTTCCCTGTTGAGTATCTCTGAACTCTTGTTTGTAC
CATTTGTAAAGCTAAAAAGTCATACAATACAAACTAAAAGTGGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1F880JQ C 1
AF RS1AY71JQ C 242
AF RS1AY71TF U 242
AF RS1F880TF U 9
BS 1 8 RS1F880JQ
BS 9 241 RS1F880TF
BS 242 273 RS1AY71TF
BS 274 274 RS1F880TF
BS 275 351 RS1AY71TF
BS 352 352 RS1F880TF
BS 353 526 RS1AY71TF
BS 527 527 RS1F880TF
BS 528 544 RS1AY71TF
BS 545 546 RS1F880TF
BS 547 694 RS1AY71TF
BS 695 705 RS1F880TF

RD RS1F880JQ 705 0 0
GTCCCTTTCCCGGCTTGAGCTTTCTTCTGTGGATCTCTATCAACTCCATTGGCCAGGATT
ATGGGGAAATGAAGGATATCTGGATGGTCTTGGGGATGCTGTTGAGCAAGGACTTGTGAA
GGCTGTTGGTGTTTCTAACTACAGTGAGAAGCGGCTACGTGATGCTTATGAGAGACTGAA
AAAGAGAGGAATCCCTCTGGCCTCAAATCAAGTTAACTACAGTTTGATATACAGAGCTCC
AGAGCAGACTGGTGTGAAGGCTGCCTGTGATGAGCTTGGAGTCACTTTGATTGCATATTC
CCCCATTGCTCAAGGTGCTCTAACTGGTAAATACACCCCAGAGAACCCACCCTCAGGTCC
TCGGGGTCGCATTTATACTCGTGAATTTTTAACAAAGCTTCAACCCCTGCTTAATAGAAT
CAAACAAATAGGCGAAATTTACACCAAAACTCCCACACAGGTAGCATTGAACTGGTTGGT
GGCACAAGGGAACGTGATACCGATCCCAGGAGCCAAGAATGCGGAACAAGCCAAAGAGTT
TGCGGGAGCTATAGGTTGGAGTTTGACAGACGATGAAGTGGCTGAGCTACGGTCTTTGGC
CTCTGAGATTAACCCCGTCGTTGGTTTCCCTGTTGAGTATCTTTGAACTCTTGTTTGTAC
CATTTGTAAAGCTAAAAAGTCATACAATACAAACTAAAAGTGGCG

QA 1 705 1 705
DS 

RD RS1AY71JQ 453 0 0
GAGCAGACTGGTGTGAAGGCTGCCTGTGATGA*CTTGGAGTCACTTTGATTGCATATTCC
CCCATTGCTCAAGGTGCTCTAACTGGTAAATACACCCCAGAGAACCCACCTTCAGGTCCT
CGGGGTCGCATTTATACTCGTGAATTTTTAACAAAGCTTCAACCCCTGCTTAATAGAATC
AAACAAATAGGCGAAATCTACACCAAAACTCCCACACAGGTAGCATTGAACTGGTTGGAG
GCACAAGGGAACGTGATACCGATCCCAGGAGCCAAGAATGCGGAATAAGCCAAAGAGTTT
GCGT*AGCTATAGGTTGGAGTCTGACAGACGATGAAGTGGCTGAGCTACGGTCTCTGGCC
TCTGAGATTAACCCCGTCGTTGGTTTCCCTGTTGAGTATCTCTGAACTCTTGTTTGTACC
ATTTGTAAAGCTAAAAAGTCATACAATACAAAC

QA 1 453 1 453
DS 

RD RS1AY71TF 453 0 0
GAGCAGACTGGTGTGAAGGCTGCCTGTGATGA*CTTGGAGTCACTTTGATTGCATATTCC
CCCATTGCTCAAGGTGCTCTAACTGGTAAATACACCCCAGAGAACCCACCTTCAGGTCCT
CGGGGTCGCATTTATACTCGTGAATTTTTAACAAAGCTTCAACCCCTGCTTAATAGAATC
AAACAAATAGGCGAAATCTACACCAAAACTCCCACACAGGTAGCATTGAACTGGTTGGAG
GCACAAGGGAACGTGATACCGATCCCAGGAGCCAAGAATGCGGAATAAGCCAAAGAGTTT
GCGT*AGCTATAGGTTGGAGTCTGACAGACGATGAAGTGGCTGAGCTACGGTCTCTGGCC
TCTGAGATTAACCCCGTCGTTGGTTTCCCTGTTGAGTATCTCTGAACTCTTGTTTGTACC
ATTTGTAAAGCTAAAAAGTCATACAATACAAAC

QA 1 453 1 453
DS 

RD RS1F880TF 697 0 0
CCCGGCTTGAGCTTTCTTCTGTGGATCTCTATCAACTCCATTGGCCAGGATTATGGGGAA
ATGAAGGATATCTGGATGGTCTTGGGGATGCTGTTGAGCAAGGACTTGTGAAGGCTGTTG
GTGTTTCTAACTACAGTGAGAAGCGGCTACGTGATGCTTATGAGAGACTGAAAAAGAGAG
GAATCCCTCTGGCCTCAAATCAAGTTAACTACAGTTTGATATACAGAGCTCCAGAGCAGA
CTGGTGTGAAGGCTGCCTGTGATGAGCTTGGAGTCACTTTGATTGCATATTCCCCCATTG
CTCAAGGTGCTCTAACTGGTAAATACACCCCAGAGAACCCACCCTCAGGTCCTCGGGGTC
GCATTTATACTCGTGAATTTTTAACAAAGCTTCAACCCCTGCTTAATAGAATCAAACAAA
TAGGCGAAATCTACACCAAAACTCCCACACAGGTAGCATTGAACTGGTTGGTGGCACAAG
GGAACGTGATACCGATCCCAGGAGCCAAGAATGCGGAACAAGCCAAAGAGTTTGCGGGAG
CTATAGGTTGGAGTCTGACAGACGATGAAGTGGCTGAGCTACGGTCTCTGGCCTCTGAGA
T*AACCCCGTCGTTGGTTTCCCTGTTGAGTATCTCTGAACTCTTGTTTGTACCATTTGTA
AAGCTAAAAAGTCATACAATACAAACTAAAAGTGGCG

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 4

CO CL2852Contig1 701 4 5 U
GGGGATCGGATCATTCATCAGCGTCTTCGTCTTTCGCTCTCATCCGTCTTCGAATTACGA
AATCATGATACATTTCGTGCTTCTTGTAAGCCGCCAAGGAAAAGTTAGGCTCACCAAATG
GTACTCCCCTTATACGCAGAAGGAAAGATCTAAGGTTATACGTGAGCTCAGTGGTGTGAT
TCTGAATCGAGGTCCCAAGCTCTGCAATTTTGTCGAGTGGAGAGGCTACAAAGTCGTCTA
CAAAAGATACGCGAGTCTCTACTTCTGTATGTGTATTGATGCGGAGGATGACGAGTTGGA
GGTCCTTGAGATCATTCACCACTACGTTGAGATTCTCGACCGCTATTTCGGAAGTGTGTG
TGAACTCGATTTGATTTTTAACTTCCACAAGGCGTATTACATATTGGATGAACTTTTGAT
TGCCGGCGAGCTCCAGGAGTCAAGCAAGAAGACTGTAGCCAGGATTATATCTGCTCAGGA
TCAAATGGTGGAAGTTGCGAAAGAGGAAGCTGGTTCCATAAGCAATATCATCGCTCAGGC
TACTAAATAGTTTCTTTCACTCTTCTACTTTGCGGTTCATTCATGTTTCCTGGCTGCTAA
GTTTAATGTTTTTGACAAACTTTTTCTTTCTTTTATCTCCTAATGACTGAAGAAGTGTGG
ATGATGCTATAAGTTTTTTTTATTTTATTTTATAAATTAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1B186TF U 1
AF RS1AQ83JQ C 4
AF RS1GU81TF U 6
AF RS1AQ83TFB U 4
BS 1 289 RS1B186TF
BS 290 290 RS1AQ83TFB
BS 291 549 RS1B186TF
BS 550 680 RS1GU81TF
BS 681 701 RS1AQ83TFB

RD RS1B186TF 549 0 0
GGGGATCGGATCATTCATCAGCGTCTTCGTCTTTCGCTCTCATCCGTCTTCGAATTACGA
AATCATGATACATTTCGTGCTTCTTGTAAGCCGCCAAGGAAAAGTTAGGCTCACCAAATG
GTACTCCCCTTATACGCAGAAGGAAAGATCTAAGGTTATACGTGAGCTCAGTGGTGTGAT
TCTGAATCGAGGTCCCAAGCTCTGCAATTTTGTCGAGTGGAGAGGCTACAAAGTCGTCTA
CAAAAGATACGCGAGTCTCTACTTCTGTATGTGTATTGATGCGGAGGATAACGAGTTGGA
GGTCCTTGAGATCATTCACCACTACGTTGAGATTCTCGACCGCTATTTCGGAAGTGTGTG
TGAACTCGATTTGATTTTTAACTTCCACAAGGCGTATTACATATTGGATGAACTTTTGAT
TGCCGGCGAGCTCCAGGAGTCAAGCAAGAAGACTGTAGCCAGGATTATATCTGCTCAGGA
TCAAATGGTGGAAGTTGCGAAAGAGGAAGCTGGTTCCATAAGCAATATCATCGCTCAGGC
TACTAAATA

QA 1 549 1 549
DS 

RD RS1AQ83JQ 698 0 0
GGTC
GGATCATTCATCAGCGTCTTCGTCTTTCGCTCTCATCCGTCTTCGAATTACGAAATCATG
ATACATTTCGTGCTTCTTGTAAGCCGCCAAGGAAAAGTTAGGCTCACCAAATGGTACTCC
CCTTATACGCAGAAGGAAAGATCTAAGGTTATACGTGAGCTCAGTGGTGTGATTCTGAAT
CGAGGTCCCAAGCTCTGCAATTTTGTCGAGTGGAGAGGCTACAAAGTCGTCTACAAAAGA
TACGCGAGTCTCTACTTCTGTATGTGTATTGATGCGGAGGATGACGAGTTGGAGGTCCTT
GAGATCATTCACCACTACGTTGAGATTCTCGACCGCTATTTCGGAAGTGTGTGTGAACTC
GATTTGATTTTTAACTTCCACAAGGCGTATTACATATTGGATGAACTTTTGATTGCCGGC
GAGCTCCAGGAGTCAAGCAAGAAGACTGTAGCCAGGATTATATCTGCTCAGGATCAAATG
GTGGAAGTTGCGAAAGAGGAAGCTGGTTCCATAAGCAATATCATCGCTCAGGCTACTAAA
TAGTTTCTTTCACTCTTCTACTTTGCGGTTCATTCATGTTTCCTGGCTGCTAAGTTTAAT
GTTTTTGACAAACTTTTTCTTTCTTTTATCTCCTAATGACTGAAGAAGTGTGGATGATGC
TATAAGTTTTTTTTATTTTATTTTATAAATTAAC

QA 5 698 5 698
DS 

RD RS1GU81TF 675 0 0
GG
GGATCATTCATCAGCGTCTTCGTCTTTCGCTCTCATCCGTCTTCGAATTACGAAATCATG
ATACATTTCGTGCTTCTTGTAAGCCGCCAAGGAAAAGTTAGGCTCACCAAATGGTACTCC
CCTTATACGCAGAAGGAAAGATCTAAGGTTATACGTGAGCTCAGTGGTGTGATTCTGAAT
CGAGGTCCCAAGCTCTGCAATTTTGTCGAGTGGAGAGGCTACAAAGTCGTCTACAAAAGA
TACGCGAGTCTCTACTTCTGTATGTGTATTGATGCGGAGGATAACGAGTTGGAGGTCCTT
GAGATCATTCACCACTACGTTGAGATTCTCGACCGCTATTTCGGAAGTGTGTGTGAACTC
GATTTGATTTTTAACTTCCACAAGGCGTATTACATATTGGATGAACTTTTGATTGCCGGC
GAGCTCCAGGAGTCAAGCAAGAAGACTGTAGCCAGGATTATATCTGCTCAGGATCAAATG
GTGGAAGTTGCGAAAGAGGAAGCTGGTTCCATAAGCAATATCATCGCTCAGGCTACTAAA
TAGTTTCTTTCACTCTTCTACTTTGCGGTTCATTCATGTTTCCTGGCTGCTAAGTTTAAT
GTTTTTGACAAACTTTTTCTTTCTTTTATCTCCTAATGACTGAAGAAGTGTGGATGATGC
TATAAGTTTTTTT

QA 3 675 3 675
DS 

RD RS1AQ83TFB 698 0 0
GGTC
GGATCATTCATCAGCGTCTTCGTCTTTCGCTCTCATCCGTCTTCGAATTACGAAATCATG
ATACATTTCGTGCTTCTTGTAAGCCGCCAAGGAAAAGTTAGGCTCACCAAATGGTACTCC
CCTTATACGCAGAAGGAAAGATCTAAGGTTATACGTGAGCTCAGTGGTGTGATTCTGAAT
CGAGGTCCCAAGCTCTGCAATTTTGTCGAGTGGAGAGGCTACAAAGTCGTCTACAAAAGA
TACGCGAGTCTCTACTTCTGTATGTGTATTGATGCGGAGGATGACGAGTTGGAGGTCCTT
GAGATCATTCACCACTACGTTGAGATTCTCGACCGCTATTTCGGAAGTGTGTGTGAACTC
GATTTGATTTTTAACTTCCACAAGGCGTATTACATATTGGATGAACTTTTGATTGCCGGC
GAGCTCCAGGAGTCAAGCAAGAAGACTGTAGCCAGGATTATATCTGCTCAGGATCAAATG
GTGGAAGTTGCGAAAGAGGAAGCTGGTTCCATAAGCAATATCATCGCTCAGGCTACTAAA
TAGTTTCTTTCACTCTTCTACTTTGCGGTTCATTCATGTTTCCTGGCTGCTAAGTTTAAT
GTTTTTGACAAACTTTTTCTTTCTTTTATCTCCTAATGACTGAAGAAGTGTGGATGATGC
TATAAGTTTTTTTTATTTTATTTTATAAATTAAC

QA 5 698 5 698
DS 



AS 1 3

CO CL2853Contig1 610 3 9 U
GGAACCACAGAATCATGAATCTTAACTTCTTCTCTAGTTCTCTCTTCTTGTTTCTACTAC
TCTCAGTATTTTCGAGCTTCATCTCAGATAGTGCATTCATCAAATCTGAAACTTTGGCTA
ATGGAAGAAATCTGCTTCAGAAAAAGAAAGCATGTCCAGTGAACTTTGAGTTTATGAACT
ACACAATCATAACAAGCCAATGCAAGGGTCCCAAATACCCACCCAAGAAGTGTTGCACCG
CATTCAAGGAATTTGCATGTCCTTACGCTGATGAGCTGAACGACTTGAGCAATGATTGTG
CAACCACTATGTTCAGCTATATCAACCTATACGGTAAATACCCACCGGGACTGTTTGCAA
ACCGATGCCAAGGTAAAGGAGGTCTCAAGTGCCCCGGTCAAATATGAATTTCTACTCTAG
TTTAACAGGGTGGTCATAGCCTTCCTATCTTCAATAATGTTTTTATTATAATCAACTTTA
TCAATAATTGTAGTCAAAATAAATTGTGGAGGAGACTCCATTGCATCACATGGTCTTAGC
CTTCATATTTTCAATTCATAATATGGTCCTAGCCTTTCATATTTTCAGTTAATAATATGT
ATCTTAACAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EM05TF U 1
AF RS1G396TF U 1
AF RS1DC11TF U 1
BS 1 128 RS1DC11TF
BS 129 129 RS1EM05TF
BS 130 142 RS1DC11TF
BS 143 143 RS1EM05TF
BS 144 461 RS1DC11TF
BS 462 462 RS1EM05TF
BS 463 514 RS1DC11TF
BS 515 515 RS1EM05TF
BS 516 610 RS1DC11TF

RD RS1EM05TF 527 0 0
GGAACCACAGAATCATGAATCTTAACTTCTTCTCTAGTTCTCTCTTCTTGTTTCTACTAC
TCTCAGTATTTTCGAGCTTCATCTCAGATAGTGCATTCATCAAATCTGAAACTTTGGCTA
ATGGAAGAAATCTGCTTCAGAAAAAGAAAGCATGTCCAGTGAACTTTGAGTTTATGAACT
ACACAATCATAACAAGCCAATGCAAGGGTCCCAAATACCCACCCAAGAAGTGTTGTACCG
CATTCAAGGAATTTGCATGTCCTTACGCTGATGAGCTGAACGACTTGAGCAATGATTGTG
CAACCACTATGTTCAGCTATATCAACCTATACGGTAAATACCCACCGGGACTGTTTGCAA
ACCGATGCCAAGGTAAAGGAGGTCTCAAGTGCCCCGGTCAAATATGAATTTCTACTCTAG
TTCAACAGGGTGGTCATAGCCTTCCTATCTTCAATAATGTTTTTATTATAATCAACTTTA
TCAATAATTGTAGTCAAAATAAATTGTGGAGGAGACTCCATTGCATC

QA 1 527 1 527
DS 

RD RS1G396TF 573 0 0
GGAACCACAGAATCATGAATCTTAACTTCTTCCCTAGTTCTCTCTTCTTGTTTCTACTAC
TCTCAGTATTTTCGAGCTTCATCTCAGATAGTGCATTCATCAAATCTGAAACTTTGGCTA
ATGGAAGAAATCTGCTTCAGAAAAAGAAAGCATGTCCAGTGAACTTTGAGTTTATGAACT
ACACAATCATAACAAGCCAATGCAAGGGTCCCAAATACCCACCCAAGAAGTGTTGCACCG
CATTCAAGGAATTTGCATGTCCTTACGCTGATGAGCTGAACGACTTGAGCAATGATTGTG
CAACCACTATGTTCAGCTATATCAACCTATACGGTAAATACCCACCGGGACTGTTTGCAA
ACCGATGCCAAGGTAAAGGAGGTCTCAAGTGCCCCGGTCAAATATGAATTTCTACTCTAG
TTTAACAGGGTGGTCATAGCCTTCCTATCTTCAATAATGTTTTTATTATAATCAACTTTA
TCAATAATTGTAGTCAAAATAAATTGTGGAGGAGACTCCATTGCATCACATGGTCTTCGC
CTTCATATTTTCAATTCATAATATGGTCCTA
GC

QA 1 571 1 571
DS 

RD RS1DC11TF 610 0 0
GGAACCACAGAATCATGAATCTTAACTTCTTCTCTAGTTCTCTCTTCTTGTTTCTACTAC
TCTCAGTATTTTCGAGCTTCATCTCAGATAGTGCATTCATCAAATCTGAAACTTTGGCTA
ATGGAAGATATCTGCTTCAGAAGAAGAAAGCATGTCCAGTGAACTTTGAGTTTATGAACT
ACACAATCATAACAAGCCAATGCAAGGGTCCCAAATACCCACCCAAGAAGTGTTGCACCG
CATTCAAGGAATTTGCATGTCCTTACGCTGATGAGCTGAACGACTTGAGCAATGATTGTG
CAACCACTATGTTCAGCTATATCAACCTATACGGTAAATACCCACCGGGACTGTTTGCAA
ACCGATGCCAAGGTAAAGGAGGTCTCAAGTGCCCCGGTCAAATATGAATTTCTACTCTAG
TTTAACAGGGTGGTCATAGCCTTCCTATCTTCAATAATGTTCTTATTATAATCAACTTTA
TCAATAATTGTAGTCAAAATAAATTGTGGAGGAGGCTCCATTGCATCACATGGTCTTAGC
CTTCATATTTTCAATTCATAATATGGTCCTAGCCTTTCATATTTTCAGTTAATAATATGT
ATCTTAACAT

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 3

CO CL2854Contig1 1341 3 2 U
GACAAGTTTAGTGGGTTTTATTAGTCACACGACCTTTTAACATTCAATACTGACACACAA
ATGAATGAAGAGACACTAAAAACATAAGAAGAACAAACATTGAGATTTTTTTAAAAAAAA
GAAGCCTAAAAACATGTGTTTCTTGCTCCTCATGCTTTAACAAAAGACGCGGTAAGACTT
TCACGTAAAACAGAGTAAACCGATCTCCACCCTTCTTCTGTAGGGTGACTTCCATCCCAA
AAGAAAGCAGCTTTAGGGTTATCACATATCACATACTTCTTCACTCCCTTCTCATCCACA
CTTCCACAGAAATACTCACTGCTCACGCCTACGCAACACGGCTTCAATGGACTCTGAAAC
GTTGTACTTCCTGGGTAAGCTCCTTTGTTCTTGAACACGGTCAAGAAAGCGTTGTAGAGA
TCAAGGATGATGAAAGTCGACTGCTTGGTTTCGTTATTGAGCTTTGTCACGACTTGTTGC
AGTAAACTGTTGTGAAGTTTCACTAAAGCGTTTTGTGACTCGTTGCAGCGCTGGAACGAG
GAGGCAACGGTGATTCCAGGGATGCAACCGAGAGGCTGCAACGACGGTACTGCTATTTTC
TTCACTCCCAAGGCATGGATCCGCCTCAAATTCACTTCCGTTTGATCCACTACTTGCTTT
ATAAATGCCGGAAACTCAGAGTTAGGGCGGTTTTGGGCGATGAAAGTGGAGTAGTCGTTG
CCGGCAACGCTGACTAGAGCGACGGAGGAAGAAAAGTCGGAGGAAGCGTAGATGTCTCCG
GCTGTGAGAATGTTCTGGAAGAAATCGATCTGCGTGGTCATGTTGGGCAAGGGGACTTGA
GTGTTGAAGACTCCTGTTCCTCCGTACGCAAAATTCATTCCATATTGTAACCGTTTCTTT
CCCGCGTAATCTTTCCAGAAGTATGGGATTGGTGATTTTATCCCAACGAATTTTGCAAGA
AAATCGGTGGAGACGCGGCCGTCGGAAAAATGGCCGGCTGGTTTACCAGGGAAAGTGATA
CCATAAGGGAATTTCCAAGAACTAGAGAGAGACTTCTTAATGTTCCCTGTATCAGCATAT
GAATCTCCGAACACAAACAGCTTCGTTGGTCTAAATCCGTACATGCGCTGATTTTTATCC
GAGCCCTCAACTTCATTTATTTCTCCAAAGAGGAGAAATACAGAGAGGAAGAAGAAGAGT
TTGATCAAAGAATCCATTTTCAAGATTCTCAGAGTAAAGGCCTCTCTTTTAGTGACAACA
GAAAGGAAAAGGAAAGGCAAGGAGATAAGAGATAGAAGATGGGGTTTAAGGAGACAAGTT
TGAGAACTGAAATTGGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 
5 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FY30JQ U 28
AF RS1AT30JQ U 1
AF RS1FY30TF C 563
BS 1 740 RS1AT30JQ
BS 741 1341 RS1FY30TF

RD RS1FY30JQ 577 0 0
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GAAGAACAAACATTGAGATTTTTTTAAAAAAAAGAAGCCTAAAAACATGTGTTTCTTGCT
CCTCATGCTTTAACAAAAGACGCGGTAAGACTTTCACGTAAAACAGAGTAAACCGATCTC
CACCCTTCTTCTGTAGGGTGACTTCCATCCCAAAAGAAAGCAGCTTTAGGGTTATCACAT
ATCACATACTTCTTCACTCCCTTCTCATCCACACTTCCACAGAAATACTCACTGCTCACG
CCTACGCAACACGGCTTCAATGGACTCTGAAACGTTGTACTTCCTGGGTAAGCTCCTTTG
TTCTTGAACACGGTCAAGAAAGCGTTGTAGAGATCAAGGATGATGAAAGTCGACTGCTTG
GTTTCGTTATTGAGCTTTGTCACGACTTGTTGCAGTAAACTGTTGTGAAGTTTCACTAAA
GCGTTTTGTGACTCGTTGCAGCGCTGGAACGAGGAGGCAACGGTGATTCCAGGGATGCAA
CCGAGAGGCTGCAACGACGGTACTGCTATTTTCTTCA

QA 1 577 1 577
DS 

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ATGAATGAAGAGACACTAAAAACATAAGAAGAACAAACATTGAGATTTTTTTAAAAAAAA
GAAGCCTAAAAACATGTGTTTCTTGCTCCTCATGCTTTAACAAAAGACGCGGTAAGACTT
TCACGTAAAACAGAGTAAACCGATCTCCACCCTTCTTCTGTAGGGTGACTTCCATCCCAA
AAGAAAGCAGCTTTAGGGTTATCACATATCACATACTTCTTCACTCCCTTCTCATCCACA
CTTCCACAGAAATACTCACTGCTCACGCCTACGCAACACGGCTTCAATGGACTCTGAAAC
GTTGTACTTCCTGGGTAAGCTCCTTTGTTCTTGAACACGGTCAAGAAAGCGTTGTAGAGA
TCAAGGATGATGAAAGTCGACTGCTTGGTTTCGTTATTGAGCTTTGTCACGACTTGTTGC
AGTAAACTGTTGTGAAGTTTCACTAAAGCGTTTTGTGACTCGTTGCAGCGCTGGAACGAG
GAGGCAACGGTGATTCCAGGGATGCAACCGAGAGGCTGCAACGACGGTACTGCTATTTTC
TTCACTCCCAAGGCATGGATCCGCCTCAAATTCACTTCCGTTTGATCCACTACTTGCTTT
ATAAATGCCGGAAACTCAGAGTTAGGGCGGTTTTGGGCGATGAAAGTGGAGTAGTCGTTG
CCGGCAACGCTGACTAGAGC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RS1FY30TF 779 0 0
GATGCACGAGAG
GCTGCA*CGACGGTACTGCTATTTC**TCACTCCCAAGGCATGGATCCGC*TCAAATTCA
CTTCCGTTTGATCCACTACTTGCTTTATAAATGCCGGAAACTCAGAGTTAGGGCGGTTTT
GGGCGATGAAAGTGGAGTAGTCGTTGCCGGCAACGCTGACTAGAGCGACGGAGGAAGAAA
AGTCGGAGGAAGCGTAGATGTCTCCGGCTGTGAGAATGTTCTGGAAGAAATCGATCTGCG
TGGTCATGTTGGGCAAGGGGACTTGAGTGTTGAAGACTCCTGTTCCTCCGTACGCAAAAT
TCATTCCATATTGTAACCGTTTCTTTCCCGCGTAATCTTTCCAGAAGTATGGGATTGGTG
ATTTTATCCCAACGAATTTTGCAAGAAAATCGGTGGAGACGCGGCCGTCGGAAAAATGGC
CGGCTGGTTTACCAGGGAAAGTGATACCATAAGGGAATTTCCAAGAACTAGAGAGAGACT
TCTTAATGTTCCCTGTATCAGCATATGAATCTCCGAACACAAACAGCTTCGTTGGTCTAA
ATCCGTACATGCGCTGATTTTTATCCGAGCCCTCAACTTCATTTATTTCTCCAAAGAGGA
GAAATACAGAGAGGAAGAAGAAGAGTTTGATCAAAGAATCCATTTTCAAGATTCTCAGAG
TAAAGGCCTCTCTTTTAGTGACAACAGAAAGGAAAAGGAAAGGCAAGGAGATAAGAGATA
GAAGATGGGGTTTAAGGAGACAAGTTTGAGAACTGAAATTGGATTCC

QA 13 779 13 779
DS 



AS 1 4

CO CL2855Contig1 657 4 7 U
GGGAGATTCTCTCTCTCCTCCTGCGGATCATATTTTTTTCCTTTTCTTTCACTTTCCTTT
GGTTTTCTCGGCGGCTTCATTCGAATCGTTTTTTCCTCTTTTTTTCTCTCTCTAGGGGGG
TAAAGCTTCCTCCTTTCTGTAGACAGACGCCATGTCGGACAAAGGACGTCCCTTACCCAA
GTTTGGAGAATGGGATGTGAATGATCCAGCATCAGCAGAAGGTTTCACAGTCATATTCAA
CAAAGCTAGGGATGAGAAGAAGACCGGTGGCAAGCCAGGATCGCCTGGTAAATCCACTGA
CGGTAATGCTAAATCCGGAGGAGGAGATCCTAGTAAACCCCAGCCTAAAAAATGGCTCTG
CTGCATGCAGTCTCCAGCAGTGGACTCTTGACGGACACCAAGATTGGATTTGCTTGCTGC
CAAGTAAAAAAAGAAGAAGAAGGTTACATTGCTTAGACATGTAAAGCAATGTTCTTCTTT
TTTATGTTTTATTGTCTTTCTTGAAAGTATCCACACAACAACAAAAAAGTTCCTAAGATG
ATTTGGAGCCCCCTTTTTAGTATTCACGATTATGACTTTCCTTTTTTTTCTTTTGGAGTC
GTTTGTTATTCTAAAAATGCTGTAAAATCGTGTTACCACTTTTATTGGAAAACCAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1F191TF U 1
AF RS1EX64TF U 33
AF RS1EX64JQ C 114
AF RS1F191JQ C 191
BS 1 539 RS1F191TF
BS 540 542 RS1EX64TF
BS 543 583 RS1F191TF
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BS 587 587 RS1EX64JQ
BS 588 657 RS1EX64TF

RD RS1F191TF 587 0 0
GGGAGATTCTCTCTCTCCTCCTGCGGATCATATTTTTTTCCTTTTCTTTCACTTTCCTTT
GGTTTTCTCGGCGGCTTCATTCGAATCGTTTTTTCCTCTTTTTTTCTCTCTCTAGGGGGG
TAAAGCTTCCTCCTTTCTGTAGACAGACGCCATGTCGGACAAAGGACGTCCCTTACCCAA
GTTTGGAGAATGGGATGTGAATGATCCAGCATCAGCAGAAGGTTTCACAGTCATATTCAA
CAAAGCTAGGGATGAGAAGAAGACCGGTGGCAAGCCAGGATCGCCTGGTAAATCCACTGA
CGGTAATGCTAAATCCGGAGGAGGAGATCCTAGTAAACCCCAGCCTAAAAAATGGCTCTG
CTGCATGCAGTCTCCAGCAGTGGACTCTTGACGGACACCAAGATTGGATTTGCTTGCTGC
CAAGTAAAAAAAGAAGAAGAAGGTTACATTGCTTAGACATGTAAAGCAATGTTCTTCTTT
TTTATGTTTTATTGTCTTTCTTGAAAGTATCCACACAACAACAAAAAAGTTCCTAAGAT*
**TTGGAGCCCCCTTTTTAGTATTCACGATTATGACTTTCCTT
CTTC

QA 1 583 1 583
DS 

RD RS1EX64TF 625 0 0
TTTTTTTCCTTTTCTTTCACTTTCCTTTGGTTTTCTCGGCGGCTTCATTCGAATCGTTTT
TTCCTCTTTTTTTCTCTCTCTAGGGGGGTAAAGCTTCCTCCTTTCTGTAGACAGACGCCA
TGTCGGACAAAGGACGTCCCTTACCCAAGTTTGGAGAATGGGATGTGAATGATCCAGCAT
CAGCAGAAGGTTTCACAGTCATATTCAACAAAGCTAGGGATGAGAAGAAGACCGGTGGCA
AGCCAGGATCGCCTGGTAAATCCACTGACGGTAATGCTAAATCCGGAGGAGGAGATCCTA
GTAAACCCCAGCCTAAAAAATGGCTCTGCTGCATGCAGTCTCCAGCAGTGGACTCTTGAC
GGACACCAAGATTGGATTTGCTTGCTGCCAAGTAAAAAAAGAAGAAGAAGGTTACATTGC
TTAGACATGTAAAGCAATGTTCTTCTTTTTTATGTTTTATTGTCTTTCTTGAAAGTATCC
ACACAACAACAAAAAAGTTCCTAAGATGATTTGGAGCCCCCTTTTTAGTATTCACGATTA
TGACTTTCCTTCTTCTTCTTTTGGAGTCGTTTGTTATTCTAAAAATGCTGTAAAATCGTG
TTACCACTTTTATTGGAAAACCAGG

QA 1 625 1 625
DS 

RD RS1EX64JQ 544 0 0
AGGGGGGTAAAGCTTCCTCCTTTCTGTAGACAGACGCCATGTCGGACAAAGGACGTCCCT
TACCCAAGTTTGGAGAATGGGATGTGAATGATCCAGCATCAGCAGAAGGTTTCACAGTCA
TATTCAACAAAGCTAGGGATGAGAAGAAGACCGGTGGCAAGCCAGGATCGCCTGGTAAAT
CCACTGACGGTAATGCTAAATCCGGAGGAGGAGATCCTAGTAAACCCCAGCCTAAAAAAT
GGCTTTGCTGCATGCAGTTTCCAGCAGTGGACTCTTGACGGACACCAAGATTGGATTTGC
TTGCTGCCAAGTAAAAAAAGAAGAAGAAGGTTACATTGCTTAGACATGTAAAGCAATGTT
TTTCTTTTTTATGTTTTATTGTCTTTCTTGAAAGTATCCACACAACAACAAAAAAGTTCC
TAAGATGATTTGGAGCCCCCTTTTTAGTATTCACGATTATGACTTTCCTTTTTTTTCTTT
TGGAGTCGTTTGTTATTTTAAAAATGCTGTAAAATCGTGTTACCACTTTTATTGGAAAAC
CAGG

QA 1 544 1 544
DS 

RD RS1F191JQ 467 0 0
TGGGATGTGAATGATCCAGCATCAGCAGAAGGTTTCACAGTCATATTCAACAAAGCTAGG
GATGAGAAGAAGACCGGTGGCAAGCCAGGATCGCCTGGTAAATCCACTGACGGTAATGCT
AAATCCGGAGGAGGAGATCCTAGTAAACCCCAGCCTAAAAAATGGCTTTGCTGCATGCAG
TCTCCAGCAGTGGACTCTTGACGGACACCAAGATTGGATTTGCTTGCTGCCAAGTAAAAA
AAGAAGAAGAAGGTTACATTGCTTAGACATGTAAAGCAATGTTTTTCTTTTTTATGTTTT
ATTGTCTTTCTTGAAAGTATCCACACAACAACAAAAAAGTTCCTAAGAT***TTGGAGCC
CCCTTTTTAGTATTCACGATTATGACTTTCCTTTTTTTTCTTTTGGAGTCGTTTGTTATT
CTAAAAATGCTGTAAAATCGTGTTGCCACTTTTATTGGAAAACCAGG

QA 1 467 1 467
DS 



AS 1 4

CO CL2856Contig1 1157 4 6 U
ACATAGCAACAAATATTTGGGCCGGGGGAATAAAATCGTAACAAATGGTATTTACACGCA
GACATGAATGTTCAAACCGTTAAAAAAGTACGCAGCAGGCACGTGGATACAGCTTTGGCA
CAGCAAACAAACAACAAACTATGATATGTTGGCTTTGTTCATTAGCAGCTGAACTGATCT
CGCTTTGTCCGGACAAGTTCCAGCGGTAATCTTTCCAATGCCATCCATAGTCTTGGAGCC
GTTGGGTCAAATTTCGGTTGTGCTTTGGCTAGCCTCGACTTGAAACTGATGGTGATGCAA
ACCTTGAACTCAACTGAAAAGGGACCAGCGAAAATGGATGGACACATCAAAAGCCGAGGA
AGTAGAACGTAAATTGGTAGTGTCATCTTACGGCAGACATCTCCATCTGCAATCTGTGTA
GACTGAATCAAAGAGGTCTCAGTAACAATTCTCTCCCCCACAATGATCGACTCAACGCGG
AGAAGGTGAATGTCGATAGAAGTAATAGGAACTGAAGATGCTTCCACCGTTAGCTCGCCG
CTAAGTGGATCCTGCAAAGAGCATTGAGTTGCTAATTTACCAGTAACCCGGAAACCACCT
GTCTTAATATCGGGAAGTAAAGGATGTCTCTGAGTGTCTTGAGTGATGTAGAAGATAACC
ATTTCTGGAGGAAGTGGCCTCTCAGGAAGATCAACTCTACCGCTCTCGATTATAAACTCA
ACTGTTGCAGATAAAGGTTTGTGCAAGTATCCTCGCGGTATATCTGCAGTAAGTAGGTAT
TGGATGTTGATATTAGTTCCATGAAACGTCTCATAGAACTTTTCTGCAATGCTTTCTGCA
GGCTCCCTCAGATTCACGGAGAAAGGAATCTCTGTAGTTCCAGGAGGGATCCTCCCAGAA
GATCTGACCTCGATCGTCTTCTTTAGTATCTGAATGGGTTTGATGACGCCATAGAAAGAC
TCTATAACTCCAGCTGATCCTCCACGTACCTGCAGATTGACTGATCCATTTACGGATAAA
CATATCGCTTGGTGAGAAATCGAATTGGGAGATTTTATCACGATCTTTCCTTCCACTGCC
TCTGAAGAGCGATAGATACGATTTGACCGAGAAAGCTTGACGGTCACCGTCGTCGTCGTC
GTCATTGGAATCAATCA


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1G462JQ U 1
AF RS1EU35JQ U 6
AF RS1G462TF C 394
AF RS1EU35TF C 395
BS 1 681 RS1G462JQ
BS 682 952 RS1G462TF
BS 953 953 RS1EU35TF
BS 954 1021 RS1G462TF
BS 1022 1022 RS1EU35TF
BS 1023 1157 RS1G462TF

RD RS1G462JQ 681 0 0
ACATAGCAACAAATATTTGGGCCGGGGGAATAAAATCGTAACAAATGGTATTTACACGCA
GACATGAATGTTCAAACCGTTAAAAAAGTACGCAGCAGGCACGTGGATACAGCTTTGGCA
CAGCAAACAAACAACAAACTATGATATGTTGGCTTTGTTCATTAGCAGCTGAACTGATCT
CGCTTTGTCCGGACAAGTTCCAGCGGTAATCTTTCCAATGCCATCCATAGTCTTGGAGCC
GTTGGGTCAAATTTCGGTTGTGCTTTGGCTAGCCTCGACTTGAAACTGATGGTGATGCAA
ACCTTGAACTCAACTGAAAAGGGACCAGCGAAAATGGATGGACACATCAAAAGCCGAGGA
AGTAGAACGTAAATTGGTAGTGTCATCTTACGGCAGACATCTCCATCTGCAATCTGTGTA
GACTGAATCAAAGAGGTCTCAGTAACAATTCTCTCCCCCACAATGATCGACTCAACGCGG
AGAAGGTGAATGTCGATAGAAGTAATAGGAACTGAAGATGCTTCCACCGTTAGCTCGCCG
CTAAGTGGATCCTGCAAAGAGCATTGAGTTGCTAATTTACCAGTAACCCGGAAACCACCT
GTCTTAATATCGGGAAGTAAAGGATGTCTCTGAGTGTCTTGAGTGATGTAGAAGATAACC
ATTTCTGGAGGAAGTGGCCTC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RS1EU35JQ 682 0 0
GCAACAAATATTTGGGCCGGGGGAATAAAATCGTAACAAATGGTATTTACACGCAGACAT
GAATGTTCAAACCGTTAAAAAAGTACGCAGCAGGCACGTGGATACAGCTTTGGCACAGCA
AACAAACAACAAACTATGATATGTTGGCTTTGTTCATTAGCAGCTGAACTGATCTCGCTT
TGTCCGGACAAGTTCCAGCGGTAATCTTTCCAATGCCATCCATAGTCTTGGAGCCGTTGG
GTCAGATTTCGGTTGTGCTTTGGCTAGCTTCGACTTGAAACTGATGGTGATGCAGACCTT
GAACTCAACTGAAAAGGGACCAGCGAAAATGGATGGACACATCAAAAGCCGAGGAAGTAG
AACGTAAATTGGTAGTGTCATCTTACGGCAGACATCTCCATCTGCAATCTGTGTAGACTG
AATCAAAGAGGTCTCAGTAACAATTCTCTCCCCCACAATGATCGACTCAACGCGGAGAAG
GTGAATGTCGATAGAAGTAATAGGAACTGAAGATGCTTCCACCGTTAGCTCGCCGCTAAG
TGGATCCTGCAAAGAGCATTGAGTTGCTAATTTACCAGTAACCCGGAAACCACCTGTCTT
AATATCGGGAAGTAAAGGATGTCTCTGAGTGTCTTGAGTGATGTAGAAGATAACCATTTC
TGGAGGAAGTGGCCTC
TCAGGA

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1G462TF 764 0 0
C
AGACATCTCCATCTGCAATCTGTGTAGACTGAATCAAAGAGGTCTCAGTAACAATTCTCT
CCCCCACAATGATCGACTCAACGCGGAGAAGGTGAATGTCGATAGAAGTAATAGGAACTG
AAGATGCTTCCACCGTTAGCTCGCCGCTAAGTGGATCCTGCAAAGAGCATTGAGTTGCTA
ATTTACCAGTAACCCGGAAACCACCTGTCTTAATATCGGGAAGTAAAGGATGTCTCTGAG
TGTCTTGAGTGATGTAGAAGATAACCATTTCTGGAGGAAGTGGCCTCTCAGGAAGATCAA
CTCTACCGCTCTCGATTATAAACTCAACTGTTGCAGATAAAGGTTTGTGCAAGTATCCTC
GCGGTATATCTGCAGTAAGTAGGTATTGGATGTTGATATTAGTTCCATGAAACGTCTCAT
AGAACTTTTCTGCAATGCTTTCTGCAGGCTCCCTCAGATTCACGGAGAAAGGAATCTCTG
TAGTTCCAGGAGGGATCCTCCCAGAAGATCTGACCTCGATCGTCTTCTTTAGTATCTGAA
TGGGTTTGATGACGCCATGGAAAGACTCTATAACTCCAGCTGATCCTCCACGTACCTGCA
GATTGACTGATCCATTTACGGATAAACGTATCGCTTGGTGAGAAATCGAATTGGGAGATT
TTATCACGATCTTTCCTTCCACTGCCTCTGAAGAGCGATAGATACGATTTGACCGAGAAA
GCTTGACGGTCACCGTCGTCGTCGTCGTCATTGGAATCAATCA

QA 2 764 2 764
DS 

RD RS1EU35TF 763 0 0
AGACATCTCCATCTGCAATCTGTGTAGACTGAATCAAAGAGGTCTCAGTAACAATTCTCT
CCCCCACAATGATCGACTCAACGCGGAGAAGGTGAATGTCGATAGAAGTAATAGGAACTG
AAGATGCTTCCACCGTTAGCTCGCCGCTAAGTGGATC*TGCAAAGAGCATTGAGTTGCTA
ATTTACCAGTAACCCGGAAACCACCTGTCTTAATATCGGGAAGTAAAGGATGTCTCTGAG
TGTCTTGAGTGATGTAGAAGATAACCATTTCTGGAGGAAGTGGCCTCTCAGGAAGATCAA
CTCTACCGCTCTCGATTATAAACTCAACTGTTGCAGATAAAGGTTTGTGCAAGTATCCTC
GCGGTATATCTGCAGTAAGTAGGTATTGGATGTTGATATTAGTTCCATGAAACGTCTCAT
AGAACTTTTCTGCAATGCTTTCTGCAGGCTCCCTCAGATTCACGGAGAGAGGAATCTCTG
TAGTTCCAGGAGGGATCCTCCCAGAAGATCTGACCTCGATCGTCTTCTTTAGTATCTGAA
TGGGTTTGATGACGCCATAGAAAGACTCTATAACTCCAGCTGATCCTCCACGTACCTGCA
GATTGACTGATCCATTTACGGATAAACATATCGCTTGGTGAGAAATCGAATTGGGAGATT
TTATCACGATCTTTCCTTCCACTGCCTCTGAAGAGCGATAGATACGATTTGACCGAGAAA
GCTTGACGGTCACCGTCGTCGTCGTCGTCATTGGAATCAATCA

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 4

CO CL2857Contig1 756 4 15 U
GGACTTTTCATTATCTTCTGTTTTCGAGATCTGAGCACTAATTTGAATTCTCAGAGAAAG
CGAAAGCGACAGAGAGAAGATGGCTCGTACCAAGCAAACCGCTCGTAAGTCTACCGGAGG
AAAGGCCCCTAGGAAGCAGCTTGCTACTAAGGCTGCACGTAAGTCTGCACCAACCACCGG
TGGAGTCAAGAAGCCACATCGTTACAGGCCTGGAACTGTTGCTCTTCGTGAAATCCGTAA
GTACCAGAAGAGTACTGAGTTGCTCATCAGGAAGCTCCCTTTCCAGAGGCTTGTTCGTGA
GATTGCCCAGGATTTCAAGACTGACCTGCGTTTCCAGAGCCATGCTGTGCTAGCACTCCA
GGAGGCAGCTGAAGCATACCTTGTTGGACTCTTTGAGGACACCAACCTGTGCGCCATTCA
TGCCAAGCGTGTCACCATCATGCCCAAAGACACCCAACTCGCTCGCAGGATCAGAGGAGA
GCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGCTCGGGGTCCTATTATGTGAATGTTGGGGTTTGCTGTT
TCTCTAAATAGACGTAGCTGGATTTTTAGATAATATGGTCTTTTAAGAAGGCTTTTGGTA
TTAGTAGACTCTCTAAAACAATGATGGTTTGTTGGTTTTTTTCTTATTTTCGGGTTTATG
ATTTGCTTTTGTGTATTTTGCAGCTACGTGTTTTGTTAAACCTTTCGTTGTTTGAATCTT
AAAACAATTAGTATGTTGAAGTTGACCTCTTTTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 0 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FU70JQ C 186
AF RS1FU70TF U 1
AF RS1FB44JQ C 48
AF RS1FB44TF U 48
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BS 747 756 RS1FB44JQ

RD RS1FU70JQ 292 0 0
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DS 

RD RS1FU70TF 658 0 0
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TCTCTAAATAGACGTAGCTGGATTTTTAGATAATATGGTCTTTTAAGAAGGCTTTTGGTA
TTAGTAGACTCTCTAAAACAATGATGGTTTGTTG*TTTTTTTCTTATTTTCGGGTTTA

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DS 

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G
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GTCTACCGGAGGAAAGGCCCCTAGGAAGCAGCTTGCTACTAAGGCTGCACGTAAGTCTGC
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GCTTGTTCGTGAGATTGCCCAGGATTTCAAGACTGACCTGCGTTTCCAGAGCCATGCTGT
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TTCGGGTTTATGATTTGCTTTTGTGTATTTTGCAGCTACGTGTTTTGTTAAACCTTTCGT
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QA 2 709 2 709
DS 

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G
TCTCAGAGAAAGCGAAAGCGACAGAGAGAAGATGGCTCGTACCAAGCAAACCGCTCGTAA
GTCTACCGGAGGAAAGGCCCCTAGGAAGCAGCTTGCTACTAAGGCTGCACGTAAGTCTGC
ACCAACCACCGGTGGAGTCAAGAAGCCACATCGTTACAGGCCTGGAACTGTTGCTCTTCG
TGAAATCCGTAAGTACCAGAAGAGTACTGAGTTGCTCATCAGGAAGCTCCCTTTCCAGAG
GCTTGTTCGTGAGATTGCCCAGGATTTCAAGACTGACCTGCGTTTCCAGAGCCATGCTGT
GCTAGCACTCCAGGAGGCAGCTGAAGCATACCTTGTTGGACTCTTTGAGGACACCAACCT
GTGCGCCATTCATGCCAAGCGTGTCACCATCATGCCCAAGGACACCCAACTCGCTCGCAG
GATCAGAGGAGAGCGTGCTTAAGTCTTGTTGTTGCTCGGGGTCCTATTATGTGAATGTTG
GGGTTTGCTGTTTCTCTAAATAGACGTAGCTGGATTTTTAGATAATATGGTCTTTTAAGA
AGGCTTTTGGTATTAGTAGACTCTCTAAAACAATGATGGTTTGTTGGTTTTTTTCTTATT
TTCGGGTTTATGATTTGCTTTTGTGTATTTTGCAGCTACGTGTTTTGT*AAACCTTTCGT
TGTTTGATTCT**AAACAATTAGTATGTTGAAGTTGAC
TCTTTCAT

QA 2 699 2 699
DS 



AS 1 4

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TGGCGCGTGGAACCGATGAGTTTAACACCAACCTCTCCTGTTTCTCTCTCCGCTTCTTCC
TCCTCCTCTTCCGCGTTCTTGTGCGTCGATGGCCTCACGGAGCTCCGGTTTCTCTCATCG
GAATTGCTTAGAGAGAATTTTCCAACTGTCTCCGGTTGTAGTGATCTCCGGAAGCTTCGA
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GCTGCTGTGATTCAAGTTAACTATCTTTCTTTTGCTCATGGTAGGAACGAGAGAAGTGTA
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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1A254TF U 59
AF RS1A254TV U 1
AF RS1A254JQ C 58
AF RS1A254TR C 58
BS 1 776 RS1A254TV

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TAGCTGCTGTGATTCAAGTTAACTATCTTTCTTTTGCTCATGGTAGGAACGAGAGAAGTG
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AAGCAAGGTTTGATTTTGTAGATAACTTGTGGATTTT

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DS 

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GAATTGCTTAGAGAGAATTTTCCAACTGTCTCCGGTTGTAGTGATCTCCGGAAGCTTCGA
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GGCAAAGCAGTTGCATTTCAATAAAGACGGGACAGCTATTAAGAAGCTTCAAGCTGGTGT
CAACAAACTTGCGGATCTTGTTGGAGTTACTTTAGCTCCTACAGGCAGAAACGTTGTTCT
CGAAAGCATATATGGTTCTCCAAGAATTGTTAATGACAGTGTAACATGTGGAACTGCTTA
GCTGCTGTGATTCAAGTTAACTATCTTTCTTTTGCTCATGGTAGGAACGAGAGAAGTGTA
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GCAAGGTTTGATTTTGTAGATAACTTGTGGATTTTGAAGGTTTTAAAATTTGATGTGAGC
TTAGCTGTTTTGTTTTGTGAGAAAGGTACCAATAACCCAAGTAATACATATCCCATTGAT
GCATCTGAATTTGAAGAATGAGATGTTTAAAATTTAATTTTTTTTCTAAGAACCCG

QA 1 776 1 776
DS 

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G
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CCTCCTCCTCTTCCGCGTTCTTGTGCGTCGATGGCCTCACGGAGCTCCGGTTTCTCTCAT
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DS 

RD RS1A254TR 719 0 0
G
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CCTCCTCCTCTTCCGCGTTCTTGTGCGTCGATGGCCTCACGGAGCTCCGGTTTCTCTCAT
CGGAATTGCTTAGAGAGAATTTTCCAACTGTCTCCGGTTGTAGTGATCTCCGGAAGCTTC
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TAGCTGCTGTGATTCAAGTTAACTATCTTTCTTTTGCTCATGGTAGGAACGAGAGAAGTG
TAAGGTTTCATTCCAGGGTGTTGGGAGGACTCTAGGTGGTAGCAGCAACGACAGCAGCGG
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ATGCATCTGAATTTGAAGAATGAGATGTTTAAAATTTAATTTTTTTTCTAAGAACCCG

QA 2 719 2 719
DS 



AS 1 4

CO CL2859Contig1 955 4 6 U
TTTTTAACAAGATCAGGATAACAAAAGGGATGCATAGTCTTCTTCACCTTCTTCTCATCG
CCACCGTTACGATCTCGATCCCTGTTGTTTTCGCCGAGAATGATTCGATATACGACGTCC
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GTGGGGATAATAAGATTCAGTCATCTATGTTGCAATTCTATGAAGTAGATCAAAGTGTTG
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TATACAAGTTCGAAACTTTTAGCTGCTCATGGGTTTTTTGAAGACACACACCTTCCATTT
GAGGTCAGATACTCCTTTCTTCCCAAGTTGCTTTCATCACTCTGTTTGAAATGAAAATGA
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TGTCCAGATTCATCACAGGTGACTGAATGTTTTTGTGAATTTTTGCTTTTATGTTTTGCA
CTGTCATGCATCTCTATTCTCCCTGTAATATAATATACTTATAATCTATTGTATGATATG
CATGTCCATTTTGTAATCATATTCCTTTATCCCAATAAGATTTTGTATAGTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1H211TF U 1
AF RS1F141TF U 247
AF RS1H211JQB C 171
AF RS1F141JQ C 247
BS 1 440 RS1H211TF
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G
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A

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CCTTCCATTTGAGGTCAGATACTCCTTTCTTCCCAAGTTGCTTTCATCACTCTGTTTGAA
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TTTGC

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G
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TAGCTCCGGCGTTATATACTTCGATGTCGGAGTTGTTCGCAAGCGGTACTCCATGTCTTT
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GTTCGAAACTTTTAGCTGCTCATGGGTTTTTTGAAGACACACACCTTCCATTTGAGGTCA
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TCATGTGAGCAAGTTAGATGGGAAGAACAAGTGTTGGTGGGTTTTGTTTGAGATGTCCAG
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ATTTTGTAATCATATTCCTTTATCCCAATAAGATTTTGTAT

QA 2 702 2 702
DS 



AS 1 4

CO CL2860Contig1 704 4 9 U
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CGTTATTGTTACATAACGTAATAGTGTGACTTCAAATTTTATTACAACATTATCAAACAC
ACAAATAACATCAAGGGAAGAGTTTGCTTCCTACGAATGCTGAGTCTTGTCCAAATCCTC
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BQ
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AF RS1A954JQ U 149
AF RS1A954TF C 5
AF RS1FW08TF C 1
AF RS1FW08JQ U 10
BS 1 9 RS1FW08TF
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CC

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DS 

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CC

QA 6 539 6 539
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ATTCTCCTCGGTTATGTCGGTGGTGGAAGATGAGGTCGAAGGTCCAAAGACACCTGTTCG
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TGTGGAATGAGACAAAAGAGCACATCATACGGTTCCCATGTTCC

QA 1 704 1 704
DS 

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TACATAACGTAATAGTGTGACTTCAAATTTTATTACAACATTATCAAACACACAAATAAC
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GGTTATGTCGGTGGTGGAAGATGAGGTCGAAGGTCCAAAGACACCTGTTCGAGGATGAGG
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CAATTCTTCTTCTACGTTCTTATCATACGCCGATGTGTGACCATTCCTAGAGGCAGAGAG
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GATCACCTGAAGGCTCTTGGATTTGGCTGCCATTCAACTGGTACCCCAAGATTGAGAGAG
AGAGAGTTGTGTTTGGGTGAGTATTAATGGAGAATACTTGCAACTTGTCTGTTTATATAA
ATATAACATACAAGATGGAAATTTCAGTGTGAAAAAAAAATAAAATACAAGTGTGGAATG
AGACAAAAGAGCACATCA

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 4

CO CL2861Contig1 794 4 24 U
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ATTTTCGTGGAGTCGGCTTCATCCCTTCT*CTAT*TACTTAATTCTCTCGCTGCCTGCTG
TTGATGTTCGTTTGCTTCATCTTTAATCGTTGACGATGTCGAAAGAGGGAGAGACGGTGA
TCGGAGTACCGTATTACGCGGGGCAGAACCCGTATCAGGCGGGGATTGTGCCGCCGAACG
CAATCTATGGAGATCCGATGGGTGCTCCGATCCATCAAACGTTTTACCGGGACACTCCTG
CTCCTTTCAATTGCCTCTATTGCGGCAATACTGGTCTCACCCATATCAGATCAAAACCTG
GTGTAGCTGCTGTTGTTGCTTGCATGACTCCATTTATGCTTGGATTCTGTTTTCTCTGCC
CTTCAATGGATTGCCTCTGGAACAAACAGCATCATTGCCCTCAGTGTGGGAATAAGGTTG
CTGACTTTGAGAAATCAGATCCCTGCCTGGTGATGGATCCGCCACAGTGGACGCAACCGA
GCTTTGCACTCCCTGCATGATATAAGACTGCATTCTTTTCTTCTTCTTATTCTTCTTGTT
AATATTACTTGTGAAGTTGAGACCTTGTGTTTGCACGTACCTACAAAAATTGAAGATTCT
GAATAAACCCTGTGAAATGTGTGAGAAAAGGAACATATACAATTGTCTGTATCGTCCAGT
GATTCGTGAATTGCACCGTTTTGTGTCTTGATTCTTATCCCTCCTTTGGATATGAAACAC
AGATTCTTTTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 
10 10 10 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1BO01TF U 11
AF RS1BO01JQ C 11
AF RS1AO73TFB U 1
AF RS1AO73JQ C 125
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RD RS1BO01TF 677 0 0
GG
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TGAAATGTGTGAGAA

QA 3 677 3 677
DS 

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GG
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TGCTTCATCTTTAATCGTTGACGATGTCGAAAGAGGGAGAGACGGTGATCGGAGTACCGT
ATTACGCGGGGCAGAACCCGTATCAGGCGGGGATTGTGCCGCCGAACGCAATCTATGGAG
ATCCGATGGGTGCTCCGATCCATCAAACGTTTTACCGGGACACTCCTGCTCCTTTCAATT
GCCTCTATTGCGGCAATACTGGTCTCACCCATATCAGATCAAAACCTGGTGTAGCTGCTG
TTGTTGCTTGCATGACTCCGTTTATGCTTGGATTCTGTTTTCTCTGCCCTTCCATGGATT
GCCTCTGGAACAAACAGCATCATTGCCCTCAGTGTGGGAATAAGGTTGCTGACTTTGAGA
AATCAGATCCCTGCCTGGTGATGGATCCGCCACAGTGGACGCAACCGAGCTTTGCACTCC
CTGCATGATATAAGACTGCATTCTTTTCTTCTTCTTATTCTTCTTGTTAATATTACTTGT
GAAGTTGAGACCTTGTGTTTGCACGTACCTACAAAAATTGAAGATTCTGAATAAACCCTG
TGAAATGTGTGAGAAAAGGAACATATACAATTGTCTGTATCGTCCAGTGATTCGTG

QA 3 718 3 718
DS 

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******TGCGTTTGCTTCATCTTTAATCGTTGACGATGTCGAAAGAGGGAGAGACGGTGA
TCGGAGTACCGTATTACGCGGGGCAGAACCCGTATCAGGCGGGGATTGTGCCGCCGAACG
CAATCTATGGAGATCCGATGGGTGCTCCGATCCATCAAACTTTTTACCGGGACACTCCTG
CTCCTTTCAATTGCCTCTATTGCGGCAATACTGGTCTCACCCATATCAGATCAAAACCTG
GTGTAGCTGCTGTTGTTGCTTGCATGACTCCATTTATGCTTGGATTCTGTTTTCTCTGCC
CTTCAATGGATTGCCTCTGGAACAAACAGCATCATTGCCCTCAGTGTGGGAATAAGGTTG
CTGACTTTGAGAAATCAGATCCCTGTCTGGTGATGGATCCGCCACAGTGGACGCAACCGA
GCTTTGCACTCCCTGCATGATATAAGACTGCATTCTTTTCTTCTTCTTATTCTTCTTGTT
AATATTACTTGTGAAGTTGAGACCTTGTGTTTGCACGTACCTACAAAAATTGAAGATTCT
GAATAAACCCTGTGAAATGTGTGAGAAAAGGAACATATACAATTGTCTGTATCGTCCAGT
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AGATTCTTTTGCC

QA 1 793 1 793
DS 

RD RS1AO73JQ 670 0 0
TGTG
CGTTTGCTTCATCTTTAATCGTTGACGATGTCGAAAGAGGGAGAGACGGTGATCGGAGTA
CCGTATTACGCGGGGCAGAACCCGTATCAGGCGGGGATTGTGCCGCCGAACGCAATCTAT
GGAGATCCGATGGGTGTTCCGATCCATCAAACTTTTTACCGGGACACTCCTGCTCCTTTC
AATTGCCTCTATTGCGGCAATACTGGTCTCACCCATATCAGATCAAAACCTGGTGTAGCT
GCTGTTGTTGCTTGCATGACTCCATTTATGCTTGGATTCTGTTTTTTCTGCCCTTCAATG
GATTGCCTCTGGAACAAACAGCATCATTGCCCTCAGTGTGGGAATAAGGTTGCTGACTTT
GAGAAATCAGATCCCTGTCTGGTGATGGATCCGCCACAGTGGACGCAACCGAGCTTTGCA
CTCCCTGCATGATATAAGACTGCATTCTTTTCTTCTTCTTATTCTTCTTGTTAATATTAC
TTGTGAAGTTGAGACCTTGTGTTTGCACGTACCTACAAAAATTGAAGATTCTGAATAAAC
CCTGTGAAATGTGTGAGAAAAGGAACATATACAATTGTCTGTATCGTCCAGTGATTCGTG
AATTGCACCGTTTTGTGTCTTGATTCTTATCCCTCCTTTGGATATGAAACACAGATTCTT
TTGCCC

QA 5 670 5 670
DS 



AS 1 3

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TCGCTGCCCAAAACATTCGCCTGCAGCGCCTTCGCTGCCTGCGTCGCCGAGGTGTGTACG
ATTCCGTTGGACACTGCGAAGGTTAGGCTTCAGCTTCAAAAGTCTGCCGTATCTGGAGAT
CTCACTCTGCCTAAGTACCGAGGGTTGCTGGGAACTGTTGGTACCATTGCAAGGGAAGAA
GGGCTTCGTTCGCTATGGAAAGGTGTTGTTCCCGGACTGCATCGCCAATGCTTGTTTGGT
GGTCTGAGGATCGGAATGTATGAGCCGGTCAAAAACTTGTACGTTGGGAAAGACCATGTT
GGTGATGTACCATTGAGCAAGAAAATCCTTGCTGGTTTGACAACAGGTGCGCTGGGTATC
ATGGTGGCGAACCCCACCGATCTTGTGAAAGTTAGACTTCAGGCTGAAGGGAAACTACCT
GCAGGTGTGCCAAAACGGTATTCTGGATCGTTGAATGCGTATTCAACTATCGTTAGACAG
GAAGGAGTTCGAGCTCTTTGGACTGGTCTTGGACCTAACGTGGCAAGAAACGCAATCATC
AATGCTGCTGAATTAGCGAGTTACGATCAAGTGAAGCAGACAATCTTGAAGATCCCGGGT
TTCACTGATAACATTGTCACACATATTCTCTCTGGACTAGGAGCAGGATTCTTTGCTGTG
TGCATTGGTTCCCCTGTCGACGTGGTTAAGTCAAGAATGATGGGAGATCCTTCTTACAAA
GGCACTATTGACTGCTTCGTTAAAACTCTGAAGGCGGACGGTCCTATGGCATTCTACAAG
GGTTTCATCCCCAACTTTGGACGTCTTGGCTCATGGAATGTCATCATGTTTTTGACCCTT
GAACAGGCAAAGAAGTATGTCCGGGAACTAGATTCGTCCACTAAACACTGAGAAACAGAA
CATTAAGCAGAGAGAGAGAGAGAATAAGAGCAACACTGTTTTCTTCTTTAATTTCGGTGG
TCGAGAGAGGCCAAAACTTCATTGAATATTGTTTTGGAATAGAGAGTCGTTTTCAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D160TF U 18
AF RS1FW23TF U 1
AF RS1FW23JQ C 410
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AGCTTCAAAAGTCTGCCGTATCTGGAGATCTCACTCTGC
GT

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CATTCTACAAGGGTTTCATCCCCAACTTTGGACGTCTTGGCTCATGGAATGTCATCATGT
TTTTGACCCTTGAACAGGCAAAGAAGTATGTCCGGGAACTAGATTCGTCCACTAAACACT
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AATTTCGGTGGTCGAGAGAGGCCAAAACTTCATTGAATATTGTTTTGGAATAGAGAGTCG
TTTTCAAGC

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 3

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TCTACAAGCTCAAACTTGGTGAGATCGTCACTACCATTCCTACCATTGGTTTCAATGTTG
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ATGAACTGAGGGATGCAGTTCTGCTTGTTTTTGCTAACAAGCAAGATCTTCCCAACGCAA
TGAACGCTGCTGAGATCACTGACAAGCTTGGCCTTCACTCTCTCCGCCAGCGACACTGGT
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CCAACAACATTGCAAACAAGGCGTAGAAAGCCGGTAGCAGGACTCATCTTTGCTTGTTTT
GTTTTATACACCACTGTTGAGGGGTCTGTTTCTCTAGCTCTACAAAACGAAACCGAGTTT
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ATAAATCATAAGTTCTTTCTTTTGCTTTTCGAGTTTTTGTTATGTCATACATTCTTCTTC
TGTATGTTGTTCTTCAACAATTAGTACTTTCCTTCAATAAATCATAAGTTCTTTCTTTTG
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 

AF RS1AA31TF U 1
AF RS1FU87TF U 175
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TGAACGCTGCTGAGATCACTGACAAGCTTGGCCTTCACTCTCTCCGCCAGCGACACTGGT
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CCAACAACATCGCTAACAAAGCGTAGAAAGC*GGTAGCAG*ATCCGTCTTTGCTTGTTTT
GTTTTATACA

QA 1 730 1 730
DS 

RD RS1FU87TF 781 0 0
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TATGTTGTTCTTCA*CAATTAGTACTTTCCTTCA*TAAATCATAAGTTCTTTC

QA 9 781 9 781
DS 

RD RS1FU87JQ 781 0 0
C
AAGAAGGAGATGCGTATTCTCATGGTTGGTCTCGATGCTGCTGGTAAGACCACCATCCTC
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ACTGTGGAATACAAGAACATTAGCTTTACCGTCTGGGATGTCGGGGGTCAGGACAAGATT
CGTCCATTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACGCAGGGACTTATCTTTGTTGTTGACAGC
AACGATCGTGACCGTGTTGTTGAAGCCAGGGACGAGCTTCACAGGATGCTCAACGAGGAT
GAACTGAGGGATGCAGTTCTGCTTGTTTTTGCTAACAAGCAAGATCTTCCCAACGCAATG
AACGCTGCTGAGATCACTGACAAGCTTGGCCTTCACTCTCTCCGCCAGCGACACTGGTAC
ATTCAGAGCACATGTGCCACCTCTGGAGAAGGACTCTACGAGGGACTTGACTGGCTCTCC
AACAACATTGCAAACAAGGCGTAGAAAGCCGGTAGCAGGACTCATCTTTGCTTGTTTTGT
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TATGTTGTTCTTCAACAATTAGTACTTTCCTTCAATAAATCATAAGTTCTTTCTTTTGCC

QA 2 781 2 781
DS 



AS 1 4

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TTGCTCGGAACTTTGACTTGGAGGGCTTACGGCTCTGCTGGGTTTCTCTTAGTCGCTGCT
TACTTCGTCATTGGAACAGCGGCGACAAAGGTTAAGATGTCAGAGAAGGAAGCGGAAGGC
GTGGCAGAGAAGAAAAAAGGTAGAAGAGGACCACGCAGTGTGATTGGTTCAAGTGCTGCT
GGTTGCGTCTGTGCTTTTCTTTCCATATATCAAGTGGGAGGATCAGCTTTTTCTCAGCTT
TTCCGCCTTGGTTTCGTTTCCAGCTTCTGCACTAAAGTCTCCGACACCGTCTCGAGCGAG
ATAGGGAAAGCTTATGGAAAAACTACGTATTTAGCCACAACATTTAAGATAGTACCAAGA
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CTTGCCTCGGTTGGCTGTTTCCTGGGTCAGATAACTCCACCAGAAGCAGCTGTATGTGTA
CTAGCTTCCCAGATTGCCAACCTTGGAGAAAGCATAATAGGCGCTTCTTTTCAAGACAAA
GAAGGATTCAAATGGCTAAACAATGATGTAGTGAACGTGATCAACATAAGCTTGGGAAGC
ATCGTGGCGATATTGATGCAGCAGTTTATACTCCAGAACTGGGTCAAGTAAAACCTGTCG
TAGTGGTCTCATGGGAGTCTCAATGAGGTTAAGATTATTAGATGCGAACAATCCACATGT
AAATACATTATATTATGTAACAATTAGTCCCACAACATGTTGAACTCTATTCGCCTTTGA
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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D237JQ U 1
AF RS1D237TF C 86
AF RS1A457TF U 456
AF RS1BA40TF U 456
BS 1 375 RS1D237JQ
BS 376 457 RS1D237TF
BS 458 929 RS1A457TF
BS 930 930 RS1BA40TF
BS 931 1139 RS1A457TF
BS 1140 1152 RS1BA40TF

RD RS1D237JQ 375 0 0
TATATATGTTTCTCATTAATATTTTATAGTTTCTCATTGCTTTATCTCTTTAATATTTTC
TTTAATATTTTGAACACAAAAGACTAGTACAATTCATGTTTTACCAATTATTATAAGATT
TTGACCTAAGTTTCAGTACTTCCCCGCATGTAAAGTGGTCAAATCATAAGAAACGCAAAA
GTAGAGGATATAATTAGAGATCTAGTCAAATTAATTATCCACGTTACTCTTGAAGATGCA
CAATAAAAGGCGACAAAAAGAATGGAGTGAAAAACATATCAAAAGACCAAAGAAGGACAC
GTGGCACCACGTTGTACGTTATTTGTTAAGCTTAATGGGCCCACGTAAAACTCGGTCAAA
ACCGAAGAGACACAT

QA 1 375 1 375
DS 

RD RS1D237TF 661 0 0
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GCATGTAAAGTGGTCAAATCATAAGAAACGCAAAAGTAGAGGATATAATTAGAGATCTAG
TCAAATTAATTATCCACGTTACTCTTGAAGATGCACAATAAAAGGCGACAAAAAGAATGG
AGTGAAAAACATATCAAAAGACCAAAGAAGGACACGTGGCACCACGTTGTACGTTATTTG
TTAAGCTTAATGGGCCCACGTAAAACTCGGTCAAAACCGAAGAGACACATCAGTTCGAAC
TCAGATTCGTACGGACCGATTCGTTAGTTAGCCGAATGTATAAATACACAACAGCACATC
TTCCACACTCTTATCGTTTCTCCGAAGATATCAAAAAAGGAAAAAAATCAAAATCAAAAT
ATCAAATAAATAAAAATCTCGCAAAATATTCTCAAGAAAGATTTAAAAGATCGTAAAACA
CACAAACACAATCTCTCTCGCTGTCTCGCACACACACACAGACACACACGAAAAAAACCC
TAAACAACATGGCGGCGGCGGTTGCATCTGGAATTGCCCCGACGACAGCGATGGTTGATC
AAGTCCCCAATCAACCAGCGGCTACGGTCGCCTCTCCTCACGCGACTCAGGTAGCTGCCG
C

QA 1 660 1 660
DS 

RD RS1A457TF 689 0 0
GG
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AAAATCTCGCAAAATATTCTCAAGAAAGATTTAAAAGATCGTAAAACACACAAACACAAT
CTCTCTCGCTGTCTCGCACACACACACAGACACACACGAAAAAAACCCTAAACTACATGG
CGGCGGCGGTTGCATCTGGAATTGCCCCGACGACAGCGATGGTTGATCAAGTCCCCAATC
AACCAGCGTCTACGGTCGCCTCTCCTCACGCGACTCAGGTAGCTGCCGTCGCGGCTGCGG
CGGCCGAGGCGTTACAAACGCACCCTAACTCCTCCCTCTACGTCGGAGATTTGGACCAAA
GTGTCAACGAGGCACATCTGTTGGATCTGTTCAACCAAGTGGCTCCTGTCCAGACAGTTA
GGGTGTGTCGCGACTTGACTCGTCGTTCTCTTGGATACGCTTACGTCAACTT*GCCAATC
CCGATGATGCCATGCGAGCAATGGATATTCTGAACTACACTCCGATCAGAGAGAGACCCA
TAAGGATCATGCGTTCGAACCGTGACCCGAGCACGAGACTGAGCGGGAAAGGCAATGTTT
TCATCAAAAACCTGGACGGGACCATCGACAACAAAGCCCTGTACGACACCTTCTCGAGTT
TCGGGACCATTCTCTCGTGCAA
TGTAG

QA 3 684 3 684
DS 

RD RS1BA40TF 697 0 0
GG
ATCGTTTCTCCGAAGATATCAAAAAAGGAAAAAAATCAAAATCAAAATATCAAATAAATA
AAAATCTCGCAAAATATTCTCAAGAAAGATTTAAAAGATCGTAAAACACACAAACACAAT
CTCTCTCGCTGTCTCGCACACACACACAGACACACACGAAAAAAACCCTAAACTACATGG
CGGCGGCGGTTGCATCTGGAATTGCCCCGACGACAGCGATGGTTGATCAAGTCCCCAATC
AACCAGCGTCTACGGTCGCCTCTCCTCACGCGACTCAGGTAGCTGCCGTCGCGGCTGCGG
CGGCCGAGGCGTTACAAACGCACCCTAACTCCTCCCTCTACGTCGGAGATTTGGACCAAA
GTGTCAACGAGGCACATCTGTTGGATCTGTTCAACCAAGTGGCTCCTGTCCAGACAGTTA
GGGTGTGTCGCGACTTGACTCGTCGTTCTCTTGGATACGCTTACGTCAACTTCGCCAATC
CCGATGATGCCATGCGAGCAATGGATATTCTGAACTACACTCCGATCAGAGAGAGACCCA
TAAGGATCATGCGTTCGAACCGTGACCCGAGCACGAGACTGAGCGGGAAAGGCAATGTTT
TCATCAAAAACCTGGACGGGACCATCGACAACAAAGCCCTGTACGACACCTTCTCGAGTT
TCGGGACCATTCTCTCGTGCAAGTAGCCATGGACG

QA 3 697 3 697
DS 



AS 1 4

CO CL2866Contig1 771 4 2 U
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GAGTTTTGGATACGACAGAGAAACCATTCTTTTGAAATAAATAGCCAAAGAGATTAATCA
GAAGAATATCAATAGGTTTAATCCATTGCATAGCTCTGTGTTGCTGCTGTTCTCTGGTCT
ATTGTTTTTTCTTTTTTTTGTTTGCCTCTTTCTATAACTTGGGCAAATGGCGTGGAGTCT
CCCACTCGGTGATAATGTGGTTCCGAGTGATCTCATTGAGAGACCTGCACCCACTTAGTG
CCATGGTTAGCTCGAACTCATCGCGTAACATTTGAAGCACTTTTCTGACTCCAGCTTCTC
CTTCAGCAGCAAGTGAGAATACCACTGGTCTACCAATGAATATCCCTGAGGCTCCAAGTG
CAAGTGCCTTGAAGACATCAGTTCCACGTCGAACACCACCGTCCAAGAAGACAGGATGAG
CCATCTTCTGCATGGCAGTAGGAGCAACCATGATCGGCATGGAGATCTTGAAACCCAAGA
CGTTTGTTGTCATATCAATCTTGCTCACATCAATCAGAATCCGAGGCCGAAAGAGGATCC
TAGCGAAAGCGTTTCTGTTCTCTTGAAGAGCCCACTGGTCCTCTGCTCCAGACGCATAGT
AGTCATATACCATCTTAGGCAACTTCTCCTTTGCGATTGCTCCATACTCGGTAACGTTTG
TGATCTCCATATTTTTTCTTGATAGGAATGGAGAGGTCTCGGAAGAGATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 25 25 5 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1A905TF C 1
AF RS1DQ83JQ U 1
AF RS1A905JQ U 57
AF RS1DQ83TF C 71
BS 1 725 RS1DQ83JQ
BS 726 771 RS1A905JQ

RD RS1A905TF 679 0 0
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GAGTTT*GGATACGACAGAGAAACCATTCTTTTGAAATAAATAGCCAAAGAGATTAATCA
GAAGAATATCAATAGGTTTAATCCATTGCATAGCTCTGTGTTGCTGCTGTTCTCTGGTCT
ATTGTTTTTTCTTTTTTTTGTTTGCCTCTTTCTATAACTTGGGCAAATGGCGTGGAGTCT
CCCACTCGGTGATAATGTGGTTCCGAGTGATCTCATTGAGAGACCTGCACCCACTTAGTG
CCATGGTTAGCTCGAACTCATCGCGTAACATTTGAAGCACTTTTCTGACTCCAGCTTCTC
CTTCAGCAGCAAGTGAGAATACCACTGGTCTACCAATGAATATCCCTGAGGCTCCAAGTG
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CCATCTTCTGCATGGCAGTAGGAGCAACCATGATCGGCATGGAGATCTTGAAACCCAAGA
CGTTTGTTGTCATATCAATCTTGCTCACATCAATCAGAATCCGAGGCCGAAAGAGGATCC
TAGCGAAAGCGTTTCTGTTCTCTTGAAGAGCCCACTGGTCCTCTGCTCCAGACGCATAGT
AGTCATATACCATCTTAGG

QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1DQ83JQ 725 0 0
GGGACTGAAGGTAGAAGTAGGCAAATAGCATTACAAGGGAATCTCTAGTCATTGTTTTGC
GAGTTTTGGATACGACAGAGAAACCATTCTTTTGAAATAAATAGCCAAAGAGATTAATCA
GAAGAATATCAATAGGTTTAATCCATTGCATAGCTCTGTGTTGCTGCTGTTCTCTGGTCT
ATTGTTTTTTCTTTTTTTTGTTTGCCTCTTTCTATAACTTGGGCAAATGGCGTGGAGTCT
CCCACTCGGTGATAATGTGGTTCCGAGTGATCTCATTGAGAGACCTGCACCCACTTAGTG
CCATGGTTAGCTCGAACTCATCGCGTAACATTTGAAGCACTTTTCTGACTCCAGCTTCTC
CTTCAGCAGCAAGTGAGAATACCACTGGTCTACCAATGAATATCCCTGAGGCTCCAAGTG
CAAGTGCCTTGAAGACATCAGTTCCACGTCGAACACCACCGTCCAAGAAGACAGGATGAG
CCATCTTCTGCATGGCAGTAGGAGCAACCATGATCGGCATGGAGATCTTGAAACCCAAGA
CGTTTGTTGTCATATCAATCTTGCTCACATCAATCAGAATCCGAGGCCGAAAGAGGATCC
TAGCGAAAGCGTTTCTGTTCTCTTGAAGAGCCCACTGGTCCTCTGCTCCAGACGCATAGT
AGTCATATACCATCTTAGGCAACTTCTCCTTTGCGATTGCTCCATACTCGGTAACGTTTG
TGATC

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1A905JQ 715 0 0
TTGCGAGT
TTTGGATACGACAGAGAAACCATTCTTTTGAAATAAATAGCCAAAGAGATTAATCAGAAG
AATATCAATAGGTTTAATCCATTGCATAGCTCTGTGTTGCTGCTGTTCTCTGGTCTATTG
TTTTTTCTTTTTTTTGTTTGCCTCTTTCTATAACTTGGGCAAATGGCGTGGAGTCTCCCA
CTCGGTGATAATGTGGTTCCGAGTGATCTCATTGAGAGACCTGCACCCACTTAGTGCCAT
GGTTAGCTCGAACTCATCGCGTAACATTTGAAGCACTTTTCTGACTCCAGCTTCTCCTTC
AGCAGCAAGTGAGAATACCACTGGTCTACCAATGAATATCCCTGAGGCTCCAAGTGCAAG
TGCCTTGAAGACATCAGTTCCACGTCGAACACCACCGTCCAAGAAGACAGGATGAGCCAT
CTTCTGCATGGCAGTAGGAGCAACCATGATCGGCATGGAGATCTTGAAACCCAAGACGTT
TGTTGTCATATCAATCTTGCTCACATCAATCAGAATCCGAGGCCGAAAGAGGATCCTAGC
GAAAGCGTTTCTGTTCTCTTGAAGAGCCCACTGGTCCTCTGCTCCAGACGCATAGTAATC
ATATACCATCTTAGGCAACTTCTCCTTTGCGATTGCTCCATACTCGGTAACGTTTGTGAT
CTCCATATTTTTTCTTGATAGGAATGGAGAGGTCTCGGAAGAGATCC

QA 9 715 9 715
DS 

RD RS1DQ83TF 701 0 0
TACGACAGAGAAACCATTCTTTTGAAATAAATAGCCAAAGAGATTAATCAGAAGAATATC
AATAGGTTTAATCCATTGCATAGCTCTGTGTTGCTGCTGTTCTCTGGTCTATTGTTTTTT
CTTTTTTTTGTTTGCCTCTTTCTATAACTTGGGCAAATGGCGTGGAGTCTCCCACTCGGT
GATAATGTGGTTCCGAGTGATCTCATTGAGAGACCTGCACCCACTTAGTGCCATGGTTAG
CTCGAACTCATCGCGTAACATTTGAAGCACTTTTCTGACTCCAGCTTCTCCTTCAGCAGC
AAGTGAGAATACCACTGGTCTACCAATGAATATCCCTGAGGCTCCAAGTGCAAGTGCCTT
GAAGACATCAGTTCCACGTCGAACACCACCGTCCAAGAAGACAGGATGAGCCATCTTCTG
CATGGCAGTAGGAGCAACCATGATCGGCATGGAGATCTTGAAACCCAAGACGTTTGTTGT
CATATCAATCTTGCTCACATCAATCAGAATCCGAGGCCGAAAGAGGATCCTAGCGAAAGC
GTTTCTGTTCTCTTGAAGAGCCCACTGGTCCTCTGCTCCAGACGCATAGTAGTCATATAC
CATCTTAGGCAACTTCTCCTTTGCGATTGCTCCATACTCGGTAACGTTTGTGATCTCCAT
ATTTTTTCTTGATAGGAATGGAGAGGTCTCGGAAGAGATCC

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 4

CO CL2867Contig1 750 4 6 U
GGGCTCATTCATTCTCACAATCCAATCTCTCTCACAACATGTCTGACGAAGAGCACCACT
TCGAGTCCTCCGACGCCGGAGCTTCCAAGACCTACCCTCAGCAGGCTGGTAACATCCGTA
AAGGTGGTCACATCGTCATCAAGGGCCGTCCCTGCAAGGTTGTTGAGGTTTCGACTTCGA
AGACTGGCAAGCACGGTCACGCGAAGTGTCACTTCGTTGCTATTGATATCTTCACTGCTA
AGAAGCTCGAGGATATTGTTCCCTCTTCCCACAATTGTGATGTTCCTCATGTGAACCGTA
TTGATTACCAGTTGATTGATATCTCTGAGGATGGCTTTGTTAGCCTTTTGACCGACAGTG
GTGGCACTAAGGACGACCTCAAGCTTCCCACCGATGATAATCTGAGCGCTCTGATGAAGA
GTGGATTCGAGGAGGGAAAGGATGTGGTGGTGTCTGTCATGTCTTCGATGGGAGAGGAGC
AGATCTGTGCCGTCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAAACCCCAAGAAGTATCATTCTC
TTTACGCAGAGGATAAAATCTTATTTACCCCAGCAGTTGTTATAAGAACAAAAACATGTT
TTTTTTCTCTGATTTAGACCATTAATGTGTGTTTCTTCTTGTTGCAAGACGACCATATCT
ATTGGTTTTGGATTGTTGAAATATTTGGTGCTTTAAAACAGTGAAAGTTTCCTACCCTTT
ACTTCGTATTATTACATGGTTGATTATGTC


BQ
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15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1BN53TF U 1
AF RS1BN53JQ C 64
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AAAA

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DS 

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AAGGTGGTCACATCGTCATCAAGGGCCGTCCCTGCAAGGTTGTTGAGGTTTCGACTTCGA
AGACTGGCAAGCACGGTCACGCGAAGTGTCACTTCGTTGCTATTGATATCTTCACTGCTA
AGAAGCTCGAGGATATTGTTCCCTCTTCCCACAATTGTGATGTTCCTCATGTGAACCGTA
TTGATTACCAGTTGATTGATATCTCTGAGGATGGCTTTGTTAGCCTTTTGACCGACAGTG
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AGATCTGTGCCGTCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAAACCCCAAGAAGTATCATTCTC
TTTACGCAGAGGATAAAATCTTATTTACCCCAGCAGTTGTTATAAGAACAAAAACATGTT
TTTTT*CTCTGATTTAGACCATTAATGTGTGTTTCTTCTTGTTGCAAGACGACCATATCT
ATTGGTTTTGGATTGTTGAAATATTTGGTGCTTTAAAACAGTGAAAGTTTCCTACCCTTT
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DS 

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TTT*TCTGATTTAGACCATTAATGTGTGTTTCTTCTTGTTGCAAGACGACCATATCTATT
GGTTTTGGATTGTTGAAATATTTGGTGCTTTAAAACAGTGAAAGTTTCCTACCCTTTACT
TCGTATTATTACATGGTTGATTATGTC

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DS 



AS 1 4

CO CL2868Contig1 1282 4 13 U
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CTACATTTATTTTTAACCAAAACAATAGAAGGATAATTTCTATTGTAGAGTAGTAAAATT
CTATCCCATAATCGAAAACCAAACATATCGCTTGATCCAAAATTCAACAATGAAAATCAA
AGGATTGAATGCAGTAGATCTCACAGTAGATATTTCTCCACAACTGTCCGGCCAAACTTC
T**TGTACATCCTTTGGCGTTTCCACCGCATTCAACGCCTTCAATACTGCTTTGACTGTG
TTGTATGAATTCCTTGAACCAATCACCTTAGACTTGATGTTCTTGAACCCCGCTAGGAGC
AACATTGTTTTCACAACTCTCCCAGCTTTCATTCCCGTTGTTGTTGGTGCAGGCCATAAA
TACAACTTAGTTTTCTTGTAAGAAGTCTGTATTGCGTGTGCAATGGTGTGCTCCTCATGA
CGCTCTATGTAATGCAGATTCTGAAAGCATTTCTCATACGCCTTCTGCATTGCAGCCTGG
CCGGCCTCAGCTTTTGCTTTTGCATACCCAATGACACCTTCGTAGTTCCCGCATACCATC
AACGCAGTGTACCTTTCAACCCTGCCACCCTTTGTGACCTTGGCAACCTTTTTAACATCA
ATTACATGCACATCGTATCCTTTTCTGTATAAAGGTTGCCTCTTCTTCTCAGTCAAAGCA
TTTCTCTCCTCAGCGAGATCTCTAATCTCCTCTTCCAACCGCTTCCCCTTCTTGCCGAAA
GTATGATCGAGCTCAGAGAGCTTGCTTTCAAGCTTCTTGTCGATGGCATTCAGCTTCTCC
AGCAGAATATCATCCCTTTCTTTCATGTCATCAAACTCCTCTTCATTATCATCATCCTTA
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TCACGCTCGATGACTCCATAGTTCGCTGGGTTGTTAGGGTCAAAGGCCTCCTTCCACTCA
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TTGGTGAGGGTCTGAAGAAGCTCTTTATGCCTCTGGAACTTCTTGTTGAACACGTCTTCT
TTCTTCCTCTCTTCATCCCAAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CQ50JQ U 37
AF RS1G267JQ U 1
AF RS1G267TF C 95
AF RS1CQ50TF C 648
BS 1 330 RS1G267JQ
BS 331 331 RS1CQ50JQ
BS 332 701 RS1G267JQ
BS 702 702 RS1CQ50JQ
BS 703 810 RS1G267JQ
BS 811 811 RS1G267TF
BS 812 846 RS1G267JQ
BS 847 847 RS1G267TF
BS 848 859 RS1G267JQ
BS 860 860 RS1G267TF
BS 861 873 RS1G267JQ
BS 874 936 RS1G267TF
BS 937 1282 RS1CQ50TF

RD RS1CQ50JQ 764 0 0
GGTGA
AAAGATCGTGTACTTTTTACTACATTTATTTTTAACCAAAACAATAGAAGGATAATTTCT
ATTGTAGAGTAATAAAATTCCATCCCCTAATCGAAAACCAAACATATCGCTTGATCCAAA
ATTCAACAATGAAAATCAAAGGATTGAATGCAGTAGATCTCACAGTAGATATTTCTCCAC
AACTGTCCGGCCAAACTTCTCTTGTACATCCTTTGGCGTTTCCACCGCATTCAACGCCTT
CAATACTGCTTTGACTGTGTTGTATGAATTCCTTGAACCAATCACCTTAGACTTGATGTT
CTTGAACCCCGCTAGGAGCAACATTGTTTTCACAACTCTCCCAGCTTTCATTCCCGTTGT
TGTTGGTGCAGGCCATAAATACAACTTAGTTTTCTTGTAAGAAGTCTGTATTGCATGTGC
AATGGTGTGCTCCTCATGACGCTCTATGTAATGCAGATTCTGAAAGCATTTCTCATACGC
CTTCTGCGTTGCAGCCTGGCCGGTTTCAGCTTTTGCTTTTGCATACCCAATGACACCTTC
GTAGTTCCCGCATACCATCAACGCAGTGTACCTTTCAACCCTGCCACCCTTTGTGACCTT
GGCAACTTTTTTAACATCAATTACATGCACATCGTATCCTTTTCTGTATAAAGGTTGCCT
CTTCTTCTCAGTCAAAGCATTTCTCTCCTCAGCGAGATCTCTAATCTCCTCTTCCAACCG
CTTCCCCTTCTTGCCGAAAGTATGATCGAGCTCAGAGAG

QA 6 764 6 764
DS 

RD RS1G267JQ 873 0 0
GGAAGATCAACGAAGGTTAGATAGTTGAGGAACACTTGGTGAAAGATCGTGTACTTTTTA
CTACATTTATTTTTAACCAAAACAATAGAAGGATAATTTCTATTGTAGAGTAGTAAAATT
CTATCCCATAATCGAAAACCAAACATATCGCTTGATCCAAAATTCAACAATGAAAATCAA
AGGATTGAATGCAGTAGATCTCACAGTAGATATTTCTCCACAACTGTCCGGCCAAACTTC
T**TGTACATCCTTTGGCGTTTCCACCGCATTCAACGCCTTCAATACTGCTTTGACTGTG
TTGTATGAATTCCTTGAACCAATCACCTTAAACTTGATGTTCTTGAACCCCGCTAGGAGC
AACATTGTTTTCACAACTCTCCCAGCTTTCATTCCCGTTGTTGTTGGTGCAGGCCATAAA
TACAACTTAGTTTTCTTGTAAGAAGTCTGTATTGCGTGTGCAATGGTGTGCTCCTCATGA
CGCTCTATGTAATGCAGATTCTGAAAGCATTTCTCATACGCCTTCTGCATTGCAGCCTGG
CCGGCCTCAGCTTTTGCTTTTGCATACCCAATGACACCTTCGTAGTTCCCGCATACCATC
AACGCAGTGTACCTTTCAACCCTGCCACCCTTTGTGACCTTGGCAACCTTTTTAACATCA
ATTACATGCACATCGTATCCTTTTCTGTATAAAGGTTGCCTTTTCTTCTCAGTCAAAGCA
TTTCTCTCCTCAGCGAGATCTCTAATCTCCTCTTCCAACCGCTTCCCCTTCTTGCCGAAA
GTATGATCGAGCTCAGAGAGCTTGCTTTCA*GCTTCTTGTCGATGGCATTCAGCTTCTCC
AGCAGA*TATCATCCCTTT*TTTCATGTCATCA

QA 1 873 1 873
DS 

RD RS1G267TF 843 0 0
GATATTCTA
TGTAGAGTAGTAAAAT*CTATCCCATAATCGAAA*CCAAACATATCGCTTGATCCAAA*T
TCAACAATGAAAATCAAAGGATTGAATGCAGTAGATCTCACAGTAGATATT*CTCCACAA
CTGTCCGGCCAAACTTCT**TGTACATC*TTTGGCGTTTCCACCGCATTCAACGC*TTCA
ATACTGCTTTGACTGTGTTGTATGAATTCCTTGAACCAATCACCTTAGACTTGATGTTCT
TGAACCCCGCTAGGAGCAACATTGTTTTCACAACTCTCCCAGCTTTCATTCCCGTTGTTG
TTGGTGCAGGCCATAAATACAACTTAGTTTTCTTGTAAGAAGTCTGTATTGCGTGTGCAA
TGGTGTGCTCCTCATGACGCTCTATGTAATGCAGATTCTGAAAGCATTTCTCATACGCCT
TCTGCATTGCAGCCTGGCCGGCCTCAGCTTTTGCTTTTGCATACCCAATGACACCTTCGT
AGTTCCCGCATACCATCAACGCAGTGTACCTTTCAACCCTGCCACCCTTTGTGACCTTGG
CAACCTTTTTAACATCAATTACATGCACATCGTATCCTTTTCTGTATAAAGGTTGCCTTT
TCTTCTCAGTCAAAGCATTTCTCTCCTCAGCGAGATCTCTAATCTCCTCTTCCAACCGCT
TCCCCTTCTTGCCGAAAGTATGATCGAGCTCAGAGAGCTTGCTTTCAAGCTTCTTGTCGA
TGGCATTCAGCTTCTCCAGCAGAATATCATCCCTTTCTTTCATGTCATCAAACTCCTCTT
CATTATCATCATCCTTATCGCCATCTGCTGCTGATACAAGACGCTCTTCTTTA
C

QA 10 842 10 842
DS 

RD RS1CQ50TF 635 0 0
T
TTTTTAACATCAATTACATGCACATCGTATCCTTTTCTGTATAAAGGTTGCCTCTTCTTC
TCAGTCAAAGCATTTCTCTCCTCAGCGAGATCTCTAATCTCCTCTTCCAACCGCTTCCCC
TTCTTGCCGAAAGTATGATCGAGCTCAGAGAGCTTGCTTTTAAGCTTCTTGTCGATGGAA
TTCAGCTTCTCCAGCAGAATATCATCCCTTTCTTTCATGTCATCAAACTCCTCTTCATTA
TCATCATCCTTATCGCCATCTGCTGCTGCTACAAGACGCTCTTCTTTATCTTCTCCTCCA
CCTTGAACATTGTCACGCTCGATGACTCCATAGTTCGCTGGGTTGTTAGGGTCAAAGGCC
TCCTTCCACTCAACCAGCCTCATAGCTCTGTTTATTTTCTGCTGGAGGACAAACTTGTCT
TTTCCCTGAGCTACCTTCAACCGATTCATCAGCTCCCCAATAACTCTGTACTCAGGCCCA
AGCTTGAAATGCTTCTCCTCGAATTTGTCGAGCTTGGTCATCCACTTGTAGGCCTCGTCG
AGCGTCTCCGACTTGGTGAGGGTCTGAAGAAGCTCTTTATGCCTCTGGAACTTCTTGTTG
AACACGTCTTCTTTCTTCCTCTCTTCATCCCAAT

QA 2 635 2 635
DS 



AS 2 4

CO CL2869Contig1 670 2 2 U
GGGGTGATTTCCAACCAGACCGTCTCCCTCCGTTGCTGCTTCCATCGATCATTACCTATT
TATGACTCCGCCTTCGCTATTAGAACAAAGAACCCTAGATTCAAGTCGTGGGGGCAGCTG
GGTTTTGATTCTCAATCATTAGAAACTGGTTTACTGCATCGGATTCGGATCGATTAGAAA
TCAAATCGGAAAAACATGAAAGAAGGGAAATCTGCAAAGTCGAATCATCAGCATCAAGAC
AACCATGAAGAGATTCACCACCAAAAGAGTCATCTCGGTTTTTTCAAATTCGCCAAACTG
TTTGATTCAGAAGCTTCCTGGGACAAGGACCAACTAGGAGATGTGTTGCATTGGATCAGG
CAAGTTGTTGGCTTACTCTGCGGTTTGCTTTGGGGTGCCATCCCTTTGGTTGGAGGCATC
CGGCTACTTCTCTTGCGTAGATTCTGGTGTATAACTTGTCCATGCTCAGAAGAAGTTTAG
CAGAAGGTGGATTTCATGGTGTTGATGACATTCTTCTTTACATTGCTCTTGATGCTTTTG
TTTTCTCAAGATGAAAAGTAGCTTTTCTTTGAAGTGTCATCTTTGTTACAACTTAATAGT
TTACTTCAGCTACAAGAAGAAAACCATTGAAATTCACTTAAAACTCTTGTTTTATGTTTC
AACTGGGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1AS20TF U 1
AF RS1AS20JQ C 285
BS 1 668 RS1AS20TF
BS 669 670 RS1AS20JQ

RD RS1AS20TF 670 0 0
GGGGTGATTTCCAACCAGACCGTCTCCCTCCGTTGCTGCTTCCATCGATCATTACCTATT
TATGACTCCGCCTTCGCTATTAGAACAAAGAACCCTAGATTCAAGTCGTGGGGGCAGCTG
GGTTTTGATTCTCAATCATTAGAAACTGGTTTACTGCATCGGATTCGGATCGATTAGAAA
TCAAATCGGAAAAACATGAAAGAAGGGAAATCTGCAAAGTCGAATCATCAGCATCAAGAC
AACCATGAAGAGATTCACCACCAAAAGAGTCATCTCGGTTTTTTCAAATTCGCCAAACTG
TTTGATTCAGAAGCTTCCTGGGACAAGGACCAACTAGGAGATGTGTTGCATTGGATCAGG
CAAGTTGTTGGCTTACTCTGCGGTTTGCTTTGGGGTGCCATCCCTTTGGTTGGAGGCATC
CGGCTACTTCTCTTGCGTAGATTCTGGTGTATAACTTGTCCATGCTCAGAAGAAGTTTAG
CAGAAGGTGGATTTCATGGTGTTGATGACATTCTTCTTTACATTGCTCTTGATGCTTTTG
TTTTCTCAAGATGAAAAGTAGCTTTTCTTTGAAGTGTCATCTTTGTTACAACTTAATAGT
TTACTTCAGCTACAAGAAGAAAACCATTGAAATTCACTTAAAACTCTTGTTTTATGTTTC
AACTGGGT
AG

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1AS20JQ 386 0 0
CAAATTCGCCAAACTGTTTGATTCAGAAGCTTCCTGGGACAAGGACCAACTAGGAGATGT
GTTGCATTGGATCAGGCAAGTTGTTGGCTTACTTTGCGGTTTGCTTTGGGGTGCCATCCC
TTTGGTTGGAGGCATCCGGCTACTTTTCTTGGGTAGATTTTGGTGTATAACTTGTCCATG
CTCAGAAGAAGTTTAGCAGAAGGTGGATTTCATGGTGTTGATGACATTTTTCTTTACATT
GCTCTTGATGCTTTTGTTTTTTCAAGATGAAAAGTAGCTTTTTTTTGAAGTGTCATTTTT
GTTACAACTTAATAGTTTACTTCAGCTACAAGAAGAAAACCCTTGAAATTCACTTAAAAC
TCTTGTTTTTTGTTTCAACTGGGTGG

QA 1 386 1 386
DS 



CO CL2869Contig2 348 2 3 U
GGGTTCGCTTTGGGGCGTCATCCCTTTGGTTGGAGACATCTGGCTACTTCTCTTGCGGGG
ATTCTGGTGTATAATTTGTCCATGCTCAGAAGAAGTTTAGAGAAGGTGGATTTCATGGTG
TTGATGACATTCTTCTTTACATTGCTCTTGATGTTTTTGTTTTCTCAAGATGAAAAGTAG
CTTTTCTTTGAAGTGTCATCTTTGTTACAACTTAATAGTTTACTTCAGCTAGAAGAAGAA
AACCATTGAAATTCACTTAAAACTCTTGTTTTATGTTTCAACGGGGTAAAAAGATGAAAT
ACACAGCTGGGAAAGACACCAATAATCTATCATTTTGAGATTGTCCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BP63TF U 1
AF RS1BP63JQ C 34
BS 1 57 RS1BP63TF
BS 58 58 RS1BP63JQ
BS 59 348 RS1BP63TF

RD RS1BP63TF 348 0 0
GGGTTCGCTTTGGGGCGTCATCCCTTTGGTTGGAGACATCTGGCTACTTCTCTTGCGTGG
ATTCTGGTGTATAATTTGTCCATGCTCAGAAGAAGTTTAGAGAAGGTGGATTTCATGGTG
TTGATGACATTCTTCTTTACATTGCTCTTGATGTTTTTGTTTTCTCAAGATGAAAAGTAG
CTTTTCTTTGAAGTGTCATCTTTGTTACAACTTAATAGTTTACTTCAGCTAGAAGAAGAA
AACCATTGAAATTCACTTAAAACTCTTGTTTTATGTTTCAACGGGGTAAAAAGATGAAAT
ACACAGCTGGGAAAGACACCAATAATCTATCATTTTGAGATTGTCCTT

QA 1 348 1 348
DS 

RD RS1BP63JQ 315 0 0
AGA
CATCTGGCTACTTTTCTTGCGGGGATTTTGGTGTATAATTTGTCCATGCTCAGAAGAAGT
TTAGAGAAGGTGGATTTCATGGTGTTGATGACATTTTTCTTTACATTGCTCTTGATGTTT
TTGTTTTCTCAAGATGAAAAGTAGCTTTTTTTTGAAGTGTCATTTTTGTTACAACTTAAT
AGTTTACTTCAGCTAGAAGAAGAAAACCATTGAAATTCACTTAAAACTCTTGTTTTATGT
TTCAACGGGGTAAAAAGATGAAATACACAGCTGGGAAAGACACCAATAATTTATCATTTT
GAGATTGTCCTT

QA 4 315 4 315
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL2871Contig1 1011 3 6 U
GATGAATGCATTCTAGAATTACTTATTTGTGACCATTTTATCTTGAAACAAAAGAACTAC
AGAGACAGAACGAGATTACATTTTATTACAAGCGAAGATACTACTAGTCTACTAGTACTA
CTACAAAACGTCTATAACAAACAATACAATGGCAAAATGGTAGTAAAAAGAATCATAAAA
CCCGATCCAGCTTAGTACACCAAGCCTCTCTTTGTTTACACCAGAATCTCAACATGCCAT
CTGAACATTTCTTCCTTTGTCGCAGGTAGGTTCAACGTCACAAGCCCAACCTCTGCATCG
TAGTTGAACTCAGTCTCGGTGCTATCAACGGCGCATCTCAGCGGACGCTGAGAAGAGTAA
GCTCCAAAACGACCACAACCTCTAACACCTAGAGATATCAGCGCTGCTGGAGAACGGTTC
TCGCTGACCACTGAAGAGGAATAAACCTCAGGTTTCTCGTCTGTCACGGTAGTGATATCC
ATGGACTGAATAGCCCCACTTGAGTTAAACATGTCCAGGAGTCCAATAGGTGCGAACGAG
ATGCTTGCAGTGATTTCCTTCAAAGGAGAGATGTGGAAGAGTTCATATTCAAGGACTTCG
AGAGTGAGTGGGATTGAGGCACCCTTTGGTAGTCTAACCAGCTCTCCTGATTTATAAGCG
TAGACTATTGAATCTCCACTCCAATCTGGACCAGCCACTTCGGAGATGAGATCAGCATCC
TCCGCACGGACCAAACCCGTGAGAGTACCAGGAGAAGTATCATGAATCCTGTTCTTCTTG
GTATCCTTGCACCAACCAGCACCTTGACAGTTGAAAACACCAACTATACCAGTAAACTTA
TTCATATTCCAGATCTTCAGCGAGCTGGTTCCATCTCTAGCTGGATCAGCAAATAGGCAG
TCACGTGTTGGCCTACCCGGAAGCTTAGCACGAAGAACCGAACCGTCAGGAAGAACCAGC
TTCCTCAATAGATCAAAGTTGTGGTTGCCCGGCTTGTCACTGACATAGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1GK12JQ U 21
AF RS1CQ24JQ U 1
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DS 

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AGAGACAGAACGAGATTACATTTTATTACAAGCGAAGATACTACTAGTCTACTAGTACTA
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TCC

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DS 

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AACTTATTCATATTCCAGATCTTCAGCGAGCTGGTTCCATCTCTAGCTGGATCAGCAAAT
AGGCAGTCACGTGTTGGCCTACCCGGAAGCTTAGCACGAAGAACCGAACCGTCAGGAAGA
ACCAGCTTCCTCAATAGATCAAAGTTGTGGTTGCCCGGCTTGTCACTGACATAGATT

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 4

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TCTCAAAACCCACAGAAGCCACCACTCCTCCCCATTTCTAAGCTCATGTCTGCCTTGGCT
CTTGCTAACCCTGCTAATCACCCACAGATGCTCGGGGAGCAGCTCTACCCACTTGTGGAG
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GATGTACTCAGGCTCTCTGCTAATCCACCAGCCGTCTCTTCCGTTGATGACCAGTTCGCC
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ATTTAACTCATTCGAGTCTCTACTGTTCATTCTAATAATC


BQ
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20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BX76TF U 1
AF RS1A695TF U 223
AF RS1EE33TF U 341
AF RS1EE33JQ C 346
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RD RS1BX76TF 738 0 0
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GAAATGAATGGGAAGATGATAGGGAGGAAACCTCTTTACATTGCTTTGGCTCAACGCAAG
GAAGAGAGGAGGAGCCACCTTCAGACTCTATTTTCCCATATGAGACCAAATGGGACAATG
TCGCCAATGGCATCACCAATGCCTGGTTTCCACCACCCACCAGGAGGTGCAATGGCAGGT
CCACACCATCCAATGTACGTAGGACAGAACGGTCAAGGTCTGGTGCCGTCTCAGCCTATG
GGGTACGGTTACCAACTTCAGTTCATGCCTGGTGTGCGTCCAGGCTCTGGTCCAGCCAAC
TTCATGATGCCTTACCCTCTTCAAAGGCAGAACCAGCCTGGTCCACGTGTTGGGTTCAGG
CGTGGTGCTACTAACATGCAGCAGCACTTCCAGCAACAACAACAGATGATGCAGCAAAAT
GCAAGTCCGGGAATGAGATACATGGGTGGCCCAGGCAACAGGAGGAATGGAATGGAAGGA
ACTGCTCCACAAGGCATCATCCCTTTGCCATTGGATGCATCTGCAATCTCTCACAATGGT
TCTCAAAACCCACAGAAGCCACCACTCCTCCCCATTTCTAAGCTCATGTCTGCCTTGGCT
CTTGCTAACCCTGCTAATCACCCACAGATGCTCGGGGAGCAGCTCTACCCACTTGTGGAG
AAGCAG*AGCCAGTTCAT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1A695TF 625 0 0
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GTGCCGTCTCAGCCTATGGGGTACGGTTACCAACTTCAGTTCATGCCTGGTGTGCGTCCA
GGCTCTGGTCCAGCCAACTTCATGATGCCTTACCCTCTTCAAAGGCAGAACCAGCCTGGT
CCACGTGTTGGGTTCAGGCGTGGTGCTACTAACATGCAGCAGCACTTCCAGCAACAACAA
CAGATGATGCAGCAAAATGCAAGTCCGGGAATGAGATACATGGGTGGCCCAGGCAACAGG
AGGAATGGAATGGAAGGAACTGCTCCACAAGGCATCATCCCTTTGCCATTGGATGCATCT
GCAATCTCTCACAATGGTTCTCAAAACCCACAGAAGCCACCACTCCTCCCCATTTCTAAG
CTCATGTCTGCCTTGGCTCTTGCTAACCCTGCTAATCACCCACAGATGCTCGGGGAGCAG
CTCTACCCACTTGTGGAGAAGCAGGAGCCAGTTCATACGGCCAAAGTCACCGGGATGTTG
CTGGAGATGGACCAAGCCGAGATCCTGCACCTTCTCGAGTCACCTGAAGCTCTTAAAGCC
AAAGTCTCTGAGGCGCTGGATGT
GC

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DS 

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GGGGC
TCTGGTCCAGCCAACTTCATGATGCCT*ACCCTCTTCAAAGGCAGAACCAGCCTGGTCCA
CGTGTTGGGTTCAGGCGTGGTGCTACTAACATGCAGCAGCACTTCCAGCAACAACAACAG
ATGATGCAGCAAAATGCAAGTCCGGGAATGAGATACATGGGTGGCCCAGGCAACAGGAGG
AATGGAATGGAAGGAACTGCTCCACAAGGCATCATCCCTTTGCCATTGGATGCATCTGCA
ATCTCTCACAATGGTTCTCAAAACCCACAGAAGCCACCACTCCTCCCCATTTCTAAGCTC
ATGTCTGCCTTGGCTCTTGCTAACCCTGCTAATCACCCACAGATGCTCGGGGAGCAGCTC
TACCCACTTGTGGAGAAGCAGGAGCCAGTTCATACGGCCAAAGTCACCGGGATGTTGCTG
GAGATGGACCAAGCCGAGATCCTGCACCTTCTCGAGTCACCTGAAGCTCTTAAAGCCAAA
GTCTCTGAGGCGCTGGATGTACTCAGGCTCTCTGCTAATCCACCAGCCGTCTCTTCCGTT
GATGACCAGTTCGCCCCCTCGTCAACAGAGTGAACTGACTCCTTAACTCTCAAGACATTA
TCTCCTGTCTTTTTAGTAAACAATCTCTTTTTCGAAAAA*CTTTTAGGAATCGCTTTCTC
TATTTTGCAACTTTAGTTTGTTTTCAAGTTCTACTCTTTT*ATCATCATTTCTTTGTTTT
GGGTCTTATCTAATGATTTA*CTCATTCGAGTCTCTACTGTTCATTCTA
TATCA

QA 6 774 6 774
DS 

RD RS1EE33JQ 775 0 0
TCTGGTCCAGCCAACTTCATGATGC**TACCCTCTTCAAAGGCAGAACCAGCCTGGTCCA
CGTGTTGGGTTCAGGCGTGGTGCTACTAACATGCAGCAGCACTTCCAGCAACAACAACAG
ATGATGCAGCAAAATGCAAGTCCGGGAATGAGATACATGGGTGGCCCAGGCAACAGGAGG
AATGGAATGGAAGGAACTGCTCCACAAGGCATCATCCCTTTGCCATTGGATGCATCTGCA
ATCTCTCACAATGGTTCTCAAAACCCACAGAAGCCACCACTCCTCCCCATTTCTAAGCTC
ATGTCTGCCTTGGCTCTTGCTAACCCTGCTAATCACCCACAGATGCTCGGGGAGCAGCTC
TACCCACTTGTGGAGAAGCAGGAGCCAGTTCATACGGCCAAAGTCACCGGGATGTTGCTG
GAGATGGACCAAGCCGAGATCCTGCACCTTCTCGAGTCACCTGAAGCTCTTAAAGCCAAA
GTCTTTGAGGCGCTGGATGTACTCAGGCTCTCTGCTAATCCACCAGCCGTCTCTTCCGTT
GATGACCAGTTCGCCCCCTCGTCAACAGAGTGAACTGACTCCTTAACTCTCAAGACATTA
TCTCCTGTCTTTTTAGTAAACAATCTCTTTTTCGAAAAAACTTTTAGGAATCGCTTTCTC
TATTTTGCAACTTTAGTTTGTTTTCAAGTTCTACTCTTTTTATCATCATTTCTTTGTTTT
GGGTCTTATCTAATGATTTAACTCATTCGAGTCTCTACTGTTCATTCTAATAATC

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 4

CO CL2873Contig1 1286 4 2 U
GGTATCACAAAGAATAAAGATGATCAGAGAGATTGTAATCGGACTCGTCAACCCAATTAA
GGTTTACGCCTTCAGCCAAGTTCTCTGTTGGAGAAAAAAGAATGGACAGGATGGTAACCT
AATTTGTAGCAAATAATATTAGAGTTAGCAACGACCAAACATGGTATCAACTAATTTCAG
AGTTGGAGGGTACCTGACACTCTTGGTCGATATCACTAGGATGACCCAGTATGACATGGA
ATTTGATAACAGTTAAAGGTTTTTCTACCCTTTGTATGTGCTCAGGCTCTTCTTCTTCAC
CTTTTCATCATCGCTGTCGCTCTCTGAATCAACGACGACAACCACCGTCTCGTTAGGGAC
AACTTCCTCTTTTAGTAGACTAAGTCCTCTTAATCTTGTGATACGAGTTGACTCGTTTCA
GAAAGTTCTTCGTCGGCGGCGAACATCTACTCCGGAAGGTTTAGATCCAACGATGCCATG
GTAGCACCTTCAATCAGATGAGACTAGGCTAAGAAATTTGGATTATGATGTAGTGATAAA
TGATGGTATCGACAATTAAATTGTGTAGTTGGAGGATTTAAGTTTGAAAGAAGAAAATTG
AAGAGGTGTTATTGCAAAAACAAAAAAAGAAGTTGTGAGTGTTTAAAAAAAAGAAGGAAG
TCGTGATTCTTGAGAAACCTAACAGATGGTAGTGTGTGCTAGAGAGAGATGGTGGACCCC
GAAGTTTCTCGGGAAGTCCGACTTGCTGACACACAACAGAGACTAGGAGAGTAGGCGGTA
TTGTGAGATAGGGACAAAATGGGAAAGAAAATAAGAGGCGTTTGGCTTGGGTAGATACTC
AATTTGACCCCATAGTAGTGGTATATAAGCCAATTGTCTCATTCTTTTAAGATCACCAGG
GCGGTATTGCCAGTGGTTTTTGGGGTATATAAGAGATTGACCAAAATTCAAGTCATATCA
TTAGATTTAGACTCTTAACGAGTGACTATTAAAATAGTAACATAAATAAATAAGAAAAAA
TTGAGTAGGAACAAAATAGCATAAAAAATATTATTTTTGTTATATACTAATTTTGATAAG
AAATGTATTTGTTTGATAGTTTCTTAAAATTAAATCAAGGAATTATATGTAACAAATGTT
TTCATAAATAGTACTATAATTTATAAGGAAGTAATATGAATTGATTATTCTCGTTAATTC
CATATGCACCATTTAGAGCTATTTGATGTTGAAATTAAGGAATTATTTTTGTCTGTAGCG
ATATTAAATCTAGAGTGAATTGGTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1GY33TF U 1
AF RS1F747TF U 1
AF RS1F747JQ C 525
AF RS1GY33JQ C 652
BS 1 628 RS1F747TF
BS 629 1286 RS1F747JQ

RD RS1GY33TF 286 0 0
GGTATCACAAAGAATAAAGATGATCAGAGAGATTGTAATCGGACTCGTCAACCCAATTAA
GGTTTACGCCTTCAGCCAAGTTCTCTGTTGGAGAAAAAAGAATGGACAGGATGGTAACCT
AATTTGTAGCAAATAATATTAGAGTTAGCAACGACCAAACATGGTATCAACTAATTTCAG
AGTTGGAGGGTACCTGACACTCTTGGTCGATATCACTAGGATGACCCAGTATGACATGGA
ATTTGATAACAGTTAAAGGTTTTTCTACCCTTTGTATGTGCTCAGG

QA 1 286 1 286
DS 

RD RS1F747TF 628 0 0
GGTATCACAAAGAATAAAGATGATCAGAGAGATTGTAATCGGACTCGTCAACCCAATTAA
GGTTTACGCCTTCAGCCAAGTTCTCTGTTGGAGAAAAAAGAATGGACAGGATGGTAACCT
AATTTGTAGCAAATAATATTAGAGTTAGCAACGACCAAACATGGTATCAACTAATTTCAG
AGTTGGAGGGTACCTGACACTCTTGGTCGATATCACTAGGATGACCCAGTATGACATGGA
ATTTGATAACAGTTAAAGGTTTTTCTACCCTTTGTATGTGCTCAGGCTCTTCTTCTTCAC
CTTTTCATCATCGCTGTCGCTCTCTGAATCAACGACGACAACCACCGTCTCGTTAGGGAC
AACTTCCTCTTTTAGTAGACTAAGTCCTCTTAATCTTGTGATACGAGTTGACTCGTTTCA
GAAAGTTCTTCGTCGGCGGCGAACATCTACTCCGGAAGGTTTAGATCCAACGATGCCATG
GTAGCACCTTCAATCAGATGAGACTAGGCTAAGAAATTTGGATTATGATGTAGTGATAAA
TGATGGTATCGACAATTAAATTGTGTAGTTGGAGGATTTAAGTTTGAAAGAAGAAAATTG
AAGAGGTGTTATTGCAAAAACAAAAAAA

QA 1 628 1 628
DS 

RD RS1F747JQ 762 0 0
ATGATGTAGTGATAAATGATGGTATCGACAATTAAATTGTGTAGTTGGAGGATTTAAGTT
TGAAAGAAGAAAATTGAAGAGGTGTTATTGCAAAAACAAAAAAAGAAGTTGTGAGTGTTT
AAAAAAAAGAAGGAAGTCGTGATTCTTGAGAAACCTAACAGATGGTAGTGTGTGCTAGAG
AGAGATGGTGGACCCCGAAGTTTCTCGGGAAGTCCGACTTGCTGACACACAACAGAGACT
AGGAGAGTAGGCGGTATTGTGAGATAGGGACAAAATGGGAAAGAAAATAAGAGGCGTTTG
GCTTGGGTAGATACTCAATTTGACCCCATAGTAGTGGTATATAAGCCAATTGTCTCATTC
TTTTAAGATCACCAGGGCGGTATTGCCAGTGGTTTTTGGGGTATATAAGAGATTGACCAA
AATTCAAGTCATATCATTAGATTTAGACTCTTAACGAGTGACTATTAAAATAGTAACATA
AATAAATAAGAAAAAATTGAGTAGGAACAAAATAGCATAAAAAATATTATTTTTGTTATA
TACTAATTTTGATAAGAAATGTATTTGTTTGATAGTTTCTTAAAATTAAATCAAGGAATT
ATATGTAACAAATGTTTTCATAAATAGTACTATAATTTATAAGGAAGTAATATGAATTGA
TTATTCTCGTTAATTCCATATGCACCATTTAGAGCTATTTGATGTTGAAATTAAGGAATT
ATTTTTGTCTGTAGCGATATTAAATCTAGAGTGAATTGGTTT

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1GY33JQ 635 0 0
AGAAGGAAGTCGTGATTCTTGAGAAACCTAACAGATGGTAGTGTGTGCTAGAGAGAGATG
GTGGACCCCGAAGTTTCTCGGGAAGTCCGACTTGCTGACACACAACAGAGACTAGGAGAG
TAGGCGGTATTGTGAGATAGGGACAAAATGGGAAAGAAAATAAGAGGCGTTTGGCTTGGG
TAGATACTCAATTTGACCCCATAGTAGTGGTATATAAGCCAATTGTCTCATTCTTTTAAG
ATCACCAGGGCGGTATTGCCAGTGGTTTTTGGGGTATATAAGAGATTGACCAAAATTCAA
GTCATATCATTAGATTTAGACTCTTAACGAGTGACTATTAAAATAGTAACATAAATAAAT
AAGAAAAAATTGAGTAGGAACAAAATAGCATAAAAAATATTATTTTTGTTATATACTAAT
TTTGATAAGAAATGTATTTGTTTGATAGTTTCTTAAAATTAAATCAAGGAATTATATGTA
ACAAATGTTTTCATAAATAGTACTATAATTTATAAGGAAGTAATATGAATTGATTATTCT
CGTTAATTCCATATGCACCATTTAGAGCTATTTGATGTTGAAATTAAGGAATTATTTTTG
TCTGTAGCGATATTAAATCTAGAGTGAATTGGTTT

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 4

CO CL2874Contig1 979 4 6 U
GGCAGTACTCGGTCATGCCATTATCAGCATTTCTAGTGAGTAAGCTCTTGAATTTGCCAT
CACATTATGCTGCCGGTCTCATATTGGTTGGTTGCTGTCCAGGCGGTACGGCAAGTAATA
TAGTCACCTACATTGCACGTGGGAATGTTGCACTATCAGTGTTGATGACAGCAGCTAGTA
CTCTTTCAGCTGTGATCATGACACCGCTTCTTACAGCCAAGCTCGCCAAACAATACGTCG
CAGTTGATGCTCTTGGATTAGTAAAGTCAACACTACAGGTAGTTCTTCTCCCAGTGTTGG
CTGGTGCATTTATGAATCAGTACTTTCAAAGAGTGGTGAAGTTTGTCTCTCCTCTCATGG
CTCCGGTTGCGGTTGGAACGGTCGCGATTCTCTGCGGGACTGCTATTGGTCAGAACGCGT
CTGCGATACTCACGTCCGGGAAACAAGTGGTCATGGCTTGTGTCCTTCTTCACCTCTCTG
GATTCCTCTTTGGCTATCTGTTTTCGAGATTGCTCAGAATTGATGTTGCTTCGTCAAGAA
CTGTCTCTATCGAAGTTGGCATGCAGAACTCGGTGCTTGGACTTGTACTGGCGGCAGAGC
ATTTTGGGAACCCGCTGACTGCAGTACCGTGCGCTGTTTCTAGCGTCTGTCACTCCATCA
TCGGTAGCGTCTTGGCTGGAGTCTGGAGACGCAGTGCCCCTAAACAGCTTGAAGACTGAA
AAAGAAATGAAAAAGTTGGGATTTTTTCACTCAGCCAGGACCGTTTAGTTATGTCTTTTG
ACCAAAAGGTTTGTCTTTTTGGAGAGCTAAGAACGGTTTTGTCTTTCTTTGGTCAGTAAT
GTTTTGTCTTTCTTTGGTAATTAAAAAAAAAAAACTGTTTATGTCGGTCTTGTTTACGGT
GACATTTACCTTTGAATCTTCCACTCTTTCAAAGACTTCATGATCTCTAAACATTAAACA
TTTTGTTGTAGACTTGCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BO37TF U 1
AF RS1B189TF U 18
AF RS1BO37JQ C 20
AF RS1B189JQ C 214
BS 1 551 RS1BO37TF
BS 552 699 RS1B189TF
BS 700 702 RS1BO37JQ
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BS 858 979 RS1B189JQ

RD RS1BO37TF 551 0 0
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CTCCGGTTGCGGTTGGAACGGTCGCGATTCTCTGCGGGACTGCTATTGGTCAGAACGCGT
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CTGTCTCTATC

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DS 

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CACTACAGGTGGTTCTTCTCCCAGTGTTGGCTGGTGCATTTATGAATCAGTACTTTCAAA
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TCATGGCTTGTGTCCTTCTTCACCTCTCTGGATTCCTCTTTGGCTATCTGTTTTCGAGAT
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CGGTGCTTGGACTTGTACTGGCGGCAGAGCATTTTGGGAACCCGCTGACTGCAGTACCGT
GCGCTGTTTCTAGCGTCTGTCACTCCATCATCGGTAGCGTCTTGGCTGGAGTCTGGAGAC
GCAGTGCCC**TAACAGCTTGAAGACTGAAA

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DS 

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CCATATCAGCA
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TTACAGCCAAGCTCGCCAAACAATACGTCGCAGTTGATGCTCTTGGATTAGTAAAGTCAA
CACTACAGGTAGTTCTTCTCCCAGTGTTGGCTGGTGCATTTATGAATCAGTACTTTCAAA
GAGTGGTGAAGTTTGTCTCTCCTCTCATGGCTCCGGTTGCGGTTGGAACGGTCGCGATTC
TCTGCGGGACTGCTATTGGTCAGAACGCGTTTGCGATACTCACGTCCGGGAAACAAGTGG
TCATGGCTTGTGTCCTTCTTCACCTCTCTGGATTCCTCTTTGGCTATCTGTTTTCGAGAT
TGCTCAGAATTGATGTTGCTTCGTCAAGAACTGTCTCTATCGAAGTTGGCATGCAGAACT
CGGTGCTTGGACTTGTACTGGCGGCAGAGCATTTTGGGAACCCGCTGACTGCAGTACCGT
GCGCTGTTTCTAGCGTCTGTCACTCCATCATCGGTAGCGTCTTGGCTGGAGTCTGGAGAC
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TCAGCCAGGACCGTTTAGTTATGTCTTTTGACCAAAAGGTTTGTCTTTTTGGAGAGCTAA
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QA 12 838 12 838
DS 

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GCGGGACTGCTATTGGTCAGAACGCGTCTGCGATACTCACGTCCGGGAAACAAGTGGTCA
TGGCTTGTGTCCTTCTTCACCTCTCTGGATTCCTCTTTGGCTATCTGTTTTCGAGATTGC
TCAGAATTGATGTTGCTTCGTCAAGAACTGTCTCTATCGAAGTTGGCATGCAGAACTCGG
TGCTTGGACTTGTACTGGCGGCAGAGCATTTTGGGAACCCGCTGACTGCAGTACCGTGCG
CTGTTTCTAGCGTCTGTCACTCCATCATCGGTAGCGTCTTGGCTGGAGTCTGGAGACGCA
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CGGTTTTGTCTTTCTTTGGTCAGTAATGTTTTGTCTTTCTTTGGTAATTAAAAAAAAAAA
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GACTTCATGATCTCTAAACATTAAACATTTTGTTGTAGACTTGCAT

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 4

CO CL2875Contig1 1050 4 8 U
TTTTTGCCTCTTTTCTCCTTTGTTTCTATCCCATAGCCGTCGCTCTTCTCTTTACATCTA
GATTTGTCAATGGGCAAAAAGATGAAGAGACGCCACGAATCCGGTGTTGAAATAACCCCG
GAGATAAGTTTGGGTGATTCAGAAATCCTAGTAACGCCAAAGAATCAGCAGAAGGCCAAG
AAGCGGAAGAAGCAAAACAAGATTGAATCCAAGAAGAACCTAAAGAAGGTTGAGATAATC
CAAGAGCCAGAATCGAACAAGAACCTAAAGAAGATAATAGATGGATTAAGTGATCGTCTA
AACGAGATGACTGAAATTGTCCAAAAACTAAAGGAGACTTCAAATCTACTTGAGAAGGAG
AAAGAAACTCCAAAGAAAAAGGTGGTTGAGTGCTGTTTCGAATCTGAAGATGCGTTTCGT
AACCACCAGAAAACCGTTTTCGTTGAGGGATTCAGGTGTTCCCCTCCTAGGGGTGATATC
AAGAGCGCATTGATAAAACACTTCAGTCCTTGTGGAGAGGTATCAACGGTTTTTATTCCC
TTTCATTGCCAAACCGGTGTTCCCATGGGATTTGCCTTCATCAATATGATAAAAGATTAC
GATAAGGCTTTAACACTCGATGGAAGTTACTTGGATGGACTGAGGCTTACGGTCAAGATG
GCAATAAAGAGAGAGGAATACTATGTTTTTACTAACCACAACGGTTGTGAACGTTGTGGT
ATTGCGTTGTCCACGCACATCAAGAAACAGAGGTTTGAGCAGTTTTACAGCAGAAATAGA
TTGTCCTCTCAGATGACATGCGTACCTGTAACTAGGTGTCCCTAACAAGGGGTTGTTTTG
TTGTTCCAATACAACAAATTTCGTGTGTTCTCAAAGTGGTTCTGTTATGGGATTCATGCT
ATTTATTTTTCATAATTTATGCCTAAATATGTAGTGATGAAACTTCTTTTTGTATCCAAG
TCTTTTGGTTTTCAAAAATACTTTAGTTTTTTTGTATTTTGGGATCTATGCTATCTAGTT
TCATAATTTAAGCTTAAATATTTAATGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1EF23TF U 1
AF RS1CX63TF U 184
AF RS1EF23JQ C 269
AF RS1CX63JQ C 326
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DS 

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G
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GCGCATTGATAAAACACTTCAGTCCTTGTGGAGAGGTATCAACGGTTTTTATTCCCTTTC
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AGGCTTTAACACTCGATGGAGGTTACTTGGATGGACTGAGGCTTACGGTCAAGATGGCAA
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ATTTTTCATAATTTATGCCTAAATATGTAGTGATGAAACTTCT

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TTACTAACCGCAACGGTTGTGAACGTTGTGGTATTGCGTTGTCCACGCACATCAAGAAAC
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ATTTAGTGATGAAACTTCTTTTTGTATCCAAGTCTTTTGGTTTTCAAAAATACTTTAGTT
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C

QA 1 780 1 780
DS 

RD RS1CX63JQ 725 0 0
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GTTTTTTTGTATTTTGGGATCTATGCTATCTAGTTTCATAATTTAAGCTTAAATATTTAA
TGATG

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

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TGGGAAGAACAAGTCTTACGCTACCAACAAGCTTCCATGGGAGTTGTTGACATCAAACAA
GAGAGTAACATTAACAACAATAATGGCTATCTCATATCTTCTCCAAACTCACCTCCTAAC
AAATCTTGTGTCACAACCACGACCACAACAAGCCTCAATAGCAACGACAATACCAACAAT
AACAATAATATGTTGGATTTCTCGAGCAATCACAATGGTTTAAATTTGTCTGAGGGTAGA
CACACTCCTCCGGATCGATCCTCTGAGTGTAACAGCTTAGAGATTGGCGGCTCTACTAAT
AATAGGCCGAGGCATCAACCTTCTCCTTCGTCACAGTCCTCCCTCAAGGTGAGAAAGGAG
AAATTAGGAGGCCGGATCGCAGTGCTTCATCAGCTAGTATCTCCTTTTGGCAAGACTGAC
ACAGCTTCTGTCCTGTCGGAAGCTATTGGATACATTAGATTCCTTCACAGTCAAATTGAG
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CGAGGAGACAGAAGTTGCTTATTTCCTGAGGACCCTGGTCAGCTTGTGAATGATCAATGC
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AAGAAAGATTTAAGAAGTCGAGGTTTATGTCTTGTTCCAATCTCCTACACACTCCAAGTT
GGCAGCGACAACGGCGCCGACTATTGGGCTCCGACACTCGGCTCCGCCAGTTGTCACTGA
GCCAAAGAAACTCTACCACGCGGAATTCCAACCTTAGAGAAAATGATATAACATCACGAG
CAGTCAATTTAATGAGAAACCAACAATTGAGTTTCCAAGACTGATTGCTCATGATGCTAT
ACAAAGTACTTGGTTTAATAATTTGCGTTTGGCGTTTCATCATTTGTTGTTGTGTGTGTC
ATCAGCTGATCAAAGCATGTTCTGTCCTTTAGGAAACTGTTTGTTAATGGTTCATTGTAA
TTTGTGGTTAAGTACTTGAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1E944TF U 1
AF RS1E944JQ C 684
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BS 726 726 RS1E944JQ
BS 727 752 RS1E944TF
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BS 850 1102 RS1E944JQ

RD RS1E944TF 854 0 0
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TGGGAAGAACAAGTCTTACGCTACCAACAAGCTTCCATGGGAGTTGTTGACATCAAACAA
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AAATCTTGTGTCACAACCACGACCACAACAAGCCTCAATAGCAACGACAATACCAACAAT
AACAATAATATGTTGGATTTCTCGAGCAATCACAATGGTTTAAATTTGTCTGAGGGTAGA
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AAATTAGGAGGCCGGATCGCAGTGCTTCATCAGCTAGTATCTCCTTTTGGCAAGACTGAC
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GTGAAGAGGAGAGGAGCCTTGTCTTCGTCTACAGAGAATCAGAATGCAAATGAAGAACCT
AAGAA*GATTTAAGAAGTCGAGGTTTATGTCT*GTTCCAATCTC*TACACACTCCAAGTT
GGCAGCGACA*CGGCGCCGACTATTGGGCTCCGACACTCG*CTCCGCCAGTTGTCACTGA
GCCAAAGAA
CTCTA

QA 1 849 1 849
DS 

RD RS1E944JQ 419 0 0
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AATCTCCTACACACTCCAAGTTGGCAGCGACAACGGCGCCGACTATTGGGCTCCGACACT
CGGCTCCGCCAGTTGTCACTGAGCCAAAGAAACTCTACCACGCGGAATTCCAACCTTAGA
GAAAATGATATAACATCACGAGCAGTCAATTTAATGAGAAACCAACAATTGAGTTTCCAA
GACTGATTGCTCATGATGCTATACAAAGTACTTGGTTTAATAATTTGCGTTTGGCGTTTC
ATCATTTGTTGTTGTGTGTGTCATCAGCTGATCAAAGCATGTTCTGTCCTTTAGGAAACT
GTTTGTTAATGGTTCATTGTAATTTGTGGTTAAGTACTTGAAGC

QA 16 419 16 419
DS 



AS 1 4

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TCACGTGGTGGGGATCCGTCTCAGGAGGTAGCCGCGGGGATATTCAGGATCAGCACGGCT
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CGTGACAATCTGAAAAAGACTAGGTTGCAGATATCAGAATTGGTTAAAAACACTTCAGCT
AAGCTTAAAGAAGCTAGCGAAGCCGATCTCCATGGAGCAGCAGCTACTCCAATTAAGAAG
ATTGCGGATGCTAAACTGGCGAAAGATTTTCAATCGGTTCTCAAAGAGTTTCAGAAAGCT
CAGAGACTTGCTGCTGAAAGAGAAACTACATATACTCCTGTCGTCACTATAGATATCCCT
ACCAGTTATAATGCACAGGAACTGGATAGTGAATCTTTAAGGACCTCTCAGCAGCAAACT
CTTCTTCTACAATCAAGGAGGCAAGAAGTAGTGTTTCTAGATAACGAGATAACATTCAAC
GAGGCAATCATCGATGAAAGAGAGCAAGGAATTAGAGAGATTCAAGAACAGATTGGTGAA
GTGAATGAAATCTTCAAAGATCTAGCTGTTTTAGTGAACGATCAAGGAGTCATGATCGAT
GACATCAGCTCTAACATTGATAACTCACAAGCTGCAACTGCACAAGCCACTGCTCAACTC
AGAAAAGCATCTAAAATTCAGAGAGCAAACTCATCTTTGACATGTCTTCTTATTCTCATT
TTTGGGATTGTTCTGCTCATTGTCATCATCGTTGTCTTGGTCTGAGCATCGAACTCCAAG
AATCAAGCCAAAGACGAGTGAATCAAAACTATACAAATTACCCCAATAAAGATATAAACT
ATTGTACAGATTCTTTATACTCCATTTGTCTTTCCCATGTAATCGAAATGAATCTTGATT
TCTAATTTTGTGAATGTTGTATGTGTTAATCCATCATAAAGACTGTTATAGCAAAATAAA
TATGTTTATCATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1E817TF U 298
AF RS1GA58JQ C 545
AF RS1E817JQ C 301
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TCTAATTTTGTGAATGTTGTATGTGTTAATCCATCATAAAGACTGTTATAGCAAAATAAA
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QA 1 794 1 794
DS 



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CO CL2878Contig1 1441 4 3 U
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 

AF RS1D412JQ U 1
AF RS1AO03JQ U 2
AF RS1D412TF C 743
AF RS1AO03TFB C 768
BS 1 713 RS1D412JQ
BS 714 873 RS1AO03JQ
BS 874 1441 RS1D412TF

RD RS1D412JQ 713 0 0
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TGACCAAATTAAATGATTATTTTATTTAACTTTGAGATATTGATCTTGTTTTTTTTTTGG
TTTGATGCAGTTAAAAAAAAACAAAAATGGCGTCTCACATTGTTGGATATCCTCGTATGG
GCCCCAAGAGAGAACTCAAGTTCGCGTTGGAGTCATTCTGGGATAAGAAGACCACTGCTG
AGGATCTTCAGAAGGTGTCTGCTGATATCAGGTCTGGTATCTGGAAGCAGATGTCTGAGG
CTGGGACTAAGTACATCCCGAGCAACACCTTTGCTCACTACGATCAGGTTCTCGACACCA
CCGCTATGCTCGGTGCTGTTCCACCCAGATACGGTTACACCGGTGGTGAGATCGGGTTGG
ATGTTTACTTCTCCATGGCCAGAGGAAATGCCTCTGTTCCCGCCATGGAAATGACCAAGT
GGTTTGACACCAACTAGTGAGTCTTGAACCCTCTGAACTGTGCCTTGCAGCGACATTGTT
AGGTGGATTTAAGAAAAAAAACTTTTTGACTAATGTAATGATGTTTTATTGATGCAGCCA
CTACATCGTCCCTGAGTTGGGCCCTGAGGTTAACTTTTCCTACGCTTCTCACAAGGCTGT
GAATGAGTACAAGGAGGCCAAAGCTGTACGTATCATTCTTCATTTATTATGAA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RS1AO03JQ 872 0 0
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GACCAAATTAAATGATTATTTTATTTAACTTTGAGATATTGATCTTGTTTTTTTTTTGGT
TTGATGCAGTTAAAAAAAAACAAAAATGGCGTCTCACATTGTTGGATATCCTCGTATGGG
CCCCAAGAGAGAACTCAAGTTCGCGTTGGAGTCATTCTGGGATAAGAAGACCACTGCTGA
GGATCTTCAGAAGGTGTCTGCTGATATCAGGTCTGGTATCTGGAAGCAGATGTCTGAGGC
TGGGACTAAGTACATCCCGAGCAACACCTTTGCTCACTACGATCAGGTTCTCGACACCAC
CGCTATGCTCGGTGCTGTTCCACCCAGATACGGTTACACCGGTGGTGAGATCGGGTTGGA
TGTTTACTTCTCCATGGCCAGAGGAAATGCCTCTGTTCCCGCCATGGAAATGACCAAGTG
GTTTGACACCAACTAGTGAGTCTTGAACCCTCTGAACTGTGCCTTGCAGCGACATTGTTA
GGTGGATTTAAGAAAAAAAACTTTTTGACTAATGTAATGATGTTTTATTGATGCAGCCAC
TACATCGTCCCTGAGTTGGGCCCTGAGGTTAACTTTTCCTACGCTTCTCACAAGGCTGTG
AATGAGTACAAGGAGGCCAAAGCTGTACGTATCATTCTTCATTTATTATGAAATTACTAG
ATTTACTATACTCTTAATTGATTGGAATAAAATAATAGGCTGTGGTTCTAGGATTTAGCG
TTTGTGCTTAGATTCATTGATTGGTGTTTCATTGAGGATACTAATGTTTTTAGAATTCAC
AAACCACACTTGCTTGATAGAATTGCTGGAAG

QA 1 872 1 872
DS 

RD RS1D412TF 699 0 0
TTGGAATAAAATAATAGGCTGTGGTTCTAGGATTTAGCGTTTGTGCTTAGATTCATTGAT
TGGTGTTTCATTGAGGATACTAATGTTTTTAGAATTCACAAACCACACTTGCTTGATAGA
ATTGCTGGAAGAAATTAATTTGACTGTGGTTGTCTTTTGTACACCTAGAGTAGTTTCTTG
TTCTTCTGCTACTTCTCTTTTGTTCACTTGAATATGTTTCGTTTTCATCTGCTAGACTGC
TATTTTAAAGTTCTGACTTTATAACTTGATGTTTATGCAGCTTGGTGTTGACACCGTCCC
CGTACTTGTTGGCCCTGTCTCTTACTTGTTGCTTTCCAAGGCTGCCAAGGGTGTAGAGAA
GTCATTTGATCTTCTTTCTCTTCTCCCCAAAGTTCTCGCTGTCTACAAGTAAGAAATCAA
TTCTCTTTATCTTTCGCTTCAGTTATGAATGATCCTCTGACATGCCACTGAATATTGTGA
CTTTGATTTGTGTACAGGGAAGTGATCACCGAGCTTAAGGCAGCTGGTGCCACCTGGATT
CAGCTTGACGAGCCTGTCCTTGTCATGGATCTTGAGGGCCACAAACTCCAGGCCTTTACT
GGAGCCTATGCTGAACTTGAATCAACTCTATCTGGCTTGAATGTTCTAGTGGAGACCTAC
TTCGCTGATATCCCTGCTGAAGCATACAAGACCCTAACC

QA 1 699 1 699
DS 

RD RS1AO03TFB 674 0 0
TCTAGGATTTAGCGTTTGTGCTTAGATTCATTGATTGGTGTTTCATTGAGGATACTAATG
TTTTTAGAATTCACAAACCACACTTGCTTGATAGAATTGCTGGAAGAAATTAATTTGACT
GTGGTTGTCTTTTGTACACCTAGAGTAGTTTCTTGTTCTTCTGCTACTTCTCTTTTGTTC
ACTTGAATATGTTTCGTTTTCATCTGCTAGACTGCTATTTTAAAGTTCTGACTTTATAAC
TTGATGTTTATGCAGCTTGGTGTTGACACCGTCCCCGTACTTGTTGGCCCTGTCTCTTAC
TTGTTGCTTTCCAAGGCTGCCAAGGGTGTAGAGAAGTCATTTGATCTTCTTTCTCTTCTC
CCCAAAGTTCTCGCTGTCTACAAGTAAGAAATCAATTCTCTTTATCTTTCGCTTCAGTTA
TGAATGATCCTCTGACATGCCACTGAATATTGTGACTTTGATTTGTGTACAGGGAAGTGA
TCACCGAGCTTAAGGCAGCTGGTGCCACCTGGATTCAGCTTGACGAGCCTGTCCTTGTCA
TGGATCTTGAGGGCCACAAACTCCAGGCCTTTACTGGAGCCTATGCTGAACTTGAATCAA
CTCTATCTGGCTTGAATGTTCTAGTGGAGACCTACTTCGCTGATATCCCTGCTGAAGCAT
ACAAGACCCTAACC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 4

CO CL2879Contig1 855 4 25 U
ATTCGTCTTCTTTGTATGGGTCCCCACCCCAGCTTACGCACAGTAATTTGAAAACTCCTT
TCTCGGCGTATCTGAGATCGTTCCGGCTAGCTTGATCCAATCCGGAGGAATAATGGCTCC
GGTGTCGGCGCTGGCCAAGTATAAGCTGGTGTTTCTGGGAGATCAATCCGCGGGAAAGAC
GAGCATCATCACTCGATTCATGTACGACAAATTCGACAACACTTACCAGGCCACGATTGG
TATTGATTTTCTATCGAAAACAATGTACCTTGAAGACCGAACTGTCAGGCTGCAGCTATG
GGATACAGCTGGGCAAGAGAGGTTCAGGAGTCTTATTCCCAGTTACATTAGGGACTCTTC
TGTTGCTGTTATTGTCTATGATGTTGCAAGCAGGCAATCCTTCCTAAACACTACTAAGTG
GATCGATGAGGTTAGGACCGAGCGTGGTAGTGATGTCATTGTTGTACTTGTGGGAAATAA
AACCGACCTTGTGGACAAAAGGCAAGTGTCGATAGAGGAAGCAGAAGCTAAGGCTCGTGA
GCTTAATGTAATGTTTATCGAAACCAGTGCCAAAGCAGGCTTCAACATTAAGGCGCTTTT
CCGTAAGATAGCAGCAGCTTTGCCAGGAATGGAAACACTGTCTTCCACAAAGCAAGAGGA
CATGGTTGATGTCAATCTCAAATCTTCCAATGCAAATGCATCTTTGGCTCAACAGCAATC
AG*AGGATGCTCTTGTTAGAACAACAACTAAACACACACACACACACAAAAGTCCTCGAG
CCTTCGCATTATCCCAAACACTATCATCGTTTGTCTGTAAAATTTTTGCCTGCTTTATAA
TCAGATTTTTTTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EE18TF U 134
AF RS1F070TF U 1
AF RS1F444TF U 62
AF RS1F444JQ C 63
BS 1 111 RS1F070TF
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BS 113 170 RS1F070TF
BS 171 171 RS1F444TF
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BS 260 339 RS1F070TF
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BS 341 588 RS1F070TF
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BS 741 741 RS1F444TF
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BS 749 749 RS1F444TF
BS 750 768 RS1F070TF
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BS 772 789 RS1F444TF
BS 790 855 RS1F444JQ

RD RS1EE18TF 587 0 0
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CGATTCATGTACGACAAATTCGACAACACTTACCAGGCCACGATTGGTATTGATTTTCTA
TCGAAAACAATGTACCTTGAAGACCGAACTGTCAGGCTGCAGCTATGGGATACAGCTGGG
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GTCTATGATGTTGCAAGCAGGCAATCCTTCCTAAACACTACTAAGTGGATCGATGAGGTT
AGGACCGAGCGTGGTAGTGATGTCATTGTTGTACTTGTGGGAAATAAAGCCGACCTTGTG
GACAAAAGGCAAGTGTCGATAGAGGAAGCAGAAGCTAAGGCTCGTGAGCTTAATGTAATG
TTTATCGAAACCAGTGCCAAAGCAGGCTTCAACATTAAGGCGCTTTTCCGTAAGATAGCA
GCAGCTTTGCCAGGAATGGAAACACTGTCTTCCACAAAGCAAGAGGACATGGTTGATGTC
AATCTCAAATCTTCCAATGCAAATGCATCTTTGGCTCAACAGCAATC

QA 1 587 1 587
DS 

RD RS1F070TF 786 0 0
ATTCGTCTTCTTTGTATGGGTCCCCACCCCAGCTTACGCACAGTAATTTGAAAACTCCTT
TCTCGGCGTATCTGAGATCGTTCCGGCTAGCTTGATCCAATCCGGAGGAATCATGGCTCC
GGTGTCGGCGCTGGCCAAGTATAAGCTGGTGTTTCTGGGAGATCAATCCGTGGGAAAGAC
GAGCATCATCACTCGATTCATGTACGACAAATTCGACAACACTTACCAGGCCACGATCGG
TATTGATTTTCTATCAAAGACAATGTACCTTGAAGACCGAACTGTCAGGCTGCAGCTATG
GGATACAGCTGGGCAAGAGAGGTTCAGGAGTCTTATTCCGAGTTACATTAGGGACTCTTC
TGTTGCTGTTATTGTCTATGATGTTGCAAGCAGGCAATCCTTCCTAAACACTACTAAGTG
GATCGATGAGGTTAGGACCGAGCGTGGTAGTGATGTCATTGTTGTACTTGTGGGAAATAA
AACCGACCTTGTGGACAAAAGGCAAGTGTCGATAGAGGAAGCAGAAGCTAAGGCTCGTGA
GCTTAATGTAATGTTTATCGAAACCAGTGCCAAAGCAGGCTTCAACATAAAGGCGCTTTT
CCGTAAGATAGCAGCAGCTTTGCCAGGAATGGAAACACTGTCTTCGACAAAGCAAGAGGA
CATGGTTGATGTCAATCTCAAATCTTCCAATGCAAATGCATCTTTGGCTCAACAGCAATC
AG*AGGATGCTCTTGTTAGA*CAACAAC*AAACACACACACACACACA
CACACAAACTCCTCGAGC

QA 1 768 1 768
DS 

RD RS1F444TF 728 0 0
GG
CGGCGTATCTGAGATCGTTCCGGCTAGCTTGATCCAATCCGGAGGAATAATGGCTCCGGT
GTCGGCGCTGGCCAAGTATAAGCTGGTGTTTCTGGGAGATCAATCCGCGGGAAAGACGAG
CATCATCACTCGATTCATGTACGACAAATTCGACAACACTTACCAGGCCACGATTGGTAT
TGATTTTCTATCGAAAACAATGTACCTTGAAGACCGAACTGTCAGGCTGCAGCTATGGGA
TACAGCTGGGCAAGAGAGGTTCAGGAGTCTTATTCCCAGTTACATTAGGGACTCTTCTGT
TGCTGTTATTGTCTATGATGTTGCAAGCAGGCAATCCTTCCTAAACACTACTAAGTGGAT
CGATGAGGTTAGGACCGAGCGTGGTAGTGATGTCATTGTTGTACTTGTGGGAAATAAAAC
CGACCTTGTGGACAAAAGGCAAGTGTCGATAGAGGAAGCAGAAGCTAAGGCTCGTGAGCT
TAATGTAATGTTTATCGAAACCAGTGCCAAAGCAGGCTTCAACATTAAGGCGCTTTTCCG
TAAGATAGCAGCAGCTTTGCCAGGAATGGAAACACTGTCTTCCACAAAGCAAGAGGACAT
GGTTGATGTCAATCTCAAATCTTCCAATGCAAATGCATCTTTGGCTCAACAGCAATCAG*
AGGATGCTCTTGTTAGAACAACAACTAAACACACACACACACACAAA*GTCCTCGAGCCT
TCGCAT

QA 3 728 3 728
DS 

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G
CGGCGTATCTGAGATCGTTCCGGCTAGCTTGATCCAATCCGGAGGAATAATGGCTCCGGT
GTCGGCGCTGGCCAAGTATAAGCTGGTGTTTCTGGGAGATCAATCCGCGGGAAAGACGAG
CATCATCACTCGATTCATGTACGACAAATTCGACAACACTTACCAGGCCACGATTGGTAT
TGATTTTCTATCGAAAACAATGTACCTTGAAGACCGAACTGTCAGGCTGCAGCTATGGGA
TACAGCTGGGCAAGAGAGGTTCAGGAGTCTTATTCCCAGTTACATTAGGGACTCTTCTGT
TGCTGTTATTGTTTATGATGTTGCAAGCAGGCAATCCTTCCTAAACACTACTAAGTGGAT
CGATGAGGTTAGGACCGAGCGTGGTAGTGATGTCATTGTTGTACTTGTGGGAAATAAAAC
CGACCTTGTGGACAAAAGGCAAGTGTCGATAGAGGAAGCAGAAGCTAAGGCTCGTGAGCT
TAATGTAATGTTTATCGAAACCAGTGCCAAAGCAGGCTTCAACATTAAGGCGCTTTTCCG
TAAGATAGCAGCAGCTTTGCCAGGAATGGAAACACTGTTTTCCACAAAGCAAGAGGACAT
GGTTGATGTCAATCTCAAATCTTCCAATGCAAATGCATCTTTGGCTCAACAGCAATCAGG
AGGATGCTCTTGTTAGAACAACAACTAAACACACACACACACACAAAAGTCCTCGAGCCT
TCGCATTATCCCAAACACTATCATCGTTTGTCTGTAAAATTTTTGCCTGCTTTATAATCA
GATTTTTTTTAG

QA 2 793 2 793
DS 



AS 1 4

CO CL2880Contig1 910 4 12 U
GGTGACTCCATGCTTTTGCAGCTCCCTCACTCCACAAAGGACTTAGCAAAAAGATGCCAG
GAGAATAACATTGAAACCGTATTTGATCTTGTGGAGATGGAGGATGAAGAACGCCAAGAG
CTTCTCAAGATGAAGGACACTGAGCTTTTAGACATTGCCAGATTCTGCAACCGCTTCCCA
AACATTGACCTGACTTACGAGGTTGTGGGCAGTGAAGATGTGACTCCAGGGAAAGAGGTG
ACATTGCAGGTGATGCTTGAGAGAGACATGGATGGGAGGACGGAAGTGGGAGCCATAGAT
GCACCTAGGTATCCCAAGACCAAAGAAGAAGGTTGGTGGCTGGTTGTGGGGGACACCAAG
ACGAACCAGTTGGTGGCCATCAAGAGAGTCTCGTTGCAGAAGAAAGCAAAGGTGAAGCTG
GATTTCCAAGTACCGAGTGAAGCAGGAGTGAAGTCTTACACACTGTACTTCATGTGTGAC
TCTTACTTGGGTTGTGACCAAGAGTATGCTTTCACTGTTGATGTCAAAGAATCTGGCACT
GAAGATCCGATGGAAGAGTGATCTTGTGTTTCAGGCGTGCTGGATCCCGGAGAAGAGCAT
TCTCACTTTTATGTAATATGCCGTCTTTGAGTTTTAGACCAAATGTGTGGTTCTTTACTG
TTCCTTTTTTTTTGTCTGGACCAAAATCGAAACAGTAGACGTCGTAAACTTGTTTTGTTT
TCTGTTACTCGAAAACGAATAATAATGAAATGCAGCAAGTTTTAGTAAAAGGACAACAGT
GAGGTCAGGATGTTGTAGAGACGTATTGAAAGCAGCACTGAGCGGTGACTGAAGTAGACA
ACTCTTGTAAGAATCTTTCTTTGCTTAAGCATTCTAAAAATCCAACACTCTTGAGAGTGT
TTTGTCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FB59JQ C 28
AF RS1FB59TF U 28
AF RS1EJ34TF U 1
AF RS1EJ34JQ C 194
BS 1 66 RS1EJ34TF
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BS 782 910 RS1EJ34JQ

RD RS1FB59JQ 739 0 0
GACTT
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CAGTAGACGTCGTAAACTTGTTTTGTTTTCTGTTACTCGAAAACGAATAATAATGAAATG
CAGCAAGTTTTAGT

QA 6 739 6 739
DS 

RD RS1FB59TF 739 0 0
GACTT
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GGAGATGGAGGATGAAGAACGCCAAGAGCTTCTCAAGATGAAGGACACTGAGCTTTTAGA
CATTGCCAGATTCTGCAACCGCTTCCCAAACATTGACCTGACTTACGAGGTTGTGGGCAG
TGAAGATGTGACTCCAGGGAAAGAGGTGACATTGCAGGTGATGCTTGAGAGAGACATGGA
TGGGAGGACGGAT*TGGGAGCCATAGATGCACCTAGGTATCCCAAGACCAAAGAAGAAGG
TTGGTGGCTGGTTGTGGGGGACACCAAGACGAACCAGTTGGTGGCCATCAAGAGAGTCTC
GTTGCAGAAGAAAGCAAAGGTGAAGCTGGATTTCCAAGTACCGAGTGAAGCAGGAGTGAA
GTCTTACACACTGTACTTCATGTGTGACTCTTACTTGGGTTGTGACCAAGAGTATGCTTT
CACTGTTGATGTCAAAGAATCTGGCACTGAAGATCCGATGGAAGAGTGATCTTGTGTTTC
AGGCGTGCTGGATCCTGGAGAAGAGCATTCTCACTTTTATGTAATATGCCGTCTTTGAGT
TTTAGACCAAATGTGTGGTTCTTTACTGTTCCTTTTTTTTTGTCTGGACCAAAATCGAAA
CAGTAGACGTCGTAAACTTGTTTTGTTTTCTGTTACTCGAAA*CGAATAATAATGAA*TG
CAGCAAGTTTTAGT

QA 6 739 6 739
DS 

RD RS1EJ34TF 781 0 0
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GAGAATGACATTGAAACCGTATTTGATCTTGTGGAGATGGAGGATGAAGAACGCCAAGAG
CTTCTCAAGATGAAGGACACTGAGCTTTTAGACATTGCCAGATTCTGCAACCGCTTCCCA
AACATTGACCTGACTTACGAGGTTGTGGGCAGTGAAGATGTGACTCCAGGGAAAGAGGTG
ACATTGCAGGTGATGCTTGAGAGAGACATGGATGGGAGGACGGAAGTGGGAGCCATAGAT
GCACCTAGGTATCCCAAGACCAAAGAAGAAGGTTGGTGGCTGGTTGTGGGGGACACCAAG
ACGAACCAGTTGGTGGCCATCAAGAGAGTCTCGTTGCAGAAGAAAGCAAAGGTGAAGCTG
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TCTTACTTGGGTTGTGACCAAGAGTATGCTTTCACTGTTGATGTCAAAGAATCTGGCACT
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TCTCACTTTTATGTAATATGCCGTCTTTGAGTTTTAGACCAAATGTGTGGTTCTTTACTG
TTCCTTTTTTTT*GTCTGGACCAAAATCGAAACAGTAGACGTCGTAAACTTGTTTTGTTT
*CTGTTACTCGAAA*CGAATAATAATGAAATGCAGCAAGTTTTAGTAAAAG*ACAACAGT
G

QA 1 781 1 781
DS 

RD RS1EJ34JQ 717 0 0
CTTACGAGGTTGTGGGCAGTGAAGATGTGACTCCAGGGAAAGAGGTGACATTGCAGGTGA
TGCTTGAGAGAGACATGGATGGGAGGACGGAAGTGGGAGCCATAGATGCACCTAGGTATC
CCAAGACCAAAGAAGAAGGTTGGTGGCTGGTTGTGGGGGACACCAAGACGAACCAGTTGG
TGGCCATCAAGAGAGTCTCGTTGCAGAAGAAAGCAAAGGTGAAGCTGGATTTCCAAGTAC
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GTGACCAAGAGTATGCTTTCACTGTTGATGTCAAAGAATCTGGCACTGAAGATCCGATGG
AAGAGTGATCTTGTGTTTCAGGCGTGCTGGATCCCGGAGAAGAGCATTCTCACTTTTATG
TAATATGCCGTCTTTGAGTTTTAGACCAAATGTGTGGTTCTTTACTGTTCCTTTTTTTT*
GTCTGGACCAAAATCGAAACAGTAGACGTCGTAAACTTGTTTTGTTTTCTGTTACTCGAA
AACGAATAATAATGAAATGCAGCAAGTTTTAGTAAAAGGACAACAGTGAGGTCAGGATGT
TGTAGAGACGTATTGAAAGCAGCACTGAGCGGTGACTGAAGTAGACAACTCTTGTAAGAA
TCTTTCTTTGCTTAAGCATTCTAAAAATCCAACACTCTTGAGAGTGTTTTGTCTTCC

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 4

CO CL2881Contig1 779 4 6 U
GGAGAAGAGAGGATAGAGAGAGATGGGGATATCGGGTTCAAAGCGAGTCAAGACGACTCT
ATCCAACTCGCCCGAGTTCCACTCGGCTTGCGACTCAGCATACGAGGAGTCTCTTTCTCT
CGCTCAGTATGCTTTCGCCGGAGTTCGTCCCTACCAACTCCTCTCCGCCGCCGCCCACAT
CCACCGGAACCTCTCCTCTTTCCCTCTGATCATCAGGTGGGTCCCTTCTCCTCCGAGTCA
GTCCCAAGTCGACTCAGCTCTCCGAGTCATCACCTCCCGAGTTACGACGGCGGATATTCT
CGGGCCGGAGGAGTTCAAGGAGTGGGCCATCGAGGTTTTCACGGGATCCGTCGTGGGAAA
CGCGAGGAAAGCGGTTGCGAGTAGGATTCCGTTAGGAATCGCCGGAATCGCTGGGATCGG
CTCCGTGACTCGGTCAGGACAGAACCTGATCGGAGCGGCGATTGGTGTGTACGCAGTTGG
AGTTGCAACTTCGGTTTTTCTCAGCCTCTCTTGACTAAAATAAAACATACATTAGTATTA
TGTTTTGCTCTTCACATGTAGTTCTGTTTCAAGAAGTGTACGGAGATTTTCTTTGTAAAC
TGGTTCTGACAACTGAAATGAGTTTGGTAATGAACTATGTGATTGTTGTCTTCAAAATCT
TGTATAGATATGTACCCAAGATTCTTAGCACTCATCTTTCTCAGCGTTTTTCGTACATTT
AATTACAGAGAGTTTTGTAAAATAAATATGATATTTAATACATTAAGCAAACTGTGAGC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1FW24TF U 1
AF RS1EB79JQ C 1
AF RS1EB79TF U 1
AF RS1FW24JQ C 46
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BS 657 657 RS1EB79JQ
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TGTATAGATATGTA

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CCACCGGAACCTCTCCTCTTTCCCTCTGATCATCAGGTGGGTCCCTTCTCCTCCGAGTCA
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CGGGCCGGAGGAGTTCAAGGAGTGGGCCATCGAGGTTTTCACGGGATCCGTCGTGGGAAA
CGCGAGGAAAGCGGTTGCGAGTAGGATTCCGTTAGGAATCGCCGGAATCGCTGGGATCGG
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DS 

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CCACCGGAACCTCTCCTCTTTCCCTCTGATCATCAGGTGGGTCCCTTCTCCTCCGAGTCA
GTCCCAAGTCGACTCAGCTCTCCGAGTCATCACCTCCCGAGTTACGACGGCGGATATTCT
CGGGCCGGAGGAGTTCAAGGAGTGGGCCATCGAGGTTTTCACGGGATCCGTCGTGGGAAA
CGCGAGGAAAGCGGTTGCGAGTAGGATTCCGTTAGGAATCGCCGGAATCGCTGGGATCGG
CTCCGTGACTCGGTCAGGACAGAACCTGATCGGAGCGGCGATTGGTGTGTACGCAGTTGG
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AATTACAGAGAGTTTTGTAAA

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1FW24JQ 734 0 0
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CGCCGCCGCCCACATCCACCGGAACCTCTCCTCTTTCCCTCTGATCATCAGGTGGGTCCC
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AATCGCTGGGATCGGCTCCGTGACTCGGTCAGGACAGAACCTGATCGGAGCGGCGATTGG
TGTGTACGCAGTTGGAGTTGCAACTTCGGTTTTTCTCAGCCTCTCTTGACTAAAATAAAA
CATACATTAGTATTATGTTTTGCTCTTCACATGTAGTTCTGTTTCAAGAAGTGTACGGAG
ATTTTCTTTGTAAACTGGTTCTGACAACTGAAATGAGTTTGGTAATGAACTATGTGATTG
TTGTCTTCAAAATCTTGTATAGATATGTACCCAAGATTCTTAGCACTCATCTTTCTCAGC
GTTTTTCGTACATTTAATTACAGAGAGTTTTGTAAAATAAATATGATATTTAATACATTA
AGCAAACTGTGAGC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 4

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AAATATAATTTCAAA


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EM10JQ C 223
AF RS1EM10TF U 1
AF RS1AS08TF U 1
AF RS1E840TF U 3
BS 1 109 RS1AS08TF
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RD RS1EM10JQ 497 0 0
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QA 1 497 1 497
DS 

RD RS1EM10TF 719 0 0
GGAC
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TCTCTCCGTCTAGCTCCATCTCCTACGGCTTTATCTCCGACAACCGGTGGATTTGGAGCT
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GTGAATGTAGGTGTTGGTCAAGTGACGGAAGTGGATAAGGATACCTTCTGGCCCATCGTT
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AAAGTGATTGCTCCTAAGTACAAAGCTTTATCAGAGAAATATGAGGACGTTGTGTTTCTT
AAGCTTGACTGCAACCCTGAAAACAGGCCATTAGCAAAGGAACTAGGAATAAGAGTGGTT
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QA 5 719 5 719
DS 

RD RS1AS08TF 735 0 0
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TCTGTCTCTCCGTCTAGCTCCATCTCCTACGGCTTTATCTCCGACAACCAGTGGATTTGG
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GTTCTGCTCACTGGATTCTGTGAGAAGGGGAGACTCCTCTGTGGTGAGGTGTAGCTTAGA
GACTGTGAATGTAAGTGTTGGTCAAGTGACGGAAGTGGATAAGGATACCTTCTGGCCCAT
CGTTAAAGCCGCCGGGGAAAAGATTGTGGTACTTGACATGTACACTCAATGGTGTGGTCC
ATGTAAAGTGATTGCTCCTAAGTACAAAGCTTTATCAGAGAAATATGAGGACGTTGTGTT
TCTTAAGCTTGACTGCAACCCTGAAAACAGGCCATTAGCAAAGGAACTAGGAATAAGAGT
GGTTCCAACTTTTAAAATATTGAAGGATAACCAAGTGGTGAAGGAAGTTACGGGTGCCAA
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AAATATAATTTCAAA

QA 1 735 1 735
DS 

RD RS1E840TF 727 0 0
GG
ACACAAGCTGATCAATTTCATCGTTCCGACACTCTTTCGCGGAACTCAACAATGCCTCTG
TCTCTCCGTCTAGCTCCATCTCCTACGGCTTTATCTCCGACAACCGGTGGATTTGGAGCT
GCGAAAAAGCAGTGTCGTATCCCTTACTCCGGCGTGGCGACGACGACGAGGATTGGGTTC
TGCTCACTGGATTCTGTGAGAAGGGGAGACTCCTCTGTGGTGAGGTGTAGCTTAGAGACT
GTGAATGTAAGTGTTGGTCAAGTGACGGAAGTGGATAAGGATACCTTCTGGCCCATCGTT
AAAGCCGCCGGGGAAAAGATTGTGGTACTTGACATGTACACTCAATGGTGTGGTCCATGT
AAAGTGATTGCTCCTAAGTACAAAGCTTTATCAGAGAAATATGAGGACGTTGTGTTTCTT
AAGCTTGACTGCAACCCTGAAAACAGGCCATTAGTAAAGGAACTAGGAATAAGAGTGGTT
CCAACTTTTAAAATATTGAAGGATAACCAAGTGGTGAAGGAAGTTACGGGTGCCAAATAT
GATGATCTAGTTGCAGCCATTGAAACAGCAAGGTCTGCTAGTTCTTCGGGATGAGCCAAT
CAACCTCCATGTCTTTACTTGTAATATGGCTGTATCAATGTAACAAGCTTTCTGTTGGTG
CTCTTATTGTGACTCTGCTTT*GTATGTGTAAATGTTTTCA*GCAATATGATGATCAAAT
ATAAT

QA 3 727 3 727
DS 



AS 1 4

CO CL2883Contig1 731 4 5 U
GGACCCCCCACGTGCCAAGGAGAGGAAACAGCTTCAAGAACAGAGCAGAGGAGGCTTCCT
CTGAGTCTGACTTGAGCAAATCCGAGCTGCTAGAAGCGCTGAGGCGTTCTCAGACAAGAG
CCAGGGAAGCTGAAAACATGGCTAAAGAAGCGTGTGCAGAGAAAGAGCACTTGGTGAAGC
TCTTGTTGAAGCAAGCCTCAGAGCTTTTCGGGTATAAGCAGTTGCTGCAACTGCTCCAGC
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GTGCTGGTTTGCTTCTGGGTTGGACTGTTGGATGGATGCAGATGCTTTCTTTCTAAGTCT
GAGAAAAGAAGAGGAGAGAGACCTCCAAATTTCAACTCTTTTTTTCTTCTTCTTACTGAG
CAGCTTTGATAAATGAGTTTGTAAAACTGTTGAAAGAATTTTGTTAATATTGTGTTTCTA
GTTGGATCGTAAAATGAAATGATCTTTCATGTAATATATGCATATGTTAAGGTTGTTAGC
TATATGATGTTTCTTTCATGTACACACAAAAATAGCTTATGTATCTTTCATGTCATTTTC
TTATGTTTTGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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TTATGTTTTGT

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 4

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BQ
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GGCTGTTCCTGCCTCTGTTCTAACGATCGGTGGTGGCTATCTTTTTGGACTGCCAATTGG
TTTTGTGGCGGACTCGGTCGGTGCTACGCTTGGCTCAGGCGCAGCGTTTCTTCTAGGCCG
TACCATTGGAAAGCCTTTTGTAGTTGCAAAATTGAAAGACTATCCTCAGTTTCAGTCAGT
GGCACTCGCGATTGAGAAA

QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1A827TF 777 0 0
GTAGCTGCAATTGTCTTAGCTTGCTATTTTCTCCCCGTTGAGCAGCTGTTGAAGGATTTT
TTGTTATGGGTTGAACAAGATCTAGGGCCTTGGGGACCTCTTGCCCTAGCTGTTGCGTAC
ATTCCTCTAACAGTTTTGGCTGTTCCTGCCTCTGTTCTAACGATCGGTGGTGGCTATCTT
TTTGGACTGCCAATTGGTTTTGTGGCGGACTCGGTCGGTGCTACGCTTGGCTCAGGTGCA
GCGTTTCTTCTAGGCCGTACCATTGGAAAGCCTTTCGTAGTAGCAAAATTGAAGGACTAT
CCTCAGTTTCAGTCAGTGGCACTCGCGATTGAGAAATCAGGTTTCAAGATATGCTTGTTG
CTCCGGCTTGCTCCTCTTCTCCCCTTCAGCATGTTGAACTACCTCTTATCTGTAACGCCG
ATAACTCTGGGCCCATACTTGCTTTCTTCTTGGCTAGGAATGATGCCAATAACGCTTGCG
TTAGTGTATGCTGGAACAACACTAAAAGACCTTTCTGATGTGACTCACAAGTGGAGCGAA
TTCTCTATAGGCCGATGGGCGTTCTTGATTTCAAGCCTTGTGATATCCGTGATATTAATG
GTGTGTGTAACGAAGGTAGCACAGAACGCTCTAAGAAAAGCGTTAGCAGAGCATGGAGGT
GACATGAACGGAGCGGTTGCAGCCTCGCCCGAGCTGAACGTTACCGACGATACTCCAAGT
GATTTGAATGAGCCTCTGTTAATAAAGATAGAGCCTCAATCACCTCAGAACCAAGAA

QA 1 777 1 777
DS 

RD RS1G285JQ 788 0 0
TTTTT
GGACTGCCAATTGGTTTTGTGGCGGACTCGGTCGGTGCTACGCTTGGCTCAGGCGCAGCG
TTTCTTCTAGGCCGTACCATTGGAAAGCCTTTTGTAGTTGCAAAATTGAAGGACTATCCT
CAGTTTCAGTCAGTGGCACTCGCGATTGAGAAATCAGGTTTCAAGATATGCTTGTTGCTC
CGGCTTGCTCCTCTTCTCCCCTTCAGCATGTTGAACTACCTCTTATCTGTAACGCCGATA
ACGCTGGGCCCATACTTGCTTTCTTCTTGGCTAGGGATGATGCCAATAACACTTGCGTTA
GTGTATGCTGGAACAACACTAAAAGACCTTTCTGATGTGACTCACAAGTGGAGCGAGTTC
TCTATAGGCCGATGGGCGTTCTTGATCTCAAGCCTTGTGATATCCGTGATATTAATGGTG
TGTGTAACGAAGGTAGCACAGAACGCTCTAAGAAAAGCATTAGCAGAGCACGGAGGTGAC
ATGAACGGAGCTGTTGCAGCCTCGCCCGAGCTGAACGTTACCGACGATACTCCAAGTGAT
TTGAATGAGCCTCTGTTAATAAAGATAGAGCCTCAATCACCTCAGAACCAAGAAAACAAT
AGTCATTAAAGAAGCTCCTGTTTAATTACTTTGTACAATAATCTTATCTTTGTTAACTTA
CAAACACACAAAAGCATAGGTTCTTTGGAGTCGGCCCGTTAATGCACAGATAAAATAATA
TGGTTGTTCTAGTTTTTCGATTTCTTGGTTTTGTATAATAACATAGATTAAAATAAATTA
TTC

QA 6 788 6 788
DS 

RD RS1A827JQ 803 0 0
GGACTGCCAATTGGTTTTGTGGCGGACTCGGTCGGTGCTACGCTTGGCTCAGGTGCAGCG
TTTCTTCTAGGCCGTACCATTGGAAAGCCTTTCGTAGTAGCAAAATTGAAGGACTATCCT
CAGTTTCAGTCAGTGGCACTCGCGATTGAGAAATCAGGTTTCAAGATATGCTTGTTGCTC
CGGCTTGCTCCTCTTCTCCCCTTCAGCATGTTGAACTACCTCTTATCTGTAACGCCGATA
ACTCTGGGCCCATACTTGCTTTCTTCTTGGCTAGGAATGATGCCAATAACGCTTGCGTTA
GTGTATGCTGGAACAACACTAAAAGACCTTTCTGATGTGACTCACAAGTGGAGCGAATTC
TCTATAGGCCGATGGGCGTTCTTGATTTCAAGCCTTGTGATATCCGTGATATTAATGGTG
TGTGTAACGAAGGTAGCACAGAACGCTCTAAGAAAAGCGTTAGCAGAGCATGGAGGTGAC
ATGAACGGAGCGGTTGCAGCCTCGCCCGAGCTGAACGTTACCGACGATACTCCAAGTGAT
TTGAATGAGCCTCTGTTAATAAAGATAGAGCCTCAATCACCTCAGAACCAAGAAAACAAT
AGTCATTAAAGAAGCTCCTGGTTAATTACTTTGTACAATAATCTTATCTTTGTTAACTTA
CAAA*ACACAAAAGCATAGGTTCTTTGGAGTCGGCCCGTTAATGCACAGATAAAATAATA
TGGTTGTTCTAGTTTTTCGATTTCTTGGTTTTGTATAATAACATAGATTAAAATAAATTA
TTCAAAAATGTCTTTTCCTTCTT

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 4

CO CL2885Contig1 772 4 14 U
GGATCAGCGCTCCGTTTAGCTCTTAGCTCTTCTGTCTCCTCTTCGGCTGATCTCTCCGTT
GAAAATGGTTGCTTTCCGGTTTCACCAATACCAAGTGGTTGGGAGAGCACTTCCAACAGA
GAAAGATGTGCAGCCTAAGATTTACAGGATGAAGCTATGGGCCACCAATGAAGTCCGCGC
CAAGTCCAAGTTTTGGTACTTCTTGAGGAAGCTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAACGGACA
AATGCTTGCCATCAATGAGATTTTCGAGAAGAACCCCACGAAGATCAAGAACTACGGTAT
CTGGCTCCGTTACCAGAGCAGAACCGGGTACCACAACATGTACAAGGAGTTCCGTGACAC
CACGCTCAACGGTGCAGTGGAGCAGATGTACACCGAGATGGCTTCTCGCCATAGAGTGAG
GTTCCCTTGCATTCAGATCATCAAGACCGCCACAGTCCCCGCAAAGCTGTGCAAGAGAGA
GAGCACCAAGCAGTTCCACAACTCCAAGATCAAGTTCCCTCTTGTTTTCAGGAAGGTCAG
GCCACCAACCAGGAAGCTCAAGACTACGTACAAGGCCTCAAAGCCTAACCTTTTCATGTA
ATAAAAAAATCCAAAATCTTTACATGATTCTCCTTATCCTTTTTCAACCATCAGCTTAGG
CTTCTTGTTCCTCAGTCTGATCAAAACATCTTCTCTTGGAATTTCAAATTTTTGCATCTT
TTATCAACTTTTGTTTTCTAGATATATGATAAGATATTCAGAGGACTTGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G379TF U 6
AF RS1CA14TF U 0
AF RS1CA14JQ C 1
AF RS1G379JQ C 7
BS 1 9 RS1CA14JQ
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BS 682 772 RS1CA14JQ

RD RS1G379TF 650 0 0
GGGC
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TCCAAAATCTTTACATGATTCTCCTTATCCTTTTTCAACCATCAGC

QA 5 650 5 650
DS 

RD RS1CA14TF 682 0 0
GGATCAGCGC
CTCCGTTTAGCTCTTAGC**TTTTGTCTCCTCTTCGGCTGATCTCTCCGTTGAAAATGGT
TGCTTTCCGTTTTCACCAATACCAAGTGGTTGGGAGAGCACTTCCAACAGAGAAAGATGT
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GTTTTGGTACTTCTTGAGGAAGCTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAACGGACAAATGCTTGC
CATCAATGAGATTTTCGAGAAGAACCCCACGAAGATCAAGAACTACGGTATCTGGCTCCG
TTACCAGAGCAGAACCGGGTACCACAACATGTACAAGGAGTTCCGTGACACCACGCTCAA
CGGTGCAGTGGAGCAGATGTACACCGAGATGGCTTCTCGCCATAGAGTGAGGTTCCCTTG
CATTCAGATCATCAAGACCGCCACAGTCCCCGCAAAGCTGTGCAAGAGAGAGAGCACCAA
GCAGTTCCACAACTCCAAGATCAAGTTCCCTCTTGTTTTCAGGAAGGTCAGGCCACCAAC
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TCCAAAATCTTTACATGATTCTCCTTATCCTTTTTCAACCATCAGCTTAGGCTTCTTGTT
CCTCAGTCTGAT

QA 11 682 11 682
DS 

RD RS1CA14JQ 772 0 0
GGATCAGCGCTCCGTTTAGCTCTTAGC**TTTTGTCTCCTCTTCGGCTGATCTCTCCGTT
GAAAATGGTTGCTTTCCGTTTTCACCAATACCAAGTGGTTGGGAGAGCACTTCCAACAGA
GAAAGATGTGCAGCCTAAGATTTACAGGATGAAGCTATGGGCCACTAATGAAGTCCGCGC
CAAGTCCAAGTTTTGGTACTTCTTGAGGAAGCTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAACGGACA
AATGCTTGCCATCAATGAGATTTTCGAGAAGAACCCCACGAAGATCAAGAACTACGGTAT
CTGGCTCCGTTACCAGAGCAGAACCGGGTACCACAACATGTACAAGGAGTTCCGTGACAC
CACGCTCAACGGTGCAGTGGAGCAGATGTACACCGAGATGGCTTCTCGCCATAGAGTGAG
GTTCCCTTGCATTCAGATCATCAAGACCGCCACAGTCCCCGCAAAGCTGTGCAAGAGAGA
GAGCACCAAGCAGTTCCACAACTCCAAGATCAAGTTCCCTCTTGTTTTCAGGAAGGTCAG
GCCACCAACCAGGAAGCTCAAGACTACGTACAAGGCCTCAAAGCCTAACCTTTTCATGTA
ATAAAAAA*TCCAAAATCTTTACATGATTCTCCTTATCCTTTTTCAACCATCAGCTTAGG
CTTCTTGTTCCTCAGTCTGATCAAAACATCTTCTCTTGGAATTTCAAATTTTTGCATCTT
TTATCAACTTTTGTTTTCTAGATATATGATAAGATATTCAGAGGACTTGTCT

QA 1 772 1 772
DS 

RD RS1G379JQ 758 0 0
GGG
CTCCGTTTTGCTCTTAGCTCTTCTGTCTCCTCTTCGGCTGATCTCTCCGTTGAAAATGGT
TGCTTTCCGGTTTCACCAATACCAAGTGGTTGGGAGAGCACTTCCAACAGAGAAAGATGT
GCAGCCTAAGATTTACAGGATGAAGCTTTGGGCCACCAATGAAGTCCGCGCCAAGTCCAA
GTTTTGGTACTTCTTGAGGAAGCTGAAGAAGGTTAAGAAAAGCAACGGACAAATGCTTGC
CATCAATGAGATTTTCGAGAAGAACCCCGCGAAGATCAAGAACTACGGTATCTGGCTCCG
TTACCAGAGCAGAACCGGGTACCACAACATGTACAAGGAGTTCCGTGACACCACTCTCAA
CGGTGCAGTGGAGCAGATGTACACCGAGATGGCTTCTCGCCATAGAGTGAGGTTCCCTTG
CATTCAGATCATCAAGACCGCCACAGTCCCCGCAAAGCTGTGCAAGAGAGAGAGCACCAA
GCAGTTCCACAACTCCAAGATCAAGTTCCCTCTTGTTTTCAGGAAGGTCAGGCCACCAAC
CAGGAAGCTCAAGGCTACGTACAAGGCCTCAAAGCCTAACCTTTTCATGTAATAAAAAAA
TCCAAAATCTTTACATGATTCTCCTTATCCTTTTTCAACCATCAGCTTAGGCTTCTTGTT
CCTCAGTCTGATCTAAACATCTTCTCTTGGAATTTCAAATTTTTGCATCTTTTATCAACT
TTTGTTTTCTAGATATATGATAAGATATTCAGAGG

QA 4 758 4 758
DS 



AS 1 4

CO CL2886Contig1 711 4 5 U
GGCCACGTCGTTGATGAAAATTGCCAATGATATACGTTTTCTTGGAAGTGGTCCAAGATG
TGGTCTTGGTGAACTTGTTCTGCCTGAAAATGAGCCAGGAAGCAGCATCATGCCTGGGAA
GGTGAACCCTACACAGTGTGAGGCCTTGACCATGGTTTGTGCTCAGGTAATGGGCAACCA
TGTCGCTGTGACAGTTGGTGGGTCAAATGGTCATTTCGAATTGAATGTATTTAAGCCGGT
GATCGCAAGCTCTCTCTTGCATTCTGTAAGATTGATAGCAGATGCTTCAGCTTCGTTTGA
GAAAAACTGTGTGAGGGGCATTGAGGCCAACAAAGAAAGGATCTCAAAGCTATTACACGA
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TGCCAAGAAAGCTCACAAAGAAGGATCGACATTGAAGGAAGCGGCTCTGAAGTTAGGTGT
TCTTACCTCTGAAGAGTTTGATACGCTTGTCGTCCCCGAGAAGATGATCGGGCCCTCCGA
TTGATGTTGAGCTAAAAGCTTCATTTCACATGTCTTATTCTTGTTAAGGGTGTAATGACA
AATAAGCAAATCCCAGAAACTCAAATTCAGATTTTGCATTGGAAGGATTCAATTCTTGAT
GTATCAGTTATTTTTGTTGAATAAAAGAGTAGCTATTCATGTTTAGACCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B286TF U 1
AF RS1DE05JQ C 71
AF RS1FS40TF U 164
AF RS1B286JQ C 126
BS 1 440 RS1B286TF
BS 441 441 RS1FS40TF
BS 442 588 RS1B286TF
BS 589 705 RS1FS40TF
BS 706 711 RS1B286JQ

RD RS1B286TF 588 0 0
GGCCACGTCGTTGATGAAAATTGCCAATGATATACGTTTTCTTGGAAGTGGTCCAAGATG
TGGTCTTGGTGAACTTGTTCTGCCTGAAAATGAGCCAGGAAGCAGCATCATGCCTGGGAA
GGTGAACCCTACACAGTGTGAGGCCTTGACCATGGTTTGTGCTCAGGTAATGGGCAACCA
TGTCGCTGTGACAGTTGGTGGGTCAAATGGTCATTTCGAATTGAATGTATTTAAGCCGGT
GATCGCAAGCTCTCTCTTGCATTCTGTAAGATTGATAGCAGATGCTTCAGCTTCGTTTGA
GAAAAACTGTGTGAGGGGCATTGAGGCCAACAAAGAAAGGATCTCAAAGCTATTACACGA
GTCTCTTATGCTTGTGACATCATTGAATCCGAAAATCGGATATGACAATGCTGCAGCAGT
TGCCAAGAAAGCTCACAAAGGAGGATCGACATTGAAGGAAGCGGCTCTGAAGTTAGGTGT
TCTTACCTCTGAAGAGTTTGATACGCTTGTCGTCCCCGAGAAGATGATCGGGCCCTCCGA
TTGATGTTGAGCTAAAAGCTTCATTTCACATGTCTTATTCTTGTTAAG

QA 1 588 1 588
DS 

RD RS1DE05JQ 641 0 0
GAACTTGTTCTGCCTGAAAATGAGCCAGGAAGCAGCATCATGCCTGGGAAGGTGAATCCT
ACACAGTGTGAGGCCTTGACCATGGTTTGTGCTAAGGTAATGGGCAACCATGTCGCTGTG
ACAGTTGGTGGGTCAAATGGTCATTTCGAATTGAATGTATTTAAGCCGGTGATCGCAAGC
TCTCTCTTGCATTCTGTAAGATTGATAGCAGATGCTTCAGCTTCGTTTGAGAAAAACTGT
GTGAGGGGCATTGAGGCCAACAAAGAAAGGATCTCAAAGCTATTACACGAGTCTCTTATG
CTTGTGACATCATTGAATCCGAAAATCGGATATGACAATGCTGCAGCAGTTGCCAAGAAA
GCTCACAAAGAAGGATCGACATTGAAGGAAGCGGCTCTGAAGTTAGGTGTTCTTACCTCT
GAAGAGTTTGATACGCTTGTCGTTCCCGAGAAGATGATCGGGCCCTCCGATTGATGTTGA
GCTAAAAGCTTCATTTCACATGTCTTATTCTTGTTAAGGGTGTAATGACAAATAAACAAA
TCCCAGAAACTCAAATTCAGATTTTGCATTGGAAGGATTCAATTCTTGATGTATCAGTTA
TTTTTGTTGAATAAAAGGGTAACTATTCATGTTTA
GACCAG

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1FS40TF 542 0 0
C
AGGTAATGGGCAACCATGTCGCTGTGACAGTTGGTGGGTCAAATGGTCATTTCGAATTGA
ATGTATTTAAGCCGGTGATCGCAAGCTCTCTCTTGCATTCTGTAAGATTGATAGCAGATG
CTTCAGCTTCGTTTGAGAAAAACTGTGTGAGGGGCATTGAGGCCAACAAAGAAAGGATCT
CAAAGCTATTACACGAGTCTCTTATGCTTGTGACATCATTGAATCCGAAAATCGGATATG
ACAATGCTGCAGCAGTTGCCAAGAAAGCTCACAAAGAAGGATCGACATTGAAGGAAGCGG
CTCTGAAGTTAGGTGTTCTTACCTCTGAAGAGTTTGATACGCTTGTCGTCCCCGAGAAGA
TGATCGGGCCCTCCGATTGATGTTGAGCTAAAAGCTTCATTTCACATGTCTTATTCTTGT
TAAGGGTGTAATGACAAATAAGCAAATCCCAGAAACTCAAATTCAGATTTTGCATTGGAA
GGATTCAATTCTTGATGTATCAGTTATTTTTGTTGAATAAAAGAGTAGCTATTCATGTTT
A

QA 2 542 2 542
DS 

RD RS1B286JQ 586 0 0
AC
CCTACACAGTGTGAGGCCTTGACCATGGTTTGTGCTCAGGTAATGGGCAACCATGTCGCT
GTGACAGTTGGTGGGTCAAATGGTCATTTCGAATTGAATGTATTTAAGCCGGTGATCGCA
AGCTCTCTCTTGCATTCTGTAAGATTGATAGCAGATGCTTCAGCTTCGTTTGAGAAAAAC
TGTGTGAGGGGCATTGAGGCCAACAAAGAAAGGATCTCAAAGCTATTACACGAGTTTCTT
ATGCTTGTGACATCATTGAATCCGAAAATCGGATATGACAATGCTGCAGCAGTTGCCAAG
AAAGCTCACAAAGGAGGATCGACATTGAAGGAAGCGGCTCTGAAGTTAGGTGTTTTTACC
TTTGAAGAGTTTGATACGCTTGTCGTCCCCGAGAAGATGATCGGGCCCTCCGATTGATGT
TGAGCTAAAAGCTTCATTTCACATGTCTTATTCTTGTTAAGGGTGTAATGACAAATAAGC
AAATCCCAGAAACTCAAATTCAGATTTTGCATTGGAAGGATTCAATTCTTGATGTATCCG
TTATTTTTGTTGAATAAAAGAGTAGCTATTCATGTTTAGACCCG

QA 3 586 3 586
DS 



AS 1 2

CO CL2887Contig1 757 2 2 U
CGTTTCTGTTATCGTTACGGGCGACGCTAAAGGAATAGCACTTAATTCGTCTTGTGCCTC
TACTCTCCATCTACGATTTAAACCCAGCGAGCTCTCTGTATTCCAGAAACATCGCAGGGT
CGTGCTCAAAGGGAGAGCAATAAAGGCGCAGTCGAAAGAAGAAGCAAGTATTCCTCCTCC
GGTGGGAGATGCATTTACTAATAGTACTATCAAGCATCTTCTCCTGCCTGTCATTGATCG
GAATCCTTATCTCTCTGAAGGCACCCGACGGGCTGCTGCTACAACAACTAGCTTGGCAAA
CAAGTATGGAGCTGATATCACAGTTGTAGTCATAGACGAAGAAAAACGAGAGTCATCTTC
GGAGCACGAGACTCAAGTATCCAACATCCGGTGGCATCTAGCAGAAGGTGGTTTCGAGGA
GTTCAAGCTCTTGGAGAGGCTTGGGGAAGGGAAAAAGGCCACGGCTGTAATAGGAGAGGT
GGCCGATGAGCTGGGGACAGAGCTGGTTGTTATGAGCATGGAAGCCATCCACTCCAAGTT
CATCGACGCCAATTTACTTGCTGAGTTCATCCCCTGCCCCGTCCTCCTCTTGCCCTTATG
AATCCAAATATTGCTCGTCTTGTCCTTCCATGCTTCCTTGACTATTTCCCAATCGTTTTT
TTTGTATGTATTGTCTGGGGAACGCATAGCAGAGACTAGAGAGAAATGTGAGATGCATGT
ACCAGACATGTTCTGTATTTATTACGATGGTTCTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1A009JQ C 1
AF RS1A009TV U 58
BS 1 64 RS1A009JQ
BS 65 757 RS1A009TV

RD RS1A009JQ 757 0 0
CGTTTCTGTTATCGTTACGGGCGACGCTAAAGGAATAGCACTTAATTCGTCTTGTGCCTC
TACTCTCCATCTACGATTTAAACCCAGCGAGCTCTCTGTATTCCAGAAACATCGCAGGGT
CGTGCTCAAAGGGAGAGCAATAAAGGCGCAGTCGAAAGAAGAAGCAAGTATTCCTCCTCC
GGTGGGAGATGCATTTACTAATAGTACTATCAAGCATCTTCTCCTGCCTGTCATTGATCG
GAATCCTTATCTCTCTGAAGGCACCCGACGGGCTGCTGCTACAACAACTAGCTTGGCAAA
CAAGTATGGAGCTGATATCACAGTTGTAGTCATAGACGAAGAAAAACGAGAGTCATCTTC
GGAGCACGAGACTCAAGTATCCAACATCCGGTGGCATCTAGCAGAAGGTGGTTTCGAGGA
GTTCAAGCTCTTGGAGAGGCTTGGGGAAGGGAAAAAGGCCACGGCTGTAATAGGAGAGGT
GGCCGATGAGCTGGGGACAGAGCTGGTTGTTATGAGCATGGAAGCCATCCACTCCAAGTT
CATCGACGCCAATTTACTTGCTGAGTTCATCCCCTGCCCCGTCCTCCTCTTGCCCTTATG
AATCCAAATATTGCTCGTCTTGTCCTTCCATGCTTCCTTGACTATTTCCCAATCGTTTTT
TTTGTATGTATTGTCTGGGGAACGCATAGCAGAGACTAGAGAGAAATGTGAGATGCATGT
ACCAGACATGTTCTGTATTTATTACGATGGTTCTGCC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RS1A009TV 700 0 0
CTCTACT
CTCCATCTACGATTTAAACCCAGCGAGCTCTCTGTATTCCAGAAACATCGCAGGGTCGTG
CTCAAAGGGAGAGCAATAAAGGCGCAGTCGAAAGAAGAAGCAAGTATTCCTCCTCCGGTG
GGAGATGCATTTACTAATAGTACTATCAAGCATCTTCTCCTGCCTGTCATTGATCGGAAT
CCTTATCTCTCTGAAGGCACCCGACGGGCTGCTGCTACAACAACTAGCTTGGCAAACAAG
TATGGAGCTGATATCACAGTTGTAGTCATAGACGAAGAAAAACGAGAGTCATCTTCGGAG
CACGAGACTCAAGTATCCAACATCCGGTGGCATCTAGCAGAAGGTGGTTTCGAGGAGTTC
AAGCTCTTGGAGAGGCTTGGGGAAGGGAAAAAGGCCACGGCTGTAATAGGAGAGGTGGCC
GATGAGCTGGGGACAGAGCTGGTTGTTATGAGCATGGAAGCCATCCACTCCAAGTTCATC
GACGCCAATTTACTTGCTGAGTTCATCCCCTGCCCCGTCCTCCTCTTGCCCTTATGAATC
CAAATATTGCTCGTCTTGTCCTTCCATGCTTCCTTGACTATTTCCCAATCGTTTTTTTTG
TATGTATTGTCTGGGGAACGCATAGCAGAGACTAGAGAGAAATGTGAGATGCATGTACCA
GACATGTTCTGTATTTATTACGATGGTTCTGCC

QA 8 700 8 700
DS 



AS 1 4

CO CL2888Contig1 969 4 3 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAGACGTCCA
ATTTCAACTCTTCAGTGAGCCGATTCCAGCGAAAACTTCTCCGCTGCGTCCGCCGGGCCC
ATCGATCGGCTGAAGATTCGACATGGAAGGGAACTCTAGCGGAGGAACAGCAGCGGGAGG
AGGAGGGAGCGATGTGGAACTGGTGAGCAAGACGTTGCAGGTGGAGCTTTTCAGCAAAGA
GCTGCAGCTTGATTCCAAGGTGTTTTACTTCGACATCGGTGATAACAGGAGGGGGAGGTT
CTTGAAGGTTTCAGAAGCATCTGTTAGTAGGAACCGAAGCACCATTATTGTTCCTGCTGG
AAGCTCCCCTGATGAAGGATGGGCTGCTTTCAGGAACATATTGGCTGAGATCCATGAAGC
TTGTGGGCTTTTCGTGATGCCAAATCAGAAACCTTCTGATGGACAAGAACATCTGGTTGG
ACTTTCAGATGATGTTGGCGCTGGATTTATACCTGGTCATGGTAACCAGCCAGCATCTTC
TTCTTCGGATCTTACTGTGGATCGAGCAACTGACTTGCCTGGCCAGGATGAAACCGGATT
GACTGGTGTTTCCAAGGTAATCAGAGCTGACCAGAAACGCTTCTTCTTTGATCTTGGGAA
CAACAACAGGGGCCATTTCCTCAGGATATCCGAGGTGGCAGGTTCTGACAGGTCATCGAT
CATTCTACCGTTATCTGGTCTAAGACAGTTTCATGAAGTAGTTGGTCACTTTGTGGAGAT
CACCAAAGATAAGATTGATGGGATGACAGGTGCAAATGTCAGACTATTGATCCTCCTCAT
AGATGAGCAACTTGATTCTTTTAGGGGTTGAGGAAATAATTTTGATTCATTCGAAATTTC
CCAATCCTCTTGAATCTCAGCGACTTCTCAAGTAGCTGTCTGATCACCTGTGTGCAATAG
TTTCAAGTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A076TF U 78
AF RS1A076TV U 1
AF RS1A050TF U 56
AF RS1A050TV U 110
BS 1 789 RS1A076TV
BS 790 814 RS1A050TF
BS 815 969 RS1A050TV

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AGGTGTTTTACTTCGACATCGGTGATAACAGGAGGGGGAGGTTCTTGAAGGTTTCAGAAG
CATCTGTTAGTAGGAACCGAAGCACCATTATTGTTCCTGCTGGAAGCTCCCCTGATGAAG
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GTCTAAGACAGTTTCATGA

QA 1 679 1 679
DS 

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ATTTCAACTCTTCAGTGAGCCGATTCCAGCGAAAACTTCTCCGCTGCGTCCGCCGGGCCC
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CTTGAAGGTTTCAGAAGCATCTGTTAGTAGGAACCGAAGCACCATTATTGTTCCTGCTGG
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TTGTGGGCTTTTCGTGATGCCAAATCAGAAACCTTCTGATGGACAAGAACATCTGGTTGG
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CATTCTACCGTTATCTGGTCTAAGACAGTTTCATGAAGTAGTTGGTCACTTTGTGGAGAT
CACCAAAGA

QA 1 789 1 789
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GGCCCATCGATCGGCTGAAGATTCGACATGGAAGGGAACTCTAGCGGAGGAACAGCAGCG
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GTTGGACTTTCAGATGATGTTGGCGCTGGATTTATACCTGGTCATGGTAACCAGCCAGCA
TCTTCTTCTTCGGATCTTACTGTGGATCGAGCAACTGACTTGCCTGGCCAGGATGAAACC
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GAGATCACCAAAGATAAGATTGATGGGATGACAGGTGCA

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DS 

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GCAGCGGGAGGAGGAGGGAGCGATGTGGAACTGGTGAGCAAGACGTTGCAGGTGGAGCTT
TTCAGCAAAGAGCTGCAGCTTGATTCCAAGGTGTTTTACTTCGACATCGGTGATAACAGG
AGGGGGAGGTTCTTGAAGGTTTCAGAAGCATCTGTTAGTAGGAACCGAAGCACCATTATT
GTTCCTGCTGGAAGCTCCCCTGATGAAGGATGGGCTGCTTTCAGGAACATATTGGCTGAG
ATCCATGAAGCTTGTGGGCTTTTCGTGATGCCAAATCAGAAACCTTCTGATGGACAAGAA
CATCTGGTTGGACTTTCAGATGATGTTGGCGCTGGATTTATACCTGGTCATGGTAACCAG
CCAGCATCTTCTTCTTCGGATCTTACTGTGGATCGAGCAACTGACTTGCCTGGCCAGGAT
GAAACCGGATTGACTGGTGTTTCCAAGGTAATCAGAGCTGACCAGAAACGCTTCTTCTTT
GATCTTGGGAACAACAACAGGGGCCATTTCCTCAGGATATCCGAGGTGGCAGGTTCTGAC
AGGTCATCGATCATTCTACCGTTATCTGGTCTAAGACAGTTTCATGAAGTAGTTGGTCAC
TTTGTGGAGATCACCAAAGATAAGATTGATGGGATGACAGGTGCAAATGTCAGACTATTG
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TTCGAAATTTCCCAATCCTCTTGAATCTCAGCGACTTCTCAAGTAGCTGTCTGATCACCT
GTGTGCAATAGTTTCAAGTA

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DS 



AS 1 4

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ACAAAAGGGCCGAGCAGTACGCCAAGGAGTACGCCGAGAAGGAGAAGGAGTTGATCTCGT
TGAAACGTGAGGCTAAGCTCAAAGGAGGTTTCTATGTTGATCCTGAAGCTAAGCTCTTGT
TCATCATCCGTATCCGTGGTATTAACGCCATTGACCCAAAGACTAAGAAGATTCTTCAGC
TCTTGCGTTCGAGACAGATATTCAACGGTGTCTTTCTCAAAGTCAACAAGGCTACAATGA
ACATGCTTCGTCGTGTTGAGCCCTATGTCACCTATGGGTTCCCTAACTTGAAGAGTGTCA
AGGAATTGATCTACAAGAGAGGATACGGAAAGCTTAACTCCCAGAGGGTTGCTTTGACTG
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ATCCACGAGATTCTAACAGTCGGACCCCATTTCAAGGAAGCTAACAACTTCCTGTGGCCC
TTCCAGCTCAAGGCACCACTCGGTGGCCTGAAGAAGA*GAGGAATCACTACGTTGAAGGT
GGTGATGCTGGAAACCGTGAGAACTTCATCAATGAGCTTATCAGGAGGATGAATTAGATG
TCTTCTTTGGCAGCCTCAAGTCTTATGATCTGTTTGTTTTCACTATTCCTGGATTTTGAT
ATTTTTGTTGAGTCGAGACATGTTGAGCTTGCTCTCTTATCGTCGTTGGATCGTATTCGT
TCGCTTTCTGTTTTAAAAAATAGTTCTACTTTCAAACTCTT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F571TF U 1
AF RS1GQ14TF U 3
AF RS1GQ14JQ C 89
AF RS1F571JQ C 291
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AGATTGTAGTTCCGGAGTCTCACCTGAAGAAGACGAAGAGAGAGGAGGAGTGGGCTTTGG
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TCTTGCGTTCGAGACAGATATTCAACGGTGTCTTTCTCAAAGTCAACAAGGCTACAATGA
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TCTTCTT
TGGCAGCCTCAAGTC

QA 1 787 1 787
DS 

RD RS1GQ14TF 825 0 0
GG
CTCTTTGAAACTCCGTTTGATTCGAACTCAACAGTGGTTAGAAATGACAGAATCAAAGAT
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AAGGGCCGAGCAGTACGCCAAGGAGTACGCCGAGAAGGAGAAGGAGTTGATCTCGTTGAA
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GCGTTTGAGACAGATATTCAACGGTGTCTTTCTCAAAGTTAACAAGGCTACAATGAACAT
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CTCTATCGTAGAGCAGGCTTTGGGTAAACATGGG*ATCATCTGCACTGAGGACTTGATCC
ACGAGATTCTAACAGTCGGACCCCATTTCAAGGAAGCTAACAGCTTCCTGTGGCCCTTCC
AGCTCAAG*CACCACTCGGTGGCCTGAAGAAGA*GAG*AATCACTACGTTGAAG*TGGTG
ATGCTGGAAACCGTGAGA*CTTCATCA*TGAGCTTATCAG*AG*ATGA*TTAGATGTCTT
CTT*GGCAGC*TCA*GTCTTATGATCTGTTTGTTT
CACTATTC

QA 3 817 3 817
DS 

RD RS1GQ14JQ 786 0 0
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GAAGACAAACGCAGCCAACAGGAAGCTTATCTACAAAAGGGCCGAGCAGTACGCCAAGGA
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TTTCTATGTTGATCCTGAAGCTAAGCTCTTGTTCATCATCCGTATCCGTGGTATTAACGC
CATTGACCCAAAGACTAAGAAGATTCTTCAGCTCTTGCGTTTGAGACAGATATTCAACGG
TGTCTTTCTCAAAGTTAACAAGGCTACAATGAACATGCTTCGTCGTGTTGAGCCCTATGT
CACCTATGGGTTCCCTAACTTGAAGAGTGTCAAGGAATTGATCTACAAGAGAGGATACGG
AAAGCTTAACTCCCAGAGGGTTGCTTTGACTGACAACTCTATCGTAGAGCAGGCTTTGGG
TAAACATGGG*ATCATCTGCACTGAGGACTTGATCCACGAGATTCTAACAGTCGGACCCC
ATTTCAAGGAAGCTAACAGCTTCCTGTGGCCCTTCCAGCTCAAGGCACCACTCGGTGGCC
TGAAGAAGAAGAGGAATCACTACGTTGAAGGTGGTGATGCTGGAAACCGTGAGAACTTCA
TCAATGAGCTTATCAGGAGGATGAATTAGATGTCTTCTTTGGCAGCCTCAAGTCTTATGA
TCTGTTTGTTTTCACTATTCCTGGATTTTGATATTTTTGTTGAGTCGAGACATGTTGAGC
TTGCTC

QA 1 786 1 786
DS 

RD RS1F571JQ 651 0 0
AAGCTCTTGTTCATCATCCGTATCCGTGGTATTAACGCCATTGACCCAAAGACTAAGAAG
ATTCTTCAGCTCTTGCGTTCGAGACAGATATTCAACGGTGTCTTTTTCAAAGTCAACAAG
GCTACAATGAACATGTTTCGTCGTGTTGAGCCCTATGTCACCTATGGGTTCCCTAACTTG
AAGAGTGTCAAGGAATTGATTTACAAGAGAGGATACGGAAAGCTTAACTCCCAGAGGGTT
GCTTTGACTGACAACTCTATCGTAGAGCAGGCTTTGGGTAAACATGGG*ATCCTTTGCAC
TGAGGACTTGATCCACGAGATTTTAACAGTCGGACCTCATTTCAAGGAAGCTAACAACTT
CCTGTGGCCCTTCCAGCTCAAGGCACCACTCGGTGGCCTGAAGAAGA*GAGGAATCACTA
CGTTGAAGGTGGTGATGCTGGAAACCGTGAGAACTTCATCAATGAGCTTATCAGGAGGAT
GAATTAGATGTTTTCTTTGGCAGCCTCAAGTCTTATGATCTGTTTGTTTTCACTATTCCT
GGATTTTGATATTTTTGTTGAGTCGAGACATGTTGAGCTTGCTCTCTTATCGTCGTTGGA
TCGTATTCGTTCGCTTTCTGTTTTAAAAAATAGTTCTACTTTCAAACTCTT

QA 1 651 1 651
DS 



AS 0 0

AS 1 4

CO CL2891Contig1 758 4 7 U
GGACCCACACACCGTCCCTCGTAGACTACTCCATCGTCTCTGAAACTAATCTGATTCAGC
CATGGCTAATGCAGCGTCTGGAATGGCAGTCCACGATGACTGCAAGCTCAAGTTTCTCGA
ACTCAAGGCCAAGAGGACTTACCGTTTCATCGTGTACAAGATCGAGGAGCAGCAGAAGCA
AGTGGTTGTAGAGAAACTCGGCGAACCTGGTCAATCACATGATGACTTTGCAGCAAGTCT
TCCAGCCGATGAATGCCGATACGCCATCTTCGATTTTGATTTCGTCACTGCTGAGAATTG
CCAGAAGAGCAAGATTTTCTTCATCGCATGGTCTCCGGACACAGCGAGAGTGAGAAGCAA
AATGATCTATGCGAGCTCTAAGGACAGGTTCAAGAGAGAGCTAGATGGGATTCAAGTAGA
GCTTCAAGCAACCGATCCGACTGAGATGGATCTCGACATTTTCAAAAGCCGAGCCAATTG
AGGAACGGTTGTGTATCAAAACTTTGTTTCTTCTATTACCAGAGTGATATGCTTTATCCT
AAAGTTTGCTGTGACGGCACCAACCAAAACAGCTTCATTTTATCTGTCTTTGTCTTGAGT
GTCTTTTTTTTTTTTTTGGTTCTTACAGTGTCTTGCTTAGAACTTAAGACAATTGGCTTG
TGCTCTTTTACAGTTGTGTAAGATTACCCTACTGGAACATTGTGCCTCATCTAACGCGAG
ACGCCTAGTGATCCATGGATTTAAATAAATGATATTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DM54JQ C 58
AF RS1DM54TF U 1
AF RS1DF90TF U 5
AF RS1DF90JQ C 90
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AGTGGTTGTAGAGAAACTCGGCGAACCTGGTCAATCACATGATGACTTTGCAGCAAGTCT
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GCTTCAAGCAACCGATCCGACTGAGATGGATCTCGACATTTTCAAAAGCCGAGCCAATTG
AGGAACGGTTGTGTATCAAAACTTTGTTTCTTCTATTACCAGAGTGATATGCTTTATCCT
AAAGTTTGCTGTGACGGCACCAACCAAAACAGCTTCATTTTATCTGTCTTTGTCTTGAGT
GTCTTTTTTTTTT***TGGTTCTTACAGTGTCTTGCTTAGAACTTAAAGCAATTGGCTTG
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ACGCCTAGTGATC

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GG
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GGCCAAGAGGACTTACCGTTTCATCGTGTACAAGATCGAGGAGCAGCAGAAGCAAGTGGT
TGTAGAGAA*CTCGGCGAACCTGGTCAATCACATGATGACTTTGCAGCAAGTCTTCCAGC
CGATGAATGCCGATACGCCATCTTCGATTTTGATTTCGTCACTGCTGAGAATTGCCAGAA
GAGCAAGATTTTCTTCATCGCATGGTCTCCGGACACAGCGAGAGTGAGAAGCAAAATGAT
CTATGCGAGCTCTAAGGACAGGTTCAAGAGAGAGCTAGATGGGATTCAAGTAGAGCTTCA
AGCAACCGATCCGACTGAGATGGATCTCGACATTTTCAAAAGCCGAGCCAATTGAGGAAC
GGTTGTGTATCAAAACTTTGTTTCTTCTATTACCAGAGTGATATGCTTTATCCTAAAGTT
TGCTGTGACGGCACCAACCAAAACAGCTTCATTTTATCTGTCTTTGTCTTGAGTGTCTTT
TTTTTTTTTTTGGTTCTTACAGTGTCTTGCTTAGAACTTAAGACAATTGGCTTGTGCTCT
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AGTGATCCATGGATTTAAATA

QA 3 743 3 743
DS 

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GTCAATCACATGATGACTTTGCAGCAAGTCTTCCAGCCGATGAATGCCGATACGCCATCT
TCGATTTTGATTTCGTCACTGCTGAGAATTGCCAGAAGAGCAAGATTTTTTTCATCGCAT
GGTCTCCGGACACAGCGAGAGTGAGAAGCAAAATGATCTATGCGAGCTCTAAGGACAGGT
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ATCTCGACATTTTCAAAAGCCGAGCCAATTGAGGAACGGTTGTGTATCAAAACTTTGTTT
CTTCTATTACCAGAGTGATATGCTTTATCCTAAAGTTTGCTGTGACGGCACCAACCAAAA
CAGCTTCATTTTATCTGTCTTTGTCTTGAGTGTCTTTTTTTTTTTTTTGGTTCTTACAGT
GTCTTGCTTAGAACTTAAGACAATTGGCTTGTGCTCTTTTACAGTTGTGTAAGATTACCC
TACTGGAACATTGTGCCTCATCTAACGCGAGACGCCTAGTGATCCATGGATTTAAATAAA
TGATATTAT

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 3

CO CL2892Contig1 837 3 21 U
CGAAAAAAAAACATTTATAACATTAAAACATCTTGATATCATATACAAAACATAACAAAG
ACAGAATAATAGGGAAACTGAAAAAAAA*GGAACAACATAAAAGCAAACAAACTTAAAAC
AACACAAAAGTAAAAGGATGATCACCACTCATCACAAAAACACACCATCATCATTAATCA
GATTCCTTTTCCTTCTTCACCTCATCTACGGTCTTGGGATGGTACCCTGGGAGCTTCTCC
TTGATCTTCTCCAAGATCCCCTTCTTCTCAGCCGGATGCGCTTCCTCCACCGGAGGAGCA
ACAACCGGTGCGGCAGGGGCGGCGGGTGAGGCATCTTCAGGCTTCTTTCCATGACCTGGA
AGCTTCTCCTTCAGCTTGTCCATAAACCCTTTCTTCTCCTCGTCAGTTTTCACCTCTCCT
TCAACAGTTGTAGAAGTAGTAGTCTTCTTCATGTCCTTCTTCTTCTTCCTCTTCACACCA
TCTTCACCTTATTCCTCGCTTGAGGAGCTAGAAGAGCTGTCGCTTCGGTGAAGCTTCTCG
AGGAGACTATGCTTCTTCTCCTCTTCCTCGTGTTTAACCTCAGGCACCACCGGTTCTGAG
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ATCAAGAAAACGTTTGCTAGGTTTTATGAGAATGTGAAATGTTCAAAGTAATACTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F687JQ U 1
AF RS1CP26JQ U 20
AF RS1CP26TF C 47
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ACAGAATAATAGGGAAACTGAAAAAAAAAGGAACAACATAAAAGCCAACAAACTTAAAAC
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AGCTTCTCCTTCAGCTTGTCCATAAACCCTTTCTTCTCCTCGTCAGTTTTCACCTCTCCT
TCAACAGTTGTAAAAGTAGTAGTCTTCTTCTTGTCCTTCTTCTTCTTCCTCTTCACACCA
TCTTCACCTTCTTCCTCGCTTGAGGAGCTAGAAAAGCTGTCGCTTCGGTGAAGCTTCTCG
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TTCTTCCCCAAGAAATCGAACAGTCCACGATCCGTAACATCGGCTGATGATTCCTCGGTC
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QA 1 760 1 760
DS 

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GAAAAAAAA*GGAACAACATAAAAGCAAACAAACTTAAAACAACACAAAAGTAAAAGGAT
GATCACCACTCATCACAAAAACACACCATCATCATTAATCAGATTCCTTTTCCTTCTTCA
CCTCATCTACGGTCTTGGGATGGTACCCTGGGAGCTTCTCCTTGATCTTCTCCAAGATCC
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CGGCGGGTGAGGCATCTTCAGGCTTCTTTCCATGACCTGGAAGCTTCTCCTTCAGCTTGT
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GCTCATGAACCACGTTCTTGGTTTCTTCGGCCATAGT

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DS 

RD RS1CP26TF 791 0 0
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TCCTCTTCACACCATCTTCACCTTATTCCTCGCTTGAGGAGCTAGAAGAGCTGTCGCTTC
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CCACCGGTTCTGAGATATGAACCTTATGTTCAAACTCAGAGTCGATGGTCCCCTCTGGTT
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CGGCCATAGTTATTATCAAGAAAACGTTTGCTAGGTTTTATGAGAATGTGAAATGTTCAA
AGTAATACTCT

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 4

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CAGCGGATTACTTGGGGCAAGCTTGATGCAATTTTTCTTTCTGCTTGGACTATCGTACAC
GTCACCCACTGTTGCGATGGCTCTAAATAGCATGTTACCCGCTATTACCTTTGCCCTGGC
TCTTATTTTCAGAATAGAGAATGCACAGAAACTGAAGAGCAGAGCAGGCGTGCTCAAGTT
AATAGGAACCCTAATTTGCATACTTGGAGCAATGTTCTTAACATTCTATAAAGGTCTTCA
AGTATCAAATCCTCATACTCATCCAGAGGCTATTGACAACAATACATTACATAACAATGG
TCACGACCAAGCAAAGAAATGGCTTCTAGGCTGTGTTTACTTGCTCACTGGGATAGTGTT
ATTGTCGCTATGGATGTTGTTTCAAGGGAAATTAAGCATTAAGTATCCGTGTACTAAGTA
CTCAAGTACTTGCCTCATGTCGGTCTTTGCAGCATTTCAATGTGCCATTTTGGGTCTTTA
TAAGAGTAGAGAAGTCGAAGATTGGATCATCAAAGACAAACTCGTCATGTTCGTTATCCT
TTACGCTGGAATAGTGGGACAAGCGATGTCGACAGTGGTAACGTCATGGTCAATAAAAAG
GACGGGAGCAGTATTCGTGTCAACATTTAGTCCCGTTTGCCTTGTGTCTGCTACGTTATG
CGATTTCCTCATCTTGCGGTCTCCTTTATACCTCGGCAGTATAATTGGATCAGTAGTGAC
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AGATGACAACAATACTAAATTGCCTGTTTGATATATTATAATAATCTATACAAATAAAAG
TAGCAATTTGAAAAGGTTCCACGGAACATCCACATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F743TF U 1
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AF RS1E668JQ C 495
AF RS1F743JQ C 496
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RD RS1F743TF 778 0 0
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QA 1 778 1 778
DS 

RD RS1E668TF 733 0 0
GG
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TTGCTGCATATAGAATGGCTATTTCTGCTTTGATATTGGTTCCGTTTTCTTATATTTGGG
AGAGGAAAACAAGGCCAATGTTAACGTTCATGCTCTTGTGCGAGCATTTCATCAGCGGAT
TACTTGGGGCAAGCTTGATGCAATTTTTCTTTCTGCTTGGACTATCTTACACGTCACCCA
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TCAGAATAGAGAATGCACAGAAACTGAAGAGCAGAGCAGGCGTGCTCAAGTTAATAGGAA
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TATGGATGTTGTTTCAAGGGAAAT*AAGCATTAAGTATCCGTGTACTATGTACTCAAGTA
CT
GCCTCATGT

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DS 

RD RS1E668JQ 726 0 0
T
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GCGGTCTCCTTTATACCTCGGCAGTATAATTGGATCAGTAGTGACTATAACGGGCCTCAA
CGTATTTCTTTGGGGAAAGAGGAGTGAGACAGATCAGACTGTTTCGAAGACTTTGACCGT
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GTTC
T

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DS 

RD RS1F743JQ 741 0 0
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TACTCATCCAGAGGCTATTGACAACAATACATTACATAACAATGGTCACGACCAAGCAAA
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GTTGTTTCAAGGGAAATTAAGCATTAAGTATCCGTGTACTAAGTACTCAAGTACTTGCCT
CATGTCGGTCTTTGCAGCATTTCAATGTGCCATTTTGGGTCTTTATAAGAGTAGAGAAGT
CGAAGATTGGATCATCAAAGACAAACTCGTCATGTTCGTTATCCTTTACGCTGGAATAGT
GGGACAAGCGATGTCGACAGTGGTAACGTCATGGTCAATAAAAAGGACGGGAGCAGTATT
CGTGTCAACATTTAGTCCCGTTTGCCTTGTGTTTGCTACGTTATGCGATTTCCTCATCTT
GCGGTCTCCTTTATACCTCGGCAGTATAATTGGATCAGTAGTGACTATAACGGGCCTCAA
CGTATTTCTTTGGGGAAAGAGGAGTGAGACAGATCAGACTGTTTCGAAGACTTTGACCGT
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TAAATTGCCTGTTTGATATATTATAATAATCTATACAAATAAAAGTAGCAATTTGAAAAG
GTTCCACGGAACATCCACATC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 4

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AGCCATCCTACGGTGAGAGACCGCCGAACGCTTCTACGCCGCGAGAGTTAAGAAACTTTC
TTCATAAACCAATCAAGAATGAGTAATGTGTGTTCAATTTCCTTCGAACAAGGATGCTGG
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GGCTGTTACCCCACTTCGGTTCAGCTTCCTCTTGTTCCTCTACTAAAGGCAAATCTCATC
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AAGGAGGCTAATCTTTACTCTGAGATAGCTGAAGGCATTTCTTCTTATGGTGTTACAAGG
CATCGCCATGTTCCTGAAATTGAACAAGGGTTATCGGATGTTACACAATCAAAAGTAACA
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GAAATGGCTCCTGGAGTTAGAACAGAAGACTTACACCAGCAGCTAAAATCGTCTTATGAG
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GGATCAAACTATTGTTTCATGAATGTGTTCCCTGATCGTATACCTGGACGAGCTATCATA
ATCTCAGTGATTGATAATCTTGTGAAAGGAGCTTCAGGGCAAGCGTTGCAGAATCTTAAC
ATAATGTTGGGATTACCCGAGACAACGGGACTCCTACACCAGCCTCTTTTCCCTTAAGGG
GATGAGCTTTTTAAAGGGTGAGAGCACCTTCTTGTCTTCTTTTGTGTCTAGAAGATTTCA
TCTGTCTTAAGTTGTTTGTTTCGAGTCTTTTACTGCCGTCGTAACAGCAATATGGTTTGT
TTTATGATTCACTATAAAGACTGAACCCTCTTCTCTTACCATTATAGACTATTGGTTTTG
TTTGTTAATTACGTTACAGAACTTATATTGTTTGACG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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TTCGGTGTCACTCTGATGACTGCAGATAGAAAAGCTGGGCAGTCTATGGATAGCGTCTTC
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ACTGTGGATGCTGTCTTCTGCTGTTTGCCTCACGGAACAACTCAGGAAATCATCAAGGGA
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AA

QA 1 842 1 842
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TAAAATCGTCTTATGAGGATGAAGAATTTGTCAAAGTGTTGGAGGAAGGAGTTGTTCCTC
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DS 



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TTCTCAGTTTTGTACTCTGTTTGGTTATATGATTATGTAAACAAGTTTTCCAACATGGCT
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10 10 

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G
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TACTCTGTTTGGTTATATGATTATGTAAACAAGTTTTCCAACATGGCTTT

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DS 



AS 1 4

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TATTCCTCACCTTCTTATTAAGCTTTCAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGGAACCATGAGCTT
CTCAATCATGAAAACCCTTCAGATTCGTAAACCCGCTTCCCTCCCCGTGTCTTCAAGCAC
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ATTGAAGAAACTACCAGTCTTCTTTACAGATCTCGAGTTTAACGAGAACCAAACCAAGTC
ATCGTTCGGGAAACAACAGAGAGGCGGCTTTGCTCAGGTGTTCTTCAGGCTCCGATCTGA
GATCCGCCGTCTCCTCCGTACTTCATCCTCCGACTCTCTCCCTCTCTCATGCAATCGATG
ATGTGGCAATCTTGCTCGTTGAAGGTTTTGCACTTTGGTTGTTGTGGTGGATCTACTCAT
ATTCTTTATATACAAGTTCATGCTCATCGAATGTTTACTCATATTCTTTATAAGCAAAAA
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1GR36TF U 1
AF RS1BI45JQ C 8
AF RS1BI45TF U 8
AF RS1CP51JQ C 14
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BS 451 451 RS1BI45TF
BS 452 569 RS1GR36TF
BS 570 570 RS1BI45TF
BS 571 582 RS1GR36TF
BS 583 583 RS1BI45TF
BS 584 595 RS1GR36TF
BS 596 596 RS1BI45TF
BS 597 611 RS1GR36TF
BS 612 612 RS1BI45TF
BS 613 649 RS1GR36TF
BS 650 668 RS1BI45TF
BS 669 784 RS1CP51JQ

RD RS1GR36TF 649 0 0
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TATTCCTCACCTTCTTATTAAGCTTTCAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGGAACCATGAGCTT
CTCAATCATGAAAACCCTTCAGATTCGTAAACCCGCTTCCCTCCCCGTGTCTTCAAGCAC
CGCCGAAGCTGGTGAACCTGGTCGTCTCCGTCGTCGTCTTTCTTCGCTTTCCTTAAATCT
CTCTCGTAACCAGCCTTCCACTGACGATTTACACAGATCCAAGTCTGTCTCTGCCATGGC
AGAGCAAAGAGGTAGTAGCTCTGTGAAAGAATGGTGGGAATGGAGTTGGTCACTGATTCT
ATTGAAGAAACTACCAGTCTTCTTTACAGATCTCGAGTTTAACGAGAACCAAACCAAGTC
ATCGTTCGGGAAACAACAGAGAGGCGGCTTCGCTCAGGTGTTCTTCAGGCTCCGATCTGA
GATCCGCCGTCTCCTCCGTACTTCATCCTCCGACTCTCTCCCTCTCTCATGCAATCGATG
ATGTGGCAATCTTGCTCGTTGAAGGTTTTTCACTTTGGTTGT*GTGGTGGATCTATTCAT
ATTCTTTATATTCAAGTTCATGCTCATCGAATGTTTACTCATATTCTTT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1BI45JQ 663 0 0
GGACCT
TTCTCTCTTTCTCTCTCTAAAGCAACCACATTTCTCTTCCTTCTTCATATTCCTCACCTT
CTTATTAAGCTTTCAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGGAACCATGAGCTTCTCAATCATGAAA
ACCCTTCAGATTCGTAAACCCGCTTCCCTCCCCGTGTCTTCAAGCACCGCCGAAGCTGGT
GAACCTGGTCGTCTCCGTCGTCTTCTTTCTTCGCTTTCCTTAAATCTCTCTCGTAACCAG
CCTTCCACTGACGATTTACACAGATCCAAGTCTGTTTCTGCCATGGCAGAGCAAAGAGGT
AGTAGCTCTGTGAAAGAATGGTGGGAATGGAGTTGGTCACTGATTCTATTGAAGAAACTA
CCAGTCTTCTTTACAGATCTCGAGTTTAACGAGAACCAAACCAAGTCATCGTTCGGGAAA
CAACAGAGAGGCGGCTTTGCTCAGGTGTTCTTCAGGCTCCGATCTGAGATTCGCCGTCTC
CTCCGTACTTCATCCTCCGACTCTCTCCCTCTCTCATGCAATTGATGATGTGGCAATCTT
GCTCGTTGAAGGTTTTGCACTTTGGTTGTTGTTGTGGATCTACTCATATTCTTTATATAT
AAGTTCATGCTCATCGAATGTTTACTCATATTCTTTATAAGCAAAAATGTCCTTC
GG

QA 7 661 7 661
DS 

RD RS1BI45TF 663 0 0
GGACCT
TTCTCTCTTTCTCTCTCTAAAGCAACCACATTTCTCTTCCTTCTTCATATTCCTCACCTT
CTTATTAAGCTTTCAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGGAACCATGAGCTTCTCAATCATGAAA
ACCCTTCAGATTCGTAAACCCGCTTCCCTCCCCGTGTCTTCAAGCACCGCCGAAGCTGGT
GAACCTGGTCGTCTCCGTCGTCTTCTTTCTTCGCTTTCCTTAAATCTCTCTCGTAACCAG
CCTTCCACTGACGATTTACACAGATCCAAGTCTGTCTCTGCCATGGCAGAGCAAAGAGGT
AGTAGCTCTGTGAAAGAATGGTGGGAATGGAGTTGGTCACTGATTCTATTGAAGAAACTA
CCAGTCTTCTTTACAGATCTCGAGTTTAACGAGAACCAAACCAAGTCATCGTTCGGGAAA
CAACAGAGAGGCGGCTTTGCTCAGGTGTTCTTCAGGCTCCGATCTGAGATTCGCCGTCTC
CTCCGTACTTCATCCTCCGACTCTCTCCCTCTCTCATGCAATTGATGATGTGGCAATCTT
GCTCGTTGAAGGTTTTGCACTTTGGTTGTTGTTGTGGATCTACTCATATTCTTTATATAT
AAGTTCATGCTCATCGAATGTTTACTCATATTCTTTATAAGCAAAAATGTCCTTC
GG

QA 7 661 7 661
DS 

RD RS1CP51JQ 771 0 0
TTCTCTCTTTCTCTCTCTAAAGCAACCACATTTCTCTTCCTTCTTCATATTCCTCACCTT
CTTATTAAGCTTTCAAGAAAAGAAGAAGAAGAAGGAACCATGAGCTTCTCAATCATGAAA
ACCCTTCAGATTCGTAAACCCGCTTCCCTCCCCGTGTCTTCAAGCACCGCCGAAGCTGGT
GAACCTGGTCGTCTCCGTCGTCGTCTTTCTTCGCTTTCCTTAAATCTCTCTCGTAACCAG
CCTTCCACTGACGATTTACACAGATCCAAGTCTGTTTCTGCCATGGCAGAGCAAAGAGGT
AGTAGCTCTGTGAAAGAATGGTGGGAATGGAGTTGGTCACTGATTCTATTGAAGAAACTA
CCAGTCTTCTTTACAGATCTCGAGTTTAACGAGAACCAAACCAAGTCGTCGTTCGGGAAA
CAACAGAGAGGCGGCTTTGCTCAGGGGTTCTTCAGGCTCCGATCTGAGATCCGCCGTCTC
CTCCGTACTTCATCCTCCGACTCTCTCCCTCTCTCATGCAATCGATGATGTGGCAATCTT
GCTCGTTGAAGGTTTTTCACTTTGGTTGT*GTGGTGGATCTATTCATATTCTTTATATTC
AAGTTCATGCTCATCGAATGTTTACTCATATTCTTTATAAGCAAAAATGTCCTTCATATG
TTCTTACTTCAAATGTGATTGATGAAGTTGTTTGCTGTAATTCCTAGATCTCATCATGTT
AAAAACATTCTTTTGTTGTGAAATGTATAATTATTTCATTTGTTTTGTACG

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 4

CO CL2897Contig1 959 4 3 U
GGCAAATGCAGGCAATGCTTGCTATTCAGAGACAACAGCAGCAATTTCGTCATCAGGTTC
CTGTAGCAGATCAGTCCATTGCTCAGAACTGTTGTCAAGATAATCCACTCCATCTTGGTG
ACAAAACTAATCTTCAAGGGCTAACTGCAATACCTTCTTTTGATCCTAGTTCATCTCTGG
AACTAGATGATCCTGCCAACTTTGCTGCTGCTGTTGATAATCCAGAATTCTCTGTTCTTT
ATCGGCTTCAAGATGTTGTAGCAAAGATACGGGAACAAGGACTTGTATAAGGGATAGCTT
ATTCCGGTTGGCTGATAGCGCAGGTCAGAGGCATCACGCTGGTGATACACCCCACAGTAA
TAAGACTAGCCAGGATGACAGTGAGGTTGTTCCTAAAGAAAAATCCAGATATAGATATGC
AGGGATGCTAGACACAGAAACAGTGACCAATCCCACAGACAGAACTGTGGCTCATTTGCT
CTTTCATAGGCCTTTTGATATGTCTGCGGCAAAGCATACGGAAGGACTAGAATCACCATC
TTCTTCCAAGACGGGAGCTGAAGTAAAAGGGAGTTTCCCTAGCACAAGAGATAGTCGCAT
GAATACGCAGAAAGCAAAAGAGGAAGACATACCTGCAGGTTCAGTTGCTTTAGGGTATGC
ATCTAACTCAGGATCCAGTAGCACTGTTGGTGAGAGGGTTGCTGAAGCATCCCAAGGAAA
CAAAAGAAAGTTGTGAAGTATAGAAGGCTTAGGTTGCGGTGTTAGAGAGGAGCTTGAGGA
AATCTGCAGAGTTGGCAACATCTCTCTGCATTGCTAGAAACAATCTCCTCTTTACTCCTT
TCATGTGAAGCTCTTATTCTTGTAATTAGTTGTTTTGTTTTGTGACTTGTTGAACACCCC
CTTCTTATTACATTACCTCCATGAGAACTACATTTTGGAATACTCGTGTTGTTTGCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CY34TF U 1
AF RS1CY34JQ C 197
AF RS1DW30TF U 327
AF RS1DW30JQ C 327
BS 1 634 RS1CY34TF
BS 635 938 RS1DW30TF
BS 939 959 RS1CY34JQ

RD RS1CY34TF 634 0 0
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CTGTAGCAGATCAGTCCATTGCTCAGAACTGTTGTCAAGATAATCCACTCCATCTTGGTG
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AACTAGATGATCCTGCCAACTTTGCTGCTGCTGTTGATAATCCAGAATTCTCTGTTCTTT
ATCGGCTTCAAGATGTTGTAGCAAAGATACGGGAACAAGGACTTGTATAAGGGATAGCTT
ATTCCGGTTGGCTGATAGCGCAGGTCAGAGGCATCACGCTGGTGATACACCCCACAGTAA
TAAGACTAGCCAGGATGACAGTGAGGTTGTTCCTAAAGAAAAATCCAGATATAGATATGC
AGGGATGCTAGACACAGAAACAGTGACCAATCCCACAGACAGAACTGTGGCTCATTTGCT
CTTTCATAGGCCTTTTGATATGTCTGCGGCAAAGCATACGGAAGGACTAGAATCACCATC
TTCTTCCAAGACGGGAGCTGAAGTAAAAGGGAGTTTCCCTAGCACAAGAGATAGTCGCAT
GAATACGCAGAAAGCAAAAGAGGAAGACATACCT

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1CY34JQ 763 0 0
CAACTTTGCTGCTGCTGTTGATAATCCAGAATTCTCTGTTCTTTATCGGCTTCAAGATGT
TGTAGCAAAGATACGGGAACAAGGACTTGTATAAGGGATAGCTTATTCCGGTTGGCTGAT
AGCGCAGGTCAGAGGCATCACGCTGGTGATACACCCCACAGTAATAAGACTAGCCAGGAT
GACAGTGAGGTTGTTCCTAAAGAAAAATCCAGATATAGATATGCAGGGATGCTAGACACA
GAAACAGTGACCAATCCCACAGACAGAACTGTGGCTCATTTGCTCTTTCATAGGCCTTTT
GATATGTCTGCGGCAAAGCATACGGAAGGACTAGAATCACCATCTTCTTCCAAGACGGGA
GCTGAAGTAAAAGGGAGTTTCCCTAGCACAAGAGATAGTCGCATGAATACGCAGAAAGCA
AAAGAGGAAGACATACCTGCAGGTTCAGTTGCTTTAGGGTATGCATCTAACTCAGGATCC
AGTAGCACTGTTGGCGAGAGGGTTGCTGAAGCATCCCAAGGAAACAAAAGAAAGTTGTGA
AGTATAGAAGGCTTAGGTTGCGGTGTTAGAGAGGAGCTTGAGGAAATCTGCAGAGTTGGC
AACATCTCTCTGCATTGCTAGAAACAATCTCCTCTTTACTCCTTTCATGTGAAGCTCTTA
TTCTTGTAATTAGTTGTTTTGTTTTGTGACTTGTTGAACACCCCCTTCTTATTACATTAC
CTCCATGAGAACTACATTTTGGAATACTCGTGTTGTTTGCTTC

QA 1 763 1 763
DS 

RD RS1DW30TF 615 0 0
G
GAGGCATCACGCTGGTGATACATCCCACAGTAATAAGACTAGCCAGGATGACAGTGAGGT
TGTTCCTAAAGAAAAATCCAGATATAGATATGCAGGGATGCTAGACACAGAAACAGTGAC
CAATCCCACAGACAGAACTGTGGCTCATTTGCTCTTTCATAGGCCTTTTGATATGTCTGC
GGCAAAGCATACGGAAGGACTAGAATCACCATCTTCTTCCAAGACGGGAGCTGAAGTAAA
AGGGAGTTTCCCTAGCACAAGAGATAGTCGCATGAATACGCAGAAAGCAAAAGAGGAAGA
CATACCTGCAGGTTCAGTTGCTTTAGGGTATGCATCTAACTCAGGATCCAGTAGCACTGT
TGGTGAGAGGGTTGCTGAAGCATCCCAAGGAAACAAAAGAAAGTTGTGAAGTATAGAAGG
CTTAGGTTGCGGTGTTAGAGAGGAGCTTGAGGAAATCTGCAGAGTTGGCAACATCTCTCT
GCATTGCTAGAAACAATCTCCTCTTTACTCCTTTCATGTGAAGCTCTTATTCTTGTAATT
AGTTGTTTTGTTTTGTGACTTGTTGAACACCCCCTTCTTATTACATTACCTCCATGAGAA
CTACATTTTGG
AAA

QA 2 612 2 612
DS 

RD RS1DW30JQ 612 0 0
G
GAGGCATCACGCTGGTGATACATCCCACAGTAATAAGACTAGCCAGGATGACAGTGAGGT
TGTTCCTAAAGAAAAATCCAGATATAGATATGCAGGGATGCTAGACACAGAAACAGTGAC
CAATCCCACAGACAGAACTGTGGCTCATTTGCTCTTTCATAGGCCTTTTGATATGTCTGC
GGCAAAGCATACGGAAGGACTAGAATCACCATCTTCTTCCAAGACGGGAGCTGAAGTAAA
AGGGAGTTTCCCTAGCACAAGAGATAGTCGCATGAATACGCAGAAAGCAAAAGAGGAAGA
CATACCTGCAGGTTCAGTTGCTTTAGGGTATGCATCTAACTCAGGATCCAGTAGCACTGT
TGGTGAGAGGGTTGCTGAAGCATCCCAAGGAAACAAAAGAAAGTTGTGAAGTATAGAAGG
CTTAGGTTGCGGTGTTAGAGAGGAGCTTGAGGAAATCTGCAGAGTTGGCAACATCTCTCT
GCATTGCTAGAAACAATCTCCTCTTTACTCCTTTCATGTGAAGCTCTTATTCTTGTAATT
AGTTGTTTTGTTTTGTGACTTGTTGAACACCCCCTTCTTATTACATTACCTCCATGAGAA
CTACATTTTGG

QA 2 612 2 612
DS 



AS 1 4

CO CL2898Contig1 576 4 1 U
GCAAGGATGAGCCAGCAGCCAAGATCACTACACTAACCATCGAGCCTAATGTCCTCAACA
TCACTTTCCGTACCTTTGTCGAAATCGTCTTCGAGAACCACGAGAAGAGCATGCAATCCT
TCCATTTGGATGGTCACTCCTTCTTCTCAGTCGCTTCTGAGCCAGGAAGATGGTCACCAG
AGAAGAGAAGCAACTACAACTTGCTCGATGCGGTCAGCAGACACACCGTGCAAGTGTTCC
CCAAGTCGTGGTCAGCCATCCTCTTGACATTCGACAACGCCGGTATGTGGAACATCAGAT
CAGAGAATTGGGAGAAAAGATACTTGGGACAGCAAATGTACGTCAGTGTTCTTTCCCCTG
AGAAATCACTAAGAGACGAATACAACATCCCACTCAACACCAACCTCTGTGGTATCGTCA
AGGGCTTGCCATTACCTACACCCTACACTATTTAATTAAACTCACTTCCACAAAAGTTTT
ATTTATTTATTTGATATGTAAAGTTCTACTTTTTACAAGTGAGTGTATTACGTGACTGAT
TAACCCTTTCCTAATCTCATTAAACATACTACTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1B423TF U 1
AF RS1B423JQ C 82
AF RS1FB87JQ C 333
AF RS1FB87TF U 333
BS 1 576 RS1B423TF

RD RS1B423TF 576 0 0
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TCACTTTCCGTACCTTTGTCGAAATCGTCTTCGAGAACCACGAGAAGAGCATGCAATCCT
TCCATTTGGATGGTCACTCCTTCTTCTCAGTCGCTTCTGAGCCAGGAAGATGGTCACCAG
AGAAGAGAAGCAACTACAACTTGCTCGATGCGGTCAGCAGACACACCGTGCAAGTGTTCC
CCAAGTCGTGGTCAGCCATCCTCTTGACATTCGACAACGCCGGTATGTGGAACATCAGAT
CAGAGAATTGGGAGAAAAGATACTTGGGACAGCAAATGTACGTCAGTGTTCTTTCCCCTG
AGAAATCACTAAGAGACGAATACAACATCCCACTCAACACCAACCTCTGTGGTATCGTCA
AGGGCTTGCCATTACCTACACCCTACACTATTTAATTAAACTCACTTCCACAAAAGTTTT
ATTTATTTATTTGATATGTAAAGTTCTACTTTTTACAAGTGAGTGTATTACGTGACTGAT
TAACCCTTTCCTAATCTCATTAAACATACTACTACC

QA 1 576 1 576
DS 

RD RS1B423JQ 495 0 0
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TCTTTTCAGTCGCTTTTGAGCCAGGAAGATGGTCACCAGAGAAGAGAAGCAACTACAACT
TGCTCGATGCGGTCAGCAGACACACCGTGCAAGTGTTCCCCAAGTCGTGGTCAGCCATCC
TCTTGACATTCGACAACGCCGGTATGTGGAACATCAGATCAGAGAATTGGGAGAAAAGAT
ACTTGGGACAGCAAATGTACGTCAGTGTTCTTTCCCCTGAGAAATCACTAAGAGACGAAT
ACAACATCCCACTCAACACCAACCTCTGTGGTATCGTCAAGGGCTTGCCATTACCTACAC
CCTACACTATTTAATTAAACTCACTTCCACAAAAGTTTTATTTATTTATTTGATATGTAA
AGTTCTACTTTTTACAAGTGAGTGTATTACGTGACTGATTAACCCTTTCCTAATCTCATT
AAACATACTACTACC

QA 1 495 1 495
DS 

RD RS1FB87JQ 244 0 0
G
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TCAACACCAACCTCTGTGGTATCGTCAAGGGCTTGCCATTACCTACACCCTACACTATTT
AATTAAACTCACTTCCACAAAAGTTTTATTTATTTATTTGATATGTAAAGTTCTACTTTT
TACAAGTGAGTGTATTACGTGACTGATTAACCCTTTCCTAATCTCATTAAACATACTACT
ACC

QA 2 244 2 244
DS 

RD RS1FB87TF 244 0 0
G
AAATGTACGTCAGTGTTCTTTCCCCTGAGAAATCACTAAGAGACGAATACAACATCCCAC
TCAACACCAACCTCTGTGGTATCGTCAAGGGCTTGCCATTACCTACACCCTACACTATTT
AATTAAACTCACTTCCACAAAAGTTTTATTTATTTATTTGATATGTAAAGTTCTACTTTT
TACAAGTGAGTGTATTACGTGACTGATTAACCCTTTCCTAATCTCATTAAACATACTACT
ACC

QA 2 244 2 244
DS 



AS 1 4

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GTCGGTTGCGATTCTTCTTCATCCATATAAACGGATCCAGTTAATAATTCATCACATTTA
ACCTCGCTTTAACTCCATAACCACGATCTTGCTTTCAATGTGAGCATATCATCTGTTAGT
TGGTGACATTTGCGTATAAAAGTGCTCTTCCACTTTTGATGTTAGATGGATGTTAGATTG
TTGTGTCTAACGGAGCCATCGTGAGTTATTGTGGCCACGTTCTACAGCAGATAAGTTTTA
CTCTTCTTATTAATTATTTATCTTGCTTATCAGTATCTTCCTTTGTTTGCAAACCTCATG
TTTTTAGTTTCTGAGTGGTTCTTATTGTTTTTGCCTGATATTTAGCAACTTACTCACTTG
GTTCTTTGAGAATCTATCAATTTCTCTACAAAGCTCATGTTCTGAGTTTCTTTTTGTTGT
TTTATTTCTTTCCTATTTTTCTACCAATAGATGAGCCTGATTACTGAACAATGTTCTTTT
GTTTTTGTTAATGGAGGACGTTGCATCTTCTGCTGCAGCAGAGTCTTTGGAGATATATAC
ATCTATATATATAACAAGTGATATATTGGAATCTGAATAGTGAAGTCAACATAGATTCAG
AAAATGACAGATATTTTGCTTACAGAATATAGATAGAAACTCAAGTTATCATCCCATTAT
AAAAGCAGTGTTATTTCGTGAGTTATTCATTTGAATTCTCACTTATTTGGTTCTTTTACT
GGCGTGATATTAGTCATCAAAAACGATTTGTCAGTGAGGAAGTAATTTTGTTTGTTTACC
CCATATGAATTATTACATCCGTCACTTCTTTTGGCCCCCAACTCTCTCTCCTTCGTCTTT
TGCGGTTGCAACTCTTTTTTTGGATTGTGTTTGTGGCGTTTGGAGAAGACCTAGAAGAAA
AACATGGCATGCGGATCTTATTCGGCTCAATAGCAAATGCCGTGAATGTGTTCACGTCTG
CTTGACTACCACGGCGATGTGTCCGTCGTCAAAACCGAGCGTTTGTTCTCCAAGCTGATT
GAAAAAAAAGTTTTTTGTTTTCCAATTTACTCTGTGATCTTTTGTACTCTGTGATCTTTT
GAGAAATTCGTGTTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1EO86TF U 1
AF RS1FV74TF U 1
AF RS1FV74JQ C 399
AF RS1EO86JQ C 412
BS 1 711 RS1EO86TF
BS 712 723 RS1FV74TF
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BS 758 786 RS1FV74TF
BS 787 1155 RS1FV74JQ

RD RS1EO86TF 711 0 0
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GTCGGTTGCGATTCTTCTTCATCCATATAAACGGATCCAGTTAATAATTCATCACATTTA
ACCTCGCTTTAACTCCATAACCACGATCTTGCTTTCAATGTGAGCATATCATCTGTTAGT
TGGTGACATTTGCGTATAAAAGTGCTCTTCCACTTTTGATGTTAGATGGATGTTAGATTG
TTGTGTCTAACGGAGCCATCGTGAGTTATTGTGGCCACGTTCTACAGCAGATAAGTTTTA
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TTTTTAGTTTCTGAGTGGTTCTTATTGTTTTTGCCTGATATTTAGCAACTTACTCACTTG
GTTCTTTGAGAATCTATCAATTTCTCTACAAAGCTCATGTTCTGAGTTTCTTTTTGTTGT
TTTATTTCTTTCCTATTTTTCTACCAATAGATGAGCCTGATTACTGAACAATGTTCTTTT
GTTTTTGTTAATGGAGGACGTTGCATCTTCTGCTGCAGCAGAGTCTTTGGAGATATATAC
ATCTATATATATAACAAGTGATATATTGGAATCTGAATAGTGAAGTCAACATAGATTCAG
AAAATGACAGATATTTTGCTTACAGAATATAGATAGAAACTCAAGTTATCA

QA 1 711 1 711
DS 

RD RS1FV74TF 786 0 0
GAAGGGAATCCAGCCTATTACCAGAAACCCTACTCTTCCCCCCTACACATTGTCGCCGTC
GTCGGTTGCGATTCTTCTTCATCCATATAAACGGATCCAGTTAATAATTCATCACATTTA
ACCTCGCTTTAACTCCATAACCACGATCTTGCTTTCAATGTGAGCATATCATCTGTTAGT
TGGTGACATTTGCGTATAAAAGTGCTCTTCCACTTTTGATGTTAGATGGATGTTAGATTG
TTGTGTCTAACGGAGCCATCGTGAGTTATTGTGGCCACGTTCTACAGCAGATAAGTTTTA
CTCTTCTTATTAATTATTTATCTTGCTTATCAGTATCTTCCTTTGTTTGCAAACCTCATG
TTTTTAGTTTCTGAGTGGTTCTTATTGTTTTTGCCTGATATTTAGCAACTTACTCACTTG
GTTCTTTGAGAATCTATCAATTTCTCTACAAAGCTCATGTTCTGAGTTTCTTTTTGTTGT
TTTATTTCTTTCCTATTTTTCTACCAATAGATGAGCCTGATTACTGAACAATGTTCTTTT
GTTTTTGTTAATGGAGGACGTTGCATCTTCTGCTGCAGCAGAGTCTTTGGAGATATATAC
ATCTATATATATAACAAGTGATATATTGGAATCTGAATAGTGAAGTCAACATAGATTCAG
AAAATGACAGATATTTTGCTTACAGAATATAGATAGAAACTCAAGTTATCATCCCATTAT
AAA*GCAGTGTTATTTCGTGAGTTATTCATTTGAAT*CTCACTTATTTGGTTCTTTTACT
GGCGTG

QA 1 786 1 786
DS 

RD RS1FV74JQ 757 0 0
TATTTAGCAACTTACTCACTTGGTTCTTTGAGAATCTATCAATTTCTCTACAAAGCTCAT
GTTCTGAGTTTCTTTTTGTTGTTTTATTTCTTTCCTATTTTTCTACCAATAGATGAGCCT
GATTACTGAACAATGTTCTTTTGTTTTTGTTAATGGAGGACGTTGCATCTTCTGCTGCAG
CAGAGTCTTTGGAGATATATACATCTATATATATAACAAGTGATATATTGGAATCTGAAT
AGTGAAGTCAACATAGATTCAGAAAATGACAGATATTTTGCTTACAGAATATAGATAGAA
ACTCAAGTTATCATCCCATTATAAAAGCAGTGTTATTTCGTGAGTTATTCATTTGAATTC
TCACTTATTTGGTTCTTTTACTGGCGTGATATTAGTCATCAAAAACGATTTGTCAGTGAG
GAAGTAATTTTGTTTGTTTACCCCATATGAATTATTACATCCGTCACTTCTTTTGGCCCC
CAACTCTCTCTCCTTCGTCTTTTGCGGTTGCAACTCTTTTTTTGGATTGTGTTTGTGGCG
TTTGGAGAAGACCTAGAAGAAAAACATGGCATGCGGATCTTATTCGGCTCAATAGCAAAT
GCCGTGAATGTGTTCACGTCTGCTTGACTACCACGGCGATGTGTCCGTCGTCAAAACCGA
GCGTTTGTTCTCCAAGCTGATTGAAAAAAAAGTTTTTTGTTTTCCAATTTACTCTGTGAT
CTTTTGTACTCTGTGATCTTTTGAGAAATTCGTGTTC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RS1EO86JQ 744 0 0
ACTCACTTGGTTCTTTGAGAATCTATCAATTTCTCTACAAAGCTCATGTTCTGAGTTTCT
TTTTGTTGTTTTATTTCTTTCCTATTTTTCTACCAATAGATGAGCCTGATTACTGAACAA
TGTTCTTTTGTTTTTGTTAATGGAGGACGTTGCATCTTCTGCTGCAGCAGAGTCTTTGGA
GATATATACATCTATATATATAACAAGTGATATATTGGAATCTGAATAGTGAAGTCAACA
TAGATTCAGAAAATGACAGATATTTTGCTTACAGAATATAGATAGAAACTCAAGTTATCA
TCCCATTATAAAAGCAGTGTTATTTCGTGAGTTATTCATTTGAATTCTCACTTATTTGGT
TCTTTTACTGGCGTGATATTAGTCATCAAAAACGATTTGTCAGTGAGGAAGTAATTTTGT
TTGTTTACCCCATATGAATTATTACATCCGTCACTTCTTTTGGCCCCCAACTCTCTCTCC
TTCGTCTTTTGCGGTTGCAACTCTTTTTTTGGATTGTGTTTGTGGCGTTTGGAGAAGACC
TAGAAGAAAAACATGGCATGCGGATCTTATTCGGCTCAATAGCAAATGCCGTGAATGTGT
TCACGTCTGCTTGACTACCACGGCGATGTGTCCGTCGTCAAAACCGAGCGTTTGTTCTCC
AAGCTGATTGAAAAAAAAGTTTTTTGTTTTCCAATTTACTCTGTGATCTTTTGTACTCTG
TGATCTTTTGAGAAATTCGTGTTC

QA 1 744 1 744
DS 



AS 2 4

CO CL2900Contig1 770 2 4 U
GGTATCAACGACTATATACTGTCTTTCTCACTTTATTTAACCATTATTTTGCCCAAGTGA
TCGGCTTCATTATTGGATACACATTAATTAGTAGTTTAATTAGTTGTAGCAACATAATAG
TTTCTTTTTATAAAGGCCATAAAAACGGCATGATGTTTTTTACTCTGTTGTTGTACATAA
CTTGTTGAAAAAGGAGAGAATCTCCTCAGAGACTTGTTTAGCCTTCTCTTGCTGGATAAA
ATGATGACCATCCTCAATTACAACAACTTCAACGTTAGGCACATGACTCTTGAACATCTC
TCCCTTCACATACCCCATCGTTTCATTTGCTCCTATATCTTTGTCTCCGGCGATAAACTT
TGTCGGAACAAGGATCTTGGAGCCTTCCCACGGCGCCAGTATCTCCCAGTTCAGATCCAT
GGCTCTGTAGTAATTCAACGGGCCAGTGAATCCAGATCTCTGAAACTTGTCTGCATAAAC
CTGAATCTCCTCTTCCGCTATCCACTCTGGAATCTTCGATGGAATCTCAAGGTCATCGAT
GATCTCTGTACCGGGAGGAGCCACCATGAAATCTGTTCTCGTCGTTAGCAAGAACTTCTT
CATAACCGTCTTGCAATCATGCTTGGCAAATGCGGCCTCAGCTCTTCCAGGTTTCTGAAA
CTGAGTGATGTATAGCCCATCTCCAAAGGTTTTGGAAAACTCCGAAGGTTTGAGGTTTGG
ATCTCTTGGAGAATATGGAACAGAGAGACTTATGAAACCTTTGACTCTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B128JQ U 1
AF RS1CR24JQ U 39
BS 1 209 RS1B128JQ
BS 210 210 RS1CR24JQ
BS 211 412 RS1B128JQ
BS 413 770 RS1CR24JQ

RD RS1B128JQ 412 0 0
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CTTGTTGAAAAAGGAGAGAATCTCCTCAGGGACTTGTTTAGCCTTCTCTTGCTGGATAAA
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TCCCTTCACATACCCCATCGTTTCATTTGCTCCTATATCTTTGTCTCCGGCGATAAACTT
TGTCGGAACAAGGATCTTGGAGCCTTCCCACGGCGCCAGTATCTCCCAGTTC

QA 1 412 1 412
DS 

RD RS1CR24JQ 732 0 0
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ATTAGTTGTAGCAACATAATAGTTTCTTTTTATAAAGGCCATAAAAACGGCATGATGTTT
TTTACTCTGTTGTTGTACATAACTTGTTGAAGAAGGAGAGAATCTCCTCAGAGACTTGTT
TAGCCTTCTCTTGCTGGATAAAATGATGACCATCCTCAATTACAACAACTTCAACGTTAG
GCACATGACTCTTGAACATCTCTCCCTTCACATACCCCATCGTTTCATTTGCTCCTATAT
CTTTGTCTCCGGCGATAAACTTTGTCGGAACAAGGATCTTGGAGCCTTCCCACGGCGCCA
GTATCTCCCAGTTCAGATCCATGGCTCTGTAGTAATTCAACGGGCCAGTGAATCCAGATC
TCTGAAACTTGTCTGCATAAACCTGAATCTCCTCTTCCGCTATCCACTCTGGAATCTTCG
ATGGAATCTCAAGGTCATCGATGATCTCTGTACCGGGAGGAGCCACCATGAAATCTGTTC
TCGTCGTTAGCAAGAACTTCTTCATAACCGTCTTGCAATCATGCTTGGCAAATGCGGCCT
CAGCTCTTCCAGGTTTCTGAAACTGAGTGATGTATAGCCCATCTCCAAAGGTTTTGGAAA
ACTCCGAAGGTTTGAGGTTTGGATCTCTTGGAGAATATGGAACAGAGAGACTTATGAAAC
CTTTGACTCTGT

QA 1 732 1 732
DS 



CO CL2900Contig2 753 2 6 U
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ACCAACGGGATTTGGTTAAACGTTGCTGAGAAAGGAGACGAAGGAGGACCTTTGGTTCTG
TTACTCCATGGCTTCCCCGAGACATGGTTCTCGTGGCGTCACCAGATCGATTTCTTGTCG
AGCCATGGCTACCACGTGGTCGCTCCAGACCTCAGAGGCTACGGTGACTCCGAGTTTCTT
CCGAGCCACGAGTCTTACACTGTGAGCCACCTCGTTGCTGATGTCATCGGTTTGCTTGAT
CACTACGGCACTGCTCAGGCTTTTGTGGCTGGACATGACTGGGGATCAGTTATAGGTTGG
TCTCTATGCTTGTTTAGACCAGACAGAGTCAAAGGTTTCATAAGTCTCTCTGTTCCATAT
TCTCCAAGAGATCCAAACCTCAAACCTTCGGAGTTTTCCAAAACCTTTGGAGATGGGCTA
TACATCACTCAGTTTCAGAAACCTGGAAGAGCTGAGGCCGCATTTGCCAAGCATGATTGC
AAGACGGTTATGAAGAAGTTCTTGCTAACGACGAGAACAGATTTCATGGTGGCTCCTCCC
GGTACAGAGATCATCGATGACCTTGAGATTCCATCGAAGATTCCAGAGTGGATAGCAGAA
GAGGAGATTCAGGTTTATGCAGACAAGTTTCAGAGATCTGGATTCACTGGCCCGTTGAAT
TACTACAGAGCCATGGATCTGACTGGGAGATAC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CR24TF U 1
AF RS1B128TF U 2
BS 1 89 RS1CR24TF
BS 90 90 RS1B128TF
BS 91 656 RS1CR24TF
BS 657 657 RS1B128TF
BS 658 742 RS1CR24TF
BS 743 753 RS1B128TF

RD RS1CR24TF 747 0 0
GGGCTCACATCAGTATCAAGAATCATGACAACAAGCTTAGTGAGAGAGAAGAAGATCAAG
ACCAACGGGATTTGGTTAAACGTTGCTGA*AAAGGAGACGAAGGAGGACCTTTGGTTCTG
TTACTCCATGGCTTCCCCGAGACATGGTTCTCGTGGCGTCACCAGATCGATTTCTTGTCG
AGCCATGGCTACCACGTGGTCGCTCCAGACCTCAGAGGCTACGGTGACTCCGAGTTTCTT
CCGAGCCACGAGTCTTACACTGTGAGCCACCTCGTTGCTGATGTCATCGGTTTGCTTGAT
CACTACGGCACTGCTCAGGCTTTTGTGGCTGGACATGACTGGGGATCAGTTATAGGTTGG
TCTCTATGCTTGTTTAGACCAGACAGAGTCAAAGGTTTCATAAGTCTCTCTGTTCCATAT
TCTCCAAGAGATCCAAACCTCAAACCTTCGGAGTTTTCCAAAACCTTTGGAGATGGGCTA
TACATCACTCAGTTTCAGAAACCTGGAAGAGCTGAGGCCGCATTTGCCAAGCATGATTGC
AAGACGGTTATGAAGAAGTTCTTGCTAACGACGAGAACAGATTTCATGGTGGCTCCTCCC
GGTACAGAGATCATCGATGACCTTGAGATTCCATCGAAGATTCCAGAGTGGATAGCGGAA
GAGGAGATTCAGGTTTATGCAGACAAGTTTCAGAGATCTGGATTCACTGGCCCGTTGAAT
TACTACAGAGCCATGGATCTGA
ACTGG

QA 1 742 1 742
DS 

RD RS1B128TF 752 0 0
GGCTCACATCAGTATCAAGAATCATGACAACAAGCTTAGTGAGAGAGAAGAAGATCAAGA
CCAACGGGATTTGGTTAAACGTTGCTGAGAAAGGAGACGAAGGAGGACCTTTGGTTCTGT
TACTCCATGGCTTCCCCGAGACATGGTTCTCGTGGCGTCACCAGATCGATTTCTTGTCGA
GCCATGGCTACCACGTGGTCGCTCCAGACCTCAGAGGCTACGGTGACTCCGAGTTTCTTC
CGAGCCACGAGTCTTACACTGTGAGCCACCTCGTTGCTGATGTCATCGGTTTGCTTGATC
ACTACGGCACTGCTCAGGCTTTTGTGGCTGGACATGACTGGGGATCAGTTATAGGTTGGT
CTCTATGCTTGTTTAGACCAGACAGAGTCAAAGGTTTCATAAGTCTCTCTGTTCCATATT
CTCCAAGAGATCCAAACCTCAAACCTTCGGAGTTTTCCAAAACCTTTGGAGATGGGCTAT
ACATCACTCAGTTTCAGAAACCTGGAAGAGCTGAGGCCGCATTTGCCAAGCATGATTGCA
AGACGGTTATGAAGAAGTTCTTGCTAACGACGAGAACAGATTTCATGGTGGCTCCTCCCG
GTACAGAGATCATCGATGACCTTGAGATTCCATCGAAGATTCCAGAGTGGATAGCAGAAG
AGGAGATTCAG*TTTATGCAGACA*GTTTCAGAGATCTGGAT*CACTGGCCCGTTGA*TT
ACTACAGAGC*ATGGATCTGACTGGGAGATAC

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 3

CO CL2901Contig1 951 3 12 U
GGGGGCATCCTATTCGCATCTCCAATGGCGATATCGGTTGCGCAGCCGATCTTTCGTCTC
CTTCCTTGCGAGATTTTTGTTATGCAAAACGGTAGAGTTCGACAATAAAAAGGTTAAAAA
TTAGTTTTTAAACAAAATTTTAACGTTTGCAAGAGCTCAACCTGAAGCATTCAAGACGGA
TATGTTATTGCAGTAAGCTCGCCAAACTTATATTTTTACTGGAATAGTCAGGTGTTGTCA
TAGGAGAGGAATAAAATTATTTTCCAGTTGAGGGCATGGTCGCATTCAACATTTTCTGGG
AGCATGGCATAACCGAAGAATCTTCAGATTTTCTTGGTTTGGTTATTCTTTGCTTACTGC
ATTTTATGCAGTTTATAATACAAGATTTTATATGATTCAGGACAAAGAAACCGGTTTCCA
TATAAGATCAAAGCTTTTGACCGGTTAAAGGCAAAGCTGCTTGAAAGATTTCACTCACAA
CTCAGTCTTGTCTGAACTTGAAGCGAACGCTGTGGTAATTGAGTTAAGACAATTTCAGGT
TCCATTCATTCAAAGCAAATTGTGGGTCTCAGAGGTCATCGTCATGACGCTGGATGGACG
AGAGGGAGAGTGAAAGTAGATGCTGGTTCAATGATGTCCTTCAATACTTCGGTTCTGCTG
TTCTTATCAATGTGCCAATGACGTTGAGTCTTATCTCGACATGGTCTGTGGATGTACTTC
TGGACTACTTACAGAAATGATAAAAATGGTCATTCTCCTATAACCTTTTTGTTAAAAATT
ATAGTCTTTCAGTAATTGTCAAGTTTTGCATTGAACAACCCTTCTCTTGAGATGTTGTAT
TAGATTGTGCTGTCAAGTAGAAGCTTATATTGACTGAGGAAATGCGATATAAAGATCATA
TAAAATATTGTAAACTACGTTTTGTCTCTGGCTTTAATGTGTTTTTTATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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G
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G
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ATCAATGTGCCAATGACGTTGAGTCTTATCTCGACATGGTCTGTGGATGTACTTCTGGAC
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TATTGTAAACTACGTTTTGTCTCTGGCTTTA*TGTGTTTTTTATGC

QA 2 707 2 707
DS 



AS 1 4

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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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GACTTACGATGTAACGGACCAAGAAAGCTTCAACAATGTCAAGCAATGGCTAAATGAAAT
CGACCGCTACGCCAGTGAGAATGTGAACAAGCTACTGGTTGGGAACAAGTCTGATCTCAC
TTCACAGAAAGTTGTATCCACTGAGACAGCCAAGGCTTTCGCCGATGAACTTGGAATCCC
TTTCTTGGAAACAAGTGCCAAGAATGCTACAAATGTTGAAGAAGCTTTCATGGCCATGAC
TTCTGCAATCAAGACAAGAATGGCGAGCCAACCTGCTGGTGGATCTAAGCCTTCAACAGT
CCAGATCCGAGGACAACCTGTAAACCAGCAATCAAGCTGCTGCTCTTCTTAATG

QA 1 774 1 774
DS 

RD RS1C572JQ 765 0 0
ATATGACTATCTCTTCAAGCTTTTGCTTATTGGTGATTCCGGTGTTGGAAAGTCCTGCTT
GCTTCTTAGGTTTGCTGATGATTCCTACCTGGATAGCTACATCAGTACCATTGGTGTTGA
CTTTAAAATCCGCACAGTCGAACAAGATGGAAAGACAATCAAACCCCAGATTTGGGACAC
AGCAGGTCAAGAACGTTTCAGAACCATCACTAGCAGTTACTACAGAGGAGCTCATGGAAT
CATTGTGACTTACGATGTAACGGACCAAGAAAGCTTCAACAATGTCAAGCAATGGCTAAA
TGAAATCGACCGCTACGCCAGTGAGAATGTGAACAAGCTACTGGTTGGGAACAAGTCTGA
TCTCACTTCACAGAAAGTTGTATCCACTGAGACAGCCAAGGCTTTCGCCGATGAACTTGG
AATCCCTTTCTTGGAAACAAGTGCCAAGAATGCTACAAATGTTGAAGAAGCTTTCATGGC
CATGACTTCTGCAATCAAGACAAGAATGGCGAGCCAACCTGCTGGTGGATTTAAGCCTTC
AACAGTCCAGATCCGAGGACAACCTGTAAACCAGCAATCAAGCTGCTGCTCTTCTTAATG
CGTTTTGTGAACACTTTTAACCATCTCATTTGTTTCCATGTACTACACCTGAACAACGTT
GTTTCTTCATCTTTTGTACTTGTTTGTTCAGTCACTTTTATTTCCAAAAGCTTTTGTATT
AATGTACGTGGAAACACTAAGCTCGGTTGTAAAAGTTTTTCGTGC

QA 1 765 1 765
DS 

RD RS1AS61JQ 705 0 0
TTAGGTTTGCTGATGATTCCTACCTGGATAGCTACATCAGTACCATTGGTGTTGACTTTA
AAATCCGCACAGTCGAACAAGATGGAAAGACAATCAAACTCCAGATTTGGGACACAGCAG
GTCAAGAACGTTTCAGAACCATCACTAGCAGTTACTACAGAGGAGCTCATGGAATCATTG
TGACTTACGATGTAACGGACCAAGAAAGCTTCAACAATGTCAAGCAATGGCTAAATGAAA
TCGACCGCTACGCCAGTGAGAATGTGAACAAGCTACTGGTTGGGAACAAGTCCGATCTCA
CTTCACAGAAAGTTGTATCCACTGAGACAGCCAAGGCTTTCGCCGATGAACTTGGAATCC
CTTTCTTGGAAACAAGTGCCAAGAATGCTACAAATGTTGAAGAAGCTTTCATGGCCATGA
CTTCTGCAATCAAGACAAGAATGGCGAGCCAACCTGCTGGTGGATTTAAGCCTTCAACAG
TCCAGATCCGAGGACAACCTGTAAACCAGCAATCAGGCTGCTGCTCTTCTTAATGCGTTT
TGTCAACACTTTTAACCATCTCATTTGTTTCCATGTACTACACCTGAACAACGTTGTTTC
TTCATCTTTTGTACTTGTTTGTTCAGTCACTTTTATTTCCAAAAGCTTTTGTATTAATGT
ACGTGGAAACACTAAGCTCGGTTGTAAAAGTTTTTCGTGCAAATC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 3

CO CL2903Contig1 736 3 7 U
CTTGAACTTTGCTTACTTGCAGATTTGTTCATTAACTAAGAACAAAGATGTCATAAAGAT
TCCAGCTTTGCTGATAATATTCATTACATAGGCTCTCAAAAGGATGATACATGGTTTACC
AATTCTATCAGGAACAGTCTGTTCATGCAATGCAAGTGCCCATCGCCTCATTGTAGTTTC
AGAGCTTCACTTCCACATCAACACCAGCAGGAAGATCCAGCTGCATCAAGGAGTCGATGG
TTTGAGCAGTAGGGTAGAGAATATCAATCATCCGCTGGTGAGTCCTGATCTCAAAATGGA
ACCTTGCATCCTTGTGGACGTGGGGAGACTTGAGAACACAGTAAATACGCTTCTTGGTTG
GCAAGGGAACAGGACCCATCGTCTTGGCATTGGTGTTCCTCGCAGCGTCTAGTATCTGCT
TGCATGAGTCCTCAATGAGAGGCACCCAGTATGACCTAAGCTTTATCCTAATCTTTTGCT
TTGGCGCCATCTTATCTGCGTCAACACTTATTGAGGAAGAGCTCGGAACCTCGGAGAAGT
CATCAGAGGCGGGTTCATCGAGGGTTTCCGGAGGGTTTGTTAAGGACGCAGGAGCCAATG
CCGCCATGAGTAGACGAAGAAGAAGAAGAAGATGGAAGCAAAGAGACTTTCTGTTTGGTG
GAAGAAGAAGATGAAAGGTTGGCGAAAGAGGGTAATATGAAGGAAGTTACAGAAGAAACC
GCCATTGAATTTCCCC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FI59JQ U 4
AF RS1A958TF C 1
AF RS1A958JQ U 24
BS 1 3 RS1A958TF
BS 4 263 RS1FI59JQ
BS 264 264 RS1A958JQ
BS 265 450 RS1FI59JQ
BS 451 451 RS1A958JQ
BS 452 555 RS1FI59JQ
BS 556 736 RS1A958JQ

RD RS1FI59JQ 552 0 0
GAACTTTGCTTACTTGCAGATTTGTTCATTAACTAAGAACAAAGATGTCATAAAGATTCC
AGCTTTGCTGATAATATTCATTACATAGGCTCTCAAAAGGATGATACATGGTTTACCAAT
TCTATCAGGAACAGTCTGTTCATGCAATGCAAGTGCCCATCGCCTCATTGTAGTTTCAGA
GCTTCACTTCCACATCAACACCAGCAGGAAGATCCAGCTGCATCAAGGAGTCGATGGTTT
GAGCAGTAGGGTAGAGAATACCAATCATCCGCTGGTGAGTCCTGATCTCAAAATGGAACC
TTGCATCCTTGTGGACGTGGGGAGACTTGAGAACACAGTAAATACGCTTCTTGGTTGGCA
AGGGAACAGGACCCATCGTCTTGGCATTGGTGTTCCTCGCAGCGTCTAGTATCTGCTTGC
ATGAGTCCTCAATGAGAGGCACCCAGTGTGACCTAAGCTTTATCCTAATCTTTTGCTTTG
GCGCCATCTTATCTGCGTCAACACTTATTGAGGAAGAGCTCGGAACCTCGGAGAAGTCAT
CAGAGGCGGGTT

QA 1 552 1 552
DS 

RD RS1A958TF 736 0 0
CTTGAACTTTGCTTACTTGCAGATTTGTTCATTAACTAAGAACAAAGATGTCATAAAGAT
TCCAGCTTTGCTGATAATATTCATTACATAGGCTCTCAAAAGGATGATACATGGTTTACC
AATTCTATCAGGAACAGTCTGTTCATGCAATGCAAGTGCCCATCGCCTCATTGTAGTTTC
AGAGCTTCACTTCCACATCAACACCAGCAGGAAGATCCAGCTGCATCAAGGAGTCGATGG
TTTGAGCAGTAGGGTAGAGAATATCAATCATCCGCTGGTGAGTCCTGATCTCAAAATGGA
ACCTTGCATCCTTGTGGACGTGGGGAGACTTGAGAACACAGTAGATACGCTTCTTGGTTG
GCAAGGGAACAGGACCCATCGTCTTGGCATTGGTGTTCCTCGCAGCGTCTAGTATCTGCT
TGCATGAGTCCTCAATGAGAGGCACCCAGTATGACCTAAGCTTTATCCTAATCTTTTGCT
TTGGCGCCATCTTATCTGCGTCAACACTTATTGAGGAAGAGCTCGGAACCTCGGAGAAGT
CATCAGAGGCGGGTTCATCGAGGGTTTCCGGAGGGTTTGTTAAGGACGCAGGAGCCAATG
CCGCCATGAGTAGACGAAGAAGAAGAAGAAGATGGAAGCAAAGAGACTTTCTGTTTGGTG
GAAGAAGAAGATGAAAGGTTGGCGAAAGAGGGTAATATGAAGGAAGTTACAGAAGAAACC
GCCATTGAATTTCCCC

QA 1 736 1 736
DS 

RD RS1A958JQ 713 0 0
TTTGTTCATTAACTAAGAACAAAGATGTCATAAAGATTCCAGCTTTGCTGATAATATTCA
TTACATAGGCTCTCAAAAGGATGATACATGGTTTACCAATTCTATCAGGAACAGTCTGTT
CATGCAATGCAAGTGCCCATCGCCTCATTGTAGTTTCAGAGCTTCACTTCCACATCAACA
CCAGCAGGAAGATCCAGCTGCATCAAGGAGTCGATGGTTTGAGCAGTAGGGTAGAGAATA
TCAATCATCCGCTGGTGAGTCCTGATCTCAAAATGGAACCTTGCATCCTTGTGGACGTGG
GGAGACTTGAGAACACAGTAAATACGCTTCTTGGTTGGCAAGGGAACAGGACCCATCGTC
TTGGCATTGGTGTTCCTCGCAGCGTCTAGTATCTGCTTGCATGAGTCCTCAATGAGAGGC
ACCCAGTATGACCTAAGCTTTATCCTAATCTTTTGCTTTGGCGCCATCTTATCTGCGTCA
ACACTTATTGAGGAAGAGCTCGGAACCTCGGAGAAGTCATCAGAGGCGGGTTCATCGAGG
GTTTCCGGAGGGTTTGTTAAGGACGCAGGAGCCAATGCCGCCATGAGTAGACGAAGAAGA
AGAAGAAGATGGAAGCAAAGAGACTTTCTGTTTGGTGGAAGAAGAAGATGAAAGGTTGGC
GAAAGAGGGTAATATGAAGGAAGTTACAGAAGAAACCGCCATTGAATTTCCCC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 3

CO CL2904Contig1 785 3 7 U
GGTGAAAAACAATAAGCTCAAATAAAGAACCAACATGAAACAAGGTCAAAGTAAATGATA
AGACTATCAATGAGTCACCTCTCTCCGCTCCAAAGAAATGTAATAAAATGTGTCCTTAAA
CCAAAAATGACTCACCTAAAAGACCCCCCAAAGAATATTACAAACAAAAGTACGAGAGAT
TATTATCCACACATACCTATAAAATCAAACAACGAAAAAAACATTCCGACGAATACCACC
GTGGTAGAGATTGCTCAACTGATTACTTGAACGGATAGCTTTTGTTTCTGATAGTCTTAG
TAGCCGCCCATCGGTGGCATTCCATATGGTGGCATCGGAGGCATTCCTGGCATTCCACCC
ATCGGTGGTGGCGGACCATAACCGCCTCCCATACCTGGACCTCCTCCCATTCCTGGCATC
GGTGGTGCAGGTAGAGCCAGTGGCAATAATTGTGCGTACATGTTCTGTTGGGACATGACA
TCCTTCTCTTCCTGCTCTTTGGCCTTCACTTCTTTCTGTGCCTCTATCTTGTCCTTGATC
AGTTCATCCACTTTGCCAGAATATTCTCGGATAAACTGGAGGAGATACGGGAAGGCAAAG
TCAATCATGTTATTGATCCAAGCAAGTTCTAGAGCAACATCTGGTCGGATTAAGTCATAA
CACACAAATAGACATGTGGCAAAGCATTCCTTTTTCCCCTGTTCAATGAAGTAAACCAGA
AGCTGTTCTGCAAGGTCATGGTCGCCGGATTGTGAAGCAGTTTCCATACAGTCCTTGTAC
ATGTT


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1FD10JQ U 1
AF RS1G154JQ U 1
AF RS1AV06JQ U 4
BS 1 454 RS1FD10JQ
BS 455 455 RS1G154JQ
BS 456 544 RS1FD10JQ
BS 545 560 RS1G154JQ
BS 561 561 RS1AV06JQ
BS 562 730 RS1G154JQ
BS 731 785 RS1AV06JQ

RD RS1FD10JQ 544 0 0
GGTGAAAAACAATAAGCTCAAATAAAGAACCAACATGAAACAAGGTCAAAGTAAATGATA
AGACTATCAATGAGTCACCTCTCTCCGCTCCAAAGAAATGTAATAAAATGTGTCCTTAAA
CCAAAAATGACTCACCTAAAAGACCCCCCAAAGAATATTACAAACAAAAGTACGAGAGAT
TATTATCCACACATACCTATAAAATCAAACAACGAAAAAAACATTCCGACGAATACCACC
GTGGTAGAGATTGCTCAACTGATTACTTGAACGGATAGCTTTTGTTTCTGATAGTCTTAG
TAGCCGCCCATCGGTGGCATTCCATATGGTGGCATCGGAGGCATTCCTGGCATTCCACCC
ATCGGTGGTGGCGGACCATAACCGCCTCCCATACCTGGACCTCCTCCCATTCCTGGCATC
GGTGGTGCAGGTAGAGCCAGTGGCAATAATTGTGTGTACATGTTCTGTTGGGACATGACA
TCCTTCTCTTCCTGCTCTTTGGCCTTCACTTCTTTCTGTGCCTCTATCTTGTCCTTGATC
AGTT

QA 1 544 1 544
DS 

RD RS1G154JQ 730 0 0
AGTGA
AAAACAATAAGCTCAAATAAAGAACCAACATGAAACAAGGTCAAAGTAAATGATAAGACT
ATCAATGAGTCACCTCTCTCCGCTCCAAAGAAATGTAATAAAATGTGTCCTTAAACCAAA
AATGACTCACCTAAAAGACCCCCCAAAGAATATTACAAACAAAAGTACGAGAGATTATTA
TCCACACATACCTATAAAATCAAACAACGAAAAAAACATTCCGACGAATACCACCGTGGT
AGAGATTGCTCAACTGATTACTTGAACGGATAGCTTTTGTTTCTGATAGTCTTAGTAGCC
GCCCATCGGTGGCATTCCATATGGTGGCATCGGAGGCATTCCTGGCATTCCACCCATCGG
TGGTGGCGGACCATAACCGCCTCCCATACCTGGACCTCCTCCCATTCCTGGCATCGGTGG
TGCAGGTAGAGCCAGTGGCAATAATTGTGCGTACATGTTCTGTTGGGACATGACATCCTT
CTCTTCCTGCTCTTTGGCCTTCACTTCTTTCTGTGCCTCTATCTTGTCCTTGATCAGTTC
ATCCACTTTGCCAGAGTATTCTCGGATAAACTGGAGGAGATACGGGAAGGCAAAGTCAAT
CATGTTATTGATCCAAGCAAGTTCTAGAGCAACATCTGGTCGGATTAAGTCATAACACAC
AAATAGACATGTGGCAAAGCATTCCTTTTTCCCCTGTTCAATGAAGTAAACCAGAAGCTG
TTCTG

QA 6 730 6 730
DS 

RD RS1AV06JQ 782 0 0
GG
AAAACAATAAGCTCAAATAAAGAACCAACATGAAACAAGGTCAAAGTAAATGATAAGACT
ATCAATGAGTCACCTCTCTCCGCTCCAAAGAAATGTAATAAAATGTGTCCTTAAACCAAA
AATGACTCACCTAAAAGACCCCCCAAAGAATATTACAAACAAAAGTACGAGAGATTATTA
TCCACACATACCTATAAAATCAAACAACGAAAAAAACATTCCGACGAATACCACCGTGGT
AGAGATTGCTCAACTGATTACTTGAACGGATAGCTTTTGTTTCTGATAGTCTTAGTAGCC
GCCCATCGGTGGCATTCCATATGGTGGCATCGGAGGCATTCCTGGCATTCCACCCATCGG
TGGTGGCGGACCATAACCGCCTCCCATACCTGGACCTCCTCCCATTCCTGGCACCGGTGG
TGCAGGTAGAGCCAGTGGCAATAATTGTGCGTACATGTTCTGTTGGGACATGACATCCTT
CTCTTCCTGCTCTTTGGCCTTCACTTCTTTCTGTGCCTCTATCTTGTCCTTGATCAGTTC
ATCCACTTTGCCAGAATATTCTCGGATAAACTGGAGGAGATACGGGAAGGCAAAGTCAAT
CATGTTATTGATCCAAGCAAGTTCTAGAGCAGCATCTGGTCGGATTAAGTCATAACACAC
AAATAGACATGTGGCAAGGCATTCCTTTTTCCCCTGTTCAATGAAGTAAACCAGAAGCTG
TTCTGCAAGGTCATGGTCGCCGGATTGTGAAGCAGTTTCCATACAGTCCTTGTACATGTT

QA 3 782 3 782
DS 



AS 1 4

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TCTCTCTCTCTCTCT****CAAGATGCAAATTTTCGTGAAAACTCTGACCGGCAAGACCA
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GACGCACCCTGGCCGATTACAACATCCAGAAGGAGTCAACTCTCCATCTCGTGCTTCGTC
TCCGTGGTGGTATGCAGATTTTCGTCAAGACCCTCACCGGCAAGACTATAACCTTGGAGG
TTGAGAGCTCTGACACGATCGACAATGTCAAAGCGAAGATCCAGGACAAGGAAGGGATTC
CTCCGGACCAGCAGAGGCTCATCTTCGCTGGGAAACAGCTCGAGGATGGTCGGACTTTGG
CGGATTACAACATCCAGAAGGAGTCTACTCTCCACTTGGTTCTTCGTCTTCGTGGTGGAA
GCTTCTGAGCGTTGTGATTGTGTGGTCTCTAAAGTGGTGTTGATGCACTTGGGAGATGAT
CTCTGTTTGCTTCTGCAAAAATGGATCTCTGTTTCCCTTTTATGTTTCAAGTTTAAATAA
TAATCCAAGTGCATTGTGAACCCTAAAATGGATCCTTTTTATGTTTTCTATCTCAGCTGT
TCTTCATTGATTACAGGATTGAGGAATGGATCCTTCTTTTGGATTCGTGTTTTGAATTC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A902JQ C 1
AF RS1FX65JQ C 219
AF RS1FX65TF U 1
AF RS1A902TF U 1
BS 1 75 RS1FX65TF
BS 76 79 RS1A902TF
BS 80 166 RS1FX65TF
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BS 168 728 RS1FX65TF
BS 729 779 RS1A902JQ

RD RS1A902JQ 779 0 0
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QA 1 779 1 779
DS 

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G

QA 1 510 1 510
DS 

RD RS1FX65TF 728 0 0
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CGGATTACAACATCCAGAAGGAGTCTACTCTCCACTTGGTTCTTCGTCTTCGTGGTGGAA
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CTCTGTTTGCTTCTGCAAAAATGGATCTCTGTTTCCCTTTTATGTTTCAAGTTTAAATAA
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TCTTCATT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1A902TF 735 0 0
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TCTCTCTCTCTCTCT****CAAGATGCAAATTTTCGTGAAAACTCTGACCGGCAAGACCA
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TCCGTGGTGGTATGCAGATTTTCGTCAAGACCCTCACCGGCAAGACTATAACCTTGGAGG
TTGAGAGCTCTGACACGATCGACAATGTCAAAGCGAAGATCCAGGACAAGGAAGGGATTC
CTCCGGACCAGCAGAGGCTCATCTTCGCTGGGAAACAGCTCGAGGATGGTCGGACTTTGG
CGGATTACAACATCTAGAAGGAGTCTACTCTCCACTTGGTTCTTCGTCTTCGTGGTGGAA
GCTTCTGAGCGTTGTGATTGTGTGGTCTCTAAAGTGGTGTTGATGCACTTGGGAGATGAT
CTCTGTTTGCTTCTGCAAAAATGGATCTCTGTTTCCCTTTTATGTTTCAAGTTTAAATAA
TAATCCAAGTGCATTGTGAACCCTAAAATGGATCCTTTTTATGTTTTCTATCTCAGCTGT
TCTTCATT
GATTACA

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 3

CO CL2906Contig1 1014 3 5 U
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ATAAGATGACAGTGGCAATGATCCATACAATACAATAACAACTCAAAATAATGTGGTAAG
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ATTGGCTGGAGTGAAAGGATGAATTCCAATACGACCGTTGGTCACATTCCCGCCGATCTG
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AAACGCCGGTGAGATGAGAGAGACGAGACAAGTAAAGGCTAAGACAAGAAGAAGAAAAGA
ATGAGAAGCCATGGCTAAGTTCTGGTCTGGACGTCTGGATTTGATAAGACACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CW58JQ U 1
AF RS1FS90JQ U 38
AF RS1CW58TF C 507
BS 1 105 RS1CW58JQ
BS 106 106 RS1FS90JQ
BS 107 678 RS1CW58JQ
BS 679 866 RS1FS90JQ
BS 867 1014 RS1CW58TF

RD RS1CW58JQ 678 0 0
GTGAATCTGTGGAACTAGGCCACTAATGAGCGGGACTAGGAACGCAGCTATTTTGAGTAA
ATAAGATGACAGTGGCAATGATCCATACAATACAATAACAACTCAGAATAATGTGGTAAG
AGAAGGTAAGGTGAAAAAAGAAAAAAAAAGTAAATGACCTAAGTCTAGAAAGTATGGAGC
TCATTATTGATTTATTTTGCTAGAAAGAGAAATGTAGATAGAGAAAGATCACCTTCACGA
AACAAAAATACTACCCAACAAAGCAAATGCTCCCAAACTGATCCCGAAATTTACGTTAGT
CGTCATCGAACCCGTGTTCCCTGGACCTCCCGCCTGTCCTGGAGTGTTCGAGGCACCACC
TCCGGGAGCAGCAGCAGGAGCGTCAGAACCAGAAAATCGCAGCACAGCTGTAGACTTCAG
ATTGGCTGGAGTGAAAGGATGAATTCCAATACGACCGTTGGTCACATTCCCGCCGATCTG
CCACACCTGGTTCACGCTATCCTCTCCCGCCGAAACCTTAACCGAGGTGCGAATCACGAC
CCTATTCCCGGTCAAGACTTCGACACGTTGATCCCAAAATTCGAAGGCAAGTCTCCCTTC
AACGAGACTGCTACCAGTAATGCCACTGATGTTGTACGTCTTCAAGACGGGAGCCTCGCC
GGGTCCGGATCTGAGTGC

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1FS90JQ 829 0 0
CGA
AACGCAGCTATTTTGAGTAAATAAGATGACAGTGGCAATGATCCATACAATACAATAACA
ACTCAAAATAATGTGGTAAGAGAAGGTAAGGTGAAAAAAGAAAAAAAAAGTAAATGACCT
AAGTCTAGAAAGTATGGAGCTCATTATTGATTTATTTTGCTAGAAAGAGAAATGTAGATA
GAGAAAGATCACCTTCACGAAACAAAAATACTACCCAACAAAGCAAATGCTCCCAAACTG
ATCCCGAAATTTACGTTAGTCGTCATCGAACCCGTGTTCCCTGGACCTCCCGCCTGTCCT
GGAGTGTTCGAGGCACCACCTCCGGGAGCAGCAGCAGGAGCGTCAGAGCCAGAAAATCGC
AGCACAGCTGTAGACTTCAGATTGGCTGGAGTGAAAGGATGAATTCCAATACGACCGTTG
GTCACATTCCCGCCGATCTGCCACACCTGGTTCACGCTATCCTCTCCCGCCGGAACCTTA
ACCGAGGTGCGAATCACGACCCTATTCCCGGTCAAGACTTCGACACGTTGATCCCAAAAT
TCGAAGGCAAGTCTCCCTTCAACGAGACTGCTACCAGTAATGCCACTGATGTTGTACGTC
TTCAAGACGGGAGCCTCGCCGGGTCCGGATCTGAGTGCGACGAAGGCTTGAGAACCGGCC
ATCCCAGTCCCCGTGGGGTTGATAGCCCAAGCGATCCAGCCGCTGGGTCGAGCTGGAGTG
GCGACGAAAGCGATGGAGAGAGATGAGTTGGTTGCATTGTATGTGTAGTGGAGGTAGGAG
TCGAGTACCGGTAGGTCTAAGCAAGTCTGAAATGGAGTTTTCTCGG

QA 4 829 4 829
DS 

RD RS1CW58TF 508 0 0
CCGCCGAAACCTTAACCGAGGTGCGAATCACGACCCTATTCCCGGTCAAGACTTCGACAC
GTTGATCCCAAAATTCGAAGGCAAGTCTCCTTTCAACGAGACTGCTACCAGTAATGCCAC
TGATGTTGTACGTCTTCAAGACGGGAGCCTCGCCGGGTCCGGATCTGAGTGCGACGAAGG
CTTGAGAACCGGCCATCCCAGTCCCCGTGGGGTTGATAGCCCAAGCGATCCAGCCGCTGG
GTCGAGCTGGAGTGGCGACGAAAGCGATGGAGAGAGATGAGTTGGTTGCATTGTATGTGT
AGTGGAGGTAGGAGTCGAGTACCGGTAGGTCTAAGCAAGTCTGAAATGGAGTTTTCTCGG
TGGTGAGTATGTTCTGTGTAGAGCAAGTTTGTGAAAACGCCGGTGAGATGAGAGAGACGA
GACAAGTAAAGGCTAAGACAAGAAGAAGAAAAGAATGAGAAGCCATGGCTAAGTTCTGGT
CTGGACGTCTGGATTTGATAAGACACCC

QA 1 508 1 508
DS 



AS 1 4

CO CL2907Contig1 741 4 12 U
GGATTGGAACTCTTCGGTTCTATCTCTCTCTATACCCTTGAAAGCAGCAGCACGACTCAA
AGAGGAAGAGAGGAAGAGAGATGGATCCAGACGCGGTAGCCAAGGCCTTCGTGGAGCACT
ACTACACCACCTTCGACGCGAATCGCGCAGGCCTTGTTTCTCTCTACCAGGAAGGATCGA
TGTTGACCTTCGAAGGGCAGAAGATCCAGGGCTCTCAGAACATCGTCGCCAAGCTCACCA
GCCTCCCCTTCCAGCAGTGCAAGCACAACATCACCACCGTCGATTGCCAGCCCTCTGGTC
CTGCAGGCGGTATGCTCGTCTTCGTCTCCGGTAACCTCCAGCTCGCCGGCGAACAGCACG
CTCTCAAGTTCAGCCAGATGTTCCATTTGGTGTCGAACCAGGGAAACTACTACGTGTTCA
ACGACATATTCAGGTTGAACTATGCTTGAGGAGTGGGGTGGCAATGGCTGGATCGTTATA
AAAGCCAAAAGAGACTGATGGTATCATGGGGGTTATTAGTTCATGTTGGTTTTAGTAGAT
TGGAGAACTTAAAAGCTTGTTTTTAGGTGTCTTTGCTGTCTGTCTTTTATTTTAATCAAT
GGAAGGTCTTTGTTACTTTGGTTGAGATGATGACTCTGTTTGTTATCTAGCATTGATCCA
TGATTCAGTAAGGTGCTTATTGGTTCTCTGTTGGAATCCTTTTACGTATTGAAAAGTTTG
CTTAAACAACTATTCTTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DG06TF U 4
AF RS1DG06JQ C 321
AF RS1DH75JQ C 1
AF RS1DH75TF U 34
BS 1 5 RS1DH75JQ
BS 6 491 RS1DG06TF
BS 492 492 RS1DH75TF
BS 493 566 RS1DG06TF
BS 567 567 RS1DH75TF
BS 568 586 RS1DG06TF
BS 587 672 RS1DH75TF
BS 673 673 RS1DH75JQ
BS 674 695 RS1DH75TF
BS 696 696 RS1DH75JQ
BS 697 733 RS1DH75TF
BS 734 741 RS1DH75JQ

RD RS1DG06TF 583 0 0
GG
GGAACTCTTCGGTTCTATCTCTCTCTATACCCTTGAAAGCAGCAGCACGACTCAAAGAGG
AAGAGAGGAAGAGAGATGGATCCAGACGCGGTAGCCAAGGCCTTCGTGGAGCACTACTAC
ACCACCTTCGACGCGAATCGCGCAGGCCTTGTTTCTCTCTACCAGGAAGGATCGATGTTG
ACCTTCGAAGGGCAGAAGATCCAGGGCTCTCAGAACATCGTCGCCAAGCTCACCAGCCTC
CCCTTCCAGCAGTGCAAGCACAACATCACCACCGTCGATTGCCAGCCCTCTGGTCCTGCA
GGCGGTATGCTCGTCTTCGTCTCCGGTAACCTCCAGCTCGCCGGCGAACAGCACGCTCTC
AAGTTCAGCCAGATGTTCCATTTGGTGTCGAACCAGGGAAACTACTACGTGTTCAACGAC
ATATTCAGGTTGAACTATGCTTGAGGAGTGGGGTGGCAATGGCTGGATCGTTATAAAAGC
CAAAAGCGACTGATGGTATCATGGGGGTTATTAGTTCATGTTGGTTTTAGTAGATTGGAG
AACTTAAAAGCTTGTTTTTAG*TGTCTTTGCTGTCTGTCTT

QA 3 583 3 583
DS 

RD RS1DG06JQ 342 0 0
TTCGTCTCCGGTAACCTCCAGCTCGCCGGCGAACAGCACGCTCTCAAGTTCAGCCAGATG
TTCCATTTGGTGTCGAACCAGGGAAACTACTACGTGTTCAACGACATATTCAGGTTGAAC
TATGCTTGAGGAGTGGGGTGGCAATGGCTGGATCGTTATAAAAGCCAAAAGCGACTGATG
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TTTTAGGTGTCTTTGCTGTCTGTCTTTTATTTTAATCAATGGAAGGTCTTTGTTACTTTG
GTTGAGATGATGACTCTGTTTGTTATCAAGCATTGATCCA
CC

QA 1 340 1 340
DS 

RD RS1DH75JQ 741 0 0
GGATTGGAACTCTTCGGTTCTATCTCTCTCTATACCCTTGAAAGCAGCAGCACGACTCAA
AGAGGAAGAGAGGAAGAGAGATGGATCCAGACGCGGTAGCCAAGGCCTTCGTGGAGCACT
ACTACACCACCTTCGACGCGAATCGCGCAGGCCTTGTTTCTCTCTACCAGGAAGGATCGA
TGTTGACCTTCGAAGGGCAGAAGATCCAGGGCTCTCAGAACATCGTCGCCAAGCTCACCA
GCCTCCCCTTCCAGCAGTGCAAGCACAACATCACCACCGTCGATTGCCAGCCCTCTGGTC
CTGCAGGCGGTATGCTCGTCTTCGTCTCCGGTAACCTCCAGCTCGCCGGCGAACAGCACG
CTCTCAAGTTCAGCCAGATGTTCCATTTGGTGTCGAACCAGGGAAACTACTACGTGTTCA
ACGACATATTCAGGTTGAACTATGCTTGAGGAT**GGGTGGCAATGGCTGGATCTTTATA
AAAGCCAAAAGAGACTGATGGTATCATGGGGGTTATTAGTTCATGTTGGTTTTAGTAGAT
TGGAGAACTTAAAAGCTTGTTTTTAGGTGTCTTTGCTGTCTGTCTTTTATTTTAATCAAT
GGAAGGTCTTTGTTACTTTGGTTGAGATGATGACTCTGTTTGTTATCTAGCATTGATCCA
TGATTCAGTAAGGTGCTTATTGGTTCTCTGTTGGAATCCTTTTACGTATTGAAAAGTTTG
CTTAAACAACTATTCTTTTCG

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1DH75TF 700 0 0
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CGGTAGCCAAGGCCTTCGTGGAGCACTACTACACCACCTTCGACGCGAATCGCGCAGGCC
TTGTTTCTCTCTACCAGGAAGGATCGATGTTGACCTTCGAAGGGCAGAAGATCCAGGGCT
CTCAGAACATCGTCGCCAAGCTCACCAGCCTCCCCTTCCAGCAGTGCAAGCACAACATCA
CCACCGTCGATTGCCAGCCCTCTGGTCCTGCAGGCGGTATGCTCGTCTTCGTCTCCGGTA
ACCTCCAGCTCGCCGGCGAACAGCACGCTCTCAAGTTCAGCCAGATGTTCCATTTGGTGT
CGAACCAGGGAAACTACTACGTGTTCAACGACATATTCAGGTTGAACTATGCTTGAGGAT
**GGGTGGCAATGGCTGGATCTTTATAAAAGCCAAAAGAGACTGATGGTATCATGGGGGT
TATTAGTTCATGTTGGTTTTAGTAGATTGGAGAACTTAAAAGCTTGTTTTTAGGTGTCTT
TGCTGTCTGTCTTTTATTTTAATCAATGGAAGGTCTTTGTTACTTTGGTTGAGATGATGA
CTCTGTTTGTTATCTAGCATTGATCCATGATTCAGTAAG*TGCTTATTGGTTCTCTGTTG
GA*TCCTTTTACGTATTGAAAAGTTTGCTTAAACAACTAT

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 4

CO CL2908Contig1 705 4 9 U
GGAAAAACTCAGAAAGAGATAGAGGGGCCAAAAAATGGCGGATGAATCTCCACAGTCTAT
CTACGACTTCACCGTCAAGGATATCTCAGGTAACGATGTGAGTTTGAGCCAATTCAAAGG
CAAAACTCTTCTGATTGTAAACGTTGCCTCCAAATGTGGACTGACGGATGCGAACTACAA
GGAACTCAATGTTTTGTACGAAAAATACAAGGAACAAGGGTTGGAGATATTAGCATTTCC
ATGCAATCAGTTTTTGGGACAAGAACCAGGAAACAATGAAGAGATTCAGCAAACTGTCTG
CACAAGGTCCAAAGCTGAGTTCCCCATCTTTGACAAGGTAGATGTGAACGGGAAGAACAC
GGCCCCGTTATACAAATACTTGAAAGCAGAGAAAGGAGGATTGCTCATTGACGCAATCAA
ATGGAACTTCACAAAGTTCTTGGTTTCTCCTGACGGCAAAGTCTCCCAGA*GATATTCTC
CCAGAACCTCTCCTCTTCAATTCGAGAAAGACATTCAAGCTCTGCTGGGACGGGCTTCTT
CTTGAATCATCATCTGAAGTTTCAAGAACGGGTTTATCTATTTATTAAACGTTTCTACAT
TTGGTCCAAATGTTTGTTCTTAAGAATCCGCAACTTTGCGAACTTGTTTTTCTCTTAATC
CTTTTGACCGTATCTTTAAATAAAAATGTTCATTGATAAGAAATT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EF05JQ C 1
AF RS1EB47JQ C 1
AF RS1EF05TF U 114
AF RS1EB47TF U 1
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BS 114 163 RS1EF05TF
BS 164 164 RS1EB47TF
BS 165 308 RS1EF05TF
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BS 310 470 RS1EF05TF
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DS 

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TCTACATTTGGTCCAAATGTTTGTTCTTAAGAATCCGCAACTTTGCGAACTTGTTTTTCT
CTTAATCCTTTTGACCGTATCTTT

QA 1 564 1 564
DS 

RD RS1EB47TF 705 0 0
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CTACGACTTCACCGTCAAGGATATCTCAGGTAACGATGTGAGTTTGAGCCAATTCAAAGG
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GGCCCCGTTATACAAATACTTGAAAGCAGAGAAAGGAGGATTGCTCATTGACGCAATCAA
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CCAGAACCTCTCCTCTTCAATTCGAGAAAGACATTCAAGCTCTGCTGGGACGGGCTTCTT
CTTGAATCATCATCTGAAGTTTCAAGAACGGGTTTATCTATTTATTAAACGTTTCTACAT
TTGGTCCAAATGTTTGTTCTTAAGAATCCGCAACTTTGCGAACTTGTTTTTCTCTTAATC
CTTTTGACCGTATCTTTAAATAAAAATGTTCATTGATAAGAAATT

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 4

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AATAATAGAGCAAGAATTCTCTTGTTTTAATCTTATCTATCCATACTTGTTTTTGTGTGT
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AAAGAAGCATATGTGTTTAAT


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B224TF U 1
AF RS1BP46TF U 6
AF RS1BP46JQ C 6
AF RS1B224JQ C 59
BS 1 31 RS1B224TF
BS 32 32 RS1BP46TF
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DS 

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GG
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AAAGTTCAGTCTTTTAAAGTGCTATAAA

QA 3 630 3 630
DS 

RD RS1BP46JQ 774 0 0
GG
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GGCGGAAGAAGTATCTAGTTTGGTCGGAATCATTGAGACCTCCGTGGAGATAAAATCTTC
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ATCCTTCGTTCAAGGCTGTGAGCTGCATGAAGGCGAAATGGGCCAAGTTGGTTCTGTCGT
AACCTGGAATTACTTTCATGATGGGGAGGCAAGAGTACTGAAAGAGAGGATCGAGTCAAT
AGACCCGGAGAACAATCGGGCCACGTACAGGGTGTTAGAGGGTGATTTAATGAACGAGTA
CAAGAGTTTCTTGATCACCTTTCAAGTGACCCCTAAGGAGGGAGAGCCTGGAAGTGTTGT
ACATTGGCACTTTGAGTACGAGAAAATTAATGAGGAGGTGGCTCACCCTGAGACTCTCCC
CCAGTTTGCCGTCGAGGTCTCTAAAGAGCTCGATGCACATCTCTTGTCCGAAGAATAATA
GAGCAAGAATTCTCTTGTTTTAATCTTATCTATCCATACTTGTTTTTGTGTGTTTGCCTT
AAAGTTCAGTCTTTTAAAGTGCTATAAATAAGGACTAAGGAGCCGTCTTGTCCGAGTTTG
TATAAAGATATTTGTGTTATGTGAGTGTTTGGAAGTTGTTACTTTTGAGCAGCCGAGTGT
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QA 3 774 3 774
DS 

RD RS1B224JQ 743 0 0
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TGCATCTCCATCCTTCGTTCAAGGCTGTGAGCTGCATGAAGGCGAAATGGGCCAAGTTGG
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AAGTGTTGTACATTGGCACTTTGAGTACGAGAAAATTAATGAGGAGGTGGCTCACCCTGA
GACTCTCCTCCAGTTTGCCGTCGAGGTCTCCAAAGAGCTCGATGCACATCTCTTGTCCGA
AGAATAATAGAGCAAGAATTCTCTTGTTTTAATCTTATCTATCCATACTTGTTTTTGTGT
GTTTGCCTTAAAGTTCAGTCTTTTAAAGTGCTATAAATAAGGACTAAGGAGCCGTCTTGT
CCGAGTTTGTATAAAGATATTTGTGTTATGTGAGTGTTTGGAAGTTGTTACTTTTGAGCA
GCCGAGTGTAGCAGCATCAGCTATGAGCTACTCAAAATTGATGTATGAAATGTTTGTTGA
TAAAAGAAGCATATGTGTTTAAT

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 4

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CTCAGTTACTAGTACTATTACTCATCTATGGCCAGAGACGGTGGCGTTTCTTGCCTACGG
AGTTCAGAGATGATGAGCGTCGGTATCGGAAAAATGGAATCTCCGCCGTTGGAGTTAGAT
GAAGTTCATGTCCTGGCCGTTGATGACAGCCTCGTTGATCGGATTGTCATCGAGAGATCG
CCTCGTATTACTTCCTGCAAAGTCACGGCGGTAGATAGCGGATGGCGTGCTCTGGAGTTT
CTAGGACTAGACAACGAGAAAGCATCTGCAGAACTAGATAGATTGAAAGTTGATTTGATC
ATCACTGATTACTGTATGCCTGGAATGACTGGCTACGAGCTCCTCAAAAAGATAAAGGAA
TCGTCCAGTTTCCGACAAGTTCCGGTTGTAATAATGTCGTCAGAGAATGTCTTAACCAGA
ATCGACAGATGTCTTGAGGAAGGTGCGGAGGACTTCTTATTAAAACCGGTGAAACTCGCC
GACGTGAAGCGCCTGAGAAGCTATTTAAACAGAGACGTTAAACTTTCCAACGCAAACAAA
CGGAAGCTTCCGGAACATTCTGTTCCCATTCAAACCTCGCTTCCTCCTCCATCGTCGCCT
GATTCGTCGGACTCTTCTCCACCGTCGACTAGCTCGCCTGAATCTTCGGAGTCTTCTCCG
CCGGTGACTATCTCGCCTGAAACGTCGGACTCTTCTCCGCCGTTATCTCCCGTGGAGATA
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CCGGATTCTTCGCCGACGCCGGAGGAATCGCCGGTACGACGGCAGAAGATGGGAAGTCCC
GGATTATTATTAGATTAATAAAGCTTGTTTTTTACTTAATCGTGTAATATTTATCTCCGT
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TAGATTTCCTTTAATCTAGCCCCACGTGGGCTTTTTTGTTTTTAAAAGCTTTTCGAATTT
TCCTATAATGATTTTAAAGG


BQ
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10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GF52TF U 1
AF RS1D410TF U 62
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AF RS1GF52JQ C 909
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GG
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GACAGATGTCTTGAGGAAGGTGCGGAGGACTTCTTATTAAAACCGGTGAAACTCGCCGAC
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TCTGTTCCCATTCAAACCTCGCTTCCTCCTCCATCGTCGCCTGATTCGTCGGACTCTTCT
CCACCGTCGACTAGCTCGCCTGAATCTTCGGAGTCTTCTCCGCCGGTGACTATCTCGCCT
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AC

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TAATCTAGCCCCACGTGGGCTTTTTTGTTTTTAAAAGCTTTTCGAATTTTCCTATAATGA
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DS 



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CCTTTAATATACATGGAATAGTTCCTATGCGTTTGAGAGTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1FA07TF U 1
AF RS1FA07JQ C 43
AF RS1AF42TF U 53
AF RS1AF42JQ C 582
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QA 1 561 1 561
DS 

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CTTTTCGTCTTTGCTCCTAGCTATCTCTGTCTTCACACGTTGAGTGATTTCTCTTTTTTT
TTT*CTTTCCTCATTTCTCACTCTAGATCAGTCATGCCTCCATCTTCACACGTCGTTTCT
CATTTTTTCTTTTCTTTTTCCCCCTTTGGTTATATAACTTCACACGTCGAATGACATCCC
GAGAATTGTTTAGATTTTTAAGGAATATAACGTTAGAAAACCTTGGTTGTTACGCCGAAG
TTGCTTCGATCGTTTCTTAAAACACATGTGTTTATAGTAGAATTCGAAAGTTACAGCCAT
AGTCATCGCTACATGAAACTCAAGTTGCTTCTCGTTGACAATTAAATTGAAGGTGAAGGT
GATAACTCGCAACATACTATCCGAGTTGTATTTTCTATTCGAAAGTGATCGAGAAAGAAA
GAAGCTCAAGTTTGGTTCAAAACAGATTGTTCCAGTGATATTCTTGATGATTCGAGACAT
GAAGAATAAGCTCGAGTAAAAAATGATGTCCCGGAAATTGTTTAAATTTTTAAGGAAAAT
AACGTTTGCATTAGATGCATAATTTGGAGATAAATATTCTTTGCGTGACATGTAGATGAT
TTCTTAAATAAAAGCTTTTCA
CG

QA 1 741 1 741
DS 

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ATTAAGTGAATCTCCATATAATAATCTCCCACACTCATATCTGATCGGGATCTTTCTCTT
GAAATTCCATCTCAAACTGTGTACTTCTTCTTCT***CCACCTTTGTTTCCTTTTTGTCT
TTGCTCCTAGCTATCTCTGTCTTCACACGTTGAGTGATTTCTCTTTTTTTTTTTCTTTCC
TCATTTCTCACTCTAGATCAGTCATGCCTCCATCTTCACACGTCGTTTCTCATTTTTTCT
TTTCTTTTTCCCCCTTTGGTTATATAACTTCACACGTCGAATGACATCCCGAGAATTGTT
TAGATTTTTAAGGAATATAACGTTAGAAAACCTTGGTTGTTACGCCGAAGTTGCTTCGAT
CGTTTCTTAAAACACATGTGTTTATAGTAGAATTCGAAAGTTACAGCCATAGTCATCGCT
ACATGAAACTCAAGTTGCTTCTCGTTGACAATTAAATTGAAGGTGAAGGTGATAACTCGC
AACATACTATCCGAGTTGTATTTTCTATTCGAAAGTGATCGAGAAAGAAAGAAGCTCAAG
TTTGGTTCAAAACAGATTGTTCCAGTGATATTCTTGATGATTCGAGACATGAAGAATAAG
CTCGAGTAAAAAATGATGTCCCGGAAATTGTTTAAATTTTTAAGGAAAATAACGTTTGCA
TTAGATGCATAATTTGGAGATAAATATTCTTTGCGTGACATGTAGATGATTTCTTAAATA
AAAGCTTTTCATGAAATCACGTCAGACATTGTCAATTCACCGTT

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1AF42JQ 301 0 0
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TGAAGAATAAGCTCGAGTAAAAAATGATGTCCCGGAAATTGTTTAAATTTTTAAGGAAAA
TAACGTTTGCATTAGATGCATAATTTGGAGATAAATATTCTTTGCGTGACATGTAGATGA
TTTCTTAAATAAAAGCTTTTCATGAAATCACGTCAGACATTGTCAATTCACCGTTAAAAA
AACTCTTAAAAATGCTTCTCCTTTAATATACATGGAATAGTTCCTATGCGTTTGAGAGTA
A

QA 1 301 1 301
DS 



AS 1 4

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CGTCAAGGAGATACTCATCACCTCTAAGCTATTATCAGGTCTAGTAGAAGTTTGCAACAT
GCAATAAATACACAAAACGAAAGTAACAATAGATAAACATCACACTAGTTCCATTACACA
TACCACCATCAAATCAAACACATGGAGTAGAGTTTCACATTCACTTATTATTTTAACGAG
ACTCTTAATTATCACGTAGAATGCGATTGTGTTTAATAGACAATCTCAGGTATGAAAACT
AAACATCGTGAAGGTGGTTGAAGGACTCCAACTTCTTGAGATTCTCCCAGGCCTTCTCCA
AAACCTTGGCCTCGTACACCTTCTTCTTCTCGCCATCAGCCACCTCCACAGTCAGATGGT
GCATCGTTCCAGCTACAACCTGCGTTTTCGCACCGATGAGCCTCCTATACTCCAGACTCA
CGTTCTCCTTCTTGTTGTGCTCATCGACAGCGAAACGAGCGAGACTCTCGACTTGAAGAT
CGTTTGCATTTGGATCGACATCGCGAACTCCTCCCAAAACTGTTCCTCCTTGTTGATCCG
TCATTATCGCCTCTTTGATTGTATTTGCTTCGTAAATCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DA31JQ U 1
AF RS1DA31TF C 2
AF RS1D615JQ U 130
AF RS1D615TF C 130
BS 1 162 RS1DA31JQ
BS 163 163 RS1D615JQ
BS 164 517 RS1DA31JQ
BS 518 639 RS1D615JQ

RD RS1DA31JQ 517 0 0
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CGTCAAGGAGATACTCATCACCTCTAAGCTATTATCAGGTCTAGTAGAAGTTTGCAACAT
GCAATAAATACACAAAACGAAAGTAACAATAGATAAACATCATACTAGTTCCATTACACA
TACCACCATCAAATCAAACACATGGAGTAGAGTTTCACATTCACTTATTATTTTAACGAG
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AAACATCGTGAAGGTGGTTGAAGGACTCCAACTTCTTGAGATTCTCCCAGGCCTTCTCCA
AAACCTTGGCCTCGTACACCTTCTTCTTCTCGCCATCAGCCACCTCCACAGTCAGATGGT
GCATCGTTCCAGCTACAACCTGCGTTTTCGCACCGATGAGCCTCCTATACTCCAGACTCA
CGTTCTCCTTCTTGTTGTGCTCATCGACAGCGAAACG

QA 1 517 1 517
DS 

RD RS1DA31TF 631 0 0
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GTCAAGGAGATACTCATCACCTCTAAGCTATTATCAGGTCTAGTAGAAGTTTGCAACATG
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ACCACCATCAAATCAAACACATGGAGTAGAGTTTCACATTCACTTATTATTTTAACGAGA
CTCTTAATTATCACGTAGAATGCGATTGTGTTTAATAGACAATCTCAGGTATGAAAACTA
AACATCGTGAAGGTGGTTGAAGGACTCCAACTTCTTGAGATTCTCCCAGGCCTTCTCCAA
AACCTTGGCCTCGTACACCTTCTTCTTCTCGCCATCAGCCACCTCCACAGTCAGATGGTG
CATCGTTCCAGCTACAACCTGCGTTTTCGCACCGATGAGCCTCCTATACTCCAGACTCAC
GTTCTCCTTCTTGTTGTGCTCATCGACAGCGAAACGAGCGAGACTCTCGACTTGAAGATC
GTTTGCATTTGGATCGACATCGCGAACTCCTCCCAAAACTGTTCCTCCTTGTTGATCCGT
CATTATCGCCTCTTTGATTGTATTTGCTTC
C

QA 1 630 1 630
DS 

RD RS1D615JQ 510 0 0
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TATCACGTAGAATGCGATTGTGTTTAATAGACAATCTCAGGTATGAAAACTAAACATCGT
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CCTCGTACACCTTCTTCTTCTCGCCATCAGCCACCTCCACAGTCAGATGGTGCATCGTTC
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TCTTGTTGTGCTCATCGACAGCGAAACGAGCGAGACTCTCGACTTGAAGATCGTTTGCAT
TTGGATCGACATCGCGAACTCCTCCCAAAACTGTTCCTCCTTGTTGATCCGTCATTATCG
CCTCTTTGATTGTATTTGCTTCGTAAATCC

QA 1 510 1 510
DS 

RD RS1D615TF 510 0 0
ACACAAAACGAAAGTAACAATAGATAAACATCACACTAGTTCCATTACACATACCACCAT
CAAATCAAACACATGGAGTAGAGTTTCACATTCACTTATTATTTTAACGAGACTCTTAAT
TATCACGTAGAATGCGATTGTGTTTAATAGACAATCTCAGGTATGAAAACTAAACATCGT
GAAGGTGGTTGAAGGACTCCAACTTCTTGAGATTCTCCCAGGCCTTCTCCAAAACCTTGG
CCTCGTACACCTTCTTCTTCTCGCCATCAGCCACCTCCACAGTCAGATGGTGCATCGTTC
CAGCTACAACCTGCGTTTTCGCACCGATGAGCCTCCTATACTCCAGACTCACGTTCTCCT
TCTTGTTGTGCTCATCGACAGCGAAACGAGCGAGACTCTCGACTTGAAGATCGTTTGCAT
TTGGATCGACATCGCGAACTCCTCCCAAAACTGTTCCTCCTTGTTGATCCGTCATTATCG
CCTCTTTGATTGTATTTGCTTC
GTAGATCC

QA 1 502 1 502
DS 



AS 1 4

CO CL2913Contig1 1409 4 11 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGTTGTGATC
CATCTCCTCTTCATAATTCTCTTATATAAAGCTCTATTTTTAAGCTGAATCCATCATCCT
AAATAAAAAAAAACCTAATCTGCAAAAACTTTAACCATGGCAAAGATTGGATGAAAAGAA
TGCCATCAATCTATTTTTATTTTTTAAGATGCTAAAAGGGAACATTGAAAGGTGTTTCAG
CTCGTGGCAGGACACAAACAATATTAGCTCTTGCATCAAAGACGAGGCTGACCTCATGAT
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ATTGTTTGATTGTAGATATATTTTTGCAGGATGAGATTGTGATGGAAGTCAATGATCGAT
TTGCTAACACCACTTGTTTGTATGTTCATGTTGAGAGTTTAATTATCTCCTCGGCGTAAA
ACCATTAAGTGCCATGGCATCTCTGAAGCTTGAGAAGAATTGACACTAGAAGTGCTTGGT
CTCAGTTCACCAGTATTGGATGGATAGTCAAATCTCCATTTTCGTGGTCAGAAGTTAGGG
AGTTTAGATAAAGAAAGATGCTTCACAACATGGTAATATTCCTACAGGAATATGAACTAG
AGGGTTCTTATATAGAAGTTAGACGACGCGGTGTTATGTGCTCTGCGGTATCACGACACA
CATGCATTTGCATGTATGGTTCAATTGATTTCCACTGGTTTCTGGACGGTGTGCTCCAAG
ATTTGTTATCTTTGCAGGGTATAGGTAATATGCAGGTTTTGGAGGAACTAATGGAGTATT
TTGATGGCGACCTCGCCGTTACAAGATCTCTTGCCTCTTGGAGACTTCTCAGTAAAAAAG
GTGAACGCTCTTTGTCGTTCCTGATCACAGATCCGGATATTCTGCATAAGATGAGTAATT
GATTATGAGATGGGAAGTGATGACAATCCGGTATGCTGCTACATTCGCCATGCCAATTCT
CAGGAGACACGGTGACCCAAGAAGGTGTGTGATGGAACTTGAAGGGAAGCATGAAGGCTT
GAGTTGCTCTGCTTTACTCTGTCATCACCAACTCCTCACAGTAGAAGAATAATAATTTGT
GTTTCTTATGAATCTCGAGCCTGGTTGGTTATATGCGATTACTTTTGTATATATTTGTTT
GGTTGAGGTTCCATTGTTTATTCTGATGGAGAGTTTTAATAAAATTTGTATTTTCAATTC
ATGAATGTGTTCTTAGTTTATTATCTTATCTTTTTTGTTGAAACAGCTTCTCAGACTTGA
GATCAAGCTATTGTTTTACTATATCCATGTTGTATTTTGGAGATTCACTATGATTTTAAG
CTCTGTTTAATTATTCAGTTTATGTTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A219TF U 26
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AF RS1A219TR C 468
AF RS1A219JQ C 585
BS 1 814 RS1A219TV
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ATAAAGCTCTATTTTTAAGCTGAATCCATCATCCTAAATAAAAAAAAACCTAATCTGCAA
AAACTTTAACCATGGCAAAGATTGGATGAAAAGAATGCCATCAATCTATTTTTATTTTTT
AAGATGCTAAAAGGGAACATTGAAAGGTGTTTCAGCTCGTGGCAGGACACAAACAATATT
AGCTCTTGCATCAAAGACGAGGCTGACCTCATGATTTCTTCAGATTTTCATCCTAATCCA
AACCTTTTTTTTGAGAATTGTTATTTCCTTTTTAGATTGTTTGATTGTAGATATATTTTT
GCAGGATGAGATTGTGATGGAAGTCAATGATCGATTTGCTAACACCACTTGTTTGTATGT
TCATGTTGAGAGTTTAATTATCTCCTCGGCGTAAAACCATTAAGTGCCATGGCATCTCTG
AAGCTTGAGAAGAATTGACACTAGAAGTGCTTGGTCTCAGTTCACCAGTATTGGATGGAT
AGTCAAATCTCCATTTTCGTGGTCAGAAGTTAGGGAGTTTAGATAAAGAAAGATGCTTCA
CAACATGGTAATATTCCTACAGGAATATGAACTAGAGGGTTCTTATATAGAAGTTAGACG
ACGCGGTGTTATGTGCTCTGCGGTATCACGACACACATGCATTTGCATGTATGGTTCAAT
TGATTTCCACTGGTTTCTGGACGGTGTGCTCCAAGATTTGTTATCTTTGCACGGTA

QA 1 776 1 776
DS 

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CATCTCCTCTTCATAATTCTCTTATATAAAGCTCTATTTTTAAGCTGAATCCATCATCCT
AAATAAAAAAAAACCTAATCTGCAAAAACTTTAACCATGGCAAAGATTGGATGAAAAGAA
TGCCATCAATCTATTTTTATTTTTTAAGATGCTAAAAGGGAACATTGAAAGGTGTTTCAG
CTCGTGGCAGGACACAAACAATATTAGCTCTTGCATCAAAGACGAGGCTGACCTCATGAT
TTCTTCAGATTTTCATCCTAATCCAAACCTTTTTTTTGAGAATTGTTATTTCCTTTTTAG
ATTGTTTGATTGTAGATATATTTTTGCAGGATGAGATTGTGATGGAAGTCAATGATCGAT
TTGCTAACACCACTTGTTTGTATGTTCATGTTGAGAGTTTAATTATCTCCTCGGCGTAAA
ACCATTAAGTGCCATGGCATCTCTGAAGCTTGAGAAGAATTGACACTAGAAGTGCTTGGT
CTCAGTTCACCAGTATTGGATGGATAGTCAAATCTCCATTTTCGTGGTCAGAAGTTAGGG
AGTTTAGATAAAGAAAGATGCTTCACAACATGGTAATATTCCTACAGGAATATGAACTAG
AGGGTTCTTATATAGAAGTTAGACGACGCGGTGTTATGTGCTCTGCGGTATCACGACACA
CATGCATTTGCATGTATGGTTCAATTGATTTCCACTGGTTTCTGGACGGTGTGCTCCAAG
ATTTGTTATCTTTGCAGGGTATAGGTAATATGCACGTTTTGGAGGAACTAATGGAGTATT
TTGATGGCGACCTCGCCGTTACAAGATCTCTTGCCTCTTGGAGACTTCTCAGTAAAAAAG
*TGAACGCTCTTTGTCGTTCCTGATCACAGATCCG*ATATTCTGC

QA 1 945 1 945
DS 

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GTATCACGACACACATGCATTTGCATGTATGGTTCAATTGATTTCCACTGGTTTCTGGAC
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CTAATGGAGTATTTTGATGGCGACCTCGCCGTTACAAGATCTCTTGCCTCTTGGAGACTT
CTCAGTAAAAAAGGTGAACGCTCTTTGTCGTTCCTGATCACAGATCCGGATATTCTGCAT
AAGATGAGTAATTGATTATGAGATGGGAAGTGATGACAATCCGGTATGCTGCTACATTCG
CCATGCCAATTCTCAGGAGACACGGTGACCCAAGAAGGTGTGTGATGGAACTTGAAGGGA
AGCATGAAGGCTTGAGTTGCTCTGCTTTACTCTGTCATCACCAACTCCTCACAGTAGAAG
AATAATAATTTGTGTTTCTTATGAATCTCGAGCCTGGTTGGTTATATGCGATTACTTTTG
TATATATTTGTTTGGTTGAGGTTCCATTGTTTATTCTGATGGAGAGTTTTAATAAAATTT
GTATTTTCAATTCATGAATGTGTTCTTAGTTTATTATCTTATCTTTTTTGTTGAAACAGC
TTTTCAGACTT

QA 1 851 1 851
DS 

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TGGTCAGAAGTTAGGGAGTTTAGATAAAGAAAGATGCTTCACAACATGGTAATATTCCTA
CAGGAATATGAACTAGAGGGTTCTTATATAGAAGTTAGACGACGCGGTGTTATGTGCTCT
GCGGTATCACGACACACATGCATTTGCATGTATGGTTCAATTGATTTCCACTGGTTTCTG
GACGGTGTGCTCCAAGATTTGTTATCTTTGCAGGGTATAGGTAATATGCAGGTTTTGGAG
GAACTAATGGAGTATTTTGATGGCGACCTCGCCGTTACAAGATCTCTTGCCTCTTGGAGA
CTTCTCAGTAAAAAAGGTGAACGCTCTTTGTCGTTCCTGATCACAGATCCGGATATTCTG
CATAAGATGAGTAATTGATTATGAGATGGGAAGTGATGACAATCCGGTATGCTGCTACAT
TCGCCATGCCAATTCTCAGGAGACACGGTGACCCAAGAAGGTGTGTGATGGAACTTGAAG
GGAAGCATGAAGGCTTGAGTTGCTCTGCTTTACTCTGTCATCACCAACTCCTCACAGTAG
AAGAATAATAATTTGTGTTTCTTATGAATCTCGAGCCTGGTTGGTTATATGCGATTACTT
TTGTATATATTTGTTTGGTTGAGGTTCCATTGTTTATTCTGATGGAGAGTTTTAATAAAA
TTTGTATTTTCAATTCATGAATGTGTTCTTAGTTTATTATCTTATCTTTTTTGTTGAAAC
AGCTTCTCAGACTTGAGATCAAGCTATTGTTTTACTATATCCATGTTGTATTTTGGAGAT
TCACTATGATTTTAAGCTCTGTTTAATTATTCAGTTTATGTTAGC

QA 1 825 1 825
DS 



AS 1 3

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AAAACAAATCACATCAACTATCAACCTGAAGCCAAAGGAAAAGGAAAAGATAACAAAAGT
GAGAAGCAATGTCAAAAGTTTCCCTTATTAGATTGTCATTGTTTGGGTTCCTGGTGATCG
CTGTCGTCACTTCATTGGCGGAAGCTACAAGAAAGTCTGTCGTTCTGGGAGGGAAGTCAG
ATGTTCCGAATGTTCAGACCAACATGGAAATTCAAGAACTTGGAAGGTACTGCGTGGAGC
AATTCAACCTAATGGAAGAGAGTGAGCAAGGAAACGCAGCATCCATTGCGGACACCGCCG
TGTTGAATCCGTTGAATTTTAGCAGAGTTTTGTCGGCTCAGAAACAGGTCGTGGCTGGTC
TAAAATACAATCTAAGGATTGAAGTGACTCAACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTTGACT
CAGTTGTGATTATTCAACCATGGCTCCATTCGAAGAAGTTACTCGGTTTCACTCCCGTTG
CTACTCCTGTCTACTAACTTTATTTCTTTATTGGCCAAACAAGTTTCTATAATATAATCC
AAAAAGATCAAAAGTGTTCAATGATATGAAGCTATTAACAATGGTTTAATAGTTGGTTTT
GTAATGTTTCACGTTGTTCATAATGAAGACAAAAGATGTTATGAAGATGTGATGAGAGAC
TTGTTAGAATATATAATGCTAAATTTGTTCAATCAAAAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1FX92TF U 463
AF RS1EA21JQ C 1
AF RS1EA21TF U 1
BS 1 463 RS1EA21TF
BS 464 488 RS1FX92TF
BS 489 489 RS1EA21TF
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RD RS1FX92TF 241 0 0
G
GAGCAGGATGTTTGACTCAGTTGTGGTTATTCAACCATGGCTCCATTCGAAGAAGTTACT
CGTTTTCACTCCCGTTGCTACTCCTGTCTACTAACTTTATTTCTTTATTGGCCAAACAAG
TTTCTATAATATAATCCAAAAAGATCAAAAGTGTTCAATGATATGAAGCTATTAACAATG
GTTTAATAGTTGGTTTTGTAATGTTTCACGTTGTTCATAATGAAGACAAAAGATGTTATG

QA 2 241 2 241
DS 

RD RS1EA21JQ 734 0 0
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QA 1 734 1 734
DS 

RD RS1EA21TF 760 0 0
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AAAACAAATCACATCAACTATCAACCTGAAGCCAAAGGAAAAGGAAAAGATAACAAAAGT
GAGAAGCAATGTCAAAAGTTTCCCTTATTAGATTGTCATTGTTTGGGTTCCTGGTGATCG
CTGTCGTCACTTCATTGGCGGAAGCTACAAGAAAGTCTGTCGTTCTGGGAGGGAAGTCAG
ATGTTCCGAATGTTCAGACCAACATGGAAATTCAAGAACTTGGAAGGTACTGCGTGGAGC
AATTCAACCTAATGGAAGAGAGTGAGCAAGGAAACGCAGCATCCATTGCGGACACCGCCG
TGTTGAATCCGTTGAATTTTAGCAGAGTTTTGTCGGCTCAGAAACAGGTCGTGGCTGGTC
TAAAATACAATCTAAGGATTGAAGTGACTCAACCCGATGGCACGAGCAGGATGTTTGACT
CAGTTGTGATTATTCAACCATGGCTCCATTCGAAGAAGTTACTCGGTTTCACTCCCGTTG
CTACTCCTGTCTACTAACTTTATTTCTTTATTGGCCAAACAAGTTTCTATAATATAATCC
AAAAAGATCAAAAGTGTTCAATGATATGAAGCTATTAACAATGGTTTAATAGTTGGTTTT
GTAATGTTTCACGTTGTTCATAATGAAGACAAA*GATGTTATGAAGATGTGATGAGAGAC
TTGTTAGAATATATAATGCTAAATTTGTTCAATCAAAAAA

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 4

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AACATCTGAAACAACACCTACGTAAAGAGGTGAAACAAAAGTATGATAGGTCGGCTCAAA
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CTGTGCTCCAAGCTTCTCTTCAGCGACCTTCTCGGCCTTGGCTTTAAGTTTGTTAAGTTG
CTTCTTCCTCTCGTAAACCACTTGAGATCTCTCCTTCCTCTTTGCCTCCAGCTCCTTGAT
GGTGTCATAGTGATTCCACCCAACTTCAGAAGAAAGACGACCCAACAGACAGTACTTGTG
GCCAGCCTGAAGCCTCAACACCTTTAGAGCGTCGGGGATAACCATCCTCTTGACTTTGTC
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CGTTTTATGTGGAATCATACCGCGAACGGTACGCCAGAAGATCTTGGAGGGAGCACGGAA
GTGAATGGGACCGTGCGAGGGTTTGGTGTTCATGCGTTTGCGAAGGAACCTCATGTACTT
CATTTTCTGACGCACGAGTCCCCCGGAGAGGCAGATCTCCTCGCATCTCACGATGACGAC
CTTCTGGCCGTTGAGGAGCTCCTTGGCCACGATCGACGCCAGGCGACTGAGCATGTGGTG
CCGCGCGTCCACGACCACGTGCTTCGAGCAGATGCCTGATCCTGACACCATTTTCTTGTT
CTGCTCTCTGTGTGTTCC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1EW15JQ U 1
AF RS1EW15TF C 35
AF RS1BL35JQ U 8
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C
C

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C

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DS 

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GG
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GTGTGTT

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DS 

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DS 



AS 1 4

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TCCATCTTATTATTGCTATACTAACCACTGTCTGAGTCCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1FH39JQ U 1
AF RS1AZ75JQ U 82
AF RS1FH39TF C 139
AF RS1AZ75TF C 293
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TTGCTTA

QA 1 787 1 787
DS 

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G
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AACCACTGTCTGAGT

QA 2 796 2 796
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AAAAAGACAACCTTCACCTTATTGGAAGAATCGGAGCGATGGTGAGCGGAGATACGGAGA
CGGTCAACGTCGGGACGCTCGCCGTAAACAGTTCGAAAATCCTTGAGGGAGAGATTGATG
TCTTCGAGGGAGACTTCGTAGCCTCTGTCTCTGAGCATCTCCAAGGCGTTCCGCCGCGCT
AGATAGTATCTGTGAGACTCTTCGCTTGATGGATCCACGTATTTGCTTAGACAAGGACCC
GGGCCTGAACTCGAACTCGAACTCTTGTCGTTCCCTATCCCCTCCATCTTATTATTGCTA
TACTAACCACTGTCTGAGT
CCC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1AZ75TF 588 0 0
CCTCGATATTGTACTGCTTGAGAAGTGCTTTCTTCTCTCCATCATTCAGAACACGATGAA
GCAGGCTCAGTACATGCTCGGTTAGGTTGACTAGCAAGTCGGTTATCTGGAATATCTCGA
CCTTGAAAGTGAAAAGCTCAATGGCTTTCAAGGCTCTATCGGTTACTTGGTTTTGCAGAA
CCAGTATCAGCCCGGTTATGGTCTCTTGGCTAAGTATCTCTGCTGCAACACTGCGGATTG
TGTTGACTTTAACCTTACCGGTACCAAAAAAGACAACCTTCACCTTATTGGAAGAATCGG
AGCGATGGTGAGCGGAGATACGGAGACGGTCAACGTCGGGACGCTCGCCGTAAACAGTTC
GAAAATCCTTGAGGGAGAGATTGATGTCTTCGAGGGAGACTTCGTAGCCTCTGTCTCTGA
GCATCTCCAAGGCGTTCCGCCGCGCTAGATAGTATCTGTGAGACTCTTCGCTTGATGGAT
CCACGTATTTGCTTAGACAAGGACCCGGGCCTGAACTCGAACTCGAACTCTTGTCGTTCC
CTATCCCCTCCATCTTATTATTGCTATACTAACCACTGTCTGAGTCCC

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 4

CO CL2917Contig1 770 4 9 U
TTTTTACGATAAAAGGTGGCTAATGCACCTGCAAATGTAATTCCATTAACTTGGGTTCAC
ATCAGTTGTACTAAACTTCCTTGGATGATTACAATCACTGGGTTCTTCTTATCTCACTCT
AGTTCTTTCTTTCTTTTCAGGATGAATCAAGACACACACTGATTATCATATTAATTTATC
ACAACAACAAAAAGCAAAAGAAAAGTGTGCTCTCACTAGTTCAGTAGCGACCCGGTCTTG
GAGGGTTGATATCTAGCGCCGAACTCAGAACCCTTCTACTGTACTCCAAACCGGTTCCAT
TTGAAACCCCTGGCGGAGGTGGCTCTTGAGTGTAATCAAGAGGCATGGGAGAAGGTGAAG
ACATCAACTGTGACGAGAATCTCTCCGAATGGTGATGATCGAAACTCAGAGAATGAGGTC
TTGTCCTGTGAACGGAACCTGACTGTGCTTTGTCTTGTCCAGATATGGCGAATTTGAGAG
TTCGATTGAAGAGAGAGACAAGACCGGAGAAGAGCTTGACGGCGTAGTCGGCGATCTCTT
CAGTCTCATACTCTGCGAACGCGAAGCCTTTTGGTTTATCGGTTTCTTTATCGCGAGGGA
TGTGTAGATCGGTTACTCTCCCAGCTTGGATCAAGATGTCATACAACACCCTATCGCTTA
CTCGCTCGTCCAGGTTCCCTATGTAGACGGTACAGTTGGTGTTCCCCGACATGGAGTACC
CTAAAAAA*GAGGAGAAGATGAAAAGAGATGCTACTGTTTCCAAGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H408TF C 1
AF RS1H408JQB U 6
AF RS1FS14JQ U 21
AF RS1FS14TF C 104
BS 1 5 RS1H408TF
BS 6 410 RS1H408JQB
BS 411 411 RS1FS14JQ
BS 412 431 RS1H408JQB
BS 432 432 RS1FS14JQ
BS 433 488 RS1H408JQB
BS 489 489 RS1FS14JQ
BS 490 723 RS1H408JQB
BS 724 770 RS1FS14JQ

RD RS1H408TF 764 0 0
TTTTTACGATAAAAGGTGGCTAATGCAC*TGCAAATGTAATTCCATTAACTTGGGTTCAC
ATCAGTTGTACTAAACTTCCTTGGATGATTACAATCACTGGGTTCTTCTTATCTCACTCT
AGTTCTTTCTTTCTTTTCAGGATGAATCAAGACACACACTGATTATCATATTAATTTATC
ACAACAACAAAAAGCAAAAGAAAAGTGTGCTCTCACTAGTTCAGTAGCGACCCGGTCTTG
GAGGGTTGATATCTAGCGCCGAACTCAGAACCCTTCTACTGTACTCCAAACCGGTTCCAT
TTGAAACCCCTGGCGGAGGTGGCTCTTGAGTGTAATCAAGAGGCATGGGAGAAGGTGAAG
ACATCAACTGTGACGAGAATCTCTCCGAATGGTGATGATCGAAACTCAGAGAATGAGGTC
TTGTCCTGTGACCGGAACCTGACTGTGCTTTGTCTTGTCCAGATATGGCGAATTTGAGAG
TTCGATTGGAGAGAGAGACAAGACCGGAGAAGAGCTTGACGGCGTAGTCGGCGATCTCTT
CAGTCTCATACTCTGCGAACGCGAAGCCTTTTGGTTTATCGGTTTCTTTATCGCGAGGGA
TGTGTAGATCGGTTACTCTCCCAGCTTGGATCAAGATGTCATACAACACCCTATCGCTTA
CTCGCTCGTCCAGGTTCCCTATGTAGACGGTACAGTTGGTGTTCCCCGACATGGAGTACC
CTAAAAAAAGAGGAGAAGATGAAAAGAGATGCTACTGTTTCC
CC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1H408JQB 718 0 0
ACGATAAAAGGTGGCTAATGCACCTGCAAATGTAATTCCATTAACTTGGGTTCACATCAG
TTGTACTAAACTTCCTTGGATGATTACAATCACTGGGTTCTTCTTATCTCACTCTAGTTC
TTTCTTTCTTTTCAGGATGAATCAAGACACACACTGATTATCATATTAATTTATCACAAC
AACAAAAAGCAAAAGAAAAGTGTGCTCTCACTAGTTCAGTAGCGACCCGGTCTTGGAGGG
TTGATATCTAGCGCCGAACTCAGAACCCTTCTACTGTACTCCAAACCGGTTCCATTTGAA
ACCCCTGGCGGAGGTGGCTCTTGAGTGTAATCAAGAGGCATGGGAGAAGGTGAAGACATC
AACTGTGACGAGAATCTCTCCGAATGGTGATGATCGAAACTCAGAAAATGAGGTCTTGTC
CTGTGACCGGAACCTGACTGTGCTTTGTCTTGTCCAGATATGGCGAATTTGAGAGTTCGA
TTGGAGAGAGAGACAAGACCGGAGAAGAGCTTGACGGCGTAGTCGGCGATCTCTTCAGTC
TCATACTCTGCGAACGCGAAGCCTTTTGGTTTATCGGTTTCTTTATCGCGAGGGATGTGT
AGATCGGTTACTCTCCCAGCTTGGATCAAGATGTCATACAACACCCTATCGCTTACTCGC
TCGTCCAGGTTCCCTATGTAGACGGTACAGTTGGTGTTCCCCGACATGGAGTACCCTA

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1FS14JQ 750 0 0
TAATGCAC
CTGCAAACGTAATTCCATTAACTTGGGTTCACATCAGTTGTACTAAACTTCCTTGGATGA
TTACAATCACTGGGTTCTTCTTATCTCACTCTAGTTCTTTCTTTCTTTTCAGGATGAATC
AAGACACACACTGATTATCATATTAATTTATCACAACAACAAAAAGCAAAAGAAAAGTGT
GCTCTCACTAGTTCAGTAGCGACCCGGTCTTGGAGGGTTGATATCTAGCGCCGAACTCAA
AACCCTTCTACTGTACTCCAAACCGGTTCCATTTGAAACCCCTGGCGGAGGTGGCTCTTG
AGTGTAATCAAGAGGCATGGGAGAAGGTGAAGACATCAACTGTGACGAGAATCTCTCCGA
ATGGTGATGATCGAAACTCAAAGAATGAGGTCTTGTCCTGTGAACGGAACCTGACTGTGC
TTTGTCTTGTCCAGATATGGCGAATTTGAGAGTTCGATTGAAGAGAGAGACAAGACCGGA
GAAGAGCTTGACGGCGTAGTCGGCGATCTCTTCAGTCTCATACTCTGCGAACGCGAAGCC
TTTTGGTTTATCGGTTTCTTTATCGCGAGGGATGTGTAGATCGGTTACTCTCCCAGCTTG
GATCAAGATGTCATACAACACCCTATCGCTTACTCGCTCGTCCAGGTTCCCTATGTAGAC
GGTACAGTTGGTGTTCCCCGACATGGATTACCCTAAAAAA*GAGGAGAAGATGAAAAGAG
ATGCTACTGTTTCCAAGATTCC

QA 9 750 9 750
DS 

RD RS1FS14TF 667 0 0
TCTTCTTATCTCACTCTAGTTCTTTCTTTCTTTTCAGGATGAATCAAGACACACACTGAT
TATCATATTAATTTATCACAACAACAAAAAGCAAAAGAAAAGTGTGCTCTCACTAGTTCA
GTAGCGACCCGGTCTTGGAGGGTTGATATCTAGCGCCGAACTCAGAACCCTTCTACTGTA
CTCCAAACCGGTTCCATTTGAAACCCCTGGCGGAGGTGGCTCTTGAGTGTAATCAAGAGG
CATGGGAGAAGGTGAAGACATCAACTGTGACGAGAATCTCTCCGAATGGTGATGATCGAA
ACTCAGAGAATGAGGTCTTGTCCTGTGAACGGAACCTGACTGTGCTTTGTCTTGTCCAGA
TATGGCGAATTTGAGAGTTCGATTGAAGAGAGAGACAAGACCGGAGAAGAGCTTGACGGC
GTAGTCGGCGATCTCTTCAGTCTCATACTCTGCGAACGCGAAGCCTTTTGGTTTATCGGT
TTCTTTATCGCGAGGGATGTGTAGATCGGTTACTCTCCCAGCTTGGATCAAGATGTCATA
CAACACCCTATCGCTTACTCGCTCGTCCAGGTTCCCTATGTAGACGGTACAGTTGGTGTT
CCCCGACATGGATTACCCTAAAAAA*GAGGAGAAGATGAAAAGAGATGCTACTGTTTCC
AAGATTCC

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

CO CL2918Contig1 1082 2 4 U
ATCACAATAGGTACAGTGCAAGCAGAGGTGCTCATTTGAATCTCAAGAGAGCTGAAAAGG
CCAGGGTTCTGGTTAGCAAGATTCCTGCGATGGTTGACACATTGGTTGCCAAGATCAGAG
GTTGGGAAGAGGAACACTGCATGTCCTTTGCATACGATGGTGTTCCTCTGCTAGCTATGT
TAGATGAGTACGTTATGCTTAGGCAAGAACGAGAAGATGAGAAACGGAGGCTGAGGGAGC
AAAAGAAGGTTCAATAACAGCCACACGTAGAGCAAGACTCTGGGTTTAGCACCAGGCCAA
GCCCTGCAAGACCCGTCAGTGCTAAGAAACCTGTGGGGGCTCGAGCTAACAACGGAACAC
CAAACCGGCGTTTATCTTTGAATGCAAACCAGAATGGAAGCAGGTCTATTGCAAAAGAAG
GAGAGAGAAGAGGGAGTCTCAACAGGACGGCTGCTCCTACAAACTACGTTGCCATTTCGA
AAGAGGAAGCTGCTTCCTCTCCTGGTTCTGGTGCTGCAGATCATGTTCAAGCTTCACCGT
GAAGATGAGAAAGGAAAAGATCTCTATTTTTCTTTCTGTTTGTGAGTTGTTTTAGGGAGA
GAGAAAGTTATATGAAACACCGAGAGAAGACAGAAAAAGACGTTTGAGAGTAGAATGGTG
TAGTAGAAAGTGTATGTGTATGTTTTGTTAATGTGTTTTGTGAATGTTGTTTGCCGTGGA
ATATCAGAAAGTATCTTGTTGTGCCTGTGACAGAAAAACCGCCAAAACTGCATACATTTT
CTTTAGAGACTTGGCCTGAATCTGATTAATCTCAACTGAAACCTAGTTAGAAACTATGTC
AGTGGTGAGGAGTTTCTTCTGTTACATTATTTCAGACATATGTATTAGCATATGCTATTC
TTGCTTTGTTTAGTGTTTAGATATTTAATATGAGCATACAGCTCCATTTATAGATGAGCA
CAACTGCTAACTAATCTTGTCGGTGCGCATATGATTTGGTGCAAGTGATGCATTAATATG
AGATTGATATGTTAGTTTTGATTTGGAGTAACTCACAAGTAATTGATATTACATTTTTGA
TA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

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CCAGGGTTCTGGTTAGCAAGATTCCTGCGATGGTTGACACATTGGTTGCCAAGATCAGAG
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AAAAGAAGGTTCAATAACAGCCACACGTAGAGCAAGACTCTGGGTTTAGCACCAGGCCAA
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CAAACCGGCGTTTATCTTTGAATGCAAACCAGAATGGAAGCAGGTCTGTTGCAAAAGAAG
GAGAGAGAAGGGGGAGTCTCAACAGGCCGGCTGCTCCTACAAACTACGTTGCCATTTCGA
AAGAGGAAGCTGCTTCCTCTCCTGGTTCTGGTGCTGCAGATCATGTTCAAGCTTCACCGT
GAAGATGGGAAAGGAAAAGATCTCTATTTTTCTTTCTGTTTGTGAGTTGTTTTAGGGAGA
GAG**AGTTATATGAAACACCGAGAGAAGACAGAAAAAGACGTTTGAGAGTAGAATGGTG
TAGTAGAAAGTGTATGTGTATGTTTTGTTAATGTGTTTTGTG

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DS 

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GAAGAGGGAGTCTCAACAGGACGGCTGCTCCTACAAACTACGTTGCCATTTCGAAAGAGG
AAGCTGCTTCCTCTCCTGGTTCTGGTGCTGCAGATCATGTTCAAGCTTCACCGTGAAGAT
GAGAAAGGAAAAGATCTCTATTTTTCTTTCTGTTTGTGAGTTGTTTTAGGGAGAGAGAAA
GTTCTATGAAACACCGAGAGAAGACAGAAAAAGACGTTTGAGAGTAGAATGGTGTAGTAG
AAAGTGTATGTGTATGTTTTGTTAATGTGTTTTGTGAATGTTGTTTGCCGTGGAATATCA
GAAAGTATCTTGTTGTGCCTGTGACAGAAAAACCGCCAAAACTGCATACATTTTCTTTAG
AGACTTGGCCTGAATCTGATTAATCTCAACTGAAACCTAGTTAGAAACTATGTCAGTGGT
GAGGAGTTTCTTCTGTTACATTATTTCAGACATATGTATTAGCATATGCTATTCTTGCTT
TGTTTAGTGTTTAGATATTTAATATGAGCATACAGCTCCATTTATAGATGAGCACAACTG
CTAACTAATCTTGTCGGTGCGCATATGATTTGGTGCAAGTGATGCATTAATATGAGATTG
ATATGTTAGTTTTGATTTGGAGTAACTCACAAGTAATTGATATTACATTTTTGATA

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 4

CO CL2919Contig1 1493 4 18 U
GGGGAAAATTCTTCGCGGAATAGAGAAAGGGATTAACCAACTTGACCATTCGCCGCTTCG
CTTTTCAAATCCACTTTCCTGAGAAAATCTCTGAATCGGGTTTCGTTTATTGTCTCGGGC
AGGGGCTTTTAATGAACTGAAGTTGAATATACTTTGAGAACTCTCGAGCTTTTTTTTTGT
GTGGGAATAAGGGTCTGTTGATTCTTGGGTGGGAGAAGATGGAGAAGTACGAGCTTTAAA
GAGATCGGTTCTGGGAACTTTGGAGTGGCGAGGCTGATGAGGGTCAAAGACTCCAAGGAA
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ATTATTAACCACAGATCACTTTGTCATCCCAATATTATCCGGTTTAAGGAGGTGGTTTTG
ACACCAACGCATATAGCTATTGTCATGGAATATGCTGCTGGTGGTGAGCTATTTGACCGT
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TCAGGAGTCAGCTACTGCCATGCTATGAATATATGCCACAGAGATCTGAAGCTCGAAAAT
ATTCTCTTGGATGGAAGTCCTGCTCCACGCCTGAAAATCTGTGATTTTGGTTATTCCAAG
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GAGGTTCTTTCTCGTAGAGAATATGATGGCAAGATGGCTGATGTATGGTCATGTGGTGTG
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TTTAGAAAAACAATGCAAAGAATAATGGCTGTTCAGTACAAGATCCCTGACTATGTCCAT
ATCTCACAAGATTGCAAACATATCCTCTCCCGTATATTTGTCGCTAATCCACTCAAGAGG
ATTACAATAGCTGAAATCAAGAAACATCCATGGTTCTTAAAGAACCTGCCACGGGAGCTT
ACTGAGATAGCTCAAGCTGCATACTACAGGAAAGAGAATCCGACGTTTTCTCTACAGAGC
GTTGAAGAGATCATGAAGATTGTGGAAGAGGCAAAAACACCTCCTCCTGTTTCTCGATCT
GTAGGAGCATTTGGGTGGGAAGGAGATGGAGATGCAGAGGAAGAAGTTGAGGAAGTAGTA
GAAGAAGACGAAGAAGATGAGTATGATAAGACGGTGAAGCAAGTCCATGCAAGTGGAGAA
ATCCCTATCAGTTAAAAGAAAAAGTATTGGTTGTTTTGTTTTTGTAAAAGAAAAAGTTCT
CGTTGGTCTGTTGAATTTATCTTTAGTGGTTTTTTGTTTGGTTCGTAAATTTGAAGATTT
CTCTTGTGGTTTGGCATTTGTATAAGTTCTGTAAAATCTGCAGTAGAAAAGACAGGTTGA
TGATGAGATTATGTTTGAGCATTGGGACCGTAAATAAAAGTCTCTTTGTCCCC


BQ
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AF RS1EH54TF U 1
AF RS1B064TF U 410
AF RS1B064JQ C 673
AF RS1EH54JQ C 686
BS 1 697 RS1EH54TF
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RD RS1EH54TF 807 0 0
GGGGAAAATTCTTCGCGGAATAGAGAAAGGGATTAACCAACTTGACCATTCGCCGCTTCG
CTTTTCAAATCCACTTTCCTGAGAAAATCTCTGAATCGGGTTTCGTTTATTGTCTCGGGC
AGGGGCTTTTAATGAACTGAAGTTGAATATACTTTGAGAACTCTCGAGCTTTTTTTTTGT
GTGGGAATAAGGGTCTGTTGATTCTTGGGTGGGAGAAGATGGAGAAGTACGAGCTTTAAA
GAGATCGGTTCTGGGAACTTTGGAGTGGCGAGGCTGATGAGGGTCAAAGACTCCAAGGAA
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ATTATTAACCACAGATCACTTTGTCATCCCAATATTATCCGGTTTAAGGAGGTGGTTTTG
ACACCAACGCATATAGCTATTGTCATGGAATATGCTGCTGGTGGTGAGCTATTTGACCGT
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ATTCTCTTGGATGGAAGTCCTGCTCCACGCCTGAAAATCTGTGATTTTGGTTATTCCAAG
TCTTCAGTTCTGCACTCTAAGCCCAAATCAACTGTTGTAACTCCAGCATACATTGCACCC
GAG*TTCTTTCTCGTAGAGA*TATGATGGCAAGATGGCTGATGTATGGTCATGTGGTGTG
ACTCTTTATGTCATGCTTGTTGGGGCA

QA 1 807 1 807
DS 

RD RS1B064TF 705 0 0
G
GGTGGTTTTGACACCAACGCATATAGCTATTGTCATGGAATATGCTGCTGGTGGTGAGCT
ATTTGACCGTATATGCAGCGCTGGTAGATTCAGTGAGGATGAGGCAAGATACTTTTTCCA
GCAGCTTATATCAGGAGTCAGCTACTGCCATGCTATGAATATATGCCACAGAGATCTGAA
GCTCGAAAATATTCTCTTGGATGGAAGTCCTGCTCCACGCCTGAAAATCTGTGATTTTGG
TTATTCCAAGTCTTCAGTTCTGCACTCTAAGCCCAAATCAACTGTTGGAACTCCAGCATA
CATTGCACCCGAGGTTCTTTCTCGTAGAGAATATGATGGCAAGATGGCTGATGTATGGTC
ATGTGGTGTGACTCTTTATGTCATGCTTGTTGGGGCATACCCATTTGAAGACCCAGAGGA
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ACGGGAGCTTACTGAGATAGCTCAAGCTGCATACTACAG*AAAGAGAATCCGACGTTT*C
TCTACAGAGCGTTGA*GAGATCATGA*GATTGTGGA
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DS 

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GGCATTTGTATAAGTTCTGTAAAATCTGCAGTAGA

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DS 

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ATGGCAAGATGGCTGATGTATGGTCATGTGGTGTGACTCTTTATGTCATGCTTGTTGGGG
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ATAAGACGGTGAAGCAAGTCCATGCAAGTGGAGAAATCCCTATCAGTTAAAAGAAAAAGT
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GTTCTGTAAAATCTGCAGTAGAAAAGACAGGTTGATGATGAGATTATGTTTGAGCATTGG
GACCGTAAATAAAAGTCTCTTTGTCCCC

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DS 



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GACGACGATCTCCGTCTTCCTTGGCTAGAGAGATAGAAAAAGCCATGGCGGACGAAGAAG
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TCCTCAACGCTCCCGCTGGCGAAATCAACTACGTCGCCAAAGATTTAAAGGCGGTTTTGA
GCGATGAGGAAGTCTACAACGAGGCAGCCATGGAGGCGTTTCCAGTGTACAATAAGTCTC
ACATGATCTGCCTTGAAATGCCTAATAGGGCGGGTGATGTGATTGTTTCATCTTACAGTG
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TCAAACAGATTTGTACAAATGTAAGACCTGCTGACGATGAAGAACTTCCATCTTCGTATA
TTGAGGAATTCAGATGTGCCCTTGATGCTGAAATCCAGAGATACGTTAGTGAATCTTACC
CGAAAGGTGTGTCCGCAGTTAACTGTGTGAAAGGCAAAGATGCTGATGGTCCAGGGTCGA
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GAAGTTGGAGATCTGTATGGAACATTGATTTCCAGGATGAATCTCAAGTGCTTGACATAA
AAGGGAAATTGCAGGTAGGAGCCCATTATTTCGAAGAGGGGAATGTGGAGTTAGATGCAA
AAAAAGAGTTCCAAGATTCGACAATATTTCAGTCTCCCGATGACTGCGCGATAGCTATAG
CCAATATCATCCGACACCATGAGACGGAGTACCTTGCAGCTCTAGAGGTGGCGTATTCCA
AATTACCGGATAACACTTTCAAGGATCTGAGGAGGAAACTTCCAGTGACAAGAACTCTGT
TCCCGTGGCAGAACACTTTACAGTTCAGCCTAACCAGAGAGGTAGAGAAAGAACTTGGAC
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CTGTGTCGTGTATTTGTTCCTTCCGCTGATGTAATGTACAGACCGCATGCAAGTATTGAA
TCTTTGATATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B738TF U 1
AF RS1DE40TF U 81
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AF RS1B738JQ C 507
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RD RS1B738TF 721 0 0
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A

QA 1 721 1 721
DS 

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GG
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AATCAACTACGTCGCCAAAGATTTAAAGGCGGTTTTGAGCGATGAGGAAGTCTACAACGA
GGCAGCCATGGAGGCGTTTCCAGTGTACAATAAGTCTCACATGATCTGCCTTGAAATGCC
TAATAGGGCGGGTGATGTGATTGTTTCATCTTACAGTGAAATTACAGAGAATGAGTACCT
TGATCCAAGAACTGCCCAGGTTGCCATTGTTGATCACGTCAAACAGATTTGTACAAATGT
AAGACCTGCTGACGATGAAGAACTTCCATCTTCGTATATTGAGGAATTCAGATGTGCCCT
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TACTGCCATGAAGCTCAGTCCCCAAAACTTCTGCAATGGAAGTTGGAGATCTGTATGGAA
CATTGATTTCCAGGATGAATCTCAAGTGCTTGACATAAAAGGGAAATTGC*GGTAGGAGC
CCATTATTTCGAAGAGGGGAATGTGGAGTTAGATGCAAAAAA*GAGTTCCAAGATTCGAC
A*TATTTCAGTCTCCCGATGACTGCGCGATAGCTATAGCCAATATCATCCGACACCATGA
GACGGAGTACCTTGCAGCTCTAG
A

QA 3 805 3 805
DS 

RD RS1A884TF 788 0 0
GGATGCC
ATGGCGGACGAAGAAGACGAGTCACCGGAGACAGAGCTAAGTTACGATCAGAAGAAGGAA
ATCGCGAAATGGTTCCTCCTCAACGCTCCCGCTGGCGAAATCAACTACGTCGCCAAAGAT
TTAAAGGCGGTTTTGAGCGATGAGGAAGTCTACAACGAGGCAGCCATGGAGGCGTTTCCA
GCGTACAATAAGTCTCACATGATCTGCCTTGAAATGCCTAATAGGGCGGGTGATGTGATT
GTTTCATCTTACAGTGAAATTACAGAGAATGAGTACCTTGATCCAAGAACTGCCCAGGTT
GCCATTGTTGATCACGTCAAACAGATTTGTACAAATGTAAGACCTGCTGACGATGAAGAA
CTTCCATCTTCGTATATTGAGGAATTCAGATGTGCCCTTGATGCTGAAATCCAGAGATAC
GTTAGTGAATCTTACCCGAAAGGTGTGTCCGCAGTTAACTGTGTGAAAGGCAAAGATGCT
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CAAAACTTCTGTAATGGAAGTTGGAGATCTGTATGGAACATTGATTTCCAGGATGAATCT
CAAGTGCTTGACATAAAAGGGAAATTGCAGGTAGGAGCCCATTATTTCGAAGAGGGGAAT
GTGGAGTTAGATGCAAAAAAAGAATTCCAAGATTCGACAATATTTCAGTCTGCGGATGAC
TGCGGGATTGCCATAGCCAATATCATCCGGCACCATGAGACAGAGTACCTTGCAGCTCTA
G

QA 8 788 8 788
DS 

RD RS1B738JQ 706 0 0
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GCCATGAAGCTCAGTCCCCAAAACTTCTGTAATGGAAGTTGGAGATCTGTATGGAACATT
GATTTCCAGGATGAATCTCAGGTGCTTGACATAAAAGGGAAATTGCAGGTAGGAGCCCAT
TATTTCGAAGAAGGGAATGTGGAGTTAGATGCAAAAAAAGAGTTCCAAGATTCGACAATA
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GAGTGCCTTGCATCTCTAGAGGTGGCGTATTCCAAATTACCGGATAACACTTTCAAGGAT
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QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

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AAAAAGTGCACCATCATCATACTATCTTTACTTTTCATTTATGTCATTACTTTATCACTA
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CTCGGCAACCCTTGGAGATTCCAAGCTTGCCATAGAGACACGTCCCCAAGATCTCATGGT
ACTTTAATAAACTTTTTAACATACTCCTCTCCCATTATGGTTAATGCAAAATTTCAAAAC
ATGTGTGTGTTTAATGGTGAAGGTCACACGTGTGCCGGGGGCATTTCTGCTTATGTTTTC
GTGGTCAGAACTCAGAAGTTAGTCACTAATACTGAGTGCATTGAAATTTATGGTCTGCAG
GAAGGTGATGAGGTTTATAGCCAATCTTCCATCTCATTTTCGTGATAGGTCAAGGCAGGA
GTGGGATTCAGTACATAAAAAGACGTTATATAATTGTTTCAGGTAATGTTCAAGAACCAT
GTGTCCGCTCTTGCAATTTGCAAACAAAATAATTCGCAATTTGCAAACAAAATAACTCTT
TACTAAACTGTGTTCTTGATGAGTGATATATATGTAAGTTTTTTCGGTCGCAGCACACAT
TCCAGTTTTGTAATCACAATAAAATGATCTGAAGATCATGTTATTACAAAGGATAGCATG
TTCAGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1H759TF U 1
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TTCAG
CG

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DS 

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QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 4

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TGCCCTCTTGAAACTAATATTTTCTCCACC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1EJ26TF U 1
AF RS1GX73TF U 1
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AF RS1GX73JQ C 531
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CTAGAACCTCGGTTCTTGCGGCTGCTAATCCGCCCTCTGGTCGATATGATGATCTTAAGA
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A*GCTTATAA
A

QA 1 730 1 730
DS 

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CTTCA
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AACAGGAGAGGCTGCCCCAATACCTATCACAGTCAGACAACTCGAAGCTATTGTCAGACT
CAGTGAGTCGCTTGCAAAAATGAGACTGTCACACGACGCCACAGAAGATGATGTAGAAAA
AGCTTATAAACTTTTCAAAACCGCAACAATGGATGCAGCAAAGTCAGGGATAAATCAACA
GATTAACATAACAAGCGAGATGGCGAAGGAGATAAAGCAAGCGGAAACACAGATCAAGAG
AAGAATGGGGATCGGGGCAAGGTTATCAGAGAGAAGACTTATTGAGGATTTGGCTAGAAT
GGGAATGAACGAGTCAATGGTGAGGAGAGCTCTGTTGATAATGCATCAGAGAGGTGAAGT
TGAGTACCAGCGAGAGAGACGTTCCATTGTCCGCAAAGCTTGATCTTTTTTCTTCGCTCA
CAGTCTTTCTTCTTTAGTTTCAGGATCTTTAAAAAGACATATTTAGTACTGTTACTTTAA
TCGGAAGGAAGAGAAACTTGCGTATGTGTTTTTGATGGAGATCCTTCCGTAAACTTTTAT
GCCCTCTTGAAACTAATATTTTCTCCACC

QA 6 814 6 814
DS 

RD RS1GX73JQ 640 0 0
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AGTGCACATGAAACAGGAGAGGCTGCCCCAATACCTATCACAGTCAGACAACTCGAAGCT
ATTGTCAGACTCAGTGAGTCGCTTGCAAAAATGAGACTGTCACACGACGCCACAGAAGAT
GATGTAGAAAAAGCTTATAAACTTTTCAAAACCGCAACAATGGATGCAGCAAAGTCAGGG
ATAAATCAACAGATTAACATAACAAGCGAGATGGCGAAGGAGATAAAGCAAGCGGAAACA
CAGATCAAGAGAAGAATGGGGATCGGGGCAAGGTTATCAGAGAGAAGACTTATTGAGGAT
TTGGCTAGAATGGGAATGAACGAGTCAATGGTGAGGAGAGCTCTGTTGATAATGCATCAG
AGAGGTGAAGTTGAGTACCAGCGAGAGAGACGTTCCATTGTCCGCAAAGCTTGATCTTTC
TTCTTCGCTCACAGTCTCTCTTCTTTAGTTTCAGGATCTTTAAAAAGACATATTTAGTAC
TGTTACTTTAATCGGAAGGAAGAGAAACTTGCGTATGTGTTTTTGATGGAGATCCTTCCG
TAAACTTTTATGCCCTCTTGAAACTAATATTTTCTCCACC

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 4

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AGAGCAAGTGTTCGGTGTCGTTCACATCTTTGCTTCTTTCAACGACACTTTCATTCATGT
TACTGATCTGTCTGGAAGAGAAACTCTCGTCCGTATCACCGGTGGGATGAAGGTGAAGGC
TAACCGTGATGAATCCTCTCCTTATGCTGCTATGCTTGCCGCCCAAGATGTTGCTCAAAG
ATGCAAGGAGCTTGGCATCACAGCCATGCACGTGAAGCTACGTGCCACTGGAGGAAACAA
AACCAAGACTCCAGGCCCTGGTGCTCAGTCTGCTCTCAGAGCCCTTGCTCGTTCTGGCAT
GAAGATTGGTCGTATTGAGGACGTGACTCCAATTCCCACAGACAGTACACGTAGAAAGGG
TGGACGAAGAGGAAGAAGACTCTGATTGCCCTATGAGAGCCTCATGATCGTTCAGCTGTT
ATACCCTTGATTCGTGTAGTTTCTTGGGTACACGCTTTGAAGTTGGTTTTGTCTCTCCAT
TTCATCCTGTCAAGTTTGCTTCGAAAACTTGCGTCTTTGTTGAGCATTGTAAAACATTTA
TACATTTGGAGTTATTTTGCATTTTCTTTCTTTATTTACATCATCAGCTTTATCG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1D765JQ C 1
AF RS1DC80JQ C 109
AF RS1D765TF U 1
AF RS1DC80TF U 1
BS 1 715 RS1D765TF

RD RS1D765JQ 715 0 0
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ATACCCTTGATTCGTGTAGTTTCTTGGGTACACGCTTTGAAGTTGGTTTTGTCTCTCCAT
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QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1DC80JQ 607 0 0
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TGGAGGAAACAAAACCAAGACTCCAGGCCCTGGTGCTCAGTCTGCTCTCAGAGCCCTTGC
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TTTATCG

QA 1 607 1 607
DS 

RD RS1D765TF 715 0 0
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TACTGATCTGTCTGGAAGAGAAACTCTCGTCCGTATCACCGGTGGGATGAAGGTGAAGGC
TAACCGTGATGAATCCTCTCCTTATGCTGCTATGCTTGCCGCCCAAGATGTTGCTCAAAG
ATGCAAGGAGCTTGGCATCACAGCCATGCACGTGAAGCTACGTGCCACTGGAGGAAACAA
AACCAAGACTCCAGGCCCTGGTGCTCAGTCTGCTCTCAGAGCCCTTGCTCGTTCTGGCAT
GAAGATTGGTCGTATTGAGGACGTGACTCCAATTCCCACAGACAGTACACGTAGAAAGGG
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ATACCCTTGATTCGTGTAGTTTCTTGGGTACACGCTTTGAAGTTGGTTTTGTCTCTCCAT
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TACATTTGGAGTTATTTTGCATTTTCTTTCTTTATTTACATCATCAGCTTTATCG

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1DC80TF 715 0 0
TGGGGATCCAAAAAAGCCCGAGCATTTTGTCACTTCTCATCCATCGGTGAACATGTCGAG
GAGAAAGACCAGAGAGCCCAAGGAGGAAACCGTGACTCTAGGACCTGCTGTTCGTGACGG
AGAGCAAGTGTTCGGTGTCGTTCACATCTTTGCTTCTTTCAACGACACTTTCATTCATGT
TACTGATCTGTCTGGAAGAGAAACTCTCGTCCGTATCACCGGTGGGATGAAGGTGAAGGC
TAACCGTGATGAATCCTCTCCTTATGCTGCTATGCTTGCCGCCCAAGATGTTGCTCAAAG
ATGCAAGGAGCTTGGCATCACAGCCATGCACGTGAAGCTACGTGCCACTGGAGGAAACAA
AACCAAGACTCCAGGCCCTGGTGCTCAGTCTGCTCTCAGAGCCCTTGCTCGTTCTGGCAT
GAAGATTGGTCGTATTGAGGACGTGACTCCAATTCCCACAGACAGTACACGTAGAAAGGG
TGGACGAAGAGGAAGAAGACTCTGATTGCCCTATGAGAGCCTCATGATCGTTCAGCTGTT
ATACCCTTGATTCGTGTAGTTTCTTGGGTACACGCTTTGAAGTTGGTTTTGTCTCTCCAT
TTCATCCTGTCAAGTTTGCTTCGAAAACTTGCGTCTTTGTTGAGCATTGTAAAACATTTA
TACATTTGGAGTTATTTTGCATTTTCTTTCTTTATTTACATCATCAGCTTTATCG

QA 1 715 1 715
DS 



AS 2 4

CO CL2924Contig1 795 2 2 U
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GGACGTGAATCGGAACACGGAGTGGTTCACGTATCCAGGGGTGTGGACGACCTACATCCT
CATCCTATTCTTCTCATGGCTCCTCGTTCTCTCCATCTTCAATTGTTCCCCTGGCATGGC
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GGGAACACCGTTTGGGGATGACCAGGGGGTCTACAATAGGCTGACTTGGTGGGAACAGAT
TGACAACGGCAAGCAACTCACTCGCAATCGCAAGTTCCTCACTCTTGTTCCCGTTGTCTT
GTACTTGATAGCGTCGCACACTACAGACTATCAAAATCCCATGCTGTTTCTGAACACGCT
TGCTGTATTTATAATGGTTGTTGCAAAGTTCCCGCACATGCACAAGGTTCGCATCTTTGG
AATCAATGCCGAACAGTGAAAGCACCAAATGCGGTTGAGCTATGAGATTTGTTGTGGTAA
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GGGTTTGTAAGTCGG


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C792TF U 1
AF RS1C792JQ C 3
BS 1 609 RS1C792TF
BS 610 795 RS1C792JQ

RD RS1C792TF 609 0 0
GGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATCAGACAACGAAGGAAGGAAGGAAAGGGGA
AAATTGATCTAAAATATAAGAAGGAAAGGATCGTAAAAATCGGAGAGAGATAGAGATAGA
GATCGGATCAGATCTGTGGGTGTGGGTTGGAATGATGTACGTGAGAGCGTTGCCGACGAC
GGACGTGAATCGGAACACGGAGTGGTTCACGTATCCAGGGGTGTGGACGACCTACATCCT
CATCCTATTCTTCTCATGGCTCCTCGTTCTCTCCATCTTCAATTGTTCCCCTGGCATGGC
CTGGACCATCGTCCACCTCGCCCATTTCGCCGTTACGTATCATTTGTTTCACTGGAAGAA
GGGAACACCGTTTGGGGATGACCAGGGGGTCTACAATAGGCTGACTTGGTGGGAACAGAT
TGACAACGGCAAGCAACTCACTCGCAATCGCAAGTTCCTCACTCTTGTTCCCGTTGTCTT
GTACTTGATAGCGTCGCACACTACAGACTATCAAAATCCCATGCTGTTTCTGAACACGCT
TGCTGTATTTATAATGGTTGTTGCAAAGTTCCCGCACATGCACAAGGTTCGCATCTTTGG
AATCAATGC

QA 1 609 1 609
DS 

RD RS1C792JQ 793 0 0
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ATTGATCTAAAATATAAGAAGGAAAGGATCGTAAAAATCGGAGAGAGATAGAGATAGAGA
TCGGATCAGATCTGTGGGTGTGGGTTGGAATGATGTACGTGAGAGCGTTGCCGACGACGG
ACGTGAATCGGAACACGGAGTGGTTCACGTATCCAGGGGTGTGGACGACCTACATCCTCA
TCCTATTCTTCTCATGGCTCCTCGTTCTCTCCATCTTCAATTGTTCCCCTGGCATGGCCT
GGACCATCGTCCACCTCGCCCATTTCGCCGTTACGTATCATTTGTTTCACTGGAAGAAGG
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ACAACGGCAAGCAACTCACTCGCAATCGCAAGTTCCTCACTCTTGTTCCCGTTGTCTTGT
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GTTTGTAAGTCGG

QA 1 793 1 793
DS 



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GAAGGAAAGGATCGTAAAAATCGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATCGGATCAGATCT
GTGGGTGTGGGTTGGAATGATGTATGTGAGAGCGTTGCCGACGACGGACGTGAATCGGAA
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ATGGCTCCTCGTTCTCTCCATCTTCAATTGTTCCCCTGGCATGGCCTGGACCATCGTCCA
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GGATGACCAGGGGGTCTACAATAGGCTGACTTGGTGGGAACAGATTGACAACGGCAAGCA
ACTCACTCGCAATCGCAAGTTCCTCACTCTTGTTCCCGTTGTCTTGTACTTGATAGCATC
GCACACTACAGACTATCAAAATCCCATGCTGTTTCTGAACACGCTTGCTGTATTTATAAT
GGTGGTTGCAAAGTTCCCGCACATGCACAAGGTTCGCATCTTTGGAATCAATGCCGAACA
GTGAAAGCACCAAATGCGGTTGAGCTATGAGATTTGTTGTGGTAAATCAATCTGATCATG
AAGCCTTGAAGTAGAAAATACATATGCCACTTTTGTCTTCTTCTTCTTTTCCTTAGATTT
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AACCCGTGGTTTAGTGATTTTTCTTCAAAAATCATTTACTAATACTAATATACATAATAT
ACAAGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F542TF U 1
AF RS1F542JQ C 84
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A*CCCGTGGTTTAGTG

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DS 

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GAGA
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GAGAGCGTTGCCGACGACGGACGTGAATCGGAACACGGAGTGGTTCACGTATCCAGGGGT
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TTGTTCCCCTGGCATGGCCTGGACCATCGTCCACCTCGCCCATTTCGCCGTTACGTATCA
CTTGTTTCACTGGAAGAAGGGAACACCGTTTGGGGATGACCAGGGGGTCTACAATAGGCT
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TCTTGTTCCCGTTGTCTTGTACTTGATAGCATCGCACACTACAGACTATCAAAATCCCAT
GCTGTTTCTGAACACGCTTGCTGTATTTATAATGGTGGTTGCAAAGTTCCCGCACATGCA
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TGAGATTTGTTGTGGTAAATCAATCTGATCATGAAGCCTTGAAGTAGAAAATACATATGC
CACTTTTGTCTTTTTTTTCTTTTCCTTAGATTTTTCTTTTCCTTGTTTATGTAAAAACCA
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AAAATCATTTACTAATACTAATATACATAATATACAAGCG

QA 5 764 5 764
DS 



AS 1 4

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AGGTGCCACAATTGCCTTCACGTACGTGAAGGGCCAAGAGGAAAAGGACGCACAAGAGAC
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AATGGCCTTTTGTTAGTCATGTATGTTGGTTATGTGTGAAAACGGTATATTTTTGTAATC
TTCTGGAAGTATCAGAAGTGTTGAAATAAAGATGAAGTTTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1GR69TF U 1
AF RS1AA04TF U 189
AF RS1AA04JQ C 281
AF RS1GR69JQ C 637
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BS 492 608 RS1GR69TF
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GGCATCTGAAAGACAAAAACAAGGAGGAGTACAACCTGGCAAAGAACACGTCATGGACCC
AACTCCACAATTCTCTAGTTCAGACTACCAACCCTCCAACAAGCTCCGTGGAAAGGTCGC
CCTGATAACGGGCGGAGACTCGGGGATTGGTAGAGCCGTGAGTTACTGTTTTGCACTTGA
AGGTGCCACAATTGCCTTCACGTACGTGAAGGGCCAAGAGGAAAAGGACGCACAAGAGAC
TCTACAAATGTTGAAGGAAGCAAATACCTCGGAGGCTAAAGACCCGATTGCAATTCCAAC
GGATTTAGGATTCGATGAGCACTGCAAGAGGGTTGTAGACGAGGTTGTTAATGCGTTTGG
ACGTATTGATGTCTTGATCAATAACGCAGCGGAGCAGTACGAAAGCAATTCCATCGAAGA
GATCGATGAGCCTAGGCTGGAACGTGTCTTCCGGACAAACATTTTCTCTTATTTCTTCCT
CACAAGGCATGCGTTGAAGCATATGAAGGAAGGAAGCAGCATAATAAACACAACATCTGT
GAACGCCT

QA 1 608 1 608
DS 

RD RS1AA04TF 801 0 0
G
GGGCGGAGACTCGGGGATTGGTAGAGCCGTGAGTTACTGTTTTGCACTTGAAGGTGCCAC
AATTGCCTTCACGTACGTGAAGGGCCAAGAGGAAAAGGACGCACAAGAGACTCTACAAAT
GTTGAAGGAAGCAAATACCTCGGAGGCTAAAGACCCGATTGCAATTCCAACGGATTTAGG
ATTCGATGAGCACTGCAAGAGGGTTGTAGACGAGGTTGTTAATGCGTTTGGACGTATTGA
TGTCTTGATCAATAACGCAGCGGAGCAGTACGAAAGCAATTCCATCGAAGAGATCGATGA
GTCTAGGCTGGAACGTGTCTTCCGGACAAACATTTTCTCTTATTTCTTCCTCACAAGGCA
TGCGTTGAAGCATATGAAGGAAGGAAGCAGCATAATAAACACAACATCTGTGAACGCCTA
TAAGGGACATGCATCGCTTCTCGACTACACCGCTACAAAAGGAGCGATTGTGGCGTTTAC
TCGAGGTCTTGCACTTCAGCTTGCTGAGAAAGGGATCCGTGTTAATGGTGTAGCACCTGG
TCCTATATGGACCCCCCTTATCCCTGCTTCGTTTAATGAGGAGAAAATTAAGAGTTTCGG
GACAGAAGTCCCAATGAAACGAGCCGGGCAGCCCATTGAGGTGGCACCTTCCTACGTTTT
CCTGGCTTGTAACCATTGCTCATCTTACTTCACAGGCCAAGTTCTTCACCCTAACGGAGG
TGCTGTTGTGAATGCCTAAAGCATGGCTCGACCGTGACAATGGACTTATTATGCTGATAG
AAGTTGTTGCGTCGTTTTTT

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DS 

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GAAAAGGACGCACAAGAGACTCTACAAATGTTGAAGGAAGCAAATACCTCGGAGGCTAAA
GACCCGATTGCAATTCCAACGGATTTAGGATTCGATGAGCACTGCAAGAGGGTTGTAGAC
GAGGTTGTTAATGCGTTTGGACGTATTGATGTCTTGATCAATAACGCAGCGGAGCAGTAC
GAAAGCAATTCCATCGAAGAGATCGATGAGTCTAGGCTGGAACGTGTCTTCCGGACAAAC
ATTTTCTCTTATTTCTTCCTCACAAGGCATGCGTTGAAGCATATGAAGGAAGGAAGCAGC
ATAATAAACACAACATCTGTGAACGCCTATAAGGGACATGCATCGCTTCTCGACTACACC
GCTACAAAAGGAGCGATTGTGGCGTTTACTCGAGGTCTTGCACTTCAGCTTGCTGAGAAA
GGGATCCGTGTTAATGGTGTAGCACCTGGTCCTATATGGACCCCCCTTATCCCTGCTTCG
TTTAATGAGGAGAAAATTAAGAGTTTCGGGACAGAAGTCCCAATGAAACGAGCCGGGCAG
CCCATTGAGGTGGCACCTTCCTACGTTTTCCTGGCTTGTAACCATTGCTCATCTTACTTC
ACAGGCCAAGTTCTTCACCCTAACGGAGGTGCTGTTGTGAATGCCTAAGGCATGGCTCGA
CCGTGACAATGGACTTATTATGCTGATAGAAGTTGTTGCGTCGTTTTTTTTTCTTTAAGT
TGTTCCGTCGTTGTGGTTCTAATGGCCTTTTGTTAGTCATGTATGTTGGTTATGTGTGAA
AACGGTATATTTTTGTAATCTTCTGGAAGTATCAGAAGTGTTGAAATAAAGATGAAGTTT
GACC

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DS 

RD RS1GR69JQ 488 0 0
CACCGCTACAAAAGGAGCGATTGTGGCGTTTACTCGAGGTCTTGCACTTCAACTTGCTGA
GAAAGGGATCCGTGTTAATGGTGTAGCACCTGGTCCTATATGGACCCCCCTTATCCCTGC
TTCGTTTAATGAGGAGAAAATTAAGAGTTTCGGGACAGAAGTCCCAATGAAACGAGCCGG
GCAGCCCATTGAGGTGGCACCTTCCTACGTTTTCCTGGCTTGTAACCATTGCTCATCTTA
CTTCACAGGCCAAGTTCTTCACCCTAACGGAGGTGCTGTTGTGAATGCCTAAGGCATGGC
TCGACCGTGACAATGGACTTATTATGCTGATAGAAGTTGTTGCGTCGTTTTTTTT*CTTT
AAGTTGTTCCGTCGTTGTGGTTTTAATGGCCTTTTGTTAGTCATGTATGTTGGTTATGTG
TGAAAACGGTATATTTTTGTAATCTTCTGGAAGTATCAGAAGTGTTGAAATAAAGATGAA
GTTTGACC

QA 1 488 1 488
DS 



AS 1 4

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GGGTTACAGAGAGAGAGAGAGTCTAAAGAGAGAGAGAAAACCCTAATTGCCGCCGCTTCT
TCCGGCGCTCGACGCGGAGTCGTCGCCGGAGATCCCGTTCTTTTCCCTTATTTTTTTCTT
TTTTTCCTTTGCCTTTGACGACGCCTCTACCTCTCTTCGATATGCATATGGTCTCTGGTT
CCATCGGTTCTTCAGATCTCAGATCTGGCCGCGTGTAGCTTGTCTTAGGCGGTTCCCGAG
TCTCTTGGAGTCATGGCGAGTTGAGTCAGGAAGATGGCTGTTTGTTGGAGGTCGGCTTTT
AGGGTTTGGATTTGGGTCGGAGCCTTTTTCCCTTGGCCGCTCCGTTCTGTTCCGTTGTGG
GCCGACGGTTTGCTGGTAGCTTTTCCCCGTGGTTTCATTGTTCTTTTGCAGATTATTGGA
AGAGCTCTGGTGGTCCTGTCACCCGCACCCGCGTTTTTTCATCATTCCGGGAGATTTGAA
GCTTCTTATCTGTTGATGGAGTTTCAGTCTCGTTCCGGCGGCTCTGTTAAGGACGTATGC
TATGGAATCATGCGATGGAGAAGTCCTTGGTGGTGGTTTAAGCACCTGTACGGTGGGGAG
CCTATTCTGTTCTAAGATGCAATTGCCGGTCAAGGTACGGATTCATCAAAATTGTTTCAA
TGGCTGTGCGTCCGCTGAATAACGTATGGGACACTGACTGCAATCTGAAGCGGCCCTGAG
CTAGGAACATGCGCCTCGGTGTTGAGTTGGTCAGGTCCATGGCCCTAATTCCAATCTAGT
GGTGATCTCCAGCTTCTGTCATATTAGAATTCCTTGTTTAGAGCTTAGTTTCAGGTTTGG
TTTTGTCCCTGTAGTAGTGTGGTTTAAGAGACGATTCATTTTCATCGTTTGTGGTGAAAA
GAGTTTGTTTTCATGGTGGTTTAAGTGATCGGGTGAATTGATAAGGTAATTTAGGTTCCA
TGTTAGTGAGCTTAAGTGATACTATACCTTCACCCAGATCACAGGTGGTTAAAGCCTCTG
CTGAGGCAATGTGGTTACAATTTGCTTGTATCAAATCTTTTGGTTAATGTGAAAGTTGAT
GTTGAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H549TF U 143
AF RS1DT57TF U 1
AF RS1H549JQB C 781
AF RS1DT57JQ C 328
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BS 900 900 RS1H549JQB
BS 901 1088 RS1DT57JQ

RD RS1H549TF 463 0 0
GG
CTCTACCTCTCTTCGATATGCATATGGTCTCTGGTTCCATCGGTTCTTCAGATCTCAGAT
CTGGCCGCGTGTAGCTTGTCTTAGGCGGTTCCCGAGTCTCTTGGAGTCATGGCGAGTTGA
GTCAGGAAGATGGCTGTTTGTTGGAGGTCGGCTTTTAGGGTTTGGATTTGGGTCGGAGCC
TTTTTCCCTTGGCCGCTCCGTTCTGTTCCGTTGTGGGCCGACGGTTTGCTGGTAGCTTTT
CCCCGTGGTTTCATTGTTCTTTTGCAGATTATTGGAAGAGCTCTGGTGGTCCTGTCACCC
GCACCCGCGTTTTTTCATCATTCCGGGAGATTTGAAGCTTCTTATCTGTTGATGGAGTTT
CAGCCTCGTTCCGGCGGCTCTGTTAAGGACGTATGCTTTGGAATCATGCGATGGAGAAGT
CCTTGGTGGTGGTTTAAGCACCTGTACGGTGGGGAGCCTAT

QA 3 463 3 463
DS 

RD RS1DT57TF 799 0 0
GGGTTACAGAGAGAGAGAGAGTCTAAAGAGAGAGAGAAAACCCTAATTGCCGCCGCTTCT
TCCGGCGCTCGACGCGGAGTCGTCGCCGGAGATCCCGTTCTTTTCCCTTATTTTTTTCTT
TTTTTCCTTTGCCTTTGACGACGCCTCTACCTCTCTTCGATATGCATATGGTCTCTGGTT
CCATCGGTTCTTCAGATCTCAGATCTGGCCGCGTGTAGCTTGTCTTAGGCGGTTCCCGAG
TCTCTTGGAGTCATGGCGAGTTGAGTCAGGAAGATGGCTGTTTGTTGGAGGTCGGCTTTT
AGGGTTTGGATTTGGGTCGGAGCCTTTTTCCCTTGGCCGCTCCGTTCTGTTCCGTTGTGG
GCCGACGGTTTGCTGGTAGCTTTTCCCCGTGGTTTCATTGTTCTTTTGCAGATTATTGGA
AGAGCTCTGGTGGTCCTGTCACCCGCACCCGCGTTTTTTCATCATTCCGGGAGATTTGAA
GCTTCTTATCTGTTGATGGAGTTTCAGTCTCGTTCCGGCGGCTCTGTTAAGGACGTATGC
TATGGAATCATGCGATGGAGAAGTCCTTGGTGGTGGTTTAAGCACCTGTACGGTGGGGAG
CCTATTCTGTTCTAAGATGCAATTGCCGGTCAAGGTACGGATTCATCAAAATTGTTTCAA
TGGCTGTGCGTCCGCTGAATAACGTATGGGACACTGACTGCAATCTGAAGCGGCCCTGAG
CTAGGA*CATGCGC*TCGGTGTTGAGTTGGTCAGT**CATGGCCCTA**TCCAATCTAGT
GGTGATCTC
AGCTCTGTCA

QA 1 789 1 789
DS 

RD RS1H549JQB 152 0 0
GGG
GATCTCCAGCTTTTGTCATATTAGAATTCCTTGTTTAGAGCTTAGTTTCAGGTTTGGTTT
TGTCCCTGTAGTAGTGTGGTTTAAGAGACGATTCATTTTCTTCGTTTGTGGTGAAAAGAG
TTTGTTTTCATGGTGGTTTAAGTGATCGG

QA 4 152 4 152
DS 

RD RS1DT57JQ 761 0 0
TTCCCTTGGCCGCTCCGTTCTGTTCCGTTGTGGGCCGACGGTTTGCTGGTAGCTTTTCCC
CGTGGTTTCATTGTTCTTTTGCAGATTATTGGAAGAGCTCTGGTGGTCCTGTCACCCGCA
CCCGCGTTTTTTCATCATTCCGGGAGATTTGAAGCTTCTTATCTGTTGATGGAGTTTCAG
TCTCGTTCCGGCGGCTCTGTTAAGGACGTATGCTATGGAATCATGCGATGGAGAAGTCCT
TGGTGGTGGTTTAAGCACCTGTACGGTGGGGAGCCTATTCTGTTCTAAGATGCAATTGCC
GGTCAAGGTACGGATTCATCAAAATTGTTTCAATGGCTGTGCGTCCGCTGAATAAGGTAT
GGGACACTGACTGCAATCTGAAGCGGCCCTGAGCTAGGAACATGCGCCTCGGTGTTGAGT
TGGTCAGGTCCATGGCCCTAATTCCAATCTAGTGGTGATCTCCAGCTTCTGTCATATTAG
AATTCCTTGTTTAGAGCTTAGTTTCAGGTTTGGTTTTGTCCCTGTAGTAGTGTGGTTTAA
GAGACGATTCATTTTCATCGTTTGTGGTGAAATGAGTTTGTTTTCATGGTGGTTTAAGTG
ATCGGGTGAATTGATAAGGTAATTTAGGTTCCATGTTAGTGAGCTTAAGTGATACTATAC
CTTCACCCAGATCACAGGTGGTTAAAGCCTCTGCTGAGGCAATGTGGTTACAATTTGCTT
GTATCAAATCTTTTGGTTAATGTGAAAGTTGATGTTGAGTC

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 4

CO CL2927Contig1 723 4 2 U
GAAACCAACTTCGTGTAGAAATAAATGTTAACATTCAATTTGCTTAGTACCATCTTCACA
TCTAACCACTTTTGTTCAGTCTAAGAACATCCTAAGAAATTGGGATCAATGTGAACAGTC
ATGTTTTAAAAAAAGCACTTTCGAACATATCCTAGTTAATGAAGTACACCCAAATCGAAC
TACGATGCTGGGAAGCGTACACCGAGCTTGACGACAACAACTTCAAAGATCCCATCAGGT
CTGAACTTTGGAGAAAACAAGCGAGGGTCCACTTGTCCCGGGAGGTTAAACGTGATCGAG
AATGGACCTGGCGGGCAGAGCTGCTGCACTTGCATTCTGTACAAGCATCCTGACGAGTCA
CTTGGGATGGCAATCTCGGGTACTAGTCCTTGAATGCATACTCTTCCCTCCCTCTGAATC
TCACATTTGATCTTATTTGGGTTTTTATGAATGCCAGGGAGAGAGACTCTGAAGAGGTAG
GCGATTTCGCTCTCACCAATGTCGATAAGACCAATGGGTGGCCCAGCAGTGCCTTGCTTG
GCAGAGCCGGTGAAAAAGACATGTGAGATCACTTTGGAGTGATGAACCTCAGGGTTCATG
GTGTTTGATTTGTTACTTCCGACAAGGGAAAGACCCGTAGCGATTTGTTGTGGACTCTCC
GGTGATGTTTGACTGCGAAGTTTCCGGTTCAGACGGGTTTGACCGTCGTCACTCACTCGA
CCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 
10 10 10 

AF RS1FC21JQ U 1
AF RS1FC21TF C 95
AF RS1CM65TF C 19
AF RS1CM65JQ U 17
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GGGTTTGACCGTCGTCACTCACTC
CAC

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GACCC

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DS 

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TCAATTTGCTTAGTACCATCTTCACATCTAACCACTTTTGTTCAGTCTAAGAACATCCTA
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TTCTGTACAAGCATCCTGACGAGTCACTTGGGATGGCAATCTCGGGTACTAGTCCTTGAA
TGCATACTCTTCCCTCCCTCTGAATCTCACATTTGATCTTATTTGGGTTTTTATGAATGC
CAGGGAGAGAGACTCTGAAGAGGTAGGCGATTTCGCTCTCACCAATGTCGATAAGACCAA
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TGGAGTGATGAACCTCAGGGTTCATGGTGTTTGATTTGTTACTTCCGACAAGGGAAAGAC
CCGTAGCGATTTGTTGTGGACTCTCCGGTGATGTTTGACTGCGAAGTTTCCGGTTCAGAC
GGGTTTGACCGTCGTCACTCACTCGACCC

QA 19 707 19 707
DS 



AS 1 3

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TAAGCTTGGTTTAATCTTACCTGGAACATCGTTTGTTTTTGACTTATCACCCTTCACAAG
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AACCTTATAGAAATCTTGGAGGAAGGTCACAAAGTCGATATACTCAAGTACATTAACTAT
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CACCGTCTAGGACCAGTTCCCGTTGGAGAAACCAGCGTCTTCATCGCTGTCTCGTCTGTT
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CCTATATGGAAGAAAGAGGTGTACAGTAATGGAGAGGTTTGGAAGGAGAATAGTGAGTTT
CTAGAGAAAAGAGACGGTTTGGTGAAGAAACATGTGGTTGGAGAACATAAAAGAAGTTGC
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AGTTCTTGATTACTTGTAGCAAAGAGCAATGTTTTAGTTTATCTCTCTCGCAATAAGCAA
AATGTCTTAAAACACATTGTTGAATCTAAAGACTTTAAATTCAAATTTAGTTTGATCTCT
CACACAGCTTTAAAACTTTCAGATCTCTCCCAGGTAGATATCTTTATCGCTGCTGCAAGA
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GTCCCAAAGCTTGGCGGTTCCATCATCAGATCCACTG


BQ
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AF RS1DF70TF U 1
AF RS1DF70JQ C 96
AF RS1GF25JQ U 730
BS 1 582 RS1DF70TF
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RD RS1DF70TF 582 0 0
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TAAGCTTGGTTTAATCTTACCTGGAACATCGTTTGTTTTTGACTTATCACCCTTCACAAG
GTTCCTGTTGTTGTATTGGACTGTGTGTGAGAACCAAAGATGTCTGCGGAGGAGAAGAAG
AACCTTATAGAAATCTTGGAGGAAGGTCACAAAGTCGATATACTCAAGTACATTAACTAT
GTCAGTGCCCCTCAAGCCGGTGCTATAGCCACATTCTCAAGCACTACAAGAGACATGTTC
CAAGGTAAAGCAGTTTTGGAGCTAAGATATGAAGCATATGTGCCAATGGCCACACGATGC
CTCAGCTCCATCTGTACAGCCGCTAGATCAAACTGGGACATCCACAAGATTGCTGTTGCT
CACCGTCTAGGACCAGTTCCCGTTGGAGAAACCAGCGTCTTCATCGCTGTCTCGTCTGTT
CACCGTGGGGATGGTTTGGATGCTTGCAAGTTCTTGATCGACGAGCTCAAGGCAACGGTT
CCTATATGGAAGAAAGAGGTGTACAGTAATGGAGAGGTTTGG

QA 1 582 1 582
DS 

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TTTTTGACTTATCACCCTTCACAAGGTTCCTGTTGTTGTATTGGACTGTGTGTGAGAACC
AAAGATGTCTGCGGAGGAGAAGAAGAACCTTATAGAAATCTTGGAGGAAGGTCACAAAGT
CGATATACTCAAGTACATTAACTATGTCAGTGCCCCTCAAGCCGGTGCTATAGCCACATT
CTCAAGCACTACAAGAGACATGTTCCAAGGTAAAGCAGTTTTGGAGCTAAGATATGAAGC
ATATGTGCCAATGGCCACACGATGCCTCAGCTCCATCTGTACAGCCGCTAGATCAAACTG
GGACATCCACAAGATTGCTGTTGCTCACCGTCTAGGACCAGTTCCCGTTGGAGAAACCAG
CGTCTTCATCGCTGTTTCGTCTGTTCACCGTGGGGATGGTTTGGATGCTTGCAAGTTCTT
GATCGACGAGCTCAAGGCAACGGTTCCTATATGGAAGAAAGAGGTGTACAGTAATGGAGA
GGTTTGGAAGGAGAATAGTGAGTTTCTAGAGAAAAGAGACGGTTTGGTGAAGAAACATGT
GGTTGGAGAACATAAAAGAAGTTGCTGTGGAAGTAAAGTTAGAGTACAAGAAGATGAAGA
GCGTAAAGACATAGCAGGAGATAACAGTTCTTGATTACTTGTAGCAAAGAGCAATGTTTT
AGTTTATCTCTCTCGCAATAAGCAAAATGTCTTAAAACACATTGTTGAATCTAAAGACTT
TAAATTCAA

QA 1 729 1 729
DS 

RD RS1GF25JQ 448 0 0
TTACTTGTAGCAAAGAGCAATGTTT*AGTTTATCTCTCTCGCAATAAGCAAAATGTCTTA
AAACACATTGTTGAATCTAAAGACTTTAAATTCAAATTTAGTTTGATCTCTCACACAGCT
TTAAAACTTTCAGATCTCTCCCAGGTAGATATCTTTATCGCTGCTGCAAGAACCAATGAT
AGGCTCAGTGGGGTGAAACACACACTCGTTGACCGATCCTTTATGACCTGGGAGCTTGTA
GAGAATGCGCCGAGTGGTTGTGTCCCAAATATGAACCATACGGTCTGCGCTACCAGCAGT
GACTTTGGTACCATCAGGTGACCACGAACACTTGAGCAGGTTCTTCTCAAAGTTGTGCTG
ATGCCCTTCAAAGATCTTCACACACCTGTTCTGTGGGGCGTAAGGACGCATGTCCCAAAG
CTTGGCGGTTCCATCATCAGATCCACTG

QA 1 448 1 448
DS 



AS 1 4

CO CL2929Contig1 775 4 4 U
GGAACAAAGGAAATATGTTTTATTCCATTAAAAGAAAAAAGAAAACAGAAACGCAGATAG
AGTTTTATTATTAGTCGTAGTCTTTAATTTCTCTCAGATGATAGACATAGTCTTGGGATA
AGTCTCTGTCTCATCAGCTTTCATGAACACAAACGAGAATGGTGTAGAGGTTAAAGCCAA
ACGTCGCACGCCATATTCGTCGTTAATTATACCGACGTTGATGCAATCATTACCGTTAGG
ACAAGACACAATCTGGTAACCGCCAGGAAAACCTTTAGTTTTCTTGATCTTGAAGAAACT
CCTCGACGAATATTCTCCAGCTTCCGGGTTAGGACCAGCCGTTATGAACAATGTCCTAAA
GTGACTTGGGGCCGCAGTGACCCACCAATAGGTTGACTGAACGCATATCGTGGCTTTGAC
GTCCATCTCGATGTTAAGGTTAATTGATTCGGGAACGAACGCAACTTTAATCCTCCAGTT
TGAGAATTTTACGGGAATCCCCCTGTTGACCTCTGAGATTTCCTGTCCGACAAAGAGGGG
ACATTGGTTGTTACCACGGGAGGCGAGATTCAGGCCGCCACCAGCAGCACCGAAGATGGC
GGGGAGAACGTAGTAACTGCCACCGAATATGACATCACCATCAGTGTCGAGAACTGGTTG
GGCGTTTATGGTAACGGCCAAAACAGCGGTTAAGGCAACAAGGAAGTAAAACATAGGCTT
CATCCTTTTTTTCTTGAGTGTATGTAGTTGATTAGGTTTGAATGTTACTGGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1D013JQ U 24
AF RS1D576JQ U 1
AF RS1D013TF C 41
AF RS1D576TF C 46
BS 1 311 RS1D576JQ
BS 312 312 RS1D013JQ
BS 313 745 RS1D576JQ
BS 746 775 RS1D013TF

RD RS1D013JQ 557 0 0
TCCATTAAAAGAAAAAAGAAAACAGAAACGCAGATAGAGTTTTATTATTAGTCGTAGTCT
TTAATTTCTCTCAGATGATAGACATAGTCTTGGGATAAGTCTCTGTCTCATCAGCTTTCA
TGAACACAAACGAGAATGGTGTAGAGGTTAAAGCCAAACGTCGCACGCCATATTCGTCGT
TAATTATACCGACGTTGATGCAATCATTACCGTTAGGACAAGACACAATCTGGTAACCGC
CAGGAAAACCTTTAGTTTTCTTGATCTTGAAAAAACTCCTCGACGAATATTCTCCAGCTT
CCGGGTTAGGACCAGCCGTTATGAACAATGTCCTAAAGTGACTTGGGGCCGCAGTGACCC
ACCAATAGGTTGACTGAACGCATATCGTGGCTTTGACGTCCATCTCGATGTTAAGGTTAA
TTGATTCGGGAACGAACGCAACTTTAATCCTCCAGTTTGAGAATTTTACGGGAATCCCCC
TGTTGACTTCTGAGATTTCCTGTCCGACAAAGAGGGGACATTGGTTGTTACCACGGGAGG
CGAGATTCAGGCCGCCA

QA 1 557 1 557
DS 

RD RS1D576JQ 748 0 0
GGAACAAAGGAAATATGTTTTATTCCATTAAAAGAAAAAAGAAAACAGAAACGCAGATAG
AGTTTTATTATTAGTCGTAGTCTTTAATTTCTCTCAGATGATAGACATAGTCTTGGGATA
AGTCTCTGTCTCATCAGCTTTCATGAACACAAACGAGAATGGTGTAGAGGTTAAAGCCAA
ACGTCGCACGCCATATTCGTCGTTAATTATACCGACGTTGATGCAATCATTACCGTTAGG
ACAAGACACAATCTGGTAACCGCCAGGAAAACCTTTAGTTTTCTTGATCTTGAAGAAACT
CCTCGACGAATCTTCTCCAGCTTCCGGGTTAGGACCAGCCGTTATGAACAATGTCCTAAA
GTGACTTGGGGCCGCAGTGACCCACCAATAGGTTGACTGAACGCATATCGTGGCTTTGAC
GTCCATCTCGATGTTAAGGTTAATTGATTCGGGAACGAACGCAACTTTAATCCTCCAGTT
TGAGAATTTTACGGGAATCCCCCTGTTGACCTCTGAGATTTCCTGTCCGACAAAGAGGGG
ACATTGGTTGTTACCACGGGAGGCGAGATTCAGGCCGCCACCAGCAGCACCGAAGATGGC
GGGGAGAACGTAGTAACTGCCACCGAATATGACATCACCATCAGTGTCGAGAACTGGTTG
GGCGTTTATGGTAACGGCCAAAACAGCGGTTAAGGCAACAAGGAAGTAAAACATAGGCTT
CATCCTTTTTTTCTTGAGTGTATGT
GGT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1D013TF 735 0 0
GAAAA
CAGAAACGCAGATAGAGTTTTATTATTAGTCGTAGTCTTTAATTTCTCTCAGATGATAGA
CATAGTCTTGGGATAAGTCTCTGTCTCATCAGCTTTCATGAACACAAACGAGAATGGTGT
AGAGGTTAAAGCCAAACGTCGCACGCCATATTCGTCGTTAATTATACCGACGTTGATGCA
ATCATTACCGTTAGGACAAGACACAATCTGGTAACCGCCAGGAAAACCTTTAGTTTTCTT
GATCTTGAAGAAACTCCTCGACGAATATTCTCCAGCTTCCGGGTTAGGACCAGCCGTTAT
GAACAATGTCCTAAAGTGACTTGGGGCCGCAGTGACCCACCAATAGGTTGACTGAACGCA
TATCGTGGCTTTGACGTCCATCTCGATGTTAAGGTTAATTGATTCGGGAACGAACGCAAC
TTTAATCCTCCAGTTTGAGAATTTTACGGGAATCCCCCTGTTGACTTCTGAGATTTCCTG
TCCGACAAAGAGGGGACATTGGTTGTTACCACGGGAGGCGAGATTCAGGCCGCCACCAGC
AGCACCGAAGATGGCGGGGAGAATGTAGTAACTGCCACCGAATATGACATCACCATCAGT
GTCGAGAACTGGTTGGGCGTTTATGGTCACGGCCAAAACAGCGGTTAAGGCAACAAGGAA
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TACTGGATCC

QA 6 735 6 735
DS 

RD RS1D576TF 730 0 0
CAGAAACGCAGATAGAGTTTTATTATTAGTCGTAGTCTTTAATT*CTCTCAGATGATAGA
CATAGTCTTGGGATAAGTCTCTGTCTCATCAGCTTTCATGAACACAAACGAGAATGGTGT
AGAGGTTAAAGCCAAACGTCGCACGCCATATTCGTCGTTAATTATACCGACGTTGATGCA
ATCATTACCGTTAGGACAAGACACAATCTGGTAACCGCCAGGAAAACCTTTAGTTTTCTT
GATCTTGAAGAAACTCCTCGACGAATCTTCTCCAGCTTCCGGGTTAGGACCAGCCGTTAT
GAACAATGTCCTAAAGTGACTTGGGGCCGCAGTGACCCACCAATAGGTTGACTGAACGCA
TATCGTGGCTTTGACGTCCATCTCGATGTTAAGGTTAATTGATTCGGGAACGAACGCAAC
TTTAATCCTCCAGTTTGAGAATTTTACGGGAATCCCCCTGTTGACCTCTGAGATTTCCTG
TCCGACAAAGAGGGGACATTGGTTGTTACCACGGGAGGCGAGATTCAGGCCGCCACCAGC
AGCACCGAAGATGGCGGGGAGAACGTAGTAACTGCCACCGAATATGACATCACCATCAGT
GTCGAGAACTGGTTGGGCGTTTATGGTAACGGCCAAAACAGCGGTTAAGGCAACAAGGAA
GTAAAACATAGGCTTCATCCTTTTTTTCTTGAGTGTATGTGGTTGATTAGGTTTGAATGT
TACTGGATCC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 4

CO CL2930Contig1 809 4 16 U
AATCCAAATGCCCCTTTTGTTTCCCATTATAGTTTTAACTTTTAAGTTTCT*ACAGAACT
AAAAGCTCTCCAGCTAATACAAAAA*GAGTACACACAAGTAACATAATAAACAAGCTTGT
AAAAGAATGTCCAAATCTGAACCAACCAAAATCACATTAGTCACAAGAAATACTTCTCCT
AAAAGAATCTATCCACACATTCAAAGACCATCCTCAAGCAGAGTGAGTTCACCTTTAAAA
TAAAATTCCTCAATTCTCTAAATCATCCTGGAAAGGAATCTTCATATCAAAATCAACCAA
AACTCTTGTTTTCAAAGAACAAGACCCACAAGGAAAAACCACAGACGCCACAGAAGCACC
CAATCTCCTAACTCGAACACAATCACCGTCTCTCAACAACTCAAACCCCATCGTTTCAAG
CTCATAGGAATCAACGGAAAAGTAATCACCACACCTACACTGATAAAAAATCTCCACGTC
TTCTTCTCCGGTGATCTCCACCGACATATCCTCTATGCTAATCTCATCAGCAGCGGTTCC
TCCGTCCTGTCTCGAGGACCGAAGGTCGTTGTCGTAAACCGCGCGTAGCTCTGCATCGCT
CAGGACTTGCCACGCCTTTTGGATCTTGAGAAACGTTTCGTCTGAGCTGCAAAGAGAGCT
GCTTAGCTTGTCTGGGTGTGAGTGGAGGATGGCGGATCGATAGCTGTTGCGGATTTGGTC
ATAGCTCGCGTCTTCTTTGACGGAGAGAATCTCGTAGTGTGTCTCGCGGAGACAAGTTTC
ACCCAGAAGCATGATTGTTGAATCCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1DW79JQ U 1
AF RS1B517JQ U 133
AF RS1B517TF C 25
AF RS1DW79TF C 31
BS 1 51 RS1DW79JQ
BS 52 52 RS1B517TF
BS 53 85 RS1DW79JQ
BS 86 86 RS1B517TF
BS 87 124 RS1DW79JQ
BS 125 125 RS1B517TF
BS 126 166 RS1DW79JQ
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BS 168 184 RS1DW79JQ
BS 185 185 RS1B517JQ
BS 186 220 RS1DW79JQ
BS 221 221 RS1B517JQ
BS 222 352 RS1DW79JQ
BS 353 353 RS1B517JQ
BS 354 447 RS1DW79JQ
BS 448 809 RS1B517TF

RD RS1DW79JQ 450 0 0
AATCCAAATGCCCCTTTTGTTTCCCATTATAGTTTTAACTTTTAAGTTTCTTACAGAACT
AAAAGCTCTCCAGCTAATACAAAAAAGAGTACACACAAGTAACATAATAAACAAGCTTGT
AAAAAAATGTCCAAATCTGAACCAACCAAAATCACATTAGTCACAAAAAATACTTCTCCT
AAAAAAATCTATCCACACATTCAAAGACCATCCTCAAGCAAAGTGAGTTCACCTTTAAAA
TAAAATTCCTCAATTCTCTAAATCATCCTGGAAAGGAATCTTCATATCAAAATCAACCAA
AACTCTTGTTTTCAAAGAACAAGACCCACAAGGAAAAACCACAGACGCCACAAAAGCACC
CAATCTCCTAACTCGAACACAATCACCGTCTCTCAACAACTCAAACCCCATCGTTTCAAG
CTCATAGGAATCAACGGAAAAGTAATC
CCC

QA 1 447 1 447
DS 

RD RS1B517JQ 318 0 0
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CCACACATTCAAAGACCATCCTCAAGCAGAGTGAGTTCACCTTTAAAATAAAATTCCTCA
ATTCTCTAAATCATCCTGGAAAGGAATCTTCATATCAAAATCAACCAAAACTCTTGTTTT
CAAAGAACAAGACCCACAAGGAAAAACCACAGACGCCACAGAAGCACCCAATCTCCTAAC
TCGAACACAATCACCGTCTCTCAACAACTCAAACCCCATCGTTTCAAGCTCATAGGAATC
AACGGAAAAGTAATC
CCC

QA 1 315 1 315
DS 

RD RS1B517TF 785 0 0
TCCCATATAGTTTTAC
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AACATAATAAACAAGCTTGTAAAAGAATGTCCAAATCTGAACCAACCAAAATCACATTAG
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GAGTGAGTTCACCTTTAAGATAAGATTCCTCAATTCTCTAAATCATCCTGGAAAGGAATC
TTCATATCAGAATCAACCAAAACTCTTGTTTTCAAAGAACAAGACCCACAAGGAAGAACC
ACAGACGCCACAGAAGCACCCAATCTCCTAACTCGAACACAATCACCGTCTCTCAACAAC
TCAAACCCCATCGTTTCAAGCTCATAGGAATCAACGGAGAAGTAATCACCACACCTACAC
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QA 17 785 17 785
DS 

RD RS1DW79TF 779 0 0
ATAGTTTAAC
TTTAAGTTTCT*ACAGAACTAAAAGCTCTCCAGCTAATACAAAAA*GAGTACACACAAGT
AACATAATAAACAAGCTTGTAAAAGAATGTCCAAATCTGAACCAACCAAAATCACATTAG
TCACAAGAAATACTTCTCCTAAAAGAATCTATCCACACATTCAAAGACCATCCTCAAGCA
GAGTGAGTTCACCTTTAAGATAAGATTCCTCAATTCTCTAAATCATCCTGGAAAGGAATC
TTCATATCAGAATCAACCAAAACTCTTGTTTTCAAAGAACAAGACCCACAAGGAAGAACC
ACAGACGCCACAGAAGCACCCAATCTCCTAACTCGAACACAATCACCGTCTCTCAACAAC
TCAAACCCCATCGTTTCAAGCTCATAGGAATCAACGGAGAAGTAATCACCACACCTACAC
TGATAAAAAATCTCCACGTCTTCTTCTCCGGTGATCTCCACCGACATATCCTCTATGCTA
ATCTCATCAGCAGCGGTTCCTCCGTCCTGTCTCGAGGACCGAAGGTCGTTGTCGTAAACC
GCGCGTAGCTCTGCATCGCTCAGGACTTGCCACGCCTTTTGGATCTTGAGAAACGTTTCG
TCTGAGCTGCAAAGAGAGCTGCTTAGCTTGTCTGGGTGTGAGTGGAGGATGGCGGATCGA
TAGCTGTTGCGGATTTGGTCATAGCTCGCGTCTTCTTTGACGGAGAGAATCTCGTAGTGT
GTCTCGCGGAGACAAGTTTCACCCAGAAGCATGATTGTTGAATCCTTCC

QA 11 779 11 779
DS 



AS 1 4

CO CL2931Contig1 777 4 3 U
TTGAACGAAAATGCATTCCATTAAAAGAGAGCAAAACAACTCACACAACAAACATCAAAG
TTTCAGATTCAAAAGCAAATTAAGTTCAACACAGAAACAATACCGATCTCAAAAGAAAGA
AAGAAAGTTACAAGTTACAACAACAACAACGAATCATTTCTTATTATTGTTTCCTTTGCC
TCCTCCTCCTCCGGAAGCAGCTGATCCTGCAGCTTGAGCAGCTTTTTTCGCCGCCTTCTC
TTGCAATGCTTTTGCATCCCTTTCACGGCGTTGCTCTGGAGTTAAACCATCGTCTTTGGT
CTTTCCTTTTCCTCCGGCACGAGCTTGAGCTCTTTCACGGTCTCGCTCTCTCTGGCTTCC
TCGTTAAAAAGAACCCATTTAGTCAAAGAAAACAAAAACTAGTTTGCTTCCTATCAACAC
AAGTATATAGCATCACCCTCAAGATCAGATCTGCTTAGAAGATTCACACGGAGAAACCAA
AGACAATTGCTGATCTAATACCAAAACCCTAACATTTGACAAAATTTTCAAGAAATTTCA
GACTTGTAAAACACGCAAAAACACAATTCAAGAACTATGAGGTTCGACATGGAAAAAAAC
TAAAGAACAAGACAAGAAAAGATTTGAAGAAAGAGAAATTCAAACGAATCAACAAGGATA
TGAGTCATGATGATGGATTGATGGTGAGCTTTAGCAGAGAAACCCGCGTAGCTTAGCCAA
CAAGAGATCTGGAGAGAGATCTCTCCCTTACAGAAGCCAAAGGCCAAGAGACAATCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1AL07TF C 1
AF RS1D327JQ U 60
AF RS1D327TF C 62
AF RS1AL07JQ U 2
BS 1 5 RS1AL07TF
BS 6 68 RS1AL07JQ
BS 69 777 RS1D327JQ

RD RS1AL07TF 777 0 0
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QA 1 777 1 777
DS 

RD RS1D327JQ 718 0 0
GTTTCAGAT
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CTTTTGCATCCCTTTCACGGCGTTGCTCTGGAGTTAAACCATCGTCTTTGGTCTTTCCTT
TTCCTCCGGCACGAGCTTGAGCTCTTTCACGGTCTCGCTCTCTCTGGCTTCCTCGTTAAA
AAGAACCCATTTAGTCAAAGAAAACAAAAACTAGTTTGCTTCCTATCAACACAAGTATAT
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AAACACGCAAAAACACAATTCAAGAACTATGAGGTTCGACATGGAAAAAAACTAAAGAAC
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CTGGAGAGAGATCTCTCCCTTACAGAAGCCAAAGGCCAAGAGACAATCC

QA 10 718 10 718
DS 

RD RS1D327TF 716 0 0
GTTCAGA
TCAAAAGCAAATTAAGTTCAACACAGAAACAATACCGATCTCAAAAGAAAGAAAGAAAGT
TACAAGTTACAACAACAACAACGAATCATTTCTTATTATTGTTTCCTTTGCCTCCTCCTC
CTCCGGAAGCAGCTGATCCTGCAGCTTGAGCAGCTTTTTTCGCCGCCTTCTCTTGCAATG
CTTTTGCATCCCTTTCACGGCGTTGCTCTGGAGTTAAACCATCGTCTTTGGTCTTTCCTT
TTCCTCCGGCACGAGCTTGAGCTCTTTCACGGTCTCGCTCTCTCTGGCTTCCTCGTTAAA
AAGAACCCATTTAGTCAAAGAAAACAAAAACTAGTTTGCTTCCTATCAACACAAGTATAT
AGCATCACCCTCAAGATCAGATCTGCTTAGAAGATTCACACGGAGAAACCAAAGACAATT
GCTGATCTAATACCAAAACCCTAACATTTGACAAAATTTTCAAGAAATTTCAGACTTGTA
AAACACGCAAAAACACAATTCAAGAACTATGAGGTTCGACATGGAAAAAAACTAAAGAAC
AAGACAAGAAAAGATTTGAAGAAAGAGAAATTCAAACGAATCAACAAGGATATGAGTCAT
GATGATGGATTGATGGTGAGCTTTAGCAGAGAAACCCGCGTAGCTTAGCCAACAAGAGAT
CTGGAGAGAGATCTCTCCCTTACAGAAGCCAAAGGCCAAGAGACAATCC

QA 8 716 8 716
DS 

RD RS1AL07JQ 776 0 0
GAAC
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AGTTACAAGTTACAACAACAACAACGAATCATTTCTTATTATTGTTTCCTTTGCCTCCTC
CTCCTCCGGAAGCAGCTGATCCTGCAGCTTGAGCAGCTTTTTTCGCCGCCTTCTCTTGCA
ATGCTTTTGCATCCCTTTCACGGCGTTGCTCTGGAGTTAAACCATCGTCTTTGGTCTTTC
CTTTTCCTCCGGCACGAGCTTGAGCTCTTTCACGGTCTCGCTCTCTCTGGCTTCCTCGTT
AAAAAGAACCCATTTAGTCAAAGAAAACAAAAACTAGTTTGCTTCCTATCAACACAAGTA
TATAGCATCACCCTCAAGATCAGATCTGCTTAGAAGATTCACACGGAGAAACCAAAGACA
ATTGCTGATCTAATACCAAAACCCTAACATTTGACAAAATTTTCAAGAAATTTCAGACTT
GTAAAACACGCAAAAACACAATTCAAGAACTATGAGGTTCGACATGGAAAAAAACTAAAG
AACAAGACAAGAAAAGATTTGAAGAAAGAGAAATTCAAACGAATCAACAAGGATATGAGT
CATGATGATGGATTGATGGTGAGCTTTAGCAGAGAAACCCGCGTAGCTTAGCCAACAAGA
GATCTGGAGAGAGATTTCTCCCTTACAGAAGCCAAAGGCCAAGAGACAATCC

QA 5 776 5 776
DS 



AS 1 3

CO CL2932Contig1 1086 3 11 U
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ATTATAACATTTATCGCCCATCAAAACTAATCAAAAGCCCATTGCCTTTCTGGAATCCTA
AGCCTAACCGAATCGGTGAAAGGCCCATATAAATCCCTATTTATTTACATTAATTACCAC
TCTACCCTCTCAAAGATTATCATGAGAGTTACCAACCAAACCAAATGATCTATCTCTCAT
TGCCTAAACTCATATGTCTGACCCGAAGGTCCGAACCCGCCACTACTCAACCCGCTCGAG
CTGTACCCGAAACTCTGAGTCAACTCGCTCGAGTTCACCTGCGAATTTCTCAACCCGCTC
TCCGCCTCTCCCTCCGCCGCTCGAAACGCGTCGTACCCTCCTCCGCCGTACCGTTGTTGC
TCGCCGGAGCTAGCTCCGGGATGGGATTAAGACCGGCTAAGCTCGCCCAGTCGAAATTCC
CGTTGAGAAGCGTCCTGAGAGAATTCACCCGAGGAAGATCGAAAGACCGATCCTTCATCT
CCGGGAACGAGTCGAGAACGTCCTCGTGGTGAGACGACGAAGAGGACGACGACCCGTTCG
TGCTGTGTTCAGGTTGAACCGGAGCAACGGCTTGTTGTCTCTGAGACCCCGACGTCTTCT
TGTAGATTCGACACAACACCCAATCATCCAACTTGGAGCTTCCGTGGCTACGAGAATGCT
CGAAGAGGCGATACTCGTGCATGATCCAGTTCGTTTTGGTGCCTTTTGGAGCTTTTCCCG
CGTAGAAAACCAGAGCTTTTTTAATCCCGACGCGGTGGCCGTCAGACGTGATGATTTTGT
CCGTACCCGTCGCCTTCCAGTAACCCGACCCGGCTACTCTGTTGGGTCTCGACCCGTTGG
ATATTTACGGTCTCTCGGGCTGAAGAAATACCATTCCTTCTCCCCAAACAAGGCCTTACT
TGGCAAATCCCAAGGATCGAACTTGTAGAGATCGATGTCTCCTATGACTTGGAGAGAGAA
ATGATAGCCTGCAACTTTCCGACAGAGATACTGAACAAGAAGCTCTTCATCTGTCGGGTA
AAATCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1AL47JQ U 1
AF RS1BQ64JQ U 1
AF RS1AL47TF C 351
BS 1 478 RS1AL47JQ
BS 479 479 RS1BQ64JQ
BS 480 747 RS1AL47JQ
BS 748 762 RS1BQ64JQ
BS 763 763 RS1AL47TF
BS 764 788 RS1BQ64JQ
BS 789 789 RS1AL47TF
BS 790 801 RS1BQ64JQ
BS 802 802 RS1AL47TF
BS 803 853 RS1BQ64JQ
BS 854 1086 RS1AL47TF

RD RS1AL47JQ 747 0 0
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TGCCTAAACTCATATGTCTGACCCGAAGGTCCGAACCCGCCACTACTCAACCCGCTCGAG
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TGTAGATTCGACACAACACCCAATCATCCAACTTGGAGCTTCCGTGGCTACGAGAATGCT
CGAAGAGGCGATACTCGTGCATGATCC

QA 1 747 1 747
DS 

RD RS1BQ64JQ 870 0 0
GAAACAACCATTTTATTTTTTAAGAATTCGACGAATCCATCAAGGTATAGTGGAACAATT
ATTATAACATTTATCGCCCATCAAAACTAATCAAAAGCCCATTGCCTTTCTGGAATCCTA
AGCCTAACCGAATCGGTGAAAGGCCCATATAAATCCCTATTTATTTACATTAATTACCAC
TCTACCCTCTCAAAGATTATCATGAGAGTTACCAACCAAACCAAATGATCTATCTCTCAT
TGCCTAAACTCATATGTCTGACCCGAAGGTCCGAACCCGCCACTACTCAACCCGCTCGAG
CTGTACCCGAAACTCTGAGTCAACTCGCTCGAGTTCACCTGCGAATTTCTCAACCCGCTC
TCCGCCTCTCCCTCCGCCGCTCGAAACGCGTCGTACCCTCCTCCGCCGTACCGTTGTTGC
TCGCCGGAGCTAGCTCCGGGATGGGATTAAGACCGGCTAAGCTCGCCCAGTCGAAATTCC
CGTTGAGAAGCGTCCTGAGAGAATTCACCCGAGGAAGATCGAAAGACCGATCCTTCATCT
CCGGGAACGAGTCGAGAACGTCCTCGTGGTGAGACGACGAAGAGGACGACGACCCGTTCG
TGCTGTGTTCAGGTTGAACCGGAGCAACGGCTTGTTGTCTCTGAGACCCCGACGTCTTCT
TGTAGATTCGACACAACACCCAATCATCCAACTTGGAGCTTCCGTGGCTACGAGAATGCT
CGAAGAGGCGATACTCGTGCATGATCCAGTTCGTTTTGGTGC*TTTTGGAGCTTTTCCCG
CGTAGAAA*CCAGAGCTTTTT*AATCCCGACGCGGTGGCCGTCAGACGTGATGATTTTGT
CCGTACCCGTCGC
TTCAGTACCCGACCCGG

QA 1 853 1 853
DS 

RD RS1AL47TF 736 0 0
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CCGTTGTTGCTCGCCGGAGCTAGCTCCGGGATGGGATTAAGACCGGCTAAGCTCGCCCAG
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GACGTCTTCTTGTAGATTCGACACAACACCCAATCATCCAACTTGGAGCTTCCGTGGCTA
CGAGAATGCTCGAAGAGGCGATACTCGTGCATGATCCAGTTCGTTTTGGTGCCTTTTGGA
GCTTTTCCCGCGTAGAAAACCAGAGCTTTTTTAATCCCGACGCGGTGGCCGTCAGACGTG
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GACCCGTTGGATATTTACGGTCTCTCGGGCTGAAGAAATACCATTCCTTCTCCCCAAACA
AGGCCTTACTTGGCAAATCCCAAGGATCGAACTTGTAGAGATCGATGTCTCCTATGACTT
GGAGAGAGAAATGATAGCCTGCAACTTTCCGACAGAGATACTGAACAAGAAGCTCTTCAT
CTGTCGGGTAAAATCC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 3

CO CL2933Contig1 791 3 5 U
AAAAAAGCCTGCAAACTGCAAAGACAATATTATATCTAACCGCCTAACTTGGCAGAAGTT
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TAACGAAACTTCATATAATTAGATAACAAAATACACATTTGGATCTCCAACTTAAACCTA
CATAATTGTGCCTTTCCTAAGATGCTTCAGCAATTACAGAGCCAACCTCACGCATAAAGT
CAGTCTTCTCCAACACAAGTTCCATTTCTTTGGCCTGCAACAGCTTCCACTTCTCTTCCA
TTTTCTTCTTAGTCTCCACAGCCACCATGCTCCATCTCTCTTTCACAAACCGTTCACCCA
CACCCAAGCTCCCAATGGATCCAACAAGAAACGAGTCTTCAAACCAGTCAGATGCACTCG
AATCTCCATTAACCAACACTTGTTTATCTACTTGTACCTTCTTACCGTTAACCAGCATCT
CCCTATCTTCTTCTTCCTTGTCACCATTTTCACCATTAACTTCCAAATTAGCATCAGATT
CAACTTCTTTCTGTACCTCTTGACCATGAGGTTTGACAGAGTCACTCTTCTTCACATTAG
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CATGAGATTTGGAGATAGATTCTACACCTCTCTTCACATACTTCTTCCTCAAAGACCTAA
TCTTCTCAGCAGTTTGGTACTTGCTAGCCTCAAAGCTAATGGATTTCTTGATGAGTTCAT
AGAAACCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BI49JQ U 32
AF RS1AX04JQ U 1
AF RS1AX04TF C 25
BS 1 410 RS1AX04JQ
BS 411 411 RS1BI49JQ
BS 412 536 RS1AX04JQ
BS 537 537 RS1BI49JQ
BS 538 791 RS1AX04JQ

RD RS1BI49JQ 706 0 0
ATATCTAACCGC
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AAAGTTAGGTAGGAAGATAACGAAACTTCATATAATTAGATAACAAAATACACATTTGGA
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AACCTCACGCATAAAGTCAGTCTTCTCCAACACAAGTTCCATTTCTTTGGCCT**AACAG
CTTCCACTTCTCTTCCATTTTCTTCTTAGTCTCCACAGCCACCATGCTCCATCTCTCTTT
CACAAACCGTTCACCCACACCCAAACTCCCAATGGATCCAACAAGAAACGAGTCTTCAAA
CCAGTCAGATGCACTCGAATCTCCATTAACCAACACTTGTTTATCTACTTGCACCTTCTT
ACCGTTAACCAGCATCTCCCTATCTTCTTCTTCCTTGTCGCCATTTTCACCATTAACTTC
CAAATTAGCATCAGATTCAACTTCTTTCTCTACCTCTTGACCATGAGGTTTGACAGAGTC
ACTCTTCTTCACATTAGACTTGAGCGCCAATCCATTAGATCCCCAAATATATTTGGACAA
GTTAAAACATCCCATATCATGAGATTTGGAGATAGATTCTACACCTCTCTTCACATACTT
CTTCCTCAAAGACCTAATCTTCTCAGCAGTTTGG

QA 13 706 13 706
DS 

RD RS1AX04JQ 791 0 0
AAAAAAGCCTGCAAACTGCAAAGACAATATTATATCTAACCGCCTAACTTGGCAGAAGTT
TTAATTACTTCAATGGAGTTCACAAGATGAAACAGAAAACCAGAAAGTTAGGTAGGAAGA
TAACGAAACTTCATATAATTAGATAACAAAATACACATTTGGATCTCCAACTTAAACCTA
CATAATTGTGCCTTTCCTAAGATGCTTCAGCAATTACAGAGCCAACCTCACGCATAAAGT
CAGTCTTCTCCAACACAAGTTCCATTTCTTTGGCCTGCAACAGCTTCCACTTCTCTTCCA
TTTTCTTCTTAGTCTCCACAGCCACCATGCTCCATCTCTCTTTCACAAACCGTTCACCCA
CACCCAAGCTCCCAATGGATCCAACAAGAAACGAGTCTTCAAACCAGTCAAATGCACTCG
AATCTCCATTAACCAACACTTGTTTATCTACTTGTACCTTCTTACCGTTAACCAGCATCT
CCCTATCTTCTTCTTCCTTGTCACCATTTTCACCATTAACTTCCAAATTAGCATCAAATT
CAACTTCTTTCTGTACCTCTTGACCATGAGGTTTGACAGAGTCACTCTTCTTCACATTAG
ACTTGAGCGCCAATCCATTAGATCCCCAAATATATTTGGACAAGTTAAAACATCCCATAT
CATGAGATTTGGAGATAGATTCTACACCTCTCTTCACATACTTCTTCCTCAAAGACCTAA
TCTTCTCAGCAGTTTGGTACTTGCTAGCCTCAAAGCTAATGGATTTCTTGATGAGTTCAT
AGAAACCATCC

QA 1 791 1 791
DS 

RD RS1AX04TF 767 0 0
AAGACAATATATATCTACG
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AAAGTTAGGTAGGAAGATAACGAAACTTCATATAAT*AGATAACAAAATACACATTTGGA
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AACCTCACGCATAAAGTCAGTCTTCTCCAACACAAGTTCCATTTCTTTGGCCTGCAACAG
CTTCCACTTCTCTTCCATTTTCTTCTTAGTCTCCACAGCCACCATGCTCCATCTCTCTTT
CACAAACCGTTCACCCACACCCAAGCTCCCAATGGATCCAACAAGAAACGAGTCTTCAAA
CCAGTCAGATGCACTCGAATCTCCATTAACCAACACTTGTTTATCTACTTGTACCTTCTT
ACCGTTAACCAGCATCTCCCTATCTTCTTCTTCCTTGTCACCATTTTCACCATTAACTTC
CAAATTAGCATCAGATTCAACTTCTTTCTGTACCTCTTGACCATGAGGTTTGACAGAGTC
ACTCTTCTTCACATTAGACTTGAGCGCCAATCCATTAGATCCCCAAATATATTTGGACAA
GTTAAAACATCCCATATCATGAGATTTGGAGATAGATTCTACACCTCTCTTCACATACTT
CTTCCTCAAAGACCTAATCTTCTCAGCAGTTTGGTACTTGCTAGCCTCAAAGCTAATGGA
TTTCTTGATGAGTTCATAGAAACCATCC

QA 20 767 20 767
DS 



AS 2 4

CO CL2934Contig1 881 2 6 U
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CCAAAACCATGAGAGGCCACAACTTCGTCGAAGCCCATTATCATCGTCAATGGCTAAAGC
CAGCACCACTCTGTTTGCTGTCACCTCCTCTGTTTCGACTCGTTTCTCTCTTCTCCCTCC
TTCTAAATCTCTTAAACTCTCAGCTCCAAGCGCGAGACTCGCCGTGCCAATGGCTGCTAT
GGCCACCACTGCTAAAAAGGTGGCTCCTGCTGTGATCGTGGGTGGCGGGAGAGTCGGACA
AGCGTTGCAGGAAATGGGTAGTGGCGATGATGTATTGGTGAAGAGAGGAGAACCCGTTCC
GGTTGATTTCGAAGGACCTATATTGGTTTGTACTAGAAATGATGATCTCGATGCTGTTCT
TGAAGCTACTCCTCAGTCTAGATGGAAAGATTTGGTGTTTTTCCAAAATGGAATGATGGA
GCCGTGGTTCGAGAGCAAAGGTTTGGGTGATGCAGACCAAGTGTTGGCCTATTTTGCTGT
GTCAAAGCTCGGTGAGCCTCCTGTGGATGGGATAACTGACACTAACCCAGAAGGTTTAAC
TGCTGCTTATGGCAAATGGGCTTCGGATGTAGCTGCAAGACTGCAATCTGGTGGCCTCTC
TTGCAAGGTACTTGACAAAGAATCTTTTCAGAAGCAAATGCTGGAGAAACTCATATGGAT
TTGTGCGTTTATGCTTGTTAGAGCTCATCATCCAGGGGCTAGTGTGGGCATGGTGGAGAA
AGAATACAGAGATGAAGTGGCGAGACTCATCCAAGAACTCGCAGCAGCTGCTGCTGCAAA
AAAGACTAACCTTTGAGACACATGGTGGAGAGACTGTGTGC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AP67TFB U 1
AF RS1BD68TF U 85
BS 1 739 RS1AP67TFB
BS 740 740 RS1BD68TF
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CCAAAACCATGAGAGGCCACAACTTCGTCGAAGCCCATTATCATCGTCAATGGCTAAAGC
CAGCACCACTCTGTTTGCTGTCACCTCCTCTGTTTCGACTCGTTTCTCTCTTCTCCCTCC
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GGCCACCACTGCTAAAAAGGTGGCTCCTGCTGTGATCGTGGGTGGCGGGAGAGTCGGACA
AGCGTTGCAGGAAATGGGTAGTGGCGATGATGTATTGGTGAAGAGAGGAGAACCCGTTCC
GGTTGATTTCGAAGGACCTATATTGGTTTGTACTAGAAATGATGATCTCGATGCTGTTCT
TGAAGCTACTCCTCAGTCTAGATGGAAAGATTTGGTGTTTTTCCAAAATGGAATGATGGA
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G

QA 1 838 1 838
DS 

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GG
GTCGAAGCCCATTATCATCGTCAATGGCTAAAGCCAGCACCACTCTGTTTGCTGTCACTT
CCTTTGTTTCGACTCGTTTCTCTCTTCTCCCTCCTTCTAAATCTCTTAAACTCTCAGCTC
CAAGTGCGGGACTCGCCGTGCCAATGGCTGCTATGGCCACCACTGCTAAAAAGGTGGCTC
CTGCTGTGATCGTGGGTGGCGGGAGAGTCGGACAAGCGTTGCAGGAAATGGGTAGTGGCG
ATGATGTATTGGTGAAGAGAGGAGAACCCGTTCCGGTTGATTTCGAAGGACCTATATTGG
TTTGTACTAGAAATGATGATCTCGATGCTGTTCTTGAAGCTACTCCTCAGTCTAGATGGA
AAGATTTGGTGTTTTTCCAAAATGGAATGATGGGGCCGTGGTTCGAGAGCAAAGGTTTGG
GTGATGCAGACCAAGTGTTGGCCTATTTTGCTGTGTCAAAGCTCGGTGAGCCTCCTGTGG
ATGGGATAACTGACACTAACCCAGAAGGTTTAACTGCTGCTTATGGCAAATGGGCTTCGG
ATGTAGCTGCAAGACTGCAATCTGGTGGCCTCTCTTGCAAGGTACTTGACAAAGAATCTT
TTCAGAAGCAAATGCTGGAGAAACTCATATGGATTTGTGCGTTTATGCTTGTTAGAGCTC
ATCATCCAGGGGCTAGTGTGGGCATGGTGGAGAAAGA*TACAGAGATGAAGTGGCGAGAC
TCATCCAAGA*CTCGCAGCAGCTGCTGCTGCAAAAAAGACTAACCTTTGAGACACATGGT
GGAGAGACTGTGTGC

QA 3 797 3 797
DS 



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CGCCTTCTGTGAGAGCGAATAAAACCAACCATTCCTCCATTTAAATTCTTTAACAGCGGT
TGGGAAATGAGCAACGGCTCTGGAATAAGCACACAGTCTCTCCACCATGTTGTCTTCAAA
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AGGAGTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BD68JQ U 1
AF RS1AP67JQ U 126
BS 1 136 RS1BD68JQ
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BS 475 752 RS1BD68JQ
BS 753 787 RS1AP67JQ

RD RS1BD68JQ 752 0 0
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TCAAACGTTTTACCGTTACTTGGCTTCTCATACACGTGTACAAAGCTCAAACTAGTTTCA
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TTTTAGCTCTCTCAGCCATTCGGCGTGGAGTGGACAAGGATCAGGTTTCCCTTCTTCAAT
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TGGGAAATGAGCAACGGCTCTGGAATAAGCACACAGTCTCTCCACCATGTTGTCTTCAAA
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CTCGAACCACGGCCCCATCATTCCATTTTGGA

QA 1 752 1 752
DS 

RD RS1AP67JQ 662 0 0
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AATGAGCAACGGCTCTGGAATAAGCACACAGTCTCTCCACCATGTTGTCTTCAAAGGTTA
GTCCTTTTTCTGCAGCAGCAGCTGCTGCGAGTTCTTGGATGAGTCTCGCCACTTCATCTC
TGTATTCTTTCTCCACCATGCCCACACTAACCCCTGGATGACGAGCTCCAACAAGCATAA
ACGCACAAATCCATATGAGTTTCTCCAGCATTTGCTTCTGAAAAGATTCTTTGTCAAGTA
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AAGCAGCAGTTAAACCTTCTGGGTTAGTGTCAGTTATCCCATCCACAGGAGGCTCACCGA
GCTTTGACACAGCAAAATAGGCCAACACTTGGTCTGCATCACCCAAACCTTTGCTCTCGA
ACCACGGCTCCATCATTCCATTTTGGAAAAACACCAAATCTTTCCATCTAGACTGAGGAG
TA

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 4

CO CL2935Contig1 729 4 7 U
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ATTAAAAAAAAACTTTTAAAAGTGAAAAGAAAAGAAACCAACAACAGAATAGTAGAAATC
AAAGTGATCATATGATTATAACTTTTTTGTTTGCTGCTCAGTGATCTTCAATCTTCTTCA
ACCCCTTCATATCAGTAGTCTCAACCGTTGAGCCGTAAAGAGCGATCTTCTGAACCTTTG
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GGTTGAGGCATTCAACACCTGACCAGTCAATGAAATCTAGCAGATCAACCTGTCCCTTAG
GAATATCGGTGGCTGATTCGGCGGACATCGTAGAAGCTTTTTTCGTTTCGTTCTTACAAA
GAAATCTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1D307JQ U 26
AF RS1EW66JQ U 1
AF RS1EW66TF C 1
AF RS1D307TF C 103
BS 1 218 RS1EW66JQ
BS 219 219 RS1D307JQ
BS 220 501 RS1EW66JQ
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BS 503 598 RS1EW66JQ
BS 599 599 RS1D307JQ
BS 600 729 RS1EW66JQ

RD RS1D307JQ 616 0 0
GTA
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GAAAAGAAACCAACGACAGAATAGTAGAAATCAAAGTGATCATATGATTATAACTTTTTT
GTTTGCTGCTCAGTGATCTTCAATCTTCTTCAACCCCTTCATATCAGTAGTCTCAACCGT
TGAGCCGTAAAGAGCGATCTTCTGAACCTTTGTGAGCTCAGAACCCGATTGGTTGTCTTC
AATGAAGGTCGTCAAGCTACGAACATTCTGAAACTTAACATATTTAAGGACCACCGGTTT
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AAGCTGTTCATCAGCATCACTCTCTAGGTTCAAACCCGCATCTTCTCTATACCCCTGCTT
GAGAGCATTGGGCAAAGAGTGACTTGAGCTCTGGTTGAGGCATTCAACACCTGACCAGTC
AATGAAATCTAGC

QA 4 616 4 616
DS 

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ATTAAAAAAAAACTTTTAAAAGTGAAAAGAAAAGAAACCAACAACAGAATAGTAGAAATC
AAAGTGATCATATGATTATAACTTTTTTGTTTGCTGCTCAGTGATCTTCAATCTTCTTCA
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TGTCACTTGGAGGAAAATCATTGACATTGCTGAAGCACATGTGCTCTTTGTTTGAGAAAA
ACTTGACAGTTTTAGGACCATCCTCTTCAGGGCCTTTGATAGCAAAAGAATGCAGTTTGA
CAACTTGGTTAAAAGGAATATTGATTAGAAGCTGTTCATCAGCATCACTCTCTAGGTTCA
AACCCGCATCTTCTCTATACCCCTGCTTGAGAGCATTGGGCAAAGAGTGACTTGAGCTTT
GGTTGAGGCATTCAACACCTGACCAGTCAATGAAATCTAGCAGATCAACCTGTCCCTTAG
GAATATCGGTGGCTGATTCGGCGGACATCGTAGAAGCTTTTTTCGTTTCGTTCTTACAAA
GAAATCTCC

QA 1 729 1 729
DS 

RD RS1EW66TF 729 0 0
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ATTAAAAAAAA*CTTTTAAAAGTGAAAAGAAAAGAAACCAACAACAGAATAGTAGAAATC
AAAGTGATCATATGATTATAACTTTTTTGTTTGCTGCTCAGTGATCTTCAATCTTCTTCA
ACCCCTTCATATCAGTAGTCTCAACCGTTGAGCCGTAAGGAGCGATCTTCTGAACCTTTG
TGAGCTCAGAACCCGATTGGTTGTCTTCAATGAAGATCGTCAAGCTACGAACATTCTGAA
ACTTAACATATTTAAGGACCACCGGTTTTCCCTTAAGGTTTTCTTCAGTTAGTTCAGCGG
TGTCACTTGGAGGAAAATCATTGACATTGCTGAAGCACATGTGCTCTTTGTTTGAGAAAA
ACTTGACAGTTTTAGGACCATCCTCTTCAGGGCCTTTGATAGCAAAAGAATGCAGTTTGA
CAACTTGGTTAAAAGGAATATTGATTAGAAGCTGTTCATCAGCATCACTCTCTAGGTTCA
AACCCGCATCTTCTCTATACCCCTGCTTGAGAGCATTGGGCAAAGAGTGACTTGAGCTTT
GGTTGAGGCATTCAACACCTGACCAGTCAATGAAATCTAGCAGATCAACCTGTCCCTTAG
GAATATCGGTGGCTGATTCGGCGGACATCGTAGAAGCTTTTTTCGTTTCGTTCTTACAAA
GAAATCTCC

QA 1 729 1 729
DS 

RD RS1D307TF 627 0 0
G
ACAGAATAGTAGAAATCAAAGTGATCATATGATTATAACTTTTTTGTTTGCTGCTCAGTG
ATCTTCAATCTTCTTCAACCCCTTCATATCAGTAGTCTCAACCGTTGAGCCGTAAAGAGC
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GCTACGAACATTCTGAAACTTAACATATTTAAGGACCACCGGTTTTCCCTTAAGGTTTTC
TTCAGTTAGTTCAGCGGTGTCACTTGGAGGAAAATCATTGACATTGCTGAAGCACATGTG
CTCTTTGTTTGAGAAAAACTTGACAGTTTTAGGACCATCCTCTTCAGGGCCTTTGATAGC
AAAAGAATGCAGTTTGACAACTTGGTTAAAAGGAATATAGATTAGAAGCTGTTCATCAGC
ATCACTCTCTAGGTTCAAACCCGCATCTTCTCTATACCCCTGCTTGAGAGCATTGGGCAA
AGAGTGACTTGAGCTCTGGTTGAGGCATTCAACACCTGACCAGTCAATGAAATCTAGCAG
ATCAACCTGTCCCTTAGGAATATCGGTGGCTGATTCGGCGGACATCGTAGAAGCTTTTTT
CGTTTCGTTCTTACAAAGAAATCTCC

QA 2 627 2 627
DS 



AS 2 4

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CTCATAACACCAATGCTCTCTGTTTCTCTGTATCCTCCAACCCAAAATTGAGTCTTTTAA
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TAACCGAAGTCATCCACAACAAGGTACTCATAGCTGCTGGGCTCTCCGGGGCGATTGGGC
AGCTCTTAAAGCCCTTCACTTCCGTGGTTTTCTACAAGAAAAAACTTGACTTTAGAACGC
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TCTGATCATGTATGATGCACAGGGTGTGAGGAGAGAAGTTGGAAAGCATGCGAGAGTGTT
GAACAAACTAACGGCTAATGCTCGGAGAGGTGAGGAGATGAGTTTAAAGGGGAAGGAAGG
TGAGACTTTGGAGTCCGATGAGATCAGTGAGGAAGTGAAACTTCCGTTGAAAGAATCAAT
AGGACATACTGAAGTTGAAGTGATAGCAGGAGCTTTGTTCGGTTTCTTAGTTAGCTTTGG
TGTTTATTCCCTTATGTAAAAGCTACCAACTTTATACGTGGGTTGTTAAGAAAGAAGGAG
AGTTTGATTATTATTGTAAAACTTAAGAGAATCAGTTGAAATGTCAAATCAGTTTTGTGG
ATACCATAGTTGGAATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E621TF U 1
AF RS1E621JQ C 26
BS 1 600 RS1E621TF
BS 601 798 RS1E621JQ

RD RS1E621TF 600 0 0
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AATTGCTTTTGAAAGGGGATTTGATGACTCCATTTTTGGTCTCACTGTGGTTTATGCTGC
TCTGATCATGTATGATGCACAGGGTGTGAGGAGAGAAGTTGGAAAGCATGCGAGAGTGTT
GAACAAACTAACGGCTAATGCTCGGAGAGGTGAGGAGATGAGTTTAAAGGGGAAGGAAGG
TGAGACTTTGGAGTCCGATGAGATCAGTGAGGAAGTGAAACTTCCGTTGAAAGAATCAAT

QA 1 600 1 600
DS 

RD RS1E621JQ 773 0 0
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CACGCCCTGCGCTCTCAATGTTGGACTCCAAGATGTAACCGAAGTCATCCACAACAAGGT
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GGTTTTCTACAAGAAAAAACTTGACTTTAGAACGCTTTGCAAGCTGGAGGCTTCCCTTCA
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GACTCCATTTTTGGTCTCACTGTGGTTTATGCTGCTCTGATCATGTATGATGCACAGGGT
GTGAGGAGAGAAGTTGGAAAGCATGCGAGAGTGTTGAACAAACTAACGGCTAATGCTCGG
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AGTGAGGAAGTGAAACTTCCGTTGAAAGAATCAATAGGACATACTGAAGTTGAAGTGATA
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CCAACTTTATACGTGGGTTGTTAAGAAAGAAGGAGAGTTTGATTATTATTGTAAAACTTA
AGAGAATCAGTTGAAATGTCAAATCAGTTTTGTGGATACCATAGTTGGAATGC

QA 1 773 1 773
DS 



CO CL2936Contig2 747 2 3 U
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TCAAACTCTCCTTCTTTCTTAACAACCCACGTATAAAGTTGGTAGCTTTTACATAAGGGA
ATAAACACCAAAGCTAACTAAGAAACCGAACAAAGCTCCTGCTATCACTTCAACTTCAGT
ATGTCCTATTGATTCTTTCGACGGAAGTTTCACTTCCTCACTGATCTCATCGGACTCCAA
AGTCTCACCTTCCTTCCCCTTTAAACTCATCTCTTCGCCTCTCCGAGCATTAGCCGTTAG
TTTGTTCAACACTCTCGCATGCTTCCCAACTTCTCTCCTCACACCCTGTGCATCATACAT
GATCAGAGCAGCATAAACCACAGTGAGACCAAAAATAGAGTCATCAAATCCCCTTTCAAA
AGCAATTGCAGTTGCTGCAGCCACAACAAAAGAGGAATGTGTTGAAGGGAAGCCTCCAGC
TTGTAAAGCGGTTCTAAAGTCAAGCTTTTTCTTGTAGAAAACCACGGAAGTGAAGGGCTT
TAAGAGTTGCCCAATTGCTCCAGAGAAGCCAGCAGCTATGAGTACCTTGTTGTGGATAAC
TTCGGTTACATCTTGGAGTCCAACATTGAGAGCGCAGGACGTGAGACGATTTGGCTTCTT
TGGCGGGATTAAAAGATTGAACTTTGGGTTGGATACAGAGAAACAGAGAGCATTGGCGTT
ATGAGACACAAAGCTCTGTTTCAGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RS1FJ51TF C 1
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BS 1 7 RS1FJ51TF
BS 8 744 RS1FJ51JQ
BS 745 747 RS1FJ51TF

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TAAGAGTTGCCCAATTGCTCCAGAGAAGCCAGCAGCTATGAGTACCTTGTTGTGGATAAC
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ATGAGACACAAAGCTCTGTTTCAGCCC

QA 1 747 1 747
DS 

RD RS1FJ51JQ 737 0 0
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ATTGATTCTTTCGACGGAAGTTTCACTTCCTCACTGATCTCATCGGACTCCAAAGTCTCA
CCTTCCTTCCCCTTTAAACTCATCTCTTCGCCTCTCCGAGCATTAGCCGTTAGTTTGTTC
AACACTCTCGCATGCTTCCCAACTTCTCTCCTCACACCCTGTGCATCATACATGATCAGA
GCAGCATAAACCACAGTGAGACCAAAAATAGAGTCATCAAATCCCCTTTCAAAAGCAATT
GCAGTTGCTGCAGCCACAACAAAAGAGGAATGTGTTGAAGGGAAGCCTCCAGCTTGTAAA
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TGCCCAATTGCTCCAGAGAAGCCAGCAGCTATGAGTACCTTGTTGTGGATAACTTCGGTT
ACATCTTGGAGTCCAACATTGAGAGCGCAGGACGTGAGACGATTTGGCTTCTTTGGCGGG
ATTAAAAGATTGAACTTTGGGTTGGATACAGAGAAACAGAGAGCATTGGCGTTATGAGAC
ACAAAGCTCTGTTTCAG

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 4

CO CL2937Contig1 1059 4 9 U
GGAGATAGAGGCTAGGCACTAACATAACTGTTCAACATACCTCCCACATCTCTCTAGAAA
CCCAGATCCAAGCGAATCTCGTCCGCTGGCTCCGGTGGCTACCATAGCACCGGAGCTGGG
CTCTTTTCTGTTTATTATTTTGTCTTTTTCTCGTGTAGCTCTGTTTCGCCGCTGTTTTTG
TAGGGGTGAAGCAACGGTTTCGTAGGCTTCGTTCGTCTGAAGCAGCGCTCCGGCTCCGCC
TCCGTTTTGACAGTCGACGGTCTTTAGTCCTCAGCCCCTTTCCTTTGTTACTGTTCAAGC
TCCTCGTTTGTGGCGATTGAGAAGTGTTTTTGCGTTCTGAGTTTTCAGATCTGGTTTCCC
TTTGGAGCTATGGCTCAGGGTTTGGCCTATTTTCGCGGTGTTTGGATTGCCCCATGTCTT
GTGTTTGCCCTTGATGATGTATCGCTTGATGGTTTTGTCGATGCTGGTGTTTGGGTGTGA
CCTCCTGGGTTCCGCTTCTCCCGCTCGTGAAAGATCGTGTTTTTACGGATATGCTTATCT
TGAGGAAAGCTCTCTCAGTTTCCTCCTCTTTGCCGTTGCTGATCTTTGCCGGCCTGGGTT
CTATCCGCAATTTTTGGTTCGTCCAATTGCGGTTGCC*GGTAGCGTTATGTGAGGCGGAT
CTGTCCTGGTGGTTTCTCTTTGCCCCTAAAGTTCTAGCCTTTGTTCGTGATTCGTGATAG
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GTTGGGGTCCTTCCATGTTCTTAATTTCTGCTGGTCCTGTCTTTTAGAGCTTTTATTTGA
TTGTCTCCAGCGATCCTTTGCCTTGGTTTATGAAGGGAGTGTTGTGGTTTTTGACTGAGC
GTTTATGTATTTGCTTTTAGTTTCATCTGTCTCCTTGTGTGGAGCTTTTAGTCTCAGGAG
ATAATATATTATCTGCCTGCTTAGTTTCTCAATCTTTTGAGCTCTGTATTTCATGTTGTA
AGCTCAGGGTGAAGTTCTAATGAAAATATTGTTCAGAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1H223TF U 1
AF RS1BR02TF U 327
AF RS1H223JQB C 287
AF RS1BR02JQ C 332
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QA 1 650 1 650
DS 

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TTTTT
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QA 6 482 6 482
DS 

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AGATCTGGTTTCCCTTTGGAGCTATGGTTCAGGGTTTGGCCTATTTTCGCGGTGTTTGGA
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GGATATGCTTATCTTGAGGAAAGCTCTTTCAGTTTCCTCCTCTTTGCCGTTGCTGATCTT
TGCCGGCCTGGGTTCTATCCGCAATTTTTGGTTCGTCCAATTGCGGTTGCC*GGTAGCGT
TATGTGAGGCGGATCTGTCCTGGTGGTTTCTCTTTGCCCCTAAAGTTCTAGCCTTTGTTT
GTGATTCGTGATAGTTCTTGCAGGAATTGTTGGTTACCTACAGCTATCATTGTGGCCTCG
CCAGGTCATACAATGTTGGGGTCCTTCCATGTTCTTAATTTCTGCTGGTCCTGTCTTTTA
GAGCTTTTATTTGATTGTCTCCAGCGATCCTTTGCCTTGGTTTATGAAGGGAGTGTTGTG
GTTTTTGACTGAGCGTTTATGTATTTGCTTTTAGTTTCATCTGTCTCCTTGTGTGGAGCT
TTTAGTCTCAGGAGATAATATATTATCTGCCTGCTTAGTTTCTCAATCTTTTGAGCTCTG
TATTTCATGTTGTAAGCTCAGGGTGAAGTTCTAATGAAAATATTGTTCAGAGG

QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1BR02JQ 727 0 0
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TTCGCGGTGTTTGGATTGCCCCATGTCTTGTGTTTGCCCTTGATGATGTATCGCTTGATG
GTTTTGTCGATGCTGGTGTTTGGGTGTGACCTCCTGGGTTCCGCTTCTCCCGCTCGTGAA
AGATCGTGTTTTTACGGATATGCTTATCTTGAGGAAAGCTCTCTCAGTTTCCTCCTCTTT
GCCGTTGCTGATCTTTGCCGGCCTGGGTTCTATCCGCAATTTTTGGTTCGTCCAATTGCG
GTTGCC*GGTAGCGTTATGTGAGGCGGATCTGTCCTGGTGGTTTCTCTTTGCCCCTAAAG
TTCTAGCCTTTGTTCGTGATTCGTGATAGTTCTTGCAGGAATTGTTGGTTACC*ACAGCT
ATCATTGTGGCCTCGCCAGGTCATACAATGTTGGGGTCCTTCCATGTTCTTAATTTCTGC
TGGTCCTGTCTTTTAGAGCTTTTATTTGATTGTCTCCAGCGATCCTTTGCCTTGGTTTAT
GAAGGGAGTGTTGTGGTTTTTGACTGAGCGTTTATGTATTTGCTTTTAGTTTCATCTGTC
TCCTTGTGTGGAGCTTTTAGTCTCAGGAGATAATATATTATCTGCCTGCTTAGTTTCTCA
ATCTTTTGAGCTCTGTATTTCATGTTGTAAGTTCAGGGTGAAGTTCTAATGAAAATATTG
TTCAGAG

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 4

CO CL2938Contig1 902 4 11 U
ATGGCGGGCGCGAAAGTGAAATGCATCACTCTGCGCCCGCCTGGGTTTGCTATCCCTTTG
GATGAGCTTAGAGCCGCGGTGAGCAGGGAGACAAGAGCTATACTGATGAACACTCCTCAC
AACCCCACGGGGAAGATGTTCACTAGAGAAGAGCTTGAAGCCATCGCTTCTCTGTGTATC
GAAAACGACGTCGTTGTGTTCTCTGATGAGGTGTATGATAAGCTTGACTTTGAGATGGAT
CACATCTGCATTGCTTCTCTCCCCGATATGTACGAGAGGACCGTGACGATGAACTCTCTA
GGAAAGACCTTCTCGTTAACGGGTTGGAAGATCGGCTGGGCCGTCGCGCCGCCTCATTTG
ACTTGGGGGATACGTCAAGCGCACTCTTACCTCACTTTCGCTACTTCGACGCCGATGCAA
GCCGCGGCTGTCGCGGCTCTGCAGGCGCCGGAGTCTTATTACGCGGAGCTGAAGAGAGAC
TACAGCGAGAAGAAGGAGATTCTTGTCAAGGGTTTGAAGGAGGTTGGGTTTGAAGTGTTC
CCGTCGAGTGGGACTTACTTTGTGGTGGTTGATCACACGCCGTTTGGGTTTGGGGACGAT
GTGGCCTTCTGTGAGTATCTTATCAAGGAAGTGGGGGTGGTTGCGATCCCGACGAGTGTG
TTTTATTTGAACCCGGAAGAAGGGAAGAACTTAGTGAGGTTTGCGTTCTGTAAAGATGAG
GAGACGCTGCGTAGTGCGGTTGAAAGGATGAAGCTGAAGCTTAAGAGAGTGGTCTGAAAG
CTTTGAATCAGTTGTAGAAGACCTCATTTTAATGCTTATTGTTGTTGTTCTTCTTCGGTT
CCGTTTGAAATATAAGACTTTGTTTCAGCAAAGCAAGCTAATAAAGTTTAGTTCACGTTA
TT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 

AF RS1CC79TF U 1
AF RS1A830TF U 456
AF RS1CF75JQ C 64
AF RS1CC79JQ C 125
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BS 388 390 RS1CF75JQ
BS 391 412 RS1CC79TF
BS 413 455 RS1CF75JQ
BS 456 598 RS1A830TF
BS 599 599 RS1CF75JQ
BS 600 683 RS1A830TF
BS 684 790 RS1CF75JQ
BS 791 791 RS1CC79JQ
BS 792 898 RS1CF75JQ
BS 899 902 RS1CC79JQ

RD RS1CC79TF 415 0 0
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GATGAGCTTAGAGCCGCGGTGAGCAGGGAGACAAGAGCTATACTGATGAACACTCCTCAC
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CACATCTGCATTGCTTCTCTCCCCGATATGTACGAGAGGACCGTGACGATGAACTCTCTA
GGAAAGACCTTCTCGTTAACGGGTTGGAAGATCGGCTGGGCCGTCGCGCCGCCTCATTTG
ACTTGGGGGATACGTCAAGCGCACTCTA**CTCACTTTCGCTACTTCGACGC
GAT

QA 1 412 1 412
DS 

RD RS1A830TF 228 0 0
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CACGCCGTTTGGGTTTGGGGACGGTGTGGCCTTCTGTGAGTATCTTATCAAGGAAGTGGG
GGTGGTTGCGATCCCGACGAGTGTGTTTTATTTGAACCCGGAAGAAGG

QA 1 228 1 228
DS 

RD RS1CF75JQ 836 0 0
GATGAGCTAGAGCGC
GTGAGCAGGGAGACAAGAGCTATACTGATGAACACTCCTCACAACCCCACGGGGACGATG
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TTTTCGGATGAAGTGTATGATAAGCTTGACTTTGAGATGGATCACATCTGCATTGCTTCT
CTCCCCGATATGTACAAGAGGACCGTGACGATGAACTCTCTAGGAAAGACCTTCTCGTTA
ACGGGTTGGAAGATCGGTTGGGCCGTTGCGCCGCCTCATTTGACTTGGGGGATACGTCAA
GCGCATTCTTACCTCACTTTCGCCACTTCGACGCCGATGCAAGCCGCGGCTGTCGCGGCT
CTGCAGGCGCCGGAGTCTTATTACGCGGAGCTGAAGAGAGACTACAGCGAGAAGAAGGAG
ATTCTCGTCAAGGGTTTGAAGGAGGTTGGGTTTGAAGTGTTCCCGTCGAGTGGGACTTAC
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CTTATCAAGGAAGTGGGGGTGGTTGCGATCCCGACGAGTGTGTTTTATTTGAACCCGGAA
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TTTGTTTCAGCAAAGCAAGCTAATAAAGTTTAGTTCACGT
C

QA 16 835 16 835
DS 

RD RS1CC79JQ 778 0 0
CCACGGGGAAGATGT*CACTAGAGAAGAGCTTGAAGCCATCGCTTCTCTGTGTATCGAAA
ACGACGTCGTTGTGTTCTCTGATGAGGTGTATGATAAGCTTGACTTTGAGATGGATCACA
TCTGCATTGCTTCTCTCCCCGATATGTACGAGAGGACCGTGACGATGAACTCTCTAGGAA
AGACCTTCTCGTTAACGGGTTGGAAGATCGGCTGGGCCGTCGCGCCGCCTCATTTGACTT
GGGGGATACGTCAAGCGCACTCTTACCTCACTTTCGCTACTTCGACGCCGATGCAAGCCG
CGGCTGTCGCGGCTCTGCAGGCGCCGGAGTCTTATTACGCGGAGCTGAAGAGAGACTACA
GCGAGAAGAAGGAGATTCTTGTGAAGGGTTTGAAGGAGGTTGGGTTTGAAGTGTTCCCGT
CGAGTGGGACTTACTTTGTGGTGGTTGATCACACGCCGTTTGGGTTTGGGGACGATGTGG
CCTTCTGTGAGTATCTTATCAAGGAAGTTGGGGTGGTTGCGATCCCGACGAGTGTGTTTT
ATTTGAACCCGGAAGAAGGGAAGAACTTGGTGAGGTTTGCGTTCTGTAAAGATGAGGAGA
CGCTGCGTAGTGCGGTTGAGAGGATGAAGCTGAAGCTTAAGAGAGTGGTCTGAAAGCTTT
GAATCAGTTGTAGAAGACCTCATTTTTATGCTTATTGTTGTTGTTCTTCTTCGGTTCCGT
TTGAAATATAAGACTTTGTTTCAGCAAAGCAAGCTAATAAAGTTTAGTTCACGTTATT

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 2

CO CL2939Contig1 1076 2 2 U
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GCTTTAACCATTATGACCGAAACCGCATTTTCTCAAAACTGCGGTAAAACCGGTTGTAAA
GGCAACATGTGCTGCAGCAGGTGGGGTTATTGTGGTACCACAAACGCCTACTGTGGAACG
GGATGTCAGAGTGGACCTTGCAAATCCAAACCTAAACCTACTCCAACTCCAAGTGGTAGT
GGCGGTCTAAACTCTGGTCCTCGCGGTACCATAGCTAGCGTTGTTACCCCAGCGTTCTTC
AACGGCATCATGAGTAAAGTCGGACGTGGTTGCCCAGCCAAAGGGTTCTACACTCGCCAG
GCGTTCATTGCGGCCGCTCAATCGTTTGCAGCCTACAAAGGAACCGTTGCTAAGCGTGAG
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ATAGCTAGGGGAAGGTACTGCTCACCGAGCACAACGTACCCATGTCAGCCGGGCAAGAAC
TACTACGGTCGTGGTCCAATCCAAATCACATGGAACTACAACTACGGTGCAGCCGGAAAG
TTTCTTGGACTTCCTCTCTTGAAGGATTCAGATATGGTGGCTCGTAGCCCAACTGTGGCT
TTCAAATGTGCCATGTGGTTTTGGAACAAGAATGTGCGTCCGGTTTTGAGCCGAGGATTT
GGAGCCACCACGAGGAGGATCAACGGCGGTGAATGTGACGGTGGGCGTCCAGCAGCAGTG
CAGAGCAGAGTTAACCATTACTTGGATTTCTGCAAGAAGCTTGGGGTTACTCCTGGAACC
AATCTCAAATGTTGAAGAAACTATAGTCAGTTGGGGTTTGAAGTGTGTATGGGGTTAAAG
ATTTCATGTGTTTCATTCGGGAAAAAAAAAGATTTCATGTGTCGAATAATAAAGAAAAAT
CATATACTAAGTTGTATGTCTTACGGTATGTAATGTTGTGCTGTGTTGTTTGTATCCGCT
GTCGTATAAGTGATACAGATGAAACTATATCTCATTAAACGTATTTCCTTGTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AAGGATTCAGATATGGTGGCTCGTAGCCCAACTGTGGCTTTCAAATGTGCCATGTGGTTT
TGGAACAAGAATGTGCGTCCGGTTTTGAGCCGAGGATTTGGAGCCACCACGAGGAGGATC
AACGGCGGTGAATGTGACGGTGGGCGTCCAGCAGCAGTGCAGAGCAGAGTTAACCATTAC
TTGGATTTCTGCAAGAAGCTTGGGGTTACTCCTGGAACCAATCTCAAATGTTGAAGAAAC
TATAGTCAGTTGGGGTTTGAAGTGTGTATGGGGTTAAAGATTTCATGTGTTTCATTCGGG
AAAAAAAAAGATTTCATGTGTCGAATAATAAAGAAAAATCATATACTAAGTTGTATGTCT
TACGGTATGTAATGTTGTGCTGTGTTGTTTGTATCCGCTGTCGTATAAGTGATACAGATG
AAACTATATCTCATTAAACGTATTTCCTTGTTTAC

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DS 



AS 1 4

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ATCTTTCCCCAGTCCTTCTCGTTGTGAACCCAACAACAACTGCTCCACCTTCTTCCCCTT
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CTTCAATCTTGTGAAACCCCCTGTGCCTCAGATGATGTCTCCAAATGCTGCGTTTCAAGA
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TTATGGAGTCTCATTTGTTATTCTCAGTTACTATCCATATATGCAGACACAAAGCCTTCT
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TGGGTCTCATCATTTCTT


BQ
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AF RS1BA32TF U 22
AF RS1E906TF U 1
AF RS1E906JQ C 665
AF RS1BA32JQ C 1196
BS 1 197 RS1E906TF
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RD RS1BA32TF 729 0 0
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GGCCA
CGCT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1E906TF 821 0 0
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AGCACAAGGCGATTACAATCTCCCAAAACATTGCGATAACAATGAGGTCCTCAAGGCTCT
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GCCTCTACCTGATGAGATAGCTGGGACATCGTATCCTTACTTATCATCTCAAAACCAAAG
CCCTCTTTCTTCTGCCTTCCAAAGTCCCATACCTTCTTACCAAGTCAGCCCATCTTCCTC
ATCTTTCCCCAGTCCTTCTCGTTGTGAACCCAACAACAACTGCTCCACCTTCTTCCCCTT
CCTCCGAAACGGTGGCATTCCATCCTCTCTTCCTTCCCTCAGAATCTCAAACAGTTGTCC
CGTCACTCCGCCCCTCTCATCTCCAACTTCCAAGAACCCTAAACCTTTACCCAACTGGGA
TTCTATTACTAAGCAGTCCATGGCCAACGCTAAACAATCGATGGCGTCTTT**ACTACCC
TTTCTATGCGGTTTCTGCACCCGCTAGTCCCACTCATCATC

QA 1 821 1 821
DS 

RD RS1E906JQ 794 0 0
ACTCCGCCCCTCTCATCTCCAACTTCCAAGAACC*TAAACCTTTACCCAACTGGGATTCT
ATTACTAAGCAGTCCATGGCCAACGCTAAACAATCGATGGCGTCTTTTAACTACCCTTTC
TATGCGGTTTCTGCACCCGCTAGTCCCACTCATCATCGCCAGTTTCATGCTCCGGCTACT
ATACCTGAATGTGATGAGTCTGATGCGTCAACTGTTGACTCTGGTCATTGGATAAGCTTT
CAGAAGTTTGCTCAACAGCAGCCTTTCTCTGGCTCTGTGGTGCCAACATCTCCTACCTTC
AATCTTGTGAAACCCCCTGTGCCTCAGATGATGTCTCCAAATGCTGCGTTTCAAGAGATT
GGTCAAAGCTCTGAGTTTAAATTTGAGAATAGCCGAGTTAAGCCGTGGGAAGGAGAGATG
ATACATGATGTTGGTATGGAGGATCTGGAGCTTACACTTGGAAACGGTAAAGCTCGTGGT
TGACTTTGAACACTTGAAAGTGAGAAGCTATTCTTCTTCCAGGTATCTCTGGATCGTTAT
GGAGTCTCATTTGTTATTCTCAGTTACTATCCATATATGCAGACACAAAGCCTTCTCTCC
ATGGAAGCATTGGAGTGTTGGTGTCGTTGTCCAATTCATGAATTTAATTTCAAAAGAGCA
TTATTTGTAGATAACAAATGTTAAGATGTGTGATCATTATGTTTCTTTACAAATGTTTGA
AACCGTTGTGTGCTGTCTTGTCTGATGTATCATGTCTTAAGCTAATTCCTTATTAATGGG
TCTCATCATTTCTT

QA 1 794 1 794
DS 

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CTTCTCTCCATGGAAGCATTGGAGTGTTGGTGTCGTTGTCCAATTCATGAATTTAATTTC
AAAAGAGCATTATTTGTAGATAACAAATGTTAAGATGTGTGATCATTATGTTTCTTTACA
AATGTTTGAAACCGTTGTGTGCTGTCTTGTCTGATGTATCATGTCTTAAGCTAATTCCTT
ATTAATGGGTC

QA 1 251 1 251
DS 



AS 1 4

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CTTGACCTTGAGAACAAGAGAAAGATGGGTTTCTTCTCGTTTCTTGGAAGAGTTCTCTTC
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CCTGCAGCTAACGAGTTGGCTCCAAAGCTTCATCTAGCCAAGTCACATCTATCTTCTAGA
TTAGGTGTAACTTTACCTAGCGTAGAGGCAAAACAAGTCGTTGTTGCTATAGTTGCGTTG
AAAGGAGTTGGAGGCTTACTCTTTGTTATTGGAAACATCTTCGGTGCTTATCTTCTGGCT
TTCTACTTGGTGGTTGTCAGTCCTATTCTGTATGATTTCTACAACTACGGACCTGAGGAG
CGTCATTTCTCTCCATTGTTGACCGAGTTCTTGCAGAGCGTTGCACTCTTTGGAGCATTA
CTCTTCTTTATTGGAATGAAGAACTCAACACCCACTAAGAGGAATCTGAAGAGGACTCCT
AAGCCGAAAGCTGCTTAGTATCTTCTGGATTTCCACACTTAATACCTTTCAGTTTTGTTT
TTGTTTTGTTCGGACAAATTCGTTTCTTAGCACTTTTGGTTTTCTTTTTGCTGTATTATT
CTTAGATTGGCTCATGATATCATATTATTATCTTTTCCTTCATTTGATATTGGGAATTCT
TGGACTTTTGATTTGCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DN83JQ C 1
AF RS1DN83TF U 1
AF RS1CL53JQ C 32
AF RS1CL53TF U 32
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BS 459 459 RS1CL53TF
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RD RS1DN83JQ 701 0 0
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TTGTTTTGTTCGGACAAATTCGTTTCTTAGCACTTTTGGTTTTCTTTTTGCTGTATTATT
CTTAGATTGGCTCATGATATCATATTATTATCTTTTCCT
CC

QA 1 699 1 699
DS 

RD RS1DN83TF 709 0 0
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TTAGGTGTAACTTTACCTAGCGTAGAGGCAAAACAAGTCGTTGTTGCTATAGTTGCGTTG
AAAGGAGTTGGAGGCTTACTCTTTGTTATTGGAAACATCTTCGGTGCTTATCTTCTGGCT
TTCTACTTGGTGGTTGTCAGTCCTATTCTGTATGATTTCTACAACTACGGACCTGAGGAG
CGTCATTTCTCTCCATTGTTGACCGAGTTCTTGCAGAGTGTTGCACTCTTTGGAGCATTA
CTCTTCTTTATTGGAATGAAGAACTCAACACCCACTAAGAGGAATCTGAAGAGGACTCCT
AAGCCGAAAGCTGCTTAGTATCTTCTGGATTTCCACACTTAATACCTTTCAGTTTTGTTT
TTGTTTTGTTCGGACAAATTCGTTTCTTAGCACTTTTGGTTTTCTTTTTGCTGTATTATT
CTTAGATTGGCTCATGATATCATATTATTATCTTTTCCT
CCAAAAAAAA

QA 1 699 1 699
DS 

RD RS1CL53JQ 706 0 0
GG
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QA 3 706 3 706
DS 

RD RS1CL53TF 706 0 0
GG
ACCTACGTCGATAAATCTACGAGGGAGCTTGACCTTGAGAACAAGAGAAAGATGGGTTTC
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TTCAATGACTTTGGAGTTGATGGTGGTCCTGCAGCTAACGAGTTGGCTCCAAAGCTTCAT
CTAGCCAAGTCACATCTATCTTCTAGATTAGGTGTAACTTTACCTAGCGTAGAGGCAAAA
CAAGTCGTTGTTGCTATAGTTGCGTTGAAAGGAGTTGGAGGCTTACTCTTTGTTATTGGA
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TTTTGGTTTTCTTTTTGCTGTATTATTCTTAGATTGGCTCATGATATCATATTATTATCT
TTTCCTTCATTTGATATTGGGA*TTCTTGGACTTTTGATTTGCT

QA 3 706 3 706
DS 



AS 1 3

CO CL2942Contig1 909 3 13 U
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TGGGAGACAGGACATGGATTAGAATATTAAACCAAGACAAAGGTACAGATCCGTTGCTCA
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CACAATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EP65JQ U 1
AF RS1BH55JQ U 104
AF RS1EP65TF C 166
BS 1 231 RS1EP65JQ
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RD RS1EP65JQ 583 0 0
GCCAACAATGAGTTGTTTTAAGACATTTTTCTGTCTCTCTGTCTACATATGTTATAGAGG
ATCATCAAAATCATAATAATTTGTTATCAGTATGGTTTAGTTCAGGTCAAAAAGCGATAA
ACACTTTTCCGGTTTTCTATTACATAAGTTTTCAAGTAAGGGCATGCATTTAGTAGCCAA
GTAATAACAGCCATGTTTCTGTGTCTTTCTGTCTACTAAATATGTTACAGAAAATCATCA
AAATGATAATAATTGGTTATCTTCTTAGTGGCTTTAAGAAAAAGAAAGATCTCAGTAGGT
TGTGACGAGTCTGAAGCGGTCATCTAAAGGGTGATTGAGACTTGACGTTCAATGCAGGAG
ATGGAGGAGTCTTCACTGACGCCCATATATCAGCTCCGTTGCTTTGAGCGACTCCTACAG
TAAAATCCATTGGAAAAAGACACAATCCTCTGTTTCTCAGGCTGTACTGCTCCATCTCCA
CCTGCGTAGCAGGGGATATTGTTTGCAGATACGGAGCGCTTAGCACCTTGACTTGTTCGT
GAAGAAACTCTATGTAGTGCATCGCGTCTAGAAGAACTGACGC

QA 1 583 1 583
DS 

RD RS1BH55JQ 744 0 0
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ATGCATTTAGTAGCCAAGTAATAACAGCCATGTTTCTGTGTCTTTCTGTCTACTAAATAT
GTTACAGAGAATCATCAGAATGATAATAATTGGCTATCTTCTTAGTGGCTTTAAGAGAAA
GAAAGATCTTAGTAGGTTGTGACGAGTCTGAAGCGGTCATCTAAAGGGTGATTGAGACTT
GACGTTCAATGCAGGAGATGGAGGAGTCTTCACTGACGCCCATATATCAGCTCCGTTGCT
TTGAGCGACTCCTACAGTAGAATCCATTGGAAAAAGACACAATCCTCTGTTTCTCAGGCT
GTACTGCTCCATCTCCACCTGCGTAGCAGGGGATATTGTTTGCAGATACGGAGCGCTTAG
CACCTTGACTTGTTCGTGAAGAAACTCTATGTAGTGCATCGCGTCTAGAAGAACTGACGC
AGTGTCGGTCTTTCCGTAAGGGGAAACTATCTGTTGAAGAGCTGACATACTTCCAGCTTT
GTCTTTCCTCTCCTTGGAACTGAAAGAGAGATCAGACTTATGGCGTTTGATGTTGTTTTT
TT*CGAGAGAGCAGACATCATTCCTCTTATTCTCCATCATCATTCCAGCGCTACTAGAAA
AGTCCATCCCAATGCATTGGGAGACAGGACATGGATTAGAATATTAAACCAAGACAAAGG
TACAGATCCGTTGCTCAACGAAGT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1EP65TF 744 0 0
GCAT
TTAGTAGCCAAGTAATAACAGCCATGTTTCTGTGTCTTTCTGTCTACTAAATATGTTACA
GAGAATCATCAGAATGATAATAATTGGTTATCTTCTTAGTGGCTTTAAGAGAAAGAAAGA
TCTCAGTAGGTTGTGACGAGTCTGAAGCGGTCATCTAAAGGGTGATTGAGACTTGACGTT
CAATGCAGGAGATGGAGGAGTCTTCACTGACGCCCATATATCAGCTCCGTTGCTTTGAGC
GACTCCTACAGTAGAATCCATTGGAAAAAGACACAATCCTCTGTTTCTCAGGCTGTACTG
CTCCATCTCCACCTGCGTAGCAGGGGATATTGTTTGCAGATACGGAGCGCTTAGCACCTT
GACTTGTTCGTGAAGAAACTCTATGTAGTGCATCGCGTCTAGAAGAACTGACGCAGTGTC
GGTCTTTCCGTAAGGGGAAACTATCTGTTGAAGAGCTGACATACTTCCAGCTTTGTCTTT
CCTCTCCTTGGAACTGAAAGAGAGATCAGACTTATGGCGTTTGATGTTGTTTTTTTTCGA
GAGAGCAGACATCATTCCTCTTATTCTCCATCATCATTCCAGCGCTACTAGAAAAGTCCA
TCCCAATGCATTGGGAGACAGGACATGGATTAGAATATTAAACCAAGACAAAGGTACAGA
TCCGTTGCTCAACGAAGTAGGCAAGGAGTTCTTATCAGAGGCTAAGACCTTTGAGTTCAT
ATCAGCTTAAGCACAATTCC

QA 5 744 5 744
DS 



AS 1 4

CO CL2943Contig1 1305 4 7 U
GGGTTCCTCCCACACGCCTCTTCCTCTCATCACTTTGTTCCTCCGACGTCGGCGTCTTCC
GTCTCTTATCCATTCTTCTCCTTTTTTCCAACACAACAAAGAATGGCTAATTGTTCGGGA
GACTCCAACGACATGGCTGCTTCTCAGTTTGACATTCTCCGATGCCCTTTCTTGAGGAAC
ATCAATGAGCCCACTAATCTCTCCTTCTCTTCCTCCTTCCCTTTCCCCATCCCTGCACCA
GCAGCAGGTCAAGGCCCTATATTCGAGGATGGACCCAATTTTGATACCGCGTTTAGGCTT
TTCCACGGCCAAGATGGTGTTGTCCCACTCTCTGACAGGGCCAGACCTGAAGCTGAGAAG
AAGCCCGTCCCTCTGTTCAATCCACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGAGA
GATCACTCTCCTCTCTGTTTTGTGTCTGCAGCCATGGTGCAAGTCAGGTTCTACCGCAAC
TATGGCAAGACCTTCAAGAAGCCGCGACGTCCTTACGAGAAGGAGCGTCTTGACGCCGAG
CTGAAGCTTGTCGGAGAATATGGTCTTCGTTGCAAGAGAGAGCTGTGGAGGGTTCAGTAC
GCGCTTAGCCGTATCCGCAACGCTGCCAGAGAGCTTCTCACCCTCGACGAGAAAAACCCT
CGTCGGATCTTTCAAGGTGAAGCTCTTCTTAGGAGGATGAACACGAATGGGCTTCTTGAT
GAATCCCAGAACAAGCTCGACTACGTTCTTGCTTTGACTGTTGAGAATTTCCTCGAGCGT
CGTCTCCAGACTCTTGTCTTCAAGTCCGGTATGGCCAAGTCCATTCACCACGCCCGTGTC
CTTATCCGACAAAGACACATCAGGGTTGGGAGGCAACTGGTGAACATTCCATCGTTCATG
GTGAAAGTAGACTCGCAGAAACACATTGACTTTTCTCTGACCAGTCCATTTGGTGGTGGT
CGACCTGGAAGAGTGAAGAGAAGGAACGAGAGAGCTGGAGCCAAGAAAGCCGGCGGTGGT
GGTGATGGAGATGAGGATGATGAAGAGTGAAAGTACCAAACCTTTTAAAACCCTCCATTG
TTAGATAAATAATGTATTTGGAGTTGTTTTCTTGAACTAGATGAAGTCAAGTGTGTTGGT
TTGTAATGGATTTAGCCTTTTATGTGGTGTGTGTTTTGCAATAATGTGGTAGTGGACCTC
TATGTTCTTGCTTGAACAATGATGCCACTTTCAGATCTTGCTCCTCTACTCTGGTTTTAC
TTTTGTATTTGCTCTTGTTTCTTTAAGTAATGTATGTTGTGGTCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B055TF U 1
AF RS1DE50TF U 1
AF RS1G940TF U 440
AF RS1G940JQ C 792
BS 1 655 RS1B055TF
BS 656 656 RS1G940TF
BS 657 676 RS1DE50TF
BS 677 677 RS1G940TF
BS 678 688 RS1DE50TF
BS 689 1032 RS1G940TF
BS 1033 1305 RS1G940JQ

RD RS1B055TF 661 0 0
GGGTTCCTCCCACACGCCTCTTCCTCTCATCACTTTGTTCCTCCGACGTCGGCGTCTTCC
GTCTCTTATCCATTCTTCTCCTTTTTTCCAACACAACAAAGAATGGCTAATTGTTCGGGA
GACTCCAACGACATGGCTGCTTCTCAGTTTGACATTCTCCGATGCCCTTTCTTGAGGAAC
ATCAATGAGCCCACTAATCTCTCCTTCTCTTCCTCCTTCCCTTTCCCCATCCCTGCACCA
GCAGCAGGTCAAGGCCCTATATTCGAGGATGGACCCAATTTTGATACCGCGTTTAGGCTT
TTCCACGGCCAAGATGGTGTTGTCCCACTCTCTGACAGGGCCAGACCTGAAGCTGAGAAG
AAGCCCGTCCCTCTGTTCAATCCACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGAGA
GATCACTCTCCTCTCTGTTTTGTGTCTGCAGCCATGGTGCAAGTCAGGTTCTACCGCAAC
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CTGAAGCTTGTCGGAGAATATGGTCTTCGTTGCAAGAGAGAGCTGTGGAGGGTTCAGTAC
GCGCTTAGCCGTATCCGCAACGCTGCCAGAGAGCTTCTCACCCTCGACGAGAAAA
CCCTCG

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1DE50TF 688 0 0
GGGTTCCTCCCACACGCCTCTTCCTCTCATCACTTTGTTCCTCCGACGTCGGCGTCTTCC
GTCTCTTATCCATTCTTCTCCTTTTTTCCAACACAACAAAGAATGGCTAATTGTTCGGGA
GACTCCAACGACATGGCTGCTTCTCAGTTTGACATTCTCCGATGCCCTTTCTTGAGGAAC
ATCAATGAGCCCACTAATCTCTCCTTCTCTTCCTCCTTCCCTTTCCCCATCCCTGCACCA
GCAGCAGGTCAAGGCCCTATATTCGAGGATGGACCCAATTTTGATACCGCGTTTAGGCTT
TTCCACGGCCAAGATGGTGTTGTCCCACTCTCTGACAGGGCCAGACCTGAAGCTGAGAAG
AAGCCCGTCCCTCTGTTCAATCCACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGAGA
GATCACTCTCCTCTCTGTTTTGTGTCTGCAGCCATGGTGCAAGTCAGGTTCTACCGCAAC
TATGGCAAGACCTTCAAGAAGCCGCGACGTCCTTACGAGAAGGAGCGTCTTGACGCCGAG
CTGAAGCTTGTCGGAGAATATGGTCTTCGTTGCAAGAGAGAGCTGTGGAGGGTTCAGTAC
GCGCTTAGCCGTATCCGCAACGCTGCCAGAGAGCTTCTCACCCTCGACGAGAAAA*CCCT
CGTCGGATCTTTCAAG*TGAAGCTCTTC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RS1G940TF 593 0 0
GG
GTGTCTGCAGCCATGGTGCAAGTCAGGTTCTACCGCAACTATGGCAAGACCTTCAAGAAG
CCGCGACGTCCTTACGAGAAGGAGCGTCTTGACGCCGAGCTGAAGCTTGTCGGAGAATAC
GGTCTTCGTTGCAAGAGAGAGCTGTGGAGGGTTCAGTACGCGCTTAGCCGTATCCGCAAC
GCTGCCAGAGAGCTTCTCACCCTCGACGAGAAAAACCCTCGTCGGATCTTTCAAGGTGAA
GCTCTTCTTAGGAGGATGAACACGAATGGGCTTCTTGATGAATCCCAGAACAAGCTCGAC
TACGTTCTTGCTTTGACTGTTGAGAATTTCCTCGAGCGTCGTCTCCAGACTCTTGTCTTC
AAGTCCGGTATGGCCAAGTCCATTCACCACGCCCGTGTCCTTATCCGACAAAGACACATC
AGGGTTGGGAGGCAACTGGTGAACATTCCATCGTTCATGGTGAAAGTAGACTCGCAGAAA
CACATTGACTTTTCTCTGACCAGTCCATTTGGTGGTGGTCGACCTGGAAGAGTGAAGAGA
AGGAACGAGAGAGCTGGAGCCAAGAAAGCCGGCGGTGGTGGTGATGGAGAT

QA 3 593 3 593
DS 

RD RS1G940JQ 514 0 0
TCTTGTCTTCAAGTCCGGTATGGCCAAGTCCATTCACCACGCCCGTGTCCTTATCCGACA
AAGACACATCAGGGTTGGGAGGCAACTGGTGAACATTCCATCGTTCATGGTGAAAGTAGA
CTCGCAGAAACACATTGACTTTTTTCTGACCAGTCCATTTGGTGGTGGTCGACCTGGAAG
AGTGAAGAGAAGGAACGAGAGAGCTGGAGCCAAGAAAGCCGGCGGTGGTGGTGATGGAGA
TGAGGATGATGAAGAGTGAAAGTACCAAACCTTTTAAAACCCTCCATTGTTAGATAAATA
ATGTATTTGGAGTTGTTTTCTTGAACTAGATGAAGTCAAGTGTGTTGGTTTGTAATGGAT
TTAGCCTTTTATGTGGTGTGTGTTTTGCAATAATGTGGTAGTGGACCTCTATGTTCTTGC
TTGAACAATGATGCCACTTTCAGATCTTGCTCCTCTACTCTGGTTTTACTTTTGTATTTG
CTCTTGTTTCTTTAAGTAATGTATGTTGTGGTCT

QA 1 514 1 514
DS 



AS 1 4

CO CL2944Contig1 982 4 8 U
CGAACAATCATTCAAACAACATAAGATCAAAATGTAATAACAATGTCAAGGAAGGACATG
TATATATACAGGTGGATGTGTATATCTATATTACTTCTATATCCAACACCGAGCTCTTTG
CACGAATTTGTTGTTTTGTCTCTACAATATCTTCTTTGCTCGGTCTACTTGAAAATATGT
TGGGTCGCATTTTCAGTATGCATCTGTTACTTCAGCTTCTATGTCCACTACCGCTGTTGA
GAAACCCTTTCCTTTCTTAGGTGGAGAAAAAAACCCATTTAGGTCTTGTCCGAAAGCAGT
AGTTTGGTTGGAAAATTTCACTGGTTCCTTAACAAACTTATCATCCGCAACTGAGAATGG
CTGAGTGCAGAAAGGGCAAAGCTGTACTTCATCGTCCAACGATGACTTGAATATCTGAAA
CTCGTTTCCGCAATTTGGACAACTGCTCTGGACAATATCTCGTTGTGCCCACCAAAGAAA
AGCTCCCAACCCCAAAATTGGAACAATCACCACAACCAGCCAGACGGATACAATAGCGTC
GAGAACCCAACCAAGTTGGCCAGTCATAGAGAGATAAGTCAAACCAATAGCCAAAGCGAG
GTTCCCGAGGATCCTCCCGTTCCCGTTCCCGTTGTTATCTCCGCCTCCGTTAAAGCCTAA
ACCTTTGTTACAGCTAACCTTAAAGACTCTTCTTTTACGATTTAGAGCTCTCTCTCTTGC
TAGAAATCCAGTTTCTTTCCGACCCATCATCGCTGGCCGTCTCTGACGAAGCTCAATCAT
GCTAGCTCTTAATCCCGACTTGTTTCCGAGCAAAGAAGGACCAAAGCTCCGTCCTTTGGA
GCGTAGTCTGTTTCTGGGTTGCTTGTTGAAGCCGTCGTGTATGGAGAAGGTACAAAGGGT
AAGCTGCGGAGTCGAAGCCATCATCGTCTGAATGCTTTGGTTTGCTTGCCGAACACCAAC
GCTCAAGCAACCAACAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DC29JQ U 2
AF RS1EB01JQ U 1
AF RS1EB01TF C 344
AF RS1DC29TF C 336
BS 1 104 RS1EB01JQ
BS 105 105 RS1DC29JQ
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BS 199 354 RS1EB01JQ
BS 355 355 RS1DC29TF
BS 356 682 RS1EB01JQ
BS 683 982 RS1DC29TF

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TTCAAACAACATGAGATCAAAATGTAATAACAATGTCAAGGAAGGACATGTATATATACA
GGTGGATGTGTATATCTATATTACTTCTATATCCAACACCGAGCTCTTTGCACGAATTTG
TTGTTTTGTCTCTACAATATCTTCTTTGCTCGGTCTACTTGAAAATATGTTGGGTCGCAT
TTTCAGTATGCATCTGTTACTTCAGCTTCTATGTCCACTACCGCTGTTGAGAAACCCTTT
CCTTTCTTAGGTGGAGAAGAAAACCCATTTAGGTCTTGTCCGAAAGC

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DS 

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CACGAATTTGTTGTTTTGTCTCTACAATATCTTCTTTGCTCGGTCTACTTGAAAATATGT
TGGGTCGCATTTTCAGTCTGCATCTGTTACTTCAGCTTCTATGTCCACTACCGCTGTTGA
GAAACCCTTTCCTTTCTTAGGTGGAGAAAAAAACCCATTTAGGTCTTGTCCGAAAGCAGT
AGTTTGGTTGGAAAATTTCACTGGTTCCTTAACAAACTTATCATCCGCAACTGAAAATGG
CTGAGTGCAGAAAGGGCAAAGCTGTACTTCATCGTCCAACGATGACTTGAATATCTGAAA
CTCGTTTCCGCAATTTGGACAACTGCTCTGGACAATATCTCGTTGTGCCCACCAAAGAAA
AGCTCCCAACCCCAAAATTGGAACAATCACCACAACCAGCCAGACGGATACAATAGCGTC
GAGAACCCAACCAAGTTGGCCAGTCATAGAGAGATAAGTCAAACCAATAGCCAAAGCGAG
GTTCCCGAGGATCCTCCCGTTCCCGTTCCCGTTGTTATCTCCGCCTCCGTTAAAGCCTAA
ACCTTTGTTACAGCTAACCTTA

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DS 

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GACTTGAATATCTGAAACTCGTTTCCGCAATTTGGACAACTGCTCTGGACAATATCTCGT
TGTGCCCACCAAAGAAAAGCTCCCAACCCCAAAATTGGAACAATCACCACAACCAGCCAG
ACGGATACAATAGCGTCGAGAACCCAACCAAGTTGGCCAGTCATAGAGAGATAAGTCAAA
CCAATAGCCAAAGCGAGGTTCCCGAGGATCCTCCCGTTCCCGTTCCCGTTGTTATCTCCG
CCTCCGTTAAAGCCTAAACCTTTGTTACAGCTAACCTTAAAGACTCTTCTTTTACGATTT
AGAGCTCTCTCTCTTGCTAGAAATCCAGTTTCTTTCCGACCCATCATCGCTGGCCGTCTC
TGACGAAGCTCAATCATGCTAGCTCTTAATCCCGACTTGTTTCCGAGCAGAGAAGGACCA
AAGCTCCGTCCTTTGGAGCGTAGTCTGTTTCTGGGTTGCTTGTTGAAGCCGTCGTGTATG
GAGAAGGTACAAAGGGTAAGCTGCGGAGTCGAAGCCATCATCGTCTGAATGCTTTGGTTT
GCTT
CC

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DS 

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CCAACGATGACTTGAATATCTGAAACTCGTTTCCGCAATTTGGACAACTGCTCTGGACAA
TATCTCGTTGTGCCCACCAAAGAAAAGCTCCCAACCCCAAAATTGGAACAATCACCACAA
CCAGCCAGACGGATACAATAGCGTCGAGAACCCAACCAAGTTGACCAGTCATAGAGAGAT
AAGTCAAACCAATAGCCAAAGCGAGGTTCCCGAGGATCCTCCCGTTCCCGTTCCCGTTGT
TATCTCCGCCTCCGTTAAAGCCTAAACCTTTGTTACAGCTAACCTTAAAGACTCTTCTTT
TACGATTTAGAGCTCTCTCTCTTGCTAGAAATCCAGTTTCTTTCCGACCCATCATCGCTG
GCCGTCTCTGACGAAGCTCAATCATGCTAGCTCTTAATCCCGACTTGTTTCCGAGCAAAG
AAGGACCAAAGCTCCGTCCTTTGGAGCGTAGTCTGTTTCTGGGTTGCTTGTTGAAGCCGT
CGTGTATGGAGAAGGTACAAAGGGTAAGCTGCGGAGTCGAAGCCATCATCGTCTGAATGC
TTTGGTTTGCTTGCCGAACACCAACGCTCAAGCAACCAACAAAAAAA

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 4

CO CL2945Contig1 923 4 12 U
GGCTAAAAAAATGGTTCACTATCATCAGCAACCAACCATAAATCCATAATCAATAATCAT
CTGATCTAACACATCACCCACCTTGAGCTACTGAGTTTCTTAAATAGATATATCTCTTTT
GTGGATTTAGAAAAAATCGCATTATTAGTAAACCTAGAAGCTCATCTTTCTATAATGGGT
AATAGCTTGGGAAGCAAGAAATCTGCTAAAATCATGAAGATCAATGGCGAGAGTTTCAAG
CTGAAGACTCCTGTGAGAGCTGATACGGTTGTTAAAGACTTTCCCGACCACGTTCTCTTG
GAATCTGAATCCGTGAAGCATTTTGGAATCAGAGCAAAGCCTTTGGGTCCTAACCAGAAC
TTGGAATCAAAAAGGCTTTATTTCATGGTGGAGCTTCCTAGAACATGGAAGGAGAGGGCC
CCGAGAAGGGTTCGGTCTGGAATCCAAATGAGTGCTAAGGAGAGGCCAGAGAATCTGAAG
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AAAGAGAGTGAGAGTGGCTCTGATTTCTCCGACAAGATCACAACTCTCTGTCTCCTCAAC
ATTCAGAGACAACGTTTGCTTCATAATGGAGGAAGAAGCTTTGGGATTGGAGATGAAGAA
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GTTAGAAGAAGAAACACCGATCCGTTTCTCAAGCCACGTTTCTTGCATCCTCTAATTACT
AAAATTGCCACTAGGAAACGGACGTGCTCCAACTTGTGTGTAACAAACTTCTAGTATTTT
CTTAATATAAACAATGCATCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RS1ER95TF U 1
AF RS1AB03JQ C 173
AF RS1ER95JQ C 158
AF RS1AB03TF U 173
BS 1 255 RS1ER95TF
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BS 257 286 RS1ER95TF
BS 287 287 RS1AB03TF
BS 288 466 RS1ER95TF
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BS 855 855 RS1ER95JQ
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RD RS1ER95TF 705 0 0
GGCTAAAAAAATGGTTCACTATCATCAGCAACCAACCATAAATCCATAATCAATAATCAT
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CCGAGAAGGGTTCGGTCTGGAATCCAAATGAGTGCTAAGGAGAGGCTAGAGAATCTGAAG
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AAAGAGAGTGAGAGTGGCTCTGATTTCTCCGACAAGATCACAGCTCTCTGTCTCCTCAAC
ATTCAGAGACAACGTTTGCTTCATAATGGAGGAAGAAGCTTTGGG

QA 1 705 1 705
DS 

RD RS1AB03JQ 709 0 0
GG
ATGGGTAATAGCTTGGGAAGCAAGAAATCTGCTAAAATCATGAAGATCAATGGCGAGAGT
TTCAAGCTGAAGACTCCTGTGAGAGCTGATACGGTTGTTAAAGACTTTCCCGACCACGTT
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CAGAACTTGGAATCAAAAAGGCTTTATTTCATGGTGGAGCTTCCTAGAACATGGAAGGAG
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QA 3 709 3 709
DS 

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QA 1 763 1 763
DS 

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GG
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QA 3 751 3 751
DS 



AS 1 4

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TCTCTTCCTTTCCTTACGATTCGTTATCGGTTGTGGTTTGTCTTCGCAGGAGGCTCTGTC
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CAGCCTCGTCCAGCGACTCAGAGGATAGCGGAAAGAGAAGGCGACACAAAAGGGGTCGAT
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CAGACAAGTGAAAATGTGGACGCTGGGCATTAGGAAGTGCATTTGTTTAAGTTCAGTCAT
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D553TF U 1
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AF RS1CL51JQ C 686
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AG*TGAGAAGAAAG

QA 1 734 1 734
DS 

RD RS1D553JQ 784 0 0
AA
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AGTGCAGCCTCGTCCAGCGACTCAGAGGATAGCGGAAAGAGAAGGCGACACAAAAGGGGT
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TCATCAGAACTGAGTGTTGTGCAACCATTAGCACAAAGACTCTTTAATATTGTTGTGATT
TACTTGTGTGGCACTTCTCTTCGTTGTTTATGTTTCATCATATTACATCAGTCAAATTAC
CG

QA 3 782 3 782
DS 

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GCACCGGAGGCATGCACACTCTGATTCAGATGACAGCGACAGGAGGAAAGACAGGAAATC
CAGGAGGCATAAGAGAAGGTCCTCAAGTAGCAGTGATGAGTACGAAAGCGGCGGGTCAGA
GGACGAGCACAGGATGAAGATAAGGCACCACCGGAGGCACAAGTCGTATAGCTCAAGGCA
GACTTCTGATGATGACAATGCGGAAGGTGCCACAAGAAGACATGCAAAGCATCACAGGCC
TAATGAGGTGGTTACTTCAAGCGATAGCGAGGAAGAGAAAGGAGGAAGAAGAAGACGAGG
GAAATATCACAGGCACAACAGGAGTGCAGCCTCGTCCAGCGACTCAGAGGATAGCGGAAA
GATAAGGCGACACAAAAGGGGTCGATGGGGAGAGTCTTCAAGTGAGGATGATGGAGCAAT
GTGAAGGAGAAGGTATCATAAACACGACAGAGAGCCAGCATCCGAAACTGATGGAATGTT
ATCAGATGAGAAAAGAGAGCACAACACAGACAAGTGAAAATGTGGACGCTGGGCATTAGG
AAGTGCATTTGTTTAAGTTCAGTCATCAGAACTGAGTGTTGTGCAACCATTAGCACAAAG
ACTCTTTAATATTGTTGTGATTTACTTGTGTGGCACTTCTCTTCGTTGTTTATGTTTCAT
CATATTACATCAGTCAAATTACTGAAA*CAATCCTAAATGATTCTGGACGAATTGACCGT
GTTGTTTT

QA 1 788 1 788
DS 

RD RS1CL51JQ 853 0 0
CGTCTG
ATCGAGCTCTGAAAGTGATAGTAGCCC*GAGGTGAGAAGAAAGTCAAGGAGAACTCACAG
TAAGCAC*GGAGGCATGCACACTCTGATTCAGATGACAGCGACAGGAGGAAAGACAGGAA
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AGAGGACGAGCACAGGATGAAGATAAGGCACCACCGGAGGCACAAGTCGCATAGCTCAAG
GCAGACTTCTGATGATGACAATGCGGAAGGTGCCACAAGAAGACATGCAAAGCATCACAG
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AAGACTCTTTAATATTGTTGTGATTTACTTGTGTGGCACTTCTCTTCGTTGTTTATGTTT
CATCATATTACATCAGTCAAATTACTGAAAACAATCCTAAATGATTCTGGACGAATTGAC
CGTGTTGTTTTTCAGCTCTCGAGTGTTATTATACACTGGTTTATATAATGAAATTGTTCC
AACTTCC

QA 7 853 7 853
DS 



AS 1 4

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CATTTCTATCATCTCCACGACCAGACCTGGCCTGTCTGCTGTCTCTATGCATAGCAGGCT
CCTCTTTGGTCCATCTTCTTTCACATGTATGTGAGTCCCGATGTCGACATCAATCTTCTT
TTCAGGAGCCTTTATTCCAAAAGTCTCACCAATTGCAAGTTGCTCACTGCATTCCGGATG
GTATTTTAAGAGATTGTTGATGATTGTTAACCGAATTTGCTCCAACGAGTCAGGATCTTC
CACTTTCCGACCAGTGTCTTGTTTTGTAATAGAAAATCTAGTCTGCTTAACGGATCCTTC
AGTTGTGACAGTTCCTTTTATTACATCCAATCCCAAATCTTTCAGTGCCTTCATTGTGTC
GATGAGAGCCCCGAGACGATCACCAAAACTGAGTTGAACAATAGTAGCTTCAGGGTCAGC
ATCCTGGTCTATCAAAACCATTGGCTTTGGAACCAAGTCCTCCTCCTCATCATCATCTTC
CAATTTCAGATAAGATGGAGTAGTGGCATCAGTTTTGTTAATTGAAGCATATACGCGGTT
TCTTGTGCTCCTCGTTGATAGAGGCGTTACACCTTGGACGAACTTGTGACGACGATCACT
GAAGCAAACAGGCGATAGATCTGGAGGTGAAACTTGAGCGGGAAAACGAGACTGACAGCT
GATGACGGAAGAAGAAGTAAAATGAGTAACAGAGAAGATAGCATTCAAGAGTGCCATTGA
AGTTGAAACAGAGATTCTTGCTTTCTTTATCTTTCTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1B257JQ U 1
AF RS1AK38JQ U 43
AF RS1AK38TF C 206
AF RS1B257TF C 336
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RD RS1B257JQ 709 0 0
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GATGAGAGCCCCGAGACGATCACCAAAACTGAGTTGAACAATAGTAGCT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1AK38JQ 793 0 0
TTTCC
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CATATACG

QA 6 793 6 793
DS 

RD RS1AK38TF 855 0 0
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CCTTGGACGAACTTGTGACGACGATCACTGAAGCAAACAGGCGATAGATCTGGAGGTGAA
ATTTGAGCGGGAAAACGAGACTGACAGCTGATGACGGAAGAAGAAGTAAAATGAGTAACA
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TTTCTTCCC

QA 7 855 7 855
DS 

RD RS1B257TF 725 0 0
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TCCCGATGTCGACATCAATCTTCTTTTCAGGAGCGTTTATTCCAAAAGTCTCACCCATTG
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AATCTTTCAGTGCCTTCATTGTGTCGATGAGAGCCCCGAGACGATCACCAAAACTGAGTT
GAACAATAGTAGCTTCAGGGTCAGCATCCTGGTCTATCAAAACCATTGGCTTTGGAACCA
AGTCCTCCTCCTCATCATCATCTTCCAATTTCAGATAAGATGGAGTAGTGACATCAGTTT
TGTTAATTGAAGCATATACGCGGTTTCTTGTGCTCCTCGTTGATAGAGGCGTTACACCTT
GGACGAACTTGTGACGACGATCACTGAAGCAAACAGGCGATAGATCTGGAGGTGAAACTT
GAGCGGGAAAACGAGACTGACAGCTGATGACGGAAGAAGAAGTAAAATGAGTAACAGAGA
AGATAGCATTCAAGAGTGCCATTGAAGTTGAAACAGAGATTCTTGCTTTCTTTATCTTTC
TTCCC

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 4

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GGGTGTATGGGTAGTGCAAGTGCTAGTCGCCTCCAACCAATGGATACAGATTCTGCAATT
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AAAATAAGAGCGCCTTGCTGCAATCTCATCTTCCCATGCCGCCACTGCCACAACGACGCT
GCAAACTCTTTACCTGATCCTAAAGAACGACATGATTTGGTCCGACAAAACGTCAAACAG
GTTATCTGTTCAGTATGTGAAACAGAACAAGAGGTAGCTCAAGTGTGCTCGAATTGCGGT
GTTTGTATGGGGGAATACTTTTGCAACATCTGCAATTTCTTTGACGACGAGACCTCAAAA
GAACAATTTCATTGTGACGACTGTGGAATTTGTAGAGTTGGTGGGCGTGACAATTTCTAT
CACTGCCAAAGCTGTGGAGCTTGCTATTCAATGGGACTGCGCGATAATCACTCATGCATT
GTGAACGCCACTAAGAATTCTTGTCCTGTCTGTTATGAGTTTTTATTTGATTCCGTAAAA
GCTGCACATGTCATGAGATGTGGCCATACTATGCATATGACTTGCTTCGGACAAATGATC
AATGAACAACAGTACCGATGCCCAATTTGCTACAAGTCAATGATGGATATGTCTTCCTCG
TGGCAATTATTAGATGCCGATATAAGGGCAGCACAGATGCCTAGTGAATATAACTATGAG
GTTGAAATTCTTTGCAATGACTGCAATAAGAGCAGCAAAGCTATGTTCCACATTCTGGGA
CACAAGTGCGCGCATTGTGGCTCTTACAACACTCGCAGGATTTCAGCTCCACAAGACGCC
CTCGCTAGGTGAAACAGAGTGACCAGTTTCTGAACCTAGAGAATAGCAAACTCTTCTTGA
TTGGTTCAACCATAAAGCAGTAATACCGCTCTGTGTTTTGCTTGTTTACATAAAGTGATC
CGGCAAGCGCCATTGGGTTTGCAATGCAGGGTTTAGTCGCCTTGTAATTGGTATCCCAGT
TGCTTTCGCCAACTACGGTTTTCTTATAAAATGTGTGAAACAGGAGGAACTATTTTAAAG
TAATTGAACATGGCATTTTGCGCAAAAAGTCTGAACTATCTTCTTATAAATATAAGCCCA
GCTTTTTTTTTCCTTTATGGGTCACAAAACAGAAAGACAACAGTTCTGAAAAGATTTTTG
AAACCATTTGACAATCGACTGTTATTTGTTAAAAGTTATAATCCTATATCAGGTGCTACT
AGGAGTTTTACAAACC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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TCAATTTGCTAGGGATGAATATAGTCTCGTGCAAACCCCAGAAATCTTCGACGGTGTCGA
AGGTATAGGCTTTGCGAAGAGAGGCTCCCCAGGGGGCGCCTTGCTTAGGTTTGGATTGGT
TAT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1BO02JQ 783 0 0
GCATAAAAATCAAACATTCAAATTTAATGTGTGTCTCCAAAATTTGATGCTTCCAAAAAG
AAATAACTGAACTTAATATTAAGAAACTCTTTCCAGTGAAAATAAAACTTTGTAGAGTTA
CACCTCAAAGTGAGTTTCCCTAAAGGTCTCAGCTATGAGTAAACCGACAGAATAATGCAA
GACAAAGCGATATTGCATCTTCCTCAGGTCTCACCACCCTTGCGTCATTTCTCTTCAGAC
AGTGAACCGAGTTCTTCTAGAATCATCATGGTTAGTGAAAGTTATCTTGTCAGCGACATC
AAGTATATCCTTCCACTTCTTCCCAATACCCATCAGAACAGCTTCATTAGATTTGGTCCT
TGTCCACAAGGAGAGCTTGTCCTGCTTTGGGCGCACACTAGCAACCACACCACAAATCTC
ATCAGCCTCATCAAATTGCTCTCCGACAAGAGCCATCAAAGTTTCAAGCCAAGCCTTGTC
TAAAGCAGGCTTCCTGTTGGAGGTAACAACAAAAGTCCACTTTCCGCCATTAGCACACTC
GGGATCTTCCCACTTGGGCTCAACACCAGCTTTGAACATGTGAATTTCTGCATTCGCCGT
CAATTTGCTAGGGATGAATATAGTCTCGTGCAAACCCCAGAAATCTTCGACGGTGTCGAA
GGTATAGGCTTTGCGAAGAGAGGCTCCCCAGGGGGCGCCTTGCTTAGGTTTGGATTGGTT
ATCGAACCAGAAACTCCACTTTCTTTCGAGCTTGTGAGGGGGCTGCTTATCCGTCGTCTC
TAT

QA 1 783 1 783
DS 

RD RS1BO02TF 779 0 0
TACA
CTCAAAGTGAGTTTCC*TAAAG*TCTCAGCTATGAGTAAAC*GACAGAATAATGCAAGAC
AAAGCGATATTGCATCTTC*TCAGGTCTCACCACCCTTGCGTCATTTCTCTTCAGACAGT
GAACCGAGTTCTTCTAGAATCATCATGGTTAGTGAAAGTTATCTTGTCAGCGACATCAAG
TATATCCTTCCACTTCTTCCCAATACCCATCAGAACAGCTTCATTAGATTTGGTCCTTGT
CCACAAGGAGAGCTTGTCCTGCTTTGGGCGCACACTAGCAACCACACCACAAATCTCATC
AGCCTCATCAAATTGCTCTCCGACAAGAGCCATCAAAGTTTCAAGCCAAGCCTTGTCTAA
AGCAGGCTTCCTGTTGGAGGTAACAACAAAAGTCCACTTTCCGCCATTAGCACACTCGGG
ATCTTCCCACTTGGGCTCAACACCAGCTTTGAACATGTGAATTTCTGCATTCGCCGTCAA
TTTGCTAGGGATGAATATAGTCTCGTGCAAACCCCAGAAATCTTCGACGGTGTCGAAGGT
ATAGGCTTTGCGAAGAGAGGCTCCCCAGGGGGCGCCTTGCTTAGGTTTGGATTGGTTATC
GAACCAGAAACTCCACTTTCTTTCGAGCTTGTGAGGGGGCTGCTTATCCGTCGTCTCTAT
TGCCGGTACTTCCGCCGCCGTAAGGGCTTCGTTCACATCCTCTGTCGCCATCGCACTTTG
GATTCGATTCTCTCGATCGGGTCAAAGAAAGAGAGTTTTGGCTAGTTTGGAATCC

QA 5 779 5 779
DS 

RD RS1EH86TF 512 0 0
CTTGTCCTGCTTTGGGCGCACACTAGCAACCACACCACAAATCTCATCAGCCTCATCAAA
TTGCTCTCCGACAAGAGCCATCAAAGTTTCAAGCCAAGCCTTGTCTAAAGCAGGCTTCCT
GTTGGAGGTAACAACAAAAGTCCACTTTCCGCCATTAGCACACTCAGGATCTTCCCACTT
GGGCTCAACACCAGCTTTGAACATGTGAATTTCTGCATTCGCCGTCAATTTGCTAGGGAT
GAATATAGTCTCGTGCAAACCCCAGAAATCTTCGACGGTGTCGAAGGTATAGGCTTTGCG
AAGAGAGGCTCCCCAGGGGGCGCCTTGCTTAGGTTTGGATTGGTTATCGAACCAGAAACT
CCACTTTCTTTCGAGCTTGTGAGGGGGCTGCTTCTCCGTCGTCTCTATTGCCGGTACTTC
CGCCGCCGTAAGGGCTTCGTTCACATCCTCTGTCGCCATCGCACTTTGGATTCGATTCTC
TCGATCGGGTCAAAGAAAGAGAGTTTTGGCT
C

QA 1 511 1 511
DS 



AS 2 4

CO CL2950Contig1 833 2 3 U
GAAGTATATGTTCTGAATTCTCAACTGAAAATCTGGGTAAATAAAAATGTTTGGTAACAC
AACATGAACGGTGAAGTCTAGGGACTGTTTTCAAGTTGGTATAACTAAACGTGAAGCAGG
AGAGCCCTGGAGGAGCAATAGCCGAAGTATGAAGACGAGCAAGATCAACTGTGTCAAGAA
ATAGAAACTGGACTTGCATGCTTTCCCCAACATGTTTCCACATTCTGGTTCAGGATCTTC
AAGCAGAGAATGTACCTTGTTCGGTTCTTCTTTGAGTACTTGTAGTGATGAACTCAGAGA
TCTTGTGAGTGCCAAGTGATGGATTTCAGCTTCGATCTTTCTCTGGAAAATGACTTCGAG
TTCAGATTCAATTTTTGAATATTCAAGTTCTTGGATCCTGGCTTCCTTTGCATCGAGTTC
AGCTCTAGCATCCTCGAGTTTGTGTTGGAGATGTTTTACCTTCTGCTTCAAGATCAGTGC
CTGTGATCCTGAGGATGTTGACTTCTCTTCTCTACAAGTTTCCTTACCGAGCTCCTGGAA
ATTTTTAAGCTCTTTCCAAAGAGCGTCATGCAGAGCTGCAAGATGCTTGATAGAATCTGC
AATTTGATCCTTGTCTGCCCAATAATTGTTGTTTTTCTTACTCTCCTTATCTTCATCTTG
TTCTCCGTTCTCGCTTCTGCTATATGTTTGGACTTCCTTCCTCTCATCGTTCTCTCCGTG
GTTCTTCGCAGCAGAAACTGCACCACTCGAGAACACAAAATCACTACTTCTAAAGTCAGA
ATCCATGCTTGAACAAGCTTTGGCTTGCATTCTTGATGTATCCCTCCAGATCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EN41JQ U 1
AF RS1DX42JQ U 1
BS 1 135 RS1DX42JQ
BS 136 136 RS1EN41JQ
BS 137 833 RS1DX42JQ

RD RS1EN41JQ 488 0 0
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CTGTGATC

QA 1 488 1 488
DS 

RD RS1DX42JQ 833 0 0
GAAGTATATGTTCTGAATTCTCAACTGAAAATCTGGGTAAATAAAAATGTTTGGTAACAC
AACATGAACGGTGAAGTCTAGGGACTGTTTTCAAGTTGGTATAACTAAACGTGAAGCAGG
AGAGCCCTGGAGGAGTAATAGCCGAAGTATGAAGACGAGCAAGATCAACTGTGTCAAGAA
ATAGAAACTGGACTTGCATGCTTTCCCCAACATGTTTCCACATTCTGGTTCAGGATCTTC
AAGCAGAGAATGTACCTTGTTCGGTTCTTCTTTGAGTACTTGTAGTGATGAACTCAGAGA
TCTTGTGAGTGCCAAGTGATGGATTTCAGCTTCGATCTTTCTCTGGAAAATGACTTCGAG
TTCAGATTCAATTTTTGAATATTCAAGTTCTTGGATCCTGGCTTCCTTTGCATCGAGTTC
AGCTCTAGCATCCTCGAGTTTGTGTTGGAGATGTTTTACCTTCTGCTTCAAGATCAGTGC
CTGTGATCCTGAGGATGTTGACTTCTCTTCTCTACAAGTTTCCTTACCGAGCTCCTGGAA
ATTTTTAAGCTCTTTCCAAAGAGCGTCATGCAGAGCTGCAAGATGCTTGATAGAATCTGC
AATTTGATCCTTGTCTGCCCAATAATTGTTGTTTTTCTTACTCTCCTTATCTTCATCTTG
TTCTCCGTTCTCGCTTCTGCTATATGTTTGGACTTCCTTCCTCTCATCGTTCTCTCCGTG
GTTCTTCGCAGCAGAAACTGCACCACTCGAGAACACAAAATCACTACTTCTAAAGTCAGA
ATCCATGCTTGAACAAGCTTTGGCTTGCATTCTTGATGTATCCCTCCAGATCT

QA 1 833 1 833
DS 



CO CL2950Contig2 784 2 10 U
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GGAGAGAAGCCTTCTTTATTCAAAGAGTGGAATGCATCACTCAGTCCCTGAATCTGTGGA
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GGCTGCTACTACTACTACACCTGCTGATGATGACGGTAGTAAATTGCTGAAGCGTGGATT
GACTGGTCTGGTGAATCCTCCTCTGAAACATGTAGACTTGTCTTCCGTTGAAGCTAGGCA
GAGTAGTGAAGGCTCTGTTGGGTCTGTGAACATGGCGGTCCATCATCATCTTCAAGGTTT
AGCTGCAAACAGATTTAGTACCGGTCCAGGTTTTATGGTTAATGTAGGCCAAGGTTTTGA
GAAGAGTGAAGAAGAGCTTAGTGGTAACTCCATAGCTGCAAAGAATGTAGGAGGAGAGAA
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CAGTTTCTGCTGCGAGAACCACGGAGAGAACGATGAGAGGAAGGAGTCCAAACATATAGC
AGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1DX42TF U 1
AF RS1EN41TF U 11
BS 1 559 RS1DX42TF
BS 560 560 RS1EN41TF
BS 561 680 RS1DX42TF
BS 681 681 RS1EN41TF
BS 682 688 RS1DX42TF
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BS 705 735 RS1DX42TF
BS 736 784 RS1EN41TF

RD RS1DX42TF 753 0 0
GGGTCGTCGCATGACCATTGATGCTCGAAACTCTTTAGCTTCTTCTGTAACTTCTCAAAG
GGAGAGAAGCCTTCTTTATTCAAAGAGTGGAATGCATCACTCAGTCCCTGAATCTGTGGA
AAACAATGGTGGTTCAGTCCCTGTTGATCATCATGAGGTTGTGAATCACAGATCATCTGC
AAATGGATCACCACAACGATCGAACAGCGTTGATAGTTTAAAGGTCGAAACTCCGACGAG
GAAAGGTTTTGGTTTGAAGAAATGGAGAAGGATCAAAAGAGATGGTCCTGTGAAGGACGA
GGCTGCTACTACTACTACACCTGCTGATGATGACGGTAGTAAATTGCTGAAGCGTGGATT
GACTGGTCTGGTGAATCCTCCTCTGAAACATGTAGACTTGTCTTCCGTTGAAGCTAGGCA
GAGTAGTGAAGGCTCTGTTGGGTCTGTGAACATGGCGGTCCATCATCATCTTCAAGGTTT
AGCTGCAAACAGATTTAGTACCGGTCCAGGTTTTATGGTTAATGTAGGCCAAGGTTTTGA
GAAGAGTGAAGAAGAGCTT*GTGGTAACTCCATAGCTGCAAAGAATGTAGGAGGAGAGAA
GATTGTTTCGGGTAGCCAAAGGGAAGATCTGGAGGGATACCATCAAGAATGCAAGCCAAA
AGCCTTGTTCAAGCATGGAT*CTGACTTTAGAAGTAGTGATTT*GTGTTCTCGAGTGGTG
CAGTTTCTGCTGCGA
GACCACGGAGAGACGATG

QA 1 735 1 735
DS 

RD RS1EN41TF 774 0 0
GG
GACCATTGATGCTCGAAACTCTTTAGCTTCTTCTGTAACTTCTCAAAGGGAGAGAAGCCT
TCTTTATTCAAAGAGTGGAATGCATCACTCAGTCCCTGAATCTGTGGAAAACAATGGTGG
TTCAGTCCCTGTTGATCATCATGAGGTTGTGAATCACAGATCATCTGCAAATGGATCACC
ACAACGATCGAACAGCGTTGATAGTTTAAAGGTCGAAACTCCGACGAGGAAAGGTTTTGG
TTTGAAGAAATGGAGAAGGATCAAAAGAGATGGTCCTGTGAAGGACGAGGCTGCTACTAC
TACTACACCTGCTGATGATGGCGGTAGTAAATTGCTGAAGCGTGGATTGACTGGTCTGGT
GAATCCTCCTCTGAAACATGTAGACTTGTCTTCCGTTGAAGCTAGGCAGAGTAGTGAAGG
CTCTGTTGGGTCTGTGAACATGGCGGTCCATCATCATCTTCAAGGTTTAGCTGCAAACGG
ATTTAGTACCGGTCCAGGTTTTATGGTTAATGTAGGCCAAGGTTTTGAGAAGAGTGAAGA
AGAGCTTAGTGGTAACTCCATAGCTGCAAAGAATGTAGGAGGAGAGAAGATTGTTTCGGG
TAGCCAA*GGGAAGATCTGGAGGGATACCATCAAGAATGCAAGCCAAAAGCCTTGTTCAA
GCATGGATTCTGACTTGAGAAGTAGTGATTTTGTGTTCTCGAGTGGTGCAGTTTCTGCTG
CGAGAACCACGGAGAGAACGATGAGAGGAAGGAGTCCAAACATATAGCAGAG

QA 3 774 3 774
DS 



AS 1 4

CO CL2951Contig1 758 4 6 U
GGACGAACACGAACACGAACAAAAGAGAACCCTAGATCGTTCCGTTGCCTTAAGACGAAT
CCGAGTGTCGTCAACGAAAGGAGCATCTTTTCGCATTTCAAACGATCAACTAAACCCAAT
TCCATGGCAGGGAGAATCATTGCGCAGTTCATTGTGATGGGTTCTGGGATATTAGGTCGT
GCTTTCTTTCAAGCTTATCGTCAGGCCATTGCAAATGCGTCTAAAACTGGGGTGGCGCAG
GAAGCGATGCAGAACGCAGTACGTAAAGCAGGAAAAGCCATTAATGAGCAAGAGGCTAGG
CAGATTCTCGGTGTAACCGAGCAGACCTCTTGGGAAGAAATATTACAGAAATATGATAAG
CTGTTTGAGAATAATGCCAAAGCTGGGAGCTTTTACCTTCAATCTAAAGTTCTTCGAGCT
AAAGAATGCCTTGAAGTTGTGTACAGAAGCAACGGTACACCTAGTTAAGACTTTAGTCCT
TCTTTCTTTTTTATACCGATTCAGAGTTCTTGCTCTTTGTGTAAAATCAAAGACAGATAA
CACTGTTCTTTGAGGTAATGTGTAACTTTGAAAAACTGCTATTGATCAGTAGTGGTAGCC
TCTTAAACTTAGAATTGATTGTTCTTCTATGCGTTTATTACTCCTTTTAGAGTTTTGTTT
ATGTTTTTGTTTCTGTTTCGGACTGAGATAAATCTACAATTTGTTATGTATATATAATAT
TCTTCTTTGTGCACCAAGTATATATAATCACTTCTGTG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1BP91TF U 1
AF RS1CR08TF U 1
AF RS1CR08JQ C 1
AF RS1BP91JQ C 36
BS 1 574 RS1BP91TF
BS 575 575 RS1CR08TF
BS 576 676 RS1BP91TF
BS 677 721 RS1CR08JQ
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BS 723 758 RS1CR08JQ

RD RS1BP91TF 676 0 0
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TCTTTCTTTTTTATACCGATTCAGAGTTCTTGCTCTTTGTGTAAAATCAAAGACAGATAA
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TCTTAAACTTAGAATTGATTGTTCTTCTATGCGTTTATTACTCCTTTTAGAGTTTTGTTT
ATGTTTTTGTTTCTGT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1CR08TF 683 0 0
GGACGAACACGAACACGAACAAAAGAGAACCCTAGATCGTTCCGTTGCCTTAAGACGAAT
CCGAGTGTCGTCAACGAAAGGAGCATCTTTTCGCATTTCAAACGATCAACTAAACCCAAT
TCCATGGCAGGGAGAATCATTGCGCAGTTCATTGTGATGGGTTCTGGGATATTAGGTCGT
GCTTTCTTTCAAGCTTATCGTCAGGCCATTGCAAATGCGTCTAAAACTGGGGTGGCGCAG
GAAGCGATGCAGAACGCAGTACGTAAAGCAGGAAAAGCCATTAATGAGCAAGAGGCTAGG
CAGATTCTCGGTGTAACCGAGCAGACCTCTTGGGAAGAAATATTACAGAAATATGATAAG
CTGTTTGAGAATAATGCCAAAGCTGGGAGCTTTTACCTTCAATCTAAAGTTCTTCGAGCT
AAAGAATGCCTTGAAGTTGTGTACAGAAGCAACGGTACACCTAGTTAAGACTTTAGTCCT
TCTTTCTTTTTTATACCGATTCAGAGTTCTTGCTCTTTGTGTAAAATCAAAGACAGATAA
CACTGTTCTTTGAGGTAATGTGTAACTTTGAAAAACTGCTATTGATCAGTAGTGGTAGCC
TCTTAAACTTAGAATTGATTGTTCTTCTATGCGTTTATTACTCCTTTTAGAGTTTTGTTT
ATGTTTTTGTTTCTGT
TTCGGAC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1CR08JQ 758 0 0
GGACGAACACGAACACGAACAAAAGAGAACCCTAGATCGTTCCGTTGCCTTAAGACGAAT
CCGAGTGTCGTCAACGAAAGGAGCATCTTTTCGCATTTCAAACGATCAACTAAACCCAAT
TCCATGGCAGGGAGAATCATTGCGCAGTTCATTGTGATGGGTTCTGGGATATTAGGTCGT
GCTTTCTTTCAAGCTTATCGTCAGGCCATTGCAAATGCGTTTAAAACTGGGGTGGCGCAG
GAAGCGATGCAGAACGCAGTACGTAAAGCAGGAAAAGCCATTAATGAGCAAGAGGCTAGG
CAGATTCTCGGTGTAACCGAGCAGACCTCTTGGGAAGAAATATTACAGAAATATGATAAG
CTGTTTGAGAATAATGCCAAAGCTGGGAGCTTTTACCTTCAATCTAAAGTTTTTCGAGCT
AAAGAATGCCTTGAAGTTGTGTACAGAAGCAACGGTACACCTAGTTAAGACTTTAGTCCT
TCTTTCTTTTTTATACCGATTCAGAGTTCTTGCTCTTTGTGTAAAATCAAAGACAGATAA
CACTGTTCTTTGAGGTAATGTGTAACTTTGAAAAACTGCTATTGATCAGTAGTGGTAGCC
TCTTAAACTTAGAATTGATTGTTTTTCTATGCGTTTATTACTCCTTTTAGAGTTTTGTTT
ATGTTTTTGTTTCTGTTTCGGACTGAGATAAATCTACAATTTGTTATGTATATATAATAT
TTTTCTTTGTGCACCAAGTATATATAATCACTTCTGTG

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1BP91JQ 723 0 0
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AGCCATTAATGAGCAAGAGGCTAGGCAGATTCTCGGTGTAACCGAGCAGACCTCTTGGGA
AGAAATATTACAGAAATATGATAAGCTGTTTGAGAATAATGCCAAAGCTGGGAGCTTTTA
CCTTCAATCTAAAGTTCTTCGAGCTAAAGAATGCCTTGAAGTTGTGTACAGAAGCAACGG
TACACCTAGTTAAGACTTTAGTCCTTCTTTCTTTTTTATACCGATTCAGAGTTCTTGCTC
TTTGTGTAAAATCAAAGACAGATAACACTGTTCTTTGAGGTAATGTGTAACTTTGAAAAA
CTGCTATTGATCAGTAGTGGTAGCCTCTTAAACTTAGAATTGATTGTTCTTCTATGCGTT
TATTACTCCTTTTAGAGTTTTGTTTATGTTTTTGTTTCTGTTTCGGACTGAGATAAATCT
ACAATTTGTTATGTATATATAATATTCTTCTTTGTGCACCAAGTATATATAATCACTTCT
GTG

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 4

CO CL2952Contig1 780 4 18 U
GGGGGAGGGTCAGCGAAATCCGAACCGCGCTTCAAGCTCGTATAAGCGACATAGAACTGA
GGATGCTTGTAGAGAGTTGCTTGAACCATTACGCGAATCTTTTCAGAATGAAATCTGATG
CAGCCAAAGTCGATGTTTTCTACTTGATATCCGGAATGTGGAGAACTTCTACAAAAAGAC
TCTTGCAATGGATTGGAGGGTTCCGTCCGTCAGACCTTTTAAATGTTGTGATGCCGTATC
TTCAGCCATTAACTGATCAGCAAATCTTGGAAGTGAGAAACCTTCAACAATCATCACAAC
AAGC*GAGGATGCTCTCTCTCAAGGGATCGATAAACTTCAGCAAAGTTTAGCTGAAAACA
TAGTGATTGATGTGGTTATGGAGTCCAATGATTACCCATCTCACATGGGTGCAGCTATTG
AGAATCTTCAAGCACTAGAAGGCTTCGTGAATCAAGCGGATCATTTGAGACAACAAACAT
TGCAGCAAATGGCAAAGATCTTAACGACAAGACAATCAGCTCGAGGTTTGCTTTGTCTGG
GAGAGTATCTTCATAGGCTACGTGCTCTTAGCTCTCTATGGGCAGCTCGTCCACGGGAAC
ACACATAAAAAGAAAACACAAGTCTAAAGCTTGAAATGATGCTAAGTAGAACGTTATGAA
GTATCTCGCTCCATATATTTTGAGACAAAGAAGATGTAGATTTGAGTGGAAACTTTGCAA
TATATTATTAGATACCAAAAAATAAGGGTATGCTCGTTAGTGTAATATTATTTTATATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DN89TF U 13
AF RS1EV23TF U 1
AF RS1DN89JQ C 7
AF RS1EV23JQ C 644
BS 1 129 RS1EV23TF
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BS 131 149 RS1EV23TF
BS 150 150 RS1DN89TF
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BS 174 174 RS1DN89TF
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RD RS1DN89TF 702 0 0
GCGAAATCCGAACCGCGCTTCAAGCTCGTATAAGCGACATAGAACTGAGGATGCTTGTAG
AGAGTTGCTTGAACCATTACGCGAATCTTTTCAGAATGAAATCTGATGCAGCCAAAGTCG
ATGTTTTCTACTTGATATCCGGAATGTGGAGAACTTCTACAAAAAGACTCTTGCAATGGA
TTGGAGGGTTCCGTCCGTCAGACCTTTTAAATGTTGTGATGCCGTATCTTCAGCCATTAA
CTGATCAGCAAATCTTGGAAGTGAGAAACCTTCAACAATCATCACAACAAGC*GAGGATG
CTCTCTCTCAAGGGATCGATAAACTTCAGCAAAGTTTAGCTGAAAACATAGTGATTGATG
TGGTTATGGAGTCCAATGATTACCCATCTCACATGGGTGCAGCTATTGAGAATCTTCAAG
CACTAGAAGGCTTCGTGAATCAAGCGGATCATTTGAGACAACAAACATTGCAGCAAATGG
CAAAGATCTTAACGACAAGACAATCAGCTCGAGGTTTGCTTTGTCTGGGAGAGTATCTTC
ATAGGCTACGTGCTCTTAGCTCTCTATGGGCAGCTCGTCCACGGGAACACACATAAAAAG
AAAACACAAGTCTAAAGCTTGAAATGATGCTAAGTAGAACGTTATGAAGTATCTCGCTCC
ATATATTTTGAGACAAAGAAGATGTAGATTTGAGTGGAA
ACT

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DS 

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TTCAGCCATTAACTGATCAGCAAATCTTGGAAGTGAGAAACCTTCAACAATCATCACAAC
AAGTAGAGGATGCTCTCTCTCAAGGGATCGATAAACTTCAGCAAAGTTTAGCTGAAAACA
TAGTGATTGATGTGGTTATGGAGTCCAATGATTACCCATCTCACATGGGTGCAGCTATTG
AGAATCTTCAAGCACTAGAAGGCTTCGTGAATCAAGCGGATCATTTGAGACAACAAACAT
TGCAGCAAATGGCAAAGATCTTAACGACAAGACAATCAGCTCGAGGTTTGCTTTGTCTGG
GAGAGTATCTTCATAGGCTACGTGCTCTTAGCTCTCTATGGGCAGCTCGTCCACGGGAAC
ACACATAAAAAGAAAACACAAGTCTAAAGCTCGGAATGATGCTAAGTAGAACGTTATGAA
GTATCTCGCTCCATATATTTTGAGACAAAGAAGATGTAGATTTGAGTGGAA*CTTTGCAA
TATATTATTAGATACCAAAAAA

QA 1 742 1 742
DS 

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GGGTCA
GCGAAATCCGAACCGCGCTTCAAGCTCGTATAAGCGACATAGAACTGAGGATGCTTGTAG
AGAGTTGCTTGAACCATTACGCGAATCTTTTCAGAATGAAATCTGATGCAGCCAAAGTCG
ATGTTTTCTACTTGATATCCGGAATGTGGAGAACTTCTACAAAAAGACTCTTGCAATGGA
TTGGAGGGTTCCGTCCGTCAGACCTTTTAAATGTTGTGATGCCGTATCTTCAGCCATTAA
CTGATCAGCAAATCTTGGAAGTGAGAAACCTTCAACAATCATCACAACAAGC*GAGGATG
CTCTCTCTCAAGGGATCGATAAACTTCAGCAAAGTTTAGCTGAAAACATAGTGATTGATG
TGGTTATGGAGTCCAATGATTACCCATCTCACATGGGTGCAGCTATTGAGAATCTTCAAG
CACTAGAAGGCTTCGTGAATCAAGCGGATCATTTGAGACAACAAACATTGCAGCAAATGG
CAAAGATCTTAACGACAAGACAATCAGCTCGAGGTTTGCTTTGTCTGGGAGAGTATCTTC
ATAGGCTACGTGCTCTTAGCTCTCTATGGGCAGCTCGTCCACGGGAACACACATAAAAAG
AAAACACAAGTCTAAAGCTTGAAATGATGCTAAGTAGAACGTTATGAAGTATCTCGCTCC
ATATATTTTGAGACAAAGAAGATGTAGATTTGAGTGGAAACTTTGCAATATATTATTAGA
TACCAAAAAA
A

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DS 

RD RS1EV23JQ 137 0 0
AAGTAGAACGTTATGAAGTATCTCGCTCCATATATTTTGAGACAAAGAAGATGTAGATTT
GAGTGGAAACTTTGCAATATATTTTTAGATACCAAAAAATAAGGGTATGCTCGTTAGTGT
AATATTATTTTATATGT

QA 1 137 1 137
DS 



AS 1 4

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GGATTTCGTATTTAATCATATAATAAGAGGATAAAAAAGAAGATGATTCGATGCTTCGCG
CGTCCACCCTTCATCACCACCGTCCATTTCGCATCTCCACCATCCATCACCATCTCCGCA
TCTCATTCTCCATCGTCGTCAGTAGCAGCATCCAGAAGAGAAATATCTCTATCCATTATC
GCCGTCGCGTCTTCCATCGTCTCCTCCTCCGGTTACTTCTCTTCTCCGGCGCTCGCTGAG
TTCTCCGAAATCCCTGACTCCGGCGGAGTAAAGAGTCTCGACCTCCGTGTCGGCGAAGGT
GAAGTCCCCATTGAAGGAGATCAGGTTGCAATACATTACTATGGGAGGTTGGCTGCGAAG
CAAGGATGGAGATTTGATTCAACGTATGATCATAAAGACAGTAGTGGAGACTCTGTTCCT
TTTACTTTCGTCCTTGGTTCTGCCAATGTTATTCCGGGGATCGAAACAGCCGTGAGGTCG
ATGAAAGTAGGAGGGATTCGTCGGGTGGTTATACCTCCGTCTCAAGGCTACCAGAATACA
TCACAAGAACCTCTCCCACCAAATTTCTTTGACAGACAAAGACTCTTCACGACTATCTTT
AACCCAACCCGTCTTGCCAATGGTGAAGGTTCTACTCTTGGAACTCTTGTTTTCGATATC
GAACTTGTCAGTACCAGACGCCCTAACCGATGATTCATACAGCCAGCCATTCATACTCTT
CGGTTGTTTCTTGCTGGACGAGATATCATAAAATAAACAATTAAAATTACAAAAGATCTT
TAGTAAGCATTTGGATATGGTTAGTTGAATCTCGATGTGCACCTCACCCACAAGCAATGA
TTATAGTATTATCAACTTGAACATAAGTGTGTGAATTTTAAATGTAGTTTGAGTAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E423TF U 1
AF RS1BF42JQ C 49
AF RS1BF42TF U 49
AF RS1E423JQ C 215
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RD RS1E423TF 547 0 0
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TCACAAG

QA 1 547 1 547
DS 

RD RS1BF42JQ 722 0 0
G
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ATTAC

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DS 

RD RS1BF42TF 718 0 0
G
GATGCTTCGCGCGTCCACCCTTCATCACCACCGTCCATTTCGCATCTCCACCATCCATCA
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CGCTCGCTGAGTTCTCCGAAATCCCTGACTCCGGCGGAGTAAAGAGTCTCGACCTCCGTG
TCGGCGAAGGTGAAGTCCCCATTGAAGGAGATCAGGTTGCAATACATTACTATGGGAGGT
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ACCAGAATACATCACAAGAACCTCTCCCACCAAATTTCTTTGACAGACAAAGACTCTTCA
CGACTATCTTTAACCCAACCCGTCTTGCCAATGGTGAAGGTTCTACTCTTGGAACTCTTG
TTTTCGATATCGAACTTGTCAGTACCAGACGCCCTAACCGATGATTCATACAGCCAGCCA
TTCATACTCTTCGGTTGTTTCTTGCTGGACGAGATATCATAAA*TAAACAATTAAA
T

QA 2 717 2 717
DS 

RD RS1E423JQ 683 0 0
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ATTACTATGGGAGGTTGGCTGCGAAGCAAGGATGGAGATTTGATTCAACGTATGATCATA
AAGACAGTAGTGGAGACTCTGTTCCTTTTACTTTCGTCCTTGGTTCTGCCAATGTTATTC
CGGGGATCGAAACAGCCGTGAGGTCGATGAAAGTAGGAGGGATTCGTCGGGTGGTTATAC
CTCCGTCTCAAGGCTACCAGAATACATCACAAGAACCTCTCCCACCAAATTTCTTTGACA
GACAAAGACTCTTCACGACTATCTTTAACCCAACCCGTCTTGCCAATGGTGAAGGTTCTA
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TCATACAGCCAGCCATTCATACTCTTCGGTTGTTTCTTGCTGGACGAGATATCATAAAAT
AAACAATTAAAATTACAAAAGATCTTTAGTAAGCATTTGGATATGGTTAGTTGAATCTCG
ATGTGCACCTCACCCACAAGCAATGATTATAGTATTATCAACTTGAACATAAGTGTGTGA
ATTTTAAATGTAGTTTGAGTAGT

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 4

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TCTCTCCTTCTCTCTCTCTCTGCCGGGATCGCACGTCGTCGTCCGGCAGAGTCTCGCCGG
AACCGCCGTAGTTACCGCCGGCCGCACGGATTATTCGCTGGAAACAACGCGTCGTGAGAG
GAGGGAGAGAATTCGAGAAAAACAAAAAAAATTCAAAACACCGATTCACTTTTTTTTGTT
TATTTAATTTGGGGAATTAAATATTCTGCGATGGATGTGATTGGATAGAAGGAAGCAAAA
AAGCAAAGGAGGAAGGTTAAAGAGAAAAAAACGAATTATTCTCTTCTCTGCTCTCTCTGT
GTTTCTTCGTGGATCGTCAAGGTAAAGAGTTTTCACGAGATCCATTCTTCACAAATTTTT
GTATTTCTTAATTTATTTATTAAAATCTGTTTGAGAGGAAGCTTAATTGTGTTTGTTTGT
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C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 

AF RS1A116TF U 1
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AF RS1A116TR C 21
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TATTTAATTTGGGGAATTAAATATTCTGCGATGGATGTGATTGGATAGAAGGAAGCAAAA
AAGCAAAGGAGGAAGGTTAAAGAGAAAAAAACGAATTATTCTCTTCTCTGCTCTCTCTGT
GTTTCTTCGTGGATCGTCAAGGTAAAGAGTTTTCACGAGATCCATTCTTCACAAATTTTT
GTATTTCTTAATTTATTTATTAAAATCTGTTTGAGAGGAAGCTTAATTGTGTTTGTTTGT
AATTAGGTAAGCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTTTTTTAAAAAAATTTGGAATTAAGTTA
GTTTCTGTGTGAACTAGTGGCAGTCCCCCCCCGCGCAAGCGCGGGGTTGTTTTATTTATG
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C

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TAAAATCTGTTTGAGAGGAAGCTTAATTGTGTTTGTTTGTAATTAGGTAAGCTCTCTCTC
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CAGTCCCCCCCCGCGCAAGCGCGGGGTTGTTTTATTTATGTAGTAGATAAGAGTGTGACA
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CGCACGGATTATTCGCTGGAAACAACGCGTCGTGAGAGGAGGGAGAGAATTCGAGAAAAA
CAAAAAAAATTCAAAACACCGATTCACTTTTTTTTGTTTATTTAATTTGGGGAATTAAAT
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AGAAAAAAACGAATTATTCTCTTCTCTGCTCTCTCTGTGTTTCTTCGTGGATCGTCAAGG
TAAAGAGTTTTCACGAGATCCATTCTTCACAAATTTTTGTATTTCTTAATTTATTTATTA
AAATCTGTTTGAGAGGAAGCTTAATTGTGTTTGTTTGTAATTAGGTAAGCTCTCTCTCTC
TCTCTTTCTTTTTTTTAAAAAAATTTGGAATTAAGTTAGTTTCTGTGTGAACTAGTGGCA
GTCCCCCCCCGCGCAAGCGCGGGGTTGTTTTATTTATGTAGTAGATAAGAGTGTGACAAC
TCTTTTGGTTTCATGTGCTTCTATGATTTCGTGATTTTTATAAGTGGCAATGTGTAGAGC
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TGCCGGGATCGCACGTCGTCGTCCGGCAGAGTCTCGCCGGAACCGCCGTAGTTACCGCCG
GCCGCACGGATTATTCGCTGGAAACAACGCGTCGTGAGAGGAGGGAGAGAATTCGAGAAA
AACAAAAAAAATTCAAAACACCGATTCACTTTTTTTTGTTTATTTAATTTGGGGAATTAA
ATATTCTGCGATGGATGTGATTGGATAGAAGGAAGCAAAAAAGCAAAGGAGGAAGGTTAA
AGAGAAAAAAACGAATTATTCTCTTCTCTGCTCTCTCTGTGTTTCTTCGTGGATCGTCAA
GGTAAAGAGTTTTCACGAGATCCATTCTTCACAAATTTTTGTATTTCTTAATTTATTTAT
TAAAATCTGTTTGAGAGGAAGCTTAATTGTGTTTGTTTGTAATTAGGTAAGCTCTCTCTC
TCTCTCTTTCTTTTTTTTAAAAAAATTTGGAATTAAGTTAGTTTCTGTGTGAACTAGTGG
CAGTCCCCCCCCGCGCAAGCGCGGGGTTGTTTTATTTATGTAGTAGATAAGAGTGTGACA
ACTCTTTTGGTTTCATGTGCTTCTATGATTTCGTGATTTTTATAAGTGGCAATGTGTAGA
GCTTTGTGATGTGGATGACAAAAAAAAGAGCTTTGTGATAC

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DS 



AS 1 4

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TGTACCAACTTGGTCAAAAGTCACTTCTTTTTATACAACTCAAAACTCTCCTCACATCTT
GATCTCTTTTCTCTCAGACACACACACACACACACACCTTCTTCATCATGGGAAGGTCTC
CATGTTGCGAGAAAGCCCACACAAACAAAGGAGCTTGGACCAAGGAAGAAGACCAACGTC
TCATCGATTACATCCGTAATCACGGCGAAGGTTGCTGACGTTCACTCCCTAAATCCGCAG
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TCAAACGTGGAAATTTTTCTGATGAAGAAGACTAAGTCATCATCAAGCTACATAGCTTAC
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AAAATTATTGGAACACTCATATTAAGAGGAAGCTTCTCAGCCACGGAATCGACCCCCAAA
CTCATCGTCCAGTTAAAGATAACGTCGCCGTGACTGATGCAAAAACGGCGTCGTCACGAT
TAACAACCACTGTTATTGTTTCACCTCAAAACGACACCGTTGAATACGCTTTTATAGTCA
AACCGAAGACGGAAAATTCCTCCGATAACGGCGCGTCCACAAGCAGCACGACAACGGACG
AGGATCTCCGACAAAACGGAGATAGTTATTACAGAGATCATTCAGGAGATATGGAGCTGA
ATCTTGACCTAACTCTCGGGTCCGGGTCCGGGTCGACTTCTTGGGTCGGGTCTAAGCCGT
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ATCTCCCAAAAATGGGTATTTTTTTAGATTTGTCTTCTTGTGTGGGTCCTTTTTGAATAT
CTATAGACATTGTTTTACTTCAGTTCTTGGCATTTTGTTTTGATTCTGTTACATACTATT
ATTACCTCTTGAAGTAAACAATATTACAATAGTCATTTTGATACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GM57TF U 1
AF RS1AR37TFB U 146
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AF RS1GM57JQ C 421
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CATGTTGCGAGAAAGCCCACACAAACAAAGGAGCTTGGACCAAAGAAGAAGACCAACGTC
TCA

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DS 

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GG
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AAGGTTGCTGACGTTCACTCCCTAAATCCGCAGGATTGTTACGGTGTGGTAAGAGTTGTA
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CCGTGACTGATGCAAAAACGGCGTCGTCACGATTAACAACCACTGTTATTGTTTCACCTC
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ATTACAGAGATCATTCAGGAGATATGGAGCTGAATCTTGACCTAACTCTCGGGTCCGGGT
CCGGGTCGACTTCTTGGGTCGGGTCTAAGCCGTGGCGGGATACGGCGATGGCGGCGCGTT
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DS 

RD RS1AR37JQ 862 0 0
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GATTACATCCGTAATCACGGCGAAGGTTGCTGACGTTCACTCCCTAAATCCGCAGGATTG
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TATTGGAACACTCATATTAAGAGGAAGCTTTTCAGCCACGGAATCGACCCCCAAACTCAT
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TTCCGACAAAACGGAGATAGTTATTACAGAGATCATTCAGGAGATATGGAGCTGAATCTT
GACCTAACTCTCGGGTCCGGGTCCGGGTCGACTTCTTGGGTCGGGTTTAAGCCGTGGCGG
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CCAAAAATGGGTATTTTTTTAGATTTGTCTTCTTGTGTGGGTCCTTTTTGAATATCTATA
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CTCTTGAAGTAAAC

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DS 

RD RS1GM57JQ 646 0 0
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AAAATTATTGGAACACTCATATTAAGAGGAAGCTTCTCAGCCACGGAATCGACCCCCAAA
CTCATCGTCCGGTTAAAGATAACGTCGCCGTGACTGATGCAAAAACGGCGTCGTCACGAT
TAACAACCACTGTTATTGTTTCACCTCAAAACGACACCGTTGAATACGCTTTTATAGTCA
AACCGAAGACGGAAAATTCCTCCGATAACGGCGCGTCCACAAGCAGCACGACAACGGACG
AGGATCTCCGACAAAACGGAGATAGTTATTACAGAGATCATTCAGGAGATATGGAGCTGA
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CTATAGACATTGTTTTACTTCAGTTCTTGGCATTTTGTTTTGATTCTGTTACATACTATT
ATTACCTCTTGAAGTAAACAATATTACAATAGTCATTTTGATACTT

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 4

CO CL2956Contig1 1061 4 2 U
GGAGATAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGCAATCTCAACACTTCATGGCCAACATTCTCCGGC
GTCATGTTCTCCTTTTAATGGTGGCCGCCGTGTTATTCTCAACCGTTCCGGTTTCAAACT
CTATTCCATTTATACTGTTCCACGGAATTGGAGACAAATGCTCTGGTGGAGTTAGTAACT
TCACGCAACTCCTAAGCAACCTCTCCGGCTCTCCTGGCTCTTGCTTAGAAATAGGAAACG
GAGAAACAGACTCATGGTTCATGCCACTAACGCAACAAACGAGTTTAGCGTGTGAGAAAG
TGAAGATGATGAAAGAGCTGAGTCAAGGTTACAACATTGTTGCACAGTCTCAAGGAAACT
TAGTAGCTAGAGGGATAATTGAGTTTTGCGACGATGCTCCTCCTCTCATCAACTATGTTT
CCTTAGGAGGACCTCATGCTGGCATTGCCGCAATCCCCAAATGCTCTTCTGGTCCTTTCT
GCGCTATAGCAGAAGCTTTGATGAAGTTAGAGATCTACAACGACTTCGTTCAAGATCATA
TTGCTCCTAGTGGTTATGTCAAGATCCCTGGTGAAATGACAAAGTATTTGGGACACTCCA
AGTATCTACCAAAGCTTAACAATGAGAGACCTGACCAAAGAAACTCCACTTTTAAAGACC
GTTTCGTGAGCTTGCATAACTTGGTTCTTGTCATGAACGACACAACACTGATCCCTAAAG
AAACTTCTTGGTTTGGATATTATTCAGATGATGGGTTTGATTCTCTGTTGTCAACTCAAC
AGGTGAAATCTCTCGCCTCACTCTCTCATTTCATTTCTGAAGATTCTTTTTTCGAATATG
TGTTCGTCTTCAGACAAAACTATACAGAGAAGACTGGATCGGTCTGAAAGCATTAGATGC
TGTCGGAAAAGTGAAGTTTGTGAGTGTCTCAGGGGACCACCTTATGATATCGTACAAGGA
CGTTGTGAAATACGTTGTGCCTTACTTGATGCAGACAAGTTTGTAAATTCTTTAACATGC
GACTCTCACTGTCATTTTATAAGAAAACATATTTGATCCCT


BQ
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AF RS1BI19TF U 1
AF RS1BI31TF U 1
AF RS1BI19JQ C 218
AF RS1BI31JQ C 234
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CTATTCCATTTATACTGTTCCACGGAATTGGAGACAAATGCTCTGGTGGAGTTAGTAACT
TCACGCAACTCCTAAGCAACCTCTCCGGCTCTCCTGGCTCTTGCTTAGAAATAGGAAACG
GAGAAACAGACTCATGGTTCATGCCACTAACGCAACAAACGAGTTTAGCGTGTGAGAAAG
TGAAGATGATGAAAGAGCTGAGTCAAGGTTACAACATTGTTGCACAGTCTCAAGGAAACT
TAGTAGCTAGAGGGATAATTGAGTTTTGCGACGATGCTCCTCCTCTCATCAACTATGTTT
CCTTAGGAGGACCTCATGCTGGCATTGCCGCAATCCCCAAATGCTCTTCTGGTCCTTTCT
GCGCTATAGCAGAAGCTTTGATGAAGTTAGAGATCTACAACGACTTCGTTCAAGATCATA
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GTTTCGTGAGCTTGCATAACTTGGTTCTTGTCATGAACGACACAACACTGATC
CCTAAGA

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AAGTATTTGGGACACTCCAAGTATCTACCAAAGCTTAACAATGAGAGACCTGACCAAAGA
AACTCCACTTTTAAAGACCGTTTCGTGAGCTTGCATAACTTGGTTCTTGTCATGAACGAC
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TCTCTGTTGTCAACTCAACAGGTGAAATCTCTCGCCTCACTCTCTCATTTCATTTCTGAA
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GGAAACTTAGTAGCTAGAGGGATAATTGAGTTTTGCGACGATGCTCCTCCTCTCATCAAC
TATGTTTCCTTAGGAGGACCTCATGCTGGCATTGCCGCAATCCCCAAATGCTCTTCTGGT
CCTTTCTGCGCTATAGCAGAAGCTTTGATGAAGTTAGAGATCTACAACGACTTCGTTCAA
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TAGATGCTGTCGGAAAAGTGAAGTTTGTGAGTGTCTCAGGGGACCACCTTATGATATCGT
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AACATGCGACTCTCACTGTCATTTTATAAGAAAACATATTTGATCCCT

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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1EU81TF U 1
AF RS1EU81JQ C 77
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BS 635 810 RS1EU81JQ

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CCAATGGATATGGAGACAACAAGAAGGAGGGTCAAGAGTGACTCCTGTGGATATAATCAA
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GCAATGCGAAAACCACGCCAAGAACTCGGTTTTCTCAAACGCCCTTTCAAGTCCAATACG
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CAGTGAACTGAACAGGGGATCTACCTCTCCAAGTTCTTTTGATACTTCAATGGACATGCA
TGCAGACTAAGAAGCTATAAGATGTAATACCCCC
CTCT

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1EU81JQ 734 0 0
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TTTCGAACCGCCGCGAACTCGCTGTCTCAGCTTTACACTCAGTCCATGAACCACCAGAAA
CTATCTTTCCAAGCCGGTGAACGCCATGGTCTGGAGAAACTGTACCAATGGATATGGAGA
CAACAAGAAGGAGGGTCAAGAGTGACTCCTGTGGATATAATCAATTACATTCAGAACGAG
CTGGAGTGCTGCACAGAGGAACCCCCAATGCGTATCACAAGTACAGGTCTCATTGCTTCT
TCAGACACGTCTTGCCCAACATCTGTTCCGGTGGTTCGGTTTGAGCAATGCGAAAACCAC
GCCAAGAACTCGGTTTTTTCAAACGCCCTTTCAAGTCCAATACGTCGTAGTCTGCAGAAC
TATCAAATTCCGCAGGGAGGCTACATATTTGGTGGAACCAGAAGCAGTGAACTGAACAGG
GGATCTACCTCTCCAAGTTCTTTTGATACTTCAATGGACATGCATGCAGACTAAGAAGCT
ATAAGATGTAATACCCCCCTCTTGTGATGATGTTTGCTTTAATACAAAACTGGTTTGGTT
TTTCATTATGTATCAATTGGTTGTCATCTTGAAGGTGGTTTGCTGGTATTTTGGTTAGGA
TTTTTGATGGTCACATGTAAATCATTGTGTCTGGAATTCATATCTCTTGATTAACTTTTT
AGTGTTCATGTTCT

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 4

CO CL2958Contig1 839 4 9 U
TAAATCCTCCACATAGAACCCAAGTTCAAGGTCTCAGCGAAACAGCTCCATTCCAACGCC
AAAAACAAGTGGTTCCAGCTTCTATCAGCATGGGTTATAGTATTCAGACTTCAGTTCCAA
ATAACGATATTCAGCAATCTCAAGCACCTCGGCCACCATTGAAAAACTCTATGATGCAGC
AAGTTGGGCAAATGGTATCACTAAACTATGGTAAAAGAATAAACAACGAGGGACCTCATG
AATCAATAAACAGACCATCAAAGATGATAAGAGTGGATGAAAGGAGAATCGATCCATTCC
ATGGAGGCCATGCGTCTAACTCAATGCTTCCAAACCCAGTACAAGTACAAGAGAGAGCGC
ATCAGACACATATCTCCCC*GGATGTTCAGTCAACGTTGCTACAGCAAGTAATGAACTTG
ACACCGGAACAGCTGAGGTTGCTGACTCCAGAGCAACAGCAAGAAGTCATGAAGCTGCAA
CGAGCTCTCAAGCAGCATTCATAGCATTGAGGTTGGTTCGTTGGTTCCATTTGATTGAAA
CTTGCAGAGATGGAAAGAGTTTTCGCACACAGATTACAATAGAAAGAAGAAGGATTCTCT
CACTTGAATTGGTGAGTGATTGTATTATTAGTGTAGCATTTATTTTGTGCTGAGTTTGTC
TTATAGTCATAGAAATATCCAGCCATCAATAATATAAAAGAGAAAGTTACAAGTCAAAGA
AGTCTCAGAACAACTGTGTCGTCTACTCCTCTCTCTCTGTTTTTCTTTCTTTTTTGCTTT
AACTAAACCATCATTCGCTTTCACTTTATATCATGTAGCAACTGGTTAGTACTTCAGTG


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 0 0 0 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F346TF U 1
AF RS1CO35JQ C 199
AF RS1CO35TF U 199
AF RS1F346JQ C 5
BS 1 297 RS1F346TF
BS 298 298 RS1CO35TF
BS 299 371 RS1F346TF
BS 372 372 RS1CO35TF
BS 373 379 RS1F346TF
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BS 381 439 RS1F346TF
BS 440 709 RS1CO35TF
BS 710 839 RS1F346JQ

RD RS1F346TF 439 0 0
TAAATCCTCCACATAGAACCCAAGTTCAAGGTCTCAGCGAAACAGCTCCATTCCAACGCC
AAAAACAAGTGGTTCCAGCTTCTATCAGCATGGGTTATAGTATTCAGACTTCAGTTCCAA
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AAGTTGGGCAAATGGTATCACTAAACTATGGTAAAAGAATAAACAACGAGGGACCTCATG
AATCAATAAACAGACCATCAAAGATGATAAGAGTGGATGAAAGGAGAATCGATCCAT*CC
ATGGAGGCCATGCGTCTAACTCAATGCTTCCAAACCCAGTACAAGTACAAGAGAGAGCGC
ATCAGACACATGTCTCCCCCGGATGTTCAGTCAACGTTGCTACAGCAAGTAATGAACTTG
ACACCGGAACAGCTGAGGT

QA 1 439 1 439
DS 

RD RS1CO35JQ 511 0 0
G
ACTAAACTATGGTAAAAGAATAAACAACGAGGGACCTCATGAATCAATAAACAGACCATC
AAAGATGATAAGAGTGGATGAAAGGAGAATCGATCCATTCCATGGAGGCCATGCGTCTAA
CTCAATGCTTCCAAACCCAGTACAAGTACAAGAGAGAGCGCATCAGACACATATCTCCCC
*******TCAGTCAACGTTGCTACAGCAAGTAATGAACTTGACACCGGAACAGCTTAGGT
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CAGCCATCAATAATATAAAAGAGAAAGTTA

QA 2 511 2 511
DS 

RD RS1CO35TF 517 0 0
G
ACTAAACTATGGTAAAAGAATAAACAACGAGGGACCTCATGAATCAATAAACAGACCATC
AAAGATGATAAGAGTGGATGAAAGGAGAATCGATCCATTCCATGGAGGCCATGCGTCTAA
CTCAATGCTTCCAAACCCAGTACAAGTACAAGAGAGAGCGCATCAGACACATATCTCCCC
*******TCAGTCAACGTTGCTACAGCAAGTAATGAACTTGACACCGGAACAGCTTAGGT
TGCTGACTCCAGAGCAACAGCAAGAAGTCATGAAGCTGCAACGAGCTCTCAAGCAGCATT
CATAGCATTGAGGTTGGTTCGTTGGTTCCATTTGATTGAAACTTGCAGAGATGGAAAGAG
TTTTCGCACACAGATTACAATAGAAAGAAGAAGGATTCTCTCACTTGAATTGGTGAGTGA
TTGTATTATTAGTGTAGCATTTATTTTGTGCTGAGTTTGTCTTATAGTCATAGAAATATC
CAGCCATCAATAATATAAAAGAGAAAGTTA
CAAGTC

QA 2 511 2 511
DS 

RD RS1F346JQ 835 0 0
TCCTCCACATAGAACCCAAGTTCAAGGTCTCAGCGAAACAGCTCCATTCCAACGCCAAAA
ACAAGTGGTTCCAGCTTCTATCAGCATGGGTTATAGTATTCAGACTTCAGTTCCAAATAA
CGATATTCAGCAATCTCAAGCACCTCGGCCACCATTGAAAAACTCTATGATGCAGCAAGT
TGGGCAAATGGTATCACTAAACTATGGTAAAAGAATAAACAACGAGGGACCTCATGAATC
AATAAACAGACCATCAAAGATGATAAGAGTGGATGAAAGGAGAATCGATCCAT*CCATGG
AGGCCATGCGTCTAACTCAATGCTTCCAAACCCAGTACAAGTACAAGAGAGAGCGCATCA
GACACATGTCTCCCC*GGATGTTCAGTCAACGTTGCTACAGCAAGTAATGAACTTGACAC
CGGAACAGCTGAGGTTGCTGACTCCAGAGCAACAGCAAGAAGTTATGAAGCTGCATCAAG
CTCTCAAGCAGCATTCATAGCATTGAGGTTGGTTCGTTGGTTCCATTTGATTGAAACTTG
CAGAGATGGAAAGAGTTTTCGCGCACAGATTACAATAGAAAGAAGAAGGATTCTCTCACT
TGAATTTGTGAGTGATTGTATTATTAGTGTAGCATTTATTTTGTGCTGAGTTTGTCTTAT
AGTCATAGAAATATCCAGCCATCAATAATATAAAAGAGAAAGTTACAAGTCAAAGAAGTC
TCAGAACAACTGTGTCGTCTACTCCTCTCTCTCTGTTTTTCTTTCTTTTTTGCTTTAACT
AAACCATCATTCGCTTTCACTTTATATCATGTAGCAACTGGTTAGTACTTCAGTG

QA 1 835 1 835
DS 



AS 1 3

CO CL2959Contig1 869 3 5 U
GCTATATAAAATGATTTGAACATTAATCATGATAATACATGTATATGTTTTCAATGTACT
TTCTGACCATGAAAACATAATTCTGTCTGCCTTAAGCAGCAACTTCTTGGTCCTTGGACG
AAAGCTGGTTCTGAATATGCTGAGGAACAACATCGAACTTAGCCAACTGCATTGTGTAAG
ACGCACGACCTTTTGTCATCCCTCTCAATGTACTCACATACTGAAACATCTCTGCTAATG
GAACCAGAGAATCCACCACCTTGAGACCACCGGGTTTGTCTCCAAAGCTGTTGATCTGAC
CTCTTCTAGAGTTAAGATCACCAATGACATCACCAAGATGTTCTTCAGGTGTAACAACTT
CAACTCTCATGATAGGTTCAAGCATTCTCGGACCAGCTTTCCTCATCCCTTCACGGAAAG
CTCCTCTCGCAGCTAGCTGGAAAGCTAGCACGCTCGAGTCCACATCATGGTATGATCCAT
CAACTAAACAAGCACGGACGTCAACAACCGGAAAACCCGCAAGCACACCTGAGCCCATAC
ACTCCTCAAGTCCTTTCATCACACCGGGGATATACTCTCTTGGCACTGCTCCTCCTTTGA
TCTCACTCTTGAACTCGTATCCTGATCCTGCTTCCAACGGCTCAAACCTGACTGTAATAT
CAGCAAACTGTCCTTGTCCACCTGATTGCTTCTTGTGTGTGTATTTCACTTCAGCTACTT
TTGAGATACTCTCACGGTAGTTCACTTGCGGTGCTCCAACGTTCGCCTCAACCTTGAACT
CTCTTTTAAGCCTGTCGACGATGATCTCAAGATGAAGCTCTCCCATCCCTTCGATGACGG
TTTGGTTCATCTCCTCATCGCGTGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EX09JQ U 1
AF RS1CJ45JQ U 4
AF RS1EX09TF C 113
BS 1 248 RS1EX09JQ
BS 249 249 RS1CJ45JQ
BS 250 737 RS1EX09JQ
BS 738 810 RS1CJ45JQ
BS 811 869 RS1EX09TF

RD RS1EX09JQ 737 0 0
GCTATATAAAATGATTTGAACATTAATCATGATAATACATGTATATGTTTTCAATGTACT
TTCTGACCATGAAAACATAATTCTGTCTGCCTTAAGCAGCAACTTCTTGGTCCTTGGACG
AAAGCTGGTTCTGAATATGCTGAGGAACAACATCGAACTTAGCCAACTGCATTGTGTAAG
ACGCACGACCTTTTGTCATCCCTCTCAATGTACTCACATACTGAAACATCTCTGCTAATG
GAACCAGAAAATCCACCACCTTGAGACCACCGGGTTTGTCTCCAAAGCTGTTGATCTGAC
CTCTTCTAGAGTTAAGATCACCAATGACATCACCAAGATGTTCTTCAGGTGTAACAACTT
CAACTCTCATGATAGGTTCAAGCATTCTCGGACCAGCTTTCCTCATCCCTTCACGGAAAG
CTCCTCTCGCAGCTAGCTGGAAAGCTAGCACGCTCGAGTCCACATCATGGTATGATCCAT
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ACTCCTCAAGTCCTTTCATCACACCGGGGATATACTCTCTTGGCACTGCTCCTCCTTTGA
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TTGAGATACTCTCACGG

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DS 

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AC
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CGACCTTTTGTCATCCCTCTCAATGTACTCACATACTGAAACATCTCTGCTAATGGAACC
AGAGAATCCACCACCTTGAGACCACCGGGTTTGTCTCCAAAGCTGTTGATCTGACCTCTT
CTAGAGTTAAGATCACCAATGACATCACCAAGATGTTCTTCAGGTGTAACAACTTCAACT
CTCATGATAGGTTCAAGCATTCTCGGACCAGCTTTCCTCATCCCTTCACGGAAAGCTCCT
CTCGCAGCTAGCTGGAAAGCTAGCACGCTCGAGTCCACATCATGGTATGATCCATCAACT
AGACAAGCACGGACGTCAACAACCGGAAAACCCGCAAGCACACCTGGGCCCATACCCTCC
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AACTGTCCTTGTCCACCTGATTGCTTCTTGTGTGTGTATTTCACTTCAGCTACTTTTGAG
ATACTCTCACGGTAGTTCACTTGCGGTGCTCCAACGTTCGCCTCAACCTTGAACTCTCTT
TTAAGCCTGTCGACGATGATCTCAA
ATGAAGCT

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TCTT
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TAAGACGCACGACCTTTTGTCATCCCTCTCAATGTACTCACATACTGAAACATCTCTGCT
AATGGAACCAGAGAATCCACCACCTTGAGACCACCGGGTTTGTCTCCAAAGCTGTTGATC
TGACCTCTTCTAGAGTTAAGATCACCAATGACATCACCAAGATGTTCTTCAGGTGTAACA
ACTTCAACTCTCATGATAGGTTCAAGCATTCTCGGACCAGCTTTCCTCATCCCTTCACGG
AAAGCTCCTCTCGCAGCTAGCTGGAAAGCTAGCACGCTCGAGTCCACATCATGGTATGAT
CCATCAACTAAACAAGCACGGACGTCAACAACCGGAAAACCCGCAAGCACACCTGAGCCC
ATACACTCCTCAAGTCCTTTCATCACACCGGGGATATACTCTCTTGGCACTGCTCCTCCT
TTGATCTCACTCTTGAACTCGTATCCTGATCCTGCTTCCAACGGCTCAAACCTGACTGTA
ATATCAGCAAACTGTCCTTGTCCACCTGATTGCTTCTTGTGTGTGTATTTCACTTCAGCT
ACTTTTGAGATACTCTCACGGTAGTTCACTTGCGGTGCTCCAACGTTCGCCTCAACCTTG
AACTCTCTTTTAAGCCTGTCGACGATGATCTCAAGATGAAGCTCTCCCATCCCTTCGATG
ACGGTTTGGTTCATCTCCTCATCGCGTGAAAAA

QA 5 757 5 757
DS 



AS 0 0

AS 1 4

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AGACTAACTTTAAAGATTTATCGATCTAGTCATCTGGGTCTTCTTCTATAGTGGTTCTGA
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AGGAGAGGGAAGCTTTAGAGATTCCTCTCTTCCAAGTGCCTGAATGCTATGTTTATTTGA
TACCTCCAAGGAAAAGCGCAGCTTCCTACAGAGCGGATGAATGGGACGTGAACAAATGGG
CATGGGAAGGAGCGTTGAAAGTGGTGAGCAAAGGAGAAGAGTGCATTATCAAACTTGTAG
ATAAAACCACTGGAGAACTTTACGCTCAGGCCTTTCTCCGAGATGGTGAGCTTCATCCAG
TAGAAGCTGTAATCGACAGTAGCAGATATTTTGTTCTCCGTGTGGAAGAAAACATAGGTG
GTCGCGCTCGTCATGCTTTTATTGGACTCGGATTCAGGGAGAGAACTGAAGCATATGATT
TCCAAGCAGCATTACATGACCACATGAAGTACTTGAACAAGAAGAAAACAGCAGAAGAGA
TGGAACAACACTTTCAGAACACATCATCTGTTGATTACAGCTTAAAGGAAGGAGAAACCA
TTGTTCTCCAACTCAAAAACATGAGCGAAAAAGACACAAAGACTAAGTTGGTAGAGAAGA
GTCTGACCAATCTGTCCTTGGAGGATAAGGGCAAGTCTATAGAAACCACCATTCCTTCAC
TCATCCCTCCGCCTCCACCTCCTGGACCGCTTTCTCCTGTTACAACCGCTCAGAAGTCCC
CATCAAGCAGCCTCAGCGTCCAAAGATCATCTGAACAACAAGATCTAGATACGAAGCGAG
AAGAAGTAGAGAAGAAAGAAGACCAAGAAGCTAATGAAACAGGCGTTGAAGATGCACCAG
ATGATGACTTTGGAGATTTCCAAGCGGCAGGCTGATTTAGCCATTGAGTATTTTTTACCA
TACAGAAAGCATCGTTTTATATAAGTAATGTGACTGATCAAAGTTTGGATTGTTTGCTTT
TGTGAGAGAGAGTCCACCTCCTGTACAATTGCATACAAAGACTATTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A425TF U 28
AF RS1AO78TFB U 1
AF RS1AO78JQ C 313
AF RS1A425JQ C 360
BS 1 125 RS1AO78TFB
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BS 486 789 RS1AO78TFB
BS 790 928 RS1AO78JQ
BS 929 929 RS1A425JQ
BS 930 965 RS1AO78JQ
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BS 967 1113 RS1AO78JQ
BS 1114 1131 RS1A425JQ

RD RS1A425TF 719 0 0
G
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GTCATCTGGGTCTTCTTCTATAGTGGTTCTGAGAATGGATCAAGCTTCGTCTTCATCGAA
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CTTCCAAGTGCCTGAATGCTATGTTTATTTGATACCTCCAAGGAAAAGCGCATCTTCCTA
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QA 2 719 2 719
DS 

RD RS1AO78TFB 793 0 0
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GTCGTGCTCGTCATGCTTTTATTGGACTCGGATTCAGGGAGAGAACTGAAGCATATGATT
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TCATCCCTC
GCTC

QA 1 789 1 789
DS 

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GAGAACTTTACGCTCAGGCCTTTCTCCGAGATGGTGAGCTTCATCCAGTAGAAGCTGTAA
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ATGCTTTTATTGGACTCGGATTCAGGGAGAGAACTGAAGCATATGATTTCCAAGCAGCAT
TACATGACCACATGAAGTACTTGAACAAGAAGAAAACAGCAGAAGAGATGGAACAACACT
TTCAGAACACATCATCTGTTGATTACAGCTTAAAGGAAGGAGAAACCATTGTTCTCCAAC
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TGTCCTTGGAGGATAAGGGCAAGTCTATAGAAACCACCATTCCTTCACTCATCCCTCCGC
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GAGATTTCCAAGCGGCAGGCTGATTTAGCCATTGAGTATTTTTTACCATACAGAAAGCAT
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TCCACCTCCTGTACAATTGCA

QA 1 801 1 801
DS 

RD RS1A425JQ 772 0 0
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GTAGAAGCTGTAATCGACAGTAGCAGATATTTTGTTCTCCGTGTGGAAGAAAACATAGGT
GGTCGCGCTCGTCATGCTTTTATTGGACTCGGATTCAGGGAGAGAACTGAAGCATATGAT
TTCCAAGCAGCATTACATGACCACATGAAGTACTTGAACAAGAAGAAAACAGCAGAAGAG
ATGGAACAACACTTTCAGAACACATCATCTGTTGATTACAGCTTAAAGGAAGGAGAAACC
ATTGTTCTCCAACTCAAAAACATGAGCGAAAAAGACACAAAGACTAAGTTGGTAGAGAAG
AGTCTGACCAATCTGTCCTTGGAGGATAAGGGCAAGTCTATAGAAACCACCATTCCTTCA
CTCATCCCTCCGCCTCCACCTCCTGGACCGCTTTCTCCTGTTACAACCGCTCAGAAGTCC
CCATCAAGCAGCCTCAGCGTCCAAAGATCATCTGAATAACAAGATCTAGATACGAAGCGA
GAAGAAGTAGAGAAGAAAGAAGACCAAGAAGCTAATGAAACAGGCGTTGAAGATGCACCA
GATGATGACTTTGGAGATTTCCAAGCGGCAGGCTGATTTAGCCATTGAGTATTTTTTACC
ATACAGAAAGCATCGTTTTATATAAGTAATGTGACTGATCAAAGTTTGGATTGTTTGCTT
TTGTGAGAGAGAGTCCACCTCCTGTACAATTGCATACAAAGACTATTTCTCC

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 4

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CCACGAAACGTTATTTCCAGATGCTAATTCACATAACAAAACAAAAAGTTATTTACGTAG
TTTCACACAGCCCTATTCAAACAAAAAAAAACTCATTGGATGCCCTTCAAATCACACACT
TTTTACCACAACCAAGGAAACTCAAAGATGGAATCTTCTGTATAAGAGTTTCCGCCACTC
GAGAAGCTGAAGGTCTTAGAGATGGTGGGCTACCGATACAGAGCGCAGCCACACTCAGCA
TTGTCTTCACTTCATCGATAATATCAATGCTATCTCTTAACAACCTCGGATCCAAAAACC
CTCTCACGCTCTCTTCTGCAACGTCTACACTTGAATCAAGAATCTCTTGGACAAGTGGAC
CCGCTACATGCGTCAGCATCTCGCCTTTGCCAGAAGAAAACGCTTCTTTTCCTGAAACCA
ACTCAAGAACCACAACTCCAAACCCATAAATATCCATCTTCTTAGAAGCAACCCCGGTTC
TTAAGTAGTGTGGGTCTGTGTACCCCGGAGATCCCACCATGGTAACATGTCTTGATCTAG
GTGACATCGTAGACGGCTGAACCATCGAAGAGAACCCGACTTTGGCTGACCCGAAATCAC
AAAGCTTAGAGTTTAAGTTTTTGTCAAGAAGTACGTTGGAAGATTTGATGTCCCCGTGCA
CGATCTGAGGGATACATTTCCCGTGAATGTGTTCGATGGCTTGAACTAGCTGCAACGCAA
TGGCGACGCGGTTCCTCCATGGCAAGACTTGTTTGCTGTTTCTATGTAGCTTCTCTTGTA
GGTTCCCTTGTGGAAGGTATTCAAGAAGAAGAGCACCATTTTCTTCTGAATCGTCGAAAT
AGCCGAGAAGCTTGACGATATTTGGATGGTGAAGACGGAGCAAGATATCAAGCTCGAGTT
TGAAGATCTTGTAAAGACGGTGGCTGCTAACGTGAACCTTGAGAGCAGCTTTGGCTGAGC
TAGACAAGCGAGCCATGTAGATGCTGCTGTAGCCACCAGAACCAATCAGTCTAGAGAAGT
TGGAAGTGAGAGCCTCAACGTCATCCCAGCTGTAACGGGTGACGCCGGAGACGGCTAGAG
ATCCTTCTTTGCTTGTGGGTTTGTCCGTGATCGTCGGGGTGACATTGAACGGGACGCATT
TCAAGAAACAAGCCATTGGAAACAGAGTAGCTTAGTGAGAAACAGAGTAGATTTTTCTGG
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ATTCGTAATAAAGAAGAAGAGTTTGGATCGGGAGGCAGAGTTTGACCGATTCTTAAATCT
GCCATTTTTTGAAGAATGTTGAAAGCTTCCTCTGAAGCAGACTTTCTGAGTTCTCC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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TGTCTTCACTTCATCGATAATATCAATGCTATCTCTTAACAACCTCGGATCCAAAAACCC
TCTCACGCTCTCTTCTGCAACGTCTACACTTGAATCAAGAATCTCTTGGACAAGTGGACC
CGCTACATGCGTCAGCATCTCGCCTTTGCCAGAAGAAAACGCTTCTTTTCCTGAAACCAA
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C

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CCTTGTGGAAGGTATTCAAGAAGAAGAGCACCATTTTCTTCTGAATCGTCGAAATAGCCG
AGAAGCTTGACGATATTTGGATGGTGAAGACGGAGCAAGATATCAAGCTCGAGTTTGAAG
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AGATCGGAGAATGAAGATTAGGGATTTAGGGGTTTGGAGTTAATGGGTTTGT*AGATTTG
TAATAAAGAAGAAGAGTTTGGATCGGGAGGCAGAGTTTGACCGATTCTTAAATCTGCCAT
TTTT*GAAGAATGTTGAAAGCTTCCTCTGAAGCAGACTTTCTGAGTTCTCC

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CTACATTCTCCAGAGTCTTACCTTCCCCATCCAGCAAAACTTCTCCCTCCTTCGTTCCCT
TCCGGTCTCCTTCCCTCAAGATCACCAATTCCGCTTACTTCCTCCCATCATCTATCTCCC
TCTCTTCACGTCGCGCATCCTTCATCATCCCACGTGCCACTCCCTCCTCCTCAGAGGGAT
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GG


BQ
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30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 

AF RS1FV01TF U 1
AF RS1EK88TF U 1
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CTACATTCTCCAGAGTCTTACCTTCCCCATCCAGCAAAACTTCTCCCTCCTTCGTTCCCT
TCCGGTCTCCTTCCCTCAAGATCACCAATTCCGCTTACTTCCTCCCATCATCTATCTCCC
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CCGACTCCCTAGCCAAAACCACCTTCCATGGCCTATGCTTCGTCTTGAAAGACAACATAG
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TTGAGCCAGGAGAGATCAAATCTAAATACTCGATCATAGTCGCCGGTGAGAACTTTGGTT
GCGGGTCGTCACGTGAACACGCTCCTGTCTGTCTAGGAGCAGCCGGAGTTAAAGCCGTTG
TTGCTCAGACTTACGCAAGGATTTTTTTCCGTAACTCGGTAGCTACGGGAGAGGTGTTTC
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AGCTGAGGGATAGTGGTGGTTTACTGACTAATCACACGACTGGTAAGCAGTATAAGCTGA
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AG
TGG

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AGGTGTTTCCCCTTGAATCAGAGGTTAGAGTTTGCGACGAGTGTACGACAGGAGACACGG
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AATCTAAAGGG

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TCTGTTTAGGAGCAGCCGGAGTTAAAGCCGTTGTTGCTCAGACTTACGCAAGGATTTTTT
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QA 1 515 1 515
DS 



AS 1 4

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BQ
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ACAGTAGCCCACAGATTCT*GTACCCATTGC

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DS 

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GTTTGCTAGAGGGTAAAAAAGCAACATGTTATCCAGTGTTTATGGAGAAGCTAGGAGCAA
CCTGTGCAACGGCTGTTGAGTCGAGAGTGGAAATTGATGGGAGGATAGTGACCAGTAGAG
GGCCCGGAACCACTATGGAATTTTCTGTCACACTTGTGGAGCAGCTGTTTGGGAAAGAGA
AAGCTGCTGAAGTCTCTGCACCTTTGGTGATGCGTCCCAACCCTGGTGATGAGTACACTA
TTACCGAGCTTAACCAAACAAAGTGGTCGTATGACAGTAGCCCACAGATTCTTGTACCCA
TTGCAGATGGCTCGGAGGAAATGGAAGCTGTTGCGATCATTGATGTACTGAGACGGGCAA
AAGCGAATGTTGTCGTTGCTGCGCTTGGTAACAGTTTTGGAAGTGGTAGCATCTCGTAAA
GTCAAGCTAGTGGCAGATGTGCTCCTCGATGGGGCTGAAAAGAACTCATACGATCTGATT
GTGTTGCCTGGTGGTCTCGGTGGTGCTGAAGCATTTGCAAGTTCGGAGAAGCTAGTGAAT
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CTGGTCTTTGAGCCACA

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DS 

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GTCGTATGACAGTAGCCCACAGATTCTTGTACCCATTGCAGATGGCTCGGAGGAAATGGA
AGCTGTTGCGATCATTGATGTACTGAGACGGGCAAAAGCGAATGTTGTCGTTGCTGCGCT
TGGTAACAGTTT*GGAAGTGGTAGCATCTCGTAAAGTCAAGCTAGTGGCAGATGTGCTTC
TCGATGAGGCTGAAAAGAACTCATACGATCTGATTGTGTTGCCTGGTGGTCTCGGTGGTG
CTGAAGCATTTGCAAGTTCGGAGAAGCTAGTGAATATGTTAAAGAAGCAGGCGGAATCAA
ACAAACCATATGGAGCAATTTGTGCATCACCTGCTCTGGTCTTTGAGCCACATGGTTTGC
TCAAGGGTAAGAAGGCGACAGCTTTTCCAGCAATGTGCAGCAAATTGTCGGACAAGAGTC
ACATTGAACATAGAGTTTTGGTGGACGGTAATCTCATAACGAGCAGGGGTCCTGGAACGT
CGTTGGAGTTTGCACTCGGAATCGTGGAGAAGTTTTATGGTCGCGAGAAAGGACTTCAGC
TAGCAAAGGCAACTCTTGTGTAAATTCAACGAAGTGTAAGAATGTCTTCTTTAAGAAAAA
TGCTTTAGTATGAAGCTATCGATAAGTGGACCTTTTATTGTAATGTGTGTTTTTACACTG
AGTGTGAGGCTTTATAATGTCCAATAAATAAAAAGACGAGCTTACTTACTCGTTTTCTTC
C

QA 1 781 1 781
DS 

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TTCTTGTACCCATTGCAGATGGCTCGGAGGAAATGGAAGCTGTTGCGATCATTGATGTAC
TGAGACGGGCAAAAGCGAATGTTGTCGTTGCTGCGCTTGGTAACAGTTT*GGAAGTGGTA
GCATCTCGTAAAGTCAAGCTAGTGGCAGATGTGCTCCTCGATGGGGCTGAAAAGAACTCA
TACGATCTGATTGTGTTGCCTGGTGGTCTCGGTGGTGCTGAAGCATTTGCAAGTTCGGAG
AAGCTAGTGAATATGTTAAAGAAGCAGGCGGAATCAAACAAACCATATGGAGCAATTTGT
GCATCACCTGCTCTGGTCTTTGAGCCACATGGTTTGCTCAAGGGTAAGAAGGCGACAGCT
TTTCCAGCAATGTGCAACAAATTGTCGGACAAGAGTCGCATTGAACATAGAGTTTTGGTG
GACGGTAATCTCATAACGAGCAGGGGTCCTGGAACGTCGTTGGAGTTTGCACTCGGAATC
GTGTAGAAGTTTTATGGTCGCGAGAAAGGACTTCAGCTAGCAAAGGCAACTCTTGTGTAA
ACTCAACGAAGTGTAAGAATGTCTTCTTTAAGGAAAATGCTTTAGTATGAAGCTATCGAT
AAGTGGACCTTTTATTGTAATGTGTGTTCTTACACTGAGTGTGAGGCTTTATAATGTCCA
ATAAATAAAAAGACGAGCTTACT
C

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 3

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TTAAAAACGCAAATTGTAAGATTTAAACAAAAAACATCAAAAACTACAGAGCAATGATTT
GCTCAAGTAGTGAAGCAGAGTGAAATACAAAGTAGAAAATCCAACAAGAATAACACAACA
AAAAAAGATGACATAGGAAGTAGAGGCTAACTCTTGATCCGGACGCTCCGGCTTATGTTG
GGATTGATACCGGTACTTTCTCCTCCATATGAACCCGTAGGTTTCCTCATATCTCTCACT
TGTCCTTTACGTATCTTGACTTTGTCTGCGTACTTGTCCCGGTAATTCTTTCTCGGGTTC
TTTTTGTCCTTGTTGCGAGGTCTAGTCAATCCTCTGTTAAAAAAAATCGCTTTTGAAATC
ACTCGTTTTCCATCCACGGTTTCCGGTTCAAACTCGATCGATGTTGGTTCCCTTGAATAG
ATCCCTGCTTTGGCAGCTCGTTTAGCTTCTTTATTCTGTTTCACTTGTTTGTAAAACTCA
TCTTCGCCTTCTGAATCGCCGTCACTATCAACCATGTTATTATCACCATCTTCATCCTTA
CCATTGTCGTCATCTGATGCAAAGACCTCGCTTTCATTCTTGCCATCTTCCTCTGACTTC
ACACCAGCTCCAGCCAAAACTTTGAGCTCAAACTTTCTACGCCGTTCTCCAATGTCATCC
CTTTGCGGTAAATCATCATCTCCAGAAACAGTCCTGGGCTTCCGTTTGGTGGACACAAGA
TTGGTGCGCTTATCAACTGGTACATCATTGTCAACGTCATCCACATAATCATCGAATGTC
TCTAGCTTCCTATTAGCTAATTTCTGGCGTTTTTGAGGTTTATCAGACTTTGAAACAGTA
GAGCCAAAAACTCCACTGCTCTTAGCTTTCCCTCTAGAGCAGCTCGAAGTTTCAACATTT
CCTCACTCTGAATATCAACTTGATCATTCTGGTGCTTGCGTTTCTCTCCTTTTTTCTTCG
CGTCTGCTTTAGATTTACTGATTTTAACCGGCTCGACTGTGTCTTGTGTGATTTTAACTG
CTGAAGCAGAAACAGGTGAAGAGGGCGTATCTTCTTTGACGACCTTTGCATTCTCTCTAG
AGACTCCTCGAATCCAGGGGGAAGCTCTCCATCGAGTTCTTTGATCTTATCTAATAAAGC
TTTGATGTCTACAAGACGGGCAAGGACCGGATGATCACGGATGGGCTGCCCTTCAGACTT
GAGTAGAAAATAGAATGTTATAGATTGGCAATAGGCCAGTAGCAGAATCTGCTTAACCTC
CAAGTACCTTGCTCCACCAGTCAACGGAACCCCCCCTTCCTTTAACTTAGTCATAATAGG
ATTTATTTTATTCTCAAGCTCTTCGACTGCATCGTTCAACTCAGATAAAAGACCAACTAT
TTCCGGAGCAGAACTATATACTACATCCATCTGCTCTTCTTTTGACAAAGAGTTTATGTC
TTTCTTGATAACTTCAACATCCTTCTCTTTCTTATCCGTGATGGATTTTGTACCCTTCTT
GCCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 0 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1ET95JQ U 41
AF RS1AG20JQ U 1
AF RS1AG20TF C 761
BS 1 62 RS1AG20JQ
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RD RS1ET95JQ 808 0 0
G
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TTTCCTCATATCTCTCACTTGTCCTTTACGTCTCTTGACTTTGTCTGCGTACTTGTCCCG
GTAATTCTTTCTCGGGTTCTTTTTGTCCTTGTTGCGAGGTCTAGTCAATCCTCTGTTACT
CAAAATCGCTTTTGAAATCACTCGTTTTCCATCCACGGTTTCTGGTTCAAACTCGATCGA
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CACTTGTTTGTAAAACTCATCTTCGCCTTCTGAATCGCCGTCACTATCAACCATGTTATT
ATCACCATCTTCATCCTTATCATTGTCGTCATCTGATGCAAAGACCTCGCTTTCATTCTT
GCCATCTTCCTCTGACTTCACACCAGCTCCAGCCAAAACTTTGAGCTCAAACTTTCTACG
CCGTTCTCCAATGTCATCCCTTTGCGGTAAATCATCATCTCCAGAAACAGTCTTGGGCTT
CCGTTTGGTGGACACAAGATTGGTGCGCTTATCAACTGGTACACCATTGTCAACGTCATC
CACATAATCATCGAATGTCTCTAGCTT

QA 2 808 2 808
DS 

RD RS1AG20JQ 918 0 0
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GCTCAAGTAGTGAAGCAGAGTGAAATACAAAGTAGAAAATCCAATAAGGATAACACAACA
AAAAA*GATGACATAGGAAGTAGAGGCTAACTCTTGATTCGGACGCTCCGGCTTATGTTG
GGATTGATACCGGTACTTTCTCCTCCATATGAACCCGTAGGTTTCCTCATATCTCTCACT
TGTCCTTTACGTATCTTGACTTTGTCTGCGTATTTGTCCCGGTAATTCTTTCTCGGGTTC
TTTTTGTCCTTGTTGCGAGGTCTAGTCAATCCTCTGTTAAAAAAAATCGCTTTTGAAATC
ACTCGTTTTCCATCCACGGTTTCCGGTTCAAACTCGATCGATGTTGGTTCCCTTGAATAG
ATCCCTGCTTTGGCAGCTCGTTTAGCTTGTTTATTCTGTTTCACTTGTTTGTAAAACTCA
TCTTCGCCTTCTGAATCGCCGTCACTATCAACCATGTTATTATCACCATCTTCATCCTTA
CCATTGTCGTCATCTGATGCAAAGACCTCGCTTTCATTCTTGCCATCTTCCTCTGACTTC
ACACCAGCTCCAGCCAAAACTTTGAGCTCAAACTTTCTACGCCGTTCTCCAATGTCATCC
CTTTGCGGTAAATCATCGTCTCCAGAAACAGTCCTGGGCTTCCGTTTGGTGGACACAAGA
TTGGTGCGCTTATCAACTGGTACATCATTGTCAACGTCATCCACATAATCATCGAATGTC
TCTAGCTTCCTATTAGCTAATTTCTGGCGTTTTTGAG*TTTATCAGACTTTGAAACAGTA
GAGCCAAAA
CTCCACTGC

QA 1 909 1 909
DS 

RD RS1AG20TF 806 0 0
TCCGTTTGGTGGACACAAGATTGGTGCGCTTATCAACTGGTACATCAT*GTCAACGTCAT
CCACATAATCATCGAATGTCTCTAGCTTC*TATTAGCTAATTTCTGGCGTTTTTGAGGTT
TATCAGACTTTGAAACAGTAGAGCCAAAAACTCCACTGCTCTTAGCTTTCCCTCTAGAGC
AGCTCGAAGTTTCAACATTTCCTCACTCTGAATATCAACTTGATCATTCTGGTGCTTGCG
TTTCTCTCCTTTTTTCTTCGCGTCTGCTTTAGATTTACTGATTTTAACCGGCTCGACTGT
GTCTTGTGTGATTTTAACTGCTGAAGCAGAAACAGGTGAAGAGGGCGTATCTTCTTTGAC
GACCTTTGCATTCTCTCTAGAGACTCCTCGAATCCAGGGGGAAGCTCTCCATCGAGTTCT
TTGATCTTATCTAATAAAGCTTTGATGTCTACAAGACGGGCAAGGACCGGATGATCACGG
ATGGGCTGCCCTTCAGACTTGAGTAGAAAATAGAATGTTATAGATTGGCAATAGGCCAGT
AGCAGAATCTGCTTAACCTCCAAGTACCTTGCTCCACCAGTCAACGGAACCCCCCCTTCC
TTTAACTTAGTCATAATAGGATTTATTTTATTCTCAAGCTCTTCGACTGCATCGTTCAAC
TCAGATAAAAGACCAACTATTTCCGGAGCAGAACTATATACTACATCCATCTGCTCTTCT
TTTGACAAAGAGTTTATGTCTTTCTTGATAACTTCAACATCCTTCTCTTTCTTATCCGTG
ATGGATTTTGTACCCTTCTTGCCTTT

QA 1 806 1 806
DS 



AS 1 4

CO CL2966Contig1 706 4 6 U
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ATGAACATAGTGTCCGTCCGGGCTCTCTCTCCGCCCTCCAGGTTGTTACATCGTGCCGAG
AGATGTAGAGTGGGAGGGAGAAACTACGAAAAGCCTGAACTGAAACAAAGCGACTTCTCA
AAAGACGAAGACGATCTCATCCTTAGGCTTCATGCACTTCTTGGCAATAGATGGTCATTG
ATAGCGGGAAGGTTACCTGGAAGAACCGATACCGAAATAAGAATCCATTGGGAAACTTAC
TTAAAGAGGAAACTCATGAAAATAGGAATAGACCCAACCAACCATCGTCTCTACCATCAC
GCAAACTATATTTCAAGACAATACCTCAGCTCCTCTCGTAAGAAACTTGAAACAGATATC
GTTAGTGATCAATCTTCTTCACTATCCGAATCATGTGATATGAGAATATTACCCGTTTCA
AGTACCGATTGCTATGATGATAGTGCTACTAGTAGTGCCGGACATAGTCGTTTGCCTGAC
CTCAACATTAGTCTCATCCCGGCTGAGACGGTGGTTTCTTGGTCAGGTTGTGGTCTTCAA
GAATCTAGCAGCAGTGGTTCGACGCGTC*AAGAAACGCTTCTTCTTTTCCGGTGAAATCG
GATATTTTATTGCTACATAAGAAATGAAAAATGGTGTATGTCATTC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1GK44TF U 1
AF RS1A634JQ C 1
AF RS1C943TF U 1
AF RS1A634TF U 9
BS 1 21 RS1C943TF
BS 22 22 RS1A634TF
BS 23 171 RS1C943TF
BS 172 172 RS1A634TF
BS 173 691 RS1C943TF
BS 692 706 RS1A634TF

RD RS1GK44TF 654 0 0
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GCAAACTATATTTCAAGACAATACCTCAGCTCCTCTCGTAAGAAACTTGAAACAGATATC
GTTAGTGATCAATCTTCTTCACTATCCGAATCATGTGATATGAGAATATTACCCGTTTCA
AGTACCGATTGCTATGATGATAGTGCTACTAGTAGTGCCGGACATAGTCGTTTGCCTGAC
CTCAACATTAGTCTCATCCCGGCTGAGACGGTGGTTTCTTGGTCAGGTTGTGGTCTTCAA
GAATCTAGCAGCAGTGGTTCGACGCGTC*AAGAAACGCTTCTTCTTTTCC
CGTG

QA 1 650 1 650
DS 

RD RS1A634JQ 706 0 0
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AAAGACGAAGACGATCTCATCCTTAGGCTTCATGCACTTCTTGGCAATAGATGGTCATTG
ATAGCGGGAAGGTTACCTGGAAGAACCGATACCGAAATAAGAATCCATTGGGAAACTTAC
TTAAAGAGGAAACTCATGAAAATAGGAATAGACCCAACCAACCATCGTCTCTACCATCAC
GCAAACTATATTTCAAGACAATACCTCAGCTCCTCTCGTAAGAAACTTGAAACAGATATC
GTTAGTGATCAATTTTCTTCACTATCCGAATCATGTGATATGAGAATATTACCCGTTTCA
AGTACCGATTGCTATGATGATAGTGCTACTAGTAGTGCCGGACATAGTCGTTTGCCTGAC
CTCAACATTAGTCTCATCCCGGCTGAGACGGTGGTTTCTTGGTCAGGTTGTGGTCTTCAA
GAATCTAGCAGCAGTGGTTCGACGCGTCTAAGAAACGCTTTTTCTTTTCCGGTGAAATCG
GATATTTTATTGCTACATAAGAAATGAAAAATGGTGTATGTCATTC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RS1C943TF 691 0 0
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ATGAACATAGTGTCCGTCCGGGCTCTCTCTCCGCCCTCCAGGTTGTTACATCGTGCCGAG
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AAAGACGAAGACGATCTCATCCTTAGGCTTCATGCACTTCTTGGCAATAGATGGTCATTG
ATAGCGGGAAGGTTACCTGGAAGAACCGATACCGAAATAAGAATCCATTGGGAAACTTAC
TTAAAGAGGAAACTCATGAAAATAGGAATAGACCCAACCAACCATCGTCTCTACCATCAC
GCAAACTATATTTCAAGACAATACCTCAGCTCCTCTCGTAAGAAACTTGAAACAGATATC
GTTAGTGATCAATCTTCTTCACTATCCGAATCATGTGATATGAGAATATTACCCGTTTCA
AGTACCGATTGCTATGATGATAGTGCTACTAGTAGTGCCGGACATAGTCGTTTGCCTGAC
CTCAACATTAGTCTCATCCCGGCTGAGACGGTGGTTTCTTGGTCAGGTTGTGGTCTTCAA
GAATCTAGCAGCAGTGGTTCGACGCGTC*AAGAAACGCTTCTTCTTTTCCGGTGAAATCG
GATATTTTATTGCTACATAAGAAATGAAAAA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1A634TF 698 0 0
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AGTGGGAGGGAGAAACTACGAAAAGCCTGAACTGAAACAAAGCGACTTCTCAAAAGACGA
AGACGATCTCATCCTTAGGCTTCATGCACTTCTTGGCAATAGATGGTCATTGATAGCGGG
AAGGTTACCTGGAAGAACCGATACCGAAATAAGAATCCATTGGGAAACTTACTTAAAGAG
GAAACTCATGAAAATAGGAATAGACCCAACCAACCATCGTCTCTACCATCACGCAAACTA
TATTTCAAGACAATACCTCAGCTCCTCTCGTAAGAAACTTGAAACAGATATCGTTAGTGA
TCAATCTTCTTCACTATCCGAATCATGTGATATGAGAATATTACCCGTTTCAAGTACCGA
TTGCTATGATGATAGTGCTACTAGTAGTGCCGGACATAGTCGTTTGCCTGACCTCAACAT
TAGTCTCATCCCGGCTGAGACGGTGGTTTCTTGGTCAGGTTGTGGTCTTCAAGAATCTAG
CAGCAGTGGTTCGACGCGTC*AAGAAACGCTTCTTCTTTTCCGGTGAAATCGGATATTTT
ATTGCTACATAAGAAATGAAAAATGGTGTATGTCATTC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 4

CO CL2967Contig1 847 4 3 U
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GCGAGAATCGTTATCCATGTCAATAGAAACAATGCCGGAGAACGCGGAGGAGAGAGATCC
GCAACAAGAGATCGAAGAGACTACACCGCTGCTCGACGGGGAATCGAATTCAAGGACCGC
GACGACGAAGGTTCCGGGGGTGGAGATCCATCTATACCGGTGTGGAGAAGGTCCGATCGA
CGTGTTCAAGTCGAATCTCGGCGGTTGGGAGCAGAATCAGCTCGAAGTTCGATCTATCCT
TGAGAAATATGGATTGAAATCCATCTTCGCTTTCAACGTCGAGAGAGGTCGAGCCGCCCC
TATCCGGTGTCACCCTAGGAATGGCTGGTCTGTGTTGCCTTACAGGGATGGTGCCGTGGT
TTACATCGACGGTGAACCTCAGGATTCTCTGCTCAAACCCATTACAAGAATCGTGCTCGG
AGTCGCAATTGTTATGCTGTTAATTACGTTTCTATTGAAAGACCCTCCAGCGTGGATCAA
GAGCAACATCTCCATGGGGAACTTTCCTCCGTGGGTGCTCGCGTGCATAGTAATAGTTGT
CACCCGAGCGAGGAAGAGAACCAGAGACTTCTTCAAGAAGTGTGGCTGGTAATGTCAGAG
ACCTTAACACTCGTTTCCCTTGTAAACGTGGTCGTTTCCCAGGCCTTTGATATGGCCTTG
AGGCGCCAAATTGCTTGCTTTCAGAAGCAAGAGGGCAATCATTCTCTCCATTTGCATCTG
TTGAACTTTTATAGTTTTATGCGTTTTCATGTGTATGCGAGTGGAAATATATAGTTTAAT
CTTCTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CJ87TF U 1
AF RS1AB04JQ C 145
AF RS1AB04TF U 145
AF RS1CJ87JQ C 172
BS 1 534 RS1CJ87TF
BS 535 840 RS1AB04TF
BS 841 847 RS1CJ87JQ

RD RS1CJ87TF 534 0 0
GGAGACAGAACACTTGTGTTCTGTTTTCGTTTTAATAAAAGAAACCTCTTCATCGGACCG
GCGAGAATCGTTATCCATGTCAATAGAAACAATGCCGGAGAACGCGGAGGAGAGAGATCC
GCAACAAGAGATCGAAGAGACTACACCGCTGCTCGACGGGGAATCGAATTCAAGGACCGC
GACGACGAAGGTTCCGGGGGTGGAGATCCATCTATACCGGTGTGGAGAAGGTCCGATCGA
CGTGTTCAAGTCGAATCTCGGCGGTTGGGAGCAGAATCAGCTCGAAGTTCGATCTATCCT
TGAGAAATATGGATTGAAATCCATCTTCGCTTTCAACGTCGAGAGAGGTCGAGCCGCCCC
TATCCGGTGTCACCCTAGGAATGGCTGGTCTGTGTTGCCTTACAGGGATGGTGCCGTGGT
TTACATCGACGGTGAACCTCAGGATTCTCTGCTCAAACCCATTACAAGAATCGTGCTCGG
AGTCGCAATTGTTATGCTGTTAATTACGTTTCTATTGAAAGACCCTCCAGCGTG

QA 1 534 1 534
DS 

RD RS1AB04JQ 699 0 0
G
CCGCTGCTCGACGGGGAATCGAATTCAAGGACCGCGACGACGAAGGTTCCGGGGGTGGAG
ATCCATCTATACCGGTGTGGAGAAGGTCCGATCGACGTGTTCAAGTCGAATCTCGGCGGT
TGGGAGCAGAATCAGCTCGAAGTTCGATCTATCCTTGAGAAATATGGATTGAAATCCATC
TTCGCTTTCAACGTCGAGAGAGGTCGAGCCGCCCCTATCCGGTGTCACCCTAGGAATGGC
TGGTCTGTGTTGCCTTACAGGGATGGTGCCGTGGTTTACATCGACGGTGAACCTCAGGAT
TCTTTGCTCAAACCCATTACAAGAATCGTGCTCGGAGTCGCAATTGTTATGCTGTTAATT
ACGTTTTTATTGAAAGACCCTCCAGCGTGGATCAAGAGCAACATCTCCATGGGGAACTTT
CCTCCGTGGGTGCTCGCGTGCATAGTAATAGTTGTCACCCGAGCGAGGAAGAGAACCAGA
GACTTTTTCAAGAAGTGTGGCTGGTAATGTCAGAGACCTTAACACTCGTTTCCCTTGTAA
ACGTGGTCGTTTCCCAGGCCTTTGATATGGCCTTGAGGCGCCAAATTGCTTGCTTTCAGA
AGCAAGAGGGCAATCATTCTCTCCATTTGCATCTGTTGAACTTTTATAGTTTTATGCGTT
TTCATGTGTATGCGAGTGGAAATATATAGTTTAAT
TTT

QA 2 696 2 696
DS 

RD RS1AB04TF 699 0 0
G
CCGCTGCTCGACGGGGAATCGAATTCAAGGACCGCGACGACGAAGGTTCCGGGGGTGGAG
ATCCATCTATACCGGTGTGGAGAAGGTCCGATCGACGTGTTCAAGTCGAATCTCGGCGGT
TGGGAGCAGAATCAGCTCGAAGTTCGATCTATCCTTGAGAAATATGGATTGAAATCCATC
TTCGCTTTCAACGTCGAGAGAGGTCGAGCCGCCCCTATCCGGTGTCACCCTAGGAATGGC
TGGTCTGTGTTGCCTTACAGGGATGGTGCCGTGGTTTACATCGACGGTGAACCTCAGGAT
TCTCTGCTCAAACCCATTACAAGAATCGTGCTCGGAGTCGCAATTGTTATGCTGTTAATT
ACGTTTCTATTGAAAGACCCTCCAGCGTGGATCAAGAGCAACATCTCCATGGGGAACTTT
CCTCCGTGGGTGCTCGCGTGCATAGTAATAGTTGTCACCCGAGCGAGGAAGAGAACCAGA
GACTTCTTCAAGAAGTGTGGCTGGTAATGTCAGAGACCTTAACACTCGTTTCCCTTGTAA
ACGTGGTCGTTTCCCAGGCCTTTGATATGGCCTTGAGGCGCCAAATTGCTTGCTTTCAGA
AGCAAGAGGGCAATCATTCTCTCCATTTGCATCTGTTGAACTTTTATAGTTTTATGCGTT
TTCATGTGTATGCGAGTGGAAATATATAGTTTAAT
CTT

QA 2 696 2 696
DS 

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TCCGATCGACGTGTTCAAGTCGAATCTCGGCGGTTGGGAGCAGAATCAGCTCGAAGTTCG
ATCTATCCTTGAGAAATATGGATTGAAATCCATCTTCGCTTTCAACGTCGAGAGAGGTCG
AGCCGCCCCTATCCGGTGTCACCCTAGGAATGGCTGGTCTGTGTTGCCTTACAGGGATGG
TGCCGTGGTTTACATCGACGGTGAACCTCAGGATTCTCTGCTCAAACCCATTACAAGAAT
CGTGCTCGGAGTCGCAATTGTTATGCTGTTAATTACGTTTCTATTGAAAGACCCTCCAGC
GTGGATCAAGAGCAACATCTCCATGGGGAACTTTCCTCCGTGGGTGCTCGCGTGCATAGT
AATAGTTGTCACCCGAGCGAGGAAGAGAACCAGAGACTTCTTCAAGAAGTGTGGCTGGTA
ATGTCAGAGACCTTAACACTCGTTTCCCTTGTAAACGTGGTCGTTTCCCAGGCCTTTGAT
ATGGCCTTGAGGCGCCAAATTGCTTGCTTTCAGAAGCAAGATGGCAATCATTCTCTCCAT
TTGCATCTGTTGAACTTTTATAGTTTTATGCGTTTTCATGTGTATGCGAGTGGAAATATA
TAGTTTAATCTTCTGG

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

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AAAACTCAGGTTTCGGATTCTTACTCACACGTAAAGAAGGCAGTGCATCATAAGTGAGCT
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TTGGTGCTCAGTCTCTGGCCTTTGTATTTGTGGAAAGGCCGAGTTTGTTTCATTCTTTGC
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AGATGTGTTCGATGCTGTCCTGTCCAGAGAGGGGAGGAGAGTATTGTTGTTTTAGTCAAT
TATTTGTATTTGTTGGTTTGGGCGAGTCTTTATAATCGTTGTGTGAAATTGTAATGAAAG
AACTAGACTTTGTTTTCCCTATTTTATTATAGGTTTCACATCAAATACCTTTCACATGG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GU58JQ C 1
AF RS1GU58TF U 1
BS 1 688 RS1GU58TF
BS 689 719 RS1GU58JQ

RD RS1GU58JQ 719 0 0
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QA 1 719 1 719
DS 

RD RS1GU58TF 688 0 0
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ATCCCTGTAGTTATGGCAACTCGCAGGGGGTTATTTGTTGCTTTTGTCATAGAAAGGCTT
AGATGTGTTCGATGCTGTCCTGTCCAGAGAGGGGAGGAGAGTATTGTTGTTTTAGTCAAT
TATTTGTATTTGTTGGTTTGGGCGAGTCTTTATAATCGTTGTGTGAAATTGTAATGAAAG
AACTAGACTTTGTTTTCCCTATTTTATT

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 4

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AAGCTTACAATCACATATACACTTTATCAATAAGTCTGCATCACAGAACATGCAACTGCT
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BQ
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AF RS1EC83JQ U 48
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AF RS1G524TF C 347
AF RS1EC83TF C 354
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BS 854 901 RS1G524TF
BS 902 902 RS1EC83TF
BS 903 981 RS1G524TF
BS 982 982 RS1EC83TF
BS 983 1064 RS1G524TF
BS 1065 1065 RS1EC83TF
BS 1066 1070 RS1G524TF
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TCTTTTGTTCCCTTAGCATAAAAGTATATACACAATCTTCTTCTCTATCTTTTTTTATGC
TTTTCTTGTCTTCAGAATCTTGATTAAATGATTCTTGAACTTCCTATCTCTCAAAAGAAA
ATCTGAGTGATTGAAGCTTACAATCACATATACACTTTATCAATAAGTCTGCATCACAGA
ACATGCAACTGCTTGTGCCCAATGTCTCAATCTCTGCTTAACTTGTTGAGGATTGTCCCC
TGGACATACTATCTTCAGTGAATCTGAATCAGTTTTCTTGGGACTACCAGGAATACTCAT
CGAGAAAGCTGATGAAAATGCGCTGCTAGTACGGCTGCTGCTGCTAGGTGATGGGA

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DS 

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TGGGTATACAGTTTATGAACAAGAAAAGACATTTTTT*GTTTTCTCATCTTTTGTTCCCT
TAGCATAAAAGTATATACACAATCTTCTTCTCTATCTTTTTT*ATGCTTTTCTTGTCTTC
AGAATCTTGATTAAATGATTCTTGAACTTCCTATCTCTCAAAAGAAAATCTGAGTGATTG
AAGCTTACAATCACATATACACTTTATCAATAAGTCTGCATCACAGAACATGCAACTGCT
TGTGCCCAATGTCTCAATCTCTGCTTAACTCGTTGAGGATTGTCCCCTGGACATACTATC
TTCAATGAATCTGAATCAGTTTTCTTGGGACTACCAGGAATACTCATCGAGAAAGCTGAT
GAAGACGCGCTGCTAGTACGGCTGCTGCTGCTAGGTGATGGGAGAGGAGAGAGCTGACGG
TTCACTGCAAAGTAAAGATCAAGAGCTGGTAAAGTATTGCATAGCTTTTGTCCAGCTTCT
TCACTGAAACCAAAACCTAACTCAATGGATCCTTTAAGCTCGTTTAAATCCTC

QA 1 593 1 593
DS 

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CTGGACA
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AGCTGATGAAGACGCGCTGCTAGTACGGCTGCTGCTGCTAGGTGATGGGAGAGGAGAGAG
CTGACGGTTCACTGCAAAGTAAAGATCAAGAGCTGGTAAAGTATTGCATAGCTTTTGTCC
AGCTTCTTCACTGAAACCAAAACCTAACTCAATGGATCCTTTAAGCTCGTTTAAATCCTC
ATCAGTTAGTTTAGTCTGTTCACTAAGATTGTCTGAAACGCCTTTGTGAAGCATCTTCTT
CTCCTGAATCATTATCATCTGACGTCTTCTTCTTTCCCAAGCAATGTCTCGTGGTGTCTC
CAACATAGATAATTGTTTTGATAACCGTTTCTTCGGCTTCTGTAAACCCACCGGAGTTGT
TGCTGCCGTCTTGGCCTCGCCAAGGGGCGGTGTTAAGACTGATAACGTAAGGTTTTCTCT
TCTTCTCACCATTTTTTTT*GTATAAAGTAGAGTGATAGGAAGCTAACGTGTTTTATGAA
GATGTGGCTTGTGATGCAAGCTAGGGTTCTTTCTTGGTTACTATCAAAGCTTTAAGCTTT
TGAATCTTGTGTGTGTAATTTAATATATTTTCTTTGTGAGATGGCCGCGTTAGAACATGT
AGCGCGGCCAACAAAGAGGTTAAAGTGGGCCGGGTTGATCAGATATGTCTTTTCTTT
C

QA 8 724 8 724
DS 

RD RS1EC83TF 759 0 0
TACTATCTTCAGTGAATCTGAATCAGTTT*CTTGGGACTACCAGGAATACTCATCGAGAA
AGCTGATGAAGATGCGCTGCTAGTACGGCTGCTGCTGCTAGGTGATGGGAGAGGAGAGAG
CTGACGGTTCACTGCAAAGTAAAGATCAAGAGCTGGTAAAGTATTGCATAGCTTTTGTCC
AGCTTCTTCACTGAAACCAAAACCTAACTCAATGGATCCTTTAAGCTCGTTTAAATCCTC
ATCAGTTAGTTTAGTCTGTTCACTAAGATTGTCTGAAACGCCTTTGTGAAGCATCTTCTT
CTCCTGAATCATTATCATCTGACGTCTTCTTCTTTCCCAAGCAATGTCTCGTGGTGTCTC
CAACATAGATAATTGTTTTGATAACCGTTTCTTCGGCTTCTGTAAACCCACCGGAGTTGT
TACTGCCGTCTTGGCCTCGCCAAGGGGCGGTGTTAAGACTGATAACGTAAGGTTTTCTCT
TCTTCTCACCATTTTTTTTTGTATAAAGTAGAGTGATAGGAAGCTAACGTGTTTTATGAA
GATGTGGCGTGTGATGCAAGCTAGGGTTCTTTCTTGGTTACTATCAAAGCTTTAAGCTTT
TGAATCTTGTGTGTGTAATTTAATATATGTTCTTTGTGAGATGGCCGCGTTAGAACATGT
AGCGCGGCCAACAAAGAGGTTAAAGTGGGCCGGGTTGATCAGATATGTCTTCTCTTTTTT
TATGCCCTTTTCTTGTTAGCTTTTGCCCAACCCGACCCC

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 4

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CAATACTATTAAGTTCAGATCTATAGCATGAACAAAGAGATGGAATATCTTTCGGATAAA
CGCATAGAAAAAAACTTTTAGTACTTGTAGTCTATACATAACCTTGTCTTTTCTCAAGTC
TCTCGATGGTTCATATTATTCCGTACAATTTTTTAATAGATTCAGTAAAGCCTAACACAA
GAGCCTAAGCAAATTCGATGGTTTAAACAGTTTAGTAGAGCTGTGATCATGTGGGTGCAT
GAACTTGCAGTTGGGACAAACAGGAGTTGATGTGCACAGCATAACCAGCATGTGGCATTT
CATGCACACTTTTGTTACCATCTCTTGCTCCTTGCAGTCAACGTCATCGTCATCACCACA
TTCAAACGCAAGCCATGACAATGATCGTCTTAATCCTGTCACAGTCGTGGTCTTCATTCT
CGGGCTTGTCAGATTGATACCCTTCGATGATGACACGTTTTCATTGTCATTTGAGGATTC
TTCTATTTCCGTAGCGGCCTTTGTAGGTGAATAAGAAGGTGAGAGGTTCAGCTCAAGGTC
TAGACTCATCTTTGGTCGCTCAACAAGCAACGGATCGTTGGGGTGTCTCGTCCTATGATC
CACAGATGTTCTCGGATAGCTCTTAGTCTCTATAGATCTCTGCCAGCCTGAAGGTAGAGG
AGTGTGGAGGTCAAGTTCAAAATCAAACGTAACTGATCTCATACTCTCTGAGTTTGATCC
TTCATTTAACATGGCTCTCTGAAGTGTTCCATGTGATTGATCTTCTTGTTTGGTCTTCTT
GAATAAATTGTGAAACTCTTCTCCATAGGCTGTAAAATCTCTCTTTCTAGAGAAAAGGGT
TTCTTCTTGTCGAGAAACCATTAGCGTTGAAATGATTTATGCTTATAATTAAGGAAAGTT
TAAACCCTTTCTATCTCTCTTTGATCATGTGAGGAAATGAGCAGATAGACTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DZ43JQ U 1
AF RS1DZ43TF C 1
AF RS1BW22JQ U 113
AF RS1BW22TF C 209
BS 1 419 RS1DZ43JQ
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BS 755 832 RS1BW22JQ
BS 833 1014 RS1BW22TF

RD RS1DZ43JQ 756 0 0
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TACAGATGTTCTCGGATAGCTCTTAGTCTCTATAGATTTCTGCCAGCCTGAAGGTAGAGG
AGTGTGGAGGTCAAGTTCAAAATCAAACGTAACT
CC

QA 1 754 1 754
DS 

RD RS1DZ43TF 756 0 0
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CAATACTATTAAGTTCAGATCTATAGCATGAACAAAGAGATGGAATATCTTTCGGATAAA
CGCATAGAAAAAAACTTTTAGTACTTGTAGTCTATACATAAC*TTGTCTTTTCTCAAGTC
TCTCGATGGTTCATATTATTCCGTACAATTTTTTAATAGATTCAGTAAAGCCTAACACAA
GAGCCTAAGCAAATTCGATGGTTTAAACAGTTTAGTAGAGCTGTGATCATGTGGGTGCAT
GAACTTGCAGTTGGGACAAACAGGAGTTGATGTGCACAGCATAACCAGCATGTGGCATTT
CATGCACACTTTTGTTACCATCTCTTGCTCCTTGCAGTCAACGTCATCGTCATCACCACC
TTCAAACGCAAGCCATGACAATGATCGTCTTAATCCTGTCACAGTCGTGGTCTTCATTCT
CGGGCTTGTCAGATTGATACCCTTCGATGATGACACGTTTTCATTGTCATTTGAGGATTC
TTCTATTTCCGTAGCGGCCTTTGTAGGTGAATAAGAAGGTGAGAGGTTCAGCTCAAGGTC
TAGACTCATCTTTGGTCGCTCAACAAGCAACGGATCGTTGGGGTGTCTCGTCCTATGATC
TACAGATGTTCTCGGATAGCTCTTAGTCTCTATAGATTTCTGCCAGCCTGAAGGTAGAGG
AGTGTGGAGGTCAAGTTCAAAATCAAACGTAACT
CC

QA 1 754 1 754
DS 

RD RS1BW22JQ 720 0 0
CGGATAAACGCATAGAATAAAACTTTTAGTACTTGTAGTCTATACATAACCTTGTCTTTT
*TCAAGTCTCTCGATGGTTCATATTATTCCGTACAATTTTTTAATAGATTCAGTAAAGCC
TAACACAAGAGCCTAAGCAAATTCGATGGTTTAAACAGTTTAGTAGAGCTGTGATCATGT
GGGTGCATGAACTTGCAGTTGGGACAAACAGGAGTTGATGTGCACAGCATAACCAGCATG
TGGCATTTCATGCACACTTTTGTTACCATCTCTTGCTCCTTGCAGTCAACGTCATCGTCA
TCACCACATTCAAACGCAAGCCATGACAATGATCGTTTTAATCCTGTCACAGTCGTGGTC
TTCATTCTCGGGCTTGTCAGATTGATACCCTTCGATGATGACACGTTTTCATTGTCATTT
GAGGATTCTTCTATTTCCGTAGCGGCCTTTGTAGGTGAATAAGAAGGGGAGAGGTTCAGC
TCAAGGTCTAGACTCATCTTTGGTCGCTCAACAAGCAACGGATCGTTGGGGTGTCTCGTC
CTATGATCCACAGATGTTCTCGGATAGCTCTTAGTCTCTATAGATCTCTGCCAGCCTGAA
GGTAGAGGAGTGTGGAGGTTAAGTTCAAAATCAAACGTAACTGATCTCATACTCTCTGAG
TTTGATCCTTCATTTAACATGGCTCTCTGAAGTGTTCCATGTGATTGATCTTCTTGTTTG

QA 1 720 1 720
DS 

RD RS1BW22TF 806 0 0
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AGTTTAGTAGAGCTGTGATCATGTGGGTGCATGAACTTGCAGTTGGGACAAACAGGAGTT
GATGTGCACAGCATAACCAGCATGTGGCATTTCATGCACACTTTTGTTACCATCTCTTGC
TCCTTGCAGTCAACGTCATCGTCATCACCACATTCAAACGCAAGCCATGACAATGATCGT
TTTAATCCTGTCACAGTCGTGGTCTTCATTCTCGGGCTTGTCAGATTGATACCCTTCGAT
GATGACACGTTTTCATTGTCATTTGAGGATTCTTCTATTTCCGTAGCGGCCTTTGTAGGT
GAATAAGAAGGTGAGAGGTTCAGCTCAAGGTCTAGACTCATCTTTGGTCGCTCAACAAGC
AACGGATCGTTGGGGTGTCTCGTCCTATGATCCACAGATGTTCTCGGATAGCTCTTAGTC
TCTATAGATCTCTGCCAGCCTGAAGGTAGAGGAGTGTGGAGGTTAAGTTCAAAATCAAAC
GTAACTGATCTCATACTCTCTGAGTTTGATCCTTCATTTAACATGGCTCTCTGAAGTGTT
CCATGTGATTGATCTTCTTGTTTGGTCTTCTTGAATAAATTGTGAAACTCTTCTCCATAG
GCTGTAAAATCTCTCTTTCTAGAGAAAAGGGTTTCTTCTTGTCGAGAAACCATTAGCGTT
GAAATGATTTATGCTTATAATTAAGGAAAGTTTAAACCCTTTCTATCTCTCTTTGATCAT
GTGAGGAAATGAGCAGATAGACTTCC

QA 1 806 1 806
DS 



AS 1 4

CO CL2971Contig1 1067 4 2 U
GGCTTTAACTTATCAAGAAACTATGGTATTAGTGATCTGTACAAATGTGAGCAAAGAGAG
GAGACAGTGGGACATAATGATAAAGAAAGAACAAAGCTACAAAACTATATAACAATCTTA
AGACAACTACAAAAACTCAAATCATATACTCTGTTGTGTCTGAAAGTTACAATGGTGCCT
GCTTTTTTTTTTTGTGTGGTGTCAGCAGAGGAAACATATGGACTTTGATCTCGATGTTTC
ACGACGGTCTTCTAAACCTTTCAAGAACCATCTGATGGCGAGGTGCTCTGAAGCATAAGT
CATGAAGGCAACCAAAACTATGGCTACACCCACCATTAGACCCAACCTCAGGAATAAAGC
GGTGATCCCTAATATATAAGGCAAAAAAACTGCAGCAATAGCCAGAAACACC*ATCCCTA
ATCCATAATACAATGTAGTAACGTCACAAGGCACACCTCCTCGCTGATGACCTTTTCCAG
AATCATCCAAGGACGATGATTCTGTTTGAATTGCTATTTTCTTTCCATGTTGATGCACCA
GAAGCAAGAAGCAACCAAACAAAAGAAAGAAGATTGTGAAAGTTCATTCGTATACCAAGA
TCAAGCCAGTCCATGGCATGATCTGCCTCGGCACGATCAGAAAGGAAACTCCAACGGATA
TCAGAAGGGCGGTGAAACAAACTACAACTGATACCGCGCCTAAGTGCCCCGGCCGTAAGC
AGTGGTATCAACGCAGAGTGGCTCCCCGGCAGGTATGGCTTCGTCTAGAGCTTTGTTCAC
TGCATCGGCTTTACTCGTCATGTATGGATCAAAATCGAACGTGAAACTAGAAGTGGTATT
TATATCTTCATCTTCTACTACTTCCACAATGGGAGAATCAAGAAACTCGGCTACTTCTTT
TCTTGATAAAATGGCGGCCTTGGCTTGAGTTTCAAGAGAAGGCTGGAACATGCGGCTTAG
GCTCGGTTTGATATACTGAAATAAGAAATTTAGAGAGAGAACGAGGAGTGAGAAATAGAG
CAACAGAATTTGAGCTTCCATTTTTCATCAAGACAAACTTCTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1C529JQ U 1
AF RS1C467JQ U 206
AF RS1C467TF C 271
AF RS1C529TF C 291
BS 1 491 RS1C529JQ
BS 492 1067 RS1C467TF

RD RS1C529JQ 491 0 0
GGCTTTAACTTATCAAGAAACTATGGTATTAGTGATCTGTACAAATGTGAGCAAAGAGAG
GAGACAGTGGGACATAATGATAAAGAAAGAACAAAGCTACAAAACTATATAACAATCTTA
AGACAACTACAAAAACTCAAATCATATACTCTGTTGTGTCTGAAAGTTACAATGGTGCCT
GCTTTTTTTTTTTGTGTGGTGTCAGCAGAGGAAACATATGGACTTTGATCTCGATGTTTC
ACGACGGTCTTCTAAACCTTTCAAGAACCATCTGATGGCGAGGTGCTCTGAAGCATAAGT
CATGAAGGCAACCAAAACTATGGCTACACCCACCATTAGACCCAACCTCAGGAATAAAGC
GGTGATCCCTAATATATAAGGCAAAAAAACTGCAGCAATAGCCAGAAACACC*ATCCCTA
ATCCATAATACAATGTAGTAACGTCACAAGGCACACCTCCTCGCTGATGACCTTTTCCAG
AATCATCCAAG

QA 1 491 1 491
DS 

RD RS1C467JQ 286 0 0
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AACCATCTGATGGCGAGGTGCTCTGAAGCATAAGTCATGAAGGCAACCAAAACTATGGCT
ACACCCACCATTAAACCCAACCTCAGGAATAAAGCGGTGATTCCTAATATATAAGGCAAA
AAAACTGCAGCAATAGCCAGAAACACC*ATCCCTAATCCATAATACAATGTAGTAACGTC
ACAAGGCACACCTCCTCCCTGATGACCTTTTCCAGAATCATCCAAG

QA 1 286 1 286
DS 

RD RS1C467TF 797 0 0
TCTGATGGCGAG*TGCTCTGAAGCATAAGTCATGAAGGCAACCAAA*CTATGGCTACACC
CACCATTAGACCCAAC*TCAGGAATAAAGCGGTGATCCCTAATATATAAGGCAAAGAAAC
TGCAGCAATAGCCAGAAACACC*ATCCCTAATCCATAATACAATGTAGTAACGTCACAAG
GCACACCTCCTCGCTGATGACCTTTTCCAGAATCATCCAAGGACGATGATTCTGTTTGAA
TTGCTATTTTCTTTCCATGTTGATGCACCAGAAGCAAGAAGCAACCAAACAAAAGAAAGA
AGATTGTGAAAGTTCATTCGTATACCAAGATCAAGCCAGTCCATGGCATGATCTGCCTCG
GCACGATCAGAAAGGAAACTCCAACGGATATCAGAAGGGCGGTGAAACAAACTACAACTG
ATACCGCGCCTAAGTGCCCCGGCCGTAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTGGCTCCCCGGC
AGGTATGGCTTCGTCTAGAGCTTTGTTCACTGCATCGGCTTTACTCGTCATGTATGGATC
AAAATCGAACGTGAAACTAGAAGTGGTATTTATATCTTCATCTTCTACTACTTCCACAAT
GGGAGAATCAAGAAACTCGGCTACTTCTTTTCTTGATAAAATGGCGGCCTTGGCTTGAGT
TTCAAGAGAAGGCTGGAACATGCGGCTTAGGCTCGGTTTGATATACTGAAATAAGAAATT
TAGAGAGAGAACGAGGAGTGAGAAATAGAGCAACAGAATTTGAGCTTCCATTTTTCATCA
AGACAAACTTCTTCTCC

QA 1 797 1 797
DS 

RD RS1C529TF 777 0 0
AAGCATAAGTCATGAAGGCAACCAAAACTATGGCTACACCCACCATTAGACCCAAC*TCA
GGAATAAAGCGGTGAT*CCTAATATATAAGGCAAAGAAACTGCAGCAATAGCCAGAAACA
CCCATCCCTAATCCATAATACAATGTAGTAACGTCACAAGGCACACCTCCTCGCTGATGA
CCTTTTCCAGAATCATCCAAGGACGATGATTCTGTTTGAATTGCTATTTTCTTTCCATGT
TGATGCACCAGAAGCAAGAAGCAACCAAACAAAAGAAAGAAGATTGTGAAAGTTCATTCG
TATACCAAGATCAAGCCAGTCCATGGCATGATCTGCCTCGGCACGATCAGAAAGGAAACT
CCAACGGATATCAGAAGGGCGGTGAAACAAACTACAACTGATACCGCGCCTAAGTGCCCC
GGCCGTAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTGGCTCCCCGGCAGGTATGGCTTCGTCTAGAG
CTTTGTTCACTGCATCGGCTTTACTCGTCATGTATGGATCAAAATCGAACGTGAAACTAG
AAGTGGTATTTATATCTTCATCTTCTACTACTTCCACAATGGGAGAATCAAGAAACTCGG
CTACTTCTTTTCTTGATAAAATGGCGGCCTTGGCTTGAGTTTCAAGAGAAGGCTGGAACA
TGCGGCTTAGGCTCGGTTTGATATACTGAAATAAGAAATTTAGAGAGAGAACGAGGAGTG
AGAAATAGAGCAACAGAATTTGAGCTTCCATTTTTCATCAAGACAAACTTCTTCTCC

QA 1 777 1 777
DS 



AS 2 4

CO CL2972Contig1 904 2 2 U
GAAATGGACAGAGGAGAAGAAGAGAGAAAACGAGGAGAGGAAGGAGATGCTGGAGAAGGA
GCTTGAGCTAGTCGAGGCCGAGATTTGCTTAGAGGAAGCTATAGAGGAGATGGATGAGAT
ACTAAAGATGAAAGAACAAGAAGAGGAAAAGAAAACTGAGATGGGTTTGTCTGAAGAGGA
TGAAGAAGATGTGGTGGTTGCTGCACCGGTTGTCAAAGAAGAGAAAGTTGTTGTCACTCC
CAAAGAGAAGAAACAGGAAGAAGATGAATCCAAAGATGATTCAGATGATGATGACGAGGA
GGACGATGATTCAGATGATGATGATGAACTTGGACCATCGAGTTTTGGATCTGTGGACAA
ACGAAGTAGGACTTCTCCGTTTTCAGCATCCTCGTTGTCTTTTGCTACGTGTGGCCTCTT
TCCCGCGGTACAATCAAGACTAGAGAGATCATTCCTAGCATGGAAGCAACAGAGGGCAGA
ACCATCAAAACTGATCCCAGGAATCAACAAAGCTGGCTTGAAGATGGGGAAGGTATCGAA
CCGGGGTTGTATACAGAGAAGCTCAAGATCTCAGTCTCAGTTGCTGTCTCTATCACGTCT
CCTATCGTCCAATGCTGCGTCATGTTCTTCTCATGATAGAAGCTCCGGTGAAGATCAAGG
TTGGCTCTGGAAAACACCGGTTGAGGAAAGGGAGGCGGTATTGTCGCTTCAGGTTCAGAC
AAAGTGTTCCAATTTGTTTGCACACACTCAAGCTTTGCCGCTTGAGTCTCTCTCATCTTT
TAAGCTTTAGAGTTGAGTTGAGTTTCTTTTGTACCCTTTTGAGCTGGCTATACTTCTTTG
ACGGTGGACACTCTTTTGAAATTATTTGTTGTGTTGTATTGTCAAAATATTTATCACAAC
TATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RS1BT96TF U 1
AF RS1DG35TF U 140
BS 1 212 RS1BT96TF
BS 213 904 RS1DG35TF

RD RS1BT96TF 212 0 0
GAAATGGACAGAGGAGAAGAAGAGAGAAAACGAGGAGAGGAAGGAGATGCTGGAGAAGGA
GCTTGAGCTAGTCGAGGCCGAGATTTGCTTAGAGGAAGCTATAGAGGAGATGGATGAGAT
ACTAAAGATGAAAGAACAAGAAGAGGAAAAGAAAACTGAGATGGGTTTGTCTGAAGAGGA
TGAAGAAGATGTGGTGGTTGCTGCACCGGTTG

QA 1 212 1 212
DS 

RD RS1DG35TF 765 0 0
GAAGAGGAAAAGAAAACTGAGATGGGTTTGTCTGAAGAGGATGAAGAAGATGTGGTGGTT
GCTGCACCGGTTGTCAAAGAAGAGAAAGTTGTTGTCACTCCCAAAGAGAAGAAACAGGAA
GAAGATGAATCCAAAGATGATTCAGATGATGATGACGAGGAGGACGATGATTCAGATGAT
GATGATGAACTTGGACCATCGAGTTTTGGATCTGTGGACAAACGAAGTAGGACTTCTCCG
TTTTCAGCATCCTCGTTGTCTTTTGCTACGTGTGGCCTCTTTCCCGCGGTACAATCAAGA
CTAGAGAGATCATTCCTAGCATGGAAGCAACAGAGGGCAGAACCATCAAAACTGATCCCA
GGAATCAACAAAGCTGGCTTGAAGATGGGGAAGGTATCGAACCGGGGTTGTATACAGAGA
AGCTCAAGATCTCAGTCTCAGTTGCTGTCTCTATCACGTCTCCTATCGTCCAATGCTGCG
TCATGTTCTTCTCATGATAGAAGCTCCGGTGAAGATCAAGGTTGGCTCTGGAAAACACCG
GTTGAGGAAAGGGAGGCGGTATTGTCGCTTCAGGTTCAGACAAAGTGTTCCAATTTGTTT
GCACACACTCAAGCTTTGCCGCTTGAGTCTCTCTCATCTTTTAAGCTTTAGAGTTGAGTT
GAGTTTCTTTTGTACCCTTTTGAGCTGGCTATACTTCTTTGACGGTGGACACTCTTTTGA
AATTATTTGTTGTGTTGTATTGTCAAAATATTTATCACAACTATT

QA 1 765 1 765
DS 



CO CL2972Contig2 761 2 1 U
CCTGAAAAAATTCTTTATTTTTTTTTAAATAGTTGTGATAAATATTTTTGACAATACAAC
ACAACAAATAATTTCAAAAGAGTGTCCACCGTCAAAGAAGTATAGCCAGCCTCAAAAGGG
TACAAAAGAAACTCAACTCAACTCTAAAGCTTAAAAGATGAGAGAGACTCAAGCGGCAAA
GCTTGAGTGTGTGCAAACAAATTGGAACACTTTGTCTGAACCTGAAGCGACAATACCGCC
TCCCTTTCCTCAACCGGTGTTTTCCAAAGCCAACCTTGATCTTCACCGGAGCTTCTATCA
TGAGAAGAACATGACGCAGCATTGGACGATAGGAGACGTGATAGAGACAGCAACTGAAAC
TGAAATCTTGAGCTTCTCTGTATACAACCCCGGTTCGATACCTTCCCCATCTTCAAGCCA
GCTTTGTTACTCGACAGTGGGGGAAAATGGATTGATGATGCTGATGCATCGTTGTCTCCA
CCTTTGTTGATTCCTGGGATCAGTTTTGATGGTTCTGCCCTCTGTTGCTTCCATGCTAGG
AATGATCTCTCTAGTCTTGATTGTACCGCGGGAAAGAGGCCACACGTAGCAAAAGACAAC
GAGGATGCTGAAAACGGAGAAGTCCTACTTCGTTTGTCCACAGATCCAAAACTCGATGGT
CCAAGTTCATCATCATCATCTGAATCATCGTCCTCCTCGTCATCATCATCTGAATCATCT
TTGGATTCATCTTCTTCCTGTTTCTTCTCTTTGGGAGTGAC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DG35JQ U 46
AF RS1F082JQ U 1
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RD RS1DG35JQ 269 0 0
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QA 1 269 1 269
DS 

RD RS1F082JQ 761 0 0
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TGAAATCTTGAGCTTCTCTGTATACAACCCCGGTTCGATACCTTCCCCATCTTCAAGCCA
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TTGGATTCATCTTCTTCCTGTTTCTTCTCTTTGGGAGTGAC

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 4

CO CL2973Contig1 883 4 9 U
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ACGTCAAGAGTTATGGTGAGAGTCTTTCTTCTCTACAATCTCTTAAACTCATTTCTTCTC
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ATCCCACCCCGCCTGAATCGGAATGTTCTTTGAGAACAGAGCCGGTGGATCTTAAACGAG
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GTGATGGATTTATTAGCGTTGAAGAGTTAAAGTCTGTGATGGCTTCCTTGGGACTCAAGC
AAGGTAAAACTCTAAAGTGTTGTAAAGAGATGATTACTCAAGTTGATGAAGATGGTGATG
GTAGAGTCAATTACAATGAGTTTCTTCAGATGATGAAGTCTGGTGGGTTTAGCAATAGAT
CATAATCAGATTAAGCTGATTTGGTCCCTTTTTACTCTGTAAATAGTTCATTTTTATGCT
TTGTTTAATCTTGAGCTGAATTGTTTAAACAACACTCTTTGTTTTTTTCCTACAACTCTG
AATGGTGCATGCCACGTGACTTTGCCAGCTTGAAACACCAAGTGTTGTAAACAGAACCAC
ACATGTAATGATAGATTGATTATTGGACGAAGATGGGTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 

AF RS1BK03TF U 1
AF RS1BK03JQ C 79
AF RS1CB86JQ C 264
AF RS1CB86TF U 264
BS 1 271 RS1BK03TF
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TGTTTGGTTCCCAAGAAGCTTAGAGTTCTCTTCCCTCCTTCTTGGTACACCGAAGACAAG
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QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1BK03JQ 805 0 0
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CTTAGAGTTCTCTTCCCTCCTTCTTGGTACACCGAAGACAAGATCCCACCCCGCCTGAAT
CGGAATGTTCTTTGAGAACAGAGCCGGTGGATCTTAAACGAGTGTTTCAGATGTTTGACA
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TCTTCATGCCAGACAAAGATCTGATCCAGATGATCCAGAAGATGGATGCAAATGGAGATG
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AAGAGGATATGAGAGATGCGTTCAATGTGTTTGATCAAGACGGTGATGGATTTATTAGCG
TTGAAGAGTTAAAGTCTGTGATGGCTTCCTTGGGACTCAAGCAAGGTAAAACTCTAAAGT
GTTGTAAAGAGATGATTACTCAAGTTGATGAAGATGGTGATGGTAGAGTCAATTACAATG
AGTTTCTTCAGATGATGAAGTCTGGTGGGTTTAGCAATAGATCGTAATCAGATTAAGCTG
ATTTGGTCCCTTTTTACTCTGTAAATAGTTCATTTTTATGCTTTGTTTAATCTTGAGCTG
AATTGTTTAAACAACACTCTTTGTTTTTTTCCTACAACTCTGAATGGTGCATGCCACGTG
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ATTATTGGACGAAGATGGGTTTATT

QA 1 805 1 805
DS 

RD RS1CB86JQ 619 0 0
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QA 1 619 1 619
DS 

RD RS1CB86TF 620 0 0
GGAGACGGCCGCATCACAAAGGAAGAGCTAAATGATTCTTTAGAGAATCTTGGTATCTTC
ATGCCAGACAAAGATCTGATCCAAATGATCCAGAAGATGGATGCAAATGGAGATGGCTGT
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GATATGAGAGATGCGTTCAATGTGTTTGATCAAGACGGTGATGGATTTATTAGCGTTGAA
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AAAGAGATGATTACTCAAGTTGATGAAGATGGTGATGGTAGAGTCAATTACAATGAGTTT
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GTCCCTTTTTACTCTGTAAATAGTTCATTTTTATGCTTTGTTTAATCTTGAGCTGAATTG
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GCCAGCTTGAAACACCAAGTGTTGTAAACAGAACCACACATGTAATGATAGATTGATTAT
TGGACGAAGATGGGTTTAT
T

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 3

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CATTAACAGCAAAATAAAATAAAATAAAAAAGCACAAAGACATAACTAACTGCAAAGCTG
TTCCCATTAAGACTACACAATCAAAAGCCTTTTTTGGTTCTTCTTCTTCTCCTCCTCATA
CAACTGTGAAAACTTTATCCTCTTTCACAGTCCCTACTGTTATTATCACCTTCATTTCAA
GCTCTCATCTTCTTGCTGGTACTGCAAGTCGGACACTTGTAGTGTTTGATGTGCTCAGCC
TTGGCAGGTGTGATCTTCACACATTTTCCATGGAACCATTTCTCACAAGCGTCACAACAT
ATCCAGAAGTCATCATAGTTCTCTCCACACGCACCACAAACAGCACCTTGTTCATCATAT
TCCTCGTCTTCTCCGCTCTCATCATCTTCTCTTGGTGGTGGAGACATCTTTGAAGCCTTG
GTGTGAGACTCAGATTGACGAGGCTTGACACCACTAGGTTTGCTTCTGCTACTGTTGTTG
TGGTTAGCAGATTGGTCCTTGGATTGCTTTGCATTGCCAGTTATAACCTCGAAAAGGGTT
GGGAGATCATTTATCATCTGGAAGAGCCTCTTCCTCTCGTTTTTACCAAACCCGAAACGG
GCACCGAGGTAAAAGGCAACAGAGATGAGCCAAGAGTCACTGTGGACAGCAACCAAAGTA
ATCCAGTCTTTTTCAGGCATCCCGTTCCTTGCAAAGTTGATGCCTAAAGCTGGTTCAGGA
AGCTCGGGAGGGACCTCATCGACAGGAAGGTTAACCTCCCATATCTCGTTAGGAAGTCCA
TAAAGACACAAGTTTTCCTTGTCAGGGTCACACTGGAGGTAAAACTGCTGCCCATCTGAT
GTGAGAGCCTTGAGGAGACCAGCTCTACGACCCTTAAAGTCGCTAAAGACCTCTTCGACA
GTGCGGTAGATAGGATTCTGTATTCCCTCCATATCAATATGAATCAGCTTCGTTCGGACA
AAAACACGCCGGCGGTGAGAGACTGCGTCGAGAAGAGAGAAAAGCCAAGATCGGCTTTTT
TTTCTTTTCCCTTTGGAGAGCAAATTTGTTTACTTTGTTTTTCGGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BU58JQ U 25
AF RS1GT66JQ U 1
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TTAA
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CTCTTGGTGGTGGAGACATCTTTGAAGCCTTGGTGTGAGACTCAAATTGACGAGGCTTGA
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TCTTCCTCTCGTTTTTACCAAACCCGAAACGGGCACCGAAGTAAAAGGCAACAGAGATGA
GCCAAGAGTCACTGTGGACAGCAACCAAAGTAATCCAGTCTTTT

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TTCCCATTAAGACTACACAATCAAAAGCCTTTTTTGGTTCTTCTTCTTCTCCTCCTCATA
CAACTGTGAAAACTTTATCCTCTTTCACAGTCCCTACTGTTATTATCACCTTCATTTCAA
GCTCTCATCTTCTTGCTGGTACTGCAAGTCGGACACTTGTAGTGTTTGATGTGCTCAGCC
TTGGCAGGTGTGATCTTCACACATTTTCCATGGAACCATTTCTCACAAGCGTCACAACAT
ATCCAGAAGTCATCATAGTTCTCTCCACACGCACCACAAACAGCACCTTGTTCATCATAT
TCCTCGTCTTCTCCGCTCTCATCATCTTCTCTTGGTGGTGGAGACATCTTTGAAGCCTTG
GTGTGAGACTCAGATTGACGAGGCTTGACACCACTAGGTTTGCTTCTGCTACTGTTGTTG
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GGGAGATCATTTATCATCTGGAAGAGCCTCTTCCTCTCGTTTTTACCAAACCCGAAACGG
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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1B668JQ U 1
AF RS1BJ15JQ U 5
BS 1 656 RS1B668JQ
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CTCTAAAGTTACAACACTAGGGAAACAAAGAAAACAGATAATGTCTAAATTCTGACAACA
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TCCTTTTTAAAAGGTTACAAAAAGGATAACAAAAGCGGATAAGATAGCAGGTAGCATAAA
GGGAAGGGATCATTGCAAACACTTGTAATCTGAAGTCGTTTTAGGACGGCATGTAAGTGG
ACGTATCAATCTGTTCAGGAAGTTCCTTGATATCAACCTCAAACCTATCTTGTACCTGGT
TGAGAACTTCAGAATCAGAAGCTGATGCCACAAATGTTATTGCAAGACCCTTTGTTCCGA
ACCTTCCAGCTCTACCAACCCTGTGAAGATATGTATCAGCAGAATCTGGCATGTCGTAGT
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TGCCAGAGTGAATGCATATCGAAGGGAAATTGCATTCAATAAGCAACTTGTTCAGC

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DS 

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AAAGTTACAACACTAGGGAAACAAAGAAAACAGATAATGTCTAAATTCTGACAACATAAA
GCATCATATTCGCTTGTACACAAGTTTAAGAGGGGATAGTTTCCTCTCGATCTCTCTCCT
TTTTAAAAGGTTACAAAAAGGATAACAAAAGCGGATAAGATAGCAGGTAGCATAAAGGGA
AGGGATCATTGCAAACACTTGTAATCTGAAGTCGTTTTAGGACGGCATGTAAGTGGACGT
ATCAATCTGTTCAGGAAGTTCCTTGATATCAACCTCAAACCTATCTTGTACCTGGTTGAG
AACTTCAGAATCAGAAGCTGATGCCACAAATGTTATTGCAAGACCCTTTGTTCCGAACCT
TCCAGCTCTACCAACCCTGTGAAGATATGTATCAGCAGAATCTGGCATGTCGTAGTTGAT
AACAATGTTGACACGCTCAATGTCAATTCCTCTCCCTACCAAGTCTGTAGCCACCAGAAT
TCTCTTGTGCCCTTCCTTGAAACTTTTGTAGTGAGTCAGCCTCTCTTCCTGAGACATGCC
AGAGTGAATGCATATCGAAGGGAAATTGCATTCAATAAGCAACTTGTTCAGCTCCCCAGC
TCTACTAACGCTCTTCACAAAGATAACAACTTGATTGAAGTCCAATGCATCGAGA

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 4

CO CL2976Contig1 811 4 15 U
GGATAACATACCCGATTCCGATCTTAATTCCCTGAAAAAAGAATAAGAA**AATCTCTAA
TGGTGTCGTCAGATTCTCAAGTGCTTCCGGTTTCCACCACCACTCAGCCCCCAACCTTAA
CCGAATCGCAACCTCCAGCCGTTGGTGCATTTGTGAACCGCTTCACCGAAACGATCCGTG
ATGGTGTGTCCCGTAGCCGACCATGGTCAGAGCTCCTCAATCGATCCGCCTTCACCAAAC
CAGACTCTCTTTCCCACGCAGCGTTGCGACTCCGGAAGAATTCCTCATATTTCAGAGTGA
ATTACCTTTGCATCGTATCTCTCATCATCGCCTTCTCTCTTCTCGCCCATCCCTTCTCTC
TCGTGCTCCTCGTCTGCCTCGCCGCTTCTTGGCTCTTCCTCTACCTCTTCCGTCCAGCCG
ATCATCCTCTCATCCTCTTCGGCCGATCTTTCTCCGACCTCGAAACTCTGGCTGCCTTAA
TCCTCTCCACAATCGTCGTCATCTTCTTCACCAGCGTCGGATCTGTACTCATATCCGCCC
TCATGGTCGGCGTAGCCACGGTCTGCGTCCATGGTGCCTTCAGAGCTCCCGATGATCTCT
TCCTTGACGAACATGATCCTGCCGCCGCCGGCTTCCTCTCAACATTCATCGGTGTTCCTA
CGTCTTCCTCTGCCTCCTCAGGGCCTTCCGCCGTATAGCGATCCGTCTCAGAATCTAATA
GTATTCTTCTTCTTCGTGAAGATTGTTTGTTGTTAGTATCATTTCTCTGTGAACCTTTGG
CCATTGTTGCAATGTAATTTCTTCATTCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1GQ07TF U 1
AF RS1C789TF U 33
AF RS1C789JQ C 34
AF RS1GQ07JQ C 499
BS 1 49 RS1GQ07TF
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RD RS1GQ07TF 662 0 0
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TCCTTGACGAACGTGATCCTGCCGCCGCCGGCTTCCTCTCAACATTCATCGGTGTTCCTA
CG

QA 1 662 1 662
DS 

RD RS1C789TF 761 0 0
G
GAAAAAAGAATAAGAA**AATCTCTAATGGTGTCGTCAGATTCTCAAGTGCTTCCGGTTT
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TCTCTCTTCTCGCCCATCCCTTCTCTCTCGTGCTCCTCGTCTGCCTCGCCGCTTCTTGGC
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TG

QA 2 759 2 759
DS 

RD RS1C789JQ 778 0 0
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TGAACCGCTTCACCGAAACGATCCGTGATGGTGTGTCCCGTAGCCGACCATGGTCAGAGC
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GGAAGAATTCCTCATATTTCAGAGTGAATTACCTTTGCATCGTATCTCTCATCATCGCCT
TCTCTCTTCTCGCCCATCCCTTCTCTCTCGTGCTCCTCGTCTGCCTCGCCGCTTCTTGGC
TCTTCCTCTACCTCTTCCGTCCAGCCGATCATCCTCTCATCCTCTTCGGCCGATCTTTCT
CCGACCTCGAAACTCTGGCTGCCTTAATCCTCTCCACAATCGTCGTCATCTTCTTCACCA
GCGTCGGATCTGTACTCATATCCGCCCTCATGGTCGGCGTAGCCACGGTCTGCGTCCATG
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QA 1 778 1 778
DS 

RD RS1GQ07JQ 313 0 0
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TTCTTCATTCAGC

QA 1 313 1 313
DS 



AS 2 4

CO CL2977Contig1 840 2 1 U
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AATCCTATTTTCCTAAAACATTTTCTAAAAATTTTAAAGTGACAAATCCAAGATGAGAGT
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CTCCACGAACATAAGTAGACAGTCACTTTGATTTAACATACACTGCTCTCCTCCATCAAG
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BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H677JQB U 1
AF RS1H568JQB U 1
BS 1 840 RS1H568JQB

RD RS1H677JQB 769 0 0
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CAATAACACTTGATTTGCATATAGATTTTAAAATCATAAAACCAATAACACTTGATTTGG
TTTGGATTTCTAAATCTACTAAAATATACAAACCAATAACACCCCCTTAAAGAAAATCAA
AATCCTATTTTCCTAAAACATTTTCTAAAAATTTTAAAGTGACAAATCCAAGATGAGAGT
GTCTCTTTTTTTCTATTTTTCTCTTATAATAATCCACTAATCACACACACTCAGCTAGCT
ACAGAGCCCACAGAGTCCAGTCAAAGTCTCCCTTTTATTTTTTAATTTGTTCACACGATC
TTCAAACACCAAAGACTATTGTGGAACCCACCGATGTATCTACTGGCCCCTGCTTGTCTT
CTCCACGAACATAAGTAGACAGTCACTTTGATTTAACATACACTGCTCTCCTCCATCAAG
TCACTTTCTTAATATTCAAACTCTGCTTTGTTGCTTTACACAGAAGCATGATGATCGATC
TGTAACCCATCCGCTTTGCTTAAAAAATGCAAGGCAATGTATGCAAGATCGACTTGTAGG
GTCTTTGTGGCACGAGCAATCTCGAAGTTGGGCTCGAAATCAATGTCAAATCAACAGTCT
TTCCATTTGACACGGTCTTCAAGCAAGATTGGTCTTTACCCTTGAAGTTCTTACTTGTCT
CCACAATCTTGGTCACAGATGGATGCTCGTTCAGAGGACCAAAACTCTT

QA 1 769 1 769
DS 

RD RS1H568JQB 840 0 0
AAATAAATTCTTGTTATTGAATAACACTTGATTTCAAAATCTATTTTAAAATCATATAAC
CAATAACACTTGATTTGCATATAGATTTTAAAATCATAAAACCAATAACACTTGATTTGG
TTTGGATTTCTAAATCTACTAAAATATACAAACCAATAACACCCCCTTAAAGAAAATCAA
AATCCTATTTTCCTAAAACATTTTCTAAAAATTTTAAAGTGACAAATCCAAGATGAGAGT
GTCTCTTTTTTTCTATTTTTCTCTTATAATAATCCACTAATCACACACACTCAGCTAGCT
ACAGAGCCCACAGAGTCCAGTCAAAGTCTCCCTTTTATTTTTTAATTTGTTCACACGATC
TTCAAACACCAAAGACTATTGTGGAACCCACCGATGTATCTACTGGCCCCTGCTTGTCTT
CTCCACGAACATAAGTAGACAGTCACTTTGATTTAACATACACTGCTCTCCTCCATCAAG
TCACTTTCTTAATATTCAAACTCTGCTTTGTTGCTTTACACAGAAGCATGATGATCGATC
TGTAACCCATCCGCTTTGCTTAAAAAATGCAAGGCAATGTATGCAAGATCGACTTGTAGG
GTCTTTGTGGCACGAGCAATCTCGAAGTTGGGCTCGAAATCAATGTCAAATCAACAGTCT
TTCCATTTGACACGGTCTTCAAGCAAGATTGGTCTTTACCCTTGAAGTTCTTACTTGTCT
CCACAATCTTGGTCACAGATGGATGCTCGTTCAGAGGACCAAAACTCTTGAGATGCTTGA
GATCGTCAGAGCTCTCTGTTTCCACTCTCTATAAAGCACTACACGGCTACGACCGCACTC

QA 1 840 1 840
DS 



CO CL2977Contig2 810 2 2 U
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CTTCAAAGTTATAAAGAAGCTTTCTTCTTCGTAAAGTTTCTTTCTCTTCAAACACTTAAA
ACACTTTCTCCATTTCTATAAAGTTTTCATTCCAACACCTCTGAGAGATTATTCACCATC
GTCGGCGACTTCGACGCACCACCGCTTTCTAGAGGCAACTCTGGAGATTTCCATCCGAGC
TCGGTCTGTTTAGCCAAGATGGGTTGTAAAAACTTTATGGAGGACAACAATAACAAGGAG
GAGAAACAGAGGTGCGGTCGTAGCCGTTGTAGTTGCTTTATAGAGAGTGGAAACAGAGAG
CTCTGACGATCTCAAGCATTCTCAAGAGTTTTGGTCCTCTGAACGAGCATCCATCTGTGA
CCAAGATTGTGGAGACAAGTAAGAACTTCAAGGGTAAAGACCAATCTTGCTTGAAGACCG
TGTCAAATGGAAAGACTGTTGATTTGACATTGATTTCGAGCCCAACTTCGAGATTGCTCG
TGCCACAAAGACCCTACAAGTCGATCTTGCATACATTGCCTTGCATTTTTTAAGCAAAGC
GGATGGGTTACAGATCGATCATCATGCTTCTGTGTAAAGCAACAAAGCAGAGTTTGAATA
TTAAGAAAGTGACTTGATGGAGGAGAGCAGTGTATGTTAAATCAAAGTGACTGTCTACTT
ATGTTCGTGGAGAAGACAGCAGGGCCAGTAGATACATCGGTGGGTTCACAATAGTCTTTG
GTGTTTGAAGATCGTGTGAACAATTAAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1H568TF U 1
AF RS1H677TF U 1
BS 1 802 RS1H568TF
BS 803 810 RS1H677TF

RD RS1H568TF 802 0 0
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ATGTTCGTGGAGAAGACAGCAGGGCCAGTAGATACATCGGTGGGTTCACAATAGTCTTTG
GTGTTTGAAGATCGTGTGAACA

QA 1 802 1 802
DS 

RD RS1H677TF 810 0 0
GATCATCAAGAAATCAAGAAATCCAAGCTTGTAAGAACCATCTAAGTAATAAGAAATCTT
CTTCAAAGTTATAAAGAAGCTTTCTTCTTCGTAAAGTTTCTTTCTCTTCAAACACTTAAA
ACACTTTCTCCATTTCTATAAAGTTTTCATTCCAACACCTCTGAGAGATTATTCACCATC
GTCGGCGACTTCGACGCACCACCGCTTTCTAGAGGCAACTCTGGAGATTTCCATCCGAGC
TCGGTCTGTTTAGCCAAGATGGGTTGTAAAAACTTTATGGAGGACAACAATAACAAGGAG
GAGAAACAGAGGTGCGGTCGTAGCCGTTGTAGTTGCTTTATAGAGAGTGGAAACAGAGAG
CTCTGACGATCTCAAGCATTCTCAAGAGTTTTGGTCCTCTGAACGAGCATCCATCTGTGA
CCAAGATTGTGGAGACAAGTAAGAACTTCAAGGGTAAAGACCAATCTTGCTTGAAGACCG
TGTCAAATGGAAAGACTGTTGATTTGACATTGATTTCGAGCCCAACTTCGAGATTGCTCG
TGCCACAAAGACCCTACAAGTCGATCTTGCATACATTGCCTTGCATTTTTTAAGCAAAGC
GGATGGGTTACAGATCGATCATCATGCTTCTGTGTAAAGCAACAAAGCAGAGTTTGAATA
TTAAGAAAGTGACTTGATGGAGGAGAGCAGTGTATGTTAAATCAAAGTGACTGTCTACTT
ATGTTCGTGGAGA*GACAGCAGGGCCAGTAGATACATCGGTGGGTTCACA*TAGTCTT*G
GTGTTTGAAGATCGTGTGAACAATTAAAAA

QA 1 810 1 810
DS 



AS 1 4

CO CL2978Contig1 1410 4 3 U
TTTTTCTTATAATTCTTTTCAATTTATCTCTTTGTGTTCATTAGATCTCTCTCCTATGTC
ATCGTCTTTCCGATTCAGATCGTCGGAGTTCAGCTCTCGATCCACGGATAGGCCTCGTAT
CGGCATGGATCTAGTGGCTTCGGTTTGATTCATGACAGAAGACGTATCTTAGCTGCTGAC
CGATCTCTCAGGATTGGTTGAATAGCTGATCTGATCTCCGATCGCGGGGTTCCTCGTTGG
ATCTGTGATTTGCGTCTCGGAGATGATGAATCCGATTGGCAAGGAGGAGCGACTGGAGAA
GAAGAGAGAAGATGAGGAAGATATGTGAAATGATATGAGATGATTGAAGGATGTATGAGA
TGTTTGTTAAGGACGATACAGCCTTTCTGATGAGAGAAGGCTTGAGTTCTGAATTAGCAT
CTTTGTCATCCGACCTTTGCCATGACAGGTGCGCTTGCATGGCAGGTCACAAAAAGTTCC
TTAATAAAAAAAAATAGTTTCGTGTTGTTGTGAGGGGAGTTCGCACGGGGAACATATTTT
TTTTTAAGCCCGGGTTCTCCCCCTCACCTTTGTGTCTTTGCATCTCGCTCTCTCGCACAC
ACTCACTGATTCCTTTTGATCTCAAATTCACCAAAATATCTCGATACAGACATATTTTGA
ATGGATCCAGATCTTACTATTGAGCAGATCTGGAGTCAAACGCACGGCCTAATCCAACAT
ACTCCATGGAGACAGAGGTACTTTTAAATTTTAGTTTCAATTCTCCCATTCAGCTGTTTA
ATCCTACAACATAACATATCTAACCAACCGTCTTTAATTTTCTCATGGACAAAAAAGATT
ATTACTATTCAGAATTGAATTATTATTAATTAGGCTTTTGTAACAAAGAAATCATATATG
GCATCTATATTTATATCACTTTACCATTACCTCGGCTCACTATTGATTTGAATTTGAAAT
TACTTATTACTTTCGTCTATAATAACATGTGATTTACAAGGTGTATATACCTAGGTAAAA
TTTGTTTGGGACAACAATTTGTACGCATTTTTATAGTGTATTGTATCTTGTTACATTTCC
ACCAATCTGTAAGCATACTGTAATGTATCATGTATGCTTTTTAGTGTTGCAAATGGCTTT
GAAGACCTTTAAAGATTTTCCCCAGCCATGCTAAAACCTGCCCCCAAGGGAAGTTAATTT
TCATGTTGTTTAAGCAGAAGAAGGTATATAAAAGAAGTTACTTTGTTCTTTTTGTACAAA
TTTGTCAAAGTTCGAGCCCACAGATCTTGTTTCTAAATCTGAATATTTCATTCTTTATCT
CACTTAATAATGAATTTTATACTGTAATGTCTCGATTATACTTGTATTACGTCGATTTGC
TCTTTGAATTAACAATTACAGTTTTTATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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CTTTGTCATCCGACCTTTGCCATGACAGGTGCGCTTGCATGGCAGGTCACAAAAAGTTCC
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TTTTTAAGCCCGGGTTCTCCCCCTCACCTTTGTGTCTTTGCATCTCGCTCTCTCGCACAC
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ATGGATCCAGATCTTACTATTGAGCAGATCTGGAGTCAAACG

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AGTTTCGTGTTGTTGTGAGGGGAGTTCGCACGGGGAACATATTTTTTTTTAAGCCCGGGT
TCTCCCCCTCACCTTTGTGTCTTTGCATCTCGCTCTCTCGCACACACTCACTGATTCCTT
TTGATCTCAAATTCACCAAAATATCTCGATACAGACATATTTTGAATGGATCCAGATCTT
ACTATTGAGCAGATCTGGAGTCAAACGCACGGCCTAATCCAACATACTCCATGGAGACAG
AGGTACTTTTAAATTTTAGTTTCAATTCTCCCATTCAGCTGTTTAATCCTACAACATAAC
ATATCTAACCAACCGTCTTTAATTTTCTCATGGACAAAAAAGATTATTACTATTCAGAAT
TGAATTATTATTAATTAGGCTTTTGTAACAAAGAAATCATATATGGC

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DS 

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GAGTCAAACGCACGGCCTAATCCAACATACTCCATGGAGACAGAGGTACTTTTAAATTTT
AGTTTCAATTCTCCCATTCAGCTGTTTAATCCTACAACATAACATATCTAACCAACCGTC
TTTAATTTTCTCATGGACAAAAAAGATTATTACTATTCAGAATTGAATTATTATTAATTA
GGCTTTTGTAACAAAGAAATCATATATGGCATCTATATTTATATCACTTTACCATTACCT
CGGCTCACTATTGATTTGAATTTGAAATTACTTATTACTTTCGTCTATAATAACATGTGA
TTTACAAGGTGTATATACCTAGGTAAAATTTGTTTGGGACAACAATTTGTACGCATTTTT
ATAGTGTATTGTATCTTGTTACATTTCCACCAATCTGTAAGCATACTGTAATGTATCATG
TATGCTTTTTAGTGTTGCAAATGGCTTTGAAGACCTTTAAAGATTTTCCCCAGCCATGCT
AAAACCTGCCCCCAAGGGAAGTTAATTTTCATGTTGTTTAAGCAGAAGAAGGTATATAAA
AGAAGTTACTTTGTTCTTTTTGTACAAATTTGTCAAAGTTCGAGCCCACAGATCTTGTTT
CTAAATCTGAATATTTCATTCTTTATCTCACTTAATAATGAATTTTATACTGTAATGTCT
CGATTATACTTGTATTACGTCGATTTGCTCTTTGAATTAACAATTACAGTTTTTATGG

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DS 



AS 1 4

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ACACATACTATTAATAAGCTTGGTGAAAATTCATTATAACATTCCTATTATTTCTGAAAC
ATAATCATCGGTCTCGTAGTAAATTAATATCTCATTCCTCTTACAGAACATAACTGAAAG
AGCTAGAAAAACAGTTCATTCTCACAGCAAAAGAAACAACAAACCTCTATTTCTTCTGGG
CAGCCTTTGAGGATGATTTGGCCTTCGAAGTTCCAACTGTTTTCTGCTCTGCTTTCTTGA
ATAGATTGGCTACTGTAGCTTGAACGAGCTTACCGTCTTTGCTGTTTGATTTTTCTTTTT
TAGCTGGAATTTCAGTAGGTAACTTTCCTGCTGATGAAGTAGTAATATCAGCTAGAGGTT
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ATGTATTGTCTTCACTTTGACCTGAGGAGTTTTCTGGAGAAGTTTCTGCAAAGTTGAATT
TCTTGCCAGAATTTCTCTGAGAGTGACGAACAGGAGGAGTTAGTTGAACTGGTGTGACTT
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CAGGCGAGTCTGTCTCTGTCTCCGTCGGTTGTTGGCTACCAGTTTCAGGAGTGGTCTTGA
CCGAAGCTGCTGCTGCT***CCTGCGCCACCTCGAAAATCAAACTCTTCAGTTTTCTCTA
CCTGAGAGAGTTCTTTAGGGAAATCAAGACGAGCTTCTTCAGGGTTCTCCTCTTTAGTCC
CAATCCACCATGACTCAGAGAACACAATCATGTTATCAAAATAGTCATCGCACAAGACGT
TTTTGCCACCTCTAGAGAACTGGAGAGTCAAGTATCTGTTCTTCGGATAAAGAATCGTTC
CAAAAAGCTTCATCCGACCCTGGGGGAAGTTGAGGTAGAGGACGGGGTTCTTGGTGGAGA
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AGAGGAAGCGGTTCTTGCGCTGAGACTTGCGGATGATGTCGGTGCCGTGGTGTTTCAGGA
CTTGCTTCGATGGTTTGAGAGAGGAGAGGCATCGGGAAGGAGAGGAGGAGAGGAGTTTGT
TGTCGAGAGCTAGGGTTTTTAGTCTCTTTCTCTGTTTTGACTCTGGATCGTCTTTGTCTC
CTCCTCCGGATCCTCCTTTCTTCGATGATGAACCTCCTCGTACCATTACTACTCTCTCTC
TCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 

AF RS1GQ22JQ U 1
AF RS1AL17JQ U 130
AF RS1AL17TF C 504
AF RS1GQ22TF C 555
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BS 932 1093 RS1AL17TF
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BS 1105 1105 RS1GQ22TF
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RD RS1GQ22JQ 704 0 0
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ACACATACTATTAATAAGCTTGGTGAAAATTCATTATAACATTCCTATTATTTCTGAAAC
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TCTTGCCAGAATTTCTCTGAGAGTGACGAACAGGAGGAGTTAGTTGAACTGGTGTGACTT
GAATCTTATCGTCCATAAACTCTCCATCATCATCAGACAAAATCTCCTCCATTACAACTT
CAGGCGAGTCTGTCTCTGTCTCCGTCGGTTGTTGGCTACCAGTT

QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1AL17JQ 802 0 0
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AACAGTTCATTCTCACAGCAAAAGAAACAACAAACCTCTATTTCTTCTGGGCAGCCTTTG
AGGATGATTTGGCCTTCGAAGTTCCAACTGTTTTCTGCTCTGCTTTCTTGAATAGATTGG
CTACTGTAGCTTGAACGAGCTTACCGTCTTTGCTGTTTGATTTTTCTTTTTTAGCTGGAA
TTTCAGTAGGTAACTTTCCTGCTGATGAAGTAGTAATATCAGCTAGAGGTTCCTCATGAA
CTCTTATTGGAGAATCAGATTCCAACACAGGCTTCTCATCTCCTTCATCAGATGTATTGT
CTTCACTTTGACCTGAGGAGTTTTCTGGAGAAGTTTCTGCAAAGTTGAATTTCTTGCCAG
AATTTCTCTGAGAGTGACGAACAGGAGGAGTTAGTTGAACTGGTGTGACTTGAATCTTAT
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CTGTCTCTGTCTCCGTCGGTTGTTGGCTACCAGTTTCAGGAGTGGTCTTGACCGAAGCTG
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GCGGCAGAGATGGGAGCGAGGAGACCGGGGAAGGAGAAGAGGAAGCGGTTTTTGCGCTGA
GGCTTGCGGATGATGTCGGTGCCGTGGTGTTTCAGGACTTGCTTCGATGGTTTGAGAGAG
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ATAAACTCTCCATCATCATCAGACAAAATCTCCTCCATTACAACTTCAGGCGAGTCTGTC
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GCTGCTCCTGCGCCACCTCGAAAATCAAACTCTTCAGTTTTCTCTACCTGAGAGAGTTCT
TTAGGGAAATCAAGACGAGCTTCTTCAGGGTTCTCCTCTTTAGTCCCAATCCACCATGAC
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CCGATGGTGGCGGCAGAGATGGGAGCGAGGAGACCGGGGAAGGAGAAGAGGAAGCGGTTC
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TTGAGAGAGGAGAGGCATCGGGAAGGAGAGGAGGAGAGGAGTTTGTTGTCGAGAGCTAGG
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CCTTTCTTCGATGATGAACCTCCTCGTACCATTACTACTCTCTCTCTC
CC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 4

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CTAGAAGCGGCCAGCTTGTTCAGATTTTAAATGGAAAGTAGTTGTTGTTGACAAACGGGA
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CACTTTCACGTCGCTATAGGATAGTTTATCCTTGTGATTATCTCGGGGGGCATTGATAGA
TCCCCTAGAAATACGAGTGACAAGGATATTATCATTAATGTCATAATGGCTTCTAAAGCT
ACGTGCTTGTCTCTGTTCTTCCGGGTTTGATGCAACAATCTTGATAACAACGGTCTCGCC
TAGACTAGCAACATCGACGGGTTGTTGGTATTTCTCAATCCATGTAATACGTCCTAAATC
CAGACAACCAGCAGTTCGCACATAGGCTATGGGAACTCCTACCTTAATGAAACCTTCAAC
AACTAAGACTCCGAGGACAATAGGGTCTTCCTTGCCGAACACAGCGTTGGTTAAGATGCT
GAGGATGCCAGGGAAGATTGCTTCATCCTCAATTTCTAGGTCCTCTCCCAGCTGTTCGAT
ATGCTCTTTGAACTGGGAGTGCAACGTATCAAGCATACCGCCGCCACAGATGACTTTGAC
TTGCAACTGTTCCGCGAGTTGACTTGCCTCAGGGGTAACGTCTACATCAAAGGCCAAGAC
AGTGGAGAAGTGCCGTTTGCGATCACTCATTTGAAAGGCCTTCCAGATCTCCACTGGGGT
GATCGTTCCTACGTCTAGAGCTCCAACAGGAATCTTCACCGTCGGGGATTCCAAGAACTC
GACCAATTCATTCAACGAATAAGTGGTAGAAGCTACAGCAACAACTCCCTCGCCACTTCT
CTTAAAATTCATCACAGATTCCATATGCTTGACTTCTTTTGCAAAGCTCTCGGACCTCTT
TACCGTCCCAGAGGTTCCTTCTCCAGAATAAATACCAACATCTCGATCCATTAACTCGTT
ACTCCAATTCGACATTGTCGGTGAAGAGATGCAGCGGCGGAAGGAATTTGTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GAGGATGCCAGGGAAGATTGCTTCATCCTCAATTTCTAGGTCCTCTCCCAGCTGTTCGAT
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GATCGTTCC
C

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GGGTGATCGTTCCTACGTCTAGAGCTCCAACAGGAATCTTCACCGTCGGGGATTCCAAGA
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CGTTACTCCAATTCGACATTGTCGGTGAAGAGATGCAGCGGCGGAAGGAATTTGTCTCC

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DS 



AS 1 3

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TGTATCAAAAGCCCAGAGAGACAAGAACCGGATCGGTTTGTTTCCAATGTTACAGAATAA
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GAACAAAGAACATCATGTAACCAGGATACAGTCCATGCCAAACCGCACTGACGGTTTTGT
AGCTAGTAACTGGAAGAAACCTGCCTTCTTCCCACTCCTCACAAGTCTCTCATACACGTA
GTGACGGAGCCAGGTGCTGGCTTGTATGTTCCACACAAGGGGAATCTGAACAGCGCTCTT
AGCAAGCTCGACACCGAGGATGTCCACGTTCTTGGCACGGTCCCATCATCACCATCATCA
GTCCAGCCACTGAAACCCAAACCAGAGATGATTC


BQ
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AF RS1CY44JQ U 123
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AAAA
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DS 



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TTAATACATCGTTTAAGAAAAGTACGGTGACTTCTGGTAAAGCTTCTCCTTCTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FU76TF U 29
AF RS1DH33TF U 1
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GG
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AAACTAATCACGGTGTTTCTTCACGAAGCCAGTCATGCTGTTGCTTGCAAGCTTACTTGT
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GGCATTTATTGGCTGATCTTGCCTGCTGGCTATCTTGG*TCATCATTTTGGGGAATGGCT
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AAAA

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GCTTACAGCAAGAATAGCTGCTGCTGGTCTGGGTCTTGCTTTATTCATCGTCCTCTTCAT
TGCCAAAAACTGGACGCTTCGAGGTCTTTGTATAGGTTTCATAGTCTTCCTCGCTATCAT
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DS 

RD RS1FU76JQ 598 0 0
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**TCGGATTTACATTTGATTGAAAGTTTAGGATTTATTTGAAAAGTTTGTATGCTTATTC
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GTACATCGTTT

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DS 



AS 1 4

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TAATTAAGTTCATCAAACAAGAACACTTTTTTTTGTAAAAGCCCCATGTCTGATTATGGT
ACGATATACTGAAAGAGTTTCTTGGCACACATATATGCAACTTATTTATTATTCGGGACA
CAATCATTACTTTTTTAAAAACTGAAACCGGTAAGGTATTTGGCTGCAGTCAGAGTCGTC
CTTTCACTCATCCGCCCTAGTATTGGCCCTTGCAGATGTTACTGGCCTGCACTACTGCAC
GGCCATTGCCATGGCTGGGATTCACACTGTCACAA*TTTGGTGGAACCTGGGGAGCCATA
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TGCTGCATCCTGTGCCCGCCATAGTATGCATCTTCATGCCGCCCATGCTTAGTCTTCTTT
TCATGCTTGGGAGGAGAAAAGAGAAAATTGAATAATGGGTTCACCACCATCTTTGTTGCT
ATTTCAAACGGCTGCACCACCGTCTCTGCCACATTACCTACGAACCTCGAAACCATGTGG
TTAGGCTGAGCCTCGCAGTCTGAGTCTGAGTCATCAGAGCTCATGTAGCTGCTGTTTCTG
CGATCCTTTCGGCCGTACCCGTTCATTTTTCTTATATATATACTTGTCTTAGTTTTTAAT
GATATGGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1F875JQ U 7
AF RS1AF45TF C 36
AF RS1F875TF C 1
AF RS1AF45JQ U 37
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C
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TATATACTTGTCTTAGTTTTTAATGATATGGATCC

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DS 



AS 1 4

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TCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 0 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 

AF RS1F683JQ U 1
AF RS1CD13JQ U 2
AF RS1CD13TF C 205
AF RS1F683TF C 215
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CTAGTTGTTAAGAACACCATGAAACTCCAAACGATTCAATATCAGACGTTGAAACACTTA
CTAAAGCAAGCTTCAACTCTTCTTAGTCTAGATTAAATCGGGGAGTCAAACATGCAAAGC
TTGAAACTTTATCTCTTTAGAAAACTCCGCTTGATCTCTTGATCTTCTATAGCGAAAATT
GACTTCCATTGAGGATAGAGCTCAAGGATAACTAACTGCGGTGATTCAGCTCTTAAAAGC
ATAAGGGATTTGGATTTAAGAGTAAAGAGAAGAGATTTGTAACAGTATCCGATTTAAATC
GGATGATTTAAACTTATTTTACATCAACCCAGGAACAGAGAACTAAAGAGAGTAAGAAAA
GTTCTGCTCTGTTTGAGTCTGAAACACCAGAACAAAAAATCGCCAAAGCGAAAAGAAGAT
TCGCCAAACGAGAAACTTATCGCCTTACGAAGACTTAAAACGATTAAAGAGAAAGTAATA
TGATACAACAAAGACAAAAAGAGGATGGTAACCGGCGGCAAAGGCCACCGGCCACCTGAA
CAAGATTTTTGATTCGAGGTTCTTCTAGAAAGAGTTTCC

QA 1 699 1 699
DS 

RD RS1F683TF 689 0 0
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TGCTCTTTTCTCTTCAACACCTCTGCCTTCAAAGACCATCATCTTCCACGCTAGTTGTTA
AGAACACCATGAAACTCCAAACGATTCAATATCAGACGTTGAAACACTTACTAAAGCAAG
CTTCAACTCTTCTTAGTCTAGATTAAATCGGGGAGTCAAACATGCAAAGCTTGAAACTTT
ATCTCTTTAGAAAACTCCGCTTGATCTCTTGATCTTCTATAGCGAAAATTGACTTCCATT
GAGGATAGAGCTCAAGGATAACTAACTGCGGTGATTCAGCTCTTAAAAGCATAAGGGATT
TGGATTTAAGAGTAAAGAGAAGAGATTTGTAACAGTATCCGATTTAAATCGGATGATTTA
AACTTATTTTACATCAACCCAGGAACAGAGAACTAAAGAGAGTAAGAAAAGTTCTGCTCT
GTTTGAGTCTGAAACACCAGAACAAAAAATCGCCAAAGCGAAAAGAAGATTCGCCAAACG
AGAAACTTATCGCCTTACGAAGACTTAAAACGATTAAAGAGAAAGTAATATGATACAACA
AAGACAAAAAGAGGATGGTAACCGGCGGCAAAGGCCACCGGCCACCTGAACAAGATTTTT
GATTCGAGGTTCTTCTAGAAAGAGTTTCC

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 2

CO CL2985Contig1 667 2 2 U
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AAAAAATGTATGAGTGCATTGAGAATGACTTGCTGGGTTCTCTGCAACTTGGCATCCACA
ACATTGCTCCGTACAGATCAAATGGAATAGAACGAGCATCGAACTTTATTAGTTCCCGTG
AAGCTGCCGGTGAGAAACGCCAACCTCCGAATTCAGGATGGAACTCAGAAGACACAAGTT
GCTCTTCGAGGAAACGTCCCAGAAGAGAAGGAGTTTACAGAAATAATCAAACCACTTTAC
TGGATTTAAACTTGCCAGCGGATGTCATTGAGCGGAAATGAACTCATCATTCTTTGCCCT
CCTCACCCTTTTTGTCCAGATCATGCTAAATGTACAAATCATAACCCTAAACCCCTCTGC
TTGATAAAACTTTTACTAACATTGCCCTTCCTCGGTTCTGAGGAAAAGGGCTAGTCTGCT
TATCTCCTATTTACAAATTCGTTCGGAATTTACACAGAATTTTGGTTATGGTGGATCGTA
TTTTTTGGTAGCCTTATGTAAGTTGCTTAGAAGCTGCCTTTGAACTCAGGCTTCTCTCAA
CGCCTCAATGTGTAAATGTTTAACCCATGTAGTAATTTGCTTTTGGAGGATCCCTCCTGA
TTTATGG


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DU27JQ C 1
AF RS1DU27TF U 1
BS 1 1 RS1DU27JQ
BS 2 667 RS1DU27TF

RD RS1DU27JQ 667 0 0
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AAAAAATGTATGAGTGCATTGAGAATGACTTGCTGGGTTCTCTGCAACTTGGCATCCACA
ACATTGCTCCGTACAGATCAAATGGAATAGAACGAGCATCGAACTTTATTAGTTCCCGTG
AAGCTGCCGGTGAGAAACGCCAACCTCCGAATTCAGGATGGAACTCAGAAGACACAAGTT
GCTTTTCGAGGAAACGTCCCAGAAGAGAAGGAGTTTACAGAAATAATCAAACCACTTTAC
TGGATTTAAACTTGCCAGCGGATGTCATTGAGCGGAAATGAACTCATCATTCTTTGCCCT
CCTCACCCTTTTTGTCCAGATCATGCTAAATGTACAAATCATAACCCTAAACCCCTTTGC
TTGATAAAACTTTTACTAACATTGCCCTTCCTCGGTTTTGAGGAAAAGGGCTAGTTTGCT
TATCTCCTATTTACAAATTCGTTCGGAATTTACACAGAATTTTGGTTATGGTGGATCGTA
TTTTTTGGTAGCCTTATGTAAGTTGCTTAGAAGCTGCCTTTGAACTCAGGCTTCTCTCAA
CGCCTCAATGTGTAAATGTTTAACCCATGTAGTAATTTGCTTTTGGAGGATCCCTCCTGA
TTTATGG

QA 1 667 1 667
DS 

RD RS1DU27TF 667 0 0
G
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AAAAATGTATGAGTGCATTGAGAATGACTTGCTGGGTTCTCTGCAACTTGGCATCCACAA
CATTGCTCCGTACAGATCAAATGGAATAGAACGAGCATCGAACTTTATTAGTTCCCGTGA
AGCTGCCGGTGAGAAACGCCAACCTCCGAATTCAGGATGGAACTCAGAAGACACAAGTTG
CTCTTCGAGGAAACGTCCCAGAAGAGAAGGAGTTTACAGAAATAATCAAACCACTTTACT
GGATTTAAACTTGCCAGCGGATGTCATTGAGCGGAAATGAACTCATCATTCTTTGCCCTC
CTCACCCTTTTTGTCCAGATCATGCTAAATGTACAAATCATAACCCTAAACCCCTCTGCT
TGATAAAACTTTTACTAACATTGCCCTTCCTCGGTTCTGAGGAAAAGGGCTAGTCTGCTT
ATCTCCTATTTACAAATTCGTTCGGAATTTACACAGAATTTTGGTTATGGTGGATCGTAT
TTTTTGGTAGCCTTATGTAAGTTGCTTAGAAGCTGCCTTTGAACTCAGGCTTCTCTCAAC
GCCTCAATGTGTAAATGTTTAACCCATGTAGTAATTTGCTTTTGGAGGATCCCTCCTGAT
TTATGG

QA 2 667 2 667
DS 



AS 1 4

CO CL2986Contig1 898 4 14 U
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TACAAAAGTAAAACAACGGTCGTAAGAGTTTTGGCATTTTGACAAACTCCCCGATACCGA
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ATAATTTTTTATTCCAATCATTAAAAAATCTAAAAAAAGATCTTTAAGAACGTGAAAATA
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CGCCTTCACCACCAGGGCATCCCACAATTCGCTTGTCATAGTAGGACTTTACAATTGCAG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1BA53JQ U 31
AF RS1C343JQ U 1
AF RS1C343TF C 136
AF RS1BA53TF C 211
BS 1 36 RS1C343JQ
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BS 795 795 RS1C343TF
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RD RS1BA53JQ 606 0 0
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TAAAAAAAGATCTTTAAAAACGTGAAAATAGTAAAAAGCAAAACTCGCGGCAAGGGAAAG
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GGAAGTCAATGTCAAGCAGCCCCTTCCCCTCAAGTTCAGCTTCAAGCTCTTCCTTCTCAT
GACCAGTAGCAATGGGCATTACATCCTCCACCTTCTTCTTCTTCGTGACAATGGTCTCTA
CTGATT

QA 1 606 1 606
DS 

RD RS1C343JQ 842 0 0
AAAACAAAAGTCGAATATATAATAACCAAAAGGCAAGAATGATTCTGATTCAAGAATTGT
TACAAAAGTAAAACAACGGTCGTAAGAGTTTTGGCATTTTGACAAACTCCCCGGTACCGA
AGTGGTGTTGTTCTAAAAGGATCAAAAACATTTTCAACTCTGTTTCGCCAGCAGGCATAT
ATAATTTTTTATTCCAATCATTAAAAAATCTAAAAAAAGATCTTTAAGAACGTGAAAATA
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CGTGACCATCAGGAGGCCCACCAGGACCAACCACTTCCAGCTCAAAGTACTGAGTGCAAA
CAGGGCATTCAAAAGACTTTCCTTTTTCAAGCCAGAACCACACAACGTCGTGTTCATCCT
CGCCTTCACTACCAGGGCATCCCACAATTCGCTTGTCATAGTAGGACTTTACAATTGCAG
GAGATTCCTTGGTTCCAAAAGGACCTTCGGGGAAGTCAATGTCAAGCAGCCTCTTCCCCT
CAAGTTCAGCTTCAAGCTCTTCCTTCTCATGACCAGTAGCAATGGGCATTACATCCTCCA
CCTTCTTCTTCTTCGTGACAATGGTCTCTACTGATTCAGTGCTGAAGAAATGGCGAGGGA
TAACGGATGAAGAAGAAGCGGGAATGGCCGATCGATTGGCGGTGCGAACGGGTCTGGCGG
CGGTGGTGGCTATGGATCGACGAGGAGAAGCGGCGGCGGCTAGGGTTTTGAGATGAGATG
AGACGATTCTTCTC*ACATGATGACGAGTTTGGGTCGTGA*CTCGAAGGA
TAGCGAATCTCC

QA 1 830 1 830
DS 

RD RS1C343TF 763 0 0
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AATCATTAAAAAATCTAAAAAAAGATCTTTAAGAACGTGAAAATAGTAAAAAGCAAAACT
CGCGGCAAGGGAGAGGCCCGAATCAGTGGTGGTCGTCTTCATCACCGTGACCATCAGGAG
GCCCACCAGGACCAACCACTTCCAGCTCAAAGTACTGAGTGCAAACAGGGCATTCAAAAG
ACTTTCCTTTTTCAAGCCAGAACCACACAACGTCGTGTTCATCCTCGCCTTCACTACCAG
GGCATCCCACAATTCGCTTGTCATAGTAGGACTTTACAATTGCAGGAGATTCCTTGGTTC
CAAAAGGACCTTCGGGGAAGTCAATGTCAAGCAGCCTCTTCCCCTCAAGTTCAGCTTCAA
GCTCTTCCTTCTCATGACCAGTAGCAATGGGCATTACATCCTCCACCTTCTTCTTCTTCG
TGACAATGGTCTCTACTGATTCAGTGCTGAAGAAATGGCGAGGGATAACGGATGAAGAAG
AAGCGGGAATGGCCGATCGATTGGCGGTGCGAACGGGTCTGGCGGCGGTGGTGGCTATGG
ATCGACGAGGAGAAGCGGCGGCGGCTAGGGTTTTGAGATGAGATGAGACGATTCTTCTCC
ACATGATGACGAGTTTGGGTCGTGAACTCGAAGGAATAGCGAAATCCTCCCAACGATTCC
GATGCTCTCCTATTCTTGTAGGGTACTTACTGGTGGGTGGTCC

QA 1 763 1 763
DS 

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CT
AAAAAAGATCTTTAAGAACGTGAAAATAGTAAAAAGCAAAACTCGCGGCAAGGGAGAGGC
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CAGAACCACACAACGTCGTGTTCATCCTCGCCTTCACCACCAGGGCATCCCACAATTCGC
TTGTCATAGTGGGACTTTACAATTGCAGGAGATTCCTTGGTTCCAAAAGGACCTTCGGGG
AAGTCAATGTCAAGCAGCCCCTTCCCCTCAAGTTCAGCTTCAAGCTCTTCCTTCTCATGA
CCAGTAGCAATGGGCATTACATCCTCCACCTTCTTCTTCTTCGTGACAATGGTCTCTACT
GATTCAGTGCTGAAGAAATGGCGAGGGATAACGGATGAAGAAGAAGCGGGAATGGCCGAT
CGATTGGCGGTGCGAACGGGTCTGGCGGCGGTGGTGGCTATGGATCGACGAGGAGAAGCG
GCGGCGGCTAGGGTTTTGAGATGAGATGAGACGATTCTTCTCCACATGATGACGAGTTTG
GGTCGTGAACTCGAAGGAATAGCGAAATCCTCCCAACGATTCCGATGCTCTCCTATTCTT
GTAGGGTACTTACTGGTGGGTGGTCC

QA 3 688 3 688
DS 



AS 1 3

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AAGCCGTATGGGCAACAGATGGTTGTGGCAAAAAGTTTAAATGCAATCTTCCCCCAACGT
CTCTAAAATTCAGAAACATAGTAAATCTTGAAGTCAGTGGTATTAGCTCGGTCAACGCAA
AGGCCTTCCACATGTTCTTGGTCAAAACCGTGAATGTCAACATCCACAACATTAAGATTA
TCGCCCCTGCCGAAAGTCCCAACACTGATGGTATCCATTTGAGCAATGCCGATAACGTTA
AGATCCTCGACAGTTTCATAGGGACAGGAGACGATTGTGTTTCAGTCGGTCGTGGTTCCA
ACAATGTAACCGTCGAACGTGTGATTTGTGGTCCTGGACACGGCCTAAGTGTTGGTAGTC
TCGGTAAGTACCCCAACGAGGAGGACGTTAGCGGCATTCACTTTAGGAACTGCACAATGA
GAAATACCGACAATGGTCTTAGAATCAAGAGTTGGGGTGGTTCGTCACCAAGCAAGGCTA
TTGACATTCATTTCGAAGATATTATCATGGAAAACGTCAAGAACCCAATCATCATTGACC
AAAACTATGGTTCAAGAGGCGGAGAGTCAAGAGTTGCCATAAGCGATGTGTTGTTCAAGA
ACGTGAGAGGAACAACAATTACAAAAGATTTTGTTCAGTTCATGTGCAGCAAATCGGTAC
CGTGTAAAGGAGTCAGAGTCGACAATGTGAACCTAAAATTCGTAGGCCACGTAAGAGGAC
ACCAGTCGTCGTCAGGTGGTTTGATCGGATCTCTTTGTAATAACGTCAATCTTATCTTTG
GGGGAAAAGTTAACTTCCCTCTGTGTCCAAATAATATTTTTGGTCTAAATAATATAATAA
AGGAGAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 0 0 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BW41TF U 1
AF RS1EL63TF U 181
AF RS1AB31TF U 127
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BS 845 845 RS1EL63TF
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RD RS1BW41TF 341 0 0
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QA 1 341 1 341
DS 

RD RS1EL63TF 720 0 0
G
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QA 2 720 2 720
DS 

RD RS1AB31TF 781 0 0
G
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CGACAGTTTCATAGGGACAGGAGACGATTGTGTTTCAGTCGGTCGTGGTTCCAACAATGT
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CGACAATGGTCTTAGAATCAAGAGTTGGGGTGGTTCGTCACCAAGCAAGGCTATTGACAT
TCATTTCGAAGATATTATCATGGAAAACGTCAAGAACCCAATCATCATTGACCAAAACTA
TGGTTCAAGAGGCGGAGAGTCAAGAGTTGCCATAAGCGATGTGTTGTTCAAGAACGTGAG
AGGAACAACAATTACAAAAGATTTTGTTCAGTTCATGTGCAGCAAATCGGTACCGTGTAA
AGGAGTCAGAGTCGACAATGTGAACCTAAAATTCGTAGGCCACGTAGGAGGACACCAGTC
GTCTTCAG*TGGTTTGATCGGATCTCTTTGTAATAACGTCAATCTTATCTTTGGGTGGAA
AGTTAACTTCCCTCTGTGTCCAAATAATATTTTTGGTCTAAATAATATAATAAAGGAGAA

QA 2 781 2 781
DS 



AS 1 4

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GAGATCAGAGGCCAGCACGTTGCATTCCTCGCTTCGTTCAGCTCTCCTGCGGTTATCTTT
GAGCAGATCTCTGTCATCTACTTGCTCCCTCGCTTGTTCGTCGCCTCCTTCACCTTGGTG
TTGCCTTTCTTCCCCACTGGCTCCTTTGAGAGGATGGAAGAGGAAGGTGATGTAGCTACT
GCTTTCACCATGGCTAGGATTGTCTCTAACATCCCCATTTCGCGTGGTGGGCCCACTAGT
GTAGTCATCTATGACATTCACGCTCTTCAGGAAAGGTTCTACTTTGCTGATCAGGTGCTT
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GAGAAAATCATAGTTGCGTTTCCTGATGATGGAGCTTGGAAGCGTTTCCACAAGCTGTTG
GATCAGTACCCCACGGTGGTGTGCACAAAGGTTCGTGAAGGGGATAAGAGAATAGTAAGG
CTGAAGGAAGGTAACCCTGCTGGTTGCCACGTTGTCATCGTTGATGATCTTGTGCAGTCT
GGTGGTACACTCATCGAGTGCCAGAAAGTATTGGCAGCTCATGGAGCAGCGAAGGTGAGT
GCTTATGTAACTCATGGTGTCTTCCCTAATAGCTCCTGGGAGCGTTTCACTCACAAGAAC
AACGGAGTAGAAGAAGCGTTTGCTTACTTCTGGATCACAGATTCTTGTCCACAGACGGTT
AAATCCATAGGAAACAAAGCTCCTTTCGAAGTCTTGAGCCTCGCGGGATCCATCGCTGAT
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TTTTCGTTTCCTTAGTGTTGTTGTACTATTAAGAGAATCACTTTGCTAAGACTTTGTTAA
AACCTCATTTGCTGTTCTCGACTTGATCGAGCTTTGCAAAATTAAGAAACAAGTATTGAA
GCCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 

AF RS1A416TF U 1
AF RS1CA72TF U 1
AF RS1A416JQ C 357
AF RS1CA72JQ C 414
BS 1 687 RS1A416TF
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BS 691 691 RS1A416JQ
BS 692 717 RS1CA72TF
BS 718 1204 RS1A416JQ

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GAGCAGATCTCTGTCATCTACTTGCTCCCTCGCTTGTTCGTCGCCTCCTTCACCTTGGTG
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CCTTTGTTTGAGACTGGGATCCCTTTGTTGACGAAACGTCTCCAACAGCTTCCTGAAACT
GAGAAAATCATAGTTGCGTTTCCTGATGATGGAGCTTGGAAGCGTTTCCACAAGCTGTTG
GATCAGTACCCCACGGTGGTGTGCACA

QA 1 687 1 687
DS 

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ATTTGTAAAGACGCCATCGTGTCTGAACTACAGAAGAAGAAAGTTCATCTCTTTTACTGC
TTAGAGTGTGAAGAACTCGCTCGCAACATCGCCGCCGAATCTGACCACATCACTCTTCAA
TCCATCAACTGGAGGAGCTTTGCTGATGGATTCCCAAATCTGTTTATCAACAACGCACAC
GAGATCAGAGGCCAGCACGTTGCATTCCTCGCTTCGTTCAGCTCTCCTGCGGTTATCTTT
GAGCAGATCTCTGTCATCTACTTGCTCCCTCGCTTGTTCGTCGCCTCCTTCACCTTGGTG
TTGCCTTTCTTCCCCACTGGCTCCTTTGAGAGGATGGAAGAGGAAGGTGATGTAGCTACT
GCTTTCACCATGGCTAGGATTGTCTCTAACATCCCCATTTCGCGTGGTGGGCCCACTAGT
GTAGTCATCTATGACATTCACGCTCTTCAGGAAAGGTTCTACTTTGCTGATCAGGTGCTT
CCTTTGTTTGAGACTGGGATCCCTTTGTTGACGAAACGTCTCCAACAGCTTCCTGAAACT
GAGAAAATCATAGTTGCGTTTCCTGATGATGGAGCTTGGAAGCGTTTCCACAAGCTGTTG
GATCAGTACCCCACGGTGGTGTGCACAAAG*TTCGTGAAGGGGATAAGAGAATAGTA

QA 1 717 1 717
DS 

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AACTGAGAAAATCATAGTTGCGTTTCCTGATGATGGAGCTTGGAAGCGTTTCCACAAGCT
GTTGGATCAGTACCCCACGGTGGTGTGCACAAAGGTTCGTGAAGGGGATAAGAGAATAGT
AAGGCTGAAGGAAGGTAACCCTGCTGGTTGCCACGTTGTCATCGTTGATGATCTTGTGCA
GTCTGGTGGTACACTCATCGAGTGCCAGAAAGTATTGGCAGCTCATGGAGCAGCGAAGGT
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GAACAACGGAGTAGAAGAAGCGTTTGCTTACTTCTGGATCACAGATTCTTGTCCACAGAC
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GTGGTTTTCGTTTCCTTAGTGTTGTTGTACTATTAAGAGAATCACTTTGCTAAGACTTTG
TTAAAACCTCATTTGCTGTTCTCGACTTGATCGAGCTTTGCAAAATTAAGAAACAAGTAT
TGAAGCCC

QA 1 848 1 848
DS 

RD RS1CA72JQ 791 0 0
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CACTAGTGTAGTCATCTATGACATTCACGCTCTTCAGGAAAGGTTCTACTTTGCTGATCA
GGTGCTTCCTTTGTTTGAGACTGGGATCCCTTTGTTGACGAAACGTCTCCAACAGCTTCC
TGAAACTGAGAAAATCATAGTTGCGTTTCCTGATGATGGAGCTTGGAAGCGTTTCCACAA
GCTGTTGGATCAGTACCCCACGGTGGTGTGCACAAAGGTTCGTGAAGGGGATAAGAGAAT
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GCAGTCTGGTGGTACACTCATCGAGTGCCAGAAAGTATTGGCAGCTCATGGAGCAGCGAA
GGTGAGTGCTTATGTAACTCATGGTGTCTTCCCTAATAGCTCCTGGGAGCGTTTCACTCA
CAAGAACAACGGAGTAGAAGAAGCGTTTGCTTACTTCTGGATCACAGATTCTTGTCCACA
GACGGTTAAATCCATAGGAAACAAAGCTCCTTTCGAAGTCTTGAGCCTCGCGGGATCCAT
CGCTGATGCTCTGCAGATTTGAAGCAAAGTAGAAGATAAAAACCTGCTCTCTGCTCTGTC
TTGGTGGTTTTCGTTTCCTTAGTGTTGTTGTACTATTAAGAGAATCACTTTGCTAAGACT
TTGTTAAAACCTCATTTGCTGTTCTCGACTTGATCGAGCTTTGCAAAATTAAGAAACAAG
TATTGAAGCCC

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 2

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GTTCCCTCTGTTTCCTCATCGGCTTCTACGCTTCAGCTCTACTCTCTCAGAATGTGCCTG
GAGTAAGACCCAGGTTGAGAATGGTGGAGATGGTGGAGAACGGTGGAGGAGAAGGTTCCT
CGATGCCTCATGGTGTTAGTGGAGATGAATCCGTTGGGTCGATTCCGTTTCAGGTACTGA
GTTGGAAACCGAGGGCTTTATATTTTCCGAATTTCGCAACTGCAGAACAATGCCAAGCTA
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GGACTCATGGAGAGGCATTCAATATTTTAAGGTATGAGCTTGGGCAAAAGTATGATTCCC
ACTATGATGTTTTCACCCTACAGAATACGGACCGCAAAAAGCAAAGGATTGCTTCCTTCC
TGCTCTACTTATCTGATGTAGAAGAAGTGGTGAACATGTTCCCATTTGAGAACGTGCTAA
TATGGGCGCTGGATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E585TF U 37
AF RS1F729TF U 1
BS 1 151 RS1F729TF
BS 152 152 RS1E585TF
BS 153 281 RS1F729TF
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RD RS1E585TF 529 0 0
G
GCTCCCGGCGTGAATACCCTTTTAAGCCGGCGAAGATTCATCGAGAAATTTTCAGATCGG
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TCTACTCTCTCAGAATGTGCCTGGAGTAAGACCCAGGTTGAGAATGGTGGAGATGGTGGA
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GTCGATTCCGTTTCAGGTACTGAGTTGGAAACCGAGGGCTTTATATTTTCCGAATTTCGC
AACTGCAGAACAATGCCAAGCTATTATTGAGAGAGCAAAGGTTAATCTGAAACCTTCTGC
TTTGGCTCTCCGGCTAGGAGAGACTGCTGAGAGCACTCAGGGCACTAGAACAAGCTCAGG
AACTTTTGTTGGTGCTTCAGAAGAGAGTTCTGGTGCTTTGGAGTTTGT

QA 2 529 2 529
DS 

RD RS1F729TF 796 0 0
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AAGCCGGCGAAGATTCATCGAGAAATTTTCAGATCGGACGAAAGGAACATAGGTCAATGA
AGAACAGATTGAAGAGCTACAAGAGAAAGAATCTAGGGTTAGCCACAGTCATCGTCTTCT
GTTCCCTCTGTTTCCTCATCGGCTTCTACGCTTCAGCTCTACTCTCTCAGAATGTGCCTG
GAGTAAGACCCAGGTTGAGAATGGTGGAGATGGTGGAGAACTGTGGAGGAGAAGGTTCCT
CGATGCCTCATGGTGTTAGTGGAGATGAATCCGTTGGGTCGATTCCGTTTCAGGTACTGA
GTTGGAAACCGAGGGCTTTATATTTTCCGAATTTCGCAACTGCAGAACAATGCCAAGCTA
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CTGC*GAGAGCACTCAGGGCACTAGAACAAGCTCAGGAACTTTTGTTAGTGCTTCAGAAG
AGAGTTCTAGTGCTTTGGAGTTTGTTGAAAAGAAAATCGCAAAAGCTACGATGATCCCAA
GGACTCATGGAGAGGCATTCAATATTTTAAGGTATGAGCTTGGGCAAAAGTATGATTCCC
ACTATGATGTTTTCACCCTACAGAATACGGACCGCAAAAAGCAAAGGATTGCTTCCTTCC
TGCTCTACTTATCTGATGTAGAAGAAGTGGTGAACATGTTCCCATTTGAGAACGTGCTAA
TATGGGCGCTGGATAT

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 4

CO CL2990Contig1 945 4 7 U
GGAAAGAGAGAAGACGTGATCGGGCGGTGAAAGAATCATTAATCACACACTTTCCCCCAG
TAATCTGTTCAGCCCAGCCGAATACGGTGGATCTTCGCCGGAGTATATCCCGGGGAAATC
GGTTTCATATGGAGAGGGCCGATGAAGGAACCGGCGAGCCTTCTGGAGCCGCCATAAGAT
CGAGGCTCAGTAACAGAGCGGATCCTTTCCTCGTTGTTTGCAGGTGCTTCAGCTTCGTTA
CCTCTCTCATCGCCATCCTCTGCGTCGTCGTTAATGTTCTCGCTGCCATTCGCTCCTTCC
GAGATAGCCACGATCTGTTCGATGGAATATTCAGGTGTTATGCTGTGGTGATTGCTTGTT
TTGTGGTTCTCGCCGAGACTGAATGGGGTTTCATCCTCAAATTTTCCAAGGTTCTTGAGT
ACTGGGCTGGGAGAGGAATGCTTCAGATTTTTGTTGCTGTGATGACAAGAGCTTTCCCTG
ACTACCTGGCTCAGAAGAAGGATCTCCTGCTTCTACAGAATATCGCTAGCTACATGCTCC
TTTCTTGTGGTCTTATCTATTTCATCTCTGGAGTTCTGTGCATTGGCTTTCTGAAGCGTG
CTCGACAGCAGAAGGAAATTTCAAGAGAACAAGCCGTCAAGGATCTTGAGGAGATAGACC
GACGCAGGGAAGAGCTGGAACAATTGCTCCTCAAGCATCGCAGTAGAGACGACGTGTGAA
TTACAAGTACCAGCTTCAGCTTCATTCAAAGGACGAGATCTGTTTCTTGTTTCTTTCTTT
TTTTTTCTTTTTGTAGTAAAGGATTGTGTGAGCTCTCTCTCTGTTTCTGCATCCCTCCCA
CTTTGATAAAATCTGTTTCTTTTTTTTCTGTCTGTTGAAAAACGAACCTTTGATACTTAA
CATGTAAGAGACGAGCAGTACTGAATATGAATTTTGACGTAGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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GGTTTCATATGGAGAGGGCCGATGAAGGAACCGGCGAGCCTTCTGGAGCCGCCATAAGAT
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TTGTGGTTCTCGCCGAGACTGAATGGGGTTTCATCCTCAAATTTTCCAAGGTTCTTGAGT
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TGTTTCT

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DS 

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ATACGGTGGATCTTCGCCGGAGTATATCCCGGGGAAATCGGTTTCATATGGAGAGGGCCG
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AATTGCTCCTCAAGCATCGCAGTAGAGACGACGTGTGAATTACAAGTACCAGCTTCAGCT
TCATTCAAAGGACGAGATCTGTTTCT*GTTTCTTTCTTTTTTTT
CTTTTGTAGTAA

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DS 

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GAGCTTC
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GAACCTTTGATACTTAACATGTAAGAGACGAGCAGTACTGAATATGAATTTTGACG
C

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DS 

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GTGCTTCAGCTTCGTTACCTCTCTCATCGCCATCCTCTGCGTCGTCGTTAATGTTCTCGC
TGCCATTCGCTCCTTCCGAGATAGCCACGATCTGTTCGATGGAATATTCAGGTGTTATGC
TGTGGTGATTGCTTGTTTTGTGGTTCTCGCCGAGACTGAATGGGGTTTCATCCTCAAATT
TTCCAAGGTTCTTGAGTACTGGGCTGGGAGAGGAATGCTTCAGATTTTTGTTGCTGTGAT
GACAAGAGCTTTCCCTGACTACCTGGCTCAGAAGAAGGATCTCCTGCTTTTACAGAATAT
CGCTAGCTACATGCTCCTTTCTTGTGGTCTTATCTATTTCATCTCTGGAGTTCTGTGCAT
TGGCTTTTTGAAGCGTGCTCGACAGCAGAAGGAAATTTCAAGAGAACAAGCCGTCAAGGA
TCTTGAGGAGATAGACCTACGCAGGGAAGAGCTGGAACAATTGCTCCTCAAGCATCGCAG
TAGAGACGACGTGTGAATTACAAGTACCAGCTTCAGCTTCATTCAAAGGACGAGATCTGT
TTCTTGTTTCTTTCTTTTTTTTTCTTTTTGTAGTAAAGGATTGTGTGAGCTCTCTCTCTG
TTTCTGCATCCCTCCCACTTTGATAAAATCTGTTTCTTTTTTTTCTGTCTGTTGAAAAAC
GAACCTTTGATACTTAACATGTAAGAGACGAGCAGTACTGAATATGAATTTTGACGTAGA
TG

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 3

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TTATATTAAAAAACTAGAGAAAGTGTTTCTAACATTTGAGAAAAGCAGTGATGACTAATT
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AACAACAAACAACTCGGAAGCGAAGCCATGAGCCATTAAGATAATACACATTCACACAAT
GATGAAACATAGTGCAAGTCCTTGACTAGTTTCCAGTAGTAACAGGTGAAAAGCTTGCGG
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TCCAGATTCTCTTACCAATGCCACCCTTCCTGTCCTAGCCACCTCGCAAATTCCGTAAAC
CTCTAACTGCGTTTGCAATGCAGCCATCTTTCTGATATCTCCTGTAACCTCGAGAGTGAT
AGTATGATCGGAGACATCAATGGCTTTAGCTCGGAACACTTGAGCGATATCGAGAACATC
CCTCCTTGCAGAAGTATGAGCAGCTACTTTGATGAGCATCAGTTCACGCTCCGCAAATGG
CATGTGGGTTATATTTTGAACCTCATGAAGATCAATCAACTTCTGAAGCTGCCTCACCAA
TTTGTCGATGTTTTCATCAGTTCCAGGGATCACTGTAGTGATCCGAGACAAGCCCTCTTT
CTCAGCAGGACCAACTGCTAGACTCTGGATGTTATAACCTCTCCTGGAGATAGCTCCGGT
TATTAGATTGAGAACTCCAGGAACATTGGCTACTAGTATAGATAACGTGTGGGACCGAAG
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GCAACCATCTTTCCCGGGTCTCCAGTTACCTCGATCGTTAGAGTGTGATCCGATGTATCC
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F114JQ U 1
AF RS1A449JQ U 98
AF RS1A449TF C 926
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BS 819 1010 RS1A449JQ
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TTATATTAAAAAACTAGAGAAAGTGTTTCTAACATTTGAGAAAAGCAGTGATGACTAATT
GACTAAAAACAAACATAGTCTTCCACATTATTTGTTTCACTTCTCTAACATCAGTCCTCT
AACAACAAACAACTCGGAAGCGAAGCCATGAGCCATTAAGATAATACACATTCACACAAT
GATGAAACATAGTGCAAGTCCTTGACTAGTTTCCAGTAGTAACAGGTGAAAAGCTTGCGG
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TCCAGATTCTCTTACCAATGCCACTCTTCCTGTCCTAGCCACCTCGCAAATTCCGTAAAC
CTCTAACTGCGTTTGCAATGCAGCCATCTTTCTGATATCTCCTGTAACCTCGAGAGTGAT
AGTATGATCGGAGACATCAATGGCTTTAGCTCGGAACACTTGAGCGATATCGAGAACATC
TCTCCTTGCAGAAGTATGAGCAGCTACTTTGATGAGCATCAGTTCACGCTCCGCAAATGG
CATGTGGGTTATATTTTGAACCTCATGAAGATCAATCAACTTCTGAAGCTGCCTCACCAA
TTTGTCGATGTTTTCATCAGTTCCAGGGATCACTGTAGTGATCCGAGACAAGCCCTCTTT
CTCAGCAGGACCAACTGCTAGACTCTGGATGTTATAACCTCTCCTGGAGATAGCTCCGGT
TATTAGATTGAGA*CTCCAGGAACATTGGCTACTAGTA

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CACTTCTCTAACATCAGTCCTCTAACAACAAACAACTCGGAAGCGAAGCCATGAGCCATT
AAGATAATACACATTCACACAATGATGAAACATAGTGCAAGTTCTTGACTAGTTTCCAGT
AGTAACAGGTGAAAAGCTTGCGGCAAGTCCTCTCTTGGGAACTACAAAGGAAGAGAGTAT
CCACGAAGGTAAGTCGAATCCACTCCAGATTCTCTTACCAATGCCACCCTTCCTGTCCTA
GCCACCTCGCAGATTCCGTAGACCTCTAACTGCGTTTGCAATGCAGCCATCTTTCTGATA
TCTCCTGTAACCTTGAGAGTGATAGTATGATCGGAGACATCAATGGCTTTAGCTCGGAAC
ACTTGAGCGATATCGAGAACATCCCTCCTTGCAGAAGTATGAGCAGCTACTTTGATGAGC
ATCAGTTCACGCTCCGCAAATGGCATGTGGGTTATATTTTGAACCTCATGAAGATCAATC
AACTTCTGAAGCTGCCTCACCAATTTGTCGATGTTTTCATCAGTTCCAGGGATCACTGTA
GTGATCCGAGACAAGCCCTCTTTCTCAGCAGGACCAACTGCTAGACTCTGGATGTTATAA
CCTCTCCTGGAGATAGCTCCGGTTATTAGATTGAGAACTCCAGGAACATTGGCTACTAGT
ATAGATAACGTGTGGGACCGAAGACCATTCGAATCTTCGTCGTAGACCACTCCCCAATGA
GCATCAAGCACCGGTTTGAAATCATTATAAGGCTCCACTGGATAAACGTCACCCCCAGAT
GATGCAGTGCCATTTCCACCAGTCAACGCTCGCTTTGTATCTCTGCAAAAGTCTCATGAG
ATGATTGGTTTAC

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TCACCCCCAGATGATGCAGTGCCATTTCCACCAGTCAACGCTCGCTTTGTATCTCTGCAA
AAGTCTCATGAGATGATTGGTTTACGAGATGTGGGTATGACGCCGCTGAAAATCTCCAGA
ACGGAGCAGTTTCTCCCATCTTTTCCCGTCTCAGAGCAATCTTGCCAGTCCTCGCGACTT
CTTTTATTCCAAACCTCTCTAAGTTGGCTGTTAGTGCAACCATCTTTCCCGGGTCTCCAG
TTACCTCGATCGTTAGAGTGTGATCCGATGTATCCACCACTTTTGCTCTAAAGATATCCA
CCAACCACATGATCTCAGAGCGGGTGGTTGGATCAGCGTTAAGTTTAATAAGCATTAACT
CACGTTCCACATGCGGCTCCTTGGAGAGATCTTCAACCTTGATGACGTTGACGAGTTTGT
TAAGCTGTTCAACAACTTGCTGCAAGACTTTGTCAGTCCCGAGAACAACAATGGTAAACA
TAGCTTTGTCTTCGTTCAACCCAACAGCGAGAGACTCGATGTTGTATCCTCTTCTAGCGA
ACACTCCAGCTATCCGGTTTATGATACCGCTCTCGTCACCCACGAACACCGAGATTGTAT
GCCTCCGCACTTTGTCACATGCAGTGGGTGAAACAGACTGAGCAGTGGTGATAGTTTTAT
CGGTGGAGGCAGCGGAGAAGAGAGTGGCACTCCTCGTCTTCCGCCCATCGATGATTTGGG
AGACTTGGACGGAGGTTTTGGACGGAAACGCGTAGGCCTTGTTCTGATTTAAGAAGTGGG
CACAGGCTAGTGAAGCAGCAGTTGTCGTAGTCGCCGCCATTGCTTTGGAGACGGTTCGGT
GAGAGGCCC

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DS 



AS 1 3

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GGATTCACCTAGAGAGAGAGAGAGTAAAGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGAGAGAGTAAAG
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ACGCCTTCGCCATTGACGAGTCCAATCTCTTCGAAAAGCTCGGTCTTCAGAGCTTCATCA
ACCTCTCC*ACCAACTTCTACACCAGGGTATATGATGACGAAGAAGAATGGTTTCGATCC
ATGTTTTCTAACTCTAAGAAAGAAGACGCCATCCAGAACCAGTATGAGTTCTTCGTCCAG
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CACCGTCCATTTCCAGTAACTCATGAAGCTGCGGAGAGATGGCTACAGCATATGCAAAAT
GCTATAGACGAGTCTGTTGACATTGACCAGGACTCGAAAGTCAAAATGATGAACTTCTTC
AGGCACACCGCTTTCTTCCTTGTGGCTGGAAACGAGTTGAAGAACCAGAACCAGAATCAG
AACAACCAAGTTGCGTGTAAGCACGCTGCCAATAAACCAGCAGAAGAAGAGTAATCAAAC
AACAACATATTCTTGTTGTATTTTTACCTTTCATATTGAAAGAGAGTACACAGATTCAAG
GGAAATTTTAGTCTTTCTTCGAATAAGCTCTACTACAAGTCTTACTTCTTCCATGTCACA
TGTGTAATCCGACATAAAAGGAATCTCATAAGTATTAACAAGATATTGAACTTTAAGATG
TTGTAATGTGACAAACAATACACTTTCTCTATGTTGAAGATTGAGAAAACACAGTGTTCC
ACGAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 0 0 0 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 0 25 25 
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10 10 10 10 10 

AF RS1DI57TF U 1
AF RS1AO19JQ C 38
AF RS1AO19TFB U 42
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BS 320 656 RS1DI57TF
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AGAGAGAGATGCAGTCGCTGCAGGAGAAGGCATCGGCATGGAGCGGCGTGGATCAGGCTG
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ACCTCTCC*ACCAACTTCTACACCAGGGTATATGATGACGAAGAAGAATGGTTTCGATCC
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AGGCACACCGCTTTCTTCCTTGTGGCTGGAAACGAGTTGAAGAACCAGAACCAGAATCAG
AACAACCAAGTTGCGTGTAAGCACGCTGCCAATAAACCAGCAGAAGAAGAGTAATCAAAC
AACAACATATTCTTGTTGTATTTTTACCTTTCATATTGAAAGAGAGTACACAGATT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RS1AO19JQ 611 0 0
CGGGGG
ACCTAGAGAGAGTAAAGAGAGAGAGATGCAGTCGCTGCAGGAGAAGGCATCGGCATGGAG
CGGCGTGGATCAGGCTGACGCTTTCGCCATTGACGAGTCCAATCTCTTCGAAAAGCTCGG
TCTTCAGAGCTTCATCAACCTCTCCCACCAACTTCTACACCAGGGTATATGATGACGAAG
AAGAATGGTTTCGATCCATGTTTTCTAACTCTAAGAAAGAAGACGCCATCCAGAACCAGT
ATGAGTTCTTCGTCCAGCGTATGGGAGGTCCTCCTCTCTATTCTCAAAGGAAAGGTCATC
CTGCTCTGATTGGTCGTCACCGTCCATTTCCAGTAACTCATGAAGCTGCGGAGAGATGGC
TACAGCATATGCAAAATGCTATAGACGAGTCTGTTGACATTGACCAGGACTCGAAAGTCA
AAATGATGAACTTTTTCAGGCACACCGCTTTTTTCCTTGTGGCTGGAAACGAGTTGAAGA
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AAGAAGAGTAATCAAACAACAACATATTCTTGTTGTATTTTTACCTTTCATATTGAAAGA
GAGTA

QA 7 611 7 611
DS 

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CCATGTTTTCTAACTCTAAGAAAGAAGACGCCATCCAGAACCAGTATGAGTTCTTCGTCC
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GTCACCGTCCATTTCCAGTAACTCATGAAGCTGCGGAGAGATGGCTACAGCATATGCAAA
ATGCTATAGACGAGTCTGTTGACATTGACCAGGACTCGAAAGTCAAAATGATGAACTTCT
TCAGGCACACCGCTTTCTTCCTTGTGGCTGGAAACGAGTTGAAGAACCAGAACCAGAATC
AGAACAACCAAGTTGCGTGTAAGCACGCTGCCAATAAACCAGCAGAAGAAGAGTAATCAA
ACAACAACATATTCTTGTTGTATTTTTACCTTTCATATTGAAAGAGAGTACACAGATTCA
AGGGAAATTTTAGTCTTTCTTCGAATAAGCTCTACTACAAGTCTTACTTCTTCCATGTCA
CATGTGTAATCCGACATAAAAGGAATCTCATAAGTATTAACAAGATATTGAACTTTAAGA
TGTTGTAATGTGACAAACAATACACTTTCTCTATGTTGAAGATTGAGAAAACACAGTGTT
CCACGAAA

QA 18 805 18 805
DS 



AS 1 4

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CTTTGGCCGGTCGTGTAGCCATAGTGACTGGAGCCACAAGAGGCATCGGCCGTGCGATTG
CCATTCACCTCCACAGCCTTGGCGCAAGAGTCACCCTCAATTATGTCTCGAGCTCATCAG
AAGCTGAACTTCTGGCTTCGGAACTAAACGCGTCATCTCAACAAAACTCAGCAATAGCAG
TGAGAGCAGATGTTTCAGATCCTGACCAGATCAATAACTTGTTTGATCAAACCGAACAAG
AGTTCGGATCAAAAGTTCACATTCTCATAAATTGTGCAGGTGTCTTGGACCCAAAGTATC
CATCTATATCCGAGACTACACTTGAAGATTTCGAAAAAACGTTCAGAACTAACACGAGAG
GGGCTTTCGTGTGTTGCAAGGAAGCTGCTAAGAGAGTTGTTAGAGGAGGTGGTGGAAGAA
TCATTATGATGTCTACTTCGCAGGTCGGAGCACTCTCGCCAGGTTATGGAGTCTATACCG
CGTCAAAGGCTGCGGTGGAAACAATGGTAAGAGTGTTGGCAAAAGAACTGAAGGGAAGCC
AGATTACCGCAAACTGCGTTGCTCCAGGGCCGGTTGCGACTGAGATGTTCTATGCAGGAA
AAAGTGATGAAACGGTGAAGATGCTTGCAAGCGCGTCTCCAATGAGGAGGATTGGCGAGC
CAAAGGATGTTGCGGAGATTGTAGGATTTTTGGCAGGTGATGGTGGGGAATGGATCAACG
GTCAGGTTATTAGGGCCAATGGAGGCTTTGTTGTGTGAAAATAGGAAGATTAAACTATAA
AATATTTGATGTTAACGTCTTTTGGTGTGTTGATGTTGTGATTCTCACTTTAATTTGTTT
CTCTCTTTTGTACCTCTGTTTTTCTCTGTTTTGTTGTGCAAGATTTGATCTTTTACCAAA
TAACTTTTTTTTCATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1B809TF U 262
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AF RS1B809JQ C 146
AF RS1GN14JQ C 201
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DS 

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AA

QA 1 662 1 662
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CATAAATTGTGCAGGTGTCTTGGACCCAAAGTATCCATCTATATCCGAGACTACACTTGA
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G

QA 1 828 1 828
DS 

RD RS1GN14JQ 776 0 0
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CCTGACCAGATCAATAACTTGTTTGATCAAACCGAACAAGAGTTCGGATCAAAAGTTCAC
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CTTGAAGATTTCGAAAAAACGTTCAGAACTAACACGAGAGGGGCTTTCGTGTGTTGCAAG
GAAGCTGCTAAGAGAGTTGTTAGAGGAGGTGGTGGAAGAATCATTATGATGTCTACTTCG
CAGGTCGGAGCACTCTCGCCAGGTTATGGAGTCTATACCGCGTCAAAGGCTGCGGTGGAA
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GCTCCAGGGCCGGTTGCGACTGAGATGTTCTATGCAGGAAAAAGTGATGAAACGGTGAAG
ATGCTTGCAAGCGCGTCTCCAATGAGGAGGATTGGCGAGCCGAAGGATGTTGCGGAGATT
GTAGGATTTT*GGCAGGTGATGGTGGGGAATGGATCAACGGTCAGGTTATTAGGGCCAAT
GGAGGCTTTGTTGTGTGAAAATAGGAAGATTAAACTATAAAATATTTGATGTTAACGTCT
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TTTCTCTGTTTTGTTGTGCAAGATTTGATCTTTTACCAAATAACTTTTTTTTCATT

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 4

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TGAATCATTTCACATCAAGGTAAACATTATTTCACTCTTTGGCACAATTTTGATTTGACT
ATGCAGATACACTTTATTTTGGCTGTTGGGTGATCATCAGACCTTGATCTTAGGCTTCTT
CACGATCATCACGGAGCAATGCGCATGGTGAGCACAGTAGTCGCTCACGCTCCCCATAAC
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ATGAACCGATTTGCTCTCACAGATTCCTTTGGCCTTGTCGACAACCTTAGCAGCGGTATG
CTTCAAATCTGCATCAACATGAGGCACAACCTCTGCAATTCCGGGACCAGCGAAACCAAC
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GAGAGAGAGCTTTCTTTCTATACAGCCC


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GY04JQ U 1
AF RS1AA60JQ U 2
AF RS1GY04TF C 3
AF RS1AA60TF C 20
BS 1 314 RS1GY04JQ
BS 315 315 RS1AA60JQ
BS 316 518 RS1GY04JQ
BS 519 710 RS1GY04TF
BS 711 748 RS1AA60TF

RD RS1GY04JQ 518 0 0
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CACGATCATCACGGAGCAATGCGCATGGTGAGCACAGTAGTCGCTCACGCTCCCCATAAC
CGCCCTCTTGATAGCTCCATGACCATGGTTTCCCACAACAAGAAGAGAAGCATGGTGTTT
ATCCACAGCCTCGCGCAGGATATTCCTCGCATCGCCTTCGAAAACTTCCATAGTCGCGTC
ATGAACCGATTTGCTCTCACAGATTCCTTTGGCCTTGTCGACAACCTTAGCAGCGGTATG
CTTCAAATCTGCATCAACATGAGGCACAACCTCTGCAATTCCGGGACCAGCGAAACCAAC
GGCAGAGACGGCGTTAAGTTTGGCGTGGATGATTAAGA

QA 1 518 1 518
DS 

RD RS1AA60JQ 485 0 0
G
CGAATACTCTGCTATTAAAAGAGTATATGTGATAAACAACCACACACAAAGATTGTCTTG
AATCATTTCACATCAAGGTAAACATTATTTCACTCTTTGGCACAATTTTGATTTGACTAT
GCAGATACACTTTATTTTGGCTGTTGGGTGATCATCAGACCTTGATCTTAGGCTTCTTCA
CGATCATCACGGAGCAATGCGCGTGGTGAGCACAGTAGTCGCTCACGCTCCCCATAACCG
CCCTCTTGATAGCTCCATGACCATGGTTTCCCACAACAAGAAGAGAAGCATGGTGTTTAT
CCACAGCCTCGCACAGGATATTCCTCGCATCGCCTTCGAAAACTTCCATAGTCGCGTCAT
GAACCGATTTGCTCTCACAGATTCCTTTGGCCTTGTCGACAACCTTAGCAGCGGTATGCT
TCAAATCTGCATCAACATGAGGCACAACCTCTGCAATTCCGGGACCAGCGAAACCAACGG
CAGA

QA 2 485 2 485
DS 

RD RS1GY04TF 710 0 0
CGAATACTCTGCTATTAAAAGAGTATATGTGATAAACAACCACACACAAAGATTGTCTTG
AATCATTTCACATCAAGGTAAACATTATTTCACTCTTTGGCACAATTTTGATTTGACTAT
GCAGATACACTTTATTTTGGCTGTTGGGTGATCATCAGACCTTGATCTTAGGCTTCTTCA
CGATCATCACGGAGCAATGCGCATGGTGAGCACAGTAGTCGCTCACGCTCCCCATAACCG
CCCTCTTGATAGCTCCATGACCATGGTTTCCCACAACAAGAAGAGAAGCATGGTGTTTAT
CCACAGCCTCGCGCAGGATATTCCTCGCATCGCCTTCGAAAACTTCCATAGTCGCGTCAT
GAACCGATTTGCTCTCACAGATTCCTTTGGCCTTGTCGACAACCTTAGCAGCGGTATGCT
TCAAATCTGCATCAACATGAGGCACAACCTCTGCAATTCCGGGACCAGCGAAACCAACGG
CAGAGACGGCGTTAAGTTTGGCGTGGATGATTAAGAGCTTGAACGGAAAATTCGGAGCAT
AAGGAGCGAAGAAACGATCAAGCGTCCACTCCAAAGCGTAGGTGCTCTGCTCGCTTTCGT
CCAGACCGACGACCATCAGCGGTTTCTCCTCTCCGGTAGCCATGACAATCTTTTGTTTGA
GCTTAATTATGGAAGAAGAAGAAGAATAAGATTCCAAAATGATGTAGC
CC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1AA60TF 729 0 0
AAAGAGTATATGTGATAAACAACCACACACAAAGATTGTCTTGAATCATTTCACATCAAG
GTAAACATTATTTCACTCTTTGGCACAATTTTGATTTGACTATGCAGATACACTTTATTT
TGGCTGTTGGGTGATCATCAGACCTTGATCTTAGGCTTCTTCACGATCATCACGGAGCAA
TGCGCGTGGTGAGCACAGTAGTCGCTCACGCTCCCCATAACCGCCCTCTTGATAGCTCCA
TGACCATGGTTTCCCACAACAAGAAGAGAAGCATGGTGTTTATCCACAGCCTCGCACAGG
ATATTCCTCGCATCGCCTTCGAAAACTTCCATAGTCGCGTCATGAACCGATTTGCTCTCA
CAGATTCCTTTGGCCTTGTCGACAACCTTAGCAGCGGTATGCTTCAAATCTGCATCAACA
TGAGGCACAACCTCTGCAATTCCGGGACCAGCGAAACCAACGGCAGAGACGGCGTTAAGT
TTGGCGTGGATGATTAAGAGCTTGAACGGAAAATTCGGAGCATAAGGAGCGAAGAAACGA
TCAAGCGTCCACTCCAAAGCGTAGGTGCTCTGCTCGCTTTCGTCCAGACCGACGACCATC
AGCGGTTTCTCCTCTCCGGTAGCCATGACAATCTTTTGTTTGAGCTTAATTATGGAAGAA
GAAGAAGAATAAGATTCCAAAATGATGTAGCAGAGAGAAAAGAGAGAGAGCTTTCTTTCT
ATACAGCCC

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 4

CO CL2995Contig1 802 4 3 U
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GAAGAGCTGATATGGATTGGGACAACGTAGCAGCTGAGGATGTGATCGAGGCGCTGAGAG
AAGTCGAATGGTCGACGCCTCCTCGTTCCTTTGGAGAGTTCTTCTCTAGATTCGCTTTCC
CTCGCTCTTTCTCTAAGTGGAAGAGCCGTCTCAAATGCAATCTCTACTATTATCGGACGA
ATTACTTTATCCTGGTGATTTTCGTTCTAGGTCTTGCTTTGATTACAAGACCATTGGCTA
TTGTGGGTGCTGCGTTTACGGCCCTAAGCATAGCTTTCCTTAACGACAGTTTTGCGGCTA
CTTTTAATGAGAAGTGTATAAGGACTATTAGGCTTTTCTCTCCACACTTGGCCGCAAAAA
TGAGGCCTCCCCACATGCCAGTCATCCGTGGGAGATCAGCAGCAAGAAAGACAGTATACG
TCTGTGGCAAACCACGATGGGTCTTTGTCGTCATTTTCCTAACAGCCAGTCTTGCCATGT
GGTTTTCTTCCTGCGGCCTTTTGTGGGTCCTCTATGCACTTCTCACTTCCCTCATCGTGG
TTATAGTTCATGCAAGCGTGAGAACACCAAATCTCAAGGCACGATTGAACACATTCCGTG
AAGAGTTTCGGGCTGTCTGGCGTAAATACAGTGAACTTTAAGTCACAGTTCGTTACACTA
TCTAAAAGCAAACCGAGCAGCCATCATGTTGTCAAGTAACCATGGTCGCAGTTTCTTCTC
GTCTCTTTTCGAGTTAATCTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A130TR C 366
AF RS1A130JQ C 402
AF RS1A130TV U 1
AF RS1A130TF U 111
BS 1 685 RS1A130TV
BS 686 686 RS1A130TR
BS 687 802 RS1A130TV

RD RS1A130TR 413 0 0
AATGAGAAGTGTATAAGGACTATTAGGCTTTTCTCTCCACACTTGGCCGCAAAAATGAGG
CCTCCCCACATGCCAGTCATCCGTGGGAGATCAGCAGCAAGAAAGACAGTATACGTTTGT
GGCAAACCACGATGGGTTTTTGTCGTCATTTTCCTAACAGCCAGTCTTGCCATGTGGTTT
TTTTCCTGCGGCCTTTTGTGGGTCCTTTATGCACTTCTCACTTCCCTCATCGTGGTTATA
GTTCATGCAAGCGTGAGAACACCAAATCTCAAGGCACGATTGAACACATTCCGTGAAGAG
TTTCGGGCTGTCTGGGGTAAATACAGTGAACTTTAAGTCACAGTTCGTTACACTATTTAA
AAGCAAACCGAGCAGCCATCATGTTGTCAAGTAACCATGGTCGCAGTTT
TTTT

QA 1 409 1 409
DS 

RD RS1A130JQ 375 0 0
CCACACTTGGCCGCAAAAATGAGGCCTCCCCACATGCCAGTCATCCGTGGGAGATCAGCA
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CTCACTTCCCTCATCGTGGTTATAGTTCATGCAAGCGTGAGAACACCAAATCTCAAGGCA
CGATTGAACACATTCCGTGAAGAGTTTCGGGCTGTCTGGGGTAAATACAGTGAACTTTAA
GTCACAGTTCGTTACACTATTTAAAAGCAAACCGAGCAGCCATCATGTTGTCAAGTAACC
ATGGTCGCAGTTT
TT

QA 1 373 1 373
DS 

RD RS1A130TV 802 0 0
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GAAGAGCTGATATGGATTGGGACAACGTAGCAGCTGAGGATGTGATCGAGGCGCTGAGAG
AAGTCGAATGGTCGACGCCTCCTCGTTCCTTTGGAGAGTTCTTCTCTAGATTCGCTTTCC
CTCGCTCTTTCTCTAAGTGGAAGAGCCGTCTCAAATGCAATCTCTACTATTATCGGACGA
ATTACTTTATCCTGGTGATTTTCGTTCTAGGTCTTGCTTTGATTACAAGACCATTGGCTA
TTGTGGGTGCTGCGTTTACGGCCCTAAGCATAGCTTTCCTTAACGACAGTTTTGCGGCTA
CTTTTAATGAGAAGTGTATAAGGACTATTAGGCTTTTCTCTCCACACTTGGCCGCAAAAA
TGAGGCCTCCCCACATGCCAGTCATCCGTGGGAGATCAGCAGCAAGAAAGACAGTATACG
TCTGTGGCAAACCACGATGGGTCTTTGTCGTCATTTTCCTAACAGCCAGTCTTGCCATGT
GGTTTTCTTCCTGCGGCCTTTTGTGGGTCCTCTATGCACTTCTCACTTCCCTCATCGTGG
TTATAGTTCATGCAAGCGTGAGAACACCAAATCTCAAGGCACGATTGAACACATTCCGTG
AAGAGTTTCGGGCTGTCTGGCGTAACTACAGTGAACTTTAAGTCACAGTTCGTTACACTA
TCTAAAAGCAAACCGAGCAGCCATCATGTTGTCAAGTAACCATGGTCGCAGTTTCTTCTC
GTCTCTTTTCGAGTTAATCTGA

QA 1 802 1 802
DS 

RD RS1A130TF 692 0 0
GCGCTGAGAGAAGTCGAATGGTCGACGCCTCCTCGTTCCTTTGGAGAGTTCTTCTCTAGA
TTCGCTTTCCCTCGCTCTTTCTCTAAGTGGAAGAGCCGTCTCAAATGCAATCTCTACTAT
TATCGGACGAATTACTTTATCCTGGTGATTTTCGTTCTAGGTCTTGCTTTGATTACAAGA
CCATTGGCTATTGTGGGTGCTGCGTTTACGGCCCTAAGCATAGCTTTCCTTAACGACAGT
TTTGCGGCTACTTTTAATGAGAAGTGTATAAGGACTATTAGGCTTTTCTCTCCACACTTG
GCCGCAAAAATGAGGCCTCCCCACATGCCAGTCATCCGTGGGAGATCAGCAGCAAGAAAG
ACAGTATACGTCTGTGGCAAACCACGATGGGTCTTTGTCGTCATTTTCCTAACAGCCAGT
CTTGCCATGTGGTTTTCTTCCTGCGGCCTTTTGTGGGTCCTCTATGCACTTCTCACTTCC
CTCATCGTGGTTATAGTTCATGCAAGCGTGAGAACACCAAATCTCAAGGCACGATTGAAC
ACATTCCGTGAAGAGTTTCGGGCTGTCTGGCGTAACTACAGTGAACTTTAAGTCACAGTT
CGTTACACTATCTAAA*GCAA*CCGAGCAGCCATCATGTTGTCAAGTAACCATGGTCGCA
GTTTCTTCTCGTCTCTTTTCGAGTTAATCTGA

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 4

CO CL2996Contig1 692 4 4 U
GGGAACCTCACAGAGTTGTGTCTGACAGATGAAACTCTTCTAAATTAGAGGTTCAACTCA
ATCAAGATTATGTTAGCTGTAAAGCTAGCATTGGTGGTTTATTTCATGACACCAATGTCG
GTTTCTCATCTGTAATTGGTACAAAGAATTTTTCATTGGGAGTGGATCTGTTGTTCCAGA
CAAACAACCTAAACGTGACAAGGTTTGATGCTGCTTTTGCTTATACTACAGAAGAAAAGA
GGACCACGTCTATTGCTTTAAATGGAGTGGGTCAGGTGGGTCAGGTGTTGGTCGCATCGT
ATCATCAAGTGGTTGATACCGACACATCAATTGCGGCACAAATGAGCTACCCTTTCCTCA
ACCGGCATCCTGTCCTTACAATCGGTGTTGAACATAGACTTGATTCACACCTCGGGTTAA
AGGCTCGAGCTGACAGCACTGGGAAACTTAACACCATTATCCAGTGGCATTCTTTGAAGG
TGTTAGGAGAGGTCAGACCTGCCCATATGCCTAGAATTGGATTGGGGATTGCTTTAAGCT
TCTGAAAGGAACAACAAAGCAGCAAAAACAATTATGTCTAGTCTTTGTTTAGCATCTTGG
TTTGACAATTTGTTTTATATTGAGACTGATTCCTCACTTGTGTCTAATAATCTCTTAAGG
TGGAAATTTTATTTTATGTGAATTTTATTGGC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1DI10TF U 1
AF RS1DT60TF U 1
AF RS1DI10JQ C 1
AF RS1DT60JQ C 42
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CT

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TTTGACAATTTGTTTT

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AGGCTCGAGCTGACAGCACTGGGAAACTTAACACCATTATCCAGTGGCATTCTTTGAAGG
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TCTGAAAGGAACAACAAAGCAGCAAAAACAATTATGTCTAGTCTTTGTTTAGCATCTTGG
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TGGAAATTTTATTTTATGTGAATTTTATTGGC

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TCTTTGTTTAGCATCTTGGTTTGACAATTTGTTTTATATTGAGACTGATTCCTCACTTGT
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DS 



AS 1 4

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TCTGAAGGAACGAGTTCACGTTCTGAACTTGGACAGTTTTCTCCCATCTTTGTCTGGCTC
CTTAGGGACTTTTATTTGGACCTAGTGGAAGATAACCGCAAGATTACTCCGCGTGACTAT
TTAGAAATTGCGTTAAGGCCGGTTCAAGGCGGTGGAGGAGATATTGCTGCTAAAAATGAG
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GAGTTTGCTGCTGGCCTGGATGCTTTGACCAAGTTTGTTTTTGAGAAGACGAGGCCCAAA
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GATGCGTTGAACAATGGTGCTGTGCCAACAATAACATCATCTTGGCAGAGTGTGGAAGAA
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TCAAAAGCTCCTGAAGAAGGTGTACTGAGGGAAGAACATGAAGAAGCAGTTCGAAAAGCC
TTGGCTATGTTTAACGCCAATGCTGCAGGGGCTGGTATAGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A222TF U 1
AF RS1A222TV U 1
AF RS1A222TR C 480
AF RS1A222JQ C 627
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BS 1235 1301 RS1A222JQ

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TTAGAAATTGC

QA 1 791 1 791
DS 

RD RS1A222TV 791 0 0
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TCGGGAAATTCCAAGTTAGTGGAGATGAGAAGCTTTTTCAGTCGAGGAGGAGCCAAAGAT
TCGCCGTCTAGTTCCGCCTCCCCTTCACCGAGATCATACCCTTCGACGTCTCCGGCTCCG
TCGTCTGCAGTGACGGGACCACCGAGACCTATTCGACTAGTGTACTGCGATGAGAAAGGA
AAGTTCCGGATGGACCCTGAAGCAGTTGCTACTCTGCTACTCGTCAAGGAGCCCATCGGC
GTTGTTTCCGTTTGCGGTAGGGCTCGTCAAGGAAAGAGCTTCATTCTTAATCAGCTTCTT
GGACGAAGTAATGGGTTTCAAGTAGCGTCAACACACAAGCCTTGTACCAAGGGGCTTTGG
TTGTGGAGTTCTCCTATCAAACGAACTGCTCTTGATGGATCTGAGTATAACCTTTTGCTC
TTAGATAGTGAAGGCATTGATGCTTATGACCAAACCGGTACCTATAGCACTTAGATATTC
TCGTTAGCTGTTCTTTTGTCGAGCATGTTCGTATACAATCAGATGGGTGGTATCGACGAA
GCTTCACTCGATCGCCTTTCTCTTGTCACTCAAATGACAAAGCATATCCGTGTGAAGGCG
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CTTAGGGACTTTTATTTGGACCTAGTGGAAGATAACCGCAAGATTACTCCGCGTGACTAT
TTAGAAATTGC

QA 1 791 1 791
DS 

RD RS1A222TR 755 0 0
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CTCGTTAGCTGTTCTTTTGTCGAGCATGTTCGTATACAATCAGATGGGTGGTATCGACGA
AGCTTCACTCGATCGCCTTTCTCTTGTCACTCAAATGACAAAGCATATCCGTGTGAAGGC
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TTTAGAAATTGCGTTAAGGCCGGTTCAAGGCGGTGGAGGAGATATTGCTGCTAAAAATGA
GATCCGAGATTCGATCCGTGCACTTTTTCCGGACAGAGAGTGTTTTCCCCTTGTAAGGCC
TCTCACCAATGAAAAGGACCTCCAGAGACTTGATCAAATTCCGTTGGAAGATTTGAGAGG
TGAGTTTGCTGCTGGCCTGGATGCTTTGACCAAGTTTGTTTTTGAGAAGACGAGGCCCAA
ACAGGTAGGGGGTACTGTGATGACCGGTCCTATACTTGCTGCTATTACACAGTCTTATCT
GGATGCGTTGAACAATGGTGCTGTGCCAACAATAACATCATCTTGGCAGAGTGTGGAAGA
AACCGAGTGTCGAAGAGCATATGATTCTGGTATGGAAGCTTACTTGGCTCCCTTTGACCA
ATCAAAAGCTCCTGAAGAAGGTGTACTGAGGGAAG

QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1A222JQ 675 0 0
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ACTTGGACAGTTTTCTCCCATCTTTGTCTGGCTCCTTAGGGACTTTTATTTGGACCTAGT
GGAAGATAACCGCAAGATTACTCCGCGTGACTATTTAGAAATTGCGTTAAGGCCGGTTCA
AGGCGGTGGAGGAGATATTGCTGCTAAAAATGAGATCCGAGATTCGATCCGTGCACTTTT
TCCGGACAGAGAGTGTTTTCCCCTTGTAAGGCCTCTCACCAATGAAAAGGACCTCCAGAG
ACTTGATCAAATTCCGTTGGAAGATTTGAGAGGTGAGTTTGCTGCTGGCCTGGATGCTTT
GACCAAGTTTGTTTTTGAGAAGACGAGGCCCAAACAGGTAGGGGGTACTGTGATGACCGG
TCCTATACTTGCTGCTATTACACAGTCTTATCTGGATGCGTTGAACAATGGTGCTGTGCC
AACAATAACATCATCTTGGCAGAGTGTGGAAGAAACCGAGTGTCGAAGAGCATATGATTC
TGGTATGGAAGCTTACTTGGCTGCCTTTGACCAATCAAAAGCTCCTGAAGAAGGTGTACT
GAGGGAAGAACATGAAGAAGCAGTTCGAAAAGCCTTGGCTATGTTTAACGCCAATGCTGC
AGGGGCTGGTATAGC

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 4

CO CL2998Contig1 456 4 4 U
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TATCATTATGGTCACAGTTCTTCTGTTCGGAGTAATAGCGATTGCTCAGAAAAGAGGACC
ACCGCGAAAAGAACCTCCTTGTAAGGAAGACTACTTTAAGAGAAACGGATCATGTAACAT
GGAAGATTGTAAGGCTGAATGTTCTAAAAAGAGGAATGGACTTGGTGCATGTGGGCGCAA
CTTTTGTTTTTGTTTCTATGAAAAGAATAAAAAAAATTCTTGCTTACCCTAATTTTTTAT
CTACATTGGAACTCAAATAATACTTATAATAATACACACCTTTATCAAAGGAAAAATAGT
AATATTATTATTTTTGTTAGTTTTTGTTGCATAATAAAATGTATAATGTTACAAATATAA
ATAATAAATATTAATTAGACGTTTGTCTTTTACCTG


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 

AF RS1CX94JQ C 1
AF RS1EL30JQ C 1
AF RS1EL30TF U 1
AF RS1CX94TF U 1
BS 1 173 RS1EL30TF
BS 174 174 RS1CX94TF
BS 175 451 RS1EL30TF
BS 452 456 RS1CX94JQ

RD RS1CX94JQ 456 0 0
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TATCATTATGGTCACAGTTCTTCTGTTCGGAGTAATAGCGATTGCTCAGAAAAGAGGACC
ACCGCGAAAAGAACCTCCTTGTAAGGAAGACTACTTTAAGAGAAACGGATCATGTAACAT
GGAAGATTGTAAGGCTGAATGTTCTAAAAAGAGGAATGGACTTGGTGCATGTGGGCGCAA
CTTTTGTTTTTGTTTCTATGAAAAGAATAAAAAAAATTCTTGCTTACCCTAATTTTTTAT
CTACATTGGAACTCAAATAATACTTATAATAATACACACCTTTATCAAAGGAAAAATAGT
AATATTATTATTTTTGTTAGTTTTTGTTGCATAATAAAATGTATAATGTTACAAATATAA
ATAATAAATATTAATTAGACGTTTGTCTTTTACCTG

QA 1 456 1 456
DS 

RD RS1EL30JQ 451 0 0
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TATCATTATGGTCACAGTTCTTCTGTTCGGAGTAATAGCGATTGCTCAGAAAAGAGGACC
ACCGCGAAAAGAACCTCCTTGTAAGGAAGACTACTTTAAGAGAAACGGATCATTTAACAT
GGAAGATTGTAAGGCTGAATGTTCTAAAAAGAGGAATGGACTTGGTGCATGTGGGCGCAA
CTTTTGTTTTTGTTTCTATGAAAAGAATAAAAAAAATTCTTGCTTACCCTAATTTTTTAT
CTACATTGGAACTCAAATAATACTTATAATAATACACACCTTTATCAAAGGAAAAATAGT
AATATTATTATTTTTGTTAGTTTTTGTTGCATAATAAAATGTATAATGTTACAAATATAA
ATAATAAATATTAATTAGACGTTTGTCTTTT

QA 1 451 1 451
DS 

RD RS1EL30TF 451 0 0
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TATCATTATGGTCACAGTTCTTCTGTTCGGAGTAATAGCGATTGCTCAGAAAAGAGGACC
ACCGCGAAAAGAACCTCCTTGTAAGGAAGACTACTTTAAGAGAAACGGATCATTTAACAT
GGAAGATTGTAAGGCTGAATGTTCTAAAAAGAGGAATGGACTTGGTGCATGTGGGCGCAA
CTTTTGTTTTTGTTTCTATGAAAAGAATAAAAAAAATTCTTGCTTACCCTAATTTTTTAT
CTACATTGGAACTCAAATAATACTTATAATAATACACACCTTTATCAAAGGAAAAATAGT
AATATTATTATTTTTGTTAGTTTTTGTTGCATAATAAAATGTATAATGTTACAAATATAA
ATAATAAATATTAATTAGACGTTTGTCTTTT

QA 1 451 1 451
DS 

RD RS1CX94TF 456 0 0
GGAAAACACATTTAGTTCATTATCTAAGATGAAAAATTCTTTTCAACCTTCGCTCATTGG
TATCATTATGGTCACAGTTCTTCTGTTCGGAGTAATAGCGATTGCTCAGAAAAGAGGACC
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GGAAGATTGTAAGGCTGAATGTTCTAAAAAGAGGAATGGACTTGGTGCATGTGGGCGCAA
CTTTTGTTTTTGTTTCTATGAAAAGAATAAAAAAAATTCTTGCTTACCCTAATTTTTTAT
CTACATTGGAACTCAAATAATACTTATAATAATACACACCTTTATCAAAGGAAAAATAGT
AATATTATTATTTTTGTTAGTTTTTGTTGCATAATAAAATGTATAATGTTACAAATATAA
ATAATAAATATTAATTAGACGTTTGTCTTTT
ACCTG

QA 1 451 1 451
DS 



AS 1 4

CO CL2999Contig1 862 4 10 U
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AGAGTTGCTGCTAGATGATGTTGGTTTTGGGACACATCTCTCAAGTAGCACCAAGGGAAA
GAGAAGTGAGAGGGACAGAGATGGGAAAGGGCAGGCTTCATCTAGAAGCGGGACCAATAA
GATAGGCCGGCCTTCCCTGTCCAACGTTAATGGTGAACGAAAACCAAAGCAGAAAACAAA
TCACATATCTTCTTCTTCAGTTAGGACCACCCCGGAGCTACCCAACGCTCCATTACCCGA
AGCAAACAGCGGGCATGATAATTTGGAGGAGGATACAGAGCCCATATTGGACTTCTCTCA
GCTACAAATACCAGATAACTTAGGAGGTCCGGAGTTTGATGGGCAACCAGGTGACATTAG
CTCCTGGTTTAACATGGATGATGACGAAGATTTCGATATAACGGAGCTTGGAGTACCAAT
GGATGATCTCTCAGGGCTGAATATAAAGTTATGAGGGTTACCTATCCCTCTTATCTATAT
ATGTATAGTCTTGGTTGGTTATACTAGTTAACAACAAAAGAAAGGGATTACAGACAGGTA
AAAGAAAAAAGTTTTGCTTCCTTGAAGGCTGGGGAATGGGTTTATTGGGGATTATTGTTA
GCTCCAGAAAAATTAGGTCATATATAGATTCTTTACTTCCTCATCTTCTTCTTAGGGTTC
TATGCTCTGATTTTCTCGGGTGAAACTCTTTACTCTCTTGATGGATGATTGTAGTTAAGC
TTCCGGCTGTAAAAAGCTTTTGTTGGGAAGAGTGATGTTGTAACGATATATACAAATATA
AATGGAGTCTTCTTCTTTGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1DH48TF U 1
AF RS1CP12TF U 169
AF RS1DH48JQ C 171
AF RS1CP12JQ C 173
BS 1 254 RS1DH48TF
BS 255 255 RS1CP12TF
BS 256 337 RS1DH48TF
BS 338 338 RS1CP12TF
BS 339 461 RS1DH48TF
BS 462 462 RS1CP12TF
BS 463 482 RS1DH48TF
BS 483 483 RS1CP12TF
BS 484 610 RS1DH48TF
BS 611 862 RS1CP12TF

RD RS1DH48TF 610 0 0
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AGAGTTGCTGCTAGATGATGTTGGTTTTGGGACACATCTCTCAAGTAGCACCAAGGGAAA
GAGAAGTGAGAGGGACAGAGATGGGAAAGGGCAGGCTTCATCTAGAAGCGGGACCAATAA
GATAGGCCGGCCTTCCCTGTCCAACGTTAATGGTGAACGAAAACCAAAGCAGAAAACAAA
TCACATATCTTCTT*TTCAGTTAGGACCACCCCGGAGCTACCCAACGCTCCATTACCCGA
AGCAAACAGCGGGCATGATAATTTGGAGGAGGATACAAAGCCCATATTGGACTTCTCTCA
GCTACAAATACCAGATAACTTAGGAGGTCCGGAGTTTGATGGGCAACCAGGTGACATTAG
CTCCTGGTTTAACATGGATGATGACGAAGATTTCGATATAATGGAGCTTGGAGTACCAAT
GGGTGATCTCTCAGGGCTGAATATAAAGTTATGAGGGTTACCTATCCCTCTTATCTATAT
ATGTATAGTCTTGGTTGGTTATACTAGTTAACAACAAAAGAAAGGGATTACAGACAGGTA
AAAGAAAAAA

QA 1 610 1 610
DS 

RD RS1CP12TF 694 0 0
GGGG
ACCAATAAGATAGGCCGGCCTTCCCTGTCCAACGTTAATGGTGAACGAAAACCAAAGCAG
AAAACAAATCACATATCTTCTTCTTCAGTTAGGACCACCCCGGAGCTACCCAACGCTCCA
TTGCCCGAAGCAAACAGCGGGCATGATAATTTGGAGGAGGATACAGAGCCCATATTGGAC
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GACATTAGCTCCTGGTTTAACATGGATGATGACGAAGATTTCGATATAACGGAGCTTGGA
GTACCAATGGATGATCTCTCAGGGCTGAATATAAAGTTATGAGGGTTACCTATCCCTCTT
ATCTATATATGTATAGTCTTGGTTGGTTATACTAGTTAACAACAAAAGAAAGGGATTACA
GACAGGTAAAAGAAAAAAGTTTTGCTTCCTTGAAGGCTGGGGAATGGGTTTATTGGGGAT
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TAGGGTTCTATGCTCTGATTTTCTCGGGTGAAACTCTTTACTCTCTTGATGGATGATTGT
AGTTAAGCTTCCGGCTGTAAAAAGCTTTTGTTGGGAAGAGTGATGTTGTAACGATATATA
CAAATATAAATGGAGTCTTCTTCTTTGATC

QA 5 694 5 694
DS 

RD RS1DH48JQ 692 0 0
GG
ACCAATAAGATAGGCCGGCCTTCCCTGTCCAACGTTAATGGTGAACGAAAACCAAAGCAG
AAACCAAATCACATATTTTCTT*TTCAGTTAGGACCACCCCGGAGCTACCCAACGCTCCA
TTACCCGAAGCAAACAGCGGGCATGATAATTTGGAGGAGGATACAGAGCCCATATTGGAC
TTCTCTCAGCTACAAATACCAGATAACTTAGGAGGTCCGGAGTTTGATGGGCAACCAGGT
GACATTAGCTCTTGGTTTAACATGGATGATGACGAAGATTTCGATATAATGGAGCTTGGA
GTACCAATGGGTGATCTCTCAGGGCTGAATATAAAGTTATGAGGGTTACCTATCCCTCTT
ATCTATATATGTATAGTCTTGGTTGGTTATACTAGTTAACAACAAAAGAAAGGGATTACA
GACAGGTAAAAGAAAAAAGTTTTGCTTCCTTGAAGGCTGGGGAATGGGTTTATTGGGGAT
TATTGTTAGCTCCAGAAAAATTAGGTCATATATAGATTCTTTACTTCCTCATCTTCTTCT
TAGGGTTCTATGCTCTGATTTTCTCGGGTGAAACTCTTTACTCTCTTGAGGGATGATTGT
AGTTAAGCTTCCGGCTGTAAAAAGCCTTTGTTGGGAAGAGTGATGTTGTAACGATATATA
CAAATATAAATGGAGTCTTCTTCTTTGATC

QA 3 692 3 692
DS 

RD RS1CP12JQ 690 0 0
ACCAATAAGATAGGCCGGCCTTCCCTGTCCAACGTTAATGGTGAACGAAAACCAAAGCAG
AAAACAAATCACATATCTTCTTCTTCAGTTAGGACCACCCCGGAGCTACCCAACGCTCCA
TTGCCCGAAGCAAACAGCGGGCATGATAATTTGGAGGAGGATACAGAGCCCATATTGGAC
TTCTCTCAGCTACAAATACCAGATAACTTAGGAGGTCCGGAGTTTGATGGGCAACCAGGT
GACATTAGCTCCTGGTTTAACATGGATGATGACGAAGATTTCGATATAACGGAGCTTGGA
GTACCAATGGATGATCTCTCAGGGCTGAATATAAAGTTATGAGGGTTACCTATCCCTCTT
ATCTATATATGTATAGTCTTGGTTGGTTATACTAGTTAACAACAAAAGAAAGGGATTACA
GACAGGTAAAAGAAAAAAGTTTTGCTTCCTTGAAGGCTGGGGAATGGGTTTATTGGGGAT
TATTGTTAGCTCCAGAAAAATTAGGTCATATATAGATTCTTTACTTCCTCATCTTCTTCT
TAGGGTTCTATGCTCTGATTTTCTCGGGTGAAACTCTTTACTCTCTTGATGGATGATTGT
AGTTAAGCTTCCGGCTGTAAAAAGCTTTTGTTGGGAAGAGTGATGTTGTAACGATATATA
CAAATATAAATGGAGTCTTCTTCTTTGATC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 4

CO CL3000Contig1 814 4 3 U
CTTTTAAGGCGAATCATAAACCAGCATCCTCATATGCTCCTTTCAGAAGATAAACAAAAG
ATTCATCACTCAAAACACTCACTCCCCTAAAGATCTTTTGTCGCCAACTCAAAATGCAAA
ACAACAAGAAATTAAAGGGAGAGCCTAGTTTCAAAAACATTTCAAACTAATATAGCAAAA
CAAGACAAAGAAAAAGAAAGAACAAGATTACGTTGGTGAGAGAGCAAAATTTTCTAATCA
GGAAGAATTTGCTCGTTGTCTGCATCTCCTTCGGTCTCAATGGTAGGCTTTGAAGGTCCA
CCAGCTCCAGGAGCTTGCTGCTTCTTGATACCACTCACTATATCATCAATCCTCAGAAGC
ATACACGCCGCTTCTATAGCTGTCTTAAACGTTTGCGCCTTCACATTGTAAGCATCCCAT
ATCTTGCTCTCTTTCATGTCAGCTATCGCACCAGTGTTTCCATCGATTCCAGTCCAAGCA
TTCTCACCATTTGCATGCTTTCCTTGCAATGCTGTCATAGTTCTGATCACGTTAACTCCA
CAGTTCTGAGCTAATGTACGTGGAATAGCTTCAAAAGCTATAGAAGCTGCTTCATAAGGC
CACTTCTCAATTCCTTCAATTGTTGCACTCTTCTGTTTCAAAGTGGCAGAAACGGTCAAC
TCAGTGGCTCCACCACCAGGAACAAGCTTCGGGTTCTTGATGATGTTTCTCGAAACAGAC
ATGGCATCCTGAAGATTCCTCTCCACTTCATTGAGAAGATCTTTACTTGGTCCTCTTAAA
GCACAGTACATGCTTTGGGCTCTTTGCATCAACA


BQ
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C

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DS 



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AAGTGAATGGAAAGCTTGTGGCTTTAGGGTTACCAGAGAAACCACTCCAGCTACCAATCT
TCCCTCTTGTTCTCGGAAGGAAAATGGTGGGAGGGAGTCAGATTGGAGGAATGAAAGAGA
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ATAAAAAAAAGAATAAGCAAATAT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FW54TF U 1
AF RS1CF33TF U 12
AF RS1FW54JQ C 516
AF RS1CF33JQ C 536
BS 1 124 RS1FW54TF
BS 125 125 RS1CF33TF
BS 126 130 RS1FW54TF
BS 131 131 RS1CF33TF
BS 132 180 RS1FW54TF
BS 181 181 RS1CF33TF
BS 182 582 RS1FW54TF
BS 583 583 RS1CF33TF
BS 584 595 RS1FW54TF
BS 596 679 RS1CF33TF
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BS 681 740 RS1CF33TF
BS 741 1203 RS1FW54JQ
BS 1204 1204 RS1CF33JQ
BS 1205 1284 RS1FW54JQ

RD RS1FW54TF 595 0 0
GGAACAACAAATCTCATAGTCACAGAGATACGAGAAATAATATGGCGAAATCTCAAGATC
AAAACAAAGCATTTGGTTGGGCGGCTAACGACAAATCTGGTGTACTCTCTCCATTTCATT
TCTCTAGAAGGGAGAATGGTGAGAACGATGTAACAGTGAAGATATTGTTTTGTGGTGTTT
GCCACTCTGATCTTCATACTATCAAGAACGATTGGGGATTCTCTCATTACCCCATCATTC
CCGGGCATGAAATCGTCGGAATAGCCACAAAAGTTGGCAAGAACGTAACAAAGTTCAAAG
AAGGAGACCGAGTAGGAGTAGGAGTAATAATCGGCTCATGCCAATCATGTGAATCATGTA
ACCAAGACTTAGAAAACTACTGTCCTCAGCTCGTATACACATACAACTCTCGTTCCTCTG
ACGGAACAAGAAACCAAGGTGGTTACTCCGACAAAATCGTTGTCGATCAACGCTTTGTCC
TAAGCTTTCCCGATGGTTTACCCAGTGATTCAGGCGCGCCGCTGCTCTGTGCTGGGATCA
CTGTGTATAGTCCAATGAAATATTACGGTATGACTGAAGAGAGAGGGAAACATTT

QA 1 595 1 595
DS 

RD RS1CF33TF 742 0 0
GGATAGTCACAG
AGAGATACGAGAAATAATATGGCGAAATCTCAAGATCAAAACAAAGCATTTGGTTGGGCG
GCTAACGACAAATCTGGTGTACTCTCTCCATTTCATTTCTCCAGAAGAGAGAATGGTGAG
AACGATGTAACAGTGAAGATATTGTTTTGTGGTGTTTACCACTCTGATCTTCATACTATC
AAGAACGATTGGGGATTCTCTCCTTACCCCATCATTCCCGGGCATGAAATCGTCGGAATA
GCCACAGAAGTTGGCAAGAACGTAACAAAGTTCAAAGAAGGAGACCGAGTAGGAGTAGGA
GTAATAATCGGCTCATGCCAATCATGTGAATCATGTAACCAAGACTTAGAAAACTACTGT
CCTCAGCTCGTATACACATACAACTCTCGTTCCTCTGACGGAACAAGAAACCAAGGTGGT
TACTCCGACAAAATCGTTGTCGATCAACGCTTTGTCCTAAGCTTTCCCGATGGTTTACCC
AGTGATTCAGGCGCGCCGCTGCTCTGTGCTGGGATCACTGTGTATAGTCCAATGAAATAT
TACGGTATGACTGAAGAGAAAGGGAAACATTTAGGTGTAAGTGGACTTGGTGGGCTTGGT
CATATCGCAGTGAAGATTGGTAAAGCCTTTGGTTTAAAAGTTACCGTGATTAGTAG*TCA
TCTGAGAAAGAGAGTGAAGCAATTGATAGACTCGGTGCTGACTCGTTTCTCGTCACA
CGGATCTCAAAGA

QA 13 729 13 729
DS 

RD RS1FW54JQ 769 0 0
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GAAGAGAGAGGGAAACATTTAGGTGTAAGTGGACTTGGTGGGCTTGGTCATATCGCAGTG
AAGATTGGTAAAGCCTTTGGTTTAAAAGTTACCGTGATTAGTAGGTCATCTGAGAAAGAG
AGTGAAGCAATTGATAGACTCGGTGCTGACTCGTTTCTCGTCACAACGGATTCTCAAAAG
ATGAAGGACGCAATTGGAACTATGGATTTCGTGTTGGACACTGTATCAGCAGAACATTCT
CTGTTACCCTTGTTCAGTTTGCTTAAAGTGAATGGAAAGCTTGTGGCTTTAGGGTTACCA
GAGAAACCACTCCAGCTACCAATCTTCCCTCTTGTTCTCGGAAGGAAAATGGTGGGAGGG
AGTCAGATTGGAGGAATGAAAGAGACACAAGAGATGCTTGACTTCTGTGCCAAGCATAAT
ATCGATGCGGATATTGAGCTCATCAAGATGAGTGATATCAACTCGGCAATGGACCGCTTG
GCTAAATCTGATGTCAGGTACCGGTTCGTGATCGATGTGGCCAACTCCATCAATTCTGCT
TGAGTCATTAGCTGAGACTAATGAACGTGTCGACCATTAGGTCTCCGTTTAAAGTCTGCT
GTGATGTTTTTTTTTTTCTGCTTTCAAT*CTATTTTCTCGTCTTACATCTATGGTGTAAT
AAATAAAGCAAATATTTCAGTTACAATAAAAAAAAGAATAAGCAAATAT

QA 1 769 1 769
DS 

RD RS1CF33JQ 737 0 0
GATCACTGTGTATAGTCCAATGAAATATTACGGTATGACTGAAGAGAAAGGGAAACATTT
AGGTGTAAGTGGACTTGGTGGGCTTGGTCATATCGCAGTGAAGATTGGTAAAGCCTTTGG
TTTAAAAGTTACCGTGATTAGTAGGTCATCTGAGAAAGAGAGTGAAGCAATTGATAGACT
CGGTGCTGACTCGTTTCTCGTCACAACGGATTCTCAAAAGATGAAGGACGCAATTGGAAT
TATGGATTTCGTGTTGGACACTGTATCAGCAGAACATTCTCTGTTACCCTTGTTCGGTTT
GCTTAAAGTGAATGGAAAGCTTGTGGCTTTAGGGTTACCAGAGAAACCACTCCAGCTACC
AATCTTCCCTCTTGTTCTCGGAAGGAAAATGGTGGGAGGGAGTCAGATTGGAGGAATGAA
AGAGACACAAGAGATGCTTGACTTCTGTGCCAAGCATAATATCGTTGCGGATATTGAGCT
CATCAAGATGAGTGATATCAACTCGGCAATGGACCGCTTGGCTAAATCTGATGTCAGGTA
CCGGTTCGTGATCGATGTGGCCAACTCCATCAATTCTGCTTGAGTCATTAGCTGAGACTA
ATGAACGTGTCGACCATTAGGTCTCCGTTTAAAGTCTGCTGTGATGTTTTTTTT***CTG
CTTTCAATTCTATTTTCTCGTCTTACATCTATGTTGTAATAAATAAAGCAAATATTTCAG
TTACAATAAAAAAAAGA

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 4

CO CL3002Contig1 1025 4 11 U
ATTACGGCCGGGGATAAATCTCTTTTTAATAGATATTCTCTTCTCACTTGATATTTTCTT
CTTCTCAGATTCCGAAGATTACGACGATGAATTCGAACGGAAAATCAATTGGTTCCGGCG
ATCTCAACTCAAAGAAATTAAACGTGAAGACCGATGTCTCATCCACTGATCGTACCGGCC
AATCCTCTGCTCTACTAATCAATCAAAGAGGGGAAAAAAAGTGTCTCTTCCTCCAAAGCT
GTCTCTATGTCGAAGAAACTAAAGGACAAATATTATGATTGAATTAAATTGGGGCTGTTT
TCACTAAAGAAGAAGATCAAAGATGTTGTTCTCAAGGCAGAGATGTTAGCACCAGATGCT
CTTGAGCTCGAAGAAGAGCAGTGGATTAAGCAAGAAGAGACATT*GCGTTACTGCGACTT
ATTGGATGATCCAACCAAATCTGACGAGATTTTCTCAAGTTAGCTGCTCGTGCCAAAGCA
GTTGATACTCTCAAAGATTTGAAGTACAAGGTTTACTCCAAG*GCTTCGAATAATCTCAA
AGCTTTAGAGAAAGCGAAGCTTGCGGCAGAACTTAAGGCAAAACAGGGCAAAGATGTCGC
TAAGAAGAGAACGAAGAAGATTTCACAACGGGATGCATATGAAGAGCATCCC*GAGGATT
TTATGGACCCTGAGACTCC*TATTGG*TGAGAGGAAACAACTCTCTTTACAGATGGCTAA
GCAATACAGTCCTGCTGCCGTAGACAGAGCGTGGTACGCTTGGT**GGGAGAAAGCTGGT
TTCTTTACTGTGGATGCTAAGAGTTCCAAGCCAGCGTTTGTTATTGTTCTTCCTCCTCCA
AATGTGACTGGACTCTTGCATATTGGCCATGCCTTAACAACTGCAATCCAGGTTTCGTTA
ATACAGTTGTTTTTTTTTTTTTTTGCCCTTCGTTTTTTCACGTCAGAAATGGATGCCAAA
AAGAAAATTTTACACTTCATGTTATTGGTCTCTGATTTCATATATGTATATATATGCTTT
TTAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1A378TV U 1
AF RS1A378TF U 338
AF RS1A378JQ C 203
AF RS1A378TR C 320
BS 1 580 RS1A378TV
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BS 767 828 RS1A378TF
BS 829 1025 RS1A378JQ

RD RS1A378TV 580 0 0
ATTACGGCCGGGGATAAATCTCTTTTTAATAGATATTCTCTTCTCACTTGATATTTTCTT
CTTCTCAGATTCCGAAGATTACGACGATGAATTCGAACGGAAAATCAATTGGTTCCGGCG
ATCTCAACTCAAAGAAATTAAACGTGAAGACCGATGTCTCATCCACTGATCGTACCGGCC
AATCCTCTGCTCTACTAATCAATCAAAGAGGGGAAAAAAAGTGTCTCTTCCTCCAAAGCT
GTCTCTATGTCGAAGAAACTAAAGGACAAATATTATGATTGAATTAAATTGGGGCTGTTT
TCACTAAAGAAGAAGATCAAAGATGTTGTTCTCAAGGCAGAGATGTTAGCACCAGATGCT
CTTGAGCTCGAAGAAGAGCAGTGGATTAAGCAAGAAGAGACATT*GCGTTACTGCGACTT
ATTGGATGATCCAACCAAATCTGACGAGATTTTCTCAAGTTAGCTGCTCGTGCCAAAGCA
GTTGATACTCTCAAAGATTTGAAGTACAAGGTTTACTCCAAG*GCTTCGAATAATCTCAA
AGCTTTAGAGAAAGCGAAGCTTGCGGCAGAACTTAAGGCA

QA 1 580 1 580
DS 

RD RS1A378TF 491 0 0
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AGTTAGCTGCTCGTGCCAAAGCAGTTGATACTCTCAAAGATTTGAAGTACAAGGTTTACT
CCAAGAGCTTCGAATAATCTCAAAGCTTTAGAGAAAGCGAAGCTTGCGGCAGAACTTAAG
GCAAAACAGGGCAAAGATGTCGCTAAGAAGAGAACGAAGAAGATTTCACAACGGGATGCA
TATGAAGAGCATCCCCGAGGATTTTATGGACCCTGAGACTCCCTATTGGGTGAGAGGAAA
CAACTCTCTTTACAGATGGCTAAGCAATACAGTCCTGCTGCCGTAGACAGAGCGTGGTAC
GCTTGGGTGGGGAGAAAGCTGGTTTCTTTACTGTGGATGCTAAGAGTTCCAAGCCAGCGT
TTGTTATTGTT

QA 1 491 1 491
DS 

RD RS1A378JQ 823 0 0
TCAAAGAGGGGAAAAAAAGTGTCTCTTCCTCCAAAGCTGTCTCTATGTCGAAGAAACTAA
AGGACAAATATTATGATTGAATTAAATTGGGGCTGTTTTCACTAAAGAAGAAGATCAAAG
ATGTTGTTCTCAAGGCAGAGATGTTAGCACCAGATGCTCTTGAGCTCGAAGAAGAGCAGT
GGATTAAGCAAGAAGAGACATT*GCGTTACTGCGACTTATTGGATGATCCAACCAAATCT
GACGAGATTTTCTCAAGTTAGCTGCTCGTGCCAAAGCAGTTGATACTCTCAAAGATTTGA
AGTACAAGGTTTACTCCAAG*GCTTCGAATAATCTCAAAGCTTTAGAGAAAGCGAAGCTT
GCGGCAGAACTTAAGGCAAAACAGGGCAAAGATGTCGCTAAGAAGAGAACGAAGAAGATT
TCACAACGGGATGCATATGAAGAGCATCCC*GAGGATTTTATGGACCCTGAGACTCC*TA
TTGG*TGAGAGGAAACAACTCTCTTTACAGATGGCTAAGCAATACAGTCCTGCTGCCGTA
GACAGAGCGTGGTACGCTTGGT**GGGAGAAAGCTGGTTTCTTTACTGTGGATGCTAAGA
GTTCCAAGCCAGCGTTTGTTATTGTTCTTCCTCCTCCAAATGTGACTGGACTCTTGCATA
TTGGCCATGCCTTAACAACTGCAATCCAGGTTTCGTTAATACAGTTGTTTTTTTTTTTTT
TTGCCCTTCGTTTTTTCACGTCAGAAATGGATGCCAAAAAGAAAATTTTACACTTCATGT
TATTGGTCTCTGATTTCATATATGTATATATATGCTTTTTAGG

QA 1 823 1 823
DS 

RD RS1A378TR 706 0 0
AAGATGTTGTTCTCAAGGCAGAGATGTTAGCACCAGATGCTCTTGAGCTCGAAGAAGAGC
AGTGGATTAAGCAAGAAGAGACATT*GCGTTACTGCGACTTATTGGATGATCCAACCAAA
TCTGACGAGATTTTCTCAAGTTAGCTGCTCGTGCCAAAGCAGTTGATACTCTCAAAGATT
TGAAGTACAAGGTTTACTCCAAG*GCTTCGAATAATCTCAAAGCTTTAGAGAAAGCGAAG
CTTGCGGCAGAACTTAAGGCAAAACAGGGCAAAGATGTCGCTAAGAAGAGAACGAAGAAG
ATTTCACAACGGGATGCATATGAAGAGCATCCC*GAGGATTTTATGGACCCTGAGACTCC
*TATTGG*TGAGAGGAAACAACTCTCTTTACAGATGGCTAAGCAATACAGTCCTGCTGCC
GTAGACAGAGCGTGGTACGCTTGGT**GGGAGAAAGCTGGTTTCTTTACTGTGGATGCTA
AGAGTTCCAAGCCAGCGTTTGTTATTGTTCTTCCTCCTCCAAATGTGACTGGACTCTTGC
ATATTGGCCATGCCTTAACAACTGCAATCCAGGTTTCGTTAATACAGTTGTTTTTTTTTT
TTTTTGCCCTTCGTTTTTTCACGTCAGAAATGGATGCCAAAAAGAAAATTTTACACTTCA
TGTTATTGGTCTCTGATTTCATATATGTATATATATGCTTTTTAGG

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 4

CO CL3003Contig1 854 4 18 U
TTTTGAAAATGTATATGCTTTCTTATGGTTGGTCAATGAAAAAGATTAAAACATAAGTTC
ATCTACTCTCATACAACGAAATGGTCAGTGATCGATTAATCTGTTATAATAATAACTTAT
TGAAATAAGAATAGATCTTGTTGGAAGTGTGACACGAATGATGGTAACACGTGAACAGAA
ACGGAAAACCAGGAATTTCTTACATCCTGACTTCTATGCTCTTCTCTAGCAAGTGCTCTT
TCACAGATTGGATGGGTACCTCTTTCCGGTAGAAAATTCCGGCAGCAAGCGCAGCAGATG
CATTTGTCGTCTCAAACACCTCAGAAAAGTGCTCAGGAGTGCCTGCTCCACTGCTTGCGA
TAACCGGTATGCCCACTAGATCAGAGATGAGCTTTACCAAGTCTGTGTCAAATCCTTTCC
CTTGACCATCACAGTCTATGCAGTTCAGTAGAATTTCACCAGCACCTAACTCTTCCACCG
CTTTTGCAAACTCATACGCTCCAATAGGCCGACCTTCTCGTCCTCCACTTACCGTGAACT
GGTACCATGCATATTCTTCCCCATTCGGACCTGGGTTAGTTACTCTGATGACTTTGTATG
GCACATCCTCAGGATGGTTCACATAAACTCTACGAGGATCGATACTTACAACCACTGCCT
GATTTCCATAAACTCTGGATATTTGTTCTAAACTACTCTTTCCTGTCTTCACCCCTGATT
TAATAAACTCTTCCGCAGCATAAACAGCGTCGCTTCCTATGGAGATCTTATCAGCACCGG
ATCTGAAATACTCAGCAGCAACTTCCAGACTCGAATAGTATCTGCCGGTAGCGTCTGTAA
ATCTCTAATACCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F466TF C 1
AF RS1H467TF C 134
AF RS1H467JQB U 83
AF RS1F206JQ U 46
BS 1 46 RS1F466TF
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BS 297 297 RS1H467JQB
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BS 490 490 RS1H467JQB
BS 491 507 RS1F206JQ
BS 508 508 RS1H467JQB
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BS 537 537 RS1H467JQB
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BS 545 545 RS1H467JQB
BS 546 854 RS1F206JQ

RD RS1F466TF 597 0 0
TTTTGAAAATGTATATGCTTTCTTATGGTTGGTCAATGAAAAAGATTAAAACATAAGTTC
ATCTACTCTCATACAACGAAATGGTCAGTGATCGATTAATCTGTTATAATAATAACTTAT
TGAAATAAGAATAGATCTTGTTGGAAGTGTGACACGAATGATGGTAACACGTGAACAGAA
ACGGAAAACCAGGAATTTCTTACATCCTGACTTCTATGCTCTTCTCTAGCAAGTGCTCTT
TCACAGATTGGATGGGTACCTCTTTCCGGTGGAAAATTCCGGCAGCAAGCGCAGCAGATG
CGTTTGTCGTCTCAAACACCTCAGAAAAGTGCTCAGGAGTGCCTGCTCCACTGCTTGCGA
TAACCGGTATGCCCACTAGATCAGAGATGAGCTTTACCAAGTCTGTGTCAAATCCTTTCC
CTTGACCATCACAGTCTATGCAGTTCAGTAGAATTTCACCAGCACCTAACTCTTCCACCG
CTTTTGCAAGCTCATACGCTCCAATAGGCCGACCTTCTCGTCCTCCACTTACCGTGCACT
GGTACCATGCATATTCTTCCCCATTCGGACCTGGGTTAGTTACTCTGATGACTTTG
C

QA 1 596 1 596
DS 

RD RS1H467TF 690 0 0
TAGATCTG
TGGAAGTGTGACACGAATGATGGTAACACGTGAACAGAAACGGAAAACCAGGAATTTCTT
ACATC*TGACTTCTATGCTCTTCTCTAGCAAGTGCTCTTTCACAGATTGGATGGGTACCT
CTTTCCGGTAGAAAATTCCGGCAGTAAGCGCAGCAGATGCATTTGTCGTCTCAAACACCT
CAGAAAAGTGCTCAGGAGTGCCTGCTCCACTGCTTGCGATAACCGGTATGCCCACTAGAT
CAGAGATGAGCTTTACCAAGTCTGTGTCAAATCCTTTCCCTTGACCATCACAGTCTATGC
AGTTCAGTAGAATTTCACCAGCACCTAACTCTTCCACCGCTTTTGCAAACTCATACGCTC
CAATAGGCCGACCTTCTCGTCCTCCACTTACCGTGAACTGGTACCATGCATATTCTTCCC
CATTCGGACCTGGGTTAGTTACTCTGATGACTTTGTATGGCACATCCTCAGGATGGTTCA
CATAAACTCTACGAGGATCGATACTTACAACCACTGCCTGATTTCCATAAACTCTGGATA
TTTGTTCTAAACTACTCTTTCCTGTCTTCACCCCTGATTTAATAAACTCTTCCGCAGCAT
AAACAGCGTCGCTTCCTATGGAGATCTTATCAGCACCGGATCTGAAATACTCAGCAGCAA
CTTCCAGACTCGAATA
GTATCC

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DS 

RD RS1H467JQB 735 0 0
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GGAAGTGTGACACGAATGATGGTAACACGTGAACAGAAACGGAAAACCAGGAATTTCTTA
CATCCTGACTTCTATGCTCTTCTCTAGCAAGTGCTCTTTCACAGATTGGATGGGTACCTC
TTTCCGGTAGAAAATTCCGGCAGTAAGCGCAGCAGATGCATTTGTCGTCTCAAACACCTC
AGAAAAGTGCTCAGGAGTGCCTGCTCCACTGCTTGCGATAACCGGTATGCCCACTAGATC
AGAGATGAGCTTTACCAAGTCTGTGTCAAATCCTTTCCCTTGACCATCACAGTCTATGCA
GTTCAGTAGAATTTCACCAGCACCTAACTCTTCCACCGCTTTTGCAAACTCATACGCTCC
AATAGGCCGACCTTCTCGTCCTCCACTTACCGTGAACTGGTACCATGCATATTCTTCCCC
ATTCGGACCTGGGTTAGTTACTCTGATGACTTTGTATGGCACATCCTCAGGATGGTTCAC
ATAAACTCTACGAGGATCGATACTTACAACCACTGCCTGATTTCCATAAACTCTGGATAT
TTGTTCTAAACTACTCTTTCCTGTCTTCACCCCTGATTTAATAAACTCTTCCGCAGCATA
AACAGCGTCGCTTCCTATGGAGATCTTATCAGCACCGGATCTGAAATACTCAGCAGCAAC
TTCCAGACTCGAATA

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DS 

RD RS1F206JQ 809 0 0
A
TAAAACATAAGTTCATCTACTCTCATACAACGAAATGGTCAGTGATCGATTAATCTGTTA
TAATAATAACTTATTGGAATAAGAATAGATCTTGTTGGAAGTGTGACACGAATGATGGTA
ACACGTGAACAGAAACGGAAAACCAGGAATTTCTTACATCCTGACTTCTATGCTCTTCTC
TAGCAAGTGCTCTTTCACAGATTGGATGGGTACCTCTTTCCGGTGGAAAATTCCGGCAGC
AAGCGCAGCAAATGCATTTGTCGTCTCAAACACCTCAAAAAAGTGCTCAGGAGTGCCTGC
TCCACTGCTTGCGATAACCGGTATGCCCACTAGATCAGAGATGAGCTTTACCAAGTCTGT
GTCAAATCCTTTCCCTTGACCATCACAGTCTATGCAGTTCAGTAGAATTTCACCAGCACC
TAACTCTTCCACCGCTTTTGCAAGCTCATACGCTCCAATAGACCGACCTTCTCGTCCTCC
ACTTACCGTGCACTGGTAACATGCATATTCTTCCCCATTCGGACCTGGGTTAGTTACTCT
GATGACTTTGTATGGCACATCCTCAGGATGGTTCACATAAACTCTACGAGGATCGATACT
TACAACCACTGCCTGATTTCCATAAACTCTGGATATTTGTTCTAAACTACTCTTTCCTGT
CTTCACCCCTGATTTAATAAACTCTTCCGCAGCATAAACAGCGTCGCTTCCTATGGAGAT
CTTATCAGCACCGGATCTGAAATACTCAGCAGCAACTTCCAGACTCGAATAGTATCTGCC
GGTAGCGTCTGTAAATCTCTAATACCAC

QA 2 809 2 809
DS 



AS 2 4

CO CL3004Contig1 684 2 9 U
GGTCGTGAACTCGAATCTAAACTTTTCTTCGATTATCAATCAATCACCCATGGAAGGAGA
GGAGATGCTTGATTGGGAGCTCGTTCACGGCTCCGACACCGATTCGATCACATCGGAGAT
GGAATCAAGTGTAATCGATGACGGTATGATCGTCTCTGATCATTTCTCTGCCGATCAAAG
CATAGGATCTGGTGATTCTTCTCGGGTCGATTACGGGTCGGAGTATCCGAATCCGGCGGG
TTTGGGTTTCGATCGGCTGGATGTTTATAAATCGGGTGATGATGCTGGTGTCGGAAACGA
ATTAGGGTTTATCGACGGTGAGGGCATGTCCGAAACAGACAATCTCCAAGTCGAGATCCA
AGATGGTGTCGAGGATGCAAGCAAGTGCTTGTCGGAAACGGACAAACTCCAAGTCGAGAG
CCAAGCTTGTGTTGAAGAACATATCGAGGATGCAAGCAAGTGTTTGTCCGAAACAGACGA
TCTTCAAGTTGAGAGCCAAGCTGGCGTTGAAGAACATGTCGAGGATTTGTCCGAAACTGA
CCATCTCCAAGCTGGTGTTGAAGAACATATTGAGGATGCGAGCAAATGTTTGTCTGAGAC
AGAGGGCAAGGAACTGGAGTCTGGGAATGTGAGTGGTGAAGAGGAGATTGTTTCTGATAG
GGAAGCAGTTGAGGGAGTGGAGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CZ23TF U 1
AF RS1F123TF U 5
BS 1 169 RS1CZ23TF
BS 170 170 RS1F123TF
BS 171 256 RS1CZ23TF
BS 257 257 RS1F123TF
BS 258 315 RS1CZ23TF
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BS 388 388 RS1F123TF
BS 389 684 RS1CZ23TF

RD RS1CZ23TF 684 0 0
GGTCGTGAACTCGAATCTAAACTTTTCTTCGATTATCAATCAATCACCCATGGAAGGAGA
GGAGATGCTTGATTGGGAGCTCGTTCACGGCTCCGACACCGATTCGATCACATCGGAGAT
GGAATCAAGTGTAATCGATGACGGTATGATCGTCTCTGATCATTTCTCTTCCGATCAAAG
CATAGGATCTGGTGATTCTTCTCGGGTCGATTACGGGTCGGAGTATCCGAATCCGGCGGG
TTTGGGTTTCGATCGGTTGGATGTTTATAAATCGGGTGATGATGCTGGTGTCGGAAACGA
ATTAGGGTTTATCGATGGTGAGGGCATGTCCGAAACAGACAATCTCCAAGTCGAGATCCA
AGATGGTGTCGAGGATGCAAGCAAGTGTTTGTCGGAAACGGACAAACTCCAAGTCGAGAG
CCAAGCTTGTGTTGAAGAACATATCGAGGATGCAAGCAAGTGTTTGTCCGAAACAGACGA
TCTTCAAGTTGAGAGCCAAGCTGGCGTTGAAGAACATGTCGAGGATTTGTCCGAAACTGA
CCATCTCCAAGCTGGTGTTGAAGAACATATTGAGGATGCGAGCAAATGTTTGTCTGAGAC
AGAGGGCAAGGAACTGGAGTCTGGGAATGTGAGTGGTGAAGAGGAGATTGTTTCTGATAG
GGAAGCAGTTGAGGGAGTGGAGGA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1F123TF 676 0 0
GG
GAACTCGAATCTAAACTTTTCTTCGATTATCAATCAATCACCCATGGAAGGAGAGGAGAT
GCTTGATTGGGAGCTCGTTCACGGCTCCGACACCGATTCGATCACAT*GGAGATGGAATC
AAGTGTAATCGATGACGGTATGATCGTCTCTGATCATTTCTCTGCCGATCAAAGCATAGG
ATCTGGTGATTCTTCTCGGGTCGATTACGGGTCGGAGTATCCGAATCCGGCGGGTTTGGG
TTTCGATCGGCTGGATGTTTATAAATCGGGTGATGATGCTGGTGTCGGAAACGAATTAGG
GTTTATCGACGGTGAGGGCATGTCCGAAACAGACAATCTCCAAGTCGAGATCCAAGATGG
TGTCGAGGATGCAAGCAAGTGCTTGTCGGAAACGGACAAACTCCAAGTCGAGAGCCAAGC
TTGTGTTGAAGAACATATCGAGGATGCAAGCAAGTGTTTGTCCGAAACAGACGATCTTCA
AGTTGAGAGCCAAGCTGGCGTTGAAGAACATGTCGAGGATTTGTCCGAAACTGACCATCT
CCAAGCTGGTGTTGAAGAACATATTGAGGATGCGAGCAAATGTTTGTCTGAGACAGAGGG
CAAGGAACTGGAGTCTGGGAATGTGAGTGGTGAAGAGGAGATTGTTTCTGATAGGGAAGC
AGTTGAGGGA
AGTG

QA 3 672 3 672
DS 



CO CL3004Contig2 1056 2 10 U
GGTGAACTACTACTATGCATAGGTTGATAGGAACATCACAAACACCATATTCTTTTAGTA
CATAACATGATGAGCCACTGTACACACACAAGTACGTGCTCTCTACTCTGGTACATAACG
TTATGAGACATAGTATAACCGGCTTCTCTCACCTAAGGCTCAAAACCGGCCATGCACCAG
GGGATGGCAGAGCAGGGCGGATCACTGGGACCCTTCTTACCTCTGTGAATGCTTCATTGA
GTCGAGCTGCCTGACTCATCACCCTCGAAACCTTCTTCTCGTCGATTGCAACTTTGAGAT
GGAACCTTTCAGCTTTCTTTTTCATATGATAGAGTCTGCGTCCCAAGAGAACAAAACCCA
TCACAGCTGCAGCCATGGAGAGAGACCAAACAGGACCAATCCTAAGTGCATAGTACTTGA
CAAGAACAAACGGCATCTTCCACCACACAGTCTCTCTACTTTTACTCTCATCACCAGACC
TCACAGCCACCACATCCCCTCCTCCACTTCCCTCAACTGCTTCCCTATCAGAAACAATCT
CCTCTTCACCACTCACATTCCCAGAATCCACTTCCTTGCCCTCTGTCTCAGACAAACATT
TGCTCGCATCCTCAATATGTTCTTCAACACAATCTTGGCTCTCGACTTGGAGTTTGTTCG
TTTCCGACAAACCCTCGACATGTTCTTCAACACCAGCTTGGATCTCGACTTGGAGATTGT
CTGTTTCGGACATGCCCTCACCATCGATAAACCCTAATTCGTTTCCGACACCAGCATCAT
CACCCGATCTATAAACATCCAACCGATCGAAACCCAAACCCGCCGGATTCGGATACTCCG
ACCCGTAATCGACCCGAGAAGAATCACCAGATCCTATGCTTTGATCGGCAGAGAAATGAT
CAGAGACGATCATACCGTCATCGATTACACTTGATTCCATCTCCGATGTGATCGAATCGG
TGTCGGAGCCGTGAACGAGCTCCCAATCAAGCATCTCCTCTCCTTCCATGGGTGATTGAT
TGATAATCGAAGAAAAGTTTAGATTCGAGTTCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1F123JQ U 1
AF RS1C694TF C 318
BS 1 362 RS1F123JQ
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BS 364 380 RS1F123JQ
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BS 590 1056 RS1C694TF

RD RS1F123JQ 589 0 0
GGTGAACTACTACTATGCATAGGTTGATAGGAACATCACAAACACCATATTCTTTTAGTA
CATAACATGATGAGCCACTGTACACACACAAGTACGTGCTCTCTACTCTGGTACATAACG
TTATGAGACATAGTATAACCGGCTTCTCTCACCTAAGGCTCAAAACCGGCCATGCACCAG
GGGATGGCAGAGCAGGGCGGATCACTGGGACCCTTCTTACCTCTGTGAATGCTTCATTGA
GTCGAGCTGCCTGACTCATCACCCTCGAAACCTTCTTCTCGTCGATTGCAACTTTGAGAT
GGAACCTTTCAGCTTTCTTTTTCATATGATAGAGTCTGCGTCCCAAGAGAACAAAACCCA
TCGCAGCTGCAGCCATGGAGGGAGACCAAACAGGACCAATCCTAAGTGCATAGTACTTGA
CAAGAACAAACGGCATCTTCCACCACACAGTCTCTCTACTTTTACTCTCATCACCAGACC
TCACAGCCACCACATCCCCTCCTCCACTTCCCTCAACTGCTTCCCTATCAGAAACAATCT
CCTCTTCACCACTCACATTCCCAGACTCCAGTTCCTTGCCCTCTGTCTC

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1C694TF 739 0 0
TTTTTCATATGATAGAGTCTGCGTCCCAAGAGAACAAAACCCATCACAGCTGCAGCCATG
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TTCCACCACACAGTCTCTCTACTTTTACTCTCATCACCAGACCTCACAGCCACGACATCC
CCTCCTCCACTTCCCTCAACTGCTTCCCTATCAGAAACAATCTCCTCTTCACCACTCACA
TTCCCAGAATCCACTTCGTTGCCCTCTGTCTCAGACAAACATTTGCTCGCATCCTCAATA
TGTTCTTCAACACAATCTTGGCTCTCGACTTGGAGTTTGTTCGTTTCCGACAAACCCTCG
ACATGTTCTTCAACACCAGCTTGGATCTCGACTTGGAGATTGTCTGTTTCGGACATGCCC
TCACCATCGATAAACCCTAATTCGTTTCCGACACCAGCATCATCACCCGATCTATAAACA
TCCAACCGATCGAAACCCAAACCCGCCGGATTCGGATACTCCGACCCGTAATCGACCCGA
GAAGAATCACCAGATCCTATGCTTTGATCGGCAGAGAAATGATCAGAGACGATCATACCG
TCATCGATTACACTTGATTCCATCTCCGATGTGATCGAATCGGTGTCGGAGCCGTGAACG
AGCTCCCAATCAAGCATCTCCTCTCCTTCCATGGGTGATTGATTGATAATCGAAGAAAAG
TTTAGATTCGAGTTCACCC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 3

CO CL3005Contig1 953 3 2 U
CGTCAACGATTTTCTATATATTTTCAATGTTTTGAAGATTTTGTTCTCGATACACACATG
TCCTTCTTATAGATCGAAGTTATTTTATACATAACATTTTTAGTCATAAAACTGAAATTT
GTCATTTATAAGAAAAAAAATATTCCCATGCTCAATGCTAGTATATAATAAAACATTCCC
ATGCGCAATCCCTAATCTGCAAGATTTGGACTGCTGAAGACTCGCTTCAAACTAGGACAC
ACTGCTCGGAACCTCGCCATGCTCACTGAGGATATCTTCGGACAGAAACGGAGATCCAGT
GTCTCTAGTGAGCAGCATCCTGATATAGCTGCTTCAACTCCTGCTTCATCCATGTTACAA
GACTGAAGAAAGAGACTAGCCAATCTTGGGCAGGCAAGCTTCAGTACTTCCAGGGAGCAA
CAGTTGCTTAGATTAAGCAAGACCAGGTTTGAACAGGCAAGATCAACCTCCTTTAAATTG
ACCGATAGCGAAAGGCTCAGTGTTGATAGATGATAAAACCGAGCTGCAGGTGGTATCAGC
ACTTTTCTGATATTGGGACAACCCACACAATTGAGGTTTTGCAGTAACCGGTTGGCTGTT
TCAGCTGGTTCTTGAGTACTCTCACTAGAACTGTTTACACCGAAGTAATCAAATAGATGT
ACATTGGTTGAACCCCAATCAAGGTCATGCATATTAACACAGCCGTTCAAGCTCAGATGG
GTAAAGTGTGTGCAGCACAAGTAGATCATCTATGGCAGTCTGACAGAGAGTTCCATAAGA
CAAGTCCAACTCTTCAAGTGCAGGTAAAGCACCTTCTTTGTATAGAGGCTCCAGTGATGT
GTCAGTGAGATATTTGCAGGCTTGTAATTTGAGCACCTTCAGTCGAGTACAGGACTTGAA
GGCAGGTTCCAAATTCATCAAGAAAGTGTACGACAAATCAAGAACAGTCAGAC


BQ
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AF RS1GY27JQ U 1
AF RS1FS68JQ U 1
AF RS1GY27TF C 203
BS 1 825 RS1FS68JQ
BS 826 953 RS1GY27TF

RD RS1GY27JQ 768 0 0
CGTCAACGATTTTCTATATATTTTCAATGTTTTGAAGATTTTGTTCTCGATACACACATG
TCCTTCTTATAGATCGAAGTTATTTTATACATAACATTTTTAGTCATAAAACTGAAATTT
GTCATTTATAAGAAAAAAAATATTCCCATGCTCAATGCTAGTATATAATAAAACATTCCC
ATGCGCAATCCCTAATCTGCAAGATTTGGACTGCTGAAGACTCGCTTCAAACTAGGACAC
ACTGCTCGGAACCTCGCCATGCTCACTGAGGATATCTTCGGACAGAAACGGAAATCCAGT
GTCTCTAGTGAGCAGCATCCTGATATAGCTGCTTCAACTCCTGCTTCATCCATGTTACAA
GACTGAAGAAAGAGACTAGCCAATCTTGGGCAGGCAAGCTTCAGTACTTCCAGGGAGCAA
CAGTTGCTTAAATTAAGCAAGACCAGGTTTGAACAGGCAAGATCAACCTCCTTTAAATTG
ACCGATAGCGAAAGGCTCAGTGTTGATAGATGATAAAACCGAGCTGCAGGTGGTATCAGC
ACTTTTCTGATATTGGGACAACCCACACAATTGAGGTTTTGCAGTAACCGGTTGGCTGTT
TCAGCTGGTTCTTGAGTACTCTCACTAGAACTGTTTACACCGAAGTAATCAAATAGATGT
ACATTGGTTGAACCCCAATCAAGGTCATGCATATTAACACAGCCGTTCAAGCTCAGATGG
GTAAAGTGTGTGCAGCACAAGTAGATCATCTATGGCAGTCTGACAGAG

QA 1 768 1 768
DS 

RD RS1FS68JQ 825 0 0
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TCCTTCTTATAGATCGAAGTTATTTTATACATAACATTTTTAGTCATAAAACTGAAATTT
GTCATTTATAAGAAAAAAAATATTCCCATGCTCAATGCTAGTATATAATAAAACATTCCC
ATGCGCAATCCCTAATCTGCAAGATTTGGACTGCTGAAGACTCGCTTCAAACTAGGACAC
ACTGCTCGGAACCTCGCCATGCTCACTGAGGATATCTTCGGACAGAAACGGAGATCCAGT
GTCTCTAGTGAGCAGCATCCTGATATAGCTGCTTCAACTCCTGCTTCATCCATGTTACAA
GACTGAAGAAAGAGACTAGCCAATCTTGGGCAGGCAAGCTTCAGTACTTCCAGGGAGCAA
CAGTTGCTTAGATTAAGCAAGACCAGGTTTGAACAGGCAAGATCAACCTCCTTTAAATTG
ACCGATAGCGAAAGGCTCAGTGTTGATAGATGATAAAACCGAGCTGCAGGTGGTATCAGC
ACTTTTCTGATATTGGGACAACCCACACAATTGAGGTTTTGCAGTAACCGGTTGGCTGTT
TCAGCTGGTTCTTGAGTACTCTCACTAGAACTGTTTACACCGAAGTAATCAAATAGATGT
ACATTGGTTGAACCCCAATCAAGGTCATGCATATTAACACAGCCGTTCAAGCTCAGATGG
GTAAAGTGTGTGCAGCACAAGTAGATCATCTATGGCAGTCTGACAGAGAGTTCCATAAGA
CAAGTCCAACTCTTCAAGTGCAGGTAAAGCACCTTCTTTGTATAG

QA 1 825 1 825
DS 

RD RS1GY27TF 751 0 0
AGA
TTGGACTGCTGAAGACTCGCT*CAAACTAGGACACACTGCTCGGAACCTCGCCATGCTCA
CTGAGGATATCT*CGGACAGAAACGGAGATCCAGTGTCTCTAGTGAGCAGCATCGTGATA
TAGCTGCTTCAACTCGTGCTTCATCCATGTTACAAGACTGAAGAAAGAGACTAGCCAATC
TTGGGCAGGCAAGCTTCAGTACTTCCAGGGAGCAACAGTTGCTTAGATTAAGCAAGACCA
GGTTTGAACAGGCAAGATCAACCTCCTTTAAATTGACCGATAGCGAAAGGCTCAGTGTTG
ATAGATGATAAAACCGAGCTGCAGGTGGTATCAGCACTTTTCTGATATTGGGACAACCCA
CACAATTGAGGTTTTGCAGTAACCGGTTGGCTGTTTCAGCTGGTTCTTGAGTACTCTCAC
TAGAACTGTTTACACCGAAGTAATCAAATAGATGTACATTGGTTGAACCCCAATCAAGGT
CATGCATATTAACACAGCCGTTCAAGCTCAGATGGGTAAAGTGTGTGCAGCACAAGTAGA
TCATCTATGGCAGTCTGACAGAGAGTTCCATAAGACAAGTCCAACTCTTCAAGTGCAGGT
AAAGCACCTTCTTTGTATAGAGGCTCCAGTGATGTGTCAGTGAGATATTTGCAGGCTTGT
AATTTGAGCACCTTCAGTCGAGTACAGGACTTGAAGGCAGGTTCCAAATTCATCAAGAAA
GTGTACGACAAATCAAGAACAGTCAGAC

QA 4 751 4 751
DS 



AS 1 4

CO CL3006Contig1 863 4 13 U
GGCTTGATTGGATAGTTAGCCTGCTTTGTTATCAGCTGTAAGAGGCCTACAGTATCAAAG
ATACACCGGCGATATTTGGTGACGGGATGAATGTCCACCGTTTAGCTCCTTCTCTACTTG
CGCTTTCTCTACCTACTACTCCACAACATGCCTCTTTAAGCTTCTCCTCTCTCGGCCTCG
GCGTCGCCCCCAATGTTCTTAACCGCAATAAATCCGTAGTCCTCCACCGTCTGGTTACCT
CCTTTAGTCAAAGTGCTTCCCATAAACCTGAAGATGCTGACCCTTATGTTGATGAAGAAG
AAGGAGGAGAAACAACGTTGGATAAGAATGCGACACGCTGGCAAAACCCGTTCGTTTCGG
AAGAGCTTGTAAAGAAATTGAAGAGATATGGATTGTCTGGAATATTGTCTTACGGTTTAC
TTAACACAGTCTATTACACCGCAGCTTTCCTCTTGGTGTGGTTTTATGTCGCCCCAGCAC
CGGGAAAAATGGGATATCTTGCTGCAGCTCAGAGATTTCTTAAAGTGATGGCCATGGTAT
GGGCTGGAAGCCAAGTTACTAAGCTCGTCAGAATAGGAGGGGCAGTGGCACTTGCACCTA
TTGTTGATAGAGGACTGTCTTGGTTTACAGTTAAATACAAGTTTAAAAGTCAGGGGAAAG
CTTTCGGCGCAATGGTTGGGATATGTCTTGGTCTGGCTTTGATGCTATTTCTCGTTGTGA
CACTGCTCTGGGCCTAGCTCAGAGTAATTGCTGCATTTGCAAGAGTTTTTGCTTTTTACA
ACAATTTTGTTTTTGGTTATTTACATTATGCACTTGACACGTATTGTGGATATGATTTGC
AATGAAATTATGGATTACTCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1FY10TF U 1
AF RS1FA25TF U 43
AF RS1FY10JQ C 104
AF RS1FA25JQ C 258
BS 1 364 RS1FY10TF
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BS 366 471 RS1FY10TF
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BS 648 769 RS1FA25TF
BS 770 770 RS1FY10JQ
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BS 795 836 RS1FA25TF
BS 837 863 RS1FY10JQ

RD RS1FY10TF 647 0 0
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ATACACCGGCGATATTTGGTGACGGGATGAATGTCCACCGTTTAGCTCCTTCTCTACTTG
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GCGTCGCCCCCAATGTTCTTAACCGCAATAAATCCGTAGTCCTCCACCGTCTGGTTACCT
CCTTTAGTCAAAGTGCTTCCCATAAACCTGAAGATGCTGACCCTTATGTTGATGAAGAAG
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AAGATCTTGTAAAGAAATTGAAGAGATATGGATTGTCTGGAATATTGTCTTACGGTTTAC
TTAACACAGTCTATTACACCGCAGCTTTCCTCTTGGTGTGGTTTTATGTCGTCCCAGCAC
CGGGAAAAATGGGATATCTTGCTGCAGCTCAGAGATTTCTTAAAGTGATGGCCATGGTAT
GGGCTGGAAGCCAAGTTACTAAGCTCGTCAGAATAGGAGGGGCAGTGGCACTTGCACCTA
TTGTTGATAGAGGACTGTCTTGGTTTACAGTTAAATACAAGTTTAAA

QA 1 647 1 647
DS 

RD RS1FA25TF 794 0 0
G
GGCCTACAGTATCAAAGATACACCGGCGATATTTGGTGACGGGATGAATGTCCACCGTTT
AGCTCCTTCTCTACTTGCGCTTTCTCTACCTACTACTCCACAACATGCCTCTTTAAGCTT
CTCCTCTCTCGGCCTCGGCGTCGCCCCCAATGTTCTTAACCGCAATAAATCCGTAGTCCT
CCACCGTCTGGTTACCTCCTTTAGTCAAAGTGCTTCCCATAAACCTGAAGATGCTGACCC
TTATGTTGATGAAGAAGAAGGAGGAGAAACAACGTTGGATAAGAATGCGACACGCTGGCA
AAACCCGTTCGTTTCGGAAGAGCTTGTAAAGAAATTGAAGAGATATGGATTGTCTGGAAT
ATTGTCTTACGGTTTACTTAACACAGTCTATTACACCGCAGCTTTCCTCTTGGTGTGGTT
TTATGTCGCCCCAGCACCGGGAAAAATGGGATATCTTGCTGCAGCTCAGAGATTTCTTAA
AGTGATGGCCATGGTATGGGCTGGAAGCCAAGTTACTAAGCTCGTCAGAATAGGAGGGGC
AGTGGCACTTGCACCTGTTGTTGATAGAGGACTGTCTTGGTTTACAGTTAAATACAAGTT
TAAAAGTCAGGGGAAAGCTTTCGGCGCAATGGTTGGGATATGTCTTGGTCTGGCTTTGAT
GCTATTTCTCGTTGTGACACTGCTCTGGGCCTAGCTCAGAGTAATTGCTGCATTTGCAAG
AGTTTT*GCTTTT*ACAACAATTTTGTTTT*GGTTATTTACATTATGCACTTGACACGTA
TTGTGGATATGAT

QA 2 794 2 794
DS 

RD RS1FY10JQ 760 0 0
AGCTCCTTCTCTACTTGCGCTTTCTCTACCTACTACTCCACAACATGCCTCTTTAAGCTT
CTCCTCTCTCGGCCTCGGCGTCGCCCCCAATGTTCTTAACCGCAATAAATCCGTAGTCCT
CCACCGTCTGGTTACCTCCTTTAGTCAAAGTGCTTCCCATAAACCTGAAGATGCTGACCC
TTATGTTGATGAAGAAGAAGGAGGAGAAACAACGTTGGATAAGAATGCGACACGCTGGCA
AAACCCGTTCGTTTCGGAAGATCTTGTAAAGAAATTGAAGAGATATGGATTGTCTGGAAT
ATTGTCTTACGGTTTACTTAACACAGTCTATTACACCGCAGCTTTCCTCTTGGTGTGGTT
TTATGTCGTCCCAGCACCGGGAAAAATGGGATATCTTGCTGCAGCTCAGAGATTTCTTAA
AGTGATGGCCATGGTATGGGCTGGAAGCCAAGTTACTAAGCTCGTCAGAATAGGAGGGGC
AGTGGCACTTGCACCTATTGTTGATAGAGGACTGTCTTGGTTTACAGTTAAATACAAGTT
TAAAAGTCAGGGGAAAGCTTTCGGCGCAATGGTTGGGATATGTCTTGGTCTGGCTTTGAC
GCTATTTCTCGTTGTGACACTGCTCTGGGCCTAGCTCAGAGTAATTGCTGCATTTGCAAG
AGTTTTTGCTTTTTACAACAATTTTGTTTTTGGTTATTTACATTATGCACTTGACACGTA
TTGTGGATATGATTTGCAATGAAATTATGGATTACTCTAC

QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1FA25JQ 604 0 0
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TTGGATAAGAATGCGACACGCTGGCAAAACCCGTTCGTTTCGGAAGAGCTTGTAAAGAAA
TTGAAGAGATATGGATTGTCTGGAATATTGTCTTACGGTTTACTTAACACAGTTTATTAC
ACCGCAGCTTTCCTCTTGGTGTGGTTTTATGTCGCCCCAGCACCGGGAAAAATGGGATAT
CTTGCTGCAGCTCAGAGATTTCTTAAAGTGATGGCCATGGTATGGGCTGGAAGCCAAGTT
ACTAAGCTCGTCAGAATAGGAGGGGCAGTGGCACTTGCACCTGTTGTTGATAGAGGACTG
TCTTGGTTTACAGTTAAATACAAGTTTAAAAGTCAGGGGAAAGCTTTCGGCGCAATGGTT
GGGATATGTCTTGGTCTGGCTTTGATGCTATTTCTCGTTGTGACACTGCTCTGGGCCTAG
CTCAGAGTAATTGCTGCATTTGCAAGAGTTTTTGCTTTTTACAACAATTTTGTTTTTGGT
TATTTACATTATGCACTTGACACGTATTGTGGATATGATTTGCAATGAAATTATGGATTA
CTC
C

QA 1 603 1 603
DS 



AS 1 3

CO CL3007Contig1 1305 3 7 U
AATACGAAATATCTTTAATTTATATTGTTTCCAAATTCAAGAAGTCTAAAACACGATAAA
AAAAGATAACACGAAATCAACCCAAAAACAAAACACACTCGCGCACGGAATAAATTAGGT
GCATGTTTCACGTGAAATGCCGAGCCTGGAATTGGGAAGGTCGATGAAAACACGGTGGTT
CTGTTGCTGCATGCTAGCAATGACATTGAGGACGGAGTTTACGTTATTCGGAGCTGCGGC
CATGGCGAGACAGCTTGTGCTACCTGAGGAGCTGTGGATGAGAAGATTGTCCGGAGGCAA
AGTCACGTTCATTCCCGCGAACATAAACGTGACCGATGGGAACACGACGGAGCCGGAGTA
GCAAGTGTCGAAGCCTCCGAGTGCTGTTGCATTTGCGTTCTTGACCCGTCGCCTGAACTC
ATTTCTCACGGCAACGTAAGCTGGTTCCACTAGCCTCGTGTAGACCGTTCCGGAGTCAAA
GATGGTGCCAGCTCCTGTTGCCGGATTAAAGGCGAGTGCACTTGGTGGAATATCCACAAT
TTTATTCCCAACACGAATCCCAACCATGTTAACATAGTAAAGCGATGATCTCCTTGGGTT
CTTTAACAATGGAGTGGTCTTGATCCTAACTGGTTGAACTTAGGGCCTAATCTTAACGTT
CCCGAGAAACTGCCGGATTTACTATTAGGCAAGAAATACGAGAATGTGGACTTATAAAGG
TTTTGCGTCTGTGAGATTAAAGACAATGGACCACGACCTAAACCCATGAGTCCTTGTGCT
GGCAACGATGTTCCGGTGGCTTTGTTGATGCACCCAAAAGTGTAGTTTGGGATGGCGTCA
TCGGTTAATGTTAGTGTGTCTTGTGTCAGAGATGCTGTGATGGTTGATCCACCGTAAGTC
ATATTGAAACCACATGATTTGCTCATGGTGCACGTTGGATTTGGAGCCTGTTTACACTGA
GGAGCTTCGCATTGAACAGTGCGAGAAGAGCTAGACTTGGAAGGGTCAAAGAGAAACGAG
GAAGCACAGCCAAGGCAACCAGAACAAGGAACCCAAGTAACGTCATTGCTAGTGTCAAGA
GCCACGAGCATGGGCTGAGCCGGTGTCCCAATGTTAGCCCTCACGATGTAAGTCGGGCTC
TGAACGATGGAACGTCCCGAGGCGATTGGGACCCAAGGTTTCTTACCAACGGCGAGGCTT
GACAAGTACTGGAGACGAGCATTGTCTTTAATAAGTGTGCTTTCCCATGAGACAGTTTTT
GGTTGTTTGTATGGAGAGCAAGGACTATCAATGTGGAACACTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1A290JQ U 1
AF RS1A290TR U 149
AF RS1A290TF C 778
BS 1 167 RS1A290JQ
BS 168 168 RS1A290TR
BS 169 784 RS1A290JQ
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BS 841 925 RS1A290TR
BS 926 1305 RS1A290TF

RD RS1A290JQ 840 0 0
AATACGAAATATCTTTAATTTATATTGTTTCCAAATTCAAGAAGTCTAAAACACGATAAA
AAAAGATAACACGAAATCAACCCAAAAACAAAACACACTCGCGCACGGAATAAATTAGGT
GCATGTTTCACGTGAAATGCCGAGCCTGGAATTGGGAAGGTCGATGAGAACACGGTGGTT
CTGTTGCTGCATGCTAGCAATGACATTGAGGACGGAGTTTACGTTATTCGGAGCTGCGGC
CATGGCGAGACAGCTTGTGCTACCTGAGGAGCTGTGGATGAGAAGATTGTCCGGAGGCAA
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GCAAGTGTCGAAGCCTCCGAGTGCTGTTGCATTTGCGTTCTTGACCCGTCGCCTGAACTC
ATTTCTCACGGCAACGTAAGCTGGTTCCACTAGCCTCGTGTAGACCGTTCCGGAGTCAAA
GATGGTGCCAGCTCCTGTTGCCGGATTAAAGGCGAGTGCACTTGGTGGAATATCCACAAT
TTTATTCCCAACACGAATCCCAACCATGTTAACATAGTAAAGCGATGATCTCCTTGGGTT
CTTTAACAATGGAGTGGTCTTGATCCTAACTGGTTGAACTTAGGGCCTAATCTTAACGTT
CCCGAGAAACTGCCGGATTTACTATTAGGCAAGAAATACGAGAATGTGGACTTATAAAGG
TTTTGCGTCTGTGAGATTAAAGACAATGGACCACGACCTAAACCCATGAGTCCTTGTGCT
GGCA*CGATGTTCCGGTGGCTTTGTTGATGCACCCAAAAGTGTAGTTTGGGATGGCGTCA

QA 1 840 1 840
DS 

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AGGACGGAGTTTACGTTATTCGGAGCTGCGGCCATGGCGAGACAGCTTGTGCTACCTGAG
GAGCTGTGGATGAGAAGATTGTCCGGAGGCAAAGTCACGTTCATTCCCGCGAACATAAAC
GTGACCGATGGGAACACGACGGAGCCGGAGTAGCAAGTGTCGAAGCCTCCGAGTGCTGTT
GCATTTGCGTTCTTGACCCGTCGCCTGAACTCATTTCTCACGGCAACGTAAGCTGGTTCC
ACTAGCCTCGTGTAGACCGTTCCGGAGTCAAAGATGGTGCCAGCTCCTGTTGCCGGATTA
AAGGCGAGTGCACTTGGTGGAATATCCACAATTTTATTCCCAACACGAATCCCAACCATG
TTAACATAGTAAAGCGATGATCTCCTTGGGTTCTTTAACAATGGAGTGGTCTTGATCCTA
ACTGGTTGAACTTAGGGCCTAATCTTAACGTTCCCGAGAAACTGCCGGATTTACTATTAG
GCAAGAAATACGAGAATGTGGACTTATAAAGGTTTTGCGTCTGTGAGATTAAAGACAATG
GACCACGACCTAAACCCATGAGTCCTTGTGCTGGCAACGATGTTCCGGTGGCTTTGTTGA
TGCACCCAAAAGTGTAGTTTGGGATGGCGTCATCGGTTAATGTTAGTGTGTCTTGTGTCA
GAGATGCTGTGATGGTTGATCCACCGTAAGTCATATTGAAACCACATGATTTGCTCA

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DS 

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GCTGGCA
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TTAATGTTAGTGTGTCTTGTGTCAGAGATGCTGTGATGGTTGATCCACCGTAAGTCATAT
TGAAACCACATGATTTGCTCATGGTGCACGTTGGATTTGGAGCCTGTTTACACTGAGGAG
CTTCGCATTGAACAGTGCGAGAAGAGCTAGACTTGGAAGGGTCAAAGAGAAACGAGGAAG
CACAGCCAAGGCAACCAGAACAAGGAACCCAAGTAACGTCATTGCTAGTGTCAAGAGCCA
CGAGCATGGGCTGAGCCGGTGTCCCAATGTTAGCCCTCACGATGTAAGTCGGGCTCTGAA
CGATGGAACGTCCCGAGGCGATTGGGACCCAAGGTTTCTTACCAACGGCGAGGCTTGACA
AGTACTGGAGACGAGCATTGTCTTTAATAAGTGTGCTTTCCCATGAGACAGTTTTTGGTT
GTTTGTATGGAGAGCAAGGACTATCAATGTGGAACACTCTT

QA 8 528 8 528
DS 



AS 2 4

CO CL3008Contig1 725 2 2 U
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TACTTGATCATCTCTGGGATGATACCGTCGCTGGTCCTCGGCCGGAGAACGGCCTTGGCA
AGCTTCGGAAACACCATACTTTCAGTTTCCGGCCTAGCTCCGGCAATGATCAACCTGACA
GTGGAAACATTAGATCGTACGGTGAAGATTCGCCGGATGAGGGTGTGAAAGTGACACGCA
GCATCATGATAATAAAACCACCAGGGTACCAAGGCGGTTCAGCTCCAGTTTCACCGGCCG
GTTCAACTCCACCGGTGTCTCCTTTCTCTGGAGGAAAGGAACCCTTTCGGTTCAGGAGAC
GCTCGACTTCGGACGCGTTCGAGAAGGCAGCAGGATCAGAGAATGGACCAAGGAACACTC
CTCCTACTTACGGCGTGTGATCTCTAATCTCTAACTAGAGAAGAAGAAGAGGAAACAGAG
TAGCCCCTGAAGCGCTTTCGTTTTGACACATCAAGTGGTCGTTGCATGCAGAGTTCTGTC
TTTCTTCCTTTTGTAGGCTAGAGAGGTTCTCTTTTGTTTATGCGTGTGTGAGGTTGTTCC
CGCGTTTGTGATTGCGTCTCTGTTTTTTTTCTCTCTTTTTGTTCCTTTTTATATGTCATC
TCGTTTTCGCAATGCTTCTACGTGTCTGTACATATTTGCTGCAATGATAATAAACATATT
AATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 10 

AF RS1EG49TF U 1
AF RS1EG49JQ C 28
BS 1 724 RS1EG49TF
BS 725 725 RS1EG49JQ

RD RS1EG49TF 725 0 0
GGATCTCTCTCTTACACAACATCTGCGAGAAAAACATAACTTTTACTTGATCCATGGGCA
TACTTGATCATCTCTGGGATGATACCGTCGCTGGTCCTCGGCCGGAGAACGGCCTTGGCA
AGCTTCGGAAACACCATACTTTCAGTTTCCGGCCTAGCTCCGGCAATGATCAACCTGACA
GTGGAAACATTAGATCGTACGGTGAAGATTCGCCGGATGAGGGTGTGAAAGTGACACGCA
GCATCATGATAATAAAACCACCAGGGTACCAAGGCGGTTCAGCTCCAGTTTCACCGGCCG
GTTCAACTCCACCGGTGTCTCCTTTCTCTGGAGGAAAGGAACCCTTTCGGTTCAGGAGAC
GCTCGACTTCGGACGCGTTCGAGAAGGCAGCAGGATCAGAGAATGGACCAAGGAACACTC
CTCCTACTTACGGCGTGTGATCTCTAATCTCTAACTAGAGAAGAAGAAGAGGAAACAGAG
TAGCCCCTGAAGCGCTTTCGTTTTGACACATCAAGTGGTCGTTGCATGCAGAGTTCTGTC
TTTCTTCCTTTTGTAGGCTAGAGAGGTTCTCTTTTGTTTATGCGTGTGTGAGGTTGTTCC
CGCGTTTGTGATTGCGTCTCTGTTTTTTTTCTCTCTTTTTGTTCCTTTTTATATGTCATC
TCGTTTTCGCAATGCTTCTACGTGTCTGTACATATTTGCTGCAATGATAATAAACATATT
AATG
C

QA 1 724 1 724
DS 

RD RS1EG49JQ 698 0 0
AGAAAAACATAACT
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GGTGTGAAAGTGACACGCAGCATCATGATAATAAAACCACCAGGGTACCAAGGCGGTTCA
GCTCCAGTTTCACCGGCCGGTTCAACTCCACCGGTGTCTCCTTTTTCTGGAGGAAAGGAA
CCCTTTCGGTTCAGGAGACGCTCGACTTCGGACGCGTTCGAGAAGGCAGCAGGATCAGAG
AATGGACCAAGGAACACTCCTCCTACTTACGGCGTGTGATCTCTAATCTCTAACTAGAGA
AGAAGAAGAGGAAACAGAGTAGCCCCTGAAGCGCTTTCGTTTTGACACATCAAGTGGTCG
TTGCATGCAGAGTTCTGTCTTTCTTCCTTTTGTAGGCTAGAGAGGTTTTCTTTTGTTTAT
GCGTGTGTGAGGTTGTTCCCGCGTTTGTGATTGCGTCTCTGTTTTTTTTCTCTCTTTTTG
TTCCTTTTTATATGTCATCTCGTTTTCGCAATGCTTCTACGTGTCTGTACATATTTGCTG
CAATGATAATAAACATATTAATGC

QA 15 698 15 698
DS 



CO CL3008Contig2 749 2 2 U
GAATCCCTCTCTCTCTCCACAACATCTGTGAGAAAACGATAACTTTACTTGATCCATGGG
CATACTTGATCATCTCTGGGATGATACCGTCGCTGGTCCTCGGCCGGAGAACGGCCTTGG
CAAGCTTCGGAAGCACCATACTTTCAGTTTCCGGCCTAGCTCCGGCAATGATCAAGCTGA
CAGTGGAAACGTTAGATCGTACGGTGAAGATTCGCCGGATGAGGGTGTGAAAGTGACACG
CAGCATCATGATTATAAAACCACCGGGATACCAAGGCGGTTCAGCTCCGGTTTCACCGGC
CGGTTCAACTCCACCGGTGTCTCCTTTCTCTGGAGGAAAGGAACCCTTTCGGTTCAGGAG
ACGCTCGACTTCGGACGCGTTCGAGAAGGCAGCAGGCAGATCAGAGAATGGACCAAGGAA
CTCTCCTCCTACTTACGGCGTGTGATCTCTAATCTCTAACTAGAGAAGAAGAAGAGGAAA
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GCAGAGCTCGTCTTTCTTCCTTTTGTAGGCTAGAGAGGTTCTCTTTTGTTTATGCGTGTG
TGAGGTTGTTCCCGCGTTTGTGATTGCGTCTCTGTTTTTTCTCTCTCTTTTTGTTCCTTT
TTATATGTCAATCTCGTTTTCGCAATGCTTCTACGTGCCTGTACATATTTGCTGCAATGA
TAATAAACATATTAATGTAGATGCTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TTGAC

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
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AF RS1D628TF U 1
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G
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TGCGAAGATATGGAATGCATTGACTGGAGATGAGCTGCACTCCTTTGAACACAAGCACAT
TGTTCGTGCTTGTGCCTTCTCTGAGGACACTCACCGTTTGCTGACTGGTGGAATGGAGAA
AATACTTCGGATATTCGATATGAATCGGCCTGACGCACCTCCAAAAGAAGTAGCAACTTC
TCCTGGTTCAATCAGAACCGTCGAATGGCTTCATGGTGATAATACTATCTTAAGCTCTTC
CACAGACACCGGTGACATTAGGTTATGGGACATAAGAAGTGACAAGATTGTTCAAACATT
AGAAACCAAGTTCCCAGTTACTAGTGCTGAAGTAAGTCAAGATGGGAGATACATTACTAC
TGCTGATGGATCTAGTGTTAAGTTCTGGGACGC*AATAATTTTGGAT*GGTGAAGAGCTA
TGAGATGC

QA 1 788 1 788
DS 

RD RS1GT09JQ 742 0 0
CGCA
CTCCAAAAGAAGTAGCAACTTCTCCTGGTTCAATCAGAACCGTCGAATGGCTTCATGGTG
ATAATACTATCTTAAGCTCTTCCACAGACACCGGTGGCATTAGGTTATGGGACATAAGAA
GTGACAAGATTGTTCAAACATTAGAAACCAAGTTCCCAGTTACTAGTGCTGAAGTAAGTC
AAGATGGGAGATACATTACTACTGCTGATGGATCTAGTGTTAAGTTCTGGGACGCCAATA
GTTTTGGATTGGTGAAGAGCTATGAGATGCCTTGCAACGTTGAATCGGCATCCTTGGAAC
CGAAAAACGGCAACACTTTCATTGCTGGAGGAGAAGATATGTGGGTACACAGGTTTGATT
TCCAGACTGGAGAGGAGATTGGGTGTAACAAGGGTCACCACGGACCAGTGCACTGCGTGA
GGTATGCGCCAGGAGGAGAGTCATACACGTCAGGATCAGAGGACGGGACAGTGAGAATAT
GGGAGGTGGGGACGGTGAACCATGAGGAGAGCAACAATCTGAGCGGTCACGTGAAGCTTG
TGGCAGAGGAAGTTGTGCGTAAAGCTGAAAGTCTTCGTATCAGTGAGAAAGCCACAGAAG
CTTCTAAATGAAAGCATCGTTTTAGCTTATGATAATACCACATAGATTCATAGTTGTTTT
TGGATCACTATAATATGTGACAGAGTTTTTGTCTTTTAATTGTCTCTCGACTAAATAAAC
AGAACATAGTCTTCTCC
C

QA 5 741 5 741
DS 

RD RS1D628JQ 807 0 0
TTCGATATGATCGG
CTGACGCACCTCCAAAAGAAGTAGCAACTTCTCCTGGT*CAATCAGAACCGTCGAATGGC
TTCATGGTGATAATACTATCTTAAGCTCTTCCACAGACACCGGTGACATTAGGTTATGGG
ACATAAGAAGTGACAAGATTGTTCAAACATTAGAAACCAAGTTCCCAGTTACTAGTGCTG
AAGTAAGTCAAGATGGGAGATACATTACTACTGCTGATGGATCTAGTGTTAAGTTCTGGG
ACGCCAATAATTTTGGATTGGTGAAGAGCTATGAGATGCCTTGCAACGTTGAATCGGCAT
CCTTGGAACCGAAAAACGGCAACACTTTCATTGCTGGAGGAGAAGATATGTGGGTACACA
GGTTTGATTTCCAGACTGGAGAGGAGATTGGGTGTAACAAGGGTCACCACGGACCAGTGC
ACTGCGTGAGGTATGCGCCAGGAGGAGAGTCATACACGTCAGGATCAGAGGACGGGACAG
TGAGAATATGGGAGGTGGGGACGGTGAACCATGAGGAGAGCAACAATCTGAGCGGTCACG
TGAAGCTTGTGGCAGAGGAAGTTGTGCGTAAAGCTGAAAGTCTTCGTATCAGTGAGAAAG
CCACAGAAGCTTCTAAATGAAAGCATCGTTTTAGCTTATGATAATACCACATAGATTCAT
AGTTGTTTTTGGATCACTATAATATGTGACAGAGTTTTTGTCTTTTAATTGTCTCTCGAC
TAAATAAACAGAACATAGTCTTCTCCTCTATTTGATCCATTCGCCTTTTTCTTATGTTAG
CAGAAACTATAGT

QA 15 807 15 807
DS 



AS 1 3

CO CL3010Contig1 1109 3 19 U
GGGAAAGAACAAAGAATATCTTATATTAAGAGGTAAACACACAAACAAAGCAAAGGCAAG
ACATCTCTATAAAATGTGATTCATATACTAAGACATGGTGTGAATTTTGTTACTTAAAAA
GTATGTTGTTTGTTTCTCCATTTACTGAATAATGCTTCCACAAATTGCACAAGGGAGGTA
AAGCAAAAACCAGACCAAAGATAGATATATTGATCTCTACTTGAAAGCATCAGAAGCAGA
GTAAAGGAAGTCCAAGAACCCTGTCCCCTTCAATAGACCTTTACCTGTCAATAGCTCAAA
ATCTAACAGCAGTAAGAATCCTATCACTGCTGCTTTGCCATTTATCACTTCGTTCTTCCT
TGAGAAACCAAATCCTTGAGAACCCTCGTCCACCACCATCCTCACCTCGTCTACGTTGAC
ATTGGTTGCTGTGAGCCCAGGCTGAGCTTTTCCACTGAAGACGATTTCAGCAGCAGCCTC
GTTCTTCCCGTTGCCTCTAATGCTGATGTA*ATGTTTTCTTCATCAAATTTGACAGGGTA
CACAAACAGCTTTCTCAGTGCAGGTGTCAAGACTCTGAGAACCGGGTTCTTTGGGTACCA
TTCCTTGATCTCTCCGGTTCTGAGATCAAATGTACTATCCGTTGCCGGGCACACAATGCA
ACCATCCTGAGTGAGCTTAGCGTTGAGAAGCCCCTCGCTGTAGGCTCCTTCGGCGGGAGA
ACGGTTCTCAATCGCGAAGACATCGTTCTTATACCAAAGCAGCAATATCGTCTCGTCGTC
TTGTATAATCACTCTCCGTTCACCTTTCGGAAGCGCGGATAACGGCACCACCGGCACCCA
GTTTCTTCCCGGGGAAGCAACAGACGAAGAAGAAGAAGGAGGAGAAACTTCCGTCGCCTC
GCATCTGACGATTCCTGCACTCCTCTGTTTCGAGTTTTGGTTTAAACGGTAAGTGAGAGA
GAACCGGCGGTTGGGGCGGGTACAGAGCGGGAACGATTTGGGAAATGACGTGGCGCGGGT
GAAAGAGGGAGGAGGAGGAGGGATGGAGTAGTTACGTGGGAGAGAGGTGGATGCGATGGT
CGCCATGGAGGAGAGTGAGAGAGAGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AM16JQ U 1
AF RS1B388JQ U 69
AF RS1B388TF C 407
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RD RS1AM16JQ 775 0 0
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GTATGTTGTTTGTTTCTCCATTTACTGAATAATGCTTCCACAAATTGCACAAGGGAGGTA
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TGAGAAACCAAATCCTTGAGAACCCTCGTCCACCACCATCCTCACCTCGTCTACGTTGAC
ATTGGTTGCTGTGAGCCCAGGCTGAGCTTTTCCACTGAAGACGATTTCAGCAGCAGCCTC
GTTCTTCCCGTTGCCTCTAATGCTGATGTAGATGTTTTCTTCATCAAATTTGACAGGGTA
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ACGGTTCTCAATCGCGAAGACATCGTTCTTATACCAAAGCAGCAATATCGTCTCG

QA 1 775 1 775
DS 

RD RS1B388JQ 872 0 0
G
TAAAATGTGATTCATATACTAAGACATGGTGTGAATTTTGTTACTTAAAAAGTATGTTGT
TTGTTTCTCCATTTACTGAATAATGCTTCCACAAATTGCACAAGGGAGGTAAAGCAAAAA
CCAGACCAAAGATAGATATATTGATCTCTACTTGAAAGCATCAGAAGCAGAGTAAAGGAA
GTCCAAGAACCCTGTCCCCTTCAATAGACCTTTACCTGTCAATAGCTCAAAATCTAACAG
CAGTAAGAATCCTATCACTGCTGCTTTGCCATTTATCACTTCGTTCTTCCTTGAGAAACC
AAATCCTTGAGAACCCTCGTCCACCACCATCCTCACCTCGTCTACGTTGACATTGGTTGC
TGTGAGCCCAGGCTGAGCTTTTCCACTGAAGACGATTTCAGCAGCAGCCTCGTTCTTCCC
GTTGCCTCTAATGCTGATGTA*ATGTTTTCTTCATCAAATTTGACAGGGTACACAAACAG
CTTTCTCAGTGCAGGTGTCAAGACTCTGAGAACCGGGTTCTTTGGGTACCATTCCTTGAT
CTCTCCGGTTCTGAGATCAAATGTACTATCCGTTGCCGGGCACACAATGCAACCATCCTG
AGTGAGCTTAGCGTTGAGAAGCCCCTCGCTGTAGGCTCCTTCGGCGGGAGAACGGTTCTC
AATCGCGAAGACATCGTTCTTATACCAAAGCAGCAATATCGTCTCGTCGTCTTGTATAAT
CACTCTCCGTTCACCTTTCGGAAGCGCGGATAACGGCACCACCGGCACCCAGTTTCTTCC
CGGGGAAGCA*CAGACGA*GAAGAAGAAG*AGGAGAA*CTTCCGTCGC*TCGCATCTGAC
GATTC*TGCACTC*TCTGTTTCGAGTTT
GTT

QA 2 869 2 869
DS 

RD RS1B388TF 703 0 0
TCGTCTACGT*GACATTGGTTGCTGTGAGCCCAGGCTGAGCTTTTCCACTGAAGACGATT
TCAGCAGCAGCCTCGTTCTTCCCGTTGCCTCTAATGCTGATGTA*ATGTTTTCTTCATCA
AATTTGACAGGGTACACAAACAGCTTTCTCAGTGCAGGTGTCAAGACTCTGAGAACCGGG
TTCTTTGGGTACCATTCCTTGATCTCTCCGGTTCTGAGATCAAATGTACTATCCGTTGCC
GGGCACACAATGCAACCATCCTGAGTGAGCTTAGCGTTGAGAAGCCCCTCGCTGTAGGCT
CCTTCGGCGGGAGAACGGTTCTCAATCGCGAAGACATCGTTCTTATACCAAAGCAGCAAT
ATCGTCTCGTCGTCTTGTATAATCACTCTCCGTTCACCTTTCGGAAGCGCGGATAACGGC
ACCACCGGCACCCAGTTTCTTCCCGGGGAAGCAACAGACGAAGAAGAAGAAGGAGGAGAA
ACTTCCGTCGCCTCGCATCTGACGATTCCTGCACTCCTCTGTTTCGAGTTTTGGTTTAAA
CGGTAAGTGAGAGAGAACCGGCGGTTGGGGCGGGTACAGAGCGGGAACGATTTGGGAAAT
GACGTGGCGCGGGTGAAAGAGGGAGGAGGAGGAGGGATGGAGTAGTTACGTGGGAGAGAG
GTGGATGCGATGGTCGCCATGGAGGAGAGTGAGAGAGAGCTCC

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 4

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AAAATATAGAAACTGAACTTGAAACATTTGTCCAAACAAAACGTAATCATACGATGAACC
ACCATGTATTCAACTGATACAACAAAAACGAAACAAAAAACAGCAGAAACTAGATTCTCA
GTTCGACAACAAACACAAATCATCTTCTTCATTCTTAATCGCTGGTGGCTGATATGAACG
CACTTCCAGGCTGACGGTTAGCCAAGGGACCATGGTTCGACAGAAACTTAGCGTTGACAC
CATCAGGAACAATCCTCTTCACCTGTCTCAGCCTCGTGTAATCAGCACGGTTGAACTTAG
TGAATCCCCACTTCCTGCTAACAATGATCTTCTGACGACCAGGGAACTTAAACTTAGCCC
TCCTCAACGCCTCCTGAGCATGGGCCCCATGGTTATCCTTACACCTAACAGACAAAAGCA
CCTGCCCGATCGCAACCCTAGCGCAAGTCCCCAGCGCCTTCCCGAACGCTCCCCTCATAC
CGGTCTGAAGCCTATCAGCTCCGGCGCACGAGAGCATCTTGTTGATCCTCAGAACATGGA
AAGGGTGAACCCTAATCCTCAGATGGAAGGCGTCTTTCCCGGCGGATTTCACCATGTACT
TGTTGCAGGCGATACGCGCTGCCTCGAGGGCCTCGCTGGAGACGTTCTCCTTCTCCCACG
AGACGAGGTGGACGCAGAATGGGAACTCGTCGACTCCTTTCTTCTTCATCCCGACGTCGT
AGATCCGGATCTTCGGGTCGGGTACACCCCGGCAGTAGCGGGATTTCGGGTAGGGTTTGC
CCTTGATCTGACGGTAACATCTCGCAGGTCTTCGTCCCATGGCTGTTGGTTGCGTTCGGC
GATTGTGGATTGCAAAGCCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1EZ06JQ U 1
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TGAATCCCCACTTCCTGCTAACAATGATCTTCTGACGACCAGGGAACTTAAACTTAGCCC
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AGATCCGGATCTTCGGGTCGGGTACACCCCGGCAGTAGCGGGATT
CGGGTAG

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DS 

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G
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CACTTCCTGCTAACAATGATCTTCTGACGACCAGGGAACTTAAACTTAGCCCTCCTCAAC
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AGCATGGGCCCCATGGTTATCCTTACACCTAACAGACAAAAGCACCTGCCCGATCGCAAC
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GCCCTCC

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GGTTGCGTTCGGCGATTGTGGATTGCAAAGCCCTCC

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DS 



AS 1 4

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CTGGTTGGAAACAAAACATGAATATCTTCATATCTGCTGCTTATTATTACTAGTACGTAG
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CATGCATTTGATTTCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1C558JQ U 1
AF RS1AP59JQ U 8
AF RS1AP59TFB C 576
AF RS1C558TF C 641
BS 1 14 RS1C558JQ
BS 15 15 RS1AP59JQ
BS 16 423 RS1C558JQ
BS 424 424 RS1AP59JQ
BS 425 642 RS1C558JQ
BS 643 643 RS1AP59JQ
BS 644 710 RS1C558JQ
BS 711 803 RS1AP59JQ
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BS 1238 1238 RS1C558TF
BS 1239 1396 RS1AP59TFB

RD RS1C558JQ 710 0 0
TTTTTTTATGAACCGTGCATGCGTATCACCACATTTACTGTACATTTTAAACATGAATAT
CTGGTTGGAAACAAAACATGAATATCTTCATATCTGCTGCTTATTATTACTAGTACGTAG
TACAAATAACAATAAAAACGGAGATAATTGAAGGCCATTAATAAGATGTTAATGACCTTG
AAGCTAGTCTCTGATTAGTCGTTATATGACTGCAAGTCCTTGAACAAACCACAAGAAGTT
TCCCAAAGTTCTTTGCCAAGTTTGGGATCTCTAGAAGCTTTTGACGATTTTATGGTCCTT
CCATTTCCTCCAAAATAGTAAACACCTGATGTTTCTGGTGGAGCTAAAGCTGCATCGACA
GAAGATTCAGCTCCTTCATCAGGGGTTAGGAGGAGGCCAATAACTTTGAAAAAGAGAAAC
GCAGAAGCAGATGAATATTTAGGAAACTCGCGCAGTAAATTTGTTTTCACAAATCCAGGA
TCTGCAGCTATAACAGAAACATGGTGTGAATCATCTTTGAGGCGAAGCTGTCTGTGCAAT
TCATATGAGAAAAGTAGAAGGCATAATTTAGAATACTCGTAGACATGAGCATGAGGATAT
TCGTCAAATGTAGTGAAATGTTCTCCAGTTACATAATCCTTGTCAAGCTTCCCAATAGAG
GCATAACGATGTGAGAAAGACGCAACATTGACGACCCGTGAAGACACAGA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1AP59JQ 796 0 0
ATGAACCATGCATGCGTATCACCACATTTACTGTACATTTTAAACATGAATATCTGGTTG
GAAACAAAACATGAATATCTTCATATCTGCTGCTTATTATTACTAGTACGTAGTACAAAT
AACAATAAAAACGGAGATAATTGAAGGCCATTAATAAGATGTTAATGACCTTGAAGCTAG
TCTCTGATTAGTCGTTATATGACTGCAAGTCCTTGAACAAACCACAAGAAGTTTCCCAAA
GTTCTTTGCCAAGTTTGGGATCTCTAGAAGCTTTTGACGATTTTATGGTCCTTCCATTTC
CTCCAAAATAGTAAACACCTGATGTTTCTGGTGGAGCTAAAGCTGCATCGACAGAAGATT
CAGCTCCTTCATCAGGGGTTAGGAGGAGGCCAATAACTTTGAAAAAGAGAAACGCAAAAG
CAGATGAATATTTAGGAAACTCGCGCAGTAAATTTGTTTTCACAAATCCAGGATCTGCAG
CTATAACAGAGACATGGTGTGAATCATCTTTGAGGCGAAGCTGTCTGTGCAATTCATATG
AGAAAAGTAGAAGGCATAATTTAGAATACTCGTAGACATGAGCATGAGGATATTCGTCAA
ATGTAGTGAAATGTTCTCCAGTTACATAATCCTTGACAAGCTTCCCAATAGAGGCATAAC
GATGTGAGAAAGACGCAACATTGACGACCCGTGAAGACACAGAGCTATTTTTCAGAAGTG
GTAAAAGAAGTCTGGTCATAGTGAATGGACCAATATAGTTTGTAGTCATCATCCTGTCAT
AGCCATTATTGAGTGG

QA 1 796 1 796
DS 

RD RS1AP59TFB 821 0 0
CTCGTAGACATGAGCATGAGGATATTCGTCAAATGTAGTGAAATGTTCTCCAGTTACATA
ATCCTTGACAAGCTTCCCAATAGAGGCATAACGATGTGAGAAAGACGCAACATTGACGAC
CCGTGAAGACACAGAGCTATTTTTCAGAAGTGGTAAAAGAAGTCTGGTCATAGTGAATGG
ACCAATATAGTTTGTAGTCATCATCCTGTCATAGCCATTATTGAGTGGTCGACTAGAAAC
TGCCATGATCCCAGCATTGTTCACTAAAAGCTGAATCGAAGGATGTAACTTTTCGTCCGA
GAGCCATTGCTCTAGAGAGTCTTTAAAATTGAAAATTGATGAAAAACAAGACATGTCAAC
TACGAAAGATTTGAGTAATGCATCTTTGTTCTTGCTCTTGATTTCTTCCAAAGTCTCTGA
AAGAAGCTGAGGAGACCTTCCAACAAGAACAACGTGGAAGCCCTTCTCTGCAAGAGAAAA
TGCAGTGGCCTTACCAATTCCAGAAGTAGGACCAGTGATAACACAAATAGGTCTTGGAGA
TCCAAACTTTGGACCGATGGAACTAGAATTGGGAGTAGACTTCGATCCAAATATACTTGC
TTTAAGTAATTTCCAGTAGGAAGAATAGAGAGCCATACCCCAAAGAAACATGTTCCAAGA
AC*AGGTGACCATGCAAAACGTATTGCCTCCATCACGTCTTTAATCATTTTTGTAGATCC
AAAATGATTCAGGTAACCTCAAATACTTGAAACAAAACCCTATTCAAACGTTGAAGGAAG
GAGGGATTAGGAGTGAAGGTTGCTGCATGCATTTGATTTCC

QA 1 821 1 821
DS 

RD RS1C558TF 755 0 0
TGT
CAAGCTTCCCAATAGAGGCATAACGATGTGAGAAAGACGCAACATTGACGACC*GTGAAG
ACACAGAGCTATTTT*CAGAAGTGGTAAAAGAAGTCTGGTCATAGTGAATGGACCAATAT
AGTTTGTAGTCATCATCCTGTCATAGCCATTATTGAGTGGTCGACTAGAAACTGCCATGA
TCCCAGCATTGTTCACTAAAAGCTGAATCGAAGGATGTAACTTTTCGTCCGAGAGCCATT
GCTCTAGAGAGTCTTTAAAATTGAAAATTGATGAAAAACAAGACATGTCAACTACGAAAG
ATTTGAGTAGTGCATCTTTGTTCTTGCTCTTGATTTCTTCCAAAGTCTCTGAAAGAAGCT
GAGGAGACCTTCCAACAAGAACAACGTGGAAGCCCTTCTCTGCAAGAGAAAATGCAGTGG
CCTTACCAATTCCAGAAGTAGGACCAGTGATAACACAAATAGGTCTTGGAGATCCAAACT
TTGGACCGATGGAACTAGAATTGGGAGTAGACTTCGATCCAAATATACTTGCTTTAAGTA
ATTTCCAGTAGGAAGAATAGAGAGCCATACCCCAAAGAAACATGTTCCAAGAACTAGGTG
ACCATGCAAAACGTATTGCCTCCATCACGTCTTTAATCATTTTTGTAGATCCAAAATGAT
TCAGGTAACCTCAAATACTTGAAACAAAACCCTATTCAAACGTTGAAGGAAGGAGGGATT
AGGAGTGAAGGTTGCTGCATGCATTTGATTTC

QA 4 755 4 755
DS 



AS 1 4

CO CL3013Contig1 982 4 11 U
GGTAGATTTTGCAACGGCAAGATCCCTGCTGATTTTATAGCGGAATTTTTAGGAGTAAAA
CCAACTTTACCGCCATACTTGAAGCCAGGGCTAACCCAAGAAGATCTCATCACTGGTGTA
TCATTTGCTTCAGGTGGTTCTGGCTTCGATCCTTTGACACCTATCGTTGTAAGCGCGATA
CCGATGTCAAACCAGTTGACATATTTTCAAGAATACATTGAGAAAGTGAAAGGCTTTGTG
GGAAAAGAGAAAGCGGAGCATATAATATCCAAAAGTCTAGCCATTGTGGTTGCGGGCAGC
GATGATCTAGCTAATACATACTATGGTACACATGCAGAAGAATTATTATATGACATCGAT
GCATATACCTCCTATATGGCTAGCTCTGCTGCAAGTTTCGCTATGCAACTATATGAATCT
GGAGCAAGAAAGATAGGATTCATTGGTATATCACCAATAGGGTGTATACCGATACAAAGA
ACCGCAAGAGGGGGACTTAAGAGAAAGTGTGCTGATGAAGTAAACGTTGCAGCTCAGCTT
TTCAATACCAAACTCTCCAGAAGTTTGCATTCAGTGGCTGAGACCTTGGAAAATGGCACT
TTGGTGTATATTGATGTCTACGCTCTCTTCGCTCAAATGATCCAAAACCCAAAAGAATAT
GGATTTGATGAGATTGATAGAGGATGTTGCGGGACGGGGCTGGTCGAATTAG*CCCGCTT
TGCAACCAATTTACATCACTTCTGTGCAGCAATGTATCTTCTT*ATATGTTTTGGGACAG
TTACCATCCAACGGAAAGAGCTTATAGAATTTTAACCAAAAAGTTTATAGAGACTGACAT
GAGCCCTTTCTATGACAAATAGATTTAAGATGTGTCTGTTGTGATAAAATTTGGCTAAAT
AAAAGGTGTAACTCATTTGGTTTAATGTTTCTTTTGGTACTTATTTGGTATAATGTATAA
TATTAACATGGAACTAGGAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AC27JQ C 576
AF RS1FD79TF U 1
AF RS1AC27TF U 101
AF RS1FD79JQ C 207
BS 1 649 RS1FD79TF
BS 650 650 RS1AC27TF
BS 651 724 RS1FD79TF
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BS 763 763 RS1AC27TF
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BS 860 892 RS1AC27TF
BS 893 982 RS1FD79JQ

RD RS1AC27JQ 132 0 0
GGG
TGAGACCTTGGAAAATGGCACTTTGGTGTATATTGATGTTTACGCTTTTTTCGCTCAAAT
GATCCAAAACCCAAAAGAATATGGATTTGATGAGATTGATAGAGGATGTTGCGGGACGGG
GCTGGTCGA

QA 4 132 4 132
DS 

RD RS1FD79TF 819 0 0
GGTAGATTTTGCAACGGCAAGATCCCTGCTGATTTTATAGCGGAATTTTTAGGAGTAAAA
CCAACTTTACCGCCATACTTGAAGCCAGGGCTAACCCAAGAAGATCTCATCACTGGTGTA
TCATTTGCTTCAGGTGGTTCTGGCTTCGATCCTTTGACACCTATCGTTGTAAGCGCGATA
CCGATGTCAAACCAGTTGACATATTTTCAAGAATACATTGAGAAAGTGAAAGGCTTTGTG
GGAAAAGAGAAAGCGGAGCATATAATATCCAAAAGTCTAGCCATTGTGGTTGCGGGCAGC
GATGATCTAGCTAATACATACTATGGTACACATGCAGAAGAATTATTATATGACATCGAT
GCATATACCTCCTATATGGCTAGCTCTGCTGCAAGTTTCGCTATGCAACTATATGAATCT
GGAGCAAGAAAGATAGGATTCATTGGTATATCACCAATAGGGTGTATACCGATACAAAGA
ACCGCAAGAGGGGGACTTAAGAGAAAGTGTGCTGATGAAGTAAACGTTGCAGCTCAGCTT
TTCAATACCAAACTCTCCAGAAGTTTGCATTCAGTGGCTGAGACCTTGGAAAATGGCACT
TTGGTGTATATTGATGTCTACGCTCTCTTCGCTCAAATGATCCAAAACCTAAAAGAATAT
GGATTTGATGAGATTGATAGAGGATGTTGCGGGACGGGGCTGGTCGAATTAG*CCCGCTT
TGCA*CCAATTTACATCACTTCTGTGCAGCAATGTATCTTCT**ATATGTTTTGGGACAG
TTACCATCCAACGGAAAGAGCTTATAGAATTTTAACCAA

QA 1 819 1 819
DS 

RD RS1AC27TF 792 0 0
AG
GATCTCATCACTGGTGTATCATTTGCTTCAGGTGGTTCTGGCTTCGATCCTTTGACACCT
ATCGTTGTAAGCGCGATACCGATGTCAAACCAGTTGACATATTTTCAAGAATACATTGAG
AAAGTGAAAGTCTTTGTGGGAAAAGAGAAAGCGGAGCATATAATATCCAAAAGTCTAGCC
ATTGTGGTTGCGGGCAGCGATGATCTAGCTAATACATACTATGGTACACATGCAGAAGAA
TTATTATATGACATCGATGCATATACCTCCTATATGGCTAGCTCTGCTGCAAGTTTCGCT
ATGCAACTATATGAATCTGGAGCAAGAAAGATAGGATTCATTGGTATATCACCAATAGGG
TGTATACCGATACAAAGAACCGCAAGAGGGGGACTTAAGGGAAAGTGTGCTGATGAAGTA
AACGTTGCAGCTCAGCTTTTCAATACCAAACTCTCCAGAAGTTTGCATTCAGTGGCTGAG
ACCTTGGAAAATGGCACTTTGGTGTATATTGATGTCTACGCTCTCTTCGCTCAAATGATC
CAAAACCCAAAAGAATATGGATTTGATGAGATTGATAGAGGATGTTGCGGGACGGGGCTG
GTCGAATTAG*CCCGCTTTGCAACCAATTTACATCACTTCTGTGCAGCAATGTATCTTCT
TTATATGTTTTGGGACAGTTACCATCCAACGGAAAGAGCTTATAGAATTTTAACCAAAAA
GTTTATAGAGACTGACATGAGCCCTTTCTATGACAA*TAGATTTAAGATGTGTCTGTTGT
GATAAAATTT

QA 3 792 3 792
DS 

RD RS1FD79JQ 776 0 0
TCAAGAATACATTGAGAAAGTGAAAGGCTTTGTGGGAAAAGAGAAAGCGGAGCATATAAT
ATCCAAAAGTCTAGCCATTGTGGTTGCGGGCAGCGATGATCTAGCTAATACATACTATGG
TACACATGCAGAAGAATTATTATATGACATCGATGCATATACCTCCTATATGGCTAGCTC
TGCTGCAAGTTTCGCTATGCAACTATATGAATCTGGAGCAAGAAAGATAGGATTCATTGG
TATATCACCAATAGGGTGTATACCGATACAAAGAACCGCAAGAGGGGGACTTAAGAGAAA
GTGTGCTGATGAAGTAAACGTTGCAGCTCAGCTTTTCAATACCAAACTCTCCAGAAGTTT
GCATTCAGTGGCTGAGACCTTGGAAAATGGCACTTTGGTGTATATTGATGTTTACGCTCT
CTTCGCTCAAATGATCCAAAACCTAAAAGAATATGGATTTGATGAGATTGATAGAGGATG
TTGCGGGACGGGGCTGGTCGAATTAGGCCCGCTTTGCAACCAATTTACATCACTTCTGTG
CAGCAATGTATCTTCTT*ATATGTTTTGGGACAGTTACCATCCAACGGAAAGAGCTTATA
GAATTTTAACCAAAAAGTTTATAGAGACTGACATGAGCCCTTTCTATGACAAATAGATTT
AAGATGTGTCTGTTGTGATAAAATTTGGCTAAATAAAAGGTGTAACTCATTTGGTTTAAT
GTTTCTTTTGGTACTTATTTGGTATAATGTATAATATTAACATGGAACTAGGAATT

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 4

CO CL3014Contig1 936 4 3 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGGTCTTCTG
GGGATCACTCTGTCTTTTCATAGGAATCTTACTCATAGGAGCTTCAAGCTTCCTAAGTGG
CTTGAGTACTTGTTTGCTTATTGTGGAGCTCAGGCTCTTCAGGGGCACCCTATTGATTGG
GTGAGTACGCATAGGTACCATCATCAGTTTTGTGATTCGGACAAGGATCCTCATAGTCCG
CTTGAAGGGTTTTGGTTTAGTCACATGAATTGGATGTTTGATACCAATACTATCACGCAA
AGGGTTGGAGAGCCTAATAATGTTGGGGACTTGGAGAAGCAGCCCTTCTATCAGTTCCTT
AAAAACACCTACATTTGGCATCCGGTAGCTCTGGCGGTGGCTCTTTACGCAATGGGTGGC
TTCCCCTTCATCGTTTGGGGAATGGGTGTAAGAATAGTATGGGTATATCACATAACGTGG
CTTGTAAACTCAGCTTGTCACGTTTGGGGAAACCAAGCTTGGAACACTGGAGATTTGTCT
AAGAACAACTGGTGGGTAGCAGCTCTAGCATTTGGAGAAGGATGGCACAACAATCACCAT
GCTTTCGAGTTCTCTGCTAGACATGGACTTGAATGGTGGCAATTTGATATGACTTGGTAC
GTCGTTAGATTCCTCCAAGCCATTGGCTTAGCAACCGATGTTAAGCTGCCATCAGAAGCT
CAGAAAGAAAGAATGGCACTTACCACCAGTGATTGATGATAGTACGTAGTAACTATGTGC
TCACCACCGGAATCAAAACTGTTGTACGTTTCGAGCTATGAAAAATTAAAAGAGTTTTTG
TTTTTTTTGGGTGCCTTTACATATAAACGTATATATGTTCTATGCAAGAGAGTGTATGTG
AACAAAACTGATTATGAATTTTAAGTTTTATCTTCC


BQ
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TTC

QA 7 734 7 734
DS 

RD RS1AI64TF 734 0 0
GACTGC
GACGCCGGGAATCAGCAATGGGGGCGTACAAGTACGCGTCGGAGCTATGGAGGAAGAAGC
AGTCGGATGTGATGAGGTTTGTGCAGAGGGTTAGGTGCTGGGAGTATCGCCAGCAGCCTT
CCATTGTTCGTCTTGTTCGTCCCACCCGTCCAGACAAAGCTCGTCGTCTCGGCTACAAGG
CCAAGCAGGGGTTTGTTGTCTACCGTGTGCGTGTGAGACGTGGAGGGCGTAAGAGGCCTG
TGCCTAAGGGTATTGTCTATGGTAAACCCACAAACCAGGGAGTGACACAGCTCAAATTCC
AGCGTAGTAAGAGATCTGTTGCTGAGGAACGTGCTGGTCGCAAACTTGGTGGTCTCAGGG
TCGTCAACTCCTACTGGCTCAATGAGGACTCTACCTACAAGTATTACGAGATTATACTTG
TTGACCCTGCACACAATGCCGTTCGAAATGATCCCCGGATCAACTGGATCTGCAACCCAG
TGCACAAGCACAGAGAACTCAGAGGGCTCACCTCAGAGGGAAAGAAGAATCGTGGTCTTC
GTGGAAAGGGTCACAACAACCACAAGAACAGACCTTCCCGCAGGGCTACGTGGAAGAAGA
ACAACTCGCTATCTCTCCGTCGTTACCGGTGATCAACGTTATGTTTGGTTTTTTCTCGAG
TGGTGTATCTTCTGTGTGGATTTATGTTTCAGAATTACATTGGGATGGAATACTTTTTTA
CATTTGGT

QA 7 734 7 734
DS 

RD RS1AE58TF 757 0 0
GACGCCGGGAATCGGCAATGGGGGCGTACAAGTACGTGTCGGAGCTATGGAGGAAGAAGC
AGTCGGATGTGATGAGGTTTGTGCAGAGGGTTAGGTGCTGGGAGTATCGCCAGCAGCCTT
CCATTGTTCGTCTTGTTCGTCCCACCCGTCCAGGCAAAGCTCGTCGTCTCGGCTACAAGG
CCAAGCAGGGGTTTGTTGTCTACCGTGTGCGTGTGAGACGTGGAGGGCGTAAGAGGCCTG
TGCCTAAGGGTATTGTCTATGGTAA*CCCACAAACCAAGGAGTGACACAGCTCAAATTCC
AGCGTAGTAAGAGATCTGTTGCTGAGGAACGTGCTGGTCGCAAACTTGGTGGTCTCAGGG
TCGTCAACTCCTACTGGCTCAATGAGGACTCTACCTACAAGTATTACGAGATTATACTTG
TTGACCCTGCACACAATGCCGTTCGAAATGATCCCCGGATCAACTGGATCTGCAACCCAG
TGCACAAGCACAGAGAACTCAGAGGGCTCACCTCAGAGGGAAAGAAGAATCGTGGTCTTC
GTGGAAAGGGTCACAACAACCACAAGAACAGACCTTCCCGCAGGGCTACGTGGAAGAAGA
ACAACTCGCTATCTCTCCGTCGTTACCGGTGATCAACGTTATGTTTGGTTTTTTCTCGAG
TGGTGTATCTTCTGTGTGGATTTATGTTTCAGA*TTACATTGGGATGGAATACTTTTTTA
CATTTGGTTTCAATTTTTGAGTTCTTTGAATTTGACT

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 4

CO CL3016Contig1 941 4 6 U
GCTACCCGACCCAAGTTGTCAGATGCTGCTCCTAACACCCTTGGTGCAGCTTGCTTAGCG
TTACACTATGCTAACGTCATCATCGTGATAGAGAGATTTGTTGCATCTCCTCACTTGATA
GGAGATGATGCGAGAGACGATCTTTACAGCATGCTACCGGCGGCGTGAGAACGTCGCTGA
GAGAAAGGCTAAAGCCTTACTCTAAAAAACCTGAGTTCTTCCACGGTTTATGATCCAGGA
CTAGCGAAAGAATGGACAGACGCAATGGCGGGTATCTTGGAATGGTTGGGTCCGTTAGCT
CACAACATGATAAAATGGCAATCCGAGAGGAGTTACGAGCACCAAAGCTTGGTTTCGAGG
ACGCACATAGTTCTTGCACAAACCCTTTTCTTTGCAAACCAGCAGAAGACAGAAGCCATC
ATCACGGAGCTTCTTGTTGGGCTCAACTATGTCTGGAGATTTGGCAGAGAACTTAACGCC
AAGGCTCTTCAAGAGTGTACCCGTGATATAGCCCTTTAGAAATGCTTGGACACAGATAAC
TAGTGAAGCTCTCCAAGACTACATGTTTACTACCTCTTTGACCCAAACCGGCACTGGAAC
TCACCCCCGGGGAAACCAAACCGTGGGCAAGCCCAGTTGTCCAATGCAGCTAACCAAACC
AGAGGACAAAAAGCTGTTACATTGCTCGATTACCACGAGAGAGAGAGACGTATTATGATC
TGCACGTCTCTTTATTATCTTATCCCCTTTAGTACTCTGCTTCGTGGATTGCAAATTGTG
ACTTGTTTGTAGTAGGATGATGATGCATTTGTATATTGTTCTATGATTTTATTGTGGTTG
AGATACATTCATTTTACTGCATATACGTATGTGCCACTGTTGTTTATGTAGGTGATACAG
AAGAATTCGTGATTTTAAATTTAATGCTTGGTGTTTTTCTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 0 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1CH78TF U 1
AF RS1AE93TF U 1
AF RS1AE93JQ C 88
AF RS1CH78JQ C 202
BS 1 208 RS1AE93TF
BS 209 209 RS1AE93JQ
BS 210 792 RS1AE93TF
BS 793 820 RS1AE93JQ
BS 821 821 RS1CH78JQ
BS 822 941 RS1AE93JQ

RD RS1CH78TF 660 0 0
GCTACCCGACCCAAGTTGTCAGATGCTGCTCCTAACACCCTTGGTGCAGCTTGCTTAGCG
TTACACTATGCTAACGTCATCATCGTGATAGAGAGATTTGTTGCATCTCCTCACTTGATA
GGAGATGATGCGAGAGACGATCTTTACAGCATGCTACCGGCGGCGTGAGAACGTCGCTGA
GAGAAAGGCTAAAGCCTTACTCTAAAAA*CCTGAGTTCTTCCACGGTTTATGATCCAGGA
CTAGCGAAAGAATGGACAGACGCAATGGCGGGTATCTTGGAATGGTTGGGTCCGTTAGCT
CACAACATGATAAAATGGCAATCCGAGAGGAGTTACGAGCACCAAAGCTTGGTTTCGAGG
ACGCACATAGTTCTTGCACAAACCCTTTTCTTTGCAAACCAGCAGAAGACAGAAGCCATC
ATCACGGAGCTTCTTGTTGGGCTCAACTATGTCTGGAGATTTGGCAGAGAACTTAACGCC
AAGGCTCTTCAAGAGTGTACCCGTGATATAGCCCTTTAGAAATGCTTGGACACAGATAAC
TAGTGAAGCTCTCCAAGACTACATGTTTACTACCTCTTTGACCCAAACCGGCACTGGAAC
TCACCCCCGGGGAAACCAAACCGTGGGCAAGCCCAGTTGTCCAATGCAGCTAACCAAACC

QA 1 660 1 660
DS 

RD RS1AE93TF 792 0 0
GCTACCCGACCCAAGTTGTCAGATGCTGCTCCTAACACCCTTGGTGCAGCTTGCTTAGCG
TTACACTATGCTAACGTCATCATCGTGATAGAGAGATTTGTTGCATCTCCTCACTTGATA
GGAGATGATGCGAGAGACGATCTTTACAGCATGCTACCGGCGGCGTGAGAACGTCGCTGA
GAGAAAGGCTAAAGCCTTACTCTAAAAA*CCTGAGTTCTTCCACGGTTTATGATCCAGGA
CTAGCGAAAGAATGGACAGACGCAATGGCGGGTATCTTGGAATGGTTGGGTCCGTTAGCT
CACAACATGATAAAATGGCAATCCGAGAGGAGTTACGAGCACCAAAGCTTGGTTTCGAGG
ACGCACATAGTTCTTGCACAAACCCTTTTCTTTGCAAACCAGCAGAAGACAGAAGCCATC
ATCACGGAGCTTCTTGTTGGGCTCAACTATGTCTGGAGATTTGGCAGAGAACTTAACGCC
AAGGCTCTTCAAGAGTGTACCCGTGATATAGCCCTTTAGAAATGCTTGGACACAGATAAC
TAGTGAAGCTCTCCAAGACTACATGTTTACTACCTCTTTGACCCAAACCGGCACTGGAAC
TCACCCCCGGGGAAACCAAACCGTGGGCAAGCCCAGTTGTCCAATGCAGCTAACCAAACC
AGAGGACAAAAAGCTGTTACATTGCTCGATTACCACGAGAGAGAGAGACGTATTATGATC
TGCACGTCTCTTTATTATCTTATCCCCTTTAGTACTCTGCTTCGTGGATTGCAAATTGTG
ACTTGTTTGTAG

QA 1 792 1 792
DS 

RD RS1AE93JQ 854 0 0
ATAGAGAGATTTGTTGCATCTCCTCACTTGATAGGAGATGATGCGAGAGACGATCTTTAC
AGCATGCTACCGGCGGCGTGAGAACGTCGCTGAGAGAAAGGCTAAAGCCTTACTCTAAAA
AACCTGAGTTCTTCCACGGTTTATGATCCAGGACTAGCGAAAGAATGGACAGACGCAATG
GCGGGTATCTTGGAATGGTTGGGTCCGTTAGCTCACAACATGATAAAATGGCAATCCGAG
AGGAGTTACGAGCACCAAAGCTTGGTTTCGAGGACGCACATAGTTCTTGCACAAACCCTT
TTCTTTGCAAACCAGCAGAAGACAGAAGCCATCATCACGGAGCTTCTTGTTGGGCTCAAC
TATGTCTGGAGATTTGGCAGAGAACTTAACGCCAAGGCTTTTCAAGAGTGTACCCGTGAT
ATAGCCCTTTAGAAATGCTTGGACACAGATAACTAGTGAAGCTTTCCAAGACTACATGTT
TACTACCTCTTTGACCCAAACCGGCACTGGAACTCACCCCCGGGGAAACCAAACCGTGGG
CAAGCCCAGTTGTCCAATGCAGCTAACCAAACCAGAGGACAAAAAGCTGTTACATTGCTC
GATTACCACGAGAGAGAGAGACGTATTATGATCTGCACGTCTCTTTATTATCTTATCCCC
TTTAGTACTTTGCTTCGTGGATTGCAAATTGTGACTTGTTTGTAGTAGGATGATGATGCA
TTTGTATATTGTTTTATGATTTTATTGTGGTTGAGATACATTCATTTTACTGCATATACG
TATGTGCCACTGTTGTTTATGTAGGTGATACAGAAGAATTCGTGATTTTAAATTTAATGC
TTGGTGTTTTTCTT

QA 1 854 1 854
DS 

RD RS1CH78JQ 740 0 0
CTCT
AAAAACTGAGTTCTTCCACGGTTTATGATCCAGGACTAGCGAAAGAATGGACAGACGCAA
TGGCGGGTATCTTGGAATGGTTGGGTCCGTTAGCTCACAACATGATAAAATGGCAATCCG
AGAGGAGTTACGAGCACCAAAGCTTGGTTTCGAGGACGCACATAGTTCTTGCACAAACCC
TTTTCTTTGCAAACCAGCAGAAGACAGAAGCCATCATCACGGAGCTTCTTGTTGGGCTCA
ACTATGTCTGGAGATTTGGCAGAGAACTTAACGCCAAGGCTCTTCAAGAGTGTACCCGTG
ATATAGCCCTTTAGAAATGCTTGGACACAGATAACTAGTGAAGCTCTCCAAGACTACATG
TTTACTACCTCTTTGACCCAAACCGGCACTGGAACTCACCCCCGGGGAAACCAAACCGTG
GGCAAGCCCAGTTGTCCAATGCAGCTAACCAAACCAGAGGACAAAAAGCTGTTACATTGC
TCGATTACCACGAGAGAGAGAGACGTATTATGATCTGCACGTCTCTTTATTATCTTATCC
CCTTTAGTACTCTGCTTCGTGGATTGCAAATTGTGACTTGTTTGTAGTAGGATGATGATG
CATTTGTATATTGTTCTATGATTTTATTGTGGTTGAGATACATTCATTTTACTGCATATA
CGTATGTGCCACTGTTGTTTATGTAGGTGATACAGAAGAATTCGTGATTTTAAATTTAAT
GCTTGGTGTTTTTCTT

QA 5 740 5 740
DS 



AS 1 4

CO CL3017Contig1 739 4 5 U
CAGGTCTCCAGTGTCTAACTACGAGTTTCAGTTTTACCAACTTCCTCCCGGTAGTCCACT
CGCTCAGCTTATCTCGCCCAGCTCGGTTATCTCCGGTTCTGGTGCAGCTTCTCCGTTTCC
TGACGGAGTCGCTCACTTTCAAGTCTCTGATCCACCAAAGCTGCTGAGCCCTGGGAAACT
GCGTTGCTCTAAGACCGTTACAGCTCCTAAAGAGCACATGAAGATTGCGAGACCAAATAA
ACCGGTTTCGTTCGATCTTGACGCGGATCATTTCATTAGATGCGTTGATCAGAAGCTGAG
AACAACGTTCCCTGAAGCGTCTACGTCGTCTCTTCAAGAGGCAGCGCAGCATTCCTCTCT
CGGGGGGCCGAGTAAGGAGTTCGATTTTGGCACCACGGATGGGAAACATTTGACCGTTGA
TGATGAACATAGAGATTCGACCAAGAACAGCAGCGATTGGTCCTTCCCTGTGATGCAATC
AGGCACACTTAGCTAACCTTCAAGGCTTCTCCTCAAGATCTAGTTATTTAGAATCTGAAT
TTTAGAATCTGAAATAATGTTCAGGATCTTAGGGACAGTTTATTGTCTCTCTTTATTGGT
TTTGTAATAAATATTTGATCAGTTGTTGTATATGGCTGTCTTTTATGTAGTTCTTTTCAA
TTTGTGCACATATATATATTGATCGCATTTGTAAACAGTTTTTTCAGACAAGTTCCAATG
AGTCTTAGATGCTTCAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1A139TR C 334
AF RS1A139JQ C 1
AF RS1A139TF U 106
AF RS1A139TV U 48
BS 1 47 RS1A139JQ
BS 48 105 RS1A139TV
BS 106 710 RS1A139TF
BS 711 711 RS1A139TV
BS 712 739 RS1A139TF

RD RS1A139TR 382 0 0
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CACGGATGGGAAACATTTGACCGTTGATGATGAACATAGAGATTCGACCAAGAACAGCAG
CGATTGGTCCTTCCCTGTGATGCAATCAGGCACACTTAGCTAACCTTCAAGGCTTCTCCT
CAAGATCTAGTTATTTAGAATCTGAATTTTAGAATCTGAAATAATGTTCAGGATCTTAGG
GACAGTTTATTGTCTCTCTTTATTGGTTTTGTAATAAATATTTGATCAGTTGTTGTATAT
GGCTGTCTTTTATGTAGTTCTTTTCAATTTGTGCACATATATATATTGATCGCATTTGTA
AACAGTTTTTTCAGACA
AGTTC

QA 1 377 1 377
DS 

RD RS1A139JQ 739 0 0
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CGCTCAGCTTATCTCGCCCAGCTCGGTTATCTCCGGTTCTGGTGCAGCTTCTCCGTTTCC
TGACGGAGTCGCTCACTTTCAAGTCTCTGATCCACCAAAGCTGCTGAGCCCTGGGAAACT
GCGTTGCTCTAAGACCGTTACAGCTCCTAAAGAGCACATGAAGATTGCGAGACCAAATAA
ACCGGTTTCGTTCGATCTTGACGCGGATCATTTCATTAGATGCGTTGATCAGAAGCTGAG
AACAACGTTCCCTGAAGCGTTTACGTCGTCTCTTCAAGAGGCAGCGCAGCATTCCTCTCT
CGGGGGGCCGAGTAAGGAGTTCGATTTTGGCACCACGGATGGGAAACATTTGACCGTTGA
TGATGAACATAGAGATTCGACCAAGAACAGCAGCGATTGGTCCTTCCCTGTGATGCAATC
AGGCACACTTAGCTAACCTTCAAGGCTTCTCCTCAAGATCTAGTTATTTAGAATCTGAAT
TTTAGAATCTGAAATAATGTTCAGGATCTTAGGGACAGTTTATTGTCTCTCTTTATTGGT
TTTGTAATAAATATTTGATCAGTTGTTGTATATGGCTGTCTTTTATGTAGTTCTTTTCAA
TTTGTGCACATATATATATTGATCGCATTTGTAAACAGTTTTTTCAGACAAGTTCCAATG
AGTCTTAGATGCTTCAGTT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1A139TF 634 0 0
AGCTTCTCCGTTTCCTGACGGAGTCGCTCACTTTCAAGTCTCTGATCCACCAAAGCTGCT
GAGCCCTGGGAAACTGCGTTGCTCTAAGACCGTTACAGCTCCTAAAGAGCACATGAAGAT
TGCGAGACCAAATAAACCGGTTTCGTTCGATCTTGACGCGGATCATTTCATTAGATGCGT
TGATCAGAAGCTGAGAACAACGTTCCCTGAAGCGTCTACGTCGTCTCTTCAAGAGGCAGC
GCAGCATTCCTCTCTCGGGGGGCCGAGTAAGGAGTTCGATTTTGGCACCACGGATGGGAA
ACATTTGACCGTTGATGATGAACATAGAGATTCGACCAAGAACAGCAGCGATTGGTCCTT
CCCTGTGATGCAATCAGGCACACTTAGCTAACCTTCAAGGCTTCTCCTCAAGATCTAGTT
ATTTAGAATCTGAATTTTAGAATCTGAAATAATGTTCAGGATCTTAGGGACAGTTTATTG
TCTCTCTTTATTGGTTTTGTAATAAATATTTGATCAGTTGTTGTATATGGCTGTCTTTTA
TGTAGTTCTTTTCAATTTGTGCACATATATATATTGATCGCATTTGTAAACAGTTTTTTC
AGACA*GTTCCAATGAGTCTTAGATGCTTCAGTT

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1A139TV 692 0 0
CCGGTAGTCCACTCGCTCAGCTTATCTCGCCCAGCTCGGTTATCTCCGGTTCTGGTGCAG
CTTCTCCGTTTCCTGACGGAGTCGCTCACTTTCAAGTCTCTGATCCACCAAAGCTGCTGA
GCCCTGGGAAACTGCGTTGCTCTAAGACCGTTACAGCTCCTAAAGAGCACATGAAGATTG
CGAGACCAAATAAACCGGTTTCGTTCGATCTTGACGCGGATCATTTCATTAGATGCGTTG
ATCAGAAGCTGAGAACAACGTTCCCTGAAGCGTCTACGTCGTCTCTTCAAGAGGCAGCGC
AGCATTCCTCTCTCGGGGGGCCGAGTAAGGAGTTCGATTTTGGCACCACGGATGGGAAAC
ATTTGACCGTTGATGATGAACATAGAGATTCGACCAAGAACAGCAGCGATTGGTCCTTCC
CTGTGATGCAATCAGGCACACTTAGCTAACCTTCAAGGCTTCTCCTCAAGATCTAGTTAT
TTAGAATCTGAATTTTAGAATCTGAAATAATGTTCAGGATCTTAGGGACAGTTTATTGTC
TCTCTTTATTGGTTTTGTAATAAATATTTGATCAGTTGTTGTATATGGCTGTCTTTTATG
TAGTTCTTTTCAATTTGTGCACATATATATATTGATCGCATTTGTAAACAGTTTTTTCAG
ACAAGTTCCAATGAGTCTTAGATGCTTCAGTT

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 4

CO CL3018Contig1 821 4 8 U
AAATTAAAACTCTCAATTTCACTATATTCCCTAAAAAAAAGAATTCATATTTGCTTTTCT
AGAACTCAAATTATTTTCAAGTTCTCTGTTTGATTATCGAGAAACATGACTATTGCTTTA
ACGATCGGAGGAAGTGGGTTCTCTGGTCTACCCGGATCTTCGTTTTCCTCATCTTCTTCA
TCGCTCCGATTGAAGAACAGCAGACGAAAGGACACGAAGATGCTGAACAGGAAAGGAGTC
ATCTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCGTATAAGACCCTTAGGATCCGACCCGATTCA
TCTGAGTACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCCTGATGTT
TGCAGAGGAAGCAACTGTGGAGTGCAGTTTCAGACAATCAACGAAGCTTACGATATTGTG
TTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAGTTTCAGCCATTCGATGTCTAT
GAAGAGGGATTCAACGGAATGAACGATCCAGATTGTGACACGTGGGAGGAATGGATGGG*
ATGGGAAGGTGCAGGAACCAGAGACTACTCCTCTCACGTGAATCCTTACGCGTGAAGACG
ACGGTGACCGACTTGGCAATGATTGTATGCAGATAAAATAACAACAGAGAGAGACAGACT
GTAAGATCAATGTAAATAGTTGAAATTGTCTCTCTTGAATGGCTCTTAAATGTAAATAAA
GTCATTTCTATGTTATGTAAAATTCTCAAAGATTCAGTGATTAGCTTAAAAGCCTTCCTG
AATTTGGATCTAATGATAATAATTTGGATTCGAAGTTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C174TF U 97
AF RS1BI83TF U 1
AF RS1BI83JQ C 59
AF RS1C174JQ C 97
BS 1 385 RS1BI83TF
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BS 387 539 RS1BI83TF
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BS 774 774 RS1C174JQ
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RD RS1C174TF 441 0 0
G
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AGATGCTGAACAGGAAAGGAGTCATCTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCGTATAAGA
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ACACGTGGGAGGAATGGATG

QA 2 441 2 441
DS 

RD RS1BI83TF 550 0 0
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AGAACTCAAATTATTTTCAAGTTCTCTGTTTGATTATCGAGAAACATGACTATTGCTTTA
ACGATCGGAGGAAGTGGGTTCTCTGGTCTACCCGGATCTTCGTTTTCCTCATCTTCTTCA
TCGCTCCGATTGAAGAACAGCAGACGAAAGGACACGAAGATGCTGAACAGGAAAGGAGTC
ATCTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCGTATAAGACCCTTAGGATCCGACCCGATTCA
TCTGAGTACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCCTGATGTT
TGCAGAGGAAGCAACTGTGGAGTGCGGTTTCAGACAATCAACGAAGCTTACGATATTGTG
TTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAGTTTCAGCCATTCGATGTCTAT
GAAGAGGGATTCAACGGAATGAACGATCCAGATTGTGACACGTGGGAGGAATGGATGGGG
ATGGGAAGGT

QA 1 550 1 550
DS 

RD RS1BI83JQ 763 0 0
CTAGAACTCAAATTATTTTCAAGTTCTCTGTTTGATTATCGAGAAACATGACTATTGCTT
TAACGATCGGAGGAAGTGGGTTCTCTGGTCTACCCGGATCTTCGTTTTCCTCATCTTCTT
CATCGCTCCGATTGAAGAACAGCAGACGAAAGGACACGAAGATGCTGAACAGGAAAGGAG
TCATCTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCGTATAAGACCCTTAGGATCCGACCCGATT
CATCTGAGTACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCGCCAAAAAGTATCATCCTGATG
TTTGCAGAGGAAGCAACTGTGGAGTGCGGTTTCAGACAATCAACGAAGCTTACGATATTG
TGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGGAGTTTCAGCCATTCGATGTCT
ATGAAGAGGGATTCAACGGAATGAACGATCCAGATTGTGACACGTGGGAGGAATGGATGG
G*ATGGGAAGGTGCAGGAACCAGAGACTACTCCTCTCACGTGAATCCTTACGCGTGAAGA
CGACGGTGACCGACTTGGCAATGATTGTATGCAGATAAAATAACAACAGAGAGAGACAGA
CTGTAAGATCAATGTAAATAGTTGAAATTGTCTCTCTTGAATGGCTCTTAAATGTAAATA
AAGTCATTTCTATGTTATGTAAAATTCTCAAAGATTCAGTGATTAGCTTAAAAGCTTTCC
TGAATTTGGATCTAATGATAATAATTTGGATTCGAAGTTTGTT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RS1C174JQ 714 0 0
G
CGAGAAACATGACTATTGCTTTAACGATCGGAGGAAGTGGGTTCTCTGGTCTACCCGGAT
CTTCGTTTTCCTCATCTTCTTCATCGCTCCGATTGAAGAACAGCAGACGAAAGGACACGA
AGATGCTGAACAGGAAAGGAGTCATCTGTTCTTCATCTTCTGTAATGGATCCGTATAAGA
CCCTTAGGATCCGACCCGATTCATCTGAGTACGAGGTCAAGCAAGCTTTCAGACAACTCG
CCAAAAAGTATCATCCTGATGTTTGCAGAGGAAGCAACTGTGGAGTGCAGTTTCAGACAA
TCAACGAAGCTTACGATATTGTGTTGAAGCAAATAAAGAATCAGATGGAGGGAACAGAGG
AGTTTCAGCCATTCGATGTCTATGAAGAGGGATTCAACGGAATGAACGATCCAGATTGTG
ACACGTGGGAGGAATGGATGGG*ATGGGAAGGTGCAGGAACCAGAGACTACTCCTCTCAC
GTGAATCCTTACGCGTGAAGACGACGGTGATCGACTTGGCAATGATTGTATGCAGATAAA
ATAACAACAGAGAGAGACAGACTGTAAGATCAATGTAAATAGTTGAAATTGTCTCTCTTG
AATGGCTCTTAAATGTAAATAAAGTCATTTCTATGTTATGTAAAATTCTCAAAGATTCAG
TGATTAGCTTAAAAGCCTTCCTGAATTTGGATCTAATGATAATAATTTGGATT

QA 2 714 2 714
DS 



AS 1 4

CO CL3019Contig1 1210 4 4 U
GATTGTCGTTAATCAGTTCTCTGTATCCGGAAGCCTGAGGAAGGCATTGATCTGTTTATG
GTGGAGATAATGCACATGCGCCGCAAGTTCGACGTTGACACACGATTGGTCGAGGGGCTT
GTTCTAGACCATGGTTCGAGACACCCTGATATGAAACGACGCGCAGAGAATTGCCACATC
CTGACTTGCAATGTGTCGCTGGAGTATGAGAAGAGTGAAATCAATGCAGGGTTTTTCTAC
TCTAATGCGGAGCAGAGGGAAGCCATGGTTACTGCCGAGAGGAAATCTGTTGATGAAAGA
GTTCAGAAAATTATCGATCTGAAGAACAAGGTGTGTGCTGGTAATGATAACAACTTTGTT
ATCATCAACCAAAAGGGTATTGACCCACCATCGTTGGATATTCTTGCTAGAGAAGGGATT
ATTGCCCTTCGAAGAGCAAAGAGGAGGAACATGGAACGTTTAGTTTTGGCATGTGGTGGA
GATGCTGTGAATTCTGTTGACGACTTGACCCCTGAGTCGCTTGGATGGGCTGGACTTGTC
TATGAGCACGTTCTTGGAGAGGAAAAGTACACCTTCGTGGAGCAAGTGAAGAACCCTAAT
TCGTGTACCATCCTCATCAAAGGGCCTAATGACCACACCATTGCTCAAATTAAAGATGCG
GTTCGTGATGGTTTAAGATCGGTCAAGAACACCATAGAAGACGAGTGTGTTGTGCTAGGA
GCAGGAGCTTTTGAAGTTGCAGCAAGACATCACTTACTCAATGAAGTCAAGAAAACCGTT
AAGGGACGTGCCCAACTTGGCGTAGAAGCTTTTGCTAATGCCCTTCTCGTGGTGCCCAAG
ACACTTGCAGAAAACGCAGGTCTTGACACCCAAGACGTGATCATTTCTCTAACGAGCGAG
CATGACAAAGGAAACGTAGTGGGATTGAACATTGAGGACGGTGAACCAATTGACCCGCAG
CTCGCTGGTATTTTCGACAATTACTCAGTGAAACGCCAACTTATCAACTCAGGGCCAGTG
ATTGCCTCACAGCTGCTTTTGGTGGACGAAGTGATTCGTGCAGGAAGAAATATGAGGAAG
CCTACTTGAAGCCCTTTGCTTTTTAACTTGCTTTTCTTCGTTCTGAGCATCTCAAGTTCT
TGTCTTTTTGTTTTAACCCTGAAAGTTGTGTGAAACCTATGTTTTGTTATGAGAAACATC
TTTTAATCCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1GH64TF U 1
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AF RS1EU02JQ C 516
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GTTCTAGACCATGGTTCGAGACACCCTGATATGAAACGACGCGCAGAGAATTGCCACATC
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GTTCAGAAAATTATCGATCTGAAGAACAAGGTGTGTGCTGGTAATGATAACAACTTTGTT
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ATTGCCCTTCGAAGAGCAAAGAGGAGGAACATGGAACGTTTAGTTTTGGCATGTGGTGGA
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GTTCGTGATGGTTTAAGA

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GTGGAGATAATGCACATGCGCCGCAAGTTCGACGTTGACACACGATTGGTCGAGGGGCTT
GTTCTAGACCATGGTTCGAGACACCCTGATATGAAACGACGCGCAGAGAATTGCCACATC
CTGACTTGCAATGTGTCGCTGGAGTATGAGAAGAGTGAAATCAATGCAGGGTTTTTCTAC
TCTAATGCGGAGCAGAGGGAAGCCATGGTTACTGCCGAGAGGAAATCTGTTGATGAAAGA
GTTCAGAAAATTATCGATCTGAAGAACAAGGTGTGTGCTGGTAATGATAACAACTTTGTT
ATCATCAACCAAAAGGGTATTGACCCACCATCGTTGGATATTCTTGCTAGAGAAGGGATT
ATTGCCCTTCGAAGAGCAAAGAGGAGGAACATGGAACGTTTAGTTTTGGCATGTGGTGGA
GATGCTGTGAATTCTGTTGACGACTTGACCCCTGAGTCGCTTGGATGGGCTGGACTTGTC
TATGAGCACGTTCTTGGAGAGGAAAAGTACACCTTCGTGGAGCAAGTGAAGAACCCTAAT
TCGTGTACCATCCTCATCAAAGGGCCTAATGACCACACCATTGCTCAAATTAAAGATGCG
GTTCGTGATGGTTTAAGATCGGTCAAGAACACCATAGAAGACGAGTGTGTTGTGCTAGGA
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TGAAGTC

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TTCTGTTGACGACTTGACCC*TGAGTCGCTTGGATGGGCTGGACTTGTCTATGAGCACGT
TCTTGGAGAGGAAAAGTACACCTTCGTGGAGCAAGTGAAGAACCCTAATTCGTGTACCAT
CCTCATCAAAGGGCCTAATGACCACACCATTGCTCAAATTAAGGATGCGGTTCGTGATGG
TTTAAGATCGGTCAAGAACACCATAGAAGACGAGTGTGTTGTGCTAGGAGCAGGAGCTTT
TGAAGTTGCAGCAAGACATCACTTACTCAATGAAGTCAAGAAAACCGTTAAGGGACGTGC
CCAACTTGGCGTAGAAGCTTTTGCTAATGCCCTTCTCGTGGTGCCCAAGACACTTGCAGA
AAACGCAGGTCTTGACACCCAAGACGTGATCATTTCTCTAACGAGCGAGCATGACAAAGG
AAACGTAGTGGGATTGAACATTGAGGACGGTGAACCAATTGACCCGCAGCTCGCTGGTAT
TTTCGACAATTACTCAGTGAAACGCCAACTTATCAACTCAGGGCCAGTGATTGCCTCACA
GCTGCTTTTGGTGGACGAAGTGATTCGTGCAGGAAGAAATATGAGGAAGCCTACTTGAAG
CCCTTTGCTTTTTAACTTGCTTTTCTTCGTTCTGAGCATCTCAAGTTCTTGTCTTTTTGT
TTTAACCCTGAAAGTTGTGTGAAACCTATGTTTTGTTATGAGAAACATCTTTTAATCCG

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CGTGGAGCAAGTGAAGAACCCTAATTCGTGTACCATCCTCATCAAAGGGCCTAATGACCA
CACCATTGCTCAAATTAAGGATGCGGTTCGTGATGGTTTAAGATCGGTCAAGAACACCAT
AGAAGACGAGTGTGTTGTGCTAGGAGCAGGAGCTTTTGAAGTTGCAGCAAGACATCACTT
ACTCAATGAAGTCAAGAAAACCGTTAAGGGACGTGCCCAACTTGGCGTAGAAGCTTTTGC
TAATGCCCTTCTCGTGGTGCCCAAGACACTTGCAGAAAACGCAGGTCTTGACACCCAAGA
CGTGATCATTTCTCTAACGAGCGAGCATGACAAAGGAAACGTAGTGGGATTGAACATTGA
GGACGGTGAACCAATTGACCCGCAGCTCGCTGGTATTTTCGACAATTACTCAGTGAAACG
CCAACTTATCAACTCAGGGCCAGTGATTGCCTCACAGCTGCTTTTGGTGGACGAAGTGAT
TCGTGCAGGAAGAAATATGAGGAAGCCTACTTGAAGCCCTTTGCTTTTTAACTTGCTTTT
TTTCGTTTTGAGCATCTCAAGTTCTTGTCTTTTTGTTTTAACCCTGAAAGTTGTGTGAAA
CCTATGTTTTGTTATGAGAAACATCTTTTAATCCG

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 4

CO CL3020Contig1 988 4 2 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGCATCTCTC
TGATTCTAGAGAACGCTTCGGCGACGAGAAGATCTAATACACAATGGCGTCTGGGATCGT
CGGAGGAGGCGGATCCTTATCGGAGGTATACAGCAGCGCTAAAAAGATCCTACTCAGAGC
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TCTCACATCCTCCGTGAAACGCGACATCACCGAGGTGCAATCTCTCTGCTCCACCATGGA
TGCTCTCTGGCGCTCAATCTCCGTCAAATCCCAACGCGATCTCTGGCGAAGGAAGACTGA
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AGGAGCGCACATCTTGCAGATATTCGATGACGAGGCTCAGGCGATGAGCTCTGTCAAGAA
CTCGAAGAGATTGCTAGAAGACTCCTTCTCTAGTGGAGTTGCTATACTCGCCAAGTATGC
TGAACAAAGGGATCGTCTGAAGAGGGCACAGCGTAAAGCTTTGGATGTTCTGAACACGGT
GGGGCTCTCCAACTCTGTGCTCAGGCTCATTGAGAGGCGCAATCGCGTTGACACCTGGAT
TAAGTATGCCGGTATGATCGCTACGATTGTCGTATTGTATCTGTTCATAAAATGGACTCG
CTGAATCTCTTAAGGAAAATTGGAAACGACTTTAGTTACACTGAATTGTATGTAGAGAGT
TATGGGTAAAGGATGCACTTTTGTTTTGCTTATGACTCTTACAAGACTTCTCCCCCGCAT
CTTATATAGTTGTTCATCAAAAGTTTGAGTTTGTCAAAATGTGTCTCCCTTTCCCTTGCT
TATTCATTGATAAAACCATTTTCTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1A019TF U 29
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AF RS1A019JQ C 218
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BS 884 988 RS1A019JQ

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AAGATCTAATACACAATGGCGTCTGGGATCGTCGGAGGAGGCGGATCCTTATCGGAGGTA
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ACCGAGGTGCAATCTCTCTGCTCCACCATGGATGCTCTCTGGCGCTCAATCTCCGTCAAA
TCCCAACGCGATCTCTGGCGAAGGAAGACTGAACAAGTTGGGGAAGAGGCTGAGTATTTG
AACAAGAGTCTGGAGAAGTACACGTGGAGGAGTCAGAGGAAGATGATGGAAGCTAAAGAG
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GACGAGGCTCAGGCGATGAGCTCTGTCAAGAACTCGAAGAGATTGCTAGAAGACTCCTTC
TCTAGTGGAGTTGCTATACTCGCCAAGTATGCTGAACAAAGGGATCGTCTGAAGAGGGCA
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ATTGAGAGGCGCAATCGCGTTGACACCTGGATTAAGTATGCCGGTATGATCGCTACGATT
GTCGTATTGTATCTGTTCATAAAATGGACTCGCTGAATCTCT

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DS 

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CGGAGGAGGCGGATCCTTATCGGAGGTATACAGCAGCGCTAAAAAGATCCTACTCAGAGC
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TCTCACATCCTCCGTGAAACGCGACATCACCGAGGTGCAATCTCTCTGCTCCACCATGGA
TGCTCTCTGGCGCTCAATCTCCGTCAAATCCCAACGCGATCTCTGGCGAAGGAAGACTGA
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AGGAGCGCACATCTTGCAGATATTCGATGACGAGGCTCAGGCGATGAGCTCTGTCAAGAA
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TGAACAAAGGGATCGTCTGAAGAGGGCACAGCGTAAAGCTTTGGATGTTCTGAACACGGT
GGGGCTCTCCAACTCTGTGCTCAGGCTCATTGAGAGGCGCAATCGCGTTGACACCTGGAT
TAAGTATGCCGGTATGATCGCTACGATTGTCGTATTGTATCTGTTCATAAAATGGACTCG
CTGAATCTCTTAAGGAAAATTGGAAACGACTTTAGTTACACTGAATTGTATGTAGAGAGT
TATGGGTAAAGGATGCACTTTTGTTTTGCTTATGACTCTTACA
GACTTCT

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DS 

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CTGGAGAAGTACACGTGGAGGAGTCAGAGGAAGATGATGGAAGCTAAAGAGAGGGCGGAT
TTGTTGAACAGAGGGAGCGGAGAAGGAGCGCACATCTTGCAGATATTCGATGACGAGGCT
CAGGCGATGAGCTCTGTCAAGAACTCGAAGAGATTGCTAGAAGACTCCTTCTCTAGTGGA
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GCTTTGGATGTTCTGAACACGGTGGGGCTCTCCAACTCTGTGCTCAGGCTCATTGAGAGG
CGCAATCGCGTTGACACCTGGATTAAGTATGCCGGTATGATCGCTACGATTGTCGTATTG
TATCTGTTCATAAAATGGACTCGCTGAATCTCTTAAGGAAAATTGGAAACGACTTTAGTT
ACACTGAATTGTATGTAGAGAGTTATGGGTAAAGGATGCACTTTTGTTTTGCTTATGACT
CTTACAAGACTTCTCCCCCGCATCTTATATAGTTGTTCATCAAAAGTTTGAGTTTGTCAA
AATGTGTCTCCCTTTCCCTTGCTTATTCATTGATAAAACCATTTTCTTACC

QA 1 771 1 771
DS 

RD RS1A019TR 690 0 0
GATGCTCTCTGGCGCTCAATCTCCGTCAAATCCCAACGCGATCTCTGGCGAAGGAAGACT
GAACAAGTTGGGGAAGAGGCTGAGTATTTGAACAAGAGTCTGGAGAAGTACACGTGGAGG
AGTCAGAGGAAGATGATGGAAGCTAAAGAGAGGGCGGATTTGTTGAACAGAGGGAGCGGA
GAAGGAGCGCACATCTTGCAGATATTCGATGACGAGGCTCAGGCGATGAGCTCTGTCAAG
AACTCGAAGAGATTGCTAGAAGACTCCTTCTCTAGTGGAGTTGCTATACTCGCCAAGTAT
GCTGAACAAAGGGATCGTCTGAAGAGGGCACAGCGTAAAGCTTTGGATGTTCTGAACACG
GTGGGGCTCTCCAACTCTGTGCTCAGGCTCATTGAGAGGCGCAATCGCGTTGACACCTGG
ATTAAGTATGCCGGTATGATCGCTACGATTGTCGTATTGTATCTGTTCATAAAATGGACT
CGCTGAATCTCTTAAGGAAAATTGGAAACGACTTTAGTTACACTGAATTGTATGTAGAGA
GTTATGGGTAAAGGATGCACTTTTGTTTTGCTTATGACTCTTACAAGACTTCTCCCCCGC
ATCTTATATAGTTGTTCATCAAAAGTTTGAGTTTGTCAAAATGTGTCTCCCTTTCCCTTG
CTTATTCATTGATAAAACCATTTTCTTACC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 4

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TGGCGCTGTTATCCGTGGAAAGAAGGGAGCGGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACA
GTCATGTGTGTTTGGGATCTATGAAGAACCCGTGACACCAGGACAGTGCAACATGGTCGT
CGAGAGGCTGGGTGATTACCTCCTCGAACAAGATCTCTAAGCCACCACCTCATCAAACGA
ATATATAGGATTTGGTTTTTGGTTTCTGGATTCTCTCTTAAGAAGCTGAAGCCTTAATCA
ATGTCTGATTCTTAAAAAATGGTTTTCTTGGTTTCATACATTTCATTTTGTTTTTTTTTC
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TCACACTGCCAAGT


BQ
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 0 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RS1CB47TF U 1
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AF RS1AP12JQ C 1
AF RS1CB47JQ C 1
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RD RS1CB47TF 716 0 0
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QA 1 716 1 716
DS 

RD RS1AP12TFB 708 0 0
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DS 

RD RS1AP12JQ 734 0 0
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TGGCGCTGTTATCCGTGGAAAGAAGGGAGCGGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACA
GTCATGTGTGTTTGGGATCTATGAAGAACCCGTGACACCAGGACAGTGCAACATGGTCGT
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ATATATAGGATTTGGTTTTTGGTTTCTGGATTCTCTCT*AAGAAGCTGAAGCCTTAATCA
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TTGCTAAACATATTTAATTAATTTTCTATTGCTTTTTAACCAATTGCATTTTTCTTTCTA
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TCACACTGCCAAGT

QA 1 734 1 734
DS 

RD RS1CB47JQ 729 0 0
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CCTAACCGCTGCAGCAATCGTTGGTCATGACGGTAGCGTTTGGGCTCAGAGTGCCAACTT
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TGGCGCTGTTATCCGTGGAAAGAAGGGAGCGGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACA
GTCATGTGTGTTTGGGATCTATGAAGAGCCCGTGACACCAGGACAGTGCAACATGGTCGT
CGAGAGGCTGGGTGATTACCTCCTCGAACAAGATCTTTAAGCCACCACCTCATCAAACGA
ATATATAGGATTTGGTTTTTGGTTTCTGGATTCTCTCTTAAGAAGCTGAAGTCTTAATCA
ATGTCTGATTCTTAAAAAATGGTTTTCTTGGTTTCATACATTTCATTTTGTTTTTTTTTC
TTGCTAAACATATTTAATTAATTTTTTATTGCTTTTTAACCAATTGCATTTTTCTTTTTA
TTGCATCCAAACTCGGTGATGATATGTAGTTGAACATCTTTAAAACATAAAAAAAAATTA
TCACACTGC

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

CO CL3022Contig1 856 2 4 U
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TATCTCCAAATGTCGACATAGCGGCTGCTGACCTATCCTTGAATATTCCCACTTGTCCGT
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CCACGCCGAAACTGGAGTCGTCGTCCAAATCATTTGTTTGAGAATGCTCGCCATTTGTAA
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TTTCGTTCTCCCAAAGATAAGGCTCGTACGTGAGCCAGTCTATGGGATCCAACTTTTGGG
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GCTTGTATCACCCCAG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C665JQ U 1
AF RS1AZ50JQ U 22
BS 1 321 RS1C665JQ
BS 322 322 RS1AZ50JQ
BS 323 750 RS1C665JQ
BS 751 856 RS1AZ50JQ

RD RS1C665JQ 750 0 0
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CCAAATCTCTTAATTACATGAAACAATAAATCAAACACAATTACAAAACTTGTTCTCTTC
GTTTTATGTAAAAACTTCTATATAGTGGCAGATATCTCAGCTGCTGCAATCATCATCATC
ATCACTCGTACCTGGTGGTTGTGAAAGAAGAGAGTAAACCGGCTGCTTGAGCCGGTATTA
TATCTCCAAATGTCGACATAGCGGCTGCTGACCTATCCTTGAATATTCCCACTTGTCCGT
CACTTAGTATTGAGCCAAATCTACTACCAGCCTGCATGAAAGACTTTAAGAACGGGGAAG
CCACGCCGAAACTGGAGTCGTCGTCCAAATCATTTGTTTGAGAATGCTCGCCATTTGTAA
ATGCATTCCATGAGTTTCTTGACGAACTTTCATTTGATGTAACTGGAATGGAGACCTTGT
TTGTACTTCTCGAGGACAGAGCCGGAGCGCTTATGGGAAGGTATTTGAAGCGGGGTACTG
TGGAGCATGGCATGATATTTGACTCTGAATTACTTGGCAGTTTCCGTGAAGTATCTGTGT
ACATGCGGTTTAGTTGCACAAAGAATCCAAATAGTACTGCGTGGCGTAGGTATGACTGCT
TTTCGTTCTCCCAAAGATAAGGCTCGTACGTGAGCCAGTCTATGGGATCCAACTTTTGGG
TCAGTTGTGAGATCACTCCATCAATGCGAC

QA 1 750 1 750
DS 

RD RS1AZ50JQ 835 0 0
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AACAATAAATCAAACACAATTACAAAACTTGTTCTCTTCGTTTTATGTAAAAACTTCTAT
ATAGTGGCAGATATCTCAGCTGCTGCAATCATCATCATCATCACTCGTACCTGGTGGTTG
TGAAAGAAGAGAGTAAACCGGCTGCTTGAGCCGGTATTATATCTCCAAATGTCGACATAG
CGGCTGCTGATCTATCCTTGAATATTCCCACTTGTCCGTCACTTAGTATTGAGCCAAATC
CACTACCAGCCTGCATGAAAGACTTTAAGAACGGGGAAGCCACGCCGAAACTGGAGTCGT
CGTCCAAATCATTTGTTTGAGAATGCTCGCCATTTGTAAATGCATTCCATGAGTTTCTTG
ACGAACTTTCATTTGATGTAACTGGAATGGAGACCTTGTTTGTACTTCTCGAGGACAGAG
CCGGAGCGCTTATGGGAAGGTATTTGAAGCGGGGTACTGTGGAGCATGGCATGATATTTG
ACTCTGAATTACTTGGCAGTTTCTGTGAAGTATCTGTGTACATGCGGTTTAGTTGCACAA
AGAATCCAAATAGTACTGCGTGGCGTAGGTATGACTGCTTTTCGTTCTCCCAAAGATAAG
GCTCGTACGTGAGCCAGTCTATGGGATCCAACTTTTGGGTCAGTTGTGAGATCACTCCAT
CAATGCGACCTCGGTTGACTGACTTTGTTTGCTGTTGGCCCTGCTTTCTCCTGAACGCTG
ATCTGTTCATTGTGATCTTTGGTGGATCTCCACATTGGTGCTTGTATCACCCCAG

QA 1 835 1 835
DS 



AS 1 4

CO CL3023Contig1 583 4 6 U
GGATGTTTCAGTGTTTGGCTTCTCCGTTTTCATCACTAGCAGCAGACTTTGCGTTAATCA
GCCGACGCGAAAATGGTGAAGGGACGCCAAGGAGAACGTGTCAGACTCTACGTCAGGGGA
ACTATCTTGGGATACAAAAGGTCGAAGTCTAACCAGTACCCAAACACATCCCTTATCCAG
ATCGAAGGGGTCAACACTACAGAGGAGGTGACATGGTACAAGGGAAAGAGGATGGCTTAC
ATCTACAAGGCTAAGACCAAGAAGAACGGTAGCCATTACCGCTGCATCTGGGGAAAGGTT
ACAAGGCCTCATGGTAACAGCGGTGTCGTCCGTGCCAAATTCACATCCAACTTGCCTCCT
AAGTCCATGGGGATGAGGGTCAGAGTCTTCATGTATCCGAGTAACATCTGAAGAAAGCTT
TTATTTTTAGCTGTGGCTTATGTCCACTAGTTTGTTATTTTGTATTTTTGATATTCGAAA
GCATTTTCCTTTCTCTGTTTTGAAATGTTTTGGAGATTCTCTGGTTTTAATCGCAAAATT
AGAATGTGTTTTCTCCTTATAATTGAGTTGGAACATATGAATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RS1GE67TF U 1
AF RS1EN10TF U 15
AF RS1GC09TF U 15
AF RS1GE67JQ C 48
BS 1 29 RS1GE67TF
BS 30 30 RS1EN10TF
BS 31 537 RS1GE67TF
BS 538 538 RS1EN10TF
BS 539 579 RS1GE67TF
BS 580 583 RS1GC09TF

RD RS1GE67TF 579 0 0
GGATGTTTCAGTGTTTGGCTTCTCCGTTT*CATCACTAGCAGCAGACTTTGCGTTAATCA
GCCGACGCGAAAATGGTGAAGGGACGCCAAGGAGAACGTGTCAGACTCTACGTCAGGGGA
ACTATCTTGGGATACAAAAGGTCGAAGTCTAACCAGTACCCAAACACATCCCTTATCCAG
ATCGAAGGGGTCAACACTACAGAGGAGGTGACATGGTACAAGGGAAAGAGGATGGCTTAC
ATCTACAAGGCTAAGACCAAGAAGAACGGTAGCCATTACCGCTGCATCTGGGGAAAGGTT
ACAAGGCCTCATGGTAACAGCGGTGTCGTCCGTGCCAAATTCACATCCAACTTGCCTCCT
AAGTCCATGGGGATGAGGGTCAGAGTCTTCATGTATCCGAGTAACATCTGAAGAAAGCTT
TTATTTTTAGCTGTGGCTTATGTCCACTAGTTTGTTATTTTGTATTTTTGATATTCGAAA
GCATTTTCCTTTCTCTGTTTTGAAATGTTTTGGAGATTCTCTGGTTTTAATCGCAAA*TT
AGAATGTGTTTTCTCCTTATAATTGAGTTGGAACATATG

QA 1 579 1 579
DS 

RD RS1EN10TF 546 0 0
GG
GGCTTCTCCGTTTTCATCACTAGCAGCAGACTTTGCGTTAATCAGCCGACGCGAAAATGG
TGAAGGGACGCCAAGGAGAACGTGTCAGACTCTACGTCAGGGGAACTATCTTGGGATACA
AAAGGTCGAAGTCTAACCAGTACCCAAACACATCCCTTATCCAGATCGAAGGGGTCAACA
CTACAGAGGAGGTGACATGGTACAAGGGAAAGAGGATGGCTTACATCTACAAGGCTAAGA
CCAAGAAGAGCGGTAGCCATTACCGCTGCATCTGGGGAAAGGTTACAAGGCCTCATGGTA
ACAGCGGTGTCGTCCGTGCCAAATTCACATCCAACTTGCCTCCTAAGTCCATGGTGATGA
GGGTCAGAGTCTTCATGTATCCGAGTAACATCTGAAGAAAGCTTTTATTTTTAGCTGTGG
CTTATGTCCACTAGTTTGTTATTTTGTATTTTTGATATTCGAAAGCATTTTCCTTTCTCT
GTTTTGAAATGTTTTGGAGATTCTCTGGTTTTAATCGCAAAATTAGAATGTGTTTTCTCC
TTAT

QA 3 546 3 546
DS 

RD RS1GC09TF 569 0 0
GG
GGCTTCTCCGTTTTCATCACTAGCAGCAGACTTTGCGTTAATCAGCCGACGCGAAAATGG
TGAAGGGACGCCAAGGAGAACGTGTCAGACTCTACGTCAGGGGAACTATCTTGGGATACA
AAAGGTCGAAGTCTAACCAGTACCCAAACACATCCCTTATCCAGATCGAAGGGGTCAACA
CTACAGAGGAGGTGACATGGTACAAGGGAAAGAGGATGGCTTACATCTACAAGGCTAAGA
CCAAGAAGAGCGGTAGCCATTACCGCTGCATCTGGGGAAAGGTTACAAGGCCTCATGGTA
ACAGCGGTGTCGTCCGTGCCAAATTCACATCCAACTTGCCTCCTAAGTCCATGGTGATGA
GGGTCAGAGTCTTCATGTATCCGAGTAACATCTGAAGAAAGCTTTTATTTTTAGCTGTGG
CTTATGTCCACTAGTTTGTTATTTTGTATTTTTGATATTCGAAAGCATTTTCCTTTCTCT
GTTTTGAAATGTTTTGGAGATTCTCTGGTTTTAATCGCAAAATTAGAATGTGTTTTCTCC
TTATAATTGAGTTGGAACATATGAATA

QA 3 569 3 569
DS 

RD RS1GE67JQ 532 0 0
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CTACGTCAGGGGAACTATCTTGGGATACAAAAGGTCGAAGTCTAACCAGTACCCAAACAC
ATCCCTTATCCAGATCGAAGGGGTCAACACTACAGAGGAGGTGACATGGTACAAGGGAAA
GAGGATGGCTTACATCTACAAGGCTAAGACCAAGAAGAACGGTAGCCATTACCGCTGCAT
CTGGGGAAAGGTTACAAGGCCTCATGGTAACAGCGGTGTCGTCCGTGCCAAATTCACATC
CAACTTGCCTCCTAAGTCCATGGGGATGAGGGTCAGAGTCTTCATGTATCCGAGTAACAT
CTGAAGAAAGCTTTTATTTTTAGCTGTGGCTTATGTCCACTAGTTTGTTATTTTGTATTT
TTGATATTCGAAAGCATTTTCCTTTCTCTGTTTTGAAATGTTTTGGAGATTCTCTGGTTT
TAATCGCAAAATTAGAATGTGTTTTCTCCTTATAATTGAGTTGGAACATATG

QA 1 532 1 532
DS 



AS 1 4

CO CL3024Contig1 655 4 12 U
GGAGAATCAAAAATTAGAAGACTGGTTGCAGAAGAAAATATAAGTTTTTTATTTGCTTTC
ACGTAAGAGTCAAAGAAAATGGCGAGCACTGTGATGACTACACTGCCTCAGTTCAATGGT
CTTCGAGTTAGCAAGATCTCTGCAGCTCCAGCGCAAGGCCTGGCAACTGTTGTGCCCATG
AGACGCAAGGGGAATGGAGCTTTGGGTGCAAAGTGTGACTTCATTGGTTCATCAACAAAT
CTGATAATGGTAACGTCGACGACTCTGATGTTGTTCGCTGGGAGATTCGGACTAGCACCA
TCAGCCAATAGGAAGGCGACAGCTGGGCTTAAGTTAGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAA
ACGGGTGACCCAGCCGGGTTCACTCTCGCCGACACTTTGGCTTGTGGTACCGTTGGTCAT
ATCATCGGCGTCGGAGTTGTCCTTGGTCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAAACATGTT
CATTTGTATTCTGTCAACTTGTAGATTTAAAAAAAAACAAAGTTCTCAAGAACCCGAGGG
GAGATCTAGTCAATGTTTATAATGTTTGTATCGCATTGTATTCCTCTTTAAAACAACTAG
AACGACCGCATCTTCAAGTATGTAACGTGAAGCGAAGGCATTGTTCCCTTGTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EH32JQ C 26
AF RS1EH32TF U 26
AF RS1EU45TF U 1
AF RS1EU45JQ C 142
BS 1 43 RS1EU45TF
BS 44 44 RS1EH32TF
BS 45 50 RS1EU45TF
BS 51 52 RS1EH32TF
BS 53 84 RS1EU45TF
BS 85 85 RS1EH32TF
BS 86 127 RS1EU45TF
BS 128 128 RS1EH32TF
BS 129 485 RS1EU45TF
BS 486 486 RS1EH32TF
BS 487 643 RS1EU45TF
BS 644 655 RS1EU45JQ

RD RS1EH32JQ 548 0 0
TTGCAGAAGAAAATATAAGTTTTTTATTTGCTTTCACGTAAGAGTCAAAGAAAATGGCGA
GCACTGTGATGACTACACTGCCTCAGTTCAATGGTCTTCGAGTTAGCAAGATCTCTGCAG
CTCCAGTGCAAGGCCTGGCAACTGTTGTGCCCATGAGACGCAAGGGGAATGGAGCTTTGG
GTGCAAAGTGTGACTTCATTGGTTCATCAACAAATCTGATAATGGTAACGTCGACGACTC
TGATGTTGTTCGCTGGGAGATTCGGACTAGCACCATCAGCCAATAGGAAGGCGACAGCTG
GGCTTAAGTTAGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACGGGTGACCCAGCCGGGTTCACTC
TCGCCGACACTTTGGCTTGTGGTACCGTTGGTCATATCATCGGCGTCGGAGTTGTCCTTG
GTCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAAACATGTTCATTTGTATTCTGTCAACTTGTAGA
TTTTTAAAAAA*CAAAGTTCTCAAGAACCCGAGGGGAGATCTAGTCAATGTTTATAATGT
TTGTATCG

QA 1 548 1 548
DS 

RD RS1EH32TF 548 0 0
TTGCAGAAGAAAATATAAGTTTTTTATTTGCTTTCACGTAAGAGTCAAAGAAAATGGCGA
GCACTGTGATGACTACACTGCCTCAGTTCAATGGTCTTCGAGTTAGCAAGATCTCTGCAG
CTCCAGTGCAAGGCCTGGCAACTGTTGTGCCCATGAGACGCAAGGGGAATGGAGCTTTGG
GTGCAAAGTGTGACTTCATTGGTTCATCAACAAATCTGATAATGGTAACGTCGACGACTC
TGATGTTGTTCGCTGGGAGATTCGGACTAGCACCATCAGCCAATAGGAAGGCGACAGCTG
GGCTTAAGTTAGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACGGGTGACCCAGCCGGGTTCACTC
TCGCCGACACTTTGGCTTGTGGTACCGTTGGTCATATCATCGGCGTCGGAGTTGTCCTTG
GTCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAAACATGTTCATTTGTATTCTGTCAACTTGTAGA
TTTTTAAAAAA*CAAAGTTCTCAAGAACCCGAGGGGAGATCTAGTCAATGTTTATAATGT
TTGTATCG

QA 1 548 1 548
DS 

RD RS1EU45TF 643 0 0
GGAGAATCAAAAATTAGAAGACTGGTTGCAGAAGAAAATATAATTTTTTT**TTGCTTTC
ACGTAAGAGTCAAAGAAAATGGCGGGCACTGTGATGACTACACTGCCTCAGTTCAATGGT
CTTCGAGCTAGCAAGATCTCTGCAGCTCCAGCGCAAGGCCTGGCAACTGTTGTGCCCATG
AGACGCAAGGGGAATGGAGCTTTGGGTGCAAAGTGTGACTTCATTGGTTCATCAACAAAT
CTGATAATGGTAACGTCGACGACTCTGATGTTGTTCGCTGGGAGATTCGGACTAGCACCA
TCAGCCAATAGGAAGGCGACAGCTGGGCTTAAGTTAGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAA
ACGGGTGACCCAGCCGGGTTCACTCTCGCCGACACTTTGGCTTGTGGTACCGTTGGTCAT
ATCATCGGCGTCGGAGTTGTCCTTGGTCTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAAACATGTT
CATTTTTATTCTGTCAACTTGTAGATTTAAAAAAAAACAAAGTTCTCAAGAACCCGAGGG
GAGATCTAGTCAATGTTTATAATGTTTGTATCGCATTGTATTCCTCTTTAAAACAACTAG
AACGACCGCATCTTCAAGTATGTAACGTGAAGCGAAGGCATTG

QA 1 643 1 643
DS 

RD RS1EU45JQ 514 0 0
GCAGCTCCAGCGCAAGGCCTGGCAACTGTTGTGCCCATGAGACGCAAGGGGAATGGAGCT
TTGGGTGCAAAGTGTGACTTCATTGGTTCATCAACAAATTTGATAATGGTAACGTCGACG
ACTTTGATGTTGTTCGCTGGGAGATTCGGACTAGCACCATCAGCCAATAGGAAGGCGACA
GCTGGGCTTAAGTTAGAGGCACGTGACTCGGGTTTACAAACGGGTGACCCAGCCGGGTTC
ACTTTCGCCGACACTTTGGCTTGTGGTACCGTTGGTCATATCATCGGCGTCGGAGTTGTC
CTTGGTTTCAAAAACATTGGTGCTATTTAAAAACATGTTCATTTTTATTCTGTCAACTTG
TAGATTTAAAAAAAAACAAAGTTCTCAAGAACCCGAGGGGAGATCTAGTCAATGTTTATA
ATGTTTGTATCGCATTGTATTCCTCTTTAAAACAACTAGAACGACCGCATTTTCAAGTAT
GTAACGTGAAGGGAAGGCATTGTTCCCTTGTTAG

QA 1 514 1 514
DS 



AS 1 4

CO CL3025Contig1 757 4 1 U
GAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGACGTGCTCCAGCTCTCAAGATCGCCGCTTCTCACTA
AGAAGACCAAAACATGGTGCACGTTTGCTACTACCGTAACCATGGAAAGACCTTCAAGGG
ACCAAGACGTCCTTTCGAGAAGGAGCGTCTCGACTCGGAGCTGAAGCTGGTCGGCGAGTA
CGGTCTCCGCAACAAGCGTGAGCTCTCGACGAGAAGAATCCCAAGAGGATCTTCGAAGGA
GAGGCGCTGCTAAGGAAGATGAACCGGTACGGGCTTCTCGACGAGAGCCAGAACAAGCTC
GATTACGTCTTGGCCTTGACGGTTGAGAACTTTCTCGAGCGTCGTCTTCAGACTATTGTG
TTTAAGTCTGGTATGGCTAAGTCTATCCATCACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCAT
ATCAGGGTTGGAAAGCAATTGGTGAACATTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGACTCGCAG
AAACACATCGACTTTGCATTGACCAGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCAGGAAGAGTGAAG
AGAAGGAACGAGAAGTCTGCGTCCAAGAAAGCCTCTGGTGGCGACGCTGACGGTGATGAC
GAAGAGTAAACCCCCAACTCTCACCGCCTGCTTTTAGCTATGAAGCACTCTGCTTTTTGA
TATCTTTAGTTTTGAATTTCGGTTCTTTTCAGACGATTGTTTTGTGGTTTCTTTGTGTGT
CGAACCTTTCCCGAGTTATATTTTTATTTTGAGACCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1A303TF U 1
AF RS1A303JQ C 23
AF RS1A303TV U 71
AF RS1A303TR C 23
BS 1 757 RS1A303TF

RD RS1A303TF 757 0 0
GAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGACGTGCTCCAGCTCTCAAGATCGCCGCTTCTCACTA
AGAAGACCAAAACATGGTGCACGTTTGCTACTACCGTAACCATGGAAAGACCTTCAAGGG
ACCAAGACGTCCTTTCGAGAAGGAGCGTCTCGACTCGGAGCTGAAGCTGGTCGGCGAGTA
CGGTCTCCGCAACAAGCGTGAGCTCTCGACGAGAAGAATCCCAAGAGGATCTTCGAAGGA
GAGGCGCTGCTAAGGAAGATGAACCGGTACGGGCTTCTCGACGAGAGCCAGAACAAGCTC
GATTACGTCTTGGCCTTGACGGTTGAGAACTTTCTCGAGCGTCGTCTTCAGACTATTGTG
TTTAAGTCTGGTATGGCTAAGTCTATCCATCACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCAT
ATCAGGGTTGGAAAGCAATTGGTGAACATTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGACTCGCAG
AAACACATCGACTTTGCATTGACCAGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCAGGAAGAGTGAAG
AGAAGGAACGAGAAGTCTGCGTCCAAGAAAGCCTCTGGTGGCGACGCTGACGGTGATGAC
GAAGAGTAAACCCCCAACTCTCACCGCCTGCTTTTAGCTATGAAGCACTCTGCTTTTTGA
TATCTTTAGTTTTGAATTTCGGTTCTTTTCAGACGATTGTTTTGTGGTTTCTTTGTGTGT
CGAACCTTTCCCGAGTTATATTTTTATTTTGAGACCT

QA 1 757 1 757
DS 

RD RS1A303JQ 735 0 0
GGACGTGCTCCAGCTCTCAAGATCGCCGCTTCTCACTAAGAAGACCAAAACATGGTGCAC
GTTTGCTACTACCGTAACCATGGAAAGACCTTCAAGGGACCAAGACGTCCTTTCGAGAAG
GAGCGTCTCGACTCGGAGCTGAAGCTGGTCGGCGAGTACGGTCTCCGCAACAAGCGTGAG
CTCTCGACGAGAAGAATCCCAAGAGGATCTTCGAAGGAGAGGCGCTGCTAAGGAAGATGA
ACCGGTACGGGCTTCTCGACGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCCTTGACGG
TTGAGAACTTTCTCGAGCGTCGTCTTCAGACTATTGTGTTTAAGTCTGGTATGGCTAAGT
CTATCCATCACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAATTGG
TGAACATTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGACTCGCAGAAACACATCGACTTTGCATTGA
CCAGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCAGGAAGAGTGAAGAGAAGGAACGAGAAGTCTGCGT
CCAAGAAAGCCTCTGGTGGCGACGCTGACGGTGATGACGAAGAGTAAACCCCCAACTCTC
ACCGCCTGCTTTTAGCTATGAAGCACTCTGCTTTTTGATATCTTTAGTTTTGAATTTCGG
TTCTTTTCAGACGATTGTTTTGTGGTTTCTTTGTGTGTCGAACCTTTCCCGAGTTATATT
TTTATTTTGAGACCT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RS1A303TV 687 0 0
AACATGGTGCACGTTTGCTACTACCGTAACCATGGAAAGACCTTCAAGGGACCAAGACGT
CCTTTCGAGAAGGAGCGTCTCGACTCGGAGCTGAAGCTGGTCGGCGAGTACGGTCTCCGC
AACAAGCGTGAGCTCTCGACGAGAAGAATCCCAAGAGGATCTTCGAAGGAGAGGCGCTGC
TAAGGAAGATGAACCGGTACGGGCTTCTCGACGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCT
TGGCCTTGACGGTTGAGAACTTTCTCGAGCGTCGTCTTCAGACTATTGTGTTTAAGTCTG
GTATGGCTAAGTCTATCCATCACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTG
GAAAGCAATTGGTGAACATTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGACTCGCAGAAACACATCG
ACTTTGCATTGACCAGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCAGGAAGAGTGAAGAGAAGGAACG
AGAAGTCTGCGTCCAAGAAAGCCTCTGGTGGCGACGCTGACGGTGATGACGAAGAGTAAA
CCCCCAACTCTCACCGCCTGCTTTTAGCTATGAAGCACTCTGCTTTTTGATATCTTTAGT
TTTGAATTTCGGTTCTTTTCAGACGATTGTTTTGTGGTTTCTTTGTGTGTCGAACCTTTC
CCGAGTTATATTTTTATTTTGAGACCT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1A303TR 735 0 0
GGACGTGCTCCAGCTCTCAAGATCGCCGCTTCTCACTAAGAAGACCAAAACATGGTGCAC
GTTTGCTACTACCGTAACCATGGAAAGACCTTCAAGGGACCAAGACGTCCTTTCGAGAAG
GAGCGTCTCGACTCGGAGCTGAAGCTGGTCGGCGAGTACGGTCTCCGCAACAAGCGTGAG
CTCTCGACGAGAAGAATCCCAAGAGGATCTTCGAAGGAGAGGCGCTGCTAAGGAAGATGA
ACCGGTACGGGCTTCTCGACGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCCTTGACGG
TTGAGAACTTTCTCGAGCGTCGTCTTCAGACTATTGTGTTTAAGTCTGGTATGGCTAAGT
CTATCCATCACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAATTGG
TGAACATTCCTTCGTTCATGGTGAGACTTGACTCGCAGAAACACATCGACTTTGCATTGA
CCAGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCAGGAAGAGTGAAGAGAAGGAACGAGAAGTCTGCGT
CCAAGAAAGCCTCTGGTGGCGACGCTGACGGTGATGACGAAGAGTAAACCCCCAACTCTC
ACCGCCTGCTTTTAGCTATGAAGCACTCTGCTTTTTGATATCTTTAGTTTTGAATTTCGG
TTCTTTTCAGACGATTGTTTTGTGGTTTCTTTGTGTGTCGAACCTTTCCCGAGTTATATT
TTTATTTTGAGACCT

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 4

CO CL3026Contig1 756 4 16 U
GGCTCACAACGATCGGATCAAAGAATCACATCCATCTCTTTTGACAATTGAAACTAGTGA
AAAATGGGGATAATCAGAAAGAAACACGATAAAAAATCCCGAAGGCCGTCGTTTAAGAGT
GTTTTAACCTCAGTACTAGCTACACAAGCCGCAATATTCCTCTTATTGCTCGCCGGTGTA
TCCCTCGCTGGCACAGCCGTCGCATTTATTGCCACCATGCCGCTATTCATAGTATTCAGT
CCGGTTCTCGTACCAGCGGGTATTGCCACTGGTTTACTGGCTACGGGTTTAGCAGCCACC
GGTAGCACCGGTGCAATGGCTGTCTCCCTCATCCTGTGGCTCTTCAAGCGAGCAACGGGC
AAGGAGCCGCCAAAAATCATGACAAAAATCTTGAGAAAGGTGTTTCCGGGTGGAGGTACT
AGTCATGCAGCTAAACTGGCAGCAAAACCAGAAGCCGAGACAGCAGCCTCACCAGCGGCC
GCACCAGCAGCCTCACCAGCAGCAGCACCGAGTACATGAAAAGAACCGGTGGGTATAAGC
AAAGGATGATAGATAAACAATCCAACTTTTAAAAATAAATAATAATTATTACGTGGGGAT
GGAAGTTAAATTTTCAGATATTATTATACTAACGGATATCGTGGTACAAAATAGTAACAA
ATGTAAGCATTTTTATTGTATAACATTTTAAGAACGAAGCGATGTATCGTTGATGTTAAC
CCTATTCAAGTTCAACAATGTTATTCTGATTCAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FY39TF U 1
AF RS1DA03JQ C 7
AF RS1FY39JQ C 112
AF RS1DA03TF U 18
BS 1 161 RS1FY39TF
BS 162 162 RS1DA03TF
BS 163 254 RS1FY39TF
BS 255 255 RS1DA03TF
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BS 462 574 RS1FY39TF
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BS 585 650 RS1FY39TF
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CC

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DS 

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ACCGGTGCAATGGCTGTCTCCCTCATCCTGTGGCTCTTCAAGCGAGCAACGGGCAAGGAG
CCGCCAAAAATCATGACAAAAATCTTGAGAAAGGTGTTTCCGGGTGGAGGTACTAGTCAT
GCAGCTAAACTGGCAGCAAAACCAGAAGCCGAGACAGCAGCCTCACCAGCGGCCGCACCA
GCAGCCTCACCAGCAGCCGCACCGAGTACATGAAAAGAACCGGTGGGTATAAGCAAAGGA
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QA 1 750 1 750
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GCCGGTGTATCCCTCGCTGGCACAGCCGTCGCATTTATTGCCACCATGCCGCTATTCATA
GTATTCAGTCCGGTTCTCGTACCGGCGGGTATTGCCACTGGTTTACTGGCTACGGGTTTA
GCAGCCACCGGTAGCACCGGTGCAATGGCTGTCTCCCTCATCCTGTGGCTCTTCAAGCGA
GCAACGGGCAAGGAGCCGCCAAAAATCATGACAAAAATCTTGAGAAAGGTGTTTCCGGGT
GGAGGTACTAGTCATGCAGCTAAACTGGCAGCAAAACCAGAAGCCGAGAGAGCAGCCTCA
CCAGCGGCCGCACCAGCAGCCTCACCAGCAGCAGCACCGAGTACATGAAAAGAACCGGTG
GGTATAAGCAAAGGATGATAGATAAACAATCCAACTTTTAAAAATAAATAATTATTATTA
CGTGGGGATGGAAGTTAAATTTTCAGATATTATTATACTAACGGATATCGTGGTACAAAA
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GATGTTAACCC

QA 1 611 1 611
DS 

RD RS1DA03TF 739 0 0
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AAAGAAACACGATAAAAAATCCCGAAGGCCGTCGTTTAAGAGTGTTTTAACCTCAGTACT
AGCTACACAAGCCGCAATATTCCTCTTATTGCTCGCCGGTGTATCCCTCGCTGGCACAGC
CGTCGCATTTATTGCCACCATGCCGCTATTCATAGTATTCAGTCCGGTTCTCGTACCAGC
GGGTATTGCCACTGGTTTACTGGCTACGGGTTTAGCAGCCACCGGTAGCACCGGTGCAAT
GGCTGTCTCCCTCATCCTGTGGCTCTTCAAGCGAGCAACGGGCAAGGAGCCGCCAAAAAT
CATGACAAAAATCTTGAGAAAGGTGTTTCCGGGTGGAGGTACTAGTCATGCAGCTAAACT
GGCAGCAAAACCAGAAGCCGAGACAGCAGCCTCACCAGCGGCCGCACCAGCAGCCTCACC
AGCAGCCGCACCGAGTACATGAAAAGAACCGGTGGGTATAAGCAAAGGATGATAGATAAA
CAATCCAACTTTTAAAAATAAATAATAATTATTACGTGGGGATGGAAGTTAAATTTTCAG
ATATTATTATACTAACGGATATCGTGGTACAAAATAGTAACAAATGTAAGCATTTTTATT
GTATAACATTTTAAGAACGAAGCGATGTATCGTTGATGTTAACCCTATTCAAGTTCA*CA
ATGTTATTCTGATTCAAGT

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 3

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AAAAAGATTACTCTATTTATAGAGTATACCCATTTTTACACTATTATCAAATGAAAATAG
AATACCATTAGAGTATTTTTACTGCAAACTCTATTTTAAAGTGGAAAATCAAATGAAACT
GGAAATACTCTTGTAACTCGCAAACATCATTTGACTATATGATCTAAACAAAAAGAAATT
AACACACAGAACAAAGTTATTAGAACTAACTATATATTTCATAAATATTGTTCAGTAAAA
CTCACTTTACGCCCTTTTATATAATTGGACGCTAGTCTGGTTAAGCCTCTCCACAAACCA
AATTTTTTCTAATGAGAGACTTCACTATTTATTTCTTCCTTGTTGTTCGTATTTGGCATC
CGTAGCAAGAAAATCAGGAATTTGGAACATCGTAATAAGAAAAATATTCTCTTCTTTCAC
AGGAAATATTTGTTGATTGTCGCCGTTGAATTTCAAACCGCAAAATGGCGGTCCACCCGT
TGCATTAATAAACTCATCTTCAGCCTTTTCGAATTTCTGCATTTTGGCGTAATTCAAACC
TGAAGTTAACGCTTTATAGCTATTTGAGTAAAGCTTAAGACATTCTTCCAACAACTTTTT
AGTAAGACTATTCTTATATTTTCTCTCTTTTATAATCTTCTCCACCATTCTTTTCACGTT
CGTTAAGTTTGATATGGCGTTATTTGCTCCTACTATGGTCAAATCACCGAGATTTCTCAC
TTTCTGACTCTTCGGATTCTCTCTGAGAGATGCAATGTAAACTTTTTCGAAATCTGGAAT
CAAGTCCCCACCTGGAAACTTTGCACCTTTTTTGCATGATTTTTGAATCAAAGAATCTGC
CACTTTGTTGGATGTGCAACCATTGAAAAGAAAAGCCAGCACAATGAGGTACATCATTTT
GTTTTTTTGAGACATCTTCATTGTGGTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F266JQ U 84
AF RS1F758JQ U 1
AF RS1F758TF C 197
BS 1 749 RS1F758JQ
BS 750 929 RS1F758TF

RD RS1F266JQ 307 0 0
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GGAACAT

QA 1 307 1 307
DS 

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AATACCATTAGAGTATTTTTACTGCAAACTCTATTTTAAAGTGGAAAATCAAATGAAACT
GGAAATACTCTTGTAACTCGCAAACATCATTTGACTATATGATCTAAACAAAAAGAAATT
AACACACAGAACAAAGTTATTAGAACTAACTATATATTTCATAAATATTGTTCAGTAAAA
CTCACTTTACGCCCTTTTATATAATTGGACGCTAGTCTGGTTAAGCCTCTCCACAAACCA
AATTTTTTCTAATGAGAGACTTCACTATTTATTTCTTCCTTGTTGTTCGTATTTGGCATC
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TGCATTAATAAACTCATCTTCAGCCTTTTCGAATTTCTGCATTTTGGCGTAATTCAAACC
TGAAGTTAACGCTTTATAGCTATTTGAGTAAAGCTTAAGACATTCTTCCAACAACTTTTT
AGTAAGACTATTCTTATATTTTCTCTCTTTTATAATCTTCTCCACCATTCTTTTCACGTT
CGTTAAGTTTGATATGGCGTTATTTGCTCCTACTATGGTCAAATCACCGAGATTTCTCAC
TTTCTGACTCTTCGGATTCTCTCTGAGAG

QA 1 749 1 749
DS 

RD RS1F758TF 733 0 0
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TTATATAATTGGACGCTAGTCTGGTTAAGCCTCTCCACAAACCAAATTTTTTCTAATGAG
AGACTTCACTATTTATTTCTTCCTTGTTGTTCGTATTTGGCATCCGTAGCAAGAAAATCA
GGAATTTGGAACATCGTAATAAGAAAAATATTCTCTTCTTTCACAGGAGATATTTGTTGA
TTGTCGCCGTTGAATTTCAAACCGCAAAATGGCGGTCCACCCGTTGCATTAATAAACTCA
TCTTCAGCCTTTTCGAATTTCTGCATTTTGGCGTAATTCAAACCTGAAGTTAACGCTTTA
TAGCTATTTGAGTAAAGCTTAAGACATTCTTCCAACAACTTTTTAGTAAGACTATTCTTA
TATTTTCTCTCTTTTATAATCTTCTCCACCATTCTTTTCACGTTCGTTAAGTTTGATATG
GCGTTATTTGCTCCTACTATGGTCAAATCACCGAGATTTCTCACTTTCTGACTCTTCGGA
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CAACCATTGAAAAGAAAAGCCAGCACAATGAGGTACATCATTTTGTTTTTTTGAGACATC
TTCATTGTGGTCC

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 3

CO CL3028Contig1 807 3 5 U
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CTGTCCAATCATGGCTAGGAACTGCAGCGGTCATTGTGATGGATAAATCAACCGATGTTG
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TCTGTGCATTGGGTGATGCAGCTGCATGGCCAGTGCAAGGTCTGATAAGGCACTTTAGGC
CGGAGCTTGAGAGAAGGATCAGGGAACGCGCTGAAAAGGAGTTGCTACAGGCTGCTGCTT
AAAACCCTTCTTAACGACAGGGTATTTGCTATCATTATCGATGGAAATAAAATCTGAAGC
ACATTATTAGGGTTTTGGGGATGCAAAACTACTTCAGAAGGAGAAGAAGGTAATGTATTT
GTTGAAATGGTTCATGTTGAACTTTAATCAAACTGTATCAGAAAGAGACTGTTTGCTCCT
TTGCGTATTCTACTTTCTTTCAATGCGTGTTTGTTTTTCTCATGACTATGCTGAGATCAC
ATTTTGGGAACAACCAACCAAAGAAAACCTTTTCATATTTGAAATAATGTATGCTCTTTT
TGGGGTTTATAATCAACCAATGGTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C041TF U 1
AF RS1F921TF U 111
AF RS1C041JQ C 7
BS 1 697 RS1C041TF
BS 698 698 RS1F921TF
BS 699 731 RS1C041TF
BS 732 761 RS1F921TF
BS 762 807 RS1C041JQ

RD RS1C041TF 731 0 0
GGGGAGGTGTTAGGGGTGGATGGGACAACCTGCTTGCTATCATTCCTGGAGGTTCATCTG
TCCCTTTGATTCCTAAGAACATATGCGAGGATGTGCTGATGGATTTCGATGCGCTCAAGG
CTGTCCAATCATGGCTAGGAACTGCAGCGGTCATTGTGATGGATAAATCAACCGATGTTG
TGGATGCAATCGCGAGGCTCTCTTACTTCTACAAGCACGAAAGCTGTGGGCAGTGCACTC
CTTGCAGAGTGGGAACAGGTTGGCTCTGGATGATCATGGAGAGAATGAAAGTTGGCAATG
CAAAGCTGGAAGAGATTGATATGCTTCACGAGGTAACCAAGCAGATCGAAGGACACACAA
TCTGTGCATTGGGTGATGCAGCTGCATGGCCAGTGCAAGGTCTGATAAGGCACTTTAGGC
CGGAGCTTGAGAGAAGGATCAGGGAACGCGCTGAAAAGGAGTTGCTACAGGCTGCTGCTT
AAAACCCTTCTTAACGACAGGGTATTTGCTATCATTATCGATGGAAATAAAATCTGAAGC
ACATTATTAGGGTTTTGGGGATGCAAAACTACTTCAGAAGGAGAAGAAGGTAATGTATTT
GTTGAAATGGTTCATGTTGAACTTTAATCAAACTGTATCAGAAAGAGACTGTTTGCTCCT
TTGCGTATTCTACTTTCTTTCAATGCGTGTTTGTTTT*CTCATGACTATGCTGAGATCAC
ATTTTGGGAAC

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DS 

RD RS1F921TF 651 0 0
GCGCTCAAGGCTGTCCAATCAGGGCTAGGAACTGCAGCGGTCATTGTGATGGATAAATCA
ACCGATGTTGTGGATGCAATCGCGAGGCTCTCTTACTTCTACAAGCACGAAAGCTGTGGG
CAGTGCACTCCTTGCAGAGAGGGAACAGGTTGGCTCTGGATGATCATGGAGAGAATGAAA
GTTGGCAATGCAAAGCTGGAAGAGATTGATATGCTTCACGAGGTAACCAAGCAGATCGAA
GGACACACAATCTGTGCATTGGGTGATGCAGCTGCATGGCCAGTGCAAGGTCTGATAAGG
CACTTTAGGCCGGAGCTTGAGAGAAGGATCAGGGAACGCGCTGAAAAGGAGTTGCTACAG
GCTGCTGCTTAAAACCCTTCTTAACGACAGGGTATTTGCTATCATTATCGATGGAAATAA
AATCTCAAGCACATTATTAGGGTTTTGGGGATGCAAAACTACTTCAGAAGGAGAAGAAGG
TAATGTATTTGTTGAAATGGTTCATGTTGAACTTTAATCAAACTGTATCAGAAAGAGACT
GTTTGCTCTTTTGCGTATTCTACTTTCTTTCAATGCGTGTTTGTTTTTCTCATGACTATG
CTGAGATCACATTTTGGGAACAACCAACCAAAGAAAACCTTTTCATATTTG

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1C041JQ 801 0 0
GAGTGTA
GGGTGGATGGGACAAC*TGCTTGCTATCAT*CCTGGAGGTTCATCTGTCCCTTTGAT*CC
TAAGAACATATGCGAGGATGTGCTGATGGATTTCGATGCGCTCAAGGCTGTCCAATCATG
GCTAGGAACTGCAGCGGTCATTGTGATGGATAAATCAACCGATGTTGTGGATGCAATCGC
GAGGCTCTCTTACTTCTACAAGCACGAAAGCTGTGGGCAGTGCACTCCTTGCAGAGTGGG
AACAGGTTGGCTCTGGATGATCATGGAGAGAATGAAAGTTGGCAATGCAAAGCTGGAAGA
GATTGATATGCTTCACGAGGTAACCAAGCAGATCGAAGGACACACAATCTGTGCATTGGG
TGATGCAGCTGCATGGCCAGTGCAAGGTCTGATAAGGCACTTTAGGCCGGAGCTTGAGAG
AAGGATCAGGGAACGCGCTGAAAAGGAGTTGCTACAGGCTGCTGCTTAAAACCCTTCTTA
ACGACAGGGTATTTGCTATCATTATCGATGGAAATAAAATCTGAAGCACATTATTAGGGT
TTTGGGGATGCAAAACTACTTCAGAAGGAGAAGAAGGTAATGTATTTGTTGAAATGGTTC
ATGTTGAACTTTAATCAAACTGTATCAGAAAGAGACTGTTTGCTCCTTTGCGTATTCTAC
TTTCTTTCAATGCGTGTTTGTTTTTCTCATGACTATGCTGAGATCACATTTTGGGAACAA
CCAACCAAAGAAAACCTTTTCATATTTGAAATAATGTATGCTCTTTTTGGGGTTTATAAT
CAACCAATGGTTCT

QA 8 801 8 801
DS 



AS 1 4

CO CL3029Contig1 743 4 2 U
GGGCACACACACACACAAGCTGATCAATTTCATCGTTCCGACACTCTTTCGCCGAACTCA
ACAATGCCTCTGTCTCTCCGTCTAGCTCCATCTCCTGCGGCTTTATCTCCGACAACCGGT
GGATTTGGAGCTGCGAAAAAGCAGTGTCGTATCCCTTACTCCGGCGTGGCGACGGCGACG
ACGACGAGGATTGGTTTCTGCTCACTGGATTTTGTGAGAAGGGGAGACTCCTCTGTGGTG
AGGTGTAGCTTAGAGACTGTGAATGTTAGTGTTGGTCAAGTGACGGAAGTGGATAAGGAT
ACCTTCTGGCCCATCGTTAAAGCCGCTGGTGAAAAGATTGTGGTACTTGACATGTACACT
CAATGGTGTGGTCCATGTAAAGTGATTGCTCCTAAATACAAAGCTTTATCTGAGAAATAT
GAGGACGTTGTGTTTCTTAAGCTTGACTGCAACCCTGAAAACAGGCCATTGGCAAAGGAG
CTAGGAATAAGAGTGGTTCCAACTTTTAAAATATTAAAGGATAACCAAGTGGTGAAGGAA
GTTACGGGTGCCAAATATGATGATCTAGTTGCAGCAATTGAAACAGCAAGGTCTGCTAGT
TCTTCGGGATGAAAACCAATCCCCCATGTCTTTACTGTAATTTGTTGTATCAATGTAACA
AACTCTCTGGGTGTTTTTATATGATGACTCTGCTTTTGTATCTGTAAATGTTTTCAAGAA
GTATGGTAATCAATATATTCCAT


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DX87JQ C 222
AF RS1DX87TF U 3
AF RS1FO92JQ C 1
AF RS1FO92TF U 1
BS 1 5 RS1FO92JQ
BS 6 743 RS1FO92TF

RD RS1DX87JQ 484 0 0
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GACGGAAGTGGATAAGGATACCTTTTGGCCCATCGTTAAAGCCGCTGGTGAAAAGATTGT
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CAGGCCATTGGCAAAGGAGCTAGGAATAAGAGTGGTTCCAACTTTTAAAATATTAAAGGA
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TTGTTGTATCAATGTAACAAACTCTCTGGGTGTTTTTATATGATGACTCTGCTTTTGTAT
C
TGT

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DS 

RD RS1DX87TF 700 0 0
GGG
CACACACACACAAGCTGATCAATTTCATCGTTCCGACACCCTTTCGCCGAACTCAACAAT
GCCTCTGTCTCTCCGTCTAGCTCCATCTCCTGCGGCCTTATCTCCGACAACCGGTGGATT
TGGAGCTGCGAAAAAGCAGTGTCGTATCCCTTACTCCGGCGTGGCGACGGCGACGACGAC
GAGGATTGGTTTCTGCTCACTGGATTTTGTGAGAAGGGGAGACTCCTCTGTGGTGAGGTG
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CTGGCCCATCGTTAAAGCCGCTGGTGAAAAGATTGTGGTACTTGACATGTACACTCAATG
GTGTGGTCCATGTAAAGTGATTGCTCCTAAATACAAAGCTTTATCTGAGAAATATGAGGA
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GGGATGAAAACCAATCCCCCATGTCTTTACTGTAATTTGTTGTATCAATGTAACAAACTC
TCTGGGTGTTTTTATATGATGACTCTGCTTTTGTATC

QA 4 700 4 700
DS 

RD RS1FO92JQ 743 0 0
GGGCACACACACACACAAGCTGATCAATTTCATCGTTCCGACACTCTTTCGCCGAACTCA
ACAATGCCTCTGTCTCTCCGTCTAGCTCCATCTCCTGCGGCTTTATCTCCGACAACCGGT
GGATTTGGAGCTGCGAAAAAGCAGTGTCGTATCCCTTACTCCGGCGTGGCGACGGCGACG
ACGACGAGGATTGGTTTCTGCTCACTGGATTTTGTGAGAAGGGGAGACTCCTCTGTGGTG
AGGTGTAGCTTAGAGACTGTGAATGTTAGTGTTGGTCAAGTGACGGAAGTGGATAAGGAT
ACCTTCTGGCCCATCGTTAAAGCCGCTGGTGAAAAGATTGTGGTACTTGACATGTACACT
CAATGGTGTGGTCCATGTAAAGTGATTGCTCCTAAATACAAAGCTTTATTTGAGAAATAT
GAGGACGTTGTGTTTCTTAAGCTTGACTGCAACCCTGAAAACAGGCCATTGGCAAAGGAG
CTAGGAATAAGAGTGGTTCCAACTTTTAAAATATTAAAGGATAACCAAGTGGTGAAGGAA
GTTACGGGTGCCAAATATGATGATCTAGTTGCAGCAATTGAAACAGCAAGGTCTGCTAGT
TCTTCGGGATGAAAACCAATCCCCCATGTCTTTACTGTAATTTGTTGTATCAATGTAACA
AACTCTCTGGGTGTTTTTATATGATGACTCTGCTTTTGTATCTGTAAATGTTTTCAAGAA
GTATGGTAATCAATATATTCCAT

QA 1 743 1 743
DS 

RD RS1FO92TF 743 0 0
GGGCA
CACACACACACAAGCTGATCAATTTCATCGTTCCGACACTCTTTCGCCGAACTCAACAAT
GCCTCTGTCTCTCCGTCTAGCTCCATCTCCTGCGGCTTTATCTCCGACAACCGGTGGATT
TGGAGCTGCGAAAAAGCAGTGTCGTATCCCTTACTCCGGCGTGGCGACGGCGACGACGAC
GAGGATTGGTTTCTGCTCACTGGATTTTGTGAGAAGGGGAGACTCCTCTGTGGTGAGGTG
TAGCTTAGAGACTGTGAATGTTAGTGTTGGTCAAGTGACGGAAGTGGATAAGGATACCTT
CTGGCCCATCGTTAAAGCCGCTGGTGAAAAGATTGTGGTACTTGACATGTACACTCAATG
GTGTGGTCCATGTAAAGTGATTGCTCCTAAATACAAAGCTTTATCTGAGAAATATGAGGA
CGTTGTGTTTCTTAAGCTTGACTGCAACCCTGAAAACAGGCCATTGGCAAAGGAGCTAGG
AATAAGAGTGGTTCCAACTTTTAAAATATTAAAGGATAACCAAGTGGTGAAGGAAGTTAC
GGGTGCCAAATATGATGATCTAGTTGCAGCAATTGAAACAGCAAGGTCTGCTAGTTCTTC
GGGATGAAAACCAATCCCCCATGTCTTTACTGTAATTTGTTGTATCAATGTAACAAACTC
TCTGGGTGTTTTTATATGATGACTCTGCTTTTGTATCTGTAAATGTTTTCAAGAAGTATG
GTAATCAATATATTCCAT

QA 6 743 6 743
DS 



AS 1 4

CO CL3030Contig1 1161 4 11 U
GGGTGGGACGAAATTGACGCCGGAATCTGAAGGAAACTCCGGTGAAAAAAGCGGTGCGTA
TAATGCTCAAAGCCGTACAGATCTTGGGTTGGTCAACATCAGGGTTAACCATCATCTCAC
GAGACTGACCAAGACCCGCAACTCCTCCACCGTCTCTTTCCTCTCCACATCTACAAACCC
TCCAAAGCTCTCAACTTTCTCCTCCTCTCCACGGAAAACACTCCGTTTCAACCCGACCCG
AATGTCTTCCCCACTTCCCGGATCCGACCCAGTTCCCAAGTCTCCAACTTTCGTCTCCGT
TCAATCAGCTGGAGATGTTCGTAAGATAAAGTTCTGTCAATGGTGTGGAGGTCCTACCAA
GCACGAGATACCTGACGGAGAAGAGAAGCTCCGAGCTATCTGCACACACTGCGACAAAAT
CGCTTACCAGAATCCTAAGATGGTTGTAGGTTGTCTTATTGAGCATGAAGGAAAGGTTTT
ACTTTGTAAACGTAACATTCAACCTTCACACGGTCTATGGACTCTTCCTGCGGGTTATCT
AGAGGTTGGAGAGTCAGCTGCTGAAGGAGCAATGAGGGAAACTTGGGAAGAAGCTGGAGC
CACTGTGGAAGTTGTTTCTCCTTTTGCGCAGCTCGATATTCCTCTTATTGGCCAAACGTA
TGTTATATTCTTAGCAAAGCTGAAGAATCTTGATTTTGCGCCTGGTCCTGAGTCATTGGA
GTGCCGTCTTTTTGCACTAGACGAGATACCCTTTGATTCCTTGGCGTTTTCATCTATATA
TGTTACCTTAAATCTGTATTTGGAAGATCTTAAAAAGGGGGAAATAAAGTTTCACTACGG
TACTATAAACAAAAGGCCTGGAAGTAGTCCTTCAGATATTCGAGCCTTTAGTCTTGATTA
CCATTTGCAGCCATGAATGGAGCTTGCAGGATTCGGTGTGATTCTTCCATGTCGTGTGTT
TTCACTTCGCGTCTCATTGTTGACTAAATGAAAGGAAGAATGAGAGATTCCTTGGAGCAA
GAAATGTTAAGGCTGTACAAAAAGAGTTTCTATTTCTGGTTTCAGTTGTTGCCCGAACTG
TAAAAGGAAAACTTCAGATGTGAAATGCAAAACATTTTGATCAATCGTTGTGTTATATTA
GTCACCATGTCACTATTTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DA43TF U 1
AF RS1A803JQ C 543
AF RS1A803TF U 543
AF RS1DA43JQ C 358
BS 1 683 RS1DA43TF
BS 684 684 RS1A803TF
BS 685 732 RS1DA43TF
BS 733 733 RS1A803TF
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BS 770 770 RS1A803TF
BS 771 804 RS1DA43TF
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RD RS1DA43TF 816 0 0
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AATGTCTTCCCCACTTCCCGGATCCGACCCAGTTCCCAAGTCTCCAACTTTCGTCTCCGT
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CGCTTACCAGAATCCTAAGATGGTTGTAGGTTGTCTTATTGAGCATGAAGGAAAGGTTTT
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CACTGTGGAAGTTGTTTCTCCTTTTGCGCAGCTCGATATTCCTCTTATTGGCCAAACGTA
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G
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G
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TATAAACAAAAGGCCTGGAAGTAGTCCTTCAGATATTCGAGCCTTTAGTCTTGATTACCA
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CC

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ATATGTTACCTTAAATCTGTATTTGGAAGATCTTAAAAAGGGGGAAATAAAGTTTCACTA
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TTAGTCACCATGTCACTATTTACT

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 4

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AGTTATATAGAAACTATGTATTATTCATAATCATATTGGAAAGCATTTTTAGCAC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1ES57TF U 1
AF RS1ET74TF U 1
AF RS1ET74JQ C 105
AF RS1ES57JQ C 145
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QA 1 583 1 583
DS 

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TGCCTCTGTTCTCTCCCTCTCCCAGCTCCAATGCTCCCCTGTTTCGCCTTCTCAGGCTCC
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GGATGAAGCGGGTGGTCTGAAAATAAGGTGCATGTGGAAGGTGAGGGATTTTGGGTGCGG
CGTTGAACTCATTAACAGGATCCATAAGGTTGCTGAAGCTTCTGGTCATTACCCTTCTCT
CCATTTGGAAAGTCCTACCCAAGTTAGAGCTGAACTATCTACCTCTTCCATTGGTGGGCT
GAGTATGAACGATTTCATAATGGCGGCAAAGATAGATGACATCAAGACTTCTGATCTTTC
CCCTAG*AAAAGAGCTTGGGCGTAACAAACTTGTTCTTTTTTT

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1ET74JQ 731 0 0
GCACCACTGTTCAGTTCTTCGGTTTCTCACCGACCCAACGTAAACTGGGTGGGTTAACGG
TAGCCCGGAACAATCTGGCGCAGGATTTTCTCGGGGACTGGGGAGCTCGAGACCCTTACC
CGGAGGAGATAGCTAGCCAGTTCGGTGATAAAGTGTTGGGACCCCAAAGCACTGAGCACA
AGATTCTGATTCCTAATGCCTCTGTTCTCTCCCTCTCCCAGCTCCAATGCTCCCCTGTTT
CGCCTTCTCAGGCTCCGTTATCCCCCGATGATGCAACAAAGCTCCTCCATAAGGTCTTGG
GGTGGAGTATAATGGAGGATGAAGCGGGTGGTCTGAAAATAAGGTGCATGTGGAAGGTGA
GGGATTTTGGGTGCGGCGTTGAACTCATTAACAGGATCCATAAGGTTGCTGAAGCTTCTG
GTCATTACCCTTCTCTCCATTTGGAAAGTCCTACCCAAGTTAGAGCTGAACTATCTACCT
CTTCCATTGGTGGGCTGAGTATGAACGATTTCATAATGGCGGCAAAGATAGATGACATCA
AGACTTCTGATCTTTCCCCTAGGAAAAGAGCTTGGGGGTAACAAACTTGTTCTTTTTTTT
TTACTTATCTCATATTTGTGACATTTTTGTATGATAACATATAATACACGTGATGTATTC
GTTGGTCTTTATGTTAAGTTATATAGAAACTATGTATTATTCATAATCATATTGGAAAGC
ATTTTTAGCAC

QA 1 731 1 731
DS 

RD RS1ES57JQ 691 0 0
TAAACTGGGTGGGTTAACGGTAGCCCGGAACAATCTGGCGCAGGATTTTCTCGGGGACTG
GGGAGCTCGAGACCCTTACCCGGAGGAGATAGCTAGCCAGTTCGGTGATAAAGTGTTGGG
ACCCCAAAGCACTGAGCACAAGATTCTGATTCCTAATGCCTCTGTTCTCTCCCTCTCCCA
GCTCCAATGCTCCCCTGTTTCGCCTTCTCAGGCTCCGTTATCCCCCGATGATGCAACAAA
GCTCCTCCATAAGGTCTTGGGGTGGAGTATAATGGAGGATGAAGCGGGTGGTCTGAAAAT
AAGGTGCATGTGGAAGGTGAGGGATTTTGGGTGCGGCGTTGAACTCATTAACAGGATCCA
TAAGGTTGCTGAAGCTTCTGGTCATTACCCTTCTCTCCATTTGGAAAGTCCTACCCAAGT
TAGAGCTGAACTATCTACCTCTTCCATTGGTGGGCTGAGTATGAACGATTTCATAATGGC
GGCAAAGATAGATGACATCAAGACTTCTGATCTTTCCCCTAGGAAAAGAGCTTGGGCGTA
ACAAACTTGTTCTTTTTTTTTTACTTATCTCATATTTGTGACATTTTTGTATGATAACAT
ATAATACACGTGATGTATTCGTTGGTCTTTATGTTAAGTTATATAGAAACTATGTATTAT
TCATAATCATATTGGAAAGCATTTTTAGCAC

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

CO CL3032Contig1 752 2 11 U
AAGCACATAAATGACGTCTTTAAGCATATTATTTTCTCATTAACATAAGTATAGAAATCA
TCGACACAAATATTGTGGAAAAAAATATAAATTTGGCACACTTTTTATATAACACTAGAT
TAGCTTCATCTTCCTTATTCCTTGACCACACCTGGTTCTTATTCACTCATCATCCCTTCA
TGCTACAACCAATATTACACTAACTGAAGAGCTGTTTGGTCTTGGCGACCAGCGGATGAG
TAATGTTGATTGTTAGGTTGCAATGCCGCGACTTGGAAATAGTTCCGTGAATCAAACGGC
TGAAAGTGCGTTTGAGGTGGTCGCATAATCTGCTCGTAGTTAGATCCTCCTGGCATCAGA
TTCATACTTGGCAGGATACTTGGATTGTTCCTCTCATTTTCAGCTATCTTTGCACGAAGA
AGCTGGTTATCGTTATGCAAATCAACTTCCTGCTCAAATTTCTTCTGCATGTAGTCAATT
TCGGCGAATAAGAGTTCATTCTTTTTGGATCGTATTCGGTTGACACTTTTGTCTAATCTG
CCTTCCAAATTTTTAAGCTCCTCGGGAGACATTGACCCTATCGTCTCACCCATTAATTGC
CTGTTCGAGTTTTGTATGCTGATAATCTTTTGACGCAACTTGGCCGAATCTTGTTGATAA
TACTGTGCATTAATTTCTGCCACCGATCCAGTGTTAGAATTATCCGATATAGCCTTCTTG
TACCTCTCAATTGTCCCTTTGACACTGTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1BO16JQ U 1
AF RS1AX74JQ U 13
BS 1 114 RS1BO16JQ
BS 115 115 RS1AX74JQ
BS 116 303 RS1BO16JQ
BS 304 304 RS1AX74JQ
BS 305 449 RS1BO16JQ
BS 450 458 RS1AX74JQ
BS 459 562 RS1BO16JQ
BS 563 563 RS1AX74JQ
BS 564 647 RS1BO16JQ
BS 648 648 RS1AX74JQ
BS 649 752 RS1BO16JQ

RD RS1BO16JQ 752 0 0
AAGCACATAAATGACGTCTTTAAGCATATTATTTTCTCATTAACATAAGTATAGAAATCA
TCGACACAAATATTGTGGAAAAAAATATAAATTTGGCACACTTTTTATATAACATTAGAT
TAGCTTCATCTTCCTTATTCCTTGACCACACCTGGTTCTTATTCACTCATCATCCCTTCA
TGCTACAACCAATATTACACTAACTGAAGAGCTGTTTGGTCTTGGCGACCAGCGGATGAG
TAATGTTGATTGTTAGGTTGCAATGCCGCGACTTGGAAATAGTTCCGTGAATCAAACGGC
TGAGAGTGCGTTTGAGGTGGTCGCATAATCTGCTCGTAGTTAGATCCTCCTGGCATCAGA
TTCATACTTGGCAGGATACTTGGATTGTTCCTCTCATTTTCAGCTATCTTTGCACGAAGA
AGCTGGTTATCGTTATGCAAATCAACTTC*********TTTCTTCTGCATGTAGTCAATT
TCGGCGAATAAGAGTTCATTCTTTTTGGATCGTATTCGGTTGACACTTTTGTCTAATCTG
CCTTCCAAATTTTTAAGCTCCTTGGGAGACATTGACCCTATCGTCTCACCCATTAATTGC
CTGTTCGAGTTTTGTATGCTGATAATCTTTTGACGCAACTTGGCCGATTCTTGTTGATAA
TACTGTGCATTAATTTCTGCCACCGATCCAGTGTTAGAATTATCCGATATAGCCTTCTTG
TACCTCTCAATTGTCCCTTTGACACTGTTGTT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RS1AX74JQ 740 0 0
AG
CGTCTTTAAGCATATTATTTTCTCATTAACATAAGTATAGAAATCATCGACACAAATATT
GTGGAAAAAAATATAAATTTGGCACACTTTTTATATAACACTAGATTAGCTTCATCTTCC
TTATTCCTTGACCACACCTGGTTCTTATTCACTCATCATCCCTTCATGCTACAACCAATA
TTACACTAACTGAAGAGCTGTTTGGTCTTGGCGACCAGCGGATGAGTAATGTTGATTGTT
AGGTTGCAATGCCGCGACTTGGAAATAGTTCCGTGAATCAAACGGCTGAAAGTGCGTTTG
AGGTGGTCGCATAATCTGCTCGTAGTTAGATCCTCCTGGCATCAGATTCATACTTGGCAG
GATACTTGGATTGTTCCTCTCATTTTCAGCTATCTTTGCACGAAGAAGCTGGTTATCGTT
ATGCAAATCAACTTCCTGCTCAAATTTCTTCTGCATGTAGTCAATTTCGGCGAATAAGAG
TTCATTCTTTTTGGATCGTATTCGGTTGACACTTTTGTCTAATCTGCCTTCCAAATTTTT
AAGCTCCTCGGGAGACATTGACCCTATCGTCTCACCCATTAATTGCCTGTTCGAGTTTTG
TATGCTGATAATCTTTTGACGCAACTTGGCCGAATCTTGTTGATAATACTGTGCATTAAT
TTCTGCCACCGATCCAGTGTTAGAATTATCCGATATGGCCTTCTTGTACCTCTCAATTGT
CCCTTTGACACTGTTGTT

QA 3 740 3 740
DS 



AS 1 4

CO CL3033Contig1 1087 4 5 U
GCAAAAGCCATTAAAAATGATGCAGAGCTACAGGGGATGAAGAACTCTCACTTGAGGGAT
GCTGCTGCTCTAGCTCATTTCTGGGCTTGGCTGGAAGAAGAAGTGCACAAGAATGAGAAC
CTAACAGAGGTAGATGTCGCTGACAGGCTCCTGGAGTTCCGTTCGTTGCAGGATGGGTTT
ATGGATACAAGCTTCGATACGATAAGTGGTTCTGGTGCAAACGGAGCGATTATTCATTAT
AAACCGGAGCCAGAGAGCTGCAGTCGTGTAGACCCTCAAAAACTTTTCTTACTCGATAGT
GGAGCTCAATATGTCGATGGAACTACAGATATCACCAGAACAGCACATTTTAGTGAACCT
TCTGCCCGAGAAAAAGAATGTTTCACCAGAGTTTTGCAGGGTCATATCGCTCTTGATCAA
GCCGTGTTCCCAGAAGGCACTCCTGGTTTTGTATTGGATGGGTTTGCACGCTCTTCTCTA
TGGAAAATCGGACTTGATTACCGCCATGGGACAGGACACGGTGTAGGTGCTGCACTTAAT
GTCCATGAAGGTCCTCAAAGTATTAGCTTTCGGTATGGAAACATGACCCCTATTCAGAGT
GGGATGATAGTAAGCAATGAACCCGGATATTATGAATACCATGCCTTTGGAATCAGAATT
GAGAACCTCCTTCATGTGAAAGATGCTGAGACACCGAACCGCTTTGGTGGTGCTACGTAC
CTTGGATTTGAGAAGCTTACATTCTTCCCAATTCAGACAAAAATGGTTGATGTATCTTTG
CTATCTCATGCTGAGATTGACTGGCTTAATAGCTACCACGCAGAAGTCTGGGAAAAGGTT
TCACCTTTGTTAGAAGGTCCTACTCAGCAATGGCTCTGGAACAACACTCGTCCCTTAGCC
AAACCATAATCAAACCAAACCAAGTGTTTTTCCCACTTGAAATTGCTCAGTAGACTTGAT
CCTGTAGGGTTATTACCAAAAATCTACTCATTTCATTTGATGGTGTCTGTAAAATTACAA
AATGTAATACTATTCCTGTAATTTTACATAAGAAGTCCCGCTTTTATTAATATTCTCGAA
TTAACAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1FO96TF U 1
AF RS1G502TF U 1
AF RS1FO96JQ C 364
AF RS1G502JQ C 366
BS 1 741 RS1FO96TF
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BS 749 749 RS1FO96JQ
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RD RS1FO96TF 741 0 0
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GGAGCTCAATATGTCGATGGAACTACAGATATCACCAGAACAGCACATTTTAGTGAACCT
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CTTGGATTTGAGAAGCTTACA

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DS 

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GCTGCTGCTCTAGCTCATTTCTGGGCTTGGCTGGAAGAAGAAGTGCACAAGAATGAGAAC
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ATGGATACAAGCTTCGATACGATAAGTGGTTCTGGTGCAAACGGAGCGATTATTCATTAT
AAACCGGAGCCAGAGAGCTGCAGTCGTGTAGACCCTCAAAAACTTTTCTTACTCGATAGT
GGAGCTCAATATGTCGATGGAACTACAGATATCACCAGAACAGCACATTTTAGTGAACCT
TCTGCCCGAGAAAAAGAATGTTTCACCAGAGTTTTGCAGGGTCATATCGCTCTTGATCAA
GCCGTGTTCCCAGAAGGCACTCCTGGTTTTGTATTGGATGGGTTTGCACGCTCTTCTCTA
TGGAAAATCGGACTTGATTACCGCCATGGGACAGGACACGGTGTAGGTGCTGCACTTAAT
GTCCATGAAGGTCCTCAAAGTATTAGCTTTCGGTATGGAAACATGACCCCTATTCAGAGT
GGGATGATAGTAAGCAATGAACCCGGATATTATGAATACCATGCCTTTGGAATCAGAATT
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CTTGGATTTGAGAAGCTTACATTCTTCC*AATTCAGACAA

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DS 

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GC
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GATAGTAAGCAATGAACCCGGATATTATGAATACCATGCCTTTGGAATCAGAATTGAGAA
CCTCCTTCATGTGAAAGATGCTGAGACACCGAACCGCTTTGGTGGTGCTACGTACCTTGG
ATTTGAGAAGCTTACATTCTTCCCAATTCAGACAAAAATGGTTGATGTATCTTTGCTATC
TCATGCTGAGATTGACTGGCTTAATAGCTACCACGCAGAAGTCTGGGAAAAGGTTTCACC
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AATACTATTCCTGTAATTTTACATAAGAAGTCCCGCTTTTATTAATATTCTCGAATTAAC
AC

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DS 

RD RS1G502JQ 722 0 0
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GTTCCCAGAAGGCACTCCTGGTTTTGTATTGGATGGGTTTGCACGCTCTTCTCTATGGAA
AATCGGACTTGATTACCGCCATGGGACAGGACACGGTGTAGGTGCTGCACTTAATGTCCA
TGAAGGTCCTCAAAGTATTAGCTTTCGGTATGGAAACATGACCCCTATTCAGAGTGGGAT
GATAGTAAGCAATGAACCCGGATATTATGAATACCATGCCTTTGGAATCAGAATTGAGAA
CCTCCTTCATGTGAAAGATGCTGAGACACCGAACCGCTTTGGTGGTGCTACGTACCTTGG
ATTTGAGAAGCTTACATTCTTCCCAATTCAGACAAAAATGGTTGATGTATCTTTGCTATC
TCATGCTGAGATTGACTGGCTTAATAGCTACCACGCAGAAGTCTGGGAAAAGGTTTCACC
TTTGTTAGAAGGTCCTACTCAGCAATGGCTCTGGAACAACACTCGTCCCTTAGCCAAACC
ATAATCAAACCAAACCAAGTGTTTTTCCCACTTGAAATTGCTCAGTAGACTTGATCCTGT
AGGGTTATTACCAAAAATCTACTCATTTCATTTGATGGTGTCTGTAAAATTACAAAATGT
AATACTATTCCTGTAATTTTACATAAGAAGTCCCGCTTTTATTAATATTCTCGAATTAAC
AC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 3

CO CL3034Contig1 1182 3 4 U
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ATGGGGTTTTTCAAAAATTTAGACAAAAGAATATGTTGTGGATGGGGGAGAGATTCACAA
TTTACAAAAGAGACTTGTATCCATCCTCTTGTGTTCCCGGGAGAAGATAAGATAAAGTGG
GGGAATCAATCGAGGTAGAAGAGAGTGACGATCTTGCGGAGATTTTTAGCTTCTTGACAT
GTCTCCATGAGAAGCTTACTGTCATGAAACGCAAAGCAGATTACTTGCTGTACTTGTGAT
ATGATGTCCATATTGCATAGTCTGCTGGCTTCTAGTAATGGCAAATGGTCATTGTGTGGC
TTTTCTACCACGTTTTGTACTTTGGACAAGAGTTCTTGGCTCTCGGGAGGTTGCTTTTTC
AAACTTTGAGGCAAAATGACTGTAAGAAGCTCTGGTCTCTCTGCTCTCAACGCACCTCTG
ATAACAGCTGCGTTAGTTCCAGATGCACCTGAAGTATATATATGATTTTTAGTAATAACC
ATGGCGTAGCTAAGTATCTCGATGAGCTCTTGATGCATGAAACCCATGTTCCTGGTCCCA
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ACATCAGGGGAAGGTTTGAGCTCAGAGACAGCAGCAGAACCAGATCCTTCAACAATGGCC
TGAGCCTGAGTAGGAATCCGGAGGCCGCCGGAATCTTCATCTGATTCAAGCCCACATGTA
ATGTGATCATCGTCTTCACTTCTCCAAGTGTCTGTGTTGGCTTGATCTTCCTTGTGTTGG
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GGCTTATGAGAAGAATCCGGAGGAGGAGAAATCAAAGAAGGTGTAAGAGGTAGAAGAAGG
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CTTCTCTTCTGTCTCCAACGCAGATATAATTCAGAAAAAATTGACAGAGAATCAATCCTT
CACTGCTTCATCCAAGAAGTAGAAGAAGAAGATAAAACACCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DI70JQ U 1
AF RS1BP62JQ U 1
AF RS1BP62TF C 526
BS 1 34 RS1BP62JQ
BS 35 35 RS1DI70JQ
BS 36 729 RS1BP62JQ
BS 730 1182 RS1BP62TF

RD RS1DI70JQ 699 0 0
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ATGGGGTTTTTCAAAAATTTAGACAAAAGAATATGTTGTGGATGGGGGAGAGATTCACAA
TTTACAAAAGAGACTTGTATCCATCCTCTTGTGTTCCCGGGAGAAGATAAGATAAAGTGG
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GTCTCCATGAGAAGCTTACTGTCATGAGACGCAAAGCAGATTACTTGCTGTACTTGTGAT
ATGATGTCCATATTGCATAGTCTGCTGGCTTCTAGTAATGGCAAATGGTCATTGTGTGGC
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ACATCAGGGGAAGGTTTGAGCTCAGAGACAGCAACAGAA

QA 1 699 1 699
DS 

RD RS1BP62JQ 729 0 0
TTTTATAACAAATGTAACGTTACAAGATGGCTGAGAATTCATCCTAGTAAAATCACAACG
ATGGGGTTTTTCAAAAATTTAGACAAAAGAATATGTTGTGGATGGGGGAGAGATTCACAA
TTTACAAAAGAGACTTGTATCCATCCTCTTGTGTTCCCGGGAGAAGATAAGATAAAGTGG
GGGAATCAATCGAGGTAGAAGAGAGTGACGATCTTGCGGAGATTTTTAGCTTCTTGACAT
GTCTCCATGAGAAGCTTACTGTCATGAAACGCAAAGCAGATTACTTGCTGTACTTGTGAT
ATGATGTCCATATTGCATAGTCTGCTGGCTTCTAGTAATGGCAAATGGTCATTGTGTGGC
TTTTCTACCACGTTTTGTACTTTGGACAAGAGTTCTTGGCTCTCGGGAGGTTGCTTTTTC
AAACTTTGAGGCAAAATGACTGTAAGAAGCTCTGGTCTCTCTGCTCTCAACGCACCTCTG
ATAACAGCTGCGTTAGTTCCAGATGCACCTGAAGTATATATATGATTTTTAGTAATAACC
ATGGCGTAGCTAAGTATCTCGATGAGCTCTTGATGCATGAAACCCATGTTCCTGGTCCCA
AAGAAGCCAATTGTTCTAGGCCCTTGTTGCTGTATCGCCAACAGCTCTTGAATGTAATCA
ACATCAGGGGAAGGTTTGAGCTCAGAGACAGCAGCAGAACCAGATCCTTCAACAATGGCC
TGAGCCTGA

QA 1 729 1 729
DS 

RD RS1BP62TF 657 0 0
TTTTTAGTAATAACCATGGCGTAGCTAAGTATCTCGATGAGCTCTTGATGCATGAAACCC
ATGTTCCTGGTCCCAAAGAAGCCAATTGTTCTAGGCCCTTGTTGCTGTATCGCCAACAGC
TCTTGAATGTAATCAACATCAGGGGAAGGTTTGAGCTCAGAGACAGCAGCAGAACCAGAT
CCTTCAACAATGGCCTGAGCCTGAGTAGGAATCCGGAGGCCGCCGGAATCTTCATCTGAT
TCAAGCCCACATGTAATGTGATCATCGTCTTCACTTCTCCAAGTGTCTGTGTTGGCTTGA
TCTTCCTTGTGTTGGGGAACACACATGGGAACACAGGGAGAAGAGGATCTGGATCGCCGG
GGGAAAAGCTGCGGCGATGAAGGAGTAGTAGAAGAAGAGGACCGGAGAATGAAATTAGGG
TTTTGCGATCGGAGCGGCTTATGAGAAGAATCCGGAGGAGGAGAAATCAAAGAAGGTGTA
AGAGGTAGAAGAAGGAGCCTCATAGGTAGAGACGAACTCATCTATCTATCTCTCCCAATC
ACTGTTTGAACTTCTCTTCTCTTCTGTCTCCAACGCAGATATAATTCAGAAAAAATTGAC
AGAGAATCAATCCTTCACTGCTTCATCCAAGAAGTAGAAGAAGAAGATAAAACACCC

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 3

CO CL3035Contig1 688 3 7 U
GGACTCACACAAACACCTTGAGCTCTCTCTACCATACAAACAAAAGAAGCCAAAATCTCC
GGCGGAGAGATTATGGCGGGACAGTCGCGAAAATGGATGATTCTGGTGGCGACGATTTGG
ATTCAGGCTTTCACCGGGACGAACTTCGATTTCTCGGCTTACTCTTCAGATTTGAAGTCG
GTTTTGGAGATTTCGCAGGTGCAGCTTAACTACCTCGCCGTGGCTTCCGATCTTGGGAAG
GTGTTCGGTTGGTCTTCGGGGCTTGCGCTGATGTACTTCCCGCTTTGGACGGTGCTCTTC
GCGGCGGCGTCTATGGGATTCGTCGGTTATGGAGTACAGTGGCTCGTCATCACTAACTTC
ATCTCTTTGCCTTATATGATGGTAACTTCACTCTTCTTTCTACAGTACTTTTCTTTTTGA
TGAGACTGCTTTTTATTCATTTTTAAATTATTTTATATCTTGCTGTTATTGGCAACCACT
ACTTTATAATAATATAAAAAAGTTAGAAAGAAAATCATGATTCGGCATGATTCTTTATTA
TTTAATCTTTCGTTGTTCATAGAGAACTCGTGAAGAATGAAATAGAAAAGTTGAGATTTG
TATAAACTAGAAACTATCTTCATTGTTGATAAATTAAATATTGGTTACTCAAAAAAAAGA
GAAGTTATATTATGAAACTGTGTGTTTT


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1D668TF U 4
AF RS1B391JQ C 1
AF RS1B391TF U 1
BS 1 4 RS1B391JQ
BS 5 96 RS1D668TF
BS 97 97 RS1B391TF
BS 98 120 RS1D668TF
BS 121 657 RS1B391TF
BS 658 658 RS1B391JQ
BS 659 688 RS1B391TF

RD RS1D668TF 119 0 0
G
TCACACAAACACCTTGAGCTCTCTCTACCATACAAACAAAAGAAGCCAAAATCTCCGGCG
GAGAGATTATGGCGGGACAGTCGCGAAAATGG*TGATTCTGGTGGCGACGATTTGG
TT

QA 2 117 2 117
DS 

RD RS1B391JQ 688 0 0
GGACTCACACAAACACCTTGAGCTCTCTCTACCATACAAACAAAAGAAGCCAAAATCTCC
GGCGGAGAGATTATGGCGGGACAGTCGCGAAAATGGATGATTCTGGTGGCGACGATTTGG
ATTCAGGCTTTCACCGGGACGAACTTCGATTTCTCGGCTTACTCTTCAGATTTGAAGTCG
GTTTTGGAGATTTCGCAGGTGCAGCTTAACTACCTCGCCGTGGCTTCCGATCTTGGGAAG
GTGTTCGGTTGGTCTTCGGGGCTTGCGCTGATGTACTTCCCGCTTTGGACGGTGCTCTTC
GCGGCGGCGTCTATGGGATTCGTCGGTTATGGAGTACAGTGGCTCGTCATCACTAACTTC
ATCTCTTTGCCTTATATGATGGTAACTTCACTCTTCTTTCTACAGTACTTTTCTTTTTGA
TGAGACTGCTTTTTATTCATTTTTAAATTATTTTATATCTTGCTGTTATTGGCAACCACT
ACTTTATAATAATATAAAAAAGTTAGAAAGAAAATCATGATTCGGCATGATTCTTTATTA
TTTAATCTTTCGTTGTTCATAGAGAACTCGTGAAGAATGAAATAGAAAAGTTGAGATTTG
TATAAACTAGAAACTATCTTCATTGTTGATAAATTAAATATTGGTTACTCAAAAAAAAGA
GAAGTTATATTATGAAACTGTGTGTTTT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RS1B391TF 688 0 0
GGAC
TCACACAAACACCTTGAGCTCTCTCTACCATACAAACAAAAGAAGCCAAAATCTCCGGCG
GAGAGATTATGGCGGGACAGTCGCGAAAATGGATGATTCTGGTGGCGACGATTTGGATTC
AGGCTTTCACCGGGACGAACTTCGATTTCTCGGCTTACTCTTCAGATTTGAAGTCGGTTT
TGGAGATTTCGCAGGTGCAGCTTAACTACCTCGCCGTGGCTTCCGATCTTGGGAAGGTGT
TCGGTTGGTCTTCGGGGCTTGCGCTGATGTACTTCCCGCTTTGGACGGTGCTCTTCGCGG
CGGCGTCTATGGGATTCGTCGGTTATGGAGTACAGTGGCTCGTCATCACTAACTTCATCT
CTTTGCCTTATATGATGGTAACTTCACTCTTCTTTCTACAGTACTTTTCTTTTTGATGAG
ACTGCTTTTTATTCATTTTTAAATTATTTTATATCTTGCTGTTATTGGCAACCACTACTT
TATAATAATATAAAAAAGTTAGAAAGAAAATCATGATTCGGCATGATTCTTTATTATTTA
ATCTTTCGTTGTTCATAGAGAACTCGTGAAGAATGAAATAGAAAAGTTGAGATTTGTATA
AACTAGAAACTATCTTCATTGTTGATAAATTAAATATTGGTTACTCAAAAAAA*GAGAAG
TTATATTATGAAACTGTGTGTTTT

QA 5 688 5 688
DS 



AS 1 4

CO CL3036Contig1 766 4 11 U
GGGAACCACAAGAAAATAGAATGGAGCCACTCTTATCAGCCGTGATCGTCCTGCTCCTGG
TTTCATGTTTCACTTCTTCAGAAGCTCTCACCAGCAACAACGGAAACATCACAATCAAAT
GGGATATCATGTCATGGAACCATGATAGTTACTTTGCTCTGGTTACAGCTTACAACTACC
AGAAACACCGTTCTGTTCCTTCACCGGGAAGGAGAATGAGCTGGAGATGGACCAAGAAAG
AGGTCATCAGGAGTATGGTCGGCGCGAAAACCACAGAGCGAGGAGTCTGTTCCATGTTCA
AAAGAAACATCCCTCGTTCCTGCCTTAGAAAACCAACAGTCGTCGATTTGCTCCCTGGTG
CTCCTTACACTCAGCAGATCGCTAACTGCTGCAGAGGTGGCGTCTTGAAACCCGGTTCGG
AAAGTGAATTCGAGATATCCGTTGGTAAAGCTGGTAACTCGGTTAAGACTGTTCGGTTGC
CGGGAAACTTCATGTTCACGGTACCTAAACAGCAGTATGTATGTAGACCGGCTAAGAACG
TTAGACCGACGGTGTTTATGTCTCCTGACACAAAGAGAACCGCTAGTGCCTTTATGACCT
GGAAGATTGTTTGCGTGTTCGACAAGGCAACATAAACAACGCAAAGTCTCTAAAGGAAAA
*GCTCATTAGCAGTTATATCTCTCCAGAATTTTCTGCTCTTCTATATTTTCTTGTATGGT
TTTAATTTTAAGGGGGAACAAAATATAATATGATTGAATTTAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1BQ57TF U 1
AF RS1CJ06TF U 7
AF RS1BQ57JQ C 52
AF RS1CJ06JQ C 55
BS 1 117 RS1BQ57TF
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BS 640 735 RS1CJ06TF
BS 736 766 RS1BQ57JQ

RD RS1BQ57TF 639 0 0
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TTTCATGTTTCACTTCTTCAGAAGCTCTCACCAGCAACAACGGAAACATCACAATCAGAT
GGGATATCATGTCATGGAACCATGATGGTTACTTTGCTCTGGTTACAGCTTACAACTACC
AGAAACACCGTTCTGTTCCTTCACCGGGATGGAGAATGAGCTGGAGATGGACCAAGAAAG
AGGTCATCAGGAGTATGGTCGGCGCGAAAACCACAGAGCGAGGAGTCTGTTCCATGTTCA
AAAGAAACATCCCTCGTTCCTGCCTTAGAAAACCAACAGTCGTCGATTTGCTCCCTGGTG
CTCCTTACACTCAGCAGATCGCTAACTGCTGCAGAGGTGGCGTCTTGAAACCCGGTTCGG
AAAGTGAATTCGAGATATCCGTTGGTAAAGCTGGTAACTCGGTTAAGACTGTTCGGTTGC
CGGGAAACTTCATGTTCACGGTACCTAAACAGCAGTATGTATGTAGACCGGCTAAGAACG
TTAGACCGACGGTGTTTATGTCTCCTGACACAAAGAGAACCGCTAGTGCCTTTATGACCT
GGAAGATTGTTTGCGTGTTCGACAACGCAACATAAACAA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RS1CJ06TF 733 0 0
G
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TTTCACTTCTTCAGAAGCTCTCACCAGCAACAACGGAAACATCACAATCAAATGGGATAT
CATGTCATGGAACCATGATAGTTACTTTGCTCTGGTTACAGCTTACAACTACCAGAAACA
CCGTTCTGTTCCTTCACCGGGAAGGAGAATGAGCTGGAGATGGACCAAGAAAGAGGTCAT
CAGGAGTATGGTCGGCGCGAAAACCACAGAGCGAGGAGTCTGTTCCATGTTCAAAAGAAA
CATCCCTCGTTCCTGCCTTAGAAAACCAACAGTCGTCGATTTGCTCCCTTGTGCTCCTTA
CACTCAGCAGATCGCTAACTGCTGCAGAGGTGGCGTCTTGAAACCCGGTTCGGAAAGTGA
ATTCGAGATATCCGTTGGTAAAGCTGGTAACTCGGTTAAGGCTGTTCGGTTGCCGGGAAA
CTTCATGTTCACGGTACCTAAACAGCAGTATGTATGTAGACCGGCTAAGAACGTTAGACC
GACGGTGTTTATGTCTCCTGACACAAAGAGAACCGCTAGTGCCTTTATGACCTGGAAGAT
TGTTTGCGTGTTCGACAAGGCAACATAAACAACGCAAAGTCTCTAAAGGAAAA*GCTCAT
TAGCAGTTATATCTCTCCAGAATTTTCTGCTCTTCTATATTTTCTTGTATGGTTTTAATT
TTAAGGGG
ACAA

QA 2 729 2 729
DS 

RD RS1BQ57JQ 715 0 0
TGC
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TCAGATGGGATATCATGTCATGGAACCATGATGGTTACTTTGCTCTGGTTACAGCTTACA
ACTACCAGAAACACCGTTCTGTTCCTTCACCGGGATGGAGAATGAGCTGGAGATGGACCA
AGAAAGAGGTCATCAGGAGTATGGTCGGCGCGAAAACCACAGAGCGAGGAGTCTGTTCCA
TGTTCAAAAGAAACATCCCTCGTTCCTGCCTTAGAAAACCAACAGTCGTCGATTTGCTCC
CTGGTGCTCCTTACACTCAGCAGATCGCTAACTGCTGCAGAGGTGGCGTCTTGAAACCCG
GTTCGGAAAGTGAATTCGAGATATCCGTTGGTAAAGCTGGTAACTCGGTTAAGACTGTTC
GGTTGCCGGGAAACTTCATGTTCACGGTACCTAAACAGCAGTATGTATGTAGACCGGCTA
AGAACGTTAGACCGACGGTGTTTATGTCTCCTGACACAAAGAGAACCGCTAGTGCCTTTA
TGACCTGGAAGATTGTTTGCGTGTTCGACAAGGCAACATAAACAACGCAAAGTCTCTAAA
GGAAAAAGCTCATTAGCAGTTATATCTCTCCAGAATTTTCTGCTCTTCTATATTTTCTTG
TATGGTTTTAATTTTAAGGGGGAACAAAATATAATATGATTGAATTTAGTCC

QA 4 715 4 715
DS 

RD RS1CJ06JQ 712 0 0
TCCTGGTTTCATGTTTCACTTCTTCAGAAGCTCTCACCAGCAACAACGGAAACATCACAA
TCAAATGGGATATCATGTCATGGAACCATGATAGTTACTTTGCTCTGGTTACAGCTTACA
ACTACCAGAAACACCGTTCTGTTCCTTCACCGGGAAGGAGAATGAGCTGGAGATGGACCA
AGAAAGAGGTCATCAGGAGTATGGTCGGCGCGAAAACCACAGAGCGAGGAGTCTGTTCCA
TGTTCAAAAGAAACATCCCTCGTTCCTGCCTTAGAAAACCAACAGTCGTCGATTTGCTCC
CTTGTGCTCCTTACACTCAGCAGATCGCTAACTGCTGCAGAGGTGGCGTCTTGAAACCCG
GTTCGGAAAGTGAATTCGAGATATCCGTTGGTAAAGCTGGTAACTCGGTTAAGGCTGTTC
GGTTGCCGGGAAACTTCATGTTCACGGTACCTAAACAGCAGTATGTATGTAGACCGGCTA
AGAACGTTAGACCGACGGTGTTTATGTCTCCTGACACAAAGAGAACCGCTAGTGCCTTTA
TGACCTGGAAGATTGTTTGCGTGTTCGACAAGGCAACATAAACAACGCAAAGTCTCTAAA
GGAAAA*GCTCATTAGCAGTTATATCTCTCCAGAATTTTCTGCTCTTCTATATTTTCTTG
TATGGTTTTAATTTTAAGGGGGAACAAAATATAATATGATTGAATTTAGTCC

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 4

CO CL3037Contig1 758 4 5 U
GGGAAAAAGAATCAGTCTCGAAACTTTTGTCGGATTTCCCAAAGAAAAAAAAA*TGGCGG
ATCAACTGACCGATGACCAGATCTCAGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGG
ATGGAGATGGTTGCATCACAACCAAGGAGCTCGGAACCGTGATGAGGTCACTAGGGCAAA
ACCCAACCGAAGCTGAGCTCCAAGACATGATCAACGAGGTCGATGCAGACGGTAACGGTA
CCATCGATTTCCCGGAGTTCCTGAACCTGATGGCCAGGAAAATGAAGGACACTGACTCTG
AGGAAGAGCTCAAGGAAGCCTTTAGGGTTTTCGACAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCTG
CGGCTGAGCTTCGACATGTGATGACGAACCTCGGTGAGAAACTTACCGACGAGGAGGTTG
ATGAGATGATCCGTGAAGCTGACGTTGATGGTGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCG
TTAAAGTCATGATGGCTAAGTAAGTGACTGAGAGCGAGAGAGTCTTATTATCCCTTGTTA
AAAAAATTAAAAGCCTTAACCTAAAAGAATGATACATTGGCTTTGATTCTGGTTGTGTTC
TTTAGGACATGTTTTTGCTTCTTTTCATGTTTTATTTGTCTGCTTTTGGCTTAAGCTATC
TCTTTAGTGTTATGTCAAGTATGAACTTCATGTTTTCAGTATCCTTTTGACAATTGATAT
TCTCTCCTTTTTATTGGTTTTAGTCCCTGTTGTTTCCC


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G240TF U 1
AF RS1G240JQ C 33
AF RS1EI34JQ C 3
AF RS1EI34TF U 3
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BS 64 64 RS1EI34TF
BS 65 613 RS1G240TF
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AAAAAATTAAAAGCCTTAACCTAAAAGAATGATACATTGGCTTTGATTCTGGTTGTGTTC
TTTAGGACATGTT

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DS 

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AAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGATAAGGATGGAGATGGTTGCATCACAACCAAGGAGCTC
GGAACCGTGATGAGGTCACTAGGGCAAAACCCAACCGAAGCTGAGCTCCAAGACATGATC
AACGAGGTCGATGCAGACGGTAACGGTACCATCGATTTCCCGGAGTTCCTGAACCTGATG
GCCAGGAAAATGAAGGACACTGACTCTGAGGAAGAGCTCAAGGAAGCCTTTAGGGTTTTC
GACAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCTGCGGCTGAGCTTCGACATGTGATGACGAACCTC
GGTGAGAAACTTACCGACGAGGAGGTTGATGAGATGATCCGTGAAGCTGACGTTGATGGT
GATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCGTTAAAGTCATGATGGCTAAGTAAGTGACTGAG
AGCGAGAGAGTCTTATTATCCCTTGTTAAAAAAATTAAAAGCCTTAACCTAAAAGAATGA
TACATTGGCTTTGATTCTGGTTGTGTTCTTTAGGACATGTTTTTGCTTCTTTTCATGTTT
TATTTGTCTGCTTTTGGCTTAAGCTATCTCTTTAGTGTTATGTCAAGTATGAACTTCATG
TTTTCAGTATCCTTTTAACAATTG
G

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DS 

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GG
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TCCTTTTTATTGGTTTTAGTCCCTGTTGTTTCCC

QA 3 756 3 756
DS 

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GG
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AGATGGTTGCATCACAACCAAGGAGCTCGGAACCGTGATGAGGTCACTAGGGCAAAACCC
AACCGAAGCTGAGCTCCAAGACATGATCAACGAGGTCGATGCAGACGGTAACGGTACCAT
CGATTTCCCGGAGTTCCTGAACCTGATGGCCAGGAAAATGAAGGACACTGACTCTGAGGA
AGGGCTCAAGGAAGCCTTTAGGGTTTTCGACAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCTGCGGC
TGAGCTTCGACATGTGATGACGAACCTCGGTGAGAAACTTACCGACGAGGAGGTTGATGA
GATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGTCAGATCAACTATGATGAGTTCGTTAA
AGTCATGATGGCTAAGTAAGTGACTGAGAGCGAGAGAGTCTTATTATCCCTTGTTAAAAA
AATTAAA*GCCTTAACCTAAAAGAATGATACATTGGCTTTGATTCTGGTTGTGTTCTTTA
GGACATGTTTTTGCTTCTTTTCATGTTTTATTTGTCTGCTTTTGGCTTAAGCTATCTCTT
TAGTGTTATGTCAAGTATGAACTTCATGTTTTCAGTATCCTTTTGACAATTGATATTCTC
TCCTTTTTATTGGTTTTAGTCCCTG

QA 3 747 3 747
DS 



AS 1 4

CO CL3038Contig1 825 4 11 U
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GCCTGATGTTTTGCAACAATTGAGCGGGAGCTCTGGTGTAACCTATTATGCCAGTAGCCT
CTTCAACAAAGGAGGATTTCCAAGTGCTATTGGCACGTCTGTAATAGCTACGATCATGGT
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GGCTTCTTGTGCTGCGATGGGTTTAAGTGCTTTGCTCTTGAGTGTTTCCTATGGGTTCGA
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CATTGTGGCATTCGCGATGGGGATGGGAGGACTACCCTGGATTATAATGGCTGAGATATT
TCCCATGAATGTGAAAGTATCAGCTGGAACCTTAGTTACCGTAACTAATTGGTTATTTGG
ATGGGTTATCACATATACTTTCAATTTCATGCTAGAGTGGAATGCATCAGGAATGTTCTT
CATCTTCTCGATGGTCTCCGCCTTTTCGATTGTATTTATATACTTTCTGGTACCGGAGAC
TAAAGGTCGATCTCTTGAAGAAATACAAGCGTTGCTCTCCAACTCTGTACAATAACTTGT
CCTTTTGGGGGTAAAATGATCATATAAATCGGTTATTTTAACTGATTAGAAATTGATTAT
TATGATTAGTGTGCGTTTGAATGAGATTTGTGTATGGATTGAGTTTTGAATGTGAAAATG
GCAACA*TAATTTGTATATGGCAATGTTAAAATACGTATTCTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 
25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C831JQ C 1
AF RS1AV19TF U 82
AF RS1GJ14TF U 94
AF RS1AV19JQ C 111
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BS 82 230 RS1AV19TF
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TATGATTAGTGTGCGTTTGAATGAGATTTGTGTATGGATTGAGTTTTGAATGTGAAA
ATGGCAACAATCATTTGC

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DS 

RD RS1AV19TF 728 0 0
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AATTATAGTCGATAAACTGGGGAGGAGAATACTCCTAATGGCTTCTTGTGCTGCGATGGG
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CTTTTCGATTGTATTTATATACTTTCTGGTACCGGAGACTAAAGGTCGATCTCTTGAAGA
AATACAAGCGTTGCTCTCCAACTCTGTACAATAACTTGTCCTTTTGGGGGTAAAATGATC
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CA
TGTTAA

QA 1 722 1 722
DS 

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G
GGTGTAACCTATTATGCCAGTAGCCTCTTCAACAAAGGAGGATTTCCAAGTGCTATTGGC
ACGTCTGTAATAGCTACGATCATGGTTCCGAAAGCAATGTTGGGAACAATTATAGTCGAT
AAACTGGGGAGGAGAACACTCCTAATGGCTTCTTGTGCTGCGATGGGTTTAAGTGCTTTG
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CCCTGGATTATAATGGCTGAGATATTTCCCATGAATGTGAAAGTATCAGCTGGAACCTTA
GTTACCGTAACTAATTGGTTATTTGGATGGGTTATCACATATACTTTCAATTTCATGCTA
GAGTGGAATGCATCAGGAATGTTCTTCATCTTCTCGATGGTCTCCGCCTTTTCGATT**A
TTTATATACTTTCTGGTACCGGAGACTAAAGGTCGATCTCTTGAAGAAATACAAGCGTTG
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ATTTTAACTGATTAGAAATTGATTATTATGATTAATGTGCGTTTGAATGAGATTTGTGTA
TGGATTGAGTTTTGAATGTGAAA*TGGCAACA*TAATTTGTA
AAA

QA 2 703 2 703
DS 

RD RS1AV19JQ 715 0 0
CCAGTAGCCTCTTCAACAAAGGAGGATTTCCAAGTGCTATTGGCACGTCTGTAATAGCTA
CGATCATGGTTCCGAAAGCAATGTTGGGAACAATTATAGTCGATAAACTGGGGAGGAGAA
TACTCCTAATGGCTTCTTGTGCTGCGATGGGTTTAAGTGCTTTGCTCTTGAGTGTTTCCT
ATGGGTTCGAGTCATTTGGAATTCTCCCAGATCTCACTCCCATCTTTACTTGCATTGGCT
TATTGGGTCACATTGTGGCATTCGCGATGGGGATGGGAGGACTACCCTGGATTATAATGG
CTGAGATATTTCCCATGAATGTGAAAGTATCAGCTGGAACCTTAGTTACCGTAACTAATT
GGTTATTTGGATGGGTTATCACATATACTTTCAATTTCATGCTAGAGTGGAATGCATCAG
GAATGTTCTTCATCTTCTCGATGGTCTCCGCCTTTTCGATTGTATTTATATACTTTCTGG
TACCGGAGACTAAAGGTCGATCTCTTGAAGAAATACAAGCGTTGCTCTCCAACTCTGTAC
AATAACTTGTCCTTTTGGGGGTAAAATGATCATATAAATCGGTTATTTTAACTGATTAGA
AATTGATTATTATGATTAGTGTGCGTTTGAATGAGATTTGTGTATGGATTGAGTTTTGAA
TGTGAAAATGGCAACAATAATTTGTATATGGCAATGTTAAAATACGTATTCTGGC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 2 4

CO CL3039Contig1 768 2 10 U
TTTTTGCTTTCACAGAAAATCAAAAGAACACACTAATAAACCGTTACCAATGGGTTTCGC
TTGGTGCGTACGCAGGTCAGCATCTAGATTAGCTTCCGTATGTGGTAATCGGATGGGTAG
AGTCCGGTCAATCTCCGCCGTTGTTAACCGTCATTCTCTTGCTCCCACCACATCCCCGTT
TCGCTCTTTTGCCCTTTACTCGACGGCTACTGATCGGATGAGCTCCGAGCAATCGCTTCT
CCGCGTGATTGACTCCGAGATCAACTCTGCTCTCCAAATCGATGATCCCGACCTGGATGA
AGAGACGGCTCCAGGTAGCTTCCCTTTCAAAATTGAAGACAATCCTGGGCATCAGACTGT
AACATTGACTAGAGATTACAAAGGGGAGCATGTTAAGGTTGTAGTAAGCATGCCTAGTCT
TGACGGTGATGAAAATGACGAGGATGATGATGATGATGAGGATGGGCATAGCAATGGATC
AAGTATTCCACTAGTCGTGACTGTTACCAAGAAGAGCGGGCTCAGCCTTGAGTTTAGCTG
TATGGCTTTCCCGGATGAGATTGCCATTGATGCTTTATCTGTGAGCAATCAGGGGAGTAC
TTTGGAGGATAAATTAGCGAACGAAAGGGCCTGATTTCGAATGCTTGGACGAGAATCTGA
AGAAGACATTCTACAAGTATCTGGAGATCAGAGGAGTGAAAGCAAGCACTACGAACTTCT
TGCACCAGTACATTATGAGGAAGTGAGAGAGAGTACTTGCTCTGGTTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DQ23TF U 1
AF RS1E892TF U 1
BS 1 45 RS1DQ23TF
BS 46 46 RS1E892TF
BS 47 174 RS1DQ23TF
BS 175 175 RS1E892TF
BS 176 259 RS1DQ23TF
BS 260 260 RS1E892TF
BS 261 594 RS1DQ23TF
BS 595 595 RS1E892TF
BS 596 733 RS1DQ23TF
BS 734 768 RS1E892TF

RD RS1DQ23TF 735 0 0
TTTTTGCTTTCACAGAAAATCAAAAGAACACACTAATAAACCGTTGCCAATGGGTTTCGC
TTGGTGCGTACGCAGGTCAGCATCTAGATTAGCTTCCGTATGTGGTAATCGGATGGGTAG
AGTCCGGTCAATCTCCGCCGTTGTTAACCGTCATTCTCTTGCTCCCACCACATCTCCGTT
TCGCTCTTTTGCCCTTTACTCGACGGCTACTGATCGGATGAGCTCCGAGCAATCGCTTCT
CCGCGTGATTGACTCCGAGGTCAACTCTGCTCTCCAAATCGATGATCCCGACCTGGATGA
AGAGACGGCTCCAGGTAGCTTCCCTTTCAAAATTGAAGACAATCCTGGGCATCAGACTGT
AACATTGACTAGAGATTACAAAGGGGAGCATGTTAAGGTTGTAGTAAGCATGCCTAGTCT
TGACGGTGATGAAAATGACGAGGATGATGATGATGATGAGGATGGGCATAGCAATGGATC
AAGTATTCCACTAGTCGTGACTGTTACCAAGAAGAGCGGGCTCAGCCTTGAGTTTAGCTG
TATGGCTTTCCCGGATGAGATTGCCATTGATGCTTTATCTGTGAGCAATCAGGGTAGTAC
TTTGGAGGATAAATTAGCGAACGAAAGGGCCTGATTTCGAATGCTTGGACGAGAATCTGA
AGAAGACATTCTACAAGTATCTGGAGATCAGAGGAGTGAAAGCAAGCACTACGAACTTCT
TGCACCAGTACAT
GA

QA 1 733 1 733
DS 

RD RS1E892TF 768 0 0
TTTTTGCTTTCACAGAAAATCAAAAGAACACACTAATAAACCGTTACCAATGGGTTTCGC
TTGGTGCGTACGCAGGTCAGCATCTAGATTAGCTTCCGTATGTGGTAATCGGATGGGTAG
AGTCCGGTCAATCTCCGCCGTTGTTAACCGTCATTCTCTTGCTCCCACCACATCCCCGTT
TCGCTCTTTTGCCCTTTACTCGACGGCTATTGATCGGATGAGCTCCGAGCAATCGCTTCT
CCGCGTGATTGACTCCGAGATCAACTCTGCTCTCCAAATCGATGATCCCGACCTGGATGA
AGAGACGGCTCCAGGTAGCTTCCCTTTCAAAATTGAAGACAATCCTGGGCATCAGACTGT
AACATTGACTAGAGATTACAAAGGGGAGCATGTTAAGGTTGTAGTAAGCATGCCTAGTCT
TGACGGTGATGAAAATGACGAGGATGATGATGATGATGAGGATGGGCATAGCAATGGATC
AAGTATTCCACTAGTCGTGACTGTTACCAAGAAGAGCGGGCTCAGCCTTGAGTTTAGCTG
TATGGCTTTCCCGGATGAGATTGCCATTGATGCTTTATCTGTGAGCAATCAGGGGAGTAC
TTTGGAGGATAAATTAGCGAACGAA*GGGCCTGATTTCGAATGCTTGGACGAGAATCTGA
G**AGACATTCTACAAGTATCTGGAGATCAGAG*AGTGAAAGCA*GCACTACGA*CTTCT
TGCACCAGTACATTATGAGGAAGTGAGAGAGAGTACTTGCTCTGGTTG

QA 1 768 1 768
DS 



CO CL3039Contig2 744 2 7 U
CACTTAAAAGTCATTACCCATAAATTCTCAAAGATTCTGTAAATGTGAAAACACATGCAT
GCAAATAACGAACATAAATTCATTCATACATTTCGACCTTACCTATTACTCTTCCATAAA
CGTCTTAACATTCTTCAACCAGAGCAAGTACTCTCTCTTCACCTTCCTCATAATGTACTG
GTGCAAGAAGTTCGTAGTGCTTGCTTTCACTCCTCTGATCTCCAGATACTTGTAGAATGT
CTTCTTCAGATTCTCGTCCAAGCATTCGAAATCAGGCCCTTCGTTCGCTAATTTATCCTC
CAAAGTACTACCCTGATTGCTCACAGATAAAGCATCAATGGCAATCTCATCCGGGAAAGC
CATACAGCTAAACTCAAGGCTGAGCCCGCTCTTCTTGGTAACAGTCACGACTAGTGGAAT
ACTTGATCCATTGCTATGCCCATCCTCATCATCATCATCATCCTCGTCATTTTCATCACC
GTCAAGACTAGGCATGCTTACTACAACCTTAACATGCTCCCCTTTGTAATCTCTAGTCAA
TGTTACAGTCTGATGCCCAGGATTGTCTTCAATTTTGAAAGGGAAGCTACCTGGAGCCGT
CTCTTCATCCAGGTCGGGATCATCGATTTGGAGAGCAGAGTTGACCTCGGAGTCAATCAC
GCGGAGAAGCGATTGCTCGGAGCTCATCCGATCAATAGCCGTCGAGTAAAGGGCAAAAGA
GCGAAACGGGGATGTGGTGGGAGC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DQ23JQ U 2
AF RS1E892JQ U 1
BS 1 162 RS1E892JQ
BS 163 163 RS1DQ23JQ
BS 164 309 RS1E892JQ
BS 310 310 RS1DQ23JQ
BS 311 644 RS1E892JQ
BS 645 645 RS1DQ23JQ
BS 646 744 RS1E892JQ

RD RS1DQ23JQ 682 0 0
G
CTTAAAAGTCATTACCCATAAATTCTCAAAGATTCTGTAAATGTGAAAACACATGCATGC
AAATAACGAACATAAATTCATTCATACATTTCGACCTTACCTATTACTCTTCCATAAACG
TCTTAACATTCTTCAACCAGAGCAAGTACTCTCTCTTCACCTTCCTCATCATGTACTGGT
GCAAGAAGTTCGTAGTGCTTGCTTTCACTCCTCTGATCTCCAGATACTTGTAGAATGTCT
TCTTCAGATTCTCGTCCAAGCATTCGAAATCAGGCCCTTCGTTCGCTAATTTATCCTCCA
AAGTACTACCCTGATTGCTCACAGATAAAGCATCAATGGCAATCTCATCCGGGAAAGCCA
TACAGCTAAACTCAAGGCTGAGCCCGCTCTTCTTGGTAACAGTCACGACTAGTGGAATAC
TTGATCCATTGCTATGCCCATCCTCATCATCATCATCATCCTCGTCATTTTCATCACCGT
CAAGACTAGGCATGCTTACTACAACCTTAACATGCTCCCCTTTGTAATCTCTAGTCAATG
TTACAGTCTGATGCCCAGGATTGTCTTCAATTTTGAAAGGGAAGCTACCTGGAGCCGTCT
CTTCATCCAGGTCGGGATCATCGATTTGGAGAGCAGAGTTGACCTCGGAGTCAATCACGC
GGAGAAGCGATTGCTCGGAGC

QA 2 682 2 682
DS 

RD RS1E892JQ 744 0 0
CACTTAAAAGTCATTACCCATAAATTCTCAAAGATTCTGTAAATGTGAAAACACATGCAT
GCAAATAACGAACATAAATTCATTCATACATTTCGACCTTACCTATTACTCTTCCATAAA
CGTCTTAACATTCTTCAACCAGAGCAAGTACTCTCTCTTCACTTTCCTCATAATGTACTG
GTGCAAGAAGTTCGTAGTGCTTGCTTTCACTCCTCTGATCTCCAGATACTTGTAGAATGT
CTTCTTCAGATTCTCGTCCAAGCATTCGAAATCAGGCCCTTCGTTCGCTAATTTATCCTC
CAAAGTACTCCCCTGATTGCTCACAGATAAAGCATCAATGGCAATCTCATCCGGGAAAGC
CATACAGCTAAACTCAAGGCTGAGCCCGCTCTTCTTGGTAACAGTCACGACTAGTGGAAT
ACTTGATCCATTGCTATGCCCATCCTCATCATCATCATCATCCTCGTCATTTTCATCACC
GTCAAGACTAGGCATGCTTACTACAACCTTAACATGCTCCCCTTTGTAATCTCTAGTCAA
TGTTACAGTCTGATGCCCAGGATTGTCTTCAATTTTGAAAGGGAAGCTACCTGGAGCCGT
CTCTTCATCCAGGTCGGGATCATCGATTTGGAGAGCAGAGTTGATCTCGGAGTCAATCAC
GCGGAGAAGCGATTGCTCGGAGCTCATCCGATCAATAGCCGTCGAGTAAAGGGCAAAAGA
GCGAAACGGGGATGTGGTGGGAGC

QA 1 744 1 744
DS 



AS 2 4

CO CL3040Contig1 745 2 3 U
GGAACCGATTTGCGCGAGTTAGAAAGAGTGTAAAACGGCGAGAGCTTCGCATCTTCTCTC
TCAGGCAGCTCTCTCTACTCTACCGATCGAACAATGTCGCTGGTAGCAAACGAGGAGTTC
CAGCACATTCTACGTGTGCTTAACACTAACGTTGATGGCAAACAAAAGATTATGTTTGCT
CTTACCTCCATCAAGGGTATTGGAAGAAGATTGGCCAACATTGTCTGCAAGAAAGCCGAT
GTCGACATGAACAAGAGGGCCGGTGAGCTGTCTGCAGCTGAGATCGATAACCTCATGACC
ATCGTTGCAAACCCAAAGCAGTACAAGATTCCAGATTGGTTCTTGAACAGACAGAAAGAC
TACAAGGATGGAAAGTACTCCCAGGTTGTTTCCAACGCACTCGACATGAAGCTGGGGGAT
GATCTTGAACGTCTCAAGAAGATCAGGAACCACCGTGGTCTGAGACACTACTGGGGTCTC
CGTGCCCGTGGACAACACACCAAGACAACTGGTCGCAGAGGAAAGACTGTTGGTGTCTCT
AAGAAGCGTTAAGACGATGATGCGAGCTGCAGCTGGATTGGATCTTTGACAGTTCCGTTT
TTATGTTTTTTGTTTTTTCGTACAATTTTGCAAGTCTCAAAGACTCGATTTTGGGTGTTT
GTTAAGACATCCTTCACTTGTTTTGTTATATTTCGAGATAATATTGTTGTCACGGCATCT
CGAGGTCAATTCTTTTGTTTTCCTC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CH69TF U 1
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GG
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CGTTGCAAACCCAAAGCAGTACAAGATTC

QA 3 331 3 331
DS 

RD RS1CH69JQ 745 0 0
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TTATGTTTTTTGTTTTTTCGTACAATTTTGCAAGTCTCAAAGACTCGATTTTGGGTGTTT
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CGAGGTCAATTCTTTTGTTTTCCTC

QA 1 745 1 745
DS 



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GATGATCTTGAACGTCTCAAGAAGATCAGGAACCACCGTGGTCTGAGACACTACTGGGGT
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BQ
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AF RS1GV74JQ C 1
AF RS1GV74TF U 1
BS 1 4 RS1GV74JQ
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RD RS1GV74JQ 691 0 0
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CTCTCAGGCAGCTCTCTCTACTCTACCGATCGAACAATGTCGCTGGTAGCAAACGAGGAG
TTCCAGCACATTCTGCGTGTGCTTAACACTAACGTTGATGGCAAACAAAAGATTATGTTT
GCTCTTACCTCCATCAAGGGTATTGGAAGAAGATTGGCCAATATTGTCTGCAAGAAAGCC
GATGTCGACATGAACAAGAGGGCCGGTGAACTGTCTGCAGCTGAGATCGATAACCTCATG
ACCATCGTTGCAAACCCAAAGCAGTACAAGATTCCAGATTGGTTCTTGAACAGACAGAAA
GACTACAAGGATGGAAAGTACTCCCAGGTTGTTTCCAATGCACTCGACATGAAGCTGAGG
GATGATCTTGAACGTCTCAAGAAGATCAGGAACCACCGTGGTCTGAGACACTACTGGGGT
CTCCGTGTCCGTGGACAACACACCAAGACAACTGGTCGCAGAGGAAAGACGGTTGGTGTC
TCTAAGACAATGATGCTAGCTGCAGCTGGATTGGATCTCTGACAGTCCCGTTTTCATGTT
TTTGTTATTTCGTACAATTTTGCAAGTCTCAAAGACTCGATTTTAGGTGTTATGTAAGAC
ATCCTTCACTTGTTTTGTTATATTTCGAGAT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1GV74TF 691 0 0
GTCT
AACCGATTTGCGCGAGAGTTAAAGAGTGTAAAAACGGCGAGAGCTTCGCATCTTCTCTCT
CAGGCAGCTCTCTCTACTCTACCGATCGAACAATGTCGCTGGTAGCAAACGAGGAGTTCC
AGCACATTCTGCGTGTGCTTAACACTAACGTTGATGGCAAACAAAAGATTATGTTTGCTC
TTACCTCCATCAAGGGTATTGGAAGAAGATTGGCCAATATTGTCTGCAAGAAAGCCGATG
TCGACATGAACAAGAGGGCCGGTGAACTGTCTGCAGCTGAGATCGATAACCTCATGACCA
TCGTTGCAAACCCAAAGCAGTACAAGATTCCAGATTGGTTCTTGAACAGACAGAAAGACT
ACAAGGATGGAAAGTACTCCCAGGTTGTTTCCAATGCACTCGACATGAAGCTGAGGGATG
ATCTTGAACGTCTCAAGAAGATCAGGAACCACCGTGGTCTGAGACACTACTGGGGTCTCC
GTGTCCGTGGACAACACACCAAGACAACTGGTCGCAGAGGAAAGACGGTTGGTGTCTCTA
AGACAATGATGCTAGCTGCAGCTGGATTGGATCTCTGACAGTCCCGTTTTCATGTTTTTG
TTATTTCGTACAATTTTGCAAGTCTCAAAGACTCGATTTTAG*TGTTATGTAAGACATCC
TTCACTTGTTTTGTTATATTTCGAGAT

QA 5 691 5 691
DS 



AS 1 4

CO CL3041Contig1 682 4 2 U
TTTTTTGGATACAAAATATGGTTGACAGACAATTTACAAACCGCATACATCATTCACACC
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TCTCTTCCTAGTTCCTATACATTTAATCAACAGCTTACTTACTTACTTTTACCCCAAACC
AAACCAGACAGGACATTAAACGCAAATCTTACAAAAATACAAACGCATATTTAAACGGCC
AACAAATACATAGACCCTTCTAAACCAATAATAAACCGGCTAAAACCGATAGACCCAACC
AACCGACCGCAAGTTTCAAGTTGCCGCTTGAACTATGTGATCTACCAGCACCAGCGCCAG
CAGAATGAATGGGAACTACACGTCCCACGCCGCTTGAACGGCTTCGACCGCTTCCGGTGC
CTCTACCTCCCCCACCACCAGCACGTCCTCCTCTTTTGATTACAACAGCTAATTCCCGAG
CATTTCCTTGAAAACTAATGTCATCTGGCTTTGAGTCACTGATGAGAGGAAGAATGTTGT
GGTTCGTATCAACTGAAGAAGGCAGCGAGTTAGCAGAAGGAAAAGCGTGATGAAGATGAA
AGATGAACAGAATGTATAAAACTAAAGATGTTCTTTTCAATCCCATTTTCCTTTTGTTTT
TGTTTTGTTTATGTGTCTTCCC


BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1F371TF C 1
AF RS1F371JQ U 7
AF RS1FG35JQ U 7
AF RS1FG35TF C 11
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TGTTTTGTTTATGTGTCTTCCC

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ATGTGTCTTCCC

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DS 

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GGAT
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TAGACCCTTCTAAACCAATAATAAACCGGCTAAAACCGATAGACCCAACCAACCGACCGC
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ATGTGTCTTCCC

QA 5 676 5 676
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TAGACCCTTCTAAACCAATAATAAACCGGCTAAAACCGATAGACCCAACCAACCGACCGC
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GGGAACTACACGTCCCACGCCGCTTGAACGGCTTCGACCGCTTCCGGTGCCTCTACCTCC
CCCACCACCAGCACGTCCTCCTCTTTTGATTACAACAGCTAATTCCCGAGCATTTCCTTG
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ATGTGTCTTCCC

QA 1 672 1 672
DS 



AS 2 4

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BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EI12TF U 2
AF RS1BF55TF U 1
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BS 590 590 RS1EI12TF
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GG
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A

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DS 

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CGGTCGTTTACCGTACGACAACATAAAACCTGACCCTGTTCTTCGAAGCCTCTTGCTTAG
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GAAGAGGCTGGGATTAGAGGATTGTTTCGAAGGGATCATATGTTTCGAAACGCTTAACCC
GACGCACACAAACGCAGTGTCTGGAAATACAGATATTTTTGATATCGTTGGACATTTCGA
CCGGTCTGAACCGGTTAGTTTGCTTCCGAAACGCCTATCGTGTGTAACCGTCAGAAGCCG
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QA 1 755 1 755
DS 



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CATATAATCTTTGATGTCTGCCCCACTCTCTTGCGATCGTGCTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EI12JQ U 1
AF RS1BF55JQ U 7
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TTCGAAACATATGATCCCTTCGAAACAATCCTCTAATCCCAGCCTCTTCAACGCCTTGAC
CGCGTGAACTCTATCCGCGTTCGTGAATATGACTTTGCGGAGAGGAAGGCTAAGCAAGAG
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ATAGTTCTTGTAGAGA

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DS 

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GG
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TTTCGAAGGCGTAATCTGCTCCTTTGACTTTGTTTGATGCACCAACCAGAACCGTGTCGA
GGCCAACGCGTTTTCCAGCTTGTACATTTCGGACACTGTCCTCAAAGAACAGCGTTCGGT
TAGGGTCAATATTGGCGATTTCGAGAGCTTTCTCAATAGCGGCTTCTGACGGTTTACACA
CGATAGGCGTTTTCGGAAGCAAACTAACCGGTTCAGACCGGTCGAAATGTCCAACGATAT
CAAAAATATCTGTATTTCCAGACACTGCGTTTGTGTGCGTCGGGTTAAGCGTTTCGAAAC
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CATCGTAGTCAAAGTCATATCCGATCGCTCTAAGACGGGC*ATTGTTGTTCCATAGTTCT
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CTTTGATGTCTGCCCCACTCTCTTGCGATCGTGCTAG

QA 3 879 3 879
DS 



AS 1 4

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TATTTTGTCAAGTCTCTTTTATTTAAATTTCTTGATCAGAGACTAAGTTGTTCTTCCCTT
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CTAGGAACCAACAGAATGAAGGAGACACTAGTCAGCAACGTAATCCCTATCCTAGAGCAA
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CTAGAGTGCAACGGAGACCCATCCGTAATCCAAGATATGATGAGGATGACTATGCACCTC
AACAGAGAGGGCCTCGCCAGCAACACCACCACCAAGGAGCGGATCTTTTAAAGATGACAC
CACCACAGTATGCTGGAAAGGTTGATCCTGAAGCTTACCTTGACTGGGAAAAGAGGATGG
ATCACATCTTCTCTTACTACAACCATCCTGGTCCCAAGAGAGTTGCTTTGGCAGTAGCTC
AGCTCACGGACAATGCCTTATCCTGGTGGGATAGATTGTGCTCTGATCGTAGGAGAGGGC
ACTTGAGGCAACTAGACGCCTGGGTAGACATGAAAGATGCTATGAGACTGAGGTTTGTGC
CACAACATTACCACCGAGACTTGCATAGGAAGTTCAGAACACTTAAGCAAGGAAGCAAGT
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TTGAGAGACAAGCTTATGGAGATCTCAAAGACCTATTCCACATAGCCGTGCAAGCTGAGC
AACACATCAAGAAGAAGAGCACCAAGGGC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G174JQ U 1
AF RS1D748JQ U 1
AF RS1AI93JQ U 1
AF RS1AI93TF C 322
BS 1 18 RS1AI93JQ
BS 19 19 RS1D748JQ
BS 20 40 RS1AI93JQ
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BS 42 768 RS1AI93JQ
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RD RS1G174JQ 649 0 0
GA
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QA 3 649 3 649
DS 

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GA
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TTTTGTCAAGTCTCTTTTATTTAAATTTCTTGATCAGAGACTAAGTTGTTCTTCCCTTGT
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AGGGATGAAATGAGGGAGTTGCGGCAAGACCTTGGAGATAGACCCACCCGAGTTGAGCAG
AGACCCATGGATCAAGCTACCCAAGCTAATGAGAGGATTCCAACTCAACACCAGCAGTAT
CAAGTTCCAAACAACCGGCGCCCTGGAGTGCTCTTCAATGATGTTCCCGAGGCTAGCACT
AGGAACCAACAGAATGAAGGAGACACTGGTCAGCAACGTAATCCCTATCCTAGAGCAAGA
GTTCAGCAAGAAGATTATGAAGAAGAGGCAGAAGAGGAAGAGGATTACTTTCCTCCACCT
AGAGTGCAACGGAGACCCATCCGTAATCCAAGATATGATGAGGATGACTATGCACCTCAA
CAGAGAGGGCCTCGCCAGCAACACCACCACCAAGGAGCGGATCTTTTAAAGATGACACCA
CCACAGTATGCTGGAAAGGTTGATCCTGAAGCTTACCTTGACTGGGAAAAGAGGATGGAT
CACATCTTCTCTTACTACAACCATCCTGGTCCCAAGAGAGTTGC

QA 3 706 3 706
DS 

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TGAGGGATGAAATGAGGGAGTTGCGGCAAGACCTTGGAGATAGACTCACCCGAGTTGAGC
AGAGACCCATGGATCAAGCTACCCAAGCTAATGAGAGGATTCCAACTCAACACCAGCAGT
ATCAAGTTCCAAACAACCGGCGCCCTGGAGTGCTCTTCAATGATGTTCCCGAGGCTAGCA
CTAGGAACCAACAGAATGAAGGAGACACTAGTCAGCAACGTAATCCCTATCCTAGAGCAA
GAGTTCAGCAAGAAGATTATGAAGAAGAGGCAGAAGAGGAAGAGGATTACTTTCCTCCAC
CTAGAGTGCAACGGAGACCCATCCGTAATCCAAGATATGATGAGGATGACTATGCACCTC
AACAGAGAGGGCCTCGCCAGCAACACCACCACCAAGGAGCGGATCTTTTAAAGATGACAC
CACCACAGTATGCTGGAAAGGTTGATCCTGAAGCTTACCTTGACTGGGAAAAGAGGATGG
ATCACATCTTCTCTTACTACAACCATCCTGGTCCCAAGAGAGTTGCTTTGGCAGTAGCTC
AGCTCACGGACAATGCCTTATCCTGGTGGGATAGATTGTGCTCTGATC

QA 1 768 1 768
DS 

RD RS1AI93TF 788 0 0
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GAGACACTAGTCAGCAACGTAATCCCTATC*TAGAGCAAGAGTTCAGCAAGAAGATTATG
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TCCGTAATCCAAGATATGATGAGGATGACTATGCACCTCAACAGAGAGGGCCTCGCCAGC
AACACCACCACCAAGGAGCGGATCTTTTAAAGATGACACCACCACAGTATGCTGGAAAGG
TTGATCCTGAAGCTTACCTTGACTGGGAAAAGAGGATGGATCACATCTTCTCTTACTACA
ACCATCCTGGTCCCAAGAGAGTTGCTTTGGCAGTAGCTCAGCTCACGGACAATGCCTTAT
CCTGGTGGGATAGATTGTGCTCTGATCGTAGGAGAGGGCACTTGAGGCAACTAGACGCCT
GGGTAGACATGAAAGATGCTATGAGACTGAGGTTTGTGCCACAACATTACCACCGAGACT
TGCATAGGAAGTTCAGAACACTTAAGCAAGGAAGCAAGTCAGTTGAGGAGTACTATGAGG
AGTTTGAGAAGTTAAGGAACCGTCTTGATCTCAATGAGGATGAGGAGACGATCATGGCTC
AGTTCATAGATGGGTTGCAAGATAGAGTGAGCAGCAAGGTTGAGAGACAAGCTTATGGAG
ATCTCAAAGACCTATTCCACATAGCCGTGCAAGCTGAGCAACACATCAAGAAGAAGAGCA
CCAAGGGC

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 4

CO CL3044Contig1 966 4 3 U
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TTCTAGCAACTTATGATGGGTGTGTCTGGTCTTTGCTTGAAGCAAAATGGTCACTTAAGC
AAACAAGCAGTCTTGATGGTCCTGTCTTTGAGATTTTTGGTGTGAGAATGGTGAAAGTTT
ATTATGGAAGGAAGCTGGAGTATGAGACAAAACGTTGCGCGAAGCTAAGAAGTGAGCAAG
ATTTCATGACAGCTGTCGAATTCTCAAAGCAGTATCCTTATGGTAAAGCTGTGGGGTTGC
TAGACTTGAAGTTTGGTTCTTTTGAGGCTAATGAGAGATGGTTGGTTTTACCTGGATTAG
TATCTGCTTTCATACTCAATGATCTTCTTAAGAATGAAGGTTTTTGTGGAGCTGCAAAAG
ACATAGTCAAAGGTAATGGGATAACTGTGAAGCTAGAAGAAGAAACAATGATGCATGTGA
ACATCAATGGGGGTGCTAGGTGCTTGTCCAAGGAGCTTAACAGTGGGAACATGGCGGAAG
AAGAAGGTGGTCATTGTGGTGGTTGTGGTGGATGTGGAGGATGTGGCGGTGGCAGTGGGT
GCGGAGGAGGTGGTGGAAGATGTGGTAATATGATGACCAATGAAAATGTTACCACAGGTG
GCGGCTCCTGCACTGGCGGTTCCACTGGATGCGGTGGGTGCGGTGGAGCCGGTGGAGGAT
GTGGTAATATGATGACCAATGAAAATGTTCCATCATTAGTAGCAGCAGCGGAAGCTCCCA
TCGACGCAGTTGCAGCTTGATTATTATTTAAAGAAAGAAAAACGATATTAAGTTTTATCT
ATGTGATGTTAACAAATGGACTAACAGTATAATAAAACTAATGAGATGTGTTGTTATGTG
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CAATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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10 10 10 10 10 10 

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G
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TTAAACGTTT

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CTAGGTGCTTGTCCAAGGAGCTTAACAGTGGGAACATGGCGGAAGAAGAAGGTGGTCATT
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DS 



AS 1 4

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CATGCTTCTTCCCGGGTATTGCTTTTGTTATACTAACAGTGTTGAACTTCCTTCTCTGGA
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TTTTTCTGAACTTTGGGTAGAAATAAATGATTCCGTTTTTCTGC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A072TV U 1
AF RS1A072TF U 1
AF RS1A072TR C 322
AF RS1A072JQ C 343
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BS 729 795 RS1A072TF
BS 796 1064 RS1A072TR

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TAACCGGGATGATTATTCTCTATCTTTTCTTGGGTATTGCTGCTGGGTACGCTGGTGTCC
GGCTCTGGAGAACCGTCAAAGGAACTTCAGAAGGATGGAGATCACTATCCTGGTCCATCG
CATGCTTCTTCCCGGGTATTGCTTTTGTTATACTAACAGTGTTGAACTTCCTTCTCTGGA
GCAGCAACAGCACTGGCGCCATCCCAATATCACTCTACTTTGAGCTCTTGGCTCTATGGT
TCTGCATCTCGGTTCCTCTCACCTTGTTTGGAGGATTCTTAGGCACGCGAGCAGAAGCAA
TTCAATTTCCAGTGAGA

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DS 

RD RS1A072TF 795 0 0
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TAACCGGGATGATTATTCTCTATCTTTTCTTGGGTATTGCTGCTGGGTACGCTGGTGTCC
GGCTCTGGAGAACCGTCAAAGGAACTTCAGAAGGATGGAGATCACTATCCTGGTCCATCG
CATGCTTCTTCCCGGGTATTGCTTTTGTTATACTAACAGTGTTGAACTTCCTTCTCTGGA
GCAGCAACAGCACTGGCGCCATCCCAATATCACTCTACTTTGAGCTCTTGGCTCTATGGT
TCTGCATCTCGGTTCCTCTCACCTTGTTTGGAGGATTCTTAGGCACGCGAGCAGAAGCAA
TTCAATTTCCAGTGAGAACCAACCAGATTCCTAGGGAGATCCCAGAACGTAAATACCCGT
CATGGCTTCTCGTCCTTGGAGCAGGAACACTTCCTTTCGGAACTCTATTCATTGAACTCT
TCTTCATATTCTCCAGCATATGGTTAGGCAGATTCTACTACGTATTTGGGTTCTTACTCA
TAGTACTGCTTCTTTTAGTAGTTGTGTGTGCAGAGGTATCAGTGGTGTTGACCTATATGC
ACCTCTGCGTGGAAGATTGGAGATGGTGGTGGAAAGCCTTCTTCGCATCTGGTTCAGTCG
CCTTGTATGTCTTTGCTTACTCCATCAACTATTTGGTGTTCGATCTCCAAAGTCTGAGCG
GACCGGTCTCGGCTATGCTTTACATTGGCTACTCTCTGCTTATGGCCATTGCAATAATGC
TCTCTACAGGAACCA

QA 1 795 1 795
DS 

RD RS1A072TR 743 0 0
CCTTGTTTGGAGGATTCTTAGGCACGCGAGCAGAAGCAATTCAATTTCCAGTGAGAACCA
ACCAGATTCCTAGGGAGATCCCAGAACGTAAATACCCGTCATGGCTTCTCGTCCTTGGAG
CAGGAACACTTCCTTTCGGAACTCTATTCATTGAACTCTTCTTCATATTCTCCAGCATAT
GGTTAGGCAGATTCTACTACGTATTTGGGTTCTTACTCATAGTACTGCTTCTTTTAGTAG
TTGTGTGTGCAGAGGTATCAGTGGTGTTGACCTATATGCACCTCTGCGTGGAAGATTGGA
GATGGTGGTGGAAAGCCTTCTTCGCATCTGGTTCAGTCGCCTTGTATGTCTTTGCTTACT
CCATCAACTATTTGGTGTTCGATCTCCAAAGTCTGAGCGGACCGGTTTCGGCTATGCTTT
ACATTGGCTACTCTCTGCTTATGGCCATTGCAATAATGCTCTCTACAGGAACCATTGGCT
TCCTTACTTCCTTTTACTTCGTCCACTATCTGTTTTCCTCTGTCAAAATCGATTGAAATT
TTTGAGAAAATCTCAGCCGTTGAATGTTTGCTTTTTCTGAAGCAATTTTTTCAGGTGTTG
TTATTTTCTTTTGTCAGTAATAGACTTGTTAGAGTCCTGTGTTTTTTCTCTCTCTGAATT
TTCGGACTTATATTACCGTTATATGTTATTTTCGTTTTTTTTTTCTGAACTTTGGGTAGA
AATAAATGATTCCGTTTTTCTGC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RS1A072JQ 722 0 0
GCACGCGAGCAGAAGCAATTCAATTTCCAGTGAGAACCAACCAGATTCCTAGGGAGATCC
CAGAACGTAAATACCCGTCATGGCTTCTCGTCCTTGGAGCAGGAACACTTCCTTTCGGAA
CTCTATTCATTGAACTCTTCTTCATATTCTCCAGCATATGGTTAGGCAGATTCTACTACG
TATTTGGGTTCTTACTCATAGTACTGCTTCTTTTAGTAGTTGTGTGTGCAGAGGTATCAG
TGGTGTTGACCTATATGCACCTCTGCGTGGAAGATTGGAGATGGTGGTGGAAAGCCTTCT
TCGCATCTGGTTCAGTCGCCTTGTATGTCTTTGCTTACTCCATCAACTATTTGGTGTTCG
ATCTCCAAAGTCTGAGCGGACCGGTTTCGGCTATGCTTTACATTGGCTACTCTCTGCTTA
TGGCCATTGCAATAATGCTCTCTACAGGAACCATTGGCTTCCTTACTTCCTTTTACTTCG
TCCACTATCTGTTTTCCTCTGTCAAAATCGATTGAAATTTTTGAGAAAATTTCAGCCGTT
GAATGTTTGCTTTTTTTGAAGCAATTTTTTCAGGTGTTGTTATTTTCTTTTGTCAGTAAT
AGACTTGTTAGAGTCCTGTGTTTTTTCTCTCTCTGAATTTTCGGACTTATATTACCGTTA
TATGTTATTTTCGTTTTTTTTTTCTGAACTTTGGGTAGAAATAAATGATTCCGTTTTTCT
GC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 4

CO CL3046Contig1 860 4 24 U
GTGGACGCCGTGGCTATGGTTACCTCTTCACATACGCAACAGAAACGTCTCACAACTCCT
TTAATCCGGCATTAGAAATTAGGGTTTGTCGGTCGTCGTCCTCTCGCCCCATGTCTACTC
GACAGCTACTCATCGACGGCGAGTGGAGAGATCCCATCTTGAAGAATCACATCCCCATCG
TCAATCCAGCTACCCAAGATGTCATTGGTGATATCCCCGTGGCTACAAAGGAGGATGTGG
AAGCTGCAGTCAACACTGCTCTAAGAGCTTTCTCAAGGAACATAGGTAAAGACTGGGCCA
AAGAACCTGGAGCTTTTCGTGCTAAGTATCTACGTGCTATTATTACTAAGGTGACTGAAA
GGAAGTCGCATCTGGCAACGCCTGAGTCGGTTGACTGTGGTAAACCATTGGATGAAACAG
TTTGGGATATGGAGGATGTTGCTGGGCGTTTTACGGGTGTTTGATGTTGCTAGATGCTAA
GCATAAAGCGCCTGTTTCTCTTCCCATGGAGAGTTTTAAGAGTTACGTTCTCAGGCAACC
TCTTTGAGTTGTGGGACTCATCACACCTTGGAACTATCAGTTTCCTTTTTTCTTTTTGGT
GGTGGGTGATCCCTTATGCTTTTAAACTTGGTTTGATCTTGTAGGAATTACCCCCCTTCT
GATGGCTCCTTCACTTGCTGCTGGATGTACTGCGGTTCTCAAGCCATCAGAGCTCCCATC
AGTGAAACTGCAAGTAACTACTTACGTACCAAGAGACACAGTTGATCAGTTGACTCATTC
ACCATTCCTTTTGTAATTTGAAACATGGACAGACTCATAACGGTTTCTATATATGACTAA
TTGATAAAGTTTTTTCTGTA


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D113TF U 1
AF RS1AS58TF U 2
AF RS1AS58JQ C 14
AF RS1D113JQ C 390
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RD RS1D113TF 696 0 0
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TTAATCCGGCATTAGAAATTAGGGTTTGTCGGTCGTCGTCCTCTCGCCCCATGTCTACTC
GACAGCTACTCATC*ATGGCGAGTGGAGAGAGCCCATCTTGAAGAATCACATCCCCATCG
TCAATCCAGCTACCCAAGATGTCATTGGTGATATCCCCGCGGCTACAAAGGAGGATGTGG
AAGCTGCAGTCAACACTGCTCGAAGAGCTTTCTCAAGGAACATAGGTAAAGACTGGGCCA
AAGAACCTGGAGCTTTTCGTGCTAAGTATCTACGTGCTATTATTACTAAGGTGACTGAAA
GGAAGCCGCATCTGGCAACGCCTGAGTCGGTTGACTGTGGTAAACCATTGGATGAAACAG
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GCATAAAGCGCCTGTTTCTCTTCCCATGGAGAGTTTTAAGAGTTACGTTCTCAGGCAACC
TCTTTGAGTTGTGGGACTCATCACACCTTGGAACTATCAGTTTCCTTTTTTCTTTTTGGT
GGTGGGTGATCCCTTATGCTTTTAAACTTGGTTTGATCTTGTAG*AATTACCCCCCTTCT
GATGGCTCCTTCACTTGCTGCTGGATGTACTGCGGT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RS1AS58TF 773 0 0
G
GGACGCCGTGGCTATGGTTACCTCTTCACATACGCAACAGAAACGTCTCACAACTCCTTT
AATCCGGCATTAGAAATTAGGGTTTGTCGGTCGTCGTCCTCTCGCCCCATGTCTACTCGA
CAGCTACTCATCGACGGCGAGTGGAGAGATCCCATCTTGAAGAATCACATCCCCATCGTC
AATCCAGCTACCCAAGATGTCATTGGTGATATCCCCGTGGCTACAAAGGAGGATGTGGAA
GCTGCAGTCAACACTGCTCTAAGAGCTTTCTCAAGGAACATAGGTAAAGACTGGGCCAAA
GAACCTGGAGCTTTTCGTGCTAAGTATCTACGTGCTATTATTACTAAGGTGACTGAAAGG
AAGTCGCATCTGGCAACGCCTGAGTCGGTTGACTGTGGTAAACCATTGGATGAAACAGTT
TGGGATATGGAGGATGTTGCTGGGCGTTTTACGGGTGTTTGATGTTGCTAGATGCTAAGC
ATAAAGCGCCTGTTTCTCTTCCCATGGAGAGTTTTAAGAGTTACGTTCTCAGGCAACCTC
TTTGAGTTGTGGGACTCATCACACCTTGGAACTATCAGTTTCCTTTTTTCTTTTTGGTGG
TGGGTGATCCCTTATGCTTTTAAACTTGGTTTGATCTTGTAG*AATTACCCCCCTTCTGA
TGGCTCCTTCACTTGCTGCTGGATGTACTGCGGTTCTCAAGCCATCAGAGCTCCCATCAG
TGAAACTGCAAGTA*CTACTTACGTACCA*GAGACACAGTTGATCAGTTGAC

QA 2 773 2 773
DS 

RD RS1AS58JQ 829 0 0
GCTATGG
TACCTCTTCACATACGCAACAGAAACGTCTCACAACTCCTTTAATCCGGCATTAGAAATT
AGGGTTTGTCGGTCGTCGTCCTCTCGCCCCATGTCTACTCGACAGCTACTCATCGACGGC
GAGTGGAGAGATCCCATCTTGAAGAATCACATCCCCATCGTCAATCCAGCTACCCAAGAT
GTCATTGGTGATATCCCCGTGGCTACAAAGGAGGATGTGGAAGCTGCAGTCAACACTGCT
CTAAGAGCTTTCTCAAGGAACATAGGTAAAGACTGGGCCAAAGAACCTGGAGCTTTTCGT
GCTAAGTATCTACGTGCTATTATTACTAAGGTGACTGAAAGGAAGTCGCATCTGGCAACG
CCTGAGTCGGTTGACTGTGGTAAACCATTGGATGAAACAGTTTGGGATATGGAGGATGTT
GCTGGGCGTTTTACGGGTGTTTGATGTTGCTAGATGCTAAGCATAAAGCGCCTGTTTCTC
TTCCCATGGAGAGTTTTAAGAGTTACGTTTTCAGGCAACCTCTTTGAGTTGTGGGACTCA
TCACACCTTGGAACTATCAGTTTCCTTTTTTCTTTTTGGTGGTGGGTGATCCCTTATGCT
TTTAAACTTGGTTTGATCTTGTAGGAATTACCCCCCTTCTGATGGCTCCTTCACTTGCTG
CTGGATGTACTGCGGTTCTCAAGCCATCAGAGCTCCCATCAGTGAAACTGCAAGTAACTA
CTTACGTACCAAGAGACACAGTTGATCAGTTGACTCATTCACCATTCCTTTTGTAATTTG
AAACATGGACAGACTCATAACGGTTTCTATATATGACTAATT

QA 8 829 8 829
DS 

RD RS1D113JQ 471 0 0
GTTGACTGTGGTAAACCATTGGATGAAACAGTTTGGGATATGGAGGATGTTGCTGGGTGT
TTTACGGGTGTTTGATGTTGCTAGATGCTAAGCATAAAGCGCCTGTTTCTCTTCCCATGG
AGAGTTTTAAGAGTTACGTTTTCAGGCAACCTCTTTGAGTTGTGGGACTCATCACACCTT
GGAACTATCAGTTTCCTTTTTTTTTTTTGGTGGTGGGTGATCCCTTATGCTTTTAAACTT
GGTTTGATCTTGTAGGAATTACCCCCCTTTTGATGGCTCCTTCACTTGCTGCTGGATGTA
CTGCGGTTCTCAAGCCATCAGAGCTCCCATCAGTGAAACTGCAAGTAACTACTTACGTAC
CAAGAGACACAGTTGATCAGTTGACTCATTCACCATTCCTTTTGTAATTTGAAACATGGA
CAGATTCATAACGGTTTCTATATATGACTAATTGATAAAGTTTTTTCTGTA

QA 1 471 1 471
DS 



AS 1 4

CO CL3047Contig1 979 4 3 U
TTTTTTTTGGGTCGCCCTCCTTTTCTCTCTCTTCCAAAAGCTCCCTCTTCTCTCTAGTCT
AAACTCCGACTGATTCAGATTCCGGCCACGTCGTCGGTCCGGCCTTGTCCTAAGTCTTTA
ATTTTTCTGTAGTTTGTGTAGATTTATGGTTTTTGGCTTGGTTACTTCAAAAAACAAAGG
TAGATCTAGGGTTTCAGATCCAAATTGATGAACAGATTTTCAGTGGTCGCGGATCTCTTC
CATCTTGGCCTTGCGTGGTGGTTTCTGGATCGTGTGGTCTCAGGTTTTAGTGTCTCCATC
ATCAGCGTAGAAAGGGCTCCTTCGCCTTGGTTGAAGGTACTTCCTTTTCTCAGAGTGTTG
GCTTAGTTCGTCTCGGGTTTGTTGGCGCTTCTCGTATGTGTGCTTCTGTTAGTGATTTAT
TTTTGCTTGGAGAGTTTGCTTTTCCTTGGTTTGCTTGCATCGGAATAGATCCCTGGGTTA
GCTCTTGCTAGTTCCCATGTGGTTACGGAGTCTCCGACTCATTCCAAAGGAAAAGGGGAC
TTTCGCTCCTTCTCGCTTCTCGCCGTGGGTGTTCGAATGGTAAAGTTGTTTCTTCGTCTC
CCTTGGATGGTTCATTGCGTTCGAACTCGTGGCTCGTGGTATGCTCCAGAGCAATAAAAG
GATTTCATGTTGGTGGCCATCTTCAATAATTCGGCTTCAGTTGCTATGCTTCTCTTCAAC
TCTCCATGTTCTTGAAGAAATCACTGATAGGGTATCTTATTTTATTTTGTGATCTTATCT
CTGTTGCTTGTTGTTCTCTTAGTAGCCAGTAGGATTATGTCTCTATGGTCTGTTTTGTTT
AGTCTCTAGGGAATGGTTGTTCTTTGTTCCGCTAGCTTTTGTCTCTAGAGGCGTTGTGTT
GTACCTGCTGGCTTGAAGTATCCCAAAAATGTATATCACCCCTGTATAGGTTATTGCAAT
GTTAATGCAGTTTTTCTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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CCTTGGATGGTTCATTGCGTTCGAACTCG

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CGGGTTTGTTGGCGCTTCTCGTATGTGTGCTTCTGTTAGTGATTTATTTTTGCTTGGAGA
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TTCTCTTAGTAGCC

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GGTTATTGCAATGTTAATGCAGTTTTTCTAT

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DS 



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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 

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AF RS1CD18JQ C 51
AF RS1C802JQ C 425
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QA 1 687 1 687
DS 

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ACA
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TATGATTTCCCACCTGCAGTAAAGGCAAAGGTGAACCGTCTCTGGGGTGGTGAATGGCAT
GGTCAAGCGCAGAAATGGTTCCTAGTACGACTGATAAAGGATGAGGACGAAAGAGAGATC
AATCTAGCAAACAACGAAGCGGATTCAGAGTTTGCAGAGTGGAAATGGGCGAGACCTGAA
GAAGTGGTAGATCAAGCAGTTGATTACAAAAGGCCAACCTACGAACAAGTCATCAAGACT
TTTGGTTCTTACTTGAATGATCCAGGAAGAGCTGCTAAATGTAAATCAGCCAAGTGGTAA
TAAGAAAACCTAAAATAATTGTTTGTCTTTTTATAAAGTTTATAATTATATTTTGGGTTC
TTTTTAGTGGAACCCTTTTGGA*TGCAAAAG*TTTGTTTAG*TGTTTTTT*GTGTTCATT
TTTGTAAATTGGT*ACTGGTACTAGAAG
TT

QA 4 751 4 751
DS 

RD RS1CD18JQ 797 0 0
CATGTTCTTCGGTTAAAACTTTCTC*TGCTTTACAGAAGTCAAAGCTTAAAAAAGAAGAA
GAAGAAGCAAAAATGGAGAATCTACCTCCTGGTTACCGTCCCAATGTTGGTGTGTGTCTA
ATCAATTCGGATAATCTGGTATTTGTAGCTTCAAGATTGAATGTTCCTGGAGCATGGCAG
ATGCCACAGGGAGGCATTGAAGATGGAGAGGATCCAAAGTCAGCAGCCATGAGAGAGTTA
CAAGAAGAAACTGGGGTCGTTTCAGCTGCAATCATCGCTGAGGTTCCAAATTGGTTGACA
TATGATTTCCCACCTGCAGTAAAGGCAAAGGTGAACCGTTTCTGGGGTGGTGAATGGCAT
GGTCAAGCGCAGAAATGGTTCCTAGTACGACTGATAAAGGATGAGGACGAAAGAGAGATC
AATCTAGCAAACAACGAAGCGGATTCAGAGTTTGCAGAGTGGAAATGGGCGAGACCTGAA
GAAGTGGTAGATCAAGCAGTTGATTACAAAAGGCCAACCTACGAACAAGTCATCAAGACT
TTTGGTTCTTACTTGAATGATCCAGGAAGAGCTGCTAAATGTAAATCAGCCAAGTGGTAA
TAAGAAAACCTAAAATAATTGTTTGTCTTTTTATAAAGTTTATAATTATATTTTGGGTTC
TTTTTAGTGGAACCCTTTTGGAATGCAAAAGGTTTGTTTAGGTGTTTTTTTGTGTTCATT
TTTGTAAATTGGTTACTGGTACTAGAAGGTTTTGGTTTACTTGGGGGTTATTGTAATAAA
AGTCTTTGTTTGGATTC

QA 1 797 1 797
DS 

RD RS1C802JQ 424 0 0
ATGGTTCCTAGTACGACTGATAAAGGATGAGGACGAAAGAGAGATCAATCTAGCAAACAA
CGAAGCGGATTCAGAGTTTGCAGAGTGGAAATGGGCGAGACCTGAAGAAGTGGTAGATCA
AGCAGTTGATTACAAAAGGCCAACCTACGAACAAGTCATCAAGACTTTTGGTTCTTACTT
GAATGATCCAGGAAGAGCTGCTAAATGTAAATCAGCCAAGTGGTAATAAGAAAACCTAAA
ATAATTGTTTGTCTTTTTATAAAGTTTATAATTATATTTTGGGTTCTTTTTAGTGGAACC
CTCTTGGAATGCAAAAGGTTTGTTTAGGTGTTTTTTTGTGTTCATTTTTGTAAATTGGTT
ACTGGTACTAGAAGGTTTTGGTTTACTTGGGGGTTATTGTAATAAAAGTCTTTGTTTGGA
TTCT

QA 1 424 1 424
DS 



AS 1 4

CO CL3049Contig1 457 4 3 U
GGGCTTACGGCATAATTATTGAGAATTTCTTATAGAAGGCTTTAAACACTTTAAAGTAAT
GTGATAGGATATAAACACCATTTAAACAAATTCAAAGATTCGAACTCCTTAAGTTGCATA
GACAAACACAAACGAATTGACAAAACAACAAGGATAATCAAACATCACTGGAAATAAAAA
ACCGAGAACAAAAAACTTAAAGATAGCAGGAGCCGATATAACACCTTGGTAGGTTCGAAG
AGGATCAAGCCTATCCATGACTTGCCGGTTCAACCCCCACCGCTTTAGCCGGGTCAGTTT
GGAGAATTAACACAACCATCGGTTAAATAAAAAAAGGGAGTGAACATTGTATTTTCTAAG
CTTCAATGGAAGCTTATCTCAAGCTCCCCATTTGGTTTCAACCTTCCAAGTTTTATCCAA
TTTAAGGAGATATTGATTAAGCTTCCATGGCTAAAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 

AF RS1GP96JQ U 1
AF RS1GP96TF C 1
AF RS1F988TF C 65
AF RS1F988JQ U 69
BS 1 365 RS1GP96JQ
BS 366 366 RS1F988JQ
BS 367 457 RS1GP96JQ

RD RS1GP96JQ 457 0 0
GGGCTTACGGCATAATTATTGAGAATTTCTTATAGAAGGCTTTAAACACTTTAAAGTAAT
GTGATAGGATATAAACACCATTTAAACAAATTCAAAGATTCGAACTCCTTAAGTTGCATA
GACAAACACAAACGAATTGACAAAACAACAAGGATAATCAAACATCACTGGAAATAAAAA
ACCGAGAACAAAAAACTTAAAGATAGCAGGAGCCGATATAACACCTTGGTAGGTTCGAAG
AGGATCAAGCCTATCCATGACTTGCCGGTTCAACCCCCACCGCTTTAGCCGGGTCAGTTT
GGAGAATTAACACAACCATCGGTTAAATAAAAAAAGGGAGTGAACATTGTATTTTCTAAG
CTTCAGTGGAAGCTTATCTCAAGCTCCCCATTTGGTTTCAACCTTCCAAGTTTTATCCAA
TTTAAGGAGATATTGATTAAGCTTCCATGGCTAAAAA

QA 1 457 1 457
DS 

RD RS1GP96TF 457 0 0
GGGCTTACGGCATAATTATTGAGAATTTCTTATAGAAGGCTTTAAACACTTTAAAGTAAT
GTGATAGGATATAAACACCATTTAAACAAATTCAAAGATTCGAACTCCTTAAGTTGCATA
GACAAACACAAACGAATTGACAAAACAACAAGGATAATCAAACATCACTGGAAATAAAAA
ACCGAGAACAAAAAACTTAAAGATAGCAGGAGCCGATATAACACCTTGGTAGGTTCGAAG
AGGATCAAGCCTATCCATGACTTGCCGGTTCAACCCCCACCGCTTTAGCCGGGTCAGTTT
GGAGAATTAACACAACCATCGGTTAAATAAGAGAAGGGAGTGAACATTGTATTTTCTAAG
CTTCAGTGGAAGCTTATCTCAAGCTCCCCATTTGGTTTCAACCTTCCAAGTTTTATCCAA
TTTAAGGAGATATTGATTAAGCTTCCATGGCTAAAAA

QA 1 457 1 457
DS 

RD RS1F988TF 393 0 0
CAGG
ATATAAACACCATTTAAACAAATTCAAAGATTCGAACTCCTTAAGTTGCATAGACAAACA
CAAACGAATTGACAAAACAACAAGGATAATCAAACATCACTGGAAATAAAAAACCGAGAA
CAAAAAACTTAAAGATAGCAGGAGCCGATATAACACCTTGGTAGGTTCGAAGAGGATCAA
GCCTATCCATGACTTGCCGGTTCAACCCCCACCGCTTTAGCCGGGTCAGTTTGGAGAATT
AACACAACCATCGGTTAAATAAGAGAAGGGAGTGAACATTGTATTTTCTAAGCTTCAATG
GAAGCTTATCTCAAGCTCCCCATTTGGTTTCAACCTTCCAAGTTTTATCCAATTTAAGGA
GATATTGATTAGGCTTCCATGGCTAAAAA

QA 5 393 5 393
DS 

RD RS1F988JQ 389 0 0
ATATAAACACCATTTAAACAAATTCAAAGATTCGAACTCCTTAAGTTGCATAGACAAACA
CAAACGAATTGACAAAACAACAAGGATAATCAAACATCACTGGAAATAAAAAACCGAGAA
CAAAAAACTTAAAGATAGCAGGAGCCGATATAACACCTTGGTAGGTTCGAAAAGGATCAA
GCCTATCCATGACTTGCCGGTTCAACCCCCACCGCTTTAGCCGGGTCAGTTTGGAAAATT
AACACAACCATCGGTTAAATAAAAAAAGGGAGTGAACATTGTATTTTCTAAGCTTCAATG
GAAGCTTATCTCAAGCTCCCCATTTGGTTTCAACCTTCCAAGTTTTATCCAATTTAAGGA
GATATTGATTAGGCTTCCATGGCTAAAAA

QA 1 389 1 389
DS 



AS 1 3

CO CL3050Contig1 750 3 7 U
GGTAACGAATTTGAGACAAGAAAAGAAAAACATAGAACGGCGAAGGAGGAGATGAATGGG
CCGCCGGAGAACGATCTTTGCTCGATATGTCATTCCCACTTTACTGCTCCTTGCCAAGCC
AATTGCTCTCATTGGTTCTGCGGAAATTGCATCATGCTTGTGTGGAGGCATGGATCTATA
TTACAGCCATGCAAATGCCCCTTGTGTCGTCGTCCCATAAGTTTGCTCGTCCCTACAGAG
GACACTATCAGAGACCGTAATGATCCTACAGTTACCGAGGTTCTTGCTGATCTTGAAACC
TACAACCGACGCTTTGGTGGACAATCAACTAGTTTAATTCAGAGGATGCAAGACCTTCCG
TTCTTACTTCGGAGATTGTTGCGGGAAATGATGGATCCACAAAGAACACTTCCACTTGTC
ATCAGAGCTCGAGTTTATATCGCAGATGATTCTCAGTGCTGTTTACATAGTCAGTCCAAT
AGATATCATTCCAGAAGGAGTTCTGGGGGTTGTCGGTTTGCTTGATGATCTACTCATAGC
CTTGATTTGTTTCCTCCATGTTGCTGCTCTCTACCGCTCGGTTCTCTATTTCCGCCATGC
CGGTTCTTGAACCAATGAATGTTTGTGACAATTCAAGAACTGAGAAATGTGCTTACCTTC
CGTCTTTGTCTTTGATCACTTAACCTTGTGTAGACACGATCATTCTGTTTTGACTATGGA
AACTTAGATCAGTGAGGATGATAGGACCAT


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B317TF U 1
AF RS1D571JQ C 2
AF RS1D571TF U 2
BS 1 32 RS1B317TF
BS 33 33 RS1D571TF
BS 34 444 RS1B317TF
BS 445 445 RS1D571TF
BS 446 710 RS1B317TF
BS 711 742 RS1D571TF
BS 743 750 RS1D571JQ

RD RS1B317TF 715 0 0
GGTAACGAATTTGAGACAAGAAAAGAAAAACAGAGAACGGCGAAGGAGGAGATGAATGGG
CCGCCGGAGAACGATCTTTGCTCGATATGTCATTCCCACTTTACTGCTCCTTGCCAAGCC
AATTGCTCTCATTGGTTCTGCGGAAATTGCATCATGCTTGTGTGGAGGCATGGATCTATA
TTACAGCCATGCAAATGCCCCTTGTGTCGTCGTCCCATAAGTTTGCTCGTCCCTACAGAG
GACACTATCAGAGACCGTAATGATCCTACAGTTACCGAGGTTCTTGCTGATCTTGAAACC
TACAACCGACGCTTTGGTGGACAATCAACTAGTTTAATTCAGAGGATGCAAGACCTTCCG
TTCTTACTTCGGAGATTGTTGCGGGAAATGATGGATCCACAAAGAACACTTCCACTTGTC
ATCAGAGCTCGAGTTTATATCGCA*ATGATTCTCAGTGCTGTTTACATAGTCAGTCCAAT
AGATATCATTCCAGAAGGAGTTCTGGGGGTTGTCGGTTTGCTTGATGATCTACTCATAGC
CTTGATTTGTTTCCTCCATGTTGCTGCTCTCTACCGCTCGGTTCTCTATTTCCGCCATGC
CGGTTCTTGAACCAATGAATGTTTGTGACAATTCAAGAACTGAGAAATGTGCTTACCTTC
CGTCTTTGTCTTTGATCACTTAACCTTGTGTAGACACGATCATTCTGTTT
GACTA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1D571JQ 749 0 0
GG
AACGAATTTGAGACAAGAAAAGAAAAACATAGAACGGCGAAGGAGGAGATGAATGGGCCG
CCGGAGAACGATCTTTGCTCGATATGTCATTCCCACTTTACTGCTCCTTGCCAAGCCAAT
TGCTCTCATTGGTTCTGCGGAAATTGCATCATGCTTGTGTGGAGGCATGGATCTATATTA
CAGCCATGCAAATGCCCCTTGTGTCGTCGTCCCATAAGTTTGCTCGTCCCTACAGAGGAC
ACTATCAGAGACCGTAATGATCCTACAGTTACCGAGGTTCTTGCTGATCTTGAAACCTAC
AACCGACGCTTTGGTGGACAATCAACTAGTTTAATTCAGAGGATGCAAGACCTTCCGTTC
TTACTTCGGAGATTGTTGCGGGAAATGATGGATCCACAAAGAACACTTCCACTTGTCATC
AGAGCTCGAGTTTATATCGCAGATGATTCTCAGTGCTGTTTACATAGTCAGTCCAATAGA
TATCATTCCAGAAGGAGTTCTGGGGGTTGTCGGTTTGCTTGATGATCTACTCATAGCCTT
GATTTGTTTCCTCCATGTTGCTGCTCTCTACCGCTCGGTTCTCTATTTCCGCCATGCCGG
TTCTTGAACCAATGAATGTTTGTGACAATTCAAGAACTGAGAAATGTGCTTACCTTCCGT
CTTTGTCTTTGATCACTTAACCTTGTGTAGACACGATCATTCTGTTTTGACTATGGAAAC
TTAGATCAGTGAGGATGATAGGACCAT

QA 3 749 3 749
DS 

RD RS1D571TF 741 0 0
GG
AACGAATTTGAGACAAGAAAAGAAAAACATAGAACGGCGAAGGAGGAGATGAATGGGCCG
CCGGAGAACGATCTTTGCTCGATATGTCATTCCCACTTTACTGCTCCTTGCCAAGCCAAT
TGCTCTCATTGGTTCTGCGGAAATTGCATCATGCTTGTGTGGAGGCATGGATCTATATTA
CAGCCATGCAAATGCCCCTTGTGTCGTCGTCCCATAAGTTTGCTCGTCCCTACAGAGGAC
ACTATCAGAGACCGTAATGATCCTACAGTTACCGAGGTTCTTGCTGATCTTGAAACCTAC
AACCGACGCTTTGGTGGACAATCAACTAGTTTAATTCAGAGGATGCAAGACCTTCCGTTC
TTACTTCGGAGATTGTTGCGGGAAATGATGGATCCACAAAGAACACTTCCACTTGTCATC
AGAGCTCGAGTTTATATCGCAGATGATTCTCAGTGCTGTTTACATAGTCAGTCCAATAGA
TATCATTCCAGAAGGAGTTCTGGGGGTTGTCGGTTTGCTTGATGATCTACTCATAGCCTT
GATTTGTTTCCTCCATGTTGCTGCTCTCTACCGCTCGGTTCTCTATTTCCGCCATGCCGG
TTCTTGAACCAATGAATGTTTGTGACAATTCAAGAACTGAGAAATGTGCTTACCTTCCGT
CTTTGTCTTTGATCACTTAACCTTGTGTAGACACGATCATTCTGTTTTGACTATGGAAAC
TTAGATCAGTGAGGATGAT

QA 3 741 3 741
DS 



AS 1 4

CO CL3051Contig1 1566 4 7 U
CTGATAAGGAGACTTGATACAAAATGTTCTTCTCAGGTTACCAAAGCAAACAGTTTGGTT
ACAAACTTATCATTTTCATGAAAAAACATAAACTCTCTTTCTCTCTCTCTCTTTATGAGC
AATTTGTACCGCAAGATTTCCATTATTTTTCATGGAAATATTTCCCACCTGTTTAATTAC
ATTACAAACCAGAAACCTCTGTCTAATCACTTAGCAGGAACAGCTTAAAGAAGAATCTCC
AAAACACTTAGCTTTGTGTTTTACAACTCTGGAGTTGTGAGAGAATCTGCGGCTTCTAGG
GGACATGTGAACTCTATCCATCATGTTGATCTTAGGCGCATCAAGAATTGCCTTTGGCAG
CGACAACGCCCATTGCATTCCCCATATTGCGAGAGGCCTCATGTATATCAATGACCTGTA
ATGCCCATCCATTGTCCAACCTTCCGGTGTCTGGAACCAGTATCCGAAACCCTCTTCTGA
CCACCCAGCTGTGAAGATTCCCTCAGCAGTAGTGAACCCTTGTTCCTCCATTCCAGAGAG
GATCATAGTAGCTGCTGCTGCATACGTGACACCTGTCCATATCTCACGTGACTGCATGCA
CGTCTCATCCACTTTCCCATCAGGATGCATCCCATTTACAGCACCCATTCTCCCTCCTTT
CGTCTTCATGACATTGAAATCAAAGATCTTTTGCGAAGTGCTTTTGATTTTAGAATCCTC
GAAGATCGGAGGCAGACCTGAGGACGCAGTATACCACTGACCCGCAAGCTGATCCGTCTG
TATAGATTTGCTGTTGCTGCTCGCCCCGCTGTCATAGTTGAAGTAAGTTCCGTTCCAGAG
CTTCGCTTCCAACGCTGCCTTCGCATTCAAAAACTTGTTCTTGCACAATTCCGCAAAGAA
CTTATCACCGATCTGGAGAGCCATTGCCGCTGCAGCCTGAAGAGCAGCAAGCCACAGGCA
ACCGCAGTAGGCGCTCACGCCATGAACGGTCCATGTATCATATGTCTGATCAGGGAAACC
GTCGTTCTCTATAAGATCGTCGTTGTCTCTATCGAACTGTTCCATGTACTCCATAGCAGC
ACGAACTGCTGGCCAGACGTCTATACCAAACTGGTAATCCCCTGTAGCTGCGAAATCTCT
ATACACCTGAAGCACAAACTTCGGGTTAAGATCTTTCCACTTGCTTGTGTCGTGTATGTT
GTAGGCATTCATTTCGTTCCACGGATCATGCATCCCTAGATCGTGAGGAACAGCGCCTCT
GACCTTGCGGATTCCCAAGTTCCCCTCTGCAAGGAACTTAACCTTCCTCCCATCTTCGGA
CAGCACGGCTTTAGCGAAATCCCGCTGGATATTTAGTTCGATCTTCGGGAAGAGCATAAG
GAGCGCATATGATGCGTAAAAGTGCACATCATACGTGTTCCACATCACATACTCCACACC
TTCTAAGTACAGAAATCGACCAACATCATCGTCATCATCTACGTGCGAGGTGTCAACAAA
TAAACCATTGCTTTTGTCTGATGCTTCCCCATTGCTGACGCAATTATCATGGTTACTCAC
TTCACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 

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GG
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CTT

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CTGCATGCACGTCTCATCCACTTTCCCATCAGGATGCATCCCATTTACAGCACCCATTCT
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CGCAAAGAACTTATCACCGATCTGGAGAGCCATTGCCGCTGCAGCCTGAAGAGCAGCAAG
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TCCATGTACTCCATAGCAGCACGAACTGCTGGCCAGACGTCTATACCAAACTGGTAATCC
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ACGTGCGAGGTGTCAACAAATAAACCATTGCTTTTGTCTGATGCTTCCCCATTGCTGACG
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DS 



AS 1 4

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BQ
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RS1GZ65TF U 1
AF RS1A926JQ C 3
AF RS1GZ65JQ C 157
AF RS1A926TF U 3
BS 1 105 RS1GZ65TF
BS 106 106 RS1A926TF
BS 107 520 RS1GZ65TF
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BS 522 723 RS1GZ65TF
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TGT
ACACATG

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RD RS1A926JQ 751 0 0
GG
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DS 

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AAGTTCACCCAAAGTTCTCAAACACTTACGAGAAAAGCTTGTGTGATAGTAAAGCAACTG
TAGCTTTAACGGTGTGGAAGAAGTCTCTTCTCTTCAACTGTGATGGATTCACAGTTTACA
ACTCTAATGGAGATCTCGTCTTTAGGGTTGACAACTACATGAACTCACCTAGAGACAACA
TCGTCCTTATGGATGCTTCCGGCTTGCCCCTTCTCTCCATCCGCCGCAAGAAGTTGAGCC
TGGGAGATTGTTGGGGGGTATACGACGGAGAAACACAAAGAGATCCATTATTTACGGCAA
GGAAAAACGTTAACATACTAACAAACAAGAGGAGCTTGGTGTGGGTTAGCACGAAGAAAA
CAGTACTATACGAGATTGAAGGATCATATGGGCAGAGAAGCTGCAAAATAGTGGACGTGA
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TGGCATTGACCATCATTCTCGACCAAATGTCAAGATCTTATTGATTTTTCAAGCTTTTGT
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ACACATGAACAGAAACAACTTTTGTT
TTC

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DS 



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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 0 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DW35JQ U 1
AF RS1DX48JQ U 1
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RD RS1DW35JQ 701 0 0
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QA 1 701 1 701
DS 

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GG
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AGAGCATCTAAACCATTTTTAACCATCCCGATATCCCGGTTAATCTCCAGCTTGAGTTCT
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GCCAGGTTAAGAGACCGTTTCAGGTACTCTGATCTAAGTGTGTTGATATGGAGCTCCTCC
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CGGGGGCTTACGAAAGCGAAAACCGTGACACAAGAAAGCCTGTCTTGAAGACTTGGTGTG
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GCGGTTGTATAAAGAGACA

QA 3 741 3 741
DS 



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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DX48TF U 9
AF RS1DW35TF U 1
BS 1 180 RS1DW35TF
BS 181 181 RS1DX48TF
BS 182 586 RS1DW35TF
BS 587 587 RS1DX48TF
BS 588 635 RS1DW35TF

RD RS1DX48TF 584 0 0
G
GGAGAGGGAGGAGGTTTGGATCAGAAGAAAATGGAAATGGTGGAAGATATCGCTAAGAGA
TGGAAGGAATTGAGCGGCAATAGCAAATGGAAAGACCTGCTTGATCCTCTTGACTTGGAT
CTACGCCGATACATCCTCCACTACGGCGACATGGTTCAAGTCGGGTACATTACCTTCAAT
AGTGGCCGCCGGTCCAAATATGTAGGAGATAGCTTCTACACCAAGGAAGATCTCTTTGCT
CGAACCGGCTACCTTAAAGCCAACCCTTTCAGGTACGAGGTGACAAAGTACATATATGGA
ACATCGTCGATAAAGTTACCAGAATGTTTCATGATCAACTCATTGTCAAGGGAAGCATGG
AACAAAGAGTCTAACTGGTTAGGTTATGTTGCGGTGGCTACTGACGAAGGCAAGGAGTTG
TTAGGGAGAAGAGACATTGTTGTAGCATGGCGAGGGACTATACAACCGTACGAGTGGGCT
AACGATTTTGATTTCCCACTTGAATCAGCTATCTCCGTATTCCCTCGAGCTGACCCGAGT
GATCCACCTCGCATTGCTAGTGGTTGGCTGTCTCTTTATACAA

QA 2 584 2 584
DS 

RD RS1DW35TF 635 0 0
GGACAAAAAGGAGAGGGAGGAGGTTTGGATCAGAAGAAAATGGAAATGGTGGAAGATATC
GCTAAGAGATGGAAGGAATTGAGCGGCAATAGCAAATGGAAAGACCTGCTTGATCCTCTT
GACTTGGATCTACGCCGATACATCCTCCACTACGGCGACATGGTTCAAGTCGGGTACATT
TCCTTCAATAGTGGCCGCCGGTCCAAATATGTAGGAGATAGCTTCTACACCAAGGAAGAT
CTCTTTGCTCGAACCGGCTACCTTAAAGCCAACCCTTTCAGGTACGAGGTGACAAAGTAC
ATATATGGAACATCGTCGATAAAGTTACCAGAATGTTTCATGATCAACTCATTGTCAAGG
GAAGCATGGAACAAAGAGTCTAACTGGTTAGGTTATGTTGCGGTGGCTACTGACGAAGGC
AAGGAGTTGTTAGGGAGAAGAGACATTGTTGTAGCATGGCGAGGGACTATACAACCGTAC
GAGTGGGCTAACGATTTTGATTTCCCACTTGAATCAGCTATCTCCGTATTCCCTCGAGCT
GACCCGAGTGATCCACCTCGCATTGCTAGTGGTTGGCTGTCTCTTTGTACAACCGCTGAT
CCACGCTCACGTTTTGACAAGACCAGTGCACGAGA

QA 1 635 1 635
DS 



AS 2 4

CO CL3054Contig1 275 2 3 U
AGGTAGCTGATGATAATGATTATTGAGCTTCTAGTGTAAAGGTCGAAGCATAAAACACAC
TACTTGAAAAAGTTACAATGAAAGCATTAAAGTATATTTTAAAATCCAAAAAACAAAAAA
GCATATAAAAGGGAATAAAGTAAAAAGGTTGCATTTATTTCACAAAAATACAAACAACAT
GGAGCTTGTCTGTCTTCTCACAGTAAATCAAAAAGAGCTTTTCTACTCTTTAAAAGTCAT
CCTAGCCTTGTTAACCTGGATAATAAGTACGGTTA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1A165TR U 1
AF RS1A165JQ U 1
BS 1 156 RS1A165JQ
BS 157 157 RS1A165TR
BS 158 275 RS1A165JQ

RD RS1A165TR 205 0 0
AGGTAGCTGATGATAATGATTATTGAGCTTCTAGTGTAAAGGTCGAAGCATAAAACACAC
TACTTGAAAGAGTTACAATGAAAGCATTAAAGTATATTTTAAAATCCAAAAAACAAAAAA
GCATATAAAAGGGAATAGAGTAAAAAGGTTGCATTTATTTCACAAAAATACAAACAACAT
GGAGCTTGTCTGTCTTCTCACAGTA

QA 1 205 1 205
DS 

RD RS1A165JQ 275 0 0
AGGTAGCTGATGATAATGATTATTGAGCTTCTAGTGTAAAGGTCGAAGCATAAAACACAC
TACTTGAAAAAGTTACAATGAAAGCATTAAAGTATATTTTAAAATCCAAAAAACAAAAAA
GCATATAAAAGGGAATAAAGTAAAAAGGTTGCATTTTTTTCACAAAAATACAAACAACAT
GGAGCTTGTCTGTCTTCTCACAGTAAATCAAAAAGAGCTTTTCTACTCTTTAAAAGTCAT
CCTAGCCTTGTTAACCTGGATAATAAGTACGGTTA

QA 1 275 1 275
DS 



CO CL3054Contig2 891 2 2 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGGGAACCAA
GATACCTAAATATTGCCGTCTCTCGAAGCCCTAGCTAAACCTATCTTCTCAACTTGCCTA
CAATGGAGAGATCCGCGATCAAAGGGATGAGTCTGCTGACATTGGACGAAAGTGATCATA
CTAAGAGAACCATACCAAGAAAGCGCGACATAGGGAGGATTCGCGTAAGAGGATATAACA
CTGACCTTCCCCATGATGATGTAGTAAACGCGTTGAGGAAACATTTCTCTTCGTGTGGAG
AGATCACAGATGTTTATATCCGCGAAATGAAAGATGGTCTACACAGTTTTGGTCTTATTT
ATTTTCTTGGAGAAGGTGCAGTGGACAAGGCCTCGCAACTTAGTGGAATTGACGTGGGAG
GATGGACCGTCATTGCTGAGCCTTATCCGTTAAACGAACAGGCGGGCTGTCTCCCTGCTG
TAATTGTTCAAGGTTATGACACTCTTCTTGATAAAGCTGATATCGAGAAAATGTTGTTTG
AACATTTCTCTTCATGTGGAGAGGTCGCTAGAATCAATGTTCACGAAAGCATTGGTGCAG
CTGTTGTAGACCTTTATGGAGAAGATGCTGAAGAAAAGGTGATGTATCTTGATGGGAGCA
ACATGGTTGGACGCAAAATAAGTGTTAAGCTTTATACTGTGCCGACTGTTTACAGTGTCC
ACCCTCGTCCTCGTCGTAACCGTACTTATTATCCAGGTTAACAAAGGCTAGGATGACTTC
TAAAGAGTAGAAAAGCTCTCTCTGATCTACTGTGAGAAGACAGACAAGCTCCATGTTGTT
TGTATCTTTGTGAAATAAATGCAACCTTTTTACTCTATTCCCTTTTATATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
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AF RS1A165TV U 1
AF RS1A165TF U 59
BS 1 865 RS1A165TV
BS 866 891 RS1A165TF

RD RS1A165TV 865 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGGGAACCAA
GATACCTAAATATTGCCGTCTCTCGAAGCCCTAGCTAAACCTATCTTCTCAACTTGCCTA
CAATGGAGAGATCCGCGATCAAAGGGATGAGTCTGCTGACATTGGACGAAAGTGATCATA
CTAAGAGAACCATACCAAGAAAGCGCGACATAGGGAGGATTCGCGTAAGAGGATATAACA
CTGACCTTCCCCATGATGATGTAGTAAACGCGTTGAGGAAACATTTCTCTTCGTGTGGAG
AGATCACAGATGTTTATATCCGCGAAATGAAAGATGGTCTACACAGTTTTGGTCTTATTT
ATTTTCTTGGAGAAGGTGCAGTGGACAAGGCCTCGCAACTTAGTGGAATTGACGTGGGAG
GATGGACCGTCATTGCTGAGCCTTATCCGTTAAACGAACAGGCGGGCTGTCTCCCTGCTG
TAATTGTTCAAGGTTATGACACTCTTCTTGATAAAGCTGATATCGAGAAAATGTTGTTTG
AACATTTCTCTTCATGTGGAGAGGTCGCTAGAATCAATGTTCACGAAAGCATTGGTGCAG
CTGTTGTAGACCTTTATGGAGAAGATGCTGAAGAAAAGGTGATGTATCTTGATGGGAGCA
ACATGGTTGGACGCAAAATAAGTGTTAAGCTTTATACTGTGCCGACTGTTTACAGTGTCC
ACCCTCGTCCTCGTCGTAACCGTACTTATTATCCAGGTTAACAAAGGCTAGGATGACTTC
TAAAGAGTAGAAAAGCTCTCTCTGATCTACTGTGAGAAGACAGACAAGCTCCATGTTGTT
TGTATCTTTGTGAAATAAATGCAAC

QA 1 865 1 865
DS 

RD RS1A165TF 833 0 0
AAGATACCTAAATATTGCCGTCTCTCGAAGCCCTAGCTAAACCTATCTTCTCAACTTGCC
TACAATGGAGAGATCCGCGATCAAAGGGATGAGTCTGCTGACATTGGACGAAAGTGATCA
TACTAAGAGAACCATACCAAGAAAGCGCGACATAGGGAGGATTCGCGTAAGAGGATATAA
CACTGACCTTCCCCATGATGATGTAGTAAACGCGTTGAGGAAACATTTCTCTTCGTGTGG
AGAGATCACAGATGTTTATATCCGCGAAATGAAAGATGGTCTACACAGTTTTGGTCTTAT
TTATTTTCTTGGAGAAGGTGCAGTGGACAAGGCCTCGCAACTTAGTGGAATTGACGTGGG
AGGATGGACCGTCATTGCTGAGCCTTATCCGTTAAACGAACAGGCGGGCTGTCTCCCTGC
TGTAATTGTTCAAGGTTATGACACTCTTCTTGATAAAGCTGATATCGAGAAAATGTTGTT
TGAACATTTCTCTTCATGTGGAGAGGTCGCTAGAATCAATGTTCACGAAAGCATTGGTGC
AGCTGTTGTAGACCTTTATGGAGAAGATGCTGAAGAAAAGGTGATGTATCTTGATGGGAG
CAACATGGTTGGACGCAAAATAAGTGTTAAGCTTTATACTGTGCCGACTGTTTACAGTGT
CCACCCTCGTCCTCGTCGTAACCGTACTTATTATCCAGGTTAACAA*GGCTAGGATGACT
TCTAAAGAGTAGAAAAGCTCTCTCTGATCTACTGTGAGAAGACAGACA*GCTCCATGTTG
TTTGTATCTTTGTGAA*TAAATGCAACCTTTTTACTCTATTCCCTTTTATATG

QA 1 833 1 833
DS 



AS 1 4

CO CL3055Contig1 807 4 20 U
TCTCTCTCTTTAGTTCGTATGATCTGATCCGAAGACGAAGCTCAGGAAGAGAAGATGGGA
ATCGTGTTCACGAAGCTGTTCTCTTCCGTATTTGGAAACAAAGAAGCTCGCATCCTCGTC
CTCGGTCTCGACAATGCCGGAAAAACCACCATCCTCTATCGGCTTCAGATGGGGGAGGTC
GTCTCCACTATTCCGACTATTGGATTTAACGTGGAGACTGTGCAGTACAATAATATCAAG
TTTCAGGTCTGGGATTTAGGTGGACAAACGAGTATCAGGCCATATTGGAGATGCTATTTC
CCAAATACGCAAGCAGTGATTTATGTTGTTGATTCGAGTGATACTGATAGAATTGGAGTC
GCCAAAGAAGAGTTCCATGCAATTTTGGAGGAAGAGGAATTGAAAGGTGCAACGGTTCTT
ATATTTGCAAACAAGCAGGATCTACCAGGAGCACTCGACGATGCAGCTGTGACCGAGGCC
TTGGAGTTGCACAAAATAAAGAGTCGTCAATGGGCAATATTCAAAACTTGTGCTGTGAAA
GGCGAAGGACTTTTCGAAGGCCTAGACTGGTTGAGTAATACGCTAAAGTCAGGGACTGGC
TAACTTCATCGCTCACCACAAAGCAGCAGCGTGCGTGTATCATCTTTTCTACTATTAGCT
TTGCATTCTTCGACAAAGGGTTGATAGCGTATCAGTTATTGACCTCTTATGTTTTTTTGT
CCGAAGAAGATAAGACTTGTGG*AGTTGTTGTTGTGACATTTAAGACGTCATTTTTAACA
TAAAATTGAACATATAAAGATTACCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 15 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 0 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RS1EO70TF U 1
AF RS1A571TF U 31
AF RS1A571JQ C 156
AF RS1EO70JQ C 182
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BS 791 807 RS1A571TF

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G

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CCAAAGAAGAGTTCCATGCAATTTTGGAGGAAGAGGAATTGAAAGGTGCAATGGTTTTTA
TATTTGCAAACAAGCAGGATCTACCAGGAGCACTCGACGATGCAGCTGTGACCGAGGCCT
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AACTTCATCGCTCACCACAAAGCAGCAGCGTGCGTGTATCATCTTTTCTACTATTAGCTT
TGCATTTTTCGACAAAGGGTTGATAGCGTATCAGTTATTGACCTCTTATGTTTTTT*GTC
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AAAATTGAACATATAAAGATTACC

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 3

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GCCAGCTTGTGTTCCTAACCTTGATGCCACCCTTGTCTTGTCTAATTTCACAAAGTCACG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EI37TF U 1
AF RS1CY84TF U 32
AF RS1EI37JQ C 216
BS 1 105 RS1EI37TF
BS 106 106 RS1CY84TF
BS 107 722 RS1EI37TF
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RD RS1EI37TF 722 0 0
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GGTTCTTCTCTTTTCTTTCCTCATGTTTTGAGTTTCTTTTCTTGAATAATGATCTCGGTG
TT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RS1CY84TF 740 0 0
GG
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TCCTGTTCTTTCCGACAACGATGAGGAAGACATTCTTCTTAGAGGCATCAACGAATATAG
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AATCGCAGACCAGTTCAAGAACCAACCATGCACAAACATGACCGGCCCTGCTTCTGTCCC
TGGATCCGAACCTGGTTTCCCAGACTACCCTATGTTCCTCACAAAATGTCACCTCGACAC
AACCGCAACCAGAGACGGTGAGATCATGCCAGCTTGTGTTCCTAACCTTGATGCCACCCT
TGTCTTGTCTAATTTCACAAAGTCACGGTACAACCAGAACCTAAATGATTCTAAGTTCAC
TGGCATTGGCATTGCTTCTGATGATAATTGGATTGTGGTCATCCTCACTGCAAACACAAC
TGAGGGTGGCTATACTCCGGCTACTAAGGACAGTAACTCAGGAGCTTTCGCGTTTGGAGT
TAATGGTGTCGTTTCTTCGTGTTTGTTGGTTCTTCTCTTTTCTTTCTTCATGTTTTGAGT
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TTCTTTCATTGTC
TATGT

QA 3 735 3 735
DS 

RD RS1EI37JQ 605 0 0
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GATCCGAACCCGGTTTCCCAGACTACCCTAGGTTCCTCACAAAATGTCACCTCGACACAA
CCGCAACCAGAGACGGTGAGATCATGCCAGCTTGTGTTCCTAACCTTGATGCCACCCTTG
TTTTGTTTAATTTCACAAAGTCACGGTACAACCAGAACCTAAATGATTTTAAGTTCACTG
GCATTGGCATTGCTTTTGATGATAATTGGATTGTGGTCATCCTCACTACAAACACAACTG
AGGGTGGCTATACTCCGGCTACTAAGGACAGTAACTCAGGAGCTTTCGCGTTTGGAGTTA
ATGGTGTCGTTTCTTCGTGTTTGTTGGTTTTTCTCTTTTCTTTCCTCATGTTTTGAGTTT
CTTTTCTTGAATAATGATCTCGGTGTTCTTTCTTCATGTGTTGAGCTTCATTATGAGTTT
CTTTCATTGTCTATGTTCTGAATAAATAATGTTTTTGGGTGAAAATCTCATTGCATTTGT
ATGTT

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 3

CO CL3057Contig1 800 3 18 U
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GCTCCTCGCTTTGTTCGTCTCACACCTTCAATGTCGTCGGAAATGAAACCCTAAAAGTAT
CCCAGCGAAGGTCTACTTTGGAGGTTGTTGCCCAGAAGAAAGCCAAGAAACTCCGCAAGG
TAATCTTGAAAGAGGATGTGTCGGACTTGGGCAAGCAAGGGCAATTACTCGACGTGAAAG
CTGGATTCTTCAGAAATTTCCTCTTGCCAACTGGAAAGGCTCAGCTCATGACTCCGCTTC
TGCTCAAGGAAATGAAAATGGAAAACGAAAGGATAGAGGCAGAAAAGCAAAGGGTGAAAG
AAGAGGCGCTACAATTAGCTACAGTGTTCGAAACCGTTGGGGCTTTCAAGGTTAAACGCA
AGGGTGGTAAAGGCAAACAAATATTTGGATCTGTCACAGCACAAGACCTCGTTGACATCA
TCAAGGCGCAGCTCCAAAGGGATATAGACAAGCGCCTTGTCTCTCTTCCGGAGATCCGTG
AAACCGGAGAATACATAGCCGAACTCAAACTTCACCCTGATGTCACTGCTCGTGTTAGGC
TCAACGTTTTCGCCAACTAACCCTTCAAATAGTCAAGACTACTGCTGCATCCCAAGGAAC
ATAGAGGAAGGGAGAAGAGACTGGCCAGGATCCAAGTTTGTGAAGTTTTTTTTCTTGATT
ATCTTTTGCTGCATTCGTCTTTTTGCTATTTTAAAAAGAATATTTTGGAATCTTGGAAAT
GTTATAATATTTTCATCAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1GL95TF U 1
AF RS1EO60TF U 52
AF RS1BD27JQ C 103
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BS 117 117 RS1EO60TF
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RD RS1GL95TF 624 0 0
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TCAACGTTTTCGCCAACTAACCCT

QA 1 624 1 624
DS 

RD RS1EO60TF 749 0 0
G
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AAAAGTATCCCAGCGAAGGTCTACTTTGGAGGTTGTTGCCCAGAAGAAAGCCAAGAAACT
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GGTGAAAGAAGAGGCGCTACAATTAGCTACAGTGTTCGAAACCGTTGGGGCTTTCAAGGT
TAAACGCAAGGGTGGTAAAGGCAAACAAATATTTGGATCTGTCACAGCACAAGACCTCGT
TGACATCATCAAGGCGCAGCTCCAAAGGGATATAGACAAGCGCCTTGTCTCTCTTCCGGA
GATCCGTGAAACCGGAGAATACATAGCCGAACTCAAACTTCACCCTGATGTCACTGCTCG
TGTTAGGCTCAACGTTTTCGCCAACTAACCCTTCAAATAGTCAAGACTACTGCTGCATCC
CAAGGAACATAGAGGAAGGGAGAAGAGACTGGCCAGGATCCAAGTTTGTGAAGTTTTTTT
*CTTGATTATCTTTTGCTGCATTCGTCTTTTTGCTATTTTAAAAAGAATATTTTGGAATC
TTGGAAATGTTATAATATTTTCATCAAG

QA 2 749 2 749
DS 

RD RS1BD27JQ 698 0 0
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CTTTCAAGGTTAAACGCAAGGGTGGTAAAGGCAAACAAATATTTGGGTCTGTCACAGCAC
AAGACCTCGTTGACATCATCAAGGCGCAGCTCCAAAGGGATATAGACAAGCGCCTTGTCT
CTCTTCCGGAGATCCGTGAAACCGGAGAATACATAGCCGAACTCAAACTTCACCCTGATG
TCACTGCTCGTGTTAGGCTCAACGTTTTCGCCAACTAACCCTTCAAATAGTCAAGACTAC
TGCTGCATCCCAAGGAACATAGAGGAAGGGAGAAGAGACTGGCCAGGATCCAAGTTTGTG
AAGTTTTTTTTCTTGATTATCTTTTGCTGCATTCGTCTTTTTGCTATTTTAAAAAGAATA
TTTTGGAATCTTGGAAATGTTATAATATTTTCATCAAG

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 4

CO CL3058Contig1 1025 4 7 U
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CCCTGTTCTCAGACTCTTATCTTTCACAGGGAGAAAGAGATTTGTCTTTTGTTTTGATGT
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TCCGGTTAGCGGATAAGTCTTCGCTTTGGCGATTTGGATGTGTTTTCTTCAACTAAAGCA
GAGCTTTTCTTCATGATTCTCCTTTTATCTATGTTTCTTTAGTTGAATTTTTTTTAGTGT
GCGTTGGCCTTTTGCGATCTCAATATCTATCCCGTCGGTTTTTGATTGAAACCATGTTAA
TAGTTTCAACTTAACATCCTTTCACGTGAGTCAGTCTTTACCATCAATCTAGCCATATAT
GGGCACTCAAGGTAAAGCTTCTCGGACAAAGGATGATTAAGTTCTTATGGGTCTCTTAGG
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CTTCAATTGACTGAAAATTCCCCTGGTTCAATCAACGATGAATCATGGCTTCTTCGATCA
AATAATCGAGGTTGGAGCGACAGGTCTTTGGCATCGGTGTTTTAACAAGAAAATCGACGC
AGAGAGTTCCGAGCAAATCTCCATGAGCTTTACAGTGAAAAACAGAGTAAAGGCCGACTG
CTGTTATTTACTTTGTTATAAATTCAGGGAGAAGCCTCGGCGGAGGAAAGGAATCCGAGA
AGCAACTCAGGGAGTTCTCCGGTGGTGAAGCTCTGAAGCGGTGGCCGCACATCTGATACC
TGCATGCTGGACACGTGTTTCCTAGAAAGTGCAGAGATGCAGGCGTGGATTCTGAAGCTT
CTCGTTTTTTTTTTTTTAAATGGGCTCTAATTTTACTATCTGTTTGAGCTTTTAATTGCT
GTAAAACCTGATGCCATCATGTAACAATGCTCATTGGGCATAGTTTAATGAAATCTATAG
TTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 

AF RS1H181TF U 1
AF RS1C389TF U 6
AF RS1C389JQ C 296
AF RS1H181JQB C 627
BS 1 534 RS1H181TF
BS 535 535 RS1C389TF
BS 536 701 RS1H181TF
BS 702 702 RS1C389JQ
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BS 733 741 RS1C389TF
BS 742 1025 RS1C389JQ

RD RS1H181TF 732 0 0
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CCCTGTTCTCAGACTCTTATCTTTCACAGGGAGAAAGAGATTTGTCTTTTGTTTTGATGT
AAACTACTTTTGTTCGATCGAGAGATCGATTTGTTTTGGTTCGCTTAGGCGATTGTGTTT
TCCGGTTAGCGGATAAGTCTTCGCTTTGGCGATTTGGATGTGTTTTCTTCAACTAAAGCA
GAGCTTTTCTTCATGATTCTCCTTTTATCTATGTTTCTTTAGTTGAATTTTTTTTAGTGT
GCGTTGGCCTTTTGCGATCTCAATATCTATCCCGTCGGTTTTTGATTGAAACCATGTTAA
TAGTTTCAACTTAACATCCTTTCACGTGAGTCAGTCTTTACCATCAATCTAGCCATATAT
GGGCACTCAAGGTAAAGCTTCTCGGACAAAGGATGATTAAGTTCTTATGGGTCTCTTAGG
TCTTTATGAAGATGATTTAGTAGAGCTGGCATTTGATAATGGTCCAGCAAAAAA*GCTTA
CTTCAATTGACTGAAAATTCCCCTGGTTCAATCAACGATGAATCATGGCTTCTTCGATCA
AATAATCGAGGTTGGAGCGACAGGTCTTTGGCATCGGTGTTTTAACAAGAAAATCGACGC
AGAGAGTTCCGAGCAAATCTCCATGAGCTTTACAGTGAAAA*CAGAGTAAAGGCCGACTG
CTGTTATTTACT

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1C389TF 737 0 0
GG
GTGTCGGGGGCTCTCTCTCCTCTTTAGAGAGGGAAAATCCTCTCTCTTTCCATCCCTGTT
CTCAGACTCTTATCTTTCACAGGGAGAAAGAGATTTGTCTTTTGTTTTGATGTAAACTAC
TTTTGTTCGATCGAGAGATCGATTTGTTTTGGTTCGCTTAGGCGATTGTGTTTTCCGGTT
AGCGGATAAGTCTTCGCTTTGGCGATTTGGATGTGTTTTCTTCAACTAAAGCAGAGCTTT
TCTTCATGATTCTCCTTTTATCTATGTTTCTTTAGTTGAATTTTTTTTAGTGTGCGTTGG
CCTTTTGCGATCTCAATATCTATCCCGTCGGTTTTTGATTGAAACCATGTTAATAGTTTC
AACTTAACATCCTTTCACGTGAGTCAGTCTTTACCATCAATCTAGCCATATATGGGCACT
CAAGGTAAAGCTTCTCGGACAAAGGATGATTAAGTTCTTATGGGTCTCTTAGGTCTTTAT
GAAGATGATTTAGTAGAGCTGGCATTTGATAATGGTCCAGCAAAAAAAGCTTACTTCAAT
TGACTGAAAATTCCCCTGGTTCAATCAACGATGAATCATGGCTTCTTCGATCAAATAATC
GAGGTTGGAGCGACAGGTCTTTGGCATCGGTGTTTTAACGAGAAAATCGACGCAGAGAGT
*CCGAGCAAATCTCCATGAGCTTTACAGTGAAAA*CAGAGTAAAGGC*GACTGCTGTTAT
TTACTTTGTTATAA
T

QA 3 736 3 736
DS 

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GTTAATAGTTTCAACTTAACATCCTTTCACGTGAGTCAGTCTTTACCATCAATCTAGCCA
TATATGGGCACTCAAGGTAAAGCTTCTCGGACAAAGGATGATTAAGTTCTTATGGGTCTC
TTAGGTCTTTATGAAGATGATTTAGTAGAGCTGGCATTTGATAATGGTCCAGCAAAAAAA
GCTTACTTCAATTGACTGAAAATTCCCCTGGTTCAATCAACGATGAATCATGGCTTCTTC
GATCAAATAATCGAGGTTGGAGCGACAGGTCTTTGGCATCGGTGTTTTAACGAGAAAATC
GACGCAGAGAGTTCCGAGCAAATCTCCATGAGCTTTACAGTGAAAAACAGAGTAAAGGCC
GACTGCTGTTATTTACTTTGTTATAAATTCAGGGAGAAGCCTCGGCGGAGGAAAGGAATC
CGAGAAGCAACTCAGGGAGTTCTCCGGTGGTGAAGCTCTGAAGCGGTGGCCGCACATCTG
ATACCTGCATGCTGGACACGTGTTTCCTAGAAAGTGCAGAGATGCAGGCGTGGATTCTGA
AGCTTCTCGTTTTTTTTTTTTTAAATGGGCTCTAATTTTACTATCTGTTTGAGCTTTTAA
TTGCTGTAAAACCTGATGCCATCATGTAACAATGCTCATTGGGCATAGTTTAATGAAATC
TATAGTTGAC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RS1H181JQB 399 0 0
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GCTTTACAGTGAAAAACAGAGTAAAGGCCGACTGCTGTTATTTACTTTGTTATAAATTCA
GGGAGAAGCCTCGGCGGAGGAAAGGAATCCGAGAAGCAACTCAGGGAGTTCTCCTGTGGT
GAAGCTCTGAAGCGGTGGCCGCACATCTGATACCTGCATGCTGGACACGTGTTTCCTAGA
AAGTGCAGAGATGCAGGCGTGGATTCTGAAGCTTCTCGTTTTTTTTTTT**AAATGGGCT
CTAATTTTACTATCTGTTTGAGCTTTTAATTGCTGTAAAACCTGATGCCATCATGTAACA
ATGCTCATTGGGCATAGTTTAATGAAATCTATAGTTG
GC

QA 1 397 1 397
DS 



AS 1 4

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AAATCTACTTTCAAATGAAACTATCTTGCGATATTGCCGGAAATCATCTGGTTACATAAA
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AATATAATAGAGTAAAATGAAAGTTGTTAGGTGTTTTTGTTCAAGCCAGTTTTGTCCTTG
ACCACGTCCGCAGCTCCTTGTGCCTTCTGCTTCATCTGTTGTCCAGCATGTTGCATGGAG
TCTTGAGCGGAAGCAGCAGCATCTTTGGCCCTGTCCATCAAACCACTTGCCTTCTCCTTA
GTCTGGCCAGTTGCTTGGCCTGCTTGGTAGCTTAGGTTTTGCTTGTCTGACATTTTCTTT
CTCTCTCGTGTTTGCTTAAAACTTAAACTGATGCTTTGATTTGTTGTTTTGTGTGTGATC
C


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 
10 

AF RS1G581JQ U 1
AF RS1G581TF C 1
AF RS1AF66TF C 32
AF RS1AF66JQ U 32
BS 1 476 RS1G581JQ
BS 477 481 RS1AF66JQ

RD RS1G581JQ 479 0 0
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GTCTGGCCAGTTGCTTGGCCTGCTTGGTAGCTTAGGTTTTGCTTGTCTGACATTTTCTTT
CTCTCTCGTGTTTGCTTAAAACTTAAACTGATGCTTTGATTTGTTGTTTTGTGTGT
CCC

QA 1 476 1 476
DS 

RD RS1G581TF 479 0 0
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AAATCTACTTTCAAATGAAACTATCTTGCGATATTGCCGGAAATCATCTGGTTACATAAA
CATCAGGAGCAGCAGAAATGAGAATTAAAACATAATTTATTAAATAACTTAAAAGAGAGG
AATATAATAGAGTAAAATGAAAGTTGTTAGGTGTTTTTGTTCAAGCCAGTTTTGTCCTTG
ACCACGTCCGCAGCTCCTTGTGCCTTCTGCTTCATCTGTTGTCCAGCATGTTGCATGGAG
TCTTGAGCGGAAGCAGCAGCATCTTTGGCCCTGTCCATCAAACCACTTGCCTTCTCCTTA
GTCTGGCCAGTTGCTTGGCCTGCTTGGTAGCTTAGGTTTTGCTTGTCTGACATTTTCTTT
CTCTCTCGTGTTTGCTTAGAACTTAAACTGATGCTTTGATTTGTTGTTTTGTGTGT
CCC

QA 1 476 1 476
DS 

RD RS1AF66TF 450 0 0
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ATAATTTATTAAATAACTTAAAAGAGAGGAATATAATAGAGTGAAATGAAAGTTGTTAGG
TGTTTTTGTTCAAGCCAGTTTTGTCCTTGACCACGTCCGCAGCTCCTTGTGCCTTCTGCT
TCATCTGTTGTCCAGCATGTTGCATGGAGTCTTGAGCGGAAGCAGCAGCATCTTTGGCCC
TGTCCATCAAACCACTTGCCTTCTCCTTAGTCTGGCCAGTTGCTTGGCCTGCTTGGTAGC
TTAGGTTTTGCTTGTCTGACATTTTCTTTCTCTCTCGTGTTTGCTTAGAACTTAAACTGA
TGCTTTGATTTGTTGTTTTGTGTGT
GATCC

QA 1 445 1 445
DS 

RD RS1AF66JQ 450 0 0
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TATTGCCGGAAATCATCTGGTTACATAAACATCAGGAGCAGCAAAAATGAAAATTAAAAC
ATAATTTATTAAATAACTTAAAAAAAAGGAATATAATAAAGTGAAATGAAAGTTGTTAGG
GGTTTTTGTTCAAGCCAGTTTTGTCCTTGACCACGTCCGCAGCTCCTTGTGCCTTCTGCT
TCATCTGTTGTCCAGCATGTTGCATGGAGTCTTGAGCGGAAGCAGCAGCATCTTTGGCCC
TGTCCATCAAACCACTTGCCTTCTCCTTATTCTGGCCAGTTGCTTGGCCTGCTTGGTAGC
TTAGGTTTTGCTTGTCTGACATTTTCTTTCTCTCTCGTGTTTGCTTAAAACTTAAACTGA
TGCTTTGATTTGTTGTTTTGTGTGTGATCC

QA 1 450 1 450
DS 



AS 2 4

CO CL3060Contig1 681 2 3 U
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GGCGGCGTATTTCGCGAGGAGGGCGGCGCAAAAGGAAAGGGTTCGAATCCTCTATCGCCG
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TGATCTGCGCGAGAAGTTCAATGCCAACCAGGATGTGGAGGATGTTGACAGAATCGACAA
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ATAAAATTTGAAGCATCTTGTGGCTATGGTTCAGAGGATAACTAAAGGCTTTCAAGGTTG
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TGTTTCAACTTGGTATACTTCTTCCATCTAAAAACATTCTCGGCTGCTCTTTAGCTGCCA
AGCATCTCATCATGATGCATGGATAAAAACAAGTTGTGTGTGTTTTGTCTACTTTGACCA
CATTATCTATCAGTGTTTTAT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E159TF U 1
AF RS1E159JQ C 1
BS 1 1 RS1E159JQ
BS 2 561 RS1E159TF
BS 562 681 RS1E159JQ

RD RS1E159TF 561 0 0
G
GGAGGAGACTCGAAACCAATCGGAAAATCAGAAGAGAAAAAAATGAGCGGAGTTTCAACG
GCGGCGTATTTCGCGAGGAGGGCGGCGCAAAAGGAAAGGGTTCGAATCCTCTATCGCCGT
GCCCTTAAGGATACTCTGAACTGGGCTGTTCACCGCCACATTTTCTACCGCGACGCTTCT
GATCTGCGCGAGAAGTTCAATGCCAACCAGGATGTGGAGGATGTTGACAGAATCGACAAA
CTGATTGCTCACGGTGAAGCAGAGTACGACAAGTGGAGACACCCTGATCCTTATATCGTT
CCATGGGCTCCTGGTGGCTCAAAGTTCTGTAGAAACCCTACTCCTCCTGCTGGGATTGAG
ATTGTGTACAACTATGGTCAAGAAGACAACCCATAAAAATTTAATTTTCATACCCTTCAA
TAAAATTTGAAGCATCTTGTGGCTATGGTTCAGAGGATAACTAAAGGCTTTCAAGGTTGA
AACTTTGAGGGACCAATTGTAGTTTTCTAAGATGTTTCGTTTGAGTTAAAGACACCTATT
GTTTCAACTTGGTATACTTC

QA 2 561 2 561
DS 

RD RS1E159JQ 681 0 0
GGGAGGAGACTCGAAACCAATCGGAAAATCAGAAGAGAAAAAAATGAGCGGAGTTTCAAC
GGCGGCGTATTTCGCGAGGAGGGCGGCGCAAAAGGAAAGGGTTCGAATCCTCTATCGCCG
TGCCCTTAAGGATACTCTGAACTGGGCTGTTCACCGCCACATTTTCTACCGCGACGCTTC
TGATCTGCGCGAGAAGTTCAATGCCAACCAGGATGTGGAGGATGTTGACAGAATCGACAA
ACTGATTGCTCACGGTGAAGCAGAGTACGACAAGTGGAGACACCCTGATCCTTATATCGT
TCCATGGGCTCCTGGTGGCTCAAAGTTCTGTAGAAACCCTACTCCTCCTGCTGGGATTGA
GATTGTGTACAACTATGGTCAAGAAGACAACCCATAAAAATTTAATTTTCATACCCTTCA
ATAAAATTTGAAGCATCTTGTGGCTATGGTTCAGAGGATAACTAAAGGCTTTCAAGGTTG
AAACTTTGAGGGACCAATTGTAGTTTTTTAAGATGTTTCGTTTGAGTTAAAGACACCTAT
TGTTTCAACTTGGTATACTTCTTCCATCTAAAAACATTCTCGGCTGCTCTTTAGCTGCCA
AGCATCTCATCATGATGCATGGATAAAAACAAGTTGTGTGTGTTTTGTCTACTTTGACCA
CATTATCTATCAGTGTTTTAT

QA 1 681 1 681
DS 



CO CL3060Contig2 697 2 2 U
TTTTCGGTTTAAACCGGTATAAAACACTGATAGATAATGTGGTCAAAGTAAACAAAACAC
ACACAACTTCTTGTTTTTATCCATGCATATCATGATGAGATGCTTGGCAGCTAAAGAGCA
GCCGAAAATGTTTTTAGATGGAAGAAGTATACCAAGCTGAAACAATAGGTGTCTTTAACT
CAAACGAAACATCTTAAAAAACTACAATTGGTCCCTCAAAGTTTCAACCTTGAAAGCCTT
TAGTTTATCCTCTGAACCATAGCCACAAGATGCTTCAAATTTTATTGATGGGTATGAAAA
TCAAATTTAAGGGTTGTCTTCTTGACCGTAGTTGTACACAATCTCAATCCCAGCAGGCGG
AGTAGGGTTTCTACAGAACTTTGAGCCACCAGGAGCCCATGGAACGATATGAGGATCAGG
GTGCCGCCACTTGTCGTACTCTGCTTCACCGTGAGCGATCAGTTTGTCGATTCTGTCAAC
ATCCTCCACATCCTGGTTGGCATTGAACTTCTCGCGCAAATCAAAAGCGTCGCGGTAGAA
AATGTGGCGATGAACAGCCCAGTTCAAAGTGTCCTTAAGGGCACGTCGATAGAGGATTCG
AACCCTTTCCTTCTGCGCCGCTCTCCGCGCGAAATACGCCGCCGTTGAAACTCCGCTCAT
TTTTTTCTGATTTTCCGATTGGTTTCGAGTCTCCTCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1F633TF C 1
AF RS1F633JQ U 5
BS 1 4 RS1F633TF
BS 5 697 RS1F633JQ

RD RS1F633TF 697 0 0
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CAAACGAAACATCTTAGAAAACTACAATTGGTCCCTCAAAGTTTCAACCTTGAAAGCCTT
TAGTTTATCCTCTGAACCATAGCCACAAGATGCTTCAAATTTTATTGATGGGTATGAAAA
TCAGATTTAAGGGTTGTCTTCTTGACCGTAGTTGTACACAATCTCAATCCCAGCAGGCGG
AGTAGGGTTTCTACAGAACTTTGAGCCACCAGGAGCCCATGGAACGATATGAGGATCAGG
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AACCCTTTCCTTCTGCGCCGCTCTCCGCGCGAAATACGCCGCCGTTGAAACTCCGCTCAT
TTTTTTCTGATTTTCCGATTGGTTTCGAGTCTCCTCC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RS1F633JQ 693 0 0
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AACTTCTTGTTTTTATCCATGCATATCATGATGAGATGCTTGGCAGCTAAAGAGCAGCCG
AAAATGTTTTTAGATGGAAGAAGTATACCAAGCTGAAACAATAGGTGTCTTTAACTCAAA
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TTATCCTCTGAACCATAGCCACAAGATGCTTCAAATTTTATTGATGGGTATGAAAATCAA
ATTTAAGGGTTGTCTTCTTGACCGTAGTTGTACACAATCTCAATCCCAGCAGGCGGAGTA
GGGTTTCTACAGAACTTTGAGCCACCAGGAGCCCATGGAACGATATGAGGATCAGGGTGC
CGCCACTTGTCGTACTCTGCTTCACCGTGAGCGATCAGTTTGTCGATTCTGTCAACATCC
TCCACATCCTGGTTGGCATTGAACTTCTCGCGCAAATCAAAAGCGTCGCGGTAGAAAATG
TGGCGATGAACAGCCCAGTTCAAAGTGTCCTTAAGGGCACGTCGATAGAGGATTCGAACC
CTTTCCTTCTGCGCCGCTCTCCGCGCGAAATACGCCGCCGTTGAAACTCCGCTCATTTTT
TTCTGATTTTCCGATTGGTTTCGAGTCTCCTCC

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

CO CL3061Contig1 1093 2 4 U
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CTTGGTGGGAGGCAACCCACTGGTAAGTGTAAATATAACTTGGTTTTGTTTTTGTTTGCT
TATTTTCGTTTTAGTTTTTTGAGTTTCAGGTCAAAAAGCAGAAAAATTCGAGATACTTCG
AAAAATTCTGGGTTGCAGAAACAGAGCTCCCTGTTCTGCAGGAGCCAAGAACAACCGCCC
AGGTGAAAATCTGGCGACAGAACACCCAGAATTTTTCGGAGCACCCGCTCCAGGTAAGTA
TCTCGACCAAAAAAAAATTTTGTAAATTCTTGTTTTCACCTTCTCTCTGATTTATTTTCA
CACCGAGACGTTGTGAAGTAAGTCTGGGGGAGGGTCTTCGTCGTTTACTAACTCGTTTCT
TTCTTTTGTTTTTCTCTTGAGTCAGTTTGAGTCAATGTTTTTAGGATCGAGTCAGTCAAA
GTTTTGTGGGAATTAGGACTTTATTCTGTGTTGATCACTAACCACCTCGTGCTTTAGTTG
TCTTATTCAGTGACCTTAGCAGTGGCGGAAGACACACATGTGGACCCAGAACACCCTGAC
ATATCTCACTTGATTCTCCAGAAGTTCTCAGCCGATCACGTTACACTGGGTAGACTTAAC
TCCAAATAACTTGAACCTAATCTTGACTGAAATTCTTCTTGTTATGGGCACTAGATCAGG
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GCTAGCTCATCTTTAGCTAGTTCCCACCCTGAACCTTAGCCTTTATTCCACCTTCATGCA
TTTGTTTTTCAGTGTTATATGTGCAGATATGTGCAAAAAGGTCGGAGAGGAAAGGATCGA
CGCAGCCTCTTACTCGTTACTGCTGTGCAGATTCAGTCAAAAGGAGAACAAGCAGATTAA
GGGAGCAACCGCTCCATAACCAATGAGCTGTGCAAGAACATGGGTGGAGAACCAGAATGA
TTTGAACCAGAAGAACCACCAGTGACAATCCAAACATCACATGTTACCTCCTTCTTCGTC
ACCCCAGCATCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DT53TF U 1
AF RS1DT53JQ C 356
BS 1 720 RS1DT53TF
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RD RS1DT53TF 757 0 0
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AGGTGAAAATCTGGCGACAGAACACCCAGAATTTTTCGGAGCACCCGCTCCAGGTAAGTA
TCTCGACCAAAAAAAAATTTTGTAAATTCTTGTTTTCACCTTCTCTCTGATTTATTTTCA
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TCTTATTCAGTGACCTTAGCAGTGGCGGAAGACACACATGTGGACCCAGAACACCCTGAC
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TCCAAATAACTTGAACCTAATCTTGACTGAAATTCTTCTTGTTATGGGCACTAGATCAGG
*AAACGAGAACTACACTCAG
ACTTCTATCTTCTATCC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RS1DT53JQ 738 0 0
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TTTCTTTCTTTTGTTTTTCTCTTGAGTCAGTTTGAGTCAATGTTTTTAGGATCGAGTCAG
TCAAAGTTTTGTGGGAATTAGGACTTTATTCTGTGTTGATCACTAACCACCTCGTGCTTT
AGTTGTCTTATTCAGTGACCTTAGCAGTGGCGGAAGACACACATGTGGACCCAGAACACC
CTGACATATCTCACTTGATTCTCCAGAAGTTCTCAGCCGATCAGGTTACACTGGGTAGAC
TTAACTCCAAATAACTTGAACCTAATCTTGACTGAAATTCTTCTTGTTATGGGCACTAGA
TCAGGGAAACGAGAACTACACTCAGGACTTCTTATTCTTTCTATCCATCTTGTTGTTCCT
GAGTGGCTAGCTCATCTTTAGCTAGTTCCCACCCTGAACCTTAGCCTTTATTCCACCTTC
ATGCATTTGTTTTTCAGTGTTATATGTGCAGATATGTGCAAAAAGGTCGGAGAGGAAAGG
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ATTAAGGGAGCAACCGCTCCATAACCAATGAGCTGTGCAAGAACATGGGTGGAGAACCAG
AATGATTTGAACCAGAAGAACCACCAGTGACAATCCAAACATCACATGTTACCTCCTTCT
TCGTCACCCCAGCATCTC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 2 4

CO CL3062Contig1 745 2 8 U
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CGATGTTGCTTTCGGAGGAGACGAACGTCGTGACGGAGATGATCAAAGGGACGAGAGACC
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ATCGGTGTCATCGCCACATGGTCGACGCCAAAATCCAGAGGAGAATCAATGGGAGAAGAA
GGGAGAAAGGATGTCCACAAGACATTCACATCAGGAAGAGAATGAGTATGCTGCTCAAGT
AACCGAGCAACAAGACTCCTCGGAGAGCCAGAAAGAAGACAACGACGGTTGGGAAACCGT
GGGGAAAAAGAAACCTGCAAGACAATCTCACAAGGTCAAGAAGGAGCAGTGGCAAGGCTA
CAAATGCCCAGCGAGCGAACAACACTACTCAGACGACTCTGAAACACACGGAGACCTAGA
GCCCTCACAGCTAGAGCTCTCAGGTCTCTCAGAAGCTTGCAACAAACTCTGGGAGCTCGA
CTCAAACCGCCTCGTCCCCGGAAACGATTACCAGATCGACTGCGGAGACGGGAAAAGAGT
CCACGAGAGATCAGACATGGCTGAAGGGCTACTCTTCTCTTGGGTGAGCGACGAGGTCTT
CAGAAAACCGACTTTCGCTAGGTTCTGCTCGTTGCTCGACAACTACAACCCGCACGAAGT
TACAAAGAAGTCGTCACCCAAGAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DC34TF U 1
AF RS1AZ42TF U 33
BS 1 49 RS1DC34TF
BS 50 50 RS1AZ42TF
BS 51 152 RS1DC34TF
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BS 709 717 RS1DC34TF
BS 718 745 RS1AZ42TF

RD RS1DC34TF 717 0 0
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CAGAAAACCGACTTTCGCTAGGTTCTGCTCGTTGCTCGACAACTACA*CCCGCACGA

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1AZ42TF 713 0 0
GG
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GAAGACAACGACGGTTGGGAAACCGTGGGGAAAAAGAAACCTGCAAGACAATCTCACAAG
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CTCGACAACTACAACCCGCACGAAGTTACAAAGAAGTCGTCACCCAAGAAG

QA 3 713 3 713
DS 



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AAAAGATATGGAAGGATTAATCAAAGGTTTAGCCGATGTTGCTTTCGGAGGAGACGAACG
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BQ
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AF RS1H214TF U 1
AF RS1CV23TF U 43
BS 1 447 RS1H214TF
BS 448 448 RS1CV23TF
BS 449 655 RS1H214TF
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RD RS1H214TF 655 0 0
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AAAAGATATGGAAGGATTAATCAAAGGTTTAGCCGATGTTGCTTTCGGAGGAGACGAACG
TCGCGGAGGAGATGATCAAAGGGACGAGAGACCCCGATCCACTTGGGCTAATGTGGTTTC
TGGTGAGGACGATGATCATAACCGCGCGGGAGGATCGGTGCCATCGCCGCATGATCGACG
CCAAAATCCAGAGGAGAATCAATGGGAGAAGAAGGGAGAAAGGATGTCCACAAGACATTC
ACATCAGGAAGAGAATGAGAATGCTGCTCAAGTAACCGAGCAACAAGACTCCTCGGAGAG
CCAGAAACAAGACAACGACGGTTGGGAAACCGTGGGGAAAAAGAAACCTTCAAGACAATC
ACATAAGGTCAAGAAGGAGCAGTGGCA*GGCTACAAATGCCCAGCGAGTGAACAACACTA
CTCAGACGACTCTGAAACACAAGGAGACCTAGAGCCCTCACAGCTAGAGCTCTCAGGTCT
CTCAGAAGCTTGCAACAAACTCTGGGAGCTCGACTCGAACCGCCTCGTCCCCGGAAACGA
TTACCAGATCGACTGCGGAGATGGGAAAAGAGTCCACGAGAGATCAGACATGGCT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1CV23TF 676 0 0
GGATC
TTGAGAGCAGTAGAAAAGATATGGAAGGATTAATCAAAGGTTTAGCCGATGTTGCTTTCG
GAGGAGACGAACGTCGCGGAGGAGATGATCAAAGGGACGAGAGACCCCGATCCACTTGGG
CTAATGTGGTTTCTGGTGAGGACGATGATCATAACCGCGCGGGAGGATCGGTGCCATCGC
CGCATGATCGACGCCAAAATCCAGAGGAGAATCAATGGGAGAAGAAGGGAGAAAGGATGT
CCACAAGACATTCACATCAGGAAGAGAATGAGAATGCTGCTCAAGTAACCGAGCAACAAG
ACTCCTCGGAGAGCCAGAAAGAAGACAACGACGGTTGGGAAACCGTGGGGAAAAAGAAAC
CTTCAAGACAATCACATAAGGTCAAGAAGGAGCAGTGGCAAGGCTACAAATGCCCAGCGA
GTGAACAACACTACTCAGACGACTCTGAAACACAAGGAGACCTAGAGCCCTCACAGCTAG
AGCTCTCAGGTCTCTCAGAAGCTTGCAACAAACTCTGGGAGCTCGACTCGAACCGCCTCG
TCCCCGGAAACGATTACCAGATCGACTGCGGAGATGGGAAAAGAGTCCACGAGAGATCAG
ACATGGCTGAAGGGTTACTCTTCTCTTGGGTGAGCGACGAGGTCTTCAGAAAACCGACGT
TCGCTAGGTTC

QA 6 676 6 676
DS 



AS 1 3

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AAAATAAATCATTTTTAACTGGCAACATATACGACTCCATAATCACTAAAACTCAACAAA
AAAAGAAAGAGGTTTTGAACAAGAAAGCAGAGATAATGCTTCTCCCAGAGGCCAAAGCTT
TCGTCTCAAAAAGCTCAAGCCTGTAAAACGTAGAACAATATCAAATGACTAAAACTCAAC
AAAAAAAGAAAGAGGTTTTGAACAAGAAAGCAGAAATAATGCTTCTCCCAGAGGCCAAAG
CTTTCTTCTCAAAAAGCTCAAGCTTTGTTAGCAATGTTGTTGGAGAGCCAGTCCAGACCT
TCGTACAGTCCCTCACCGGTGGTGGCGCACGTGCTCTGGATGTACCAATGACGCTGCCTG
AGAGAGTGGAGTCCAAGCTTATCGATAATCTCAGCAGCATTCATCGCATTTGGAAGATCC
TGCTTGTTAGCAAACACAAGTAGTACTGCATCACGAAGCTCATCCTCGTTTAACATCCTG
TGAAGTTCATCTCTTGCTTCAACAACACGATCTCTGTCATTGCTATCAACCACGAAGATC
AGACCTTGAGTGTTCTGGAAGTAGTGCCTCCACAAGGGACGGATCTTGTCTTGACCCCCG
ACATCCCAGACAGTGAAGCTGCTGTTTTTGTATTCAACTGTTTCCACATTAAACCCAATG
GTGGGGATGGTGGTAACGATCTCACCAAGCTTGAGCTTGTAAAGAATGGTGGTCTTACCA
GCAGCATCAAGACCAACCATAAGGATACGCATCTCCTTCTTCGCAAATAGTCTGCTGAAA
AGCTTCGCAAATGATAGCCCCAATTTTCACTTCACCTGCTGATCCTTTTCTAGCTTGATG
CGAAAATATCTGTCC


BQ
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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0 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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CGAAA

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BQ
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GTTTGGGGTCAGTAAAC

QA 1 677 1 677
DS 

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G
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ATAAGTACAATACACAACGCAAGTACACTTACGATCAATTTGCTGATTCCCTCATTCGAC
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AACTTAATTGTCCCTTTATTTAACAAGGAAAATTTGTTTCATTCAAAAAAAAACTCTTAA
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QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 3

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AATAAAATGTGACTCGGTCTTTGTTTAAAATAGCTGAAAATAACAATCATAAACAGTTGG
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TTCAACCAAGGCTCTGTCTTCAGGTACTCTCCCACAATTGAAACTGCATCCACCAATGTT
TGTTTCTCATCTTGAGCTGCATAGTTCTTGTCCAATGCCGGTAGAGTCTTCTTTAAACAG
CGCACCTTACAAGTTAACCAAGCTAAAACTTTCGAGTTATCAAGGCGATAGAACTTCATA
GATCCAACCTCTTGAGTTTGACAAACGATCTCCATACACTTCTCTGCAAGTGACAACAGA
TGTTGATAGTCAGGATATCCTTCCACAAATAAAATCTCATCCAGTTGCCTGAACTTCCCA
GGATCATCACCTTTCTTCATTCTTGCTTGGTCGAAAACAGGTAACAAGATGAAAACAGGA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EB66JQ U 1
AF RS1BD08JQ U 58
AF RS1EB66TF C 665
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RD RS1EB66JQ 743 0 0
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CCAGTCTCTACCTTTGCTTGCTTTGTCTGTTTCCCAGGCTTGCCTGTCTTCTTGTTTGCT
TTCTCCTGTGATGAATTTGAGTAGTCCATCTTATTCTCAATTGCATTTGGAAAGGTCTCC
GTATTGGTTTCTTTCGTTACTGGGTCAACAAACTCGAGTCCGAAATGATCATACAGAAGC
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GGATCATCACCTTTCTTCATTCTTGCTTGGTCGAAAACAGGTAACAAGATGAAAACAGGA
TCAACCGGTGTGGCCATATATAA

QA 1 743 1 743
DS 

RD RS1BD08JQ 772 0 0
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TGGATAGTATTTCAGCACTTTTTCTTACAAGCCCTTGAAAACATATCCCTTATGTTCTTT
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GCTTTCTCCTGTGATGAATTTGAGTAGTCCA*CTTATTCTCAATTGCATTTGGAAAGGTC
TCCGTATTGGTTTCTTTCGTTACTGGGTCAACAAACTCAAGTCCGAGATGATCATACAGA
AGCTTCAACCAAGGCTCTGTCTTCAGGTACTCTCCCACAATTGAAACTGCATCCACCAAT
GTTTGTTTCTCATCTTGAGCTGCATAGTTCTTGTCCAATGCCGGTAGAGTCTTCTTTAAA
CAGCGCACCTTACAAGTTAACCAAGCTAAAACTTTCGAGTTATCAAGGCGATAGAACTTC
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GGATCAACCGGTGTGGCCATATATAAGCTTCCATCTTGAGAAATGTAATCTCCCAGGAAC
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QA 1 772 1 772
DS 

RD RS1EB66TF 443 0 0
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CCGGTGTGGCCATATATAAGCTTCCATCTTGAGAAATGTAATCTCCCAGGAACCAAGAAC
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TTCCATTTTCTGATTTTGGATGGCGAAGTGTTAATAGTTCTCCAGGTTTGCCTCCACCAC
ATCCTGAATCTGGGGCAATGAGAACTCGTGTCTTCTCAACTCCTTCCCACCAAACAGTAG
AACTCATCTTCAAGCTTAAGTAAACTGGAAGTCTACGACTTTTAGATGGTACACCAGTGA
TGAAGAAGGTGAGCAACTAGTGAGGTAAATGAATCAGGACGAAGTTTCTGAAAGACATTT
CATCGAACAGTTGGTTACAAAAA

QA 1 443 1 443
DS 



AS 1 4

CO CL3066Contig1 1221 4 8 U
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CGTTACAAATTTTCTCAAGACAAAAATCACTTAGAAAAGAGCTAAAGCGATCCACCTACC
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GTTGAACTTCTTTCTTGAGGAACAAGCATTTCTTCTTATAGAAATGAGTTTGAAAAAATG
AAGTAGACATTCTCGTATAAAAGACTTTTAGGGTTTCTCTGTTTTCTCCAATACAAACAC
ATTCCCTTTTCCATCTCTCCCTACTTGTAAATCTTCGTCTAAATATGAGATCTCAAATAG
TCCTTCAGGGTTGAAGATTCCCAGCAGAAGATTCATGTTCTTCTTGAAAATATTCATCAA
CTGATCTGGCATGATTGTTGAGCTTTCATAAGTAATCTCAACACTCGTTTTAGATATGAT
CTTGAAGTTGGCGACGATTCTAAACTCGCCGTCGCGTAGATTCAATCCACGGACATCGAA
TTTCAACACATGGACTGTTTTGCCCTGAGCAATGTCGATCTGTTGAAGAAGATCTCCGAG
AGAGACGAAGTCTCGAAGACCCAACTTGGTTCTTTTGGAGCCCAACACAGTGATTGTGCT
GTAAATGAGTTTCCAGCAACCTCCGATCTTGTCTAACTCCCCGGTCGGCTCCGGCGTCGG
ATTCCGACATTCTAATAGTTTCACCAGACGCTCGATCTCTGTTTTTTTATCCGATTTAAC
TCCGAAGACCCCTCTATTGATCCCTTGGAGAGCTTCGTAGAGCTCTTCTTTAATCTGTGG
AACAGTAATATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCATCTACTTGTTATTCGTTTGGGGAGGAAGC
AGAGCTCTGTTCTGTGACTTTTCCGATGAACATGGGCCTGAGACGAAACGGGTTGTCACT
AAAACTCAGCGTTTTGCTATTGAAATCGCTGAAAGAGAGTAACATCTTCGCGTTTCCTGT
TCTTCTTGGGATTGCTTCTCGTGAAGCTGCCATTGGTGGTGGTGGCTGGATAAGCTTACT
CGACATTGCCAGATGTCACAAAGTCGGCAGCGAACCAAATGAAACTTGAGAACGAATAAG
AAGAAGAAGGTAAGAGATTTTGATAGTTGGGGGAGAGTGAATTTTTTATGGGGAGGAGAA
TCGACAGTTTTGGTTCATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AL48JQ U 14
AF RS1EB62JQ U 1
AF RS1AL48TF C 510
AF RS1EB62TF C 514
BS 1 153 RS1EB62JQ
BS 154 154 RS1AL48JQ
BS 155 767 RS1EB62JQ
BS 768 768 RS1AL48TF
BS 769 788 RS1EB62JQ
BS 789 881 RS1AL48TF
BS 882 882 RS1EB62TF
BS 883 1221 RS1AL48TF

RD RS1AL48JQ 704 0 0
CCAATTACTTGTACAGTATTATTGAGCTATCAATTTTTTCAATACATCGTTACAAATTTT
CTCAAGACAAAAATCACTTAGAAAAGAGCTAAAGCGATCCACCTACCCTAAATAATATGA
AAGAACATGTAAATGTCTCAACAGAAAATAACAAAACAAAAGAAAACGTTGAACTTCTTT
CTTGAGGAACAAGCATTTCTTCTTATAGAAATGAGTTTGAAAAAATGGAGTAGACATTCT
CGTATAAAAGACTTTTAGGGTTTCTCTGTTTTCTCCAATACAAACACATTCCCTTTTCCA
TCTCTCCCTACTTGTAAATCTTCGTCTAAATATGAGATCTCAAATAGTCCTTCAGGGTTG
AAGATTCCCAGCAGAAGATTCATGTTCTTCTTGAAAATATTCATCAACTGATCTGGCATG
ATTGTTGAGCTTTCATAAGTAATCTCAACACTCGTTTTAGATATGATCTTGAAGTTGGCG
ACGATTCTAAACTCGCCGTCGCGTAGATTCAATCCACGGACATCGAATTTCAACACATGG
ACTGTTTTGCCCTGAGCAATGTCGATCTGTTGAAGAAGATCTCCGAGAGAGACGAAGTCT
CGAAGACCCAACTTGGTTCTTTTGGAGCCCAACACAGTGATTGTGCTGTAAATGAGTTTC
CAGCAACCTCCGATCTTGTCTAACTCCCCGGTCGGCTCCGGCGT

QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1EB62JQ 788 0 0
GAATAAGATCAATCCAATTACTTGTACAGTATTATTGAGCTATCAATTTTTTCAATACAT
CGTTACAAATTTTCTCAAGACAAAAATCACTTAGAAAAGAGCTAAAGCGATCCACCTACC
CTAAATAATATGAAAGAACATGTAAATGTCTCAGCAGAAAATAACAAAACAAAAGAAAAC
GTTGAACTTCTTTCTTGAGGAACAAGCATTTCTTCTTATAGAAATGAGTTTGAAAAAATG
AAGTAGACATTCTCGTATAAAAGACTTTTAGGGTTTCTCTGTTTTCTCCAATACAAACAC
ATTCCCTTTTCCATCTCTCCCTACTTGTAAATCTTCGTCTAAATATGAGATCTCAAATAG
TCCTTCAGGGTTGAAGATTCCCAGCAGAAGATTCATGTTCTTCTTGAAAATATTCATCAA
CTGATCTGGCATGATTGTTGAGCTTTCATAAGTAATCTCAACACTCGTTTTAGATATGAT
CTTGAAGTTGGCGACGATTCTAAACTCGCCGTCGCGTAGATTCAATCCACGGACATCGAA
TTTCAACACATGGACTGTTTTGCCCTGAGCAATGTCGATCTGTTGAAGAAGATCTCCGAG
AGAGACGAAGTCTCGAAGACCCAACTTGGTTCTTTTGGAGCCCAACACAGTGATTGTGCT
GTAAATGAGTTTCCAGCAACCTCCGATCTTGTCTAACTCCCCGGTCGGCTCCGGCGTCGG
ATTCCGACATTCTAATAGTTTCACCAGACGCTCGATCTCTGTTTTTT*ATCCGATTTAAC
TCCGAAGA

QA 1 788 1 788
DS 

RD RS1AL48TF 712 0 0
CGTC
GCGTAGATTCAATCCACGGACATCGAATTTCAACACATGGACTGTTTTGCC*TGAGCAAT
GTCGATCTGTTGAAGAAGATCTCCGAGAGAGACGAAGTCTCGAAGACCCAACTTGGTTCT
TTTGGAGCCCAACACAGTGATTGTGCTGTAAATGAGTTTCCAGCAACCTCCGATCTTGTC
TAACTCCCCGGTCGGCTCCGGCGTCGGATTCCGACATTCTAATAGTTTCACCAGACGCTC
GATCTCTGTTTTTTTATCCGATTTAACTCCGAAGACCCCTCTATTGATCCCTTGGAGAGC
TTCGTAGAGCTCTTCTTTAATCTGTGGAACAGTAATATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCATC
TACTTGTTGTTCGTTTGGGGAGGAAGCAGAGCTCTGTTCTGTGACTTTTCCGATGAACAT
GGGCCTGAGACGAAACGGGTTGTCACTAAAACTCAGCGTTTTGCTATTGAAATCGCTGAA
AGAGAGTAACATCTTCGCGTTTCCTGTTCTTCTTGGGATTGCTTCTCGTGAAGCTGCCAT
TGGTGGTGGTGGCTGGATAAGCTTACTCGACATTGCCAGATGTCACAAAGTCGGCAGCGA
ACCAAATGAAACTTGAGAACGAATAAGAAGAAGAAGGTAAGAGATTTTGATAGTTGGGGG
AGAGTGAATTTTTTATGGGGAGGAGAATCGACAGTTTTGGTTCATTCC

QA 5 712 5 712
DS 

RD RS1EB62TF 691 0 0
GCGTAGATTCAATCCACGGACATCGAATTTCAACACATGGACTGTTT*GCC*TGAGCAAT
GTCGATCTGTTGAAGAAGATCTCCGAGAGAGACGAAGTCTCGAAGACCCAACTTGGTTCT
TTTGGAGCCCAACACAGTGATTGTGCTGTAAATGAGTTTCCAGCAACCTCCGATCTTGTC
TAACTCCCCGGTCGGCTCCGGCGTCGGATTCCGACATTCTAATAGTTTCACCAGACGCTC
GATCTCTGTTTTTTTATCCGATTTAACTCCGAAGACCCCTCTATTGATCCCTTGGAGAGC
TTCGTAGAGCTCTTCTTTAATCTGTGGAACAGTAATATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCATC
TACTTGTTATTCGTTTGGGGAGGAAGCAGAGCTCTGTTCTGTGACTTTTCCGATGAACAT
GGGCCTGAGACGAAACGGGTTGTCACTAAAACTCAGCGTTTTGCTATTGAAATCGCTGAA
AGAGAGTAACATCTTCGCGTTTCCTGTTCTTCTTGGGATTGCTTCTCGTGAAGCTGCCAT
TGGTGGTGGTGGCTGGATAAGCTTACTCGACATTGCCAGATGTCACAAAGTCGGCAGCGA
ACCAAATGAAACTTGAGAACGAATAAGAAGAAGAAGGTAAGAGATTTTGATAGTTGGGGG
AGAGTGAATTTTTTATGGGGAGGAGAATC
CC

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 4

CO CL3067Contig1 565 4 3 U
GGAAAAACACACAACCAAAAACCAGATAATAACATGAGATCTCTCTTCATACTAGCCTTG
TTCCTACTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGACTTGCAACAACGTGGTTAGT
GATCTTTACCCTTGCCTCTCCTACGTGATGCAAGGCGGAAAAGTCCCACCAGCTAACTGC
TGCAGCGGTGTCAGAACGCTCAACAGTCAGGCTCAAACCTCTGTGGACCGTCGGAGCGTG
TGCCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTCGTCTAGCAACCTCAACAAT
GCTCTGTCTTTGCCTGCTAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCAGGATCAGCCCTTCCACC
AACTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATCCTAAAGGAAGCTACTACTACTACT
ATTACTGCAAGAACTTAAAACATATGGCTTGGTAGTAACTATGCTGATCAGTTGATGTAT
CTTCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAATAAAAATTATCAACATGCTATGATATCAGAC
CAAAAATATAATCTTTCTTACATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BA37TF U 1
AF RS1CY50JQ C 225
AF RS1CY50TF U 225
AF RS1BE63TF U 273
BS 1 510 RS1BA37TF
BS 511 530 RS1CY50TF
BS 531 565 RS1BE63TF

RD RS1BA37TF 510 0 0
GGAAAAACACACAACCAAAAACCAGATAATAACATGAGATCTCTCTTCATACTAGCCTTG
TTCCTACTTCTTGCTTTTCACCATGGTGAAGCAGCCGTGACTTGCAACAACGTGGTTAGT
GATCTTTACCCTTGCCTCTCCTACGTGATGCAAGGCGGAAAAGTCCCACCAGCTAACTGC
TGCAGCGGTGTCAGAACGCTCAACAGTCAGGCTCAAACCTCTGTGGACCGTCGGAGCGTG
TGCCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTCGTCTAGCAACCTCAACAAT
GCTCTGTCTTTGCCTGCTAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCAGGATCAGCCCTTCCACC
AACTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATCCTAAAGGAAGCTACTACTACTACT
ATTACTGCAAGAACTTAAAACATATGGCTTGGTAGTAACTATGCTGATCAGTTGATGTAT
CTTCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAAT

QA 1 510 1 510
DS 

RD RS1CY50JQ 307 0 0
GGACCGTCGGAGCGTGTGCCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTCGTC
TAGCAACCTCAACAATGCTCTGTCTTTGCCTGCTAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCAG
GATCAGCCCTTCCACCAACTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATCCTAAAGGA
AGCTACTACTACTACTATTACTGCAAGAACTTAAAACATATGGCTTGGTAGTAACTATGC
TGATCAGTTGATGTATCTTCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAATAAAAATTATCAACA
TGCTAT
C

QA 1 306 1 306
DS 

RD RS1CY50TF 307 0 0
GGACCGTCGGAGCGTGTGCCGTTGCATCAAAAATGCGATTGGAGGAGCCTCTTACTCGTC
TAGCAACCTCAACAATGCTCTGTCTTTGCCTGCTAAGTGTGGTGTTAATCTCCCTTTCAG
GATCAGCCCTTCCACCAACTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAGATCCTAAAGGA
AGCTACTACTACTACTATTACTGCAAGAACTTAAAACATATGGCTTGGTAGTAACTATGC
TGATCAGTTGATGTATCTTCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAATAAAAATTATCAACA
TGCTAT
C

QA 1 306 1 306
DS 

RD RS1BE63TF 293 0 0
G
TCTTACTCGTCTAGCAACCTCAACAATGCTCTGTCTTTGCCTGCTAAGTGTGGTGTTAAT
CTCCCTTTCAGGATCAGCCCTTCCACCAACTGCGACAGTATCAATTGAGATAAGCAGAAG
ATCCTAAAGGAAGCTACTACTACTACTATTACTGCAAGAACTTAAAACATATGGCTTGGT
AGTAACTATGCTGATCAGTTGATGTATCTTCACGTCTATTTTCTTCAAAGTTCTAATAAA
AATTATCAACATGCTATGATATCAGACCAAAAATATAATCTTTCTTACATCT

QA 2 293 2 293
DS 



AS 1 4

CO CL3068Contig1 962 4 6 U
GGAATCGTCTTCTCCAGTGACAGATGGAGCTGGTGAAGCATCAGTGCTCGTGCACGTCAT
GCCTGTGCTTTGAATCGATAAAGCATCACAGCTCGAACCCTCTGAGGGTGATGATTTTTG
ATGAAGACTCCAATACATCATACTTGCCGTTAAGATCAATATCATCTTTTGATTCACCTG
CATTGAATTTCCACAAATTAGAGACATAAGAAAACCTCAGGGACTAGTTTACATATCGTT
TCATAAGATTTAGATGAATGTGTCCTACCTCCACGATATCTTCGGGTAACAAGAAAGTCG
AGCAACCAATCTTTCTTGCTACACTGACAATGTATGAAGCATTCAGTCTCTTCTCGTCGT
CTTTAAAATGTTTCAGTAACCAAAAAAAAACGGTTAATTAAGTAAGCAGGAAAGATAGAG
AGTGAAGGGGGTAAGCTTTGTTAAAGAGAGTAGTGGGACCTGCTTGACCCTTGGTGACAA
GATTCCAGTTAACAACTCTTGGCTCAACCGCCCATAGAAGATCTAGGAAGAATAATCCGC
TAGATACACTCTTATCCTATTGAAGTACATCAAGAGAGTTTTTATCCAACATATGTCATA
TGTGACTGCAATTCAGTGGATTTTTACTTTTAGTTTTAATTTAATATATTTCTATTAATT
TTTCAAAAGATTACAGTATTTCCCAATAGATTACAACATATGTGACTTCAGTGGATATTT
TTAGATTTGGTGAAGTGGAAGTAATAAAAGATACCTTGAAGCTTTCAAGGTTTGATTTCC
TGCCCATGATTCTGACTTTCCTGTTTGCCCAGCTCAGGATTTCTAAGTCAGTCACGTCAT
TGCCTCGCGTCCGAGATCGAAGATTGTTGAGAAGTTGGAGCATTTGGGTTCTCATCAACT
GCCACAGGAAGCCTGAGACATGTGTATATATTATACACCTACACTGTTATAAAATTACTA
GG


BQ
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15 15 

AF RS1GH77TF U 1
AF RS1E574TF U 1
AF RS1E574JQ C 119
AF RS1GH77JQ C 298
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GCCTGTGCTTTGAATCGATAAAGCATCACAGCTCGAACCCTCTGAGGGTGATGATTTTTG
ATGAAGACTCCAATACATCATACTTGCCGTTAAGATCAATATCATCTTTTGATTCACCTG
CATTGAATTTCCACAAATTAGAGACATAAGAAAACCTCAGGGACTAGTTTACATATCGTT
TCATAAGATTTAGATGAATGTGTCCTACCTCCACGATATCTTCGGGTAACAAGAAAGTCG
AGCAACCAATCTTTCTTGCTACACTGACAATGTATGAAGCATTCAGTCTCTTCTCGTCGT
CTTTAAAATGTTTCAGTAACCAAAAAAAAACGGTTAATTAAGTAAGCAGGAAAGATAGAG
AGTGAAGGGGGTAAGCTTTGTTAAAGAGAGTAGTGGGACCTGCTTGACCCTTGGTGACAA
GATTCCAGTTAACAACTCTTGGCTCAACCGCCCATAGAAGATCTAGGAAGAATAATCCGC
TAGATACACTCTTATCCTATTGAAGTACATCAAGAGAGTTTTTATCCAACATATGTCATA
TGTGACTGCAATTCAGTGGATTTTTACTTTTAGTTTTAATTTAATATATTTCTATTAATT
TTTCAAAAGATTACAGTATTTCCCAATAGATTACAACATATGTGACTTCAGTGGATATTT
T*AGATTTGGTGAAGTGGAAGTA*TAAAAGATACCTTGAAGCTTT

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DS 

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TGCATTGAATTTCCACAAATTAGAGACATAAGAAAACCTCAGGGACTAGTTTACATATCG
TTTCATAAGATTTAGATGAATGTGTCCTACCTCCACGATATCTTCGGGTAACAAGAAAGT
CGAGCAACCAATCTTTCTTGCTACACTGACAATGTATGAAGCATTCAGTCTCTTCTCGTC
GTCTTTAAAATGTTTCAGTAACCAAAAAAAAACGGTTAATTAAGTAAGCAGGAAAGATAG
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AAGATTCCAGTTAACAACTCTTGGCTCAACCGCCCATAGAAGATCTAGGAAGAATAATCC
GCTAGATACACTCTTATCCTATTGAAGTACATCAAGAGAGTTTTTATCCAACATATGTCA
TATGTGACTGCAATTCAGTGGATTTTTACTTTTAGTTTTAATTTAATATATTTCTATTAA
TTTTTCAAAAGATTACAGTATTTCCCAATAGATTACAACATATGTGACTTCAGTGGATAT
TTTTAGATTTGGTGAAGTGGAAGTAATAAAAGATACCTTGAAGCTTTCAAGGTTTGATTT
CCTGCCCATGATTCTGACTTTCCTGTTTGCCCAGCTCAGGATTTCTAAGTCAGTCACGTC
ATTGCCTCGCGTCCGAGATCGAAGATTGTTGAGAAGTTGGAGCATTTGGGTTCTCATCAA
CTGCCACAGGAAGCCTGAGACATGTGTATATATTATACACCTACACTGTTATAAAATTAC
TAGG

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DS 

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CGTCTTTAAAATGTTTCAGTAACCAAAAAAAAACGGTTAATTAAGTAAGCAGGAAAGATA
GAGAGTGAAGGGGGTAAGCTTTGTTAAAGAGAGTAGTGGGACCTGCTTGACCCTTGGTGA
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CGCTAGATACACTCTTATCCTATTGAAGTACATCAAGAGAGTTTTTATCCAACATATGTC
ATATGTGACTGCAATTCAGTGGATTTTTACTTTTAGTTTTAATTTAATATATTTCTATTA
ATTTTTCAAAAGATTACAGTATTTCCCAATAGATTACAACATATGTGACTTCAGTGGATA
TTTTTAGATTTGGTGAAGTGGAAGTAATAAAAGATACCTTGAAGCTTTCAAGGTTTGATT
TCCTGCCCATGATTCTGACTTTCCTGTTTGCCCAGCTCAGGATTTCTAAGTCAGTCACGT
CATTGCCTCGCGTCCGAGATCGAAGATTGTTGAGAAGTTGGAGCATTTGGGTTCTCATCA
ACTGCCACAGGAAGCCTGAGACATGTGTATATATTATACACCTACACTGTTATAAAATTA
CTAGG

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 4

CO CL3069Contig1 1411 4 2 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGATATGCGTAC
CATTTATAATCGAGCACTTCAGACTTCGAACCACAACTAAATCCCTTCTACGTTACTGGT
TCACCGGCGTGGGTTGGGCGCTTGGTTTGATAGACTTCCTCTTGCCACGACCGGAGGACA
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CGCTTCCAGCCGCTAATGACCTTAACAGAAATCTCATCGGTGCTGGAAATGTCAACACGG
GTGAGGAATATGAGGATGATGAAGAGCAATCTGATTCAGACAGGTACAACTTCGTACTCA
GGATAATCCTTCTGCTACTTGTTGCATGGGTTACTCTTCTTCTCTTCAATTCAGCATTGA
TAGTTGTACCAGTTTCTCTTGGGCGTGCTCTATTTACTGCCATCCCAATTCTCCCAATAA
CGCATGGCATCAAATGCAATGACCTGTATGCCTTCGTCATTGGCATGTATGCTTTATGGA
CTACCATATCTGGTGCCAGGTACGCCATCGAGCATGTCAAGTCAAAGAGGACTTCGGTCT
TACTTGACCAAATCTGGAAATGGTGTGGGATTGTCTTCAAGAGCTCGGTGCTGCTAGCCA
TATGGGTTTTTGTAATTCCTGTTTTAATCGGACTTCTATTTGAGCTTTTGGTAATTGTTC
CAATGAGAGTCCCAGTAGATGAAAGCCCTGTCTTCCTCCTTTATCAAGACTGGGCTCCTG
GCCTCATCTTTTTGAAGATCTGGACTAGATTGGTAATGCTGGATCATATACTTCCGATAA
TGAATGATACCTGGAGAGCGAAGTTTGAGAGAGTAAGAGAAGATGGCTTCTCAAGGCTTC
AATGGCTATGGATACTTAAAGAGATTGTATCCCCTATCGTGATGAAACTGCTAACAGCAC
TATGCGTGCCTTATGTCCTGGCGAGAGGAGTCTTCCCCATGCTCGGATATCCACTGGTTG
TGAACTCGGCGGCCTATAGGTATTCTTGGATAGGTTGTCTCTCTATGAGTCTCTTTTGCT
TCTGTGCAAAGAGATGCCATGTCTGGTTCAGAAACCTTCACAACTCCATCCGTGATGATC
GTTACCTCATTGGCCGGAGGCTCCATAACTTTGGGGAAGCTGTTTTGGCTCACCAAAACC
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CTGGACTTAGGCACAGACGTGCAATCCAAGAAGAAGCTTAGAAAGATTAGTGTTTTTGTC
AAGTGATTAAACATAAAACAGTTTCAAAAGATTTTTTTATGTTAGTCGATATGTATATAT
AAATATATATACGTTGATCCTCTTTTTTTGG


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AATCCTTCTGCTACTTGTTGCATGGGTTACTCTTCTTCTCTTCAATTCAGCATTGATAGT
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GGTT

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CATTTATAATCGAGCACTTCAGACTTCGAACCACAACTAAATCCCTTCTACGTTACTGGT
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TTTTGG

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DS 



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TATTGGAACCAATCTCTTAGCTGCTGGTACTGATGTTTCCTTCGACACCAAATCCGGCGA
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AGTGGGAACTCAGCATTCACTCACCCCTTGACCATGGTCAAGGCACGTGTGAACAGTGCC
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BQ
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15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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CAACACTGCTGTTGGAGCCGAAGTGAGCCACAAGTTCTCTAGCA
GGCC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1F944TF 725 0 0
GGGCGTTTCTCTCA
CTCTCTCTCGGGGTATCTTTTGTTCTTTGAAGTAGGAAGCAAAGCAAAAATGGTGAAAGG
TCCAGGTCTCTACACTGACATCGGCAAAAAAGTCAGAGATCTGCTGTACAAGGACCACAA
CAGCGACCACAAATTGAGTATCACCACTATCTCTCCAGCCGGTGTTGCCATCACTTCAAC
TGGAACTAAGAAAGGTGACCTCCTTT*GGGAGATGTCGCTTTTCTTTTGAAGCAAAAGAA
CATCACTACTGATTTTAGAGTTTCCACTGACAATACCGTTTTGATCACTGCTACCGTTGA
TGAGGCTGCACCTGGACTCAAGTCTATCTTCAGCTTCAGGGCCCCTGACCAAAATTCCGG
CAAGATTGAGCTTCAGTACTTGCATGACTACGCTGGTATCAGCACCAGCATGGGCTTGAC
TCAGAACCCCACTGTCAACTTCTCTGGTGTTATTGGAACCAATCTCTTAGCTGCTGGTAC
TGATGTTTCCTTCGACACCAAATCCGGCGATTTTACCAAGATCAATGCTGGTTTAAATTT
CACTAAGGATGATTTAATTGCCTCCCTTACCCTGAATGACAAAGGAGATTCTGTCAACGC
TTCGTACTACCACATTGTTAATCCCCTGTTCAACACTGCTGTTGGAGCCGAAGTGAGCCA
CAAGTTCTCTAGCAAGGCCA*CACCATAACAGTGGGAACTCAGCATTCACT

QA 15 725 15 725
DS 

RD RS1F944JQ 656 0 0
CTTAGCTGCTGGTACTGATGTTTCCTTCGACACCAAATCCGGCGATTTTACCAAGATCAA
TGCTGGTTTAAATTTCACTAAGGATGATTTAATTGCCTCCCTTACCCTGAATGACAAAGG
AGATTCTGTCAACGCTTCGTACTACCACATTGTTAATCCCCTGTTCAACACTGCTGTTGG
AGCCGAAGTGAGCCACAAGTTTTCTAGCAAGGCCAACACCATAACAGTGGGAACTCAGCA
TTCACTCACCCCTTGACCATGGTCAAGGCACGTGTGAACAGTGCCGGAATAGCCAATGCT
TTCATTCAACACCAGTGGACACCTGGGTCCTTTTTCACTATTTCTGGAGAAGTTGACACC
AAAGCTATTGACAAGAATGCTAAGGTTGGTTTGGCTCTCTCTCTCAAGCCTTGAAACTGA
TGAGCCAAACAAATCAAAGCATTTAAAATAGTTTTTTTCTTTAGACTTGGGTTCTATTTC
CTCTGCTTGGTTTGTTGGGTTTTAATGGCTATTGCTTAAAACTTTCTCCCCTTTTTCTTG
TCGGATTTGTAGAGAATAAAAAGGTTGAAAAAGATCCGTCTGTCTTGTTGACATGATGAA
ACACTAAAGATCCTTTTGAGTTCTGTTTCTATTTATTTGCTGTGCACTTTACTCC
C

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1GE27JQ 355 0 0
TCACTATCTCTGGAGAAGTTGACACCAAAGCTATTGACAA**ATGCTAAGGTTGGTTTGG
CTCTCTCTCTCAAGCCTTGAAACTGATGAGCCAAACAAATCAAAGCATTTAAAATAGTTT
TTTTCTTTAGACTTGGGTTCTATTTCCTCTGCTTGGTTTGTTGGGTTTTAATGGCTACTG
CTTAAAACTTTCTCCCCTTTTTCTTGTCGGATTTGTAGAGAATAAAAAGGTTGAAAAAGA
TCCGTCTGTCTTGTTGTCATGATGAAACACTAAAGATCCTTTTGAGTTCTGTTTCTATTT
ATTTGCTGTGCACTTTACTCCTACTCGGTTTTGTTTTCGAGACTTTCCTGGGCTT

QA 1 355 1 355
DS 



AS 1 4

CO CL3071Contig1 689 4 3 U
TTTTTTTTTCGACATAACAATGACAAAGATAGATTACATCCGCTCCCCATACTAAAACGA
TACATCATGATTTCTTAGGTACTTAGTTATTTAGTTTTATATTCCATACTAAACGTACGT
ACTTATTTAAATTTATTAATCCACGATATAATAACAATTAACAAAGAACAATAATCACTT
CATGAAACCTTGAGCCATCTTAGCATAACCTCCCAAGCCACCACCAGACTCCTCTTCGGG
CTTCTTAGCTTCCGGTTCAGCCTGACTTGCCGGAGGAGGAGCACCGGCAGCCGGGGGAGG
AGTACCGGCGGCGCCGGAGGAATGAGGACTCGAAATCGTTTAAATACTTCTCGGCCTTCT
CTATGTACTGACCAGCGCCGCTCTTCTCATCCAGCTTTCCGTATTTCTGGGCGGCATCTA
AAATATCAGCGCTGGCTCCAGCGACTTTAGCCTTGTCGAGTTTGTCTGACTCGTTACGAG
CAGCGGCTTGAGCAGCTTCGGCTACAACCTTGGCACTAGCCATGAGCTCGGAGGATGAAG
CTGGTCTGTTGGTTGTTTCGGTTCCTTCCGCGGGCTTGTTGTGGTCTGGCTCCTCTGGTT
TGGAGTCGGAGAATTTCTTTACCTGATCGGAGAGGAAGTTCATCTTTTTTTTTCTTGGTT
TGCTGAATATGATTTATTGTGGTGGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1EC94JQ U 6
AF RS1FS26JQ U 10
AF RS1EC94TF C 1
AF RS1FS26TF C 10
BS 1 9 RS1EC94TF
BS 10 607 RS1EC94JQ
BS 608 689 RS1EC94TF

RD RS1EC94JQ 602 0 0
TTTT
CGACATAACAATGACAAAGATAGATTACATCCGCTCCCCATACTAAAACGATACATCATG
ATTTCTTAGGTACTTAGTTATTTAGTTTTATATTCCATACTAAACGTACGTACTTATTTA
AATTTATTAATCCACGATATAATAACAATTAACAAAGAACAATAATCACTTCATGAAACC
TTGAGCCATCTTAGCATAACCTCCCAAGCCACCACCAGACTCCTCTTCGGGCTTCTTAGC
TTCCGGTTCAGCCTGACTTGCCGGAGGAGGAGCACCGGCAGCCGGGGGAGGAGTACCGGC
GGCGCCGGAGGAATGAGGACTCGAAATCGTTTAAATACTTCTCGGCCTTCTCTATGTACT
GACCAGCGCCGCTCTTCTCATCCAGCTTTCCGTATTTCTGGGCGGCATCTAAAATATCAG
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GAGCAGCTTCGGCTACAACCTTGGCACTAGCCATGAGCTCGGAGGATGAAGCTGGTCTGT
TGGTTGTTTCGGTTCCTTCCGCGGGCTTGTTGTGGTCTGGCTCCTCTGGTTTGGAGTC

QA 5 602 5 602
DS 

RD RS1FS26JQ 601 0 0
CGACATAACAATGACAAAGATAGATTACATCCGCTCCCCATACTAAAACGATACATCATG
ATTTCTTAGGTACTTAGTTATTTAGTTTTATATTCCATACTAAACGTACGTACTTATTTA
AATTTATTAATCCACGATATAATAACAATTAACAAAGAACAATAATCACTTCATGAAACC
TTGAGCCATCTTAGCATAACCTCCCAAGCCACCACCAGACTCCTCTTCGGGCTTCTTAGC
TTCCGGTTCAGCCTGACTTGCCGGAGGAGGAGCACCGGCAGCCGGGGGAGGAGTACCGGC
GGCGCCGGAGGAATGAGGACTCGAAATCGTTTAAATACTTCTCGGCCTTCTCTATGTACT
GACCAGCGCCGCTCTTCTCATCCAGCTTTCCGTATTTCTGGGCGGCATCTAAAATATCAG
CGCTGGCTCCAGCGACTTTAGCCTTGTCGAGTTTGTCTGACTCGTTACGAGCAGCGGCTT
GAGCAGCTTCGGCTACAACCTTGGCACTAGCCATGAGCTCGGAGGATGAAGCTGGTCTGT
TGGTTGTTTCGGTTCCTTCCGCGGGCTTGTTGTGGTCTGGCTCCTCTGGTTTGGAGTC
GGA

QA 1 598 1 598
DS 

RD RS1EC94TF 689 0 0
TTTTTTTTTCGACATAACAATGACAAAGATAGATTACATCCGCTCCCCATACTAAAACGA
TACATCATGATTTCTTAGGTACTTAGTTATTTAGTTTTATATTCCATACTAAACGTACGT
ACTTATTTAAATTTATTAATCCACGATATAATAACAATTAACAAAGAACAATAATCACTT
CATGAAACCTTGAGCCATCTTAGCATAACCTCCCAAGCCACCACCAGACTCCTCTTCGGG
CTTCTTAGCTTCCGGTTCAGCCTGACTTGCCGGAGGAGGAGCACCGGCAGCCGGGGGAGG
AGTACCGGCGGCGCCGGAGGAATGAGGACTCGAAATCGTTTAGATACTTCTCGGCCTTCT
CTATGTACTGACCAGCGCCGCTCTTCTCATCCAGCTTTCCGTATTTCTGGGCGGCATCTA
AGATATCAGCGCTGGCTCCAGCGACTTTAGCCTTGTCGAGTTTGTCTGACTCGTTACGAG
CAGCGGCTTGAGCAGCTTCGGCTACGACCTTGGCACTAGCCATGAGCTCGGAGGATGAAG
CTGGTCTGTTGGTTGTTTCGGTTCCTTCCGCGGGCTTGTTGTGGTCTGGCTCCTCTGGTT
TGGAGTCGGAGAATTTCTTTACCTGATCGGAGAGGAAGTTCATCTTTTTTTTTCTTGGTT
TGCTGAATATGATTTATTGTGGTGGATCC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1FS26TF 680 0 0
CGACATAACAATGACAAAGATAGATTACATCCGCTCCCCATACTAAAACGATACATCATG
ATTTCTTAGGTACTTAGTTATTTAGTTTTATATTCCATACTAAACGTACGTACTTATTTA
AATTTATTAATCCACGATATAATAACAATTAACAAAGAACAATAATCACTTCATGAAACC
TTGAGCCATCTTAGCATAACCTCCCAAGCCACCACCAGACTCCTCTTCGGGCTTCTTAGC
TTCCGGTTCAGCCTGACTTGCCGGAGGAGGAGCACCGGCAGCCGGGGGAGGAGTACCGGC
GGCGCCGGAGGAATGAGGACTCGAAATCGTTTAGATACTTCTCGGCCTTCTCTATGTACT
GACCAGCGCCGCTCTTCTCATCCAGCTTTCCGTATTTCTGGGCGGCATCTAAGATATCAG
CGCTGGCTCCAGCGACTTTAGCCTTGTCGAGTTTGTCTGACTCGTTACGAGCAGCGGCTT
GAGCAGCTTCGGCTACGACCTTGGCACTAGCCATGAGCTCGGAGGATGAAGCTGGTCTGT
TGGTTGTTTCGGTTCCTTCCGCGGGCTTGTTGTGGTCTGGCTCCTCTGGTTTGGAGTCGG
AGAATTTCTTTACCTGATCGGAGAGGAAGTTCATCTTTTTTTTTCTTGGTTTGCTGAATA
TGATTTATTGTGGTGGATCC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 4

CO CL3072Contig1 686 4 3 U
GTCCTTTGTCTTCGTATAAGAGCGCCTTTGCTAGTAAGGACGCAGGAAGCACAAAAACTT
TAGTGAAGGACGTCTTCTTCTCTGCCTTCTCCTCTCCAAAGGCCAAGAGAGAGACTGCAT
CCCTTGCCTTCGCTAGCTCTTTTGGTTTCCCAAGGATAGCGGTAGCTGGGGTTCCTACCG
CTTTCTTCGCTCCGCGAATGAGACAGAAAGTGAGAGGAAAAAGCACGTTCTCTCTTTGCG
AGGTCCGAAAGTGGAGAACGCATAGCATTCTCTGGGCACATAGGATCAAAGGTAAAGCAG
GGCTTTCTTGGCAGAGTTTTAGGCGGCAAGATACTTTAGGGCTTGTTGGAGCTGCTGGGC
ATAACAAATCGAAGCCGAAGACGGATCAAGGTAGCTTGCCTGCCAAGCCGATAGGCGAAA
GGGCGAAGCAACTCAAAGCTCTCCGGGGTTTGAGGGCGAAGGATGGAGCGTGCAAAGTCG
ATCGTGCACCTGTCACTTATATAATAGCCAGTCATCAATTAGAAGCAGGCAAAATGGTGG
TGAATTGCGATTGGTCCAAACCTTCGACCAGCTCCTTCTTGCAATCCGCCCAGAATGACC
ATCCTAAGCCCTTATTCACTGTGTGAAGAACGGGGCAGTCCGCTGGAGTGTAGGCTTCTT
GGCCACGCCCCCTGCTTATAGATACG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1DE31TF U 1
AF RS1C977TF U 1
AF RS1C977JQ C 1
AF RS1DE31JQ C 77
BS 1 602 RS1DE31TF
BS 603 653 RS1C977TF
BS 654 686 RS1C977JQ

RD RS1DE31TF 604 0 0
GTCCTTTGTCTTCGTATAAGAGCGCCTTTGCTAGTAAGGACGCAGGAAGCACAAAAACTT
TAGTGAAGGACGTCTTCTTCTCTGCCTTCTCCTCTCCAAAGGCCAAGAGAGAGACTGCAT
CCCTTGCCTTCGCTAGCTCTTTTGGTTTCCCAAGGATAGCGGTAGCTGGGGTTCCTACCG
CTTTCTTCGCTCCGCGAATGAGACAGAAAGTGAGAGGAAAAAGCACGTTCTCTCTTTGCG
AGGTCCGAAAGTGGAGAACGCATAGCATTCTCTGGGCACATAGGATCAAAGGTAAAGCAG
GGCTTTCTTGGCAGAGTTTTAGGCGGCAAGATACTTTAGGGCTTGTTGGAGCTGCTGGGC
ATAACAAATCGAAGCCGAAGACGGATCAAGGTAGCTTGCCTGCCAAGCCGATAGGCGAAA
GGGCGAAGCAACTCAAAGCTCTCCGGGGTTTGAGGGCGAAGGATGGAGCGTGCAAAGTCG
ATCGTGCACCTGTCACTTATATAATAGCCAGTCATCAATTAGAAGCAGGCAAAATGGTGG
TGAATTGCGATTGGTCCAAACCTTCGACCAGCTCCTTCTTGCAATCCGCCCAGAATGACC
AT
TC

QA 1 602 1 602
DS 

RD RS1C977TF 658 0 0
GTCCTTTGTCTTCGTATAAGAGCGCCTTTGCTAGTAAGGACGCAGGAAGCACAAAAACTT
TAGTGAAGGACGTCTTCTTCTCTGCCTTCTCCTCTCCAAAGGCCAAGAGAGAGACTGCAT
CCCTTGCCTTCGCTAGCTCTTTTGGTTTCCCAAGGATAGCGGTAGCTGGGGTTCCTACCG
CTTTCTTCGCTCCGCGAATGAGACAGAAAGTGAGAGGAAAAAGCACGTTCTCTCTTTGCG
AGGTCCGAAAGTGGAGAACGCATAGCATTCTCTGGGCACATAGGATCAAAGGTAAAGCAG
GGCTTTCTTGGCAGAGTTTTAGGCGGCAAGATACTTTAGGGCTTGTTGGAGCTGCTGGGC
ATAACAAATCGAAGCCGAAGACGGATCAAGGTAGCTTGCCTGCCAAGCCGATAGGCGAAA
GGGCGAAGCAACTCAAAGCTCTCCGGGGTTTGAGGGCGAAGGATGGAGCGTGCAAAGTCG
ATCGTGCACCTGTCACTTATATAATAGCCAGTCATCAATTAGAAGCAG*CAAAATGGTGG
TGAATTGCGATTGGTCCAAACCTTCGACCAGCTCCTTCTTGCAATCCGCCCAGAATGACC
ATCCTAAGCCCTTATTCACTGTGTGAAGAACGGGGCAGTCCGCTGGAGTGTAG
CTCTG

QA 1 653 1 653
DS 

RD RS1C977JQ 686 0 0
GTCCTTTGTCTTCGTATAAGAGCGCCTTTGCTAGTAAGGACGCAGGAAGCACAAAAACTT
TAGTGAAGGACGTCTTCTTCTCTGCCTTCTCCTCTCCAAAGGCCAAGAGAGAGACTGCAT
CCCTTGCCTTCGCTAGCTCTTTTGGTTTCCCAAGGATAGCGGTAGCTGGGGTTCCTACCG
CTTTTTTCGCTCCGCGAATGAGACAGAAAGTGAGAGGAAAAAGCACGTTCTCTCTTTGCG
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GGCTTTCTTGGCAGAGTTTTAGGCGGCAAGATACTTTAGGGCTTGTTGGAGCTGCTGGGC
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GGGCGAAGCAACTCAAAGCTCTCCGGGGTTTGAGGGCGAAGGATGGAGCGTGCAAAGTCG
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TGAATTGCGATTGGTCCAAACCTTCGACCAGCTCCTTCTTGCAATCCGCCCAGAATGACC
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GGCCACGCCCCCTGCTTATAGATACG

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DS 

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AATGAGACAGAAAGTGAGAGGAAAAAGCACGTTCTCTCTTTGCGAGGTCCGAAAGTGGAG
AACGCATAGCATTCTCTGGGCACATAGGATCAAAGGTAAAGCAGGGCTTTCTTGGCAGAG
TTTTAGGCGGCAAGATACTTTAGGGCTTGTTGGAGCTGCTGGGCATAACAAATCGAAGCC
GAAGACGGATCAAGGTAGCTTGCCTGCCAAGCCGATAGGCGAAAGGGCGAAGCAACTCAA
AGCTCTCCGGGGTTTGAGGGCGAAGGATGGAGCGTGCAAAGTCGATCGTGCACCTGTCAC
TTATATAATAGCCAGTCATCAATTAGAAGCAGGCAAAATGGTGGTGAATTGCGATTGGTC
CAAACCTTCGACCAGCTCCTTCTTGCAATCCGCCCAGAATGACCATCCTAAGCCCTTATT
CACTGTGTGAAGAACGGGGCAGTCCGCTGGAGTGTAGGCTTCTTGGCCACGCCCCCTGCT
TATAGATACG

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 4

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TCTTAACCAAAACAAAATAACTTTTCTAGTTCAACTTTTAGGAACGGATGGTTTTATTTT
ACCAAATCACAGGTAACTAGTAAACCATATTAAACGAAAAGGATTACAATTAACAGAATT
TGAACAGCTAAAACAGTCATTGATGAGCTCGCTGATTGTGCATGATTTGGTTTGGCATGA
ATCTTTCTTCCTAACCGGGTGGCCACTTCATCTGTCGGCCCCCAAGGACGTGGAGATGAA
GATGGTAAACGGATTGGCATCCTTCAGCACCGTTGTTTATAACCACACGGAACCCATCCA
CAATGCCTTCTTTCTCAGCAACAATCTTTGATGCGTGCAGAAGTTGACCAAGAACTTCTA
CGTGTCTTGGTTCAGCCTTGCCAAGTGTGGTCAAGCAATCTCTCAACTTAGGGATGACCA
AAACATGAACAGGAGCCTGTGGGTTTATGTCTCTGAATGCCAAAACACTCTCATCTTCAT
AGACAATGTCTGATGGAATCTCTTTCGCTACTATCTTGTCAAATATGGTCGGGGCTCCGG
TGTCAGAAGCAGCTTTCGCGGCGGCCTCTTCATTGTGTGCGGCACGAGTAGAAGAGATGG
TTCTTTGAGAAGCAATACGAGGAAGAGCCCTAATCAATTCTCCGGTAGAGAAGATTCTCG
AATTCGATCGAACAGATTGAGCAATCCTCCCCACCGTAGAGAAGTTCCGGAGCAGCATCA
CAGAGGAGGAAGTGGCAGCCATCGAAGAAGCTCTGCTTCGACAACCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H660JQB U 62
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AF RS1H660TF C 104
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RD RS1H660JQB 631 0 0
CC
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QA 3 631 3 631
DS 

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QA 5 760 5 760
DS 

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TGAACAGCTAAAACAGTCATTGATGAGCTCGCTGATTGTGCATGATTTGGTTTGGCATGA
ATCTTTCTTCCTAACCGGGTGGCCACTTCATCTGTCGGCCCCCAAGGACGTGGAGATGAA
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CAATGCCTTCTTTCTCAGCAACAATCTTTGATGCGTGCAGAAGTTGACCAAGAACTTCTA
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AAACATGAACAGGAGCCTGTGGGTTTATGTCTCTGAATGCCAAAACACTCTCATCTTCAT
AGACAATGTCTGATGGAATCTCTTTCGCTATTATCTTGTCAAATATGGTCGGGGCTCCGG
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AATTCGATCGAACAGATTGAGCAATCCTCCCCACCGTAGAGAAGTTCCGGAGCAGCATCA
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QA 1 828 1 828
DS 

RD RS1H660TF 721 0 0
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AAGGACGTGGAGATGGAGATGGTAAACGGATTGGCATCCTTCAGCACCGTTGTTTATAAC
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ACGAGTAGAAGAGATGGTTCTTTGAGAAGCAATACGAGGAAGAGCCCTAATCAATTCTCC
GGTAGAGAAGATTCTCGAATTCGATCGAACAGATTGAGCAATCCTCCCCACCGTAGAGAA
GTTCCGGAGCAGCATCACAGAGGAGGAAGTGGCAGCCATCGAAGAAGCTCTGCTTCGAC
CC

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 4

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GATCGGAGAGAGAGAGAATAATTCAGTAAAGCGACCATGTTGGTGTACACTGATCTTCTC
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GACATTGTCGACACCTTCAGGCTCCAGGAGCAGCCTACCTACGACAAGAAGGGGTTCATC
GCCTATATCAAGAAGTACATCAAGCTTTTGACCCCCAAGCTCAACGAGGAACAGCAAGCA
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CAGTTCTTTGTTGGGGAGAGCATGCACGATGACAGCACTGTGGTCTTTGCTTACTACAAG
GAGGGTGCTACTAACCCTACATTTTTGTACTTCGGACATGGTTTGAAGGAGGTCAAGTGC
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TATGTTTCGTTATATTGTTCTGTGTTTTTTCGTTACCTGATTACTTTTCTTTCTACTTCT
CATCTCTGTTGCAAGATTCTTAAGTTATTAATCCGAAAACAATGGTTTTTTTAGTTGC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

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RD RS1D728TF 690 0 0
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GATCGGAGAGAGAGAGAATAATTCAATAAAGCGACCATGTTGGTGTACACTGATCTTCTC
ACCGGTGATGAGCTTCTCTCTGACTCTTTCCCTTACAAGGAGATTGAGAATGGCATCCTT
TGGGAAGTCGAAGGAAAGTGGACAACCCAGGGATCTGTAGAGGTTAACATTGGTGCCAAC
CCCTCTGCCGAAGAAGGTGGTGAGGACGAGGGTGTTGACGACACTGTTCAGAAGGTCGTT
GACATTGTCGACACCTTCAGGCTCCAGGAGCAGCCTACCTACGACAAGAAGGGGTTCATC
GCCTATATCAAGAAGTACATCAAGCTTTTGACCCCCAAGCTCAACGAGGAACAGCAAGCA
GAGTTCAAGAAGGGTATTGAGGGAGCTACCAAGTACTTGCTCCCCAAGCTCAAGGACTTC
CAGTTCTTTGTTGGGGAGAGCATGCACGATGACAGCACTGTGGTCTTTGCTTACTACAAG
GAGGGTGCTACTAACCCTACATTTTTGTACTTCGGACATGGTTTGAAGGAGGTCAAGTGC
TAAGTGAGACAAGCTCTCGTTGGGGTACTGTGGTCGGTCGCAGCGACTCTATTTAAGTCT
TATGTTTCGTTATATTGTTCTGTGTTTTT
C

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1AT07TF 709 0 0
GTCTCTCTCCCGCAACCTTACAGATTCGTTTTTCCCCCCCCATCGATCGGAGAGAGAGAG
AATAATTCAGTAAAGCGACCATGTTGGTGTACACTGATCTTCTCACCGGTGATGAGCTTC
TCTCCGACTCTTTCCCTTACAAGGAGATTGAGAATGGTATCCTTTGGGAAGTCGAAGGAA
AGTGGACAACCCAGGGATCTGTAGAGGTTAACATTGGTGCCAACCCCTCTGCCGAAGAAG
GTGGTGAGGACGAGGGTGTTGACGACACTGTTCAGAAGGTTGTTGACATTGTCGACACCT
TCAGGCTCCAGGAGCAGCCTACCTACGACAAGAAGGGGTTCATCGCCTATATCAAGAAGT
ACATCAAGCTTTTGACCCCCAAGCTCAACGAGGAACAGCAAGCAGAGTTCAAGAAGGGTA
TTGAGGGAGCTACCAAGTACTTGCTTCCCAAGCTCAAGGACTTCCAGTTCTTTGTTGGGG
AGAGCATGCACGATGACAGCACTGTGGTCTTTGCTTACTACAAGGAGGGTGCTACTAACC
CTACATTTTTGTACTTCGGACATGGTTTGAAGGAGGTCAAGTGCTAAGTGAGACAAGCTC
TCGTTGGGGTACTGTGGTCGGTCGCAGCGACTCTATTTAAGTCTTATGTTTCGTTATATT
GTTCTGTGTTTTT*CGTTACCTGATTACTTTTCTTTCTACTTCTCATCT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1AT07JQ 726 0 0
CCC
CCCCCATCGATCGGAGAGAGAGAGAATAATTCAGTAAAGCGACCATGTTGGTGTACACTG
ATCTTCTCACCGGTGATGAGCTTCTCTCCGACTCTTTCCCTTACAAGGAGATTGAGAATG
GTATCCTTTGGGAAGTCGAAGGAAAGTGGACAACCCAGGGATCTGTAGAGGTTAACATTG
GTGCCAACCCCTCTGCCGAAGAAGGTGGTGAGGACGAGGGTGTTGACGACACTGTTCAGA
AGGTTGTTGACATTGTCGACACCTTCAGGCTCCAGGAGCAGCCTACCTACGACAAGAAGG
GGTTCATCGCCTATATCAAGAAGTACATCAAGCTTTTGACCCCCAAGCTCAACGAGGAAC
AGCAAGCAGAGTTCAAGAAGGGTATTGAGGGAGCTACCAAGTACTTGCTTCCCAAGCTCA
AGGACTTCCAGTTCTTTGTTGGGGAGAGCATGCACGATGACAGCACTGTGGTCTTTGCTT
ACTACAAGGAGGGTGCTACTAACCCTACATTTTTGTACTTCGGACATGGTTTGAAGGAGG
TCAAGTGCTAAGTGAGACAAGCTCTCGTTGGGGTACTGTGGTCGGTCGCAGCGACTCTAT
TTAAGTCTTATGTTTCGTTATATTGTTCTGTGTTTTTTCGTTACCTGATTACTTTTCTTT
CTACTTCTCATCTCTGTTGCAAGATTCTTAAGTTATTAATCGGAAAACAATGGTTTTTT
AAAG

QA 4 722 4 722
DS 

RD RS1D728JQ 634 0 0
TCTTTCCCTTACAAGGAGATTGAGAATGGCATCCTTTGGGAAGTCGAAGGAAAGTGGACA
ACCCAGGGATCTGTAGAGGTTAACATTGGTGCCAACCCCTCTGCCGAAGAAGGTGGTGAG
GACGAGGGTGTTGACGACACTGTTCAGAAGGTCGTTGACATTGTCGACACCTTCAGGCTC
CAGGAGCAGCCTACCTACGACAAGAAGGGGTTCATCGCCTATATCAAGAAGTACATCAAG
CTTTTGACCCCCAAGCTCAACGAGGAACAGCAAGCAGAGTTCAAGAAGGGTATTGAGGGA
GCTACCAAGTACTTGCTCCCCAAGCTCAAGGACTTCCAGTTCTTTGTTGGGGAGAGCATG
CACGATGACAGCACTGTGGTCTTTGCTTACTACAAGGAGGGTGCTACTAACCCTACATTT
TTGTACTTCGGACATGGTTTGAAGGAGGTCAAGTGCTAAGTGAGACAAGCTCTCGTTGGG
GTACTGTGGTCGGTCGCAGCGACTCTATTTAAGTCTTATGTTTCGTTATATTGTTCTGTG
TTTTTTCGTTACCTGATTACTTTTCTTTCGACTTGTCATCTCTGTTGCAAGATTCTTAAG
TTATTAATCCGAGAACAATGGTTTTTTTAGTTGC

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 4

CO CL3075Contig1 1080 4 10 U
GCAATCAGGCGAGTACCTTAGCCAGCTCTAGACACTTCTGGAACGCCGGACCAGGTAAAC
ACTTCGTTAAGAAATCAGCTGCATTTAGGGTAGTATGCACTTTGATTAGGTTAACGGAAC
CCTCATGAACTTTATCCTGGATGAAATGCCACTTTGTTTCCATGTGTTTAGTTCTGCCAT
GATAAACTGCATTTTTAACTAGACATATTGCACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCC
GGGGGGTTCCTGGTGAAGCTGTTTACAACGAGAAGAGGACCTCTGTTCAGAATGAAGATG
GAACCAAGATTGAATACAGAGTGTGGAATCCTTTCCGTTCTAAGCTTGCGGCTGCTATTC
TTGGTGGTGTTGATAACATTTGGATTAAACCTGGTGCTAAAGTTCTTTACCTTGGTGCTG
CTTCTGGAACCACAGTCTCTCATGTGTCTGATCTTGTTGGACCCGAGGGATGTGTCTACG
CAGTTGAGTTTTCTCACAAAAGTGGGAGAGATTTGGTGAACATGGCGAAGAAGAGGACTA
ACGTTATCCCAATCATTGAAGATGCTAGACACCCTGCTAAGTACAGAATGCTTGTAGGCA
TGGTTGATGTTATCTTCTCTGATGTTGCACAGCCTGATCAGGCTAGGATTGTGGCTTTGA
ATGCAAGCTTCTTCCTCAAAACTGGAGGTCACTTTGTGACCTCAATCAAGGCAAACTGTA
TCGACTCAACAGTTCCAGCTGAAGCTGTGTTTCAGAGCGAAGTGAAGAAGCTCCAACAAG
AGCAGTTCAAGCCGGCAGAGCAAGTGACGCTTGAGCCATTTGAGCGTGACCATGCTTGTG
TCGTTGGTTCCTACCGTGCCCCTAAGAAGGCCAAGGCTGCTACTGCCGCTTAGAAACTCC
TTTTGTGTTGTGGAGTTTGTTTGTTTTTCAGTTTCTGCTTCTGTCTTGTTTCTCTTTTAG
AATCTGTAGTGTTTTAGAATCTGTTAAACCAGACTTGGAACTCATCAGTTGTTAAATCAG
ATTTTGCTTGTTGAGAAAGTTTTAATAGTAATTCGTCTCGGTTATGGCATGTGCGATTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F634TF U 1
AF RS1BJ41TF U 277
AF RS1BJ41JQ C 316
AF RS1F634JQ C 342
BS 1 505 RS1F634TF
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BS 754 1055 RS1BJ41JQ
BS 1056 1080 RS1F634JQ

RD RS1F634TF 684 0 0
GCAATCAGGCGAGTACCTTAGCCAGCTCTAGACACTTCTGGAACGCCGGACCAGGTAAAC
ACTTCGTTAAGAAATCAGCTGCATTTAGGGTAGTATGCACTTTGATTAGGTTAACGGAAC
CCTCATGAACTTTATCCTGGATGAAATGCCACTTTGTTTCCATGTGTTTAGTTCTGCCAT
GATAAACTGCATTTTTAACTAGACATATTGCACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCC
GGGGGGTTCCTGGTGAAGCTGTTTACAACGAGAAGAGGACCTCTGTTCAGAATGAAGATG
GAACCAAGATTGAATACAGAGTGTGGAATCCTTTCCGTTCTAAGCTTGCGGCTGCTATTC
TTGGTGGTGTTGATAACATTTGGATTAAACCTGGTGCTAAAGTTCTTTACCTTGGTGCTG
CTTCTGGAACCACAGTCTCTCATGTGTCTGATCTTGTTGGACCCGAGGGATGTGTCTACG
CAGTTGAGTTTTCTCACAAAAGTGGTAGAGATTTGGTGAACATGGCGAAGAAGAGGACTA
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TGGTTGATGTTATCTTCTCTGATGTTGCACAGCCTGATCAGGCTAGGATTGTGGCTTTGA
ATGCAAGCTTCTTCCTCAAAACTG

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1BJ41TF 477 0 0
GGAT
CTCTGTTCAGAATGAAGATGGAACCAAGATTGAATACAGAGTGTGGAATCCTTTCCGTTC
TAAGCTTGCGGCTGCTATTCTTGGTGGTGTTGATAACATTTGGATTAAACCTGGTGCTAA
AGTTCTTTACCTTGGTGCTGCTTCTGGAACCACAGTCTCTCATGTGTCTGATCTTGTTGG
ACCCGAGGGATGTGTCTACGCAGTTGAGTTTTCTCACAGAAGTGGGAGAGATTTGGTGAA
CATGGCGAAGAAGAGGACTAACGTTATCCCAATCATTGAAGATGCTAGACACCCTGCTAA
GTACAGAATGCTTGTAGGCATGGTTGATGTTATCTTCTCTGATGTTGCTCAGCCTGATCA
GGCTAGGATTGTGGCTTTGAATGCAAGCTTCTTCCTCAAAACTGGAGGTCACTTTGTGAC
CTCAATCAAGGCAAACTGTATCGACTCAACACTTCCAGCTGAAGCTGTGTTTC

QA 5 477 5 477
DS 

RD RS1BJ41JQ 740 0 0
ACAGAGTGTGGAATCCTTTCCGTTCTAAGCTTGCGGCTGCTATTCTTGGTGGTGTTGATA
ACATTTGGATTAAACCTGGTGCTAAAGTTCTTTACCTTGGTGCTGCTTCTGGAACCACAG
TCTCTCATGTGTCTGATCTTGTTGGACCCGAGGGATGTGTCTACGCAGTTGAGTTTTCTC
ACAGAAGTGGGAGAGATTTGGTGAACATGGCGAAGAAGAGGACTAACGTTATCCCAATCA
TTGAAGATGCTAGACACCCTGCTAAGTACAGAATGCTTGTAGGCATGGTTGATGTTATCT
TCTCTGATGTTGCTCAGCCTGATCAGGCTAGGATTGTGGCTTTGAATGCAAGCTTCTTCC
TCAAAACTGGAGGTCACTTTGTGACCTCAATCAAGGCAAACTGTATCGACTCAACAGTTC
CAGCTGAAGCTGTGTTTCAGAGCGAAGTGAAGAAGCTCCAACAAGAGCAGTTCAAGCCGG
CAGAGCAAGTGACGCTTGAGCCATTTGAGCGTGACCATGCTTGTGTCGTTGGTTCCTACC
GTGCCCCTAAGAAGGCCAAGGCTGCTACTGCCGCTTAGAAACTCCTTTTGTGTTGTGGAG
TTTGTTTGTTTTTCAGTTTCTGCTTCTGTCTTGTTTCTCTTTTAGAATCTGTAGTGTTTT
AGAATCTGTTAAACCAGACTTGGAACTCATCAGTTGTTAAATCAGATTTTGCTTGTTGAG
AAAGTTTTAATAGTAATTCG

QA 1 740 1 740
DS 

RD RS1F634JQ 739 0 0
AAGCTTGCGGCTGCTATTCTTGGTGGTGTTGATAACATTTGGATTAAACCTGGTGCTAAA
GTTCTTTACCTTGGTGCTGCTTCTGGAACCACAGTCTCTCATGTGTCTGATCTTGTTGGA
CCCGAGGGATGTGTCTACGCAGTTGAGTTTTCTCACAAAAGTGGTAGAGATTTGGTGAAC
ATGGCGAAGAAGAGGACTAACGTTATCCCTATCATTGAAGATGCTAGACACCCTGCTAAG
TACAGAATGCTTGTAGGCATGGTTGATGTTATTTTTTTTGATGTTGCACAGCCTGATCAG
GCTAGGATTGTGGCTTTGAATGCAAGCTTTTTCCTCAAAACTGGAGGTCACTTTGTGATT
TCAATCAAGGCAAACTGTATCGACTCAACAGTTCCAGCTGAAGCTGTGTTTCAGAGCGAA
GTGAAGAAGCTCCAACAAGAGCAGTTCAAGCCGGCAGAGCAAGTGACGCTTGAGCCATTT
GAGCGTGACCATGCTTGTGTCGTTGGTTCCTACCGTGCCCCTAAGAAGGCCAAGGCTGCT
ACTGCCGCTTAGAAACTCCTTTTGTGTTGTGGAGTTTGTTTGTTTTTCAGTTTTTGCTTC
TGTCTTGTTTCTCTTTTAGAATCTGTAGTGTTTTAGAATCTGTTAAACCAGACTTGGAAC
TCATCAGTTGTTAAATCAGATTTTGCTTGTTGAGAAAGTTTTAATAGTAATTCGTCTCGG
TTATGGCATGTGCGATTAG

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 3

CO CL3076Contig1 770 3 6 U
GGAGGATGAAGGAGGAGATTCGGGGACTGAAGATCTGACTAATGGGAAGACACTGAAACG
GGCGCGTTTGGTGTGGACCCCGCAGCTGCACAAGAGATTCGTGGATGTTGTGGCCCACCT
GGGGGTTAAAAACGCCGTGCCCAAGACGATTATGCAGCTTATGAACGTCGAAGGGTTGAC
TCGAGAGAACGTCGCGTCTCGCCTCCAGAAGTACAGGCTCTACCTCAAAAGGATGCAGGG
ATTGACCTCGGAAGGTCCCTCTTCTTCGGATAAGCTCTTCTCCTCAACCCCTGTCCCTCC
ACAGAGCTTCCAAGAACATGTGGGAGTGCCGCCGCTGCCGCCGCCGATGATGCAGATGCC
AGTCTATGCGCATCATATGGGTATGCAAGGATATCATCACCATAATCACGCTCATGATCC
TTATCATCATGGAAGTGGTGGTGGACCTGCAAATCCATATATGATGCAGCAGAACAAGTT
CGGATCCGTGGCTTCCTATCCTCCTGTTGGAGGTGGAAGCGCGAATGAGAATTAAAATGA
ATCGAATAGAACTAACGAATCGGAGTCGATTCATCTTTGGGAAGTATAAACTGTTCTTGG
AGCCATATATTGTGTAGCACAATACTGTATTCTTCTAGTTTGTTTATAGATATGGCAACC
ATAGTGATAGTTTCACGTTCTTTCTTATGGTAAATTAAACCATTCCTGTATGTAAATCAT
TTGTAATTGCAAAAGAGTTGGTAATACTCAAAAGTGGCTTTATCTTCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 

AF RS1E274TF U 1
AF RS1AY83JQ C 159
AF RS1AY83TF U 159
BS 1 200 RS1E274TF
BS 201 201 RS1AY83TF
BS 202 531 RS1E274TF
BS 532 751 RS1AY83TF
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BS 753 770 RS1AY83TF

RD RS1E274TF 531 0 0
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GGCGCGTTTGGTGTGGACCCCGCAGCTGCACAAGAGATTCGTGGATGTTGTGGCCCACCT
GGGGGTTAAAAACGCCGTGCCCAAGACGATTATGCAGCTTATGAACGTCGAAGGGTTGAC
TCGAGAGAACGTCGCGTCTCACCTCCAGAAGTACAGGCTCTACCTCAAAAGGATGCAGGG
ATTGACCTCGGAAGGTCCCTCTTCTTCGGATAAGCTCTTCTCCTCAACCCCTGTCCCTCC
ACAGAGCTTCCAAGAACATGTGGGAGTGCCGCCGCTGCCGCCGCCGATGATGCAGATGCC
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TTATCATCATGGAAGTGGTGGTGGACCTGCAAATCCATATATGATGCAGCAGAACAAGTT
CGGATCCGTGGCTTCCTATCCTCCTGTTGGAGGTGGAAGCGCGAATGAGAA

QA 1 531 1 531
DS 

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GG
ATGAACGTCGAAGGGTTGACTCGAGAGAACGTCGCGTCTCGCCTCCAGAAGTACAGGCTC
TACCTCAAAAGGATGCAGGGATTGACCTCGGAAGGTCCCTTTTTTTCGGATAAGCTTTTT
TCCTCAACCCCTGTCCCTCCACAGAGCTTCCAAGAACATGTGGGAGTGCCGCCGCTGCCG
CCGCCGATGATGCAGATGCCAGTTTATGCGCATCATATGGGTATGCAAGGATATCATCAC
CATAATCACGCTCATGATCCTTATCATCATGGAAGTGGTGGTGGACCTGCAAATCCATAT
ATGATGCAGCAGAACAAGTTCGGATCCGTGGCTTCCTATCCTCCTGTTGGAGGTGGAAGC
GCGAATGAGAATTAAAATGAATCGAATAGAACTAACGAATCGGAGTCGATTCATCTTTGG
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CATTCCTGTATGTAAATCATTTGTAATTGCAAAAGAGTTGGTAATACTCAAAAGTGGCTT
TATTTTCCCT

QA 3 612 3 612
DS 

RD RS1AY83TF 612 0 0
GG
ATGAACGTCGAAGGGTTGACTCGAGAGAACGTCGCGTCTCGCCTCCAGAAGTACAGGCTC
TACCTCAAAAGGATGCAGGGATTGACCTCGGAAGGTCCCTCTTCTTCGGATAAGCTCTTC
TCCTCAACCCCTGTCCCTCCACAGAGCTTCCAAGAACATGTGGGAGTGCCGCCGCTGCCG
CCGCCGATGATGCAGATGCCAGTCTATGCGCATCATATGGGTATGCAAGGATATCATCAC
CATAATCACGCTCATGATCCTTATCATCATGGAAGTGGTGGTGGACCTGCAAATCCATAT
ATGATGCAGCAGAACAAGTTCGGATCCGTGGCTTCCTATCCTCCTGTTGGAGGTGGAAGC
GCGAATGAGAATTAAAATGAATCGAATAGAACTAACGAATCGGAGTCGATTCATCTTTGG
GAAGTATAAACTGTTCTTGGAGCCATATATTGTGTAGCACAATACTGTATTCTTCTAGTT
TGTTTATAGATATGGCAACCATAGTGATAGTTTCACGTTCTTTCTTATGGTAAATTAAAC
CATTCCTGTATGTAAATCATTTGTAATTGCAAAAGAGTTGGTAATACTCAAGAGTGGCTT
TATCTTCCCT

QA 3 612 3 612
DS 



AS 1 4

CO CL3077Contig1 793 4 9 U
AATAATAATAACTTCTCGTTTACATAAAGGTGAAGCAAAATGTATACACACATGAAATGC
GCAAATATTATTTGTATTTACCACACTATTATACATTTCTCTAATCATAATACACAAATT
GCAAATAATAATAATGTGGTACCCTCTTCTTACACAAGACGGAGTTTGTACATATTTGAT
CTGACCTAAGAGGGGTTTTAGGGCGACCTTACAAGCTTATTGGCTTTGGATCTCGGCATA
AGTGATTGTAAGCGCACGCTGAAGTTTCCATGGAGACAAAACCTCAACCTCTGCCAAGAA
CGTCGCTGTGACTGGCCGGTGATCCGATAGCTTAATCTCATTCCTTCTGTAACTAAGAAG
CTTAACCCCCTTCCCTTTCCAAATGACGCGGTCACACCAGGCCGGTTTACGTTTTCCTGA
TTCCGGGTCGTCTCCTATATAATTTTCCGAGTTGATTTCATATTTGTATGTCGGTGGAAA
ACATAAAGCCCCCTCTGACCATCCCTCCAATACGTTGCCTTTTCTCACTTCGATTGAAAG
CTGGTCATTCTCAAGCAACCTCTGCCATTCCTTTCTTGCAATAAGCTCGTGTGTCTTCTC
ATACGACAAGTTAATCCGATAGTTCAGATCTCCCAGCCAGATTACTCTTTCGTGATCACG
GATGCTTCTTGGAAGCACACTGGCATCTGAAGAATGGGGATGAAACAGCGTTCTTCTTTG
AATTTCAATTACATCATCGTTTCTTTTCTGGTGATCTGTATCCTTTTCCCCTGATGACAG
ATGTGTGCACAGG


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H452JQB U 77
AF RS1E859JQ U 1
AF RS1DQ39JQ U 1
AF RS1H452TF C 50
BS 1 141 RS1DQ39JQ
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BS 143 248 RS1DQ39JQ
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BS 529 793 RS1DQ39JQ

RD RS1H452JQB 527 0 0
TTTACCACACTATTATACATTTCTCTAATCATAATACACAAATTGCAAATAATAATAATG
TGGTACCCTCTTCTTACACAAGACGGAGTTTGTACATATTTGATCTGACCTAAGAGGGGT
TTTAGGGCGACCTTACAAGCTTATTGGCTTTGGATCTCGGCATAAGTGATTGTAAGCGCA
CGCTGAAGTTTCCATGGAGACAAAACCTCAACCTCTGCCAAGAACGTCCCTGTGACTGGC
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ATATAATTTTCCGAGTTGATTTCATATTTGTATGTCGGTGGAAAACATAAAGCCCCCTCT
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AACCTCTGCCATTCCTTTCTTGCAATAAGCTCGTGTGTCTTCTCATA

QA 1 527 1 527
DS 

RD RS1E859JQ 722 0 0
GC
TAATAATAACTTCTCGTTTACATAAAGGTGAAGCAAAATGTATACACACATGAAATGCGC
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AAATAATAATAATGTGGTATCCTCTTCTTACACAAGACGGAGTTTGTACATATTTGATCT
GACCTAAGAGGGGTTTTAGGGCGACCTTACAAGCTTATTGGCTTTGGATCTCGGCATAAG
TGATTGCAAGCGCACGCTGAAGTTTCCATGGAGACAAAACCTCAACCTCTGCCAAGAACG
TCGC*GTGACTGGCCGGTGATCCGATAGCTTAATCTCATTCCTTCTGTAACTAAGAAGCT
TAACCCCCTTCCCTTTCCAAATGACGCGGTCACACCAGGCCGGTTTACGTTTTCCTGATT
CCGGGTCGTCTCCTATATAATTTTCCGAGTTGATTTCATATTTGTATGTCGGTGGAAAAC
ATAAAGCCCCCTCTGACCATCCCTCCAATACGTTGCCTTTTCTCATTTCGATTGAAAGCT
GGTCATTCTCAAGCAACAGCTGCCATTCCTTACTTGCAATAAGCTCGTGTGTCTTCTCAT
ACGACAAGTTAATCCGATAGTTCAGATCTCCCAGCCAGATTACTCTTTCATGATCACGGA
TGCTTCTTGGAAGTACACTGGCATCTGAAGAATGGGGATGAAACAGCGTCCTTCTTTGAA

QA 3 722 3 722
DS 

RD RS1DQ39JQ 793 0 0
AATAATAATAACTTCTCGTTTACATAAAGGTGAAGCAAAATGTATACACACATGAAATGC
GCAAATATTATTTGTATTTACCACACTATTATACATTTCTCTAATCATAATACACAAATT
GCAAATAATAATAATGTGGTATCCTCTTCTTACACAAGACGGAGTTTGTACATATTTGAT
CTGACCTAAGAGGGGTTTTAGGGCGACCTTACAAGCTTATTGGCTTTGGATCTCGGCATA
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CGTCGCTGTGACTGGCCGGTGATCCGATAGCTTAATCTCATTCCTTCTGTAACTAAGAAG
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TTCCGGGTCGTCTCCTATATAATTTTCCGAGTTGATTTCATATTTGTATGCCGGTGGAAA
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ATACGACAAGTTAATCCGATAGTTCAGATCTCCCAGCCAGATTACTCTTTCGTGATCACG
GATGCTTCTTGGAAGCACACTGGCATCTGAAGAATGGGGATGAAACAGCGTTCTTCTTTG
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QA 1 793 1 793
DS 

RD RS1H452TF 733 0 0
TTTTTTTTTGT
GCAAATATTATTTGTATTTACCACACTATTATACATT*CTCTAATCATAATACACAAATT
GCAAATAATAATAATGTGGTACCCTCTTCTTACACAAGACGGAGTTTGTACATATTTGAT
CTGACCTAAGAGGGGTTTTAGGGCGACCTTACAAGCTTATTGGCTTTGGATCTCGGCATA
AGTGATTGTAAGCGCACGCTGAAGTTTCCATGGAGACAAAACCTCAACCTCTGCCAAGAA
CGTCGCTGTGACTGGCCGGTGATCCGATAGCTTAATCTCATTCCTTCTGTAACTAAGAAG
CTTAACCCCCTTCCCTTTCCAAATGACGCGGTCACACCAGGCCGGTTTACGTTTTCCTGA
TTCCGGGTCGTCTCCTATATAATTTTCCGAGTTGATTTCATATTTGTATGTCGGTGGAAA
ACATAAAGCCCCCTCTGACCATCCCTCCAATACGTTGCCTTTTCTCACTTCGATTGAAAG
CTGGTCATTCTCAAGCAACCTCTGCCATTCCTTTCTTGCAATAAGCTCGTGTGTCTTCTC
ATACGACAAGTTAATCCGATAGTTCAGATCTCCCAGCCAGATTACTCTTTCGTGATCACG
GATGCTTCTTGGAAGCACACTGGCATCTGAGGAATGGGGATGAAACAGCGTTCTTCTTTG
AATTTCAATTACATCATCGTTTCTTTTCTGGTGATCTGTATCCTTTTCCCCTGATGACAG
A
C

QA 12 732 12 732
DS 



AS 1 4

CO CL3078Contig1 1019 4 21 U
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CATCATAATCACATGTACGCACGCGCGCGCGCGCACGCTCACACACCCACACACCCACAC
ATACAATTTAACTGAAACTAGGGTTCCTTTTTTTTGTGTGCGTTTCATCAATCATCAAAT
GGCTATTAAGTGTGTGACTCTACGTTTCAGGTATGGGAACAAAGATCGCTGAGCGAATTA
CGACAAACTCATTTGGCTTAGAGAGTGTTGATTGTAGTGGATTCGTCAGATTTGGTGTTG
ATGGTCCACGGAAATCTTCAAAGAAGAAATTGACTGACGACAGAGAAGAGGAAGGAGTTT
TTTTTCTAAGGTCAATGGATAGGTTTTTTGAAAAGCAAAATGCTGAGTCCATCAGACGGA
CAATGCAAGCCCAAGAAGATCTTTTCAAGCAACAGGTACAAGAGCTGCATAGAGTATATA
ATATACAGAAGAAGATGATGGAGCAACTCAAACATAGAAGCCAATACTGTACTACTAACA
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ATGTGGCTAGAGCCACGAACACAGTAACGGATCATATTGAAGAGAGTGAGCTAGAACTGA
CACTGAGCATTGGAATGTCTTCTTCCTCTATGAACAAGGACATGGACTACTCGTCGACGA
CATCACTCAAATCATCATCGGATAATTGTAATAATCAGAGCAACACTATTAATTGTAATA
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GAGAGAAGAAGAGACCTCATTGGCTCTTTCAGGGACTTAGTATTAACCGGACTTCATGAA
TTTTGTTAATTCACTGACTCTTTCTTTTTCCTTCTTCGTCTTATTCTTGATTTTCTTCTT
TTGTATCTTATCTGTTACTATTATTATCTACCAGATTTACTGATACTTGTATTAGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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ATGTGGCTAGAGCCACGAACACAGTAACGGATCATATTGAAGAGAGTGAGCTAGAACTGA
CACTGAGCATTGGAATGTCTTCTTCCTCTATGA

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GGGGAA
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GACGGACAATGCAAGCCCAAGAAGATCTTTTCAAGCAACAGGTACAAGAGCTGCATAGAG
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TGGACCGAGAGAAGA*GAGACTTCATTGGCTCTT

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AGAGACCTC

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DS 

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TA
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TAAGGTCAATGGATAGGTTTTTTGAAAAGCAAAATGCTGAGTCCATCAGACGGACAATGC
AAGCCCAAGAAGATCTTTTCAAGCAACAGGTACAAGAGCTGCATAGAGTATATAATATAC
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CTAGAGCCACGAACACAGTAACGGATCATATTGAAGAGAGTGAGCTAGAACTGACACTGA
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TCAAATCATCATCGGATAATTGTAATAATCAGAGCAACACTATTAATTGTAATAACCAAG
AAAGTAGCGGACCAACCACGCCTATGAGCAGCTCAAGTACGACGTCGTTGGACCGAGAGA
AGAAGAGACCTCATTGGCTCTTTCAGGGACTTAGTATTAACCGGACTTCATGAATTTTGT
TAATTCACTGACTCTTTCTTTTTCCTTCTTCGTCTTATTCTTGATTTTCTTCTTTTGTAT
CTTATCTGTTACTATTATTATCTACCAGATTTACTGATACTTGTATTAGCTCC

QA 3 835 3 835
DS 



AS 1 4

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AAGCAAAATGCAGTGTTTGAGAGCTTAAAGCAGGGTAGCAGTGCTATTAAAGCCATTCAA
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TATCAAGATGATTTGAATGCTATTTTGGG*AGAGAAATTATCAGCAGAGGATGAAGAAGA
GATATTAGCAGAATTCGATAACCTAGAAAGTCAGCTTGCTGTTGATGAGATGCCTGATGT
GCCTACAACGGAGCTCCAAGAATCCGAGAAGATAGATCTTCCAGATGTGCCAACCCGAAG
ACCAATCCCTTCCAATGCTGAAATCACACCAGCTGAATCAGCCACAAAGAAAAAAGTTCT
CGAAAAACCTTTGCCAGCTTGAGCTAGAAGAAACTAGTCAGCAAAACGATTATATCATTC
TTTTAGCACTTCTCTTTTAATTCTCTTGAAGTTTTACTGTACAATCTTTAAGTCTCTTGT
TGTAAAGAACAAAGATTTGTGGGATCGCACTGTGTGAAAGGATTCAAATTTCAATAATGA
AAGAAAATCCAGATTATGAC


BQ
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15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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CGAAAAGAGAGGGCTTTGTTAGCACTGAGGAAGAAACGGACGCAAGAAGATTTGTTGAAG
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AAGCAAAAGGCAGTGTTTGAGAGCTTAAAGCAGGGTAGCAGTGCTATTAAAGCCATTCAA
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A

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GC

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DS 



AS 1 4

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TCTTGTTATCTTATGAATGAAATCAATACTTGTAAACCAGACTTTAAATGTTGTATTTTC
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1DB88TF U 77
AF RS1AI66TF U 1
AF RS1DB88JQ C 484
AF RS1AI66JQ C 557
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G
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TCGAAAATGAGCGGCCAATTAACCAGACGAAGCAGAACAAGTTCCGACTCAAGCCAGTTA
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TCGA
GATAT

QA 2 665 2 665
DS 

RD RS1AI66TF 845 0 0
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CACAACCAAGTCTTATTATTTCTTATAAACTCACCAACACCTTGGAGTTCTACAGCTACA
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ATGCTGCACAGAAAACCTTCTTCGACATTCTTAAAACCCGAGGGGAGAAGCTTCTGCGGT
ACCCTCCACCTGTAGCTATTGATCTATCCCCACCTCCAGCTGTCCGAGAAGGAGTTTCTC
TAACTCTTGAGATAATCGAGAACTACAACAGCATGATGGTTTCCGCTTCAGGGGAGAAAC
CGGCTTTTGATCCCGTCCTCTCTGCACTGCTCGACCCTATCATTAAGATGTGTGAGCAAG
CAGCAGAGGCGCACAAATCGAAAATGAGCGGCCAATTAACCAGACGAAGCAGAACAAGTT
CCGACTCAAGCCAGTTAACATCAGTCGATGCTCTACTCTCTAGCAGCTCGGCCCCACCTC
AGAACAATGAAACACTTTCGAAGATATTCCTCATCAACTGTTTATGCGCGATCCAACAAC
CGTTGCTAAGACACGATGTGGCGTCGCAGTACGTGACCAACATCGGATCAATGATCGAGA
CACAT

QA 1 840 1 840
DS 

RD RS1DB88JQ 862 0 0
CTCTTGAGATAATCGAGAACTACAACAGCATGATGGTT*CCGCTTCAGGGGAGAAACCGG
CTTTTGATCCCGTCCTCTCTGCACTGCTCGACCCTATCATTAAGATGTGTGAGCAAGCAG
CAGAGGCGCACAAATCGAAAATGAGCGGCCAATTAACCAGACGAAGCAGAACAAGTTCCG
ACTCAAGCCAGTTAACATCAGTCGATGCTCTACTCCCTAGCAGCTCGGCCCCACCTCAGA
ACAATGAAACACCTTCGAAGATATTCCTCATCAACTGTTTATGCGCGATCCAACAACCGT
TGCTAAGACACGATGTGGCGTCGCAGTACGTGACCAACATCGGATCAATGATCGAGAACC
ACATAAACCTCCTTGTCCAGAAAGAAGTCGGCACGCTCCTCCAAAGATGCGGTCTTTCAG
ACAAAATGCAGATCTTCCGCTCCTCCACCACAACTGAACTTCCTTTGTCTGAACGACAGG
AGACATCACCCGCAATGCTGTCGGAATGCCTCAAGGCCTTCTTCGGCCTCGTTTTGGGAA
GCGAAGGCTCTCTTCCTGAGTTCGAGCAGATACAAGTCCCTAAACTCAGGTCCGAAGCTT
GCGTGCGTGTGGCTAAAACGTTAGCT*AAGATTATGAAGTTATATACCGAGTAGTGACGG
ATCAGCAAAACGGATATCCAGATCCGAAATCCCTCGCTCGACATCCACCGGATCAGATCC
GAACCATTCTCGGTATATGAGTGCAAGCTTCTTCTACCCGTTTTTTTTCTGGTTCTTTCT
TGTTATCTTATGAATGAAATCAATACTTGTAAACCAGACTTTAAATGTTGTATTTTCAAA
TAAAGTTCACACTTTATTTATC

QA 1 862 1 862
DS 

RD RS1AI66JQ 794 0 0
CCTCTCTGCACTGCTCGACCCTATCATTAAGATGTGTGAGCAAGCAGCAGAGGCGCACAA
ATCGAAAATGAGCGGCCAATTAACCAGACGAAGCAGAACAAGTTCCGACTCAAGCCAGTT
AACATCAGTCGATGCTCTACTCTCTAGCAGCTCGGCCCCACCTCAGAACAATGAAACACT
TTCGAAGATATTCCTCATCAACTGTTTATGCGCGATCCAACAACCGTTGCTAAGACACGA
TGTGGCGTCGCAGTACGTGACCAACATCGGATCAATGATCGAGAACCACATAAACCTCCT
TGTCCAGAAAGAAGTCGACACGCTCCTCCAAAGATGCGGTCTTTCAGACAAAATGCAGAT
CTTCCGCTCCTCCACCACAACTGAACTTCCTTTGTCTGAACGACAGGAGACATCACCCGC
AATGCTGTCGGAATGCCTCAAGGCCTTCTTCGGCCTCGTTTTGGGAAGCGAAGGCTCTCT
TCCTGAGTTCGAGCAGATACAAGTCCCTAAACTCAGGTCCGAAGCTTGCGTGCGTGTGGC
TAGAACGTTAGCTGAAGATTATGAAGTTATATACCGAGCAGTGACGGATCAGCAAAACGG
ATATCCAGATCCGAAATCCCTCGCTCGACATCCACCGGATCAGATCCGAACCATTCTCGG
TATATGAGTGCAAGCTTCTTCTACCCGTTTTTTTTCTGGTTCTTTCTTGTTATCTTATGA
ATGAAATCAATACTTGTAAACCAGACTTTAAATGTTGTATTTTCATATAAAGTTCACACT
TTATTTATCTAAAC

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 4

CO CL3081Contig1 738 4 13 U
GGGCCTCGTGTGTCCTCTCTGTCTCAGCTTTCCCTCAACCATCAGAGAAGAATGGGACCT
GGAGATAGTGAAACAATGGAATGCAAGTGTGGTATGCCTCTTTGCATCTGTGTTGCTCCA
CCCAAAACCTCACAGGCTACACCGGCTCCTATGGCTCTTTCTCAGTCAGGTCCCAGACCA
AAGTCTGACACTTCAGCTAAAAGTAAAGGTTCCACTTCCAGCAGCAATGCTACTAGACTA
GACAAGCCCCAAAAAGAATATCAAGTCAATGGGGAGGGATTAAGAGAAGCAATTAAGAAT
GGTGACACTGCTGGCGTGAAAAAGCTTCTGAACGAGGGCGTGGATGCAAATTACCATGAC
AAGCAGGGAATGTCAGTGCTTCATCTGGCGGTTTTATTCAACCAAACTGATATTGCGTTG
ATGTTAATGGAACATGGAGCAAACCTTGACTACAAAAATGCACAAGGAGAAACACCACTA
GATTGTGCTCCTGCAACGCTGCAATATAAGATGCGGGAAAAGATGAAGTCCACTTAATAT
GAATTCAGGCAGAGTTACAAATCTTTCCTCAAAAAGTCTGTAAAGGACAAATCAAGGGGT
CATGAATTTGCTTGTAAGACACATCATATTTGACATTCTGTATGCAATTTCTCCGTCTTG
TGTGAACTTTGAAACGTCGGCTTCTTCCACTCTTGTAAGTCTTTATGTGTTATCCGCTGA
GTCATTGTTGTCAACAAC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RS1FW37JQ C 1
AF RS1FW37TF U 1
AF RS1B429TF U 4
AF RS1B429JQ C 198
BS 1 5 RS1FW37JQ
BS 6 492 RS1FW37TF
BS 493 493 RS1B429TF
BS 494 530 RS1FW37TF
BS 531 531 RS1B429TF
BS 532 665 RS1FW37TF
BS 666 666 RS1B429JQ
BS 667 687 RS1B429TF
BS 688 688 RS1B429JQ
BS 689 710 RS1B429TF
BS 711 711 RS1B429JQ
BS 712 733 RS1B429TF
BS 734 738 RS1B429JQ

RD RS1FW37JQ 671 0 0
GGGCCTCGTGTGTCCTCTCTGTCTCAGCTTTCCCTCAACCATCAGAGAAGAATGGGACCT
GGAGATAGTGAAACAATGGAATGCAAGTGTGGTATGCCTCTTTGCATCTGTGTTGCTCCA
CCCAAAACCTCACAGGCTACACCGGCTCCTATGGCTCTTTCTCAGTCAGGTCCCAGACCA
AAGTCTGACACTTCAGCTAAAAGTAAAGGTTCCACTTCCAGCAGCAATGCTACTAGACTA
GACAAGCCCCAAAAAGAATATCAAGTCAATGGGGAGGGATTAAGAGAAGCAATTAAGAAT
GGTGACACTGCTGGCGTGAAAAAGCTTCTGAACGAGGGCGTGGATGCAAATTACCATGAC
AAGCAGGGAATGTCAGTGCTTCATCTGGCGGTTTTATTCAACCAAACTGATATTGCGTTG
ATGTTAATGGAACATGGAGCAAACCTTGACTACAAAAATGCACAAGGAGAAACACCACTA
GATTGTGCTCCT*CAACGCTGCAATATAAGATGCGGGAAAAGATGAAGTCGACTTAATAT
GAATTCAGGCAGAGTTACAAATCTTTCCTCAAAAAGTCTGTAAAGGACAAATCAAGGGGT
CATGAATTTGCTTGTAAGACACATCATATTTGACATTCTGTATGCAATTTCTCCGTCTTG
TGTGA
ACTTTG

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1FW37TF 671 0 0
GGGCC
TCGTGTGTCCTCTCTGTCTCAGCTTTCCCTCAACCATCAGAGAAGAATGGGACCTGGAGA
TAGTGAAACAATGGAATGCAAGTGTGGTATGCCTCTTTGCATCTGTGTTGCTCCACCCAA
AACCTCACAGGCTACACCGGCTCCTATGGCTCTTTCTCAGTCAGGTCCCAGACCAAAGTC
TGACACTTCAGCTAAAAGTAAAGGTTCCACTTCCAGCAGCAATGCTACTAGACTAGACAA
GCCCCAAAAAGAATATCAAGTCAATGGGGAGGGATTAAGAGAAGCAATTAAGAATGGTGA
CACTGCTGGCGTGAAAAAGCTTCTGAACGAGGGCGTGGATGCAAATTACCATGACAAGCA
GGGAATGTCAGTGCTTCATCTGGCGGTTTTATTCAACCAAACTGATATTGCGTTGATGTT
AATGGAACATGGAGCAAACCTTGACTACAAAAATGCACAAGGAGAAACACCACTAGATTG
TGCTCCT*CAACGCTGCAATATAAGATGCGGGAAAAGATGAAGTCGACTTAATATGAATT
CAGGCAGAGTTACAAATCTTTCCTCAAAAAGTCTGTAAAGGACAAATCAAGGGGTCATGA
ATTTGCTTGTAAGACACATCATATTTGACATTCTGTATGCAATTTCTCCGTCTTGTGTGA
ACTTTG

QA 6 665 6 665
DS 

RD RS1B429TF 734 0 0
GG
TCGTGTGTCCTCTCTGTCTCAGCTTTCCCTCAACCATCAGAGAAGAATGGGACCTGGAGA
TAGTGAAACAATGGAATGCAAGTGTGGTATGCCTCTTTGCATCTGTGTTGCTCCACCCAA
AACCTCACAGGCTACACCGGCTCCTATGGCTCTTTCTCAGTCAGATCCCAGACCAAAGTC
TGACACTTCAGCTAAAAGTAAAGGTTCCACTTCCAGCAGCAATGCTACTAGACTAGACAA
GCCCCAAAAAGAATATCAAGTCAATGGGGAGGGATTAAGAGAAGCAATTAAGAATGGTGA
CACTGCTGGCGTGAAAAAGCTTCTGAATGAGGGCGTGGATGCAAATTTCCATGACAAGCA
GGGAATGTCAGTGCTTCATCTGGCGGTTTTATTCAACCAAACTGATATTGCGTTGATGTT
AATGGAACATGGAGCAAACCTTGACTACAAAAATGCACAAGGAGAAACACCACTAGATTG
TGCTCCTGCAACGCTGCAATATAAGATGCGGGAAAAGATGAAGTCCACTTAATATGAATT
CAGGCTGAGTTACAAATCTTTCCTCAAAAAGTCTGTAAAGGACAAATCAAGGGGTCATGA
ATTTGCTTGTAAGACATATCATATT*GACATTCTGTATGCAATTTCTCCGTCTTGTGTGA
*CTTTGAAACGTCGGCTTCTTC*ACTCTTGTAAGTCTTTATGTGT*ATCCGCTGAGTCAT
TGTTGTCA
CACA

QA 3 730 3 730
DS 

RD RS1B429JQ 541 0 0
TAAAAGTAAAGGTTCCACTTCCAGCAGCAATGCTACTAGACTAGACAAGCCCCAAAAAGA
ATATCAAGTCAATGGGGAGGGATTAAGAGAAGCAATTAAGAATGGTGACACTGCTGGCGT
GAAAAAGCTTCTGAATGAGGGCGTGGATGCAAATTTCCATGACAAGCAGGGAATGTCAGT
GCTTCATCTGGCGGTTTTATTCAACCAAACTGATATTGCGTTGATGTTAATGGAACATGG
AGCAAACCTTGACTACAAAAATGCACAAGGAGAAACACCACTAGATTGTGCTCCTGCAAC
GCTGCAATATAAGATGCGGGAAAAGATGAAGTCCACTTAATATGAATTCAGGCTGAGTTA
CAAATCTTTCCTCAAAAAGTCTGTAAAGGACAAATCAAGGGGTCATGAATTTGCTTGTAA
GACATATCATATT*GACATTCTGTATGCAATTTCTCCGTCTTGTGTGAACTTTGAAACGT
CGGCTTCTTCCACTCTTGTAAGTCTTTATGTGTTATCCGCTGAGTCATTGTTGTCAACAA
C

QA 1 541 1 541
DS 



AS 1 2

CO CL3082Contig1 853 2 16 U
CAACCAGAACTTTCCTTTCGAATATGTATTAGGTATAAAGTCTTATACATTTTTTTTGAA
CGGATGGATCCACAACATGAACAAAAAAAGAGAGGGGGATAAAGGATGATCGCACTTTTT
TTACTAAAGATACGTTTAATTTGAAGACTAGAAACTTATCAAAATTAATCAATCCTATGC
CAAGAACCAGATTTGAACTGGTGACACGAGGATTTTCAGTCCTCTGCTCTACCAACTGAG
CTATCCCGGCCATTACCGAAGTATCATTCTCATTTTATGAGATGACTTAGGTCTATGTCA
ATTAAAAGAAACGCAAAAGTAGTAAATGAAAAAAGTTTTGGACCGGGAATTCATTGGATC
TTCGAAAAGAAGACTTTCTAAGTTTTAGAATGAAAAATGATTTAAATTCGAAATAATTCA
AATCGATATTTCTTTCTCATTTGTATATGTATGATATATCCCACAAGACTTGTCTATAAT
AAGAAAAGAAATTCGAGTTTGTAAAAGTGTCGGATGAATGAAAAAAGATAATGAATTCTT
GAATAACTAAAAAAAGGGTAAGGTGTCAAACAAACTTTTTTAGGGAATAGGGTTGGGGGA
TAGAGGGACTTGAACCCTCACGATTTTAAAAGTCAACGGATTTTCATCTTACTATAAATT
TCATTGTTGTCAGTATTGACATGTAGAATGGGACTCTATCTTTATTCTCGTCCGATTAAT
AAGTTCCACCAAGGATCTATCAGACTATGAAGTGAATCATTTGATTCAACACAAGGGATT
GAACTCATTTGTTAGACAGCTTCCATTGAGTCTCTGCACCTATCCCGCTTTCTAACTCTG
GTTTTTCGCGTAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BQ55JQ U 1
AF RS1GU64JQ U 1
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CGGATGGATCCACAACATGAACAAAAAAAGAGAGGGGGATAAAGGGTGATTGCACTTTTT
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GAATAACTAAAAAAAGGGTAAGGTGTCAAACAGACTTTTTTAGGGAATAGGGTTGGGGGA
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TCATTGTTGTCAGTATTGACATGTAGAATGGGACTCTATCTTTATTCTCGTCCGATTAAT
AAGT*CCACCAAGGATCTATCAGACTATGAAGTGAATCATT

QA 1 761 1 761
DS 

RD RS1GU64JQ 853 0 0
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CGGATGGATCCACAACATGAACAAAAAAAGAGAGGGGGATAAAGGATGATCGCACTTTTT
TTACTAAAGATACGTTTAATTTGAAGACTAGAAACTTATCAAAATTAATCAATCCTATGC
CAAGAACCAGATTTGAACTGGTGACACGAGGATTTTCAGTCCTCTGCTCTACCAACTGAG
CTATCCCGGCCATTACCGAAGTATCATTCTCATTTTATGAGATGACTTAGGTCTATGTCA
ATTAAAAGAAACGCAAAAGTAGTAAATGAAAAAAGTTTTGGACCGGGAATTCATTGGATC
TTCGAAAAGAAGACTTTCTAAGTTTTAGAATGAAAAATGATTTAGATTCGAAATAATTCA
AATCGATATTTCTTTCTCATTTGTATATGTATGATATATCCCACAAGACTTGTCTATAAT
AAGAAAAGAAATTCGAGTTTGTAAAAGTGTCGGATGAATGAAAAAAGATAATGAATTCTT
GAATAACTAAAAAAAGGGTAAGGTGTCAAACAAACTTTTTTAGGGAGTAGGGTTGGGG*A
TAGAGGGACTTGAACCCTCACGATTTTAAAAGTCAACGGATTTTCATCTTACTATAAATT
TCATTGTTGTCAGTATTGACATGTAGAATGGGACTCTATCTTTATTCTCGTCCGATTAAT
AAGTTCCACCAAGGATCTATCAGACTATGAAGTGAATCATTTGATTCAACACAAGGGATT
GAACTCATTTGTTAGACAGCTTCCATTGAGTCTCTGCACCTATCCCGCTTTCTAACTCTG
GTTTTTCGCGTAC

QA 1 853 1 853
DS 



AS 1 4

CO CL3083Contig1 1288 4 27 U
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TCCTCCTTCGCTCTCTCATCTTCTCTTTCACTTCCTCCGTATTTATCCATGGGAGGGACA
AAGAGGTTCATGGTTCTGTGTAGCTCTGAGAAATCCCACAAGGAAGATCAGATGACAGGT
TCAATAACTGGAGCAACTGGATTTGTAGGGAGACGATTGGTTTACAAACTACGTTCTGAT
AATCACTCTGACCGTGTCTTAACTCGCTCTAAATCCAAAGCTGAGCTTATTTTTCCTGCC
AAGGACTTCCCAGGTATCGTGATTGCTGAAGAACGGGAGTGGCGAGACTGCATTCAAGGC
TCTACTGCTGTTGTCAACTTGGCTGGTCTGCCTATTAGTACAAGATGGTCTCCCGAGATC
AAGAAAGAGATCAAGGACAGCCGAGTCCGCGTCACCTCTAAAGTTGTTGAGTTGATTAAT
AATTCACCTGTGGATGCTCGACCTACCGTTCTAGTTAGCGCCACAGCTGTTGGTTACTAT
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GAGGTTTGCAGAGAATGGGAAGGAACCGCGCTGAAAGCCAATAAGGATGTAAGAGTTGCA
CTTATCCGCATTGGTGTTGTTCTTGGTAAAGATGGTGGGGCTTTAGCCATGATGATACCC
TTTTTCCAAATGTTTGCTGGAGGACCTCTCGGTTCAGGACAACAATGGTTCTCTTGGATT
CACGTGGATGACTTGGTGAATCTAATCTATGAAGCCCTCACTAAACCATCCTATCAAGGA
GTTATAAATGGGACAGCGCCAAACCCAGTTAGGCTTGGGGAGATGTGTCAGCAGCTAGGC
AGCGTTCTTGGTCGACCGTCATGGCTACCAGTTCCTGACTTTGCACTCAAAGCTTTGCTC
GGAGAAGGTGCAACTGTGGTTCTCGAAGGACAGAAGGTTTTACCTGTAAGAGCCAAAGAG
CTTGACTTTGAATTCAAATACAAATACGTGAAAGATGCACTCAGAGCCATTATGCAGTAA
GATGACGACAACACAGAGATCATCTTCCAGCTTCAGATTTGGTCAACAGAAAAACAATTG
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AATAGAAAACAAGTGATTCTACCATCTCTCACCCATCAAACCAGAGGATAAAAACCAGAG
AGAGCTTTATTAAATCATTTTGTTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 15 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E127TF U 1
AF RS1EI52TF U 5
AF RS1EI52JQ C 370
AF RS1E127JQ C 518
BS 1 176 RS1E127TF
BS 177 177 RS1EI52TF
BS 178 250 RS1E127TF
BS 251 251 RS1EI52TF
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BS 746 770 RS1EI52JQ
BS 771 771 RS1E127JQ
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BS 972 972 RS1E127JQ
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BS 1025 1025 RS1E127JQ
BS 1026 1081 RS1EI52JQ
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BS 1083 1223 RS1EI52JQ
BS 1224 1288 RS1E127JQ

RD RS1E127TF 751 0 0
GGGTTTAACGATCAAATCAGCAACACCATGGAGCTTCTCTGCTCACCAGCGTCTCTTTCC
TCCTCCTTCGCTCTCTCATCTTCTCTTTCACTTCCTCCGTATTTATCCATGGGAGGGACA
AAGAGGTTCATGGTTCTGTGTAGCTCTGAGAAATCCCACAAGGAAGATCAGATGAC*GGT
TCAATAACTGGAGCAACTGGATTTGTAGGGAGACGATTGGTTTACAAACTACGTTCTGAT
AATCACTCTGTCCGTGTCTTAACTCGCTCTAAATCCAAAGCTGAGCTTATTTTTCCTGCC
AAGGACTTCCCAGGTATCGTGATTGCTGAAGAACGGGAGTGGCGAGACTGCATTCAAGGC
TCTACTGCTGTTGTCAACTTGGCTGGTCTGCCTATTAGTACAAGATGGTCTCCCGAGATC
AAGAAAGAGATCAAGGACAGCCGAGTCCGCGTCACCTCTAAAGTTGTTGAGTTGATTAAT
AATTCACCTGTGGATGCTCGACCTACCGTTCTAGTTAGCGCCACAGCTGTTGGTTACTAT
GGTACTAGTGAGACGGGAGTATTTGATGAAAAGAGCCCATCACGAAATGATTATCTTTCA
GAGGTTTGCAGAGAATGGGAAGGAACCGCGCTGAAAGCCAATAACGATGTAAGAGTTGCA
CTTATCCGCATTGGTGTTGTTCTTGGTAAAGATGGTGGGGCTTTAGCCATGATGATACC*
TTTTTCCAA*TGTTTGCTGGAGGAC
TCTGGG

QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1EI52TF 736 0 0
GG
AACGATCAAATCAGCAACACCATGGAGCTTCTCTGCTCACCAGCGTCTCTTTCCTCCTCC
TTCGCTCTCTCATCTTCTCTTTCACTTCCTCCGTATTTATCCATGGGAGGGACAAAGAGG
TTCATGGTTCTGTGTAGCTCTGAGAAATCCCACAAGGAAGATCAGATGACAGTTTCAATA
ACTGGAGCAACTGGATTTGTAGGGAGACGATTGGTTTACAAACTACGTTCTGATAATCAC
TCTGACCGTGTCTTAACTCGCTCTAAATCCAAAGCTGAGCTTATTTTTCCTGCCAAGGAC
TTCCCAGGTATCGTGATTGCTGAAGAACGGGAGTGGCGAGACTGCATTCAAGGCTCTACT
GCTGTTGTCAACTTGGCTGGTCTGCCTATTAGTACAAGATGGTCTCCCGAGATCAAGAAA
GAGATCAAGGACAGCCGAGTCCGCGTCACCTCTAAAGTTGTTGAGTTGATTAATAATTCA
CCTGTGGATGCTCGACCTACCGTTCTAGTTAGCGCCACAGCTGTTGGTTACTATGGTACT
AGTGAGACGGGAGTATTTGATGAAAAGAGCCCATCAGGAAATGATTATCTTTCAGAGGTT
TGCAGAGAATGGGAAGGAACCGCGCTGAAAGCGAAAAA*GATGTAAGAGTTGCACTTATC
CGCATTGGTGTTGTTCTTGGTAAAGATGGTGGGGCTTTAGCCATGATGATACCCTTTTTC
CAAATGTTTGCTGG

QA 3 736 3 736
DS 

RD RS1EI52JQ 854 0 0
GCTGTGTCACTTGGCT
GTCTGCCTATTAGTACAAGATG*TCTCCCGAGATCAAGAAAGAGATCAAGGACAGC*GAG
TCCGCGTCACCTCTAAAGTTGTTGAGTTGATTAATAATTCACCTGTGGATGCTCGACCTA
CCGTTCTAGTTAGCGCCACAGCTGTTGGTTACTATGGTACTAGTGAGACGGGAGTATTTG
ATGAAAAGAGCCCATCAGGAAATGATTATCTTTCAGAGGTTTGCAGAGAATGGGAAGGAA
CCGCGCTGAAAGCGAATAAGGATGTAAGAGTTGCACTTATCCGCATTGGTGTTGTTCTTG
GTAAAGATGGTGGGGCTTTAGCCATGATGATACCCTTTTTCCAAATGTTTGCTGGAGGAC
CTCTCGGTTCAGGACAACAATGGTTTTCTTGGATTCACGTGGATGACTTGGTGAATTTAA
TCTATGAAGCCCTCACTAAACCATCCTATCAAGGAGTTATAAATGGGACAGCGCCAAACC
CAGTTAGGCTTGGGGAGATGTGTCAGCAGCTAGGCAGCGTTCTTGGTCGACCGTCATGGC
TACCAGTTCCTGACTTTGCACTCAAAGCTTTGCTCGGAGAAGGTGCCACTGTTGTTCTCG
AAGGACAGAAGGTTTTACCTGTAAGAGCCAAAGAGCTTGGCTTTGAATTCAAATACAAAT
ACGTGAAAGATGCACTCAGAGCCATTATGCAGTAAGGTGACGACAACACAGAGATCATCT
TCCAGCTTCAGATTTGGTCAACAGAAAAACAATTGAGATTCTTTTGCTATTTGTTATTTT
TGAGCAAAAACTCAGAGGCGATGTATGTATCTGACAATAGAAAACAAGTGATTCTACC

QA 17 854 17 854
DS 

RD RS1E127JQ 771 0 0
GCGCCACAGCTGTTGGTTACTATGGTACTAGTGAGACGGGAGTATTTGATGAAAAGAGCC
CATCAGGAAATGATTATCTTTCAGAGGTTTGCAGAGAATGGGAAGGAACCGCGCTGAAAG
CCAATAAGGATGTAAGAGTTGCACTTATCCGCATTGGTGTTGTTCTTGGTAAAGATGGTG
GGGCTTTAGCCATGATGATACCCTTTTTCCAAATGTTTGCTGGAGGACCTCTGGGTTCAG
GACAACAGTGGTTCTCTTGGATTCACGTGGATGACTTGGTGAATCTAATCTATGAAGCCC
TCACTAAACCATCCTATCAAGGAGTTATAAATGGGACAGCGCCAAACCCAGTTAGGCTTG
GGGAGATGTGTCAGCAGCTAGGCAGCGTTCTTGGTCGACCGTCGTGGCTACCAGTTCCTG
ACTTTGCACTCAAAGCTTTGCTCGGAGAAGGTGCAACTGTGGTTCTCGAAGGACAGAAGG
TTTTACCTGTAAGAGCCAAAGAGCTTGACTTTGAATTCAAATACAAATACGTGAAAGATG
TACTCAGAGCCATTATGCAGTAAGATGAC***AACACAGAGATCATCTTCCAGCTTCAGA
TTTGGTCA*CAGAAAAACAATTGAGATTCTTTTGCTATTTGTTATTTTTGAGCAAAAACT
CAGAGGCGATGTATGTATCTGACAATAGAAAACAAGTGATTCTACCATCTCTCACCCATC
AAACCAGAGGATAAAAACCAGAGAGAGCTTTATTAAATCATTTTGTTTCCC

QA 1 771 1 771
DS 



AS 2 4

CO CL3084Contig1 332 2 2 U
GCAGATTTCTATTAGCCATTATAATAGAGGATATCGTACAGCCCCCTTTTGATGTAACTT
TGAGCACACGAGGATTTGAATACGAACTTGAATATGATTCAATGGAGCAAGTAATTGATA
CTCATCTGAATACCTGGAGTACGACGTGCATTCTCTCCATCTCCAAGACCAAAAAGTTCC
ACGAGATTCATAATAACAATGATGAACTGTGAAGTTGTGGGTGTTTTTCTTATTTTAGAT
CAGAAATAATGTGTTTTTTTTTGTGTGTGTGGAGTTTTCACCTCACCATGCAACTATGGT
AATTAATTGATATCATACAAGAGTCTTATACC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BM12JQ C 1
AF RS1BM12TF U 1
BS 1 1 RS1BM12JQ
BS 2 332 RS1BM12TF

RD RS1BM12JQ 332 0 0
GCAGATTTCTATTAGCCATTATAATAGAGGATATCGTACAGCCCCCTTTTGATGTAACTT
TGAGCACACGAGGATTTGAATACGAACTTGAATATGATTCAATGGAGCAAGTAATTGATA
CTCATCTGAATACCTGGAGTACGACGTGCATTCTCTCCATCTCCAAGACCAAAAAGTTCC
ACGAGATTCATAATAACAATGATGAACTGTGAAGTTGTGGGTGTTTTTCTTATTTTAGAT
CAGAAATAATGTGTTTTTTTTTGTGTGTGTGGAGTTTTCACCTCACCATGCAACTATGGT
AATTAATTGATATCATACAAGAGTCTTATACC

QA 1 332 1 332
DS 

RD RS1BM12TF 332 0 0
G
CAGATTTCTATTAGCCATTATAATAGAGGATATCGTACAGCCCCCTTTTGATGTAACTTT
GAGCACACGAGGATTTGAATACGAACTTGAATATGATTCAATGGAGCAAGTAATTGATAC
TCATCTGAATACCTGGAGTACGACGTGCATTCTCTCCATCTCCAAGACCAAAAAGTTCCA
CGAGATTCATAATAACAATGATGAACTGTGAAGTTGTGGGTGTTTTTCTTATTTTAGATC
AGAAATAATGTGTTTTTTTTTGTGTGTGTGGAGTTTTCACCTCACCATGCAACTATGGTA
ATTAATTGATATCATACAAGAGTCTTATACC

QA 2 332 2 332
DS 



CO CL3084Contig2 583 2 2 U
CTTACTCAGATGAGTATCAATTACTTGCTCCATTGAATCATATTCAAGTTCGTATTCAAA
TCCTCGTGTGCTCAAAGTTACATCAAAAGGGGGCTGTGCACGATATCCTCTATTATAATG
GCTAATAGAAATCTGAAATGAAGTTGAGCCTTTCGCAATTTCAGCTTTTATTGACCGCGG
AAGAATCACAGTACCGCCTATGCAGTTATGATCAGTTTGTCGCGGTAAGTCCAACGTCAC
GTTGTTCAAGCAGTACGTGTACGTGCCGGCATCACCGTCCTCACTGAAAGAAACAAAGCC
GTGTTGTGTGCCTTCAGAACCCAAAGTTCCAAATAATGTTTCCTTTTTTACCCATATCCA
CGCTAATTTCCATGGCTGTTCCAATTCGTGATCCACCACGTAGTTGGAGATTGTGACGTT
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TTAACCCCGTTGTGAGAGAAACCAAAAACAAATCATTATACTGTATTGTATAATTGCTTG
ACTATGTACTATCATATGTAAGATTCATTCAGCTATATAGTTC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1E084JQ C 1
AF RS1E084TF U 1
BS 1 5 RS1E084JQ
BS 6 583 RS1E084TF

RD RS1E084JQ 583 0 0
CTTACTCAGATGAGTATCAATTACTTGCTCCATTGAATCATATTCAAGTTCGTATTCAAA
TCCTCGTGTGCTCAAAGTTACATCAAAAGGGGGCTGTGCACGATATCCTCTATTATAATG
GCTAATAGAAATCTGAAATGAAGTTGAGCCTTTCGCAATTTCAGCTTTTATTGACCGCGG
AAGAATCACAGTACCGCCTATGCAGTTATGATCAGTTTGTCGCGGTAAGTCCAACGTCAC
GTTGTTCAAGCAGTACGTGTACGTGCCGGCATCACCGTCCTCACTGAAAGAAACAAAGCC
GTGTTGTGTGCCTTCAGAACCCAAAGTTCCAAATAATGTTTCCTTTTTTACCCATATCCA
CGCTAATTTCCATGGCTGTTCCAATTCGTGATCCACCACGTAGTTGGAGATTGTGACGTT
AGCCGAGTAACTACCATCACTTTCAATTGCCATGTCCCACCTTATATCCACATTCGCGTC
TTAACCCCGTTGTGAGAGAAACCAAAAACAAATCATTATACTGTATTGTATAATTGCTTG
ACTATGTACTATCATATGTAAGATTCATTCAGCTATATAGTTC

QA 1 583 1 583
DS 

RD RS1E084TF 583 0 0
CTTAC
TCAGATGAGTATCAATTACTTGCTCCATTGAATCATATTCAAGTTCGTATTCAAATCCTC
GTGTGCTCAAAGTTACATCAAAAGGGGGCTGTGCACGATATCCTCTATTATAATGGCTAA
TAGAAATCTGAAATGAAGTTGAGCCTTTCGCAATTTCAGCTTTTATTGACCGCGGAAGAA
TCACAGTACCGCCTATGCAGTTATGATCAGTTTGTCGCGGTAAGTCCAACGTCACGTTGT
TCAAGCAGTACGTGTACGTGCCGGCATCACCGTCCTCACTGAAAGAAACAAAGCCGTGTT
GTGTGCCTTCAGAACCCAAAGTTCCAAATAATGTTTCCTTTTTTACCCATATCCACGCTA
ATTTCCATGGCTGTTCCAATTCGTGATCCACCACGTAGTTGGAGATTGTGACGTTAGCCG
AGTAACTACCATCACTTTCAATTGCCATGTCCCACCTTATATCCACATTCGCGTCTTAAC
CCCGTTGTGAGAGAAACCAAAAACAAATCATTATACTGTATTGTATAATTGCTTGACTAT
GTACTATCATATGTAAGATTCATTCAGCTATATAGTTC

QA 6 583 6 583
DS 



AS 1 3

CO CL3085Contig1 738 3 13 U
GTGTTGAACTTTTGAGATGTTCTTCTTTGTTTACAAGTTACATTGATTGCCTTAAGCAAT
AGCAAAGGAGAGGGCACGCACATACGTTCATACATACACACATTTTACACATATGGAATA
ACAATATAAGCAACTTAGGACACTGGACCAGAA*CCAGAGGACTTGATGTTTTGTTTTAA
CTTAGTTTCTGGACTCGAAGGGGATTGCTCTGATGACAATCACATGGTAAAGAGCAGCAA
GTGCAGCACCAATGAAGGGTCCAACCCAAAACACCCAGTGGTCGTCCCAGGAATGGTCTT
TGTTGTAGATGATTGCAGCTCCAAGACTTCTAGCTGGGTTGATGCCTGTGCCAGTGATTG
GGATGGTTGCTAAGTGAACCAAGAAAACCGCAAACCCGATTGGGAGTGGTGCAAGAATAG
GGACATGAGAGTCACGGGCGTTTCTCTTGGCGTCAGTGGCTGAGAAAACTGTGTAAACGA
GGACGAATGTACCGATGATTTCAGCACCAAGACCACTACCTTTGGTGTATCCATGAGCCA
CAGTGTTGGCTCCTCCTCCTAGAGCCTGGTATTGATTAGGCTGGAAACCTTTAACCACAC
CAGCTCCGCATATGGCTCCCAAGCACTGCATCACTATGTAGTACAAAGCTCTGGTGAGTG
ACAGCTTCCTAGCTAAGAAAAGACCAAAAGTGACCGCTGGGTTGATGTGTCCACCGGAGA
TACCGGCGGTGCAGTAGA


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BK91JQ U 6
AF RS1BK91TF C 6
AF RS1DR18JQ U 1
BS 1 37 RS1DR18JQ
BS 38 38 RS1BK91JQ
BS 39 59 RS1DR18JQ
BS 60 65 RS1BK91JQ
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BS 128 153 RS1DR18JQ
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BS 159 195 RS1DR18JQ
BS 196 196 RS1BK91JQ
BS 197 738 RS1DR18JQ

RD RS1BK91JQ 592 0 0
GAACTTTTGAGATGTTCTTCTTTGTTTACAAGTTACATTGATTGCCTTAAGCAATAGCAA
AGGAGAGGGCACGCACATACGTTCATACATACACACATTTTACACATATGGAATAACAAT
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TAGATGATTGCAGCTCCAAGACTTCTAGCTGGGTTGATGCCTGTGCCAGTGATTGGGATG
GTTGCTAAGTGAACCAAGAAAACCGCAAACCCGATTGGGAGTGGTGCAAGAATAGGGACA
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AATGTACCGATGATTTCAGCACCAAGACCACTACCTTTGGTGTATCCATGAGCCACAGTG
TTGGCTCCTCCTCCTAGAGCCTGGTATTGATTAGGCTGGAAACCTTTAACC
C

QA 1 591 1 591
DS 

RD RS1BK91TF 592 0 0
GAACTTTTGAGATGTTCTTCTTTGTTTACAAGTTACATTGATTGCCTTAAGCAATAGCAA
AGGAGAGGGCACGCACATACGTTCATACATACACACATTTTACACATATGGAATAACAAT
ATAAGCAACTTAGGACACTGGACCAGAA*CCAGAGGACTTGATGTTTTGTTTTAACTTAG
TTTCTGGACTCGAAGGGGATTGCTCTGATGACAATCACATGGTAAAGAGCAGCAAGTGCA
GCACCAATGAAGGGTCCAACCCAAAACACCCAGTGGTCGTCCCAGGAATGGTCTTTGTTG
TAGATGATTGCAGCTCCAAGACTTCTAGCTGGGTTGATGCCTGTGCCAGTGATTGGGATG
GTTGCTAAGTGAACCAAGAAAACCGCAAACCCGATTGGGAGTGGTGCAAGAATAGGGACA
TGAGAGTCACGGGCGTTTCTCTTGGCGTCAGTGGCTGAGAAAACTGTGTAAACGAGGACG
AATGTACCGATGATTTCAGCACCAAGACCACTACCTTTGGTGTATCCATGAGCCACAGTG
TTGGCTCCTCCTCCTAGAGCCTGGTATTGATTAGGCTGGAAACCTTTAACC
C

QA 1 591 1 591
DS 

RD RS1DR18JQ 738 0 0
GTGTTGAACTTTTGAGATGTTCTTCTTTGTTTACAAGCTACATTGATTGCCTTAAGCAA*
*****AGGAGAGGGCACGCACATACGTTCATACATACACACATTTTACACATATGGAATA
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CTTAGTTTCTGGACTTGAAGGGGATTGCTCTGATGACAATCACATGGTAAAGAGCAGCAA
GTGCAGCACCAATGAAGGGTCCAACCCAAAACACCCAGTGGTCGTCCCAGGAATGGTCTT
TGTTGTAGATGATTGCAGCTCCAAGACTTCTAGCTGGGTTGATGCCTGTGCCAGTGATTG
GGATGGTTGCTAAGTGAACCAAGAAAACCGCAAACCCGATTGGGAGTGGTGCAAGAATAG
GGACATGAGAGTCACGGGCGTTTCTCTTGGCGTCAGTGGCTGAGAAAACTGTGTAAACGA
GGACGAATGTACCGATGATTTCAGCACCAAGACCACTACCTTTGGTGTATCCATGAGCCA
CAGTGTTGGCTCCTCCTCCTAGAGCCTGGTATTGATTAGGCTGGAAACCTTTAACCACAC
CAGCTCCGCATATGGCTCCCAAGCACTGCATCACTATGTAGTACAAAGCTCTGGTGAGTG
ACAGCTTCCTAGCTAAGAAAAGACCAAAAGTGACCGCTGGGTTGATGTGTCCACCGGAGA
TACCGGCGGTGCAGTAGA

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 3

CO CL3086Contig1 451 3 3 U
GCTGGAATTTGAGCATGAAAATTAATATTAAAAGATGGTTTCAAAATTGAACAGCACAGT
AACCTAGTCTTTGTAAAATAGAATATGAAGATTGTGAATAAAGGAAATGAACCAAATGAG
AGTTTACTTCATCCTAAATATCACAAAAACAGAATCAAAAGCTCTCTCCTCAGAATCACT
CTTCCTTTCAAGCTTCAACTGGGTACTCAAAAGTGACATCCTTTCCAGTGAGTTTACGGT
ACACACCAATCATAGTCTCGAGCTTGTACTCTGTGTTGTTCCTTTCTTTGGTATCCAAGT
AAACCTTCATGATCTTGGAACCATCAAGACGGTAACGAGTACGTTTGCCAACAATCTCAG
CAGGGTAAGCGACATCCTCGAGCATAGCTTCCTGAACAGAGGTAAAAATTCTGTTGCGTG
GCCTCTGAACAGCAGCACCCTTCTTGGGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1D056JQ U 61
AF RS1AB13JQ U 1
AF RS1AB13TF C 338
BS 1 129 RS1AB13JQ
BS 130 130 RS1D056JQ
BS 131 451 RS1AB13JQ

RD RS1D056JQ 217 0 0
AACCTAGTCTTTGTAAAATAGAATATGAAGATTGTGAATAAAGGAACTGAACCAAATGAG
AGTTTACTTCATCCTAAATATCACAAAAACAGAATCAAAAGCTCTCTCCTCAGAATCACT
CTTCCTTTCAAGCTTCAACTGGGTACTCAAAAGTGACATCCTTTCCAGTGAGTTTACGGT
ACACACCAATCATAGTCTCGAGCTTGTACTCTG
CGTT

QA 1 213 1 213
DS 

RD RS1AB13JQ 451 0 0
GCTGGAATTTGAGCATGAAAATTAATATTAAAAGATGGTTTCAAAATTGAACAGCACAGT
AACCTAGTCTTTGTAAAATAGAATATGAAGATTGTGAATAAAGGAAATGAACCAAATGAG
AGTTTACTTTATCCTAAATATCACAAAAACAGAATCAAAAGCTCTCTCCTCAGAATCACT
CTTCCTTTCAAGCTTCAACTGGGTACTCAAAAGTGACATCCTTTCCAGTGAGTTTACGGT
ACACACCAATCATAGTCTCGAGCTTGTACTCTGTGTTGTTCCTTTCTTTGGTATCCAAGT
AAACCTTCATGATCTTGGAACCATCAAGACGGTAACGAGTACGTTTGCCAACAATCTCAG
CAGGGTAAGCGACATCCTCGAGCATAGCTTCCTGAACAGAGGTAAAAATTCTGTTGCGTG
GCCTCTGAACAGCAGCACCCTTCTTGGGAGC

QA 1 451 1 451
DS 

RD RS1AB13TF 114 0 0
AGTACGTTTGCCAACAATCTCAGCAGGGTAAGCGACATCCTCGAGCATAGCTTCGTGAAC
AGAGGTAAGAGTTCTGTTGCGTGGCCTCTGAACAGCAGCACCCTTCTTGGGAGC

QA 1 114 1 114
DS 



AS 1 4

CO CL3087Contig1 803 4 4 U
GGAAAGCTCTGTTGGACATAACCAGCCTAGAATTCCAGCCAAAGTCCAACTTGGGATCAA
ATTCATATGAAGAATACAAGTTGAGCACATCCAAGTTCCAAACCTGGTTCTACAATACAA
TTCGCAGATTCAGATTGAACCCTCGACTTGGAAAACATTAGGGTAGCTGCTGAGTAGACT
TATCCTTGGTCCTTTATTTTAAAGGTAAAGTATCAACGTGTTCCTGGCCATGTCGTTGGT
CGCAAGTAATTTAAGCAAGTGACTTGTATATCTTTTTATTATTTGTATAAATATAATCAA
TTCTTGTATTTCTTATAAATGCCTGACTTGGTTAGTCATAAACATGTATATATATTCTTA
GCTAGGAAACAATTTTTTTTCTTCCTAGGTAGGGGATGTAAAGCCGAAAAAATGAAGAAG
ATTCGATCCCCCCACTTCTTCTGCTCTCAAACTATCTCATGGATGATGGCTTGGTGGGCA
CACTCTGCTCATCCCTGAAGAAGTTTTCTGGATCCACTGCTGTTTTTACGTTGACCAACC
GATCAAAATTCTCTCCGAAGTACTTTCTCCCGTAAACCTCAGCTTCTCTGTAACTGTTTG
GACCATGACTGTTGATCCCTATTTCAAGATCCCTGTAGTTTAGATACGTGTGCCTTGGAT
TCTTGGTGACGAAAGGAGCCATGTAGCTGTAGAAGCTTCTGGTCTTTTCCATGAAACTGT
TCTCCGCTTCTATCCCCGCATCTTTCCAGTTCATTGAGTGCTGCACCTTGAATAGCCTTT
TCCTGTGAGGGAAGGGGGTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1AP63JQ U 137
AF RS1AW20JQ U 1
AF RS1AP63TFB C 31
AF RS1AW20TF C 39
BS 1 419 RS1AW20JQ
BS 420 420 RS1AP63TFB
BS 421 717 RS1AW20JQ
BS 718 803 RS1AP63TFB

RD RS1AP63JQ 270 0 0
GAACCCTCGACTTGGAAAACATTAGGGTAGCTGCTGAGTAAACTTATCCTTGGTCCTTTA
TTTTAAAGGTAAAGTATCAACGTGTTCCTGGCCATGTCGTTGGTCGCAAGTAATTTAAGC
AAGTGACTTGTATATCTTTTTATTATTTGTATAAATATAATCAATTCTTGTATTTCTTAT
AAATGCCTGACTTGGTTAGTCATAAACATGTATATATATTCTTAGCTAGGAAACAATTTT
TTTTCTTCCTAGGTAGGGGATGTAAAGCCG

QA 1 270 1 270
DS 

RD RS1AW20JQ 717 0 0
GGAAAGCTCTGTTGGACATAACCAGCCTAGAATTCCAGCCAAAGTCCAACTTGGGATCAA
ATTCATATGAAGAATACAAGTTGAGCACATCCAAGTTCCAAACCTGGTTCTACAATACAA
TTCGCAGATTCAGATTGAACCCTCGACTTGGAAAACATTAGGGTAGCTGCTGAGTAGACT
TATCCTTGGTCCTTTATTTTAAAGGTAAAGTATCAACGTGTTCCTGGCCATGTCGTTGGT
CGCAAGTAATTTAAGCAAGTGACTTGTATATCTTTTTATTATTTGTATAAATATAATCAA
TTCTTGTATTTCTTATAAATGCCTGACTTGGTTAGTCATAAACATGTATATATATTCTTA
GCTAGGAAACAATTTTTTTTCTTCCTAGGTAGGGGATGTAAAGCCGAAAAAATGAAGAAA
ATTCGATCCCCCCACTTCTTCTGCTCTCAAACTATCTCATGGATGATGGCTTGGTGGGCA
CACTCTGCTCATCCCTGAAGAAGTTTTCTGGATCCACTGCTGTTTTTACGTTGACCAACC
GATCAAAATTCTCTCCGAAGTACTTTCTCCCGTAAACCTCAGCTTCTCTGTAACTGTTTG
GACCATGACTGTTGATCCCTATTTCAAGATCCCTGTAGTTTAGATACGTGTGCCTTGGAT
TCTTGGTGACGAAAGGAGCCATGTAGCTGTAGAAGCTTCTGGTCTTTTCCATGAAAC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1AP63TFB 773 0 0
AATTCCAGCCAAAGTCCAACTTGGGATCAAATTCATATGAAGAATACAAGTTGAGCACAT
CCAAGTTCCAAACCTGGTTCTACAATACAATTCGCAGATTCAGATTGAACCCTCGACTTG
GAAAACATTAGGGTAGCTGCTGAGTAGACTTATCCTTGGTCCTTTATTTTAAAGGTAAAG
TATCAACGTGTTCCTGGCCATGTCGTTGGTCGCAAGTAATTTAAGCAAGTGACTTGTATA
TCTTTTTATTATTTGTATAAATATAATCAATTCTTGTATTTCTTATAAATGCCTGACTTG
GTTAGTCATAAACATGTATATATATTCTTAGCTAGGAAACAATTTTTTTTCTTCCTAGGT
AGGGGATGTAAAGCCGAAAAAATGAAGAAGATTCGATCCCCCCACTTCTTCTGCTCTCAA
ACTATCTCATGGATGATGGCTTGGTGGGCACACTCTGCTCATCCCTGAAGAAGTTTTCTG
GATCCACTGCTGTTTTTACGTTGACCAACCGATCAAAATTCTCTCCGAAGTACTTTCTCC
CGTAAACCTCAGCTTCTCTGTAACTGTTTGGACCATGACTGTTGATCCCTATTTCAAGAT
CCCTGTAGTTTAGATACGTGTGCCTTGGATTCTTGGTGACGAAAGGAGCCATGTAGCTGT
AGAAGCTTCTGGTCTTTTCCATGAAACTGTTCTCCGCTTCTATCCCCGCATCTTTCCAGT
TCATTGAGTGCTGCACCTTGAATAGCCTTTTCCTGTGAGGGAAGGGGGTCTTC

QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1AW20TF 765 0 0
CCAAAGTCCA*CTTGGGATCAAATTCATATGAAGA*TACAAGTTGAGCACATCCAAGTTC
CAAACCTGGTTCTACAATACAATTCGCAGATTCAGATTGAACCCTCGACTTGGAAAACAT
TAGGGTAGCTGCTGAGTAGACTTATCCTTGGTCCTTTATTTTAAAGGTAAAGTATCAACG
TGTTCCTGGCCATGTCGTTGGTCGCAAGTAATTTAAGCAAGTGACTTGTATATCTTTTTA
TTATTTGTATAAATATAATCAATTCTTGTATTTCTTATAAATGCCTGACTTGGTTAGTCA
TAAACATGTATATATATTCTTAGCTAGGAAACAATTTTTTTTCTTCCTAGGTAGGGGATG
TAAAGCCGAAAAAATGAAGAAGATTCGATCCCCCCACTTCTTCTGCTCTCAAACTATCTC
ATGGATGATGGCTTGGTGGGCACACTCTGCTCATCCCTGAAGAAGTTTTCTGGATCCACT
GCTGTTTTTACGTTGACCAACCGATCAAAATTCTCTCCGAAGTACTTTCTCCCGTAAACC
TCAGCTTCTCTGTAACTGTTTGGACCATGACTGTTGATCCCTATTTCAAGATCCCTGTAG
TTTAGATACGTGTGCCTTGGATTCTTGGTGACGAAAGGAGCCATGTAGCTGTAGAAGCTT
CTGGTCTTTTCCATGAAACTGTTCTCCGCTTCTATCCCCGCATCTTTCCAGTTCATTGAG
TGCTGCACCTTGAATAGCCTTTTCCTGTGAGGGAAGGGGGTCTTC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 3

CO CL3088Contig1 1063 3 5 U
ATAAGAGAAATATCCAGTAGTAAATTTATTGAAACGAAATTTATGAAGGAAGGTGTCGAA
AACTTCACATTACAGATCCCATTGATGCAACAAGAAAACACGATAATGTTGTTGATACAG
AAATTACAAGTTTCTTTACTTCCGCCGATAACACTCGCAGTACATTCTTAATATCCAGAC
AACACAACAAAAAAAAGGAAGTTACAAGTTTTATGATGGAAACGAGACCATTTACGCCTC
TGCTCTTTGCTTCTGTCAGAACAAGAAGATGATCAAATTGAACATTGTAGGTTTGTAGGT
TTTGTTGCTTATCTTTCACCTCTCTTTTTTTTTGATTAAGCACATCCAAAGAACTGCTCT
ATAGACTGCGAGGTGAACACGTTGGGAGCCGTTCGCTCTGGTTTCAATGCAGACACGTGA
AGCTGGTATTTGATGAACCGAGCTAGTTGTGTGCTGATCTCTGGGTTTGTATCAATATGC
CAGTCAGGTTCTATTTGTCTAACAAAGGATGTTCTTCCGATCTCTGTACTACAGAACAGG
ACCTTATCTTTGACCAAACCACCAGAGTTGAAAACACCTGCAGTCTCTAAAGCCTGTAGA
ACTCTGGCTTCACTTTCGTCGTCAAGAACTCTTTCCATGAGATATAAATCAGAATACTTT
GTAATCTCTAGGAGAACTTCCAGAACCGATGACCTCACTGTTGCTTGTTTTTGGAGTTCT
TCTGGACTTGATTCCTCAAGAATGACTCCAAGAAGACGGCATGTTACCTTCCTTCCTTCA
CTAAGCTTCTGCCTAACAATCTGCCCCAGTGTAGGTTTGACAGGCTGAAAGAAGTGATCA
ACAACATCTTGCACTCCGTTATCCTCATGAGGCAAAGAAACATCTGACTGAGCAGCAGCA
GCAGCACTAGAGGAGGAGGATTCAGCTGACTGCATCGTCCTGCGTTTTGGCTGCCTTCTT
CGAGGCTCCCCTGGTGGTCTTCTTATAGCCCTCCATGTGAATATCACAGCTATCGCAAGC
CCCGCGATTGCACCAATAGATCTTGAATCCAGATTGGGAATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1GF08JQ U 1
AF RS1C461JQ U 31
AF RS1GF08TF C 326
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BS 85 85 RS1C461JQ
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RD RS1GF08JQ 738 0 0
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T
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AGCCGTTCGCTCTGGTTTCAATGCAGACACGTGAAGCTGGTATTTGATGAACCGAGCTAG
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CGATGACCTCACTGTTGCTTGTTTTTGGAGTTCTTCTGGACTTGATTCCTCAAGAATGAC
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DS 



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TCTATCTTCAG


BQ
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G
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AAAAAA

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DS 

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QA 1 666 1 666
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TCTCCAAAAAAAGAGAGGAAATGTTGTATGTATAATTGGCCTCTAGTCTCAACTTATGCT
TCTATCTTCAG

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 3

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AAACCTGACCAAACTCCGAACAATGCAACATATCGATCGAGAGACAAAGAAACCAAACAC
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GAAGACATTTCCGTAGGTAACTCCAGCGAGTCCACCACCGATGAGTGGTCCAACCCAGTA
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GATTTGACCACCGACAGCAAGGCCAAAAGTGACGGCTGGGTTCACATGGCCACCGGAGAT
GTTGGCTCCGATTGCAACCGCCACGAAGAGGGCGAAACCATGACATACGGCGATGGCGAC
AAGCCCCGGGGTATCAAGAGCCGCATCTGACGTCAGCTTCGCGTAGGCAATGGCGGAACC
AACACCAGCGAAAACAAAGAGCAAAGTGGAGATGAACTCAGCCAGGTAAGCTCTTAGAGA
AGCCAAGCTGAAAGAATCATCAAAAGAACCAAAGGCAACTCCAGCCATTGTTTTCGATGA
AAACTGGAGAAGAGGAAGTGAAGTTTTTTGTTTTGCTTAATGAAGAAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A877JQ U 143
AF RS1AX10JQ U 1
AF RS1A877TF C 280
BS 1 702 RS1AX10JQ
BS 703 703 RS1A877TF
BS 704 762 RS1AX10JQ
BS 763 952 RS1A877TF

RD RS1A877JQ 429 0 0
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AGAGAACCCTTTTTGGGATCAGCGGCGGTGGCGTAGACGGTGTAGACTAAAGAGAAAGTG
ATGATGATCTCCATCACTACTCCTTCTATCGCTCCTACTCCCGCAGCAACGCTGTGGGTT
GGAACCGCCAAACCACCGGTGACGTATTTGAGAAGGAAGCAAGCGGCGGTGGAGCCGAGA
AGCTGAGCC

QA 1 429 1 429
DS 

RD RS1AX10JQ 762 0 0
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AAACCTGACCAAACTCCGAACAATGCAACATATCGATCGAGAGACAAAGAAACCAAACAC
AGAATCCTCACATTTTCTTGCTTAGAACTCAGAAGCCAGAGGAACATGTTCGGAAGTCAT
GAAGACATTTCCGTAGGTAACTCCAGCGAGTCCACCACCGATGAGTGGTCCAACCCAGTA
GACCCAGTGACCAGAGAAGTCTCCTGCTGCAACAGCTGGTCCAAAGGAACGTGCTGGGTT
CATGGATCCACCAGAGAATGGACCGGCGGCTAGGATGTTGGCACCGACGATGAGACCAAT
GGCGAGGGGAGCGATGGTTCCGAGAGAACCCTTTTTGGGATCAGCGGCGGTGGCGTAGAC
GGTGTAGACTAAAGAGAAAGTGATGATGATCTCCATCACTACTCCTTCTATCGCTCCTAC
TCCCGCAGCAACGCTGTGGGTTGGAACCGCCAAACCACCGGTGACGTATTTGAGAAGGAA
GCAAGCGGCGGTGGAGCCGAGAAGCTGAGCCACCCAGTAGAAAACTCCGGTGATTAGTGT
GATTTGACCACCGACAGCAAGGCCAAAAGTGACGGCTGGGTTCACATGGCCACCGGAGAT
GTTGGCTCCGATTGCAACCGCCACGAAGAGGGCGAAACCATGGCATACGGCGATGGCGAC
AAGCCCCGGGGTATCAAGAGCCGCATCTGACGTCAGCTTCGC

QA 1 762 1 762
DS 

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GGCACCGACGATGAGACCAATGGCGAGGGGAGCGATGGTTCCGAGAGAACCCTTTTTGGG
ATCAGCGGCGGTGGCGTAGACGGTGTAGACTAAAGAGAAAGTGATGATGATCTCCATCAC
TACTCCTTCTATCGCTCCTACTCCCGCAGCAACGCTGTGGGTTGGAACCGCCAAACCACC
GGTGACGTATTTGAGAAGGAAGCAAGCGGCGGTGGAGCCGAGAAGCTGAGCCACCCAGTA
GAAAACTCCGGTGATTAGTGTGATTTGACCACCGACAGCAAGGCCAAAAGTGACGGCTGG
GTTCACATGGCCACCGGAGATGTTGGCTCCGATTGCAACCGCCACGAAGAGGGCGAAACC
ATGACATACGGCGATGGCGACAAGCCCCGGGGTATCAAGAGCCGCATCTGACGTCAGCTT
CGCGTAGGCAATGGCGGAACCAACACCAGCGAAAACAAAGAGCAAAGTGGAGATGAACTC
AGCCAGGTAAGCTCTTAGAGAAGCCAAGCTGAAAGAATCATCAAAAGAACCAAAGGCAAC
TCCAGCCATTGTTTTCGATGAAAACTGGAGAAGAGGAAGTGAAGTTTTTTGTTTTGCTTA
ATGAAGAAGATCC

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

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GAAGAGACGAAAATATAAAGATGCAATCCAGCAACATATAGTACTACCAAAGTTTCGACC
ATAAGCATAGTAAACTCATGAAAAGATAATCCAAAAACAAAACAGGGGAAACTGTTGTTA
TTTAGGAGGCTTGGTCTTCACCCTCGGTGATGACTTTCGTAGTTGTAATTCCCTTCGTGG
CCAACAGATCTGTGTACTCTTGATACGGCGATTTTTTAAAGCTCGTCTCCTTCCAGAACT
CTGGTGTGAGGAATCCGTAAGTCTTCTGAAGGCAATCGAATGTAGCCTTGACGAAGTTTC
CAAGAGTCTTGGTAGAACCTCTCGAGGAAGTGAAAACATCATCAATACCAGCGAACTGAA
GAACCTTCTTAGGAACCCTAGCGGCCACAATACCAGCACCTCTAGGAGCAGGAACCATCC
TAACGGTAACGGAACCACACTTCCCCGTAACCTTACAAGGAACAGTATGAGGCTTCCCAA
TCTTGTTACCCCAGTAACCTCTCCTCACGGGAATCACAGACAGCTTCGCCAGTATAATCC
CACCTCTGATCGCCGTGGCAACCTCCTTGGAGCATTTCACACCAAGACCCACGTGTCCGT
TCGTGTCTCCGACAACGACAAAGGCCTTGAACCTCGTCCTCTGACCGGCCCTGGTCTGTT
TCTGAACCGGCATGATCTTCATCACCTCGTCTTTCAACGTCGACGACGAGGAGATCGATG
ATCTGGTACTCCTTCACGAGGCGCCGCGTTCTCCTCACGTTCAGCATTTTCGAA


BQ
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15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1B625JQ U 1
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TTAAGCATAGTAAACTCATGAAAGGATAATCCAAAAACAAAACAGGGGAAACTGTTGTTA
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TCTTGTTACCCCAGTAACCTCTCCTCACGGGAATCACAGACAGCTTCGCCAGTATAATCC
CACCTCTGATCGCCGTGGCAACCTCCTTGGAGCATTTCACACCAAGACCCACGTGTCCGT
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TCTGAACCGGCATGATCTTCATCACCTCGTCTTTCAAG
TGGGACGACGAGAGATCG

QA 1 758 1 758
DS 

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AACTAGAACATTACCATATCCATAATTTAAAAAAA*CTGAGCAGAAGTAACCGTTTGAGA
AGAGACGAAAATATAAAGATGCAATCCAGCAACATATAGTACTACCAAAGTTTCGACCAT
AAGCATA***AACTCATGAAAAGATAATCCAAAAACAAAACAGGGGACACTGTTGTTATT
TAGGAGGCTTGGTCTTCACCCTCGGTGATGACTTTCGTAGTTGTAATTCCCTTCGTGGCC
AACAGATCTGTGTACTCTTGATACGGGGATTTTTTAAAGCTCGTCTCCTTCCAGAACTCT
GGTGTGAGGAATCCGTAAGTCTTCTGAAGGCAATCGAATGTAGCCTTGACGAAGTTTCCA
AGGGTTTTGGTAGATCCTCTCGAGGAAGTGAAAACATCATCAATACCAGCGAACTGAAGA
ACCTTCTTAGGAACCCTAGCGGCCACAATACCAGCACCTCTAGGAGCAGGAACCATCCTA
ACGGTAACGGAACCACACTTCCCCGTAACCTTACAAGGAACCGTATGCGGCTTCCCAATC
TTGTTCCCCCAGTAACCTCTCCTCACGGGAATCACAGACAGCTTCGCCAGTATAATCCCA
CCTCTGATCGCCGTGGCAACCTCCTTGGAGCATTTCACACCAAGACCCACGTGTCCGTTC
GTGTCTCCGACAACGACAAAGGCCTTGAACCTCGTCCTCTGACCGGCTCTGGTCTGTTTC
TGAACCGGCATGATCTTCATCACCTCGTCTTTCAGCGTCGACGACGAGGAGATCGATGAT
CTGGTACTCCTTCACGAGGCGCCGCGTTCTCCTCACGTTCAGCATTTTCGAA

QA 1 832 1 832
DS 



AS 1 4

CO CL3092Contig1 673 4 7 U
TTTTTTTTAATAACAAGAAACACATTTCCCCACTTAGTTTCATAACAATTTTAAATTTGT
TGAACGAGTATTCAACATTTTCAATACAAAACTTAATGCTCAAGGAAGGGTTTAAAAGTG
TACCCAACGTTTCCTGGTCTTATCACACGGTCTAGACCGCTGAAATGTAGTCACTTGTAG
ATAAGTTGGCTCTACAACTATTGTTCTCCCGGTGATATCAATGGCGTAAAACTTGCTTCT
ATATGAAACTATCGCTTCAAGATTTGCATCGGGATGTGTGATCTGGAGCTCAGTCCAACG
CTCCTCGACTGACCTATACACCGTGGGAGCCGTGAATATGGAATTCCTTAGAACCATAAA
TTCGTTGTTATCTGCGCCTAAACTCATAAAGCCGATGTCTTCTTCCAGTTTGACAAGACG
TTGGAATCCGTCGGACCAAGTGGAACAAGCGACATGTTCTTGAGCTAACTCGAAGACTTG
ACATCAATATCGAGGACCGTTGTGATCAGAAGAAGACTTGACAAGGTAAATACGGGTGGT
CGAGACATGACAATCATCACCATAAGCACCAGAGTCTACGGGAAGAGGACATCTAGGTGC
TTTCATCCGTCGAAGTTTGAGGAGGCTAGAGGATCGCCAAAAGGAACATACTGACCGGAA
GTGGATCAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1EA73JQ U 9
AF RS1FN35JQ U 9
AF RS1EA73TF C 1
AF RS1FN35TF C 9
BS 1 8 RS1EA73TF
BS 9 350 RS1EA73JQ
BS 351 351 RS1FN35JQ
BS 352 474 RS1EA73JQ
BS 475 475 RS1FN35JQ
BS 476 511 RS1EA73JQ
BS 512 673 RS1EA73TF

RD RS1EA73JQ 505 0 0
AATAACAAGAAACACATTTCCCCACTTAGTTTCATAACAATTTTAAATTTGTTGAACGAG
TATTCAACATTTTCAATACAAAACTTAATGCTCAAGGAAGGGTTTAAAAGTGTACCCAAC
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GCTCTACAACTATTGTTCTCCCGGTGATATCAATGGCGTAAAACTTGCTTCTATATGAAA
CTATCGCTTCAAGATTTGCATCGGGATGTGTGATCTGGAGCTCAGTCCAACGCTCCTCGA
CTGACCTATACACCGTGGGAGCCGTGAATATGGAATTCCTTAAAACCATAAATTCGTTGT
TATCTGCGCCTAAACTCATAAAGCCGATGTCTTCTTCCAGTTTGACAAGACGTTGGAATC
CGTCGGACCAAGTGGAACAAGCGACATGTTCTTGAGCTAACTCGAAAACTTGACATCAAT
ATCGAGGACCGTTGTGATCAGAA
GA

QA 1 503 1 503
DS 

RD RS1FN35JQ 503 0 0
AATAACAAGAAACACATTTCCCCACTTAGTTTCATAACAATTTTAAATTTGTTGAACGAG
TATTCAACATTTTCAATACAAAACTTAATGCTCAAGGAAGGGTTTAAAAGTGTACCCAAC
GTTTCCTGGTCTTATCACACGGTCTAGACCGCTGAAATGTAGTCACTTGTAAATAAGTTG
GCTCTACAACTATTGTTCTCCCGGTGATATCAATGGCGTAAAACTTGCTTCTATATGAAA
CTATCGCTTCAAGATTTGCATCGGGATGTGTGATCTGGAGCTCAGTCCAACGCTCCTCGA
CTGACCTATACACCGTGGGAGCCGTGAATATGGAATTCCTTAGAACCATAAATTCGTTGT
TATCTGCGCCTAAACTCATAAAGCCGATGTCTTCTTCCAGTTTGACAAGACGTTGGAATC
CGTCGGACCAAGTGGAACAAGCGACATGTTCTTGAGCTAACTCGAAGACTTGACATCAAT
ATCGAGGACCGTTGTGATCAGAA

QA 1 503 1 503
DS 

RD RS1EA73TF 673 0 0
TTTTTTTTAATAACAAGAAACACATTTCCCCACTTAGTTTCATAACAATTTTAAATTTGT
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TACCCAACGTTTCCTGGTCTTATCACACGGTCTAGACCGCTGAAATGTAGTCACTTGTAG
ATAAGTTGGCTCTACAACTATTGTTCTCCCGGTGATATCAATGGCGTAAAACTTGCTTCT
ATATGAAACTATCGCTTCAAGATTTGCATCGGGATGTGTGATCTGGAGCTCAGTCCAACG
CTCCTCGACTGACCTATACACCGTGGGAGCCGTGAATATGGAATTCCTTAGAACCATAAA
TTCGTTGTTATCTGCGCCTAAACTCATAAAGCCGATGTCTTCTTCCAGTTTGACAAGACG
TTGGAATCCGTCGGACCAAGTGGAACAAGCGACATGTTCTTGAGCTAACTCGAAGACTTG
ACATCAATATCGAGGACCGTTGTGATCAGAAGAAGACTTGACAAGGTAAATACGGGTGGT
CGAGACATGACAATCATCACCATAAGCACCAGAGTCTACGGGAAGAGGACATCTAGGTGC
TTTCATCCGTCGAAGTTTGAGGAGGCTAGAGGATCGCCAAAAGGAACATACTGACCGGAA
GTGGATCAGATCC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RS1FN35TF 665 0 0
AATAACAAGAAACACATTTCCCCACTTAGTTTCATAACAATTTTAAATTTGTTGAACGAG
TATTCAACATTTTCAATACAAAACTTAATGCTCAAGGAAGGGTTTAAAAGTGTACCCAAC
GTTTCCTGGTCTTATCACACGGTCTAGACCGCTGAAATGTAGTCACTTGTAGATAAGTTG
GCTCTACAACTATTGTTCTCCCGGTGATATCAATGGCGTAAAACTTGCTTCTATATGAAA
CTATCGCTTCAAGATTTGCATCGGGATGTGTGATCTGGAGCTCAGTCCAACGCTCCTCGA
CTGACCTATACACCGTGGGAGCCGTGAATATGGAATTCCTTAGAACCATAAATTCGTTGT
TATCTGCGCCTAAACTCATAAAGCCGATGTCTTCTTCCAGTTTGACAAGACGTTGGAATC
CGTCGGACCAAGTGGAACAAGCGACATGTTCTTGAGCTAACTCGAAGACTTGACATCAAT
ATCGAGGACCGTTGTGATCAGAAGAAGACTTGACAAGGTAAATACGGGTGGTCGAGACAT
GACAATCATCACCATAAGCACCAGAGTCTACGGGAAGAGGACATCTAGGTGCTTTCATCC
GTCGAAGTTTGAGGAGGCTAGAGGATCGCCAAAAGGAACATACTGACCGGAAGTGGATCA
GATCC

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 3

CO CL3093Contig1 718 3 7 U
TTTTTTTTGTGTGTTGGAATGGCGTCGCTGCAAAGCTCAGGGATGTTGACGAAAGAGCAG
ATGGTTTATCTCTTTGATCGATTCGATTACTTGACCTCGCAATCTGATGTGAAAAAAAGA
ATCTCCGACGCCGTTGAGGATAAACAGGAAGCTGTGGCTGTTACAACTGCAATTCAAGAG
GAGATATTCTTGGAGATGGGAATTGACCCAGGATTTGGTATTGGATGCTTGGGAAAGCTG
AACTCTGCGTTTGAAAACGATAAAGAGTTGATGATTGGTTTCTACAAGTTTCTCGCTAAG
GAGGAGATGGCGTGTGAAGAAGCTGAGCTTGGACCAGATTGTTTTCAACAGAAAATGGAA
GCACAACAGCAATTACATGAACAGCAACTGGAGATGCTAAAGTATATGCGTAAGTTTCCT
CTGGACGACCAATCTGCTATCCTTAAAAAGCTACAGAAGCAACTAGAGAATGCGGATTTT
GAGCCTGAGGCATCCCTTTTGTCAGGAGAGCAATTGGAGGAAGCTGGAAGAAGAAGAGTT
TCACCAGTTTTTGGAAGCAGATGATAGCTTTCTCGTTTCTCACAGGCCACTTCAATTTGT
AAACTGTCTCTTTCTCTTTTCACTTCCATATACTTAACCTTTTTAGATGCAAATGTAAGC
AAAAAATTTGGATGAACTTTTCATTTGCATGAGAAATGTAAACAAAAATATTCAAAAA


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F485TF U 1
AF RS1H221JQB C 2
AF RS1H221TF U 2
BS 1 195 RS1F485TF
BS 196 196 RS1H221TF
BS 197 200 RS1F485TF
BS 201 201 RS1H221TF
BS 202 241 RS1F485TF
BS 242 708 RS1H221TF
BS 709 718 RS1H221JQB

RD RS1F485TF 241 0 0
TTTTTTTTGTGTGTTGGAATGGCGTCGCTGCAAAGCTCAGGGATGTTGACGAAAGAGCAG
ATGGTTTATCTCTTTGATCGATTCGATTACTTGACCTCGCAATCTGATGTGAAAAAAAGA
ATCTCCGACGCCGTTGAGGATAAACAGGAAGCTGTGGCTGTTACAACTGCAATTCAAGAG
GAGATATTCTTGGAGCTGGGGATTGACCCAGGATTTGGTATTGGATGCTTGGGAAAGCTG
A

QA 1 241 1 241
DS 

RD RS1H221JQB 717 0 0
TTTTTTTGTGTGTTGGAATGGCGTCGCTGCAAAGCTCAGGGATGTTGACGAAAGAGCAGA
TGGTTTATCTCTTTGATCGATTCGATTACTTGACCTCGCAATCTGATGTGAAAAAAAGAA
TCTCCGACGCCGTTGAGGATAAACAGGAAGCTGTGGCTGTTACAACTGCAATTCAAGAGG
AGATATTCTTGGAGATGGGAATTGACCCAGGATTTGGTATTGGATGCTTGGGAAAGCTGA
ACTCTGCGTTTGAAAACGATAAAGAGTTGATGATTGGTTTCTACAAGTTTCTCGCTAAGG
AGGAGATGGCGTGTGAAGAAGCTGAGCTTGGACCAGATTGTTTTCAACAGAAAATGGAAG
CACAACAGCAATTACATGAACAGCAACTGGAGATGCTAAAGTATATGCGTAAGTTTCCTC
TGGACGACCAATCTGCTATCCTTAAAAAGCTACAGAAGCAACTAGAGAATGCGGATTTTG
AGCCTGAGGCATCCCTTTTGTCAGGAGAGCAATTGGAGGAAGCTGGAAGAAGAAGAGTTT
CACCAGTTTTTGGAAGCAGATGATAGCTTTCTCGTTTCTCACAGGCCACTTCAATTTGTA
AACTGTCTCTTTCTCTTTTCACTTCCATATACTTAACCTTTTTAGATGCAAATGTAAGCA
AAAAATTTGGATGAACTTTTCATTTGCATGAGAAATGTAAACAAAAATATTCAAAAA

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1H221TF 707 0 0
TTTTTTTGTGTGTTGGAATGGCGTCGCTGCAAAGCTCAGGGATGTTGACGAAAGAGCAGA
TGGTTTATCTCTTTGATCGATTCGATTACTTGACCTCGCAATCTGATGTGAAAAAAAGAA
TCTCCGACGCCGTTGAGGATAAACAGGAAGCTGTGGCTGTTACAACTGCAATTCAAGAGG
AGATATTCTTGGAGATGGGAATTGACCCAGGATTTGGTATTGGATGCTTGGGAAAGCTGA
ACTCTGCGTTTGAAAACGATAAAGAGTTGATGATTGGTTTCTACAAGTTTCTCGCTAAGG
AGGAGATGGCGTGTGAAGAAGCTGAGCTTGGACCAGATTGTTTTCAACAGAAAATGGAAG
CACAACAGCAATTACATGAACAGCAACTGGAGATGCTAAAGTATATGCGTAAGTTTCCTC
TGGACGACCAATCTGCTATCCTTAAAAAGCTACAGAAGCAACTAGAGAATGCGGATTTTG
AGCCTGAGGCATCCCTTTTGTCAGGAGAGCAATTGGAGGAAGCTGGAAGAAGAAGAGTTT
CACCAGTTTTTGGAAGCAGATGATAGCTTTCTCGTTTCTCACAGGCCACTTCAATTTGTA
AACTGTCTCTTTCTCTTTTCACTTCCATATACTTAACCTTTTTAGATGCAAATGTAAGCA
AAAAATTTGGATGAACTTTTCATTTGCATGAGAAATGTAAACAAAAA

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 4

CO CL3094Contig1 812 4 10 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGACGAAACT
ACGTCCAGAAGCCATACTCGTCAATCTACGCATCACATTCATCGTTTTTTCAGAATTGTC
ACAGAAGAAAAAGAAACACAGAAACTTTACACGAAGGTGATGATTCTTAAACTTTTCACG
AGAAGAGAAGAGAAAGAAAAGAGAGACGACGATAATGCCAACTACTCTCTCTCTCCTTCT
TCCTTCTTCCTTCTCTCCTCTCTGCCAAGAAAACGTAACAAAAAAAAGTATTTGGACAAT
TTATAAACATTATTTATGGAAATGTTTAGGTGTATCTACGGAGGAGCGGATATAGCTAAT
AAGAAACTAGTAGGTGGCTAAGATCCGCCATGGTCAAACTATAGAAGACCAATCATTCTC
GCATCCCTTAATTTCTGTGAAATTATTTAAAATAATAATGATATATGTTCAGAGACCGTA
TGACACGATCGTGACCGTTGTTATTATCTCTGTAAGTGAATCCAACGGTTGTGGTCGAAG
CGCGCGCGGAATGACTCTTTTCTTTCAGCCGTTTGTAAATTTGTTTAGTTAGTATCTAAT
TACATCTACGGCTAGTCCAAAAAGTAAATTATTTTCTTAACTACTTTCGGCAACTTGATC
AACTATAAATTATGTTTTAGTTAACTCCCCTCCGAACAATTTTTTTTTTCAGTTGTTTTA
TAAGTTTAAAAAACTAAACTATGTCCTTGATTTTTCCCGGTAGTTCCTGAAATATAATTT
GGAAATTTTTGAATAAATGGCTTGTTCGTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1A258TF U 1
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AF RS1A258TR C 50
AF RS1A258TV U 54
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GGGAAATTTTTGATAAATGGCTTGTTC
GTAGC

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TCCTTCTTCCTTCTTCCTTCTCTCCTCTCTGCCAAGAAAACGTAACAAAAAAAAGTATTT
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TCCTTCTTCCTTCTTCCTTCTCTCCTCTCTGCCAAGAAAACGTAACAAAAAAAAGTATTT
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ATCTAATTACATCTACGGCTAGTCCAAAAAGTAAATTATTTTCTTAACTACTTTCGGCAA
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ATAATTTGGAAATTTTTGAATAAATGGCTTGTTC
GTAGC

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 4

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RS1DU29TF U 1
AF RS1DH78TF U 9
AF RS1DH78JQ C 330
AF RS1GH62TF U 910
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AAGCCCTAACAATGTCCTCCCTCTCAAGACCAGCCAAAAAACCACAGTAGAAGAGTCCTT
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TGGCTTATATGGTCACGAGACCACCTACAACAACAACAAAGAAGAGTTCAACAACAACAA
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TGAAGAGTCTTACAACAACTACGACGAGAAGTACCCCAAGAAGACGGAGAGCTACGACAA
CAAGGAAGAGTTCAACCAAAAGTACGATGAAAACGTCAAGGAAGAGTCTTTCTCTGAGAA
CAATGAAGACAAGAGAAGCTTCTACAACTCAAACGTTTACGGAACCGAGTTAGAACGTGA
AACGCCGTACAAAGGTTACAGCCACAATATGGAGAGACAAGGCATGAGTGACACAAGATT
CATGGAGAAAGGTAACTACTATTACGACCTTTACA
ACGATTGAAAC

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DS 

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GG
ACATTGTCTTTCTCTTCTCCCTATCACACTACACAACACATCATGGCTTTCTCCACTAGA
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AGAGATAGCAACTTCTTTGGAAAATTCCACCGAGAATCCTCCAAAGACCAAAGCCCTAAC
AATGTCCTCCCTCTCAAGACCAGCCAAAAAACCACAGTAGAAGAGTCCTTCCCAAACAAG
AAAGACCAAGAACAAGACCCTACCTTTGTCCCCGAGTCCGAAAACGGCTATGGCTTATAT
GGTCACGAGACCACCTACAACAACAACAAAGAAGAGTTCAACAACAACAACAACAAGTAC
GATGAAAAGTTCAACGGTGAGACTTTCCCAACTCCAAGACTGAGCGAGGCTGAAGAGTCT
TACAACAACTACGACGAGAAGTACCCCAAGAAGACGGAGAGCTACGACAACAAGGAAGAG
TTCAACCAAAAGTACGATGAAAACGTCAAGGAAGAGTCTTTCTCTGAGAACAATGAAGAC
AAGAGAAGCTTCTACAACTCAAACGCTTACGGAACCGAGTTAGAACGTGAAACGCCGTAC
AAAGGTTACAGCCACGATATGGAGAGACAAGGCATGAGTGACACAAGATTCATGGAGAAA
GGTAACTACTATTGCGACCTTTACA
CGATAGAAACC

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DS 

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AGACTTTCCCAACTCCAAGACTGAGCGAGGCTGAAGAGTCTTACAACAACTACGACGAGA
AGTACCCCAAGAAGACGGAGAGCTACGACAACAAGGAAGAGTTCAACCAAAAGTACGATG
AAAACGTCAAGGAAGAGTCTTTCTCTGAGAACAATGAAGACAAGAGAAGCTTCTACAACT
CAAACGCTTACGGAACCGAGTTAGAACGTGAAACGCCGTACAAAGGTTACAGCCACGATA
TGGAGAGACAAGGCATGAGTGACACAAGATTCATGGAGAAAGGTAACTACTATTGCGACC
TTTACAACGATAGAAACCACGGCCATTTCTACCGGAAGCCTCATCAGAAAAGCCCTGCCG
GTTATTATTCTTCTCAGGCGACCGAGAATAACTACGACCAGTCGTACAACAACTACAACA
ACGAGGAGGAGAAGAGCTTCAAGGATCCTTACGACTCTAAGTGGGAGAAGAACATGATGA
ACGAACAGCCTGAGGAGTTCGATGAGGAGCAAGGAGACCAATTAAAGCCTTGATGAATAC
TACACTCTTGAAAGTATTTTTCTTTTATTTCAACTAAGTTATGTTACGTATGGTTGATTA
ATCAAACTAAATCAGTGTTATCACTACAACAAATTAAAAGTGAAAAAAGAGAAATGGGTT
TTTGTGTGTTTTCAGTTGAAATGTGTTTGCTTTTGCATATAATATTCGGAGGAAATAAAG
ATTATATATACT

QA 1 792 1 792
DS 

RD RS1GH62TF 215 0 0
G
TTAAAGCCTTGATGAATACTACACTCTTGAAAGTATTTTTCTTTTATTTCAACTAAGTTA
TGTTACGTATGGTTGATTAATCAAACTAAATCAGTGTTATCACTACAACAAATTAAAAGT
GAAAAAAGAGAAATGGGTTTTTGTGTGTTTTCAGTTGAAATGTGTTTGCTTTTGCATATA
ATATTCGGAGTAAATAAAGATTATATATACTATT

QA 2 215 2 215
DS 



AS 1 4

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GGAGTGATGGTCGCTAAACATTCGATTTGTGTAATTTTATTTATCGTAATATTACATCCT
TCCTCACTCTTCCGTATGGAGGAGGAGGAGACGATGATGGCAACGAAGGTGATGGAGAGA
GGATTCAAGCTGATTCTAGGATCTCAATCGATGGCGAGAAAAAGGATTTTGGGTGAAATG
GGCTATGATTTCACTATCGTGACTGCAGACATAGACGAGAAAGCTATCAGGAGAGACAGT
CCTCAAGACTTGGTTGTCGCTCTCGCTCAAGCCAAGGCAGATGAGATAATATCGAAGCTT
GGAGATCAAAGCCAGTTTGCTCAAGATCCTCTACCAACCTTGTTGATTACTGCTGACACT
GTAGTTGTGTACGAAGGTATTATCCGAGAAAAACCAACCTCCAAAGAAGAAGCTCGCCAA
TTTATCAAAGGCTATTCCGGGTCACACGGAGGCGTTATTGGATCTGTTATAGTAAGCAAC
TTGAAAACTGGTGTTCGAAGAGTTGGATGGGACAAAGCTGAGGTTTATTTCCATGACATA
CCAGCAAAAGTCATAGACGCTCTTATTGATGATGCCATAACTTCCAAGGGTACTGGAGGT
TTAACCTTGGAGCATCCCCTCATTTCACCCTTTATCGATACCGTGGTGGGAGGAGTTGAT
ACAGTCATGGGACTTCCTAAAGAACTCACTGAAAAATTCATCACCGATGTGTTGTAGCTC
TAGCAAGGCTTTTGAAGATTCCTCCTCTAGAAAGGCTTAGATTGATTATGCTCTGTGGTT
CTCAAGATTTTTGTTTGTTTGATTGTGTAATCAAATCGTATATGTTGTAAGTGGATACAA
CATAGATTTACCTTATCGCTATCCCCAAGTTGACGAAA


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 10 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BT82TF U 1
AF RS1BX93TF U 4
AF RS1BX93JQ C 48
AF RS1BT82JQ C 89
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TCCCCACTCTTCCGTATGGAGGAGGAGGAGACGATGATGGCAACGAAGGTGATGGAGAGA
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GGCTATGATTTCACTATCGTGACTGCAGACATAGACGAGAAAGCTATCAGGAGAGACAGT
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GGAGATCAAAGCCAGTTTGCTCAAGATCCTCTACCAACCTTGTTGATTACTGCTGACACT
GTAGTTGTGTACGAAGGTATTATCCGAGAAAAACCAACCTCCAAAGAAGAAGCTCGCCAA
TTTATCAAAGGCTATTCCGGGTCACACGGAGGCGTTATTGGATCTGTTATAGTAAGCAAC
TTGAAAACTGGTGTTCGAAGAGTTGGATGGGACAAAGCTGAGGTTTATTTCCATGACATA
CCAGCAAAAGTCATAGACGCTCTTATTGATGATGCCATAACTT
T

QA 1 583 1 583
DS 

RD RS1BX93TF 747 0 0
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TTCAAGCTGATTCTAGGATCTCAATCGATGGCGAGAAAAAGGATTTTGGGTGAAATGGTC
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GTTGTGTACGAAGGTATTATCCGAGAAAAACCAACCTCCAAAGAAGAAGCTCGCCAATTT
ATCAAAGGCTATTCCGGGTCACACGGAGGCGTTATTGGATCTGTTATAGTAAGCAACTTG
AAAACTGGTGTTCGAAGAGTTG*ATGGGACAAAGCTGAGGTTTATTTCCATGACATACCA
GCAAAAGTCATAGACGCTCTTATTGATGATGCCATAACTTCCAAGGGTACTGGAGGTTTA
ACCTTGGAGCATCCCCTCATTTCACCCTTTATCGATACCGTGGTGGGAGGAGTTGATACA
GTCATGGGACTTCCTAAAGAACTCACTGAAAAATTCATCACCGATGTGTTGTAGCTCTAG
CAAG*CTTTTGAAGATTCCTCCTCTAG

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DS 

RD RS1BX93JQ 819 0 0
TAATA
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CGAAGCTTGGAGATCAAAGCCAGTTTGCTCAAGATCCTCTACCAACCTTGTTGATTACTG
CTGACACTGTAGTTGTGTACGAAGGTATTATCCGAGAAAAACCAACCTCCAAAGAAGAAG
CTCGCCAATTTATCAAAGGCTATTCCGGGTCACACGGAGGCGTTATTGGATCTGTTATAG
TAAGCAACTTGAAAACTGGTGTTCGAAGAGTTG*ATGGGACAAAGCTGAGGTTTATTTCC
ATGACATACCAGCAAAAGTCATAGACGCTCTTATTGATGATGCCATAACTTCCAAGGGTA
CTGGAGGTTTAACCTTGGAGCATCCCCTCATTTCACCCTTTATCGATACCGTGGTGGGAG
GAGTTGATACAGTCATGGGACTTCCTAAAGAACTCACTGAAAAATTCATCACCGATGTGT
TGTAGCTCTAGCAAGGCTTTTGAAGATTCCTCCTCTAGAAAGGCTTAGATTGATTATGCT
CTGTGGTTCTTAAGATTTTTGTTTGTTTGATTGTGTAATCAAATCGTATATGTTGTAAGT
GGATACAACATAGATTTACCTTATCGCTATCCCC

QA 6 819 6 819
DS 

RD RS1BT82JQ 790 0 0
AGACGATGATGGCAACGAAGGTGATGGAGAGAGGATTCAAGCTGATTCTAGGATCTCAAT
CGATGGCGAGAAAAAGGATTTTGGGTGAAATGGGCTATGATTTCACTATCGTGACTGCAG
ACATAGACGAGAAAGCTATCAGGAGAGACAGTCCTCAAGACTTGGTTGTCGCTCTCGCTC
AAGCCAAGGCAGATGAGATAATATCGAAGCTTGGAGATCAAAGCCAGTTTGCTCAAGATC
CTCTACCAACCTTGTTGATTACTGCTGACACTGTAGTTGTGTACGAAGGTATTATCCGAG
AAAAACCAACCTCCAAAGAAGAAGCTCGCCAATTTATCAAAGGCTATTCCGGGTCACACG
GAGGCGTTATTGGATCTGTTATAGTAAGCAACTTGAAAACTGGTGTTCGAAGAGTTGGAT
GGGACAAAGCTGAGGTTTATTTCCATGACATACCAGCAAAAGTCATAGACGCTCTTATTG
ATGATGCCATAACTTTCAAGGGTACTGGAGGTTTAACCTTGGAGCATCCCCTCATTTCAC
CCTTTATCGATACCGTGGTGGGAGGAGTTGATACAGTCATGGGACTTCCTAAAGAACTCA
CTGAAAAATTCATCACCGATGTGTTGTAGCTCTAGCAAGGCTTTTGAAGATCCCTCCTCT
AGAAAGGCTTAGATTGATTATGCTCTGTGGTTCTCAAGATTTTTGTTTGTTTGATTGTGT
AATCAAATCGTATATGTTGTAAGTGGATACAACATAGATTTACCTTATCGCTATCCCCAA
GTTGACGAAA

QA 1 790 1 790
DS 



AS 2 4

CO CL3097Contig1 320 2 1 U
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CGCAACAATTATGCTACAATTTGCAAAGGCCAACAACAATGAGGGGAGATAGAAGAAATA
CAAAAAAAATTCGTCAACAAATTTTAGGAATAGCAAAATACTAGTATCATCTATACATGA
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CTGGATAGGGACCTTGTGGGTAATATGGTGATGGTTGAGGAGGATACGGAGGAGGAGGGT
AAGTTGAGGATGGTGGAGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A117TR U 86
AF RS1A117JQ U 1
BS 1 320 RS1A117JQ

RD RS1A117TR 190 0 0
AAGGGCAACAACAATGAGGGGAGATAGAAGAAATACAAAAAAAATTCGTCAACAAATTTT
AGGAATAGCAAAATACTAGTATCATCTATACATGATGACCACTTTTCATCAATTCTCAAC
GCCGGAGTTTTAGTATGGAGGTGGCGGGTATTGTCCTGGATAGGGACCTTGTGGGTAATA
TGGTGATGGT

QA 1 190 1 190
DS 

RD RS1A117JQ 320 0 0
GGAGAAAGATGGCTTAATATAAAAAGATCCAAACTTCTAAAATGAGTTTCATTGACCAAT
CGCAACAATTATGCTACAATTTGCAAAGGCCAACAACAATGAGGGGAGATAGAAGAAATA
CAAAAAAAATTCGTCAACAAATTTTAGGAATAGCAAAATACTAGTATCATCTATACATGA
TGACCACTTTTCATCAATTCTCAACGCCGGAGTTTTAGTATGGAGGTGGCGGGTATTGTC
CTGGATAGGGACCTTGTGGGTAATATGGTGATGGTTGAGGAGGATACGGAGGAGGAGGGT
AAGTTGAGGATGGTGGAGGA

QA 1 320 1 320
DS 



CO CL3097Contig2 691 2 6 U
GTTGGGTGCCAGAAATTGAAAGACACGGAATGGTTTTCGAGGCAAGATCCATACGTTGTC
CTCGAGTACCGCGGCGCTAGGCACCAAACCAGAACCTGCACAGATGGTGGGAAAAGCGCA
GTGTTTCAGGAGAAGTTTATGTTCACGTTGTTTGAAGGCATTAAGGATCTTAAGGTTGCT
GTCTGGAATAGCAACACTCTCTCCACTGATGACTTCATTGGCAATGCTACGATTCAGTTG
CAGAAGGTTCTTTCTCAGGGATACGACGATTGTACATGGACTTCTTCAGACTAAAACTGG
CAGATATGCGGGAGAAGTAAGACTCATACTGCATTATGCAAGTGCAAAGAACCAACATCA
CGGATCTGCGCCATCAGCACCACCGTATGCTCCTCAAGTACCTCACTACTCAGCACCGCC
CTCTCCATCTCCATATTCGTCACCACCATACTCTGGACCATCTCTGTACCCACAAGTACA
ATACTCTCAGCCGCAATCAGCATACCCACCAGCTTCAGCCTATCCTCCTCAGCCATATGG
TTACCCTCCCTCCTCCCTCAACCTCCGCTTACCCTCCCGGTCCTTCAGCTTACCCTCCTC
CTCCACCATCCTCAACTTACCCTCCTCCTCCGTATCCTCCTCAACCATCACCATATTACC
CACAAGTCCCTATCCAGGACATACCCGCCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A117TV U 1
AF RS1A117TF U 251
BS 1 282 RS1A117TV
BS 283 283 RS1A117TF
BS 284 549 RS1A117TV
BS 550 550 RS1A117TF
BS 551 661 RS1A117TV
BS 662 691 RS1A117TF

RD RS1A117TV 661 0 0
GTTGGGTGCCAGAAATTGAAAGACACGGAATGGTTTTCGAGGCAAGATCCATACGTTGTC
CTCGAGTACCGCGGCGCTAGGCACCAAACCAGAACCTGCACAGATGGTGGGAAAAGCGCA
GTGTTTCAGGAGAAGTTTATGTTCACGTTGTTTGAAGGCATTAAGGATCTTAAGGTTGCT
GTCTGGAATAGCAACACTCTCTCCACTGATGACTTCATTGGCAATGCTACGATTCAGTTG
CAGAAGGTTCTTTCTCAGGGATACGACGATTGTACATGGACT*CTTCAGACTAAAACTGG
CAGATATGCGGGAGAAGTAAGACTCATACTGCATTATGCAAGTGCAAAGAACCAACATCA
CGGATCTGCGCCATCAGCACCACCGTATGCTCCTCAAGTACCTCACTACTCAGCACCGCC
CTCTCCATCTCCATATTCGTCACCACCATACTCTGGACCATCTCTGTACCCACAAGTACA
ATACTCTCAGCCGCAATCAGCATACCCACCAGCTTCAGCCTATCCTCCTCAGCCATATGG
TTACCCTCC*TCCTCCCTCAACCTCCGCTTACCCTCCCGGTCCTTCAGCTTACCCTCCTC
CTCCACCATCCTCAACTTACCCTCCTCCTCCGTATCCTCCTCAACCATCACCATATTACC
C

QA 1 661 1 661
DS 

RD RS1A117TF 441 0 0
TTTCTCAGGGATACGACGATTGTACATGGACTTCTTCAGACTAAAACTGGCAGATATGCG
GGAGAAGTAAGACTCATACTGCATTATGCAAGTGCAAAGAACCAACATCACGGATCTGCG
CCATCAGCACCACCGTATGCTCCTCAAGTACCTCACTACTCAGCACCGCCCTCTCCATCT
CCATATTCGTCACCACCATACTCTGGACCATCTCTGTACCCACAAGTACAATACTCTCAG
CCGCAATCAGCATACCCACCAGCTTCAGCCTATCCTCCTCAGCCATATGGTTACCCTCCC
TCCTCCCTCAACCTCCGCTTACCCTCCCGGTCCTTCAGCTTACCCTCCTCCTCCACCATC
CTCAACTTACCCTCCTCCTCCGTATCCTCCTCAACCATCACCATATTACCCACAAGTCCC
TATCCAGGACATACCCGCCAC

QA 1 441 1 441
DS 



AS 1 4

CO CL3098Contig1 785 4 5 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGCCGCGTCGA
CAATCTTAACCTTAGCTCTCGATCTCTCAACTCCACGCTCCTTCTCTTCGTGAGGATTTG
GACTCTCCGACGACGGAGAAGACTTCATTTCACTGGAATGGTCTAGTGCAAGAAAGTAGA
AAAACAAATTGATTCTAAATATGGATATGTCTGAAGAAGAGTTAAGTGCTGTAACTCGAG
CAGAAGAATGGAGCTCAGAAAATGAAGATGAACCCGATGATTCTGTTGACATTGATATGC
CAATGATAGAAACGCGAAGCAGGTTTGGATGTTCAAGGGCAAAAAGAAAGCGTGAGGAAG
CTGATCCATATGAAGAGATTTATGTTGCACGCAATGCAATTCTTAAAAGACAGAATAAGC
TACTTGAAGAGAGGCTCCGGATGATGGAACTAGATCAGAGATGCAGTGTCGAGCATGTGG
TGAAGATACTTAATGAGCTGCCTGGAGTGATAAAGTGGACACCATTTCACACTGCTGCAC
TTGACCATCTCATAACTGATGTAGCTAACAGAGAGGCGTTTATGGCTTTCTCTAGTGTTG
ATGATAAGATTAGCTATCTTAAGCATATGATATGAATGGAGTCAAGCTTTGTGGTGGGTT
GTAGTGTTTTTT*CTTTGATAATTTTAACCTTCCTGTATATTACTTCTGTTTATGACTTT
*GTTTCAGTTCCCTTTTTT*GTTATGACTGACTACTTATGATTATGGAATCAATTGTGTG
TTGTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 

AF RS1A384TF U 1
AF RS1A384TV U 1
AF RS1A384JQ C 63
AF RS1A384TR C 63
BS 1 672 RS1A384TF
BS 673 673 RS1A384TV
BS 674 720 RS1A384TF
BS 721 721 RS1A384TV
BS 722 785 RS1A384TF

RD RS1A384TF 785 0 0
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CAATCTTAACCTTAGCTCTCGATCTCTCAACTCCACGCTCCTTCTCTTCGTGAGGATTTG
GACTCTCCGACGACGGAGAAGACTTCATTTCACTGGAATGGTCTAGTGCAAGAAAGTAGA
AAAACAAATTGATTCTAAATATGGATATGTCTGAAGAAGAGTTAAGTGCTGTAACTCGAG
CAGAAGAATGGAGCTCAGAAAATGAAGATGAACCCGATGATTCTGTTGACATTGATATGC
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TACTTGAAGAGAGGCTCCGGATGATGGAACTAGATCAGAGATGCAGTGTCGAGCATGTGG
TGAAGATACTTAATGAGCTGCCTGGAGTGATAAAGTGGACACCATTTCACACTGCTGCAC
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ATGATAAGATTAGCTATCTTAAGCATATGATATGAATGGAGTCAAGCTTTGTGGTGGGTT
GTAGTGTTTTTTTCTTTGATAATTTTAACCTTCCTGTATATTACTTCTGTTTATGACTTT
TGTTTCAGTTCCCTTTTTT*GTTATGACTGACTACTTATGATTATGGAATCAATTGTGTG
TTGTT

QA 1 785 1 785
DS 

RD RS1A384TV 785 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGCCGCGTCGA
CAATCTTAACCTTAGCTCTCGATCTCTCAACTCCACGCTCCTTCTCTTCGTGAGGATTTG
GACTCTCCGACGACGGAGAAGACTTCATTTCACTGGAATGGTCTAGTGCAAGAAAGTAGA
AAAACAAATTGATTCTAAATATGGATATGTCTGAAGAAGAGTTAAGTGCTGTAACTCGAG
CAGAAGAATGGAGCTCAGAAAATGAAGATGAACCCGATGATTCTGTTGACATTGATATGC
CAATGATAGAAACGCGAAGCAGGTTTGGATGTTCAAGGGCAAAAAGAAAGCGTGAGGAAG
CTGATCCATATGAAGAGATTTATGTTGCACGCAATGCAATTCTTAAAAGACAGAATAAGC
TACTTGAAGAGAGGCTCCGGATGATGGAACTAGATCAGAGATGCAGTGTCGAGCATGTGG
TGAAGATACTTAATGAGCTGCCTGGAGTGATAAAGTGGACACCATTTCACACTGCTGCAC
TTGACCATCTCATAACTGATGTAGCTAACAGAGAGGCGTTTATGGCTTTCTCTAGTGTTG
ATGATAAGATTAGCTATCTTAAGCATATGATATGAATGGAGTCAAGCTTTGTGGTGGGTT
GTAGTGTTTTTT*CTTTGATAATTTTAACCTTCCTGTATATTACTTCTGTTTATGACTTT
*GTTTCAGTTCCCTTTTTTTGTTATGACTGACTACTTATGATTATGGAATCAATTGTGTG
TTGTT

QA 1 785 1 785
DS 

RD RS1A384JQ 723 0 0
ATCTTAACCTTAGCTCTCGATCTCTCAACTCCACGCTCCTTCTCTTCGTGAGGATTTGGA
CTCTCCGACGACGGAGAAGACTTCATTTCACTGGAATGGTCTAGTGCAAGAAAGTAGAAA
AACAAATTGATTCTAAATATGGATATGTCTGAAGAAGAGTTAAGTGCTGTAACTCGAGCA
GAAGAATGGAGCTCAGAAAATGAAGATGAACCCGATGATTCTGTTGACATTGATATGCCA
ATGATAGAAACGCGAAGCAGGTTTGGATGTTCAAGGGCAAAAAGAAAGCGTGAGGAAGCT
GATCCATATGAAGAGATTTATGTTGCACGCAATGCAATTCTTAAAAGACAGAATAAGCTA
CTTGAAGAGAGGCTCCGGATGATGGAACTAGATCAGAGATGCAGTGTCGAGCATGTGGTG
AAGATACTTAATGAGCTGCCTGGAGTGATAAAGTGGACACCATTTCACACTGCTGCACTT
GACCATCTCATAACTGATGTAGCTAACAGAGAGGCGTTTATGGCTTTCTCTAGTGTTGAT
GATAAGATTAGCTATCTTAAGCATATGATATGAATGGAGTCAAGCTTTGTGGTGGGTTGT
AGTGTTTTTT*CTTTGATAATTTTAACCTTCCTGTATATTACTTCTGTTTATGACTTT*G
TTTCAGTTCCCTTTTTT*GTTATGACTGACTACTTATGATTATGGAATCAATTGTGTGTT
GTT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1A384TR 723 0 0
ATCTTAACCTTAGCTCTCGATCTCTCAACTCCACGCTCCTTCTCTTCGTGAGGATTTGGA
CTCTCCGACGACGGAGAAGACTTCATTTCACTGGAATGGTCTAGTGCAAGAAAGTAGAAA
AACAAATTGATTCTAAATATGGATATGTCTGAAGAAGAGTTAAGTGCTGTAACTCGAGCA
GAAGAATGGAGCTCAGAAAATGAAGATGAACCCGATGATTCTGTTGACATTGATATGCCA
ATGATAGAAACGCGAAGCAGGTTTGGATGTTCAAGGGCAAAAAGAAAGCGTGAGGAAGCT
GATCCATATGAAGAGATTTATGTTGCACGCAATGCAATTCTTAAAAGACAGAATAAGCTA
CTTGAAGAGAGGCTCCGGATGATGGAACTAGATCAGAGATGCAGTGTCGAGCATGTGGTG
AAGATACTTAATGAGCTGCCTGGAGTGATAAAGTGGACACCATTTCACACTGCTGCACTT
GACCATCTCATAACTGATGTAGCTAACAGAGAGGCGTTTATGGCTTTCTCTAGTGTTGAT
GATAAGATTAGCTATCTTAAGCATATGATATGAATGGAGTCAAGCTTTGTGGTGGGTTGT
AGTGTTTTTT*CTTTGATAATTTTAACCTTCCTGTATATTACTTCTGTTTATGACTTT*G
TTTCAGTTCCCTTTTTT*GTTATGACTGACTACTTATGATTATGGAATCAATTGTGTGTT
GTT

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 4

CO CL3099Contig1 826 4 16 U
GGGATTACGATAATTCATTGTTGGAGGATCAATCAAATCATCAGCTTCGGGAGATCTCTT
CTGGGAATCGAGGATCTGTTAAGTTATCTGTGGTCATCATGATACATTTTGTGCTTCTGG
TTAGTCGACAGGGAAAAGTGAGGCTCACCAAGTGGTATTCGCCTTACACACAGAAGGAAA
GGTCTAAGGTCATACGCGAACTCAGCGGTGTAATCCTGAACAGAGGTCCCAAGCTCTGCA
ATTTCATCGAATGGAGAGGATACAAGGTTGTCTACAAAAGGTACGCAAGCCTGTACTTCT
GCATGTGCATTGATGAGGCGGATAACGAGTTGGAGGTACTGGAGATCATTCACCACTATG
TCGAGATTCTTGACCGTTACTTTGGCAGTGTGTGTGAACTGGATTTGATTTTTAACTTCC
ACAAGGCGTATTATATATTGGATGAGCTGTTGATCGCCGGTGAGCTTCAAGAGTCGAGCA
AGAAAACAGTGGCGAGGATAATATCAGCTCAGGATCAATTGGTGGAGGCTGCTAAAGAGG
AGGCTAGTTCCATAAGTAACATCATTGCTCAGGCTACCAAGTAGTTTCTTTCTGATTTGT
TGTTAAAAAGCATTCGTTAATGGTTTAATATTTCCTTATTTTCTGAGAAATTCTATTCTA
AATCACACTTTTCTTTTCCATGTTATGTCATGTGTTTTGTCTGTTTGATAAGAAGAAAGA
AACATTTATTGATCGGTGTGGGTTTATGAGTAGTGACTCCTTTGTAAAGACAACATACAG
CACATTCTTTGCCATCTACCATGATTGATAAGAGTACTACCGCCAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 15 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EB90TF U 1
AF RS1EB90JQ C 1
AF RS1CF22TF U 32
AF RS1CF22JQ C 68
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BS 675 709 RS1EB90TF
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RD RS1EB90TF 709 0 0
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CTGGGAATCGAGGATCTGTTAAGTTATCTGTGGTCATCATGATACATTTTGTGCTTCTGG
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AGGCTAGTTCCATAAGTAACATCATTGCTCAG*CTACCAAGTAGTTTCTTTCTGATTTGT
TGTTAAAA*GCATTCGTTAATGGTTTAATATTTCCTTATTTTCTGAGAAAT*CTAT*CTA
AATCACACTTTC**TTTCCATGTTATGTCATGTGTTTTGTCTGTTTGAT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1EB90JQ 765 0 0
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CTGGGAATCGAGGATCTGTTAAGTTATCTGTGGTCATCATGATACATTTTGTGCTTCTGG
TTAGTCGACAGGGAAAAGTGAGGCTCACCAAGTGGTATTCGCCTTACACACAGAAGGAAA
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ATTTCATCGAATGGAGAGGATACAAGGTTGTCTACAAAAGGTACGCAAGCCTGTACTTCT
GCATGTGCATTGATGAGGCGGATAACGAGTTGGAGGTACTGGAGATCATTCACCACTATG
TCGAGATTCTTGACCGTTACTTTGGCAGTGTGTGTGAACTGGATTTGATTTTTAACTTCC
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AGAAAACAGTGGCGAGGATAATATCAGCTCAGGATCAATTGGTGGAGGCTGCTAAAGAGG
AGGCTAGTTCCATAAGTAACATCATTGCTCAGGCTACCAAGTAGTTTCTTTCTGATTTGT
TGTTAAAAAGCATTCGTTAATGGTTTAATATTTCCTTATTTTCTGAGAAATTCTATTCTA
AATCACACTTTTCTTTTCCATGTTATGTCATGTGTTTTGTCTGTTTGATAAGAAGAAAGA
AACATTTATTGATCGGTGTGGGTTTATGAGTAGTGACTCCTTTGT

QA 1 765 1 765
DS 

RD RS1CF22TF 714 0 0
GGA
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CAAAAGGTACGCAAGCCTGTACTTCTGCATGTGCATTGATGAGGCGGATAACGAGTTGGA
GGTACTGGAGATCATTCACCACTATGTCGAGATTCTTGACCGTTACTTTGGCAGTGTGTG
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CTTATTTTCTGAGAAATTCTATTCTAAATCACACTTTTCTTTTCCATGTTATGTCATGTG
TTTTGTCTGTTTGATA*GAAGAAAGAAACATTTATTGATCGGTGTGGGTTT

QA 4 714 4 714
DS 

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ACAGGGAAAAGTGAGGCTCACCAAGTGGTATTCGCCTTACACACAGAAGGAAAGGTCTAA
GGTCATACGCGAACTCAGCGGTGTAATCCTGAACAGAGGTCCCAAGCTCTGCAATTTCAT
CGAATGGAGAGGATACAAGGTTGTCTACAAAAGGTACGCAAGCCTGTACTTCTGCATGTG
CATTGATGAGGCGGATAACGAGTTGGAGGTACTGGAGATCATTCACCACTATGTCGAGAT
TCTTGACCGTTACTTTGGCAGTGTGTGTGAACTGGATTTGATTTTTAACTTCCACAAGGC
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AGTGGCGAGGATAATATCAGCTCAGGATCAATTGGTGGAGGCTGCTAAAGAGGAGGCTAG
TTCCATAAGTAACATCATTGCTCAGGCTACCAAGTAGTTTCTTTCTGATTTGTTGTTAAA
AAGCATTCGTTAATGGTTTAATATTTCCTTATTTTCTGAGAAATTCTATTCTAAATCACA
CTTTTCTTTTCCATGTTATGTCATGTGTTTTGTCTGTTTGATAAGAAGAAAGAAACATTT
ATTGATCGGTGTGGGTTTATGAGTAGTGACTCCTTTGTAAAGACAACATACAGCACATTC
TTTGCCATCTACCATGATTGATAAGAGTACTACCGCCAC

QA 1 759 1 759
DS 



AS 2 4

CO CL3100Contig1 796 2 4 U
GGTTGATCAATAAATTGAAAATTTTATCAAAAAAATACTATTTTTAGCAATATGACAAAA
GCATACAAATATAACGAAAATTCTGAAACAAAATGTATATGTTATTCAGGCAGAGCCGAC
ACACAAGACGAAAATCAAACTGAAGGTTTTTCATATCCACCTATAACAATAGTAAAACTA
ATCGAATAGGAAAAACTACTCGTCGTCAGAATCAGCGAATGTGATCTTGGTAGCTTTTGG
AACATCAGCTGCTATTTCTTTGAAATGAGCTCCATACAGTTTTGATTCCTTTTTCTTTAC
ATGAGTGCCAAACTTCGTAAGATCAGTAGGCACGACTTGTCCAGCTTCTCTGAAAACATT
CACAAGCTCTCCAGCAAGACCCTTGTTCTGTTGTGTGAAGAAGGTGTGGGCAACACCCTT
TTTACCCGCTCGTCCCGTCCTCCCGATTCTGTGTACATAATCCTCTGTTGTAGAGGGAAA
CTGTAGTTTATCACAACTTCCACGTCCGGGATATCAAGCCCTCTTGCTGCCACATCAGTA
GCCACCAGCAACGGACTTGATCCATCTTTGAACGATGCCAAAGATCTGGTACGTTCGCTC
TGTGCTTTGTTTCCGTGTATGGATACAGCTTTCCAGCCTCTTTGCTGAAGAAAACGCTCA
AGACGTTCAGCTTCAATCTTGTACAAGGCAAATACCAAAACCCTGTTCTTTTGTGATTTA
TGGTATTTTTCTAGTAAAGCAATAAGGCGCTGATCACGTGCACGATCGTCTATGACCTCG
ACGATTTGCATAACGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A154JQ U 1
AF RS1A154TR U 63
BS 1 746 RS1A154JQ
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RD RS1A154JQ 788 0 0
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GCATACAAATATAACGAAAATTCTGAAACAAAATGTATATGTTATTCAGGCAGAGCCGAC
ACACAAGACGAAAATCAAACTGAAGGTTTTTCATATCCACCTATAACAATAGTAAAACTA
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GCCACCAGCAACGGACTTGATCCATCTTTGAACGATGCCAAAGATCTGGTACGTTCGCTC
TGTGCTTTGTTTCCGTGTATGGATACAGCTTTCCAGCCTCTTTGCTGAAGAAAACGCTCA
AGACGTTCAGCTTCAATCTTGTACAAGGCAAATACCAAAACCCTGTTCTTTTGTGATTTA
TGGTATTTTTCTAGTAAAGCAATAAG*CGCTGATCACGTGCACGATCGTCTATGACCTCG
ACGATTTG

QA 1 788 1 788
DS 

RD RS1A154TR 734 0 0
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ACAAGACGAAAATCAAACTGAAGGTTTTTCATATCCACCTATAACAATAGTAAAACTAAT
CGAATAGGAAAAACTACTCGTCGTCAGAATCAGCGAATGTGATCTTGGTAGCTTTTGGAA
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GAGTGCCAAACTTCGTAAGATCAGTAGGCACGACTTGTCCAGCTTCTCTGAAAACATTCA
CAAGCTCTCCAGCAAGACCCTTGTTCTGTTGTGTGAAGAAGGTGTGGGCAACACCCTTTT
TACCCGCTCGTCCCGTCCTCCCGATTCTGTGTACATAATCCTCTGTTGTAGAGGGAAACT
GTAGTTTATCACAACTTCCACGTCCGGGATATCAAGCCCTCTTGCTGCCACATCAGTAGC
CACCAGCAACGGACTTGATCCATCTTTGAACGATGCCAAAGATCTGGTACGTTCGCTCTG
TGCTTTGTTTCCGTGTATGGATACAGCTTTCCAGCCTCTTTGCTGAAGAAAACGCTCAAG
ACGTTCAGCTTCAATCTTGTACAAGGCAAATACCAAAACCCTGTTCTTTTGTGATTTATG
GTATTTTTCTAGTAAAGCAATAAGGCGCTGATCACGTGCACGATCGTCTATGACCTCGAC
GATTTGCATAACGT

QA 1 734 1 734
DS 



CO CL3100Contig2 725 2 2 U
GCAAGACTTTCCAGAAACCTTCTCCGATTCAGTCTCATTCGTGGCCCTTTTTGTTGGATG
GTCGCGATCTTATCGGGATCGCCAAAACCGGTTCAGGTAAGACATTGGCGTTTGGGATTC
CTGCGATTATGCACATGTTGAAGAAGAACAAGAGTGGTAAAGGAACAAGGAACCCGACTT
GTCTTGTTCTTTCTCCGACAAGAGAGTTAGCTGTTCAGATTTCTGATGTTTTGAGTGAAG
CTGGAGAACCGTGTGGTTTGAAATCGATTTGTGTGTATGGTGGAAGCTCTAAAAGGCCTC
AAATTGACGCCATTCGATCTGGAGTTGATATTGTCATTGGTACGCCAGGTCGCTTGAGAG
ACCTGATTGAGTCTAATGTGCTTCGTCTCTCAGATGTTTCCTTTGTGGTATTGGATGAAG
CAGATCGAATGCTTGATATGGGTTTCGAGGAACCAGTCCGGTTTATTCTGAGCAAAACGA
ATAAAGTTCGTCAGATGGTTATGTTCAGTGCAACTTGGCCTATAGATGTTCACAAATTGG
CACAGGAATTCATGGATCCAAACCCGGTCAAGATAGTCATAGGTTCTGAAGACTTGGCTG
CCAACCACGACGTTATGCAAATCGTCGAGGTCATAGACGATCGTGCACGTGATCAGCGCC
TTATTGCTTTACTAGAAAAATACCATACATCACAAAGAACACGGTTTTGGTATTTGCCTT
GTACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1A154TV U 1
AF RS1A154TF U 114
BS 1 675 RS1A154TV
BS 676 725 RS1A154TF

RD RS1A154TV 675 0 0
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CTGGAGAACCGTGTGGTTTGAAATCGATTTGTGTGTATGGTGGAAGCTCTAAAAGGCCTC
AAATTGACGCCATTCGATCTGGAGTTGATATTGTCATTGGTACGCCAGGTCGCTTGAGAG
ACCTGATTGAGTCTAATGTGCTTCGTCTCTCAGATGTTTCCTTTGTGGTATTGGATGAAG
CAGATCGAATGCTTGATATGGGTTTCGAGGAACCAGTCCGGTTTATTCTGAGCAAAACGA
ATAAAGTTCGTCAGATGGTTATGTTCAGTGCAACTTGGCCTATAGATGTTCACAAATTGG
CACAGGAATTCATGGATCCAAACCCGGTCAAGATAGTCATAGGTTCTGAAGACTTGGCTG
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TTATTGCTTTACTAG

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1A154TF 612 0 0
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CCGACTTGTCTTGTTCTTTCTCCGACAAGAGAGTTAGCTGTTCAGATTTCTGATGTTTTG
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AGGCCTCAAATTGACGCCATTCGATCTGGAGTTGATATTGTCATTGGTACGCCAGGTCGC
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GATGAAGCAGATCGAATGCTTGATATGGGTTTCGAGGAACCAGTCCGGTTTATTCTGAGC
AAAACGAATAAAGTTCGTCAGATGGTTATGTTCAGTGCAACTTGGCCTATAGATGTTCAC
AAATTGGCACAGGAATTCATGGATCCAAACCCGGTCAAGATAGTCATAGGTTCTGAAGAC
TTGGCTGCCAACCACGACGTTATGCAAATCGTCGAGGTCATAGACGATCGTGCACGTGAT
CAGCGCCTTATTGCTTTACTAGAAAAATACCATACATCACAAAGAACACGGTTTTGGTAT
TTGCCTTGTACA

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 4

CO CL3101Contig1 885 4 5 U
CCATTACGGCCGGGGGAACCATTTCAGCTCAAAGAAAACATACTTTTTTTTTCATCCTCT
CCCTTCTCTCTAACTTCCTCCATCGCTTGTCCATCTTTGATGACTGACCGACGGTGGGTG
GGCTCCCATAGCCACGCTATCAGTCCGATCCTTTTCTTTCCTTTGTTTATGTTTCATTTT
CTTGTAGTTTGTGGTGTTTTCTCTAGTTACAAACTTGATTTTTATAAAAGCAGATCTAGA
TCTCAGTTCTCAGATCTTAAGATGGTGATGGTGATTCAAAGGCGGTGCAAGAATGGTGGT
TTTGTGGCTGTTCTTCGTCGTTAGCGATCTCGCCTTGAAGGGTTCCCGACGTCAGATCCA
AGGGTCACCTTCGGTACTTTTGTAGGTCCAAAGTTTTCTCCTTTTTGATTGCTGTTGTTG
ACTCTAGGCCCCTTTGATTTGGCCGTGGTTATTGGTTAGACTTCTGGTGTTGATTGTTAT
GTGGTTGGAGGATTTGTTTTTCCTTGCCTTAGTTTGCTTCGGTATAGATCCTGACGCGAC
CTCTCCTTTGTGCTTCTCGGGTTACGGATCTCCGGCTCATTCTCAAGGAAGAGGAGCTTC
GGCTCTCTTGCACTTTGCTGTGAGTTTCGATGGTTAAAGCGTTGGTTCCTCGTCTCCTTT
TGCTGATTCCTTGCGGGTGTACTCGTAGCTCTAGGTATGTTCCAGAGCAGTATAAAATGA
GTTTCGGCCTGGATCACTCCAATAAATTCAGCGTTATGTGCTATCCTCCATCTCCTTCCT
CCCTCCTTGGATGATTCTTCTTTTCAGTTGCCTTGAATATTAAATGTGATCTCTACTTTT
GTTGGTTTCTAATTTGTTAAAACTTAATATATGTTTTGGCTCCCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A287TF U 1
AF RS1A287TV U 1
AF RS1FN08TF U 140
AF RS1FN08JQ C 318
BS 1 330 RS1A287TF
BS 331 331 RS1FN08TF
BS 332 728 RS1A287TF
BS 729 835 RS1FN08TF
BS 836 885 RS1FN08JQ

RD RS1A287TF 728 0 0
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CCCTTCTCTCTAACTTCCTCCATCGCTTGTCCATCTTTGATGACTGACCGACGGTGGGTG
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CTTGTAGTTTGTGGTGTTTTCTCTAGTTACAAACTTGATTTTTATAAAAGCAGATCTAGA
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TGCTGATTCCTTGCGGGTGTACTCGTAGCTCTAGGTATGTTCCAGAGCAGTATAAAATGA
GTTTCGGC

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1A287TV 728 0 0
CCATTACGGCCGGGGGAACCATTTCAGCTCAAAGAAAACATACTTTTTTTTTCATCCTCT
CCCTTCTCTCTAACTTCCTCCATCGCTTGTCCATCTTTGATGACTGACCGACGGTGGGTG
GGCTCCCATAGCCACGCTATCAGTCCGATCCTTTTCTTTCCTTTGTTTATGTTTCATTTT
CTTGTAGTTTGTGGTGTTTTCTCTAGTTACAAACTTGATTTTTATAAAAGCAGATCTAGA
TCTCAGTTCTCAGATCTTAAGATGGTGATGGTGATTCAAAGGCGGTGCAAGAATGGTGGT
TTTGTGGCTGTTCTTCGTCGTTAGCGATCTTGCCTTGAAGGGTTCCCGACGTCAGATCCA
AGGGTCACCTTCGGTACTTTTGTAGGTCCAAAGTTTTCTCCTTTTTGATTGCTGTTGTTG
ACTCTAGGCCCCTTTGATTTGGCCGTGGTTATTGGTTAGACTTCTGGTGTTGATTGTTAT
GTGGTTGGAGGATTTGTTTTTCCTTGCCTTAGTTTGCTTCGGTATAGATCCTGACGCGAC
CTCTCCTTTGTGCTTCTCGGGTTACGGATCTCCGGCTCATTCTCAAGGAAGAGGAGCTTC
GGCTCTCTTGCACTTTGCTGTGAGTTTCGATGGTTAAAGCGTTGGTTCCTCGTCTCCTTT
TGCTGATTCCTTGCGGGTGTACTCGTAGCTCTAGGTATGTTCCAGAGCAGTATAAAATGA
GTTTCGGC

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1FN08TF 696 0 0
G
CAGTCCGATCCTTTTCTTTCCTTTGTTTATGTTTCATTTTCTTGTAGTTTGTGGTGTTTT
CTCTAGTTACAAACTTGATTTTTATAAAAGCAGATCTAGATCTCAGTTCTCAGATCTTAA
GATGGTGATGGTGATTCAAAGGCGGTGCAAGAATGGTGGTTTTGTGGCTGTTCTTCGTCG
TTAGCGATCTCGCCTTGAAGGGTTCCCGACGTCAGATCCAAGGGTCACCTTCGGTACTTT
TGTAGGTCCAAAGTTTTCTCCTTTTTGATTGCTGTTGTTGACTCTAGGCCCCTTTGATTT
GGCCGTGGTTATTGGTTAGACTTCTGGTGTTGATTGTTATGTGGTTGGAGGATTTGTTTT
TCCTTGCCTTAGTTTGCTTCGGTATAGATCCTGACGCGACCTCTCCTTTGTGCTTCTCGG
GTTACGGATCTCCGGCTCATTCTCAAGGAAGAGGAGCTTCGGCTCTCTTGCACTTTGCTG
TGAGTTTCGATGGTTAAAGCGTTGGTTCCTCGTCTCCTTTTGCTGATTCCTTGCGGGTGT
ACTCGTAGCTCTAGGTATGTTCCAGAGCAGTATAAAATGAGTTTCGGCCTGGATCACTCC
AATAAATTCAGCGTTATGTGCTATCCTCCATCTCCTTCCTCCCTCCTTGGATGATTCTTC
TTTTCAGTTGCCTTGAATATTAAATGTGATCTCTA

QA 2 696 2 696
DS 

RD RS1FN08JQ 568 0 0
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TTTTGTAGGTCCAAAGTTTTCTCCTTTTTGATTGCTGTTGTTGACTTTAGGCCCCTTTGA
TTTGGCCGTGGTTATTGGTTAGACTTCTGGTGTTGATTGTTATGTGGTTGGAGGATTTGT
TTTTCCTTGCCTTAGTTTGCTTCGGTATAGATCCTGACGCGACCTCTCCTTTGTGCTTCT
CGGGTTACGGATTTCCGGCTCATTTTCAAGGAAGAGGAGCTTCGGCTCTCTTGCACTTTG
CTGTGAGTTTCGATGGTTAAAGCGTTGGTTCCTCGTCTCCTTTTGCTGATTCCTTGCGGG
TGTACTCGTAGCTCTAGGTATGTTCCAGAGCAGTATAAAATGAGTTTCGGCCTGGATCAC
TCCAATAAATTCAGCGTTATGTGCTATCCTCCATCTCCTTCCTCCCTCCTTGGATGATTT
TTCTTTTCAGTTGCCTTGAATATTAAATGTGATCTCTACTTTTGTTGGTTTCTAATTTGT
TAAAACTTAATATATGTTTTGGCTCCCG

QA 1 568 1 568
DS 



AS 1 4

CO CL3102Contig1 1009 4 11 U
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CACTTGGTTGCTGTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGCATTAGACACCTATTCTGCATCTTA
TTATACAATTTACAACTTCAAAATATAATTCAGTTGCTATTGCTTCCCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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AF RS1AF90TF U 1
AF RS1D509TF U 1
AF RS1AF90JQ C 166
AF RS1D509JQ C 291
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CA

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CTGAATCGATGAATGAAGATGTAGATT
GAG

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CCCG

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DS 

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TCTGTCTGTACACTTGGTTGCTGTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGCATTAGACACCTATT
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QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 4

CO CL3103Contig1 924 4 5 U
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CCACAAAACATAGCAGACTGCACAGGCACATACACACACACATACAATTATTATTAATCA
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AAGCGGCCTAGACCACGGCTTCCCAAAACAAGAAGATCTGGTCGGACCCGGCTAACTTCT
TGGCATATAACGTCCTTTGGATCACCTTTCTTGATCCATGCCTCGCAACTAACCCCAATC
TCATGACATTTTGTAACGAAAAACTCGAGAAGGTGAAGACCTTTAGACTTGTTAGACTCT
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TCGTCCACAACATGTACATGTAGCAAGAGAATCTTGAAATCGCTAGTGTTGGATCGGACC
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DP83JQ U 1
AF RS1DG12JQ U 21
AF RS1DP83TF C 53
AF RS1DG12TF C 204
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AAGCGGCCTAGACCACGGCTTCCCAAAACAAGAAGATCTGGTCGGACCCGGCTAACTTCT
TGGCATATAACGTCCTTTGGATCACCTTTCTTGATCCATGCCTCGCAACTAACCCCAATC
TCATGACATTTTGTAACGAAAAACTCGAGAAGGTGAAGACCTTTAGACTTGTTAGACTCT
CTCATGTCTCTGAAATCATCAGGAGACGCATATATGCTGTCTACCTCATCAAAACCGTCT
TCGTCCACAACATGTACATGTAGCAAGAGAATCTTGAAATCGCTAGTGTTGGATCGGACC
ATTTTCTCCAGAGTCCATTCGAAAGCTCTTTTGCTGCTTATCGAAGGGTGAGGCTTCCCT
TTGATCGTCGATTCGTTCACAGCCACCATCACTCGTGTCGGCTCCATCTCCATCTTT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1DG12JQ 653 0 0
CG
TATGAAATTATTTGAAATATTATGTTGGATGATATAAACCACAAAACATAGCAGACTGCA
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CACTCTGGGATAAAATGAAAGAAGAGTTTATGATGTAGTTGGTTTAGTCATCAGCAGGAT
CACTGGGAGTTTCATCGGCATTGCGTTTGATCGTGAGGACTGGACACTCAGCATGCTTCA
CACAGAACCCACTCACCGTCCCCACAAAGACCTTTTGGAAGCGGCCTAAACCACGGCTTC
CCAAAACAAGAAGATCTGGTCGGACCCGGCTAACTTCTTGGCATATAACGTCCTTTGGAT
CACCTTTCTTGATCCATGCCTCGCAACTAACCCCAATCTCATGACATTTTGTAACGAAAA
ACTCGAGAAGGTGAAGACCTTTAGACTTGTTAGACTCTCTCATGTCTCTGAAATCATCAG
GAGACGCATATATGCTGTCTACCTCATCAAAACCGTCTTCGTCCACAACATGTACATGTA
GCAAGAGAATCTTGAAATCGCTAGTGTTGGATCGGACCATTTTCTCCAGAGTCCATTTGA
AAGCTCTTTTGCTGCTTACCGAAGGGTGAGGCTTCCCTTTGATCGTCGATT

QA 3 653 3 653
DS 

RD RS1DP83TF 751 0 0
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ATTAATCATAGAGTTGGACACACAAAAGCACACTCTGGGATAAAATGAAAGAAGAGTTTA
TGATGTGGTTGGTTTAGTCATCAGCAGGATCACTGGGAGTTTCATCGGCATTGCGTTTGA
TCGTGAGGACTGGACACTCAGCATGCTTCACACAGAACCCACTCACCGTCCCCACAAAGA
CCTTTTGGAAGCGGCCTAGACCACGGCTTCCCAAAACAAGAAGATCTGGTCGGACCCGGC
TAACTTCTTGGCATATAACGTCCTTTGGATCACCTTTCTTGATCCATGCCTCGCAACTAA
CCCCAATCTCATGACATTTTGTAACGAAAAACTCGAGAAGGTGAAGACCTTTAGACTTGT
TAGACTCTCTCATGTCTCTGAAATCATCAGGAGACGCATATATGCTGTCTACCTCATCAA
AACCGTCTTCGTCCACAACATGTACATGTAGCAAGAGAATCTTGAAATCGCTAGTGTTGG
ATCGGACCATTTTCTCCAGAGTCCATTCGAAAGCTCTTTTGCTGCTTATCGAAGGGTGAG
GCTTCCCTTTGATCGTCGATTCGTTCACAGCCACCATCACTCGTGTCGGCTCCATCTCCA
TCTTTCACCAAATTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTCTCGAATTC
TCTGATATACTTGAACAAGTCCTGTTTT
CCC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RS1DG12TF 721 0 0
ACTGGGAGTTTCATCGGCATTGCGTTTGATCGTGAGGACTGGACACTCAGCATGCTTCAC
ACAGAACCCACTCACCGTCCCCACAAAGAC*TTTTGGAAGCGGCCTAGACCACGGCTTCC
CAAAACAAGAAGATCTGGTCGGACCCGGCTAACTTCTTGGCATATAACGTCCTTTGGATC
ACCTTTCTTGATCCATGCCTCGCAACTAACCCCAATCTCATGACATTTTGTAACGAAAAA
CTCGAGAAGGTGAAGACCTTTAGACTTGTTAGACTCTCTCATGTCTCTGAAATCATCAGG
AGACGCATATATGCTGTCTACCTCATCAAAACCGTCTTCGTCCACAACATGTACATGTAG
CAAGAGAATCTTGAAATCGCTAGTGTTGGATCGGACCATTTTCTCCAGAGTCCATTTGAA
AGCTCTTTTGCTGCTTACCGAAGGGTGAGGCTTCCCTTTGATCGTCGATTCGTTCACAGC
CACCATCACTCGTGTCGGCTCCATCTCCATCTTTCACCAAATTCTTCTTCTTCTTCTTCT
TCTTCTTCTTCTTCTTCTTTCTCGAATTCTCTGATATACTTGAACAAGTCCTGTTTTAAG
ACAATGATCTGGTCAGAAGATGGACAACTAGGCTCTGCGTCGTGCGCCGTGGGTATAGAA
GCGTATTTTGCCCAATAATCTTATACACTTGCTATAGTGCGCTGCTTTTTCTGTTTCGTC
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 4

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AAAGTTTTCTTCGACATGAGCGTCGGCGACAAACCCGCCGGCCGCATCGTGATGGAGCTT
TACGCCGACACAACCCCCGAAACCGCCGAGAATTTCCGCGCCCTCTGCACCGGCGAGAAG
GGAGTCGGCAAATCCGGAAAGCCGCTCCACTACAAGGGCTCGGCCTTCCACCGCTTGATC
CCCAAGTTCATGTGCCAGGGAGGAGATTTCACCGCCGGGAACGGGACCGGAGGAGAGTCG
ATCTACGGCATGAAGTTCAAGGACGAGAACTTTGTCAAGAAACACACCGGTCCGGGCATC
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AAGACGTCGTGGCTCGATGGGAAGCATGTTGTGTTCGGTCAGGTTGTTGAAGGGATGGAT
GTCGTTAGGAACATTGAGAAGGTTGGATCTGACAGTGGAAGGACCTCTAAGAAGGTTGTG
ATCGCTGACTGTGGTCAGCTTTAGATCTGGTGATGAGAAAGTGTGAGAGAGAGAGTGGTT
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CTTCTTCGTTTCGATCTTTGTGTTTCTGTGGCTACGATTGAATAATAATGATAATGATTA
ATCTTAGTTACAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 
15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GK48TF U 1
AF RS1GK48JQ C 168
AF RS1EF08JQ C 85
AF RS1EF08TF U 8
BS 1 731 RS1GK48TF
BS 732 739 RS1EF08TF

RD RS1GK48TF 735 0 0
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TACGCCGACACAACCCCCGAAACCGCCGAGAATTTCCGCGCCCTCTGCACCGGCGAGAAG
GGAGTCGGCAAATCCGGAAAGCCGCTCCACTACAAGGGCTCGGCCTTCCACCGCTTGATC
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CTGTCCATGGCCAACGCTGGTCCGAACACGAACGGATCTCAGTTTTTCATCTGCACTGAG
AAGACGTCGTGGCTCGATGGGAAGCATGTTGTGTTCGGTCAGGTTGTTGAAGGGATGGAT
GTCGTTAGGAACATTGAGAAGGTTGGATCTGACAGTGGAAGGACCTCTAAGAAGGTTGTG
ATCGCTGACTGTGGTCAGCTTTAGATCTGGTGATGAGAAAGTGTGAGAGAGAGAGTGGTT
GATCCAATGGTAGCTTTGTGTTTTTCTGTTGTGTTTTTTTTTCTTTGTTCCCGTTCTTCT
CTTCTTCGTTTCGATCTTTGTGTTTCTGTGGCTACGATTGAATAATAATGATAATGATTA
ATCTTAGTTAC
AAAA

QA 1 731 1 731
DS 

RD RS1GK48JQ 564 0 0
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CCACCGCTTGATCCCCAAGTTCATGTGCCAGGGAGGAGATTTCACCGCCGGGAACGGGAC
CGGAGGAGAGTCGATTTACGGCATGAAGTTCAAGGACGAGAACTTTGTCAAGAAACACAC
CGGTCCGGGCATCCTGTCCATGGCCAACGCTGGTCCGAACACGAACGGATCTCAGTTTTT
CATCTGCACTGAGAAGACGTCGTGGCTCGATGGGAAGCATGTTGTGTTCGGTCAGGTTGT
TGAAGGGATGGATGTCGTTAGGAACATTGAGAAGGTTGGATCTGACAGTGGAAGGACCTC
TAAGAAGGTTGTGATCGCTGACTGTGGTCAGCTTTAGATCTGGTGATGAGAAAGTGTGAG
AGAGAGAGTGGTTGATCCAATGGTAGCTTTGTGTTTTTCTGTTGTGTTTTTTTTTCTTTG
TTCCCGTTCTTCTCTTCTTCGTTTCGATCTTTGTGTTTCTGTGGCTACGATTGAATAATA
ATGATAATGATTAATCTTAGTTAC

QA 1 564 1 564
DS 

RD RS1EF08JQ 647 0 0
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GCCGAGAATTTCCGCGCCCTCTGCACCGGCGAGAAGGGAGTCGGCAAATCCGGAAAGCCG
CTCCACTACAAGGGCTCGGCCTTCCACCGCTTGATCCCCAAGTTCATGTGCCAGGGAGGA
GATTTCACCGCCGGGAACGGGACCGGAGGAGAGTCGATTTACGGCATGAAGTTCAAGGAC
GAGAACTTTGTCAAGAAACACACCGGTCCGGGCATCCTGTCCATGGCCAACGCTGGTCCG
AACACGAACGGATTTCAGTTTTTCATCTGCACTGAGAAGACGTCGTGGCTCGATGGGAAG
CATGTTGTGTTCGGTCAGGTTGTTGAAGGGATGGATGTCGTTAGGAACATTGAGAAGGTT
GGATCTGACAGTGGAAGGACCTCTAAGAAGGTTGTGATCGCTGACTGTGGTCAGCTTTAG
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TCTGTTGTGTTTTTTTTTCTTTGTTCCCGTTCTTTTTTTCTTCGTTTCGATCTTTGTGTT
TCTGTGGCTACGATTGAATAATAATGATAATGATTAATCTTAGTTAC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RS1EF08TF 732 0 0
AAAACTCTAATCTCTCAAATCTTCTCCCCAAACACAAAAAAATGGTTAACCCTAAAGTTT
TCTTCGACATGAGCGTCGGCGACAAACCCGCCGGCCGCATCGTGATGGAGCTTTACGCCG
ACACAACCCCCGAAACCGCCGAGAATTTCCGCGCCCTCTGCACCGGCGAGAAGGGAGTCG
GCAAATCCGGAAAGCCGCTCCACTACAAGGGCTCGGCCTTCCACCGCTTGATCCCCAAGT
TCATGTGCCAGGGAGGAGATTTCACCGCCGGGAACGGGACCGGAGGAGAGTCGATCTACG
GCATGAAGTTCAAGGACGAGAACTTTGTCAAGAAACACACCGGTCCGGGCATCCTGTCCA
TGGCCAACGCTGGTCCGAACACGAACGGATCTCAGTTTTTCATCTGCACTGAGAAGACGT
CGTGGCTCGATGGGAAGCATGTTGTGTTCGGTCAGGTTGTTGAAGGGATGGATGTCGTTA
GGAACATTGAGAAGGTTGGATCTGACAGTGGAAGGACCTCTAAGAAGGTTGTGATCGCTG
ACTGTGGTCAGCTTTAGATCTGGTGATGAGAAAGTGTGAGAGAGAGAGTGGTTGATCCAA
TGGTAGCTTTGTGTTTTTCTGTTGTGTTTTTTTT*CTTTGTTCCCGTTCTTCTCTTCTTC
GTTTCGATCTTTGTGTTTCTGTGGCTACGATTGAATAATAATGATAATGATTAATCTTAG
TTACAAAAAAAA

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 4

CO CL3105Contig1 723 4 4 U
GGAAGGTTCGTTAAAGTTCAAAGCGAGAGAGATCTGAATCGAAAGAAATTGGGTTACATC
TCCGGTCTGATCGCTCGTGAAATCTCCAGAGAATATGATCCGATTCATATTATTGCAGAA
CAGACAAGGGAAGACTCGTCCTGCCAAGTACTATGTACCTCTCGAAGAATCCGAGAAACA
CAAAGTCGAATACGAGGTTCATAGGTTAGTGGTGAACCGCGACGCAAAATTCACCAATTT
CGTTGAGTTTAGAACACACAAGGTGATATACAGGCGTTACGCTGGACTGTTCTTCTCCGT
GTGCGTGGATATAACGGACAATGAGTTGGCTTACCTTGAGTGCATCCATTTGTTTGTGGA
GATTTTGGATCATTTCTTCAGCAATGTCTGTGAGCTTGATCTCGTCTTCAACTTCCACAA
GGTGTACTTGATACTTGATGAATTCATTCTTGCTGGAGAACTCCAAGAAACCAGCAAAAG
GGCGATCATCGAGAGGATGTCGGAGCTCGAGAAGCTAGAGTGATATGATTGTTTCTCAAA
GAGCTGGGGTTATTGTTTAATAGATGTCTTGGTCACTCTTTTCCTTGGCGTGTCCAGAGA
TTTGATATTCTTTGTTGAGTTGAAGACGACAATGGTGATGTTAAGATTATTTGTAAAAG*
ATATAAAACGACTCTGTTGAGATCACTATCCAAAATTTGCTTTATGTAAGATTTTCTTTC
AGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1EI78TF U 1
AF RS1AT01TF U 11
AF RS1ET86TF U 11
AF RS1EI78JQ C 1
BS 1 501 RS1EI78TF
BS 502 684 RS1AT01TF
BS 685 705 RS1ET86TF
BS 706 723 RS1EI78JQ

RD RS1EI78TF 501 0 0
GGAAGGTTCGTTAAAGTTCAAAGCGAGAGAGATCTGAATCGAAAGAAATTGGGTTACATC
TCCGGTCTGATCGCTCGTGAAATCTCCAGAGAATATGATCCGATTCATATTATTGCAGAA
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CAAAGTCGAATACGAGGTTCATAGGTTAGTGGTGAACCGCGACGCAAAATTCACCAATTT
CGTTGAGTTTAGAACACACAAGGTGATATACAGGCGTTACGCTGGACTGTTCTTCTCCGT
GTGCGTGGATATAACGGACAATGAGTTGGCTTACCTTGAGTGCATCCATTTGTTTGTGGA
GATTTTGGATCATTTCTTCAGCAATGTCTGTGAGCTTGATCTCGTCTTCAACTTCCACAA
GGTGTACTTGATACTTGATGAATTCATTCTTGCTGGAGAACTCCAAGAAACCAGCAAAAG
GGCGATCATCGAGAGGATGTC

QA 1 501 1 501
DS 

RD RS1AT01TF 674 0 0
GG
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GCTCGTGAAATCTCCAGAGAATATGATCCGATTCATATTATTGCAGAACAGACAAGGGAA
GACTCGTCTTGCCAAGTACTATGTACCTCTCGAAGAATCCGAGAAACACAAAGTCGAATA
CGAGGTTCATAGGTTAGTGGTGAACCGCGACGCAAAATTCACCAATTTCGTTGAGTTTAG
AACACACAAGGTGATATACAGGCGTTACGCTGGACTGTTCTTCTCCGTGTGCGTGGATAT
AACGGACAATGAGTTGGCTTACCTTGAGTGCATCCATTTGTTTGTGGAGATTTTGGATCA
TTTCTTCAGCAATGTCTGTGAGCTTGATCTCGTCTTCAACTTCCACAAGGTGTACTTGAT
ACTTGATGAATTCATTCTTGCTGGAGAACTCCAAGAAACCAGCAAAAGGGCGATCATCGA
GAGGATGTCGGAGCTCGAGAAGCTAGAGTGATATGATTGTTTCTCAAAGAGCTGGGGTTA
TTGTTTAATAGATGTCTTGGTCACTCTTTTCCTTGGCGTGTCCAGAGATTTGATATTCTT
TGTTGAGTTGAAGACGACAATGGTGATGTTAAGATTATTTGTAAAAG*ATATAAAACGAC
TCTGTTGAGATC

QA 3 674 3 674
DS 

RD RS1ET86TF 695 0 0
GG
AAAGTTCAAAGCGAGAGAGATCTGAATCGAAAGAAATTGGGTTACATCTCCGGTCTTATC
GCTCGTGAAATCTCCAGAGAATATGATCCGATTCATATTATTGCAGAACAGACAAGGGAA
GACTCGTCTTGCCAAGTACTATGTACCTCTCGAAGAATCCGAGAAACACAAAGTCGAATA
CGAGGTTCATAGGTTAGTGGTGAACCGTGACGCAAAATTCACCAATTTCGTTGAGTTTAG
AACACACAAGGTGATATACAGGCGTTACGCTGGACTGTTCTTCTCCGTGTGCGTGGATAT
AACGGACAATGAGTTGGCTTACCTTGAGTGCATCCATTTGTTTGTGGAGATTTTGGATCA
TTTCTTCAGCAATGTCTGTGAGCTTGATCTCGTCTTCAACTTCCACAAGGTGTACTTGAT
ACTTGATGAATTCATTCTTGCTGGAGAACTCCAAGAAACCAGCAAAAGGGCGATCATCGA
GAGGGTGTCGGAGCTCGAGAAGCTAGAGTGATATGATTGTTTCTCAAAGAGCTGGGGTTA
TTGTTTAATAGATGTCTTGGTCACTCTTTTCCTTGGCGTGTCCAGAGATTTGATATTCTT
TGTTGAGTTGAAGACGACAATGGTGATGTTAAGATTATTTGTAAAAG*ATATAAAACGAC
TCTGTTGAGATCACTATCCAAAATTTGCTTTAT

QA 3 695 3 695
DS 

RD RS1EI78JQ 723 0 0
GGAAGGTTCGTTAAAGTTCAAAGCGAGAGAGATCTGAATCGAAAGAAATTGGGTTACATC
TCCGGTCTGATCGCTCGTGAAATCTCCAGAGAATATGATCCGATTCATATTATTGCAGAA
CAGACAAGGGAAGACTCGTCCTGCCAAGTACTATGTACCTCTCGAAGAATCCGAGAAACA
CAAAGTCGAATACGAGGTTCATAGGTTAGTGGTGAACCGCGACGCAAAATTCACCAATTT
CGTTGAGTTTAGAACACACAAGGTGATATACAGGCGTTACGCTGGACTGTTTTTCTCCGT
GTGCGTGGATATAACGGACAATGAGTTGGCTTACCTTGAGTGCATCCATTTGTTTGTGGA
GATTTTGGATCATTTCTTCAGCAATGTCTGTGAGCTTGATCTCGTCTTCAACTTCCACAA
GGTGTACTTGATACTTGATGAATTCATTCTTGCTGGAGAACTCCAAGAAACCAGCAAAAG
GGCGATCATCGAGAGGATGTCGGAGCTCGAGAAGCTAGAGTGATATGATTGTTTCTCAAA
GAGCTGGGGTTATTGTTTAATAGATGTCTTGGTCACTCTTTTCCTTGGCGTGTCCAGAGA
TTTGATATTCTTTGTTGAGTTGAAGACGACAATGGTGATGTTAAGATTATTTGTAAAAGG
ATATAAAACGACTCTGTTGAGATCACTATCCAAAATTTGCTTTATGTAAGATTTTCTTTC
AGC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

CO CL3106Contig1 754 2 4 U
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TAAGGAGTTTCTGAGTTGGGCTTTGCGTCCACCTGGGTACTATCAGAGCTGGCATATTGG
AGTTCGTGCCAAGGTGTCAAAGAAACTTGTGGCGTTTATCAGTGGTGTGCCAGCTAGGAT
CAGGGTGCGTGACGATGTTGTGAAGATGGCGGAGATCAATTTCTTGTGCGTTCACAAGAA
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AGCTGTACAAGTTACCATATGTACCGGCTACTCCTGGATTTAGGAAAATGGAGCCCTGTG
ATGTCCCTGCTGTGACACGGCTGCTTAGGAATTATCTTAGTCAGTTTGTTGTTGCTACAG
ACTTTGATGAGAATGATGTTGAGCACTGGCTTCTCCCAAGGGAGGATGTTGTGGACAGTT
ACCTTGTAGAAAGCCCCGAGACCCATGATGTTAATGATTTCTGCAGGTTTTACACTCTTC
CTTCAACAATTTTCGGCAACCCCAACTACTCAACAATGAAAGCTGCTTATTCATACTACA
ATGTGGCAACAAAGACGACTTTTTTTCAGCTGATGAGTGATGCTTTAATAGTCGCCAAAC
AGAAGGGTTTTGATGTATTCAATGCATTGGATGTTATGCACAATGAGAGTTTCCTCAAAG
AGGTGAAGTTTGGGCCAGGAGATGGGCAGCCTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EE07TF U 1
AF RS1EE07JQ C 376
BS 1 513 RS1EE07TF
BS 514 514 RS1EE07JQ
BS 515 526 RS1EE07TF
BS 527 754 RS1EE07JQ

RD RS1EE07TF 533 0 0
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TAAGGAGTTTCTGAGTTGGGCTTTGCGTCCACCTGGGTACTATCAGAGCTGGCATATTGG
AGTTCGTGCCAAGGTGTCAAAGAAACTTGTGGCGTTTATCAGTGGTGTGCCAGCTAGGAT
CAGGGTGCGTGACGATGTTGTGAAGATGGCGGAGATCAATTTCTTGTGCGTTCACAAGAA
GCTTAGGTCGAAGAGGCTTGCACCTGTCATGATTAAGGATGACAATGAGCAGAACCATCA
AGCTGTACAAGTTACCATATGTACCGGCTACTCCTGGATTTAGGAAAATGGAGCCCTGTG
ATGTCCCTGCTGTGACACGGCTGCTTAGGAATTATCTTAGTCAGTTTGTTGTTGCTACAG
ACTTTGATGAGAATGATGTTGAGCACTGGCTTCTCCCAAGGGAGGATGTTGTGGACAGTT
ACCTTGTAGAAAGCCCCGAGACCCATGATGTTACTGATTTCTGCAG
CTTCTAC

QA 1 526 1 526
DS 

RD RS1EE07JQ 379 0 0
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ATGTTGAGCACTGGCTTTTCCCAAGGGAGGATGTTGTGGACAGTTACCTTGTAGAAAGCC
CCGAGACCCATGATGTTAATGATTTTTGCAGGTTTTACACTCTTCCTTCAACAATTTTCG
GCAACCCCAACTACTCAACAATGAAAGCTGCTTATTCATACTACAATGTGGCAACAAAGA
CGACTTTTTTTCAGCTGATGAGTGATGCTTTAATAGTCGCCAAACAGAAGGGTTTTGATG
TATTCAATGCATTGGATGTTATGCACAATGAGAGTTTCCTCAAAGAGGTGAAGTTTGGGC
CAGGAGATGGGCAGCCTCA

QA 1 379 1 379
DS 



AS 1 4

CO CL3107Contig1 885 4 11 U
AATATGAAATATCTTCATTTACAACCCTTTTTAATTGGTAAAATAAATGTCCACACAAGC
AAAACAAAGCAAAGACATGCAAAGCACAGAAGTCCATAACTCAATGTTGACTGACCAGAA
GGTCCCCTTTAAGGGAAGTGTATTCCATTACATATAACTAAGCACGACAAGATGAACTCA
CTGCCCTATCCATGGCCCTATCTGGTAGAACCATTCCTGTTAGGTTTTCTGTTGGTTGTA
CTCTCGGTAACCTTCTTGCAATTTCATAGAATATCTCCTTGACATTAGCTGCGGTTTTTG
CTGAAGTTTCCATGAAGAAAAGACCGTTCTCCTGAGCATATGTTTGTGCCTCCTCTGCGG
AAACCTTCCTTGCATCTAATAAATCAGATTTGTTTCCAGCAAGGGCCATCACCATATTAG
CGTTACCTTGTGCCTGAAGTTCCTGAACCCATTTCTTTGCCCTCTCAAACGAGGCTTGGT
TTGTAACGTCAAAGACAATGATAGCAGCAGCAGCACCCCTGTAGTACATAGGAGCCAAAC
TATGGTACCGTTCCTGACCTGCTGTATCCCATATCTCAAACTTTACAGTCGCATCGTTGA
CAGCTAGTGTTTGTGAGAAAAAAGCAGCACCGATGGTTGATTCCTGAAACTCAACAAACT
GATCTTTAACAAAGCGTAACACAAGGCTCGATTTCCCAGCGCCAACATCTCCAAGCAACA
CCAATTTGGCGTTAATGGTCTTGTTTGCAGCGGTGGTAGCCATGATTGAGCTCA*GAGAG
AGAGAGAGAGAGAGAGCTCGTGGATGGAGGAAATGAGATTGAAGATCAAAAGACGGAGAG
AACCCAAAAAGACGCGTCGTCGGCAACAACCACTCAATTTTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1F096JQ U 1
AF RS1BG90JQ U 6
AF RS1BG90TF C 161
AF RS1F096TF C 240
BS 1 165 RS1F096JQ
BS 166 166 RS1BG90JQ
BS 167 386 RS1F096JQ
BS 387 387 RS1BG90JQ
BS 388 622 RS1F096JQ
BS 623 623 RS1BG90JQ
BS 624 682 RS1F096JQ
BS 683 683 RS1BG90JQ
BS 684 694 RS1F096JQ
BS 695 799 RS1BG90JQ
BS 800 885 RS1BG90TF

RD RS1F096JQ 694 0 0
AATATGAAATATCTTCATTTACAACCCTTTTTAATTGGTAAAATAAATGTCCACACAAGC
AAAACAAAGCAAAGACATGCAAAGCACAGAAGTCCATAACTCAATGTTGACTGACCAGAA
GGTCCCCTTTAAGGGAAGTGTATTCCATTACATATAACTAAGCACAACAAGATGAACTCA
CTGCCCTATCCATGGCCCTATCTGGTAGAACCATTCCTGTTAGGTTTTCTGTTGGTTGTA
CTCTCGGTAACCTTCTTGCAATTTCATAGAATATCTCCTTGACATTAGCTGCGGTTTTTG
CTGAAGTTTCCATGAAGAAAAGACCGTTCTCCTGAGCATATGTTTGTGCCTCCTCTGCGG
AAACCTTCCTTGCATCTAATAAATCAAATTTGTTTCCAGCAAGGGCCATCACCATATTAG
CGTTACCTTGTGCCTGAAGTTCCTGAACCCATTTCTTTGCCCTCTCAAACGAGGCTTGGT
TTGTAACGTCAAAGACAATGATAGCAGCAGCAGCACCCCTGTAGTACATAGGAGCCAAAC
TATGGTACCGTTCCTGACCTGCTGTATCCCATATCTCAAACTTTACAGTCGCATCGTTGA
CAGCTAGTGTTTGTGAGAAAAA*GCAGCACCGATGGTTGATTCCTGAAACTCAACAAACT
GATCTTTAACAAAGCGTAACACGAGGCTCGATTT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RS1BG90JQ 794 0 0
GC
AATATCTTCATTTACAACCCTTTTTAATTGGTAAAATAAATGTCCACACAAGCAAAACAA
AGCAAAGACATGCAAAGCACAGAAGTCCATAACTCAATGTTGACTGACCAGAAGGTCCCC
TTTAAGGGAAGTGTATTCCATTACATATAACTAAGCACGACAAGATGAACTCACTGCCCT
ATCCATGGCCCTATCTGGTAGAACCATTCCTGTTAGGTTTTCTGTTGGTTGTACTCTCGG
TAACCTTCTTGCAATTTCATAGAATATCTCCTTGACATTAGCTGCGGTTTTTGCTGAAGT
TTCCATGAAGAAAAGACCGTTCTCCTGAGCATATGTTTGTGCCTCCTCTGCGGAAACCTT
CCTTGCATCTAATAAATCAGATTTGTTTCCAGCAAGGGCCATCACCATATTAGCGTTACC
TTGTGCCTGAAGTTCCTGAACCCATTTCTTTGCCCTCTCAAACGAGGCTTGGTTTGTAAC
GTCAAAGACAATGATAGCAGCAGCAGCACCCCTGTAGTACATAGGAGCCAAACTATGGTA
CCGTTCCTGACCTGCTGTATCCCATATCTCAAACTTTACAGTCGCATCGTTGACAGCTAG
TGTTTGTGAGAAAAAAGCAGCACCGATGGTTGATTCCTGAAACTCAACAAACTGATCTTT
AACAAAGCGTAACACAAGGCTCGATTTCCCAGCGCCAACATCTCCAAGCAACACCAATTT
GGCGTTAATGGTCTTGTTTGCAGCGGTGGTAGCCATGATTGAGCTCA*GAGAGAGAGAGA
GAGAGAGAGCTC

QA 3 794 3 794
DS 

RD RS1BG90TF 725 0 0
AGCACGACAAGATGA*CTCACTGCCCTATCCATG*CCCTATCTG*TAGAACCATTC*TGT
TAGGTTTTCTGTTGGTTGTACTCTCGGTAAC*TTCTTGCAATTTCATAGAATATCTCCTT
GACATTAGCTGCGGTTTTTGCTGAAGTTTCCATGAAGAAAAGACCGTTCTCCTGAGCATA
TGTTTGTGCCTCCTCTGCGGAAACCTTCCTTGCATCTAATAAATCAGATTTGTTTCCAGC
AAGGGCCATCACCATATTAGCGTTACCTTGTGCCTGAAGTTCCTGAACCCATTTCTTTGC
CCTCTCAAACGAGGCTTGGTTTGTAACGTCAAAGACAATGATAGCAGCAGCAGCACCCCT
GTAGTACATAGGAGCCAAACTATGGTACCGTTCCTGACCTGCTGTATCCCATATCTCAAA
CTTTACAGTCGCATCGTTGACAGCTAGTGTTTGTGAGAAAAAAGCAGCACCGATGGTTGA
TTCCTGAAACTCAACAAACTGATCTTTAACAAAGCGTAACACAAGGCTCGATTTCCCAGC
GCCAACATCTCCAAGCAACACCAATTTGGCGTTAATGGTCTTGTTTGCAGCGGTGGTAGC
CATGATTGAGCTCAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTCGTGGATGGAGGAAATGAGATT
GAAGATCAAAAGACGGAGAGAACCCAAAAAGACGCGTCGTCGGCAACAACCACTCAATTT
TATCC

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1F096TF 646 0 0
ACTCTCGGTAACCT*CTTGCAATTTCATAGAATATCTCCTTGACATTAGCTGCGGTTTTT
GCTGAAGTTTCCATGAAGAAAAGACCGTTCTCCTGAGCATATGTTTGTGCCTCCTCTGCG
GAAACCTTCCTTGCATCTAATAAATCAGATTTGTTTCCAGCAAGGGCCATCACCATATTA
GCGTTACCTTGTGCCTGAAGTTCCTGAACCCATTTCTTTGCCCTCTCAAACGAGGCTTGG
TTTGTAACGTCAAAGACAATGATAGCAGCAGCAGCACCCCTGTAGTACATAGGAGCCAAA
CTATGGTACCGTTCCTGACCTGCTGTATCCCATATCTCAAACTTTACAGTCGCATCGTTG
ACAGCTAGTGTTTGTGAGAAAAA*GCAGCACCGATGGTTGATTCCTGAAACTCAACAAAC
TGATCTTTAACAAAGCGTAACACGAGGCTCGATTTCCCAGCGCCAACATCTCCAAGCAAC
ACCAATTTGGCGTTAATGGTCTTGTTTGCAGCGGTGGTAGCCCTGATTGAGCTCA**AGA
GAGAGAGAGAGAGAGAGCTCGTGGATGGAGGGAATGAGATTGAAGATCAAAAGACGGAGA
GAACTCAAAAAGACGCGTCGTCGGCAACAACCACTCAATTTTATCC

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 4

CO CL3108Contig1 670 4 2 U
TGTTTATTTTATCGCTTCTTTTCTATTAAAGAAAACTCGTAATTGGCGAGTTCTTTTCAA
TATGTAAACTACACAAGAAAAAGAGCTGCACAAACATGAAGAGAAAACCACAGGCAAAGA
GAGACAGCAAGTAACAACATCAAAATTGTTCAAAATATTCTCCATATAAACTCTTTAGCG
TTTCATCAGTTTCTTGTCTTACATTATGGAACATGAGTTTGGATTCTCGTCGCTGAATAG
TTGAGGCGGGTAAGCATGAGGCGGCATTTCCATAGGCGGAACCGCTACACGCGGTGGTTG
GTAATAATAATAGTAATAAGGATTATCTATCTTCCTCACATCCACAACTTTTCCCTCTTC
CTCGCCGCTGCCGCCACCGCTTTCAGCTGCTTTGCCTTCCCCTTTGTCGCCATCCCCTTC
TTTCTTGTCTTCCTTCTCTTCCTCTGCTTTCTTCTTTGGAATCTTTAGTAGGTTCTCCTT
CTTGAGTTTTCTTCTCAGATTCTTCTCCTTTTTTCTCATCAGCCTCTACTTTCTTTCCTT
CTCCTTCTTTTTTCTCCTCTTTTGGTTTCTTTTCCTCCATTTTCTTCTCCTCTGCTGCTT
CTGGTTTCTTCTCCTCCTCTCCCATTTTTTGTTTGTTTTGGTTAAGTTTCGAGTGTTTCT
ATGTTCACCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1GD45JQ U 11
AF RS1GD45TF C 1
AF RS1E788TF C 3
AF RS1E788JQ U 11
BS 1 10 RS1GD45TF
BS 11 670 RS1E788JQ

RD RS1GD45JQ 628 0 0
ATCGCTTCTTTTCTATTAAAGAAAACTCGTAATTGGCGAGTTCTTTTCAATATGTAAACT
ACACAAGAAAAAGAGCTGCACAAACATGAAGAGAAAACCACAGGCAAAGAGAGACAGCAA
GTAACAACATCAAAATTGTTCAAAATATTCTCCATATAAACTCTTTAGCGTTTCATCAGT
TTCTTGTCTTACATTATGGAACATGAGTTTGGATTCTCGTCCCTGAATAGTTGAGGCGGG
TAAGCATGAGGCGGCATTTCCATAGGCGGAACCGCTACACGCGGTGGTTGGTAATAATAA
TAGTAATAAGGATTATCTATCTTCCTCACATCCACAACTTTTCCCTCTTCCTCGCCGCTG
CCGCCACCGCTTTCAGCTGCTTTGCCTTCCCCTTTGTCGCCATCCCCTTCTTTCTTGTCT
TCCTTCTCTTCCTCTGCTTTCTTCTTTGGAATCTTTAGTAGGTTCTCCTTCTTGAGTTTT
CTTCTCAGATTCTTCTCCTTTTTTCTCATCAGCCTCTACTTTCTTTCCTTCTCCTTCTTT
TTTCTCCTCTTTTGGTTTCTTTTCCTCCATTTTCTTCTCCTCTGCTGCTTCTGGTTTCTT
CTCCTCCTCTCCCATTTTTTGTTTGTTT

QA 1 628 1 628
DS 

RD RS1GD45TF 670 0 0
TGTTTATTTTATCGCTTCTTTTCTATTAAAGAAAACTCGTAATTGGCGAGTTCTTTTCAA
TATGTAAACTACACAAGAAAAAGAGCTGCACAAACATGAAGAGAAAACCACAGGCAAAGA
GAGACAGCAAGTAACAACATCAAAATTGTTCAAAATATTCTCCATATAAACTCTTTAGCG
TTTCATCAGTTTCTTGTCTTACATTATGGAACATGAGTTTGGATTCTCGTCGCTGAATAG
TTGAGGCGGGTAAGCATGAGGCGGCATTTCCATAGGCGGAACCGCTACACGCGGTGGTTG
GTAATAATAATAGTAATAAGGATTATCTATCTTCCTCACATCCACAACTTTTCCCTCTTC
CTCGCCGCTGCCGCCACCGCTTTCAGCTGCTTTGCCTTCCCCTTTGTCGCCATCCCCTTC
TTTCTTGTCTTCCTTCTCTTCCTCTGCTTTCTTCTTTGGAATCTTTAGTAGGTTCTCCTT
CTTGAGTTTTCTTCTCAGATTCTTCTCCTTTTTTCTCATCAGCCTCTACTTTCTTTCCTT
CTCCTTCTTTTTTCTCCTCTTTTGGTTTCTTTTCCTCCATTTTCTTCTCCTCTGCTGCTT
CTGGTTTCTTCTCCTCCTCTCCCATTTTTTGTTTGTTTTGGTTAAGTTTCGAGTGTTTCT
ATGTTCACCC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RS1E788TF 668 0 0
TTTATTTTATCGCTTCTTTTCTATTAAAGAAAACTCGTAATTGGCGAGTTCTTTTCAATA
TGTAAACTACACAAGAAAAAGAGCTGCACAAACATGAAGAGAAAACCACAGGCAAAGAGA
GACAGCAAGTAACAACATCAAAATTGTTCAAAATATTCTCCATATAAACTCTTTAGCGTT
TCATCAGTTTCTTGTCTTACATTATGGAACATGAGTTTGGATTCTCGTCGCTGAATAGTT
GAGGCGGGTAAGCATGAGGCGGCATTTCCATAGGCGGAACCGCTACACGCGGTGGTTGGT
AATAATAATAGTAATAAGGATTATCTATCTTCCTCACATCCACAACTTTTCCCTCTTCCT
CGCCGCTGCCGCCACCGCTTTCAGCTGCTTTGCCTTCCCCTTTGTCGCCATCCCCTTCTT
TCTTGTCTTCCTTCTCTTCCTCTGCTTTCTTCTTTGGAATCTTTAGTAGGTTCTCCTTCT
TGAGTTTTCTTCTCAGATTCTTCTCCTTTTTTCTCATCAGCCTCTACTTTCTTTCCTTCT
CCTTCTTTTTTCTCCTCTTTTGGTTTCTTTTCCTCCATTTTCTTCTCCTCTGCTGCTTCT
GGTTTCTTCTCCTCCTCTCCCATTTTTTGTTTGTTTTGGTTAAGTTTCGAGTGTTTCTAT
GTTCACCC

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1E788JQ 660 0 0
ATCGCTTCTTTTCTATTAAAGAAAACTCGTAATTGGCGAGTTCTTTTCAATATGTAAACT
ACACAAGAAAAAGAGCTGCACAAACATGAAGAGAAAACCACAGGCAAAGAGAGACAGCAA
GTAACAACATCAAAATTGTTCAAAATATTCTCCATATAAACTCTTTAGCGTTTCATCAGT
TTCTTGTCTTACATTATGGAACATGAGTTTGGATTCTCGTCGCTGAATAGTTGAGGCGGG
TAAGCATGAGGCGGCATTTCCATAGGCGGAACCGCTACACGCGGTGGTTGGTAATAATAA
TAGTAATAAGGATTATCTATCTTCCTCACATCCACAACTTTTCCCTCTTCCTCGCCGCTG
CCGCCACCGCTTTCAGCTGCTTTGCCTTCCCCTTTGTCGCCATCCCCTTCTTTCTTGTCT
TCCTTCTCTTCCTCTGCTTTCTTCTTTGGAATCTTTAGTAGGTTCTCCTTCTTGAGTTTT
CTTCTCAGATTCTTCTCCTTTTTTCTCATCAGCCTCTACTTTCTTTCCTTCTCCTTCTTT
TTTCTCCTCTTTTGGTTTCTTTTCCTCCATTTTCTTCTCCTCTGCTGCTTCTGGTTTCTT
CTCCTCCTCTCCCATTTTTTGTTTGTTTTGGTTAAGTTTCGAGTGTTTCTATGTTCACCC

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL3109Contig1 1093 2 16 U
GACAATTAGAACCAAAGTACTTGAAAAAACTATACAAACCATAACATCGGCCACAGTAAT
TTCACACATGGAGGAAACAACAGATTCGGTGTGAAAAATATTTTATTGAAGGAGAGAAAG
AGAGAGAGAGAGAGACATCATCATCATCATCATCATCATCATCACATGTTGGATTTGGTT
TGTCTTGCGATCTTGAACCACTCGGTGTGGAAAGAGCCTTCAACATCAGTCCTTTCATAA
GTATGAGCACCAAAGTAGTCTCTCTGAGTTTGTACAAGGTTCGCTGGCAACCTCTCTCTC
CTGTAAGAATCAAAGTAGGCCAGACTAGCAGACATACCGGGCGTGCTGATACCCGAGTTG
ATACTCAAGCAGACAACTCTCCTCCAAGCCGACTGTCTCTCGATGATCTCTTTCGCAAAC
TCGGGATCCACCAAGAGGTTAGCCAGCTCTGCGTTCCTGTCGTAAGCTTGCTCGATCCTG
TCCAAGAAGATCGCTCTGATGATGCACCCTCCTTTCCAGATCCTCGCCAGCTCACCTAGC
TTAAGGCCCCATCCTTTCTCCATGCTCTTGGCGCGGATCAGGTTCATCCCTTGCGCGTAG
CTGCAGATTTTCGACGCGTAAAGCGCCTTCCTCACGTCATCGATGAGCTGTTTCTTGTCG
ACGGTTTGGTCGGTTAAGACATCTCCAAAACCACCTTCCTTGAAGACCTTAGCTGCTTCA
ACACGCTCATCTTTCAACCCGCTGAGGAACCTCGCGTCAAGAGATGACTCAATGGTGGGA
GAAGGAACAGAGAGCTCAGCAGCTTGCTGGACAGTCCATTTCCCGGTACCTTTCATCCCG
GTTTTGTCCAAAACCTTGTCAACCAAATGCCCATCTCCCTTATCGTCCTTGATACCGAAG
ATATCCGCCGTGATCTCCACCAAGAAACTCTCGAGCTCGCCTTTGTTCCACTCGGTGAAG
ACCCCGTGAAGCTCCTCGTTAGACAGTTTACCAACGGATTTCAGAACGTCATAGGCTTCA
GCAATCAGCTGCATGTCGCCGTACTCAATCCCGTTGTGTACCATTTTGACGAAGTTTCCA
GACCCGCCTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FV70JQ U 1
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BS 1 521 RS1FV70JQ
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DS 

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CGATGAGCTGTTTCTTGTCGACGGTTTGGTCGGTTAAGACATCTCCAAAACCACCTTCCT
TGAAGACCTTAGCTGCTTCAACACGCTCATCTTTCAACCCGCTGAGGAACCTCGCGTCAA
GAGATGACTCAATGGTGGGAGAAGGAACAGAGAGCTCGGCAGCTTGCTGGACAGTCCATT
TCCCGGTACCTTTCATCCCGGTTTTGTCCAAAACCTTGTCAACCAAATGCCCATCTCCCT
TATCGTCCTTGATACCGAAGATATCCGCCGTGATCTCCACCAAGAAACTCTCGAGCTCGC
CTTTGTTCCACTCGGTGAAGACCCCGTGAAGCTCCTCGTTAGACAGTTTACCAACGGATT
TCAGAACGTCATAGGCTTCAGCAATCAGCTGCATGTCGCCGTACTCAATCCCGTTGTGTA
CCATTTTGACGAAGTTTCCAGACCCGCCTTTCC

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 4

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ACATGAAAACTAAGGTTATTGGCTGTCCGAAAACAATCGATGGTGATTTAAAGAGCAAAG
AAGTCCCCACCAGTTTCGGGTTTGACACTGCTTGCAAGATATACTCAGAAATGATTGGAA
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TAGCCCAAGGAAACGTTGACGAAGAAGGACAATGGAAGAAGAATCTAAAAGAGGAGACTC
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CACATGGAAATGTCCAGGTGGCTAAAATAGAGACAGAGAAAATGCTGATTCAAATGGTTG
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TGCTACGCATTGGGTTGCGGTGCTGGATCACTTCTCCAGAGTGGAAAGACCGGTTTAATC
TCATCGGTTGGGAATTTGGCTGCTCCTGTTGAGAAATGGACCGTTGGTGGTACACCGCTA
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ATGGTTGAACTTGAAGGTGCCCCGTTTAAGAAATTTGCATCGCAGCGTGAAGAATGGGCT
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ATAAATCACACTTTACTGCTCGAACTCGGTGCTCAAGCCTGAAGAGTTTTGTTACTGTCA
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TGAGTTAAGTAAACCAGCAGGTGATCATTGTGTCG


BQ
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15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A251TV U 1
AF RS1A251TF U 196
AF RS1A251JQ C 562
AF RS1A251TR C 562
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BS 416 416 RS1A251TF
BS 417 440 RS1A251TV
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BS 468 900 RS1A251TV
BS 901 1235 RS1A251JQ

RD RS1A251TV 900 0 0
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ACATGAAAACTAAGGTTATTGGCTGTCCGAAAACAATCGATGGTGATTTAAAGAGCAAAG
AAGTCCCCACCAGTTTCGGGTTTGACACTGCTTGCAAGATATACTCAGAAATGATTGGAA
ATGTTATGATCGATGCACGTTCCACGGGAAAATACTACCACTTTGTGCGTCTTATGGGCC
GTGCTGCTTCTCATATTACACTTGAATGCGCTTTGCAAACCCATCCAAACATTACCATTA
TTGGAGAAGAGGTTTCGGAGAAGAAACTAACGTTGAAAAACGTTACGGATTACATTGTTG
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GGTCTAATCGATTTCATCCC*TGAGGTCCAAGAGCTTATTTCAGAA*CTGAACGAAATCT
TAGCCCAAGGAAACGTTGACGAAGAAGGACAATGGAAGAAGAATCTAAAAGAGGAGACTC
TAAAGCTTTTTGAGTTTCTTCCTCAAACAATTCAGGAACAACTGATGCTTGAGAGAGATC
CACATGGAAATGTCCAGGTGGCTAAAATAGAGACAGAGAAAATGCTGATTCAAATGGTTG
AAACCGAGCTAGAGAAAAAGAAGAAGGATGGTTCATATAAACGCGAGTTCATGGGCAAAT
CGCACTTCTTTGGGTATGAGGGAAGA*TGTGGATTGCCTACAAATTTCGATGCAACTTAC
TGCTACGCATTGGGTTGCGGTGCTGGATCACTTCTCCAGAGTGGAAAGACCGGTTTAATC
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DS 

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TTACACTTGAATGCGCTTTGCAAACCCATCCAAACATTACCATTATTGGAGAAGAGGTTT
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GCGCTGAAAATGGTTATAACTATGGTGTCATTCTTGTGCCCTGAAGGTCTAATCGATTTC
ATCCCCTGAGGTCCAAGAGCTTATTTCAGAAACTGAACGAAATCTTAGCCCAAGGAAACG
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AGGTGGCTAAAATAGAGACAGAGAAAATGCTGATTCAAATGGTTGAAACCGAGCTAGAGA
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TGCGGTGCTGGATCACTTCTCCAGAGTGGAAAGACCGGTTTA*TCTCATCGGTTGGGAAT
TTGGCTGCTCCTGTTGAGAAATGGACCGTTGGTGGTACACCGCTA
CTTCAT

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DS 

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TGATCATTGTGTCG

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DS 

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CTAAAATAGAGACAGAGAAAATGCTGATTCAAATGGTTGAAACCGAGCTAGAGAAAAAGA
AGAAGGATGGTTCATATAAACGCGAGTTCATGGGCAAATCGCACTTCTTTGGGTATGAGG
GAAGA*TGTGGATTGCCTACAAATTTCGATGCAACTTACTGCTACGCATTGGGTTGCGGT
GCTGGATCACTTTTCCAGAGTGGAAAGACCGGTTTAATTTCATCGGTTGGGAATTTGGCT
GCTCCTGTTGAGAAATGGACCGTTGGTGGTACACCGCTAACTTCATTGATGGATGTTGAG
AGAAGACATGGTAAATTCAAGCCTGTTATCAAGAAAGCTATGGTTGAACTTGAAGGTGCC
CCGTTTAAGAAATTTGCATCGCAGCGTGAAGAATGGGCTTTGAAGAATAGATACATTAGT
CCTGGTCCGATTCAGTTCAAGGGACCGGGATTTGATGCGATAAATCCCACTTTACTGCTC
GAACTCGGTGCTCAAGCCTGAAGAGTTTTGTTACTGTCAGATTCACTCACTTTGTTTGTA
AAAAGCTTTGTAGTAAGAATGTTAAAATGTTGTGACTTTTGAGTTAAGTAAACCAGCAGG
TGATCATTGTGTCG

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 3

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GACAAAATTGATCAGAAGGATGATGTGTATAGAGAGAGATTCAACAACATTATAAAAGCA
TACTCGAGTTCTTAAAACACTCTTCCTAGCAAAATTTCTTCAGCCCAGTAACATAACCTA
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TTGGAGAGAAATGTTTCATATTCCATCAACGACCTGTCTGCTCTAGCCTTGAGCCATAGA
CTTTTATAGAAGAGCGCCTGTGGGTTGAATTGCGCTTCTGTTTCATGACTCCTTACAACC
TGGCCAAAGCCATTTTCTTTGGCTACAACGTATTCAACTTGAGGCTCTGCTCCTGCTTCC
CCTTTGACCATGGGATACTTCTCTTTCCTTCTAAACTCAACTGCGGAACTCAGATTTATC
GCCTTTGGTATCTGATGTTCTCTAATCGATTGCTTGCACACATTCGGCAACGAAGTGAAA
CCATCATATTTCCCGGAATGCTCATGCACTCTGTTACTGATGTACGAGTTGAGATTCTGT
ACAGTAGAGTTGATGAGAGCAAGATCTTGCTCATTTGGTGAACCTGAACCATGTGCATGT
GTTAGCAACTCTGACAATCCATGTATGGTTGTGAGCAGCTTTTTAACATCCATCTGTGGA
GAAGGATTTCCATAACGGTGACGACCCATCTGCTTTGTATCAACTTCCTGATAAGATGGC
TCCACGGGCACTGAGGGGTGTGTTAAGCCTGCATGTATCTCTTTGTAGCTAACTGGAGAG
AACAAAACAGAACTATTCACATTATCATTTGCAGCTTGGTTTCCCACAGAGGCATATACT
TTTGGTTTAGTATCTGCTAACGAGAACTGTGGGGCTAGTGGATTCAGCTTCTTCTTCTGA
ACTTGAGACCCAAGCCGAGGGTTGGATGAGTATATTTTACCAGAGTGATGATTCACACTA
CCAATGTGGCCGACCTCTGAAGAAGCATAAGCAGAGTGAGCATTTCTCTCAGTGGACATC
ATCATGTGATCAGCTACAACAGACTTGTCATGGACAACGGCATAAGCAGGAACAAACACA
GGGGCCAAAGGATCCAGCTTTGTACTTCTTTGGAACTGATTGCTACTATCTTCTTGACGT
ACTACTAAACCCAAACTTTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BO38JQ U 1
AF RS1DV79JQ U 1
AF RS1BO38TF C 575
BS 1 408 RS1BO38JQ
BS 409 409 RS1DV79JQ
BS 410 537 RS1BO38JQ
BS 538 538 RS1DV79JQ
BS 539 732 RS1BO38JQ
BS 733 1281 RS1BO38TF

RD RS1BO38JQ 732 0 0
TGATCAAATAGCAACCAAAAAGGTTGAGCATCTGTTTTGTGACAAAACTGTCAAGGGCAT
GACAAAATTGATCAGAAGGATGATGTGTATAGAGAGAGATTCAACAACATTATAAAAGCA
TACTCGAGTTCTTAAAACACTCTTCCTAGCAAAATTTCTTCAGCCCAGTAACATAACCTA
GTTGGGTTTCAATCACCAGACCTGAGATTTAGCCGTTTTAATCTCTACACTCTAACCTTA
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CCATCATATTTCCCGGAATGCTCATGCACTCTGTTACTGATGTACGAGTTGAGATTCTGT
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GTTAGCAACTCT

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1DV79JQ 737 0 0
TGATCAAATAGCAACCAAAAAGGTTGAGCATCTGTTTTGTGACAAAACTGTCAAGGGCAT
GACAAAATTGATCAGAAGGATGATGTGTATAGAGAGAGATTCAACAACATTATAAAAGCA
TACTCGAGTTCTTAAAACACTCTTCCTAGCAAAATTTCTTCAGCCCAGTAACATAACCTA
GTTGGGTTTCAATCACCAGACCTGAGATTTAGCCGTTTTAATCTCTACACTCTAACCTTA
TATGTATATATATAGTCTCACAACTCAACAGCCTCCCACTAAATTGCTCAAGTTCTTGAA
TTGGAGAGAAATGTTTCATATTCCATCAACGACCTGTCTGCTCTAGCCTTGAGCCATAGA
CTTTTATAGAAGAGCGCCTGTGGGTTGAATTGCGCTTCTGTTTCATGACTCCTTACAACC
TGGCCAAAGCCATTTTCTTTGGCTACAACGTATTCAACTTGAGGCTCTGCTCCTGCTTCC
CCTTTGACCATGGGATACTTCTCTTTCCTTCTAAACTCAACTGCGGAACTCAGATTTATC
GCCTTTGGTATCTGATTTTCTCTAATCGATTGCTTGCACACATTCGGCAACGAAGTGAAA
CCATCATATTTCCCGGAATGCTCATGCACTCTGTTACTGATGTACGAGTTGAGATTCTGT
ACAGTAGAGTTGATGAGAGCAAGATCTTGCTCATTTGGTGAACCTGAACCATGTGCATGT
GTTAGCAACTCT
GACAA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1BO38TF 707 0 0
TGCACACATTCGGCAACGAAGTGAAACCATCATATTTCCCGGAATGCTCATGCACTCTGT
TACTGATGTACGAGTTGAGATTCTGTACAGTAGAGTTGATGAGAGCAAGATCTTGCTCAT
TTGGTGAACCTGAACCATGTGCATGTGTTAGCAACTCTGACAATCCATGTATGGTTGTGA
GCAGCTTTTTAACATCCATCTGTGGAGAAGGATTTCCATAACGGTGACGACCCATCTGCT
TTGTATCAACTTCCTGATAAGATGGCTCCACGGGCACTGAGGGGTGTGTTAAGCCTGCAT
GTATCTCTTTGTAGCTAACTGGAGAGAACAAAACAGAACTATTCACATTATCATTTGCAG
CTTGGTTTCCCACAGAGGCATATACTTTTGGTTTAGTATCTGCTAACGAGAACTGTGGGG
CTAGTGGATTCAGCTTCTTCTTCTGAACTTGAGACCCAAGCCGAGGGTTGGATGAGTATA
TTTTACCAGAGTGATGATTCACACTACCAATGTGGCCGACCTCTGAAGAAGCATAAGCAG
AGTGAGCATTTCTCTCAGTGGACATCATCATGTGATCAGCTACAACAGACTTGTCATGGA
CAACGGCATAAGCAGGAACAAACACAGGGGCCAAAGGATCCAGCTTTGTACTTCTTTGGA
ACTGATTGCTACTATCTTCTTGACGTACTACTAAACCCAAACTTTCC

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 3

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ACAGTGGGCTCGGTCTGGTTCTTATGGAAGAAACTTCTCCGCGCTGCCAAACTACTCCCC
TTCAGATTCCGAAGTCCAAGACCAGGTGTTGGTGGAAGGGAAAGCTAAATCAAGAGCTGC
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GAGGCTATACGAGTCTTGGGAAGAGAACCCTGCTATTTCTTTTGTTTTGATGAAGGGTAG
CGGAAAAACGTTCTGTTCTGGGGCAGATGTCTTGCCTCTTTATCACTCTATCAATGAAGG
AAATACTGAAGAATGTAAACACTTTTTCGGGGACTTGTACAATTTTGTATACCTCCAAGG
AACTTATTTGAAACCAAATATAGCTATAATGGATGGTGTAACCATGGGTTGTGGTGGTGG
CATTGCAATTCCAGGGATGTTTCGTGTTGCAACTGATAAAACTGTGTTGGCTCATCCAGA
GGTGCAAATTGGTTTTCATCCTGATGCAGGAGCTTCCTACTATCTTTCAAGGCTTCCTGG
TTATTTAGGGGAATACTTGGCTTTAACAGGGCAGAAACTTGATGGTGTCGAAATGATAGC
ATGTGGCCTTGCTACCCACTTTTGCCTACACTCGAGACTTGGGATGGTCGAAGAGAGGAT
TGGTAAACTGTTGACAGATGATCCTACTGTCATTGACGCTTCTCTTGCTCAGTACAGTGA
TCTAGTTTATCCTGACAATACCAGTGTACTTCACAAGATTGAGATGATTGATAGATACTT
TGGGCTTGACACTGTCGAAGAAATCATTGAGGCTATGGAAAATGAGGTTGCTAATTCTGG
CAATGAATGATGCAAGAAAACTCTTAAACAAGTCAAAGAAGCTTCTCCTTTGAGCTTAAA
GATTACTTTACAATCCATACGAGAAGGTAGATTTCAAACTCTTGATCAATGTCTCACACG
TGAGTACCGTATATCTCTTTGTGGAGTCTCGAAGACTGTCTCTGGTGACTTCTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1EZ09TF U 1
AF RS1A626TF U 14
AF RS1F536TF U 424
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ATGTGGCCTTGCTACCCA

QA 1 738 1 738
DS 

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TGTAAACACTTTTTCGGGGACTTGTACAATTTTGTATACCTCCAAGGAACTTATTTGAAA
CCAAATATAGCTATAATGGATGGTGTAACCATGGGTTGTGGTGGTGGCATTGCAATTCCA
GGGATGTTTCGTGTTGCAACTGATAAAACTGTGTTGGCTCATCCAGAGGTGCAAATTGGT
TTTCATCCTGATGCAGGAGCTTCCTACTATCTTTCAAGGCTTCCTGGTTATTTAGGGGAA
TACTTGGCTTTAACAGGGCAGAAACTTGATGGTGTCGAAATGATAGCATGTGGCCTTGCT
ACCCATTTTTGCCTACACTCGAGACTTGGGATGGTCGAAGAGAGGATTGGTAAACTGTTT
ACAGATGATCCTACTGTCATTGACGCTTCTCTTGCTCA*TACAGTGATCTAGTTTATCCT
GACA*TACCAGTGTACTTCACA*GATTGAGATGATTGA

QA 1 878 1 878
DS 

RD RS1F536TF 713 0 0
TACTGAAGAATGTAAACACTTTTTCGGGGACTTGTACAATTTTGTATACCTCCAAGGAAC
GTATTTGAAACCAAATATAGCTATAATGGATGGTGTAACCATGGGTTGTGGTGGTGGCAT
TGCAATTCCAGGGATGTTTCGTGTAGCAACAGATAAAACTGTGTTGGCCCATCCAGAGGT
GCAAATTGGTTTTCATCCTGATGCAGGAGCTTCCTACTATCTTTCAAGGCTTCCTGGTTA
TTTAGGGGAATACTTGGCTCTAACAGGGCAGAAACTTGATGGTGTCGAAATGATAGCATG
TGGCCTTGCTACCCACTTTTGCCTACACTCGAGACTTGGGATGGTCGAAGAGAGGATTGG
TAAACTGTTGACAGATGATCCTACTGTCATTGAGGCTTCTCTTGCTCAGTACAGTGATCT
AGTTTATCCTGACAATACCAGTGTACTTCACAAGGTTGAGATGATTGATAGATACTTTGG
GCTTGACACTGTCGAAGAAATCATTGAGGCTATGGAAAATGAGGTTGCTAATTCTGGCAA
TGAATGATGCAAGAAAACTCTTAAACAAGTCAAAGAAGCTTCTCCTTTGAGCTTAAAGAT
TACTTTACAATCCATACGAGAAGGTAGATTTCAAACTCTTGATCAATGTCTCACACGTGA
GTACCGTATATCTCTTTGTGGAGTCTCGAAGACTGTCTCTGGTGACTTCTGCG

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 4

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CCACCGCAACTTTTCTTCAGCCGGCGAAGAAGATCGCCACTTCTTCTCCTTCTCGCAACG
TTGTTCATCTCCGATCTAACCAAACCGTGGGCAAGTCCTTTGGCCTAGAATCTTCACCTG
CTAGATTCACTTGCTCCATCCACTCTGACTTCAAAGACTTCATCGGAAAGTGCTCTGATG
CAGCCAAAATTGCTGGTTTCGCTCTCGCCACCTCTGCTCTCGTTGTCTCGGGGGCGAGTG
CGGAGGGAGCACCAAAGAGGTTAACGTACGACGAGATACAGAGCAAGACTTACATGGAGG
TTAAGGGGACTGGTACTGCGAACCAGTGCCCCACAATCGACGGTGGCTCTGAAACATTCT
CATTCAAACCTGGTAAGTACACAGGCAAGAAATTCTGCTTCGAGCCTACTTCCTTCACCG
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ACAACTTCAGTGGCAAATTCTTAGTTCCTTCGTACCGTGGCTCGTCTTTCTTGGACCCTA
AGGGACGTGGTGGATCCACTGGATACGATAATGCAGTGGCTTTGCCTGCGGGAGGCAGAG
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TCACTTTGAAGATCACAAAGAGTAAACCAGAGACAGGAGAAGTGATCGGAGTGTTCGAGA
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GGGTTTGGTATGGTCAGCTTGAGTGATTGTTCTAATCTGAATCTGTTTGTCACAAGTTGT
ATTAAAACATCTTCTTTATATATTAATTAAAATGCTCAATAAATAAATAATGTATTAGCG
AATAATTTAATAGATTATGTTTCAGCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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CCACCGCAACTTTTCTTCAGCCGGCGAAGA***TCGCCACTTCTTCTCCTTCTCGCAACG
TTGTTCATCTCCGATCTAACCAAACCGTGGGCAAGTCCTTTGGCCTAGAATCTTCACCTG
CTAGATTCACTTGCTCCATCCACTCTGACTTCAAAGACTTCATCGGAAAGTGCTCTGATG
CAGCCAAAATTGCTGGTTTCGCTCTCGCCACCTCTGCTCTCGTTGTCTCGGGGGCGAGTG
CGGAGGGAGCACCAAAGAGGTTAACGTACGACGAGATACAGAGCAAGACTTACATGGAGG
TTAAGGGGACTGGTACTGCGAACCAGTGTCCCACAATCGACGGTGGCTCTGAAACATTCT
CATTCAAACCTGGTAAGTACACAGGCAAGAAATTCTGCTTCGAGCCTACTTCCTTCACCG
TCAAGGCAGATAGCGTCAGCAAGAACGCCCCGCCGGATTTCCAAAACACCAAGCTCATGA
CCCGTCTCACTTACACTCTCGACGAGATCGAAGGACCCTTTGAGGTCAGTTCAGATGGAA
GCGTGAAGTTCAAGGAAGAAGATGGGATCGATTATGCAGCAGTCACAGTCCAGCTTCCGG
GAGGAGAACGCGTGCCGTTCCTCTTCACG*TGAAACAGCT

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DS 

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QA 1 578 1 578
DS 

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TTCCAAAACACCAAGCTCATGACCCGTCTCACTTACACTCTCGACGAGATCGAAGGACCC
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GGCTCGTCTTTCTTGGACCCTAAGGGACGTGGTGGATCCACTGGATACGATAATGCAGTG
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ACGGCTGCTTCGGTCGGAGAGATCACTTTGAAGATCACAAAGAGTAAACCAGAGACAGGA
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CCAAAGGATGTTAAGATCCAAGGGGTTTGGTATGGTCAGCTTGAGTGATTGTTCTAATCT
GAATCTGTTTGTCACAAGTTGTATTAAAACATCTTCTTTATATATTAATTAAAATGCTCA
ATAAATAAATAATGTATTAGCGAATAATTTAATAGATTATGTTTCAGCC

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 4

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ACTTTACATGATGACACAATAAGCAAAAAGAGAAAAAAAAAATTGTAATGACTAAAATAA
AATCTTTGGTCCTTTGATGCATATCTTAGTGTTTTCTGTTTCACATATCTGGATCTTGAT
CGAGTACTCATATTCTCCACATGTCTTCTCATCCTCCTCGTTCTTGACGCAGCTTTGGTA
AAAAAAGAAGTTGACTATGGTGTCAAGAACCAAGAAGAGAGCGTACAAGTAAGCTATGAA
CGTCCCTTCAATAGCCATCGAAGTGACATCTCTGTCTCCTTTGTAAAATGATCTCATTAC
TCTGTACCGAAACAGGGCTTCCACACCAGCTAAGCCGAGGTTAGTAGGCAGAGCAAGAGC
CAATGCTGTTGATGTTCTTCCGCGAATGAGAAGACACGCCTTGAGGAGTGTTGTGTATCC
TCCTGAGGACGAGGAAGGAGATGAAACCAAGGCTAAGTTGGAGATGACAAAGGCGTTTGC
GAGGATGAGTGAGTAGATAATGGCTGAGGATAAGGAGAAGAGAGTGTAGAAGTTTCTAGA
AGAGAATCCAAAGGAGTCTAGGATGTTGAATGATATGAAGAACAGAGCAAAAGCAGAGGC
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GGGAGAGTCATGATTGTTTGATAGAAGTTTGATGATGTAAGCTTTGGAGAAGAGGAGGAA
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TAAGATGTTGAAGAAACCAAGGGAAGAAGAGAAGCCAGCACCGCGGAAGAGAGTGTTTAG
CTTCATGTGAATGGAGGAAGAGGAAGATGAGAAGAAGAGCTGAGAGAGGAGGAGAGCGGT
GGAGAAAGGGAGGGCAACGGCAGCTGCGGTGGTGGCACGGTAGTAGTGTTGTAGGAGTGT
GTGGATTGATCTTCTCATGATCTTGCTTGGATCCTCCATTGTCTTCTTCATTCCAACTTT
GCTAATTTTTTTTCCTTTGAAGATGTGTGTTTCTTGAATGATCCACCAAATCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1FZ20JQ U 19
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AF RS1FZ20TF C 430
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RD RS1FZ20JQ 699 0 0
AG
TTCCAAGATTGGCATTGATTATGTAGTTTCTGATATGTAAACTTTACATGATGACACAAT
AAGCAAAAAGAGAAAAAAAAAATTGTAATGACTAAAATAAAATCTTTGGTCCTTTGATGC
ATATCTTAGTGTTTTCTGTTTCACATATCTGGATCTTGATCGAGTACTCATCTTCTCCAC
ATGTCTTCTCATCCTCCTCGTTCTTGACGCAGCTTTGGTAAAAAAAGAAGTTGACTATGG
TGTCAAGAACCAAGAAGAGAGCGTACAAGTAAGCTATGAACGTCCCTTCAATAGCCATCG
AAGTGACATCTCTGTCTCCTTTGTAAAATGATCTCATTACTCTGTACCGAAACAGGGCTT
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CGCGAATGAGAAGACACGCCTTGAGGAGTGTTGTGTATCCTCCTGAGGACGAGGAAGGAG
ATGAAACCAAGGCTAAGTTGGAGATGACAAAGGCGTTTGCGAGGATGAGTGAGTAGATAA
TGGCTGAGGATAAGGAGAAGAGAGTGTAGAAGTTTCTAGAAGAGAATCCAAAGGAGTCTA
GGATGTTGAATGATATGAAGAACAGAGCAAAAGCAGAGGCGTTTGCTGAGAGGAGGAAGA
ATGAGTTGCAAATATAACTTCCGAGAAGAGGAAAGTA

QA 3 699 3 699
DS 

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ACTTTACATGATGACACAATAAGCAAAAAGAGAAAAAAAAA*TTGTAATGACTAAAATAA
AATCTTTGGTCCTTTGATGCATATCTTAGTGTTTTCTGTTTCACATATCTGGATCTTGAT
CGAGTACTCATATTCTCCACATGTCTTCTCATCCTCCTCGTTCTTGACGCAGCTTTGGTA
AAAAAAGAAGTTGACTATGGTGTCAAGAACCAAGAAGAGAGCGTACAAGTAAGCTATGAA
CGTCCCTTCAATAGCTATCGAAGTGACATCTCTGTCTCCTTTGTAAAATGATCTCATTAC
TCTGTACCGAAACAGGGCTTCCACACCAGCTAAGCCGAGGTTAGTAGGCAGAGCAAGAGC
CAATGCTGTTGATGTTCTTCCGCGAATGAAAAGACACGCCTTGAGGAGTGTTGTGTATCC
TCCTGAGGACGAGGAAGGAGATGAAACCAAGGCTAAGTTGGAGATGACAAAGGCGTTTGC
GAGGATGAGTGAGTAGATAATGGCTGAGGATAAGGAGAAGAGAGTGTAGAAGTTTCTAGA
AGAGAATCCAAAGGAGTCTAGGATGTTGAATGATATGAAGAACAGAGCAAAAGCAGAGGC
GTTTGCTGAGAGGAGGAAGAATGAGTTGCAAATATAACTTCCGAGAAGAGGAAAGTAATA
GGGAGAGTCATGATTGTTTGATAGAAGTTTGATGATGTAAGCTTTGGAGAAGA

QA 1 773 1 773
DS 

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TGATGT
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AGGAGATGAAACCAAGGCTAAGTTGGAGATGACAAAGGCGTTTGCGAGGATGAGTGAGTA
GATAATGGCTGAGGATAAGGAGAAGAGAGTGTAGAAGTTTCTAGAAGAGAATCCAAAGGA
GTCTAGGATGTTGAATGATATGAAGAACAGAGCAAAAGCAGAGGCGTTTGCTGAGAGGAG
GAAGAATGAGTTGCAAATATAACTTCCGAGAAGAGGAAAGTAATAGGGAGAGTCATGATT
GTTTGATAGAAGTTTGATGATGTAAGCTTTGGAGAAGAGGAGGAAAGTGAGGGAGAAAGG
GAGAGTGAGTAAAGAGGAAGAGAGTGTTTGTGAGAGTTTAAGGCTTAAGATGTTGAAGAA
ACCAAGGGAAGAAGAGAAGCCAGCACCGCGGAAGAGAGTGTTTAGCTTCATGTGAATGGA
GGAAGAGGAAGATGAGAAGAAGAGCTGAGAGAGGAGGAGAGCGGTGGAGAAAGGGAGGGC
AACGGCAGCTGCGGTGGTGGCACGGTGGTAGTGTTGTAGGAGTGTGTGGATTGATCTTCT
CATGATCTTGCTTGGATCCTCCATTGTCTTCTTCATTCCAACTTTGCTAATTTTTTTTCC
TTTGAAGATGTGTGTTTCTTGAATGATCCACCAAATCTTCC

QA 7 707 7 707
DS 

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TCTTCCGCGAATGAGAAGACACGCCTTGAGGAGTGTTGTGTATCCTC*TGAGGACGAGGA
AGGAGATGAAACCAAGGCTAAGTTGGAGATGACAAAGGCGTTTGCGAGGATGAGTGAGTA
GATAATGGCTGAGGATAAGGAGAAGAGAGTGTAGAAGTTTCTAGAAGAGAATCCAAAGGA
GTCTAGGATGTTGAATGATATGAAGAACAGAGCAAAAGCAGAGGCGTTTGCTGAGAGGAG
GAAGAATGAGTTGCAAATATAACTTCCGAGAAGAGGAAAGTAATAGGGAGAGTCATGATT
GTTTGATAGAAGTTTGATGATGTAAGCTTTGGAGAAGAGGAGGAAAGTGAGGGAGAAAGG
GAGAGTGAGTAAAGAG******AGTGTTTGTGAGAGTTTAAGGCTTAAGATGTTGAAGAA
ACCAAGGGAAGAAGAGAAGCCAGCACCGCGGAAGAGAGTGTTTAGCTTCATGTGAATGGA
GGAAGAGGAAGATGAGAAGAAGAGCTGAGAGAGGAGGAGAGCGGTGGAGAAAGGGAGGGC
AACGGCAGCTGCGGTGGTGGCACGGTAGTAGTGTTGTAGGAGTGTGTGGATTGATCTTCT
CATGATCTTGCTTGGATCTTCCATTGTCTTCTTCATTCTAACTTTGCTAATTTTTTTTCC
TTTGAAGATGTGTGTTTCTTGAATGATCCACCAAATCTTCC

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 3

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GGGCGGAGAATCTCACTGTCTCTTTGACTCAATCTCCTCGTCTGCACCAGAAGATTATTC
TCTAAAGATTACTCTTACGAAGAAGATGAGTAGTAGCGTGGTGGAGACGACGAGAGCAGA
GCTGGGGCTGGTGGTAGTGTATTTGAACAAAGCGGAGGCGAGGGACAAGATATGCAGAGC
TATACAGTACGGATCCAAGTTCTTGAGTGATGGACAGCCTGGCACTGCTCAGAATGTGGA
CAAGTCAACCAGCTTGGCCCGTAAAGTCTTCCGTCTCTTCAAGTTTGTGAATGACCTTCA
TGCCCTCATTAGCCCTCTTCCCAAAGGCACCCCACTCCCTCTTGCTCTCCTCGGAAAGTC
CAAGAACGCATTGCTCTCTACCTTCTTGTTCCTTGATCAAATTGTGTGGCTTGGCAGGAC
TGGCATTTACAAGAACAAAGAACGAGTTGAGCTTCTTGGACGTATATCCCTCTTCTGCTG
GATGGGTTCTTCGGCTTGCACACCCTTAGTCGAGATTGGGGAGCTTGGTAGGCTCTCAGC
TTCAATTAAGAAGCTCGAAAAAGAGATTGGCAACAAGGATAAACACCAAAATGAGCAATA
CCGCGCCAAACTACAGAGATCAAACGAGAGGTCATTGGCTCTGATCAAAGCCGGAATGGA
TTTCGTTGTTGCTTTCG*TTTGCTTCAATTGGCTCCCAAGAAAGTCACTCCCCGTGTCAC
TGGCGCTTTTGGTTTCGCCTCCTCTCTTATCTCTTGTTATCAGTTACTGCCATCGCATCC
CAAGTCCAAGACGGTTTGAGAGACAAGGAAAAGATGAAGTAGAGGGGGGTCGTAGTGTCT
TGATGTTCCATAGTGTTTTTTTGCATTAACTTACTTTTGTGTTTGATTTTTCTTTAATAC
TTGATTTTGTGCTGAAACGTTTGTCTGTTTGGAGAATAAAATGATAAAACGTTGCAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DD78TF U 1
AF RS1AY65TF U 18
AF RS1AY65JQ C 229
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BS 797 958 RS1AY65JQ

RD RS1DD78TF 724 0 0
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GCTGGGGCTGGTGGTGGTGTATTTGAACAAAGCGGAGGCGAGGGACAAGATATGCAGAGC
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TGCCCTCATTAGCCCTCTTCCCAAAGGCACCCCGCTCCCTCTTGCTCTCCTCGGAAAGTC
CAAGAACGCATTGCTCTCTACCTTCTTGTTCCTTGATCAAATTGTGTGGCTTGGCAGGAC
TGGCATTTACAAGAACAAAGAACGAGCTGAGCTTCTTGGACGTATATCCCTCTTCTGCTG
GATGGGTTCTTCGGCTTGCACATCCTTAGTCGAGATTGGGGAGCTTGGTAGGCTCTCAGC
TTCAATTAAGAAGCTCGAAAAAGAGATTGGCAACAAGGATAAACACCAAAATGAGCAATA
CCGCGCCAAACTACAGAGATCAAACGAGAGGTCATTGGCTCTGATCAAAGCCGGAATGGA
TTTCGTTGTTGCTTTCG*TTTGCTTCAATTGGCTCC*AAGAA*GTCACTCCCCGTGTCAC
TGGC

QA 1 724 1 724
DS 

RD RS1AY65TF 786 0 0
GG
CTCTTTGACTCAATCTCCTCGTCTGCACCAGAAGATTATTCTCTAAAGATTACTCTTACG
AAGAAGATGAGTAGTAGCGTGGTGGAGACGACGAGATCAGAGCTGGGGCTGGTGGTAGTG
TATTTGAACAAAGCGGAGGCGAGGGACAAGATATGCAGAGCTATACAGTACGGATCCAAG
TTCTTGAGTGATGGACAGCCTGGC*CTGCTCAGAATGTGGACAAGTCAACCAGCTTGGCC
CGTAAAGTCTTCCGTCTCTTCAAGTTTGTGAATGACCTTCATGCCCTCATTAGCCCTCTT
CCCAAAGGCACCCCACTCCCTCTTGCTCTCCTCGGAAAGTCCAAGAACGCATTGCTCTCT
ACCTTCTTGTTCCTTGATCAAATTGTGTGGCTTGGCAGGACTGGCATTTACAAGAACAAA
GAACGAGTTGAGCTTCTTGGACGTATATCCCTCTTCTGCTGGATGGGTTCTTCGGCTTGC
ACACCCTTAGTCGAGATTGGGGAGCTTGGTAGGCTCTCAGCTTCAATTAAGAAGCTCGAA
AAAGAGATTGGCAACAAGGATAAACACCAAAATGAGCAATACCGCGCCAAACTACAGAGA
TCAAACGAGAGGTCATTGGCTCTGATCAAAGCCGGAATGGATTTCGTTGTTGCTTTCG*T
TTGCTTCAATTGGCTCCCAAGAAAGTCACTCCCCGTGTCACTGGCGCTTT*GGTTTCGCT
**CTCTCTTATCTCTTGTTATCAGT*ACTGC*ATCGCATCC*AAGTCCAAGACGGTT
GAGAGAC

QA 3 779 3 779
DS 

RD RS1AY65JQ 730 0 0
TCA
GAATGTGGACAAGTCAACCAGCTTGGCCCGTAAAGTCTTCCGTCTCTTCAAGTTTGTGAA
TGACCTTCATGCCCTCATTAGCCCTCTTCCCAAAGGCACCCCACTCCCTCTTGCTCTCCT
CGGAAAGTCCAAGAACGCATTGCTCTCTACCTTCTTGTTCCTTGATCAAATTGTGTGGCT
TGGCAGGACTGGCATTTACAAGAACAAAGAACGAGTTGAGCTTTTTGGACGTATATCCCT
CTTTTGCTGGATGGGTTTTTCGGCTTGCACACCCTTAGTCGAGATTGGGGAGCTTGGTAG
GCTTTCAGCTTCAATTAAGAAGCTCGAAAAAGAGATTGGCAACAAGGATAAACACCAAAA
TGAGCAATACCGCGCCAAACTACAGAGATCAAACGAGAGGTCATTGGCTTTGATCAAAGC
CGGAATGGATTTCGTTGTTGCTTTCGGTTTGCTTCAATTGGCTCCCAAGAAAGTCACTCC
CCGTGTCACTGGCGCTTTTGGTTTCGCCTCCTCTCTTATCTCTTGTTATCAGTTACTGCC
ATCGCATCCCAAGTCCAAGACGGTTTGAGAGACAAGGAAAAGATGAAGTAGAGGGGGGTC
GTAGTGTCTTGATGTTCCATAGTGTTTTTTTGCATTAACTTACTTTTGTGTTTGATTTTT
CTTTAATACTTGATTTTGTGCTGAAACGTTTGTCTGTTTGGAGAATAAAATGATAAAACG
TTGCAGT

QA 4 730 4 730
DS 



AS 1 3

CO CL3116Contig1 1087 3 9 U
AGAGTCATGAATTTACTACACAGCGGAAAATAACACAGTTTGGGAACCAAAAGCCAAATG
CACATTTTGAAAAAAAACAGACAAGCAAGTAGAAATGGACTTCCCCAAGAGAATGGTTAC
TATATTATTATTACTACTTACTTACTACTACTCTAAAAACATTATATATACATCCATATA
AAGGTTTACCAGAACCGGTTTAGCCTTTTATAAAAAGCTCTTCTTCTTCTTCTTATTAAT
CTTACTCACTTGACATGGCAATCGTAAGGAGAAGAAGCAAACACTTGATCTGGAACCACT
AGAGGAAGCTTCTCTATGTACACAAACAGCCTCTTCTTATTCTCCCTCTCCACCGTTTGG
AGACTGACCGTATCTGATTTCTCCATCAACATCCACAGGTCCCCTGAGTTCACTCTCTTC
AGACTGTCCCTGCAGAAAGGGCATGATTCTGACCTCCCATGCCAGTCACGGTAACACTTG
ATGCATAAAGAATGTGTACGGTTGGGTAGAACAACCATGCTGTTCATCTCCATACATATA
CCACACTCTTCGTCTCTCTCCACGTCAATCTCCGAGAGCTTTACTCTTTCCATCTCCTCT
TTGTTCCTGTACCGTACTTTGCAGACCTCTTTCTGTTTCCGGTCATCCACGTCTGTGATG
CCCCTTTCTAGTTGCAACAGCGATGGAAATATCACAGCATAGAAATCTTTAATACTGGTT
TTTCTCTCGTAAACCGACATTGTGGTCTTCCCATCCGCATAGGTCATGTAAATGAGAACT
CTGAGCAAACCGAGTGCACCGGCCAGGTGGCAATCAGTCAATTGGACAAGAAAGAGTAAA
AACTGAGCTGCCGGGTTGTAAGATAGCCTCATCTGAACACGAGCTCCATCCTTCTCCCGA
GGATAATCTAAAGCTACAGTGTTAGCGTGTTGGATATCTGCTTCGAGAGCTTTCAGAGAA
TCCTTGAACGAAACTCTTGCCATGGAACGTCAATTTCCAGCGATGATAAGAAGAAGAAGA
AGAAGATCAGAAGCAAAGAAAAAGTTTGATGCTTTTTAGAAGAGAAGATATTTCCACACA
CACACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CE08JQ U 1
AF RS1GV20JQ U 15
AF RS1GV20TF C 359
BS 1 34 RS1CE08JQ
BS 35 35 RS1GV20JQ
BS 36 395 RS1CE08JQ
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BS 501 695 RS1CE08JQ
BS 696 818 RS1GV20JQ
BS 819 1087 RS1GV20TF

RD RS1CE08JQ 695 0 0
AGAGTCATGAATTTACTACACAGCGGAAAATAACGCAGTTTGGGAACCAAAAGCCAAATG
CACATTTTGAAAAAAAACAGACAAGCAAGTAGAAATGGACTTCCCCAAGAGAATGGTTAC
TATATTATTATTACTACTTACTTACTACTACTCTAAAAACATTATATATACATCCATATA
AAGGTTTACCAGAACCGGTTTAGCCTTTTATAAAAAGCTCTTCTTCTTCTTCTTATTAAT
CTTACTCACTTGACATGGCAATCGTAAGGAGAAGAAGCAAACACTTGATCTGGAACCACT
AGAGGAAGCTTCTCTATGTACACAAACAGCCTCTTCTTATTCTCCCTCTCCACCGTTTGG
AGACTGACCGTATCTGATTTCTCCATCAACATCCAAAGGTCCCCTGAGTTCACTCTCTTC
AGACTGTCCCTGCAGAAAGGGCATGATTCTGACCTCCCATGCCAGTCACGGTAACACTTG
ATGCATAAAGAATGTGTACAGTTGGGTAGAACAACCATGCTGTTCATCTCCATACATATA
CCACACTCTTCGTCTCTCTCCACGTCAATCTCCGAGAGCTTTACTCTTTCCATCTCCTCT
TTGTTCCTGTACCGTACTTTGCAGACCTCTTTCTGTTTCCGGTCATCCACGTCTGTGATG
CCCCTTTCTAGTTGCAACAGCGATGGAAATATCAC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1GV20JQ 804 0 0
ACTACACAGCGGAAAATAACACAGTTTGGGAACCAAAAGCCAAATGCACATTTTGAAAAA
AAACAGACAAGCAAGTAGAAATGGACTTCCCCAAGAGAATGGTTACTATATTATTATTAC
TACTTACTTACTACTACTCTAAAAACATTATATATACATCCATATAAAGGTTTACCAGAA
CCGGTTTAGCCTTTTATAAAAAGCTCTTCTTCTTCTTCTTATTAATCTTACTCACTTGAC
ATGGCAATCGTAAGGAGAAGAAGCAAACACTTGATCTGGAACCACTAGAGGAAGCTTCTC
TATGTACACAAACAGCCTCTTCTTATTCTCCCTCTCCACCGTTTGGAGACTGACCGTATC
TGATTTCTCCATCAACATCCACAGGTCCCCTGAGTTCACTCTCTTCAGACTGTCCCTGCA
GAAAGGGCATGATTCTGACCTCCCATGCCAGTCACGGTAACACTTGATGCATAAAGAATG
TGTACGGTTGGGTAGAACAACCATGCTGTTCATCTCCATACATATACCACACTCTTCGTC
TCTCTCCACGTCAATCTCCGAGAGCTTTACTCTTTCCATCTCCTCTTTGTTCCTGTACCG
TACTTTGCAGACCTCTTTCTGTTTCCGGTCATCCACGTCTGTGATGCCCCTTTCTAGTTG
CAACAGCGATGGAAATATCACAGCATAGAAATCTTTAATACTGGTTTTTCTCTCGTAAAC
CGACATTGTGGTCTTCCCATCCGCATAGGTCATGTAAATGAGAACTCTGAGCAAACCGAG
TGCACCGGCCAGGTGGCAATCAGT

QA 1 804 1 804
DS 

RD RS1GV20TF 729 0 0
GGAGACTGAC*GTATCTGATTTCTCCATCAACATCCACAGGTCCC*TGAGTTCACTCTCT
TCAGACTGTCC*TGCAGAAAGGGCATGATTCTGACCTCCCATGCCAGTCACGGTAACACT
TGATGCATAAAGAATGTGTACGGTTGGGTAGAACAACCATGCTGTTCATCTCCATACATA
TACCACACTCTTCGTCTCTCTCCACGTCAATCTCCGAGAGCTTTACTCTTTCCATCTCCT
CTTTGTTCCTGTACCGTACTTTGCAGACCTCTTTCTGTTTCCGGTCATCCACGTCTGTGA
TGCCCCTTTCTAGTTGCAACAGCGATGGAAATATCACAGCATAGAAATCTTTAATACTGG
TTTTTCTCTCGTAAACCGACATTGTGGTCTTCCCATCCGCATAGGTCATGTAAATGAGAA
CTCTGAGCAAACCGAGTGCACCGGCCAGGTGGCAATCAGTCAATTGGACAAGAAAGAGTA
AAAACTGAGCTGCCGGGTTGTAAGATAGCCTCATCTGAACACGAGCTCCATCCTTCTCCC
GAGGATAATCTAAAGCTACAGTGTTAGCGTGTTGGATATCTGCTTCGAGAGCTTTCAGAG
AATCCTTGAACGAAACTCTTGCCATGGAACGTCAATTTCCAGCGATGATAAGAAGAAGAA
GAAGAAGATCAGAAGCAAAGAAAAAGTTTGATGCTTTTTAGAAGAGAAGATATTTCCACA
CACACACCC

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 4

CO CL3117Contig1 800 4 14 U
TATAGGAGATGAATTGCAGGATCCCTCAGTGTCTTTGTTATTAAAAATCAAGGCTGAACC
AGAAGGAGAGCATATCTTACAAATAGAGGCAATTCAGTTCCTAACCAGAGAATCATCGGT
TTTGAAGATCTGGTCCGGTGGTGTGAAGGTGTCAAGGTGTTCTGGTGTAATCGATTATTT
CGTTCTGCCCAGAGTTGGTAGATGGATGATTGCCAAGCGATGACGGCATCTCTCTTATGG
TTTGGCGGGAGAGAGACGCTGATAATAGGTGCCACAGTGGAGTCCGAATCTCTGGCAACA
GGCAGTTTGATGCAATTCCGTTCCAAACAGCCTTGATGGAAGGGCATAGGAAGAAGACAG
CAGGCGGTCCTTAGTGGGTCCTTAGTAAGTTACTATTAACCATTTTCCAGATTTTTAGAA
GTTAGGAATGGAAGTGATTATCGGTAGTTAGGATTGAACTGGAGTTTGATTGATTTGGTG
TTTTTATTTTAAATAGGCAAAGATATGTGATTACCGTATTTTAGAACTTCTCCAAAAGTT
CATGGTTGTTAAAAATGATAGAGACCTACATATTGTCTGGAAGCAAATGATATAGTTTGA
AACAAACAAAGCGTTATGTTTGTGTAAGACATCCTATAAATCTTTTAACAACAAACATTC
AACGTTTGTTTCTGAGACTTTACAGCCTCATCAAAAATATTCCTCTTCATTTGTCTATTC
CATCTATGTATCGAACTTTTCCAAAAGTTCCAATAATACTTGTATTGTTGTGTTATTAAT
CTTAAATATTTAGTAAATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AL96TF U 25
AF RS1BX89TF U 132
AF RS1AL96JQ C 1
AF RS1BX89JQ C 31
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RD RS1AL96TF 668 0 0
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AGCAAATGATATAGTTTGAAACAAACAAAGTGTTATGTTTGTGTAAGACATCCTATAAAT
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QA 18 668 18 668
DS 

RD RS1BX89TF 609 0 0
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AATAGGCAAAGATATGTGATTACCGTATTTTAGAACTTCTCCAAAAGTTCATGGTTGTTA
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CTGAGACTTTACAGCCTCATCAAAAATATTCCTCTTCATTTGTCTATTCCATCTATGTAT
CGAACTTTT

QA 1 609 1 609
DS 

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CGTTCTGCCCAGAGTTGGTAGATGGATGATTGCCAAGCGATGACGGCATCTCTCTTATGG
TTTGGCGGGAGAGAGACGCTGATAATAGGTGCCACAGTGGAGTCCGAATCTCTGGCAACA
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TTTTTATTTTAAATAGGCAAAGATATGTGATTACCGTATTTTAGAACTTTTC*AAAAGTT
CATGGTTGTTAAAAATGATAGAGACCTACATATTGTCTGGAAGCAAATGATATAGTTTGA
AACAAACAAAGTGTTATGTTTGTGTAAGACATCCTATAAATCTTTTAACAACAAACATTC
AACGTTTGTTTCTGAGACTTTACAGCCTCATCAAAAATATTCCTCTTCATTTGTCTATTC
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CTTAAATGTTTAGTAAATAT

QA 1 800 1 800
DS 

RD RS1BX89JQ 764 0 0
GTGTCTTTGTA
TAAAAATCAAGGCTGAACCAGAAGGAGAGCATATCTTACAAATAGAGGCAATTCAGTTCC
TAACCAGAGAATCATCGGTTTTGAAGATCTGGTCCGGTGGTGTGAAGGTGTCAAGGTGTT
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GACGGCATCTCTCTTATGGTTTGGCGGGAGAGAGACGCTGATAATAGGTGCCACAGTGGA
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ATTTTCCAGATTTTTAGAAGTTAGGAATGGAAGTGATTATCGGTAGTTAGGATTGAACTG
GAGTTTGATTGATTTGGTGTTTTTATTTTAAATAGGCAAAGATATGTGATTACCGTATTT
TAGAACTTCTCCAAAAGTTCATGGTTGTTAAAAATGATAGAGACCTACATATTGTCTGGA
AGCAAATGATATAGTTTGAAACAAGCAAAGCGTTATGTTTGTGTAAGACATCCTATAAAT
CTTTTAACAACAAACATTCAACGTTTGTTTCTGAGACTTTACAGCCTCATCAAAAATATT
CCTCTTCATTTGTCTATTCCATCTATGTATCGAACTTTTCCAAAAGTTCCAATAATACTT
GTATTGTTGTGTTATTAATCTTAAATATTTAGT

QA 12 764 12 764
DS 



AS 1 4

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AGTGCTCTTGAACCACCACAGTGAGAGACGTTCCCAGAAAAATGGCCCACGACACTCACA
CCGATGACTTAGACGAGCTTCTCGACAGCGCATTGGATGATTTCAAGGATCTCAATCTTA
CTCAAAAAAGTGAAGATGGTGGAAAAGAAGAGATGGAGTCATCATTGCCTAGTGGGGTTC
AAGGCCTTGGAATGGGTTTACCAGACATGAGAACCAAGAAGAAAGGAAAGAACAAGGTTG
CTAAAGAGGACCATGTTTCCGAGGCTCTTGATAAACTCAGGGAACAAACCAGAGAAACCG
TCAAAGGCCTCAAGTCCTTGTCTTCCAAGAATCTGCAGCCTCCTGGTTCTTCTTCTGATG
ATGCTATGGTTGAAGATTGGATCAAACAATTCGAGGATCTTACGGGATCTCAGGATTTGG
AGTCGATTGTGGACACGATGATGCAACAGCTGTTGTCCAAGGATATTCTCCACGAACCAA
TGAAGGAGATCGGAGCAAGATACCCGAAATGGCTTGAAGAGCATGAAAGCGGTCTAAGCA
AAGAAGATTTCGAACGGTATTCACGCCAGTATGAACTGATCAAAGAGCTCAACTCGGTGT
ACGAGGACGAACCAGACAATTCGACCAAGATTATGG*AGATTATGCAGAAGATGCAAGAG
TGTGGACAACCACCGAGCGATATTGTGCAAGAGATGGATCCTGGCTTTGATTTCGCTAGT
CTAGGACAAATGTCTCCAGATATGCTCGAGTCTTCACCAAATTGTTGTGTAATGTAAGAG
TCGAAACATGTTTAGTGGCCTGGTCAAGCCATTATTGGAGACCATGTTTTTTCTTCTTGT
TTCTCTTGTGCAACGCAAAGCTTGTGTTTAGGTTTTGTTTTGTCTTTGATTACTTAGTTA
CTTTATATTGGGATCGGTTCAGGTTCTTTTGGATTCTTTGATTTGAGGATAATGTTACTA
TATTGAAAAGTGAATTCATCAGAAATATTACTGGAGAACAAAAGTGAACCTTTACTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1EX92TF U 1
AF RS1AM66JQ C 553
AF RS1AM66TF U 34
AF RS1EX92JQ C 417
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AGTCGATTGTGGACACGATGATGCAACAGCTGTTGTCCAAGGATATTCTCCACGAACCAA
TGAAGGAGATCGGAGCAAGATACCCGAAATGGCTTGAAGAGCATGAAAGCGGTCTAAGCA
AAGAAGATTTCGAACGGTATTCACGCCAGTATGAACTGATCAAAGAGCTCAACTCGGTGT
ACGAGGAC

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DS 

RD RS1AM66JQ 172 0 0
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QA 1 172 1 172
DS 

RD RS1AM66TF 827 0 0
GG
GAGATATTTCTCTCTTACACATCTGAGTGCTCTTGAACCACCACAGTGAGAGACGTTCCC
AGAAAAATGGCCCACGACACTCACACCGATGACTTAGACGAGCTTCTCGACAGCGCATTG
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GAGTCATCATTGCCTAGTGGGGTTCAAGGCCTTGGAATGGGTTTACCAGACATGAGAACC
AAGAAGAAAGGAAAGAACAAGGTTGCTAAAGAGGACCATGTTTCCGAGGCTCTTGATAAA
CTCAGGGAACAAACCAGAGAAACCGTCAAAGGCCTCAAGTCCTTGTCTTCCAAGAATCTG
CAGCCTCCTGGTTCTTCTTCTGATGATGCTATGGTTGAAGATTGGATCAAACAATTCGAG
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GAAGAGCATGAAAGCGGTCTAAGCAAAGAAGATTTCGAACGGTATTCACGCCAGTATGAA
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GGATCCTGGCTTTGATTTCGCTAGTCTAGGACAAATGTCTCCAGATATGCTCGAGTCTTC
ACCAAATTGTTGTGTAATGTAAGAGTCGAAACATGTTTAGTGGCC

QA 3 827 3 827
DS 

RD RS1EX92JQ 662 0 0
GATGATGCTATGGTTGAAGATTGGATCAAACAATTCGAGGATCTTACGGGATCTCAGGAT
TTGGAGTCGATTGTGGACACGATGATGCAACAGCTGTTGTCCAAGGATATTCTCCACGAA
CCAATGAAGGAGATCGGAGCAAGATACCCGAAATGGCTTGAAGAGCATGAAAGCGGTTTA
AGCAAAGAAGATTTCGAACGGTATTCACGCCAGTATGAACTGATCAAAGAGCTCAACTCG
GTGTACGAGGACGAACCAGACAATTCGACCAAGATTATGG*AGATTATGCAGAAGATGCA
AGAGTGTGGACAACCACCGAGCGATATTGTGCAAGAGATGGATCCTGGCTTTGATTTCGC
TAGTTTAGGACAAATGTCTCCAGATATGCTCGAGTCTTCACCAAATTGTTGTGTAATGTA
AGGGTCGAAACATGTTTAGTGGCCTGGTCAAGCCATTATTGGAGACCATGTTTTTTCTTC
TTGTTTCTCTTGTGCAACGCAAAGCTTGTGTTTAGGTTTTGTTTTGTCTTTGATTACTTA
GTTACTTTATATTGGGATCGGTTCAGGTTCTTTTGGATTCTTTGATTTGAGGATAATGTT
ACTATATTGAAAAGTGAATTCATCAGAAATATTACTGGAGAACAAAAGTGAACCTTTACT
AC

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 4

CO CL3119Contig1 955 4 12 U
GGAAACTGGATCCCAATAAACTCCATCGGAACAGCGTTGTCGTTTTTTTATTCCCAATAG
AGAGAAATGGCGCAACAGCAACAATCGTTGATCTACAGTTTCGTGGCACGAGGGACGGTG
ATCCTGGTGGAGTTCACGGATTTCAAGGGAAATTTCACATCGATCGCTGCACAGTGCCTC
CAAAAGCTTCCTTCTTCCAACAACAAGTTCACCTACAACTGCGATGGTCATACCTTCAAT
TACTTAGTTGAAAATGGATTCACTTATTGTGTTGTTGCAGTTGATTCTGCTGGGAGGCAG
ATTCCTATGGCTTTCTTGGAGCGAGTTAAGGAGGATTTCAACAAGAGATATGGTGGTGGC
AAGGCTGCTACTGCTCAACCCAACTCCTTGAATAAGGAATTTGGGTCGAAACTGAAAGAG
CACATGCAGTATTGTATGGATCATCCTGATGAGATTAGCAAGCTTGCTAAGGTTAAAGCT
CAAGTTTCTGAAGTTAAAGGTGTCATGATGGAAAACATTGAGAAGGTCCTTGACCGTGGT
GAGAAAATCGAACTTTTGGTGGACAAAACCGAAAACCTTCGCTCACAGGCGCAAGATTTC
AGAACACAAGGAACTCAAATGAGAAGAAAGATGTGGTTTCAGAACATGAAGATAAAACTC
ATTGTTCTTGCAATCATCATCGCCTTGATCCTCATCATCGTCCTCTCAGTCTGCGGTGGC
TTCAACTGCGGCAAATAAGTCTTGGAACATCTCTGATTTCCGAGAACATCATCCTCATTC
AGTTTGTTGTGCTTTTTTTTTTTCTTTTTGGTTTAAAATTTCTCATGGCTATGTTTCTCT
TGCTTAGATTTGCACTTGTTGAAATTGGTTTTGTATAGGTCATATATATGTATGAAACTG
ATTCTTGCAAACCATTTACTTGGACCTAATTTAAATGCTTGTGTTTGCTTTGGGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1GV59TF U 1
AF RS1FK22TF U 1
AF RS1FK22JQ C 217
AF RS1GV59JQ C 217
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TTCA
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TACTTAGTTGAAAATGGATTCACTTATTGTGTTGTTGCAGTTGATTCTGCTGGGAGGCAG
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AAGGCTGCTACTGCTCAACCCAACTCCTTGAATAAGGAATTTGGGTCGAAACTGAAAGAG
CACATGCAGTATTGTATGGATCATCCTGATGAGATTAGCAAGCTTGCTAAGGTTAAAGCT
CAAGTTTCTGAAGTTAAAGGTGTCATGATGGAAAACATTGAGAAGGTCCTTGACCGTGGT
GAGAAAATCGAACTTTTGGTGGACAAAACCGAAAACCTTCGCTCACAGGCGCAAGATTTC
AGAACACAAGGAACTCAAATGAGAAGAAAGATGTGGTTTCAGAACATGAAGATAAA*CTC
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TCT

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CTTCGCTCACAGGCGCAAGATTTCAGAACACAAGGAACTCAAATGAGAAGAAAGATGTGG
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AATTTCTCATGGCTATGTTTCTCTTGCTTAGATTTGCACTTGTTGAAATTGGTTTTGTAT
AGGTCATATATATGTATGAAACTGATTCTTGCAAACCATTTACTTGGACCTAATTTAAAT
GCTTGTGTTTGCTTTGG
CC

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DS 



AS 1 4

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GAAAACTGGTTTGGTTTTTTACTTTTTTTTACTAAACCGTTTTTTAAGAGATTATTATCA
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CAAAACTCCTAAACCGACCCAAGTCAGTTCCCCATATTTTAACATATAAGACCTCGGGAA
TCACATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DV12TF U 1
AF RS1AU10TF U 179
AF RS1DV12JQ C 329
AF RS1AU10JQ C 436
BS 1 199 RS1DV12TF
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BS 1051 1148 RS1DV12JQ
BS 1149 1208 RS1AU10JQ

RD RS1DV12TF 677 0 0
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ATCGCTGCGTTGTCGACGGTGTCCCGATGCTGGTTGAAGAA*TGAATCTGTTAACGACGG
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CGATAAGCAACTACTTC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RS1AU10TF 640 0 0
G
ATGATTAAAGAAGAGGTTGACCTCGTGTTCCCTTTGTTTGACGGTGCTGCTGAGACCGGG
AGAATCACTAGAAAAGCTTTCACTGAATGGGTGGTTAAGGTGTACACTAGCAGGAAAGCT
CTAGCACATCCCTTAAACGACACAAAAACAGCGGTTAAGCAGTTAAACAAACTCGTGACA
GCGATCTTGATCGTTATTACGATCGTCATTTGGCTGCTGCTACTAGAAGTAGCAACGACC
AAAGTTTTGCTGTTCTTCTCCACTCAACTCGTTGCTCTTGCTTTTATAATCGGAAGCACT
TGCAAGAACCTCTTTGAGTCCATTGTGTTTGTCTTCGTCATGCATCCTTTTGATGTCGGT
GATCGCTGCGTTGTCGACGGCGTCCCGATGCTGGTTGAAGAAATGAATCTGTTAACGACG
GTGTTCTTGAAACTCGACAACGAGAAAGTGTATTATCCGAACAGTGTTTTGGCCACGAAA
CCGATAAGCAACTACTTCAGAAGTCCAGATATGGGAGAAACTGTGGAGTTCTCTATCGCA
TTTTCAACACCAGTCTCTAAGATTGCACATCTCAAAGAAAGAATCGCTGAGTACTTGGAG
CAGAACCCGCAGCATTGGTCACCGATACACACGGTGGTG

QA 2 640 2 640
DS 

RD RS1DV12JQ 820 0 0
AGCGGTTAAGCAGTTAAACAAACTCGTGACAGCGATCTTGATCGTTATTACGATCGTCAT
TTGGCTGCTGCTACTAGAAGTAGCAACGACCAAAGTTTTGCTGTTCTTCTCCACTCAACT
CGTTGCTCTTGCTTTTATAATCGGAAGCACTTGCAAGAACCTCTTTGAGTCCATTGTGTT
TGTCTTCGTCATGCATCCTTTTGATGTCGGTGATCGCTGCGTTGTCGACGGTGTCCCGAT
GCTGGTTGAAGAA*TGAATCTGTTAACGACGGTGTTCTTGAAACTCGACAACGAGAAAGT
GTATTATCCGAACAGTGTTTTGGCCACGAAACCGATAAGCAACTACTTCAGAAGTCCAGA
TATGGGAGAAACTGTGGAGTTCTCTATCGCATTTTCAACACCAGTCTCTAAGATTGCACA
TCTCAAAGAAAGAATCGCTGAGTACTTGGAGCAGAACCCGCAGCATTGGTCACCGATACA
CACGGTGGTGGTTAAGGAGATAGAGAACATGAACAAGCTGAATATGGCTCTATACAGCAA
CCACACCATCACGTTTCAGGAATACAGAGAGAGGAATATCAGAAGAACCGAGCAGTCTTT
GGCGATTAAGAAAATGTTGGAGGATCTTCACATCGATTACACTCTCCTTCCTCAACAAGT
CCTTCTCACCAAGCTCGACAAAAATTAGAGTAGAAAACTGGTTTGGTTTTTTACTTTTTT
T*ACTAAACCGTTTTTTAAGAGATTATTATCAAATGTTGCAGTACTCTGTTTTATCTTAG
ACTTTTTAGAGTAGAAGATGAAATCAATATTCCAAAACTC

QA 1 820 1 820
DS 

RD RS1AU10JQ 773 0 0
TCTCCACTCAACTCGTTGCTCTTGCTTTTATAATCGGAAGCACTTGCAAGAACCTCTTTG
AGTCCATTGTGTTTGTCTTCGTCATGCATCCTTTTGATGTCGGTGATCGCTGCGTTGTCG
ACGGCGTCCCGATGCTGGTTGAAGAAATGAATCTGTTAACGACGGTGTTCTTGAAACTCG
ACAACGAGAAAGTGTATTATCCGAACAGTGTTTTGGCCACGAAACCGATAAGCAACTACT
TCAGAAGTCCAGATATGGGAGAAACTGTGGAGTTCTCTATCGCATTTTCAACACCAGTCT
CTAAGATTGCACATCTCAAAGAAAGAATCGCTGAGTACTTGGAGCAGAACCCGCAGCATT
GGTCACCGATACACACGGTGGTGGTTAAGGAGATAGAGAACATGAACAAGCTGAAGATGG
CTCTATACAGCAACCACACCATCACGTTTCAGGAATACAGAGAGAGGAATATCAGAAGAA
CCGAGCAGTCTTTGGCGATTAAGAAAATGTTGGAGGATCTTCACATCGATTACACTCTCC
TTCCTCAACAAGTCCTTCTCACCAAGCTCGACAAAAATTAGAGTAGAAAACTGGTTTGGT
TTTTTACTTTTTTTTACTAAACCGTTTTTTAAGAGATTATTATCAAATGTTGCAGTACTC
TGTTTTATCTTAGACTTTTTAGAGTAGAAGATGAAATCAATATTCCAAAACTCCTAAACC
GACCCAAGTCAGTTCCCCATATTTTAACATATAAGACCTCGGGAATCACATTG

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 4

CO CL3121Contig1 657 4 2 U
ATAAAAGCAATATATAAATGGCTAAAGAGCCAAACTCATAATTGAAATTGAAATGATCCT
TCTCATGTCCGCAACATAAATAAAACATTCCACCAAAGACGAAACAGTTCCCTTAACGAT
TAAAACTAAAAGATCAAAAACCTTTTTACTTAATCAACGTTCTGCATAACATCCTCAGCG
GTAAACTTGGTCCCCTTGTCCTTATCCGCCGCGGCACGTCCCTTGGCCTTCCTCTCCAAA
AGCGACTTCCTGTCCTTGTCCAACCTCAGCTTCGTTATCACCACCTTCGACGGCTGAACG
CCGACGTTCACCGTGGTCCCGTTCACCTTCTCCCTCGTGATCCTTTCGATGTGGATGACC
CACTTGCGACGGTACACCTGGACGACCTTTCCCTCGCGGCCCTTGTAGGTCCCGCGGACG
ATCTGGACCTCGTCGTCCTTGCGGATGGGCATGGATCTGACGTTGTACTTGGCGCGAAGG
TCGGTGGAGAGAGGCGAGCTCATGATGACGCGTCTCTCGCTCGACGAGGCTGTGAAGTGG
GCCTTGCGGTTCTTCCTGCGGGAGGAGGTGGCTCTTGGGTTGTACTTCATCTTCGCCGCC
GGGTCTTTTTGGTGGAAAATGGAGGTCTCTTTTAGGGTTTCTCTCAACGAAGGAGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D755JQ U 27
AF RS1EO04JQ U 1
AF RS1EO04TF C 1
AF RS1D755TF C 405
BS 1 645 RS1EO04JQ
BS 646 657 RS1D755TF

RD RS1D755JQ 498 0 0
GCGT
CAAACTCATAATTGAAATTGAAATGATCCTTCTCATGTCCGCAACATAAATAAAACATTC
CACCAAAGACAAAACAGTTCCCTTAACGATTAAAACTAAAAGATCAAAAACCTTTTTGCT
TAATCAACGTTCTGCATAACATCCTCAGCGGTAAACTTGGTCCCCTTGTCCTTATCCGCC
GCGGCACGTCCCTTGGCCTTCCTCTCCAAAAGCGACTTCCTGTCCTTGTCCAACCTCAGC
TTCGTTATCACCACCTTCGACGGCTGAACGCCGACGTTCACCGTGGTCCCGTTCACCTTC
TCCCTCGTGATCCTTTCGATGTGGATGACCCACTTGCGACGGTACACCTGGACGACCTTT
CCCTCGCGGCCCTTGTAGGTCCCGCGGACGATCTGGACCTCGTCGTCCTTGCGGATGGGC
ATGGATCTGACGTTGTACTTGGCGCGAAGGTCGGTGGAGAGAGGCGAGCTCATGATGACG
CGTCTCTCGCTCGA

QA 5 498 5 498
DS 

RD RS1EO04JQ 647 0 0
ATAAAAGCAATATATAAATGGCTAAAGAGCCAAACTCATAATTGAAATTGAAATGATCCT
TCTCATGTCCGCAACATAAATAAAACATTCCACCAAAGACGAAACAGTTCCCTTAACGAT
TAAAACTAAAAGATCAAAAACCTTTTTACTTAATCAACGTTCTGCATAACATCCTCAGCG
GTAAACTTGGTCCCCTTGTCCTTATCCGCCGCGGCACGTCCCTTGGCCTTCCTCTCCAAA
AGCGACTTCCTGTCCTTGTCCAACCTCAGCTTCGTTATCACCACCTTCGACGGCTGAACG
CCGACGTTCACCGTGGTCCCGTTCACCTTCTCCCTCGTGATCCTTTCGATGTGGATGACC
CACTTGCGACGGTACACCTGGACGACCTTTCCCTCGCGGCCCTTGTAGGTCCCGCGGACG
ATCTGGACCTCGTCGTCCTTGCGGATGGGCATGGATCTGACGTTGTACTTGGCGCGAAGG
TCGGTGGAGAGAGGCGAGCTCATGATGACGCGTCTCTCGCTCGACGAGGCTGTGAAGTGG
GCCTTGCGGTTCTTCCTGCGGGAGGAGGTGGCTCTTGGGTTGTACTTCATCTTCGCCGCC
GGGTCTTTTTGGTGGAAAATGGAGGTCTCTTTTAGGGTTTCTCTC
CC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1EO04TF 647 0 0
ATAAAAGCAATATATAAATGGCTAAAGAGCCAAACTCATAATTGAAATTGAAATGATCCT
TCTCATGTCCGCAACATAAATAAAACATTCCACCAAAGACGAAACAGTTCCCTTAACGAT
TAAAACTAAAAGATCAAAAACCTTTTTACTTAATCAACGTTCTGCATAACATCCTCAGCG
GTAAACTTGGTCCCCTTGTCCTTATCCGCCGCGGCACGTCCCTTGGCCTTCCTCTCCAAA
AGCGACTTCCTGTCCTTGTCCAACCTCAGCTTCGTTATCACCACCTTCGACGGCTGAACG
CCGACGTTCACCGTGGTCCCGTTCACCTTCTCCCTCGTGATCCTTTCGATGTGGATGACC
CACTTGCGACGGTACACCTGGACGACCTTTCCCTCGCGGCCCTTGTAGGTCCCGCGGACG
ATCTGGACCTCGTCGTCCTTGCGGATGGGCATGGATCTGACGTTGTACTTGGCGCGAAGG
TCGGTGGAGAGAGGCGAGCTCATGATGACGCGTCTCTCGCTCGACGAGGCTGTGAAGTGG
GCCTTGCGGTTCTTCCTGCGGGAGGAGGTGGCTCTTGGGTTGTACTTCATCTTCGCCGCC
GGGTCTTTTTGGTGGAAAATGGAGGTCTCTTTTAGGGTTTCTCTC
CC

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1D755TF 253 0 0
GTAGGTCCCGCGGACGATCTGGACCTCGTCGTCCTTGCGGATGGGCATGGATCTGACGTT
GTACTTGGCGCGAAGGTCGGTGGAGAGAGGCGAGCTCATGATGACGCGTCTCTCGCTCGA
CGAGGCTGTGAAGTGGGCCTTGCGGTTCTTCCTGCGGGAGGAGGTGACTCTTGGGTTGTA
CTTCATCTTCGCCGCCGGGTCTTTTTGGTGGAAAATGGAGGTCTCTTTTAGGGTTTCTCT
CAACGAAGGAGCC

QA 1 253 1 253
DS 



AS 1 4

CO CL3122Contig1 1432 4 14 U
GCATAGCGTCGTTCGCCGGATATGTAATCTACATAGACTTCATGAACAACATGGGGCACT
GCAACTTCGAGCTCGTCCCTAAGCGTCTTTTCCACCTCTTTCCTCCCCTCAAGTTCCTCT
GCTACACTCCCTCATTCCACTCGCTGCACCACACCCAATTCCGGACCAACTACTCCCTCT
TCATGCCCTTGTATGACTACATCTACGGCACAATGGATAAATCCTCGGATACATTGTACG
AGAAATCTCTTGAAAGAGGAGAAGATAGAGTGGACGTCGTGCACTTAACTCACCTGACGA
CGCCCGAGTCCATATGCCATTTGCGGATTGGCTTGGCTTCATTTGCCTCCTATCCCTTCT
CTTATAGATGGTTCATGCGCCTTTTGTGGCCTTTCACATCTCTCTCCATGCTCTTCACTC
TTTTCTACGCCAGCAGCCCCTTTGTCGCTGAGAGAAACTCTTTTGAGAAGCTCAACTTGC
AGTCTTGGATCATACCCAGATATAATCTGCAGTACTTGTTAAAATGAAGGAAAGACGCGA
TCAACAACATGATTGAGAAAGCAATACTAGAGGCAAATAAAAAAGGAGTGAAGGTGCTTA
GCCTGGGTCTCATGAACCAAGGGGAGGAGCTAAACAGGAATGGAGAGGTGTATATTGACA
AGCATCCAGAAATGAAAGTAAGATTGGTGGATGGCAGTAGATTGTCAGCAGCCGTCGTGA
TCAGTAGTCTACCCAAATCAACGACAAAAGTAGTGATGACAGGCAATCTCGCAAAGGTGG
CATACACCATCGCCTCTGCTCTTTGCCAGAGAGGAGTTCAGGTCTCGACTCTATTACCAG
AAAAGTATGAGAACCTAAGATCATTTGTTCCACAAGAATGCAGAGACCGTTTGGTCCTTT
TAACCTCTGAAGCACTCGCTTCAAACAAGATA*GGCTGATGGGAGAAGGAACAACTAGAG
AGGAGCAGGAAATGGCCACAAAAGGAACGTTATTTATCCCAATCTCACAGTTCCCCCTCA
AGCAGTTTCGTAGAGATTGTATCTATCATACACCACCGGCTTTAATAATTCCAAAATCTC
TAGTGAATATCCACTCCTGTGAGAACTGGTTACCGAGAAAGGCGATGGGTGCAACCAGAG
TGGCTGGCATATTGCACGCCTTAGAAGGATGGGAAATGCATGAGTGCGACACATCCATTC
TTCTTTCAGATTTGGACCAAGTATGGGAAGCTTGTTTCAGCCACGGCTTCCAGCCTTTGC
TGCTTCCGCATCACTTCAAATACCCCTGATACCCTACTTTCAAATGATGTGTGTTGTTTC
CGTAATTGATAATATATGATTTACAATAAGCTTCTAGACAATGGATCCAGAATTTCACCT
CTGTATTTGTTTTCATACGTTTAAATGATATATGTTGTTAGCTGATGGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

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GCTACACTCCCTCATTCCACTCGCTGCACCACACCCAATTCCGGACCAACTACTCCCTCT
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CTTATAGATGGTTCATGCGCCTTTTGTGGCCTTTCACATCTCTCTCCATGCTCTTCACTC
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CATCT

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G
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A*GGCTGATGGGAGAAGGAACAACTAGAGAGGAGCAGGAAATGGCCACAAAAGGAACGTT
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A
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CGACAAAAGTAGTGATGACAGGCAATCTCGCAAAGGTGGCATACACCATCGCCTCTGCTC
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CAAACAAGATA*GGCTGATGGGAGAAGGAACAACTAGAGAGGAGCAGGAAATGGCCACAA
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TCTATCATACACCACCGGCTTTAATAATTCCAAAATCTCTAGTGAATATCCACTCCTGTG
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TAAATGATATATGTTGTTAGCTGATGG

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DS 

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TTTC*CCTCTGTATTTGTTTTCATACGTTTAAATGATATATGTTGTTAGCTGATGGTTTC

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 3

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GCACAGTCCTCTTCTTTTAGAAAGCACTGAACTTGCTCAAAGGCCTCAATGGCGATTTCA
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ACTCTCGCGCTGGCGTTTGTGTATGCTTCACCACGTGCTTCCCATATAGTTGAAAGACGG
TTTAAAGCCACTGTGTATGGGTCTCCTCCTGACTGATCATCATGTAACAATGGTCTTGAA
TTAGTTCCCACAGCAGCAATTCTTTGCGCTAAGGCTTCTAAGGGAACATCAAGCCAAATG
CTAATACCTTTATGCATGTACTTCCAATTAATGGGTCTTATAACAGCACCTCCACCAGTT
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AGAATATTTCCAGTTTCCAACAATGCTGAGGAGTTCTTGTCCGAAACTGATCTTTGTCGA
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ACGAGATGCAGCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B810JQ U 1
AF RS1C141JQ U 1
AF RS1B810TF C 389
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CCTACTGTCGTCTTCCCG

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1C141JQ 748 0 0
GT
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AAAACTGTACACAGCAGTCATCATCAGAACTAGCAAACTGAACAAGAACACGTAAAACTG
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TGGGGTAAGATCTGACACGTTTCTGTACCCGATCTTTGACGTGATATTCTCCAAAGAGAC
TCTCGCGCTGGCGTTTGTGTATGCTTCACCACGTGCTTCCCATATAGTTGAAAGACGGTT
TAAAGCCACTGTGTATGGGTCTCCTCCTGACTGATCATCATGTAACAATGGTCTTGAATT
AGTTCCCACAGCAGCAATTCTTTGCGCTAAGGCTTCTAAGGGAACATCAAGCCAAATGCT
AATACCTTTATGCATGTACTTCCAATTAATGGGTCCTATAACAGCACCTCCACCAGTTGA
CACAACAACTTGGTGGTACATCAGAGAGAGCTTCTTTAGTGCCTCCGTCTCTTTCTCTCT
GAAGACACTCTCACCGAAATGCTCAAATATCTCAGTTACAGAAGTTCCATTCATCGCCAC
CTCGATCAATGTGTCACAATCAAAGAAGGAATAACCAAGTGCTCTTGCCATGATCTTTCC
TACTGTCGTCTTCCCGGAACCCATCA

QA 3 748 3 748
DS 

RD RS1B810TF 705 0 0
CTGACTGATCATCATGTAACAATGGTCTTGAATTAGTTCCCACAGCAGCAATTCTTTGCG
CTAAGACTTCTAAGGGAACATCAAGCCAAATGCTAATACCTTTATGCATGTACTTCCAAT
TAATGGGTCTTATAACAGCACCTCCACCAGTTGACACAACAACTTGGTGGTACATCAGAG
AGAGCTTCTTTAGTGCCTCCGTCTCTTTCTCTCTGAAGACACTCTCACCGAAATGCTCAA
ATATCTCAGTTACAGAAGTTCCATTCATCGCCTCCTCGATCAATGTGTCACAATCAAAGA
AGGAATAACCAAGTGCTCTTGCCATGATCTTTCCTACTGTCGTCTTCCCGGAACCCATCA
TTCCAACAAGATACATAGATCGTCCATTTAAATACGGTTTAACCTCTTCAGCTTTTCTCT
TCAAAACAAGTTCTTCATCAAATGGAGAATGAAGAATATTTCCAGTTTCCAACAATGCTG
AGGAGTTCTTGTCCGAAACTGATCTTTGTCGAAGATCCCTTCTTTTGTCAGGTTTCAAAT
GAGCTATAAGCCATTTATTCTCTTTGACTCGCTGAGAGTAACGTAGAGAACCACGAGGTT
TCCCTTCAAAATTTCTCCAATCAATACATGGTGCGGAGTAGTGAAACCTCTGAACAGCTT
CCATATTCTTTTCCCCTGACGGCGGAGCAAACACGAGATGCAGCC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 4

CO CL3124Contig1 879 4 13 U
ATAAAGCTGGATAACGATTATATTGAAATAGAACTGTCTTTACAAGTACTCCAGAACCCT
GAGAGAATTATTAATGGAGTCTCTCACCTCCCCCTACACATGAGTGATCTAATCTCTAGA
TAACCCTTCCGCTCTCTCCTCTCACTGCTTATATAGTAAAAGGTCCTTCTCTAGTCACAC
ACACTGCGTGACGCCTCCTTACGCACATGCTTCCTCACGTGATGTGTTCATTATGCATAA
*GAAATATTCACATATGGATAAGATCCACCTCAACCTTCTAGAAGCTCTTTACCCTCTTC
ATCAATAACCCACACATAACAATACCGCCCCCATTGAAATCAACCTTGTCCTCAAGGTTG
AGACACATTGACCGGCTTATACTAGCGTTGTTCCGCTCTTTGAGTAGTGAAGGTTCTTCA
TGTTTGTCCTTATTTTTCCAGCAAAGCACTGAATTGCACAAGCATCCTCTCTTTCTGGAA
GAGATTACTCCAAGCTCACGGGACAGCTTCTTCTCCCTATCACGAATTTCCTCAGCTTGT
CTCTCCTCATCAATATCATGCACATCCCAACCTTTATTTCTTGAGCCTCTTCTAGTGAGG
GATTGCTCTGGTGGCCTAGGAGCACCAAACAACACATAGATGACGTCTAGAGCAAACAGG
TTCTCATTAGGTTCTCCTTGTTGGTTTCTCTTCCTAGCATCCCCAACAATATCCCAAGTA
AAAGCAGCGACATATATGTAGTCCTGCCAAGAGAACT**ACCGGTTGTTCTCGGTTCATG
TCTACTCTTATGCCAGTCTTTTTCCACTGTGTTGATGTTACAACTGTAGGAACATACCCT
TCCGGACCCCATTCGAGCATCTGATCATACTTCAACCGC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1DI06JQ U 1
AF RS1DI06TF C 98
AF RS1A232JQ U 1
AF RS1A232TR U 113
BS 1 58 RS1A232JQ
BS 59 59 RS1DI06JQ
BS 60 228 RS1A232JQ
BS 229 229 RS1DI06JQ
BS 230 240 RS1A232JQ
BS 241 241 RS1DI06JQ
BS 242 523 RS1A232JQ
BS 524 524 RS1DI06JQ
BS 525 552 RS1A232JQ
BS 553 553 RS1DI06JQ
BS 554 757 RS1A232JQ
BS 758 759 RS1DI06JQ
BS 760 879 RS1A232JQ

RD RS1DI06JQ 784 0 0
GC
AAAGCTGGATAACGATTATATTGAAATAGAACTGTCTTTACAAGTACTCCAGAACCCTGA
GAGAATTATTAATGGAGTCTCTCACCTCCCCCTACACATGAGTGATCTAATCTCTAGATA
ACCCTTCCGCTCTCTCCTCTCACTGCTTATATAGTAAAAGGTCCTTCTCTAGTCACACAC
ACTGCGTGACGCCTCCTTACGCACATGCTTCCTCACGTGATGTGTTCATTATGCATAA*G
AAATATTCACATATGGATAAGATCCACCTCAACCTTCTAGAAGCTCTTTACCCTCTTCAT
CAATAACCCACACATAACAATACCGCCCCCATTGAAATCAACCTTGTCCTCAAGGTTGAG
ACACATTGACCGGCTTATACTAGCGTTGTTCCGCTCTTTGAGTAGTGAAGGTTCTTCATG
TTTGTCCTTATTTTTCCAGCAAAGCACTGAATTGCACAAGCATCCTCTCTTTCTGGAAGA
GATTACTCCAAGCTCACGGGACAGCTTCTTCTCCCTATCACGAATTTCCTCAGCTTGTCT
CTCCTCATCAATATCATGCACATCCCAACCTTTATTTCTTGAGCCTCTTCTAGTGAGGGA
TTGCTCTGGTGGCCTAGGAGCACCAAACAACACATAGATGACGTCTAGAGCAAACAGGTT
CTCATTAGGTTCTCCTTGTTGGTTTCTCTTCCTAGCATCCCCAACAATATCCCAAGTAAA
AGCAGCGACATATATGTAGTCCTGCCAAGAGAACT**ACCGGTTGTTCTCGGTTCATGTC
T
C

QA 3 783 3 783
DS 

RD RS1DI06TF 687 0 0
ACATGAGTGATCTAATCTCTAGATAACC*TTCCGCTCTCTCCTCTCACTGCTTATATAGT
AAAAGGTCCTTCTCTAGTCACACACACTGCGTGACGCCTCCTTACGCACATGCTTCCTCA
CGTGATGTGTTCATTATGCATAA*GAAATATTCACATATGGATAAGATCCACCTCAACCT
TCTAGAAGCTCTTTACCCTCTTCATCAATAACCCACACATAACAATACCGCCCCCATTGA
AATCAACCTTGTCCTCAAGGTTGAGACACATTGACCGGCTTATACTAGCGTTGTTCCGCT
CTTTGAGTAGTGAAGGTTCTTCATGTTTGTCCTTATTTTTCCAGCAAAGCACTGAATTGC
ACAAGCATCCTCTCTTTCTGGAAGAGATTACTCCAAGCTCACGGGACAGCTTCTTCTCCC
TATCACGAATTTCCTCAGCTTGTCTCTCCTCATCAATATCATGCACATCCCAACCTTTAT
TTCTTGAGCCTCTTCTAGTGAGGGATTGCTCTGGTGGCCTAGGAGCACCAAACAACACAT
AGATGACGTCTAGAGCAAACAGGTTCTCATTAGGTTCTCCTTGTTGGTTTCTCTTCCTAG
CATCCCCAACAATATCCCAAGTAAAAGCAGCGACATATATGTAGTCCTGCCAAGAGAACT
**ACCGGTTGTTCTCGGTTCATGTCT
C

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1A232JQ 879 0 0
ATAAAGCTGGATAACGATTATATTGAAATAGAACTGTCTTTACAAGTACTCCAGAACCTT
GAGAGAATTATTAATGGAGTCTCTCACCTCCCCCTACACATGAGTGATCTAATCTCTAGA
TAACCCTTCCGCTCTCTCCTCTCACTGCTTATATAGTAAAAGGTCCTTCTCTAGTCACAC
ACACTGCGTGACGCCTCCTTACGCACATGCTTCCTCACGTGATGTGTTTATTATGCATAA
AGAAATATTCACATATGGATAAGATCCACCTCAACCTTCTAGAAGCTCTTTACCCTCTTC
ATCAATAACCCACACATAACAATACCGCCCCCATTGAAATCAACCTTGTCCTCAAGGTTG
AGACACATTGACCGGCTTATACTAGCGTTGTTCCGCTCTTTGAGTAGTGAAGGTTCTTCA
TGTTTGTCCTTATTTTTCCAGCAAAGCACTGAATTGCACAAGCATCCTCTCTTTCTGGAA
GAGATTACTCCAAGCTCACGGGACAGCTTCTTCTCCCTATCACAAATTTCCTCAGCTTGT
CTCTCCTCATCAGTATCATGCACATCCCAACCTTTATTTCTTGAGCCTCTTCTAGTGAGG
GATTGCTCTGGTGGCCTAGGAGCACCAAACAACACATAGATGACGTCTAGAGCAAACAGG
TTCTCATTAGGTTCTCCTTGTTGGTTTCTCTTCCTAGCATCCCCAACAATATCCCAAGTA
AAAGCAGCGACATATATGTAGTCCTGCCAAGAGAACTCCACCGGTTGTTCTCGGTTCATG
TCTACTCTTATGCCAGTCTTTTTCCACTGTGTTGATGTTACAACTGTAGGAACATACCCT
TCCGGACCCCATTCGAGCATCTGATCATACTTCAACCGC

QA 1 879 1 879
DS 

RD RS1A232TR 767 0 0
TCTCTAGATAACCCTTCCGCTCTCTCCTCTCACTGCTTATATAGTAAAAGGTCCTTCTCT
AGTCACACACACTGCGTGACGCCTCCTTACGCACATGCTTCCTCACGTGATGTGTTTATT
ATGCATAAAGAAATATTCACATATGGATAAGAACCACCTCAACCTTCTAGAAGCTCTTTA
CCCTCTTCATCAATAACCCACACATAACAATACCGCCCCCATTGAAATCAACCTTGTCCT
CAAGGTTGAGACACATTGACCGGCTTATACTAGCGTTGTTCCGCTCTTTGAGTAGTGAAG
GTTCTTCATGTTTGTCCTTATTTTTCCAGCAAAGCACTGAATTGCACAAGCATCCTCTCT
TTCTGGAAGAAATTACTCCAAGCTCACGGGACAGCTTCTTCTCCCTATCACAAATTTCCT
CAGCTTGTCTCTCCTCATCAGTATCATGCACATCCCAACCTTTATTTCTTGAGCCTCTTC
TAGTGAGGGATTGCTCTGGTGGCCTAGGAGCACCAAACAACACATAGATGACGTCTAGAG
CAAACAGGTTCTCATTAGGTTCTCCTTGTTGGTTTCTCTTCCTAGCATCCCCAACAATAT
CCCAAGTAAAAGCAGCGACATATATGTAGTCCTGCCAAGAGAACTCCACCGGTTGTTCTC
GGTTCATGTCTACTCTTATGCCAGTCTTTTTCCACTGTGTTGATGTTACAACTGTAGGAA
CATACCCTTCCGGACCCCATTCGAGCATCTGATCATACTTCAACCGC

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 3

CO CL3125Contig1 708 3 11 U
GGGATCTCATCAAAACAGTTGGTAGAAACAGTGAAGAAACCCGTAGCTCTTCAGGATGGG
TCGTATGCATTCAAGAGGAAAGGGTATCTCTGCATCTGCTTTGCCATACAAGCGTTCACC
CCCGACTTGGCTCAAGACCGCCGCTCTTGATGTTGATGAGTCGATATGCAAGTTTGCAAA
GAAAGGTCTGACACCATCTCAGATTGGTGTGATTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCTCA
GGTGAAGAGTGTTACCGGAAACAAGATCTTGCGAATTCTGAAAGCACACGGTCTTGCTCC
TGAGATTCCTGAGGATCTTTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTT
GGAGAGGAACAGGAAAGACAAGGATTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTGGAGAGCAGGAT
TCACCGTCTTGCTCGTTATTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCTGTCTGGAAGTACGA
GT*TACTACTGCCTCTACTCTTGTGGCTTAGAGAGAGAGTGAAGTGCAATGGACTTACTA
TCAAGAAAGACTACCGTTTCTATTTGAGTATCAGTAGACTTAATTACTCTGTTTGCATTT
AGTGATTTTTGTTGGCTAAATTACAATGATCGTTTTGATCATTTCAATGAACAAACGTTG
GTTAAATTTGTCTTTCATAAGTATCATAAATCAAAACTATTTTTAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1DK53TF U 1
AF RS1DX50JQ C 40
AF RS1DX50TF U 40
BS 1 139 RS1DK53TF
BS 140 140 RS1DX50TF
BS 141 482 RS1DK53TF
BS 483 483 RS1DX50TF
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BS 680 680 RS1DX50TF
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BS 708 708 RS1DX50JQ

RD RS1DK53TF 700 0 0
GGGATCTCATCAAAACAGTTGGTAGAAACAGTGAAGAAACCCGTAGCTCTTCAGGATGGG
TCGTATGCATTCAAGAGGAAAGGGTATCTCTGCATCTGCTTTGCCATACAAGCGTTCACC
CCCGACTTGGCTCAAGACCACCGCTCTTGATGTTGATGAGTCGATATGCAAGTTTGCAAA
GAAAGGTCTGACACCATCTCAGATTGGTGTGATTCTTCGTGACTCTCACGGTATCCCTCA
GGTGAAGAGTGTTACCGGAAACAAGATCTTGCGAATTCTGAAAGCACACGGTCTTGCTCC
TGAGATTCCTGAGGATCTTTACCACTTGATCAAGAAAGCAGTTGCTATCCGCAAGCACTT
GGAGAGGAACAGGAAAGACAAGGATTCCAAGTTTAGGTTGATTCTTGTGGAGAGCAGGAT
TCACCGTCTTGCTCGTTATTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCTCCTGTCTGGAAGTACGA
GTCTACTACTGCCTCTACTCTTGTGGCTTAGAGAGAGAGTGAAGTGCAATGGACTTACTA
TCAAGAAAGACTACCGTTTCTATTTGAGTATCAGTAGACTTAATTACTCTGTTTGCATTT
AGTGATTTTTGTTGGCTAAATTACAATGATCGTTTTGATCATTTCAATGAACAAACGTTG
GTTAAATTTGTCTTTCATA*GTATCATAAGTCAAA
CTATT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1DX50JQ 669 0 0
GGG
GTAGCTCTTCAGGATGGGTCGTATGCATTCAAGAGGAAAGGGTATCTCTGCATCTGCTTT
GCCATACAAGCGTTCACCCCCGACTTGGCTCAAGACCGCCGCTCTTGATGTTGATGAGTC
GATATGCAAGTTTGCAAAGAAAGGTCTGACACCATCTCAGATTGGTGTGATTCTTCGTGA
CTCTCACGGTATCCCTCAGGTGAAGAGTGTTACCGGAAACAAGATCTTGCGAATTCTGAA
AGCACACGGTCTTGCTCCTGAGATTCCTGAGGATCTTTACCACTTGATCAAGAAAGCAGT
TGCTATCCGCAAGCACTTGGAGAGGAACAGGAAAGACAAGGATTCCAAGTTTAGGTTGAT
TCTTGTGGAGAGCAGGATTCACCGTCTTGCTCGTTATTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCC
TCCTGTCTGGAAGTACGAGT*TACTACTGCCTCTACTCTTGTGGCTTAGAGAGAGAGTGA
AGTGCAATGGACTTACTATCAAGAAAGACTACCGTTTCTATTTGAGTATCAGTAGACTTA
ATTACTCTGTTTGCATTTAGTGATTTTTGTTGGCTAAATTACAATGATCGTTTTGATCAT
TTCAATGAACAAACGTTGGTTAAATTTGTCTTTCATAAGTATCATAAATCAAAACTATTT
TTAGTC

QA 4 669 4 669
DS 

RD RS1DX50TF 669 0 0
GGG
GTAGCTCTTCAGGATGGGTCGTATGCATTCAAGAGGAAAGGGTATCTCTGCATCTGCTTT
GCCATACAAGCGTTCACCCCCGACTTGGCTCAAGACCGCCGCTCTTGATGTTGATGAGTC
GATATGCAAGTTTGCAAAGAAAGGTCTGACACCATCTCAGATTGGTGTGATTCTTCGTGA
CTCTCACGGTATCCCTCAGGTGAAGAGTGTTACCGGAAACAAGATCTTGCGAATTCTGAA
AGCACACGGTCTTGCTCCTGAGATTCCTGAGGATCTTTACCACTTGATCAAGAAAGCAGT
TGCTATCCGCAAGCACTTGGAGAGGAACAGGAAAGACAAGGATTCCAAGTTTAGGTTGAT
TCTTGTGGAGAGCAGGATTCACCGTCTTGCTCGTTATTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCC
TCCTGTCTGGAAGTACGAGT*TACTACTGCCTCTACTCTTGTGGCTTAGAGAGAGAGTGA
AGTGCAATGGACTTACTATCAAGAAAGACTACCGTTTCTATTTGAGTATCAGTAGACTTA
ATTACTCTGTTTGCATTTAGTGATTTTTGTTGGCTAAATTACAATGATCGTTTTGATCAT
TTCAATGAACAAACGTTGGTTAAATTTGTCTTTCATAAGTATCATAAATCAAAACTATTT
TTAGT
C

QA 4 668 4 668
DS 



AS 1 2

CO CL3126Contig1 588 2 1 U
GATGATCGGCTCTGGCAACAACAAAGACTGCGAAGAATGGTTCTTCGACAGGATTGTGAG
GGATAGACCAGTGCCAATCCCCGGATCAGGATTGCAGCTAACCAACATATCTCATGTCAG
AGACTTGTCTTCCATGCTCACTTCAGCTGTGTCCAACCCTGAGGCTGCCTCCTGCAACAT
CTTCAACTGCGTTAGTGACAGAGCCGTTACTCTTGACGGTATGGCCAAGCTCTGTGCTGC
TGCTGCTGGCAAAACCGTTGAGATCTTGCATTACGACCCTAAAGCCATTGGGGTTGACGC
CAAGAAGGCTTTTCCATTCAGAAACATGCATTTCTACGCGGAACCAAGAGCAGCAAAGGA
TATATTAGGGTGGGAAAGTAAAACGAATCTACCTGAAGATCTCAAGGAGAGATATGAGGA
GTATGTTAAGATTGGCAGAGACAGGAAGGAGATCAAGTTTGAATTAGATGACAAGATTCT
CGAAGCCCTCAAAACTCCAGTGGCCGCTTAATCATATACTATCTTCCTCTGTAAGCTACC
CATATGTACTCTCTTTTTTTTTCCCTCGGCTCATATGATATGATGAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1D867TF U 1
AF RS1D867JQ C 325
BS 1 588 RS1D867TF

RD RS1D867TF 588 0 0
GATGATCGGCTCTGGCAACAACAAAGACTGCGAAGAATGGTTCTTCGACAGGATTGTGAG
GGATAGACCAGTGCCAATCCCCGGATCAGGATTGCAGCTAACCAACATATCTCATGTCAG
AGACTTGTCTTCCATGCTCACTTCAGCTGTGTCCAACCCTGAGGCTGCCTCCTGCAACAT
CTTCAACTGCGTTAGTGACAGAGCCGTTACTCTTGACGGTATGGCCAAGCTCTGTGCTGC
TGCTGCTGGCAAAACCGTTGAGATCTTGCATTACGACCCTAAAGCCATTGGGGTTGACGC
CAAGAAGGCTTTTCCATTCAGAAACATGCATTTCTACGCGGAACCAAGAGCAGCAAAGGA
TATATTAGGGTGGGAAAGTAAAACGAATCTACCTGAAGATCTCAAGGAGAGATATGAGGA
GTATGTTAAGATTGGCAGAGACAGGAAGGAGATCAAGTTTGAATTAGATGACAAGATTCT
CGAAGCCCTCAAAACTCCAGTGGCCGCTTAATCATATACTATCTTCCTCTGTAAGCTACC
CATATGTACTCTCTTTTTTTTTCCCTCGGCTCATATGATATGATGAAC

QA 1 588 1 588
DS 

RD RS1D867JQ 264 0 0
CATGCATTTCTACGCGGAACCAAGAGCAGCAAAGGATATATTAGGGTGGGAAAGTAAAAC
GAATCTACCTGAAGATCTCAAGGAGAGATATGAGGAGTATGTTAAGATTGGCAGAGACAG
GAAGGAGATCAAGTTTGAATTAGATGACAAGATTCTCGAAGCCCTCAAAACTCCAGTGGC
CGCTTAATCATATACTATCTTCCTCTGTAAGCTACCCATATGTACTCTCTTTTTTTTTCC
CTCGGCTCATATGATATGATGAAC

QA 1 264 1 264
DS 



AS 1 2

CO CL3127Contig1 1160 2 2 U
TGGGATGTCCACAAGGCTTTTCTCTGCGTATCTCAACAAAATTGGCCATAAAGCTCGTCA
ATATGATGCATTTGAGATTGGGTTTATAACCACAGACGATTTCACAAATGCTGATATACT
TGAAGCAACGTACCCTGCTGTCGCCAAAACGCTGCTTAATAACTGGAGCAAGGACAAGGC
TGTCCCTGTAGTTACTGGCTTCCTCGGAAAGGGATGGAGGTCTTGTGCTATAACGACGTT
GGGTAGGGGTGGTAGCGATTTGACGGCAACAACGATTGGGAAAGCCTTAGGACTAAGGGA
GATTCAGGTTTGGAAAGATGTGGATGGAGTTTTGACTTGTGATCCGAATATATACTCTGG
AGCTCAGTCTGTTCCTTACTTAACGTTCGATGAGGCAGCTGAGCTTGCTTACTTCGGTGC
TCAGGTGTTGCATCCACTGTCCATGAGGCCAGCAAGAGATGGTGACATTCCCGTCAGAGT
TAAGAACTCGTACAACCCCAATGCTCCAGGAACTGTCATCACCAGGTCAAGAGACATGAG
TAAGGCCGTTCTCACAAGCATTGTTCTGAAACGTAATGTGACCATGTTGGACATAGCGAG
CACTCGTATGCTCGGCCAGTACGGTTTCCTTGCCAAGGTGTTTACCACATTCGAAGACTT
GGGCATATCGGTGGATGTTGTGGCAACAAGTGAAGTTAGTATATCTCTGACACTTGATCC
AGCAAAGCTCTGGGGTAGGGAGTTAGTTCAGCGAGCAAACGAGCTGGATCATGTGGTGGA
GGAGCTAGAGAAGATTGCTGTTGTGAAGCTGCTTCAGCGCAGATCAATCATCTCTCTCAT
AGGAAACGTTCAGAAATCATCACTCATATTAGAGAAGGTTTTTAAAGTACTTAGAAGCAA
TGGAGTGAATGTGCAGATGATCTCACAGGGTGCGTCTAAGGTGAACATTTCATTGATAGT
GAATGATGAAGAGGCTGAACAATGTGTGAGGGCTCTTCACTCTGCCTTCTTTGAGACCTC
TTCTTGATGCACAAGACACAGAGCTAAAGAATGTGTCTACTAAGACTTGGAACTACTTCA
CACTCTTCTTCTCTTTCTAGTTGTTGTTGTGATACGGTTATAATGTTGTTTCAAACTCTA
TAATCAATAAAATGTCTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FF76TF U 1
AF RS1FF76JQ C 335
BS 1 614 RS1FF76TF
BS 615 1160 RS1FF76JQ

RD RS1FF76TF 618 0 0
TGGGATGTCCACAAGGCTTTTCTCTGCGTATCTCAACAAAATTGGCCATAAAGCTCGTCA
ATATGATGCATTTGAGATTGGGTTTATAACCACAGACGATTTCACAAATGCTGATATACT
TGAAGCAACGTACCCTGCTGTCGCCAAAACGCTGCTTAATAACTGGAGCAAGGACAAGGC
TGTCCCTGTAGTTACTGGCTTCCTCGGAAAGGGATGGAGGTCTTGTGCTATAACGACGTT
GGGTAGGGGTGGTAGCGATTTGACGGCAACAACGATTGGGAAAGCCTTAGGACTAAGGGA
GATTCAGGTTTGGAAAGATGTGGATGGAGTTTTGACTTGTGATCCGAATATATACTCTGG
AGCTCAGTCTGTTCCTTACTTAACGTTCGATGAGGCAGCTGAGCTTGCTTACTTCGGTGC
TCAGGTGTTGCATCCACTGTCCATGAGGCCAGCAAGAGATGGTGACATTCCCGTCAGAGT
TAAGAACTCGTACAACCCCAATGCTCCAGGAACTGTCATCACCAGGTCAAGAGACATGAG
TAAGGCCGTTCTCACAAGCATTGTTCTGAAACGTAATGTGACCATGTTGGACATAGCGAG
CACTCGTATGCTCG
CCAG

QA 1 614 1 614
DS 

RD RS1FF76JQ 826 0 0
ACTTGTGATCCGAATATATACTCTGGAGCTCAGTCTGT*CCTTACTTAACGTTCGATGAG
GCAGCTGAGCTTGCTTACTTCGGTGCTCAGGTGTTGCATCCACTGTCCATGAGGCCAGCA
AGAGATGGTGACATTCCCGTCAGAGTTAAGAACTCGTACAACCCCAATGCTCCAGGAACT
GTCATCACCAGGTCAAGAGACATGAGTAAGGCCGTTCTCACAAGCATTGTTCTGAAACGT
AATGTGACCATGTTGGACATAGCGAGCACTCGTATGCTCGGCCAGTACGGTTTCCTTGCC
AAGGTGTTTACCACATTCGAAGACTTGGGCATATCGGTGGATGTTGTGGCAACAAGTGAA
GTTAGTATATCTCTGACACTTGATCCAGCAAAGCTCTGGGGTAGGGAGTTAGTTCAGCGA
GCAAACGAGCTGGATCATGTGGTGGAGGAGCTAGAGAAGATTGCTGTTGTGAAGCTGCTT
CAGCGCAGATCAATCATCTCTCTCATAGGAAACGTTCAGAAATCATCACTCATATTAGAG
AAGGTTTTTAAAGTACTTAGAAGCAATGGAGTGAATGTGCAGATGATCTCACAGGGTGCG
TCTAAGGTGAACATTTCATTGATAGTGAATGATGAAGAGGCTGAACAATGTGTGAGGGCT
CTTCACTCTGCCTTCTTTGAGACCTCTTCTTGATGCACAAGACACAGAGCTAAAGAATGT
GTCTACTAAGACTTGGAACTACTTCACACTCTTCTTCTCTTTCTAGTTGTTGTTGTGATA
CGGTTATAATGTTGTTTCAAACTCTATAATCAATAAAATGTCTTTC

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 4

CO CL3128Contig1 747 4 8 U
CTGAAATATTCAATTATTTTTTCATTTGTTTACAAAAGGCTTGCAAAACTACATTATTGA
GAAATTTCATAATTCAAATGAAATTATTAGGAAAAAGATACCATCCACCGTTCGCACATG
TACATATACAGTGGGTCGACGTTTAAAGTCGAGAATCATAACATGCATAAAATTAAATAA
AATAGGAAAAAGCTATCTAAATGAAAGAACCTTTAACATGATTGTGGTTAATTCCAACTA
GGCAACTATTGATCATTTTCGGGAACAAGAACGGAAACTTCTACGCCTCTTGGCCACCGT
GAGAGCCGTCGTAGTGGTAGTGGTTGTTGAGGGGGATGACGTCATCTTCTGGTTATAAAC
AGAAGAAAAGAAGCGATCGATCTCATCTTTGTTGACAATAATCTCAAACTTGGATGACAT
CATAAGCTTCCTCTTGCAAGATCTGACAAGAGAAGACGGCGTGGGAGGTGGGCGCCGTTT
CTGCGGCGGAGGAGGAGGAGTAGTGGCGGTTGAGGGAGGAATCTTGTGATGTGAGGAAGT
AGGAGTGGTGCAGCCGCCGCCGTTGCCGTCATCATCTATGTTGGTGTTGTTGGATCGGAT
CTTGATCGGTGTTGAGAAATTCAACATGGGCAGATCTTGTATTAAACCAACATCCATTTG
TTTTCTTTTGTTTATATATGAATATTAAACTGATCTGTTCTTGAAGGTTTTGTTTTTGTG
TTTTGGCGTGTGCCTGGACGAATCTCC


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GG46JQ U 1
AF RS1D216JQ U 3
AF RS1D216TF C 3
AF RS1GG46TF C 113
BS 1 105 RS1GG46JQ
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BS 419 419 RS1D216JQ
BS 420 454 RS1GG46JQ
BS 455 747 RS1D216JQ

RD RS1GG46JQ 454 0 0
CTGAAATATTCAATTATTTTTTCATTTGTTTACAAAAGGCTTGCAAAACTACATTATTGA
GAAATTTCATAATTCAAATGAAATTATTAGGAAAAAGATACCATCTACCGTTCGCACATG
TACATATACAGTGGGTCGACGTTTAAAGTCGAGAATCATAACATGCATAAAATTAAATAA
AATAGGAAAAAGCTATCTAAATGAAAGAACCTTTAACATGATTGTGGTTAATTCCAACTA
GGCAACTATTGATCATTTTCGGGAACAAGAACGGAAACTTCTACGCCTCTTGGCCACCGT
GAGAGCCGTCGTAGTGGTAGTGGTTGTTGAGGGGGATGACGTCATCTTCTGGTTATAAAC
AGAAAAAAAGAAGCGATCGATCTCATCTTTGTTGACAATAATCTCAAACTTGGATGACGT
CATAAGCTTCCTCTTGCAAGATCTGACAAGAGAA

QA 1 454 1 454
DS 

RD RS1D216JQ 745 0 0
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CATATACAGTGGGTCGACGTTTAAAGTCGAGAATCATAACATGCATAAAATTAAATAAAA
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GAGCCGTCGTAGTGGTAGTGGTTGTTGAGGGGGATGACGTCATCTTCTGGTTATAAACAG
AAGAAAAGAAGCGATCGATCTCATCTTTGTTGACAATAATCTCAAACTTGGATGACATCA
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GCGGCGGAGGAGGAGGAGTAGTGGCGGTTGAGGGAGGAATCTTGTGATGTGAGGAAGTAG
GAGTGGTGCAGCCGCCGCCGTTGCCGTCATCATCTATGTTGGTGTTGTTGGATCGGATCT
TGATCGGTGTTGAGAAATTCAACATGGGCAGATCTTGTATTAAACCAACATCCATTTGTT
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TTGGCGTGTGCCTGGACGAATCTCC

QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1D216TF 739 0 0
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AATTTCATAATTCAAATGAAATTATTAGGAAAAAGATACCATCCACCGTTCGCACATGTA
CATATACAGTGGGTCGACGTTTAAAGTCGAGAATCATAACATGCATAAAATTAAATAAAA
TAGGAAAAAGCTATCTAAATGAAAGAACCTTTAACATGATTGTGGTTAATTCCAACTAGG
CAACTATTGATCATTTTCGGGAACAAGAACGGAAACTTCTACGCCTCTTGGCCACCGTGA
GAGCCGTCGTAGTGGTAGTGGTTGTTGAGGGGGATGACGTCATCTTCTGGTTATAAACAG
AAGAGAAGAAGCGATCGATCTCATCTTTGTTGACAATAATCTCAAACTTGGATGACATCA
TAAGCTTCCTCTTGCAAGATCTGACAAGAGAAGACGGCGTGGGAGGTGGGCGCCGTTTCT
GCGGCGGAGGAGGAGGAGTAGTGGCGGTTGAGGGAGGAATCTTGTGATGTGAGGAAGTAG
GAGTGGTGCAGCCGCCGCCGTTGCCGTCATCATCTATGTTGGTGTTGTTGGATCGGATCT
TGATCGGTGTTGAGAAATTCAACATGGGCAGATCTTGTATTAAACCAACATCCATTTGTT
TTCTTTTGTTTATATATGAATATTAAACTGATCTGTTCTTGAAGGTTTTGTTTTTGTGTT
TTGGCGTGTGCCTGGAC
GA

QA 1 737 1 737
DS 

RD RS1GG46TF 629 0 0
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TTAAATAAAATAGGAAAAAGCTATCTAAATGAAAGAACCTTTAACATGATTGTGGTTAAT
TCCAACTAGGCAACTATTGATCATTTTCGGGAACAAGAACGGAAACTTCTACGCCTCTTG
GCCACCGTGAGAGCCGTCGTAGTGGTAGTGGTTGTTGAGGGGGATGACGTCATCTTCTGG
TTATAAACAGAAGAGAAGAAGCGATCGATCTCATCTTTGTTGACAATAATCTCAAACTTG
GATGACGTCATAAGCTTCCTCTTGCAAGATCTGACAAGAGAAGACGGCGTGGGAGGTGGG
CGCCGTTTCTGCGGCGGAGGAGGAGGAGTAGTGGCGGTTGAGGGAGGAATCTTGTGGTGT
GAGGAAGTAGGAGTGGTGCAGCCGCCGCCGTTGCCGTCATCATCTATGTTGGTGTTGTTG
GATCGGATCTTGATCGGTGTTGAGAAATTCAACATGGGCAGATCTTGTATTAAACCAACA
TCCATTTGTTTTCTTTTGTTTATATATGAATATTAAACTGATCTGTTCTTGAAGGTTTTG
TTTTTGTGTTTTGGCGTGTGCCTGGAC
CC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 4

CO CL3129Contig1 1056 4 11 U
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ATCCACCAGAAGGACGGCAAACCGAAACAAACATTGTTCACTGTTCCAAAGTTTTCACTG
ACGAATCGAATTGTAATCTCCTTTTCCCTTTAGGATTCAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTT
TGTTTCTTACTTGAAGGGACCCCGATCAATAATGCCGCCGAGGAGAAAAGCAAAGAAGGG
TGTCAAGCGCACTGAAGAAGACAAGAAGGAAGTAGACAAAGAGATTCAAATAGAAGAGAA
GAAGAAAGAGGACTTTGTGGACGAAGAAGCTGAAAGACAAGCTGTTGCAATAAGGGCGAT
TCGTGATGTGGAGATTGAACACACTTTAACTGCACTCAGCTTGCTCTGCTCCTATTTTAC
CGAGGAACAGATTCAGACTCCTGTCTTGGGCTTCTTTAAAGACAATCTTCCTGATTTGTC
CATTGCGAGGAACGAAGAAAGTGGGGAGATTGAGTTAAAGTGGAATGATTCAGATGGCGT
TGACGTCAATGATTCTATACTGAAGCGCTTGTCCATGGGTTTCCCTGATTTATACAACTC
TTCTAGGCCTTCTCTTGGTGGCTACAGTAACGTGGAAGGAAGCATGTTAGGAACTGGTAA
CACACACCTCAAGAATCTTGGG*ACATCTGCGAATCAAATGCTTGCAAGCCATGATGCTC
TTAGGACTCCCGTGGTAAATGGGCAGAGGCTCTCTTTTGGAATGACACCAAAGACTCGGA
GGCAACCAAAACATGGAGAGATAATGCTTTCTGTACATGGCTCTCCTTTGGGTGTCTATA
AAGAAGATGACAACATGGGAGCTATTAATGAAGAAGACAGTTGAAGATTTGCTTCAAAAG
GTTCAGAAACTTGCTGATTCTCATTTAGTCTAAGCTAAGCTAATGTTTGCTGTGCATGTC
TATTCAGATTTCATAAATTATGTTAGTATATATATGAAAATTCTGCCTTGTAATTTACCA
TTTGTTTCCTCTCTTTTATCTAACTATTTTATAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1BZ44TF U 585
AF RS1H270TF U 1
AF RS1H270JQB C 223
AF RS1BZ44JQ C 275
BS 1 637 RS1H270TF
BS 638 638 RS1BZ44TF
BS 639 650 RS1H270TF
BS 651 651 RS1BZ44TF
BS 652 724 RS1H270TF
BS 725 725 RS1H270JQB
BS 726 744 RS1H270TF
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BS 772 1054 RS1H270JQB
BS 1055 1056 RS1BZ44JQ

RD RS1BZ44TF 136 0 0
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TGTTAGGAACTGGTAACACACACCTCAAGAATCTTGGGGACATCTGCGAATCAAATGCTT
GCA*GCCATGATGCTC

QA 1 136 1 136
DS 

RD RS1H270TF 744 0 0
GGGGTGCGAGTGTTTCTCTTAAGAGTAAAAAAATCCCAAGAGTCAGAGAAAAAACCCTAA
ATCCACCAGAAGGACGGCAAACCGAAACAAACATTGTTCACTGTTCCAAAGTTTTCACTG
ACGAATCGAATTGTAATCTCCTTTTCCCTTTAGGATTCAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTT
TGTTTCTTACTTGAAGGGACCCCGATCAATAATGCCGCCGAGGAGAAAAGCAAAGAAGGG
TGTCAAGCGCACTGAAGAAGACAAGAAGGAAGTAGACAAAGAGATTCAAATAGAAGAGAA
GAAGAAAGAGGACTTTGTGGACGAAGAAGCTGAAAGACAAGCTGTTGCAATAAGGGCGAT
TCGTGATGTGGAGATTGAACACACTTTAACTGCACTCAGCTTGCTCTGCTCCTATTTTAC
CGAGGAACAGATTCAGACTCCTGTCTTGGGCTTCTTTAAAGACAATCTTCCTGATTTGTC
CATTGCGAGGAACGAAGAAAGTGGGGAGATTGAGTTAAAGTGGAATGATTCAGATGGCGT
TGACGTCAATGATTCTATACTGAAGCGCTTGTCCATGGGTTTCCCTGATTTATACAACTC
TTCTAGGCCTTCTCTTGGTGGCTACAGTAACGTGGAAAGAAGCATGTTAG*AACTGGTAA
CACACACCTCAAGAATCTTGGG*ACATCTGCGAATCAAATGCTTGCAAGCCATGATGCTC
TTAG*ACTCCCGTGGTAAATGGGC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1H270JQB 834 0 0
GAGAAAAGCAAAGAAGGGTGTCAAGCGCACTGAAGAAGACAAGAAGGAAGTAGACAAAGA
GATTCAAATAGAAGAGAAGAAGAAAGAGGACTTTGTGGACGAAGAAGCTGAAAGACAAGC
TGTTGCAATAAGGGCGATTCGTGATGTGGAGATTGAACACACTTTAACTGCACTCAGCTT
GCTCTGCTCCTATTTTACCGAGGAACAGATTCAGACTCCTGTCTTGGGCTTCTTTAAAGA
CAATCTTCCTGATTTGTCCATTGCGAGGAACGAAGAAAGTGGGGAGATTGAGTTAAAGTG
GAATGATTCAGATGGCGTTGACGTCAATGATTCTATACTGAAGCGCTTGTCCATGGGTTT
CCCTGATTTATACAACTCTTCTAGGCCTTCTCTTGGTGGCTACAGTAACGTGGAAGGAAG
CATGTTAGGAACTGGTAACACACACCTCAAGAATCTTGGG*ACATCTGCGAATCAAATGC
TTGCAAGCCATGATGCTCTTAGGACTCCCGTGGTAAATGGGCAGAGGCTCTCTTTTGGAA
TGACACCAGAGACTCGGAGGCAACCAAAACATGGAGAGATAATGCTTTCTGTACATGGCT
CTCCTTTGGGTGTCTATAAAGAAGATGACAACATGGGAGCTATTAATGAAGAAGACAGTT
GAAGATTTGCTTCAAAAGGTTCAGAAACTTGCTGATTCTCATTTAGTCTAAGCTAAGCTA
ATGTTTGCTGTGCATGTCTATTCAGATTTCATAAATTATGTTAGTATATATATGAAAATT
CTGCCTTGTAATTTACCATTTGTTTCCTCTCTTTTATCTAACTATTTTATAA
CC

QA 1 832 1 832
DS 

RD RS1BZ44JQ 782 0 0
GACAAAGAGATTCAAATAGAAGAGAAGAAGAAAGAGGACTTTGTGGACGAAGAAGCTGAA
AGACAAGCTGTTGCAATAAGGGCGATTCGTGATGTGGAGATTGAACGCACTTTAACTGCA
CTCAGCTTGCTCTGCTCCTATTTTACCGAGGAACAGATTCAGACTCCTGTCTTGGGCTTC
TTTAAAGACAATCTTCCTGATTTGTCCATTGCGAGGAACGAAGAAAGTGGGGAGATTGAG
TTAAAGTGGAATGATTCAGATGGCGTTGACGTCAATGATTCTATACTGAAGCGCTTGTCC
ATGGGTTTCCCTGATTTATACAACTCTTCTAGGCCTTCTCTTGGTGGCTACAGTAACGTG
GAAGGAAGCATGTTAGGAACTGGTAACACACACCTCAAGAATCTTGGG*ACATCTGCGAA
TCAAATGCTTGCA*GCCATGATGCTCTTAGGACTCCCGTGGCAAATGGGCGGAGGCTCTC
TTTTGGAATGAGACCAAAGACTCGGAGGCAACCAAAACATGGAGAGATAATGCTTTCTGT
ACATGGCTCTCCTTTGGGTGTCTATAAAGAAGATGACAACATGGGAGCTATTAATGAAGA
AGACAGTTGAAGATTTGCTTCAAAAGGTTCAGAAACTTGCTGATTCTCATTTAGTCTAAG
CTAAGCTAATGTTTGCTGTGCATGTCTATTCAGATTTCATAAATTATGTTAGTATATATA
TGAAAATTCTGCCTTGTAATTTACCATTTGTTTCCTCTCTTTTATCTAACTATTTTATAA
GC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 4

CO CL3130Contig1 921 4 28 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGTATCAGGTTG
AAGTCCCGCTTCGGCACAGGTTTCATCGCCAACATTAGCTTCAACGAAAGCAACAACAAC
GGAGAGAACAACGGCAACGGTGAAGCTGATTCACGCGAGCCAGTGAAGAAATTCTTCAAA
GATCATCTCAATGTGAAACCGATAGAAGAAACCAAAGCCTTCATGACTTTTGTTATACCG
CACGACAAAGAGAATCTTTTGACAAGGTTTTTCGCTGAGCTGCAAGACAGAGAAGTTGAG
TTTGGAATCTCAGACATCCAACTTGGTCTAGCAACTCTTGAAGAAGTCTTCTTGAACATA
GCAAGAAAAGCTGAACTCGAAAGCGCTGCCGTTGATGGTACAATGGTCACTCTGGAACTA
ACTTCTGGCTCATCCGTCGAGATACCGGTGGGGGCAAGATTTGTTGGGATACCAGGAACT
GAAACTGCAGAGAATCCGCGTGGAGTCATGGTGGAAGTGTACTGGCAACAAGACGAGTCG
GGATCGTTGTGCGTCTCGGGACATTCCACGGAGATGCCGGTTCCTGATATTGTTCCCGCG
ACAGATCCGGTTGCACCAGGGCATGGCGGAGTAAGCTTGTTGGGACGGAGAGGACGGGGA
CAGCAAGTTCAGGGGATTGCGATTGATCCTGAGTTTGTCGGCTCCCGTCGTGTTAGTAGA
AGCGGTTCCTTTGCTTCCCAACGTTCTTCACTTTGAAAATGAGAATCTAACACACACACA
CACACCTACAGTTTCTTAACTTACCGGACTCGGCTATGTTATATTCTCACGCGGGGTTTG
TTTATTTGAATTGTGTGTTCGTGATTAATGATGTAAATTAGACGGGTGTTTGTGGTTTTA
AAAACTAATGTTTATACTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 5 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A305TF U 1
AF RS1FH45TF U 74
AF RS1A305TV U 90
AF RS1FH45JQ C 101
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BS 87 87 RS1FH45TF
BS 88 89 RS1A305TF
BS 90 90 RS1FH45TF
BS 91 108 RS1A305TF
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BS 681 876 RS1A305TF
BS 877 921 RS1FH45JQ

RD RS1A305TF 879 0 0
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AAGTCCCGCTTCGGCACAGGTTTCATTGCTAACATTAGCTTCAACGAAGGCAACAACAAC
GGAGAGAACAACGGCAACGGTGAAGCTGATTCACGCGAGCCAGTGAAGAAATTCTTCAAA
GACCATCTCAATGTGAAACCAATAGAAGAAACCAAAGCCTTCATGACTTTTGTTATACCG
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TTTGGAATCTCAAACATCCAACTTGGTCTAGCAACTCTTGAAGAAGTCTTCTTGAACATA
GCAAGAAAAGCTGAACTCGAAAGCGCTGCCGTTGACGGTACAATGGTCACTCTCGAACTA
ACTTCTGGCTCATCCGTCGAGATACCGGTGGGGGCAAGATTTGTTGGGATACCAGGAACT
GAAACTGCAGAGAATCCGCGTGGAGTCATGGTGGAAGTGTACTGGCAACAAGACGAGTCG
GGATCATTGTGCATCTCGGGACATTCCACGGAGATGCCGGTTCCTGATATTGTTCCCGCG
ACAGATCCAGTTGCACCAGGGCATGGGGGAGTAAGCTTGTTGGGACGGAGAGGACGGGGA
CAGCAAGTTCAGGGGATTGTGATTGATCCTGAGTTTGTCGGCTCCCGTCGTGTTAGTAGA
AGCGGTTCCTTTGCTTCCCAACGTTCTTCACTTTGAAAATGAGAATCTAACACACACACA
CACACCTACAGTTTCTTAACTTACCGGACTCGGCTATGTTATATTCTCACGCGGGGTTTG
TTTATTTGAATTGTGTGTTCGTGATTAATGATGTAA
ATT

QA 1 876 1 876
DS 

RD RS1FH45TF 784 0 0
GCACAGGTTTCATCGCCAACATTAGCTTCAACGAAAGCAACAACAACGGAGAGAACAACG
GCAACGGTGAAGCTGATTCACGCGAGCCAGTGAAGAAATTCTTCAAAGATCATCTCAATG
TGAAACCGATAGAAGAAACCAAAGCCTTCATGACTTTTGTTATACCGCACGACAAAGAGA
ATCTTTTGACAAGGTTTTTCGCTGAGCTGCAAGACAGAGAAGTTGAGTTTGGAATCTCAG
ACATCCAACTTGGTCTAGCAACTCTTGAAGAAGTCTTCTTGAACATAGCAAGAAAAGCTG
AACTCGAAAGCGCTGCCGTTGATGGTACAATGGTCACTCTGGAACTAACTTCTGGCTCAT
CCGTCGAGATACCGGTGGGGGCAAGATTTGTTGGGATACCAGGAACTGAAACTGCAGAGA
ATCCGCGTGGAGTCATGGTGGAAGTGTACTGGCAACAAGACGAGTCGGGATCGTTGTGCG
TCTCGGGACATTCCACGGAGATGCCGGTTCCTGATATTGTTCCCGCGACAGATCCGGTTG
CACCAGGGCATGGCGGAGTAAGCTTGTTGGGACGGAGAGGACGGGGACAGCAAGTTCAGG
GGATTGCGATTGATCCTGAGTTTGTCGGCTCCCGTCGTGTTAGTAGAAGCGGTTCCTTTG
CTTCCCAACGTTCTTCACTTTGAAAATGAGAATCTAACACACACACACACACCTACAGTT
TCTTAACTTACCGGACTCGGCTATGTTATATTCTCACGCGGGGTTTGTTTATTTGAATTG
TGTG

QA 1 784 1 784
DS 

RD RS1A305TV 790 0 0
T
AACATTAGCTTCAACGAAGGCAACAACAACGGAGAGAACAACGGCAACGGTGAAGCTGAT
TCACGCGAGCCAGTGAAGAAATTCTTCAAAGACCATCTCAATGTGAAACCAATAGAAGAA
ACCAAAGCCTTCATGACTTTTGTTATACCGCACGACAAAGAGAATCTTTTGACAAGGTTT
TTCGCTGAGCTGCAAGACAGAGAAGTTGAGTTTGGAATCTCAAACATCCAACTTGGTCTA
GCAACTCTTGAAGAAGTCTTCTTGAACATAGCAAGAAAAGCTGAACTCGAAAGCGCTGCC
GTTGACGGTACAATGGTCACTCTCGAACTAACTTCTGGCTCATCCGTCGAGATACCGGTG
GGGGCAAGATTTGTTGGGATACCAGGAACTGAAACTGCAGAGAATCCGCGTGGAGTCATG
GTGGAAGTGTACTGGCAACAAGACGAGTCGGGATCATTGTGCATCTCGGGACATTCCACG
GAGATGCCGGTTCCTGATATTGTTCCCGCGACAGATCCAGTTGCACCAGGGCATGGGGGA
GTAAGCTTGTTGGGACGGAGAGGACGGGGACAGCAAGTTCAGGGGATTGTGATTGATCCT
GAGTTTGTCGGCTCCCGTCGTGTTAGTAGAAGCGGTTCCTTTGCTTCCCAACGTTCTTCA
CTTTGAAAATGAGAATCTAACACACACACACACACCTACAGTTTCTTAACTTACCGGACT
CGGCTATGTTATATTCTCACGCGGGGTTTGTTTATTTGAATTGTGTGTTCGTGATTAATG
ATGTAA
TTA

QA 2 787 2 787
DS 

RD RS1FH45JQ 821 0 0
TCAACGAAAGCAACAACAACGGAGAGAACAACGGCAACGGTGAAGCTGATTCACGCGAGC
CAGTGAAGAAATTCTTCAAAGATCATCTCAATGTGAAACCGATAGAAGAAACCAAAGCCT
TCATGACTTTTGTTATACCGCACGACAAAGAGAATCTTTTGACAAGGTTTTTCGCTGAGC
TGCAAGACAGAGAAGTTGAGTTTGGAATCTCAGACATCCAACTTGGTCTAGCAACTCTTG
AAGAAGTCTTCTTGAACATAGCAAGAAAAGCTGAACTCGAAAGCGCTGCCGTTGATGGTA
CAATGGTCACTCTGGAACTAACTTCTGGCTCATCCGTCGAGATACCGGTGGGGGCAAGAT
TTGTTGGGATACCAGGAACTGAAACTGCAGAGAATCCGCGTGGAGTCATGGTGGAAGTGT
ACTGGCAACAAGACGAGTCGGGATCGTTGTGCGTCTCGGGACATTCCACGGAGATGCCGG
TTCCTGATATTGTTCCCGCGACAGATCCGGTTGCACCAGGGCATGGCGGAGTAAGCTTGT
TGGGACGGAGAGGACGGGGACAGCAAGTTCAGGGGATTGCGATTGATCCTGAGTTTGTCG
GCTCCCGTCGTGTTAGTAGAAGCGGTTCCTTTGCTTCCCAACGTTCTTCACTTTGAAAAT
GAGAATCTAACACACACACACACACCTACAGTTTCTTAACTTACCGGACTCGGCTATGTT
ATATTCTCACGCGGGGTTTGTTTATTTGAATTGTGTGTTCGTGATTAATGATGTAAATTA
GACGGGTGTTTGTGGTTTTAAAAACTAATGTTTATACTGAC

QA 1 821 1 821
DS 



AS 1 4

CO CL3131Contig1 954 4 8 U
ATACTTTGGATAAATGGAAATTGATAAAATTTAAGATTACAAGAGATACATCTTGAAGTG
TACCAAGAAGAAGATACATCATCAATAATGAGCTTGATAGATTTGTAACATGCATAGTAT
TTATTATAGTATTCAATTTAGGAATGGCTGCTCGACATCGGCGAGTGGGACATCTGAACG
GTCAATGAGGACGTTCTCGTAGATGAATCCAGCAAGTCCACCACCGATCAACGGTCCAAC
CCAATATACCCAATGGTCAGTCCAGTTCCCAGAGACCAAAGCAGGTCCAAAGGATCTGGC
CGGGTTCATTGAGGCTCCAGAAAAGGCGCCACCGGCAAGGATGTTGGCTCCGACGACAAA
TCCGGTGAGAAGTGGGCCTAGCCCATCAAGGGAGCCTTTCTTGGGATCCACCATCATGGC
GTAAACAGTGAAGAGAAGTGAGAATGTCAAGATGATCTCCCATATGATCCCCTGAGTGTA
ACTTATTCCACTTGCCAAAGTGTGAACCGGAGTTCCCATTCCTCCGGTGAGGTAACTTAG
GAGGAAGCAGGCTGCGGAGGAGGCCAACAGCTGATCAATCCAGTAGAGGAACGCGCGGAA
GACGCTGATGTGACCTCCGAAAAGTAGGCCGATGGTAACAGCGGGGTTGAGGTGGCCACC
AGAGATATGTCCAGCAGATATCATTACCGCCACCACAAATGCATGAGCCACCGCGACCGC
TAAAAGTCCCACTAACGTGTTTCCGATTAAGCTGTCCGTGGCCATGGCGGATCCGACGCC
GGCGAAAACAAAGAAGAAGGTGGTGATGAATTCGACAATGAGAGCTTTGATGCAGTCCGG
CTGAGCCACCTCGCGGTGGTTCCCTAAGTCGATCTTCTTCATGGTTGTGTTGTGAAATAA
ATTTAAAAATTCTAAACAAGAGAAATATTCTTGGATGGTTCTGGTTGATGTTCC


BQ
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CC

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TGCGAATATGGATCACATGAATGGGTCGGGATGTGTGATGTGGACCGGAGAGCTCTTGGA
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CATATGTAGAT

QA 1 731 1 731
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C
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CC

QA 2 692 2 692
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G
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QA 2 717 2 717
DS 

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G
AACATCCACTCGAGGTTTAGAATGAGTTCCACAGGGTACTTACAAGTGATCACATGGACC
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AAAGGCTTCGTTCCCAAGAATGCGGGGGCATGGGAGTTGAGAGATGCGTCAGGTGGTTGT
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AAGCTACCGGAGACAAGCGAAGCGGTTGTGGACGAGGTGATCGAGTTGAAGGAATGCAGG
GAGAAGTGTGTTAGAGATTGTAACTGCACCGGGTATGCGAATATGGATAACATGAATGGG
TCGGGATGTGTGATGTGGACCGGAGAGCTCTTGGATATGCGGAAGTACGATGCTGGAGGT
CATGATATTTATGTCAAGGTAGCAGAAGCTAGTCTTGTCCCCTCGTAGATATGAAGGATC
CAATAATATGCTAAAACTTCAGGTGATTCGGATTTCATATGTAGATATCCGGATGCGTTG
TTTTTAGATATAATATCTAAAGTATCTAAAAATAAATGATGTGAAATCCTTATTATTTAT
GTATGTTTTATATCAATGAAACGTTTATTCATCAATAATTTTATGTTATCATATCT

QA 2 717 2 717
DS 



AS 1 4

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ATCACACCAAATGCATCAAAGAGCAGCAAGGTCTCTGGGATGATCACTTCTCTGCTGATC
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GGATAAGCATCTCAAGTATGAAACTGCAATGGTAAATCTTTCTTCTAGTTTTTGGAATTT
GATTTGGTACCTTTTTGTTTGACTCTCTGCTTTGTGTGTTTGGTTTCAGATGAATGCTAG
TAAGAACAATCTGACTTGTGACGAACCGGAAGAAATTCAATCACCCAAGTTGACTAGTTA
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TGCCTTCCACTCCTCTGGCTTGGCGGTTTGAATTCACTCTCAAAGAAGAAGACTATGACG
ACCTTCTCTTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1D512JQ U 1
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AF RS1CR87TF C 121
AF RS1D512TF C 160
BS 1 646 RS1D512JQ
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RD RS1D512JQ 646 0 0
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QA 1 487 1 487
DS 

RD RS1CR87TF 735 0 0
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GGATAAGCATCTCAAGTATGAAACTGCAATGGTAAATCTTTCTTCTAGTTTTTGGAATTT
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QA 1 735 1 735
DS 

RD RS1D512TF 696 0 0
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TGGGGTTCTTCATCCCAAAGCTTCTTCCAATAACAAGTAAATGCGAAACCAACAACATAG
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ATGATCACTTCTCTGCTGATCTTCTACTTCTTCACCATGGTAAAAGCTCTTGATGGTGGT
GGTTACTGATCTTTTGCTTGTGAACTTGTGCTTAAAAGCTTTGTTCTTTTGTTTTTTTTT
TGTAGATTCTTCCAGCGTCAAGGATAAGCATCTCAAGTATGAAACTGCAATGGTAAATCT
TTCTTCTAGTTTTTGGAATTTGATTTGGTACCTTTTTGTTTGACTCTCTGCTTTGTGTGT
TTGGTTTCAGATGAATGCTAGTAAGAACAATCTGACTTGTGACGAACCGGAAGAAATTCA
ATCACCCAAGTTGACTAGTTACATGAAGCGCTCAACTCCATGGCGCTCCCCAGTCCGCCA
TGGTTCTGTGATGAAGAAAGATGCCTTCCACTCCTCTGGCTTGGCGGTTTGAATTCACTC
TCAAAGAAGAAGACTATGACGACCTTCTCTTCTCCC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 4

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GTGCTCCACCACATGAAAATGGGAAGAGTCCAGAAACAGCCACTGATGCGGCAAACAACA
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ATCAGAAAACAAACGGCTCAACAAGCACAGACCACGCCGGAGAGAAAGACCTTCCCTCCA
GAACACTGGGCGGACACCGAGCC*GGAAAAGCCGAAGTTGTTTACGAGAACGGTGCAGAT
ATCGAGGCGCTTATGCCTAAGCTACGCCAATCCGATTATTTCACCGAACCAAGTATACTG
GAACTAGCGGCTAAAGAAAGAGCGGATCCTGGTTACTGCACGCGGGTTAAAGACTTTGTG
GTGGGACGACACGGTTATGGGAGCATAAAGTTCATGGGAGAGACTGATGTTCGTAGGCTA
GACTTAGAATCTTTGGTTCAGTTCAATAACAGGGAAGTGATTGTATACCTAGACGAGAGC
AAGAAACCAGCTGTTGGGGAAGGGCTGAATAAACCGGCGGAGGTGACCTTGCTGAATATA
AAGTGTATCGATAAAAAGACAGGGAAACAGTTTACTGAAGGAGAGAGAGTGGAGAAGTAC
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CAACCTACTCCTTCCGTTTCAAATTATATGTCTTTAGAGAGCAAATTTTTTATTTCAAAA
TAAGTGTCGTTTTCGATTTTCAATGTAAAATTTATTGAAAATATTCTCTATTCTATTTTT
AT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 

AF RS1A235TF U 1
AF RS1A235TV U 1
AF RS1A235JQ C 234
AF RS1A235TR C 267
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GTGCTCCACCACATGAAAATGGGAAGAGTCCAGAAACAGCCACTGATGCGGCAAACAACA
AAAATGGTAACGGAAAACTTGGTTCTGCTGAAGAAAGAACTCACCCATTTGTCAACGGAA
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GAACACTGGGCGGACACCGAGCC*GGAAAAGCCGAAGTTGTTTACGAGAACGGTGCAGAT
ATCGAGGCGCTTATGCCTAAGCTACGCCAATCCGATTATTTCACCGAACCAAGTATACTG
GAACTAGCGGCTAAAGAAAGAGCGGATCCTGGTTACTGCACGCGGGTTAAAGACTTTGTG
GTGGGACGACACGGTTATGGGAGCATAAAGTTCATGGGAGAGACTGATGTTCGTAGGCTA
GACTTAGAATCTTTGGTTCAGTTCAATAACAGGGAAGTGATTGTATACCTAGACGAGAGC
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GACGACGATGAAGCTTAGAGTCTCATCTCAGTG

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CTTTGTGGTGGGACGACACGGTTATGGGAGCATAAAGTTCATGGGAGAGACTGATGTTCG
TAGGCTAGACTTAGAATCTTTGGTTCAGTTCAATAACAGGGAAGTGATTGTATACCTAGA
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GAGTTGTGCAGTAAGAAATAGTACCATCTCCATCTGTTGTGTGTTTTTTCTAGACCTTTT
TTTCTTACAACCTACTCCTTCCGTTTCAAATTATATGTCTTTAGAGAGCAAATTTTTTAT
TTCAAAATAAGTGTCGTTTTCGATTTTCAATGTAAAATTTATTGAAAATATTCTCTATTC
TATTTTTAT

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TCCTGGTTACTGCACGCGGGTTAAAGACTTTGTGGTGGGACGACACGGTTATGGGAGCAT
AAAGTTCATGGGAGAGACTGATGTTCGTAGGCTAGACTTAGAATCTTTGGTTCAGTTCAA
TAACAGGGAAGTGATTGTATACCTAGACGAGAGCAAGAAACCAGCTGTTGGGGAAGGGCT
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CGAACATTTTAGTTCCTATAAGCTCGATGATGAAGACGACGATGAAGCTTAGAGTCTCAT
CTCAGTGTTAATTCTGTTTGGATGTTGGAGTTGTGCAGTAAGAAATAGTACCATCTCCAT
CTGTTGTGTGTTTTTTCTAGACCTTTTTTTCTTACAACCTACTCCTTCCGTTTCAAATTA
TATGTCTTTAGAGAGCAAATTTTTTATTTCAAAATAAGTGTCGTTTTCGATTTTCAATGT
AAAATTTATTGAAAATATTCTCTATTCTATTTTTAT

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 4

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AACACGACTGTCGCCTGACCGAAACTGATTCATGATCTCGTCTCTTTCCTTCTGAGGCAT
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GGAAGTCATCTCCAAAATCTCGTGGGGAAGAGTTGCAGAAACCAAACAAACCTGAAGATC
AGGTG


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1DU43JQ U 1
AF RS1DU43TF C 1
AF RS1CZ02JQ U 12
AF RS1CP18TF C 204
BS 1 665 RS1DU43JQ
BS 666 829 RS1CZ02JQ
BS 830 905 RS1CP18TF

RD RS1DU43JQ 666 0 0
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CACCT
C

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DS 

RD RS1DU43TF 666 0 0
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G*GAATTAAGGTTAGCTAAAACAGAGATTTTACTTTTTACCTAGTAAGAAAATATAAGCA
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ATAAAATAAAACCCTAAACCTAACATCAAAGGGGGTAGGTATGAAGCATCATAAGATAGT
GCAACAGCATGACCACAAGCTCTGAACAAAACCTTCTCATTCAGACACGGTCATTTAGAT
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AACACGACTGTCGCCTGACCGAAACTGATTCATGATCTCGTCTCTTTCCTTCTGAGGCAT
GTCACCGTGCATTGATGAGACTGTGAAGTTGTTAGTCCTCATTTTCTCACTTAGCCAATC
CACCT
C

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1CZ02JQ 818 0 0
G
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AATGTCGTCGCTTTTAACAAAGTTGATCGCAACACCCTTACGCCCAAAACGACCAGACCG
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GCCTGACCGAAACTGATTCATGATCTCGTCTCTTTCCTTCTGAGGCATGTCACCGTGCAT
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ATCAAATTTCCACTCCTCTTTCTCAACAGCAACGAAAAATTGTTTAATGCCTTCAAGAGT
CAACTCATCACGCTTCACAAGTATCTTCACCGGTTCC

QA 2 818 2 818
DS 

RD RS1CP18TF 702 0 0
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GAACAAAACTTTCTCATTCAGACACGGTCATTTAGATAAGATCAGCTACATTCATTGGCA
TCTCATCAATCTGAGTACTGTAGTACTGCTCAATGTCCCGGAGGATCTTAATGTCGTCGC
TTTTAACAAAGTTGATCGCAACACCCTTACGCCCAAAACGACCAGATCGTCCAATACGAT
GGATGTAAAGCTCACGGTTGTTGGGGAGATCATAATTGATGACAAGAGAAACTTGCTGCA
CATCAATACCACGTGCCCATACATCTGTTGTGATCAAAACACGACTGTCGCCTGACCGAA
ACTGATTCATGATCTCGTCTCTTTCCTTCTGAGGCATGTCACCGTGCATTGATGAGACTG
TGAAGTTGTTAGTCCTCATTTTCTCACTTAGCCAATCCACCTTTCGTTTTGTATTGCAGA
AGATAACAGCTTGAGTGATAGTAAGTGTGTCATAAAGATCACACAGTGTATCAAATTTCC
ACTCCTCTTTCTCAACAGCAACGAAAAATTGTTTAATGCCTTCAAGAGTCAACTCATCAC
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GGGGAAGAGTTGCAGAAACCAAACAAACCTGAAGATCAGGTG

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 4

CO CL3136Contig1 925 4 23 U
GGAAGCTTCGCCGCCGCAGCAGCAGCAGCAGCTAAGATTCGCTCAACCGAAAACCAGGGC
TCCTTAGAGACGACGGAGCTTAGCCTTGCAGGACTCTTCAACGGCATGTCCGGAGCGTGG
ATTCGCCTCTCCAGCAATCACACTCTGCTTCGTCATGATTCCAACGTGACAGAACACATC
CCACTTCTCAATTCTCGAGAAGTAAACCACCAAAACCACCAAGAAGCTGTTCCGAAATGG
CCATGGCTCCTGTACTTAGCCGGAGCAATGGGTTGCCTAATCTGCAGCTCTGTTTCACAC
CTCCTCGCTTGCCACTCAAAACGTTTCAACCTCTTCTTCTGGCGTTTGGACTACGCAGGA
ATCTCGCTGATGATCGTCTCCTCTTTCTTCGCGCCTATCTACTACGCATTCTCCTGCCAC
CCTAACTTCCGTTTCATCTACCTCTCCTCAATATCAATCCTCGGTCTCCTCGCCATCATC
ACTCTCCTCGCTCCAGCTCTCTCAGCGCCGCGTTTCAGACCATTCAGGGCCTATCTTTTC
CTTGCGATGGGATTCTGTAGCGTGGTACCAGCTTCACATGTGCTTTGCCTTTACTGGGGC
CACCCTAACGTGTTATTCGCTCTAGCTTGCGAGCTTGCCACTGGTCTGTCTTATGCTGTG
GGAGCAGTGTTTTATGTTAGCCGTGTGCCTGAGAGATGGAAGCCTGGAGCGTTTGACATT
GCCGGGCACAGCCATCAGATATTCCATGTGTTTGTTGTTTTGGGAGCTCTTGTTCATTGT
GTTGCCACTCTTGTCATTGTGGATTTTCGACGAGCGTCTCCTTGTGGGGTTTAGAAATAA
ACTACGCTTGTTTGAATCTTCCAATTCGATGTATTCTTGATTGTGATATTTGAAATTGAA
ACTAAGCTTGTAGGTTTTAGGGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BO89TF U 1
AF RS1B974TF U 98
AF RS1BO89JQ C 384
AF RS1B974JQ C 131
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BS 367 443 RS1BO89TF
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BS 720 802 RS1B974TF
BS 803 925 RS1B974JQ

RD RS1BO89TF 719 0 0
GGAAGCTTCGCCGCCGCAGCAGCAGCAGCAGCTAAGATTCGCTCAACCGAAAACCAGGGC
TCCTTAGAGACGACGGAGCTTAGCCTTGCAGGACTCTTCAACGGCATGTCCGGAGCGTGG
ATTCGCCTCTCCAGCAATCACACTCTGCTTCGTCATGATTCCAACGTGACAGAACACATC
CCACTTCTCAACTCTCGAGAAGTAAACCACCAAAACCACCAAGAATCTGTTCCGAAATGG
CCATGGCTTTTGTACTTAGCCGGAGCAATGGGTTGCCTAATCTGCAGCTCTGTTTCACAC
CTCTTCGCTTGCCACTCAAAACGTTTCAACCTCTTCTTCTGGCGTTTGGACTACGCAGGA
ATCTCACTGATGATCGTCTCCTCTTTCTTCGCGCCTATCTACTACGCATTCTCCTGCCAC
CCTAACTTCCGTTTCATCTACCTTTCTTCAATCTCAATCCTCGGTCTCCTCGCTATCATC
ACTCTCCTCGCTCCAGCTCTCTCAGCGCCGCGTTTCAGACCATTCAGGGCCTATCTTTTC
CTTGCGATGGGATTCTGTAGTGTGGTACCAGCTTCACATGTGCTTTGCCTTTACTGGGGC
CACCCTAACGTGTTATTCGCTCTAGCTTGCGAGCTTGCCACTGGTCTGTCTTATGCTGTG
GGAGCAGTGTTTTATGTTAGCCGTGTGCCTGAGAGATGGAAGCCTGGAGCGTTTGACAT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RS1B974TF 705 0 0
G
CAACGGCATGTCCGGAGCGTGGATTCGCCTCTCCAGCAATCACACTCTGCTTCGTCATGA
TTCCAACGTGACAGAACACATCCCACTTCTCAATTCTCGAGAAGTAAACCACCAAAACCA
CCAAGAAGCTGTTCCGAAATGGCCATGGCTCCTGTACTTAGCCGGAGCAATGGGTTGCCT
AATCTGCAGCTCTGTTTCACACCTCCTCGCTTGCCACTCAAAACGTTTCAACCTCTTCTT
CTGGCGTTTGGACTACGCAGGAATCTCGCTGATGATCGTCTCCTCTTTCTTCGCGCCTAT
CTACTACGCATTCTCCTGCCACCCTAACTTCCGTTTCATCTACCTCTCCTCAATATCAAT
CCTCGGTCTCCTCGCCATCATCACTCTCCTCGCTCCAGCTCTCTCAGCGCCGCGTTTCAG
ACCATTCAGGGCCTATCTTTTCCTTGCGATGGGATTCTGTAGCGTGGTACCAGCTTCACA
TGTGCTTTGCCTTTACTGGGGCCACCCTAACGTGTTATTCGCTCTAGCTTGCGAGCTTGC
CACTGGTCTGTCTTATGCTGTGGGAGCAGTGTTTTATGTTAGCCGTGTGCCTGAGAGATG
GAAGCCTGGAGCGTTTGACATTGCCGGGCACAGCCATCAGATATTCCATGTGTTTGTTGT
TTTGGGAGCTCTTGTTCATTGTGTTGCCACTCTTGTCATTGTGG

QA 2 705 2 705
DS 

RD RS1BO89JQ 515 0 0
TTTT
TTCGCGCCTATTTACTACGCATTTTCCTGCCACCCTAACTTCCGTTTCATCTACCTTTCT
TCAATCTCAATCCTCGGTCTCCTCGCTATCATCACTCTCCTCGCTCCAGCTCTTTCAGCG
CCGCGTTTCAGACCATTCAGGGCCTATCTTTTCCTTGCGATGGGATTCTGTAGTGTGGTA
CCAGCTTCACATGTGCTTTGCCTTTACTGGGGCCACCCTAACGTGTTATTCGCTCTAGCT
TGCGAGCTTGCCACTGGTCTGTCTTATGCTGTGGGAGCAGTGTTTTATGTTAGCCGTGTG
CCTGAGAGATGGAAGCCTGGAGCGTTTGACATTGCCGGGCACAGCCATCAGATATTCCAT
GTGTTTGTTGTTTTGGGAGCTCTTGTTCATTGTGTTGCCACTCTTGTCATTGTGGATTTT
CGACGAGCGTCTCCTTGTGGGGTTTAGAAATAAACTACGCTTGTTTGAATCTTTCAATTC
GATGTATTCTTGATTGTGATATTTGAAATTG

QA 5 515 5 515
DS 

RD RS1B974JQ 795 0 0
CCAGCAATCACACTCTGCTTCGTCATGATTCCAACGTGACAGAACACATCCCACTTCTCA
ATTCTCGAGAAGTAAACCACCAAAACCACCAAGAAGCTGTTCCGAAATGGCCATGGCTCC
TGTACTTAGCCGGAGCAATGGGTTGCCTAATCTGCAGCTCTGTTTCACACCTCCTCGCTT
GCCACTCAAAACGTTTCAACCTCTTCTTCTGGCGTTTGGACTACGCAGGAATCTCGCTGA
TGATCGTCTCCTCTTTCTTCGCGCCTATCTACTACGCATTCTCCTGCCACCCTAACTTCC
GTTTCATCTACCTCTCCTCAATATCAATCCTCGGTCTCCTCGCCATCATCACTCTCCTCG
CTCCAGCTCTTTCAGCGCCGCGTTTCAGACCATTCAGGGCCTATCTTTTCCTTGCGATGG
GATTCTGTAGCGTGGTACCAGCTTCACATGTGCTTTGCCTTTACTGGGGCCACCCTAACG
TGTTATTCGCTCTAGCTTGCGAGCTTGCCACTGGTCTGTCTTATGCTGTGGGAGCAGTGT
TTTATGTTAGCCGTGTGCCTGAGAGATGGAAGCCTGGAGCGTTTGACATTGCCGGGCACA
GCCATCAGATATTCCATGTGTTTGTTGTTTTGGGAGCTCTTGTTCATTGTGTTGCCACTC
TTGTCATTGTGGATTTTCGACGAGCGTCTCCTTGTGGGGTTTAGAAATAAACTACGCTTG
TTTGAATCTTCCAATTCGATGTATTCTTGATTGTGATATTTGAAATTGAAACTAAGCTTG
TAGGTTTTAGGGACC

QA 1 795 1 795
DS 



AS 1 3

CO CL3137Contig1 802 3 4 U
GATTAAACCAAGCGGGCTGATTCAGCCCCC*ACATCCTCTCTCTTTTTAATAAGTCTTAA
CATGAACAATTCTTTATCAAACCCCACGTTTACATTTTTTTTT*ACATGAAAATGTTT**
CTTTTATACCAACATCATCCTTAGATTGCATTATGAATTTTGAAGTTAGCAGGGAGAAAT
TGAATATAGTGGTCTCTTCTTCTTCTTCTTTCTTCACAAGCACACACACACACACTAGTT
TTTGTTCTGAGAAGGATCTTCTTTTTAGTTCTTAGACAGACTCAACTCCTTCGCCTTGTT
GCTGTGCAAGATATCTCTCTCGTCGCTCCTTCCATTCATCGATCACAAGTCCTTCTCCAA
TCATCTTTGGACCTGTTTCCTCTGGTGGTTTCTTTCTCGTCTCCACTGCTGCATCCGCTT
CGGCTAACTGACGCTTCAGTTTCTCCAGTGCAGGGTTCGGACGTTCTGGATCCAAGAAGA
TAACACGCAATATTTGCTCCTTGGACACATCATCTTTTTGCTCATCAAACAGCTCAGGCA
CATAGTCCATTGGACCTTTAACCTTCAGGCTCATGATTTTAAACTTAGCCCTGCTCCTCT
GATCCATTGGCTTCTCATTATTCTCAGGAGGCTCAACAAACTTGAAAACAGTGGCGATAA
TAGTCTCTCCAGGAGCAAGAATAGCACCAGGTGGACGCATGAAGCAACTCTTCGGCTCAG
TTGTTTGAAACTTGAACGCTACATGTGATTTGCTGGTGTTTTTAATCTTAATAGCGCTTC
TCACTTGCTTCCAGGCTCATAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DD50JQ U 1
AF RS1DD50TF C 12
AF RS1GU89JQ U 5
BS 1 103 RS1DD50JQ
BS 104 104 RS1GU89JQ
BS 105 693 RS1DD50JQ
BS 694 802 RS1GU89JQ

RD RS1DD50JQ 694 0 0
GATTAAACCAAGCGGGCTGATTCAGCCCCC*ACATCCTCTCTCTTTTTAATAAGTCTTAA
CATGAACAATTCTTTATCAAACCCCACGTTTACATTTTTTTTTTACATGAAAATGTTT**
CTTTTATACCAACATCATCCTTAGATTGCATTATGAATTTTGAAGTTAGCAGGGAGAAAT
TGAATATAGTGGTCTCTTCTTCTTCTTCTTTCTTCACAAGCACACACACACACACTAGTT
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GATCCATTGGCTTCTCATTATTCTCAGGAGGCTCAACAAACTTGAAAACAGTGGCGATAA
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C

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DS 

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G
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C

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QA 9 798 9 798
DS 



AS 1 4

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GTCCCATTGAAAGGCATTGAAGATGTTCAAGAGAAATTCAAGGAGCTCTGCCTTGGAAGC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ET28TF U 1
AF RS1A128TV U 522
AF RS1A128TF U 745
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AACAACCCTTATTGATGA
ATCAACCAAAA

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DS 

RD RS1A128TF 281 0 0
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TCAACC

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DS 

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CGAGATTTGGTCAAGAAGCTGGG*CTAATTTGTACCC*AGAGGATGACCCTTCTAGAAAG
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TCAATGGTGATATATTCTCCGTTTTTGCTTGATCTCTGAGAAACCCAACAGGGATGAGGA
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TGAATCAACCAAAAAAAAACATCAGTTTCATTGCAATAAAAAAATTCGCTCAGGTGGCTT
GTTCTTTT

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DS 



AS 1 2

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AGTCCGATGATTAAGAAGAAAATATGAAAAAAATAATGATGTGGGAGTGGGACATTTGCT
GTGTTTCTTTGATGGTTTTCTCTTTTTATCTTTATGATGTTCTTGTAAGATTTGTGTCTT
TCGTTGATTTGCATTTGCATCTTTATATTCTGTAATAATTTCATTATCTCTTTTATAAAG
TTTGTGTTGTGTTTCTAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CP21TF U 1
AF RS1CP21JQ C 326
BS 1 788 RS1CP21TF
BS 789 789 RS1CP21JQ
BS 790 805 RS1CP21TF
BS 806 1100 RS1CP21JQ

RD RS1CP21TF 813 0 0
GGACAATACTCATCACAGCTCTACATAATCAATCACCTTTAAAGCTCTCATATTTTTCTG
TTTATCACATCTCGTTTTAACTGTTCAGGCGACAACTATCACTATGGCGGAAGAGTACAA
GAACGCTTCGGAGGAGTTCAAGAACGAGACCCCAAAGGTTGCCACCACCGGGGAATCATC
TGCGACGACGACGACGACGGGAGAGGTTAAGGATCGTGGATTGTTTGACTTCCTCAAGAA
AAAAGAGGAAGTGAAGCCTCAAGAAACGTCGACGACGCTGGAGTCAGAGTTCGAGCACAA
GGCTCAGGTCTCGGAACCGCCGGCGTTTGTGGCGAAGCACGAAGAAGAGGAAGAGAAGGA
GCATAAGCCTACTCTCCTCGAGAAGCTCCACCAGAAGCACGAGGAAGAAGAAGAAGAGAA
CAAACCTAGTCTCCTCCAAAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGA
GGAAGAAGGTGAAGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGAAGAAGAAGATGGCCGAAGA
AGATGAAAAAATAAAGGAAGATAGAAAGGATGTAATGGAGCAGATCAGGGGAGAAGTTTC
CACACGGAACAAAGACAGAGGAGGATGCTCCAGTCATCGCCACCCTGCCGGTGAAGGAGG
AAACGGTAGAGCATCCGGAGGAGAAGAAAGGACTGATGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTC
CAGGTCACAGCGAGAAACCAGAGGATTCTCAAGTGGTCGACACGGGGGCTGCGGTACCAG
TGACTGAG*AAACGGCTGAGCATCC
CGGAGAGA

QA 1 805 1 805
DS 

RD RS1CP21JQ 775 0 0
TTTGTGGCGAAGCACGAAGAAGAGGAAGAGAAGGAGCATAAGCCTACTCTCCTCGAGAAG
CTCCACCAGAAGCACGAGGAAGAAGAAGAAGAGAACAAACCTAGTCTCCTCCAAAAGCTT
CACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTTCAAGCGAGGAAGAAGGTGAAGACGGTGAGAAG
AGGAAGAAGGAAAAGAAGAAGAAGATGGCCGAAGAAGATGAAAAAATAAAGGAAGATAGA
AAGGATGTAATGGAGCAGATCAGGG*AGAAGTTTCCACACGGAACAAAGACAGAGGAGGA
TGCTCCAGTCATCGCCACCCTGCCGGTGAAGGAGGAAACGGTAGAGCATCCGGAGGAGAA
GAAAGGACTGATGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTCACAGCGAGAAACCAGAGGA
TTCTCAAGTGGTCGACACGGGGGCTGCGGTACCAGTGACTGAGGAAACGGCTGAGCATCC
GGAAGAGAAGAAAGGGTTTCTTGAGAAGATCAAAGAGAAGCTTCCAGGTTATCACGCCAA
GGGTACTGAAGAGGAGGAGAAGAAGAAAGAAAAGGAGTCCGATGATTAAGAAGAAAATAT
GAAAAAAATAATGATGTGGGAGTGGGACATTTGCTGTGTTTCTTTGATGGTTTTCTCTTT
TTATCTTTATGATGTTCTTGTAAGATTTGTGTCTTTCGTTGATTTGCATTTGCATCTTTA
TATTCTGTAATAATTTCATTATCTCTTTTATAAAGTTTGTGTTGTGTTTCTAAGT

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 3

CO CL3140Contig1 953 3 5 U
GCTCCTCCTCCTGTACAAGGAGTGAGAGGCCAGAGCGCCACCTTATACCCTCCCATGGCT
TCTTCACCCTCGTTTGGATTCCCTCCTGGGAACTTTGCTCCTCCTCCTCAGAACACTATC
AATAGGGGTGGTCCCTCGGGTTCAGAGATGGGTCCAGTTCAGCCAACAGGGTTCCGGATA
TACCAGCACCATCAGCGAGATGACTCTGTACCTTTAGCAGCTCTTAGACAACACCGTGGA
GGAGTTCCTCGGTTTAGAATGATGCCTGATGATGAAGTTGCGATATTGGAGTTTGGAGAC
TTCCTTGGTGGTGGTGGTTCCGGAAATAACCACATTGATCATCATCGTGATATGCGTTTG
GACATCGAGGAAATGTCTTATGAGGAGCTACTTGCGTTGAGCGAGCGAATTGGAACGGTG
AACACTGGTTTGCCAGAGGAAGATGTTAAGAACCATCTGAAAACAAGAACATGTTCTGTA
ATCAACCTTGCAGAAGAGTCCTCCTCGTCCTCTCCGCAAACTAAAGACAGAGAAACTGAA
CCTTGCACGATATGTCAGGAGAGTTTCAAGAACGAAGAGAAGGTTGCGACTTTGGATTGT
GGGCACGAGTATCATGCAGAATGCTTGGAGAAATGGCTGGTTGTGAAGAACGTTTGCCCA
ATCTGTAAAGCAGAGGCCTTGGTCATGGAGAAGACAACTGTTTAATCTATATATTGGGTT
TATATATATATCTTTATATAAAAGAAACTTAACAAGAAGAGGATAAGAAAACGATAGTTT
GGGTTTATTTGCAGCTCAAAAAAGGATTCTGTAAATTTGTACTCTTTTTTGTTTGTTTGT
GCACATATTAATATGTGTTAATGGTGTCACTCTTTTTTTCATTTGGTTTCTTGGCTTATG
TGACACTGAAAAAATGTACAGGCTAATTTGCTTTATCTTAGGGCTTTTTAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AC36TF U 1
AF RS1GA26TF U 294
AF RS1GA26JQ C 509
BS 1 647 RS1AC36TF
BS 648 648 RS1GA26TF
BS 649 723 RS1AC36TF
BS 724 857 RS1GA26TF
BS 858 953 RS1GA26JQ

RD RS1AC36TF 733 0 0
GCTCCTCCTCCTGTACAAGGAGTGAGAGGCCAGAGCGCCACCTTATACCCTCCCATGGCT
TCTTCACCCTCGTTTGGATTCCCTCCTGGGAACTTTGCTCCTCCTCCTCAGAACACTATC
AATAGGGGTGGTCCCTCGGGTTCAGAGATGGGTCCAGTTCAGCCAACAGGGTTCCGGATA
TACCAGCACCATCAGCGAGATGACTCTGTACCTTTAGCAGCTCTTAGACAACACCGTGGA
GGAGTTCCTCGGTTTAGAATGATGCCTGATGATGAAGTTGCGATATTGGAGTTTGGAGAC
TTCCTTGGTGGTGGTGGTTCCGGAAATAACCACATTGATCATCATCGTGATATGCGTTTG
GACATCGAGGAAATGTCTTATGAGGAGCTACTTGCGTTGAGCGAGCGAATTGGAACGGTG
AACACTGGTTTGCCAGAGGAAGATGTTAAGAACCATCTGAAAACAAGAACATGTTCTGTA
ATCAACCTTGCAGAAGAGTCCTCCTCGTCCTCTCCGCAAACTAAAGACAGAGAAACTGAA
CCTTGCACGATATGTCAGGAGAGTTTCAAGAACGAAGAGAAGGTTGCGACTTTGGATTGT
GGGCACGAGTATCATGCAGAATGCTTGGAGAAATGGCTGGTTGTGAATAACGTTTGCCCA
ATCTGTAAAGCAGAGGCCTTGGTCATGGAGAAGACAACTGTTTAATCTATATATTGGGTT
TAT
TTGCAGCTCA

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1GA26TF 564 0 0
G
GGAGACTTCCTTGGTGGTGGTGGTTCTGGAAATAACCACATTGATCATCATCGTGATATG
CGTTTGGACATCGAGGAAATGTCTTATGAGGAGCTACTTGCGTTGAGCGAGCGAATTGGA
ACGGTGAACACTGGTTTGCCAGAGGAAGATGTTAAGAACCATCTGAAAACAAGAACATGT
TCTGTAATCAACCTTGCAGAAGAGTCCTCCTCGTCCTCTCCGCAAACTAAAGACAGAGAA
ACTGAACCTTGCACGATATGTCAGGAGAGTTTCAAGAACGAAGAGAAGGTTGCGACTTTG
GATTGTGGGCACGAGTATCATGCAGAATGCTTGGAGAAATGGCTGGTTGTGAAGAACGTT
TGCCCAATCTGTAAAGCAGAGGCCTTGGTCATGGAGAAGACAACTGTTTAATCTATATAT
TGGGTTTATATATATATCTTTATATAAAAGAAACTTAACAAGAAGAGGATAAGAAAACGA
TAGTTTGGGTTTATTTGCAGCTCAAAAAAGGATTCTGTAAATTTGTACTCTTTTTTGTTT
GTTTGTGCACATATTAATATGTG

QA 2 564 2 564
DS 

RD RS1GA26JQ 445 0 0
CCTCTCCGCAAACTAAAGACAGAGAAACTGAACCTTGCACGATATGTCAGGAGAGTTTCA
AGAACGAAGAGAAGGTTGCGACTTTGGATTGTGGGCACGAGTATCATGCAGAATGCTTGG
AGAAATGGCTGGTTGTGAAGAACGTTTGCCCAATCTGTAAAGCAGAGGCCTTGGTCATGG
AGAAGACAACTGTTTAATCTATATATTGGGTTTATATATATATCTTTATATAAAAGAAAC
TTAACAAGAAGAGGATAAGAAAACGATAGTTTGGGTTTATTTGCAGCTCAAAAAAGGATT
CTGTAAATTTGTACTCTTTTTTGTTTGTTTGTGCACATATTAATATGTGTTAATGGTGTC
ACTCTTTTTTTCATTTGGTTTCTTGGCTTATGTGACACTGAAAAAATGTACAGGCTAATT
TGCTTTATCTTAGGGCTTTTTAACC

QA 1 445 1 445
DS 



AS 2 4

CO CL3141Contig1 755 2 2 U
TCCTCTCAGACCCGAAAGAAGAACAACACCCCTCAAGTGACAAACATGTTGCGTTTCGTC
ATGCTCTCTCTAACTCTAGTTGCTCTCATCAACTCATCAAAAATCCCTAAAGCAGCAGCA
ACTCCACCTTCCAGATACCAAAACTACAAAACGTTCGTAAAAAACGCATGCAACTCAACA
ACATATCCTACAATGTGCTACAACTCATTGTCCTCCTACTCCTCCACCATCAAAGCCGAC
CCAATCAAACTCTGCACAACGTCCCTCAACGTCAACCTCATATACGCCAAAAACGCCACG
TCAGTCGTCTCTAACCTTCTCAAAAAGGCCAAATCCACCTCCAGCCCTGACGTCCCGGTC
CTCAAGGACTGCGCGGAGGAGATGAAGGACACCGTCGACGAGCTCAAGCAAGCAATGGCC
GAGTTGAAGAATCTCAACGGCGGAGGTATCTCAAAGGAGGAGCATCTAAAGAACGTGAAT
ACGTGGGTGAGTGCGGCGTTGACAGACGACAGTACGTGTACGGACGAGCTCGATGAAGGG
GAAGTGAATGAGGAGACGAAGAAGAAGGTGGAGAAGGTTGTTTCCGAACTTTCAAAGACT
ACAAGCAATACTTTGGCCCTTATTACCAATTATCTACGTTTCTAAATTGAACGTTATATT
CAACTTTCATCTCTTTGCATGTGCGCATGTGCACGCTTTCTTTTCCTTTCTATGTCATAT
ATATATTGGCAATCAAATAAATTCCAAAATTTCGC


BQ
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AF RS1EO26TF U 1
AF RS1EO26JQ C 305
BS 1 726 RS1EO26TF
BS 727 755 RS1EO26JQ

RD RS1EO26TF 726 0 0
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ATGCTCTCTCTAACTCTAGTTGCTCTCATCAACTCATCAAAAATCCCTAAAGCAGCAGCA
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TCAGTCGTCTCTAACCTTCTCAAAAAGGCCAAATCCACCTCCAGCCCTGACGTCCCGGTC
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CAACTTTCATCTCTTTGCATGTGCGCATGTGCACGCTTTCTTTTCCTTTCTATGTCATAT
ATATAT

QA 1 726 1 726
DS 

RD RS1EO26JQ 451 0 0
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TGAATGAGGAGACGAAGAAGAAGGTGGAGAAGGTTGTTTCCGAACTTTCAAAGACTACAA
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ATTGGCAATCAAATAAATTCCAAAATTTCGC

QA 1 451 1 451
DS 



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BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1H470JQB C 1
AF RS1H470TF U 1
BS 1 5 RS1H470JQB
BS 6 692 RS1H470TF
BS 693 695 RS1H470JQB

RD RS1H470JQB 695 0 0
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ATACGTGGGTGAGTGCGGCGTTGACGGACGATACTACTTGTACGGACGAGTTTGATGAAG
GGGAAGTGAATGAGGAGACGAAGAAGAAGGTGGAGAAGGCTGTTTCCGAACTTTCAAAGA
CTACAAGCAATACTTTGGCCCTTATTACCAATTATCTACGTTTCTAAATTGAACGTTATA
TTCAACTTCATCTCTTTGCATGTGCATGTGTACGCTTTCGTTTCCTTTCTATGTCATATA
TATATTGGCAATCAAATAAATTCCAAAATTTCCAC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1H470TF 695 0 0
GCATA
CTCTCTCTAACTCTAGTTACCCTCATCAACTCATCAAACATCCCTAAAACAGCAGCAACT
CCACCCACCACATACCAAAACTACGAAACGTTCGTAAAAACCGCATGCAACTCAACAACA
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ATCAAACTCTGCACAACGTCCCTCAGCGTCAACCTCAAATACGCCAAAAACGCCACGTTA
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AAGGACTGCGTGGAGGAGATGAAGGACACCGTCGACGAGCTCAAGCAAGCAATGGCCGAG
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TGGGTGAGTGCGGCGTTGACGGACGATACTACTTGTACGGACGAGTTTGATGAAGGGGAA
GTGAATGAGGAGACGAAGAAGAAGGTGGAGAAGGCTGTTTCCGAACTTTCAAAGACTACA
AGCAATACTTTGGCCCTTATTACCAATTATCTACGTTTCTAAATTGAACGTTATATTCAA
CTTCATCTCTTTGCATGTGCATGTGTACGCTTTCGTTTCCTTTCTATGTCATATATATAT
TGGCAATCAAATAAATTCCAAAATTTC
CAC

QA 6 692 6 692
DS 



AS 1 4

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ATTACGTTAATGGAACCGCCAAAACTCTCACCAGAACAAATATCTAAAGATACCGAAGAA
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AAGGAGTCTTGATCTAACTCTTTTGCAAGAATAATCATGCTTGCCATTGGAGCAAAATGA
AGAAGAAATAAAAGAGCAAATCCACAAGCATGAACAAGAAAATGAAGAAGTCAAATCTGA
TGAAGTTACACAAGTTTCATCTGGATCACCTGAAGGTGAGACCGTTGTTGAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FG06TF U 1
AF RS1CV40TF U 83
AF RS1CV40JQ C 95
AF RS1FG06JQ C 413
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GGAA
CAA

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DS 

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CTA
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A*CTGGAGAACCGAGTCTTGACCTGAAGGAGCAAGAAGAGACGGTGAAGACTGTCACATC
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TTGAAGAAAAATCCC

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DS 

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CAAAAAGAAAGGAGTCTTGATCTAACTCTTTTGCAAGAATAATCATGCTTGCCATTGGAG
CAAAATGAAGAAGAAATAAAAGAGCAAATCCACAAGCATGAACAAGAAAATGAAGAAGTC
AAATCTGATGAAGTTACACAAGTTTCATCTGGATCACCTGAAGGTGAGACCGTTGTTGAA
TCC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 4

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AGAAAACCCCTTCTTTCTTTCTTTCTCTTCCGCCATTGAAATGGCTCTTAAAGCTCCACC
AGTCGCCGGATTATTCCCTCCTCTCCGCCCCACTGCTTCCACTTCTAATCGCCCCTGTAG
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TGATTTGACCAAGATGCGTCAAGCCACTGCACAGGTTTTAGCTTCACAAAAGCAGCTGGA
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TCTTGCAAAAGGAGACGAGGATCCTGCACGTGAAGCCCTTAAACGAAGAAAGTCTTTT*G
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TTTTGTTTCTTGAAGAAAAATAACACCAAAAGCATGTGTTTAAATAAGTAAATATCCAGC
TACCTAATCTTCATTTATGACTTGGTTAAATTTGGTATTTTCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AH14TF U 48
AF RS1CO25TF U 1
AF RS1FV45TF U 366
AF RS1AH14JQ C 356
BS 1 563 RS1CO25TF
BS 564 564 RS1AH14TF
BS 565 788 RS1CO25TF
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BS 869 1069 RS1FV45TF
BS 1070 1070 RS1AH14JQ
BS 1071 1088 RS1FV45TF
BS 1089 1089 RS1AH14JQ
BS 1090 1107 RS1FV45TF
BS 1108 1108 RS1AH14JQ
BS 1109 1112 RS1FV45TF
BS 1113 1113 RS1AH14JQ
BS 1114 1129 RS1FV45TF
BS 1130 1130 RS1AH14JQ
BS 1131 1143 RS1FV45TF
BS 1144 1243 RS1AH14JQ

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TTAAAGCTTCACCAGTCGCCGGATTATTCCCTCCTCTCCGCCCCACTGCTTCCACTTCTA
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ACTCCGGTGGAGCTTTGAGAGTGAACGAGCTGAGACTAGCTTGTGCAAATAGGTTGAAGT
GCAATGCTCATGGTCCTACCATGAATCTTTTTGAAAGATTTTCTAGGGTTGTCAAGTCAT
ATGCCAATGCACTTATAAGCTCCTTTGAAGACCCTGAGAAGATCCTCGAGCAAACTGTTA
TTGAAATGAATTCTGATTTGACCAAGATGCGTCAAGCCACTGCACAGGTTTTAGCTTCAC
AAAAGCAGCTGGAGAACAAATATAAAGCTTCAAAGCAATCTTCTGATGATTGGTACAAAA
GAGCACAACTTGCTCTTGCAAAAGGAGACGAGGATCCTGCACGTGAAGCCCTTAAACGAA
GAAAGTCTTTT*GCTGACAACGCCGCTGCCCTGAAAACTCAACTAGATCAGC

QA 1 592 1 592
DS 

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AGAAAACCCCTTCTTTCTTTCTTTCTCTTCCGCCATTGAAATGGCTCTTAAAGCTCCACC
AGTCGCCGGATTATTCCCTCCTCTCCGCCCCACTGCTTCCACTTCTAATCGCCCCTGTAG
TACCCTCAGGCTCAGGCCACTTCCCCTCCGAACATCCTTCTTCGGAAACTCCGGTGGAGC
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TCCTACCATGAATCTTTTTGAAAGATTTTCTAGGGTTGTCAAGTCATATGCCAATGCACT
TATAAGCTCCTTTGAAGACCCTGAGAAGATCCTCGAGCAAACTGTTATTGAAATGAATTC
TGATTTGACCAAGATGCGTCAAGCCACTGCACAGGTTTTAGCTTCACAAAAGCAGCTGGA
GAACAAATATAAAGCTTCAAAGCAATCTTCTGATGATTGGTACAAAAGAGCACAACTTGC
TCTTGCAAAAGGAGACGAGGATCTTGCACGTGAAGCCCTTAAACGAAGAAAGTCTTTT*G
CTGACAACGCCGCTGCCCTGAAAACTCAACTAGATCAGCAAAAAGGTGTTGTCGACAATC
TTGTCTCGAATACGAGGTTATTGGAGAGCAAGATACAAGAGGCAAAAGCAAAGAAAGATA
CGCTCCTTGCACGTGCTCGCACTGCTAAGACTGCAACCAAAGTTCAAGAGATGATAGGGA
CAGTGAAT

QA 1 788 1 788
DS 

RD RS1FV45TF 783 0 0
GCTC
CTTTGAAGACCCTGAGAAGATCCTCGAGCAAACTGTTATTGAAATGAATTCTGATTTGAC
CAAGATGCGTCAAGCCACTGCACAGGTTTTAGCTTCACAAAAGCAGCTGGAGAACAAATA
TAAAGCTTCAAAGCAATCTTCTGATGATTGGTACAAAAGAGCACAACTTGCTCTTGCAAA
AGGAGACGAGGATCTTGCACGTGAAGCCCTCAAACGAAGAAAGTCTTTT*GCTGACAACG
CCGCTGCCCTGAAAACTCAACTAGATCAGCAAAAAGGTGTTGTCGACAATCTTGTCTCGA
ATACGAGGTTATTGGAGAGCAAGATACAAGAGGCAAAAGCAAAGAAAGATACGCTCCTTG
CACGTGCTCGCACTGCTAAGACTGCAACCAAAGTTCAAGAGATGATAGGGACAGTGAATA
CAAGCGGTGCTCTCTCAGCCTTTGAGAAAATGGAGGAGAAAGTGATGGCTATGGAGTCTG
AAGCAGATGCACTTACTC*GATTGGAACGGATGAACTCGAGGGAAAGTTTCAAATGCTTG
AAACTTCATCTGTGGATGATGATCTTGCAAAGTTGAAGAATGAGTTGTCCGGAAGCTCAA
AGAAAGGAGAGCTTCCTCCAGGGAGAAGCACGGTCGCAGCAAACACAGGATACCCATTCA
AGGACTCGGAGATCGAGAACGAGTTAAACGAATTACGAAG*AAAGCTAACGAGTTTTAG*
CAACTGCTGTTTCTGAGT*GTGT*ACTGGTTAACTTCTTT*ATGTAACTATTTT
GTTTC

QA 5 778 5 778
DS 

RD RS1AH14JQ 888 0 0
GCACTTATAAGCTC*TTTGAAGACC*TGAGAAGATCCTCGAGCAAACTGTTATTGAAATG
AATTCTGATTTGACCAAGATGCGTCAAGCCACTGCACAGGTTTTAGCTTCACAAAAGCAG
CTGGAGAACAAATATAAAGCTTCAAAGCAATCTTCTGATGATTGGTACAAAAGAGCACAA
CTTGCTCTTGCAAAAGGAGACGAGGATCCTGCACGTGAAGCCCTTAAACGAAGAAAGTCT
TTTTGCTGACAACGCCGCTGCCCTGAAAACTCAACTAGATCAGCAAAAAGGTGTTGTCGA
CAATCTTGTCTCGAATACTAGGTTATTGGAGAGCAAGATACAAGAGGCAAAAGCAAAGAA
AGATACGCTCCTTGCACGTGCTCGCACTGCTAAGACTGCAACCAAAGTTCAAGAGATGAT
AGGGACAGTGAATACAAGCGGTGCTCTCTCAGCCTTTGAGAAAATGGAGGAGAAAGTGAT
GGCTATGGAGTCTGAAGCAGATGCACTTACTCAGATTGGAACGGATGAACTCGAGGGAAA
GTTTCAAATGCTTGAAACTTCATCTGTGGATGATGATCTTGCAAAGTTGAAGAATGAGTT
GTCCGGAAGCTCAAAGAAAGGAGAGCTTCCTCCAGGGAGAAGCACGGTCGCAGCAAACAC
AGGATACCCATTCAAGGACTCGGAGATCGAGAACGAGTTAAACGAATTACGAAGGAAAGC
TAACGAGTTTTAGGCAACTGCTGTTTCTGAGTTGTGTTACTGGTTAACTTCTTTTATGTA
ACTATTTTTGTTTCTTGAAGAAAAATAACACCAAAAGCATGTGTTTAAATAAGTAAATAT
CCAGCTACCTAATCTTCATTTATGACTTGGTTAAATTTGGTATTTTCC

QA 1 888 1 888
DS 



AS 1 3

CO CL3144Contig1 1043 3 6 U
GCTCGGGACTGGACCTGATACCCTCAAGGAAATCGCCGAGGGACGTCACCCGTTCTGCTC
TGCTCTCAAGAACGCCAAGAACCCTGCAATCATTGTTGGCGCCGGTCTCTTCAACAGAAC
AGACAAAGATGCTATCCTCTCTGCTGTTGAGTCCATTGCACAAGCCAACAATGTCGTCAG
ACCAGACTGGAACGGTCTTAACTATCTCCTCCTGTACGCTGCTCAAGCAGCTGCTCTTGA
TCTTGGTCTCATTCAACATCTGCTAAAGCCCTTGAGTCTGCGAAATTTGTCTACTTGATG
GGAGCAGACGATGTAGATGTTGACAAGATTCCTAAAGACGCCTTTGTGGTTTACCAAGGT
CACCATGGAGACAAAGCAGTTTACCGTGCAAATGTAATCCTCCCTGCGTCGGCCTTCACC
GAGAAAGAGGGAACCTATGAAAACACAGAAGGATTCACCCAACAGACTGTTCCCGCTGTC
CCAACGGTTGGTGATGCAAGAGATGACTGGAAGATTGTGAGAGCTTTGTCCGAGGTCTCT
GGTGTGAATCTTCCATACAACTCCATCGAAAGTGTTAGGTCCAGGATCAAGAGCGTCGCA
CCGAATCTAGTCCACACAGATGAACGAGAGCCAGCTGCTTTTGGGCCTTCATTGAAGCCT
GAGTGCAAGGAGACAATGAGCACAACGCCGTTCAAACCAGTGGTCGAGAACTTTTACATG
ACAAACGCCATCACGAGAGCATCAAAGATCATGGCTCAGTGCAGTGCCGTTCTCTTGAAG
AAGTGAGAGCTTTTCTCTGTTTCACTTTTTTTGTTTGTTTGCAAAAAATAAAGGCTCTCT
TTATTTAAGCCGAGTACTCTTTAATCTTGCGGTGAAACCTATAAACAAAATGGCAATAAC
CACATTGTTAGATGCAAAACTTTGCTGTATTAAATTGGATGTTTTGATTTGTTGCATCTT
GTGTTTGTTCTTTGTAGGGATTTGAATATTCATGTGTACTTTCTCTTTAATGTCATATCA
TATATGAAGAACGTTTTGGGCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1ET27TF U 1
AF RS1GZ45TF U 363
AF RS1GZ45JQ C 611
BS 1 588 RS1ET27TF
BS 589 589 RS1GZ45TF
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BS 730 763 RS1ET27TF
BS 764 1043 RS1GZ45TF

RD RS1ET27TF 763 0 0
GCTCGGGACTGGACCTGATACCCTCAAGGAAATCGCCGAGGGACGTCACCCGTTCTGCTC
TGCTCTCAAGAACGCCAAGAACCCTGCAATCATTGTTGGCGCCGGTCTCTTCAACAGAAC
AGACAAAGATGCTATCCTCTCTGCTGTTGAGTCCATTGCACAAGCCAACAATGTCGTCAG
ACCAGACTGGAACGGTCTTAACTATCTCCTCCTGTACGCTGCTCAAGCAGCTGCTCTTGA
TCTTGGTCTCATTCAACATCTGCTAAAGCCCTTGAGTCTGCGAAATTTGTCTACTTGATG
GGAGCAGACGATGTAGATGTTGACAAGATTCCTAAAGACGCCTTTGTGGTTTACCAAGGT
CACCATGGAGACAAAGCAGTTTACCGTGCAAATGTAATCCTCCCTGCGTCGGCCTTCACC
GAGAAAGAGGGAACCTATGAAAACACAGAAGGATTCACCCAACAGACTGTTCCCGCTGTC
CCAACGGTTGGTGATGCAAGAGATGACTGGAAGATTGTGAGAGCTTTGTCCGAGGTCTCT
GGTGTGAATCTTCCATACAACTCCATCGAAAGTGTTAGGTCCAGGATCGAGAGCGTCGCA
CCGAATCTAGTCCACACAGATGAACGAGAGCCAGCTGCTTTTGGGCCTTCATTGAAGCCT
GAGTGCAAGGAGACAATGAGCACAACGCCGTTCAAACCAGTGGTCGAGAACTTTTACATG
ACAAACGC*ATCACGAGAGCATCAAAGATCATGGCTCAGTGCA

QA 1 763 1 763
DS 

RD RS1GZ45TF 681 0 0
G
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AAAGAGGGAACCTATGAAAACACAGAAGGATTCACCCAACAGACTGTTCCCGCTGTCCCA
ACGGTTGGTGATGCAAGAGATGACTGGAAGATTGTGAGAGCTTTGTCCGAGGTCTCTGGT
GTGAATCTTCCATACAACTCCATCGAAGGTGTTAGGTCCAGGATCAAGAGCGTCGCACCG
AATCTAGTCCACACAGATGAACGAGAGCCAGCTGCTTTTGGGCCTTCATTGAAGCCTGAG
TGCAAGGAGACAATGAGCACAACGCCGTTCAAACCAGTGGTCGAGAACTTTTACATGACA
AACGCCATCACGAGAGCATCAAAGATCATGGCTCAGTGCAGTGCCGTTCTCTTGAAGAAG
TGAGAGCTTTTCTCTGTTTCACTTTTTTTGTTTGTTTGCAAAAAATAAAGGCTCTCTTTA
TTTAAGCCGAGTACTCTTTAATCTTGCGGTGAAACCTATAAACAAAATGGCAATAACCAC
ATTGTTAGATGCAAAACTTTGCTGTATTAAATTGGATGTTTTGATTTGTTGCATCTTGTG
TTTGTTCTTTGTAGGGATTTGAATATTCATGTGTACTTTCTCTTTAATGTCATATCATAT
ATGAAGAACGTTTTGGGCAA

QA 2 681 2 681
DS 

RD RS1GZ45JQ 431 0 0
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AGACAATGAGCACAACGCCGTTCAAACCAGTGGTCGAGAATTTTTACATGACAAACGCCA
TCACGAGAGCATCAAAGATCATGGCTCAGTGCAGTGCCGTTTTCTTGAAGAAGTGAGAGC
TTTTTTCTGTTTCACTTTTTTTGTTTGTTTGCAAAAAATAAAGGCTCTCTTTATTTAAGC
CGAGTACTCTTTAATCTTGCGGTGAAACCTATAAACAAAATGGCAATAACCACATTGTTA
GATGCAAAACTTTGCTGTATTAAATTGGATGTTTTGATTTGTTGCATCTTGTGTTTGTTC
TTTGTAGGGATTTGAATATTCATGTGTACTTTCTCTTTAATGTCATATCATATATGAAGA
ACGTTTTGGGC

QA 1 431 1 431
DS 



AS 1 2

CO CL3145Contig1 704 2 2 U
GGACAACAATACAGAAAGACAACGAATCCAGAAGTCTACTTCTCTTGTAATAACTAAGAA
TCGAAAATGTCGATGATTCCGAGCTTCTTCGGCAACAACAGGCGTGGGGGTAACAACTTC
TTCGACCCCTTCTCTCTCGACGTTTGGGACCCGCTCAAGGACTTTCCATCTTCTTCCTTC
TCTCGGGAGAACTCTGCGATCGCGAACGCGCGCGTGGACTGGAGGGAGACTCCCGAGGCG
CACGTGTTCAAGGCGGATTTGCCCGGGCTGAAGAAGGAGGAAGTGAAGGTGGAAATTGAG
GATGACAGTGTGCTGAAGATCAGTGGGGAGAGACACGTGGAGAAGGAGGATAAGAACGAC
GTGGCACAGTGTGGAGAGGTCGAGTGGACAGTTCACGAGGAAGTTTAGGCTTCCGGAGAA
TGCGAAGATGGATCAGGTGAAGGCGGCGATGGAGAACGGAGTTTTGACTGTGACTGTGCC
GAAGGCTGAGGTGAAGAAACTTGATGTCAAATTTATTCAGATCTCTGGTTGAGCATCTGA
CTCAGCGAACTTCGTATCAATGTGTTCATCTTTGTGCGTTTTGGGGTCTTGTCACAGTTG
TGGTCTTAGTGAGTGTCTGTTTGTGTCTTTATGTAACGGTTGTGAAATGGCTATGATGTG
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BQ
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TTT


BQ
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20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 

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G
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C

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AAGATGCAGCCAGGTTGCTTCTGGAAACAAAGTTCCGAAGATTACCAGTCGTGGATTCAG
ATGGAAAACTGATTGGGATCCTTACAAGGGGGAACGTAGTAAGGGCTGCACTGCAGATCA
AGCGTGAAACAGAGAACTGTGAAACTTAGCTAGATAATCCCTTTCAATCTGCCATAGTTA
AATAGCAAATCTGTTCATTCCATTCATGGAAGTATATATAATGTAAACCCAAACTGGGAA
TTCAAGACGTTATTGTGTAGGGCAAAGTCTATTCTCTATTCTCTAATCTTATTGGCACCA
CCAAACACAAACGAGCAAACAGAACTTGATCTACTGTTT

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 4

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CACTGGTCAAATCTCTGTTCCTCATTGAAAGGCATAACAAGTTAAAGCTAGCACTCACGG
GTCTCTCTACTTGTTTTGTTTTTTTTCAAAACAAAACAAACACTCCGACACAAATCAAAA
CCCGACAAATCCACATTTCATGTGCTCTGCCCCTAACAAAAAGGTCCACAACCAAACCAA
CCAATCTTGTCTTTTACCACCTCTATAGCTGTATACCTTTTTTACTTCGCTTTCCCATAT
CCTTTTTAACCTCTTAAGGTCTCTCAGAAACAGAGAGAAAGAGACACTTTCACAGAAAGA
AAACCATGGGCGTCTCTCTGTTCGTCGCCTTCACCCTTCTCTCACTCTGTTTGCACACTT
CAACATCCGAGCTTCTACGGTTTCAGCTCTCCACCATATCAGCTGCACCTTCGCTTTTGC
CCGAAGCGCCTTCTAGTTTCTCAGCTTCACCTCCTCCGGAGGCTATGTCTCCGGATATAT
CTCCTCTGTTCCCTACTCCAGGTTCGAGCGAAATGTCTCCTTCTCCGTCAGAATCTTCTG
AGATGCCGACAATCCCATCAAGCCTTAGTCCACCAAACCCAGATGCTGTGGCTCGTGATC
CCCTGCTAGACACTTCTCCGGTGGGGTCTCCTCTGCCTGCATCTTCCTCTGTTTCTTTGG
TCTGGTCACAACCCTCTCTGCTTCTTGTGTTCCCCATACTGCTGCAGCTACTACCTTTCT
GAATATTCTCTAGTTAATCACTAAAAACAGAGGTTGACAATGTATTTTCCTTGTAGTTTG
ATATTATATACCTTTTTCTATTAATTGTTGGTATGAATGAAAATTGCTCATGAAGTACTC
TCCTGCCATTTGGCTGGCTAGTGCAGTTGTTACTACTTGTAACTTGTGTTATGGGTTTTG
TGCCTCAAATTGATTGATCCAAATTATAAGTAATACTGTAAGAGTGTATCTCACATGTGG
CTATCTGAAACTGTGGCTTGCTTTGTTGTGATTGAACAAATAAGAGATGCATTAAGTGGG
GTAGAGGATAATTACGCTAATCCAGGTTACAAATACAGCACGAAACAAAAGATGTTTCAA
TCTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

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AF RS1BC03JQ C 399
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QA 1 590 1 590
DS 

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GGGCGTCTCTCTGTTCGTCGCCTTCACCCTTCTCTCACTCTGTTTGCACACTTCAACATC
CGAGCTTCTACGGTTTCAGCTCTCCACCATATCAGCTGCACCTTCGCTTTTGCCCGAAGC
GCCTTCTAGTTTCTCAGCTTCACCTCCTCCGGAGGCTATGTCTCCGGATATATCTCCTCT
GTTCCCTACTCCAGGTTCGAGCGAAATGTCTCCTTCTCCGTCAGAATCTTCTGAGATGCC
GACAATCCCATCAAGCCTTAGTCCACCAAACCCAGATGCTGTGGCTCGTGATCCCCTGCT
AGACACTTCTCCGGTGGGGTCTCCTCTGCCTGCATCTTCCTCTGTTTCTTTGGTCTGGTC
ACAACCCTCTCTGCTTCTTGTGTTCCCCATACTGCTGCAGCTACTACCTTTCTGAATATT
CTCTAGTTAATCACTAAAAACAGAGGTTGACAATGTATTTTCCTTGTAGTTTGATATTAT
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ATTTGGCTGGCTAGTGCAGTTGTTACTACTTGTAACTTGTGTTATGGGTTTTGTGCCTCA
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AAACTGTGGCTTGCTTTGTTGTGATTGA
CAATAAGAGATG

QA 1 748 1 748
DS 

RD RS1FV21JQ 548 0 0
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AGCGAAATGTCTCCTTCTCCGTCAGAATCTTCTGAGATGCCGACAATCACATCAAGCCTT
AGTCCACCAAACCCAGATGCTGTGGCTCGTGATCCCCTGCTAGACACTTTTCCGGTGGGG
TCTCCTCAGCCTGCATCTTCCTCTGTTTCTTTGGTCTGGTCACAACCCTTTCTGCTTCTT
GTGTTCCCCATACTGCTGCAGCTACTACCTTTCTGAATATTCTCTAGTTAATCACTAAAA
ACAGAGGTTGACAATGTATTTTCCTTGTAGTTTGATATTATATACCTTTTTCTATTAATT
GTTGGTATGAATGAAAATTGCTCATGAAGTACTCTCCTGCCATTTGGCTGGCTAGTGCAG
TTGTTACTACTTGTAACTTGTGTTATGGGTTTTGTGCCTCAAATTGATTGATCCAAATTA
TAAGTAATACTGTAAGAGTGTATCTCACATGTGGCTATCTGAAACTGTGGCTTGCTTTGT
TGTGATTG

QA 1 548 1 548
DS 

RD RS1BC03JQ 748 0 0
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GAGGCTATGTCTCCGGATATATCTCCTCTGTTCCCTACTCCAGGTTCGAGCGAAATGTCT
CCTTCTCCGTCAGAATCTTCTGAGATGCCGACAATCCCATCAAGCCTTAGTCCACCAAAC
CCAGATGCTGTGGCTCGTGATCCCCTGCTAGACACTTCTCCGGTGGGGTCTCCTCTGCCT
GCATCTTCCTCTGTTTCTTTGGTCTGGTCACAACCCTCTCTGCTTCTTGTGTTCCCCATA
CTGCTGCAGCTACTACCTTTCTGAATATTCTCTAGTTAATCACTAAAAACAGAGGTTGAC
AATGTATTTTCCTTGTAGTTTGATATTATATACCTTTTTCTATTAATTGTTGGTATGAAT
GAAAATTGCTCATGAAGTACTCTCCTGCCATTTGGCTGGCTAGTGCAGTTGTTACTACTT
GTAACTTGTGTTATGGGTTTTGTGCCTCAAATTGATTGATCCAAATTATAAGTAATACTG
TAAGAGTGTATCTCACATGTGGCTATCTGAAACTGTGGCTTGCTTTGTTGTGATTGAACA
AATAAGAGATGCATTAAGTGGGGTAGAGGATAATTACGCTAATCCAGGTTACAAATACAG
CACGAAACAAAAGATGTTTCAATCTTAC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 4

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GGACTCCGATCTCAATCTCGCTGTACAGAAAAAAAAACCAAAGAGAGAAATCACGACCCG
GCATCTGACCCGAAAACCCGGAAGACACACGAAAAAACCATGGGCAAGGACGGATTGAGC
GACGACCAGGTCTCCTCAATGAAGGAGGCCTTCATGCTCTTCGACACAGACGGCGACGGA
AAAATCGCGCCGTCGGAGCTCGGGATCCTGATGCGATCCCTCGGCGGGAACCCGACCCAG
GCCCAGCTGAAATCCATCGCCGCATCCGAGAGCCTCACGTCTCCGTTCGATT*CGACAGG
TTCCTCGATCTGATGGCGAAGCACCTGAAGACGGAGCCGTTCGATCGCCAGCTACGAGAT
GCTTTCAAGGTGCTCGACAAGGAGGGGAGTGGATTCGTAGCGGTTGCGGATCTGAGGCAT
ATCTTGACGAGTATTGGTGAGAAGCTGGAGGCTAGTGAGTTTGATGAGTGGATCAAGGAG
GTGGATGTTGGATCCGACGGGAAGATCCGGTATGAGGATTTCATTGCCAGGATGGTTGCT
AAGTGAAAGATCTTTTGAAATGTTACTAACTTTATTATTGTTGTTTCTTGTTTGTTTCGT
TTTGTTATGGAGATGTTGTGTGGTGGTGGTGGTGATTCGTTGAAGTTTTTAATCTCTTAT
GCATTTGTAGTTCGTTGGTTTTTGGATACAATGAATGTAATTGGGTCCAAATATGTGTTG
CTTTTTTTTTTGGCCCCTTTTAATCTCGAAATGTGTCTGATGAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CN37TF U 1
AF RS1GW13TF U 1
AF RS1D585TF U 15
AF RS1D585JQ C 84
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BS 293 293 RS1D585TF
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TTCCTCGATCTGATGGCGAAGCACCTGAAGACGGAGCCGTTCGATCGCCAGCTACGAGAT
GCTTTCAAGGTGCTCGACAAGGAGGGGAGTGGATTCGTGGCGGTTGCGGATCTGAGGCAT
ATCTTGACGAGTATTGGTGAGAAGCTGGAGGCTAGTGAGTTTGATGAGTGGATCAAGGAG
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AAGTGAAAGGTCTTTTGAAATGTTACTAACTTTATTATTGTTGTTTCTTGTTTGTTTCGT
TTTGTTATGGAGATGTTGTGTGGTGGTGGTGGTGATTCGTTGAAGTTTTTAATCTCTTAT
GCATTTGTAGTTCGTTGGTTTTTGGATACAATGAATGTAATTGAG
TCC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RS1GW13TF 705 0 0
GGACTCCGATCTCAATCTCGCTGTACAGAAAAAAAAACCAAACAGAGAAATCACGACCCG
GCATCTGACCCGAAAACCCGGAAGACACACGAAAAAACCATGGGCAAGGACGGATTGAGC
GACGACCAGGTCTCCTCAATGAAGGAGGCCTTCATGCTCTTCGACACAGACGGCGACGGA
AAAATCGCGCCGTCGGAGCTCGGGATCCTGATGCGATCCCTCGGCGGGAACCCGACCCAG
GCCCAGCTGAAATCCATCGCCAACTCCGAGAGCCTCACGTCTCCGTTCGATTTCGAGAGG
TTCCTCGATCTGATGGCGAAGCACCTGAAGACGGAGCCGTTCGATCGCCAGCTCCGAGAT
GCTTTCAAGGTGCTCGACAAGGAGGGGAGTGGATTCGTGGCGGTTGCGGATCTGAGGCAT
ATATTGACGAGTATTGGGGAGAAGCTGGAGGCTAGTGAGTTTGATGAGTGGATCAAGGAG
GTGGATGTTGGATCCGATGGGAAGATCCGGTATGAGGATTTCATTGCGAGGATGGTTGCT
AAGTGAAAGATCTTTTGAAATGTTACTAACTTTATTATTGTTGTTTCTTGTTTGTTTCGT
TTTGTTATGGAGATGTTGTGTGGTG*********ATTCGTTGAAGTTTTTAATCTCTTAT
GCATTTGTAGTTCGTTGGTTTT*GGATACAATGAATGTAATTG
AG

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1D585TF 708 0 0
GGAATCTCGCTGTACAG
AAAAAACCAAAGAGAGAAATCACGACCCGGCATCTGACCCGAAAACCCGGAAGACACACG
AAAAAACCATGGGCAAGGACGGATTGAGCGACGACCAGGTCTCCTCAATGAAGGAGGCCT
TCATGCTCTTCGACACAGACGGCGACGGAAAAATCGCGCCGTCGGAGCTCGGGATCCTGA
TGCGATCCCTCGGCGGGAACCCGACCCAGGCCCAGCTGAAATCCATCGCCGCATCCGAGA
GCCTCACGTCTCCGTTCGATT*CGACAGGTTCCTCGATCTGATGGCGAAGCACCTGAAGA
CGGAGCCGTTCGATCGCCAGCTACGAGATGCTTTCAAGGTGCTCGACAAGGAGGGGAGTG
GATTCGTAGCGGTTGCGGATCTGAGGCATATCTTGACGAGTATTGGTGAGAAGCTGGAGG
CTAGTGAGTTTGATGAGTGGATCAAGGAGGTGGATGTTGGATCCGACGGGAAGATCCGGT
ATGAGGATTTCATTGCCAGGATGGTTGCTAAGTGAAAGATCTTTTGAAATGTTACTAACT
TTATTATTGTTGTTTCTTGTTTGTTTCGTTTTGTTATGGAGATGTTGTGTGGTGGTGGTG
GTGATTCGTTGAAGTTTTTAATCTCTTATGCATTTGTAGTTCGTTGGTTTTTGGATACAA
TGAATGTAATTGGGTCCAAATATGTGTTGCT

QA 18 708 18 708
DS 

RD RS1D585JQ 681 0 0
GACACACGAAAAAACCATGGGCAAGGACGGATTGAGCGACGACCAGGTCTCCTCAATGAA
GGAGGCCTTCATGCTCTTCGACACAGACGGCGACGGAAAAATCGCGCCGTCGGAGCTCGG
GATCCTGATGCGATCCCTCGGCGGGAACCCGACCCAGGCCCAGCTGAAATCCATCGCCGC
ATCCGAGAGCCTCACGTCTCCGTTCGATT*CGACAGGTTCCTCGATCTGATGGCGAAGCA
CCTGAAGACGGAGCCGTTCGATCGCCAGCTACGAGATGCTTTCAAGGTGCTCGACAAGGA
GGGGAGTGGATTCGTAGCGGTTGCGGATCTGAGGCATATCTTGACGAGTATTGGTGAGAA
GCTGGAGGCTAGTGAGTTTGATGAGTGGATCAAGGAGGTGGATGTTGGATCCGACGGGAA
GATCCGGTATGAGGATTTCATTGCCAGGATGGTTGCTAAGTGAAAGATCTTTTGAAATGT
TACTAACTTTATTATTGTTGTTTCTTGTTTGTTTCGTTTTGTTATGGAGATGTTGTGTGG
TGGTGGTGGTGATTCGTTGAAGTTTTTAATCTCTTATGCATTTGTAGTTCGTTGGTTTTT
GGATACAATGAATGTAATTGGGTCCAAATATGTGTTGCTTTTTTTTTTGGCCCCTTTTAA
TCTCGAAATGTGTCTGATGAG

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 4

CO CL3149Contig1 973 4 8 U
GTCCTGAAATTTTGCAAAACCTTACAAAGAACAACATTTTTTTTATTCATTTTATAAAGA
AAATTTACACAAATATAACTCGGAATCCAGAGATGCAGATGAATAAAATTACTCAAAAGT
TATATGTCACATTCTGAAGCGTAAAAAAGAGTAATGTTTTTAATAAGGTCAGTTCATAAA
AGCCGAGCTGGGTGTTTGGTTCTTGTTGCTGCTCAGCCTTCTCCTTCTCATCCACTTGGT
CTCACAAGACGATGGAGAAGCCGCTCCTTCAGATGGTGGGAGCTCGCAAGGAAGCGCCAT
AGCAGTGCTGGTGAAGGCGTTGAGAACAAGGAAAGCCAAAATGGGAGATAAATCTAATCC
TCCAAGAGGCGGTATGACTCCCCGGAATATGTTCAAGTACGGATCACATAAAGTGCTGAG
GGGGTTAACAATGGCAGGAGGAGCAGTGGGGAACCAGGTGAGTACTAGACGGACAACAAG
GATAGTGTTATAGATGTTGAAGAAGTTTATCAACCCGTTAGCAACCACCATTCCTGCAAC
CGAATCTCCAGGAAGAACCGCTGCAAACCCGTGTTCAGACATACCAAACCTAACCCTTGT
AGTGTTGTTCCTCAAACGAATCTCGTCGCAAACACCGCGAAACTCGGATGACAAGCGAAC
CGCTTCCCGAAACAGAGGGTTCTTAGCGGCGAGTGAGTGGACGAAGCCTGCGAATTTCTC
AGTCGCGGAGAGCAGAGAACGATGGAAGTCTTGAATCAACTTGACGGAGTCTGAAGCTGG
TGGTAGAGGTCGCAAACTGGGCTTGTTCGTACGCACGGAAGGTGTTTGCGTAAATGCCGA
GGAGAGCGATACGAAGAAGTTCGGTATCGTTACTCCCGGAGAGGAATTGGAGCTTTTCGT
ATCTGGTTCATTGGCAGCAGTCGCCTCCATTGCTGCAGCTGAGCTCTGAGATTTTTTCGT
ACAAGGTGAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B686JQ U 28
AF RS1GU61JQ U 1
AF RS1GU61TF C 419
AF RS1B686TF C 219
BS 1 143 RS1GU61JQ
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RD RS1B686JQ 657 0 0
G
GAACAACATTTTTTTTATTCATTTTATAAAGAAAATTTACACAAATATAACTCGGAATCC
AGAGATGCAGATGAATAAAATTACTCAAAAGTTATATGTCACATTCTGAAGCGTAAAAAA
GAGTAATGTTTTTAATAAGGTCAGTTCATAAAAGCCGAGCTGGGTGTTTGGTTCTTGTTG
CTGCTCAGCCTTCTCCTTCTCATCCACTTGGTCTCACAAGACGATGGAGAAGCCGCTCCT
TCAGATGGTGGGAGCTCGCAAGGAAGCGCCATAGCAGTGCTGGTGAAGGCGTTGAGAACA
AGGAAAGCCAAAATGGGAGATAAATCTAATCCTCCAAGAGGCGGTATGACTCCCCGGAAT
ATGTTCAAGTACGGATCACATAAAGTGCTGAGGGGGTTAACAATGGCAGGAGGAGCAGTG
GGGAACCAGGTGAGTACTAGACGGACAACAAGGATAGTGTTATAGATGTTGAAGAAGTTT
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CCGTGTTCAGACATACCAAACCTAACCCTTGTAGTGTTGTTCCTCAAACGAATCTCGTCG
CAAACACCGCGAAACTCGGATGACAAGCGAACCGCTTCCCGAAACAGAGGGTTCTT

QA 2 657 2 657
DS 

RD RS1GU61JQ 756 0 0
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AAATTTACACAAATATAACTCGGAATCCAGAGATGCAGATGAATAAAATTACTCAAAAGT
TATATGTCACATTCTGAAGCGTAGAAAAGAGTAATGTTTTTAATAAGGTCAGTTCATAGA
AGCCGAGCTGGGTGTTTGGTTCTTGTTGCTGCTCAGCCTTCTCCTTCTCATCCACTTGGT
CTCACAAGACGATGGAGAAGCCGCTCCTTCAGATGGTGGGAGCTCGCAAGGAAGCGCCAT
AGCAGTGCTGGTGAAGGCGTTGAGAACAAGGAAAGCCAAAATGGGAGATAAATCTAATCC
TCAAAGAGGCGGTATGACTCCCCGGAATATGTTCAAGTACGGATCACATAAAGTGCTGAG
GGGGTTAACAATGGCAGGAGGAGCAGTGGGGAACCAGGTGAGTACTAGACGGACAACAAG
GATAGTGTTATAGATGTTGAAGAAGTTTATCAACCCGTTAGCAACCACCATTCCTGCAAC
CGAATCTCCAGGAAGAACCGCTGCAAACCCGTGTTCAGACATACCAAACCTAACCCTTGT
AGTGTTGTTCCTCAAACGAATCTCGTCGCAAACACCGCGAAACTCGGATGACAAGCGAAC
CGCTTCCCGAAACAGAGGGTTCTTAGCGGCGAGTGAGTGGACGAAGCCTGCGAATTTCTC
AGTCGCGGAGAGCAGAGAACGATGGAAGTCTTGAAT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RS1GU61TF 549 0 0
AGGGGGTTAACAATGGCAGGAGGAGCAGTGGGGAACCAGGTGAGTACTAGACGGACAACA
AGGATAGTGTTATAGATGTTGAAGAAGTTTATCAACCCGTTAGCAACCACCATTCCTGCA
ACCGAATCTCCAGGAAGAACCGCTGCAAACCCGTGTTCAGACATACCAAACCTAACCCTT
GTAGTGTTGTTCCTCAAACGAATCTCGTCGCAAACACCGCGAAACTCGGATGACAAGCGA
ACCGCTTCCCGAAACAGAGGGTTCTTAGCGGCGAGTGAGTGGACGAAGCCTGCGAATTTC
TCAGTCGCGGAGAGCAGAGAACGATGGAAGTCTTGAATCAACTTGACGGAGTCTGAAGCT
GGTGGTAGAGGTCGCAAACTGGGCTTGTTCGTACGCACGGAAGGTGTTTGCGTAAATGCC
GAGGAGAGCGATACGAAGAAGTTCGGTATCGTTACTCCCGGAGAGGAATTGGAGCTTTTC
GTATCTGGTTCATTGGCAGCAGTCGCCTCCATTGCTGCAGCTGAGCTCTGAGATTTTTTC
GT
CCCCCCC

QA 1 542 1 542
DS 

RD RS1B686TF 755 0 0
C
TCTCCTTCTCATCCACTTG*TCTCACAAGACGATGGAGAAGCCGCTCCTTCAGATGGTGG
GAGCTCGCAAGGAAGCGCCATAGCAGTGCTGGTGAAGGCGTTGAGAACAAGGAAAGCCAA
AATGGGAGATAAATCTAATCCTCCAAGAGGCGGTATGACTCCCCGGAATATGTTCAAGTA
CGGATCACATAAAGTGCTGAGGGGGTTAACAATGGCAGGAGGAGCAGTGGGGAACCAGGT
GAGTACTAGACGGACAACAAGGATAGTGTTATAGATGTTGAAGAAGTTTATCAACCCGTT
AGCAACCACCATTCCTGCAACCGAATCTCCAGGAAGAACCGCTGCAAACCCGTGTTCAGA
CATACCAAACCTAACCCTTGTAGTGTTGTTCCTCAAACGAATCTCGTCGCAAACACCGCG
AAACTCGGATGACAAGCGAACCGCTTCCCGAAACAGAGGGTTCTTAGCAGCGAGTGAGTG
GACGAAGCCTGCGAATTTCTCAGTCGCGGAGAGCAGAGAACGATGGAAGTCTTGAATCAA
CTTGACGGAGTCTGAAGCTGGTGGTAGAGGTCGCAAACTGGGCTTGTTCGTACGCACGGA
AGGTGTTTGCGTAAATGCCGAGGAGAGCGATACGAAGAAGTTCGGTATCGTTACTCCCGG
AGAGGAATTGGAGCTTTTCGTATCTGGTTCATTGGCAGCAGTCGCCTCCATTGCTGCAGC
TGAGCTCTGAGATTTTTTCGTACAAGGTGAACCC

QA 2 755 2 755
DS 



AS 1 2

CO CL3150Contig1 806 2 2 U
GCAGCAAAGGTCATCATCGACACTTCCTTCTCGGGATTAGAATACAGTTCAACTACCTGG
GATTTGAAGGAAGCTATGGATGCATCCTTGTCGGTTTCCCTGCTTGGATGTCTCTCTTTG
AATATGCTCAGTGGAGCAATGAAACTCGGGTTTCTAGTTTTGGATCAGTCTCTGGTTGAT
GCCTTCCATACCCTCCCAGGGCTGAGCAAACCACACAGCACTGTGAAGTATGCCGCTAAG
AAAATGTTGGCTCTGAAAGAAGAGAAAGCAAGTGACTTTTTGGATGCCGTTTCTGAAACC
ATAAAGACGTTACAAGGCAGATCCAAGCGCTTGAAAGAGGTACTAGAGAAGTCTGGTTGG
GAGGTTATCGAACCAGCAGGCGGAATCTCAATGGTGCAAAGCCGAAAGCTTATCTCAACA
AAAGTGTAAAGGTGAAAGGAGGAGAGGGACAAGTGGAGCTAAATGATTCAAATATGAGGG
ACGTGTTTCTCAGCCATACAGGTGTTTGCTTGAACAGTGGTTCCTGGACTGGAATACCAG
GTTACTGCCGCTTTGCATTTGCACTGGAGGACAGTGAGTTTGAGAAGGCTATTGAATCGA
TCGCTCAATTTAAAACCGTCCTCCTCGGCAACTGAAACTAAAGACGCATTACTGTGTTTC
TGGTTTTTGCCAGTAAATGTGGGAATGGGACTTCAGTCGCTCGCTCTTCTTTTGCGTTTC
CTTTGTTTCTAATACTTTGCGTTGGTCGGTTTTCCTTTTCGAAAGGTTACTTTTCATGCT
AATAAAAGGATTCGTGGACTTTGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AG04TF U 1
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GCCTTCCATACCCTCCCAGGGCTGAGCAAACCACACAGCACTGTGAAGTATGCCGCTAAG
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TCG

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DS 

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AATGGTGCAAAGCCGAAAGCTTATCTCAACAAAAGTGTAAAGGTGAAAGGAGGAGAGGGA
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TTTTCCTTTTCGAAAGGTTACTTTTCATGCTAATAAAAGGATTCGTGGACTTTGATC

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 4

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AGCCGTTACTGTTATGGAAGGCCATGTCTTGGTCTAATCTGAGATCATGTATTGCTACAC
AAAAACAAAAAAAA*CAAGCTCCTTCCACTAATGAATAAAGACAGGAAACCACTGATATA
AAATATTTGTGTTCGTTACAGTTATTTCTTTGGGAACTTTCTTTGTTGTGGTAAGTAAAT
CAGATCTTGTCTGATTTGATATAACAGAAGACGTTTTTCTAAAAATTTCTGTCACTATTC
AATGAGATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AJ23TF U 1
AF RS1CP73JQ C 339
AF RS1CP73TF U 339
AF RS1AJ23JQ C 313
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TACCATTCTTGACACTAAAGCTACTGCCACCAACAACATCCTCGTTGTGCTTCCATCTTT
GGAATCTGTCACCGAGTTGCAGCCAAGAATGGATGATATATTGAAATGCCCTTGCGATGA
CATCATCGTCACAGCTGCTGGTTCTGCCGGATCAGCTTATGATTTTCACGGTCGTTACTT
TGCTCCTAAACTTGGTGTCGATGAG*ACCCTGTTTGTGGAAGTGCACATTTTGCGTTGGC
ACATTATTGGAGCCTCAAGATGAACAAGTGTGGCTTCTTAGCTCAC*AAGCTTCGCGTAG
A

QA 1 840 1 840
DS 

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GGGATTT
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GGCCTTGAACGGAGCTACCATTCTTGACACTAAAGCTACTGCCACCAACAACATCCTCGT
TGTGCTTCCATCTTTGGAATCTGTCACCGAGTTGCAGCCAAGAATGGATGATATATTGAA
ATGCCCTTGCGATGGCATCATCGTCACAGCTGCTGGTTCTGCCGGATCAGCTTATGATTT
TCACAGTCGTTACTTTGCTCCTAAACTTGGTGTCGATGAGGACCCTGTTTGTGGAAGTGC
ACATTGTGCGTTGGCACATTATTGGAGCCTCAAGATGAACAAGTGTGGCTTCTTAGCTCA
CCAAGCTTCGCGTAGGAGTGGAACACTTGGGATTCATTTAGACAAGGAGAAGCAGAGGGT
TCTCCTGAGAGGCAAAGCCGTTACTGTTATGGAAGGCCATGTCTTGGTCTAATCTGAGAT
CATGTATTGCTACACAAAAACAAAAAAAA*CAAGCTCCTTCCACTAATGAATAAAGACAG
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DS 

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GGTTGATTCAGACAGTGTCGAGTTTGTCACAAGGTCAGGGGTTCTTACAGCCAAGCGAGT
CTCAGAGCTCAATGATGATGGTGAAGTGAAAAGAGGATCCTTTTTGATCGAGCTGAATTT
CCCTGTGGTTCCAACTTGCGATATCGATCTCAGTGATGCTTCCTCCTCCTTGATCGCCAA
GGCCTTGAACGGAGCTACCATTCTTGACACTAAAGCTACTGCCACCAACAACATCCTCGT
TGTGCTTCCATCTTTGGAATCTGTCACCGAGTTGCAGCCAAGAATGGATGATATATTGAA
ATGCCCTTGCGATGGCATCATCGTCACAGCTGCTGGTTCTGCCGGATCAGCTTATGATTT
TCACAGTCGTTACTTTGCTCCTAAACTTGGTGTCGATGAGGACCCTGTTTGTGGAAGTGC
ACATTGTGCGTTGGCACATTATTGGAGCCTCAAGATGAACAAGTGTGGCTTCTTAGCTCA
CCAAGCTTCGCGTAGGAGTGGAACACTTGGGATTCATTTAGACAAGGAGAAGCAGAGGGT
TCTCCTGAGAGGCAAAGCCGTTACTGTTATGGAAGGCCATGTCTTGGTCTAATCTGAGAT
CATGTATTGCTACACAAAAACAAAAAAAAACAAGCTCCTTCCACTAATGAATAAAGACAG
GAAACCACTGATATAAAATATTTGTGTTCGTTAC

QA 8 701 8 701
DS 

RD RS1AJ23JQ 838 0 0
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CACAAGGTCAGGGGTTCTTACAGCCAAGCGAGTCTCAGAGCTCAATGATGATGGTGAAGT
GAAAAGAGGATCCTTTTTGATCGAGCTGAATTTCCCTGTGGTTCCAACTTGCGATATCGA
TCTCAGTGATGCTTCCTCCTCCTTGATCGCCAAGGCCTTGAACGGAGCTACCATTCTTGA
CACTAAAGCTACTGCCACCAACAACATCCTCGTTGTGCTTCCATCTTTGGAATCTGTCAC
CGAGTTGCAGCCAAGAATGGATGATATATTGAAATGCCCTTGGGATGACATCATCGTCAC
AGCTGCTGGTTCTGCCGGATCAGCTTATGATTTCCACGGTCGTTACTTTGCTCCTAAACT
TGGTGTCGATGAGGACCCTGTTTGTGGAAGTGCACATTTTGCGTTGGCACATTATTGGAG
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TGGGATTCATTTAGACAAGGAGAAGCAGAGGGTTCTCCTGAGAGGCAAAGCCGTTACTGT
TATGGAAGGCCATGTCTTGGTTTAATCTGAGATCATGTATTGCTACACAAAAACAAAAAA
AA*CAAGCTCCTTCCACTAATGAATAAAGACAGGAAACCACTGATATAAATTATTTGTGT
TCATTACAGTTATTTCTTTGGGAACTTTCTTTGTTGTGGTAAGTAAATCAGATCTTGTCT
GATTTGATATAACAGAAGACGTTTTTCTAAAAATTTCTGTCACTATTCAATGAGATTC

QA 1 838 1 838
DS 



AS 1 3

CO CL3152Contig1 1296 3 12 U
AGGAAGAAGAAGAAATCCCAACTGCATTAGTAGCGTGGTCTACTGACGTGTTGTGATAAT
CTTATACCAGAAGTTTAGTTTTGTTTGTATGGGCAAATTACATTATAAAAAAACCTTTGC
TTATGAAGCTAAAACATTTTCTTCATAAGAGCTTCTTTATATTTACATCCAACAGAAGAG
TCTTTCTTCACTGTCTTTTCTAGAGAGTTTTCTTCAGTCCCTTCACTATCTTACCAAACC
ACATCAAGTTCATTACACTCAAAGCAATCGGTACTACAAATACCAGCAGATAACCGAACG
TATGCATCTCTACCACCTGATCATAGTGTATGTAGACATGGTAAAACATGTAGATGAACA
GAAGTATTCTTGCCGTCATCCAAGCCAATAAAATAGCAACTCCATTAATAAGATAAGCTT
TAGACCGCTTCAAACCAGCAGTGTCAAGGAACCATCTAAGATTGATAGATGGTGTAGTCA
CTTCAGAGATTAAAACCATGTATGTGTAAAGCTGAGCCTCTTCTGAGAACAGAGAATACG
CTACTGCTACACCAGATAAGCTGTGATGGAAAATATATTCTAATCCCCCCAAAGAAGGGT
AAAGCCAAATGATCATTCCAAGATCAGAAAGAAAGTAACCAACCGATACTCCTAAACCAA
AGTTAGATAGAGGCGAGCTACGAAACACCATAAGGCCTTGAAGACTTGTTTGGTCAGAAA
ACAAATCAGAAAAGAACACAAAGTAGAGTGCCATGAATGATATAAATACCGCATGAACTG
TGGAAATTCCCCTGTTGTTCCATTCAATTCTCTTCATTTTTGTGAGAGCTGAGTATGATT
TGATGTGAACTGAGCTGAATGAATCCGTAAGATCATAGACCATTTTGCAGAGAAAGATTC
CAGAAAGAACAGAAGTATAAGGAAGACATGGATCTGCTAACAGATAGCGCTTAACAAAAC
CCTCTGCCTGATTCTGGTAAGACTTGACGTCCATGATTGTCTTTAGTCCTCGATCTTATG
TGGTGTGAATGGGGTTTAGTTCTTCCTCTCAAACTTAACGTCTTTCAAGATTAACTTTCT
CGAATATATTCGTATGCGCAAGAAGAAGACAAAGAAAGACTCTGTTTCTTGCTTTGTGTT
TTGTTTATCAGAGAAAACCTCAAAGCCGGGACAACCTTAAAACTGTTAAACGAACAAGGA
TAGACCCAGAAGCAGAAGCAATCAACACGTGAACCGCAAAAAGATGCAGAAGAAACGCCA
AGGCGCTGATGAAGAGTAAGAGCAAGGACGTTACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C409JQ U 1
AF RS1GY22JQ U 67
AF RS1C409TF C 592
BS 1 426 RS1C409JQ
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RD RS1C409JQ 771 0 0
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CTTATACCAGAAGTTTAGTTTTGTTTGTATGGGCAAATTACATTATAAAAAAACCTTTGC
TTATGAAGCTAAAACATTTTCTTCATAAGAGCTTCTTTATATTTACATCCAACAGAAGAG
TCTTTCTTCACTGTCTTTTCTAGAGAGTTTTCTTCAGTCCCTTCACTATCTTACCAAACC
ACATCAAGTTCATTACACTCAAAGCAATCGGTACTACAAATACCAGCAGATAACCGAACG
TATGCATCTCTACCACCTGATCATAGTGTATGTAGACATGGTAAAACATGTAGATGAACA
GAAGTATTCTTGCCGTCATCCAAGCCAATAAAATAGCAACTCCATTAATAAGATAAGCTT
TAGACCTCTTCAAACCAGCAGTGTCAAGGTACCATCTAAGATTGATAGATGGTGTAGTCA
CTTCAGAGATTAGAACCATGTATGTGTAAAGCTGAGCCTCTTCTGAGAACAGAGAATACG
CTACTGCTACACCAGATAAGCTGTGATGGAAAATATATTCTAATCCTCCTAAAGAAGGGT
AAAGCCAAATGATCATTCCAAGATCAGAAAGAAAGTAACCAACCGATACTCCTAAACCAA
AGTTAGATAGAGGCGAGCTACGAAACACCATAAGGCCTTGAAGACTTGTTTGGTCAGAAA
ACAAATCAGAAAAGAACACAAAGTAGAGTGCCATGAATGATATAAATACCG

QA 1 771 1 771
DS 

RD RS1GY22JQ 689 0 0
CCAGAAGTTTAGTTTTGTTTGTATGGGCAAATTACATTATAAAAAAACCTTTGCTTATGA
AGCTAAAACATTTTCTTCATAAGAGCTTCTTTATATTTACATCCAACAGAAGAGTCTTTC
TTCACTGTCTTTTCTCGATAGTTTTCTTCAGTCCCTTCACTATCTTACCAAACCACATCA
AGTTCATTACACTCAAAGCAATCGGTACTACAAATACCAGCAGATAACCGAACGTATGCA
TCTCTACCACCTGATCATAGTGTATGTAGACATGGTAAAACATGTAGATGAACAGAAGTA
TTCTTGCCGTCATCCAAGCCAATAAAATAGCAACTCCATTAATAAGATAAGCTTTAGACC
GCTTCAAACCAGCAGTGTCAAGGAACCATCTAAGATTGATAGATGGTGTAGTCACTTCAG
AGATTAAAACCATGTATGTGTAAAGCTGAGCCTCTTCTGAGAACAGAGAATACGCTACTG
CTACTCCAGATAAGCTGTGATGGAAAATATATTCTAATCCCCCCAAAGAAGGGTAAAGCC
AAATGATCATTCCAAGATCAGAAAGAAAGTAACCAACCGATACTCCTAAACCAAAGTTAG
ATAGAGGCGAGCTACGAAACACCATAAGGCCTTGAAGACTTGTTTGGTCAGAAAACAAAT
CAGAA**GAAAACAAAGTAGAGTGCCATG

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1C409TF 705 0 0
AAGAAGGGTAAAGCCAAATGATCATTCCAAGATCAGAAAGAAAGTAACCAACCGATACTC
CTAAACCAAAGTTAGATAGAGGCGAGCTACGAAACACCATAAGGCCTTGAAGACTTGTTT
GGTCAGAAAACAAATCAGAAAAGAACACAAAGTAGAGTGCCATGAATGATATAAATACCG
CATGAACTGTGGAAATTCCCCTGTTGTTCCATTCAATTCTCTTCATTTTTGTGAGAGCTG
AGTATGATTTGATGTGAACTGAGCTGAATGAATCCGTAAGATCATAGACCATTTTGCAGA
GAAAGATTCCAGAAAGAACAGAAGTATAAGGAAGACATGGATCTGCTAACAGATAGCGCT
TAACAAAACCCTCTGCCTGATTCTGGTAAGACTTGACGTCCATGATTGTCTTTAGTCCTC
GATCTTATGTGGTGTGAATGGGGTTTAGTTCTTCCTCTCAAACTTAACGTCTTTCAAGAT
TAACTTTCTCGAATATATTCGTATGCGCAAGAAGAAGACAAAGAAAGACTCTGTTTCTTG
CTTTGTGTTTTGTTTATCAGAGAAAACCTCAAAGCCGGGACAACCTTAAAACTGTTAAAC
GAACAAGGATAGACCCAGAAGCAGAAGCAATCAACACGTGAACCGCAAAAAGATGCAGAA
GAAACGCCAAGGCGCTGATGAAGAGTAAGAGCAAGGACGTTACCC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 4

CO CL3153Contig1 873 4 10 U
GGAAGGAAAGCAATCGTCTCTCTGTCTCTCTCATCCAAGCAGGTGCCTTCGTCTCTCTCT
CAGCTTTGGCGTTCGTGATGCGTCGTTCTGGTGCTGCTGCATCTAAGAAGAAATCGGATT
CAATCACATCTTCAGCCACGGATCTCTTTCGCTCAGCATCGAGTAAGGCGACGACTAAAG
AAATGGATCGAATAGACCATTTGTTTAATCAGTATGCCAATTCATCTTCCAATCTCATTG
ATCCTGAAGGAATAGAGGAGCTCTGTTCCAATTTGGATGTTCCTCATACTGATATCAGAA
TCTTGATGCTTGCTTGGAAAATGAAATCTGAGAAACAAGGCTACTTTACTCAGGAGGAGT
GGAGAAGAGGCCTTAAGGCTTTAAGAGCTGATACACTCAGTAAACTGAAGAAATCCCTCC
CCGAGCTCGAGAAAGAGGTCAGGAGGCAATTAAATTTTGCAGATTTCTATGCTTATGCCT
TCCGCTATTGCTTAACAGAGGAAAAGCAGAAGAGCATAGACATAGAGACTATATGTCAAC
TCCTCGAGATTGTCATGGGATCTACATTCCGACCCCAAGTTGACTACTTTGTCGACTACT
TAAAGACCCAAAACGACTACAAAGTCATAAACATGGATCAATGGATGGGCTTTTACAGGT
TCTGCAATGAGATAAGTTTCCCGGAGATGACGGAATACAATCCAGAGCTTGCATGGCCTT
TGGTTCTCGACAATTTTGTTGAGTGGATTCGTGAAAAACAAGCCTGAAAAGTTTTTACCC
TGTATCGGTCGGTGTTTGGTTTTTGCGGGATCGTTGGTTCCTTCTCAACAAACAGATTCA
GCCAGACTTTTATTTCAGTTTCTTCAATCCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 10 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GJ31TF U 10
AF RS1CJ21TF U 1
AF RS1AL83TF U 10
AF RS1AL83JQ C 137
BS 1 294 RS1CJ21TF
BS 295 295 RS1AL83TF
BS 296 606 RS1CJ21TF
BS 607 607 RS1AL83TF
BS 608 694 RS1CJ21TF
BS 695 695 RS1AL83TF
BS 696 732 RS1CJ21TF
BS 733 733 RS1AL83TF
BS 734 745 RS1CJ21TF
BS 746 873 RS1AL83JQ

RD RS1GJ31TF 590 0 0
GG
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GCTTGGAAAATGAAATCTGAGAAACAAGGCTACTTTACTCAGGAGGAGTGGAGAAGAGGC
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GTCATGGGATCTACATTCCGACCCCAAGTTGACTACTTTGTCGACTAC

QA 3 590 3 590
DS 

RD RS1CJ21TF 758 0 0
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CAATCACATCTTCAGCCACGGATCTCTTTCGCTCAGCATCGAGTAAGGCGACGACTAAAG
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ATCCTGAAGGAATAGAGGAGCTCTGTTCCAATTTGGATGTTCCTCATACTGATACCAGAA
TCTTGATGCTTGCTTGGAAAATGAAATCTGAGAAACAAGGCTACTTTACTCAGGAGGAGT
GGAGAAGAGGCCTTAAGGCTTTAAGAGCTGATACACTCAGTAAACTGAAGAAATCCCTCC
CCGAGCTCGAGAAAGAGGTCAGGAGGCAATTAAATTTTGCAGATTTCTATGCTTATGCCT
TCCGCTATTGCTTAACAGAGGAAAAGCAGAAGAGCATAGACATAGAGACTATATGTCAAC
TCCTCGAGATTGTCATGGGATCTACATTCCGACCCCAAGTTGACTACTTTGTCGACTACT
TAAAGATCCAAAACGACTACAAAGTCATAAACATGGATCAATGGATGGGCTTTTACAGGT
TCTGCAATGAGATAAGTTTCCCGGAGATGACGGA*TACAATCCAGAGCTTGCATGGCCTT
TGGTTCTCGACA*TTTTGTTGAGTG
ATCGTGAAAAAAA

QA 1 745 1 745
DS 

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GG
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TTCGTGATGCGTCGTTCTGGTGCTGCTGCATCTAAGAAGAAATCGGATTCAATCACATCT
TCAGCCACGGATCTCTTTCGCTCAGCATCGAGTAAGGCGACGACTAAAGAAATGGATCGA
ATAGACCATTTGTTTAATCAGTATGCCAATTCATCTTCCAATCTCATTGATCCTGAAGGA
ATAGAGGAGCTCTGTTCCAATTTGGATGTTCCTCATACTGATATCAGAATCTTGATGCTT
GCTTGGAAAATGAAATCTGAGAAACAAGGCTACTTTACTCAGGAGGAGTGGAGAAGAGGC
CTTAAGGCTTTAAGAGCTGATACACTCAGTAAACTGAAGAAATCCCTCCCCGAGCTCGAG
AAAGAGGTCAGGAGGCAATTAAATTTTGCAGATTTCTATGCTTATGCCTTCCGCTATTGC
TTAACAGAGGAAAAGCAGAAGAGCATAGACATAGAGACTATATGTCAACTCCTCGAGATT
GTCATGGGATCTACATTCCGACCCCAAGTTGACTACTTTGTCGACTACTTAAAGACCCAA
AACGACTACAA*GTCATAAACATGGATCAATGGATGGGCTTTTACAGGTTCTGCAATGAG
ATAAGTTTCCCGGAGATGACGGAATACAATCCAGAGCTTGCATGGCCTTTGGTTCTCGAC
AATTTTGTTGAGTG
GATTCGTG

QA 3 736 3 736
DS 

RD RS1AL83JQ 737 0 0
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CCATTTGTTTAATCAGTATGCCAATTCATCTTCCAATCTCATTGATCCTGAAGGAATAGA
GGAGCTCTGTTCCAATTTGGATGTTCCTCATACTGATATCAGAATCTTGATGCTTGCTTG
GAAAATGAAATCTGAGAAACAAGGCTACTTTACTCAGGAGGAGTGGAGAAGAGGCCTTAA
GGCTTTAAGAGCTGATACACTCAGTAAACTGAAGAAATCCCTCCCCGAGCTCGAGAAAGA
GGTCAGGAGGCAATTAAATTTTGCAGATTTCTATGCTTATGCCTTCCGCTATTGCTTAAC
AGAGGAAAAGCAGAAGAGCATAGACATAGAGACTATATGTCAACTCCTCGAGATTGTCAT
GGGGTCTACATTCCGACCCCAAGTTGACTACTTTGTCGACTACTTAAAGACCCAAAACGA
CTACAAAGTCATAAACATGGATCAATGGATGGGCTTTTACAGGTTCTGCAATGAGATAAG
TTTCCCGGAGATGACGGAATACAATCCAGAGCTTGCATGGCCTTTGGTTCTCGACAATTT
TGTTGAGTGGATTCGTGAAAAACAAGCCTGAAAAGTTTTTACCCTGTATCGGTCGGTGTT
TGGTTTTTGCGGGATCGTTGGTTCCTTCTCAACAAACAGATTCAGCCAGACTTTTATTTC
AGTTTCTTCAATCCTTC

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 4

CO CL3154Contig1 735 4 3 U
GACGCTTATTTAGTTAAACAAGTCCACAAATCTTGAATCGATAATGTGGACTGTCTCCTC
GTCTCTCGTTCTGTTCTTCACCATCATCACAAGCTTCTTCTCCACTCTAACAACATCCGC
TTCACCAGCTCTCCATCCAGATGAATGTACTCAATGAAAATCTTGGTCCTTATAATATCA
AAGGTCAGTATCCATAACTTTTTTCGTATATAATTTCTATAATTTTTGCAGTGAAAGCGC
TTGGGGAGATAGCTACTACACTTGGAATCAAGAGACTGAACCTAAGTGATGGAGATCCTT
GTCTTTTAAAAACTCTAAAAATTGGTGTTGTTTCTAGTTCGGATTCGGATATGGAAAATA
TCGTTGCTTGTGATTGTAGTTTCAACAACAACATGACATGTCATATTATAGAACTAAAAC
TCAAGTCCTTAAGTCTTTCAGGGAAACTCCCGCCTGAGTTGGCCAAACTTCAGCATCTCC
AGAAGATAAACTTGTGCCGAAACTACCTTTCTGACTCAATCCCAATGGAGTGGGCTTCAT
TGCCAAACCTCACTTACATGTCGTTCTGCGCGAATCGTTTGTCTGGGCCATTACCACCTG
GTTTACAAAACTTCAAGAGTCTACAATTCTTAGGGGTTGAAGCCAACCAGTTCTCTGGTC
CTATTCCTGATGAGCTTGGTAACATGATCAACCTAACAGGATTGTATGGTTCTCTTTGCA
TCTTAACTATCTTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1A246TF U 50
AF RS1A246JQ C 1
AF RS1A246TR C 1
AF RS1A246TV U 49
BS 1 49 RS1A246JQ
BS 50 698 RS1A246TF
BS 699 735 RS1A246TV

RD RS1A246TF 651 0 0
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TGGAGATCCTTGTCTTTTAAAAACTCTAAAAATTGGTGTTGTTTCTAGTTCGGATTCGGA
TATGGAAAATATCGTTGCTTGTGATTGTAGTTTCAACAACAACATGACATGTCATATTAT
AGAACTAAAACTCAAGTCCTTAAGTCTTTCAGGGAAACTCCCGCCTGAGTTGGCCAAACT
TCAGCATCTCCAGAAGATAAACTTGTGCCGAAACTACCTTTCTGACTCAATCCCAATGGA
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ATTACCACCTGGTTTACAAAACTTCAAGAGTCTACAATTCTTAGGGGTTGAAGCCAACCA
GTTCTCTGGTCCTATTCCTGATGAGCTTGGTAACATGATCAACCTAACA
CG

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1A246JQ 735 0 0
GACGCTTATTTAGTTAAACAAGTCCACAAATCTTGAATCGATAATGTGGACTGTCTCCTC
GTCTCTCGTTCTGTTCTTCACCATCATCACAAGCTTCTTCTCCACTCTAACAACATCCGC
TTCACCAGCTCTCCATCCAGATGAATGTACTCAATGAAAATCTTGGTCCTTATAATATCA
AAGGTCAGTATCCATAACTTTTTTCGTATATAATTTCTATAATTTTTGCAGTGAAAGCGC
TTGGGGAGATAGCTACTACACTTGGAATCAAGAGACTGAACCTAAGTGATGGAGATCCTT
GTCTTTTAAAAACTCTAAAAATTGGTGTTGTTTCTAGTTCGGATTCGGATATGGAAAATA
TCGTTGCTTGTGATTGTAGTTTCAACAACAACATGACATGTCATATTATAGAACTAAAAC
TCAAGTCCTTAAGTCTTTCAGGGAAACTCCCGCCTGAGTTGGCCAAACTTCAGCATCTCC
AGAAGATAAACTTGTGCCGAAACTACCTTTCTGACTCAATCCCAATGGAGTGGGCTTCAT
TGCCAAACCTCACTTACATGTCGTTTTGCGCGAATCGTTTGTCTGGGCCATTACCACCTG
GTTTACAAAACTTCAAGAGTCTACAATTCTTAGGGGTTGAAGCCAACCAGTTCTCTGGTC
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TCTTAACTATCTTCC

QA 1 735 1 735
DS 

RD RS1A246TR 735 0 0
GACGCTTATTTAGTTAAACAAGTCCACAAATCTTGAATCGATAATGTGGACTGTCTCCTC
GTCTCTCGTTCTGTTCTTCACCATCATCACAAGCTTCTTCTCCACTCTAACAACATCCGC
TTCACCAGCTCTCCATCCAGATGAATGTACTCAATGAAAATCTTGGTCCTTATAATATCA
AAGGTCAGTATCCATAACTTTTTTCGTATATAATTTCTATAATTTTTGCAGTGAAAGCGC
TTGGGGAGATAGCTACTACACTTGGAATCAAGAGACTGAACCTAAGTGATGGAGATCCTT
GTCTTTTAAAAACTCTAAAAATTGGTGTTGTTTCTAGTTCGGATTCGGATATGGAAAATA
TCGTTGCTTGTGATTGTAGTTTCAACAACAACATGACATGTCATATTATAGAACTAAAAC
TCAAGTCCTTAAGTCTTTCAGGGAAACTCCCGCCTGAGTTGGCCAAACTTCAGCATCTCC
AGAAGATAAACTTGTGCCGAAACTACCTTTCTGACTCAATCCCAATGGAGTGGGCTTCAT
TGCCAAACCTCACTTACATGTCGTTCTGCGCGAATCGTTTGTCTGGGCCATTACCACCTG
GTTTACAAAACTTCAAGAGTCTACAATTCTTAGGGGTTGAAGCCAACCAGTTCTCTGGTC
CTATTCCTGATGAGCTTGGTAACATGATCAACCTAACAGGATTGTATGGTTCTCTTTGCA
TCTTAACTATCTTCC

QA 1 735 1 735
DS 

RD RS1A246TV 687 0 0
G
ACTGTCTCCTCGTCTCTCGTTCTGTTCTTCACCATCATCACAAGCTTCTTCTCCACTCTA
ACAACATCCGCTTCACCAGCTCTCCATCCAGATGAATGTACTCAATGAAAATCTTGGTCC
TTATAATATCAAAGGTCAGTATCCATAACTTTTTTCGTATATAATTTCTATAATTTTTGC
AGTGAAAGCGCTTGGGGAGATAGCTACTACACTTGGAATCAAGAGACTGAACCTAAGTGA
TGGAGATCCTTGTCTTTTAAAAACTCTAAAAATTGGTGTTGTTTCTAGTTCGGATTCGGA
TATGGAAAATATCGTTGCTTGTGATTGTAGTTTCAACAACAACATGACATGTCATATTAT
AGAACTAAAACTCAAGTCCTTAAGTCTTTCAGGGAAACTCCCGCCTGAGTTGGCCAAACT
TCAGCATCTCCAGAAGATAAACTTGTGCCGAAACTACCTTTCTGACTCAATCCCAATGGA
GTGGGCTTCATTGCCAAACCTCACTTACATGTCGTTCTGCGCGAATCGTTTGTCTGGGCC
ATTACCACCTGGTTTACAAAACTTCAAGAGTCTACAATTCTTAGGGGTTGAAGCCAACCA
GTTCTCTGGTCCTATTCCTGATGAGCTTGGTAACATGATCAACCTAACAGGATTGTATGG
TTCTCTTTGCATCTTAACTATCTTCC

QA 2 687 2 687
DS 



AS 2 4

CO CL3155Contig1 980 2 2 U
GGCTCTTACCAAATCAGAGAGAGAAATAACATCTCTAATCTATTAGAAGTAACATGATCG
GACAGCTTATGAACCTTAACGCGACGGAGCTCTGTCTCGGCCTCCCTGGCGGCATTAAAG
CCGTCGACAGCCCGGCCAGATCGTCGGTGAGGAACAAGAGAGGCTTCTCCGAGACCGTGG
ATCTCATGCTCAATCTTCAGTGCAACAAAGAAGAAACCGTCGATCTTAACAACGCCACAG
CTTCCAAAGAGAAGACTCTCCTCAAAGACCCTGCTAAGCCTCCTGCTAAAGCCCAAGTGG
TGGGATGGCCACCTGTGAGGAACTACAGGAAGAACATGATGACTCAGCAGAAAACAAGCG
CCGAGGAGGAGGCCAGCAGCGAGAAGGCCGGAAATGGTGGAGGAGCTGCCTTGGTGAAGG
TATCCATGGATGGAGCTCCTTACCTAAGAAAAGTTAACCTCACGATGTACAAAAGCTATC
AGGATCTCTCTGATGCTTTGGCCAAAATGTTCAGCTCCTTCATTATGGGGAACTATGGAG
CACAAGGAATGATAGATTTCATGAACGAGAGCAAGCTCATGAATCTGTTGAACAGTTCCG
AATATGTTCCAAGCTACGAGGACAAAGATGGCGATTGGATGCTCGTCGGAGATGTCCCAT
GGGAAATGTTCGTCCAGTCGTGCAAACGTTTGCGCATCATGAAGGGATCTGAAGCAATTG
GACTTGCTCCCAGAGCAATGGAGAAGTACTGCAAGAACAGATCATGAATTTTATAATAAG
AAGAAAAAAAGAACCATCAATGTCCATATGACGGGTTCTTGATTTGCATTTTTATGTATT
TCTATCTCCTATATGTGTGTTGTAATTTAAATACTTGATGGGTATCTAGGGCAATAGTAT
TATGTTACCAGTAAGGTGTGGAAAAAAATGTAATGTGACCAAAAGAGAGGAAACTGAAAA
TATCTCTGTGTTTGTGTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EZ17TF U 1
AF RS1EZ17JQ C 134
BS 1 655 RS1EZ17TF
BS 656 980 RS1EZ17JQ

RD RS1EZ17TF 655 0 0
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GACAGCTTATGAACCTTAACGCGACGGAGCTCTGTCTCGGCCTCCCTGGCGGCATTAAAG
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QA 1 655 1 655
DS 

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TGCTTTGGCCAAAATGTTCAGCTCCTTCATTATGGGGAACTATGGAGCACAAGGAATGAT
AGATTTCATGAACGAGAGCAAGCTCATGAATCTGTTGAACAGTTCCGAATATGTTCCAAG
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CCAGTCGTGCAAACGTTTGCGCATCATGAAGGGATCTGAAGCAATTGGACTTGCTCCCAG
AGCAATGGAGAAGTACTGCAAGAACAGATCATGAATTTTATAATAAGAAGAAAAAAAGAA
CCATCAATGTCCATATGACGGGTTCTTGATTTGCATTTTTATGTATTTCTATCTCCTATA
TGTGTGTTGTAATTTAAATACTTGATGGGTATCTAGGGCAATAGTATTATGTTACCAGTA
AGGTGTGGAAAAAAATGTAATGTGACCAAAAGAGAGGAAACTGAAAATATCTCTGTGTTT
GTGTCAT

QA 1 847 1 847
DS 



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CACAAGGAATGATAGATTTCATGAACGAGAGCAAGCTCATGAATCTGTTGAACAGTTCCG
AATATGTTCCAAGCTACGAGGACAAAGATGGCGATTGGATGCTCGTCGGAGATGTCCCAT
GGGAAATGTTCGTCCAGTCGTGCAAACGTTTGCGCATCATGAAGGGATCTGAAGCAATTG
GACTTGCTCCCAGAGCAATGGAGAAGTACTGCAAGAACAGATCATGAATTTTATAATAAG
AAGAAAAAAAGAACCATCAATGTCCATATGACGGGTTCTTGATCTGCATTTTATGATTTT
TATGTATTTCTATCTCCTATATGCGTGTTGTAATTTAAATACTTGATGGGTATCTAGGGC
AATAGTATTATGTTACCAGTAAGGTGTGGAAAAAATGTAATGTGACCAAAAGAGAGGAAA
CTGAAAATATCTCTGTGTTTGTGTCATATTTATTGCCCAGCATGTGTCTGTCGGCTTAAT
GATCAATCACTAATTGACATATACATATATAAACATGTATGTATGTGTCTGTTATTGATC
CCTACTAGAGCATGTGTCTGTCGGTTAATGTCAATCACTACTTGATATATGCATATATAA
ATGTATGTACATGTGTTTTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1G017TF U 1
AF RS1G017JQ C 293
BS 1 744 RS1G017TF

RD RS1G017TF 744 0 0
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AGGATCTCTCTGATGCCTTGGCCAAAATGTTCAGCTCCTTCACTATGGGAAACTATGGAG
CACAAGGAATGATAGATTTCATGAACGAGAGCAAGCTCATGAATCTGTTGAACAGTTCCG
AATATGTTCCAAGCTACGAGGACAAAGATGGCGATTGGATGCTCGTCGGAGATGTCCCAT
GGGAAATGTTCGTCCAGTCGTGCAAACGTTTGCGCATCATGAAGGGATCTGAAGCAATTG
GACTTGCTCCCAGAGCAATGGAGAAGTACTGCAAGAACAGATCATGAATTTTATAATAAG
AAGAAAAAAAGAACCATCAATGTCCATATGACGGGTTCTTGATCTGCATTTTATGATTTT
TATGTATTTCTATCTCCTATATGCGTGTTGTAATTTAAATACTTGATGGGTATCTAGGGC
AATAGTATTATGTTACCAGTAAGGTGTGGAAAAAATGTAATGTGACCAAAAGAGAGGAAA
CTGAAAATATCTCTGTGTTTGTGTCATATTTATTGCCCAGCATGTGTCTGTCGGCTTAAT
GATCAATCACTAATTGACATATACATATATAAACATGTATGTATGTGTCTGTTATTGATC
CCTACTAGAGCATGTGTCTGTCGGTTAATGTCAATCACTACTTGATATATGCATATATAA
ATGTATGTACATGTGTTTTGATCC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1G017JQ 452 0 0
AGCAATTGGACTTGCTCCCAGAGCAATGGAGAAGTACTGCAAGAACAGATCATGAATTTT
ATAATAAGAAGAAAAAAAGAACCATCAATGTCCATATGACGGGTTCTTGATCTGCATTTT
ATGATTTTTATGTATTTCTATCTCCTATATGCGTGTTGTAATTTAAATACTTGATGGGTA
TCTAGGGCAATAGTATTATGTTACCAGTAAGGTGTGGAAAAAATGTAATGTGACCAAAAG
AGAGGAAACTGAAAATATCTCTGTGTTTGTGTCATATTTATTGCCCAGCATGTGTCTGTC
GGCTTAATGATCAATCACTAATTGACATATACATATATAAACATGTATGTATGTGTCTGT
TATTGATCCCTACTAGAGCATGTGTCTGTCGGTTAATGTCAATCACTACTTGATATATGC
ATATATAAATGTATGTACATGTGTTTTGATCC

QA 1 452 1 452
DS 



AS 1 4

CO CL3156Contig1 761 4 18 U
GGGGGGAGGAGATAGCACACACCTACAATCACATCTACGGTCTTTCTTTAACCGGACTCC
GGTTCTTTACGGTTTACGGTCCATGGGGAAGACCGGACATGGCTTACTTCTTCTTCACTA
AAGCCATACTCCACGGGAAGTCCATCGACATCTACAGAACTCAGGACAACCAAGAAGTGG
CGCGTGACTTCACCTACATCGACGATATAGTCAAAGGGTGTGTCGGTGCGTTAGACACGG
CGGAGAAGAGCACCGGAAGCGGGGGAAAGAAGCGAGGACCGGCTCAGTTACGTGTTTATA
ATCTCGGGAACACGTCTCCGGTTCCGGTCGGGAGATTGGTTTCGATATTGGAAGGGTTGT
TAGGGACGAAAGCGAAGAAGCATCTGATCAAAATGCCTAGAAACGGTGACGTGCCTTACA
CGCATGCTAACGTGAGCTTAGCGTATAGAGATTTCGGGTATAAACCGACGACGGATCTCG
CAGCCGGGTTGAGGAAGTTCGTCAAGTGGTACGTTAGTTATTATGGGATACAGCCGAGGG
TGAAAAAGGAAAACTCTCGCGCCGACGAATCCTCTTAATAATCTCTCTCTCACTCTCTCC
CCTTCATGATCATCACATGTCTATTTTCTGTTTTACAAGAAAAAA*ACAATTATTTACAA
GATAGATTTCTGTATTTTTCAGTTTTTGTTTTATAAAAATGCCAAAATCATTAATGTTTC
TGCGGTGAATCAAAGTGTGAGTATTAAATTGTTACAGCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 
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30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 0 0 30 30 30 30 30 30 30 
30 30 30 30 30 30 30 0 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 30 15 30 30 30 30 30 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1DV63JQ C 110
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AF RS1DV63TF U 2
AF RS1B078JQ C 9
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GACGGATCTCGCGGCCGGGTTGAGGAAGTTCGTCAAGTGGTACGTTAGTTATTATGGGAT
ACAGCCGAGGGTGAAAAAGGAAAACTCTCGCGCCGACGAATCCTCTTAATAATCTCTCTC
TCACTCTCTCCCCTTCATGATCATCACATGTTTATTT

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DS 

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TGGGGACGAAAGCGAAGAAGCATCTGATCAAAATGCCTAGGAACGGTGACGTGCCTTACA
CGCATGCTAACGTGAGCTTAGCGTATAGAGATTTCGGGTATAAACCGACGACGGATCTCG
CAGCGGGGTTGAGGAAGTTCGTCAAGTGGTACGTTAGTTATTATGGGATACAGCCGAGGG
TGAAAAAGGAAAACTCTCGCGCCGACGAATCCTCTTAATAATCTCTCTCTC**TCTCTCC
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GATAGATTTCTGTATTTTTCAGTTTTT

QA 1 687 1 687
DS 

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GGGGGAG
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ACGGTTTACGGTCCTTGGGGAAGACCGGACATGGCTTACTTCTTCTTCACTAAAGCCATA
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TCTGTATTTTTCAGTTTTT
G

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DS 

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ACGGTTTACGGTCCATGGGGAAGACCGGACATGGCTTACTTCTTCTTCACTAAAGCCATA
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TTCACCTACATCGACGATATAGTCAAAGGGTGTGTCGGTGCGTTAGACACGGCGGAGAAG
AGCACCGGAAGCGGGGGAAAGAAGCGAGGACCGGCTCAGTTACGTGTTTATAATCTCGGG
AACACGTCTCCGGTTCCGGTCGGGAGATTGGTTTCGATATTGGAAGGGTTGTTGGGGACG
AAAGCGAAGAAGCATCTGATCAAAATGCCTAGGAACGGTGACGTGCCTTACACGCATGCT
AACGTGAGCTTAGCGTATAGAGATTTCGGGTATAAACCGACGACGGATCTCGCAGCGGGG
TTGAGGAAGTTCGTCAAGTGGTACGTTAGTTATTATGGGATACAGCCGAGGGTGAAAAAG
GAAAACTCTCGCGCCGACGAATCCTCTTAATAATCTCTCTCTC**TCTCTCCCCTTCATT
ATCATCACATGTCTATTTTCTGTTTTACAAGAAAAAA*ACAATTATTTACAAGATAGATT
TCTGTATTTTTCAGTTTTTGTTTTATAAAAATGCCAAAATCATTAATGTTTCTGCGGTGA
ATCAAAGTGTGAGTATTAAATTGTTACAGCTGC

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DS 



AS 1 4

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CCAAATGATAATTCATGGAAATGAAACCTGATATATAATATAAGTTAATGGGAGCTTACA
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GGTTTAGTCTTTGAAGCATTAGTGTTGTTGGTTCTCTGAGGTTT*GGCATCATCTACATC
ATCATCATCATCATAAGAAGCGGGGATTTCAGTGAAAGTTCTCCTCTTACGCCAGCGCAT
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1B008JQ U 15
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CCAAATGATAATTCATGGAAATGAAACCTGATATATAATATAAGTTAATGGGAGCTTACA
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TAAGCACGTTCGTACTGAGGATTACTATTATTAACGGAAGCTTCTTCACGGGTTTTCCGT
CTCTGTCTTCGTTGAGCTCTCTTCTGTTTGCGAGTTTGCGCTTTGCTTGAAGCTTTCGCA
TTAACCGGCG

QA 1 310 1 310
DS 

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ATGGAAATGAAACCTGATATATAATATAAGTTAATGGGAGCTTACAGAATCTCAACAAAA
GTGAAAATCATAAAGCAGTACAAAGCATTCTTGTTTAGTCTCGTCTTAAGCACGTTCGTA
CTGAGGATTACTATTATTAACGGAAGCTTCTTCACGGGTTTTCCGTCTCTGTCTTCGTTG
AGCTCCCTTCTGTTTGCGAGTTTGCGCTTTGCTTGAAGCTTTCGCATTAACCGGCGCAGC
AGGAACGCTCTCAGTTGGTTGTGGTCCACCAAATACACCGTCAAGAGCATCATCTTCTTC
ATCCGCCATTTCGCCATCAGAATTTCCAGAGGCATTTTGGAGCACTGGTTTAGTCTTTGA
AGCATTAGTGTTGTTGGTTCTCTGAGGTTT*GGCATCATCTACATCATCATCATCATCAT
AAGAAGCGGGGATTTCAGTGAAAGTTCTCCTCTTACGCCAGCGCATCTGAGGTTTCTCTC
CTTGATCGTTGTAAACCGCTTCAGGGTAGAAATGCTTGGACATAAGCTGCCATCTCCAAG
CTTCACCTCTGTTGTACTTGACTAAGACATTGACAAGCTCTCTCTGCATACGTGTAGCAT
CTTGCCTAAGAATGTTATCAAGGCATGAAACAGCAGTAGTGGAGTTTGACCAATCCCAAG
CAGCAGTAAAAGCCGCCAC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1B008TF 756 0 0
CAGCAGG
ACGCTCTCAGTTGGT*GTG*TCCACCAAATACAC*GTCAAGAGCATCATCTTCTTCATCC
GCCATTTCGCCATCAGAATTTCCAGAGGCATTTTGGAGCACTGGTTTAGTCTTTGAAGCA
TTAGTGTTGTTGGTTCTCTGAGGTTT*GGCATCATCTACATCATCATCATCATCATAAGA
AGCGGGGATTTCAGTGAAAGTTCTCCTCTTACGCCAGCGCATCTGAGGTTTCTCTCCTTG
ATCGTTGTAAACCGCTTCAGGGTAGAAATGCTTGGACATAAGCTGCCATCTCCAAGCTTC
ACCTCTGTTGTACTTGACTAAGACATTGACAAGCTCTCTCTGCATACGTGTAGCATCTTG
CCTAAGAATGTTATCAAGGCATGAAACAGCAGTAGTGGAGTTTGACCAATCCCAAGCAGC
AGTAAAAGCCGCCACAGCAGGTAAAACTGTAAGAGGAAGCTTCAGCATTTTCATCCTTTT
CGCCACTTGCCAACCTAAACCACCAGCTAGACCAGAGGCAAAGCCAGCAGTCCAGAGAAC
TTTGATATGGCAAGAGGCAATCACACTCATCTCTTCCGCCGTTATCTTCTCCTGCTCGGG
TTTATTTTCGAGGGCAAGATAAAGCTGATTCAAAGCGGACAACGCCATCGTCGTTCCTTA
AGAATCAATTTCCCAGCAAACGAATAGAGAAGCGACTCTCGACTCTCTCTTCCTGATCCA
ACAAAACTTTTTATAAGTCTCTCTCTCCC

QA 8 756 8 756
DS 

RD RS1DC66TF 706 0 0
CGCTCTCAGTTGGTTGTG
GTCCACCAAATACAC*GTCAAGAGCATCATCTTCTTCATCTGCCATTTCGCCATCAGAAT
TTCCAGAGGCATTTTG*AGCACTGGTTTAGTCTTTGAAGCATTAGTGTTGTTGGTTCTCT
GAGGTTTTGGCATCATCTACATCATCATCATCATCATAAGAAGCGGGGATTTCAGTGAAA
GTTCTCCTCTTACGCCAGTGCATCTGAGGTTTCTCTCCTTGATCGTTGTAAACCGCTTCA
GGGTAGAAATGCTTGGACATAAGCTGCCATCTCCAAGCTTCACCTCTGTTGTACTTGACT
AAGA*ATTGACAAGCTCTCTCTGCATACGTGTAGCATCTTGCCTAAGAATGTTATCAAGG
CATGAAACAGCAGTAGTGGAGTTTGACCAATCCCAAGCAGCAGTAAAAGCCGCCACAGCA
GGTAAAACTGTAAGAGGAAGCTTCAGCATTTTCATCCTTTTCGCCACTTGCCAACCTAAA
CCACCAGCTAGACCAGAGGCAAAGCCAGCAGTCCAGAGAACTTTGATATGGCAAGAGGCA
ATCACACTCATCTCTTCCGCCGTTATATTCTCCTGCTCGGGTTTATTTTCGAGGGCAAGA
TAAAGCTGATTCAAAGCGGACAACGCCATCGTCGTTCCTTAAGAATCAATTTCCCAGCAA
ACGAATAGAGAAGCGACTCTCGACTC
CC

QA 19 704 19 704
DS 



AS 2 4

CO CL3158Contig1 836 2 14 U
GGGTACTCACAAGTCACAACCATGGCCAACACCAGCGAGCAGCCAACCACAGACTCCCAC
GTAGCCATTCTCGCGTTCCCCTTCGGCTCTCACTCCCCTGTTCTCCTCGACGTAACACGC
CGTCTCGCCTCCGCCTCTCCCACCACACTCTTCTCCTTCTTAAACACCGCTAAATCCAAC
TCCTCATTGTTCCTCTCAGATCCTCCATCGAACATCCGAGTCCATGAAGTCGCCGACGGC
GTTTCGGAGGGATACGTATTGTCCGGAAGACCACATGAGGCGTTCGAGCTGTTTATCGTA
GCGGCGCCTGAAAATTTCCGAAAAGCGGTCGCGTCCGCGGAGAGTGACGTTGGTAAGAAA
GTAACGTGCTTGTTAACGGATGCGTTCTTCTGGTTCGCTTCGGATATGGCGGCAGAGATG
AAGGCGACATGGGTTGCGTTTTGGGCAGCCGGACCAAACTCGATGACTGCTCATCTCTAT
ACAGATCGCATCAGAGATGCCATAGGTGTGAATGAAGTAGATGGGTGTATGGAGGAGACA
CTAGGGTTTATCCCAGGGATGGAGAAGTACAGAGTCAAGGACACACCAGACGGAGTTGTG
GTTGGGAACTTAGACTCTGCTTTCTCAGACACGTTGCACCGAATGGGTCTTGCTTTACCT
CGTGCCGATGCAGTTTTCGTCACTCCATTCGAAGAGTTGGATCCTACATTAACCAATAAC
CTCAAGTCAGAGTTCAAACGTTTCTTTAGCATTGGTCCTCTCGCGTGGTTATCATCTACA
TCTCAAACGGAGACACCGGTGCAAGATCCTTATAACAGCTTGGCTTGGATCAAGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B270TF U 1
AF RS1BQ26TF U 188
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BS 711 729 RS1B270TF
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BS 770 786 RS1B270TF
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BS 788 803 RS1B270TF
BS 804 836 RS1BQ26TF

RD RS1B270TF 813 0 0
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GTAGCCATTCTCGCGTTCCCCTTCGGCTCTCACTCCCCTGTTCTCCTCGACGTAACACGC
CGTCTCGCCTCCGCCTCTCCCACCACACTCTTCTCCTTCTTAAACACCGCTAAATCCAAC
TCCTCATTGTTCCTCTCAGATCCTCCATCGAACATCCGAGTCCATGAAGTCGCCGACGGC
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AAGGCGACATGGGTTGCGTTTTGGGCAGCCGGACCAAACTCGATGACTGCTCATCTCTAT
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CTAGGGTTTATCCCAGGGATGGAGAAGTACAGAGTCAAGGACACACCAGACGGAGTTGTG
GTTGGGAACTTAGACTCTGCTTTCTCAGACACGTTGCACCGAATGGGTCTTGCTTTACCT
CGTGCCGATGCAGTTTTCGTCACTCCATTCGAAGAGTTGGATCCTACAT*AACCAATAAC
CTCAAGTCATAGTTCAA*CGTTTCTT*AGCATTGGTCCTCTCGCGTG**TATCATCTACA
TCTCAA*CGGAGACACCGGTGCA
GATCCTATAC

QA 1 803 1 803
DS 

RD RS1BQ26TF 649 0 0
G
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GGGATACGTATTGTCCGGAAGACCACATGAGGCGTTCGAGCTGTTTATCGTAGCGGCGCC
TGAAAATTTCCGAAAAGCGGTCGCGTCCGCGGAGAGTGACGTTGGTAAGAAAGTAACGTG
CTTGTTAACGGATGCGTTCTTCTGGTTCGCTTCGGATATGGCGGCAGAGATGAAGGCGAC
ATGGGTTGCGTTTTGGGCAGCCGGACCAAACTCGATGACTGCTCATCTCTATACAGATCG
CATCAGAGATGCCATAGGTGTGAATGAAGTAGATGGGTGTATGGAGGAGACACTAGGGTT
TATCCCAGGGATGGAGAAGTACAGAGTCAAGGACACACCAGACGGAGTTGTGGTTGGGAA
CTTAGACTCTGCTTTCTCAGACACGTTGCACCGAATGGGTCTTGCTTTACCTCGTGCCGA
TGCAGTTTTCGTCACTTCATTCGAAGAGTTGGATCCTACATTAACCAATAACCTCAAGTC
AGAGTTCAAACTTTTCTTTAGCATTGGTCCTCTCGCGTTGTTATCATCTACATCTCAAAC
GGAGACACCGGTGCAAGATCCTTATAACAGCTTGGCTTGGATCAAGAA

QA 2 649 2 649
DS 



CO CL3158Contig2 892 2 4 U
AAAAAAAAAACGGAAATGGTTGTTTTTAATATTATTTCATGGACAACAATACTTATATAG
AAATACAATGATAAGATTAAAAACCTTTCTAGAACATAGGATTAAGCAGCTATGGGGGAC
ATCCATACAATTCTTTGTAACAGTTTTAAGTCTGTTACTGTTATTACCATCAATACAAAT
ATGTTTTTAATTTAAAGTGCTCACAACTACATCCAACAATCCTTTGAAATTCTCAACGGA
ACTTCCTTTCGCAAAAACAGCTTGGTGGGCTTGTTCTCTAAGCTTCTCAACATTGCTCTT
CATCTTCTTACCATCATCTTGAACCAAAACTTGATCCAAACATTTCACGAATCCATCTCT
CGTAAAGACTCCACCGATAATCATCATTCCAATCTCCCAAATAACCTCCACTGCTCTTCC
GTTGAGTCCATTATCACCAATACACGGCCTGCAAATCATCGGCACACCTCCGGACACACT
CTCCAACATGGAGTTCCATCCACAATGCGTCACATACACACCCGTTGATTCGTGTTTCAG
CAGTTCAACTTGCGGAACCCATGGAACCACTATCCCTTGCTCTCTTGTCCGTTCCAAAAA
CCCTTTTGGTAACTGAACCATGTTCTTTTCCTTGAGCGACCAGACAAACGGAACATTGCT
TGATTCCAATCCTTCCGCTATCGCCACAAGCTCTCCAGGAGGCGGCGTCATGACTGTACC
AAAGCTAATGTACGCTACAGAAGCAGTCCCCTGCTTCTTGATCCAAGCCAAGCTGTTATA
AGGATCTTGCACCGGTGTCTCCGTTTGAGATGTAGATGATAACAACGCGAGAGGACCAAT
GCTAAAGAAACGTTTGAACTATGACTTGAGTTATTGGTTATGTAGATCCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1BQ26JQ U 1
AF RS1B270JQ U 55
BS 1 238 RS1BQ26JQ
BS 239 239 RS1B270JQ
BS 240 677 RS1BQ26JQ
BS 678 892 RS1B270JQ

RD RS1BQ26JQ 677 0 0
AAAAAAAAAACGGAAATGGTTGTTTTTAATATTATTTCATGGACAACAATACTTATATAG
AAATACAATGATAAGATTAAAAACCTTTCTAGAACATAGGATTAAGCAGCTATGGGGGAC
ATCCATACAATTCTTTGTAACAGTTTTAAGTCTGTTACTGTTATTACCATCAATACAAAT
ATGTTTTTAATTTAAAGTGCTCACAACTACATCCAACAATCCTTTGAAATTCTCAACG*A
ACTTCCTTTCGCAAAAACAGCTTGGTGGGCTTGTTCTCTAAGCTTCTCAACATTGCTCTT
CATCTTCTTACCATCATCTTGAACCAAAACTTGATCCAAACATTTCACGAATCCATCTCT
CGTAAAGACTCCACCGATAATCATCATTCCAATCTCCCAAATAACCTCCACTGCTCTTCC
GTTGAGTCCATTATCACCAATACACGGCCTGCAAATCATCGGCACACCTCCGGACACACT
CTCCAACATGGAGTTCCATCCACAATGCGTCACATACACACCCGTTGATTCGTGTTTCAG
CAGTTCAACTTGCGGAACCCATGGAACCACTATCCCTTGCTCTCTTGTCCGTTCCAAAAA
CCCTTTTGGTAACTGAACCATGTTCTTTTCCTTGAGCGACCAGACAAACGGAACATTGCT
TGATTCCAATCCTTCCG

QA 1 677 1 677
DS 

RD RS1B270JQ 838 0 0
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GTGGACATCCATACAATTCTTTGTAACAGTTTTAAGTCTGTTACTGTTATTACCATCAAT
ACAAATATGTTTTTAATTTAAAGTGCTCACAACTACATCCAACAATCCTTTGAAATTCTC
AACGGAACTTCCTTTCGCAGAGACAGCTTGGTGGGCTTGTTCTCTAAGCTTCTCAACATT
GCTCTTCATCTTCTTACCATCATCTTGAACCAAAACTTGATCCAAACGTTTCACGAATCC
ATCTCTCGTAAAGACTCCACCGATAATCATCATTCCAATCTCCCAGATAACCTCCACTGC
TCTTCCGTTGAGTCCATTATCACCAATACACGGCCTGCAAATCATCGGCACACCTCCGGA
CACACTCTCCAACATGGAGTTCCATCCACAATGCGTCACATACACACCCGTTGATTCGTG
TTTCAGCAGTTCAACTTGCGGAACCCATGGAACCACTATCCCTTGCTCTCTTGTCCGTTC
CAAAAACCCTTTTGGTAACTGAACCATGTTCTTTTCCTTGAGCGACCAGACAAACGGAAC
ATTGCTTGATTCCAATCCTTCCGCTATCGCCACAAGCTCTCCAGGAGGCGGCGTCATGAC
TGTACCAAAGCTAATGTACGCTACAGAAGCAGTCCCCTGCTTCTTGATCCAAGCCAAGCT
GTTATAAGGATCTTGCACCGGTGTCTCCGTTTGAGATGTAGATGATAACAACGCGAGAGG
ACCAATGCTAAAGAAACGTTTGAACTATGACTTGAGTTATTGGTTATGTAGATCCACT

QA 1 838 1 838
DS 



AS 1 3

CO CL3159Contig1 981 3 8 U
GGGCTGCCGTCATTTTCAACTTAAGAAAATAGAGCTCAGTCATGTTTCTCGTCCTTCGCT
GTCGATATCTAATCACCATCTAAAAAGACACATTAAAGTTCAGCAGATACGTTTTGGGAG
AACAGAAGAACGGTCAATCAAAACAGAGAATTTCGATTTCAAATTTTGAGGTTATGTTCT
ACACCCATAGATCTATATTTATCAGAAAGAGGATCATCATTTGGAGTTTTCATCTAATAG
TTATGGTTATTTCTTTGAGGCTGTTCGTTGTAGATCGGATCCGCTGACAGTCAACTTCAT
CGGTGTTTTCCCGTCGATCCAGAAGGAACCAGGAAACGAGCGAGATATCATTGGAAAGCT
CTTACTGTCAGATTTCTATATCATCTTTTAGATTCTCAAACCGAGAGCCAGTTCCGATCA
GTCTCGGTGTAAGGGAGAAACGGTTGACCTAAAAGAAAGATGTAAATCTGTAAATTTGTC
ATCTGCGTTTGCAACCAGTGTGGAGATGAAGCTATTTTGGTTAATCAAATGGTGCCCGAT
CAGAGTAAACTCGGTGGCTACGGACAAAGGACATATAGGACTACATTCTGACCGGAGGGA
TCAAAACGTTAACGAAAGTTCGAGAGTTGCTATCTTAGAGGTGTTAAGGTCCATTCGGCG
TTTTCTCAAGTTTTCTTCAGAACCCGTGGCAAAGGTGAGACAGACGAGTATATGATATTT
GGACGGATTGGTGCTATTGGACTTTTTATTCAGATTTTTATTTGGGCTTTGGGTGAGTGG
AGTTGTGTATATGGGCTTTTATGTTGTGAGATATTGTTGGTGGCGTGTTATTCTCCGGAT
ATGAGGTGACGGGTGTCACATCTTCCGTCAACAAATGTCCGTTTTCGTTGCTGTAAGAGC
ATCTTTATTGCAATATTTCATCATATTTTATGGGAATATAATAAAAGGAAAAACTAATGA
GAGATGTGTTTTTTGGTTAGT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H415TF U 1
AF RS1FJ08TF U 4
AF RS1H415JQB C 293
BS 1 17 RS1H415TF
BS 18 18 RS1FJ08TF
BS 19 62 RS1H415TF
BS 63 63 RS1FJ08TF
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BS 186 636 RS1H415TF
BS 637 981 RS1H415JQB

RD RS1H415TF 643 0 0
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GTTGATATCTAATCACCATCTAAAAAGACACATTAAAGTTCAGCAGATACGTTTTGGGAG
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ACACTCATAGATCTATATTTATCAGAAAGAGGATCATCATTTGGAGTTTTCATCTAATAG
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CTTACTGTCAGATTTCTATATCATCTTTTAGATTCTCAAACCGAGAGCCAGTTCCGATCA
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AGAGTGT

QA 1 636 1 636
DS 

RD RS1FJ08TF 633 0 0
GG
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TATCTAATCACCATCTAAAGAGACACATTAAAGTTCAGCAGATACGTTTTGGGAGAACAG
AAGAACGGTCAATCAAAACAGAGAATTTCGATTTCAAATTTTGAGGTTATGTTCTACACC
CATAGATCTATATTTATCAGAAAGAGGATCATCATTTGGAGTTTTCATCTAATAGTTATG
GTTATTTCTTTGAGGCTGTTCGTTGTAGATCGGGTCCGCTGACAGTCAACTTCATCGGTG
TTTTCCCGTCGATCCAGAAGGAACCAGGAAACGAGCGAGATATCATTGGAAAGCTCTTAC
TGTCAGATTTCTATATCATCTTCTAGATTCTCAAACCGAGAGCCAGTTCCGATCAGTCTC
GGTGTAAGGGAGAAACGGTTGACCTAAAAGAAAGATGTAAATCTGTAAATTTGTCATCTG
CGTTTGCAACCAGTGTGGAGATGAAGCTATTTTGGTTAATCAAATGGTGCCCGATCAGAG
TAAACTCGGTGGCTACGGACAAAGGACATATAGGACTACATTCTTACCGGAGGGATCAAA
ACGTTAACGAAAGTTCGAGAGTTGCTATCTT

QA 3 633 3 633
DS 

RD RS1H415JQB 689 0 0
AACTTCATCGGTGTTTTCCCGTCGATCCAGAAGGAACCAGGAAACGAGCGAGATATCATT
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TCCGATCAGTCTCGGTGTAAGGGAGAAACGGTTGACCTAAAAGAAAGATGTAAATCTGTA
AATTTGTCATCTGCGTTTGCAACCAGTGTGGAGATGAAGCTATTTTGGTTAATCAAATGG
TGCCCGATCAGAGTAAACTCGGTGGCTACGGACAAAGGACATATAGGACTACATTCTGAC
CGGAGGGATCAAAACGTTAACGAAAGTTCGAGAGTTGCTATCTTAGAGGTGTTAAGGTCC
ATTCGGCGTTTTCTCAAGTTTTCTTCAGAACCCGTGGCAAAGGTGAGACAGACGAGTATA
TGATATTTGGACGGATTGGTGCTATTGGACTTTTTATTCAGATTTTTATTTGGGCTTTGG
GTGAGTGGAGTTGTGTATATGGGCTTTTATGTTGTGAGATATTGTTGGTGGCGTGTTATT
CTCCGGATATGAGGTGACGGGTGTCACATCTTCCGTCAACAAATGTCCGTTTTCGTTGCT
GTAAGAGCATCTTTATTGCAATATTTCATCATATTTTATGGGAATATAATAAAAGGAAAA
ACTAATGAGAGATGTGTTTTTTGGTTAGT

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 3

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CTGTTTTCCTCAAACAATGGAACAAACGGTTCGCACCGGAAAGAAAATAAATGTATATAA
AAAGAATCTTTATGAACAACTAAAACAGTAAAACAATGCAAAGATAAAACATGAAATCTC
TTTCACCTTTTAGAAAAAAAATAGCCATCAAAAGAAGTCTACGCAAAAATTGACCTTCTT
TAGCGGCTCTCTCTCCACTCTTCTTTTACTTTCTTTTTTCTTTGTGTGTTATCTCATCAT
CTTTATGATACAGGAGCAACCAGATTCAACTCAAGAGGCTTCAAAGCTGCCTGAACAAGT
TCTTGAACAGTACGGTTTCGGCGACAAACATCTGAGAGTTCCTCTGCGTGCCCTATCAAA
GAATTCACATCAGCTCCATTAGTAACATCGGATAACCCTTGCAAGAACTTGGTAGCCTCA
GTCTCTGTCACAGCTGTTCTAGGTATCAGGCTAACGCTTTGCTTAGCCCAACCCACTGCT
TGTAAACCGTATGTTCTGGTCAGCGCTAGCAGCGTGTATGTTACCGTATCTAGCCGAGAA
CTAGGAAGTGCCCCTGCTAATGATGAGATCAAGATTCTTGTGATTGTTGCTCCCCTGGGG
ATAATGACACTGTCCCTGATTCGTACAAACTGTTCTTCATTCACAGACTTCTCGAGGTCG
AAAACGTCGGATAAAAATGTCAATATCGAGTGGCAGGCCTCTCTGTGCTGCACTGTCATT
CCAATAATTGCGCAATCTACAATTGGTGAAAAGATAGGAGATGGAATAAACAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FT64JQ U 1
AF RS1A274JQ U 39
AF RS1A274TR U 39
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BS 422 507 RS1FT64JQ
BS 508 829 RS1A274JQ
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RD RS1FT64JQ 507 0 0
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CTGTTTTCCTCAAACAATGGAACAAACGGTTCACACCGGAAAGAAAATAAATGTATATAA
AAAGAATCTTTATGGACAACTAAAACAGTAAAACAATGCAAAGATAAAACATGAAATCTC
TTTCACCTTTTAGAAAAAAAATAGCCATCAAAAGAAGTCTACGCAAAAATTGACCTTCTT
TAGCGGCTCTCTCTCCACTCTTCTTTTACTTTCTTTTTTCTTTGTGTGTTATCTCATCAT
CTTTATGATACAGGAGCAACCAGATTCAACTCAAGAGGCTTCAAAGCTGCCTGAACAAGT
TCTTGAACAGTACGGTTTCGGCGACAAACATCTGAGAGTTCCTCTGCGTGCCCTATCAAA
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GTCTCTGTCACAGCTGTTCTAGGTATC

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DS 

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CG
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AAGATAAAACATGAAATCTCTTTCACCTTTTAAAAAAAAAATAGCCATCAAAAGAAGTCT
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TTTGTGTGTTATCTCATCATCTTTATGATACAGGAGCAACCAGATTCAACTCAAGAGGCT
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CCTCTGCGTGCCCTATCAAAGAATTCACATCAGCTCCATTAGTAACATCGGATAACCCTT
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GCTTAGCCCAACCCACTGCTTGTAAACCGTATGTTCTGGTCAGCGCTAGCAGCGTGTATG
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CTCTGTGCTGCACTGTCATTCCAATAATTGCGCAATCTACAATTGGTGAAAAGATAGGAG
ATGGAATAA

QA 3 791 3 791
DS 

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CG
TACCAATCCTTGAAGGGCCTCTGTTTTCCTCAAACAATGGAACAAACGGTTCGCACCGGA
AAGAAAATAAATGTATATAAAAAGAATCTTTATGAACAACTAAAACAGTAAAACAATGCA
AAGATAAAACATGAAATCTCTTTCACCTTTTAGAAAAAAAATAGCCATCAAAAGAAGTCT
ACGCAAAAATTGACCTTCTTTAGCGGCTCTCTCTCCACTCTTCTTTTACTTTCTTTTTTC
TTTGTGTGTTATCTCATCATCTTTATGATACAGGAGCAACCAGATTCAACTCAAGAGGCT
TCAAAGCTGCCTGAACAAGTTCTTGAACAGTACGGTTTCGGCGACAAACATCTGAGAGTT
CCTCTGCGTGCCCTATCAGAGAATTCACATCAGCTCCATTAGTAACATCGGATAACCCTT
GCAAGAACTTGGTAGCCTCAGTCTCTGTCACAGCTGTTCTAGGTATCAGGCTAACGCTTT
GCTTAGCCCAACCCACTGCTTGTAAACCGTATGTTCTGGTCAGCGCTAGCAGCGTGTATG
TTACCGTATCTAGCCGAGAACTAGGAAGTGCCCCTGCTAATGATGAGATCAAGATTCTTG
TGATTGTTGCTCCCCTGGGGATAATGACACTGTCCCTGATTCGTACAAACTGTTCTTCAT
TCACAGACTTCTCGAGGTCGAAAACGTCGGATAAAAATGTCAATATCGAGTGGCAGGCCT
CTCTGTGCTGCACTGTCATTCCAATAATTGCGCAATCTACAATTGGTGAAAAGATAGGAG
ATGGAATAAACAAAT

QA 3 797 3 797
DS 



AS 1 2

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TCCAACGTCACGTGCACGCGGTATCTCCAGTAATGTTTGGGGTTGGTGGGGTCATTGATC
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TCTGGAACACACTGACTTGGAGGGATTTCATCTACGCCAATCACTTCCTTGAAGTACCGT
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CTAGGCATGCGCTGGATGCGGAGACCGACCAAAGCCAGTTCTTTCATAACAGGATGTACG
CAAGCCGGAACGAGACCAAGATCCTCCCCACACGCCAGCATATTAGATGAATTTAACAGA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1D534JQ U 1
AF RS1EP78JQ U 9
BS 1 140 RS1D534JQ
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RD RS1D534JQ 780 0 0
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CCGCTGCCTGCAACGAGGTTCTTGATGGTTGATTTCAAGTCTATGTCCTTCATAAGCGAG
TCCAACGTCACGTGTACGCGGTATCTCCAGTAATGTTTGGGGTTGGTGGGGTCATTGATC
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GGGAAAATAGCCCACATGGATGGAGCTTCAACATGTTGCCTCAGAATGAAATGGGTTATC
TCTGGAACACACTGACTTGGAGGTATTTCATCTACGCCAATCACTTCCTTGAAGTACCGT
TGTCTTCTCTCTTCGTCCTCCTCCCACCAAGCTCGTAGTGTAGAGCAGTCGTGGCATGAA
GGAGCACAGACCGTCATATAGTCATAGTTAGACGGAATCCCAAACTCCACATCAGACTCA
CTAGGCATGCGCTGGATGCGGAGACCGACCAAAGCCAGTTCTTTCATAACAGGATGTACG
CAAGCTGGAACGAGACCAAGATCCTCCCCACACGCCAGCATATTAGATGAATTTAACAGA

QA 1 780 1 780
DS 

RD RS1EP78JQ 772 0 0
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TATAACTCCTTTCTTGTTGTTATCATCTTCACCAGAGGCCGGAACAGATCTTCAGCTGCC
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CACGTGCACGCGGTATCTCCAGTAATGTTTGGGGTTGGTGGGGTCATTGATCGTCTCTTC
TTTTGCAGGACGAGCAGTGTACTCTTCTTTTAAAGCCAACATATCCTGAAGTGGGAAAAT
AGCCCACATGGATGGAGCTTCAACATGTTGCCTGAAAATGAAATGGGTTATCTCTGGAAC
GCACTGACTTGGAGGGATTTCATCTACGCCAATCACTTCCTTGAAGTACCGTTGTCTTCT
CTCTTCGTCCTCTTCCCACCAAGCTCGTAGTGTAGAGCAGTCGTGGCACGAAGGTGCACA
GACCGTCATATAGTCATAGTTAGACGGAATCCCAAACTCCAAATCAGACTCACTAGGCAT
GCGCTGGATGCGGAGACCGACCAAAGCCAGTTCTTTCATAACAGGATGTACGCAAGCCGG
AACGAGACCAAGATCCTCCCCACACGCCAGCATATTAGATGAATTTAACAGA

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 3

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GGAGAGGATTGTCGAGGTAGCGTATGGAGCATCCGTGAAAGCAGTTTTAACGTTGTTGGA
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ACTCCGTTCCGGTTACAAACCCACGGCGGAGCTGCAACTTTCTGATCTACTCCGTTTCGT
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TGAACTACCAACGGCTTTCTTCGAACTTGTTCTTGGAAGAAACATGAAATACAGCTCATG
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TTGCGAAAGAGCCAAAGTGGAAGATGGACAAAGTGTTCTCGATGTCGGATGTGGCTGGGG
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CGAAATCATTGTTGGGGATATTAGCACTTTTGAGCATGAAGGAACATATGATCGAGTATT
CTCCATCGAAATGTTCGAGCATATGAAAAACTATGGAGAGCTTCTGAGAAATTGGGAGCT
GGATGAAGAAAGATAGTCTTCTGTTTGTCACTATTTCTGCATAAGACATTGCTACCACTT
TGAGATGTGCATGACGATGACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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GG
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TAAAAGAGATGCCTATAGCGATCAATACCGAGAAGCCGAAGACGCAACACTATGAACTAC
CAACGGCTTTCTTCGAACTTGTTCTTGGAAGAAACATGAAATACAGCTCATGCTATTTCC
CAAAGGATTCAAGTAGCTTAGAAGAAGCAGAGGAAGCAATATTGGCCCTATATTGCGAAA
GAGCTAAAGTGGAAGATGGACAAAGTGTTCTCGATGTCGGATGTGGCTGGGGATCTTTGT
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AAATGTT
T

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GGATGAAGAAAGATAGTCTTCTGTTTGTCACTATTTCTGCATAAGACATTGCTACCACTT
TGAGATGTGCATGACGATGACTG

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DS 



AS 1 3

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GCAACCTCGTAGGTACTCGGAGATGAGCTTTAGCAAGTGATTACATTTGTTTAAAACTAG
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CTCACTTTGGCCGCAATTGTTCCTGAATTTTTTAGGGAAGTCGTTGTCTCAAAAGCCTTG
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GTG


BQ
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RD RS1A134TF 838 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGAAGAAAAAACA
GTTACGGAATGCTCGAGGTTCACAGCATTGGCATGAGAAAGGGACACACCACGATTCGCA
GCGTTCACCATCTGCACCTGCTAAAACTGGGAATGAATATGCACATACTAAAAAGAATGT
AGTTGCTTCAAGTCTTAGTTCTGCTTCTCCTCCTTTTTATCCCTCAGTGTCCTCGAGTAA
TGTGGCACATGGTATACAAGTTGGTATGGAAAAACTCCACACGAATGAAAGTGCCCCTTC
CTCCGGGAAGAAGTATAGGAATACAAAATCCGTTTATCTTCCTGTCAATACTGCCCGGAA
TGTTCAGTCCGCGAGTCAAGGTAGAGGTGCTCCTGCTGCTGAAAACGTGTTTTACCCCCA
ATCTCATAGTCAAGGTGACAACATGCAACTCAATGGAGATTCAAAAGGCACTGGCCAAAG
CTATACTAGATCTTCCGGGCAGAGTTTTGATCAGCACGCTGCTGTAAACAGATCATTGTC
TTCCTCTACCCAAAAAACTAGCTCATCAAAAAATCGTTATCCTCCTGGTGAATTAGAATC
TGCGTTGGAAACAGTTGCGTCATTTGGTAAGGGTAAAGGGACCCTTCACCCTAGTGGAAG
CGGCTCTTTGATGTATAGTGGGTCTCATGTGATGGGGCGTGCAGAAAGTCTGGCATCTGG
TGACAACTCTAATTTCCCAGCTTTTCTGCCTGTTATGCAATTCGGTGGTCAACATGGTGG
GGTTCCAACATTTGGAATGGCTTTTCCAGGATACTACCAGCCTGAAAATGGTGTTGGA

QA 1 838 1 838
DS 

RD RS1A134TV 797 0 0
AAAGGGACACACCACGATTCGCAGCGTTCACCATCTGCACCTGCTAAAACTGGGAATGAA
TATGCACATACTAAAAAGAATGTAGTTGCTTCAAGTCTTAGTTCTGCTTCTCCTCCTTTT
TATCCCTCAGTGTCCTCGAGTAATGTGGCACATGGTATACAAGTTGGTATGGAAAAACTC
CACACGAATGAAAGTGCCCCTTCCTCCGGGAAGAAGTATAGGAATACAAAATCCGTTTAT
CTTCCTGTCAATACTGCCCGGAATGTTCAGTCCGCGAGTCAAGGTAGAGGTGCTCCTGCT
GCTGAAAACGTGTTTTACCCCCAATCTCATAGTCAAGGTGACAACATGCAACTCAATGGA
GATTCAAAAGGCACTGGCCAAAGCTATACTAGATCTTCCGGGCAGAGTTTTGATCAGCAC
GCTGCTGTAAACAGATCATTGTCTTCCTCTACCCAAAAAACTAGCTCATCAAAAAATCGT
TATCCTCCTGGTGAATTAGAATCTGCGTTGGAAACAGTTGCGTCATTTGGTAAGGGTAAA
GGGACCCTTCACCCTAGTGGAAGCGGCTCTTTGATGTATAGTGGGTCTCATGTGATGGGG
CGTGCAGAAAGTCTGGCATCTGGTGACAACTCTAATTTCCCAGCTTTTCTGCCTGTTATG
CAATTCGGTGGTCAACATGGTGGGGTTCCAACATTTGGAATGGCTTTTCCAGGATACTAC
CAGCCTGAAAATGGTGTTGGAA*CCCGGAGATGACCTGGATGCCAGTTTTGACTGGTCCA
GGAGCTTTAGGAGCTTC

QA 1 797 1 797
DS 

RD RS1B467JQ 690 0 0
TATGCAATTCGGTGGTCAACATGGTGGGGTTCCAACATTTGGAATGGCTTTTCCGGGATA
CTACCAGCCTGAAAATGGTGTTGGAAACCCGGAGATGACCTGGATGCCAGTTTTGACTGG
TCCAGGAGCTTTAGGAGCTTCATACAGTCCGCCATATGCTGCTATTGATGGTTCTTACCA
AGCACACAAGCCAGGGTTACCTTCCTCTGCAGGATCCTCCAGCAAAGAGAATAGCACGAA
TAACCTTAATGATCTGGAGAATCCCGTGGAGAGTTTTGAGGTTACAGAGAGTGGGGTTTC
AAAACGGCAAAACAACAACCCAAGCAAGCAACCTCGTAGGTACTCGGAGATGAGCTTTAG
CAAGTGATTACATTTGTTTAAAACTAGGAAGATTGGTTAGGGACTCCTTGGCGCAGGGCC
CTGGCGCTTCTCCAAGCTTCTTTACATCTCACTTTGGCCGCAATTGTTCCTGAATTTTTT
AGGGAAGTCGTTGTCTCAAAAGCCTTGGTCAGCCTGTTTGGTGTTTCTTCTTTCCATTTT
TTTTCCTATGTAATCATTTCTGTTTGTTTCTTATATAAGGTTGATGACTTCTGGTTTGGT
TAGTGTGTTTATTTTTCCGTATAACGCAGTTTCTAAACAGACAATGTTATGAAAAAATGA
AATGGTTAATGGATGAGACATGTGTGAGTG

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 3

CO CL3164Contig1 568 3 7 U
GGGACCGATTAGAAGGCGAACCTCAAAAAGATGCAGATCTTCGTGAAAACCCTAACCGGC
AAGACCACCACTCTCGAGGTCGAGTCCTCCGACACCATCGACAATGTCAAAGCCAAGATC
CAAGACAAAGAAGGTATCCCTCCGGATCAGCAGCGTCTGATCTTCGCCGGTAAACAGCTC
GAAGATGGCCGCACTTTGGCTGACTACAACATCCAGAAAGAATCGACGCTTCATCTTGTG
TTGAGGCTTAGGGGAGGTATCATTGAGCCTTCTTTGATGGCGTTGGCTCGTAAGTACAAC
CAAGATAAGATGATTTGCCGCAAATGCTATGCTCGTCTTCATCCAAGAGCTGTGAACTGC
AGGAAGAAGAAGTGTGGCCATAGCAACCAGTTGAGGCCTAAGAAGAAGATCAAGTAGACT
CGTTTCAAGAATCTATCTTGTTTGCCTCTTTTTAATTATCTTTCCCTTGACTACGTCGTT
TTTATGTTATGTGAACAGATTATATCAGTAAAATGATTGGTTTTCAATATTGGTTTCCTT
TATTCCTTTATCTATATGTTTGTTTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F621JQ C 9
AF RS1F621TF U 9
AF RS1E635TF U 1
BS 1 15 RS1E635TF
BS 16 16 RS1F621TF
BS 17 67 RS1E635TF
BS 68 68 RS1F621TF
BS 69 257 RS1E635TF
BS 258 258 RS1F621TF
BS 259 568 RS1E635TF

RD RS1F621JQ 517 0 0
GG
AGAAGGCGAACCTCAAAAAGATGCAGATCTTCGTGAAAACCCTAACCGGCAAGACCACCA
CTCTCGAGGTCGAGTCCTCCGACACCATCGACAATGTCAAAGCCAAGATCCAAGACAAAG
AAGGTATCCCTCCGGATCAGCAGCGTCTGATCTTCGCCGGTAAACAGCTCGAAGATGGCC
GCACTTTGGCTGACTACAACATCCAGAAAGAATCGACGCTTCATCTTGTGTTGAGGCTTA
GGGGAGGTATCATTGAGCCTTCTTTGATGGCGTTGGCTCGTAAGTACAACCAAGATAAGA
TGATTTGCCGCAAATGCTATGCTCGTCTTCATCCAAGAGCTGTGAACTGCAGGAAGAAGA
AGTGTGGCCATAGCAACCAGTTGAGGCCTAAGAAGAAGATCAAGTAGACTCGTTTCAAGA
ATCTATCTTGTTTGCCTCTTTTTAATTATCTTTCCCTTGACTACGTCGTTTTTATGTTAT
GTGAACAGATTATATCAGTAAAATGATTGGTTTTC

QA 3 517 3 517
DS 

RD RS1F621TF 517 0 0
GG
AGAAGGCGAACCTCAAAAAGATGCAGATCTTCGTGAAAACCCTAACCGGCAAGACCACCA
CTCTCGAGGTCGAGTCCTCCGACACCATCGACAATGTCAAAGCCAAGATCCAAGACAAAG
AAGGTATCCCTCCGGATCAGCAGCGTCTGATCTTCGCCGGTAAACAGCTCGAAGATGGCC
GCACTTTGGCTGACTACAACATCCAGAAAGAATCGACGCTTCATCTTGTGTTGAGGCTTA
GGGGAGGTATCATTGAGCCTTCTTTGATGGCGTTGGCTCGTAAGTACAACCAAGATAAGA
TGATTTGCCGCAAATGCTATGCTCGTCTTCATCCAAGAGCTGTGAACTGCAGGAAGAAGA
AGTGTGGCCATAGCAACCAGTTGAGGCCTAAGAAGAAGATCAAGTAGACTCGTTTCAAGA
ATCTATCTTGTTTGCCTCTTTTTAATTATCTTTCCCTTGACTACGTCGTTTTTATGTTAT
GTGAACAGATTATATCAGTAAAATGATTGGTTTTC

QA 3 517 3 517
DS 

RD RS1E635TF 568 0 0
GGGACCGATTAGAAGACGAACCTCAAAAAGATGCAGATCTTCGTGAAAACCCTAACCGGC
AAGACCATCACTCTCGAGGTCGAGTCCTCCGACACCATCGACAATGTCAAAGCCAAGATC
CAAGACAAAGAAGGTATCCCTCCGGATCAGCAGCGTCTGATCTTCGCCGGTAAACAGCTC
GAAGATGGCCGCACTTTGGCTGACTACAACATCCAGAAAGAATCGACGCTTCATCTTGTG
TTGAGGCTTAGGGGAGGCATCATTGAGCCTTCTTTGATGGCGTTGGCTCGTAAGTACAAC
CAAGATAAGATGATTTGCCGCAAATGCTATGCTCGTCTTCATCCAAGAGCTGTGAACTGC
AGGAAGAAGAAGTGTGGCCATAGCAACCAGTTGAGGCCTAAGAAGAAGATCAAGTAGACT
CGTTTCAAGAATCTATCTTGTTTGCCTCTTTTTAATTATCTTTCCCTTGACTACGTCGTT
TTTATGTTATGTGAACAGATTATATCAGTAAAATGATTGGTTTTCAATATTGGTTTCCTT
TATTCCTTTATCTATATGTTTGTTTTTG

QA 1 568 1 568
DS 



AS 1 2

CO CL3165Contig1 744 2 2 U
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CTCTCTCTCTGATCATGGCTTCTTCTGCATCACCTGGAGTGAAATTTGTGCCGCAAGAGG
ATAACTTCTTGCAGAGACATGTTGCCTTCTTTGACCGGAACAAAGATGGCATTGTTTATC
CCTCGGAGACATATCAAGGATTTAGAGCAATCGGATGTGGATATCTCTTGTCGGCATTTG
CTTCTCTGTTCATCAACATGGGTCTAAGCAGCAAAACTCGCCCGGGTAAAGGTTTCTCCT
TCTCATTTCCCATAGAGGTTAAGAATATACACCTTGCCAAACATGGCAGCGATTCAGGCG
TTTACGATAAGGATGGAAGGTTTGTGGCATCGAAGTTCGAGGAGATATTCGCGGAGCATT
CAAAAACACATCCCGATGCTTTGACGGGGGAGGAACTCAAACAACTCCTCAACGCAAACA
AAGAGCCTAATGATCGCAAAGGAGCTATTGCTGGATATACAGAGTGGAATATGTTGCATT
ACTTGTGTAAAGACAAGAACGGTCTGTTGCACAAAGAGACGGTGAGAGCTGCGTACGATG
GTTCTCTTTTCGAACAACTCGAGAGACAAACAGCTTCTAAGAAGCATCCATAAACACCCG
CTTCAAACAAACTCTTATTTGCTTGTGAATCTGTTTATTTATTCAAACTTTCAGTACATT
AATGTTATCGTGGACAATGGCGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E312TF U 1
AF RS1E312JQ C 103
BS 1 732 RS1E312TF
BS 733 744 RS1E312JQ

RD RS1E312TF 732 0 0
GGACTTTTCATGTGACTTCTCTCTTTCAACCGTTTCCTTTTTCTCTGTCTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCTGATCATGGCTTCTTCTGCATCACCTGGAGTGAAATTTGTGCCGCAAGAGG
ATAACTTCTTGCAGAGACATGTTGCCTTCTTTGACCGGAACAAAGATGGCATTGTTTATC
CCTCGGAGACATATCAAGGATTTAGAGCAATCGGATGTGGATATCTCTTGTCGGCATTTG
CTTCTCTGTTCATCAACATGGGTCTAAGCAGCAAAACTCGCCCGGGTAAAGGTTTCTCCT
TCTCATTTCCCATAGAGGTTAAGAATATACACCTTGCCAAACATGGCAGCGATTCAGGCG
TTTACGATAAGGATGGAAGGTTTGTGGCATCGAAGTTCGAGGAGATATTCGCGGAGCATT
CAAAAACACATCCCGATGCTTTGACGGGGGAGGAACTCAAACAACTCCTCAACGCAAACA
AAGAGCCTAATGATCGCAAAGGAGCTATTGCTGGATATACAGAGTGGAATATGTTGCATT
ACTTGTGTAAAGACAAGAACGGTCTGTTGCACAAAGAGACGGTGAGAGCTGCGTACGATG
GTTCTCTTTTCGAACAACTCGAGAGACAAACAGCTTCTAAGAAGCATCCATAAACACCCG
CTTCAAACAAACTCTTATTTGCTTGTGAATCTGTTTATTTATTCAAACTTTCAGTACATT
AATGTTATCGTG

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1E312JQ 642 0 0
AATTTGTGCCGCAAGAGGATAACTTCTTGCAGAGACATGTTGCCTTCTTTGACCGGAACA
AAGATGGCATTGTTTATCCCTCGGAGACATATCAAGGATTTAGAGCAATCGGATGTGGAT
ATCTCTTGTCGGCATTTGCTTCTCTGTTCATCAACATGGGTCTAAGCAGCAAAACTCGCC
CGGGTAAAGGTTTCTCCTTCTCATTTCCCATAGAGGTTAAGAATATACACCTTGCCAAAC
ATGGCAGCGATTCAGGCGTTTACGATAAGGATGGAAGGTTTGTGGCATCGAAGTTCGAGG
AGATATTCGCGGAGCATTCAAAAACACATCCCGATGCTTTGACGGGGGAGGAACTCAAAC
AACTCCTCAACGCAAACAAAGAGCCTAATGATCGCAAAGGAGCTATTGCTGGATATACAG
AGTGGAATATGTTGCATTACTTGTGTAAAGACAAGAACGGTCTGTTGCACAAAGAGACGG
TGAGAGCTGCGTACGATGGTTCTCTTTTCGAACAACTCGAGAGACAAACAGCTTCTAAGA
AGCATCCATAAACACCCGCTTCAAACAAACTCTTATTTGCTTGTGAATCTGTTTATTTAT
TCAAACTTTCAGTACATTAATGTTATCGTGGACAATGGCGTG

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 3

CO CL3166Contig1 1448 3 9 U
GTGCTTGCACGCTGACTAAACTTGTTCTTAGATTGGAAGAGGTTCAGCCATCTAAAACTG
AAGTGAACAAGACAGTCACACAGGCTTTACTGATCATGGTTTCTATGCTGCAACTTGGTC
AATCTCCTGCTTCTCCACACCCTATTGATAATGATTCGTACGAGAGGATTGTCTTGTGCA
TAAAATTGCTTTGCCATAGGAATGATGAGATGAAAAAGATATGGCTGGAATCCTGCCGCC
AGAGTTTTGTCAAGATGATTTCTGAAAAACAGCTGACCGAGATGGCCGAACTTAAGGCAA
AGACCCAAACAACTAATGCTCAGCCTGATGATCTCATTGACTTCTTCCATCTAAAGAGCC
GGAAGGGAATGAGTCAACTTGAGTTGGAAGACCAGGTACAAGATGACCTAAAGCGTGCAA
CTGGAGAATTCACCAAGGACGAGAACGATGCCAACAAACTCAACCGCATTCTTCAACTCA
CAGGATTCAGTGATCCGGTCTATGCTGAAGCATACGTGACGGTCCATCACTATGACATTG
CACTCGAAGTTACCGTTATCAACCGTACAAAGGAAACCCTTCAGAATATGTGCTTGGAGT
TAGCAACCATGGGTGATCTCAAGCTTGTTGAGCGTCCTCAAAACTATAGTCTGGCACCGG
GAACGAGCATGCAGATAAAAGCAAACATAAAGGTCTCGTCCACAGAGACCGGAGTCATAT
TCGGAAACATCGTCTATGAGACATCAAACGTAATGGAGCGAAACGTCGTGGTTCTCAACG
ACATACACATTGATATCATGGACTATATCTCCCCTGCTGTTTGCTCAGAGGTTGCTTTCA
GAACCATGTGGGCAGAATTTGAATGGGAGAACAAGGTTGCTGTGAACACCACGATTCAGA
ACGAGAGAGAGTTCCTCGATCACATTATCAAATCCACAAACATGAAGTGTCTCACTGCCC
CATCTGCAATAGAAGGAGAATGCGGTTTCCTTGCAGCAAACCTATATGCAAAGAGTGTGT
TTGGTGAGGATGCTCTTGTGAACGTGAGTATCGAGAAGCAAACTGATGGAGTATTGAGTG
GGTACATAAGGATAAGGAGCAAGACGCAAGGGATTGCTCTAAGTCTTGGGGACAAGATCA
CCCTCAAACAGAAGGGTAGTAGCTGAGGCCTTGGATGGTGGCGCACAAGGTAACTTTCGT
TTCTCTCTTGAGCAATTTTTATAGTTGGTTGAATCTGTTTACTATATGGAGTGGAGTGAG
GGAGGCGTTTTAAGTATATGTAAAGACCAAACTGTTATCATTCCTTAACCGGTTTATAGT
TTCCGGTATGGTACCGATGGATTCTTCCCCGTACGGCTGTGTGTTTTTCTCTTTCTTTTA
ATTAGTACCTGAAGATTTTGTTTTTATTTGTAATGCTTTTTTTCTTTCTATATTATCGTT
TGTTGGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G101TF U 1
AF RS1FQ50TF U 415
AF RS1G101JQ C 763
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AGACCCAAACAACTAATGCTCAGCCTGATGATCTCATTGACTTCTTCCATCTAAAGAGCC
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CTGGAGAATTCACCAAGGACGAGAACGATGCCAACAAACTCAACCGCATTCTTCAACTCA
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CACTCGAAGTTACCGTTATCAACCGTACAAAGGAAACCCTTCAGAATATGTGCTTGGAGT
TAGCAACCATGGGTGATCTCAAGCTTGTTGAGCGTCCTCAAAACTATAGTCTGGCACCGG
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ACATACACATTGATATCATGGACTATATCTCCC*TGCTGTTTGCTCAGAGGT
GCT

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DS 

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AACTCACAGGATTCAGTGATCCGGTCTATGCTGAAGCATACGTGACGGTCCATCACTATG
ACATTGCACTCGAAGTTACCGTTATCAACCGTACAAAGGAAACCCTTCAGAATATGTGCT
TGGAGTTAGCAACCATGGGTGATCTCAAGCTTGTTGAGCGTCCTCAAAACTATAGTCTGG
CACCGGGAACGAGCATGCAGATAAAAGCAAACATAAAGGTCTCGTCCACAGAGACCGGAG
TCATATTCGGAAACATCGTCTATGAGACATCAAACGTAATGGAGCGAAACGTCGTGGTTC
TCAACGACATACACATTGATATCATGGACTATATCTCCCCTGCTGTTTGCTCAGAGGTTG
CTTTCAGAACCATGTGGGCAGAATTTGAATGGGAGAACAAGGTTGCTGTGAACACCACGA
TTCAGAACGAGAGAGAGTTCCTCGATCACATTATCAAATCCACAAACATGAAGTGTCTCA
CTGCCCCATCTGCAATAGAAGGAGAATGCGGTTTCCTTGCAGCAAACCTATATGCAAAGA
GTGTGTTTGGTGAGGATGCTCTTGTGAACGTGAGTATCGAGAAGCAAACTGATGGAGTAT
TGAGTGGGTACAT

QA 1 673 1 673
DS 

RD RS1G101JQ 686 0 0
ACGTCGTGGTTCTCAACGACATACACATTGATATCATGGACTATATCTCCCCTGCTGTTT
GCTCAGAGGTTGCTTTCAGAACCATGTGGGCAGAATTTGAATGGGAGAACAAGGTTGCTG
TGAACACCACGATTCAGAACGAGAGAGAGTTCCTCGATCACATTATCAAATCCACAAACA
TGAAGTGTCTCACTGCCCCATCTGCAATAGAAGGAGAATGCGGTTTCCTTGCAGCAAACC
TATATGCAAAGAGTGTGTTTGGTGAGGATGCTCTTGTGAACGTGAGTATCGAGAAGCAAA
CTGATGGAGTATTGAGTGGGTACATAAGGATAAGGAGCAAGACGCAAGGGATTGCTCTAA
GTCTTGGGGACAAGATCACCCTCAAACAGAAGGGTAGTAGCTGAGGCCTTGGATGGTGGC
GCACAAGGTAACTTTCGTTTCTCTCTTGAGCAATTTTTATAGTTGGTTGAATCTGTTTAC
TATATGGAGTGGAGTGAGGGAGGCGTTTTAAGTATATGTAAAGACCAAACTGTTATCATT
CCTTAACCGGTTTATAGTTTCCGGTATGGTACCGATGGATTCTTCCCCGTACGGCTGTGT
GTTTTTCTCTTTCTTTTAATTAGTACCTGAAGATTTTGTTTTTATTTGTAATGCTTTTTT
TCTTTCTATATTATCGTTTGTTGGGG

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 3

CO CL3167Contig1 887 3 6 U
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GAGATCGTGGCGCTGTTACCCCCGTCAAAAACCAGGGATCTTGCGGTTCTTGTTGGAGTT
CCAGTGCAACCGGAGCTCTGGAAGGTGCTAACTTCCTCGCTACCGGCAAGCTCGTCAGCC
TTAGCGAGCAACAGCTTGTCGACTGTGATCACGAGTGTGACCCAGAAGAGGCAGGTTCAT
GCGACTCTGGTTGCAACGGTGGCCTCATGAACAGCGCTTTTGAGTACACACTCAAAACCG
GAGGGCTCATGAGAGAAGAAGACTATCCTTACACCGGAAAGGACGGTACTACTTGTAAGC
TAGACAAGTCCAAGATCGTTGCGTCCGTCTCCAACTTCAGCGTCATTTCCATCGACGAAG
ACCAGATCGCTGCGAATCTTGTCAAGAACGGACCTCTCGCGGTAGCCATCAACGCCGCAT
ATATGCAGACTTACATCGGAGGAGTCTCGTGCCCTTACGTGTGCATGAGGAGGCTCAACC
ACGGTGTCTTATTGGTGGGTTATGGATCGGCTGGTTACGCTCCGGCTAGGTTCAAGGAGA
AGCCTTACTGGATCATTAAGAACTCGTGGGGAGAGACTTGGGGTGAGAATGGTTTTTACA
AAATCTGCAGAGGCTGTAACGTTTGTGGCGTTGACAGTCTTGTCTCCACCGTTACAGCCA
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CGCTGGTGATTTGTGTGAGCGAGGACTCTTTGATTGGCTACCTATTTCTCTCTGCTTTTT
AAAAAGGATGATGAAGTTTGTATTGTAAATAAAAATGCATTTTCTCC


BQ
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AF RS1C649TF U 11
AF RS1C070TF U 1
AF RS1C649JQ C 184
BS 1 224 RS1C070TF
BS 225 225 RS1C649TF
BS 226 277 RS1C070TF
BS 278 278 RS1C649TF
BS 279 638 RS1C070TF
BS 639 887 RS1C649JQ

RD RS1C649TF 590 0 0
G
AAGGCTCCCATCCTCCCTACCGAGGATCTCCCCGAGGAGTTTGATTGGAGAGATCGTGGC
GCTGTTACCCCCGTCAAAAACCAGGGATCTTGCGGTTCTTGTTGGAGTTTCAGTGCAACC
GGAGCTCTGGAAGGTGCTAACTTCCTCGCTACCGGCAAGCTCGTCAGCCTTAGCGAGCAA
CAGCTTGTCGACTGTGATCACGAGTGTGACCCAGAAGAGGCAGGTTCATGCGACTCTGGT
TGCAACGGTGGCCTCATGAACAGCGCTTTTGAGTACACACTCAAAACCGGAGGGCTCATG
AGAGAAGAAGACTATCCTTACACCGGAAAGGACGGTACTACTTGTAAGCTAGACAAGTCC
AAGATCGTTGCGTCCGTCTCCAACTTCAGCGTCATTTCCATCGACGAAGACCAGATCGCT
GCGAATCTTGTCAAGAACGGACCTCTCGCGGTAGCCATCAACGCCGCATATATGCAGACT
TACATCGGAGGAGTCTCGTGCCCTTACGTGTGCATGAGGAGGCTCAACCACGGTGTCTTA
TTGGTGGGTTATGGATCGGCTGGTTACGCTCCGGCTAGGTTCAAGGAGA

QA 2 590 2 590
DS 

RD RS1C070TF 638 0 0
GGGACGCCAACAAGGCTCCCATCCTCCCTACCGAGAATCTCCCCGAGGAGTTTGATTGGA
GAGATCGTGGCGCTGTTACCCCCGTCAAAAACCAGGGATCTTGCGGTTCTTGTTGGAGTT
CCAGTGCAACCGGAGCTCTGGAAGGTGCTAACTTCCTCGCTACCGGCAAGCTCGTCAGCC
TTAGCGAGCAACAGCTTGTCGACTGTGATCACGAGTGTGACCCATAAGAGGCAGGTTCAT
GCGACTCTGGTTGCAACGGTGGCCTCATGAACAGCGCCTTTGAGTACACACTCAAAACCG
GAGGGCTCATGAGAGAAGAAGACTATCCTTACACCGGAAAGGACGGTACTACTTGTAAGC
TAGACAAGTCCAAGATCGTTGCGTCCGTCTCCAACTTCAGCGTCATTTCCATCGACGAAG
ACCAGATCGCTGCGAATCTTGTCAAGAACGGACCTCTCGCGGTAGCCATCAACGCCGCAT
ATATGCAGACTTACATCGGAGGAGTCTCGTGCCCTTACGTGTGCATGAGGAGGCTCAACC
ACGGTGTCTTATTGGTGGGTTATGGATCGGCTGGTTACGCTCCGGCTAGGTTCAAGGAGA
AGCCTTACTGGATCATTAAGAACTCGTGGGGAGAGACT

QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1C649JQ 704 0 0
GCGAGCAACAGCTTGTCGACTGTGATCACGAGTGTGACCCAGAAGAGGCAGGTTCATGCG
ACTCTGGTTGCAACGGTGGCCTCATGAACAGCGCTTTTGAGTACACACTCAAAACCGGAG
GGCTCATGAGAGAAGAAGACTATCCTTACACCGGAAAGGACGGTACTACTTGTAAGCTAG
ACAAGTCCAAGATCGTTGCGTCCGTCTCCAACTTCAGCGTCATTTCCATCGACGAAGACC
AGATCGCTGCGAATCTTGTCAAGAACGGACCTCTCGCGGTAGCCATCAACGCCGCATATA
TGCAGACTTACATCGGAGGAGTCTCGTGCCCTTACGTGTGCATGAGGAGGCTCAACCACG
GTGTCTTATTGGTGGGTTATGGATCGGCTGGTTACGCTCCGGCTAGGTTCAAGGAGAAGC
CTTACTGGATCATTAAGAACTCGTGGGGAGAGACTTGGGGTGAGAATGGTTTTTACAAAA
TCTGCAGAGGCTGTAACGTTTGTGGCGTTGACAGTCTTGTCTCCACCGTTACAGCCACCG
TCTCACCCGCCGCCCATTAGTTAAACCAGCGAGCTCTTGTTTTAATAAATTAACTAACGC
TGGTGATTTGTGTGAGCGAGGACTCTTTGATTGGCTACCTATTTCTCTCTGCTTTTTAAA
AAGGATGATGAAGTTTGTATTGTAAATAAAAATGCATTTTCTCC

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 3

CO CL3168Contig1 1015 3 7 U
GGATACAACATTTTGTTATCTCCACAGCAGATTCCAACTAAACAGGAATTAAACACACAA
GATCAAGAAGAAGATGGTGATGCTATTTATTAAGCTCTGCCTCTTCGCCATGGCCCCCCT
CTGCACTGTCGCTTCGAATGCTCAGACACAAGGAATAGGGTTTGGATATGGAGGTAGAAA
TGGACCAAACCAATGGGGACACTTAAACCCTCAGTACACTGAATGCTCGGTCGGTAAATT
GCAATCTCCAATTGATATCCAAAGGGGACAAACCTTTTACAACAGCACATTAGAACCGCT
TCACCGCGATTACTACACCACAAATGCAACACTCGTGAACCACGTCTGCAATGTCGCCAT
GTTCTTCGCGGAAGGAGCAGGAGATGTGGTAATAAACGATAAGAACTATACCTTATTGCA
AATGCATTGGCACACTCCTTCGGAACATCATCTCCATGGTGTCCAATATGCAGCTGAACT
ACACATGGTACACCAAGCAAAAGATGGAAGCTTTGCTGTGGTAGCAAGCCTCTTCAAAAT
CGGCAGTGAAGAGCCTTTCCTCTCTCAGATGAAGGATAAATTAATGAAGCTAAAGGATGA
GAGGCTCAAAGGGAACCAAACAGCACAAGTGGAAGTTGGAAAAATAAACACAAGACATAT
CGAACGTAAGACTCGAAAGTACTTCAGATACTATGGCTCACTCACCACTCCTCCTTGTTC
CGAAAACGTATCTTGGACCATTCTTGGCAAGGTGAGGTCAATGTCAAAGGAACAAGTAGA
ACTACTACGATTTCCATTGGACATTTTTTACAAGAAAAATGCAAGACCTTGTCAACCCCT
AAACGGCCGGGGAGTTGAGATGTTCCACGAGCGGGTCACCAAAAAGGGAACCGGAAACAA
AAAGAAAAAACCCAATTAAACTATTTTTGCATATCGATTTGTTCAGAACCTAATTAGCCC
CCAAAAAACTAGTTTTGTAAAATCGTAATGAAAAAAAATAATTGTATGTGGTACT


BQ
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AF RS1EM76TF U 1
AF RS1A711TF U 2
AF RS1EM76JQ C 476
BS 1 643 RS1EM76TF
BS 644 644 RS1A711TF
BS 645 668 RS1EM76TF
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BS 670 704 RS1EM76TF
BS 705 766 RS1A711TF
BS 767 1015 RS1EM76JQ

RD RS1EM76TF 704 0 0
GGATACAACATTTTGTTATCTCCACAGCAGATTCCAACTAAACAGGAATTAAACACACAA
GATCAAGAAGAAGATGGTGATGCTATTTATTAAGCTCTGCCTCTTCGCCATGGCCCCCCT
CTGCACTGTCGCTTCGAATGCTCAGACACAAGGAATAGGGTTTGGATATGGAGGTAGAAA
TGGACCAAACCAATGGGGACACTTAAACCCTCAGTACACTGAATGCTCGGTCGGTAAATT
GCAATCTCCAATTGATATCCAAAGGGGACAAACCTTTTACAACAGCACATTAGAACCGCT
TCACCGCGATTACTACACCACAAATGCAACACTCGTGAACCACGTCTGCAATGTCGCCAT
GTTCTTCGCGGAAGGAGCAGGAGATGTGGTAATAAACGATAAGAACTATACCTTATTGCA
AATGCATTGGCACACTCCTTCGGAACATCATCTCCATGGTGTCCAATATGCAGCTGAACT
ACACATGGTACACCAAGCAAAAGATGGAAGCTTTGCTGTGGTAGCAAGCCTCTTCAAAAT
CGGCAGTGAAGAGCCTTTCCTCTCTCAGATGAAGGATAAATTAATGAAGCTAAAGGATGA
GAGGCTCAAAGGGAACCAAACAGCACAAGTGGAAGTTGGAAAA*TAAACACAAGACATAT
CGAACGTA*GACTCGAAAGTACTTCAGATACTATGGCTCACTCA

QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1A711TF 765 0 0
GATACAACATTTTGTTATCTCCACAGCAGATTCCAACTAAACAGGAATTAAACACACAAG
ATCAAGAAGAAGATGGTGATGCTATTTATTAAGCTCTGCCTCTTCGCCATGGCCCCCCTC
TGCACTGTCGCTTCGAATGCTCAGACACAAGGAATAGGGTTTGGATATGGAGGTAGAAAT
GGACCAAACCAATGGGGACACTTAAACCCTCAGTACACTGAATGCTCGGTCGGTAAATTG
CAATCTCCAATTGATATCCAAAGGGGACAAACCTTTTACAACAGCACATTAGAACCGCTT
CACCGCGATTACTACACCACAAATGCAACACTCGTGAACCACGTCTGCAATGTCGCCATG
TTCTTCGCGGAAGGAGCAGGAGATGTGGTAATAAACGATAAGAACTATACCTTATTGCAA
ATGCATTGGCACACTCCTTCGGAACATCATCTCCATGGTGTCCAATATGCAGCTGAACTA
CACATGGTACACCAAGCAAAAGATGGAAGCTTTGCTGTGGTAGCAAGCCTCTTCAAAATC
GGCAGTGAAGAGCCTTTCCTCTCTCAGATGAAGGATAAATTAATGAAGCTAAAGGATGAG
AGGCTCAAAGGGAACCAAACAGCACAAGTGGAAGTTGGAAAAATAAACACAAGACATATC
GAACGTAAGACTCGAAAGTACTTCAGATACTATGGCTCACTCACCACTCCTCCTTGTTCC
GAAAACGTATCTTGGACCATTCTTGGCAAGGTGAGGTCAATGTCA

QA 1 765 1 765
DS 

RD RS1EM76JQ 540 0 0
GAACTACACATGGTACACCAAGCAAAAGATGGAAGCTTTGCTGTGGTAGCAAGCCTTTTC
AAAATCGGCAGTGAAGAGCCTTTCCTTTTTCAGATGAAGGATAAATTAATGAAGCTAAAG
GATGAGAGGCTCAAAGGGAACCAAACAGCACAAGTGGAAGTTGGAAAAATAAACCCAAGA
CATATCGAACGTAAGACTCGAAAGTACTTCAGATACTATGGCTCACTCACCACTCCTCCT
TGTTCCGAAAACGTATTTTGGACCATTTTTGGCAAGGTGAGGTCAATGTCAAAGGAACAA
GTAGAACTACTACGATTTCCATTGGACATTTTTTACAAGAAAAATGCAAGACCTTGTCAA
CCCCTAAACGGCCGGGGAGTTGAGATGTTCCACGAGCGGGTCACCAAAAAGGGAACCGGA
AACAAAAAGAAAAAACCCAATTAAACTATTTTTGCATATCGATTTGTTCAGAACCTAATT
AGCCCCCAAAAAACTAGTTTTGTAAAATCGTAATGAAAAAAAATAATTGTATGTGGTACT

QA 1 540 1 540
DS 



AS 1 3

CO CL3169Contig1 1639 3 9 U
GGTTTCGGAAACGTGGTCAGACACAGAGATTTCGAAGAGAGATCAAACCATTACGATGCT
CTTCTAGCTGCTGAATCTCGTGCCTTGTCTGGAAAGAAAGGAATCCATTCCGCTAAAGAG
TCTCCAGCAATGCACATCACTGACCTGACCGTGGCCGCGGCTAAGAAAGCCAAAGATTTC
TTGCCGTCGCTTCAGAGGATCAGGAGGATACCGGCTGTCGTGGAATATGTGCTGAGTGGA
CATCGGTTTAAGCTTTATATCCCGAAGCTGACGTGTAGTGTAGCGTTTGCGTTCTCTGGT
GTTAGATGCCCTGGCCGTGGAGAGCCTTTTTCGGATGAAGCTATCTCTGTGATGAGACGG
AGGATCATGCAGAGAGATGTTGAGATTGAAGTTGAAACGGTGGATAGAACCGGTACTTTC
TTGGGATCAATGTGGGAGGGGAGGACAAACGTGGCGACTGTTCTGCTTGAAGCTGGTTTA
GCGAAAATGCAGACAAGCTTTGGTGCAGACAGGATCGTTGAAGCACATATTCTTGAACAG
GCTGAGAGAACCGCTAAGAATCAGAAACTGAAGATTTGGGAAAACTATGTTGAAGGACAA
GAAGTCTCAAACGGTAGTACAACCGTAGAGACCAGACAAAAGGAGACTTTAAAGGTTGCT
GTTACAGAAGTGCTTGGAGGTGGTCGGTTCTATGTTCAATCTGTTGGAGATCAAAGAATA
GCTTCTATTCAGAACCAGCTTGCATCTCTGAGTGTTAAAGATGCTCCAATCATTGGGTCC
TTCAACCCCAAGAGAGGTGACATTGTTCTTGCACAGTTTAGCCTTGACAACTCCTGGAAC
CGTGCAATGATTGTGAGTGCACCCAGAGAAGCTATTCAGTCTCCAGATGAGAAGCTTGAA
GTGTTCTACATCGATTATGGAAACCAGGAGTTAGTCCCTTACAGCGCAATCCGACCAATA
GATGCTTCTGTGTCTTCAGCACCAGGGCTTGCTCAGCTATGCAGGCTCGCCTACATAAAG
GTTCCAAGCTTGGAGGAAGACTTTGGTCCTGAAGCTGGAGAGTATCTGCATACCGTGACG
CTGGGAAGTGGTAAAGAGTTCAAAGCAGTGATAGAAGAAAGAGACACATCTGGAGGTAAA
GCCAAAGGCCAAGGAACTGGAACCGAGCTTGCTGTCACTCTCATTGCTGTTGATGAAGAG
ATCTCTGTCAACGCTGCAATGCTTCAGGAAGGAATAGCGAGAATGTAGAAACGTAGGAGG
TTTGAGCACAAGGACAAGCAAGCAGTTCTTGATGCTTTAGAGAAGTACCAGGAGGAAGCT
CGCAAGGCTAGAACTGGAATCTGGCAGTACGGTGACGTGGAATCAGATGATGAGGATACT
GGTCCGGCCAGGAAGCCTGCCGGTGGTCGCCGGTAGATCATCGGAAATTAATATGATGGT
TTCAAAGGTACCATGAGGTAGGGGAACAAGTGTTCTGTCTGGTCGGTTTCTATAAGAGGG
TTTAAAGACACGTCATCAGATTTTTTTGAAAGTTTTTTTAGATTGTTCACTTTCTTTTTT
TCTTTTTAATTTTTATACTTTTTGAGTTTTAAAGAGGACTTTCTATGTAGGTCTTGAAAT
AAGGGAAGTTTGAACTATG


BQ
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GTTACAGAAGTGCTTGGAGGTGGTCGGTTCTATGTTCAATCTGTTGGAGATCAAAGAATA
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TTCA*CCCCAAGAGAGGTGACATTGTTCTTGCACAGTTTAGCCTTGACA*CTCCTGGAAC
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GG
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GAGAGTATCTGCATACCGTGACGCTGGGAAGTGGTAAAGAGTTCAAAGCAGTGATAGAAG
AAAGAGACATATCTG

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DS 

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CGGCCAGGAAGCCTGCCGGTGGTCGCCGGTAGATCATCGGAAATTAATATGATGGTTTCA
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AAGACACGTCATCAGATTTTTTTGAAAGTTTTTTTAGATTGTTCACTTTCTTTTTTTCTT
TTTAATTTTTATACTTTTTGAGTTTTAAAGAGGACTTTCTATGTAGGTCTTGAAATAAGG
GAAGTTTGAACTATG

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DS 



AS 1 3

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ACACCATAACCATTCCCAAGGCATCTGAAGGACCCATGACTCGATCTAAGCAAAGAAGGC
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CTATATTTCTAGCTGATCCACCCAAGAGAGGACATATCAACACGACAAGTGATGACTTGA
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ATTCAAATGTTTACTTGGCAGGAACTGAAGCTGAAGAAGAATCCTTCCATGAAGAAACCA
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AGTTCCACCATGAACCAAGGGAAGTCTTTTCATTATTTACAATTTGTGCAGGTAAGATGG
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1AM57TF U 1
AF RS1D564TF U 159
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GTCAGTCTAGTGGTTCCTAGAACTCTCCCATCTCAGCAGCCACCTTGGTTCAAGACCCAA
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ATTGCTTTGCGTAGAAACCTTAAGTCCTGTCGTTTTGGAGTCTTTTATTTTGCTTTGAGT
CAGCTGAAAGACTATTTATAAAGTCCCATACGCAGCTTGTAACAGACAACTTTGGACCTA
ATCAATATATGAGTCAGTTT
GCAC

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DS 

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AACACGACAAGTGATGACTTGAGCAATGCCTTTGCGCAACTCAATATCACTCAAGGTAAG
TCAGCTTATTTGAATGGTGCTGATTCAAATGTTTACTTGGCAGGAACTGAAGCTGAAGAA
GAATCCTTCCATGAAGAAACCAACAAGATTAAAGCTGAAGATAATAAAGAGAAGACTGAA
GAAGAGCTTGAAGAAGAAGAGCAAGACAAGACATCTTTCAAAAATGAACCAAGCGTGCTC
AACTTCAAGAATACCACAAAGGAGTTCCACCATGAACCTAGGGAAGTCTTTTCATTATTT
ACAATTTGTGCAGGTAAGATGGGTCAGTCTAGTGGTTCCTAGAACTCTCCCATCTCAGCA
GCCACCTTGGTTCAAGACCCAAACTCGTTTAGTTTATTTTCTTTTTTTAAGTTTTTGCAA
TCTTTCCTTTTTGGGGCATTTTATTGCTTTGCGTAGAAACCTTAAGTCCTGTCGTTTTGG
AGTCTTTTATTTTGCTTTGAGTCAGCTGAAGGACTATTTATAAAGTCCCATACGCAGCTT
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DS 

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GTCCCATACGCAGCTTGTAACAGACAACTTTGGACCTAATCAATATATGAGTCAGTTTGC
AC

QA 1 302 1 302
DS 



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TGCGATTCCCAATTCGCCACAACACGTGTTGTGGCTAACCTTATCTCTACTTCAATTGGG
CTTATATTGGACTTTTAA


BQ
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AF RS1F451JQ C 1
AF RS1F451TF U 1
AF RS1CR47TF U 162
BS 1 400 RS1F451TF
BS 401 618 RS1CR47TF

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TTAAGAGTCAAATGGATTTGTGCTTTGTTTTCTATATTAAGATGTTGATCTAATAAGTTG
TTTAGTTGCTTTTGTCTTTCTCTCTTCTCTCTGTTTCACACTTTTTTTTGATTTTGAATC
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TTAAGAGTCAAATGGATTTGTGCTTTGTTTTCTATATTAAGATGTTGATCTAATAAGTTG
TTTAGTTGCTTTTGTCTTTCTCTCTTCTCTCTGTTTCACACTTTTTTTTGATTTTGAATC
TTCTCTTTATCATCGATACTCAATATTTTATTTTGGAAGAGTTTATAAATCTTTGCTTAT
TTGATTGGCCTAAGTAAAGGCTATAACAAAATCTCTCAATCGAAATTAAGATTTGAGTTG
TTGAAAAACTTCTTCGGTTTAGTCCAGATTTTGTTGCTAAATCATTCTGAGCTTTCATTG
TGTTTATTTCTGGTGTTAAATTAATAATCATTCTTTGTCC

QA 1 400 1 400
DS 

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TTTTTTTTGATTTTGAATCTTCTCTTTATCATCGATACTCAATATTTTATTTTGGAAGAG
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GAAATTAAGATTTGAGTTGTTGAAAAACTTCTTCGGTTTAGTCCAGATTTTGTTGCTAAA
TCATTCTGAGCTTTCATTGTGTTTATTTCTGGTGTTAAATTAATAATCATTCTTTGTCCA
AAAAAAATTAATAATCATTCAATTTCGAAGATGAATTGCTTGAAAAGAAGAGCTGGAAAA
AGGTGTTCGAAGAGCTAGCTACTGGTGATGTCAGAATTACGCCGCCGTTAGTGAATCTAT
GATCTTCCGGCACCGTTACTGCGATTCCCAATTCGCCACAACACGTGTTGTGGCTAACCT
TATCTCTACTTCAATTGGGCTTATATTGGACTTTTAA

QA 1 457 1 457
DS 



AS 1 3

CO CL3172Contig1 806 3 14 U
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CACTCACCAAGGAAGCCGAGGCCCTGCTTATGGTGAAGCTTTTAGAGATAACCATCGAAT
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TACTGATATCAAGATTAGGAGGAGAGTTGCTGTTGGTTTGAATCCAAACATTCGATTTTA
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TGGGAAGCGGACCTATTACACATTGTTGATATATCTAAGCGGCAACAATAACGCAAAATC
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AGGTGGAGAAACTGTCTTTTATGGTTCAAGGAACAGTATCGTAGCTGAGGTAGCTCCAGT
GGAAGGTATGGCTCTGTTTCATATTCATGGAGACAAGTGTATGTTGCACGAAGGAAGAAA
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TATTCACATTCTATGTGTTTTGTGTTTCACAAATTTATTACTTTCATTCAACATTTCGAA
CCAGTAATTAACTTTATGTTCACCGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CA75TF U 6
AF RS1EY92TF U 1
AF RS1CA75JQ C 35
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BS 164 164 RS1CA75TF
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GG
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GAAACTGTCTTTTATGGTTCAAGGAACAGTATCGTAGCTGAGGTAGCTCCA

QA 3 593 3 593
DS 

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GAACTGTCTCACTAGTGATGAGTCAAAGGGCTTTGTTAAAATCACAGAGTCTCTAGGTTT
CACTCACCAAGGA*GCCGAGGCCCTGCTTATGGTGAAGCTTTTAGAGATAACCATCGAAT
CTCTGTCAACGATCCTGTTCTTGCTGACACACTATGGCAATCCGGGCTTTCTAATTTGTT
TACTGATATCAAGATTAGGAGGAGAGTTGCTGTTGGTTTGAATCCAAACATTCGATTTTA
CAGGTATAGTGCTGGTCAGCATTTTGGTCGTCACATTGATGAAAGTGTTGATCTTGAAGA
TGGGAAGCGGACCTATTACACATTGTTGATATATCTAAGCGGCAACAATAACGCAAAATC
CAAATCCAAGAGCAGTTCTTCAAGCAAGACGAATGATTCTCCTTTAGCTGAGCCTTTAGT
AGGTGGAGAAACTGTCTTTTATGGTTCAAGGAACAGTATCGTAGCTGAGGTAGCTCCAGT
GGA*GGTATGGCTCTGTTTCATATTCATGGAGACAAGTGTATGTTGCACGAAG*AAGAA*
TGTCTCCA**GGAGTCAAGTATGTGTTCCGTTCTGATGTTGTT

QA 1 703 1 703
DS 

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AAGAATCTTGATCTCTTCACGGTGGAGAACTGTCTCACTAGTGATGAGTCAAAGGGCTTT
GTTAAAATCGCAGAGTCTCTAGGTTTCACTCACCAAGGAAGCCGAGGCCCTGCTTATGGT
GAAGCTTTTAGAGATAACCATCGAATCTCTGTCAACGATCCTGTTCTTGCTGACACACTA
TGGCAATCCGGGCTTTTTAATTTGTTTACTGATATCAAGATTAGGAGGAGAGTTGCTGTT
GGTTTGAATCCAAACATTCGATTTTACAGGTATAGTGCTGGTCAGCATTTTGGTCGTCAC
ATTGATGAAAGTGTTGATCTTGAAGATGGGAAGCGGACCTATTACACATTGTTGATATAT
TTAAGCGGCAACAATAACGCAAAATCCAAATCCAAGAGCAGTTCTTCAAGCAAGACGAAT
GATTCTCCTTTAGCTGAGCCTTTAGTAGGTGGAGAAACTGTCTTTTATGGTTCAAGGAAC
AGTATCGTAGCTGAGGTAGCTCCAGTGGAAGGTATGGCTCTGTTTCATATTCATGGAGAC
AAGTGTATGTTGCACGAAGGAAGAAATGTCTCCAAGGGAGTCAAGTATGTGTTCCGTTCT
GATGTTGTTTTTGCATAACGAAACATTATTCACATTCTATGTGTTTTGTGTTTCACAAAT
TTATTACTTTCATTCAACATTTCGAACCAGTAATTAACTTTATGTTCACCGT

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 3

CO CL3173Contig1 922 3 2 U
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GATGGATGGACTTGATCATATCAAATACATCTCCAAGCTAAATCTCTATTCTCAGTAGAA
CCAGAAAACGAGAAGGCAAAAACAAGTTCTATTGATTCTTTTTAGTAGTGGGAGTGAATG
ATGATGATGATGATGATGATGATTTAGAGCTCTGAATCTGATCATCTTTAGATGTTTTGA
TTATAAACAGAAGCGTTTCCACAAGCATCGCCAAAACTAGTCCAAGAATCCCACCAGCAG
CACTCAGAGCGGGGTTGCGGTTGAATAAGGCTCTGAAGGAAGCGTAACCAACCAGATATC
CAGTGAACATGGTAAGACCAACGTGTAAACCAAAACCGAGCTGGTCTTTGTAAGAGGAGA
AAGGCTCTTCGACTTGTTTCCTAGGTGTAATATCTTTAACAAGCTCAGCATACTCCTTCC
TCTCCGCTATTTCTCTCAGCTTAACCAATCTCAGCTTCAGTTCTTCACTCTTTTCTCTGG
GTTTTGGACTGGTGAAGACGAAATCTGAGCGGGGAGAAAAGTCCCGACAAGTCCGGTCGG
GTCGAAGGATCGGATCCTGTCCACATAGCCCGGAGCAATTTGTAGGGAACGGTGTTCCGC
GAGCGCAGATCAGAAGCGATGTCTCTGAGTTCCTCGGAGAGACGATGGTCATCGCAGGCC
AACGCGAGAAACGATTGTATCGGTTCGGTTGCGGAGAGAATCAGGCCAGAGGCATTTCTC
GGGTCGGGTTGATCCATCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FA26JQ U 477
AF RS1AI46JQ U 1
AF RS1AI46TF C 175
BS 1 709 RS1AI46JQ
BS 710 922 RS1AI46TF

RD RS1FA26JQ 146 0 0
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GAGAAAGGCTCTTCTACTTGTTTCCTAGGTGTAATATCTTTAACAAGCTCAGCATACTCC
TTCCTCTCCGCTATTTCTCTCA
CCTT

QA 1 142 1 142
DS 

RD RS1AI46JQ 709 0 0
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TTAATACATAAGAATTAAAAAAATCAACTGTTTCAGACAATTTTCTGTGTTTTTGTGTTA
GATGGATGGACTTGATCATATCAAATACATCTCCAAGCTAAATCTCTATTCTCAGTAGAA
CCAGAAAACGAGAAGGCAAAAACAAGTTCTATTGATTCTTTTTAGTAGTGGGAGTGAATG
ATGATGATGATGATGATGATGATTTAGAGCTCTGAATCTGATCATCTTTAGATGTTTTGA
TTATAAACAGAAGCGTTTCCACAAGCATCGCCAAAACTAGTCCAAGAATCCCACCAGCAG
CACTCAGAGCGGGGTTGCGGTTGAATAAGGCTCTGAAGGAAGCGTAACCAACCAGATATC
CAGTGAACATGGTAAGACCAACGTGTAAACCAAAACCGAGCTGGTCTTTGTAAGAGGAGA
AAGGCTCTTCGACTTGTTTCCTAGGTGTAATATCTTTAACAAGCTCAGCATACTCCTTCC
TCTCCGCTATTTCTCTCAGCTTAACCAATCTCAGCTTCAGTTCTTCACTCTTTTCTCTGG
GTTTTGGACTGGTGAAGACGAAATCTGAGCGGGGAGAAAAGTCCCGACA

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1AI46TF 748 0 0
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GTAGAACCAGAGAACGAGAAGGCAAAAACAAGTTCTATTGATTCTTTTTAGTAGTGGGAG
TGAATGATGATGATGATGATGATGATGATTTAGAGCTCTGAATCTGATCATCTTTAGATG
TTTTGATTATAAACAGAAGCGTTTCCACAAGCATCGCCAAAACTAGTCCAAGAATCCCAC
CAGCAGCACTCAGAGCGGGGTTGCGGTTGAATAAGGCTCTGAAGGAAGCGTAGCCAACCA
GATATCCAGTGAACATGGTAAGACCAACGTGTAAACCAAAACCGAGCTGGTCTTTGTAAG
AGGAGAAAGGCTCTTCGACTTGTTTCCTAGGTGTAATATCTTTAACAAGCTCAGCATACT
CCTTCCTCTCCGCTATTTCTCTCAGCTTAACCAATCTCAGCTTCAGTTCTTCACTCTTTT
CTCTGGGTTTTGGACTGGTGAAGACGAAATCTGAGCGGG*AGAAAAGTCCCGACAAGTCC
GGTCGGGTCGAAGGATCGGATCCTGTCCACATAGCCCGGAGCAATTTGTAGGGAACGGTG
TTCCGCGAGCGCAGATCAGAAGCGATGTCTCTGAGTTCCTCGGAGAGACGATGGTCATCG
CAGGCCAACGCGAGAAACGATTGTATCGGTTCGGTTGCGGAGAGAATCAGGCCAGAGGCA
TTTCTCGGGTCGGGTTGATCCATCTTTT

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 3

CO CL3174Contig1 740 3 3 U
AGGGACACAACAATACACCAATTCTGCCAAATAGCGTTTTGAGATTCGTCTAAAGCTAAA
ATAACAATTTAAAGATTTTTCATGTTAGGATCGAAAACTCTGTTTTGCGGATTTTGAGTT
TTTGAATCAAAGATGGGGAGGTTGTTTGTGGTTCACCTTGAAGGGAAGATCTATAGCTGC
AAACACTGCAAGACTCATCTTGCTGTATATGAAGACATCATCTCCAAGTCTTTTCACTGT
AAGCATGGAAAAGCTTATCTTTTCAACAAAGTTTCCAATGTTACAATTGGAGAAACAGAA
GACAGAATGATGATGACAGGAAAACATACAGTGGCTGACATTTTCTGTGTCTCATGTGGA
TCAATAGTTGGTTGGAGATATGAGACTGCTCATGAGAAAAGCCAGAAGTACAAAGAAGGA
AAGTCAGTTCTTGAAAGATTTAAGATATCGGGTCCTGATGGGAGCAACTACTGGGTGAGT
AGCCATGGAAGGCATATAGGTGGAAGTGATGCAGATGATTCTTGAACTCATCCTCTATCC
TTCTTATTTGACATCCCCTGTAAATGTAAATTCGTCAATCTCCACTCCAACTTGGTCTTA
TAAGTAACGAAAACACTTCTTTTCTTGCTTTCATTATGATCTGAAAATCCCTCAGTAAAT
AAAGTCTGATTCTGTGTAATGATCATGTTTCATCAAAACCTATGCTTTTCATATTGCAAT
AACAAAATGTCATAATAAAT


BQ
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AF RS1C603TF U 1
AF RS1DM37JQ C 3
AF RS1DM37TF U 3
BS 1 647 RS1C603TF
BS 648 721 RS1DM37TF
BS 722 740 RS1DM37JQ

RD RS1C603TF 648 0 0
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ATAACAATTTAAAGATTTTTCATGTTAGGATCGAAAACTCTGTTTTGCGGATTTTGAGTT
TTTGAATCAAAGATGGGGAGGTTGTTTGTGGTTCACCTTGAAGGGAAGATCTATAGCTGC
AAACACTGCAAGACTCATCTTGCTGTATATGAAGACATCATCTCCAAGTCTTTTCACTGT
AAGCATGGAAAAGCTTATCTTTTCAACAAAGTTTCCAATGTTACAATTGGAGAAACAGAA
GACAGAATGATGATGACAGGAAAACATACAGTGGCTGACATTTTCTGTGTCTCATGTGGA
TCAATAGTTGGTTGGAGATATGAGACTGCTCATGAGAAAAGCCAGAAGTACAAAGAAGGA
AAGTCAGTTCTTGAAAGATTTAAGATATCGGGTCCTGATGGGAGCAACTACTGGGTGAGT
AGCCATGGAAGGCATATAGGTGGAAGTGATGCAGATGATTCTTGAACTCATCCTCTATCC
TTCTTATTTGACATCCCCTGTAAATGTAAATTCGTCAATCTCCACTCCAACTTGGTCTTA
TAAGTAACGAAAACACTTCTTTTCTTGCTTTCATTATGATCTGAAAA
A

QA 1 647 1 647
DS 

RD RS1DM37JQ 738 0 0
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AACAATTTAAAGATTTTTCATGTTAGGATCGAAAACTCTGTTTTGCGGATTTTGAGTTTT
TGAATCAAAGATGGGGAGGTTGTTTGTGGTTCACCTTGAAGGGAAGATCTATAGCTGCAA
ACACTGCAAGACTCATCTTGCTGTATATGAAGACATCATCTCCAAGTCTTTTCACTGTAA
GCATGGAAAAGCTTATCTTTTCAACAAAGTTTCCAATGTTACAATTGGAGAAACAGAAGA
CAGAATGATGATGACAGGAAAACATACAGTGGCTGACATTTTCTGTGTCTCATGTGGATC
AATAGTTGGTTGGAGATATGAGACTGCTCATGAGAAAAGCCAGAAGTACAAAGAAGGAAA
GTCAGTTCTTGAAAGATTTAAGATATCGGGTCCTGATGGGAGCAACTACTGGGTGAGTAG
CCATGGAAGGCATATAGGTGGAAGTGATGCAGATGATTCTTGAACTCATCCTCTATCCTT
CTTATTTGACATCCCCTGTAAATGTAAATTCGTCAATCTCCACTCCAACTTGGTCTTATA
AGTAACGAAAACACTTCTTTTCTTGCTTTCATTATGATCTGAAAATCCCTCAGTAAATAA
AGTCTGATTCTGTGTAATGATCATGTTTCATCAAAACCTATGCTTTTCATATTGCAATAA
CAAAATGTCATAATAAAT

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1DM37TF 727 0 0
GGACACAACAATACACCAATTCTGCCAAATAGCGTTTTGAGATTCGTCTAAAGCTAAAAT
AACAATTTAAAGATTTTTCATGTTAGGATCGAAAACTCTGTTTTGCGGATTTTGAGTTTT
TGAATCAAAGATGGGGAGGTTGTTTGTGGTTCACCTTGAAGGGAAGATCTATAGCTGCAA
ACACTGCAAGACTCATCTTGCTGTATATGAAGACATCATCTCCAAGTCTTTTCACTGTAA
GCATGGAAAAGCTTATCTTTTCAACAAAGTTTCCAATGTTACAATTGGAGAAACAGAAGA
CAGAATGATGATGACAGGAAAACATACAGTGGCTGACATTTTCTGTGTCTCATGTGGATC
AATAGTTGGTTGGAGATATGAGACTGCTCATGAGAAAAGCCAGAAGTACAAAGAAGGAAA
GTCAGTTCTTGAAAGATTTAAGATATCGGGTCCTGATGGGAGCAACTACTGGGTGAGTAG
CCATGGAAGGCATATAGGTGGAAGTGATGCAGATGATTCTTGAACTCATCCTCTATCCTT
CTTATTTGACATCCCCTGTAAATGTAAATTCGTCAATCTCCACTCCAACTTGGTCTTATA
AGTAACGAAAACACTTCTTTTCTTGCTTTCATTATGATCTGAAAATCCCTCAGTAAATAA
AGTCTGATTCTGTGTAATGATCATGTTTCATCAAAACCTATGCTTTTCATATTGCAATA
CAAATGTC

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 3

CO CL3175Contig1 969 3 7 U
GGAAAGTAAATTCTAATTCAATAACAATGAAGACCATTTCATTGACTCTTATTCCATTTT
TAATATCCATGGCACCATATCCAGCTTTGAGCAAAGCCCCTTTCGGCACTCCTGCGGCCG
GCGGCGGCTCTATTGGATTTAACGCCCCTACTGGCCCTGGCTATAGGAGTGGGGATACAG
CCCCAGGAGGCTCTACTGGGATTAACGGACCTACTGGCCCCGGCTATAAGGGTGGGGGTC
CCGGCGCCTATAAGAGCGGCGATACTAGCAATGGCTATAAAAGTGGATCTACACCGGGTA
AGCGATATGGAGGTGGCACGGGTGCGGCTATCGGTGTGTTCCCCAAGAAACCTGTACCGA
CGCCAATGCCAGCAGAATGCAAACCGATTTCAGGATGCGTCACTAAGCATATAGCCGGAG
GCAACCCCAAGGAGCCTCAATACCATGGACCATGTTGTATGGAATTTAAAAACAAAGTAT
CGTGTGTGTGTAAATTCCTTTTGTCCAAGAATGCTAAGCAAATAAACGCTGCCAATGGTG
TGATTCGAAGTTGTAATTTTAAAAATCCCATTTGTATAAAGAAGCCAATGCCAGCAGCAT
GCAGACCAGAGGTTAAGCATTGTGTCGAAATGCATATGTACAGAGTAGGAGCTAGCAATC
CTACATTCGGAAGCCCATGTTGTCAGAAATTTAAAACCTCGAAACGATGTGTCATGGCGT
TTAGAAACTCCCCAGAGCCTCATTTAAGCCATGCAGCTAAGGGTGTTATTGCAGGTTGTC
ACTTTTCATAAATAATTATACAAAGGAGCTAAAAATGGATAATATTGCAAACCTATTTGA
GACAATGTAAATATTGGTTTTTATTTGATGAAATTAAAATATCAGTATTACTTTATACTG
ACTTGTTGTATTTGTATGTGTGAATATGTAAATACTATCTTTTTCAGAATGAAAAATATG
CATGGTATG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C637TF U 1
AF RS1CM22TF U 322
AF RS1C637JQ C 226
BS 1 695 RS1C637TF
BS 696 696 RS1CM22TF
BS 697 762 RS1C637TF
BS 763 763 RS1CM22TF
BS 764 789 RS1C637TF
BS 790 850 RS1CM22TF
BS 851 969 RS1C637JQ

RD RS1C637TF 789 0 0
GGAAAGTAAATTCTAATTCAATAACAATGAAGACCATTTCATTGACTCTTATTCCATTTT
TAATATCCATGGCACCATATCCAGCTTTGAGCAAAGCCCCTTTCGGCACTCCTGCGGCCG
GCGGCGGCTCTATTGGATTTAACGCCCCTACTGGCCCTGGCTATAGGAGTGGGGATACAG
CCCCAGGAGGCTCTACTGGGATTAACGGACCTACTGGCCCCGGCTATAAGGGTGGGGGTC
CCGGCGCCTATAAGAGCGGCGATACTAGCAATGGCTATAAAAGTGGATCTACACCGGGTA
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CGCCAATGCCAGCAGAATGCAAACCGATTTCAGGATGCGTCACTAAGCATATAGCCGGAG
GCAACCCCAAGGAGCCTCAATACCATGGACCATGTTGTATGGAATTTAAAAACAAAGTAT
CGTGTGTGTGTAAATTCCTTTTGTCCAAGAATGCTAAGCAAATAAACGCTGCCAATGGTG
TGATTCGAAGTTGTAATTTTAAAAATCCCATTTGTATAAAGAAGCCAATGCCAGCAGCAT
GCAGACCAGAGGTTAAGCATTGTGTCGAAATGCATATGTACAGAGTAGGAGCTAGCAATC
CTACATTCGGAAGCCCATGTTGTCAGAAATTTAAA*CCTCGAAACGATGTGTCATGGCGT
TTAGAAACTCCCCAGAGCCTCATTTAAGCCATGCAGCTAAGG*TGTTATTGCAGGTTGTC
ACTTTTCAT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RS1CM22TF 529 0 0
GTGCGGCTATCGCTGTGTTCCCCAAGAAACCTGTACCGACGCCAATGCCAGCAGAATGCA
AACCGATTTCAGGATGCGTCACTAAGCATATAGCCGGAGGCAACCCCAAGGAGCCTCAAT
ACCGTGGACCATGTTGTATGGAATTTAAAAACAAAGTATCGTGTGTGTGTAAATTCCTTT
TGTCCAAGAATGCTAAGCAAATAAACGCTGCCAATGGTGTGATTCGAAGTTGTAATTTTA
AAAATCCCATTTGTATAAAGAAGCCAATGCCAGCAACATGCAGACCAGAGGTTAAGCATT
GTGTCGAAATGCATATGTACAGAGTAGGAGCTAGCAATCCTACATTCGGAAGCCCATGTT
GTCAGAAATTTAAAACCTCGAAACGATGTGTCATGGCGTTTAGAAACTCCCCAGAGCCTC
ATTTAAGCCATGCAGCTAAGGGTGTTATTGCAGGTTGTCACTTTTCATAAATAATTATAC
AAAGGAGCTAAAAATGGATAATATTGCAAACCTATTTGAGACAATGTAA

QA 1 529 1 529
DS 

RD RS1C637JQ 744 0 0
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GATCTACACCGGGTAAGCGATATGGAGGTGGCACGGGTGCGGCTATCGGTGTGTTCCCCA
AGAAACCTGTACCGACGCCAATGCCAGCAGAATGCAAACCGATTTCAGGATGCGTCACTA
AGCATATAGCCGGAGGCAACCCCAAGGAGCCTCAATACCATGGACCATGTTGTATGGAAT
TTAAAAACAAAGTATCGTGTGTGTGTAAATTCCTTTTGTCCAAGAATGCTAAGCAAATAA
ACGCTGCCAATGGTGTGATTCGAAGTTGTAATTTTAAAAATCCCATTTGTATAAAGAAGC
CAATGCCAGCAGCATGCAGACCAGAGGTTAAGCATTGTGTCGAAATGCATATGTACAGAG
TAGGAGCTAGCAATCCTACATTCGGAAGCCCATGTTGTCAGAAATTTAAAACCTCGAAAC
GATGTGTCATGGCGTTTAGAAACTCCCCAGAGCCTCATTTAAGCCATGCAGCTAAGGGTG
TTATTGCAGGTTGTCACTTTTCATAAATAATTATACAAAGGAGCTAAAAATGGATAATAT
TGCAAACCTATTTGAGACAATGTAAATATTGGTTTTTATTTGATGAAATTAAAATATCAG
TATTACTTTATACTGACTTGTTGTATTTGTATGTGTGAATATGTAAATACTATCTTTTTC
AGAATGAAAAATATGCATGGTATG

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL3176Contig1 835 2 2 U
GGGTCTCTCTCTCCGACGGACAGCCGTGAGAAACCATGTGGTCGGCGACGCTCGCTTTCC
CTTCCTTTGTGGCTTCATCAACTTCTCTATCAAGCTACACAAAACCGAGACTTCCTAAGA
TTCAAGCTTCTCTATCGAATTACCCTCTCGCGAGCAAAATCATGGTCAGAAGTAAAGTTT
CTGCCTTTTCACTATTATCTGGACTACCCTTTAGTTAAGATTATATATCTTCTTCTCTCT
GATGATTTGATTCTGTTTTAATGGTTAATGGAAGGATTCCGAGTCAGGATTGGCTGTAAC
ATATATTAGTGTCTGGAGGTTTTAGAACTCTGTTCTCGTGGCGAAACATAACAATCATCG
TGAAATTGAAGTTCGATTTGGTGATTTATTGTCTTTAAATCTGCAGACTTACCGTTTTCT
ATAAGTGAAGACTTTCTGCAGAAGGAGTTTTCAGCTTTCGGCGAGATAGCTGAAGTTAAG
CTTGTCAAAGATGAGTCAATGAAGAGATCAAAAGGTTATGCCTTCATTCAATACATGTCT
CAAGATGATGCCTTTCTAGCCATAGAGACCATGGACCGTAGGATGTACAATGGGAGGATG
ATTTATATAGACATTGCTAAACCAGGGAAGCGTGATTTCCAACAACAGCCGAGGACTTCT
GGTCCCCCTGAGAATCAGCTCCACGTGCCAGAAGAACCGGCCAGTAACGAGGTCGCTGAT
TGCTGGTATTAATTGTTTAGGACCATTGTTATGTCAAATCTCGTCACAATGATCAATATA
AACAAAAATGTTGTTTTTTTTACTACTGATAAACAATCACCGACACGGTTCCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GH88TF U 1
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CAAGATGATGCCTTTCTAGCCATAGAGACCATGGACCGTAG
ATGTACAATG

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DS 

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AT
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CAAAAATGTTGTTTTTTTTACTACTGATAAACAATCACCGACACGGTTCCAGC

QA 3 415 3 415
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1BA61JQ U 30
AF RS1BA62JQ U 1
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RD RS1BA61JQ 431 0 0
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AACTATATCGA

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DS 

RD RS1BA62JQ 741 0 0
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AATTTTGCCAACCCCTTTTCCCACAATAACAAAAGAAAATACATATGTGCAATACGTGTA
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CAAACTTCCTACAAGCTACTTAGCTCTATGGCCATATCAACAGCCGCTATAAGCAAGAGC
AAGATTTATGCTTGGTTAGAAGAAGAAAGGCATAACCAGCAAAAACGTTTGATTTCAACA
TCATTGGGATTTAAAAGAGCACATAGGAGCATTAGAAAACTAAAATCCGATTAAACAAAA
TCGGAACTTTATTATATTCAAACCGAACCAGAGACAGAAGATGAAGAAGAACAACTTTGA
TTCAGTTTGGAAACACACAAC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 3

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AACCGAATGAGCTAGAGAGTGATATCAACGAGGGAGGGAACAGCGGGAACTACGAAAGAA
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AGGGAAAGCTTGGTAGCCTACAGGTTGATCAAGACATGAATACTGAAAAGGAAAGAGAGG
AGAGTATTTCAAGTTCGAATTCAAATGAAAATGGTGATAAAGACCGGTGGGTTGGTCTAT
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GTGGTTTGACTTGTCAAAGTGATGATCTCTGGGATCTCTCAGATTTTGGAGAAATGCAGC
AAGTGGATAGCATATGAGACCGAGCATAACCTGAAAAAATCTTTTGATTGTAAAGTCTAG
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GAGTCAATTAGGATATATATAGCCTCTAGTTTAGACCAGTTTGAAGCACATTATGTTCGT
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TTGTG


BQ
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G
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BQ
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AF RS1H307TF U 4
AF RS1CF38TF U 1
AF RS1CF38JQ C 641
BS 1 467 RS1CF38TF
BS 468 468 RS1H307TF
BS 469 698 RS1CF38TF
BS 699 699 RS1CF38JQ
BS 700 737 RS1CF38TF
BS 738 738 RS1CF38JQ
BS 739 771 RS1CF38TF
BS 772 772 RS1CF38JQ
BS 773 781 RS1CF38TF
BS 782 782 RS1CF38JQ
BS 783 795 RS1CF38TF
BS 796 1348 RS1CF38JQ

RD RS1H307TF 585 0 0
GG
GAGAAGGATGGCGTCACCGAGTCATACCCCTCCTCCCGATCACGGCGGCGCCGACTCGGT
CGAGACTCGGTCTCCCGAGCTCAGAAAAGATCCGGTGACTAACCGCTGGGTCATATTCTC
CCCCGCCCGAGCCAAGAGACCGACCGATTTCAAATCAAAATCTCCAGAGAACCCTAATCC
CAAAAAACCTTCATCTTGCCCCTTCTGCATCGGCCGCGAGCACGAGTGCGCTCCGGAGAT
ATTCCGCGTCCCGCCGGATGATGATGACGATCCGAATTGGAAAATCCGGGTCATCGAGAA
TCTCTACCCTGCTCTAAGCAGGAATCTCGAGACCCAATCGACGGATACTAATCGGAGCAA
CCTGAATCGGAGTATAGTCGGGTTCGGATTCCACGACGTGGTGATCGAAGCCCCTCTTCA
CTCGATTCAGCTCTCCGATGTTGATCCGGTGGGTATCGGCGACGTTATGATCGCCTATAG
GAAGAGGATCGAGCATATCGCTCAACACGATTCCATCGATTACATTCAGGTGTTCAAGAA
CCATGGTGCGTCGGCAGGAGCGTCGATGAGTCACTCCCACAGT

QA 3 585 3 585
DS 

RD RS1CF38TF 795 0 0
GCGGAGAGAAGGATGGCGTCACCGAGTCATACCCCTCCTCCCGATCACGGCGGCGCCGAC
TCGGCCGAGACTCGGTCTCCCGAGCTCAGAAAAGATCCGGTGACTAACCGCTGGGTCATA
TTCTCCCCCGCCCGAGCCAAGAGACCGACCGATTTCAAATCAAAATCTCCAGAGAACCCT
AATCCCAAAAAACCTTCATCTCGCCCCTTCTGCATCGACCGCGAGCACGAGTGCGCTCCG
GAGATATTCCGCGTCCCGCCGGATGATGATGACGATCCGAATTGGAAAATCCGGGTCATC
GAGAATCTCTACCCGGCTCTAAGCAGGAATCTCGAGACCCAATCGACGGATACTAATCGG
AGCAACCTGAATCGGAGTATAGTCGGGTTCGGATTCCACGACGTGGTGATCGAAGCCCCT
CTTCACTCGATTCAGCTCTCCGATGTTGATCCGGTGGGTATCGGCGATGTTATGATCGCC
TATAGGAAGAGGATCGAGCAGATCGCTCAACACGATTCCATCAATTACATTCAGGTGTTC
AAGAACCATGGTGCGTCGGCAGGAGCGTCGATGAGTCACTCCCACAGTCAGATAATGGCT
CTCCCTGTTGTTCCTCCGACGGTTTCTTCACGGCCTGATGGAACTAAAGATTATTTCGAG
GAGACTGGGAAGTGTTGTCTCTGTGAAGCTAAAGCAAA*CACTTTGTGATCGATGAGTCG
TCTCATTTCGTTTCCGT*GCTCCTTATGCTTCTACGTATCCCTTTGAGGTT*GGATTGTT
C*AAAGTATCACTCT

QA 1 795 1 795
DS 

RD RS1CF38JQ 708 0 0
GAACTAAAGATTATTTCGAGGAGACTGGGAAGTGTTGTCTCTGTGAAGCTAAAGCAAAAC
ACTTTGTGATCGATGAGTCGTCTCATTTCGTTTCCGTTGCTCCTTATGCTTCTACGTATC
CCTTTGAGGTTTGGATTGTTCCAAAGTATCACTCTTCCCACTTCCATCATCTCGATGACG
TCAAGGCTGTTGACCTTGGAGGACTTCTGAAACTCGTGCTTCAGAAGATAGCGAAGCAGC
TAAACGACCCTCCTTATAATTATATGATTCACACTTCTCCCCTCAAGGTGGCGGAGTTAC
AGTTACCTTACACGCACTGGTTCTTACAGATCGTACCTCAGCTTTCCGGGGTTGGGGGGT
TTGAGATGGGAACAGGGTGTTACATAAACCCTGTATTCCCCGAGGATGTAGCAAAGGTTT
TGCGTGAAGTTAGCCTTGCTTGAATCCGGTTTTGTTCTTCCAACCTGAGGTTCTGAGGGA
AAGTCCTTGGTGTGGGATTTTTTTTTTGCTTCTTTGAGGAAACGTGTCTCTGGCTCATCG
TCTCTGTTTCATCTGTGGAAGAAGAGAAGATGTTTCAGCTTTGATTCAAATAACATTCAT
GTAAACAATACGTATTAGGTCTTTTGTAATAAGCTGAGTTCCTTTAAAAAAACGTGTTAA
GACTCATTCACGGACATCTTTTCTCTTCAAAAGAAAAAAATTCCGACT

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 3

CO CL3180Contig1 1088 3 9 U
GGGACATTTTACATATAACTTTCCATCTTCCGTTACTCTCTCTCTAGATCTTTGTTAAGA
ATTACTCAAGATGTTGCTTAAGACGTCTCCCGCACTTTCTATCTTGAGCTCCGGCGGCGT
TGGAGATCTCTTTCCTCCGTCGAGTGTTATGTTTCCTTCGACCGCTTGCCGTGGATCAAG
GTTGTCTGTTAAGGCGGCGAAAGGAACGAGCACCAAGTCGTTGACCGGAGTTGTTTTCGA
GCCTTTTGAGGAAGTGAAGAAAGAAATGGATCTGCGCGTTCCCACAACTCCTCTGGTTTC
TCTCGCCCGCCACAGATTCTCGGACGAATCTGAAGCTGCGATTAACGAACAGATCAATGT
GGAGTATAATTTCTCCTACATCTATCACGCCCTGTATGCCTACTTTGACAGAGATAATGT
TGGTTTGAAAGGTTTCGCCAATTTCTTCAAAGATTCGTCTGTTGAAGAACGAGGTCACGC
TGAGAAGTTTATGGAGTACCAGAACAAGCGTGGTGGGAGAGTGAAGCTCCAGTCTATTTT
GATGCCGTTCTCTGAGTTTGATCACGAGGAGAAAGGAGATGCATTGTATGCTATGGAGCT
TGCACTGTCTTTGGAGAAACTTACAAATGAAAAGCTTCTCAAGTTGCAAAGTGTGGGTGT
TAAAAACAACGATGTTCAGCTGGTTGATTTTGTCGAATCTGAGTTTCTAGGAGAGCAGGT
CGAAGCTATCAAGAAAATCTCAGAGTATGTTGCCCAGCTAAGAAGAATTGGAAAGGGTCA
TGGGGTGTGGCATTTTGACCAAATGCTTCTGGATGACCAAGAGGTTCTGCATTGAGGGTT
AAAGGAAGGAAAGTTGCATGCAGCTCTTGATGATTCTGATTTGGTGATAATGTTTTTCTT
GTGCTATACGGCACTGTTCTATCTTTTTAGAACGAGGTCTTTATGGATAATAATAGTAGT
TCTTTTCTTCTTTCTTTTCTATGTTGTGTTTAAAAGAATGTTCGTGAGTGTTTTTGAATG
TAAGTAGTACTCTGAGAATAAATGTAGAAGTCCAGTGCTTTTAATGTGACTAATAGTCAC
ACTTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DB95TF U 1
AF RS1C621TF U 44
AF RS1C621JQ C 352
BS 1 370 RS1DB95TF
BS 371 371 RS1C621TF
BS 372 476 RS1DB95TF
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BS 700 756 RS1C621TF
BS 757 1088 RS1C621JQ

RD RS1DB95TF 699 0 0
GGGACATTTTACATATAACTTTCCATCTTCCGTTACTCTCTCTCTAGATCTTTGTTAAGA
ATTACTCAAGATGTTGCTTAAGACGTCTCCCGCACTTTCTATCTTGAGCTCCGGCGGCGT
TGGAGATCTCTTTCCTCCGTCGAGTGTTATGTTTCCTTCGACCGCTTGCCGTGGATCAAG
GTTGTCTGTTAAGGCGGCGAAAGGAACGAGCACCAAGTCGTTGACCGGAGTTGTTTTCGA
GCCTTTTGAGGAAGTGAAGAAAGAAATGGATCTGCGCGTTCCCACAACTCCTCTGGTTTC
TCTCGCCCGCCACAGATTCTCGGACGAATCTGAAGCTGCGATTAACGAACAGATCAATGT
GGAGTATAATGTCTCCTACATCTATCACGCCCTGTATGCCTACTTTGACAGAGATAATGT
TGGTTTGAAAGGTTTCGCCAATTTCTTCAAAGATTCGTCTGTTGAAGAACGAGGTCGCGC
TGAGAAGTTTATGGAGTACCAGAACAAGCGTGGTGGGAGAGTGAAGCTCCAGTCTATTTT
GATGCCGTTCTCTGAGTTTGATCACGAGGAGAAAGGAGATGCATTGTATGCTATGGAGCT
TGCACTGTCTTTGGAGAAACTTACAAATGAAAAGCTTCTCAAGTTGCAAATTGTGGGTGT
TAAAAACAACGATGTTCAGCTGGTTGATTTTGTCGAATC

QA 1 699 1 699
DS 

RD RS1C621TF 713 0 0
GG
AGATCTTTGTTAAGAATTACTCAAGATGTTGCTTAAGGCGTCTCCCGCACTTTCTATCTT
GAGCTCCGGCGGCGTTGGAGATCTCTTTCCTCCGTCGAGTGTTATGTTTCCTTCGACCGC
TTGCCGTGGATCAAGGTTGTCTGTTAAGGCGGCGAAAGGAACGAGCACCAAGTCGTTGAC
CGGAGTTGTTTTCGAGCCTTTTGAGGAAGTGAAGAAAGAAATGGATCTGCTCGTTCCCAC
AACTCCTCTGGTTTCTCTCGCCCGCCACGGATTCTCGGACGAATCTGAAGCTGCGATTAA
CGAACAGATCAATGTGGAGTATAATTTCTCCTACATCTATCACGCCCTGTATGCCTACTT
TGACAGAGATAATGTTGGTTTGAAAGGTTTCGCCAATTTCTTCAAAGATTCGTCTGTTGA
AGAACGAGGTCACGCTGAGAAGTTTATGGAGTACCAGAACAAGCGTGGTGGGAGAGTGAA
GCTCCAGTCTATTTTGATGCCGTTCTCTGAGTTTGATCACGAGGAGAAAGGAGATGCATT
GTATGCTATGGAGCTTGCACTGTCTTTGGAGAAACTTACAAATGAAAAGCTTCTCAAGTT
GCAAAGTGTGGGTGTTAAAAACAACGATGTTCAGCTGGTTGATTTTGTCGAATCTGAGTT
TCTAGGAGAGCAGGTCGAAGCTATCAAGAAAATCTCAGAGTATGTTGCCCA

QA 3 713 3 713
DS 

RD RS1C621JQ 737 0 0
GATCAATGTGGAGTATAATTTCTCCTACATCTATCACGCCCTGTATGCCTACTTTGACAG
AGATAATGTTGGTTTGAAAGGTTTCGCCAATTTCTTCAAAGATTCGTCTGTTGAAGAACG
AGGTCACGCTGAGAAGTTTATGGAGTACCAGAACAAGCGTGGTGGGAGAGTGAAGCTCCA
GTCTATTTTGATGCCGTTCTCTGAGTTTGATCACGAGGAGAAAGGAGATGCATTGTATGC
TATGGAGCTTGCACTGTCTTTGGAGAAACTTACAAATGAAAAGCTTCTCAAGTTGCAAAG
TGTGGGTGTTAAAAACAACGATGTTCAGCTGGTTGATTTTGTCGAATCTGAGTTTCTAGG
AGAGCAGGTCGAAGCTATCAAGAAAATCTCAGAGTATGTTGCCCAGCTAAGAAGAATTGG
AAAGGGTCATGGGGTGTGGCATTTTGACCAAATGCTTCTGGATGACCAAGAGGTTCTGCA
TTGAGGGTTAAAGGAAGGAAAGTTGCATGCAGCTCTTGATGATTCTGATTTGGTGATAAT
GTTTTTCTTGTGCTATACGGCACTGTTCTATCTTTTTAGAACGAGGTCTTTATGGATAAT
AATAGTAGTTCTTTTCTTCTTTCTTTTCTATGTTGTGTTTAAAAGAATGTTCGTGAGTGT
TTTTGAATGTAAGTAGTACTCTGAGAATAAATGTAGAAGTCCAGTGCTTTTAATGTGACT
AATAGTCACACTTTTGC

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 3

CO CL3181Contig1 777 3 5 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGCGGAGGCTTG
TATAAGGGTCTTGGTCCACTCTGGGGACGTCAGATTCCTTACACCATGATGAAGTTTGCT
TCGTTTGAGACCATTGTTGAGATGATCTACAAGTACGCAATCCCTAACCCAAAGCACGAG
TGCAGCAAAGGTCTGCAGCTCGGGGTTAGTTTTGCTGGAGGTTACGTTGCAGGAGTGTTC
TGTGCAATTGTTTCCCACCCTGCTGATAACCTAGTTTCGTTCCTCAACAATGCTAAGGGA
GCAACCGTTGGTGATGCGGTGAAGAAGATAGGACTGTTGGGACTCTTCACAAGAGGACTT
CCTCTAAGGATTGTGATGATAGGGACATTGACCGGAGCACAATGGGGTTTATATGATGCC
TTCAAAGTGTTTGTTGGCCTTCCTACCACCGGGG*TGTTGCTCCAGCGCCTGCCATCGTT
GCTGCTGAAGCCAAAGCCCAAAACTAAATGATGATGAAAAGGGTTTAGTATTTTTGTTTG
ACAAAAAATAAGAGAAACGTATTGCAGAGAGAGGAAGAGTGAGCTCATCCTCCGATTCCA
ACTTTATTTTTCCTTTTTCTTTTTTGTGTTCCTGAATTCAGGATAGTGCTCTCTTTCCCT
ATTATTGTTTCTTTCGTGTTTGTGGGATTGTAATCGTAAAAAGATGAGGGGG*ACACACT
GCACAATAGAGAGAGCGGG*CACACACCCACTTACTACTTTTGGTTATATTTCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A332TF U 1
AF RS1A332TV U 61
AF RS1FT10JQ C 360
BS 1 712 RS1A332TF
BS 713 713 RS1A332TV
BS 714 739 RS1A332TF
BS 740 740 RS1A332TV
BS 741 777 RS1A332TF

RD RS1A332TF 777 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGCGGAGGCTTG
TATAAGGGTCTTGGTCCACTCTGGGGACGTCAGATTCCTTACACCATGATGAAGTTTGCT
TCGTTTGAGACCATTGTTGAGATGATCTACAAGTACGCAATCCCTAACCCAAAGCACGAG
TGCAGCAAAGGTCTGCAGCTCGGGGTTAGTTTTGCTGGAGGTTACGTTGCAGGAGTGTTC
TGTGCAATTGTTTCCCACCCTGCTGATAACCTAGTTTCGTTCCTCAACAATGCTAAGGGA
GCAACCGTTGGTGATGCGGTGAAGAAGATAGGACTGTTGGGACTCTTCACAAGAGGACTT
CCTCTAAGGATTGTGATGATAGGGACATTGACCGGAGCACAATGGGGTTTATATGATGCC
TTCAAAGTGTTTGTTGGCCTTCCTACCACCGGGG*TGTTGCTCCAGCGCCTGCCATCGTT
GCTGCTGAAGCCAAAGCCCAAAACTAAATGATGATGAAAAGGGTTTAGTATTTTTGTTTG
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ACTTTATTTTTCCTTTTTCTTTTTTGTGTTCCTGAATTCAGGATAGTGCTCTCTTTCCCT
ATTATTGTTTCTTTCGTGTTTGTGGGATTGTAATCGTAAAAAGATGAGGGGGGACACACT
GCACAATAGAGAGAGCGGGGCACACACCCACTTACTACTTTTGGTTATATTTCTTTT

QA 1 777 1 777
DS 

RD RS1A332TV 715 0 0
TATAAGGGTCTTGGTCCACTCTGGGGACGTCAGATTCCTTACACCATGATGAAGTTTGCT
TCGTTTGAGACCATTGTTGAGATGATCTACAAGTACGCAATCCCTAACCCAAAGCACGAG
TGCAGCAAAGGTCTGCAGCTCGGGGTTAGTTTTGCTGGAGGTTACGTTGCAGGAGTGTTC
TGTGCAATTGTTTCCCACCCTGCTGATAACCTAGTTTCGTTCCTCAACAATGCTAAGGGA
GCAACCGTTGGTGATGCGGTGAAGAAGATAGGACTGTTGGGACTCTTCACAAGAGGACTT
CCTCTAAGGATTGTGATGATAGGGACATTGACCGGAGCACAATGGGGTTTATATGATGCC
TTCAAAGTGTTTGTTGGCCTTCCTACCACCGGGG*TGTTGCTCCAGCGCCTGCCATCGTT
GCTGCTGAAGCCAAAGCCCAAAACTAAATGATGATGAAAAGGGTTTAGTATTTTTGTTTG
ACAAAAAATAAGAGAAACGTATTGCAGAGAGAGGAAGAGTGAGCTCATCCTCCGATTCCA
ACTTTATTTTTCCTTTTTCTTTTTTGTGTTCCTGAATTCAGGATAGTGCTCTCTTTCCCT
ATTATTGTTTCTTTCGTGTTTGTGGGATTGTAATCGTAAAAAGATGAGGGGG*ACACACT
GCACAATAGAGAGAGCGGG*CACACACC*ACTTACTACTTTTGGTTATATT
TCTT

QA 1 711 1 711
DS 

RD RS1FT10JQ 412 0 0
TCCTCTAAGGATTGTGATGATAGGGACATTGACCGGAGCACAATGGGGTTTATATGATGC
CTTCAAAGTGTTTGTTGGCCTTCCTACCACCGGGGGTGTTGCTCCAGCGCCTGCCATCGT
TGGTGCTGAAGCCAAAGCCCAAAACTAAATGATGATGAAAAGGGTTTAGGATTTTTGTTT
GACAAAAAATAAGAGAAACGTATTGCAGAGAGAGGAAGAGTGAGCTCATCCTCCGATTCC
AACTTTATTTTTCCTTTTTGTTTTTTGTGTTCCTGAATTCAGGATAGTGCTCTCTTTCCC
TATTATTGTTTCTTTCGTGTTTGTGGGATTGTAATCGTAAAAAGATGAGAGGG*ACACAC
TGCACAATAGAGAGAGCGGG*CACACACCCACTTACTACTTTTGGTTATATT

QA 1 412 1 412
DS 



AS 1 2

CO CL3182Contig1 753 2 10 U
TTTTTTCTCGGTGAAAGAGACTGCGACCTTTTAACTAATCCATAGTATAATTTTTCTAAA
ACGTTACAAATCTTGCCGACTTTTCATTCTCTAATCATTCTTATAACTCCATTTGTTTTT
TACTAAACAAACAACATTTATTGTCAATCTTGGTTGCTACCTTCAAAAGAAAGAAAGAAA
GAAAGATCAACTCATCAGAAAGCTACTTTGAGAGAAAGAGAGTGAGCTCTGAGAAAATCA
CCAATGGCTTCGAAGCTTGTAGTCATAATTGTGTTCATCCTCGATCTCGTCGCCGTTGGT
TTAGCCATTGCCGCCGAGCAGAGAAGAAGTGTCGGGAAGGTTGTAACGGACACTGAGAAG
ACATATGAGTACTGCGTGTACGGCACGGACATTGCTACGAGCTATGGAGCTGGTGCATTC
CTTCTCCTCTTTATAAGCCAAGTCCTTATTATGAGTGCTAGCCGCTGCTTCTGCTGTGGG
AAGTCCCTAACCCCCGGCGGTTCAAGAGCTTGTGCCCTCCTTCTCTTCCTCACTTGCTGG
GTATTCTTCCTGGTCGCTGAGGTATGTTTGCTTGCGGCATCAATCAGAAACGCGTACCAC
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GGAGTGTTTGCAGCTGGTGCTGCTTTTACCCTCTTCACCGCCATCGTCTCTCAGCTCTAT
TACGTTTGCTACTCTCGTGCTAGAGATGCTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C989TF U 1
AF RS1BE33TF U 7
BS 1 311 RS1C989TF
BS 312 312 RS1BE33TF
BS 313 532 RS1C989TF
BS 533 533 RS1BE33TF
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BS 716 744 RS1C989TF
BS 745 753 RS1BE33TF

RD RS1C989TF 744 0 0
TTTTTTCTCGGTGAAAGAGACTGCGACCTTTTAACTAATCCATAGTATAATTTTTCTAAA
ACGTTACAAATCTTGCCGACTTTTCATTCTCTAATCATTCTTATAACTCCATTTGTTTTT
TACTAAACAAACAACATTTATTGTCAATCTTGGTTGCTACCTTCAAAAGAAAGAAAGAAA
GAAAGATCAACTCATCAGAAAGCTACTTTGAGAGAAAGAGAGTGAGCTCTGAGAAAATCA
CCAATGGCTTCGAAGCTTGTAGTCATAATTGTGTTCATCCTCGATCTCGTCGCCGTTGGT
TTAGCCATTGCTGCCGAGCAGAGAAGAAGTGTCGGGAAGGTTGTAACGGACACTGAGAAG
ACATATGAGTACTGCGTGTACGGCACGGACATTGCTACGAGCTATGGAGCTGGTGCATTC
CTTCTCCTCTTTATAAGCCAAGTCCTTATTATGAGTGCTAGCCGCTGCTTCTGCTGTGGG
AAGTCCCTAACCCCCGGCGGTTCAAGAGCTTGTGCCCTCCTTCTCTTCCTCATTTGCTGG
GTATTCTTCCTGGTCGCTGAGGTATGTTTGCTTGCGGCATCAATCAGAAACGCGTACCAC
ACAAAATACAGGAAGATGTGGAACATCGATAACCCGCCTAGCTGTGAAGTTATAAGGAAA
GGAGTGTTTGCAGCTGGTGCTGCTTTTACCCTCTTCACCGCCATCGTCTCTCAGTTCTAT
TACGTTTGCTACTCTCGTGCTAGA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1BE33TF 747 0 0
CTCGGTGAAAGAGACTGCGACCTTTTAACTAATCCATAGTATAATTTTTCTAAAACGTTA
CAAATCTTGCCGACTTTTCATTCTCTAATCATTCTTATAACTCCATTTGTTTTTTACTAA
ACAAACAACATTTATTGTCAATCTTGGTTGCTACCTTCAAAAGAAAGAAAGAAAGA****
TCAACTCATCAGAAAGCTACTTTGAGAGAAAGAGAGTGAGCTCTGAGAAAATCACCAATG
GCTTCGAAGCTTGTAGTCATAATTGTGTTCATCCTCGATCTCGTCGCCGTTGGTTTAGCC
ATTGCCGCCGAGCAGAGAAGAAGTGTCGGGAAGGTTGTAACGGACACTGAGAAGACATAT
GAGTACTGCGTGTACGGCACGGACATTGCTACGAGCTATGGAGCTGGTGCATTCCTTCTC
CTCTTTATAAGCCAAGTCCTTATTATGAGTGCTAGCCGCTGCTTCTGCTGTGGGAAGTCC
CTAACCCCCGGCGGTTCAAGAGCTTGTGCCCTCCTTCTCTTCCTCACTTGCTGGGTGTTC
TTCCTGGTCGCTGAGGTATGTTTGCTTGCGGCATCAATCAGAAACGCGTACCACACGAAA
TACAGGAAGATGTGGAACATCGATAACCCGCCGAGCTGTGAAGTTATAAGGAA*GGAGTG
TTTGCAGCTGGTGCTGCTTTTACCCTCTTCACCGCCATCGTCTCTCAGCTCTAT*ACGTT
TGCTACTCTCGTGCTAGAGATGCTTAC

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 3

CO CL3183Contig1 733 3 2 U
GGCAGCCAAAAATTCTCAGCCATTGAGAGTTTAACATTTCATCCAAAAAATGTTTTTTCA
GATTATTCAGGGGGTTTTCACAGGCGTTGCGGCATTAGCTCTATTGGCATTCGCTGGTAT
AACCCTTGGTAGCTCAGCCGTGGCATTAGCCGTAAGCACGCCGTTTTTTGTCCTATTCAG
TCCGATTCTCGTGCCAGCAACTATAGCCACCACTTTGTTAACTACGGGCTTGTCGGCCAC
CGGCGGCCTCGGTTTAACGGCTATCCGCATCATCTGGAAGCTCTACAAGCGTATTAAGGC
GAAGGGAGGGTCAAAAATTCCGGGATTGGCCCCGGGGGCTCCAGACTCTAAGCCAGCGTC
TGGGGGGTAAACGAAGTAGGCCTTTCGTAGTATGAGATGATCTAAGGGGGAATTAAATGA
GAATTATTGGGGTTCCTTAAATAAAGCCTAAAATTATCCACTCTCTTTAATATAATACTA
ATTACACGCGGATGAACCTAATGTTTCAAATACCATTCTTCATATGTATATCGTGTTACG
AAATTATAATAAATGTACTCGATTGTGTTGTAACGAATCAAGTGATATCAGTGAGATTAC
CATAGATTATTATAGTCAAGTTACATTGTTGATTCACTGAATCATTCGACTTTGAACCAA
GTGTTGTTTCTACTACATTATGTTTTAAAAGATAAGCCTTAAGTTCTTAATTTGCAACTA
CCGATTTTATCTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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C

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G

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G


BQ
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ATTTTGGTTTTCGTATTATGGATCTTGGTTCGCGCTTTATGGCATTTCCACTATAAAGAA
AATGCAATCCCGCAAAGGATTGTTCATGGAACTACTATCGAGATTCTTTGGACCATCTTT
CCTAGTCTCATCTTGATGTTCATTGCTATACCATCATTTGCTCTCTTATACTCAATGGAC
GAGGTAGTAGTAGATCCAGCCATTACTATCAAAGCTATTGGACATCAATGGTATTGGACT
TATGAGTATTCTGACTATAACAGTTCCGATGAGCAGTCACTCACTTTTGACAGTTATATG
ATTCCAGAAGA*GATCTAGAATTGGGTCAATTACGTTTATTAGA*GTGGACAATAGAGTG
GTTGTAC*AGCCAAA*CTCATCTACGTAT
ATGTACATCTGCTGATGTA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RS1BU01TF 685 0 0
G
CTTGATGTTCATTGCTATACCATCATTTGCTCTCTTATACTCAATGGACGAGGTAGTAGT
AGATCCAGCCATTACTATCAAAGCTATTGGACATCAATGGTATTGGACTTATGAGTATTC
TGACTATAACAGTTCCGATGGGCAGTCACTCACTTTTGACAGTTATATGATTCCAGAAGA
AGATCTAGAATTGGGTCAATTACGTTTATTAGAAGTGGACAATAGAGTGGTTGTACCAGC
CAAAACTCATCTACGTATTATTGTAACATCTGCTGATGTACTTCATAGTTGGGCTGTACC
TTCCTTAGGTGTCAAATGTGATGCTGTACCTGGTCGTTTAAATCAAATCTCTATTTTGGT
ACAACGAGAAGGAGTTTACTATGGTCAGTGCAGTGAGATTTGTGGAACTAATCATGCCTT
TATGCCTATCGTCGTAGAAGCTGTTTCTAGGAAAGATTATGGTTCTTGGGTATCCAATCA
ATTAATCCCCCAAACCGGGGAAGCTTAAGCGGAAATTGAAGAGTAAGGTGAGGGAGGGGG
AAGAGCCATCAAACTTTAGAGGCTTAACTCGCTCGCTCTAACGCTCGTTTAGTAGACAGC
TCGTCAGTCAAGTACATAACGAGCCTTGTCTACGAAGCTCCGCTCCCTCGTCTTGCTTGC
TTCTGGCGAAGCTTCTAGCACTAG

QA 2 685 2 685
DS 

RD RS1B493JQ 833 0 0
CAT
CTTGATGTTCAT*GCTATACCATCATTTGCTCTCTTATACTCAATGGACGAGGTAGTAGT
AGATCCAGCCATTACTATCAAAGCTATTGGACATCAATGGTATTGGACTTATGAGTATTC
TGACTATAACAGTTCCGATGAGCAGTCACTCACTTTTGACAGTTATATGATTCCAGAAGA
AGATCTAGAATTGGGTCAATTACGTTTATTAGAAGTGGACAATAGAGTGGTTGTACCAGC
CAAAACTCATCTACGTATTATTGTAACATCTGCTGATGTACTTCATAGTTGGGCTGTACC
TTCCTTAGGTGTCAAATGTGATGCTGTACCTGGTCGTTTAAATCAAATCTCTATTTTGGT
ACAACGAGAAGGAGTTTACTATGGTCAGTGCAGTGAGATTTGTGGAACTAATCATGCCTT
TATGCCTATCGTCGTAGAAGCTGTTTCTAGGAAAGATTATGGTTCTTGGTTATCCAATCA
ATTAATCCCCCAAACCGGGGAAGCTTAAGCGGAAATTGAAGAGTAAGGTGAGGGAGGGGG
AAGAGCTATCAAACTTTAGAGGCTTAACTCGCTCGCTCTAACGCTCGTTTAGTAGACAGC
TCGTCAGTCAAGTACATAACGAGCCTTGTCTACGAAGCTCCGCTCCCTCGTCTTGCTTGC
TTCTGGCGAAGCTTCTAGCACTAGAAAAAAATAGGCTTGTATGGCAGGAATACCACTTTT
GAGGCCGATCACCACTACATAGGAGCGATAGCGAAGCCAAGCCGTATAAAGGCGAGCAGC
CCTTCTAGCAATAGCAAACGGCCTACTTATAGCCTTTTCCCCTTTATTCG

QA 4 833 4 833
DS 



AS 1 3

CO CL3185Contig1 786 3 2 U
GGGACCACTGAATTCTTCGTCGCTCTTTCTCTCTCTCTCTCCCCTTCCCAATTTCTTCAA
GTTCTCAAACTCTCTCAAGAGCTCAAGAACATAACTTCTTCAATTCTCAACGAAATTTTG
TGATTCTTGTTGCTGAGAACTCGAAATCCCTATATGTTTCTCCTTATAATCTCGGTTTTC
CTCAAAGCAAGCTAAGATACTGAGATTTCGAGTTGATTTTTCTTGGTTGAAAAAGTTCAA
ATTTTTAAAAGTGGGATTTGCTCGATTTCTTGTTCTAAAATCGTTATTTATGCTTCCATT
AGCTTGATTGATGAGTTGGGTTGATGAAAAACGAGTTTAATTGTCTTGAATTAGAATTTC
AAAAATTAGGGTTCTTGAGAATTGAGATTTTCGAATTTTTTGGGGAAAATCGTTATTTAT
TCTTTCATTAGCTTGATTGATGACTCTTGCTAGGCGATTGGTGTTTACTGATCTATGTTT
GATAAATTGGTTTATGTGTGATGAAAAATCCTCATGAGACTCACACACTTTCCAAGTCTT
TGTTTTGTAGGGCACGATGGGGAGAGCCCGTGGAAGAGTGACCAAAGAAGACAAAGGAAA
GGGACTTGCATCTACTTCCCAAGACCAAGCTGTCACAGCAGATGTCAAAAGTATTAACTT
ACAAAAAAGTTTCAACCTTTCTTTGAAATGTTATTAACTTGTTACAAAGTTTCAATTTTT
TTTGCACTGGTTATTTGTGGCATGTACATGTGGATACGAGACATAGCATATACATAGTTT
TCTCAG


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1BS24TF U 133
AF RS1D664TF U 1
AF RS1D664JQ C 2
BS 1 592 RS1D664TF
BS 593 786 RS1D664JQ

RD RS1BS24TF 102 0 0
CTGAGAACTCGAAATCCCTATATGTTTCTCCTTATAATCTCGGTTTTCCTCATAGCAAGC
TAAGATACTGAGATTTCGAGTTGATTTTTCTTGGTTGAAAAA

QA 1 102 1 102
DS 

RD RS1D664TF 592 0 0
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GTTCTCAAACTCTCTCAAGAGCTCAAGAACATAACTTCTTCAATTCTCAACGAAATTTTG
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CTCAAAGCAAGCTAAGATACTGAGATTTCGAGTTGATTTTTCTTGGTTGAAAAAGTTCAA
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AAAAATTAGGGTTCTTGAGAATTGAGATTTTCGAATTTTTTGGGGAAAATCGTTATTTAT
TCTTTCATTAGCTTGATTGATGACTCTTGCTAGGCGATTGGTGTTTACTGATCTATGTTT
GATAAATTGGTTTATGTGTGATGAAAAATCCTCATGAGACTCACACACTTTCCAAGTCTT
TGTTTTGTAGGGCACGATGGGGAGAGCCCGTGGAAGAGTGACCAAAGAAGAC

QA 1 592 1 592
DS 

RD RS1D664JQ 785 0 0
GGACCACTGAATTCTTCGTCGCTCTTTCTCTCTCTCTCTCCCCTTCCCAATTTCTTCAAG
TTCTCAAACTCTCTCAAGAGCTCAAGAACATAACTTCTTCAATTCTCAACGAAATTTTGT
GATTCTTGTTGCTGAGAACTCGAAATCCCTATATGTTTCTCCTTATAATCTCGGTTTTCC
TCAAAGCAAGCTAAGATACTGAGATTTCGAGTTGATTTTTCTTGGTTGAAAAAGTTCAAA
TTTTTAAAAGTGGGATTTGCTCGATTTCTTGTTCTAAAATCGTTATTTATGCTTCCATTA
GCTTGATTGATGAGTTGGGTTGATGAAAAACGAGTTTAATTGTCTTGAATTAGAATTTCA
AAAATTAGGGTTCTTGAGAATTGAGATTTTCGAATTTTTTGGGGAAAATCGTTATTTATT
CTTTCATTAGCTTGATTGATGACTCTTGCTAGGCGATTGGTGTTTACTGATCTATGTTTG
ATAAATTGGTTTATGTGTGATGAAAAATCCTCATGAGACTCACACACTTTCCAAGTCTTT
GTTTTGTAGGGCACGATGGGGAGAGCCCGTGGAAGAGTGACCAAGGAAGACAAAGGAAAG
GGACTTGCATCTACTTCCCAAGACCAAGCTGTCACAGCAGATGTCAAAAGTATTAACTTA
CAAAAAAGTTTCAACCTTTCTTTGAAATGTTATTAACTTGTTACAAAGTTTCAATTTTTT
TTGCACTGGTTATTTGTGGCATGTACATGTGGATACGAGACATAGCATATACATAGTTTT
CTCAG

QA 1 785 1 785
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3187Contig1 986 3 18 U
CGGGGGGTCACTGATTGTTTCAGAAAGAGAGATGGAGAGAGCAACCACCATTTCTCCGAG
CCTGAATCAAAACTACCTACTTTGTCCTTCACGCGCCTTCACCACGCGCATCCACTCCTT
CTCTACTACTCGGAGCTTATCGCCATCATCTTCCTCCTCCTCCATCAAGGTTCAGCATTC
CTCCTCTTCTGTATCTTCCTGTTTCATCAATGGCGGAACCTCCCTTACTCGTTGCAACGC
CCTCCTCTCCAATTCGTCTTCCAGTAGTACGGAGGTAGCAGACATAGATTGGGACAACAT
CGGGTTCGGTCTGAAACCGACTGATTACATGTACGTCATGAAATGCAACCTTAACGGTGA
GTTCTCAAAGGGTGAATTGCAGCGTTTTGGGAACATCGAAGTCAGCCCCTCTGCTGGTGT
CCTCAACTATGGACAGGGATTGTTCGAAGGGATGAAAGCTTACAGAAAGCAAGACGGCAA
GAACATCCTCCTCTTTCGTCCTCAAGAGAATGCAACGCGTATGAGAAATGGTGCCGAGAG
GATGTGTATGCCTGCTCCTTCCGTTGATCAGTTTGTCCAAGCTGTGAAAGCAACCGTGTT
AGCTAACAAACGTTGGGTTCCACCTGCAGGTAAAGGTTCTTTGTATATTAGACCGTTGCT
AATGGGAACTGGAGCTGTTCTTGGTCTTGCCCCTGCCCCAGAATATACTTTCCTTGTCTA
TGTTTCTCCTGTTGGAAACTACTTCAAGGAAGGTGTGGCACCAATCAATTTGATTTGTGG
AAAGTGAATTTTCACCGTGCAACACCTGGTGGTACTGGAGGTGTTAAGACCATTTGGCAA
TTACGCTGCTGTACTAAAAGCACAGTCGATTGCGAAATCTAAAGGATATTCTGATGTTTT
GTACCTTGATTGCGTTTACAAAAGATATCTTTGAAGAAGTCTCCTCTTGCAATATCTTCA
TTGTTAAGGACAATGTGATATCTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BA77TF U 1
AF RS1GV14TF U 4
AF RS1CM56TF U 417
BS 1 48 RS1BA77TF
BS 49 49 RS1GV14TF
BS 50 124 RS1BA77TF
BS 125 125 RS1GV14TF
BS 126 127 RS1BA77TF
BS 128 128 RS1GV14TF
BS 129 241 RS1BA77TF
BS 242 242 RS1GV14TF
BS 243 477 RS1BA77TF
BS 478 478 RS1GV14TF
BS 479 480 RS1BA77TF
BS 481 481 RS1GV14TF
BS 482 563 RS1BA77TF
BS 564 564 RS1GV14TF
BS 565 629 RS1BA77TF
BS 630 630 RS1CM56TF
BS 631 696 RS1GV14TF
BS 697 986 RS1CM56TF

RD RS1BA77TF 633 0 0
CGGGGGGTCACTGATTGTTTCAGAAAGAGAGATGGAGAGAGCAACCACTATTTCTCCGAG
CCTGAATCAAAACTACCTACTTTGTCCTTCACGCGCCTTCACCACGCGCATCCACTCCTT
CTCTGCTTCTCGGAGCTTATCGCCATCATCTTCCTCCTCCTCCATCAAGGTTCAGCATTC
CTCCTCTTCTGTATCTTCCTGTTTCATCAATGGCGGAACCTCCCTTACTCGTTGCAACGC
CGTCCTCTCCAATTCGTCTTCCAGTAGTACGGAGGTAGCAGACATAGATTGGGACAACAT
CGGGTTCGGTCTGAAACCGACTGATTACATGTACGTCATGAAATGCAACCTTAACGGTGA
GTTCTCAAAGGGTGAATTGCAGCGTTTTGGGAACATCGAAGTCAGCCCCTCTGCTGGTGT
CCTCAACTATGGACAGGGATTGTTCGAAGGGATGAAAGCTTACAGAAAGCAAGACGGTAA
AAACATCCTCCTCTTTCGTCCTCAAGAGAATGCAACGCGTATGAGAAATGGTGCCGAGAG
GATGTGTATGCCTGCTCCTTCCGCTGATCAGTTTGTCCAAGCTGTGAAAGCAACCGTGTT
AGCTAACAAACGTTGGGTTCCACCTGCAG
GAAA

QA 1 629 1 629
DS 

RD RS1GV14TF 693 0 0
GGA
GTCACTGATTGTTTCAGAAAGAGAGATGGAGAGAGCAACCACCATTTCTCCGAGCCTGAG
TCAAAACTACCTACTTTGTCCTTCACGCGCCTTCACCACGCGCATCCACTCCTTCTCTAC
TACTCGGAGCTTATCGCCATCATCTTCCTCCTCCTCCATCAAGGTTCAGCATTCCTCCTC
TTCTGTATCTTCCTGTTTCATCAATGGCGGAACCTCCCTTACTCGTTTCAACGCCCTCCT
CTCCAATTCGTCTTCCAGTAGTACGGAGGTAGCAGACATAGGTTGGGACAACATCGGGTT
CGGTCTGAAACCGACTGATTACATGTACGTCATGAAATGCAACCTTAACGGTGAGTTCTC
AAAGGGTGAATTGCAGCGTTTTGGGAACATCGAAGTCAGCCCCTCTGCTGGTGTCCTCAA
CTATGGACAGGGATTGTTCGAAGGGATGAAAGCTTACAGAAAGCAAGACGGCAAGAACAT
CCTCCTCTTTCGTCCTCAAGAGAATGCAACGCGTATGAGAAATGGTGCCGAGAGGATGTG
TATGCCTGCTCCTTCCGTTGATCAGTTTGTCCAAGCTGTTAAAGCAACCGTGTTAGCTAA
CAAACGTTGGGTTCCACCTGCAG*TAAAGGTTCTTTGTATATTAGACCGTTGCTAATGGG
AACTGGAGCTGTTCTTGGTCTTGCCCCTGC

QA 4 693 4 693
DS 

RD RS1CM56TF 570 0 0
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GCAAGAACATCCTCCTCTTTCGTCCTCAAGAGAATGCAACGCGTATGAGAAATGGTGCCG
AGAGGATGTGTATGCCTGCTCCTTCCGTTGATCAGTTTGTCCAAGCTGTGAAAGCAACCG
TGTTAGCTAACAAACGTTGGGTTCCACCTGCAGGTAAAGGTTCTTTGTATATTAGACCGT
TGCTAATGGGAACTGGAGCTGTTCTTGGTCTTGCCCCTGCCCCAGAATATACTTTCCTTG
TCTATGTTTCTCCTGTTGGAAACTACTTCAAGGAAGGTGTGGCACCAATCAATTTGATTT
GTGGAAAGTGAATTTTCACCGTGCAACACCTGGTGGTACTGGAGGTGTTAAGACCATTTG
GCAATTACGCTGCTGTACTAAAAGCACAGTCGATTGCGAAATCTAAAGGATATTCTGATG
TTTTGTACCTTGATTGCGTTTACAAAAGATATCTTTGAAGAAGTCTCCTCTTGCAATATC
TTCATTGTTAAGGACAATGTGATATCTACT

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 3

CO CL3188Contig1 512 3 1 U
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AATCACTCATATTTTCTTTTAATGTTTTAACTCTCCTCGTCATTTTTGTACTAGTGGCCG
GAGCGATGGGCAAGCGAATAAAAATAAAAAAGATATGTGTCCTATATCTCTAGATAACCA
AAAGGATGGAAGTTGTCACAACAAGCCAGCTTGCCAATCTGCATGCAATAAGAGGATACA
AGGGTTAGGAATAAAGGGAATGATCGCTGGTTGTACCTCGGGAAACAAATGCATGTGCTA
TGCCCCATGTGGAAAATAATCTTAATGTTTAGTTTATTGACAACAGAAATCAGATATATT
TATAATAAATTATGATATGATTTATAGTAATAATTAAATAAGTTGTCAAATTTGTTATTG
TCAAATTATGATAACAATAAATATGATCATTTGCATATGTAATGAATGGCAAAATAAGTT
GGAAAAGTTAATTAGAATTATTAACTTCTAAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FX90TF U 1
AF RS1GQ45TF U 1
AF RS1AJ17TF U 1
BS 1 512 RS1AJ17TF

RD RS1FX90TF 388 0 0
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AAAGGATGGAAGTTGTCACAACAAGCCAGCTTGCCAATCTGCATGCAATAAGAGGATACA
AGGGTTAGGAATAAAGGGAATGATCGCTGGTTGTACCTCGGGAAACAAATGCATGTGCTA
TGCCCCATGTGGAAAATAATCTTAATGTTTAGTTTATTGACAACAGAAATCAGATATATT
TATAATAAATTATGATATGATTTATAGT

QA 1 388 1 388
DS 

RD RS1GQ45TF 455 0 0
GGACAACAAATTTTCTGATAAAAAACATAATCAACTCATTCATTTTACCAAGAATGAAAA
AATCACTCATATTTTCTTTTAATGTTTTAACTCTCCTCGTCATTTTTGTACTAGTGGCCG
GAGCGATGGGCAAGCGAATAAAAATAAAAAAGATATGTGTCCTATATCTCTAGATAACCA
AAAGGATGGAAGTTGTCACAACAAGCCAGCTTGCCAATCTGCATGCAATAAGAGGATACA
AGGGTTAGGAATAAAGGGAATGATCGCTGGTTGTACCTCGGGAAACAAATGCATGTGCTA
TGCCCCATGTGGAAAATAATCTTAATGTTTAGTTTATTGACAACAGAAATCAGATATATT
TATAATAAATTATGATATGATTTATAGTAATAATTAAATAAGTTGTCAAATTTGTTATTG
TCAAATTATGATAACAATAAATATGATCATTTGCA

QA 1 455 1 455
DS 

RD RS1AJ17TF 512 0 0
GGACAACAAATTTTCTGATAAAAAACATAATCAACTCATTCATTTTACCAAGAATGAAAA
AATCACTCATATTTTCTTTTAATGTTTTAACTCTCCTCGTCATTTTTGTACTAGTGGCCG
GAGCGATGGGCAAGCGAATAAAAATAAAAAAGATATGTGTCCTATATCTCTAGATAACCA
AAAGGATGGAAGTTGTCACAACAAGCCAGCTTGCCAATCTGCATGCAATAAGAGGATACA
AGGGTTAGGAATAAAGGGAATGATCGCTGGTTGTACCTCGGGAAACAAATGCATGTGCTA
TGCCCCATGTGGAAAATAATCTTAATGTTTAGTTTATTGACAACAGAAATCAGATATATT
TATAATAAATTATGATATGATTTATAGTAATAATTAAATAAGTTGTCAAATTTGTTATTG
TCAAATTATGATAACAATAAATATGATCATTTGCATATGTAATGAATGGCAAAATAAGTT
GGAAAAGTTAATTAGAATTATTAACTTCTAAG

QA 1 512 1 512
DS 



AS 1 3

CO CL3189Contig1 679 3 2 U
GCTTCCAGGGACCACGGTGTACAGAAACGTAAAGCAGTATCCAGAGGCTTACACATACAA
CGGGATTGTGATTGTCAGAATCGATGCTCCTATTTACTTTGCCAACATAAGCTACATTAA
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GGAGCGAATCTCCTTTGTTATCCTAGAATTGTCACCTGTTACTCACATAGACTCGAGCGC
TGTGGAAGCTTTAAAAGAACTGTATCAGGAGTACAAAGCAAGGGACATTCAGCTAGCGAT
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TGGAAAAGAATGGTACTTTGTGAGGGTGCACGACGCGGTGCAAGTGTGTCTTAACTGCGT
ACAGAGCTCTAGCTTGGGAGACAAGAAACAAAGTTTCTTGAGAAGGTTTGGGAACAATGG
GAGCAACAACGGTTCATCATCTTACACTGATCTTCAATCCTACAACACTTTGTTGAAGGA
GCCATTGTTGCCAGTGGAGAAGTAAAGTATCATGTAATGTAAGTTACTGTGTATAGTTGT
TGCGATTTTGTAAACAACAAAATTTACCTGATATATACTGTTATTATTTTCCTCAAATAC
AGTAATAAAATTAGAGGCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A454JQ C 1
AF RS1A454TF U 1
AF RS1FY14TF U 239
BS 1 652 RS1A454TF
BS 653 679 RS1FY14TF

RD RS1A454JQ 489 0 0
GCTTCCAGGGACCACGGTGTACAGAAACGTAAAGCAGTATCCAGAGGCTTACACATACAA
CGGGATTGTGATTGTCAGAATCGATGCTCCTATTTACTTTGCCAACATAAGCTACATTAA
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TGTGGAAGCTTTAAAAGAACTGTATCAGGAGTACAAAGCAAGGGACATTCAGCTAGCGAT
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TGGAAAAGAATGGTACTTTGTGAGGGTGCACGACGCGGTGCAAGTGTGTCTTAACTGCGT
ACAGAGCTCTAGCTTGGGAGACAAGAAACAAAGTTTCTTGAGAAGGTTTGGGAACAATGG
GAGCAACAA

QA 1 489 1 489
DS 

RD RS1A454TF 654 0 0
GCTTCCAGGGACCACGGTGTACAGAAACGTAAAGCAGTATCCAGAGGCTTACACATACAA
CGGGATTGTGATTGTCAGAATCGATGCTCCTATTTACTTTGCCAACATAAGCTACATTAA
AGACAGACTGCGAGAATATGAAGTTGCTGTTGACAAATACACAACCAAGGGACCAGAGGT
GGAGCGAATCTCCTTTGTTATCCTAGAATTGTCACCTGTTACTCACATAGACTCGAGCGC
TGTGGAAGCTTTAAAAGAACTGTATCAGGAGTACAAAGCAAGGGACATTCAGCTAGCGAT
CTCAAATCCGAACAAAGACGTCCACATGACGATAGCAAGATCAGGAATGGTCGAGCTCGT
TGGAAAAGAATGGTACTTTGTGAGGGTGCACGACGCGGTGCAAGTGTGTCTTAACTGCGT
ACAGAGCTCTAGCTTGGGAGACAAGAAACAAAGTTTCTTGAGAAGGTTTGGGAACAATGG
GAGCAACAACGGTTCATCATCTTACACTGATCTTCAATCCTACAACACTTTGTTGAAGGA
GCCATTGTTGCCAGTGGAGAAGTAAAGTATCATGTAATGTAAGTTACTGTGTATAGTTGT
TGCGATTTTGTAAACAACAAAATTTACCTGATATATACTGTTATTATTTTCC
CC

QA 1 652 1 652
DS 

RD RS1FY14TF 441 0 0
GCTGTGGAAGCTTTAAAAGAACTGTATCAGGAGTACAAAGCAAGGGACATTCAGCTAGCG
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GTTGGAAAAGAATGGTACTTTGTGAGGGTGCACGACGCGGTGCAAGTGTGTCTTAACTGC
GTACAGAGCTCTAGCTTGGGAGACAAGAAACAAAGTTTCTTGAGAAGGTTTGGGAACAAT
GGGAGCAACAACGGTTCATCATCTTACACTGATCTTCAATCCTACAACACTTTGTTGAAG
GATCCATTGTTGCCAGTGGAGAAGTAAAGTATCATGTAATGTAAGTTACTGTGTATAGTT
GTTGCGATTTTGTAAACAACAAAATTTACCTGATATATACTGTTATTATTTTCCTCAAAT
ACAGTAATAAAATTAGAGGCT

QA 1 441 1 441
DS 



AS 1 2

CO CL3190Contig1 1111 2 2 U
GGGATTCTCTTTCATCTTCGTCGTCTCGCAATGGGGAAGAAGAGAAAGCACAGCGAGACC
GAACAGGCGGCACCACTGAAGAAAGACGACTCTGCTCCGGAGAGACCCAAAAGAACTCTA
CTGGGCTGGAAAGACAAGGCCCAAGATGCAGAGGAACCCAAACAACCAGCGCCTGAGTTC
AGGAACAAAGAGAAGGTCCTCGTCACATGCTCACGTCGCATCAGTTTCAGGTACCGACAT
CTGATGCTCAACATCGTGTCTCTTCTACCTCACTGTAAGAAAGATAGTAAGGTCGAAGCT
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TTATTCTTTGAGTGTAGGAAGCATAAAGATCTTTACTTGTGGATGGTTAAGTCTCCTAGT
GGACCCTCTGTTAAGTTCCTGGTTAATGCTGTTCACACAATGGAGGAGCTGAAACTCACT
GGAAACCATCTGAAAGGGTCAAGGCCACTCTTGACGTTCTCATCTAACTTTGATAAAGAT
GTACACTGGAAGCTTCTGAAAGAGATGTTAACGCAGATTTTTGGAATCCCCAAGGAACAT
AGAAAGTCTAAACCTTACCATGATCATGTGTTTGCTTTCTCCATTGTTGATGACCATATA
TGGTTCCGTAATTACCAGATATCGGTACCTCATAATGAGGCAGACAAGGTTGCAAGAGGT
GGTCTGGATAAAATGACACTTGTTGAGGTTGGTCCAAGGTTTTGTTTAAATCCGATTAAG
ATATTTGGAGGCAGCTTTGGAGGTCCAACTCTTTACGAGAACCCATTCTATGTATCTCCA
AACCAGATTCGAGCATTGGAGAAAAGAAATAAGGCTGGGAAGTTTGCAAAGAAGATCAAA
GCGAAAACGAGGAAAAAGATGCATGAGCTTTCCAACCCATTGGAGCCTGATGAGTTTGCT
GACATGTGGAAGGATGATGAATGATAATTGATAAGAGTTCTAATCAATTTTTTTGCTGTT
GTGAACTTCCACATATTCATAGAACCATCAACACATTTTTGTATGAACGGCTCTTGACTC
TGTTTTATTTTATCTGTTTTTTTTTCTTTTC


BQ
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AF RS1DH92TF U 1
AF RS1DH92JQ C 274
BS 1 699 RS1DH92TF
BS 700 1111 RS1DH92JQ

RD RS1DH92TF 702 0 0
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AGAAAGTCTAAACCTTACCATGATCATGTGTTTGCTTTCTCCATTGTTGATGACCATATA
TGGTTCCGTAATTACCAGATATCGGTACCTCATAATGAG
CAG

QA 1 699 1 699
DS 

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AATGAGGCAGACAAGGTTGCAAGAGGTGGTCTGGATAAAATGACACTTGTTGAGGTTGGT
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CATTTTTGTATGAACGGCTCTTGACTCTGTTTTATTTTATCTGTTTTTTTTTCTTTTC

QA 1 838 1 838
DS 



AS 1 3

CO CL3191Contig1 826 3 5 U
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CACTGGCCGTTTCTCAAACGGTCGGCTCATCATCGATTTCATTGCTGAATTCTTGGGGTT
TCCGCTTGTGCCTTCTTTTTATGGATCACAAAACGCAAACTTTGAAAAGGGAGTTAACTT
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TATGGGGGGGAGAACATTTCTTGTGCCGGGGGAGTTTCCCCTGGGA


BQ
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AF RS1A048TF U 1
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AF RS1FJ02TF U 50
BS 1 704 RS1A048TF
BS 705 768 RS1A048TV
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DS 

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TTTATCTACTCTACTTCTCACTAATATCGTAAACTCGGAAACGCAGTGTCGGCGTTTCAA
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TCCTAACCATCTCCCTCACGTGGCGTTTCCGCCCTACGGAGAGACCTTCTTTCACCATCC
CACTGGCCGTTTCTCAAACGGTCGGCTCATCATCGATTTCATTGCTGAATTCTTGGGGTT
TCCGCTTGTGCCTTCTTTTTATGGATCACAAAACGCAAACTTTGAAAAGGGAGTTAACTT
CGCGGTAGGAGGAGCAACGGCACTGGAACGTTCTTTTCTTGAGGAAAGAGGGATTCATTT
TCCTTACACCAACGTCAGTTTAGGAGTTCAGCTTAGGAGCTTCAAGGATGCTCTGCCTAA
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AGAAATTGGAGGGAATGACTATAATTACGTTTGCTTTGTGGGCAAAACCATTGAAGAGGC
CAGAGAGTTCGTTCCACTGGTGATCAGTACTATTTCTTCTGCAATCACTGAGTTGATCGG
T

QA 1 781 1 781
DS 

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ACCAAAGCTTCAAGCATCTCAATGGCGTCTCCCTATTGTCCTCCGATGATGAAGAAGCTC
ATGATCTTCTTTTTATCTACTCTACTTCTCACTAATATCGTAAACTCGGAAACGCAGTGT
CGGCGTTTCAAGTCGATCATCAGTTTCGGTGATTCCATTGCGGACACAGGAAACTTGCTC
GGCCTCTCTGATCCTAACCATCTCCCTCACGTGGCGTTTCCGCCCTACGGAGAGACCTTC
TTTCACCATCCCACTGGCCGTTTCTCAAACGGTCGGCTCATCATCGATTTCATTGCTGAA
TTCTTGGGGTTTCCGCTTGTGCCTTCTTTTTATGGATCACAAAACGCAAACTTTGAAAAG
GGAGTTAACTTCGCGGTAGGGGGAGCAACGGCACTGGAACGTTCTTTTCTTGAGGAAAGA
GGGATTCATTTTCCTTACACCAACGTCAGTTTAGGAGTTCAGCTTAGGAGCTTCAAGGAT
GCTCTGCCTAAGCTTTGTGGCTCCCCATCAGACTGCAGAGATATGATCGAAAATGCTTTG
ATTCTCATGGGAGAAATTGGAGGGAATGATTATAATTACGTTTTCTTTGTGGGCAAAACC
ATTGAAGAG*CCAGAGAGTTCGTTCCACTGGTGATCAGTACTATTTCTTCTGCAATCACG
GAGTTGATCGGTATGGGGGGGAGAACATTTCTTGTGCCGGGGGAGTTTCCCCTGGGA

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 3

CO CL3192Contig1 634 3 8 U
GGATCTTTCTCCAGTTTCCAAATCAAAAATCGATTCCTTTTCTCCCTAGCAAAACCCTAG
CTTCGACGAATCGCTTGCCGTTTCTTCTTCCGAGTCGGATCGAATCGCCATGGCCAAGAG
CTCTTTCAAGCTTTCTAATCCTCTGGAGACAAGGATGAATGAAGCGAGTCGAATCAGAGA
GAAGTACCCTGACAGAGTCCCTGTGATCGTGGAGAAGGCTGGACAGAGTGATGTTCCTGA
CATTGACAAGAAGAAGTATCTCGTCCCAGCTGATCTAACCGTTGGTCAGTTTGTGTACGT
GGTTCGCAAAAGAATCAAGCTTGGAGCTGAGAAAGCAATCTTTGTCTTTGTCAAAGACAC
ATTGCCTCCAACTGCTGCATTGATGTCTGCGATCTATGAAGAACACAAAGATGAAGACGG
GTTCCTCTACATGACTTACAGCGGAGAGAACACTTTTGGTTCTTTCATCGTTGCTTGAAA
TAAGTTAAATTTCCCATCTTTCCATGAATGTACATAGATAAAA*GGAGGAAGATAAGATG
TACATTCCTTCCTTATTCTCTCTGGCTTTTGCTTTTTCTCTTGCTTTGAATCTTTGACAT
TTGGGTTTATTATAATCTTCACAAACCTTTTCCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1AS93TF U 1
AF RS1D716TF U 1
AF RS1FM38TF U 20
BS 1 101 RS1AS93TF
BS 102 102 RS1D716TF
BS 103 244 RS1AS93TF
BS 245 245 RS1D716TF
BS 246 266 RS1AS93TF
BS 267 267 RS1D716TF
BS 268 607 RS1AS93TF
BS 608 634 RS1D716TF

RD RS1AS93TF 608 0 0
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CTTCGACGAATCGCTTGCCGTTTCTTCTTCCGAGTCGGATCAAATCGCCATGGCCAAGAG
CTCTTTCAAGCTTTCTAATCCTCTGGAGACAAGGATGAATGAAGCGAGTCGAATCAGAGA
GAAGTACCCTGACAGAGTCCCTGTGATCGTGGAGAAGGCTGGACAGAGTGATGTTCCTGA
CATTAACAAGAAGAAGTATCTCGTCC*AGCTGATCTAACCGTTGGTCAGTTTGTGTACGT
GGTTCGCAAAAGAATCAAGCTTGGAGCTGAGAAAGCAATCTTTGTCTTTGTCAAAGACAC
ATTGCCTCCAACTGCTGCATTGATGTCTGCGATCTATGAAGAACACAAAGATGAAGACGG
GTTCCTCTACATGACTTACAGCGGAGAGAACACTTTTGGTTCTTTCATCGTTGCTTGAAA
TAAGTTAAATTTCCCATCTTTCCATGAATGTACATAGATAAAA*GGAGGAAGATAAGATG
TACATTCCTTCCTTATTCTCTCTGGCTTTTGCTTTTTCTCTTGCTTTGAATCTTTGACAT
TTGGGTT
A

QA 1 607 1 607
DS 

RD RS1D716TF 634 0 0
GGATCTTTCTCCAGTTTCCAAATCAAAAATCGATTCCTTTTCTCCCTAGCAAAACCCTAG
CTTCGACGAATCGCTTACCGTTTCTTCTTCCGAGTCGGATCGAATCGCCATGGCTAAGAG
CTCTTTCAAGCTTTCTAATCCTCTGGAGACAAGGATGAATGAAGCGAGTCGAATCAGAGA
GAGGTACCCTGACAGAGTCCCGGTGATTGTGGAGAAGGCTGGACAGAGTGACGTTCCTGA
CATTGACAAGAAGAAGTATCTCGTCCCAGCTGATCTAACCGTTGGTCAGTTTGTGTACGT
GGTTCGCAAAAGAATCAAGCTTGGAGCTGAGAAAGCAATCTTCGTCTTTGTCAAGGATAC
ATTGCCTCCAACTGCTGCGTTGATGTCTGCGATCTATGAAGAACACAAAGATGAAGACGG
GTTCCTCTACATGACTTACAGCGGAGAGAACACTTTTGGTTCTTTCATTGCTGCTTGAAA
TAAGTAAAATTTCC*ATCTTTCCATGAATGTACATAGATAAAAAGGAGGAAGATAAGATG
TACATTCCTTCCTTATTCTCTCTGGCTTTTGCTTTTTCTTTTGCTTTGAATCTTTGACAT
TTGGGTTTATTATAATCTTCACAAACCTTTTCCT

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1FM38TF 613 0 0
GG
ATCAAAAATCGATTCCTTTTCTCCCTAGCAAAACCCTAGCTTCGACGAATCGCTTGCCGT
TTCTTCTTCCGAGTCGGATCGAATCGCCATGGCCAAGAGCTCTTTCAAGCTTTCTAATCC
TCTGGAGACAAGGATGAATGAAGCGAGTCGAATCAGAGAGAAGTACCCTGACAGAGTCCC
TGTGATCGTGGAGAAGGCTGGACAGAGTGATGTTCCTGACATTGACAAGAAGAAGTATCT
CGTCCCAGCTGATCTAACCGTTGGTCAGTTTGTGTACGTGGTTCGCAAAAGAATCAATCT
TGGAGCTGAGAAAGCAATCTTTGTCTTTGTCAAAGACACATTGCCTCCAACTGCTGCATT
GATGTCTGCGATCTATGAAGAACACAAAGATGAAGACGGGTTCCTCTACATGACTTACAG
CGGAGAGAACACTTTTGGTTCTTTCATCGTTGCTTGAAATAAGTTAAATTTCCCATCTTT
CCATGAATGTGCATAGATAAAA*GGAGGAAGATAAGATGTACATTCCTTCCTTATTCTCT
CTGGCTTTTGCTTTTTCTCTTGCTTTGAATCTTTGACATTTGGGTTTATTATAATCTTCA
CAAACCTTTTC

QA 3 613 3 613
DS 



AS 1 2

CO CL3193Contig1 835 2 18 U
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ATTGGTAACATGCACATCACCTAAGTTTGTCTTGGTAGCCACTCAGCGTTTTTATAACAA
CATGCACATCAACCTTACAAAATCCATTTCCTTCATCTCTTGAATAATCTAATCCAACTA
AACAAACAAGAAACAATAGAAACAACATCAACTCAGTCTCAACAGAAAACGTGGGCTATA
TCCACTCCTTGGGGTTGATACAAGCATCCAACAGCTTCCACTCTTCCGTCCCCTCTTCCG
GTTTATGGTCATATTCCCATCTTGCTGACAGTGGAAGAGAGACAAGAATACTCTCTATTC
TCCCTCCTGCCTTCAGACCAAATGTCGTTCCACGATCATATACCAAGTTGAATTCGACAT
ATATTCCTCGCCGCAGCTGCTGCCATGCCTTGTGCTGCTCTGTAAACTCCATGTCTTTCC
TCTTCTCTACTATAGGTATATAAGCCGGTACCACTGAGTTCGCACATTCAGTGGAGAAAG
CAAGAAGCATCTCCTGATCATAATCATTAAGATCGTCAAAAAATATCCCCCCAAGTCCTC
GTCTCTCATCACGGTGCTTGATGTAAAAGTAGTCATCGCACCACTTCTTGAATCGTGGAT
AGAAGGAAGGGTCAAACTTGTCACACGCTTGCTTTTGAATAGAATGGAAATGCTTGACAT
CGTCTTCGAAGATGTAAGCTGGAGTGAAATCAGTTCCACCACCGAACCACCACTGCCTCG
GAGCTCCAGGAACATCCTTGGGAGCATCAGTCTCGAAGTAACGATAATTAAAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H337JQB U 1
AF RS1H170TF C 138
BS 1 228 RS1H337JQB
BS 229 229 RS1H170TF
BS 230 369 RS1H337JQB
BS 370 370 RS1H170TF
BS 371 396 RS1H337JQB
BS 397 397 RS1H170TF
BS 398 422 RS1H337JQB
BS 423 423 RS1H170TF
BS 424 541 RS1H337JQB
BS 542 542 RS1H170TF
BS 543 600 RS1H337JQB
BS 601 601 RS1H170TF
BS 602 700 RS1H337JQB
BS 701 701 RS1H170TF
BS 702 742 RS1H337JQB
BS 743 743 RS1H170TF
BS 744 782 RS1H337JQB
BS 783 835 RS1H170TF

RD RS1H337JQB 782 0 0
AACGAGTTGAACTGGATGGGAGCCTGTAGACAATAAACATGTCAGTTGTTAAAATACAGC
ATTGGTAACATGCACATCACCTAAGTTTGTCTTGGTAGCCACTCAGCGTTTTTATAACAA
CATGCACATCAACCTTACAAAATCCATTTCCTTCATCTCTTGAATAATCTAATCCAACTA
AACAAACAAGAAACAATAGAAACAACATCAACTCAGTCTCAACAGAAAGCGTGGGCTATA
TCCACTCCTTGGGGTTGATACAAGCATCCAACAGCTTCCACTCTTCCGTCCCCTCTTCCG
GTTTATGGTCATATTCCCATCTTGCTGACAGTGGAAGAGAGACAAGAATACTCTCTATTC
TCCCTCCTGTCTTCAGACCAAATGTCGTTCCACGATTATATACCAAGTTGAATTCGACAT
ATCTTCCTCGCCGCAGCTGCTGCCATGCCTTGTGCTGCTCTGTAAACTCCATGTCTTTCC
TCTTCTCTACTATAGGTATATAAGCCGGTACCACTGAGTTCGCACATTCAGTGGAGAAAG
CCAGAAGCATCTCCTGATCATAATCATTAAGATCGTCAAAAAATATCCCCCCAAGTCCTC
TTCTCTCATCACGGTGCTTGATGTAAAAGTAGTCATCGCACCACTTCTTGAATCGTGGAT
AGAAGGAAGGGTCAAACTTGTCACACGCTTGCTTTTGAATCGAATGGAAATGCTTGACAT
CGTCTTCGAAGATGTAAGCTGGTGTGAAATCAGTTCCACCACCGAACCACCACTGCCTCG
GA

QA 1 782 1 782
DS 

RD RS1H170TF 698 0 0
CAAAATCCATTTC*TTCATCTCTTGAATAATCTAATCCAACTAAACAAACAAGAAACAAT
AGAAACAACATCAACTCAGTCTCAACAGAAAACGTGGGCTATATCCACTCCTTGGGGTTG
ATACAAGCATCCAACAGCTTCCACTCTTCCGTCCCCTCTTCCGGTTTATGGTCATATTCC
CATCTTGCTGACAGTGGAAGAGAGACAAGAATACTCTCTATTCTCCCTCCTGCCTTCAGA
CCAAATGTCGTTCCACGATCATATACCAAGTTGAATTCGACATATATTCCTCGCCGCAGC
TGCTGCCATGCCTTGTGCTGCTCTGTAAACTCCATGTCTTTCCTCTTCTCTACTATAGGT
ATATAAGCCGGTACCACTGAGTTCGCACATTCAGTGGAGAATGCAAGAAGCATTTCCTGA
TCATAGTCATTAAGATCGTCAAAAAATATCCCTCCAAGTCCTCGTCTCTCATCACGGTGC
TTGATGTAAAAGTAGTCATCGCACCACTTCTTGAATCGTGGATAGAAGGAAGGGTCAAAC
TTGTCACACGCTTGTTTTTGAATAGAATGGAAATGCTTGACATCGTCTTCGAAGATGTAA
GCTGGAGTGAAATCAGTTCCACCACCGAACCACCACTGCCTCGGAGCTCCAGGAACATCC
TTGGGAGCATCAGTCTCGAAGTAACGATAATTAAAATC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 3

CO CL3194Contig1 361 3 2 U
GATCGGAGTATCCTATGCTTCTCCTCCACCTCCACCCTTCTATTGATTCTTGGACAGATT
GTTTACAGAGACTAAGCGAGTGAATCAAGATTGTCTTAGAAGATTTATTTGATGAAAATA
AGAACAAAAAGAAGAAGAGATTATTATGGTTTCCAGGAAACAAAAAAAAAGTTGTATGTA
TAGAGGGATGATGATATAATCGGAGCAACATCTGCTCCATTGTTTTTCAATTTGTGAGAT
TAATTTTATTTTTGTGTTATTTTTCATAGTGAAACTCAGCCACATTTTTCTCTTTTGTTT
TTTGTATTTGATCTTATCAGACGAGCCGTAGAGGCTTATTACATTTTTTTTTTCATTTCT
C


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 

AF RS1BD82TF U 1
AF RS1E811TF U 1
AF RS1EK07TF U 1
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TAATTTTATTTTTGTGTT
ATT

QA 1 258 1 258
DS 

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TAATTTTATTTTTGTGTT

QA 1 258 1 258
DS 

RD RS1EK07TF 361 0 0
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GTTTACAGAGACTAAGCGAGTGAATCAAGATTGTCTTAGAAGATTTATTTGATGAAAATA
AGAACAAAAAGAAGAAGAGATTATTATGGTTTCCAGGAAACAAAAAAAAAGTTGTATGTA
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TAATTTTATTTTTGTGTTATTTTTCATAGTGAAACTCAGCCACATTTTTCTCTTTTGTTT
TTTGTATTTGATCTTATCAGACGAGCCGTAGAGGCTTATTACATTTTTTTTTTCATTTCT
C

QA 1 361 1 361
DS 



AS 1 3

CO CL3195Contig1 887 3 7 U
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TCAAGAAGAAGAAGAAGCTCGATGATGATTCGTCAACGGACTACTCTCATGGCGTCGTCT
TGGCGATTCCTTCCGTTGCTTCATCGGATGATTCATCTCGAGGCGGATGCTCTGTTACCT
CCGCCGGAGAAGACGATGACAAGAGCTCGATCATCTGTTTAAGTACTGAATCGAAGAGTA
GCAGTCCGACTGTTGCCGTAGATCTACAGGCTCATCAAATCTCCGAGACGGAAACTTCAA
CATCTATCACCAGCAGGAGTATCAGAAAAGCGGTAAATCCAGTGAGTGAAGAAGCGTTGG
GAGAAACAACAGAGATGGAGTCCTCATCATCATCGGCGCAAAAAGTGAGTAAGAGTCCGA
CGCCGGGAGATATTGAAGAGTTCTTATCGGAGCTGGAGAATAAAGATCAGAAACGATTCA
TTGAGAAGTACAACTTCGATATCGTTAATGACAAACCGCTCCAAGGTCGCTACAAGTGGG
GATCGATTTAAGGGCCATGAAAGGAATTAAAATAGCATGCGGAAGAAGATAGCTTCTTTT
TCTCCTAATTACATTCCACTTGTACAGCTTTCTTTTTCTCTAATCAGTTTAGCCTATGTT
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GGAAAGGTTGTTCTTGTTTGGATTTTAAAACATTGGATGCTTATTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1EK14TF U 1
AF RS1GN85TF U 5
AF RS1GN85JQ C 305
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RD RS1EK14TF 643 0 0
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CCGCCG*AGAAGACGATGACAAGAGCTCGATCATCTGTTTAAGTACTGAATCGAAGAGTA
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CATCTATCACCAGCAGGAGTATCAGAAAAGCGGTAAATCCAGTGAGTGAAGAAGCGTTGG
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QA 1 643 1 643
DS 

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GG
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CGACTGTTGCCGTAGATCTACAGGCTCATCAAATCTCCGAGACGGAAACTTCAACATCTA
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TTTAAGGGCCATGAAAGGAATTAAAATAGCATGCGGAAGAAGATAGCTTCTTTTTCTCCT
AATTACATTCCACTTGTACAGCTTTCTTTTTCTCTAATCAGTTTAGCCTATGTTAGT

QA 3 719 3 719
DS 

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GAAGTACAACTTCGATATCGTTAATGACAAACCGCTCCAAGGTCGCTACAAGTGGGGATC
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CTAATTACATTCCACTTGTACAGCTTTCTTTTTCTCTAATCAGTTTAGCCTATGTTAGTT
GTACAAACAAATGAAAAAAATACAAGCTTTATGTCGAGATTTATGATCTGATTAAGTAAT
CTCTATGGGTTTTGATCTTGTGGGGTTTATCAGGTTTATTTTAAATGCATGAATATGGAA
AGGTTGTTCTTGTTTGGATTTTAAAACATTGGATGCTTATTAC

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 3

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ACCACGCCCTTGACGCCGTCGGCATCACCTACAAGAAAGTCCCCATTGTTGTCTCTGAGA
CCGGATGGCCCTCCAACGGCGACCCGCAGGAGGTTGGAGCCAACTGCGACAATGCACGCA
AGTACGATGGAAACCTGATCAAGATGATGATGAGCAAGAAGATGAGGACTCCCATTAGAC
CAGACTGCGATCTCACCATCTTCGTCTTCGCTCTCTTCAATGAGAACATGAAGCCTGGCC
CCACTTCCGAGAGGAACTACGGCCTCTTCAACCCTGACGGAACTCCCGTTTACTCCCTCG
GGATCAAGACCTCCTCCTCCTCGGGTGGTAGTAGTAGTAGCGGCAGCAAAAACTCCACCG
GTGGTGGTAGTAGCAGCAGTGGAGGTAGCACTGGTGGATCACCCGGTGGCGGCGGCGGCG
GCATCTACACGCCAGAGAACCCTTCACCGGATTACATGTCCATTTCCTCCGCAATGGGAA
AAGGCAGATTCGTTGAGTGCGTGTTCTTCTTCCTCTTGCTTTGCATCATCAAGCTTCGGC
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AAATTATCCCCAAATTTTATTTTATTTAATTAGTTTGTTATGTTGGTGTTTGGTCGGAAA
CCTATTTTCTGAATGGACCGTGGATTTAGAAAACTTGCCATCTTTGTTGTGCCC


BQ
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AF RS1EQ61TF U 1
AF RS1EQ61JQ C 327
AF RS1GJ77TF U 547
BS 1 737 RS1EQ61TF
BS 738 740 RS1GJ77TF
BS 741 770 RS1EQ61TF
BS 771 822 RS1GJ77TF
BS 823 834 RS1EQ61JQ

RD RS1EQ61TF 770 0 0
GGACTAACCCCAAACACATCTCTCTCGACTTCGTCCTCTTCCAGCCAAACCAGGGCTTCA
CCGATCCTGGCTCCAATTTCCACTACGAAAACATGCTCTTCGCCCAGGTTGACGCCGTCT
ACCACGCCCTTGACGCCGTCGGCATCACCTACAAGAAAGTCCCCATTGTTGTCTCTGAGA
CCGGATGGCCCTCCAACGGCGACCCGCAGGAGGTTGGAGCCAACTGCGACAATGCACGCA
AGTACGATGGAAACCTGATCAAGATGATGATGAGCAAGAAGATGAGGACTCCCATTAGAC
CAGACTGCGATCTCACCATCTTCGTCTTCGCTCTCTTCAATGAGAACATGAAGCCTGGCC
CCACTTCCGAGAGGAACTACGGCCTCTTCAACCCTGACGGAACTCCCGTTTACTCCCTCG
GGATCAAGACCTCCTCCTCCTCGGGTGGTAGTAGTAGTAGCGGCAGCAAAAACTCCACCG
GTGGTGGTAGTAGCAGCAGTGGAGGTAGCACTGGTGGATCACCCGGTGGCGGCGGCGGCG
GCATCTACACGCCAGAGAACCCTTCACCGGATTACATGTCCATTTCCTCCGCAATGGGAA
AAGGCAGATTCGTTGAGTGCGTGTTCTTCTTCCTCTTGCTTTGCATCATCAAGCTTCGGC
TGTAAAAGCTTTCACCCCACTAGATCTCGGCTTTGTACCTCTAATTGGGTTGATGACGTG
AAATTATCCCCAAATTTA**TTTATTTAATTAGTTTGTTATGTTGGTGTT

QA 1 770 1 770
DS 

RD RS1EQ61JQ 508 0 0
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TTCAACCCTGACGGAACTCCCGTTTACTCCCTCGGGATCAAGACCTCCTCCTCCTCGGGT
GGTAGTAGTAGTAGCGGCAGCAAAAACTCCACCGGTGGTGGTAGTAGCAGCAGTGGAGGT
AGCACTGGTGGATCACCCGGTGGCGGCGGCGGCGGCATCTACACGCCAGAGAACCCTTCA
CCGGATTACATGTCCATTTCCTCCGCAATGGGAAAAGGCAGATTCGTTGAGTGCGTGTTT
TTCTTCCTCTTGCTTTGCATCATCAAGCTTCGGCTGTAAAAGCTTTCACCCCACTAGATC
TCGGCTTTGTACCTCTAATTGGGTTGATGACGTGAAATTATCCCCAAATTTTATTTTATT
TAATTAGTTTGTTATGTTGGTGTTTGGTCGGAAACCTATTTTCTGAATGGACCGTGGATT
TAGAAAACTTGCCATCTTTGTTGTGCCC

QA 1 508 1 508
DS 

RD RS1GJ77TF 276 0 0
G
CACGCCAGAGAACCCTTCACCGGATTACATGTCCATTTCCTCCGCAATGGGAAAAGGCAG
ATTCGTTGAGTGCGTGTTCTTCTTCCTCTTGCTTTGCATCATCAAGCTTCGGCTGTAAAA
GCTTTCACCCCACTAGATCTCGGCTTTGTACCTCTAATTGGGTTGATGACGTGAAATTAT
CCCCAAATTTTATTTTATTTAATTAGTTTGTTATGTTGGTGTTTGGTCGGAAACCTATTT
TCTGAATGGACCGTGGATTTAGAAAACTTGCCATC

QA 2 276 2 276
DS 



AS 1 3

CO CL3197Contig1 862 3 4 U
GCCAGAGAAAATCTCGTGTACTATATTTAATCACTCACTCACTCACAATAAAAACTCAAA
TTTAAATCAAAGTAAAAAAAAATCAAAACTAAAAAAAATCTCACGTTCTCGCGTATTTTT
GTTTTTAACTTAGCAAAAAAAAAATTAATACAGACAGTGAAAAATAAAAAATAACGGCAA
AACAAAAGTATTACACAGCCGCCGAACGCCGTCTCCACCACCGGCGCCGCCGGGTCATCC
ACGATTAGTTGTGTTTGTTTTCTCTGTGTATTTTTAATCTTGTGGATCTTCCTCACCGCC
TCCAAGTGAATCACTAGCCTGAGATTCGCCTGAAACTTGCCGTCCGTACTGATTTAAACC
GGAAAGAATATTATGATGCTGTTGTTGTTGATGATGATGATGTCTCTCATGTGTACTATG
ATGATCCCCACCGTCACTTATTCTTCCTCCTTCATTATTATTATTATCTTCATTGATCTC
ATGATTACTACTGGTTGCTAGCTGTTGTCCAGTAAGAAATGCCATTGGCGCTGCAAAATT
CATAAAATGCAAACCGCTTGAAACCGCACCGCCTGAAACGCCCGAAACGCTACTTCTGTA
TAAGGCAGCAGCGGCAGTGTTAATCGAAGGAAACGTCCACACAGGCTCTCCACCACCACC
GCTGCCTCCAGAAACTCCTCCTGTTTGGTTATTATTACCACCACCTGCGGCCGCCGCCGC
AGCCGCAACCGTCCAGAAGTTTCCTGGTATTTGCGCGGTTGTAGCCGTGGAACCACTGTT
GCTAGACTGAAGCGTATAGCCACCGATTTGTTCATGTTGATGATGTATATCCGACGCCGT
TTGGAGTCTCCGTTTTGTCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GO07JQ U 76
AF RS1FG20JQ U 1
AF RS1GO07TF C 164
BS 1 212 RS1FG20JQ
BS 213 213 RS1GO07JQ
BS 214 592 RS1FG20JQ
BS 593 862 RS1GO07TF

RD RS1GO07JQ 162 0 0
AAAAAAATCAAAACTAAAAAAA*TCTCACGTTCTCGCGTATTTTTGTTTTTAACTTAGCA
AAAAAAAAATTAATACAGACAGTGAAAAATAAAAAATAACGGCAAAACAAAAGTATTACA
CAGCCGCCGAACGCCGTCTCCACCACCGGCGCCGCCTGGTCA

QA 1 162 1 162
DS 

RD RS1FG20JQ 592 0 0
GCCAGAGAAAATCTCGTGTACTATATTTAATCACTCACTCACTCACAATAAAAACTCAAA
TTTAAATCAAAGTAAAAAAAAATCAAAACTAAAAAAAATCTCACGTTCTCGCGTATTTTT
GTTTTTAACTTAGCAAAAAAAAAATTAATACAGACAGTGAAAAATAAAAAATAACGGCAA
AACAAAAGTATTACACAGCCGCCGAACGCCGTTTCCACCACCGGCGCCGCCGGGTCATCC
ACGATTAGTTGTGTTTGTTTTCTCTGTGTATTTTTAATCTTGTGGATCTTCCTCACCGCC
TCCAAGTGAATCACTAGCCTGAGATTCGCCTGAAACTTGCCGTCCGTACTGATTTAAACC
GGAAAGAATATTATGATGCTGTTGTTGTTGATGATGATGATGTCTCTCATGTGTACTATG
ATGATCCCCACCGTCACTTATTCTTCCTCCTTCATTATTATTATTATCTTCATTGATCTC
ATGATTACTACTGGTTGCTAGCTGTTGTCCAGTAAGAAATGCCATTGGCGCTGCAAAATT
CATAAAATGCAAACCGCTTGAAACCGCACCGCCTGAAACGCCCGAAACGCTA

QA 1 592 1 592
DS 

RD RS1GO07TF 699 0 0
AAT
AAAAATAACGGCAAAACAAAAGTATTACACAGCCGCCGAACGC*GTCTCCACCACCGGCG
CCGCCGGGTCATCCACGATTAGTTGTGTTTGTTTTCTCTGTGTATTTTTAATCTTGTGGA
TCTTCCTCACCGCCTCCAAGTGAGTCACTAGCCTGAGATTCGCCTGAAACTTGCCGTCCG
TACTGATTTAAACCGGAGAGAATATTATGATGCTGTTGTTGTTGATGATGATGATGTCTC
TCATGTGTACTATGATGATCCCCACCGTCACTTCTTCTTCCTCCTTCATTATTATTATTA
TCTTCATTGATCTCATGATTACTACTGGTTGCTAGCTGTTGTCCAGTAAGAAATGCCATT
GGCGCTGCAAAATTCATAAAATGCAAACCGCTTGAAACCGCACCGCCTGAAACGCCCGAA
ACGCTACTTCTGTATAAGGCAGCAGCGGCAGTGTTAATCGAAGGAAACGTCCACACAGGC
TCTCCACCACCACCGCTGCCTCCAGAAACTCCTCCTGTTTGGTTATTATTACCACCACCT
GCGGCCGCCGCCGCAGCCGCAACCGTCCAGAAGTTTCCTGGTATTTGCGCGGTTGTAGCC
GTGGAACCACTGTTGCTAGACTGAAGCGTATAGCCACCGATTTGTTCATGTTGATGATGT
ATATCCGACGCCGTTTGGAGTCTCCGTTTTGTCTGC

QA 4 699 4 699
DS 



AS 1 3

CO CL3198Contig1 762 3 7 U
GGGAGCTTTATAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAAGCAGAGATGGCTAGTGGAATCGCTCGT
GGTCGTTTAGCAGAGGAGAGGAAATCGTGGAGGAAGAATCATCCTCATGGTTTTGTGGCG
AAGCCTGAGACTGGGCCTGATGGGTCGGTGAATCTAATGGTGTGGCATTGCACTGTTCCT
GGTAAAGCCGGTACTGATTGGGAAGGTGGGTTCTTTCCATTAACGATGCACTTCAGCGAG
GACTATCCGAGCAAGCCTCCCAAATGCAAATTCCCACCAGGCTTTTTCCACCCTAATGTC
TATCCATCAGGGACAGTCTGTCTCTCAATCCTTAACGAGGATTCCGGGTGGAGACCAGCC
ATCACTGTGAAGCAGATTCTTGTCGGTATTCAGGATTTACTTGACACGCCTAATCCAGCT
GACCCTGCACAGACTGATGGGTATCATCTCTTCATTCAGGATGCAGTTGAGTACAAGAAA
AGGGTTAAGCTGCAGTCCAAGCAGTATCCTCCCATCGTCTAGAAACCTTCTTCGAAGGGA
ACACCAAAATCTGATGACAAACCTCTGATCTTTTTGTGGTCTTTGTGTCTTTGTGATTGT
GTTTAAATGTCATCGGGTGAATGAAAACTCCTCATTTTGGCACCTTTGAGACATTACTAG
AATCTCTATTGTTTTCGGAAAAAAGGAACAGAATCATCTTTTTCTGTCTATTAACTGTTA
ATATTCTTGGTACTGATTCAGTTGGTGTTTGCTTCTATACAT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AR24TFB U 1
AF RS1FR22TF U 1
AF RS1FR22JQ C 1
BS 1 63 RS1AR24TFB
BS 64 65 RS1FR22TF
BS 66 174 RS1AR24TFB
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BS 176 539 RS1AR24TFB
BS 540 674 RS1FR22TF
BS 675 762 RS1FR22JQ

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GGT**TTTAGCAGAGGAGAGGAAATCGTGGAGGAAGAATCATCCTCATGGTTTTGTGGCG
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GGTAAAGCCGGTACTGATTGGGAAGGTGGGTTCTTTCCATTAACGATGCACTTCAGCGAG
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GAACA

QA 1 539 1 539
DS 

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GGTCGTTTAGCAGAGGAGAGGAAATCGTGGAGGAAGAATCATCCTCATGGTTTTGTGGCG
AAGCCTGAGACTGGGCCTGATGGGTCGGTGAATCTAATGGTGTGGCATTGCACTGTTCCT
GGTAAAGCCGGTACTGATTGGGAAGGTGGGTTCTTTCCATTAACGATGCACTTCAGCGAG
GACTATCCGAGCAAGCCTCCCAAATGCAAATTCCCACCAGGCTTTTTCCACCCTAATGTC
TATCCATCAGGGACAGTCTGTCTCTCAATCCTTAACGAGGATTCCGGGTGGAGACCAGCC
ATCACTGTGAAGCAGATTCTTGTCGGTATTCAGGATTTACTTGACACGCCTAATCCAGCT
GACCCTGCACAGACTGATGGGTATCATCTCTTCATTCAGGATGCAGTTGAGTACAAGAAA
AGGGTTAAGCTGCAGTCCAAGCAGTATCCTCCCATCGTCTAGAAACCTTCTTCGAAGGGA
ACACCAAAATCTGATGACAAACCTCTGATCTTTTTGTGGTCTTTGTGTCTTTGTGATTGT
GTTTAAATGTCATCGGGTGAATGAAAACTCCTCATTTTGGCACCTTTGAGACATTACTAG
AATCTCTATTGTTT

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1FR22JQ 762 0 0
GGGAGCTTTATAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAAGCAGAGATGGCTAGTGGAATCGCTCGT
GGTCGTTTAGCAGAGGAGAGGAAATCGTGGAGGAAGAATCATCCTCATGGTTTTGTGGCG
AAGCCTGAGACTGGGCCTGATGGGTCGGTGAATCTAATGGTGTGGCATTGCACTGTTCCT
GGTAAAGCCGGTACTGATTGGGAAGGTGGGTTCTTTCCATTAACGATGCACTTCAGCGAG
GACTATCCGAGCAAGCCTCCCAAATGCAAATTCCCACCAGGCTTTTTCCACCCTAATGTC
TATCCATCAGGGACAGTCTGTCTCTCAATCCTTAACGAGGATTCCGGGTGGAGACCAGCC
ATCACTGTGAAGCAGATTCTTGTCGGTATTCAGGATTTACTTGACACGCCTAATCCAGCT
GACCCTGCACAGACTGATGGGTATCATCTCTTCATTCAGGATGCAGTTGAGTACAAGAAA
AGGGTTAAGCTGCAGTCCAAGCAGTATCCTCCCATCGTCTAGAAACCTTTTTCGAAGGGA
ACACCAAAATTTGATGACAAACCTCTGATCTTTTTGTGGTCTTTGTGTCTTTGTGATTGT
GTTTAAATGTCATCGGGTGAATGAAAACTCCTCATTTTGGCACCTTTGAGACATTACTAG
AATCTCTATTGTTTTCGGAAAAAAGGAACAGAATCATCTTTTTCTGTCTATTAACTGTTA
ATATTCTTGGTACTGATTCAGTTGGTGTTTGCTTCTATACAT

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 3

CO CL3199Contig1 999 3 13 U
GGGCATCTCCAAATCTATGGCTACGTCGGTTGCGCAGCCGATCGTATTCGCATCTACCTG
AGCTAAGATGATAAATCGGTTCTTTCACATATTTCCCTTACCTTCCTCTCCCTTTCATTC
CCCTCACCCATTAAGCCTCTCCTTTCCTCGCCATGCGTCTCTCTCTCCGACCACTACTTC
TCATTTTCCGTTCCTGAGAAGCCTCTTCGTGTAGCCATCCTCCTCAGTGGCGGCGGCGAT
AGAACTGTCGCCCTCCGCCTCCTCCACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGA
CCCGCTTTTTATCATCATCTCCTTCAACTTTTTGTTCATTCTCTAGAGCTCTCTGTTATG
CCGAATTGTTGGCGTAGTTGAAGACCCTCGATTCAGTTCTGCCGTCGAATTCGATCTACG
AGTCGGCGTCGTATACACATGGATCTAGTAGCTCCGTTTTGATTCATGATCCAGAAGACG
GATCTTAGCTGCTGAGATCTCAGACGGATCGGTTGAAGAGCTGATCTGATCAAGCATCAT
GATCTCTCGGCAAAAGCTAGGTTCGTCGGATCTGTGATATGCTTTGCGGATTGATGAGTC
CTAGAGGAGCAATTGAAGAAGAGGGAAGAGGATGGATATGCGAATTGATAATGAGATTGA
AGGATGTATGAGATGTTTGTTAAGGACGATGAGTTCTGATTAGCATCTTTGTCATCCGAC
CTTTGCCATGACAGGTGCGCTTGCATGGCAGGTCACACAAAAATAATAATAAAAATAATC
GTTTTGTGTTTGGTGAGGGAGAGTTCGCACGGGAGAATTTTTTTTTAAAAGCCCGGGTTC
TCCCTCTCACCTTGTGTCTTTGCACTCTCTCTTTCACTCTGATTCCATTCGATTGCGCCA
TAATATTTCCCCATACCACATACATTTTTGAATTAACTCGAGCAGATCTGAAGTCAAACG
CGGCCATATCTAAATTCCAACATACCTCCACAGAGCAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G284TF U 1
AF RS1BC77TF U 311
AF RS1EH88TF U 319
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AGCTAAGATGATAAATCGGTTCTTTCACATATTTCCCTTACCTTCCTCTCCCTTTCATTC
CCCTCACCCATTAAGCCTCTCCTTTCCTCGCCATGCGTCTCTCTCTCCGACCACTACTTC
TCATTTTCCGTTCCTGAGAAGCCTCTTCGTGTAGCCATCCTCCTCAGTGGCGGCGGCGAT
AGAACTGTCGCCCTCCGCCTCCTCCACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGA
CCCGCTTTTTATCATCATCTCCTTCAACTTTTTGTTCATTCTCTAGAGCTCTCTGTTATG
CCGAATTGTTGGCGTAGTTGAAGACCCTCGATTCAGTTCTGCCGTCGAATTCGATCTACG
AGTCGGCGTCGTATACACATGGATCTAGTAGCTCCGTTTTGATTCATGATCCAGAAGACG
GATCTTAGCTGTGGAGATCTCAGACGGATCGGTTGAAGAGCTGATCTGATCAAGCATCAT
GATCTCTCGGCAAAAGCTAGGTTCGTCGGATCTGTGATATGCTTTGCGGATTGATGAGTC
CT

QA 1 602 1 602
DS 

RD RS1BC77TF 681 0 0
ATCATCATCTCCTTCAACTTTTTGTTCATTCTCTAGAGCTCTCTGTTATGCCGAATTGTT
GGCGTAGTTGAAGACCCTCGATTCAGTTCTGCCGTCGAATTCGATCTACGAGTCGGCGTC
GTATACACATGGATCTAGTAGCTCCGTTTTGATTCATGATCCAGAAGACGGATCTTAGCT
GCTGAGATCTCAGACGGATCGGTTGAAGAGCTGATCTTATCAAGCATCATGATCTCTCGG
CAAAAGCTAGGTTCGTCGGATCTGTGATATGCTTTGCGGATTGATGAGTCCTAGAGGAGC
AATTGAAGAAGAGGGAAGAGGATGGATATGCGAATTGATAATGAGATTGAAGGATGTATG
AGATGTTTGTTAAGGACGATGAGTTCTGATTAGCATCTTTGTCATCCGACCTTTGCCATG
ACAGGTGCGCTTGCATGGCAGGTCACAGAAAAATAATAATAAAAATAATCGTTTTGTGTT
TGGTGAGGGGGAGTTCGCACGGGA*ATTTTTTTTTTAAAAGCCCGGGTTCTCCCTCTCAC
CTTGTGTCTTTGCACTCTCTCTTTCACTCTGATTCCATTCGATTGCGCCATAATATTTCC
CCATACCACATACATTTTTGAATTAACTCGAGCAGATCTGAAGTCAAACGCGGCCATATC
TAAATTCCAACATACCTCCAC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RS1EH88TF 681 0 0
CTCCTTCAACTTTTTGTTCATTCTCTAGAGCTCTCTGTTATGCCGAATTGTTGGCGTAGT
TGAAGACCCTCGATTCAGTTCTGCCGTCGAATTCGATCTACGAGTCGGCGTCGTATACAC
ATGGATCTAGTAGCTCCGTTTTGATTCATGATCCAGAAGACGGATCTTAGCTGCTGAGAT
CTCAGACGGATCGGTTGAAGAGCTGATCTGATCAAGCATCATGATCTCTCGGCAAAAGCT
GGGTTCGTCGGATCTGTGATATGCTTTGCGGATTGATGAGTCCTAGAGGAGCAATTGAAG
AAGAGGGAAGAGGATGGATATGCGAATTGATAATGAGATTGAAGGATGTATGAGATGTTT
GTTAAGGACGATGAGTTCTGATTAGCATCTTTGTCATCCGACCTTTGCCATGACAGGTGC
GCTTGCATGGCAGGTCACACAAAAATAATAATAAAAATAATCGTTTTGTGTTTGGTGAGG
GAGAGTTCGCACGGGAGAATTTTTTTTTTTAAGCCCGGGTTCTCCCTCTCACCTTGTGTC
TTTGCACTCTCTCTTTCACTCTGATTCCATTCGATTGCGCCATAATATTTCCCCGTAC*A
CATACATTTTTGAATTAACTCGAGCAGATCTGAAGTCAAACGCGGCCATATCTACATTCC
AACATACCTCCACAGAGCAAA

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 3

CO CL3200Contig1 977 3 9 U
AACCAAAGTTGACTTTATTCATATCGTCTTTACTTTTTTACTCAAAACGTTCCACAAACA
GACAAGACTGATAAAAACAGAAGCACACAGACAGCATTTGGTTTTCCGTTTTCATGACAA
CGTATACATCCATTACTTAGCAAGGGGGTTTGTACCATCCCCACGGGTCGTTTGATGTGT
AGAGAGTCACTTGCTTCACATTCAAGCAGTTATCAAGTCCCCATTCTCCTAATTCGCGTC
CAAACCCACTGCGTTTGACTCCACCCCATGGAGCTTGAGTAAAGCATGGCTGTGAGCAGT
TAATCCACACAATCCCAGCTTCAAAGTCCTGGCTTATGCGGTCACATCTTTCAGCGTCAT
TAGATATCACTGCAGCTCCTAATCCGTAATGGGAATCATTTGCTAGCTCAATTGCCTCAT
CCTCACTGGAGAATGTTTTCACGCAAAGAACAGGCCCGAAAACTTCTTCCCTCCAAATTT
GCATTGAAGTGGTTACATCAGTTATGATGGTTGGTTTAATGAAGAAGCCCTTTTTCAGAT
GCTCAGGTCGGGAACCACCATGTAAAATCGTTGCCCCTTCACTTTTAGCCGTTGAGATAA
ACTTCAATATTTTCTCGTACTGTCCTTCGCTGACAACAGGACCAAGCCTGCATCCTTCTT
CCAAGGGGTCAGAAACTTTAATGTTCTTGCTCCATTTTACAAGCTTTTCTATGAATTCAG
ATGCGATTTTTTCATTAAGAAGGCGGGAAGTTGCACTGCAGATCTGACCATTTGTCCAGA
AGCAACCGAAGAGAGCCCATTCAGCAGCTTTATCAAGATCAACGTCATCAAACACAATGA
GAGGGCTCTTCCCACCCAGCTCCATCGAAACAGGCTTCACCAACTGAGCAGCAGCTGTCA
TGACCTTGCTTCCCGTGGCAAAACTTCCGGTAAAAGCAATCTTGTCGACATTGGGATGTG
AAGCCAAAGGAGCACCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D354JQ U 1
AF RS1FR59JQ U 1
AF RS1FR59TF C 259
BS 1 118 RS1D354JQ
BS 119 119 RS1FR59JQ
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BS 651 716 RS1FR59JQ
BS 717 977 RS1FR59TF

RD RS1D354JQ 650 0 0
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TAGATATCACTGCAGCTCCTAATCCGTAATGGGAATCATTTGCTAGCTCAATTGCCTCAT
CCTCACTGGAGAATGTTTTCACGCAAAGAATAGGCCCGAAAACTTCTTCCCTCCAAATTT
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GCTCAGGTCGGGAACCACCATGTAAAATCGTTGCCCCTTCACTTTTAGCCGTTGAGATAA
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QA 1 650 1 650
DS 

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CG
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CAAGACTGATAAAAACAGAAGCACACAGACAGCATTTGGTTTTCCGTTTTCATGACAACG
TATACATCCATTACTTAGCAAGGGGGTTTGTACCATCCCCACGGGTCGTTTGATGTGTAG
AGAGTCACTTGCTTCACATTCAAGTAGTTATCAAGTCCCCATTCTCCTAATTCGCGTCCA
AACCCACTGCGTTTGACTCCACCCCATGGAGCTTGAGTAAAGCATGGCTGTGAGCAGTTA
ATCCACACAATCCCAGCTTCAAAGTCCTGGCTTATGCGGTCACATCTTTCAGCGTCATTA
AATATCACTGCAGCTCCTAATCCGTAATGGGAATCATTTGCTAGCTCAATTGCCTCATCC
TCACTGGAGAATGTTTTCACGCAAAGAACAGGCCCGAAAACTTCTTCCCTCCAAATTTGC
ATTGAAGTGGTTACATCAGTTATGATGGTTGGTTTAATGAAGAAGCCCTTTTTCAGATGC
TCAGGTCGGGAACCACCATGTAAAATCGTTGCCCCTTCACTTTTAGCCGTTGAGATAAAC
TTCAATATTTTCTCGTACTGTCCTTCGCTGACAACAGGACCAAGCCTGCATCCTTCTTCC
AAGGGGTCAGAAACTTTAATGTTCTTGCTCCATTTTACAAGCTTTTCTATGAAT

QA 3 716 3 716
DS 

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CTCCACCCCATGGAGCTTGAGTAAAGCATGGCTGTGAGCAGTTAATCCACACAATCCCAG
CTTCAAAGTCCTGGCTTATGCGGTCACATCTTTCAGCGTCATTAGATATCACTGCAGCTC
CTAATCCGTAATGGGAATCATTTGCTAGCTCAATTGCCTCATCCTCACTGGAGAATGTTT
TCACGCAAAGAACAGGCCCGAAAACTTCTTCCCTCCAAATTTGCATTGAAGTGGTTACAT
CAGTTATGATGGTTGGTTTAATGAAGAAGCCCTTTTTCAGATGCTCAGGTCGGGAACCAC
CATGTAAAATCGTTGCCCCTTCACTTTTAGCCGTTGAGATAAACTTCAATATTTTCTCGT
ACTGTCCTTCGCTGACAACAGGACCAAGCCTGCATCCTTCTTCCAAGGGGTCAGAAACTT
TAATGTTCTTGCTCCATTTTACAAGCTTTTCTATGAATTCAGATGCGATTTTTTCATTAA
GAAGGCGGGAAGTTGCACTGCAGATCTGACCATTTGTCCAGAAGCAACCGAAGAGAGCCC
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GCTCCATCGAAACAGGCTTCACCAACTGAGCAGCAGCTGTCATGACCTTGCTTCCCGTGG
CAAAACTTCCGGTAAAAGCAATCTTGTCGACATTGGGATGTGAAGCCAAAGGAGCACCC

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 3

CO CL3201Contig1 823 3 17 U
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TTGTTCAAGTGCAAACAACAAGACACTTAAAGAGAGAAAAACATAGACTAGAAACTTGTT
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AATATCTCCTTACAGAACTCAATGGCTGACTCCAAATCGCCAGCCTTACACATTGCAGGA
AGCAACGAGGAAAAAATCAATTTCATCGGTCGAAAACCGTTCTTCTCTAACTCCTTATAC
CACATTTTAGCTTCATCAACTTTACCTTCACCAGCACATCCTCTAACCAAGGCAGTGAAT
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TTTGACTTCATCTCCAAGGCTAATCCTAACAACCTGGCATTGTAACTACGTATATCTCTA
CCAACATTCTTCTCTGTGATGTGTTTTGGGTCGTTCTCGTCGTTTACGAGGGTGATGAGG
GACGGTGTTCGTTGCGAGGTTGCTGTGACGGCGGAGAAAAAGCGGATGTTCGTGGGGGTG
TTTAAGCTGTTGGTGCGACGGAGGAGGAAGCGGGAGAGAAACGACATCGTTTTTGGTGTT
TGGAGGTTTTGTCTTTAGTCGGAATGTTCAAAGTTTCATTTCC


BQ
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AF RS1CM55JQ U 1
AF RS1F764JQ U 1
AF RS1F764TF C 98
BS 1 124 RS1CM55JQ
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RD RS1CM55JQ 519 0 0
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AATATCTCCTTGCAGAACTCAATGGCTGACTCCAAATCGCCAGCCTTACACATTGCAGGA
AGCAACGAGGAAAAAATCAATTTCATCGGTCGAAAACCGTTCTTCTCTAACTCCTTATAC
CACATTTTGGCTTCATCAACCTTACCTTCACCAGCACATCCTCTAACCAAGGCAGTGAAT
GTGAACACATCGGGTTTGATCCCATTACCCTTAAGCTCC

QA 1 519 1 519
DS 

RD RS1F764JQ 701 0 0
GC
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GTTCAAGTGCAAACAACAAGACACTTAAAGAGAGAAAAACATAGACTAGAAACTTGTTGA
TAGGCTTGGCAATGAACTACTACTTTACTCTTCAGAAGAGAGACGTAGTTTGAACTGTAA
ATACTCATTCTTCTTCGCAAGTTCAACAATCTCCTCAGCTTCTTCTCGCTTTGACCCTTT
CACCAATTCATCAACCACCTCTTGCATGATAGCACCATCCACGAGTAAACGCTTAGTGAA
TATCTCCTTACAGAACTCAATGGCTGACTCCAAATCGCCAGCCTTACACATTGCAGGAAG
CAACGAGGAAAAAATCAATTTCATCGGTCGAAAACCGTTCTTCTCTAACTCCTTATACCA
CATTTTAGCTTCATCAACTTTACCTTCACCAGCACATCCTCTAACCAAGGCAGTGAATGT
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TGACTTCATCTCCAAGGCTAATCCTAACAACCTGGCATTGTAACTACGTATATCTCTACC
AACATTCTTCTCTGTGATGTGTTTTGGGTCGTTCTCGTCGTTTACGAGGGTGATGAGGGA
CGGTGTTCGTTGCGAGGTTGCTGTGACGGCGGAGAAAAA

QA 3 701 3 701
DS 

RD RS1F764TF 726 0 0
AAAACATAGACTAGAAACTTGTTGATAGGCTTGGCAATGAACTACTACTTTACTCTTCAG
AAGAGAGACGTAGTTTGAACTGTAAATACTCATTCTTCTTCGCAAGTTCAACAATCTCCT
CAGCTTCTTCTCGCTTTGACCCTTTCACCAATTCATCAACCACCTCTTGCATGATAGCAC
CATCCACGAGTAAACGCTTAGTGAATATCTCCTTACAGAACTCAATGGCTGACTCCAAAT
CGCCAGCCTTACACATTGCAGGAAGCAACGAGGAAAAAATCAATTTCATCGGTCGAAAAC
CGTTCTTCTCTAACTCCTTATACCACATTTTAGCTTCATCAACTTTACCTTCACCAGCAC
ATCCTCTAACCAAGGCAGTGAATGTGAACACGTCAGGTTTGATCCCATTACCCTTAAGCT
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CATTGTAACTACGTATATCTCTACCAACATTCTTCTCTGTGATGTGTTTTGGGTCGTTCT
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AAAAGCGGATGTTCGTGGGGGTGTTTAAGCTGTTGGTGCGACGGAGGAGGAAGCGGGAGA
GAAACGACATCGTTTTTGGTGTTTGGAGGTTTTGTCTTTAGTCGGAATGTTCAAAGTTTC
ATTTCC

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DS 



AS 1 3

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CTTCCCCTAGTGTGTCTAACTCAGCAATGGCCGCATCAAAAGCCGTTTTAGCTAGGTCGC
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BQ
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AF RS1D031TF C 1
BS 1 636 RS1D031JQ

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AAAA

QA 1 173 1 173
DS 

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QA 1 636 1 636
DS 

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TCCTAACACTAGCAGTACCATTTCACACAAAGATTCTTCATTTCTGCTCTTCTGCTGGCT
TCACAGCTGCTGCTGCTGCTTCCTTGATCTCGTCTGCAGATTCATCCTGCATGTCGGATG
TCCAGAGAGTGAGGTTGTCACGGAGAAGCTGCATGATCAAAGTGCTATCCTTGTATGACT
CTTCCCCTAGTGTGTCTAACTCAGCAATGGCCGCATCAAAAGCCGTTTTAGCTAGGTCGC
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DS 



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GGTGAAGGGGGGGAAATCTGAGAAGCAGATAGTGTCTCTGGCCGAAGCAGCGGCGAAGAT
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TGAGCTGTTATCGAGGTATACCGATTACTTTGCGAAGGCACTCTCAGGAGTATCGTTCCC
ATGGGTGAAGATGTTCAAGGACGCTCCTTTATCCACTCTGATCGATGTTCCGTTATCTCA
TATTCCTGATTCTGTCTACGGAACAACACGCAATTGGCTCGACCTCCCTCCAGTTGAACT
TGAGGATTTCTCTGCCTTCGTACTGCGTGCGTTTGATCAGATCCTCCTTGATTTGGAAGG
AGGTGGTGGTGGTGATGACTCCAAATCTCAGGTGGGAATGTTTGTTGCGTTAGCCATCGT
TTTGCGTTGTAAACCTGAGGCTTTGGCTCCTGTCTTACCCATTCTGAGACAGAATCCTAA
GTATCAGGGACACGACAAGCTTCCCGTTACTGTTTGGATGTTGGCTCAGGCCTCCAAAAG
TAACGATCTATGTCTTGGCTTGTATTCATGGTCACATAACTTGCTACCACTTGTCACAGT
CAGTAGTAAGAAGCGTTGCTATATCCCTCAGTCTATGGATCTAATCCTGCAATTCGTTGA
GGAGATTCTGTCGCGTCCAAGGGCTCCGGCCATACTTGTAGATGGAGCTCTTAGGGAAGG
AGAGCCGCTCATTCCACTTACTTCATTTGAGATCTTGGTGCGTCTCGCATTCCCTGCTCC
AGACGCAAGAGTAGAGTCTACAGCAAGGGTTGAGGCAATATATCCCTTGCTGAAGGACGT
GGCTCTTTCACCAGATATGCCAGGAGGAAGCAACGCCGGGAAGCAGATGTTCACTTTTTC
CTTGAGATCAGCCAGAAAGGGTATTGTTACAGGAAATCCTGTTTTAGCCGAGGAAGCTAC
ATCTATCGCTGTCTGGTGTGTGGTGGAAAGCGTTGACTGCTTTGAGCACTGGGACATTCT
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CTGATGGCAAGATCTTATGAATGCTTTTGAGAT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DG91TF U 1
AF RS1H577TF U 678
AF RS1H577JQB C 1151
BS 1 741 RS1DG91TF
BS 742 1321 RS1H577TF
BS 1322 1322 RS1H577JQB
BS 1323 1390 RS1H577TF
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BS 1392 1446 RS1H577TF
BS 1447 1713 RS1H577JQB

RD RS1DG91TF 741 0 0
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GGTGAAGGGGGGGAAATCTGAGAAGCAGATAGTGTCTCTGGCCGAAGCAGCGGCGAAGAT
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ATGGGTGAAGATGTTCAAGGACGCTCCTTTATCCACTCTGATCGATGTTCCGTTATCTCA
TATTCCTGATTCTGTCTACGGAACAACACGCAATTGGCTCGACCTCCCTCCAGTTGAACT
TGAGGATTTCTCTGCCTTCGTACTGCGTGCGTTTGATCAGATCCTCCTTGATTTGGAAGG
AGGTGGTGGTGGTGATGACTCCAAATCTCAGGTGGGAATGTTTGTTGCGTTAGCCATCGT
TTTGCGTTGTAAACCTGAGGCTTTGGCTCCTGTCTTACCCATTCTGAGACAGAATCCTAA
GTATCAGGGACACGACAAGCTTCCCGTTACTGTTTGGATGTTGGCTCAGGCCTCCAAAAG
TAACGATCTATGTCTTGGCTTGTATTCATGGTCACATAACTTGCTACCACTTGTCACAGT
CAGTAGTAAGAAGCGTTGCTATATCCCTCAGTCTATGGATCTAATCCTGCAATTCGTTGA
GGAGATTCTGTCGCGTCCAAG

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DS 

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TTACTTCATTTGAGATCTTGGTGCGTCTCGCATTCCCTGCTCCAGACGCAAGAGTAGAGT
CTACAGCAAGGGTTGAGGCAATATATCCCTTGCTGAAGGACGTGGCTCTTTCACCAGATA
TGCCAGGAGGAAGCAACGCCGGGAAGCAGATGTTCACTTTTTCCTTGAGATCAGCCAGAA
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GTGTGGTGGAAAGCGTTGACTGCTTTGAGCACTGGGACATTCTCTATAGGGAGAATCTAG
AAGCTAGTGTTGCTCTTCTTAAAGAGCTGCTAGGCCAAAGGATGTTTTTCCGCAAGCTAT
CAACATCACCAAGCGATACTCTCACTGTCAATCAAACTATGGAGAGCTTCAGGCGTAAGA
ACAAAAAAGCCATCGCTGAAGGAGGATCCAATCGTTCTCTTTACAAAGAAGCTGACAAGT
ACTCACACTGATCTCGTGGAGAATCTCCCGTGGAGATGATGGAG*CTTCAGAATGACACC
CATTAATGTTTTGGTTCTAGCTGCTGTCGGAGCTTCTGTGGGAGTTGCTGTAG*AGCTGC
TACTTTCGGAGCTGCTACTCTCGGAGCTGTAGACGTTGCTGTCGGAGCT
CTCGCGCTACT

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DS 

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AAGCTATCAACATCACCAAGCGATACTCTCACTGTCAATCAAACTATGGAGAGCTTCAGG
CGTAAGAACAAAAAAGCCATCGCTGAAGGAGGATCCAATCGTTCTCTTTACAAAGAAGCT
GACAAGTACTCACACTGATCTCGTGGAGAATCTCCCGTGGAGATGATGGAGGCTTCAGAA
TGACACCCATTAATGTTTTGGTTCTAGCTGCTGTCGGAGCTTCTGTGGGAGTTGCTGTAG
GAGCTGCTACTTTCGGAGCTGCTACTCTCGGAGCTGTAGACGTTGCTGTCGGAGCTTTCG
GCGCTACTGTCGGAGCTGCTGCTGTCGGAGCTCTTATTGCATCATTCCACTAGCGTAGTC
ACAAAGTTGCAGTGCGCACACAAAAAAAAAAAAAAGTTATAAAGAGTTTGCTAGCCGGGC
AGAGGTGCACCAAATATGAATTTGCGGCGAATCTTCATCATGAGTCCGTGTAGATATCTT
TTGATATTCTTCTTCTAATACTTAGAACCACATATCTCATGCAAGATGTGCTGATGGCAA
GATCTTATGAATGCTTTTGAGAT

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DS 



AS 1 3

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CATCCTGCTAGCCGATGGACCCGATGCTAAGCCTTCTGGTGGTTCAGCACCTGAAGTTGG
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GCAGAGGCATTGTGGCGAGTTATCGACAAGGCCGGCAAGCTCCGGACAACAAGATTTGTC
TGGATTGGCCGCACCACCACGGTTTCCTACCTGCACGTACGAAAGACAGTCCGTCATGTT
CAACAGATTCGTCATGCAGTCTGGTTCAACCGAAGGTCCTGAGGAAGGAGATGGAGCCAT
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BQ
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AF RS1CK68JQ U 19
AF RS1GK65TF C 1
AF RS1GK65JQ U 19
BS 1 18 RS1GK65TF
BS 19 50 RS1CK68JQ
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BS 584 762 RS1GK65JQ

RD RS1CK68JQ 565 0 0
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QA 1 565 1 565
DS 

RD RS1GK65TF 762 0 0
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AGATGAAATGCAGAAGATACTGAGAAAAAGAGAATAAGGTGCAGTGTTTCGTGCATCGCT
CATCCTGCTAGCCGATGGACCCGATGCTAAGCCTTCTGGTGGTTCAGCACCTGAAGTTGG
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AGCCTTTGCCTTATCAATCTTGATTCCATAATGAACCTCCATATCTCCGCCGAGTAGGTA
GCAGAGGCATTGTGGCGAGTTATCGACAAGGCCGGCAAGCTCCGGACAACAAGATTTGTC
TGGATTGGCCGCACCACCACGGTTTCCTACCTGCACGTACGAAAGACAGTCCGTCATGTT
CAACAGATTCGTCATGCAGTCTGGTTCAACCGAAGGTCCTGAGGAAGGAGATGGAGCCAT
TTGTTCTGTCACGCTAGCTGATAACAATGCTGCAATCAGAATAGCGGCTATTACTGCAAC
GTTAGTCATTGTGTTTTTGCGTTTCTGTGTGAGAGGATTTCC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1GK65JQ 744 0 0
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CAAATAATGGAGTCGCTAAAAAGAAAAGGAAATCAGGATTATAGATGAAATGCAGAAGAT
ACTGAGAAAAAGAGAATAAGGTGCAGTGTTTCGTGCATCGCTCATCCTGCTAGCCGATGG
ACCCGATGCTAAGCCTTCTGGTGGTTCAGCACCTGAAGTTGGAGCGAAGGCTGGGGAGGA
TTCCTCGTTGCCCATAGCTTCCGGTGCTCCAACTGGAATTCCAAACAGTGAACATAGTGA
GGGATCTGGAGTAACGACGCCACAAACTCCGGGAAGCTTGAGAGCCTTTGCCTTATCAAT
CTTGATTCCATAATGAACCTCCATATCTCCGCCGAGTAGGTAGCAGAGGCATTGTGGCGA
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GCGTTTCTGTGTGAGAGGATTTCC

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 3

CO CL3205Contig1 1010 3 8 U
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TGAAGCTGCTATATTGGCTGGACGACGTGCAAAGACGGCGATATCATCGAAAGAGATTGA
TGACTCTATTGACAGAATCGTTGCTGGTATGGAAGGAACTGTGATGACTGATAGCAAGAG
CAAAAGCTTGGTTGCTTACCATGAAGTTGGTCGTGCCGTGTGTGGAACATTGACTCCAGG
ACATGACGCTGTGCAAAAGGTAACGTTGGTACCAAGAGGACAAGCGAGAGGTCTGACTTG
GTTCATTCCATCAGATGACCCTACTCTCATCTCCAAGCAACAACTCTTTGCAAGAATAGT
TGGTGGACTCGGTGGTAGAGCCGCTGAAGAAATCATCTTTGGTGAGCCTGAGGTTACTAC
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TGGAATGTCTGAAATTGGACCATGGTCGTTGATGGATTCATCGGCGCAAAGCGATGTGAT
CATGAGGATGATGGCAAGAAACTCTATGTCCGAGAAGCTCGCAGAGGACATTGACTCTGC
GGCGAAGAAACTGTCAGACAGTGCATACGAGATAGCTCTAAGCCACATAAGGAACAACCG
TGAAGCCATGGATAAGATATTTGGAGTGCTTCTGGAGAAAGAAACTATCGGAGGCGACGA
GTTCCGAGCAATTCTCTCCGAGTTCACTGAGATCCCGCCGGAAAACCGAGTTCCTGCCTC
AATCCCAACATCTACACCAACGCCAGCTTCTGTCTAGGTAATGAATCTGTATACTTCCGA
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TACTGTGTAACACAAGTAAATGTTATAAGTGGAATTGGTATATTCACCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1H436TF U 901
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TGAAGCTGCTATATTGGCTGGACGACGTGCAAAGACGGCGATATCATCGAAAGAGATTGA
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TGGTGGACTCGGTGGTAGAGCCGCTGAAGAAATCATCTTTGGTGAGCCTGAGGTTACTAC
TGGAGCCGTTGGTGACTTGCAACAGATCACCGGTTTGGCTAAGCAGATGGTAACAACATT
TGGAATGTCTGAAATTGGACCATGGTCGTTGATGGATTCATCGGCGCAA*GCGATGTGAT
CATGAGGATGATGGCAAGAA*CTCTATGTCCGAGAAGCTCGCAGAGGACATTGACTCTGC
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TGAAGCCATGGA

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TGATGACTGATAGCAAGAGCAAAAGCTTGGTTGCTTACCATGAAGTTGGTCGTGCCGTGT
GTGGAACATTGACTCCAGGACATGACGCTGTGCAAAAGGTAACGTTGGTACCAAGAGGAC
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AACTCTTTGCAAGAATAGTTGGTGGACTCGGTGGTAGAGCCGCTGAAGAAATCATCTTTG
GTGAGCCTGAGGTTACTACTGGAGCCGTTGGTGACTTGCAACAGATCACCGGTTTGGCTA
AGCAGATGGTAACAACATTTGGAATGTCTGAAATTGGACCATGGTCGTTGATGGATTCAT
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AAAACCGAGTTCCTGCCTCAATCCCAACATCTACACCAACGCCAGCTTCTGTCTAGGTAA
TGAATCTGTATACTTCCGATTTTTCTGTACATTTGTACTGTCAAAACTTGAGCTCTAGAA
ATATGTGGTGATGTCCCAATACTGTGTAACACAAGTAAATGTTATAAGTGGAATTGGTAT
ATTCACCAA

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TACTGTGTAACACAAGTAAATGTTATAAGTGGAATTGGTATATTCACC

QA 1 108 1 108
DS 



AS 0 0

AS 1 3

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AGAAGATTTGATACAAAATCCATAACCGGGCCAGTACAGAACCAATAAAAATCTCCTTTC
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AGAGAACATCCGGAGGCATTGATCCAGTTGACTCAATCTTAAATATAAAATGGTTCTTGA
CACGTCGAAGAGCCCCATTCTCTATCCATTCTTTTTCTCGAGCCACATTCTCTATCCATT
TTTTTTCTTCTTCGTCTTTGTTTTCTTCCTCTCCATAATTTTCCCTCACGCATTGCCTAC
ACAGCGTGCAATCACGCGGCCGTGCTACCGTTGCCCTCTTCCTACCATTGCCCATGTCTT
CAATGTCAAAAACCTTCTGCGGGCAGGCTTTTACGAGTCGTTCAGCATCTTCATCCTCAA
CTTCCCTTAGTAGAATAACCTCAGGAAGCATCCGATACCAAGCCGTCGCTACTGGTGACC
ACTTTGCATGTGTTTTACCAATGCCCTTAACCGCATGAGCCTCCAGCTCAATCTCATGAC
CAGGGCCGAGTTTTGCGATCAATATGTCAGGATAGCTCGGAGAGATATTACTATCCTTAG
CAGCAAATTCAGGGAAGGAATCTTTTTGGCTTCGGCTGAAGGAAGTATAAGTTTTTGGCT
TTGAGTTGGAATCTCCTGATTCTTTAACCAACTCACTCCCATTTGGTAACCAAATCAGTT
CCTTTGTTAAAACTTTCTTACGTCCTTCACCTTTTGCACATTTCGCGTGGAGTTTGAAAA
CGATGGTGTTCTTTTCATTTGGCTGGTCGTTTTCAGATAAATAGTCGAAGAGCTTGGGGT
CCGCAGCAATAGGAACAAGACCCATCCTCTGAGCAAGAACTTCATCTTGAACAATGGATG
TGTTGTTTGCTATAAACACTTTTTCAAAAGCCATTGTAGGAAGCTCAGCTAGAAGGATCC
TTCTGAAGGCATTGGCGATTGCTGCATCGATACCGATCATATCGAATGTCAATTCCATGC
CATCTTTTGAAAGTTCGATCACATTGACTTTGAAATTATCAGAGAAGTTTTCGAGTTTCA
CACTGTTGTCAACTCCCACACTGTTGTAGGCACCCGAGTAAGCGATACTCGTCGTATGAA
TAGGAGCGTCTTCTTTACAGAGGCCACGAGTTCGCTGGAGTTGAAGATGAGGAGGAAGTC
CGGCAGGGATGTCGGGGAGATCCATTATGTTGAAATTCTTGGCGAATGTCTTTTCTTCCT
CGGTCACTATCCTCTTTTCTTTTTTGGTAGTCATCTTTCTTTGCAATGAGTGGGCAACTA
CGAAGTTTTAGGGTTTTAGATGGGGAGTGGGATATGAACTTTCGGCTTCCTAGATGCGTT
TCCTAGTCTGAGTTTTGATCAATCTCTCTCTTTTTTTTCTTTATGATTCCTTCGGCTCTT
CTTTGTTTGTTTTCCCGTTCTGAACTGAACTCC


BQ
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AF RS1CJ38JQ U 1
AF RS1CW83JQ U 328
AF RS1CW83TF C 816
BS 1 633 RS1CJ38JQ
BS 634 634 RS1CW83JQ
BS 635 753 RS1CJ38JQ
BS 754 914 RS1CW83JQ
BS 915 1533 RS1CW83TF

RD RS1CJ38JQ 753 0 0
GAACTCAAACGAACTTATGCAACATGAACATCTCAATGTTCTTAGTATCGAAAATCAAAG
AGAAGATTTGATACAAAATCCATAACCGGGCCAGTACAGAACCAATAAAAATCTCCTTTC
AGGAGAGAGTAGTGATAACACGTTCACATTTAGTTTCCAGAATCTTGACAGCTTCAGCGA
AGAGAACATCCGGAGGCATTGATCCAGTTGACTCAATCTTAAATATAAAATGGTTCTTGA
CACGTCGAAGAGCCCCATTCTCTATCCATTCTTTTTCTCGAGCCACATTCTCTATCCATT
TTTTTTCTTCTTCGTCTTTGTTTTCTTCCTCTCCATAATTTTCCCTCACGCATTGCCTAC
ACAGCGTGCAATCACGCGGCCGTGCTACCGTTGCCCTCTTCCTACCATTGCCCATGTCTT
CAATGTCAAAAACCTTCTGCGGGCAGGCTTTTACGAGTCGTTCAGCATCTTCATCCTCAA
CTTCCCTTAGTAGAATAACCTCAGGAAGCATCCGATACCAAGCCGTCGCTACTGGTGACC
ACTTTGCATGTGTTTTACCAATGCCCTTAACCGCATGAGCCTCCAGCTCAATCTCATGAC
CAGGGCCGAGTTTTGCGATCAATATGTCAGGATGGCTCGGAGAGATATTACTATCCTTAG
CAGCAAATTCAGGGAAGGAATCTTTTTGGCTTCGGCTGAAGGAAGTATAAGTTTTTGGCT
TTGAGTTGGAATCTCCTGATTCTTTAACCAACT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1CW83JQ 587 0 0
CCTCTCCATAATTTTCCCTCACGCATTGCCTACACAGCGTGCAATCACGCGGCCGTGCTA
CCGTTGCCCTCTTCCTACCATTGCCCATGTCTTCAATGTCAAAAACCTTCTGCGGGCAGG
CTTTTACGAGTCGTTCAGCATCTTCATCCTCAACTTCCCTTAGTAGAATAACCTCAGGAA
GCATCCGATACCAAGCCGTCGCTACTGGTGACCACTTTGCATGTGTTTTACCAATGCCCT
TAACCGCATGAGCCTCCAGCTCAATCTCATGACCAGGGCCGAGTTTTGCGATCAATATGT
CAGGATAGCTCGGAGAGATATTACTATCCTTAGCAGCAAATTCAGGGAAGGAATCTTTTT
GGCTTCGGCTGAAGGAAGTATAAGTTTTTGGCTTTGAGTTTGAATCTCCTGATTCTTTAA
CCAACTCACTCCCATTTGGTAACCAAATCAGTTCCTTTGTTAAAACTTTCTTACGTCCTT
CACCTTTTGCACATTTCGCGTGGAGTTTGAAAACGATGGTGTTCTTTTCATTTGGCTGGT
CGTTTTCAGATAAATAGTCGAAGAGCTTGGGGTCCGCAGCAATAGGA

QA 1 587 1 587
DS 

RD RS1CW83TF 718 0 0
GCACATTTCGCGTGGAGTTTGAAAACGATGGTGTTCTTTTCATTTGGCTGGTCGTTTTCA
GATAAATAGTCGAAGAGCTTGGGGTCCGCAGCAATAGGAACAAGACCCATCCTCTGAGCA
AGAACTTCATCTTGAACAATGGATGTGTTGTTTGCTATAAACACTTTTTCAAAAGCCATT
GTAGGAAGCTCAGCTAGAAGGATCCTTCTGAAGGCATTGGCGATTGCTGCATCGATACCG
ATCATATCGAATGTCAATTCCATGCCATCTTTTGAAAGTTCGATCACATTGACTTTGAAA
TTATCAGAGAAGTTTTCGAGTTTCACACTGTTGTCAACTCCCACACTGTTGTAGGCACCC
GAGTAAGCGATACTCGTCGTATGAATAGGAGCGTCTTCTTTACAGAGGCCACGAGTTCGC
TGGAGTTGAAGATGAGGAGGAAGTCCGGCAGGGATGTCGGGGAGATCCATTATGTTGAAA
TTCTTGGCGAATGTCTTTTCTTCCTCGGTCACTATCCTCTTTTCTTTTTTGGTAGTCATC
TTTCTTTGCAATGAGTGGGCAACTACGAAGTTTTAGGGTTTTAGATGGGGAGTGGGATAT
GAACTTTCGGCTTCCTAGATGCGTTTCCTAGTCTGAGTTTTGATCAATCTCTCTCTTTTT
TTTCTTTATGATTCCTTCGGCTCTTCTTTGTTTGTTTTCCCGTTCTGAACTGAACTCC

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 3

CO CL3208Contig1 484 3 1 U
GGAACCCTAAAGAAAGTTTTAACCTAGCGTCGTCGTCCTCGTCGCCTCCAACAGCAGAGC
CAGAGAAGCAAATAAGATTCTCTGTAATCGACCATGGGAAAGGTGCACGGTTCATTGGCT
CGTGCCGGGAAGGTGAGAGGTCAGACACCGAAAGTGGCTAAACAGGACAAGAAGAAGAAG
CCTCGTGGCCGCGCTCACAAGCGATTGCAACACAACCGCCGTTTCGTCACTGCAGTTGTT
GGCTTTGGCAAAAAGAGAGGACCAAACTCATCAGAGAAGTAGAGACAAAACCAAGACTTC
TGGTGTGGTTTTCCGTCGGATTATTTTGATGTTTTGATAATGCGTTTTAGTTCCGGTATG
GTAATGAGTCGATGGATGTTGAGCCAATGTTTGTTGTCAATTTTATTCGTGTTTCTCCTT
GGATTATTTTTATTATATTAAAGACACTCAAACTCCATTATAGGAGGAGAAAGTACACGA
TCAT


BQ
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10 10 10 10 

AF RS1E184TF U 205
AF RS1E184JQ C 45
AF RS1ET11TF U 1
BS 1 484 RS1ET11TF

RD RS1E184TF 273 0 0
TTGCAACACAACCGCCGTTTCGTCACTGCAGTTGTTGGCTTTGGCAAAAAGAGAGGACCA
AACTCATCAGAGAAGTATAGACAAAACCAAGACTTCTGGTGTGGTTTTCCGTCGGATTAT
TTTGATGTTTTGATAATGCGTTTTAGTTCCGGTATGGTAATGAGTCGATGGATGTTGAGC
CAATGTTTGTTGTCAATTTTATTCGTGTTTCTCCTTGGATTATTTTTATTATATTAAAGA
CACTCAAACTCCATTATACGAGGAGAAAG
CGCA

QA 1 269 1 269
DS 

RD RS1E184JQ 432 0 0
CCTCCAACAGCAGAGCCAGAGAAGCAAATAAGATTCTCTGTAATCGACCATGGGAAAGGT
GCACGGTTCATTGGCTCGTGCCGGGAAGGTGAGAGGTCAGACACCGAAAGTGGCTAAACA
GGACAAGAAGAAGAAGCCTCGTGGCCGCGCTCACAAGCGATTGCAACACACCCGCCGTTT
CGTCACTGCAGTTGTTGGCTTTGGCAAAAAGAGAGGACCAAACTCTTCAGAGAAGTAGAG
ACAAAACCAAGACTTTTGGTGTGGTTTTCCGTCGGATTATTTTGATGTTTTGATAATGCG
TTTTAGTTCCGGTATGGTAATGAGTCGATGGATGTTGAGCCAATGTTTGTTGTCAATTTT
ATTCGTGTTTCTCCTTGGATTATTTTTATTATATTAAAGACACTCAAACTCCATTATAGG
AGGAGAAAG
CGC

QA 1 429 1 429
DS 

RD RS1ET11TF 484 0 0
GGAACCCTAAAGAAAGTTTTAACCTAGCGTCGTCGTCCTCGTCGCCTCCAACAGCAGAGC
CAGAGAAGCAAATAAGATTCTCTGTAATCGACCATGGGAAAGGTGCACGGTTCATTGGCT
CGTGCCGGGAAGGTGAGAGGTCAGACACCGAAAGTGGCTAAACAGGACAAGAAGAAGAAG
CCTCGTGGCCGCGCTCACAAGCGATTGCAACACAACCGCCGTTTCGTCACTGCAGTTGTT
GGCTTTGGCAAAAAGAGAGGACCAAACTCATCAGAGAAGTAGAGACAAAACCAAGACTTC
TGGTGTGGTTTTCCGTCGGATTATTTTGATGTTTTGATAATGCGTTTTAGTTCCGGTATG
GTAATGAGTCGATGGATGTTGAGCCAATGTTTGTTGTCAATTTTATTCGTGTTTCTCCTT
GGATTATTTTTATTATATTAAAGACACTCAAACTCCATTATAGGAGGAGAAAGTACACGA
TCAT

QA 1 484 1 484
DS 



AS 1 3

CO CL3209Contig1 833 3 2 U
GGGAAGGAAAAAAACAAAATCTGCTTCTCTGTTAGCTCAAAGATCAACCATGGAAGCTAC
CGCCCTAAGCTCTGCGGCCACCATCGTCTCTTCCTCATCTTCGTCGCTATCCATCTTCTC
TCCGAAGAAGAGAACACACTCATCTTTTCCGAGAATCGTCCGGTTTTCGATGAAGGACGA
CAAAGATTATGATCCCAAATCCGAATCGGATTCATTGAGCCTCGTTCCTCTATTCCAAAA
TCGAACTCTCTCGAATGATGAGGCCATGGGATTGGTCTTGAGCGCCGCGTCCGTCAGAGG
CTGGACTACCGGTTCCGGGATGGAGGGGCCGTCTCTTCCGGCCAAGGCCGATGTGGAGAC
GGTTTCAACATTTCCTTGGTCACTATTCACGAAATCGCCACGTAGGCGTATGCGCGTCGC
CTTCACTTGCAACGTTTGTGGACAGAGAACTACACGAGCCATAAATCCACATGCTTACAC
TGACGGCACCGTCTTCGTGCAGTGCTGCGGATGCAATGTGTTCCATAAGCTGGTGGATAA
TCTGAACTTGTTTCATGAGGTGAAGTATTATGTGAGCTCTAGTTCCAACTACCAAGATGC
AAAGTGGGATCTTGGGGGATTCAATCTCTTCCAGATGGGCGACGATACTGATGATGATGG
CGGCGTTGACGGCCACGATGACTCCTTCCCTCTTTAAAGACGTTGGGGGCTAATCAATAA
TTTGTGCAAACGAATGTCATATGTATATCTCTGTATATAGCTATCATCTAGCATGAATAA
CACCTTTGAAGTATCTCTGTTCCCATTAATAATAAAGTGGTCATATATATGCC


BQ
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AF RS1G750TF U 29
AF RS1DP04TF U 1
AF RS1DP04JQ C 143
BS 1 630 RS1DP04TF
BS 631 833 RS1DP04JQ

RD RS1G750TF 399 0 0
GG
GTTAGCTCAAAGATCAACCATGGAAGCTACCGCCCTAAGCTCTGCGGCCACCATCGTCTC
TTCCTCATCTTCGTCGCTATCCATCTTCTCTCCGAAGAAGAGAACACACTCATCTTTTCC
GAGAATCGTCCGGCTTTCGATGAAGGACGACAAAGATTATGATCCCAAATCCGAATCGGA
TTCATTGAGCCTCGTTCCTCTATTCCAAAATCGAACTCTCTCGAATGATGAGGCCATGGG
ATTGGTCTTGAGCGCCGCGTCCGTCAGAGGCTGGACTACCGGTTCCGGGATGGAGGGGCC
GTCTCTTCCGGCCAAGGCCGATGTGGAGACGGTTTCAACATTTCCTTGGTCACTATTCAC
GAAATCGCCACGTAGGCGTATGCGCGTCGCCTTCACT

QA 3 399 3 399
DS 

RD RS1DP04TF 630 0 0
GGGAAGGAAAAAAACAAAATCTGCTTCTCTGTTAGCTCAAAGATCAACCATGGAAGCTAC
CGCCCTAAGCTCTGCGGCCACCATCGTCTCTTCCTCATCTTCGTCGCTATCCATCTTCTC
TCCGAAGAAGAGAACACACTCATCTTTTCCGAGAATCGTCCGGTTTTCGATGAAGGACGA
CAAAGATTATGATCCCAAATCCGAATCGGATTCATTGAGCCTCGTTCCTCTATTCCAAAA
TCGAACTCTCTCGAATGATGAGGCCATGGGATTGGTCTTGAGCGCCGCGTCCGTCAGAGG
CTGGACTACCGGTTCCGGGATGGAGGGGCCGTCTCTTCCGGCCAAGGCCGATGTGGAGAC
GGTTTCAACATTTCCTTGGTCACTATTCACGAAATCGCCACGTAGGCGTATGCGCGTCGC
CTTCACTTGCAACGTTTGTGGACAGAGAACTACACGAGCCATAAATCCACATGCTTACAC
TGACGGCACCGTCTTCGTGCAGTGCTGCGGATGCAATGTGTTCCATAAGCTGGTGGATAA
TCTGAACTTGTTTCATGAGGTGAAGTATTATGTGAGCTCTAGTTCCAACTACCAAGATGC
AAAGTGGGATCTTGGGGGATTCAATCTCTT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RS1DP04JQ 691 0 0
TCTTTTCCGAGAATCGTCCGGTTTTCGATGAAGGACGACAAAGATTATGATCCCAAATCC
GAATCGGATTCATTGAGCCTCGTTCCTCTATTCCAAAATCGAACTCTCTCGAATGATGAG
GCCATGGGATTGGTCTTGAGCGCCGCGTCCGTCAGAGGCTGGACTACCGGTTCCGGGATG
GAGGGGCCGTCTCTTCCGGCCAAGGCCGATGTGGAGACGGTTTCAACATTTCCTTGGTCA
CTATTCACGAAATCGCCACGTAGGCGTATGCGCGTCGCCTTCACTTGCAACGTTTGTGGA
CAGAGAACTACACGAGCCATAAATCCACATGCTTACACTGACGGCACCGTCTTCGTGCAG
TGCTGCGGATGCAATGTGTTCCATAAGCTGGTGGATAATCTGAACTTGTTTCATGAGGTG
AAGTATTATGTGAGCTCTAGTTCCAACTACCAAGATGCAAAGTGGGATCTTGGGGGATTC
AATCTCTTCCAGATGGGCGACGATACTGATGATGATGGCGGCGTTGACGGCCACGATGAC
TCCTTCCCTCTTTAAAGACGTTGGGGGCTAATCAATAATTTGTGCAAACGAATGTCATAT
GTATATCTCTGTATATAGCTATCATCTAGCATGAATAACACCTTTGAAGTATCTCTGTTC
CCATTAATAATAAAGTGGTCATATATATGCC

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 3

CO CL3210Contig1 557 3 7 U
GGGCGGAGAAGACGGCGCAGGAGACCAGAGGGGCTGAAAGGAGAAGAAATGGTGAGCAGA
GAAGCGTTGATCGCATACAGAGCCCTGCTCAGGGCCACGAGGAAATCATTCGCCGGAGAT
ACCGATATGCTCAAGGCTTCGGCTTCCGAGATCCGTAATAAGTTCGAAGAGAACCGCCAC
GTGGCTTCAGATTCCGACATCCCTCGCCTACTCGAAGAAGCGCGTGAGGCCACTCAATTC
ATTTCCACCATGATCGTCCAGGCCAAGCTCAACGAACGCGGCGGATACGAGGTGAAAGCA
AGTCAGGAACACGCGGGAGCGACTTTGGAGCTTCCTACAGAGGAGATGCTTCGGAAAAAA
TCTGTATGAGTTAAGTGTTGGTGTCTCTGAGACCATATTGTCACTGTCAGAAACTGGATT
TCTGCTCCCTTACTCGTTTTGTTTTAATAGGGAAAGGTGGAACCTTCTTTTTTGTGATTC
TCTGTTTTGTTCTCTCTTCACAGCTAAACCCAACTCTGATTTTATTAATAAAGAGATCAT
CACTTGCATTTTTTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AR52TFB U 1
AF RS1AR52JQ C 1
AF RS1E967TF U 88
BS 1 87 RS1AR52TFB
BS 88 93 RS1E967TF
BS 94 94 RS1AR52TFB
BS 95 125 RS1E967TF
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BS 127 546 RS1E967TF
BS 547 557 RS1AR52JQ

RD RS1AR52TFB 488 0 0
GGGCGGAGAAGACGGCGCAGGAGACCAGAGGGGCTGAAAGGAGAAGAAATGGTGAGCAGA
GAAGCGTTGATCGCATACAGAGCCCTGCTCAGGGCCACGAGGAAATCATTCGCCGGAGAT
ACCGATATGCTCAAGGCTTCGGCTTCCGAGATCCGTAATAAGTTCGAAGAGAACCGCCAC
GTGGCTTCAGATTCCGACATCCCTCGCCTACTCGAAGAAGCGCGTGAGGCCACTCAATTC
ATTTCCACCATGATCGTCCAGGCCAAGCTCAACGAACGCGGCGGATACGAGGTGAAAGCA
AGTCAGGAACACGCGGGAGCGACTTTGGAGCTTCCTACAGAGGAGATGCTTCGGAAAAAA
TCTGTATGAGTTAAGTGTTGGTGTCTCTGAGACCATATTGTCACTGTCAGAAACTGGATT
TCTGCTCCCTTACTCGTTTTGTTTTAATAGGGAAAGGTGGAACCTTCTTTTTTGTGATTC
TCTGTTTT

QA 1 488 1 488
DS 

RD RS1AR52JQ 557 0 0
GGGCGGAGAAGACGGCGCAGGAGACCAGAGGGGCTGAAAGGAGAAGAAATGGTGAGCAGA
GAAGCGTTGATCGCATACAGAGCCCTGCTCAGGGCCACGAGGAAATCATTCGCCGGAGAT
ACCGATATGCTCAAGGCTTCGGCTTCCGAGATCCGTAATAAGTTCGAAGAGAACCGCCAC
GTGGCTTCAGATTCCGACATCCCTCGCCTACTCGAAGAAGCGCGTGAGGCCACTCAATTC
ATTTCCACCATGATCGTCCAGGCCAAGCTCAACGAACGCGGCGGATACGAGGTGAAAGCA
AGTCAGGAACACGCGGGAGCGACTTTGGAGCTTCCTACAGAGGAGATGCTTCGGAAAAAA
TCTGTATGAGTTAAGTGTTGGTGTCTCTGAGACCATATTGTCACTGTCAGAAACTGGATT
TCTGCTCCCTTACTCGTTTTGTTTTAATAGGGAAAGGTGGAACCTTCTTTTTTGTGATTC
TCTGTTTTGTTCTCTCTTCACAGCTAAACCCAACTCTGATTTTATTAATAAAGAGATCAT
CACTTGCATTTTTTTTT

QA 1 557 1 557
DS 

RD RS1E967TF 459 0 0
CTCAGGACCACGAGGAAATCATTCGCCGGAGATACCGAGATGCTCAAGGCTTCGGCTTCC
GAGATCCGTAATAAGTTCGAAGAGAACCGCCACGTGGCTTCAGATTCCGACATCCCTCGC
CTACTCGAAGAAGCGCGTGAGGCCACTCAATTCATTTCCACCATGATCGTCCAGGCCAAG
CTCAACGAACGCGGCGGATACGAGGTGAAAGCAAGTCAGGAACACGCGGGAGCGACTTTG
GAGCTTCCTACAGAGGAGATGCTTCGGAAAAAATCTGTATGAGTTAAGTGTTGGTGTCTC
TGAGACCATATTGTCACTGTCAGAAACTGGATTTCTGCTCCCTTACTCGTTTTGTTTTAA
TAGGGAAAGGTGGAACCTTCTTTTTTGTGATTCTCTGTTTTGTTCTCTCTTCACAGCTAA
ACCCAACTCTGATTTTATTAATAAAGAGATCATCACTTG

QA 1 459 1 459
DS 



AS 1 2

CO CL3211Contig1 933 2 4 U
GGGAAGACGCAAAGACAGAAAACAAATCAGCTCAGACCTTCTCAGCCTCTAGGAAGGTTT
TAGTTTCGCCTATTCATTGACCGGAAGTCCAGAATCGGACAATACCGTCGAAGATGGCTC
CGATCATCAGATCTAGCCCAGCTCTCGCTTTCCTCGTTTTGCAGATTAGCTCCATCTTCT
TTGCTTCCACTCTCCCATACTCTTCTTCTGGTTCTGAGGATGGTTACACAATCACTGGCA
GAGTGAAGATTCCACCAAGCAACGTGATTGGTCACACAGCAAAGAGCTCTAATGTCAAAG
CTATACTCAATGGTGGACAGAGTGTTACATTTCTCAGGCCTGATGGATATTTCACTTTTC
ACAAAGTGCCTGCTGGGACTCATTTGATCGAAGTATCTGCAATGGGCTACTTCTTTTCTC
CGGTACGAGTCGATGTTAGTGCACGGCACCATGGCAAAGTTCATGCAACACTAACCGAAA
CCAGGAGGAGTCTTACTGAGCTGGTTTTAGAGCCACTGAGGGAAGAGCAATACTACGAGA
TTCGAGAGCCTTTCTCCATGTTGTCAATGGTGAAGAGTCCGATGGGTCTCATGGTGGGAT
TCATGGTCGTGGTTGTGTTCCTAATGCCCAAACTGATGGAAAACATAGATCCAGAGGAGA
TGAAGCAAGCACAAGAGGAAATGAGGAGGCAAGGTGTGCCTTCGCTCTCGAGTTTGTTGC
CAAGCGCCGGGGCTAGCCGTTAACAGTTTTTCTGTCAGCTCAATGTATCACAAAACGAGC
GGAGAAAGGGTATCCCGTTCTTGTGAGAGACACACTCACTGTAATAGATTTGTATTGTGT
AATAGATCTTCATATTTGTATTGTGTAATAGATCTTAATATTTGTGTTGTGTAATAGCTA
TTAAGAACATAAGAAAAAACGATAATTTAATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CK93TF U 1
AF RS1CK93JQ C 167
BS 1 680 RS1CK93TF
BS 681 681 RS1CK93JQ
BS 682 693 RS1CK93TF
BS 694 933 RS1CK93JQ

RD RS1CK93TF 697 0 0
GGGAAGACGCAAAGACAGAAAACAAATCAGCTCAGACCTTCTCAGCCTCTAGGAAGGTTT
TAGTTTCGCCTATTCATTGACCGGAAGTCCAGAATCGGACAATACCGTCGAAGATGGCTC
CGATCATCAGATCTAGCCCAGCTCTCGCTTTCCTCGTTTTGCAGATTAGCTCCATCTTCT
TTGCTTCCACTCTCCCATACTCTTCTTCTGGTTCTGAGGATGGTTACACAATCACTGGCA
GAGTGAAGATTCCACCAAGCAACGTGATTGGTCACACAGCAAAGAGCTCTAATGTCAAAG
CTATACTCAATGGTGGACAGAGTGTTACATTTCTCAGGCCTGATGGATATTTCACTTTTC
ACAAAGTGCCTGCTGGGACTCATTTGATCGAAGTATCTGCAATGGGCTACTTCTTTTCTC
CGGTACGAGTCGATGTTAGTGCACGGCACCATGGCAAAGTTCATGCAACACTAACCGAAA
CCAGGAGGAGTCTTACTGAGCTGGTTTTAGAGCCACTGAGGGAAGAGCAATACTACGAGA
TTCGAGAGCCTTTCTCCATGTTGTCAATGGTGAAGAGTCCGATGGGTCTCATGGTGGGAT
TCATGGTCGTGGTTGTGTTCCTAATGCCCAAACTGATGGAAAACATAGATCCAGAGGAGA
TGAAGCAAGCACAAGAGGAA*TGAGGAGGCAAG
TGTG

QA 1 693 1 693
DS 

RD RS1CK93JQ 767 0 0
TAGCTCCATCTTCTTTGCTTCCACTCTCCCATACTCTTCTTCTGGTTCTGAGGATGGTTA
CACAATCACTGGCAGAGTGAAGATTCCACCAAGCAACGTGATTGGTCACACAGCAAAGAG
CTCTAATGTCAAAGCTATACTCAATGGTGGACAGAGTGTTACATTTCTCAGGCCTGATGG
ATATTTCACTTTTCACAAAGTGCCTGCTGGGACTCATTTGATCGAAGTATCTGCAATGGG
CTACTTCTTTTCTCCGGTACGAGTCGATGTTAGTGCACGGCACCATGGCAAAGTTCATGC
AACACTAACCGAAACCAGGAGGAGTCTTACTGAGCTGGTTTTAGAGCCACTGAGGGAAGA
GCAATACTACGAGATTCGAGAGCCTTTCTCCATGTTGTCAATGGTGAAGAGTCCGATGGG
TCTCATGGTGGGATTCATGGTCGTGGTTGTGTTCCTAATGCCCAAACTGATGGAAAACAT
AGATCCAGAGGAGATGAAGCAAGCACAAGAGGAAATGAGGAGGCAAGGTGTGCCTTCGCT
CTCGAGTTTGTTGCCAAGCGCCGGGGCTAGCCGTTAACAGTTTTTCTGTCAGCTCAATGT
ATCACAAAACGAGCGGAGAAAGGGTATCCCGTTCTTGTGAGAGACACACTCACTGTAATA
GATTTGTATTGTGTAATAGATCTTCATATTTGTATTGTGTAATAGATCTTAATATTTGTG
TTGTGTAATAGCTATTAAGAACATAAGAAAAAACGATAATTTAATGC

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 3

CO CL3212Contig1 962 3 2 U
GGCCTTCATTTTCTTACGGGACCCTTTTCTTACCAGAGGAGAAGTTCGTGGAAACGGCAC
TGACGAACGAGATCTAGCACTTTCACGGATCGATCGAAGAAGAAGAAAGATGAACATTTT
CAGATTAGCAGGTGATATGACTCACCTGGCCAGTGTCCTCGTCTTGCTCCTCAAGATCCA
CACCATCAAATCCTGCGCTGGTGTGTCATTGAAGACTCAAGAGCTCTACGCCATTGTATT
CGCGACGCGTTATCTGGATATTTTCACGAGCTTTGTCTCCGTCTACAACACCTTCATGAA
GTTGGTCTTCTTAGGAAGCTCCTTCTCCATTGTTTGGTACATGAGGTATCACAAGGCCGT
CCAAAGGACTTACGACAGGGAGCAAGATACCTTTCGTCATTGGTTCCTTGTCCTTCCCTG
CCTTCTCTTGGCTCTTCTCATTCACGAAAAGTTCACCTTTCTTGAGGTACTGTGGACGTT
TTCGTTGTACTTGGAGGTTGTTGCTATATTACCTCAGCTTGTCTTGCTTCAAAGGACTAG
AAATATCGATAACTTGACCGGCCAATACATATTCCTCCTTGGTGGGTACAGGGGATTGTA
CATCTTAAACTGGATCTACCGTTACTTCACTGAGCCACACTTCGTTCACTGGATAACATG
GATCGCGGGGTTTGTTCAGACATTGCTCTATGCCGACTTCTTCTATTATTATTTCCTAAG
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AACCCTACCGATTCAGTTTGGTGCCTGGATACAATATCTGCTGGAAAGTTTACCAGTTTA
CTCTGTTGTTAGTTAATGGAGGAGACGAGCATAGATTTTATGTAAACTCCAGAAATTTAA
CTTGTTGTTACACATTTTTGAACTTTTTCGTGTCTCAGCTTTTTGTTCGAGTAAGTGTTA
CT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 

AF RS1DI40TF U 6
AF RS1DS79TF U 1
AF RS1DS79JQ C 297
BS 1 724 RS1DS79TF
BS 725 962 RS1DS79JQ

RD RS1DI40TF 686 0 0
GG
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CGAGATCTAGCACTTTCACGGATCGATCGAAGAAGAAGAAAGATGAACATTTTCAGATTA
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GGGTTTGTTCAGACATTGCTCTAT

QA 3 686 3 686
DS 

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TGACGAACGAGATCTAGCACTTTCACGGATCGATCGAAGAAGAAGAAAGATGAACATTTT
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CACCATCAAATCCTGCGCTGGTGTGTCATTGAAGACTCAAGAGCTCTACGCCATTGTATT
CGCGACGCGTTATCTGGATATTTTCACGAGCTTTGTCTCCGTCTACAACACCTTCATGAA
GTTGGTCTTCTTAGGAAGCTCCTTCTCCATTGTTTGGTACATGAGGTATCACAAGGCCGT
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CCTTCTCTTGGCTCTTCTCATTCACGAAAAGTTCACCTTTCTTGAGGTACTGTGGACGTT
TTCGTTGTACTTGGAGGTTGTTGCTATATTACCTCAGCTTGTCTTGCTTCAAAGGACTAG
AAATATCGATAACTTGACCGGCCAATACATATTCCTCCTTGGTGGGTACAGGGGATTGTA
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GATCGCGGGGTTTGTTCAGACATTGCTCTATGCCGACTTCTTCTATTATTATTTCCTAAG
CTGG

QA 1 724 1 724
DS 

RD RS1DS79JQ 666 0 0
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CTAGAAATATCGATAACTTGACCGGCCAATACATATTCCTCCTTGGTGGGTACAGGGGAT
TGTACATCTTAAACTGGATCTACCGTTACTTCACTGAGCCACACTTCGTTCACTGGATAA
CATGGATCGCGGGGTTTGTTCAGACATTGCTCTATGCCGACTTCTTCTATTATTATTTCC
TAAGCTGGAAGAACAACAAAAAGCTCCAGTTGCCAGCTTAATCTCTGGATTTTCGATGCT
CGGAAACCCTACCGATTCAGTTTGGTGCCTGGATACAATATCTGCTGGAAAGTTTACCAG
TTTACTCTGTTGTTAGTTAATGGAGGAGACGAGCATAGATTTTATGTAAACTCCAGAAAT
TTAACTTGTTGTTACACATTTTTGAACTTTTTCGTGTCTCAGCTTTTTGTTCGAGTAAGT
GTTACT

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

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TGGTTATTCAACGAGGTGAAGATATTAATTACGATGAAGATGCAAATCGGTATGCTCGCG
CTTCTGGTGACTCTCTCTGCGATTGAAATCGGATTGGCTTCTTCTCCCAACACCGTCCCT
GCTTTCCTCTGGTCTCCGCATCTCCAGGATGGGAATGAGGGTGTGAATTATCAGGTCATG
TCTGGAAAGGATCTGGTTGACTCTGTTTTCACTCAAGGAGGATGGTCCAACATTCTTTGC
TCTGAGAAGAAAGCTGAGCAGCCTGTTGTTGATGTTGCACTTGTCTTCATCGGCACAGAG
TTACTGTCTTCTGATGTTTCTTCCAAAAGTAGTTCCCTTGTCAACACATTGAGTGGGCTC
TTTACATCTTCCAACTTCTCATTGGCATTCCCATACATTGCTGCGCCAGAGGAAGAAAGG
ATGGAGAGTTTGTTGCTTTCAGGGCTTAAGCAAGCTTGCCCTCACAATGTAGGAGCCGGC
AATATTGCCTTCTCTGAATCTTGCTTTGTTGAGGATGGAACGATTCAGAAACTATCAGAC
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GATTTGGTTGTGCTCTGTTCCGAGGGTTCTGAATCAAAGGGTCAATCACACTCAGAGCGT
GAAAGCATCTCCGAGCTTGTTAGTTCCGTAGAACAATCTGGCAGTAAATATACAGCTCTT
TATGTCTCTGATCCTTATTGGTACACATCTTACAAAACTCTCCAAAGGTTTCTAGCTGAA
AGTGGTACAGGAAACAGCACCGTTGGTGTTGCTACAACCTGTGACGAACTCTGCAAATTT
AAGTCATCACTTTTGGAGGGCATACTAGTGGGAATCGTTTTCCTTCTCATCTTGATCAGT
GGACTTTGTTGTATGGCGGGTATCGATACACCAACCAGATTCGAGACTCCTCAAGATTCT
TGAGCTTGTTGTTGACCCCTTAAAAGAGTCATCCCCACCTTTTGCTTTGCTTTGCCTTTT
TGATTGTGACGGGTCTTTTCTTCTGCATAGTGCGTATGGTGAAAAAGGTACTTATTACAC
TACTTTTAAAAACAAAAATTTGCATATGCGATTACAAAGTCCCCTTGTAACATTTTATTC
ATCTTGTTTGTGTCTTTCTTAAACGTTAATAAGTCAATAATGGAGAACGAGTGAAAACCA
GAGACACTGGAACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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BS 1 644 RS1BR60TF
BS 645 1274 RS1BR60JQ

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CTTCTGGTGACTCTCTCTGCGATTGAAATCGGATTGGCTTCTTCTCCCAACACCGTCCCT
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TCTGGAAAGGATCTGGTTGACTCTGTTTTCACTCAAGGAGGATGGTCCAACATTCTTTGC
TCTGAGAAGAAAGCTGAGCAGCCTGTTGTTGATGTTGCACTTGTCTTCATCGGCACAGAG
TTACTGTCTTCTGATGTTTCTTCCAAAAGTAGTTCCCTTGTCAACACATTGAGTGGGCTC
TTTACATCTTCCAACTTCTCATTGGCATTCCCATACATTGCTGCGCCAGAGGAAGAAAGG
ATGGAGAGTTTGTTGCTTTCAGGGCTTAAGCAAGCTTGCCCTCACAATGTAGGAGCCGGC
AATATTGCCTTCTCTGAATCTTGCTTTGTTGAGGATGGAACGATTCAGAAACTATCAGAC
CTTCAGTCTTTCAAAGATCATTTGCTTGCTAGAAAAGAAACAAG
A

QA 1 644 1 644
DS 

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TGAA
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GTTAGTTCCGTAGAACAATCTGGCAGTAAATATACAGCTCTTTATGTCTCTGATCCTTAT
TGGTACACATCTTACAAAACTCTCCAAAGGTTTCTAGCTGAAAGTGGTACAGGAAACAGC
ACCGTTGGTGTTGCTACAACCTGTGACGAACTCTGCAAATTTAAGTCATCACTTTTGGAG
GGCATACTAGTGGGAATCGTTTTCCTTCTCATCTTGATCAGTGGACTTTGTTGTATGGCG
GGTATCGATACACCAACCAGATTCGAGACTCCTCAAGATTCTTGAGCTTGTTGTTGACCC
CTTAAAAGAGTCATCCCCACCTTTTGCTTTGCTTTGCCTTTTTGATTGTGACGGGTCTTT
TCTTCTGCATAGTGCGTATGGTGAAAAAGGTACTTATTACACTACTTTTAAAAACAAAAA
TTTGCATATGCGATTACAAAGTCCCCTTGTAACATTTTATTCATCTTGTTTGTGTCTTTC
TTAAACGTTAATAAGTCAATAATGGAGAACGAGTGAAAACCAGAGACACTGGAACC

QA 5 720 5 720
DS 



AS 1 2

CO CL3214Contig1 753 2 14 U
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TTGGCTTATTGATAATTTGAAGCAAGAATCGCTTAGCACTCAACTCAAGAGGCAAAACCT
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BQ
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AF RS1BH56JQ U 1
AF RS1C102JQ U 4
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TTGGCTTATTGATAAT**GAAGCAAGAATCGCTTAGCACTCAACTCAAGAGGCAAAACTT
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TTGGCAGGGTTATCAAACTGTTGGAGCATATAAGCATCAGGAGTTGATTTCAAGAT

QA 1 716 1 716
DS 

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GCAATGAGTTTCCCTGCATTCTCAGGTCTCTTTGCTACCTTGATTGCTGCAGCAGCAGCA
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ATAGCTTCCTCACTTGAAATCGCTATGACTTCATCCATAATACCCTGATCCAAATTCTTA
GGTATAAATCCAGCTCCTATTCCTTGAATCTTGTGAGGTCCCGGTTTGCCACCAGAAAGT
ATGTCGCTTTCGGTTGGTTCAACGCCAATAACCTGCACTTTGGGGTTCTTCTCTTTGATG
AATCGACCAACACCAGTGATAGTCCCACCAGTTCCAATCCCTGCAACGAATATATCCACC
TTTCCCTTTGTATCTTCCCATATCTCAGGGCCAGTAGTCTCATAATGGATCTTTGGATTG
GCAGGATTATCAAACTGTTGGAGCATGTAAGCATCAGGAGTTGATTTCAAGATTTCCTCG
GCCTTCTGAACTGCACCAGTCATGCCTTTA

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 3

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TCCACCGTCAAACTCGACGGCTCCTCCTTGGGTATATATATATACCCCTTCACATGGGCA
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TGAATTCAGCTACTTTGAAGGATCTGAAGCTTTTGATCAAGAAGAAAGTTAATGAGATGG
AGCAAGCAAACATGGGTCAACGCCACATCTCTTGGAAGCATGTATGGTCAAACTTCTGTC
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GAAATAACTCTCAGATCGCATTTGTTCCATATGTGACGAAGAAAGGTCCGGGAAGACACT
CGAAGAGGAAGAAGCATCGTCTCTTTCGTTCACTCCACAAGACTTGTTAGATAGTAACGG
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TAGATACATTTCAAAAGCGATTTATGGTTTCAACTTCTTTTTTTTTGAGACGTTAGGTCT
GATATGTTTTTGAAACTATGTCAAGATTCCCTGTGATGAAAGTTTTAGTAATCTGTAACG
GTGAGAAAGTGGGGCTCCCTCTTGGATTACTTTACCCATGGAGGTTTTAGAGGAACCATT
GCTGTAGATTCTTGGCAACTTCTGAGGGTTGGTTCTTTCTTTTAACTGTTTTCTTGAGAT
TCGCTGACATTGAACTAGACGTCTTTTCCTTTTTATTTTTTTTTATTATAGGTACTTTGA
TTACTCAGTCTGTTACTATTAGTTGGTGGATTCTGATCAGGTTGTCAAGCATCATTAGGG
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ATGCCGCACACACAAGCAGATTAAAGAAAAAAAGCACCAAGTGATGATCTGGAATACTGT
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TTTGCTGGTTTAGATGATGATAATCCGGTTCGGTGTAAAACTGTATGTAAGCTGTAAATT
ATTGGTCGCAGTGTGCATAACAGAAATAAATGGTGTTATTTTCATTACTAATCCGGTAAG
TAATGACACATTAATTACAC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CO53TF U 1
AF RS1F076TF U 428
AF RS1CO53JQ C 727
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GAAATAACTCTCAGATCGCATTTGTTCCATATGTGACGAAGAAAGGTCCGGGAAGACACT
CGAAGAGGAAGAAGCATCGTCTCTTTCGTTCACTCCACAAGACTTGTTAGATAGTAACGG
TAGGTTTTCGACCAAACATAGTTATGTCATTCAACACTTGAGCTGAAAAATTGAGGTCAC
TAGATACATTTCAAAAGCGATTTATGGTTTCAACTTCTTTTTTTTTGAGACGTTAG*TCT
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GTGAGAAAGTGGGGCTCCCTCTTGGATTACTTT

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GG
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CTCAGATCGCATTTGTTCCATATGTGACGAAGAAAGGTCCGGGAAGACACTCGAAGAGGA
AGAGGCATCGTCTCTTTCGTTCACTCCACAAGACTTGTTAGATAGTAACGGTAGGTTTTC
GACCAAACATAGTTATGTCATTCAACACTTGAGCTGAAAAATTGAGGTCACTAGATACAT
TTCAAAAGCGATTTATGGTTTCAACTTCTTTTTTTTTGAGACGTTAGGTCTGATATGTTT
TTGAAACTATGTCAAGATTCCCTGTGATGAAAGTTTTAGTAATCTGTAACGGTGAGAAAG
TGGGGCTCCCTCTTGGATTACTTTACCCATGGAGGTTTTAGAGGAACCATTGCTGTAGAT
TCTTGGCAACTTCTGAGGGTTGGTTCTTTCTTTTAACTGTTTTCTTGAGATTCGCTGACA
TTGAACTAGACGTCTTTTCCTTTTTATTTTTTTTTATTATAGGTACTTTGATTACTCAGT
CTGTTACTATTAGTTGGTGGATTCTGATCGGGTTGTCAAGCATCATTAGGGCATTTTCTC
ACGAACGAGAGGAAAAACAACATATTCAGTGGCAAGTTGCGATGCATCAGCATGCCGCAC
ACACAAGCAGATTAAAGAAAAAA*GCACCAAGTGATGATCTGGAATACTGTATGCTCTTG
AGTCGTGATGC*ATCAGCAGATGGTGGGA

QA 3 751 3 751
DS 

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AAGTGGGGCTCCCTCTTGGATTACTTTACCCATGGAGGTTTTAGAGGAACCATTGCTGTA
GATTCTTGGCAACTTCTGAGGGTTGGTTCTTTCTTTTAACTGTTTTCTTGAGATTCGCTG
ACATTGAACTAGACGTCTTTTCCTTTTTATTTTTTTTTATTATAGGTACTTTGATTACTC
AGTCTGTTACTATTAGTTGGTGGATTCTGATCAGGTTGTCAAGCATCATTAGGGCATTTT
CTCACGAACGAGAGGAAAAACAACATATTCAGTGGCAAGTTGCGATGCATCAGCATGCCG
CACACACAAGCAGATTAAAGAAAAAAAGCACCAAGTGATGATCTGGAATACTGTATGCTC
TTGAGTCGTGATGCCATCAGCAGATGGTGGGATTGATCTTTATTAGAGTGTGAGTTTGCT
GGTTTAGATGATGATAATCCGGTTCGGTGTAAAACTGTATGTAAGCTGTAAATTATTGGT
CGCAGTGTGCATAACAGAAATAAATGGTGTTATTTTCATTACTAATCCGGTAAGTAATGA
CACATTAATTACAC

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 2

CO CL3216Contig1 1116 2 2 U
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GCTTCGTTCTACCGACTGGTTTATCTCCCCGTCGCGGTGGCTTCAGAGTATCACTGATCC
GATGCTCCGCTTCTCCTCTCACTACTAACTCCACCGCCTCTGGCCTTGTGGAGAAGCCTT
GGAATACATATGACGCTAGGCTTGTGTTAGAAGACGGCTCCATCTGGCCTGCTAAGTCAT
TTGGTGCTCCTGGAACACGTATTGCTGAATTGGTCTTTAACACCTCATTGACAGGGTATC
AAGAGATTCTGACTGATCCTAGTTACGCTGGGCAGTTTGTGTTAATGACAAATCCACAGA
TTGGTAACACCGGTGTGAATCTCGATGTTTCATGCAAATCTCCTTACGAGTGGGTTAACA
AAACAGACCCTGAATGGGATTTCAACTCGGCTTCACGCGACGGGGCATCTCACAGAGTTA
TTGCATATGACTTTGGCATCAAGCATAACATCCTGAGACGCCTATCCTCTTACGGATGTC
AAATCACGGTTGTTCCGTCGACATTCCCAGCTTCTGAGGCGCTTAAAATGAATCCAGACG
GGATTCTGTTCAGCAACGGTCCTGGAGACCCTTCTGCTGTGCCGTATGCTGTTGAGACGG
TGAAAGAGCTTCTTGGTAAAGCTCCTGTGTATGGGATCTGTATTGGTCATCATGGTGGAA
ACCACCCGGTTCGTAATAACAGAACTGGCCAGGTGGAGATCAGTGCTCAGAACCATAACT
ATGCGGTTGACCCGGCTTCACTACCTGGAGGTGTGGAAGTGACACATGTTAATCTCAATG
ATGGGAGCTGTGCGGGTCTATCTTTCCCGGAGATGAATGTCATGTCTCTCCAGTACCACC
CTGAAGCCTCCCCTGGACCTCACGACTCTGATAACGCATTTAAAGAGTTCATAGAGCTTA
TGAAGAAATCGAAACAGAGCTCCTGAGGAAAACAAGTCTTTGTTTTTGTTTACTTCGCAC
TTAAATTAAACACGTGTTTTTTTTTTGTTACTGACAATGGAGTGAAACTATTGTTCTGGC
TGTGTGATCATGTTAAAGGAACCATTCCACAAAAAA


BQ
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AF RS1BU68TF U 1
AF RS1BU68JQ C 385
BS 1 653 RS1BU68TF
BS 654 1116 RS1BU68JQ

RD RS1BU68TF 653 0 0
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GCTTCGTTCTACCGACTGGTTTATCTCCCCGTCGCGGTGGCTTCAGAGTATCACTGATCC
GATGCTCCGCTTCTCCTCTCACTACTAACTCCACCGCCTCTGGCCTTGTGGAGAAGCCTT
GGAATACATATGACGCTAGGCTTGTGTTAGAAGACGGCTCCATCTGGCCTGCTAAGTCAT
TTGGTGCTCCTGGAACACGTATTGCTGAATTGGTCTTTAACACCTCATTGACAGGGTATC
AAGAGATTCTGACTGATCCTAGTTACGCTGGGCAGTTTGTGTTAATGACAAATCCACAGA
TTGGTAACACCGGTGTGAATCTCGATGTTTCATGCAAATCTCCTTACGAGTGGGTTAACA
AAACAGACCCTGAATGGGATTTCAACTCGGCTTCACGCGACGGGGCATCTCACAGAGTTA
TTGCATATGACTTTGGCATCAAGCATAACATCCTGAGACGCCTATCCTCTTACGGATGTC
AAATCACGGTTGTTCCGTCGACATTCCCAGCTTCTGAGGCGCTTAAAATGAATCCAGACG
GGATTCTGTTCAGCAACGGTCCTGGAGACCCTTCTGCTGTGCCGTATGCTGTT

QA 1 653 1 653
DS 

RD RS1BU68JQ 732 0 0
ATGTTTCATGCAAATCTCCTTACGAGTGGGTTAACAAAACAGACCCTGAATGGGATTTCA
ACTCGGCTTCACGCGACGGGGCATCTCACAGAGTTATTGCATATGACTTTGGCATCAAGC
ATAACATCCTGAGACGCCTATCCTCTTACGGATGTCAAATCACGGTTGTTCCGTCGACAT
TCCCAGCTTTTGAGGCGCTTAAAATGAATCCAGACGGGATTCTGTTCAGCAACGGTCCTG
GAGACCCTTTTGCTGTGCCGTATGCTGTTGAGACGGTGAAAGAGCTTCTTGGTAAAGCTC
CTGTGTATGGGATCTGTATTGGTCATCATGGTGGAAACCACCCGGTTCGTAATAACAGAA
CTGGCCAGGTGGAGATCAGTGCTCAGAACCATAACTATGCGGTTGACCCGGCTTCACTAC
CTGGAGGTGTGGAAGTGACACATGTTAATCTCAATGATGGGAGCTGTGCGGGTCTATCTT
TCCCGGAGATGAATGTCATGTCTCTCCAGTACCACCCTGAAGCCTCCCCTGGACCTCACG
ACTCTGATAACGCATTTAAAGAGTTCATAGAGCTTATGAAGAAATCGAAACAGAGCTCCT
GAGGAAAACAAGTCTTTGTTTTTGTTTACTTCGCACTTAAATTAAACACGTGTTTTTTTT
TTGTTACTGACAATGGAGTGAAACTATTGTTCTGGCTGTGTGATCATGTTAAAGGAACCA
TTCCACAAAAAA

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL3217Contig1 907 2 8 U
GGATAAAACCTAACAAGAAAGCTTGCGTTAGCTTGTTTCCTTACTAACCTGTCCGATTAA
CTCATTAGGCCATGGCTCCTTCCGCTGCCTCTTCAAAAATTAAAGGAGGAAAATCTGGTA
AGGAAGGATATAATGCGTTGGAGCAACATGTAGCCTTCTTCGACAGAAACGGAGACGGCG
TCATATATCCGTGGGAAACCTACCAAGGATTTAGAGCGATAGGGATAGGGCGTCTCCCGT
CAGCTATTGCTGGCCTCTTCATCAACATGGGCCTTAGCAAGAAATCTCGCCCGGGGAAGG
GATTCTCGCCGTTGTTTCCAGTAGAAGTGAAGAATAGTCGCTTTCTCATCCATGGCAGTC
ACACCGACGCATACGACAAGGACGGAAGATTTGCGGAATCGAAATTCGACGAGATTTTCG
ACAAGCATGCTCGCAAACATCGCAATGCTCTCACTTACAAGGAAGTTCTTGAAATGCTTA
AGGCTAATAGAGACCATAAAGACTTTGGAGGATGGATTGCATCATACGGAGAATGGAAAC
TATTATATGAATTATGCAAAGATAAAGATGGTTTATTGACGAGAGAGGCAGTAAAGGGCG
CCTTCGATGGCAGCATTTTCAGAAAATTGGAGAAAGAACGATTATCTTCTTCTCATAACA
AGAAAGAAAAAAGACCACGTTAATTATTCCCAAAGCCCATGCATCATTTAATCTTCAGCA
TTACAAATGGATTTTTACATGTGACTAATGTGTGTTAATTTCTTATATGAAAATGGTTAG
TTTTTTTTTATTGAATTTCAAATTTATTAATCATAAGTAGAAACCTTTACAAACTATTTA
TATACTGTTTATCGTAAAGAATGAAAGAATAAGTGTTTCAAGTTTGGATGACTTGAAACC
ATCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CE15TF U 1
AF RS1CE15JQ C 169
BS 1 671 RS1CE15TF
BS 672 672 RS1CE15JQ
BS 673 721 RS1CE15TF
BS 722 722 RS1CE15JQ
BS 723 735 RS1CE15TF
BS 736 736 RS1CE15JQ
BS 737 747 RS1CE15TF
BS 748 907 RS1CE15JQ

RD RS1CE15TF 758 0 0
GGATAAAACCTAACAAGAAAGCTTGCGTTAGCTTGTTTCCTTACTAACCTGTCCGATTAA
CTCATTAGGCCATGGCTCCTTCCGCTGCCTCTTCAAAAATTAAAGGAGGAAAATCTGGTA
AGGAAGGATATAATGCGTTGGAGCAACATGTAGCCTTCTTCGACAGAAACGGAGACGGCG
TCATATATCCGTGGGAAACCTACCAAGGATTTAGAGCGATAGGGATAGGGCGTCTCCCGT
CAGCTATTGCTGGCCTCTTCATCAACATGGGCCTTAGCAAGAAATCTCGCCCGGGGAAGG
GATTCTCGCCGTTGTTTCCAGTAGAAGTGAAGAATAGTCGCTTTCTCATCCATGGCAGTC
ACACCGACGCATACGACAAGGACGGAAGATTTGCGGAATCGAAATTCGACGAGATTTTCG
ACAAGCATGCTCGCAAACATCGCAATGCTCTCACTTACAAGGAAGTTCTTGAAATGCTTA
AGGCTAATAGAGACCATAAAGACTTTGGAGGATGGATTGCATCATACGGAGAATGGAAAC
TATTATATGAATTATGCAAAGATAAAGATGGTTTATTGACGAGAGAGGCAGTAAAGGGCG
CCTTCGATGGCAGCATTTTCAGAAAATTGGAGAAAGAACGATTATCTTCTTCTCATAACA
AGAAAGAAAAA*GACCACGTTAATTATTCCCAAAGCCCATGCATCATTTAATCTTCAGCA
T*ACAAATGGATTTT*ACATGTGACTA
ATGTGTGTTAA

QA 1 747 1 747
DS 

RD RS1CE15JQ 739 0 0
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GGCGTCTCCCGTCAGCTATTGCTGGCCTCTTCATCAACATGGGCCTTAGCAAGAAATCTC
GCCCGGGGAAGGGATTCTCGCCGTTGTTTCCAGTAGAAGTGAAGAATAGTCGCTTTCTCA
TCCATGGCAGTCACACCGACGCATACGACAAGGACGGAAGATTTGCGGAATCGAAATTCG
ACGAGATTTTCGACAAGCATGCTCGCAAACATCGCAATGCTCTCACTTACAAGGAAGTTC
TTGAAATGCTTAAGGCTAATAGAGACCATAAAGACTTTGGAGGATGGATTGCATCATACG
GAGAATGGAAACTATTATATGAATTATGCAAAGATAAAGATGGTTTATTGACGAGAGAGG
CAGTAAAGGGCGCCTTCGATGGCAGCATTTTCAGAAAATTGGAGAAAGAACGATTATCTT
CTTCTCATAACAAGAAAGAAAAAAGACCACGTTAATTATTCCCAAAGCCCATGCATCATT
TAATCTTCAGCATTACAAATGGATTTTTACATGTGACTAATGTGTGTTAATTTCTTATAT
GAAAATGGTTAGTTTTTTTTTATTGAATTTCAAATTTATTAATCATAAGTAGAAACCTTT
ACAAACTATTTATATACTGTTTATCGTAAAGAATGAAAGAATAAGTGTTTCAAGTTTGGA
TGACTTGAAACCATCTTCC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

CO CL3218Contig1 648 2 4 U
TTTTTGCTGTCTTCCAAGGTCTACTCAAGGTACTAGCCGGTATCGACACTAACTTCACTG
TCACATCCAAAGCCTCGGACGAAGATGGGGATTTCGCAGAGCTTTACATCTTCAAATGGA
CAGCTCTTCTCATTCCACCAACCACTGTCCTAGTTGTAAACCTCATAGGCATTGTGGCTG
GTGTCTCTTATACTGTGAACAGCGAGTACCAGTCATGGGGTCCGCTCTTTGGGAAGCTTT
TCTTCGCCTTATGGGTCATTGCCCATCTCTACCCTTTCTTGAAAGGTCTACTGGGAAGAC
AGAACAGAACGCCAACCATCGTCATTGTCTGGTCTGTTCTTCTCGCCTCCATTTTTTCGT
TGCTTTGGGTCAGGATCAATCCATTCGTCTCTGTCACTCCACAGGCCAACCCCAATGCCG
TCCCAGGAGGTGTCTTTTAGACCCCTATTTATATTACATTTTGTGTGCATATTATGGTGA
ACCAGGCGGTTATGGTGGTGACTCAGTGTCAAATGATTAGTTTTGAAACTGTTGGTGGCT
GTGTCACTGTTGTGATGATCTTATTTATTTCGGTATGTTGTAGTTTTTTTCCAGTGGAGA
TGATGATGTGGAAACCAAATGATACATAATATAATTGTTATTCATCTT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1BI64TF U 1
AF RS1AW42TF U 6
BS 1 191 RS1BI64TF
BS 192 192 RS1AW42TF
BS 193 645 RS1BI64TF
BS 646 648 RS1AW42TF

RD RS1BI64TF 646 0 0
TTTTTGCTGTCTTCCAAGGTCTACTCAAGGTACTAGCCGGTATCGACACTAACTTCACTG
TCACATCCAAAGCCTCGGACGAAGATGGGGATTTCGCAGAGCTTTACATCTTCAAATGGA
CAGCTCTTCTCATTCCACCAACCACTGTCCTAGTTGTAAACCTCATAGGCATTGTGGCTG
GTGTCTCTTATGCTGTGAACAGCGAGTACCAGTCATGGGGTCCGCTCTTTGGGAAGCTTT
TCTTCGCCTTATGGGTCATTGCCCATCTCTACCCTTTCTTGAAAGGTCTACTGGGAAGAC
AGAACAGAACGCCAACCATCGTCATTGTCTGGTCTGTTCTTCTCGCCTCCATTTTTTCGT
TGCTTTGGGTCAGGATCAATCCATTCGTCTCTGTCACTCCACAGGCCAACCCCAATGCCG
TCCCAGGAGGTGTCTTTTAGACCCCTATTTATATTACATTTTGTGTGCATATTATGGTGA
ACCAGGCGGTTATGGTGGTGACTCAGTGTCAAATGATTAGTTTTGAAACTGTTGGTGGCT
GTGTCACTGTTGTGATGATCTTATTTATTTCGGTATGTTGTAGTTTTTTTCCAGTGGAGA
TGATGATGTGGAAACCAAATGATACATAATATAATTGTTATTCAT
C

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1AW42TF 643 0 0
GCTGTCTTCCAAGGTCTACTCAAGGTACTAGCCGGTATCGACACTAACTTCACTGTCACA
TCCAAAGCCTCGGACGAAGATGGGGATTTCGCAGAGCTTTACATCTTCAAATGGACAGCT
CTTCTCATTCCACCAACCACTGTCCTAGTTGTAAACCTCATAGGCATTGTGGCTGGTGTC
TCTTATACTGTGAACAGCGGGTACCAGTCATGGGGTCCGCTCTTTGGGAAGCTTTTCTTC
GCCTTATGGGTCATTGCCCATCTCTACCCTTTCTTGAAAGGTCTACTGGGAAGACAGAAC
AGAACGCCAACCATCGTCATTGTCTGGTCTGTTCTTCTCGCCTCCATTTTTTCGTTGCTT
TGGGTCAGGATCAATCCATTCGTCTCTGTCACTCCACAGGCCAACCCCAATGCCGTCCCA
GGAGGTGTCTTTTAGACCCCTATTTATATTACATTTTGTGTGCATATTATGGTGAACCAG
GCGGTTATGGTGGTGACTCAGTGTCAAATGATTAGTTTTGAAACTGTTGGTGGCTGTGTC
ACTGTTGTGATGATCTTATTTATTTCGGTATGTTGTAGTTTTTT*CCAGTGGAGATGATG
ATGTGGAAACCAAATGATACATAATATAATTGTTATTCATCTT

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 2

CO CL3219Contig1 759 2 6 U
GATTCTATACCTATTCCAAATACTCAAAAATTCAAAATACCCAATCTGAACCGGAACAAA
TATCCAAACACCCATCCCTACTATAGTATAGATTAGATGAATGCTCTTGACGTTTATAAG
CTCTTGTTGATCCCTTACAAGAGAGACCTCAAGTGTAAGGATCTCTTGAATATGTGGTTC
AATATTCTTCTACAATGAAAAGATCAAAAGTTTCAAGGAACCGAAAAACAAGGCAAGTAC
GTACGTCTCAAGAGTTACCCATAAACATAAAGCTCTCTTCTGCCAAAAGAGCAGTTCAAG
TGAGTTTAGTCTCCCGATAGGAGTGGAATCACAAAGACGGTCTCTGACAAAGAATGAAGA
GTTGACAGCTGATGAAAGCCATAACCAGAGAAGTCATCAGCTCAAACCCAACAACTTTGG
GGAAATGCCATCCCATGACTCTCCTTAAATAGCTCGTGATTGAAGGCATTGTAGCGATGA
TCACTGCACACGCGTATATGATGGGGATCAGAGTCTTTGGCTTGTTCTTGCGTAGCCACA
TCAATGAACCTAGCGCAGCTAAAGATATCGTAAACACCAGATTTGCATTGGCTTCAAGCC
CTTGCAAAACATAATCCCAGGTGAACTCAAGTCCTCGAGCACCAACCCAAAGAGGAGCCA
ACCTATGCAAAACAGAATCCGCAAATGCCCATCCAAGGCCAACAGCTTGAAACTTATGGT
TCTGAGAGATGTTCCTGTGTGTCAGCTGAGCCAGAGCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1BO40JQ U 1
AF RS1B374JQ U 174
BS 1 197 RS1BO40JQ
BS 198 198 RS1B374JQ
BS 199 447 RS1BO40JQ
BS 448 448 RS1B374JQ
BS 449 656 RS1BO40JQ
BS 657 759 RS1B374JQ

RD RS1BO40JQ 656 0 0
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TATCCAAACACCCATCCCTACTATAGTATAGATTAGATGAATGCTCTTGACGTTTATAAG
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AATATTCTTCTACAATGTAAAGATCAAAAGTTTCAAGGAACCGAAAAACAAGGCAAGTAC
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CTTGCAAAACATAATCCCAGGTGAACTCAAGTCCTCGAGCACCAACCCAAAGAGGA

QA 1 656 1 656
DS 

RD RS1B374JQ 586 0 0
GC
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AGTACGTACGTCTCAAGAGTTACCCATAAACATAAAGCTCTCTTCTGCCAAAAGAGCAGT
TCAAGTGAGTTTAGTCTCCCGATAGGAGTGGAATCACAAAGACGGTCTCTGACAAAGAAT
GAAGAGTTGACAGCTGATGAAAGCCATAACCAGAGAAGTCATCAGCTCAAACCCAACAAC
TTTGGGGAAATGCCATCCCATGACTCTCCTTAAATAGCTCGTGATTGAAGGCATTGTAGC
GATGATCACTGCACACGTGTATATGATGGGGATCAGAGTCTTTGGCTTGTTCTTGCGTAG
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AGCCAACCTATGCAAAACAGAATCCGCAAATGCCCATCCAAGGCCAACAGCTTGAAACTT
ATGGTTCTGAGAGATGTTCCTGTGTGTCAGCTGAGCCAGAGCAA

QA 3 586 3 586
DS 



AS 1 3

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AGAAAG**GGCGGGAAAAGTGTGTATGGTGATGGCACTTATCATGATAGGGTGTGTTTTA
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TTCACAGCCTGTTCCATAGCATGTGGCAAACATAACAAACCTTGTTACGACGGATGTTTG
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ACCGCTTGATCTGATCTTATTCTATTTGTGATTTGTGTCTTTATTGCTAAGGATGTCATC
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BQ
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AF RS1BL81JQ C 1
AF RS1BL81TF U 1
AF RS1BA01TF U 2
BS 1 1 RS1BL81JQ
BS 2 405 RS1BL81TF
BS 406 418 RS1BA01TF

RD RS1BL81JQ 405 0 0
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TTCACAGCCTGTTCCATAGCATGTGGCAAACATAACAAACCTTGTTACGACGGATGTTTG
ACCAAGTGTGGTCTCCCAAAACGTCCTTCTAAACCAACATCATCTCCATCACCTTCTACC
ACCGCTTGATCTGATCTTATTCTATTTGTGATTTGTGTCTTTATTGCTAAGGATGTCATC
TTTATGTATTTCTTTAACATGAATATTAAGTGAGAATTATACGAT

QA 1 405 1 405
DS 

RD RS1BL81TF 405 0 0
G
GGCACATCTCAAATCTATCAATAACTAAATAAAACACAAGTCCTAATAAACCTGTAAAGA
GAAAG**GGCGGGAAAAGTGTGTATGGTGATGGCACTTATCATGATAGGGTGTGTTTTAC
AAGCATGCAATGGAGCCAATGTTGACGAGGCCAAGCCGAAAGAATCAAAATTCGTTTGCT
TCACAGCCTGTTCCATAGCATGTGGCAAACATAACAAACCTTGTTACGACGGATGTTTGA
CCAAGTGTGGTCTCCCAAAACGTCCTTCTAAACCAACATCATCTCCATCACCTTCTACCA
CCGCTTGATCTGATCTTATTCTATTTGTGATTTGTGTCTTTATTGCTAAGGATGTCATCT
TTATGTATTTCTTTAACATGAATATTAAGTGAGAATTATACGAT

QA 2 405 2 405
DS 

RD RS1BA01TF 417 0 0
GGCACATCTCAAATCTATCAATAACTAAATAAAACACAAGTCCTAATAAACCTGTAAAGA
GAAAAATGGCGGGAAAAGTGTGTATGGTGATGGCACTTATCATGATAGGGTGTGTTTTAC
AAGCATGCAATGGATCCAATGTTGGCGAGGCCAAGCCGAAAGAATCAAGATTCGTTTGCT
TCACAGCCTGTTCCATAGCATGTGGCAAACATAACAAACCTTGTTACGACGGATGTTTGA
CCAAGTGTGGTCTCCCAAAACGTCCTTCTAAACCAACATCATCTCCATCACCCTCTACCA
CCGCTTGATCTGATCTTATTCTATTTGTGATTTGTGTCTTTATTGCTAAGGATGTCATCT
TTATGTATTTCTTTAACATGAATATTAAGTGAGAATTATACGATAAATTTTCTGATT

QA 1 417 1 417
DS 



AS 1 3

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GGGGATCCCTCCTGCTCCGCGTGGAGTTCCTCAGATCAATGTGTGTTTTGATATTGACGC
TAACGGGATCTTGAACGTGTCGGCGGAGTATAAAACAGCTGGCGTGAAGAACCAGATCAC
GATCACGAACGACAAGGGGAGGTTGAGTAAAGAGGAGATTGAGAAGATGGTGCAGGACGC
TGAGAAGTATAAGGCGGAGGATGAGCAGGTGAAGAAGAGAGTGGAGGCTAAGAACTCGCT
GGAGAATTACGCTTATAACATGAGGAACACTGTTAAGGACGAGAAGCTGGCTGGGGAGCT
GGATCAGGAAGATAAGCAGAAGATCGAGAAGGCGATTGATGAGACGATTGAGTGGATTGA
AGGGAACCAGCTGGCGGAGGTTGATGAGTTTGAGTATAAATTGAAGGAGCTGGAGGGGAT
TTGCAGCCCGATTATATCGAAGATGTATCAGGGAGGTGGTGGTGCTGGTGCTGGAGTTCC
TAATGATGGTATGCCAGGAGACGGTGGGTCAGGTGGGTCTGGCGGCTCTGGTGGTGGAGC
AGGTCCAAAGATAGAAGAGGTTGATTAGAGCGGTGGAGAGTGTGAAGACAAAAAGTGTTG
AGTCTTTGTTGTACTTTTGTGTCTGAAGTATCTTAAAGAGTGTCGATAGGTGTTTTGATA
GTGATGATGAAAGCAATGTAGTTGTATGGTGTACTCTATGTCAGTTTGTTTCGAAGTAAA
ATAAATAACGTGATCTGCCTTTTCCCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1D709TF U 1
AF RS1F203JQ C 230
AF RS1F203TF U 230
BS 1 295 RS1D709TF
BS 296 296 RS1F203TF
BS 297 444 RS1D709TF
BS 445 445 RS1F203TF
BS 446 598 RS1D709TF
BS 599 599 RS1F203TF
BS 600 666 RS1D709TF
BS 667 667 RS1F203TF
BS 668 714 RS1D709TF
BS 715 747 RS1F203TF

RD RS1D709TF 718 0 0
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TAACGGGATCTTGAACGTGTCGGCGGAGTATAAAACAGCTGGCGTGAAGAACCAGATCAC
GATCACGAACGACAAGGGGAGGTTGAGTAAAGAGGAGATTGAGAAGATGGTGCAGGACGC
TGAGAAGTATAAGGCGGAGGATGAGCAGGTGAAGAAGAGAGTGGAGGCTAAGAACTCGCT
GGAGAATTACGCTTATAACATGAGGAACACTGTTAAGGACGAGAAGCTGGCTGGGAAGCT
GGATCAGGAAGATAAGCAGAAGATCGAGAAGGCGATTGATGAGACGATTGAGTGGATTGA
AGGGAACCAGCTGGCGGAGGTTGATGAGTTTGAGTATAAATTGAAGGAGCTGGAGGGGAT
TTGCAGCCCGATTATATCGAAGATTTATCAGGGAGGTGGTGGTGCTGGTGCTGGAGTTCC
TAATGATGGTATGCCAGGAGACGGTGGGTCAGGTGGGTCTGGCGGCTCTGGTGGTGGAGC
AGGTCCAAAGATAGAAGAGGTTGATTAGAGCGGTGGAGAGTGTGAAGACAAAAAGTGTGG
AGTCTTTGTTGTACTTTTGTGTCTGAAGTATCTTAAAGAGTGTCGATAGGTGTTTTGATA
GTGATGGTGAAAGCAATGTAGTTGTATGGTGTACTCTATGTCAGTTTGTTTCGA
GTAA

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DS 

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G
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CTGGGGAGCTGGATCAGGAAGATAAGCAGAAGATCGAGAAGGCGATTGATGAGACGATTG
AGTGGATTGAAGGGAACCAGCTGGCGGAGGTTGATGAGTTTGAGTATAAATTGAAGGAGC
TGGAGGGGATTTGCAGCCCGATTATATCGAAGATGTATCAGGGAGGTGGTGGTGCTGGTG
CTGGAGTTCCTAATGATGGTATGCCAGGAGACGGTGGGTCAGGTGGGTCTGGCGGCTCTG
GTGGTGGAGCAGGTCCAAAGATAGAAGAGGTTGATTAGAGCGGTGGAGAGTGTGAAGACA
AAAAGTGTTGAGTCTTTGTTGTACTTTTGTGTCTGAAGTATCTTAAAGAGTGTCGATAGG
TGTTTTGATAGTGATGATGAAAGCAATGTAGTTGTATGGTGTACTCTATGTCAGTTTGTT
TCGAAGTAAAATAAATAACGTGATCTGCCTTTTCCCC

QA 2 518 2 518
DS 

RD RS1F203TF 518 0 0
G
AGAACTCGCTGGAGAATTACGCTTATAACATGAGGAACACTGTTAAGGACGAGAAGCTGG
CTGGGGAGCTGGATCAGGAAGATAAGCAGAAGATCGAGAAGGCGATTGATGAGACGATTG
AGTGGATTGAAGGGAACCAGCTGGCGGAGGTTGATGAGTTTGAGTATAAATTGAAGGAGC
TGGAGGGGATTTGCAGCCCGATTATATCGAAGATGTATCAGGGAGGTGGTGGTGCTGGTG
CTGGAGTTCCTAATGATGGTATGCCAGGAGACGGTGGGTCAGGTGGGTCTGGCGGCTCTG
GTGGTGGAGCAGGTCCAAAGATAGAAGAGGTTGATTAGAGCGGTGGAGAGTGTGAAGACA
AAAAGTGTTGAGTCTTTGTTGTACTTTTGTGTCTGAAGTATCTTAAAGAGTGTCGATAGG
TGTTTTGATAGTGATGATGAAAGCAATGTAGTTGTATGGTGTACTCTATGTCAGTTTGTT
TCGAAGTAAAATAAATAACGTGATCTGCCTTTTCCCC

QA 2 518 2 518
DS 



AS 1 3

CO CL3222Contig1 1034 3 5 U
GCGACAACACTCCATGACGAGCAACGACGGATCAGTGCCTAACGGCGTTATAGTGGAGCA
GACGTCGTCAGCGGTTAACAAAGGAACTCTTAACGCCGTGAAGAAGCCACCGGCTAAGGA
TCGACATAGCAAAGTTGACGGGAGAGGGAGACGTATTCGTATGCCGATCATATGCGCAGC
TCGAGTCTTCCAGTTGACTAGAGAGTTAGGTCACAAATCAGACGGTCAGACCATAGAGTG
GCTCCTCCGTCAAGCCGAGCCTTCTATCATAGCCGCCACGGGAACAGGCACGACTCCGGC
TAGTTTCTCCACCTCTTCTCTATCCACTTCCTCCTCCTTAACGCTCGGGAAACTAGGAGT
AAGAGAGGGGGAGGGAGAAGTCGGCGCTGGACTAGGAGGAGGGTTAGCAGTTGGACATAC
AATGGGGGCTTCGTTAGTGAGTGGTGGTGGGGTTTTGGGGCGGTTCCAGCGAGACCTGAT
TTCGGACAAGTATGGAGCTTTGCCGGAGCTCCGCCGGAGATGTTATTTGCACAGCAGCAG
CAACCAGCCACTTTATTCGTCCGCCACCAGCAGCAACAACAACAACAAGCTTCAGCTGCT
ACTGCAATGGGAGAGGCATCAGCAGCTAGAGTTGGGAACTATCTTCCGGGTCATCATCTT
AATTTGCTAGCTTCCTTGTCGGGTGGGAATACCGGGTCGGGTCGCAGGGAAGAGAATGAC
TCACGTTGAAATAAGGGTTTCAGGGTTTAAGAATATTTGGTGTCAAAATTTGTTAAGGAG
AGTAATATAGAAGGAGGCAGTGAGGTCGACTGAATGATCTGTTGTTACTAAAAAACGCCA
TAATGGACAGCAAAAAGATCTTTGTACGTCTGTACATGATTTCTTTTTTATGTTTCTCGT
CAGTGAAGTTGAGCCCCCAGGAACTATTGAATATTGATCTCTCCTTAATTACCCCCGGTC
AAAGGATTGTAATTCCGAATCTTTCTCGTGACTTGTATGAATGGGAGAATTGAAGATAAA
AAGAAAAACAAAAA


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 0 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C964TF U 1
AF RS1BQ29TF U 2
AF RS1C964JQ C 340
BS 1 450 RS1C964TF
BS 451 674 RS1BQ29TF
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BS 683 1034 RS1C964JQ

RD RS1C964TF 450 0 0
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GACGTCGTCAGCGGTTAACAAAGGAACTCTTAACGCCGTGAAGAAGCCACCGGCTAAGGA
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TCGAGTCTTCCAGTTGACTAGAGAGTTAGGTCACAAATCAGACGGTCAGACCATAGAGTG
GCTCCTCCGTCAAGCCGAGCCTTCTATCATAGCCGCCACGGGAACAGGCACGACTCCGGC
TAGTTTCTCCACCTCTTCTCTATCCACTTCCTCCTCCTTAACGCTCGGGAAACTAGGAGT
AAGAGAGGGGGAGGGAGAAGTCGGCGCTGGACTAGGAGGAGGGTTAGCAGTTGGACATAC
AATGGGGGCTTCGTTAGTGAGTGGTGGTGG

QA 1 450 1 450
DS 

RD RS1BQ29TF 686 0 0
G
GACAACACTCCATGACGAGCAACGACGGATCAGTGCCTAACGGCGTTATAGTGGAGCAGA
CGTCGTCAGCGGTTAACAAAGGAACTCTTAACGCCGTGAAGAAGCCACCGGCTAAGGATC
GACATAGCAAAGTTGACGGGAGAGGGAGACGTATTCGTATGCCGATCATATGCGCAGCTC
GAGTCTTCCGGTTGACTAGAGAGTTAGGTCACAAATCAGACGGTCAGACCATAGAGTGGC
TCCTCCGTCAAGCCGAGCCTTCTATCATAGCCGCCACGGGAACAGGCACGACTCCGGCTA
GTTTCTCCACCTCTTCTCTATCCACTTCCTCCTCCTTAACGCTCGGGAAACGAGGAGTAA
GAGAGGGGGAGGGAGAAGTCGGCGCTGGACTAGGAGGAGGGTTAGCAGTTGGACATACAA
TGGGGGCTTCGTTAGTGAGTGGTGGTGGGGTTTTGGGGCGGTTCCAGCGAGACCTGATTT
CGGACAAGTATGGAGCTTTGCCGGAGCTCCGCCGGAGATGTTATTTGCACAGCAGCAGCA
ACCAGCCACTTTATTCGTCCGCCACCAGCAGCAACAACAACAACAAGCTTCAGCTGCTAC
TGCAATGGGAGAGGCATCAGCAGCTAGAGTTGGGAACTATCTTCCGGGTCATCATCTTAA
TTTGCTAGCTTCTTTGTCGG
TGGGA

QA 2 681 2 681
DS 

RD RS1C964JQ 695 0 0
T
ACGCTCGGGAAACTAGGAGTAAGAGAGGGG*AGGGAGAAGTCGGCGCTGGACTAGGAGGA
GGGTTAGCAGTTGGACATACAATGGGGGCTTCGTTAGTGAGTGGTGGTGGGTTTT**GGG
CGGTTCCAGCGAGACCTGATTTCGGACAAGTATGGAGCTTTGCCGGAGCTCCGCCGGAGA
TGTTATTTGCACAGCAGCAGCAACCAGCCACTTTATTCGTCCGCCACCAGCAGCAACAAC
AACAACAAGCTTCAGCTGCTACTGCAATGGGAGAGGCATCAGCAGCTAGAGTTGGGAACT
ATCTTCCGGGTCATCATCTTAATTTGCTAGCTTCCTTGTCGGGTGGGAATACCGGGTCGG
GTCGCAGGGAAGAGAATGACTCACGTTGAAATAAGGGTTTCAGGGTTTAAGAATATTTGG
TGTCAAAATTTGTTAAGGAGAGTAATATAGAAGGAGGCAGTGAGGTCGACTGAATGATCT
GTTGTTACTAAAAAACGCCATAATGGACAGCAAAAAGATCTTTGTACGTCTGTACATGAT
TTCTTTTTTATGTTTCTCGTCAGTGAAGTTGAGCCCCCAGGAACTATTGAATATTGATCT
CTCCTTAATTACCCCCGGTCAAAGGATTGTAATTCCGAATCTTTCTCGTGACTTGTATGA
ATGGGAGAATTGAAGATAAAAAGAAAAACAAAAA

QA 2 695 2 695
DS 



AS 1 3

CO CL3223Contig1 377 3 3 U
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ATGATTGCCTCCTTCATCGTCGTCATGATGATGGTAATGATGATCATGACCGAAGTCGAG
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GATGGCTCATAAAGTTTATGAGAAAATAAATGGTTCTTACAATGAAGAGCTTCAAGCATG
GTTAAATATATTGTCATTTTTTTCATCCTCCTATGATTAGTTGTGGATGTTTTACTTATA
TAATAATGTTTTTCAAAAGAATATTCATATGTGAATGAAATGTATACTAGTTTCATATTG
CATAAAATGAGATTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FE67JQ C 18
AF RS1FE67TF U 18
AF RS1G568TF U 1
BS 1 293 RS1G568TF
BS 294 294 RS1FE67TF
BS 295 377 RS1G568TF

RD RS1FE67JQ 316 0 0
CCATTTAAGATTTTATCAAACCATGGCTATCGAAAAGAGAACCATGATTGCCTCCTTCAT
CGTCGTCATGATGATGGTAATGATGATCATGACCGAAGTCGAGGCCAGGAACCATGTTTC
AGTCAAGCCGCCTCCAAAAAAGAGGTTTATCTTTTTTTAAATCGATGGCTCATAAAGTTT
ATGAGAAAATAAATGGTTCTTACAATGAAGAGCTTCAAGCATGGTTAAATATATTGTCAT
TTTTTTCATCCTCCTATGATTAGTTGTGGATGTTTTACTTATATAATAATGTTTTTCAAA
AGAATATTCATATGTG

QA 1 316 1 316
DS 

RD RS1FE67TF 316 0 0
CCATTTAAGATCTTATCAAACCATGGCTATCGAAAAGAGAACCATGATTGCCTCCTTCAT
CGTCGTCATGATGATGGTAATGATGATCATGACCGAAGTCGAGGCCAGGAACCATGTTTC
AGTCAAGCCGCCTCCAAAAAAGAGGTTTATCTTTTTCTAAATCGATGGCTCATAAAGTTT
ATGAGAAAATAAATGGTTCTTACAATGAAGAGCTTCAAGCATGGTTAAATATATTGTCAT
TTTTTTCATCCTCCTATGATTAGTTGTGGATGTTTTACTTATATAATAATGTTTTTCAAA
AGAATATTCATATGTG

QA 1 316 1 316
DS 

RD RS1G568TF 377 0 0
GGGAAGCAAAAAAAGAACCATTTAAGATCTTATCAAACCATGGCTATCGAAAAGAGAACC
ATGATTGCCTCCTTCATCGTCGTCATGATGATGGTAATGATGATCATGACCGAAGTCGAG
GCCAGGAACCATGTTTCAGTCAAGCCGCCTCCAAAAAAGAGGTTTATCTTTTTCTAAATC
GATGGCTCATAAAGTTTATGAGAAAATAAATGGTTCTTACAATGAAGAGCTTCAAGCATG
GTTAAATATATTGTCATTTTTTTCATCCTCCTATGATTAGTTGTGGATGTTTTGCTTATA
TAATAATGTTTTTCAAAAGAATATTCATATGTGAATGAAATGTATACTAGTTTCATATTG
CATAAAATGAGATTTTT

QA 1 377 1 377
DS 



AS 1 3

CO CL3224Contig1 1513 3 3 U
GGGGGTAACACATGAAACTTTATTTACTTTACACAAACACAAGTGAAAGACATGATTTGT
TTTTTTTGTTCATCTCACCCACACAAATATAGCCCCATCCCATATCTAATTTACACATGC
TCTTGTAAAAAATACTAAAGGAAATAAACCCGAAAAGTGTATAAACTAGTACCATTTTCT
TGAGACAATTACTAATAATATACGTAGGATGATGATATGTAAATATCTCTCTCTTTATGG
ATATGGTAAAAGGGAACTTTTAGTCTGTGTCTTCGTATTGTTGTTGTTTTCTTTTAAATC
CAATTCAAGGGTTTTGCTCATCAAAAATGTCCAAAAGAGAAAGAACCTCAGGGACGGTGA
GTTCGAGGCGGAACTTAGGGCCGTCGTAGTGGTGGAGAATGGGACGGAAGGAATCTTCTT
CCAAAGGCAAACAAACTTTCCTCGTGATGGCCCTGACCTGAGCAGGGAACCGAGATTCGC
CAGGACATTTCTTGTCTTCCAAAGCGTTGAGCTCAATGTTAGTCCCACCGAAGCTAGCGG
CCTGGTAGACACCGTGGAGCTGGTGAGTGGAGTAGTTGTAGAGGAAGAGAGGAAGACCGG
GAGTGATGGCTCTGACCGAGTCCCTGTATCTCGGAGGCAAACCGAATAGCTGGCGCTTCA
GATTCTCCTCC*ATGGTGTCGTTGTTGCAGACAAAGATGTAACCACCGATGGTCTCGTTC
CTCGGAAGTGCCTCCGCGGGAGGAAGAGTCTTAAACCTCTTCTCGTTGGTGATCTTGTCA
TCTTCCTT*GTTGTTGTTGTTATTCTTCTGATTCTTCCTGTTCTTCTTCCCTACTCCTTT
CTGGGAGATCTGATGATGATCTTGATCGATGATCATCCCCTTGTTGTTCTTGAAATTGAA
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CGTTTGTTGGTGGTGCTCCAGATGGAGTCGTTTAAGGAAAGATTGTGGGGCGCCTGGAGG
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AATGGCCGAATTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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BS 843 918 RS1A264TR
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CT

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DS 

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TCTTGTAAAAAATACTAAAGGAAATAAACCCGAAAAGTGTATAAACTAGTACCATTTTCT
TGAGACAATTACTAATAATATACGTAGGATGATGATATGTAAATATCTCTCTCTTTATGG
ATATGGTAAAAGGGAACTTTTAGTCTGTGTCTTCGTATTGTTGTTGTTTTCTTTTAAATC
CAATTCAAGGGTTTTGCTCATCAAAAATGTCCAAAAGAGAAAGAACCTCAGGGACGGTGA
GTTCGAGGCGGAACTTAGGGCCGTCGTAGTGGTGGAGAATGGGACGGAAGGAATCTTCTT
CCAAAGGCAAACAAACTTTCCTCGTGATGGCCCTGACCTGAGCAGGGAACCGAGATTCGC
CAGGACATTTCTTGTCTTCGAAAGCGTTGAGCTCAATGTTAGTCCCACCGAAGCTAGCGG
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CTCGGAAGTGCCTCCGCGGGAGGAAGAGTCTTAAACCTCTTCTCGTTGGTGATCTTGTCA
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GCCATAGCTCTTGGGCTG

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DS 

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TTTCCCCCGGCCGTAATGGCCGAATTC

QA 1 867 1 867
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G962TF U 1
AF RS1E827JQ C 311
BS 1 492 RS1G962TF
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BS 494 651 RS1G962TF
BS 652 868 RS1E827JQ

RD RS1G962TF 652 0 0
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GGAGGTTCAGCTGGAATCAGAGAAGAAAACGATGGGGACAATGATGAACGCAACACAAGA
GGAAACCATCAGGAAAATTGAAGAAGCTGAGAGGCTCGCTCGGGCACATGGAACTGCAAA
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GAAAGTCCAAGCAAAATAAAGTCAGTTTTTGTATTCAGAGTCTTCTGAAAA
A

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1E827JQ 558 0 0
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CAGATTGAAGACTACTTCAAACCGATAGACAAGCAAGCTGGTACAATAATGGAGGTTCAG
CTGGAATCAGAGAAGAAAACGATGGGGACAATGATGAACGCAACACAAGAGGAAACCATC
AGAAAAATTGAAGAAGCTGAGAGGCTCGTTCGGGCACATGGAACTGCAAATGCAACTGTA
GATGCAAACATGGGAGAGCGAATTCAAGATTCAAAATCCTCTGCCAATGAGAAAGTCCAA
GCAAAATAAAGTCAGTTTTTGTATTCAGAGTCTTCTGAAAAAGTCCAATGTTTCAGATTC
TCTGTTGGATTTTAATAATATGAATTGACTGAATAGAATCAATACCGAGATTGTGTTCTG
TTTAGCGTGCAAGAGAACTTATAAGCTGGCTCTGGTTGAACTATCCAACAGCAACCTCGT
TTTTGTCAATATAGTATACTGCACCATCGTGTCAAAAACATATGTTGTAGTATCGAAAAC
ATGACTTTTTTTTTAACA

QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 3

CO CL3226Contig1 896 3 12 U
ATTCATATGTACAATGAAATATTCAGAGGAATCGGACTTACTTCGAATTAAAGGATCAAA
GCAATTGAACTACCATTTACACATCAATAAACTTGATGAAATCTAAAGCGGAGACGTACT
AAACCATCATCCAAGACTAAGACTATGGTTTTTGATTATTGAAGAAAGCATCGAGCACAC
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ATGCAACCAGGCTTCAAGTGCGAATACGGAGACGACGTCGTCTTCGTCTTCGAGGTCAAG
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ACGCTACGCGGCACCATCTCCTCGTCGAGATCATACGAATCGTCGTATTCGCCGTCATGG
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AGATCCTTATCAGTAACTACTTGATCGCGAACGACATCACCATCAGTATCATCATCATCA
TCGCCAGCAGCATCGAGATCCAGATCCGCGGGGAGTTCAACGTCAGTCACGGGGATAATT
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TCCCAGAGATCGAGATCGAGATCGAGATCGTCTTCGTGGTTGAGAACGAGAGGAGACATG
GTGATAACCCTAGATCGATTCGCCATTTCGAGATTTTTTTTTTTTTCGATTTTAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1EE28JQ U 1
AF RS1EJ40JQ U 24
AF RS1EJ40TF C 130
BS 1 35 RS1EE28JQ
BS 36 36 RS1EJ40JQ
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BS 738 896 RS1EJ40TF

RD RS1EE28JQ 737 0 0
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GCAATTGAACTACCATTTACACATCAATAAACTTGATGAAATCTAAAGCGGAGACGTACT
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ACCTTGGCGATCGCTCGTTTCCCGAGCTTCCTCATCCTCTGCCTCCCCAGCTTCTTACAC
ACGCTACGCGGCACCATCTCCTCGTCGAGATCATACGAATCGTCGTATTCGCCGTCATGG
TCGTCGTCGCCGCCGTCATCGTAACAACCACCACCGTGATTAGCGTAATCTCCCAACGTA
ATACCAAACGAACAGGTAGAGCCCCGGCGGAGAAGCAAAATCCGCCTCTGAGCCCATCGG
AGATCCTTATCAGCAACTACTTGATCGCGAACGACATCACCATCAGTATCATCATCATCA
TCGCCAGCAGCATCGAGATCCAGATCCGCGGGGAGTTCAACGTCAGTCACGGGGATAATT
TGAGGCGGAGGAGAAATGACAAAGGAAGCAGCGTCGTCAAGAGATATGACGTCATCATCG
GAAAGACTATCAACGGA

QA 1 737 1 737
DS 

RD RS1EJ40JQ 714 0 0
CAA
AGGAATCGGACTTACTTCGAATTAAAGGATCAAAGCAATTGAACTACCATTTACACATCA
ATAAACTTGATGAAATCTAAAGCGGAGACGTACTAAACCATCATCCAAGACTAAGACTAT
GGTTTTTGATTATTGAAGAAAGCATCGAGCACACGAAACTTGGGAATCAATGAATCAGCA
CTTGAACTTGAGGCCGAGACCATTCTTCCCGCGGATGCAACCAGGCTTCAAGTGCGAATA
CGGAGACGACGTCGTCTTCGTCTTCGAGGTCAAGACCTTGGCGATCGCTCGTTTCCCGAG
CTTCCTCATCCTCTGCCTCCCCAGCTTCTTACAAACGCTACGCGGCACCATCTCCTCGTC
GAGATCATACGAATCGTCGTATTCGCCGTCATGGTCGTCGTCGCCGCCGTCATTGTAACA
ACCACCACCATGATTAGCGTAATCTCCCAACGTAATACCAAACGAACAGGTAGAGCCCCG
GCGGAAAAGCAAAATCCGCCTCTGAGCCCATCGGAGATCCTTATCAGTAACTACTTGATC
GCGAACGACATCACCATCAGTATCATCATCATCATCGCCAGCAGCATCGAGATCCAGATC
CGCGGGGAGTTCAACGTCAGTCACGGGGATAATTTGAGGCGGAGGAGAAATGACAAAGGA
AGCAGCGTCGTCAAGAGATATGACGTCATCATCGGAAAGACTATCAACGGA

QA 4 714 4 714
DS 

RD RS1EJ40TF 767 0 0
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GGCTTCAAGTGCGA*TACGGAGACGACGTCGTCTTCGTCTTCGAGGTCAAGACCTTGGCG
ATCGCTCGTTTCCCGAGCTTCCTCATCCTCTGCCTCCCCAGCTTCTTACAAACGCTACGC
GGCACCATCTCCTCGTCGAGATCATACGAATCGTCGTATTCGCCGTCATGGTCGTCGTCG
CCGCCGTCATTGTAACAACCACCACCATGATTAGCGTAATCTCCCAACGTAATACCAAAC
GAACAGGTAGAGCCCCGGCGGAGAAGCAAAATCCGCCTCTGAGCCCATCGGAGATCCTTA
TCAGTAACTACTTGATCGCGAACGACATCACCATCAGTATCATCATCATCATCGCCAGCA
GCATCGAGATCCAGATCCGCGGGGAGTTCAACGTCAGTCACGGGGATAATTTGAGGCGGA
GGAGAAATGACAAAGGAAGCAGCGTCGTCAAGAGATATGACGTCATCATCGGAAAGACTA
TCAACGGAGAAGGAATCGTCGGAGTACTCGCCGTCGGAGGGGTTAACAACTTCCCAGAGA
TCGAGATCGAGATCGAGATCGTCTTCGTGGTTGAGAACGAGAGGAGACATGGTGATAACC
CTAGATCGATTCGCCATTTCGAGATTTTTTTTTTTTTCGATTTTAAT

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 3

CO CL3227Contig1 500 3 1 U
GGAGATGGCCAAAACCTTCTCTTATCTTTAGAGAAGAGATGGCTGATGTCAAACGCGTAG
TCATCCTATCAATCATCTTGGTCCTGTTCTTGTCTCAGTCCCTTCTTTTGTGTTCAGGTC
ATGAAGCTGGTCAAACAAGGAAGCTTGGAGTTTTCATAAGGAAAAGGGGAGGAGGAGGGT
ACAGAAGGTCCCGCACCACCACATCAGCTTCTGTAACACTTTTGTCAGGCTCTTTCCATA
TGACTGCCTGCTTTGCCTCCTCTTTCCTGCTCTCTCTTCTTTTCTAGGGTTTTTTTTCTT
TTACTGTCAAAGGTTATTTTTCCTTTTACTTTCCCTACAAGAATCGCTGTAGTCAATAGT
AATGTCAACACGAACTCTCTGTATTCTCATATAAGTTTGAGTTCTGTTAAAAATGTGTGG
AACATGAAGATTGTGAGCTCTATAGTATAACACAAGTAACAACCTAACCGGTTTTGCTCC
AGCCTTGTATCTCTGGAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CU53TF U 51
AF RS1DN77TF U 1
AF RS1DN77JQ C 24
BS 1 500 RS1DN77TF

RD RS1CU53TF 343 0 0
GG
ACGCGTAGTCATCCTATCAATCATCTTGGTCCTGTTCTTGTCTCAGTCCCTTCTTTTGTG
TTCAGGTCATGAAGCTGGTCAAACAAGGAAGCTTGGAGTTTTCATAAGGAAAAGGGGAGG
AGGAGGGTACAGAAGGTCCCGCACCACCACATCAGCTTCTGTAACACTTTTATCAGGCTC
TTTCCATATGACTGCCTGCTTTGCCTCCTCTTTCCTGCTCTCTCTTCTTTTCTAGGGTTT
TTTTTCTTTTACTGTCAAAGGTTATTTTTCCTTTTACTTTCCCTACAAGAATCGCTGTAG
TCAATAGTAATGTCAACACGAACTCTCTGTATTCTCATATA

QA 3 343 3 343
DS 

RD RS1DN77TF 500 0 0
GGAGATGGCCAAAACCTTCTCTTATCTTTAGAGAAGAGATGGCTGATGTCAAACGCGTAG
TCATCCTATCAATCATCTTGGTCCTGTTCTTGTCTCAGTCCCTTCTTTTGTGTTCAGGTC
ATGAAGCTGGTCAAACAAGGAAGCTTGGAGTTTTCATAAGGAAAAGGGGAGGAGGAGGGT
ACAGAAGGTCCCGCACCACCACATCAGCTTCTGTAACACTTTTGTCAGGCTCTTTCCATA
TGACTGCCTGCTTTGCCTCCTCTTTCCTGCTCTCTCTTCTTTTCTAGGGTTTTTTTTCTT
TTACTGTCAAAGGTTATTTTTCCTTTTACTTTCCCTACAAGAATCGCTGTAGTCAATAGT
AATGTCAACACGAACTCTCTGTATTCTCATATAAGTTTGAGTTCTGTTAAAAATGTGTGG
AACATGAAGATTGTGAGCTCTATAGTATAACACAAGTAACAACCTAACCGGTTTTGCTCC
AGCCTTGTATCTCTGGAGTC

QA 1 500 1 500
DS 

RD RS1DN77JQ 477 0 0
ATCTTTAGAGAAGAGATGGCTGATGTCAAACGCGTAGTCATCCTATCAATCATCTTGGTC
CTGTTCTTGTCTCAGTCCCTTCTTTTGTGTTCAGGTCATGAAGCTGGTCAAACAAGGAAG
CTTGGAGTTTTCATAAGGAAAAGGGGAGGAGGAGGGTACAGAAGGTCCCGCACCACCACA
TCAGCTTCTGTAACACTTTTGTCAGGCTCTTTCCATATGACTGCCTGCTTTGCCTCCTCT
TTCCTGCTCTCTCTTCTTTTCTAGGGTTTTTTTTCTTTTACTGTCAAAGGTTATTTTTCC
TTTTACTTTCCCTACAAGAATCGCTGTAGTCAATAGTAATGTCAACACGAACTCTCTGTA
TTCTCATATAAGTTTGAGTTCTGTTAAAAATGTGTGGAACATGAAGATTGTGAGCTCTAT
AGTATAACACAAGTAACAACCTAACCGGTTTTGCTCCAGCCTTGTATCTCTGGAGTC

QA 1 477 1 477
DS 



AS 1 2

CO CL3228Contig1 898 2 8 U
GGGAAACTCTTCTTCTCTGATCTCTCATCATCATCATCACTATGGATACTCTTCACCCGG
AGAACGATCGCCTTCCCTCTCCGCCGTTAATCTCAGACCGAGTTCTAATAAACGGCGTCA
TCACGCCGTTGACTTTAACCGCCGACGGAGAGCTACAATGGACGGAATCCGCTCTTAGGA
AATCTACAACGGAGAAAGAGATCCTGAGCTTCGCCGTGGAAGGGAACAAGGTCAAATTGA
AGACGTTGGTTGAGAGAAGAGGATCAATCTGCTGCGGAGGAAGTGGTGGAGATTACGCGA
GGAAGGATTTCGTGTTCGAGCCTCTCTACGACGAATCTAGAAAGCTGTGGTGCGATAAGC
TTCGTCAACGCCTCGACTCTCTCGTCGGTCGGCCTAAGAGGCTGCTCGTGTTTGTGAACC
CGTTTGGTGGGAAGAAGACGGCTAGGAAGATATTTTTGGAGGAAGTGAAGCCGTTGTTCG
ATGATGCTCATGTTCAACTTGATGTTCAAGAAACTAAGTATCAGTTGCATGCAAAGGAGA
TGGTTAGGTCCATTGATTTGTCAAAATACGACGGTATTGTTTGCGTTAGCGGCGACGGTG
TCCTTGTTGAGTAGGTTGTGAATGGACTGCTCGAAAGAGCAGACTGGAGAACTGCCTTGA
AGTTGCCTATCGGAATGGTCCCTGCAGGAAGTGGTAATGGCATGATAAAGTCATTGCTGG
ACCCGGTTGGGCTGTCTTGCAGTGCAGCAAGTGCCACTGTTTCCATTATCCGAGGTCATA
GACGTTCTTTAGATGTGGCAACTATCTCACAAGGGACTACCAAATTCTTCAGCGTCTTGA
TGCTTGCTTGGGGATTAGTGGCTGATATAGACATCGAGTCAGAAAAGTTCTCGTACCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FG94TF U 1
AF RS1ED23TF U 197
BS 1 406 RS1FG94TF
BS 407 407 RS1ED23TF
BS 408 609 RS1FG94TF
BS 610 612 RS1ED23TF
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BS 763 898 RS1ED23TF

RD RS1FG94TF 762 0 0
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TGGTTAGGTCCATTGATTTGTCAAAATACGACGGTATTGTTTGCGTTAGCGGCGACGGTG
TCCTTGTTG***AGGTTGTGAATGGACTGCTCGAAAGAGCAGACTGGAGAACTGCCTTGA
AGTTGCCTATCGGAATGGTCCCTGCAG*AAGTGGTAATGGCATGATAAAGTCATTGCTGG
ACCCGGTTGGGCTGTCTTGCAGTGCAGCAAGTGCCACTGTTT

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1ED23TF 702 0 0
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CTCTCTCGTCGGTCGGCCTAAGAGGCTGCTCGTTTTTGTGAACCCGTTTGGTGGGAAGAA
GACGGCTAGGAAGATATTTTTGGAGGAAGTGAAGCCGTTGTTTGATGATGCTCATGTTCA
ACTTGATGTTCAAGAAACTAAGTATCAGTTGCATGCAAAGGAGATGGTTAGGTCCATTGA
TTTGTCAAAATACGACGGTATTGTTTGCGTTAGCGGCGACGGTGTCCTTGTTGAGTAGGT
TGTGAATGGACTGCTCGAAAGAGCAGACTGGAGAACTGCCTTGAAGTTGCCTATCGGAAT
GGTCCCTGCAGGAAGTGGTAATGGCATGATAAAGTCATTGCTGGACCCGGTTGGGCTGTC
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GGCAACTATCTCACAAGGGACTACCAAATTCTTCAGCGTCTTGATGCTTGCTTGGGGATT
AGTGGCTGATATAGACATCGAGTCAGAAAAGTTCTCGTACCT

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 3

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GGCTCTCGCTCGCAAATCATCAAACAGTTTCGTCTCTTTGCGATCAGATCTCATAGGAGA
GCTAATGGCTTCAGGTTTCAGCGGCGATGAAACTGCTCCTTTCTTCGGATTCCTCGGCGC
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CGGTGTGGCGTCGATGGGTGTGATGAGACCAGAGCTTGTGATGAAATCGATTGTTCCCGT
GGTTATGGCTGGTGTTTTAGGTATCTATGGTCTGATCATTGCTGTCATCATCAGTACCGG
AATCAACCCCAGGGCCAAGTCTTACTATCTATTCGATGGCTATGCTCATCTATCTTCCGG
TCTCGCTTGTGGTCTCGCCGGTCTTTCAGCTGGTATGGCTATTGGTATCGTCGGTGACGC
TGGTGTTAGAGCGAATGCACAACAACCGAAGCTGTTTGTGGGAATGATTTTGATTCTCAT
TTTTGCTGAAGCACTTGCGTTGTACGGTCCCATTGTTGGTATCATCCTCTCTTCTCGTGC
TGGTCAGTCTAGAGCCGAGTGAAAAAATCAGAAAGCCTTTTGGTTTACATCCTCTTTGTA
ATGTTTATGATATGTTTTCTTTTGTGGCATTGTGAGTTCTTTTGGTGTTTCTCATGAAAA
ACAACAAGTAACATGAGTGATAATCATTTGACTTTTGGTTCTGAATATTTTTTTTTCTTT
TGCACACTATATGGAATACATCAATAATTTAATAAAACAATATGATGATTCTATAAATTT
TGTCAGTTGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1A901TF U 1
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TTCCCGTGGTTATGGCTGGTGTTTTAGGTATCTATGGTCTGATCATTGCTGTCATCATCA
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CTTCCGGTCTCGCTT

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TGCCGCCGCTCTCGTCTTCTCCTGTATGGGAGCAGCGTACGGGACAGCAAAGAGCGGGGT
CGGTGTGGCGTCGATGGGTGTGATGAGACCAGAGCTTGTGATGAAATCGATTGTTCCCGT
GGTTATGGCTGGTGTTTTAGGTATCTATGGTCTGATCATTGCTGTCATCATCAGTACCGG
AATCAACCCCAGGGCCAAGTCTTACTATCTATTCGATGGCTATGCTCATCTATCTTCCGG
TCTCGCTTGTGGTCTCGCCGGTCTTTCAGCTGGTATGGCTATTGGTATCGTCGGTGACGC
TGGTGTTAGAGCGAATGCACAACAACCGAAGCTGTTTGTGGGAATGATTTTGATTCTCAT
TTTTGCTGAAGCACTTGCGTTGTACGGTCCCATTGTTGGTATCATCCTCTCTTCTCGTGC
TGGTCAGTCTAGAGCCGAGTGAAAAAATCAGAAAGCCTTTTGGTTTACATCCTCTTTGTA
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ACAACAAGTAACATGAGTGATAATCATTTGACTTTTGGTTCTGAATATTTTTTTTTCTTT
TGCACACTATATGGAATACATCAATA

QA 1 746 1 746
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GGGTCGGTGTGGCGTCGATGGGTGTGATGAGACCAGAGCTTGTGATGAAATCGATTGTTC
CCGTGGTTATGGCTGGTGTTTTAGGTATCTATGGTCTGATCATTGCTGTCATCATCAGTA
CCGGAATCAACCCCAGGGCCAAGTCTTACTATCTATTCGATGGCTATGCTCATCTATCTT
CCGGTCTCGCTTGTGGTCTCGCCGGTCTTTCAGCTGGTATGGCTATTGGTATCGTCGGTG
ACGCTGGTGTTAGAGCGAATGCACAACAACCGAAGCTGTTTGTGGGAATGATTTTGATTC
TCATTTTTGCTGAAGCACTTGCGTTGTACGGTCCCATTGTTGGTATCATCCTCTCTTCTC
GTGCTGGTCAGTCTAGAGCCGAGTGAAAAAATCAGAAAGCCTTTTGGTTTACATCCTCTT
TGTAATGTTTATGATATGTTTTCTTTTGTGGCATTGTGAGTTCTTTTGGTGTTTCTCATG
AAAAACAACAAGTAACATGAGTGATAATCATTTGACTTTTGGTTCTGAATATTTTTTTTT
CTTTTGCACACTATATGGAATACATCAATAATTTAATAAAACAATATGATGATTCTATAA
ATTTTGTCAGTTGACG

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DS 



AS 1 2

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TTCTCCAATGTCGTGGTGATTCTTATGGGTCTAAATCTTATGGGTTTAAATGCCGTACAT
GCCTTGACACCGCAATTTTAGGGTTTCGTAAGAAATGTCCGAGTATCAAAGGAGGAATGA
TATGGTACGACCAATGTTTTCTCCATGTTAGTGCGATTGGTATAGAATTTCCAAGCAGGA
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TATTTGCCAAGAGAGCATTGGATTTTTTCTCTGAGCTAACACTTAAAGTCGAGAAAACCA
CCAGAGACGGCCTTCGCGTCATATTTTACGCCGCAGGAGAAGAAAAGCTCGGGAAAAATA
CATTATATGCAATGGTGCAATGTATAGAATCAACAATAGATTGTAAAACTTGTTTGACAT
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CGAACTGTGATGTAAGGTATGAACTGTCCCCTTTTTTTAGATTTGTTAAGCACTATTAAG
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TTTTTGCTGAAATGTAATATTTATATATCAATAAAAATAGTGTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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BS 633 947 RS1DO67JQ

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AGAATGTCGGTTTCTCACAAAGTGGTAATGGAACAACGGCAGAAAATTTTGTTACCGTCC
TTCTCCAATGTCGTGGTGATTCTTATGGGTCTAAATCTTATGGGTTTAAATGCCGTACAT
GCCTTGACACCGCAATTTTAGGGTTTCGTAAGAAATGTCCGAGTATCAAAGGAGGAATGA
TATGGTACGACCAATGTTTTCTCCATGTTAGTGCGATTGGTATAGAATTTCCAAGCAGGA
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TATTTGCCAAGAGAGCATTGGATTTTTTCTCTGAGCTAACACTTAAAGTCGAGAAAACCA
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TTTTAATTATGTTGATTTTTCTTTTTGCTGAAATGTAATATTTATATATCAATAAAAATA
GTGTTTAC

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DS 



AS 1 2

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GAAGATAAAAGCACAAGAACTAAAGGGAATGTGCGCGC


BQ
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AF RS1DL27JQ C 1
AF RS1DL27TF U 1
BS 1 638 RS1DL27TF

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TGCGGAGATCACCTCTCACTCTAATTTCGCCGAGTCTACTGAGGCGGTGCTCAATTTCGT
TTGCACTGCTTGCAGCAAGCCTTGTCGCTCTAAAACCGAAAGTGATTTGCATACGAAAAG
AACAGGGCATACTGAGTTTGTGGATAAGACAATGGAGACGGTTAAACCCATCAGCTTGGA
AGCAGCTCCTAAGGATGCTATGGAGATTGACAACCCTGATGGTTCTAGTGGTAGTGGAGA
TGCTGCTGAAGAGATGGTTGTTCCAGAGGTTGACAAAAACATACTCGAGGAACTTGAAGG
GATGGGTTTCCCTAAAGCTCGTGCTACCCGAGCACTCCACTTCTCTGGTAATGCCAGTCT
CGAGGCTGCAGTTAATTGGGTGGTGGAGCATGAAAATGATCCTGACGTAGATGAATTGCC
AAAGGTACCTGCCAACTCTAAAGTTGGGCCTCCTAAACCTGCTCTTACCCCAGAAGAAGT
GAAGATAAAAGCACAAGAACTAA*GGGAATGTGCGCGC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1DL27TF 638 0 0
GGATCTGAAACCAAGTTCGTTCGTTCGAGAGATTGATTGATCAGTAGCCATGGCAGGAGT
GCCGCTCAAGTGTGGTGATTGCGGTGCGCTGCTGAAGTCAGTGGAGGAGGCTCAGGAGCA
TGCGGAGATCACCTCTCACTCTAATTTCGCCGAGTCTACTGAGGCGGTGCTCAATCTCGT
TTGCACTGCTTGCAGCAAGCCTTGTCGCTCTAAAACCGAAAGTGATTTGCATACGAAAAG
AACAGGGCATACTGAGTTTGTGGATAAGACAATGGAGACGGTTAAACCCATCAGCTTGGA
AGCAGCTCCTAAGGATGCTATGGAGATTGACAACCCTGATGGTTCTAGTGGTAGTGGAGA
TGCTGCTGAAGAGATGGTTGTTCCAGAGGTTGACAAAAACATACTCGAGGAACTTGAAGG
GATGGGTTTCCCTAAAGCTCGTGCTACCCGAGCACTCCACTTCTCTGGTAATGCCAGTCT
CGAGGCTGCAGTTAATTGGGTGGTGGAGCATGAAAATGATCCTGACGTAGATGAATTGCC
AAAGGTACCTGCCAACTCTAAAGTTGGGCCTCCTAAACCTGCTCTTACCCCAGAAGAAGT
GAAGATAAAAGCACAAGAACTAAAGGGAATGTGCGCGC

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

CO CL3232Contig1 961 2 8 U
GGGAGGCGAGAGAGAGAGAGAGAGGTTCATTTCGATTTCTCTTCGAAAAATTAAAATAAT
CCAGAGGGGGTGGAGGTGGAGAGATGGTGAGGATGGTGAGAAGCTGCTTACAGTCGATGA
TGAAGCTTGTGAATTCCCTTCTTGGAATGGTTGGTGTCGCCATGATCCTCTACTCTGTTT
GGCTCATCAGGCAATGGCAACAACAAACCGGATCTCTCCCCTTCCCTTACCCTCATGATG
ATTACCCCCTTCCTTGGTTCATTTATGCTTTTCTTTGTCTCGGGGCTCTTCTCTGTCTTG
TCACTTGCGCTGGCCACATCGCTGCTGAAACCGTTAATTCTTGTTGTCTTTACTTTTATA
TGGGATTCATCCTCTTGCTTATTATGATTCAAGGTGGTGTCGTTGCCGATACCTTTCTTA
ACCCTGACTGGAAACAGGACTTTCCAGATGATCCAAGTGGTGCCTTCATCCGTTTCTCTA
AGTTCGTTGAGTCAAACTTCAAGATTTGCAGATGGATTGGTCTCTCCATTTTCTTTGTCC
AGGGTGCATCAGTTCTATTGGCCATGTTGCTCAAAGCTCTTGGACCTCACCCGCATTATG
ACAGTGACGATGAATATGATTTGAGCACGGTTTCACTCCTACATGATGCTCGCCAGCCTC
ATCGTCCATACGTTGTTGGAGAACCCATTTATGGACCCAAACCGGATTCCTGGACTGTTA
GGATTAATGAAAGAGCCAACCGGTAAGAGAGATGGAGTCCAAGAGAAAGCTATGAGAAGC
AAAGTAGCCAATAGTCACCTCTTTTAGTATATATTACTTACTTTGCTTCTTTGTTGCATC
TATCTATCTATCTCTCACTCCAAAGTCCAACAAAACCACTATGTCTTGTAAAAAAAATAT
TGCACACACATATGGGGATGTACTTATGCATTTTAAAAACTACAATATATATGATCACTT
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RS1FQ81TF U 1
AF RS1FQ81JQ C 257
BS 1 721 RS1FQ81TF
BS 722 722 RS1FQ81JQ
BS 723 745 RS1FQ81TF
BS 746 746 RS1FQ81JQ
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BS 762 762 RS1FQ81JQ
BS 763 777 RS1FQ81TF
BS 778 961 RS1FQ81JQ

RD RS1FQ81TF 795 0 0
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CCAGAGGGGGTGGAGGTGGAGAGATGGTGAGGATGGTGAGAAGCTGCTTACAGTCGATGA
TGAAGCTTGTGAATTCCCTTCTTGGAATGGTTGGTGTCGCCATGATCCTCTACTCTGTTT
GGCTCATCAGGCAATGGCAACAACAAACCGGATCTCTCCCCTTCCCTTACCCTCATGATG
ATTACCCCCTTCCTTGGTTCATTTATGCTTTTCTTTGTCTCGGGGCTCTTCTCTGTCTTG
TCACTTGCGCTGGCCACATCGCTGCTGAAACCGTTAATTCTTGTTGTCTTTACTTTTATA
TGGGATTCATCCTCTTGCTTATTATGATTCAAGGTGGTGTCGTTGCCGATACCTTTCTTA
ACCCTGACTGGAAACAGGACTTTCCAGATGATCCAAGTGGTGCCTTCATCCGTTTCTCTA
AGTTCGTTGAGTCAAACTTCAAGATTTGCAGATGGATTGGTCTCTCCATTTTCTTTGTCC
AGGGTGCATCAGTTCTATTGGCCATGTTGCTCAAAGCTCTTGGACCTCACCCGCATTATG
ACAGTGACGATGAATATGATTTGAGCACGGTTTCACTCCTACATGATGCTCGCCAGCCTC
ATCGTCCATACGTTGTTGGAGAACCCATTTATGGACCCAAACCGGATTCCTGGACTGTTA
G*ATTAATGAAAGAGCCAACCGGTA*GAGAGATGGAGTCCA*GAGAAAGCTATGAGA
GCAAGTAGCCATAGTCAC

QA 1 777 1 777
DS 

RD RS1FQ81JQ 705 0 0
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CATCGCTGCTGAAACCGTTAATTCTTGTTGTCTTTACTTTTATATGGGATTCATCCTCTT
GCTTATTATGATTCAAGGTGGTGTCGTTGCCGATACCTTTCTTAACCCTGACTGGAAACA
GGACTTTCCAGATGATCCAAGTGGTGCCTTCATCCGTTTCTCTAAGTTCGTTGAGTCAAA
CTTCAAGATTTGCAGATGGATTGGTCTCTCCATTTTCTTTGTCCAGGGTGCATCAGTTCT
ATTGGCCATGTTGCTCAAAGCTCTTGGACCTCACCCGCATTATGACAGTGACGATGAATA
TGATTTGAGCACGGTTTCACTCCTACATGATGCTCGCCAGCCTCATCGTCCATACGTTGT
TGGAGAACCCATTTATGGACCCAAACCGGATTCCTGGACTGTTAGGATTAATGAAAGAGC
CAACCGGTAAGAGAGATGGAGTCCAAGAGAAAGCTATGAGAAGCAAAGTAGCCAATAGTC
ACCTCTTTTAGTATATATTACTTACTTTGCTTCTTTGTTGCATCTATCTATCTATCTCTC
ACTCCAAAGTCCAACAAAACCACTATGTCTTGTAAAAAAAATATTGCACACACATATGGG
GATGTACTTATGCATTTTAAAAACTACAATATATATGATCACTTC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL3233Contig1 1267 2 2 U
GATTGCCTCTGTCTCTGAGCATCAGCCAACGGCCTGGTCGTCTTTCATGTTTGACTACCA
TATTCTGCTCTTCCTTTTCCCTGCCGGACTTTACTTCTGTTTCAAGCGTTTGTCAGATGC
TACGATATTTATCGTCATGTATGGTCTCACCAGCTTGTACTTTGCTGGTGTCATGGTTCG
GCTTATTCTCGTCGCCACCCCAGCGGTTTGCCTTATCAGTGCCATAGCTGTCTCCGCTAC
TGTCAAGAATTTAACTTCTCTGTTAAGGACGAAACAAAAGGTTCCCCAGACTGGTTCAAC
GAAAGGAGTCGGTAGTTCAAAATCCTCTTCAAAGGTTACACTTGATCAGTCTCAACCTTT
CCAGAAGAACGGTGCCATTGCTCTTCTTGTTGGTGTATTTTATTTGCTCAGTAGATAAGC
TATTCACTGCACATGGGTGACATCAGAGGCTTACTCATCTCCCTCAATTGTCCTAGCTGC
AAGAGGAGCCCATGGGAACAGAATCATCTTTGACGATTACCGCGAGGCCTACTACTGGCT
TAGGCAAAATACTCCTACCGATGCTAAGGTCATGTCGTGGTGGGACTATGGATACCAAAT
CACTGCTATGGGAAACAGAACGGTCATCGTCGATAACAACACCTGGAACAACACTCATAT
CGCTACTGTTGGACGTGCCATGTCTTCTTATGAAGACGAGGCACATGACATCATGAGGTC
TCTTGATGTGAACTACGTATTGGTCGTTTTTGGTGGCGTTACTGGCTATTCTTCAGATGA
TATCAACAAGTTCTTGTGGATGGTGAGAATCGGAGGTGGAGTATACCCAGTGATCAAGGA
ACCTGATTACCTTGTGAATGGCGAGTTCCGTGTAGACAAAGGCGCATCACCAAAGATGCT
GAACTGTCTCATGTACAAGTTATGCTATTACAGGTTCGGCGAGCTGGTCACGGAATATGG
CAAGCCAGCCGGGTATGATAGAGCAAGAGGGGTGGAGATAGGGAACAAAGACATCAAACT
GGAACACTTGGAAGAAGCCTACACAACATCAAACTGGATTGTCCGTATTTACAGAGTCAA
GCCTCCCACAAACAGGGTGTGACTCTTTTAAGAGCTTCCATCATCAGAGAATGTGGCTTT
AGATAGTTGGTAGTTTTAAGCAGGAAACAAACTTATCATTTCGGATTTTTGTTGGACATG
GTTCTGTTTTCTTGCAGAGACAACTTTTTGCGACTTATTATCGCGTATAAGTTTGAAACA
TATTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TATTCACTGCACATGGGTGACATCAGAGGCTTACTCATCTCCCTCAATTGTCCTAGCTGC
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TAGGCAAAATACTCCTACCGATGCTAAGGTCATGTCGTGGTGGGACTATGGATACCAAAT
CACTGCTATGGGAAACAGAACGGTCATCGTCGATAACAACACCTGGAACAACACTCATAT
CGCTACTGTTGGACGTGCCATGTCTTCTTATGAAG

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TA
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AGATAGGGAACAAAGACATCAAACTGGAACACTTGGAAGAAGCCTACACAACATCAAACT
GGATTGTCCGTATTTACAGAGTCAAGCCTCCCACAAACAGGGTGTGACTCTTTTAAGAGC
TTCCATCATCAGAGAATGTGGCTTTAGATAGTTGGTAGTTTTAAGCAGGAAACAAACTTA
TCATTTCGGATTTTTGTTGGACATGGTTCTGTTTTCTTGCAGAGACAACTTTTTGCGACT
TATTATCGCGTATAAGTTTGAAACATATTTGC

QA 3 634 3 634
DS 



AS 1 3

CO CL3234Contig1 1555 3 9 U
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CCCCGGAACTATTGTGAAAATAGTTGCAGAGCAATTGACAGAAGAAACGACTGCCCCAGA
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GAAGCAACATATGGATGTGTCTGATGCTGAAGCTAAAGCAGTAGATGGTGAAAATGAAGA
TCTGCCTAATGGAGACTCAAGTCCACAGTCATCAGGAGAAAAGCAAGAGGCATGCGAGGC
ACAAAAAGAGATGAGCAAGAAGCTCTCTGCTTCTGCTCCACCCTATACCCCAACGACCAT
TCCAATTTTTGGGTCGATTACTGTTCCAGTGTTCAACGACCACGTGGGTATCCTTCCCTC
CCCACCGAATATTCCACCAATGCTTCCTGTAAACCATCTCCGCAGGTCAGCTCCTCATCA
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TGGAAACAGGGTCCCTCGTAACAAACCAAGCTTCTCCATTAGCCCTGAGTCTAATGGCGA
GGCTAATCAGTTCATTGGCCCAAGAATAATGAACCCTCATGCGGCTGAGTTCATACCGAG
TCAACCATGGGTTTCTAACGGATATCCAGTGTCACCAAACGGCTATCTTGTATCACCAAA
TGGGACGGAAATAACGCAGAATGGGTACCCGTTGTCGCCGGTAGCAGGTGCATATCCGTG
TAACATACCCGCACAGCCTCAGAACGGACATATTATACCTGCACCACTGGCTTTAGAGGA
GTTACCTGGTACCGAAAGCGCCCAGGAGAAGAGTGGAGGCGAAGAAGAGAAGAAAGCGGC
AGAGGATGAAGAAGTCACTGTACAAGAAAGTAAAGAAACGCCCGAAAATGGACAGTCGGC
AGTAGGCGAAGAGAGACCCACAGAAGAAGAGATATCTAACGGGAGTTGAAGTAGTTTTCT
GTCATTGAAGTATTGACATGACACCGAGGCTAAAGGAATGGAGAGAAACTTGGTTTTATG
GATGAGGTAGAGGTAAACCAATCATAGTTGGGCATGAGAGTCGAGGAAAGCATTTCTACC
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TTTACTCCTCCTGCATTCAGTTTTTTTCTTTTTTTTCTTTTGGTTTCCATAGCTGAGAAC
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BQ
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AF RS1FR56TF U 1
AF RS1CI71TF U 233
AF RS1CI71JQ C 829
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CCCCGGAACTATTGTGAAAATAGTTGCAGAGCAATTGACAGAAGAAACGACTGCCCCAGA
GACTTTGGACGCAGAAAAAGTTGCAGTAGATAGTCCTGAAAATGTTAAGGCTGAGGAGGT
TGAGAGTGAGAGTAAGCATGAGGCTACAGAAACGGAAACGAAAAATGCTGATGGCAATGA
ACAAGGAGGGGCTGCTGTTGGTGGACCAAAGTTGATGAGTGCACAAGAGGATATCAAGGC
TGATAAGGCAGGAGAAGAAGGATCTCCAACAAAGACAGCGGTTTCAGATGCAAGTCAAGG
AGTATCTGAAAGTGTACAAACAGCAAAAGATTCAAATGGAAGTGACCCAGTAATAGGAGT
GAAGCAACATATGGATGTGTCTGATGCTGAAGCTAAAGCAGTAGATGGTGAAAATGAAGA
TCTGCCTAATGGAGACTCAAGTCCACAGTCATCAGGAGAAAAGCAAGAGGCATGCGAGGC
ACCAAAAGAGTTGAGCAAGAAGCTCTCTGCTTCTGCTCCACCCTATACCCCAACGACCAT
TCCAATTTTTGGGTCGATTACTGTTCCAGTGTTCAACGACCACGTGGGTATCCTTCCCTC
CCCACCGAATATTCCACCAATGCTTCCTGTAAACCATCTCCGCA

QA 1 704 1 704
DS 

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ATCGAGGCTGATAAGGCAGGAGAAGAAGGATCTCCAACAAAGACAGCGGTTTCAGATGCA
AGTCAAGGAGTATCTGAAAGTGTACAAACAGCAAAAGATTCAAATGGAAGTGACCCAGTA
ATAGGAGTGAAGCAACATATGGATGTGTCTGATGCTGAAGCTAAAGCAGTAGATGGTGAA
AATGAAGATCTGCCTAATGGAGACTCAAGTCCACAGTCATCAGGAGAAAAGCAAGAGGCA
TGCGAGGCACAAAAAGAGATGAGCAAGAAGCTCTCTGCTTCTGCTCCACCCTATACCCCA
ACGACCATTCCAATTTTTGGGTCGATTACTGTTCCAGTGTTCAACGACCACGTGGGTATC
CTTCCCTCCCCACCGAATATTCCACCAATGCTTCCTGTAAACCATCTCCGCAGGTCAGCT
CCTCATCAGTCTGTAACAGCTCGAGTTCCATACGGGCCTAGGCTCTCAGGTGGTGGCTAC
AACCGATCTGGAAACAGGGTCCCTCGTAACAAACCAAGCTTCTCCATTAGCCCTGAGTCT
AATGGCGAGGCTAATCAGTTCATTGGCCCAAGAATAATGAACCCTCATGCGGCTGAGTTC
ATACCGAGTCAACCATGGGTTTCTAACGGATATCCAGTGTCACCAAACGGCTATCTTGTA
TCACCAAATGGGACGGAAATAACGCAGAATGGGTACCCGTTGTCGCCGGTAGCAG*TGCA
TATCCGTGTA

QA 1 790 1 790
DS 

RD RS1CI71JQ 727 0 0
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GTTCATACCGAGTCAACCATGGGTTTCTAACGGATATCCAGTGTCACCAAACGGCTATCT
TGTATCACCAAATGGGACGGAAATAACGCAGAATGGGTACCCGTTGTCGCCGGTAGCAGG
TGCATATCCGTGTAACATACCCGCACAGCCTCAGAACGGACATATTATACCTGCACCACT
GGCTTTAGAGGAGTTACCTGGTACCGAAAGCGCCCAGGAGAAGAGTGGAGGCGAAGAAGA
GAAGAAAGCGGCAGAGGATGAAGAAGTCACTGTACAAGAAAGTAAAGAAACGCCCGAAAA
TGGACAGTCGGCAGTAGGCGAAGAGAGACCCACAGAAGAAGAGATATCTAACGGGAGTTG
AAGTAGTTTTCTGTCATTGAAGTATTGACATGACACCGAGGCTAAAGGAATGGAGAGAAA
CTTGGTTTTATGGATGAGGTAGAGGTAAACCAATCATAGTTGGGCATGAGAGTCGAGGAA
AGCATTTCTACCTTTGAATGGTTTGTGTTTCAGCACAGAATCAAGACTCGTGGCTCCTCT
GCTTTAACAAACTTTACTCCTCCTGCATTCAGTTTTTTTCTTTTTTTTCTTTTGGTTTCC
ATAGCTGAGAACTTAAAAATATTCAAGACCTTGAGGAGCCTCCTGAATAAAACATTTTTT
CTTTTCG

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 3

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AAAACTTCCGATGTATAATGTACAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGGTTTGGTTTAT
AGCCACCACCGCCGACTCAAGAGAGATATGCCTATGAGAGGTCGAACGATCCCTGCCCTT
CGTTGATGGCGTAAAGCAGTTTCTTGTACATGATTTCCTTAGTAAAATAAGGAGGGAGCT
TAAGGTAGTTGGCGCAAGTCATGACGCTGGGAAGATCGTCGTCTGCTGTTTCCGTAGCCC
CTGTCCCATTAGCTGCTGCATTTGAGGTTGATGAAAGCTTTCTCACAATCGTCAGCTTCG
GGTTCAGAACAGCTAAGCCACCAGGAGGAAGCCTAGGAGCTCCAGTTACAAACTGGCAGA
AAGCCCGCTGTTGATCCGCTGTAAGCTCTCCCATGATCTCCAGTAAGTTAACGATTGCCG
GACTTTTTGCAGCATAACCGTGATCAAACTTGATATGTTCAACAAGAGTCTCCGCCTCCC
ACAACTCTCTACGACCACACAACAAGTAGTCCAGCTCGGAAGGGGTGAATATTTGTAGAG
ACTTTATGTCAAAGACCTGATTGAATCCAGATCTGAAGGCTTCGATCTGCCGGGCAACTC
CTCTCTTGACAGTAGCATCAACGACCAAGGATATATAGTCCTCAAGACTATTAATATCAA
CAATGTCATCTCCAGGTCTCAATATGCATTCAGGATAGCCAGGTAGGGTGAAGTCCAAGC
AAAGATCTTCAATACGGGATCCACGTAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G629JQ U 1
AF RS1BR03JQ U 18
AF RS1G629TF C 412
BS 1 122 RS1G629JQ
BS 123 123 RS1BR03JQ
BS 124 662 RS1G629JQ
BS 663 749 RS1BR03JQ
BS 750 811 RS1G629TF

RD RS1G629JQ 662 0 0
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AAAACTTCCGATGTATAATGTACAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGGTTTGGTTTAT
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CGTTGATGGCGTAAAGCAGTTTCTTGTACATGATTTCCTTAGTAAAATAAGGAGGGAGCT
TAAGGTAGTTGGCGCAAGTCATGACGCTGGGAAGATCGTCGTCTGCTGTTTCCGTAGCCC
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ACTTTATGTCAAAGACCTGATTGAATCCAGATCTGAAGGCTTCGATCTGCCGGGCAACTC
CT

QA 1 662 1 662
DS 

RD RS1BR03JQ 732 0 0
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ATGTACAAAGAGAGAGAGAGAG********GGGTTTGGTTTATAGCCACCACCGCCGACT
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AGTTTCTTGTACATGATTTCCTTAGTAGAATAAGGAGGGAGCTTAAGGTAGTTGGCGCAA
GTCATGACGCTGGGAAGATCGTCGTCTGCTGTTTCCGTAGCCCCTGTCCCATTAGCTGCT
GCATTTGAGGTTGATGAGAGCTTTCTCACAATCGTCAGCTTCGGGTTCAGAACAGCTAAG
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CCGTGATCAAACTTGATATGTTCAACAAGAGTCTCCGCCTCCCACAACTCTCTACGACCA
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CTCAATATGCAT

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1G629TF 400 0 0
AAAT
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TGCCGGACTTTTTGCAGCATAACCGTGATCAAACTTGATATGTTCAACAAGAGTCTCCGC
CTCCCACAACTCTCTACGACCACACAACAAGTAGTCCAGCTCGGAAGGGGTGAATATTTG
TAGAGACTTTATGTCAAAGACCTGATTGAATCCAGATCTGAAGGCTTCGATCTGCCGGGC
AACTCCTCTCTTGACAGTAGCATCAACGACCAAGGATATATAGTCCTCAAGACTATTAAT
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CAAGCAAAGATCTTCAATACGGGATCCACGTAAACC

QA 5 400 5 400
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CACACCGATATCCCATTATCTTACTACACTGGACTTCTTGGCATGCCTGGTATGACTGCT
TATGCTGGATTTTACGAAATTTGTTCACCTAAGAGAGGAGAGACTGTCTTCGTGTCAGCT
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GTTGGAAGCGCCGGTAGTAAAGAAAAGGTTAATCTTCTCAAGACAACGTTTGGATTCGAC
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BQ
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15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DX75TF U 2
AF RS1AA34TF U 1
BS 1 10 RS1AA34TF
BS 11 11 RS1DX75TF
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RD RS1DX75TF 695 0 0
GG
CACCAAGCATTGAGAATCCTATCGAAAGCACGCATCATCCACTCAAGAATAAATCATATT
AGTGATTCAAAAGTACGTAAATAGGGAGAAATGGCGAACACAGAGCCAGCAACTGTGACC
AACAAGCAAATCATATTCTCAGGTTATGTGAGTGGATTCCCGAAGGAGTCCGATCTAAAA
TTCACCACAACCACCATCGATCTAAGGATTCCAGAGAGATCCACATCAATTCTGGTGAAG
AATCTTTACCTGTCTTGCGATCCTTACATGCGCATTTGCATGGGAAAGCCTGAGCCGTTG
AGTTCTTCGCTCGTCCCACCGTTCAATACAGGCGAGCCAATCATTGGCCTTGGAGTGTCT
AAAGTGATAGATTCAGGGCACCCAGATTACAAAAAAGGAGACTTACTCTGGGGAGTAGTT
GGATGGGAGGAGTACAGTGTTATTACTCTATTTCCTTATTCACATTTTAAGATCCATCAC
ACCGATATTCCATTATCTTACTACACTGGACTTCTTGGCATGCCTGGTATGACTGCTTAT
GCTGGATTTTACGAAATTTGTTCACCTAAGAGAGGAGAGACTGTCTTCGTGTCAGCTGCA
TCCGGTGCAGTTGGTCAGCTTGTGGGACAATTTGCAAAGCTGATGGGTTGTTATGTCGTT
GGAAGCGCCGGTAGTAAAGAAAAG
TTGATCTTC

QA 3 686 3 686
DS 

RD RS1AA34TF 768 0 0
GGACACCAAGTATTAAGAATCCTATCGAAAGCACGCATCATCCACTCAAGAATAAATCAT
ATTAGTAATTCAAAAGTACGTAAATAGGGAGAAATGGCGAGCACAGAGCCAGCAACGGTG
ACCAACAAGCAAATCATATTCTCAGGTTATGTGAGTGGATTCCCGAAGGAGTCCGATCTA
AAATTCACCACAACCACCATTGATCTAAGGATTCCAGAGAGATCCACATCAATTCTGGTG
GAGAATCTTTACTTGTCTTGCGATCCTTACATGCGCATTTGCATGGGAAAGCCTGAGCCG
TTGAGTTCTTCGCTCGTCCCACCGTTCAATACAGGCGAGCCAATCACTGGCCTTGGAGTG
TCGAAAGTGATAGATTCAGGGCACCCAGATTACAAAAAAGGAGACTTACTCTGGGGAGTA
GTTGGATGGGAGGAGTACAGTGTTATTACTCTATTTCCTTACTCACATTTTAAGATCCAT
CACACCGATGTCCCATTATCTTACTACACTGGACTTCTTGGCATGCCTGGTATGACTGCT
TATGCTGGATTTTACGAAATTTGTTCACCTAAGAGAGGAGAGACTGTCTTCGTGTCAGCT
GCATCCGGTGCAGTTGGTCAGCTTGTGGGACAATTTGCAAAGCTGATGGGTTGTCATGTC
GTTGGAAGCGCCGGTAGTAAAGAAAAGGTTAATCTTCTCAAGACAACGTTTGGATTCGAC
GACGCTTTCAATTACAAGGAGGAGAATGACCTTAACACTGCCCTAAAG

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL3238Contig1 810 2 6 U
CGATGTAATAATTTATAAGTGCCACGAATTTCGAATAAACCAATCTAAAGTCGAAACCAA
AATGGATGTAAACCAATAGAAAGATGACAACATAGAAAGAGTTTTAAGCAATTCTGTCAC
AAAAGAGCAGTTGTTAAATCCCAAAAAAACTCTACGATTCAAAGGTTGCAAGGACTCTAG
AAGATATCAAAACACTAGTAACAGAGTAAGCACCCTGTGGAGATAGAGGTGGGGGTGAAG
AAGAGCATCTCTCACTTGAAGCACTTGGCGTCCAAAAGAGCCTCACCTTCAAAAGGCTCG
GCATCTTCAATCATCTGGCTAACACGCTCTTTCTGTGCTTCGTCAGAAATATCAACTTTG
GTCCACTCGTAGAGCTCCATGTCGTAAACCTCATCCATAATGAATTTGGGGATTTCTGGT
CCACGGAACAGCCACAAACCCTTCACCTTGAAAGGAGCCTCTGACCCGCAAATGAGCATC
TTTCCAAAGGCATATTTACGTGCCAAGTCCATTCGCTGGAGGAACCCACCAACCTTATTC
AGTGTAACAAACGAAACCATGTTCTCGTCGTTGTACTTGTAGTCACAGAACCATAGCGAG
TATCCCTCTGGATCGTACATGTCCCAGAATCCTTTGATTGCAACCTCACGGAAGTTGGAC
TTGGTGTTGGAGTAAAGCCTCTTCCACTCATCAAGAACCATTGGGCTAGGAGGTAGCAAA
TCAAGAGGATTCTTGGCCTTGGGCTTTGGTGCTTCTTACTCCTCAGCAAACTTGGGTGCC
TCTGCTGCAGGGGCAGGCTTCTTAGCTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FJ13JQ U 1
AF RS1EO68JQ U 48
BS 1 55 RS1FJ13JQ
BS 56 56 RS1EO68JQ
BS 57 347 RS1FJ13JQ
BS 348 348 RS1EO68JQ
BS 349 650 RS1FJ13JQ
BS 651 810 RS1EO68JQ

RD RS1FJ13JQ 652 0 0
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AAGATATCAAAACACTAGTAACAGAGTAAGCACCCTGTGGAGATAGAGGTGGGGGTGAAG
AAGAGCATCTCTCACTTGAAGCACTTGGCGTCCAAAAGAGCCTCACCTTCAAAAGGCTCG
GCATCTTCAATCATCTGGCTAACACGCTCTTTCTGTGCTTCGTCAGAGATATCAACTTTG
GTCCACTCGTAGAGCTCCATGTCGTAAACCTCATCCATAATGAATTTGGGGATTTCTGGT
CCACGGAACAGCCACAAACCCTTCACCTTGAAAGGAGCCTCTGACCCGCAAATGAGCATC
TTTCCAAAGGCATATTTACGTGCCAAGTCCATTCGCTGGAGGAACCCACCAACCTTATTC
AGTGTAACAAACGAAACCATGTTCTCGTCGTTGTACTTGTAGTCACAGAACCATAGCGAG
TATCCCTCTGGATCGTACATGTCCCAGAATCCTTTGATTGCAACCTCACG
CC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RS1EO68JQ 763 0 0
G
AGTCGAAACCAAAATGGATGTAAACCAATAGAAAGATGACAACATAGATAGAGTTTTAAG
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CAAGGACTCTAGAAGATATCAAAACACTAGTAACAGAGTAAGCACCCTGTGGAGATAGAG
GTGGGGGTGAAGAAGAGCATCTCTCACTTGAAGCACTTGGCGTCCAAAAGAGCCTCACCT
TCAAAAGGCTCGGCATCTTCAATCATCTGGCTAACACGCTCTTTCTGTGCTTCGTCAGAA
ATATCAACTTTGGTCCACTCGTAGAGCTCCATGTCGTAAACCTCATCCATAATGAATTTG
GGGATTTCTGGTCCACGGAACAGCCACAAACCCTTCACCTTGAAAGGAGCCTCTGACCCG
CAAATGAGCATCTTTCCAAAGGCATATTTACGTGCCAAGTCCATTCGCTGGAGGAACCCA
CCAACCTTGTTCAGTGTAACAAACGAAACCATGTTCTCGTCGTTGTACTTGTAGTCACAG
AACCATAGCGAGTATCCCTCTGGATCGTACATGTCCCAGAATCCTTTGATTGCAACCTCA
CGGAAGTTGGACTTGGTGTTGGAGTAAAGCCTCTTCCACTCATCAAGAACCATTGGGCTA
GGAGGTAGCAAATCAAGAGGATTCTTGGCCTTGGGCTTTGGTGCTTCTTACTCCTCAGCA
AACTTGGGTGCCTCTGCTGCAGGGGCAGGCTTCTTAGCTCCT

QA 2 763 2 763
DS 



AS 1 3

CO CL3239Contig1 619 3 2 U
GGATCGTTTCTCAGTTTCAGAAACTCATCACCATCTCTGAGATATCAAAGATTTAAACAA
ACAGCGACGATGCCGAGCAGATACCCAGGAGCCGTGACACAAGACTGGGAGCCAGTGGTG
CTCCACAAAACCAAGCCAAAGAGCCAAGACCTCCGTGATCCCAAGGCGGTTAACGCGGCT
CTCAGAAGTGGTTTAGCGGTTCAGACGGTGAAGAAATTCGACGCCGGTTCTAACAAGAAG
GGGAAGTCGACGGCGGTGCCTGTGATCAACACGAAGAAGTTGGAAGAAGAGACGGAGCCG
TCGGCGATGGATCGTGTGAAAGCGGAGGTGAGGCTAGCGATACAGAAAGCTCGGTTGGAG
AAGAATATGTCACAAGCGGATCTGGCGAAACAGATCAACGAGCGGACACAGGTGGTTCAA
GAATACGAGAACGGGAAAGCTGTTCCTAACCAGGCCGTGCTTGCCAAGATGGAGAAGGTT
CTGGGTGTTAAACTCAGGGGTAAACATGTTAAATAATGCAAAACGATACCGTATCTGTTT
TTCTTTTTTTGGTGCCTATCTACCATCTAGTTTCGTATTCTCTCATTTTGTGAAAATAAT
TAAGAACGCTTTTCATTCG


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1G553TF U 1
AF RS1EX74JQ C 1
AF RS1EX74TF U 1
BS 1 4 RS1EX74JQ
BS 5 619 RS1EX74TF

RD RS1G553TF 591 0 0
GGAT
CGTTTCTCATTTTCAGAAACTCATCACCATCTCTGAGATATCAAAGATTTAAACAAACAG
CGACGATGCCGAGCAGATACCCAGGAGCCGTGACACAAGACTGGGAGCCAGTGGTGCTCC
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GAAGTGGTTTAGCGGTTCAGACGGTGAAGAAATTCGACGCCGGTTCTAACAAGAAGGGGA
AGTCGACGGCGGTGCCTGTGATCAACACGAAGAAGTTGGAAGAAGAGACGGAACCGTCGG
CGATGGATCGTGTGAAAGCGGAGGTGAGGCTAGCGATACAGAAAGCTCGGTTGGAGAAGA
AGATGTCACAAGCGGATCTGGCGAAACAGATCAACGAGCAGACACAGGTGGTTCAAGAAT
ACGAGAACGGGAAAGCTGTTCCTAACCAGGCCGTGCTTGCCAAGATGGAGAAGGTTCTGG
GTGTTAAACTCAGGGGTAAGCATGTTAAATAATGCAAAACGATACCGTATCTGTTTTTCT
TTTTTTGGTGCCTATCTACCATCTAGTTTCGTATTCTCTCATTTTGT

QA 5 591 5 591
DS 

RD RS1EX74JQ 619 0 0
GGATCGTTTCTCAGTTTCAGAAACTCATCACCATCTTTGAGATATCAAAGATTTAAACAA
ACAGCGACGATGCCGAGCAGATACCCAGGAGCCGTGACACAAGACTGGGAGCCAGTGGTG
CTCCACAAAACCAAGCCAAAGAGCCAAGACCTCCGTGATCCCAAGGCGGTTAACGCGGCT
CTCAGAAGTGGTTTAGCGGTTCAGACGGTGAAGAAATTTGACGCCGGTTCTAACAAGAAG
GGGAAGTCGACGGCGGTGCCTGTGATCAACACGAAGAAGTTGGAAGAAGAGACGGAGCCG
TCGGCGATGGATCGTGTGAAAGCGGAGGTGAGGCTAGCGATACAGAAAGCTCGGTTGGAG
AAGAATATGTCACAAGCGGATCTGGCGAAACAGATCAACGAGCGGACACAGGTGGTTCAA
GAATACGAGAACGGGAAAGCTGTTCCTAACCAGGCCGTGCTTGCCAAGATGGAGAAGGTT
TTGGGTGTTAAACTCAGGGGTAAACATGTTAAATAATGCAAAACGATACCGTATCTGTTT
TTCTTTTTTTGGTGCCTATCTACCATCTAGTTTCGTATTCTCTCATTTTGTGAAAATAAT
TAAGAACGCTTTTCATTCG

QA 1 619 1 619
DS 

RD RS1EX74TF 619 0 0
GGAG
CGTTTCTCAGTTTCAGAAACTCATCACCATCTCTGAGATATCAAAGATTTAAACAAACAG
CGACGATGCCGAGCAGATACCCAGGAGCCGTGACACAAGACTGGGAGCCAGTGGTGCTCC
ACAAAACCAAGCCAAAGAGCCAAGACCTCCGTGATCCCAAGGCGGTTAACGCGGCTCTCA
GAAGTGGTTTAGCGGTTCAGACGGTGAAGAAATTCGACGCCGGTTCTAACAAGAAGGGGA
AGTCGACGGCGGTGCCTGTGATCAACACGAAGAAGTTGGAAGAAGAGACGGAGCCGTCGG
CGATGGATCGTGTGAAAGCGGAGGTGAGGCTAGCGATACAGAAAGCTCGGTTGGAGAAGA
ATATGTCACAAGCGGATCTGGCGAAACAGATCAACGAGCGGACACAGGTGGTTCAAGAAT
ACGAGAACGGGAAAGCTGTTCCTAACCAGGCCGTGCTTGCCAAGATGGAGAAGGTTCTGG
GTGTTAAACTCAGGGGTAAACATGTTAAATAATGCAAAACGATACCGTATCTGTTTTTCT
TTTTTTGGTGCCTATCTACCATCTAGTTTCGTATTCTCTCATTTTGTGAAAATAATTAAG
AACGCTTTTCATTCG

QA 5 619 5 619
DS 



AS 1 3

CO CL3240Contig1 515 3 9 U
TGAAAACAGAACAACCACAAACATAAAGAATCAAGAACCGGAAAATGGTGAAGGTGATGT
GGGTTTCCGTTTTAGCTCTCGTGGCAGCGGTTCTCCTCGTGACGGTGGAAAAACTTCCGG
TGGCCGAAGGAGTGACCTGCTCGGTGACGGAACTGTCTCCATGTTTGGCGGCGTTTATGT
CATCTTCGTCACCGTCGGCGTCGTGCTGCGCCAAGCTGAGAGAGCAGAAGCCATGCCTTT
GTGGGTACATGAGGAACCCTAGCCTCCGCCAATACGTTAGCTCCCCAAACGCAAAAAAAA
GTCTCCAACGATTGCAAGGTTGCTTCCCCAAACTGTTAATCATGATTAATAAGTGACAAG
TTTACCTGATTATGAGTGTTAAGTTACAAGTAAAAGTGGGTCTTGTCCTCTTTCACTAGT
GTTTAATATAATAATGGGTGATGATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATGCTTG
AATGTTATATGTATGTTTCTGTCTTGTAAAACATG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1CT75TF U 1
AF RS1H242JQB C 185
AF RS1H242TF U 1
BS 1 249 RS1CT75TF
BS 250 250 RS1H242TF
BS 251 299 RS1CT75TF
BS 300 300 RS1H242TF
BS 301 318 RS1CT75TF
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BS 320 470 RS1CT75TF
BS 471 473 RS1H242TF
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RD RS1CT75TF 515 0 0
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QA 1 515 1 515
DS 

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TTATATGTATGTTTCTGTCTTGTAAAACATG

QA 1 331 1 331
DS 

RD RS1H242TF 515 0 0
TGAAAACAGAACAACCACAAACATAAAGAATCAAGAACCGGAAAATGGTGAAGGTGATGT
GGGTTTCCGTTTTAGCTCTCGTGGCAGCGGTTCTCCTCGTGACGGTGGAAAAACTTCCGG
TGGCCGAAGGAGTGACCTGCTCGGTGACGGAACTGTCTCCATGTTTGGCGGCGTTTATGT
CATCTTCGTCACCGTCGGCGTCGTGCTGCGCCAAGCTGAGAGAGCAGAAGCCATGCCTTT
GTGGGTACATGAGGAACCCTAGCCTCCGCCAATACGTTAGCTCCCCAAACGCAAAAAAAA
GTCTCCAACGATTGCAAGGTTGCTTCCCCAAACTGTTAATCATGATTAATAAGTGACAAG
TTTACCTGATTATGAGTGTTAAGTTACAAGTAAAAGTGGGTCTTGTCCTCTTTCACTAGT
GTTTAATATAATAATGGGTGATGATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATGCTTG
AATGTTATATGTATGTTTCTGTCTTGTAAAACATG

QA 1 515 1 515
DS 



AS 1 2

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AAGGAAGCGGCTGCGTCTGTGTCTGTGCCTGGATTCAGGAATAAAGAGAAGGTTCTCGTT
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AATGAGCTCGTTGAGCTTAAGGGTTCTTCTTCCTGCTTGTTCTTCGAGTGTAGGAAGCAT
AAAGATCTTTACATGTGGATGGTCAAGTCTCCTAGTGGACCCTCTGTTAAGTTCTTGGTT
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CCTCTCTTGACCTTCTCATCTAACTTCGATAAAGATGTACACTGGAAACTCTTGAAAGAG
ATGTTAACACAGGTTTTTGGAATCCCCAAGGAGCACAGAAAGTCTAAACCTTACCATGAC
CATGTTTTTGCTTTCTCTATCGTCGATGACCATATCTGGTTCCGTAATTACCAGATATCA
GTACCTCATAATGAGGCAGACAAGGTTGCTCGTGGTGGTCTTGATAAAATGACCCTTGTC
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CCAACCCTTTACGAGAACCCATTCTACGTATCTCCAAACCAGATCCGAGCCTTGGAGAAA
AGAAATAAAGCAGGGAAATTTGCAAAGAAGATCAAAGCAAAAACAAGGAGAAAGATGCAT
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GGTAATATTTTTCTTGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F011TF U 1
AF RS1F011JQ C 441
BS 1 732 RS1F011TF
BS 733 1157 RS1F011JQ

RD RS1F011TF 732 0 0
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AGGAAGAGAAAGCATAGCGAGGCTGAAGCGGCGGCGCCGGTGAAGGACGACTCTGCTCCG
GAGAGACCTAAAAGAACGCTTTTGGGTTGGAAAGATAAGAAAGAAGATGTGGAGGAAGCT
AAGGAAGCGGCTGCGTCTGTGTCTGTGCCTGGATTCAGGAATAAAGAGAAGGTTCTCGTT
ACTTGTTCCCGTCGGATTAGTTTCAGGTACCGACATCTGATGTTGAACGTAGTGTCACTT
CTGCCTCATTGTAAGAAAGATAGTAAGGTTGAAGCTAAGAGCAGTAAAGGCGCGACCCTT
AATGAGCTCGTTGAGCTTAAGGGTTCTTCTTCCTGCTTGTTCTTCGAGTGTAGGAAGCAT
AAAGATCTTTACATGTGGATGGTCAAGTCTCCTAGTGGACCCTCTGTTAAGTTCTTGGTT
AATGCTGTTCACACAATGGAGGAGCTGAAACTCACTGGAAATCATCTGAAAGGGTCACGT
CCTCTCTTGACCTTCTCATCTAACTTCGATAAAGATGTACACTGGAAACTCTTGAAAGAG
ATGTTAACACAGGTTTTTGGAATCCCCAAGGAGCACAGAAAGTCTAAACCTTACCATGAC
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GTACCTCATAAT

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1F011JQ 717 0 0
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GGAGCTGAAACTCACTGGAAATCATCTGAAAGGGTCACGTCCTCTCTTGACCTTCTCATC
TAACTTCGATAAAGATGTACACTGGAAACTCTTGAAAGAGATGTTAACACAGGTTTTTGG
AATCCCCAAGGAGCACAGAAAGTCTAAACCTTACCATGACCATGTTTTTGCTTTCTCTAT
CGTCGATGACCATATCTGGTTCCGTAATTACCAGATATCAGTACCTCATAATGAGGCAGA
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TTTAAACCCGATTAAGATCTTTGGAGGAAGCTTTGGAGGTCCAACCCTTTACGAGAACCC
ATTCTACGTATCTCCAAACCAGATCCGAGCCTTGGAGAAAAGAAATAAAGCAGGGAAATT
TGCAAAGAAGATCAAAGCAAAAACAAGGAGAAAGATGCATGAGCTTTCAAACCCGTTGGA
GCCTGATGAATTTGCAGACATGTGGAAGGAGGATGAATGATCAAAGTCCCATTCAAGTTT
TTCTTGTTGTAAACCCCTTCCAAATTCACAGAACGCTCACATTTTTATCTTTGTACTACT
GTTCTCGACTCTGTTTTTCTCTCTCTTTTATGGATCAAAAGGTAATATTTTTCTTGC

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 3

CO CL3242Contig1 616 3 12 U
GGAGTTTCACCCATATTTGCTTGGTTGCTCTGTCTTCCTCAAAATCAAAACAGAAGAGAA
ACTGTCCAAATCTCGCACTGGAACTCTAGGACAAGCAAAGGGGATCAAGAACATCATGCC
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TTCAGTA*TTTTTTCTCTTGGATTCTATGCACATGGTGTTCTGTTCCCTAATCCAGAAAG
GGTACTTGAAGAAGCCAAAGAGTCATGTGCAAAAGCCAAGTCTTTATCAGAGGAGTATTA
CGCTCAACTGGATGAGTTAATTGAAAATAAAAAGGTGTTGGACGATGCATTGCAGTTGTA
TCTGGCTGGAAATGCTCAGTTGAAAGAACTTAAAGAAGCCAATGGACTTTGAAAACGTTT
TGTCAATCGCAGGAAGAATCTGAGTGGAGTCTCTTGTGATGAAATTGAACAGAAGAAATG
ATCTAATTTGGTGCGAAGAATGAAAGCAGTAATATGGAATCTTTAAAACTTTTGGGCTGT
TAGTAATTAGTATATATATCAACTTTGGAGTAACATTCTTCAGTTTGTTTTGTTGTTAGC
TAATATCATTTCAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EX41TF U 1
AF RS1G074TF U 17
AF RS1G074JQ C 92
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GTGTAAGTAGCT

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DS 

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GG
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TCTGAGTGGAGTCTCTTGTGATGAAATTGAACAGAAGAAATGATCTAATTTGGTGCGAAG
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ATATGGAATCTTTAAAACTTTTGGGCTGTTAGTAATTAGTATATATATCAACTTTGGAGT
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QA 1 525 1 525
DS 



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BQ
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AF RS1BC48TF U 3
AF RS1AW17JQ C 1
AF RS1AW17TF U 1
BS 1 2 RS1AW17JQ
BS 3 510 RS1AW17TF

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DS 

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ATGCTTGATAAATGTGCATTTTATTAACGT

QA 1 510 1 510
DS 

RD RS1AW17TF 510 0 0
AG
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GTTTGAAGGAGGACTTTGAGGAGCACGCTGAGAAAGTCAAGAAGCTCACCGCGAGCCCAT
CGAACGAGGACTTGCTCATCCTCTACGGGCTCTACAAACAAGCCACCGTTGGTCCAGTGA
CCACTAGTCGTCCTGGAATGTTTAGCATGAAGGAAAGAGCCAAGTGGGATGCCTGGAAGG
CCGTTGAAGGGAAATCGACGGACGAATCCATGAGTGACTACATCACTAAGGCGAAGCAAC
TCCTTGAAGCAGATGCTTCCTCGGCTTCAGCTTGATGGTGATTTTATTAAATGCAGTAAT
TCTATCTAAGCTTCAAATAACTTTTTAGAATAAGACTTGTTCTTTGCTACTTGTGTGTTT
TCTATCGTCATGAATCTATTTATGACCTTGGTCTCCTGATTTGGGCCATCTCTTGAAAAT
GCTTGATAAATGTGCATTTTATTAACGT

QA 3 510 3 510
DS 



AS 1 3

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TGACGACAAGTTTGCGGAACTAATCAAAGACTCTTTTGATTCTCATTACCAATTCTTGGG
TGTTTCCACGGATGCTGACCTTGAAGATATAAAATCTGCTTACCGGAGGTTATCGAAAGA
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TATACTATTAAAGTACAAGCACATTTGGATTTTTTACTAAACATACCATTTCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GP94TF U 1
AF RS1E812TF U 13
AF RS1GP94JQ C 296
BS 1 655 RS1GP94TF
BS 656 895 RS1GP94JQ

RD RS1GP94TF 655 0 0
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TCGAACTTCATGCATTTGTTTTCCAAGAATCCAAAACAGCAAGCAGTTCATTGACAAGAT
GGGAGCATTTAGAAAGATAGCGAGAAGAAGAGTGAGGCTTATTCACGCATCACAAGGTCC
AACAAAACCACCAAAACCATTGCCTGGAGTAGACACAAGAATCCACTGGGAAAACCCGGA
AGATGGATGGATAGGTGGAGGATCCGACCCGATCAAACCTGACGAAACCAATCTTTTCGG
TGACGACAAGTTTGCGGAACTAATCAAAGACTCTTTTGATTCTCATTACCAATTCTTGGG
TGTTTCCACGGATGCTGACCTTGAAGATATAAAATCTGCTTACCGGAGGTTATCGAAAGA
GTATCATCCAGACACAACTTCATTACCACTTAAAACAGCTTCAGACAAGTTCATGAAACT
AAGAGAAGTCTACGATGTTTTGAGCGACCAGGAGAGTAGGAGATTCTATGACTGGACACT
GGCTCAGGAGGTTGCGAGTCGTCAAGCTGAGAAGATGAGAATGAAGCTTGAGGATCCGAA
AGAGCAAGAATTTCGGAATTATGAATCTATACCCGATATGGTTGATCGGTTAGGT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1E812TF 643 0 0
GG
ATCTTGAAACACAGTACGCCATGGCTTCTCCAGCTTCCACTTATGCTCGAACTTCATGCA
TTTGTTTTCCAAGAATCCAAAACAGCAAGCAGTTCATTGACAAGATGGGAGCATTTAGAA
AGATAGCGAGAAGAAGAGTGAGGCTTATTCACGCATCACAAGGTCCAACAAAACCACCAA
AACCATTGCCTGGAGTAGACACAAGAATCCACTGGGAAAACCCGGAAGATGGATGGATAG
GTGGAGGATCCGACCCGATCAAACCTGACGAAACCAATCTTTTCGGTGACGACAAGTTTG
CGGAACTAATCAAAGACTCTTTTGATTCTCATTACCAATTCTTGGGTGTTTCCACGGATG
CTGACCTTGAAGATATAAAATCTGCTTACCGGAGGTTATCGAAAGAGTATCATCCTGACA
CAACTTCATTACCACTTAAAACAGCTTCAGACAAGTTCATGAAACTAAGAGAAGTCTACG
ATGTTTTGAGCGACCAGGAGAGTAGGAGATTCTATGACTGGACACTGGCTCAGGAGGTTG
TTAGTCGTCAAGCTGAGAAGATGAGAATGAAGCTTGAGGATCCGAAAGAGCAAGAATTTC
GGAATTATGAATCTATACCCGATATGGTTGATCGGTTAGGT

QA 3 643 3 643
DS 

RD RS1GP94JQ 600 0 0
TTCGGTGACGACAAGTTTGCGGAACTAATCAAAGACTCTTTTGATTCTCATTACCAATTC
TTGGGTGTTTCCACGGATGCTGACCTTGAAGATATAAAATCTGCTTACCGGAGGTTATCG
AAAGAGTATCATCCAGACACAACTTCATTACCACTTAAAACAGCTTCAGACAAGTTCATG
AAACTAAGAGAAGTTTACGATGTTTTGAGCGACCAGGAGAGTAGGAGATTCTATGACTGG
ACACTGGCTCAGGAGGTTGCGAGTCGTCAAGCTGAGAAGATGAGAATGAAGCTTGAGGAT
CCGAAAGAGCAAGAATTTCGGAATTATGAATCTATACCCGATATGGTTGATCGGTTAGGT
GGAAGGAACATGGAGCTTAGTGATCAAGCCATGACTGCTCTTACGTTCGATGTTTTGATC
GTTATATTTGCCGTTTGTTGTATAGTGTATGTGGTTGTCTTTAAAGATCCTTATTACTAG
GTAAGGAGCTATATACAGGGAAGTTGAAATTCAGGGAAATCTGTATAGGTGGAAAATGGA
ACATCTATACTATTAAAGTACAAGCACATTTGGATTTTTTACTAAACATACCATTTCTTT

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 3

CO CL3245Contig1 824 3 17 U
GAACCACATAAAACTAATACACCTCACAATTTCTCAATCGACACAAAGATATCAAAAAAA
AAAGTAAATCTAAGCCTCTAATATTCTTCATCATGGCCTCAGTAACCTCAGCCACCGTCG
CAATCCCATCGTTCACCGGTCTCAAATCCACAATCTCCAAACCCTCCGCCATCGTCAGAA
TCCCCAAAACATCACGGAAGCTCACCGTGAAGTCATCTCTAAAGGACTTCGGAGTCGCGG
CCGTAGCGGCTGCAGCTTCAATCGCTTTGGCTGGAAACGCCATGGCGATAGATGTTCTCT
TGGGATCAGGAGATGGAGCGTTAGCTTCCGTTCCCAACGAGTTCACAATAGCGAAAGGAG
AGAAGATTGTGTTCAAGAACAACGCTGGATTCCCACACAATGTTGTGTTCGATGAGGACG
AGATCCCGAGTGGTGTTGACGCGAGCAAGATCTCCATGGACGAGCAAGATCTACTCAACG
CTGCGGGAGAGACGTACGAGGTTGCTTTGACCGAGCCTGGGACTTACAGCTTCTATTGTG
CGCCCCATCAGGGTGCTGGTATGGTCGGTAAAGTCACCGTTAACTAAATAAAGTGTGAAT
GTAAGTGAAAGAGTGTCTCTGAACCAAAGTAGAGGCTTTCCTTTTTGTAATTCTAAAGAG
TGTTGAGTCGAATGGACCGTGATTTGTTATAGTATGAATGGTTCCATAAGTGCTTTTTTC
CTGGTTTATAAATTGTATGTAGATTTATGTCTCTCCCTATAATTTTCTTAGGAATATGAT
AAACTAAATAGGAAAATAAATGGTAAAAATATGCTGTTTGTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1BS88TF U 1
AF RS1GK22TF U 39
AF RS1GK22JQ C 301
BS 1 61 RS1BS88TF
BS 62 63 RS1GK22TF
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BS 191 247 RS1BS88TF
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BS 631 679 RS1GK22TF
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RD RS1BS88TF 630 0 0
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A**GTAAATCTAAGCCTCTAATATTCTTCATCGTGGCCTCAGTAACCTCAGCCACCGTCG
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TCCCCAAAATATCACGGAAGCTCACCGTGAAGTCATCTCTAAAGGACTTCGGAGTCGCGG
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AGATCCCGAGTGGTGTTGACGCGAGCAAGATCTCCATGGACGAGCAAGATCTACTCAACG
CTGCGGGAGAGACGTACGAGGTTGCTTTGATCGAGCCTGGGACTTACAGCTTCTATTGTG
CGCCCCATCAGGGTGCTGGTATGGTCGGTAAAGTCACCGTTAACTAAATAAAGTGTGAAT
GTAAGTGAAAGAGTGTCTCTGAACCAAAGT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RS1GK22TF 641 0 0
G
GACACAAAGATATCAAAAAAAAAAGTAAATCTAAGCCTCTAATATTCTTCATCATGGCCT
CAGTAACCTCAGCCACCGTCGCAATCCCATCGTTCACCGGTCTCAAATCCACGATCTCCA
AACCCTCCGCCATCGTCAGAATCCCCAAAACATCACGGAAGCTCACCGTGAAGTCATCTC
TAAAGGACTTCGGAGTCGCGGCTGTTGCGGCTGCAGCTTCAATCGCTTTGGCTGGAAACG
CCATGGCGATAGATGTTCTCTTGGGATCAGGAGATGGAGCGTTAGCTTCCGTTCCCAACG
AGTTCACAATAGCGAAAGGAGAGAAGATTGTGTTCAAGAACAACGCTGGATTCCCACACA
ATGTTGTGTTCGATGAGGACGAGATCCCGAGTGGTGTTGACGCGAGCAAGATCTCCATGG
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GGACTTACAGCTTCTATTGTGCGCCCCATCAGGGTGCTGGTATGGTCGGTAAAGTCACCG
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CCTTTTTGTAATTCTAAAGAGTGTTGAGTCGAATGGACCG

QA 2 641 2 641
DS 

RD RS1GK22JQ 524 0 0
TGGGATCAGGAGATGGAGCGTTAGCTTCCGTTCCCAACGAGTTCACAATAGCGAAAGGAG
AGAAGATTGTGTTCAAGAACAACGCTGGATTCCCACACAATGTTGTGTTCGATGAGGACG
AGATCCCGAGTGGTGTTGACGCGAGCAAGATCTCCATGGACGAGCAAGATCTACTCAACG
CTGCGGGAGAGACGTACGAGGTTGCTTTGACCGAGCCTGGGACTTACAGCTTCTATTGTG
CGCCCCATCAGGGTGCTGGTATGGTCGGTAAAGTCACCGTTAACTAAATAAAGTGTGAAT
GTAAGTGAAAGAGTGTCTCTGAACCAAAGTAGAGGCTTTCCTTTTTGTAATTCTAAAGAG
TGTTGAGTCGAATGGACCGTGATTTGTTATAGTATGAATGGTTCCATAAGTGCTTTTTTC
CTGGTTTATAAATTGTATGTAGATTTATGTCTCTCCCTATAATTTTCTTAGGAATATGAT
AAACTAAATAGGAAAATAAATGGTAAAAATATGCTGTTTGTGCC

QA 1 524 1 524
DS 



AS 1 3

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AAAATCCTTCACGCACATGTAGTGTCTTCCAGGAGAGGTGTACAAAACTTTGAAGATACA
GAACTCATATGGTCAGAGCCATCGCATAATATATCTTTTTTATGTGACAGTATTCACACG
TCAAATCACTTCTACAAACAACTCTCCTATCACACAAGCTTAGGAGGAGTCGCATATGTT
TCATCAAACAAAATCTATACACGAGTTAAATACCAACGTTCTGGGAAGTCTGACTCTGCT
GAGCTCCACGCTTTCTCAGCTTTGTCAAGAAGTAAGCCAATGCAACCTTTGCACCTAAGG
CGGAGTGACCACGAGACAGGCAAACTGCACTACCAACCGCACCTCCCACGAGTAACAGAC
CCTTTGCTAACTGTTTCTTCGAAGGCTTTGTCAACAGTTTCTTCCTTTTGGCTCCTTCAC
CTGTAATGATAGTTCCCGAGGAGTTTGTGATGTCATCTGTCTGATTCTCTAACTCTGATG
GAATCTTTTGCATTAAGCTAACAGCAGATATAGTGGGCCCTTGGGGTCTATGACTGGCTG
CAATGTACTTACGAAGCGCACTGTCCATCTTACAAACGTAACTCCATATGCCTCTTGAGA
AAGCAAGCTTCGCCATCTCAACATTTAATCCAGCATCTTCCTGGTGAAACATGTGGATCT
CACAAGCATCCCTACCAGGAACTTTCTTGATTCGCCAACCAGATCTGAAATAACTTACAC
GTACATACTTCCTCTGCTGCGGCACCATATTGTGATCACATTCCTTAATGAAACAATAAA
ACTTGTCCGTCCCCTCCCACAACCTCCAAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BI86JQ U 1
AF RS1GJ70JQ U 100
AF RS1DK75JQ U 1
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RD RS1BI86JQ 700 0 0
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DS 

RD RS1GJ70JQ 588 0 0
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TCTGGGAAGTCTGACTCTGCTGAGCTCCACGCTTTCTCAGCTTTGTCAAGAAGTAAGCCA
ATGCAACCTTTGCACCTAAGGCGGAGTGACCACGAGACAGGCAAACTGCACTACCAACCG
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TCTGATTCTCTAACTATGATGGAATCCTTTGCATTAAGCTAACAGCAGATATAGTGGGCC
CTTGGGGTCTATGACTGGCTGCAATGTACTTACGAAGCGCACTGTCCATCTTACAAACGT
AACTCCATATGCCTCTTGAGAAAGCAAGCTTCGCCATCTCAACATTTAATCCAGCATCTT
CCTGGTGGAACATGTGGATCTCACAAGCATCCCTACCAGGAACTTTCT

QA 1 588 1 588
DS 

RD RS1DK75JQ 810 0 0
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TCAAATCACTTCTACAAACAACTCTCCTATCACACAAGCTTAGGAGGAGTCGCATATGTT
TCATCAAACAAAATCTATACACGAGTTAAATACCAACGTTCTGGGAAGTCTGACTCTGCT
GAGCTCCACGCTTTCTCAGCTTTGTCAAGAAGTAAGCCAATGCAACCTTTGCACCTAAGG
CGGAGTGACCACGAGACAGGCAAACTGCACTACCAACCGCACCTCCCACGAGTAGCAGAC
CCTTTGCTAACTGTTTCTTCGAAGGCTTTGTCAACAGTTTCTTCCTTTTGGCTCCTTCAC
CTGTAATGATAGTTCCCGAGGAGTTTGTGATGTCATCTGTCTGATTCTCTAACTCTGATG
GAATCTTTTGCATTAAGCTAACAGCAGATATAGTGGGCCCTTGGGGTCTATGACTGGCTG
CAATGTACTTACGAAGCGCACTGTCCATCTTACAAACGTAACTCCATATGCCTCTTGAGA
AAGCAAGCTTCGCCATCTCAACATTTAATCCAGCATCTTCCTGGTGAAACATGTGGATCT
CACAAGCATCCCTACCAGGAACTTTCTTGATTCGCCAACCAGATCTGAAATAACTTACAC
GTACATACTTCCTCTGCTGCGGCACCATATTGTGATCACATTCCTTAATGAAACAATAAA
ACTTGTCCGTCCCCTCCCACAACCTCCAAG

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DS 



AS 1 3

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CATTCCAAGCGTGGTGGATTCAGAAGATGTCCTTAAGCTTTGCATCACATCTCTTAAAGA
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CGGGATATCGAACATAACAAACATGAAAAGAATTGTGGAGAAGTTTATAAAAGAGAAGAG
ATATAAAAGTAGGCTTATTAAAAAGAAGTTGGAAGTTTGTCTTAACCATTACCAAGATGG
CTATGAGTGGCTAACCTCAGGTTTGAATTACCTCAAAGAGAAGGATCTTGATTTGTCTTC
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CGGAATAAATCCCTTTATTAAAGAGAATGACGTCCTCTACGTAATGACCCATATTCCTTA
CATGATTATTTCTATGGATGATTGTGAGACGAGCAAAGGCGGTTGCACGTAGAGACTTAC
GGGGGGCACGTGCCCCGATCTCTTTTTTTATTTTCCTTCCCTAGTTTACATTGACTTTGT
GAAAGGCTCTCAATTCAAAAGTTAAACATCATGAGAAAATACAATGTGCTCTGTCTCAAT
AATGTTCTACGTCCGCCCCTGGAGACGAGTGCAGTGAGGTGTTAAGTGAGTTCTCATTAA
TCAGTTTTATTTTGTGTGTTAAGGACCTTTATCTTTCAACTTCTCATATCATCCCCTTAT
TATTAATCAAGAAGCAATTTGAAAGAACAACATTTAATGTGTAAACTT


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GZ17TF U 1
AF RS1E702TF U 2
AF RS1GZ17JQ C 374
BS 1 571 RS1GZ17TF
BS 572 628 RS1E702TF
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RD RS1GZ17TF 571 0 0
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CGGGATATCGAACATAACAAACATGAAAAGAATTGTGGAGAAGTTTATAAAAGAGAAGAG
ATATAAAAGTAGGCTTATTAAAAAGAAGTTGGAAGTTTGTCTTAACCATTACCAAGATGG
CTATGAGTGGCTAACCTCAGGTTTGAATTACCTCAAAGAGAAGGATCTTGATTTGTCTTC
AGATGATTTGGGGATGGCAAGTAAGGAAGTAAACGATTGTAGAGAGAGATTCAAAAAAGG
CGGAATAAATCCCTTTATTAAAGAGAATGACGTCCTCTACGTAATGACCCATATTCCTTA
CATGATTATTTCTATGGATGATTGTGAGACG

QA 1 571 1 571
DS 

RD RS1E702TF 749 0 0
GG
AAACAAATACATAATGTTATCGACTTACCTCGTTGTGTTCGTTCTTCTCTTCAGTGGTTT
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TCCAAGCGTGGTGGATTCAGAAGATGTCCTTAAGCTTTGCATCACATCTCTTAAAGAGAA
TCCAGAGACCAAGAAAGTGAGAAATAAGATTGAATTGGCCGTGGTAGGTACGAATAACGG
GATATCGAACATAACAAACATGAAAAGAATTGTGGAGAAGTTTATAAAAGAGAAGAGATA
TAAAAGTAGGCTTATTAAAAAGAAGTTGGAAGTTTGTCTTAACCATTACCAAGATGGCTA
TGAGTGGCTAACCTCAGGTTTGAATTACCTCAAAGAGAAGGATCTTGATTTGTCTTCAGA
TGATTTGGGGATGGCAAGTAAGGAAGTAAACGATTGTAGAGAGAGATTCAAAAAAGGCGA
AATAAATCCCTTTATTAAAGAGAATTACGTCCTCTACGTAATGACCCATATTCCTTACAT
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AGGCTCTCAATTCAAAAGTTAAACATCATGAGAAAATACAATGTGCTCTGTCTCA*TAAT
GTTCTACGTCCGCCCCTGGAGACGAGT

QA 3 749 3 749
DS 

RD RS1GZ17JQ 515 0 0
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ATGGCAAGTAAGGAAGTAAACGATTGTAGAGAGAGATTCAAAAAAGGCGGAATAAATCCC
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ATGGATGATTGTGAGACGAGCAAAGGCGGTTGCACGTAGAGACTTACGGGGGGCACGTGC
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GCAATTTGAAAGAACAACATTTAATGTGTAAACTT

QA 1 515 1 515
DS 



AS 1 3

CO CL3248Contig1 1366 3 11 U
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AGCGGAATTGAGAATAAGTCTTCTATCACGACTGCGAAACCCAAAACTGAATCCGATTTG
GATATGCAAAAGCTTGTGGCTATGTTCAAGAAACTAAATCCATTGGCCAAGGAGTTTTTC
CCTTCTTATTACAATCCCAAGAAGAACAATCAGACAGGAAAAGACAATCAGCTTCTGTCT
GCTGATGATGTAACGGCCACAAAAAAACAATCTGGTGAAGAAGATGATCTTAATGGAAAG
AAAGGTGACAATAACCAGAAGAGAAGAAACAGTTATAGCCAAGGGAGGAGAAGGTTAACT
GGAAGAATTTCTAAGGCTCAGAGAGAGGATAGTATGAGAAGAACGGTCTATGTTTCTGAC
ATTTACCAGAGTGTGACTGAGGAGGGTCTTGCTGGCTTGTTTAGTAACTGTGGACAAGTT
GTTGATTGTCGGATTTGTGGGGATCCACATTCAGTTCTTCGATTTGCGTTTGTCGAGTTT
GCAGATGACCAGGGCGCCCGAGAAGCTTTAAGCCTTGGTGGAACGATGCTCGGGTACTAC
CCGGTGAGGGTCTTGCCCTCCAAAACTGCTATTCTTCCAGTGAATCCCACATTTCTTCCC
AGGTCAGAAGATGAAAGGGAGATGTGTTCAAGGACAATCTATTGCACAAATATCGACAAG
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AGGGTAAGTCCTTCAAAGACACCAGTAAGGCCACGAATCACTCGACCACCGTCTACAAAC
TAGAAAGAGACCCGACTAGCTGGCTTTCCAGAAGAGAGATGATTTCAAACTTCTTTTTTC
GATTCTCTCTTTTTGACGTTTTAGAACAGTTTATCTTCTCCAGTTACATTTGTAACTGGA
AGGTGGGAACCCTTATGGTTCTGTTTTCTGAATTTGGAGTTATTATTAGGCTCTGTCTTT
TCTGACTGAGATACTTCCATCTGTTTCATCATCTTTCTCTAAGGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DW57TF U 435
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ATCAACTGCATT

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ATGGTTCTGTTTTCTGAATTTGGAGTTATTATTAGGCTCTGTCTTTTCTGACTGAGATAC
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DS 



AS 1 3

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AAAGAGAGTGCTTTGGTTTGGCATCATCAAGACGCGGATCCAGACTTTGGATCCTGCCAA
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GGCTAGGGGAAGGTGTTTTCTTCTACCTCCCCCTCCCTTTTGTTTATTCTGTTTGCTTTT
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TAACTGCCATTTTTGACT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H309TF U 1
AF RS1ES29TF U 425
AF RS1H309JQB C 418
BS 1 697 RS1H309TF
BS 698 1041 RS1ES29TF
BS 1042 1158 RS1H309JQB

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TTCTTGGATTATGATGGCACTCTTGTCCCTGAGAGCTCGCTCGTTAAAACCCCTACTGCT
GAAGTGCTTTCTGTTCTGAAATCTCTGTGTGATGATCCTAAAAACACTGTGTTTATCGTC
AGTGGCAGAGGCTGGGAGTCTCTGGGCGATTGGTTATCTCCGTGTGAGAATCTTGGAACA
GCAGCTGAACATGGATACTTCATAAGGTGGAGTAGCAAGAAGGAATGGGAGTGGAAGACA
ATAGTAGAACCGGTTATGAGATCATACATGGACGCAACCGATGGTTCCACTATAGAGTTT
AAAGAGAGTGCTTTGGTTTGGCATCATCAAGACGCGGATCCAGACTTTGGATCCTGCCAA
GCGAAGGAGCTTCTTGATCATTTAGAGAGTGTGCTTGCAAACGAGCCTGTGGTCGTCCAG
AGAGGCCAACACATCGTAGAGGTCAAACCACAGGGAGTAAGTAAAGGTTTGGCCGTGGAG
AAAGTCATACACAGAATGGTGGAGAATGGGATCTCACCTGACATGGTGATGTGTATAGGA
GATGACAGATCAGACGAGGACATGTTTGAGAGCATATTAAACACAGTGACAAACCCTGAC
CTCCCGATGAGACCAGAGATCTTTGCCTGCACGGTGG

QA 1 697 1 697
DS 

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G
GGAGCTTCTTGATCATTTAGAGAGTGTGCTTGCAAACGAGCCTGTGGTCGTCAAGAGAGG
CCAACACATCGTAGAGGTCAAACCACAGGGAGTAAGTAAAGGCTTGGCCGTGGAGAAAGT
CATACACAGAATGGTGGAGAATGGGATCTCACCTGACATGGTGATGTGTATAGGAGATGA
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GATGAGACCAGAGATCTTTGCCTGCACGGTGGGGAGAAAACCAAACAAAGCCAAGTACTT
TTTGGACGATGTCTCTGACGTATTGAAGCTCCTAGAGGGACTGGGTGCTGCGTCGAGCAG
CTCGAAGCCAGAGTATGAACAAACATCCGCATCATCCTCATCCTCATCCTCACATGCACA
TGTGGCGTTTGAGAGCATCATCTGATAAGGAAGAAAAAATGATCATGAAGAAGTGTGTCA
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TATTTTAGAATTGGAG

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DS 

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CAAGCGAA
GGAGCTTCTTGATCATTTAGAGAGTGTGCTTGCAAACGAGCCTGTGGTCGTCCAGAGAGG
CCAACACATCGTAGAGGTCAAACCACAGGGAGTAAGTAAAGGTTTGGCCGTGGAGAAAGT
CATACACAGAATGGTGGAGAATGGGATCTCACCTGACATGGTGATGTGTATAGGAGATGA
CAGATCAGACGAGGACATGTTTGAGAGCATATTAAACACAGTGACAAACCCTGACCTCCC
GATGAGACCAGAGATCTTTGCCTGCACGGTGGGGAGAAAACCAAGCAAAGCCAAGTACTT
TTTGGACGATGTTTCTGACGTATTGAAGCTCCTAGAGGGACTGGGTGCTGCGTCGAGCAG
CTCGAAGCCAGAGTATGAACAAACATCCGCATCATCCTCATCCTCATCCTCACATGCACA
TGTGGCGTTTGAGAGCATCATCTGATAAGGAAGAAAAAATGATCATGAAGAAGTGTGTCA
GTGTGAGTAGCCAAAACCAACATAGAAATGCTTGGGGCGTTGTGTATAATGAAAAGGCTA
GGGGAAGGTGTTTTCTTCTACCTCCCCCTCCCTTTTGTTTATTCTGTTTGCTTTTTGTTT
TATTTTAGAATTGGAGTGTTCAATCTCTTTGTATAGAATATCTTTGAAAGTCTCTATGGT
GGTTTGTATCTAACACGGAACAGAGTAACCATCTTCTGCTGCTATATATTTGGTATAACT
GCCATTTTTGACT

QA 9 741 9 741
DS 



AS 1 2

CO CL3250Contig1 1332 2 4 U
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AATCAAACGGCCAGAAATGATTATACCTGAATCGGGTCATTCGGCTTATGATAAGGCGGC
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GAAGGCAATGAGAAGGCATATTAACAGAAACACCATCATGATTGTTGGATCAGCACCAGG
ATTCCCTCATGGCATCATTGATCCTATTGAGGAGCTTGGTCAACTGGCTTTTAGCTATGG
AATATGCTTCCATGTTGACCTTTGCCTTGGTGGTTTTGTGTTACCTTTCGCTCGTAAACT
TGGGTACCAGATCCCAGCATTTGATTTTTCTGTAAAAGGAGTCACTTCAATCTCGGTGGA
CGTGCATAAATATGGTTTGGCTCCTAAAGGAACTAGTACAGTTCTCTACAGAAATCATGA
GATCAGAAAGCACCAATTTGTTGCTGTAACTGAATGGTCAGGAGGACTATACGTGTCTCC
AACTATAGCTGGGAGTAGGCCTGGTTCTTTGGTTGCTGGTGCTTGGGCTGCCATGATGTC
TCTCGGCGAAGAAGGCTATCTAGAAAACACAGGAAAGATAATGGAAGCATCAAAGAGACT
AGAGGAAGGAGTAAGAGGAATCAGTGAACTGTTTGTAGTTGGAAAGCCAGATATGACAAT
CGTGGCGTTTGGTTCTAAAGCATTAGATATCTTTGAGGTTAATGACATCATGTCTTCAAA
AGGTTGGCATCTGAATGCACTACAGAGACCCAACAGCATTCATATATGTGTAACTCTTCA
ACACGTCCCTGTGGTCGATGACTTCCTCCAGGATCTGCGTGAGGCTGTTGAAACTGTGAA
AGCAAACCCAGGACCGATCACAGGTGGCTTGGCTCCAATATATGGAGCAGCTGGGAAGAT
GCCGGACCGAGGGATGGTGAATGAGCTTCTTGTTAGTTTCATGGACAGCCAATACTAGTC
AAGTTTCTTTTCCAAGGATTGAGTAAATTGATGATTATCACATTTTCAAGTTGCAAGAGG
CAAAAACACTGTACATTCACAACCTGATTGTTTGGTGGTCTGTCCTACTTAAATTTCATC
ACACTTTATAACAAAAAAAAAACTCATTTCGTTACATTACACATTCAGAAAAAGAAATAA
TAAAGATTGATC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H385TF U 1
AF RS1DQ88JQ C 609
BS 1 641 RS1H385TF
BS 642 642 RS1DQ88JQ
BS 643 670 RS1H385TF
BS 671 1332 RS1DQ88JQ

RD RS1H385TF 670 0 0
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AATCAAACGGCCAGAAATGATTATACCTGAATCGGGTCATTCGGCTTATGATAAGGCGGC
TCAGTATTTTAACATCAAGTTGTGGCGAGTTCCAGTAGGCAAAGACTTCCGAGCTGATGT
GAAGGCAATGAGAAGGCATATTAACAGAAACACCATCATGATTGTTGGATCAGCACCAGG
ATTCCCTCATGGCATCATTGATCCTATTGAGGAGCTTGGTCAACTGGCTTTTAGCTATGG
AATATGCTTCCATGTTGACCTTTGCCTTGGTGGTTTTGTGTTACCTTTCGCTCGTAAACT
TGGGTACCAGATCCCAGCATTTGATTTTTCTGTAAAAGGAGTCACTTCAATCTCGGTGGA
CGTGCATAAATATGGTTTGGCTCCTAAAGGAACTAGTACAGTTCTCTACAGAAATCATGA
GATCAGAAAGCACCAATTTGTTGCTGTAACTGAATGGTCAG*AGGACTATACGTGTCTCC
AACTATAGCT

QA 1 670 1 670
DS 

RD RS1DQ88JQ 724 0 0
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CTGGGAGTAGGCCTGGTTCTTTGGTTGCTGGTGCTTGGGCTGCCATGATGTCTCTCGGCG
AAGAAGGCTATCTAGAAAACACAGGAAAGATAATGGAAGCATCAAAGAGACTAGAGGAAG
GAGTAAGAGGAATCAGTGAACTGTTTGTAGTTGGAAAGCCAGATATGACAATCGTGGCGT
TTGGTTCTAAAGCATTAGATATCTTTGAGGTTAATGACATCATGTCTTCAAAAGGTTGGC
ATCTGAATGCACTACAGAGACCCAACAGCATTCATATATGTGTAACTCTTCAACACGTCC
CTGTGGTCGATGACTTCCTCCAGGATCTGCGTGAGGCTGTTGAAACTGTGAAAGCAAACC
CAGGACCGATCACAGGTGGCTTGGCTCCAATATATGGAGCAGCTGGGAAGATGCCGGACC
GAGGGATGGTGAATGAGCTTCTTGTTAGTTTCATGGACAGCCAATACTAGTCAAGTTTCT
TTTCCAAGGATTGAGTAAATTGATGATTATCACATTTTCAAGTTGCAAGAGGCAAAAACA
CTGTACATTCACAACCTGATTGTTTGGTGGTCTGTCCTACTTAAATTTCATCACACTTTA
TAACAAAAAAAAAACTCATTTCGTTACATTACACATTCAGAAAAAGAAATAATAAAGATT
GATC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL3251Contig1 1001 2 4 U
GTACACAAAACTTTTATTAAAAATAGCACTTAATGTAAACATTATTGTTTTCACGTTTTA
AGCAAGTGTTATAATATTAACAATGCCTGTCATATGGTTCACATGAAGCTATCAAAAACA
TTACATAGCACAAAGTATTACATACTGAAACTAGGTAAAAACACCCAGAAGAAAAGGTTT
ATTGAGATGCACAACAAAGACTGTTTTTATAATCTCCTGTAACTGTGAGTCTCTCTGTTT
TCTAACCCACCGATCCTTCAAGCTTGATGCTCATAAGCTGGTTAACTTCGGCTCCAAACT
CATCAGGCAGATTGTTGAAAACATCTCTGCAGAACCCAGAGATCATCGCCACTAACGCTC
TCTCATGATCAATTCCTCTCTGCTGGAAATAGAAAAGCTGATCTTCTCCAATCTTCGAAG
TACTCGCTTCATGCTCAACTTTCGCCGATGGGTTCTTAACCTGGATGTAAGGATAGGTAT
TAGCAGCTGCTTTGTCACCAATAAGCATAGAGTCACAAACCGAAGTGTTCTTAGCATTCT
CAGCTTTGGACTGAACCTGAACAAGACCACGGTAACAGTTCCTCGAGTTCCCAGCCGAGA
TACCTTTCGAAATGATCCTACTCTTCGTGTTCTTCCCTTTATGAATCATCTTAGTCCCCG
TATCCGCCCGCTGATAGTTATTCGTCAACGCCACAGAGTAAAACTCCCCAACAGAATCAC
CACCTTCCAGAACAACACTCGGATACTTCCACGTGATCGCCGACCCCGTCTCCACCTGCG
TCCACGAGATCTTGGACCTGTCTCCAGCGCAAAGACCACGCTTCGTGACGAAATTGTAAA
TCCCTCCTCTCCCTTCCTCGTCCCCCGCGTACCAGTTCTGCACAGTGGAGTACTTAATCT
CAGCTCCTTCCCCACAGTAGAGCTCAACAACCGCCGCGTGAAGCTGATTCGTGTCGTAAG
AAGGAGCGGTACACCCTTCAAGATACTCAACGAAGCTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BR06JQ U 1
AF RS1BP48TF C 295
BS 1 652 RS1BR06JQ
BS 653 653 RS1BP48TF
BS 654 812 RS1BR06JQ
BS 813 1001 RS1BP48TF

RD RS1BR06JQ 812 0 0
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TTACATAGCACAAAGTATTACATACTGAAACTAGGTAAAAACACCCAGAAGAAAAGGTTT
ATTGAGATGCACAACAAAGACTGTTTTTATAATCTCCTGTAACTGTGAGTCTCTCTGTTT
TCTAACCCACCGATCCTTCAAGCTTGATGCTCATAAGCTGGTTAACTTCGGCTCCAAACT
CATCAGGCAGATTGTTGAAAACATCTCTGCAGAACCCAGAGATCATCGCCACTAACGCTC
TCTCATGATCAATTCCTCTCTGCTGGAAATAGAAAAGCTGATCTTCTCCAATCTTCGAAG
TACTCGCTTCATGCTCAACTTTCGCCGATGGGTTCTTAACCTGGATGTAAGGATAGGTAT
TAGCAGCTGCTTTGTCACCAATAAGCATAGAGTCACAAACCGAAGTGTTCTTAGCATTCT
CAGCTTTGGACTGAACCTGAACAAGACCACGGTAACAGTTCCTCGAGTTCCCAGCCGAGA
TACCTTTCGAAATGATCCTACTCTTCGTGTTCTTCCCTTTATGAATCATCTTCGTCCCCG
TATCCGCCCGCTGATAGTTATTCGTCAACGCCACAGAGTAAAACTCCCCAACAGAATCAC
CACCTTCCAGAACAACACTCGGATACTTCCACGTGATCGCCGACCCCGTCTCCACCTGCG
TCCACGAGATCTTGGACCTGTCTCCAGCGCAA

QA 1 812 1 812
DS 

RD RS1BP48TF 707 0 0
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ACGCTCTCTCATGATCAATTCCTCTCTGCTGGAAATAGAAAAGCTGATCTTCTCCAATCT
TCGAAGTACTCGCTTCATGCTCAACTTTCGCCGATGGGTTCTTAACCTGGATGTAAGGAT
AGGTATTAGCAGCTGCTTTGTCACCAATAAGCATAGAGTCACAAACCGAAGTGTTCTTAG
CATTCTCAGCTTTGGACTGAACCTGAACAAGACCACGGTAACAGTTCCTCGAGTTCCCCG
CCGAGATACCTTTCGAAATGATCCTACTCTTCGTGTTCTTCCCTTTATGAATCATCTTAG
TCCCCGTATCCGCCTGCTGATAGTTATTCGTCAACGCCACAGAGTAAAACTCCCCAACAG
AATCATCACCTTCCAGAACAACACTCGGATACTTCCACGTGATCGCCGACCCCGTCTCCA
CCTGCGTCCACGAGATCTTGGACCTGTCTCCAGCGCAAAGACCACGCTTCGTGACGAAAT
TGTAAATCCCTCCTCTCCCTTCCTCGTCCCCCGCGTACCAGTTCTGCACAGTGGAGTACT
TAATCTCAGCTCCTTCCCCACAGTAGAGCTCAACAACCGCCGCGTGAAGCTGATTCGTGT
CGTAAGAAGGAGCGGTACACCCTTCAAGATACTCAACGAAGCTCCCC

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 3

CO CL3252Contig1 1085 3 7 U
GCTTAGAATTTTCTTATTCTTTAGTTAGGTTAGGAAAAATGTTCCGTCCTTTTTAAATCA
TAATCTTTTCATTATACATAATTAAGATCTTTAAGAAAAAAATACATAGCCAAAAATAGA
TGAATAAATACTGCATTTCGCTCTAACCATTATTCTATTTCTCTGAATTGTCATTACCTA
AATTGTCATATTTTCAAGGAAGCTTGAACAGTAATGCCACTTGCACCTAACTCCGTGGAT
ATGTAACACTATCACTCTTATTTGATATGAGCAAAGAATTAATCATATTTATAATCAAGC
ATGAGTTTGTTGCTTCATACTTTTTGTTTTGTTTCCTTGATGTATCTTTCAAACAAAAAA
TACCCCTCCTCCTACTTAAATAAAAATTTCCAATCAAACGTGGTTGCTTTCTTAGCAAGC
TACTACCGAGGACTCTGGTAAGACTCAGGGAACCATCTCTGAAGAAGCCGATGTTTTAGT
TTTACCAACAAGGCAAAGGCTCCATAGCATGGCAAATGCATCACTGCAACTGAGAAATAC
CATAGTGGAGCATAGTGTGATGATAAGTCCAGGAAAGGGTAAGGCCACCATACACGGACT
AATGAGTGGAGAGTCCATTGGAATAAAACATAAGCTATAGTCCAAGAGAAGAAGTAAGCA
ATTCTGAAGCATGGAAAGCTCAAAGAATTCAAAGCAGCATCACCAAGCAAGAAAATGGCG
CTAAGAGAGTGCATGTTGATCACCAAAACATTGAGGCTATAATCATGGATCTCAA*GGAA
AGGAACAAGGATGAACCAGAACACACAGTCAGTGAGCAAAACTGCACCTGCATTCATCTG
AAAAATTATTTGGAAAACATATCCCCAAAAATTAGCAGGATTGCTAGAGTATTGACTCTG
TTGATGGGTATGATCAGAGCCTTTGGATCTTGCCCTCTCTGAGTCTATGGCTTCAATGCT
ATCTACTCTATCACCAGCCGCTCTTTTGTTGTATTTGTAGCATCCATGCAGCGAAAGAAG
AGAACCTAGTCCAAAATAGAGTGTGATCAAAGCAAAAGTCCACTGTGTATAGTAGAAGAA
GATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RS1AE37JQ U 1
AF RS1DR41JQ U 269
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AGGAACAAGGATGA

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DS 

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TCCAATCAAACGTGGTTGCTTTCTTAGCAAGCTACTACCGAGGACTCTGGTAAGACTCAG
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CATAAGCTATAGTCCAAGAGAAGAAGTAAGCAATTCTGAAGCATGGAAAGCTCAAAGAAT
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TCAGTGAGCAAAACTGCACCTGCATTCATCTGAAAAATTATTTGGAAAACATATCCCCAA
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CTTGCCCTCTCTGAGTCTATGGCTTCAATGCTATCTACTCTATCACCAGCCGCTCTTTTG
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DS 

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DS 



AS 1 3

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CAAAAGCTACAATGACTAAAATTATAAAAGAGATGTTACCAGCGGATGTTCGTGTTGCTA
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AAGCGCTTCAGGTTCTTGGCTTTGGGGAATACGTTGAAGAAGTCTACGCTGCTTATGAGC
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AGATGACGGAGGAGGAAGCAGCGGCGGAACAGCAGAGAATGTTTGCCGAAGCTCGAGCGA
GAATGAATGGTGGTGTTTCTATTCCTCAACCAGATCAAGAACAACAAGTAGATGATAATA
CCCAACAGTCGAATCTACAAAGCTAATCAAGAAGAAAGGGAGAATCCTTTGTTTTTAACA
TTATCATTTTGACTTCATTTTTCTAGCGTTTCTTTGTAAAGTGCCAAAAAAAAACATGGT
CCGTCTTGGTGTTGATATGCTTTCCACATTTTAACTTAGATTTGTTTTTTTTTTCTCTTT
TGAATTTAAAATCACTTGTGATTCAGATGTAATTAGTAAGCATTCCCTTGTTTTTTGCAA
CTGTCAGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GT

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GGCT
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CAAGATCTTCTCATCGAGTGTTGTGTAGAGTTTATAAATCTGATATCGTCAGAGTCTAAT
GAAGTGTGTAACAAAGAGGATAAACGAACAATCGCGCCTGAGCATGTGCTCAAAGCGCTT
CAGGTTCTTGGCTTTGGGGAATACGTTGAAGAAGTTTACGCTGCTTATGAGCAACATAAA
TACGAAACCATGCAAGATTCACAGAGGAGTGTGAAGGTGAACAGCGGAGCAGAGATGACG
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GGTGGTGTTTCTATTCCTCAACCAGATCAAGAACAACAAGTAGATGATAATACCCAACAG
TCGAATCTACAAAGCTAATCAAGAAGAAAGGGAGAATCCTTTGTTTTTAACATTATCATT
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GTGTTGATATGCTTTCCACATTTTAACTTAGATTTGTTTTTTTTTTTTCTTTTGAATTTA
AAATCACTTGTGATTCAGATGTAATTAGTAAGCATTCCCTTGTTTTTTGCAACTGTCAGA
TC

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 3

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TTCAGAAAATCAACAGAAGAGCCAAAACTCTTTCGTTGCATTTTTAATAGTTTTAAACTT
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BS76JQ U 138
AF RS1C502JQ U 1
AF RS1C502TF C 220
BS 1 183 RS1C502JQ
BS 184 184 RS1BS76JQ
BS 185 201 RS1C502JQ
BS 202 202 RS1BS76JQ
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BS 286 286 RS1BS76JQ
BS 287 624 RS1C502JQ
BS 625 910 RS1C502TF

RD RS1BS76JQ 317 0 0
TTCCATGTATATACGAGTAAACCATATAATTTTAAAAATTAATTTCAGAAAATCAACAGA
AGAGCCAAAACTCTTTCGTTGCATTTTTAATAGTTTTAAACTTAGGCACCAGCGTAAGGG
TTAGCAGGTTTAGGGGTGTTTTTGACGAGACCACATTGGAGGCTTGTCTCGGGCATGTTG
TATTCATCTCTAAGTGATTTCTCTGGAGACAAGACGCTGACGTAAAGCTGCTGTCCTAAG
TAACGTCTCTCTGTGTTCTCAGAACGAACGTTCCACATTCCACAGTTATCAAATGTGAGC
AAGATTGCTGCCCAGCA

QA 1 317 1 317
DS 

RD RS1C502JQ 624 0 0
CTTTTGCTTATTTCATCAAGATTATGGATACATTACATATTTGTTACAAAAAGTGAAGAA
ACAAAAAAACAAAGAGAAGACTAATGCTTCTTGAAAAGAAAAAAAGTTACTTAAGGTAGA
CATAAAATACATGTCAATTCCATGTATATACGAGTAAACCATATAATTTTAAAAATTAAT
TTCGGAAAATCAACAGAAGAGTCAAAACTCTTTCGTTGCATTTTTAATAGTTTTAAACTT
AGGCACCAGCGTAAGGGTTAGCAGGTTTAGGTGTGTTTTTGACGAAACCACATTGGAGGC
TTGTCTCGGGCATGTTGTATTCATCTCTAAGTGATTTCTCTGGAGACAAGACGCTGACGT
AAAGTTGCTGTCCTAAGTAACGTCTCTCTGTGTTCTCAGATCGAACGTTCAACATTCCAC
AGTTATCAAATGTGAGCAAGATTGCTGCCCAGCACTTCGGGTAGACTTGAACTGTGTGTC
TGCTCACTGCATCCAAGAGGTTGTAGTTCTTCCTCTTCTCTGGGGTCCAAGTCCCTGGCT
CAACAGCAACGGAGAAGAAAGAATAACCGTCCAAGTGCCAAGACTGAACACTCTTCTCGT
GGTTCTCGAACACCACCTCGATGA

QA 1 624 1 624
DS 

RD RS1C502TF 691 0 0
CA
TTTTAATAGTTT*AAACTTAGGCACCAGCGTAAGGGTTAGCAGGTTTAGGTGTGTTTTTG
ACGAGACCACATTGGAGGCTTGTCTCGGGCATGTTGTATTCATCTCTAAGTGATTTCTCT
GGAGACAAGACGCTGACGTAAAGTTGCTGTCCTAAGTAACGTCTCTCTGTGTTCTCAGAT
CGAACGTTCAACATTCCACAGTTATCAAATGTGAGCAAGATTGCTGCCCAGCACTTCGGG
TAGACTTGAACTGTGTGTCTGCTCACTGCATCCAAGAGGTTGTAGTTCTTCCTCTTCTCT
GGGGTCCAAGTCCCTGGCTCAACAGCAACGGAGAAGAAAGAATAACCGTCCAAGTGCCAA
GACTGAACACTCTTCTCGTGGTTCTCGAACACCACCTCGATGAAGGTGCGGTGAGTGATG
TTAAGAACGTTAGGCTCGACCTTGATGGTCTTGATCTGTTCCAGAGTCGGGTCATCGGTG
ATGGTATCATACTTAAACACCTTGTCGGAAATACCAAAGTACTCGGCGAGCTTTAGTGGG
GTTTCAGGGTCAGTGTGGGAGACTCCGTTCAATGCGTACCTAAGCTTGCCATCGACCTTG
GCCTGAGTGTTCACGAGCTTGATTGTGCGTGTGATGTTGATCTTTCCATAATGGTAAGAT
CCCTGAGGGTTAGGCCTGGCTGCACTAGC

QA 3 691 3 691
DS 



AS 1 3

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AATGACCTTACAATATATAACGCAGCAGGTAATAGTTCAATT*CTAA**AGGATAAGAAT
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GTAGAGTGATGGGTCTCAAGACACGAGAGGGCTAAAGGGATTAGAGGCTGTAGCGTTGGG
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TGTGTGAAGCTTGATGTTCACCAGCTTTCCAGCTATCATTCTCCATGTCAAGTCTTCCGG
ACCTAATGGCTGAGCAGGGCTGGAATATAGGAAATGCCGCGAGTATTGAGCAAGGCTGTT
CTGGAATTTTTTGACTCGGGAAGGTGTGAGGCTTCTTAAATGATTGATAAGCCACCCTGG
TTGTATTGCATCACTAGAAGAAACGATCACAGCAACCTTCTTGTAATCAAGTATTCCTTC
AAATGGAAGTTCCAACTCGTCACTGACTATAACAGGTATACATCCACTGACTATGGCATC
AAACAATCTCGCCGAGGATGGTGTGTCACCAGCCGGACACAAACAGAATAAAGATCTACG
CATGCCTTCCTGAGCTGCCAATTTACCTCCCTCTCCGGCAGTCCCCTCAGTGATGATTAC
ATCCTTGACACCACTTAGTTCTGCACCAAGCTTGGCACGTATTTTCCCTCCAGCGTTCCT
CTTAAGCCGCCCTCGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H238JQB U 1
AF RS1H238TF C 19
AF RS1AY11JQ U 66
BS 1 183 RS1H238JQB
BS 184 184 RS1AY11JQ
BS 185 223 RS1H238JQB
BS 224 224 RS1AY11JQ
BS 225 373 RS1H238JQB
BS 374 374 RS1AY11JQ
BS 375 612 RS1H238JQB
BS 613 797 RS1AY11JQ

RD RS1H238JQB 612 0 0
AGGACATACCCAGTCTTAAAAACCATTAAGATTCATAACATTTCGACATGGCTAAAGTTG
AATGACCTTACAATATATAACGCAGCAGGTAATAGTTCAATT*CTAA**AGGATAAGAAT
TTCAAACAGTCTTGACCTTGAGTATACATATCCAGTGGATTTTAAGACTGAAAATGTGAA
GTAAAGTGATGGGTCTCAAGACACGAGAGGGCTAAAGGGATTAAAGGCTGTAGCGTTGGG
TCTCCAGCAATCACATCTGCAAATAGTCCTAGATCCTTTAACAACCCGCTGTGACCTCCT
TGTGTGAAGCTTGATGTTCACCAGCTTTCCAGCTATCATTCTCCATGTCAAGTCTTCCGG
ACCTAATGGCTGAACAGGGCTGGAATATAGGAAATGCCGCGAGTATTGAGCAAGGCTGTT
CTGGAATTTTTTGACTCGGGAAGGTGTGAGGCTTCTTAAATGATTGATAAGCCACCCTGG
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AAATGGAAGTTCCAACTCGTCACTGACTATAACAGGTATACATCCACTGACTATGGCATC
AAACAATCTCGC

QA 1 612 1 612
DS 

RD RS1H238TF 701 0 0
G
AAACCATTAAGATTCATAACATTTCGACATGGCTAAAGTTGAATGACTTTACAATATATA
ACGCAGCAGGTAATAGTTCAATT*CTAA**AGGATAAGAATTTCAAACAGTCTTGAC*TT
GAGTATACATATCCAGTGGATTTTAAGACTGAAAATGTGAAGTAGAGTGATGGGTCTCAA
GACACGAGAGGGCTAAAGGGATTAGAGGCTGTAGCGTTGGGTCTCCAGCAATCACATCTG
CAAATAGTCCTAGATCCTTTAACAACCCGCTGTGACCTCCTTGTGTGAAGCTTGATGTTC
ACCAGCTTTCCAGCTATCATTCTCCATGTCAAGTCTTCCGGACCTAATGGCTGAGCAGGG
CTGGAATATAGGAAATGCCGCGAGTATTGAGCAAGGCTGTTCTGGAATTTTTTGACTCGG
GAAGGTGTGAGGCTTCTTAAATGATTGATAAGCCACCCTGGTTGTATTGCATCACTAGAA
GAAACGATCACAGCAACCTTCTTGTAATCAAGTATTCCTTCAAATGGAAGTTCCAACTCG
TCACTGACTATAACAGGTATACATCCACTGACTATGGCATCAAACAATCTCGCCGAGGAT
GGTGTGTCACCAGCCGGACACGAACAGAATAAAGATCTACGCATGCCTTCCTGAGCTGCC
AATTTACCTCCCTCTCCGGCAGTCCCCTCGGTGATGATT
C

QA 2 700 2 700
DS 

RD RS1AY11JQ 732 0 0
CC
TTACAATATATAACGCAGCAAGTAATAGTTCAATTTCTAATTAGGATAAGAATCTCAAAC
AGTCTTGACCTTGAGTATACATATCCAGTGGATTTTAAGACTGAAAATGTGAAGTGGAGT
GATGGGTCTCAAGACACGAGAGGACTCAAGGGATTAGAGGCTGTAGCGTTGGGTCTCCAG
CAATCACATCTGCAAATAGTCCTAGATCCTTTAACAACCCGCTGTGACCTCCTTGTGTGA
AGCTTGATGTTCACCAGCTTTCCAGCTATCATTCTCCATGTCAAGTCTTCCGGACCTAAT
GGCTGAGCAGGGCTGGAATATAGGAAATGCCGCGAGTATTGAGCGAGGCTGTTCTGGAAT
TTTTTGACTCGGGAAGGTGTGAGGCTTCTTAAATGATTGATAAGCCACCCTGGTTGTATT
GCATCACTAGAAGAAACGATCACAGCAACCTTCTTGTAATCAAGTATTCCTTCAAATGGA
AGTTCCAACTCGTCACTGACTATAACAGGTATACATCCACTGACTATGGCATCAAACAAT
CTCGCCGAGGATGGTGTGTCACCAGCCGGACACAAACAGAATAAAGATCTACGCATGCCT
TCCTGAGCTGCCAATTTACCTCCCTCTCCGGCAGTCCCCTCAGTGATGATTACATCCTTG
ACACCACTTAGTTCTGCACCAAGCTTGGCACGTATTTTCCCTCCAGCGTTCCTCTTAAGC
CGCCCTCGGA

QA 3 732 3 732
DS 



AS 1 3

CO CL3256Contig1 763 3 10 U
GTGAGGTTCTTCATTCCCATTCAATCTCTCTGTTCCTCAAAGCTTTACAAAAACATGTCG
GACGAAGAGCACCACTTCGAGTCCAGCGACGCCGGAGCTTCCAAGACCTACCCTCAGCAG
GCTGGTAACATCCGTAAAGGTGGTCACATCGTCATCAAGGGCCGTCCCTGCAAGGTTGTT
GAGGTTTCTACTTCAAAGACTGGGAAGCACGGTCACGCTAAGTGTCACTTTGTTGCAATT
GATATCTTCACTGCTAAGAAGCTTGAGGATATTGTTCCCTCTTCCCACAATTGTGATGTT
CCACATGTGAACCGTATTGATTACCAGCT*ATTGATATCTCTGAGGATGGCTTTGTTAGC
CTTTTGACCGACAGTGGTGGCACTAAGGATGACCTCAAGATGCCCACCGATGACAATCTA
AGCGCTCTGATGAAGAGTGGATTCGAGGAGGGAAAGGATGTTGTGGTGTCTGTCATGTCT
TCAATGGGAGAGGAGCAGATCTGTGCCGTCAAGGAAGTTGGTGGTGGCAAGTAAACAAAT
TATCATTCTCTCTACACGGAGGATAATCTTATTACCCCCAGTTGTTATAAGAACAAAACA
AAAAAACATGTTTTTCCTTTTTTCTAATTTTAGACCATTTGTGTGTTTTTACTTGTTGCA
AGACACAACCATTATCTATTGGTTTTGGATTGTTTAAAA*TTTGGTGTTTTAATCATAGG
AAGTGGTTCCTATGATATATTCTTAATCCCTTTGCTTATTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AAAAAACATGTTTTTCCTTTTTTCTAATTTTAGACCATTTGTGTGTTTTTACTTGTTGCA
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TAATC

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DS 

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DS 

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AATCATAGGAAGTGGTTCCTATGATATATTCTTAATCCCTTTGCTTATTATC

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DS 



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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D128TF U 1
AF RS1CT63TF U 606
AF RS1D128JQ C 1039
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GGAAAATTTAAATCTCTCTGGTCTGATCCGTAGCTCATGTTAAACTAGATTCGCGCTTTG
TGTTCCAAATGCCGAGATTCGCATTTTCTCTGCTTTCTCATATCTGAGATTTGGTTTCCA
TTGGGAAATCTGTTGCGCGAGTGCGGGATACTTCCGTGTTATTTGATGATGTCAGCATTG
TGACTATTAAACAACTGTGACTATCGCATCAACTAGCATTATCTACCGATGGCAAAGATG
ATAAACAAGACGCTTTTGCTAACGTACAGCTACTTACTCATCTACATTCTACTCTCTTCT
GGCGTTATTTTCTACAACAAGTGGGTTCTATCTCCCAAATACTTCAACTTTCCTCTTCCT
ATAACATTGACTATGATCCACATGGGCTTTTCTGGCTTTGTCGCCTTCCTTCTCATTCGT
GTTTTCAAGGTTGTCTCTCCTGTTAAAATGACATTCGAAATATACGTAACATGTGTGGTA
CCTATAAGCGCATTCTTTGCATCCAGCCTCTGGTTTGGCAATACTGCTTACTTGCACATC
TCTGTTGCCTTCATTCAGATGCTCAAAGCACTCATGCC

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DS 

RD RS1CT63TF 690 0 0
G
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GCCTTCATTCAGATGCTCAAAGCACTCATGCCTGTAGCAACCTTTATCATGGCCGTTGTT
TGTGGCACTGACAAGGCAAGGTGCGACGTGTTCATGAACATGCTTCTGGTCAGTGTTGGA
GTTGTGGGTTCCTCCTATGGCGAAATTAATTTCAACGTAATCGGGACCGTCTACCAGGTC
ACCGGCATCTTTGCTGAAGCACTTAGACTGGTCCTAACTCAAGTTCTTCTTCAGAAAAAG
GGCTTGACGCTAAACCCTGTCACCAGCTTATACTATATAGCCCCTTGCAGCTTTGTTTTC
CTGTCCTTGCCTTGGTATGTACTGGAGAAACCAAACATAGAAGTCTCTCAGATCCAATTC
AACTTCTGGATCTTCTTCTCTAACGCTCTCTGCGCACTTGCCTTAAACTTCTCCATATTC
TTAGTCATCGGAAGAACGGGAGCAGTAACCATCAGGGTTGCTGGCGTTCTCAAAGACTGG
ATTCTCATAGCCCTCTCCACTGTCATATTCCCTGAATCCACCATCACTGGTCTCAACATT
ATCGGATACGCAATAGCACTCTGTGGGGGTGTAATGTACAATTACATAAAAATTAAAGAT
GTGAAAGCGACTCAACCA*TCACTGATAG

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AGAACGGGAGCAGTAACCATCAGGGTTGCTGGCGTTCTCAAAGACTGGATTTTCATAGCC
CTCTCCACTGTCATATTCCCTGAATCCACCATCACTGGTCTCAACATTATCGGATACGCA
ATAGCACTCTGTGGGGTTGTAATGTACAATTACATAAAAATTAAAGATGTGAAAGCGACT
CAACCAATCACTGATAGCCTCCCAGATCGAATCACCAAGGATTGGAAGGCGAAGAGCTCG
TCGGATGGAGAGAGCCCCAGAGGAATAGAGCTTATTGATGAGGAAGCTCCTTTGATAACG
TCGCGGTTGTCGCATATCGGGCGGACTCAGCTTGGAACTCACACTGCCGTCTGAGCAACG
TACAGATGTGAATGAGGCCAGTATGTTGTGTCTTTCTTTTTATCTCCTTGGAACCCAACC
TTTTTTCATAGAATTTACGTCGGTTTATTATTACTTAACAATGTTTAGTTCTTATAAGAA
AAACCCAATTGCC

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 2

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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GB31JQ C 1
AF RS1GB31TF U 1
BS 1 270 RS1GB31TF

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TGAAATAATGAATCTTGAAAGTTAAAACAATTCCATTTCTCGCATTTGTCAAAAGAACCA
CAAGTTATTAATCAATATCTGTAAACTTAC

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DS 

RD RS1GB31TF 270 0 0
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ACGGGACATGAAGTTACTTCCGGGTTTTCACAGCTTATGGAGGGTCAAACCAGAAATTAG
CAAGACGGGGACAAGTGGAAACCCCGATGATATCATAGCAGAACATCTGTCTTCAAGAGC
TGAAATAATGAATCTTGAAAGTTAAAACAATTCCATTTCTCGCATTTGTCAAAAGAACCA
CAAGTTATTAATCAATATCTGTAAACTTAC

QA 1 270 1 270
DS 



AS 1 3

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TTCTTCTCCAACGCATCCTTCACAAGAAACTTTAGCCTCCACAGTGTTGGTTCGTCCAGT
ACGTCCATCTCAATCGTCACTACCTCTGCTTTAGTTTGGAATCTAGGATCAGCCTGAGCA
ACTACACCCAACACTTTCTGTAGCTCATCCGGAGACAGTTTCAAGAATGCCAACCCAATA
TTACGTTTCTCCTCGCTTGTAATTTTCCTGCATCTTCCCACAACTACCTGCCTTAGCTTC
TCCAGCTCGTCATTAACATTGCAAATCTCATTGCTCAAATCTCTAGTTGTTTTGGTATGA
GATGCTTCTTTTGCTAGCAGCGCCTCCATTGCTGCTTGCTTCTCCTCTTCCTCCCGTATT
TTCTCCTCTTCTTGAACTTTTGGAAGGAAGTGTGTCCATTTCTCCTCAAACTTTGCCAGT
AATGTCTTGGCCATAGAGTAAACATCACTACCTTCTTCATTATACTTCATAGCGTTCTCA
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GCCTCCATTTGATTCTTTATCGTGCTGAAGTCCATTGGCTCGTCAATAACCTCATAGTAG
TCATCAAGACCAAGACTTTCTACATCGACAGGATGCATAAAAGGCCAAGCGCACTTGTGC
TGGGTTATCTGACGGAAGATAGTACCGAACTGACGCATGAGGTCATGCATCCTCTTAGCA
GCAACGGCTTCTCTACGGGCAACCTCTTGTTGGACCTTCCTGATCCCAACAACGTGTCTA
GAGGAGGCAGAGGAGGGGGAAGAGTTTGAGACGGCATGGTCGAGTAAAACTCCTCTACTT
GTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1GB09JQ U 8
AF RS1EK69JQ U 1
AF RS1GB09TF C 477
BS 1 170 RS1EK69JQ
BS 171 171 RS1GB09JQ
BS 172 764 RS1EK69JQ
BS 765 1084 RS1GB09TF

RD RS1GB09JQ 617 0 0
AAAATTTTTGATTAGTAAAATTCAAACAGTAGAAGCTAGTTTTGTT*CTGATGATATATA
CAAGGATTGCAGAACATTCAGACAAAGAGAAGATGTTCTTGTTTGTGGATCACAAGCATG
GCCGCTTTGTTCTTCTTTCTGCTAACTTGTTCACCGCGTTTCGATTTTTAGAAACCTCAT
TGTTTTGTTTTGTCCCTCTACATTCTTCTGTCTTTATTGTCTCTTCTTTCTTCTTCTTCT
CCAACGCATCCTTCACAAGAAACTTTAGCCTCCACAGTGTTGGTTCGTCCAGTACGTCCA
TCTCAATCGTCACTACTTCTGCTTTAGTTTGGAATCTAGGATCAGCCTGAGCAACTACAC
CCAACACTTTCTGTAGCTCATCCGGAGACAGTTTCAAGAATGCCAACCCAATATTACGTT
TCTCCTCGCTTGTAATTTTCCTGCATCTTCCCACAACTACCTGCCTTAGCTTCTCCAGCT
CGTCATTAACATTGCAAATCTCATTGCTCAAATCTCTAGTTGTTTTGGTATGAGATGCTT
CTTTTGCTAGCAGCGCCTCCATTGCTGCTTGCTTCTCCTCTTCCTCCCGTATTTTCTCCT
CTTCTTGAACTTTTGGA

QA 1 617 1 617
DS 

RD RS1EK69JQ 764 0 0
CTTTTTTAAAATTTTTGATTAGTAAAATTCAAACAGTAGAAGCTAGTTTTGTTTCTGATG
ATATATACAAGGATTGCAGAACATTCAGACAAAGAGAAGATGTTCTTGTTTGTGGATCAC
AAGCATGGCCGCTTTGTTCTTCTTTCTGCTAACTTGTTCACCGCGTTTCGCTTTTTAAAA
ACCTCATTGTTTTGTTTTGTCCCTCTACATTCTTCTGTCTTTATTGTCTCTTCTTTCTTC
TTCTTCTCCAACGCATCCTTCACAAGAAACTTTAGCCTCCACAGTGTTGGTTCGTCCAGT
ACGTCCATCTCAATCGTCACTACCTCTGCTTTAGTTTGGAATCTAGGATCAGCCTGAGCA
ACTACACCCAACACTTTCTGTAGCTCATCCGGAGACAGTTTCAAGAATGCCAACCCAATA
TTACGTTTCTCCTCGCTTGTAATTTTCCTGCATCTTCCCACAACTACCTGCCTTAGCTTC
TCCAGCTCGTCATTAACATTGCAAATCTCATTGCTCAAATCTCTAGTTGTTTTGGTATGA
GATGCTTCTTTTGCTAGCAGCGCCTCCATTGCTGCTTGCTTCTCCTCTTCCTCCCGTATT
TTCTCCTCTTCTTGAACTTTTGGAAGGAAGTGTGTCCATTTCTCCTCAAACTTTGCCAGT
AATGTCTTGGCCATAGAGTAAACATCACTACCTTCTTCATTATACTTCATAGCGTTCTCA
AACACTAGACGCATATCAGCGTATATCTGCATAACATGTTTGTA

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1GB09TF 608 0 0
CTTCTCCAGCTCGTCATTAACATTGCAAATCTCATTGCTCAAATCTCTAGTTGTTTTGGT
ATGAGATGCTTCTTTTGCTAGCAGCGCCTCCATTGCTGCTTGCTTCTCCTCTTCCTCCCG
TATTTTCTCCTCTTCTTGAACTTTTGGAAGGAAGTGTGTCCATTTCTCCTCAAACTTTGC
CAGTAATGTCTTGGCCATAGAGTAAACATCACTACCTTCTTCATTATACTTCATAGCGTT
CTCAAACACTAGACGCATATCAGCGTATATCTGCATAACATGTTTGTACCCGGTACCATC
TTTAGCCTCCATTTGATTCTTTATCGTGCTGAAGTCCATTGGCTCGTCAATAACCTCATA
GTAGTCATCAAGACCAAGACTTTCTACATCGACAGGATGCATAAAAGGCCAAGCGCACTT
GTGCTGGGTTATCTGACGGAAGATAGTACCGAACTGACGCATGAGGTCATGCATCCTCTT
AGCAGCAACGGCTTCTCTACGGGCAACCTCTTGTTGGACCTTCCTGATCCCAACAACGTG
TCTAGAGGAGGCAGAGGAGGGGGAAGAGTTTGAGACGGCATGGTCGAGTAAAACTCCTCT
ACTTGTGC

QA 1 608 1 608
DS 



AS 1 2

CO CL3260Contig1 906 2 20 U
GGGGCGACACACACACTCTATTTGAGCAAACCCGGTGGTGAAAATGTCATTCGATCTATC
TCGTCTCTCCCTCACCTCCTCGTCTCGTCTCTCGTTTCTCACTCACACCGCTACTAAGAA
AGGATTCGTTAAGTGTTCGATGAAGTCGTACAGATTATCTGAACTTAGTTTCTCTCAAGT
TGAAAACTTGAAGGCACGCCCTCGCATTGACTTCTCTTCCATTTTCACCACTGTTAACCC
AATCATCGACGCTGTTCGTAGCAAAGGAGATACTGCTGTCAAAGAGTACACTGAGAGATT
TGACAAAGTACAGCTCACTAAAGTGGTGGAAGATGTGTCCGAGCTTCCTATTCCCGAGCT
CGACCCCGCAGTTAAAGAAGCGTTTGATGTTGCGTATGACAACATTTATGCCTTTCACTT
GGCCCAAAAGTCAACCGAGAAAAGCGTTGAGAATATGAAAGGTGTCAGGTGTAAAAGAGT
GTCAAGATCTATCGGTTCTGTAGGTCTTTATGTGCCTGGTGGAACAGCTGTTTTGCCATC
CACTGCTTTGATGCTTGCAATTCCTGCTCAGATTGCTGGATGTAAAACAGTTGTCCTCGC
AACTCCACCAACTAAGGAAGGAAGCATATGCAAGGAGGTGCTGTATTGTGCCAAGAGGGC
TGGTGTAACCCACATCCTTAAAGCTGGTGGAGCGCACGCTATAGCTGCCATGGCCTGGGG
GACAGATTCTTGTCCTAAGTTGAGAAGATTTTTGGTCCTGGGAATCAGTATGTTACCGCT
GCTAAGATGATTCTTCAAACAGCGAGGCATGGTTTCGATTGACATGCCTGCTGGGCCTTC
AGAGTCTAGTATCGCTGATGACATGCTAGTCCAGTTACATTGCAGCCGACTACTTTCTCA
GCTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1DR53TF U 1
AF RS1E438TF U 98
BS 1 108 RS1DR53TF
BS 109 109 RS1E438TF
BS 110 131 RS1DR53TF
BS 132 132 RS1E438TF
BS 133 195 RS1DR53TF
BS 196 196 RS1E438TF
BS 197 198 RS1DR53TF
BS 199 199 RS1E438TF
BS 200 477 RS1DR53TF
BS 478 478 RS1E438TF
BS 479 627 RS1DR53TF
BS 628 628 RS1E438TF
BS 629 630 RS1DR53TF
BS 631 631 RS1E438TF
BS 632 696 RS1DR53TF
BS 697 697 RS1E438TF
BS 698 720 RS1DR53TF
BS 721 721 RS1E438TF
BS 722 742 RS1DR53TF
BS 743 906 RS1E438TF

RD RS1DR53TF 742 0 0
GGGGCGACACACACACTCTATTTGAGCAAACCCGGTGGTGAAAATGTCATTCGATCTATC
TCGTCTCTCCCTCACCTCCTCGTCTCGTCTCTCGTTTCTCACTCACACGGCTACTAAGAA
AGGATTCGTTAGGTGTTCGATGAAGTCGTACAGATTATCTGAACTTAGTTTCTCTCAAGT
TGAAAACTTGAAGGCTCGTCCTCGCATTGACTTCTCTTCCATTTTCACCACTGTTAACCC
AATCATCGACGCTGTTCGTAGCAAAGGAGATACTGCTGTCAAAGAGTACACTGAGAGATT
TGACAAAGTACAGCTCACTAAAGTGGTGGAAGATGTGTCCGAGCTTCCTATTCCCGAGCT
CGACCCCGCAGTTAAAGAAGCGTTTGATGTTGCGTATGACAACATTTATGCCTTTCACTT
GGCCCAAAAGTCAACCGAGAAAAGCGTTGAGAATATGAAAGGTGTCAGGTGTAAAAGGGT
GTCAAGATCTATCGGTTCTGTAGGTCTTTATGTGCCTGGTGGAACAGCTGTTTTGCCATC
CACTGCTTTGATGCTTGCAATTCCTGCTCAGATTGCTGGATGTAAAACAGTTGTCCTCGC
AACTCCACCAACTAAGGAAGGAAGCATTTGTAAGGAGGTGCTGTATTGTGCCAAGAGGGC
TGGTGTAACCCACATCCTTAAAGCTGGTGGAGCGCA*GCTATAGCTGCCATGGCCTGGGG
*ACAGATTCTTGTCCTAAGTTG

QA 1 742 1 742
DS 

RD RS1E438TF 809 0 0
G
TCACTCACACCGCTACTAAGAAAGGATTCGTTAAGTGTTCGATGAAGTCGTACAGATTAT
CTGAACTTAGTTTCTCTCAAGTTGAAAACTTGAAGGCACGCCCTCGCATTGACTTCTCTT
CCATTTTCACCACTGTTAACCCAATCATCGACGCTGTTCGTAGCAAAGGAGATACTGCTG
TCAAAGAGTACACTGAGAGGTTTGACAAAGTCCAGCTCACTAAAGTGGTGGAAGATGTGT
CCGAGCTTCCTATTCCCGAGCTCGACTCCGCAGTTAAAGAAGCGTTTGATGTTGCGTATG
ACAACATTTATGCGTTTCACTTTGCCCAAAAGTCAGCTGAGAAAATCGTTGAGAATATGA
AAGGTGTCAGGTGTAAAAGAGTGTCGAGATCTATTGGTTCTGTAGGTCTTTATGTGCCTG
GTGGAACAGCTGTTTTGCCGTCTACTGCTTTGATGCTTGCAATTCCTGCTCAGATTGCTG
GATGTAAAACAGTTGTCCTCGCCACTCCACCAACTAAGGAAGGAAGCATATGCAAGGAGG
TGCTGTATTGTGCTAAGAGGGCTGGTGTAACCCACATCCTTAAAGCTGGTGGAGCGCACG
CTATAGCTGCCATGGCCTGGGGGACAGATTCTTGTCCTAAGTTGAGAAGATTTTTGGTCC
TGGGAATCAGTATGTTACCGCTGCTAAGATGATTCTTCAAACAGCGAGGCATGGTTTCGA
TTGACATGCCTGCTGGGCCTTCAGAGTCTAGTATCGCTGATGACATGCTAGTCCAGTTAC
ATTGCAGCCGACTACTTTCTCAGCTGAG

QA 2 809 2 809
DS 



AS 1 2

CO CL3261Contig1 472 2 1 U
GGGTGCAAGCCTAAGCCTAACACCCAATGATGAGGATGATGATGATGATGATTGGCCAGA
AGAAGAAGATGATGCTCATGATTGGGCTCCCATGTTTACAGGGAATGAGGATGATGTTTC
TTTCAGTGATCTCGAAGGTGACGACGATATTAGTAGCTTAGCACTCAAGTCTAAGATTAC
TTCAAAGGGCACGGACCAAAAAGCAACATGAAACATCATCTCGGTCTTGTTGCTTTGTCT
TTACCTCAAGATCAAATCAATGGGAACTGAACATAAAAGGATTTGTACCGAGTCAAAGCG
TGAAGTTTTTTGGGTGAGTTTGATTGTTTGTCGAATGAAAAGAAAAAAAAAGAAGGTTTT
GAAACATGTACAGAAGATTTATTCAGTCACTTCAATTGCATTTGTAATGTTTTTCTTTAT
CGCCAATGTAAGGAAATATTGGAAGCAATGATATACTATGTGAAACGTGTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FI92JQ C 1
AF RS1FI92TF U 1
BS 1 472 RS1FI92TF

RD RS1FI92JQ 472 0 0
GGGTGCAAGCCTAAGCCTAACACCCAATGATGAGGATGATGATGATGATGATTGGCCAGA
AGAAGAAGATGATGCTCATGATTGGGCTCCCATGTTTACAGGGAATGAGGATGATGTTTC
TTTCAGTGATCTCGAAGGTGACGACGATATTAGTAGCTTAGCACTCAAGTTTAAGATTAC
TTCAAAGGGCACGGACCAAAAAGCAACATGAAACATCATCTCGGTCTTGTTGCTTTGTCT
TTACCTCAAGATCAAATCAATGGGAACTGAACATAAAAGGATTTGTACCGAGTCAAAGCG
TGAAGTTTTTTGGGTGAGTTTGATTGTTTGTCGAATGAAAAGAAAAAAAAAGAAGGTTTT
GAAACATGTACAGAAGATTTATTCAGTCACTTCAATTGCATTTGTAATGTTTTTCTTTAT
CGCCAATGTAAGGAAATATTGGAAGCAATGATATACTATGTGAAACGTGTTT

QA 1 472 1 472
DS 

RD RS1FI92TF 472 0 0
GGGTGCAAGCCTAAGCCTAACACCCAATGATGAGGATGATGATGATGATGATTGGCCAGA
AGAAGAAGATGATGCTCATGATTGGGCTCCCATGTTTACAGGGAATGAGGATGATGTTTC
TTTCAGTGATCTCGAAGGTGACGACGATATTAGTAGCTTAGCACTCAAGTCTAAGATTAC
TTCAAAGGGCACGGACCAAAAAGCAACATGAAACATCATCTCGGTCTTGTTGCTTTGTCT
TTACCTCAAGATCAAATCAATGGGAACTGAACATAAAAGGATTTGTACCGAGTCAAAGCG
TGAAGTTTTTTGGGTGAGTTTGATTGTTTGTCGAATGAAAAGAAAAAAAAAGAAGGTTTT
GAAACATGTACAGAAGATTTATTCAGTCACTTCAATTGCATTTGTAATGTTTTTCTTTAT
CGCCAATGTAAGGAAATATTGGAAGCAATGATATACTATGTGAAACGTGTTT

QA 1 472 1 472
DS 



AS 1 3

CO CL3262Contig1 961 3 13 U
GGACACAAAGGAAGAAAATAAAAAAATGGGAAACTCTCTGGTCTTTCTTTTCCCAATCTT
CCACTTGTTGGTGTTATTAGGATCCTCAGTAAATGCTTATTGGCCACCATCACCTGGTTA
CTGGCCAAGCTCCAAGGTTGGCTCCTTGAGCTTCTACAAAGGTTTTAAGAATCTTTGGGG
TCCTCAGCATCAGAGAATGGACCAAGATGGCCTCACCATTTGGCTCGATAGAACCTCAGG
AAGTGGATTCAAGTCAGTGAAGCCATTCAGATCAGGCTACTTTGGAGCTTCCATCAAGCT
TCAGTCTGGCTACACTGCCGGAGTCATCACATCTCTCTATCTATCAAATAGTGAGGCACA
TCCAGGATTCCATGATGAAGTGGACATAGAATTTTTGGGGACGACATTTGGAAAACCATA
CACACTTCAGACAAATGTGTACATTAGAGGAAGTGGTGATGGCAAAATCATTGGTCGTGA
GATGAAGTTTCGCTTGTGGTTTGATCCAACTTCGGGGTTTCACCACTATGCTATTCTTTG
GAACCCTAGAGAAATCATTTTTTTGGTGGATGACATTCCCATAAGAAGTTACCCAAAAAA
GAGTGCAGCTACATTTCCTTTAAGACCAATGTGGCTTTATGGTTCCATATGGGACGCTTC
TTCTTGGGCAACTGAAGATGGTAAATACAAAGCCGACTATAAATATCAGCCTTTTACTGC
CAAATACACTAATTTCAAAGCCATTGGTTGCACCGCCTACTCACCAGCACGATGTCATCC
AGTGTCCGCTTCGCCGTACCGTTTTGGTGGGCTAACCCGAAAACAATACCAAGCAATGAG
ATGGGTACAAACACATAATATGGTATACAATTACTGCAGAGATTATAAGCGTGATCATTC
TCTAACGCCTGAATGTTGGCGTTAAATGTCTTGAACTTGAATATTTTTTGATACCATAAA
A


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RS1FE38TF U 1
AF RS1CV24TF U 3
AF RS1CV24JQ C 220
BS 1 196 RS1FE38TF
BS 197 197 RS1CV24TF
BS 198 304 RS1FE38TF
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BS 660 709 RS1CV24TF
BS 710 961 RS1CV24JQ

RD RS1FE38TF 659 0 0
GGACACAAAGGAAGAAAATAAAAAAATGGGAAACTCTCTGGTCTTTCTTTTCCCAATCTT
CCACTTGTTGGTGTTATTAGGATCCTCAGTAAATGCTTATTGGCCACCATCACCTGGTTA
CTGGCCAAGCTCCAAGGTTGGCTCCTTGAGCTTCTACAAAGGTTTTAAGAATCTTTGGGG
TCCTCAGCATCAGAGA*TGGACCAAGATGGCCTCACCATTTGGCTCGATAGAACCTCAGG
AAGTGGATTCAAGTCAGTGAAGCCATTCAGATCAGGCTACTTTGGAGCTTCCATCAAGCT
TCAGCCTGGCTACACTGCCGGAGTCATCACATCTCTTTATCTATCAAATAGTGAGGCACA
TCCAGGATTCCATGATGAAGTGGACATAGAATTTTTGGGGACGACATTTGGAAAACCATA
CACACTTCAGACAAATGTGTACATTAGAGGAAGTGGTGATGGCAAAATCATTGGTCGTGA
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GAACCCTAGAGAAATCATTTTTTTGGTGGATTACATTCCCATAAGAAGTTACCCAAAAAA
GAGTGCAGCTACATTTCCTCTAAGACCAATGTGGCTTTATGGTTCCATATGGGACGCTT

QA 1 659 1 659
DS 

RD RS1CV24TF 707 0 0
GG
ACAAAGGAAGAAAATAAAAAAATGGGAAACTCTCTGGTCTTTCTTTTCCCAATCTTCCAC
TTGTTGGTGTTATTAGGATCCTCAGTAAATGCTTATTGGCCACCATCACCTGGTTACTGG
CCAAGCTCCAAGGTTGGCTCCTTGAGCTTCTACAAAGGTTTTAAGAATCTTTGGGGTCCT
CAGCATCAGAGAATGGACCAAGATGGCCTCACCATTTGGCTCGATAGAACCTCAGGAAGT
GGATTCAAGTCAGTGAAGCCATTCAGATCAGGCTACTTTGGAGCTTCCATCAAGCTTCAG
TCTGGCTACACTGCCGGAGTCATCACATCTCTCTATCTATCAAATAGTGAGGCACATCCA
GGATTCCATGATGAAGTGGACATAGAATTTTTGGGGACGACATTTGGAAAACCATACACA
CTTCAGACAAATGTGTACATTAGAGGAAGTGGTGATGGCAAAATCATTGGTCGTGAGATG
AAGTTTCGCTTGTGGTTTGATCCAACTTCGGGGTTTCACCACTATGCTATTCTTTGGAAC
CCTAGAGAAATCATTTTTTTGGTGGATGACATTCCCATAAGAAGTTACCCAAAAAAGAGT
GCAGCTACATTTCCTTTAAGACCAATGTGGCTTTATGGTTCCATATGGGACGCTTCTTCT
TGGGCAACTGAAGATGGTAAATACAAAGCCGACTATAAATATCAG

QA 3 707 3 707
DS 

RD RS1CV24JQ 742 0 0
TTGGCTCGATAGAACCTCAGGAAGTGGATTCAAGTCAGTGAAGCCATTCAGATCAGGCTA
CTTTGGAGCTTCCATCAAGCTTCAGTCTGGCTACACTGCCGGAGTCATCACATCTCTCTA
TCTATCAAATAGTGAGGCACATCCAGGATTCCATGATGAAGTGGACATAGAATTTTTGGG
GACGACATTTGGAAAACCATACACACTTCAGACAAATGTGTACATTAGAGGAAGTGGTGA
TGGCAAAATCATTGGTCGTGAGATGAAGTTTCGCTTGTGGTTTGATCCAACTTCGGGGTT
TCACCACTATGCTATTCTTTGGAACCCTAGAGAAATCATTTTTTTGGTGGATGACATTCC
CATAAGAAGTTACCCAAAAAAGAGTGCAGCTACATTTCCTTTAAGACCAATGTGGCTTTA
TGGTTCCATATGGGACGCTTCTTCTTGGGCAACTGAAGATGGTAAATACAAAGCCGACTA
TAAATATCAGCCTTTTACTGCCAAATACACTAATTTCAAAGCCATTGGTTGCACCGCCTA
CTCACCAGCACGATGTCATCCAGTGTCCGCTTCGCCGTACCGTTTTGGTGGGCTAACCCG
AAAACAATACCAAGCAATGAGATGGGTACAAACACATAATATGGTATACAATTACTGCAG
AGATTATAAGCGTGATCATTCTCTAACGCCTGAATGTTGGCGTTAAATGTCTTGAACTTG
AATATTTTTTGATACCATAAAA

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 3

CO CL3263Contig1 706 3 1 U
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ATGCTTTTATCAAGAGTCGGACAAGAACCCGTGGGAGATCAAAAACGCGTTTTCACGTGT
AAAACGTGTTTGAAAGAGTTCCATTCGTTTCAAGCGTTAGGAGGTCACAGCGCGAGCCAC
AAGAAGCATAACAACAATGAGAACCTCTCTGGATTGATAAAGAAAGCTAAAGCCCCCTCG
TCGCATACTTGTCCCATATGCGGAGTGGAGTTTCCGATGGGACAAGCTCTAGGAGGTCAC
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AGTTTGGGGATGGTTGAGAATTTGAATCTCAAGTTGGAGCTTGGAAGAACAGTTTGTTAA
TTAATTTGTTTCTTTTGTCTGAATATATTAATGAGTTTCTCTCATTTTTTGAATTTTTCC
TTAAATAGTTTAGATTTGTACATACATATCTGCAGATTTAGGAAACTTCAGATACTTCAT
AGGGTGTAATCTTATACTATTTCCTAGAGAATATATTTGTTACTTT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1E112TF U 4
AF RS1FJ50TF U 1
AF RS1FJ50JQ C 116
BS 1 706 RS1FJ50TF

RD RS1E112TF 636 0 0
GG
AACAACAATCACACCAAACACACATACACAACAAACAAAGAAAACAAAAACAAAAATGGT
TGCAATCTCTGAGATTAAGTCGACGGTGGAGGATACGGCGGTGGCGAATTGTCTGATGCT
TTTATCAAGAGTCGGACAAGAACCCGTGGGAGATCAAAAACGCGTTTTCACGTGTAAAAC
GTGTTTGAAAGAGTTCCATTCGTTTCAAGCGTTAGGAGGCCACAGCGCGAGCCACAAGAA
GCATAACAACAATGAGAACCTCTCTGGATTGATAAAGAAAGCTAAAGCCCCCTCGTCGCA
TACTTGTCCCATATGCGGAGTGGAGTTTCCGATGGGACAAGCTCTAGGAGGTCACATGAG
GAGACACAGGAACGAGAGTGGGGCTGCGTTGGTTACACGGGCGTTACTACCAGAGCCGAC
GATGACGACGTTGAAGAAGT*GAGCAGTGGGAAGAGGGTGGCTTGTTTGGATCTGAGTTT
GGGGATGGTTGAGAATTTGAATCTCAAGTTGGAGCTTGGAGGAACAGTTTGTTAATTAAT
TTGTTTCTTTTGTCTGAATATATTAATGAGTTTCTCTCATTTTTTGAATTTTTCCTTAAA
TAGTTTAGATTTGTACATACATATCTGCAGATTT

QA 3 636 3 636
DS 

RD RS1FJ50TF 706 0 0
GGAACAACAACAATCACACCAAACACACATACACAACAAACAAAGAAAACAAAAACAAAA
ATGGTTGCAATCTCTGAGATTAAGTCGACGGTGGAGGATACGGCGGTGGCGAATTGTCTG
ATGCTTTTATCAAGAGTCGGACAAGAACCCGTGGGAGATCAAAAACGCGTTTTCACGTGT
AAAACGTGTTTGAAAGAGTTCCATTCGTTTCAAGCGTTAGGAGGTCACAGCGCGAGCCAC
AAGAAGCATAACAACAATGAGAACCTCTCTGGATTGATAAAGAAAGCTAAAGCCCCCTCG
TCGCATACTTGTCCCATATGCGGAGTGGAGTTTCCGATGGGACAAGCTCTAGGAGGTCAC
ATGAGGAGACACAGGAACGAGAGTGGGGCTGCGTTGGTTACACGGGCGTTACTACCAGAG
CCGACGATGACGACGTTGAAGAAGTCGAGCAGTGGGAAGAGGGTGGCTTGTTTGGATCTG
AGTTTGGGGATGGTTGAGAATTTGAATCTCAAGTTGGAGCTTGGAAGAACAGTTTGTTAA
TTAATTTGTTTCTTTTGTCTGAATATATTAATGAGTTTCTCTCATTTTTTGAATTTTTCC
TTAAATAGTTTAGATTTGTACATACATATCTGCAGATTTAGGAAACTTCAGATACTTCAT
AGGGTGTAATCTTATACTATTTCCTAGAGAATATATTTGTTACTTT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RS1FJ50JQ 591 0 0
GTCTGATGCTTTTATCAAGAGTCGGACAAGAACCCGTGGGAGATCAAAAACGCGTTTTCA
CGTGTAAAACGTGTTTGAAAGAGTTCCATTCGTTTCAAGCGTTAGGAGGTCACAGCGCGA
GCCACAAGAAGCATAACAACAATGAGAACCTCTTTGGATTGATAAAGAAAGCTAAAGCCC
CCTCGTCGCATACTTGTCCCATATGCGGAGTGGAGTTTCCGATGGGACAAGCTCTAGGAG
GTCACATGAGGAGACACAGGAACGAGAGTGGGGCTGCGTTGGTTACACGGGCGTTACTAC
CAGAGCCGACGATGACGACGTTGAAGAAGTCGAGCAGTGGGAAGAGGGTGGCTTGTTTGG
ATCTGAGTTTGGGGATGGTTGAGAATTTGAATCTCAAGTTGGAGCTTGGAAGAACAGTTT
GTTAATTAATTTGTTTCTTTTGTCTGAATATATTAATGAGTTTCTCTCATTTTTTGAATT
TTTCCTTAAATAGTTTAGATTTGTACATACATATCTGCAGATTTAGGAAACTTCAGATAC
TTCATAGGGTGTAATCTTATACTATTTCCTAGAGAATATATTTGTTACTTT

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 3

CO CL3264Contig1 681 3 1 U
GCACTGTTATTTGGGCTTAAGAGAGAAACACCAACAAAAAAAAAGCTATGCAGAGCTCGA
CGATCTTCTTCTCTGGTGTTGTTCCTCCTGCTCTACGTGTCAGATCGGTCTTCACTCCAG
CGAATCCAGCAACCGATCGAGGTTCCATGGCGAGCCCCTCTGGTGGTCCAAAGTGGGCTC
AGAAAACCATCACTCTTCCACCTCAACGACGTGGATGTCATCTCATCACTTCTAAGATTC
TGAAAGAAATTGGACAAGATCTGTCCGGTTTCAACTGTGGTCTTGCTCATGTCTTCTTAC
AACACACAAGTGCTTCTCTTACAATCAATGAGAATTATGATCCAGATGTTCAGGCTGATA
CTGAGACTTTCTTGAACACCATTGTTCCTGAGGGGAGGTCAGCTCCTTGGAGGCATACCA
TGGAAGGTCCAGATGACATGCCAGCTCATATCAAATCTTCGATGTTT*GGATGTCAGCTC
ACAATT*CCAATT*ACAAAAGGAAAACTT*GGCATGGGAACCTGGCAGGGAATATGGCTA
TGTGAACACCGTGATGCTCCAACAGCACGCAAAGTTGTGGTCACACTCAATGGAATCTAG
ATATACATGTTTAAGGGCTTTGTAACCTCGTGGTTTTACTTACGTCTTGTAATGGATGTT
GTTCACTTTTTTTTCTATGAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AK93JQ C 263
AF RS1AK93TF U 407
AF RS1E465TF U 1
BS 1 681 RS1E465TF

RD RS1AK93JQ 318 0 0
GTCCGGTTTCAACTGTGGTCTTGCTCATGTCTTCTTACAACACACAAGTGCTTTTCTTAC
AATCAATGAGAATTATGATCCAGATGTTCAGGCTGATACTGAGACTTTCTTGAACACCAT
TGTTCCTGAGGGGAGGTCAGCTCCTTGGAGGCATACCATGGAAGGTCCAGATGACATGCC
AGCTCATATCAAATTTTCGATGTTT*GGATGTCAGCTCACAATT*CCAATT*ACAAAAGG
AAAACTT*GGCATGGGAACCTGGCAGGGAATATGGCTATGTGAACCCCGTGATGCTCCAA
CAGCACGCAAAGTTGTGG

QA 1 318 1 318
DS 

RD RS1AK93TF 227 0 0
TTGGAGGCATACCATGGAAGGTCCAGATGACATGCCAGCTCATATCAAATCTTCGATGTT
TTGGATGTCAGCTCACAATTTCCAATTTACAAAAGGAAAACTTTGGCATGGGAACCTGGC
AGGGAATATGGCTATGTGAACACCGTGATGCTCCAACAGCACGCAAAGTTGTGGTCACAC
TCAATGGAATCTAGATATACATGTTTAAGGGCTTTGTAACCTCGTGG

QA 1 227 1 227
DS 

RD RS1E465TF 681 0 0
GCACTGTTATTTGGGCTTAAGAGAGAAACACCAACAAAAAAAAAGCTATGCAGAGCTCGA
CGATCTTCTTCTCTGGTGTTGTTCCTCCTGCTCTACGTGTCAGATCGGTCTTCACTCCAG
CGAATCCAGCAACCGATCGAGGTTCCATGGCGAGCCCCTCTGGTGGTCCAAAGTGGGCTC
AGAAAACCATCACTCTTCCACCTCAACGACGTGGATGTCATCTCATCACTTCTAAGATTC
TGAAAGAAATTGGACAAGATCTGTCCGGTTTCAACTGTGGTCTTGCTCATGTCTTCTTAC
AACACACAAGTGCTTCTCTTACAATCAATGAGAATTATGATCCAGATGTTCAGGCTGATA
CTGAGACTTTCTTGAACACCATTGTTCCTGAGGGGAGGTCAGCTCCTTGGAGGCATACCA
TGGAAGGTCCAGATGACATGCCAGCTCATATCAAATCTTCGATGTTT*GGATGTCAGCTC
ACAATT*CCAATT*ACAAAAGGAAAACTT*GGCATGGGAACCTGGCAGGGAATATGGCTA
TGTGAACACCGTGATGCTCCAACAGCACGCAAAGTTGTGGTCACACTCAATGGAATCTAG
ATATACATGTTTAAGGGCTTTGTAACCTCGTGGTTTTACTTACGTCTTGTAATGGATGTT
GTTCACTTTTTTTTCTATGAA

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 3

CO CL3265Contig1 1034 3 3 U
GAACGGGACGTTGTTTGGGACTCTGAGTGGGAACACGAGAGAGGTTCTTCATAAGTTTAC
CGTTGATTTGCCGAAGAAGCACGGGAGAGGAGGGCAGTCTGCGCTTCGTTTCGCTAGGCT
TAGGATGGAGAAGAGGCATAACTACGTGAGGAAGACGGCCGAGCTCGCCACGCAGTTTTA
TATCAACCCTGCTACGAGCCAGCCGAATGTCGCGGGTTTGATCCTTGCCGGTTCGGCTGA
TTTCAAGACCGAGCTTAGCCAGTCTGAGTTGTTTGATCCGCGTCTCCAGGCGAAGATACT
CAACGTGGTTGATGTTTCCTACGGAGGCGAGAACGGTTTCAACCAGGCGATCGAGCTCTC
TGCTGAGATTTTGTCTAACGTGAAGTTCATACAGGAGAAGAAACTGATCGGGAAGTACTT
CGAGGAGATAAGTCAGGACACGGGGAAGTACGTGTTCGGCGTGGAGGACACGCTGAAGGC
TCTGGAGATGGGCGCGATCGAGACGCTGATCGTGTGGGAGAATCTTGATATCAACAGGTA
CGAGCTGAAGAACAGCACGAGCGGGGAGATTGTGGTGAAGCATTTCGGGAAAGATCAGGA
GACTGATCAGAGCAACTTCCACGACGCGGAGACTAACGCTGAGCTCGAGGTCCAGGAGAA
GATGCCGCTGCTCGAGTGGCTCGCGAACGAGTACAAACGTTTCGGATGCACGCTTGAGTT
CGTGACTAACAAGTCGCAGGAAGGGTCGCAGTTCTGCAGAGGGTTTGGTGGGATCGGTGG
TATGCTTCGTTACCAGCTTGACATGAGGACTTTTGATGAGTTGTCGGATGGTGACGTGTA
TGAGGATTCTGATTGATTGAAGTGAGAAAACCTTTTGGTGCTGGTTTCAGATCGATACAG
TAAGATGGTCTCTTTCTTAAAATTTTATCTTCTCCGACAGTTTGCTAGACAGTTTGTGTT
GTAATTGATTCTATTTTGAAGGTTCTGGACATCTTTTTTCGGTTCTAATTTCTATTTCAA
CTATTTTTCACGAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D348TF U 1
AF RS1DZ62TF U 93
AF RS1D348JQ C 346
BS 1 701 RS1D348TF
BS 702 739 RS1DZ62TF
BS 740 1034 RS1D348JQ

RD RS1D348TF 701 0 0
GAACGGGACGTTGTTTGGGACTCTGAGTGGGAACACGAGAGAGGTTCTTCATAAGTTTAC
CGTTGATTTGCCGAAGAAGCACGGGAGAGGAGGGCAGTCTGCGCTTCGTTTCGCTAGGCT
TAGGATGGAGAAGAGGCATAACTACGTGAGGAAGACGGCCGAGCTCGCCACGCAGTTTTA
TATCAACCCTGCTACGAGCCAGCCGAATGTCGCGGGTTTGATCCTTGCCGGTTCGGCTGA
TTTCAAGACCGAGCTTAGCCAGTCTGAGTTGTTTGATCCGCGTCTCCAGGCGAAGATACT
CAACGTGGTTGATGTTTCCTACGGAGGCGAGAACGGTTTCAACCAGGCGATCGAGCTCTC
TGCTGAGATTTTGTCTAACGTGAAGTTCATACAGGAGAAGAAACTGATCGGGAAGTACTT
CGAGGAGATAAGTCAGGACACGGGGAAGTACGTGTTCGGCGTGGAGGACACGCTGAAGGC
TCTGGAGATGGGCGCGATCGAGACGCTGATCGTGTGGGAGAATCTTGATATCAACAGGTA
CGAGCTGAAGAACAGCACGAGCGGGGAGATTGTGGTGAAGCATTTCGGGAAAGATCAGGA
GACTGATCAGAGCAACTTCCACGACGCGGAGACTAACGCTGAGCTCGAGGTCCAGGAGAA
GATGCCGCTGCTCGAGTGGCTCGCGAACGAGTACAAACGTT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RS1DZ62TF 663 0 0
GGCAGTCTGCGCTTCGTTTCGCTAGGCTTAGGATGGAGAAGAGGCATAACTACGTGAGGA
AGACGGCCGAGCTCGCCACGCAGTTTTATATCAACCCTGCTACGAGCCAGCCGAATGTCG
CGGGTTTGATCCTTGCCGGTTCGGCTGATTTCAAGACCGAGCTTAGCCAGTCTGAGTTGT
TTGATCCGCGTCTCCAGGCGAAGATACTCAACGTGGTTGATGTTTCCTACGGAGGCGAGA
ACGGTTTCAACCAGGCGATCGAGCTCTCTGCTGAGATTTTGTCTAACGTGAAGTTCATAC
AGGAGAAGAAACTGATCGGGAAGTACTTCGAGGAGATAAGTCAGGACACGGGGAAGTACG
TGTTCGGCGTGGGGGACACGCTGAAGGCTCTGGAGATGGGCGCGATCGAGACGCTGATCG
TGTGGGAGAATCTTGATATCAACAGGTACGAGCTGAAGAACAGCACGAGCGGGGAGATTG
TGGTGAAGCATTTCGGGAAAGATCAGGAGACTGATCAGAGCAACTTCCACGACGCGGAGA
CTAACGCTGAGCTCGAGGTCCAGGAGAAGATGCCGCTGCTCGAGTGGTTCGCGAACGAGT
ACAAACGTTTCGGATGCACGCTTGAGTTCGTGACTAACAAGTCGCAG
AAGGTCGCAGTTCTGC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RS1D348JQ 689 0 0
GGCGATCGAGCTCTCTGCTGAGATTTTGTCTAACGTGAAGTTCATACAGGAGAAGAAACT
GATCGGGAAGTACTTCGAGGAGATAAGTCAGGACACGGGGAAGTACGTGTTCGGCGTGGA
GGACACGCTGAAGGCTCTGGAGATGGGCGCGATCGAGACGCTGATCGTGTGGGAGAATCT
TGATATCAACAGGTACGAGCTGAAGAACAGCACGAGCGGGGAGATTGTGGTGAAGCATTT
CGGGAAAGATCAGGAGACTGATCAGAGCAACTTCCACGACGCGGAGACTAACGCTGAGCT
CGAGGTCCAGGAGAAGATGCCGCTGCTCGAGTGGCTCGCGAACGAGTACAAACGTTTCGG
ATGCACGCTTGAGTTCGTGACTAACAAGTCGCAGGAAGGGTCGCAGTTCTGCAGAGGGTT
TGGTGGGATCGGTGGTATGCTTCGTTACCAGCTTGACATGAGGACTTTTGATGAGTTGTC
GGATGGTGACGTGTATGAGGATTCTGATTGATTGAAGTGAGAAAACCTTTTGGTGCTGGT
TTCAGATCGATACAGTAAGATGGTCTCTTTCTTAAAATTTTATCTTCTCCGACAGTTTGC
TAGACAGTTTGTGTTGTAATTGATTCTATTTTGAAGGTTCTGGACATCTTTTTTCGGTTC
TAATTTCTATTTCAACTATTTTTCACGAG

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 2

CO CL3266Contig1 923 2 12 U
TTTTTCATCACATATTCCACCCACACTAACCAAACCATGAACCGTAATCATCACGAACCA
ATCCTACTTACATTCTTCACTCTTCTTCTCCAACTTCCAAACTTTATCAATGCATCACCA
TCCCCACCCATAACGGCTCTTTACGCCTTCGGCGACTCGACGGTGGATTCCGGCAACAAC
AACTACATCCCCACTCTTTTTCAAAGCAACCATCCACCCTACGGCAGATCTTTCCCGGAT
AAACTCTCCACCGGAAGATTCTCAGATGGAAAACTCGCCACCGACTTTATAGCCTCTTCT
CTAGGTCTCAAACCCACTTTACCAGCTTACCTCAACCCCTCGGTCAAACCGGCTGACCTT
TTGACCGGTGTTAGCTTTGCTTCGGCTGGAGGTGGTCTAGATGACCGGACTGCAATGATG
TCGTTGACTTTGACCATGGACAATCAATGGAGTTACTTTGAGGAGGCTGTACGTAAGATG
AAGAGTGTGGTTGGAGATTCGGAGACTAATCGGGTGATTAAGAATGCTCTGTTTGTGATT
AGTGCTGGGACTAATGATATGATCTATAATGTTTATGATCATGTTCTTGGGAGCTTTATT
TCCGTTTCGGACTATCAAGATTATCTACTCAGCAAAGTCGAAGCGTTTATCCAGAGACTA
CACGACGCAGGAGCACGAAGGATTACAGTAGCTGGACTACCACCAATTGGATGCCTTCCC
GTGCAAGTAACACTTGGTACCGTCACTATCCCTCGCATTCTCCATCATCGGATATGCACG
GAAAATCAAAACGCTGATTCTCAGCTCTACAATCAAAAGCTACGGAAGCTTAACTACCGT
CTCAGTCAGAGGCTTCCAGGCTCGAAATCTTACCTTGACATCTACACTCCATATAGACAT
GATCAGACATCCTCCCAGATATG


BQ
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AAACTCTCCACCGGAAGATTCTCAGATGGAAAACTCGCCACCGACTTTATAGCCTCTTCT
CTAGGTCTCAAACCCACTTTACCAGCTTACCTCAACCCCTCGGTCAAACCGGCTGACCTT
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CACGACGCAG*AGCACGAAG*ATTACAGTAGCTGGACTACCACCAATTGGATGCCT*CCC
GTGCAAGTAACACTTGGTACCGTCAC

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DS 

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GG
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CCACTCTTTTTCAAAGCAACCATCCACCCTACGGCAGATCTTTCCCGGATAAACTCTCCA
CCGGAAGATTCTCAGATGGAAAACTCGCCACCGACTTTATAGCCTCTTCTCTAGGTCTCA
AACCCACTTTACCAGCTTACCTCAACCCCTCGGTCAAACCGGCTGACCTTTTGACCGGTG
TTAGCTTTGCTTCGGCTGGAGGTGGTCTAGATGACCGGACTGCAATGATGTCGTTGACTT
TGACCATGGACAATCAATGGAGTTACTTTGAGGAGGCTGTACGTAAGATGAAGAGTGTGG
TTGGAGATTCGGAGACTAATCGGGTGATTAAGAATGCTCTGTTTGTGATTAGTGCTGGGA
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ACTATCAAGATTATCTACTCAGCAAAGTCGAAGCGTTTATCCAGAGACTACACGACGCAG
GAGCACGAAGGATTACAGTAGCTGGACTACCACCAATTGGATGCCTTCCGGTGCAAGTAA
CACTTGGTACCGTCACTATCCCTCGCATTCTCCATCATCGGATATGCACGGAAAATCAAA
ACGCTGATTCTCAGCTCTACAATCAAAAGCTACGGAAGCTTAACTACCGTCTCAGTCAGA
GGCTTCCAGGCTCGAAATCTTACCTTGACATCTACACTCCATATAGACATGATCAGACAT
CCTCCCAGATATG

QA 3 795 3 795
DS 



AS 1 3

CO CL3267Contig1 1032 3 16 U
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ACTCCTCTAGACGCGCGTCAACTACAATGGAAAAGCTGAAAGGACTTGGCTTTGATCCTT
CTTTCTTCTCCGGAGCTATTACCAGTGGTGAACTCACCCATCAATCTTTGCAGAGGAGAG
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TGGGAGACTCGCTTCACCATGATATAAAGGGGGGTAATGTTGCGGGGATTGAATCAGTGT
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CTGCGTTTAAATGGTAATGTGCTCATTGTACAAAATCTTGTTATTTGCTTCTTCAACTAG
ACATAACACTTG


BQ
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TGATCTATGAGTCGGCTATGGCGATTGCAG*AGTTGAGAATC
AGAGAGCTATTGCA

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1FR80TF 755 0 0
GG
GTTCTTCTCCTTGTGGTTGCAATAAGAAAAATGCTCTCTTCTCCTAAACTCTCCCAGCAA
ATGAATGGACTGAAAGACATCGCCGAGACACGGAACTTTAAGGCATGGCTGTTAGATCAG
TATGGAGTCCTTCATGATGGCAAACAACCTTACCCCGGCGCAATCTCAACTTTAAAGAAT
CTAGCAACAGTGGGTGCGAAGATCGTGATCATAAGCAACTCCTCTAGACGCGCGTCAACT
ACAATGGAAAAGCTGAAAGGACTTGGCTTTGATCCTTCTTTCTTCTCCGGAGCTATTACC
AGTGGTGAACTCACCCATCAATCTTTGCAGAGGAGAGATGATCCTTGGTTCGCTGCACTA
GGAAGGCGTTGCATCCACATCACTTGGAAAGACCGAGGAGCTATCTCTTTGGAAGGTCTC
GATCTAAACGTAGTGGAGAACGTGGAGGAAGCTGACTTTGTTTTAGCTCACGGCACTGAA
GCCATAGGACTTCCTTCAGGGGGTGTATCTCCCATGCCTCTCGACGGGCTTGAGAAGATC
TTGGAGAAATCTGCAGCTAGAAAACTCCCCATGATCGTCGCCAATCCAGATTACATGACT
GTCGAAGCAAACGTTTTCCACATCATGCCGGGCACACTGGCTGCCAAGTATGAAGAGCTT
GGAGGAGAAGTTAAATGGATGGGGAAGCCTCACAAGATGGTCTATGAGTCGGCTATGGCG
ATTGCAG*AGTTGAGATCC*AGAGA**GCTATT

QA 3 755 3 755
DS 

RD RS1FR80JQ 731 0 0
TTTCTTCTCCGGAGCTATTACCAGTGGTGAACTCACCCATCAATCTTTGCAGAGGAGAGA
TGATCCTTGGTTCGCTGCACTAGGAAGGCGTTGCATCCACATCACTTGGAAAGACCGAGG
AGCTATCTCTTTGGAAGGTCTCGATCTAAACGTAGTGGAGAACGTGGAGGAAGCTGACTT
TGTTTTAGCTCACGGCACTGAAGCCATAGGACTTCCTTCAGGGGGTGTATCTCCCATGCC
TCTCGACGGGCTTGAGAAGATCTTGGAGAAATTTGCAGCTAGAAAACTCCCCATGATCGT
CGCCAATCCAGATTACATGACTGTCGAAGCAAACGTTTTCCACATCATGCCGGGCACACT
GGCTGCCAAGTATGAAGAGCTTGGAGGAGAAGTTAAATGGATGGGGAAGCCTCACAAGAT
GGTCTATGAGTCGGCTATGGCGATTGCAGGAGTTGAGAATCCAGAGGAGGCTATTGCGGT
GGGAGACTCGCTTCACCATGATATAAAGGGGGGTAATGTTGCGGGGATTGAATCAGTGTT
CATCACTGGAGGGATTCATGGTAGTGAGCTTGGTCTCACTTCTTTTGATGAAACTGCGAG
TCTTGACTCGGTCAAGACCCTTACTGCTAAACACAAAGCATTCCCATCTTATGTTTTGTC
TGCGTTTAAATGGTAATGTGCTCATTGTACAAAATCTTGTTATTTGCTTCTTCAACTAGA
CATAACACTTG

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 3

CO CL3268Contig1 635 3 10 U
GGACGCATAAGAAGCGATGAAAACTGTATCGGTGGACGAAACCAAAAACACGGTGGTGCT
GCGAGCCGAGCACCGGGACGAGGAAGGCCGGAAAGCTGTGGATAAATTCGAGCTGAAGAC
TCGAAACCCCGACACGATCAAGCAAGTCGAGAAGAAGCTGATGGAGAAAGGCGTCCAACG
GATGGAGAGACACCCTTCCGACGGGACTCAGATCAAACGTCCGCCGCCGAAGTCCGGTCA
CGGCGGGAAGTACACGTGGGAGGGGTCTGATCGGATGTAGGATTACGAGATGCAGCCAGA
TCCGCCGGCGATGGACGAAGGTGATCCTAATTACGACGAGGAGAAGATCGGGGGAGGTGG
TGGTGATGACGTGGCGGTGGAGGTTGTGAAAGGTGAGGTTGAGGTGGCGAAGGAAGCGCC
GGGAGGTGTGGCTAGGGTGGAGGTTGATCCTCTCGCTTGATCAGTTCTACTCGAGTTGCA
AGGACACAGAGGAAAGTGTTGGGGCAAATGTGAGAAGAAAGGGAAACTTTGGGGTGTGGT
TTTTAATTTTTTAGTTTGCGATGTTTTAATGTATTGTTGACGTGGTGGAACGTTACTTGT
GTAAAGAAATAATAGCATTACTGCATTGAAATGCT


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CO33TF U 1
AF RS1EI90JQ C 3
AF RS1EI90TF U 3
BS 1 86 RS1CO33TF
BS 87 87 RS1EI90TF
BS 88 277 RS1CO33TF
BS 278 278 RS1EI90TF
BS 279 305 RS1CO33TF
BS 306 306 RS1EI90TF
BS 307 335 RS1CO33TF
BS 336 337 RS1EI90TF
BS 338 373 RS1CO33TF
BS 374 635 RS1EI90TF

RD RS1CO33TF 373 0 0
GGACGCATAAGAAGCGATGAAAACTGTATCGGTGGACGAAACCAAAAACACGGTGGTGCT
GCGAGCCGAGCACCGGGACGAGGAAGTCCGGAAAGCTGTGGATAAATTCGAGCTGAAGAC
TCGAAACCCCGACACGATCAAGCAAGTCGAGAAGAAGCTGATGGAGAAAGGCGTCCAACG
GATGGAGAGACACCCTTCCGACGGGACTCAGATCAAACGTCCGCCGCCGAAGTCCGGTCA
CGGCGGGAAGTACACGTGGGAGGGGTCTGATCGGATGGAGGATTACGAGATGCAGCCAGA
TCCGCTGGCGATGGACGAAGGTGATCCTAATTACG**GAGGAGAAGATCGGGGGAGGTGG
TGGTGATGACGTG

QA 1 373 1 373
DS 

RD RS1EI90JQ 633 0 0
GG
GCATAAGAAGCGATGAAAACTGTATCGGTGGACGAAACCAAAAACACGGTGGTGCTGCGA
GCCGAGCACCGGGACGAGGAAGGCCGGAAAGCTGTGGATAAATTCGAGCTGAAGACTCGA
AACCCCGACACGATCAAGCAAGTCGAGAAGAAGCTGATGGAGAAAGGCGTCCAACGGATG
GAGAGACACCCTTCCGACGGGACTCAGATCAAACGTCCGCCGCCGAAGTCCGGTCACGGC
GGGAAGTACACGTGGGAGGGGTCTGATCGGATGTAGGATTACGAGATGCAGCCAGATCCG
CCGGCGATGGACGAAGGTGATCCTAATTACGACGAGGAGAAGATCGGGGGAGGTGGTGGT
GATGACGTGGCGGTGGAGGTTGTGAAAGGTGAGGTTGAGGTGGCGAAGGAAGCGCCGGGA
GGTGTGGCTAGGGTGGAGGTTGATCCTCTCGCTTGATCAGTTCTACTCGAGTTGCAAGGA
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AATTTTTTAGTTTGCGATGTTTTAATGTATTGTTGACGTGGTGGAACGTTACTTGTGTAA
AGAAATAATAGCATTACTGCATTGAAATGCT

QA 3 633 3 633
DS 

RD RS1EI90TF 633 0 0
GG
GCATAAGAAGCGATGAAAACTGTATCGGTGGACGAAACCAAAAACACGGTGGTGCTGCGA
GCCGAGCACCGGGACGAGGAAGGCCGGAAAGCTGTGGATAAATTCGAGCTGAAGACTCGA
AACCCCGACACGATCAAGCAAGTCGAGAAGAAGCTGATGGAGAAAGGCGTCCAACGGATG
GAGAGACACCCTTCCGACGGGACTCAGATCAAACGTCCGCCGCCGAAGTCCGGTCACGGC
GGGAAGTACACGTGGGAGGGGTCTGATCGGATGTAGGATTACGAGATGCAGCCAGATCCG
CCGGCGATGGACGAAGGTGATCCTAATTACGACGAGGAGAAGATCGGGGGAGGTGGTGGT
GATGACGTGGCGGTGGAGGTTGTGAAAGGTGAGGTTGAGGTGGCGAAGGAAGCGCCGGGA
GGTGTGGCTAGGGTGGAGGTTGATCCTCTCGCTTGATCAGTTCTACTCGAGTTGCAAGGA
CACAGAGGAAAGTGTTGGGGCAAATGTGAGAAGAAAGGGAAACTTTGGGGTGTGGTTTTT
AATTTTTTAGTTTGCGATGTTTTAATGTATTGTTGACGTGGTGGAACGTTACTTGTGTAA
AGAAATAATAGCATTACTGCATTGAAATGCT

QA 3 633 3 633
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3270Contig1 1014 3 4 U
GGAACTATATGTTCTCTCTCTCTCGATAGCTCCTCCCAGGAAACCTATAATTTCTTAGAT
CCATCTCAGAGAATGGCTGGTGGATTTACCATCAACATAAACATTCCGGCGGGTGAAGGA
TTTACCATTAACATTAACCCAAACTCTGCTCCAGGGGGAGCCGAGGTAGGGGCTGCCTTT
GGCCGAATTCAACCTCCAGCTGGTAAACTAGATCCTCTCTCTATATGTACGAATCCCTCC
TCTCAAAAGCCCCGAGAATGCTCTGATCCATCTAACCCTAAGGTTTTCTTTGATATGACG
GCTTGCGGTAAACCTATTGGTCGGATCGTGATGGAGCTCTTTGCCGACACGACCCCACGG
ACGGCAGAGAATTTCCGCGCCCTCTGTACAGGCGAGAAAGGCATGGGGAAGAAGGGTAAG
CCCCTCCATTACAAAGGATCAGTCATCTACCATAGGTGCGCCGATTATATGATTGAAGGA
GGAGATTTCACTAACGAAGGGAAAGGATGCGGAGGCGAATCAATCTACGACAGTGGGTTT
TTCGAGGATGAGAACTTCATCAAAAAGCACACATGTCCGGGTATGATCTCCATGAACAAC
CGTGGTCCTGACACCAACGAATCTAACTTTATGATCTGCTTGACGGAGTGCCCGGAACTC
GACGATGAACACGTCGTGTTCGGCCAAGTTGTTGAAGGATTGGATGTGGTCAGGACCATT
TCAAAGATATCTGTTAGGGACAAGCTTTCCTGGCCCGTGGTGATCGCCGACTGCGGTCAG
ATTTCATAGATCTGAGATATTTTCAAGTACAATGGTTGCTTGGTCCTTTTCGCCGACAAG
CTTGTGTCCTTTTGATGTTTGGTCGGGTGCGTTTTTCTTTTTGCTTCTTTCTTGAATTTA
GATTGGCTACCATTGAAAAATGATAACCATCATCAGTTTTAGCTATAGTTGCTATTGCAG
AAACATATTAAAAATAAATCTGTGCTTTTGGACCTTTTAAATATGTTTTCCATC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G679TF U 1
AF RS1D358TF U 1
AF RS1D358JQ C 282
BS 1 146 RS1D358TF
BS 147 149 RS1G679TF
BS 150 678 RS1D358TF
BS 679 1014 RS1D358JQ

RD RS1G679TF 566 0 0
GGAACTATATGTTCTCTCTCTCTCGATAGCTCCTCCCAGGAAACCTATAATTTCTTAGAT
CCATCTCAGAGAATGGCTGGTGGATTTACCATCAACATAAACATTCCGGCGGGTGAAGGA
TTTACCATTAACATTAACCCAAACTCTGCTCCAGGGGGAGCCGAGGTAGGGGCTGCCTTT
GGCCGAATTCAACCTCCAGCTGGTAAACTAGATCCTCTCTCTATATGTACGAATCCCTCC
TCTCAAAAGCCCCGAGAATGCTCTGATCCATCTAACCCTAAGGTTTTCTTTGATATGACG
GCTTGCGGTAAACCTATTGGTCGGATCGTGATGGAGCTCTTTGCCGACACGACCCCACGG
ACGGCAGAGAATTTCCGCGCCCTCTGTACAGGCGAGAAAGGCATGGGGAAGAAGGGTAAG
CCCCTCCATTACAAAGGATCAGTCATCTACCATAGGTGCGCCGATTATATGATTGAAGGA
GGAGATTTCACTAACGAAGGGAAAGGATGCGGAGGCGAATCAATCTACGACAGTGGGTTT
TTCGAGGATGAGAACTTCATCAAAAA

QA 1 566 1 566
DS 

RD RS1D358TF 678 0 0
GGAACTATATGTTCTCTCTCTCTCGATAGCTCCTCCCAGGAAACCTATAATTTCTTAGAT
CCATCTCAGAGAATGGCTGGTGGATTTACCATCAACATAAACATTCCGGCGGGTGAAGGA
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GGCCGAATTCAACCTCCAGCTGGTAAACTAGATCCTCTCTCTATATGTACGAATCCCTCC
TCTCAAAAGCCCCGAGAATGCTCTGATCCATCTAACCCTAAGGTTTTCTTTGATATGACG
GCTTGCGGTAAACCTATTGGTCGGATCGTGATGGAGCTCTTTGCCGACACGACCCCACGG
ACGGCAGAGAATTTCCGCGCCCTCTGTACAGGCGAGAAAGGCATGGGGAAGAAGGGTAAG
CCCCTCCATTACAAAGGATCAGTCATCTACCATAGGTGCGCCGATTATATGATTGAAGGA
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CGTGGTCCTGACACCAACGAATCTAACTTTATGATCTGCTTGACGGAGTGCCCGGAACTC
GACGATGAACACGTCGTG

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1D358JQ 733 0 0
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TGCCGACACGACCCCACGGACGGCAGAGAATTTCCGCGCCCTCTGTACAGGCGAGAAAGG
CATGGGGAAGAAGGGTAAGCCCCTCCATTACAAAGGATCAGTCATCTACCATAGGTGCGC
CGATTATATGATTGAAGGAGGAGATTTCACTAACGAAGGGAAAGGATGCGGAGGCGAATC
AATCTACGACAGTGGGTTTTTCGAGGATGAGAACTTCATCAAAAAGCACACATGTCCGGG
TATGATCTCCATGAACAACCGTGGTCCTGACACCAACGAATCTAACTTTATGATCTGCTT
GACGGAGTGCCCGGAACTCGACGATGAACACGTCGTGTTCGGCCAAGTTGTTGAAGGATT
GGATGTGGTCAGGACCATTTCAAAGATATCTGTTAGGGACAAGCTTTCCTGGCCCGTGGT
GATCGCCGACTGCGGTCAGATTTCATAGATCTGAGATATTTTCAAGTACAATGGTTGCTT
GGTCCTTTTCGCCGACAAGCTTGTGTCCTTTTGATGTTTGGTCGGGTGCGTTTTTCTTTT
TGCTTCTTTCTTGAATTTAGATTGGCTACCATTGAAAAATGATAACCATCATCAGTTTTA
GCTATAGTTGCTATTGCAGAAACATATTAAAAATAAATCTGTGCTTTTGGACCTTTTAAA
TATGTTTTCCATC

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 3

CO CL3271Contig1 1225 3 7 U
GGCCAATTAAATATTCCAACACTCTCGTCTCGCCCTCTCTCTCTTACACAGTGTCGATCT
TTACGAGGTTCGCTAGTTCGGACTCCCTTCTCTACCTCCTCCGCTCTCACCGTATTCTCC
CTTCGATGGCAACCACCACCGTCGCAGCAGCAGCAACAAAGCTCACCTCCTTGAGATCCG
CCAGGAACCTCGGCATCCACGAGATCTGCCAGGTCCGTCAATGGTCTCCTCTTCAGTCCG
CAATGCCTCGTTACGGAATGCTCCGATGCGGATCGGGACAGTCCTTTGCAACATCCACCG
TTGTGAAAGCTCAAGCGACGGCTGTTGAGCAATCGACGGGTGAAGCTGTTCCGAAAGTGG
AGTCTCCTGTGGTCGTTGTCACTGGTGCCTCTAGAGGGATTGGTAAAGCTATTGCTCTTT
CCTTGGGCAAAGCCGGCTGCAAGGTGTTGGTGAACTATGCTAGGTCAGCAAAGGAGGCTG
AGGAAGTTTCCAAACAGATTGAAGCGTATGGTGGCCAAGCTATTACTTTTGGGGGTGACG
TCTCAAAAGAAGCTGATGTGGAAGCCATGATGAAAACCGCTATTGATGCATGGGGAACCA
TTGATGTCGTCGTTAACAATGCAGGAATCACTCGGGATACCTTGTTGATTCGCATGAAGA
AGTCACAATGGGATGAAGTGATCGATTTGAATCTCACTGGAGTGTTTCTCTGTACCCAGG
CAGCAACAAAGATCATGATGAAGAAGAGAAAGGGAAGAATCATCAACACAGCGTCAGTTG
TTGGTCTCATTGGTAACATTGGCCAAGCAAACTATGCTGCTGCTAAAGCTGGAGTTATTG
GGTTCTCCAAGACTGCCGCCAGAGAGGGTGCGAGCAGGAATATTAATGTCAACGTGGTTT
GTCCTGGATTCATTGCATCTGACATGACTGCCAAGCTTGGAGAAGACATGGAAAAGAAAA
TCTTGGGAACAATCCCATTAGGACGGTATGTACAACCGGAAGATGTGGCTGGCTTGGTAG
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CGGACAAAAGTTGAGTTTATTCTGGAACTTGGTCGGATTTCTGTTCTGCGGATTCTGTTT
GGAGAGAAATCTAAAACGCATTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C903TF U 1
AF RS1AJ59TF U 39
AF RS1C903JQ C 431
BS 1 345 RS1C903TF
BS 346 346 RS1AJ59TF
BS 347 682 RS1C903TF
BS 683 768 RS1AJ59TF
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BS 804 1225 RS1C903JQ

RD RS1C903TF 682 0 0
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AGTCTCCTGTGGTCGTTGTCACTGGTGCCTCTAGAGGGATTGGTAAAGCTATTGCTCTTT
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AGTCACAATGGGATGAAGTGAT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1AJ59TF 765 0 0
GG
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CCGCTCTCACCGTATTCTCCCTTCGATGGCAACCACCACCGTCGCAGCAGCAGCAACAAA
GCTCACCTCCTTGAGATCCGCCAGGAACCTCGGCATCCACGAGATCTGCCAGGTCCGTCA
ATGGTCTCCTCTTCAGTCCGCAATGCCTCGTTACGGAATGCTCCGATG**GATCGGGACA
GTCCTTTGCAACATCCACCGTTGTGAAAGCTCAAGCGACGGCTGTTGAGCAATCGACGGG
TGAAGCTGTTCCGAAAGTGGAGTCTCCTGTGGTCGTTGTCACTGGTGCCTCTAGAGGGAT
TGGTAAAGCTATTGCTCTTTCCTTGGGCAAAGCCGGCTGCAAGGTGTTGGTGAACTATGC
TAGGTCAGCAAAGGAGGCTGAGGAAGTTTCCAAACAGATTGAAGCGTATGGTGGCCAAGC
TATTACTTTTGGGGGTGATGTCTCAAAAGAAGCTGATGTGGAAGCCATGATGAAAACCGC
TATTGATGCATGGGGAACCATTGATGTCGTCGTTAACAATGCGGGAATCACTCGGGATAC
CTTGTTGATTCGCATGAAGAAGTCACAATGGGATGAAGTGATCGATTTGAATCTCACTGG
AGTGTTTCTCTGTACCCAGGCAGCAACAAAGATCATGATGAAGAAGAGAAAGGGAAGAAT
CATCAACATAGCGTCAGTTGTTGGTCTCATTGGTAACATTGGC

QA 3 765 3 765
DS 

RD RS1C903JQ 795 0 0
AAG
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TAACAATGCAGGAATCACTCGGGATACCTTGTTGATTCGCATGAAGAAGTCACAATGGGA
TGAAGTGATCGATTTGAATCTCACTGGAGTGTTTCTCTGTACCCAGGCAGCAACAAAGAT
CATGATGAAGAAGAGAAAGGGAAGAATCATCAACACAGCGTCAGTTGTTGGTCTCATTGG
TAACATTGGCCAAGCAAACTATGCTGCTGCTAAAGCTGGAGTTATTGGGTTCTCCAAGAC
TGCCGCCAGAGAGGGTGCGAGCAGGAATATTAATGTCAACGTGGTTTGTCCTGGATTCAT
TGCATCTGACATGACTGCCAAGCTTGGAGAAGACATGGAAAAGAAAATCTTGGGAACAAT
CCCATTAGGACGGTATGTACAACCGGAAGATGTGGCTGGCTTGGTAGAATTCTTGGCTCT
CAGTCCTGCAGCCAGTTACATTACCGGACAGTCATTCACCATTGATGGAGGTATTGCTAT
CTAGGCATTGAGGTTTTGTTCAGATTTGCTTTTGTGTTTTGGTAAAACGGACAAAAGTTG
AGTTTATTCTGGAACTTGGTCGGATTTCTGTTCTGCGGATTCTGTTTGGAGAGAAATCTA
AAACGCATTGCC

QA 4 795 4 795
DS 



AS 1 2

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TTAAAGACTTTAAAAAGTCGAGTTATTATGTACAAGGAGGGTCGGAGTAGTGGAAGCAGC
ATAATAATGGGCGGTGGCGGATCATCGAGATCGGAGCTTCTCGGCGGAGCTACTGATCAG
AAACGAATCAACGAAGCTTTAGACAAACATCTCAGAAAGTCTTCACCTTCCACTTCTAAA
GACAGAGATTCGTTCCCTTCGACCTCAACTACTGCTAAATCTCAACTTCAAGAAGGAGTT
GAATCTGAAACGGATAGTGAAGGATCGGATGTGAGTGGGTCAGAAGGTGAAACGTCGTGG
ATCTCGTGGTTTTGTAACTTGAGAGGGAATGAGTTTTTCTGTGAAGTGGATGAGGATTAT
GTACAGGATGATTTCAATCTCTGTGGGTTGAGTGGTCAAGTTCCTTATTATGATTATGCA
CTTGATCTCATCTTAGATGTTGAATCCTCAAACAGTGATATGTTTACTGAAGAACAGAAT
GAGTTAGTGGAATCAGCTGCGGAAATGTTATATGGACTTATTCATGTTCGTTACATTCTC
ACTACTAAAGGATTAACTGCTATGTTGGAGAAGTACAAGAACTATGATTTTGGAAGATGT
CCGAGAGTGTTCTGCTGCGGGCAGTCTTGTCTTCCTGTTGGACAATCCGATATCCCTAGG
TCGAGCACGGTGAAGATATACTGCCCTAAATGCGAGGATCTTTACTACCCTCGATCTAAA
TACCAAGGCAGTATCCTTTTTTCCACTTTGTTCAGAAAGGCTTTGGGAGATGTTAAGAGT
GTGTTTTGTTGTTTACTTTGTCTTAGTGTTTATTTTTTTTCCTTAATGGTTATTTTTGCA
GACATTGATGGAGCTTATTTTGGGACTACATTCCCACATTTGTTTCTCATGGCCCATGGG
AACATGAAACCGCAGAAGCCGAGTCAAAGCTATGTTCCTAAAATCTTTGGCTTTAAGGTA
CACAAGAAGCAATGATGATGATGATACTCTCTTCTCTCACCAGTCCAACGAGTTATATAA
ACACAATCTTGGTGGCGAAGCCCCTTCTTCTTAATGGTGTTTGGAGGATGACAAGAGCTC
TTATGGGAAAAAACATCTTGAAGAGTTGAGTTTTCTGTATGTAATCTTGAATTAAACTGA
TCTGATATAGAACCTGTCTTTGGCTAGGTTGGGAGAGAAACGAAAACATGAGGTCTTGTT
GATTCATTTACCTGTTGAGATTCAAGTAAATCATTTACTGATATGGTTTTGATTTTGCCT
AACTGTTTGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AGAAGCAATGATGATGATGATACTCTCTTCTCTCACCAGTCCAACGAGTTATATAAACAC
AATCTTGGTGGCGAAGCCCCTTCTTCTTAATGGTGTTTGGAGGATGACAAGAGCTCTTAT
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ATATAGAACCTGTCTTTGGCTAGGTTGGGAGAGAAACGAAAACATGAGGTCTTGTTGATT
CATTTACCTGTTGAGATTCAAGTAAATCATTTACTGATATGGTTTTGATTTTGCCTAACT
GTTTGTTG

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AGACAAGGTTTACCCTGAGGGCACGCACCTTATGGTTCCTTGGTTCGAAAGGCCGGTCAT
TTACGACGTTCGTGCCCGACCTTACCTTGTTGAGAGTACATCTGGAAGCCATGATCTCCA
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TCTGAAAGCTGTTGTTGCTTAGTACAATGCAAGCCAGCTTATCACCCAGAGAGAGGCGGT
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CGATGTGTCCATCACGACCCTGACATTCGGGAAAGAGTTCACTGCTGCCATTGAAGCAAA
GCAGGTGGCGGCTCAAGAGGCTGAGAGGGCTAAGTTCATCGTAGAGAAGGCTGAACAAGA
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TGCTCAAACCATAGCACACTCGGCCAACAAGGTGTACCTGAGCTTTGATGATCTCTTGCT
TAACCTACAGGAGATGAATTTGGAAGTGAATCCAAAGAAGTAGAGAGGCTTCTAAAAGTA
AAACCCACATGTGGGTTGTGTCGTCTTTTCAATTTCCTCTCGCATCATTTGGAACAAAAG
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AAAAAGGAAGAAGACACCGTCTTTGCTTAGC


BQ
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AGCCTATCAGATGAATCTCAACAACGTGAAAGTTCCCAAGGTGCCAGGTGGCGGTGCTGT
ATCTGCGTTGCTTAAGGTTGGGATTATCGGTGGGCTCGGTCTCTACGCTGCCACGCAGAG
TCTCTACAGTGTCGACGGAGGTCATCGAGCTATCATGTTCAACCGTTTAGTCGGTGTCAA
AGACAAGGTTTACCCTGAGGGCACGCACCTTATGGTTCCTTGGTTCGAAAGGCCGGTCAT
TTACGACGTTCGTGCCCGACCTTACCTTGTTGAGAGTACATCTGGAAGCCATGATCTCCA
GATGGTGAAGATTGGGCTGAGAGTTCTCACTCGTCCCATGGCGGATCAGTTACCTGAGAT
CTACAGAACCCTCGGTGAGAACTACAGCGAGAGAGTTCTGCCTTCCATAATCCACGAGAC
TCTGAAAGCTGTTGTTGCTTAGTACAATGCAAGCCAGCTTATCACCCAGAGAGAGGCGGT
TAGTAGGGAGATCAGGAAGATTCTGACTCAACGAGCAACTAACTTCAACATTGCGCTTGA
CGATGTGTCCATCACGACCCTGACATTCGGGAAAGAGTTCACTGCTGCCATTGAA

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1EX16JQ 606 0 0
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ACTCAACGAGCAACTAACTTCAACATTGCGCTTGACGATGTGTCCATCACGACCCTGACA
TTCGGGAAAGAGTTCACTGCTGCCATTGAAGCAAAGCAGGTGGCGGCTCAAGAGGCTGAG
AGGGCTAAGTTCATCGTAGAGAAGGCTGAACAAGACAAGAGAAGTGCAGTTATCCGCGCC
CAGGGAGAAGCCAAGAGTGCTCAGCTTATAGGCCAAGCGATTGCAAACAACCAAGCGTTC
ATAACGCTCAGGAAGATCGAGGCGGCGAGAGAGATTGCTCAAACCATAGCACACTCGGCC
AACAAGGTGTACCTGAGCTTTGATGATCTCTTGCTTAACCTACAGGAGATGAATTTGGAA
GTGAATCCAAAGAAGTAGAGAGGCTTCTAAAAGTAAAACCCACATGTGGGTTGTGTCGTC
TTTTCAATTTCCTCTCGCATCATTTGGAACAAAAGATAAGACCTTTGGATTGTTATATAC
TCAAGTTGTTCTTGGGATCTCATTATCCCATCAGAAAAAAGGAAGAAGACACCGTCTTTG
CTTAGC

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 2

CO CL3275Contig1 1190 2 2 U
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TAAAGTTACTCGTCCACAAGGAAGGTATAAACGTAGAGAGAAGGCGAAGCTTGTCAATTC
TTACTCTTCCAAAGATCTTGAAGGAATACTTGTTAAGCGAACTGAGGAGCCTTCTCCTGC
GGTTTGTGACATAGCTGATACTATGGAGATTGAAATTATATCTGAGGACCAACATGCTAG
TGTTAAAGAACAGAAAATCGAAGAACCTTCTGATGACTGGTGGGGATTTAAATCCGGGTT
TGTCTCGGGTGGTCTTCTTGGAGCCAAGTCCGGCAAAAAGAAATCATCCAAGTCTAAGGA
GAGAAAAATGTTTTGTGAGGACGATCAAGAGAATCTTTACAACATGGTTCAGGATAAAGC
CACAGCTGGAAAACAAGGACTTGGTATCAAAGACCGTCCAAAGAAGATAGCTGGTGTTCG
TTACCAAGGGAAGAAAACATCTTTTGATAACGGTGATGATGATGATGATAATGATGATGA
AGAGGAAGAAGAAGAGAGTGACGAGGATGATGCCAAGGACTCTGTTATCGAAAATTCTGT
CCAAGCAAAAAGGAAGCGAGAAGAGAGTGAAGAAGAAGACGACGAGGACTCTGTTATTGA
AAACTCTCTCCCAGCAAAAAGGAAGCGTGATGAAATCATTGAACCCAAAATCAAGTTGAA
GAACCTATGCAAACAGATTCTTAAAAAGGTCGCTGGTAGTAGCGGATCAATGAAGCTGAA
ACGGCTTAAATCTATGATTGATGAACAAGCGCCATCAATTCTCTCAGAGTTCTCTTCAAG
GAAAGATGCTATTGCTTACTTGAAACTTAAGATGGAGCGAAGTGACAAGTTTATTGTGGA
GGGAAAGAAAATCAGTCTCGTATCAAAAAAGAAGTGAGTGAGGACAAATATCATTATACC
TGCCTGCGTAGGAAAGTGGAGATTAAGGCAAGTTTTGTTACTAATCAACATCAGTATGTA
TAACAAGTATCATCCTTTTCAAAGATGTGTTTTATAGTCTATTCATACATTAAATGAGAG
TTATGCATAAAAACTCCACAATAATCTCTTCTATTTAAGAGCAGTTGGAATACATGATTT
ATTTGAACATATGGTAAAACAGAGCTTCAATTTCAGTTTTCTTATAATAC


BQ
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AF RS1H505TF U 1
AF RS1H505JQB C 557
BS 1 675 RS1H505TF
BS 676 1190 RS1H505JQB

RD RS1H505TF 675 0 0
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TGTTAAAGAACAGAAAATCGAAGAACCTTCTGATGACTGGTGGGGATTTAAATCCGGGTT
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AAACTCTCTCCCAGC

QA 1 675 1 675
DS 

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ATTCTTAAAAAGGTCGCTGGTAGTAGCGGATCAATGAAGCTGAAACGGCTTAAATCTATG
ATTGATGAACAAGCGCCATCAATTCTCTCAGAGTTCTCTTCAAGGAAAGATGCTATTGCT
TACTTGAAACTTAAGATGGAGCGAAGTGACAAGTTTATTGTGGAGGGAAAGAAAATCAGT
CTCGTATCAAAAAAGAAGTGAGTGAGGACAAATATCATTATACCTGCCTGCGTAGGAAAG
TGGAGATTAAGGCAAGTTTTGTTACTAATCAACATCAGTATGTATAACAAGTATCATCCT
TTTCAAAGATGTGTTTTATAGTCTATTCATACATTAAATGAGAGTTATGCATAAAAACTC
CACAATAATCTCTTCTATTTAAGAGCAGTTGGAATACATGATTTATTTGAACATATGGTA
AAACAGAGCTTCAATTTCAGTTTTCTTATAATAC

QA 1 634 1 634
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL3277Contig1 773 2 3 U
TTTTTGTTTGATTTTGTTCTTTCCCAAATCATCAAAGCTGGTGGAGAGATGTCGATGGGA
AGCGACTCGACATGGGTGGGGAAGAAACCGATCCGGCGCATCGGCGGATTATCTGATGCT
CTCTCCATCGCCTCCGATCTCGGTTACGCCGTCGCTCCTCCTCCCTCTCAGGAAGAGTTA
CAAAGCTTGGCGTCTTCAAATGGCGAAAGAGGCGATGATTTGGTAAATGTTTTGAGAGAG
TTATCTTCTGTTCAGAGGAAAATTGCAGACTTGCAGGTCGAGCTTCAAGGGAGGAAGGAT
GATAAGAATGTGGCTCATTTGATTCATGTGAGTGAGATGCAAAATAAAATCGAGACTTTG
TCAAGAATTACTCAAATACTGAAAGATGTTATACAAAATAAGGATCGCATCATTGCTCGT
CTCCAACAACCTTATTCACTAGATTGCATTCCAGTTGAAGCTGAATATCAGAAACAATTT
TCAGAGTTGCCAATGAGAGCCGCCAGTGATTATGGCGCCCTAACAGCATCAGTCTCTGAT
TTTCAGTGGAGCCAAAACTTTAAAGAACCTCCTTCAGTCTGGGGGGAAATGCTGCGTCCA
ATACCGGTGGCACTAGCGTCATGCACGAGATTCTTTGAGGCCATGTCTGCGATGAGAGAA
TCATTTGCGACTCTTCAGACCTTCGAGTTGGTACTCTGCAGCTTCTTTACAACACCCCAG
GAGTGACGAATTGTCACAAGAGACTCAGACTGTGTGACTCAACAGTTCAGCTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H751TF U 1
AF RS1FL29TF U 1
BS 1 71 RS1FL29TF
BS 72 72 RS1H751TF
BS 73 773 RS1FL29TF

RD RS1H751TF 677 0 0
TTTTTGTTTGATTTTGTTCTTTCCCAAATCATCAAAGCTGGTGGAGAGATGTCGATGGGA
AGCGACTCGACATGGGTGGGGAAGAAACCGATCCGGCGCATCGGCGGATTATCTGATGCT
CTCTCCATCGCCTCCGATCTCGGTTACGCCGTCGCTCCTCCTCCCTCTCAGGAAGAGTTA
CAAAGCTTGGCGTCTTCAGATGGCGAAAGAGGCGATGATTTGGTAAATGTTTTGAGAGAG
TTATCTTCTGTTCAGAGGAAAATTGCAGACTTGCAGGTCGAGCTTCAAGGGAGGAAGGAT
GATAAGAATGTGGCTCATTTGATTCATGTGAGTGAGATGCAAAATAAAATCGAGACTTTG
TCAAGAATTACTCAAATACTGAAAGATGTTATACAAAATAAGGATCGCATCATTGCTCGT
CTCCAACAACCTTATTCACTAGATTGCATTCCAGTTGAAGCTGAATATCAGAAACAATTT
TCAGAGTTGCTAATGAGAGCCGCCAGTGATTATGGCGCCCTAACAGCATCAGTCTCTGAT
TTTCAGTGGAGCCAAAACTTTAAAGAACCTCCTTCAGTCTGGGGGGAAATGCTGCGTCCA
ATACCGGTGGCACTAGCGTCATGCACGAGATTCTTTGAG*CCATGTCTGCGATGAGAGAA
TCATTTGCGACTCTTCA

QA 1 677 1 677
DS 

RD RS1FL29TF 773 0 0
TTTTTGTTTGATTTTGTTCTTTCCCAAATCATCAAAGCTGGTGGAGAGATGTCGATGGGA
AGCGACTCGACTTGGGTGGGGAAGAAACCGATCCGGCGCATCGGCGGATTATCTGATGCT
CTCTCCATCGCCTCCGATCTCGGTTACGCCGTCGCTCCTCCTCCCTCTCAGGAAGAGTTA
CAAAGCTTGGCGTCTTCAAATGGCGAAAGAGGCGATGATTTGGTAAATGTTTTGAGAGAG
TTATCTTCTGTTCAGAGGAAAATTGCAGACTTGCAGGTCGAGCTTCAAGGGAGGAAGGAT
GATAAGAATGTGGCTCATTTGATTCATGTGAGTGAGATGCAAAATAAAATCGAGACTTTG
TCAAGAATTACTCAAATACTGAAAGATGTTATACAAAATAAGGATCGCATCATTGCTCGT
CTCCAACAACCTTATTCACTAGATTGCATTCCAGTTGAAGCTGAATATCAGAAACAATTT
TCAGAGTTGCCAATGAGAGCCGCCAGTGATTATGGCGCCCTAACAGCATCAGTCTCTGAT
TTTCAGTGGAGCCAAAACTTTAAAGAACCTCCTTCAGTCTGGGGGGAAATGCTGCGTCCA
ATACCGGTGGCACTAGCGTCATGCACGAGATTCTTTGAGGCCATGTCTGCGATGAGAGAA
TCATTTGCGACTCTTCAGACCTTCGAGTTGGTACTCTGCAGCTTCTTTACAACACCCCAG
GAGTGACGAATTGTCACAAGAGACTCAGACTGTGTGACTCAACAGTTCAGCTT

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 3

CO CL3278Contig1 729 3 7 U
GGGTCGTTGCTCGAGATTGAAATCGAAACATGGCTCACAGGATACTGAGAGATCACGACG
CCGATGGATGGGAACGCTCCGACTTCCCAATCGTCTGCGAATCTTGCCTCGGTGACAATC
CCTACGTTCGAATGACCAAGGCGGAGTATGATAAGGAGTGTAAGATATGCACAAGGCCTT
TCACTGTGTTTAGGTGGAGACCTGGGAGAGACGCTAGGTACAAGAAAACCGAGATTTGTC
AGACTTGCTGCAAGCTGAAGAACGTGTGTCAAGTCTGCCTTCTGGATCTTGAGTATGGTC
TTCCTGTTCAAGCTAGGGACACTGCCCTCAACATCACTACTCATGACTCTATCCCAAAGA
GTGATGTCAACAGAGAGTACTTCGCTGAGGAGCATGACAGGAAGACTAGAGCTGGACTGG
ATTATGAATCTTCGTTCGGGAAGATGCGTCCTAATGATACTATTCTAAAGCTTCAGAGGA
CAACACCTTACTATAAGAGGAACAGAGCGCATGTTTGTAGTTTCTACATCAGGGGTGAGT
GTACGAGAGGTGATGAATGTCCGTATCGGCATGAGATGCCTGAAACAGGAGAGCTTTCCC
AGCAGAACATTAAAGACCGTTATTATGGTGTTAATGATCCAGTTGCAATGAAGTTACTTG
GAAAAGCTGGTGAGATGGGCACGTTAGAATCACCAGACGACGAAAGCATCAAACGCTTTA
CGTCGTGGA


BQ
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1H795TF U 1
AF RS1ED53TF U 1
AF RS1DY47TF U 7
BS 1 646 RS1ED53TF
BS 647 647 RS1DY47TF
BS 648 697 RS1ED53TF
BS 698 698 RS1DY47TF
BS 699 720 RS1ED53TF
BS 721 721 RS1DY47TF
BS 722 729 RS1ED53TF

RD RS1H795TF 598 0 0
GGGTCGTTGCTCGAGATTGAAATCGAAACATGGCTCACAGGATACTGAGAGATCACGACG
CCGATGGATGGGAACGCTCCGACTTCCCAATCGTCTGCGAATCTTGCCTCGGTGACAATC
CCTACGTTCGAATGACCAAGGCGGAGTATGATAAGGAGTGTAAGATATGCACAAGGCCTT
TCACTGTGTTTAGGTGGAGACCTGGGAGAGACGCTAGGTACAAGAAAACCGAGATTTGTC
AGACTTGCTGCAAGCTGAAGAACGTGTGTCAAGTCTGCCTTCTGGATCTTGAGTATGGTC
TTCCTGTTCAAGCTAGGGACACTGCCCTCAACATCACTACTCATGACTCTATCCCAAAGA
GTGATGTCAACAGAGAGTACTTCGCTGAGGAGCATGACAGGAAGACTAGAGCTGGACTGG
ATTATGAATCTTCGTTCGGGAAGATGCGGCCTAATGATACTATTCTAAAGCTTCAGAGGA
CAACACCTTACTATAAGAGGAACAGAGCGCATGTTTGTAGTTTCTACATCAGGGGTGAGT
GTACGAGAGGTGATGAATGTCCGTATCGGCATGAGATGCCTGAAACAGGAGAGCTTTC

QA 1 598 1 598
DS 

RD RS1ED53TF 729 0 0
GGGTCGTTGCTCGAGATTGAAATCGAAACATGGCTCACAGGATACTGAGAGATCACGACG
CCGATGGATGGGAACGCTCCGACTTCCCAATCGTCTGCGAATCTTGCCTCGGTGACAATC
CCTACGTTCGAATGACCAAGGCGGAGTATGATAAGGAGTGTAAGATATGCACAAGGCCTT
TCACTGTGTTTAGGTGGAGACCTGGGAGAGACGCTAGGTACAAGAAAACCGAGATTTGTC
AGACTTGCTGCAAGCTGAAGAACGTGTGTCAAGTCTGCCTTCTGGATCTTGAGTATGGTC
TTCCTGTTCAAGCTAGGGACACTGCCCTCAACATCACTACTCATGACTCTATCCCAAAGA
GTGATGTCAACAGAGAGTACTTCGCTGAGGAGCATGACAGGAAGACTAGAGCTGGACTGG
ATTATGAATCTTCGTTCGGGAAGATGCGTCCTAATGATACTATTCTAAAGCTTCAGAGGA
CAACACCTTACTATAAGAGGAACAGAGCGCATGTTTGTAGTTTCTACATCAGGGGTGAGT
GTACGAGAGGTGATGAATGTCCGTATCGGCATGAGATGCCTGAAACAGGAGAGCTTTCCC
AGCAGAACATTAAAGACCGTTATTATGGTGTTAATGATCCAGTTGCGATGAAGTTACTTG
GAAAAGCTGGTGAGATGGGCACGTTAGAATCACCAGATGACGAAAGCATCAAACGCTTTA
TGTCGTGGA

QA 1 729 1 729
DS 

RD RS1DY47TF 723 0 0
GGGTCGTGCTCGAG
AATCGAAACATGGCTCACAGGATACTGAGAGATCACGACGCCGATGGATGGGAACGCTCC
GATTTCCCAATCGTCTGCGAGTCTTGCCTCGGTGACAATCCCTACGTTCGAATGACCAAG
GCGGAGTATGATAAGGAGTGTAAGATATGCACAAGACCTTTCACTGTGTTTAGGTGGAGA
CCTGGGAGAGACGCTAGGTACAAGAAAACCGAGATTTGTCAGACTTGCTGCAAGCTGAAG
AACGTGTGTCAAGTCTGTCTTCTGGATCTTGAGTATGGTCTTCCTGTTCAAGCTAGGGAC
ACTGCGCTCAACATTACTACTCATGACTCTATCCCAAAGAGTGATGTCAACAGAGAGTAC
TTCGCTGAGGAGCATGACAGGAAGACTAGAGCTGGACTGGATTATGAATCTTCTTTTGGG
AAGATGCGTCCTAATGATACTATTCTAAAGCTTCAAAGGACAACACCGTACTATAAGAGG
AACAGAGCGCATGTTTGTAGTTTCTACATCAGGGGTGAGTGTACTAGAGGTGAGGAATGT
CCGTACCGGCATGAGATGTCTGAAACAGGAGAGCTTTCGCAGCAGAACATTAAAGACCGT
TATTATGGTGTTAATGATCCAGTTGCAATGAAGTTACTTGGAAAAGCTGGTGAGATGGGC
ACGTTAGAATCACCAGACGATGAAAGCATCAAACGCTTTACGTCGTGGA

QA 15 723 15 723
DS 



AS 1 2

CO CL3279Contig1 1094 2 2 U
CGTTCAAAATAGCATAATGTCTATTATACCCTTTATATAATTTACAAAATTAAAATTTAA
CTTAACATTATTTTCACTCACGAAAATGACAAAACCACAAGACATATTTTCTCACCAAAA
CTACGAATAATTTTTTCCGCTAAAATCCAAAAAAATGCATTTTCTCGCCAACACCGCAAA
ATGTGTCTTTTCACCAAAACGCATTTTCTCGCCAAAACCGCAAAAACATGTTTTCCCACC
AAAACCGCAAAGCGTGTTTTCCGCCAAAATCGCAAAAATGTGTTTTCCCGCCAAAATGCG
TTTTCCTGATGTGCATAGATAGTATCATAGACAAGGGTCCAGCAAACTCCTGAGAGATAA
AGAGGGAGTACAACAGTTGGATCTAAGCTTCCTTTCACTGCAGTCCATCCTAACAGTGCT
CCCCAGTTTATGGTCAATCCTAAAAATGCTTGAGGCCAAAATGTAAACCTCTTCATAAGT
GGATAGGAGAAGACAAGTAACAAAGATGAAGCCCCTAAAACACGGCTGTAATTGTTCAGT
TGGAGAAGAATCCCTAAGCCTAAAAGCAACTGTAGCCCAAGAAACTGAAGCCCTTGAAAT
GGTGTCAAAAGACCACTGGCAATAGGTCTTAATCTTGTACGATCAACCTTTGTATCAATG
TCCCGGTCAAGCAGATCATTAATAGTACAGCCAGCACCTCTAAGAAGAAGTGCACCGCAA
CCGAACAAACCCATCATTTTAAAACTTGGAAGGCTTCCAGGATCAGCAGCCAACGCAATT
GACCACATACAGGGCCAAGCAAGCAACCAAGTCCCGATGGGTTTATCCAAACGAGCAAGC
TTAGCATAACCTCTAGCTCCTTGAGGCAAATACAAATCCACCCAAGAAGCTTCCTTAACA
CCACCACTCTTCTCCTTGTCGTCGTCTTTCTTAGGATTCCCTTCCACAACCGAAGACATT
CCTGATACTAATCTATAGTTCCAGCCAACACCGAGAAGCTTCTCCTCACGATAAAAGTCC
GTGCCTTTACTACACACATCGTAGTTATGACTCCACGGAGGATACTTAGGCAAAGGGTTT
ATGCAATGTCGTCC


BQ
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AF RS1DX74JQ U 1
AF RS1D338TF C 446
BS 1 700 RS1DX74JQ
BS 701 1094 RS1D338TF

RD RS1DX74JQ 700 0 0
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CTTAACATTATTTTCACTCACGAAAATGACAAAACCACAAGACATATTTTCTCACCAAAA
CTACGAATAATTTTTTCCGCTAAAATCCAAAAAAATGCATTTTCTCGCCAACACCGCAAA
ATGTGTCTTTTCACCAAAACGCATTTTCTCGCCAAAACCGCAAAAACATGTTTTCCCACC
AAAACCGCAAAGCGTGTTTTCCGCCAAAATCGCAAAAATGTGTTTTCCCGCCAAAATGCG
TTTTCCTGATGTGCATAGATAGTATCATAGACAAGGGTCCAGCAAACTCCTGAGAGATAA
AGAGGGAGTACAACAGTTGGATCTAAGCTTCCTTTCACTGCAGTCCATCCTAACAGTGCT
CCCCAGTTTATGGTCAATCCTAAAAATGCTTGAGGCCAAAATGTAAACCTCTTCATAAGT
GGATAGGAGAAGACAAGTAACAAAGATGAAGCCCCTAAAACACGGCTGTAATTGTTCAGT
TGGAGAAGAATCCCTAAGCCTAAAAGCAACTGTAGCCCAAGAAACTGAAGCCCTTGAAAT
GGTGTCAAAAGACCACTGGCAATAGGTCTTAATCTTGTACGATCAACCTTTGTATCAATG
TCCCGGTCAAGCAGATCATTAATAGTACAGCCAGCACCTC

QA 1 700 1 700
DS 

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ATGAAGCCCCTAAAACACGGCTGTAATTGTTCAGTTGGAGAAGAATCCCTAAGCCTAAAA
GCAACTGTAGCCCAAGAAACTGAAGCCCTTGAAATGGTGTCAAAAGACCACTGGCAATAG
GTCTTAATCTTGTACGATCAACCTTTGTATCAATGTCCCGGTCAAGCAGATCATTAATAG
TACAGCCAGCACCTCTAAGAAGAAGTGCACCGCAACCGAACAAACCCATCATTTTAAAAC
TTGGAAGGCTTCCAGGATCAGCAGCCAACGCAATTGACCACATACAGGGCCAAGCAAGCA
ACCAAGTCCCGATGGGTTTATCCAAACGAGCAAGCTTAGCATAACCTCTAGCTCCTTGAG
GCAAATACAAATCCACCCAAGAAGCTTCCTTAACACCACCACTCTTCTCCTTGTCGTCGT
CTTTCTTAGGATTCCCTTCCACAACCGAAGACATTCCTGATACTAATCTATAGTTCCAGC
CAACACCGAGAAGCTTCTCCTCACGATAAAAGTCCGTGCCTTTACTACACACATCGTAGT
TATGACTCCACGGAGGATACTTAGGCAAAGGGTTTATGCAATGTCGTCC

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 3

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ATATCTATCAGTGGAATATACTGAAGACCACAAATCATATGTCTCTATACGGTTTCATCA
GCTACCTTGTAATCTTCCGCACATGATTGGATGGAGAAATTAACAGCGACTTCTATAAAA
CAAGCTCAACACAATTTAATTAGCTGGTGCAAAAACATAATTAGAAAGATGTATATGCAT
ATGAAAATATGCTTGGCTCCTCATACGCCATCCACGTAAGTCCTCGATGGTCGATGAGCT
TAGTGTATGGCATACAGGGAGCCAGGCATATATGTACTATGTATATATGTATCATGATGC
ATAAACGTGTATGTATTGAAACTATTCGCCTACAAAAGATCGATGTCTAATTCTATTTTA
AAGTAAAGCTATATCCAACTGAACATGCATGAACATATATAAGCAACAATATCAGCTAGA
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GATCTTTTGCTCTCTCTCTATCAGGAGAAATTAAGGTTAGGGTTCTTGAAGGCCTGAAAG
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BQ
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AF RS1E681JQ U 1
AF RS1GY89JQ U 1
AF RS1GY89TF C 3
BS 1 640 RS1E681JQ
BS 641 759 RS1GY89TF

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ACTAAACTACGTTAATGTGATTACAGAAGGGATCCTCGTAAGAAGTGCAGTAACAAGACA
AACATTTGTACCAGAAAAATACGAATCGAAAGACTAAATCGTAATCAGAGGGTCACCAAA
ATATCTATCAGTGGAATATACTGAAGACCACAAATCATATGTCTCTATACGGTTTCATCA
GCTACCTTGTAATCTTCCGCACATGATTGGATGGAGAAATTAACAGCGACTTCTATAAAA
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ATGAAAATATGCTTGGCTCCTCATACGCCATCCACGTAAGTCCTCGATGGTCGATGAGCT
TAGTGTATGGCATACAGGGAGCCAGGCATATATGTACTATGTATATATGTATCATGATGC
ATAAACGTGTATGTATTGAAACTATTCGCCTACAAAAGATCGATGTCTAATTCTATTTTA
AAGTAAAGCTATATCCAACTGAACATGCATGAACATATATAAGCAACAATATCAGCTAGA
TGTTTATAAACAAGCTTAAACATGGACTGTGATTTGCATG

QA 1 640 1 640
DS 

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CCAGAAAAATACGAATCGAAAGACTAAATCGTAATCAGAGGGTCACCAAAATATCTATCA
GTGGAATATACTGAAGACCACAAATCATATGTCTCTATACGGTTTCATCAGCTACCTTGT
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GCTTGGCTCCTCATACGCCATCCACGTAAGTCCTCGATGGTCGATGAGCTTAGTGTATGG
CATACAGGGAGCCAGGCATATATGTACTATGTATATATGTATCATGATGCATAAACGTGT
ATGTATTGAAACTATTCGCCTACAAAAGATCGATGTCTAATTCTATTTTAAAGTAAAGCT
ATATCCAACTGAACATGCATGAACATATATAAGCAACAATATCAGCTAGAT

QA 11 601 11 601
DS 

RD RS1GY89TF 757 0 0
GATCTGAA
CGTACGGGAATATAATTAGCTATCGATATAATTTAACAATTTCATAACCAACTAAACTAC
GTTAATGTGATTACAGAAGGGATCCTCGTAAGAAGTGCAGTAACAAGACAAACATTTGTA
CCAGAAAAATACGAATCGAAAGACTAAATCGTAATCAGAGGGTCACCAAAATATCTATCA
GTGGAATATACTGAAGACCACAAATCATATGTCTCTATACGGTTTCATCAGCTACCTTGT
AATCTTCCGCACATGATTGGATGGAGAAATTAACAGCGACTTCTATAAAACAAGCTCAAC
ACAATTTAATTAGCTGGTGCAAAAACATAATTAGAAAGATGTATATGCATATGAAAATAT
GCTTGGCTCCTCATACGCCATCCACGTAAGTCCTCGATGGTCGATGAGCTTAGTGTATGG
CATACAGGGAGCCAGGCATATATGTACTATGTATATATGTATCATGATGCATAAACGTGT
ATGTATTGAAACTATTCGCCTACAAAAGATCGATGTCTAATTCTATTTTAAAGTAAAGCT
ATATCCAACTGAACATGCATGAACATATATAAGCAACAATATCAGCTAGATGTTTATAAA
CAAGCTTAAACATGGACTGTGATTTGCATGTACGGAAATGGAATTGAAAAGATCTTTTGC
TCTCTCTCTATCAGGAGAAATTAAGGTTAGGGTTCTTGAAGGCCTGAAAGAGACGAGAGA
AATTGAGGTTAGGGTTCTTGAAGCCCTCC

QA 9 757 9 757
DS 



AS 1 3

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AATTAAAGAAGGTCGATCATGATGATAATACTATAGTACAAGCAGTAAACCACAATGATT
TATAACAAGTTTCTTATCTACTCTCGACTTATTTAATAGTTGATCATAATTAGTTTCTAC
TTGTAATTGCAAGCAGAAAACATCCGTCTCAAGCAGAAGTTTCACTACTCTCACGTTTTA
CCTCTTACTCCCCAACCAAAAGAGACTTGATGATCTTATCAGTCACCCCTTCCACAAGAG
GTAACAAATGTCCGGATCCTGAGATTTCATGGTAATGAATCCATGGAAGCTTTGATGCTA
TATAACTCTGAAGCTTCACTGGCACAAACCTGTCCTCATCACCATGCCATAAGTGAACCG
AGCCATTCTTGTTCGGGAACGGATCTTGAAGGTCTAAAGGATCGAACTCCCAGCTTGAAA
ATCCAACATTCAAATCTCGGTGTAGGCTTTCGTATTCACCTTGTTGTCTTGTGTATGCCC
GATTTGGACTGATGAATCCGAGCTTAGACAAGACCTCCATGTCCTGACGGGAGAAAATGA
TGGGGTTTCCAGCGATCACATTGGAGATCGGGAACCATTTCTGAGTGTTCCACCAATACG
TAAGCCAAGGAGCATAGTGAGCTACGCGAAGTGACCATTGATCTGCAGGATACATAAGTG
AGAAAGCTTCTCTTGTTATGTCTCCTGGTAAGTTCCTCCACCAGTAGTTAATCGCTGGTG
CTACAAGCGCTGCTCCTGCTAACCTGTGAGGAATGTACTTAAGGCC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BA18JQ U 1
AF RS1BA18TF C 2
AF RS1C303JQ U 5
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TGGGGTTTCCAGCGATCACATTGGAGATCGGGAACCATTTCTGAGTGTTCCACCAATACG
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AGAAAGCTTCTCTTGTTATGTCTCCTGGTAAGTTCCTCCACCAGTAGTTAATCGCTGGTG
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TG

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ATT
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ATTCTTGTTCGGGAACGGATCTTGAAGGTCTAAAGGATCGAACTCCCAGCTTGAAAATCC
AACATTCAAATCTCGGTGTAGGCTTTCGTATTCACCTTGTTGTCTTGTGTATGCCCGATT
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QA 4 765 4 765
DS 

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ACAAGTTTCTTATCTACTCTCGACTTATTTAATAGTTGATCATAATTAGTTTCTACTTGT
AATTGCAAGCAGAAAACATCCGTCTCAAGCAGAAGTTTCACTACTCTCACGTTTTACCTC
TTACTCCCCAACCAAAA*AGACTTGATGATCTTACCAGTCACCCCTTCCACAAGAGGTAA
CAAATGTCCGGATCCTGAGATTTCATGGTAATGAATCCATGGAAGCTTTGATGCTATATA
ACTCTGAAGCTTCACTGGCACAAACCTGTCCTCATCACCATGCCATAAGTGAACCGAGCC
ATTCTTGCTCGGGAACGGATCTTGAAGGTCTAAAGGATCGAACTCCCAGCTTGAAAATCC
AACATTCAAATCTCGGTGTAGGCTTTCGTATTCACCTTGTTGTCTTGTGTATGCCCGATT
TGGACTGATGAATCCGAGCTTAGACAAGACCTCCATGTCCTGACGGGAGAAAATGATGGG
GTTTCCAGCGATCACATTGGAGATCGGGAACCATTTCTGAGTGTTCCACCAATACGTAAG
CCAAGGAGCATAGTGAGCTACGCGAAGTGACCATTGATCTGCAGGATACATAAGTGAGAA
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AAGCGCTGCTCCTGCTAACCTGTGAGGAATG

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 3

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CCCAGAGCTCTTCTTGTTGCTCCCGATGATTTAAAAATCAATTTCTTTTGCATGTTCTTG
TTTGTTTTTATCAGAGAAAAAACATAATTAAGGTTACATTTATCAGTTCGGACTTATACA
AGACTTGCAATATGTTGTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FL73TF U 1
AF RS1FL73JQ C 208
AF RS1H682TF U 318
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BS 595 779 RS1H682TF
BS 780 780 RS1FL73JQ
BS 781 863 RS1H682TF

RD RS1FL73TF 594 0 0
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DS 

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G

QA 1 626 1 626
DS 

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G
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TTTTT

QA 2 546 2 546
DS 



AS 1 3

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AGCGTTGAAGCTTGATTTTGGTTTAGCCACCAAAAGAAATCTCAAAAGACTCCTTTCTCT
AGTTGAAGAAGCATTAGGCCTCTCTCTCTCTGCTTTGAGTTTTGCTTATCAGAATTTGCA
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CATTTTGAAAATCAGGTTGCCTGTTTTCTTTGTTTTTTTTTTTTAATGTAGATTGATTCT
CTTTTTATATATCATGGGGTCATTTTCTTGTTTTAGTTTTAGTTTCCTTGTGGACGTTAA
AGCAAAAAGAAAACATATATAAGTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D892TF U 9
AF RS1EL74TF U 1
AF RS1D892JQ C 231
BS 1 28 RS1EL74TF
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BS 727 753 RS1EL74TF
BS 754 807 RS1D892JQ

RD RS1D892TF 665 0 0
GG
ATCGCCTTAAAACAGATCCAATCGCCAAGTGAATCGTCTCTTCCGCCAAAACCAAAAACA
AAATGGCTGAGGCAGCACCTGCATTGAGGAAGCCTGTGTTCACTAAGGTTAGTGAGTTGA
GACCAGGAACCAATGGTCTCTCACTTAACGTGAAAGTTATCAGCACGAAGATGGTGATGC
AGAGAGGAGGAGGAGGTCGTCCCAGTGGTCCTCAGGCTCGTCAGATGCGTATTGCTGAAT
GTCTTGTTGGTGATGAGACTGGAATCATTATCTTTACCGCAAGAAACGATCAAGTGGATT
TGATGAAAGAAGGGAAGATAGTGACCCTGCGCAATGCGAAGATCGACATGTACAAGGGCT
CTATGAGGCTTGTTGTTGATAGGTGGGGGCGCGTTGAAGTCGCCGAGGATTCCGCAGACA
TCACTGTCAAGGAAGATAACAATCTTTCCCTCATCGAGTATGAGCTTGTGAGCGTTGAAG
CTTGATTTTGGTTTAGCCACCAAAAGAAATCTCAAAAGACTCCTTTCTCTAGTTGAAGAA
GCATTAGGCCTCTCTCTCTCTGCTTTGAGTTTTGCTTATCAGAATTTGCAGGTTGGTTTT
TTGTTGCTGGTTTGAATCTTTATGCTTGCCTCTGATGTATGTACCGTTCTCATTTTGAAA
ATC

QA 3 662 3 662
DS 

RD RS1EL74TF 753 0 0
GGTTGTGTTCATCGCCTTAAAACAGATCTAATCGCCAAGTGAATCGTCTCTTCCGCCAAA
ACAAAAAACAGAATGGCTGAGGCATCACCTGCATTGAGGAAGCCTGTGTTCACCAAGGTT
AGTGAGCTGAGACCAGGAACCAATGGTCTCTCACTTAACGTGAAAGTTATCAGCACGAAG
ATGGTGATGCAGAGAGGAGGAGGAGGTCGTCCCAGTGGTCCTCAGGCGCGTCAGATGCGT
ATTGCTGAATGTCTTGTTGGTGATGAGACTGGAATCATTATCTTTACCGCAAGAAACGAT
CAAGTTGACTTGATGAAAGAAGGGAAGATAGTGACACTGCGCAATGCGAAGATCGACATG
TACAAGGGCTCTATGAGGCTTGCTGTTGATAGGTGGGGGCGCGTTGAAGTCGCTGAGGAT
TCCGCAGACATCACTGTCAAGGAAGATAACAATCTTTCCCTCATCGAGTATGAGCTTGTG
AGCGTTGAAGCTTAAATTTGGTTTAGACACCAAAAGAAATCTCAAAAGACTCCTTTCTCT
AGTTGAAGAAGCATTAGGCCTCTCTCTCTCTGCTTTGAGTTTTGCTTATCAGAATTTGCA
GGTTGGTTTTTTGTTGCTGGTTTGAATCTTTATGCTTGCCTCTGATGTATGTACCGTTCT
CATTTTGAAATTCAG*TTGCCTGTTTTCTTTGTTTTTTTTTT**AATGTAGATTGATTCT
CTTTT*ATATATCATGGGGTCATTTTCTTGTTT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1D892JQ 577 0 0
TCAGATGCGTATTGCTGAATGTCTTGTTGGTGATGAGACTGGAATCATTATCTTTACCGC
AAGAAACGATCAAGTGGATTTGATGAAAGAAGGGAAGATAGTGACCCTGCGCAATGCGAA
GATCGACATGTACAAGGGCTCTATGAGGCTTGTTGTTGATAGGTGGGGGCGCGTTGAAGT
CGCCGAGGATTCCGCAGACATCACTGTCAAGGAAGATAACAATCTTTCCCTCATCGAGTA
TGAGCTTGTGAGCGTTGAAGCTTGATTTTGGTTTAGCCACCAAAAGAAATCTCAAAAGAC
TCCTTTCTCTAGTTGAAGAAGCATTAGGCCTCTCTCTCTCTGCTTTGAGTTTTGCTTATC
AGAATTTGCAGGTTGGTTTTTTGTTGCTGGTTTGAATCTTTATGCTTGCCTCTGATGTAT
GTACCGTTCTCATTTTGAAAATCAGGTTGCCTGTTTTCTTTGTTTTTTTTTTTTAATGTA
GATTGATTCTCTTTTTATATATCATGGGGTCATTTTCTTGTTTTAGTTTTAGTTTCCTTG
TGGACGTTAAAGCAAAAAGAAAACATATATAAGTGCC

QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 3

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TGCTTTAACGAAGTCAAAGCTCCAAAAAAAACTAAGAGATGGAGAATCTACCACCTGGTT
ATCGTCCCAATGTTGGTGTTTGTCTAATCAATTCGGATAATCTGGTATTTGTAGCTTCAA
GATTGAATGTTCCTGGAGCATGGCAGATGCCACAGGGAGGCATTGAAGATGGAGAGGATC
CAAAGTCAGCAGCCATGAGAGAGTTACAAGAAGAAACTGGAGTCGTTTCAGCTGCAATCA
TCGCTGAGGTTCCAAATTGGTTGACAAATGATTTCCCACCTGCAGTAAAAGCAAAAGTTA
ACCGTCTATGGGGCGGTGAATGGCATGGTCAAGCACAGAAATGGTTTCTAGTGAGACTGA
TAAACGACGAGGACGAAAGAGAGATCAATCTAGCTAGCAATGAAGCGGATTCAGAGTTTG
CGGAGTGGAGATGGGCGAGACCGGAAGAAGTGGTAGAGCAAGCAGTCGATTACAAAAGGC
CAACGTATGAACAAGTCATAAAGACTTTTGGTTCTTACTTGAATGATCCAGGAAGAGCTG
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CATTTTGTAAATTGGTTATTGGAACTAGAAGGTTTTGGTTTTGGTTTTAACTTGAGGGTT
TATATTGTAATAAAGTCTTGGTCTGGATCCGCAAAAAGGAATGACTTGTGTATGTCCTTG
TAACTTATTATAACCAAGTGTAAGGAATTCAAAGGTTAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DE62TF U 1
AF RS1GO30TF U 340
AF RS1DE62JQ C 89
BS 1 629 RS1DE62TF
BS 630 630 RS1GO30TF
BS 631 679 RS1DE62TF
BS 680 820 RS1DE62JQ

RD RS1DE62TF 682 0 0
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TGCTTTAACGAAGTCAAAGCTCCAAAAAAAACTAAGAGATGGAGAATCTACCACCTGGTT
ATCGTCCCAATGTTGGTGTTTGTCTAATCAATTCGGATAATCTGGTATTTGTAGCTTCAA
GATTGAATGTTCCTGGAGCATGGCAGATGCCACAGGGAGGCATTGAAGATGGAGAGGATC
CAAAGTCAGCAGCCATGAGAGAGTTACAAGAAGAAACTGGAGTCGTTTCAGCTGCAATCA
TCGCTGAGGTTCCAAATTGGTTGACAAATGATTTCCCACCTGCAGTAAAAGCAAAAGTTA
ACCGTCTATGGGGCGGTGAATGGCATGGTCAAGCACAGAAATGGTTTCTAGTGAGACTGA
TAAACGACGAGGACGAAAGAGAGATCAATCTAGCTAGCAATGAAGCGGATTCAGAGTTTG
CGGAGTGGAGATGGGCGAGACCGGAAGAAGTGGTAGAGCAAGCAGTCGATTACAAAAGGC
CAACGTATGAACAAGTCATAAAGACTTTTGGTTCTTACTTGAATGATCCAGGAAGAGCTG
CTAAATGTAAATCTGCCAAGTGGTGATAAAGAAAC*AATGCTTGTCTTTTGCTTTGTGTT
CATTTTGTAAATTGGTTAT
GGA

QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1GO30TF 350 0 0
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AATGGTTTCTAGTGAGACTGATAAACGACGAGGACGAAAGAGAGATCAATCTAGCTAACA
ATGAAGCGGATTCAGAGTTTGCGGAGTGGAAATGGGCGAGACCGGAAGAAGTGGTAGAGC
AAGCAGTCGATTACAAAAGGCCAACGTATGAACAAGTCATAAAGACTTTTGGTTCTTACT
TGAATGATCCAGGAAGAGCTGCTAAATGTAAATCTGCCAAGTGGTGATAAGGAAACCAAT
GTTTGTCTTTTGCTTTGTGTTCATTTTGTAAATTGGTTAT
TGGAACTAGA

QA 1 340 1 340
DS 

RD RS1DE62JQ 732 0 0
AAACTAAGAGATGGAGAATCTACCACCTGGTTATCGTCCCAATGTTGGTGTTTGTCTAAT
CAATTCGGATAATCTGGTATTTGTAGCTTCAAGATTGAATGTTCCTGGAGCATGGCAGAT
GCCACAGGGAGGCATTGAAGATGGAGAGGATCCAAAGTCAGCAGCCATGAGAGAGTTACA
AGAAGAAACTGGAGTCGTTTCAGCTGCAATCATCGCTGAGGTTCCAAATTGGTTGACAAA
TGATTTCCCACCTGCAGTAAAAGCAAAAGTTAACCGTCTATGGGGCGGTGAATGGCATGG
TCAAGCACAGAAATGGTTTCTAGTGAGACTGATAAACGACGAGGACGAAAGAGAGATCAA
TCTAGCTAGCAATGAAGCGGATTCAGAGTTTGCGGAGTGGAGATGGGCGAGACCGGAAGA
AGTGGTAGAGCAAGCAGTCGATTACAAAAGGCCAACGTATGAACAAGTCATAAAGACTTT
TGGTTCTTACTTGAATGATCCAGGAAGAGCTGCTAAATGTAAATCTGCCAAGTGGTGATA
AGGAAAC*AATGCTTGTCTTTTGCTTTGTGTTCATTTTGTAAATTGGTTATTGGAACTAG
AAGGTTTTGGTTTTGGTTTTAACTTGAGGGTTTATATTGTAATAAAGTCTTGGTCTGGAT
CCGCAAAAAGGAATGACTTGTGTATGTCCTTGTAACTTATTATAACCAAGTGTAAGGAAT
TCAAAGGTTAGG

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 3

CO CL3285Contig1 682 3 3 U
GGGAGAGAGAGAGAGAGCGAAAGAGAGATGGCTGAAACAGCGAGAAGACAAGGTGGTGGT
GGGAGGCCGTTTCCGCCGCCTCCTCCGAGAGGCGTTAATCAACCCCCTCGCCCTAAAGCC
GAACCTGTCGATCGCGAGAAGACGTGTCCTTTGCTTCTTCGTGTGTTCACCAAGAGTGGT
GGTCATCATACTAAGGAAGATTATGCTGTTAGAGGCAAAGAGCCAAAGGACGAAGTTCAG
ATTTACACTTGGAAAGATGCCAATCTTCGCGAGCTAACAGATTTGGTCAAAGAGGTTTCT
GTGGCAGCTAGGAGAAGAGATGCGAGATTATCGTTTGCGTTTGTTTATCCAGACAAGAAT
GGCCGCTTTATTGTCAGACAGGTTGGTCAGACGATGTCTTATCCAAACAGAAAACAACCA
GACGACAGTAAAACACTCGCGGACCTTCATTTTGAGATTGGAGATTATCTGGATGTGGCA
ATCTACTAGGAGGAGGAGGTTTCTGTTTTT*CCTCGAGTAACATTTAGGGGTGTGTGCAC
AAGGAAAAGAACACATTCGTAGTCGTTCCCATTCCTTGTTTTCTTTAACAACAGTTGTTC
CCATTTCAAAACTTCGTTTAGACACATATTATGTATCCTTGGATCTGGTCTGTGCACAAC
TGGTTTAGTCATAACTTTTCTC


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AQ41JQ C 141
AF RS1BN50TF U 3
AF RS1AQ41TFB U 1
BS 1 122 RS1AQ41TFB
BS 123 123 RS1BN50TF
BS 124 682 RS1AQ41TFB

RD RS1AQ41JQ 499 0 0
GACGTGTCCTTTGCTTCTTCGTGTGTTCACCAAGAGTGGTGGTCATCATACTAAGGAAGA
TTATGCTGTTAGAGGCAAAGAGCCAAAGGACGAAGTTCAGATTTACACTTGGAAAGATGC
CAATCTTCGCGAGCTAACAGATTTGGTCAAAGAGGTTTCTGTGGCAGCTAGGAGAAGAGA
TGCGAGATTATCGTTTGCGTTTGTTTATCCAGACAAGAATGGCCGCTTTATTGTCAGACA
GGTTGGTCAGACGATGTCTTATCCAAACAGAAAACAACCAGACGACAGTAAAACACTCGC
GGACCTTCATTTTGAGATTGGAGATTATCTGGATGTGGCAATCTACTAGGAGGAGGAGGT
TTCTGTTTTT*CCTCGAGTAACATTTAGGGGTGTGTGCACAAGGAAAAGAACACATTCGT
AGTCGTTCCCATTCCTTGTTTTCTTTAACAACAGTTGTTCCCATTTCAAAACTTCGTTTA
GACACATATTATGTATCCT

QA 1 499 1 499
DS 

RD RS1BN50TF 639 0 0
GG
GAGAGAGAGAGAGCGAAAGAGAGATGGCTGAAACAGCGAGAAGACAAGGTGGTGGTGGGA
GGCCGTTTCCGCCGCCTCCTCCGAGAGGCGTTAATCAACCCCCTCGCCCTAAAGCCGAAC
CTGTCGATCGCGAGAAGACGTGTCCTTTGCTACTTCGTGTGTTCACCAAGAGTGGTGGTC
ATCATACTAAGGAAGATTATGCTGTGAGAGGCAAAGAGCCAAAGGACGAAGTTCAGATTT
ACACTTGGAAAGATGCCAATCTTCGCGAGCTAACGGATTTGGTCAAAGAGGTTTCTGTGG
CAGCTAGGAGAAGAGATGCTAGATTATCGTTTGCGTTTGTTTATCCAGACAAGAATGGCC
GCTTTATTGTCAGACAGGTTGGTCAGACGATGTCTTATCCAAACAGAAAACAACCAGACG
ACAGTAAAACACTCGCGGACCTTCATTTTGAGATTGGAGATTATCTGGATGTGGCAATCT
ACTAGGAGGAGGAGGTTTCTGTTTTTTCCTCGAGTAACATTTAGGGGTGTGTGCACAAGG
AAAAGAACACATTCGTAGTCGTTCCCATTCCTTGTTTTCTTTAACAACAGTTGTTCCCAT
TTCAAAACTTCGTTTAGACACATATTATGTATCCT
TG

QA 3 637 3 637
DS 

RD RS1AQ41TFB 682 0 0
GGGAGAGAGAGAGAGAGCGAAAGAGAGATGGCTGAAACAGCGAGAAGACAAGGTGGTGGT
GGGAGGCCGTTTCCGCCGCCTCCTCCGAGAGGCGTTAATCAACCCCCTCGCCCTAAAGCC
GAGCCTGTCGATCGCGAGAAGACGTGTCCTTTGCTTCTTCGTGTGTTCACCAAGAGTGGT
GGTCATCATACTAAGGAAGATTATGCTGTTAGAGGCAAAGAGCCAAAGGACGAAGTTCAG
ATTTACACTTGGAAAGATGCCAATCTTCGCGAGCTAACAGATTTGGTCAAAGAGGTTTCT
GTGGCAGCTAGGAGAAGAGATGCGAGATTATCGTTTGCGTTTGTTTATCCAGACAAGAAT
GGCCGCTTTATTGTCAGACAGGTTGGTCAGACGATGTCTTATCCAAACAGAAAACAACCA
GACGACAGTAAAACACTCGCGGACCTTCATTTTGAGATTGGAGATTATCTGGATGTGGCA
ATCTACTAGGAGGAGGAGGTTTCTGTTTTT*CCTCGAGTAACATTTAGGGGTGTGTGCAC
AAGGAAAAGAACACATTCGTAGTCGTTCCCATTCCTTGTTTTCTTTAACAACAGTTGTTC
CCATTTCAAAACTTCGTTTAGACACATATTATGTATCCTTGGATCTGGTCTGTGCACAAC
TGGTTTAGTCATAACTTTTCTC

QA 1 682 1 682
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3287Contig1 801 3 3 U
CCATTACGGCCGGGGGATTCGATTCGAGTCTCTCCGGCGACTTTCACACTCCACAGAAGG
CAGCGTTTTCAGATTTGGGGAGAAAAAAAATGTCGAACATAAACATAGAAGGGATTATGA
AGGATCTACCAGACGACGGGAGGACTCCTAAGACGAAGATCGTCTGCACTCTTGGTCCCG
CCTCTCGCTCCGTTCCCATGATCGAGAAGCTTCTCAGAGCCGGCATGAACGTCGCTCGTT
TCAACTTCTCTCACGGTAGCCACGAGTACCATCAGGAGACTCTCGACAATCTCCGCGCCG
CTATGCAGAACACTGGCATGCG*GCTGCTGTTATGCTCGACACAAAGGGGCCTGAGATTC
GTACTGGATTCTTGAAAGATGGGAACCCTATACAGCTCAAGGAAGGTCAGGAGATAACTA
TCAGCACTGACTACGACATCAAGGGCGATGAGAAAACTATTTCAATGAGCTACAAGAAGC
TGCCGGTGGATGTTCAGCCGGGGCATACAATACTGTGTGCTGATGGGAGCATTAGTCTAG
CTGTGCTGTCGTGCGATACGAAGGCTGGGACTGTGAGATGTCGGTGCGAGAATACAGCGA
TGCTGGGGGAGGGAAAGAACGTGAATCTCCCTGGTGTTGTTGTTGATCTCCCTACGCTGA
CTGAGAAGGATGTGGAGGATATTCTGAAATGGGGTGTTCCGAACAAGATCGATATGATTG
CTCTCTCGTTTGTTCGGAAAGGATCGGATCTTGTTAATGTCAGAAGTGCTTGGATCACAT
TCCAGAGTATAATGTTGATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CU01TF U 15
AF RS1A127TV U 95
AF RS1A127TF U 1
BS 1 739 RS1A127TF
BS 740 740 RS1A127TV
BS 741 801 RS1A127TF

RD RS1CU01TF 454 0 0
GGATTCGATTCGAGTCTCTCCGGCGACTTTCACACTCCACATAAGGCAGCGTTTTCAGAT
TTGGGGAGAAAAAAAATGTCGAACATAAACATAGAAGGGATTATGAAGGATCTACCAGAC
GACGGGAGGACTCCTAAGACGAAGATCGTCTGCACTCTTGGTCCCGCCTCTCGCTCCGTT
CCCATGATCGAGAAGCTTCTCAGAGCCGGCATGAACGTCGCTCGTTTCAACTTCTCTCAC
GGTAGCCACGAGTACCATCAGGAGACTCTCGACAATCTCCGCGCCGCTATGCAGAACACT
GGCATGCTCGCTGCTGTTATGCTCGACACAAAGGGGCCTGAGATTCGTACTGGATTCTTG
AAAGATGGGAACCCTATACAGCTCAAGGAAGGTCAGGAGATAACTATCAGCACTGACTAC
GACATCAAGGGC**TGAGAAAACTATTTCAATGA

QA 1 454 1 454
DS 

RD RS1A127TV 666 0 0
GAACATAAACATAGAAGGGATTATGAAGGATCTACCAGACGACGGGAGGACTCCTAAGAC
GAAGATCGTCTGCACTCTTGGTCCCGCCTCTCGCTCCGTTCCCATGATCGAGAAGCTTCT
CAGAGCCGGCATGAACGTCGCTCGTTTCAACTTCTCTCACGGTAGCCACGAGTACCATCA
GGAGACTCTCGACAATCTCCGCGCCGCTATGCAGAACACTGGCATGCG*GCTGCTGTTAT
GCTCGACACAAAGGGGCCTGAGATTCGTACTGGATTCTTGAAAGATGGGAACCCTATACA
GCTCAAGGAAGGTCAGGAGATAACTATCAGCACTGACTACGACATCAAGGGCGATGAGAA
AACTATTTCAATGAGCTACAAGAAGCTGCCGGTGGATGTTCAGCCGGGGCATACAATACT
GTGTGCTGATGGGAGCATTAGTCTAGCTGTGCTGTCGTGCGATACGAAGGCTGGGACTGT
GAGATGTCGGTGCGAGAATACAGCGATGCTGGGGGAGGGAAAGAACGTGAATCTCCCTGG
TGTTGTTGTTGATCTCCCTACGCTGACTGAGAAGGATGTGGAGGATATTCTGAAATGGGG
TGTTCCGAACAAGATCGATATGATTGCTCTCTCGTTTGTTCGGAAAGGATCGGATCTTGT
TAATGT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RS1A127TF 801 0 0
CCATTACGGCCGGGGGATTCGATTCGAGTCTCTCCGGCGACTTTCACACTCCACAGAAGG
CAGCGTTTTCAGATTTGGGGAGAAAAAAAATGTCGAACATAAACATAGAAGGGATTATGA
AGGATCTACCAGACGACGGGAGGACTCCTAAGACGAAGATCGTCTGCACTCTTGGTCCCG
CCTCTCGCTCCGTTCCCATGATCGAGAAGCTTCTCAGAGCCGGCATGAACGTCGCTCGTT
TCAACTTCTCTCACGGTAGCCACGAGTACCATCAGGAGACTCTCGACAATCTCCGCGCCG
CTATGCAGAACACTGGCATGCG*GCTGCTGTTATGCTCGACACAAAGGGGCCTGAGATTC
GTACTGGATTCTTGAAAGATGGGAACCCTATACAGCTCAAGGAAGGTCAGGAGATAACTA
TCAGCACTGACTACGACATCAAGGGCGATGAGAAAACTATTTCAATGAGCTACAAGAAGC
TGCCGGTGGATGTTCAGCCGGGGCATACAATACTGTGTGCTGATGGGAGCATTAGTCTAG
CTGTGCTGTCGTGCGATACGAAGGCTGGGACTGTGAGATGTCGGTGCGAGAATACAGCGA
TGCTGGGGGAGGGAAAGAACGTGAATCTCCCTGGTGTTGTTGTTGATCTCCCTACGCTGA
CTGAGAAGGATGTGGAGGATATTCTGAAATGGGGTGTTCCGAACAAGATCGATATGATTG
CTCTCTCGTTTGTTCGGAA*GGATCGGATCTTGTTAATGTCAGAAGTGCTTGGATCACAT
TCCAGAGTATAATGTTGATGT

QA 1 801 1 801
DS 



AS 1 3

CO CL3288Contig1 967 3 9 U
GGGTCCATCTGTTTCTCTCGGAGATTTAGTTGCGAAGAAGAACGAGCTTAAGATTTTGAT
TCAGGTGGAGATTTAATCAGACAGTGATTATGGAGAGTGAAACGAAACCAACCTTCAACA
AATCAACAGGGCTTCCACGCAAGCGATTCTACAGAGCAAGAGCTCATAGCAACCCACTCA
GCGACTCTCACTTCTCCATTCCCATCTCCCCATCTCACGTCGTCTTTTCGCTTCACTTCC
CCAAGTTCGTTGGAGCCAACAACGAAGAAGAAGTCTCCAAGAAGGTTGAGTTCGCTGATA
TCGGATGCGGCTTCGGCGGTCTTCTCATCTCCCTCGCGACGCTCTTCCCTGATACATTGA
TGATCGGCATGGAGCTGAGGGATAAAGTTACTGAATACGTCAAGGAACGGATCTTAGCCT
TGAGGAAGACGAGCTCGGGGGGACAGTACGAGAACATCTCTGTTGTTAGGACTAACTCGA
TGAAGTACATTCCGAATTACTTTGAGAAAGGACAGCTTTCCAAGATGTTTTTCCTCTTTC
CGGATCCGCATTTCAAGGAGAAGAATCACAGGAGGAGGGTGATTAGTATTGATTTGCTGG
ATGAGTATGCGTACGTTCTTAGAGCTGGTGGGATTATATACACGATCACTGACGTTGAGG
AGCTTGGTGAGTGGATGAGGTCTTGCTTGGAGAAACATCCCATGTTTGAGTCTTTGACAC
AGGAAGAGCTTGATTCTGATCCTGTCGTTGAGCTTCTGTGCAGTGCTACTGAGGAAGGAC
AGAAAGTTGCCAGGAATGGAGGTCAGACTTTCAGAGCCGTTTTCAGACGCATTGCATATG
TTTCTTGAATTCAATCTCTTTCTTTTTTGTAGTGAACCCCTTATTGTTGTTGTAACCCCA
GATTCTTTCTTCACTTCAAATTTATTGGGATAGTATTTTTACAGAAATTAATGATCTTTC
AAGGCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C769TF U 1
AF RS1EM66TF U 18
AF RS1C769JQ C 168
BS 1 117 RS1C769TF
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BS 119 718 RS1C769TF
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BS 736 769 RS1EM66TF
BS 770 967 RS1C769JQ

RD RS1C769TF 718 0 0
GGGTCCATCTGTTTCTCTCGGAGATTTAGTTGCGAAGAAGAACGAGCTTAAGATTTTGAT
TCAGGTGGAGATTTAATCAGACAGTGATTATGGAGAGTGAAACGAAACCAACCTTCAGCA
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CCAAGTTCGTTGGAGCCAACAACGAAGAAGAAGTCTCCAAGAAGGTTGAGTTCGCTGATA
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TGATCGGCATGGAGCTGAGGGATAAAGTTACTGAATACGTCAAGGAACGGATCTTAGCCT
TGAGGAAGACGAGCTCGGGGGGACAGTACGAGAACATCTCTGTTGTTAGGACTAACTCGA
TGAAGTACATTCCGAATTACTTTGAGAAAGGACAGCTTTCCAAGATGTTTTTCCTCTTTC
CGGATCCGCATTTCAAGGAGAAGAATCACAGGAGGAGGGTGATTAGTATTGATTTGCTGG
ATGAGTATGCGTACGTTCTTAGAGCTGGTGGGATTATATACACGATCACTGACGTTGAGG
AGCTTGGTGAGTGGATGAGGTCTTGCTTGGAGAAACATCCCATGTTTGAGTCTTTGAC

QA 1 718 1 718
DS 

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GG
GGAGATTTAGTTGCGAAGAAGAACGAGCTTAAGATTTTGATTCAGGTGGAGATTTAATCA
GACAGTGATTATGGAGAGTGAAACGAAACCAACCTTCAACAAGTCAACAGGGCTTCCACG
CAAGCGATTCTACAGAGCAAGAGCTCATAGCAACCCACTCAGCGACTCTCACTTCCCCAT
TCCCATCTCCCCATCTCACGTCGTCTTTTCGCTTCACTTCCCCAAGTTCGTTGGAGCCAA
CAACGAAGAAGAAGTCTCCAAGAAGGTTGAGTTCGCTGATATCGGATGCGGCTTCGGCGG
TCTTCTCATCTCCCTCGCGACGCTCTTCCCTGATACATTGATGATCGGCATGGAGCTGAG
GGATAAAGTTACTGAATACGTCAAGGAACGGATCTTAGCCTTGAGGAAGACGAGCTCGGG
GGGACAGTACGAGAACATCTCTGTTGTTAGGACTAACTCGATGAAGTACATTCCGAATTA
CTTTGAGAAAGGACAGCTTTCCAAGATGTTTTTCCTCTTTCCGGATCCGCATTTCAAGGA
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TCCTGTCGTTGAGCTTCTGTGCAGTGCTAC

QA 3 752 3 752
DS 

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TCGCTTCACTTCCCCAAGTTCGTTGGAGCCAACAACGAAGAAGAAGTCTCCAAGAAGGTT
GAGTTCGCTGATATCGGATGCGGCTTCGGCGGTCTTCTCATCTCCCTCGCGACGCTCTTC
CCTGATACATTGATGATCGGCATGGAGCTGAGGGATAAAGTTACTGAATACGTCAAGGAA
CGGATCTTAGCCTTGAGGAAGACGAGCTCGGGGGGACAGTACGAGAACATCTCTGTTGTT
AGGACTAACTCGATGAAGTACATTCCGAATTACTTTGAGAAAGGACAGCTTTCCAAGATG
TTTTTCCTCTTTCCGGATCCGCATTTCAAGGAGAAGAATCACAGGAGGAGGGTGATTAGT
ATTGATTTGCTGGATGAGTATGCGTACGTTCTTAGAGCTGGTGGGATTATATACACGATC
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GAGTCTTTGACACAGGAAGAGCTTGATTCTGATCCTGTCGTTGAGCTTCTGTGCAGTGCT
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CGCATTGCATATGTTTCTTGAATTCAATCTCTTTCTTTTTTGTAGTGAACCCCTTATTGT
TGTTGTAACCCCAGATTCTTTCTTCACTTCAAATTTATTGGGATAGTATTTTTACAGAAA
TTAATGATCTTTCAAGGCCG

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 3

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CATTTCAACAGTAAAAGGAACATGCTTCGAGAGGTGGACATGTTTCTTCTATTGACATTA
CATATATGTATTCAACGACTGGAAACGAGAAAAAA**ACAACAGAGGGATTAATAATGTC
ATGAACTCTTCTCTTCCAATGAGATCTGCAACTCCAAATCTTCACTTCCTCTCTTGATCG
CTAGTTTCACCTTATCACCCACACTATACTCATCCAATACCTTCATCAATTCCGCTTTGC
TTTTCACGGGTTTATCATCAACTGCAACAATGATATCTCCAAGTACTATATTACCAGCAA
AACCTCGGGATGTTGGACGTAACCCTGCTTTTGCAGCCAGACTATCTCCAGGCACCTGAA
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TGTTAATACCAGCTCGAAGGACTTTGCTGAACTGGATTAGTTGAGGAACAATTTTCAATA
CAGTTGATGACGGTATTGCAAATCCAACACCAGCAGATGTTCCTGTCTGTGTGTATATGG
CTGTGTTGATACCAATTAAGTTTCCTTTTGAATCGAGCAGAGGACCTCCACTGTTTCCCG
GGTTAATAGCTGCATCGGTTTGAATCCCACCACCAATGGTAACACCGGTTTGGCTAAAAA
TGTCACGGTTAAGACCGCTGATGACACCAACCGTAAGGATGTGGTCAAAACCAAACGGGT
TCCCAATTGCTAAACACTGCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EU96JQ U 22
AF RS1GJ81JQ U 66
AF RS1GT80JQ U 1
BS 1 589 RS1GT80JQ
BS 590 590 RS1GJ81JQ
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RD RS1EU96JQ 661 0 0
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ATGCTTCGAGAGGTGGACATGTTTCTTCTATTGACATTACATATATGTATTCAACGACTG
GAAACGAGAAAAAA**ACAACAGAGGGATTAATAATGTCATGAACTCTTCTCTTCCAATG
AGATCTGCAACTCCAAATCTTCACTTCCTCTCATGATCGCTAGTTTCACCTTATCACCCA
CACTATACTCATCCAATACCTTCATCAATTCCGCTTTGCTTTTCACGGGTTTATCATCAA
CTGCAACAATGATATCTCCAAGTACTATATTACCAGCAAAACCTCGGGATGTTGGACGTA
ACCCTGCTTTTGCAGCCAGACTATCTCCAGGCACCTGAAGTACAAGAGCTCCATTACGAA
CATTGAGTTGATTAGCTACTTGATCTGGAGCTAACTCTATGTTAATACCAGCTCGAAGGA
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ATCCAACGCCAGCAGATGTTCCTGCCTGTGTGTATATGGCTGTGTTGATACCAATTAAGT
TTCCTTTTGAATCGAGCAGAGGACCTCCACTGTTTCCCGGGTTAATAGCTGCATCGGTTT
G

QA 1 661 1 661
DS 

RD RS1GJ81JQ 688 0 0
GG
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GTATTCAACTACTGGGAACAAGAAAAAAAAACAACAGAGGGATTAATA*TGTCATGAACT
CTTCTCTTCCAATGAGATCTGTAACTCCAAATCTTCACTTCCTCTCTTGATCGCTAGTTT
CACCTTATCACCCACACTATACTCATCCAATACCTTCATCAATTCAGCTTTGCTTCTCAC
GGGTTTATCATCAACTGCAACAATGATATCTCCGAGTACTATATTACCAGCAAAACCCCG
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AGCTGCATCGGTTTGAATCCCACCACCAATGGTAACACCGGTTTGGCTAAAAATGTCGCG
GTTAAGACCGCTGATGACACCGACCG

QA 3 688 3 688
DS 

RD RS1GT80JQ 802 0 0
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CATATATGTATTCAACGACTGGAAACGAGAAAAAA**ACAACAGAGGGATTAATAATGTC
ATGAACTCTTCTCTTCCAATGAGATCTGCAACTCCAAATCTTCACTTCCTCTCTTGATCG
CTAGTTTCACCTTATCACCCACACTATACTCATCCAATACCTTCATCAATTCCGCTTTGC
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AACCTCGGGATGTTGGACGTAACCCTGCTTTTGCAGCCAGACTATCTCCAGGCACCTGAA
GTACAAGAGCTCCATTACGAACATTGAGTTGATTAGCTACTTGATCTGGAGCTAACTCTA
TGTTAATACCAGCTCGAAGGACTTTGCTGAACTGGATTAGTTGAGGAACAATTTTCAATA
CAGTTGATGACGGTATTGCAAATCCAACACCAGCAGATGTTCCTGTCTGCGTGTATATGG
CTGTGTTGATACCAATTAAGTTTCCTTTTGAATCTAGCAGAGGACCTCCACTGTTTCCCG
GGTTAATAGCTGCATCTGTTTGAATCCCACCACCAATGGTAACACCGGTTTGGCTAAAAA
TGTCACGGTTAAGACCGCTGATGACACCAACCGTAAGGATGTGGTCAAAACCAAACGGGT
TCCCAATTGCTAAACACTGCTG

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 3

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TGTTTTGAATTAAGCTAATAATCTAGAAGCGACGTGCAATGGCAATAGTTATACAGGTAA
TCCTCATCAGTACCAAAGAATCTTCTAAAATTAAAAGGATCAATGGTGATGCCTCCTCTT
AGGCCAAGAGTAAATGAAGCAGCAAAACTCAGAGCTCGGTTTTCAGATCATTGACTAGTT
GACTGAACATGATGCCGATATCCATTCCTTGATTCATAGTTGGTATGACTTGTGAGTAAG
GGCATTGTTTGGAAAAGCCGACCTTTTTGTTTTTGGACTGTTTAATCGATTTGCTAAGCC
TGTTTAGGCATTGCTTGAACTTCTTATGGCAGCTTATGTTAGTCATACCTTTAGAATCAA
CGCAGTTGTCATGAGCCATACAGCAAGCATCAAGATCATCACAAGGCTCCTCATCAGGAC
ATCCAAAGTGTCCAATCCCACAATACTTGCCATATCGTATAGAAAGTGTGTCGCAATTCT
GCGCAATGCAGGTTCTGGTGCATTCCTCGCTGCGTGCAACGTCAAAGAGGAAGAGGGCAA
CGAAGAAAGCAGCCTTCACAAAACGCATCCAAGAAAAGCGAATCATCATCATCTTCTGTC
GACTTCTCTCTCTTTCC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DK92JQ U 1
AF RS1DK92TF C 1
AF RS1C695JQ U 47
BS 1 594 RS1DK92JQ
BS 595 677 RS1C695JQ

RD RS1DK92JQ 594 0 0
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CGCAGTTGTCATGAGCCATACAGCAAGCATCAAGATCATCACAAGGCTCCTCATCAGGAC
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GCGCAATGCAGGTTCTGGTGCATTCCTCGCTGCGTGCAACGTCAAAGAGGAAGA

QA 1 594 1 594
DS 

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TCCTCATCAGTACCAAAGAATCTTCTAAAATTAAAAGGATCAATGGTGATGCCTCCTCTT
AGGCCAAGAGTAAATGAAGCAGCAAAACTCAGAGCTCGGTTTTCAGATCATTGACTAGTT
GACTGAACATGATGCCGATATCCATTCCTTGATTCATAGTTGGTATGACTTGTGAGTAAG
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TGTTTAGGCATTGCTTGAACTTCTTATGGCAGCTTATGTTAGTCATACCTTTAGAATCAA
CGCAGTTGTCATGAGCCATACAGCAAGCATCAAGATCATCACAAGGCTCCTCATCAGGAC
ATCCAAAGTGTCCAATCCCACAATACTTGCCATATCGTATAGAAAGTGTGTCGCAATTCT
GCGCAATGCAGGTTCTGGTGCATTCCTCGCTGCGTGCAACGTCAAAGAGGAAGAGGGCAA
CGAAGAAAGCAGCCTTCACAAAACGCATCCAAGAAAAGCGAATCATCATCATCTTCTGTC
GACTTCTCTC
CC

QA 1 670 1 670
DS 

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TGATGCCTCCTCTTAGGCCAAGAGTAAATGAAGCAGCAAAACTCAGAGCTCGGTTTTCAG
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GACTTGTGAGTAAGGGCATTGTTTGGAAAAGCCGACCTTTTTGTTTTTGGACTGTTTAAT
CGATTTGCTAAGCCTGTTTAGGCATTGCTTGAACTTCTTATGGCAGCTTATGTTAGTCAT
ACCTTTAGAATCAACGCAGTTGTCATGAGCCATACAGCAAGCATCAAGATCATCACAAGG
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GAGGAAGAGGGCAACGAAGAAAGCAGCCTTCACAAAACGCATCCAAGAAAAGCGAATCAT
CATCATCTTCTGTCGACTTCTCTCTCTTTCC

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 2

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ATGGGACATAAGTGATATGAATTTAGCAGACGCTATGGGGAGAGCCAAGGTTCTTGACAT
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BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1AF05TF U 1
AF RS1AU06TF U 2
BS 1 690 RS1AF05TF
BS 691 776 RS1AU06TF

RD RS1AF05TF 695 0 0
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GTTCATCGAGAGCTTCAAAGTTGAGAGCCCGAACGCGAAATACACAGAGAATGAGATTCA
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ATGGATCGTGAAGCCCAAGGTTGTCAAATACGATTTCAAAACCGATACTCGTGTCCCCAA
ATTAGGGGTTATGCTTGTTGGTTGGGGAGGAAACAATGGATCAACCCTCACCGCCGGTGT
AATTGCCAATAAAGAAGGAATCTCGTGGGCGACAAAGGACAAAGTGCAACAAGCGAACTA
CTTCGGGTCGTTAACACAAGCATCGTCTATTCGTGTCGGATCCTTCAACGGTGAAGAGAT
CTATGCTCCTTTCAAGAGTCTCGTTCCAATGGTGAATCCGGATGATGTTGTGTTTGGAGG
ATGGGACATAAGTGATATGAATTTAGCAGACGCTATGGGGAGAGCCAAGGTTCTTGACAT
TGATCTGCAGAAACAGCTTAGGCCTTTCATGGAGAACATTGTCCCACTCCCTGGTATCTT
CGATCCTGATTTCGTCGCTGCCAATCAGGGGTCACGTGCCAACAACGTCATCAAAGGTAC
CAAGAAGGAACAAGTCGACCAAATCATCAA
GACAT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1AU06TF 775 0 0
GGC
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GTGTACGATTACGAGACGACGGAGGTCGTTCACGAGAACGTTAACGGTGCTTACCAATGG
ATCGTGAAGCCCAAGGTTGTCAAATACGATTTCAAAACCGATACTCGTGTCCCCAAATTA
GGGGTTATGCTTGTTGGTTGGGGAGGAAACAATGGATCAACCCTCACCGCCGGTGTAATT
GCCAATAAAGAAGGAATCTCGTGGGCGACAAGGGACAAAGTGCAACAAGCGAACTACTTC
GGGTCGTTAACACAAGCATCGTCTATTCGTGTCGGATCCTTCAACGGTGAAGAGATCTAT
GCTCCTTTCAAGAGTCTCTTTCCAATGGTGAATCCGGATGATGTTGTGTTTGGAGGATGG
GACATAAGTGATATGAATTTAGCAGACGCTATGGGGAGAGCCAAGGTTCTTGACATTGAT
CTGCAGAAACAGCTTAGGCCTTTCATGGAGAACATTGTCCCACTCCCTGGTATCTTCGAT
CCTGATTTCGTCGCTGCCAATCAGGGGTCACGTGCCAACAACGTCATCAAAGGTACCAAG
AAGGA*CAAGTCGACCAAATCATCAAGACATGAGGGAGTTAAGAGAGACAAGTGGATAAG
TTGTGGTCTGTGGACGGTACACAGAGCGTACAGCATGTGATCGTGGGGCTAA

QA 4 775 4 775
DS 



AS 1 2

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GTCTTTGGCTCACCAATTCACCGGGCTGAGATGCTCTCCGCTCTCTTCCTCTCCCAGGCT
ATCGAGGAGAGCAGCCAAGAACTTCCCGCAGAACAAATCCTCCACCTCCGTTTCTCCGAC
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GATGTTCGAAGACGCTTACGAGCGTTGCAGAACTGCTCCCATGGAAGGCTTCGCTTTCAC
CGTCGACGATTTCGCAGCCGCCATCGAACAATACGACTTCAATTCCGAAATGACACTAGG
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GGAATTGGATCTGTGGTCCTCGGAGTTGTTCAGAGCTTGAAGCCCTATGGTGCCTTCATT
GACATTGGAGGAATCAATGGGCTTCTCCACGTCAGTCAGATCAGTCATGACCGTGTCTCG
GATATCGCTACTGTTCTTCAGCCTGGTGACACTCTTAAGGTTATGATACTGAGCCATGAC
CGTGACAGAGGAAGAGTAAGTCTCTCCACAAAGAAGCTGGAGCCAACACCTGGTGATATG
ATTCGCAACCCAAAACTTGTCTTCGAGAAGGCTGAGGAGATGGCTCAGACGTTCAGACAG
AGAATCGCCCAAGCAGAAGCTATGGCCCGTGCAGACATTCTTCGCTTCCAACCTGAGAGT
GGCCTGACGCTAAGTTCTGAAGGGATACTAGGACCACTCGGATCTGACTTGCCAGATGAT
GGAGTTGATCTCACCGTCGGTGACATTCCTCCTGCCGTTGATCTTTAGATTCAAAACCTT
TTTTTTTTGCTTGCGTTAACTTGTCATAGACAAAAACACATATCCTGGAGCTTAATGTAA
TATGTAAGAAACTCATGTGTATGTTTCATTGATTGCAATGTCCAAAAGTTCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1C780TF U 1
AF RS1C780JQ C 649
BS 1 744 RS1C780TF
BS 745 1434 RS1C780JQ

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GTCTTTGGCTCACCAATTCACCGGGCTGAGATGCTCTCCGCTCTCTTCCTCTCCCAGGCT
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GATCGTCGCGGCGGTCGCGATGTCCAGCGGGCAGACGAGAGAGAGGCTGGAGCTTAAGAA
GATGTTCGAAGACGCTTACGAGCGTTGCAGAACTGCTCCCATGGAAGGCTTCGCTTTCAC
CGTCGACGATTTCGCAGCCGCCATCGAACAATACGACTTCAATTCCGAAATGACACTAGG
GTGAAAGGAACGGTGTTCAAGACCGATGCAAACGGCGCATTAGTCGACATTTCTGCAAAA
TCGTCGGCTTACTTGTCGGTTGAGCAGGCTTGCATTCACAGGATCAAGCATGTGGAGGAA
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GACAGTTTGCTGTTGAGCTTAAGGATGATTCAGTATGAACTCGCTTGGGAACGGTGTAGG
CAGCTTCAGGCTGAGGATGTTGTTGTTAAAGCTAAGGTTATTGGTGCTAACAAAGGTGGT
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GCACCAGCTGAAGAGCTACTTGAG

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1C780JQ 786 0 0
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CAGGCTCAACTTGGAATTGGATCTGTGGTCCTCGGAGTTGTTCAGAGCTTGAAGCCCTAT
GGTGCCTTCATTGACATTGGAGGAATCAATGGGCTTCTCCACGTCAGTCAGATCAGTCAT
GACCGTGTCTCGGATATCGCTACTGTTCTTCAGCCTGGTGACACTCTTAAGGTTATGATA
CTGAGCCATGACCGTGACAGAGGAAGAGTAAGTCTCTCCACAAAGAAGCTGGAGCCAACA
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TTGCCAGATGATGGAGTTGATCTCACCGTCGGTGACATTCCTCCTGCCGTTGATCTTTAG
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TTCATC

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 3

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TTCGATCTC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1G311JQ U 132
AF RS1G324JQ U 1
AF RS1G324TF C 1
BS 1 609 RS1G324JQ

RD RS1G311JQ 196 0 0
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CTGGAGTCACCGGTTCTTCATACAAACCAAACACCATTGATTGTCCTGTTTTCTTGATCG
TTATTCCTCCAGCTCC

QA 1 196 1 196
DS 

RD RS1G324JQ 609 0 0
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ATTCTAGAAAGCTAAGAGGTCCTGTTCGATCAAGTAATCACCCAACCTCTCGACGGCCAT
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TTGGATGACCATATACTTTAGTCCTGCAAGAAACATACCAGTGGGAGCAAGGTGACCCGG
CTCATCGAAATCTTTCATGATATCTGTCATCTCTTGAGGCTTGAACTGAGGAAAATTAGC
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TTGGCCGTCACCGACATCGCACATTAAGTGCTCATCAACGTAAGTTTGCCACGACATTGT
TTCGATCTC

QA 1 609 1 609
DS 

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TAAGTAGAAACCAGAAATACCAAAATTAAATTAGTAAAAAAAAAGAAACCCATGCACCCA
ACCAAAAGAAAAACAAAGGTGAAACAATAGTTTAAAGGATTTGAATAACAGCAATGGAGC
ATTCTAGAAAGCTAAGAGGTCCTGTTCGATCAAGTAATCACCCAACCTCTCGACGGCCAT
GTTACATTGTCCTGGAGTCACCGGTTCTTCGTACAAACCAAACACCATTGATTGTCCTGT
TTTCTTGATCGTTATTCCTCCAGCTCCCTTCTTGCCACGGATGACTGCACCAGGCTCGCC
TTGGATGACCATATACTTTAGTCCTGCAAGAAACATACCAGTGGGAGCAAGGTGACCCGG
CTCATCGAAATCTTTCATGATATCTGTCATCTCTTGAGGCTTGAACTGAGGAAAATTAGC
GCTCTGAGCCCAAACGCTACCGTCATGGCCGATGATGGCGGCAGCGGTGAGGTGGTGACC
TTGGCCGTCACCGACATCGCACATTAAGTGCTCATCAACGTAAGTTTGCCACGACATTGT
TTCGATCTC

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 2

CO CL3294Contig1 737 2 3 U
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AGGCAAACAGTTCAAGAAGAGAGATAGGAGATTCTAGACAACAACTTTTGGTTTATTTGC
TTCTCACTTCTTTTGCCGAGTCTTGAGTTCTTTTACCCTCTCTTCTGTAGCTTTCAGTGC
TTCCCCGCAGATAGCTATCAACTCATCGATCTCTTCAGGTGAGATAATGAGCGGTGGAGA
CATCATTATGCTATCCCCTGCAACGCGGACTAACATCCCGCGCTTCTGGCACTCGGCTCC
AAAGTATGCGCCAACACCCCATTCTGGTGGAAATGGTTCGTTTGGTGACTTGTTGTCTGT
AAATTCAGTCCCGAGAATCAAACCAGTTCCCCTTATCTCTCCAATAATAGGACTAGTCTT
GGCAAAGGCTTTAAGACCATCTTGAAACCTTGGGGCAACTCTGGCGACATGCTCTGGCGT
GTTCCTCTCTTTGTAGATCTTTAATGCTTCAATTGCTACAGCACATGAAACTGGATGACC
AGAATAAGTAAATCCATGCGAGAAAGCACCTAGTTTGTTGCTTTGAGAATAAATGACATC
TGCTACTTCTTGACTCATAAGAATGGCTCCAATCGGCATATATGCTGATGACAGTGCTTT
GGCTAAAGACACAAGATCTGGCTTGATGTTGTATTTGTCACAGCCAAACATTGTCCCAGG
CCTTCCAAATGCACATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FZ96JQ U 3
AF RS1BK92JQ U 1
BS 1 187 RS1BK92JQ
BS 188 188 RS1FZ96JQ
BS 189 737 RS1BK92JQ

RD RS1FZ96JQ 542 0 0
GAACT
AAAGTTGGATGATTTATTATGCATATAACTGAAAATGTGCATGTGCAAGATAAAGGCAAA
CAGTTCAAGAAGAGAGATAGGAGATTCTAGACAACAACTTTTGGTTTATTTGCTTCTCAC
TTCTTTTGCTGAGTCTTGAGTTCTTTTACCCTCTCTTCTGTAGCTTTCAGTGCTTCCC*G
CAGATAGTTATCAACTCATCGATCTCTTCAGGTGAGATAATGAGCGGTGGAGACATCATT
ATGCTATCCCCTGCAACGCGGACTAACATCCCGCGCTTCTGGCACTCGGCTCCAAAGTAT
GCGCCAACACCCCATTCTGGTGGAAATGGTTCGTTTGGTGACTTGTTGTCTGTAAATTCA
GTCCCGAGAATCAAACCAGTTCCCCTTATCTCTCCAATAATAGGACTAGTCTTGGCAAAG
GCTTTAAGACCATCTTGAAACCTTGGGGCAACTCTGGCGACATGCTCTGGCGTGTTCCTC
TCTTTGTAGATCTTTAATGCTTCAATTGCTACAGCACATGAAACTGGATGACCAGAA

QA 6 542 6 542
DS 

RD RS1BK92JQ 737 0 0
GGGAACTAAAGTTGGATGATTTATTATGCATATAACTGAAAATGTGCATGTGCAAGATAA
AGGCAAACAGTTCAAGAAGAGAGATAGGAGATTCTAGACAACAACTTTTGGTTTATTTGC
TTCTCACTTCTTTTGCCGAGTCTTGAGTTCTTTTACCCTCTCTTCTGTAGCTTTCAGTGC
TTCCCCGTAGATAGCTATCAACTCATCGATCTCTTCAGGTGAGATAATGAGCGGTGGAGA
CATCATTATGCTATCCCCTGCAACGCGGACTAACATCCCGCGCTTCTGGCACTCGGCTCC
AAAGTATGCGCCAACACCCCATTCTGGTGGAAATGGTTCGTTTGGTGACTTGTTGTCTGT
AAATTCAGTCCCGAGAATCAAACCAGTTCCCCTTATCTCTCCAATAATAGGACTAGTCTT
GGCAAAGGCTTTAAGACCATCTTGAAACCTTGGGGCAACTCTGGCGACATGCTCTGGCGT
GTTCCTCTCTTTGTAGATCTTTAATGCTTCAATTGCTACAGCACATGAAACTGGATGACC
AGAATAAGTAAATCCATGCGAGAAAGCACCTAGTTTGTTGCTTTGAGAATAAATGACATC
TGCTACTTCTTGACTCATAAGAATGGCTCCAATCGGCATATATGCTGATGACAGTGCTTT
GGCTAAAGACACAAGATCTGGCTTGATGTTGTATTTGTCACAGCCAAACATTGTCCCAGG
CCTTCCAAATGCACATA

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

CO CL3295Contig1 1054 2 2 U
GAATAGCTTTTGTATGATGTTGGATCTGACTTGTGCGAATTGGATTCCTTGTTTTTATTT
TTTATTTTTTGGGCAGGATGGGGTACCAACGAGGACCTGATCATATCAATCTTGGCGCAC
AGAAACGCGGAACAGAGGAAGCTGATCAGGCAAACATACCATGAAGTCTTTGGAGAAGAC
CTTCTCAAGAGTCTTGACAAGGAACTCTCAAGCGACTTCGAGAGAGCAATCTTGCTCTGG
ACTATGGAGCCCGGCGAGCGTGATGCTTTATTGGTTAACGAAGCAACCAGAAGATGGACT
TCAAGCAACCAAGTGCTAATGGAAGTAGCTTGCACAAGGACCTCAACGCAGCTTCTTCAC
GCTAGGCAAGCTTACCATGCTCGCTTCAAGAAGTCTATTGAAGAGGATGTTGCTCACCAC
ACCACCGGTGACTTCAGAAAGCTTTTGGTTTCTCTTATCAGCTCATACAGGTACGAAGGA
GAGGAGGTGAACATGACATTGGCAAAGCAAGAAGCTAAGATAATCCATGAGGAAATCAAG
GACAAGCACTACAACGATGATGAGGTCATTAGGATTTTGTCCACTAGGAGCAAAGCTCAG
ATCAATGCTACTTTCAATCGCTACCAAGATTCTCATGGCGAGGAAATCCTCAAGAGTCTT
GAGGAAGGAGATGGGGACGACAAGTTCCTTCAACTGTTGAGGTCAACGATTCAGTGCTTG
ACAAGACCAGAGCTTTACTTTGTGGATGTTTTTCGCTCTGCAATCAACAAAACCGGAACA
GACGAAGGAGCTCTCACTAGAATTGTGACTACAAGGGCTGAGATTGATTTGAAGGTTATT
GGACAAGAGTTTCAGAGAAGGAACAGCATTTCTCTGGAGAAAGCCATTACCAAAGACACT
CGTGGAGATTACGAGAAGATGCTCGTTGCACTTCTCGGTGAAGATGATGATGCTTAAAAT
CAAATCCTCCTCTCTCTCTCTCTCTTTTCTTCAAACCGTTTGATGTTGTTCTTTTAAAAC
TTCGTTTGTTTGTGTTTTGAGTTTCCAATAATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FV07TF U 1
AF RS1FV07JQ C 277
BS 1 660 RS1FV07TF
BS 661 1054 RS1FV07JQ

RD RS1FV07TF 660 0 0
GAATAGCTTTTGTATGATGTTGGATCTGACTTGTGCGAATTGGATTCCTTGTTTTTATTT
TTTATTTTTTGGGCAGGATGGGGTACCAACGAGGACCTGATCATATCAATCTTGGCGCAC
AGAAACGCGGAACAGAGGAAGCTGATCAGGCAAACATACCATGAAGTCTTTGGAGAAGAC
CTTCTCAAGAGTCTTGACAAGGAACTCTCAAGCGACTTCGAGAGAGCAATCTTGCTCTGG
ACTATGGAGCCCGGCGAGCGTGATGCTTTATTGGTTAACGAAGCAACCAGAAGATGGACT
TCAAGCAACCAAGTGCTAATGGAAGTAGCTTGCACAAGGACCTCAACGCAGCTTCTTCAC
GCTAGGCAAGCTTACCATGCTCGCTTCAAGAAGTCTATTGAAGAGGATGTTGCTCACCAC
ACCACCGGTGACTTCAGAAAGCTTTTGGTTTCTCTTATCAGCTCATACAGGTACGAAGGA
GAGGAGGTGAACATGACATTGGCAAAGCAAGAAGCTAAGATAATCCATGAGGAAATCAAG
GACAAGCACTACAACGATGATGAGGTCATTAGGATTTTGTCCACTAGGAGCAAAGCTCAG
ATCAATGCTACTTTCAATCGCTACCAAGATTCTCATGGCGAGGAAATCCTCAAGAGTCTT

QA 1 660 1 660
DS 

RD RS1FV07JQ 778 0 0
AACGAAGCAACCAGAAGATGGACTTCAAGCAACCAAGTGCTAATGGAAGTAGCTTGCACA
AGGACCTCAACGCAGCTTCTTCACGCTAGGCAAGCTTACCATGCTCGCTTCAAGAAGTCT
ATTGAAGAGGATGTTGCTCACCACACCACCGGTGACTTCAGAAAGCTTTTGGTTTCTCTT
ATCAGCTCATACAGGTACGAAGGAGAGGAGGTGAACATGACATTGGCAAAGCAAGAAGCT
AAGATAATCCATGAGGAAATCAAGGACAAGCACTACAACGATGATGAGGTCATTAGGATT
TTGTCCACTAGGAGCAAAGCTCAGATCAATGCTACTTTCAATCGCTACCAAGATTCTCAT
GGCGAGGAAATCCTCAAGAGTCTTGAGGAAGGAGATGGGGACGACAAGTTCCTTCAACTG
TTGAGGTCAACGATTCAGTGCTTGACAAGACCAGAGCTTTACTTTGTGGATGTTTTTCGC
TCTGCAATCAACAAAACCGGAACAGACGAAGGAGCTCTCACTAGAATTGTGACTACAAGG
GCTGAGATTGATTTGAAGGTTATTGGACAAGAGTTTCAGAGAAGGAACAGCATTTCTCTG
GAGAAAGCCATTACCAAAGACACTCGTGGAGATTACGAGAAGATGCTCGTTGCACTTCTC
GGTGAAGATGATGATGCTTAAAATCAAATCCTCCTCTCTCTCTCTCTCTTTTCTTCAAAC
CGTTTGATGTTGTTCTTTTAAAACTTCGTTTGTTTGTGTTTTGAGTTTCCAATAATGC

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 3

CO CL3296Contig1 1023 3 4 U
GTGATTCTGCCAAACGAGGAGGATAAGAGAGTCTTTGCGTGCCCTGCATGTTTCCACGCC
GGTGACGGGGTTATATTGAGACGATTTGCGATTTGAGACCAAAGAGAGAAGGAAAACTGA
CATCCGAAGAATAAGTGGTCTCTGCTCTCTGATCCAGAATTACAAAGAAGGCAGATGGGA
GGTACTTGCAAAAAAATCAGGGGGAAGAGACCAGCTTCCGGAGTGATGAAGATCGGAAAG
CTTGGCATGTTCTGAGATCTCTAATCTTGTGGAGGGTCTGACATTGAGGAAGGTCCGAAG
ATTACCAAAAGGGCTCCAGTTATCATTCCAAAATCTGCAGGATCCAGAAGTTGGAAAGAT
TGCTCGAGAGCACTTCCCTTTTGAACCAAGCTACCCAGATAGAGCCAGACCTGAAAAACA
ACAGCCAAATAAGTTTCAATGCACAAGCCTTATTCCAGAAGCTGCAGCATTTGGTGAAGG
TGGCAATGAGAATGAGTCGCTTGAAGCCAAGGCACAGAAAGCCCTGGGTTGTCCTTGCAT
AGCAGATCTGCGTAATGGATCTTGCGGGTCTCAGTTCACTGAGACTTTCCGTTGCTTTCT
CATGAGCACTGCTGAAGAAAAGGGATCAGACTGTGTGCATCCATTTGTGGCATTGCAAAG
CTGTATCAAAGCCAACCCAAGCGCATTCTCAAAAGAGATTCTTGAGGACGAGAAAAAGGA
AGAGCAGCAGCCTGTGCAACCAGACCATAGAAACATCCCTCCTCTCTGGGCTAAGGACAC
TCCTCGCCGTGGCAAATCCAAGCTTTAGAACCTCTACAACAATGGAACCTTATTCTTTTC
TATCTTCTCTTACGAACAACAAACTGAAGAAATTACAAGAAACCATTGTGTAAACGTTTG
GTTCTCTTGTTCACATTCTCGTGTATGATCCAAAACGAATCGCTTATTCGGAAGCTTAAC
CGTTTGGTTTAATTCACAAATCAAAACTTTATTCGGTGCAATAATAATATAACCAACCGG
TTT


BQ
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10 10 10 

AF RS1EG07TF U 1
AF RS1EG07JQ C 297
AF RS1EU51TF U 623
BS 1 689 RS1EG07TF
BS 690 905 RS1EU51TF
BS 906 906 RS1EG07JQ
BS 907 1023 RS1EU51TF

RD RS1EG07TF 689 0 0
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GGTGACGGGGTTATATTGAGACGATTTGCGATTTGAGACCAAAGAGAGAAGGAAAACTGA
CATCCGAAGAATAAGTGGTCTCTGCTCTCTGATCCAGAATTACAAAGAAGGCAGATGGGA
GGTACTTGCAAAAAAATCAGGGGGAAGAGACCAGCTTCCGGAGTGATGAAGATCGGAAAG
CTTGGCATGTTCTGAGATCTCTAATCTTGTGGAGGGTCTGACATTGAGGAAGGTCCGAAG
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TGCTCGAGAGCACTTCCCTTTTGAACCAAGCTACCCAGATAGAGCCAGACCTGAAAAACA
ACAGCCAAATAAGTTTCAATGCACAAGCCTTATTCCAGAAGCTGCAGCATTTGGTGAAGG
TGGCAATGAGAATGAGTCGCTTGAAGCCAAGGCACAGAAAGCCCTGGGTTGTCCTTGCAT
AGCAGATCTGCGTAATGGATCTTGCGGGTCTCAGTTCACTGAGACTTTCCGTTGCTTTCT
CATGAGCACTGCTGAAGAAAAGGGATCAGACTGTGTGCATCCATTTGTGGCATTGCAAAG
CTGTATCAAAGCCAACCCAAGCGCATTCT

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1EG07JQ 703 0 0
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AGATTGCTCGAGAGCACTTCCCTTTTGAACCAAGCTACCCAGATAGAGCCAGACCTGAAA
AACAACAGCCAAATAAGTTTCAATGCACAAGCCTTATTCCAGAAGCTGCAGCATTTGGTG
AAGGTGGCAATGAGAATGAGTCGCTTGAAGCCAAGGCACAGAAAGCCCTGGGTTGTCCTT
GCATAGCAGATCTGCGTAATGGATCTTGCGGGTCTCAGTTCACTGAGACTTTCCGTTGCT
TTCTCATGAGCACTGCTGAAGAAAAGGGATCAGACTGTGTGCATCCATTTGTGGCATTGC
AAAGCTGTATCAAAGCCAACCCAAGCGCATTCTCAAAAGAGATTCTTGAGGACGAGAAAA
AGGAAGAGCAGCAGCCTGTGCAACCAGACCATAGAAACATCCCTCCTCTCTGGGCTAAGG
ACACTCCTCGCCGTGGCAAATCCAAGCTTTAGAACCTCTACAACAATGGAACCTTATTCT
TTTCTATCTTCTCTTACGAACAACAAACTGAAGAAATTACAGGAAACCATTGTGTAAACG
TTTGGTTCTCTTGTTCACATTCTCGTGTATGATCCAAAACGAATCGCTTATTCGGAAGCT
TAACCGTTTGGTTTAATTCACAAATCAAAACTTTATTCGGTGC

QA 1 703 1 703
DS 

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GCATTCTCAAAAGAGATTCTTGAGGACGAGAAAAAGGAAGAGCAGCAGCCTGTGCAACCA
GACCATAGAAACATCCCTCCTCTCTGGGCTAAGGACACTCCTCGCCGTGGCAAATCCAAG
CTTTAGAACCTCTACAACAATGGAACCTTATTCTTTTCTATCTTCTCTTACGAACAACAA
ACTGAAGAAATTACAAGAAACCATTGTGTAAACGTTTGGTTCTTTTGTTCACATTCTCGT
GTATGATCCAAAACGAATCGCTTATTCGGAAGCTTAACCGTTTGGTTTAATTCACAAATC
AAAACTTTATTCGGTGCAATAATAATATAACCAACCGGTTT

QA 1 401 1 401
DS 



AS 1 2

CO CL3297Contig1 761 2 26 U
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CAAAAAAACAAAGTCAATCTTTCTTTAGCAGATCATCAGCCATCATCATGGATGAAGAGT
ACGAAGTTATCGCTCTCGGTACTGGTCTCAAGGAGTGCATCCTCAGTGGTCTCCTCTCCG
TCGATGGTATCAAGGTACTTCACATGGACAGGAATGACTATTACGGTGGAGAGTCAACAT
CACTTAATCTCAATCAGCTGTGGAAGAAGTTTAGAAGAGAAGATAAGGCTCCTGCTCATT
TAGGCTCTAGCAGAGACTACAATGTTGACATGATGCCCAAGTTTATGATGGCAAATGGCA
AGCTTGTCCGCGTCCTCATTCATACCGATGTGACCAAGTACCTGTCTTTTAAGGCTGTTG
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CACTCAAATCTCCTCTTATGGGTATTTTTGAGAAACGTCGTGCTGGAAAGTTCTTCAGCT
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TGATGAGAATGAAGCTCTACGCAGAGTCCCTTGCACGTTTC


BQ
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AF RS1FT58TF U 1
AF RS1CK10TF U 68
BS 1 132 RS1FT58TF
BS 133 133 RS1CK10TF
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RD RS1FT58TF 739 0 0
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CAAAAAAACAAAGTCAATCTTTCTTTAGCAGATCATCAGCCATCATCATGGATGAAGAGT
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TCGATGGTATCAAGGTACTTCACATGGACAGGAATGACTATTACGGTGGAGAGTCAAC*T
CACTTAATCTCAATCAGCTGTGGAAGAAGTTTAGGGGAGAAGATAAGGCTCCTGCTCATT
TAGGCTCTAGCAGAGACTACAATGTTGACATGATGCCCAAGTTTATGATGGCGAATGGCA
AGCTTGTCCGCGTCCTCATTCATACTGATGTGACCAAGTACCTGTCTTTTAAGGCTGTTG
ATGGGAGCTATGTCTTCGTCAAAGGCAAGGTTCAAAAGGTGCCAGCAACTCCAATGGAAG
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TCACTACCAAG*AGTTGATTGCGAAATTCGGTCTTGATGAAAACACTATTGACTTTATTG
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TGATGAGAATGAAGCTCTA

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1CK10TF 694 0 0
G
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ATCAAGTTACTTCACATGGACAGGAATGACTATTACGGTGGAGAGTCAACATCACTTAAT
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AGCAGAGACTACAATGTTGACATGATTCCCAAGTTTATGATGGCAAATGGCAAGCTTGTT
CGCGTCCTTATTCATACCGATGTGACCAAGTACCTGTCTTTTAAGGCTGTTGATGGCAGC
TATGTCTTCGTCAAAGGCAAGGTTCAAAAGGTGCCAGCAACCCCAATGGAGGCACTCAAA
TCTCCTCTTATGGGTATTTTTGAGAAACGTCGTGCTGGAAAGTTCTTCAGCTATGTTCAG
GAGTATGATGAGAAGGATCCTAAAACACATGATGGAGTTGATTTGAAGAGAGTCACAACC
AAGGAGTTGATTGCGAAATTCGGTCTTGATGAAAACACTATTGACTTTATTGGGCATGCT
GTGGCACTTCACAGTAATGATATCCATCTCCATCAACCTGCTTATGATACTGTGATGAGA
ATGAAGCTCTACGCAGAGTCCCTTGCACGTTTC

QA 2 694 2 694
DS 



AS 1 3

CO CL3298Contig1 932 3 12 U
AAGTAAAGTACTGTATTGTTTATTTTTATTTGAAGGTTTGGAGCGGCAAGATAAGGATTG
TAATCAATCATCTACTTGAATAATTAAAACAATACACATGACAAGAAACTTAAAACTTTA
AAACCAAACTGAAATGTAAATGAATTGCTCAAAAGACTAAAGACTAAAAAAGAGTGGAGT
GGTGGTGCAAAAGAGCCAATGTTTGAGAGTCTTTTTCTCACTCTCAAACTCTTTATTTTG
ATTTTCATCTTCCTAAAATCAAATATCAAAAACCCCTTTGTTGTTTATATGTTGGTGGGA
GCTGATTTCTCAGGCCAACTGCTAGTAGATTCTCCAAGAGAACCGTTTCCACCATCTTCC
TCTTGAGACACAACAGGGATCTTCACAGATGAAGCTCTCTCCATTTCCTTCTCCAGCTCT
TCTTCAGACCTCAACGCGTTGAACTGTCCCTCCAGCGACTTAGCTGCAGCTAACCACGCA
GTGACAATGACCAACAGTATCATCCCTAGGTACGGTGTTGAATTTGCCAGTGATCCAAAT
GATAAGATCATGAACTGCTGGATTAGAGCACCCCCTGATTTCCCCAACGGGTTGCAAACC
ACATCAATTGCTGCTTTCCCTTTAACCTTGGTATCCTCATCCAAGGGGATGTAAGCCATT
TCTTTACAAGGATCAAACAAGCTGTACTTGGCACTCTTGCTGAAGATATTCTGGAGGGCA
CCAACATAGACAGCTGCGAGTAACGGAGTCATACCAAGCTTGGCAACAAGCAGTGCGAAT
GGGCCGCCAAACAATATCAGAGAGAAGAAGGCAACGCCAGTCAATAACAGAACAGTTGGG
GTGATCTTTGCAGCTACTCCCCAGCCATACTTATCGAATACGTATTGACTGAGAAGCATC
ATTGTGAATGTTGCAATACCAGTGCATGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B705JQ U 60
AF RS1F969JQ U 1
AF RS1F969TF C 146
BS 1 126 RS1F969JQ
BS 127 127 RS1B705JQ
BS 128 147 RS1F969JQ
BS 148 148 RS1B705JQ
BS 149 206 RS1F969JQ
BS 207 207 RS1B705JQ
BS 208 327 RS1F969JQ
BS 328 328 RS1B705JQ
BS 329 426 RS1F969JQ
BS 427 427 RS1B705JQ
BS 428 736 RS1F969JQ
BS 737 932 RS1F969TF

RD RS1B705JQ 605 0 0
GTAATCAATCATCTACTTGAATAATTAAAACAATACACATGACAAGAAACTTAGAACTTT
AAGACCAAACTGAAATGTAAATGAATTGCTCAAAAGACTAAAGACTAAAAAAGAGTGGAG
TGGTGGTGCAAAAGAGCCAATGTTTGAGAGTCTTTTTCTCACTCTCAAACTCTTTATTTT
GATTTTCATCTTCCTAAAATCAAATATCAAAAACCCCTTTGTTGTTTATATGTTGGTGGG
AGCTGATTTCTCAGGCCAACTGCTAGTAGATTCTCCAAGAGAACCGTTTCCACCATCTTC
CTCTTGAGACACAACAGGGATCTTCACAGATGAAGCTCTCTCCATTTCCTTCTCCAGCTC
TTCTTCAGACCTCAACGCGTTGAACTGTCCCTCCAGCGACTTAGCTGCAGCTAACCACGC
AGTGACAATGACCAACAGTATCATCCCTAGGTACGGTGTTGGATTTGCCAGTGATCCAAA
TGATAAGATCATGAACTGCTGGATTAGAGCACCCCCTGATTTCCCCAACGGGTTGCAAAC
CACATCAATTGCTGCTTTCCCTTTAACCTTGGTATCCTCATCCAAGGGGATGTAAGCCAT
TTCTT

QA 1 605 1 605
DS 

RD RS1F969JQ 736 0 0
AAGTAAAGTACTGTATTGTTTATTTTTATTTGAAGGTTTGGAGCGGCAAGATAAGGATTG
TAATCAATCATCTACTTGAATAATTAAAACAATACACATGACAAGAAACTTAAAACTTTA
AAACCAGACTGAAATGTAAATGAATTGTTCAAAAGACTAAAGACTAAAAAAGAGTGGAGT
GGTGGTGCAAAAGAGCCAATGTTTGAAAGTCTTTTTCTCACTCTCAAACTCTTTATTTTG
ATTTTCATCTTCCTAAAATCAAATATCAAAAACCCCTTTGTTGTTTATATGTTGGTGGGA
GCTGATTTCTCAGGCCAACTGCTAGTAAATTCTCCAAGAGAACCGTTTCCACCATCTTCC
TCTTGAGACACAACAGGGATCTTCACAGATGAAGCTCTCTCCATTTCCTTCTCCAGCTCT
TCTTCAAACCTCAACGCGTTGAACTGTCCCTCCAGCGACTTAGCTGCAGCTAACCACGCA
GTGACAATGACCAACAGTATCATCCCTAGGTACGGTGTTGAATTTGCCAGTGATCCAAAT
GATAAGATCATGAACTGCTGGATTAGAGCACCCCCTGATTTCCCCAACGGGTTGCAAACC
ACATCAATTGCTGCTTTCCCTTTAACCTTGGTATCCTCATCCAAGGGGATGTAAGCCATT
TCTTTACAAGGATCAAACAAGCTGTACTTGGCACTCTTGCTGAAGATATTCTGGAGGGCA
CCAACATAGACAGCTG

QA 1 736 1 736
DS 

RD RS1F969TF 787 0 0
ATG
TCAAAAGACTAAAGACTAAAAA*GAGTGGAGTGT**GTGCAAAAGAGCCAATGTT*GAGA
GTCTTTT*CTCACTCTCAAACTCTTTATTTTGATTTTCATCTTC*TAAAATCAAATATCA
AAAACCC*TTTGTTGTTTATATGTTGGTGGGAGCTGATTTCTCAGGCCAACTGCTAGTAG
ATTCTCCAAGAGAACCGTTTCCACCATCTTCCTCTTGAGACACAACAGGGATCTTCACAG
ATGAAGCTCTCTCCATTTCCTTCTCCAGCTCTTCTTCAGACCTCAACGCGTTGAACTGTC
CCTCCAGCGACTTAGCTGCAGCTAACCACGCAGTGACAATGACCAACAGTATCATCCCTA
GGTACGGTGTTGAATTTGCCAGTGATCCAAATGATAAGATCATGAACTGCTGGATTAGAG
CACCCCCTGATTTCCCCAACGGGTTGCAAACCACATCAATTGCTGCTTTCCCTTTAACCT
TGGTATCCTCATCCAAGGGGATGTAAGCCATTTCTTTACAAGGATCAAACAAGCTGTACT
TGGCACTCTTGCTGAAGATATTCTGGAGGGCACCAACATAGACAGCTGCGAGTAACGGAG
TCATACCAAGCTTGGCAACAAGCAGTGCGAATGGGCCGCCAAACAATATCAGAGAGAAGA
AGGCAACGCCAGTCAATAACAGAACAGTTGGGGTGATCTTTGCAGCTACTCCCCAGCCAT
ACTTATCGAATACGTATTGACTGAGAAGCATCATTGTGAATGTTGCAATACCAGTGCATG
TTGC

QA 4 787 4 787
DS 



AS 1 2

CO CL3299Contig1 738 2 2 U
GGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGCAAGTGGAATCGCTCGTGGTCGTTTGGCGGA
GGAGAGGAAGTCGTGGAGGAAGAATCATCCTCATGGATTTGTGGCGAAGCTGGAGACTGG
AGCTGATGGGTCTGTCAATCTAATGGTGTGGCATTGCACTATCCCTGGTAAAGCTGGGAC
TGATTGGGAAGGTGGATACTTTCCATTAACGATGCACTTCAGCGAGGACTATCGAGCAAG
CCTCCTAAATGCAAATTCCCACCAGGCTTCCTCCACCCTAATGTCTATCCTTCCGGAACA
GTCTGTCTCTCCATCCTCAACGAGGATTCCGGATGGAGACCAGCCATCACAGTGAAGCAG
ATTCTTGTCGGTATTCAGGATTTACTTGACACCCCTAATCCCGCTGACCCTGCACAGACT
GATGGTTACCATCTCTTCATTCAGGATGCAGTTGAGTACAAGAAAAGGGTTAAGCTACAG
TCCAAACAGTATCCTCCCATTGTCTAAAACCCTCAGAAGAGGACAAACACTAAAACTGAT
GACAAACCTCTCTGAATCTTTTTGTGTTCTTTGTGATTGTGTTTAAATGTCAACGGGTGA
TTGAAAACTCCTCATTTTGTTGCACCTTTGAGACACTACTAGAATCTCTTTGATTTTCAT
AAAAGAAAAACATCTCTTTTCTCTCTCTGTTAACTGTTAATATTCTTGGTTATTGAATCA
CTTAGTGTTTGTTTCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C608TF U 1
AF RS1C608JQ C 309
BS 1 715 RS1C608TF
BS 716 738 RS1C608JQ

RD RS1C608TF 715 0 0
GGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGCAAGTGGAATCGCTCGTGGTCGTTTGGCGGA
GGAGAGGAAGTCGTGGAGGAAGAATCATCCTCATGGATTTGTGGCGAAGCTGGAGACTGG
AGCTGATGGGTCTGTCAATCTAATGGTGTGGCATTGCACTATCCCTGGTAAAGCTGGGAC
TGATTGGGAAGGTGGATACTTTCCATTAACGATGCACTTCAGCGAGGACTATCGAGCAAG
CCTCCTAAATGCAAATTCCCACCAGGCTTCCTCCACCCTAATGTCTATCCTTCCGGAACA
GTCTGTCTCTCCATCCTCAACGAGGATTCCGGATGGAGACCAGCCATCACAGTGAAGCAG
ATTCTTGTCGGTATTCAGGATTTACTTGACACCCCTAATCCCGCTGACCCTGCACAGACT
GATGGTTACCATCTCTTCATTCAGGATGCAGTTGAGTACAAGAAAAGGGTTAAGCTACAG
TCCAAACAGTATCCTCCCATTGTCTAAAACCCTCAGAAGAGGACAAACACTAAAACTGAT
GACAAACCTCTCTGAATCTTTTTGTGTTCTTTGTGATTGTGTTTAAATGTCAACGGGTGA
TTGAAAACTCCTCATTTTGTTGCACCTTTGAGACACTACTAGAATCTCTTTGATTTTCAT
AAAAGAAAAACATCTCTTTTCTCTCTCTGTTAACTGTTAATATTCTTGGTTATTG

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1C608JQ 430 0 0
T
TCCATCCTCAACGAGGATTCCGGATGGAGACCAGCCATCACAGTGAAGCAGATTTTTGTC
GGTATTCAGGATTTACTTGACACCCCTAATCCCGCTGACCCTGCACAGACTGATGGTTAC
CATTTTTTCATTCAGGATGCAGTTGAGTACAAGAAAAGGGTTAAGCTACAGTCCAAACAG
TATCCTCCCATTGTTTAAAACCCTCAGAAGAGGACAAACACTAAAACTGATGACAAACCT
TTTTGAATCTTTTTGTGTTCTTTGTGATTGTGTTTAAATGTCAACGGGTGATTGAAAACT
CCTCATTTTGTTGCACCTTTGAGACACTACTAGAATTTCTTTGATTTTCATAAAAGAAAA
ACATTTCTTTTCTCTTTCTGTTAACTGTTAATATTCTTGGTTATTGAATCACTTAGTGTT
TGTTTCTTT

QA 2 430 2 430
DS 



AS 1 2

CO CL3300Contig1 756 2 6 U
GAATTAAAAAAATTATTATATTGCTTTTGTTTGTGTTACATGGAAAGAAATTGTAATAAC
TGTGTTGTACATTAAATTGTAATTCATCAAATCATAACTCAATTTCCATGGCATGTAATC
GTTTGGTCTCTGAAGGCATCTTTTCCAACTCAAAAGTGACTAAACCAGAGGAGGCATCAT
ACTCAAATGCAACTTCATTTGCCTCAACAACACATCTCTTAGGCCTCACAGATGAGTAAG
CTCCAAACTTACCACACCCTTTGACTTCCATTACCACTTTCATCTCCTCAACGTCATATC
TAAGTCCTTCGATAGCTCCTCCCGAATTGTACATGTTTACAAGACCGAGCGGAGCAAATG
AAACACCATCACTAGCTAGGTGAGTAATGGGACTCACAGTGAAAATCTCATGCTCACGGA
TCTTCAGTGAGATCGGTAGAGACACATTGTATGGCATAACGTTGAGTTCTCCTCTGCTTT
GGGAGTAAACAGCACAGTCTCCGTTCCAGGTCTTCGGATCAGTGGAGGCCTCGGATATCA
AATGAACATCACGACCACGGATGGAGCCGGTGATGCATTCAGTTTGTGTCTGGTGGAAGA
TGTTTTTCCTTTCCGTGCTACTCCAAGCTGATCCTTGGCAGTTGTACACACCAAGAACTC
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BQ
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TTCCTTTCCGTGCTACTCCAAGCTGATCCTTGGCAGTTGTACACACCAAGAACTCCAGTG
TATTTGTTCATGTTCCATATCTTTAGCAAGCTAACACCATCCCGGGGCAGGATCTGCGAA
TAAACAATCTTGTGTTGGTCTACCAGGCAAT

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DS 



AS 1 3

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TACAATGCATGCTGAAAGATTCTCTGTCAAGAACATAAAAGCATAAGAGTAATTCAAATA
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ATCATCAGTTGCGAATGTCAGGAACAGGCAAGTTCTTCAACTGCAACTGTTTGTGCATCC
ATTGCCAGTTCTCTGGGGTCACTTCTCCTCCGAGAGAACGGATGACGGATCCCCCACTGC
ATGATCCCATTTTGCAACACTCTTCCAAAGGCAATCCCTTTATCAATCCATACAGAAACC
CGCTGGCGAATAGGTCACCTGCTCCAGTGGCATCAGTAGCTATTGTCTCACCTATGGCCG
GTACTTGTACCACCTCCTTATCATGTTTTGCAATGCAGCCTTTAGGGCCTAAAGTTACCA
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CACCCCTAAGCAGTTCAGCTGCTTCATCCTCGTTAGCAAAGCAAAGATCTATGTTACCAG
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AGTCATCAACCAAGCAAACGCACTGCCCAGTGGAACCTTTCTTCTTCCTCAACCTTGAGA
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AAGCCCCAATGATCCCCGTGGGTATACCGAACCCAACACTCAATCCTCGAACAGTATTAG
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CGATATTTTTGCATTCC


BQ
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BS 787 820 RS1DT02JQ
BS 821 1337 RS1A596TF

RD RS1A596JQ 786 0 0
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TACAATGCATGCTGAAAGATTCTCTGTGAAGAACATAAAAGCATAAGAGTAATTCAAATA
TGAAACGGCCCTGTTTAAGGCGTAATCACTTGAAATTTGAAAGCCAGAATCTGCTAGTTG
ATCATCAGTTGCGAATGTCAGGAACAGGCAAGTTCTTCAACTGCAACTGTTTGTGCATCC
ATTGCCAGTTCTCTGGGGTCACTTCTCCTCCGAGAGAACGGATGACGGATCCCCCACTGC
ATGATCCCATTTTGCAACACTCTTCCAAAGGCAATCCCTTTATCAATCCATACAGAAACC
CGCTGGCGAATAGGTCACCTGCTCCCGTGGCATCAGTAGCTATTGTCTCACCTATGGCCG
GTACTTGTACCACCTCCTTATCATGTTTTGCAATGCAGCCTTTAGGGCCTAAAGTTACCA
CAGCCCAACTGCAATGCCTGCTTAGGAACTCAAGAGCAGCCTCCGGGCCCGCTTCTTGCT
CACCCCTAAGCAGTTCAGCTGCTTCATCCTCGTTAGCAAAGCAAAGATCTATGTTACCAG
ACTCCAGAAGCTGTCTCAGCTCTGATCTATAATTCCTGACCATCTCAAAACTAGCTAAAT
CCAAAGAAACAGAAAGACCTTCTTGCTTGGCAAATCCAATAGCTGCTTTAATTACTTCTA
AGTTAAGAAGTGCATATCTTAGGACCAACCACTTAGAGCCAGTGAAATCATCTTTGCTTA
ACTCAT

QA 1 786 1 786
DS 

RD RS1DT02JQ 820 0 0
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ACAATGCATGCTGAAAGATTCTCTGTCAAGAACATAAA*GCATAAGAGTAATTCAAATAT
GAAACGGCCCTTTTTAAGGCGTAATCACTTGAAATTTGAAAGCCAGAATCTGCTAGTTGA
TCATCAGTTGCGAATGTCAGGAACAGGCAAGTTCTTCAACTGCAACTGTTTGTGCATCCA
TTGCCAGTTCTCTGGGGTCACTTCTCCTCCGAGAGAACGGATGACGGATCCCCCACTGCA
TGATCCCATTTTGCAACACTCTTCCAAAGGCAATCCCTTTATCAATCCATACAGAAACCC
GCTGGCGAATAGGTCACCTGCTCCAGTGGCATCAGTAGCTATTGTCTCACCTATGGCCGG
TACTTGTACCACCTCCTTATCATGTTTTGCAATGCAGCCTTTAGGGCCTAAGGTTACCAC
AGCCCAACTGCAATGCCTGCTTAGGAACTCAAGAGCAGCCTCCGGACCCGCTTCTTGCTC
ACCCCTAAGCAGTTCAGCTGCTTCATCCTCGTTAGCAAAGCAAAGATCTATGTTACCAGA
CTCCAGAAGCTGTCTCAGCTCTGATCTATAATTCCGGACCATCTCAAAACTAGCTAAATC
CAAAGAAACAGAAAGACCTTCTTGCTTGGCAAATCCAATAGCTGCTTTAATTACTTGTAA
GTTAAGAACTGCATATCTTAGGACCAACCACTTAGAGCCAGTGAAATCATCTTTGCTTAA
TTCATCAGCCTGAATCTTGACAGCAATGGAGAGACATGG
C

QA 1 819 1 819
DS 

RD RS1A596TF 656 0 0
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GGACCAACCACTTAGAGCCAGTGAAATCATCTTTGCTTAACTCATCAGCCTGAATCTTGA
CAGCACTGGAGAGACATGGTCGCATTGTGCGATTACCAGAGTCATCAACCAAGCAAACGC
ACTGCCCAGTGGAACCTTTCTTCTTCCTCAACCTTGAGATACTGACACCACTGAAACCCA
TATTGCTCACAAACAACTGCCCTTGTTCATCGTCGCCATAAGCCCCAATGATCCCCGTGG
GTATACCGAACCCAACACTCAATCCTCGAACAGTATTAGCCACACTTCCACCAGCCATCT
TCTTTAATGGAGCCGCACTTATATGTGTGTTAAGCTCTTTCAGTATATGCTCTAACTCAT
CCTTTTGCACGGGAATGGAGCCACCACGATCACCGGGAATTTGATCGAGTAAGGACCAAT
CGACGGGAGCGACGTTATCGATAAGAGCTGCTGGTTGGAGTCCAAGTACCACTGGAGGAT
GAGCTTCCTGGCTATTATTGGGCAAGACCTCCGCTACCATTCTCCGATGAGATCTCTTTC
GCTCTGTATCTCTTGTTGTGCACTCGATAAGGCCTTGCCCGATATTTTTGCATTCC

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 3

CO CL3302Contig1 282 3 4 U
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TTCTGCGAAACCCAGCATGAGAGCCAAGTGGAAGAAGAAGCGTATGAGGAGGTTGAAGAG
GAAGAGACGAAAGATGAGACAGCGATCTAAGTAGTTTTCGAATCTGTTTAGACCGACATT
TGTGAGAGTTTTGTTGGTTTTCTGTTTGAGTTTCGATGTTTTTTTCAGTCAGAACTGTGT
TTTATTACATGAAAGAATCCACTTTGGTTCTCGGTTTATTAT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AS82JQ C 1
AF RS1GL27TF U 1
AF RS1AS82TF U 1
BS 1 214 RS1GL27TF
BS 215 215 RS1AS82TF
BS 216 276 RS1GL27TF
BS 277 282 RS1AS82JQ

RD RS1AS82JQ 282 0 0
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TTCTGCGAAACCCAGCATGAGAGCCAAGTGGAAGAAGAAGCGTATGAGGAGGTTGAAGAG
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QA 1 282 1 282
DS 

RD RS1GL27TF 276 0 0
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TTCTGCGAAACCCAGCATGAGAGCCAAGTGGAAGAAGAAGCGTATGAGGAGGTTGAAGAG
GAAGAGACGAAAGATGAGACAGCGATCTAAGTAGTTTTCGAATCTGTTTAGACCGACATT
TGTGAGAGTTTTGTTGGTTTTCTGTTTGAGTTTCAATGTTTTTTTCAGTCAGAACTGTGT
TTTATTACATGAAAGAATCCACTTTGGTTCTCGGTT

QA 1 276 1 276
DS 

RD RS1AS82TF 282 0 0
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TTCTGCGAAACCCAGCATGAGAGCCAAGTGGAAGAAGAAGCGTATGAGGAGGTTGAAGAG
GAAGAGACGAAAGATGAGACAGCGATCTAAGTAGTTTTCGAATCTGTTTAGACCGACATT
TGTGAGAGTTTTGTTGGTTTTCTGTTTGAGTTTCGATGTTTTTTTCAGTCAGAACTGTGT
TTTATTACATGAAAGAATCCACTTTGGTTCTCGGTT
TATTAT

QA 1 276 1 276
DS 



AS 1 3

CO CL3303Contig1 696 3 3 U
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TGAACCAGCTTATGAATCTTAACCCGCAACTCCGAACCATGCTTGATTCGAATCCTCAGT
TGAGGGAAATGATGCAGAATCAAGATTTCCTTCGTCAGTTTAGCTCCCCGGAGATGATGC
AGCAAATGATGACTCTACAACGCAGGGCTGGATTTATTGATGAATATGTTTGGCGGTCTT
GGTGCTGGCGGCCTGAGTGGCATGAACCAGTCCAATGTTCCTCCAGAGGAACGCTTCGCG
ACTCAGTTGCAACAGCTACAAGAAATGGGATTCTATGACAGAGCAGAGAACATAAGGGCT
TTGCTTGCAACCAATGGAAACGTTAACGCTGCTGTAGAACGACTCTTGGGAAGTATTGGC
CAGTAGCAGCAGGGAGCAGGTTCGTGAATTGATTGTCTCTCATCAATATCTGTGGCAATC
TCTTAAGTTATGGAATTCTTATTTATGATAGGATCGTGAAACTTGTGGATAAAAAAAAGC
CGCACGATATTTGTGGTCGTCTTCTTACTCTTTACCCATCATCCCCAAAACCTTTTTTTA
TATATTTTGTTTCATCTTTCAGATTTTATTTGAGTTGTTACAACATACATGTGTAAGAGC
TGGTTTGGGAACTTGGAATTGCTACTACATTTACGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BQ50TF U 351
AF RS1GZ20TF U 1
AF RS1GZ20JQ C 20
BS 1 589 RS1GZ20TF
BS 590 590 RS1BQ50TF
BS 591 696 RS1GZ20TF

RD RS1BQ50TF 289 0 0
G
ATAAGGGCTTTGCTTGCAACCAATGGAAACGTTAACGCTGCTGTAGAACGACTCTTGGGA
AGTATTGGCCAGTAGCAGCAGGGAGCAGGTTCGTGAATTGATTGTCTCTCATCAATATCT
GTGGCAATCTCTTAAGTTATGGAATTCTTATTTATGATAGGATCGTGAAACTTGTGGATA
AAAAAAAGCCGCACGATATTTGTGGTCGTCTTCTTACTCTTTACCCATCATCCCCAAAAC
CTTTTTTTATATATTTTGTTTCATCTTTCCTATTTTATTTGAGTTGTT

QA 2 289 2 289
DS 

RD RS1GZ20TF 696 0 0
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TGAACCAGCTTATGAATCTTAACCCGCAACTCCGAACCATGCTTGATTCGAATCCTCAGT
TGAGGGAAATGATGCAGAATCAAGATTTCCTTCGTCAGTTTAGCTCCCCGGAGATGATGC
AGCAAATGATGACTCTACAACGCAGGGCTGGATTTATTGATGAATATGTTTGGCGGTCTT
GGTGCTGGCGGCCTGAGTGGCATGAACCAGTCCAATGTTCCTCCAGAGGAACGCTTCGCG
ACTCAGTTGCAACAGCTACAAGAAATGGGATTCTATGACAGAGCAGAGAACATAAGGGCT
TTGCTTGCAACCAATGGAAACGTTAACGCTGCTGTAGAACGACTCTTGGGAAGTATTGGC
CAGTAGCAGCAGGGAGCAGGTTCGTGAATTGATTGTCTCTCATCAATATCTGTGGCAATC
TCTTAAGTTATGGAATTCTTATTTATGATAGGATCGTGAAACTTGTGGATAAAAAAAAGC
CGCACGATATTTGTGGTCGTCTTCTTACTCTTTACCCATCATCCCCAAA*CCTTTTTTTA
TATATTTTGTTTCATCTTTCAGATTTTATTTGAGTTGTTACAACATACATGTGTAAGAGC
TGGTTTGGGAACTTGGAATTGCTACTACATTTACGT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RS1GZ20JQ 677 0 0
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TAACCCGCAACTCCGAACCATGCTTGATTCGAATCCTCAGTTGAGGGAAATGATGCAGAA
TCAAGATTTCCTTCGTCAGTTTAGCTCCCCGGAGATGATGCAGCAAATGATGACTCTACA
ACGCAGGGCTGGATTTATTGATGAATATGTTTGGCGGTCTTGGTGCTGGCGGCCTGAGTG
GCATGAACCAGTCCAATGTTCCTCCAGAGGAACGCTTCGCGACTCAGTTGCAACAGCTAC
AAGAAATGGGATTTTATGACAGAGCAGAGAACATAAGGGCTTTGCTTGCAACCAATGGAA
ACGTTAACGCTGCTGTAGAACGACTCTTGGGAAGTATTGGCCAGTAGCAGCAGGGAGCAG
GTTCGTGAATTGATTGTCTTTCATCAATATCTGTGGCAATCTCTTAAGTTATGGAATTTT
TATTTATGATAGGATCGTGAAACTTGTGGATAAAAAAAAGCCGCACGATATTTGTGGTCG
TCTTCTTACTCTTTACCCATCATCCCCAAAACCTTTTTTTATATATTTTGTTTCATCTTT
CAGATTTTATTTGAGTTGTTACAACATACATGTGTAAGAGCTGGTTTGGGAACTTGGAAT
TGCTACTACATTTACGT

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 2

CO CL3304Contig1 796 2 2 U
GATTGGGTGAACCAAGAGAAGTTCCACAAAGAAGTTGACAAGCACTACTGGAAAGCGATC
GCGGAGCTGATCCCGCGTGAGGTTCCCAACATTGAGAAGAAGAGAGGGAAAAAGGATCCC
GACAAGAAACCTTCAGTGAATGTTATCCAGGGTCCTAAACCTGGGAAGCCTACTGATCTA
GGGGGAATGAGGCAGATATTCTTGAAGCTCAAGACTAATCCACCACCCCACATGATGCCT
CCTCCTCCTCCAGCCAAGGACGCGAAAGATGCCAAAGATGGTAAAGATGCAAAAGGTGAG
AAGAAGGACGCCAAAGATGTCAAAGATGGAAAACCCGCCGCAGAGGCAAAGGCGGCAGAG
GAAAAACCTGCATCACCTGCCAAGGACGCAAGTGCTGAAACAACAGCGAAACCTGAGGCT
GCCACTGCTGCTGCTGCTGCTGCTTCTGGCTCGGGAGAGGGGGAAAAGCCTGTGGCTGAG
GCTGAAGGAGCCAAGGCAGAGTGAAAGAAAAGGGTGTGTTAGCATTACTGTTGGAGGGGG
GGTTGGGGGGATAAATTGGTATTGGAGTTACAGTAGCTGCGGGGCAAAATAAGAAGAGGT
TAACATGTGCACATAGAAGCTCTATTGGGGGATCTTTATGGCACACCATTTCTTTTTCTG
GAGAGAGAAAGAGATAATCTTAGTCCTTCCTTTTGGTTTTCTATTTTTATTCATTATTTC
TTCTGTTGTGCAAAATTTGGTGATGAGGATATTGTCTGGGATTATTCATTTTACTTCCAC
GTTATTACATTTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GJ91TF U 1
AF RS1GJ91JQ C 448
BS 1 569 RS1GJ91TF
BS 570 796 RS1GJ91JQ

RD RS1GJ91TF 572 0 0
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GCGGAGCTGATCCCGCGTGAGGTTCCCAACATTGAGAAGAAGAGAGGGAAAAAGGATCCC
GACAAGAAACCTTCAGTGAATGTTATCCAGGGTCCTAAACCTGGGAAGCCTACTGATCTA
GGGGGAATGAGGCAGATATTCTTGAAGCTCAAGACTAATCCACCACCCCACATGATGCCT
CCTCCTCCTCCAGCCAAGGACGCGAAAGATGCCAAAGATGGTAAAGATGCAAAAGGTGAG
AAGAAGGACGCCAAAGATGTCAAAGATGGAAAACCCGCCGCAGAGGCAAAGGCGGCAGAG
GAAAAACCTGCATCACCTGCCAAGGACGCAAGTGCTGAAACAACAGCGAAACCTGAGGCT
GCCACTGCTGCTGCTGCTGCTGCTTCTGGCTCGGGAGAGGGGGAAAAGCCTGTGGCTGAG
GCTGAAGGAGCCAAGGCAGAGTGAAAGAAAAGGGTGTGTTAGCATTACTGTTGGAGGGGG
GGTTGGGGGGATAAATTGGTATTGGAGTT
ACA

QA 1 569 1 569
DS 

RD RS1GJ91JQ 349 0 0
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AAAAGGGTGTGTTAGCATTACTGTTGGAGGGGGGGTTGGGGGGATAAATTGGTATTGGAG
TTACAGTAGCTGCGGGGCAAAATAAGAAGAGGTTAACATGTGCACATAGAAGCTCTATTG
GGGGATCTTTATGGCACACCATTTCTTTTTCTGGAGAGAGAAAGAGATAATCTTAGTCCT
TCCTTTTGGTTTTCTATTTTTATTCATTATTTCTTCTGTTGTGCAAAATTTGGTGATGAG
GATATTGTCTGGGATTATTCATTTTACTTCCACGTTATTACATTTTTAT

QA 1 349 1 349
DS 



AS 1 2

CO CL3305Contig1 929 2 4 U
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ACGCGTCGTGCTCTCTTCTTCCCGTCTAATCTTCTTCGGCGACAGAGAATAGGAATCAGC
TTCCCAGCATCAAACAAATCGTCTCCCTCTTCCTCACTTTTGATCGATAATACTCAGGAG
TTGTTAAAGCAGGGAGGCCCTTTGTGATGATATATAATCAAGAACCATCCATTCTCTCAA
GCGGTACAGAAACGAAGGATGTAAAGGGTTGAAGAAATGACTCGTCATATAAAATGACTC
GTCTCTCTTCCATCTCCATGCAGAAACCAAAGCAAAGGAAGAAAAATATGGCTCAAACTC
TCGATTGGGATGTTGTTATTGATGAAATCTCAGGGGTTTATGAGATCTTAGAAGCTATGG
GAATGGCGTCCATGAGCAGCTCTAATGGAGAAAGCCTTAAACTTTGTGTGTTTGACTTGA
GGAGAGGCCAAAACTAAGGACAGGAGCTTGACAAGATCTTGTTCTTCTTTCCTCCTGATA
CTTTTCTCACCAGAAGCAGCTTGTAAGGTAATAGAAGCAGAGAGACATTCGCATGTCTTC
TATGAAGCCGACCCTGATATATGGATGGTCATGGTTGTAGATAAAAATAAGGAGATTGAA
GCCATATGGAGGGTTGATGCGTTGCAGAAAGTGCTAAAGAAAGTCCATTCCCTCTTTGTT
ATGTTTCACGGATCAGTTAGGTCATTGCTTGATAAAGAACCATTTGGTGGACTTATCGGA
TCACACTTGCAGTTATATGTTTTTTTTTGGAATTTTTAAACCTAAGGACTAACCAAAAGT
CCCACCAATAATCACAAATTTCATTAAAGTTCCATAACAATGTCCTAAACTACAAATATT
AATAAAAAATTTTAAGGACTTACTAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BM36TF U 1
AF RS1BM36JQ C 596
BS 1 611 RS1BM36TF
BS 612 612 RS1BM36JQ
BS 613 734 RS1BM36TF
BS 735 929 RS1BM36JQ

RD RS1BM36TF 734 0 0
AGGGGGACGTTCAAGGACGTGTCTTAGTTAAGATACAAATTTGCTCGTCCTTAGCTGGAC
ACGCGTCGTGCTCTCTTCTTCCCGTCTAATCTTCTTCGGCGACAGAGAATAGGAATCAGC
TTCCCAGCATCAAACAAATCGTCTCCCTCTTCCTCACTTTTGATCGATAATACTCAGGAG
TTGTTAAAGCAGGGAGGCCCTTTGTGATGATATATAATCAAGAACCATCCATTCTCTCAA
GCGGTACAGAAACGAAGGATGTAAAGGGTTGAAGAAATGACTCGTCATATAAAATGACTC
GTCTCTCTTCCATCTCCATGCAGAAACCAAAGCAAAGGAAGAAAAATATGGCTCAAACTC
TCGATTGGGATGTTGTTATTGATGAAATCTCAGGGGTTTATGAGATCTTAGAAGCTATGG
GAATGGCGTCCATGAGCAGCTCTAATGGAGAAAGCCTTAAACTTTGTGTGTTTGACTTGA
GGAGAGGCCAAAACTAAGGACAGGAGCTTGACAAGATCTTGTTCTTCTTTCCTCCTGATA
CTTTTCTCACCAGAAGCAGCTTGTAAGGTAATAGAAGCAGAGAGACATTCGCATGTCTTC
TATGAAGCCGAGCCTGATATATGGATGGTCATGGTTGTAGATAAAAATAAGGAGATTGAA
GCCATATGGAGGGTTGATGCGTTGCAGAAAGTGCTAAAGAAAGTCCATTCCCTCTTTGTT
ATGTTTCACGGATC

QA 1 734 1 734
DS 

RD RS1BM36JQ 334 0 0
TTTTT
TATGAAGCCGACCCTGATATATGGATGGTCATGGTTGTAGATAAAAATAAGGAGATTGAA
GCCATATGGAGGGTTGATGCGTTGCAGAAGGTGCTAAAGAAAGTCCATTCCCTTTTTGTT
ATGTTTCACGGATCAGTTAGGTCATTGCTTGATAAAGAACCATTTGGTGGACTTATCGGA
TCACACTTGCAGTTATATGTTTTTTTTTGGAATTTTTAAACCTAAGGACTAACCAAAAGT
CCCACCAATAATCACAAATTTCATTAAAGTTCCATAACAATGTCCTAAACTACAAATATT
AATAAAAAATTTTAAGGACTTACTAAAAA

QA 6 334 6 334
DS 



AS 1 3

CO CL3306Contig1 521 3 2 U
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TCGTTTCTCTTTTCTGTTCTTCTGAGTCTTTATTTTATCCTCTCACTTTCGCTGTCAAAC
CTTAAAAGTACTCGCTCATCTCCATAATTTAAGAATCTTGTTTTGAATCTACATGAAAGC
TTTAGTCGTAATATAATCGAAAAGCCCGTTGACTCTGCAATACCCTCATGTGCTAAATTT
TCCAAGTAAGTATAACACGTAGCTTTTGCTTTCCCACCCCCCACCCCTATAAAAGAAAAG
AAAAGAAAACGACATCTTGTATTCGATCAAGTTCTTCCTCTTGAAAACAGGGTTATGTGC
TTTTGAGTTATCTGTAACTATTTGAGAATGGTGGATAGAAACGAGAATCAAGCTCCTGAG
AAGCTTCAGGTTAAATTCTACAAAACCAAAAACTCAGATCCATTAACTTTTCATTGTTTT
TCTCTGAATTTAGAACTAAGATTCTTGTTTATGTCTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
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AF RS1CH84TF U 1
AF RS1G554JQ C 219
AF RS1G554TF U 56
BS 1 211 RS1CH84TF
BS 212 521 RS1G554TF

RD RS1CH84TF 211 0 0
GCGATCAAGTACAGAAAACGATAAAAGCTTTCATACTTGGGATTCTTTAATCTTTTTGAT
TCGTTTCTCTTTTCTGTTCTTCTGAGTCTTTATTTTATCCTCTCACTTTCGCTGTCAAAC
CTTAAAAGTACTCGCTCATCTCCATAATTTAAGAATCTTGTTTTGAATCTACATGAAAGC
TTTAGTCGTAATATAATCGAAAAGCCCGTTG

QA 1 211 1 211
DS 

RD RS1G554JQ 234 0 0
AATACCCTCATGTGTTAAATTTTCCAAGTAAGTATAACACGTAGCTTTTGCTTTCCCACC
CCCCACCCCTATAAAAGAAAAGAAAAGAAAACGACATCTTGTATTCGATCAAGTTCTTCC
TCTTGAAAACAGGGTTATGTGCTTTTGAGTTATCTGTAACTATTTGAGAATGGTGGATAG
AAACGAGAATCAAGCTCCTGAGAAGCTTCAGGTTAAATTTTACAAAACCAAAAA

QA 1 234 1 234
DS 

RD RS1G554TF 466 0 0
GG
GATTCGTTTCTCTTTTCTGTTCTTCTGAGTCTTTATTTTATCCTCTCACTTTCGCTGTCA
AACCTTAAAAGTACTCGCTCATCTCCATAATTTAAGAATCTTGTTTTGAATCTACATGAA
AGCTTTAGTCGTAATATAATCGAAAAGCCCGTTGACTCTGCAATACCCTCATGTGCTAAA
TTTTCCAAGTAAGTATAACACGTAGCTTTTGCTTTCCCACCCCCCACCCCTATAAAAGAA
AAGAAAAGAAAACGACATCTTGTATTCGATCAAGTTCTTCCTCTTGAAAACAGGGTTATG
TGCTTTTGAGTTATCTGTAACTATTTGAGAATGGTGGATAGAAACGAGAATCAAGCTCCT
GAGAAGCTTCAGGTTAAATTCTACAAAACCAAAAACTCAGATCCATTAACTTTTCATTGT
TTTTCTCTGAATTTAGAACTAAGATTCTTGTTTATGTCTGTTCC

QA 3 466 3 466
DS 



AS 1 3

CO CL3307Contig1 860 3 2 U
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AGAGGTAATATTTTTATTCATGTGATCACGAGTCTTTAGAGAAACCAAAGAAAGCCAAAA
TGGCACCAAATATGTCTGAAGAGAGCAAAGCCTTAAGCACCCTCTTCTTCTCGGGTGTGT
AAGGAGGGTATCTTAAATCCGAGTCACCATCAAAGCTCCTGTAAAGAACCCCTTTCCTAT
GGCTAAACGTCTCATACGAGAATTTACCGTGGTAAGCCCCAATCCCACTCTCCCCAACTC
CTCCAAACGGTAAATCTTTCAAAGTCACATGTAAGACGGTCTCATTTATGCTCATTCCTC
CTGCAGACACGTTCTGCACGAACTGGTTCTGCAACTCTTTGTTGTCCGTGAAGAGATACG
CCGCCAAAGGCTTTGGCTTTGACCGTATAACCTGAAACCCATCTTCAATCTTTGATACGG
TTATCACAGGAAGTAATGGTCCAAATATCTCTTCATGCATCATTGTAGACTCCTCCGGCA
CATCAACAAGTATCGTTGGAGATATTTTTAGCTTATCTTCCATTGTTTGGCCTCCATGAA
CAATCTTGTCAGCAACTCCGTTCTCTTTCATCATACTCTCCAAGCGTTTGAAGTGGAAAG
AGTTCACTATCCGCGACAAGTCCTTGGAGTCTAATGGATTGTCTCCAAAGAATGTCTTCA
GTTCAGTCTTCAGAGCATCTATCAGTTTTGGTGCAAAGTCTTTAGTTGTGATAACGTAGT
CAACGCCAATGCAAGCCTGTCCATTGTTACAACCCCATTTCCCTGTTATGATCCTCCTAG
CAGCAACTTGTAGATAACAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CI61JQ U 1
AF RS1CI61TF C 1
AF RS1GJ29JQ U 44
BS 1 683 RS1CI61JQ
BS 684 860 RS1GJ29JQ

RD RS1CI61JQ 683 0 0
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TTATCACAGGAAGTAATGGTCCAAATATCTCTTCATGCATCATTGTAGACTCCTCCGGCA
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CAATCTTGTCAGCAACTCCGTTCTCTTTCATCATACTCTCCAAGCGTTTGAAGTGGAAAG
AGTTCACTATCCGCGACAAGTCC

QA 1 683 1 683
DS 

RD RS1CI61TF 683 0 0
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AGAGGTAATATTTTTATTCATGTGATCACGAGTCTTTAGAGAAACCAAAGAAAGCCAAAA
TGGCACCAAATATGTCTGAAGAGAGCAAAGCCTTAAGCACCCTCTTCTTCTCGGGTGTGT
AAGGAGGGTATCTTAAATCCGAGTCACCATCAAAGCTCCTGTAAAGAACCCCTTTCCTAT
GGCTAAACGTCTCATACGAGAATTTACCGTGGTAAGCCCCAATCCCACTCTCCCCAACTC
CTCCAAACGGTAAATCTTTCAAAGTCACATGTAAGACGGTCTCATTTATGCTCATTCCTC
CTGCAGACACGTTCTGCACGAACTGGTTCTGCAACTCTTTGTTGTCCGTGAAGAGATACG
CCGCCAAAGGCTTTGGCTTTGACCGTATAACCTGAAACCCATCTTCAATCTTTGATACGG
TTATCACAGGAAGTAATGGTCCAAATATCTCTTCATGCATCATTGTAGACTCCTCCGGCA
CATCAACAAGTATCGTTGGAGATATTTTTAGCTTATCTTCCATTGTTTGGCCTCCATGAA
CAATCTTGTCAGCAACTCCGTTCTCTTTCATCATACTCTCCAAGCGTTTGAAGTGGAAAG
AGTTCACTATCCGCGACAAGTCC

QA 1 683 1 683
DS 

RD RS1GJ29JQ 817 0 0
G
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GTAGACTCCTCCGGCACATCAACAAGTATCGTTGGAGATATTTTTAGCTTATCTTCCATT
GTTTGGCCTCCATGAACAATCTTGTCAGCAACTCCGTTCTCTTTCATCATACTCTCCAAG
CGTTTGAAGTGGAAAGAGTTCACTATCCGCGACAAGTCCTTGGAGTCTAATGGATTGTCT
CCAAAGAATGTCTTCAGTTCAGTCTTCAGAGCATCTATCAGTTTTGGTGCAAAGTCTTTA
GTTGTGATAACGTAGTCAACGCCAATGCAAGCCTGTCCATTGTTACAACCCCATTTCCCT
GTTATGATCCTCCTAGCAGCAACTTGTAGATAACAT

QA 2 817 2 817
DS 



AS 1 3

CO CL3308Contig1 1106 3 11 U
GAAAACCCTTCCCTTCCTCTCCTCTTTCTCCTATCCATCACAGTTCTGCAATGGCTTCTT
CTTCGATACTGACATCAACCTTGAAGCCTCTAGCCATGGCGGATTCTTCCTCTTCTACCT
TTCTCTCCCATCCTTCACTCTCCACTATCATCAACTCTTCCAAAACTCGCTGCTTCTCTA
CTCTTTCTCTCCTCACCAAACGCACTAACCCACCCTTCTCCTTCTCCCACCTTTCCCTCT
CTCTCAACTCCAAAACCCACCTCAAAAAATCCCCCTTTCTCTCCTCCCTCGCCCAGACTT
CGGATTGGGCTCAGCCAGACGGGGAGGAAACCGGAGATTCGAGCGCTTCGGTCGCCGTTG
AGGAGAACGACCCTGAAGCCACCCTCTCGGAAGAGGAAGGAGGAGGTGGCGATTTCCCGG
AGCCACCGGAAGAAACGAAGCTCTTCGTCGGTAACTTGGCTTACGACGTTGATAGCCAAG
CCTTGGCTATGCTCTTTGAGCAAGCTGGTACCGTTGAAATCGCCGAGGTTATTTACAATA
GGGAAACCGATCAGAGTCGTGGATTTGGATTTGTGACGATGAGTACGGTGGAAGAAGCTG
AGACTGCTGTTGAGAAATTCAACCGTTATGATCTGAACGGACGGGCTTTGACAGTAAACA
AAGCAGCTCCAAGAG*CTCACGCCCAGAACGCCAACCTCGGGTATACGAGCCTGCATTCA
GAGTCTACGTGGGAAACCTTCCGTGGGATGTTGACAATGGGCGTCTAGAACAAGTATTCA
GTGAGCATGGCAAAGTAGTGGAAGCTCGTGTGGTTTATGACCGTGAGACAGGTCGTTCAC
GTGGGTTCGGGTTTGTCACAATGTCTAACGAGATTGAACTCAACGACGCTATCGCTGCTC
TTGATGGACAGAACATGGAGGGTAGAGCTATCAGAGTAAATGTAGCGGAGGAGCGCCCGA
GGCGATTTTAAGATCTCTTTGTACCCTTAACTCTCTTCACACCTCTTGTGGTTTGTTTAG
ACGAGATTCTTACACTCTTTTGGCGATTTTTTTTTTGTTTGTTTGAAGTTTGAACTCTGA
GTGCGAAGCTTCTTCTAAAGTAATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BV89TF U 1
AF RS1B267TF U 31
AF RS1BV89JQ C 385
BS 1 383 RS1BV89TF
BS 384 384 RS1B267TF
BS 385 661 RS1BV89TF
BS 662 662 RS1B267TF
BS 663 697 RS1BV89TF
BS 698 751 RS1B267TF
BS 752 752 RS1BV89JQ
BS 753 769 RS1B267TF
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BS 773 793 RS1B267TF
BS 794 1106 RS1BV89JQ

RD RS1BV89TF 697 0 0
GAAAACCCTTCCCTTCCTCTCCTCTTTCTCCTATCCATCACAGTTCTGCAATGGCTTCTT
CTTCGATACTGACATCAACCTTGAAGCCTCTAGCCATGGCGGATTCTTCCTCTTCTACCT
TTCTCTCCCATCCTTCACTCTCCACTATCATCAACTCTTCCAAAACTCGCTGCTTCTCTA
CTCTTTCTCTCCTCACCAAACGCACTAACCCACCCTTCTCCTTCTCCCACCTTTCCCTCT
CTCTCAACTCCAAAACCCACCTCAAAAAATCCCCCTTTCTCTCCTCCCTCGCCCAGACTT
CGGATTGGGCTCAGCCAGACGGGGAGGAAACCGGAGATTCGAGCGCTTCGGTCGCCGTTG
AGGAGAACGACCCTGAAGCCACCTTCTCGGAAGAGGAAGGAGGAGGTGGCGATTTCCCGG
AGCCACCGGAAGAAACGAAGCTCTTCGTCGGTAACTTGGCTTACGACGTTGATAGCCAAG
CCTTGGCTATGCTCTTTGAGCAAGCTGGTACCGTTGAAATCGCCGAGGTTATTTACAATA
GGGAAACCGATCAGAGTCGTGGATTTGGATTTGTGACGATGAGTACGGTGGAAGAAGCTG
AGACTGCTGTTGAGAAATTCAACCGTTATGATCTGAACGGACGGGCTTTGACAGTAAACA
A*GCAGCTCCAAGAG*CTCACGCCCAGAACGCCAACC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RS1B267TF 765 0 0
GG
ATCCATCACAGTTCTGCAATGGCTTCTTCTTCGATACTGACATCAACCTTGAAGCCTCTA
GCCATGGCGGATTCTTCCTCTTCTACCTTTCTCTCCCATCCTTCACTCTCCACTATCATC
AACTCTTCCAAAACTCGCTGCTTCTCTACTCTTTCTCTCCTCACCAAACGCACTAACCCA
CCCTTCTCCTTCTCCCACCTTTCCCTCTCTCTCAACTCCAAAACCCACCTCAAAAAATCC
CCCTTTCTCTCCTCCCTCGCCCGGACTTCGGATTGGGCTCAGCCAGACGGGGAGGAAACC
G*AGATTCGAGCGCTTCGGTCGCCGTTGAGGAGAACGACCCTGAAGCCACCCTCTCGGAA
GAGGAAGGAGGAGGTGGCGATTTCCCGGAGCCACCGGAGGAAGCGAAGCTCTTCGTCGGT
AACTTGGCTTACGACGTTGATAGCCAAGCCTTGGCTATGCTCTTTGAGCAAGCTGGTGCC
GTTGAAATCGCCGAGGTTATTTACAATAGGGAAACCGATCAGAGTCGTGGATTTGGATTT
GTGACGATGAGTACGGTGGAAGAAGCTGAGACTGCTGTTGAGAAATTCAACCGTTATGAT
CTGAACGGACGGGCTTTGACAGTAAACAAAGCAGCTCCAAGAG*CTCACGCCCAGAACGC
CAACCTCGGGTATACGAGCCTGCATTCAGAGTCTACGTGGGAAACCTTCCGTGGGATGT*
GACAATGGGCGTCTAGAC**AGTATTCAGTGAGCATGGCAA
GT

QA 3 763 3 763
DS 

RD RS1BV89JQ 722 0 0
TCTCGGAAGAGGAAGGAGGAGGTGGCGATTTCCCGGAGCCACCGGAAGAAACGAAGCTCT
TCGTCGGTAACTTGGCTTACGACGTTGATAGCCAAGCCTTGGCTATGCTCTTTGAGCAAG
CTGGTACCGTTGAAATCGCCGAGGTTATTTACAATAGGGAAACCGATCAGAGTCGTGGAT
TTGGATTTGTGACGATGAGTACGGTGGAAGAAGCTGAGACTGCTGTTGAGAAATTCAACC
GTTATGATCTGAACGGACGGGCTTTGACAGTAAACAAGGCAGCTCCAAGAGGCTCACGCC
CAGAACGCCAACCTCGGGTATACGAGCCTGCATTCAGAGTCTACGTGGGAAACCTTCCGT
GGGATGTTGACAATGGGCGTCTAGAACAAGTATTCAGTGAGCATGGCAAAGTAGTGGAAG
CTCGTGTGGTTTATGACCGTGAGACAGGTCGTTCACGTGGGTTCGGGTTTGTCACAATGT
CTAACGAGATTGAACTCAACGACGCTATCGCTGCTCTTGATGGACAGAACATGGAGGGTA
GAGCTATCAGAGTAAATGTAGCGGAGGAGCGCCCGAGGCGATTTTAAGATCTCTTTGTAC
CCTTAACTCTCTTCACACCTCTTGTGGTTTGTTTAGACGAGATTCTTACACTCTTTTGGC
GATTTTTTTTTTGTTTGTTTGAAGTTTGAACTCTGAGTGCGAAGCTTCTTCTAAAGTAAT
TT

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 3

CO CL3309Contig1 784 3 8 U
GGGGAGAACAAACTCTAATCTTTCTCCTTTCTCGATGTCGATTGATTTCCTCTTCCTCTT
TTTCGTTTCTTCTGTTTACGAATCTTCCCCATGAACAATCAATTCTCTCCCCACTTCTCT
TCACTCTTTAATTCCATTAATGGATTCTTTTCGCTTTCTTCCTTTGAGATTCTATATAAG
ATCTCATTCTGGGTGTTTTGATTTTCATCGGAAGTTTTTCTATCCTCTTGACTGTGGATT
GCGATGAAGTTATCCGGTGTTCTCGACTCAGTGAAAACGAACGGCGAAGCGGCGGTCCCC
TCAACTCTGGTTAAACCCGTCGTCCAAATCGGTGTCTCTTCTGGTTAAACTCATTTTTGT
TATCTGAATTTCACAGACCAAAGCAGAGAAGAAGATCCTTACAGAGGAGGAACTTGAGCA
GAAGAAGAAGGATGACAAGGAGTTGAAAAACCAATAGCTTCCGAACTCTAGCTGGTGATT
TTGGAGTCGGGTCTAAACAGCTTAGTAATGTGAAAAGATCACAACTTGCTTCTCTGCAGC
AATATAAAAGTTAAGTTCTCTGGTCTCTTTTGTTGGCATTTCTGTATTTTATCATTTTGG
TCTCCACTATTGTTTTTATTGGTGGAAGATTGCATCTGGTCTTATATAATCTACACAAAT
ACAGACAAATGTATCTTGATTCAGGGGAGAAGTTGATGATTTGCTAAAGATCAAGACACT
TATGCCCAAACACTATTGTCTATCTCTCAGAAAGAGAAAGGTTTATGCTATGTATATACA
TACT


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1GB34TF U 1
AF RS1GB34JQ C 5
AF RS1GQ29TF U 15
BS 1 450 RS1GB34TF
BS 451 528 RS1GQ29TF
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RD RS1GB34TF 450 0 0
GGGGAGAACAAACTCTAATCTTTCTCCTTTCTCGATGTCGATTGATTTCCTCTTCCTCTT
TTTCGTTTCTTCTGTTTACGAATCTTCCCCATGAACAATCAATTCTCTCCCCACTTCTCT
TCACTCTTTAATTCCATTAATGGATTCTTTTCGCTTTCTTCCTTTGAGATTCTATATAAG
ATCTCATTCTGGGTGTTTTGATTTTCATCGGAAGTTTTTCTATCCTCTTGACTGTGGATT
GCGATGAAGTTATCCGGTGTTCTCGACTCAGTGAAAACGAACGGCGAAGCGGCGGTCCCC
TCAACTCTGGTTAAACCCGTCGTCCAAATCGGTGTCTCTTCTGGTTAAACTCATTTTTGT
TATCTGAATTTCACAGACCAAAGCAGAGAAGAAGATCCTTACAGAGGAGGAACTTGAGCA
GAAGAAGAAGGATGACAAGGAGTTGAAAAA

QA 1 450 1 450
DS 

RD RS1GB34JQ 708 0 0
AGAACAAACTCTAATCTTTCTCCTTTCTCGATGTCGATTGATTTCCTCTTCCTCTTTTTC
GTTTCTTCTGTTTACGAATCTTCCCCATGAACAATCAATTCTCTCCCCACTTCTCTTCAC
TCTTTAATTCCATTAATGGATTCTTTTCGCTTTCTTCCTTTGAGATTCTATATAAGATCT
CATTCTGGGTGTTTTGATTTTCATCGGAAGTTTTTCTATCCTCTTGACTGTGGATTGCGA
TGAAGTTATCCGGTGTTCTCGACTCAGTGAAAACGAACGGGGAAGCGGCGGTCCCCTCAA
CTCTGGTTAAACCCGTCGTCCAAATCGGTGTCTCTTCTGGTTAAACTCATTTTTGTTATT
TGAATTTCACAGACCAAAGCAGAGAAGAAGATCCTTACAGAGGAGGAACTTGAGCAGAAG
AAGAAGGATGACAAGGAGTTGAAAAACCAATAGCTTCCGAACTCTAGCTGGTGATTTTGG
AGTTGGGTCTAAACAGCTTAGTAATGTGAAAAGATCACAACTTGCTTCTCTGCAGCAATA
TAAAAGTTAAGTTCTCTGGTCTCTTTTGTTGGCATTTCTGTATTTTATCATTTTGGTCTC
CACTATTGTTTTTATTGGTGGAAGATTGCATCTGGTCTTATATAATCTACACAAATACAG
ACAAATGTATCTTGATTCAGGGGAGAAGTTGATGATTTGCTAAAGATC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1GQ29TF 770 0 0
GG
AATCTTTCTCCTTTGTTGATGTCGATTGATTTCCTCTTCCTCTTTTTCGTTTATTATGTT
TACGAATCTTCCCCATGAACAATCAATTCTCTCCCCACTTCTCTTCACTCTTTAATTCCA
TTAATGGATTCTTTTCGCTTTCTTCCTTTGAGATTCTATATAAGATCTCATTCTGGGTGT
TTTGATTTTCATCAGAAGTTTTTCTATCCTCTCGACTGTGCATTGCGATGAAGTTATCCG
GTGTTCCCGACTCAGTGAAAACGAACGGCGAAGCGGCGGTCCCCTCAACTCCGGTTAAAC
CCGTCGTCCAAATCGGTGTCTCTTCTGGTTAAACTCATTTTTGTTATCTGAATTTCACAG
ACCAAAGCAGAGAAGAAGATCCTTACAGAGGAGGAACTTGAGCAGAAGAAGAAGGATGAC
AAGGAGTTGAAAAACCAATAGCTTCCGAACTCTAGCTGGTGATTTTGGAGTCGGGTCTAA
ACAGCTTAGTAATGTGAAAAGATCACAACTTGTTTCTCTGCAGCAATATAAAAGTTAAGT
TCTCTGGTCTCTTTTGTTGGCATTTCTTTATTTTATCATTTTGGTCTCCACTATTGTTTT
TATTGGTGGAAGATTGCATCTGGTCTTATATAATCTACACAAATACAGACAAATGTATCT
TGATTCAGGG*AGAAGTTGATGATTTGCTAAAGATCAAGACACTTATGCCCAAACACTAT
TGTCTATCTCTCAGAAAGAGAAAGGTTTATGCTATGTATATACATACT

QA 3 770 3 770
DS 



AS 1 3

CO CL3310Contig1 821 3 16 U
TCTTTGCAGGTAAGCTCTCGTTAACCTTAAGAAACTGCGTAATCTTCGAGGAACCATAAG
CTTTTGATCTGTTCTATGAAAGGTGTAGAATGTTAGTCGTAGGAACTGCTAGATTCGTCA
GTGGCTTAGATTTAGATTTAGATTTTGCCATAACAATTCATGTGTGTTGAAATATTAGGA
CATGACATGCTTCAAAGTGTTCTTTTGCTAAGACATGAGTTTTATCTTACCAGGTAAGTA
GCAGATAACCGAAAGATGGGACGTGTCAGAACCAAGACCGTGAAGAAATCATCTCGTCAA
GTCATCGAGAAGTACTACTCTCGCATGACACTCGACTTCCACACGAACAAGAAGATCCTC
GAAGAAGTCGCAATCATCCCTTCGAAGCGTCTTCGCAACAAGATCGCTGGATTCTCCACC
CATTTGATGAAACGTATCCAGAAGGGACCGGTCCGTGGCATCTCGCTCAAGCTTCAAGAG
GAAGAGCGTGAGCGCCGCATGGACTTTGTTCCCGATGAGTCTGCCATCAAGACCGATGTG
ATCAAGGTCGATAAAGAGACTCTAGAGATGCTTGCTTCCCTTGGAATGTCTGACGCTCAT
GGCTTCTCTGAAGTTGAGGCACAGGCGGCACCTTCTTTCAGCAGGCCACCAAGAAGGTTC
TGAGGAGGAGGTTGTTGTTGTTATCAGTCGAATCAAGAGAGAAATCTTTAGATTGGCTGT
TTTTGTTTTGAAGTTAGGGACGAAAGACTTACTGTTCTTGAAATGTTTATTGTTTCTTTT
GATTCGAGATTTATGTCCTAAACTGAAAGTTATACACTAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RS1CL32TF U 1
AF RS1GW53TF U 225
AF RS1GW53JQ C 317
BS 1 316 RS1CL32TF
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BS 318 624 RS1CL32TF
BS 625 625 RS1GW53TF
BS 626 644 RS1CL32TF
BS 645 645 RS1GW53TF
BS 646 656 RS1CL32TF
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BS 693 713 RS1CL32TF
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BS 715 723 RS1CL32TF
BS 724 821 RS1GW53TF

RD RS1CL32TF 737 0 0
TCTTTGCAGGTAAGCTCTCGTTAACCTTAAGAAACTGCGTAATCTTCGAGGAACCATAAG
CTTTTGATCTGTTCTATGAAAGGTGTAGAATGTTAGTCGTAGGAACTGCTAGATTCGTCA
GTGGCTTAGATTTAGATTTAGATTTTGCCATAACAATTCATGTGTGTTGAAATATTAGGA
CATGACATGCTTCAAAGTGTTCTTTTGCTAAGACATGAGTTTTATCTTACCAGGTAAGTA
GCAGATAACCGAAAGATGGGACGTGTCAGAACCAAGACCGTGAAGAAATCATCTCGTCAA
GTCATCGAGAAGTACTGCTCTCGCATGACACTCGACTTCCACACGAACAAGAAGATCCTC
GAAGAAGTCGCAATCATCCCTTCGAAGCGTCTTCGCAACAAGATCGCTGGATTCTCCACC
CATTTGATGAAACGTATCCAGAAGGGACCGGTCCGTGGCATCTCGCTCAAGCTTCAAGAG
GAAGAGCGTGAGCGCCGCATGGACTTTGTTCCCGATGAGTCTGCCATCAAGACCGATGTG
ATCAAGGTCGATAAAGAGACTCTAGAGATGCTTGCTTCCCTTGGAATGTCTGACGCTCAT
GGCTTCTCTGAAGTTGAGGCACAG*CGGCACCTTCTTTCAGCAG*CCACCAAGAAG*TTC
TGAGGAGGAGGTTGTTGTTGT*ATCAGTCGA*TCAAGAGAGAAATCTTTAGATAGGCTGT
TTT
GTTTGGAGTAGGGA

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1GW53TF 597 0 0
TCTTTG
CAGGTAAGTAGCAGATAACCGAAAGATGGGACGTGTCAGAACCAAGACCGTGAAGAAATC
ATCTCGTCAAGTCATCGAGAAGTACTACTCTCGCATGACACTCGACTTCCACACGAACAA
GAAGATCCTCGAAGAAGTCGCAATCATCCCTTCGAAGCGTCTTCGCAACAAGATCGCTGG
ATTCTCCACCCATTTGATGAAACGTATCCAGAAGGGACCGGTCCGTGGCATCTCGCTCAA
GCTTCAAGAGGAAGAGCGTGAGCGCCGCATGGACTTTGTTCCCGATGAGTCTGCCATCAA
GACCGATGTGATCAAGGTCGATAAAGAGACTCTAGAGATGCTTGCTTCCCTTGGAATGTC
TGACGCTCATGGCTTCTCTGAAGTTGAGGCACAGGCGGCACCTTCTTTCAGCAGGCCACC
AAGAAGGTTCTGAGGAGGAGGTTGTTGTTGTTATCAGTCGAATCAAGAGAGAAATCTTTA
GATTGGCTGTTTTTGTTTTGAAGTTAGGGACGAAAGACTTACTGTTCTTGAAATGTTTAT
TGTTTCTTTTGATTCGAGATTTATGTCCTAAACTGAAAGTTATACACTAAA

QA 7 597 7 597
DS 

RD RS1GW53JQ 502 0 0
A
CTCTCGCATGACACTCGACTTCCACACGAACAAGAAGATCCTCGAAGAAGTCGCAATCAT
CCCTTCGAAGCGTCTTCGCAACAAGATCGCTGGATTCTCCACCCATTTGATGAAACGTAT
CCAGAAGGGACCGGTCCGTGGCATCTCGCTCAAGCTTCAAGAGGAAGAGCGTGAGCGCCG
CATGGACTTTGTTCCCGATGAGTCTGCCATCAAGACCGATGTGATCAAGGTCGATAAAGA
GACTCTAGAGATGCTTGCTTCCCTTGGAATGTCTGACGCTCATGGCTTTTCTGAAGTTGA
GGCACAGGCGGCACCTTCTTTCAGCAGGCCACCAAGAAGGTTTTGAGGAGGAGGTTGTTG
TTGTTATCAGTCGAATCAAGAGAGAAATCTTTAGATTGGCTGTTTTTGTTTTGAAGTTAG
GGACGAAAGACTTACTGTTCTTGAAATGTTTATTGTTTCTTTTGATTCGAGATTTATGTC
CTAAACTGAAAGTTATACACT

QA 2 502 2 502
DS 



AS 1 3

CO CL3311Contig1 688 3 1 U
GGAGACATCATTTTGTGGAATTCGAACTTCTCATTCTCTCTTTCATCTTCTCCTCTTACG
TAACCCTAGCGAAGTCGGAGATTCACCGGTAGATCAATCTTGAATCGCCATTGAAATCGA
CGGAGGAGAGAGAGAGCTGGGTGATTACCAGTAAGAGGAGGAACACATAGATAGGGAGGG
AGATAATGGATTTGGATAAATGGATATCGAAGGTTAAAGAAGAAGGTCAGCATCTCTGCG
AGGACGAGCTTCAGCTTCTCTGCGAATACGTGAAAGAGATTCTGATTGAGGAGTCCAATG
TACAGCCTGTCAACAGCCCTGTCACCGTCTGCGGTGACATCCATGGCCAGTTTCATGATC
TCATGAAGCTTTTTCAGACCGGTGGTCATGTTCCCGACACCAACTACATATTTATGGGGG
ACTTCGTTGATAGAGGTTACAACAGCCTTGAAGTCTTCACTATTCTTTTGCTTCTTAAAG
CCAGACATCCAGCCAATATTACACTTCTGCGTGGAAATCATGAAAGTAGACAGCTAACGC
AGGTGTATGGTTTTTATGACGAATGCCAAAGGAAGTATGGTAACGCTAATGCATGGCGAT
ATTGCACAGATGTTTTTGACTATCTTACCATATCTGCTATTATAGATAGCACTGTTCTAT
GTGTTCATGGTGGTCTTTCCCCGGATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CE11TF U 1
AF RS1G739TF U 43
AF RS1GI15TF U 43
BS 1 688 RS1CE11TF

RD RS1CE11TF 688 0 0
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TAACCCTAGCGAAGTCGGAGATTCACCGGTAGATCAATCTTGAATCGCCATTGAAATCGA
CGGAGGAGAGAGAGAGCTGGGTGATTACCAGTAAGAGGAGGAACACATAGATAGGGAGGG
AGATAATGGATTTGGATAAATGGATATCGAAGGTTAAAGAAGAAGGTCAGCATCTCTGCG
AGGACGAGCTTCAGCTTCTCTGCGAATACGTGAAAGAGATTCTGATTGAGGAGTCCAATG
TACAGCCTGTCAACAGCCCTGTCACCGTCTGCGGTGACATCCATGGCCAGTTTCATGATC
TCATGAAGCTTTTTCAGACCGGTGGTCATGTTCCCGACACCAACTACATATTTATGGGGG
ACTTCGTTGATAGAGGTTACAACAGCCTTGAAGTCTTCACTATTCTTTTGCTTCTTAAAG
CCAGACATCCAGCCAATATTACACTTCTGCGTGGAAATCATGAAAGTAGACAGCTAACGC
AGGTGTATGGTTTTTATGACGAATGCCAAAGGAAGTATGGTAACGCTAATGCATGGCGAT
ATTGCACAGATGTTTTTGACTATCTTACCATATCTGCTATTATAGATAGCACTGTTCTAT
GTGTTCATGGTGGTCTTTCCCCGGATGT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RS1G739TF 635 0 0
GG
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ACATAGATAGGGAGGGAGATAATGGATTTGGATAAATGGATATCGAAGGTTAAAGAAGAA
GGTCAGCATCTCTGCGAGGACGAGCTTCAGCTTCTCTGCGAATACGTGAAAGAGATTCTG
ATTGAGGAGTCCAATGTACAGCCTGTCAACAGCCCTGTCACCGTCTGCGGTGACATCCAT
GGCCAGTTTCATGATCTCATGAAGCTTTTTCAGACCGGTGGTCATGTTCCCGACACCAAC
TACATATTTATGGGGGACTTCGTTGATAGAGGTTACAACAGCCTTGAAGTCTTCACTATT
CTTTTGCTTCTTAAAGCCAGACATCCAGCCAATATTACACTTCTGCGTGGAAATCATGAA
AGTAGACAGCTAACGCAGGTGTATGGTTTTTATGACGAATGCCAAAGGAAGTATGGTAAC
GCTAATGCATGGCGATATTGCACAGATGTTTTTGACTATCTTACCATATCTGCTATTATA
GATAGCACTGTTCTATGTGTTCATGGTGGTCTT

QA 3 635 3 635
DS 

RD RS1GI15TF 636 0 0
GG
ATCTTCTCCTCTTACGTAACCCTAGCGAAGTCGGAGATTCACCGGTAGATCAATCTTGAA
TCGCCATTGAAATCGACGGAGGAGAGAGAGAGCTGGGTGATTACCAGTAAGAGGAGGAAC
ACATAGATAGGGAGGGAGATAATGGATTTGGATAAATGGATATCGAAGGTTAAAGAAGAA
GGTCAGCATCTCTGCGAGGACGAGCTTCAGCTTCTCTGCGAATACGTGAAAGAGATTCTG
ATTGAGGAGTCCAATGTACAGCCTGTCAACAGCCCTGTCACCGTCTGCGGTGACATCCAT
GGCCAGTTTCATGATCTCATGAAGCTTTTTCAGACCGGTGGTCATGTTCCCGACACCAAC
TACATATTTATGGGGGACTTCGTTGATAGAGGTTACAACAGCCTTGAAGTCTTCACTATT
CTTTTGCTTCTTAAAGCCAGACATCCAGCCAATATTACACTTCTGCGTGGAAATCATGAA
AGTAGACAGCTAACGCAGGTGTATGGTTTTTATGACGAATGCCAAAGGAAGTATGGTAAC
GCTAATGCATGGCGATATTGCACAGATGTTTTTGACTATCTTACCATATCTGCTATTATA
GATAGCACTGTTCTATGTGTTCATGGTGGTCTT
T

QA 3 635 3 635
DS 



AS 1 3

CO CL3312Contig1 797 3 1 U
ATTCAGAGGAAAGCGACCTTCCGATTCTCTCGCCAAGATTCACGCAAGGTACGAGTCTTG
CTTACAGGATCTGTTAAATCTCCGAGTGCTACAGAGATTAGAGATGGACTTTTCTACCGA
AAGAACCAGAATCTGCGCTTTCCTCAACAAAGCATATGAGTTGGTTGATGATCCTTCTAC
GGATAAGATAATTTCGTGGGCACCAAACGGCAGGACATTCGTGGTTTGGAAACCGCTCAA
GTGTTCAAGTGACCTTCTTCCACTACGCTTGGGAATCGCAAACTTTGCAAGATTCGAGTC
ATATGGCTTTAGCAAGATTGTGTCTGGACAACAGTTGGAGTTTCTATGCAAAGATTTTGA
GAAGGGTCACCCTGAGCTTTTGGAGAGGATTAGCGATCGGTATGTGGCCAAGTTGAGAGC
TTTCTATGAGAAGAGGTACAAGCCATTTGAGGATCGGCTTAAAAATGCAAAGACCAAGGA
AGAGTGGGATCTAGCAGTGAAGGAGCAGAAGGAGTTTTTTGAAAACGATAGTAAGGAGAG
AAGGGCGAGCAGGCCAAGGACGAAGAGCTCTCCACCAGCTTCGGAGAATTAAGTGCAGAG
TAATGGAATTTGAGAACATTCTTCTGTATCTTTGTGAAAACCTTTTCATGTTATGGGTTT
CCCTACTGTGGTTTGTTTTCTGAACA*TATTTCTCGTGTTCTTTTGTTTCCACTTAATCC
CTTCTCGTCTATTTAGTGTGTTTCTACTTTCATTGTAAGATACCCTTTGTGTGCTCAATA
A*CTATGAGCTTGCTTG


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RS1AI58JQ C 1
AF RS1AI58TF U 1
AF RS1EC10TF U 102
BS 1 797 RS1AI58TF

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AACTATGAGCTTG
CTG

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DS 

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AAGAACCAGAATCTGCGCTTTCCTCAACAAAGCATATGAGTTGGTTGATGATCCTTCTAC
GGATAAGATAATTTCGTGGGCACCAAACGGCAGGACATTCGTGGTTTGGAAACCGCTCAA
GTGTTCAAGTGACCTTCTTCCACTACGCTTGGGAATCGCAAACTTTGCAAGATTCGAGTC
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AGAGTGGGATCTAGCAGTGAAGGAGCAGAAGGAGTTTTTTGAAAACGATAGTAAGGAGAG
AAGGGCGAGCAGGCCAAGGACGAAGAGCTCTCCACCAGCTTCGGAGAATTAAGTGCAGAG
TAATGGAATTTGAGAACATTCTTCTGTATCTTTGTGAAAACCTTTTCATGTTATGGGTTT
CCCTACTGTGGTTTGTTTTCTGAACA*TATTTCTCGTGTTCTTTTGTTTCCACTTAATCC
CTTCTCGTCTATTTAGTGTGTTTCTACTTTCATTGTAAGATACCCTTTGTGTGCTCAATA
A*CTATGAGCTTGCTTG

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G
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GGTTGATGGTCCTTCTACGGATAAGATAATTTCGTGGGCACCAAACGGCAGGACGTTCGT
GGTTTGGAAACCGCTCAAGTGTTCAAGTGACTTTCTTCCACTACGCTTGGGAATCACAAA
CTTTGCAAGATTCGAGTCATATGGCTTTAGCAAGATTGTGTCTGGACAACGGTTGGAGTT
TCTATGCAAAGATTTTGAGAAGGGTCACCCTGAGCTTTTGGAGAGGATTAGCGATCGGTA
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AAATGCAAAGACCAAGGAAGAGTGGGATATAGCAGCGAAGGAGCAGAAGGAGTTTTTTGA
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TTTTCATGTTATGGGTTTCCCTACTGTGGTTTGTTTTCTGAACAATATTTCTCGTGTTCT
TTTGTTTCCACTTAATCCCTTCTCGTCTAGTTAGTGTGTTTCTACTTTCATTGTAAGATA
CCCTTTGTGTGCTCAATAA*CTATGAGCTTG

QA 2 692 2 692
DS 



AS 1 2

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TTTCCGGGTCTGCCAGCCTGAGAGTTTCCTTGAGGAATTCAGGAACAGGACCCCCACAAT
GAAGTTTGAGAGCTTGTGCAAGTGCAAGAAACAGGCGGACAACGAGTGTTCTGTATGCCT
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AACATGCTTGGAGAAATGGATAGACTACTGGAACATCACTTGCCCACTCTGTAGGACTCC
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GGAAGCTCTTGTTTGAACTT


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AI18TF U 1
AF RS1AI18JQ C 3
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GGGGTA

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DS 

RD RS1AI18JQ 858 0 0
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AAGCTCTTGTTTGAACTT

QA 1 858 1 858
DS 



AS 1 3

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AGTTATCAATTTGCCTTTCAACGTTTCTGAATTTGAATTTGTTAAGAACTCGAAGCTTGG
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GTCTTCCTCCGATGGAGAACACATC


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DT96TF C 1
AF RS1H596JQB U 1
AF RS1H164JQB U 4
BS 1 3 RS1DT96TF
BS 4 411 RS1H596JQB
BS 412 412 RS1H164JQB
BS 413 448 RS1H596JQB
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RD RS1DT96TF 440 0 0
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GTAACACAAACACGTACTTATTAATACAAACTCACTTATTGAAACACATAGACGGACTTA
TTAGTACTTAGGTGGTTGATAACAGTTAACAAAGCAAACACATTGAGTTGCATGTCCGTA
CGTGGTTAGAGAAACTCTAACTTGGAAAGTACATGGTTTTAGAAACGGTTTCAATTTCGA
CTTGGACAGTCAACTTATCATCAACAAGGAAGCCCTTTGATAAATCTCTGAGATTAGAGA
GAGGGACAAATTCACTAGAACCCCAACCATATGCACGTCCAGTTTCCCAGCGGCTGAACC
AGTTATCAATTTGCCTTTCAACGTTTCTGAATTTGAATTTGTTAAGAACTCGAAGCTTGG
CTCGAACATAAATTCTCTC
C

QA 1 439 1 439
DS 

RD RS1H596JQB 448 0 0
GGT
GCTTAAAAGACGAGAGATGTTTGATAGATGCATGATGAGAATACAGACTCATTTATTGTA
ACACAAACACGTACTTATTAATACAAACTCACTTATTGAAACACATAGACGGACTTATTA
GTACTTAGGTGGTTGATAACAGTTAACAAAGCAAACACATTGAGTTGCATGTCCGTACGT
GGTTAGAGAAACTCTAACTTGGAAAGTACATGGTTTTAGAAACGGTTTCAATTTCGACTT
GGACAGTCAACTTATCATCAACAAGGAAGCCCTTTGATAAATCTCTGAGATTAGAGAGAG
GGACAAATTCACTAGAACCCCAACCATATGCACGTCCAGTTTCCCAGCGACTGAACCAGT
TATCAATTTGCCTTTCAACGTTTCTGAATTTGAATTTGTTAAGAACTCCAAGCTTGGCTC
GAACATAAATTCTCTCATAGGGTCT

QA 4 448 4 448
DS 

RD RS1H164JQB 562 0 0
GCTTAAAAGACGAGAGATGTTTGATAGATGCATGATGAGAATACAGACTCATTTATTGTA
ACACAAACACGTACTTATTAATACAAACTCACTTATTGAAACACATAGACGGACTTATTA
GTACTTAGGTGGTTGATAACAGTTAACAAAGCAAACACATTGAGTTGCATGTCCGTACGT
GGTTAGAGAAACTCTAACTTGGAAAGTACATGGTTTTAGAAACGGTTTCAATTTCGACTT
GGACAGTCAACTTATCATCAACAAGGAAGCCCTTTGATAAATCTCTGAGATTAGAGAGAG
GGACAAATTCACTAGAACCCCAACCATATGCACGTCCAGTTTCCCAGCGACTGAACCAGT
TATCAATTTGCCTTTCAACGTTTCTGAATTTGAATTTGTTAAGAACTCGAAGCTTGGCTC
GAACATAAATTCTCTCATAGGGTCTGAGTTCCTCGGTCTTATTAACGACAAGATACATGG
ACAAAGCTTTTCCCTTTCCCTTGTCACGACCACTTGGATTCACTTGTATATTCCAACGTC
TTCCTCCGATGGAGAACACATC

QA 1 562 1 562
DS 



AS 1 3

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AAAAAAA*TGGCCTCATCAAGATTTCAACTTGTTGCCCTTCTTGTCATCTTCTCTCTCGT
TATTACTGCCCAATCTGAAAGAGAAAAGGAAGAAATGGACGGACCATGCCGCTTGAGAGG
AACATGCGATGAGGACAGCGACTGCAACGCCCATTGCCACAGAAGCACGGACATTATACC
CATGAACGGCCATTGTCTCTTCGACAGACCCACCCCCGTATGCTGCTGCCTCTTTGATTA
AGTCCCATCCTTTTTTTATTCTTCAAGTTTCCATGCATGCATGATCCTAATTAAACTAAT
GATGTAAACATATACATAAATGTTCACGTCCTAACTACTTGAAGAATAGAAGAAGCGATC
TTGTGTTTCTTATACTTTTGATTTCTTGTTTACCATATGTTGTAAGAGAATGACTATTTA
TGAACATATTATACATATAC


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RS1AD15JQ C 1
AF RS1AD15TF U 1
AF RS1CK16TF U 1
BS 1 498 RS1AD15TF
BS 499 500 RS1AD15JQ

RD RS1AD15JQ 500 0 0
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CATGAACGGCCATTGTTTTTTCGACAGACCCACCCCCGTATGCTGCTGCCTCTTTGATTA
AGTCCCATCCTTTTTTTATTCTTCAAGTTTCCATGCATGCATGATCCTAATTAAACTAAT
GATGTAAACATATACATAAATGTTCACGTCCTAACTACTTGAAGAATAGAAGAAGCGATC
TTGTGTTTCTTATACTTTTGATTTCTTGTTTACCATATGTTGTAAGAGAATGACTATTTA
TGAACATATTATACATATAC

QA 1 500 1 500
DS 

RD RS1AD15TF 500 0 0
GGAAGCACAAAACATCAAGTTGAATATCTTGCATTAATATAAATAAATAAAACAAACTGC
AAAAAAA*TGGCCTCATCAAGATTTCAACTTGTTGCCCTTCTTGTCATCTTCTCTCTCGT
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AACATGCGATGAGGACAGCGACTGCAACGCCCATTGCCACAGAAGCACGGACATTATACC
CATGAACGGCCATTGTCTCTTCGACAGACCCACCCCCGTATGCTGCTGCCTCTTTGATTA
AGTCCCATCCTTTTTTTATTCTTCAAGTTTCCATGCATGCATGATCCTAATTAAACTAAT
GATGTAAACATATACATAAATGTTCACGTCCTAACTACTTGAAGAATAGAAGAAGCGATC
TTGTGTTTCTTATACTTTTGATTTCTTGTTTACCATATGTTGTAAGAGAATGACTATTTA
TGAACATATTATACATAT
AC

QA 1 498 1 498
DS 

RD RS1CK16TF 498 0 0
GGAAGCACAAAACATCAATTTGAATATCTTGCATTAATATAAATAAATAAAACAAACTGC
AAAAAAAATGGCCTCATCAAGATTTCAACTTGTTGCCCTTCTTGTCATCTCCTCTCTCGT
TATTACTGCCCAATCTGAAAGAGAAAAGGAAGAAATGGACGGACCATGCCGCTTGAGAGG
AACATGCGATGAGGACAGCGACTGCAACGCCCATTGCCACAGAAGCACGGACATTATACC
CATGAACGGCCATTGTCTCTTCGACAGACCCACCCCCGTATGCTGCTGCCTCTTTGATTA
AGTCCCATCCTTTTTTTATTCTTCAAGTTTCCATGCATGCATGATCCTAATTAAACTAAT
GATGTAAACATATACATAAATGTTCACGTCCTAACTACTTGAAGAATAGAAGAAGCGATC
TTGTGTTTCTTATACTTTTGATTTCTTGTTTACCATATGTTGTAAGAGAATGACTATTTA
TGAACATATTATACATAT

QA 1 498 1 498
DS 



AS 1 3

CO CL3316Contig1 1065 3 7 U
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AAAGAGGATTCGATTTTGAGAAAACGATGGAAGACGATGGAAGAGACGCTCATCAGCTCG
ATTTGGAAAACGCCGATCGACATGTTTGGTTGATGAAGAGTCCTGTTGTTGTCTCCAAGA
CCTGGGAGAAGCTCACTCCCCCTCCTTCTTCATCCTCGTTTTCTTCGTATTCTTCCCCTG
GACTCACTAGTTTGGCCAAGGTTGTTGAATCCGTTAATCCTCTACAGCCCGAGCCCGAGT
TCAACATGGAGATGGTGGGTGCTGAGTATGGGAACATGCCAAAGAGCTACTCTTTGAACA
TGTTTAAAGACTTTGTTCCAATGTCTGTCTTATCCGCTGTCGATCTCGAAGAGAATCCAG
CTGCTGAAGGAACGATAGAACAAAAATTCGACATGAAGCCACAGGGAGAAGACATTGAAG
AGTATGCAAGGCTTTGTCGAGAGAGAACAAGCAGATCCATGGTTAAGAACCGACAGATCC
AGGTTATTGATAATGACCGTGGAGTACATATGAGGTTTTTGCCTGGATTGCCTAATTTGC
TTTCCTCCAATTCAAGGGAAAAGAGGAAAGCTGTCCCAGTCAAGCAAACAGATGTGAAGA
GGACGAGGAGAGATCGTGGTGAGCTCGAAGGCATAATGTTCAACCTATTCGAAGGACAAC
CAAACTGGACCTTGAAGCAGCTAGTACAGAAGACTGACCAACCAGCGCAGTTTTTGAAAG
AGATACTAAACGAGCTTTGCGTTTACAATAAGCGAGGATCGAACCAAGGGACTTATGAGC
TTAAGCCAGAATACAAGAAAGCTGGTGAAGATGATACAGGTGGACAGTAAAAAAAACAAT
CGCATGTGTAGCAAACATCTATGTACTACTTACATGTGCCAAGTCATTCTAGCGAGAGGA
GTTTTATTTTAATTTTTACTAGTTAAGCCAAAATAGTCAAATTATGAAATTTTAGTGTTT
CTTAACACTTATTAATCATTCTTTTATAAAATCTTACTCCAAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B849TF U 1
AF RS1G182TF U 11
AF RS1B849JQ C 428
BS 1 655 RS1B849TF
BS 656 690 RS1G182TF
BS 691 691 RS1B849JQ
BS 692 714 RS1G182TF
BS 715 715 RS1B849JQ
BS 716 774 RS1G182TF
BS 775 1065 RS1B849JQ

RD RS1B849TF 655 0 0
GGAGGCATAAACAAGAGAAACCGAAACAGAGAGTTTAGGATCAGAAGAAGTGTCTGCGAG
AAAGAGGATTCGATTTTGAGAAAACGATGGAAGACGATGGAAGAGACGCTCATCAGCTCG
ATTTGGAAAACGCCGATCGACATGTTTGGTTGATGAAGAGTCCTGTTGTTGTCTCCAAGA
CCTGGGAGAAGCTCACTCCCCCTCCTTCTTCATCCTCGTTTTCTTCGTATTCTTCCCCTG
GACTCACTAGTTTGGCCAAGGTTGTTGAATCCGTTAATCCTCTACAGCCCGAGCCCGAGT
TCAACATGGAGATGGTGGGTGCTGAGTATGGGAACATGCCAAAGAGCTACTCTTTGAACA
TGTTTAAAGACTTTGTTCCAATGTCTGTCTTATCCGCTGTCGATCTCGAAGAGAATCCAG
CTGCTGAAGGAACGATAGAACAAAAATTCGACATGAAGCCACAGGGAGAAGACATTGAAG
AGTATGCAAGGCTTTGTCGAGAGAGAACAAGCAGATCCATGGTTAAGAACCGACAGATCC
AGGTTATTGATAATGACCGTGGAGTACATATGAGGTTTTTGCCTGGATTGCCTAATTTGC
TTTCCTCCAATTCAAGGGAAAAGAGGAAAGCTGTCCCAGTCAAGCAAACAGATGT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1G182TF 771 0 0
GGAAGG
GAAACCGAAACAGAGAGTTTAGGATCAGATGAAGTGTCTGCGAGAAAGAGGATTCGATTT
TGAGAAAACGATGGAAGACGATGGAAGAGACGCTCATCAGCTCGATTTGGAAAACGCCGA
TCGACATGTTTGGTTGATGAAGAGTCCTGTTGTTGTCTCCAAGACCTGGGAGAAGCTCAC
TCCTCCTCCTTCTTCATCCTCGTTTTCTTCGTATTCTTCCCCTGGACTCACTAGTTTGGC
CAAGGTTGTTGAATCCGTTAATCCTCTACAGCCCGAGCCCGAGTTCAACATGGAGATGGT
GGGTGCTGAGTATGGGAACATGCCAAAGAGCTACTCTTTGAACATGTTTAAAGACTTTGT
TCCAATGTCTGTCTTATCCGCTGTCGATCTCGAAGAGAATCCAGCTGCTGAAGGAACGAT
AGAACAAAAATTCGACATGAAGCCACAGGGAGAAGACATTGAAGAGTATGCAAGGCTTTG
TCGAGAGAGAACAAGCAGATCCATGGTTAAGAACCGACAGATCCAGGTTATTGATAATGA
CCGTGGAGTACATATGAGGTTTTTGCCTGGATTGCCTAATTTGCTTTCCTCCAATTCAAG
GGAAAAGAGGAAAGCTGTCCCAGTCAAGCAAACAGATGTGAAGAGGACGAGGAGAGATCG
TGGTGAGCTCGAAG*CATAATGTTCAACCTATTCGAAG*ACAACCAAACTGGACCTTGAA
GCAGCTAGTACAGAAGACTGACCAACCAGCGCAGTTTT
GAAGAGA

QA 7 764 7 764
DS 

RD RS1B849JQ 638 0 0
AGGAACGATAGAACAAAAATTCGACATGAAGCCACAGGGAGAAGACATTGAAGAGTATGC
AAGGCTTTGTCGAGAGAGAACAAGCAGATCCATGGTTAAGAACCGACAGATCCAGGTTAT
TGATAATGACCGTGGAGTACATATGAGGTTTTTGCCTGGATTGCCTAATTTGCTTTCCTC
CAATTCAAGGGAAAAGAGGAAAGCTGTCCCAGTCAAGCAAACAGATGTGAAGAGGACGAG
GAGAGATCGTGGTGAGCTCGAAGGCATAATGTTCAACCTATTCGAAGGACAACCAAACTG
GACCTTGAAGCAGCTAGTACAGAAGACTGACCAACCAGCGCAGTTTTTGAAAGAGATACT
AAACGAGCTTTGCGTTTACAATAAGCGAGGATCGAACCAAGGGACTTATGAGCTTAAGCC
AGAATACAAGAAAGCTGGTGAAGATGATACAGGTGGACAGTAAAAAAAACAATCGCATGT
GTAGCAAACATCTATGTACTACTTACATGTGCCAAGTCATTCTAGCGAGAGGAGTTTTAT
TTTAATTTTTACTAGTTAAGCCAAAATAGTCAAATTATGAAATTTTAGTGTTTCTTAACA
CTTATTAATCATTCTTTTATAAAATCTTACTCCAAATT

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 3

CO CL3317Contig1 1332 3 5 U
GGGCAATCCGAAACAAAGGCAATCAATCAACTTTTTATCCCTGAAATGGCGGCGGCTCTG
CAGACAAACATCCGACCGGTCAAGTTTCCGGCAACGTTGAGAGCTCTCACCAAACAATCC
TCTTCCGCACCTTGAGAGTAAGATGCGCCGCTGCTTCCCCCGGAAAAAAGAGATACAACA
TCACTCTCCTTCCCGGCGACGGCATCGGTCCGGAGGTTATCTCCATAGCTAAAAATGTGC
TTCAGCAAGCTGGTTCCTTGGAAGGTCTGGAGTTTAGCTTCCAGGAAATGCCTGTAGGAG
GAGCTGCTTTGGATTTGGTTGGAGTGCCTTTGCCTGAGGACACCATCTCCGCTGCTAAAG
AATCAGATGCTATTCTTCTTGGAGCCATTGGAGGGTACAAATGGGATAAGAATGAAAAAC
ATCTCAAGCCTGAGACTGGTTTGCTTCAGCTTCGGGCCGGTCTTAAAGTCTTTGCCAATC
TCAGACCTGCTACAGTTCTTCCTCAGTTGGTGGATGCTTCGACCTTGAAGAGAGAGGTTG
CAGAAGGTGTTGATCTAATGGTTGTTAGGGAGCTTACTGGAGGTATTTACTTTGGAGTGC
CAAGGGGCATTAAGACTAATGAAAATGGTGAGGAAGTTGGGTTTAATACCGAGGTCTATG
CTGCTCACGAGATTGATAGAATTGCTCGTGTTGCCTTCGAGACTGCTCGGAAACGGCGTG
GCAAGCTGTGTTCTGTTGACAAAGCTAATGTCTTGGATGCCTCGATCTTATGGAGGAGGC
GAGTGACCGCATTAGCCGCTGAATATCCGGATGTTGAACTGTCACATATGTATGTCGACA
ATGCTGCGATGCAGCTCGTTCGTGATCCCAAACAGTTTGACACCATTGTCACAAACAACA
TTTTTGGGGATATATTATCTGATGAAGCGTCAATGATCACAGGAAGCATTGGCATGCTTC
CCTTTGCTAGTCTCAGTGGTTCGGGACCTGGACTCTTTGAACCTATACATGGCTCCGCAC
CTGATATTGTTGGACAGGATAAAGCGAACCCGTTGGCAACCATCCTCAGCGCTGCGATGC
TTTTGAAATACGGACTTGGAGAAGAAAAGGCAGCTAAGAGAATTGAAGACGCGGTGTTGG
GTGCTTTGAACAAAGGATTCAGAACAGGAGACATTTACTCCGCAGGAACTAAACTTGTGG
GGTGCAAGGAGATGGGAGAGGAGGTTTTGAAGTCAGTGGACTCCCATGTTCAAGCTTCTG
TTTAATCATCTGTACAACTTTGAGGAGAATTTTCATTATTTTTCCAATAATAATAAGTGT
TTGTACGCGAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GB47TF U 1
AF RS1FT49TF U 185
AF RS1GB47JQ C 769
BS 1 349 RS1GB47TF
BS 350 868 RS1FT49TF
BS 869 869 RS1GB47JQ
BS 870 942 RS1FT49TF
BS 943 1332 RS1GB47JQ

RD RS1GB47TF 349 0 0
GGGCAATCCGAAACAAAGGCAATCAATCAACTTTTTATCCCTGAAATGGCGGCGGCTCTG
CAGACAAACATCCGACCGGTCAAGTTTCCGGCAACGTTGAGAGCTCTCACCAAACAATCC
TCTTCCGCACCTTGAGAGTAAGATGCGCCGCTGCTTCCCCCGGAAAAAAGAGATACAACA
TCACTCTCCTTCCCGGCGACGGCATCGGTCCGGAGGTTATCTCCATAGCTAAAAATGTGC
TTCAGCAAGCTGGTTCCTTGGAAGGTCTGGAGTTTAGCTTCCAGGAAATGCCTGTAGGAG
GAGCTGCTTTGGATTTGGTTGGAGTGCCTTTGCCTGAGGACACCATCTC

QA 1 349 1 349
DS 

RD RS1FT49TF 762 0 0
G
CTCCTTCCCGGCGACGGCATCGGTCCGGAGGTTATCTCCATAGCTAAAAATGTGCTTCAG
CAAGCTGGTTCCTTGGAAGGTCTGGAGTTTAGCTTCCAGGAAATGCCTGTAGGAGGAGCT
GCTTTGGATTTGGTTGGAGTGCCTTTGCCTGAGGACACCATCTCCGCTGCTAAAGAATCA
GATGCTATTCTTCTTGGAGCCATTGGAGGGTACAAATGGGATAAGAATGAAAAACATCTC
AAGCCTGAGACTGGTTTGCTTCAGCTTCGGGCCGGTCTTAAAGTCTTTGCCAATCTCAGA
CCTGCTACAGTTCTTCCTCAGTTGGTGGATGCTTCGACCTTGAAGAGAGAGGTTGCAGAA
GGTGTTGATCTAATGGTTGTTAGGGAGCTTACTGGAGGTATTTACTTTGGAGTGCCAAGG
GGCATTAAGACTAATGAAAATGGTGAGGAAGTTGGGTTTAATACCGAGGTCTATGCTGCT
CACGAGATTGATAGAATTGCTCGTGTTGCCTTCGAGACTGCTCGGAAACGGCGTGGCAAG
CTGTGTTCTGTTGACAAAGCTAATGTCTTGGATGCCTCGATCTTATGGAGGAGGCGAGTG
ACCGCATTAGCCGCTGAATATCCGGATGTTGAACTGTCACATATGTATGTCGACAATGCT
GCGATGCAGCTCGTTCGTGATCCGAAACAGTTTGACACCATTGTCACAAACAACATTTTT
GGGGATATATTATCTGATGAAGCGTCAATGATCACAG
AAGC

QA 2 758 2 758
DS 

RD RS1GB47JQ 564 0 0
TATGGAGGAGGCGAGTGACCGCATTGGCCGCTGAATATCCGGATGTTGAACTGTCACATA
TGTATGTCGACAATGCTGCGATGCAGCTCGTTCGTGATCCCAAACAGTTTGACACCATTG
TCACAAACAACATTTTTGGGGATATATTATTTGATGAAGCGTCAATGATCACAGGAAGCA
TTGGCATGCTTCCCTTTGCTAGTCTCAGTGGTTCGGGACCTGGACTCTTTGAACCTATAC
ATGGCTCCGCACCTGATATTGTTGGACAGGATAAAGCGAACCCGTTGGCAACCATCCTCA
GCGCTGCGATGCTTTTGAAATACGGACTTGGAGAAGAAAAGGCAGCTAAGAGAATTGAAG
ACGCGGTGTTGGGTGCTTTGAACAAAGGATTCAGAACAGGAGACATTTACTCCGCAGGAA
CTAAACTTGTGGGGTGCAAGGAGATGGGAGAGGAGGTTTTGAAGTCAGTGGACTCCCATG
TTCAAGCTTCTGTTTAATCATCTGTACAACTTTGAGGAGAATTTTCATTATTTTTCCAAT
AATAATAAGTGTTTGTACGCGAGG

QA 1 564 1 564
DS 



AS 1 3

CO CL3318Contig1 910 3 28 U
GGGAAGTCGCCGGAATCGCATCGGCTTTTGTTCCGTTGCTTAAAACACACAGCTTGCAGA
GATCGATTGAGAACACGAAGCTGACGCTTTTAACGGTTCTAATCGAATCGATTCTTTCTT
TCAGGAGTTGAGCCATCGCTCGAAGGATGGTCGATAGAGAAGAATGCTATTTGATCTTCT
GTCTTATATTCTTCATGATTGGTGTGCCTTGCTACAGCCATGAAAGCTTGTTTGATGTGA
AAACTTTGTATGCTGGGAAGGATTTATGGAAGGAGATACTGCCATTGCAATCTGGTTCTA
GAGTTTACAGATTAGAAGGTCTTAAATCAAATTCTTGGTATTAAGTCAAGATCTCGTACC
CAGCTTCTATCCCAGCTATGTTCTCTCTGCAACTATTGAGGAGCGGTGAAATGGGTTTGA
AGCTTAATCATATGAGGAGATTGCTAAACACTGAGAAGTTGATCTTCAAATCCCAAAGTC
TTGAAAATAAGGAGGGATTGTATGTGTTGGTGACGGTTGAGCCTGAAGGAATCGTAGCTA
TACCTAATTTCAAAGAACGGTCTTTCATCATTTACAACATAGTTTGTGAAGAACAGCTGT
TAGGCATCGCATACTCATGCTGGTCAGTGGTCCTTTTAGTAGTATTGTGTCTCGTGGTTG
CACTGATTCTTCCCCGGTTTCTCCCACCTCATCTTCTGATCAAAGATGGAGATCGTGACC
GTTAATAATATCAAGAGGTAGCATACGGTTTAAAATCTTCTCTCTCTTACACATATGTTT
TGTTACTCTGTTAGCTTCTTGATGCTTATTCATCCAACTCGGTTTGGATTTAGTTGTATT
ATATTGGATATGAGGTAGGTATTTTGGATATGTATGTTTTTGGAAGATTATTTCGACATG
GTTTTTGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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GG
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AGATTGCTAAACACTGAGAAGTTGATCTTCAAATCCCAAAGTCTTGAAAATAAGGAGGGA
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GTAGCATACGGTTTAAAATCTTCTTTCTCTTACATATATGTTTTGTTACTCTGTTAGCTT
CTTGATGCTTATTCATCCAACTCGGTTTGGATTTAGTTGTATTATATTGGATATGAGGTA
GGTATTTTGGATATGTATGTTTTTGGAAGATTATTTCGACATGGTTTTTGAGT

QA 1 833 1 833
DS 



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CTCATGAAAGGTTAAGAGCATCATCGTCGCCTTTATATTGCGAGTCAAGCCGTGCTTTGA
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AGCTTACTTGTCCGTTATGCCGTGGACATATAAAAGAATGGGTGGCTGTTGAAGATGCTC
GAGGTTTCATGAACGCGAAGCTTAGGAGCTGTTCTTCTGAGAGTTGTGAGTTCATTGGAA
CTTACTCTGATCTGAGAAAGCACGCGAGGAGGCTAGAGAGGCAGAGGGATTTAGGGGACT
TGCTTAGCACACTACAGTCTTCTTTCGTAGGAGAAGAGAGAAGCAGCAATGATGATGGTA
TTCTATCGTTTGATGATGGTGGTTGGCTTACGGTGTTCTTCCTCATCCGTGTGTTTAGAC
CAGAATCGGGTGGTGGAGGATCAAGGAGTAGTAGTAGCTGGTCTGGTACGTCTAGAGCTA
GGTCCCATATAGGTGTGAGAAGAAGATCTTCAAGGCTTTGGGGAGAGAGCTATGAAGGTG
ATACGGGAACGTCATCTAGAGATAGAGATGAAGAGAACAACAATCAGTCTTCTGATGAAC
AAGAGTCTAGACGTCGTGTCAGAAGAAGAGCTTTCATCGCTGATGATGTTGATGATGATG
ATGGAGAACCTTGATGGCTCTTTTGGTGTTTATGCAAAGAAAATGGTGGAAACTTTGTAG
TAATAATGAAACCTATTCTGTAAATTTTGTTGAAGATTGAGAAAAAAGTTTCTTTTTTTT
CTAATTTAGAAACAAAATGTTC


BQ
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AF RS1G993TF U 1
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AAAAGACAGTTTCTTTGTTGAGAATTATTATGCCGAAAGAGAGGAAAGACCGATCTGTAT
CTCATGAAAGGTTAAGAGCATCATCGTCGCCTTTATATTGCGAGTCAAGCCGTGCTTTGA
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AACATCCTCACAACGGCATCCTTCTCATTTGCTCTTCCTTTGACAAAGGTTGTCGTCCTT
ACATGTGTGACACTAGCCACCGTCATTCCAACTGTTTCGATCAGTACCGTAAAGCTTCCA
AACAGACGACACCAGCTGAGACTGAAGGTGGTGGTGGTGTAGCTTCAGGCTCCAACACTG
TAGATTTAAGAGAAGAGGCTGCATCTGA

QA 1 568 1 568
DS 

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TTCGATCAGTAC*GTAAAGCTTCCAAACAGACGACACCAGCTGAGACTGAAGGTGGTGGT
GGTGTAGCTTCAGGCTCCAACACTGTAGATTTAAGAGAAGAGGCTGCATCTGATGAGGTA
ACAGACCAAGAAAAAACCAAACCGAAGCTTACTTGTCCGTTATGCCGTGGACATATAAAA
GAATGGGTGGCTGTTGAAGATGCTCGAGGTTTCATGAACGCGAAGCTTAGGAGCTGTTCT
TCTGAGAGTTGTGAGTTCATTGGAACTTACTCTGATCTGAGAAAGCACGCGAGGAGGCTA
GAGAGGCAGAGGGATTTAGGGGACTTGCTTAGCACACTACAGTCTTCTTTCGTAGGAGAA
GAGAGAAGCAGCAATGATGATGGTATTCTATCGTTTGATGATGGTGGTTGGCTTACGGTG
TTCTTCCTCATCCGTGTGTTTAGACCAGAATCGGGTGGTGGAGGATCAAGGAGTAGTAGT
AGCTGGTCTGGTACGTCTAGAGCTAGGTCCCATATAGGTGTGAGAAGAAGATCTTCAAGG
CTTTGGGGAGAGAGCTATGAAGGTGATACGGGAACGTCATCTAGAGATAGAGATGAAGAG
AACAACAATCAGTCTTCTGATGAACAAGAGTCTAGACGTCGTGTCAGAAGAAGAGCTTTC
ATCGCTGATGATGTTGATGATGATGATGGAGAACCTTGATGGCTCTTTTGGTGTTTATGC
AAAGAAAATGGTGGAAACTTTGTAGTAATAATGAAACCTATTCTGTAAATTTTGTTGAAG
ATTGAGAAAAAAGTTTCTTTTTTTTCTAATTTAGAAACAAAATGTTC

QA 8 834 8 834
DS 



AS 1 3

CO CL3320Contig1 611 3 6 U
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CCGGA*AAGGAACAAAGTTTTTTCAAACTTCGGGCTTGGGTTAGCGATGTCGTACGACGA
TGTGGAGATAGAGGATATGGAGTGGAACGAAGAGATGAAGGCGTACACGTACCCTTGCCC
CTGTGGCGATCTGTTCCAGATCACCAAGGAGGATCTGCGTCTCGGCGAAGAGATCGCGAA
TTGCCCAAGCTGCTCCCTCTACATCACCGTCATCTACAACATGGAGGATTTTCAGAACAA
TTCGAATAATAACCAGCCTAAAAGCAGCCAACCCGTCGCCGTCGCTTGAGATTGTGATGG
AATCGAGTAGAAAGAGTGTTCAAGAGCAGTAGGAGAGAGATCGCATGCTGTTACGGAATA
GTTTTGGAAATCATATATTATGAAAGTGTGCCACCGTTCCTAGATTAGGGGTTTTGATAC
TAACCACTTATAAAAGTTAACAGAGAAACAGAGGTCTTGTCTTGCTGCTTATGCATATGA
TTATTGAACCCAATTCTTGGTGTTTTCTTACACATTTGATCCTGATATTATTTTTAAACT
GATTGGTTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FM61TF U 1
AF RS1CB41JQ C 35
AF RS1CB41TF U 35
BS 1 65 RS1FM61TF
BS 66 66 RS1CB41TF
BS 67 69 RS1FM61TF
BS 70 70 RS1CB41TF
BS 71 386 RS1FM61TF
BS 387 611 RS1CB41TF

RD RS1FM61TF 386 0 0
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AATCGAGTAGAAAGAGTGTTCAAGAG

QA 1 386 1 386
DS 

RD RS1CB41JQ 577 0 0
GG
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QA 3 577 3 577
DS 

RD RS1CB41TF 577 0 0
GG
AGATACGCAGTGCCCTAATTTCCGCCGGA*AAGGAACAAAGTTTTTTCAAACTTCGGGCT
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GAAGGCGTACACGTACCCTTGCCCCTGTGGCGATCTGTTCCAGATCACCAAGGAGGATCT
GCGTCTCGGCGAAGAGATCGCGAATTGCCCAAGCTGCTCCCTCTACATCACCGTCATCTA
CAACATGGAGGATTTTCAGAACAATTCGAATAATAACCAGCCTAAAAGCAGCCAACCCGT
CGCCGTCGCTTGAGATTGTGATGGAATCGAGTAGAAAGAGTGTTCAAGAGCAGTAGGAGA
GAGATCGCATGCTGTTACGGAATAGTTTTGGAAATCATATATTATGAAAGTGTGCCACCG
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TTGTCTTGCTGCTTATGCATATGATTATTGAACCCAATTCTTGGTGTTTTCTTACACATT
TGATCCTGATATTATTTTTAAACTGATTGGTTTGG

QA 3 577 3 577
DS 



AS 1 3

CO CL3321Contig1 1094 3 4 U
GGAGAGTTACCACCGAGTCAACTCGCTTCTTCTCCTTCTCCGCCATGGCTGCTTCTTCAC
TCCACACCTCAATCTCTCCGCTGCCTCTTCTGCAGCAGCAGCTGACATGGGAGACGACAA
GAGTAGAGAGAGTGAAGAGATGGAGAAGATGATCGATAGGAGCATCAACGCCACGATCGT
TCTTGCTGCTGGTACTTACGCCATCACCAAACTGCTCACCATCGATCATGATTATTGGCA
TGGATGGACACTGTTTGAGATACTAAGATACGCTCCTCAACATAACTGGCTTGCTTACGA
GGAAGCCTTAAAGAGTAACCCTGTTCTTGCCAAAATGGTCATAAGTGGAGTTGTGTATTC
TGTAGGAGATTGGTTAGCTCAGTGTTATGAAGGCAAACCTTTGTTTGAGATTGATAGAGC
AAGAACGTTGAGATCAGGGCTAGTGGGGTTCACTCTCCATGGCTCTTTGTCTCATTTCTA
TTACCAGTTCTGCGAGGAGCTTTTCCCTTTTCAAGATTGGTGGGTGGTTCCTGCTAAAGT
GGCTTTTGATCAAACCGTGTGGTCTGCTATATGGAACAGTATTTACTTCACGGTTCTTGG
GTTTCTTCGCCTTGAATCGCCTCTCAGCATCTTCAAAGAGTTGAAAGCTACGTTCTTGCC
TATGCTAACAGCAGGGTGGAAGCTTTGGCCGTTTGCTCATTTGATCACATACGGTTTGGT
TCCTGTAGAACAACGGCTACTCTGGGTTGATTGTGTGGAACTTATCTGGGTCACTATACT
TTCAACTTACTCAAACGAAAAATCAGAAGCTAGAATCTCGGAGTCTGTCATTGAGACTTC
TTCGAGTTCTACTACTACATCCATTGATCCCTCCAAGGAATGAGAAAGCAGCATGCCAAG
ATTGGGGTTTATGGTCATGGTATTGTATATATATATATATATACACACAGAGTTAGCCCA
CAATAGAGTGACCAGAGATTTGAGATTGTTACAAAAGAGGTGAAAATATTGAAAATTTCA
AATGGATGGTTCTCTCCATGTGTAAGAAAGTTAACCAGTATCTTGAATATACCCATAAAT
ATCTTTATTAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DD17TF U 1
AF RS1EH58TF U 374
AF RS1DD17JQ C 790
BS 1 576 RS1DD17TF
BS 577 937 RS1EH58TF
BS 938 943 RS1DD17JQ
BS 944 1094 RS1EH58TF

RD RS1DD17TF 576 0 0
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TCCACACCTCAATCTCTCCGCTGCCTCTTCTGCAGCAGCAGCTGACATGGGAGACGACAA
GAGTAGAGAGAGTGAAGAGATGGAGAAGATGATCGATAGGAGCATCAACGCCACGATCGT
TCTTGCTGCTGGTACTTACGCCATCACCAAACTGCTCACCATCGATCATGATTATTGGCA
TGGATGGACACTGTTTGAGATACTAAGATACGCTCCTCAACATAACTGGCTTGCTTACGA
GGAAGCCTTAAAGAGTAACCCTGTTCTTGCCAAAATGGTCATAAGTGGAGTTGTGTATTC
TGTAGGAGATTGGTTAGCTCAGTGTTATGAAGGCAAACCTTTGTTTGAGATTGATAGAGC
AAGAACGTTGAGATCAGGGCTAGTGGGGTTCACTCTCCATGGCTCTTTGTCTCATTTCTA
TTACCAGTTCTGCGAGGAGCTTTTCCCTTTTCAAGATTGGTGGGTGGTTCCTGCTAAAGT
GGCTTTTGATCAAACCGTGTGGTCTGCTATATGGAA

QA 1 576 1 576
DS 

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GG
AGCTCAGTGTTATGAAGGCAAACCTTTGTTTGAGATTGATAGAGCAAGAACGTTGAGATC
AGGGCTAGTGGGGTTCACTCTCCATGGCTCTTTGTCTCATTTCTATTACCAGTTCTGCGA
GGAGCTTTTCCCTTTTCAAGATTGGTGGGTGGTTCCTGCTAAAGTGGCTTTTGATCAAAC
CGTGTGGTCTGCTATATGGAACAGTATTTACTTCACGGTTCTTGGGTTTCTTCGCCTTGA
ATCGCCTCTCAGCATCTTCAAAGAGTTGAAAGCTACGTTCTTGCCTATGCTAACAGCAGG
GTGGAAGCTTTGGCCGTTTGCTCATTTGATCACATACGGTTTGGTTCCTGTAGAACAACG
GCTACTCTGGGTTGATTGTGTGGAACTTATCTGGGTCACTATACTTTCAACTTACTCAAA
CGAAAAATCAGAAGCTAGAATCTCGGAGTCTGTCATTGAGACTTCTTCGAGTTCTACTAC
TACATCCATTGATCCCTCCAAGGAATGAGAAAGCAGCATGCCAAGATTGGGGTTTATGGT
CATGGTATTGTATATATATATA******CACACAGAGTTAGCCCACAATAGAGTGACCAG
AGATTTGAGATTGTTACAAAAGAGGTGAAAATATTGAAAATTTCAAATGGATGGTTCTCT
CCATGTGTAAGAAAGTTAACCAGTATCTTGAATATACCCATAAATATCTTTATTAAAAA

QA 3 721 3 721
DS 

RD RS1DD17JQ 292 0 0
CTCAAACGAAAAATCAGAAGCTAGAATCTCGGAGTCTGTCATTGAGACTTCTTCGAGTTC
TACTACTACATCCATTGATCCCTCCAAGGAATGAGAAAGCAGCATGCCAAGATTGGGGTT
TATGGTCATGGTATTGTATATATATATATATATACACACAGAGTTAGCCCACAATAGAGT
GACCAGAGATTTGAGATTGTTACAAAAGAGGTGAAAATATTGAAAATTTCAAATGGATGG
TTCTCTCCATGTGTAAGAAAGTTAACCAGTATCTTGAATATACCCATAAATA

QA 1 292 1 292
DS 



AS 1 3

CO CL3322Contig1 707 3 4 U
GTACTGATGATTATGATATAACCGGTTTCAGATACACAAGTAAGGAAACATCTCCTCTTG
ATTCTGCTTCCGTGATGCTCCAGTGTCGTGGTGACTCTTATGGGTCTAAATGCAATACAT
GCGCTGACATCGCAGTCACAGGGTTTCTTAAAAGATGTCCAAAGAACAAAGGAGGAATAA
TATGGTACGACCAATGTTTTCTCTATGTTACTGCGTTCGATGATTCGTTGAGACTTAAAA
CTAATTACAAGAATATTTTTTCTATGTACAACCCAAAAAACGTGAGAGGGGATGGAAAAT
TGTTTGCCAAGAAGACGATGGATTTTTTCTCTGAACTAACACTTAAAGTGAAGAAATCTG
CCAAATACAATCCCGTCATATTATACGCAGCAGGGGAAAAGAAAATTGGAAAAAATACAT
TATATGCAATGGTGCAGTGTGTAGAACTAACGTTAGATTGTAAAACTTGTTTGGCATGGA
GTATCACAAAAATTTTCATGAACAGCGACATTAAACAAGGAGGGAGAGTTTTTGGTATGA
ACTGTGAGATAAGATATGAGCTATACCCTTTTTTAAGGAGTTAAGTATTTATGTGGTGGT
GATTGATACATCTTATTCATATCTAATTATGTTTTAGTTTTGCTTACTTTTTCATTTTGC
TGAAATATAATATTCATATATTAATAAAAAGAGTGTTTACAGAAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RS1DZ71TF U 1
AF RS1DZ71JQ C 1
AF RS1F110TF U 336
BS 1 631 RS1DZ71TF
BS 632 666 RS1F110TF
BS 667 667 RS1DZ71JQ
BS 668 707 RS1F110TF

RD RS1DZ71TF 631 0 0
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ATTCTGCTTCCGTGATGCTCCAGTGTCGTGGTGACTCTTATGGGTCTAAATGCAATACAT
GCGCTGACATCGCAGTCACAGGGTTTCTTAAAAGATGTCCAAAGAACAAAGGAGGAATAA
TATGGTACGACCAATGTTTTCTCTATGTTACTGCGTTCGATGATTCGTTGAGACTTAAAA
CTAATTACAAGAATATTTTTTCTATGTACAACCCAAAAAACGTGAGAGGGGATGGAAAAT
TGTTTGCCAAGAAGACGATGGATTTTTTCTCTGAACTAACACTTAAAGTGAAGAAATCTG
CCAAATACAATCCCGTCATATTATACGCAGCAGGGGAAAAGAAAATTGGAAAAAATACAT
TATATGCAATGGTGCAGTGTGTAGAACTAACGTTAGATTGTAAAACTTGTTTGGCATGGA
GTATCACAAAAATTTTCATGAACAGCGACATTAAACAAGGAGGGAGAGTTTTTGGTATGA
ACTGTGAGATAAGATATGAGCTATACCCTTTTTTAAGGAGTTAAGTATTTATGTGGTGGT
GATTGATACATCTTATTCATATCTAATTATG

QA 1 631 1 631
DS 

RD RS1DZ71JQ 702 0 0
GTACTGATGATTATGATATAACCGGTTTCAGATACACAAGTAAGGAAACATCTCCTCTTG
ATTCTGCTTCCGTGATGCTCCAGTGTCGTGGTGACTCTTATGGGTCTAAATGCAATACAT
GCGCTGACATCGCAGTCACAGGGTTTCTTAAAAGATGTCCAAAGAACAAAGGAGGAATAA
TATGGTACGACCAATGTTTTCTCTATGTTACTGCGTTCGATGATTCGTTGAGACTTAAAA
CTAATTACAAGAATATTTTTTCTATGTACAACCCAAAAAACGTGAGAGGGGATGGAAAAT
TGTTTGCCAAGAAGACGATGGATTTTTTCTCTGAACTAACACTTAAAGTGAAGAAATCTG
CCAAATACAATCCCGTCATATTATACGCAGCAGGGGAAAAGAAAATTGGAAAAAATACAT
TATATGCAATGGTGCAGTGTGTAGAACTAACGTTAGATTGTAAAACTTGTTTGGCATGGA
GTATCACAAAAATTTTCATGAACAGCGACATTAAACAAGGAGGGAGAGTTTTTGGTATGA
ACTGTGAGATAAGATATGAGCTATACCCTTTTTTAAGGAGTTAAGTATTTATGTGGTGGT
GATTGATACATCTTATTCATATCTAATTATGTTTTAGTTTTGCTTACTTTTTCATTTTGC
TGAAATATAATATTCATATATTAATAAAAAGAGTGTTTACAG

QA 1 702 1 702
DS 

RD RS1F110TF 372 0 0
CTAACACTTAAAGTGAAGAAATCTGCCAAATACAATCCCGTCATATTATACGCAGCAGGG
GAAAAGAAAATTGGAAAAAATACATTATATGCAATGGTGCAGTGTGTAGAACTAACGTTA
GATTGTAAAACTTGTTTGGCATGGAGTATCACAAAAATTTTCATGAACAGCGACATTAAA
CAAGGAGGGAGAGTTTTTGGTATGAACTGTGAGATAAGATATGAGCTATACCCTTTTTTA
AGGAGTTAAGTATTTATGTGGTGGTGATTGATACATCTTATTCATATCTAATTATGTTTT
AGTTTTGCTTACTTTTTCATTTTGCTGAAATGTAATATTCATATATTAATAAAAAGAGTG
TTTACAGAAACC

QA 1 372 1 372
DS 



AS 1 3

CO CL3323Contig1 871 3 11 U
GGAGGGTTATAAACTAATTAACAAAACATTGTTTAGTAACGTGGAAAAGGAAAGAGATAG
GCCGACCAAATACGGGCGGTGGATCGGCCTTATCTGTTTCCTATAAAACAAGCCTAGTCG
AGTCTTTGTTTCTAGCTTAGGGTTTGGTTTCAGAGGAAGGAAAGAACGAACGAACGCAAA
TCAAATCGAAGAGGGTTGGATGGATCGTGACAGCAATGATGGACGTATTCCCTTAAGCAG
CCTTTCCTGCTACAAAGAAATGTGTAGGCTTGCTGATAAGGATTGTCACTTTTCCACAAT
TCGACGCCCTCCCCTTTTGTTCAGAGACGTGTACGAGATGGTGAATGATCCTTCAACTGA
TTCAGTTGTCTCCTGGGGTGATAGCGGCAAGAGCTTCATCGTCTGGAAGGAATCTGAGTT
CCTCGGAGATGTTCTTCCTAGGTGCTTATCCTATGATTACAAAGATATGACATCTTTCAC
CACCAAGTTTCATGCCCTCGGCTATAATAAAGTTGAAGAATCTGTGCATTGGGAATACAC
AGCCAATTATTTGGTGAGAGGACAGCCTCCCTCCCCTAAGGATCCATCCCCATGTACTTC
TGCTGATCTTTTGACGATGGTTACTCCAGAATATGCCAAAATCTACGAGTGGTCCTTTGC
TTACATTAAGGATCGCAAACAATAAGCTCTGTTGGTTCTGTTCAATGGAGTTGCTTTGCT
CTCGTTGTTTTCTTAATCGTATTTTATCGTCCTGTTTGAAAACATTGGGTTTGGTCTCTC
TCTCCTTTTCTTTTAACTTATGGTTGTAAGATAAAAGATGTTTGCATTTTAATAAAAGGT
AGATCATTATGATCTTTTGGTTCTGTTGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BO64TF U 1
AF RS1ER58TF U 126
AF RS1BO64JQ C 106
BS 1 666 RS1BO64TF
BS 667 761 RS1ER58TF
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BS 790 795 RS1ER58TF
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BS 809 809 RS1BO64JQ
BS 810 831 RS1ER58TF
BS 832 871 RS1BO64JQ

RD RS1BO64TF 666 0 0
GGAGGGTTATAAACTAATTAACAAAACATTGTTTAGTAACGTGGAAAAGGAAAGAGATAG
GCCGACCAAATACGGGCGGTGGATCGGCCTTATCTGTTTCCTATAAAACAAGCCTAGTCG
AGTCTTTGTTTCTAGCTTAGGGTTTGGTTTCAGAGGAAGGAAAGAACGAACGAACGCAAA
TCAAATCGAAGAGGGTTGGATGGATCGTGACAGCAATGATGGACGTATTCCCTTAAGCAG
CCTTTCCTGCTACAAAGAAATGTGTAGGCTTGCTGATAAGGATTGTCACTTTTCCACAAT
TCGACGCCCTCCCCTTTTGTTCAGAGACGTGTACGAGATGGTGAATGATCCTTCAACTGA
TTCAGTTGTCTCCTGGGGTGATAGCGGCAAGAGCTTCATCGTCTGGAAGGAATCTGAGTT
CCTCGGAGATGTTCTTCCTAGGTGCTTATCCTATGATTACAAAGATATGACATCTTTCAC
CACCAAGTTTCATGCCCTCGGCTATAATAAAGTTGAAGAATCTGTGCATTGGGAATACAC
AGCCAATTATTTGGTGAGAGGACAGCCTCCCTCCCCTAAGGATCCATCCCCATGTACTTC
TGCTGATCTTTTGACGATGGTTACTCCAGAATATGCCAAAATCTACGAGTGGTCCTTTGC
TTACAT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RS1ER58TF 706 0 0
TTGTTTCTAGCTTAGGGTTTGGTTTCAGAGGAAGGAAAGAACGAACGAACGCAAATCAAA
TCGAAGAGGGTTGGATGGATCGTGACAGCAATGATGGACGTATTCCCTTAAGCAGCCTTT
CCTGCTACAAAGAAATGTGTAGGCTTGCTGATAAGGATTGTCACTTTTCCACAATTCGAC
GCCCTCCCCTTTTGTTCAGAGACGTGTACGAGATGGTGAATGATCCTTCAACTGATTCAG
TTGTCTCCTGGGGTGATAGCGGCAAGAGCTTCATCGTCTGGAAGGAATCTGAGTTCCTCG
GAGATGTTCTTCCTAGGTGCTTATCCTATGATTACAAAGATATGACATCTTTCACCACCA
AGTTTCATGCCCTCGGCTATAATAAAGTTGAAGAATCTGTGCATTGGGAATACACAGCCA
ATTATTTGGTGAGGGGACAGCCTCCCTCCCCTAAGGATCCATCCCCATGTACTTCTGCTG
ATCTTTTGACGATGGTTACTCCAGAATATGCCAAAATCTACGAGTGGTCCTTTGCTTACA
TTAAGGATCGCAAACAATAAGCTCTGTTGGTTCTGTTCAATGGAGTTGCTTTGCTCTCGT
TGTTTTCTTAATCGTATTTTATCGTCCTGTTTGAAA*CATTGGGTTTGGTCTCTCTCTCC
TTT*CTTTTA*CTTATGGTTGTA*GATAAAAGATGTTTGCATTTTA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RS1BO64JQ 766 0 0
AAAACAAG
CTAGTCGAGTCTTTGTTTCTAGCTTAGGGTTTGGTTTCAGAGGAAGGAAAGAACGAACGA
ACGCAAATCAAATCGAAGAGGGTTGGATGGATCGTGACAGCAATGATGGACGTATTCCCT
TAAGCAGCCTTTCCTGCTACAAAGAAATGTGTAGGCTTGCTGATAAGGATTGTCACTTTT
CCACAATTCGACGCCCTCCCCTTTTGTTCAGAGACGTGTACGAGATGGTGAATGATCCTT
CAACTGATTCAGTTGTCTCCTGGGGTGATAGCGGCAAGAGCTTCATCGTCTGGAAGGAAT
CTGAGTTCCTCGGAGATGTTCTTCCTAGGTGCTTATCCTATGATTACAAAGATATGACAT
CTTTCACCACCAAGTTTCATGCCCTCGGCTATAATAAAGTTGAAGAATCTGTGCATTGGG
AATACACAGCCAATTATTTGGTGAGAGGACAGCCTCCCTCCCCTAAGGATCCATCCCCAT
GTACTTCTGCTGATCTTTTGACGATGGTTACTCCAGAATATGCCAAAATCTACGAGTGGT
CCTTTGCTTACATTAAGGATCGCAAACAATAAGCTCTGTTGGTTCTGTTCGATGGAGTTG
CTTTGCTCTCGTTGTTTTCTTAATCGTATTTTATCGTCCTGTTTGAAAACATTGGGTTTG
GTCTCTCTCTCCTTTTCTTTTAACTTATGGTTGTAAGATAAAAGATGTTTGCATTTTAAT
AAAAGGTAGATCATTATGATCTTTTGGTTCTGTTGACG

QA 9 766 9 766
DS 



AS 1 3

CO CL3324Contig1 1099 3 3 U
AGGGACAACATCACTGGACCGACCAACTCCAAAGCAAAGTCCAAATCAAAACTTGTCTCT
TCCTTCTCTAACTTACAAAAAAAAACCCTAAACTCCCAATTTTCTCATTCACTCTTTTTT
TTTCTTTCGCTGAAAATGGAAGACGAAGAAGGCATCGGGTTAATTCTAGCCAGAGCCACC
GAGCTAAGACTCAAGATCAACGATTGTATCGATACCTCCAGCACCGATGTTTCTTCTCCC
AGAGAAGGAAAGAAAGATGAGATTACTGGACTTCAAGAAAAGGATTTTGACTCATTCAGC
TCTGACGATGTGGATGATGAAGAAGAATCTGGTGAACAGCTTTTGTGTATACGCGATGCT
CTCGAATCTCTTGAGTCTCAGCTTGCTGCTTTACAGAATCTACGGCAAAGGCAACAGTAT
GAGAAACAAGTAGCTCTCTCTGAGATTGATTACAGCAGGAAGATGTTGCTTGAGAAGCTC
AAGGAGTACAAAGGGAAAGAACTTGAAGTGCTAAGCGAGGCTTCAACTTTTGCTGGCGAA
AGAGTTGACTATGAGAACGATCTTCTCCTTCCTCCTTACCCTGTTCACCCTCCTCTTCCT
CTCTCCCTCGGTTTGGATAATAACAATGCCTACTTACCTCATTTACCGTCAAAGCAGAAG
AAATCTGCAGATGCAAATGGGTTTGGCTCAGCAGAGGTCAAGGGTCCTAATGGAGTTGTT
CGCTTCTTAGGCTCTGTTGCAAAGATCATGCTACCAATCATCGGCGTCATTTCAGTCTTG
TCTGCTTCCGGTTATGGTCCAGAGATCAAGAAAAGAGGAGTGTCATTCAAACTTCTGGGG
CTTCTCCCTCAACGAGTAGTCAGAGCACCTAATCAATGCCCGCCTGGGAAAGTTCTAGTG
ATTGAAGACGGTGAAGCAAGGTGTCTTGTGAAGGAAAGAGTCGAAATACCTTTTGACTCG
GTGGTTGCAAAACGAGATGTAACATACGGATACGGTTGAACTGAATGAAAAAAACTCCTT
TCTCTGTAATCTTTACTGCCTCCACTGTGTAACGTTTCAACCTTTTATCTCTTTAACTCT
CCCAAAGTTTTGTTCTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CD56TF U 1
AF RS1DD93TF U 73
AF RS1CD56JQ C 408
BS 1 692 RS1CD56TF
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RD RS1CD56TF 692 0 0
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AGAGTTGACTATGAGAACGATCTTCTCCTTCCTCCTTACCCTGTTCACCCTCCTCTTCCT
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GG
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TGATGAAGAAGAATCTGGTGAACAGCTTTTGTGTATACGCGATGCTCTCGAATCTCTTGA
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GAACGATCTTCTCCTTCCTCCTTACCCTGTTCACCCTCCTCTTCCTCTCTCCCTCGGTTT
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CTC

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DS 

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TAATGGAGTTGTTCGCTTCTTAGGCTCTGTTGCAAAGATCATGCTACCAATCATCGGCGT
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GAAAGTTCTAGTGATTGAAGACGGTGAAGCAAGGTGTCTTGTGAAGGAAAGAGTCGAAAT
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AAAAAAACTCCTTTCTCTGTAATCTTTACTGCCTCCACTGTGTAACGTTTCAACCTTTTA
TCTCTTTAACTCTCCCAAAGTTTTGTTCTTTG

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 3

CO CL3325Contig1 805 3 1 U
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GAGCAACCAACCAAACCTAGTGAACTCAAGCTCCGTACCAATAACTTTATCAGCGCCAAG
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TACGGACGCGAGTAAGGTCAGCGCGCGAAGCAAGCTTCCTGCTTTGAGTGCCACGAGGAA
GAAGTAAAGGAGTGGTCTCGAGGAGGATGTTAGGGTTCCGTCAAGATCGGCCACTACGGT
CTGGTCGGATCGGTCTTAAGCGTTTACTTTGTAGCTTGACAAAGGCTCAAAGCGACGTCG
TTTCGTCATCGTTCCCAAGAGTGTC


BQ
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AF RS1C289JQ U 1
AF RS1AY04JQ U 1
AF RS1C289TF C 235
BS 1 805 RS1AY04JQ

RD RS1C289JQ 576 0 0
GGAACAATAGTCGGATAATTTTATTAGAATTAGCTTCTGCCACACGTAATTACTTAGAAA
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CCGTTACACCATGTAAGCCTCCTTGCAGAGAGACATGAAAGCGTAATCTGACTTGCTATC
TCCCAGCCCCAAATCAGGTAACCCCACTTCACCACCACCACCACCACCACCACCGAACTC
TTTCAAAATGGCGTCGTGTTTCTGCTGGCCCAACATGATACCCGGTTTTCTAGCGAAACC
GAGCAACCAACCAAACCTAGTGAACTCAAGCTCCGTACCAATAACTTTATCAGCGCCAAG
AAACTCCTTAGCGAACGGCTCGACCATGACCCGAGGACTCGCCGTCACAATGTACCGTTT
CCCGAACGCCTTGAAAACACACCACGTGTCCCGGTTCAGTTCTTTCTCGTAGACTTTTGC
TAGGACGTGGCGGGCGACGTGTTCAACGTCGCCGAGCTTGAGGCCGGCGAATGTGATGAA
GACGGCTACTCTGACGGCGAGACTTTCGGAGACGAA

QA 1 576 1 576
DS 

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GGAACAATAGTCGGATAATTTTATTAGAATTAGCTTCTGCCACACGTAATTACTTAGAAA
TTAACGTTTTTTTGTCGCATAGCAAGTGAAGGAGCGTAGAAACTATGTGTGACATGTGAT
CCGTTACACCATGTAAGCCTCCTTGCAGAGAGACATGAAAGCGTAATCTGACTTGCTATC
TCCCAGCCCCAAATCAGGTAACCCCACTTCACCACCACCACCACCACCACCACCGAACTC
TTTCAAAATGGCGTCGTGTTTCTGCTGGCCCAACATGATACCCGGTTTTCTAGCGAAACC
GAGCAACCAACCAAACCTAGTGAACTCAAGCTCCGTACCAATAACTTTATCAGCGCCAAG
AAACTCCTTAGCGAACGGCTCGACCATGACCCGAGGACTCGCCGTCACAATGTACCGTTT
CCCGAACGCCTTGAAAACACACCACGTGTCCCGGTTCAGTTCTTTCTCGTAGACTTTTGC
TAGGACGTGGCGGGCGACGTGTTCAACGTCGCCGAGCTTGAGGCCGGCGAATGTGATGAA
GACGGCTACTCTGACGGCGAGACTTTCGGAGACGAAGACATACGTGAGGTGCACGAGTGG
TACGGACGCGAGTAAGGTCAGCGCGCGAAGCAAGCTTCCTGCTTTGAGTGCCACGAGGAA
GAAGTAAAGGAGTGGTCTCGAGGAGGATGTTAGGGTTCCGTCAAGATCGGCCACTACGGT
CTGGTCGGATCGGTCTTAAGCGTTTACTTTGTAGCTTGACAAAGGCTCAAAGCGACGTCG
TTTCGTCATCGTTCCCAAGAGTGTC

QA 1 805 1 805
DS 

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GAACTCTTTCAAAATGGCGTCGTGTTTCTGCTGGCCCAACATGATACCCGGTTTTCTAGC
GAAACCGAGCAACCAACCAAACCTAGTGAACTCAAGCTCCGTACCAATAACTTTATCAGC
GCCAAGAAACTCCTTAGCGAACGGCTCGACCATGACCCGAGGACTCGCCGTCACAATGTA
CCGTTTCCCGAACGCCTTGAAAACACACCACGTGTCCCGGTTCAGTTCTTTCTCGTAGAC
TTTTGCTAGGACGTGGCGGGCGACGTGTTCAACGTCGCCGAGCTTGAGGCCGGCGAATGT
GATGAAGACGGCTACTCTGACGGCGAGACTTTCGGAGACGAAGACATACGTGAGGTGCAC
GAGTGGTACGGACGCGAGTAAGGTCAGCGCGCGAAGCAAGCTTCCTGCTTTGAGTGCCAC
GAGGAAGAAGTAAAGGAGTGGTCTCGAGGAGGATGTTAGGGTTCCGTCAAGATCGGCCAC
TACGGTCTGGTCGGATCGGTCTTAAGCGTTTACTTTGTAGCTTGACAAAGGCTCAAAGCG
ACGTCGTTTCGTCATCGTTCCCAAGAGTGTC

QA 1 571 1 571
DS 



AS 1 3

CO CL3326Contig1 576 3 7 U
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CGTAACAGTCAAAGGAAATGGCGAGCACTGTAATGACTACCCTGCCTCAGTTCAATGGTC
TTCGTGCCAGCAAGATCTCCGCAGCTCCTGTTCAACGCCTGGCAACTGTTCAGCCCATGA
GACGTAAGGGAAATGGTGCATTAGGTGCAAAGTGTGGTGACTTCATTGGTTCATCAACAA
ATCTGATAATGGTAACATCTACGACCCTGATGCTGTTCGCGGGGAGATTCGGACTTGCAC
CATCAGCAAATAGGAAAGCAACAGCTGGACTTAAGCTGGAGGCACGTGACTCGGGTCTAC
AAACGGGTGATCCAGCCGGATTCACGCTCGCTGACACGTTGGCCTGTGGCACCGTTGGTC
ATATCATCGGAGTAGGAGTTGTCCTTGGCCTAAACAACATTGGTGCTATATAAAACTTAT
TTTATTGTGTATTTGTAACCATTGTAGATTTCTTAAACAAAATTCTCAAGATACCTGAGG
GGGAGATCTAAATAAATATTTAAGTGTCTTTATGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1BH41TF U 1
AF RS1B207JQ C 3
AF RS1B207TF U 3
BS 1 134 RS1BH41TF
BS 135 135 RS1B207TF
BS 136 291 RS1BH41TF
BS 292 292 RS1B207TF
BS 293 454 RS1BH41TF
BS 455 455 RS1B207TF
BS 456 576 RS1BH41TF

RD RS1BH41TF 576 0 0
GGGAGAACCAAAAAAAAAAACTGAAAAACAGATCGCACAGTAAAATTTAAGTTTGTTTAA
CGTAACAGTCAAAGGAAATGGCGAGCACTGTAATGACTACCCTGCCTCAGTTCAATGGTC
TTCGTGCCAGCAAGCTCTCCGCAGCTCCTGTTCAACGCCTGGCAACTGTTCAGCCCATGA
GACGTAAGGGAAATGGTGCATTAGGTGCAAAGTGTGGTGACTTCATTGGTTCATCAACAA
ATCTGATAATGGTAACATCTACGACCCTGATGCTGTTCGCGGGGAGATTCGTACTTGCAC
CATCAGCAAATAGGAAAGCAACAGCTGGACTTAAGCTGGAGGCACGTGACTCGGGTCTAC
AAACGGGTGATCCAGCCGGATTCACGCTCGCTGACACGTTGGCCTGTGGCACCGTTGGTC
ATATCATCGGAGTAGGAGTTGTCCTTGGCCTAAAAAACATTGGTGCTATATAAAACTTAT
TTTATTGTGTATTTGTAACCATTGTAGATTTCTTAAACAAAATTCTCAAGATACCTGAGG
GGGAGATCTAAATAAATATTTAAGTGTCTTTATGTT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RS1B207JQ 574 0 0
GGAGAACC
AAAAAAAAAACTGAAAAACAGATCGCACAGTAAAATTTAAGTTTGTTTAACGTAACAGTC
AAAGGAAATGGCGAGCACTGTAATGACTACCCTGCCTCAGTTCAATGGTCTTCGTGCCAG
CAAGATCTCCGCAGCTCCTGTTCAACGCCTGGCAACTGTTCAGCCCATGAGACGTAAGGG
AAATGGTGCATTAGGTGCAAAGTGTGGTGACTTCATTGGTTCATCAACAAATCTGATAAT
GGTAACATTTACGACCCTGATGCTGTTCGCGGGGAGATTCGGACTTGCACCATCAGCAAA
TAGGAAAGCAACAGCTGGACTTAAGCTGGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACGGGTGA
TCCAGCCGGATTCACGCTCGCTGACACGTTGGCCTGTGGCACCGTTGGTCATATCATCGG
AGTAGGAGTTGTCCTTGGCCTAAACAACATTGGTGCTATATAAAACTTATTTTATTGTGT
ATTTGTAACCATTGTAGATTTCTTAAACAAAATTCTCAAGATACCTGAGGGGGAGATCTA
AATAAATATTTAAGTGTCTTTATGTT

QA 9 574 9 574
DS 

RD RS1B207TF 574 0 0
GGAGAACC
AAAAAAAAAACTGAAAAACAGATCGCACAGTAAAATTTAAGTTTGTTTAACGTAACAGTC
AAAGGAAATGGCGAGCACTGTAATGACTACCCTGCCTCAGTTCAATGGTCTTCGTGCCAG
CAAGATCTCCGCAGCTCCTGTTCAACGCCTGGCAACTGTTCAGCCCATGAGACGTAAGGG
AAATGGTGCATTAGGTGCAAAGTGTGGTGACTTCATTGGTTCATCAACAAATCTGATAAT
GGTAACATCTACGACCCTGATGCTGTTCGCGGGGAGATTCGGACTTGCACCATCAGCAAA
TAGGAAAGCAACAGCTGGACTTAAGCTGGAGGCACGTGACTCGGGTCTACAAACGGGTGA
TCCAGCCGGATTCACGCTCGCTGACACGTTGGCCTGTGGCACCGTTGGTCATATCATCGG
AGTAGGAGTTGTCCTTGGCCTAAACAACATTGGTGCTATATAAAACTTATTTTATTGTGT
ATTTGTAACCATTGTAGATTTCTTAAACAAAATTCTCAAGATACCTGAGGGGGAGATCTA
AATAAATATTTAAGTGTCTTTATGTT

QA 9 574 9 574
DS 



AS 1 2

CO CL3327Contig1 975 2 2 U
GGATTCGCAGCCGGAAACGTTCATTTCCGTTAGCGCCGAGAGAAAATCACGATGCCGGCG
AAACAGAGGACGCCTAATGTCAGCCGAAACCCTGATCTGATCAGGGGAGTAGGTAAATAC
TCAAGGTCTCAGATGTACCACAAGAGAGGTCTTTGGGCTATCAAGGCCAAAAACGGCGGC
GTTTTTCCCCGCCACGACACTAAGTCCAAAGTTGATTCTCCTGCGGACCTCTCGCCAACA
GACGCAAGCCAAAGCCTACCAAGCTCAAATCCAGCATTACGCCAGGGACAGTGCTGATCA
TCCTTGCTGGTAGGTTCAAGGGCAAGAGAGTTGTCTTCTTGAAGCAGCTTACTTCTGGTT
TACTTCTTGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTTCCTTTGAGACGTGTTAACCAGT
CCTATGTGATTGGCACTTCCACAAAGGTTGACATTTCTGGAGTTAGCGTCGATAAATTCG
ATGATAAGTATTTTGGAAAGGTTGCTGAGAAGAAGAACAAGAAGGGAGAAGGAGAGTTCT
TTGAGGCAGAGAAAGAGGAGAAGAAGGAGATTCCACAAGGGAAGAAAGATGACCAGAAGG
CCGTTGATGCAGCTTTGATCAAAGCCATTGAGGCAGTTCCAGAGTTGAAGACTTACTTGG
GCGCAAGGTTCTCATTGAAACAGGGGATGAAGCCCCATGAGCTTGTTTTCAAAATTTCAT
AACCTTTTTTTGCTGAGGTTTTTAGAGTGTCTATCACCTTTAGTTTCATCACCTTTAGTT
TTATCCTATGAACGGTTGGCCTTGTTCACCGGTCAAATACAATTTTTGGCGTCGATCTTG
TTTTTGAACGTTAGTTTTTGTAGCAATGGACTATCTTTTTTTCTTTGCAAGACCTTCGAA
TTTTCACAACAGTTGACGTGGTGATTGTAAAAGGAATAAGACACTACAATTAACAAGATG
TGTTTTGAGGTAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AQ37TFB U 1
AF RS1AQ37JQ C 350
BS 1 707 RS1AQ37TFB
BS 708 975 RS1AQ37JQ

RD RS1AQ37TFB 707 0 0
GGATTCGCAGCCGGAAACGTTCATTTCCGTTAGCGCCGAGAGAAAATCACGATGCCGGCG
AAACAGAGGACGCCTAATGTCAGCCGAAACCCTGATCTGATCAGGGGAGTAGGTAAATAC
TCAAGGTCTCAGATGTACCACAAGAGAGGTCTTTGGGCTATCAAGGCCAAAAACGGCGGC
GTTTTTCCCCGCCACGACACTAAGTCCAAAGTTGATTCTCCTGCGGACCTCTCGCCAACA
GACGCAAGCCAAAGCCTACCAAGCTCAAATCCAGCATTACGCCAGGGACAGTGCTGATCA
TCCTTGCTGGTAGGTTCAAGGGCAAGAGAGTTGTCTTCTTGAAGCAGCTTACTTCTGGTT
TACTTCTTGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTTCCTTTGAGACGTGTTAACCAGT
CCTATGTGATTGGCACTTCCACAAAGGTTGACATTTCTGGAGTTAGCGTCGATAAATTCG
ATGATAAGTATTTTGGAAAGGTTGCTGAGAAGAAGAACAAGAAGGGAGAAGGAGAGTTCT
TTGAGGCAGAGAAAGAGGAGAAGAAGGAGATTCCACAAGGGAAGAAAGATGACCAGAAGG
CCGTTGATGCAGCTTTGATCAAAGCCATTGAGGCAGTTCCAGAGTTGAAGACTTACTTGG
GCGCAAGGTTCTCATTGAAACAGGGGATGAAGCCCCATGAGCTTGTT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1AQ37JQ 626 0 0
TACTTCTGGTTTACTTCTTGTGTCCGGACCGTTCAAGATCAATGGTGTTCCTTTGAGACG
TGTTAACCAGTCCTATGTGATTGGCACTTCCACAAAGGTTGACATTTTTGGAGTTAGCGT
CGATAAATTCGATGATAAGTATTTTGGAAAGGTTGCTGAGAAGAAGAACAAGAAGGGAGA
AGGAGAGTTTTTTGAGGCAGAGAAAGAGGAGAAGAAGGAGATTCCACAAGGGAAGAAAGA
TGACCAGAAGGCCGTTGATGCAGCTTTGATCAAAGCCATTGAGGCAGTTCCAGAGTTGAA
GACTTACTTGGGCGCAAGGTTTTCATTGAAACAGGGGATGAAGCCCCATGAGCTTGTTTT
CAAAATTTCATAACCTTTTTTTGCTGAGGTTTTTAGAGTGTCTATCACCTTTAGTTTCAT
CACCTTTAGTTTTATCCTATGAACGGTTGGCCTTGTTCACCGGTCAAATACAATTTTTGG
CGTCGATCTTGTTTTTGAACGTTAGTTTTTGTAGCAATGGACTATCTTTTTTTCTTTGCA
AGACCTTCGAATTTTCACAACAGTTGACGTGGTGATTGTAAAAGGAATAAGACACTACAA
TTAACAAGATGTGTTTTGAGGTAAAG

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 3

CO CL3328Contig1 1035 3 6 U
AATAGAAATACAAAAGAATCATGGAATGATTACAACTATAATTCAATCACATAAGAATAA
TGATGATCCTATAAATAAAAAGGGTATCACAATCGAAAAAACAAAAGACCTTGTTCTTAA
ACCGGGAATCTACCGGTCATCTGTATATGCTCAAGTGTTTTTGGCAAACCATACTTGTTA
ACCGCTAACCTCCCGGCCCTGAACCCGTCTCCATAAACCGGAAAAGCATCAGACTCGATT
TGGTGCTTGAAAAACTCACCAAGCTTCCTCTCGTACTGCGATCTTGGTCCCTTCTTCACT
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GCTTCTAACCACTTATGAGCCATCACTTGACATATTCCTTCTTCAACGTCTTGGCTCAGT
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GTGAGTAGCCTAGGGAGGCCAAATAAGATGAGAATGGCAGTGACCTCGCATTGACGTGTT
AGCTTGTAAGGCTCTGTAATCATATTCCCAGCCCAGTTTCCTGTCCCATGCTTCGATCTC
TTTCTCACAGTGCTAACAGTTTGTTCTTCTGAAAGGCAGAGTCCTCTCGTCTCTGGCATG
TGGTAGTGACCATTCTTTTCACCTTCTCTGGCTTCGTTAAGTGCTTGCCTCTCAACTAAA
AGAAGTGGAACGTCCTGCTCCACCTTCATGAAAAGCCCTTCGTAGAATTCTTGTATCTGC
AAGTAGAGAGGCTGGCATTGAAAAGTGTCCATGACCGCTGAGTCCAGACACTCGAGACAA
AGTTTCCGTCCATCGTTAAGTTCAACATATCCTGTATTCCGTGGCTCCATTCTTTCACAA
CTGCAACATCTTGGGGTAGCATCGTGTTCGTGAGAAGGGCAATACTTCTGGACCCAAAAA
GGATGCGCCCTATATTCAATTAGACCAGCATGGTTCGTTGGAATAAAGAGGCTGCAGACA
TCACATTTTGGATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GU55JQ U 23
AF RS1B069JQ U 1
AF RS1GU55TF C 295
BS 1 222 RS1B069JQ
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BS 260 794 RS1B069JQ
BS 795 1035 RS1GU55TF

RD RS1GU55JQ 288 0 0
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QA 1 288 1 288
DS 

RD RS1B069JQ 794 0 0
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GTGAGTAGCCTAGGGAGGCCAAATAAGATGAGAATGGCAGTGACCTCGCATTGACGTGTT
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TTTCTCACAGTGCTAACAGTTTGTTCTTCTGAAAGGCAGAGTCCTCTCGTCTCTGGCATG
TGGTAGTGACCATTCTTTTCACCTTCTCTGGCTTCGTTAAGTGCTTGCCTCTCAACTAAA
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AAGTAGAGAGGCTG

QA 1 794 1 794
DS 

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AACTCGGCTTCTAACCACTTATGAGCCATCACTTGACATATTC*TTCTTCAACGTCTTGG
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GAACCAGTGAGTAGCCTAGGGAGGCCAAATAAGATGAGAATGGCAGTGACCTCGCATTGA
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GGTCTCTTTCTCACAGTGCTAACAGTTTGTTCTTCTGAAAGGCAGAGTCCTCTCGTCTCT
GGCATGTGGTAGTGACCATTCTTTTCACCTTCTCTGGCTTCGTTAAGTGCTTGCCTCTCA
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ATCTGCAAGTAGAGAGGCTGGCATTGAAAAGTGTCCATGACCGCTGAGTCCAGACACTCG
AGACAAAGTTTCCGTCCATCGTTAAGTTCAACATATCCTGTATTCCGTGGCTCCATTCTT
TCACAACTGCAACATCTTGGGGTAGCATCGTGTTCGTGAGAAGGGCAATACTTCTGGACC
CAAAAAGGATGCGCCCTATATTCAATTAGACCAGCATGGTTCGTTGGAATAAAGAGGCTG
CAGACATCACATTTTGGATGC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 3

CO CL3329Contig1 911 3 14 U
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TGGGAATGAAAAGAGACCAGGTTACTATCCATAAATACCAAAACAAAAGAAAACAAAAGA
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GT**CACACTGCCTCTACTTCCTTCAACTTCTCGTCGTACTCTTCTTTCTCAGAGTTTTG
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CGCCTCCAGTTTGTCTGCAAGCTTGTCCTTGTCGCTAACTTGGTTCTTCATGTTGTACAC
GTATGTCTCCAGGCTGTTCCTCGCGTCGATTCTCTCCTTCACCTTCTTGTCCTCCTCTGC
AAACTCCTCTGCCTCCTTAACCATCCGGTCAATCTCTTCCTGGCTCAAACGTCCCTTCTC
GTTTGTGATTGTGATCTTCTCTGATTTACCAGAAGCCTTGTCCTCTGCCTTCACGTTCAG
GATACCGTTGGCGTCCACTTCAAACGTGACTTCGATTTGAGGTGTTCCTCTTGGGGCCGG
TGGGATTCCAGTGAGGTCGAACTTCCCGAGCAGCCTGCAGTCCTTGGTAAGACTTCGCTC
ACCTTCAAAGACCTGAATGGAGACGGTGGTCTGCTGGCCTTGGTACGTCGTGAAAACCTG
CGACTTCTTTGTCGGAATGACTGTGTTTCTCGGGATCAGTTTCGTCATCACTCCTCCACT
GTCTCATACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GK76JQ U 1
AF RS1GK76TF C 183
AF RS1C050JQ U 62
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TTCACCTCCAGCACCTCCTGGTGCACCACCTGTCCTCTGATACACGGCCGTGACGATTGG
GT**CACACTGCCTCTACTTCCTTCAACTTCTCGTCGTACTCTTCTTTCTCAGAGTTTTG
GTTCTCGTCAAGCCACTCCAAGGCTTCTTTGGTCGCTGCTTCTATCTTCTCCTTCTCATC
CGCCTCCAGTTTGTCTGCAAGCTTGTCCTTGTCGCTAACTTGGTTCTTCATGTTGTACAC
GTATGTCTCCAGGCTGTTCCTCGCGTCGATTCTCTCCTTCACCTTCTTGTCCTCCTCTGC
AAACTCCTCTGCCTCCTTAACCATCCGGTCAATCTCTTCCTGGC

QA 1 584 1 584
DS 

RD RS1GK76TF 695 0 0
T
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ACCTCCAGCACCTCCTGGTGCACCACCTGTCCTCTGATACACGGCCGTGACGATTGGGT*
*CACACTGCCTCTACTTCCTTCAACTTCTCGTCGTACTCTTCTTTCTCAGAGTTTTGGTT
CTCGTCAAGCCACTCCAAGGCTTCTTTGGTCGCTGCTTCTATCTTCTCCTTCTCATCCGC
CTCCAGTTTGTCTGCAAGCTTGTCCTTGTCGCTAACTTGGTTCTTCATGTTGTACACGTA
TGTCTCCAGGCTGTTCCTCGCGTCGATTCTCTCCTTCACCTTCTTGTCCTCCTCTGCAAA
CTCCTCTGCCTCCTTAACCATCCGGTCAATCTCTTCCTGGCTCAGACGTCCCTTCTCGTT
TGTGATTGTGATCTTCTCTGATTTACCAGAGGCCTTGTCCTCTGCCTTCACGTTCAGGAT
ACCGTTGGCGTCCACTTCAAACGTGACTTCGATTTGAGGTGTTCCTCTTGGGGCCGGTGG
GATTCCAGTGAGGTCGAACTTCCCGAGCAGCCTGCAGTCCTTGGTAAGACTTCGCTCACC
TTCAAAGACCTGAATGGAGACGGTGGTCTGCTGGTCTTGGTATGTCGTGAAAACCTGCGA
CTTCTTTGTCGGAATGACTGTGTTTCTCGGGATC

QA 2 695 2 695
DS 

RD RS1C050JQ 850 0 0
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TTATCATTCTTCTTTATCCCTCAAAACTTCACCAAGAGGTCTGTCTAAGAAATTAACAAT
AAAAAAAAAGGCACAACTTAGAGCTCATCGTGAGACTCATCCTCCTCCTCGTTCGCTGAT
TCACCTCCAGCACCTCCTGGTGCACCACCTGTCCTCTGATACACAGCCGTGATGATTGGG
TTACACACTGCCTCTACTTCCTTCAACTTCTCGTCGTACTCTTCTTTCTCTGAGTTTTGG
TTCTCGTCAAGCCACTCCAAGGCTTCTTTGGTCGCTGCTTCTATCTTCTCCTTCTCATCC
GCCTCCAGTTTGTCTGCAAGCTTGTCCTTGTCGCTAACTTGGTTCTTCATGTTGTACACG
TATGTCTCCAGGCTGTTCCTCGCGTCGATTCTCTCCTTCACCTTCTTGTCCTCCTCTGCA
AACTCCTCTGCCTCCTTAACCATCCGGTCAATCTCTTCCTGGCTCAAACGTCCCTTCTCG
TTTGTGATTGTGATCTTCTCTGATTTACCAGAAGCCTTGTCCTCTGCTTTCACGTTCAGG
ATACCGTTGGCGTCCACTTCAAACGTGACTTCGATTTGAGGTGTTCCTCTTGGGGCCGGT
GGGATTCCAGTGAGGTCGAACTTCCCGAGCAGCCTGCAGTCCTTGGTAAGACTTCGCTCA
CCTTCAAAGACCTGAATGGAGACG*TGGTCTGCTGGCCTTGGTACGTCGTGAAA*CCTGC
GACTTCTTTGTCGGA*TGACTGTGTTTCTTGGGATCAGTTTCGTCATCACTCCTCCACTG
TCTCATACCC

QA 1 850 1 850
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AAAAATCTGTTTTGAGAATCTCTAGATGTTTCGGTTTACTAAACATAAACAAATATAAGA
AAAATATAAAAAACATAGTTCAGAGATATGAGAAATAAAAAAGTAACAGAGCTATACACA
TTTAGTGTGTTCAACTCTTTTGCTTCTTCTTCTCCACTCTTTTAGACTTGCTCCACTTGA
GGAAAATCTGATAAGACAAACCACCAAACACCATCGAAACGCATCCCCACTGCTTCAACG
ACAACGGATTCCCGCTCATTACCGATGACACGACGATGCTAACAAACTTCCTCGTCGTCG
TTATGGTCGTGTTAGCTAGCGACCCGAAGTTACTTATCGTCATAAATATGAAGTTTTGTC
CCACCGCACCGCATAGACAGTACTTCAGAATGTCCCACGCCGCTTCCGGGTGTTGTTTAC
AGAACTGATACGCTTCGAACCCCATCCCTTGTGGCAATCCAAACATGTAGACCATGTTGT
ATATCGTGCCCCATAGATTCATCCCCAGCATTATGTCCCAAGCTTCGGTCTTCGGGTACC
TCGAGGCAATGGAGTCTTGGGTGGCGTTTGTGAATCCGTCAAAGGCGAGGTTTAAGAAGC
AGAGCGCGTAGCCGAGAGGAGCATTTGGATGTGCTAGCTTGCTAATTGTCTTAGAGCTTG
TCTTAAGAAGAGCAAATATGGCTACTCCCCCCGCGACGAGAAAGGTGCAAATGTATTCAG
GGAAAGTGTATCTTATTCCATAAACCAAAGTTCCCATCAGCATAACTGGAATCATTTTTG
AAGATTTTGCCAGGACCTGAGCTGGATAACTGATATACTTCAAGGCCTCGATCCCCATGG
CGGGACCAATAGTATTAGTAATGCCGGCACTCCAATACGTCCACCATGGTGCACCACCGT
TACCAGTGTTTGACCACATCTTAATCATAATATAAGACCAGACCAAGCAGACAACACTTT
GAGCCAAGTTCAAGAATGCAAGGTGCTCGAACCTCTTCTCATCTGGACCGAATCTCTTCG
TGGACAGAGTTTCCTGAAGAACGCATTGGTAGATGTAGGCGGACCAGATTCCGGAGATGC
ACAGCGCCAACAGCAGAATTCGCCGGAATCCAGATCCGTTCGCCTCCATCACCCCCACCT
CCTCGCCGCCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
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20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FW31JQ U 1
AF RS1BX06TF C 420
BS 1 457 RS1FW31JQ
BS 458 458 RS1BX06TF
BS 459 514 RS1FW31JQ
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BS 594 738 RS1FW31JQ
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BS 740 748 RS1FW31JQ
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BS 750 757 RS1FW31JQ
BS 758 1212 RS1BX06TF

RD RS1FW31JQ 758 0 0
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AAAAATCTGTTTTGAGAATCTCTAGATGTTTCGGTTTACTAAACATAAACAAATATAAGA
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AGAGCGCGTAGCCGAGAGGAGCATTTGGATGTGCTAGCTTGCTAATTGTCTTAGAGCTTG
TCTTAAGAAGAGCAAATA*GGCTACTCCTCCCGCGAC
A

QA 1 757 1 757
DS 

RD RS1BX06TF 793 0 0
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TATATCGTGCCCCATAGATTCATCCCCAGCATTATGTCCCAAGCTTCGGTCTTCGGGTAC
CTTGATGCAATGGAGTCTTGGGTGGCGTTTGTGAATCCGTCAAAGGCGAGGTTTAAGAAG
CAGAGCGCGTAGCCGAGTGGAGCATTTGGATGTGCTAGCTTGCTAATTGTCTTAGAGCTT
GTCTTAAGAAGAGCAAATATGGCTACTCCCCCCGCGACGAGAAAGGTGCAAATGTATTCA
GGGAAAGTGTATCTTATTCCATAAACCAAAGTTCCCATCAGCATAACTGGAATCATTTTT
GAAGATTTTGCCAGGACCTGAGCTGGATAACTGATATACTTCAAGGCCTCGATCCCCATG
GCGGGACCAATAGTATTAGTAATGCCGGCACTCCAATACGTCCACCATGGTGCACCACCG
TTACCAGTGTTTGACCACATCTTAATCATAATATAAGACCAGACCAAGCAGACAACACTT
TGAGCCAAGTTCAAGAATGCAAGGTGCTCGAACCTCTTCTCATCTGGACCGAATCTCTTC
GTGGACAGAGTTTCCTGAAGAACGCATTGGTAGATGTAGGCGGACCAGATTCCGGAGATG
CACAGCGCCAACAGCAGAATTCGCCGGAATCCAGATCCGTTCGCCTCCATCACCCCCACC
TCCTCGCCGCCGT

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

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CAACAAATGAAATCAATGCTTAACCAATAAACATAACTCCCAAAAAAATCAAAAAACAAT
GAGCCAAAACAAAAAAGCATACAAAAATATTGAAGTTGTTTAAAAAGAAGAACACGAGCA
AAGGTGTAAAGGAGAGAGAAAGAAACAAAAAAGACGAAGTTGAGAGTTTCTTCTTTCATC
CTTTGATCTTCAAGTTCCTCACTTGGGATTCTACATTATCTGCATTGTTCTGTGTACTTA
CTACATTATTCATCCATGGATGTTCCAAGCACTGCTGAGCAGTTGGTCGTTTCTCAGGCG
CAAACTCCAGAACCGGACTCAGAAACTCCGCAAACTCCTTTGCTTCTGCTTCAGGAAGCT
TGTATTTATCCGCCAGCAACCGATCCAGCGGCCATTTGTTGCTGAGGTGGATGGGCTTCG
ATGCGTAGGGGTTGAAGGACGAGAGTTTGGTCTAGAAGCAACTATGTTTGGTGAATTTGA
CTGTCTTCTAGAAGTTGGAGTAAATGGTCTTGAGCTTAGGGAGGGTCTGGCCTTGTCCAA
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AGTACGAGTGGGAGTGGGAGTTCTAGCTGAAGATGAGGAACGGGAGCTAGGGGATGAAGG
TCTGATGTAGGATGAGACTGAAGCTGAACTAGTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CD89JQ U 172
AF RS1BS18JQ U 1
BS 1 209 RS1BS18JQ
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TCTTTCATCCTTTGATCTTCAAGTTCCTCACTTGGGATTCTACATTATCTGCATTGTTCT
GTGTA

QA 1 125 1 125
DS 

RD RS1BS18JQ 755 0 0
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CAACAAATGAAATCAATGCTTAACCAATAAACATAACTCCCAAAAAAATCAAAAAACAAT
GAGCCAAAACAAAAAAGCATACAAAAATATTGAAGTTGTTTAAAAAGAAGAACACGAGCA
AAGGTGTAAAGGAGAGAGAAAGAAACAAAGAAGACGAAGTTGAGAGTTTCTTCTTTCATC
CTTTGATCTTCAAGTTCCTCACTTGGGATTCTACATTGTCTGCATTGTTCTGTGTACTTA
CTACATTATTCATCCATGGATGTTCCAAGCACTGCTGAGCAGTTGGTCGTTTCTCAGGCG
CAAACTCCAGAACCGGACTCAGAAACTCCGCAAACTCCTTTGCTTCTGCTTCAGGAAGCT
TGTATTTATCCGCCAGCAACCGATCCAGCGGCCATTTGTTGCTGAGGTGGATGGGCTTCG
ATGCGTAGGGGTTGAAGGACGAGAGTTTGGTCTAGAAGCAACTATGTTTGGTGAATTTGA
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AGTACGAGTGGGAGTGGGAGTTCTAGCTGAAGATGAGGAACGGGAGCTAGGGGATGAAGG
TCTGATGTAGGATGAGACTGAAGCTGAACTAGTGT

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 3

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ATGCTTTTAT


BQ
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AF RS1G304TF U 124
AF RS1DB81JQ C 1
AF RS1DB81TF U 1
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RD RS1G304TF 462 0 0
G
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TTAAATATGCCGAGGTGAGTAACTACGACCGGTTCAAGTCTGGGTTTGAAGAGAGTGAGA
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QA 2 462 2 462
DS 

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GAGAAGGAGGAGGCGGCCACGACGGTTACGCCTGTGGTGGATGATGGTGCTCCCCCGCCG
CTTGAACCGCAGGTGGTTCCTACGTAAGAGAGTGAGTGACTTTCACTGTTACGATTGTAC
ATTTAATTAAGAATGCAATAACACATTTTACCACAACCAAAAGAAAGGCACTGTCTTGTG
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QA 1 610 1 610
DS 

RD RS1DB81TF 610 0 0
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GCCAAGGTCGGCCTCCTCTCGTTCCCTCCAAGGGACGATGGCTACGAGTTCAATAAACCG
TACAGCAACAAGACCGGTGCGATCATAGACGAGGAAGTAAGGGAATGGGTGGCGAAAGCT
TACGAGAAGACAGTGGAGCTGATCGAGGAACACAAGGAGCAAGTGGCTGAGATCGCTGAG
CTTTTGCTGGAGAAAGAAGTGCTGCATCAGGAGGATCTTTTGAAAGTTTTGGGTGAGCGT
CCGTTTAAATATGCCGAGGTGAGTAACTACGACCGGTTCAAGTCTGGGTTTGAAGAGAGT
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ATTCAGTGAACTTAAGTGTAGCAATGAATATTTT*GTTCTGAATTATTGCTTCTAATAAG
ATGCTTTTAT

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 3

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TAAGCCAGGAACGTTAAGACACGCGGTGACACGAGACGGACCGCTTTGGATCATCTTCGC
AAGAAACATGGTCTTGAACCTGAAACAAGAACTGATGGTGACGAGCGATAAAACGATCGA
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GTTTGGAGCAACGAATGTTTGGATCGATCATGTCTCGATGGCGAGATGTTCTGATGGTAT
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CCAAGAGGTGATGCTTTTTGGGGCCAATAACAAACACGTGATTGACAAGAAGATGCAGAT
AACAGTTGCATTCAACCACTTTGGTAAGAGACTGGAACAGAGAATGCCTAGGGTCAGATT
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AAACATGAACCCTACAATCATTAGCCATGGCAACCGTTTCATTGCTCCTCCTAACGAACG
AGCCAAACAGATCACAAAGAGAGAGTACACGCATTACGCGGATTGGAAGCTTTGGAATTG
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TGCGTGGAGCCCTAAACCGAAAAACCCTATCCCAAACAAGTTTGCGATCCGACCTAAACC
GGGAACGATGGTCCGTGAACTCGCCATGGACGCAGGAGTACTGGGATGCAAACGGGGTCA
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TATTTGCTTGTTGTCCAAGAAAAGAATGAGAGAAATAGAGAGAAAAAAAGCAAATGAAAG
TGGTTTTCTTTGATCGGGGTTTTGTAATATTATTCTTGTCAGGATTCAGTTCCCTTTAAA
TAAAATTTTCCCCAAATATTTTCACC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DU12TF U 1
AF RS1GC19TF U 567
AF RS1DU12JQ C 558
BS 1 707 RS1DU12TF
BS 708 772 RS1GC19TF
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BS 774 1188 RS1GC19TF
BS 1189 1286 RS1DU12JQ

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GGAGAAAAACCGTAAGAAACTAGCGGTTTGTGCCCTCGGATTCGGCAGGAGAACCAGCGG
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TAAGCCAGGAACGTTAAGACACGCGGTGACACGAGACGGACCGCTTTGGATCATCTTCGC
AAGAAACATGGTCTTGAACCTGAAACAAGAACTGATGGTGACGAGCGATAAAACGATCGA
TGGACGTGGAGCTAGGGTTTACATCATGGGCGGTGCTGGATTAACGCTGCAGTTTGTGAA
CAATGTGATCATACACAATATCTATATCAAGCACATTGTTCCGGGCATCGGTGGTTTGAT
CAGAGACTCTGAGCAACATATAGGGCTAAGGACAAGAAGTGATGGTGATGGGATCAATTT
GTTTGGAGCAACGAATGTTTGGATCGATCATGTCTCGATGGCGAGATGTTCTGATGGTAT
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CCAAGAGGTGATGCTTTTTGGGGCCAATAACAAACACGTGATTGACAAGAAGATGCAGAT
AACAGTTGCATTCAACCACTTTGGTAAGAGACTGGAACAGAGAATGC

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DS 

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G
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TAGACTGGAACAGAGAATGCCTAGGGTCAGATTCGGAACGATCCATGTGGTGAACAATGA
CTACACACATTGGGAAATGTATGCAGTAGGTGGAAACATGAACCCTACAATCATTAGCCA
TGGCAACCGTTTCATTGCTCCTCCTAACGAACGAGCCAAACAGATCACAAAGAGAGAGTA
CACGCATTACGCGGATTGGAAGCTTTGGAATTGGCAATCAGAAGGAGATTACTTCTTGAA
CGGAGCTTACTTTGTGCAATCAGGAAAACCTAATGCGTGGAGCCCTAAACCGAAAAACCC
TATCCCAAACAAGTTTGCGATCCGACCTAAACCGGGAACGATGGTCCGTGAACTCGCCAT
GGACGCAGGAGTACTGGGATGCAAACGGGGTCAAGCCTGCTGAGTGAAATAACCATTTTG
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GAGAGAAATAGAGAGAAAAAA

QA 2 622 2 622
DS 

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TTGGGGCCAATAACAAACACGTGATTGACAAGAAGATGCAGATAACAGTTGCATTCAACC
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TGAACAATGACTACACACATTGGGAAATGTATGCAATAGGTGGAAACATGAACCCTACAA
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CGAAAAACCCTATCCCAAACAAGTTTGCGATCCGACCTAAACCGGGAACGATGGTCCGTG
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AACCATTTTGTTGCCTTCCAACAAACAAAGCTTGTGCTCTTTGTATTTGCTTGTTGTCCA
AGAAAAGAATGAGAGAAATAGAGAGAAAAAAAGCAAATGAAAGTGGTTTTCTTTGATCGG
GGTTTTGTAATATTATTCTTGTCAGGATTCAGTTCCCTTTAAATAAAATTTTCCCCAAAT
ATTTTCACC

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DS 



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CCAAGGCTGAGTATGATGAGGCAGGTCCAGGAATTGTTCACAGAAAATGCTTCTAAGCTC
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TTCTGTGCACTTTTGTGTAACAAAACTCTTATGGGTTTTTACTTTACGTCTGCGTTTGAA
AGAAACAGCTTTCGTTTTTGCGTTAATACTCCATTGGTTTTGTTACTCGAGTGATGTTTT
TATTTTTCTATAATTTCTTTCAACATTGGGAAGAAGAACCTTTGATACTCTTTGTATTGT
TAATATATGTATTGTAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CN56JQ C 1
AF RS1CN56TF U 1
AF RS1C370TF U 417
BS 1 502 RS1CN56TF
BS 503 617 RS1C370TF

RD RS1CN56JQ 502 0 0
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CCAAGGCTGAGTATGATGAGGCAGGTCCAGGAATTGTTCACAGAAAATGCTTCTAAGCTC
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QA 1 502 1 502
DS 

RD RS1CN56TF 502 0 0
GCTACAACTCGATCATGAAGTGTGACGTGGATATCAGGAAGGACTTGTACGGTAACATCG
TGCTCAGTGGTGGAACAACTATGTTCTCGGGTATTGCAGACCGTATGAGCAAAGAGATCA
CAGCACTTGCACCAAGCAGCATGAAGATTAAGGTGGTTGCACCTCCCGAGAGAAAGTACA
GTGTCTGGATCGGTGGTTCCATTCTTGCTTCCCTCAGCACATTCCAGCAGATGTGGATCT
CCAAGGCTGAGTATGATGAGGCAGGTCCAGGAATTGTTCACAGAAAATGCTTCTAAGCTC
TCTCTCTATCTCAAGTAAAGGCTGAAAGCTGTGGGTTTTATTGAATGGGATCAAAGTTTC
TTTTTTTTTCTCCTATCCTATTTGCTTTTCCATTTGTTTGTTTCATTTTCTTTCTTTTGT
TTCTGTGCACTTTTGTGTAACAAAACTCTTATGGGTTTTTACTTTACGTCTGCGTTTGAA
AGAAACAGCTTTCGTTTTTGCG

QA 1 502 1 502
DS 

RD RS1C370TF 201 0 0
G
TGTTTCTGTGCACTTTTGTGTAACAAAACTCTTATGGGTTTTTACTTTACGTCTGCGTTT
GAAAGAAACAGCTTTCGTTTTTGCGTTAATACTCCATTGGTTTTGTTACTCGAGTGATGT
TTTTATTTTTCTATAATTTCTTTCAACATTGGGAAGAAGAACCTTTGATACTCTTTGTAT
TGTTAATATATGTATTGTAT

QA 2 201 2 201
DS 



AS 1 3

CO CL3336Contig1 1011 3 9 U
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GCAACAACCATACACTTTGTGATAATACATACATATTAATCACATCTCAAAAGCCATATA
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TGTGACGTCAATGTACGACAACAAAGAGGTTTTGATACGTTCCAACAAATCCCACATGTT
ATTTACTCCTTTCCGGCAAACCAGTGGGAAGCGATTCACTTTGGCACTTCGAATGAACTT
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GTAGGTTATGAAGTTTTCATAATCCTCATAAAGTGGCTGACCATCTACGACCACCCAGGG
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ATAACAAGTCTCCCACTTGTCGTACTTGTGCTCAGTCACCAAACCCTCAACGCATAGGAT
AAACGGGAAATGATCGCTCAATTTAGGCCAAGCATCCATCGCACAAGCCTCAACAGTATC
CAATAAGCATTCAAACGCACCGTGCTGGCAAACGGCAGTGACATTATTATGGGAGGAGCG
GAGCTTGGTGTTACCCCAGGGAGAGAGATGGAGATCTACGATTGATATGAGATCTTCTTC
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AAAGCAGATAAGAGAAACGTAGCAGACCAGAAGAAGATGAAGAAGTTTGCTCGAAGCCAT
GAGTTATTGCAAAATGCAAAGAGAAAGAGAAGGTCTGTTGTGTTGTTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1E569JQ U 1
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AF RS1E569TF C 347
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RD RS1E569JQ 576 0 0
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GCAACAACCATACACTTTGTGATAATACATACATATTAATCACATCTCAAAAGCCATATA
GCTTTCAAAGTAATCATGCTACATATCATAAAATAAAGAAAAAGGTGTTTATAGCAGTCC
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ATTTACTCCTTTCCGGCAAACCAGTGGGAAGCGATTCACTTTGGCACTTCGAATGAACTT
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ATAACAAGTCTCCCACTTGTCGTACTTGTGCTCAGT

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DS 

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ACAGTATCCAATAAGCATTCAAACGCACCGTGCTGGCAAACGGCAGTGACATTATTATGG
GAGGAGCGGAGCTTGGTGTTACCCCAGGGAGAGAGATGGAGATCTACGATTGATATGAGA
TCTTCTTCGAAGAGCTTCGTGAGGTGGTTAACGATGAAGGATGAGCAGTAGGGACATAGA
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TTCGACTGGAGGTTT


BQ
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AF RS1EU17TF U 48
AF RS1B039JQ C 1
AF RS1B039TF U 1
BS 1 435 RS1B039TF

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GG
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GCTTCGTTTTTGTCGATTTTTGATACACAACAAGCTCAGGGAGAACTGAATGTAACGTTT
TTTGGTGCTTTCATAGGATCTGTAATCCAAGATATTGCTGACAAAGTGTTGTAGTTGTAT
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TTCGACTGGAGGTTT

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DS 

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AGTTTTCTTTTATTATAAAGACCAAACTAAATGTATTGTCTTCAAGTTGCAGCTTATCAC
TTGTTCTTCAACGCTTCGCGGTTATGTTATCTTCTTGCTTTGATTGTCTTTGTCTTTCTC
AGGTTCTCTTCTATTTTCCATGATACATCAATGGTTAATCACGTTGGCGAATCCAGAACG
GCTTCGTTTTTGTCGATCTCTGATACACAACAAGCTCAGGGAGAACTGAATGTAACGTTT
TCTGGTGCTTTCATAGGATCTGTAATCCAAGATATTGCTGACAAAGTGTTGTAGTTGTAT
AATGTTTATGTACTTATATAATAACAGATGATTATCCTTTGCTTTGTTGTTTATCTCCAG
TTCGACTGGAGGTTT

QA 1 435 1 435
DS 



AS 1 3

CO CL3338Contig1 895 3 13 U
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GACATATGCATTGGCGCATCGGCTGCTCCTACTTACTTTCCTCCTCATTACTTTATCAAT
GAAGATATTAAAGGCAAGACGTCTGAGTTTCACCTAGTTGATGGCGGAGTTACTGCTAAT
AATCCGACTCTGCTGGCCATGACAGCTGTCACTAAGCAGATCGTGAATGATAATCCTGAC
ATGGGTGAGCTCAAGCCGTTAGGTTACAACAAGTTTCTCGTTGTGTCGATAGGAACAGGG
TCTGCACAAAAGGAGGAGAAGTATAGCGCAAAAAAGGCTGCAAAATGGGGAATCATATCT
TGGTTATATGACAATGGATCTGCTCCTATACTAGACATTACCATGGAATCAAGCCGCGAC
TTAGTTGATTTCCACAGTTCTGTTGTATTCAAAGCCCGACAATCCGAGGACAAGTATCTC
AGAATTGATGATGATACATTGAAAGGAGATGCAAGCTCTATGGACTTAGCAACAAAATCC
AATTTAGAGAATCTTGTGATAAATGGAGAGAAGATGCTGAAAAACAGAGTTGCGCAAATG
AACATCGACACTGGTCTATATGAACCTGTTCCTGGAAATGTCACCAATGAGCAAGAGCTC
AAGAGGTTTGCGAAAATGCTCTCGGATGAAAGGAAACTAAGGATGCAAAGCGACGAGACA
CGTAAAGTTTCATCAAATTGAATTAAGCTTGATGATCGCTCGTGCTTTGTGATTTGGTGC
ATAAAATATAATCTGTAAAAAATACAAATAACAGTAGTAAGAATAATTTGCTGTACAAGA
CGGTTTTGTGTGTGTTTGCCTTCTTTTGATAATGAAGTTACGCTAGTTTCATATC


BQ
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GAAGATATTAAAGGCAAGACGTCTGAGTTTCACCTAGTTGATGGCGGAGTTACTGCTAAT
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AATTTAGAGAATCTTGCGATAAATGGAGAGAAGATGCTGAAAAACAGAGTTGCGCAAATG
AACATCGACACTGGTCTATATGAACCTGTTCCTGGAAATGTCACCAATGAGCAAGAGCTC
AA

QA 1 662 1 662
DS 

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G
GCTAATAATCCGACTCTGCTGGCCATGACAGCTGTCACTAAGCAGATCGTGAATGATAAT
CCTGACATGGGTGAGCTCAAGCCGTTAGGTTACAACAAGTTTCTCGTTGTGTCGATAGGA
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ATATCTTGGTTATATGACAATGGATCTGCTCCTATACTAGACATTACCATGGAATCAAGC
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GAGACACGTAAAGTTTCATCAAATTGAATTAAGCTTGATGATCGCTCGTGCTTTGTGATT
TGGTGCATAAAATATAATCTGTAAAAA*TACAAATAACAGTAGTAAGAATAATTTGCTGT
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DS 

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GCTCAAGCCGTTAGGTTACAACAAGTTTCTCGTTGTGTCGATAGGAACAGGGTCTGCACA
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GAATCTTGTGATAAATGGAGAGAAGATGCTGAAAAACAGAGTTGCGCAAATGAACATCGA
CACTGGTCTATATGAACCTGTTCCTGGAAATGTCACCAATGAGCAAGAGCTCAAGAGGTT
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TAATCTGTAAAAAATACAAATAACAGTAGTAAGAATAATTTGCTGTACAAGACGGTTTTG
TGTGTGTTTGCCTTCTTTTGATAATGAAGTTACGCTAGTTTCATATC

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DS 



AS 1 3

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GGCAACCCCAATGGAGGCGCGAAGAAGAAGATCGATCCCAGAGTCAGTAACCGTGCAGAT
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ATCGTTGATAGAATCGTCATACTTCCGCAGCCTCTTCGTCTCTCTCCACCGAAACTCATC
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CGGATTGGTTTGGATTGAAGTGGAATTCGGATTCGACGAAAATCACAATACCGTAGCCAA
ATCATTTGTGGGCAATCCAGTTACGCAAGAATGGGTTGAGATCCATCAGCCTCAAGATCC
TTCTATTATTCCCACTAGTTTGCTAACGCGTGTTGTGAACGGTGTCGTTTCAAGCTTCAA
AATGATCAATACTACTTATGAGGTTAATGATACAAACGATGTACGGAGCATGTATGTGTA
TTCTTCTGAGATAGGGGCATGGTCTTTCAAGCGGCTTCGCTCCCCTGTTCCCCTCCAGCG
AGCTGGTTTTAACAAGCCCTTGATTCTCAACGGGATGGTTTATGTTTGGGACAAGAGATT
GGACGACGATGATGATACTGCCCCTGGAGTTCTGGTAGCTTATGACTTTTTTGCTGAAGA
AGATGATAATCATTGTCGGATTATACCTCTCCCTGTCCCGTATAGCAAGTGCGTTAGGAG
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TGATACTGATTCGGTCTATCTATGGAGTAGACAACACGGTTGCGTGGTATCTGGTAATTT
AAGGACACGAGAGTTTACTCTTCGTCAGGATACGGAGACTTGGAGTGATGGTGAAGGTTG
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AGCTTTGGTCGTCACGTTATCACAATTTGTGCCCCCACAGTGGATGGATCCGGTGCCTCG
CCCGCCGTATTGACATCCTTCTTGTGTCAATGTTTTCCTAGTCTTGATTCTGTTTTGTTT
CGTCTCAGCTTCTTGTTTTGTCACACTATGTATCAGGTCTTTTCTTTTGTGATCGACTAG
TTGCTCACACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CY51TF U 1
AF RS1AP27TFB U 21
AF RS1CY51JQ C 711
BS 1 285 RS1CY51TF
BS 286 738 RS1AP27TFB
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BS 740 765 RS1AP27TFB
BS 766 1451 RS1CY51JQ

RD RS1CY51TF 285 0 0
GGAAGAAAACCCTAAGAAAAAAAGAGTGTTCCGTTCGACTGAGAGAGTGGCGAGTGGAAC
GGCAACCCCAATGGAGGCGCGAAGAAGAAGATCGATCCCAGAGTCAGTAACCGTGCAGAT
CATCGCGAGACTACCTCTGAAAAGCATCGCGAGATTCAAATCGGTGTGCAAACAATGGAG
ATCGTTGATAGAATCGTCATACTTCCGCAGCCTCTTCGTCTCTCTCCACCGAAACTCATC
TTCCTCCTCCTCCTGGTCACTTATGTTCCCAATGAAGTATAAGAA

QA 1 285 1 285
DS 

RD RS1AP27TFB 745 0 0
GG
AGAGTGTTCCGTTCGACTGAGAGAGTGGCGAGTGGAACGGCAACCCCAATGGAGGCGCGA
AGAAGAAGATCGTTCCCAGAGTCAGTAACCGTGCAGATCATCGCGAGACTACCTCTGAAA
AGCATCGCGAGATTCAAATCGGTGTGCAAACAATGGAGATCGTTGATAGAATCGTCATAC
TTCCGCAGCCTCTTCGTCTCTCTCCACCGAAACTCATCTTCCTCCTCCTCCTGGTCACTT
ATGTTCCCAATGAAGTATAAGAATCCCATCACCGAAGCTATAGGCTTCTATGGATGCAAG
AGATGGGATCTTCCCAAATCCCCAGCCTCCTATTTCATCCCTTTTCAACGGTATCCCAAT
CACCCTCCCTTAGACTATTACTACATTTCTTCCTCAAACGGATTGGTTTGGATTGAAGTG
GAATTCGGATTCGACGAAAATCACAATACCGTAGCCAAATCATTTGTGGGCAATCCAGTT
ACGCAAGAATGGGTTGAGATCCATCAGCCTCAAGATCCTTCTATTATTCCCACTAGTTTG
CTAACGCGTGTTGTGAACGGTGTCGTTTCAAGCTTCAAAATGATCAATACTACTTATGAG
GTTAATGATACAAACGATGTACGGAGCATGTATGTGTATTCTTCTGAGATAGGGGCATGG
TCTTTCAAGCGGCTTCGCTCCCCTGTTCCCCTCCAGCGAGCTGGTTTTAACAAGCCTTTG
ATTCTCAACGGGATGGTTTATGT

QA 3 745 3 745
DS 

RD RS1CY51JQ 741 0 0
CCCTCCAGCGAGCTGGTTTTAACAAGCCCTTGATTCTCAACGGGATGGTTTATGTTTGGG
ACAAGAGATTGGACGACGATGATGATACTGCCCCTGGAGTTCTGGTAGCTTATGACTTTT
TTGCTGAAGAAGATGATAATCATTGTCGGATTATACCTCTCCCTGTCCCGTATAGCAAGT
GCGTTAGGAGATGTTTGTCTACTTCAGGTGGAAATGTTATCTATGTCGAAATATTGGAGC
GAAGATTGAAGGTTTGGAAGCTGAAGAGTGACAACTCTGATGGAGAATGGTGGCGGTTGA
CAAGAGAGGAGATCGACATGGCCTCTGTGGGCTTTGATGTCGATTGTTTTCCTTTGGGAG
TTAACCCGTTTGATACTGATTCGGTCTATCTATGGAGTAGACAACACGGTTGCGTGGTAT
CTGGTAATTTAAGGACACGAGAGTTTACTCTTCGTCAGGATACGGAGACTTGGAGTGATG
GTGAAGGTTGCTGGCGCGTAAACACGTCTGATTCTAACAAGTATCTGGAAGATACATATG
AACTTGATGCAGCTTTGGTCGTCACGTTATCACAATTTGTGCCCCCACAGTGGATGGATC
CGGTGCCTCGCCCGCCGTATTGACATCCTTCTTGTGTCAATGTTTTCCTAGTCTTGATTC
TGTTTTGTTTCGTCTCAGCTTCTTGTTTTGTCACACTATGTATCAGGTCTTTTCTTTTGT
GATCGACTAGTTGCTCACACC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 3

CO CL3340Contig1 787 3 11 U
GGAAACACACAGACACAGAAGGTAAAGCAAAAATGGTGTCGGGATCAGGTATATGCTCGA
AGCGCGTGGTCGTCGACGCGCGCCACCACATGCTGGGGCGTCTGGCGTCGATCGTGGCCA
AGGAGCTGCTCAACGGGCAGAAGGTCGTCATCGTTAGATGCGAGGAGATTTGCCTCTCCG
GTGGACTCGTTCGCCAGAAAATGAAGTACATGAGGTTCCTTCGCAAACGTATGAACACGA
AGCCTTCTCACGGACCCATTCACTTCCGTGCTCCCTCCAAGATCTTCTGGCGTACTGTTC
GCGGTATGATTCCACACAAAACGAAGCGTGGATCTGCTGCACTTGCACGCATGAAGGTGT
TTGAAGGTGTGCCTCAACCATATGACAAGGTCAAGAGGATGGTCATCCCCGATGCTCTCA
AGGTCTTGAGGCTTCAAGCTGGTCACAAGTACTGTCTTTTGGGCCGTCTCTCTTCTGAAG
TCGGGTGGAACCACTACGACACCATCAAGGAGCTGGAGACGAAGAGGAAGGAGAGATCCC
AAGTTGTTTACGAGCGTAAGAAGCAGCTTAACAAACTTAGAGCTAAGGCTGAGAAGGTGG
CTGAAGAGAAGCTTGGAGCACAGCTCGAGATTCTTGCACCAGTCAAGTACTGAGATGATC
ATTAATAGTTTGTCTTTGCATGTTTTGAGCCGACCTATAATACTTTTTTCACTTTCACTT
AGGTGTTGTATCGGATTTTGCCGTAATGTTTTCTTTCTTGAGTTACAATTTATTATATCC
CATGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E813TF U 13
AF RS1E813JQ C 95
AF RS1DT15TF U 1
BS 1 375 RS1DT15TF
BS 376 376 RS1E813JQ
BS 377 722 RS1DT15TF
BS 723 723 RS1E813JQ
BS 724 745 RS1DT15TF
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BS 747 751 RS1DT15TF
BS 752 752 RS1E813JQ
BS 753 763 RS1DT15TF
BS 764 764 RS1E813JQ
BS 765 787 RS1DT15TF

RD RS1E813TF 308 0 0
ACACAGAAGGTAAAGCAAAAATGGTGTCGGGATCAGGTATATGCTCGAAGCGCGTGGTCG
TCGACGCGCGCCACCACATGCTGGGGCGTCTGGCGTCGATCGTGGCCAAGGAGCTGCTCA
ACGGGCAGAAGGTCGTCATCGTTAGATGCGAGGAGATTTGCCTCTCCGGTGGACTCGTTC
GCCAGAAAATGAAGTACATGAGGTTCCTTCGCAAACGTATGAACACGAAGCCTTCTCACG
GACCCATTCACTTCCGTGCTCCCTCCAAGATCTTCTGGCGTACTGTTCGCGGTATGATTC
CACACAAA

QA 1 308 1 308
DS 

RD RS1E813JQ 688 0 0
GGGGCGTCTGGCGTCGATCGTGGCCAAGGAGCTGCTCAACGGGCAGAAGGTCGTCATCGT
TAGATGCGAGGAGATTTGCCTCTCCGGTGGACTCGTTCGCCAGAAAATGAAGTACATGAG
GTTCCTTCGCAAACGTATGAACACGAAGCCTTCTCACGGACCCATTCACTTCCGTGCTCC
CTCCAAGATCTTCTGGCGTACTGTTCGCGGTATGATTCCACACAAAACGAAGCGTGGATC
TGCTGCACTTGCACGCATGAAGGTGTTTGAAGGTGTGCCTCAACCATATGACAAGGTCAA
GAGGATGGTCATCCCCGATGCTCTCAAGGTCTTGAGGCTTCAAGCTGGTCACAAGTACTG
TCTTTTGGGCCGTCTCTCTTCTGAAGTCGGGTGGAACCACTACGACACCATCAAGGAGCT
GGAGACGAAGAGGAAGGAGAGATCCCAAGTTGTTTACGAGCGTAAGAAGCAGCTTAACAA
ACTTAGAGCTAAGGCTGAGAAGGTGGCTGAAGAGAAGCTTGGAGCACAGCTCGAGATTCT
TGCACCAGTCAAGTACTGAGATGATCATTAATAGTTTGTCTTTGCATGTTTTGAGCCGAC
CTATAATACTTTTTTCACTTTCACTTAGGTGTTGTATCGGATTTTGCCGTAATGTTTTCT
TTCTTGAGTTACAATTTATT
TATATCCC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RS1DT15TF 787 0 0
GGAAACACACAGACACAGAAGGTAAAGCAAAAATGGTGTCGGGATCAGGTATATGCTCGA
AGCGCGTGGTCGTCGACGCGCGCCACCACATGCTGGGGCGTCTGGCGTCGATCGTGGCCA
AGGAGCTGCTCAACGGGCAGAAGGTCGTCATCGTTAGATGCGAGGAGATTTGCCTCTCCG
GTGGACTCGTTCGCCAGAAAATGAAGTACATGAGGTTCCTTCGCAAACGTATGAACACGA
AGCCTTCTCACGGACCCATTCACTTCCGTGCTCCCTCCAAGATCTTCTGGCGTACTGTTC
GCGGTATGATTCCACACAAAACGAAGCGTGGATCTGCTGCACTTGCACGCATGAAGGTGT
TTGAAGGTGTGCCTCCACCATATGACAAGGTCAAGAGGATGGTCATCCCCGATGCTCTCA
AGGTCTTGAGGCTTCAAGCTGGTCACAAGTACTGTCTTTTGGGCCGTCTCTCTTCTGAAG
TCGGGTGGAACCACTACGACACCATCAAGGAGCTGGAGACGAAGAGGAAGGAGAGATCCC
AAGTTGTTTACGAGCGTAAGAAGCAGCTTAACAAACTTAGAGCTAAGGCTGAGAAGGTGG
CTGAAGAGAAGCTTGGAGCACAGCTCGAGATTCTTGCACCAGTCAAGTACTGAGATGATC
ATTAATAGTTTGTCTTTGCATGTTTTGAGCCGACCTATAATACTTTTTTCACTTTCACTT
AG*TGTTGTATCGGATTTTGCCGTA*TGTTT*CTTTCTTGAGT*ACAATTTATTATATCC
CATGTCT

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 3

CO CL3341Contig1 1069 3 2 U
GGAAAAATCGTGGTTCAATTTGATGTTTTCTAAGGGAGAATTGGAATACAGAGGCGAGCT
AGGTAAAGCAATGGATAGTTTTGCTCCTATTGAAAAGACTACTATAAGTAAAGACCGGTT
TATATATTATATGTATAAAAACTTTTATGGTTGGGGTGAGCGTTCTAGTTATTACAATAA
TGTTGATCTTTTAGTTAACTCCAAGGACATTCGGAATTTCATATCGGACGACACCTTTTT
TGTTAGGGATAGTAATAAAAATAGTTATTCTATATATTTTGATATAAAAAAAGAAAAAAT
TTGAGATTAACAATGATTTGAGTGACCTAGAAAATTTTTTTTATAGTTATTGTAGTTCTA
GTTATCTGAATAATAGATCTAAAGGTGACAACGATCTGCACTATGATCCTTACATTAAGG
ATACTAAATATAATTGTACTAATCACATTAATAGTTGCATTGACTCTTATTTTCGTTCTC
ACATCTGTATTGACAGTCACTTTTTAAGCGACGGTAAAAATTCCAATGAAAGTTACATTT
ATAATTTCATTTTTAGTGAAAGGGAAAGTGAAAGTGGAAAGATTCGTGAAAGCAAAAATG
ACAAGATAAGAACTAATAGTAATCGTAATAATTTAATGAGTTCTAAGGATTTCGATATAA
CTAAAAACTACAATCAATTGTGGATTCAATGCGATAATTGTTATGGATTAATGTATAAGA
AAGTCGAAATGAATGTTTGTGAAGAATGTGGACATTATTTGAAAATGACCAGTTCAGAGA
GAATTGAGCTTTTGATTGATCCGGGTACTTGGAATCCTATGGATGAAGACATGGTCTCTG
CGGATCCCATTAAATTTCATTCGAGGGAGGAACCTTATAAAAAGCGTATTGCCTCTGCTC
AAAAAAGACAGGGTTGACTGACGCTATTCAACAGTACAGGTCAACTAAATGGTATTCCCG
TAGCTCTTGGGGTTATGGATTTCAGTTCTGGGGGTAGTATGGGATCCGTAGTAGCGAAAA
AAAACTCGTTTGATCGAGTATGCTACCATCATGTTACTCTTATTTAGTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EB22JQ C 1
AF RS1EB22TF U 1
AF RS1AT04TF U 281
BS 1 588 RS1EB22TF
BS 589 1069 RS1AT04TF

RD RS1EB22JQ 593 0 0
GGAAAAATCGTGGTTCAATTTGATGTTTTCTAAGGGAGAATTGGAATACAGAGGCGAGCT
AGGTAAAGCAATGGATAGTTTTGCTCCTATTGAAAAGACTACTATAAGTAAAGACCGGTT
TATATATTATATGTATAAAAACTTTTATGGTTGGGGTGAGCGTTCTAGTTATTACAATAA
TGTTGATCTTTTAGTTAACTCCAAGGACATTCGGAATTTCATATCGGACGACACCTTTTT
TGTTAGGGATAGTAATAAAAATAGTTATTCTATATATTTTGATATAAAAAAAGAAAAAAT
TTGAGATTAACAATGATTTGAGTGACCTAGAAAATTTTTTTTATAGTTATTGTAGTTCTA
GTTATCTGAATAATAGATCTAAAGGTGACAACGATCTGCACTATGATCCTTACATTAAGG
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ACATCTGTATTGACAGTCACTTTTTAAGCGACGGTAAAAATTCCAATGAAAGTTACATTT
ATAATTTCATTTTTAGTGAAAGGGAAAGTGAAAGTGGAAAGATTCGTGG
AAGC

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1EB22TF 594 0 0
GGAAAAATCGTGGTTCAATTTGATGTTTTCTAAGGGAGAATTGGAATACAGAGGCGAGCT
AGGTAAAGCAATGGATAGTTTTGCTCCTATTGAAAAGACTACTATAAGTAAAGACCGGTT
TATATATTATATGTATAAAAACTTTTATGGTTGGGGTGAGCGTTCTAGTTATTACAATAA
TGTTGATCTTTTAGTTAACTCCAAGGACATTCGGAATTTCATATCGGACGACACCTTTTT
TGTTAGGGATAGTAATAAAAATAGTTATTCTATATATTTTGATATAAAAAAAGAAAAAAT
TTGAGATTAACAATGATTTGAGTGACCTAGAAAATTTTTTTTATAGTTATTGTAGTTCTA
GTTATCTGAATAATAGATCTAAAGGTGACAACGATCTGCACTATGATCCTTACATTAAGG
ATACTAAATATAATTGTACTAATCACATTAATAGTTGCATTGACTCTTATTTTCGTTCTC
ACATCTGTATTGACAGTCACTTTTTAAGCGACGGTAAAAATTCCAATGAAAGTTACATTT
ATAATTTCATTTTTAGTGAAAGGGAAAGTGAAAGTGGAAAGATTCGTG
GGAAGC

QA 1 588 1 588
DS 

RD RS1AT04TF 789 0 0
GGATAT
AAAAAAGAAAAAATTTGAGATTAACAATGATTTGAGTGACCTAGAAAATTTTTTTTATAG
TTATTGTAGTTCTAGTTATCTGAATAATAGATCTAAAGGTGACAACGATCTGCACTATGA
TCCTTACATTAAGGATACTAAATATAATTGTAATAATCACATTAATAGTTGCATTGACTC
TTATTTTCGTTCTCACATCTGTATTGACAGTCACTTTTTAAGCGATAGTAAAAATTCCAA
TGAAAGTTGCATTTATAATTTCATTTTTAGTGAAAGGGAAAGTGAAAGTGGAAAGATTCG
TGAAAGCAAAAATGACAAGATAAGAACTAATAGTAATCGTAATAATTTAATGAGTTCTAA
GGATTTCGATATAACTAAAAACTACAATCAATTGTGGATTCAATGCGATAATTGTTATGG
ATTAATGTATAAGAAAGTCGAAATGAATGTTTGTGAAGAATGTGGACATTATTTGAAAAT
GACCAGTTCAGAGAGAATTGAGCTTTTGATTGATCCGGGTACTTGGAATCCTATGGATGA
AGACATGGTCTCTGCGGATCCCATTAAATTTCATTCGAGGGAGGAACCTTATAAAAAGCG
TATTGCCTCTGCTCAAAAAAGACAGGGTTGACTGACGCTATTCAACAGTACAGGTCAACT
AAATGGTATTCCCGTAGCTCTTGGGGTTATGGATTTCAGTTCTGGGGGTAGTATGGGATC
CGTAGTAGCGAAAAAAAACTCGTTTGATCGAGTATGCTACCATCATGTTACTCTTATTTA
GTG

QA 7 789 7 789
DS 



AS 1 3

CO CL3342Contig1 976 3 5 U
ATAATCAGCTTACTTTTCTTTTTACTTTTGGTTGACTTTTGTTTTGTCTAGTCAAGTGTG
AGCATACAACAGTTGAACTCAAGAGCGCGGAATAAAACAAACGTAGTACATCTAAAATAT
ATATAAAAAAGGATAAACAAAAGGGTTTTTCAAGGAAAAAAAAGACACGAGACAGTTAGT
GTAAAAGTCTGCCTCCACAAGTGAATGTGACGATGCATGAGTCGTCCACAAAGACTGTAT
AGTTATGAGCAGGTTTTGATAGCAATGGCGGAAGCGTAACCAGAAGGTCGCACACGCACT
CGTTGTCTATTTGCCTCAACCACTTGCAGCAATCTTGTTGACCATACGTCTCATCTCCGT
GTCGGTGATGATGGTGATGGTGGTGGTGGTCGTCGTCGTCATTATCGTGGTGGTCGTGGT
CATCGTGATCATGGTCATCATGATCGTGGTCGTGGTCATCGTCATCATGGCCGTGGTCAT
CG**ATCATGGTGGTGGTGGTGGTCATCGTCATCATGGTCGTGATCATCGTCATCATCGT
GGTCATGGTCGTCATCATCATCATGGTCGTGGTCATCGTCATCATCATGGTCATGGTCGT
CATCATCATGGTCATGGTCATCGTCATCATCATGGTCGTGGTCATGGTCATCATCATCAT
CATCATGGTCGTGGTCATGGTGGTCATGATGATCATCGTCATGGGGATGGTGGTCATGGT
CATGGTCGTGGTCATGGTCATCATCATGATCATGGTCAGGAGAAGGTGGGACAGTGGGGG
AAGAAGGTAGGACAGTGGTCACTGGGACACGTGCGCAGGCGTAGTTAGCCAGAGCGTACT
GAGAGACGCATAATGGACGTGGCGGTGGAATCTGTATGATTCTCTGGCCTCGTGTGAAAG
AGGAAGAGGAGAGAGCCAAAAGTAGAACAGCTACAATAAAAAGAGTTTCCATTATGAGTA
TGTGTGTGTGTGTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DA69JQ U 1
AF RS1FJ61JQ U 61
AF RS1DA69TF C 278
BS 1 156 RS1DA69JQ
BS 157 157 RS1FJ61JQ
BS 158 755 RS1DA69JQ
BS 756 782 RS1FJ61JQ
BS 783 976 RS1DA69TF

RD RS1DA69JQ 755 0 0
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ATATAAAAAAGGATAAACAAAAGGGTTTTTCAAGGAGAAAAAAGACACGAGACAGTTAGT
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AGTTATGAGCAGGTTTTGATAGCAATGGCGGAAGCGTAACCAGAAGGTCGCACACGCACT
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CATCGTGATCATGGTCATCATGATCGTGGTCGTGGTCATCGTCATCATGGCCGTGGTCAT
CG**ATCATGGTGGTGGTGGTGGTCATCGTCATCATGGTCGTGATCATCGTCATCATCGT
GGTCATGGTCGTCATCATCATCATGGTCGTGGTCATCGTCATCATCATGGTCATGGTCGT
CATCATCATGGTCATGGTCATCGTCATCATCATGGTCGTGGTCATGGTCATCATCATCAT
CATCATGGTCGTGGTCATGGTGGTCATGATGATCATCGTCATGGGGATGGTGGTCATGGT
CATGGTCGTGGTCATGGTCATCATCATGATCATGG

QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1FJ61JQ 722 0 0
C
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TAAAAGTCTGCCTCCACAAGTGAATGTGACGATGCATGAGTCGTCCACAAAGACTGTATA
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GTCATGGTCGTCATCATCATCATGGTCGTGGTCATCGTCATCATCATGGTCATGGTCGTC
ATCATCATGGTCATGGTCATCGTCATCATCATGGTAGTGGTCATGGTCATCATCATCATC
ATCATGGTCGTGGTCATGGTGGTCATGATGATCATCGTCATGGGGATGGTGGTCATGGTC
ATGGTCATGGTCATGGTCATCATCATGATCATGGTCAGGAGAAGGTGGGACAGTGGGGGA
A

QA 2 722 2 722
DS 

RD RS1DA69TF 699 0 0
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GTCGTGATCATCGTCATCATCGTGGTCATGGTCGTCATCATCATCATGGTCGTGGTCATC
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GTCATGGGGATGGTGGTCATGGTCATGGTCGTGGTCATGGTCATCATCATGATCATGGTC
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QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 3

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AATGTGAATGAAATGTACTAGTTTCATATTTCATACTCCCTCCATCCCACTTTAAGTGGA
GTTTTAGAGAAATTTTTTATTCAATTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1E711TF U 144
AF RS1FH81JQ C 1
AF RS1FH81TF U 1
BS 1 448 RS1FH81TF

RD RS1E711TF 244 0 0
G
ATGTCACAATCAAGCCGCCTCCAAAGTGATTATAGTCTTTGTTTTTCTAAATCGATGGCT
CCAAAAGTTTATGAGAAAATAAATGGTTCCTTCAACGAGGAGCTTCAAGCATGGTTTAAC
TAATTTTTATTACTATATATATCATTATTTCATCCTCTTATGTGTTTAGTAATGGATGTA
TATCTTATAAATAATGTTTCACAAAATAATATTTTTAATGTGAATGAAATGTACTAGTTT
CAT

QA 2 244 2 244
DS 

RD RS1FH81JQ 448 0 0
GGATCAAGAAAAAAGAAGAAAAAAACAAGAACCATTTAAGAGCTTATAAAACAATGGCTA
TCGAAAAGAAAACCCTGATCGCCTCCTTCATCACCATTATGATGATGGTAATGATGATCG
CGAACCAAGTTGAGGCCAGGAACCATGTCACAATCAAGCCGCCTCCAAAGTGATTATAGT
CTTTGTTTTTTTAAATCGATGGCTCCAAAAGTTTATGAGAAAATAAATGGTTCCTTCAAC
GAGGAGCTTCAAGCATGGTTTAACTAATTTTTATTACTATATATATCATTATTTCATCCT
CTTATGTGTTTAGTAATGGATGTATATTTTATAAATAATGTTTCACAAAATAATATTTTT
AATGTGAATGAAATGTACTAGTTTCATATTTCATACTCCCTCCATCCCACTTTAAGTGGA
GTTTTAGAGAAATTTTTTATTCAATTTT

QA 1 448 1 448
DS 

RD RS1FH81TF 448 0 0
GGATCAAGAAAAAAGAAGAAAAAAACAAGAACCATTTAAGAGCTTATAAAACAATGGCTA
TCGAAAAGAAAACCCTGATCGCCTCCTTCATCACCATTATGATGATGGTAATGATGATCG
CGAACCAAGTTGAGGCCAGGAACCATGTCACAATCAAGCCGCCTCCAAAGTGATTATAGT
CTTTGTTTTTCTAAATCGATGGCTCCAAAAGTTTATGAGAAAATAAATGGTTCCTTCAAC
GAGGAGCTTCAAGCATGGTTTAACTAATTTTTATTACTATATATATCATTATTTCATCCT
CTTATGTGTTTAGTAATGGATGTATATCTTATAAATAATGTTTCACAAAATAATATTTTT
AATGTGAATGAAATGTACTAGTTTCATATTTCATACTCCCTCCATCCCACTTTAAGTGGA
GTTTTAGAGAAATTTTTTATTCAATTTT

QA 1 448 1 448
DS 



AS 1 3

CO CL3344Contig1 969 3 3 U
TTTTTTCTTCCCCTTTCTTAGCGATTACCTGAGAATCTCCGATCCTTCCTTCCTTGATCC
TCGCAATGGCTACGTATACAGCTGACGACGACTATGATTTCCTCTACAAGGTGGTACTGA
TCGGAGACTCCGGCGTCGGCAAATCCAACCTCCTCTCTCGATTCACACGCAACGAGTTCA
GCCTCGACTCCAAATCCACCATCGGCGTCGAATTCGCCACCCGAACCATTCACGTCGACG
ACAAAATCGTCAAAGCTCAGATTTGGGACACCGCCGGTCAAGAAAGATACCGAGCGATCA
CTAGCGCATACTATCGAGGAGCTTTAGGAGCATTACTTGTCTACGACGTTACACGGCACG
TGACTTTCGAGAACGTCGAGAGATGGCTCAAGGAGCTTAGAGACCACACCGACGCCAACA
TTGTTATTATGCTCGTTGGGAACAAGGCTGATCTGCGTCACCTTAGGGCTGTTTCAACGG
AAGATGCTACGGCGTTTGCTGAGAGGGAGAAGACTTTCTTTATGGAGACGTCCGCATTGG
AAGCTTTGAACGTTGAGGATGCTTTCACTCAGCTGCTTTCTCAGATATACCGTGTGGCTA
GCAAAAGAGCTTTGGATGTTGGTGATGGTGATGATGGTGATCAGTCTGCTCTCCCTAAAG
GACAGAGTATTCATGTCGGGTCTAAGGGAGATGTGTCTGAGGTTAAGAAGATCGGTTGCT
GCTCGAGTTGATCTCAGTTGTTAGAGGAACTATGTGGTTTTGAGTAAATCTATGGAACGG
ATGATGATTCTCCCTTGTCTTGTTACTTTTGGTGTAAGCTAGTTTCTCGGATCCTTATAA
ATGTTTTATCTATGTGTTACATGATCATATTAGACAATCTATAAACCATTTATCCCTCTG
GTTACATATTGGGCAGATCAAGAACCTGAAGTTTCTGTATAGACTTTCCAAAAGGGTTCT
TTTTTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GI68TF U 1
AF RS1BR31TF U 258
AF RS1BR31JQ C 258
BS 1 579 RS1GI68TF
BS 580 948 RS1BR31TF
BS 949 969 RS1BR31JQ

RD RS1GI68TF 580 0 0
TTTTTTCTTCCCCTTTCTTAGCGATTACCTGAGAATCTCCGATCCTTCCTTCCTTGATCC
TCGCAATGGCTACGTATACAGCTGACGACGACTATGATTTCCTCTACAAGGTGGTACTGA
TCGGAGACTCCGGCGTCGGCAAATCCAACCTCCTCTCTCGATTCACACGCAACGAGTTCA
GCCTCGACTCCAAATCCACCATCGGCGTCGAATTCGCCACCCGAACCATTCACGTCGACG
ACAAAATCGTCAAAGCTCAGATTTGGGACACCGCCGGTCAAGAAAGATACCGAGCGATCA
CTAGCGCATACTATCGAGGAGCTTTAGGAGCATTACTTGTCTACGACGTTACACGGCACG
TGACTTTCGAGAACGTCGAGAGATGGCTCAAGGAGCTTAGAGACCACACCGACGCCAACA
TTGTTATTATGCTCGTTGGGAACAAGGCTGATCTGCGTCACCTTAGGGCTGTTTCAACGG
AAGATGCTACGGCGTTTGCTGAGAGGGAGAAGACTTTCTTTATGGAGACGTCCGCATTGG
AAGCTTTGAACGTTGAGGATGCTTTCACTCAGCTGCTTT
C

QA 1 579 1 579
DS 

RD RS1BR31TF 691 0 0
CAGATTTGGGACACCGCCGGTCAAGAAAGATACCGAGCGATCACTAGCGCATACTATCGA
GGAGCTTTAGGAGCATTACTTGTCTACGACGTTACACGGCACGTGACTTTCGAGAACGTC
GAGAGATGGCTCAAGGAGCTTAGAGACCACACCGACGCCAACATTGTTATTATGCTCGTT
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GCTGAGAGGGAGAAGACTTTCTTTATGGAGACGTCCGCATTGGAAGCTTTGAACGTTGAG
GATGCTTTCACTCAGCTGCTTTCTCAGATATACCGTGTGGCTAGCAAAAGAGCTTTGGAT
GTTGGTGATGGTGATGATGGTGATCAGTCTGCTCTCCCTAAAGGACAGAGTATTCATGTC
GGGTCTAAGGGAGATGTGTCTGAGGTTAAGAAGATCGGTTGCTGCTCGAGTTGATCTCAG
TTGTTAGAGGAACTATGTGGTTTTGAGTAAATCTATGGAACGGATGATGATTCTCCCTTG
TCTTGTTACTTTTGGTGTAAGCTAGTTTCTCGGATCCTTATAAATGTTTTATCTATGTGT
TACATGATCATATTAGACAATCTATAAACCATTTATCCCTCTGGTTACATATTGGGCAGA
TCAAGAACCTGAAGTTTCTGTATAGACTTTC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1BR31JQ 712 0 0
CAGATTTGGGACACCGCCGGTCAAGAAAGATACCGAGCGATCACTAGCGCATACTATCGA
GGAGCTTTAGGAGCATTACTTGTCTACGACGTTACACGGCACGTGACTTTCGAGAACGTC
GAGAGATGGCTCAAGGAGCTTAGAGACCACACCGACGCCAACATTGTTATTATGCTCGTT
GGGAACAAGGCTGATCTGCGTCACCTTAGGGCTGTTTCAACGGAAGATGCTACGGCGTTT
GCTGAGAGGGAGAAGACTTTCTTTATGGAGACGTCCGCATTGGAAGCTTTGAACGTTGAG
GATGCTTTCACTCAGCTGCTTTTTCAGATATACCGTGTGGCTAGCAAAAGAGCTTTGGAT
GTTGGTGATGGTGATGATGGTGATCAGTCTGCTCTCCCTAAAGGACAGAGTATTCATGTC
GGGTCTAAGGGAGATGTGTCTGAGGTTAAGAAGATCGGTTGCTGCTCGAGTTGATCTCAG
TTGTTAGAGGAACTATGTGGTTTTGAGTAAATCTATGGAACGGATGATGATTCTCCCTTG
TCTTGTTACTTTTGGTGTAAGCTAGTTTCTCGGATCCTTATAAATGTTTTATCTATGTGT
TACATGATCATATTAGACAATCTATAAACCATTTATCCCTCTGGTTACATATTGGGCAGA
TCAAGAACCTGAAGTTTCTGTATAGACTTTCCAAAAGGGTTCTTTTTTTGTT

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 3

CO CL3345Contig1 832 3 2 U
GGCGTCAAATTGTTTCGGATTGGTAAAAACTTTATCATTTCACCTGTTATGGTGTGTTAT
TGACAGCTGAAATTAATTATTTTTAAGAGGACCGGGCAAACAAAAACACCTCAACAATAG
TAAAACCAAAACCAATTTTTGGTAGTCGGTAACCAAATGGAAAAAAACCGAAACAAGTGA
TTCAGAGCTTTATCCTGTAGACCAACAGTTATGGTTCTGGATGTGCACGTCGATCCAAGG
TTTATTATGTGGTAATCATCCAAGGTTTCATTTAATCAACCGCTGAATCTTTCTCTCACA
GAAGAAGTCTTCGAACATCCTCAAAGTTTGAACGCAGTTCAGACAGAAACGAAGCTCCAA
CTTGTCCATCAAAGATCCGATGATCAGCGGATAGCGTCACATTCATTTTTGTTACAACCG
AAGGCTTCTCAGTTCCATCTATTCCAAGAATTGCCTCCACAACTTTATTTCCTCTACCAA
CTGCTAGAATTCCAGCCTGAGGGGGGTTAATGATTGTGCAGAATTGGTCCACAGGATACA
TTCCTAGATTTGAAATGCTGAATGTCCCTCCTTGAAACTCATGAGGAGCAAGCTTTCCAG
ATCGCGCCTTTTGTGCCAGCTCCTTAACCTCTGAGGATATAGCAGAAATGGATTTTTGGT
CAGCATTTCTGATAATTGGAGTCATTAAGCCCTTCTCAGTTGCAACTGCAATTGATATGT
CAACATCCTCACACAAAACAATTTCTCCTTTCTCAGCATCCCAGAAAGCATTAGCTTGTC
GTACATTCCTCAGTGCGACTGCCACTGCTTTAATAACTATGTCATTGACCGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1DH88JQ U 1
AF RS1DH88TF C 136
AF RS1BI53JQ U 41
BS 1 616 RS1DH88JQ
BS 617 832 RS1BI53JQ

RD RS1DH88JQ 616 0 0
GGCGTCAAATTGTTTCGGATTGGTAAAAACTTTATCATTTCACCTGTTATGGTGTGTTAT
TGACAGCTGAAATTAATTATTTTTAAGAGGACCGGGCAAACAAAAACACCTCAACAATAG
TAAAACCAAAACCAATTTTTGGTAGTCGGTAACCAAATGGAAAAAAACCGAAACAAGTGA
TTCAGAGCTTTATCCTGTAGACCAACAGTTATGGTTCTGGATGTGCACGTCGATCCAAGG
TTTATTATGTGGTAATCATCCAAGGTTTCATTTAATCAACCGCTGAATCTTTCTCTCACA
GAAGAAGTCTTCGAACATCCTCAAAGTTTGAACGCAGTTCAGACAGAAACGAAGCTCCAA
CTTGTCCATCAAAGATCCGATGATCAGCGGATAGCGTCACATTCATTTTTGTTACAACCG
AAGGCTTCTCAGTTCCATCTATTCCAAGAATTGCCTCCACAACTTTATTTCCTCTACCAA
CTGCTAGAATTCCAGCCTGAGGGGGGTTAATGATTGTGCAGAATTGGTCCACAGGATACA
TTCCTAGATTTGAAATGCTGAATGTCCCTCCTTGAAACTCATGAGGAGCAAGCTTTCCAG
ATCGCGCCTTTTGTGC

QA 1 616 1 616
DS 

RD RS1DH88TF 624 0 0
TTTTTGGTAGTCGGTAACCAAATGGAAAAAAACCGAAACAAGTGATTCAGAGCTTTATCC
TGTAGACCAACAGTTATGGTTCTGGATGTGCACGTCGATCCAAGGTTTATTATGTGGTAA
TCATCCAAGGTTTCATTTAATCAACCGCTGAATCTTTCTCTCACAGAAGAAGTCTTCGAA
CATCCTCAAAGTTTGAACGCAGTTCAGACAGAAACGAAGCTCCAACTTGTCCATCAAAGA
TCCGATGATCAGCGGATAGCGTCACATTCATTTTTGTTACAACCGAAGGCTTCTCAGTTC
CATCTATTCCAAGAATTGCCTCCACAACTTTATTTCCTCTACCAACTGCTAGAATTCCAG
CCTGAGGGGGGTTAATGATTGTGCAGAATTGGTCCACAGGATACATTCCTAGATTTGAAA
TGCTGAATGTCCCTCCTTGAAACTCATGAGGAGCAAGCTTTCCAGATCGCGCCTTTTGTG
CCAGCTCCTTAACCTCTGAGGATATAGCAGAAATGGATTTTTGGTCAGCATTTCTGATAA
TTGGAGTCATTAAGCCCTTCTCAGTTGCAACTGCAATTGATATGTCAACATCCTCACACA
AAACAATTTCTCCTTTCTCAGCA
C

QA 1 623 1 623
DS 

RD RS1BI53JQ 792 0 0
CG
CCTGTTATGGTGTGTTATTGACAGCTGAAATTAATTATTTTTAAGAGGACCGGGCAAACA
AAAACACCTCAACAATAGTAAAACCAAAACCAATTTTTGGTAGTCGGTAACCAAATGGAA
AAAAACCGAAACAAGTGATTCAAAGCTTTATCCTGTAAACCAACAGTTATGGTTCTGGAT
GTGCACGTCGATCCAAGGTTTATTATGTGGTAATCATCCAAGGTTTCATTTAATCAACCG
CTGAATCTTTCTCTCACAGAAAAAGTCTTCGAACATCCTCAAAGTTTGAACGCAGTTCAA
ACAGAAACGAAGCTCCAACTTGTCCATCAAAGATCCGATGATCAGCGGATAGCGTCACAT
TCATTTTTGTTACAACCGAAGGCTTCTCAGCTCCATCTATTCCAAGAATTGCCTCCACAA
CTTTATTTCCTCTACCAACTGCTAAAATTCCGGCCTGAGGGGGGTTAATGATTGCGCAAA
ATTGGTCCACAGGATACATTCTTAAATTTGAAATGCTGAATGTCCCTCCTTGAAACTCAT
GAGGAGCAAGCTTTCCAGATCGCGCCTTTTGTGCCAGCTCCTTAACCTCTGAGGATATAG
CAGAAATGGATTTTTGGTCAGCATTTCTGATAATTGGAGTCATTAAGCCCTTCTCAGTTG
CAACTGCAATTGATATGTCAACATCCTCACACAAAACAATTTCTCCTTTCTCAGCATCCC
AGAAAGCATTAGCTTGTCGTACATTCCTCAGTGCGACTGCCACTGCTTTAATAACTATGT
CATTGACCGA

QA 3 792 3 792
DS 



AS 1 3

CO CL3346Contig1 892 3 5 U
GTCATTGGCCTTTCTCTATATAAAGCTCACGGATCGAGAGGGACAAGATACACCACTTAA
ACGATCAGACAATTAAGTTTATTTGTCGGAAAATGGACGATATCAACCAAGAACTCAACA
ATTACTGGGAACCCAACTCCTTCCTCCAAAACGAAGAGTTTGAATATGACAGCTGGCCGT
TGGAGGAAGCTATTTCCGGATCATATGATTCGAGTTCGCCTGACGGTGCGGCTACGTCTC
CGGCTTCAAAGAATATTGTGTTGGAGAGAAACAGAAGGCAAAAGCTTAACCAGAGGCTCT
TTGCTCTTCGAGCAGTTGTTCCTAATATCACTAAGATGGATAAAGCATCAATACTCAAAG
ATGCTATAAGTTACATACAAGGATTACAATATGAAGAAACGAAGCTCGAAGCTGAGATCA
GAGAACTTGAATCTACACCAAAGAGTAGCCTGAGTTTTGGTAAAGATTTTGACCGTGACT
T***GGTTCCTGTCACATCTAAGCGAATGAAGCAGCTTGATTCTGGTTCTTCCCGTTCTC
TCATCGAAGTTCTTGAATTGAAGGTAACATTCATGGGAGAGAGGACAATGGTGGTGAATG
TAACATGTGATAAGAGAACAGATACAATGGTGAAACTGTGTGAAGTTCTTGAGTCATTGA
ATCTCATAATCATCACTTCCAATCTCAACTCTTTCTCCGGCATGATCTTCAACACTCTCT
TCATTGAGGCGGATGAAGAAGAACAAGAGGTGTTGAGGTTGAAAATAGAATCAGGAATAG
GAGCTTATAATGGAGCTCAGAGCCCTACTTGTAGCATGGACTCTCTATACTAAAAAGTTT
GTGTTTTGAATTATCTCTACAAAAAATAGTATATATTTTTCATTTTTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EB67TF U 1
AF RS1BW66TF U 60
AF RS1EB67JQ C 437
BS 1 368 RS1EB67TF
BS 369 370 RS1BW66TF
BS 371 720 RS1EB67TF
BS 721 770 RS1BW66TF
BS 771 892 RS1EB67JQ

RD RS1EB67TF 720 0 0
GTCATTGGCCTTTCTCTATATAAAGCTCACGGATCGAGAGGGACAAGATACACCACTTAA
ACGATCAGACAATTAAGTTTATTTGTCGGAAAATGGACGATATCAACCAAGAACTCAACA
ATTACTGGGAACCCAACTCCTTCCTCCAAAACGAAGAGTTTGAATATGACAGCTGGCCGT
TGGAGGAAGCTATTTCCGGATCATATGATTCGAGTTCGCCTGACGGTGCGGCTACGTCTC
CGGCTTCAAAGAATATTGTGTTGGAGAGAAACAGAAGGCAAAAGCTTAACCAGAGGCTCT
TTGCTCTTCGAGCAGTTGTTCCTAATATCACTAAGATGGATAAAGCATCAATACTCAAAG
ATGCTATAT*TTACATACAAGGATTACAATATGAAGAAACGAAGCTCGAAGCTGAGATCA
GAGAACTTGAATCTACACCAAAGAGTAGCCTGAGTTTTGGTAAAGATTTTGACCGTGACT
T***GGTTCCTGTCACATCTAAGCGAATGAAGCAGCTTGATTCTGGTTCTTCCCGTTCTC
TCATCGAAGTTCTTGAATTGAAGGTAACATTCATGGGAGAGAGGACAATGGTGGTGAATG
TAACATGTGATAAGAGAACAGATACAATGGTGAAACTGTGTGAAGTTCTTGAGTCATTGA
ATCTCATAATCATCACTTCCAATCTCAACTCTTTCTCCGGCATGATCTTCAACACTCTCT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RS1BW66TF 711 0 0
AACGATCAGACAATTAAGTTTATTTGTCGGAAAATGGACGATATCAACCAAGAACTCAAC
AATTACTGGGAACCCAACTCCTTCCTCCAAAACGAAGAGTTTGAATATGACAGCTGGCCG
TTGGAGGAAGCTATTTCCGGATCATATGATTCGAGTTCGCCTGACGGTGCGGCTACGTCT
CCGGCTTCAAAGAATATTGTGTTGGAGAGAAACAGAAGGCAAAAGCTTAACCAGAGGCTC
TTTGCTCTTCGAGCAGTTGTTCCTAATATCACTAAGATGGATAAAGCATCAATACTCAAA
GATGCTATAAGTTACATACAAGGATTACAATATGAAGAAACGAAGCTCGAAGCTGAGATC
AGAGAACTTGAATCTACACCAAAGAGTAGCCTGAGTTTTGGTAAAGATTCTGACCGTGAC
TTACTGGTTCCTGTCACATCTAAGCGAATGAAGCAGCTTGATTCTGGTTCTTCCCGTTCT
CTCATCGAAGTTCTTGAATTGAAGGTAACATTCATGGGAGAGAGGACAATGGTGGTGAAT
GTAACATGTGATAAGAGAACAGATACAATGGTGAAACTGTGTGAAGTTCTTGAGTCATTG
AATCTCATAATCATCACTTCCAATCTCAACTCTTTCTCCGGCATGACCTTCAACACTCTC
TTCATTGAGGCGGATGAAGAAGAACAAGAGGTGTTGAGGTTGAAAATAGAA

QA 1 711 1 711
DS 

RD RS1EB67JQ 456 0 0
ACCAAAGAGTAGCCTGAGTTTTGGTAAAGATTTTGACCGTGACTT***GGTTCCTGTCAC
ATCTAAGCGAATGAAGCAGCTTGATTCTGGTTCTTCCCGTTCTTTCATCGAAGTTCTTGA
ATTGAAGGTAACATTCATGGGAGAGAGGACAATGGTGGTGAATGTAACATGTGATAAGAG
AACAGATACAATGGTGAAACTGTGTGAAGTTCTTGAGTCATTGAATCTCATAATCATCAC
TTCCAATCTCAACTCTTTTTCCGGCATGATTTTCAACACTCTCTTCATTGAGGCGGATGA
AGAAGAACAAGAGGTGTTGAGGTTGAAAATAGAATCAGGAATAGGAGCTTATAATGGAGC
TCAGAGCCCTACTTGTAGCATGGACTCTCTATACTAAAAAGTTTGTGTTTTGAATTATCT
CTACAAAAAATAGTATATATTTTTCATTTTTTCTCC

QA 1 456 1 456
DS 



AS 1 3

CO CL3347Contig1 441 3 2 U
GGGCGGAAACAAAATATCTGAACTCCTGATACTAGCTAGTCCTCTTTATACTAGCTAGTC
ATTATTTAACCCTCCAAAAATGAATACTAACTCATCTAAATCGATCTTTTTCTTGCTAGC
CCTAATCCTCACGGCATTGGTGTTCCAACAATCGGAAGTAGCTGCTAAGATGAAGTATTG
TTCGGCCATCGATAAAGAACCGGGATGTCATGATTCTTTGAAATTAGCGGCGGCAAATGA
TTTCAGATGGCTAGGAAAAGACTGTTGCAAAGTGGTGTACTCAATATCTGAACCTTGCTT
CTTGGATGTCTTGTATGGCCAAAATTTGAATATTAATACCTTAAAAAGCATCTGTGTTAA
TATTGTCGGACCAATATAACTTTTTGCGTAACCCATCTTTTCAGTGATATCTATAATAAT
AAAAGTGAAATTAAAGCTTTT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RS1GV90JQ C 1
AF RS1GV90TF U 1
AF RS1H594TF U 1
BS 1 438 RS1GV90TF
BS 439 441 RS1GV90JQ

RD RS1GV90JQ 441 0 0
GGGCGGAAACAAAATATTTGAACTCCTGATACTAGCTAGTCCTCTTTATACTAGCTAGTC
ATTATTTAACCCTCCAAAAATGAATACTAACTCATTTAAATCGATCTTTTTCTTGCTAGC
CCTAATCCTCACGGCATTGGTGTTCCAACAATCGGAAGTAGCTGCTAAGATGAAGTATTG
TTCGGCCATCGATAAAGAACCGGGATGTCATGATTTTTTGAAATTAGCGGCGGCAAATGA
TTTCAGATGGCTAGGAAAAGACTGTTGCAAAGTGGTGTACTCAATATTTGAACCTTGCTT
TTTGGATGTCTTGTATGGCCAAAATTTGAATATTAATACCTTAAAAAGCATCTGTGTTAA
TATTGTCGGACCAATATAACTTTTTGCGTAACCCATCTTTTCAGTGATATCTATAATAAT
AAAAGTGAAATTAAAGCTTTT

QA 1 441 1 441
DS 

RD RS1GV90TF 441 0 0
GGGCGGAAACAAAATATCTGAACTCCTGATACTAGCTAGTCCTCTTTATACTAGCTAGTC
ATTATTTAACCCTCCAAAAATGAATACTAACTCATCTAAATCGATCTTTTTCTTGCTAGC
CCTAATCCTCACGGCATTGGTGTTCCAACAATCGGAAGTAGCTGCTAAGATGAAGTATTG
TTCGGCCATCGATAAAGAACCGGGATGTCATGATTCTTTGAAATTAGCGGCGGCAAATGA
TTTCAGATGGCTAGGAAAAGACTGTTGCAAAGTGGTGTACTCAATATCTGAACCTTGCTT
CTTGGATGTCTTGTATGGCCAAAATTTGAATATTAATACCTTAAAAAGCATCTGTGTTAA
TATTGTCGGACCAATATAACTTTTTGCGTAACCCATCTTTTCAGTGATATCTATAATAAT
AAAAGTGAAATTAAAGCT
CTT

QA 1 438 1 438
DS 

RD RS1H594TF 441 0 0
GGGCGGAAACAAAATATCTGAACTCCTGATACTAGCTAGTCCTCTTTATACTAGCTAGTC
ATTATTTAACCCTCCAAAAATGAATACTAACTCATCTAAATCGATCTTTTTCTTGCTAGC
CCTAATCCTCACGGCATTGGTGTTCCAACAATCGGAAGTAGCTGCTAAGATGAAGTATTG
TTCGGCCATCGATAAAGAACCGGGATGTCATGATTCTTTGAAATTAGCGGCGGCAAATGA
TTTCAGATGGCTAGGAAAAGACTGTTGCAAAGTGGTGTACTCAATATCTGAACCTTGCTT
CTTGGATGTCTTGTATGGCCAAAATTTGAATATTAATACCTTAAAAAGCATCTGTGTTAA
TATTGTCGGACCAATATAACTTTTTGCGTAACCCATCTTTTCAGTGATATCTATAATAAT
AAAAGTGAAATTAAAGCT
CTT

QA 1 438 1 438
DS 



AS 1 2

CO CL3348Contig1 517 2 2 U
GGCCTTTCACATCGTTTAACTCAAACACTGATATCTGGAATTCGAGTCGGTATGACGCTA
GGGTTGTTATCAGCGATTGGAAGATCATTCCGAAGAAAGCGAGCGTCTTCTCTTGATATT
CTCTCTCCCAAACGAGCTCCCAGAGATTTCTACAAGGGCAAAAACTGCAAACCTACTGGT
TTCCACACCAAAAAAGGAGGATATGTTGTGCAGCCTGATAAATTACCAAACTACGTAATC
CCTGATCTCACCGGCTTTAAGCTGAAACCATATGTGTCTCAGTGCCCTATAGAGGTCAAC
AAAACAACTGAAGCTTCCAAGTGAAACATGTCGGAAGAAAATATGTTTCGAGCCTTAGTA
AGCTTAAAGTTAAGCAATTTGTGTTTGTTGCGAAATTCGTATTTTTTTTCTTCAAGGACT
TCAAGCAACTTGTGACAACTTTTGAGTTATTAATGTTTACTCTCTCTACCATATAAGACT
TTTTAAATTTGATAAGAAGCACAGAGATATTGTTGCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DT40JQ C 1
AF RS1DT40TF U 1
BS 1 2 RS1DT40JQ
BS 3 517 RS1DT40TF

RD RS1DT40JQ 517 0 0
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GGGTTGTTATCAGCGATTGGAAGATCATTCCGAAGAAAGCGAGCGTCTTCTCTTGATATT
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AAAACAACTGAAGCTTCCAAGTGAAACATGTCGGAAGAAAATATGTTTCGAGCCTTAGTA
AGCTTAAAGTTAAGCAATTTGTGTTTGTTGCGAAATTCGTATTTTTTTTCTTCAAGGACT
TCAAGCAACTTGTGACAACTTTTGAGTTATTAATGTTTACTCTCTCTACCATATAAGACT
TTTTAAATTTGATAAGAAGCACAGAGATATTGTTGCC

QA 1 517 1 517
DS 

RD RS1DT40TF 517 0 0
GG
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GTTGTTATCAGCGATTGGAAGATCATTCCGAAGAAAGCGAGCGTCTTCTCTTGATATTCT
CTCTCCCAAACGAGCTCCCAGAGATTTCTACAAGGGCAAAAACTGCAAACCTACTGGTTT
CCACACCAAAAAAGGAGGATATGTTGTGCAGCCTGATAAATTACCAAACTACGTAATCCC
TGATCTCACCGGCTTTAAGCTGAAACCATATGTGTCTCAGTGCCCTATAGAGGTCAACAA
AACAACTGAAGCTTCCAAGTGAAACATGTCGGAAGAAAATATGTTTCGAGCCTTAGTAAG
CTTAAAGTTAAGCAATTTGTGTTTGTTGCGAAATTCGTATTTTTTTTCTTCAAGGACTTC
AAGCAACTTGTGACAACTTTTGAGTTATTAATGTTTACTCTCTCTACCATATAAGACTTT
TTAAATTTGATAAGAAGCACAGAGATATTGTTGCC

QA 3 517 3 517
DS 



AS 1 3

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AAAAGAATGGAATTAGTTGAAGAGATGGGTGAAAAAAGAGTTGTGGTTGACAAAGCTTTT
CTCTACGAAGAAGACAAACCACTTACCGTCTGCAAAACCTCTCTGTTCCACACCGGTGAT
GGTTTCGCCGCCTACGACTGTCACGGCGATATCATCTTT*AGGGTCGATTCATACGGACC
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GGACGCGTCAACGAACGTGATGCTTGGACGTGATGTGTTCACTCTAGAGATTAAACCTGT
TTTCGACGGCGCTTTCGCGATGGGTTTGGTCCTTGTGCTTGACCAAATTAACGGTGATGA
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ATAAATTTGTTGACTATATGTGATATTTTACAAGTTTATTTTGTCAAATAATTTTATGAT
ATATACAGAAACTGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DE56TF U 1
AF RS1C386TF U 84
AF RS1DE56JQ C 167
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GGAAGTAGAGGTTTACGACGAAACCGGAGAAGAGTACACCATAGATGGTGACTTCTCGCA
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GGACGCGTCAACGAACGTGATGCTTGGACGTGATGTGTTCACTCTAGAGATTAAACCTGT
TTTCGACGGCGCTTTCGCGATGGGTTTGGTCCT

QA 1 633 1 633
DS 

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TTGGACGCGATGTGTTCACTCTAGAGATTAAACCTGGTTTCGACGGCGCTTTCGCGATGG
GTTTGGTCCTTGTGCTTGACCAAATTAACGGTGATGATCCAGTTGAGATTGGTGATGA

QA 1 598 1 598
DS 

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GGACGGTGCACGATGGAAGTAGAGGTTTACGACGAAACCGGAGAAGAGTACACCATAGAT
GGTGACTTCTCGCAACGAAGCTGTTTCATATACGACACGAAGAAGCGAACTGTGGCTGAG
ATCAAACGCAAAGTGGACGCGTCAACGAACGTGATGCTTGGACGTGATGTGTTCACTCTA
GAGATTAAACCTGTTTTCGACGGCGCTTTCGCGATGGGTTTGGTCCTTGTGCTTGACCAA
ATTAACGGTGATGATCCAGTTGAGATAGGTGATGAACAGGTGCACCCTTTTGTAGAGGAC
ATTTGAAGCTGTTTGTGTATCATTATGTGTAAAAACACAAAGTTGTTACGTTGCATATTA
TATAGCCTGTCTCTATAAATTTGTTGACTATATGTGATATTTTACAAGTTTATTTTGTCA
AATAATTTTATGATATATACAGAAACTGTTTT

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 3

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AACCATCATCGTTCGCAGGAACTACCTCCACTTCGTGAAGAAGTATCAGAGGTATGAGAA
GAGACACTCCAACATCCCTGCTCACGTCTCGCCCTGCTTCCGTGTCAAAGAAGGTGATCA
TGTCATCATTGGCCAGTGCAGGCCCTTGTCGAAGACGGTGAGGTTCAATGTGCTGAAGGT
GATCCCAGCGGGCGCATCCGCCTTTGCTAAGAAGGCATTCACTGGAATGTAAGAGCTTTT
TTTGAAGTATTGTTGTTACTTTTGCTTGGTTTTGATTTTGGAATCTGAAATGACTACTTT
CATCTTTTTTTTATCTTCGGTATCTCTAGAAATCAACTACATTTTGTCTACTTGATCAGA
AAACCTTATGCAA


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RS1D796TF U 21
AF RS1A643JQ C 1
AF RS1A643TF U 1
BS 1 673 RS1A643TF

RD RS1D796TF 595 0 0
GG
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AAGCAACCCAAGGTCTTCCTAAGCTCCAAGACATCAGGGAAAGGAAAGAGACCTGGCAAA
GGCGGAAACCGTTTCTCGAAGAACATTGGTTTGGGCTTCAAGACTCCCCGTGAAGCCATT
GAAGGAACTTACATTGATAGGAAATGTCCATTCACTGGAACCGTCTCTGTAAGAGGACGT
ATCTTAGCTGGTACTTGCCACAGTGCTAAGATGCAGAGAACCATCATCGTTCGCAGGAAC
TACCTCCACTTCGTGAAGAAGTATCAGAGGTATGAGAAGAGACACTCCAACATCCCTGCT
CACGTCTCGCCCTGCTTCCGTGTCAAAGAAGGTGATCATGTCATCATTGGCCAGTGCAGG
CCCTTGTCGAAGACGGTGAGGTTCAAT*TGCTGAAGGTGATCCCAGCGGGCGCATCCGCC
TTTGCTAAGAAGGCATTCACTGGAATGTAAGAGCTTTTTTTGAAGTATTGTTGTTACTTT
TGCTTGGTTTTGATTTTGGAATCTGAAATGACTACTTTCATCTTTTTTTTATC

QA 3 595 3 595
DS 

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CAAGACTCCCCGTGAAGCCATTGAAGGAACTTACATTGATAGGAAATGTCCATTCACTGG
AACCGTCTCTGTAAGAGGACGTATCTTAGCTGGTACTTGCCACAGTGTTAAGATGCAGAG
AACCATCATCGTTCGCAGGAACTACCTCCACTTCGTGAAGAAGTATCAGAGGTATGAGAA
GAGACACTCCAACATCCCTGCTCACGTCTCGCCCTGCTTCCGTGTCAAAGAAGGTGATCA
TGTCATCATTGGCCAGTGCAGGCCCTTGTCGAAGACGGTGAGGTTCAATGTGCTGAAGGT
GATCCCAGCGGGCGCATCCGCCTTTGCTAAGAAGGCATTCACTGGAATGTAAGAGCTTTT
TTTGAAGTATTGTTGTTACTTTTGCTTGGTTTTGATTTTGGAATCTGAAATGACTACTTT
CATCTTTTTTTTATCTTCGGTATCTCTAGAAATCAACTACATTTTGTCTACTTGATCAGA
AAACCTTAT

QA 1 669 1 669
DS 

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ACAGACTGAGAAGGCTTTTCTTAAGCAACCCAAGGTCTTCCTAAGTTCCAAGACATCAGG
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CAAGACTCCCCGTGAAGCCATTGAAGGAACTTACATTGATAGGAAATGTCCATTCACTGG
AACCGTCTCTGTAAGAGGACGTATCTTAGCTGGTACTTGCCACAGTGCTAAGATGCAGAG
AACCATCATCGTTCGCAGGAACTACCTCCACTTCGTGAAGAAGTATCAGAGGTATGAGAA
GAGACACTCCAACATCCCTGCTCACGTCTCGCCCTGCTTCCGTGTCAAAGAAGGTGATCA
TGTCATCATTGGCCAGTGCAGGCCCTTGTCGAAGACGGTGAGGTTCAATGTGCTGAAGGT
GATCCCAGCGGGCGCATCCGCCTTTGCTAAGAAGGCATTCACTGGAATGTAAGAGCTTTT
TTTGAAGTATTGTTGTTACTTTTGCTTGGTTTTGATTTTGGAATCTGAAATGACTACTTT
CATCTTTTTTTTATCTTCGGTATCTCTAGAAATCAACTACATTTTGTCTACTTGATCAGA
AAACCTTATGCAA

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

CO CL3351Contig1 865 2 2 U
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AAACGACTTTGTTTAAATCTCATCATCATCATCATCATCTGGGTCATTGAAAGTCCAGAT
CTATCGGAGCTGATCCACTCTCCTTTACTCCAATCGATGGGAGCAGTGGCTGCTTGGCTT
GCTACAGAGAACCTGAAACTATAAAGGATCCACTTTCCAATCCCATAGCTCAAACTGTTA
AGAAACCGAGCGTATCTGAAGATTTCTGGTCAACAAGCACGGTTGATATGGACAACATCG
CCTTCCCTTCTCAGGGAGGAAGCATATCATCATCAAACCAGACTTTTGATTCTCAATCTG
TTGCCAGAAACTCAGATCCCCCTCCTGAGTTTGTAAACCAAGGTCTTCTTGTTTGGAATC
AGACAAGGGAGCGTTGGGTGGGCAAAGAAAGACGTAATAATAACCCACCGGATCGCAATC
GTGGATCCAAGATAGATTGGAACGCAGCATCGTATGATAGTTTGCTGGGGAGTAACAAGT
TATTTCCTCAACCCATCCCTCTCAATGAAATGGTGGATTTTTTGGTGGAGATTTGGGAAC
AAGATGGTCTATATGATTGATACACACATACATACACTGGTTCTGATTTTTGTTTGTTCC
TTTTATCCCTTGCTGTGATCTTCCATTTGGTATTGGTCGACCAAACTGGGGGATGTGGCT
CATATCATATGTTTTCACCGTAAATGAGAAAAATCTCTTATTGTACCCCCACTATCTTGA
AGTAAAAAAAAAAGGGTTTAGAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DZ13TF U 1
AF RS1DZ13JQ C 318
BS 1 569 RS1DZ13TF
BS 570 865 RS1DZ13JQ

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CCTTCCCTTCTCAGGGAGGAAGCATATCATCATCAAACCAGACTTTTGATTCTCAATCTG
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GTGGATCCAAGATAGATTGGAACGCAGCA

QA 1 569 1 569
DS 

RD RS1DZ13JQ 548 0 0
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CCCCCTCCTGAGTTTGTAAACCAAGGTCTTCTTGTTTGGAATCAGACAAGGGAGCGTTGG
GTGGGCAAAGAAAGACGTAATAATAACCCACCGGATCGCAATCGTGGATCCAAGATAGAT
TGGAACGCAGCATCGTATGATAGTTTGCTGGGGAGTAACAAGTTATTTCCTCAACCCATC
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TGATACACACATACATACACTGGTTCTGATTTTTGTTTGTTCCTTTTATCCCTTGCTGTG
ATCTTCCATTTGGTATTGGTCGACCAAACTGGGGGATGTGGCTCATATCATATGTTTTCA
CCGTAAATGAGAAAAATCTCTTATTGTACCCCCACTATCTTGAAGTAAAAAAAAAAGGGT
TTAGAACT

QA 1 548 1 548
DS 



AS 1 3

CO CL3352Contig1 763 3 6 U
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GACGACGATGATGATGATGAAGATTCGGAAGAGAAATTATATCCAAACAAAACTTCGTCG
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TAGACACAACAAACAACCGGTCAAGCATATATGTGCAGAGCTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FU82TF U 1
AF RS1BU17TF U 51
AF RS1GX13TF U 1
BS 1 569 RS1FU82TF
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RD RS1FU82TF 603 0 0
GGAACTTTCATAGAAGAGTTCCTTAGGGTTAACTCAACAATGGTGGATCCAGTGATGGTT
TCTTCAAACAACAAACCTATCTTCTTCACAGATCTGTCTGGACAAAACTCCATTCCTATG
ATTCCGGATTCGTTTATTTCGAATCACGTGAAGGGTAAAACTCAGTCAACGAAACTGAAA
CTGACTACAGATGTTTCGGACAGATCGTGGGAAGTTGAACTGGACGGTCAGAGATTCGCT
CGCGGGTGGAACCAATTCTCGATTGACCATGGTGTCCGAAAGGACGACGTTTTGAGTTTC
AGGCACGACGGCGACATGGTTTTCCACGTCACGCCCTTTGGCCGTAGTTTCTCTCGTCAG
ATACTACAGTTCGCCTCTTCTACCTCTGAAGATGAAAATGAAGACGATGAACATAATATC
TTTGATGATGATGTTTTTGATGAAGACGACGACGAGGAGCATGCCGATGCTGGAGATGAT
GACGACGATGATGATGATGAAGATTCGGAAGAGAAATTATATCCAAACAAAACTTCGTCG
AAGAAGAGAGCAATAACAGAAACAGAGAAACTCTTACCTCCTTGCGCACGTCACATCTTC
AAC

QA 1 603 1 603
DS 

RD RS1BU17TF 635 0 0
AGTGATGGTTTCTTCAAACAACAAACCTATCTTCTTCACAGATCTGTCTGGACAAAACTC
CATTCCTATGATTCCGGATTCGTTTATTTCGAATCACGTGAAGGGTAAAACTCAGTCAAC
GAAACTGAAACTGACTACAGATGTTTCGGACAGATTGTGGGAAGTTGAACTGGACGGTCA
GAGATTCGCTCGCGGGTGGAAACAATTCTCGATTGACCATGGTGTCCGAAAGGACGACGT
TTTGAGTTTCAGGCACGACGGCGACATGGTTTTCCACGTCACGCCCTTTGGCCGTAGTTT
CTCTCGTCAGATACTACAGTTCGCCTCTTCTACCTCTGAAGATGAAAATGAAGACGATGA
ACATAATATCTTTGATGATGATGTTTTTGATGAAGACGACGACGAGGAGCATGCCGATGC
TGGAGATGATGATGACGATGATGATGATGAAGATTCGGAAGAGGAATTATATCCAAACAA
AACTTCGTCGAAGAAGAGAGCAATAACAGAAACAGAGAA*CTCTTACCTTCTTGCGCACG
TCACATCTTCAACCCTAAGCCGAAGTCACCTGTGTCTTTCAAACAACTTTGCTAGGTCAA
TTGGTCTGA*CAACAGACACTGTGAGATTGATCTA

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1GX13TF 763 0 0
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TCTTCAAACAACAAACCTATCTTCTTCACAGATCTGTCTGGACAAAACTCCATTCCTATG
ATTCCGGATTCGTTTATTTCGAATCACGTGAAGGGTAAAACTCAGTCAACGAAACTGAAA
CTGACTACAGATGTTTCGGACAGATCGTGGGAAGTTGAACTGGACGGTCAGAGATTCGCT
CGCGGGTGGAACCAATTCTCGATTGACCATGGTGTCCGAAAGGACGACGTTTTGAGTTTC
AGGCACGACGGCGACATGGTTTTCCACGTCACGCCCTTTGGCCGTAGTTTCTCTCGTCAG
ATACTACAGTTCGCCTCTTCTACCTCTGAAGATGAAAATGAAGACGATGAACATAATATC
TTTGATGATGATGTTTTTGATGAAGACGACGACGAGGAGCATGCCGATGCTGGAGATGAT
GACGACGATGATGATGATGAAGATTCGGAAGAGAAATTATATCCAAACAAAACTTCGTCG
AAGAAGAGAGCAATAACAGAAACAGAGAA*CTCTTACCTCCTTGCGCACGTCACATCTTC
AACCCTAAGCCGAAGTCACCTGTGTCTTTCAA*CAACTTTGCTAGGTCAAATGGTCTGAA
CAACAGACACTGTGAGATTGATCTACTCAACGAAGATGGCAAATCTTGGACATTGGATCT
TAGACACAACAAACAACCGGTCAAGCATATATGTGCAGAGCTG

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 3

CO CL3353Contig1 1243 3 7 U
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TTTGTGACAGACAGTGAGAAAATGTCAGTTGAGTTCGACAATTGCAAGTTGCTTCTTGTT
GACAAGAAAATTACCAATGCAAGAGATCTTGTTGGTGTTCTGGAGGATGCGATTAGAGGA
GGATACCCAATTTTAATTATTGCAGAAGACATTGAGCAGGAGGCTTTAGCGACCCTTGTT
GTTAACAAGCTCAGAGGCACACTGAAGATTGCAGCTCTCAAAGCTCCAGGTTTTGGAGAG
CGCAAGAGCCAGTACCTTGATGATATTGCCACTCTCACTGGAGCAACTGTGATACGTGAG
GAAGTTGGTCTTTCACTTGACAAAGCTGGAAAAGAGGTTCTTGGTAATGCCGCAAAGGTC
GTCCTCACGAAGGAGACTTCGACCATTGTAGGTGATGGGACAACACAAGACGCAGTGCAA
AAGCGTGTTACACAGATTAAGAATCTTATTGAGCAAGCAGAGCAAGATTATGAGAAGGAA
AAACTGAATGAGAGAATTGCAAAGCTCTCTGGTGGAGTTGCTGTTATTCAGGTGGGAACA
CAAACAGAGACAGAACTCAAAGAGAAGAAACTGAGAGTTGAAGATGCTCTTAATGCTACA
AAGGCTGCTGTCGAGGAAGGTATTGTTGTTGGTGGTGGTTGTACTCTCCTTCGGCTTGCT
TCCAAGGTTGATGCCATTAAAGCCGCCCTTGAAAATGATGAAGAAAAGGTAGGTGCGGAT
ATCGTGAAAAGAGCACTGAGTTATCCTCTGAAACTTATTGCCAAGAATGCTGGAGTTAAT
GGAAGCGTAGTTAGCGAGAAGGTGCTTTCTAACGATAACGTGAAATACGGCTACAATGCT
GCAACCGGCAAGTACGAGGATTTAATGGCTGCAGGAATCATTGATCCAACAAAGGTTGTG
AGATGTTGCTTGGAACATGCAGCTTCTGTTGCGAAGACATTCTTGATGTCAGACTGTGTC
GTTGTTGAGATAAAGGAACCTGAGCCAGCTCCTGTAGGCAACCCAATGGACAACTCAGGA
TATGGATACTGAGGAGAGACGGGAACAAAGTAACTCTACCGGAAACAGATTCCTTTTGAG
CTTGCAATAGATGAGAGCTAAGTGTTAATGACTTTGAACTAAGAGAATGTGATGTGTGTA
CTGAAATTTTGAATCAATCTTATGAATAAAATCATGATTCCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A493TF U 1
AF RS1GX48TF U 185
AF RS1A493JQ C 406
BS 1 251 RS1A493TF
BS 252 252 RS1GX48TF
BS 253 663 RS1A493TF
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BS 855 1243 RS1A493JQ

RD RS1A493TF 680 0 0
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TTTGTGACAGACAGTGAGAAAATGTCAGTTGAGTTCGACAATTGCAAGTTGCTTCTTGTT
GACAAGAAAATTACCAATGCAAGAGATCTTGTTGGTGTTCTGGAGGATGCGATTAGAGGA
GGATACCCAATTTTAATTATTGCAGAAGACATTGAGCAGGAGGCTTTAGCGACCCTTGTT
GTTAACAAGCTTAGAGGCACACTGAAGATTGCAGCTCTCAAAGCTCCAGGTTTTGGAGAG
CGCAAGAGCCAGTACCTTGATGATATTGCCACTCTCACTGGAGCAACTGTGATACGTGAG
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GTCCTCACGAAGGAGACTTCGACCATTGTAGGTGATGGGACAACACAAGACGCAGTGCAA
AAGCGTGTTACACAGATTAAGAATCTTATTGAGCAAGCAGAGCAAGATTATGAGAAGGAA
AAACTGAATGAGAGAATTGCAAAGCTCTCTGGTGGAGTTGCTGTTATTCAGGTGGGAACA
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AAG*CTGCTGTCGAGGA
GGT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RS1GX48TF 670 0 0
G
CCCAATTTTAATTATTGCAGAAGACATTGAGCAGGAGGCTTTAGCGACCCTTGTTGTTAA
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GAGCCAGTATCTTGATGATATTGCCATTCTCACTGGAGCAACTGTGATACGTGAGGAAGT
TGGTCTTTCACTTGACAAAGCTGGAAAAGAGGTTCTTGGTAATGCCGCAAAGGTCGTCCT
CACGAAGGAGACTTCGACCATTGTAGGTGATGGGACAACACAAGACGCAGTGCAAAAGCG
TGTTACACAGATTAAGAATCTTATTGAGCAAGCAGAGCAAGATTATGAGAAGGAAAAACT
GAATGAGAGAATTGCAAAGCTCTCTGGTGGAGTTGCTGTTATTCAGGTGGGAGCACAAAC
AGAGACAGAACTCAAAGAGAAGAAACTGAGAGTTGAAGATGCTCTTAATGCTACAAAGGC
TGCTGTTGAGGAAGGTATTGTTGTTGGTGGTGGTTGTACTCTCCTTCGGCTTGCTTCCAA
GGTTGATGCCATTAAAGCCGCCCTTGAAAATGATGAAGAAAAGGTAGGTGCGGATATCGT
GAAAAGAGCACTGAGTTATCCTCTGAAACTTATTGCCAAGAATGCTGGAGTTAATGGAAG
CGTAGTTAG

QA 2 670 2 670
DS 

RD RS1A493JQ 838 0 0
AATGCCGCAAAGGTCGTCCTCACGAAGGAGACTTCGACCATTGTAGGTGATGGGACAACA
CAAGACGCAGTGCAAAAGCGTGTTACACAGATTAAGAATCTTATTGAGCAAGCAGAGCAA
GATTATGAGAAGGAAAAACTGAATGAGAGAATTGCAAAGCTCTCTGGTGGAGTTGCTGTT
ATTCAGGTGGGAACACAAACAGAGACAGAACTCAAAGAGAAGAAACTGAGAGTTGAAGAT
GCTCTTAATGCTACAAAGGCTGCTGTCGAGGAAGGTATTGTTGTTGGTGGTGGTTGTACT
CTCCTTCGGCTTGCTTCCAAGGTTGATGCCATTAAAGCCGCCCTTGAAAATGATGAAGAA
AAGGTAGGTGCGGATATCGTGAAAAGAGCACTGAGTTATCCTTTGAAACTTATTGCCAAG
AATGCTGGAGTTAATGGAAGCGTAGTTAGCGAGAAGGTGCTTTCTAACGATAACGTGAAA
TACGGCTACAATGCTGCAACCGGCAAGTACGAGGATTTAATGGCTGCAGGAATCATTGAT
CCAACAAAGGTTGTGAGATGTTGCTTGGAACATGCAGCTTCTGTTGCGAAGACATTCTTG
ATGTCAGACTGTGTCGTTGTTGAGATAAAGGAACCTGAGCCAGCTCCTGTAGGCAACCCA
ATGGACAACTCAGGATATGGATACTGAGGAGAGACGGGAACAAAGTAACTCTACCGGAAA
CAGATTCCTTTTGAGCTTGCAATAGATGAGAGCTAAGTGTTAATGACTTTGAACTAAGAG
AATGTGATGTGTGTACTGAAATTTTGAATCAATCTTATGAATAAAATCATGATTCCTT

QA 1 838 1 838
DS 



AS 1 3

CO CL3354Contig1 1185 3 4 U
GAACAAATCATTCCATATTAAAGTCTCGATGGGCCTACGGTTTGGACACACCAATCTCGA
AAGTTTCGTTCAGATTTGTCCATCACCATTTTTCATCGGAGTAGAAAGCCTTACTTACCC
TTATCAAATGTACATGACTAATAAAACTATTAAAATTGTACAACTTATTCAACTGTACAA
ATAATACAACCGTATAATTAGTAACTAATATAACTAACAAAATTAGTTTTAAATATTAAT
AAAGTTAAATTGATTTGGTCAGGTCTAGGGATATAGGTGGATTCAAATTTAACTGGTGAT
TGGTAAATAAAATGAACTTTTTGATTTTATGGACTTTTTATCCATTTTTCCTTTAAAATT
AATTCAAAAATAATAATAATAACATGGAGCCATTTTAGAGAAATGAATCTCCCTTTGGAT
CATTTGAGAATTTGTCTCGATATCTAATGGTTCTGTCCGTAAATGTGAAATCATATAGTT
TTTCCACCTTCATTGCGTTTAGTCTCTCTGTCTAGGAGTTTGACTTTGACAGATCGCAGA
CAATAGTCTAGCAATGTAAAATATAATAGAATAGATTTATTATTGTGTTGTCATCAATAT
GAGAATACAAGAGGCATATATATATCACTAACATTAACATAATGTTATGAATAGATAATG
CTAACTTTCCTAAACACTTAATGTAAATATCCTAAGAATATCTTGAGATTAACTTGATCT
TCAAGTCTTTCCTTTTAATCTTCTGGGTCTTCATGGGTTTCACAGTCTTGGTCCGTAAGA
TACATATCTTCCGGCCAATATATCTCTAATACTCCCTCGCACGACAAACGTGGGATGCAA
CATGCAAATCTGCAATCACAAAGCAGACCACGTATGTCGTGGACACTATGTCGAGAAAAA
CAAATCAGTAGATTCATTCGGGAATAAACTTCAACTTAGATAAGAAGGATGAAAACTTCA
GCTCTTCTTTGGTCTTGACAATGAGAATACATCCCGTGGATGCAACTGCAGCTCCACAAA
CAATCGTCCTTAACTTGGACAGTCCGTAACTTGGACTAAAACAGACCTAAAAAAAAACAT
GAGCGTTCAACTAGAACTCCCCCGTAATGGTTAAATTATAATCAATAAATCCCAAACTAT
GAGAAAACAACACTTTGAGTTATTCTAAACCATAGAATAGATCTC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DI86TF U 1
AF RS1E205TF U 1
AF RS1E205JQ C 436
BS 1 613 RS1DI86TF
BS 614 614 RS1E205TF
BS 615 762 RS1DI86TF
BS 763 1185 RS1E205JQ

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AATTCAAAAATAATAATAATAACATGGAGCCATTTTAGAGAAATGAATCTCCCTTTGGAT
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TCAAGTCTTTCCTTTTAATCTTCTGGGTCTTCATGGGTTTCA

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AAGTTTCGTTCAGATTTGTCCATCACCATTTTTCATCGGAGTAGAAAGCCTTACTTACCC
TTATCAAATGTACATGACTAATAAAACTATTAAAATTGTACAACTTATTCAACTGTACAA
ATAATACAACCGTATAATTAGTAACTAATATAACTAACAAAATTAGTTTTAAATATTAAT
AAAGTTAAATTGATTTGGTCAGGTCTAGGGATATAGGTGGATTCAAATTTAACTGGTGAT
TGGTAAATAAAATGAACTTTTTGATTTTATGGACTTTTTATCCATTTTTCCTTTAAAATT
AATTCAAAAATAATAATAATAACATGGAGCCATTTTAGAGAAATGAATCTCCCTTTGGAT
CATTTGAGAATTTGTCTCGATATCTAATGGTTCTGTCCGTAAATGTGAAATCATATAGTT
TTTCCACCTTCATTGCGTTTAGTCTCTCTGTCTAGGAGTTTGACTTTGACAGATCGCAGA
CAATAGTCTAGCAATGTAAAATATAATAGAATAGATTTATTATTGTGTTGTCATCAATAT
GAGAATACAAGAGGCATATATATATCACTAACATTAACATAATGTTATGAATAGATAATG
CTAACTTTCCTAAACACTTAATGTAAATATCCTAAGAATATCTTGAGATTAACTTGATCT
TCAAGTCTTTCCTTTTA
TCTT

QA 1 737 1 737
DS 

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CAATATATCTCTAATACTCCCTCGCACGACAAACGTGGGATGCAACATGCAAATCTGCAA
TCACAAAGCAGACCACGTATGTCGTGGACACTATGTCGAGAAAAACAAATCAGTAGATTC
ATTCGGGAATAAACTTCAACTTAGATAAGAAGGATGAAAACTTCAGCTCTTCTTTGGTCT
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TGGACAGTCCGTAACTTGGACTAAAACAGACCTAAAAAAAAACATGAGCGTTCAACTAGA
ACTCCCCCGTAATGGTTAAATTATAATCAATAAATCCCAAACTATGAGAAAACAACACTT
TGAGTTATTCTAAACCATAGAATAGATCTC

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 3

CO CL3355Contig1 957 3 5 U
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TATCATTGGATTTATACACTTTTGTTGTCAATGCAATTCAAAGCGACAATGTCCGGATAA
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AGATGAAACGCGTTGACGATCGAAAGACGACGAAAAGTTCTAAAAGGACGAGAGGAGAAG
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BQ
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AF RS1GB12JQ U 1
AF RS1GF43JQ U 4
AF RS1GF43TF C 246
BS 1 454 RS1GB12JQ
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RD RS1GB12JQ 643 0 0
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GACCAGCTGTATCCCATATCTCAAACTTGACAGTCGCGTCATT

QA 1 643 1 643
DS 

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GAGATCCAAACCCTCGTTCAAATACAAATATCTTTTAAGATTCACCATAGTTGGAAATAT
CATTGGATTTATACACTTTTGTTGTCAATGCAATTCAAAGCGACAATGTCCGGATAAGAA
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CAGCTGTATCCCATATCTCAAACTTGACAGTCGCGTCATTCACAGCCAATGTCTGAGAGA
AAAAA

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1GF43TF 712 0 0
TTTGGGAGAACCATCCCTGTTGGGTTCTCTGCTGGCTGTACACGTGGTAGCCTTTT*GCG
ATTTCGTAGAAGATGTCTTTGACATTAGTTGCAGTCTTCGCTGAGGTTTCCATGAAGAAA
AGGCTGTTCTCTTGAGCATATGTCTCTGCCTCCTCTGGAGACACTTTCCTTGCATCTAAT
AAATCAGCTTTGTTTCCAGCAAGAGCCATAACCATATTAGGGTTACCTTGTGCCTGCAGT
TCCTGAACCCATTTCTTCGCCCTCTCAAAAGAGGCTTGATTAGTAATGTCAAAGACAATA
ATGGCAGCAGCAGCACCCCTGTAGTACATTGGAGCCAAGCTATGGTAACGTTCCTGACCA
GCTGTATCCCATATCTCAAACTTGACAGTCGCGTCATTCACAGCCAATGTCTGAGAGAAA
AAAGCTGCACCTATGGTTGATTCCTGGAACTCAACAAACTGATCTTTAACAAAACGAAGC
ACAAGACTTGACTTTCCAGCACCAACATCTCCAAGCAATACCAATTTGGCGTTGATGTTC
TTGTTTCCAGAGGTGGCCATGATCGTTGATCTGAAGCTTCGAGAAATCGCAGATGAGATG
AAACGCGTTGACGATCGAAAGACGACGAAAAGTTCTAAAAGGACGAGAGGAGAAGAGCGA
AGAAGCTTCTTTCGTCAAAACACACAACCAAATCTATCTTTTGCTCTCTCCC

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 3

CO CL3356Contig1 562 3 4 U
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GCTGACTTCGAAACTTAAGCCTATTCACCTCGAAGTCACTGACATATCTGGAGGTTGCGG
TTCGAGTTTTGAAGTCGAGGTTGTATCTGAGCAATTCGAAGGGAAGAGATTGCTAGAGAG
GCACCGTATGGTGAATGCTGCACTTGAAGAAGAAATGAAGGAGATTCATGCTCTCTCTAT
TAAGAAAGCTCAGACTCCACAGCAGTGGAAGCCGTCCCAAGACTCTTCTTCTACTACTCA
AGCCAAAGATGCTTGAAACTCTGTTTATTTAAGGCCTTGTGAGAAAAGAACAAGAGAATG
ACTATGTTTGATACTTTTGTCGTTGCTTGCAAATCTACAAGACTACTTTTATGCTTTCTT
CTTGTAAAACGGTTTCATTTGGGCTCGGATGAGTTTAACAGCACTATCGGACATCCATAA
CTGAAGTTTATGAATTAGCATATACTATTACACTGGCTGCTTTTGCCCAAAGCCCATTGG
TGAAGACAAGGTTTTTGGAATA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GH44TF U 181
AF RS1DE83JQ C 1
AF RS1DE83TF U 1
BS 1 180 RS1DE83TF
BS 181 400 RS1GH44TF
BS 401 552 RS1DE83TF
BS 553 562 RS1DE83JQ

RD RS1GH44TF 220 0 0
GCACCGTATGGTGAATGCTGCACTTGAAGAAGAAATGAAGGAGATTCATGCTCTCTCTAT
TAAGAAAGCTCAGACTCCACAGCAGTGGAAGCCGTCCCAAGACTCTTCTTCTACTACTCA
AGCCAAAGATGCTTGAAACTCTGTTTATTTAAGGCCTTGTGAGAAAAGAACAAGAGAATG
ACTATGTTTGATACTTTTGTCGTTGCTTGCAAATCTACAA

QA 1 220 1 220
DS 

RD RS1DE83JQ 562 0 0
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GCTGACTTCGAAACTTAAGCCTATTCACCTCGAAGTCACTGACATATCTGGAGGTTGCGG
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GCACCGTATGGTGAATGCTGCACTTGAAGAAGAAATGAAGGAGATTCATGCTCTCTCTAT
TAAGAAAGCTCAGACTCCACAGCAGTGGAAGCCGTCCCAAGACTCTTCTTCTACTACTCA
AGCCAAAGATGCTTGAAACTCTGTTTATTTAAGGCCTTGTGAGAAAAGAACAAGAGAATG
ACTATGTTTGATACTTTTGTCGTTGCTTGCAAATCTACAAGACTACTTTTATGCTTTCTT
CTTGTAAAACGGTTTCATTTGGGCTCGGATGAGTTTAACAGCACTATCGGACATCCATAA
CTGAAGTTTATGAATTAGCATATACTATTACACTGGCTGCTTTTGCCCAAAGCCCATTGG
TGAAGACAAGGTTTTTGGAATA

QA 1 562 1 562
DS 

RD RS1DE83TF 552 0 0
GATTGTATTCGGAGCAATAGAGAGAGAGAGGATGGTGACTAAGGAACAGGTCGAAGCTTC
GCTGACTTCGAAACTTAAGCCTATTCACCTCGAAGTCACTGACATATCTGGAGGTTGCGG
TTCGAGTTTTGAAGTCGAGGTTGTATCTGAGCAATTCGAAGGGAAGAGATTGCTAGAGAG
GCACCGTATGGTGAATGCTGCACTTGAAGAAGAAATGAAGGAGATTCATGCTCTCTCTAT
TAAGAAAGCTCAGACTCCACAGCAGTGGAAGCCGTCCCAAGACTCTTCTTCTACTACTCA
AGCCAAAGATGCTTGAAACTCTGTTTATTTAAGGCCTTGTGAGAAAAGAACAAGAGAATG
ACTATGTTTGATACTTTTGTCGTTGCTTGCAAATCTACAAGACTACTTTTATGCTTTCTT
CTTGTAAAACGGTTTCATTTGGGCTCGGATGAGTTTAACAGCACTATCGGACATCCATAA
CTGAAGTTTATGAATTAGCATATACTATTACACTGGCTGCTTTTGCCCAAAGCCCATTGG
TGAAGACAAGGT

QA 1 552 1 552
DS 



AS 1 2

CO CL3357Contig1 762 2 2 U
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TCTCGGATTGAACAAGAACAGAGAACCAGAATTTCTGAAAGTGCTGATGCTGAGATAAAG
CGTTGGGCAACTGGAAAAGAAGGAAACATGCGTGCGCTGTTATCTTCCTTGCAAATCGTG
CTCTGGCCTGGATGCGGTTGGGAGGCTGTCTCTCTAACAGATTTGATCACTTCTTCAGCA
GTCAAGAAAGTGTATAGAAAGGCAACGCTGTATGTTCATCCCGATAAAGTTCAGCAGAAA
GGAGCCACCCTTGAACAGAAGTATATTGCCGAAAAGGTTTTTGACATTTTGAAGGAAGCT
TGGAACAAGTTCAACAAAGAGGAGCTCTCGTAAGGCTGTTTGGGATCTAGTTGCCCCCCG
CGAATCCTTCATTTCAGGTTTGAGAACAGTTTCCTTCCAGTTGACATTGAATCAGGACTG
AGTACCCCAAGCAATTGTTGATTAAGAGGTAGAGAAAAGACTTGAAGAGACTTTGGTACC
TGTTGTTTGTGTCTCGTTTGCTTATTATCTCTACACAATCATCTGCGAGTTTCCTTTAGT
CTTGTCATGTTTTTTTATCTTCTTTTCTCACATTTTTTTCTTTTACATTAACTCGGCACC
TTTTCATTTTATGTACAACAAAAAGACCATGGGGAGATATTGTATAGCCCCAAAAGAACC
AATAGATTTTTCTTTTATGAATATATGTCGAGTGTTATTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H294TF U 1
AF RS1H294JQB C 20
BS 1 677 RS1H294TF
BS 678 762 RS1H294JQB

RD RS1H294TF 684 0 0
GAGAGAACAAAGAGCCGTGTGGCACAAGCTGTAGCTGATATGAACAACCGTGATCAGCAA
TCTCGGATTGAACAAGAACAGAGAACCAGAATTTCTGAAAGTGCTGATGCTGAGATAAAG
CGTTGGGCAACTGGAAAAGAAGGAAACATGCGTGCGCTGTTATCTTCCTTGCAAATCGTG
CTCTGGCCTGGATGCGGTTGGGAGGCTGTCTCTCTAACAGATTTGATCACTTCTTCAGCA
GTCAAGAAAGTGTATAGAAAGGCAACGCTGTATGTTCATCCCGATAAAGTTCAGCAGAAA
GGAGCCACCCTTGAACAGAAGTATATTGCCGAAAAGGTTTTTGACATTTTGAAGGAAGCT
TGGAACAAGTTCAACAAAGAGGAGCTCTCGTAAGGCTGTTTGGGATCTAGTTGCCCCCCG
CGAATCCTTCATTTCAGGTTTGAGAACAGTTTCCTTCCAGTTGACATTGAATCAGGACTG
AGTACCCCAAGCAATTGTTGATTAAGAGGTAGAGAAAAGACTTGAAGAGACTTTGGTACC
TGTTGTTTGTGTCTCGTTTGCTTATTATCTCTACACAATCATCTGCGAGTTTCCTTTAGT
CTTGTCATGTTTTTTTATCTTCTTTTCTCACATTTTTTTCTTTTACATTAACTCGGCACC
TTTTCATTTTATGTACA
ACAAAAA

QA 1 677 1 677
DS 

RD RS1H294JQB 743 0 0
TGGCACAAGCTGTAGCTGATATGAACAACCGTGATCAGCAATCTCGGATTGAACAAGAAC
AGAGAACCAGAATTTCTGAAAGTGCTGATGCTGAGATAAAGCGTTGGGCAACTGGAAAAG
AAGGAAACATGCGTGCGCTGTTATCTTCCTTGCAAATCGTGCTCTGGCCTGGATGCGGTT
GGGAGGCTGTCTCTCTAACAGATTTGATCACTTCTTCAGCAGTCAAGAAAGTGTATAGAA
AGGCAACGCTGTATGTTCATCCCGATAAAGTTCAGCAGAAAGGAGCCACCCTTGAACAGA
AGTATATTGCCGAAAAGGTTTTTGACATTTTGAAGGAAGCTTGGAACAAGTTCAACAAAG
AGGAGCTCTCGTAAGGCTGTTTGGGATCTAGTTGCCCCCCGCGAATCCTTCATTTCAGGT
TTGAGAACAGTTTCCTTCCAGTTGACATTGAATCAGGACTGAGTACCCCAAGCAATTGTT
GATTAAGAGGTAGAGAAAAGACTTGAAGAGACTTTGGTACCTGTTGTTTGTGTCTCGTTT
GCTTATTATCTCTACACAATCATCTGCGAGTTTCCTTTAGTCTTGTCATGTTTTTT*ATC
TTCTTTTCTCACATTTTTTTCTTTTACATTAACTCGGCACCTTTTCATTTTATGTACAAC
AAAAAGACCATGGGGAGATATTGTATAGCCCCAAAAGAACCAATAGATTTTTCTTTTATG
AATATATGTCGAGTGTTATTATC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 3

CO CL3358Contig1 474 3 1 U
GAAGAAAACGAAGGGGGTGTTGTTATTATAACAAGAAACAAGAGTTGTGTAATCTTTTCA
CAAAGGTTCTTTCATTCTATTTTATCCACAGAATATCAAAAGCTTTTATTAAAAAGGTGG
AGTCAGTCTTCAATCCTGCTTAACACCACCACTCTCCTCCGCGACGACGACGGGTTTAAC
TATCGTTGCTTCTGTGCTTCCAGCTCCAGCTTCTGCAGCCGCTTTGGTGGAGTTGTTGTC
GTTGGGCTTGAAAAGGACAAGCTGGAGGAACTCTCGCTGGCTTCCTGTACTCCCATCCGA
GCCAAGCATACACTTTGGCCATTAAGAAATCGATGATCCGAGGAAGTAGATTGATGAGCG
GGACGAGGAACAGCGGCACCAAACAAAATATACAAACCATATTCAATTTAGGGTTCTGGA
CACAAGAATTGGGAATTTCGCTCCAAGTTGAATCGCGGAGAGATCGATCAAAAA


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1D632JQ U 1
AF RS1GO51JQ U 3
AF RS1D632TF C 1
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TATCGTTGCTTCTGTGCTTCCAGCTCCAGCTTCTGCAGCCGCTTTGGTGGAGTTGTTGTC
GTTGGGCTTGAAAAGGACAAGCTGGAGGAACTCTCGCTGGCTTCCTGTACTCCCATCCGA
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QA 1 474 1 474
DS 

RD RS1GO51JQ 472 0 0
C
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CAGTCTTCAATCCTGCTTAACACCACCACTCTCCTCCGCGACGACGACGGGTTTAACTAT
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AAGAATTGGGAATTTCGCTCCAAGTTGAATCGCGGAGAGATCGATCAAAAA

QA 2 472 2 472
DS 

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GAA
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CAGTCTTCAATCCTGCTTAACACCACCACTCTCCTCCGCGACGACGACGGGTTTAACTAT
CGTTGCTTCTGTGCTTCCAGCTCCAGCTTCTGCAGCCGCTTTGGTGGAGTTGTTGTCGTT
GGGCTTGAAAAGGACAAGCTGGAGGAACTCTCGCTGGCTTCCTGTACTCCCATCCGAGCC
AAGCATACACTTTGGCCATTAAGAAATCGATGATCCGAGGAAGTAGATTGATGAGCGGGA
CGAGGAACAGCGGCACCAAACAAAATATACAAACCATATTCAATTTAGGGTTCTGGACAC
AAGAATTGGGAATTTCGCTCCAAGTTGAATCGCGGAGAGATCGATCAAAAA

QA 4 474 4 474
DS 



AS 1 2

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ATACG


BQ
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20 20 20 20 20 

AF RS1BC27JQ C 1
AF RS1BC27TF U 1
BS 1 652 RS1BC27TF
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RD RS1BC27JQ 665 0 0
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ATACG

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DS 

RD RS1BC27TF 665 0 0
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ATACG

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1EV50TF U 1
AF RS1EV50JQ C 381
BS 1 731 RS1EV50TF
BS 732 1249 RS1EV50JQ

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TGGAAGTCCATGAGCTACGTTGCGAGAGACGTCGCCATTGTGTTTGCATTGGCTGCTGGA
GCTGCTTACCTCAACAGTTGGCTTGTCTGGCCTCTCTATTGGCTTGCTCAAGGAACCATT
TTCTGGGCTCTCTTTGTTCTTGGCCATGACTGTGGACATGGTAGCTTCTCAAATGATCCG
AGGTTGAACAGTGTTGTTGGTCACCTTCTTCATTCCTCAATCCTAGTCCCTTACCATGGC
TGGAGAATTAGCCACAGGACTCACCACCAGAACCATGGACATGTTGAGAACGATGAATCT
TGGCATCCTATGTCTGAGAAAATATACAAGACTTTGGATAGACCCACTCGGTTCTTTAGG
TTCACACTGCCTCTCGTGATGCTCGCGTACCCTTTCTACTTGTGGGCTCGAAGCCCGGGG
AAAAAGGGTTCTCATTACCATCCGGACAGTGATTTGTTCCTCCCTAAAGAGAAGAAGGAT
GTTCTTACTTCTACAGCTTGTTGGACTGCAATGGCTGCTCTGCTTGTGTGTCTCAACTTT
GTGATGGGTCCAATGCAAATGCTCAAACTCTATGGAATCCCTTACTGGATAAATGTAATG
TGGTTGGACTTTGTGACTTACCTGCATCATCATGGTCATGAAGATAAGCTCCCTTGGTAC
CGTGGGAAGGA
TGGAG

QA 1 731 1 731
DS 

RD RS1EV50JQ 869 0 0
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GCTCGCGTACCCTTTCTACTTGTGGGCTCGAAGCCCGGGGAAAAAGGGTTCTCATTACCA
TCCGGACAGTGATTTGTTCCTCCCTAAAGAGAAGAAGGATGTTCTTACTTCTACAGCTTG
TTGGACTGCAATGGCTGCTCTGCTTGTGTGTCTCAACTTTGTGATGGGTCCAATGCAAAT
GCTCAAACTCTATGGAATCCCTTACTGGATAAATGTAATGTGGTTGGACTTTGTGACTTA
CCTGCATCATCATGGTCATGAAGATAAGCTCCCTTGGTACCGTGGGAAGGAATGGAGTTA
CTTGAGAGGAGGGCTAACAACATTGGATCGTGACTACGGAGTGATCAACAACATCCACCA
CGACATCGGAACTCATGTGATACATCATCTTTTCCCGCAGATCCCACATTATCATCTCGT
AGAAGCGACAGAAGCGGCTAAACCAGTATTAGGCAAGTATTACAGGGAGCCTGATAAGTC
TGGACCTTTGCCATTACATTTACTGGGAATCTTAGCAAAAAGTATGAAAGAAGATCATTA
TGTGAGCGACCAAGGAGATGTTGTATACTATAAAGCAGATCCTAATCTATATGGAGAGGT
CAAAGTAACAGCAGATTAAAATGAAGCAAGCAGAAAGTGATAGAGAACTTTTTCTATTTC
TGACCAGCTGATTTTTTTGCTTATTAACGTCCAATCTATTGTGTTACTACTACCTCCAGA
GAGTTAGTATCTCTGAATACAATCAGATGGAAACGACAAATTTGTTTTCAGTACTGAAGC
TATAAATATAAGATACATTGAATCGTCTT

QA 1 869 1 869
DS 



AS 1 2

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GCTCTCACTGGAGTCACCATTGGGACTGTGACATCTAGTGGGACTGTGACACCTACTCAG
AAAGTCTGGAGAACTTTTCAGTCTCTTGGGAACATTGCATTTGCCTATGCTTACTCCATG
ATTCTCATTGAGATCCAGGACACGTTGAAATCACCACCTGCAGAGGAAAACACAATGAGG
AAAGCAACTCTCATAAGTGTAGCAGTGACAACGCTCTTCTACATGCTCTGTGGCTGCGTA
GGGTATGCAGCATTTGGGGACTCCTCACCTGGAAACCTCCTCGCCGCTGGAGGATTCAGA
AACCCCTACTGGTTGCTCGACATAGCCAACCTCGCCATCGTGATCCACCTGGTTGGAGCT
TACCAAGTCTACTGCCAGCCGCTCTTTGCCTTTGTGGAGAAAGAAGCCGCCAAGAGGTAT
CCAGAGAGCAAGTTCATCACAAACGAGACCAAGATCCACCTCTTCCCAGGATCAAAGCCT
TTCAACTTGAACCTCTTCAGGCTCGTGTGGAGGACCATCTTTGTGATTACAACAACGTTG
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TGGCCACTAACGGTGTATTTCCCCGTGGAGATGTACATTGTGCAGAAGAATGTGGGGAGA
TGGAGCACGAGATGGGTTTGTCTTCAAGTCTTGAGTCTGGCTTGTCTTGTTGTGTCTGTA
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AAGACGGATTTTTGAGAGCCCTTTCGGAACAAATAAACTCCCCGCAATAGGGATGCAGTT
ATATATAAAATTGGATGTTGTGACTTGATCTTTTAAGTTAGTTAAAACTTTTTTCAAGTG
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BQ
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AF RS1F971TF U 1
AF RS1F971JQ C 286
BS 1 733 RS1F971TF
BS 734 734 RS1F971JQ
BS 735 745 RS1F971TF
BS 746 922 RS1F971JQ

RD RS1F971TF 745 0 0
GCTCTCACTGGAGTCACCATTGGGACTGTGACATCTAGTGGGACTGTGACACCTACTCAG
AAAGTCTGGAGAACTTTTCAGTCTCTTGGGAACATTGCATTTGCCTATGCTTACTCCATG
ATTCTCATTGAGATCCAGGACACGTTGAAATCACCACCTGCAGAGGAAAACACAATGAGG
AAAGCAACTCTCATAAGTGTAGCAGTGACAACGCTCTTCTACATGCTCTGTGGCTGCGTA
GGGTATGCAGCATTTGGGGACTCCTCACCTGGAAACCTCCTCGCCGCTGGAGGATTCAGA
AACCCCTACTGGTTGCTCGACATAGCCAACCTCGCCATCGTGATCCACCTGGTTGGAGCT
TACCAAGTCTACTGCCAGCCGCTCTTTGCCTTTGTGGAGAAAGAAGCCGCCAAGAGGTAT
CCAGAGAGCAAGTTCATCACAAACGAGACCAAGATCCACCTCTTCCCAGGATCAAAGCCT
TTCAACTTGAACCTCTTCAGGCTCGTGTGGAGGACCATCTTTGTGATTACAACAACGTTG
ATCTCTATGCTGATGCCTTTCTTCAACGATGTGCTTGGTCTCTTGGGGGCCATCGGTTTT
TGGCCACTAACGGTGTATTTCCCCGTGGAGATGTACATTGTGCAGAAGAATGTGGGGAGA
TGGAGCACGAGATGGGTTTGTCTTCAAGTCTTGAGTCTGGCTTGTCTTGTTGTGTCTGTA
GCCGCGGCAGCAG*ATCTGTGGTTG

QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1F971JQ 637 0 0
GCTGGAGGATTCAGAAACCCCTACTGGTTGCTCGACATAGCCAACCTCGCCATCGTGATC
CACCTGGTTGGAGCTTACCAAGTTTACTGCCAGCCGCTTTTTGCCTTTGTGGAGAAAGAA
GCCGCCAAGAGGTATCCAGAGAGCAAGTTCATCACAAACGAGACCAAGATCCACCTCTTC
CCAGGATCAAAGCCTTTCAACTTGAACCTTTTCAGGCTCGTGTGGAGGACCATCTTTGTG
ATTACAACAACGTTGATCTTTATGCTGATGCCTTTTTTCAACGATGTGCTTGGTTTCTTG
GGGGCCATCGGTTTTTGGCCACTAACGGTGTATTTCCCCGTGGAGATGTACATTGTGCAG
AAGAATGTGGGGAGATGGAGCACGAGATGGGTTTGTCTTCAAGTCTTGAGTCTGGCTTGT
CTTGTTGTGTCTGTAGCCGCGGCAGCAGGATCTGTGGTTGGGATTGTTACTGATCTCAAG
AGTTACAGACCTTTCAAGACGGATTTTTGAGAGCCCTTTCGGAACAAATAAACTCCCCGC
AATAGGGATGCAGTTATATATAAAATTGGATGTTGTGACTTGATCTTTTAAGTTAGTTAA
AACTTTTTTCAAGTGTTCTATATGAGATATTCGACGC

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 3

CO CL3362Contig1 579 3 2 U
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TTTTCCAATTAAGAAGAAAAAGAAAGAGAAAAGATGAGTTCAAGGAGCAAAGCATGGTTA
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AATTACATGATCCGATCGGTAAATCAACGTATCCGAAATAACGTGAGATCCGCTGCTCAG
GCGAGCAGGTTCTCTTCTTCGTCAACCACCGCCGTTGCCGCCGGTAAGGATGGTGACAAG
GCCAAGCAAGCCGAGGAGTCTCTCAGGACAGTCATGTACTTGAGCTGTTGGGGTCCTAAT
TGATGAAGACGGATGGATAGATATTTTTATTATCTTTGCCATATATAGATTGGTTCGGAT
AGGTTGTATCTATGTCGGTGAAATCGAAAGCCTAAGAACCTTAAATAGGAGCTATGAGTC
TTGGGGTTTTGATGGATTGTTTTGGGGATGCAATTATTGACGGATTCGAATTGTACAGAA
TGTAGAGATGAATATAAAGGTTTATGTTCATGTTACTGG


BQ
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AF RS1BU57TF U 1
AF RS1DL85JQ C 2
AF RS1DL85TF U 2
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BS 569 579 RS1DL85TF

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TGTAGAGATGAATATAAAGGTTTATGTT

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DS 

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TTTCCAATTAAGAAGAAAAAGAAAGAGAAAAGATGAGTTCAAGGAGCAAAGCATGGTTAG
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ATTACATGATCCGATCGGTAAATCAACGTATCCGAAATAACGTGAGATCCGCTGCTCAGG
CGAGCAGGTTCTCTTCTTCGTCAACCACCGCCGTTGCCGCCGGTAAGGATGGTGACAAGG
CCAAGCAAGCCGAGGAGTCTCTCAGGACAGTCATGTACTTGAGCTGTTGGGGTCCTAATT
GATGAAGACGGATGGATAGATATTTTTATTATCTTTGCCATATATAGATTGGTTCGGATA
GGTTGTATCTATGTCGGTGAAATCGAAAGCCTAAGAACCTTAAATAGGAGCTATGAGTCT
TGGGGTTTTGATGGATTGTTTTGGGGATGCAATTATTGACGGATTCGAATTGTACAGAAT
GTAGAGATGAATATAAAGGTTTATGTTCATGTTACTGG

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DS 



AS 1 3

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TTGGAACTGGAACATTTACCTGTTTCCTCTATGGTGCTTTGGGGTGGTTGTTAGATACTG
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ATTCATCCCCGTACATTCGCTGCTCAAAGGTCAAGACAGGTTGAGGAAAAATATAGAGAG
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TCATGGCCCACGCCCTAGCATTCGTCCTAAACAGGTCTATGTTGCCAACCATACCTCAAT
GATTGATTTCATCGTCTTGGAGCAGATGACCGCATTTGCTGTTATAATGCAGAAGCATCC
TGGTTGGGTTGGGCTTCTGCAGAGCACAATATTAGAGAGTGTAGGATGTATCTGGTTCAA
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ATACAACAAGATTTTTGTTGACGCCTTCTGGAACAGCAGAAAACAATCATTCACGATGCA
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ACTTCGGGCAGGCCTCAAAAAGGTCCCTTGGGATGGATACTTGAAGTATTCAAGACCAAG
CTCCAAGCATAGTGAACGCAAGCAACAGAGTTTTGCGGAGTCCCTCCTTGCTAGATTGGA
AGAGAAGTGAATGTAACGATAAAGCACCTTTCCGTTTAGATAAAACAAACTTCGTGGCTT
ATTTTTGCTTTAGTTTCTTTACGTTTTGTGAATCTTTCAATATGAATTTTTTTGTAAGAC
TACAACCGGTCTTATTCACGAGCTCTTCCGAGTTTGGAAAGGCTAAGAATTTAATACATT
CATTAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ER75TF U 1
AF RS1G882TF U 415
AF RS1G882JQ C 740
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BS 1025 1328 RS1G882JQ

RD RS1ER75TF 743 0 0
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GACGTCGAGATCGGAGCTTAACATCGAAGATTATCTTCCTTCCGGCTCGTCCATCCATGA
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TTGGAACTGGAACATTTACCTGTTTCCTCTATGGTGCTTTGGGGTGGTTGTTAGATACTG
CATTCTCTTTCCCTTGAGGTGCCTCACTTTAGCTTTTGGGTGGTTTATTTTCCTTTCAAC
ATTCATCCCCGTACATTCGCTGCTCAAAGGTCAAGACAGGTTGAGGAAAAATATAGAGAG
GGTCTTGGTGGAAATGATTTGCAGCTTTTTTGTCGGTTCATGGACAGGAGTTGTCAAATA
TCATGGCCCACGCCCTAGCATTCGTCCTAAACAGGTCTATGTTGCCAACCATACCTCAAT
GATTGATTTCATCGTCTTGGAGCATATGACCGCATTTGCTGTTATAATGCAGAAGCATCC
TGGTTGGGTTGGGCTTCTGCAGAGCACAATATTAGAGAGTGTAGGATGTATCTGGTTCAA
TCGTTCCGAGGCAAAG*ATCGTGAAATTGTAGCGAGAAAGTTAAG*GACCATGTCCAAG*
AGCTGACA*TAATCCTCTTCTCA

QA 1 743 1 743
DS 

RD RS1G882TF 610 0 0
G
GAGAGGGTCTTGGTGGAAATGATTTGCAGCTTTTTTGTCGGTTCATGGACAGGAGTTGTC
AAATATCATGGCCCACGCCCTAGCATTCGTCCTAAACAGGTCTATGTTGCCAACCATACC
TCAATGATTGATTTCATCGTCTTGGAGCAGATGACCGCATTTGCTGTTATAATGCAGAAG
CATCCTGGTTGGGTTGGGCTTCTGCAGAGCACAATATTAGAGAGTGTAGGATGTATCTGG
TTCAATCGTTCCGAGGCAAAGGATCGTGAAATTGTAGCGAGAAAGTTAAGAGACCATGTC
CAAGGAGCTGACAATAATCCTCTTCTCATATTTCCCGAAGGGACGTGTGTAAATAATAAT
TATACTGTGATGTTTAAGAAGGGTGCTTTTGAATTGGGCTGCACTGTATGTCCAATCGCA
ATCAAATACAACAAGATTTTTGTTGACGCCTTCTGGAACAGCAGAAAACAATCATTCACG
ATGCACTTGCTGCAACTCATGACTTCATGGGCAGTTGTGTGTGAAGTGTGGTACTTGGAA
CCCCAAACTATAAGGCCTGGTGAAACAGCAATTGAGTTTGCAGAGAGGGTGAGAGACATG
ATATCACTT

QA 2 610 2 610
DS 

RD RS1G882JQ 589 0 0
CTCATATTTCCCGAAGGGACGTGTGTAAATAATAATTATACTGTGATGTTTAAGAAGGGT
GCTTTTGAATTGGGCTGCACTGTATGTCCAATCGCAATCAAATACAACAAGATTTTTGTT
GACGCCTTCTGGAACAGCAGAAAACAATCATTCACGATGCACTTGCTGCAACTCATGACT
TCATGGGCAGTTGTGTGTGAAGTGTGGTACTTGGAACCCCAAACTATAAGGCCTGGTGAA
ACAGCAATTGAGTTTGCAGAGAGGGTGAGAGACATGATATCACTTCGGGCAGGCCTCAAA
AAGGTCCCTTGGGATGGATACTTGAAGTATTCAAGACCAAGCTCCAAGCATAGTGAACGC
AAGCAACAGAGTTTTGCGGAGTCCCTCCTTGCTAGATTGGAAGAGAAGTGAATGTAACGA
TAAAGCACCTTTCCGTTTAGATAAAACAAACTTCGTGGCTTATTTTTGCTTTAGTTTCTT
TACGTTTTGTGAATCTTTCAATATGAATTTTTTTGTAAGACTACAACCGGTCTTATTCAC
GAGCTCTTCCGAGTTTGGAAAGGCTAAGAATTTAATACATTCATTAATG

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 3

CO CL3364Contig1 869 3 7 U
GGGAATCATTTCTGCAAGATCATAAAAACTGAATATCAAACTAGCTGCTTGTAAACATCT
ACACTCTCAACCTCAAGCACACAAAATAAAAAAAGAAATGGGAACAGAGATGGTAATGGT
TCACGAGGTTCCTTTTCCTCCACAGATCATCACTTCCAAGCCCCTCTCTCTTCTTGGACA
AGGCATCACTGACATCGAGATCCACTTTCTCCAAGTGAAGTTCACGGCCATAGGAGTTTA
CTTAGATCCATCAGATGTTAAAACCCATCTTGACAAATGGAAAGGCAAGACCGGAAAGGA
TCTCGCCGGCGATGACGACTTCTTCGACGCCCTGGCCTCCGGGGAGATTGAGAAAGTTAT
AAGAGTGGTGGTGATAAAAGAAATAAAAGGAGCTCAGTACGGAGTGCAGCTAGAGAATGC
GGTGAGAGATCGTTTGGCTGCTGAGGATAAGTACGAGGAGGAAGAAGAAACCGAGCTCGA
GAAAGTTGTTGGATTTTTTCAGTCTAAGTACTTCAAGACTCATTCTATCATTACTTACCG
TTTCTCAGCCAAAGATGGCATTTGCGAGATCGGATTTGAGACGGAAGGTAAAGAAGAGGA
GAAATTGAAAGTAGTGAATGCTAATGTGGTGGGGATGATGCAGAAGTGGTACTTGTCTGG
AAGTAGAGGAGTTTCACCGTCCACCATCGTCTCCCTCGCCGATTCTCTGTCCGCAGTTTT
AACCTAAAACTACTTATATAAGCACCTATCATCTTGTTGCCCCAAAAAAAAGCACCTAGC
ATCTATGTGTGTTTTATGTTGTTGTATTATGCCGTTCTTAAGCGAGACATCGTGTTAATT
GGTTATCTTTATAAAATGTTTAATGGCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BJ12TF U 1
AF RS1AF94TF U 6
AF RS1AF94JQ C 52
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DS 

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GG
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DS 



AS 1 3

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GTTTATGTGCAACAGTGAAGACGATCATATCTTGGATTCAAGTTTAATTACTTTCTAATT
TGAGGAACAACAGTTATATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FD83TF U 301
AF RS1C304TF U 1
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GTA
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QA 4 345 4 345
DS 

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TACGCTTCACTGGCTCCACTCATCAACCTCTACGTCCCTCACCGTCCCAACCCCGTCCTC
GTCATCGGCTGCGGAAACTCGGCGTTCAGCGAAGGAATGGTTGACGACGGGTACGAAGAC
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CGTCCTCCGCTCAAATATTTGAAGATGGATGTGCGTGATATGAAGGCGTTTGGAGATGGT
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AGACAACACTCAACGCAGATGCTTGAGGAAGTTT*GGAGGGTACTCAAGG*ATAAAGGAG
TCTACATTCTGATTACATATGGAACTCC*GGATTACCGACTTAGGCTGTTTAAAGACTCA
CGCTCTT*GGACGACGAAACTCCATGTGATAGACAAAAGTTTAACAAATCATCATCAACC
ATTAGAAACGTCAAAATGGGAACTGACGAAACCCATTCCTCTAG

QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1FD83JQ 679 0 0
GTCAGCATCGATATCTCCTCTGTGGTGATCGATGCTATGGTTAAGAAATACTCCGACCGT
CCTCGGCTCAAATATTTGAAGATGGATGTGCGTGATATGAAGGCGTTTGGAGATGGTTCT
TTTGATGCTGTGATTGATAAAGGAACCTTAGACTCTATTTTGTGTGGGAGCAATTCGAGA
CAACACTCAACGCAGATGCTTGAGGAAGTTT*GGAGGGTACTCAAGG*ATAAAGGAGTCT
ACATTCTGATTACATATGGAGCTCC*GGATTACCGACTTAGGCTGTTTAAAGACTCACGC
TCTT*GGACTACGAAACTCCATGTGATAGACAAAAGTTTAACAGATCATCA***ACCGTT
AGAAACGTCGAAATGGGAACTGACGAAACCTATTCCTCTAGATTTTGAGGGAAGTTCGGT
GGAATCAGCAATTGGCAAAAGCCCTGATGTTCATTACATCTATGTCTGTATTAAGGATGA
ATCGTTGAAGAGGGAGGCAGACACAGCTTGAAGTCATGAGAACCTTTTTTTTTGCTCGTT
GCTTAGAACATCTAGGTCCTACAAGGACTTGGGTTTTTTTTTTTTTGTCTTTGTTGTGTT
TATGTGCAACAGTGAAGACGATCATATCTTGGATTCAAGTTTAATTACTTTCTAATTTGA
GGAACAACAGTTATATTCC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 3

CO CL3366Contig1 473 3 10 U
GGCGCGAAAATCTCGTCGTCTTTCATCACACTCGGGCCATTGTTTGTAGATCTGCTCGCG
TTTTTCAACCCTAATCGCCAGAACCGATTCATACGAGATCAGATATCTTACCTGAAACAA
ACCGAAAGGGTTGATTAATCGTGGCACTTCTCGAGGGATTTTACAGAGTCATCATGCGCC
GTAACTCAGTCTACGTCTCCTTCATCATCGCCGGCGCTTTCTTCGGCGAACGGGCTGTGG
ATTACGGTGTTCATAAGCTCTGGGAAAGCAAAAATGTTGGGAAACGGTATGAAGACATCT
CTGTGTTGGGTCAAAGGCCTATTGAAGAATGAGATTTCTCCTTTGTTGTTGTTGTTACTT
TGCACTTGCAAAGTCTCTTTCTTTCTTTGTTGAATAAATCATTTGGATGATGATTTTCAT
ATACTTTCACCTAAAGCTGCTATTTGATTCTGGTTAATTAAATGTTTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AD49TF U 1
AF RS1EV84JQ C 47
AF RS1EV84TF U 47
BS 1 140 RS1AD49TF
BS 141 141 RS1EV84TF
BS 142 253 RS1AD49TF
BS 254 254 RS1EV84TF
BS 255 330 RS1AD49TF
BS 331 331 RS1EV84TF
BS 332 356 RS1AD49TF
BS 357 357 RS1EV84TF
BS 358 459 RS1AD49TF
BS 460 473 RS1EV84TF

RD RS1AD49TF 459 0 0
GGCGCGAAAATCTCGTCGTCTTTCATCACACTCGGGCCATTGTTTGTAGATCTGCTCGCG
TTTTTCAACCCTAATCGCCAGAACCGATTCATACGAGATCAGATATCTTACCTGAAACAA
ACCGAAAGGGTTGATTAATCATGGCACTTCTCGAGGGATTTTACAGAGTCATCATGCGCC
GTAACTCAGTCTACGTCTCCTTCATCATCGCCGGCGCTTTCTTCGGCGAACGGGCTGTGG
ATTACGGTGTTCACAAGCTCTGGGAAAGCAAAAATGTTGGGAAACGGTATGAAGACATCT
CTGTGTTGGGTCAAAGGCCTATTGAAGAATTAGATTTCTCCTTTGTTGTTGTTGTTGCTT
TGCACTTGCAAAGTCTCTTTCTTTCTTTGTTGAATAAATCATTTGGATGATGATTTTCAT
ATACTTTCACCTAAAGCTGCTATTTGATTCTGGTTAATT

QA 1 459 1 459
DS 

RD RS1EV84JQ 427 0 0
TAGATCTGCTCGCGTTTTTCAACCCTAATCGCCAGAACCGATTCATACGAGATCAGATAT
CTTACCTGAAACAAACCGAAAGGGTTGATTAATCGTGGCACTTCTCGAGGGATTTTACAG
AGTCATCATGCGCCGTAACTCAGTCTACGTCTCCTTCATCATCGCCGGCGCTTTCTTCGG
CGAACGGGCTGTGGATTACGGTGTTCATAAGCTCTGGGAAAGCAAAAATGTTGGGAAACG
GTATGAAGACATCTCTGTGTTGGGTCAAAGGCCTATTGAAGAATGAGATTTCTCCTTTGT
TGTTGTTGTTACTTTGCACTTGCAAAGTCTCTTTCTTTCTTTGTTGAATAAATCATTTGG
ATGATGATTTTCATATACTTTCACCTAAAGCTGCTATTTGATTCTGGTTAATTAAATGTT
TTTTTTT

QA 1 427 1 427
DS 

RD RS1EV84TF 427 0 0
TAGATCTGCTCGCGTTTTTCAACCCTAATCGCCAGAACCGATTCATACGAGATCAGATAT
CTTACCTGAAACAAACCGAAAGGGTTGATTAATCGTGGCACTTCTCGAGGGATTTTACAG
AGTCATCATGCGCCGTAACTCAGTCTACGTCTCCTTCATCATCGCCGGCGCTTTCTTCGG
CGAACGGGCTGTGGATTACGGTGTTCATAAGCTCTGGGAAAGCAAAAATGTTGGGAAACG
GTATGAAGACATCTCTGTGTTGGGTCAAAGGCCTATTGAAGAATGAGATTTCTCCTTTGT
TGTTGTTGTTACTTTGCACTTGCAAAGTCTCTTTCTTTCTTTGTTGAATAAATCATTTGG
ATGATGATTTTCATATACTTTCACCTAAAGCTGCTATTTGATTCTGGTTAATTAAATGTT
TTTTTTT

QA 1 427 1 427
DS 



AS 1 3

CO CL3367Contig1 967 3 13 U
GGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGA
AGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATAACA
ATACCGGGCTCTTTGAGTCTGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAATCCCTTAACGAGGA
TCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATA
TTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGATGGGTCGCCCGGTCCGC
CTTCGGCGAGCACCGGTCGGCTTGTCTCTTCTGTTGGCGATACGCTCCTGGTCTTAACTG
GCCGGGTCGTGCCTCCTTCGCTGTTACTTTGAAGAAATTAGAGTGCTCAAAGCAAGCCTA
TGCTCTGTATACATTAGCATGGGATAACATCATAGGATTTCGATCCTATTGTGTTGGCCT
TCGGGATCGGAGTAATGATTAACAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTTCATAGTCAGAG
GTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACAACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTT
CATTAATCAAGTTCGTTATGGATGAGGTGTACGACATGGAGCTGTACGAGTGGACTAAGG
TTGACATCTCCGATGAAGCCCAGAAGGAGCGTGTTAGCCAGATGATCGAGGACGCAGAGC
CGTTTGAAGGTGAAGCTCTCTTGGACGCCAAGTGCTTCAAGTGAAAAAGATTATTGGTTT
TGGTTTGATACGCTCTCTCATATGAGTTTTGCTTCGGTGACTTGTGTTTTGATGATCCTA
TGGGTCGCTTAGTCTGTTTTTCTAATCGAGTTTTAAAGACAAGGCTGCGGTCTAAGTATA
CTTTTATCTTTTATTCTTGTGTTTGTTAATGGTTCTCTTTTTGCTGAGACAATTCATTTA
CCATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H358TF U 1
AF RS1DX27TF U 134
AF RS1DX27JQ C 150
BS 1 391 RS1H358TF
BS 392 767 RS1DX27TF
BS 768 768 RS1DX27JQ
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BS 874 875 RS1DX27JQ
BS 876 881 RS1DX27TF
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BS 895 895 RS1DX27JQ
BS 896 911 RS1DX27TF
BS 912 967 RS1DX27JQ

RD RS1H358TF 391 0 0
GGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGA
AGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATAACA
ATACCGGGCTCTTTGAGTCTGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAATCCCTTAACGAGGA
TCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATA
TTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGATGGGTCGCCCGGTCCGC
CTTCGGCGAGCACCGGTCGGCTTGTCTCTTCTGTTGGCGATACGCTCCTGGTCTTAACTG
GCCGGGTCGTGCCTCCTTCGCTGTTACTTTG

QA 1 391 1 391
DS 

RD RS1DX27TF 790 0 0
G
GAGTCTGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAATCCCTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCA
AGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGCA
GTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGATGGGTCGCCCGGTCCGCCTTCGGCGAGCACC
GGTCGGCTTGTCTCTTCTGTTGGCGATACGCTCCTGGTCTTAACTGGCCGGGTCGTGCCT
CCTTCGCTGTTACTTTGAAGAAATTAGAGTGCTCAAAGCAAGCCTATGCTCTGTATACAT
TAGCATGGGATAACATCATAGGATTTCGATCCTATTGTGTTGGCCTTCGGGATCGGAGTA
ATGATTAACAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTTCATAGTCAGAGGTGAAATTCTTGGA
TTTATGAAAGACGAACAACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGTTC
GTTATGGATGAGGTGTACGACATGGAGCTGTACGAGTGGACTAAGGTTGACATCTCCGAT
GAAGCCCAGAAGGAGCGTGTTAGCCAGATGATCGAGGACGCAGAGCCGTTTGAAGGTGAA
GCTCTCTTGGACGCCAAGTGCTTCAAGTGAAAA*GATTATTGGTTTTGGTTTGATACGCT
CTCTCATATGAGTTTTGCTTCG*TGACTTGTGTTTTGATGATCCTATGGGTCGCTTAGTC
TGTTTTTCTAATCGAGTTT**AAGACA**GCTGCGGTCTA*GTATACTTTTATCTTT
ATTCTGTGTTGT

QA 2 778 2 778
DS 

RD RS1DX27JQ 818 0 0
AATGAGTACAATCTAAATCCCTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCA
GCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTA
GTTGAACCTTGGGATGGGTCGCCCGGTCCGCCTTCGGCGAGCACCGGTCGGCTTGTCTCT
TCTGTTGGCGATACGCTCCTGGTCTTAACTGGCCGGGTCGTGCCTCCTTCGCTGTTACTT
TGAAGAAATTAGAGTGCTCAAAGCAAGCCTATGCTCTGTATACATTAGCATGGGATAACA
TCATAGGATTTCGATCCTATTGTGTTGGCCTTCGGGATCGGAGTAATGATTAACAGGGAC
AGTCGGGGGCATTCGTATTTCATAGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAA
CAACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGTTCGTTATGGATGAGGTG
TACGACATGGAGCTGTACGAGTGGACTAAGGTTGACATCTCCGATGAAGCCCAGAAGGAG
CGTGTTAGCCAGATGATCGAGGACGCAGAGCCGTTTGAAGGTGAAGCTCTCTTGGACGCC
AAGTGCTTCAAGTGAAAAAGATTATTGGTTTTGGTTTGATACGCTCTCTCATATGAGTTT
TGCTTCGGTGACTTGTGTTTTGATGATCCTATGGGTCGCTTAGTCTGTTTTTCTAATCGA
GTTTTAAAGACAAGGCTGCGGTCTAAGTATACTTTTATCTTTTATTCTTGTGTTTGTTAA
TGGTTCTCTTTTTGCTGAGACAATTCATTTACCATACC

QA 1 818 1 818
DS 



AS 1 3

CO CL3368Contig1 1273 3 17 U
CGATTGTTTCTGTTATTTATTTGAGTCGGTTCTAATTTTTGTTTTCAGGCATCAAGATGG
TAACGCCAGTTATAAGAACCGCTGATCTCCGGTCCGACACGGTGACCAAGCCAACTGAGT
CAATGCGTTCAGCTATGGCGAACGCGGAAGTAGACGACGACGTTTTGGGGAGCGATCCAA
CGGCAGTGCTTTTGGAAAGAGAGGTGGCTGAGATCGCAGGAAAAGAAGCGGCCATGTTTG
TTCCGTCAGGGACAATGGGGAATCTGATAAGCGTTTTAGTCCATTGCGATGAGAGAGGGA
GCGAAGTGATTCTTGGAGATGATTCTCACATTCATATTTATGAAAACGGTGGCGTTTCAA
GCCTCGGTGGAGTGCACCCAAGAACGGTGAAGAATGAAGAGGATGGGACGATGGAGATTA
GTTCTATTGAAGCTGCTATGAGGAGTCCCAAAGGAGATCTCCATTATCCGGTTACTAAGC
TTATATGTCTTGAGAACACTCAAGCAAATTGTGGAGGTAAATGCTTACCTATAGAATATA
TAGACAAGGTTGGAGAGTTAGCCAAGAAACATGGATTGAAGCTTCACATTGATGGAGCTC
GTATCTTCAACGCTTCTGTTGCACTCGGAGTACCAGTGAAGAGGATTGTTCAAGCCGCTG
ACTCTGTATCGATTTGTTTGTCGAAAGGCATAGGTGCACCTGTCGGTTCGGTAATCGTGG
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TAAGAGTGAACGTCGCGGCAGTGGAAACCAACATCATATACGTAGATCTACCAAAAGATC
CCAAGTTTGGAGCTGAAGACGCATGTAAGAGTTTGGAAGTTCTAGGTGTGCTTGTTATAC
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AATATGCGCTCTCTTGTTTTGAGAAACTGTTTAGCTCGGTGCCAGAAGAGAAGGTTTGAT
TTGAAGTTATTCACGTGTTGGACTATGTCATAGTACTTGAATCTATTTTCTTGCTTTACA
AATTGAAATAGTTTGGTCAAGCAATAGACAACTATCTTTATTATAATCCAAGTTATTGAA
CAATTTATGAAGC


BQ
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GTATCTTCAACGCTTCTGTTGCACTCGGAGTACCAGTGAAGAGGATTGTTCAAGCCGCTG
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GAA

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DS 

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G
TATGAAAACGGTGGCGTTTCAAGCCTCGGTGGAGTGCACCCAAGAACGGTGAAGAATGAA
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CTCCATTATCCGGTTACTAAGCTTATATGTCTTGAGAACACTCAAGCAAATTGTGGAGGT
AAATGCTTACCTATAGAATATATAGACAAGGTTGGAGAGTTAGCCAAGAAACATGGATTG
AAGCTTCACATTGATGGAGCTCGTATCTTCAACGCTTCTGTTGCACTCGGAGTACCAGTG
AAGAGGATTGTTCAAGCCGCTGACTCTGTATCGATTTGTTTGTCGAAAGGCATAGGTGCA
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AAAACCTTGGGTGGAGGAATGAGACAGATAGGTGTGCTCTGTGCCGCCGCATTGGTGGCT
CTCCCTGATAACGTCGCTAAGCTCGACGATGACCACAAGAAAGCCAAGATCTTGGCAGAA
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TACGTAGATCTACCAAAAGATCCCAAGTTTGGAGCTGA*GACGCATGTAAGAGTTTGGAA
GTTCTAG*TGTGCTTGTTATACCTCAAACTACATTCAGAATCAG*ATTGTTCTGCAC*AC
CAAATCTCAGATAGCGACTGG**ATATGCGCTCTCTTGTTT
GAGA

QA 2 762 2 762
DS 

RD RS1E264JQ 741 0 0
AGAATATATAGACAAGGTTGGAGAGTTAGCCAAGAAACATGGATTGAAGCTTCACATTGA
TGGAGCTCGTATCTTCAACGCTTCTGTTGCACTCGGAGTACCAGTGAAGAGGATTGTTCA
AGCCGCTGACTCTGTATCGATTTGTTTGTCGAAAGGCATAGGTGCACCTGTCGGTTCGGT
AATCGTGGGAAGCAAAAGTTTCATCACCAAAGCAAGGTGGTTAAGGAAAACCTTGGGTGG
AGGAATGAGACAGATAGGTGTGCTCTGTGCCGCCGCATTGGTGGCTCTCCCTGATAACGT
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TGAACGGTTAAGAGTGAACGTCGCGGCAGTGGAAACCAACATCATATACGTAGATCTACC
AAAAGATCCCAAGTTTGGAGCTGAAGACGCATGTAAGAGTTTGGAAGTTCTAGGTGTGCT
TGTTATACCTCAAACTACATTCAGAATCAGGATTGTTCTGCACCACCAAATCTCAGATAG
CGACTTGGAATATGCGCTCTCTTGTTTTGAGAAACTGTTTAGCTCGGTGCCAGAAGAGAA
GGTTTGATTTGAAGTTATTCACGTGTTGGACTATGTCATAGTACTTGAATCTATTTTCTT
GCTTTACAAATTGAAATAGTTTGGTCAAGCAATAGACAACTATCTTTATTATAATCCAAG
TTATTGAACAATTTATGAAGC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 3

CO CL3369Contig1 667 3 5 U
ATATCATAAACCAAATTAAAAATGACTAAACCGAAATCTCCACTGAACACTGGGCACCAC
CCCCAGCTACAACGTTCAAAACAATTTAATCTATACAAACAGGTCCCAACCCAAACTCTT
AATGCAACAAGATTTTAAACGTGCTAACAAAAAAAAAATATAAAATCAAGCCACTCTAAG
TGTATAGCAATAACACCAGATATGGAAGCTAAATCTGACGATGAGCTTTTCAAGGAAGAC
AAGATATCTCTCTACTCAATTGTTGTTGTTATGAGCCGCAGGTGTAATCTCATCTTGTGT
CTCCCCTGCGTTGTTTCTTGTTAACCTGCTGAGCTGAATTCCTGCAAAACTTGCACCAGT
ACTAGTAGCTCCAGGACCAGGACCAGAACCAGAATCAGGATTACTAGGAGCAGCAGCCTG
AGAGCTTCCTTCGTTCCCATTACTAGCTGCAGCAGCAGCTTTTAGCTCCCTCTTGTTCTT
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GAAGTTACTTCCCATCTGTGAGACAAGGGCGTAAAGAGGCAGTGTACTGTAACTGCAAAG
CACTTGAATGAAGACTCCGATAACCAATCGTGGCACAATGTATCTCACTTGTCCCATAAT
GCAAGAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

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BS 276 276 RS1B092JQ
BS 277 667 RS1GY19JQ

RD RS1B092JQ 472 0 0
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ATTTAATCTATACAAACAGGTCCCAACCCAAACTCTTAATGCAACAAGATTTTAAACGTG
CTAACAAAAAAAAAATATAAAATCAAGCCACTCTAAGTGTATAGCAATAACACCAGATAT
GGAAGCTAAATCTGACGATGAGCTTTTCAAGGAAGACAAGATATCTCTCTACTCAATTGT
TGTTGTTATGAGCCGCAGGTGTAATCTCATCTTGTGTCTCCCCTGCGTTGTTTCTTGTTA
ACCTGCTGAGCTGAATTCCTGCAAAACTTGCACCAGTACTAGTAGCTCCAGGACCAGGAC
CAGAACCAGAATCAGGATTACTAGGAGCAGCAGCCTGAGAGCTTCCTTCGTTCCCATTAC
TAGCTGCAGCAGCAGCTTTTAGCTCCCTCTTGTTCTTCACTTTCTGTGCCC
C

QA 1 471 1 471
DS 

RD RS1B092TF 472 0 0
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ATTTAATCTATACAAACAGGTCCCAACCCAAACTCTTAATGCAACAAGATTTTAAACGTG
CTAACAAAAAAAAAATATAAAATCAAGCCACTCTAAGTGTATAGCAATAACACCAGATAT
GGAAGCTAAATCTGACGATGAGCTTTTCAAGGAAGACAAGATATCTCTCTACTCAATTGT
TGTTGTTATGAGCCGCAGGTGTAATCTCATCTTGTGTCTCCCCTGCGTTGTTTCTTGTTA
ACCTGCTGAGCTGAATTCCTGCAAAACTTGCACCAGTACTAGTAGCTCCAGGACCAGGAC
CAGAACCAGAATCAGGATTACTAGGAGCAGCAGCCTGAGAGCTTCCTTCGTTCCCATTAC
TAGCTGCAGCAGCAGCTTTTAGCTCCCTCTTGTTCTTCACTTTCTGTGCCC
C

QA 1 471 1 471
DS 

RD RS1GY19JQ 667 0 0
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CCCCAGCTACAACGTTCAAAACAATTTAATCTATACAAACAGATCCCAACCCAAACTCTT
AATGCAACAAGATTTTAAACGTGCTAACAAAAAAAAAATATAAAATCAAGCCACTCTAAG
TGTATAGCAATAACACCAGATATGGAAGCTAAATCTGACGATGAGCTTTTCAAGGAAGAC
AAGATATCTCTCTACTCAATTGTTGTTGTTATGAGTCGCAGGTGTAATCTCATCTTGTGT
CTCCCCTGCGTTGTTTCTTGTTAACCTGCTGAGCTGAATTCCTGCAAAACTTGCACCAGT
ACTAGTAGCTCCAGGACCAGGACCAGAACCAGAATCAGGATTACTAGGAGCAGCAGCCTG
AGAGCTTCCTTCGTTCCCATTACTAGCTGCAGCAGCAGCTTTTAGCTCCCTCTTGTTCTT
CACTTTCTGTGCCCAACCAACAAGACCGACCTGCACATTCTCCTCAAATATCGCTTTCTT
GAAGTTACTTCCCATCTGTGAGACAAGGGCGTAAAGAGGCAGTGTACTGTAACTGCAAAG
CACTTGAATGAAGACTCCGATAACCAATCGTGGCACAATGTATCTCACTTGTCCCATAAT
GCAAGAG

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 3

CO CL3370Contig1 860 3 4 U
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GTTGTTACACTTTTAGTGGTGATTGCGTACCAAGAGGGAGAAGCCATACAATGTTCACGG
ATAACCATGTACTTAGCACCATGTTTGTCTTATGTAAAAGGTGGAGGAAACCCGCCTCCT
CCGTGTTGCGCCGGGCTCAATAATCTAAAAGCCTCAGCGCCGGGGAAACCCGATAAACAA
GCAGCTTGTCAATGCTTGAAGAATGTAGCTAATGCTATATCCGGATTCAACGATGACAAT
GCCAAACAACTCCCTGGTAAATGCGGTGTTAATGTGGGGGTCCCTTTCTCCAAGAGCGTG
GACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAAGGACTACCAACGGACATGCAGCAATCATATAAA
GTGGATATCCTAAACGAGCAAAAAGCATTATAGCAAAACTAATCGGATACTTTAAACATG
CAATCATATAGCTCTTGTCAAAATAAACTGTGGAATTCATACATCTAGACAATTTTCTCT
AGTCTAAATGTTTTAATTTTTAAACGAGGATTAATTAGCCAAGTTAATTATCTTTGATTA
GTACTATTAACAGAAAATAGTATAGTATGGTAGTATCTGCTTTTGTACCATGTGAACAAA
AGTAAGACGCTTCTATGCTTTCTACCACACAACCTTTCACCACAGTGTGATCTCCATCTC
CAATTCCTAAACAGCAAAAATAGGGGGGCAAATATGTCTTTTGCTCATATATTTGGGTTA
ATTAGCGAAGTTTTGTATTTAATTACACAGGCCCCAACATTTAATAGTGGTTGTCGGTAA
TAATAACATAAGCTTTCTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BK73TF U 432
AF RS1D475TF U 1
AF RS1D475JQ C 183
BS 1 714 RS1D475TF
BS 715 715 RS1D475JQ
BS 716 740 RS1D475TF
BS 741 860 RS1D475JQ

RD RS1BK73TF 171 0 0
G
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TTAATTTTTAAACGAGGATTAATTAGCCAAGTTAATTATCTTTGATTAGT

QA 2 171 2 171
DS 

RD RS1D475TF 740 0 0
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GTTGTTACACTTTTAGTGGTGATTGCGTACCAAGAGGGAGAAGCCATACAATGTTCACGG
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CCGTGTTGCGCCGGGCTCAATAATCTAAAAGCCTCAGCGCCGGGGAAACCCGATAAACAA
GCAGCTTGTCAATGCTTGAAGAATGTAGCTAATGCTATATCCGGATTCAACGATGACAAT
GCCAAACAACTCCCTGGTAAATGCGGTGTTAATGTGGGGGTCCCTTTCTCCAAGAGCGTG
GACTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAAGGACTACCAACGGACATGCAGCAATCATATAAA
GTGGATATCCTAAACGAGCAAAAAGCATTATAGCAAAACTAATCGGATACTTTAAACATG
CAATCATATAGCTCTTGTCAAAATAAACTGTGGAATTCATACATCTAGACAATTTTCTCT
AGTCTAAATGTTTTAATTTTTAAACGAGGATTAATTAGCCAAGTTAATTATCTTTGATTA
GTACTATTAACAGAAAATAGTATAGTATGGTAGTATCTGCTTTTGTACCATGTGAACAAA
AGTAAGACGCTTCTATGCTTTCTACCACACAACCTTTCACCACAGTGTGATCTC*ATCTC
CAATTCCTAAACAGCAAAAA

QA 1 740 1 740
DS 

RD RS1D475JQ 678 0 0
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AGCTTGTCAATGCTTGAAGAATGTAGCTAATGCTATATCCGGATTCAACGATGACAATGC
CAAACAACTCCCTGGTAAATGCGGTGTTAATGTGGGGGTCCCTTTCTCCAAGAGCGTGGA
CTGTAACAGCATAAACTGAAAAGAAGGACTACCAACGGACATGCAGCAATCATATAAAGT
GGATATCCTAAACGAGCAAAAAGCATTATAGCAAAACTAATCGGATACTTTAAACATGCA
ATCATATAGCTCTTGTCAAAATAAACTGTGGAATTCATACATCTAGACAATTTTCTCTAG
TCTAAATGTTTTAATTTTTAAACGAGGATTAATTAGCCAAGTTAATTATCTTTGATTAGT
ACTATTAACAGAAAATAGTATAGTATGGTAGTATCTGCTTTTGTACCATGTGAACAAAAG
TAAGACGCTTCTATGCTTTCTACCACACAACCTTTCACCACAGTGTGATCTCCATCTCCA
ATTCCTAAACAGCAAAAATAGGGGGGCAAATATGTCTTTTGCTCATATATTTGGGTTAAT
TAGCGAAGTTTTGTATTTAATTACACAGGCCCCAACATTTAATAGTGGTTGTCGGTAATA
ATAACATAAGCTTTCTCG

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 3

CO CL3371Contig1 565 3 1 U
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TTGCATGCATGGAAGTTTTTTTTTTGTTCAAACTCTTGGAAGTTATATATACTTACCAAA
GTCATTTATTATTCATATAATAATTCGCAAATAGAATAATCTCCAGAGATTTTTGACTTC
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TAAAATACTTCACCTTACTTGTTAGCATCGTACTAAATGACATCACCATACCTTTAGTTT
CTTCATCCTCTTCTTCTTTTATGATCATTTGGTTCACCTCTTCCTCTCTCGAACCATCTT
CTTCATCACTCTCATAACGTTCTTTCACCCACGTCTTCTTCACGTGATGCTTTGCCGGTG
CACCTTCTTGGTCGTTTTCGGTAAACCCTTGAAAATGTGTAGTACTCCATGCTTGATCTG
CTTTATATTACTTTGAATTGTATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1F234TF C 1
AF RS1FF38JQ U 1
AF RS1F234JQ U 17
BS 1 565 RS1FF38JQ

RD RS1F234TF 565 0 0
CTCTTAGATATCAATATTTCGCAACAGAAATTACAACTTACAAGCACATGGTGAAACATG
TTGCATGCATGGAAGTTTTTTTTTTGTTCAAACTCTTGGAAGTTATATATACTTACCAAA
GTCATTTATTATTCATATAATAATTCGCAAATAGAATAATCTCCAGAGATTTTTGACTTC
AACCCCTGCATCTGTAGTACTTGGGATGGCCACGGTGGTACCTGTTCGACGGAGGAGGCA
TGACTCTTCCTCCACCACTAGACGCTGCCGGTGGCGTATCATGTTTGAGAGCTCCATAGT
TAAGATACTTCACCTTACTTGTTAGCATCGTACTAGATGACATCACCATACCTTTAGTTT
CTTCATCCTCTTCTTCTTTTATGATCATTTGGTTCACCTCTTCCTCTCTCGAACCATCTT
CTTCATCACTCTCATAACGTTCTTTCACCCACGTCTTCTTCACGTGATGCTTTGCCGGTG
CACCTTCTTGGTCGTTTTCGGTAAACCCTTGAAAATGTGTAGTACTCCATGCTTGATCTG
CTTTATATTACTTTGAATTGTATCC

QA 1 565 1 565
DS 

RD RS1FF38JQ 565 0 0
CTCTTAGATATCAATATTTCGCAACAGAAATTACAACTTACAAGCACATGGTGAAACATG
TTGCATGCATGGAAGTTTTTTTTTTGTTCAAACTCTTGGAAGTTATATATACTTACCAAA
GTCATTTATTATTCATATAATAATTCGCAAATAGAATAATCTCCAGAGATTTTTGACTTC
AACCCCTGCATCTGTAGTACTTGGGATGGCCACGGTGGTACCTGTTCGACGGAGGAGGCA
TGACTCTTCCTCCACCACTAGACGCTGCCGGTGGCGTATCATGTTTGAAAGCTCCATAGT
TAAAATACTTCACCTTACTTGTTAGCATCGTACTAAATGACATCACCATACCTTTAGTTT
CTTCATCCTCTTCTTCTTTTATGATCATTTGGTTCACCTCTTCCTCTCTCGAACCATCTT
CTTCATCACTCTCATAACGTTCTTTCACCCACGTCTTCTTCACGTGATGCTTTGCCGGTG
CACCTTCTTGGTCGTTTTCGGTAAACCCTTGAAAATGTGTAGTACTCCATGCTTGATCTG
CTTTATATTACTTTGAATTGTATCC

QA 1 565 1 565
DS 

RD RS1F234JQ 549 0 0
TTTCGCAACAGAAATTACAACTTACAAGCACATGGTGAAACATGTTGCATGCATGGAAGT
TTTTTTTTTGTTCAAACTCTTGGAAGTTATATATACTTACCAAAGTCATTTATTATTCAT
ATAATAATTCGCAAATAGAATAATCTCCAGAGATTTTTGACTTCAACCCCTGCATCTGTA
GTACTTGGGATGGCCACGGTGGTACCTGTTCGACGGAGGAGGCATGACTCTTCCTCCACC
ACTAGACGCTGCCGGTGGCGTATCATGTTTGAAAGCTCCATAGTTAAAATACTTCACCTT
ACTTGTTAGCATCGTACTAAATGACATCACCATACCTTTAGTTTCTTCATCCTCTTCTTC
TTTTATGATCATTTGGTTCACCTCTTCCTCTCTCGAACCATCTTCTTCATCACTCTCATA
ACGTTCTTTCACCCACGTCTTCTTCACGTGATGCTTTGCCGGTGCACCTTCTTGGTCGTT
TTCGGTAAACCCTTGAAAATGTGTAGTACTCCATGCTTGATCTGCTTTATATTACTTTGA
ATTGTATCC

QA 1 549 1 549
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3373Contig1 1223 3 13 U
TGGATCCAGGTTAACAGAAAGCTTATAAAAGAGCAGGATACTTGGCGGAAGAAGTTCAAG
GAAATAGAAGAGAGGTGAAAGATGTTTTTCTCTTGTTAAATATGATTTTACATAAAACGA
AAATCATAATACGTGGTAAAGAAACAATCGACTTATGGTGTCTATTCAGGGAAGCTGCAT
TGCTAGGATCAAAAGACGAGACTATAGCTGATCTTGAAGAACAGATAAGAGATATAAGGG
TGTTTGTTGAAGCACAGAAAACGTTAAAGAATATGTCATCAGATTCGGATGGTATACGTG
AAGGAACCGTCTTGCCAGTGCCTATCAACCAGGAGCCAGTTAGAAGGCAGAAGAAGAAGT
CAAACCGTAGAAAGTAAATGAAGATTGGGTTTGTGATATTCTTTTGGTTTGTTGTCCAAA
TTGATCTAATATCTGGTGTAGTAGTACTATTGTAGATAAAAATACTATTTTTCAACAGGA
AATAACTTTTGGTTTTGGTTAAACGTGTTTAGTGATACTAGTAAGTCTTGCCGACACAGG
GACCAAATTCAAACGTAATCAACTCCTCGTCACTTTTTCATCAAGATTATTACACAACTA
GCTTTGAATTGCTGGTTTCATTACATTATATACACACACAAATACATCCACGCTGGTGGG
GCTATGATCAGCAGTGGGAACCCTTTTTGCAGCTGAGCGCACCAGAAGATATAGTTATCT
CACCAACATTAGAGGACGGTCTAGCAGCTAGGCTTGAGGCTCTCGAATAGCTTGACGATT
TAGTTGGTCCAGCTCCAGAAAGTGTAAAGAATGCACCATTAAGCATTAGATCTCCTTCGG
ATCTCCAATTCCAATGACTCCATTCGCTTTCTGGCGCATCCTCATGCTTTGTTACCTCTT
TGCTAAAAGAGTTAGCAGGAGCAAGGAAACGGTTGCCTTGGGAGTTGATGGTAGGATTAG
CACTTCCTCCAATTGCATACATTTCCCAATGTGTATAGTCATTGTCCACCACATGGAAAT
ATCCATGTCGACACCTTGGCATTCTTTGGACAAGGCCTTCTCCAAAGTGGTTAAAAGCGA
TAGTGACTTGCATATTCTTGTCTTGCTCGTACGTATCACCATGTCCCAATAACATAACCT
TATTGTGATGCGTCAAGTAATTATTAGAAATCGTTATAGCCGTCGATCCACGGATTGCAT
CAATCAACCCATCGTTACAATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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GCTTTGAATT

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CTTGTCTTGCTCGTACGTATCACCATGTCCC

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DS 

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TGCTGGTTTCATTACATTATATACACACACAAATACATCCACGCTGGTGGGGCTATGATC
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CAGCTCCAGAAAGTGTAAAGAATGCACCATTAAGCATTAGATCTCCTTCGGATCTCCAAT
TCCAATGACTCCATTCGCTTTCTGGCGCATCCTCATGCTTTGTTACCTCTTTGCTAAAAG
AGTTAGCAGGAGCAAGGAAACGGTTGCCTTGGGAGTTGATGGTAGGATTAGCACTTCCTC
CAATTGCATACATTTCCCAATGTGTATAGTCATTGTCCACCACATGGAAATATCCATGTC
GACACCTTGGCATTCTTTGGACAAGGCCTTCTCCAAAGTGGTTAAAAGCGATAGTGACTT
GCATATTCTTGTCTTGCTCGTACGTATCACTATGTCCCAATAACATAACCTTATTGTGAT
GCGTCAAGTAATTATTAGAAATCGTTATAGCCGTCGATCCACGGATTGCATCAATCAACC
CATCGTTACAATTC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 3

CO CL3374Contig1 652 3 18 U
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CATCATGAGCAATACTTGTGTTCTTTGGCTCGCTGTCATACCGGAAAGAAGTGCATTCGT
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CAGAGCTGTAACTGTATTTTATCTCCGAACTCTGTGCATTTGCGTTACTTTCATCAATGG
GACTTTCTCTCTCGCTTCCAGAGTCAGAGGAACTGCTCCTAGAAGCGCTTCC


BQ
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TTTTCAAGATATATTTACATAAAAGTGTGACATATGTATATTAAATTTAATGTGTCAATC
TGTGTTGTTTCAAAAATGAAAAGTTGAAACAATTTCTTTTCATGTTGAAAATGTGCTCAA
AGATGACTTCTGA*AAAAAAAAACTTTTGAAAAGATTTCACTCTTCATCAAAAAAACCGT
GGTCTTCTTCCTTTGGTTCAAACCTATTCAAAGACGACTCGCCTGCATCATCATCATCAT
CATCATC******TGAATAAATACTTTGGGCTTCAAATTTTGAGCTTTGAACGTGCTCAA
GCCGAGTTTCATGATTCTCATCCTCATCTTCTTCCTCCTCCTCATCATCATCACTATGAT
CATCATGAGCAATACTTGTGTTCTTTGGCTCGCTGTCATACCGGAAAGAAGTGCATTCGT
TGTCTGATTTACAGCTGCTTTTACTGCTTAGCCTCTCGTTATCTTCTTCTTCCTCTTCCT
CAGAGCTGTAACTGTATTTTATCTCCGAACTCTGTGCATTTGCGTTACTTTCATCAATGG
GACTT

QA 1 605 1 605
DS 

RD RS1CO61TF 583 0 0
TAT
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AAAATGAAAAGTTGAAACAATTTCTTTTCATGTTGAAAATGTGCTCAAAGATGACTTCTG
AGAAAAAAAAACTTTTGAAAAGATTTCACCCTTCATCAGAAGAACCGTGGTCTTCTTCCT
TTGGTTCAAACCTATTCAAAGACGACTCGCCTGCATCATCATCATCATCATCATCATCAT
CTGAATAAATACTTTGGGCTTCAGATTTTGAGCTTTGAACGTGCTCAAGCCGAGTTTCAT
GATTCTCATCCTCATCTTCCTCCTCCTCCTCATCATCATCACTATGATCATCATGAGCAA
TACTTGTGTTCTTTGGCTCGCTGTCATACCGGAAAGAAGTGCATTCGTTGTCTGATTTAC
AGCTGCTTTTACTGCTTAGCCTCTCGTTATCTTCTTCTTCCTCTTCCTCAGAGCTGTAAC
TGTATTTTATCTCCGAACTCTGTGCATTTGCGTTACTTTCATCAATGGGACTTTCTCTCT
CGCTTCCAGAGTCAGAGGAACTGCTCCTAGAAGCGCTTCC

QA 4 583 4 583
DS 

RD RS1CO61JQ 580 0 0
ATTTACATAAAAGTGGGACATATGTATATTAGATTTAATGTGTCAATCTGTGTTGTTTCA
AAAATGAAAAGTTGAAACAATTTCTTTTCATGTTGAAAATGTGCTCAAAGATGACTTCTG
AGAAAAAAAAACTTTTGAAAAGATTTCACCCTTCATCAGAAGAACCGTGGTCTTCTTCCT
TTGGTTCAAACCTATTCAAAGACGACTCGCCTGCATCATCATCATCATCATCATCATCAT
CTGAATAAATACTTTGGGCTTCAGATTTTGAGCTTTGAACGTGCTCAAGCCGAGTTTCAT
GATTCTCATCCTCATCTTCCTCCTCCTCCTCATCATCATCACTATGATCATCATGAGCAA
TACTTGTGTTCTTTGGCTCGCTGTCATACCGGAAAGAAGTGCATTCGTTGTCTGATTTAC
AGCTGCTTTTACTGCTTAGCCTCTCGTTATCTTCTTCTTCCTCTTCCTCAGAGCTGTAAC
TGTATTTTATCTCCGAACTCTGTGCATTTGCGTTACTTTCATCAATGGGACTTTCTCTCT
CGCTTCCAGAGTCAGAGGAACTGCTCCTAGAAGCGCTTCC

QA 1 580 1 580
DS 



AS 1 3

CO CL3375Contig1 1263 3 15 U
GGGTCTGCTTTACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCAGTACTTGAATCTCTCGTGT
TACACGACTTTGCGATTAGATTCTCCCAAAAGCCCCACAATTTCAAATGGCGGATCCATC
ATCATCTCCTCAAAGCCTCACCCTTTCCACTTCCCCACCTCCTCCTCCTCCACCTACCCT
TCAATCAACAACCTCGGAACCACCGCCTCCTCCACCGACTCATCGCTCCTCCTCCCTCTT
CCCCTTCCTCAACAAGCCTCTGAACCGACCGAAGCTCCGTGTGACGTCCAAATTCGACAG
CGACAGTCTCCTCTTCCTGAACAAAGTCTCTTGCAAGCTTTTCGACAACCTCGCCAAGCT
CAAGCTCTCGTTTCAGAACAACTCCCAGCGCGAGGTCACTCAGCCTCAGGTCTCTCTCAC
CTCCAAGTACCTCTCTGTTCTCTACGATGTCGAGGAGAAGAACACTTTCATCAAGAGCAC
CGTCGATGTCTCCCCTCGCCTTCAGCTCCGAGCTCTTCATAATGTCAATGCACAACAAGG
AGAGGTTACTATGGAGGCAAACCTGGCTGAACCTGGTTACTCTCTTGAGCTTTCATCACC
TGTTCCTATTGGCTACCCAAGAGCGACTCTTAAATTCCCACTAGGCGAAGTTTCGATACA
AGAGAGAGAAGAGGGGGAGGAGGAAGAGGAGAAGAATAAGAGAATGTTATCCGTTAATGG
GATCCTCAAACGTCAAGTTATGGATGGTGTTTGTTCTGCTCTATACACAGATGAAGAGTT
GAGGCTGAGATATGCTTATAAGGATGAAGCGTTGTCTTTCGTCCCAACCATCTCCCTTCC
TTCCAATGCTGCTTCGTTTGCATTCAAGCGTCGGTTTAGCCCTTCAGATAAGTTGAGCTA
CTGGTACAAGTTTGATTCAAACATGTGGAGTGCTGTTTACAAACGCACGTATGGTAAAGA
CTACAAGTTCAAAGCTGGCTATGATTTTGAAGTACGCCTTGGCTGGGCTTCTCTCTGGGT
GGGGGATGAAGCTGGTAAAGTGAAAACGACGCCAATGAAGATGAAAGTGCAGTTCATGCT
TCAAGTCCCACAAGATGACATCAAAACCTCAGTCTTGATGTTCCGAGTCAAGAAAAGATG
GGACATTTGAATGAAAAAAACAAAAATCTATAATAACAGTCTCATTTTACACTTTTGCAT
ACTGTCTCTCTGTAATACTGTAGTAAAACCACTGTAATAAAGATTAATGTAAACCTTCTT
TGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1CX38TF U 1
AF RS1CC25TF U 95
AF RS1CX38JQ C 505
BS 1 463 RS1CX38TF
BS 464 464 RS1CC25TF
BS 465 644 RS1CX38TF
BS 645 645 RS1CC25TF
BS 646 678 RS1CX38TF
BS 679 727 RS1CC25TF
BS 728 728 RS1CX38JQ
BS 729 802 RS1CC25TF
BS 803 803 RS1CX38JQ
BS 804 807 RS1CC25TF
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BS 809 843 RS1CC25TF
BS 844 844 RS1CX38JQ
BS 845 869 RS1CC25TF
BS 870 1263 RS1CX38JQ

RD RS1CX38TF 678 0 0
GGGTCTGCTTTACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCAGTACTTGAATCTCTCGTGT
TACACGACTTTGCGATTAGATTCTCCCAAAAGCCCCACAATTTCAAATGGCGGATCCATC
ATCATCTCCTCAAAGCCTCACCCTTTCCACTTCCCCACCTCCTCCTCCTCCACCTACCCT
TCAATCAACAACCTCGGAACCACCGCCTCCTCCACCGACTCATCGCTCCTCCTCCCTCTT
CCCCTTCCTCAACAAGCCTCTGAACCGACCGAAGCTCCGTGTGACGTCCAAATTCGACAG
CGACAGTCTCCTCTTCCTGAACAAAGTCTCTTGCAAGCTTTTCGACAACCTCGCCAAGCT
CAAGCTCTCGTTTCAGAACAACTCCCAGCGCGAGGTCACTCAGCCTCAGGTCTCTCTCAC
CTCCAAGTACCTCTCTGTTCTCTACGATGTCGAGGAGAAGAACGCTTTCATCAAGAGCAC
CGTCGATGTCTCCCCTCGCCTTCAGCTCCGAGCTCTTCATAATGTCAATGCACAACAAGG
AGAGGTTACTATGGAGGCAAACCTGGCTGAACCTGGTTACTCTCTTGAGCTTTCATCACC
TGTTCCTATTGGCTACCCAAGAGCGACTCTTAAATTCCCACTAG*CGAAGTTTCGATACA
AGAGAGAGAAGAGGGGGA

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1CC25TF 775 0 0
GG
ACAATTTCAAATGGCGGATCCATCATCATCTCCTCAAAGCCTCACCCTTTCCACTTCCCC
ACCTCCTCCTCCTCCACCTACCCTTCAATCAACAACCTCGGAACCACCGCCTCCTCCATC
GACTCATCGCTCCTCCTCCCTCTTCCCCTTCCTCAACAAGCCTCTGAACCGACCGAAGCT
CCGTGTGACGTCCGAATTCGACAGCGACAGTCTCCTCTTCCTGAACAAAGTCTCTTGCAA
GCTTTTCGACAACCTCGCCAAGCTCAAGCTCTCGTTTCAGAACAACTCCCAGCGCGAGGT
CACTCAGCCTCAGGTCTCTCTCACCTCCAAGTACCTCTCTGTTCTCTACGATGTCGAGGA
GAAGAACACTTTCATCAAGAGCACCGTCGATGTCTCCCCTCGCCTTCAGCTC*GAGCTCT
TCATAATGTCAATGCACAACAAGGAGAGGTCGCTATGGAGGCAAACCTGGCTGAACCTGG
TTACTCTCTTGAGCTTTCATCACCTGTTCCTATTGGCTACCCAAGAGCGACTCTTAAATT
CCCACTAGGCGAAGTTTCGATACAAGAGAGAGAAGAGGGGGAGGAGGAAGAGGAGAAGAA
TAAGAGAATGTTATCCGTTAATGGGATCCTCGAACGTCAAGTTATGGATGGTGTTTGTTC
TGCTCTATACACAGATGAAGAGTTGAGGCTGAGATATGCTTATAAG*ATGA*GCGTTGTC
TTTCGTCCCAACCATCTCCCTTCCTTC*AATGCTGCTTCGTTTGCATTCAAGC

QA 3 775 3 775
DS 

RD RS1CX38JQ 759 0 0
GCTC
CGAGCTCTTCATAATGTCAATGCACAACAAGGAGAGGTTACTATGGAGGCAAACCTGGCT
GAACCTGGTTACTCTCTTGAGCTTTCATCACCTGTTCCTATTGGCTACCCAAGAGCGACT
CTTAAATTCCCACTAGGCGAAGTTTCGATACAAGAGAGAGAAGAGGGGGAGGAGGAAGAG
GAGTAGAATAAGAGAATGTTATCCGTTAATGGGATCCTCAAACGTCAAGTTATGGATGGT
GTTTGTTCTGCTCTATACACAGATGAAGAGTTGAGGCTGAGATATGCTTATAAGGATGAA
GCGTTGTCTTTCGTCCCAACCATCTCCCTTCCTTCCAATGCTGCTTCGTTTGCATTCAAG
CGTCGGTTTAGCCCTTCAGATAAGTTGAGCTACTGGTACAAGTTTGATTCAAACATGTGG
AGTGCTGTTTACAAACGCACGTATGGTAAAGACTACAAGTTCAAAGCTGGCTATGATTTT
GAAGTACGCCTTGGCTGGGCTTCTCTCTGGGTGGGGGATGAAGCTGGTAAAGTGAAAACG
ACGCCAATGAAGATGAAAGTGCAGTTCATGCTTCAAGTCCCACAAGATGACATCAAAACC
TCAGTCTTGATGTTCCGAGTCAAGAAAAGATGGGACATTTGAATGAAAAAAACAAAAATC
TATAATAACAGTCTCATTTTACACTTTTGCATACTGTCTCTCTGTAATACTGTAGTAAAA
CCACTGTAATAAAGATTAATGTAAACCTTCTTTGG

QA 5 759 5 759
DS 



AS 1 3

CO CL3376Contig1 1229 3 6 U
GATAAAGCTACCATATAGTTTCGAATCAAAACTAGGGTTACAAAATTTCTCTCAGGTATG
CCTCTCTCTCTCTCTTTCTCATCTTCTTGTGTGGAACCATTTTATATAAACTTAATGGAA
TATTTTCTATATATTTAATAATTAAAACGTTTTATCCTTTTATATTAGTGTTTTTGTTTC
GTGATCTTCAATCAGAATTTCTACAATCATATATGTTTTTCTGTCTACTGCTATAAGGTC
CAAATGGTTGATTTTGTGCAATTGATCATTCTGATTAGGGATAATAATAATGTGTAAAGT
GGATCGATTTCAATTTTAGTAATATATCATGGCATGTTATGTCCATTGTTGACGGGGTTT
TATTTTGACATTAATGTGATCGTTGAGTTTATCTATGTGATAGTGAGTGAGCTTATATAT
ATTTTTGTGGAATGAAACTGAAATTATCTGGAAAGGATGGGTGCTTAACCTTGTGATTAT
GATCGTTTCACTGCATTTCTTGGGTCATGCTCATGTAGTGTGAAGACGACGTACGAGAAA
ACAAACAATGGAGGTATATGGAAACTCACCCGTGGTTGGTTCCGCCAATGTTATCTACTT
GTCTGCGTTACTTGGTCGCGATGGACCCAATCCATGTCACAAATGTGACTGGAAATGCGA
GAACGAAAATGTGTGTGGAAATATGTACCGTTGCAAGCTAACCGGGTTGAACCATGTTTG
TGACAAGAACTGCAACCAACGGATCCTGTATGATAACCACAACTCTTTGTGCCGAGCCAG
TGGCCAGATATTCCCACTCTCACCGGCTGAGGAACAGGCGGTTAGAGGAGTCCGGAGGAA
GCTTTGATGATGAGAGTCAAACCTCTGAAAGCTGCGTCAAGCGCCGCCCGACGTGACGCT
CAGTTTCTTTCTTCTCCTTTCGAGAGGTCTTTTTGCTGCCGTGAGCCCAATTTGCAGCCA
GGCTGGAGATGGAATGGAGATGAACTAGAGATCTTTCTATCTCCGAGGGAATAATAACTT
ACCTTTCTTTTCGATTTTGGACAAACTATGTAATAAGAGATAATTATTCATGTTCTCTTC
CAGGGAGACTAGGTGTAGCTCCCGGTATGAAGCAGCATTTTATTTTAGTACCGTTGAACT
TTTATGTAGTAGTTAACGTAGGAGAGACTTCATGATTTTGCTGCTCTGTTGTGGACGTTT
CTTGTTTTAATATAACTTGTTGAAGTAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FB34TF U 1
AF RS1AD70TF U 748
AF RS1FB34JQ C 474
BS 1 662 RS1FB34TF
BS 663 663 RS1FB34JQ
BS 664 707 RS1FB34TF
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BS 748 1088 RS1AD70TF
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RD RS1FB34TF 721 0 0
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CCTCTCTCTCTCTCTTTCTCATCTTCTTGTGTGGAACCATTTTATATAAACTTAATGGAA
TATTTTCTATATATTTAATAATTAAAACGTTTTATCCTTTTATATTAGTGTTTTTGTTTC
GTGATCTTCAATCAGAATTTCTACAATCATATATGTTTTTCTGTCTACTGCTATAAGGTC
CAAATGGTTGATTTTGTGCAATTGATCATTCTGATTAGGGATAATAATAATGTGTAAAGT
GGATCGATTTCAATTTTAGTAATATATCATGGCATGTTATGTCCATTGTTGACGGGGTTT
TATTTTGACATTAATGTGATCGTTGAGTTTATCTATGTGATAGTGAGTGAGCTTATATAT
ATTTTTGTGGAATGAAACTGAAATTATCTGGAAAGGATGGGTGCTTAACCTTGTGATTAT
GATCGTTTCACTGCATTTCTTGGGTCATGCTCATGTAGTGTGAAGACGACGTACGAGAAA
ACAAACAATGGAGGTATATGGAAACTCACCCGTGGTTGGTTCCGCCAATGTTATCTACTT
GTCTGCGTTACTTGGTCGCGATGGACCCAATCCATGTCACAAATGTGACTGGAAATGCGA
GA*CGAAAATGTGTGTGGAAATATGTACCGTTGCAAGCTAACCGGGT
GAACATGTCTGTGA

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1AD70TF 341 0 0
GTATGATAACCACAACTCTTTGTGCCGAGCCAGTGGCCAGATATTCCCACTCTCACCGGC
TGAGGAACAGGCGGTTAGAGGAGTCCGGAGGAAGCTTTGATGATGAGAGTCAAACCTCTG
AAAGCTGCGTCAAGCGCCGCCCGACGTGACGCTCAGTTTCTTTCTTCTCCTTTCGAGAGG
TCTTTTTGCTGCCGTGAGCCCAATTTGCAGCCAGGCTGGAGATGGAATGGAGATGAACTA
GAGATCTTTCTATCTCCGAGGGAATAATAACTTACCTTTCTTTTCGATTTTGGACAAACT
ATGTAATAAGAGATAATTATTCATGTTCTCTTCCAGGGAGA

QA 1 341 1 341
DS 

RD RS1FB34JQ 756 0 0
TGATTATGATCGTTTCACTGCATTTCTTGGGTCATGCTCATGTAGTGTGAAGACGACGTA
CGAGAAAACAAACAATGGAGGTATATGGAAACTCACCCGTGGTTGGTTCCGCCAATGTTA
TCTACTTGTTTGCGTTACTTGGTCGCGATGGACCCAATCCATGTCACAAATGTGACTGGA
AATGCGAGAACGAAAATGTGTGTGGAAATATGTACCGTTGCAAGCTAACCGGGTTGAACC
ATGTTTGTGACAAGAACTGCAACCAACGGATCCTGTATGATAACCACAACTCTTTGTGCC
GAGCCAGTGGCCAGATATTCCCACTCTCACCGGCTGAGGAACAGGCGGTTAGAGGAGTCC
GGAGGAAGCTT*GATGATGAGAGTCAAACCTTTGAAAGCTGCGTCAAGCGCCGCC*GACG
TGACGCTCAGTTTCTTTTTTCTCCTTTCGAGAGGTCTTTT*GCTGCCGTGAGCCCAATTT
GCAGCCAGGCTGGAGATGGAATGGAGATGAACTAGAGATCTTTCTATTTCCGAGGGAATA
ATAACTTACCTTTCTTTTCGATTTTGGACAAACTATGTAATAAGAGATAATTATTCATGT
TTTTTTCCAGGGAGACTAGGTGTAGCTCCCGGTATGAAGCAGCATTTTATTTTAGTACCG
TTGAACTTTTATGTAGTAGTTAACGTAGGAGAGACTTCATGATTTTGCTGCTCTGTTGTG
GACGTTTCTTGTTTTAATATAACTTGTTGAAGTAGG

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL3377Contig1 618 2 5 U
AACTGCACCCTCATAAACACTGACAATGGTGTAAGGATCAAGACATGGCCGTCCTCAGCT
TGCTCCACGACCGCCTCGGGTATCCATTTCGAGAATATTTTCCTCAGGAACGTTACTAAC
CCTATCCTCATCGACCAAGAGTACTGCCCCTGGAACCAATGCAACAAGAACAAACCATCA
TCTATCAAGCTGGTGGACATAAGCTTCAAGCATATCAGAGGAACATCAGCGAACAAAGAC
GCAGTTAAGCTTTTGTGCAGCAAGGGATTCCCATGCAAGAACGTGGAGATCGGTGACATT
AACATTAGGTACAACGGAGCCGACGGTCCAGCAACATTCCAATGCTCCAACCTATCTCCC
AAACTGATGGGAATTCAGGTTCCTAGAGCCTGTAGCAGCCCAGTGACTAAGCTACCAGGC
CAATAAGAAATCTCGATGTACGTGACAACCTATACGCAATCTAAAATGTACAACCCAATG
TGTGTTATATTTTTTTCATTTGATTTGTTCGTTTGTGAAATAACATATTCTTTTTGCAAA
ATGATAAGTTTGGAGGAAATCTTAGTAATGTAATAGTTTCTCTCATCTTATTAACTTAGC
CAATAAGCTTATTTATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EB82JQ C 1
AF RS1EH65TF U 183
BS 1 183 RS1EB82JQ
BS 184 509 RS1EH65TF
BS 510 510 RS1EB82JQ
BS 511 613 RS1EH65TF
BS 614 618 RS1EB82JQ

RD RS1EB82JQ 618 0 0
AACTGCACCCTCATAAACACTGACAATGGTGTAAGGATCAAGACATGGCCGTCCTCAGCT
TGCTCCACGACCGCCTCGGGTATCCATTTCGAGAATATTTTCCTCAGGAACGTTACTAAC
CCTATCCTCATCGACCAAGAGTACTGCCCCTGGAACCAATGCAACAAGAACAAACCATCA
TCTATCAAGCTGGTGGACATAAGCTTCAAGCATATCAGAGGAACATCAGCGAACAAAGAC
GCAGTTAAGCTTTTGTGCAGCAAGGGATTCCCATGCAAGAACGTGGAGATCGGTGACATT
AACATTAGGTACAACGGAGCCGACGGTCCAGCAACATTCCAATGCTCCAACCTATCTCCC
AAACTGATGGGAATTCAGGTTCCTAGAGCCTGTAGCAGCCCAGTGACTAAGCTACCAGGC
CAATAAGAAATCTCGATGTACGTGACAACCTATACGCAATCTAAAATGTACAACCCAATG
TGTGTTATATTTTTTTCATTTGATTTGTTCGTTTGTGAAATAACATATTCTTTTTGCAAA
ATGATAAGTTTGGAGGAAATCTTAGTAATGTAATAGTTTCTCTCATCTTATTAACTTAGC
CAATAAGCTTATTTATAC

QA 1 618 1 618
DS 

RD RS1EH65TF 436 0 0
G
ATCAAGCTGGTGGACATAAGCTTCAAGCATATCAGAGGAACATCAGCGAACAAAGACGCA
GTTAAGCTTTTGTGCAGCAAGGGATTCCCATGCAAGAACGTGGAGATCGGTGACATTAAC
ATTAGGTACAACGGAGCCGACGGTCCAGCAACATTCCAATGCTCCAACCTATCTCCCAAA
CTGATGGGAATTCAGGTTCCTAGAGCCTGTAGCAGCCCAGTGACTAAGCTACCAGGCCAA
TAAGAAATCTCGATGTACGTGACAACCTATACGCAATCTAAAATGTACAACCCAATGTGT
GTTATATTTTTTTCATTTGATTTGTTTGTTTGTGAAATAACATATTCTTTTTGCAAAATG
ATAAGTTTGGAGGAAATCTTAGTAATGTAATAGTTTCTCTCATCTTATTAACTTAGCCAA
TAAGCTTATT
TATAC

QA 2 431 2 431
DS 



AS 1 3

CO CL3378Contig1 792 3 26 U
GGGAAGAAACATAACTGGCGACCAAAAGTTACAGATTCTTGAAAACTATTAGGGTTGATT
TGATTCATGGGCTTACTAGATCATCTCTGGGATGATACCGTCGCTGGTCCTCGGCCAAAT
AACGGCCTTGGCAAGCTTCGGAGACACCATACCTTCAGTTTCCGGCCTAGCTCCGGCAAT
GATCAATCGGACGGTGGAAGCGTGAGATCGTACGGTGAAGTATCACCAGAGGAGGCCGTG
AAGGTAACACGCAGCATCATGATAATAAAACCACCAGGATACCAAGGCGGTTCAGCTCCG
GTTTCACCGGCCGGTTCAACTCCGCCGGTATCTCCTTTCTCTG**CAAACGCAGGAGGAA
AGGAACCCTTTCGGTTTAGGAGAAGGTCGACGTCGGACGCGTTCGATAAGGGAGCAGGAT
CAGAGAATGGACCAAGGAACTCTCCTCCTACTTACGGCCTGTGATCTCTAATCTCTAACT
CAAATGAGAGAAAGAAGAAGAAAAAGAACAGAGTAGCTCC***CCAACACGCTTTCGTTT
AGACGACACATCAATCAAGTGGTCCTTCCTTGCATGCAGAGTTCGTGTTTCTTCCGTTTG
TAGGCCTAAAGAGGTTCTCTTTTTGTGTGTGTTTGTGCGTGTATGAGTTTGTTCTCTGTG
TGTGTGTGTTGTGAATACGTCTCTGTTTTTTTTTCCTTTCTTTTTCTGTATGTCATCTCA
CTTTCGCAGTGCTTCTACGTGTCTGTACATATTTGCTGGAGTGATAATAAAAATAAGTAG
ATGCTTAATGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DP67TF U 1
AF RS1A564JQ C 82
AF RS1A564TF U 98
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AGACGACACAT****CAAGTGGTCCTTCCTTGCATGCAGAGTTCGTGTTTCTTCCGTTTG
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TGTGTGTGTTGTGAATACGTCTCTGTTTTTTTTTCCTTTCTTTTTCTGTATGTCATCTCG
CTTTCGCAGTGCTTCTACGTGTCTGTACATATTTGCTGGAGTGATAAT

QA 1 768 1 768
DS 

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CT
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ACACCATACCTTCAGTTTCCGGCCTAGCTCCGGCAATGATCAATCGGACGGTGGAAGCGT
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AATAAAACCACCAGGATACCAAGGCGGTTCAGCTCCGGTTTCACCGGCCGGTTCAACTCC
GCCGGTATCTCCTTTCTCTG**CAAACGCAGGAGGAAAGGAACCCTTTCGGTTTAGGAGA
AGGTCGACGTCGGACGCGTTCGATAAGGGAGCAGGATCAGAGAATGGACCAAGGAACTCT
CCTCCTACTTACGGCCTGTGATCTCTAATCTCTAACTCAAATGAGAGAAAGAAGAAGAAA
AAGAACAGAGTAGCTCC***CCAACACGCTTTCGTTTAGACGACACATCAATCAAGTGGT
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TGTGTGTGTTTGTGCGTGTATGAGTTTGTTCTCTGTGTGTGTGTGTTGTGAATACGTCTC
TGTTTTTTTTTCCTTTCTTTTTCTGTATGTCATCTCACTTTCGCAGTGCTTCTACGTGTC
TGTACATATTTGCTGGAGTGATAATAAAAATAAGTAGATGCTTAATGTC

QA 3 711 3 711
DS 

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GTTTCCGGCCTAGCTCCGGCAATGATCAATCGGACGGTGGAAGCGTGAGATCGTACGGTG
AAGTATCACCAGAGGAGGCCGTGAAGGTAACACGCAGCATCATGATAATAAAACCACCAG
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TCTCTG**CAAACGCAGGAGGAAAGGAACCCTTTCGGTTTAGGAGAAGGTCGACGTCGGA
CGCGTTCGATAAGGGAGCAGGATCAGAGAATGGACCAAGGAACTCTCCTCCTACTTACGG
CCTGTGATCTCTAATCTCTAACTCAAATGAGAGAAAGAAGAAGAAAAAGAACAGAGTAGC
TCC***CCAACACGCTTTCGTTTAGACGACACATCAATCAAGTGGTCCTTCCTTGCATGC
AGAGTTCGTGTTTCTTCCGTTTGTAGGCCTAAAGAGGTTCTCTTTTTGTGTGTGTTTGTG
CGTGTATGAGTTTGTTCTCTGTGTGTGTGTGTTGTGAATACGTCTCTGTTTTTTTTTCCT
TTCTTTTTCTGTATGTCATCTCACTTTCGCAGTGCTTCTACGTGTCTGTACATATTTGCT
GGAGTGATAATAAAA*TAAGTAGATGCTTAATGTC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 3

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AAGGCAGCAGGGAAAGAAAATGGGGCGTTGGGGTCTTTTGGTCGGAAGGCAGTGTCTTTT
GTCTTGATTACAGTCACTGGTGGTGTTGCTTTGAGTGCTCTCGACGACCTTTCTATCTAT
CGCGGTTGTAGCAGCAAGGCCATGGAGAAGGTGATGAGGAATAAGGCTATGATCGAAGCT
ATGGGAGAGCCAATTGAGAAAGGGCCATGGTACAATGCCTCACTAGCTGTTTCTCAGCAA
AGGCACTCTGTCTCTTGTTCCTTTCCTCTGGTTGGCCCACAAGGCACCGGAATCTTGCAT
CTCAAAGCTGTTCGCAATGGAGAAGATAGCTTGTTTGGGTTTCTCCAGCAAAGGGACTGG
GACATTCTGATTATGGACGCACTTGTCCACGTCCCTTCAAACGATGGACCCCAACAAACC
TTGAGAATCGACATCTCTGACTATACTCCTCCTTCGGCTGCTACAGACTACAAACCTTCT
TCCGAACCAGAAAAGCCAGAGATTAGCTAAGAAGAGAAAGAATACTACGTAAGCTTTTGT
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AACAAGATGTTTTGTGTACTGACAAATAAAAACATAATTCTTTTTGGTACTATACAAAAG
TTGAATACATGACTGGTAAAACTAACCAGTACGTTTGGATTTTGGATGTTG


BQ
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5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1GP20TF U 1
AF RS1GP20JQ C 389
AF RS1C911TF U 342
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AGGCACTCTGTCTCTTGTTCCTTTCCTCTGGTTGGCCCACAAGGCACCGGAATCTTGCAT
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GACATTCTGATTATGGACGCACTTGTCCACGTCCCTTCAAACGATGGACCCCAACAAACC
TTGAGAATCGACATCTCTGACTATACTCCTCCTTCGGCTGCTACAGACTACAAACCTTCT
TCCGAACCAGAAAAGCCAGAGATTAGCTAAGAAGAGAAAGAATACTACGTAAGCTTTTGT
GGATCACCTTGCTAGAGTTTTATTCCTTTCCTTGATGTTCTTCTGTGCGACA*GTATACC
AACA*GATGTTTTGTGTACTGACAA
TAAAACATAATT

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DS 

RD RS1GP20JQ 382 0 0
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GCTTGTTTGGGTTTCTCCAGCAAAGGGACTGGGACATTCTGATTATGGACGCACTTGTCC
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AAGAAGAGAAAGAATACTACGTAAGCTTTTGTGGATCACCTTGCTAGAGTTTTATTCCTT
TCCTTGATGTTTTTCTGTGCGACAAGTATACCAACAAGATGTTTTGTGTACTGACAAATA
AAAACATAATTCTTTTTGGTAC

QA 1 382 1 382
DS 

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G
CTAGCTGTTTCTCAGCAAAGGCACTCTGTCTCTTGTTCCTTTCCTCTGGTTGGCCCACAA
GGCACCGGAATCTTGCATCTCAAAGCTGTTCGCAATGGAGAAGATAGCTTGTTTGGGTTT
CTCCAGCAAAGGGACTGGGACATTCTGATTATGGACGCACTTGTCCACGTCCCTTCAAAC
GATGGACCCCAACAAACCTTGAGAATCGACATCTCTGACTATACTCCTCCTTCGGCTGCT
ACAGACTACAAACCTTCTTCCGAACCAGAAAAGCCAGAGATTAGCTAAGAAGAGAAAGAA
TACTACGTAAGCTTTTGTGGATCACCTTGCTAGAGTTTTATTCCTTTCCTTGATGTTCTT
CTGTGCGACAAGTATACCAACAAGATGTTTTGTGTACTGACAAATAAAAACATAATTCTT
TTTGGTACTATACAAAAGTTGAATACATGACTGGTAAAACTAACCAGTACGTTTGGATTT
TGGATGTTG

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DS 



AS 1 3

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CCCAATCATTCACTCACTCACCAGCTGAATTGAATCTGAAGAAAAAAAAACAGTGAGTTG
TGTGATTGATTGAGTCTTGTGGAAGAAGAGGGAAGTTAAGTAATGGCGAAAGCAGGAGGG
ATCACGAACGCAGTGAACGTAGGGATCGCCGTTCAAGCGTATTGGGAGAATCGTGAGTTC
ATCTCGCACATCTCCCTCAATGTTCGTCGTCTCTTCGAGTTCCTCGTCCAATTCGAGTCG
ACGACAAAGAGCAAATTGGCATCACTGAATGAGAAGTTGGATCTTCCGGAACGTCGCTTG
GAGATGCTTGAGGTCCAAGTGAGTACCGCCGCGGCTAATCCTTCTCTGTTTGCTACCTGA
AAACATATAGCCAGTGTCTGAGCCTTTGGCCTAATCAGAAGAAGAAGAAGCCATCTTTTC
GTTTTGAATGTGTACCGTTGAATCATTCTTTCTTTTTTCCGTAGCTGTAGTAAACTATAA
ATATGAATCCACGCATGAACTGTGTAATCTTTGTCTATCCCAGTGTTGATGTAACTTGTA
AGATGTTTTGAATCCCAAATTATTTCGCTATGTCAGTTGGAGTTTGCTTCAAAAAAAAA


BQ
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AF RS1BP58TF U 1
AF RS1FB78JQ C 1
AF RS1FB78TF U 1
BS 1 108 RS1BP58TF
BS 109 110 RS1FB78TF
BS 111 209 RS1BP58TF
BS 210 210 RS1FB78TF
BS 211 219 RS1BP58TF
BS 220 220 RS1FB78TF
BS 221 346 RS1BP58TF
BS 347 347 RS1FB78TF
BS 348 390 RS1BP58TF
BS 391 391 RS1FB78TF
BS 392 626 RS1BP58TF
BS 627 659 RS1FB78TF

RD RS1BP58TF 626 0 0
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DS 

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TGTGATTGATTGAGTCTTGTGGAAGAAGAGGGAAGTTAAGTAATGGCGAAAGCAGGAGGG
ATCACGAACGCAGTGAACGTAGGGATCGCCGTTCAAGCGTATTGGGAGAATCGTGAGTTC
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ACGACAAAGAGCAAATTGGCATCACTGAATGAGAAGTTGGATCTTCCGGAACGTCGCTTG
GAGATGCTTGAGGTCCAAGTGAGTACCGCCGCGGCTAATCCTTCTCTGTTTGCTACCTGA
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AGATGTTTTGAATCCCAAATTATTTCGCTATGTCAGTTGGAGTTT
TGCTTC

QA 1 645 1 645
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QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 3

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TCCCAAATACGTTGAGGTAGAATATGCAGATGACACCAAGTTCAAATTCTCATCTGAGTT
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GATATCTGGAAGGCGGTATGTAGGAATCATGTCTGCAGATCCGGTGGGAAACTATGGGGT
AAGGTTAGTGTTTGATGACTTGCATAGAACAGGGATATATCCATGGGATTATTTCTACGA
GCTTGGGAGCAATAAGTTTGGTCTCATGAGAAACTATATCAAGACTCTCCAAAAGCATCG
TCTCAGCCGTGAACCTCCTCCTCCGAGAAGGAAATGATTAATGTGTTATAAAACTTTTTT
CAAAGTGTTTTGATAAAATCTTTCTTGTGCAGAAACATGTAATCTTGTTGCCTTGTTTCA
GAGTCACGGAACACAAATAGTCCTAAAAGCTGGCCTTTTACTCTTTAGTTAAAATTATAT
GGGTCTTAACAAAGTAGCCCATCTAAACCTGC


BQ
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AF RS1A329TF U 289
AF RS1A329TV U 86
AF RS1FS36JQ C 1
BS 1 85 RS1FS36JQ
BS 86 300 RS1A329TV
BS 301 302 RS1FS36JQ
BS 303 532 RS1A329TF
BS 533 632 RS1FS36JQ

RD RS1A329TF 244 0 0
GTGGGAAACTATGG
GGTTAGTGTTTGATGACTTGCATAGAACAGGGATATATCCATGGGATTATTTCTACGAGC
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TCAGCCGTGAACCTCCTCCTCCGAGAAGGAAATGATTAATGTGTTATAAAACTTTTTTCA
AAGTGTTTTGATAAAATCTTTCTTGTGCAGAAACATGTAATCTTGTTGCC

QA 15 244 15 244
DS 

RD RS1A329TV 447 0 0
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AGAAGGAAATGATTAATGTGTTATAAAACTTTTTTCAAAGTGTTTTGATAAAATCTTTCT
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QA 1 447 1 447
DS 

RD RS1FS36JQ 632 0 0
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GCGAATCCACGGCACAAGCGATGTCACTGTTCCGAAACTTTCAGGATTCTCTATTGTATC
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TCTCAGAGTCCATAGTCCAGCTGCTGATGGAAAGGTCAGATCAATCGGTGGTGACAAGGT
GATATCTGGAAGGCGGTATGTAGGAATCATGTCTGCAGATCCGGTGGGAAACTATGGGGT
AAGGTTAGTGTTTGATGACTTGCATAGAACAGGGATATATCCATGGGATTATTTCTACGA
GCTTGGGAGCAATAAGTTTGGCCTCATGAGAAACTATATCAAGACTCTCCAAAAGCATCG
TTTCAGCCGTGAACCTCCTCCTCCGAGAAGGAAATGATTAATGTGTTATAAAACTTTTTT
CAAAGTGTTTTGATAAAATCTTTCTTGTGCAGAAACATGTAATCTTGTTGCCTTGTTTCA
GAGTCACGGAACACAAATAGTCCTAAAAGCTGGCCTTTTACTCTTTAGTTAAAATTATAT
GGGTCTTAACAAAGTAGCCCATCTAAACCTGC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 3

CO CL3382Contig1 1201 3 13 U
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ATCGATTCAAGAGCAAGCGAAAGAGTTCATACCACATTCAGGTATCTCGATTGAAATACC
CATAAATGGTATTTTCCGTAGAAACAGTATTTTTGCTTTTTTTGATGATCCTAGATACAG
AAGAAAGAGTTCCGGAATTCTTAAATATGGAACTCTAAAGGCGGACTCAATCGTCCAAAA
AGAGGATATGATTGAGTATCGAGGAGTCCAAAAATTTAAGACAAAATACGAAATGAAAGT
AGATCGCTTTTTTTTCATTCCTGAGGAAGTGCATATTTTACCCGAATCCTCCGCCATAAT
GGTCCAGAACTATAGTATCATTGGAGTCGATACACGAATCACTTTAAATATAAGAAGCCA
AGTCGGCGGGTTGATCCGAGTGGAGAGAAAAAAAAAAAAGGATTGAACTAAAAATATTTT
CGGGGGATATACATTTTCCGGACAAGACAGATAAGATATCCCGACATAGTGGCATCTTGA
TACCGCCAGGAAGGGGAAAAACAAACTCTAAAGAATCCAAAAATTTGAAAAATTGGATTT
ATGCCCAACGGATCATACCAACCAAGAAAAAGTTTTTTGTTTTGGTGCGGCCCGTAGCCA
CCTATGAGATAACGGACAGTATAAATTTAGCAACACTCTTCCCACAAGATCTCTTTCGGG
AAAAGGATAATATTCAACTTCGAGTTTTCAACTATATCCTTTATGGAAATGGTAAACCAA
CTCGAGGAATTTCTGACACAAGTATTCAATTGGTTCGCACTTGTTTAATCTTGAATTGGG
ACCAAGACAACAAAAAATCTTCCCTCGAGGAGGTCCGCGCTTTCGTTGTTGAAGTAAGTA
CAAAGGGTTTGATTCGAGATTTCATAAGAATTGGCTTAGTGAAATCCCATATTTCGTATA
TAAGAAAAAGGAATAATCCGCCGGATTCGGGATTGATCTCTGCAGATTCCGTGAATCCGT
TTTATTCGCTTTCTCCCAAGGCTGGCATTCTTCAACAATCGCTTAGACAAAATCCCGGAA
CTATTCGTATGTTCTTAAATAGAAATAAGGAATCCCAATCTTTGTTAATTTTATCATCCT
CTAATTGTTTTAGAATCGGTCCATTTAATCATGTAAAATATCACAATGTTATAAACGAAG
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RS1EY14TF U 1
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G
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DS 



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BQ
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TAA

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AA
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ATCGTAATGCCCTTGCGAAGGATTGATGGTGACTGCTGCTGCTTTTGCTGCTGAAGGATC
TCAATATGATTTCTGTAGTCGCTACTTCGCTCCTAACTTTGGAATTAACGAGGACCCTGT
AACTGGGAGTGCGCATTGTGCTTTAGCACATTACTGGAGCACCAAGATGAGCAAGTGTGA
TTTTTTAGCCTACCAGGCGTCAAGCAGAGGAGGAACGCTGAATGTTCACCTGGACAAAGG
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TGATTTTTTTTTGGCTATTATCAAATCAGCCTTTTCTTGTAAACCCATGAAATGGAAATA
AAGGAAGTCTA

QA 3 613 3 613
DS 



AS 1 3

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ATGAGTGGTACTTCTTCAACCCCAGAGACAGAAAGTATCCGAACGGAGTCCGTCCGAACC
GGGCAGCTGTTTCCGGTTATTGGAAAGCGACCGGTACAGACAAAGCCATTTACAGCGGTT
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TCAAAACTGACTGGATCATGCACGAGTACCGTCTCAACGATTCACGTAAAGCATCAACCA
AACGTAACGGTTCGATGAGGTTGGATGAATGGGTACTATGTAGGATATACAAGAAGAGAC
TAGGAGCAGGGAAGCTTCTGGATGAGAGAGAGGGTTACATGGACGAAGTACAAATCGATG
AGACGTTAACAGTTGTTACGAACGAAGCAGAGAGAAGAAATGAGGAAGAGATAACGATGA
TGACGTCGACGAAGCTTCCTAGAACGTGTTCGCTTGCCCATTTGCTAGAAATGGATTACA
TGGGACCCATCTCACACATTTTAACACCATTCGATCTCCATAGTCCTGATCCGA*CATTG
CGA*CGAGTCTGGTTGGGTCGGAGATCTACAGATTAACCAATACGAGATCTGGAACCATC
ATCGTCAGGCTAGCATGTTTCAGTTTTAGTGATGGATTGGTATAAAGAAGAAGAAGAAGG
AAGAAATGAACATGGAAGATTGTAAAATATTAACTAGTAAAGAACCAAATTGTGATTCTT
TATATTTTCTCGCATATGAATGTGAAACGAAAAGATAATGTTTAATTAATATTAAGCTGC
TTCAGCATGTTCAAGCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DT41TF U 1
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CGA*CGAGTCTGGT
TGG

QA 1 794 1 794
DS 

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CTGTTTCCGGTTATTGGAAAGCGACCGGTACAGACAAAGCCATTTACAGCGGTTCATGTA
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CTGACTGGATCATGCACGAGTACCGTCTCAACGATTCACGTAAAGCATCAACCAAACGTA
ACGGTTCGATGAGGTTGGATGAATGGGTACTATGTAGGATATACAAGAAGAGACTAGGAG
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TAACAGTTGTTACGAACGAAGCAGAGAGAAGAAATGAGGAAGAGATAACGATGATGACGT
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C*ATCTCACACATTTTAACACCATTCGATCTCCATAGTC*TGATCCGA*CATTGCGA*CG
AGTCTGGT*GGGTCGGAGATCTACAGATTA*CCAATACGAGATCTG**ACCATCATCGTC
AG*CTAGCATGTTT

QA 5 858 5 858
DS 

RD RS1EX18JQ 744 0 0
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CGATGATGACGTCGACGAAGCTTCCTAGAACGTGTTCGCTTGCCCATTTGCTAGAAATGG
ATTACATGGGACCCATCTCACACATTTTAACACCATTCGATCTCCATAGTCCTGATCCGA
ACATTGCGAACGAGTCTGGTTGGTTCGGAGATCTACAGATTAACCAATACGAGATCTTGA
ACCATCATCGTCAGGCTAGCATGTTTCAGTTTTAGTGATGGATTGGTATAAAGAAGAAGA
AGAAGGAAGAAATGAACATGGAAGATTGTAAAATATTAACTAGTAAAGAACCAAATTGTG
ATTCTTTATATTTTCTCGCATATGAATGTGAAACGAAAAGATAATGTTTAATTAATATTA
AGCTGCTTCAGCATGTTCAAGCGT

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 3

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AAGAGAAGATCCAAGTAAATTAAAAGAATCCCAAGGAAGAGGAAGGTGATGTTTTCTCTA
ATGCATGGACTCTGGACTCACATGTTCAGCAAGACTGAGTTCCATGTCCTCATTCTTGGT
ATCGACAAAGCTGGCAAAACGACGTTTTTGGAGAAACTGAAGACGATTTACTCAATCTCT
GAAGGTCTTCCACATGATCGTATTGTTCCTACTGTTGGCCTTAACATCGGTCGTATTGAA
GTCGCCAATGCTAAAATCGTCTTCTGGGACCTTGGTGGTCAGCCTGGTTTGCGTTCGATT
TGGGAGAAGTATTGTGAAGAAGCACACGCATTGATATATTTGATCGACGCAGCTTGCCCA
TCTCGCTTTGAAGACTCAAAATCTGCTCTAGAGAAAGCCCTGCGGCATGAGGATTTGCAA
GGAGCGCCTCTTTTGATATTGGCAAACAAGCAAGATCTCCCAAATGCTGTCTCGGCTGAG
GAGCTAGACCGATACCTGGATCTCAAGAAACTAGACGAAAGGGTGTACATGTTTGAAGCA
GCTTCTGGATATGATGGGCGAGGAATCAAAGAGAGCATAGAATGGCTGGTGGGAGTGATG
GAGAGAAGCAAAAGAACCGAAACATTAAGAGCCCGTGCAGGATATGTTCCTATCCCAACT
TCCTAGACTTGAAAGGAGTGTTCGCAAACTCAATTCTCAAACCAACTGTTTTCTGTCAGA
AACATTTGTAGATAAAAAAAAAAGTGGACCAGAATCGTGCATTGTTTTGTGTTAGCACAT
GATAAGTAGGGCTAGTAATATCCTTATTATATTTGCCTTTACATCCTTTCTAATGCTATG
ATTCAGATTGAGACTTGAGGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B795TF U 1
AF RS1EL93TF U 1
AF RS1B795JQ C 210
BS 1 138 RS1B795TF
BS 139 139 RS1EL93TF
BS 140 278 RS1B795TF
BS 279 279 RS1EL93TF
BS 280 623 RS1B795TF
BS 624 637 RS1EL93TF
BS 638 639 RS1B795JQ
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BS 676 676 RS1B795JQ
BS 677 743 RS1EL93TF
BS 744 921 RS1B795JQ

RD RS1B795TF 623 0 0
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AAGAGAAGATCCAAGTAAATTAAAAGAATCCCAAGGAAGAGGAAGGTGATGTTTTCTCTA
ATGCATGGACTCTGGACTTACATGTTCAGCAAGACTGAGTTCCATGTCCTCATTCTTGGT
ATCGACAAAGCTGGCAAAACGACGTTTTTGGAGAAACTGAAGACGATTTACTCAATCTCT
GAAGGTCTTCCACATGATCGTATTGTTCCTACTGTTGGGCTTAACATCGGTCGTATTGAA
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TGGGAGAAGTATTGTGAAGAAGCACACGCATTGATATATTTGATCGACGCAGCTTGCCCA
TCTCGCTTTGAAGACTCAAAATCTGCTCTAGAGAAAGCCCTGCGGCATGAGGATTTGCAA
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GAGCTAGACCGATACCTGGATCTCAAGAAACTAGACGAAAGGGTGTACATGTTTGAAGCA
GCTTCTGGATATGATGGGCGAGG

QA 1 623 1 623
DS 

RD RS1EL93TF 743 0 0
GGGAGTGCAAAACCAGATCTTTCTCTCCTTGTCCTTCTCCCGATCTTCTTCACACCTCAA
AAGAGAAGATCCAAGTAAATTAAAAGAATCCCAAGGAAGAGGAAGGTGATGTTTTCTCTA
ATGCATGGACTCTGGACTCACATGTTCAGCAAGACTGAGTTCCATGTCCTCATTCTTGGT
ATCGACAAAGCTGGCAAAACGACGTTTTTGGAGAAACTGAAGACGATTTACTCAATCTCT
GAAGGTCTTCCACATGATCGTATTGTTCCTACTGTTGGCCTTAACATCGGTCGTATTGAA
GTCGCCAATGCTAAAATCGTCTTCTGGGACCTTGGTGGTCAGCCTGGTTTGCGTTCGATT
TGGGAGAAGTATTATGAAGAAGCACACGCATTGATATATTTGATCGACGCAGCTTGCCCA
TCTCGCTTTGAAGACTCAAAATCTGCTCTAGAGAAAGCCCTGCGGCATGAGGATTTGCAA
GGAGCGCCTCTTTTGATATGGGCAAACAAGCAAGATCTCCCAAATGCTGTCTCGGCTGAG
GAGCTAGACCGATACCTGGATCTCAAGAAACTAGACGAAAGGGTGTACATGTTTGAAGCA
GCTTCTGGATATGATGGGCGAGGAATCAAAGAGAGCA**GAATGGCTGGTGGGAGTGATG
GAGAGAAGCAAAAGAGCCGAAACATTAAGAGCCCGTGCAGGATATGTTCCTATCCCAACT
TCCTAGACTTGAAAGGAGTGTTC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RS1B795JQ 712 0 0
GGAGAAACTGAAGACGATTTACTCAATCTCTGAAGGTCTTCCACATGATCGTATTGTTCC
TACTGTTGGCCTTAACATCGGTCGTATTGAAGTCGCCAATGCTAAAATCGTCTTCTGGGA
CCTTGGTGGTCAGCCTGGTTTGCGTTCGATTTGGGAGAAGTATTGTGAAGAAGCACACGC
ATTGATATATTTGATCGACGCAGCTTGCCCATCTCGCTTTGAAGACTCAAAATCTGCTCT
AGAGAAAGCCCTGCGGCATGAGGATTTGCAAGGAGCGCCTCTTTTGATATTGGCAAACAA
GCAAGATCTCCCAAATGCTGTCTCGGCTGAGGAGCTAGACCGATACCTGGATCTCAAGAA
ACTAGACGAAAGGGTGTACATGTTTGAAGCAGCTTCTGGATATGATGGGCGAGGAATCAA
AGAGAGCATAGAATGGCTGGTGGGAGTGATGGAGAGAAGCAAAAGAACCGAAACATTAAG
AGCCCGTGCAGGATATGTTCCTGTCCCAACTTCCTAGACTTGAAAGGAGTGTTCGCAAAC
TCAATTCTCAAACCAACTGTTTTCTGTCAGAAACATTTGTAGATAAAAAAAAAAGTGGAC
CAGAATCGTGCATTGTTTTGTGTTAGCACATGATAAGTAGGGCTAGTAATATCCTTATTA
TATTTGCCTTTACATCCTTTCTAATGCTATGATTCAGATTGAGACTTGAGGT

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 2

CO CL3386Contig1 1092 2 20 U
GGGCCTTCAAATCTCATCAAACCAAATCTCATCGATCACCCTCCATCGTCGTTATATCTC
TTTCCTTTTTGTTGAATCTCAATATCTCGGAATCGCATCTTTGATTTAGGGGGTACTGAT
TGGTTTCTCGTCTTTCTTTTTTTGGACTTTAAATTGTCGTGTTTTTTTTAAGCTCATAGG
GCATCAATTGCAACTTAGTTGCAACGAGGAATTGTTGGGGGGGGTTTTGTTAGACGAGAT
GGGAAGATGGAAAAGTACGAGCTGGTGAAAGACATAGGAGCAGGGAATTTCGGAGTGGCG
AGGCTCATGAAGGTCAAAAACTCTAAAGAACTTGTTGCCATGAAATACATCGAGCGTGGT
CCCAAGATTGATGAGAATGTGGCAAGAGAGATCATTAACCACAGATCACTTCGCCATCCT
AATATTATCCGATTTAAGGAGGCGGTGTTGACTCCAACTCATCTTGCTATCGCTATGGAA
TATGCTGCCGGTGGTGAACTTTTCGAGCGCATTTGCAGTGCTGGCAGATTCAGTGAGGAT
GAGGCGAGATACTTCTTTCAGCAGCTTATATCAGGTGTTAGCTATTGCCATGCTATGCAA
ATATGCCATAGAGATCTGAAGCTCGAGAATACACTCCTGGATGGAAGTCCTGCTCCACGT
CTCAAAATCTGTGATTTTGGTTATTCCAAGTCCTCTCTACTGCACTCGAGGCCCAAATCA
ACAGTTGGAACTCCAGCATATATTGCACCTGAGGTCCTTTCTAGGAGAGAGTATGACGGC
AAGATGGCTGATGTATGGTCTTGTGGTGTAACTCTTTATGTCATGCTTGTTGGAGCATAC
CCATTCGAAGACCAGGAAGACCCCAAAAACTTCAGGAAAACAATACAAAAAATCATGGCC
GTTCAGTACAAGATCCCGGACTACGTCCACATCTCACAGATTGCAAACATCTCCTTTCCC
GTATATTTGTTGCCAATTCACTCAAGAGGATAAGCATTGCAGAAATCAAGAAACATCCAT
GGTTCTTGAGACTTGCCGAGGGACTAACAGAGACAGCTCAAGCTGCATATTTCAGAAGAG
ATCCAACGTTCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EI82TF U 1
AF RS1DX84TF U 327
BS 1 398 RS1EI82TF
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BS 489 489 RS1DX84TF
BS 490 509 RS1EI82TF
BS 510 510 RS1DX84TF
BS 511 635 RS1EI82TF
BS 636 637 RS1DX84TF
BS 638 762 RS1EI82TF
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BS 777 777 RS1DX84TF
BS 778 791 RS1EI82TF
BS 792 1092 RS1DX84TF

RD RS1EI82TF 791 0 0
GGGCCTTCAAATCTCATCAAACCAAATCTCATCGATCACCCTCCATCGTCGTTATATCTC
TTTCCTTTTTGTTGAATCTCAATATCTCGGAATCGCATCTTTGATTTAGGGGGTACTGAT
TGGTTTCTCGTCTTTCTTTTTTTGGACTTTAAATTGTCGTGTTTTTTTTAAGCTCATAGG
GCATCAATTGCAACTTAGTTGCAACGAGGAATTGTTGGGGGGGGTTTTGTTAGACGAGAT
GGGAAGATGGAAAAGTACGAGCTGGTGAAAGACATAGGAGCAGGGAATTTCGGAGTGGCG
AGGCTCATGAAGGTCAAAAACTCTAAAGAACTTGTTGCCATGAAATACATCGAGCGTGGT
CCCAAGATTGATGAGAATGTGGCAAGAGAGATCATTAATCATAGATCACTTCGCCATCCT
AATATTATCCGATTTAAGGAGGTGGTGTTGACTCCAACTCATCTTGCTATTGCTATGGAA
TATGCTGCTGGTGGTGAACTTTTCGAGCGTATTTGCAGTGCTGGCAGATTCAGTGAGGAT
GAGGCGAGATACTTCTTTCAGCAGCTTATATCAGGTGTTAGCTATTGCCATGCTATGCAA
ATATGCCATAGAGATCTGAAGCTCGAGAATACACTTTTGGATGGAAGTCCTGCTCCACGT
CTCAAAATCTGTGATTTTGGTTATTCCAAGTCCTCTCTACTGCACTCGAGGCCCAAATCA
ACAGTTGGAACTCCAGCATATATTGCACCTGAGGTCCTTTCTCGGAGAGAGTATGATGGC
AAGATGGCTGA

QA 1 791 1 791
DS 

RD RS1DX84TF 766 0 0
G
GAACTTGTTGCCATGAAATACATCGAGCGTGGTCCCAAGATTGATGAGAATGTGGCAAGA
GAGATCATTAACCACAGATCACTTCGTCATCCTAATATTATCCGATTTAAGGAGGCGGTG
TTGACTCCAACTCATCTTGCTATCGCTATGGAATATGCTGCCGGTGGTGAACTTTTCGAG
CGCATTTGCGGTGCTGGCAGATTCAGTGAGGATGAGGCGAGATACTTCTTTCAGCAGCTT
ATATCAGGTGTTAGCTATTGCCATGCTATGCAAATATGCCATAGAGATCTGAAGCTCGAG
AATACACTCCTGGATGGAAGTCCTGCTCCACGTCTCAAAATCTGTGATTTTGGTTATTCC
AAGTCCTCTCTACTGCACTCGAGGCCCAAATCAACAGTTGGAACTCCAGCATATATTGCA
CCTGAGGTCCTTTCTAGGAGAGAGTATGACGGCAAGATGGCTGATGTATGGTCTTGTGGT
GTAACTCTTTATGTCATGCTTGTTGGAGCATACCCATTCGAAGACCAGGAAGACCCCAAA
AACTTCAGGAAAACAATACAAAAAATCATGGCCGTTCAGTACAAGATCCCGGACTACGTC
CACATCTCACAGATTGCAAACATCTCCTTTCCCGTATATTTGTTGCCAATTCACTCAAGA
GGATAAGCATTGCAGAAATCAAGAAACATCCATGGTTCTTGAGACTTGCCGAGGGACTAA
CAGAGACAGCTCAAGCTGCATATTTCAGAAGAGATCCAACGTTCT

QA 2 766 2 766
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL3388Contig1 855 2 2 U
GGGGACAAACTAAAGAAAAGCAAATCCACATTCGCCGACGTGAACCCCTGGAACCTCCCC
AATCTCATCTCCTTGTGTAATCGATTCAAATCAGGCAACGTCGAATTATTAGCAAAAACT
AATCTCGAAAAATGTCGTTAGGGCAAAAGGGTTCGGGGGATCCTGGTGCGATGCTCACTT
CTCTTTTGAACAAGCGAGAGAAGCTTCGACAAGACTTACGGAGCATCGAGAAGCAGGTCA
GTTTGGTCAATTCAAATCTTCAATTTGTCGATACTGCCAACTAGGGTTGTTTTTTTTTTC
TTTTTTTTTGTCTGTTAGGTTTATGAATTGGAGACGAGCTATCTTCAAGAATCGAGCCAT
ATAGGAAATGCGTTAAAGGGTTTCGAAGGCTTCCTTTCTTCCTCCAAAAGCACTGCCAGT
GCTAAGAGGTCAAGAAAGTTTCAGCCTGAAGACAGAGTCTTCTCATTGTCCTCGGTAACC
TCACCTGCTGCTGAAGAACTTGGCGTTGGAAGAGAAGATGGACGGGCTGAGTTGGGGCCA
GGGAGATCCAAGGGTGGATTGTCCACAGGACAGGGAAAACCGAGAAAGGGAGAGGACACG
GAGTGGCGAGAGATGCAAAGAGAAACAGACCATCTACAGAACCAGATTATGATGATGAAG
ATGATCCAGATACCAGTATGTATGTGCCCGGTTCACTCATCTAGTGCTTTTTTTTTTTGG
TTGTGCCTTAAAAACAGTAAGAAACAAATCACCTTTCTAGCCTCTTTTTTTTGCATCCCA
AAACATAACCAAAGTAAATCTAGGAACTATTTTCACAGATTTATAATATCAATTAATATA
TGAAATATTTTGTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F891TF U 1
AF RS1F891JQ C 206
BS 1 649 RS1F891TF
BS 650 855 RS1F891JQ

RD RS1F891TF 649 0 0
GGGGACAAACTAAAGAAAAGCAAATCCACATTCGCCGACGTGAACCCCTGGAACCTCCCC
AATCTCATCTCCTTGTGTAATCGATTCAAATCAGGCAACGTCGAATTATTAGCAAAAACT
AATCTCGAAAAATGTCGTTAGGGCAAAAGGGTTCGGGGGATCCTGGTGCGATGCTCACTT
CTCTTTTGAACAAGCGAGAGAAGCTTCGACAAGACTTACGGAGCATCGAGAAGCAGGTCA
GTTTGGTCAATTCAAATCTTCAATTTGTCGATACTGCCAACTAGGGTTGTTTTTTTTTTC
TTTTTTTTTGTCTGTTAGGTTTATGAATTGGAGACGAGCTATCTTCAAGAATCGAGCCAT
ATAGGAAATGCGTTAAAGGGTTTCGAAGGCTTCCTTTCTTCCTCCAAAAGCACTGCCAGT
GCTAAGAGGTCAAGAAAGTTTCAGCCTGAAGACAGAGTCTTCTCATTGTCCTCGGTAACC
TCACCTGCTGCTGAAGAACTTGGCGTTGGAAGAGAAGATGGACGGGCTGAGTTGGGGCCA
GGGAGATCCAAGGGTGGATTGTCCACAGGACAGGGAAAACCGAGAAAGGGAGAGGACACG
GAGTGGCGAGAGATGCAAAGAGAAACAGACCATCTACAGAACCAGATTA

QA 1 649 1 649
DS 

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TCGACAAGACTTACGGAGCATCGAGAAGCAGGTCAGTTTGGTCAATTCAAATCTTCAATT
TGTCGATACTGCCAACTAGGGTTGTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGTCTGTTAGGTTTATG
AATTGGAGACGAGCTATCTTCAAGAATCGAGCCATATAGGAAATGCGTTAAAGGGTTTCG
AAGGCTTCCTTTCTTCCTCCAAAAGCACTGCCAGTGCTAAGAGGTCAAGAAAGTTTCAGC
CTGAAGACAGAGTTTTTTCATTGTCCTCGGTAACCTCACCTGCTGCTGAAGAACTTGGCG
TTGGAAGAGAAGATGGACGGGCTGAGTTGGGGCCAGGGAGATCCAAGGGTGGATTGTCCA
CAGGACAGGGAAAACCGAGAAAGGGAGAGGACACGGAGTGGCGAGAGATGCAAAGAGAAA
CAGACCATCTACAGAACCAGATTATGATGATGAAGATGATCCAGATACCAGTATGTATGT
GCCCGGTTCACTCATCTAGTGCTTTTTTTTTTTGGTTGTGCCTTAAAAACAGTAAGAAAC
AAATCACCTTTCTAGCCTCTTTTTTTTGCATCCCAAAACATAACCAAAGTAAATCTAGGA
ACTATTTTCACAGATTTATAATATCAATTAATATATGAAATATTTTGTAG

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 3

CO CL3389Contig1 741 3 6 U
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CTGCGCTGTTATTCTAAATTTGTCTAATCAAGTTAAAATAGTTTTTTATCTTTTTACTTT
AAAATATGCTAAAAATGGAGTAATATATCACTCCACTTAAGTCAAAAGTAAAAAAAAATA
TCATTTTCACTTTTTCTGATTTCAAGTTTTTCCCATTCTCTTAATTAATTAGTAATCAAA
ACTTAAAGGTGAAAAACAAATTTAAAGGCACTCGCGAAGGCGTCGAGAAAGGAGACCTAA
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TGACCATCATGATGGGGATTTCAGGTTTCTACAGTTTTGATCAGTCTGTTATTGTGGTTT
CAAATACAAGAGAGAGAAGGATTTTGTGTTGTGGATCTCAAGCTTGGCATAACATCCCAA
AACCCAAACTCAAAATTTTATTGGGTTTAGAAGGAAAATCCGTCATCCATAACCCATTAG
GATTAAATATGGGATTCCTATACCATTTTATGATAAATAGAAACCTCATCTAGGGTTGGG
CATAAGACGAGAATTTGTTATTTTGCGTTTATTTGCGACTTGATTTGCCTTGTACGAATA
ATACATTTTTTGACTTGTACTTAACTTGTTAAAA*CGAGTATTTGTTATTTCGAGTACTT
TATCAAACATTAATTACTTGG


BQ
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AF RS1FB08TF U 1
AF RS1AZ08JQ C 12
AF RS1AZ08TF U 12
BS 1 363 RS1FB08TF
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BS 714 726 RS1AZ08TF
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RD RS1FB08TF 713 0 0
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CTGCGCTGTTATTCTAAATTTGTCTAATCAAGTTAAAATAGTTTTTTATCTTTTTACTTT
AAAATATGCTAAAAATGGAGTAATATATCACTCCACTTAAGTCAAAAGTAAAAAAAAATA
TCATTTTCACTTTTTCTGATTTCAAGTTTTTCCCATTCTCTTAATTAATTAGTAATCAAA
ACTTAAAGGTGAAAAACAAATTTAAAGGCACTCGCGAAGGCGTCGAGAAAGGAGACCTAA
CCGATGTTTGAAGCTCTTTCCGGCAAAGGATCCATCACATATCTCAGTTTCGAGGTTCAA
TGATCATCATGATGGGGATTTCAGGTTTCTACAGTTTTGATCAGTCTGTTATTGTGGTTT
CAAATACAAGAGAGAGAAGGATTTTGTGTTGTGGATCTCAAGCTTGGCATAACATCCCAA
AACCCAAACTCAAAATTTTATTGGGTTTAGAAGGAAAATCCGTCATCCATAACCCATTAG
GATTAAATATGGGATTCCTATACCATTTTATGATAAATAGAAACCTCATCTAGGGTTGGG
CATAAGACGAGAATTTGTTATTTTGCGTTTATTTGCGACTTGATTTGCCTTGTACGAATA
ATACATTTTTTGACTTGTACTTAACTTGTTAAAA*CGAGTATTTGTTATTTCG

QA 1 713 1 713
DS 

RD RS1AZ08JQ 730 0 0
GG
GACTCGATAGCATCATTGCTATAATAACGTAGAATAAAATAAAAATTCTGCGCTGTTATT
CTAAATTTGTCTAATCAAGTTAAAATAGTTTTTTATCTTTTTACTTTAAAATATGCTAAA
AATGGAGTAATATATCACTCCACTTAAGTCAAAAGTAAAAAAAAATATCATTTTCACTTT
TTCTGATTTCAAGTTTTTCCCATTCTCTTAATTAATTAGTAATCAAAACTTAAAGGTGAA
AAACAAATTTAAAGGCACTCGCGAAGGCGTCGAGAAAGGAGACCTAACCGATGTTTGAAG
CTCTTTCCGGCAAAGGATCCATCACATATTTCAGTTTCGAGGTTCAATGACCATCATGAT
GGGGATTTCAGGTTTTTACAGTTTTGATCAGTCTGTTATTGTGGTTTCAAATACAAGAGA
GAGAAGGATTTTGTGTTGTGGATCTCAAGCTTGGCATAACATCCCAAAACCCAAACTCAA
AATTTTATTGGGTTTAGAAGGAAAATCCGTCATCCATAACCCATTAGGATTAAATATGGG
ATTCCTATACCATTTTATGATAAATAGAAACCTCATCTAGGGTTGGGCATAAGACGAGAA
TTTGTTATTTTGCGTTTATTTGCGACTTGATTTGCCTTGTACGAATAATACATTTTTTGA
CTTGTACTTAACTTGTTAAAAACGAGTATTTGTTATTTCGAGTACTTTATCAAACATTAA
TTACTTGG

QA 3 730 3 730
DS 

RD RS1AZ08TF 730 0 0
GG
GACTCGATAGCATCATTGCTATAATAACGTAGAATAAAATAAAAATTCTGCGCTGTTATT
CTAAATTTGTCTAATCAAGTTAAAATAGTTTTTTATCTTTTTACTTTAAAATATGCTAAA
AATGGAGTAATATATCACTCCACTTAAGTCAAAAGTAAAAAAAAATATCATTTTCACTTT
TTCTGATTTCAAGTTTTTCCCATTCTCTTAATTAATTAGTAATCAAAACTTAAAGGTGAA
AAACAAATTTAAAGGCACTCGCGAAGGCGTCGAGAAAGGAGACCTAACCGATGTTTGAAG
CTCTTTCCGGCAAAGGATCCATCACATATCTCAGTTTCGAGGTTCAATGACCATCATGAT
GGGGATTTCAGGTTTCTACAGTTTTGATCAGTCTGTTATTGTGGTTTCAAATACAAGAGA
GAGAAGGATTTTGTGTTGTGGATCTCAAGCTTGGCATAACATCCCAAAACCCAAACTCAA
AATTTTATTGGGTTTAGAAGGAAAATCCGTCATCCATAACCCATTAGGATTAAATATGGG
ATTCCTATACCATTTTATGATAAATAGAAACCTCATCTAGGGTTGGGCATAAGACGAGAA
TTTGTTATTTTGCGTTTATTTGCGACTTGATTTGCCTTGTACGAATAATACATTTTTTGA
CTTGTACTTAACTTGTTAAAA*CGAGTATTTGTTATTTCGAGTACTTTATCAA*CATTAA
TTACTTGG

QA 3 730 3 730
DS 



AS 1 2

CO CL3390Contig1 891 2 8 U
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AATCATTACATCTCTCTCTATACGTAAAAGACAAGCTGTGAAATAATACCATGTAACTGA
TACATAAATAAACCCGAATAAAATCACAAAATAGAGAAAGAATCTATTTTTGTATAAAAA
AAACAGAACCAAACCAGTCTTGTTTCTTTTCTTATTGATATGTATTTTTTTCTTTTTTCA
AAAAGCTCTAAGCAGAAGTAGAGCCCTTGAGCTTCTTGGTGATGGTAGCAATGTACTTGC
CTTGGTGAAACGCTTGCTGTAACTCCAGCTCCGTTGGCTGCCTCGACCCATCTCCAGCAA
ATGTTCCAGCTCCATAAGGGCTACCTCCTTTCACACTCTCCATCTCAAACATCCCCGCAC
CAAAAGTGTAACCGATGGGGACAAACACCATCCCGTGGTGAACCAGCTGAGTTATCGCCG
TCAATGCGGTGGTTTCCTGGCCACCACCTTGAGAGCCAGTGCTGTAGAAGATACCAGCTG
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ACTGAGCAGCCATCATACCGAACCTTGTTGGGAATCCGAAGAGGAAGCCATCAGCTTCGG
TTAGCTCGTTGGGTGTGATGATTGGTGATTCACTCTTGGGTGGTGCGCTCATCTTAGAGA
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AAGCAGCTCCTTTCCTTATCTCTTCAGCCAATTTCTCAACATGGCCGTACATTGAGTAGT
ACACGATATACACTTTGGTCGCCATATCGAAAATAGTTGTCTCTGCAGTAG


BQ
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AF RS1GH58JQ U 1
AF RS1AH23TF C 170
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AAACAGAACCAAACCAGTCTTGTTTTTTTTCTTATTGATATGTATTTTTTTCTTTTT*CA
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GTTTGCCAGCGAGCGACTG

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AAAAAA
AAAAAAAACAGAACCAAACCAGTCTTGTTTCTTTTCTTATTGATATGTATTTTTTTCTTT
TTTCAAAAAGCTCTAAGCAGAAGTAGAGCCCTTGAGCTTCTTGGTGATGGTAGCAATGTA
CTTGCCTTGGTGAAACGCTTGCTGTAACTCCAGCTCCGTTGGCTGCCTCGACCCATCTCC
AGCAAATGTTCCAGCTCCATAAGGGCTACCTCCTTTCACACTCTCCATCTCGAACATTCC
CGCACCGAAAGTGTAACCGATGGGGACAAACACCATCCCGTGGTGAACCAGCTGAGTTAT
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AGAGAGTACTTCTTCCGGAAGTGTCTCAGGTACCTGCCAGAGTTTGGCTTCAACACCTTC
AACAGAAGCAGCTCCTTTCCTTATCTCTTCAGCCAATTTCTCAACATGGCCGTACATTGA
GTAGTACACGATATACACTTTGGTCGCCATATCGAAAATAGTTGTCTCTGCAGTAG

QA 7 722 7 722
DS 



AS 1 3

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GTTCGTACAATGTTTCAGCACTGTCTTTGCTCGCGACCTACAAGATAATCTCGATGCCAC
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TCCAAGTAATATTGGTTTTGGTGCGGTTGGAAGTTTAGAAGTTGCCATCACATTCTCGAT
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CGACAAAGATAAGATTAAAGGTATTGTAATTACTCCAGCGACTACTCATGAGTTTGGTCT
TTCCCCTGGAAAAGATGGTGTAGAATTCTGACACAGCGAGGGAGAAACCATTCCTAAAAA
CCGAGTATTGAAGACCATGCCACTTTCCTGAGAGTTATGTTAGCTGGAGATTGAAGTTAC
TATAAAAGCATATGATAAACTGATAAAGTAGATAAAAGTACTTTCCCTATGTTTTTTGAG
ACAAATAAGTTGTTGTAAACCAAATCAATCAAGAATCGGTCAACAAAGTC


BQ
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AF RS1DX54TF U 1
AF RS1DG88TF U 145
AF RS1DX54JQ C 168
BS 1 590 RS1DX54TF

RD RS1DX54TF 590 0 0
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TCAAATCACACCAAAACATGTCGAAACAGCTCAGCTTACTAATTTCGGAGCTAAACACAT
TCCAAGTAATATTGGTTTTGGTGCGGTTGGAAGTTTAGAAGTTGCCATCACATTCTCGAT
TCCTATCATCCAGATTCCTTTTCCAAAGGAAGGTTCTACGGTGGGCATTATTAACGAACA
CGACAAAGATAAGATTAAAGGTATTGTAATTACTCCAGCGACTACTCATGAGTTTGGTCT
TTCCCCTGGAAAAGATGGTGTAGAATTCTGACACAGCGAGGGAGAAACCATTCCTAAAAA
CCGAGTATTGAAGACCATGCCACTTTCCTGAGAGTTATGTTAGCTGGAGATTGAAGTTAC
TATAAAAGCATATGATAAACTGATAAAGTAGATAAAAGTACTTTCCCTATGTTTTTTGAG
ACAAATAAGTTGTTGTAAACCAAATCAATCAAGAATCGGTCAACAAAGTC

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G
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GTTGGAAGTTTAGAAGTTGCCATCACATTCTCGATTCCTATCATCCAGATTCCTTTTCCA
AAGGAAGGTTCTACGGTGGGCATTATTAACGAACACGACAAAGATAAGATTAAAGGTATT
GTAATTACTCCAGCGACTACTCATGAGTTTGGTCTTTCCCCTGGAAAAGATGGTGTAGAG
TTCTGACACAGCGAGGGAGAAACCATTCCTAAAAACCGAGTATTGAAGACCATGCCACTT
TCCTGAGAGTTATGTTAGCTGGAGATTGAAGTTACTATAAAAGCATATGATAAACTGATA
AAGTAGATAAAAGTACTTTCCCTATGTTTTTTGAGACAAATAATTTGTTGTAAACCAAAT
CAATCAAGAATCGGTC

QA 2 437 2 437
DS 

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TCACATTTTCGATTCCTATCATCCAGATTCCTTTTCCAAAGGAAGGTTTTACGGTGGGCA
TTATTAACGAACACGACAAAGATAAGATTAAAGGTATTGTAATTACTCCAGGGACTACTC
ATGAGTTTGGTCTTTCCCCTGGAAAAGATGGTGTAGAATTTTGACACAGGGAGGGAGAAA
CCATTCCTAAAAACCGAGTATTGAAGACCATGCCACTTTCCTGAGAGTTATGTTAGCTGG
AGATTGAAGTTACTATAAAAGCATATGATAAACTGATAAAGTAGATAAAAGTACTTTCCC
TATGTTTTTTGAGACAAATAAGTTGTTGTAAACCAAATCAATCAAGAATCGGTCAACAAA
GTC

QA 1 423 1 423
DS 



AS 1 3

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GGGATTAAATCCATTTAGACAACGAAACATAGTCAGATACAATGCTGTCTTCTCGAGCTT
TTAATGCAGCGTCTCGCTCGTCTCTCAGTCGTCCTCTTCTCTCCAAGAGACTAGCTTCTT
CTGGTCGGACTGCTGATCCTAAGATCCATAGTCGTAACGATGGAGACGAGCCTAGTCTTT
TCCCAACAGACCCCGAAGGTTTGGATGATGTAGCGAATCCTAAGACTCCGGCAGATGAGA
TTGTACCGGACATTCGACCACCCGGTTTAGAAAAAGAACCGCTTAAGCCTCCTAAAAACC
CACGAGCTACTTCACACAGGATTGAGTCTACTCCGGTTAGTCTACCCGCAGATCCCAGTC
TCCAACAGAAACGAAGATAAGAGCAGCAAAAGCCTTGGCAGCTGCACCCGCTATGGTCGC
CTAGTTTAAGACATAATATTGTGAACTGAAGGCAGATATGTTTACTTTTTATTAGCTTTT
GAGAATATAAAAAAAAAACTATTGCTTTCTTGGGATTAAAGAAAGTTAGTTACTTCTATT
TTTGCAAATGCGTTACTTCCTCTGTTTTTGAATAAGTGTCATTTTGATATTTTTCACACA
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GTATTTGAAAT


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EG17JQ C 179
AF RS1EG17TF U 1
AF RS1B716TF U 1
BS 1 318 RS1B716TF
BS 319 319 RS1EG17TF
BS 320 443 RS1B716TF
BS 444 444 RS1EG17TF
BS 445 479 RS1B716TF
BS 480 480 RS1EG17TF
BS 481 607 RS1B716TF
BS 608 608 RS1EG17TF
BS 609 671 RS1B716TF

RD RS1EG17JQ 460 0 0
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GATTGTACCGGACATTCGACCCCCCGGTTTAGAAAAAGAACCGCTTAAGCCTCCTAAAAA
CCCACGAGCTACTTCACACAGGATTGAGTCTACTCCGGTTAGTCTACCCGCAGATCCCAG
TCTCCAACAGAAACGAAGATAAGAGCAGCAAAAGCCTTGGCAGCTGCACCCGCTATGGTC
GCCTAGTTTAAGACATAATATTGTGAACTGAAGGCAGATATGTTTACTTTTTATTAGCTT
TTGAGAATATAAAAAAAAAACTATTGCTTTCTTGGGATTAAAGAAAGTTAGTTACTTCTA
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CAGATTAAGAAAGTGATGGAAATATACGTAGGTTGTTACT

QA 1 460 1 460
DS 

RD RS1EG17TF 624 0 0
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TTGTACCGGACATTCGACCACCCGGTTTAGAAAAAGAACCGCTTAAGCCTCCTAAAAACC
CACGAGCTACTTCACACAGGATTGAGTCTACTCCGGTTAGTCTACCCGCAGATCCCAGTC
TCCAACAGAAACGAAGATAAGAGCAGCAAAAGCCTTGGCAGCTGCACCCGCTATGGTCGC
CTAGTTTAAGACATAATATTGTGAACTGAAGGCAGATATGTTTACTTTTTATTAGCTTTT
GAGAATATAAAAAAAAAACTATTGCTTTCTTGGGATTAAAGAAAGTTAGTTACTTCTATT
TTTGCAAATGCGTTACTTCCTCTGTTTTTGAATAAGTGTCATTTTGATATTTTTCACACA
GATTAAGAAAGTGATGGAAATATA

QA 1 624 1 624
DS 

RD RS1B716TF 671 0 0
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TTAATGCAGCGTCTCGCTCGTCTCTCAGTCGTCCTCTTCTCTCCAAGAGACTAGCTTCTT
CTGGTCGGACTGCTGATCCTAAGATCCATAGTCGTAACGATGGAGACGAGCCTAGTCTTT
TCCCAACAGACCCCGAAGGTTTGGATGATGTAGCGAATCCTAAGACTCCGGCAGATGAGA
TTGTACCGGACATTCGACCACCCGGTTTAGAAAAAGAACCGCTTAAGCCTCCTAAAAACC
CACGAGCTACTTCACACAAGATTGAGTCTACTCCGGTTAGTCTACCCGCAGATCCCAGTC
TCCAACAGAAACGAAGATAAGAGCAGCAAAAGCCTTGGCAGCTGCACCCGCTATGGTCGC
CTAGTTTAAGACATAATATTGTGGACTGAAGGCAGATATGTTTACTTTTTATTAGCTTT*
GAGAATATAAAAAAAAAACTATTGCTTTCTTGGGATTAAAGAAAGTTAGTTACTTCTATT
TTTGCAAATGCGTTACTTCCTCTGTTTTTGAATAAGTGTCATTTTGATATTTTTCACACA
GATTAAGGAAGTGATGGAAATATACGTAAGTTGTTACTAATTACATCTTTCTGATCAATA
GTATTTGAAAT

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 3

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AAGGTCGCTAAGAGGAAGTTGGGTACCCACAAGAGAGCCAAGCGAAAGAGAGAGGAGATG
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TCTTCTATGTTATTGGAAGCTTTGTTATTTTTATTACTCTTTTTGTTCGCCCTTGCAAAT
CTGCTTTAGTCTCAAAAGACTTTTGTGTTTTGTTAGAAATATGGATTAGTGTTTGCTTCA
CTCTTTTTCTATTAAGCTTTTTAAAACTTGCTACGTTTATGTCGATCGATTCACTTTTAC
CC


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 5 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 

AF RS1AW39TF U 1
AF RS1BK22JQ C 2
AF RS1BK22TF U 50
BS 1 57 RS1AW39TF
BS 58 59 RS1BK22JQ
BS 60 60 RS1BK22TF
BS 61 368 RS1AW39TF
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BS 370 410 RS1AW39TF
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BS 489 541 RS1AW39TF
BS 542 542 RS1BK22JQ

RD RS1AW39TF 541 0 0
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GCTCCTTACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTCAAGGTTGGCAAAGACAAGAGGGCTCTT
AAGGTCGCTAAGAGGAAGTTGGGTACCCACAAGAGAGCCAAGCGAAAGAGAGAGGAGATG
TCTAGCGTTCTCCGTAAGATGAGGTCTGGTGGTGACAAGAAGTAAAAGCATCTCAAGTCT
TCTTCTAT*TTATTGGAAGCTTTGTTATTTTTATTACTCTTTTTGTTCGCTCTTGCAAAT
CTGCTTTAGTCTCAAAAGACTTTTGTGTTTTGTTAGAAATATGGATTAGTGTTTGCTTCA
CTCTTTT*CTATTAAGCTTTTTAAAACTTGCTACGTTTATGTCGATCGATTCACTTTTAC
C

QA 1 541 1 541
DS 

RD RS1BK22JQ 541 0 0
GG
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AACAAAGGTCACGTCGTCACCAGACGCGAATTGGCTCCTCGTCCCAACTCTCGCAAAGGG
AAAACGAGCAAGAGGACATTGTTCATCAGATCACTGATCAGGGAGGTTGCTGGATTTGCT
CCTTACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTCAAGGTTGGCAAAGACAAGAGGGCTCTTAAG
GTCGCTAAGAGGAAGTTGGGTACCCACAAGAGAGCCAAGCGAAAGAGAGAGGAGATGTCT
AGCGTTCTCCGTAAGATGAGGTCTGGTGGTGACAAGAAGTAAAAGCATCTCAAGTCTTTT
TTTATGTTATTGGAAGCTTTGTTATTTTTATTACTCTTTTTGTTCGCCCTTGCAAATCTG
CTTTAGTCTCAAAAGACTTTTGTGTTTTGTTAGAAATATGGATTAGTGTTTGCTTCACTC
TTTTTCTATTAAGCTTTTTAAAACTTGCTACGTTTATGTCGATCGATTCACTTTTACCC

QA 3 541 3 541
DS 

RD RS1BK22TF 493 0 0
TGTTCGTTGG
TTTGAACAAAGGTCACGTCGTCACCAGACGCGAATTGGCTCCTCGTCCCAACTCTCGCAA
AGGGAAAACGAGCAAGAGGACATTGTTCATCAGATCACTGATCAGGGAGGTTGCTGGATT
TGCTCCTTACGAGAAGAGAATCACTGAGCTTCTCAAGGTTGGCAAAGACAAGAGGGCTCT
TAAGGTCGCTAAGAGGAAGTTGGGTACCCACAAGAGAGCCAAGCGAAAGAGAGAGGAGAT
GTCTAGCGTTCTCCGTAAGATGAGGTCTGGTGGTGACAAGAAGTAAAAGCATCTCAAGTC
TTCTTCTATGTTATTGGAAGCTTTGTTATTTTTATTACTCTTTTTGTTCGCCCTTGCAAA
TCTGCTTTAGTCTCAAAAGACTTTTGTGTTTTGTTAGAAATATGGATTAGTGTTTGCTTC
ACTCTTTTTCTATTAAGCTTTTTAAAACTTGCTACGTTTATGTCGATCGATTCACTTTTA
CC
C

QA 11 492 11 492
DS 



AS 1 3

CO CL3394Contig1 621 3 5 U
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AAGAAAAAGTAGACAATGTTAGGCAGAGGAAAGCGACCTCAGCAAAACTTAAGAAGCTGA
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CACAGAATTGCATCGAACCTCTTCAAGCGCTTCGTGACGGTAGTAAAGAGGTGATGAGCA
TGAAAGGTCAGAGTGCAGATAGGAGACGCGATATAGCTACATTGAGGAAGAAAAAGAAGG
AAGAGAAGATAGGTCGGCGTGATCAGCGAAGGGATCAGAAGAAGAAGAGAAAACTAATGG
CTTCTTCTTAAGTGGTCTTTTACCAAACTTTTGTTTTACGACTTTTATGTTTTATCCAAT
CAGATGTTTTTATATAGAAAAACTTAGGGAAAATCGCATTTTAAATCCTCGAAGTGTCAC
TTTATAGCATTTTAAATACCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1A942TF U 97
AF RS1B310JQ C 1
AF RS1B310TF U 1
BS 1 97 RS1B310TF
BS 98 292 RS1A942TF
BS 293 293 RS1B310TF
BS 294 407 RS1A942TF
BS 408 621 RS1B310TF

RD RS1A942TF 311 0 0
G
CTCAGCAAAACTTAAGAAGCTGAAGGAGGAACTTAGCTCGCTATTATCACGTCCTATGCA
GCCTAAGAAATTTTCAGACCGTTACTTTGCTGGGCGTGGTATGTCGCCACTATTACAGAA
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GAGAAGAAAGCTTGTTGTGGTTTCACAGAATTGCATCGAACCTCTTCAAGCGCTTCGTGA
CGGTAGTAAAGAGGTGATGAGCATGAAAGGTCAGAGTGCAGATAGGAGACGCGATATAGC
TACATTGAGG

QA 2 311 2 311
DS 

RD RS1B310JQ 621 0 0
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CACAGAATTGCATCGAACCTCTTCAAGCGCTTCGTGACGGTAGTAAAGAGGTGATGAGCA
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CAGATGTTTTTATATAGAAAAACTTAGGGAAAATCGCATTTTAAATCCTCGAAGTGTCAC
TTTATAGCATTTTAAATACCG

QA 1 621 1 621
DS 

RD RS1B310TF 621 0 0
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AAGAAAAAGTAGACAATGTTAGGCAGAGGAAAGCGACCTCAGCAAAACTTAAGAAGCTGA
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ACTTTGCTGGGCGTGGTATGTCGCCACTATTACAGAATCAGTTAGCAGAGTTAACAAATC
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CACAGAATTGCATCGAACCTCTTCAAGCGCTTCGTGACGGTAGTAAAGAGGTGATGAGCA
TGAAAGGTCAGAGTGCAGATAGGAGACGCGATATAGCTACATTGAGGAAGAAAAAGAAGG
AAGAGAAGATAGGTCGGCGTGATCAGCGAAGGGATCAGAAGAAGAAGAGAAAACTAATGG
CTTCTTCTTAAGTGGTCTTTTACCAAACTTTTGTTTTACGACTTTTATGTTTTATCCAAT
CAGATGTTTTTATATAGAAAAACTTAGGGAAAATCGCATTTTAAATCCTCGAAGTGTCAC
TTTATAGCATTTTAAATACCG

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 3

CO CL3395Contig1 833 3 4 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGCCGCATCAGC
CAAAGCAAAGCAGAACAAAAAAAAAAACTAAAACATCAAGAAAATGGCTCATACTCTCGA
CCTCGAAGGCATCACCAAAGCAATCTCAGGAATGGGAGTTGATGAGGGAGCATTAATAAG
TACTCTGGGGAACTCACACAAGGATCATCGCAAGTTGTTTAGGAAAGCAAGCAAGAGTTT
CTTTGTGGAAGATGAAGAAAGAGCTTTTGAGAAATGTCATGATCACTTTGTCAAACATCT
CAAGCTTGAGTTCTCTCGTTTCACTAACGCGGTGGTGATGTGGTCGATGCATCCATGGGA
GAGAGACGCAAGATTGGTGAAGAAAGCCCTTAAGAAAGGAGATGAATCTTACAACGTCAT
CGTAGAGGTGTCATGCACTCGCTCCTCTGAGGATCTCCTAGGGGCACGCAAAGCTTACCA
CTCTCTCTTCGACCAGTCCATGGAAGAAGACATTGCCTCTCACATCCATGGCCCTCAACG
CAAGCTGCTTGTGGGGCTCGTGAGTGCTTATAGATACGAAGGGAACAAGGTGAAGGAAGA
TTCAGCCAAATCCGACGCTAAGATTTTGGCCGAGGCTGTGGCTTCTTCAGGAGAGAGAGC
CATAGAGAATGATGAGGTTGTTAGGATTCTGACGACAAGAAGCAAACTCCATCTCCAACA
TCTCTACAAATACTTCAACCAAATCAACGGCTCTGATCTTCTTGGGGGTGCATCTGAGTC
TTCGCTCATCAATGAAGCATTGCTTTGTTTACTCAAACCCTCTGTGTATTTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GL55TF U 53
AF RS1A036TF U 1
AF RS1A036TV U 166
BS 1 85 RS1A036TF
BS 86 87 RS1GL55TF
BS 88 786 RS1A036TF
BS 787 833 RS1A036TV

RD RS1GL55TF 203 0 0
GG
ATCAGCCAAAGCAAAGCAGAACAAAAAAAAAAACTAAAACATCAAGAAAATGGCTCATAC
TCTCGACCTCGAAGGCATCACCAAAGCAATCTCAGGAATGGGAGTTGATGAGGGAGCATT
AATAAGTACTCTGGGGAACTCACACAAGGATCATCGCAAGTTGTTTAGGAAAGCAAGCAA
GAGTTTCTTTGTGGAAGATGA

QA 3 203 3 203
DS 

RD RS1A036TF 786 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGCCGCATCAGC
CAAAGCAAAGCAGAACAAAAAAAAA**CTAAAACATCAAGAAAATGGCTCATACTCTCGA
CCTCGAAGGCATCACCAAAGCAATCTCAGGAATGGGAGTTGATGAGGGAGCATTAATAAG
TACTCTGGGGAACTCACACAAGGATCATCGCAAGTTGTTTAGGAAAGCAAGCAAGAGTTT
CTTTGTGGAAGATGAAGAAAGAGCTTTTGAGAAATGTCATGATCACTTTGTCAAACATCT
CAAGCTTGAGTTCTCTCGTTTCACTAACGCGGTGGTGATGTGGTCGATGCATCCATGGGA
GAGAGACGCAAGATTGGTGAAGAAAGCCCTTAAGAAAGGAGATGAATCTTACAACGTCAT
CGTAGAGGTGTCATGCACTCGCTCCTCTGAGGATCTCCTAGGGGCACGCAAAGCTTACCA
CTCTCTCTTCGACCAGTCCATGGAAGAAGACATTGCCTCTCACATCCATGGCCCTCAACG
CAAGCTGCTTGTGGGGCTCGTGAGTGCTTATAGATACGAAGGGAACAAGGTGAAGGAAGA
TTCAGCCAAATCCGACGCTAAGATTTTGGCCGAGGCTGTGGCTTCTTCAGGAGAGAGAGC
CATAGAGAATGATGAGGTTGTTAGGATTCTGACGACAAGAAGCAAACTCCATCTCCAACA
TCTCTACAAATACTTCAACCAAATCAACGGCTCTGATCTTCTTGGGGGTGCATCTGAGTC
TTCGCT

QA 1 786 1 786
DS 

RD RS1A036TV 668 0 0
GGGAGCATTAATAAGTACTCTGGGGAACTCACACAAGGATCATCGCAAGTTGTTTAGGAA
AGCAAGCAAGAGTTTCTTTGTGGAAGATGAAGAAAGAGCTTTTGAGAAATGTCATGATCA
CTTTGTCAAACATCTCAAGCTTGAGTTCTCTCGTTTCACTAACGCGGTGGTGATGTGGTC
GATGCATCCATGGGAGAGAGACGCAAGATTGGTGAAGAAAGCCCTTAAGAAAGGAGATGA
ATCTTACAACGTCATCGTAGAGGTGTCATGCACTCGCTCCTCTGAGGATCTCCTAGGGGC
ACGCAAAGCTTACCACTCTCTCTTCGACCAGTCCATGGAAGAAGACATTGCCTCTCACAT
CCATGGCCCTCAACGCAAGCTGCTTGTGGGGCTCGTGAGTGCTTATAGATACGAAGGGAA
CAAGGTGAAGGAAGATTCAGCCAAATCCGACGCTAAGATTTTGGCCGAGGCTGTGGCTTC
TTCAGGAGAGAGAGCCATAGAGAATGATGAGGTTGTTAGGATTCTGACGACAAGAAGCAA
ACTCCATCTCCAACATCTCTACAAATACTTCAACCAAATCAACGGCTCTGATCTTCTTGG
GGGTGCATCTGAGTCTTCGCTCATCAATGAAGCATTGCTTTGTTTACTCAAACCCTCTGT
GTATTTCA

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 3

CO CL3396Contig1 578 3 8 U
GGAACCAACATAAAAAGCGATGGCTCAGATGGCGAAATCCATGATAGAAGTGGAGATCAA
AGTGTCAGCTGATAAGATTTTCCAAGCTATCAAGGCTACTTCTCGCAGCGTACCAAAACT
ATCTCCAGAGAAAATACTTAGCGTGGAGGAGCAAGTCGGTGATGACACCAAGAACTGGAC
TTTGTCTGTCGATGGAAAAGTGGAGAAGATGAAGGAGAGAGTTGAAATAGACGAGGAAAA
CAAATCAATGACGGTGTTTGTGTTCGATGGAGATGTAATGGAAAACTACAGTAGCTTCAA
ATGCAACCTTCAGATTATACCGAAGCTCCATGGGAGAAGTATAGCGAGATGGAGCTGGGA
ATACGAGAAGCTTAACTCAGATTCTCCAGCTCCTAACAAGTATATGGACTTTGCGGTCTA
TCTCACTAGAGATATCGAGTCTAGTCTTCTCAAAACGTAAAGATGCAAGTTATAGATGTA
TTGCTTTGTTTATAACAATGGTTGCATCTCTTTATGCCATGTGTGTACGTGCGGAAGTTA
CATGAATAAAAGTTTGAAGGGGGTTGTGTTTTGACGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1G644TF U 1
AF RS1F623JQ C 10
AF RS1F623TF U 10
BS 1 86 RS1G644TF
BS 87 87 RS1F623TF
BS 88 91 RS1G644TF
BS 92 92 RS1F623TF
BS 93 349 RS1G644TF
BS 350 350 RS1F623TF
BS 351 569 RS1G644TF
BS 570 578 RS1F623TF

RD RS1G644TF 569 0 0
GGAACCAACATAAAAAGCGATGGCTCAGATGGCGAAATCCATGATAGAAGTGGAGATCAA
AGTGTCAGCTGATAAGATTTTCCAAGTTATCGAGGCTACTTCTCGCAGCGTACCAAAACT
ATCTCCAGAGAAAATACTTAGCGTGGAGGAGCAAGTCGGTGATGACACCAAGAACTGGAC
TTTGTCTGTCGATGGAAAAGTGGAGAAGATGAAGGAGAGAGTTGAAATAGACGAGGAAAA
CAAATCAATGACGGTGTTTGTGTTCGATGGAGATGTAATGGAAAACTACAGTAGCTTCAA
ATGCAACCTTCAGATTATACCGAAGCTCCATGGGAGAAGTATAGCGAGACGGAGCTGGGA
ATACGAGAAGCTTAACTCAGATTCTCCAGCTCCTAACAAGTATATGGACTTTGCGGTCTA
TCTCACTAGAGATATCGAGTCTAGTCTTCTCAAAACGTAAAGATGCAAGTTATAGATGTA
TTGCTTTGTTTATAACAATGGTTGCATCTCTTTATGCCATGTGTGTACGTGCGGAAGTTA
CATGAATAAAAGTTTGAAGGGGGTTGTGT

QA 1 569 1 569
DS 

RD RS1F623JQ 569 0 0
GG
AAAAAGCGATGGCTCAGATGGCGAAATCCATGATAGAAGTGGAGATCAAAGTGTCAGCTG
ATAAGATTTTCCAAGCTATCAAGGCTACTTCTCGCAGCGTACCAAAACTATTTCCAGAGA
AAATACTTAGCGTGGAGGAGCAAGTCGGTGATGACACCAAGAACTGGACTTTGTCTGTCG
ATGGAAAAGTGGAGAAGATGAAGGAGAGAGTTGAAATAGACGAGGAAAACAAATCAATGA
CGGTGTTTGTGTTCGATGGAGATGTAATGGAAAACTACAGTAGCTTCAAATGCAACCTTC
AGATTATACCGAAGCTCCATGGGAGAAGTATAGCGAGATGGAGCTGGGAATACGAGAAGC
TTAACTCAGATTCTCCAGCTCCTAACAAGTATATGGACTTTGCGGTCTATCTCACTAGAG
ATATCGAGTCTAGTCTTCTCAAAACGTAAAGATGCAAGTTATAGATGTATTGCTTTGTTT
ATAACAATGGTTGCATCTCTTTATGCCATGTGTGTACGTGCGGAAGTTACATGAATAAAA
GTTTGAAGGGGGTTGTGTTTTGACGTT

QA 3 569 3 569
DS 

RD RS1F623TF 569 0 0
GG
AAAAAGCGATGGCTCAGATGGCGAAATCCATGATAGAAGTGGAGATCAAAGTGTCAGCTG
ATAAGATTTTCCAAGCTATCAAGGCTACTTCTCGCAGCGTACCAAAACTATCTCCAGAGA
AAATACTTAGCGTGGAGGAGCAAGTCGGTGATGACACCAAGAACTGGACTTTGTCTGTCG
ATGGAAAAGTGGAGAAGATGAAGGAGAGAGTTGAAATAGACGAGGAAAACAAATCAATGA
CGGTGTTTGTGTTCGATGGAGATGTAATGGAAAACTACAGTAGCTTCAAATGCAACCTTC
AGATTATACCGAAGCTCCATGGGAGAAGTATAGCGAGATGGAGCTGGGAATACGAGAAGC
TTAACTCAGATTCTCCAGCTCCTAACAAGTATATGGACTTTGCGGTCTATCTCACTAGAG
ATATCGAGTCTAGTCTTCTCAAAACGTAAAGATGCAAGTTATAGATGTATTGCTTTGTTT
ATAACAATGGTTGCATCTCTTTATGCCATGTGTGTACGTGCGGAAGTTACATGAATAAAA
GTTTGAAGGGGGTTGTGTTTTGACGTT

QA 3 569 3 569
DS 



AS 1 3

CO CL3397Contig1 803 3 9 U
CGAGGAAAAAACTCAACAAACTTTTAAATCCAATGCTTGTAAGTTGAGAGAAACAACAGC
ACTTGCAAGGAACCAATTACACAAAAAAAAAA*CGAAAATTGCCAAAAATTTGGATTTTA
CCGCAACTCAAATTTCATCAAAAATACAATAACCATGCCATTGCTGCCTGCAATTGAAGC
AGTGTGTATCAAGACTCAAACTGCGATTACATTTCCCTGAGCTTCGGCAACGAGTCTCTT
CTTGTTCGATCTATCTTTGGACTTATGAGACTTTCGTTTCCTTGAAGGAGTCTTTTGGTC
TGTCTCTTGTTCTATTAAGGACACAGAAGCAATGATCTCTTCTTCTATCTTCTTGTCTTT
AGGATACTCTGTCTCAGACTCTGGATCAATCACAGACATCTCGCCGAGTGTGTAGTCTAA
CAAGAAACTGCTTCTTACAAATCTGTCCATCCTATTGAAATGTCTCTGAAAATATGGGAT
TAGACCTTCCAGGAGTTCTCCAATTCCTTTAACCTGAACGATTTCTGTGGGAGGAAGTAT
GTTGAAGGTTTGGTAAAGAACAAACTGAGCAATGTGGCATCGGTTTGGTCTTGTGTTCCA
TTCTCTGAGATATTCAAAAAGTAAACGGAACTCTTCTTTTTCAAGTCCTTGAAGAGCTTT
CACAATCTGCTCGTCTGATTCTCTTTTCTTGCAGAGGCCAGCAAAGAGTTCGTAAACTTT
GTGAGGCCTACGAAGCTCAAATGCTAATCTTATGGCTTTAGTGTATTCGGCATCTAACAC
TGCGTTTTCCAGCTCTTGCCCTC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B874JQ U 1
AF RS1GS33JQ U 4
AF RS1B874TF C 43
BS 1 92 RS1B874JQ
BS 93 93 RS1GS33JQ
BS 94 376 RS1B874JQ
BS 377 377 RS1GS33JQ
BS 378 482 RS1B874JQ
BS 483 483 RS1GS33JQ
BS 484 653 RS1B874JQ
BS 654 785 RS1GS33JQ
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RD RS1B874JQ 653 0 0
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CTTGTTCGATCTATCTTTGGACTTATGAGACTTTCGTTTCCTTGAAGGAGTCTTTTGGTC
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AGGATACTCTGTCTCAAACTCTGGATCAATCACAGACATCTCGCCGAGTGTGTAGTCTAA
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TTCTCTGAGATATTCAAAAAGTAAACGGAACTCTTCTTTTTCAAGTCCTTGAA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RS1GS33JQ 782 0 0
GC
AAAAAACTCAACAAACTTTTAAATCCAATGCTTGTAAGTTGAGAGAAACAACAGCACTTG
CAAGGAACCAATTACACAAAAAAAAA**CGAAAATTGCCAAAAATTTGGATTTTACCGCA
ACTCAAATTTCATCAAAAATACAATAACCATGCCATTGCTGCCTGCAATTGAAGCAGTGT
GTATCAAGACTCAAACTGCGATTACATTTCCCTGAGCTTCGGCAACGAGTCTCTTCTTGT
TCGATCTATCTTTGGACTTCTGAAACTTTCGTTTCCTTGAAGGAGTCTTTTGGTCTGTCT
CTTGTTCTATTAAGGACACAGAAGCAATGATCTCTTCTTCTATCTTCTTGTCTTTAGGAT
ACTCTGTCTCAGACTCTGGATCAATCACAGACATCTCGCCGAGTGTGTAGTCTAACAAGA
AACTGCTTCTTACAAATCTGTCCATCCTATTGAAATGTCTCTGAAAATATGGGATTAGAC
CTTCCAGGAGTTCTCCAATTCCTTTAACCTGAACGATTTCTGTGGGAGGAAGTATGTTGA
AGGTT*GGTAAAGAACAAACTGAGCAATGTGGCATCGGTTTGGTCTTGTGTTCCATTCTC
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TCTGCTCGTCTGATTCTCTTTTCTTGCAGAGGCCAGCAAAGAGTTCGTAAACTTTGTGAG
GCCTACGAAGCTCAAATGCTAATCTTATGGCTTTAGTGTATTCGGCATCTAACACTGCGT

QA 3 782 3 782
DS 

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AG
TGAGAGAAACAACAGCACTTGCAAGGAACCAAT*ACACAAAAAAAAAA*CGAAAATTGCC
AAAAATTTGGATTTTACCGCAACTCAAATTTCATCAAAAATACAATAACCATGCCATTGC
TGCCTGCAATTGAAGCAGTGTGTATCAAGACTCAAACTGCGATTACATTTCCCTGAGCTT
CGGCAACGAGTCTCTTCTTGTTCGATCTATCTTTGGACTTATGAGACTTTCGTTTCCTTG
AAGGAGTCTTTTGGTCTGTCTCTTGTTCTATTAAGGACACAGAAGCAATGATCTCTTCTT
CTATCTTCTTGTCTTTAGGATACTCTGTCTCAGACTCTGGATCAATCACAGACATCTCGC
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TCTGAGAATATGGGATTAGACCTTCCAGGAGTTCTCCAATTCCTTTAACCTGAACGATTT
CTGTGGGAGGAAGTATGTTGAAGGTTTGGTAAAGAACAAACTGAGCAATGTGGCATCGGT
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AGAGTTCGTAAACTTTGTGAGGCCTACGAAGCTCAAATGCTAATCTTATGGCTTTAGTGT
ATTCGGCATCTAACACTGCGTTTTCCAGCTCTTGCCCTC

QA 3 761 3 761
DS 



AS 1 3

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CCGTTGACCAAAGATACGGTGGTGCCGGAGGAAAAAGCGGTGAACACTGAAGAGAAACCA
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A804TF U 1
AF RS1D954TF U 2
AF RS1A804JQ C 83
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BS 73 73 RS1D954TF
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RD RS1A804TF 695 0 0
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GTTAATGCACCGGCGCCATCTCCGGCGACCAACCTCATTGTGTCAGCAACAACCGCGGTG
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CAGAAGGCCAAGATTGAGATTGTATTGGGGAAATCAGACAAATTCGATTCTCTGATGACT
CCGTTGACCAAAGATACGGTGGTGCCGGAGGAAAAAGCGGTGAACACTGAAGAGAAACCA
ATAGAAGCTGAAGTTAAACCTGAAGGCAAGGAGTGATCATGTAAACAAATTTCTACGTGT
TTCGAGTGTTAAACATAAGTTTCTTTGCATAATGAGCAAACTTTGCTTCATTACTAACTA
AAAAAG*AAATCAAAAAATGTTTT*GTGGAGTTATAGAAAGACAATCAAATGTTGTGTTG
ATGATTTCTTTTTATTACTCTCCCTCTTTGTTGA
A

QA 1 694 1 694
DS 

RD RS1D954TF 706 0 0
GGAACTTCCC
AAAAAAGAAGAGCGAGAGACTAACAATGGCGATGGAAGTAGCAACTCCGGTTAATGCACC
GACGCCATCTCCGGCGACCAACCTCATTGTGTCAGCAACAACCGCGGTGGAAACTCAGAA
GAAGAACAGGATCCAAGTGTCTAACACCAAGAAACCCTTGTTCTTCTACGTTAACCTCGC
CAAGAGATACATTCAACAACACAACGAGGTCGAGCTTTCTGCACTTGGAATGGCGATCAC
AACAGTGGTTACTATCTCAGAAATTTTGAAGAACAATGGACTTGCAACAGAGAAAAAAGT
TCTGACATCAACAGTGGGAATGAAGGACGAGAACAAAGGGAGAGTAGTTCAGAAGGCCAA
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AACATAAGTTTCTTTGCATAATGAGCAAACTTTGCTTCATTACTAACTAAAAAAACAAAT
CAAAAATTTTTTTTGTGGAGTTATAGAAAGACAATCAAATGTTGTGTTGATGATTTCTTT
TT*TTACTCTCCCTCTTTGTTGA*CTATATAAAAAA

QA 11 706 11 706
DS 

RD RS1A804JQ 638 0 0
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TCCAAGTGTCTAACACCAAGAAACCCTTGTTCTTCTACGTTAATCTCGCCAAGAGATACA
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CAGTGGGAATGAAGGACGAGAACAAAGGGAGAGTAGTTCAGAAGGCCAAGATTGAGATTG
TATTGGGGAAATCAGACAAATTCGATTCTTTGATGACTCCGTTGACCAAAGATACGGTGG
TGCCGGAGGAAAAAGCGGTGAACACTGAAGAGAAACCAATAGAAGCTGAAGTTAAACCTG
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CTTTGCATAATGAGCAAACTTTGCTTCATTACTAACTAAAAAAG*AAATCAAAAAATGTT
TT*GTGGAGTTATAGAAAGACAATCAAATGTTGTGTTGATGATTTCTTTTTATTACTCTC
CCTCTTTGTTGAACTATATAAAAAATTAAAATTGCTTT

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 3

CO CL3399Contig1 839 3 4 U
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GGATCCGGGGATTACGATGGTGAGATCGTCACATATTGAAGCTAATAATGGCGAAACGGA
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ATACTTCGAGGAGTTATGGAGATTCTGGATGCTAATAAACTTGATCGCGATCTCGGCTAT
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TAAGATGAGATTAGCCTCAGCATTGGCTTCACCAAGGAAATGTGGGACACCCAAGACAGC
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TGATCAGGTTAAGAAGTGGTTTATGTGTTACAACCTTCAAGATTGTGACGGGAGTGTGCA
AGGAGTGCAGGGTGGTGTTATGTTTTTTTACTATTCAATAAGCTCTATGAGCAATTGTTA
TCTTTTAATGGCTTCTGTTTTTCATAATTTCTTTGTTATATGGGTGATAGAGTATCAATG
GTTCTCAGCTGTTGAGTATATTCTCACTGAGATTTGGAATAAAAATGGATGTTTGAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1H231TF U 1
AF RS1CE34JQ C 127
AF RS1CE34TF U 127
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TTCTCGCCATGGTGAGAATGTCAAACAAGAAGAGAGTAAAGAGACTTTGATCCCGAAATC
TGA

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DS 

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G
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CAGGGCACTCGCAAGAAATTATTTAAGGGTATGATAAGCACTGCGGGAAGCAGTAAGATG
AGATTAGCCTCAGCATTGGCTTCACCAAGGAAATGTGGGACACCCAAGACAGCTTCTCGC
CATGGTGAGAATGTCAAACAAGAAGAGAGTAAGGAGACTTTGATCCCGAAATCTGATCAG
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ATGGCTTCTGTTTTTCATAATTTCTTTGTTATATGGGTGATAGAGTATCAATGGTTCTCA
GCTGTTGAGTATATTCTCACTGAGATTTGGAATAAAAATGGATGTTTGAGTT

QA 2 713 2 713
DS 

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G
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GAGGAGTTATGGAGATTCTGGATGCTAATAAACTTGATCGCGATCTCGGCTATCATCAAA
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ATGGAACAGGAGAAGGGAGGAGTGGAAGTGGAGCAGGCTGTGAAGGAACCAGGGAAGAAA
CAGGGCACTCGCAAGAAATTATTTAAGGGTATGATAAGCACTGCGGGAAGCAGTAAGATG
AGATTAGCCTCAGCATTGGCTTCACCAAGGAAATGTGGGACACCCAAGACAGCTTCTCGC
CATGGTGAGAATGTCAAACAAGAAGAGAGTAAGGAGACTTTGATCCCGAAATCTGATCAG
GTTAAGAAGTGGTTTATGTGTTACAACCTTCAAGATTGTGACGGGAGTGTGCAAGGAGTG
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ATGGCTTCTGTTTTTCATAATTTCTTTGTTATATGGGTGATAGAGTATCAATGGTTCTCA
GCTGTTGAGTATATTCTCACTGAGATTTGGAATAAAAATGGATGTTTGAGTT

QA 2 713 2 713
DS 



AS 1 2

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TTACAATCACTGTCGATGAATTAAACAATCCCAACCCCACAACCAAACCCCAATCCTCAA
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CAGACGACGACGATTCACCCTCCGGAAAGCGATCTAAACTCGATCGGTTCCCTCTTAGCC
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ACCTCCGCCTGCTCAAAGACAATCTTGCTGACTATGCGAATGAGTACCCGGCGCAGTTCG
TTTTAGGGTACTGTGCGACCTACATTTTCATGCAGACGTTTATGATCCCAGGGACTATCT
TTATGTCGCTTTTGGCTGGAGCTCTCTTTGGGGTTATCAAAGGTGTTGTCTTGGTCGTTT
TCAACGCAACCGCTGGAGCTACTTGCTGTTTCTTTTTGTCTAAGTTGATTGGTCGGCCGT
TGATCACTTGGCTGTGGCCTGACAAGTTGAGATTCTTTCAGGCTGAGATTGGTAAGCGTA
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TGGTCGGTCTCATTCCCGCTGCTTACATAACCGTCAGAGCTGGACTTGCTATTGGGGATC
TCAAATCGGTGAAGGACCTGTATGATTTCAAGACATTGTCAGTGCTTTTCCTCATTGGGT
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AGAATCAATACATTTTTTTCGGAATCAAGTTATTATTTTCTTTATAT


BQ
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AF RS1G341TF U 1
AF RS1G341JQ C 413
BS 1 637 RS1G341TF
BS 638 1187 RS1G341JQ

RD RS1G341TF 637 0 0
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TTACAATCACTGTCGATGAATTAAACAATCCCAACCCCACAACCAAACCCCAATCCTCAA
AGTGGTGGGTGATGTCTCTCACACGGAATCTAATCAGAGACGAAGAGCTCGGAGCCATGT
CAGACGACGACGATTCACCCTCCGGAAAGCGATCTAAACTCGATCGGTTCCCTCTTAGCC
GATGGGAACTCGCGGTCTCCCTCGGCGTCTTCCTCGTCTTCTCCTCTGGTCTCTTCTGCA
TCTACATGACAATGCCCGGTGCCCAATTCGGCAAGCTCAAGCTCCCCAGAAGCATCTCTG
ACCTCCGCCTGCTCAAAGACAATCTTGCTGACTATGCGAATGAGTACCCGGCGCAGTTCG
TTTTAGGGTACTGTGCGACCTACATTTTCATGCAGACGTTTATGATCCCAGGGACTATCT
TTATGTCGCTTTTGGCTGGAGCTCTCTTTGGGGTTATCAAAGGTGTTGTCTTGGTCGTTT
TCAACGCAACCGCTGGAGCTACTTGCTGTTTCTTTTTGTCTAAGTTGATTGGTCGGCCGT
TGATCACTTGGCTGTGGCCTGACAAGTTGAGATTCTT

QA 1 637 1 637
DS 

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DS 



AS 1 3

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AAGAAGAGGAAGACTACTGGGTTGTTGCAGCCGTAAGAAGCAAGTACAATGAGATTGTTA
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GCGGTAGTCTTCGTGTTCTGATAGATGATGCTCTTTCTCCTTCTGAAGATGTTTCAGGAA
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AGGTTGAAATGTGGCATGATCTAGCTAGCACGCTGATGCCTAACGGTCGCATTATGGTGA
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
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*CTGTGCCGGA
TC

QA 1 791 1 791
DS 

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G
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GTTATAGTGGATACTGCTGATGCCAGATATCTTCTCCTTGATTCAACTAAGAATGCACAT
AGTGTTATCAACAAGGGAGGTGAGAATTGGACTGATGCTTATTGGGATGAGTTTGCAAGT
TTGCCACCTATTGTCCCTGATGGTCCCATTGCCATCTATGGATTGGGTGGTGGAACAGCT
GCAAGACTGATTCTTGAGTTGTGGCCTTCTGCTCAGCTTGAGGGTTGGGAAATTGATGAC
ATTTTGATTGAGAAAGCGAGAGACTATATGGGGCTGTCAGAGTTAGAGAAGCCAACATCA
AAAGGCGGTAGTCTTCGTGTTCTGATAGATGATGCTCTTTCTCCTTCTGAAGATGTTTCA
GGAAAATATGCTGGGATCATCGTTGATTTGTTTGCTGATGGAAAGGTCTTAGATCAGCTG
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T
AGTGA

QA 2 722 2 722
DS 

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GCTGCAACAGGTTGAAATGTGGCATGATCTAGCTAGCAGGCTGATGCCTAACGGTCGCAT
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GGTGTTAGGTGATTCGGTGTGGATGTTGAATCCTACCATCAAGGTCTTGTCTGAAGCATT
CCCTGGACAAGTTTACTGGAAGAGGACGCCAGATTCAGAAGGTCTCAACTTTGTTGCCTT
AACGGGAGGTGTAACTGATCTTAGTGACTGGTCTAACAAGGTTCCAGTCCGTTTGAGTGA
GACAGTGAAGCAGTGGAAACTATGCGAGAATCTTTAATTTATAGATGTTCTGGAAGGCGT
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GCTAATATTTGATTAGAAGCTCACAAGTTAATAGTGAGAGATGCTTTTATGATCTGTTCT
GACATCTTTGTAACCAACCCAAATTTTAAAAGACAGAACACAGCACACACTT

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DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AGAGGATTCTCTCTTCCTTGTCTAGACGATCCGTTGCTGCTCATCCCTGGCACGATCTTG
AGATTGGTCCTGGAGCTCCACAGATTTTCAACGTGGTAGTTGAGATCACAAAGGGAAGCA
AGGTCAAATATGAACTTGACAAAAAGACTGGACTCATCAAGGTTGATCGTATTCTCTACT
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ACCCTATTGATGTTTTAGTCATCATGCAGGAACCTGTGCTTCCAGGTTGTTTTCTGCGTG
CTCGTGCTATTGGATTAATGCCTATGATTGACCAGGGTGAGAAAGATGACAAGATCATTG
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ACCGTCTCTCTGAGATTCGTCGTTTCTTTGAAGACTACAAGAAGAATGAGAACAAGGAAG
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CTTTGAATTTGTCCTTGTGAACTCAATAATATTTTCTTCTAAATCATCTTTGTTATGTCT
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BQ
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AF RS1G723TF U 1
AF RS1G723JQ C 393
BS 1 599 RS1G723TF
BS 600 919 RS1G723JQ

RD RS1G723TF 599 0 0
ACACCAACACTTGTTTCTCTCCCAAAGCTTTCTCCCTTTTTGACTCCAAGCAAGCAACGA
TGAGTGGAGAAACGAAAGAGAATCAGAAGCTGCAGCAGCGACCTGCTCCTCGTCTTAACG
AGAGGATTCTCTCTTCCTTGTCTAGACGATCCGTTGCTGCTCATCCCTGGCACGATCTTG
AGATTGGTCCTGGAGCTCCACAGATTTTCAACGTGGTAGTTGAGATCACAAAGGGAAGCA
AGGTCAAATATGAACTTGACAAAAAGACTGGACTCATCAAGGTTGATCGTATTCTCTACT
CCTCAGTTGTTTACCCTCACAACTATGGTTTCGTTCCTCGCACCCTTTGTGAAGACAATG
ACCCTATTGATGTTTTAGTCATCATGCAGGAACCTGTGCTTCCAGGTTGTTTTCTGCGTG
CTCGTGCTATTGGATTAATGCCTATGATTGACCAGGGTGAGAAAGATGACAAGATCATTG
CAGTTTGTGTTGATGATCCTGAGTACAAACATTACACTGACATCAAAGAGCTTCCTCCTC
ACCGTCTCTCTGAGATTCGTCGTTTCTTTGAAGACTACAAGAAGAATGAGAACAAGGAA

QA 1 599 1 599
DS 

RD RS1G723JQ 527 0 0
CCTGTGCTTCCAGGTTGTTTTCTGCGTGCTCGTGCTATTGGATTAATGCCTATGATTGAC
CAGGGTGAGAAAGATGACAAGATCATTGCAGTTTGTGTTGATGATCCTGAGTACAAACAT
TACACTGACATCAAAGAGCTTCCTCCTCACCGTCTCTCTGAGATTCGTCGTTTCTTTGAA
GACTACAAGAAGAATGAGAACAAGGAAGTTGCAGTTAATGATTTTCTCCCATCTGAGAAA
GCTATTGAAGCTATCCAGTACTCAATGGACCTTTATGCTGAGTACATTCTCCATACCCTG
CGACGTTGAAGCTTTATCCTCTCAACAGTTATGCTACCTCTTTCTTGTTACCCTGAGATG
TTGAAGCTTTCTCCTCTCAACATTTCTGCAACCGTCTTGTTTCTGTTTCTTTCTATGATG
ATTACTTTCTCTGAATTTTCTTGTTAAACTTTGAATTTGTCCTTGTGAACTCAATAATAT
TTTCTTCTAAATCATCTTTGTTATGTCTTAGAAATTGGAATACCTTC

QA 1 527 1 527
DS 



AS 1 2

CO CL3404Contig1 969 2 2 U
GAGAAGAAGACAGGAAAACATTCTCAAGCTAAGAACCTGTTGGCTGAGAGGAGGAGGAGG
AAGAAGCTAAACGATAGGCTTTACGCTCTTCTGTCTCTTGTTCCTAGGATAACCAAGTTG
GATAGGGCATCGATTCTTGGTGACGCGATCAACTACGTTAAGGAGTTGCAGAATGAGGCA
AAGGAGCTTCAAGACGAGCTTGAAGAGAACTCAGAGACTGAAGATGGATCTAATAGGCAG
CAAGTAGGGATGAGCCTGAACGGGACAGTAGTCACTGGGTTTCACCCGGGGCTTTCGTGT
AACTCTAATGTTCCTAACCTGAAACAAGATGTTGATCTTGAGAATGCCAATTATAAAGGA
CAAGAAATGGAGCCGCAGGTGGACGTGGCTCAGTTAGATGGCAGAGAGTTTTTCGTAAAG
GTGATTTGTGAATACAAACCAGGAGGCTTCGCAAGGCTGATGGAGGCACTTGATTCTTTG
GGACTTGAGGTTACAAATGCTAACACCACTCGCTTCCTCAGTCTTGTCTCTAATGTCTTT
AAAGTCGAGAAAACAGATAGCGAGATGGTGCCAGCTGAACATGTGAGGAACTCTTTGCTG
GAAATAACCAGGAACACATCTAGAGGATGGCATGATGATCAGATGGCAACCGGTTCCATG
CAAAACGAAAAGAACGAGGTTGACTACCAACACTATGATGATCACCACCATCACGGCTAT
CATCACCACCTACATGATCCTCAGATGAATCACAGCGCTCACCATCATCATCATCATCAT
CATCACCAACACATCAACCATTACCAAAACTAATAAGGAACATGTTCCCAGAGCTATCAA
GATGGGTGTTCTTTACAGAGAAAGAACCATTAATATACGCATAAAATGCACTTCAAACAT
CTTTCCATTTCAAGAAATATAATAAAAAGGAATACCAGATTCTCATGGGACATAGAAGTA
TATATAAAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CA74TF U 1
AF RS1CA74JQ C 162
BS 1 659 RS1CA74TF
BS 660 969 RS1CA74JQ

RD RS1CA74TF 659 0 0
GAGAAGAAGACAGGAAAACATTCTCAAGCTAAGAACCTGTTGGCTGAGAGGAGGAGGAGG
AAGAAGCTAAACGATAGGCTTTACGCTCTTCTGTCTCTTGTTCCTAGGATAACCAAGTTG
GATAGGGCATCGATTCTTGGTGACGCGATCAACTACGTTAAGGAGTTGCAGAATGAGGCA
AAGGAGCTTCAAGACGAGCTTGAAGAGAACTCAGAGACTGAAGATGGATCTAATAGGCAG
CAAGTAGGGATGAGCCTGAACGGGACAGTAGTCACTGGGTTTCACCCGGGGCTTTCGTGT
AACTCTAATGTTCCTAACCTGAAACAAGATGTTGATCTTGAGAATGCCAATTATAAAGGA
CAAGAAATGGAGCCGCAGGTGGACGTGGCTCAGTTAGATGGCAGAGAGTTTTTCGTAAAG
GTGATTTGTGAATACAAACCAGGAGGCTTCGCAAGGCTGATGGAGGCACTTGATTCTTTG
GGACTTGAGGTTACAAATGCTAACACCACTCGCTTCCTCAGTCTTGTCTCTAATGTCTTT
AAAGTCGAGAAAACAGATAGCGAGATGGTGCCAGCTGAACATGTGAGGAACTCTTTGCTG
GAAATAACCAGGAACACATCTAGAGGATGGCATGATGATCAGATGGCAACCGGTTCCAT

QA 1 659 1 659
DS 

RD RS1CA74JQ 808 0 0
AGGAG
TGCAGAATGAGGCAAAGGAGCTTCAAGACGAGCTTGAAGAGA*CTCAGAGACTGAAGATG
GATCTAATAGGCAGCAAGTAGGGATGAGCCTGAACGGGACAGTAGTCACTGGGTTTCACC
CGGGGCTTTCGTGTAACTCTAATGTTCCTAACCTGAAACAAGATGTTGATCTTGAGAATG
CCAATTATAAAGGACAAGAAATGGAGCCGCAGGTGGACGTGGCTCAGTTAGATGGCAGAG
AGTTTTTCGTAAAGGTGATTTGTGAATACAAACCAGGAGGCTTCGCAAGGCTGATGGAGG
CACTTGATTCTTTGGGACTTGAGGTTACAAATGCTAACACCACTCGCTTCCTCAGTCTTG
TCTCTAATGTCTTTAAAGTCGAGAAAACAGATAGCGAGATGGTGCCAGCTGAACATGTGA
GGAACTCTTTGCTGGAAATAACCAGGAACACATCTAGAGGATGGCATGATGATCAGATGG
CAACCGGTTCCATGCAAAACGAAAAGAACGAGGTTGACTACCAACACTATGATGATCACC
ACCATCACGGCTATCATCACCACCTACATGATCCTCAGATGAATCACAGCGCTCACCATC
ATCATCATCATCATCATCACCAACACATCAACCATTACCAAAACTAATAAGGAACATGTT
CCCAGAGCTATCAAGATGGGTGTTCTTTACAGAGAAAGAACCATTAATATACGCATAAAA
TGCACTTCAAACATCTTTCCATTTCAAGAAATATAATAAAAAGGAATACCAGATTCTCAT
GGGACATAGAAGTATATATAAAA

QA 6 808 6 808
DS 



AS 1 3

CO CL3405Contig1 1404 3 13 U
GGTTTGGAAAAACATTTATTAATATCTTCCTAAAACCAGAAAAAAACAAAACCAACAAAT
AAATTAACTTATTATAACCGATAAAATTCCAAATAGTTCTCGGAATTTACGGTGGACAAG
GTAAATGATGCACATAGTAAAAAATGATCCACACAATGGCAACCACTAAATTAAATACAA
TCATTTCATACAAAACCATATGTTTTTTCCTTTGCCCGACTTTGTGGGGATTAATGAAGA
AGTATAGAATCATTCACATTCCCCTTCCGTTGTCGCAGAGGAAACATAACTCACAACAAG
AGACGTTTTACTCTCATCAGCCATAACTGGGAGCTAGAACAGTTGCTTGCAAGAACGACA
AGTGAGCTCCAACATTGTTGCATTTATTCTCTTCATTGCTTCTTCTCTAACAAACTGAGC
TTTCTCCAGCTCGGCTTCCGCTTGTTTCCTTATATTCTTCGCCCTCTCTAAATCCATTTC
CGCCATCTCTATCTGCCTCTTCGCTTCTTGTCTCATTTCATCCGCTCTCCTCGCTTCCTC
ATTCGCTGTCAATGCTACACTCATCTCTTCCTTTTCGTTTCTTTTCATGTTTGATGATGT
TTTCGCCATTCCTATAGACAGTTGAAGCTGGAGGCTTTCGAAAGGAGATGAAGATGCATC
GACAGGGTAAGAAAAAGCTAGTGACTGTTGATGGGACGCTTGTGGTGGC*TTAACATAGG
AAGTCCATGCAGTGAAGGTCCAATGCTTGTGGTCGAAAAGGTTCTTGATGGAGTTGAATG
GCCTGATATGTTCTGCTGTAGAGGACGCGGGGGGTTGGTGGGTTGAGGTCGCCGGATGTT
GCAAGTATCTTGATGCTCTATGAAACTCTCAACCCTGGAGAAAACGCGGCCGCAGTCGCA
GGAATGACCGCGTGAGCCGCATGTTTTGAGATGGGCTTTGTAGTCAGATTGAACAGCGTA
GCCTTTTGAGCATCTCTCGCGAACCCATTGCTTGATTGCGCTGTGTTTCCTGCGAAAGTG
CTTTTTGATTCCGACCAGATCTCCTAGTGCGTGGCACGGGTCGTGGTGGAGACAAGTCTG
CTCAGGACACACATAAACTCTCTTCCTCACCTCTTCATCTTTCTTCTCCCTCTTCAGTAG
CTTCCATGGTACTTTATGCCTTCTTCTATGCATCTGGAGATTCTGATCCCTCTGAAACCC
TTGGTTGCAGATCTCACACACGTACCGATCTGACTCTAGCAACGTTCTTGGTGATAAAGA
TACAACCTCTGCATCTGGATCTGGTGTCCCTGATGGTCTCCTTTTTCTCTTGTTGTTCAC
TGGGGTTTCATTGATGGCAAGGAGATCGGAGGAAGATGAAGAGACATGGTTGTTGTTTCT
CTCGTAGTCTATCATCGGATGCCC


BQ
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T
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BQ
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GAT

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DS 



AS 1 3

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TAATTA


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1CP41TF U 1
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QA 1 888 1 888
DS 

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G
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GAGCTGACCATTATAACGAGACTCTCATGTGGTGCTATAGCTGGAACTGTTGGTCAAACC
ATTGCTTATCCGCTCGATGTGATTCGTAGGAGAATGCAAATGGTGGTGTGGAAAGATGCT
TCCTCTGTTGTTACAGGCGAGGGGAGAAGCAAGCTTGAGTACAACGGTATGGTTGATGCA
TTTAGGAAGACAGTTCGTCATGAAGGCTTTGGAGCTTTGTACAAGGGTTTGGTCCCCAAC
TCAGTGAAGGTTGTACCATCAATTGCGATTGCATTTGTGACATATGAGATGGTGAAAGAC
GTGTTAGGAGTGGAGTTTAGGATATCAGACTGAGTCTGTTTGATGATATCTTCAAGAAGA
GAGAGAGAGAGAGAGAGGACACTTCTATTTTTGTAGCCAGAGGAGACAGAAGAGAAGTAC
AACATTTTAGGGTCTTTTATTTGATCTCCTTTCAGCATCCATGGAA

QA 2 647 2 647
DS 

RD RS1DA12JQ 642 0 0
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GGAAAGATGCTTCCTCTGTTGTTACAGGCGAGGGGAGAAGCAAGCTTGAGTACAACGGTA
TGGTTGATGCATTTAGGAAGACAGTTCGTCATGAAGGCTTTGGAGCTTTGTACAAGGGTT
TGGTCCCCAACTCAGTGAAGGTTGTACCATCAATTGCGATTGCATTTGTGACATATGAGA
TGGTGAAAGACGTGTTAGGAGTGGAGTTTAGGATATCAGACTGAGTCTGTTTGATGATAT
CTTCAAGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGACACTTCTATTTTTGTAGCCAGAGGAGACAG
AAGAGAAGTACAACATTTTAGGGTCTTTTATTTGATCTCCTTTCAGCATCCATGGAAGAG
ATAAAAGGCTATAGAGCTTTAGCCAAACTTCTATTTTTTTTTCCTTTCTACTTATAGATT
GAGTTTTCTTCTGAATCAAAATAAGCCAAGAGGCCAACTATATTAAACCTATTTGGTTCT
GGAGTTTGTGTGTTTTACAAGTTTTTGTTGGGTCTTTTGATATTAAGTTATCATTATTAT
TACCACTCTTATTGGTACTTTGTGGATTAGTTTGAATAATTA

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 3

CO CL3408Contig1 1071 3 5 U
GGTATCCACCAGAACCCGTCGAATATCTTTTGTGCCCGTCTTCGTCTTCCTCGCTCTCTC
CGTGTTGACTCTTGAGCCGATCCAACCATACCAACAACGACGCGATTCTCCGAGGATGCC
TCGGGACTTGTCAAGATCGAGGTCACCTTCTCCATCACCTTCACGTCGCAGGAAGCACTC
TAGGTCTCCTGTAAGGCATAGGCATAGCAGGAGAAACAGGAGAGACAGAAGCCGTTCTCC
ATACTCATCTTATTCATATAGCAGACGAAGAAGTCGTTCTATCTCTCCTAGGCGCCACCG
GAGTCGATCTGCTACTCCTAAGCGACGCTCACCAACACCAAAACGCTACAAAAGACAAAA
GAGTAGGAGCTCTTCTCTATCTCCTGCAAAAAGATCTCCTGCCACAGCCCTTGAGTCAGC
TAAAAATAGTAATGGAGGAAAGCTAATCAAAGAAGAGGAAGAGCGGAAAAGGCGACAGCA
GGAAGCAGAACTGAAGCTAATAGAGGAAGAAACTATGAAACGGGTTGAAGAAGCTATTAG
GAAAAAGGTTGAAGAAAGCTTACAGTCTGAGAAAGTCAAAATGGAAATTCTAACACTGTT
GGAGGAAGGACGAAAGAGAGTTAGTGAAGAAGTCGCAGCTCAGCTTGAGAAGGAGAAGGC
AGCTTCTCTTATCGAGGCCAAAGAAAAAGAGGGCGCCATGCGGTGTTTGTCGCAGGAAAG
AGAGCAACAAGGGAAAGAAGAGATGTCGAGAATAGAGGAGGAGAACAGGAAGAAAGTAGA
AGAAGCTCAGCTAAAAGAAGCAATGGAGAGGCAAAGGAAAGAGGAAGAACGTTATCGGGA
GCTGGAGGAGCGGCAAAGACAGAAGGAAGAAGCAATGCGAAAGAAGAAAGCAGAAGAGGA
AGAAGAACGTCTGAAACAGATGAAACTGTTGGGTAAAAACAAATCACGCCCTAAACTATC
CTTTGCCTTAAGCTCCAAGTGAATGGATGAAAAACAAAATGAAAATGGTTCTGTTGTGAT
GATATGTGCTTCTTTCTCTCAAAGATGCTTTATGATTATTTGTTGGAGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E831TF U 1
AF RS1A548TF U 30
AF RS1E831JQ C 320
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BS 671 1071 RS1E831JQ

RD RS1E831TF 648 0 0
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CGTGTTGACTCTTGAGCCGATCCAACCATACCAACAACGACGCGATTCTCCGAGGATGCC
TCGGGACTTGTCAAGATCGAGGTCACCTTCTCCATCACCTTCACGTCGCAGGAAGCACTC
TAGGTCTCCTGTAAGGCATAGGCATAGCAGGAGAAACAGGAGAGACAGAAGCCGTTCTCC
ATACTCATCTTATTCATATAGCAGACGAAGAAGTCGTTCTATCTCTCCTAGGCGCCACCG
GAGTCGATCTGCTACTCCTAAGCGACGCTCACCAACACCAAAACGCTACAAAAGACAAAA
GAGTAGGAGCTCTTCTCTATCTCCTGCAAAAAGATCTCCTGCCACAGCCCTTGAGTCAGC
TAAAAATAGTAATGGAGGAAAGCTAATCAAAGAAGAGGAAGAGCGGAAAAGGCGACAGCA
GGAAGCAGAACTGAAGCTAATAGAGGAAGAAACTATGAAACGGGTTGAAGAAGCTATTAG
GAAAAAGGTTGAAGAAAGCTTACAGTCTGAGAAAGTCAAAATGGAAATTCTAACACTGTT
GGAGGAAGGACGAAAGAGAGTTAGTGAAGAAGTCGCAGCTCAGCTTGA

QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1A548TF 641 0 0
GG
GTGCCCGTCTTCGTCTTCCTCGCTCTCTCCGTGTTGACTCTTGAGCCGATCCAACCATAC
CAACAACGACGCGATTCTCCGAGGATGCCTCGGGACTTGTCAAGATCGAGGTCACCTTCT
CCATCACCTTCACGTCGCAGGAAGCACTCTAGGTCTCCTGTAAGGCATAGGCATAGCAGG
AGAAGCAGGAGAGACAGAAGCCGTTCTCCATACTCATCTTATTCATATAGCAGACGAAGA
AGTCGTTCTATCTCTCCTAGGCGCCACCGGAGTCGATCTGCTACTCCTAAGCGACGCTCA
CCAACACCAAAACGTTACAAAAGACAAAAGAGTAGGAGCTCTTCTCTATCTCCTGCAAAA
AGATCTCCTGCCACAACCCTTGAGTCAGCTAAAAATAGTAATGGAGGAAAGCTAATCAAA
GAAGAGGAAGAGCGGAAAAGGCGACAGCAGGAAGCAGAACTGAAGCTAATAGAGGAAGAA
ACTATGAAACGGGTTGAAGAAGCTATTAGGAAAAAGGTTGAAGAAAGCTTACAGTCTGAG
AAAGTCAAAATGGAAATTCTAACACTGTTGGAGGAAGGACGAAAGAGAGTTAGTGAAGAA
GTCGCAGCTCAGCTTGAGAAGGAGAAGGCAGCTTCTCTT

QA 3 641 3 641
DS 

RD RS1E831JQ 752 0 0
AAGCGACGCTCACCAACACCAAAACGCTACAAAAGACAAAAGAGTAGGAGCTCTTCTCTA
TCTCCTGCAAAAAGATCTCCTGCCACAGCCCTTGAGTCAGCTAAAAATAGTAATGGAGGA
AAGCTAATCAAAGAAGAGGAAGAGCGGAAAAGGCGACAGCAGGAAGCAGAACTGAAGCTA
ATAGAGGAAGAAACTATGAAACGGGTTGAAGAAGCTATTAGGAAAAAGGTTGAAGAAAGC
TTACAGTCTGAGAAAGTCAAAATGGAAATTCTAACACTGTTGGAGGAAGGACGAAAGAGA
GTTAGTGAAGAAGTCGCAGCTCAGCTTGAGAAGGAGAAGGCAGCTTCTCTTATCGAGGCC
AAAGAAAAAGAGGGCGCCATGCGGTGTTTGTCGCAGGAAAGAGAGCAACAAGGGAAAGAA
GAGATGTCGAGAATAGAGGAGGAGAACAGGAAGAAAGTAGAAGAAGCTCAGCTAAAAGAA
GCAATGGAGAGGCAAAGGAAAGAGGAAGAACGTTATCGGGAGCTGGAGGAGCGGCAAAGA
CAGAAGGAAGAAGCAATGCGAAAGAAGAAAGCAGAAGAGGAAGAAGAACGTCTGAAACAG
ATGAAACTGTTGGGTAAAAACAAATCACGCCCTAAACTATCCTTTGCCTTAAGCTCCAAG
TGAATGGATGAAAAACAAAATGAAAATGGTTCTGTTGTGATGATATGTGCTTCTTTCTCT
CAAAGATGCTTTATGATTATTTGTTGGAGCTT

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 3

CO CL3409Contig1 500 3 14 U
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ATGGTGGAAGCGCAGAAGTTGTGCGTGCGGTCTAGTGGGACATGGTCAGGAGTATGTGGA
AATAATAATGCTTGCAAGAACCAGTGCATCAACCTCGAGGGAGCACGACATGGATCTTGC
AACTATATTTTCCCATATCACAGGTGTATCTGCTACTTCCCATGTTAATCTACCAAAACT
CATTGGTTGTACCAAAACTATGTGGTGCTTGTGTGTTTATTTACATTTAATAAGTCTGTG
TCACTCTATGAGTGACCTTATGACATGAACCAAGTATGTTTATGATGTTTGTATGTTTTC
TGTGATACTGTCAAGTATGTTTTATGCATGTTTTCTCCGATAATATAAAGTTTTATGTAC
CACGTACTATGTTTCTTTTG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 

AF RS1A949TF U 1
AF RS1BP96JQ C 1
AF RS1BP96TF U 1
BS 1 145 RS1A949TF
BS 146 146 RS1BP96TF
BS 147 147 RS1A949TF
BS 148 148 RS1BP96TF
BS 149 153 RS1A949TF
BS 154 154 RS1BP96TF
BS 155 296 RS1A949TF
BS 297 297 RS1BP96TF
BS 298 457 RS1A949TF
BS 458 458 RS1BP96TF
BS 459 468 RS1A949TF
BS 469 469 RS1BP96TF
BS 470 484 RS1A949TF
BS 485 500 RS1BP96TF

RD RS1A949TF 484 0 0
GGACACACTTCACACAAATACATCGAAAACAAATTCCTAATAGTCATGGCCAAGTTTGTT
TCCATCATCACCCTTCTTTTCGTTGCTCTTGTACTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACA
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AATAATAATGCTTGCAAGAACCAGTGCATCAACCTCGAGGGAGCACGACATGGATCTTGC
AACTATATTTTCCCATATCACAGGTGTATCTGCTACTTCCCATGTTAATCTACCAACACT
CATTGGTTGTACCAAAACTATGTGGTGCTTGTGTGTTTATTTACATTTAATAAGTCTGTG
TCACTCTATGAGTGACCTTATGACATGAACCAAGTATGTTTATGATGTTTGTATGTTTTC
TGTGATACTGTCAAGTATGTTTTATGCATGTTTTCTCTGATAATATAA*GTTTTATGTAC
CACG

QA 1 484 1 484
DS 

RD RS1BP96JQ 500 0 0
GGACACACTTCACACAAATACATCGAAAACAAATTCCTAATAGTCATGGCCAAGTTTGTT
TCCATCATCACCCTTCTTTTCGTTGCTCTTGTACTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACA
ATGGTGGAAGCGCAGAAGTTGTGCGTGCGGTCTAGTGGGACATGGTCAGGAGTATGTGGA
AATAATAATGCTTGCAAGAACCAGTGCATCAACCTCGAGGGAGCACGACATGGATTTTGC
AACTATATTTTCCCATATCACAGGGGTATTTGCTACTTCCCATGTTAATTTACCAAAACT
CATTGGTTGTACCAAAAATATGTGGGGCTTGTGTGTTTATTTACATTTAATAAGTTTGTG
TCACTTTATGAGTGACCTTATGACATGAACCAAGTATGTTTATGATGTTTGTATGTTTTT
TGTGATACTGTCAAGTATGTTTTATGCATGTTTTTTCCGATAATATAAAGTTTTATGTAC
CACGTACTATGTTTTTTTTG

QA 1 500 1 500
DS 

RD RS1BP96TF 500 0 0
GGACACACTTCACACAAATACATCGAAAACAAATTCCTAATAGTCATGGCCAAGTTTGTT
TCCATCATCACCCTTCTTTTCGTTGCTCTTGTACTCTTTGCTGCTTTTGAAGCACCAACA
ATGGTGGAAGCGCAGAAGTTGTGCGTGCGGTCTAGTGGGACATGGTCAGGAGTATGTGGA
AATAATAATGCTTGCAAGAACCAGTGCATCAACCTCGAGGGAGCACGACATGGATCTTGC
AACTATATTTTCCCATATCACAGGTGTATCTGCTACTTCCCATGTTAATCTACCAAAACT
CATTGGTTGTACCAAAACTATGTGGTGCTTGTGTGTTTATTTACATTTAATAAGTCTGTG
TCACTCTATGAGTGACCTTATGACATGAACCAAGTATGTTTATGATGTTTGTATGTTTTC
TGTGATACTGTCAAGTATGTTTTATGCATGTTTTCTCCGATAATATAAAGTTTTATGTAC
CACGTACTATGTTTCTTTTG

QA 1 500 1 500
DS 



AS 1 2

CO CL3410Contig1 1285 2 6 U
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GGAAGATATGGCAGAATCTCGCAGCAATAGAGCGGCGGTTCAGGCTACAAACGACGATGC
ATCCGCCAGTAAACTGTCTTGTGTCAAAAAGGGTTACATGAAAGACGATTATGTTCATCT
CTTTGTCAAAAGACCCCTTCGAAGATCCCCGATTATTAATCGAGGTTACTTTTCCCGTTG
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GAAACAGATACTCTCACTCGGAGCTGGCTTCGATACTACTTACTTCCAGCTACTGGATGA
GGGGAAAGGGCCCTATTTGTACGTGGAACTGGACTTTAAGGAGGTCACAAGTAAGAAGGC
TGCGGTTATAGAAAACTCCAGCCAGCTGAGGGACAAACTAGGAGCTAATTCATCTATATC
AATTGAGGAAGGCCAAGTTCTCACTGATCATTACAAGTTACTTCCAGTTGACCTGCGTGA
TATACCAAAACTAAGAGATGTTATATCGTTTGCTGGTATGGATCCTAGTCTGCCGACATT
TATTATTGCAGAATGTGTTCTGATTTACCTGGACCCAGATTCAAGCCGTGCCATCGTCAA
TTGGGTGTCAGAGACGTTTTCAACTGCAGTTTTTTTCTTATATGAGCAGATCCGTCCAGA
TGATGCATTTGGACATCAGATGATTATAAACTTGGAGAGTCGGGGTTGTGCACTCTTAAG
CATTGATGCAACACCGACTTTACTTGCAAAGGAGAGGTTGTTTCTTGACAATGGATGGCA
GAGAGCTGTTGCCTGGGATATGCTAAAAGTGTATGGAAGCTTTGTTGATACCCAAGAAAA
ACGCAGGATTGAGCGATTGGAGCTGTTTGACGAATTTGAAGAGTGGCACATGATGCAGGA
ACATTACAGCGTCACATATGCTGTCAACGACGCAATGGGGATATTTGGGGATTTCGGTTT
CACAACAGGAAGCCGTGATATCGTGAACATCTCATCTGCAATGTCACCTTGAAAAAAGAA
TGGGAGGAGTGTTTTTGTTTGAAAACGGTAAGTCAGTGTTTCTTTCTTTCTACATTTATT
GGAGAAACTAAAAACCCTGGTGGGTTAATATGTTTAACACTTTGTTTATGGATTGGAAGT
TGAAAGCATTTTATTCGTCTTTGCTGGAAACAAGCTGCTTTTGAGATTAAGATGAATGAA
TGATACCGACTGTATCGCTTCGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D262TF U 1
AF RS1D262JQ C 537
BS 1 695 RS1D262TF
BS 696 696 RS1D262JQ
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BS 718 744 RS1D262TF
BS 745 1285 RS1D262JQ

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GGAAGATATGGCAGAATCTCGCAGCAATAGAGCGGCGGTTCAGGCTACAAACGACGATGC
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GGGGAAAGGGCCCTATTTGTACGTGGAACTGGACTTTAAGGAGGTCACAAGTAAGAAGGC
TGCGGTTATAGAAAACTCCAGCCAGCTGAGGGACAAACTAGGAGCTAATTCATCTATATC
AATTGAGGAAGGCCAAGTTCTCACTGATCATTACAAGTTACTTCCAGTTGACCTGCGTGA
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TATTATTGCAGAATGTGTTCTGATTTACCTGGACCCAGATTCAAGCCGTGCCATCGTCAA
TTGGGTGTCAGAGACGTTTTCAACTGCAGTTTTTT*CTTATATGAGCAGATCCGTC*AGA
TGATGCATTTGGACATCAGATGAT
ATAACTTGGAGAGT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1D262JQ 749 0 0
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TCAATTGGGTGTCAGAGACGTTTTCAACTGCAGTTTTTTTCTTATATGAGCAGATCCGTC
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TAAGCATTGATGCAACACCGACTTTACTTGCAAAGGAGAGGTTGTTTCTTGACAATGGAT
GGCAGAGAGCTGTTGCCTGGGATATGCTAAAAGTGTATGGAAGCTTTGTTGATACCCAAG
AAAAACGCAGGATTGAGCGATTGGAGCTGTTTGACGAATTTGAAGAGTGGCACATGATGC
AGGAACATTACAGCGTCACATATGCTGTCAACGACGCAATGGGGATATTTGGGGATTTCG
GTTTCACAACAGGAAGCCGTGATATCGTGAACATCTCATCTGCAATGTCACCTTGAAAAA
AGAATGGGAGGAGTGTTTTTGTTTGAAAACGGTAAGTCAGTGTTTCTTTCTTTCTACATT
TATTGGAGAAACTAAAAACCCTGGTGGGTTAATATGTTTAACACTTTGTTTATGGATTGG
AAGTTGAAAGCATTTTATTCGTCTTTGCTGGAAACAAGCTGCTTTTGAGATTAAGATGAA
TGAATGATACCGACTGTATCGCTTCGAGC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

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AGGCGTGTTCGGTGGTAGCGAAGGCGGAGAGGTGGCTAATGGTGGAGATTGGAGATGTTA
AATCAAGTGGATGAAACCGGGAGAGCGTATGGAACGGGGAGAAGAAAATGCAGCATTGCC
CGTGTTTGGATTGTCCCTGGCAAAGGAAAGTTCCTTGTTAACGACAAAGAGTTCGATGTC
TATTTCCCTATGCTTGATCACCGTGCCGCTCTTCTCCGCCCACTTGCTGAAACCAAAACC
TTAGGTAGTTGGGATATTAACTGCACTGTTAATGGCGGTGGAACTACAGGTCAAGTTGGA
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AAAGCCAAGGCAAGAAAGAGTTTCCAATGGGTCAAGCGTTAAATCCATTCGATATCCTTC
TCTTTCTCTATGTCTTCAGTTTCATTGGTTCATCTTACTTTACTTATACCGGGTTTGGAA
GAATCACCGGAAGATAACTTGTTCTTTTGGTCCGGTTTCTTAGTCTTTCTTGCACCAACA
CATTACTCTACTACGACTCTTGAGTCTTGGAAACTTGAGTTACGTTTGGTTTGTGAGTCA
GGACACATAGTTTGTATGTTTTTGTTCCTGTTTCTTCAAAAGGTGCATTGATAATGG


BQ
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20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RS1F838TF U 1
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TCTTTCTCTATGTCTTCAGTTTCATTGGTTCATCTTACTTTACTTATACCGGGTTTGGAA
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TTT
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GTTTCTTAGTCTTTCTTGCACCAACACATTACTCTACTACGACTCTTGAGTCTTGGAAAC
TTGAGTTACGTTTGGTTTGTGAGTCAGGACACATAGTTTGTATGTTTTTGTTCCTGTTTC
TTCAAAAGGTGCATTGATAATGG

QA 4 506 4 506
DS 



AS 0 0

AS 0 0

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AACTATTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C021TF U 1
AF RS1FI31TF U 269
AF RS1C021JQ C 1
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DS 

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DS 

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TTTGCACCGGAGAGAAAGGAGTCGGGAGGATGGGGAAGCCGCTCCACTACAAGGGATCTT
CCTTCCACCGCGTGATCCCGGGGTTCATGTGCCAAGGAGGCGATTTCACCGCCGGGAACG
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TTGAATGTTATCTTTGCTATTTGAATGTTGCTTTTGCTTCGTATCGTTCGAGTTTGTAAA
ACCCTCAGTGGTTTTGGATTTGACTATCTATGAATAATTATGAATAACTATGAGCTTTTT
AACTATTT

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 3

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ACACAGCCGGATTTGGTTCAACAGAGTGATCATGAGGATGATGCCCAGGAATTGGATTTT
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BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GA71TF U 1
AF RS1GN70TF U 4
AF RS1EJ44TF U 1
BS 1 54 RS1EJ44TF
BS 55 55 RS1GA71TF
BS 56 687 RS1EJ44TF

RD RS1GA71TF 585 0 0
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QA 6 581 6 581
DS 

RD RS1GN70TF 582 0 0
GG
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TCTCATCAAGCGCAACTACACTTCTCCACGTCCTGTTTTTACAAATTATCAGTTATCTTC
GAGGGTGTTTTTGAATCCCTTCACGAGCTTCCGTCATGAGTCTACGGCAGTGGAGACACA
GCCGGATTTGGTTCAACAGAGTGATCATGAGGATGATGCCCAGGAATTGGATTTTCCGGG
CGGCAAAGTCGGTTACACATCTGAGATGAAATTCATACCGGAATCATTTTCTCGAAGAAT
CCCATGCTATCGAGTTCTTAACGAACACGGAAGCATCATCTCCAACAGCGATTATGTTCC
GGTGAGCGAGAAACTAGCGGTTAGAATGTACGAACAGATGGTGACGCTTCAGGTGATGGA
CCACATCTTCTACGAAGCTCAACGTCAAGGAAGAATCTCATTCTATCTCACATCCGTCGG
AGAATAAGCCATCAACATCGCATCAGCCGCCGCTCT
AAGT

QA 3 578 3 578
DS 

RD RS1EJ44TF 687 0 0
GGATTACTCTTCATCATTTTCTTCGCTTCTTCTTGTACTTTTTCTTTTGCATACGTGGCG
ATCTGGTTTGCTAGATCCAGAAACCTCGTCTCTAGCTTGAGACAGAACCTGGGTTTGTCG
GCGATTCTCATCAAGCGCAACTACACTTCTCCACGTCCTGTTTTTACAAATTATCAGTTA
TCTTCGAGGGTGTTTTTGAATCCCTTCACGAGCTTCCGTCATGAGTCTACGGCAGTGGAG
ACACAGCCGGATTTGGTTCAACAGAGTGATCATGAGGATGATGCCCAGGAATTGGATTTT
CCGGGCGGCAAAGTCGGTTACACATCTGAGATGAAATTCATACCGGAATCATTTTCTCGA
AGAATCCCATGCTATCGAGTTCTTAACGAACACGGAAGCATCATCTCCAACAGCGATTAT
GTTCCGGTGAGCGAGAAACTAGCGGTTAGAATGTACGAACAGATGGCGACGCTTCAGGTG
ATGGACCACATCTTCTACGAAGCTCAACGTCAAGGAAGAATCTCATTCTATCTCACATCC
GTCGGAGAAGAAGCCATCAACATCGCATCAGCCGCCGCTCTAAGTCCGAAGACGTCGTGT
TACCTCAGTACAGAGAGCCTGGAGTGCTTCTATGGCGTGACTTCACGTTAGAGGAGTTTG
CGATCAGTGCTTTGGCAACAAGCTGAT

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 3

CO CL3416Contig1 740 3 7 U
GGAGCCTTAAGCTATTTTCCTCACCAGCATTTTCACACAAACCAACTTCAGCGACAAGAT
AACAAACTTGTGAAGATCGATCGGATAAAAA*TGGCGGAGAAGAGCTTCAAGTACATCAT
CCTCGGCGGCGGCGTCTCAGCCGGATACGCAGCTAAGGAGTTTGCTAGTCAAGGAGTTAA
ACCAGGAGAATTGGCGGTTATCTCCAAAGAGGCGGTGGCTCCTTATGAACGTCCTGCTCT
TAGCAAGGGATATTTGTTTCCTGAAGGGGCGGCTAGACTCCCAGGTTTCCATTGCTGTGT
TGGTAGTGGTGGAGAAAAACTGCTTCCTGAATCATACAAACAGAAAGGGATTGAGTTGAT
ACTAAGCACAGAAATAGTGAAAGCAGATCTTGCTGCCAAGAGTCTTGTCAGCGCAGCTGG
AGATGTCTTCAAATATGAAACTCTCATCATTGCAACTGGTTCTACTGTTCTCAGATTGAC
TGATTTTGGTGTGAAAGGTGCTGACTCAAAGAACATCCTCTATCTGAGGGAGATTGATGA
TGCTGACAAAGTGGTTGAAGCAATCAAAGCAAAGAAAGGTGGAAAGGCTGTAGTTGTTGG
CGGAGGTTACATTGGTCTTGAGCTTAGTGCAGCTTTGAGGATCAACAATTTTGATGTCAC
TATGGTTTTCCCTGAACCTTGGTGCATGCCTAGGCTTTTCACCGCCGACATTGCTGCTTT
CTATGAGACTTACTATACAA


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DB71TF U 3
AF RS1CB61TF U 1
AF RS1GH46TF U 27
BS 1 49 RS1CB61TF
BS 50 50 RS1DB71TF
BS 51 394 RS1CB61TF
BS 395 395 RS1DB71TF
BS 396 480 RS1CB61TF
BS 481 481 RS1DB71TF
BS 482 740 RS1CB61TF

RD RS1DB71TF 633 0 0
G
GCCTTAAGCTATTTTCCTCACCAGCATTTTCACACAAACCAACTTCAGCGACAAGATAAC
AAACTTGTGAAGATCGATCGGATAAAAA*TGGCGGAGAAGAGCTTCAAGTACATCATCCT
CGGCGGCGGCGTCTCAGCCGGATACGCGGCTAAGGAGTTTGCTAGTCAAGGAGTTAAACC
AGGAGAATTGGCGGTTATCTCCAAAGAGGCGGTGGCTCCTTATGAACGTCCTGCTCTTAG
CAAGGGATATTTGTTTCCTGAAGGGGCGGCTAGACTCCCAGGTTTCCATTGCTGTGTTGG
TAGTGGTGGAGAAAAACTGCTTCCTGAATCATACAAACAGAAAGGGATTGAGTTGATACT
AAGCACAGAAATAGTGAAAGCAGATCTTGCTGCCAAGAGTCTTGTCAGCGCAGCTGGAGA
TGTCTTCAAATATGAAACTCTCATCATTGCAACTGGTTCTACTGTTCTCAGATTGACTGA
TTTTGGTGTGAAAGGTGCTGACTCAAAGAACATCCTCTATCTGAGGGAGATTGATGATGC
TGACAAAGTGGTTGAAGCAATCAAAGCAAAGAAAGGTGGAAAGGCTGTAGTTGTTGGCGG
AGGTTACATTGGTCTTGAGCTTAGTGCAGCTT

QA 2 633 2 633
DS 

RD RS1CB61TF 740 0 0
GGAGCCTTAAGCTATTTTCCTCACCAGCATTTTCACACAAACCAACTTCGGCGACAAGAT
AACAAACTTGTGAAGATCGATCGGATAAAAA*TGGCGGAGAAGAGCTTCAAGTACATCAT
CCTCGGCGGCGGCGTCTCAGCCGGATACGCAGCTAAGGAGTTTGCTAGTCAAGGAGTTAA
ACCAGGAGAATTGGCGGTTATCTCCAAAGAGGCGGTGGCTCCTTATGAACGTCCTGCTCT
TAGCAAGGGATATTTGTTTCCTGAAGGGGCGGCTAGACTCCCAGGTTTCCATTGCTGTGT
TGGTAGTGGTGGAGAAAAACTGCTTCCTGAATCATACAAACAGAAAGGGATTGAGTTGAT
ACTAAGCACAGAAATAGTGAAAGCAGATCTTGCTACCAAGAGTCTTGTCAGCGCAGCTGG
AGATGTCTTCAAATATGAAACTCTCATCATTGCAACTGGTTCTACTGTTCTCAGATTGAC
AGATTTTGGTGTGAAAGGTGCTGACTCAAAGAACATCCTCTATCTGAGGGAGATTGATGA
TGCTGACAAAGTGGTTGAAGCAATCAAAGCAAAGAAAGGTGGAAAGGCTGTAGTTGTTGG
CGGAGGTTACATTGGTCTTGAGCTTAGTGCAGCTTTGAGGATCAACAATTTTGATGTCAC
TATGGTTTTCCCTGAACCTTGGTGCATGCCTAGGCTTTTCACCGCCGACATTGCTGCTTT
CTATGAGACTTACTATACAA

QA 1 740 1 740
DS 

RD RS1GH46TF 701 0 0
GG
ATTTTCACACAAACCAACTTCAGCGACAAGATAACAAACTTGTGAAGATCGATCGGATAA
AAAATGGCGGAGAAGAGCTTCAAGTACATCATCCTCGGCGGCGGCGTCTCAGTCGGATAC
GCAGCTGAGGAGTTTGCTAGTCAAGGGGTTAAACCAGGAGAATCGGCGGTTATCTCCAAA
GAGGCGGTGGCTCCTTATGAACGTCCTGCTCTTAGCAAGGGATATTTGTTTCCTGAAGGG
GCGGCTAGACTTCCAGGTTTCCATTGCTGTGTTGGTAGTGGTGGAGAAAAACTGCTTCCT
GAATCATACAAACAGAAAGGGATTGAGTTGATACTAAGCACAGAAATAGTGAAAGCAGAT
CTTGCTGCCAAGAGTCTTGTCAGCGCAGCTGGAGATGTCTTCAAATATGAAACTCTCATA
ATTGCAACTGGTTCTACTGTTCTCAGATTGACTGACTTTGGTGTGAAGGGTGCTGACTCA
AAGAACATCCTCTATCTGAGGGAGATTGATGATGCTGACAAAGTGGTTGAAGCAATCAAA
GCAAAGAAAGGTGGAAAGGCTGTAGTTGTTGGCGGAGGTTACATTGGTCTTGAGCTTAGT
GCAGCTTTGAG*ATCAACAATTTTGATGTCACTATGGTTTTCCCTGAACCTTGGTGCATG
CCTGGGCTTTTCACCGCCGACATTGCTGCTTTCTATGAG

QA 3 701 3 701
DS 



AS 1 2

CO CL3417Contig1 866 2 20 U
GGAGAATCACCCAGAAACTCACAAATCGTTATTCTTCTCGCACCCTCCCCCAATCACATC
GAAAATGGCTGAAAATGGTTCTCTAGACCAGTTCTTGTCTGCTGCCATTGATGCCGCTCA
AAAAGCTGGACAGGTCATTCGTAAAGGCTTTTACGAGACCAAACATGTTGAACACAAAGG
CCAGGTGGATCTGGTGACAGAGACTGATAAAGGATGTGAAGAACTCGTGTTTAACCACCT
CAAGCACCTTTTTCCCAATCACAAGTTCATTGGAGAAGAGACAACAGCTGCAAATGGCGT
GACTGAATTAACAGACGAACCTACTTGGATCGTTGATCCTCTTGATGGAACTACTAATTT
CGTTCACGGGTTCCCTTTTGTCTGTGTTTCCATTGGCCTTACCATTGGGAAAGTCCCTGT
CGTTGGCGTTGTCTATAATCCTATTATGGATGAGCTATTCACCGGTGTCCAAGGGAAAGG
AGCTTTCTTGAATGGAAAACCAATCAAAGTGTCAACTCAGAGTGAGCTTGTAACCGCTTT
GCTCCTAGCAGAGGCGGGCACTAAGCGAGATAAAGCTACCTTAGACGATGCAACTAACAG
GATCAACAGTTTATTAACCAAGGTTAGGTCTCTGAGGATGGGTGGCTCGTGCGCACTGGA
CCTCTGCGGTGTCGCTTGTGGAAGGGGTGACATCTTCTATGAAATCGGTTTCGGCGGTCC
ATGGGACATTGCAGCTGGAATTGTGATCGTCAGAGAAGCTGGTGGACATATCTTTGATCC
ATCCGGTAAAGAGTTGGACATCACATCGCAGAGAATTGCGGCGTCAAACGCTTCACTCAA
GGAGTTGTTCGTGGAGGCGTGCGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BZ05TF U 1
AF RS1F333TF U 54
BS 1 87 RS1BZ05TF
BS 88 88 RS1F333TF
BS 89 312 RS1BZ05TF
BS 313 313 RS1F333TF
BS 314 330 RS1BZ05TF
BS 331 331 RS1F333TF
BS 332 426 RS1BZ05TF
BS 427 427 RS1F333TF
BS 428 747 RS1BZ05TF
BS 748 748 RS1F333TF
BS 749 750 RS1BZ05TF
BS 751 751 RS1F333TF
BS 752 767 RS1BZ05TF
BS 768 768 RS1F333TF
BS 769 771 RS1BZ05TF
BS 772 772 RS1F333TF
BS 773 822 RS1BZ05TF
BS 823 823 RS1F333TF
BS 824 837 RS1BZ05TF
BS 838 866 RS1F333TF

RD RS1BZ05TF 837 0 0
GGAGAATCACCCAGAAACTCACAAATCGTTATTCTTCTCGCACCCTCCCCCAATCACATC
GAAAATGGCTGAAAATGGTTCTCTAGATCAGTTCTTGTCTGCTGCCATTGATGCCGCTCA
AAAAGCTGGACAGGTCATTCGTAAAGGCTTTTACGAGACCAAACATGTTGAACACAAAGG
CCAGGTGGATCTGGTGACAGAGACTGATAAAGGATGTGAAGAACTCGTGTTTAACCACCT
CAAGCACCTTTTTCCCAATCACAAGTTCATTGGAGAAGAGACAACAGCTGCAAATGGCGT
GACTGAATTAACTGACGAACCTACTTGGATTGTTGATCCTCTTGATGGAACTACTAATTT
CGTTCACGGGTTCCCTTTTGTCTGTGTTTCCATTGGCCTTACCATTGGGAAAGTCCCTGT
CGTTGGTGTTGTCTATAATCCTATTATGGATGAGCTATTCACCGGTGTCCAAGGGAAAGG
AGCTTTCTTGAATGGAAAACCAATCAAAGTGTCAACTCAGAGTGAGCTTGTAACCGCTTT
GCTCCTAGCAGAGGCGGGCACTAAGCGAGATAAAGCTACCTTAGACGATGCAACTAACAG
GATCAACAGTTTATTAACCAAGGTTAGGTCTCTGAGGATGGGTGGCTCGTGCGCACTGGA
CCTCTGCGGTGTCGCTTGTGGAAGGGGTGACATCTTCTATGAAATCGGTTTCGGCGGTCC
ATGGGACATTGCAGCTGGAATTGTGATTGTTAGAGAAGCTGGTGGACTTATTTTTGATCC
ATCCGGTAAAGAGTTGGACATCACATCGCAGAGAATTGCGGCTTCAAACGCTTCACT

QA 1 837 1 837
DS 

RD RS1F333TF 813 0 0
GG
ACATCGAAAATGGCTGAAAATGGTTCTCTAGACCAGTTCTTGTCTGCTGCCATTGATGCC
GCTCAGAAAGCTGGACAGGTCATTCGTAAAGGCTTTTACGAGACCAAACATGTTGAACAC
AAAGGCCAGGTGGATCTGGTGACAGAGACTGATAAAGGATGTGAATAACTCGTGTTTAAC
CATCTCAAGCACCTTTTTCCCAATCACAAGTTCATTGGAGAAGAGACAACAGCTGCAAAT
GGTGTGACTGAATTAACAGACGAACCTACTTGGATCGTTGATCCTCTTGATGGAACTACT
AATTTCGTTCACGGGTTCCCTTTTGTCTGTGTTTCCATTGGCCTTACCATTGGGAAAGTC
CCTGTCGTTGGCGTTGTCTATAATCCTATTATGGATGAGCTATTCACTGGTGTCCAAGGG
AAAGGAGCTTTCTTGAATGGAAAACCAATCAAAGTGTCAACTCAGAGTGAGCTTGTTACC
GCTTTGCTCCTAGCAGAGGCGGGCACTAAGCGAGATAAAGCTACCTTAGACGATGCAACT
AACAGGATCAACAGTTTATTAACCAAGGTTAGGTCTCTGAGGATGGGTGGCTCGTGCGCA
CTGGACCTCTGCGGTGTTGCTTGTGGAAGGGGTGACATCTTCTATGAAATCGGTTTCGGT
GGTCCATGGGACATTGCGGCTGGAATTGTGATCGTCAGAGAAGCTGGTGGACATATCTTT
GATCCATCGGGTAAAGAGTTGGACATCACATCGCAGAGAATTGCGGCGTCAA*CGCTTCA
CTCAAGGAGTTGTTCGTGGAGGCGTGCGGCT

QA 3 813 3 813
DS 



AS 1 2

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CCCAGACGAGGTCCCTTCTCCAGCTCAGGATTCTGAAACTCTCAATAAATCTTTCCGCGG
ATGGGGAACAGACGAGAAGGCTATCATACGCGTTTTAGGTAAAAGAAACGAGAGCCAGAG
AAAGAGAATCAGGGAGAGTTACAGAGAGATTTGCGGCAAAGATCTTATCGATGATCTCTC
CTCTGAACTCTCTGGTGATTTCAAGAAAGCTGTGATTCTGTGGACTAAAGATCCAGCAGA
GAGAGACGCAAGGCTTGCTTACAAAGTCTTGAATGACAAAAAGAAAACCATAGAGAAGCT
GAAGATCATCGTGGAGATCGCTTGCACAAGTTCTCCTAACCATTTGGTTGCTGTGAGGAA
AGCTTATTGTTCTCTCTACGACTCATCCCTTGAAGAACACATTGCTTCCTTTGTGCCCTT
TCCTCTTGCAAAGTTGCTGGTGACATTAGCAACTTCATTCAGATATGATAAAGAGAAGGT
TGACAAAGAAGTAGCTACAATAGAGGCGGGTATGCTGCATGAAGCGATAACAAAGAAGCA
GTTAGATCATGATCATGTCCTTTACATAATAGGAACTCGCAGTATCTACCAGCTCAGAGC
AACCTTTGTTGCTTACAAGAAGAGTTATGGAAACACATTAGATAAGGATGTTGATGGATG
TCCAGGAGATGCTGATCTTAGAAGTTATTGCAGATGGTGATCTTGTGCATTGAGTTCCCT
GAGAAACATTTTGCAAAGGTTGTACATGATTCTATTGAGGGGTTTGGAACAGATGAAGAT
TCGTTGACGAGAGCGATTGTGATGCGTGCAGAGATTGATCTGATGAAAGTAAGAGGAGAG
TATTTCAATATGTATAGTTCAAGCATGGATAACGCTATCATTGGCGATGTTTCTGGTGAC
TACAAGGACTTCCTCATGACTCTACTTGGTTCCAAAATCTGATCTTTGTTTTATATTTAT
TCTTGGCTTGGCTTGTGATTTGTGACTTGTATCAAAACTTCTCGTTCCAATTCTGATTTT
AAAAATTGTTAGAAAAATAATCAAAACAACTCTTGATTCTGAATTTGTATAATATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BS71TF U 1
AF RS1BS71JQ C 404
BS 1 677 RS1BS71TF
BS 678 678 RS1BS71JQ
BS 679 692 RS1BS71TF
BS 693 1136 RS1BS71JQ

RD RS1BS71TF 695 0 0
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GAAGATCATCGTGGAGATCGCTTGCACAAGTTCTCCTAACCATTTGGTTGCTGTGAGGAA
AGCTTATTGTTCTCTCTACGACTCATCCCTTGAAGAACACATTGCTTCCTTTGTGCCCTT
TCCTCTTGCAAAGTTGCTGGTGACATTAGCAACTTCATTCAGATATGATAAAGAGAAGGT
TGACAAAGAAGTAGCTACAATAGAGGCGGGTATGCTGCATGAAGCGATAACAAAGAAGCA
GTTAGATCATGATCATGTCCTTTACATAATAGGAACTCGCAGTATCTACCAGCTCAGAGC
AACCTTTGTTGCTTACA*GAAGAGTTATGGAA
CAC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RS1BS71JQ 733 0 0
TTGG
TTGCTGTGAGGAAAGCTTATTGTTCTCTCTACGACTCATCCCTTGAAGAACACATTGCTT
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ATAAAGAGAAGGTTGACAAAGAAGTAGCTACAATAGAGGCGGGTATGCTGCATGAAGCGA
TAACAAAGAAGCAGTTAGATCATGATCATGTCCTTTACATAATAGGAACTCGCAGTATCT
ACCAGCTCAGAGCAACCTTTGTTGCTTACAAGAAGAGTTATGGAAACACATTAGATAAGG
ATGTTGATGGATGTCCAGGAGATGCTGATCTTAGAAGTTATTGCAGATGGTGATCTTGTG
CATTGAGTTCCCTGAGAAACATTTTGCAAAGGTTGTACATGATTCTATTGAGGGGTTTGG
AACAGATGAAGATTCGTTGACGAGAGCGATTGTGATGCGTGCAGAGATTGATCTGATGAA
AGTAAGAGGAGAGTATTTCAATATGTATAGTTCAAGCATGGATAACGCTATCATTGGCGA
TGTTTCTGGTGACTACAAGGACTTCCTCATGACTCTACTTGGTTCCAAAATCTGATCTTT
GTTTTATATTTATTCTTGGCTTGGCTTGTGATTTGTGACTTGTATCAAAACTTCTCGTTC
CAATTCTGATTTTAAAAATTGTTAGAAAAATAATCAAAACAACTCTTGATTCTGAATTTG
TATAATATG

QA 5 733 5 733
DS 



AS 1 3

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CCTCTCGCTCAGTTCCATTCTTCTTCTTTTTCCCTCAGACCGACACAGTTTTATGGCAAG
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CGCTTCTCAGCCGTTTCAAGGGACGACGCCACAACGCCTGAACTCGAAGAAGATGCGGTT
GAGACACGAAGAAGAGAGGAGGAGAAATTCGCAGTTCTGAACACTGGAATCTACGAGTGC
AGATCGTGCGGGTACAAGTACGACGAGTCCGCGGGTGATCCGTCGTACCCGATCCCTCCT
GGGTTTCAGTTTGACAAGTTGCCTGAAGACTGGAGATGCCCAACTTGTGGAGCAGCTCAG
AGTTTCTTCGAGAGTAAGATGGTTGAGATTGCTGGTTTTGCTCAGAATCAACAATATGGG
CTTGGGGGTAATGCACTTACCTCTGGTCAGAAGACTGCTTTGATCTTCGGGAGTCTCCTC
CTCTTTTTCCTGCTTTTCTTGAGTGGCTATTTCATCCAATAGAGCGCGTTTCATGTTTTT
TACTATTATTATGTTAATCATGTTGTTATCTATCATACACCATTAGTCTCCTTTTTATAA
ACGGAAGCTACATTATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1H409TF U 10
AF RS1C367TF U 1
AF RS1C367JQ C 55
BS 1 677 RS1C367TF
BS 678 678 RS1C367JQ

RD RS1H409TF 646 0 0
GG
AAACAATTAAACCAATAAAAACATGGCGACCGCTATGTTCTCCTTCTCTCCTCTCGCTCA
GTTCCATTCTTCTTCTTTTTCCCTCAGACCGACACAGTTTTATGGCAAGACACAACATCA
GCTTCACCACAAAATCTTCATCACCCCGAATCACCAATCTACACCTTCCCGCTTCTCAGC
CGTTTCAAGGGACGACGCCACAACGCCTGAACTCGAAGAAGATGCGGTTGAGACACGAAG
AAGAGAGGAGGAGAAATTCGCAGTTCTGAACACTGGAATCTACGAGTGCAGATCGTGCGG
GTACAAGTACGACGAGTCCGCGGGTGATCCCTCGTACCCGATCCCTCCTGGGTTCCAGTT
TGACAAGTTGCCTGAAGACTGGAGATGCCCAACTTG**GAGCAGCTCAGAGTTTCTTCGA
GAGTAAAATGGTTGAGATTGCTGGTTTTGCTCAGAATCAACAATATGGGCTTGGGGGTAA
TGCACTTACCTCTGGTCAGAAGACTGCTTTGATCTTCGGGAGTCTCCTCCTCTTTTTCCT
GCTTTTCTTGAGTGGCTATTTCATCCAATAGAGCGCGTTTCATGTTTTT*ACTATTATTA
TGTTAATCATGTTGTTATCTATCATACACCATTAGTCTCCTTTT

QA 3 646 3 646
DS 

RD RS1C367TF 677 0 0
GGGAACAAACCAAACAATTAAACCAATAAAAACATGGCGACCGCTATGTTCTCCTTCTCT
CCTCTCGCTCAGTTCCATTCTTCTTCTTTTTCCCTCAGACCGACACAGTTTTATGGCAAG
ACACAACAGCAGCTTCACCACAAAATCTTCATCACCCCGAGTTACCAATCTACGCCTTCC
CGCTTCTCAGCCGTTTCAAGGGACGACGCCACAACGCCTGAACTCGAAGAAGATGCGGTT
GAGACACGAAGAAGAGAGGAGGAGAAATTCGCAGTTCTGAACACTGGAATCTACGAGTGC
AGATCGTGCGGGTACAAGTACGACGAGTCCGCGGGTGATCCGTCGTACCCGATCCCTCCT
GGGTTTCAGTTTGACAAGTTGCCTGAAGACTGGAGATGCCCAACTTGTGGAGCAGCTCAG
AGTTTCTTCGAGAGTAAGATGGTTGAGATTGCTGGTTTTGCTCAGAATCAACAATATGGG
CTTGGGGGTAATGCACTTACCTCTGGTCAGAAGACTGCTTTGATCTTCGGGAGTCTCCTC
CTCTTTTTCCTGCTTTTCTTGAGTGGCTATTTCATCCAATAGAGCGCGTTTCATGTTTTT
TACTATTATTATGTTAATCATGTTGTTATCTATCATACACCATTAGTCTCCTTTTTATAA
ACGGAAGCTACATTATA

QA 1 677 1 677
DS 

RD RS1C367JQ 624 0 0
TTCTCTCCTCTCGCTCAGTTCCATTCTTCTTCTTTTTCCCTCAGACCGACACAGTTTTAT
GGCAAGACACAACAGCAGCTTCACCACAAAATCTTCATCACCCCGAGTTACCAATTTACG
CCTTCCCGCTTTTCAGCCGTTTCAAGGGACGACGCCACAACGCCTGAACTCGAAGAAGAT
GCGGTTGAGACACGAAGAAGAGAGGAGGAGAAATTCGCAGTTCTGAACACTGGAATTTAC
GAGTGCAGATCGTGCGGGTACAAGTACGACGAGTCCGCGGGTGATCCGTCGTACCCGATC
CCTCCTGGGTTTCAGTTTGACAAGTTGCCTGAAGACTGGAGATGCCCAACTTGTGGAGCA
GCTCAGAGTTTTTTCGAGAGTAAGATGGTTGAGATTGCTGGTTTTGCTCAGAATCAACAA
TATGGGCTTGGGGGTAATGCACTTACCTCTGGTCAGAAGACTGCTTTGATCTTCGGGAGT
CTCCTCCTCTTTTTCCTGCTTTTCTTGAGTGGCTATTTCATCCAATAGAGCGCGTTTCAT
GTTTTTTACTATTATTATGTTAATCATGTTGTTATCTATCATACACCATTAGTCTCCTTT
TTATAAACGGAAGCTACATTATAC

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

CO CL3420Contig1 824 2 6 U
GGTCCCAAACGGTTCATGTGAAACTCTCTATTGAAATGACTGTTGGGCTTCAAAAATGTT
TTTGAGGTCTTTTCTTATGAAATTACAAAACTTGAAATTATGACATAAACACACTCATTT
TTAACTACCATCACACACAATACTCTTTAACTACCATTACAAGTAAAATCCGGAAACAAC
AGTAACTTTTTTTCAAACAACCCCAGTGTGACTTAAATAGATCTCGCCTGTGTATCGCAT
AAACTTCTTCTGTCTGCACTGTGACACAAACTCTTGAACGAGCTGCGATTCTCTTCCCCA
GTTCTACTTCGGAAGTAGTAGGGTTGTCAAAGTTCTGCCCCTTATAGGAAGTAATCAGGG
GCAGGTTTTTTAGCGGGAGGCCCTCTCGAGTCCTGCTGCGCTGCCTCGAACACACGGAAC
TCTTTGTTTAAATTCTCGTCAAGCTCTAAAATCGAAGCCACACTACCGCACCTGTAACAG
TAATTTGGGGCTGACCAGACAGTCACAATCTGGCTATCGAACATCCATTTGTAACCCTCC
ATAACAAGCTGATGGGCTCGAGCTATGTAGTCAATGTTGTTTGTGTGGTTAAACGAGGAG
ACAACACTGCCGCCAAAAAGGAATCCAGCACCACGTGGACTCAATCCCCAGCCATCAACA
ATATCTTCAGGATCAGACCATAGGAGGTCACACATGGCACCATCATGTGGCACTTCTTGC
TTCCGGTCATTGTCCTGATCTGATCAAGAGTAATATCTTGTTTTCAACAACAGCTGAAGA
CTCATGTAGTCAAAATCCATAAACCTGTGTGATTGCCTGCTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FM70JQ U 1
AF RS1EO52JQ U 15
BS 1 430 RS1FM70JQ
BS 431 431 RS1EO52JQ
BS 432 448 RS1FM70JQ
BS 449 449 RS1EO52JQ
BS 450 619 RS1FM70JQ
BS 620 824 RS1EO52JQ

RD RS1FM70JQ 619 0 0
GGTCCCAAACGGTTCATGTGAAACTCTCTATTGAAATGACTGTTGGGCTTCAAAAATGTT
TTTGAGGTCTTTTCTTATGAAATTACAAAACTTGAAATTATGACATAAACACACTCATTT
TTAACTACCATCACACACAATACTCTTTAACTACCATTACAAGTAAAATCCGGAAACAAC
AGTAACTTTTTTTCAAACAACCCCAGTGTGACTTAAATAGATCTCGCCTGTGTATCGCAT
AAACTTCTTCTGTCTGCACTGTGACACAAACTCTTGAACGAGCTGCGATTCTCTTCCCCA
GTTCTACTTCGGAAGTAGTAGGGTTGTCAAAGTTCTGCCCCTTATAGGAAGTAATCAGGG
GCAGGTTTTTTAGCGGGAGGCCCTCTCGAGTCCTGCTGCGCTGCCTCGAACACACGGAAC
TCTTTGTTTAGATTCTCGTCAAGCTCTAGAATCGAAGCCACACTACCGCACCTGTAACAG
TAATTTGGGGCTGACCAGACAGTCACAATCTGGCTATCGAACATCCATTTGTAACCCTCC
ATAACAAGCTGATGGGCTCGAGCTATGTAGTCAATGTTGTTTGTGTGGTTAAACGAGGAG
ACAACACTGCCGCCAAAAA

QA 1 619 1 619
DS 

RD RS1EO52JQ 810 0 0
CATGTGAAACTCTCTATTGAAATGACTGTTGGGCTTCAAAAATGTTTTTGAGGTCTTTTC
TTATGAAATTACAAAACTTGAAATTATGACATAAACACACTCATTTTTAACTACCATCAC
ACACAATACTCTTTAACTACCATTACAAGTAAAATCCGGAAACAACAGTAACTTTTTTTC
AAACAACCCCAGTGTGACTTAAATAGATCTCGCCTGTGTATCGCATAGACTTCTTCTGTC
TGCACTGTGACACAGACTCTTGAACGAGCTGTGATTCTCTTCCTCAGTTCTACTTCGGAA
GTAGTAGGGTTGTCAAAGTTCTGCCCCTTATAGGAAGTAATCAGGGGCAGGTTTTTTAGC
GGGAGGCCCTCTCGAGTCCTGCTGCGCTGCCTCGAACACACGGAACTCTTTGTTTAAATT
CTCGTCAAGCTCTAAAATCGAAGCCACATTACCGCACCTGTAACAGTAATTTGGGGCTGA
CCAGACAGTCACAATCTGGCTATCGAACATCCATTTGTAACCCTCCATAACAAGCTGATG
GGCTCGAGCTATGTAGTCAATGTTGTTTGTGTGGTTAAACGAGGAGACAACACTGCCGCC
AAAAAGGAATCCAGCACCACGTGGACTCAATCCCCAGCCATCAACAATATCTTCAGGATC
AGACCATAGGAGGTCACACATGGCACCATCATGTGGCACTTCTTGCTTCCGGTCATTGTC
CTGATCTGATCAAGAGTAATATCTTGTTTTCAACAACAGCTGAAGACTCATGTAGTCAAA
ATCCATAAACCTGTGTGATTGCCTGCTCTC

QA 1 810 1 810
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3422Contig1 675 3 6 U
GGAGGAGAGACAAAAATTAACTACGATGATGAAACCCTCAGCGAAATCAATTCAGAGAGT
TGGTCGTTTCTTAAGGAAGAGCCTTGGGAGCATCAAATCCACTGTTTGCTTTGGTAAATA
CCACCACAACTTCCCTAACAACAACACTCCACTCTTGAGCCCCTTCTCATGCAGTCTTGC
CCTCTCTTGTCCACAAGATTCCCAGACTGAAGAAACGCACAGCGTTATCTCTTGTGAGAG
CAAGGCTGTTACAGAAACCAGAGATGAGAGACTCATCAACAAAAACCAACGTAAGAAGAA
ACCGAAGACAAAGGCTGCAGCTGCCGAGTCATTCGAGGAGGCAAAGAGAAGAGGTGACAT
GTTGGGACAAAAGCTGAAAGATCTGAACATGGTTGATCTCAGAGACATGGAGCATGCATC
GGATGTAAAAGAAGCGCTTAGATGCTATTCAAGCATTAGAAGCCCTGTCTACCTTGACAT
TGTTGACAATTTCTTCATAGACATGTACTACGAGTTCTCTGATCCACGCACCTCTTCTGG
TATCAACGGTTCAAGAAGAAAAGCTGGCTCTTTCAGACTCTAAGACCCTCTATTCAGCTT
CGCTTGCAAGGCAGGGTGAAGCTATCTCGTTTAAGATTATTACTACTTAAAGAAACGTTG
TTCATAAAAGTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CR71JQ C 231
AF RS1BV96TF U 1
AF RS1CR71TF U 268
BS 1 288 RS1BV96TF
BS 289 289 RS1CR71TF
BS 290 320 RS1BV96TF
BS 321 321 RS1CR71TF
BS 322 606 RS1BV96TF
BS 607 675 RS1CR71TF

RD RS1CR71JQ 274 0 0
CTTGTGAGAGCAAGGCTGTTACAGAAACTAGAGATGAGAGACTCATCAACAAAAACCAAC
GTAAGAAGAAACCGAAGACAAAGGCTGCAGCTGCCGAGTCATTCGAGGAGGCAAAGAGAA
GAGGTGACATGTTGGGACAAAAGCTGAAAGATCTGAACATGGTTGATCTCAGAGACATGG
AGCATGCATCGGATGTAAAAGAAGCGCTTAGATGCTATTCAAGCATTAGAAGCCCTGTCT
ACCTTGACATTGTTGACAATTTCTTCATAGACAT

QA 1 274 1 274
DS 

RD RS1BV96TF 606 0 0
GGAGGAGAGACAAAAATTAACTACGATGATGAAACCCTCAGCGAAATCAATTCAGAGAGT
TGGTCGTTTCTTAAGGAAGAGCCTTGGGAGCATCAAATCCACTGTTTGCTTTGGTAAATA
CCACCACAACTTCCCTAACAACAACACTCCACTCTTGAGCCCCTTCTCATGCAGTCTTGC
CCTCTCTTGTCCACAAGATTCCCAGACTGAAGAAACGCACAGCGTTATCTCTTGTGAGAG
CAAGGCTGTTACAGAAACCAGAGATGAGAGACTCATCAACAAAAACCAGCGTAAGAAGAA
ACCGAAGACAAAGGCTGCAGTTGCCGAGTCATTCGAGGAGGCAAAGAGAAGAGGTGACAT
GTTGGGACAAAAGCTGAAAGATCTGAACATGGTTGATCTCAGAGACATGGAGCATGCATC
GGATGTAAAAGAAGCGCTTAGATGCTATTCAAGCATTAGAAGCCCTGTCTACCTTGACAT
TGTTGACAATTTCTTCATAGACATGTACTACGAGTTCTCTGATCCACGCACCTCTTCTGG
TATCAACGGTTCAAGAAGAAAAGCTGGCTCTTTCAGACTCTAAGACCCTCTATTCAGCTT
CGCTTG

QA 1 606 1 606
DS 

RD RS1CR71TF 408 0 0
GAGACTCATCAACAAAAACCAACGTAAGAATAAACCGAAGACAAAGGCTGCAGCTGCCGA
GTCATTCGAGGAGGCAAAGAGAAGAGGTGACATGTTGGGACAAAAGCTGAAAGATCTGAA
CATGGTTGATCTCAGAGACATGGAGCATGCATCGGATGTAAAAGAAGCGCTTAGATGCTA
TTCAAGCATTAGAAGCCCTGTCTACCTTGACATTGTTGACAATTTCTTCATAGACATGTA
CTACGAGTTCTCTGATCCACGCACCTCTTCTGGTATCAACGGTTCAAGAAGAAAAGCTGG
CTCTTTCAGACTCTAAGACCCTCTATTCAGCTTCGCTTGCAAGGCAGGGTGAAGCTATCT
CGTTTAAGATTATTACTACTTAAAGAAACGTTGTTCATAAAAGTTGTT

QA 1 408 1 408
DS 



AS 1 3

CO CL3423Contig1 736 3 2 U
GGATCCTCACATATTATCTTCATTTATCAAATTTTCTTTTTTCTTTTATCAAACCTGAAA
TCTCCTCGAATCTTGTCCAACCATGATGTCTTGCGGCGCTTCCAATGTCTTGATATCCCC
AAACGGCTGCGTTTTGGCATCTCCTAAGCCTCTTGGCAGATTCCTCAGCGCCAAGCCCGG
CGTACGGAGACTTTTCGTATCCGTCGTTAGAGCTTCTTCCGATGATCCTGATTGTAATGA
CGAGGAATGTGCTCCCGACAAAGAGGTTGGGACAGTGAGTATGGAATGGTTGGCTGGAGA
GAAGACGAAAGTGGTGGGAACGTTTCCACCTCGGAAGCGTGGTTGGACTGGCTATGTTGA
GAAAGATACTGCCGGTCAGACTAATGTTTACTCTATTGAGCCTGCAGTATATGTTGCAGA
GAGTGCCATAAGCTCAGGTACTGCAGGATCTTCGTCTGATGGGGCTGAGAACACAGCAGC
AATCGTAGGAGGCCTTGCCCTTATCGCAATCGCTGCTGCGTCCTCTATACTTCTCCAAGT
CGGGAAAGATGCCCCGGCTCGACCTAAACCAGTGGATTACAGTGGACCCTCTCTTAGCTA
CTACATCAACAAGTTCAAGCCTTCACAAGTTGTTCAAGCCTCTTCACCCGCCCTCACTGA
AGCTCCACCGGTGGCTCAGAAGAAACTTCATTGCCCGAAACTACGGCCAGTGAGTCAGCC
AGAGAGCGTCTTCTGT


BQ
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AF RS1A684JQ C 168
AF RS1A684TF U 1
AF RS1EB04TF U 54
BS 1 675 RS1A684TF
BS 676 736 RS1EB04TF

RD RS1A684JQ 429 0 0
GCGCCAAGCCCGGCGTACGGAGACTTTTCGTATCCGTCGTTAGAGCTTCTTCCGATGATC
CTGATTGTAATGACGAGGAATGTGCTCCCGACAAAGAGGTTGGGACAGTGAGTATGGAAT
GGTTGGCTGGAGAGAAGACGAAAGTGGTGGGAACGTTTCCACCTCGGAAGCGTGGTTGGA
CTGGCTATGTTGAGAAAGATACTGCCGGTCAGACTAATGTTTACTCTATTGAGCCTGCAG
TATATGTTGCAGAGAGTGCCATAAGCTCAGGTACTGCAGGATCTTCGTCTGATGGGGCTG
AGAACACAGCAGCAATCGTAGGAGGCCTTGCCCTTATCGCAATCGCTGCTGCGTCCTCTA
TACTTCTCCAAGTCGGGAAAGATGCCCCGGCTCGACCTAAACCAGTGGATTACAGTGGAC
CCT
TTTTTA

QA 1 423 1 423
DS 

RD RS1A684TF 675 0 0
GGATCCTCACATATTATCTTCATTTATCAAATTTTCTTTTTTCTTTTATCAAACCTGAAA
TCTCCTCGAATCTTGTCCAACCATGATGTCTTGCGGCGCTTCCAATGTCTTGATATCCCC
AAACGGCTGCGTTTTGGCATCTCCTAAGCCTCTTGGCAGATTCCTCAGCGCCAAGCCCGG
CGTACGGAGACTTTTCGTATCCGTCGTTAGAGCTTCTTCCGATGATCCTGATTGTAATGA
CGAGGAATGTGCTCCCGACAAAGAGGTTGGGACAGTGAGTATGGAATGGTTGGCTGGAGA
GAAGACGAAAGTGGTGGGAACGTTTCCACCTCGGAAGCGTGGTTGGACTGGCTATGTTGA
GAAAGATACTGCCGGTCAGACTAATGTTTACTCTATTGAGCCTGCAGTATATGTTGCAGA
GAGTGCCATAAGCTCAGGTACTGCAGGATCTTCGTCTGATGGGGCTGAGAACACAGCAGC
AATCGTAGGAGGCCTTGCCCTTATCGCAATCGCTGCTGCGTCCTCTATACTTCTCCAAGT
CGGGAAAGATGCCCCGGCTCGACCTAAACCAGTGGATTACAGTGGACCCTCTCTTAGCTA
CTACATCAACAAGTTCAAGCCTTCACAAGTTGTTCAAGCCTCTTCACCCGCCCTCACTGA
AGCTCCACCGGTGGC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1EB04TF 683 0 0
CCTGAAATCTCCTCGAATCTTGTCCAACCATGATGTCTTGCGGCGCTTCCAATGTCTTGA
TATCCCCAAACGGCTGCGTTTTGGCATCTCCTAAGCCTCTTGGCAGATTCCTCAGCGCCA
AGCCCGGCGTACGGAGACTTTTCGTATCCGTCGTTAGAGCTTCTTCCGATGATCCTGATT
GTAATGACGAGGAATGTGCTCCCGACAAAGAGGTTGGGACAGTGAGTATGGAATGGTTGG
CTGGAGAGAAGACGAAAGTGGTGGGAACGTTTCCACCTCGGAAGCGTGGTTGGACTGGCT
ATGTTGAGAAAGATACTGCCGGTCAGACTAATGTTTACTCTATTGAGCCTGCAGTATATG
TTGCAGAGAGTGCCATAAGCTCAGGTACTGCAGGATCTTCGTCTGATGGGGCTGAGAACA
CAGCAGCAATCGTAGGAGGCCTTGCCCTTATCGCAATCGCTGCTGCGTCCTCTATACTTC
TCCAAGTCGGGAAAGATGCCCCGGCTCGACCTAAACCAGTGGATTACAGTGGACCCTCTC
TTAGCTACTACATCAACAAGTTCAAGCCTTCACAAGTTGTTCAAGCCTCTTCACCCGCCC
TCACTGAAGCTCCACCGGTGGCTCAGAAGAAACTTCATTGCCCGAAACTACGGCCAGTGA
GTCAGCCAGAGAGCGTCTTCTGT

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

CO CL3424Contig1 748 2 2 U
GGGTCGCTGTTTTAACTGTGGTGTTGACGGTCATTGGGCTCGAGACTGCACTGCAGGGGA
CTGGAAGAACAAGTGTTACCGCTGCGGGGAGAGAGGACATATTGAGAGAAACTGCAAGAA
CAGTCCCAAGAAGCTCAGGCGAAGTGGAAGCTACTCCAGGTCACCTGTAAGATCCCGTTC
TCCTCCTCGTCGTAGAAGAAGCCCAAGCCGTAGCAGGAGTCTTAGCCGAAGCTACAGCCG
ATCAAGATCTCCAGTGAAAAGAAGAGAGAGAAGTGTCGAGGAGAGATCTCGCAGTCCAAA
GAGAATGGAGGACTCTCTATCGCCAAGAGGCAGGGACCGTAGTCCGATTATGGACGATGA
AGGTAGCCCGAGGATCATAGACGGGAGCCCTCCACCTTCTCCAAAGCTTGAAAAGCAAGC
AGGATCAGACCATGACGGTGGTGGCAGCCCTCAAAACAATGGTAATGGCAGCAACACTGT
GGGACGCAGTGCTGACAGCCCGAGAGAGGACCGAAGCCCCGTTGATGATGATTACGAGGC
CAACCGTGCTTCCCCTAGAGGAAGGGAGTTTCCTTGACTTTGATGGCTCATGGCCTCAAG
TCACAGGCACTTTAGCATGTTGTATTATTATATCAGACTGCTCCAGATAATTACTTTTTT
TTTTTGTGTTTGTTTGCTTTGGATCTTTTTATGTTCATGTTGTCCGGATTTTTTTTTTTT
ACTCAATTGAGATGATGGTTAAACTTGC


BQ
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AF RS1GJ79TF U 1
AF RS1GJ79JQ C 437
BS 1 532 RS1GJ79TF
BS 533 748 RS1GJ79JQ

RD RS1GJ79TF 532 0 0
GGGTCGCTGTTTTAACTGTGGTGTTGACGGTCATTGGGCTCGAGACTGCACTGCAGGGGA
CTGGAAGAACAAGTGTTACCGCTGCGGGGAGAGAGGACATATTGAGAGAAACTGCAAGAA
CAGTCCCAAGAAGCTCAGGCGAAGTGGAAGCTACTCCAGGTCACCTGTAAGATCCCGTTC
TCCTCCTCGTCGTAGAAGAAGCCCAAGCCGTAGCAGGAGTCTTAGCCGAAGCTACAGCCG
ATCAAGATCTCCAGTGAAAAGAAGAGAGAGAAGTGTCGAGGAGAGATCTCGCAGTCCAAA
GAGAATGGAGGACTCTCTATCGCCAAGAGGCAGGGACCGTAGTCCGATTATGGACGATGA
AGGTAGCCCGAGGATCATAGACGGGAGCCCTCCACCTTCTCCAAAGCTTGAAAAGCAAGC
AGGATCAGACCATGACGGTGGTGGCAGCCCTCAAAACAATGGTAATGGCAGCAACACTGT
GGGACGCAGTGCTGACAGCCCGAGAGAGGACCGAAGCCCCGTTGATGATGAT

QA 1 532 1 532
DS 

RD RS1GJ79JQ 312 0 0
GGGGGTGGC
AGCCCTCAAAACAATGGTAATGGCAGCAACACTGTGGGACGCAGTGCTGACAGCCCGAGA
GAGGACCGAAGCCCCGTTGATGATGATTACGAGGCCAACCGTGCTTCCCCTAGAGGAAGG
GAGTTTCCTTGACTTTGATGGCTCATGGCCTCAAGTCACAGGCACTTTAGCATGTTGTAT
TATTATATCAGACTGCTCCAGATAATTACTTTTTTTTTTTGTGTTTGTTTGCTTTGGATC
TTTTTATGTTCATGTTGTCCGGATTTTTTTTTTTTACTCAATTGAGATGATGGTTAAACT
TGC

QA 10 312 10 312
DS 



AS 1 3

CO CL3425Contig1 646 3 5 U
GGATTCTTTCGTGTTCAGAATCATGGCTTTCGCCAACAATAACCAATGCACAAAAGTAAT
GTTTTATGCTTTTGTTCTTTATTTTTCAATATCGTCATTGTCAGTTTCCACAGATGCTAC
AATGGACAGGCCAATCGCAAGAAGTTTGTTACCTTTTCAAAAGAAAACTGTTGTGATAAC
AAATTATGCAGTTAACAAAGAAGTTATGAATGTACATTGCAGCTCTTCAGAAAGTGATTT
GGGGTTAAAGCATATCTCTTATCATCAGTCAACTACTTTCCATTTTAAGGTAAATTGGAA
AGCCACTACAAAATTCCGTTGCCATGTTACATGGCGTGGAGGTGGAGATCATTGGTTTAC
TGCATTCAGTCGTGGGGATGGGAGAGACAAATGTGGTGAATGTGTTTGGCAAGTCTACGG
TGATGGTGGATATGGTGATAAGCCTCTGATGTTTTATGATCGCAACGAATATGGTTATCA
CCTTTACGATTGGGACAAATAATTTCAAAACAAGAAATACTACTTTATAATAGATCGACT
AACTACAATTCAATTTGACTAAGACTTGTAACTTAGTATTTATGTTATTATTGTTGTTGG
ATCATCTGAATAATCTTATTATATAAAGTTTGGTTCTTCAAAAAAA


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DF51TF U 1
AF RS1DA93TF U 1
AF RS1DF51JQ C 1
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BS 226 226 RS1DF51TF
BS 227 338 RS1DA93TF
BS 339 339 RS1DF51TF
BS 340 646 RS1DA93TF

RD RS1DF51TF 580 0 0
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GGGGTTAAAGCATATCTCTTATCATCAGTCAACTACTTTCCATTTTAAGGTAAATTGGAA
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TGCATTCAGTCGTGGGGATGGGAGAGACAAATGTGGTGAATGTGTTTGGCAAGTCTACGG
TGATGGTGGATATGGTGATAAGCCTCTGATGTTTTATGATCGCAACGAATATGGTTATCA
CCTTTACGATTGGGACAAATAATTTCAAAACAAGAAATACTACTTTATAATAGATCGACT
AACTACAATTCAATTTGACTAAGACTTGTAACTTAGTATT

QA 1 580 1 580
DS 

RD RS1DA93TF 646 0 0
GGATTCTTTCGTGTTCAGAATCATGGCTTTCGCCAACAATAACCAATGCACAAAAGTAAT
GTTTTATGCTTTTGTTCTTTATTTTTCAATATCGTCATTGTCAGTTTCCACAGATGCTAC
AATGGACAGGCCAATCGCAAGAAGTTTGTTACCTTTTCAAAAGAAAACTGTTGTGATAAC
AAATTATGCAGTTAACAAAGAAGTTATGAATGTACATTGCAGCTCCTCAGAAAGTGATTT
GGGGTTAAAGCATATCTCTTATCATCAGTCAACTACTTTCCATTTTAAGGTAAATTGGAA
AGCCACTACAAAATTCCGTTGCCATGTTACATGGCGTGTAGGTGGAGATCATTGGTTTAC
TGCATTCAGTCGTGGGGATGGGAGAGACAAATGTGGTGAATGTGTTTGGCAAGTCTACGG
TGATGGTGGATATGGTGATAAGCCTCTGATGTTTTATGATCGCAACGAATATGGTTATCA
CCTTTACGATTGGGACAAATAATTTCAAAACAAGAAATACTACTTTATAATAGATCGACT
AACTACAATTCAATTTGACTAAGACTTGTAACTTAGTATTTATGTTATTATTGTTGTTGG
ATCATCTGAATAATCTTATTATATAAAGTTTGGTTCTTCAAAAAAA

QA 1 646 1 646
DS 

RD RS1DF51JQ 638 0 0
GGATTCTTTCGTGTTCAGAATCATGGCTTTCGCCAACAATAACCAATGCACAAAAGTAAT
GTTTTATGCTTTTGTTCTTTATTTTTCAATATCGTCATTGTCAGTTTCCACAGATGCTAC
AATGGACAGGCCAATCGCAAGAAGTTTGTTACCTTTTCAAAAGAAAACTGTTGTGATAAC
AAATTATGCAGTTAACAAAGAAGTTATGAATGTACATTGCAGCTCTTCAGAAAGTGATTT
GGGGTTAAAGCATATCTCTTATCATCAGTCAACTACTTTCCATTTTAAGGTAAATTGGAA
AGCCACTACAAAATTCCGTTGCCATGTTACATGGCGTGGAGGTGGAGATCATTGGTTTAC
TGCATTCAGTCGTGGGGATGGGAGAGACAAATGTGGTGAATGTGTTTGGCAAGTTTACGG
TGATGGTGGATATGGTGATAAGCCTTTGATGTTTTATGATCGCAACGAATATGGTTATCA
CCTTTACGATTGGGACAAATAATTTCAAAACAAGAAATACTACTTTATAATAGATCGACT
AACTACAATTCAATTTGACTAAGACTTGTAACTTAGTATTTATGTTATTATTGTTGTTGG
ATCATCTGAATAATCTTATTATATAAAGTTTGGTTCTT

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

CO CL3426Contig1 824 2 8 U
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GCCGCCTGAAGATGAGAAGTCTAATTTCGCCAAGGAGCTTTACGGAGAAAATTTGCAGCT
TTCGAAACCTGGTAATGAAGATCACAACCCTTGAGGGTTTAGACGGATCCTTCTTTGGAA
GTTCTGATGATGAACCAAGTGAAGCTTACTCCATGAACAAGGAGACGGAGAAAATACGTG
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AGGAAGGTTATAACGTTGGATACAGGGAATCAGTTCTTGCTGGCTACAAGTTTGGTTTTG
TTAGAGGTGTTTCCAGTGCGATGGCTTCCCTCCCAGATGAGCTCAGAGAAAAGCTGATCG
ATGAACAAGGAACTAGAGACAAGTTTCATAAACTACACGATTCTGTGCATGCTCTCTCAA
CTGAAGCGGCAATGAAAGTGTTTTATGGAACTCTGATTACAAAGCAAGTGGAAGACAAGA
GTGGAGAAGAAGGGTCTGACTCTAGTGTTGCTTATGTTACTTCCACAACTGACTTGGGAA
GCTATGTAAGTGAGCTAAGCTCTCTTCTTCACAAATCTCCTAAGATTGAAGTTAGATTGG
ACATATAGACCAAGAGAAGCATGGAAGCTTGCTGTGCAAGATGGTGAGCATATAGCTTCT
TTGGTAGTATGGATTGTCCCAATATTAAATCAACAAGAGTATACCACTAAACAATAATAT
TATCTTTTCATACATATTAATCTTTCGGAAGAAACACTTTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AU43TF U 1
AF RS1AU43JQ C 4
BS 1 149 RS1AU43TF
BS 150 150 RS1AU43JQ
BS 151 387 RS1AU43TF
BS 388 388 RS1AU43JQ
BS 389 657 RS1AU43TF
BS 658 658 RS1AU43JQ
BS 659 669 RS1AU43TF
BS 670 824 RS1AU43JQ

RD RS1AU43TF 669 0 0
GGGACGTCTTTTGGGTCAAACTGCTCAATATCGTCACATCTTCGCTGTAGAACGGATGGA
GCCGCCTGAAGATGAGAAGTCTAATTTCGCCAAGGAGCTTTACGGAGAAAATTTGCAGCT
TTCGAAACCTGGTAATGAAGATCACAACC*TTGAGGGTTTAGACGGATCCTTCTTTGGAA
GTTCTGATGATGAACCAAGTGAAGCTTACTCCATGAACAAGGAGACGGAGAAAATACGTG
AGAAATTTCACACGGTTGGATACCGTGACGGTATTAGTGCTGGGAAAGAAGCTGCTGCGC
AGGAAGGTTATAACGTTGGATACAGGGAATCAGTTCTTGCTGGCTACAAGTTTGGTTTTG
TTAGAGGTGTTTCCAGTGCGATGGCTTTCCTCCCAGATGAGCTCAGAGAAAAGCTGATCG
ATGAACAAGGAACTAGAGACAAGTTTCATAAACTACACGATTCTGTGCATGCTCTCTCAA
CTGAAGCGGCAATGAAAGTGTTTTATGGAACTCTGATTACAAAGCAAGTGGAAGACAAGA
GTGGAGAAGAAGGGTCTGACTCTAGTGTTGCTTATGTTACTTCCACAACTGACTTGGGAA
GCTATGTAAGTGAGCTAAGCTCTCTTCTTCACAAATCTCCTAAGATTGAAGTTAGAT*GG
ACATATAGA

QA 1 669 1 669
DS 

RD RS1AU43JQ 821 0 0
GGACGTCTTT
GGTCAAACTGCTCAATATCGTCACATCTTCGCTGTAGAACGGATGGAGCCGCCTGAAGAT
GAGAAGTCTAATTTCGCCAAGGAGCTTTACGGAGAAAATTTGCAGCTTTCGAAACCTGGT
AATGAAGATCACAACCCTTGAGGGTTTAGACGGATCCTTCTTTGGAAGTTCTGATGATGA
ACCAAGTGAAGCTTACTCCATGAACAAGGAGACGGAGAAAATACGTGAGAAATTTCACAC
GGTTGGATACCGTGACGGTATTAGTGCTGGGAAAGAAGCTGCTGCGCAGGAAGGTTATAA
CGTTGGATACAGGGAATCAGTTCTTGCTGGCTACAAGTTTGGTTTTGTTAGAGGTGTTTC
CAGTGCGATGGCTTCCCTCCCAGATGAGCTCAGAGAAAAGCTGATCGATGAACAAGGAAC
TAGAGACAAGTTTCATAAACTACACGATTCTGTGCATGCTCTCTCAACTGAAGCGGCAAT
GAAAGTGTTTTATGGAACTCTGATTACAAAGCAAGTGGAAGACAAGAGTGGAGAAGAAGG
GTCTGACTCTAGTGTTGCTTATGTTACTTCCACAACTGACTTGGGAAGCTATGTAAGTGA
GCTAAGCTCTCTTCTTCACAAATCTCCTAAGATTGAAGTTAGATTGGACATATAGACCAA
GAGAAGCATGGAAGCTTGCTGTGCAAGATGGTGAGCATATAGCTTCTTTGGTAGTATGGA
TTGTCCCAATATTAAATCAACAAGAGTATACCACTAAACAATAATATTATCTTTTCATAC
ATATTAATCTTTCGGAAGAAACACTTTCCCC

QA 11 821 11 821
DS 



AS 1 3

CO CL3427Contig1 952 3 9 U
GGATTGAACTTCCATTTCATTTGCTTTATTTTAAAACAATTACATATACTTCCATTTCAT
ATCAAATCTGCGGAGGCAAAAGGAACATGTCACTCATGCACAAGAAGCTTCCACAGCTAA
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ACTCCTTGATCCAATACACGCCTTTTGGACCACGGAGAGAGATCGGGCGCTACTGCAACG
GCCGTAGCTGAAACTACCGCAAGTACCCGTGGGCGTACCGAAGCTTGCAAAGTTTATAGA
AGATATCACCTGAGTGGAGACAGGGCATTTTAAGGAAAGAACCGGCCTGGTTCTGTTTGA
GAGCTTGAAGTCGGAAGTCCACGTGTTCACAGGAGCTGGATGAGACTGTGACACCGTCAA
ACACAAGTTGCTTCCTGTTTGTCTCGTGGCGAATGATATCTTTGTCGGATCTCCACCCAT
TTCTTCCAGCAGAACAAGAGTGTTCCCGCTAGGTTTTATCCACGAGCGAGGCACGTGATA
CAATGTCTGAAAAGGTTTTCCACAATTCTTGAGACATTTGTAATTGCGGTAAGATCCTCT
GTAGTCGCATGACCCTACGCAACCATCGGTTCGTGCAATACTGGTTGGCCAGTACCGACC
TATGCTCTGTCCATTCACCCACGCAATGCCTTTTCCTGTACCTGTGAAGTCTATTGCTAC
TGGAGCACTCCCGGAAGGAGCATCAAATGTTGTCTTGTACCAAATCAGTGGCTGGCTAGT
GGGCAAAGGAGAGTTTGAAACCCATTCAGAAGAATCTCCATTTCCTAAACCTTTGTCTTC
CCCTTTCAGTCCAACCTGATAAGTCCATTGCTGTGATGACAAATCGGTTGAGCTACCAGT
TTTTGCGCTTTTAAGTGACACAGGACCGGTGATTCCTGCTCCAGTTAAGTCC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1AS68JQ U 1
AF RS1BR49JQ U 1
AF RS1BR49TF C 386
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BS 749 952 RS1BR49TF

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ATCAAATCTGCGGAGGCAAAAGGAACATGTCACTCATGCACAAGAAGCTTCCACAGCTAA
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ACTCCTTGATCCAATACACGCCTTTTGGACCACGGAGAGAGATCGGGCGCTACTGCAACG
GCCGTAGCTGAAACTACCGCAAGTACCCGTGGGCGTACCGAAGCTTGCAAAGTTTATAGA
AGATATCACCTGAGTGGAGACAGGGCATTTTAAGGAAAGAACCGGCCTGGTTTTGTTTGA
GAGCTTGAAGTCGGAAGTCCACGTGTTCACAGGAGCTGGATGAGACTGCGACACCGTCAA
ACACAAGTTGCTTCCTGTTTGTCTCGTGGCGAATGATATCTTTGTCGGATCTCCACCCAT
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CAATGTCTGAAAAGGTTTTCCACAATTCTTGAGACATTTGTAATTGCGGTAAGATCCTCT
GTAGTCGCATGACCCTACGCAACCATCGGTTCGTGCAATACTGGTTGGCCAGTACCGACC
TATGCTCTGTCCATTCACCCACGCAATGCCTTTTCCTGTACCTGTGAAGTCTATTGCTAC
TGGAGCACTCCCG

QA 1 733 1 733
DS 

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GA
ATTGAACTTCCATTTCATTTGCTTTATTTTAAAACAATTACATATACTTCCATTTCATAT
CAAATCTGCGGAGGCAAAAGGAACATGTCACTCATGCACAAGAAGCTTCCACAGCTAAGC
TCTTAACGACGCCACGACAAGGCTCTCCAAAGACTCTGGTCGAGACTTCAACTTTACAAC
TCCTTGATCCAATACACGCCTTTTGGACCACGGAGAGAGATCGGGCGCTACTGCAACGGC
CGTAGCTGAAACTACCGCAAGTACCCGTGGGCGTACCGAAGCTTGCAAAGTTTATAGAAG
ATATCACCTGAGTGGAGACAGGGCATTTTAAGGAAAGAACCGGCCTGGTTCTGTTTGAGA
GCTTGAAGTCGGAAGTCCACGTGTTCACAGGAGCTGGATGAGACTGTGACACCGTCAAAC
ACAAGTTGCTTCCTGTTTGTCTCGTGGCGAATGATATCTTTGTCGGATCTCCACCCATTT
CTTCCAGCAGAACAAGAGTGTTCCCGCTAGGTTTTATCCACGAGCGAGGCACGTGATACA
ATGTCTGAAAAGGTTTTCCACAATTCTTGAGACATTTGTAATTGCGGTAAGATCCTCTGT
AGTCGCATGACCCTACGCAACCATCGGTTCGTGCAATACTGGTTGGCCAGTACCGACCTA
TGCTCTGTCCATTCACCCACGCAATGCCTTTTCCTGTACCTGTGAAGTCTATTGCTACTG
GAGCACTCCCGGAAG*AGCATCAAAT

QA 3 748 3 748
DS 

RD RS1BR49TF 567 0 0
TTCACAGGAGCTGGATGAGACTGTGACACCGTCAAACACAAGTTGCTTCCTGTTTGTCTC
GTGGCGAATGATATCTTTGTCGGATCTCCACCCATTTCTTCCAGCAGAACAAGAGTGTTC
CCGCTAGGTTTTATCCACGAGCGAGGCACGTGATACAATGTCTGAGAAGGTTTTCCACAA
TTCTTGAGACATTTGTAATTGCGGTAAGATCCTCTGTAGTCGCATGACCCTACGCAACCA
TCGGTTCGTGCAATACTGGTTGGCCAGTACCGACCTATGCTCTGTCCATTCACCCACGCA
ATGCCTTTTCCTGTACCTGTGAAGTCTATTGCTACTGGAGCACTCCCGGAAGGAGCATCA
AATGTTGTCTTGTACCAAATCAGTGGCTGGCTAGTGGGCAAAGGAGAGTTTGAAACCCAT
TCAGAAGAATCTCCATTTCCTAAACCTTTGTCTTCCCCTTTCAGTCCAACCTGATAAGTC
CATTGCTGTGATGACAAATCGGTTGAGCTACCAGTTTTTGCGCTTTTAAGTGACACAGGA
CCGGTGATTCCTGCTCCAGTTAAGTCC

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 3

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GAACGCTGTGTTTGATCGTCTTCCCCTGGATGATGATGAAGCTGCTTCTATGCAGCAGAA
CCAGCAGTACTACCAGAATGGAAGAGCCCGTCCTTTAGATGGCGGCATTCATGGATTACC
TCAAAACCTGCTCACTAATGGGAACTCAGGCTCTGATATATACCATTGGGGGCCTACGCA
GCGTGTCATGTCCAAGCCTTAATATTGCTAATAAAATTAGAGGGGGAACCATAAGTTACC
TGAAACTAATCTTCCTCTCCTCTGTAGTTTGTGTACCTGAAACATTACAAAGAAGAAACT
AAAACAAAGATAAGTAATTTGTTAATGAACTTAAGCAGCATCCTCTAGTTTAATACAAAA
TATTACTGTGTTTTTATTCGTGATCCCAACAGAATGTTCTCTACTAATAAGAAGACATAG
CAGAGAAAGTGATTTTGCCAATTTGTCATTGACACAACAAGAAAATAACACACGTGTGCA
TGTCTTCCCCAAACCTTGTCATCATGTTTCTCTCATACTCTCAGAAGTGGAGAGGGTTAT
AGTTTTTTTTTTTCTTTTATGAAGTTTTAACAGTTCATTCCGTTGCAAAACAAAGATCAA
TCAACAATAAGTCAAGAACAGCGTACGAGGTTTGAACAATCTGTCTCTCAGCAAAAGTGA
TATGATTATTTCATAAATTGATAATCTAGGTAACATCTCTTACGAGTACAACACCAAGGC
GAAACAACCAAAGACCAGCAAGGTATTTGTTTCAAATCTGCAGCGCATCAGCAATGGATC
CTGCGAGGCTCAAGACTTCAAAAGGTGCCTTGTTTCCTATGGACTTAACCGTCTGTGGAC
AAAAATCCGTGATCCAAAAGTATGCAAACGCTTCCTCTGATCCATTGTTCTTGTGAGTGA
AACGCTCCCAGGAGCTCTTTGGGAAGACACCGTGAGTTACATAAGCACTCACCTTCGCAG
CTCCATGAGCTGCCAATACTTTCTGGCATTCAATGAGTGTACCACCAGATTGCACAAGAT
CATCAACGATGACAACGTGGCAACCAGCGGGGTTCCCTTCCTTCAGCCTGACTATTCTCT
TATCACCTTCACGAACCTTTGTGCAAACCACCGTGGGATACTGGTCCAACAGCTTGTGGA
AACGCTTCCAGGCTCCATCATCCGGAAATGCAACTATGATCTTGTCAGTTTCAGGAAGTT
GCTGAAGACGTTTGGTCAACAATGGGATACCAGTCTCAAACAAAGGAAGAACCTGATCAG
CAAAGTAGAACCTTTCCTGTAGGGCGTGGATGTCATAGATGACAACACTAGTGGGACCAC
CACGCGAAATGGGGATGTTGGACACAATCCTAGCCATGGTGAAAGCAGTAGCTACATCTC
CTTCCTCTTCCATCCTCTCAAATGAGCCAGTGGGGAAGAAAGGCAACACCAACGTGAAGG
ACGCAACAAACAAGCGAGGGAGCAAGTAAATGACAGAGATCTGCTCAAAGATGACCGCAG
GAGAGCTGAACGAAGCAAGGAAGGCAACGTGCTGTCCTCTGATCTCATGTGCGTTGTTAA
TAAACAGATTTGGGAACCCATCAGCAAAACTCCTCCAGTTGATGGATTGAAGAGTGATGT
GATCAGATTCAGAGGCGATGTTGCGAGCTAGTTCTTCACGCTCTAAGCAGTAAAAGAGAT
GGACTTTTTTCTTCTGTAGTTCAGACACGATGGCTTCTTTACAAATCAGGTTCTTCTCCA
TGTTGTTGTTATTGTTGTTGGCTGCGTTCTCAGACATTGACGCCGTTGAAGACTCTTGAG
TGTCGGAATCAGATTACACACAAAAA


BQ
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TGAAACTAATCTTCCTCTCCTCTGTAGTTTGTGTACCTGAAACATTACAAAGAAGAAACT
AAAACAAAGATAAGTAATTTGTTAATGAACTTAAGCAGCATCCTCTAGTTTAATACAAAA
TATTACTGTGTTTTTATTCGTGATCCCAACAGAATGTTCTCTACTAATAAGAAGACATAG
CAGAGAAAGTGATTTTGCCAATTTGTCATTGACACAACAAGAAAATAACACACGTGTGCA
TGTCTTCCCCAAACCTTGTCATCATGTTTCTCTCATACTCTCAGAAGTGGAGAGGGTTAT
AGTTTTTTTTTTTCTTTTATGAAGTTTTAACAGTTCATTCCGTTGCAAAACAAAGATCAA
TCAACAATAAGTCAAGAACAGCGTACGAGGTTTGAACAATCTGTCTCTCAGCA
GA

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DS 

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AG
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TACGAGGTTTGAACAATCTGTCTCTCAGCAAAAGTGATATGATTATTTCATAAATTGATA
ATCTAGGTAACATCTCTTACGAGTACAACACCAAGGCGAAACAACCAAAGACCAGCAAGG
TATTTGTTTCAAATCTGCAGCGCATCAGCAATGGATCCTGCGAGGCTCAAGACTTCAAAA
GGTGCCTTGTTTCCTATGGACTTAACCGTCTGTGGACAAAAATCCGTGATCCAAAAGTAT
GCAAACGCTTCCTCTGATCCATTGTTCTTGTGAGTGAAACGCTCCCAGGAGCTCTTTGGG
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TGGCATTCAATGAGTGTACCACCAGATTGCACAAGATCATCAACGATGACAACGTGGCAA
CCAGCGGGGTTCCCTTCCTTCAGCCTGACTATTCTCTTATCACCTTCACGAACCTTTGTG
CAAACCACCGTGGGATACTGGTCCAACAGCTTGTGGAAACGCTTCCAGGCTCCATCATCC
GGAAATGCAACTATGATCTTGTCAGTTTCAGGAAGTTGCTGAAGACGTTTGGTCAACAAT
GGGATACCAGTCTCAAACAAAGGAAGAACCTGAT

QA 3 696 3 696
DS 

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AGTTTCAGGAAGTTGCTGAAGACGTTTGGTCAACAATGGGATACCAGTCTCAAACAAAGG
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CAGGTTCTTCTCCATGTTGTTGTTATTGTTGTTGGCTGCGTTCTCAGACATTGACGCCGT
TGAAGACTCTTGAGTGTCGGAATCAGATTACACACAAAAA

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 3

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TAAACCTTTAATAGAAATGCTCTAAGAAGCTGTTGCTTGATTTTGGTTTTGTAAATACCA
TTGTAAATACCAAAAACAGTATCACTTGATGTAAGATTTTTGATTGAATAAATTTTACAT
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AGGCACATGCACGATGGTCTCAAAAATATTTAAGGTAAAAAACACAGACACACAAGCACA
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CAAACAGCGCATAATGCCCAAACCTGATATGGTCTCAAAGAAATTAGATCACATTTCGCC
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TCCCTTTGAGACCGGGGACTGAGCTTTTGTCTTCGACCGTTTCTGACCAGTCTGAAACCA
AATGTTAGCGGATCTGGGAGCAACACATCCATAACGGTCGTCTGGAGAGCTGTCTGAATT
GCATCCTTTATATCCAGTTCTCCTGAGCTGTTCCTTCCGGACTGCCACCTGACTTTTATC
TTCGAAATGAGATTTTTGATCAAAGCATTTATCTCAGCTTTCGTGTTCTTCTCTGAGAAG
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GGCACGACAGATTCTTTTCCCTGGGGATCCCCACTGTTAGACAACGGCCCTGCATAGTGA
ATAAGCAATGAAGGGCTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G915JQ U 1
AF RS1DH09JQ U 388
AF RS1DH09TF C 935
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TCATTCAAAACAAGAATATATTGTATAAGATTACTTACGACCAATAACTTCACAAATGCT
ACCAGAAAAATCTCCATGTTATTCACAAGATATGATGATGGTGGAGGGGACCGATCGTTT
CATAAATTACTTCGAGAAGAGCGGTCTCAGAACTGAGGCCGTAAGATTCAAAAAGAATAC
AGGCACATGCACGATGGTCTCAAAAATATTTAAGGTAAAAAACACAGACACACAAGCACA
TATATATCTAGAACCAGTACTTTAAAACAATGGGATTGATTCTTTCGTGAAATTAACAAA
CAAACAGCGCATAATGCCCAAACCTGATATGGTCTCAAAGAAATT

QA 1 525 1 525
DS 

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TCCGCGGCAAAAGATGGGTTCGTTTGGAGATGCGGTTCGGGCCCTTGCTCTTAGTACATC
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GAATGAGAAACAGTGTCTTGTTTCTTGCAGGGGCGCAACTTCCATTGAGATTCCACTAAG
TGCACCAGCCCATAGGACAGTGGCATCAGCTCCTTCAGCGCAGTTCTGTCCAGCTACGTC
TCTGCAAGTAACACTTAGATTCAACTTGATTGCTTCGCTTGTGTTATTGCGGACCAGAAC
CTCCATAGGAGTGACTTCGTGTGACAAAACTGATCCCTTTGAGACCGGGGACTGAGCTTT
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TCCATAACGGTCGTCTGGAGAGCTGTCTGAATT

QA 1 633 1 633
DS 

RD RS1DH09TF 704 0 0
CGA
CGTTTCTGACCAGTCTGAAACCAAATGTTAGCGGATCTGGGAGCAACACATCCATAACGG
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CGGACTGCCACCTGACTTTTATCTTCGAAATGAGATTTTTGATCAAAGCATTTATCTCAG
CTTTCGTGTTCTTCTCTGAGAAGCTCGGATGTTTATTATTTGAACCGTCAAGAACCGGTA
GCTTGAAATGCTCCAATGGTATTAGCACCCTAGCAGAATAGTCTCGGTCGATTCTTGTTT
TTGGGTATTCATACTCTGGAGAATCTTGGACTGGGGAAGAATCATCTTCCTTGGCGGAAT
TTTCCAGCTGAACAAACACGCTGATTTCAAAAACAACATCCGTTGGGTTAGATAACTCGA
GTTCAAGAAACCGTAAGCCCCAGCTTCCCCGAAAGGGATTGATCTTGACAAGTCTGTCTG
TATTGCTCTCTGTTTCAGTGTCTTCATCCCGAAGGTTGTCACCCACATGTGCAGGGATCT
CCATGGAAAGCAAACGAGCTTTCACAAAGGACAAACCTTGCAAAACACAAATCTGTAGGG
GAACAACAAGACGTCTGCCCGGTGGCACGACAGATTCTTTTCCCTGGGGATCCCCACTGT
TAGACAACGGCCCTGCATAGTGAATAAGCAATGAAGGGCTC

QA 4 704 4 704
DS 



AS 1 3

CO CL3430Contig1 900 3 9 U
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TTTTCCCAATATCTTCAAGGATACTTATGCCTCATCAGGTTGTGTATAACATAACAAAAA
TTTCCGATAGGTTACACAGAAAACGAAATAAAACTCTCTAAGGGAAAGCTTCAAAAGTTT
TTTCCAAGTTCAATCTTTTTCATCAGTGTCATCGTCTGGTGGAGAATAGAATCCAAGATT
CCAGCAACCGTGAAGACACCACCGATAATGGCGCATACATTGGTAATGAAGTGTGAGAAG
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ACTGGTAAATAGTAAGTATGAGCAACGCTGCTATGTGCTGTGTACTCATACTCCTCTACC
ACTGCATGTCCATTGCTTTTCAATACCTCTGTCTTTACTATTTGCAGATAATGCTCGATG
GTAACATTAGGACCCAGATCACGTTGGTTTATGAAGGGGCGGCCGTTCAAACGGTCGTGA
CTATGACCGAGATAAGGTGACAAGCGCTTTAAGTCAGCGAATGTCTGAGGCAAAATCTTC
CGCCCAAATGAAAGATGGTTAACAACATGGGACATATTCATCTGAGAAGAATCAAATGAA
TGTGATCCCGAGCGTGCTGAAACCATTAGGTTGCCTGGAACCTTCTTTACACGTATGTAT
CCTTCAATTCGGCATCCTCCTGTAGAAGGTGCCTTTTCTAAAGTTTTCGATGCATTGCCT
GATTTGTCCTCTAGTGCAAGTTTATGGGGCTCTACATGGATTGGTTCTACCAGACCTATC
ACCATCTTCACTAAGCTTTCCGTATCACGATCTCCATAGTATGATTCATGATCATGGTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DM72JQ U 1
AF RS1DI15JQ U 51
AF RS1DK18JQ U 65
BS 1 123 RS1DM72JQ
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RD RS1DM72JQ 742 0 0
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TTTACGATAGGTTACACAGAAAACGAAATAAAACTCTTTAAGGGAAAGCTTCAAAAGTTT
TTTCCAAGTTCAATCTTTTTCATCAGTGTCATCGTCTGGTGGAGAATAGAATCCAAGATT
CCAGCAACCGTGAAGACACCACCGATAATGGCGCATACATTGGTAATGAAGTGTGAGAAG
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CTATGACCGAGATAAGGTGACAAGCGCTTTAAGTCAGCGAATGTCTGAGGCAAAATCTTC
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TGTGATCCCGAGCGTGCTGAAACCATTAGGTTGCCTGGAACCTTCTTTACACGTATGTAT
CCTTCAATTCGGCATCCTCCTG

QA 1 742 1 742
DS 

RD RS1DI15JQ 811 0 0
C
GGATAAACATTTTCCCAATATCTTCAAGGATACTTATGCCTCATCAGGTTGTGTATAACA
TAACAAAAATTTCCGATAGGTTACACAGAAAACGAAATAAA*CTCTCTAAGGGAAAGCTT
CAAAAGTTTTTTCCAAGTTCAATCTTTTTCATCAGTGTCATCGTCTGGTGGAGAATAGAA
TCCAAGATTCCAGCAACCGTGAAGACACCACCGATAATGGCGCATACATTGGTAATGAAG
TGTGAGAAGGATCTTGAGTTTTCGGTTATGAGAACCTGCATAGGTGAGAGCTCGAAGTGA
AACTTGGCGACTGGTAAATAGTAAGTATGAGCAACGCTGCTATGTGCTGTGTACTCATAC
TCCTCTACCACTGCATGTCCATTGCTTTTCAATACCTCTGTCTTTACTATTTGCAGATAA
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AGACCTATCACCATCTTCACTAAGCTTTCC

QA 2 811 2 811
DS 

RD RS1DK18JQ 836 0 0
CCCAATATCTTCAAGGATACTTATGCCTCATCAGGTTGTGTATAACATAACAAAAATTTC
CGATAGGTTACACAGAAAACGAAATAAAACTCTCTAAGGGAAAGCTTCAAAAGTTTTTTC
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CAACCGTGAAGACACCACCGATAATGGCGCATACATTGGTAATGAAGTGTGAGAAGGATC
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GTAAATAGTAAGTATGAGCAACGCTGCTATGTGCTGTGTACTCATACTCCTCTACCACTG
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CATTAGGACCCAGATCACGTTGGTTTATGAAGGGGCGGCCGTTCAAACGGTCGTGACTAT
GACCGAGATAAGGTGACAAGCGCTTTAAGTCAGCGAATGTCTGAGGCAAAATCTTCCGCC
CAAATGAAAGATGGTTAACAACATGGGACATATTCATCTGAGAAGAATCAAATGAATGCG
ATCCCGAGCGTGCTGAAACCATTAGGTTGCCTGGAACCTTCTTTACACGTATGTATCCTT
CAATTCGGCATCCTCCTGTAGAAGGTGCCTTTTTTAAAGTTTTCGATGCATTGCCTGATT
TGTCCTCTAGTGCAAGTTTATGGGGCTCTACATGGATTGGTTCTACCAGACCTATCACCA
TCTTCACTAAGCTTTCCGTATCACGATCTCCATAGTATGATTCATGATCATGGTGT

QA 1 836 1 836
DS 



AS 1 3

CO CL3431Contig1 1304 3 22 U
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CTTCTCAATTATCTCCGTCGTCGCAGTGATGAGTAGGAGATACAGTCCGCCTTATTACAG
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ATACGGTGGTAGTGGTGGTGGTGGTGGACGTAAGGGATCTAGCCATGGAAGTCTCTTGGT
TCGAAACATTCCTCTCGATTGCAGACCAGAAGAGCTTCGTGTTCCCTTTGAGAGGTTTGG
ACCTGTGAGGGATGTCTATATCCCCAGAGACTATTACTCAGGGGAACCTCGGGGGTTTGC
CTTTGTGGAGTTTGTCGATGCATATGATGCTGGGGAGGCTCAAAGAAGCATGAACAGAAG
AGTATTTGGTGGAAGAGAGATAACCGTGGTTGTTGCTTCAGAGTCCAGGAAAAGACCTGA
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TCATGGACGGTCTCGTTCACGTTCAATCTCTAGATCACGCTCTCCCCGTCGTCCATCGGA
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CTATTCAGCATCACCAAGGAGAAGACAAGAGGAACGTCCACGATCACCACTAAGAAGTCC
TCCTCGAGGAGAAGGAGATGCAAAGTACAGTCGCAGGTCCTATTCCCCTGGCTATGAAGG
TGCTGCTACTGCTGCTGAAGACCGAGACACAAATGGAGACAATGAGACTAGAGAGTGAGC
TTATTTTGTTATTGCTCTTGGGGATTGACTGTGTCTGATTTTCTTGTTTGGGACATTGAT
TGGTCCTTTTTTTTTTTACCAGGAAACCGGACTATGAACCAGAGGAAAGGCGTCGTGGTG
GAAGAGAGGTTTCAAGGTCTCCATCAGGATCCAGGTCCAGATCTGTGGAAGCGTCTCCAA
GATGAAACTTGTGTTGAAGAAAGATTCTCTTTCTCAGAACAAAACTTTGTGCAACTCTCG
CTCTATGGTGTTTCTTTGTTTCTCTAGTTGTGAACTCTCTGTGTTCTCAAGAAACTCCTT
TACTCTGGCTTGTTAAAAAGATTCATCTCGTCATGTAATGATTCTTAAGATCATTCTCAG
TTTATTTTTTCTTTTTTTCTTTTTAATATTTGTATGAAGTCTTATGTTCCTATGAATCTC
CATCTGATAAAGTCAAGGTTGACGACAATATATTTTATTTAAGC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 
0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DW07TF U 1
AF RS1BM38TF U 1
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DS 

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**TCTCAATTA*CTCCGTCGTCGCAGTGATGAGTAGGAGATACAGTCCGCCTTATTACAG
TCCTCCGAGGAGAGGATACGGTGGTCGTGGCAGAAGCCCTCCTCCTCCTCCGCGACGTGG
ATACGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGACGTAAGGGATCTAGCCATGGAAGTCTCTTGGT
TCGAAACGTTCCTCTCGATTGCAGACCAGAAGAGCTTCGTGTTCCCTTTGAGAGGTTTGG
TCCTGTGAGGGATGTCTATATCCCCAGAGACTATTACTCAGGGGAACCTCGGGGGTTTGC
TTTTGTGGAGTTTGTCGATGCATATGATGCTGGGGAGGCTCAAAGAAGCATGAACAGAAG
AGTATTTGGTGGAAGAGAGATAACCGTGGTTGTTGCTTCAGAGTCCAGGAAAAGACCTGA
GGAGATGCGTGTGAAGACTAGGACTCGTAGCAGGGAACCTTCTGGCTCTAGAGGTCGTTC
TCATGGACGGTCTCGTTCACGTTCAATCTCTAGATCACGCTCTCCCCGTCGTCCATCGGA
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TCCTCGAG

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DS 

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TCTAGAAGCAGACGCCGATCAAGGTCTTACTCACCTGCACCTAGAAGAAGAGGAGCAGAC
TATTCAGCATCACCAAGGAGAAGACAAGAGGAACGTCCACGATCACCACTAAGAAGTCCT
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GCTGCTACTGCTGCTGAAGACCGAGACACAAATGGAGACAATGAGACTAGAGAGTGAGCT
TATTTTGTTATTGCTCTTGGGGATTGACTGTGTCTGATTTTCTTGTTTGGGACATTGATT
GGTCCTTTTTTTTTTTACCAGGAAACCGGACTATGAACCAGAGGAAAGGCGTCGTGGTGG
AAGAGAGGTTTCAAGGTCTCCATCAGGATCCAGGTCCAGATCTGTGGAAGCGTCTCCAAG
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TCTATGGTGTTTCTTTGTTTCTCTAGTTGTGAACTCTCTGTGTTCTCAAGAAACTCCTTT
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TTATTTTTTCTTTTTTTCTTTTTAATATTTGTATGAAGTCTTATGTTCCTATGAATCTCC
ATCTGATAAAGTCAAGGTTGACGACAATATATTTTATTTAAGC

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

CO CL3432Contig1 1232 2 2 U
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TTAGACTGAAGCTCGAAGTACAAGTTGAGGAGGTGGACTATGACAAAGACGCATCTGTTC
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CTTTAGAGCTTGACCTGAAACGACCTTTTGTTTTGAGAAAGGCATTTTGGGACTCATTGG
CTCTTGATACACTCAAGCAAGCCTCAGATCCCGCTGCCAGTGCTGATCTAGCTGTAGTTC
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CATTGAAGAAATTCTTTGAGAATGTTCTGCAGGCCTTTGTGAAACATGTTGACCAGTGTC
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TTATTGGAAGCAGAGAGAAGACAGTTGAGAGCTATAATTGAGAACAAATCGCGTATAATT
CCGGTGCACACAAACTCTGGATATAGACATAGCTTGGGAGAGGTTCTAAATGCTCCCAAC
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TTCACCATGCTTTCAAATGATCCAGCTCGGGCATGCTATGGACCAAAACATGTAGAAGTT
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AGTTGGATCAGTCGTTGCTGTTGTGCAGCGTTTGTGAAACAACGTACCTTGTTGAATCTT
GAGCCTTTGTGATTTATAAAACATATTTGTGG


BQ
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AF RS1CM69TF U 1
AF RS1CM69JQ C 511
BS 1 674 RS1CM69TF
BS 675 1232 RS1CM69JQ

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GTGTCACTTTTAGAAAGGTTCAGAGAGAGGTACCTGGTGGGGGAAGAGACTCTGAACGTG
TTAGACTGAAGCTCGAAGTACAAGTTGAGGAGGTGGACTATGACAAAGACGCATCTGTTC
TACGCATACGTGGGAAGAATATCCTGGAGAATGAGCACGTAAAGATTGGTGCATTCCATA
CTTTAGAGCTTGACCTGAAACGACCTTTTGTTTTGAGAAAGGCATTTTGGGACTCATTGG
CTCTTGATACACTCAAGCAAGCCTCAGATCCCGCTGCCAGTGCTGATCTAGCTGTAGTTC
TAATGCAAGAAGGACTTGGACAAATCTTCCTTGTTGGCAGAAGCGTGACAAGTAGCCGTG
CACGAATAGAAACATCAATTCCTAGGAAGCATGGGCCTGCCATTGCTGGTTACGAGTCTG
CATTGAAGAAATTCTTTGAGAATGTTCTGCAGGCCTTTGTGAAACATGTTGACCAGTGTC
GTTCGCTGTGCAGTGATCGCAAGTCCCGGCTTTACAAAAGACCAGTTTCATCGTCACTTA
TTATTGGAAGCAGAGAGAAGACAGTTGAGAGCTATAATTGAGAACAAATCGCGTATAATT
CCGGTGCACACAAACTCTGGATATAGACATAGCTTGGGAGAGGTTCTAAATGCTCCCAAC
GTGATGAATATGAT

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1CM69JQ 722 0 0
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GCTATAATTGAGAACAAATCGCGTATAATTCCGGTGCACACAAACTCTGGATATAGACAT
AGCTTGGGAGAGGTTCTAAATGCTCCCAACGTGATGAATATGATCAAAGATACTAAAGCA
GCAAAAGAGGTCAAAGCTCTAAACGATTTCTTCACCATGCTTTCAAATGATCCAGCTCGG
GCATGCTATGGACCAAAACATGTAGAAGTTGCTCATGAACGAATGGCAGTCCAAACACTT
CTCATCACAGATGAGCTTTTCAGGAATTCCGACGTTAAAACAAGGAAGAAGTATGTGGAT
TTGGTTGAGTCAGTGAAAGATTCAGGAGGAGAGGCGTTTATATTTTCGTCGATGCATGTT
TCAGGAGAACAGTTGGCACAGCTGACTGGAATTGCAGCTCTTCTCAGGTTCCCTTTACCA
GACCTCGAAGACATCGAGATGTAATATATATATCTTCTTCGGGTGTAGAAAACATACAAG
ATCATATACGTCTCACTATACTTATTAGCATCTCTTTATAGTTTTCAAGAGAGATTTGTA
TTGTGGCCCAAAAGGCAAACTCTTACATTAAGTTGGATCAGTCGTTGCTGTTGTGCAGCG
TTTGTGAAACAACGTACCTTGTTGAATCTTGAGCCTTTGTGATTTATAAAACATATTTGT
GG

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL3433Contig1 1234 2 4 U
ATAAATCTTCCTTTGCTATTCATACAAGACACAGAAGGACCACGCATATCCTTATTAAAA
CAAACATAAACGTGCATATTCTTTAGATCTTGAGGTATAGTAATCCAGAGGTACCATCGA
AACCTTTGGATCTGTAGAACTTTGAATACTCTGTGATGGTGGTGTCTCTATAAATGGGAG
GGTTTTGTTCAGACAAAAGCTCTTTGATAGGTCCATAAACTCTAGGATTCTCCATCCAAT
ACGAACTGAAGAAGCACGCCACTGAGATGCGCGGTCCAGCTACTTTAGCCAAAACACGAT
GTTCCACGCTTATGAACTTGCCGTTTGTAATAAGCTGCACAAATACCCAATAACAGTAAA
AGCATTGATCACGCTAAAAAGGGGTGGGTTAGTTAGTTAACCTGGAGAAGGTCTCCAACG
TTGACGACAAGAGCTCCAGGGACATGAGGAACATCAACCCAGTATTGGTCATGGAGAACT
TGTAGCCCTCCGATGTGATCTTGAAGAAGAACCGTGAGAAAAGAGTTGTCCGAGTGACTG
GTTAACCCTAGAGCTAAGTCGGGTTGAGGACAAGGCGGGTAATAATGGCCGATTAGCAGT
AATGATTTGGTGCAGTCCATGTCCTTGAGGTGATTAGTGTTTAACCCTAGAGCTTCTGAG
AGAAGCTCAAAGAGCATTTTGCCTACTTTCATCACTTCCTTTGAGTACTCAATCATCACC
TCCCCACAAGCGGCTGGCAAGTCTTCCGGTCTAGGAGGATCTGGAGCCGTGAAACAAACT
AGCGTATCTCTCCAGTTAGTAGACGGTGCGTTGTACAGATCGAAGTTGCTCATGTAACCC
ACATTGCTACTCGTATCTCGAGAGTAGAACCCTTTCCTCACTTCCGGGTCTCGCTCGTGA
AACTCACGAACCCCTTCTATCATCCTCTCCATCGCATCTAGCGGGATACCGTGGTTGATC
ACCTGGAAGAAGCCCCATCTCTCGGCCGCGTCTCCGATCTTCTCCACCAGGTTCCGCCGC
GAGGTGGTAGAGTCCGTGCTGCTGCCTCCTTGGAGATCGATTGTTGGGATGGTGAACTGC
GATGATGAAGGTGGCTTTGGGGCTTTTATAGTAGCGGGAGGTGCATGGAAGATGGCGGGA
ATCTCGGAGACTCCGCTGAGTTGAACGATCAAAGGCAACAGTGGCCGTAGACTCCATTGT
TGTTTTTTGTTTTTTTTGTTTTTCTCGTGTATCC


BQ
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AF RS1B113JQ U 1
AF RS1A514TF C 509
BS 1 553 RS1B113JQ
BS 554 554 RS1A514TF
BS 555 681 RS1B113JQ
BS 682 1234 RS1A514TF

RD RS1B113JQ 681 0 0
ATAAATCTTCCTTTGCTATTCATACAAGACACAGAAGGACCACGCATATCCTTATTAAAA
CAAACATAAACGTGCATATTCTTTAGATCTTGAGGTATAGTAATCCAGAGGTACCATCGA
AACCTTTGGATCTGTAGAACTTTGAATACTCTGTGATGGTGGTGTCTCTATAAATGGGAG
GGTTTTGTTCAGACAAAAGCTCTTTGATAGGTCCATAAACTCTAGGATTCTCCATCCAAT
ACGAACTGAAGAAGCACGCCACTGAGATGCGCGGTCCAGCTACTTTAGCCAAAACACGAT
GTTCCACGCTTATGAACTTGCCGTTTGTAATAAGCTGCACAAATACCCAATAACAGTAAA
AGCATTGATCACGCTAAAAAGGGGTGGGTTAGTTAGTTAACCTGGAGAAGGTCTCCAACG
TTGACGACAAGAGCTCCAGGGACATGAGGAACATCAACCCAGTATTGGTCATGGAGAACT
TGTAGCCCTCCGATGTGATCTTGAAGAAGAACCGTGAGAAAAGAGTTGTCCGAGTGACTG
GTTAACCCTAGAGTTAAGTCGGGTTGAGGACAAGGCGGGTAATAATGGCCGATTAGCAGT
AATGATTTGGTGCAGTCCATGTCCTTGAGGTGATTAGTGTTTAACCCTAGAGCTTCTGAG
AGAAGCTCAAAGAGCATTTTG

QA 1 681 1 681
DS 

RD RS1A514TF 726 0 0
G
AACCGTGAGAAAAGAGTTGTCCGAGTGACTGGTTAACCCTAGAGCTAAGTCGGGTTGAGG
ACAAGGCGGGTAATAATGGCCGATTAGCAGTAATGATTTGGTGCAGTCCATGTCCTTGAG
GTGATTAGTGTTTAACCCTAGAGCTTCTGAGAGAAGCTCAAAGAGCATTTTGCCTACTTT
CATCACTTCCTTTGAGTACTCAATCATCACCTCCCCACAAGCGGCTGGCAAGTCTTCCGG
TCTAGGAGGATCTGGAGCCGTGAAACAAACTAGCGTATCTCTCCAGTTAGTAGACGGTGC
GTTGTACAGATCGAAGTTGCTCATGTAACCCACATTGCTACTCGTATCTCGAGAGTAGAA
CCCTTTCCTCACTTCCGGGTCTCGCTCGTGAAACTCACGAACCCCTTCTATCATCCTCTC
CATCGCATCTAGCGGGATACCGTGGTTGATCACCTGGAAGAAGCCCCATCTCTCGGCCGC
GTCTCCGATCTTCTCCACCAGGTTCCGCCGCGAGGTGGTAGAGTCCGTGCTGCTGCCTCC
TTGGAGATCGATTGTTGGGATGGTGAACTGCGATGATGAAGGTGGCTTTGGGGCTTTTAT
AGTAGCGGGAGGTGCATGGAAGATGGCGGGAATCTCGGAGACTCCGCTGAGTTGAACGAT
CAAAGGCAACAGTGGCCGTAGACTCCATTGTTGTTTTTTGTTTTTTTTGTTTTTCTCGTG
TATCC

QA 2 726 2 726
DS 



AS 1 3

CO CL3434Contig1 787 3 6 U
GATTGCAAGCTTGCGCGCATAACCCCACTGGAGTTGATCCAACACTCGAGCAATGGGAAC
AGATTCGGCAAGTAGTGAGATCTAAAAGCTTATTACCCTTCTTTGATAATGCATATCAGG
GTTTTGCTAGTGGTAACCTTGAATCAGATGCACAAGCGGTTCGTATGTTTGTTGCTGATG
GAGGTGAATGTTTGATAGCTCAAAGTTTTGCCAAAAATATGGGTCTTTATGGAGATCGTA
TTGGCGCTCTTACAATTGTATGCACCTCAGAAGATGTGGCTAGGAAAGTAAAGAGCCAAC
TGCTACTTGTTGTGAGACCTATGTATCTTAGCCCACCTATTCATGGAGCATCCATCGTTA
CCACAATTCTTAAAAATAGTGATTTGTACAATGACTGGACGGTTGAGCTGAAAGGAATGG
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CTGGTGACTGGAGTCATATTATCAGACAGATTGGGATGTTTAGTTTTACGGGGTTGAATG
AGAAGCAAGTTCGCTTCATAGCCAAAGAGTATCACATTTACATGATTCATAACGGGAGGG
TAAGCATTGCAGGTCTAAGTTCTAAGACAGTTTCCCAACTCGCTGATGCTATACATGCTG
CAGTTACCCGTGTGTCCTAATCTAGCGATTGTGCTCTTTGTTGTCTTATGAGAAAAAAAG
AGTTCTTGACTTCTTGTGTACATTTCATAAGCGAAACAATAAAGCATATATAATGTAACG
TATAATA


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1H377TF U 1
AF RS1H377JQB C 60
AF RS1AW50TF U 252
BS 1 612 RS1H377TF
BS 613 613 RS1AW50TF
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BS 703 714 RS1H377TF
BS 715 787 RS1AW50TF

RD RS1H377TF 714 0 0
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AGATTCGGCAAGTAGTGAGATCTAAAAGCTTATTACCCTTCTTTGATAATGCATATCAGG
GTTTTGCTAGTGGTAACCTTGAATCAGATGCACAAGCGGTTCGTATGTTTGTTGCTGATG
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TTGGCGCTCTTACAATTGTATGCACCTCAGAAGATGTGGCTAGGAAAGTAAAGAGCCAAC
TGCTACTTGTTGTGAGACCTATGTATCTTAGCCCACCTATTCATGGAGCATCCATCGTTA
CCACAATTCTTAAAAATAGTGATTTGTACAATGACTGGACGGTTGAGCTGAAAGGAATGG
CTAACCGCATACTTAGCATGCGAAAACAGTTATATGAAGCTTTTCAAGCTAGAGGCACAC
CTGGTGACTGGAGTCATATTATCAGACAGATTGGGATGTTTAGTTTTACGGGGTTGAATG
AGAAGCAAGTTCGCTTCATAGCCAAAGAGTATCACATTTACATGATTCATAACGGGAGGG
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CAGTTACCCGTGTGTCCTAATCTAGCGATTGTGCTCTTTGT*GTCTTATGAGAA

QA 1 714 1 714
DS 

RD RS1H377JQB 728 0 0
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GGTTTTGCTAGTGGTAACCTTGAATCAGATGCACAAGCGGTTCGTATGTTTGTTGCTGAT
GGAGGTGAATGTTTGATAGCTCAAAGTTTTGCCAAAAATATGGGTCTTTATGGAGATCGT
ATTGGCGCTCTTACAATTGTATGCACCTCAGAAGATGTGGCTAGGAAAGTAAAGAGCCAA
CTGCTACTTGTTGTGAGACCTATGTATCTTAGCCCACCTATTCATGGAGCATCCATCGTT
ACCACAATTCTTAAAAATAGTGATTTGTACAATGACTGGACGGTTGAGCTGAAAGGAATG
GCTAACCGCATACTTAGCATGCGAAAACAGTTATATGAAGCTTTTCAAGCTAGAGGCACA
CCTGGTGACTGGAGTCATATTATCAGACAGATTGGGATGTTTAGTTTTACGGGGTTGAAT
GAGAAGCAAGTTCGCTTCATAGCCAAAGAGTATCACATTTACATGATTCATAACGGGAGG
GTAAGCATTGCAGGTCTAAGTTTTAAGACAGTTTCCCAACTCGCTGATGCTATACATGCT
GCAGTTACCCGTGTGTCCTAATCTAGCGATTGTGCTCTTTGTTGTCTTATGAGAAAAAAA
GAGTTCTTGACTTCTTGTGTACATTTCATAAGCGAAACAATAAAGCATATATAATGTAAC
GTATAATA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1AW50TF 536 0 0
ACAATTGTATGCACCTCAGAAGATGTGGCTAGGAAAGTAAAGAGTCAACTGCTACTTGTT
GTGAGACCTATGTATCTTAGCCCACCTATTCATGGAGCATCCATCGTTACCACAATTCTT
AAAAATAGTGATTTGTACAATGACTGGACGGTTGAGCTGAAAGGAATGGCTAACCGCATA
CTTAGCATGCGAAAACAGTTATATGAAGCTTTTCAAGCTAGAGGCACACCTGGTGACTGG
AGTCATATTATCAGACAGATTGGGATGTTTAGTTTTACGGGGTTGAATGAGAAGCAAGTT
CGCTTCATAGCCAAAGAGTATCACATTTACATGATTCATAACGGGAGGGTAAGCATTGCA
GGTCTAAGTTCTAAGACAGTTTCCCAACTCGCTGATGCTATACATGCTGCAGTTACCCGT
GTGTCCTAATCTAGCGATTGTGCTCTTTGTTGTCTTATGAGAAAAAAAGAGTTCTTGACT
TCTTGTGTACATTTCATAAGCGAAACAATAAAGCATATATAATGTAACGTATAATA

QA 1 536 1 536
DS 



AS 1 3

CO CL3435Contig1 881 3 2 U
GTTTACCGGTTTCGAGCAACAACAGAGGCAGGGTATCGCCTTACCCGCTTCGCTCTTGTC
GGAGCAAGAAACAAAAAGAAGCCGAGTCATCATCATCACCTCTGGAGTCAGAGAGTGTGA
GTGAATGGGAGGACGTCAGGTGTGTGATCTGCATGGAGCCGCCACACAATGCCGTCCTCT
TGCAGTGCTCTTCCTTCTCCAAAGGATGCCGTGCTTACATGTGCGACACAAGCGCCCGCC
ACTCCAACTGCTTCAAGCAGTACCGCAGAAACAACGACAAGAGCACAAGCCGCTGCTGCA
GTCTCAGGGCCCTTAACTGTCCCTACTGCAGAGGAGAGGTTTACGGGACGGTGAAGTCTA
CGTGCGCGCGGAGATTCATGAACGCGAGACCCAGGTGCTGTTCTATGGACAAGTGTGGTT
TCTCTGGGACCTATTCTCAGCTGAAGAGTCACTTGAAAGCTGAGCATCCGGGTTTTACAC
CTCCGAAAGTGGACCCTCTGGAGAAACGCAAGTGGGAGGACCTGGAAAGAGCGGAGTTTA
TCGAGATTATCAACGCTCGTCATAGATGGGAATCGGAACAGAGATCTCTTTATCAGCTTC
CACACCACCATCCCTTGATCGATCTCAACTTTGATGCTTTCATGCACAATCTTTTTGCTG
GTGTAAGGGGCCAAGCAAGTGGTGACAATACTCGCATGCCCCGATCAGAGTTCCATGGTA
TCAGAGGGACTCCGTGATGATTATTCCAAGTGCCTAGTCCAAGTTTTGATTTTTATCCAT
ACTGTACTCTTAATTGTTTTAGGTTTTTATAGTGACATCAGCTCTTGTTGTAGGCATACC
TTGCATTGTCTGTATTTATGTTTCAGTTAGTCAAGTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1A191TF U 124
AF RS1A191TV U 1
AF RS1A191JQ C 84
BS 1 796 RS1A191TV
BS 797 881 RS1A191JQ

RD RS1A191TF 539 0 0
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AGTGCTCTTCCTTCTCCAAAGGATGCCGTGCTTACATGTGCGACACAAGCGCCCGCCACT
CCAACTGCTTCAAGCAGTACCGCAGAAACAACGACAAGAGCACAAGCCGCTGCTGCAGTC
TCAGGGCCCTTAACTGTCCCTACTGCAGAGGAGAGGTTTACGGGACGGTGAAGTCTACGT
GCGCGCGGAGATTCATGAACGCGAGACCCAGGTGCTGTTCTATGGACAAGTGTGGTTTCT
CTGGGACCTATTCTCAGCTGAAGAGTCACTTGAAAGCTGAGCATCCGGGTTTTACACCTC
CGAAAGTGGACCCTCTGGAGAAACGCAAGTGGGAGGACCTGGAAAGAGCGGAGTTTATCG
AGATTATCAACGCTCGTCATAGATGGGAATCGGAACAGAGATCTCTTTATCAGCTTCCAC
ACCACCATCCCTTGATCGATCTCAACTTTGATGCTTTCATGCACAATCTTTTTGCTGGT

QA 1 539 1 539
DS 

RD RS1A191TV 796 0 0
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GGAGCAAGAAACAAAAAGAAGCCGAGTCATCATCATCACCTCTGGAGTCAGAGAGTGTGA
GTGAATGGGAGGACGTCAGGTGTGTGATCTGCATGGAGCCGCCACACAATGCCGTCCTCT
TGCAGTGCTCTTCCTTCTCCAAAGGATGCCGTGCTTACATGTGCGACACAAGCGCCCGCC
ACTCCAACTGCTTCAAGCAGTACCGCAGAAACAACGACAAGAGCACAAGCCGCTGCTGCA
GTCTCAGGGCCCTTAACTGTCCCTACTGCAGAGGAGAGGTTTACGGGACGGTGAAGTCTA
CGTGCGCGCGGAGATTCATGAACGCGAGACCCAGGTGCTGTTCTATGGACAAGTGTGGTT
TCTCTGGGACCTATTCTCAGCTGAAGAGTCACTTGAAAGCTGAGCATCCGGGTTTTACAC
CTCCGAAAGTGGACCCTCTGGAGAAACGCAAGTGGGAGGACCTGGAAAGAGCGGAGTTTA
TCGAGATTATCAACGCTCGTCATAGATGGGAATCGGAACAGAGATCTCTTTATCAGCTTC
CACACCACCATCCCTTGATCGATCTCAACTTTGATGCTTTCATGCACAATCTTTTTGCTG
GTGTAAGGGGCCAAGCAAGTGGTGACAATACTCGCATGCCCCGATCAGAGTTCCATGGTA
TCAGAGGGACTCCGTGATGATTATTCCAAGTGCCTAGTCCAAGTTTTGATTTTTATCCAT
ACTGTACTCTTAATTG

QA 1 796 1 796
DS 

RD RS1A191JQ 798 0 0
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GTGATCTGCATGGAGCCGCCACACAATGCCGTCCTCTTGCAGTGCTCTTCCTTCTCCAAA
GGATGCCGTGCTTACATGTGCGACACAAGCGCCCGCCACTCCAACTGCTTCAAGCAGTAC
CGCAGAAACAACGACAAGAGCACAAGCCGCTGCTGCAGTCTCAGGGCCCTTAACTGTCCC
TACTGCAGAGGAGAGGTTTACGGGACGGTGAAGTCTACGTGCGCGCGGAGATTCATGAAC
GCGAGACCCAGGTGCTGTTCTATGGACAAGTGTGGTTTCTCTGGGACCTATTCTCAGCTG
AAGAGTCACTTGAAAGCTGAGCATCCGGGTTTTACACCTCCGAAAGTGGACCCTCTGGAG
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AGATGGGAATCGGAACAGAGATCTCTTTATCAGCTTCCACACCACCATCCCTTGATCGAT
CTCAACTTTGATGCTTTCATGCACAATCTTTTTGCTGGTGTAAGGGGCCAAGCAAGTGGT
GACAATACTCGCATGCCCCGATCAGAGTTCCATGGTATCAGAGGGACTCCGTGATGATTA
TTCCAAGTGCCTAGTCCAAGTTTTGATTTTTATCCATACTGTACTCTTAATTGTTTTAGG
TTTTTATAGTGACATCAGCTCTTGTTGTAGGCATACCTTGCATTGTCTGTATTTATGTTT
CAGTTAGTCAAGTGTTCC

QA 1 798 1 798
DS 



AS 1 3

CO CL3436Contig1 1221 3 13 U
AGTCAAACCAAACAAAGCAAACCCGTGAGAATCTCTCAAATAACCAAATCGAGTGGAACA
TAGTTTTAGCAAAGCATTGAAACAATAATTAGGAAAGAGATTCGAAATGTTCTTCAAGAC
GATCCTTTTAATAGTTTTTTTTCCTTATTTGCTACAAATCCCAACACCGATTCAAAGAAA
ACAGAAAACAAATGAAAGATTTTAAAGCAAAACCAGGCAAAAAGACTAGTCCAAAAGATT
AAAAAACCAAGGAGATGAAAAAACAAAGCTACCCCCTCCTCAAGGGCCTCATTTGGATGC
TTGATTCTTCTCAAGGCTTGAGAGCGAGAGCAAACCCAACCTTGGCACTCTTCTCGATGG
CCCTAGAGTCAACCTCTCCAAAAATGGTGACGAACGACTTTGGACGCCACTGGTGTTGGA
TCAAAGCGTTGGCTAAACCATCATTGTTCACACGTGCCTTCACTGTAGTCAATGGGTCAA
GAGCATGCTGAGCACCAACGGTTATGGCGTTCTTTTGGGTAGTGAAGCTGTACGTAACCT
CAGCTCCAACCACTGTGTTGCTCGACGGGTTCACGGTGTGGTAGTACGACCCATTCAGTT
TGTCACCCTTGTCATTCAGAGTAAGAGAAGCAATCAAATCGTCCTTGGTGAAACTGAAAC
CAGCATTGAAATGCTTGAAATCGCCGGACTGGGTGTTGAAGGAAACATCGGTACCAAGAG
CCAAGACGTTGTTTCCAACCACACCGGAGAAATTGACAATGGGGCTAGCTGTCAAACCAA
CACTGGTGTAGATACCAGCATAGTCGTGCAGATACTGGAGCTCAACCTTGCCGGATTTCT
GATCAGGCACCTTGGCGCTGACAATTGCCTTCAGTCCAGGGGCGGCCTCATCATAGGTGA
AAGTGGTCAGCAGAGAAGAGTCAGTGGCGACTTTGATATCAGCAGTGAAGTTCTTGTTCT
TGACTTGGGTAGATACATCACCCACAAACAAATCTCCCTTGTTTGTTCCAGTGGTAGTGA
TTGCAACACCGGTGGAAGAGTAGGTGGTGATGCTGAGTTTCTGGTCTCCTTGGTAGTCCT
TGTACAGAAGATCTCTGGCCTTTTTGCCGATTTCGGTGTAGAGTCCTGGACCTTTAACCA
TGATGATTGTTTCTTTAGGGGGAAAGCTGTTGCAGCAGTATACGAATCGGAGCAGAGCAG
AGAGGAGTGACGATGGCGTCC


BQ
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AF RS1F847TF C 468
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AGAAAACCAAGGAGATGAAAAAACTAAGCTACCCCCTCCTCAAGGGCCTCATTTGGATGC
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DS 

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TTCTTCAAGACGATCCTTTTAATAGTTTTTTTTTCTTATTTGCTACAAATCCCAACACCG
ATTCAAAGAAAACAGAAAACAAATGAAAGATTTTAAAGCAAAACCAGGCAAAAAGATTAG
TCCAAAAGATTAAAAAACCAAGGAGATGAAAAAACAAAGCTACCCCCTCCTCAAGGGCCT
CATTTGGATGCTTGATTCTTCTCAAGGCTTGAGAGCGAGAGCAAACCCAACCTTGGCACT
CTTCTCGATGGCCCTAGAGTCAACCTCTCCAAAAATGGTGATGAACGACTTTGGACGCCA
CTGGTGTTGGATCAAAGCGTTGGCTAAACCATCATTGTTCACACGTGCCTTCACTGTAGT
CAATGGGTCAAGAGCATGCTGAGCACCAACGGTTATGGCGTTCTTTTGGGTAGTGAAGCT
GTACGTAACCTCAGCTCCAACCACTGTGTTGCTCGACGGGTTCACGGTGTGGTAGTACGA
CCCATTC

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DS 

RD RS1F847TF 754 0 0
GTCAATGGGTCAAGAGCATGCTGAGCACCAACGGTTATGGCGTTCTTTTGGGTAGTGAAG
CTGTACGTAAC*TCAGCTCCAACCACTGTGTTGCTCGACGGGTTCACGGTGTGGTAGTAC
GACGCATTCAGTTTGTCACCCTTGTCATTCAGAGTAAGAGAAGCAATCAAATCGTCCTTG
GTGAAACTGAAACCAGCATTGAAATGCTTGAAATCGCCGGACTGGGTGTTGAAGGAAACA
TCGGTACCAAGAGCCAAGACGTTGTTTCCAACCACACCGGAGAAATTGACAATGGGGCTA
GCTGTCAAACCAACACTGGTGTAGATACCAGCATAGTCGTGCAGATACTGGAGCTCAACC
TTGCCGGATTTCTGATCAGGCACCTTGGCGCTGACAATTGCCTTCAGTCCAGGGGCGGCC
TCATCATAGGTGAAAGTGGTCAGCAGAGAAGAGTCAGTGGCGACTTTGATATCAGCAGTG
AAGTTCTTGTTCTTGACTTGGGTAGATACATCACCCACAAACAAATCTCCCTTGTTTGTT
CCAGTGGTAGTGATTGCAACACCGGTGGAAGAGTAGGTGGTGATGCTGAGTTTCTGGTCT
CCTTGGTAGTCCTTGTACAGAAGATCTCTGGCCTTTTTGCCGATTTCGGTGTAGAGTCCT
GGACCTTTAACCATGATGATTGTTTCTTTAGGGGGAAAGCTGTTGCAGCAGTATACGAAT
CGGAGCAGAGCAGAGAGGAGTGACGATGGCGTCC

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 3

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CCACAAAGCTAATTATATAACTTCGTTTAGTATAGTAAAACCATTGCATGAACCTATCAG
CTTTATACAATACAGTAGCAGCTGGGCCATGTTCTCTAAGGTATATAAATTATATGATGA
TAAAATTAAAAAATATGAGATATCCGCAACATTCTCTAAGCAGAGCATTTGTTCAGGACA
ACAGTTTCAATAGGAATCTTATCAACAGGAAAAGCACAGTCAATGGGAGATTTCTCCGGT
AACAAGCTACACGGTTTTGGCGTCACCTTGCTCGAAATTCCGGAAATGGCCGTACAATTC
CACAGCAACTTCTTGGGCTCAGCAGCCAAAGCAATGTTTATATTCGACATACATATCTTT
GTGAAAGGATCGTTGGTGAACCCGTCGAGCCTAGCGGGCTGCGTAACGTTATCTGCGGTC
ATGTCACGGTAATTAATATTCGTAATCTCGGGCATAGCCTTGGGGTCATAACCCGAAGCA
GGGTGTTGGTTATAGGCACCACTCATCCAGAAAACGTATTTCATTGTCTTCATTGTGAAC
CTTCGAGCAAAGATATCTTTAACGTAACCTCCACGACCAACAGCTGTTTTGATTCGGATA
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ATTTCACTTCCCAGTGCTATTCCAGCACTGTCGGGAGAGATGCATGTGAGCCTTCGGATA
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GCGATGCAATCGTCTCCGGAGACTACGAAACAGTCTTCGATCAATGTGTTGGTGCATGAA
TCAGGGTTGATTCCATCGGTATTAGGAGAATCGATAGGAGCGAGAATGGTAACACCTTTA
ACGATGACGTTAGTGCAATACACTGGATGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FW66JQ U 1
AF RS1CL56JQ U 29
AF RS1FW66TF C 295
BS 1 179 RS1FW66JQ
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BS 800 840 RS1CL56JQ
BS 841 930 RS1FW66TF

RD RS1FW66JQ 568 0 0
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CTTTATACAATACAGTAGCAGCTGGGCCATGTTCTCTAAGGTATATAAATTATATGATGA
TAAAATTAAAAAATATGAGATATCCGCAACATTCTCTAAGCAGAGCATTTGTTCAGGACG
ACAGTTTTAATAGGAATCTTATCAACAGGAAAAGCACAGTCAATGGGAGATTTCTCCGGT
AACAAGCTACACGGTTTTGGCGTCACCTTGCTCGAAATTCCGGAAATGGCCGTACAATTC
CACAGCAACTTCTTGGGCTCAGCAGCCAAAGCAATGTTTATATTCGACATACATATCTTT
GTGAAAGGATCGTTGGTGAACCCGTCGAGCCTAGCGGGCTGCGTAACGTTATCTGCGGTC
ATGTCACGGTAATTAATATTCGTAATCTCGGGCATAGCCTTGGGGTCATAACCCGAAGCA
GGGTGTTGGTTATAGGCACCACTCATCCAGAAAACGTATTTCATTGTCTTCATTGTGAAC
CTTCGAGCAAAGATATCTTTAACGTAAC

QA 1 568 1 568
DS 

RD RS1CL56JQ 812 0 0
G
GTATAGTAAAACCATTGCATGAACCTATCAGCTTTATACAATACAGTAGCAGCTGGGCCA
TGTTCTCTAAGGTATATAAATTATATGATGATAAAATTAAAAAATATGAGATATCCGCAA
CATTCTCTAAGCAGAGCATTTGTTCAGGACAACAGTTTCAATAGGAATCTTATCAACAGG
AAAAGCACAGTCAATGGGAGATTTCTCCGGTAACAAGCTACACGGTTTTGGCGTCACCTT
GCTCGAAATTCCGGAGATGGCCGTACAATTCCACAGCAACTTCTTGGGCTCAGCAGCCAA
AGCAATGTTTATATTCGACATACATATCTTTGTGAAAGGATCGTTGGTGAACCCGTCGAG
CCTAGTGGGCTGCGTAACGTTATCCGCGGTCATGTCACGGTAATTAATATTCGTAATCTC
GGGCATAGCCTTGGGGTCATAACCCGAAGCAGGGTGTTGGTTATAGGCACCACTCATCCA
GAAAACGTATTTCATTGTCTTCATTGTGAACCTTCGAGCAAAGATATCTTTAACGTAACC
TCCACGACCAACAGCTGTTTTGATTCGGATAGGGGATTGTGTCTGAAGCAACGTTATGTC
TTCCATCCTAACGTCTTTGATCCCACCGGACATTTCACTTCCCAGTGCTATTCCAGCACT
GTCGGGAGAGATGCATGTGGGCCTTCGGATAGAGAGTTGCTGAGTTGGCATTCCGACTTT
GATACCGAACTGATCCCAACCGCTCTTGACGGCGATGCAATCGTCTCCG*AGACTACGAA
ACAGTCTTCGATCAATGTGTTGGTGCATGAA

QA 2 812 2 812
DS 

RD RS1FW66TF 636 0 0
CAATTCCACAGCAACTTCTTGGGCTCAGCAGCCAAAGCAATGTTTATATTCGACATACAT
ATCTTTGTGAAAGGATCGTTGGTGAACCCGTCGAGCCTAGCGGGCTGCGTAACGTTATCT
GCGGTCATGTCACGGTAATTAATATTCGTAATCTCGGGCATAGCCTTGGGGTCATAACCC
GAAGCAGGGTGTTGGTTATAGGCACCACTCATCCAGAAAACGTATTTCATTGTCTTCATT
GTGAACCTTCGAGCAAAGATATCTTTAACGTAACCTCCACGACCAACAGCTGTTTTGATT
CGGATAGCGGATTGTGTCTGAAGCAACGTTATGTCTTCCATCCTAACGTCTTTGATCCCA
CCGGACATTTCACTTCCCAGTGCTATTCCAGCACTGTCGGGAGAGATGCATGTGAGCCTT
CGGATAGAGAGTTGCTGAGTTGGCATTCCGACTTTGATACCGAACTGATACCAACCGCTC
TTGACGGCGATGCAATCGTCTCCGGAGACTACGAAACAGTCTTCGATCAATGTGTTGGTG
CATGAATCAGGGTTGATTCCATCGGTATTAGGAGAATCGATAGGAGCGAGAATGGTAACA
CCTTTAACGATGACGTTAGTGCAATACACTGGATGC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 3

CO CL3438Contig1 738 3 3 U
GTCTGTTCAAAAAATTCATTTAGATCAATTTTATTAAACATATCCACGTACACCGTCATA
TACGAGATTATACACATTAATAATCATGAAACATTATTCCATTTTTAAAGATCGTTCTGA
TATAAATCACTTCACACCTTTCAGAATCACCTCAGGTTCCAAACGAAGGATTTCTTGATC
AGAAAGTAACTTTGACATCTCTTCCTCCGGCAAAGTCACTGAAACTGTCCTCCCAAACCC
TTTCTCCGGCGACGGTATAACCATGATCACACCTTCTCCGCCGTCGTTTCCAATCCGGTA
ACTCACGTGCATAGGCTTAACACCCTCCTCAAACACGGCCTGGTACATCAACGGCTCTCC
TTCCACGATCATATGTTCCATGTTAACAATCGTCAGGTCCTTACCATACATCTTCCCTTG
GTACCTAGCCCGTTTCAGACCGAACCTGATTTTCTCCACGTTCAGACTCGACACACGTTC
GTTCAGTAAACGTGCCACGTGTCCTACCCCTACGTCCACCACGTTAGTCATCTCAAGAGA
CGAAAAGTTCAAAGCATTACCGAAGAAACCGTAAGGAAGCGGATTAGGCAAGAGCCTCCT
GAAGTCCACACATAAGCAAACTCGATCACTCTTGTCCTTCGCTAGAGAGACACGTGTCCA
GAAAAGAGCGGCGAACACATCAAACGGCGTCGCTTTGGGGGATATCTCGTGGATGGAGTG
TTCCTTGACACATCTCGT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EM90TF C 2
AF RS1CS43JQ U 39
AF RS1GS04JQ U 1
BS 1 475 RS1GS04JQ
BS 476 476 RS1CS43JQ
BS 477 738 RS1GS04JQ

RD RS1EM90TF 462 0 0
TCTGTTCAAAAAATTCATTTAGATCAATTTTATTAAACATATCCACGTACACCGTCATAT
ACGAGATTATACACATTAATAATCATGAAACATTATTCCATTTTTAAAGATCGTTCTGAT
ATAAATCACTTCACACCTTTCAGAATCACCTCAGGTTCCAAACGAAGGATTTCTTGATCA
GAAAGTAACTTTGACATTTCTTCCTCCGGCAAAGTCACTGAAACTGTCCTCCCAAACCCT
TTCTCCGGCGACGGTATAACCATGATCACACCTTCTCCGCTGTCGTTTCCAATCCGGTAA
CTCACGTGCATAGGCTTAACACCCTCCTCAAACACGGCCTGGTACATCAACGGCTCTCCT
TCCACGATCATATGTTCCATGTTAACAATCGTCAGGTCCTTACCATACATCTTCCCTTGG
TACCTAGCCCGTTTCAGACCGAACCTGATTTTCTCCACGTTC

QA 1 462 1 462
DS 

RD RS1CS43JQ 611 0 0
CATATCCACGTACACCGTCATATACGAGATTATACACATTAATAATCATGAAACATTATT
CCATTTTTAAAGATCGTTCTGATATAAATCACTTCACACCTTTCAGAATCACCTCAGGTT
CCAAACGAAGGATTTCTTGATCAGAAAGTAACTTTGACATCTCTTCCTCCGGCAAAGTCA
CTGAAACTGTCCTCCCAAACCCTTTCTCCGGCGACGGTATAACCATGATCACACCTTCTC
CGCCGTCGTTTCCAATCCGGTAACTCACGTGCATAGGCTTAACACCCTCCTCAAACACGG
CCTGGTACATCAACGGCTCTCCTTCCACGATCATATGTTCCATGTTAACAATCGTCAGGT
CCTTACCATACATCTTCCCTTGGTACCTAGCCCGTTTCAGACCGAACCTGATTTTCTCCA
CGTTCAGACTCGACACACGTTCGTTCAGTAAACGTGCCACGTGTCCTACCCCTACGTCCA
CCACGTTAGTCATCTCAAGAGACGAAAAGTTCAAAGCATTACCGAAGAAACCGTAAGGAA
GCGGATTAGGCAAGAGCCTCCTGAAGTCCACACATAAGCAAACTCGATCACTCTTGTCCT
TCGCTAGAGAG

QA 1 611 1 611
DS 

RD RS1GS04JQ 738 0 0
GTCTGTTCAAAAAATTCATTTAGATCAATTTTATTAAACATATCCACGTACACCGTCATA
TACGAGATTATACACATTAATAATCATGAAACATTATTCCATTTTTAAAGATCGTTCTGA
TATAAATCACTTCACACCTTTCAGAATCACCTCAGGTTCCAAACGAAGGATTTCTTGATC
AGAAAGTAACTTTGACATCTCTTCCTCCGGCAAAGTCACTGAAACTGTCCTCCCAAACCC
TTTCTCCGGCGACGGTATAACCATGATCACACCTTCTCCGCCGTCGTTTCCAATCCGGTA
ACTCACGTGCATAGGCTTAACACCCTCCTCAAACACGGCCTGGTACATCAACGGCTCTCC
TTCCACGATCATATGTTCCATGTTAACAATCGTCAGGTCCTTACCATACATCTTCCCTTG
GTACCTAGCCCGTTTCAGACCGAACCTGATTTTCTCCACGTTCAGACTCGACACATGTTC
GTTCAGTAAACGTGCCACGTGTCCTACCCCTACGTCCACCACGTTAGTCATCTCAAGAGA
CGAAAAGTTCAAAGCATTACCGAAGAAACCGTAAGGAAGCGGATTAGGCAAGAGCCTCCT
GAAGTCCACACATAAGCAAACTCGATCACTCTTGTCCTTCGCTAGAGAGACACGTGTCCA
GAAAAGAGCGGCGAACACATCAAACGGCGTCGCTTTGGGGGATATCTCGTGGATGGAGTG
TTCCTTGACACATCTCGT

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 3

CO CL3439Contig1 1299 3 12 U
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AAAGAGTTGAGAGCTTAGCAAAGAGCGGAATCGAATCGATCCCAAAAGAATACATTCGTC
CAAAAGAAGAGCTCAAAAGCATCAACGACGTGTTCCAAGAAGAGAAGAAAGAAGACGGTC
CACAAGTCCCCACCATCGATCTCCAAGACATCGAGTCAGAAGACCAAACGATCCGTGAGA
AATGCATAGAGAAGCTCAAAAACGCGGCTATGGACTGGAGAGTGATGCATCTGATCAACC
ACGGTATACCTGTTGATCTAATGGAGCGTGTGAAGAAGTCAGGAGAAGAGTTCTTCGGTT
TTGCCCGAGGAAGAGAAGGAGAAGTACGCAAACGATCAAGCCAAGGGAAAGATTCAAGGG
TATGGAAGTAAATTAGC***CAACGCGAGTGGACAGCTTGAGTGGGAAGATTACTTCTTC
CATCTT*GTTTACCCTGAAGACAAGAGAGATCTATCTCTGTGGCCTAAGACACCAACTGA
TTACATTGAAGCGACGAGCGAGTACGCCAAGTGTCTTCGTTTGCTAGCAACAAAAGTCTT
CAAGGCCCTCTCTATCGGTCTAGGCTTAGAGCCTGACCGTCTTGAGAAAGAAGTTGGTGG
CTTAGAAGAGCTTCTCCTCCAGATGAAGATAAACTATTACCCGAAATGCCCTCAGCCTGA
GCTAGCACTTGGCGTGGAAGCTCACACCGATGTAAGCGCTTTGACCTTCATTCTACACAA
CATGGTTCCTGGTTTGCAGCTGTTCTACGAGGGTAAATGGGTCATTGCCAAATGCGTTCC
TGATTCGGTTGTCATGCATATTGGAGATACGTTGGAGATTCTTAGTAACGGGAAGTTCAA
GAGTATACTTCACCGTGGGTTGGTGAATAAGGAGAAGGTTAGGGTTTCTTGGGCTGTGTT
CTGTGAGCCACCAAAGGATAAGATTGTTCTTGAGCCGTTGCCGGAGATGGTGAGTGTTGA
ATCTCCGGCTAAGTTTCCTCCAAGGACGTTTGCTCAGCATATTGCGCATAAGCTGTTTAA
GAACGACCAAGAGGATTTGGTATCTGAGAAAAAGGATTTGGTGTCTGAGAAAAAGGATTA
AGTTTGAGTCATTATACAGCATGTGAAACTCTATGTTGGTGGTTTCTCTGTTATCTTATG
TTTGTGTATGTATCATGTCTTTGATGTGTGTCTTATTAAGATGTGAAGACATATTTATAT
GGATTGTGTCATTGTGGTATGTTAAAGCTTGTTTACTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1A554TF U 55
AF RS1H305TF U 1
AF RS1A554JQ C 372
BS 1 134 RS1H305TF
BS 135 135 RS1A554TF
BS 136 361 RS1H305TF
BS 362 362 RS1A554TF
BS 363 367 RS1H305TF
BS 368 368 RS1A554TF
BS 369 437 RS1H305TF
BS 438 440 RS1A554TF
BS 441 606 RS1H305TF
BS 607 607 RS1A554JQ
BS 608 707 RS1H305TF
BS 708 1299 RS1A554JQ

RD RS1A554TF 452 0 0
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TTCGTCCAAAAGAAGAGCTCAAAAGCATCAACGACGTGTTCCAAGAAGAGAAGAAAGAAG
ACGGTCCACAAGTCCCCACCATCGATCTCCAAGACATCGAGTCAGAAGACCAAACGATCC
GTGAGAAATGCATAGAGAAGCTCAAAAACGCGGCTATGGACTGGGGAGTGATGCATCTGA
TCAACCACGGTATACCTGTTGATCTAATGGAGCGTGTGAAGAAGTCAGGAGAAGAGTTCT
TCGGTTTTGCCCGAGGAAGAGAAGGAGAAGTACGCAAACGATCAAGCCAAGGGAAAGATT
CAAGGGTATGGAAGTAAATTAGC***CAACGCGAGTGGACAGCTTGAGTGGGAAGATTAC
TTCTTCCATCTTTGTTTACCCTGAAGACAAG
G

QA 1 451 1 451
DS 

RD RS1H305TF 707 0 0
GAACAAACCGAGAAGACAAAGACATTACAAGAAGTACAAACAAGAAGATGGTTGCCGTTG
AAAGAGTTGAGAGCTTAGCAAAGAGCGGAATCGAATCGATCCCAAAAGAATACATTCGTC
CAAAAGAAGAGCTCGAAAGCATCAACGACGTGTTCCAAGAAGAGAAGAAAGAAGACGGTC
CACAAGTCCCCACCATCGATCTCCAAGACATCGAGTCAGAAGACCAAACGATCCGTGAGA
AATGCATAGAGAAGCTCAAAAACGCGGCTATGGACTGGAGAGTGATGCATCTGATCAACC
ACGGTATACCTGTTGATCTAATGGAGCGTGTGAAGAAGTCAGGAGAAGAGTTCTTCGGTT
T*GCCCGTGGAAGAGAAGGAGAAGTACGCAAACGATCAAGCCAAGGGAAAGATTCAAGGG
TATGGAAGTAAATTAGCTAACAACGCGAGTGGACAGCTTGAGTGGGAAGATTACTTCTTC
CATCTT*GTTTACCCTGAAGACAAGAGAGATCTATCTCTGTGGCCTAAGACACCAACTGA
TTACATTGAAGCGACGAGCGAGTACGCCAAGTGTCTTCGTTTGCTAGCAACAAAAGTCTT
CAAGGCTCTCTCTATCGGTCTAGGCTTAGAGCCTGACCGTCTTGAGAAAGAAGTTGGTGG
CTTAGAAGAGCTTCTCCTCCAGATGAAGATAAACTATTACCCGAAAT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1A554JQ 928 0 0
AGAGAAGGAGAAGTACGCAAACGATCAAGCCAAGGGAAAGATTCAAGGGTATGGAAGTAA
ATTAGC***CAACGCGAGTGGACAGCTTGAGTGGGAAGATTACTTCTTCCATCTT*GTTT
ACCCTGAAGACAAGGGAGATCTATCTCTGTGGCCTAAGACACCAACTGATTACATTGAAG
CGACGAGCGAGTACGCCAAGTGTCTTCGTTTGCTAGCAACAAAAGTCTTCAAGGCCCTCT
CTATCGGTCTAGGCTTAGAGCCTGACCGTCTTGAGAAAGAAGTTGGTGGCTTAGAAGAGC
TTCTCCTCCAGATGAAGATAAACTATTACCCGAAATGCCCTCAGCCTGAGCTAGCACTTG
GCGTGGAAGCTCACACCGATGTAAGCGCTTTGACCTTCATTCTACACAACATGGTTCCTG
GTTTGCAGCTGTTCTACGAGGGTAAATGGGTCATTGCCAAATGCGTTCCTGATTCGGTTG
TCATGCATATTGGAGATACGTTGGAGATTCTTAGTAACGGGAAGTTCAAGAGTATACTTC
ACCGTGGGTTGGTGAATAAGGAGAAGGTTAGGGTTTCTTGGGCTGTGTTCTGTGAGCCAC
CAAAGGATAAGATTGTTCTTGAGCCGTTGCCGGAGATGGTGAGTGTTGAATCTCCGGCTA
AGTTTCCTCCAAGGACGTTTGCTCAGCATATTGCGCATAAGCTGTTTAAGAACGACCAAG
AGGATTTGGTATCTGAGAAAAAGGATTTGGTGTCTGAGAAAAAGGATTAAGTTTGAGTCA
TTATACAGCATGTGAAACTCTATGTTGGTGGTTTCTCTGTTATCTTATGTTTGTGTATGT
ATCATGTCTTTGATGTGTGTCTTATTAAGATGTGAAGACATATTTATATGGATTGTGTCA
TTGTGGTATGTTAAAGCTTGTTTACTTT

QA 1 928 1 928
DS 



AS 1 2

CO CL3440Contig1 1258 2 2 U
GGAGGTTTCGTGTTGTTCACAAACTTGTCGGAATCTCAACACCAAAAAAAACTTTCTTTA
TTGAAACAAAAACAAATATTCAAGGAAAGATGGCGCTCATAAATGGAAGCATGAACCTAT
CATCAATCAAAACGTCAATATACAACCACCGTCAGTCAAGCTTCTCCTCAACCGTACCAA
GAACCACAACCCTCCGTATCTCCGCCGTGCAAACCGACCCAAAACCACCAGCTTCCTCGG
CGGTAACGACGTCACCGTCGAAGTCCGTTGGAGTTAACGTGAGTAAATCTAAATGGGCAC
CCGAGAGCTGGAAGAAGAAGAAGGCTTTGCAGCAGCCGGAGTATCCTGACTTAGCTGAGC
TTGAAGCCGTGCTCGACACGATCGAATCTTTCCCTCCGATCGTTTTCGCCGGAGAAGCTA
GACTTCTTGAAGAGCGTTTAGGCCAAGCAGCAATGGGTGAAGCGTTTTTGCTACAAGGAG
GAGATTGTGCAGAGAGTTTCAAAGAGTTCAACGCTAACAACATTCGTGATACGTTTAGGA
TTCTTCTCCAGATGGGTGCTGTTTTGATGTTCGGTGGCCTAGTCCCCGTCGTCAAGGTTG
GAAGAATGGCGGGTCAGTTTGCGAAGCCGAGGTCTGACTCGTTTGAGGAGAGGAACGGTG
TGAAGTTACCGAGTTATAGAGGAGATAACATCAACGGAGATGCGTTTGATTCCAAGTCTA
GGATTCCTGATCCACAGAGGATGATCAGAGCTTATTGTCAATCTGCAGCTACTTTGAATC
TCTTGAGAGCTTTTGCTAGTGGTGGTTATGCTGCTATGCAGAGAGTTACTCAGTGGAATC
TTGATTTCACAGAACGTAGTGAGCAAGGAGACAGGTACCGTGAACTAGCGCACCGTGTTG
ATGAAGCGCTTGGTTTCATGCACGCGGCTGGACTCACGCTTGATCATCCCATCATGCAAA
CAACCGAGTTCTGGACTTCTCATGAGTGTTTGCTCTTGCCTTATGAACAATCACTAACAA
GGCTGGACTCAACTTCTGGTCTCTACTATGATTGTTCTGCTCATATGATTTGGGTCGGTG
AGCGAACCAGACAGCTTGATGGAGCTCACGTCGAGTTCTTAAGAGGTGTTTCTAATCCTC
TTGGAATCAAAGTGAGTGATAAGATGGACCCAACGGAGCTTGTGAAGCTGATTGAGATCT
TGAATGCTGATATAAGCCTGGAAGATCACGATATCACAAGAATGGGAGCAGAGAATAT


BQ
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AF RS1DS60TF U 1
AF RS1BR38TF U 512
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TTGAAGCCGTGCTCGACACGATCGAATCTTTCCCTCCGATCGTTTTCGCCGGAGAAGCTA
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GAGATTGTGCAGAGAGTTTCAAAGAGTTCAACGCTAACAACATTCGTGATACGTTTAGGA
TTCTTCTCCAGATGGGTGCTGTTTTGATGTTCGGTG

QA 1 576 1 576
DS 

RD RS1BR38TF 747 0 0
G
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GGTGGCCTAGTCCCCGTCGTCAAGGTTGGAAGAATGGCGGGTCAGTTTGCGAAGCCGAGG
TCTGACTCGTTTGAGGAGAGGAACGGTGTGAAGTTACCGAGTTATAGAGGAGATAACATC
AACGGAGATGCGTTTGATTCCAAGTCTAGGATTCCTGATCCACAGAGGATGATCAGAGCT
TATTGTCAATCTGCAGCTACTTTGAATCTCTTGAGAGCTTTTGCTAGTGGTGGTTATGCT
GCTATGCAGAGAGTTACTCAGTGGAATCTTGATTTCACAGAACGTAGTGAGCAAGGAGAC
AGGTACCGTGAACTAGCGCACCGTGTTGATGAAGCGCTTGGTTTCATGCACGCGGCTGGA
CTCACGCTTGATCATCCCATCATGCAAACAACCGAGTTCTGGACTTCTCATGAGTGTTTG
CTCTTGCCTTATGAACAATCACTAACAAGGCTGGACTCAACTTCTGGTCTCTACTATGAT
TGTTCTGCTCATATGATTTGGGTCGGTGAGCGAACCAGACAGCTTGATGGAGCTCACGTC
GAGTTCTTAAGAGGTGTTTCTAATCCTCTTGGAATCAAAGTGAGTGATAAGATGGACCCA
ACGGAGCTTGTGAAGCTGATTGAGATCTTGAATGCTGATATAAGCCTGGAAGATCACGAT
ATCACAAGAATGGGAGCAGAGAATAT

QA 2 747 2 747
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GTATCTAAAAAGTGCAAAGGATTATCCCATTGAAAGAGGGGGAAGCAGAAAAACGAATTT
GAAATCTTGTTCGGTACAAACGCTAAATACCAAAAAAAAAATTACAAAAAAGAAAGGTAG
AAGAAAAACCGGTGGGTGCTGCAAACGCGGACCAAAAACACACTAAAAGACAGACAAAGA
GAAGCTTTTGAGCTTTTGGATTGGTTTAATCATCGCCTTGGCCATCTTCTTTCACCAGTT
TGATCATGTCGTCGATTCTCAGAATCGTAATTGCTGCCTCTGTTGCAAACTGGATAATTT
TCACTTTGCTCATCGCTGGTTTGATCACTCCTGCTTCCAAATTGTTACGGACTATTCCGT
TTACAAGGTCCAGTCCCATGCTTGAATAGTGCTTCTTATCAGCCTTGGTTTGTGCGGTGT
GGTGGTATGCTCTTAGTTTAGCTACCAACTCGGTTGCATCCTTGGCGGCGTTTACAGCAA
GCACCTTAGGTATAACCAATAACGCCTCTGCAAATTCAGCAATTGCCAATTGTTCCCGAG
AGCCCAAGGTCGTAGCAAGGTGCTCCAGATACACAGACAATGCTGACTCAACTGCACCTC
CACCCGCAACCACCGTGTTGGACTCGAGGGTCCTCTTGACAATACACAAAGAATCGTGCA
GTGCTCTCTCCATCTCATCAAGCATGTAGTCATTTGCACCTCTCAAGATCAAGGATACCG
CACTGCTGGTTTTGGTTCCCTTTATCAATACAACATCGTCATCCGCAATTCTCTCCTCCA
CAACTTCATCTGCCGACCCAAGGTGCGCCGGATCAAACGTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DA63JQ U 1
AF RS1BA13TF C 527
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AAGAAAAACCGGTGGGTGCTGCAAACGCGGACCAAAAACACACTAAAAGACAGACAAAGA
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CACCCGCAACTACCGTGTTGGACTCGAGGGTCCTCTTGACAATACGCAAAGAATCGTGCA
GTGCTCTCTCCATCTCATCAAGCATGTAGTCATTTGCACCTCTCAAGATCAAG*ATACCG
CACTGCTGGTTTTGGTTCCCTTTATCAA

QA 1 808 1 808
DS 

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CACTTGTTCTCGAGAGCCCAAGGTCGTAGCAAGGTGCTCCAGATACACAGACAATGCTGA
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CAAAGAATCGTGCAGTGCTCTCTCCATCTCATCAAGCATGTAGTCATTTGCACCTCTCAA
GATCAAGGATACCGCACTGCTGGTTTTGGTTCCCTTTATCAATACAACATCGTCATCCGC
AATTCTCTCCTCCACAACTTCATCTGCCGACCCAAGGTGCGCCGGATCAAACGTTTC

QA 1 357 1 357
DS 



AS 1 3

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CTTTACCTTCCCCCC*TGCCTGCATCTCAACGATGGAGTTCACTACCAACGACATGGAAA
AGGTGTTTCTGTTCGACCACCTTCGCAAAGGATGTGAGGCTCAGTACGCTAAGGATCCTC
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CTGTTCCCCAGGCGAAGGTCATGTTAAGTGATGCTATTTCCAAGTTGGAAGATGTATTGA
CATTGAACCCAGGGAAGCATGAGGCGCTTTGGTGTCTTGGCAACGCGTACACTACCCAGG
CTTTTCTTTTTCCTGATGCCGATGTAGCCAAAGGTCACTTCGATAAAGCCGT*GAATATC
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AGAACAATGACTTCACGTACGATGTATGTGGTTGGATCATTCTAGCATGTGGGATTGTTG
CTTGGGTTGGCATGGCAAAAGCCCTTGACCCTCCACCACCTCCTGCTAGATAAAAATCCG
TAGTGTTTTTAAGTGAAACAGAGTAACGGTTTATTACGGTTTTGTTTCACCGACCGGATC
ATGTACACCTATCAAATTGTTTTGTTTACTTAACTATTAGGATGGTTATTGACTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 25 25 25 25 
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AF RS1B358TF U 1
AF RS1FG90TF U 22
AF RS1B358JQ C 56
BS 1 686 RS1B358TF
BS 687 838 RS1B358JQ

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AGGTGTTTCTGTTCGACCACCTTCGCAAAGGATGTGAGGCTCAGTACGCTAAGGATCCTC
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CTGTTCCCCAGGCGAAGGTCATGTTAAGTGATGCTATTTCCAAGTTGGAAGATGTATTGA
CATTGAACCCAGGGAAGCATGAGGCGCTTTGGTGTCTTGGCAACGCGTACACTACCCAGG
CTTTTCTTTTTCCTGATGCCGATGTAGCCAAAGGTCACTTCGATAAAGCCGT*GAATATC
TCCAAAGAGCTGTAGATGAGGATCCAGGTAATGAGATATATCGCAAGGCCTTGGATGTTG
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AGAACAATGACTTCACGTACGATGTATGTGGTTGGATCATTCTAGCATGTGGGATTGTTG
CTTGGGTTGGCATGGCAAAAGCCCTT

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DS 

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GG
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ATCTCAACGATGGAGTTCACTACCAACGTCATGGAAAAGGTGTTTCTGTTCGACCACCTT
CGCAAAGGATGTGAGGCTCAGTACGCTAAGGATCCTCTCGATTCCGATAATTTGCTAAAG
TGGGCTGGTTCGTTGATTGAACTTGCTCAGTTCCAGACTGTTCCCCAGGCGAAGGTCATG
TTAAGTGATGCTATTTCCAAGTTGGAAGATGTATTGACATTGAACCCAGGGAAGCATGAG
GCGCTTTGGTGTCTTGGCAACGCGTACACTACCCAGGCTTTTCTTTTTCCTGATGCCGAT
GTAGCCAAAGGTCACTTCGATAAAGCCGTTGAATATCTCCAAAGAGCTGTAGATGAGGAT
CCAGGTAATGAGATATATCGCAAGGCCTTGGATGTTGCAATAAGGGGCCCGGAGATGCTA
ATGGAGCTGACACAGAGTGGAATGATGCAGCAGGCACTAGCTGGAGGAGGAGGAGGTCGC
TCAGCTTCGTCAAATGCTAGCGGTGGTAAGAAGAAGAAGAACAATGACTTCACGTACGAT
GTATGTGGTTGGATCATTCTAGCATGTGGGATTGTTGCTTGGGTTG

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DS 

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GAAGACTTTAC*TTCCCCCC*TGC*TGCATCTCAACGATGGAGTTCACTACCAACGACAT
GGAAAAGGTGTTTCTGTTCGACCACCTTCGCAAAGGATGTGAGGCTCAGTACGCTAAGGA
TCCTCTCGATTCCGATAATTTGCTAAAGTGGGCTGGTTCGTTGATTGAACTTGCTCAGTT
CCAGACTGTTCCCCAGGCGAAGGTCATGTTAAGTGATGCTATTTCCAAGTTGGAAGATGT
ATTGACATTGAACCCAGGGAAGCATGAGGCGCTTTGGTGTCTTGGCAACGCGTACACTAC
CCAGGCTTTTCTTTTTCCTGATGCCGATGTAGCCAAAGGTCACTTCGATAAAGCCGT*GA
ATATCTCCAAAGAGCTGTAGATGAGGATCCAGGTAATGAGATATATCGCAAGGCCTTGGA
TGTTGCAATAAGGGGCCCGGAGATGCTAATGGAGCTGACACAGAGTGGAATGATGCAGCA
GGCACTAGTTGGAGGAGGAGGAGGTCGCTCAGCTTCGTCAAATGCTAGCGGTGGTAAGAA
GAAGAAGAACAATGACTTCACGTACGATGTATGTGGTTGGATCATTCTAGCATGTGGGAT
TGTTGCTTGGGTTGGCATGGCAAAAGCCCTTGACCCTCCACCACCTCCTGCTAGATAAAA
ATCCGTAGTGTTTTTAAGTGAAACAGAGTAACGGTTTATTACGGTTTTGTTTCACCGACC
GGATCATGTACACCTATCAAATTGTTTTGTTTACTTAACTATTAGGATGGTTATTGACTT
TCG

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 3

CO CL3444Contig1 1010 3 4 U
GTCTCGCGCTTCATGATGAAGAAGAAAGAAGCGTACAGCGACACTTTCCTCCAACACGTG
GCGCTTAACTTCATCCTAGCTGGACGCGACACGTCATCGGTTGCACTGAGCTGGTTCTTC
TGGCTTATCACGATGCATCCAACCGTCGAGGATAAAATCGTCCGGGAGATCTGCTCCGTT
CTGATCGATACACGTGGCACTGAGAACGCCGCGTCTTGGACGGAGGAGCCGTTAAATTTC
GACGAGATCGACCGGCTGGTTTACCTGAAGGCGGCGCTCTCCGAGACGCTCAGGCTTTAC
CCTTCGGTGCCGGAAGATTCGAAGCACGTCGAGAACGACGACGTTTTACCGGACGGAACC
TTCGTCCCGGCGGGATCTTCGGTGAGTTATTCGATATACGCGGCGGGGAGGATGAAGACG
ACATGGGGAGAAGATTGTCTGGAGTTTATTCCGGAGAGATGGATCTCGCCGATCGACGGC
AAATTCATCAACCACGATCAGTACCGATTTGTGGCATTCAACGCCGGACCGAGAATCTGT
CTGGGAAAAGATTTGGCGTATCTTCAGATGAAGACCATCGCGGCGGCTGTGCTTCTCCGT
CACCGGCTTACGGTGGTGCCGGGACACAAGGTGGAGCAGAAGATGTCGTTGACGCTTTTT
ATGAAGAATGGACTTGTGGTTAATCTGCATAAGAGGGACCTCCAAGGAATCATCAAGAGT
CTAGTGGTCGACAAAAGTGACCGTCTCGTTAACGGCAATTGTACCGGCGTCACTGGTGGA
GGCGTCGCCGTTTACGTGGAAGTTCCCGTGGCTTAAAGCCAGCTGATAACGTTTCTCATT
CATATACACCTTTATTTTTTTAATTCCAAAACCATAACATTTTGGACAGAAATACGACTG
TGGTTCACTTCTGTTCGATATGAAACTGTAAGCATATACATACATTCCAATTAGTAGCTA
CTCGCTTTATTTACTTTCTTGTAAACTTCTTAAAAGTTTCTTTTATGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
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20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BA44TF U 1
AF RS1BA44JQ C 178
AF RS1GQ72TF U 242
BS 1 665 RS1BA44TF
BS 666 666 RS1GQ72TF
BS 667 678 RS1BA44TF
BS 679 1010 RS1GQ72TF

RD RS1BA44TF 678 0 0
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CTGATCGATACACGTGGCACTGAGAACGCCGCGTCTTGGACGGAGGAGCCGTTAAATTTC
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TTCGTCCCGGCGGGATCTTCGGTGAGTTATTCGATATACGCGGCGGGGAGGATGAAGACG
ACATGGGGAGAAGATTGTCTGGAGTTTATTCCGGAGAGATGGATCTCGCCGATCGACGGC
AAATTCATCAACCACGATCAGTACCGATTTGTGGCATTCAACGCCGGACCGAGAATCTGT
CTGGGAAAAGATTTGGCGTATCTTCAGATGAAGACCATCGCGGCGGCTGTGCTTCTCCGT
CACCGGCTTACGGTGGTGCCGGGACACAAGGTGGAGCAGAAGATGTCGTTGACGCTTTTT
ATGAA*AATGGACTTGTG

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1BA44JQ 795 0 0
CG
TCTGATCGATACACGTGGCACTGAGAACGCCGCGTCT*GGACGGAGGAGCCGTTAAATTT
CGACGAGATCGACCGGCTGGTTTAC*TGAAGGCGGCGCTCTCCGAGACGCTCAGGCTTTA
CCCTTCGGTGCCGGAAGATTCGAAGCACGTCGAGAACGACGACGTTTTACCGGACGGAAC
CTTCGTCCCGGCGGGATCTTCGGTGAGTTATTCGATATACGCGGCGGGGAGGATGAAGAC
GACATGGGGAGAAGATTGTCTGGAGTTTATTCCGGAGAGATGGATCTCGCCGATCGACGG
CAAATTCATCAACCACGATCAGTACCGATTTGTGGCATTCAACGCCGGACCGAGAATCTG
TCTGGGAAAAGATTTGGCGTATCTTCAGATGAAGACCATCGCGGCGGCTGTGCTTCTCCG
TCACCGGCTTACGGTGGTGCCGGGACACAAGGTGGAGCAGAAGATGTCGTTGACGCTTTT
TATGAAGAATGGACTTGTGGTTAATCTGCATAAGAGGGACCTCCAAGGAATCATCAAGAG
TCTAGTGGTCGACAAAAGTGACCGTCTCGTTAACGGCAATTGTACCGGCGTCACTGGTGG
AGGCGTCGCCGTTTACGTGGAAGTTCCCGTGGCTTAAAGCCAGCTGATAACGTTTCTCAT
TCATATACACCTTTATTTTTTTAATTCCAAAACCATAACATTTTGGACAGAAATACGACT
GTGGTTCACTTCTGTTCGATATGAAACTGTAAGCATATACATACATTCCAATTAGTAGCT
ACTCGCTTTATTT

QA 3 795 3 795
DS 

RD RS1GQ72TF 769 0 0
G
CGAGATCGACCGGCTGGTTTACCTGAAGGCGGCGCTCTCCGAGACGCTCAGGCTTTACCC
TTCGGTGCCGGAAGATTCGAAGCACGTCGAGAACGACGACGTTTTACCGGACGGAACCTT
CGTCCCGGCGGGATCTTCGGTGATTTATTCGATATACGCGGCGGGGAGGATGAAGACGAC
ATGGGGAGAAGATTGTCTGGAGTTTATTCCGGAGAGATGGATCTCGCCGATCGACGGCAA
ATTCATCAACCACGATCAGTACCGATTTGTGGCATTCAACGCCGGACCGAGAATCTGTCT
GGGAAAAGATTTGGCGTATCTTCAGATGAAGACCATCGCGGCGGCTGTGCTTCTCCGTCA
CCGGCTTACGGTGGTGCCGGGACACAAGGTGGAGCAGAAGATGTCGTTGACGCTTTTTAT
GAAGAATGGACTTGTGGTTAATCTGCATAAGAGGGACCTCCAAGGAATCATCAAGAGTCT
AGTGGTCGACAAAAGTGACCGTCTCGTTAACGGCAATTGTACCGGCGTCACTGGTGGAGG
CGTCGCCGTTTACGTGGAAGTTCCCGTGGCTTAAAGCCAGCTGATAACGTTTCTCATTCA
TATACACCTTTATTTTTTTAATTCCAAAACCATAACATTTTGGACAGAAATACGACTGTG
GTTCACTTCTGTTCGATATGAAACTGTAAGCATATACATACATTCCAATTAGTAGCTACT
CGCTTTATTTACTTTCTTGTAAACTTCTTAAAAGTTTCTTTTATGATG

QA 2 769 2 769
DS 



AS 1 3

CO CL3445Contig1 793 3 5 U
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TCTTCAAAATGATGAGGATAACGCTTACAGGAAGATCCGTCTCAGAGCTGAAGATGTTCA
GGGAAGGAATGTCTTGACTCAGTTCTGGGGCATGGACTTCACCACTGATAAACTCAGATC
CTTGGTGAAGAAGTGGCAGACTTTGATTGAGTCTCATGTTGATGTTAAGATCACCGACAA
CTACACATTGAGGCTTTTCTGCATTGCTTTCACCAAGAGACGTGCTAACCAAGTCAAGAG
AACTTGCTATGCTCAGTCAAGCCAAATCCGTCAGATTCGCCGCAAGATGAGGGAGATTAT
GATCAAGGAAGCTTCCTCTTCTGACCTCAAGGAGCTTGTTGCCAAGTTTATTCCAGAATC
TATTGGTAAAGAGATTGAGAAGGCAACTCAGGGCATCTACCCTCTTCAGAATGTTTTCAT
CCGTAAAGTCAAGATCCTCAACGCTCCTAAATTCGACCTCGGAAAGCTCATGGAGGTTCA
CGGAGACTACACAGCAGAGGATGTTGGTGTGAAGGTTGACAGGCCGGCCGATGAGACTGT
GGTCGAAGAACCTACTGAGATCATTGGAGCTTAAGAGATTCGTTTTTATTCCAAACTTTT
AGTATCTTTAATGCTCTGTGTCGTTTCAGACTCGTTTGGTCCTTGAGCTTTTCTTTTTGA
TGTATTTGTGTACTTTTTCTCAGTATAAAATTTGCCAGTTTTGGATATTATTTATCCAAC
GCTTGTTCATTCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1B246TF U 1
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AF RS1DD29TF U 643
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TTG

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TACACATTGAGGCTTTTCTGCATTGCTTTCACCAAGAGACGTGCTAACCAAGTCAAGAGA
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ATTGGTAAAGAGATTGAGAAGGCAACTCAGGGCATCTACCCTCTTCAGAATGTTTTCATC
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DS 



AS 1 3

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CAGAATCTCAACCATGCTTCTGAAGAAAGGAGCAGAGAGAGGATTGACAGCGTTTGAGAT
TGGGAACATGATGTGCAGAGAAACTCTGAGCAAGAAGTCTCTAGTGGAGGAGATGGCGGA
GGAAGCTCAAGAGGCTATGCTTCCCGGGACTAGCGAGGGTGCATTCCTTGAAGCCTTGTC
TGATGTGATGGATTACCATCTTGATGAAGTGGTTCGCTCTCAGGAACACTAGAATTGGTT
CTTGTGTGAATCGTTACACTCTTAACTACTTGGAATTATGGTACATATACACTCTTGTTT
GGTTTGCCTTTATATAAAAATCCGTGGCTTTTGTTTCTCAACTGCTTTTTAACTATCTGT
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AATGACAATTTCAGTGTTACAGTAGC


BQ
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AF RS1GO84TF U 1
AF RS1DC55TF U 687
AF RS1GO84JQ C 669
BS 1 691 RS1GO84TF
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RD RS1GO84TF 742 0 0
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GCT

QA 1 739 1 739
DS 

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G
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GACTAGCGAGGGTGCATTCCTTGAAGCCTTGTCTGATGTGATGGATTACCATCTTGATGA
AGTGGTTCGCTCTCAGGAACACTAGAATTGGTTCTTGTGTGAATCGTTACACTCTTAACT
ACTTGGAATTATGGTACATATACACTCTTGTTTGGTTTGCCTTTATATAAAAATCCGTGG
CTTTTGTTTCTCAACTGCTTTTTAACTATCTGTCATCTTTTGGA

QA 2 585 2 585
DS 

RD RS1GO84JQ 678 0 0
TTTTAATGAGAAAAGACAAAGAAGGAAATGTTGTTCTGGTTCCCATTGATCATGGTTACT
GCTTGCCTGAAAGCTTTGAGGATTGCACGTTCGAGTGGCTTTACTGGTCACAAGCCAGGA
AACCATACTCCAGCGAGACACTAGACTACATAAGATCACTTAACGCCGAGGAAGATATCA
ACCTCCTGAAGTTCCATGGATGGAAGATGCCATTGAAAACTGCTAGAACACTCAGAATTT
CAACGATGCTTCTGAAGAAAGGAGCAGAGAGAGGATTGACAGCGTTTGAGATTGGGAACA
TGATGTGCAGAGAAACTCTGAGCAAGAAGTCTCTAGTGGAGGAGATGGCGGAGGAAGCTC
AAGAGGCTATGCTTCCCGGGACTAGCGAGGGTGCATTCCTTGAAGCCTTGTCTGATGTGA
TGGATTACCATCTTGATGAAGTGGTTCGCTTTCAGGAACACTAGAATTGGTTCTTGTGTG
AATCGTTACACTCTTAACTACTTGGAATTATGGTACATATACACTCTTGTTTGGTTTGCC
TTTATATAAAAATCCGTGGCTTTTGTTTCTCAACTGCTTTTTAACTATCTGTCATCTTTT
GGACATATGTACAAGTTGTGTTGTTAATTTATCCGTGAACATATTTCCTGGTAATGACAA
TTTCAGTGTTACAGTAGC

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 3

CO CL3447Contig1 739 3 3 U
GGAATCGGGGAGGGTTTAAGCAGCGATGGCTCTCTGAGAGCTTCTTCATTAGAGAAAATC
ATCATCATCGGCGACTTTGTCAACGCTTCTTCTAACTCCAGATTCTAGTCAGAAGCTGAG
TTTTGTGACTTGAGATGGCGACTACGGAGTAGAGCGGGATAGAAAATCAGGAAGTCCAAC
CAAACCAAGTGGCTCCTGGTTTTGTAGGAGCAATCGA**AAAAGTACAAGAAACTGAGAG
ATCACGCTGAAGCTTATCCATATGTTTGGGGTTCTTACACTGTTGTCTACGGCGGTCTTT
TCCTTTGGACTGCTTATAGATGGAGGAAGCTGAGGAGAACCGAGGATCGGGTTCGTGGCC
TTCAGACCAAACTTAGGAAACTCGTCCAAGACGAACAAGCTACTGCAGTAACAGCTTCTA
AATCTGCTCAATCACTGGACAAGTCTTCTTCTGTTTCTGACAAGACATCACTGCCTTGAT
TAGTTACTAGTTTTATAATTAAACCCCCTCGTCTCTGTTAAGACTTATGATGAGGTTGGT
TTCAATATTCGTGGGGTTAAATCTGTTTTGTTGCTGTGCTTTTTGTTATTTTGCTCGCAT
AGGCTTTTTCTATAAAGTCAAATTCATGTACATGAATGAAGAAGAGAATACGCTGAAATG
TTGAATTGCGAAAAAATGATGTTGACCCTTACCTTGATTGGTTACAAGTTTTATAATCAA
GCTTCCGGTGTATTTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DF34TF U 1
AF RS1EB32TF U 22
AF RS1DF34JQ C 98
BS 1 585 RS1DF34TF
BS 586 676 RS1EB32TF
BS 677 739 RS1DF34JQ

RD RS1DF34TF 585 0 0
GGAATCGGGGAGGGTTTAAGCAGCGATGGCTCTCTGAGAGCTTCTTCATTAGAGAAAATC
ATCATCATCGGCGACTTTGTCAACGCTTCTTCTAACTCCAGATTCTAGTCAGAAGCTGAG
TTTTGTGACTTGAGATGGCGACTACGGAGTAGAGCGGGATAGAAAATCAGGAAGTCCAAC
CAAACCAAGTGGCTCCTGGTTTTGTAGGAGCAATCGA**AAAAGTACAAGAAACTGAGAG
ATCACGCTGAAGCTTATCCATATGTTTGGGGTTCTTACACTGTTGTCTACGGCGGTCTTT
TCCTTTGGACTGCTTATAGATGGAGGAAGCTGAGGAGAACCGAGGATCGGGTTCGTGGCC
TTCAGACCAAACTTAGGAAACTCGTCCAAGACGAACAAGCTACTGCAGTAACAGCTTCTA
AATCTGCTCAATCACTGGACAAGTCTTCTTCTGTTTCTGACAAGACATCACTGCCTTGAT
TAGTTACTAGTTTTATAATTAAACCCCCTCGTCTCTGTTAAGACTTATGATGAGGTTGGT
TTCAATATTCGTGGGGTTAAATCTGTTTTGTTGCTGTGCTTTTTG

QA 1 585 1 585
DS 

RD RS1EB32TF 655 0 0
AGCGATGGCTCTCTGAGAGCTTCTTCATTAGGGAAAATCATCATCATCGGCGACTTTGTC
AACGCTTCTTCTAACTCCAGATTCTAGTCAGAAGCTGAGTTTTGTGACTTGAGATGGCGA
CTACGGAGCAGAGCGGGATAGAAAATCAGGAAGTCCAACCAAACCAAGTGGCTCCTGGTT
TTGTAGGAGCAATCGAAGAAAAGTACAAGAAACTGAGAGATCACGCTGAAGCTTATCCAT
ATGTTTGGGGTTCTTACACTGTTGTCTACGGCGGTCTTTTCCTTTGGACTGCTTATAGAT
GGAGGAAGCTGAGGAGAACCGAGGATCGGGTTCGTGGCCTTCAGACCAAACTTAGGAAAC
TCGTCCAAGACGAACAAGCTACTGCAGTAACAGCTTCTAAATCTGCTCAATCACTGGACA
AGTCTTCTTCTGTTTCTGACAAGACATCACTGCCTTGATTAGTTACTAGTTTTATAATTA
AACCCCCTCGTCTCTGTTAAGACTTATGATGAGGTTGGTTTCAATATTCGTGGGGTTAAA
TCTGTTTTGTTGCTGTGCTTTTTGTTATTTTGCTCGCATAGGCTTTTTCTATAAAGTCAA
ATTCATGTACATGAATGAAGAAGAGAATACGCTGAAATGTTGAATTGCGAAAAAA

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1DF34JQ 642 0 0
CCAGATTCTAGTCAGAAGCTGAGTTTTGTGACTTGAGATGGCGACTACGGAGTAGAGCGG
GATAGAAAATCAGGAAGTCCAACCAAACCAAGTGGCTCCTGGTTTTGTAGGAGCAATCGA
**AAAAGTACAAGAAACTGAGAGATCACGCTGAAGCTTATCCATATGTTTGGGGTTCTTA
CACTGTTGTCTACGGCGGTCTTTTCCTTTGGACTGCTTATAGATGGAGGAAGCTGAGGAG
AACCGAGGATCGGGTTCGTGGCCTTCAGACCAAACTTAGGAAACTCGTCCAAGACGAACA
AGCTACTGCAGTAACAGCTTCTAAATCTGCTCAATCACTGGACAAGTCTTCTTCTGTTTC
TGACAAGACATCACTGCCTTGATTAGTTACTAGTTTTATAATTAAACCCCCTCGTCTCTG
TTAAGACTTATGATGAGGTTGGTTTCAATATTCGTGGGGTTAAATCTGTTTTGTTGCTGT
GCTTTTTGTTATTTTGCTCGCATAGGCTTTTTCTATAAAGTCAAATTCATGTACATGAAT
GAAGAAGAGAATACGCTGAAATGTTGAATTGCGAAAAAATGATGTTGACCCTTACCTTGA
TTGGTTACAAGTTTTATAATCAAGCTTCCGGTGTATTTTGCC

QA 1 642 1 642
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL3449Contig1 700 2 17 U
ATTGACGCAAACGGTATCGTTACAGTCTCAGCCAAAGACAAGGCAACAGGTAAAGAGCAG
CAGATCACAATCAGATCATCAGGTGGTCTCTCAGACGATGAGATCAACAGAATGGTGAAA
GAAGCTGAGCTCAACTCACACAAGGATCAAGAGAAGAAGCAGCTTATCGACATTAGGAAC
ACGGCTGATACAACAATCTACAGCGTTGAGAAGAGTTTGAGTGAGTACAGAGAGAAGATT
CCTGCTGAGATTGCCTCTGAGATTGAGACTGCTGTGTCTGATCTCAGGACGGCAATGGCT
GGTGAAGAGGTAGAGGACATCAAGGCTAAGCTTGAAGCTGCCAACAAGGCAGTGTCGAAG
ATTGGAGAACACATGTCCAAGGGATCAGGTTCGTCTGGGACCTCTGGTGGTGAAGGTTCA
AGCGGGACTGACCAGCAGACCCCTGAAGCTGAATTTGAAGAGGCGAGCGGTTCAAAGAAA
TGAGTTAGGTAAACCGGTTTAACTCGGTTTTGTTTCCAAATAAAGTTGACATGCATTTAT
CCTTCACAAAATTGATTAAAGTTTTCTTTTTGTATGTTAAAACGTCCTTTGTGGAGGTAA
TTCTTGAGATATTTGATACTCGGATGTAGTTCTTGGTTTCTTTGTTTGGTCTTTTCTTGG
AATCTATGGTTATTATCTTGACCGGTTAACCGGATTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DU70JQ C 1
AF RS1D549TF U 274
BS 1 273 RS1DU70JQ
BS 274 313 RS1D549TF
BS 314 314 RS1DU70JQ
BS 315 383 RS1D549TF
BS 384 384 RS1DU70JQ
BS 385 400 RS1D549TF
BS 401 401 RS1DU70JQ
BS 402 486 RS1D549TF
BS 487 487 RS1DU70JQ
BS 488 492 RS1D549TF
BS 493 493 RS1DU70JQ
BS 494 565 RS1D549TF
BS 566 566 RS1DU70JQ
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BS 651 651 RS1DU70JQ
BS 652 680 RS1D549TF
BS 681 700 RS1DU70JQ

RD RS1DU70JQ 700 0 0
ATTGACGCAAACGGTATCGTTACAGTCTCAGCCAAAGACAAGGCAACAGGTAAAGAGCAG
CAGATCACAATCAGATCATCAGGTGGTCTCTCAGACGATGAGATCAACAGAATGGTGAAA
GAAGCTGAGCTCAACTCACACAAGGATCAAGAGAAGAAGCAGCTTATCGACATTAGGAAC
ACGGCTGATACAACAATCTACAGCGTTGAGAAGAGTTTGAGTGAGTACAGAGAGAAGATT
CCTGCTGAGATTGCCTCTGAGATTGAGACTGCTGTGTCTGATCTCAGGACGGCAATGGCT
GGTGAAGAGGTAGAGGACATCAAGGCTAAGCTTGAAGCTGCCAACAAGGCAGTGTCGAAG
ATTGGAGAACACATGTCTAAGGGATCAGGTTCGTCTGGGACCTCTGGTGGTGAAGGTTCA
AGCGGGACTGACCAGCAGACCCCTGAAGCTGAGTTTGAAGAGGCGAGCGGTTCAAAGAAA
TGAGTTAGGTAAACCGGTTTAACTCGGTTTTGTTTCCAAATAA*GTTGACATGCATTTAT
CCTTCACAAAATTGATTAAAGTTTTCTTTTTGTATGTTAAAACGTCCTTTGTGGGGGTAA
TTCTTGAGATATTTGATACTCGGATGTAGTTCTTGGTTTCTTTGTTTGGTCTTTTCTTGG
AATCTATGGTTATTATCTTGACCGGTTAACCGGATTTGAC

QA 1 700 1 700
DS 

RD RS1D549TF 414 0 0
GTGTCTGATCTCAGGACGGCAATGGCTGGTGAAGAGGTAGGGGACATCAAGGCTAAGCTT
GAAGCTGCCAACAAGGCAGTGTCGAAGATTGGAGAACACATGTCCAAGGGGTCAGGTTCG
TCTGGGAGCTCTGGTGGTGAAGGTTCAAGCGGGACTGACCAGCAGACCCCTGAAGCTGAA
TTTGAAGAGGCGAGCGGTTCAAAGAAATGAGTTCGGTAAGCCGGTTTAACTCGGTTTTGT
TTCCAAATAAAGTTGACATGCATTTATCCTTCACAAAATTGATTAAAGTTTTTTTTTTGT
ATGTTAAAACGTCCTTTGTGGAGGTAATTCTTGAGATATTTGATACTCGGATGTAGTTCT
TGGTTTCTTTGTTTGGT*TTTTCTTGGAATCTATGGTTATTATCTTG
ACCGGTT

QA 1 407 1 407
DS 



AS 1 3

CO CL3450Contig1 808 3 13 U
GGGGTTTTCGGTGGAATTAGGGTTAGACATGGCGGCTTCATCGAGTAGAGTAGATTACGA
AATCATCACCGATCCGTTCGATCCACGATGTGTGGTTGCATGCCTTAAGAACCTCTTTGG
AGAACTGACCAAGAAGGATAAGCTTCTGCTGAAGAGGATGCGAGGGAAAGAGGACGATAC
GAGTCCAAAGGACACCCCACAGGAGGAACGCGATCTCATCAACGAACAGATCAGGAAGTC
ACAGGGATTTGACGTGGATTTTTCCAAGTTCCGATGCCTTTTTGATTTCTACGCTGCTTT
CCATGTCGATGAAAGACATTCAAACGTAATAAGAGAAACCGATAGGCAGTTTTTCAGAAG
ATTGGCTCAGGAAGCCATTGCGGATTACAACACTAGAGAGGGGACCAGGTTTGAATTTGT
TGAGGTCGAGAAAGCAAATGTGTATAGTAATAGTGGATTCATTTACTTCATCACCTTTGT
AGCCAAAGATCCTTGCGACCAGTCAAAAGTGTTTCAAGCTAAGGTCATCAATGTTTTCTG
TAGAGAGATTGTGCACAGCTTCTGCAGGCTTAAACCCCGTCAACAAGTAGAATGCGATGA
AGCTAGGAGAGTTGTGAAGAAACCAAGGTATAATACAAGATCAAGCAAGCGTGCGGGCGT
CATTACTTATGTCTCTTAGATAATGCAATTACCATTGTCCGAGATATTCTCCTGTTTGAG
GGGAATTTTATCTCTTTATCATTATGTTTATGTATGACTTTTGTGGGACAACAACTACTA
AAATCTTACTCCCTCAGCCATCAGTACC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GE84TF U 1
AF RS1FJ94TF U 2
AF RS1FJ94JQ C 107
BS 1 103 RS1GE84TF
BS 104 104 RS1FJ94TF
BS 105 382 RS1GE84TF
BS 383 383 RS1FJ94TF
BS 384 444 RS1GE84TF
BS 445 445 RS1FJ94TF
BS 446 502 RS1GE84TF
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BS 504 624 RS1GE84TF
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BS 626 643 RS1GE84TF
BS 644 722 RS1FJ94TF
BS 723 808 RS1FJ94JQ

RD RS1GE84TF 643 0 0
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AATCATCACCGATCCGTTCGATCCACGATGTGTGGTTGCATGCTTTAAGAACCTCTTTGG
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GAGTCCAAAGGACACCCCACAGGAGGAACGCGATCTCATCAACGAACAGATCAGGAAGTC
ACAGGGATTTGACGTGGATTTTTCCAAGTTCCGATGCCTTTTTGATTTCTACGCTGCTTT
CCATGTCGATGAAAGACATTCAAACGTAATAAGAGAAACCGATAGGCAGTTTTTCAGAAG
ATTGGCTCAGGAAGCCATTGCGAATTACAACACTAGAGAGGGGACCAGGTTTGAATTTGT
TGAGGTCGAGAAAGCAAATGTGTACAGTAATAGTGGATTCATTTACTTCATCACCTTTGT
AGCCAAAGATCCTTGCGACCAGACAAAAGTGTTTCAAGCTAAGGTCATCAATGTTTTCTG
TAGAGAGATTGTGCACAGCTTCTGCAGGCTTAAACCCCGTCAACAAGTAGAATGCGATGA
AGCTAGGAGAGTTGTGAAGAAACCGAGGTATAATACAAGATCA

QA 1 643 1 643
DS 

RD RS1FJ94TF 722 0 0
GGGG
TTTCGGTGGAATTAGGGTTAGACATGGCGGCTTCATCGAGTAGAGTAGATTACGAAATCA
TCACCGATCCGTTCGATCCACGATGTGTGGTTGCATGCCTTAAGAACCTCTTTGGAGAAC
TGACCAAGAAGGATAAGCTTCTGCTGAAGAGGATGCGAGGGAAAGAGGACGATACGAGTC
CAAAGGACACCCCACAGGAGGAACGCGATCTCATCAACGAACAGATCAGGAAGTCACAGG
GATTTGACGTGGATTTTTCCAAGTTCCGATGCCTTTTTGATTTCTACGCTGCTTTCCATG
TCGATGAAAGACATTCAAACGTAATAAGAGAAACCGATAGGCAGTTTTTCAGAAGATTGG
CTCAGGAAGCCATTGCGGATTACAACACTAGAGAGGGGACCAGGTTTGAATTTGTTGAGG
TCGAGAAAGCAAATGTGTATAGTAATAGTGGATTCATTTACTTCATCACCTTTGTAGCCA
AAGATCCTTGCGACCAGTCAAAAGTGTTTCAAGCTAAGGTCATCAATGTTTTCTGTAGAG
AGATTGTGCACAGCTTCTGCAGGCTTAAACCCCGTCAACAAGTAGAATGCGATGAAGCTA
GGAGAGTTGTGAAGAAACCAAGGTATAATACAAGATCAAGCAAGCGTGCGGGCGTCATTA
CTTATGTCTCTTAGATAATGCAATTACCATTGTCCGAGATATTCTCCTGTTTGAGGG
A

QA 5 721 5 721
DS 

RD RS1FJ94JQ 702 0 0
AAGAACCTCTTTGGAGAACTGACCAAGAAGGATAAGCTTCTGCTGAAGAGGATGCGAGGG
AAAGAGGACGATACGAGTCCAAAGGACACCCCACAGGAGGAACGCGATCTCATCAACGAA
CAGATCAGGAAGTCACAGGGATTTGACGTGGATTTTTCCAAGTTCCGATGCCTTTTTGAT
TTCTACGCTGCTTTCCATGTCGATGAAAGACATTCAAACGTAATAAGAGAAACCGATAGG
CAGTTTTTCAGAAGATTGGCTCAGGAAGCCATTGCGGATTACAACACTAGAGAGGGGACC
AGGTTTGAATTTGTTGAGGTCGAGAAAGCAAATGTGTATAGTAATAGTGGATTCATTTAC
TTCATCACCTTTGTAGCCAAAGATCCTTGCGACCAGTCAAAAGTGTTTCAAGCTAAGGTC
ATCAATGTTTTCTGTAGAGAGATTGTGCACAGCTTCTGCAGGCTTAAACCCCGTCAACAA
GTAGAATGCGATGAAGCTAGGAGAGTTGTGAAGAAACCAAGGTATAATACAAGATCAAGC
AAGCGTGCGGGCGTCATTACTTATGTTTCTTAGATAATGCAATTACCATTGTCCGAGATA
TTCTCCTGTTTGAGGGGAATTTTATCTCTTTATCATTATGTTTATGTATGACTTTTGTGG
GACAACAACTACTAAAATCTTACTCCCTCAGCCATCAGTACC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 3

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TCGCAGGTACAAGTACGCCTTGCCTCTTCTCCTCACCGCTGTCGGAGGTTACCTTTTCTT
GAGGACCAAGAAAAAAGAAATAGATCCT*CAAGTGAAGTGGTTGCTGCTGAATCAGGTTC
AGCCTCTGCAGCTTCTGTTACCATGGAAAGGCCTGTGTCTTCTGCAGTGGTTGCAGCGCC
AGTTGTGATCAAGACACGTGAGCCAATACCTGAGATGCAACAACGTGCGCTCTTCAAATG
GATCTTGGAGGAGAAAAGGAAAGTGAAACCTAGAAATGCGGAGGAGAAGAAGAAGATTGA
TGAAGAAAAAGCGATTCTGAAACATTTCATTGGATCCAAAACCATTCCTACTCTCTGATT
GTATTTTCAGTTTCTGTGTTGATTTGGTTTCAGTTTTTTTTT**CTTAATTATTCTTGTA
GATATCATATATCTTTTGCTTTTGTAAACAGAAAAACATAATACTTTGAATGTTGAAACC
ATTAACTTTGAAATCTTTGATTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1F211TF U 1
AF RS1B280JQ C 40
AF RS1B280TF U 40
BS 1 123 RS1F211TF
BS 124 124 RS1B280TF
BS 125 208 RS1F211TF
BS 209 209 RS1B280TF
BS 210 522 RS1F211TF
BS 523 524 RS1B280TF
BS 525 567 RS1F211TF
BS 568 568 RS1B280TF
BS 569 576 RS1F211TF
BS 577 625 RS1B280TF

RD RS1F211TF 576 0 0
GGGATTCAGATATATTATCGCCCGCCGAAGCCAATTTCAACGCTTCCACCCTTCCTCCGT
TGTCTTCGTAAATACTATGGATGGTGGTTCTGTTCCTCCTCCTCCGAAGGAATCATTCGC
TCGAAGGTACAAGTACGCCTTGCCTCTTCTCCTCACCGCTGTCGGAGGTTACCTTTTCTT
GAGGACCAAGAAAAAAGAAATAGATCCTGCAAGTGAAGTGGTTGCTGCTGAATCAGGTTC
AGCCTCTGCAGCTTCTGTTACCATGGAAAGGCCTGTGTCTTCTGCAGTGGTTGCAGCGCC
AGTTGTGATCAAGACACGTGAGCCAATACCTGAGATGCAACAACGTGCGCTCTTCAAATG
GATCTTGGAGGAGAAAAGGAAAGTGAAACCTAGAAATGCGGAGGAGAAGAAGAAGATTGA
TGAAGAAAAAGCGATTCTGAAACATTTCATTGGATCCAAAACCATTCCTACTCTCTGATT
GTATTTTCAGTTTCTGTGTTGATTTGGTTTCAGTTTTTTTTTTTCTTAATTATTCTTGTA
GATATCATATATCTTTTGCTTTTGTAAGCAGAAAAA

QA 1 576 1 576
DS 

RD RS1B280JQ 586 0 0
GG
GCTTCCACCCTTCCTCCGTTGTCTTCGTAAATACTATGGATGGTGGTTCTGTTCCTCCTC
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TCGGAGGTTACCTTTTCTTGAGGACCAAGAAAAAAGAAATAGATCCT*CAAGTGAAGTGG
TTGCTGCTGAATCAGGTTCAGCCTTTGCAGCTTCTGTTACCATGGAAAGGCCTGTGTTTT
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AGGAGAAGAAGAAGATTGATGAAGAAAAAGCGATTTTGAAACATTTCATTGGATCCAAAA
CCATTCCTACTCTCTGATTGTATTTTCAGTTTCTGTGTTGATTTGGTTTCAGTTTTTTTT
T**CTTAATTATTCTTGTAGATATCATATATCTTTTGCTTTTGTAAACAGAAAAACATAA
TACTTTGAATGTTGAAACCATTAACTTTGAAATCTTTGATTTTG

QA 3 586 3 586
DS 

RD RS1B280TF 586 0 0
GG
GCTTCCACCCTTCCTCCGTTGTCTTCGTAAATACTATGGATGGTGGTTCTGTTCCTCCTC
CTCCGAAGGAATCATTCGCTCGCAGGTACAAGTACGCCTTGCCTCTTCTCCTCACCGCTG
TCGGAGGTTACCTTTTCTTGAGGACCAAGAAAAAAGAAATAGATCCT*CAAGTGAAGTGG
TTGCTGCTGAATCAGGTTCAGCCTCTGCAGCTTCTGTTACCATGGAAAGGCCTGTGTCTT
CTGCAGTGGTTGCAGCGCCAGTTGTGATCAAGACACGTGAGCCAATACCTGAGATGCAAC
AACGTGCGCTCTTCAAATGGATCTTGGAGGAGAAAAGGAAAGTGAAACCTAGAAATGCGG
AGGAGAAGAAGAAGATTGATGAAGAAAAAGCGATTCTGAAACATTTCATTGGATCCAAAA
CCATTCCTACTCTCTGATTGTATTTTCAGTTTCTGTGTTGATTTGGTTTCAGTTTTTTTT
T**CTTAATTATTCTTGTAGATATCATATATCTTTTGCTTTTGTAAACAGAAAAACATAA
TACTTTGAATGTTGAAACCATTAACTTTGAAATCTTTGATTTTG

QA 3 586 3 586
DS 



AS 1 2

CO CL3452Contig1 719 2 2 U
GGCCATCCCAACTAAACAAGACTCTCTCTCTCTCATCTCTTGTCTCTCTTCTATCTCTTT
TCTCTCTCTCTTCTCTCTCTAAATCAATTATGCAAAAAGCAATAAGACCATCCGAGTCAT
CGTGGACGAAGACCACACCGGGCAGCATCTTCCGTCCAAAGAATGAAGATAAAACATCAT
CATCATTATCATGGCTAACATCATCACCATCACCACAAAAGACACCATTTTCAAGCACTA
AGAAATCAAGCTATAACGTTTTGGTGATGGAGAATGCTGTGGTGGTGTTTGCGAGGAGAG
GCTGTTGTATGGGACATGTGGTAAAAAAGTTGCTACTGACACACGGCGTGAACCCATTGG
TCGTTGAGATTGATGCAGAAGACAACAACGATGACAATATCATCATAAGTGAATTGGGTA
AAACCGTAATTAATAAAGAGAACTTACCAGTCATGTTCATAGGAGGAAAGTTGTTTGGAG
GATTGGAGAATCTGATGGCCGCTCATATTAATGGTGATTTAGTGCCTACTCTCAGACAAG
CAGGGGCTTTATGGCTTTGATTCATGATTTTCTTCCTAGTCTTTCTCCTTGTTGCATTAT
TTGTTATATGTTTTCGGTGATGTTTCAAACTATCTGAATTTGTAACTAATGTTATGTGAT
TCGTTTGATCATAGAGAAACACATAAAATTATAAAAGCACAAAAACACAATTTTCTTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CQ20JQ C 1
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DS 

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CGTGGACGAAGACCACACCGGGCAGCATCTTCCGTCCAAAGAATGAAGATAAAACATCAT
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GCTGTTGTATGGGACATGTGGTAAAAAAGTTGCTACTGACACACGGCGTGAACCCATTGG
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AAACCGTAATTAATAAAGAGAACTTACCAGTCATGTTCATAGGAGGAAAGTTGTTTGGAG
GATTGGAGAATCTGATGGCCGCTCATATTAATGGTGATTTAGTGCCTACTCTCAGACAAG
CAGGGGCTTTATGGCTTTGATTCATGATTTTCTTCCTAGTCTTTCTCCTTGTTGCATTAT
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TCGTTTGATCATAGAGAAACACATAAAATTATAAAAGCACAAAAA

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 3

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TC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 

AF RS1B928JQ U 1
AF RS1D701JQ U 1
AF RS1B928TF C 530
BS 1 178 RS1B928JQ
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RD RS1B928JQ 727 0 0
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CATTAAT

QA 1 727 1 727
DS 

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CG
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CACAAATTATTAAGAAATGGTGGTGCGAACTTATTGAACTATTCTAGCTTTGTAGTTGGG
CTTGGGTATAATAGGAAATGGAATACAGTCTCATCTTATTTTATCTCCCTCTCTCTCTCT
AGTAAACCATCAAGCCTTACTTAGTCAGCACATGGCAAAAGAAAGCTAAACCCAGAATTC
TCTCGGATAAGAGGTGGTGGCTCTACATCTCCAATCTCAATCCTTTCCATTGATTTTGAC
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GCATTGTTTGAATCTTCTGTCATTAGCACCCTCATATTTGCTATCACGTCTGGCGATACG
CTATGAGTTCCGTACTTATCGTCCCAGTACATGGTACTTATTCGGTATAGCTGCTGTATG
CTGAGTACTGGGCACAGATCATGACTTATCTCATCCAATGTTTTTTGAGGTTTTTGGTGT
ATCACCAGAAACCCGATGGCCTGTCTGATATGCTTAAGCTCATCCCAAGAAGAACCTGCG
TACTCATCAGTTGCTTTGTAACACCAGTGCTCTAATTCAGCCAAACCTGCTTTTACGTAC
TCCCCATTACTAAATGAGCAACATTCCCGTCTTAGCAAAAGGCTGTTGAACAGTTGAACA
TTAATGAATGAGAATATCTGCGTGAACACCTTTCGGAC
AAGAACG

QA 3 760 3 760
DS 

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GAGG
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TTTACGTACTCCCCATTACTAAATGAGCAACATTCCCGTCTTAGCAAAAGGCTGTTGAAC
AGTTGAACATTAATGAATGAGAATATCTGCGTGAACACCTTTCGGACCAAGAACGGAGGA
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TGCGCGATCAATGCTTGTTGAGCTTCAGAATTGCCAACAGAACGAGATGCCCCTTTCACT
AAACTTGCCCTTGATGTTCTTGGTGCCTGAATGCACAGTCCAAGGAGAGGAGAAATCTCT
TTCTTCAAGTTATCACGAATCATTCCATATATCTTTTCAACATAAGCTGTTAGCTGCTGC
TTGAAGAGCAGAGCCGGGTATTTAGCCTCGACTTGCCTTAAGGTATCAGCTCCACCGTTA
ATCAAGCTAAGATTCACACCTTGGGGTGCGCCACGGAAGCTCTGAGTCATCCTCCCAAAG
AGAGTGGCAGAAGATGAGCGACGGCGTTGTGGAGCCATCCCTGCCGCACCGCTAGCTTTA
AGGGTGCGTTGGAGGAGTAAAAGCAACGTTGATGCATTGGACAACCAATATGCTAATATA
TCATTGTTC

QA 5 733 5 733
DS 



AS 1 3

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CTTGCTAAGAAGAATGGAGAGAGGCTTGGCTTCCTCGCTTGATTCAGAATCTTCTTCTTG
TTCCTGTCTAGATGTATTTTGTTCAAACCTCTCTTAATACAGAAACTCCCATTCTCATTC
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CAAAAAAA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EG69JQ C 173
AF RS1BL59TF U 2
AF RS1EG69TF U 1
BS 1 47 RS1EG69TF
BS 48 48 RS1BL59TF
BS 49 167 RS1EG69TF
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BS 169 608 RS1EG69TF

RD RS1EG69JQ 414 0 0
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TCTCATTTTGAAAGTTGTATCAATATCACTCTTGAAACCAGATGATTCCTATAT

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DS 

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TCCTGTCTAGATGTATTTTGTTCAAACCTCTCTTAATACAGAAACTCCCATTCTCATTCT
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AACAA

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DS 

RD RS1EG69TF 608 0 0
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AAGAATGTCAACGAAGGGAAAGGTTTATTCGCACCACTTGTCGTTGTCACTAGGAACATA
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ATTACAGAGTTCTGTAAATCGATAGGAGCTGATGCGAAACAGAGACAAGGATTGATTAGG
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TTCCTGTCTAGATGTATTTTGTTCAAACCTCTCTTAATACAGAAACTCCCATTCTCATTC
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CAAAAAAA

QA 1 608 1 608
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RS1GQ04JQ C 1
AF RS1GQ04TF U 1
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RD RS1GQ04JQ 472 0 0
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GGAGGAAGACTACCGGTACCGGTAGGATGAGATATCTCAAAAATGTTCCTCGCCGGTTCA
AGACTGGTTTCAGAGAAGGTACTGAAGCCAAGCCAAGGAACAAGGTGGCTTCATCAGCCT
AAAAAATCCAGATCGAGATAACTGCAGGAAGAAGTAAAACTTAGCAGTTTTGGATCTCTG
TTAGTTTGAGATTTGGATAAATCTGAATACATTCATCATGTTTTATGGGGTTTGATTCCA
TTTGCTTATAAAAGTTTTGAACCTGGTTGAAATATCATCTTGCATTTTTAGC

QA 1 472 1 472
DS 

RD RS1GQ04TF 472 0 0
GG
AGGGTTTCTGCAACAATGACGAAGGGAACAGGGAGTTTCGGAAAGAGGAGGAACAAGAGT
CATACTCTCTGTGTGAGATGCGGTCGTCGTAGCTTTCACATCCAGAAGAGTCGCTGCTCC
GCCTGCGCTTACCCTGCCGCTCGCAAGAGGACATACAACTGGAGTGTGAAGGCGATCAGG
AGGAAGACTACCGGTACCGGTAGGATGAGATATCTCAAAAATGTTCCTCGCCGGTTCAAG
ACTGGTTTCAGAGAAGGTACTGAAGCCAAGCCAAGGAACAAGGTGGCTTCATCAGCCTAA
AAAATCCAGATCGAGATAACTGCAGGAAGAAGTAAAACTTAGCAGTTTTGGATCTCTGTT
AGTTTGAGATTTGGATAAATCTGAATACATTCATCATGTTTTATGGGGTTTGATTCCATT
TGCTTATAAAAGTTTTGAACCTGGTTGAAATATCATCTTGCATTTTT
AGC

QA 3 469 3 469
DS 



AS 1 3

CO CL3456Contig1 1014 3 10 U
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AACCATGTCTGCCTCCACCAGCAAATTCGCCGATGAGCTGATCGCCAACGCTGCCTACAT
CGGCACACCTGGAAAAGGTATTCTCGCCGCCGACGAGTCCACCGGTACCATCGGAAAGCG
TCTCGCGAGCATCAACGTCGAGAACGTGGAGACCAACAGACGTGCTCTCCGTGAGCTTCT
CTTTACCGCCCCTGGTGCTCTCCCTTGCCTCAGCGGTGTCATCCTCTTCGAGGAGACTCT
TTACCAGAAGAGTTCCGATGGTAAGCTTTTCGTTGATATCTTGAAGGAAGGAGGAGTACT
CCCAGGTATCAAAGTCGATAAGGGTACCGTCGAGCTAGCCGGAACCAACGGTGAGACCAC
CACTCAAGGTCTCGACGGTCTCGGTGAGCGTTGCAAGAAGTACTACGAAGCCGGTGCCCG
TTTCGCCAAGTGGCGTGCGGTCCTCAAGATTGGCGAGAACGAGCCATCAGAGCTTTCCAT
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CGTCACCGAGCGTGTCCTCGCAGCTTGCTACAAG*CTCTTAGCGACCACCACGTTTTGCT
CGAGGGAACTCTCTTGAAGCCTAACATGGTCACTCCTGGATCCGACAGTGCCAAGGTTGC
GCCAGAGGTTATCGCTGAGCACACCGTCCGTGCTCTTCAGAGAACGGTACCAGCAGCTGT
TCCAGCCATCGTGTTCTTGTCTGGTGGACAGAGCGAGGAGGAGGCGACCAAGAACTTGAA
CGCGATGAACCGGTTGAAGACCAAGAAGCCATGGTCGTTGTCTTTCTCATTCGGGCGTGT
TCAATTTTAGAATGATGAGTGGTTTAAAAACGCCCAAATAAAAAGACCATTTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B722TF U 1
AF RS1BT76TF U 8
AF RS1B722JQ C 291
BS 1 74 RS1B722TF
BS 75 75 RS1BT76TF
BS 76 162 RS1B722TF
BS 163 163 RS1BT76TF
BS 164 727 RS1B722TF
BS 728 728 RS1B722JQ
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BS 742 750 RS1B722TF
BS 751 1014 RS1B722JQ

RD RS1B722TF 750 0 0
GGATCCCATCTCTCTCGTCTGCCTTCTTTCTCAAAAACTTCCTCGATCTTTCCGTCGAAA
AACCATGTCTGCCTTCACCAGCAAATTCGCCGATGAGCTGATCGCCAACGCTGCCTACAT
CGGCACACCTGGAAAAGGTATTCTCGCCGCCGACGAGTCCACTGGTACCATCGGAAAGCG
TCTCGCGAGCATCAACGTCGAGAACGTGGAGACCAACAGACGTGCTCTCCGTGAGCTTCT
CTTTACCGCCCCTGGTGCTCTCCCTTGCCTCAGCGGTGTCATCCTCTTCGAGGAGACTCT
TTACCAGAAGAGTTCCGATGGTAAGCTTTTCGTTGATATCTTGAAGGAAGGAGGAGTACT
CCCAGGTATCAAAGTCGATAAGGGTACCGTCGAGCTAGCCGGAACCAACGGTGAGACCAC
CACTCAAGGTCTCGACGGTCTCGGTGAGCGTTGCAAGAAGTACTACGAAGCCGGTGCCCG
TTTCGCCAAGTGGCGTGCGGTCCTCAAGATTGGCGAGAACGAGCCATCAGAGCTTTCCAT
CCACGAGAACGCTTACGGATTGGCTAGATACGCTGTTATCTGCCAGGAGAACGGTCTTGT
ACCAATCGTTGAGCCTGAGATCCTCGTCGACGGATCCCATGACATCCACAAGTGTGCTGC
CGTCACCGAGCGTGTCCTCGCAGCTTGCTACAAG*CTCTTAGCGACCACCACGTTTTGCT
CGAGGGA*CTCTCTTGAAGC*TAACATGGT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RS1BT76TF 724 0 0
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TCTGCCTCCACCAGCAAATTCGCCGATGAGCTGATCGCCAACGCTGCCTACATCGGCACA
CCTGGAAAAGGTATTCTCGCCGCCGACGAGTCCACCGGTACCATCGGAAAGCGTCTCGCG
AGCATCAACGTCGAGAACGTGGAGACCAACAGACGTGCTCTCCGTGAGCTTCTCTTTACC
GCCCCTGGTGCTCTCCCTTGCCTCAGCGGTGTCATCCTCTTCGAGGAGACTCTTTACCAG
AAGAGTTCCGATGGTAAGCTTTTCGTTGATATCTTGAAGGAAGGAGGAGTACTCCCAGGT
ATCAAAGTCGATAAGGGTACCGTCGAGCTAGCCGGAACCAACGGTGAGACCACCACTCAA
GGTCTCGACGGTCTCGGTGAGCGTTGCAAGAAGTACTACGAAGCCGGTGCCCGTTTCGCC
AAGTGGCGTGCGGTCCTCAAGATTGGCGAGAACGAGCCATCAGAGCTTTCCATCCACGAG
AACGCTTACGGATTGGCTAGATACGCTGTTATCTGCCAGGAGAACGGTCTTGTACCAATC
GTTGAGCCTGAGATCCTCGTCGACGGATCCCATGACATCCACAAGTGTGCTGCCGTCACC
GAGCGTGTCCTCGCAGCTTGCTACAAG*CTCTTAGCGACCACCACGTTTTGCTCGAGGGA
CTCT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RS1B722JQ 724 0 0
AGGAGACTCTTTACCAGAAGAGTTCCGATGGTAAGCTTTTCGTTGATATCTTGAAGGAAG
GAGGAGTACTCCCAGGTATCAAAGTCGATAAGGGTACCGTCGAGCTAGCCGGAACCAACG
GTGAGACCACCACTCAAGGTCTCGACGGTCTCGGTGAGCGTTGCAAGAAGTACTACGAAG
CCGGTGCCCGTTTCGCCAAGTGGCGTGCGGTCCTCAAGATTGGCGAGAACGAGCCATCAG
AGCTTTCCATCCACGAGAACGCTTACGGATTGGCTAGATACGCTGTTATCTGCCAGGAGA
ACGGTCTTGTACCAATCGTTGAGCCTGAGATCCTCGTCGACGGATCCCATGACATCCACA
AGTGTGCTGCCGTCACCGAGCGTGTCCTCGCAGCTTGCTACAAGGCTCTTAGCGACCACC
ACGTTTTGCTCGAGGGAACTCTCTTGAAGCCTAACATGGTCACTCCTGGATCCGACAGTG
CCAAGGTTGCGCCAGAGGTTATCGCTGAGCACACCGTCCGTGCTCTTCAGAGAACGGTAC
CAGCAGCTGTTCCAGCCATCGTGTTCTTGTCTGGTGGACAGAGCGAGGAGGAGGCGACCA
AGAACTTGAACGCGATGAACCGGTTGAAGACCAAGAAGCCATGGTCGTTGTCTTTCTCAT
TCGGGCGTGTTCAATTTTAGAATGATGAGTGGTTTAAAAACGCCCAAATAAAAAGACCAT
TTGA

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 3

CO CL3457Contig1 867 3 14 U
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TCCTCTATTGCAAGCTGTGATTAGATCAAACAATAATGGAGATTTTGAAAAGCCGTCTAA
GACGTGACTTCATGTGTAATCTATGCGCCCAGCTCGGTTCGTGCCGTTACGTTTGTGATT
CTTCTCCTCCGTAACGTGTTGCATTTATTCAACGCCATTAACGCCTTAACCGTTTCGACT
CACTGCAATCACGATCACTCATTCAGTGATTCTCATCCTTCTTCCAGCGGTGGATCTCCA
ACTATATAAAGAGCAAGACAGAGACCATGAGTAGTAATTCAAGAACAGAATCAGAAACTG
AATCTTCATCAAGCCTTTAGTCTAGAGACCCTCCTCGCAGATCATCTGTTTCTGATAGCT
TACGAAGATAGAAGAGCCGGGTCTGATTACAGAACAGATGAAATTAATCGGAGAAACTGT
AATCAAGATGCACATGAAGAGTTGATGGGATCTCCAGCGGTGCTAGGAAATATGCTGCTT
GATAGGAAAACTCGGAACCTAACATCATCTTGGTGGGAAAGCTTCCAAGGCCCCGTTATA
TATCAATGTTCCTGACAACTTTGGTTCCAAATCCTTTTTTTTGAACGACCTTTGGTTCCA
AATCCAAGATTAGACCAAACAACGAGTGATAATCTGTTTGATTGGTTTGTCTGTGTTTTA
GGAATAAGTGGGATGGAAAAAGCGAAGAAGAATGGAAAGATTGATATATACATGTGTGTG
TAATTCTGTGTTTATTTATGGCTTTCTATGTTTTGTCTCTGCAAAAGAAGTTGTTTGAGT
ATCAAGAATGGAAGTAAGATTATATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AH44TF U 132
AF RS1FH92TF U 1
AF RS1AH44JQ C 278
BS 1 721 RS1FH92TF
BS 722 723 RS1AH44JQ
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BS 741 741 RS1AH44JQ
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BS 753 761 RS1FH92TF
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BS 784 792 RS1FH92TF
BS 793 867 RS1AH44JQ

RD RS1AH44TF 274 0 0
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TAACGTGTTGCATTTATTCAACGCCATTAACGCCTTAACCGTTTCGACTCACTGCAATCA
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AGCAAGACAGAGACCATGAGTAGTAATTCAAGAACAGAATCAGAAACTGAATCTTCATCA
AGCCTTTAGTCTAGAGACCCTCCTCGCAGAT
TCA

QA 1 271 1 271
DS 

RD RS1FH92TF 804 0 0
GGATGAGAAGCCACCATTGTCGTGAAAAAAAAGAGAAGCCGCCATTGAATAGTAGGTTCA
TCCTCTATTGCAAGCTGTGATTAGATCAAACAATAATGGAGATTTTGAAAAGCCGTCTAA
GACGTGACTTCATGTGTAATCTATGCGCCCAGCTCGGTTCGTGCCGTTACGTTTGTGATT
CTTCTCCTCCGTAACGTGTTGCATTTATTCAACGCCATTAACGCCTTAACCGTTTCGACT
CACTGCAATCACGATCACTCATTCAGTGATTCTCATCCTTCTTCCAGCGGTGGATCTCCA
ACTATATAAAGAGCAAGACAGAGACCATGAGTAGTAATTCAAGAACAGAATCAGAAACTG
AATCTTCATCAAGCCTTTAGTCTAGAGACCCTCCTCGCAGATCATCTGTTTCTGATAGCT
TACGAAGATAGAAGAGCCGGGTCTGATTACAGAACAGATGAAATTAATCGGAGAAACTGT
AATCAAGATGCACATGAAGAGTTGATGGGATCTCCAGCGGTGCTAGGAAATATGCTGCTT
GATAGGAAAACTCGGAACCTAACATCATCTTGGTGGGAAAGCTTCCAAGGCCCCGTTATA
TATCAATGTTCCTGACAACTTTGGTTCCAAATCCTTTTTTTTGAACGACCTTTGGTTCCA
AATCCAAGATTAGACCAAACAACGAGTGATAATCTGTTTGATTGGTTTGTCTGTGTTTTA
G**ATAAGTGGGATGGAAAA*GCGA*GAAGA*TGGAAAGAT*GATATATACATGTGTGTG
TA*TTCTGTGTT
ATTGTGGCTTTC

QA 1 792 1 792
DS 

RD RS1AH44JQ 590 0 0
CTTCTTCCAGCGGTGGATCTCCAACTATATAAAGAGCAAGACAGAGACCATGAGTAGTAA
TTCAAGAACAGAATCAGAAACTGAATTTTCATCAAGCCTTTAGTCTAGAGACCCTCCTCG
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ATGAAATTAATCGGAGAAACTGTAATCA*GATGCACATGAAGAGTTGATGGGATCTCCAG
CGGTGCTAGGAAATATGCTGCTTGATAGGAAAACTCGGAACCTAACATCATCTTGGTGGG
AAAGCTTCCAAGGCCCCGTTATATATCAATGTTCCTGACAACTTTGGTTCCAAATCCTTT
TTTTTGAACGACCTTTGGTTCCAAATCCAAGATTAGACCAAACAACGAGTGATAATCTGT
TTGATTGGTTTGTCTGTGTTTTAGGAATAAGTGGGATGGAAAAAGCGAAGAAGAATGGAA
AGATTGATATATACATGTGTGTGTAATTCTGTGTTTATTTATGGCTTTCTATGTTTTGTC
TCTGCAAAAGAAGTTGTTTGAGTATCAAGAATGGAAGTAAGATTATATAT

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 3

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GGAATATTCACTCTCTCTCTCTTGTCTCTCTCATATCTTCGTGGTACTGGTACGCCATAG
CTCGTCTTCAAAGTCGTCTTTTCTTTTCTTTTCTTGTTTCAATCAGATCTCTTGGTCACT
TGTTAACCAAAAGAATCATGGAACTCAACTTCCTATCTAGAGCTCTTACATCATTCATCC
TTGTACTCACAGTACTTGCATCCTTCTCATCTTCAAGTTTCATCTCTGATGGTGTGTTCG
AACCGCAGAATTTGGCTATTGGAAGAAACCTACTTCAGACTAAGAAAGCATGTCCTGTGA
ACTTTGAGTTTATGAACTACACAATCATAACAAGCCAATGCAAAGGTCCCAAATTCCCAC
CCAAAGAATGCTGTGGCGCTTTCAAGGACTTTGCATGTCCTTACACTGATGAGATCAACG
ACTTGAGTAATGAGTGTGCTACCACTATGTTCAGTTACATCAATCTCTATGGAAAATACC
CACCGAGACTTTTCGCAAACCAGTGCCAAGAAGGTAAAGAAGGTCTCGCCTGCCCCGCTC
TGTCTCCCACCTCAGCAAGCGACACAAACGCAGCCACCACAGCTGCTCCTCGTCTTTGGC
TGGCCGTCTTCACGGCTTTCTTGGTGTTTGTTAACTTGCTCTAAGTCCCATGTCTGTAAT
ATAGCAACTTGAGGAAGCTGGATCTCTGTATATCCACGATTTGTTTTACTTGTACCATCT
CATTCTTTTGATTTTTGGAGCTTCAAAAAATTCTAAATTGATAATATGTATTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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GG
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AAAGAATCATGGAACTCAACTTCCTATCTAGAGCTCTTACATCATTCATCCTTGTACTCA
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DS 

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DS 



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AACAAGAAGTCCTTCAATTTCTGTTCAACGGGGAGAAAAATGAAAGCGGTGCCGATAGCG
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GCAGAAATCGATAGAGAGAAAGAGAGGCAACTCTTCGAATTTTTTCACTGCTCTTCGATC
TCCGATCTTTGTTTCCGGTTCACTCC


BQ
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AF RS1BM11JQ U 1
AF RS1BA80TF C 484
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RD RS1BM11JQ 759 0 0
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CTCCCTCAGTAAAACAAAAATCTTTGAAAAATTTACAAACTTAAGAGGTTTGGTTTCTTT
TGTTTGTTCTTTTCTTATGGGTCGATTCTGATGTCGAGAGGCTCGTGTAGATGATCCGGT
GGTGGTGGTGGTTCTGCTATAGGTAGCATGGATGTGTCATCATTCTTCTTCCCATCTAAT
ATATCTGCTGCATTTTCAGCCAATGCTTTCTCCAATGATGACTTCGCCACTCTTGTAATG
CATACTATCAAAATTACAGCTAGAGCAATGCCAACCATCATTAGTACCCAACGAAAAACT
GACACCTCATGCCATCCATGTGTAATATCAAACAGATCTTTCAGTGTTGTTCCAACATAA
ACTAGCGCAAATGTAATGGGCATCATTCCCAACCAAGTGGCCAGCATGTATTCCCCTAAC
CGAACAGGGGTGACTGATAGCAGGTAATTCAACATATTGAAGGGCAGAAGGGGAACAACA
CGTAGCAGCAAAACTATCTTGAAGCCAGATCTTTGAATTGCAACGGAAACAGCTTGAAAC
TTTGGGTAATGCTTTATTTTTGAGGTGACATAAGATTTACCAATCGTTCTACCAAGTAGA
AATGCTGCTGTTGCACCTAATGTAGCTCCAAGAGAGTCGGCTACAAATCCTACAGGCAGG
CCAAAAAGATAACCACCCCCTAGCGTAAGTACAGAAGCC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RS1BA80TF 803 0 0
ACAGGGGTGACTGATAGCAGGTA*TTCAACATAT*GAAGGGCAGAAGGGGAACAACACGT
AGCAGCAAAACTATCTTGAAGCCAGATCTT*GAATTGCAACGGAAACAGATTGAAACTTT
GGGTAATGCTTTATTTTTGAGGTGACATAAGATTTACCAATCGTTCTACCAAGTAGAAAT
GCTGCTGTTGCACCTAATGTAGCTCCAAGAGAGTCGGCTACAAATCCTACAGGCAGGCCA
AAAAGATAACCACCCCCTAGCGTAAGTACAGAAGCCGGAACCGCCACAACTGTGAGGGGA
ATATAAGCCAAAGCCAGTGCAATTGGCCCAAAGGGTCCAAGATCTTCCTTAATCCATAAC
AAGAAGTCCTTCAATTTCTGTTCAACGGGGAGAAAAATGAAAGCGGTGCCGATAGCGACA
AGGAGCAGCAGCGAGATTGCTATTCGGAAAGTGGACGGAGAAAGAGACCTCGCCGCCATA
TACAAGGATCTGAGGCGTCTGCGCCACCAAGGCCTCGAATGGTCATCCTCATCGCCGTCG
TAGTCATACTGATCTCCATTTGCATAAGATCCTGGCTTGAGCCACGGCCTCGCCCTTAAC
CCCTCCACTTTCGCCAGATTTGTGTTCTCTCCCAAAGACGATTCCGGAGATATGCTTCAG
ACGCGTCGCCTCTATCTCCCGCTGAATTGACACTGGGATGAATCTGAGAGTGAGATTGCA
GAAATCGATAGAGAGAAAGAGAGGCAACTCTTCGAATTTTTTCACTGCTCTTCGATCTCC
GATCTTTGTTTCCGGTTCACTCC

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 3

CO CL3460Contig1 933 3 6 U
GGCCTCTCCATCCTGTCCGAATCTGAACGAATTCGCTCTTCTTCTCCGATCAATCTCCCT
AACTTTTTTTTCCCTTGATACTCATCGAGTAGGTTCATTGTTCTGTTCGCTCAATTCTCA
GATTTTGAAAATGAGTTTGAAGGCTACGATCCTATTATTAGGGCTCGTGTGGAGCTTCCA
GGCAGCGTTAGGTATCAGATTCGTGATAGACAGAGAAGAATGCTTCTCCCACAAGGCTGA
ATACGAAGGGGACACGCTTCACGTCTCTTTCGTCGTCATCAAGTCTGATTCCCAATGGCA
TTTCAACGAGGATGGTGTAGATCTTGTGATACATGGCCCAACAGGGGAACAAATTCATGA
CTTTAGGGAGCAGATCAGTGCCAAGCACGACTTCGTTGTTCAAAAGAAAGGGGTTTACCG
TTTTTGTTTCACAAACAAGTCTCCTTATCATGAAACCATTGATTTCGATGTACAGCTTGG
CCACTTTGCGTACTATGATCAGCATGCAAAGGACGAGCATTTCACTCCTTTGATGGAGCA
AATATCAAAGTTAGAGGAGGCTCTTTACAACATCCAGTTTGAACAGCATTGGTTAGAGGC
TCAGACCGATCGTCAAGCCATTGTGAATGAAAACATGAGCAAAAGAGCAGTACACAAAGC
TTTGTTCGAGTCGTTTGCATTGATCGGTGCAAGTGTCCTCCAAGTTTATCTCCTGCGTCG
CTTGTTTGAGCGCAAACTCGGCATGTCTCGTGTCTAAAAGCTTTTGTTTTTAGCTCTTAA
GAACTTATTCTCCCTCATAAGTTTAAAATGTACCAGAGAATCTTTTTTACTTGACTCCTT
TTACAGACACAATCGAAAGATGTGTTGTTTTTTTCCCTTATGTTGAAGAAACAATCAGCC
TTTTTTTTTCTTTATTAACATAAAGCTGTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RS1GI92TF U 1
AF RS1B666TF U 303
AF RS1GI92JQ C 788
BS 1 555 RS1GI92TF
BS 556 791 RS1B666TF
BS 792 792 RS1GI92JQ
BS 793 898 RS1B666TF
BS 899 899 RS1GI92JQ
BS 900 933 RS1B666TF

RD RS1GI92TF 555 0 0
GGCCTCTCCATCCTGTCCGAATCTGAACGAATTCGCTCTTCTTCTCCGATCAATCTCCCT
AACTTTTTTTTCCCTTGATACTCATCGAGTAGGTTCATTGTTCTGTTCGCTCAATTCTCA
GATTTTGAAAATGAGTTTGAAGGCTACGATCCTATTATTAGGGCTCGTGTGGAGCTTCCA
GGCAGCGTTAGGTATCAGATTCGTGATAGACAGAGAAGAATGCTTCTCCCACAAGGCTGA
ATACGAAGGGGACACGCTTCACGTCTCTTTCGTCGTCATCAAGTCTGATTCCCAATGGCA
TTTCAACGAGGATGGTGTAGATCTTGTGATACATGGCCCAACAGGGGAACAAATTCATGA
CTTTAGGGAGCAGATCAGTGCCAAGCACGACTTCGTTGTTCAAAAGAAAGGGGTTTACCG
TTTTTGTTTCACAAACAAGTCTCCTTATCATGAAACCATTGATTTCGATGTACAGCTTGG
CCACTTTGCGTACTATGATCAGCATGCAAAGGACGAGCATTTCACTCCTTTGATGGAGCA
AATATCAAAGTTAGA

QA 1 555 1 555
DS 

RD RS1B666TF 631 0 0
G
CAACGAGGATGGTGTAGATCTTGTGATACATGGCCCAACAGGGGAACAAATTCATGACTT
TAGGGAGCAGATCAGTGCCAAGCATGACTTCGTTGTTCAAAAGAAAGGGGTTTACCGTTT
TTGTTTCACAAACAAGTCTCCTTATCATGAAACCATTGATTTCGATGTACAGCTTGGCCA
CTTTGCGTACTATGATCAGCATGCAAAGGACGAGCATTTCACTCCTTTGATGGAGCAAAT
ATCAAAGTTAGAGGAGGCTCTTTACAACATCCAGTTTGAACAGCATTGGTTAGAGGCTCA
GACCGATCGTCAAGCCATTGTGAATGAAAACATGAGCAAAAGAGCAGTACACAAAGCTTT
GTTCGAGTCGTTTGCATTGATCGGTGCAAGTGTCCTCCAAGTTTATCTCCTGCGTCGCTT
GTTTGAGCGCAAACTCGGCATGTCTCGTGTCTAAAAGCTTTTGTTTTTAGCTCTTAAGAA
CTTATTCTGCCTCATAAGTTTAAAATGTACCAGAGAATCTTTTTTACTTGACTCCTTTTA
CAGACACAATCGAAAGATGTGTTGTTTTTTTCCCTTATGTTGAAGAAACAATCAGTCTTT
TTTTTTCTTTATTAACATAAAGCTGTTTCT

QA 2 631 2 631
DS 

RD RS1GI92JQ 143 0 0
TTCTCCCTCATAAGTTTAAAATGTACCAGAGAATCTTTTTTACTTGACTCCTTTTACAGA
CACAATCGAAAGATGTGTTGTTTTTT*CCCTTATGTTGAAGAAACAATCAGCCTTTTTTT
TTCTTTATTAACATAAAGCTGTT

QA 1 143 1 143
DS 



AS 1 3

CO CL3461Contig1 663 3 10 U
GGATCATCACAAACAAACAAGAATCAAACAAGTTTGCGAGTCGTTGACATGAGTCCCCAC
CAAACTGAAACACCCGCGAACGATGATGCGGTGGTTCCAAAGACACAGTGGACGTCGGAG
TTTGGTGAACCGTCGCCACTGAGAAAGATGATATCCGTGTCTTCAATCGCCGCTGGTGTA
CAGTTCGGATGGGCCTTACAGCTATCTCTTATGACTCCCTACGTGCAGCTCCTCGGCATC
CCACACAAGTGGTCTTCTCTCATCTGGCTATGCGGTCCCATCTCCGGCATGCTCGTCCAG
CCGACCGTCGGTTACTACAGCGACCGATGCACGTCGAAGTTCGGTCGTCGGCGTCCTTTC
ATCGCTTCCGGAGCCATCCTCGTGGTAGTCGCTGGTTTACTGATCGGGTACGCCGCTGAT
CTCGGACAAGTGGCAGGAGACAAACTCGAGGACAAGGTGAAGGTGCGTGCCATATGGTTC
TTCGCTCTCGGGTTCTGGATCCTCGACGTGGCGAATAACACTCTCCAAGGCCCTTGTCGT
GCTTTTTTAGCCGACTTAGCTGCGGGAGACGCGAGGAAAACGCGGACCGCAAACGCGTTT
TTTTCCTTTTTCATGGCGGTTGGAAACATATTGGGATACGCGGCGGGTTCTTACACCAAC
CTA


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 5 5 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1G309TF U 5
AF RS1GZ39TF U 1
AF RS1H082TF U 4
BS 1 65 RS1GZ39TF
BS 66 66 RS1H082TF
BS 67 199 RS1GZ39TF
BS 200 200 RS1H082TF
BS 201 477 RS1GZ39TF
BS 478 478 RS1H082TF
BS 479 603 RS1GZ39TF
BS 604 604 RS1H082TF
BS 605 617 RS1GZ39TF
BS 618 663 RS1H082TF

RD RS1G309TF 584 0 0
G
ATCACAAACAAACAAGAATCAAACAAGTTTGCGAGTCGTCGACATGAGTCCCCACCAAAC
TGAAAACCCCAAGAACGATGATGCGGTGGTTCCAGAGACACAGTGGACGTCGGAGTTTGG
TGAACCGTCGCCACTGAGAAAGATGATATCCGTCTCTTCAATCGCCGCCGGTGTACAGTT
CGGATGGGCCTTACAGCTATCTCTTATGACACCCTACGTGCAGCTCCTCGGCATCCCACA
CAAGTGGTCTTCTCTCATCTGGCTATGCGGTCCCATCTCCGGCATGCTCGTCCAGCCGAC
CGTCGGTTACTACAGCGACCGATGCACGTCGAGGTTCGGTCGTCGGCGTCCTTTCATCGC
TTCCGGAGCCATCCTCGTGGTAGTCGCTGGTTTACTGATCGGGTACGCCGCTGATCTCGG
ACAAGTGACAGGAGACAAACTCGAGGACAAGGTGAAGGTGCGTGCCATATGGTTCTTCGC
TCTCGGGTTCTGGATCCTCGACGTGGCGAATAACACTCTCCAAGGCCCTTGTCGTGCTTT
TCTAGCCGACTTAGCTGCGGGAGACGCGAGGAAAACGCG
AACC

QA 2 580 2 580
DS 

RD RS1GZ39TF 617 0 0
GGATCATCACAAACAAACAAGAATCAAACAAGTTTGCGAGTCGTTGACATGAGTCCCCAC
CAAACCGAAACACCCGCGAACGATGATGCGGTGGTTCCAAAGACACAGTGGACGTCGGAG
TTTGGTGAACCGTCGCCACTGAGAAAGATGATATCCGTGTCTTCAATCGCCGCTGGTGTA
CAGTTCGGATGGGCCTTAC*GCTATCTCTTATGACTCCCTACGTGCAGCTCCTCGGCATC
CCACACAAGTGGTCTTCTCTCATCTGGCTATGCGGTCCCATCTCCGGCATGCTCGTCCAG
CCGACCGTCGGTTACTACAGCGACCGATGCACGTCGAAGTTCGGTCGTCGGCGTCCTTTC
ATCGCTTCCGGAGCCATCCTCGTGGTAGTCGCTGGTTTACTGATCGGGTACGCCGCTGAT
CTCGGACAAGTGGCAGGAGACAAACTCGAGGACAAGGTGAAGGTGCGTGCCATATGGCTC
TTCGCTCTCGGGTTCTGGATCCTCGACGTGGCGAATAACACTCTCCAAGGCCCTTGTCGT
GCTTTTTTAGCCGACTTAGCTGCGGGAGACGCGAGGAAAACGCGGACCGCAAACGCGTTT
TTT*CCTTTTTCATGGC

QA 1 617 1 617
DS 

RD RS1H082TF 660 0 0
GG
ATCACAAACAAACAAGAATCAAACAAGTTTGCGAGTCGTTGACATGAGTCCCCACCAAAC
TGAAACACCCGCGAACGATGATGCGGTGGTTCCAAAGACACAGTGGACGTCGGAGTTTGG
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CGGATGGGCCTTACAGCTATCTCTTATGACTCCCTACGTGCAGCTCCTCGGCATCCCACA
CAAGTGGTCTTCTCTCATCCGGCTATGCGGTCCCATCTCCGGCATGCTCGTCCAGCCGAC
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TTTAGCCGACTTAGCTGCGGGAGACGCGAGGAAAACGCGGGCCGCAAACGCGTTTTTTTC
CTTTTTCATGGCGGTTGGAAACATATTGGGATACGCGGCGGGTTCTTACACCAACCTA

QA 3 660 3 660
DS 



AS 1 3

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AAAGTCAAAGTATGGTGTTGGTGTTCACTTGGCTGCTGCAAACTGCCCTTACTTCAGTGC
GACACATTGTGATGTTGATGAAAACGGTGTGCGTCACATGGTTTTGCGCCGTGTGATAAT
GGGGAATATGAAGCCACTTGGTGGTGATAGAGCTCAGTTCTTTACTGGTGGAGAAGAGTA
TGATAATGGAGTAGATAATGTGTCGAGTCCGAAGCATTATGTTGTCTGGAACATGAATAT
GAACACTCATGTTTGTCCAGAATTTGTAGTTAGCTTCAAGCTGTTGTCTATCCCCAATGC
TGAAGGGAATTTACTTTCTGCTACTCAGAGTAAGCATGAGAGTTCAGGGCTCACTTTGGA
AGGAACCAAAGGATCTCCCTCCAATGGGCTAGGAAGCGGAAACAACAGTGCAGGTTCCAG
CACTAGGAAGCCCAGCTCTAATTTGATGCCTTACCCTCTGCTCTTCAATGCAATCTCAAG
CAAAATTGATCCGAAAGCCATGGACTTGATCACTGCTTATTACCAACAACTTAGGGAGAA
GAAGCTATCTCGAGAGGGATTTTCGAAGAAGCTGCGGATGATTGTTGGAGATGATGATCT
GCTGAGAACCACCATTACAGCTCTTCAACGCTTGCCACACCCTGCTATTAAAATGGAACC
GATCACAAGTGGCTACTAAAGATGGAGTTAGAAAAATGTGTCGACTTCTTTGTGCTGTCT
TGACTTTATAATAAGATTAAGACAAGGAACTTGTTCCTTTTTTAGTTTTCTCTTTGTGAA
ACAAATCTCCATTGTCCAGATATTTCCTCAATTTGAATTTGTCTTTATCGATCAACAGCT
TATGTTCTTTGTTATTCATCAGACTGGCTTTTAACTCAATTGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EG74TF U 1
AF RS1EG74JQ C 465
AF RS1EY32TF U 738
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BS 491 491 RS1EG74JQ
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AAAGTCAAAGTATGGTGTTGGTGTTCACTTGGCTGCTGCAAACTGCCCTTACTTCAGTGC
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TGATAATGGAGTAGATAATGTGTCGAGTCCGAAGCATTATGTTGTCTGGAACATGAATAT
GAACACTCATGTTTGTCCAGAATTTGTAGTTAGCTTCAAGCTGTTGTCTATCCCCAATGC
TGAAGGGAATTTACTTTCTGCTACTCAGAGTAAGCATGAGAGT

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1EG74JQ 779 0 0
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TGTCTATCCCCAATGCTGAAGGGAATTTACTTTCTGCTACTCAGAGTAAGCATGAGAGTT
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QA 1 779 1 779
DS 

RD RS1EY32TF 495 0 0
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CAGCTCTTCAACGCTTGCCACACCCTGCTATTAAAATGGAACCGATCACAAGTGGCTATT
AAAGATGGAGTTAGAAAAATGTGTCGACTTCTTTGTGCTGTCTTGACTTTATAATAAGAT
TAAGACAAGGAACTTGTTCCTTTTTTAGTTTTCTCTTTGTGAAACAAATCTCCATTGTCC
AGATATTTCCTCAATTTGAATTTGTCTTTATCGATCAACAGCTTATGTTCTTTGTTATTC
ATCA
TTGGCTTTTAA

QA 1 484 1 484
DS 



AS 1 3

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AGGTGGTGAAGAAGAGGTCCGCCAAGTTCATCAGACCCCAGAGCGACCGTAGAATAACCG
TCAAGGAAAGCTGGAGGAGGCCAAAGGGTATTGATTCAAGGGTCAGAAGAAAGTTCAAAG
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CCAATGGATTCAAGAAGTTCGTTGTTCACAACACGAGTGATCTGGAGTTGTTGATGATGC
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GCCAGGAAGACGAGTGAAGAAGGCAATACACTTGAGAGAGATATCTTATTGTTTCTGGTT
TATTACTACTGTGTTTTGTGTTTGCATTCAACAAACATGAGTTTTGGTTTTCAGACCGTT
TCTTTGATTATTTCTTATTTCAGTATTTCTCAAAGGCTAGGCGTTTTATGGTCTCTCTCT
TACAAGATAAATCAATTGTTTCTTATCACAAAACTCAGAAAGCTTTCGACTTTGTGACAT
GACCAAATAAATGCCTATGAGAGATGTTTGTCTCTCACTAAATGAATACTTTTGGCTGGT
GTGAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1DQ41JQ C 1
AF RS1DQ41TF U 1
AF RS1F857TF U 1
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AC

QA 1 569 1 569
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GTGAA

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 3

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TTTGAA


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RS1B771JQ C 259
AF RS1AZ15TF U 257
AF RS1B771TF U 1
BS 1 487 RS1B771TF
BS 488 488 RS1AZ15TF
BS 489 726 RS1B771TF

RD RS1B771JQ 205 0 0
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DS 

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TT
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GTT

QA 3 350 3 350
DS 

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TGCAATTTGGTT*GTGGAGAGGCTCGGGGATTACCTCATCGAGTCTGATCTCTAAAAATT
TATGTTT*CGATGTCTCTTCTTTTTAACTAAAAAAGAATGGTCATTGCCCCCTTTTTTCG
TTGTGATTGATTGTAGTAACGCAATCGATCTGAACTTTAGAACCAAATATCTTTGTTTGG
TCTTCTTGTTCCCGGGTTTGGGTTTGTGTGTCTTGTAATGGCATTTGATGATATTATTTT
TTCTTTCATTATGTGTTTTCTTGGATTTTGCTTCTTCGAATCTCTTGGATGGATATGTGG
TTTGAA

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 3

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TTCTTCTTCTCCAGGTTTCTTAGGCTGGTTGACTGGTGGATCCTCTGGCTCCCTTACTTC
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AAGCAAACTCAAGATCACTACTCTTCCTAATGGCCTCAAAATCGCCTCAGAGATGTCTCC
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ACGACACCGTAAGCAGCAAGTTTTGTTGAAGCAGGAAAATATTTGCTAGACATTCAACAA
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TATTATTTTTTATTTAAATGGAATTTTGTATTCCAATAAATATTTTCTTACTACATTAAC
ACTAAGTAACACAGTCACAGTGGTTCTGTGATGACATTTTTATGCTGTTTCGAATTTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DF92TF U 1
AF RS1F858TF U 15
AF RS1DF92JQ C 517
BS 1 244 RS1DF92TF
BS 245 250 RS1F858TF
BS 251 657 RS1DF92TF
BS 658 733 RS1F858TF
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BS 746 1140 RS1DF92JQ

RD RS1DF92TF 657 0 0
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TCATCATCCTCGGCTTCGACTCGATACTCATTTTCTCCGATTTAAAGTTTCCATACTCGC
CATGTATCGCACGGCAGCTTCACGAGCCAGGGCTCTCAAGGGATCTCTTAGCCGAGGTTT
GGGACCTGCGGCGCGTTATGCGAGCTCTAGTGCTGTTGCTACGAGCTCTTCTTCTTCTTC
TTCT******CCAGGTTTCTTAGGCTGGTTGACTGGTGGATCCTCTGGCTCCCTTACTTC
ACTGGACATGCCACTACAGGGCGTTTCTCTTCCTCCCCCGCTTCCTGACCGCGTCGAGCC
AAGCAAACTCAAGATCACTACTCTTCCTAATGGCCTCAAAATCGCCTCAGAGATGTCTCC
CAATCCGGCAGCTTCTATTGGTTTGTACGTTGATTGTGGTTCGATCTATGAGGCTCCTTA
TTTCCATGGAGCAACGCATTTGCTTGAAAGGATGGCTTTCAAGAGCACGACCAACAGAAG
CCATCTACGTCTCGTCAGGGAAATAGAAGCTATTGGAGGGAACACCTCTGCGTCTGCGTC
TCGGGAGCAGATGAGTTACACTATTGATGCTCTTAAAACCTATGTCCCTGAAATGGT

QA 1 657 1 657
DS 

RD RS1F858TF 731 0 0
ACTAAACTGAGATTATTCTCCGTCTCGCTCACCTCTCCTCTCAGACTCATCATCCTCGGC
TTCGACTCGATACTCATTTTCTCCGATTTAAAGTTTCCGTACTCGCCATGTATCGCACGG
CAGCTTCACGAGCCAGGGCTCTCAAGGGATCTCTTAGCCGAGGTTTGGGACCTGCGGCGC
GTTATGCGAGCTCTAGTGCTGTTGCTACGAGCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCCAG
GTTTCTTAGGCTGGTTGACTGGTGGATCCTCTGGCTCCCTTACTTCACTGGACATGCCAC
TACAGGGCGTTTCTCTTCCTCCCCCGCTTCCTGACCGCGTCGAGCCAAGCAAACTCAAGA
TCACTACTCTTCCTAATGGCCTCAAAATCGCCTCAGAGATGTCTCCCAATCCGGCAGCTT
CTATTGGTTTGTACGTTGATTGTGGTTCGATCTATGAGGCTCCTTATTTCCATGGAGCAA
CGCATTTGCTTGAAAGGATGGCTTTCAAGAGCACGACCAACAGAAGCCATCTACGTCTCG
TCAGGGAAATAGAAGCTATTGGAGGGAACACCTCTGCGTCTGCGTCCCGGGAGCAGATGA
GTTACACTATTGATGCTCTTAAAACCTATGTCCCTGAAATGGTTGAGGTTCTTATTGACA
GTGTGAGGAACCCTGCTTTCTTGGACTGGGAAGTCAATGAAGAGCTACGTAAAATGAAG*
TGGAGATAGCG

QA 1 731 1 731
DS 

RD RS1DF92JQ 624 0 0
TTTCAAGAGCACGACCAACAGAAGCCATCTACGTCTCGTCAGGGAAATAGAAGCTATTGG
AGGGAACACCTCTGCGTCTGCGTCTCGGGAGCAGATGAGTTACACTATTGATGCTCTTAA
AACCTATGTCCCTGAAATGGTTGAGGTTCTTATTGACAGTGTGAGGAACCCTGCTTTCTT
GGACTGGGAAGTCAATGAAGAGCTACGTAAAATGAAGGTGGAGATAGCGGAACTTGCGAA
GAACCCTATGGGGTTCCTCATGGAGGCTGTTCTTGAAGACAGTAGACGAACTTACATTGA
AAGACATTACAGATTTCACCAGCAAGATTATTTCAAAGCCTTTGACAATGGGTTCCTTTG
GAGATGTGTTGTCTGTTCCGAGTTACGACACCGTAAGCAGCAAGTTTTGTTGAAGCAGGA
AAATATTTGCTAGACATTCAACAATGTTTTGAGACTTCTAAAATAAATCTTTTGGGGAGA
AGAGAAGAAGACCCAACCAAATATTATTATTTTTTATTTAAATGGAATTTTGTATTCCAA
TAAATATTTTCTTACTACATTAACACTAAGTAACACAGTCACAGTGGTTCTGTGATGACA
TTTTTATGCTGTTTCGAATTTCAG

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 3

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AGTTGGGAAAATAAGATTTGCATGATTTAAAAGCTGTATCATGTTCTTAAGGAACACATG
GAACAATCTTATCATGAACCTTCTCAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G072TF U 20
AF RS1AO26TFB U 1
AF RS1G072JQ C 308
BS 1 689 RS1AO26TFB

RD RS1G072TF 569 0 0
G
ATCTTCTCTCAAGTTCCTTCGGAGCAACTCTTCCTTCATCGTCGCGTGGATTTCATTTTT
CGTTTACACAATCGCTGAAAAATGGAAGGAGAAGCGGGAAACGGAGGATCTCGGAAACGC
ATGAAGCCTTCTGATGAAGAGGGAAAAGGAGATTCGAGAGATGGAATGAGCCTCGATACA
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TCTCAAATTCTCGACAAGATTGAGAGCTTCACTCAGACTGTCTCTAATCTGCTTGACACA
GGAAAGACAATGTTCAAGGAACTCAGTAACGAATTCGAAGAACGCTTGATCACGATACAC
AAGGAGCATGTTGAGAAATGGCAGGAAGAGATCAAGGAATTGCGTTTGCTTGATGCATCT
AACGAGGAGACTACTTCTCTCTTACACAACGCTCGCTTCCTCATTCAGAATCCTAACATT
GAGCCTTGAGGTAACCAATCTAAACCCACAAAGGAAGTAGTACTATCATCCATTACTGAG
AACATTTTACATATCGCCTTAGACCAAC

QA 2 569 2 569
DS 

RD RS1AO26TFB 689 0 0
GGACACTCGCTCACTCTTTCATCTTCTCTCAAGTTCCTTCGGAGCAACTCTTCCTTCATC
GTCGCGTGGATTTCATTTTTCGTTTACACAATCGCTGAAAAATGGAAGGAGAAGCGGGAA
ACGGAGGATCTCGGAAACGCATGAAGCCTTCTGATGAAGAGGGAAAAGGAGATTCGAGAG
ATGGAATGAGCCTCGATACAACTGAGAATGAAGAAACTGAGACGAAACTTGTTGCTTCTG
ATGAGATGGAACTTAACATTTCTCAAATTCTCGACAAGATTGAGAGCTTCACTCAGACTG
TCTCTAATCTGCTTGACACAGGAAAGACAATGTTCAAGGAACTCAGTAACGAATTCGAAG
AACGCTTGATCACGATACACAAGGAGCATGTTGAGAAATGGCAGGAAGAGATCAAGGAAT
TGCGTTTGCTTGATGCATCTAACGAGGAGACTACTTCTCTCTTACACAACGCTCGCTTCC
TCATTCAGAATCCTAACATTGAGCCTTGAGGTAACCAATCTAAACCCACAAAGGAAGTAG
TACTATCATCCATTACTGAGAACATTTTACATATCGCCTTAGACCAACATATATGTGTTT
AGTTGGGAAAATAAGATTTGCATGATTTAAAAGCTGTATCATGTTCTTAAGGAACACATG
GAACAATCTTATCATGAACCTTCTCAGAT

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1G072JQ 378 0 0
TCTGCTTGACACAGGAAAGACAATGTTCAAGGAACTCAGTAACGAATTCGAAGAACGCTT
GATCACGATACACAAGGAGCATGTTGAGAAATGGCAGGAAGAGATCAAGGAATTGCGTTT
GCTTGATGCATCTAACGAGGAGACTACTTCTTTCTTACACAACGCTCGCTTCCTCATTCA
GAATCCTAACATTGAGCCTTGAGGTAACCAATCTAAACCCACAAAGGAAGTAGTACTATC
ATCCATTACTGAGAACATTTTACATATCGCCTTAGACCAACATATATGTGTTTAGTTGGG
AAAATAAGATTTGCATGATTTAAAAGCTGTATCATGTTCTTAAGGAACACATGGAACAAT
CTTATCATGAACCTTC
CC

QA 1 376 1 376
DS 



AS 1 3

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AAGAAAAAGAAAAAATCAAAGTTCTATAGACACAGTCCTCTTTTACTCAAGGCAGAAATT
TCAAAGCAAGCTATGTTCCTCAAGTTAAAGAAAAAACATCATCCGTGTTTGGAGCTAGTA
ATCTTGTTGCTAGCCTTTCCCTCGGAAACTTTTCATGTAGAAGAATCCTCCCCTTCCATG
GGCAAGTCTGGTTGTGTTGCCCATTCAGTCCACGAGCCATCGTAAACTGGCACATCAGTT
TTCCCCACTCGGTGAAGCCCCATTGCAAGGATGCAAGCTGTTACCCCAGTGCCACACGAA
GCCATAATAGGCTTGTCCAATGAGATCTCTTCTTGTTCAAATCGTTTCTTCAGGTCTTCT
GCTGGCGACATTGTTTGAGAAGCAGAATCAAACAACTGAGGATAAGGGACACACTTGCTT
CCAGGGATATGACCACTTCTTATTCCCTTACGGGGTTCTGGAGCTGTACCATCAAACCTG
GCTTTGGAACGTGCGTCTACGTGTTGATATGTTTGATCCTCCAAATTGTTCTTAACCTGA
TCAAGTGTCCACACTAGATGCGGCTGGAACTTGGTCTGAAAGGTTATTGGACTCACGGTA
TGTCCTTGGTAGATTTTCTCTATAGCCTCACTTGCAGCACTGGCTTTCAAAATAGCATCA
CCTGATGCACTAGATTCAATATCGTAACCTGAAGCACGCCATCTCGGTAGTCCTCCATCC
AGCACCCACACTTTGTCATGTCCGAAAACTCGGAACATCCACCATACACGAGCTGCACTA
AAGACCCCCTTCGCATCATAAACAACCACTCCATCCTCGTTATCAATTCCAAGAGCAGAG
CAACCAGCAGCAAAAGCTTCCTCAGAGGGCAACATATGTGGCAAACTTGTTGATCGATCT
GATATTCCATCCAAATCAAAGAAGAGAGCACCGGGGATATGAGCAACCTGATATTCTTGG
ATGGGATTCCTCTGCTCATCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GK95JQ U 13
AF RS1DH14JQ U 1
AF RS1GK95TF C 414
BS 1 426 RS1DH14JQ
BS 427 427 RS1GK95JQ
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BS 495 495 RS1GK95TF
BS 496 557 RS1DH14JQ
BS 558 1042 RS1GK95TF

RD RS1GK95JQ 428 0 0
CATGAATCATGACCATTAACAATTTCATGTTTGTTTGACTTTATTCCAAAGAAAAAGAAA
AAATCAAAGTTCTATAGACACAGTCCTCTTTTACTCAAGGCAGAGATTTCAAAGCAAGCT
ATGTTCCTCAAGTTAAAGAAAAAACATCATCCGTGTTTGGAGCTAGTAATCTTGTTGCTA
GCCTTTCCCTCGGAAACTTTTCATGTAGAAGAATCCTCCCCTTCCATGGGCAAGTCTGGT
TGTGTTGCCCATTCAGTCCACGAGCCATCGTAAACTGGCACATCAGTTTTCCCCACTCGG
TGAAGCCCCATTGCAAGGATGCAAGCTGTTACCCCAGTGCCACACGAAGCCATAATAGGC
TTGTCCAATGAGATCTCTTCTTGTTCAAATCGTTTCTTCAGGTCTTCTGCTGGCGACATT
GTTTGAGA

QA 1 428 1 428
DS 

RD RS1DH14JQ 557 0 0
CATAATTGTTTTCATGAATCATGACCATTAACAATTTCATGTTTGTTTGACTTTATTCCA
AAGAAAAAGAAAAAATCAAAGTTCTATAGACACAGTCCTCTTTTACTCAAGGCAGAAATT
TCAAAGCAAGCTATGTTCCTCAAGTTAAAGAAAAAACATCATCCGTGTTTGGAGCTAGTA
ATCTTGTTGCTAGCCTTTCCCTCGGAAACTTTTCATGTAGAAGAATCCTCCCCTTCCATG
GGCAAGTCTGGTTGTGTTGCCCATTCAGTCCACGAGCCATCGTAAACTGGCACATCAGTT
TTCCCCACTCGGTGAAGCCCCATTGCAAGGATGCAAGCTGTTACCCCAGTGCCACACGAA
GCCATAATAGGCTTGTCCAATGAGATCTCTTCTTGTTCAAATCGTTTCTTCAGGTCTTCT
GCTGGCAACATTGTTTGAGAAGCAGAATCAAACAACTGAGGATAAGGGACACACTTGCTT
CCAGGGATATGACCCCTTCTTATTCCCTTACGGGGTTCTGGAGCTGTACCATCAAACCTG
GCTTTGGAACGTGCGTC

QA 1 557 1 557
DS 

RD RS1GK95TF 629 0 0
GTCTTCTGCTGGCGACATTGTTTGAGAAGCAGAATCAAACAACTGAGGATAAGGGACACA
CTTGCTTCCAGGGATATGACCACTTCTTATTCCCTTACGGGGTTCTGGAGCTGTACCATC
AAACCTGGCTTTGGAACGTGCGTCTACGTGTTGATATGTTTGATCCTCCAAATTGTTCTT
AACCTGATCAAGTGTCCACACTAGATGCGGCTGGAACTTGGTCTGAAAGGTTATTGGACT
CACGGTATGTCCTTGGTAGATTTTCTCTATAGCCTCACTTGCAGCACTGGCTTTCAAAAT
AGCATCACCTGATGCACTAGATTCAATATCGTAACCTGAAGCACGCCATCTCGGTAGTCC
TCCATCCAGCACCCACACTTTGTCATGTCCGAAAACTCGGAACATCCACCATACACGAGC
TGCACTAAAGACCCCCTTCGCATCATAAACAACCACTCCATCCTCGTTATCAATTCCAAG
AGCAGAGCAACCAGCAGCAAAAGCTTCCTCAGAGGGCAACATATGTGGCAAACTTGTTGA
TCGATCTGATATTCCATCCAAATCAAAGAAGAGAGCACCGGGGATATGAGCAACCTGATA
TTCTTGGATGGGATTCCTCTGCTCATCAC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 3

CO CL3468Contig1 995 3 13 U
GCGATAATTTGGCTTCCAAAAGAGATGAACATACTGCAAAAGCAAGCAGCACTGTCGTGG
AATCTGATCGTGAGAAACAGAGCAGTTATTCTCCACCATCTGATGTTGGTGTAGTAGGAT
CCTTCTCTACAAACGAGAGTGATGCTCCAAGGAAAATATCCGATGTGGACTTGCGGGATG
TCCTAACGGCTGCTCAAGCTGCTGCTGATTCAGCGGAACGTGCGGCCGCAGCTGCCCGTT
CAGCTGCAAGTCCTGCGCAGCTCAGAATCAACGAGCTCACGAAGAAGACGCATGACCAGT
CTCCAGAGAGTCCGACTGAGAATCCTTTCTATTCAACCCCACCACAACAGACGATGGAAA
GACCTCAATCTGATCATACTGAGTTCCAAATGGAAGAGACGTCATCACTTTTCAACCACC
AAACAGAGAGACTCCACTCAATGGAAAAACCGCAGTTTGATCACCAAAACTCATCTGCCA
GCAGCTACGGAGATCTTACTGACTTCCAACTAGGTGACTATTCATCACCTTTTAACCACC
AAGCAGGGAGACTCCCTTCAATGGAAAAGCCTCGGTTTGATCATCAGAATTCATCAGCCA
GCAGCTACGGAGATATTACAGAGCTCCAAAGACAAGATACCTCGTCATTTGACAGACTCA
GTCCTTCTGACCAAGACCACCAGCAAATGAGACTACCTTCGAGGGAAGATGATCCATATT
ACTCATACCCTAATCTGTTCACATCGCAGAACCCTGACCGCTCACCTGGCTCTCGTTCAT
TTTCAGACACTTCAAAACCTGCCCATGATTCTTGATCTCTCACCTTCAAATTTATAATGC
AAACTTGATCCTCATCTTGTGGAACAAAGAGTTCAAAACGCTTTTTTAAAACTGCTTTTC
TTTCCTCTGTTCTTTTGTTTGTGTGGAAAATTTGTATAATATATAGAAACTTGGTGTGAT
TGATTATGTTTAAAATAAAAGGGCGTTTGCTCAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1GH92TF U 1
AF RS1C628TF U 391
AF RS1AO93TFB U 715
BS 1 398 RS1GH92TF
BS 399 399 RS1C628TF
BS 400 406 RS1GH92TF
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BS 451 451 RS1C628TF
BS 452 542 RS1GH92TF
BS 543 852 RS1C628TF
BS 853 853 RS1AO93TFB
BS 854 971 RS1C628TF
BS 972 995 RS1AO93TFB

RD RS1GH92TF 542 0 0
GCGATAATTTGGCTTCCAAAAGAGATGAACATACTGCAAAAGCAAGCAGCACTGTCGTGG
AATCTGATCGTGAGAAACAGAGCAGTTATTCTCCACCATCTGATGTTGGTGTAGTAGGAT
CCTTCTCTACAAACGAGAGTGATGCTCCAAGGAAAATATCCGATGTGGACTTGCGGGATG
TCCTAACGGCTGCTCAAGCTGCTGCTGATTCAGCGGAACGTGCGGCCGCAGCTGCCCGTT
CAGCTGCAAGTCCTGCGCAGCTCAGAATCAACGAGCTCACGAAGAAGACGCATGACCAGT
CTCCAGAGAGTCCGACTGAGAATCCTTTCTATTCAACCCCACCACAACAGACGATGGAAA
GACCTCAATCTGATCATACTGAGTTCCAAATGGAAGAGTCGTCATCTCTTTTCAACCACC
AAACAGAGAGACTCCCCTCAATGGAAAAAC*GCAGTTTGATCACCAAAACTCATCTGCCA
GCAGCTACGGAGATCTTACTGACTTCCAACTAGGTGACTATTCATCACCTTTTAACCACC
AA

QA 1 542 1 542
DS 

RD RS1C628TF 581 0 0
G
GGAAGAGACGTCATCACTTTTCAACCACCAAACAGAGAGACTCCACTCAATGGAAAAACC
GCAGTTTGATCACCAAAACTCATCTGCCAGCAGCTATGGAGATCTTACTGACTTCCAACT
AGGTGACTATTCATCACCTTTTAACCACCAAGCAGGGAGACTCCCTTCAATGGAAAAGCC
TCGGTTTGATCATCAGAATTCATCAGCCAGCAGCTACGGAGATATTACAGAGCTCCAAAG
ACAAGATACCTCGTCATTTGACAGACTCAGTCCTTCTGACCAAGACCACCAGCAAATGAG
ACTACCTTCGAGGGAAGATGATCCATATTACTCATACCCTAATCTGTTCACATCGCAGAA
CCCTGACCGCTCACCTGGCTCTCGTTCATTTTCAGACACTTCAAAACCTGCCCATGATTC
TTGATCTCTCACCTTCAAATTTATAATGCAAACTTGATCCTTATCTTGTGGAACAAAGAG
TTCAAAACGCTTTTTTAAAACTGCTTTTCTTTCCTCTGTTCTTTTGTTTGTGTGGAAAAT
TTGTATAATATATAGAAACTTGGTGTGATTGATTATGTTT

QA 2 581 2 581
DS 

RD RS1AO93TFB 281 0 0
G
ATATTACTCATACCCTAATCTGTTCACATCGCAGAACCCTGACCGCTCACCTGGCTCTCG
TTCATTTTCAGACACTTCAAAACCTGCCCATGATTCTTGATCTCTCACCTTCAAATTTAT
AATGCAAACTTGGTCCTCATCTTGTGGAACAAAGAGTTCAAAACGCTTTTTTAAAACTGC
TTTTCTTTCCTCTGTTCTTTTGTTTGTGTGGAAAATTTGTATAATATATAGAAACTTGGT
GTGATTGATTATGTTTAAAATAAAAGGGCGTTTGCTCAAG

QA 2 281 2 281
DS 



AS 1 3

CO CL3469Contig1 856 3 3 U
AAAGAAAGAAAGAGTAGTATTTATATTCAAGGAAGAGAGTTGTGTAAATAATAATATTTA
CATGATAAGAAAAAATTACTTGGTGAAACTAAGCTTAAAAAGAACAGCGGCAGCTTGATC
ACCAGCCAATAAAAAATAAGGGTGTCTGAAAGCAGCAGCGGCAAAAAGGCGTCCGCGTCT
CAAAAAACCTCGCTCGGATATAAGTTTAGTGACGAGGTCCCAGCCTCTGCCAAAGTCCAA
ATCAAGGATGCTCAAGTCAGGCCTAGTCCGAGTCCTGTCACGCCATCTATTAAGGTCATA
TTGAACAGACTTGATCTCAAGATTGAAATTCTTCAAACCCGCAAAAAATCTTATGGTAGG
AACCGCCATTTGCAGAAGCACTATCCCAGCAAAATACATATCAAACAGATCCGGACTGTT
CAACTGCCAAAAAATGGGGGAAAGCAAAGCGGCAATAGGCTCGGGAGGAGGAGTTGGGGT
TTCCTCGGGGAGGACATAGAGCTCAGGAGGACAGTAGTCAGGATCTAGCAATGTGCGCTC
AGGGATGTAATTCTTGCCGATGCGAAGATCAGCAGCAGCACCAAAGTCAATGAGCTTAAT
CTGCCCCTTCTTTGTAACCACCAAGTTGGCGGGCTTCACGTCCCTGTGAACAATGCCAGT
ATCATGGATCTTCCTGAGAGATGTAATGATCTGACGCATTATCTGCTTAATGATGAGTGC
ACGACGTTTCACAGATTCCACACCTTGAAGAACACGCCCAAACATGATGGACTCCAGATT
TGAAGGAAAACTCCTATCTTTCATGTAATCACCCAGATCACGGTCTCCCTCGAACCTCCA
GACGAGCCATTTGCCG


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EA96JQ U 1
AF RS1CQ67JQ U 4
AF RS1AJ85TF C 559
BS 1 651 RS1EA96JQ
BS 652 744 RS1CQ67JQ
BS 745 856 RS1AJ85TF

RD RS1EA96JQ 651 0 0
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CATGATAAGAAAAAATTACTTGGTGAAACTAAGCTTAAAAAGAACAGCGGCAGCTTGATC
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QA 1 651 1 651
DS 

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GATAAGAAGAAATTACTTGGTGAAACTAAGCTTAAAAAGAACAGCGGCAGCTTGATCACC
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AGAACCTCGCTCGGATATAAGTTTAGTGACGAGGTCCCAGCCTCTGCCAGAGTCCAGATC
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AACAGACTTGATCTCAAGATTGAAATTCTTCAAACCCGCAAAAGATCTTATGGTAGGAAC
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CTGCCAGAGAATGGGGGAAAGCAAAGCGGCAATAGGCTCGGGAGGAGGAGTTGGGGTTTC
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ACGTTTCACAGATTCCACACC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1AJ85TF 298 0 0
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CACACCTTGAAGAACACGCCCAAACATGATGGACTCCAGATTTGAAGGAAAACTCCTATC
TTTCATGTAATCACCCAGATCACGGTCTCCCTCGAACCTCCAGACGAGCCATTTGCCG

QA 1 298 1 298
DS 



AS 1 3

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AGACAATGTGGTGGGTTCGATATCGAGCATTTGATGGAATCAAAACCAGGCTGCTGTAAC
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AGGTTGGGTATCCATAAGTACAATATGATCCAGGGGACTAACTTGCAGCTGCATGGTGTA
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AAGGATCCAGCTGCCGACGGTTCCCTTGTCACTTTTCAGACCAGTTTTTATGAAGAAGGC
TTTGGCATCAAGAGGTTGACTTGTTCTATTGCTAGACCTAAGCCTGGACCACACGAGGAG
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TCAGAGATTCGAAAAAATGACTGGATTCGTCTTTACTTGGAGCTTGCATTCTACACTGCA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EK15TF U 1
AF RS1AI86TF U 31
AF RS1BS67TF U 36
BS 1 227 RS1EK15TF
BS 228 229 RS1AI86TF
BS 230 728 RS1EK15TF
BS 729 835 RS1AI86TF

RD RS1EK15TF 728 0 0
GGATTACACTAAAAGTAGCCGCCGCTTGCTTCCGTCTGAGCAAAGTGAAAAAAAATGAGA
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AGACAATGTGGTGGGTTCGATATCGAGCATTTGATGGAATCAAAACCAGGCTGCTGTAAC
TTCTGGGCTTCCGAGATCATAAAAGATCAAATTGCCCCGACGGACAT**TCCTATATGCT
AGGTTGGGTATCCATAAGTACAATATGATCCAGGGGACTAACTTGCAGCTGCATGGTGTA
GAGAAATACAATGCGTACACTAAAGTAGCTTATTCCAGTCACTATGTAACCGCAGTTGCA
AAGGATCCAGCTGCCGACGGTTCCCTTGTCACTTTTCAGACCAGTTTTTATGAAGAAGGC
TTTGGCATCAAGAGGTTGACTTGTTCTATTGCTAGACCTAAGCCTGGACCACACGAGGAG
GATCAAGCATCTGAATCTGAAACTGAATCTGAAACTGAATATGAATACTCAAGTAGTTTG
CCTGAGTGGCCTGGAGAGAATGCTTTCGATGATAAGAAGCATTATTACGTGGTGAAGAAA
TCAGAGATTCGAAAAAATGACTGGATTCGTCTTTACTTGGAGCTTGCATTCTACACTGCA
AATATGACCCTACCAAATCTTGATCTGTCGAAGTTGGTCATTACCAAAGTAGCCGTGTAT
ACTAGCGA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1AI86TF 805 0 0
TCCGTCT
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AGCGTGACTTTATGTTTAAAGTGAGACAATGTGGTGGGTTCGATACCGAGCATTTGATGG
AATCAAAACCAGGCTGCTGTAACTTCTGGGCTTCCGAGATCATAAAAGATCAAATTGCCC
CGACGGACATCGTCCTATATGCTAGGTTGGGTATCCATAAGTACAATATGATCCAGGGGA
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AGACCAGTTTTTATGAAGAAGGCTTTGGCATCAAGAGGTTGACTTGTTCTATTGCTAGAC
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AATATGAATACTCAAGTAGTTTGCCTGAGTGGCCTGGAGAGAATGCTTTCGATGATAAGA
AGCATTATTACGTGGTGAAGAAATCAGAGATTCGAAAAAATGACTGGATTCGTCTTTACT
TGGAGCTTGCATTCTACACTGCAAATATGACCCTACCAAATCTTGATCTGTCGAAGTTGG
TCATTACCAAAGTAGCCGTGTATACTAGCGACGAGAGCATTGCTGTGCCAAACGAGAGAC
TCAATGCCAGAAATGCAATCTTCTACATCAAGTACAAGTACTGCCCACATAAAACAGGCT
CACGTTGCAGAGAACACG

QA 8 805 8 805
DS 

RD RS1BS67TF 775 0 0
GG
GAGCAAAGTGAAAAAAAATGAGAGATTCCTCGGAGAAAATGCGTGAGTGGTACAAGATGG
AGCGTGACTTTATGTTTAAAGTGAGACAATGTGGTGGGTTCGATATCGAGCATTTGATGG
AATCAAAACCAGGCTGCTGTAACTTCTGGGCTTCCGAGATCACAAAAGATCAAATTGCCC
CGACGGACATCGTCCTATATGCTAGGTTGGGTATCCATAAGTACAATATGATCCAGGGGA
CTAACTTGCAGCTGCATGGTGTAGAGAAATACAATGCGTACACTAAAGTAGCTTATTCCA
GTCACTATGTAACCGCAGTTGCAAAGGATCCAGCTGCCGACGGTTCCCTTGTCACTTTTC
AGACCAGTTTTTATGAAGAAGGCTTTGGCATCAAGAGGTTGACTTGTTCTATTGCTAGAC
CTAAGCCTGGACCACACGAGGAGGATCAAGCATCTGAATCTGAAACTGAATCTGAAACTG
AATATGAATACTCAAGTAGTTTGCCTGAATGGCCTGGAGAGAATGCTTTCGATGATAAGA
AGCATTATTACGTGGTGAAGAAATCAGAGATTCGAAAAAATGACTAGATTCGTCTTTACT
TGGAGCTTGCATTCTACACTGCAAATATGACCCTACCAAATCTTGATCTGTCGAAGTTGG
TCATTACCAAAGTAGCCGTGTATACTAGCGACGAGAGCATTGCTGTGCCAAACGAGAGAC
TCAATGCCAGAAATGCAATCT*CTACATCA*GTACA*GTACTGCCCACATAAA

QA 3 775 3 775
DS 



AS 1 3

CO CL3471Contig1 892 3 2 U
GGGCAAGGGGGGTTTTCGGAGAGGGTTTCGTGTTCTTCTTTTTCTTCTTCTTCCATATCT
CCGAATTTGGTTTCGCTTTAAATAGGATAAAGTCTAAACCTTTTCTCGCAGCGATGGAAG
ATAAACCGCTAGGGATCCTTAGGGTTCATGTGAAAAGAGGGATTAATCTCGCGATTCGCG
ATTCCTCGAGCAGTGATCCTTATGTTGTCGTCACGTTGGGCAATCAGAAACTGAAGACCC
GTGTGATCAGTAGTAACTGTAATCCAGTGTGGAACGAACAGCTGACCCTTTCCATCAAAG
ATGTGAATGACCCTATCCGTCTGCTTATGTTTATGCAGACGGTGTATGATAAAGACAGAT
TCTCGGGAGATGACAAAATGGGCGATGCGGAAATAGACATGAAGCCTTTCCTAGAAGCGC
ATCAGATGGAGTTAGATTTTCAGAAGCTCCCCAATGGTTGTGCAATCAAGAGGATCCGTC
CAGGAAGGACCAACTGTTTGGCTGAAGAGAGCAGCATCACCTGGAGCGATGGGAAGATCA
AACAAGACATGATTCTTAGACTAAGGAACGTGGAGTGTGGGGAAGTGGAGTTGATGCTTG
AGTGGACTGATGGTCCTGGCTGCAAGGGTCTTGGACCCGAAGGATCCAAGAAGACACCAT
GGATGCCAACTAAAAGATTGGACTAAGGCTGCGAGACACCGTGAAGATGTTGTGTTCATG
GAAAGACGAGTTTGTCTTTTGTCTCTTTTGATTATTATGACGAAAGGCTGTGCTCTGTGT
CTTTAGTTGTACATGTCGAATACTCGAATACAAACCCAAACCTTAATATATATATTTGTA
TCTGTTTCTACTATTGAAGAAATAAAAGCAAAGCCTGAATTTCTAGAAGCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AD55TF U 1
AF RS1C711JQ C 352
AF RS1C711TF U 352
BS 1 573 RS1AD55TF
BS 574 892 RS1C711TF

RD RS1AD55TF 573 0 0
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DS 

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QA 3 541 3 541
DS 

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GG
GACAGATTCTCGGGAGATGACAAAATGGGCGATGCGGAAATAGACATGAAGCCTTTCCTA
GAAGCGCATCAGATGGAGTTAGATTTTCAGAAGCTCCCCAATGGTTGTGCAATCAAGAGG
ATCCGTCCAGGAAGGACCAACTGTTTGGCTGAAGAGAGCAGCATCACCTGGAGCGATGGG
AAGATCAAACAAGACATGATTCTTAGACTAAGGAACGTGGAGTGTGGGGAAGTGGAGTTG
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GTTCATGGAAAGACGAGTTTGTCTTTTGTCTCTTTTGATTATTATGACGAAAGGCTGTGC
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ATTTGTATCTGTTTCTACTATTGAAGAAATAAAAGCAAAGCCTGAATTTCTAGAAGCTG

QA 3 541 3 541
DS 



AS 1 3

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BQ
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AF RS1FI29JQ C 52
AF RS1A619TF U 1
AF RS1FI29TF U 6
BS 1 203 RS1A619TF
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RD RS1FI29JQ 370 0 0
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ATGGTAAAGACGGGGACTGTTATGATCAAATCCCGTTCCCTGAAAAATGCAGCAAACATG
GAGACAAGAAATGCTTCAAAGACATGCTTTTTACGAACATAACACGGCGTTTTTTTAGTT
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CAGATGCGTAACAGAGTTTATGGTGGTGACACATACATAAGCAATGGTGGTAATCTAATG
GTATT
TTTTT

QA 1 365 1 365
DS 

RD RS1A619TF 592 0 0
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GTACTACTTTGGTTATGGTTTCTTGTGTTTTCATATGTTTCGTTCTGAGTCATGGTAAAG
ACGGGGACTGTTATGATCAAATCCCGTTCCCTGAAAAATGCAGCAAACATGGAGACAAGA
AATGCTTCAAAGACATGCTTTCTGCGAACATAACACGGCGTTTTCTTAGTTGCAACTGTA
TAAACCGGGAACCATTCAAATCATCTGAAAGCCCACAAACCGATTTACACAAGAAGGAAC
ACCCCGGACATATCTGCAATTGTCTCAGAGCTGTTCCCGGTGATTGTGTGCCAGATGCGT
AACAGAGTTTATGGTGGTGACACATACATAAGCAATGGTGGTAATCTAATGGTATTCTTC
TTCTTAGTAAAGGCAATAATATTTGTTTCTAGTGTTCATGGTCAACACAGAGTGTGATGG
TCACCAATTAGACCCTAGGTGTTATTAATTAATCATGGACAATATATACGTATTTCACTC
AATTTTTTCGCTTATTTTTGTTTAGTTTCGATATTTCCAAATCTGTATTAAT

QA 1 592 1 592
DS 

RD RS1FI29TF 593 0 0
GG
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TTTGGTTATGGTTTCTTGTGTTTTCATATGTTTCGTTCTGAGTCATGGTAAAGACGGGGA
CTGTTATGATCAAATCCCGTTCCCTGAAAAATGCAGCAAACATGGAGACAAGAAATGCTT
CAAAGACATGCTTTCTACGAACATAACACGGCGTTTTCTTAGTTGCAACTGTATAAACCG
GGAACCATTCAAATCATCTGAAAACCCACAAACCGATTTACACAAGAAGGAACACCCCGG
ACATATCTGCAATTGTCTCAGAGCTGTTCCCG*TGATTGTGTGCCAGATGCGTAACAGAG
TTTATGGTGGTGACACATACATAAGCAATGGTGGTAATCTAATGGTATTCTTCTTCTTAG
TAAAGGCAATAATATTTGTTTCTAGTGTTCATGGTCAACACAGAGTGTGATGGTCACCAA
TTAGACCCTAGGCGTTATTAATTAATCATGGACAATATATACGTATTTCACTCAATTTTT
TCGCTTATTTTTGTTTAGTTTCGATATTTCCAAATCTGTATTAATAAAAAA

QA 3 593 3 593
DS 



AS 1 3

CO CL3473Contig1 864 3 7 U
GGCCCCGCACTCTCTCTCCTCAATCCTTATCTTTCGACGTCTCTTCATTTCTTCGAGAGT
TAACAAAGAATTAGGTGGTGATCGGTGCATGACGAGCGCATCGGAACTCTTCTCAACTCG
AAGATCCCGTCCGGGTAGATCCGACCCGGATTTAGAATCCGACTCTTCTCTTTATCGACA
CCACTCACATCACCATCACCGCCGTCACGGGATCCATCATCTTAATCACCGTCATGATTC
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TGGTCTCTCGGAACGTAGACCTGTTCATGATGTTCAAGGTACGTTACAGTATTTGAATAC
CAACGGTACCGATTCGGAAACTGAAGGCAACAGCTTTGGAAACCTAGAGAGGCTTCCCGG
AGCTGTTCTTCTCGCGAGGGAAAGACTTTTCGAAAGATTGAGAGGCGTTTCTTTGTCGAG
TAACAGTCGAAGCAACAGAGTTTCACTGAGTGATAATCAGATTGAGTCCTCGTTCTATGG
AGAACCAGAAGGGATTCAAGTGTCCCATGAATGCAACAAGAAACCATTAGGTCTCACACA
AGGTGCAATTAATGGTTTAAACCGGCAGACTTTTAGCTCAGCCGGCGAGGTTAGAACCGA
GAGGAGAGATTGTAGCATATGTTTAGAGAGTTTCACTAACGGCGACGTGCTTATATCCTT
GCCATGTACCCATAGTTTCCATTCCTCGTGCTTAAACCCTTGGCTTAAGGCTTGTGGAGA
TTGCCCTTATTGCCGTAGAGCCATAGCTAAGGATAGAGTGACATGTAAATAGGAACCTTT
TCCTGACCATACCCACACGCATCT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DW53TF U 1
AF RS1FV47TF U 60
AF RS1FV47JQ C 468
BS 1 477 RS1DW53TF
BS 478 478 RS1FV47TF
BS 479 497 RS1DW53TF
BS 498 498 RS1FV47TF
BS 499 562 RS1DW53TF
BS 563 765 RS1FV47TF
BS 766 864 RS1FV47JQ

RD RS1DW53TF 562 0 0
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TAACAAAGAATTAGGTGGTGATCGGTGCATGACGAGCGCATCGGAACTCTTCTCAACTCG
AAGATCCCGTCCGGGTAGATCCGACCCGGATTTAGAATCCGACTCTTCTCTTTATCGACA
CCACTCACATCACCATCACCGCCGTCACGGGATCCATCATCTTAATCACCGTCATGATTC
AAACGCCTGTGATCCTCCCCGACGAGCCCCGCCGCGTCTCCGTCGCTTCTGTCACCATCT
TGGTCTCTCGGAACGTAGACCTGTTCATGATGTTCAAGGTACGTTACAGTATTTGAATAC
CAACGGTACCGATTCGGAAACTGAAGGCAACAGCTTTGGAAACCTAGAGAGGCTTCCCGG
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TAACAGTCGAAGCAACATAGTTTCACTGAGTGATAATCAGATTGAGTCCTCGTTCTATGG
AGAACCAGAAGGGATTCAAGTG

QA 1 562 1 562
DS 

RD RS1FV47TF 706 0 0
GG
AACAAAGAATTAGGTGGTGATCGGTGCATGACGAGCGCATCGGAGCTCTTCTCAACTCGA
AGATCCCGTCCGGGTAGATCCGACCCGGATTTAGAATCCGACTCTTCTCTTTATCGACAC
CACTCACATCACCATCACCGCCGTCACGGGATCCATCATCTTAATCACCGTCATGATTCA
AACGCCTGTGATCCTCCCCGACGAGCCCCGCCGCGTCTCCGTCGCTTCTGTCACCATCTT
GGTCTCTCGGAACGTAGACCTGTTCATGATGTTCAAGGTACGTTACAGTATTTGAATACC
AACGGTACCGATTCGGAAACTGAAGGCAACAGCTTTGGAAACCTAGAGAGGCTTCCCGGA
GCTGTTCTTCTCGCGAGGGAAAGACTTTTCGAAAGATTGAGAGGCGTTTCTTTGTCGAGT
AACAGTCGAAGCAACAGAGTTTCACTGAGTGATAATCAGATTGAGTCCTCGTTCTATGGA
GAACCAGAAGGGATTCAAGTGTCCCATGAATGCAACAAGAAACCATTAGGTCTCACACAA
GGTGCAATTAATGGTTTAAACCGGCAGACTTTTAGCTCAGCCGGCGAGGTTAGAACCGAG
AGGAGAGATTGTAGCATATGTTTAGAGAGTTTCACTAACGGCGACGTGCTTATATCCTTG
CCATGTACCCATAGTTTCCATTCCTCGTGCTTAAACCCTTGGCT

QA 3 706 3 706
DS 

RD RS1FV47JQ 397 0 0
TTTTTTTGTGG
AGTAACAGTGGAAGCAACAGAGTTTCACTGAGTGATAATCAGATTGAGTCCTCGTTTTAT
GGAGAACCAGAAGGGATTCAAGTGTCCCATGAATGCAACAAGAAACCATTAGGTTTCACA
CAAGGTGCAATTAATGGTTTAAACCGGCAGACTTTTAGTTCAGCCGGGGAGGTTAGAACC
GAGAGGAGAGATTGTAGCATATGTTTAGAGAGTTTCACTAACGGGGACGTGCTTATATCC
TTGCCATGTACCCATAGTTTCCATTCCTCGTGCTTAAACCCTTGGCTTAAGGCTTGTGGA
GATTGCCCTTATTGCCGTAGAGCCATAGCTAAGGATAGAGTGACATGTAAATAGGAACCT
TTTCCTGACCATACCCACACGCATCT

QA 12 397 12 397
DS 



AS 1 3

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TCTTCCTATCTTATTAACTATTCTTCTTCTTGCCTTCGCCGTTACAGAATCCAAAGCATA
CTCCACAACAACGCCGTTCGAAGGACATAAGCCGGGTAAACTCACCCACCTCCACTTCTA
CTTCCATGACGTAATCACCGGTGACAAACCAACCGCCATAAGAGTCGCTGCGCCCCCTGG
AACAAACTCCTCCACAGTCTCATTTGGTGTGGTTATGATTGCCGACGACCCGTTGACAGA
GGGACCAGACCCGAGCTCGAAGGAAGTCGGGAGAGCTCAGGGGATGTATACATCTACGGA
TATGAAAATCTTAAGCTTCACAATGGTCTTCAACTTGGTGTTCACGGAAGGAGAGTTTAA
CGGCAGCACCGTAGCGATGTATGGACGGAATCCGATAATGTCGAAGGTGAGAGAGATGCC
GATCATCGGAGGCACCGGTGCGTTCAGGTTTGCTAGAGGCTATGCACAAGCCAGAACTTA
TAAACTTGTTGGTTTAAATGCCGTGGTTGAATACAATGTATTCATTTGGCATTAATTATT
TGGGATTTCGTTTATTTTGTAATTCTATAATGAAATATTGTTTCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1BU91TF U 1
AF RS1BL03JQ C 23
AF RS1BL03TF U 30
BS 1 476 RS1BU91TF
BS 477 477 RS1BL03TF
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BS 609 647 RS1BU91TF

RD RS1BU91TF 647 0 0
GGTAGAGTATAGTTTGTGGCTAACACGAACAACGAACATGGCTAAATGTTTTCTGCCTCC
TCTTCCTATCTTATTAACTATTCTTCTTCTTGCCTTCGCCGTTACAGAATCCAAAGCATA
CTCCACAACAACGCCGTTCGAAGGACATAAGCCGGGTAAACTCACCCACCTCCACTTCTA
CTTCCATGACGTAATCACCGGTGACAAACCAACCGCCATAAGAGTCGCTGCGCCCCCTGG
AACAAACTCCTCCACAGTCTCATTTGGTGTGGTTATGATTGCCGACGACCCGTTGACAGA
GGGACCAGACCCGAGCTCGAAGGAAGTCGGGAGAGCTCAGGGGATGTATACATCTACGGA
TATGAAAATCTTAAGCTTCACAATGGTCTTCAACTTGGTGTTCACGGAAGGAGAGTTTAA
CGGCAGCACCGTAGCGATGTATGGACGGAATCCGATAATGTCGAAGGTGAGAGAGACGCC
GATCATCGGAGGCACCGGTGCGTTCAGGTTTGCTAGAGGCTATGCACAAGCCAGAACTTA
TAAACTTGTTGGTTTAAATGCCGTGGTTGAATACAATGTATTCATTTGGCATTAATTATT
TGGGATT*CGTTTATTTTGTAATTCTATAATGAAATATTGTTTCACT

QA 1 647 1 647
DS 

RD RS1BL03JQ 625 0 0
GGACGAA
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TTGCCTTCGCCGTTACAGAATCCAAAGCATACTCCACAACAACGCCGTTCGAAGGACATA
AGCCGGGTAAACTCACCCACCTCCACTTCTACTTCCATGACGTAATCACCGGTGACAAAC
CAACCGCCATAAGAGTCGCTGCGCCCCCTGGAACAAACTCCTCCACAGTCTCATTTGGTG
TGGTTATGATTGCCGACGACCCGTTGACAGAGGGACCAGACCCGAGCTCGAAGGAAGTCG
GGAGAGCTCAGGGGATGTATACATCTACGGATATGAAAATCTTAAGCTTCACAATGGTCT
TCAACTTGGTGTTCACGGAAGGAGAGTTTAACGGCAGCACCGTAGCGATGTATGGACGGA
ATCCGATAATGTCGAAGGTGAGAGAGATGCCGATCATCGGAGGCACCGGTGCGTTCAGGT
TTGCTAGAGGCTATGCACAAGCCAGAACTTATAAACTTGTTGGTTTAAATGCCGTGGTTG
AATACAATGTATTCATTTGGCATTAATTATTTGGGATTTCGTTTATTTTGTAATTCTATA
ATGAAATATTGTTTCACT

QA 8 625 8 625
DS 

RD RS1BL03TF 618 0 0
CAACGAACATGGCTAAATGTTTTCTGCCTCCTCTTCCTATCTTATTAACTATTCTTCTTC
TTGCCTTCGCCGTTACAGAATCCAAAGCATACTCCACAACAACGCCGTTCGAAGGACATA
AGCCGGGTAAACTCACCCACCTCCACTTCTACTTCCATGACGTAATCACCGGTGACAAAC
CAACCGCCATAAGAGTCGCTGCGCCCCCTGGAACAAACTCCTCCACAGTCTCATTTGGTG
TGGTTATGATTGCCGACGACCCGTTGACAGAGGGACCAGACCCGAGCTCGAAGGAAGTCG
GGAGAGCTCAGGGGATGTATACATCTACGGATATGAAAATCTTAAGCTTCACAATGGTCT
TCAACTTGGTGTTCACGGAAGGAGAGTTTAACGGCAGCACCGTAGCGATGTATGGACGGA
ATCCGATAATGTCGAAGGTGAGAGAGATGCCGATCATCGGAGGCACCGGTGCGTTCAGGT
TTGCTAGAGGCTATGCACAAGCCAGAACTTATAAACTTGTTGGTTTAAATGCCGTGGTTG
AATACAATGTATTCATTTGGCATTAATTATTTGGGATTTCGTTTATTTTGTAATTCTATA
ATGAAATATTGTTTCACT

QA 1 618 1 618
DS 



AS 1 2

CO CL3475Contig1 760 2 6 U
GCAACACTCTTATGTTCCGTCCTGCTGATGGAAACGAAACAGCCGGTGCGTACAAGATAG
CTGCCACCAAGCGCAAGACACCGTCTATCTTAGCTCTGTCTAGGCAAAAGCTTCCTCAGC
TTCCAGGCACATCCATCGAAGGAGTTGAGAAGGGTGGATACACGATCTCTGACAACTCAT
CAGGAAACAAACCCGATGTGATCTTGGTTGGAACTGGATCTGAGCTAGAGATTGCTGCAC
AGGCTGCGGAGGTGCTTAGGAAAGAAGGCAAAACCGTGAGAGTTGTGTCTTTCGTCTGCT
GGGAGCTGTTTGATGAGCAAACAGATGAGTACAAGGAGAGTGTCTTGCCGTCTGATGTAT
CTGCTAGAGTTAGTATCGAAGCAGCTTCGACTTTCGGATGGGGGAAGATTGTTGGAGGCA
AAGGGAAGTCCATTGGTATTAATTCGTTTGGGGCTAGTGCACCAGCTCCATTACTCTACA
AGGAGTTTGGCATCACTGTTGAAGCTGTTGTTTATGCGGCTAAGTCATTCTTCTAAGTGA
CTTTCACCATTATTCTCTATAAAGGTTTCACTACATTGTCTCATTACCTAAAAATAAAGT
GCAACAAGACGAAAAGAGACTCTTCTTTCTTTTCTTTTTTTGTTTCTTGTAATGCGGGTC
AACATAGGTTTTGGGTTTGGGAAGAGAAGAAAGTAGAAGACAATGTAAAACTCTCTTATG
ATCAGTTGTGTATTGTTGTTATATATGCTTGAGTTTCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DQ08TF U 1
AF RS1DQ08JQ C 297
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TATGATCAGTTGTGTATTGTTGTTATATATGCTTGAGTTTCAGC

QA 1 464 1 464
DS 



AS 1 3

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BQ
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AF RS1CB25JQ C 1
AF RS1CB25TF U 1
AF RS1D086TF U 34
BS 1 578 RS1CB25TF
BS 579 585 RS1D086TF

RD RS1CB25JQ 578 0 0
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AAACCTGAGTACTATTCTTGATGACAGCAGAACCAGTACTATTGAGGAGAAACCAGAAGT
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AACTGTTTTGAAACCTTAAACCTCCAAACCTTGCTTCTCCCAGATTCAGAGACTCTTTCC
TGCATGAGAGATGGATACTGGAGTTGTCATCACCCAGGAACCAGTGTTTACAAAGACAAG
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AAACCTGAGTACTATTCTTGATGACAGCAGAACCAGTACTATTGAGGAGAAACCAGAAGT
TGCTGAGGTTTTGAATGGTCCAGGGAATAAAGAAACCGAGGAATCAAAACACGAAAAAGA
AGAAGTGGTGAAGACTATTTCCGTTGTCGAAGACAGTAAGATGGTAAAAGAGAAAGAAAG
GGAGACAGAAACGGATGAACAAGGCACAGTCTTTGTTCAACAACCTAAAAACACAGATGA
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TAAGGCCATTGAAGAGATACCAACGATAAGGACTGATG

QA 1 578 1 578
DS 

RD RS1D086TF 552 0 0
GG
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TCTCCCAGTTTCAGAGACTCTTTCCTGCATGAGAGATGGATACTGGAGTTGTCATCACCC
AAGAACCAGTGTTTACAAAGACAAGTGTTGAAGAAGCTCATGCAGGAGTAGTACTTGAAC
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GTACTATTGAGGAGAAACCAGAAGTTGCTGAGGTTTTGAATGGTCCAGGGAATAAAGAAA
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TTTATCAACCTAAAAACACAGATGATGCGAAGGTAGGTGTTGAAACAGAAACCAAGAACT
CACAAGAACAAGAGAAGGACATCTCTAAGGCCATTGAAGAGATACCAACAATAAGGACTG
ATGAAGTAGA

QA 3 552 3 552
DS 



AS 1 3

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GTGCCTAATAAAAGAAAAGAAGAATGCGATTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RS1BF70JQ C 1
AF RS1BF70TF U 7
AF RS1BL80TF U 55
BS 1 6 RS1BF70JQ
BS 7 511 RS1BF70TF
BS 512 513 RS1BF70JQ

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CAAATGTGTCGGACCTAAGCTGTTTGCGGAACTAAAATGATTGGAGAGAAAGTTGGAGTG
TTCAGTTTCTGTCTTGTATTTTTTTTTTTTTTTCTTTATCAAGGTTTTTCTGTATAAAAT
GCAGTGGAGATACTGCAGACCAGATTGCAACTAGATCCTTCTTGGCTTGTTTCTCCGGCA
AAGCTGTGAATCCTTTGTCTGTTAGGAGGAAACCTTTATTGAGTTTGTGATACTTCATTA
GTGCCTAATAAAAGAAAAGAAGAATGCGATTAC

QA 1 513 1 513
DS 

RD RS1BF70TF 507 0 0
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GAGATACTGCAGACCAGATTGCAACTAGATCCTTCTTGGCTTGTTTCTCCGGCAAAGCTG
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AATAAAAGAAAAGAAGAATGCGATT
AC

QA 1 505 1 505
DS 

RD RS1BL80TF 457 0 0
TATTTCCAATTTCACCATGGCCGATGTAGAAGTTGTTGATCCGAAAAAGTGTCTTGAGGA
ATCTTGTAAACCAAAATGTGTGAAGCTACTACTTGAATATCAGGCGTGTGTGAAGAGGAT
CCAAGGTGATGAGTCTGGACACAAACATTGCACTGGGTAGTATTTCGATTACTGGCAATG
TGTTGACAAATGTGTCGGACCTAAGCTGTTTGCGGAACTAAAATGATTGGAGAGAATGTT
GGAGTGTTCAGTCTCTGTCTTGTATTTTTTTTTTTTTT*CTTTATCAAGGTTTTTCTGTA
TAAAATGCAGTGGAGATACTGCAGACCAGATTGCAACTAGATCCTTCTTGGCTTGTTTCT
CCGGCAAAGCTGTGAATCCTTTGTCTGTTAGGAGGAAACCTTTATTGAGTTTGTGATACT
TCATTAGTGCCTAATAAAAGAAAAGAAGAATGCGATT

QA 1 457 1 457
DS 



AS 1 3

CO CL3478Contig1 998 3 8 U
GGCCCAAGCAAGTAATCAGATGATGTGAAATCATGTAAAATCAATAATCCAGGATATGAC
AGCGGCTAAGCTCAGATAACAACAAGAAACAAATCAATAATCTTTCATTACAGTAAACAA
TTCTTTATCCCTTTTTTGGCTCTGAAACTACAAAAACATAAGTAATCTCCCACCAAGGCA
AAGGCTCAAAGGGTACTACTTCTCATGAAAATGTGATTTTTTTTTTCTAAAAGCGGAATG
GAGTTTCAGGTCCGTACTTGTTGTTCCTCATGTTGAAATGATCAAACTTTGAGCTATTAC
TGTACTCTACCGGCTTCACCGTATCTGATGCTGCTGTTGTTGTCTTTGGTTCTGCTGTCT
CGGTTGTTGTTTTATCTCTATGGCAACGCCTTGATCGCTCTTTATGAACCTTTGGTGGTG
GTGCAACCTCTCCCGAGACGTAAAACTGGGCATACTCCTGCCGTTTTGATGAGGACCGAT
GGTGTTTGGATGATGGATCTTTTGTTGCACTACTTGACCTCGTCTTCGATGTCTTATGTT
CCGGGTAACTATCACTGGATTTAGGCAAGTGGGCATGTCGGGATTCAGAGACTGGTGCTG
GGGCAGTATGCCTTTGGACTAAAGGTGGTCCCTGTTCCTGCTCGTCTTCAGGCATTTTGA
GTCTATCTTTTAGTGGCCTTAGATTGGAGCTGGTTTTGAACCGGGCTGGGAGTAGGTGGC
TGGTTAAAAACTCGAGGCTGAGTTTGCAGAGATCGATAAGGAGTTGCCCAAATGATGGCC
AGCCAGGTTCTTCCTTGGTTGTTGCTGTTGTTGTTGTCTCAAGGACAGGTCGAGAGAGTT
TCTCTTTGCCTGGTTGCTCTTCTTCAAAGCTGGCTTCTGACGTCGTAGAGACAAAAGAAT
GTCCGAAACCTTGCTGCAGCAAACAAGTAGCGTAACCAATGACAACAGCACCAATAACCA
AGAGGATATCAGTAGAAGAGATAGAGCTAGAGTGATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EW82JQ U 103
AF RS1G403JQ U 1
AF RS1G403TF C 267
BS 1 115 RS1G403JQ
BS 116 116 RS1EW82JQ
BS 117 225 RS1G403JQ
BS 226 226 RS1EW82JQ
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BS 230 230 RS1EW82JQ
BS 231 589 RS1G403JQ
BS 590 998 RS1G403TF

RD RS1EW82JQ 264 0 0
TTTCATTACAGTAAACAATTCTTTATCCCTTTTT*GGCTCTGAAACTACAAAAACATAAG
TAATCTCCCACCAAGGCAAAGGCTCAAAGGGTACTACTTCTCATGAGGATGTGATTTTTT
TTTTCTAAAAGCGGAATGGAGTTTCAGGTCCGTACTTGTTGTTCCTCATGTTGAAATGAT
CAAACTTTGAGCTATTACTGTACTCTACCGGCTTCACCGTATCTGATGCTGCTGTTGTTG
TCTTTGGTTCTGCTGTCTCGGTTG

QA 1 264 1 264
DS 

RD RS1G403JQ 589 0 0
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TTCTTTATCCCTTTTTTGGCTCTGAAACTACAAAAACATAAGTAATCTCCCACCAAGGCA
AAGGCTCAAAGGGTACTACTTCTCATGAAAATGTGATTTTTTTTT*CTAGAAGCGGAATG
GAGTTTCAGGTCCGTACTTGTTGTTCCTCATGTTGAAATGATCAAACTTTGAGCTATTAC
TGTACTCTACCGGCTTCACCGTATCTGATGCTGCTGTTGTTGTCTTTGGTTCTGCTGTCT
CGGTTGTTGTTTTATCTCTATGGCAACGCCTTGATCGCTCTTTATGAACCTTTGGTGGTG
GTGCAACCTCTCCCGAGACGTAAAACTGGGCATACTCCTGCCGTTTTGATGAGGACCGAT
GGTGTTTGGATGATGGATCTTTTGTTGCACTACTTGACCTCGTCTTCGATGTCTTATGTT
CCGGGTAACTATCACTGGATTTAGGCAAGTGGGCATGTCGGGATTCAGA

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1G403TF 732 0 0
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GATGCTGCTGTTGTTGTCTTTGGTTCTGCTGTCTCGGTTGTTGTTTTATCTCTATGGCAA
CGCCTTGATCGCTCTTTATGAACCTTTGGTGGTGGTGCAACCTCTCCCGAGACGTAAAAC
TGGGCATACTCCTGCCGTTTTGATGAGGACCGATGGTGTTTGGATGATGGATCTTTTGTT
GCACTACTTGACCTCGTCTTCGATGTCTTATGTTCCGGGTAACTATCACTGGATTTAGGC
AAGTGGGCATGTCGGGATTCAGAGACTGGTGCTGGGGCAGTATGCCTTTGGACTAAAGGT
GGTCCCTGTTCCTGCTCGTCTTCAGGCATTTTGAGTCTATCTTTTAGTGGCCTTAGATTG
GAGCTGGTTTTGAACCGGGCTGGGAGTAGGTGGCTGGTTAAAAACTCGAGGCTGAGTTTG
CAGAGATCGATAAGGAGTTGCCCAAATGATGGCCAGCCAGGTTCTTCCTTGGTTGTTGCT
GTTGTTGTTGTCTCAAGGACAGGTCGAGAGAGTTTCTCTTTGCCTGGTTGCTCTTCTTCA
AAGCTGGCTTCTGACGTCGTAGAGACAAAAGAATGTCCGAAACCTTGCTGCAGCAAACAA
GTAGCGTAACCAATGACAACAGCACCAATAACCAAGAGGATATCAGTAGAAGAGATAGAG
CTAGAGTGATAC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3480Contig1 567 3 4 U
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TAGAGAGAATGGGTCGCCAAAACGTTTTCGTAGTTTTTGGCCTTGTGTTCTTGGCCGTCC
TTGGCCTCGCAGCAGCTGCATCTTCTCCATCTCCTTCATCGTCACCCTCCAAAGCTCCGT
CTACTCCCACAACTGATGTCGAAGCTCCAGTGTCCGAGGATACTATTGGAACCACCGACG
ACGATGCAGCTGCTTCTCCTGGTGACGGTGACGTGGCTGTCGCTGGTCCTCTAGGAAGTG
ACTCCTCATATGGTAGCATTGCACCTTCAGGCCCTGCTGCTGACAGTGGCGCGGCGGCTC
TTGGTGTCTCTGCAGTCGTTGTTGGTGTTACATCCATCGCTGGATCTTTCTTGTTTCTCT
GAGGTGTGTTATTATCGTGAGAAGATTATCTTTAATGGAGACTATTTATATGTATGGATG
ATTGTGATGACTATGTTGTAATTTGTTTCCTCTTTATTACGAGAAACAATTGTCTTTGTA
ATAAAAATGAAAATGACGAAACTTCCG


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DY81TF U 1
AF RS1E909JQ C 1
AF RS1E909TF U 1
BS 1 490 RS1DY81TF
BS 491 491 RS1E909TF
BS 492 536 RS1DY81TF
BS 537 567 RS1E909TF

RD RS1DY81TF 536 0 0
GGAATCATCACAATCTCAAACCTAAAATAAATTAAAAGGAATCTACGTTGAAGGAGAGAA
TAGAGAGAATGGGTCGCCAAAACGTTTTCGTAGTTTTTGGCCTTGTGTTCTTGGCCGTCC
TTGGCCTCGCAGCAGCTGCATCTTCTCCATCTCCTTCATCGTCACCCTCCAAAGCTCCGT
CTACTCCCACAACTGATGTCGAAGCTCCAGTGTCCGAGGATACTATTGGAACCACCGACG
ACGATGCAGCTGCTTCTCCTGGTGACGGTGACGTGGCTGTCGCTGGTCCTCTAGGAAGTG
ACTCCTCATATGGTAGCATTGCACCTTCAGGCCCTGCTGCTGACAGTGGCGCGGCGGCTC
TTGGTGTCTCTGCAGTCGTTGTTGGTGTTACATCCATCGCTGGATCTTTCTTGTTTCTCT
GAGGTGTGTTATTATCGTGAGAAGATTATCTTTAATGGAGACTATTTATATGTATGGATG
ATTGTGATGATTATGTTGTAATTTGTTTCCTCTTTATTACGAGAAACAATTGTCTT

QA 1 536 1 536
DS 

RD RS1E909JQ 567 0 0
GGAATCATCACAATCTCAAACCTAAAATAAATTAAAAGGAATCTACGTTGAAGGAGAGAA
TAGAGAGAATGGGTCGCCAAAACGTTTTCGTAGTTTTTGGCCTTGTGTTCTTGGCCGTCC
TTGGCCTCGCAGCAGCTGCATCTTCTCCATCTCCTTCATCGTCACCCTCCAAAGCTCCGT
CTACTCCCACAACTGATGTCGAAGCTCCAGTGTCCGAGGATACTATTGGAACCACCGACG
ACGATGCAGCTGCTTCTCCTGGTGACGGTGACGTGGCTGTCGCTGGTCCTCTAGGAAGTG
ACTCCTCATATGGTAGCATTGCACCTTCAGGCCCTGCTGCTGACAGTGGCGCGGCGGCTC
TTGGTGTCTCTGCAGTCGTTGTTGGTGTTACATCCATCGCTGGATCTTTCTTGTTTCTCT
GAGGTGTGTTATTATCGTGAGAAGATTATCTTTAATGGAGACTATTTATATGTATGGATG
ATTGTGATGACTATGTTGTAATTTGTTTCCTCTTTATTACGAGAAACAATTGTCTTTGTA
ATAAAAATGAAAATGACGAAACTTCCG

QA 1 567 1 567
DS 

RD RS1E909TF 567 0 0
GGAATCATCACAATCTCAAACCTAAAATAAATTAAAAGGAATCTACGTTGAAGGAGAGAA
TAGAGAGAATGGGTCGCCAAAACGTTTTCGTAGTTTTTGGCCTTGTGTTCTTGGCCGTCC
TTGGCCTCGCAGCAGCTGCATCTTCTCCATCTCCTTCATCGTCACCCTCCAAAGCTCCGT
CTACTCCCACAACTGATGTCGAAGCTCCAGTGTCCGAGGATACTATTGGAACCACCGACG
ACGATGCAGCTGCTTCTCCTGGTGACGGTGACGTGGCTGTCGCTGGTCCTCTAGGAAGTG
ACTCCTCATATGGTAGCATTGCACCTTCAGGCCCTGCTGCTGACAGTGGCGCGGCGGCTC
TTGGTGTCTCTGCAGTCGTTGTTGGTGTTACATCCATCGCTGGATCTTTCTTGTTTCTCT
GAGGTGTGTTATTATCGTGAGAAGATTATCTTTAATGGAGACTATTTATATGTATGGATG
ATTGTGATGACTATGTTGTAATTTGTTTCCTCTTTATTACGAGAAACAATTGTCTTTGTA
ATAAAAATGAAAATGACGAAACTTCCG

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 3

CO CL3481Contig1 1088 3 11 U
AAGGTATTTGTTTCAGATTATTGAAAGGGAGTTCTACAAATACAGCAGGCTGGTAAAGGC
CAAAGACATGTCTTAAATAACTGCAGAAAGGAACAAGAGTTACAGATACTAGATTGTGTT
TTAGTAAAGCCAATAAAAAACTTTGGAAACAGAAAATACAGTTTTGGTTCATCTCTCGAA
GTTGTATAAAGCTTCAAGATCTGGAGAGGATACCACGAAATAGGTAAAAAGACAAGATTG
GAATATCTCATTTCTTCCCACCACCGGAAACGTTGAACTTGAAAAAAATGATATCTCCGT
CCTGAACAACATATGTTTTCCCCTCCTGTCTGTATTTCCCTGCCCCCTTGACTGCAGTTT
CATTGCCAAGTTCCTTGAGATCCTCAAACTTCATGACCTCGGCACAAATGAATCCTCTCT
CAAAATCAGTATGAATGGCCCCTGCAGCTTGAGGAGCCTTTGACTGACGTCTTATTTGCC
AGCACTTCACCTCATCAGGCCCAGCTGTAAAGAAATATATGAGGTTAATAGCTGAAAATC
CAGTTTTGATGATCCTCGGAAGAGCACTTTGCAGTTTGTTCTCCTCACAATACTTTGCTG
CTTCGTCTGGGAGCATATCAGCGAGACTCCTTTCGAAAACACCACTGAAAGGAATCATAG
TATCACCACCGTGTTCTTGAACCCAAGCATGAATCTTCGGCAGGAACTTGTTTTTCTTCC
TCTGGTAGTCTCTCTCATTCATGTTAATCAAGTAAACAACGGGCTTAGCGGAAAGCAATT
GGAAAGTGTTCAAAATCTCGATATCAGCTGCTTTCCAGTCCCCAAAACGGACATCCTTTC
CTTCTTCCAGCCAAGCTTTAACCTTAAGCAAGAGGTCAAGTTCAACTTTGAGGGCCTTGT
CATTGCTCCTCTTCATGCTCTTCTCCATATCTTCAACCTTCTTTTTAATGAACTCAATAT
CCTTAAGCCGCAATTCTTCAGTAATGGTCTCCAAATCTCTAACAGGATCAACGATATCAT
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CACGGATC


BQ
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DS 



AS 1 3

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BQ
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AF RS1GW18TF U 1
AF RS1G542TF U 68
AF RS1G542JQ C 585
BS 1 343 RS1GW18TF
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TAAACACTTCTCTTCATGTGGAGAGGTTGTGTGTGTTTCTATCCCCTATTTCGCTATAGA
CGGTGCTCCCAACAGATCTGGCTATATATATATTTTGGGAGACGGCGCAGAAGAGAAGGC
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GGTGTTCCTTAAACTCACTCCCGAAATGACTGCTAGGTTGGCCGAGGCAGAACGAGCTTA
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GACCTCCTTGACCAACCGTTTCTCTTCATGCGGAGAGATTGTTGATTTTCAGTTATTCCC
CGTAGAACATCATCCCAGTCAAGATCACCAAGCCATCATTTCTATTCTGGGAGAAGGTGC
AGAAGAGA

QA 1 608 1 608
DS 

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GTTAAGGGATATGACACTTCCCTTCATGTGGATGTTGTCAAGAGCCAGTTAACTAAACAC
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CCCAACAGATCTGGCTATATATATATTTTGGGAGACGGCGCAGAAGAGAAGGCACTGCAA
CTTAGTGGAAGTGAGATGGAAGGACGCAAAATAGTTACTACTTCAACTCACGAGGTGTTC
CTTAAACTCACTCCTGAAATGACTGCTAGGTTGGCCGAGGCAGAAC*AGCTTATGATGGC
AAAATGATTATAGTTAGAGGATATGACACTTCGCTTCCTGCTGCTGATATCAAGACCTCC
TTGACCAACCGTTTCTCTTCATGCAGAGAGATTGTTGATTTTCAGTTATTCCCCGTAGAA
CATCATCCCAGTCAAGATCACCAAGTCATCATTTCTATTCTGGGAGAAGGTGCAGAAGAG
AAGGCCCTGGAACTTAATGGGAGTGACATGGGAGGAGGATTCAAACTAGTTGTTGTGCCT
GCTTTAAAACCCGTGGGAAACAGCCCCACTCCTGT

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DS 

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GATTCAAACTAGTTGTTGTGCCTGCTTTAAAACCCGTGGGAAACAGCCCCACTCCTGTCG
ATGATGCTTTCCCACGTGGCTTCATGATCCCAGCTCGGGTTGCCAACCCCAAGAAGACGA
GCCGTTACAAGATGAAGAAGAAGAAGGCCAAACGTAAGAAGGCTTGGAAGTAGAAAGCCT
ATTCTCCACTGGTGATGCACTGCCATCCTACTTTTGTCTCTCTTTATGTGATATATCGTC
GGTCACCTTTAACATTATCCCACCTGTCTTGTTTTATGTGTGTGTCCCGATGTTAAAACT
CAGTCAGTACTCATGACCTGTTCCTGTTTCACTGAGTCCGATTTGTGGTTAACTCGAATA
ATCTTGTGATGGAAAAAATGGATTTTATTTTTGCCGT

QA 1 457 1 457
DS 



AS 1 3

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TGGAGACGGTCTAAGTTAAAGTTGGTTTCTCTCAATTGTGTTGCCTCCGGTCGTTTCTGG
CGATCGTTACAGATTGACGGATTATAAAGGGACACTGTTTCTCCTTCTTTGACGAATCCA
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TTGTTCTTCAGAGGATATGGTGACAAATCTGAAGGCTTCTATAAGAGAATTGGGTGGGAA
AGTGAGGGAACAGAATCAGAGAAAATGTGATGTTAAGGATAAGCTGCAGCAGTTGCGAAA
AAGAATAAACGCTGAAGGTGTTGTTGATGTTTCAGTTTCAGTCCAGGAGGAGTTGATACC
TCTTTTGAGATCACTCAAGGAATTAGAAAAACAGGAATCTGAAGTCCGGTCGAACTGCGA
TGCCAAGCGTTCTGCGTTAGAAGATGCTGTTTGTGATTTGGAGGAGAGAGTCGCAAAGGG
TGAGATTCCCGAGGAAGATTTAGATGTTTTGTTGGTTGAATCACTTGATCATCTCACTTC
AGCAAAGAAGGAGCTTGCAGCAACGCTAAGAGAAATAGTGTCTCTGAAGCGACAGATTGA
TGATGTACCATGCCAATCTGAACTCCTCCAATATGAAAGAAGATTCTCAGAGCTTAATGT
TTGTATACAGGAGAAGCTTCAACAAACTAGGAAGCTCTATGGGACATACAATGCTCTTTC
AGAAATAAAAGATTTGATGCTAAAGGAGATTTCATTACTGAATTCAATAGGTTCACAGTT
TCAAGACGTGATTGGTACACCTACTGGCCGCGTGAAGCTAATTGATTCAATGGAAGTAGT
CATGAAAGGAATCCAACAGAAGCTAGGAAAGGTACAACTTGGGCTTCAAGAAGAGCAGAG
GCTCTGTGATGCTTCAAAAGAAAAGTATACTGCTGCAGCTGCAGAGCAAAGAAAATGCTA
TAATTCTTTCCAAGTATAAGTATTTTCAAAGCCGACATTATTTGGACTTTGGCGATTTTA
AACAAGTTTGTCTCTTCAGCCTATGATATCGATAGATAGTTTGCTGTGTTTGTCTTTTAT
AAAGTATATATTTTCAAGCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C415TF U 1
AF RS1C415JQ C 369
AF RS1BG45TF U 439
BS 1 700 RS1C415TF
BS 701 701 RS1BG45TF
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BS 786 1069 RS1BG45TF
BS 1070 1070 RS1C415JQ
BS 1071 1161 RS1BG45TF

RD RS1C415TF 789 0 0
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TGGAGACGGTCTAAGTTAAAGTTGGTTTCTCTCAATTGTGTTGCCTCCGGTCGTTTCTGG
CGATCGTTACAGATTGACGGATTATAAAGGGACACTGTTTCTCCTTCTTTGACGAATCCA
TTCGAAGATCACTGGGGGGTTTGAGTGAATGATGGGAAAAGAAGATATCAGTGAAGAGGT
TTGTTCTTCAGAGGATATGGTGACAAATCTGAAGGCTTCTATAAGAGAATTGGGTGGGAA
AGTGAGGGAACAGAATCAGAGAAAATGTGATGTTAAGGATAAGCTGCAGCAGTTGCGAAA
AAGAATAAACGCTGAAGGTGTTGTTGATGTTTCAGTTTCAGTCCAGGAGGAGTTGATACC
TCTTTTGAGATCACTCAAGGAATTAGAAAAACAGGAATCTGAAGTCCGGTCGAACTGCGA
TGCCAAGCGTTCTGCGTTAGAAGATGCTGTTTGTGATTTGGAGGAGAGAGTCGCAAAGGG
TGAGATTCCCGAGGAAGATTTAGATGTTTTGTTGGTTGAATCACTTGATCATCTCACTTC
AGCAAAGAAGGAGCTTGCAGCAACGCTAAGAGAAATAGTGTCTCTGAAGCGACAGATTGA
TGATGTACCATGCCAATCTGAACTCCTCCAATATGAAAGA*GATTCTCAGAGCTTAATGT
TTGTATACAGGAGAAGCTTCA*CAAACTAG*AAGCTCTATGGGACATACA*TGCTCTTTC
AGAAA
AAAA

QA 1 785 1 785
DS 

RD RS1C415JQ 758 0 0
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GATCACTCAAGGAATTAGAAAAACAGGAATCTGAAGTCCGGTCGAACTGCGATGCCAAGC
GTTCTGCGTTAGAAGATGCTGTTTGTGATTTGGAGGAGAGAGTCGCAAAGGGTGAGATTC
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AGGAGCTTGCAGCAACGCTAAGAGAAATAGTGTCTCTGAAGCGACAGATTGATGATGTAC
CATGCCAATCTGAACTCCTCCAATATGAAAGAAGATTCTCAGAGCTTAATGTTTGTATAC
AGGAGAAGCTTCAACAAACTAGGAAGCTCTATGGGACATACAATGCTCTTTCAGAAATAA
AAGATTTGATGCTAAAGGAGATTTCATTACTGAATTTAATAGGTTCACAGTTTCAAGACG
TGATTGGTACACCTACTGGCCGCGTGAAGCTAATTGATTCAATGGAAGTAGTCATGAAAG
GAATCCAACAGAAGCTAGGAAAGGTACAACTTGGGCTTCAAGAAGAGCAGAGGCTCTGTG
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TCCAAGTATAAGTATTTTCAAAGCCGACATTATTTGGACTTTGGTGATTTTAAACAAGTT
TGTCTCTTCAGCCTATGATATCGATAGATAGTTTGC
CG

QA 1 756 1 756
DS 

RD RS1BG45TF 723 0 0
GGGAA
TAGAAAAACAGGAATCTGAAGTCCGGTCGAACTGCGATGCCAAGCGTTCTGCGTTAGAAG
ATGCTGTTTGTGAGTTGGAGGAGAGAGTCGCAAAGGGTGAGATTCCCGAGGAAGATTTAG
ATGTTTTGTTGGTTGAATCACTTGATCATCTCACTTCAGCAAAGAAGGAGCTTGCAGCAA
CGCTAAGAGAAATAGTGTCTCTGAAGCGACAGATTGATGATGTACCATGCCAATCTGAAC
TCCTCCAATATGAAAGAAGATTCTCAGAGCTTAATGTTTGTATACAGGAGAAGCTTCAAC
AAACTAGGAAGCTCTATGGGACATACAATGCTCTTTCAGAAATAAAAGATTTGATGCTAA
AGGAGATTTCATTACTGAATTCAATAGGTTCACAGTTTCAAGACGTGATTGGTACACCTA
CTGGCCGCGTGAAGCTAATTGATTCAATGGAAGTAGTCATGAAAGGAATCCAACAGAAGC
TAGGAAAGGTACAACTTGGGCTTCAAGAAGAGCAGAGGCTCTGTGATGCTTCAAAAGAAA
AGTATACTGCTGCAGCTGCAGAGCAAAGAAAATGCTATAATTCTTTCCAAGTATAAGTAT
TTTCAAAGCCGACATTATTTGGACTT*GGCGATTTTAAACAAGTTTGTCTCTTCAGCCTA
TGATATCGATAGATAGTTTGCTGTGTTTGTCTTTTATAAAGTATATATTTTCAAGCAC

QA 6 723 6 723
DS 



AS 1 2

CO CL3484Contig1 751 2 2 U
GGGACTCTGTCAGCCTCTCTCTTCTCAAAAACATGTCTCTCTCTTCTCTCTCCTTCGACA
CCAAGCCAAGATTCGCCGTCGGAGGTCCATTCCACCGCCGTTACTTCCTCGAGTCCATCG
GCTGGTGGGATCTGCACGGGTCTTGGTATCGCTCCAAGAGCTGTTGGTGATCTAATTGGA
GTGGTGAAAGCATACACTACGAGAGTTGGTTCAGGACCGTTTCCTACGGAGAATTTGGGG
ACAGGCGGTGACCTTCTTAGGTTGGCTGGACAGGAGTTTGGCACTACGACTGGTCGTCCT
CGTCGGTGCGGATGGCTAGACCTTGTTGCGTTGAAGTTCTCTTGCCAGATCAATGGGTTT
GCATCGCTTAATCTCACTAAGCTCGATGTGCTTTCTGACCTGAACGAGATTCAGCTTGGT
GTGGCTTACAAGAAGAGTGATGGCACCCGTGTTGGCTCTTTCCCTGGTGATCTTCGTCTT
CTTGAAGAACTTCAAGTGGAGTATGAAACGTTACCAGGATGGAACTCTGACATTTCCTCA
ATCAGAAACTACGCTGATCTTCCGAAGGCTGCACAGCAATACGTTGAGAGGATTGAAGAA
CTCGTGGGTGTGCCTATTCATTACATTGGTATTGGACCCGGTCGTGATGCCCTTATATAT
AAATGATTTTTAGGTTAGGCTTTTTTTGTCTGACTTCAAAAAAAAAAGATTACTAAACAC
TTTGGAATGATTAATGTTATCTGTTGGCATT


BQ
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AF RS1CY86TF U 1
AF RS1CY86JQ C 473
BS 1 669 RS1CY86TF
BS 670 751 RS1CY86JQ

RD RS1CY86TF 669 0 0
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CGTCGGTGCGGATGGCTAGACCTTGTTGCGTTGAAGTTCTCTTGCCAGATCAATGGGTTT
GCATCGCTTAATCTCACTAAGCTCGATGTGCTTTCTGACCTGAACGAGATTCAGCTTGGT
GTGGCTTACAAGAAGAGTGATGGCACCCGTGTTGGCTCTTTCCCTGGTGATCTTCGTCTT
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AAATGATTT

QA 1 669 1 669
DS 

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TTTCCTCAATCAGAAACTACGCTGATCTTCCGAAGGCTGCACAGCAATACGTTGAGAGGA
TTGAAGAACTCGTGGGTGTGCCTATTCATTACATTGGTATTGGACCCGGTCGTGATGCCC
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CTAAACACTTTGGAATGATTAATGTTATCTGTTGGCATT

QA 1 279 1 279
DS 



AS 1 3

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CTTCATCTTCATCTATCCTCGCCATCCCTACGCTCGTGCTCTTCGGCAACCCTCCATACT
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BQ
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AF RS1EG96TF U 1
AF RS1EA11JQ U 33
AF RS1EA11TF C 25
BS 1 191 RS1EG96TF
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RD RS1EG96TF 720 0 0
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GAAAAATCAAAACTAAAATATATCAAAAATCAATCCACAAATTACTATTAAAAAGAGAGA
GAGAGAAACAAAAACACTAAAACTTAGGGCTACCAGTAACAGCATATGATTTGCTACGAG
GATACAAAAGCCCAGAGACTTTCTTAGTCGTCTTCGGTTTCACAGATCCTTCCTCTCCTT
CTTCATCTTCATCTATCCTCGCCATCCCTACGCTCGTGCTCTTCGGCAACCCTCCATACT
TCATCTTCTTCTGCATCTCTTGCTGCAGCTTCTCTTGTTTCACCTTCTCTTGTATAAACA
TGTCTATCTCATTCTTGTGTCCTAAACTCCTAACCGACGCTGCTCTCACTAGCTCGCTGT
AGTCATCATCAATCCCAAAATCAGTTGTTCTGCGTGTAGGTGCGGATGAGGAGAAGGCGG
CGGAGGAAGAGCTCTTGCTTCTAGGAAAAGCAGTGGAGACGGAAGAGGAGGAGGAGGGAT
ACTGACTCCGAGAAGCACAACCGGTGATGCTTCTCACGTAAGCTTTGCCTAAAGCTCTGA
AAGGTGTTGAGATGATTCTCAAGAACTTGTTCTGGCTTTGTCCTCCGTTTCTCATGCTCT
GTTTTGGAGAATGGTTTTGTGTTTTTTTTTGTTTTGTTTGGTGTGTTTGAAATGATGGGT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RS1EA11JQ 669 0 0
CGAATTCTATCATTATTTCTTTGTTGCAGAAAAATCAAAACTAAAATATATCAAAAATCA
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TCTTGTTTCACCTTCTCTTGTATAAACATGTCTATCTCATTCTTGTGTCCTAAACTCCTA
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GTGGAGACGGAAGAGGAGGAGGAGGGATACTGACTCCGAGAAGCACAACCGGTGATGCTT
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TGGCTTTGTCCTCCGTTTCTCATGCTCTGTTTTGGAGAATGGTTTTGTGTTTTAGTTTGT
TTTGTTT
CC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RS1EA11TF 677 0 0
TTTTTTT
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AATCCACAAATTACTATTAAAAAGAGAGAGAGAGAAACAAAAACACTAAAACTTAGGGCT
ACCAGTAACAGCATATGATTTGCTACGAGGATACAAAAGCTCAGAGACTTTCTTAGTCGT
CTTCGGTTTCACAGATCCTTCCTCTCCTTCTTCATCTTCATCTATCCTCGCCATCCCTAC
GCTCGTGCTCTTCGGCAACCCTCCATACTTCATCTTCTTCTGCATCTCTTGCTGCAGCTT
CTCTTGTTTCACCTTCTCTTGTATAAACATGTCTATCTCATTCTTGTGTCCTAAACTCCT
AACCGACGCTGCTCTCACTAGCTCGCTGTAGTCATCATCAATCCCAAAATCAGTTGTTCT
GCGTGTAGATGCGGATGAGGAGAAGGCGGCGGAGGAAGAGCTCTTGCTTCTAGGAAAAGC
AGTGGAGACGGAAGAGGAGGAGGAGGGATACTGACTCCGAGAAGCACAACCGGTGATGCT
TCTCACGTAAGCTTTGCCTAAAGCTCTGAAAGGTGTTGAGATGATTCTCAAGAACTTGTT
CTGGCTTTGTCCTCCGTTTCTCATGCTCTGTTTTGGAGAATGGTTTTGTGTTTTAGTTTG
TTTTGTTT
CC

QA 8 675 8 675
DS 



AS 1 3

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GGGCCGTCGTACGTTCTCAGATAATCTCACTGCTCGTGTGGGACCATGCAAAGCGACGTG
ACTATGAATCCACGACCATCGGCTGACTCTAGCTCCTCTGACGTCGAAGCTGAGATCAGC
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CTTGGTGCTGATTCTGAAGACCAGAGCTTGGATTTGATCATTCATCCTTCTAAAGCTGAA
GCTACTATCTGGCTTGTTGAAGAGATACATCGACTCACTTCTTCTCATCTTCAGATTGCT
CAGCTTTGGGGATCTGATCCTATGTATCACATGTTGATTGATCCTATCATTCCTAAGTTA
CCACAAACATGAACACTCCCTTTTTGTATCTATTTCTCTTTCTTTAACTTTAAGACAATG
TAATGTGAATGCTTTTTCTTTCGAAA


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CA55TF U 7
AF RS1GS64JQ C 1
AF RS1GS64TF U 1
BS 1 8 RS1GS64JQ
BS 9 223 RS1CA55TF
BS 224 224 RS1GS64TF
BS 225 290 RS1CA55TF
BS 291 291 RS1GS64TF
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BS 501 599 RS1CA55TF
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GG
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DS 

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DS 

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ATGCTTTTTCTTTCGAAA

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DS 



AS 1 3

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TT


BQ
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10 10 

AF RS1EQ03JQ U 1
AF RS1EQ03TF C 1
AF RS1CV21JQ U 1
BS 1 54 RS1CV21JQ
BS 55 55 RS1EQ03JQ
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C

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C

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TCTTGGTTCTCCTTTTCAATCAGTCGGATCAGAGTGTCGCATCTTCTTGCAAGTTCCTGA
CTCGTGCGGGATTTCACAAACCAGTCAAACCTAAACAAAGGCGATGTCCCGTATGCTGCC
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CACTCTTCATTGTACAGCTTCCCTTTGTTCTGACCATACTGAATCTTCATTTCCAGCCAA
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TATCGCTCTTTGAAGACTTGTGCATATCTTTCAACTTCTTCCTCTGTTTTACCTTCCATC
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TT

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 3

CO CL3488Contig1 820 3 7 U
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GATGTTCTTTCGGTGAGGTAATTAGAATTGGCAAAATTGACAGGAGATTCAATGCTTAGG
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BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BH82JQ U 1
AF RS1E924JQ U 1
AF RS1AC20JQ U 621
BS 1 486 RS1BH82JQ
BS 487 706 RS1E924JQ
BS 707 707 RS1AC20JQ
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BS 737 737 RS1AC20JQ
BS 738 761 RS1E924JQ
BS 762 820 RS1AC20JQ

RD RS1BH82JQ 486 0 0
GGGAAAGAGTCTAAAATCAAATTATGCAGACCGTTTTCGGATCCAAAATCGACAATATCG
TACCAGTGTTTTCGAAAGAGTTGGACATGAATTTGCAAAAACCCAACAAAATCAGTGATG
TAGCTTAAAAATGAACATAGCATACAACAGTACTGAAAGTAGAGAAAGGAGACCTTTAAC
CATCTGCCAAAGATCATATTTGGACCGATAAAACAAAATCTTTATAGTCAAACGTTATTG
AGAGATGGGCCTCCTTTAAGAGAGAGCGACGCAACGGCCTCAGAAACAGTCAAGAAGAGA
CACCCAGGCCTCATGAACTCCTCTTCTTCGTCAGCTCTTTGTAGCTTCTCCATCACTTCA
CTTAATGGGTTCACAAACACAAGCTCGATGTTCTTCTTTGCTGTGGTTTTCTTTAATTCT
TTAAAGAATGAGACTCCGTTTGTGTCCACCCCACTCACAGCTGACATTTCAAGAATCAAG
AACCGA

QA 1 486 1 486
DS 

RD RS1E924JQ 761 0 0
GC
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CCAGTGTTTTCGAAAGAGTTGGACATGAATTTGCAAAAACCCAACAAAATCAGTGATGTA
GCTTAAAAATGAACATAGCATACAACTGTACTGAAAGTAGAGAAAGGAGACCTTTAACCA
TCTGCCAAAGATCATATTTGGACCGATAAAACAAAATCTTTATAGTCAAACGTTATTGAG
AGATGGGCCTCCTTTAAGAGAGAGCGACGCAACGGCCTCAGAAACAGTCAAGAAGAGACA
CTCAGGCCTCATGAACTCCTCTTCTTCGTCAGCTCTTTGTAGCTTCTCCATCACTTCACT
TAATGGGTTCACAAACACAAGCTCGATGTTCTTCTTTGCTGTGGTTTTCTTTAATTCTTT
AAAGAATGAGACTCCGTTTGTGTCCACCCCACTCACAGCTGACATTTCAGGAATCAAGAA
CCGAAGGCTAGAATGCTTCTCTTGCGCTTCCTCTTCTTCGCATTCTTCTATCCAACGAGA
TGTTCTTTCGGTGAGGTAATTAGAATTGGCAAAATTGACAGGAGATTCAATGCTTAGGAC
AAGGAACCCCGGGATCCTTCGTGCATCTTTGTAATGATGAAGATTACGGTACACATCCGT
CCCCGGAATATTCCCCATAATAACGGTCTTCGGCCTCGTTACTT*GCATTAATAACTTGA
ACAACGATAGTCCC*ACCGCTATAGCTAGACCGTTCTGG

QA 3 761 3 761
DS 

RD RS1AC20JQ 200 0 0
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AATAACGGTCTTCGGCCTCGTTACTTTGCATTAATAACTTGAACAACGATAGTCCCCACC
GCTATAGCTAGACCGTTCTGGACCGACAAGAAAACAACACCAAAGAAGGCGCATAACATC
ACCAAGAAATCAAACTTATC

QA 1 200 1 200
DS 



AS 1 2

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TCTGGGATTGATGGCGGCCCTGTTTATAGGGATTCCAGTCCATAGCATTACTGGTTGGTG
GCGTGTCTGTTTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BG50TF U 1
AF RS1CV14TF U 1
BS 1 619 RS1BG50TF
BS 620 733 RS1CV14TF

RD RS1BG50TF 619 0 0
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CTGCTCTCTCCCACACGTCCTCGTCGCTACGCTCTCGTCTTTCCTCTTCGGCTACCACTT
AGGAGTTGTTAATGAACCGCTTGAAAGCATTTCTTCATATCTTGGCTTTACTGGAAACAC
ATTAGCTGAAGGCTTGGTGGTTAGTGTGTGTCTTGGTGGCGCATTTATCGGTTCTTTATT
CAGCGGTGGAGCTGCTGATGGACTCGGACGACGGCGAGCCTTTCAGCTTTCTGCTTTGCC
TATGATTTTAGGTGCTTTCGTTAGTGGAGTTAGTAACAGCTTAGGTGTCATGCTTTTGGG
AAGATTCTTGGTTGGGACTGGCATGGGTCTTGGCCCTCCTGTGGCTGCACTATATGTCAC
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QA 1 619 1 619
DS 

RD RS1CV14TF 733 0 0
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GAAAATCACTAGCTCTTGCCGCATGTGGGGATCGCAATCGTCTTCGATGTACAAGAGGAC
GTCATCGAGAGATTATTCTCCAGCGCTCGACGTCGAAGATAACAACGACTCACGTCTTTT
ACTGGTTGATGATGACGACGACGTGAGCAAGGAAACGGAAACCACAAATCCGCCATGGAT
CTGCTCTCTCCCACACGTCCTCGTCGCTACGCTCTCGTCTTTCCTCTTCGGCTACCACTT
AGGAGTTGTTAATGAACCGCTTGAAAGCATTTCTTCATATCTTGGCTTTACTGGAAACAC
ATTAGCTGAAGGCTTGGTGGTTAGTGTGTGTCTTGGTGGCGCATTTATCGGTTCTTTATT
CAGCGGTGGAGCTGCTGATGGACTCGGACGACGGCGAGCCTTTCAGCTTTCTGCTTTGCC
TATGATTTTAGGTGCTTTCGTTAGTGGAGTTAGTAACAGCTTAGGTGTCATGCTTTTGGG
AAGATTCTTGGTTGGGACTGGCATGGGTCTTGGCCCTCCTGTGGCTGCACTATATGTCAC
AGAGGTATCGCCAGCTTTTGTAAGGGGGACTTATGGAAGCTTCATACAGATAGCTACATG
TCTGGGATTGATGGCGGCCCTGTTTATAGGGATTCCAGTCCATAGCATTACTGGTTGGTG
GCGTGTCTGTTTC

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 2

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CACCGATTATTCATTAAATAAATCTCAAGTGAACACACACTAATACTTGATGTAAGCAAC
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GTCCTTCTCCTTGTAGAAGTAACCCAAACACTTGCAATCACGGTCGCACTTAGCCTTGCA
ATCGTTCACAGAAGTTGGGCCTTGTCCATCATTAACATAAGGCCCAGTAAAATGCTCAAC
GCCGACGATCTTGTAGTAATTCACGGCCTTACCTTTGCCTCCGCTGCAGAACTGCGTCGT
TTTAGGTGGTGCGCATTGGTCGCTCCATCCGAGTAACCCTTTGGGTGTAGGGCACGCAAC
GCACATTCCACGGTCGCAGTAACCGTAGTCGCCGCAAAACGACGGTAAGCCGCATTGTCT
GACGAAGTAAGTGGAGAAGAAAGAGAAGGACTCTTCCCATGTGAGGTACGTTGCTGGGTC
GAACCACGAGAAGGCCTTGAGGCTACCGTCGGAGCCGAGTCTGAGATACGATATGGTTCC
GTTGTAGTTGATCTTGTTCAGGTTTAGAGTTCCATCTCCGCTTCCAATTGGTCGGGATTG
GAGTAAACGACGGTTGTTACCTGGATTAGTGGTTGTTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1B244TF C 1
AF RS1AN87JQ U 29
BS 1 42 RS1B244TF
BS 43 226 RS1AN87JQ
BS 227 227 RS1B244TF
BS 228 266 RS1AN87JQ
BS 267 267 RS1B244TF
BS 268 760 RS1AN87JQ

RD RS1B244TF 569 0 0
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CAATGGCAATACAATTATTTAAAAAAAAACGGTGAGCCTTAACAAAATCATTACAAAACT
CACCGATTATTCATTAAATAAATCTCAAGTGAACACACACTAATACTTGATGTAAGCAAC
AGAAGAAGTGTTGGCGTCTTTGATGAGTGTACCAAGAAGAGGAGCGATCAAACACTTCTT
GTCCTTCTCCTTGTAGAAGTAACCCAAACACTTGCAATCACGGTCGCACTTAGCCTTGCA
ATCGTTCACAGAAGTTGGGCCTTGTCCATCATTAACATAAGGCCCAGTAAAATGCTCAAC
GCCGACGATCTTGTAGTAATTCACGGCCTTACCTTTGCCTCCGCTGCAGAACTGCGTCGT
TTTAGGTGGTGCGCATTGGTCGCTCCATCCGAGTAACCCTTTGGGTGTAGGGCACGCAAC
GCACATTCCACGGTCGCAGTAACCGTAGTCGCCGCAGAACGACGGTAAGCCGCATTGTCT
GACGAAGTAAGTGGAGAAGAAAGAGAAG
C

QA 1 568 1 568
DS 

RD RS1AN87JQ 732 0 0
ACACAAAGCCTATG
GCTTTTATTCAGATTAAACAATGGCAATACAATTATTTAAAAAAAAACGGTGAGCCTTAA
CAAAATCATTACAAAACTCACCGATTATTCATTAAATAAATCTCAAGTGAACACACACTA
ATACTTGATGTAAGCAACAGAAGAAGTGTTGGCGTCTTTGATGAGTGTACCAAGAAGAGG
AGCGGTCAAACACTTCTTGTCCTTCTCCTTGTAGAAGTAACCCACACACTTGCAATCACG
GTCGCACTTAGCCTTGCAATCGTTCACAGAAGTTGGGCCTTGTCCATCATTAACATAAGG
CCCAGTAAAATGCTCAACGCCGACGATCTTGTAGTAATTCACGGCCTTACCTTTGCCTCC
GCTGCAGAACTGCGTCGTTTTAGGTGGTGCGCATTGGTCGCTCCATCCGAGTAACCCTTT
GGGTGTAGGGCACGCAACGCACATTCCACGGTCGCAGTAACCGTAGTCGCCGCAAAACGA
CGGTAAGCCGCATTGTCTGACGAAGTAAGTGGAGAAGAAAGAGAAGGACTCTTCCCATGT
GAGGTACGTTGCTGGGTCGAACCACGAGAAGGCCTTGAGGCTACCGTCGGAGCCGAGTCT
GAGATACGATATGGTTCCGTTGTAGTTGATCTTGTTCAGGTTTAGAGTTCCATCTCCGCT
TCCAATTGGTCGGGATTGGAGTAAACGACGGTTGTTACCTGGATTAGTGGTTGTTGGT

QA 15 732 15 732
DS 



AS 1 2

CO CL3491Contig1 705 2 6 U
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GATGGAAAGCGTAAGCCTTTTCTCTCTTGTCCATACCATATCTTTTCATTGCAACTAACT
TGGTTTCATCAATCAGATTTACTTTTTGAATTTTTTTGGCAGAATACTTGTTCCTGAGTA
TGGATTCATGCACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGCATCATCACCGAGTGA
TACCGCCATTCTCAACCAAACTATGAAGAGCTTCAGGCTAAAGAACGAGGAAGCCATCAC
TGAAGGAAGAGCCAATGGTTCTCTCTACAAGGAAGCTGACAAGCCATGCAAAGTGATATC
AGGGAGACTCTCCCGTGGAAGTGGCTGCCTCAAAGGAACAGCCATCACTGTTATGGTTCT
AGCTGCAGCTGCTGCTGTTCTATCTTCCAACCCTGAGGTTACAACTGAGCTGAAGAACCT
GGTGGACTCATTGGAGCTGCACCAGTACTATAATCCAATCATCACAGCTTTGAAGAACTA
AGAGAGAAGAGAGACAAAACAAGCTGAGGACGATAAGTTAATCGTCAGTGTGAGAATTTA
CTTAAAGTTAAAATCCTTTTACTTCTAAGATACAAAGTTTTGAAAAAAATTTGACAATGA
GAATAAAGTTATTTCTGTTTATTATATTTTGAGTTTCACAATCAT


BQ
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AF RS1CL50TF U 1
AF RS1ED33TF U 214
BS 1 280 RS1CL50TF
BS 281 281 RS1ED33TF
BS 282 648 RS1CL50TF
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BS 650 684 RS1CL50TF
BS 685 705 RS1ED33TF

RD RS1CL50TF 684 0 0
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GATGGAAAGCGTAAGCCTTTTCTCTCTTGTCCATACCATATCTTTTCATTGCAACTAACT
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TGGATTCATGCACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGCATCATCACCGAGTGA
TACCGCCATTCTCAACCAAACTATGAAGAGCTTCAGGCTAGAGAACGAGGAAGCCATCAC
TGAAGGAAGAGCCAATGGTTCTCTCTACAAGGAAGCTGACAAGCCATGCAAAGTGATATC
AGGGAGACTCTCCCGTGGAAGTGGCTGCCTCAAAGGAACAGCCATCACTGTTATGGTTCT
AGCTGCAGCTGCTGCTGTTCTATCTTCCAACCCTGAGGTTACAACTGAGCTGAAGAACCT
GGTGGACTCATTGGAGCTGCACCAGTACTATAATCCAATCATCACAGCTTTGAAGAACTA
AGAGAGAAGAGAGACAAAACAAGCTGAGGACGATAAGTTAATCGTCAGTGTGAGAATTTA
CTTAAAGTTAAAATCCTTTTACTTCTAAGATACAAAGTTTTGAAAAAA*TTTGACAATGA
GAATAAAGTTATTTCTGTTTATTA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1ED33TF 492 0 0
TGTCAAGCTAT
CATCATCACCGAGTGATACCGCCATTCTCAACCGAACTATGAAGAGCTTC*GGCTAAAGA
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CATGCAAAGTGATATCAGGGAGACTCTCCCGTGGAAGTGGCTGCCTCAAAGGAACAGCCA
TCACTGTTATGGTTCTAGCTGCAGTTGCTGCTGTTCTATCTTCCAACCCTGAGGTTACAA
CTGAGCTGAAGAACCTGGTGGACTCATTGGAGCTGCACCAGTACTATAATCCAATCATCA
CAGCTTTGAAGAACTAAGAGAGAAGAGAGACAAAACAAGCTGAGGACGATAAGTTAATCG
TCAGTGTGAGAATTTACTTAAAGTTAAAATCCTTTTACTTCTAAGATACAAAGTTTTGAA
AAAAATTTGACAATGAGAATAAAGTTATTTCTGTTTATTATATTTTGAGTTTCACAATCA
T

QA 12 492 12 492
DS 



AS 1 3

CO CL3492Contig1 1171 3 15 U
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TCTTGTAGAGATACAATAAGCAGTAGACATAATAGTAATCATAGGATTAACACCAACAGC
ACTCGGCAACACACTTGCATCGCACACAAACAACTTCTCAGCTTCCCAACACTCTCCATT
CAAATCCACCGCTCCCTCTCTCTCATCTTCTCCAATTCTACAGCTTCCCATCTGATGAGC
TGAGCTATACACACCCCATTTCTCAGTCATCGCCTTTGGCCCATCCACTACATCCACCGA
GTCCAAGAACTCCTCTATCGACTTCTCATCAACCCCTTTACATATCAGTTTCTGCCCATC
GCTTCTATGAGTTCCCACTTCCTCTGCTCCAGCTGCAATGAGTATCCTCAACGACTGTCT
AAACCCTGCTCTGAAATTCTCTTTATCGGTTTTATCCACAACGTAGCTTATTCTGCCTTC
GGTTCTCACCTCCCCTGACCCGCGGTCTCTAACTATCGTTATGAGATTCGCGGTTCTTGA
GTATCTTGACATTCTCTTCTTCATGCCAACCCCTGAGGTCCATGGACATAGTACCGAGAA
TGAGGCTGGTCCTAGTGCCGGCGTCTCTATGATGGCTCTAACTTCTGAATCTTCTGATAA
CACTTTGCTCATTGATGTTATGATCCCACCTTCGTAGGATGTTCCCTTGATGTTGACATT
AGAAGATTCCTTGTCCGGGAAGTAACCCCACGCCATTAAGACAGGATGTAAGTGAAGGTT
TCTACCGATATGTCGGTTTCTCAACCCGCTGGAGATCATCAACGGAGGTGTTAGAAGAGA
ACCCGCCGCCGAAACCGTCACCTTAGCTTCGATCTTGATCTTCTTGGCTATGTTTCCGTT
AAAAGACTTGGCCATCACTCCCAAACATTTCATCTTCTTCTTCTTCCCTCCTCTGTTCTT
TTCGAGTATGAACCTCTTTGTTCCGGTGGTGATCATCTTCGCGGAGATATTCTTCCGGCT
GCGGCACTGGAGGCAAGACGGCTTCGCAGAAGCTGGCTAGGGATTCCATCTCTGCCGCCG
TGACTTCCCGGTGGCCGAAACTTCTGGCGTCTGTGTGGTTACCCATCACCTTTTCGCTTT
AACTGTGAAAAGTCTGTGAGAAGATACTTCC


BQ
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GATCTTCTTGGCTATGTTTCCGTTAAAAGACTTGGCCATCACTCCCAAACATTTCATCTT
CTTCTTCTTCCCTCCTCTGTTCTTTTCGAGTATGAACCTCTTTGTTCCGGTGGTGATCAT
CTTCGCGGAGATATTCTTCCGGCTGCGGCACTGGAGGCAAGACGGCTTCGCAGAAGCTGG
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DS 



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BQ
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AF RS1AG37TF U 74
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DS 

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GG
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GGAGAAGCGTTCGAGTCACTCTGATCTTGACGATGAGTTCGAGGCTGATTTCCAGCGTTT
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TTTCACGGCGACTCCGAACGCCGCCGTCTCCTCCTTGGCTGCCGCTCCTGGCAAGAAAGT
TACTGACTCTAACGGACAAGCTGCAAAGAGGAAGAGGAAGAGCCAATACCGAGGGATAAG
GCAACGTCCTTGGGGCAAATGGGCTGCTGAGATCCGTGATCCTAAGGAAGGTTCAAGGAT
CTGGCTTGGAACTTTCTCAACAGCCGAGGAAGCTGCGAGAGCTTATGATGCTGCAGCACG
CAGAATCCGCGGCTCCAAAGCTAAGGTGAACTTCCCAGTGGAAACCCTTACTGTCTCTCA
CAAACCAGTGGCTAAACCTAATCCGAACCCAGCTTCGGTTCAGAACTTCGACAACACGTG
TTTCATGGAGGACACACAGCAAGGGAACAACAACAACAATCAGTTTGCGCTGACAAACTC
TATTGATGCTGGAGGTGGTAGTGGATATCATCAGTATTTCAGCTCAGACCAGG*TAGTAA
TTCATTCGGTTGGAGCGATCAAGCTCCAATAACTCCTGAGATATCTTCTGCGTTTATCAA
CAACAACAACTCTGCTCT

QA 3 860 3 860
DS 

RD RS1BQ22JQ 755 0 0
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CCAGTGGAAACCCTTACTGTCTCTCACAAACCAGTGGCTAAACCTAATCCGAACCCAGCT
TCGGTTCAGAACTTCGACAACACGTGTTTCATGGAGGACACACAGCAAGGGAACAACAAC
AACAATCAGTTTGCGCTGACAAACTCTATTGATGCTGGAGGTGGTAGTGGATATCATCAG
TATTTCAGCTCAGACCAGGGTAGTAATTCATTCGGTTGGAGCGATCAAGCTCCAATAACT
CCTGAGATATTTTCTGCGTTTATCAACAACAACAACTCTGCTCTGTTCGTGGAGGATGCA
AATCCAGCTAAGAAGCTCAACTCCATGGATTTTGAGACACCTGAATGGGACTCTTCACTT
GGTTTCCTCAGTGGAGATGCTGTGGTGACTGAGGAAAACGGTGCAAACCCTATAGAGTTA
TGGAGCATTGATGAGATCGAGTCCATGATCGGAGGGGTCTTCTAAAAAGATACATTTTCA
TGTAAATAAGGCTGCATGTTAGTGAGTTTCCCGCATCATCATCTCCTTTAAACCTGCAAA
ACAATTTAAGATCTGTTACTTTTGTTTCATCTTCTTGCTGTATATGTCTATCTGAGGAGC
TGCTGTTGGGGAATGGTTGTAAGCCTATTTAACTTTGCATGCTAATAAGGTTGTGATGAA
GTTCATATAGGGGCTTAATTTTCAGGAGTTTCCGT

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL3494Contig1 478 2 2 U
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CTTTGGATTCCGTTTAAGTTCATCTACCAAACTCTCCGATCTCTCTTATTCAAGCTTTTC
GGTCTGCGAACTCCTTCTAACCATACTTTTCAGGAAGAAGAAGTTGAGGTTGTGGAAGTA
TCATCGAGGGGGCTCCGGGCGAAACCGAAACTACAGCAGAAGTCGAAAGCAACTTCCGGC
AAGCCCGGAAGTGTTAACAAGAAGCCTTCCTAAGTTATGTATAATTTACGGAAAGATTCT
TGCTTACATGCTCTGCTAATTAAGAAAATGTGATTTCTCTTCTCCTTTTGCACTGTATTT
TTCTTTTTACTGATTTTGCATTGTATATTTCTCGAAGCTTGCAAGTTCACCGAGACCTTT
TGTTTCATAATAATAAAAGACGGTGAGAATCTTGTGTGATTCTTGGCGAGAATGTTGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GB30JQ C 1
AF RS1GB30TF U 1
BS 1 472 RS1GB30TF
BS 473 478 RS1GB30JQ

RD RS1GB30JQ 478 0 0
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CTTTGGATTCCGTTTAAGTTCATCTACCAAACTCTCCGATCTCTCTTATTCAAGCTTTTC
GGTCTGCGAACTCCTTCTAACCATACTTTTCAGGAAGAAGAAGTTGAGGTTGTGGAAGTA
TCATCGAGGGGGCTCCGGGCGAAACCGAAACTACAGCAGAAGTCGAAAGCAACTTCCGGC
AAGCCCGGAAGTGTTAACAAGAAGCCTTCCTAAGTTATGTATAATTTACGGAAAGATTCT
TGCTTACATGCTCTGCTAATTAAGAAAATGTGATTTCTCTTCTCCTTTTGCACTGTATTT
TTCTTTTTACTGATTTTGCATTGTATATTTCTCGAAGCTTGCAAGTTCACCGAGACCTTT
TGTTTCATAATAATAAAAGACGGTGAGAATCTTGTGTGATTCTTGGCGAGAATGTTGT

QA 1 478 1 478
DS 

RD RS1GB30TF 472 0 0
GGAATCGGAGAGAACATGGAGAGAGAAGGAAGAAAAGAAGGCGAAGGAGCTTTTTACTAT
CTTTGGATTCCGTTTAAGTTCATCTACCAAACTCTCCGATCTCTCTTATTCAAGCTTTTC
GGTCTGCGAACTCCTTCTAACCATACTTTTCAGGAAGAAGAAGTTGAGGTTGTGGAAGTA
TCATCGAGGGGGCTCCGGGCGAAACCGAAACTACAGCAGAAGTCGAAAGCAACTTCCGGC
AAGCCCGGAAGTGTTAACAAGAAGCCTTCCTAAGTTATGTATAATTTACGGAAAGATTCT
TGCTTACATGCTCTGCTAATTAAGAAAATGTGATTTCTCTTCTCCTTTTGCACTGTATTT
TTCTTTTTACTGATTTTGCATTGTATATTTCTCGAAGCTTGCAAGTTCACCGAGACCTTT
TGTTTCATAATAATAAAAGACGGTGAGAATCTTGTGTGATTCTTGGCGAGAA

QA 1 472 1 472
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL3496Contig1 855 2 16 U
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GTTCATTACTACCTCTTAACTTCAAAACGTAAAATGGACAAAACATCATATGATATCATA
CAAAACGAAAATTGATTCTGAACATAGAAGTGGCCATATTTTCTTGCTTTTTCCTTCCAT
ACACAAAAAAAGAGAGTTGAAGATACCACTAGTCCTGCATATTACTTCTCGACTTTTTAT
AAAAGACAGATCACATCATCTGCAGATGCAGATCACCTGTCTGCTGTGCTAGTTCCACCA
TCATCGCTTCATCAAAGAACTTGTTCCCGCTTACGTCCTCACTCATTCCCTTTCTACGGC
GAGTCTTCACCACGAACTCGCGAGCTAGGTGCTGGATGGGGGCAGGCTCAAGTGGGCGCA
ACAGGACGGATTTGTCCAGAGGGTCTCCTGGTACTATGGCCCAGTGATCAAAGACAGACA
CGCAAAAGGCTTGTCCCTGTGTGTGATACCTCAGGTCCGTCTCAAACCCAAAGGACTCTA
TCACTGGCAGGAAAGCCTTCACAATGTAGGCTGGGGTGCCGGGCTGGGGAACATCTGATG
TGACGTGCCCACGTCTACGTGATAGAACGGTGTAGATGGCAGTTACACAGTCGATGGGTG
TTTGGATCTCGACGTAGTAAACAGGTTCCATAAGCCTTGGAGTGGCCATGAGAAAGGATG
AGTAAGCAACGCGACGTGCTGTTGGAATCATCTGACCAGATCCTCGATGCAACGGCTCTG
GTGCTATCCAGGCATCACAATCTTGAACTTGACATTCCTGATGGGCCATCACACATGGTC
TTCTCGCGCTCCCAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BT23JQ U 1
AF RS1FN42JQ U 1
BS 1 109 RS1BT23JQ
BS 110 111 RS1FN42JQ
BS 112 166 RS1BT23JQ
BS 167 167 RS1FN42JQ
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BS 187 262 RS1BT23JQ
BS 263 263 RS1FN42JQ
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BS 373 373 RS1FN42JQ
BS 374 426 RS1BT23JQ
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BS 604 763 RS1BT23JQ
BS 764 855 RS1FN42JQ

RD RS1BT23JQ 763 0 0
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GTTCATTACTACCTCTTAACTTCAAAACGTAAAATGGACAAAACATCAT**GATATCATA
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AGTAAGCAACGCGACGTGCTGTTGGAATCATCTGACCAGATCC

QA 1 763 1 763
DS 

RD RS1FN42JQ 855 0 0
GCAAGTAACAAAGATTTGTCAATATTGCTAACTGATCGAGTCAGGTGTTGACAGTTTGAA
GTTCATTACTACCTCTTAACTTCAAAACGTAAAATGGACAAAACATCATATGATATCATA
CAAAACGAAAATTGATTCTGAACATAGAAGTGGCCTTATTTTCTTGCTTTTTCCTTCCAT
ACACAAAAAAAGAGAGTTGAAGATACCACTAGTCCTGCATATTACTTCTCGACTTTTTAT
AAGAGACAGATCACATCATCTGCAGATGCATATCACCTGTCTGCTGTGCTAGTTCCACCA
TCATCGCTTCATCAAAGAACTTGTTCCCGCTTACGTCCTCACTCATTCCCTTTCTACGGC
GAGTCTTCACCACGAACTCGCGAGCTAGGTGCTGGATGGGGGCAGGCTCAAGTGGGCGCA
ACAGGACGGATTTGTCCAGAGGGTCTCCTGGTACTATGGCCCAGTGATCAAAGACAGACA
CGCAGAAGGCTTGTCCCTGTGTGTGATACCTCAGGTCCGTCTCAAACCCAAAGGACTCTA
TCACTGGCAGGAAAGCCTTCACAATGTAGGCTGGGGTGCCGGGCTGGGGAACATCTGATG
TGACGTGCCCACGTCTACGTGATAGAACGGTGTAGATGGCAGTTACACAGTCGATGGGTG
TTTGGATCTCGACGTAGTAAACAGGTTCCATAAGCCTTGGAGTGGCCATGAGAAAGGATG
AGTAAGCAACGCGACGTGCTGTTGGAATCATCTGACCAGATCCTCGATGCAACGGCTCTG
GTGCTATCCAGGCATCACAATCTTGAACTTGACATTCCTGATGGGCCATCACACATGGTC
TTCTCGCGCTCCCAC

QA 1 855 1 855
DS 



AS 1 3

CO CL3497Contig1 701 3 10 U
CGCTCATCAAGTCATCATCATCATAAAAATGCTCGAGAACAAAAAAAAACACACAGAAGC
AAATGACATGGTTTACGAGATCACGTTTTTGATCACACACCGCATTGAATCAAAATACAA
TTCAGGAGCAACAACAGAATAAAAAACATAGGAAGTATATATTATACGAAACAAATGTTT
AAAAATCAATCGGTCGATGTTAATAAGTATAGAACTCAGCCAATTCTTCAACGGATCCTA
CTTCTTGACCAGTCTTGAGCATCCACAACAAGTGCTCGAACAAAACAACTTCACAAGCTA
CAACAATCTCACGATCTTGTTCATCGGATCTAGAAGACCTATCCACCAGTTCTTGAAAAA
GTGGGTGAGAGATGATGTCCGGTTTAAGCATGTAAGGTCTTCGAGTCTGACCAACATAAA
CAACATGGAGATTGCTGTTCTCTGAGAGCTCATCGGAGACAGCAGCCGAGGAGGACGAGT
GGTGGTGATTCTTGGCGAAGGAAGGCCATTTCTTTATTGCCGACTTGAGCTTTGTCAGCT
TCCCAACTTTGGCCATTGCTTTTGAAACTAACCTCTTTTTTCTTGGATTCGGAACAAGAG
TGTTGTTGAAACAAGATAGGGTTTAGGGTTTATGAAAATATATGAGTGTGTGTTGGTCAA
AAGATTGAATGAAGAATAGAAAATGTTTTGAGATGTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1GQ83JQ U 1
AF RS1F487JQ U 107
AF RS1F487TF C 107
BS 1 239 RS1GQ83JQ
BS 240 240 RS1F487JQ
BS 241 368 RS1GQ83JQ
BS 369 369 RS1F487JQ
BS 370 434 RS1GQ83JQ
BS 435 435 RS1F487JQ
BS 436 446 RS1GQ83JQ
BS 447 447 RS1F487JQ
BS 448 463 RS1GQ83JQ
BS 464 701 RS1F487JQ

RD RS1GQ83JQ 463 0 0
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AAATGACATGGTTTACGAGATCACGTTTTTGATCACACACCGCATTGAATCAAAATACAA
TTCAGGAGCAACAACAGAATAAAAAACATAGGAAGTATATATTATACGAAACAAATGTTT
AAAAATCAATCGGTCGATGTTAATAAGTATAGAACTCAGCCAATTCTTCAACGGATCCTC
CTTCTTGACCAGTCTTGAGCATCCACAACAAGTGCTCGAACAAAACAACTTCACAAGCTA
CAACAATCTCACGATCTTGTTCATCGGATCTAGAAGACCTATCCACCAGTTCTTGAAAAA
GTGGGTGAAAGATGATGTCCGGTTTAAGCATGTAAGGTCTTCGAGTCTGACCAACATAAA
CAACATGGAGATTGTTGTTCTCTGAGCGCTCATCGGAGACAGC

QA 1 463 1 463
DS 

RD RS1F487JQ 595 0 0
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TGTGTGTTGGTCAAAAGATTGAATGAAGAATAGAAAATGTTTTGAGATGTTCTCC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RS1F487TF 595 0 0
GAATCAAAATACAATTCAGGAGCAACAACAGAATAAAAAACATAGGAAGTATATATTATA
CGAAACAAATGTTTAAAAATCAATCGGTCGATGTTAATAAGTATAGAACTCAGCCAATTC
TTCAACGGATCCTACTTCTTGACCAGTCTTGAGCATCCACAACAAGTGCTCGAACAAAAC
AACTTCACAAGCTACAACAATCTCACGATCTTGTTCATCGGATCTAGAAGACCTATCCAC
CAGTTCTTGAAAAAGTGGGTGAGAGATGATGTCCGGTTTAAGCATGTAAGGTCTTCGAGT
CTGACCAACATAAACAACATGGAGATTGCTGTTCTCTGAGAGCTCATCGGAGACAGCAGC
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GAGCTTTGTCAGCTTCCCAACTTTGGCCATTGCTTTTGAAACTAACCTCTTTTTTCTTGG
ATTCGGAACAAGAGTGTTGTTGAAACAAGATAGGGTTTAGGGTTTATGAGAATATATGAG
TGTGTGTTGGTCAAAAGATTGAATGAAGAATAGAAAATGTTTTGAGATGTTCTCC

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 3

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GTCGACTTCTTCTTCCTTTGTCTTTGGTCCTTACAAGATCGATCCGCGTGAAGTGTTCTA
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TCACGTCTTGCCTCGTAAAGGTGGTGACTTTGAGAAGAATGATGAGATTTACGATGCAAT
TGATGAGAAGGAGAAGGAACTGAAGCAGAAGCTTGATCTAGACAAAGACCGTGTTGATAG
GAGCATTGAGGAGATGGCTAACGAGGCTTCTCAGTACAGATCTCTTTTCGATTGCTAGTT
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CTCTCAAGTTGAGGTTGATGTTTCAGACTTCAATTCCAACTTGTAATCTCTTTCTTATGT
CACCCAACTAGAATCATCTATGTGTTTATTTGAAGAACCAACATGACAC


BQ
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AF RS1A516JQ C 1
AF RS1A516TF U 37
AF RS1CS12TF U 144
BS 1 36 RS1A516JQ
BS 37 655 RS1A516TF
BS 656 709 RS1CS12TF

RD RS1A516JQ 655 0 0
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GTCGACTTCTTCTTCCTTTGTCTTTGGTCCTTACAAGATCGATCCGCGTGAAGTGTTCTA
CGCAACTCCTCTCTCTTACGCCATGGTTAATCTCCGTCCTCTTCTTCCTGGTCATGTTCT
TGTCTGTCCAAGACGCCTTGTGCCGCGCTTTACTGATCTCACAGCTGATGAGACCAGTGA
TCTGTGGCTTACCGCTCAGAGGGTTGGCTCTCGGATTGAGACCTTCCACAATGCATCTTC
TCTCACGTTAGCCATCCAAGATGGTCCTCAGGCGGGACAGAGTGTTCCACATGTGCACAT
TCACGTCTTGCCTCGTAAAGGTGGTGACTTTGAGAAGAATGATGAGATTTACGATGCAAT
TGATGAGAAGGAGAAGGAACTGAAGCAGAAGCTTGATCTAGACAAAGACCGTGTTGATAG
GAGCATTGAGGAGATGGCTAACGAGGCTTCTCAGTACAGATCTCTTTTCGATTGCTAGTT
TTAAGCAAAAGATATCCACTGGCTTCTAAGCCTTTTTAATAAGACCATTGTGACAAGCAT
CTCTCAAGTTGAGGTTGATGTTTCAGACTTCAATTCCAACTTGTAATCTCTTTCT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1A516TF 619 0 0
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TCCTCTTCTTCCTGGTCATGTTCTTGTCTGTCCAAGACGCCTTGTGCCGCGCTTTACTGA
TCTCACAGCTGATGAGACCAGTGATCTGTGGCTTACCGCTCAGAGGGTTGGCTCTCGGAT
TGAGACCTTCCACAATGCATCTTCTCTCACGTTAGCCATCCAAGATGGTCCTCAGGCGGG
ACAGAGTGTTCCACATGTGCACATTCACGTCTTGCCTCGTAAAGGTGGTGACTTTGAGAA
GAATGATGAGATTTACGATGCAATTGATGAGAAGGAGAAGGAACTGAAGCAGAAGCTTGA
TCTAGACAAAGACCGTGTTGATAGGAGCATTGAGGAGATGGCTAACGAGGCTTCTCAGTA
CAGATCTCTTTTCGATTGCTAGTTTTAAGCAAAAGATATCCACTGGCTTCTAAGCCTTTT
TAATAAGACCATTGTGACAAGCATCTCTCAAGTTGAGGTTGATGTTTCAGACTTCAATTC
CAACTTGTAATCTCTTTCT

QA 1 619 1 619
DS 

RD RS1CS12TF 566 0 0
G
GGTTAATCTCCGTCCTCTTCTTCCTGGTCATGTTCTTGTCTGTCCAAGACGCCTTGTGCC
GCGCTTTACTGATCTCACAGCTGATGAGACCAGTGATCTGTGGCTTACCGCTCAGAAGGT
TGGCTCTCGGATTGAGACCTTCCACAATGCATCTTCTCTCACGTTAGCCATCCAAGATGG
TCCTCAGGCGGGACAGAGTGTTCCACATGTGCACATTCACGTCTTGCCTCGTAAAGGTGG
TGACTTTGAGAAGAATGATGAGATTTACGATGCAATTGATGAGAAGGAGAAGGAACTGAA
GCAGAAGCTTGATCTAGACAAAGACCGTGTTGATAGGAGCATTGAGGAGATGGCTAACGA
GGCTTCTCAGTACAGATCTCTTTTCGATTGCTAGTTTTAAGCAAAAGATATCCACTGGCT
TCTAAGCCTTTTTAATAAGACCATTGTGACAAGCATCTCTCAAGTTGAGGTTGATGTTTC
AGACTTCAATTCCAACTTGTAATCTCTTTCTTATGTCACCCAACTAGAATCATCTATGTG
TTTATTTGAAGAACCAACATGACAC

QA 2 566 2 566
DS 



AS 1 3

CO CL3499Contig1 1309 3 17 U
GGATCCCATTATCATATCATCCTTCAAAACACAAAGCTAGAGAGAAAGAAAATGTGTTCC
TCAAAATCAAAGAACATGAACCAAGAAGCCATTTCCCAAATCAATGGTCGTCCGGTTCTT
CAGCCAAAATCGAACCAAGTTCCCACTTTAGACCGACGCAATTCACTCAAGAAATCCCCT
CCTAAACCTTTGATACATCCCATTGCATCAAAGTTAGCGTCACCAAGACAAATATCCCTA
AACTCTCCACCTTTGTCTCCCAACTTAAAACCCATAAGAAAACTGGCCGGTCATGAGAAA
CCTAAACAGGCTGCTAAACCGGTGAAATTATCAGAGAGCACTGATGGTGGCTGCAGAGAG
GTTAAGTCATTGATGACTGTTCAGAAGCAACCTGGAAGTATAGCTGCTGCACGAAGACAA
GAGGTTGCTATGAAACAAGAAGAAAGAAAGAAGAAAACCTCTCATTATGGTAGAGTAAAA
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TTCATCACTACAAGTTCAGATCCAATCTATGTGGCTTACCATGACGAAGAATGGGGAGTT
CCTGTTCATAATGACAACCTACTGTTTGAGCTTCTGGTGTTAACCGGAGCTCAAGTAGGA
TCCGACTGGACTTCGGTTTTGAAGAGAAGAAACACTTTTAGAGAGGCTTTCTCTGGTTTC
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AAGGCCAAAGCCGTCTATAGGCAAAAGAAGATCATTGTTGGTCACATTGGCTTTATTTAT
TAGTTTTACGTAATCATAATAATATTGATGTGTTATTATTGTAGCACTATATATACCATG
TGATATATAGATTTGAGGTCCTAACTTTAGGTGTTGTTTCTTGTACAAAAGTAGTTGTTT
GTGTGTGTGATTGTGCCTTATCTTTAATATATATTTGTGTATTTGGTTT


BQ
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AF RS1GV31TF U 532
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GAG
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TGAAGCACAAACCGGTTACCACAGAATACACATCTTGCCAAAAGATTCCGGTGAAGACAT
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TACAAAAGTAGTTGTTTGTGTGTGTGATTGTGCCTTATCTTTAATATATATTTGTGTATT
TGGTTT

QA 4 789 4 789
DS 

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TGGGGAGTTCCTGTTCATAATGACAACCTACTGTTTGAGCTTCTGGTGTTAACCGGAGCT
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TCTGGTTTCGAAGCAGAGCTTGTCGCAGAGTTCAACGAGAAGAAGATACAGTCGATAGTC
AACGACTATGGAATTGGCCTTAGCCAAGTCCTTGCAATTGTTGACAACTCTAAACAAATT
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TATACCATGTGATATATAGATTTGAG*TCCTAACTTTAG*TGTTGTTTCTTGTACAAA*G
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TATAT

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

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CTAGACCACCCTAATGTCGTTGCTTTAAAGCATAGCTTCTACACGAGAGCAGATAATGAA
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TCCCCTAATTTGAGATGCACAGCTTTGGAAGCTTGTATTCATCCGTTATTTGATGAGCTA
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BQ
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AF RS1DY50TF U 1
AF RS1DY50JQ C 568
BS 1 708 RS1DY50TF
BS 709 1313 RS1DY50JQ

RD RS1DY50TF 708 0 0
GAACCAGATATTATTGATGGCGCTGGCACTGAACCTGGACATGTGATTAGAACCACACTC
CGTGGACGAAATGGCCAATCAAGACAGACAGTCAGTTACATATCAGAACATGTAGTTGGT
ACTGGCTCCTTTGGCATGGTTTTCCAAGCCAAATGTAGGGAAACTGGGGAGATTGTTGCA
ATCAAGAAGGTTCTACAAGACAAGCGTTACAAGAACAGGGAGCTACAGATCATGCAGATG
CTAGACCACCCTAATGTCGTTGCTTTAAAGCATAGCTTCTACACGAGAGCAGATAATGAA
GAGGTTTATTTGAATCTTGTCCTTGAGTTTGTCCCTGAGACCGTCAATCGTGCTGCAAGA
AGTTACACTAGGACGAACCAGCTCATGCCTTTAATATACGTTAAACTCCACACCTATCAG
ATTTGCAGGGCGCTTGCTTACATCCATAATAGCTTTGGTCTTTGTCACCGTGATATTAAG
CCTCAAAACCTGCTAGTGAACCCACATACGCATCAGCTAAAAATCTGTGATTTCGGGAGT
GCAAAAGTGTTGGTGAAAGGAGAACCGAATGTTTCTTACATCTGTTCTAGATACTATCGT
GCTCCAGAACTCATTTTTGGCGCCAGCGAATACACACCTGCAATTGATATATGGTCCACT
GGTTGTGTGATGGCTGAATTGCTTCTTGGACAGCCTCTGTTTCCTGGT

QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1DY50JQ 746 0 0
AATGTT
TCTTACATCTGTTCTAGATACTATCGTGCTCCAGAACTCATTTTTGGCGCCAGCGAATAC
ACACCTGCAATTGATATATGGTCCACTGGTTGTGTGATGGCTGAATTGCTTCTTGGACAG
CCTCTGTTTCCTGGTGAAAGCGGAGTCGATCAGCTTGTTGAAATCATCAAGGTTTTAGGA
ACACCAACGAGGGAGGAAATCAAGTGCATGAATCCAAACTATACAGAATTTAAATTTCCC
CAGATAAAACCTCATCCATGGCACAAGGTCTTCCAAAAACGTTTACCACCGGAAGCGGTT
GATCTTCTATGTAGGTTCTTCCAATATTCCCCTAATTTGAGATGCACAGCTTTGGAAGCT
TGTATTCATCCGTTATTTGATGAGCTAAGGGACCCCAACACTCGTCTTCCCAATGGCCGG
CCACTTCCTCCGCTTTTCAACTTCAAACCTCAAGAGCTATCTGGAATCCCTTCTGAGATC
GTGAACCGGCTTGTACCAGAGCATGCCCGTAAGCAGAACTTCTTCATGGCTTTGGATGCC
TAAAGCGCTTATCTGTTTCTTTCTTCTTCTTTTTTTGCTTCTGTATAAACTGTCTAGAGT
AATCGGGTATTTGGAGCAACCAGAAGGCATTATACGCCCTTTTGTTTTCAGTGAGTTGTT
TGGTTACCGGGAGACGAGGATGCATGAAATACAAACAGTACTTGAGTTTGGTACTGGCTA
TAAGACCACGTGTTTGTTCC

QA 7 746 7 746
DS 



AS 1 3

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TGTTTCTTCCAGCTTTACAGAGATTCAAAAGGGGAGACATTAAAAAAAAAGGATGAGTGG
GTTTAGAGCGTTCAAAGCACAGGTGCCCATTCAATGGAGCGAGAGCTTGTACATAACCTT
AGTGAGAGGTCTCCCTGGAACCAGGAAGCTTCACAGGCGTACACTCGAGGCCATGGGACT
CCGCAGATGCCATCGCACTGTTCTTCACTCCAACACTTCTTCCATTAGAGGAATGATTCA
ACAGGTTAAAAGGATGGTTGTTGTTGAGACAGAGGAGATGTTCAAAGCTCGCAAAGAAGC
TGAAGCCAACCACAAAGCTCTCCGCCCTCCACTTGTTGTCAGTCATTCAAGCCCTGCAAC
AGGCTCATCCAACATGTCTTCTTGAGGATTTCAGAATATGGTAGAGCTCTTCAACCGTCA
CTTTGTTTAAGCTCCACTTACATTTGTGAGGGAAGTCATAAGTAGTCTAGACGCGATAAG
ACAATTTCATTTATCAGTGAATTTGGTACCTCTTTGTGTACACTAGGTACTTGTGTATGT
TTACACTCTCATTTTGTCAAATCTCAAATCCACCAGTTTGGTTAA


BQ
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AF RS1GS09JQ C 1
AF RS1GS09TF U 1
AF RS1GL60TF U 118
BS 1 643 RS1GS09TF
BS 644 645 RS1GL60TF

RD RS1GS09JQ 643 0 0
TTTTTCCGAGCTCTGTTCGCCGCCTTAGAGTCAATCCTCCGTCACCGGAATTTACACCTC
TGTTTCTTCCAGCTTTACAGAGATTCAAAAGGGGAGACATTAAAAAAAAAGGATGAGTGG
GTTTAGAGCGTTCAAAGCACAGGTGCCCATTCAATGGAGCGAGAGCTTGTACATAACCTT
AGTGAGAGGTCTCCCTGGAACCAGGAAGCTTCACAGGCGTACACTCGAGGCCATGGGACT
CCGCAGATGCCATCGCACTGTTCTTCACTCCAACACTTCTTCCATTAGAGGAATGATTCA
ACAGGTTAAAAGGATGGTTGTTGTTGAGACAGAGGAGATGTTCAAAGCTCGCAAAGAAGC
TGAAGCCAACCACAAAGCTCTCCGCCCTCCACTTGTTGTCAGTCATTCAAGCCCTGCAAC
AGGCTCATCCAACATGTCTTCTTGAGGATTTCAGAATATGGTAGAGCTCTTCAACCGTCA
CTTTGTTTAAGCTCCACTTACATTTGTGAGGGAAGTCATAAGTAGTCTAGACGCGATAAG
ACAATTTCATTTATCAGTGAATTTGGTACCTCTTTGTGTACACTAGGTACTTGTGTATGT
TTACACTCTCATTTTGTCAAATCTCAAATCCACCAGTTTGGTT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RS1GS09TF 643 0 0
TTTTTCCGAGCTCTGTTCGCCGCCTTAGAGTCAATCCTCCGTCACCGGAATTTACACCTC
TGTTTCTTCCAGCTTTACAGAGATTCAAAAGGGGAGACATTAAAAAAAAAGGATGAGTGG
GTTTAGAGCGTTCAAAGCACAGGTGCCCATTCAATGGAGCGAGAGCTTGTACATAACCTT
AGTGAGAGGTCTCCCTGGAACCAGGAAGCTTCACAGGCGTACACTCGAGGCCATGGGACT
CCGCAGATGCCATCGCACTGTTCTTCACTCCAACACTTCTTCCATTAGAGGAATGATTCA
ACAGGTTAAAAGGATGGTTGTTGTTGAGACAGAGGAGATGTTCAAAGCTCGCAAAGAAGC
TGAAGCCAACCACAAAGCTCTCCGCCCTCCACTTGTTGTCAGTCATTCAAGCCCTGCAAC
AGGCTCATCCAACATGTCTTCTTGAGGATTTCAGAATATGGTAGAGCTCTTCAACCGTCA
CTTTGTTTAAGCTCCACTTACATTTGTGAGGGAAGTCATAAGTAGTCTAGACGCGATAAG
ACAATTTCATTTATCAGTGAATTTGGTACCTCTTTGTGTACACTAGGTACTTGTGTATGT
TTACACTCTCATTTTGTCAAATCTCAAATCCACCAGTTTGGTT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RS1GL60TF 528 0 0
G
GGGTTTAGAGCATTCAAAGCACAGGTTCCCATTAAGTGGAGCGAGAGCTTGTACATAACC
TTAGTGAGAGGTCTCCCTGGAACCAGGAAGCTTCACAGGCGTACACTCGAGGCTATGGGA
CTCCGCAGATGCCATCGCACTGTTCTTCACTCCAACACTTCTTCCATTAGAGGAATGATT
CAACAGGTTAAAAGGATGGTTGTTGTTGAGACAGAGGAGATGTTCAAAGCTCGGAAAGAA
GCTGAAGCCAACCACAAAGCTCTCCGCCCTCCACTTGTTGTCAGTCATTCAAGCCCTGCA
ACAGGCTCATCCAACATGTCTTCTTGAGGATTTCAGAAGATGGTAGAGCTCTTCAACCGT
CACTTTGTTTAAGCTCCACTTACATTTGTGAGGGAAGTCATAAGTAGTCTAGACGCGATA
AGACAATTTCATTTATCAGTGAATTTGGTACCTCTTTGTGTACACTAGGTACTTGTGTAT
GTTTACACTCTCATTTTGTCAAATCTCAAATCCACCAGTTTGGTTAA

QA 2 528 2 528
DS 



AS 1 3

CO CL3502Contig1 835 3 11 U
CTCCGACGCCTTTGAACGTCCGTCACTTTAACTTCCACTTCCACTCTATTGTTCATCAAC
AACAGCCAAAGCCATGTCTCACACTCTCGGCCTCACCAAACCCAACTCCACCGATCATCC
CAAGATCTCGTTCGCCGCGAAGGAGATCGACGTGACGGAGTGGAAAGGGGACTTGCTCGT
CGTCGGCGCGACGGAGCAAGACCTGACGAAGGACGCTAGCTCCAAGTTCGAAAACCTGAT
CTTGAACAAGCTCGACGCACACACGAGCGGACTCTTGGGTTTAGTCTCTTCCGAGGAAGA
TTTCACCGGTAAACCCGGTCAGTCAACGGTTCTCAGACTCCCCGGTTTAGCATCCAAACG
GATCGGTTTGATCGGTTTAGGAAAATCATCTCCCGCGGCTTTTCAGAGCCTTGGCGAAGG
TGTAGCCACAGTGTCGAAGGCTTCACAGTCTAGTACTGTTGCTGTTGTTCTTGCCTCACC
TGAGAGTGAATCCAGCTATGCTTCGGCTATAGCTTCAGGCGTAGTGCTGGGGCTATTCGA
AGACGGGAGGTATAAGTCTGAGTCAAAGAAACCATCTTTGAAGTCTGTGGATATCATTGG
GTTTGGAGCTGGATCTGAATTGGAGAAGAAGCTTAAGTATGCTCAAGATGTTTCTTACGG
TGTCATTTTCGGGAGGGAGCTCATTAACTCCCCTGCCAATGTCCTCACTCCTGCTGTGTT
AGCTGAGGAAGCGGCGAAAGTGGCTTCTACGTACAGTGATGTGTTTACGCGAACATCTTG
AACGAGAGCAGTGCAGAGAGTTGAAGATGGGATCTTATCTAGCCGTTGCTGCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EX43TF U 1
AF RS1A793TF U 20
AF RS1DM15TF U 140
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BS 536 656 RS1EX43TF
BS 657 766 RS1A793TF
BS 767 835 RS1DM15TF

RD RS1EX43TF 656 0 0
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AACAGCCAAAGCCATGTCTCACACTTTCGGCCTCACCAAACCCAACTCCACCGATCATCC
CAAGATCTCGTTCGCCGCGAAGGAGATCGACGTGACGGAGTGGAAAGGGGACTTGCTCGT
CGTCGGCGCGACGGAGCAAGACCTGACGAAGGACGCTAGCTCCAAGTTCGAAAACCTGAT
CTTGAACAAGCTCGACGCACACACGAGCGGACTCTTGGGTTTAGTCTCTTCCGAGGAAGA
TTTCACCGGTAAACCCGGTCAGTCAACGGTTCTCAGACTCCCCGGTTTAGCATCCAAACG
GATCGGTTTGATCGGTTTAGGAAAATCATCTCCCGCGGCTTTTCAGAGCCTTGGCGAAGG
TGTAGCCACAGTGTCGAAGGCTTCACAGTCTAGTACTGTTGCTGTTGTTCTTGCTTCACC
TGAGAGTGAATCTAGCTATGCTTCGGCTATAGCTTCAGGCGTAGTGCTGGGGCTGTTCGA
AGACGGGAGGTATAAGTCTGAGTCAAAGAAACCATCTTTGAAGTCTGTGGATATCATTGG
GTTTGGAGCTGGATCTGAATTGGAGAAGAAGCTTAAGTATGCTCAAGATGTTTCTT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RS1A793TF 747 0 0
GG
GTCACTTTAACTTCCACTTCCACTCTATTGTTCATCAACAACAGCCAAAGCCATGTCTCA
CACTCTCGGCCTCACCAAACCCAACTCCACCGATCATCCCAAGATCTCGTTCGCCGCGAA
**AGATCGACGTGACGGAGTGGAAAGGGGACTTGCTCGTCGTCGGCGCGACGGAGCAAGA
CCTGACGAAGGACGCTAGCTCCAAGTTCGAAAACCTGATCTTGAACAAGCTCGACGCACA
CACGAGCGGACTCTTGGGTTTAGTCTCTTCCGAGGAAGATTTCACCGGTAAACCCGGTCA
GTCAACGGTTCTCAGACTCCCCGGTTTAGCATCCAAACGGATCGGTTTGATCGGTTTAGG
AAAATCATCTCCCGCGGCTTTTCAGAGCCTTGGCGAAGGTGTAGCCACAGTGTCGAAGGC
TTCACAGTCTAGTACTGTTGCTGTTGTTCTTGCCTCACCTGAGAGTGAATCCAGCTATGC
TTCGGCTATAGCTTCAGGCGTAGTGCTGGGGCTATTCGAAGACGGGAGGTATAAGTCTGA
GTCAAAGAAACCATCTTTGAAGTCTGTGGATATCATTGGGTTTGGAGCTGGATCTGAATT
GGAGAAGAAGCTTAAGTATGCTCAAGATGTTTCTTACGGTGTCATTTTCGGGAGGGAGCT
CATTAACTCCCCTGCCAATGTCCTCACTCCTGCTGTGTTAGCTGAGGAAGCGGCGAAAGT
GGCTTCTACGTACAGTGATGTGTTT

QA 3 747 3 747
DS 

RD RS1DM15TF 696 0 0
AAGG
AGATCGACGTGACGGAGTGGAAAGGGGACTTGCTCGTCGTCGGCGCGACGGAGCAAGACC
TGACGAAGGACGCTAGCTCCAAGTTCGAAAACCTGATCTTGAACAAGCTCGACGCACACA
CGAGCGGACTCTTGGGTTTAGTCTCTTCCGAGGAAGATTTCACCGGTAAACCCGGTCAGT
CAACGGTTCTCAGACTCCCCGGTTTAGCATCCAAATGGATCGGTTTGATCGGTTTAGGAA
AATCATCTCCCGCGGCTTTTCAGAGCCTTGGCGAAGGTGTAGCCACAGTGTCGAAGGCTT
CACAGTCTAGTACTGTTGCTGTTGTTCTTGCCTCACCTGAGAGTGAATCCAGCTATGCTT
CGGCTATAGCTTCAGGCGTAGTGCTGGGGCTATTCGAAGACGGGAGGTATAAGTCTGAGT
CAAAGAAACCATCTTTGAAGTCTGTGGATATCATTGGGTTTGGAGCTGGATCTGAATTGG
AGAAGAAGCTTAAGTATGCTCAAGATGTTTCTTACGGTGTCATTTTCGGGAGGGAGCTCA
TTAACTCCCCTGCCAATGTCCTCACTCCTGCTGTGTTAGCTGAGGAAGCGGCGAAAGTGG
CTTCTACGTACAGTGATGTGTTTACGCGAACATCTTGAACGAGAGCAGTGCAGAGAGTTG
AAGATGGGATCTTATCTAGCCGTTGCTGCTGC

QA 5 696 5 696
DS 



AS 1 3

CO CL3503Contig1 900 3 14 U
GGATGCACCAGCACTCCATGAGGCTGACATAGGATTAGCAATGGGCATTGCCGGAACAGA
GGTGGCGAAAGAGAGCGCTGATGTCATTATTCTCGACGATAATTTCAGTACTATTGTGAC
AGTGGCCAAATGGGGACGTTCGGTTTACATTAACATTCAGAAGTTTGTGCAGTTCCAGCT
AACGGTCAATGTTGTTGCCCTCATTGTTAACTTCTCTTCAGCTTGCTTGACTGGAAGTGC
TCCTCTAACTGCTGTTCAACCGCTTTGGGTAAACATGATAATGGACACACTTGGAGCTCT
TGCTCTAGCTACAGAGCCACCTAACAACATGCTGATGAAACGTATGCCCGTTGGAAGGAA
AGGGAATTTCATTACAAACGCAATGTGGAGGAACATCTTAGGACAAGCTGTGTATCAGTT
CGTTATCATTTGGCTTCTACAGGCTAAAGGGAAGTCACTGTTTGGTCTTGTTGGTCCTGA
TTCTACTCTTGTGTTGAACACACTTATCTTTAACTGTTTCGTCTTCTGTCAGGTCTTCAA
TGAGATAAGCTCGCGGGAAATGGAAGAGATCGATGTATTCAAAGGCATACTCGACAACTA
TGTGTTTGTGGTTGTTATCGGTATAACTGTTTTCCTTCAGATCATAATCATTGAGTTCTT
GGGGACATTTGCAAGCACCACACCTCTCACATTCGTCCAGTGGTTCTTCAGCATATTTGT
TGGCTTCTTAGGAATGCCGATCGCTGCTGGCTTGAAGAAAATAGAAGTGTAATGCCACTG
CTAAAAGTATCACTCTTATAGAACATAAGTTCCTTTGGACACAAGCAAATATTTTGTCTT
TTTTTTTGGTGCAATTTTTTTTCCTTTACTGAATAAGGTTATTTATTTACCGACAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CI12TF U 1
AF RS1GR17TF U 224
AF RS1GR17JQ C 272
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BS 847 847 RS1GR17JQ
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RD RS1CI12TF 654 0 0
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GGTGGCGAAAGAGAGCGCTGATGTCATTATTCTCGACGATAATTTCAGTACTATTGTGAC
AGTGGCCAAATGGGGACGTTCGGTTTACATTAACATTCAGAAGTTTGTGCAGTTCCAGCT
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TTCTACTCTTGTGTTGAACACACTTATCTTTAACTGTTTCGTCTTCTGTCAGGTCTTCAA
TGAGATAAGCTCGCGGGAAATGGAAGAGATCGATGTATTCAAAGGCATACTCGACAACTA
TGTGTTTGTGGTTGTCATCGGTATAACTGTTTTCTTTCAGATCATAATCATTGA

QA 1 654 1 654
DS 

RD RS1GR17TF 677 0 0
G
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ACACACTTGGAGCTCTTGCTCTAGCTACAGAGCCACCTAACAACATGCTGATGAAACGTA
TGCCCGTTGGAAGGAAAGGGAATTTCATTACAAACGCAATGTGGAGGAACATCTTAGGAC
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GTCTTGTTGGTCCTGATTCTACTCTTGTGTTGAACACACTTATCTTTAACTGTTTCGTCT
TCTGTCAGGTCTTCAATGAGATAAGCTCGCGGGAAATGGAAGAGATCGATGTATTCAAAG
GCATACTCGACAACTATGTGTTTGTGGTTGTTATCGGTATAACTGTTTTCCTTCAGATCA
TAATCATTGAGTTCTTGGGGACATTTGCAAGCACCACACCTCTCACATTCGTCCAGTGGT
TCTTCAGCATATTTGTTGGCTTCTTAGGAATGCCGATCGCTGCTGGCTTGAAGAAAATAG
AAGTGTAATGCCACTGCTAAAAGTATCACTCTTATAGAACATAAGTTCCTTTGGACACAA
GCAAATATTTTGTCTTTTTTTT*GGTGCAATTTTTTTTCCTTTACTGAATAAGGTTATTT
ATTTACCGACAAAAAA

QA 2 677 2 677
DS 

RD RS1GR17JQ 623 0 0
AACATGATAATGGACACACTTGGAGCTCTTGCTCTAGCTACAGAGCCACCTAACAACATG
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AACATCTTAGGACAAGCTGTGTATCAGTTCGTTATCATTTGGCTTCTACAGGCTAAAGGG
AAGTCACTGTTTGGTCTTGTTGGTCCTGATTCTACTCTTGTGTTGAACACACTTATCTTT
AACTGTTTCGTCTTCTGTCAGGTCTTCAATGAGATAAGCTCGCGGGAAATGGAAGAGATC
GATGTATTCAAAGGCATACTCGACAACTATGTGTTTGTGGTTGTTATCGGTATAACTGTT
TTCCTTCAGATCATAATCATTGAGTTCTTGGGGACATTTGCAAGCACCACACCTCTCACA
TTCGTCCAGTGGTTCTTCAGCATATTTGTTGGCTTCTTAGGAATGCCGATCGCTGCTGGC
TTGAAGAAAATAGAAGTGTAATGCCACTGCTAAAAGTATCACTCTTATAGAACATAAGTT
CCTTTGGACACAAGCAAATATTTTGTCTTTTTTTTTGGTGCAATTTTTTTTCCTTTACTG
AATAAGGTTATTTATTTACCGAC

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 3

CO CL3504Contig1 1304 3 4 U
GGCCAACCGAATCTCTCTCTCATCCCTCCCCTTCTTCTCTTCAGCTTACTTCTCTTCTCA
ACTCTACCTGGATCATAAGCTTGACTGTTTCTATTTCTTCTTCTCTTCTTAAATCCTCCC
CTCTCATCAAAACTAAACTCTAACCTCCCCTATGGATTAATAAACCCATGAACAAAGATT
TAAATTCTATAGATAACACGACGGAGCTGTTGACGGATCTGGTGTGAGCATCATCGGATT
CGTCTGGAGTCAACGAGTTATGGGGGTTTGAGGTTCATTTGTCGAGTCACGGTTCATTAG
ATTTCGGTTCCGGCGTGAGAGACAGTAGAGATTACGTCGTTGATAGGATTATCAGGAATT
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AGAGGGAATATAGCTGGGAGAGGAGATCGGGGCGAGGGACAGTATCGTGGCGGAGCATGG
CGTCGACGATGCAGATCTCTTGGTGGAGACGCTCGGCGGTGGAGGTGGGGGATCCAGGAG
ACGAGTGCGGCGGAAGAAAAGAAAAGGGAGAGAAATGGAGAAATTATGGGGTCGTTAATG
GTGGAGAATCTGTGTAGAAAAAGAGATGATCATAGCGGTGATCAGCGAAGTCTCAAGATC
TTTTACGCAGAGTTGAAACGTAGGTGATGAGGGTATTAGAGTCATTAAATTTTAAGCACA
GTATGTAACCGTGTAAAATGGTAGATCACTAATTAGATGATAATGTGTGTGTATACAATT
GTGTATACAATGCAAATACTCTATTTTGTTTTATGGTTAGTTGGTGTAACTTTTCTATTT
TCTACGTAATGTAAAAAAAAAGAAAACTTAATGACCTGGCGAATGCAATTTGTTTCAAGG
GTTGGTCTGAGCAACCCGAAGTGGCATCCTTCATCGAGTTACAATTTACATATTACAAGA
GATAAATTCAAATCAAATCAAATTTGACTTGTCCTGTAAACCCTCCTTTCGTTTTCTTTT
CTCCGATCTTGTTGAAGACACCTCAAATTCGTATTCTTGGTGAGACGACGATGAGTTCGA
AAAAGGTAGAAGGGTCGTCTTCTCCGGCGACTCGACGACGTGACCCCTACGAGGTTCTCT
CCGTATCAAGAACCGCCACTTATCAAGAAATCAAATCCTCTTACAGAAAACTCGCTCTAA
TGTAACCAAACCTCCTTATCTTCTTTCTTCTCTCTTTTTAAGATTCTCAGTAAAGATCTA
ATCTTTATCATATAGGTATCATCCAGACAGACGCCACACCCTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DA02TF U 1
AF RS1DA02JQ C 221
AF RS1AD33TF U 508
BS 1 621 RS1DA02TF
BS 622 622 RS1AD33TF
BS 623 644 RS1DA02TF
BS 645 1304 RS1AD33TF

RD RS1DA02TF 644 0 0
GGCCAACCGAATCTCTCTCTCATCCCTCCCCTTCTTCTCTTCAGCTTACTTCTCTTCTCA
ACTCTACCTGGATCATAAGCTTGACTGTTTCTATTTCTTCTTCTCTTCTTAAATCCTCCC
CTCTCATCAAAACTAAACTCTAACCTCCCCTATGGATTAATAAACCCATGAACAAAGATT
TAAATTCTATAGATAACACGACGGAGCTGTTGACGGATCTGGTGTGAGCATCATCGGATT
CGTCTGGAGTCAACGAGTTATGGGGGTTTGAGGTTCATTTGTCGAGTCACGGTTCATTAG
ATTTCGGTTCCGGCGTGAGAGACAGTAGAGATTACGTCGTTGATAGGATTATCAGGAATT
GTTCGAATAGTGGAGTAATTGGAAAAGGAGCGGAGAGGGGGGGAGAGACCTCGGTGTGGG
AGAGGGAATATAGCTGGGAGAGGAGATCGGGGCGAGGGACAGTATCGTGGCGGAGCATGG
CGTCGACGATGCAGATCTCTTGGTGGAGACGCTCGGCGGTGGAGGTGGGGGATCCAGGAG
ACGAGTGCGGCGGAAGAAAAGAAAAGGGAGAGAAATGGAGAAATTATGGGGTCGTTAATG
GTGGAGAATCTGTGTAGAAAA*GAGATGATCATAGCGGTGATCA

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1DA02JQ 632 0 0
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GTCGAGTCACGGTTCATTAGATTTCGGTTCCGGCGTGAGAGACAGTAGAGATTACGTCGT
TGATAGGATTATCAGGAATTGTTCGAATAGTGGAGTAATTGGAAAAGGAGCGGAGAGGGG
GGGAGAGACCTCGGTGTGGGAGAGGGAATATAGCTGGGAGAGGAGATCGGGGCGAGGGAC
AGTATCGTGGCGGAGCATGGCGTCGACGATGCAGATCTCTTGGTGGAGACGCTCGGCGGT
GGAGGTGGGGGATCCAGGAGACGAGTGCGGCGGAAGAAAAGAAAAGGGAGAGAAATGGAG
AAATTATGGGGTCGTTAATGGTGGAGAATCTGTGTAGAAAAAGAGATGATCATAGCGGTG
ATCAGCGAAGTCTCAAGATCTTTTACGCAGAGTTGAAACGTAGGTGATGAGGGTATTAGA
GTCATTAAATTTTAAGCACAGTATGTAACCGTGTAAAATGGTAGATCACTAATTAGATGA
TAATGTGTGTGTATACAATTGTGTATACAATGCAAATACTCTATTTTGTTTTATGGTTAG
TTGGTGTAACTTTTCTATTTTCTACGTAATGT

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1AD33TF 797 0 0
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GAGAGAAATGGAGAAATTATGGGGTCGTTAATGGTGGAGAATCTGTGTAGAAGAAGAGAT
GATCATAGCGGTGATCAGCGAAGTCTCAAGATCTTTTACGCAGAGTTGAAACGTAGGTGA
TGAGGGTATTAGAGTCATTAAATTTTAAGCACAGTATGTAACCGTGTAAAATGGTAGATC
ACTAATTAGATGATAATGTGTGTGTATACAATTGTGTATACAATGCAAATACTCTATTTT
GTTTTATGGTTAGTTGGTGTAACTTTTCTATTTTCTACGTAATGTAAAAAAAAAGAAAAC
TTAATGACCTGGCGAATGCAATTTGTTTCAAGGGTTGGTCTGAGCAACCCGAAGTGGCAT
CCTTCATCGAGTTACAATTTACATATTACAAGAGATAAATTCAAATCAAATCAAATTTGA
CTTGTCCTGTAAACCCTCCTTTCGTTTTCTTTTCTCCGATCTTGTTGAAGACACCTCAAA
TTCGTATTCTTGGTGAGACGACGATGAGTTCGAAAAAGGTAGAAGGGTCGTCTTCTCCGG
CGACTCGACGACGTGACCCCTACGAGGTTCTCTCCGTATCAAGAACCGCCACTTATCAAG
AAATCAAATCCTCTTACAGAAAACTCGCTCTAATGTAACCAAACCTCCTTATCTTCTTTC
TTCTCTCTTTTTAAGATTCTCAGTAAAGATCTAATCTTTATCATATAGGTATCATCCAGA
CAGACGCCACACCCTGA

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 3

CO CL3505Contig1 494 3 1 U
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TTCGGAGGTTGGCTCGTAGAGGTGGAGTCAAGCGTATCAGCGGTCTCATCTACGAAGAGA
CACGTGGCGTCCTCAAGATCTTCTTGGAGAACGTCATCCGTGATGCAGTTACCTACACGG
AGCACGCCAGGAGGAAGACTGTGACCGCCATGGACGTCGTCTATGCTCTGAAGAGGCAAG
GGAGGACTCTCTACGGGTTCGGCGGTTAAGGGGCGTTTTAGATTCGCGTTTGCGTTTCTG
TGTTTCTTTTCTGGGAATTTCTAATCGAATTATGTTTTTCATTAGCGTTTGCGTTTTGAA
TTATGTTTGGGTACTGGCGTTTATGTGTTGCGGTAGCGTTTCGTTTTATGTGTAATTAGG
CCTTTGATTAACGATGCAATGTCAATCCATGGTTAAGAAGTTTCTGGAGAAATATGATTA
AATTTTATTTCCAC


BQ
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AF RS1DA33TF U 19
AF RS1FJ40JQ C 1
AF RS1FJ40TF U 1
BS 1 494 RS1FJ40TF

RD RS1DA33TF 451 0 0
G
GGTTCTGAGAGACAACATCCAGGGAATCACCAAGCCGGCGATTCGGAGGTTGGCTCGTAG
AGGTGGAGTCAAGCGTATCAGCGGTCTCATCTACGAAGAGACACGTGGCGTCCTCAAGAT
CTTCTTGGAGAACGTCATCCGTGATGCAGTTACCTACACGGAGCACGCCAGGAGGAAGAC
TGTGACCGCCATGGACGTCGTCTATGCTCTGAAGAGGCAAGGGAGGACTCTCTACGGGTT
CGGCGGTTAAGGGGCGTTTTAGATTCGCGTTTGCGTTTCTGTGTTTCTTTTCTGGGAATT
TCTAATCGAATTATGTTTTTCATTAGCGTTTGCGTTTTGAATTATGTTTGGGTACTGGCG
TTTATGTGTTGCGGTAGCGTTTCGTTCTATGTGTAATTAGGCCTTTGATTAACGATGCAA
TGTCAATCCATGGTTAAGAAGTTTCTGGAG

QA 2 451 2 451
DS 

RD RS1FJ40JQ 494 0 0
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TTCGGAGGTTGGCTCGTAGAGGTGGAGTCAAGCGTATCAGCGGTCTCATCTACGAAGAGA
CACGTGGCGTCCTCAAGATCTTCTTGGAGAACGTCATCCGTGATGCAGTTACCTACACGG
AGCACGCCAGGAGGAAGACTGTGACCGCCATGGACGTCGTTTATGCTCTGAAGAGGCAAG
GGAGGACTCTCTACGGGTTCGGCGGTTAAGGGGCGTTTTAGATTCGCGTTTGCGTTTCTG
TGTTTCTTTTCTGGGAATTTTTAATCGAATTATGTTTTTCATTAGCGTTTGCGTTTTGAA
TTATGTTTGGGTACTGGCGTTTATGTGTTGCGGTAGCGTTTCGTTTTATGTGTAATTAGG
CCTTTGATTAACGATGCAATGTCAATCCATGGTTAAGAAGTTTCTGGAGAAATATGATTA
AATTTTATTTCCAC

QA 1 494 1 494
DS 

RD RS1FJ40TF 494 0 0
GGGCGAAGCGTCACAGGAAGGTTCTGAGAGACAACATCCAGGGAATCACCAAGCCGGCGA
TTCGGAGGTTGGCTCGTAGAGGTGGAGTCAAGCGTATCAGCGGTCTCATCTACGAAGAGA
CACGTGGCGTCCTCAAGATCTTCTTGGAGAACGTCATCCGTGATGCAGTTACCTACACGG
AGCACGCCAGGAGGAAGACTGTGACCGCCATGGACGTCGTCTATGCTCTGAAGAGGCAAG
GGAGGACTCTCTACGGGTTCGGCGGTTAAGGGGCGTTTTAGATTCGCGTTTGCGTTTCTG
TGTTTCTTTTCTGGGAATTTCTAATCGAATTATGTTTTTCATTAGCGTTTGCGTTTTGAA
TTATGTTTGGGTACTGGCGTTTATGTGTTGCGGTAGCGTTTCGTTTTATGTGTAATTAGG
CCTTTGATTAACGATGCAATGTCAATCCATGGTTAAGAAGTTTCTGGAGAAATATGATTA
AATTTTATTTCCAC

QA 1 494 1 494
DS 



AS 1 3

CO CL3506Contig1 846 3 4 U
TTTTTCTTCCTGTCTCTCTCCTCTGTTTGTATCCATGGATAAGATTAATCTTGTGAAGAA
TGGTGTTTTGAGACTGCCACCTGGTTTCAGGTTTCATCCCACTGATGAAGAACCTGTGGT
TCAGTATCTCAAGAGAAAAGTTTTTTCTTCCCCATTACCAGCTTCCATCATTCCTGATGT
CGATGTTTGCAGAGCTGATCCTTGGGACTTACCTGGCAACTTAGAAAAGGAGAGGTACTT
CTTCAGCACAAGGGAAGCCAAGTACCCAAATGGGAACCGGTCCAATAGGGCAACTGAGTC
CGGTTATTGGAAAGCTACTGGTATTGATAAACGGGTTGTGACCTCTAGAGGAAACCAAAT
CGTTGGTTTAAAGAAAACTCTCGTCTTTTACAAAGGCAAACCACCTCATGGCTCAATAAC
CGATTGGATCATGCACGAATATCGGCTCTCTTCCTCTCCTTCGAGTTCTATAGGCCCCAC
TCAGAATTGGGTTCTTTGTCGCATCTTCCTTAAGAAGAGAGCCGGTGCCAAGAACGAAGA
CGAGGGAGATAACCGGAATCTTAGATGTAATAATGACCAACTTGAAATAATTACACCAAA
CCAAACCGAGGATACAACCAAACCAATCTTCTTCGACTTCATGAGAAAAGAAAGGACTAC
GGATTTGAACCTTTTGCCGAGCTCTCCTTCTTCCGGTCACGCTTCAAGTGGAGTCACGAC
GGAGATCTTCTCTTCTGATGAAGAGACCAGTAGTTGCAATAGTTTAAGAAGAAATCCTTA
ATTAAATTTTAATGTTGACTGTCTTATATAGTAATTTTATATTAATACGACTCTCCTTCC
TTTCTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 

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TACTTTATTTTACTCTCTGTTTTCATGTGTTCTCTGTTTCTCTGAAAAGTATTGTCAGAT
TACATCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FN88TF U 1
AF RS1FM83TF U 60
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CGTTCCCAATCACCCTCCGGTCAATTCTGCGGCGCTTACTCCAGAACCGTCCCGTCGTCG
TCTTCCTCCTCCGCAGCCTTCGCTTCCTCCACGAGCTCTACCTTCTCCTCCCCGTCCTCA
TCCTTCTTCAGCAACCACCACCGATCCTCCTCTCCCCCTCGCGTCAATCTCTACACTCCT
CCCCACCACCCTATGTTTCGCTATTCTCTCGACAGAAGATCCAACTCTCCTCCCAACCGA
TCCATCTCCGTCTCCAAGAAACCTCAGCCTAAGGTCTCCGA

QA 1 521 1 521
DS 

RD RS1FM83TF 647 0 0
GG
GCAGAACCAACCTCCCTCCGGGGCCTCTTATAGAGAGAGAAACAATCAAAAACCTCCTTC
TTCCTTCCTCCCTCCTCCAGAGACTTTGTTGTCTCTCTCTCTTTTGACTCCGAGTCCTCA
TTAGAAAAGCAATGGTGACCACGTCCTCATCTCGTACCAAGTCAAACAACTCTGTCCTTC
GTTCCCAATCACCCTCCGGTCAATTCTGCGGCGCTTACTCCAGAACCGTCCTGTCGTCCT
CTTCCTCCTCCGCAGCGTTCGCTTCCTCCACGAGCTCTACCTTCTCCTCCCCGTCCTCAT
CCTTCTTCAGCAACCACCACCGATCCTCCTCTCCCCCTCGCGTCAATCTCTACACTCCTC
CCCACCACCCTATGTTTCGCTATTCTCTCGACACCAGATCCAACTCTCCTCCCAACCGAT
CCATCTCCGTCTCCAAGAAACCTCAGCCTAAGGTCTCCGAGAAGACGACGGCGACGAGGA
GGAGGTGTATGTGTTCTCCGACGACGCATCCTGGTTCTTTCAGATGTAGTCTCCACAAGA
ACGTTGCGAATCCGCACGGGCAAGGTACGGCGTCGTATACGACGAACAGTTTGAATATGC
GGCGATCGGCGATGACGAACTCGCTTGTGAGAATCGGTGGGGTTG

QA 3 647 3 647
DS 

RD RS1FN88JQ 583 0 0
ACGCATCCCGGATCTTTCCGGTGTAGTCTCCACAAGAACGTTGCGAATCCTCACGGGCAA
GGTACGGCGTCGTATACGACGAACAGTTTGAATATGGGGCGATCGGCGATGACGAACTCG
CTTGTGAGAATCGGTGGGGTTGAAGGAGAGTGGGTGAGAAGATCGTTGACGACTCTGATA
AGGCCTTCGTCTCATCATCTGAAAAGACGAGCTGCGTTTCAGCCACGTCCTAGTAGGCTT
TCGGTTATGTCGAGAGCCGAGTGTGATTGATCTGATCTGATCTGGTTTTAGATTTCAGGT
TTGCTTTTCTCTTTATTAAAAAAAAACACAGAAGGAATCACTAGGGGGACAGATCTGGTC
GGAAAGAAGATGAATTGGCCTGTAATGAGAGATTTACGACGATTGTGGGAGGAGAAATCT
CAACCCTTGAAATCGGAGTTTTGTAAAACGAACACACCATCATATGTTTTTTTTGTTGTT
GGGTGAAGAAAGATGCGGAAGTGCATTGTGTACATATACTTTATTTTACTCTCTGTTTTC
ATGTGTTCTCTGTTTCTCTGAAAAGTATTGTCAGATTACATCC

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 3

CO CL3508Contig1 625 3 4 U
GGATATCAAACAACAAAACATAAGTAGAGACAAATATTCATATTTTATCACAAAAGCAAA
GAAAGAAAAGCAAACACACAAATGGCTTTGGCTCTGAGGTTCTTCACTTGCATTGTTCTG
ACAGTGTGCATTGTTGCGTCAGTAGATGCAGAAATCTCATGTGGCACAGTGGCAAGTAGC
TTGGCTCCATGTGCCAACTATCTATCGAGCGGTGGGGAGGTTCCGCCTCCGTGCTGTGCT
GGAGTCACTAAGTTGAATGGCATGGCTCAAACCACACCAGACCGTCAACAAGCATGCAAA
TGCCTACAGTCCGCTGCAAAGAGCGTTGCTGGTCTTAACCCAAGTCTAGCCGCTGGTCTT
CCTGGAAAGTGCGGTGTTACCATTCCTTATCCCATCTCCATGAGCACTAACTGCGACACC
GTCAAGTGAAGTGGAAGTTTAATTATATCAGCATGTGTATGGAGAGTATGGTTTAGCATA
AATAAAATAAAACACGTCTATGGACGCTGCTATCACACTACGCCTTTGTCCTATGGTTTT
CCTAAGTTGTATCTTAATATGTTTGAGATATGATGATATCATTGTAATCCTATGAATCTA
ATATATATTAGCATAACTTATATCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C701TF U 1
AF RS1GZ64TF U 1
AF RS1GZ64JQ C 96
BS 1 208 RS1C701TF
BS 209 209 RS1GZ64TF
BS 210 619 RS1C701TF
BS 620 625 RS1GZ64JQ

RD RS1C701TF 619 0 0
GGATATCAAACAACAAAACATAAGTAGAGACAAATATTCATATTTTATCACAAAAGCAAA
GAAAGAAAAGCAAACACACAAATGGCTTTGGCTCTGAGGTTCTTCACTTGCATTGTTCTG
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TTGGCTCCATGTGCCAACTATCTATCGAACGGTGGGGAGGTTCCGCCTCCGTGCTGTGCT
GGAGTCACTAAGTTGAATGGCATGGCTCAAACCACACCAGACCGTCAACAAGCATGCAAA
TGCCTACAGTCCGCTGCAAAGAGCGTTGCTGGTCTTAACCCAAGTCTAGCCGCTGGTCTT
CCTGGAAAGTGCGGTGTTACCATTCCTTATCCCATCTCCATGAGCACTAACTGCGACACC
GTCAAGTGAAGTGGAAGTTTAATTATATCAGCATGTGTATGGAGAGTATGGTTTAGCATA
AATAAAATAAAACACGTCTATGGACGCTGCTATCACACTACGCCTTTGTCCTATGGTTTT
CCTAAGTTGTATCTTAATATGTTTGAGATATGATGATATCATTGTAATCCTATGAATCTA
ATATATATTAGCATAACTT

QA 1 619 1 619
DS 

RD RS1GZ64TF 625 0 0
GGATATCAAACAACAAAACATAAGTAGAGACAAATATTCATATTTTATCACAGAAGCAAA
GAAAGAAAAGCAAACACACAAATGGCTTTGGCTCTGAGGTTCTTCACTTGCATTGTTCTG
ACAGTGTGCATTGTTGCGTCAGTAGATGCAGAAATCTCATGTGGCACAGTGGCAAGTAGC
TTGGCTCCATGTGCCAACTATCTATCGAGCGGTGGGGAGGTTCCGCCTCCGTGCTGTGCT
GGAGTCACTAAGTTGAATGGCATGGCTCAAACCACACCAGACCGTCAACAAGCATGCAAA
TGCCTACAGTCCGCTGCAAAGAGCGTTGCTGGTCTTAACCCAAGTCTAGCCGCTGGTCTT
CCTGGAAAGTGCGGTGTTACCATTCCTTATCCCATCTCCATGAGCACTAACTGCGACACC
GTCAAGTGAAGTGGAAGTTTAATTATATCAGCATGTGTATGGAGAGTATGGTTTAGCATA
AATAAAATAAAACACGTCTATGGACGCTGCTATCACACTACGCCTTTGTCCTATGGTTTT
CCTAAGTTGTATCTTAATATGTTTGAGATATGATGATATCATTGTAATCCTATGAATCTA
ATATATATTAGCATAACTT
ATATCC

QA 1 619 1 619
DS 

RD RS1GZ64JQ 530 0 0
GAGGTTCTTCACTTGCATTGTTCTGACAGTGTGCATTGTTGCGTCAGTAGATGCAGAAAT
CTCATGTGGCACAGTGGCAAGTAGCTTGGCTCCATGTGCCAACTATCTATCGAGCGGTGG
GGAGGTTCCGCCTCCGTGCTGTGCTGGAGTCACTAAGTTGAATGGCATGGCTCAAACCAC
ACCAGACCGTCAACAAGCATGCAAATGCCTACAGTCCGCTGCAAAGAGCGTTGCTGGTCT
TAACCCAAGTCTAGCCGCTGGTCTTCCTGGAAAGTGCGGTGTTACCATTCCTTATCCCAT
CTCCATGAGCACTAACTGCGACACCGTCAAGTGAAGTGGAAGTTTAATTATATCAGCATG
TGTATGGAGAGTATGGTTTAGCATAAATAAAATAAAACACGTCTATGGACGCTGCTATCA
CACTACGCCTTTGTCCTATGGTTTTCCTAAGTTGTATCTTAATATGTTTGAGATATGATG
ATATCATTGTAATCCTATGAATCTAATATATATTAGCATAACTTATATCC

QA 1 530 1 530
DS 



AS 1 3

CO CL3509Contig1 1045 3 3 U
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CCAACATAAATTATACAATGCATAGTCTTATGACAAAGTGATTTGAATCTCTAGCTGATG
CAGAGAGTGGATATCTTCACCTTCGGCTCTTGCTCTCGTCCTTCACCCTCTCTCTCTTCT
TATAAAGCTTCTCAAGGACTCGTTTTGCCTCACAGTTGGGGAAGTTGGAAAGATCATAGT
AATGCGGTGCAACATCTACTAACCAGTCACCGCGGATATCTGTAACAGTGCGAATGAAAT
TGCGAGTAGTCAAGACATATTCATTATAAATCACCCACTCTGGTTTGTGATCTAGGCAAT
TGGATGGATGCAAGTGAACCACTTGGTTATCTTTGACGGTCAAGTAATGGCCAGTGCGTT
CTAGGTGAGCCACCTGCATGAAATAACCAGAAAGCATTGCCTTTCTGATATTGACGTAGT
AGCCGCGGCTGTTGAAATCAGTGCTGCACATCTTGAGATTAAACCTCGACATTATTCTCA
CTAGCTGCTGCCTCACATTGTCTGCAGACTTCATTGCTCTATTGTTGACAAAGTTCTCAA
AACACCAGTTTGGGTCCTCATTGTTCTGCTTGTAGGCGTGGTACACGTTTAGCAGCGTCA
GGTGATCTCCATCAATGTGTCCAAACTTAGATTTAGCTTCATCTGCTGCTTTTTGAGCCT
CTCAGGCCGAACAAAGCAATTCGGTACTGATAACATTGCAGAAACTGAGAGAATCTCATT
TGAACAGTTGAATTCAGGGCTGACTATGAGCATCTTTGACATCTGCGGATCCAAGGGAAA
CTCGCTCATTATCTCACCAGTCCTTGTCAAGTTACCTTCATCATCCGATGCTCCAAGATA
ATTCAAAACCTCTAATGCTCTCATCAGTGTCTCAGGAGCAGGAGGGTCCATGAAATCAAA
GTGCACCAAGTCATCTATACCCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DV65JQ U 1
AF RS1GD77JQ U 33
AF RS1DV65TF C 387
BS 1 684 RS1DV65JQ
BS 685 700 RS1GD77JQ
BS 701 1045 RS1DV65TF

RD RS1DV65JQ 684 0 0
CGTTGAATAGTGCCGCTTGATAACAGAGCTTTTGTAATATCAAATTTATAAAGATTTTAA
AACGAAAATTTTGAGTAATGCAAAGATTCGTTCATTGAACAGAAACAAAGGACCAAGTAT
CCAACATAAATTATACAATGCATAGTCTTATGACAAAGTGATTTGAATCTCTAGCTGATG
CAGAGAGTGGATATCTTCACCTTCGGCTCTTGCTCTCGTCCTTCACCCTCTCTCTCTTCT
TATAAAGCTTCTCAAGGACTCGTTTTGCCTCACAGTTGGGGAAGTTGGAAAGATCATAGT
AATGCGGTGCAACATCTACTAACCAGTCACCGCGGATATCTGTAACAGTGCGAATGAAAT
TGCGAGTAGTCAAGACATATTCATTATAAATCACCCACTCTGGTTTGTGATCTAGGCAAT
TGGATGGATGCAAGTGAACCACTTGGTTATCTTTGACGGTCAAGTAATGGCCAGTGCGTT
CTAGGTGAGCCACCTGCATGAAATAACCAGAAAGCATTGCCTTTCTGATATTGACGTAGT
AGCCGCGGCTGTTGAAATCAGTGCTGCACATCTTGAGATTAAACCTCGACATTATTCTCA
CTAGCTGCTGCCTCACATTGTCTGCAGACTTCATTGCTCTATTGTTGACAAAGTTCTCAA
AACACCAGTTTGGGTCCTCATTGT

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1GD77JQ 668 0 0
C
GTAATATCAAATTTATAAAGATTTTAAAACGAAAATTTTGAGTAATGCAAAGATTCGTTC
ATTGAACAGAAACAAAGGACCAAGTATCCAACATAAATTATACAATGCATAGTCTTATGA
CAAAGTGATTTGAATCTCTAGCTGATGCAGAGAGTGGATATCTTCACCTTCGGCTCTTGC
TCTCGTCCTTCACCCTCTCTCTCTTCTTATAAAGCTTCTCAAGGACTCGTTTTGCCTCAC
AGTTGGGGAAGTTGGAAAGATCATAGTAATGCGGTGCAACATCTACTAACCAGTCACCGC
GGATATCTGTAACAGTGCGAATGAAATTGCGAGTAGTCAAGACATATTCATTATAAATCA
CCCACTCTGGTTTGTGATCTAGGCAATTGGATGGATGCAAGTGAACCACTTGGTTATCTT
TGACGGTCAAGTAATGGCCAGTGCGTTCTAGGTGAGCCACCTGCATGAAATAACCAGAAA
GCATTGCCTTTCTGATATTGACGTAGTAGTCGCGGCTGTTGAAATCAGTGCTGCACATCT
TGAGATTAAACCTCGACATTATTCTCACTAGCTGCTGCCTCACATTGCCTGCAGACTTCA
TTGCTCTATTGTTGACAAAGTTCTCAAAACACCAGTTTGGGTCCTCATTGTTCTGCTTGT
AGGCGTG

QA 2 668 2 668
DS 

RD RS1DV65TF 659 0 0
TAAATCACCCACTCTGGTTTGTGATCTAGGCAATTGGATGGATGCAAGTGAACCACTTGG
TTATCTTTGACGGTCAAGTAATGGCCAGTGCGTTCTAGGTGAGCCACCTGCATGAAATAA
CCAGAAAGCATTGCCTTTCTGATATTGACGTAGTAGCCGCGGCTGTTGAAATCAGTGCTG
CACATCTTGAGATTAAACCTCGACATTATTCTCACTAGCTGCTGCCTCACATTGTCTGCA
GACTTCATTGCTCTATTGTTGACAAAGTTCTCAAAACACCAGTTTGGGTCCTCATTGTTC
TGCTTGTAGGCGTGGTACACGTTTAGCAGCGTCAGGTGATCTCCATCAATGTGTCCAAAC
TTAGATTTAGCTTCATCTGCTGCTTTTTGAGCCTCTCAGGCCGAACAAAGCAATTCGGTA
CTGATAACATTGCAGAAACTGAGAGAATCTCATTTGAACAGTTGAATTCAGGGCTGACTA
TGAGCATCTTTGACATCTGCGGATCCAAGGGAAACTCGCTCATTATCTCACCAGTCCTTG
TCAAGTTACCTTCATCATCCGATGCTCCAAGATAATTCAAAACCTCTAATGCTCTCATCA
GTGTCTCAGGAGCAGGAGGGTCCATGAAATCAAAGTGCACCAAGTCATCTATACCCCCT

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 3

CO CL3510Contig1 1296 3 8 U
GGACGTAGCAGAAGAGAAACACAAAGACAAAACAAACCTCAGGCATGTCTAGCCGGAGAG
AAATACGGTGCCGTTGTGGTAGATGGATGTGGGCTCAACCTGGGGTTAGTTCCATCCAAT
GCTCAACCTGCCATTCTGCCACGCAGCTCTCCTCCCTCGTGGACATAGCGCGTGGTGCGA
ACCGCGTGCTTCAAGGGCTTCAACAGCTGCGCAGACAACACAAACAACAGCAACCGCAGC
ATCAGCAACAAATAATGGCTCAACAGCCACCAACACCACCACCGAGGCTGCTCGAGCCTC
TTCCTTCCCCGTTTGGGAAGAAGAGAGCTGTTTTATGCGGTTTGGACTATAAGGGCAAAA
GCTATAGCTTGAAAGGTTGCATCAGTGATGCAAAGTCCATGAGATCTTTCTTGGTTCAGC
AAATGGGTTTCCCTATTGACTCTATTCTCATGCTCACAGAAGATGAAGCCAGTCCGCAGA
GAATACCAACGAAGAAAAACATTAGAAAGGCGATGCGATGGTTAGTTGAAGGAAACAGAG
CAAGGGACTCCCTTGTGTTCCATTACTCTGGTCATGGATCTCAGCAGAAGGACTACGATG
GAGACGAGGTCGATGGTCAAGACGAAGCTTTGTGCCCTTTAGACCATGAGACCGAAGGAA
AAATCATAGATGATGAGATCAACAAGATACTCGTGAGGCCGCTCGTCCATGGAGCTAAGC
TACACGCTGTCATCGACGCATGTAACAGCGGGACTGTCCTTGATTTACCCTCTGTTTGCA
GGATGGAGAGGAATGGTTATTATGAGTGGGAACGTCAAACATCAGGGAGAACTTACAAAG
GAACAAATGGTGGAACAGCTATTTGTTTCAGTGCGTGTGATGATCATGAAGCCAGTGGTT
ACACTCCTGTATTCACGGGAAAGAACGCAGGAGCCATGACTTATAGCTTCATAAAGGCGG
TGAAAACAGCTGGAACAGTACCAACGTACGGTCACCTGCTTAACCACATGTGCTCTGCGA
TACGAGAGGCTCAGTCTCGCCTCGCCAGTGATGGGCACTACACAAACCCTGATGAGACCC
CGGTGCCACTTCCAACATCATCTGAGGTATTCGACATATATGCTACAAAGTTTGTGCTCT
GAAGGCTGTGTCAGTCACCTATTCTGCAAATAAACTACTCTACGCATACACATCTTCTTT
ATCTATATGTATAAATCATGTAATGATATGTCTGCAGCATACTTGCCAAAGCTGTAACAA
GTCTCTCTTCTTTTAAATAATTAAAGCTATGAAACT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BS16TF U 1
AF RS1B007TF U 3
AF RS1BS16JQ C 558
BS 1 138 RS1BS16TF
BS 139 139 RS1B007TF
BS 140 359 RS1BS16TF
BS 360 360 RS1B007TF
BS 361 487 RS1BS16TF
BS 488 488 RS1B007TF
BS 489 652 RS1BS16TF
BS 653 1296 RS1BS16JQ

RD RS1BS16TF 652 0 0
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AAATACGGTGCCGTTGTGGTAGATGGATGTGGGCTCAACCTGGGGTTAGTTCCATCCAAT
GCTCAACCTGCCATTCTGTCACGCAGCTCTCCTCCCTCGTGGACATAGCGCGTGGTGCGA
ACCGCGTGCTTCAAGGGCTTCAACAGCTGCGCAGACAACACAAACAACAGCAACCGCAGC
ATCAGCAACAAATAATGGCTCAACAGCCACCAACACCACCACCGAGGCTGCTCGAGCCTC
TTCCTTCCCCGTTTGGGAAGAAGAGAGCTGTTTTATGCGGTTTGGACTATAAGGGCAAA*
GCTATAGCTTGAAAGGTTGCATCAGTGATGCAAAGTCCATGAGATCTTTCTTGGTTCAGC
AAATGGGTTTCCCTATTGACTCTATTCTCATGCTCACAGAAGATGAAGCCAGTCCGCAGA
GAATACCTACGAAGAAAAACATTAGAAAGGCGATGCGATGGTTAGTTGAAGGAAACAGAG
CAAGGGACTCCCTTGTGTTCCATTACTCTGGTCATGGATCTCAGCAGAAGGACTACGATG
GAGACGAGGTCGATGGTCAAGACGAAGCTTTGTGCCCTTTAGACCATGAGAC

QA 1 652 1 652
DS 

RD RS1B007TF 652 0 0
GG
GTAGCAGAAGAGAAACACAAAGACAAAACAAACCTCAGGCATGTCTAGCCGGAGAGAAAT
ACGGTGCCGTTGTGGTAGATGGATGTGGGCTCAACCTGGGGTTAGTTCCATCCAATGCTC
AACCTGCCATTCTGCCACGCAGCTCTCCTCCCTCGTGGACATAGCGCGTGGTGCGAACCG
CGTGCTTCAAGGGCTT*AACAGCTGCGCAGACAACACAAACAACAGCAACCGCAGCATCA
GCAACAAATAATGGCTCAACAGCCACCAACACCACCACCGAGGCTGCTCGAGCCTCTTCC
TTCCCCGTTTGGGAAGAAGAGAGCTGTTTTATGCGGTTTGGACTATAAGGGCAAAAGCTA
TAGCTTGAAAGGTTGCATCAGTGATGCAAGGTCCATGAGATCTTTCTTGGTTCAGCAAAT
GGGTTTCCCTATTGACTCTATTCTCATGCTCACAGAAGGTGAAGCCAGTCCGCAGAGAAT
ACCAACGAAGAAAAACATTAGAAGGGCGATGCGATGGTTAGTTGAAGGAAACAGAGCAAG
GGACTCCCTTGTGTTCCATTACTCTGGTCATGGATCTCAGCAGAAGGACTACGATGGAGA
CGAGGTCGATGGTCAAGACGAAGCTTTGTGCCCTTTAGACCATGAGAC
CG

QA 3 650 3 650
DS 

RD RS1BS16JQ 739 0 0
TTCCATTACTCTGGTCATGGATCTCAGCAGAAGGACTACGATGGAGACGAGGTCGATGGT
CAAGACGAAGCTTTGTGCCCTTTAGACCATGAGACCGAAGGAAAAATCATAGATGATGAG
ATCAACAAGATACTCGTGAGGCCGCTCGTCCATGGAGCTAAGCTACACGCTGTCATCGAC
GCATGTAACAGCGGGACTGTCCTTGATTTACCCTCTGTTTGCAGGATGGAGAGGAATGGT
TATTATGAGTGGGAACGTCAAACATCAGGGAGAACTTACAAAGGAACAAATGGTGGAACA
GCTATTTGTTTCAGTGCGTGTGATGATCATGAAGCCAGTGGTTACACTCCTGTATTCACG
GGAAAGAACGCAGGAGCCATGACTTATAGCTTCATAAAGGCGGTGAAAACAGCTGGAACA
GTACCAACGTACGGTCACCTGCTTAACCACATGTGCTCTGCGATACGAGAGGCTCAGTCT
CGCCTCGCCAGTGATGGGCACTACACAAACCCTGATGAGACCCCGGTGCCACTTCCAACA
TCATCTGAGGTATTCGACATATATGCTACAAAGTTTGTGCTCTGAAGGCTGTGTCAGTCA
CCTATTCTGCAAATAAACTACTCTACGCATACACATCTTCTTTATCTATATGTATAAATC
ATGTAATGATATGTCTGCAGCATACTTGCCAAAGCTGTAACAAGTCTCTCTTCTTTTAAA
TAATTAAAGCTATGAAACT

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 3

CO CL3511Contig1 664 3 7 U
GTAAAAACAAAATTATATTGTAGGCAGGCTGAAACTGCAAAATATCTAACAGAAAATCAA
GAGAGGAAGTAACAATTTTGATAATCTCATAAAAAAAAGGAAGGCCTTTTCCTATTATCT
GAATCAAACGCAGAATATGATGTTGAAAGGCTAGAGGTTGTATAACAAGAAACATCATGC
TGAAAAAGACAACAAGTCATCGCCCATCACTTATTACATCCTGGGATTATATATCTTCAA
GACTCCAAACGAACATGAGTACTCAGAGTAGGGCTCATCGAACACATCATCGCCCGGAAG
GCGGAATACGCCAAGACATCCAGGAAAAACCACAATTTCACATCCATCTGGAGCAGGCAT
AGGAGGACAGCCTTCAGTAAACACAAGACCACCACACGACACCATCACTCGTCCACCTAA
AGGGAACGAGACAAGCTCGGGCGCTTGAATGTATATAAAATCATCAAATTCAGGTTGAGG
ATCCATAAAATTAAACCTTGCAAAGCCACCCGTGACATAAAACTTCATCCCCCACTCTCC
GTTATAAAGTTCCACAGATGTTAAAGGAAATTTAAAAATGACACCTGTACGAAAAAGTTT
TGGTTGCGCTTGAGGAGGTGGCAAGAGTTCTCCCGGAGGAGGAGGAGGAGGCAAGAGTTC
TCCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1AL59JQ U 2
AF RS1AL59TF C 1
AF RS1FU29JQ U 88
BS 1 1 RS1AL59TF
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GAAAAAGACAACAAGTCATCGCCCATCACTTATTACATCCTGGGATTATATATCTTCAAG
ACTCCAAACGAACATGAGTACTCAGAGTAGGGCTCATCGAACACATCATCGCCCGGAAGG
CGGAATACGCCAAGACATCCAGGAAAAACCACAATTTCACATCCATCTGGAGCAGGCATA
G

QA 1 361 1 361
DS 

RD RS1AL59TF 559 0 0
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GAGAGGAAGTAACAATTTTGATAATCTCATAAAAAAAAGGAAGGCCTTTTCCTATTATCT
GAATCAAACGCAGAATATGATGTTGAAAGGCTAGAGGTTGTATAACAAGAAACATCATGC
TGAAAAAGACAACAAGTCATCGCCCATCACTTATTACATCCTGGGATTATATATCTTCAA
GACTCCAAACGAACATGAGTACTCAGAGTAGGGCTCATCGAACACATCATCGCCCGGAAG
GCGGAATACGCCAAGACATCCAGGAAAAACCACAATTTCACATCCATCTGGAGCAGGCAT
AGGAGGACGGCCTTCAGTAAACACAAGACCACCACACGACACCATCACTCGTCCACCTAA
AGGGAACGAGACAAGCTCGGGCGCTTGAATGTATATAAGATCATCAAGTTCAGGTTGAGG
ATCCATAGAATTAGACCTTGCAAAGCCACCCGTGACATAAAACTTCATCCCCCACTCTCC
GTTATAAAGTTCCACAGA
C

QA 1 558 1 558
DS 

RD RS1FU29JQ 577 0 0
AAA
AAAAAAAAGGAAGGCCTTTTCCTATTATCTGAATCAAACGCAAAATATAATGTTGAAAGG
CTAGAGGTTGTATAACAAGAAACATCATGCTGAAAAAGACAACAAGTCATCGCCCATCAC
TTATTACATCCTGGGATTATATATCTTCAAGACTCCAAACGAACATGAGTACTCAGAGTA
GGGCTCATCGAACACATCATCGCCCGGAAGGCGGAATACGCCAAGACATCCAGGAAAAAC
CACAATTTCACATCCATCTGGAGCAGGCATAGGAGGACAGCCTTCAGTAAACACAAGACC
ACCACACGACACCATCACTCGTCCACCTAAAGGGAACGAGACAAGCTCGGGCGCTTGAAT
GTATATAAAATCATCAAATTCAGGTTGAGGATCCATAAAATTAAACCTTGCAAAGCCACC
CGTGACATAAAACTTCATCCCCCACTCTCCGTTATAAAGTTCTACAGATGTTAAAGGAAA
TTTAAAAATGACACCTGTACGAAAAAGTTTTGGTTGCGCTTGAGGAGGTGGCAAGAGTTC
TCCCGGAGGAGGAGGAGGAGGCAAGAGTTCTCCC

QA 4 577 4 577
DS 



AS 1 2

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AAAAAATAAAAAAAATTGAAAAACACAAAAAGAATCATTTAGTTGCATCATTTGCATTTT
TAGGATTGAGTCTAGAAACATATAGGTTGCATTCATGCATTAGGGGGATTTCAACCTTGT
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CACCCTTTAGAAAGCTTGTAAACTTCGCGCCTTGAATGCTCCTCTTGAAACTCATTTGAC
TGTTGATACTCTCTCTTCGAAGCAAGCTCCTGTTTTAATGTCTCTTGCATATGGTCCCTT
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TGTTGAGTGAGGACTCTTTGGAAAGCTTTACATGTGCATAATGTTGAGAGTATTGGAAAC
GACAATGCTTAGTATCCATTCTTGCTAGATTAGTCACTCTATTGTCTAGCTATAGGAAGG
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ATTAGTCTTTATGGGAAAAGTGGAGAAGTATCTAGCTTTTATTGTGAAAAGTCTTGGCCC
C


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
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10 

AF RS1EY48TF U 1
AF RS1BC32JQ C 3
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RD RS1EY48TF 634 0 0
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AAAAAT**AAAAATTTTGAAAAACACAAAAAGAATCATTTAGTTGCATCATTTGCATTTT
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TGTTGATACTCTCTCTTTGAAGCAAGCTCCTGTTTTAATGTCTCTTGCATATGGTCCCTT
GTGTACTAAGTCATGGATATACACACTTGAGTTGTCCCATCTGTTTTACCAATCTT*TTG
ACAAACTCAAGTGGTACTCCACTCCCAAAACCCATACCTCCTTTTTAAACCATCATTATT
TGTTGAGTGAGGCCTCTTTGGAAAGCTTTACATGTGCATAATGTTGAGAGTATTGGGAAC
GACAATGCTTAGTCTCCATTCTTGCTAGATTAGTCACTCTATTGTCTAGCTATAGGAAGG
GGGTGAGTGTTGTGATTGTGATTTGGGAATATGA

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1BC32JQ 719 0 0
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AAAATAAAAAAAATTGAAAAACACAAAAAGAATCATTTAGTTGCATCATTTGCATTTTTA
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GTACTAAGTCATGGATATACACACTTGAGTTGTCCCATCCTTTTTACCAATCTTCTTGAC
AAACTCAAGTGGTACTCCACTCCCAAAACCCATACCTCCTTTTTAAACCATCATTATTTG
TTGAGTGAGGACTCTTTGGAAAGCTTTACATGTGCATAATGTTGAGAGTATTGGAAACGA
CAATGCTTAGTATCCATTCTTGCTAGATTGGTCACTCTATTGTCTAGCTATAGGAAGGGG
GTGAGTGTTGTGATTGTGATTTGGGAATATGAAAGGTTTGACTCTTTGTGCTTAAATGAT
TAGTCTTTATGGGAAAAGTGGAGAAGTATCTAGCTTTTATTGTGAAAAGTCTTGGCCCC

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 3

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ACCTTCCTCACCACACAACGCAAGAGGAGTGGGTGGCTCATTACGGAGACAAATGGGATC
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TCTTTCAAAACCCATCTCTGTCTTTGTTTCCTCCACCGTCGTCTTCGTCGTCAGCTTCAT
GGTGACAGGACAAAATCAGAGGGGGAAAGTAGTAGTTGAGATTATATTCTTCCTGATGTA
TATATATGACCTAATAGAGAAGCATCAGCGAGATTAGGTTGGGTTATTTTGTTAGTAACG
TTTAAAAATTAGAGTTAGGAAGATTCAAGTTAGTAATATGTTACTGTTTAATTTTTCTAC
ATCATCACGGATTTTGATATGGGTTTAGAGAATCTTTAAATCCGATTATTATTAAATTAA
AATTAGACAACAAACAAACCTCATGACTGTTTTGGATTATTATACATTTATGGTTTTGAT
GGATGGATCGTTTATACTTTATCATCGTGGAACCACCATCGAGTCTCCTTTGGGGATCTT
CCGTTCTTACAATTCTTCACATATCGGTCATTATCGGTCGGTCGTTGCTTTTCAGTGGAG
CTAGAGAGCATGGAGAGAATGCTGATGCAGATAGAACTCACAGTCATCGCTGGAGACCAC
GAATCATACAGTATATCTAAGCAAATATGCCCATTGCTGTAAATGTGAGGATGCAAGGGA
GCCGGAGGAAGAAAAATCACTTGCGACGACTCCATAGGATAGTGCTCGGGAAAATCAACT
TGAAGCTGAAAGGTCTCGTTCGCGTACAGAGTTCCTGGAGCTCCAATAGCTTCGATTATC
CATCTTTGGAGATTGTCAGTGACCTTGTGTTTGAACCCCGTAGGTGGATTCATCTGCCAC
TCCACAAGCTCTTTCTGAAGCCTTTTACACGCGATCTTGCTCAGAGCCTTGTGAGAAGGA
GCACCAGAACTTGACATGGCTTTGTAGAGATGGAGTGAGAAAGAGATGATCTCCTCTTCG
TAGAAGAAGAAGAAGAAAGGAAGGCTCGAGGAAAAA


BQ
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TATATATGACCTAATAGAGAAGCATCAGCGAGATTAGGTTGGGTTATTTTGTTAGTAACG
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ATCATCACGGATTTTGATATGGGTTTAGAGAATCTTTAAATCCGATTATTATTAAATTAA
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AGGAAGGC

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AGAACTTGACATGGCTTTGTAGAGATGGAGTGAGAAAGAGATGATCTCCTCTTCGTAGAA
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QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 3

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TCCTCCCACTGCTGATGATTTCACCGAAATAGTATCGAAAATTGCGGGTTTGGATCATGA
GAACGTGACGAAGCTTGATGGTTACTGTTGTGAGCATGGACAACGCTTGGTGGTCTACGA
GTTCTGTAGAAACGGCTCGTTGCACGAGTTCTTGCATCTTTCGGAAGAGGAAGAAAGCAA
GCCGTTGATATGGAATCCTCGTGTCAAGATCGCTCTTGGCACTGCACGCGCATTGGAGTA
CTTGCATGAAGTTTGCTCACCGTCTATAGTGCACAAGAACATCAAATCAGCTAATATTTT
ACTTGACGCAGAGCTGAACCCTCACCTCTCAGACGCTGGTCTCGCTAGCTTCCTCCCTAC
TGCTAATGAGCTACTGAACCAAAACGATGAAGGATACAGCGCACCGGAAGTATCAATGTC
AGGTCAATACTCACTGAAGAGCGATGTGTACAGTTTTGGAGTAGTGATGCTTGAGCTTTT
AACCGGAAGAAAACCATTTGACAGCACAAGGTCAAGATCTGAGCAGTCATTGGTGAGATG
GGCAACACCTCAGCTACACGACATTGATGCATTGGGGAAAATGGTTGATCCAGCTCTCAA
AGGGCTTTACCCTGTCAAATCTCTATCCCGGTTTGCAGATGTTATCGCTCTCTGCGTTCA
GCCGGAGCCAGAGTTTAGACCGCCGATGTCTGAAGTGGTGCAAGCGTTGGTTGTGCTTGT
GCAGAGAGCTAACATGAGCAAGAGAACTGTCGGAGTCGGGTCTGGTGGTAGCTCTGGAGC
TAATGATTACATGTAAATTCTTTACCTGAGAAACCAAAAAAAACAAACAAAGTCTTTGCT
CTGATTCTGAGAGGGAGAAGAACAAAGTGACAGAGGCAGAGAAAATCAACAAAACAGAAG
TTTTTATTTATTTTGTGTTCATAAAACTGAGAGAATAACAACAACGACAACAACAACCTT
TACGCATTGTACAATCCCATGTTTCCTTGTAATATGTTCCCAAGTTTGTAGCTTTTCAGA
TTCCGACACAACGAACAAAACCATGTCCTTTTGTGAGTTTTTCGGGCCAAGACTGTCTTT
ATCTATATTTTGTAGG


BQ
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AF RS1BB02TF U 1
AF RS1BB02JQ C 390
AF RS1BO56TF U 545
BS 1 678 RS1BB02TF
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AGGGCTTTACCCTGTCAA
TCTCTAT

QA 1 678 1 678
DS 

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TTTGTGAGTTTTTCGGGCCAAGACTGTCTTTATCTATATTTTGTAGG

QA 1 767 1 767
DS 

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TTTTTTGATTACTACA
ACAGCACAAGGTCAAGATCTGAGCAGTCATTGGTGAGATGGGCAACACCTCAGCTACACG
ACATTGATGCATTGGGGAAAATGGTTGATCCAGCTCTCAAAGGGCTTTACCCTGTCAAAT
CTCTATCCCGGTTTGCAGATGTTATCGCTCTCTGCGTTCAGCCGGAGCCAGAGTTTAGAC
CGCCGATGTCTGAAGTGGTGCAAGCGTTGGTTGTGCTTGTGCAGAGAGCTAACATGAGCA
AGAGAACTGTCGGAGTCGGGTCTGGTGGTAGCTCTGGAGCTAATGATTACATGTAAATTC
TTTACCTGAGAAACCAAAAAAA*CAAACAAAGTCTTTGCTCTGATTCTGAGAGGGAGAAG
AACAAAGTGACAGAGGCAGAGAAAATCAACAAAACAGAAGTTTTTATTTATTTTGTGTTC
ATAAAACTGAGAGAATAACAACAACGACAACAACAACCTTTACGCATTGTACAATCCCAT
GTTTCCTTGTAATATGTTCCCAAGTTTGTAGCTTTTCAGATTCCGACACAACGAACAAA*
CCATGTCCTTTTGTGAGTTTTTCGGGCCAAGACTGTCTTTATCTATA

QA 17 603 17 603
DS 



AS 1 2

CO CL3515Contig1 807 2 4 U
GAAACTATAATCATATAATTCTTCACCTTTTCGAATCATGATGAATTCAAGAATTTTCAT
TGCCATCTTATTATCCTGCATTATCGCTTCGATTCATGCATATGATCCCGATGCCCTTCA
AGATCTCTGCGTTGCTGATAAATCTCATGGAACCAAGTTGAACGGGTTCCCATGCAAAGA
AATGTCAAACATCACATCGTCCGACTTCTTCTTCGCCGGAATATCAAGCCCCGCCGTCAT
AAACTCCACGATGGGCTCTGCCGTGACGGGAGCCAACGTGGAAAAGATCCCAGGACTCAA
TACTCTCTCAGTTTCCTTAGCACGTATAGACTACTCGCCGGGTGGCTTAAACCCACCTCA
CACTCACCCACGTGCCACTGAAGTCGTTTTTGTCCTCGAAGGAGAGCTCGAAGTTGGGTT
TATCACGACGGCAAACAAGCTTTTCTCTAAAACCATTAAACTTGGTGAAGTTTTTGTATT
CCCAAGAGGGCTTGTGCATTTTCAAAAGAACAATGGGAAATCTCCAGCATCTGTTTTGTG
TGCGTTTAATAGTCAGTTACCGGGAACGGTGTCTGTTGCGGCGACGCTTTTTGCGACGGA
GCCTGCTTTGCCGGAAGATGTGTTGACAAAGACTTTTCAGGTGAGATCTAAGATGGTTGA
CAAGATTAAAGAAAGGCTTTCTACCAAAAAATAATTCAATTATATGTAATTGGTTCATGA
TGAAAACCTTTGAAATTTTTTTCTTATAAATGTTGTGGTAACTAAAAATAAATTATTACT
GTAATTGACTGGTTTATGTTGGTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FR94TF U 1
AF RS1FR94JQ C 121
BS 1 640 RS1FR94TF
BS 641 641 RS1FR94JQ
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BS 672 807 RS1FR94JQ

RD RS1FR94TF 671 0 0
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AAACTCCACGATGGGCTCTGCCGTGACGGGAGCCAACGTGGAAAAGATCCCAGGACTCAA
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CACTCACCCACGTGCCACTGAAGTCGTTTTTGTCCTCGAAGGAGAGCTCGAAGTTGGGTT
TATCACGACGGCAAACAAGCTTTTCTCTAAAACCATTAAACTTGGTGAAGTTTTTGTATT
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TGCGTTTAATAGTCAGTTACCGGGAACGGTGTCTGTTGCGGCGACGCTTTTTGCGACGGA
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CAAGATTAAAG

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1FR94JQ 687 0 0
AGATCTCTGCGTTGCTGATAAATCTCATGGAACCAAGTTGAACGGGTTCCCATGCAAAGA
AATGTCAAACATCACATCGTCCGACTTCTTCTTCGCCGGAATATCAAGCCCCGCCGTCAT
AAACTCCACGATGGGTTCTGCCGTGACGGGAGCCAACGTGGAAAAGATCCCAGGACTCAA
TACTCTCTCAGTTTCCTTAGCACGTATAGACTACTCGCCGGGTGGCTTAAACCCACCTCA
CACTCACCCACGTGCCACTGAAGTCGTTTTTGTCCTCGAAGGAGAGCTCGAAGTTGGGTT
TATCACGACGGCAAACAAGCTTTTCTCTAAAACCATTAAACTTGGTGAAGTTTTTGTATT
CCCAAGAGGGCTTGTGCATTTTCAAAAGAACAATGGGAAATCTCCAGCATCTGTTTTGTG
TGCGTTTAATAGTCAGTTACCGGGAACGGTGTCTGTTGCGGCGACGCTTTTTGCGACGGA
GCCTGCTTTGCCGGAAGATGTGTTGACAAAGACTTTTCAGGTGAGATTTAAGATGGTTGA
CAAGATTAAAGAAAGGCTTTCTACCAAAAAATAATTCAATTATATGTAATTGGTTCATGA
TGAAAACCTTTGAAATTTTTTTCTTATAAATGTTGTGGTAACTAAAAATAAATTATTACT
GTAATTGACTGGTTTATGTTGGTTTAC

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

CO CL3516Contig1 408 2 1 U
GTAAATTCTCTGGGATTAAATCTTCCTCCTTTCTGCAGACCCTTATGTCGGACAAAGGTC
GTCCCTTGCCCAAGTTTGGTGAATGGGATGTGAACGATCCAGCATCAGCTGAAGGTTTCA
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AAAGATGGATTTTGCTTGCCTCCCCTCCCCTAAAGAAAAGTCACATTGCTTAGAGATCTA
AAGCAATGATATTTTATGTTTTTTATTGTCTTCCTTGAAAGTACCCAC


BQ
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AF RS1DO38JQ C 1
AF RS1DO38TF U 1
BS 1 408 RS1DO38TF

RD RS1DO38JQ 408 0 0
GTAAATTCTCTGGGATTAAATCTTCCTCCTTTCTGCAGACCCTTATGTCGGACAAAGGTC
GTCCCTTGCCCAAGTTTGGTGAATGGGATGTGAACGATCCAGCATCAGCTGAAGGTTTCA
CAGTCATATTCGACAAAGCTAGGGATGAGAAGAAGACCGGTGGCAAACCCGGATCACCTG
GTAAATCCACTGATGGTCATGCTAAGTCCGGAGGAGGAGGAGGAGGTGATCCTAGTAAAC
CCCAGCCCAAAAAATGGCTCTGCTGCATGCAATCTCCAGCTGTGGACTCCTGAATGACAC
AAAGATGGATTTTGCTTGCCTCCCCTCCCCTAAAGAAAAGTCACATTGCTTAGAGATCTA
AAGCAATGATATTTTATGTTTTTTATTGTCTTCCTTGAAAGTACCCAC

QA 1 408 1 408
DS 

RD RS1DO38TF 408 0 0
GTAAATTCTCTGGGATTAAATCTTCCTCCTTTCTGCAGACCCTTATGTCGGACAAAGGTC
GTCCCTTGCCCAAGTTTGGTGAATGGGATGTGAACGATCCAGCATCAGCTGAAGGTTTCA
CAGTCATATTCGACAAAGCTAGGGATGAGAAGAAGACCGGTGGCAAACCCGGATCACCTG
GTAAATCCACTGATGGTCATGCTAAGTCCGGAGGAGGAGGAGGAGGTGATCCTAGTAAAC
CCCAGCCCAAAAAATGGCTCTGCTGCATGCAATCTCCAGCTGTGGACTCCTGAATGACAC
AAAGATGGATTTTGCTTGCCTCCCCTCCCCTAAAGAAAAGTCACATTGCTTAGAGATCTA
AAGCAATGATATTTTATGTTTTTTATTGTCTTCCTTGAAAGTACCCAC

QA 1 408 1 408
DS 



AS 1 3

CO CL3517Contig1 748 3 4 U
GGACCGTGAATCTCTCTGGAAAAAACGCAGTTTCTTTCCTACTACGATGCTGGGTGGTTT
ACGCAGATCCGCGGCGACCTTATTCGATCACAGTCAGTCTCTGCTTCGTAATCTATCCTT
TCATGGAGTGCGTGTGCAAGGAATCCGTGTGGGAAACGCAGAGGTTCCAAACCACAAGCC
CCTCAAGACCGGTCTTCAAGAAGTTTACGGAATAGGACGCCGTAAGTCTCACCAGGTTCT
CTGTGGCCTCGGCATCACCAACAAGCTCGCCAGAGACTTAACTGGCAAAGAACTCATTGA
CCTCCGTGAAGAAGTTGGCATGCACCAACATGGTGATGAGCTGAGGAGGCGTGTTGGATC
GGAGATACAGAGACTGGTGGAAGTAGACTGTTACAGAGGAAGTAGGCATAGACATGGGAT
GCCTTGCAGAGGTCAAAGAACCAAAACTAATGCTCGCACCAAAAAGGGAAAGAGAGTTGC
TATCGCTGGAAAGAAGAAAGCTCCTCGCAAGTAGAACCCTTAAAACCTCTCTGTAGTAGC
ACCAGTCTACGACTCTGTTTGGATGAAATTTGATCAAATAAGCAGACATGATTTGCTGAG
GAAGTAGAGAACTTCCAAGTAAGCATGATCTTGATTCTTGAACTAGTTCTGTAATACTCT
CTAGCTTCTCTGGTCTCTTGGTTTTGTTTGTTATCCTTTAGAACATGGATCAAAAAGTTA
GCCCATTAACAACTTTTTCTTTGTCCCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GJ86TF U 1
AF RS1CJ50TF U 1
AF RS1CJ50JQ C 71
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BS 703 703 RS1CJ50JQ
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DS 

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ACGCAGATCCGCGGCGACCTTATTCGATCACAGTCAGTCTCTGCTTCGTAATCTATCCTT
TCATGGAGTGCGTGTGCAAGGAATCCGTGTGGGAAACGCAGAGGTTCCAAACCACAAGCC
CCTCAAGACCGGTCTTCAAGAAGTTTACGGAATAGGACGCCGTAAGTCTCACCAGGTTCT
CTGTGGCCTCGGCATCACCAACAAGCTCGCCAGAGACTTAACTGGCAAAGAACTCATTGA
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GGAGATACAGAGACTGGTGGAAGTAGACTGTTACAGAGGAAGTAGGCATAGACATGGGAT
GCCTTGCAGAGGTCAAAGAACCAAAACTAATGCTCGCACCAAAAAGGGAAAGAGAGTTGC
TATCGCTGGAAAGAAGAAAGCTCCTCGCAAGTAGAACCCTTAAAACCTCTCTGTAGTAGC
ACCAGTCTACGACTCTGTTTGGATGAAATTTGATCAAATAAGCAGACATGATTTGCTGAG
GAAGTAGAGAACTTCCAAGTAAGCATGATCTTGATTCTTGAACTAGTTCTGTAATACTCT
CTAGCTTCTCTGGTCTCTTGGTTTTGTTTGTTATCCTTTAGA*CATGGATCAAAA
GTAGCCCATTACAAC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1CJ50JQ 678 0 0
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CGTGTGCAAGGAATCCGTGTGGGAAACGCAGAGGTTCCAAACCACAAGCCCCTCAAGACC
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GGCATCACCAACAAGCTCGCCAGAGACTTAACTGGCAAAGAACTCATTGACCTCCGTGAA
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GACTCTGTTTGGATGAAATTTGATCAAATAAGCAGACATGATTTGCTGAGGAAGTAGAGA
ACTTCCAAGTAAGCATGATCTTGATTCTTGAACTAGTTCTGTAATACTCTCTAGCTTCTC
TGGTCTCTTGGTTTTGTTTGTTATCCTTTAGAACATGGATCAAAAAGTTAGCCCATTAAC
AACTTTTTCTTTGTCCCC

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 3

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AGGTAGAAATATGACGTCATGTTTGAGGACGCCTCTGGATGTAAGCAGTGATGGGGTTTC
TGATGTCACAAAGGAGTCTCAGAGCTCGACCGAAGTTGTCATATTTGGTACAGGTCTTCA
GAATGAAATTGGGGAATACAATTGCTTTTTGAATGTTATCATACAGTCTCTATGGAATCT
GAGGATGTTTCGGGATGAATTCTTACGGAGCTCAACGCTAGAGCACCATCACGTGGGAGA
TCCTTGTGTTGTCTGCTCATTGTATGAAGTTTTTACTGCTTTAAGCGCTGCATCGAAGGA
AATGCAAAAAGAACCAGAACCTGTAGCTCCTTCATCTCTCAGGATTGCGTTGAGTAACTT
GTATCCAGATAGCAGTTCCTTCCAGGAGGCTCAGATGAACGATGCTTCAGAAGTAATGGC
TGTGATTTTCGACTGTCTTCATCGTGCATTTTCTCAAAGCTCAAGTGTGTCTGACACAGA
ATCGTCTGAGAGCAACTGTACAGGTTCATGGGACTGTGGCAACCGCACATGTATTGCCCA
TTCGCTGTTTGGAATGAATATTTTTGAGCAACTGAACTGCTACAGCTGTGGGCTGGAGTC
CAGGCATATGAAGTACACTTCCTTTTTCCATAATATCAACGCTAGTGCCCTACGGACCAT
GAAGGTTGCCTGCGCTGAGAATTCATTTGACGATCTTTTAAACCTTGTCGAGATGAACCA
CCAACTACCCTGTGATCCTGATGCTGGTGGGTGTGGGAAACCCAACCATATCCGCCACAT
TCTCACAACTCCACCACATGTTTTCACTACAGTTTTAGGGTGGCAAAACTCATGTGAGAG
TGTAGAAGACATAGCAGCTACGCTCGCAGCCCTAAATACCGAGATAGACATCAGTATCAT
GTACCGTGGTCTGGACCCAAAGAGTACCTATAGCTTAGCTTCTGTGGTATGCTATTATGG
ACAGCATTATCATTGCTTTGCATATAGTCATGAACACGTTCGGTGGATCATGTTCGATGA
CAAAACCGTGAAAGTGATTGGTAGTTGGAGTGATGTGCTTTCTATGTGTAAGAAAGGACA
CTTGCAGCCACAGTTCTTCTCTATGAGAGAACACGTTAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E979TF U 1
AF RS1B048TF U 482
AF RS1CZ34TF U 482
BS 1 686 RS1E979TF
BS 687 687 RS1B048TF
BS 688 692 RS1E979TF
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BS 694 698 RS1E979TF
BS 699 699 RS1B048TF
BS 700 723 RS1E979TF
BS 724 1126 RS1B048TF
BS 1127 1181 RS1CZ34TF

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AGGTAGAAATATGACGTCATGTTTGAGGACGCCTCTGGATGTAAGCAGTGATGGGGTTTC
TGATGTCACAAAGGAGTCTCAGAGCTCGACCGAAGTTGTCATATTTGGTACAGGTCTTCA
GAATGAAATTGGGGAATACAATTGCTTTTTGAATGTTATCATACAGTCTCTATGGAATCT
GAGGATGTTTCGGGATGAATTCTTACGGAGCTCAACGCTAGAGCACCATCACGTGGGAGA
TCCTTGTGTTGTCTGCTCATTGTATGAAGTTTTTACTGCTTTAAGCGCTGCATCGAAGGA
AATGCAAAAAGAACCAGAACCTGTAGCTCCTTCATCTCTCAGGATTGCGTTGAGTAACTT
GTATCCAGATAGCAGTTCCTTCCAGGAGGCTCAGATGAACGATGCTTCAGAAGTAATGGC
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ATCGTCTGAGAGCAACTGTACAGGTTCATGGGACTGTGGCAACCGCACATGTATTGCCCA
TTCGCTGTTTGGAATGAATATTTTTGAGCAACTGAACTGCTACAGCTGTGGGCTGGAGTC
CAGGCATATGAAGTACACTTCCTTTT*CCATA*TATCA*CGCTAGTGCCCTACGGACCAT
GAA

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1B048TF 645 0 0
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TCGCTGTTTGGAATGAATATTTTTGAGCAACTGAACTGCTACAGCTGTGGGCTGGAGTCC
AGGCATATGAAGTACACTTCCTTTTTCCATAATATCAACGCTAGTGCCCTACGGACCATG
AAGGTTGCCTGCGCTGAGAATTCATTTGACGATCTTTTAAACCTTGTCGAGATGAACCAC
CAACTACCCTGTGATCCTGATGCTGGTGGGTGTGGGAAACCCAACCATATCCGCCACATT
CTCACAACTCCACCACATGTTTTCACTACAGTTTTAGGGTGGCAAAACTCATGTGAGAGT
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TACCGTGGTCTGGACCCAAAGAGTACCTATAGCTTAGCTTCTGTGGTATGCTATTATGGA
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AAAACCGTGAAAGTGATTGGTAGTTGGAGTGATGTGCTTTCTATG

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1CZ34TF 700 0 0
GTGATTTTCGACTGTCTTCATCGTGCATTTTCTCAAAGCTCAAGTGTGTCTGACACAGAA
TCGTCTGAGAGCAACTGTACAGGTTCATGGGACTGTGGCAACCGCACATGTATTGCCCAT
TCGCTGTTTGGAATGAATATTTTTGAGCAACTGAACTGCTACAGCTGTGGGCTGGAGTCC
AGGCATATGAAGTACACTTCCTTTTTCCATAATATCAACGCTAGTGCCCTACGGACCATG
AAGGTTGCCTGCGCTGAGAATTCATTTGACGATCTTTTAAACCTTGTCGAGATGAACCAC
CAACTACCCTGTGATCCTGATGCTGGTGGGTGTGGGAAACCCAACCATATCCGCCACATT
CTCACAACTCCACCACATGTTTTCACTACAGTTTTAGGGTGGCAAAACTCATGTGAGAGT
GTAGAAGACATAGCAGCTACGCTCGCAGCCCTAAATACCGAGATAGACATCAGTATCATG
TACCGTGGTCTGGACCCAAAGAGTACCTATAGCTTAGCTTCTGTGGTATGCTATTATGGA
CAGCATTATCATTGCTTTGCATATAGTCATGAACACGTTCGGTGGATCATGTTCGATGAC
AAAACCGTGAATGTGATTGGTAGTTGGAGTGATGTGCTTTCTATGTGTAAGAAAGGACAC
TTGCAGCCACAGTTCTTCTCTATGAGAGAACACGTTAGAT

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 3

CO CL3519Contig1 592 3 10 U
AATTGTAAATTTAGCTTAACAGAAAAAAAAAAGTCACACTCATGTTTAACATAATACTCT
TTCTAGCTTTTAAATTTCCAAAAAAAACAGTCTCAGGTTACACATCTGCAGCAGTAAATC
TCAAAACCCCAACTGGAACTACGATTTGAGTTTAGGGAACTCAATGTCCATTTCCTTTTT
CCACGCAAAATTGGGATCAAGCGCTTGAGGAAGCACCTTAGAGCGCAGTCACCTTCCCGA
CAGCTACTGTTTTCCCTTCCGTTCGTAGAGTGAATCTTCCTAGTTGAGGGAAATCTGAGA
ATTTTTCAACACAGATTGAATTGGTAACCTGTATACGGCAAACCACAGCAGCACCGTTCT
TCACAAACAGAACTTCCTTTTTCATGGGCTTCCTCGTCTTCATATCAATTTGGCTTATCA
ATTCGATGATCTCGCATTCCTCAACAACTGCATGAATGTGCAGAATAGCCTTGTACCCAG
CTGTGAAAATAGCATTGTCAAGCAGCTCAAGGATTTGCAGTTGTGCAACAAATTCAGTAA
CAGCAGGTACAGGTTTTACCGTGCTGGATAAAACAAAACCTGGAAGGATATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1CU36JQ U 1
AF RS1CU36TF C 1
AF RS1DI85JQ U 34
BS 1 130 RS1CU36JQ
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RD RS1CU36JQ 220 0 0
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TTCTAGCTTTTAAATTTCCAAAAAAAACAGTCTCAGGTTACACATCTGCAGCAGTAAATC
TCAAAACCCCCACTGGAACTACCATTTGAGTTTAGGGAACTCAATGTCCATTTCCTTTTT
CCACGCAAAATTGGGATCAAGCGCTTGAGGAAGCACCTTA

QA 1 220 1 220
DS 

RD RS1CU36TF 498 0 0
AATTGTAAATTTAGCTTAACAGAGAGAAAAAAGTCACACTCATGTTTAACATAATACTCT
TTCTAGCTTTTAAATTTCCAAAAAAAACAGTCTCAGGTTACACATCTGCAGCAGTAAATC
TCAAAACCCCAACTGGAACTACGATTTGAGTTTAGGGAACTCAATGTCCATTTCCTTTTT
CCACGCAAAATTGGGATCAAGCGCTTGAGGAAGCACCTTAGAGCGCAGTCACCTTCCCGA
CAGCTACTGTTTTCCCTTCCGTTCGTAGAGTGAATCTTCCTAGTTGAGGGAAATCTGAGA
ATTTTTCAACACAGATTGAATTGGTAACCTGTATACGGCAAACCACAGCAGCACCGTTCT
TCACAAACAGAACTTCCTTTTTCATGGGCTTCCTCGTCTTCATATCAATTTGGCTTATCA
ATTCGATGATCTCGCATTCCTCAACAACTGCATGAATGTGCAGAATAGCCTTGTACCCAG
CTGTGAAAATAGCATTG
C

QA 1 497 1 497
DS 

RD RS1DI85JQ 559 0 0
TCACACTCATGTTTAACATAATACTCTTTCTAGCTTTTAAATTTCCAAAAAAAACAGTCT
CAGGTTACACATCTGCAGCAGTAAATCTCAAAACCCCAACTGGAACTACGATTTGAGTTT
AGGGAACTCAATGTCCATTTCCTTTTTCCACGCAAAATTGGGATCAAGCGCTTGAGGAAG
CACCTTAGAGCGCAGTCACCTTCCCGACAGCTACTGTTTTCCCTTCCGTTCGTAGAGTGA
ATCTTCCTAGTTGAGGGAAATCTGAGAATTTTTCAACACAGATTGAATTGGTAACCTGTA
TACGGCAAACCACAGCAGCACCGTTCTTCACAAACAGAACTTTCTTTTTCATGGGCTTCC
TCGTGTTCATATCAATTTGGCTTATCAATTCGATGATCTCGCATTCCTCAACAACTGCAT
GAATGTGCAGAATAGCCTTGTACCCAGCTGTGAAAATAGCATTGTCAAGCAGCTCAAGGA
TTTGCAGTTGTGCAACAAATTCAGTAACAGCAGGTACAGGTTTTACCGTGCTGGATAAAA
CAAAACCTGGAAGGATATC

QA 1 559 1 559
DS 



AS 1 3

CO CL3520Contig1 961 3 11 U
GGGAACACAAATCGCGACACCAATGGCGGCGACAGAGGAAGAGATGCCGACGACGACGAA
GGAAGGCGCTAACCTACTGGGGAAGCCAAAGTATAAGAAACTGGAGAACGGGAGATTCAG
ATGCGTGCAAACGGGTCACGAGCTCCTCGAGAAAGACAAGAAGGTCTATTCAGAGAGCAA
ACGGTGCCGTTTAGGGCTTATCGACCACGCCTTGTCCCACAGCAAGCCTCCTCTTAACTT
GTTTGAGCAAGACCCTAGCTCTCGTTCAAAGCTGCTGTGTAAGCTTACGGGTGACACGGT
GAACAAGACTGAGGAGCATATTTGGAAGCATATCAATGGACGCCGCTTCCTTAACAAACT
AGAGGAGAAGGAACGAGAGAATGAATCTGGGATTGTTCCTGAGGAAGGTGGAGAAACTGT
GGCGAAAGAGGATGGTGTAAAGGAAGGAAAGAAGAAGAACAAAAAGAAGAAGAAGAAGGA
TAAGAAGAAAAAGAAGAACAAGGAGTTAGATAAAAAGGAAGAGAGTGGAGAGGATGTTAC
TGATGGAGCTGAACATGGAAATGATGAAGATGTTGAGGAGAGAGAGCTTGACTTTTGGAT
GCCGCCAGATGGAGAGAGGTGGGACTTTGATGATGGTGGAGACCGGTGGGGATCAGATTC
GGACACGGAAGATGATCCAATAGGTGAGATTGATGAAGATGGAAAGACTAGTTTGGATGA
CTGCATAATAGGTGAAGTTGATGAAGATGGCGAAAATAGTGTGGATGAGACTCATGAAAG
TAAAAAGAGGAAACCTGAAGAAGTCAGTTCCAGCAACCTTCCTTCGAAGAAGAAGAAGAA
GAAGAAGAACAAGAAGGTCAAAACAACATTGTCATAAGTCTTATATGTTCTCTCTCTTTC
TCTCTGTTGTTGTTCCTTTTTTGTGTATTACTCTGTTCTTCAATTCATGGGATCAGTTTT
G


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1CM41TF U 1
AF RS1D895TF U 6
AF RS1D895JQ C 193
BS 1 55 RS1CM41TF
BS 56 58 RS1D895TF
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BS 658 712 RS1D895TF
BS 713 961 RS1D895JQ

RD RS1CM41TF 657 0 0
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GGAAGGCGCTAACCTACTGGGGAAGCCAAAGTATAAGAAACTGGAGAACGGGAGATTCAG
ATGCGTGCAAACGGGTCACGAGCTCCTCGAGAAAGACAAGAAGGTCTATTCAGAGAGCAA
ACGGTGCCGTTTAGGGCTTATCGACCACGCCTTGTCCCACAGCAAGCCTCCTCTTAACTT
GTTTGAGCAAGACCCTAGCTCTCGTTCAAAGCTGCTGTGTAAGCTTACGGGTGACACGGT
GAACAAGACTGAGGAGCATATTTGGAAGCATATCAATGGACGCCGCTTCCTTAACAAACT
AGAGGAGAAGGAACGAGAGAAAGAATCTGGGATTGTTCCTGAGGAAGGTGGAGAAACTGT
GGCGAAAGAGGATGGTGTAAAGGAAGGAAAGAAGAAGAACAAAAAGAAGAAGAAGAAGGA
TAAGAAGAAACATAAGAACAAGGAGTTAGATAAAAAGGAAGAGAGTGGAGAGGATGTTAC
TGATGGAGCTGAACATGGAAATGATGAAGATGTTGAGGAGAGAGAGCTTGACTTTTGGAT
GCCGCCAGATGGAGAGAGGTGGGACTTTGATGATGGTGGAGACCGGTGGGGATCAGA

QA 1 657 1 657
DS 

RD RS1D895TF 707 0 0
G
ACAAATCGCGACACCAATGGCGGCGACAGAGGAAGAGATGCCGACGACGACGAAGGAAGG
CGCTAACCTACTGGGGAAGCCAAAGTATAAGAAACTGGAGAACGGGAGATTCAGATGCGT
GCAAACGGGTCACGAGCTCCTCGAGAAAGACAAGAAGGTCTATTCAGAGAGCAAACGGTG
CCGTTTAGGGCTTATCGACCACGCCTTGTCCCACAGCAAGCCTCCTCTTAACTTGTTTGA
GCAAGACCCTAGCTCTCGTTCAAAGCTGCTGTGTAAGCTTACGGGTGACACGGTGAACAA
GACTGAGGAGCATATTTGGAAGCATATCAATGGACGCCGCTTCCTTAACAAACTAGAGGA
GAAGGAACGAGAGAATGAATCTGGGATTGTTCCTGAGGAAGGTGGAGAAACTGTGGCGAA
AGAGGATGGTGTAAAGGAAGGAAAGAAGAAGAACAAAAAGAAGAAGAAGAAGGATAAGAA
GAAAAAGAAGAACAAGGAGTTAGATAAAAAGGAAGAGAGTGGAGAGGATGTTACTGATGG
AGCTGAACATGGAAATGATGAAGATGTTGAGGAGAGAGAGCTTGACTTTTGGATGCCGCC
AGATGGAGAGAGGTGGGACTTTGATGATGGTGGAGACCGGTGGGGATCAGATTCGGACAC
GGAAGATGATCCAATAGGTGAGATTGATGAAGATGGAAAGACTAGT

QA 2 707 2 707
DS 

RD RS1D895JQ 769 0 0
AGGGCTTATCGACCACGCCTTGTCCCACAGCAAGCCTCCTCTTAACTTGTTTGAGCAAGA
CCCTAGCTCTCGTTCAAAGCTGCTGTGTAAGCTTACGGGTGACACGGTGAACAAGACTGA
GGAGCATATTTGGAAGCATATCAATGGACGCCGCTTCCTTAACAAACTAGAGGAGAAGGA
ACGAGAGAATGAATCTGGGATTGTTCCTGAGGAAGGTGGAGAAACTGTGGCGAAAGAGGA
TGGTGTAAAGGAAGGAAAGAAGAAGAACAAAAAGAAGAAGAAGAAGGATAAGAAGAAAAA
GAAGAACAAGGAGTTAGATAAAAAGGAAGAGAGTGGAGAGGATGTTACTGATGGAGCTGA
ACATGGAAATGATGAAGATGTTGAGGAGAGAGAGCTTGACTTTTGGATGCCGCCAGATGG
AGAGAGGTGGGACTTTGATGATGGTGGAGACCGGTGGGGATCAGATTCGGACACGGAAGA
TGATCCAATAGGTGAGATTGATGAAGATGGAAAGACTAGTTTGGATGACTGCATAATAGG
TGAAGTTGATGAAGATGGCGAAAATAGTGTGGATGAGACTCATGAAAGTAAAAAGAGGAA
ACCTGAAGAAGTCAGTTCCAGCAACCTTCCTTCGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAACAA
GAAGGTCAAAACAACATTGTCATAAGTCTTATATGTTCTCTCTCTTTCTCTCTGTTGTTG
TTCCTTTTTTGTGTATTACTCTGTTCTTCAATTCATGGGATCAGTTTTG

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

CO CL3521Contig1 572 2 5 U
AAAGCCGCCGGTGTCGGAGCTTTGCAAGCTGTGTCGAGGGAAGCTTACTTTACAGTGGTC
GATGGTTTTGACTCGAGCAGCATGGGTCCACCGTCTGAGGACACCGGCAGCAAGAAACAT
AGGTTCCCTAATCTCAGAGGTGAAAACAACAGCAAATCTCTGGAGGCATTGGTGAAGAAT
ACAGGAAAAGAATCTCTCCAATGGGGGCTAGCAGCTGGATTATACTCTGGTATAACTTAT
GGTATGAAGGAGGCTCGTGGAGGAGCTCATGATTGGAGAAACAGTGCAGTGGCTGGAGCA
TCGACAGGAGCGGCAATGGCTATGACAACCTCGGAGAGGACAAGCCATGAGCAAGTGGTT
CAGTCTGCTCTTACTGGAGCAGCCATTTCCACTGCTGCTAATCTCCTTTCCAGCGTTTTC
TAGATGATTTTCATTATAAGGTTGTTATTTGTGTTAGTTTTACATAAATATGTCTCCATC
TCCTTTTAAATTTCTCTACGTGCCAGTGAAGACTACGTTTTGTCTGAAACTCAAAACTCA
TGAGGCCACAAATCACATATCACATTTTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BA92TF U 110
AF RS1BA92JQ C 1
BS 1 109 RS1BA92JQ
BS 110 489 RS1BA92TF
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GTATAACTTATGGTATGAAGGAGGCTCGTGGAGGAGCTCATGATTGGAGAAACAGTGCAG
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CCAGCGTTTTCTAGATGATTTTCATTATAAGGTTGTTATTTGTGTTAGTTTTACATAAAT
ATGTCTCCATCTCCTTTTAA*TTTCTCTACGTGCCAGTGAAGACTACGTTTTGTCTGAAA
CTCAAA
CTCA

QA 1 426 1 426
DS 

RD RS1BA92JQ 572 0 0
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GATGGTTTTGACTCGAGCAGCATGGGTCCACCGTCTGAGGACACCGGCAGCAAGAAACAT
AGGTTCCCTAATCTCAGAGGTGAAAACAACAGCAAATCTCTGGAGGCATTGGTGAAGAAT
ACAGGAAAAGAATCTCTCCAATGGGGGCTAGCAGCTGGATTATACTCTGGTATAACTTAT
GGTATGAAGGAGGCTCGTGGAGGAGCTCATGATTGGAGAAACAGTGCAGTGGCTGGAGCA
TCGACAGGAGCGGCAATGGCTATGACAACCTCGGAGAGGACAAGCCATGAGCAAGTGGTT
CAGTCTGCTCTTACTGGAGCAGCCATTTCCACTGCTGCTAATCTCCTTTCCAGCGTTTTC
TAGATGATTTTCATTATAAGGTTGTTATTTGTGTTAGTTTTACATAAATATGTCTCCATC
TCCTTTTAAATTTCTCTACGTGCCAGTGAAGACTACGTTTTGTCTGAAACTCAAAACTCA
TGAGGCCACAAATCACATATCACATTTTCCCC

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 3

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AAACGACCCGGTGTCGCATATAGCAAGGAGGATTGGAGGCAACATTGGCAGTCCCTCGGC
AACTCCCTCGAGAGCTCCGTTCGCGATGTCCTTCTCTTAAGCCAGATCGCCGAACCCACC
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CTCATCGCCGAGTCCTCAGAGGGCAAGTTCGAGAGTGAAGTCTTCGGAGGCAAATCCAAG
GGTGTGCACCACTTTCATGGCGCTGTGTTCACTGGTATACTCATTGACCCCGAGTATGCC
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TATGGTCGTATTAAATTGAACGCCGGCACACCCACGGGATTCGGATTGTCCGGCGTCAAG
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ATTGCTACAACCAAAATCAATGAAGAAAATCAGATTGTCTTCAACAGGTTGGCCGGAACT
TGATTTCGGCATTCGAAGTTGATGGAGTTACGGAACCGAAACCGACACCTTTCAAACCAA
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AAAAAGAGGCAATCTTAATTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DE76TF U 310
AF RS1DE76JQ C 552
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DS 

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G
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AGAAGATCCGGCTTGATATTCCGCACGGATTGCACGACGGGGCACGTGTCACCTTCTCGT
GGAAATGGACTACAGACTCGGATGGAAAAAAGAACAGACCTGAAGCCACGTATGGTCGTA
TTAAATTGAACGCCGGCACACCCACGGGATTCGGATTGTCCGGCGTCAAGGGTGCTGGCG
GATGGGCAGGTTATGACTTTTGGGGTCATATAAAGTCCAAGGACCAAATCATTGCTACAA
CCAAAATCAATGAAGAAAATCAGATTGTCTTCAACAGGTTGGCCGGAACTTGATTTCGGC
ATTCGAAGTTGATGGAGTTACGGAACCGAAACCGACACCTTTCAAACCAAACCAAGTTCT
ACGTAATTGTTTCTTTTCTGCATTTTGTTTCAGTTGATAATAAGAAGAGAAGAGGTCTTC
CTCCTATATAGGAAACCATCTCCTCCACTTTCCCTTAATTTCCATGTTCAAAGGAGTTAT
GACTCCACTGTGTTTATGTATCTTCTCTATTTAAATGA
TA

QA 2 699 2 699
DS 

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TAAATTGAACGCCGGCACACCCACGGGATTCGGATTGTCCGGCGTCAAGGGTGCTGGCGG
ATGGGCAGGTTATGACTTTTGGGGTCATATAAAGTCCAAGGACCAAATCATTGCTACAAC
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TTCGAAGTTGATGGAGTTACGGAACCGAAACCGACACCTTTCAAACCAAACCAAGTTTTA
CGTAATTGTTTTTTTTCTGCATTTTGTTTCAGTTGATAATAAGAAGAGAAGAGGTCTTCC
TCCTATATAGGAAACCATTTCCTCCACTTTCCCTTAATTTCCATGTTCAAAGGAGTTATG
ACTCCACTGTGTTTATGTATTTTCTCTATTTAAATGAATAAAAAAGCCAAAAAAGAGGCA
ATCTTAATTACC

QA 1 492 1 492
DS 



AS 1 2

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AATCGTTCCTCATCATCTTTATCTCGATTTCCGTCTACGATGAGCTCGGAGGAAGCCAAG
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CTCTTCTGTGGTAAGGAATACCCAGAGTGTCCACCAAGTGTCAAGTTCCAGACCCGGATT
AACATGGCCTGCGTTAACCCTCAGACTGGAGTGGTTGAACCGAGTCTCTTTCCTATGCTC
GCTAACTGACGCCGAGAATACACAATGGAGGACATTCTGGTTAAACTTAAAAAAGAAATG
ATGACTTCACATAACCGCAAGTTAGCTCAACCCCCGGAAGGTACCGAGGAAGCTAGGGCA
GATCCAAAGGGACCAGCTAAATGCTGTGTGATGTGAAGAGAGAAGTTGGGGCTGTCAACA
ATTTGTATTAATATAAGAGACAATGTATATAAAACATCATTTGAATCTTTTGAAAATTGC
CTACAACTTAAATGTCACAGTGTTGTTTGAGAGATTATTATATATGTATAAACCAATAAC
AGGTAATGATCATCCTAATAAATCTTCTCTTTCATAGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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BQ
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ATTCAACTTGATAGTAAAAGAGTTACGAGTAAATCAGAGGCAACACGTAAACGATCAATG
TTATGATCTTACAAATTACAGCGACTGGTCTAGTCAAAAACTGAAACGGTCTTATGTCTG
TGCACGTAAAAGCGGGGAAGGTGAAACCGGTGAATGAGGAGAGAAGAAGCCATCCTCAAA
CCGTCTCGTGTCCTTAAAGCTCAACCGCAGGCTACTCTGCCAACACTTCTTCTTCTTTGC
CATCGGTTTTGTCCGGTTCAGGCTCTCCTCTTCAAGTTGACTAGTGAACACTTTGATCCT
CTCTAGTGCCGTCTCCATTGTCTTGTGGTCCATGTTTGCAAAACATACTCTAAACCAACC
GGGTTCGTGGCAATGGCACGAGCCGCCTGGAGAAACATTAAGCTTCACCTTGTGGACGAT
CACACGCCATAACTCGGTCTCTGATTCGAATGTAGCGGTCTTCAGAAGATTTCTTAAATC
CATCCATATGAACAATCCGGCTCCTGCCTTCAACCAACCAATGCCTAGACCGTCTAAACC
AATGGTTAACTCTGCGTGTCTTGCAGCTAACCGTAATTTGATCTCGCGGAGGAACTGGCC
AACAAAGTCTTCGTCAGATAACATGTTAGCAATCAGATGCTGCGTTTGGGTTGAGACCAG
ACCAAAACTTGACATTTTCCTTGCAATGTTAACCACCCGGTTATTGTAAGAGTATATTAT
ACCGACTCTTAAACCAGGCAAACCCATGTCTTT

QA 1 813 1 813
DS 

RD RS1AC13TF 776 0 0
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AGACCAAAACTTGACATTTTCCTTGCAATGTTAACCACCCGGTTATTGTAAGAGTATATT
ATACCGACTCTTAAACCAGGCAAACCCATGTCTTTGGAAAGACTATATACAATATGGATC
AAATCGCGGTTGCAATCAGGGATCTCCTCGATCACTTCTGCCACACTGATGAACTCTGAT
TGACCAAAAGTAGTTGCGGCATAAATCTCATCCGCAATGAGGTGAATCCCTTTGTCATTG
GTGAAGTTAACCAGAGATTTCAAGCAATCCCGGTCTAATGTCGTACCAAGAGGATTCGAA
GGATTGGTTATGAGTAAACCCTTAACCGTAATGTTCGCATTTTCGTACGCAGCTTCCAAG
TCTTCCACCGTGATCTTAAAGCCGTTAGAGCTGTGACAAGTAACCGGTACAAGATTCACT
CCGGTTCTCCATCTTAAATCTCTATCAAACCCTGGATAATAAGGAGTAGGAACTAAGAAA
CCGTCGCCGGGATTGGCTAGACAGAAAGCAACTGTCTCATGTGCGCCCCCCGGCCGTAAG
CAGTGGTATCAACGCAGAGTACGAGGATAAACACGATCGCGGATCTACAAGTTTTCGATT
TTCTCCTAAGCTCCATTCCCATGGCTGTGAATTAAGAAAAAAAAAATCACTAGATCTGAA
GCTCCCCGTTACAGTTTTCTTTATTTTTTTCCTTATACGCTTGGAGACGGAGACCC

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 3

CO CL3525Contig1 944 3 12 U
GAACAGCATCAAGGTGCTGAGTTTATGGATGCATTGTTGGAATCTTACCAAGGCGAAAAC
GCAGAGTACAAGATGACTAGGAAGCAAATCAAGGCATTATTCGCGGAGCTATTCGTTGGA
GCCGGTGACTCCTCTTCTTCAACAACAAGGTGGGCAATGGCAGAAATAATCAACAACCCT
AATATCCTTGAAAGACTGAGAGAAGAAATCGATTCAGTGGTGGGGACAAATAGGTTGGTT
CAAGAAACTGATCTACCAAAACTCCCTTACTTGCAAGCGGTGGTCAAGGAAGCTCTAAGA
TTGCACCCTGTAGGATCTGTGGTGCCAAGGGAGTTTCAAGAAGGCTGTACGATAGGAGGG
TTCTACATACCTGAGGGAACATCACTTGCTGTCAATTCTTATGCTATCATGAGAGATCCT
GATTCTTGGGAAGATCCTTATGAGTTTAAGCCAGAGAGGTTTCTAACATCTTCAAGGTCA
TGGAAAGAGGAGGAGAGAAAAGAGCAAGCACTTAAGTTCCTGGCGTTTGGGGCTGGAAGG
AGAGGATGTCCTGGATCAAATCTAGGGAGTACTTTTGTAGGAACCGCGGTTGGAGTGATG
GTGCAGGGCTTTGACTGGGAAATTGAAGGAGATAAAGTCAACATGGAAGAAGCCTCAGGA
TTGAGATTCTTTATGGCTTTGGCTAAGCCACTTAAGTGCACTCCTCGTCCTCGAAATATG
AACCCTTTACCTTCTGATATGCAGATTCCAAATATGAACCATCTTACGGTAAGAGTCTTA
CCTTCTGATTCAGGAGGTCAGGATTACACTCAATTCACAAACATATAACTATAATATATT
ACATATTTACATGCCTTATAGTTTTGCATTCGTACGTTGATATGTTGAATGCAATTTCCT
TAAAACATTGTATATAATTATTATAATCAATAAGTAGTTCAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1AH63TF U 1
AF RS1FA72TF U 364
AF RS1DX83TF U 522
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BS 930 944 RS1FA72TF

RD RS1AH63TF 706 0 0
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AATATCCTTGAAAGACTGAGAGAAGAAATCGATTCAGTGGTGGGGACAAATAGGTTGGTT
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TTGCACCCTGTAGGATCTGTGGTGCCAAGGGAGTTTCAAGAAGGCTGTACGATAGGAGGG
TTCTACATACCTGAGGGAACATCACTTGCTGTCAATTCTTATGCTATCATGAGAGATCCT
GATTCTTGGGAAGATCCTTATGAGTTTAAGCCAGAGAGGTTTCTAACTTCTTCAAGGTCA
TGGAAAGAGGAGGAGAGGAAAGAGCAAGTACTTAAGTTCCTGGCGTTTGGGGCTGGAAGG
AGAGGATGTCCTGGATCAAATCTAGGGAGTACTTTTGTAGGAACCGCGGTTGGAGTGATG
GTGCAGGGCTTTGACTGGGAAATTGAAGGAGATAAAGTCAACATGGAAGAAGCCTCAGGA
TTGAGATTCTTTATGGCTTTGGCTAAGCCACTTAAGTGCACTCCTC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RS1FA72TF 581 0 0
G
ACATACCTGAGGGAACATCACTTGCTGTCAATTCTTATGCTATCATGATAGATCCTGATT
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AGGGCTTTGACTGGGAAATTGAAGGAGATAAAGTCAACATGGAAGAAGCCTCAGGATTGA
GATTCTTTATGGCTTTGGCTAAGCCACTTAAGTGCACTCCTCGTCCTCGAAATATGAACC
CTTTACCTTCTGATATGCAGATTCCAAATATGAACCATCTTACGGTAAGATTCTTACCTT
CTGATTCAGGAGGTCAGGATTACACTCAATTCACAAACATATAACTATAATATATTACAT
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ACATTGTATATAATTATTATAATCGATAAGTAGTTCAACT

QA 2 581 2 581
DS 

RD RS1DX83TF 420 0 0
GGCGTTTGGGGCTGGAAGGAGAGGATGTCCTGGATCAAATCTAGGGAGTACTTTTGTAGG
AACCGCGGTTGGAGTGATGGTGCAGGGCTTTGACTGGGAAATTGAAGGAGATAAAGTCAA
CATGGAAGAAGCCTCAGGATTGAGATTCTTTATGGCTTTGGCTAAGCCACTTAAGTGCAC
TCCTCGTCCTCGAAATATGAACCCTTTACCTTCTGATATGCAGATTCCAAATATGAACCA
TCTTACGGTAAGAGTCTTACCTTCTGATTCAGGAGGTCAGGATTACACTCAATTCACAAA
CATATAACTATAATATATTACATATTTACATGCCTTATAGTTTTGCATTCGTACGTTGAT
ATGTTGAATGCAATTTCCTTAAAACATTGTATATAATTATTATAATCAATAAGTAGTTCA

QA 1 420 1 420
DS 



AS 1 2

CO CL3526Contig1 888 2 2 U
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ATTGAAGATTCTGTGCCTGGTGTTTTGGCTGGTAAAGCTGCTGGGAGTTATGTGATTGCT
GTTCCTTCTCTGCCTAAACAAACACATCTTTATACATCGGCAGACGAAGTCATCAATTCT
CTGCTTGACATTAAACCTGAAAAATGGGGTCTTCCTCCGTTTCAAGATTGGATAGAGAAC
ACTTTACCAATTGATCCTTGGCGTATTGGTGGTCCAGTTATCAAAGGATTTGGCCGTGGC
TCTAAAGTACTCGGAATCCCCACAGCGAACTTGTCAACGAAGGATTACGCGGAGGAGCTA
GTGGAGCATCCTTCGGGAGTGTACTTTGGTTGGGCAGGGTTAGCAACTAGAGGTGTCTTT
AAAATGGTCATGAGCATTGGTTGGAATCCTTATTTCAACAACACCGAGAAAACTATTGAG
CCATGGTTGCTTCACGATTTCACTGAAGATTTCTATGGAGAAGAGCTACGTCTTATAATT
GTTGGCTATATACGTCCTGAGGCTAACTTTCCTTCACTGGAGAGTCTAGTAGCAAAGATT
CACGAGGACAGGGATGTCGCAGAGAAAGCTCTTGATCTTCCATCGTATGCTAAGTTAAAG
GATGATCCTTACCTGACTAAATATGATTAAAGTCATTTATGTAAAGAATCAAAAACTTTG
TTTTTCTCACATTCTTGATTATGAATTTGATTTAATAACCAAACTCTCTAATTGTTTGTA
AAACTCGAATAAGACTTCTGTCTTTGCTTTACTTACTGTCAAGTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E410TF U 1
AF RS1E410JQ C 199
BS 1 249 RS1E410TF
BS 250 888 RS1E410JQ

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CCTGATATTTTTCTTGAAGCAGCGAGAAAGTTGAATAGAGATCCAGGAGAGTGTTTGGTT
ATTGAAGATTCTGTGCCTGGTGTTTTGGCTGGTAAAGCTGCTGGGAGTTATGTGATTGCT
GTTCCTTCTCTGCCTAAACAAACACATCTTTATACATCGGCAGACGAAGTCATCAATTCT
CTGCTTGAC
A

QA 1 249 1 249
DS 

RD RS1E410JQ 690 0 0
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GAAAAATGGGGTCTTCCTCCGTTTCAAGATTGGATAGAGAACACTTTACCAATTGATCCT
TGGCGTATTGGTGGTCCAGTTATCAAAGGATTTGGCCGTGGCTCTAAAGTACTCGGAATC
CCCACAGCGAACTTGTCAACGAAGGATTACGCGGAGGAGCTAGTGGAGCATCCTTCGGGA
GTGTACTTTGGTTGGGCAGGGTTAGCAACTAGAGGTGTCTTTAAAATGGTCATGAGCATT
GGTTGGAATCCTTATTTCAACAACACCGAGAAAACTATTGAGCCATGGTTGCTTCACGAT
TTCACTGAAGATTTCTATGGAGAAGAGCTACGTCTTATAATTGTTGGCTATATACGTCCT
GAGGCTAACTTTCCTTCACTGGAGAGTCTAGTAGCAAAGATTCACGAGGACAGGGATGTC
GCAGAGAAAGCTCTTGATCTTCCATCGTATGCTAAGTTAAAGGATGATCCTTACCTGACT
AAATATGATTAAAGTCATTTATGTAAAGAATCAAAAACTTTGTTTTTCTCACATTCTTGA
TTATGAATTTGATTTAATAACCAAACTCTCTAATTGTTTGTAAAACTCGAATAAGACTTC
TGTCTTTGCTTTACTTACTGTCAAGTTTAC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 3

CO CL3527Contig1 737 3 8 U
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TCACTCTCAGTGTTTCTCTCTTCTGCTCTGTGTAACTTCTTTTCTCTAAAAGTTAAAACC
CACATCGAAATTAAAACTCCCTACGACCCAAAGGTATCCCAAAGCAAAAGACAACAGAAG
CATCATCAAGCTTCCAAGCATTACACAGTGGAAAACAAAAGACTTTAAGAGTTTCAGACA
AACATCTTTACATGTCGGTGAGAGCAGAGATATATATGTATAATAAACTTGTAGCTGTTA
CTGTTGTTGTCGAGGGACAGCACGGGAACGAACAGGTGTCTTTGAGGGACTCACCCTTAT
GGGTAAAGAACCAAGAAGCACGCCACTGCAATTGAGAGCCGTTATTGCACTTTCAGCCAT
GACAAACTCAACGAAACCGATTCTAGTTGGATGATGATAATCTCCCAAAAGCCTCAAACG
TAATACCTCTCCACACACAGCCTCAAAGAAGAGTTTTATGTCCGTTTGAGTGACCTTCTT
GTCGATGTTAGTGCAGTAGATAGTTCTCGCACACTTCTCACGCTCATCTTCAGTCTAAGA
ACCAAGAACAGGACTAGTCAAATCACTTAACTTTGCACTCAGAATGGGATGAAACAGAAG
ACAACAAAAGACTCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G753TF C 50
AF RS1E735JQ U 1
AF RS1F482JQ U 8
BS 1 379 RS1E735JQ
BS 380 380 RS1F482JQ
BS 381 444 RS1E735JQ
BS 445 445 RS1F482JQ
BS 446 536 RS1E735JQ
BS 537 537 RS1F482JQ
BS 538 649 RS1E735JQ
BS 650 737 RS1F482JQ

RD RS1G753TF 483 0 0
AATAAGTCCAAGAGCAACAACAACAGTATAAATAACTAAAAACTCCCATTAACAGAGACA
ATCTTCAAACCTCACTCTCAGTGTTTCTCTCTTCTGCTCTGTGTAACTTCTTTTCTCTAA
AAGTTAAAACCCACATCGAAATTAAAACTCCCTACGACCCAA*GGTATCCCAAAGCAAAA
GACAACAGAAGCATCATCAAGCTTCCAAGCATTACACAGTGGAAAACAAAAGACTTTAAG
AGTTTCAGACAAACATCTTTACATGTCGGTGAGAGCAGAGATATATATGTATAATAAACT
TGTAGCTGTTACTGTTGTTGTCGAGGGACAGCACGGGAACGAACAGGTGTCTTTGAGGGA
CTCACCCTTATGGGTAAAGAACCAAGAAGCACGCCACTGCAATTGAGAGCCGTTATTGCA
CTTTCAGCCATGACAAACTCAACGAAACCGATTCTAGTTGGATGATGATAATCTCCCAAA
AGC

QA 1 483 1 483
DS 

RD RS1E735JQ 649 0 0
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GAGCAACAACAACAGTATAAATAACTAAAAACTCCCATTAACAGAGACAATCTTCAAACC
TCACTCTCAGTGTTTCTCTCTTCTGCTCTGTGTAACTTCTTTTCTCTAAAAGTTAAAACC
CACATCGAAATTAAAACTCCCTACGACCCAAAGGTATCCCAAAGCAAAAGACAACAGAAG
CATCATCAAGCTTCCAAGCATTACACAGTGGAAAACAAAAGACTTTAAGAGTTTCAGACA
AACATCTTTACATGTCGGTGAGAGCAGAGATATATATGTATAATAAACTTGTAGCTGTTA
CTGTTGTTGTCGAGGGACAACACGGGAACGAACAGGTGTCTTTGAGGGACTCACCCTTAT
GGGTAAAGAACCAAGAAGCACGCCCCTGCAATTGAGAGCCGTTATTGCACTTTCAGCCAT
GACAAACTCAACGAAACCGATTCTAGTTGGATGATGATAATCTCCCAAAAGCCTCAGACG
TAATACCTCTCCACACACAGCCTCAAAGAAGAGTTTTATGTCCGTTTGAGTGACCTTCTT
GTCGATGTTAGTGCAGTAGATAGTTCTCGCACACTTCTCACGCTCATCT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1F482JQ 730 0 0
AAATATAAAATGTAGAACATTTACTAACAAAAGCAGGTTTCTAATAAGTCCAAGAGCAAC
AACAACAGTATAAATAACTAAAAACTCCCATTAACAGAGACAATCTTCAAACCTCACTCT
CAGTGTTTCTCTCTTCTGCTCTGTGTAACTTCTTTTCTCTAAAAGTTAAAACCCACATCG
AAATTAAAACTCCCTACGACCCAAAGGTATCCCAAAGCAAAAGACAACAGAAGCATCATC
AAGCTTCCAAGCATTACACAGTGGAAAACAAAAGACTTTAAGAGTTTCAAACAAACATCT
TTACATGTCGGTGAGAGCAGAGATATATATGTATAATAAACTTGTAGCTGTTACTGTTGT
TGTCGAGGGACAGCACGGGAACGAACAGGTGTCTTTGAGGGACTCACCCTTATGGGTAAA
GAACCAAGAAGCACGCCACTGCAATTGAGAGCCGTTATTGCACTTTCAGCCATGACAAAC
TCAACGAAACCGATTCTAGTTGGATGATGATAATCTCCCAAAAGCCTCAAACGTAATACC
TCTCCACACACAGCCTCAAAGAAGAGTTTTATGTCCGTTTGAGTGACCTTCTTGTCGATG
TTAGTGCAGTAGATAGTTCTCGCACACTTCTCACGCTCATCTTCAGTCTAAGAACCAAGA
ACAGGACTAGTCAAATCACTTAACTTTGCACTCAGAATGGGATGAAACAGAAGACAACAA
AAGACTCACC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 3

CO CL3528Contig1 860 3 2 U
GGTCGTCCTAAGTCGTAACACATGGCATAACTCCAAATATTACAATATACCTCAAATAAC
ATATAAGAAGTTTGGCGTCATTACTGGCCGCACAAATTTATTTAAAAGTGAAAAACATAC
GAAATGAGAGAAATCACGAGCTTCACCAAAAGCAAGAATGAAACAGTGGATCAAATAAAT
ATCAAGGCATCTGATCAACAATATCAGCAACAGCGTCCTTGGACTCCTTCAACAGCTTGA
TACTGTTCTTAAGCTTCTCTCTCTTGCTCGCCAACGAAGGAGACTCCTCAAGCATCTTCA
CAATAACGTCTCCTCCACCTCTGTGATTCAACAACTCCGCGACAACCTCCTTCTGAAACT
GACTGTCGACAAATTTCTTCAAAGTGAACTGTAGGTAGAGTGCAGTGTGGTCCACGATTC
TTCGTATGACGATGGTCCAATAGGCTGTGATCCTCATCTTCATGTCGAAAGCTTGATGCA
GCAGTTCTGCATGATACTTCTTTAGATGCGTGACCGGAACAGTTCCGAATCCGGTTAAAG
CGACATGATAATAGTTATTCACACAATTGATGAACCCTCCTTGTTCAGTCATACGCTGTG
TGTAAACCTTTGTGTACTCTTGGTTACACGTGTAATCCGTCAGTTTCTCCATCAACGATC
TCGGACACTCGGCTCACCGATTGTTCTTTGATTTTAGAGATCAGTCTCCGACAAGCTCGT
TTGATGGAACGTTGCAACTGAGGGAAGTTTTCAGAGTAGTTGGTGATGACTGATGAGATA
ACAACCTCAACGGAGTCCATATCTCTCTGATGAACCCGATGGGTTTAGCATGCATTGCGT
CACACGTTGCGAGAGATAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EN80JQ U 1
AF RS1EN80TF C 12
AF RS1CL34JQ U 24
BS 1 637 RS1EN80JQ
BS 638 860 RS1CL34JQ

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ATCAAGGCATCTGATCAACAATATCAGCAACAGCGTCCTTGGACTCCTTCAACAGCTTGA
TACTGTTCTTAAGCTTCTCTCTCTTGCTCGCCAACGAAGGAGACTCCTCAAGCATCTTCA
CAATAACGTCTCCTCCACCTCTGTGATTCAACAACTCCGCGACAACCTCCTTCTGAAACT
GACTGTCGACAAATTTCTTCAAAGTGAACTGTAGGTAGAGTGCAGTGTGGTCCACGATTC
TTCGTATGACGATGGTCCAATAGGCTGTGATCCTCATCTTCATGTCGAAAGCTTGATGCA
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CGACATGATAATAGTTATTCACACAATTGATGAACCCTCCTTGTTCAGTCATACGCTGTG
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DS 

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AATTTCTTCAAAGTGAACTGTAGGTAGAGTGCAGTGTGGTCCACGATTCTTCGTATGACG
ATGGTCCAATAGGCTGTGATCCTCATCTTCATGTCGAAAGCTTGATGCAGCAGTTCTGCA
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GTGTACTCTTGGTTACACGTGTAATC

QA 1 626 1 626
DS 

RD RS1CL34JQ 837 0 0
GC
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GGCCGCACAAATTTATTTAAAAGTGAAAAACATACGAAATGAGGGAAATCACGAGCTTCA
CCAAAAGCAAGAATGAAACAGTGGATCAAATAAATATCAAGGCATCTGATCAACAATATC
AGCAACAGCGTCCTTGGACTCCTTCAACAGCTTGATACTGTTCTTAAGCTTCTCTCTCTT
GCTCGCCACCGAAGGAGACTCCTCAAGCATCTTCACAATAACGTCTCCTCCACCTCTGTG
ATTCAACAACTCCGCGACAACCTCCTTCTGAAACTGACTGTCGACAAATTTCTTCAAAGT
GAACTGTAGGTAGAGTGCAGTGTGGTCCACGATTCTTCGTATGACGATGGTCCAATAGGC
TGTGATCCTCATCTTCATGTCGAAAGCTTGATGCAGCAGTTCTGCATGATACTTCTTTAG
ATGCGTGACCGGAACAGTTCCGAATCCGGTTAAAGCGACATGATAATAGTTATTCACACA
ATTGATGAACCCTCCTTGTTCAGTCATACGCTGTGTGTAAACCTTTGTGTACTCTTGGTT
ACACGTGTAATCCGTCAGTTTCTCCATCAACGATCTCGGACACTCGGCTCACCGATTGTT
CTTTGATTTTAGAGATCAGTCTCCGACAAGCTCGTTTGATGGAACGTTGCAACTGAGGGA
AGTTTTCAGAGTAGTTGGTGATGACTGATGAGATAACAACCTCAACGGAGTCCATATCTC
TCTGATGAACCCGATGGGTTTAGCATGCATTGCGTCACACGTTGCGAGAGATAGC

QA 3 837 3 837
DS 



AS 1 3

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CACGCAACCTCTCACGACGGCTCATCCGTGGACTACCACAATGCTCACCGTGTCTACAAA
TGGGTCCGCTCCTCTCCCGCCAACCTCAAGCCTCTCGTTCACGCGCTTTCCTCTAGGGTT
AACCGCACAAGAAGCTGGACCGTCGCCGTGAAAGCCCTGATGCTTGTCCACGGTGTCCTT
TGCTGCAAAGTCACGTCCCTACAAGAGATTCGCCGCCTCCCTTTCGACCTATCTGATTTC
TCCGATGGTCATTCGCGTCCAAGCAAGACTTGGGGTTTCAACGCTTTTATCCGAGCCTAT
TTCTCGTTTCTTGACCAGTACGCTCTATTCTTTTCCGAACAAATGCGTGGCCGGGGCAAA
AAAACTCGGGAAGATTCTATTGAACAAGAGCTGGAGAGGATCCAGAACCTTCAGTCTCTT
CTCCATATGCTTCTCCAAATCCGTCCCATGGCTGAGAACATGAAGAAGACGCTTATCCTT
GAAGCCATGGACTGCGTTGTCCTCGAGATCTTTGACGTTTATGGAAGAATCTGCAGCGCG
ATCGCCAAGCTTCTCATCAAGATCCATCCAGGTGCTGAAAAAGATGAAGCTGTGATGGCT
CTCAAGATTGTAAAGAAGGCTACATCTCAAGGAGAAGACCTCGCCCTCTACTTTGAGTTC
TGCAAAGAGTTTGGTGTCTCAAACGCGCATGAAGTCCCTAAGTTTGTCAGGATCCCAGAA
GAAGACATTGAAGCAATCGAGAAAGCCATTAGAGGAGTCCAAGAAGAAGAGGAGACAAAG
GAGGAACAAGAGGAAGTAGAGGAAGAAAAGAGTATCATATTAGTGGAGAGACCAGAGTTC
AAGACAATCATAACTGATAAATGGGAAGTTTTCGAAGATGACTATTGTTTCACATGTAAA
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TTGCAGTGACCAGATTGATTTTTATTGTTTGGTTCTCTTCTGTTTGTAATATTCTTTTTG
TTGGATGTGGGGATGATAATAAACGTTAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C942TF U 1
AF RS1CH01TF U 206
AF RS1C942JQ C 498
BS 1 648 RS1C942TF
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BS 882 1230 RS1C942JQ

RD RS1C942TF 673 0 0
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TGGGTCCGCTCCTCTCCCGCCAACCTCAAGCCTCTCGTTCACGCGCTTTCCTCTAGGGTT
AACCGCACAAGAAGCTGGACCGTCGCCGTGAAAGCCCTGATGCTTGTCCACGGTGTCCTT
TGCTGCAAAGTCACGTCCCTACAAGAGATTCGCCGCCTCCCTTTCGACCTATCTGATTTC
TCCGATGGTCATTCGCGTCCAAGCAAGACTTGGGGTTTCAACGCTTTTATCCGAGCCTAT
TTCTCGTTTCTTGACCAGTACGCTCTATTCTTTTCCGAACAAATGCGTGGCCGGGGCAAA
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CTCCATATGCTTCTCCAAATCCGTCCCATGGCTGAGAACATGAAGAAGACGCTTATCCTT
GAAGCCATGGACTGCGTTGTCCTCGAGATCTTTGACGTTTATGGAAGA*TCTGCAGCGCG
ATCGCCAAGCTTC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RS1CH01TF 678 0 0
G
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CGTGAAAGCCCTGATGCTTGTCCACGGTGTCCTTTGCTGCAAAGTCACGTCCCTACAAGA
GATTCGCCGCCTCCCTTTCGACCTATCTGATTTCTCCGATGGTCATTCGCGTCCAAGCAA
GACTTGGGGTTTCAACGCTTTTATCCGAGCCTATTTCTCGTTTCTTGACCAGTACGCTCT
ATTCTTTTCCGAACAAATGCGTGGCCGGGGCAAAAAAACTCGGGAAGATTCTATTGAACA
AGAGCTGGAGAGGATCCAGAACCT*CAGTCTCTTCTCCATATGCTTCTCCAAATCCGTCC
CATGGCTGAGAACATGAAGAAGACGCTTATCCTTGAAGCCATGGACTGCGTTGTCCTCGA
GATCTTTGACGTTTATGGAAGAATCTGCAGCGCGATCGCCAAGCTTCTCATCAAGATCCA
TCCAGGTGCTGAAAAAGATGAAGCTGTGATGGCTCTCAAGATTGTAAAGAAGGCTACATC
TCAAGGAGAAGACCTCGCCCTCTACTTTGAGTTCTGCAAAGAGTTTGGTGTCTCAAACGC
GCATGAAGTCCCTAAGTTTGTCAG*ATCCCAGAAGAAGCCATTGAAGCAATCGAGAAAGC
CATTAGAGGAGTCCA
GA

QA 2 676 2 676
DS 

RD RS1C942JQ 733 0 0
CTA
TGAACAAGAGCTGGAGAGGATCCAGAACCTTCAGTCTCTTCTCCATATGCTTCTCCAAAT
CCGTCCCATGGCTGAGAACATGAAGAAGACGCTTATCCTTGAAGCCATGGACTGCGTTGT
CCTCGAGATCTTTGACGTTTATGGAAGAATCTGCAGCGCGATCGCCAAGCTTCTCATCAA
GATCCATCCAGGTGCTGAAAAAGATGAAGCTGTGATGGCTCTCAAGATTGTAAAGAAGGC
TACATCTCAAGGAGAAGACCTCGCCCTCTACTTTGAGTTCTGCAAAGAGTTTGGTGTCTC
AAACGCGCATGAAGTCCCTAAGTTTGTCAGGATCCCAGAAGAAGACATTGAAGCAATCGA
GAAAGCCATTAGAGGAGTCCAAGAAGAAGAGGAGACAAAGGAGGAACAAGAGGAAGTAGA
GGAAGAAAAGAGTATCATATTAGTGGAGAGACCAGAGTTCAAGACAATCATAACTGATAA
ATGGGAAGTTTTCGAAGATGACTATTGTTTCACATGTAAAGATATCAAAGAAACTGATCA
AGATAAAGACTATAACGTGGATGCGAATCTGCTGCCTCTTATAGTTATTGATGAGCCAGT
TCACTTCACTCACACGTTTCCTGATTTAATAACCTTCTAATTGCAGTGACCAGATTGATT
TTTATTGTTTGGTTCTCTTCTGTTTGTAATATTCTTTTTGTTGGATGTGGGGATGATAAT
AAACGTTAGA

QA 4 733 4 733
DS 



AS 1 3

CO CL3530Contig1 1076 3 8 U
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CATTGCAAACTTATATGAAAACATCATTTTTCCTCTTTAACATCATCATTTCACATTAAC
CACCGTTTATAAAAAGGTTTAAGGACACTTGGGTATGCCACCACGTGTCTTCATGTTGAC
GTAACAAGATCCACACTTTTCCTTATTACCGTACGTGCCAGGAGGAACGCACTTGCAGCG
GTAGCAGCACGTGACGCACGCTCTCATACATACGTTCTTCCTCGAGTGTTGCCCACATCG
AGTCCCACATAAAGACACGCAATCTATTCGAGGTCTCACAGGAGACGGTGTCGGAGGTTT
AGCTGGCGGCTTAACCGGAGGTGATGGAGTTGGGTTGACGGGTGGTTTGGATGGTGGTGG
AAACGTAGTCGGTGGTGCATTATATGGAGGTATTGGGGTTGGTTTAACCGGTGCTGTAGG
CGGTTTGACTGGTGGTATCGTGGGTGGTTTAACTGGTGGCGTTGGGGGTTTGTACATAGG
TGGTTGAACCGACGGTGGTTTGACCGGTGGTGTTGTCGGTGGTTTTAACCGTTGGCGTTG
GGGGTTTGTAAGTAGGTGGTGGTTTGACTGGTGCTATCGTTGGTGGCTTAACCGATGGCG
TTGGGGGTTTGTACGTAGGTTGAGGTTTGAGTGGTGGTGTCGTGGGTGGATTAACCGGTG
GCGTTGGGGGTTTGTATGTAGGTGGTTTGACCAGAGGTGATGTGGGTGGTTTAACTGGAG
GAGTTGGGTATGATGTAGCTGGTGGTTTTGTTGGTGTAGCCGGAGTGGTTGGTGGTTTAA
CCGGAGGTGTTACGGTGGGTGGTTTAATAGGAGTAGTAGGCAGTGAGGGTGGCTTGTATG
ACGGAGACGGTGGTTTGTTTGCCGGGGACGTCGGTGACGTTGGTAAAGAAACTAATGCAC
TGGATTCCTCTTTTGAAGCCGCAAAAACAACATTGGTAAAGACTGGAAGAAAAATGAAGA
CTGAAAGAAGCGGGAGAGACATGTTGTGAGAGATGAGGAGCGGTGCAGTCTCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ED27JQ U 44
AF RS1CG24JQ U 1
AF RS1CG24TF C 569
BS 1 421 RS1CG24JQ
BS 422 422 RS1ED27JQ
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BS 587 669 RS1CG24JQ
BS 670 1076 RS1CG24TF

RD RS1ED27JQ 410 0 0
AAGACAAAAATAAAACGCATTGCAAACTTATATGAAAACATCATTTTTCCTCTTTAACAT
CATCATTTCACATTAACCACCGTTTATAAAAAGGTTTAAGGACACTTGGGTCTGCCACCA
CGTGTCTTCATGTTGACGTAACAAGATCCACACTTTTCCTTATTACCGTACGTGCCAGGA
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GAGTGTTGCCCACATCGAGTCCCACATAAAGACACGCAATCTATTCGAGGTCTCACAGGA
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GGTTTGGATGGTGGTGGAAACGTAGTCGGTGGTGCATT*TATGGAGGTA
C

QA 1 409 1 409
DS 

RD RS1CG24JQ 669 0 0
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CATTGCAAACTTATATGAAAACATCATTTTTCCTCTTTAACATCATCATTTCACATTAAC
CACCGTTTATAAAAAGGTTTAAGGACACTTGGGTATGCCACCACGTGTCTTCATGTTGAC
GTAACAAGATCCACACTTTTCCTTATTACCGTACGTGCCAGGAGGAACGCACTTGCAGCG
GTAGCAGCACGTGACGCACGCTCTCATACATACGTTCTTCCTCGAGTGTTGCCCACATCG
AGTCCCACATAAAGACACGCAATCTATTCGAGGTCTCACAGGAGACGGTGTCGGAGGTTT
AGCTGGCGGCTTAACCGGAGGTGATGGAGTTGGGTTGACGGGTGGTTTGGATGGTGGTGG
AGACGTAGTCGGTGGTGCCTTATATGGAGGTATTGGGGTTGGTTTAACCGGTGCTGTAGG
CGGTTTGACTGGTGGTATCGTGGGTGGTTTAACTGGTGGCGTTGGGGGTTTGTACATAGG
TGGTTGAACCGACGGTGGTTTGACCGGTGGTGTTGTCGGTGGTTT*AACCGTTGGCGTTG
GGGGTTTGTAAGTAGGTGGTGGTTTGACTGGTGCTATCGTTGGTGGCTTAACCGATGGCG
TTGGGGGTT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RS1CG24TF 508 0 0
GGTGTTGTCGGTGGTTTTAACCGTTGGCGTTGGGGGTTTGTAAGTAGGTGGTGGTTTGAC
TGGTGCTATCGTTGGTGGCTTAACCGATGGCGTTGGGGGTTTGTACGTAGGTTGAGGTTT
GAGTGGTGGTGTCGTGGGTGGATTAACCGGTGGCGTTGGGGGTTTGTATGTAGGTGGTTT
GACCAGAGGTGATGTGGGTGGTTTAACTGGAGGAGTTGGGTATGATGTAGCTGGTGGTTT
TGTTGGTGTAGCCGGAGTGGTTGGTGGTTTAACCGGAGGTGTTACGGTGGGTGGTTTAAT
AGGAGTAGTAGGCAGTGAGGGTGGCTTGTATGACGGAGACGGTGGTTTGTTTGCCGGGGA
CGTCGGTGACGTTGGTAAAGAAACTAATGCACTGGATTCCTCTTTTGAAGCCGCAAAAAC
AACATTGGTAAAGACTGGAAGAAAAATGAAGACTGAAAGAAGCGGGAGAGACATGTTGTG
AGAGATGAGGAGCGGTGCAGTCTCATCC

QA 1 508 1 508
DS 



AS 1 2

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TCAAAGACTTACAAGATCCAGAAAAGCGAAAAGCTATGGATGACAAGATTAAACTCAAGG
AGGAACAAGAGGCTTTTAAGGCTGAATTACGCTCAATGCAAGAAGCAGCACAGTGGAGAA
GATCCCAAGGCATATCAATGGAAGGCGATGCAGAGCTCTTAGCAGCAACCGAGGTTAAAC
CTGTACCTAAAAGAGACGAGTGGATGACGACCCTTCCTCCTGAAAGAAAGACCGGGGTGC
CTGTGCAGCAATCAACCACGACATTTAGCAGAAATGCTAGAGAAGGACGCGGAGACACTA
CAGCCTGGACTGATACTCCTATGGACAAAGCTGAAAGAGCAAAGATGAACTACTTAGAGG
CGTACAACAAGGCGAATGCGCTTGCTTCAAATGAAGAGGTGAATATGAAAAGAAGCCTAG
ATGCTGATCTTGTGGACAAGTACAACAAAGAGAAAAGATCAAAGTCTTTGGTAGAGAAGC
ACAGGGAAGAGTCTACTTCTTCATCTTCAAGCCGTCTCAAGAAGAAGAAGAAATTGTCTT
CGTCTTTGTCTTCGTCCAAAGAGAAAAATGAAAAGGACGAGTGGGTGGGGAACCATCCAT
GGCTGAAGGTTTGGCTTCCAAGTTTTCTTCTGGGAATTTCCAAAGAAGCTTTCTTTGAAG
CTCTTGTTTCCATGTTATGAGACATGTATTGCAGAAAATTTATTTTAGACTGACTATACA
AATAAGTCTTTTTTTTTCTCTCTTGGTGGGAAATTTACAAAAGAAACGTATTTTATATTC
TACCAAATTTATTTTACTTTTGTATGTTGTCTCTTTCAGCAAATCATACATAGCAAATTA
TACTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E675TF U 1
AF RS1E675JQ C 251
BS 1 627 RS1E675TF
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BS 629 663 RS1E675TF
BS 664 907 RS1E675JQ

RD RS1E675TF 663 0 0
GACCCAGACAAATGCTCTCATCCGCAAGCTCAGGAAGCTTTCGTTTTACTAATAAAGCTT
TCAAAGACTTACAAGATCCAGAAAAGCGAAAAGCTATGGATGACAAGATTAAACTCAAGG
AGGAACAAGAGGCTTTTAAGGCTGAATTACGCTCAATGCAAGAAGCAGCACAGTGGAGAA
GATCCCAAGGCATATCAATGGAAGGCGATGCAGAGCTCTTAGCAGCAACCGAGGTTAAAC
CTGTACCTAAAAGAGACGAGTGGATGACGACCCTTCCTCCTGAAAGAAAGACCGGGGTGC
CTGTGCAGCAATCAACCACGACATTTAGCAGAAATGCTAGAGAAGGACGCGGAGACACTA
CAGCCTGGACTGATACTCCTATGGACAAAGCTGAAAGAGCAAAGATGAACTACTTAGAGG
CGTACAACAAGGCGAATGCGCTTGCTTCAAATGAAGAGGTGAATATGAAAAGAAGCCTAG
ATGCTGATCTTGTGGACAAGTACAACAAAGAGAAAAGATCAAAGTCTTTGGTAGAGAAGC
ACAGGGAAGAGTCTACTTCTTCATCTTCAAGCCGTCTCAAGAAGAAGAAGAAATTGTCTT
CGTCTTTGTCTTCGTCCAAAGAGAAAA*TGAAAAGGACGAGTGGGTGGGGAACCATCCAT
GGC

QA 1 663 1 663
DS 

RD RS1E675JQ 657 0 0
AAGAGACGAGTGGATGACGACCCTTCCTCCTGAAAGAAAGACCGGGGTGCCTGTGCAGCA
ATCAACCACGACATTTAGCAGAAATGCTAGAGAAGGACGCGGAGACACTACAGCCTGGAC
TGATACTCCTATGGACAAAGCTGAAAGAGCAAAGATGAACTACTTAGAGGCGTACAACAA
GGCGAATGCGCTTGCTTCAAATGAAGAGGTGAATATGAAAAGAAGCCTAGATGCTGATCT
TGTGGACAAGTACAACAAAGAGAAAAGATCAAAGTCTTTGGTAGAGAAGCACAGGGAAGA
GTCTACTTCTTCATCTTCAAGCCGTCTCAAGAAGAAGAAGAAATTGTCTTCGTCTTTGTC
TTCGTCCAAAGAGAAAAATGAAAAGGACGAGTGGGTGGGGAACCATCCATGGCTGAAGGT
TTGGCTTCCAAGTTTTCTTCTGGGAATTTCCAAAGAAGCTTTCTTTGAAGCTCTTGTTTC
CATGTTATGAGACATGTATTGCAGAAAATTTATTTTAGACTGACTATACAAATAAGTCTT
TTTTTTTCTCTCTTGGTGGGAAATTTACAAAAGAAACGTATTTTATATTCTACCAAATTT
ATTTTACTTTTGTATGTTGTCTCTTTCAGCAAATCATACATAGCAAATTATACTATC

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 3

CO CL3532Contig1 971 3 23 U
GGGGAGAAGGATTAAAAACTCGTAGTTTGGCTTTCAACAATCTGCGCACGACGACGACGA
CGATCATGGCGCCGATTCTCAGATCCACGTCCCTTCTCGCTTTGCACGTCTTTCAGATTT
CTCTCTTCTTCTTTGCCTCTACTCTGCCAACCTCGTCTGGGACTGAGGATAGTTACACGA
TCACGGGTCGTGTAAGGATCCCAGCAAGCACTGCGATTGGTCACGCAGCAAAATTCTCAA
ATATCAAAGTTGTCCTCAATGGTGGACAGAATATTACTTTCCTCAGGCCTGATGGCTACT
TTACATTCCACAAAGTGACAGCTGGGACCCATCTGATTGAAGTCTATGCGTTGGGCTTCT
TCTTCTCTCCAGTGCGAGTTGATGTTAGCGCTAGGCACCATGGCAAGGTTCAAGCAACAC
TAACAGAAACCAGGAGGAGTCTTACCGAGCTGGTTTTGGAGCCTCTACGGGCAGACCAAT
ACTATGAGATGCGTGAACCTTTCAATGTAGCGGCAATTTTGAAAAGTCCAATGGGTCTTA
TGGTGGGATTCATGGTTGTTGTTGTGTTCTTAATGCCCAAGTTGATGGAGAACATAGATC
CAGAGGAAATGAAGAGAACACAAGAGGAGCTGAGAAACCAAGGAGTGCCTTCACTCTCTA
GCTTGTTGCCCGCTAGCCGCTAAGGAGATCTCCTCAGCACTAATCAAAAGTCCCAAGACC
CAGAACTTCTTGCATGTACCGGCATAACACTTCTGACGAGCATTTGGAAGAAATCAACGT
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GCATCATTTGGGTTTGGACTGTTGTTAGATGTGACACTCAAGCTGACCTTTAAATCTGCT
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BQ
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GG
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AF RS1DW02TF U 1
AF RS1EI10TF U 456
AF RS1EI10JQ C 496
BS 1 647 RS1DW02TF
BS 648 1129 RS1EI10TF
BS 1130 1130 RS1EI10JQ
BS 1131 1170 RS1EI10TF
BS 1171 1171 RS1EI10JQ
BS 1172 1219 RS1EI10TF

RD RS1DW02TF 647 0 0
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TGCCTTTTTTCTACTAATCTTTTCTAGAAATTTATAAAGCAAAACCGAAGAGATATAAGC
CGAGGAGGAGAAAAGCAGGCGTTGTTTGTTGTTTTGTTCATCTCTGTTTCCAAGAACCAA
ACTTTGGATTCTCTGTTCTTCTTCTTCTTTTTGTAATAATTTCTTTATCGAGAGAGAAGG
GGGTTAACTAAGAGATGTATTATCAGTTGACAAAGTCTTCTTACATGGACTCTTCGAAGA
TTCTTGAGGCTGACATCGAGCACGCCAATGGACTGGCTGCTGAGATTCCCATGGGAAAGA
GCGGTGTCCGACTTCAGATGAAACTGGTTGCAGCAATTTGGCTCCTTTCTTCATATTCCT
TCTTCAATGGATGGACTTCTCATGTCTGCTTCCAAGATATTTTGATTTCTTCCACATACT
CATTTACAAGGTACGTTCTGATGGGCGTTGGAATCTATCCAGGTACGGAAGGAAAGCTAC
AATCAGAGAGTTTTACGGTGTTATATTACCATCACTCGAGCGTCTTCATATCAACTTCTC
CGACTTACCAGGCGACAGCGTATGGTACTCGAATCCAAAAGCCATCG

QA 1 647 1 647
DS 

RD RS1EI10TF 764 0 0
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TATCCAGGTACGGAAGGAAAGCTACAATCAGAGAGTTTTACGGTGTTATATTACCATCAC
TCGAGCGTCTTCATATCAACTTCTCCGACTTACCAGGCGACAGCGTATGGTACTCGAATC
CAAAAGCCATCGCCAAGAAGAATTACGACGTTGAAGACAACAGATTCATCATGACCAACG
TTGACTCGGAAGAAAGAGAAGAGGAATGCGGGATCTGCTTAGAGCCGTGCACCAAAATGG
TGTTACCTAACTGCTGTCACGCCATGTGCATCAAGTGCTACAGGAACTGGAACACGAAGT
CCGAGTCGTGCCCGTTTTGTAGAGGCAGCATCAAGAGAGTGAACTCGGAGGATCTGTGGG
TGCTGACGTGCGATTAAGATGTGGTGGATCCAGAGACGGTCACGAAAGAGGATTTGCTGC
GGTTCTACCTCCACATCAATAGCCTCCCTAAAGATTATCCGGAAGCCGTCTTCTTAGGCT
ACAACGAGTACTTGATATGATGATTTTATCAACATCACACGGGTGGGGTGTACAGAGAGG
GAAAGATCCCGGACCTTTTAACTAAGTGTATATAAAGAATCTGGTGATCCATGATTTAAT
CCTTCGTCTTTTAG*TTATGATAAGAATAAGATGATTGTCATGAAATATGTGTACTCTTG
TTATGATATATATATAAGAGAGACTATGATCTCTGTTTACATAA

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1EI10JQ 722 0 0
TTCTGATGGGCGTTGGAATCTATCCAGGTACGGAAGGAAAGCTACAATCAGAGAGTTTTA
CGGTGTTATATTACCATCACTCGAGCGTCTTCATATCAACTTCTCCGACTTACCAGGCGA
CAGCGTATGGTACTCGAATCCAAAAGCCATCGCCAAGAAGAATTACGACGTTGAAGACAA
CAGATTCATCATGACCAACGTTGACTCGGAAGAAAGAGAAGAGGAATGCGGGATTTGCTT
AGAGCCGTGCACCAAAATGGTGTTACCTAACTGCTGTCACGCCATGTGCATCAAGTGCTA
CAGGAACTGGAACACGAAGTCCGAGTCGTGCCCGTTTTGTAGAGGCAGCATCAAGAGAGT
GAACTCGGAGGATCTGTGGGTGCTGACGTGCGATTAAGATGTGGTGGATCCAGAGACGGT
CACGAAAGAGGATTTGCTGCGGTTCTACCTCCACATCAATAGCCTCCCTAAAGATTATCC
GGAAGCCGTCTTCTTAGGCTACAACGAGTACTTGATATGATGATTTTATCAACATCACAC
GGGTGGGGTGTACAGAGAGGGAAAGATCCCGGACCTTTTAACTAAGTGTATATAAAGAAT
CTGGTGATCCATGATTTAATCCTTCGTCTTTTAGGTTATGATAAGAATAAGATGATTGTC
ATGAAATATGTGTACCCTTGTTATGATATATATATAAGAGAGACTATGATCTCTGTTTAC
AT

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL3534Contig1 1071 2 4 U
GGACAACACAAAACTTCAAACATCAATCAAAGCCTTATACTCTCTTTCCAAAAAAAAGAA
AAAAAAAATCAAATGGAAGACATATCAGTGAGCAAAAGCAACAATGGAAATGTTGTTGTA
CTCAACATCCAAGCTCCTCCTGTCTCAAAAACTCCACTGCCTTCTTCTCCACCATTGTTA
TCTGTCCACTTCTTGCAAAAGCTTATAGCAGAACTCGTGGGAACTTACTACTTGATATTT
GCGGGTTGTGCCGCTATTGCCGTGAACGCTCAACACAACCATGTTGTGACTCTTGTAGGC
ATTGCAGTGGTTTGGGGTCTAGTGGTGATGGTTCTTGTTTACACTCTAGGCCACATCTCA
GCACATTTCAATCCGGCTGTCACTATCGCCTTGGCATCTTGCAAGAGATTCCCTCTGTAT
CAACTCCCAGCCTACATAACTGTTCAAGTCATCGGATCAACCTTGGCTTCTGCGACTCTG
CGTCTTCTGTTTGACCTAAACAATGACGTGTGCAGCAAGAAACACGATGTCTTCCTCGGA
TCATCTCCTTCTGGGACTGACCTTCAAGGATTCGTGATGGAGTTCATCATCACCGGCTTC
CTTATGATAGTTATATGTGCCGTCACAACCTCCAAGAAAACAACCAAGGAACTAGAGGGT
TTAATCATTGGTGCAACCGTCACACTGAATGTTATCTTTGCAGGAGAGGTATCAGGAGCA
TCGATGAATCCAGCAAGAAGCATAGGGCCGGCACTTGTGTGGGGATGTTACAAAGGGATC
TGGATTTACTTGCTGGCTCCAACACTTGGAGCTGTTTCTGCGGCCTTGATTCATAAACTG
TTACCGTCTACAGAGAAAGCAATCCCTGAGTTCTCCAAGACAGGGTCTTCACATAAAAGA
GTTACAGATCTTCCTTTGTGATGATTGTAGATAAATCTTTAAGGCCAATCCTCGTTCTTG
TATCTTAAAATATGTTGAACAATCCTTATTGTATGTAATACTGTATAGTGTTCGATTTGT
AAGAATTTATTTGTTTTTAATAAAGAAAGATATAGAGGCACGAGCCTCGAG


BQ
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AF RS1GE33TF U 1
AF RS1FN57JQ C 481
BS 1 521 RS1GE33TF
BS 522 522 RS1FN57JQ
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BS 649 1071 RS1FN57JQ

RD RS1GE33TF 652 0 0
GGACAACACAAAACTTCAAACATCAATCAAAGCCTTATACTCTCTTTCCAAAAAAAAGAA
AAAAAAAATCAAATGGAAGACATATCAGTGAGCAAAAGCAACAATGGAAATGTTGTTGTA
CTCAACATCCAAGCTCCTCCTGTCTCAAAAACTCCACTGCCTTCTTCTCCACCATTGTTA
TCTGTCCACTTCTTGCAAAAGCTTATAGCAGAACTCGTGGGAACTTACTACTTGATATTT
GCGGGTTGTGCCGCTATTGCCGTGAACGCTCAACACAACCATGTTGTGACTCTTGTAGGC
ATTGCAGTGGTTTGGGGTCTAGTGGTGATGGTTCTTGTTTACACTCTAGGCCACATCTCA
GCACATTTCAATCCGGCTGTCACTATCGCCTTGGCATCTTGCAAGAGATTCCCTCTGTAT
CAACTCCCAGCCTACATAACTGTTCAAGTCATCGGATCAACCTTGGCTTCTGCGACTCTG
CGTCTTCTGTTTGACCTAAACAATGACGTGTGCAGCAAGAA*CACGATGTCTTCCTCGGA
TCATCTCCTTCTGGGACTGACCTTCAAGGATTCGTGATGGAGTTCATCATCACCGGCTTC
CTTATGATAGTTATATGTGCCGTCACAACCTCCAAGAAAACAACCAAG
AACT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1FN57JQ 591 0 0
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TCATCTCCTTCTGGGACTGACCTTCAAGGATTCGTGATGGAGTTCATCATCACCGGCTTC
CTTATGATAGTTATCTGTGCCGTCACAACCTCCAAGAGAACAACCAAGGAACTAGAGGGT
TTAATCATTGGTGCAACCGTCACACTGAATGTTATCTTTGCAGGAGAGGTATCAGGAGCA
TCGATGAATCCAGCAAGAAGCATAGGGCCGGCACTTGTGTGGGGATGTTACAAAGGGATC
TGGATTTACTTGCTGGCTCCAACACTTGGAGCTGTTTCTGCGGCCTTGATTCATAAACTG
TTACCGTCTACAGAGAAAGCAATCCCTGAGTTCTCCAAGACAGGGTCTTCACATAAAAGA
GTTACAGATCTTCCTTTGTGATGATTGTAGATAAATCTTTAAGGCCAATCCTCGTTCTTG
TATCTTAAAATATGTTGAACAATCCTTATTGTATGTAATACTGTATAGTGTTCGATTTGT
AAGAATTTATTTGTTTTTAATAAAGAAAGATATAGAGGCACGAGCCTCGAG

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 3

CO CL3535Contig1 1299 3 9 U
AGGGTGAGGAGCACTGTGGTTACTTGCTTTGCTGGTATTACATCATCCGTATTTGTTTCT
TTCAGTCAGAAGGAAAGGGACTTTGTTACTTCATCAATTATAAACTCTGCATTGCATGAC
AAATCACCTTCAGTCAGATCAGCAGCTTGCCGAGCTATTGGCGTAATTTCATGTTTTCCA
GAAACTTCTTTAAGTATTGGGATATATGAAAAGTTTATCTTAGCTGTTGAAGCGAACACC
CGCGATCCCCTAACTCGGTGCGTGTAACATCATCCTGGGCTTTGGCCAATGTATGTGAAG
CTCTGCGTTACCGCGTCAATGATAGGTCCCTTGAAGGTTCAAATACAACTTCACAAGTCG
TGGACTCGCTAATAGAATGTGCTTTGCGCCTTACTGAAGATGGGGACAAGGTCAAAGCCA
ATGCAGTTCGAGCACTGGGGAGTATTTCTAAATATGTAAAATTGAGATGCATGACAAGTA
ACCACGAGGCTTTACCTTCCCCCCATCACCATTTATCTTGCGCGGTAGATTCAAGCTGGT
TGGAGAGAACTGTGCAAGCATTTCTTTCTTGTGTTACTACTGGTAATGTTAAGGTTCAAT
GGAATGTTTGTCATGCGTTAAGCAATTTATTCTCCAATGAGACAGTAAAACTACAAGATA
TGGACTGGGCTCCAAGTGTTTTTAGTATTCTACTATTGCTGCTTCGTGATGCATCAAACT
TTAAGATAAGAATACAAGCTGCTGCCGCTTTAGCTGTTCCTGTAACCCCACTTGCTTATG
GGAGATCATTCCCTGATGTTGTCAAAGGTGTGTGGCATACTTTACAGAATCTGAATTCCG
ATAGAGAGACGACACCAACAAATTTCAAATATAAGAGATCGCTTGAGAATCAGTTAACCT
CGACCATGCTGCATCTCCTTAGCCTAGTTTCAAGCGGTCGTTGTGAAGCGTTGACAGACT
TTCTTCTAAAAAAAGCCTCTTTTCTAGAAGAGTGGTTAAGAGGATTGTGTGTTACATTGA
AGGAGGAAGACAATGCGTCGGGATCATCAAGCAGCACGAGCACTTCGGGTGAGAAGCAAA
AAAAAGAGTTGATCTCTAAAGCTATACGGTCACTTGCCAGTAGCCTAGAGGCTGGGCGTG
TCCCTGAAGTGGCTCTAAAGTTGCAAGAGCTAGATAGCAATGTGAATTGATATAGCAGGC
TACGTTTTCGGGTTATATTCGCCCTGTTGTAACTCAAGTATACAATTCAACAAATGTACA
TTACCTCCGTGACAAATTTTGTTATGTGCCGATATATAG


BQ
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BQ
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TATCTCACAGCCAATTGCCAAGGGACTGTACCAGTATTTCTCAGATGGATGGAGCGATTC
TAAGAAGTGTTCCTCTCCGTAAAAGAAAGAAGACACGTTTCTCTTTGGGACTCACCGATG
AAACTCGAAG

QA 1 670 1 670
DS 

RD RS1GR31TF 704 0 0
GGATGGAGGCTTGGTTGAATACTTCTTTGGAAAAGATGGCAGTGACAAACTTAGGCACGA
TAAATTCACTCAGTTTTTGAAGGATCTAACTGAAGAAATGCTGAGGCTGGAGTTTGCGCA
TTATGACTATAAACGAAGAGGAACTATATCAGCCAAGGATTTTGCACTGTCCATGGTAGC
TGCGGCTGATGCAAGCCATTTGGGCAAGCTGCTTGATCGAGTGGAGGATCTGAGCGAACA
CCCGCATCTCCGGGACATGCGTATCTCGTTAAAGGAATTCAAACAGTTTGCTGAGCTACG
CACTAAACTTGGGCCGTTTTCTCTCGCGCTTTTCGCTTATGGCAAAGCCAATGGTTTACT
TACAATGAAAGATTTCAAAAGAGCCGCCTCTCAGGTATGTGGAGTATCATTGTCAGACAA
TGTTATAGAGATTGCGTTTCATGTGTTTGATTCGAATAGAGATGGGAATTTGAGTGTTT*
*GAGTTTCTGAGGGTTCTACATAGAAGAGAGAAGGATATCTCACAGCCAATTGCCAAGGG
ACTGTACCAGTATTTCTCAGATGGATGGAGCGATTCTAAGAAGTGTTCCTCTCCGTAAAA
GAAAGAAGACACGTTTCTCTTTGGGACTCACCGATGAAACTCGAAGACTAATGTTTTTGC
GCGTCTCTTGGGTTCATAGGAGTGAGCCCAGAGATTT
ATTAATC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RS1G874JQ 423 0 0
TCTCGCGCTTTTCGCTTATGGCAAAGCCAATGGTTTACTTACAATGAAAGATTTCAAAAG
AGCCGCCTTTCAGGTATGTGGAGTATCATTGTCAGACAATGTTATAGAGATTGCGTTTCA
TGTGTTTGATTCGAATAGAGATGGGAATTTGAGTGTTGAAGAGTTTCTGAGGGTTCTACA
TAGAAGAGTGAAGGATATCTCCCAGCCAATTGCCAAGGGACTGTACCAGTATTTCTCAGA
TGGATGGAGCGATTCTAAGAAGTGTTCCTCTCCGTAAAAGAAAGAAGACACGTTTCTCTT
TGGGACTCACCGATGAAACTCGAAGACTAATGTTTTTGCGCGTCTCTTGGGTTCATACGA
GTGAGCCCAGAGATTTTATTAATCCACGGTTGCATTGTGTAAGAAAGAAATCTGAATAAA
TCT

QA 1 423 1 423
DS 



AS 1 3

CO CL3537Contig1 931 3 4 U
GGGATAACCCTAATTTTCACACGACCAAGGAGAAGCCGTCTCGCTCTTCCCACCACCGCT
GATTACTTGAGATGTCGCGTGTGTACGTTGGTAATTTGGATCCGCGAGTTACTGAGCGTG
AGCTCGAAGATGAGTTTCGTGTCTATGGAGTCATCAAGAGTGTTTGGGTTGCAAGACGTC
CACCTGGTTATGCCTTTCTTGATTTTGAAGACTCAAGAGACGCCCGTGACGCTATCCGTG
ATTTAGATGGCAAAAATGGATGGAGGGTAGAGGAGTCTCATAACCGAGGTGGTGGAGGAG
GCCGTGGTGGTCGTGGAGGAGGAGATGGTGGTCGTGGCCGTGGTGGCTCTGATTTGAAGT
GCTATGAGTGTGGCGAGCCTGGTCACTTTGCACGTGAGTGCCGCTCTCGTGGCGGTGACG
GGAGGCGCCGCAGTCCTTCTCCTCGTGGTCGCAGTCCTCCTAGATACAGGAAGAGCCCAA
CCTATGGAGAAAGGCGCAGGAGTTACAGCCCTCGTGCAAGATCTCCTCCTCCTCCGAGGC
GTCGCAGTCCTTCTCCTCGTGGACGCAACTACAGTAGGTCACCTCCACCTTACAGAGGAC
GTGAGGAGGTGCCATATACTAATGGAAATGGTCTGAAAGATGTGCGCAGAAGCCGGAGCT
GAATGTTAAGGGATGGATGAGGAAAACTACTGTTTGCTTGCGACGTCAAGAAGACAGCTT
AAGGAAAACTAATATATGTATTTCACTTAAAGAACCATTTTTTAGCTGTTGGGTGGATTG
GATATGCTTTGCTACTTTTGTCTGCCGTGGTTATGTCTACCGTTAGGTAAACGTATTTTA
ATATTCCTACTTAAGTTCTTAAAACAGAAGTTCTGAGTGTTTTGTTTTATTATGTCGAGG
TTTCTTCCGTGTTTCTACTGCTTCATTGATT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DY43TF U 4
AF RS1AO24TFB U 1
AF RS1AO24JQ C 66
BS 1 577 RS1AO24TFB
BS 578 578 RS1AO24JQ
BS 579 647 RS1AO24TFB
BS 648 931 RS1AO24JQ

RD RS1DY43TF 493 0 0
GG
AACCCTAATTTTCACACGACCAAGGAGAAGCCGTCTCGCTCTTCCCACCACCGCTGATTA
CTTGAGATGTCGCGTGTGTACGTTGGTAATTTGGATCCGCGAGTTACTGAGCGTGAGCTC
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GGTTATGCCTTTCTTGATTTTGAAGACTCAAGAGACGCCCGTGACGCCATCCGTGATTTA
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GGTGGTCGTGGAGGAGGAGATGGTGGTCGTGGCCGTGGTGGTTCTGATTTGAAGTGCTAT
GAGTGTGGCGAGCCTGGTCACTTTGCACGTGAGTGCCGCTCTCGTGGCGGTGGCGGGAGG
CGCCGCAGTCCTTCTCCTCGTGGTCGCAGTCCTCCTAGATACAGGAAGAGCCCAACCTAT
GGAGAAAGGCG

QA 3 493 3 493
DS 

RD RS1AO24TFB 647 0 0
GGGATAACCCTAATTTTCACACGACCAAGGAGAAGCCGTCTCGCTCTTCCCACCACCGCT
GATTACTTGAGATGTCGCGTGTGTACGTTGGTAATTTGGATCCGCGAGTTACTGAGCGTG
AGCTCGAAGATGAGTTTCGTGTCTATGGAGTCATCAAGAGTGTTTGGGTTGCAAGACGTC
CACCTGGTTATGCCTTTCTTGATTTTGAAGACTCAAGAGACGCCCGTGACGCTATCCGTG
ATTTAGATGGCAAAAATGGATGGAGGGTAGAGGAGTCTCATAACCGAGGTGGTGGAGGAG
GCCGTGGTGGTCGTGGAGGAGGAGATGGTGGTCGTGGCCGTGGTGGCTCTGATTTGAAGT
GCTATGAGTGTGGCGAGCCTGGTCACTTTGCACGTGAGTGCCGCTCTCGTGGCGGTGACG
GGAGGCGCCGCAGTCCTTCTCCTCGTGGTCGCAGTCCTCCTAGATACAGGAAGAGCCCAA
CCTATGGAGAAAGGCGCAGGAGTTACAGCCCTCGTGCAAGATCTCCTCCTCCTCCGAGGC
GTCGCAGTCCTTCTCCTCGTGGACGCAACTACAGTAG*TCACCTCCACCTTACAGAGGAC
GTGAGGAGGTGCCATATACTAATGGAAATGGTCTGAAAGATGTGCGC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RS1AO24JQ 866 0 0
CTTGAGATGTCGCGTGTGTACGTTGGTAATTTGGATCCGCGAGTTACTGAGCGTGAGCTC
GAAGATGAGTTTCGTGTCTATGGAGTCATCAAGAGTGTTTGGGTTGCAAGACGTCCACCT
GGTTATGCCTTTCTTGATTTTGAAGACTCAAGAGACGCCCGTGACGCTATCCGTGATTTA
GATGGCAAAAATGGATGGAGGGTAGAGGAGTCTCATAACCGAGGTGGTGGAGGAGGCCGT
GGTGGTCGTGGAGGAGGAGATGGTGGTCGTGGCCGTGGTGGCTCTGATTTGAAGTGCTAT
GAGTGTGGCGAGCCTGGTCACTTTGCACGTGAGTGCCGCTCTCGTGGCGGTGACGGGAGG
CGCCGCAGTCCTTCTCCTCGTGGTCGCAGTCCTCCTAGATACAGGAAGAGCCCAACCTAT
GGAGAAAGGCGCAGGAGTTACAGCCCTCGTGCAAGATCTCCTCCTCCTCCGAGGCGTCGC
AGTCCTTCTCCTCGTGGACGCAACTACAGTAGGTCACCTCCACCTTACAGAGGACGTGAG
GAGGTGCCATATACTAATGGAAATGGTCTGAAAGATGTGCGCAGAAGCCGGAGCTGAATG
TTAAGGGATGGATGAGGAAAACTACTGTTTGCTTGCGACGTCAAGAAGACAGCTTAAGGA
AAACTAATATATGTATTTCACTTAAAGAACCATTTTTTAGCTGTTGGGTGGATTGGATAT
GCTTTGCTACTTTTGTCTGCCGTGGTTATGTCTACCGTTAGGTAAACGTATTTTAATATT
CCTACTTAAGTTCTTAAAACAGAAGTTCTGAGTGTTTTGTTTTATTATGTCGAGGTTTCT
TCCGTGTTTCTACTGCTTCATTGATT

QA 1 866 1 866
DS 



AS 1 2

CO CL3538Contig1 744 2 1 U
GGCCGTAAAAACGTTTTAGATAACGTCGATTAGACTCTCCAAAAAACGTTGCTCTAACCT
CTCATTACAGAAACACCTGATCTCTAATTCTGGTGCGGCGTCCGCCGTAGTCGGAGGCTT
TCTTTCATCTCTTCCTTTTTTTTTTTTTGCTTTTCTCTTCATCGTTTTCTATTTGTTTCT
TTGCATATCGTTTTGGAAATTGTGAATCAACCGAAGATTCGTAGTGCTTCAACGACGATG
GTTTACTGCTACCTCTGGAACAACGGCGAGATCTGTAGACGGCAGTAGATGCGAGAGTCG
GTTTTTAGGCTGAAAAAGGAGACAGATCTAGTTTTTCCATTTTTTAGATCTGCAGCAAAT
CCTTCAAAACGGCGGCGCATGGTGAGGCGAGGCCTAGATCTCCCTTCCTGTCCGGCGGTG
AGACGATTGGAGGAGAAAAAACGATAGCGAGTGAAAAATGATGTGACTTCTGGTTCTCAG
AGCAACATGTGTCAAGGCTCATGACGTCGGCGTAGTCAACCGGTGGAATTAACCTTACAA
CGGCATGTGGCAGAGGCTCTGCATCCCAGCACCGGAGAGGACGTTCAGTTCACAACCGGC
GGCAAGAGTTCTGCACCGTTGGAAGCTTTGGATTTGCGGTGCCTATTAGTGTCGCTGTTA
AAGTCCGCCTTTTCAGTACGGATACATGTCCGCTTTGTGGCTGAGATCGAACATCAAACC
CGGAGATGTGAGCTGAGCCTCGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D617TF U 62
AF RS1CC15TF U 1
BS 1 744 RS1CC15TF

RD RS1D617TF 397 0 0
G
CATTACAGAAACACCTGATCTCTAATTCTGGTGCGGCGTCCGCCGTAGTCGGAGGCTTTC
TTTCATCTCTTCCTTTTTTTTTTTTTGCTTTTCTCTTCATCGTTTTCTATTTGTTTCTTT
GCATATCGTTTTGGAAATTGTGAATCAACCGAAGATTCGTAGTGCTTCAACGACGATGGT
TTACTGCTACCTCTGGAACAACGGCGAGATCTGTAGACGGCAGTAGATGCGAGAGTCGGT
TTTTAGGCTGAAAAAGGAGACAGATCTAGTTTTTCCATTTTTTAGATCTGCAGCAAATCC
TTCAAAACGGCGGCGCATGGTGAGGCGAGGCCTAGATCTCCCTTCCTGTCCGGCGGTGAG
ACGATTGGAGGAGAAAAAACGATAGCGAGTGAAAAA

QA 2 397 2 397
DS 

RD RS1CC15TF 744 0 0
GGCCGTAAAAACGTTTTAGATAACGTCGATTAGACTCTCCAAAAAACGTTGCTCTAACCT
CTCATTACAGAAACACCTGATCTCTAATTCTGGTGCGGCGTCCGCCGTAGTCGGAGGCTT
TCTTTCATCTCTTCCTTTTTTTTTTTTTGCTTTTCTCTTCATCGTTTTCTATTTGTTTCT
TTGCATATCGTTTTGGAAATTGTGAATCAACCGAAGATTCGTAGTGCTTCAACGACGATG
GTTTACTGCTACCTCTGGAACAACGGCGAGATCTGTAGACGGCAGTAGATGCGAGAGTCG
GTTTTTAGGCTGAAAAAGGAGACAGATCTAGTTTTTCCATTTTTTAGATCTGCAGCAAAT
CCTTCAAAACGGCGGCGCATGGTGAGGCGAGGCCTAGATCTCCCTTCCTGTCCGGCGGTG
AGACGATTGGAGGAGAAAAAACGATAGCGAGTGAAAAATGATGTGACTTCTGGTTCTCAG
AGCAACATGTGTCAAGGCTCATGACGTCGGCGTAGTCAACCGGTGGAATTAACCTTACAA
CGGCATGTGGCAGAGGCTCTGCATCCCAGCACCGGAGAGGACGTTCAGTTCACAACCGGC
GGCAAGAGTTCTGCACCGTTGGAAGCTTTGGATTTGCGGTGCCTATTAGTGTCGCTGTTA
AAGTCCGCCTTTTCAGTACGGATACATGTCCGCTTTGTGGCTGAGATCGAACATCAAACC
CGGAGATGTGAGCTGAGCCTCGAG

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 3

CO CL3539Contig1 801 3 2 U
GGACTCGAATCTGCGTACAAATCACGAACACGTTGAACTCCTTTTGCTCTCCTCTCTCTC
TCTCTCAAACCCTACGATCTTCCTCAAGATTCGATAATGAAAGGAGGCAAATCAAAGACC
GAGACCAGGAGCTCTAAGCTGTCTGTGACCAAGAAGCCTGCCAAGGCAGCAGGCCGTAGC
AAAGCGGCTGCTAAGGATCCAAACAAACCAAAGAGGCCTGCCAGTGCCTTCTTCGTTTTC
ATGGAAGACTTCCGTCAGACTTTCAAGAAGGAACACCCCAAGAACAAATCTGTTGCTGCT
GTTGGAAAAGCTGCTGGAGACAAGTGGAAATCCTTATCAGACGCTGAGAAGGCACCTTAC
GTTGCTAAGGCTGAGCAGCGCAAGGTCGACTATGAGAAGAACATGAAGGCCTACAACAAG
AAACAGGAGGAAGGCCCGAAGGAAGAAGAAGAATCTGACAAGTCAGTCTCAGAAGTTAAT
GATGAAGATGATGCTGAGGATGGTAGTGATGAGGAGGAGGACGATGACTAATAAGGTTGA
AGTTTGTAACATTAGTATAGATGGCTGCAAAGATCTCTCTCTGTTTTCTTTAATCTTAAA
ATGTTTATGGGGCTGATTAAAAGGTGTCTTTTATCTTTCTTTTCGTTTTGGTACTTCCCA
CAATCTATATCACATGTTACCAAGCCCTTTGTATGGAGAAAGTGAAATGTAGAATGTTTA
GATGGTGAAAGAGAGACATGCAGCTCTGTACTCTTGTGTTCTATAAAACGATTTACCTTC
TCTCAGTCTATTTTTTCTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1G004TF U 1
AF RS1B944JQ C 177
AF RS1B944TF U 177
BS 1 724 RS1G004TF
BS 725 801 RS1B944TF

RD RS1G004TF 724 0 0
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AAACAGGAGGAAGGCCCGAAGGAAGAAGAAGAATCTGACAAGTCAGTCTCAGAAGTTAAT
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GATG

QA 1 724 1 724
DS 

RD RS1B944JQ 625 0 0
G
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TACGTTGCTAAGGCTGAGCAGCGCAAGGTCGACTATGAGAAGAACATGAAGGCCTACAAC
AAGAAACAGGAGGAAGGCCCGAAGGAAGAAGAAGAATCTGACAAGTCAGTCTCAGAAGTT
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TGAAGTTTGTAACATTAGTATAGATGGCTGCAAAGATCTCTCTCTGTTTTCTTTAATCTT
AAAATGTTTATGGGGCTGATTAAAAGGTGTCTTTTATCTTTCTTTTCGTTTTGGTACTTC
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QA 2 625 2 625
DS 

RD RS1B944TF 625 0 0
G
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TTCATGGAAGACTTCCGTCAGACTTTCAAGAAGGAACACCCCAAGAACAAATCTGTTGCT
GCTGTTGGAAAAGCTGCTGGAGACAAGTGGAAATCCTTATCAGACGCTGAGAAGGCACCT
TACGTTGCTAAGGCTGAGCAGCGCAAGGTCGACTATGAGAAGAACATGAAGGCCTACAAC
AAGAAACAGGAGGAAGGCCCGAAGGAAGAAGAAGAATCTGACAAGTCAGTCTCAGAAGTT
AATGATGAAGATGATGCTGAGGATGGTAGTGATGAGGAGGAGGACGATGACTAATAAGGT
TGAAGTTTGTAACATTAGTATAGATGGCTGCAAAGATCTCTCTCTGTTTTCTTTAATCTT
AAAATGTTTATGGGGCTGATTAAAAGGTGTCTTTTATCTTTCTTTTCGTTTTGGTACTTC
CCACAATCTATATCACATGTTACCAAGCCCTTTGTATGGAGAAAGTGAAATGTAGAATGT
TTAGATGGTGAAAGAGAGACATGCAGCTCTGTACTCTTGTGTTCTATAAAACGATTTACC
TTCTCTCAGTCTATTTTTTCTGTT

QA 2 625 2 625
DS 



AS 1 3

CO CL3540Contig1 776 3 2 U
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BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G067JQ U 1
AF RS1FC54JQ U 1
AF RS1G067TF C 37
BS 1 729 RS1FC54JQ
BS 730 776 RS1G067TF

RD RS1G067JQ 421 0 0
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TCTGAAAGGGGTTGAGGAATTTTATCAACAACATCACTTGGTTATTTTTCAAGTCATCTA
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TGAGTATAACTCAGTTCCTGCTGCCAGAGTTACTTATTCTGTGTAATTTCTTCGTGAGCG
ACTAGAGCTTCCATGATGCTCTCGACCCATCCTTCAAGCCCTGGTTGCTCCGGGTGGTAA
ACCTTTTTAAATCCTAGTCGTCTTGCAGCTGAAGCAGGCTCATCAAATACACGGGCTGTT
CCAGCTCCCACTACACCCACTTTCACTTTTGGAGAGCAAGCTGCCTTCCACGCCTGGAGA
A

QA 1 421 1 421
DS 

RD RS1FC54JQ 729 0 0
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TCTGAAAGGGGTTGAGGAATTTTATCAACAACATCACTTGGTTATTTTTCAAGTCATCTA
ACTTACAAGCAGGTGTCCCAGTCCAGTCCACCATAAGTCCAGTTCATGAGTGGGTGGAAT
TGAGTATAACTCAGTTCCTGCTGCCAGAGTTACTTATTCTGTGTAATTTCTTCGTGAGCG
ACTAGAGCTTCCATGATGCTCTCGACCCATCCTTCAAGCCCTGGTTGCTCCGGGTGGTAA
ACCTTTTTAAATCCTAGTCGTCTTGCAGCTGAAGCAGGCTCATCAAATACACGGGCTGTT
CCAGCTCCCACTACACCCACTTTCACTTTTGGAGAGCAAGCTGCCTTCCACGCCTGGAGA
AAGACAGAAGCTGCCTGTGGAGAGGTTATGATGATCCAGTCAAAGTTCTTATCAGTTAGT
ACGAAAGCGAGGCGATCGAAATCAGGTCCCGGAGCATGTTGAATCAGTGGGAGCTCTAAA
GATGAAATCCCACGTTTCTCCAGGGCTTTGATGATTTGTTTGTTCTTGCCACTTTCTCGG
GTAACAACCACCTGGGGAATCAAATTGGAGGTGGAGAGAGACGGCGACGATGAATCTCGA
ACCAAACAAGGAGTTGCGTAAACTCCCTTTTTCAGACAATGGTAAGGACGTTGAAGAGAT
AAGAGAGGA

QA 1 729 1 729
DS 

RD RS1G067TF 740 0 0
TATC
TACAAAAGCTGCCCAAGATATCTGAAAGGGGTTGAGGAATTT*ATCAACAACATCACTTG
GTTATTTT*CAAGTCATCTAACTTACAAGCAGGTGTCCCAGTCCAGTCCACCATAAGTCC
AGTTCATGAGTGGGTGGAATTGAGTATAACTCAGTTCCTGCTGCCAGAGTTACTTATTCT
GTGTAATTTCTTCGTGAGCGACTAGAGCTTCCATGATGCTCTCGACCCATCCTTCAAGCC
CTGGTTGCTCCGGGTGGTAAACCTTTTTAAATCCTAGTCGTCTTGCAGCTGAAGCAGGCT
CATCAAATACACGGGCTGTTCCAGCTCCCACTACACCCACTTTCACTTTTGGAGAGCAAG
CTGCCTTCCACGCCTGGAGAAAGACAGAAGCTGCCTGTGGAGAGGTTATGATGATCCAGT
CAAAGTTCTTATCAGTTAGTACGAAAGCGAGGCGATCGAAATCAGGTCCCGGAGCATGTT
GAATCAGTGGGAGCTCTAAAGATGAAATCCCACGTTTCTCCAGGGCTTTGATGATTTGTT
TGTTCTTGCCACTTTCTCGGGTAACAACCACCTGGGGAATCAAATTGGAGGTGGAGAGAG
ACGGCGACGATGAATCTCGAACCAAACAAGGAGTTGCGTAAACTCCCTTTTTCAGACAAT
GGTAAGGACGTTGAAGAGATAAGAGAGGAGCAGGAGACAGAAGCGACGCCATTTAAAAGG
CTTCGGATGGGAGCCC

QA 5 740 5 740
DS 



AS 1 2

CO CL3541Contig1 786 2 4 U
GTGGAATCGATCTTTTCGCTTGTCCTAAGAAGATAAACCACATTGCTCAGCACATTGAGC
TCCCTAATTTGAAACAAGCTTCATCACAAGCCTGTGATGTCCCTAGTCTGTTGATAGTAA
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GCTTAGTCTTATACTTCAAATTAAATGAGAATTATCACAAAGAGATCTCATCTCACTTTC
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AAGACG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 

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AA
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DS 

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QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 3

CO CL3542Contig1 1247 3 12 U
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GTAGGATCACTTTATTATTTCAAACACTAACATATATTTTATATGTTTTCATGTCTGTTA
AGAATAAAAACCACCATTGTTATTAATGTTATTGTTTTATTATCTTT


BQ
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AF RS1FH48TF U 1
AF RS1FW51TF U 1
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CTAGACAATGGGGAAAGGCAAAGTTCTTGCCTAGTTCAAGTTTCATGCCTGCTGCTGCAG
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CGTCAGCAAATCATTCTTCTTTCCGTCCTGCCTTGAACTCGTCGGCTGATGCACGAGTGA
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ACTGA

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DS 

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TTTTAAATTAATTCTTTTTTTGTCAGAAACAGAGAAATAAAATTGTTTAGTATTGTTCCT
TGTTTCGGTGTGAGATGGAAAGAGATTTTCTTGGTTTGAGCGACAAGCAGTATCTCAGCA
ACGTTAAACGCGAGGCTGGCGATGATCGTGTCGGAGAACTAGGGTTGAGCAAGAAGGCAG
CTAGACAATGGGGAAAGGCAAAGTTCTTGCCTAGTTCAAGTTTCATGCCTGCTGCTGCAG
ATTTTCAGGCGGGATCGTACCACTGGGGCCCAGTTTCTGCGGCCAGCAATCTCCGCATAA
GCCAATTAAGCGGTGGTGCGTTTCAGAACGCGAATCCGCTTTTACTTGGCGGATCAGTTC
CGTTAGCAAATCATTCTTCTTTCCGTCCTGCCTTGAACTCGTCGGCTGATGCACGAGTGA
CTTCCTCAGGATCACTACCTCAGCTCACGATCTTCTATGGTGGAACTGTTAGCGTCTTTA
ATGATATATCTCCTGATAAGGCTCAATCTATTATGTCATGTGCCCGGAACGGTTTGAAAG
GAGAAACTGGAGAGAGCAGCTTGAAGAAACCAGTTAGAGAA*CTGAAAGAGTTTATGGAG
AACAAATCCATAACGCTACTGCTGCTGCAGCATCATCGAGCTCTGCCAGTTACGCTGAAA
GTTTCTCTAG*TGTAGAGACAGACCCGTTGGTACGACTAATGCAATGTGTATGATTGA
TCATTCACGCA

QA 1 778 1 778
DS 

RD RS1FH48JQ 738 0 0
ATCTTCTATGGTGGAACTGTTAGCGTCTTTAATGATATATCTCCTGATAAGGCTCAAGCT
ATTATGTCATGTGCCCGGAACGGTTTGAAAGGAGAAACTGGAGAGAGCAGCTTGAAGAAA
CCAGTTAGAGAAACTGAAAGAGTTTATGGAAAACAAATCCATAACGCTACTGCTGCTGCA
GCATCATCGAGCTCTGCCAGTTACGCTGAAAGTTTCTCTAGGTGTAGAGGCAGACCCGTT
GGTACGACTAATGCAATGTGTATGATTGAATCATTCAACGCAGCAGGTCCTGGAAATATG
ATTCCTTCAGTTCCTCAAGCTCGTAAAGCATCGTTGGCTCGGTTCTTGGAGAAGCGCAAA
GAGAGGCTCATGAGTGCACTACCGTACAAGAAGATGCTTCTTGATTTGTCGACCGGAGAA
TCCAGTGGAATGAATTACTCTTTTGCTTCGCATACCTAAAACCTTTTTTATTCTTCCTTT
TCTAAAACCACTCGGAGGTTTTATTACGATGGTAACTTGTAATATAATCAATAGATTATT
ATTATTAGCTACCATTTATTATGCTACGAGCAGGAGAAGGCGCCAGGCGTCTATATATTT
GAGCATTGTTGTAATGGTTTAGTCTGTTATCGTAGGATCACTTTATTATTTCAAACACTA
ACATATATTTTATATGTTTTCATGTCTGTTAAGAATAAAAACCACCATTGTTATTAATGT
TATTGTTTTATTATCTTT

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 3

CO CL3543Contig1 976 3 12 U
GGGAGCCTTCACCAAGCAAAGTGTTGTTCCTCCTTCTCCAGGCGAGAGAAGAGGAAGCAA
AGCCGCCATGGTTGGACCAGGAAGACCTCAAATCGTCCTCTTCGGTTCTTCAATCGTTCA
GTACAGTTTCAGCAATGGTGGCTGGGGAGCCACTCTCGCTGACGTCTACTCTCGCACGGC
TGATGTTATCCTTCGTGGATACGGTGGTTGGAACTCAAGATTTGCCTTAAAGGTTCTTGA
CCAAGTCTTCCCAAAGGATGCTGTAGTACAACCTTCTTTGGTGATAGTTTACTTTGGTGG
GAATGATTCAATGCCTCCTCATCCATCAGGGAAGGGAACTCATGTTCCTCTCTCTGAGTT
CATTGACAACATGAGGAAGATTGGGGAGCATCTTCTGAGCCTTTCAGACAAGACCCGTGT
CATTTTCCTCTCTCCACCACCAATGAACGAGAGACAGATCGAGTTAGTTTTTGGAGATGC
AATAAAAGGCCGGAGAAACGAAGCTTGCCGTCCATATGCAGAAGCGTTGTTGAACCTATG
CAGTGAGATCCATGTGAAATGTGTTGATCTCTGGAACGTTATACAGCAACAAGATGATTG
GTTGAACACCTGCTTCACAGATGGGATCCATTTCACAGCCAAGGCAAGCGAGATTGTGGC
GAAGGAGGCGTTGAAGGTAGTGAGAGAAGCGGAGTGGAAACCGAGTCTTTACTGGAAGTC
CCTACCTATTGAGTTTCCTTTAGATTATGGTGTACCGGACTCGCTAAGCCTTAGTGAGCT
AGAGTTATTCAGAAACGAACAGTTGGAGCTACTAACTAGTACGGCGGCTTTACTGTAAAA
CGTTTAGAGAACTACATGCTAGTGGATGGTGTACCATTTTATTCTCTCTTGTGTGCATCA
GATAATACAGAACAATATGCATTTGAATGTACAAAACTCTGTTTTCTTTTGGTGTACAAT
GACGGTTGTCACTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GT55TF U 8
AF RS1BO20TF U 1
AF RS1GT55JQ C 400
BS 1 397 RS1BO20TF
BS 398 398 RS1GT55TF
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BS 786 976 RS1GT55JQ

RD RS1GT55TF 598 0 0
GG
CACCAAGCAAAGTGTTGTTCCTCCTTCTCCAGGCGAGAGAAGAGGAAGCAAAGCCGCCAT
GGTTGGACCAGGAAGACCTCAAATCGTCCTCTTCGGTTCTTCAATCGTTCAGTACAGTTT
CAGCAATGGTGGCTGGGGAGCCACTCTCGCTGACGTCTACTCTCGCACGGCTGATGTTAT
CCTTCGTGGATACGGTGGTTGGAACTCAAGATTTGCCTTAAAGGTTCTTGACCAAGTCTT
CCCAAAGGATGCTGTAGTACAACCTTCTTTGGTGATAGTTTACTTTGGTGGGAATGATTC
AATGCCTCCTCATCCATCAGGGAAGGGAGCTCATGTTCCTCTCTCTGAGTTCATTGACAA
CATGAGGAAGATTGGGGAGCATCTTCTGAGCCTTTCAGACAAGACCCGTGTCATTTTCCT
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CCATGTGAAATGTGTTGATCTCTGGAACGTTATACAGCAACAAGATGATTGGTTGA

QA 3 598 3 598
DS 

RD RS1BO20TF 785 0 0
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AGCCGCCATGGTTGGACCAGGAAGACCTCAAATCGTCCTCTTCGGTTCTTCAATCGTTCA
GTACAGTTTCAGCAATGGTGGCTGGGGAGCCACTCTCGCTGACGTCTACTCTCGCACGGC
TGATGTTATCCTTCGTGGATACGGTGGTTGGAACTCAAGATTTGCCTTAAAGGTTCTTGA
CCAAGTCTTCCCAAAGGATGCTGTAGTACAACCTTCTTTGGTGATAGTTTACTTTGGTGG
GAATGATTCAATGCCTCCTCATCCATCAGGGAAGGGAACTCATGTTCCTCTCTCTGAGTT
CATTGACAACATGAGGAAGATTGGGGAGCATCTTCTGTGCCTTTCAGACAAGACCCGTGT
CATTTTCCTCTCTCCACCACCAATGAACGAGAGACAGATCGAGTTAGTTTTTGGAGATGC
AATAAAAGGCCGGAGAAACGAAGCTTGCCGTCCATATGCAGAAGCGTTGTTGAACCTATG
CAGTGAGATCCATGTGAAATGTGTTGATCTCTGGAACGTTATACAGCAACAAGATGATTG
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AGAGT

QA 1 785 1 785
DS 

RD RS1GT55JQ 577 0 0
CCTTTCAGACAAGACCCGTGTCATTTTCCTCTCTCCACCACCAATGAACGAGAGACAGAT
CGAGTTAGTTTTTGGAGATGCAATAAAAGGCCGGAGAAACGAAGCTTGCCGTCCATATGC
AGAAGCGTTGTTGAACCTATGCAGTGAGATCCATGTGAAATGTGTTGATTTCTGGAACGT
TATACAGCAACAAGATGATTGGTTGAACCCCTGCTTCACAGATGGGATCCATTTCACAGC
CAAGGCAAGCGAGATTGTGGCGAAGGAGGCGTTGAAGGTAGTGAGAGAAGCGGAGTGGAA
ACCGAGTCTTTACTGGAAGTCCCTACCTATTGAGTTTCCTTTAGATTATGGTGTACCGGA
CTCGCTAAGCCTTAGTGAGCTAGAGTTATTCAGAAACGAACAGTTGGAGCTACTAACTAG
TACGGCGGCTTTACTGTAAAACGTTTAGAGAACTACATGCTAGTGGATGGTGTACCATTT
TATTCTCTCTTGTGTGCATCAGATAATACAGAACAATATGCATTTGAATGTACAAAACTC
TGTTTTCTTTTGGTGTACAATGACGGTTGTCACTCTC

QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 3

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GGAACACTACTATTCAAAGCAAGATGGCTTCTTCTAGTTGTTTCACCGTACAATCAAGCT
TCGTCTCAGCACAAACAAGGCTCGTCTCCATCTCAAAACAATCTCTCTCTGGATTCGCCT
GTCCTTCTCTTACAAAACCTAGAAACTTGAATCTCTCTGTTCTTCGTTGTTGTTCCATGG
GTTCCTTTAACTCTTCTCAGAAATCAGACAACGTCCAAGAAACTGCGAAGAGTGACTTTG
CTTCTATAAGTGAAGGTGAGTGGAAGAAACGGCTTACACCAGAACAGTATTACATCACTA
GACAGAAGGGAACAGAGAGAGCTTTCACTGGGGAGTATTGGAACACAAAGACCCCAGGAG
TATACAAATGTATCTGTTCTGACACGCCACTGTTTGACTCATCAACAAAGTTTGACAGTG
GAACCGGGTGGCCATCGTATTACCAACCTATTGGAAACAATGTCAAGTCAAAGCTAGACC
TCTCTATCATCTTCATGCCAAGACAAGAAGTTATCTGTGCTGTTTGTAATGCCCACCTTG
GTCATGTCTTTGATGACGGTCCACGACCAACCGGAAAAAGATATTGCCTCAACAGTGCTG
CTCTGAAACTTGAGGCATTGGAGAGAACAAGAGAATGAGAGTTTCTGGTACAAAGTATTG
TTCATATATTATATAATATAGTTCCATCCTTGTATTGAAAACATTGTAATCACATGTAAT
AATACACAGAAGAAGAGTTGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E376TF U 1
AF RS1FE82TF U 167
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CTCTGAAACTTGAGGCATTGGAGAGAACAAGAGAATGAGAGTTTCTGGTACAAAGTATTG
TTCATATATTATATAATATAGTT
T

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DS 

RD RS1FE82TF 566 0 0
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GAAGAGTGACTTTGCTTCTATAAGTGAAGGTGAGTGGAAGAAACGGCTTACACCAGAACA
GTATTACATCACTAGACAGAAGGGAACAGAGAGAGCTTTCACTGGGGAGTATTGGAACAC
AAAGACCCCAGGAGTATACAAATGTATCTGTTC**ACACGCCACTGTTTGACTCATCAAC
AAAGTTTGACAGTGGAACCGGGTGGCCATCGTATTACCAACCTATTGGAAACAATGTCAA
GTCAAAGCTAGACCTCTCTATCATCTTCATGCCAAGACAAGAAGTTATCTGTGCTGTTTG
TAATGCCCATCTTGGTCATGTCTTTGATGACGGTCCACGACCAACCTGAAAAAGATATTG
CCTCAACAGTGCTGCTCTGAAACTTGAGGTATTGGAGAGAACAAGAGAATGAGAGTTTCT
GGTACAAAGTATTGTTCATATATTATATAATACAGTTCCATCCTTGTATTGAAAACATTG
TAATCACATGTAATAATACACAGAAG

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DS 

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TCTTTGATGACGGTCCACGACCAACCGGAAAAAGATATTGCCTCAACAGTGCTGCTCTGA
AACTTGAGGCATTGGAGAGAACAAGAGAATGAGAGTTTCTGGTACAAAGTATTGTTCATA
TATTATATAATATAGTTTCATCCTTGTATTGAAAACATTGTAATCACATGTAATAATACA
CAGAAGAAGAGTTGATTCC

QA 1 259 1 259
DS 



AS 1 2

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GTGGTGGTGGTAGACAACATCATGACGGCACTGAAACTGATAGGAAGAAGAAACATTACC
ATCGTCACACCGCTCAACAGATTCAACGACTTGAATCGAGTTTCAAGGAGTATCCTCATC
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AGTTCTGGTTCCAGAACAGAAGAACTCAGCTTAAGGCGCAACATGAGAGGCATATAACAA
TGCACTAAAGGCAGAGAACAACAAGATTTGATGTGAGAACATAGGCATTAGAGAAGCACT
CAAGCATGCTATATGCCCTACTGTGGAGGTCCTCCCGTTAGTGAAGATCCTTACTTCGAT
GAGCATAAGCTCCGGATCGAGAATACACATCTTAGAGACAAGCTTGAAAGAATGTCAACA
GTTGCATCAAAGTACATGGGAAGACTAATCTCCTCCTACCTCTCAACGCTACAGCCAATG
CACATCTCACCGTTGGATCTGTCCATGACTGGTCCTTCACTGGATTTTGATCTTCTTCCA
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CTTATGAACGACATTGCTTTGACTGCGACGGAAGAATTGCTTAGGCTTTTTAGCACAAAC
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CTTTAGATTCTCAATTGTGCATGTATTTTTTTTGGTTGCATGTATAATAATACTTAACTT
CAGAAGATTATACAAGATTATACAGAGACTGTCAGATTTTTGAAGAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CT78TF U 1
AF RS1BJ90TF U 434
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DS 

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CTAGAGCTGATTGTGGCAACGGCAGAGACGTTCTCAGTTTGATGCTCAGGTTTATATGTT
TTCAGAGTTTGACTATGCAACTGGTGCTGGTTGATACTTCCTCAGTAAGTAAGTTGCTCA
AATAATAGTCTGTTAGTTACGATCATGAAAAGCAACAACATCGTGATCTTTAGATTCTCA
ATTGTGCATGTATTTTTTTTGGTTGCATGTATAATAATACTTAACTTCAGAAGATTATAC
AAGATTATACAGAGACTGTCAGATTTTTGAAGAAAA

QA 1 576 1 576
DS 



AS 1 3

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TGTCCTTGGCCTTGCCGCAGCTGCATCCTCTCCGTCTCCTTCAGCGTCACCCTCCAAAGC
TCCGGCGGCTCCCAAAAATGATGTCGAAGCTCCAGTGAGCGAGGATACCATTGGAACCAC
CGACGACGATGCAGCTGCTTCTCCAGGTGATGGTGACGTGGCTGTGGCTGGTCCTCTAGG
AAGTGACTCCTCCTACGGTAGCAATGGACCTTCACCTTCTACCGATGCTGCTGACAATGG
GGCGGCTGCTCTTAGCCTCTCTGCGTTCGTTATTGGTGTTACATCTATTGCTGGTTCTTT
CTTGTTTCTTTGAGGTGTGTATTATCATCAGAATATTATTCTGTATGAGGTCTATTTATT
TATATGAATGATTGTGATGGTTGTGTTGTAATTTATTTTTTCTTTTATTGTGAGAAACGA
TGTGTTTGTAAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BH69JQ C 4
AF RS1BH69TF U 4
AF RS1E492TF U 1
BS 1 468 RS1E492TF
BS 469 469 RS1BH69TF
BS 470 552 RS1E492TF

RD RS1BH69JQ 507 0 0
GG
ATCACAATCTCTATACCTCAAACCTACAATAAGATAAAAGAGAGCTACCTAAAAGGGGAG
AGAGAAGAATGGGTCGCCAAAACGCTATCGTAGTTTTTGGCCTCGTGTTCTTGACTGTCC
TTGGCCTTGCCGCAGCTGCATCCTCTCCGTCTCCTTCAGCGTCACCCTCCAAAGCTCCGG
CGGCTCCCAAAAATGATGTCGAAGCTCCAGTGAGCGAGGATACCATTGGAACCACCGACG
ACGATGCAGCTGCTTCTCCAGGTGATGGTGACGTGGCTGTGGCTGGTCCTCTAGGAAGTG
ACTCCTCCTACGGTAGCAATGGACCTTCACCTTCTACCGATGCTGCTGACAATGGGGCGG
CTGCTCTTAGCCTCTCTGCGTTCGTTATTGGTGTTACATCTATTGCTGGTTCTTTCTTGT
TTCTTTGAGGTGTGTATTATCATCAGAATATTATTCTGTATGAGGTCTATTTATTTATAT
GAATGATTGTGATGGTTGTGTTG
CG

QA 3 505 3 505
DS 

RD RS1BH69TF 507 0 0
GG
ATCACAATCTCTATACCTCAAACCTACAATAAGATAAAAGAGAGCTACCTAAAAGGGGAG
AGAGAAGAATGGGTCGCCAAAACGCTATCGTAGTTTTTGGCCTCGTGTTCTTGACTGTCC
TTGGCCTTGCCGCAGCTGCATCCTCTCCGTCTCCTTCAGCGTCACCCTCCAAAGCTCCGG
CGGCTCCCAAAAATGATGTCGAAGCTCCAGTGAGCGAGGATACCATTGGAACCACCGACG
ACGATGCAGCTGCTTCTCCAGGTGATGGTGACGTGGCTGTGGCTGGTCCTCTAGGAAGTG
ACTCCTCCTACGGTAGCAATGGACCTTCACCTTCTACCGATGCTGCTGACAATGGGGCGG
CTGCTCTTAGCCTCTCTGCGTTCGTTATTGGTGTTACATCTATTGCTGGTTCTTTCTTGT
TTCTTTGAGGTGTGTATTATCATCAGAATATTATTCTGTATGAGGTCTATTTATTTATAT
GAATGATTGTGATGGTTGTGTTG
CG

QA 3 505 3 505
DS 

RD RS1E492TF 552 0 0
GGATCATCACAATCTCTATACCTCAAACCTACAATAAGATAAAAGAGAGCTACCTAAAAG
GGGAGAGAGAAGAATGGGTCGCCAAAACGCTATCGTAGTTTTTGGCCTCGTGTTCTTGAC
TGTCCTTGGCCTTGCCGCAGCTGCATCCTCTCCGTCTCCTTCAGCGTCACCCTCCAAAGC
TCCGGCGGCTCCCAAAAATGATGTCGAAGCTCCAGTGAGCGAGGATACCATTGGAACCAC
CGACGACGATGCAGCTGCTTCTCCAGGTGATGGTGACGTGGCTGTGGCTGGTCCTCTAGG
AAGTGACTCCTCCTACGGTAGCAATGGACCTTCACCTTCTACCGATGCTGCTGACAATGG
GGCGGCTGCTCTTAGCCTCTCTGCGTTCGTTATTGGTGTTACATCTATTGCTGGTTCTTT
CTTGTTTCTTTGAGGTGTGTATTATCATCAGAATATTATTCTGTATGAAGTCTATTTATT
TATATGAATGATTGTGATGGTTGTGTTGTAATTTATTTTTTCTTTTATTGTGAGAAACGA
TGTGTTTGTAAT

QA 1 552 1 552
DS 



AS 1 3

CO CL3547Contig1 493 3 7 U
GGTCCGACCAATCGAGGAAACATTTAAAACAATGGCTGACGCGACAGAAAAAGCTGAGCA
CGACCGTATTTTCAAGAAGTTTGATGCTAACGGTGATGGAACTATCTCTTCAACCGAGCT
TGGAGATGCTCTCAAGAACCTTGGCTCGGTAACGCACGATGACGTTAAGCGTATGATGTC
TGAGATTGACACCGATGGTGATGGATTCATATCGTACCAAGAGTTTTCTGATTTCGCTAA
GGCTAATCGTGGCCTTATGAAAGACGTCGCCAAGATTTTCTAAGCGACATTTTCAGACTT
ATATTGATATGAAATTTTAATCATGTTTAGTATTTTTTTGTAATGACAATCATCTGATTA
AGAATGTTTCATTTTTCTTTATGTTTTCATTTCATGTAATGATATATTGAAGAATCCTCC
ATTCATTAGTGTTTATTTCGATTTGTATTTTAGCGTGGGCTGAAATGGTTCTAGACAGCA
ATTTATATTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AS63JQ C 4
AF RS1AS63TF U 4
AF RS1F445TF U 1
BS 1 15 RS1F445TF
BS 16 16 RS1AS63TF
BS 17 178 RS1F445TF
BS 179 179 RS1AS63TF
BS 180 353 RS1F445TF
BS 354 354 RS1AS63TF
BS 355 493 RS1F445TF

RD RS1AS63JQ 413 0 0
GG
GACCAATCGAGGAAACATTTAAAACAATGGCTGACGCGACAGAAAAAGCTGAGCACGACC
GTATTTTCAAGAAGTTTGATGCTAACGGTGATGGAACTATCTCTTCAACCGAGCTTGGAG
ATGCTCTCAAGAACCTTGGCTCGGTAACGCACGATGACGTTAAGCGTATGATGTCTGAGA
TTGACACCGATGGTGATGGATTCATATCGTACCAAGAGTTTTCTGATTTCGCTAAGGCTA
ATCGTGGCCTTATGAAAGACGTCGCCAAGATTTTTTAAGCGACATTTTCAGACTTATATT
GATATGAAATTTTAATCATGTTTAGTATTTTTTTGTAATGACAATCATCTGATTAAGAAT
GTTTCATTTTTCTTTATGTTTTCATTTCATGTAATGATATATTGAAGAA
CC

QA 3 411 3 411
DS 

RD RS1AS63TF 413 0 0
GG
GACCAATCGAGGAAACATTTAAAACAATGGCTGACGCGACAGAAAAAGCTGAGCACGACC
GTATTTTCAAGAAGTTTGATGCTAACGGTGATGGAACTATCTCTTCAACCGAGCTTGGAG
ATGCTCTCAAGAACCTTGGCTCGGTAACGCACGATGACGTTAAGCGTATGATGTCTGAGA
TTGACACCGATGGTGATGGATTCATATCGTACCAAGAGTTTTCTGATTTCGCTAAGGCTA
ATCGTGGCCTTATGAAAGACGTCGCCAAGATTTTCTAAGCGACATTTTCAGACTTATATT
GATATGAAATTTTAATCATGTTTAGTATTTTTTTGTAATGACAATCATCTGATTAAGAAT
GTTTCATTTTTCTTTATGTTTTCATTTCATGTAATGATATATTGAAGAA
CC

QA 3 411 3 411
DS 

RD RS1F445TF 493 0 0
GGTCCGACCAATCGAAGAAACATTTAAAACAATGGCTGACGCGACAGAAAAAGCTGAGCA
CGACCGTATTTTCAAGAAGTTTGATGCTAACGGTGATGGAACTATCTCTTCAACCGAGCT
TGGAGATGCTCTCAAGAACCTTGGCTCGGTAACGCACGATGACGTTAAGCGTATGATGGC
TGAGATTGACACCGATGGTGATGGATTCATATCGTACCAAGAGTTTTCTGATTTCGCTAA
GGCTAATCGTGGCCTTATGAAAGACGTCGCCAAGATTTTCTAAGCGACATTTTCAGACTT
ATATTGATATGAAATTTTAATCATGTTTAGTATTTTTTTGTAATGACAATCATTTGATTA
AGAATGTTTCATTTTTCTTTATGTTTTCATTTCATGTAATGATATATTGAAGAATCCTCC
ATTCATTAGTGTTTATTTCGATTTGTATTTTAGCGTGGGCTGAAATGGTTCTAGACAGCA
ATTTATATTGTCC

QA 1 493 1 493
DS 



AS 1 2

CO CL3548Contig1 487 2 1 U
CATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGCTGGGTTAAATGATCCAAGGGTCAT
GTACTCTGAACCCGCCAAGTTCGTGGCGAAACTGAGAGAAATGAAGACCGACAACAATTT
GCTTTTGTTCAAATGTGAGCTTGGCGCTGGACATTTCTCCAAATCTGGGAGATTCGAGAA
GCTTCAGGAAGATGCGTTTACGTTTGCGTTCATGATGAAAGTTTTGGACATGATTCCTGA
TTCTGTGTGAGCGCTCATAAGAAAGCCTCTTTGAGAATTTAGATTGTGGTCTTTTCTTTA
AAGCTCAGATTCCTTATAGACACATTTTTATGCGTTTGCTAATAAAGAGCCGAAGACTTA
ACGAGACATATTAAAGAAGGCTTAATGATGGTCTGAAAAATGTTTCTTAATGATCATAGA
GATTTAAAAATCAAACACTAATCTGTGTTACTCATTTTATTCTAAATGGATTTGATTGAT
TACAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A062TV U 1
AF RS1A062TF U 64
BS 1 487 RS1A062TV

RD RS1A062TV 487 0 0
CATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGCTGGGTTAAATGATCCAAGGGTCAT
GTACTCTGAACCCGCCAAGTTCGTGGCGAAACTGAGAGAAATGAAGACCGACAACAATTT
GCTTTTGTTCAAATGTGAGCTTGGCGCTGGACATTTCTCCAAATCTGGGAGATTCGAGAA
GCTTCAGGAAGATGCGTTTACGTTTGCGTTCATGATGAAAGTTTTGGACATGATTCCTGA
TTCTGTGTGAGCGCTCATAAGAAAGCCTCTTTGAGAATTTAGATTGTGGTCTTTTCTTTA
AAGCTCAGATTCCTTATAGACACATTTTTATGCGTTTGCTAATAAAGAGCCGAAGACTTA
ACGAGACATATTAAAGAAGGCTTAATGATGGTCTGAAAAATGTTTCTTAATGATCATAGA
GATTTAAAAATCAAACACTAATCTGTGTTACTCATTTTATTCTAAATGGATTTGATTGAT
TACAAGT

QA 1 487 1 487
DS 

RD RS1A062TF 424 0 0
CTCTGAACCCGCCAAGTTCGTGGCGAAACTGAGAGAAATGAAGACCGACAACAATTTGCT
TTTGTTCAAATGTGAGCTTGGCGCTGGACATTTCTCCAAATCTGGGAGATTCGAGAAGCT
TCAGGAAGATGCGTTTACGTTTGCGTTCATGATGAAAGTTTTGGACATGATTCCTGATTC
TGTGTGAGCGCTCATAAGAAAGCCTCTTTGAGAATTTAGATTGTGGTCTTTTCTTTAAAG
CTCAGATTCCTTATAGACACATTTTTATGCGTTTGCTAATAAAGAGCCGAAGACTTAACG
AGACATATTAAAGAAGGCTTAATGATGGTCTGAAAAATGTTTCTTAATGATCATAGAGAT
TTAAAAATCAAACACTAATCTGTGTTACTCATTTTATTCTAAATGGATTTGATTGATTAC
AAGT

QA 1 424 1 424
DS 



AS 1 3

CO CL3549Contig1 1277 3 4 U
GAAGAATTGTTACATATCTTTCAATGGGGATACTGAAGATTCTTGGTTTAAAAGGACGGA
GTGAGCCGTATGTTACTGAAGATGAGTTGAAACTGATGCTAAGGGGTGCAGAGTTTAGTG
GCGCCATTGAAGAAGAGGAGCAGGATATGATTGAAAATGTGCTGGAGATAAAAGATACAC
ATGTCCGAGAGGTGATGACTCCTCTGGTTGATGTTGTTGCAATTGACGCCAGCGGCAGTC
TAGTTGATTTCCATAGCATGTGGGTGACCCATCAGTACTCAAGGGTGCCTGTGTTTGAGC
AGCGTATAGATAACATAGTCGGTATCGCATATGCTATGGATCTTCTTGATTATGTTCAGA
AGGGTGATCTGCTAGAAAGTACTTCTGTGGGAGACATGGCACATAAACCTGCCTACTTTG
TCCCCGATTCAATGTCAGTTTGGAATCTTCTTAGAGAATTTCGCATAAGAAAGGTTCACA
TGGCTGTTGTCCTTAACGAATACGGTGGAACCATTGGTATAGTAACACTCGAAGATGTTG
TGGAAGAGATTGTTGGTGAAATATTTGATGAAAATGATTCAAAAGAGGAGATTCAGAAGA
AGACAGGGTATATCGTGATGAGAGACGAGGGGGTATATGATGTTGATGCTAATACATCAA
TTGATCAGCTATCCGAAGAACTGAATATAAAGATGCCAGAGGGGATTCAGTATGAGACAG
TCTCAGGCTTTGTGTGTGAGGCCTTTGGTTATATCCCGAAAACGGGAGAGAGTGTAAAGG
TTGTTCTTGAAAAGGAGAACTGGGAAGAGGAGGGTGAAGAAGAGGAAGGTAAACAGGAGA
AGCAGGAGCAGAAGGAAAAGCACCAAATCTATAGAGTTGAGATTCTAGCAGGCAATGCAA
GGAAAGTGAGTGCTGTCAGGTTTGAAAGAGTCAACGACATGGATCAAGTGTCGGAGGCAA
AAGATGTAAGAAGCATGGTTCCTAAGTTCGTGAGGAAATGGAGCAGTGAAGAGGATGATG
GGAACTCGTCACACCAAGAAAAAACCGAGGATGCCGTCTCAGATGATGAACATGTATTGG
CTGCTGATAATAGCAACAAACATTGAATGAAACAACAGTTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCT
TTTTTCAGTTTCTTTGAAAAGGAAATCTACAGACTTTAGAGATGTCAGAGCTCTTTAACT
CGAATTAAGAAGTGAGCTCACAAATACAGGAACCCACAAAAAATCATGAGAAAGTATTCG
AGTGGGTTCAATAACGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CU81TF U 1
AF RS1CU81JQ C 417
AF RS1CT90TF U 646
BS 1 632 RS1CU81TF
BS 633 633 RS1CU81JQ
BS 634 670 RS1CU81TF
BS 671 1277 RS1CT90TF

RD RS1CU81TF 670 0 0
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ATGTCCGAGAGGTGATGACTCCTCTGGTTGATGTTGTTGCAATTGACGCCAGCGGCAGTC
TAGTTGATTTCCATAGCATGTGGGTGACCCATCAGTACTCAAGGGTGCCTGTGTTTGAGC
AGCGTATAGATAACATAGTCGGTATCGCATATGCTATGGATCTTCTTGATTATGTTCAGA
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TCCCCGATTCAATGTCAGTTTGGAATCTTCTTAGAGAATTTCGCATAAGAAAGGTTCACA
TGGCTGTTGTCCTTAACGAATACGGTGGAACCATTGGTATAGTAACACTCGAAGATGTTG
TGGAAGAGATTGTTGGTGAAATATTTGATGAAAATGATTCAAAAGAGGAGATTCAGAAGA
AGACAGGGTATATCGTGATGAGAGACGAGGGG*TATATGATGTTGATGCTAATACATCAA
TTGATCAGCT

QA 1 670 1 670
DS 

RD RS1CU81JQ 739 0 0
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AAGAAGACAGGGTATATCGTGATGAGAGACGAGGGGGTATATGATGTTGATGCTAATACA
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ACAGTCTCAGGCTTTGTGTGTGAGGCCTTTGGTTATATCCCGAAAACGGGAGAGAGTGTA
AAGGTTGTTCTTGAAAAGGAGAACTGGGAAGAGGAGGGTGAAGAAGAGGAAGGTAAACAG
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TTGGCTGCTGATAATAGCAACAAACATTGAATGAAACAACAGTTTTTCTTTTCTTTTCTT
TTCTTTTTTCAGTTTCTTT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1CT90TF 632 0 0
GA
GCTAATACATCAATTGATCAGCTATCCGAAGAACTGAATATAAAGATGCCAGAGGGGATT
CAGTATGAGACAGTCTCAGGCTTTGTGTGTGAGGCCTTTGGTTATATCCCGAAAACGGGA
GAGAGTGTAAAGGTTGTTCTTGAAAAGGAGAACTGGGAAGAGGAGGGTGAAGAAGAGGAA
GGTAAACAGGAGAAGCAGGAGCAGAAGGAAAAGCACCAAATCTATAGAGTTGAGATTCTA
GCAGGCAATGCAAGGAAAGTGAGTGCTGTCAGGTTTGAAAGAGTCAACGACATGGATCAA
GTGTCGGAGGCAAAAGATGTAAGAAGCATGGTTCCTAAGTTCGTGAGGAAATGGAGCAGT
GAAGAGGATGATGGGAACTCGTCACACCAAGAAAAAACCGAGGATGCCGTCTCAGATGAT
GAACATGTATTGGCTGCTGATAATAGCAACAAACATTGAATGAAACAACAGTTTTTCTTT
TCTTTTCTTTTCTTTTTTCAGTTTCTTTGAAAAGGAAATCTACAGACTTTAGAGATGTCA
GAGCTCTTTAACTCGAATTAAGAAGTGAGCTCACAAATACAGGAACCCACAAAAAATCAT
GAGAAAGTATTCGAGTGGGTTCAATAACGT

QA 3 632 3 632
DS 



AS 1 3

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AGTTCATGAGGATGATGAAGAGAACTGCTGCTTATGAGTACTAAACATAGTTGTTGTTGT
TTGTAATGATACTGAGGAGGTCTCTGCTGCTATATATAGTTCCTTTAACCGAGGCATTAC
TATGTCCTTTACTGAAGATTACCATGTTTCGGTTTTTTTATCTATCTTAGCGAGACAAGT
TTGGTCTTTTGTGTCGGTTTAAGTTGTAGTATAAAAGAATCTATTTGCAAAAGTTTCTTT
AATGTTAAATGAGTTTATTGAGTCC


BQ
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AF RS1DC43TF U 1
AF RS1C104JQ C 179
AF RS1C104TF U 179
BS 1 542 RS1DC43TF
BS 543 543 RS1C104TF
BS 544 590 RS1DC43TF
BS 591 805 RS1C104TF

RD RS1DC43TF 590 0 0
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AGCTCATGAGGATGATGAAGAGAACTGCTGCTTATGAGTACTAAACATAG

QA 1 590 1 590
DS 

RD RS1C104JQ 627 0 0
G
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TAATGTTAAATGAGTTTATTGAGTCC

QA 2 627 2 627
DS 

RD RS1C104TF 627 0 0
G
GACACTGATGGCTCTGGCACCATCGATGCCAAAGAGCTTAACGTTGCCATGAGGGCGCTT
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GACACCAAAGAAGAGCTCACCAAGGCTTTCAAGATCATTGATCTTGACAATAATGGGAAG
ATATCTGCTGATGATATCAAACGCATGGCAAAGGACTTGGGTGAAAACTTCACTGATGCT
GAGATACGTGAGATGGTTGAAGAAGCTGACCGTGACCGTGATGGTGAAGTTAATATGGAA
GAGTTCATGAGGATGATGAAGAGAACTGCTGCTTATGAGTACTAAACATAGTTGTTGTTG
TTTGTAATGATACTGAGGAGGTCTCTGCTGCTATATATAGTTCCTTTAACCGAGGCATTA
CTATGTCCTTTACTGAAGATTACCATGTTTCGGTTTTTTTATCTATCTTAGCGAGACAAG
TTTGGTCTTTTGTGTCGGTTTAAGTTGTAGTATAAAAGAATCTATTTGCAAAAGTTTCTT
TAATGTTAAATGAGTTTATTGAGTCC

QA 2 627 2 627
DS 



AS 1 2

CO CL3551Contig1 803 2 6 U
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AGAACTGCGGTGATGGCTGCGCTAGTGGTGGTTGCTTTTCTTGCGGTGGAAGTGGCGGCG
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GCTCAGGACAAACATTTCTACCTCGACGACTGGCTCTATTTTGTGTACAATAGAAACCAA
TACAACGTTCTAGAAGTGAACGAGACCAACTACATTAGCTGCAACTCCAATAACCCCATC
GCTAACTGGACTCATGGAGCCGGAAGGGATGTCGTTCATCTCAATGTGACCAGGCATTAC
TATCTCATTAGCGGTGACGGTGGTGGCTGTTACGGCGGTATGAAGCTCGCTGTTTTAGTT
GAGAAGCCTCCTCCTTCACCAGCTCCAGCACCTAGCAAAAACATTGCAAGAAGAGCCTTC
ACCGTCTCAGGTTTTGCTCCTCAGTTTGTTATTCCAGTAGCTGTATTTGCAGCAATCGGG
TTAGTGTGGGACAATGTGGTACTGCCGTTTTGGTAGTCTTGATTTCTTCAAATGAGAAAA
AAACAATTGTTAATTTGTTATCGTCGAATCCTCATATTTCAGATTGTTGTAGTGACAGTG
TTACTCTCTTTTTTTTCTTCTTCTTAATGTTGGTTTCGTGGATCTTCTTCTATCATTGTT
CCCTGGACGTGTGGGAAATCAATTGTTGAAGAACAATTGTAGTTTAATTTATTTTGATGA
ACCTTCTAAACTTGATTGAGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1EX08TF U 1
AF RS1CD55JQ C 35
BS 1 122 RS1EX08TF
BS 123 124 RS1CD55JQ
BS 125 602 RS1EX08TF
BS 603 603 RS1CD55JQ
BS 604 675 RS1EX08TF
BS 676 803 RS1CD55JQ

RD RS1EX08TF 675 0 0
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AGAACTGCGGTGATGGCTGCGCTAGTGGTGGTTGCTTTTCTTGCGGTGGAAGTGGCGGCG
AA**AATGGACGGTGGGAGATAACAAGTTCTGGAATCCCAATGTCAATTATACCGTTTGG
GCTCAGGACAAACATTTCTACCTCGACGACTGGCTCTATTTTGTGTACAATAGAAACCAA
TACAACGTTCTAGAAGTGAACGAGACCAACTACATTAGCTGCAACTCCAATAACCCCATC
GCTAACTGGACTCATGGAGCCGGAAGGGATGTCGTTCATCTCAATGTGACCAGGCATTAC
TATCTCATTAGCGGTGACGGTGGTGGCTGTTACGGCGGTATGAAGCTCGCTGTTTTAGTT
GAGAAGCCTCCTCCTTCACCAGCTCCAGCACCTAGCAAAAACATTGCAAGAAGAGCCTTC
ACCGTCTCAGGTTTTGCTCCTCAGTTTGTTATTCCAGTAGCTGTATTTGCAGCAATCGGG
TTAGTGTGGGACAATGTGGTACTGCCGTTTTGGTAGTCTTGATTTCTTCAAATGAGAAAA
AA*CAATTGTTAATTTGTTATCGTCGAATCCTCATATTTCAGATTGTTGTAGTGACAGTG
TTACTCTCTTTTTTT

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1CD55JQ 769 0 0
TTTTTTTTCTAGAGTGATCGATGGCGAGAACTGCGGTGATGGCTGCGCTAGTGGTGGTTG
CTTTTCTTGCGGTGGAAGTGGCGGCGAAGAAATGGACGGTGGGAGATAACAAGTTCTGGA
ATCCCAATGTCAATTATACCGTTTGGGCTCAGGACAAACATTTCTACCTCGACGACTGGC
TCTATTTTGTGTACAATAGAAACCAATACAACGTTCTAGAAGTGAACGAGACCAACTACA
TTAGCTGCAACTCCAATAACCCCATCGCTAACTGGACTCATGGAGCCGGAAGGGATGTCG
TTCATCTCAATGTGACCAGGCATTACTATCTCATTAGCGGTGACGGTGGTGGCTGTTACG
GCGGTATGAAGCTCGCTGTTTTAGTTGAGAAGCCTCCTCCTTCACCAGCTCCAGCACCTA
GCAAAAACATTGCAAGAAGAGCCTTCACCGTCTCAGGTTTTGCTCCTCAGTTTGTTATTC
CAGTAGCTGTATTTGCAGCAATCGGGTTAGTGTGGGACAATGTGGTACTGCCGTTTTGGT
AGTCTTGATTTCTTCAAATGAGAAAAAAACAATTGTTAATTTGTTATCGTCGAATCCTCA
TATTTCAGATTGTTGTAGTGACAGTGTTACTCTCTTTTTTTTCTTCTTCTTAATGTTGGT
TTCGTGGATCTTCTTCTATCATTGTTCCCTGGACGTGTGGGAAATCAATTGTTGAAGAAC
AATTGTAGTTTAATTTATTTTGATGAACCTTCTAAACTTGATTGAGGCT

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

CO CL3552Contig1 713 2 2 U
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AAGCTGTCGAACCCCATGAGGGACATTAAGGTCCAAAAACTTGTTCTTAACATCTCCGTT
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ACCCCTGTTTTCTCAAAGGCGAGGTACACTGTGAGGTCTTTTGGTATCAGGCGTAACGAA
AAGATTGCGTGCTATGTTACTGTGAGAGGTGACAAGGCAATGCAGCTTCTTGAGAGTGGT
TTGAAAGTTAAGGAGTATGAGCTTCTCAGGAGGAACTTTAGTGACACTGGTTGCTTTGGA
TTCGGTATCCAAGAGCACATTGATCTTGGTATCAAGTATGATCCTTTTACGGGTATTTAC
GGAATGGACTTCTATGTAGTTCTTGAACGTCCAGGATACCGTGTGGCTCGTCGCCGTAGG
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TTTACGATTTCTGGATGTTTAAGAATCGCTTGTTCTAGTAAAACCTCTTTTTG


BQ
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AF RS1C061TF U 1
AF RS1C061JQ C 1
BS 1 134 RS1C061TF
BS 135 713 RS1C061JQ

RD RS1C061TF 134 0 0
GGGTTTCCACAACTCTCTGTTAGTTCGATTGTTGATCTACTTCAAATGGCGTCGGAGAAG
AAGCTGTCGAACCCCATGAGGGACATTAAGGTCCAAAAACTTGTTCTTAACATCTCCGTT
GGTGAGAGTGGTGA

QA 1 134 1 134
DS 

RD RS1C061JQ 713 0 0
GGGTTTCCACAACTCTCTGTTAGTTCGATTGTTGATCTACTTCAAATGGCGTCGGAGAAG
AAGCTGTCGAACCCCATGAGGGACATTAAGGTCCAAAAACTTGTTCTTAACATCTCCGTT
GGTGAGAGTGGTGATCGTCTCACTCGTGCCTCCAAGGTTTTGGAACAGCTCAGTGGACAA
ACCCCTGTTTTCTCAAAGGCGAGGTACACTGTGAGGTCTTTTGGTATCAGGCGTAACGAA
AAGATTGCGTGCTATGTTACTGTGAGAGGTGACAAGGCAATGCAGCTTCTTGAGAGTGGT
TTGAAAGTTAAGGAGTATGAGCTTCTCAGGAGGAACTTTAGTGACACTGGTTGCTTTGGA
TTCGGTATCCAAGAGCACATTGATCTTGGTATCAAGTATGATCCTTTTACGGGTATTTAC
GGAATGGACTTCTATGTAGTTCTTGAACGTCCAGGATACCGTGTGGCTCGTCGCCGTAGG
TGCAAGGCTCGTGTTGGTATCCAACACAGAGTGACCAAGGATGATGCAATGAAATGGTTC
CAAGTTAAGTATGAAGGAGTTATCCTCAACAAGTCTCAGAACATCACTGGCTAAACTAAA
ACTTGAATCTTCATAGATTTTTTGTTGATTCTAGCTTTTGTTTTTTTTTAAGTTGTCATC
TTTACGATTTCTGGATGTTTAAGAATCGCTTGTTCTAGTAAAACCTCTTTTTG

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 3

CO CL3553Contig1 669 3 3 U
TTTTTTTTTGTCACACTGGAAGTTAAATAGAATTTGAAATTGGACCAAGCCACGACACGA
CAAAGACACGAGTCTGATTCTAAGGACACCATCACACCATAGTAACTTAAAACGCACGTA
AACAGCTAATGAAATTTTGAAAAAAAAGACATGATTATTATTGTTGCTCTGACATCATCT
TAAGCTAGACCTAGCTCAAGGACCTTTACGAATCCTTAAACCAAA***AACAACTCAACT
ACTCAAGGGAAATGAACTCCTCCGGTACTTCCTCCACCGACTCCGGAACCAACACCACCG
CCTATCCCGTTTCCTAAGCCACCGCCTATCCCATTTCCTAAGCCACCGCCTAATCCTCCA
CCAACACCACCAAGTCCACCAAAACCAAGGTTACCACCGGGACCAGCCACACCTCCACCG
ACGCCACCGAAAGGTAAACCGTTGTCTCCGATGCCGGAGTACCCGCCACCGTATCCAAGG
TAGTTCTTCTGGTCAGAGAGTCCTCCTGGGATGTTTCTTGCTCCAGAAGCAAAAACTGAG
GCTAGGGCAAGAACCAAGAAGAGAGTGAGAAAACACTTTGCCATAATTTCAAAGTGGTAA
AGAACGGTAATATTGATAACAGGAAAGTAGACAAGATTTGAGTTATTATGTTTATTGCTT
TGCCGGTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1DF41JQ U 10
AF RS1FF29JQ U 21
AF RS1DF41TF C 1
BS 1 9 RS1DF41TF
BS 10 535 RS1DF41JQ
BS 536 669 RS1DF41TF

RD RS1DF41JQ 526 0 0
GTCACACTGGAAGTTAAATAGAATTTGAAATTGGACCAAGCCACGACACGACAAAGACAC
GAGTCTGATTCTAAGGACACCATCACACCATAGTAACTTAAAACGCACGTAAACAGCTAA
TGAAATTTTGAAAAAAAAGACATGATTATTATTGTTGCTCTGACATCATCTTAAGCTAGA
CCTAGCTCAAGGACCTTTACGAATCCTTAAACCAAA***AACAACTCAACTACTCAAGGG
AAATGAACTCCTCCGGTACTTCCTCCACCGACTCCGGAACCAACACCACCGCCTATCCCG
TTTCCTAAGCCACCGCCTATCCCATTTCCTAAGCCACCGCCTAATCCTCCACCAACACCA
CCAAGTCCACCAAAACCAAGGTTACCACCGGGACCAGCCACACCTCCACCGACGCCACCG
AAAGGTAAACCGTTGTCTCCGATGCCGGAGTACCCGCCACCGTATCCAAGGTAGTTCTTC
TGGTCAGAGAGTCCTCCTGGGATGTTTCTTGCTCCAGAAGCAAAAA

QA 1 526 1 526
DS 

RD RS1FF29JQ 475 0 0
C
GTTAAATAGAATTTGAAATTGGACCAAGCCACGACACGACAAAGACACGAGTCTGATTCT
AAGGACACCATCACACCATAGTAACTTAAAACGCACGTAAACAGCTAATGAAATTTTGAA
AAAAAAGACATGATTATTATTGTTGCTCTGACATCATCTTAAGCTAGACCTAGCTCAAGG
ACCTTTACAAATCCTTAAACCAAAATTAACAACTCAACTACTCAAGGGAAATGAACTCCT
CCGGTACTTCCTCCACCGACTCCGGAACCAACACCACCGCCTATCCCGTTTCCTAAGCCA
CCGCCTATCCCATTTCCTAAGCCACCGCCTAATCCTCCACCAACACCACCAAGTCCACCA
AAACCAAGGTTACCACCGGGACCAGCCACACCTCCACCGACGCCACCGAAAAGTAAACCG
TTGTCTCCGATGCCGGAGTACCCGCCACCGTATCCAAGGTAGTTCTTCTGGTCA

QA 2 475 2 475
DS 

RD RS1DF41TF 669 0 0
TTTTTTTTTGTCACACTGGAAGTTAAATAGAATTTGAAATTGGACCAAGCCACGACACGA
CAAAGACACGAGTCTGATTCTAAGGACACCATCACACCATAGTAACTTAAAACGCACGTA
AACAGCTAATGAAATTTTGAAAAAAAAGACATGATTATTATTGTTGCTCTGACATCATCT
TAAGCTAGACCTAGCTCAAGGACCTTTACGAATCCTTAAACCAAA***AACAACTCAACT
ACTCAAGGGAAATGAACTCCTCCGGTACTTCCTCCACCGACTCCGGAACCAACACCACCG
CCTATCCCGTTTCCTAAGCCACCGCCTATCCCATTTCCTAAGCCACCGCCTAATCCTCCA
CCAACACCACCAAGTCCACCAAAACCAAGGTTACCACCGGGACCAGCCACACCTCCACCG
ACGCCACCGAAAGGTAAACCGTTGTCTCCGATGCCGGAGTACCCGCCACCGTATCCAAGG
TAGTTCTTCTGGTCAGAGAGTCCTCCTGGGATGTTTCTTGCTCCAGAAGCAAAAACTGAG
GCTAGGGCAAGAACCAAGAAGAGAGTGAGAAAACACTTTGCCATAATTTCAAAGTGGTAA
AGAACGGTAATATTGATAACAGGAAAGTAGACAAGATTTGAGTTATTATGTTTATTGCTT
TGCCGGTCC

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 2

CO CL3554Contig1 755 2 2 U
GGAATTAATAAATCATCCTTCTCGTCTTCATCGTCGGAGAGAGAGAGTTAAAGATCTACG
AAAGGAAGAAGAAGAAGATGGAGAGCAGACAGGCGGCGAGGATCTCAAAGATCAATGTCT
TTGTATTTGTCGGTCTGATACTATTGAATTCAATCAATCAAATCTCCTCGCTCTCCGTTA
CAGTCGAGGAAGATGAATGCGTCCAAGAGTACGTCCTCTACGAAGGAGACACCGTCTCTG
GAAACTTCGTCGTCGTCGACCATGATGTCTTCTGGGGACCAGATCATACCGGTATTGATT
TCACGGTGACGTCACCAGCTGGGAACATTGTACAGACGTTGAAGGGGACATCAGGAGATA
AGTTTGAGTTTAAGGCACCGAGAAGTGGGATGTACAAGTTTTGTTTCCACAACCCTTACT
CTGCTCCTGAGACTGTCTCCTTCTACATTCACGTTGGTCATATCCCTAATGAGCATGACT
TAGCCAAAGACGAACACTTGGACCCGGTGAATGTTAAGATAGCTGAGCTGAGAGAGTCTT
TGGAATCTGTTGTTGCTGAGCAGAAGTATCTTAAAGCACGTGATACCCGTCACCGTCATA
CTAATGAGAGCACGAGAAAGCGAGTGATATTCTACACAGTAGAGAGTACATTTTCCTAGC
AGCAGCAAGTGGTCTTCAGATTCTCTACATCCGTAAGCTCTTCAGCAAGTCTGTTGCGTA
CACAGAGTTTGACATAGTTGAAACCCCCGACATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1H725TF U 1
AF RS1C620TF U 31
BS 1 599 RS1H725TF
BS 600 755 RS1C620TF

RD RS1H725TF 599 0 0
GGAATTAATAAATCATCCTTCTCGTCTTCATCGTCGGAGAGAGAGAGTTAAAGATCTACG
AAAGGAAGAAGAAGAAGATGGAGAGCAGACAGGCGGCGAGGATCTCAAAGATCAATGTCT
TTGTATTTGTCGGTCTGATACTATTGAATTCAATCAATCAAATCTCCTCGCTCTCCGTTA
CAGTCGAGGAAGATGAATGCGTCCAAGAGTACGTCCTCTACGAAGGAGACACCGTCTCTG
GAAACTTCGTCGTCGTCGACCATGATGTCTTCTGGGGACCAGATCATACCGGTATTGATT
TCACGGTGACGTCACCAGCTGGGAACATTGTACAGACGTTGAAGGGGACATCAGGAGATA
AGTTTGAGTTTAAGGCACCGAGAAGTGGGATGTACAAGTTTTGTTTCCACAACCCTTACT
CTGCTCCTGAGACTGTCTCCTTCTACATTCACGTTGGTCATATCCCTAATGAGCATGACT
TAGCCAAAGACGAACACTTGGACCCGGTGAATGTTAAGATAGCTGAGCTGAGAGAGTCTT
TGGAATCTGTTGTTGCTGAGCAGAAGTATCTTAAAGCACGTGATACCCGTCACCGTCAT

QA 1 599 1 599
DS 

RD RS1C620TF 725 0 0
GG
GTCGGAGAGAGAGAGTTAAAGATCTACGAAAGGAAGAAGAAGAAGATGGAGAGCAGACAG
GCGGCGAGGATCTCAAAGATCAATGTCTTTGTATTTGTCGGTCTGATACTATTGAATTCA
ATCAATCAAATCTCCTCGCTCTCCGTTACAGTCGAGGAAGATGAATGTGTCCAAGAGTAC
GTCCTCTACGAAGGAGACACCGTCTCTGGAAACTTCGTCGTCGTCGACCATGATGTCTTC
TGGGGACCAGATCATACCGGTATTGATTTCACGGTGACGTCACCAGCTGGGAACATTGTA
CAGACGTTGAAGGGGACATCAGGAGATAAGTTTGAGTTTAAGGCACCGAGAAGTGGGATG
TACAAGTTTTGTTTCCACAACCCTTACTCTGCTCCTGAGACTGTCTCCTTCTACATTCAC
GTTGGTCATATCCCTAATGAGCATTACTTAGCCAAGGACGAACACTTGGACCCGGTGAAT
GTTAAGATAGCTGAGCTGAGAGAGTCTTTGGAATCTGTTGTTGCTGAGCAGAAGTATCTT
AAAGCACGTGATACCCGTCACCGTCATACTAATGAGAGCACGAGAAAGCGAGTGATATTC
TACACAGTAGAGAGTACATTTTCCTAGCAGCAGCAAGTGGTCTTCAGATTCTCTACATCC
GTAAGCTCTTCAGCAAGTCTGTTGCGTACACAGAGTTTGACATAGTTGAAACCCCCGACA
TCG

QA 3 725 3 725
DS 



AS 1 2

CO CL3555Contig1 1161 2 2 U
GCTTCATCGAATTGAGCATCCATCTCAAGGTTAATCTTATGGGGTACGATTACTCGGGGT
ATGGACAATCTACTGGAAAGCCGAGTGAGCATCATACATATGCTGATATTGAAGCTGCAT
ACAAATGTCTTGAAGAGACGTATGGAGCAAAACAGGAAGACGTGATCCTCTATGGCCAAT
CCGTAGGAAGTGGGCCTACGTTAGACCTCGCTGCAAGGTTACCTCAGTTAAGAGCTGTTG
TTCTCCATAGCCCTATTCTTTCAGGTCTTAGAGTGATGTATCCTGTTAAGAAGACGTACT
GGTTCGACATCTACAAGAATATCGACAAGATCCCACTTGTGAATTGCCCTGTTCTTGTCA
TTCATGGAACTAGTGATGAAGTTGTCGACTTTCCCACGGGAAACAGTTATGGGAACTCTC
TAAAGACAAGTACGAACCGCTTTGGCTCGAAGGTGGTAACCACTGTGATCTAGAACAGTA
CCCTGAATACATCAAACACCTAAAGAAGTTTATCACAACCGTAGAGAGGTCTCTCTCCTC
TAGGAAGAGCACGTGCCACCAATCGGAAAACCAGAGCAGCGATGTCGAGATGCCGAGGCA
GAGCGTTGATAGAAGAGAGAAACCAAGACAGAGCGTCGACAGAAGGGAGAAAGAGAAACC
TCCCAAGGGTCAGTCCAAGAAGAGTAAGCTGAGAATCACTTTCGAGCAGCATTTGGACCG
GTCGAGGAGGAGCGTTGACCTCCATGACAAGGCGAGGAAGAGCGTTGACCACTATAGTCA
TCATCATCATCATCAGAATAATCATGAGATTGAGAGAGGAAGGAAGAGTGTTGATAGATT
GGATAGAGTACGGTCCGAATAAACACGGAGAAATCTACAATGCGTACATATTGTTGTTTA
CAGAACAAGAACATTTGATCTTGATCTTTGCATTGCAGTTCTAATGTTGATGTTTCTTTT
TCTGTTTTCTTGTTTTGTTTGTGAGTTATTCTGTAGTTTTAATATTTGGAGTGTGATATT
TCCTGAACTTGTGAAGCTTATGTATTAAGCAAACAATTGAGTGAGATTAGGGCTTTGCAT
TAGAAGGAATTCTCTAAACTCTACAGCTAAATTGTATAAACTTCAAAATCTTTTTAAATA
CATGTAGTGTGAATTTCTTAG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BO74TF U 1
AF RS1BO74JQ C 395
BS 1 636 RS1BO74TF
BS 637 1161 RS1BO74JQ

RD RS1BO74TF 636 0 0
GCTTCATCGAATTGAGCATCCATCTCAAGGTTAATCTTATGGGGTACGATTACTCGGGGT
ATGGACAATCTACTGGAAAGCCGAGTGAGCATCATACATATGCTGATATTGAAGCTGCAT
ACAAATGTCTTGAAGAGACGTATGGAGCAAAACAGGAAGACGTGATCCTCTATGGCCAAT
CCGTAGGAAGTGGGCCTACGTTAGACCTCGCTGCAAGGTTACCTCAGTTAAGAGCTGTTG
TTCTCCATAGCCCTATTCTTTCAGGTCTTAGAGTGATGTATCCTGTTAAGAAGACGTACT
GGTTCGACATCTACAAGAATATCGACAAGATCCCACTTGTGAATTGCCCTGTTCTTGTCA
TTCATGGAACTAGTGATGAAGTTGTCGACTTTCCCACGGGAAACAGTTATGGGAACTCTC
TAAAGACAAGTACGAACCGCTTTGGCTCGAAGGTGGTAACCACTGTGATCTAGAACAGTA
CCCTGAATACATCAAACACCTAAAGAAGTTTATCACAACCGTAGAGAGGTCTCTCTCCTC
TAGGAAGAGCACGTGCCACCAATCGGAAAACCAGAGCAGCGATGTCGAGATGCCGAGGCA
GAGCGTTGATAGAAGAGAGAAACCAAGACAGAGCGT

QA 1 636 1 636
DS 

RD RS1BO74JQ 767 0 0
CACGGGAAACAGTTATGGGAACTCTCTAAAGACAAGTACGAACCGCTTTGGCTCGAAGGT
GGTAACCACTGTGATCTAGAACAGTACCCTGAATACATCAAACACCTAAAGAAGTTTATC
ACAACCGTAGAGAGGTCTCTCTCCTCTAGGAAGAGCACGTGCCACCAATCGGAAAACCAG
AGCAGCGATGTCGAGATGCCGAGGCAGAGCGTTGATAGAAGAGAGAAACCAAGACAGAGC
GTCGACAGAAGGGAGAAAGAGAAACCTCCCAAGGGTCAGTCCAAGAAGAGTAAGCTGAGA
ATCACTTTCGAGCAGCATTTGGACCGGTCGAGGAGGAGCGTTGACCTCCATGACAAGGCG
AGGAAGAGCGTTGACCACTATAGTCATCATCATCATCATCAGAATAATCATGAGATTGAG
AGAGGAAGGAAGAGTGTTGATAGATTGGATAGAGTACGGTCCGAATAAACACGGAGAAAT
CTACAATGCGTACATATTGTTGTTTACAGAACAAGAACATTTGATCTTGATCTTTGCATT
GCAGTTCTAATGTTGATGTTTCTTTTTCTGTTTTCTTGTTTTGTTTGTGAGTTATTCTGT
AGTTTTAATATTTGGAGTGTGATATTTCCTGAACTTGTGAAGCTTATGTATTAAGCAAAC
AATTGAGTGAGATTAGGGCTTTGCATTAGAAGGAATTCTCTAAACTCTACAGCTAAATTG
TATAAACTTCAAAATCTTTTTAAATACATGTAGTGTGAATTTCTTAG

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL3556Contig1 1021 2 2 U
GGCCTCATCACCATCCAATTACATCGTTTTCTTCGTCACAACTCAATTTAAAAAGAAAAA
AAAAGGAAGAATCTTCTTCTCTTCGAACGAACGTTTCTTCGACATATCCTCTTTGCACAA
CGATAAGCCCAGCGATCATGGCTCAAACAGATCTCAATCAGCCGAAACTCGATATGACTA
AGGAGGAGAAGGAGAGGTTGAAGTACTTGGAGTTCGTGCAAGCTGCCGCTGTGGAAGCAG
TGCTTCGCTTTGCTCTGATTTACGCGAAGGCGAAGGACAAGTCTGGTCCTTTGAAGCCCG
GTGTTGAATCCGTTGAAGGAGCTGTCAAGACTGTCGTCGGTCCAGTCTACCAGAAGTACC
ACGACGTCCCCGTCGAGGTTCTCAAATACATGGACCAGAAGGTTGACATGTCAGTGACTG
AACTCGACCGACGTGTCCCACCAGTGGTCAAGCAAGTCTCTGCCCACGCTATCTCAGCTG
CTCAGATCGCACCCGTAGTGGCCCGTGCCCTCGCCTCCGAGGTTCGACGCGCTGGGGTCG
TGGAAACCGCCTCCGGGATGGCTAAATCCGTCTACACCAAGTACGAGCCTGCAGCCAAAG
AGCTGTACGCGAGCTACGAGCCTAAAGCAGAGCAGTGCGCCGTTTCCGCTTGGAAGAAGC
TGAACCAGCTTCCTCTGTTCCCGAGGCTTGCTCAAGTCGCTGTTCCAACGGCTGCTTTCT
GCTCTGAGAAGTACAATGACACGGTGGTGAAGGCTGCTGAGAAAGGGTACAGGGTCTCAT
CGTACATGCCTTTGGTTCCAACAGAGAGGATCTCGAAGATCTTCAGCGAGGAGAAGACTG
AGACGGCCAAGCCTGTGGAGTTTCAGCCACTCAATTGATTTGGAGGGGTTTGGTAGTTTG
TTGTTGTTTGGTTTGATGTGAACCGGATCTTGGTTAGCGATGGTTCTGGTTCTTTTGTTT
CTTTGTCTTTTCTTCTCCTTTGTTTCTATGAATTTTCGCTTTAATAACACAAAACTTCTG
C


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RS1E330TF U 1
AF RS1E330JQ C 375
BS 1 662 RS1E330TF
BS 663 1021 RS1E330JQ

RD RS1E330TF 662 0 0
GGCCTCATCACCATCCAATTACATCGTTTTCTTCGTCACAACTCAATTTAAAAAGAAAAA
AAAAGGAAGAATCTTCTTCTCTTCGAACGAACGTTTCTTCGACATATCCTCTTTGCACAA
CGATAAGCCCAGCGATCATGGCTCAAACAGATCTCAATCAGCCGAAACTCGATATGACTA
AGGAGGAGAAGGAGAGGTTGAAGTACTTGGAGTTCGTGCAAGCTGCCGCTGTGGAAGCAG
TGCTTCGCTTTGCTCTGATTTACGCGAAGGCGAAGGACAAGTCTGGTCCTTTGAAGCCCG
GTGTTGAATCCGTTGAAGGAGCTGTCAAGACTGTCGTCGGTCCAGTCTACCAGAAGTACC
ACGACGTCCCCGTCGAGGTTCTCAAATACATGGACCAGAAGGTTGACATGTCAGTGACTG
AACTCGACCGACGTGTCCCACCAGTGGTCAAGCAAGTCTCTGCCCACGCTATCTCAGCTG
CTCAGATCGCACCCGTAGTGGCCCGTGCCCTCGCCTCCGAGGTTCGACGCGCTGGGGTCG
TGGAAACCGCCTCCGGGATGGCTAAATCCGTCTACACCAAGTACGAGCCTGCAGCCAAAG
AGCTGTACGCGAGCTACGAGCCTAAAGCAGAGCAGTGCGCCGTTTCCGCTTGGAAGAAGC
TG

QA 1 662 1 662
DS 

RD RS1E330JQ 647 0 0
GAGGTTCTCAAATACATGGACCAGAAGGTTGACATGTCAGTGACTGAACTCGACCGACGT
GTCCCACCAGTGGTCAAGCAAGTCTCTGCCCACGCTATCTCAGCTGCTCAGATCGCACCC
GTAGTGGCCCGTGCCCTCGCCTCCGAGGTTCGACGCGCTGGGGTCGTGGAAACCGCCTCC
GGGATGGCTAAATCCGTCTACACCAAGTACGAGCCTGCAGCCAAGGAGCTGTACGCGAGC
TACGAGCCTAAAGCAGAGCAGTGCGCCGTTTCCGCTTGGAAGAAGCTGAACCAGCTTCCT
CTGTTCCCGAGGCTTGCTCAAGTCGCTGTTCCAACGGCTGCTTTCTGCTCTGAGAAGTAC
AATGACACGGTGGTGAAGGCTGCTGAGAAAGGGTACAGGGTCTCATCGTACATGCCTTTG
GTTCCAACAGAGAGGATCTCGAAGATCTTCAGCGAGGAGAAGACTGAGACGGCCAAGCCT
GTGGAGTTTCAGCCACTCAATTGATTTGGAGGGGTTTGGTAGTTTGTTGTTGTTTGGTTT
GATGTGAACCGGATCTTGGTTAGCGATGGTTCTGGTTCTTTTGTTTCTTTGTCTTTTCTT
CTCCTTTGTTTCTATGAATTTTCGCTTTAATAACACAAAACTTCTGC

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 3

CO CL3557Contig1 754 3 4 U
AATTTGAAAACAGAACTAAAATCATCACCCCTAAAAAGGTCTGAAATTAAAAGGGACACA
AGTTTACAGAAAATAAACGAAATCTTCAAGTTTTTGTCTTTAGACTGTTCATCATAATAA
GACTAGAAAAAAAAAAAGGATTCAATGTGCGTTTTAAGTCTTCGAAAGATTTATTAAAGC
AGAAAGAAGACCCATATGAACAAAATACGGCCAATTACATGCCCATATTCGTATGTCCAT
CAAAGATCAAAATGGTGGTTCTTACCGCACAGGCTGTTGGTTATAGTGGTTCTTCTCCTT
CTTCTTTGCAGCCGCCAGCTTTGCACGTCTAGCAGCTGCCTCCTGCGCGGCTGTTTTGGC
TCCGGCATCCACCTCTTTGCTTGATTTCTTCTTCTTCATGGATGCAATCTTTTTTAGCCT
TTCTTTGACATCAATTGCAGAATCTTCCTCAGTCGGTTCAAACCCAGCAGCTTCACCTAC
AGCCTCTGTGTTGGCTTGTTGTTCTTGAGACTCTTTTACCTCCTTCTGTTTATCCTTCTT
TTTCTTCTTCTTTGATGCCTTTGACTCCCCACCTGCTGCGTTCTCTTTCTTCTCCCCTTC
TCCATTGGTCTCTTCTTTAGCCTCTTTAGAGGCATCTTGGCCATTATCCTCCTTGGGGGC
AACTCCAAAATCAGCCAACAAAGCCTCAAGCTCAGCAAGTTCCTTCTTTTTCCTCTCTTT
CTTGGACAGTTGCCTCTCTGCCTCTTTAGGAGGC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GW81JQ U 1
AF RS1GX53JQ U 188
AF RS1DS71JQ U 110
BS 1 183 RS1GW81JQ
BS 184 184 RS1DS71JQ
BS 185 684 RS1GW81JQ
BS 685 754 RS1DS71JQ

RD RS1GW81JQ 684 0 0
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TCCGGCATCCACCTCTTTGCTTGATTTCTTCTTCTTCATGGATGCAATCTTTTTTAGCCT
TTCTTTGACATCAATTGCAGAATCTTCCTCAGTCGGTTCAAACCCAGCAGCTTCACCTAC
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TTTCTTCTTCTTTGATGCCTTTGACTCCCCACCTGCTGCGTTCTCTTTCTTCTCCCCTTC
TCCATTGGTCTCTTCTTTAGCCTCTTTAGAGGCATCTTGGCCATTATCCTCCTTGGGGGC
AACTCCAAAATCAGCCAACAAAGC

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RD RS1GX53JQ 505 0 0
AA
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AAATGGTGGTTCTTACCGCACAGGCTGTTGGTTATAGTGGTTCTTCTCCTTCTTCTTTGC
AGCCGCCAGCTTTGCACGTCTAGCAGCTGCCTCCTGCGCGGCTGTTTTGGCTCCGGCATC
CACCTCTTTGCTTGATTTCTTCTTCTTCATGGATGCAATCTTTTTTAGCCTTTCTTTGAC
ATCAATTGCAAAATCTTCCTCAGTCGGTTCAAACCCAGCAGCTTCACCTACAGCCTCTGT
GTTGGCTTGTTGTTCTTGAGACTCTTTTACCTCCTTCTGTTTATCCTTCTTTTTCTTCTT
CTTTGATGCCTTTGACTCCCCACCTGCTGCGTTCTCTTTCTTCTCCCCTTCTCCATTGGT
CTCTTCTTTAGCCTCTTTAGAGGCATCTTGGCCATTATCCTCCTTGGGGGCAACTCCAAA
ATCAGCCAACAAAGCCTCAAGCT

QA 3 505 3 505
DS 

RD RS1DS71JQ 645 0 0
CATCATAATAAGACTAGAAAAAAAAA**GGATTCAATGTGCGTTTTAAGTCTTCGAAAGA
TTTATTAAAGCAGAAAGAAGACCCATATGAACAAAATACGGCCAATTACATGCCCATATT
CGTATGTCCATCAAAGATCAAAATGGTGGTTCTTACCGCACAGGCTGTTGGTTATAGTGG
TTCTTCTCCTTCTTCTTTGCAGCCGCCAGCTTTGCACGTCTAGCAGCTGCCTCCTGCGCG
GCTGTTTTGGCTCCGGCATCCACCTCTTTGCTTGATTTCTTCTTCTTCATGGATGCAATC
TTTTTTAGCCTTTCTTTGACATCAATTGCAGAATCTTCCTCAGTCGGTTCAGACCCAGCA
GCTTCACCTACAGCCTCTGTGTTGGCTTGTTGTTCTTGAGACTCTTTTACCTCCTTCTGT
TTATCCTTCTTTTTCTTCTTCTTTGATGCCTTTGACTCCCCACCTGCTGCGTTCTCTTTC
TTCTCCCCTTCTCCATTGGTCTCTTCTTTAGCCTCTTTAGAGGCATCTTGGCCATTATCC
TCCTTGGGGGCAACTCCAAAATCAGCCAACAAAGCCTCAAGCTCAGCAAGTTCCTTCTTT
TTCCTCTCTTTCTTGGACAGTTGCCTCTCTGCCTCTTTAGGAGGC

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 3

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FE78JQ U 1
AF RS1DN33JQ U 62
AF RS1DN33TF C 166
BS 1 350 RS1FE78JQ
BS 351 351 RS1DN33JQ
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RD RS1FE78JQ 629 0 0
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AAGGGAAAGGCCAGTGAGCCTGAGTAGAA

QA 1 629 1 629
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GG
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CTGAAAGCCACAACCTCCGAGGTTTGAACTTTGTAGATACACCAAAAGATTACTTGTGCC
AGACGGCATAGCGATGGCCACTTGTTGCTAGAGTCCACTCTCTACCAGAAGGACACCAAG
AGGCATCTCCAAGCTTCATGCACAGTTTCTCACCAACAATGGCTGCGTATAGATTAGACT
TTGCTTCCAAAACACGGATCGTTGACCTACTATGAATATCTTGTCGCCTCCTAACGTCAA
TCAGTTTGACAATCTGGTCATGAATCGAGCTTCCCCAATCGTAGAAGTGATCATAGAACA
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QA 3 568 3 568
DS 

RD RS1DN33TF 639 0 0
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CAAAAGATTACTTGTGCCAGACGGCATAGCGATGGCCACTTGTTGCTAGAGTCCACTCTC
TACCAGAAGGACACCAAGAGGCATCTCCAAGCTTCATGCACAGTTTCTCACCAACAATGG
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GTCGCCTCCTAACGTCAATCAGTTTGACAATCTGGTCATGAATCGAGCTTCCCCAATCGT
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CATCACACAAACGCCAATACTGACCCTTTACAGCTTCCTGCAGAATCCCTTTAGTAGTGA
AGTCAAATGCAGCTGAAAGCTGTCCCGTGGCATCTATCC

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DS 



AS 1 3

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GGTAATCTCTTGAAGAAGTTGGCAGGTACTGAAGGCATTCTGCTCCTGAATCTTGGATGA
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ACAGCCCATATCAACGACAAGACGATGAATAAAGCAGTTGCTCTCGGGTCCCTCCAGCTA
AGTAAGGCTTGAATCCTCTCTCCTTGTGTCGCCAGGTCCCCCACCACCGTCTGGACTCTT
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CGAGCGTCCATGTGAGGCGGGTGTCTCGGTCTGTACCGGTAGTTCCACATGCCTATCACA
AAGAGGTAGAGGAAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RS1B736JQ U 1
AF RS1A660JQ U 51
AF RS1A660TF C 51
BS 1 194 RS1B736JQ
BS 195 195 RS1A660JQ
BS 196 531 RS1B736JQ
BS 532 532 RS1A660JQ
BS 533 616 RS1B736JQ
BS 617 619 RS1A660JQ

RD RS1B736JQ 616 0 0
GGAAAAAATTTGGCTCATTTTATTTCACTAGCGGTTGAATATTGGAACATAATACATAAT
ATTGGGGAATAACATTCAGGCAAAACTAGTTTCCTTGGCTTCACTCTACAAGTTTCTCCA
CTTATATGTTCATACACACTATTACAAATACAAACCTAAAGTAGCATATCTGACCTGGCT
GGTAATCTCTTGAAAAAGTTGGCAGGTACTGAAGGCATTCTGCTCCTGAATCTTGGATGA
CGCAGCATGAACAGGCCGAGCAAGATGGCAATCACCTGGAACGGTGTGATGTATATAAAC
ACAGCCCATATCAACGACAAGACGATGAATAAAGCAGTTGCTCTCGGGTCCCTCCAGCTA
AGTAAGGCTTGAATCCTCTCTCCTTGTGTCGCCAGGTCCCCCACCACCGTCTGGACTCTT
CCACCGACACTCCTAAGCCTGTCATACCTCATTCTGACAATGTCTGCTGGTCTGCTAGTC
GGGAAAGTGTCAAACTCCTCGTCAAGCTCGTCTGGGTGGGTGTTGTCTGCTCGGGACACA
CGAGCGTCCATGTGAGGCGGGTGTCTCGGTCTGTACCGGTAGTTCCACATGCCTATCACA
AAGAGGTAGAGGAAGA

QA 1 616 1 616
DS 

RD RS1A660JQ 569 0 0
AATACATAATATTGGGGAATAACATTCAGGCAAAACTAGTTTCCTTGGCTTCACTCTACA
AGTTTCTCCACTTATATGTTCATACACACTATTACAAATACAAACCTAAAGTAGCATATC
TGACCTGGCTGGTAATCTCTTGAAGAAGTTGGCAGGTACTGAAGGCATTCTGCTCCTGAA
TCTTGGATGACGCAGCATGAACAGGCCGAGCAAGATGGCAATCACCTGGAACGGTGTGAT
GTATATAAACACAGCCCATATCAACGACAAGACGATGAATAAAGCAGTTGCTCTCGGGTC
CCTCCAGCTAAGTAAGGCTTGAATCCTCTCTCCTTGTGTCGCCAGGTCCCCCACCACCGT
CTGGACTCTTCCACCGACACTCCTAAGCCTGTCATACCTCATTCTGACAATGTCTGCTGG
TCTGCTAGTCGGGAAAGTGTCAAACTCCTCGTCAAGCTCGTCTGGGTGGGTGTTGTCTGC
TTGGGACACACGAGCGTCCATGTGAGGCGGGTGTCTCGGTCTGTACCGGTAGTTCCACAT
GCCTATCACAAAGAGGTAGAGGAAGATCC

QA 1 569 1 569
DS 

RD RS1A660TF 569 0 0
AATACATAATATTGGGGAATAACATTCAGGCAAAACTAGTTTCCTTGGCTTCACTCTACA
AGTTTCTCCACTTATATGTTCATACACACTATTACAAATACAAACCTAAAGTAGCATATC
TGACCTGGCTGGTAATCTCTTGAAGAAGTTGGCAGGTACTGAAGGCATTCTGCTCCTGAA
TCTTGGATGACGCAGCATGAACAGGCCGAGCAAGATGGCAATCACCTGGAACGGTGTGAT
GTATATAAACACAGCCCATATCAACGACAAGACGATGAATAAAGCAGTTGCTCTCGGGTC
CCTCCAGCTAAGTAAGGCTTGAATCCTCTCTCCTTGTGTCGCCAGGTCCCCCACCACCGT
CTGGACTCTTCCACCGACACTCCTAAGCCTGTCATACCTCATTCTGACAATGTCTGCTGG
TCTGCTAGTCGGGAAAGTGTCAAACTCCTCGTCAAGCTCGTCTGGGTGGGTGTTGTCTGC
TTGGGACACACGAGCGTCCATGTGAGGCGGGTGTCTCGGTCTGTACCGGTAGTTCCACAT
GCCTATCACAAAGAGGTAGAGGAAGA
TCC

QA 1 566 1 566
DS 



AS 1 2

CO CL3560Contig1 1035 2 2 U
GGGAAAGACGCAATCTTTTGTTTCCTCATTGGAGAAGATGAACGCGGCCATTAGAGCTGC
GATCGGCAGACCACAGAGCTTAGCTTCTCACCTGAAAACAGCGCTTTTTCACTCTACACC
CGTCTTGGAACGCAAACGCCGCTCTTCCTGGGAATCGAGATCATATGTTCACAAGAAGAG
GAACAGAAGAATGAGGGAGAAGCAAGAGTTGTTGCGCAATGTGAATGCTTTCGCAGCAAA
CATGTTTACGAGTTGGCATGATGATGATGAGTATGATGAGCCCTCCTCACGGAAGAAAAA
CTCGTGGTACAAAAAGAAGTATGCCAAAGAAGAGCCCAAAGGAAAATGGACTGGGAAACA
CGGCTCCCAGAGTTGGGGTCCAAATAGGGGGCACTTTGATTTTAGCGGAGTGGATGATGA
CTTTGACATTGACTATGTCTTCCGAACTGCTTTTGGTGGATCCCGAGGTTTCTCTTTTTC
ATTCACCTTCGAGAGGAGGATGAACCTCCTCGATGGCATCATTCTTCAAGGTTCTCCAAT
AACTCTAAAAGGTCTGGGAGATCAAAACATCATCGAATATACGAGGATGAAGATGAAGAA
GGGTATACTTCAACAGAATCCAGCGACTCTGAGTCTGAGCCAAACCAAGCTTCTCATAGA
CAAGCTCTTGGCCTGAGTCCTTCTGGTCCATTAAACCTCAAAGACGTCAAACATGCATAT
CGAACTTGCGCTTTGAAATGGCACCCAGATCGTCATCAAGGCTCAACCAAGGAGGCGGCT
GAAGCAAAGTTTAAGGTCTGCAGTGTGGCTTATCAATCTTTATGCGAAAAGCTAGCAGTG
AACTGAAAGATGAAGGAGTTTTATATAGAGTGTTTGATTACTTAGAGATATGATATTCAA
AGTGTTCATTTAAAAGCTTATCCTAAATAATAACACTACTATAGGATCCAAAGCTATTTC
TTTCTTCTGTCATCTTTTATTACTAAACTTTCAAAACATTTCTACCAAAGTGATGAGTAT
TTATTTCTCAGCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AA59TF U 1
AF RS1AA59JQ C 198
BS 1 756 RS1AA59TF
BS 757 1035 RS1AA59JQ

RD RS1AA59TF 756 0 0
GGGAAAGACGCAATCTTTTGTTTCCTCATTGGAGAAGATGAACGCGGCCATTAGAGCTGC
GATCGGCAGACCACAGAGCTTAGCTTCTCACCTGAAAACAGCGCTTTTTCACTCTACACC
CGTCTTGGAACGCAAACGCCGCTCTTCCTGGGAATCGAGATCATATGTTCACAAGAAGAG
GAACAGAAGAATGAGGGAGAAGCAAGAGTTGTTGCGCAATGTGAATGCTTTCGCAGCAAA
CATGTTTACGAGTTGGCATGATGATGATGAGTATGATGAGCCCTCCTCACGGAAGAAAAA
CTCGTGGTACAAAAAGAAGTATGCCAAAGAAGAGCCCAAAGGAAAATGGACTGGGAAACA
CGGCTCCCAGAGTTGGGGTCCAAATAGGGGGCACTTTGATTTTAGCGGAGTGGATGATGA
CTTTGACATTGACTATGTCTTCCGAACTGCTTTTGGTGGATCCCGAGGTTTCTCTTTTTC
ATTCACCTTCGAGAGGAGGATGAACCTCCTCGATGGCATCATTCTTCAAGGTTCTCCAAT
AACTCTAAAAGGTCTGGGAGATCAAAACATCATCGAATATACGAGGATGAAGATGAAGAA
GGGTATACTTCAACAGAATCCAGCGACTCTGAGTCTGAGCCAAACCAAGCTTCTCATAGA
CAAGCTCTTGGCCTGAGTCCTTCTGGTCCATTAAACCTCAAAGACGTCAAACATGCATAT
CGAACTTGCGCTTTGAAATGGCACCCAGATCGTCAT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RS1AA59JQ 838 0 0
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ATGATGATGATGAGTATGATGAGCCCTCCTCACGGAAGAAAAACTCGTGGTACAAAAAGA
AGTATGCCAAAGAAGAGCCCAAAGGAAAATGGACTGGGAAACACGGCTCCCAGAGTTGGG
GTCCAAATAGGGGGCACTTTGATTTTAGCGGAGTGGATGATGACTTTGACATTGACTATG
TCTTCCGAACTGCTTTTGGTGGATCCCGAGGTTTCTCTTTTTCATTCACCTTCGAGAGGA
GGATGAACCTCCTCGATGGCATCATTCTTCAAGGTTCTCCAATAACTCTAAAAGGTCTGG
GAGATCAAAACATCATCGAATATACGAGGATGAAGATGAAGAAGGGTATACTTCAACAGA
ATCCAGCGACTCTGAGTCTGAGCCAAACCAAGCTTCTCATAGACAAGCTCTTGGCCTGAG
TCCTTCTGGTCCATTAAACCTCAAAGACGTCAAACATGCATATCGAACTTGCGCTTTGAA
ATGGCACCCAGATCGTCATCAAGGCTCAACCAAGGAGGCGGCTGAAGCAAAGTTTAAGGT
CTGCAGTGTGGCTTATCAATCTTTATGCGAAAAGCTAGCAGTGAACTGAAAGATGAAGGA
GTTTTATATAGAGTGTTTGATTACTTAGAGATATGATATTCAAAGTGTTCATTTAAAAGC
TTATCCTAAATAATAACACTACTATAGGATCCAAAGCTATTTCTTTCTTCTGTCATCTTT
TATTACTAAACTTTCAAAACATTTCTACCAAAGTGATGAGTATTTATTTCTCAGCTCT

QA 1 838 1 838
DS 



AS 1 3

CO CL3561Contig1 880 3 7 U
GGATCTTTCTGGGACAAAGTCCGTTCCTTCTGATTCCCAGATGTTCGATTCAATTTGAGC
ATCCAGAAGAAGAAGAAGCTTAACAGAAGAATCTTTGTGTTTTTTTTTTTGTTCAATAAT
CTTTCCCAAAAAAAGAGGGAGAAAATGAGCGCATCGAGATTTGTAAAATGTGTGACGGTT
GGTGATGGAGCTGTCGGAAAAACATGTTTGTTGATCTCTTACACAAGCAACACTTTCCCT
ACGGACTATGTGCCCACCGTTTTCGATAATTTCAGTGCAAATGTGGTGGTCAATGGAGCC
ACCGTTAATCTTGGATTGTGGGATACCGCAGGGCAAGAGGATTACAATAGATTAAGACCA
CTGAGTTACCGTGGAGCAGATGTTTTCATATTGGCCTTCTCTCTTATCAGTAAAGCCAGT
TATGAAAATGTCTCCAAAAAGCGGATCCCTGAGCTGAAACATTACGCGCCTGGTGTCCCC
ATCATCCTCGTTGGATCAAAGCTTGATCTTCGAGATGATAAGCAGTTCTTCGTCGACCAT
CCTGGTGCTGTCCCGATTACTACTGCTCAGGGAGAGGAGCTGAGGAAGCTAATATATGCA
CCTACTTACGTCGAATGCAGTTCCAAATCTCAAGAGAATGTGAAAGCGGTGTTTGACGCA
GCCATACGAGTGGTCTTGCAACCTCCGAAGCAAAAGAAGAAGAAGAGCAAAGCGCAGAAG
GCATGCTCCATCCTATGATGATGATATGATTGGAAAAGCTCTGTTTTTTATTTATTTGTG
GTTTTGGTAACATTTCATCAATGAGTTAATGGACAGACCCACCAAGTTTGGTTTTGGTCT
TTTCTTTTGATTCTTAATATTATTAAATCGAGTTTATTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1H411TF U 1
AF RS1FF08TF U 151
AF RS1H411JQB C 212
BS 1 571 RS1H411TF
BS 572 572 RS1FF08TF
BS 573 644 RS1H411TF
BS 645 819 RS1FF08TF
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BS 821 879 RS1FF08TF
BS 880 880 RS1H411JQB

RD RS1H411TF 644 0 0
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ATCCAGAAGAAGAAGAAGCTTAACAGAAGAATCTTTGTGTTTTTTTTTTTGTTCAATAAT
CTTTCCCAAAAAAAGAGGGAGAAAATGAGCGCATCGAGATTTGTAAAATGTGTGACGGTT
GGTGATGGAGCTGTCGGAAAAACATGTTTGTTGATCTCTTACACAAGCAACACTTTCCCT
ACGGACTATGTGCCCACCGTTTTCGATAATTTCAGTGCAAATGTGGTGGTCAATGGAGCC
ACCGTTAATCTTGGATTGTGGGATACCGCAGGGCAAGAGGATTACAATAGATTAAGACCA
CTGAGTTACCGTGGAGCAGATGTTTTCATATTGGCCTTCTCTCTTATCAGTAAAGCCAGT
TATGAAAATGTCTCCAAAAAGCGGATCCCTGAGCTGAAACATTACGCGCCTGGTGTCCCC
ATCATCCTCGTTGGATCAAAGCTTGATCTTCGAGATGATAAGCAGTTCTTCGTCGACCAT
CCTGGTGCTGTCCCGATTACTACTGCTCAGG*AGAGGAGCTGAGGAAGCTAATATATGCA
CCTACTTACGTCGAATGCAGTTCCAAATCTCAAGAGAATGTGAA

QA 1 644 1 644
DS 

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GCATCGAGATTTGTAAAATGTGTGACGGTTGGTGATGGAGCTGTCGGAAAAACATGTTTG
TTGATCTCTTACACAAGCAACACTTTCCCTACGGACTATGTGCCCACCGTTTTCGATAAT
TTCAGTGCAAATGTGGTGGTCAATGGAGCCACCGTTAATCTTGGATTGTGGGATACTGCA
GGGCAAGAGGATTACAATAGATTAAGACCACTGAGTTACCGTGGAGCAGATGTTTTCATA
TTGGCCTTCTCTCTTATCAGTAAAGCCAGTTATGAAAATGTCTCCAAAAAGTGGATCCCT
GAGCTGAAACATTACGCGCCTGGTGTCCCCATCATCCTCGTTGGATCAAAGCTTGATCTT
CGAGATGATAAGCAGCTCTTCGTCGACCATCCTGGTGCTGTCCCAATTACTACTGCTCAG
GGAGAGGAGCTGAGGAAGCTAATAGATGCATCTACTTACGTCGAATGCAGTTCCAAATCT
CAAGAGAATGTGAAAGCGGTGTTTGACGCAGCCATACGAGTGGTCTTGCAACCTCCGAAG
CAAAAGAAGAAGAAGAGCAAAGCGCAGAAGGCATGCTCCATCCTATGATGATGATATGAT
TGGAAAAGCTCTGTTTTTTATTTATTTGTGGTTTTGGTAACATTTCATCAATGAGTTAAT
GGACAGACC*ACCAAGTTTGGTTTTGGTCTTTTCTTTTGATTCTTAATATTATTAAATCG
AGTTTATTC

QA 1 729 1 729
DS 

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TGATCTCTTACACAAGCAACACTTTCCCTACGGACTATGTGCCCACCGTTTTCGATAATT
TCAGTGCAAATGTGGTGGTCAATGGAGCCACCGTTAATCTTGGATTGTGGGATACCGCAG
GGCAAGAGGATTACAATAGATTAAGACCACTGAGTTACCGTGGAGCAGATGTTTTCATAT
TGGCCTTCTCTCTTATCAGTAAAGCCAGTTATGAAAATGTCTCCAAAAAGCGGATCCCTG
AGCTGAAACATTACGCGCCTGGTGTCCCCATCATCCTCGTTGGATCAAAGCTTGATTTTC
GAGATGATAAGCAGTTTTTCGTCGACCATCCTGGTGCTGTCCCGATTACTACTGCTCAGG
GAGAGGAGCTGAGGAAGCTAATATATGCACCTACTTACGTCGAATGCAGTTCCAAATCTC
AAGAGAATGTGAAAGCGGTGTTTGACGCAGCCATACGAGTGGTCTTGCAACCTCCGAAGC
AAAAGAAGAAGAAGAGCGAAGCGCAGAAGGCATGCTCCATCCTATGATGATGATATGATT
GGAAAAGCTCTGTTTTTTATTTATTTGTGGTTTTGGTAACATTTCATCAATGAGTTAATG
GACAGACCCACCAAGTTTGGTTTTGGTCTTTTCTTTTGATTCTTAATATTATTAAATCGA
GTTTATTCG

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 3

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AAGAAGAACTTCCTTGCTCGCATGCATATGAAAGCCGTATCAACTCGCCTTCGTAGATAC
GGTCTCAGGTACGATGATCTACACGATCAGTATGAAAGTCTGGACATTAAGGAAGCTCTG
AACAGATTGCCCAGGGAGGTCGTTGACGCTCGTAACCAGCGTCTCAAGCGTGCCATGGAC
CTCTCCATGAAGCACGAGTACCTTCCCAAGGATCTTCAGGCGGTGCAGACACCATTCCGT
GGCTATCTACAGGAGATGCTGGCTCTCGTTGAAAGGGAAAGAAAGGAACGTGAAGCCTTG
GGAGCTCTACCACTCTACCAGCGCACGTTCCCTTAAGCACATCCTTTTTCCCTATCTTCT
GATAAACTCTACTTCTCTGCATCAATCTCCTCTCCAGATGGGGATTAATTTTTGATATTT
TGGAAATCACATTCCTGAACAGAGCTATTTACTTCCTCAAAAGCCCAAGTCTTTTGTGAT
TCTTTTCCTAAATTGGATGATATGTTGCTTGCTACATTTTTACACTTTCTGCTGGCATGA
ATAAAATCGACGACACAACACTGAGTCTGGTTCAGTGATTCTCATTTTCTCAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1FI13TF U 1
AF RS1GL61JQ C 46
AF RS1GL61TF U 46
BS 1 148 RS1FI13TF
BS 149 149 RS1GL61TF
BS 150 217 RS1FI13TF
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BS 340 453 RS1FI13TF
BS 454 717 RS1GL61TF

RD RS1FI13TF 453 0 0
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AACAGATTGCCCAGGGAGGTCGTTGACGCTCGTAACCAGCGTCTCAAGCGTGCCATGGAC
CTCTCCATGAAGCACGAGTACCTTCCCAAGGATCTTCATGCGGTGCAGACACCATTCCGT
GGCTATCTACAGGAGATGCTGGCTCTCGTTGAAAGGGAAAGAAAGGAACGTGAAGCCTTG
GGAGCTCTACCACTCTACCAGCGCACGTTCCCT

QA 1 453 1 453
DS 

RD RS1GL61JQ 666 0 0
GG
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ACTAATCGATCCAAAGAAGAACTTCCTTGCTCGCATGCATATGAAAGCCGTATCAACTCG
CCTTCGTAGATACGGTCTCAGGTACGATGATCTACACGATCAGTATGAAAGTCTGGACAT
TAAGGAAGCTCTGAACAGATTGCCCAGGGAGGTCGTTGACGCTCGTAACCAGCGTCTCAA
GCGTGCCATGGACCTCTCCATGAAGCACGAGTACCTTCCCAAGGATCTTCAGGCGGTGCA
GACACCATTCCGTGGCTATCTACAGGAGATGCTGGCTCTCGTTGAAAGGGAAAGAAAGGA
ACGTGAAGCCTTGGGAGCTCTACCACTCTACCAGCGCACGTTCCCTTAAGCACATCCTTT
TTCCCTATCTTCTGATAAACTCTACTTCTCTGCATCAATCTCCTCTCCAGATGGGGATTA
ATTTTTGATATTTTGGAAATCACATTCCTGAACAGAGCTATTTACTTCCTCAAAAGCCCA
AGTCTTTTGTGATTCTTTTCCTAAATTGGATGATATGTTGCTTGCTACATTTTTACACTT
TCTGCTGGCATGAATAAAATCGACGACACAACACTGAGTCTGGTTCAGTGATTCTCATTT
TCTC

QA 3 666 3 666
DS 

RD RS1GL61TF 672 0 0
GG
GAGAGAGAGAGAAAGAGAAGCACGCACACACGGAGAGAAAATGTCGACGTTTCTGCAATC
ACTAATCGATCCAAAGAAGAACTTCCTTGCTCGCATGCATATGAAAGCCGTATCAACTCG
CCTTCGTAGATACGGTCTCAGGTACGATGATCTACACGATCAGTATGAAAGTCTGGACAT
TAAGGAAGCTCTGAACAGATTGCCCAGGGAGGTCGTTGACGCTCGTAACCAGCGTCTCAA
GCGTGCCATGGACCTCTCCATGAAGCACGAGTACCTTCCCAAGGATCTTCAGGCGGTGCA
GACACCATTCCGTGGCTATCTACAGGAGATGCTGGCTCTCGTTGAAAGGGAAAGAAAGGA
ACGTGAAGCCTTGGGAGCTCTACCACTCTACCAGCGCACGTTCCCTTAAGCACATCCTTT
TTCCCTATCTTCTGATAAACTCTACTTCTCTGCATCAATCTCCTCTCCAGATGGGGATTA
ATTTTTGATATTTTGGAAATCACATTCCTGAACAGAGCTATTTACTTCCTCAAAAGCCCA
AGTCTTTTGTGATTCTTTTCCTAAATTGGATGATATGTTGCTTGCTACATTTTTACACTT
TCTGCTGGCATGAATAAAATCGACGACACAACACTGAGTCTGGTTCAGTGATTCTCATTT
TCTCAAAAAA

QA 3 672 3 672
DS 



AS 1 3

CO CL3563Contig1 639 3 2 U
GGATATAGGGCGGTAACTTTATTATATAAAGACCTCAAAGTCATTCCATTTTAACGGAAA
AGCTCTCCACGCCAAAAGAAAAAAGAAAGAGACCCAAGAATCTTAGCAACAATGGCGATG
GCTTTCAAGATGGCCACGACGGGGATGCGAGTGACGGAAGAGTGCACGAGCTCATTCTTG
GAGATGAAATGGAAGAAAGTGCACAGATACATCGTGTTCAAGATCGATGAGAATTCCCGT
AAAGCCACCGTCGATAAAGTTGGTGGTGCCGGAGAAAACTATCAAGATCTCGCCGCTTCC
TTACCCGTGGACGACTGTCGCTATGCCGTATTTGATTTCGACTTTGTCACGGTCGATAAC
TGCCGCAAGAGCAAGATCTTCTTCATCTACTGGTCGCCGGAGGCATCTAGGATAAGGGCA
AAGATCTTATACGCAACGTCGAAGGCTGGGCTGAGGAGGGTTTTGGAAGGGATTCACTAT
GAGCTTCAAGCTACCGATCCGACTGAGATGGGATTCGATATTATCCAAGACCGTGCCAAA
TAAGTTAATCAAAAGAGTATAATATAATATGACTGACCCCACTTTGTCGGATAATTATCA
TTGATCAGGTATCAATAAATGTTAATTATTGGTGGTTAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 
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AF RS1CB32JQ C 1
AF RS1CB32TF U 1
AF RS1F928TF U 54
BS 1 608 RS1CB32TF
BS 609 639 RS1F928TF

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TTGATCAG
GTA

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DS 

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GAGATGAAATGGAAGAAAGTGCACAGATACATCGTGTTCAAGATCGATGAGAATTCCCGT
AAAGCCACCGTCGATAAAGTTGGTGGTGCCGGAGAAAACTATCAAGATCTCGCCGCTTCC
TTACCCGTGGACGACTGTCGCTATGCCGTATTTGATTTCGACTTTGTCACGGTCGATAAC
TGCCGCAAGAGCAAGATCTTCTTCATCTACTGGTCGCCGGAGGCATCTAGGATAAGGGCA
AAGATCTTATACGCAACGTCGAAGGCTGGGCTGAGGAGGGTTTTGGAAGGGATTCACTAT
GAGCTTCAAGCTACCGATCCGACTGAGATGGGATTCGATATTATCCAAGACCGTGCCAAA
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TTGATCAG
TATCA

QA 1 608 1 608
DS 

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GG
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CGATGGCTTTCAAGATGGCCACGACGGGGATGCGAGTGACGG**GAGTGCACGAGCTCAT
TCTTGGAGATGAAATGGAAGAAAGTGCACAGATACATCGTGTTCAAGATCGATGAGAATT
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CTTCCTTACCCGTG*ACGACTGTCGCTATGCCGTATTTGATTTCGACTTTGTCACGGTCG
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ACTATGAGCTTCAAGCTACCGATCCGACTGAGATGGGATTCGATATTATCCAAGACCGTG
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TATCATTGATCAGGTATCAATAAATGTTAATTATTGGTGGTTAC

QA 3 586 3 586
DS 



AS 1 3

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GCTTGAAAGTAGGCTTCTACAGCAAAACTTGCCCACAGGTCGAGGGTATTGTTAAAAAGG
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TCCACGACTGCTTCGTGCGGGGATGTGACGGATCAATTTTGTTAGACTCATCGAACAATC
AAGCCGAGAAGAATGCGGTTCCTAACCTAAGCCTTAGAGGGTTTGGCATCATAGACGATT
CCAAGGCGGCTCTAGAAAAAGTGTGCCCTGGCATAGTTTCTTGCTCTGATATTTTAGCCC
TTATTGCCAGGGACGCAGTGGTTGCACTTGAAGGACCAGCGTGGGAAGTTGAAACGGGAA
GAAGAGATGGTAGGGTTTCTAATATCAATGAGGTCAACTTGCCATCGCCTTTTGATAACA
TCACCAAGCTTATCACCGAATTTAGCACAAAGGGACTCAACGAGAAAGATCTAGTCGTTC
TTTCAGGTGGACACGCTATTGGAATGGGACATTGTCCTCTGATGTCAAACCGTCTTTACA
ACTTCACCGGAAGAGGAGACAGCGACCCAAGTTTGGACTCGGAGTACGCCAGTAACCTCA
GGAAGAAATGCAACCGGCAGACACCACGACGGCTCTAGAGATGGATCCAGGAAGTTTCAA
GACATTCGACGTGAGCTACTTCAAGCTAGTGGCAAAGAGAAGGGGGCTATTCCAGTCGGA
TGCTGCTCTATTGGACAATTCAAAGACTAGGGGTTATGTCTTGCAGCAGGCACGTGGTTC
AACCTTCTTCCATGACTTTGGTGTCTCTATGGTGAAAATGGGTCGGAACGGAGTTCTTAC
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GTTTAATTCATATGGTTTGCTTCTTTGCTTAATTGCGATTTGTGTTTCTTGGGGATAAGA
TAAGCCATGTATTTTCCTTCAAAGTCTAAGAAATGGATTAATAATAATTGATTGTTGTG


BQ
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AF RS1BI17TF U 1
AF RS1BI17JQ C 346
AF RS1FB37TF U 974
BS 1 688 RS1BI17TF
BS 689 973 RS1BI17JQ
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AGCGATCAGTTGTCTCTTGCTTTTTCTTAGTGTTGTTGCTAGCAGAAGCAAATGCACAAG
GCTTGAAAGTAGGCTTCTACAGCAAAACTTGCCCACAGGTCGAGGGTATTGTTAAAAAGG
TCGTGTTTGCTGCCATGAAGAAAGCGCCTACCCTCGGTGCTCCTTTGCTTAGAATGTTCT
TCCACGACTGCTTCGTGCGGGGATGTGACGGATCAATTTTGTTAGACTCATCGAACAATC
AAGCCGAGAAGAATGCGGTTCCTAACCTAAGCCTTAGAGGGTTTGGCATCATAGACGATT
CCAAGGCGGCTCTAGAAAAAGTGTGCCCTGGCATAGTTTCTTGCTCTGATATTTTAGCCC
TTATTGCCAGGGACGCAGTGGTTGCACTTGAAGGACCAGCGTGGGAAGTTGAAACGGGAA
GAAGAGATGGTAGGGTTTCTAATATCAATGAGGTCAACTTGCCATCGCCTTTTGATAACA
TCACCAAGCTTATCACCGAATTTAGCACAAAGGGACTCAACGAGAAAGATCTAGTCGTTC
TTTCAGGTGGACACGCTATTGGAATGGGACATTGTCCTCTGATGTCAAACCGTCTTTACA
ACTTCACCGGAAGAGGAGACAGCGACCC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RS1BI17JQ 774 0 0
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CTGATATTTTAGCCCTTATTGCCAGGGACGCAGTGGTTGCACTTGAAGGACCAGCGTGGG
AAGTTGAAACGGGAAGAAGAGATGGTAGGGTTTCTAATATCAATGAGGTCAACTTGCCAT
CGCCTTTTGATAACATCACCAAGCTTATCACCGAATTTAGCACAAAGGGACTCAACGAGA
AAGATCTAGTCGTTCTTTCAGGTGGACACGCTATTGGAATGGGACATTGTCCTCTGATGT
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GCAGGCACGTGGTTCAACCTTCTTCCATGACTTTGGTGTCTCTATGGTGAAAATGGGTCG
GAACGGAGTTCTTACGGGTCGTGCCGGGGAGATTCGTAGCATGTGTCGTGTTCGTAACTA
AGAGTCTTTTTTTTGGTTTAATTCATATGGTTTGCTTCTTTGCTTAATTGCGATTTGTGT
TTCTTGGGGATAAGATAAGCCATGTATTTTCCTTCAAAGTCTAAGAAATGGATT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RS1FB37TF 166 0 0
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GGTTTGCTTCTTTGCTTAATTGCGATTTGTGTTTCTTGGGGATAAGATAAGCCATGTATT
TTCCTTCAAAGTCTAAGAAATGGATTAATAATAATTGATTGTTGTG

QA 1 166 1 166
DS 



AS 1 3

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GGCTGCTTTGTCTGATAAACTAGCGGATGCTTACCAGAACGCAAGGCCAAGGTACCCGAT
CGACTGGTTCACGAAGCTTGCTGCTCGAACCAGTCAACACAAATTGGCTTGGGATGTCGG
TACTGGAAATGGTCAAGCCGCCATTGGTCTCGCAGAGTACTTCGAGAAAGTTGTGGCTAC
AGACATAAACGAAGCACAACTGAAACGAGCGGTGAAACACGAGCGAATCAGCTACCATCA
CACTCCAACAGAGTTGTCCGAAGACAAAATGGTCGCTCTAGTCGGCGGAGATAACTCCGT
TGACCTCATCATCGCAGCACAAGCCGTTCACTACTTCGATCTCATACCATTCTACAACAT
AGCCAAACGTGTACTTCGCAAAGAAGGAGGTTTAATCGCTGTTTGGGTCTACAACGACCT
AATCATCTCCCCTGAAGTCGATGCCATCATGAAACGTCTTGTCGACTCCACGTTTCCGTA
TAGAACTCCCGTTATGAATCTTGCGTTTGACGGCTACAAAACGATACCGTTTCCGTTTGA
AGGCATAGGGATGGGATCAGAAGGGAAGCCTATACAGCTTGACATTCCTCATAAGCTTTC
GCTTAAAGGGTTTATAGGGTTCTTGAGATCTTGGCAGCCTGCTATGAAAGCCAAAGAAAG
AGGAGTTGTGCTTGTAACTGAAGATTTGATCAATCAGTTTGA*GATGCTTGGGGTGATGA
TGATGATGTTAAGGATATTTTCTACAAAGCTCATATGATCGTTGGCAAACTTTCGGCTGC
AGATATAGAACGTCATAGAAAGGGATTTGAATCAAACTGTGGGGTTACAAAACTGAAGGA
TAGTAACAACTCAGCCGTTATTGCTTCAGTGACGGCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F569TF U 1
AF RS1CI83TF U 6
AF RS1CI83JQ C 707
BS 1 38 RS1F569TF
BS 39 39 RS1CI83TF
BS 40 151 RS1F569TF
BS 152 152 RS1CI83TF
BS 153 329 RS1F569TF
BS 330 330 RS1CI83TF
BS 331 522 RS1F569TF
BS 523 523 RS1CI83TF
BS 524 728 RS1F569TF
BS 729 729 RS1CI83TF
BS 730 819 RS1F569TF
BS 820 938 RS1CI83JQ

RD RS1F569TF 820 0 0
GGAAGCCAAGACAAGAACAAGAACACGAAACACACAAATAGATCAAGAAGAAAAAAGAAT
GGCTGCTTTGTCTGATAAACTAGCGGATGCTTACCAGAACGCAAGGCCAAGGTACCCGAT
CGACTGGTTCACGAAGCTTGCTGCTCGAACCGGTCAACACAAATTGGCTTGGGATGTCGG
TACTGGAAATGGTCAAGCCGCCATTGGTCTCGCAGAGTACTTCGAGAAAGTTGTGGCTAC
AGACATAAACGAAGCACAACTGAAACGAGCGGTGAAACACGAGCGAATCAGCTACCATCA
CACTCCAACAGAGTTGTCCGAAGACAAAA*GGTCGCTCTAGTCGGCGGAGATAACTCCGT
TGACCTCATCATCGCAGCACAAGCCGTTCACTACTTCGATCTCATACCATTCTACAACAT
AGCCAAACGTGTACTTCGCAAAGAAGGAGGTTTAATCGCTGTTTGGGTCTACAACGACCT
AATCATCTCCCCTGAAGTCGATGCCATCATGAAACGTCTTGTTGACTCCACGTTTCCGTA
TAGAACTCCCGTTATGAATCTTGCGTTTGACGGCTACAAAACGATACCGTTTCCGTTTGA
AGGCATAGGGATGGGATCAGAAGGGAAGCCTATACAGCTTGACATTCCTCATAAGCTTTC
GCTTAAAGGGTTTATAGGGTTCTTGAGATCTTGGCAGCCTGCTATGAAAGCCAAAGAAAG
AGGAGTTGAGCTTGTAACTGAAGATTTGATCAATCAGTTTGA*GATGCTTGGGGTGATGA
TGATGATGTTAAGGATATTTTCTACAAAGCTCATATGAT
T

QA 1 819 1 819
DS 

RD RS1CI83TF 803 0 0
GG
AAGACAAGAACAAGAACACGAAACACACAAAGAGATCAAGAAGAAAAAAGAATGGCTGCT
TTGTCTGATAAACTAGCGGATGCTTACCAGAACGCAGGGCCAAGGTACCCGATCGACTGG
TTCACGAAGCTTGCTGCTCGAACCAGTCAACACAAATTGGCTTGGGATGTCGGTACTGGA
AATGGTCAAGCCGCCATTGGTCTCGCAGAGTACTTCGAGAAAGTTGTGGCTACAGACATA
AACGAAGCACAACTGAAACGAGCGGTGAAACACGAGCGAATCAGCTACCATCACACTCCA
ACAGAGTTGTCCGAAGACAAAATGGTCGCTCTAGTCGGCGGAGATAACTCCGTTGACCTC
ATCATCGCTGCACAAGCCGTTCACTACTTCGATCTCATACCATTCTACAACATAGCCAAA
CGTGTACTTCGCAAAGAAGGAGGTTTAATCGCTGTTTGGGTCTACAACGACCTAATCATC
TCCCCTGAAGTCGATGCCATCATGAAACGTCTTGTCGACTCCACGTTTCCGTATAGAACT
CCCGTTATGAATCTTGCGTTTGACGGCTACAAAACGATACCGTTTCCGTTTGAAGGCATA
GGGATGGGATCAGAAGGGAAGCCTATACAGCTTGACATTCCTCATAAGCTTTCGCTTAAA
GGGTTTATAGGGTTCTTGAGATCTTGGCAGCCTGCTATGAAAGCCAAAGAAAGAGGAGTT
GTGCTTGTAACTGA*GATTTGATCAATCAGTTTGA*GATGCTTGGGGTGATGATGATGAT
GTTAAGGATATTTTCTACAAA

QA 3 803 3 803
DS 

RD RS1CI83JQ 232 0 0
AAAGCCAAAGAAAGAGGAGTTGTGCTTGTAACTGAAGATTTGATCAATCAGTTTGAAGAT
GCTTGGGGTGATGATGATGATGTTAAGGATATTTTTTACAAAGCTCATATGATCGTTGGC
AAACTTTCGGCTGCAGATATAGAACGTCATAGAAAGGGATTTGAATCAAACTGTGGGGTT
ACAAAACTGAAGGATAGTAACAACTCAGCCGTTATTGCTTCAGTGACGGCTG

QA 1 232 1 232
DS 



AS 1 2

CO CL3566Contig1 737 2 3 U
TTTTTATTACATTCCTCTGCCAATTCGTGAGTCTCACCTCTCCCCCGGATGGAGTTCTCT
AGAGAAGCTGGAATGATGATGGAAAATAAGCGGAGTGTATGTTCTCTCGAAGAAAGTAGC
ATCAAGCGTCACAAGTCTGATCTCTCTTTCAGTTCCAAGAGAAAGGACAAAGCTGGAGAA
CGTATCTCAGCTCTTCAACAGATAGTTTCCCCTTACGGAAAGACCGACTCTGCATCAGTT
CTTCAAGACGCGTTTCATTACATAGAGTTTCTACATGAACAAGTGAAGGTGCTAAGCGCT
CCGTATCTGCAAACAATGACCGCTGCTACGCAGGAGGAGCTGGAGCAGTACAGCCTGAGA
AACAGAGGATTATGTCTTGTTCCAATGGAGTATACAGCAGGAGTTGCTCAAAGCAACGGT
ACTGATATCTGGGCGCCCGTGAAGACTCCTCCATCTCCAGCTTTCGGCGTAAAGTCTCAA
TCACCCTTTAGATGACTGATTCAGACTCTTCCCAACCTACTAAGATCTTTGTCTTAAGCC
TTAAGAAGATGGTCAATTGTTATTGTTCAGATCCTGCCTCTGTATCATACGTAGACCAAA
GGCACATGAAGTTGGTTTGGAACAGCTCAGAGTTGGTGATGGCTGTTTCTATTTGACCGC
CTTAAATATGTAATTCGCCTAAGCTTAAACCAAACGATTCTAATGCTAAGTAATCTTTAT
GCCAAAGCTTGCCTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F708TF U 338
AF RS1GI40JQ C 1
BS 1 337 RS1GI40JQ
BS 338 541 RS1F708TF
BS 542 737 RS1GI40JQ

RD RS1F708TF 204 0 0
AGCTGGAGCAGTACAGCCTGAGAAACAGAGGATTATGTCTTGTTCCAATGGAGTATACAG
CAGGAGTTGCTCAAAGCAACGGTACTGATATCTGGGCGCCCGTGAAGACTCCTCCATCTC
CAGCTTTCGGCGTAAAGTCTCAATCACCCTTTAGATGACTGATTCAGACTCTTCCCAACC
TACTAAGATCTTTGTCTTAAGCCT

QA 1 204 1 204
DS 

RD RS1GI40JQ 737 0 0
TTTTTATTACATTCCTCTGCCAATTCGTGAGTCTCACCTCTCCCCCGGATGGAGTTCTCT
AGAGAAGCTGGAATGATGATGGAAAATAAGCGGAGTGTATGTTCTCTCGAAGAAAGTAGC
ATCAAGCGTCACAAGTCTGATCTCTCTTTCAGTTCCAAGAGAAAGGACAAAGCTGGAGAA
CGTATCTCAGCTCTTCAACAGATAGTTTCCCCTTACGGAAAGACCGACTCTGCATCAGTT
CTTCAAGACGCGTTTCATTACATAGAGTTTCTACATGAACAAGTGAAGGTGCTAAGCGCT
CCGTATCTGCAAACAATGACCGCTGCTACGCAGGAGGAGCTGGAGCAGTACAGCCTGAGA
AACAGAGGATTATGTCTTGTTCCAATGGAGTATACAGCAGGAGTTGCTCAAAGCAACGGT
GCTGATATCTGGGCGCCCGTGAAGACTCCTCCATCTCCAGCTTTCGGCGTAAAGTCTCAA
TCACCCTTTAGATGACTGATTCAGACTCTTCCCAACCTACTAAGATCTTTGTCTTAAGCC
TTAAGAAGATGGTCAATTGTTATTGTTCAGATCCTGCCTCTGTATCATACGTAGACCAAA
GGCACATGAAGTTGGTTTGGAACAGCTCAGAGTTGGTGATGGCTGTTTCTATTTGACCGC
CTTAAATATGTAATTCGCCTAAGCTTAAACCAAACGATTCTAATGCTAAGTAATCTTTAT
GCCAAAGCTTGCCTCAG

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 3

CO CL3567Contig1 1144 3 17 U
GGAAGCATTTTATAGGTAAGAGATCTGTGAGCTCATACGTTATCATCAAATGGCGAAGGA
GACAGTGTGTGTAACCGGCGCCAACGGTTTCATCGGATCCTGGATCATCCGAACGCTACT
TGACAACGGATACACCAAAATCCACGCCTCGATATACCCAGGATCCGACCCGACTCAGCT
CCTCAAACTACCAAGACCCGACGAGACAAACACCGAGATCAAGATCTTCGAAGCCGATCT
CCTAGACTCCGACGCCATTGCCCGAGCCGTAGACGGGTGCGCTGGAGTGTTCCATGTGGC
GTCACCTTGTACGTTGGATCCACCGGAGAATCCGGAGAAGGAGCTGGTCGAACCGGCGGT
TAAGGGAACGATCAATGTGTTGTTGGCAGCTAATAGGTTCAATGTGAGGCGCGTGGTGAT
CACTTCCTCTATCTCGGCTTTGGTTCCGAACCCTGATTGGCCGGAAGGAAGACCTGTAGA
TGAGTCTTCGTGGACCGATCTCGAGTTTTGCAAGTCGATGCAGAAATGGTATCCAATTTC
AAAGACACTAGCTGAGAAAGCAGCTTGGGAGTTTTCTGAGAAGCATGGAACCAACGTTGT
GACCGTCCATCCATCCACATGCCTCGGACCACTTCTGCAACCTAGCCTAAACGCAAGCTG
CGCCGTTTTGCTCCAGCTCTTACAAGGCTCGACCGAGACACAAGAGCATCATTGGCTCGG
TGTGGTGCACGTGAGAGATGTGGCTAAAGCTCACGTGATGCTGTTCGAAACACCTGAAGC
TTCTGGTCGGTTTCTATGCAGTAACGGGATCTATCAGTTCAGTGAGTTCGCTGCTCTGGT
CTCCAAACTCTTCCCTGAGTTTGGTGTTCACAAGTTTGATAAAGAAACTCAACCAGGGCT
TGCAGCGTGTAAAGATGCGGCTAAGAGATTGATTGAGATGGGGTTGGAGTTTACTCCGGT
TGAAGATGCGATTAAGGGGACGGTCCAGAGTCTTAGAGACAAAGGCTTCCTCTGAATGAA
TTTAATATCGTCGCAAATTCCCAACTATGTGACCTTTGTTGTAATGTACAAGTAGAGGAA
CTAAGAAGTGAACGGGTGGTTCATATGATACATCTATGTATTGAGTACAAGGTATTATCA
AAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 

AF RS1BS06TF U 1
AF RS1AR81TFB U 54
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TGT

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DS 



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BQ
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AF RS1E845JQ U 36
AF RS1AA53TF C 1
AF RS1AA53JQ U 61
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BS 36 89 RS1E845JQ
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TGCATCTTTGCAGAAGAAAAAGAACGAAGAAGCAGGCTTCTTTGGTTTGTTAGGATCCAC
AGTCTCGTTCTTCTTCTTGTTCTTAGTCGTTTCTTTCTTCATCTTTATGATGTTGTCAGT
TTTCTCTTTCTTCTTGAGAAGTTGGAGAGCTTCTTGTTTGTGGAGTTTCATCAGTTCCTC
TTCTTCTTTCTTTTGGCTCATAGCTTCTTCC

QA 1 571 1 571
DS 



AS 1 3

CO CL3569Contig1 1096 3 5 U
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CTTTCGCGAATCTACGCGTGGTTGATCATGGAATCTCCGTTCAAGCCTGATGTGCTCAAA
GGCAAGGTTGCTCTCATCACCGGAGGCGGATCCGGCATCGGTTTCGAGATCTCCTCTCAG
TTCGGCAAACACGGTGCTTCCATCGCCATCATGGGACGCCGCAAGCAAGTCCTCGACGCC
GCCGTCTCTGATCTCCGATCTCTCGGGATTCCGGCTATTGGATTGGAAGGTGATGTTCGT
AAGCCGGAGGATGCGAAGAGAGTCGTGGAATCAACTTTTCAGCGTTTCGGTAGGATTGAT
ATCCTCGTTAACGCCGCCGCCGGTAATTTCCTCTCGGCGGCTGAGGATTTGTCTACCAAT
GGTTTCCGAACAGTTTTAGATATTGATGCGGTTGGAACATTCAACATGTGCCACGAAGCA
CTTAAGTACCTTAAGAAAGGAGGGCCTGGTAGAGACTCATCAAGCAGCGGTGGTTCCATA
CTCAACATAAGTGCTACTCTGCATTATACGGCTTCTTGGTACCAGATACATGTTTCTGCA
GCCAAGGCAGCAGTTGATGCTACGACAAGGAACTTGGCATTGGAGTGGGGAACCGACTAC
GAGATTAGAGTCAACGGGGTTGCACCAGGACCGATAGGAGGCACGCCTGGAATGAGTAAG
CTTGTACCTGACGAGATCGAAAACAAAACCCGAGAGTACATGCCTCTGTATAAACTTGGA
GAGAAGTGGGATATCGCCATGGCTGCAATCTACCTCAGCTGTGATACTGGGAAATATGTG
AATGGACTAACAATGGTGGTTGATGGAGGATTGTTTCTTAGCAAGCCTCGCCATTTGGCA
AAAGAAGCTGTGAAGGAACTATCACGTGTTGTCGAGAAGAGGTCTAGGGCCAAGCCTGTT
GGTCTGCCGACCAGTAAACTTTGAAGAGCATTTTGAGTTTCTCATCTCAAACATTAAGTG
TGTGTTGTTGGGTTATTTGATTGTTTTACATTGAAGACAAATAAAATGGTGGTGCTAAGA
TTCCCCCTTCATAGTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CN42TF U 1
AF RS1BL70TF U 262
AF RS1BL70JQ C 379
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GCCGTCTCTGATCTCCGATCTCTCGGGATTCCGGCTATTGGATTGGAAGGTGATGTTTGT
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ATCCTCGTTAACGCCGCCGCCGGTAATTTCCTCTCGGCGGCTGAGGATTTGTCTACCAAT
GGTTTCCGAACAGTTTTAGATATTGATGCGGTTGGAACATTCAACATGTGCCACGAAGCA
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CTCAACATAAGTGCTACTCTGCATTATACGGCTTCTTGGTACCAGATACATGTTTCTGCA

QA 1 600 1 600
DS 

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GGTAATTTCCTCTCGGCGGCTGAGGATTTGTCTACCAATGGTTTCCGAACAGTTTTAGAT
ATTGATGCGGTTGGAACATTCAACATGTGCCACGAAGCACTTAAGTACCTTAAGAAAGGA
GGGCCTGGTAGAGACTCATCAAGCAGCGGTGGTTCCATACTCAACATAAGTGCTACTCTG
CATTATACGGCTTCTTGGTACCAGATACATGTTTCTGCAGCCAAGGCAGCAGTTGATGCT
ACGACAAGGAACTTGGCATTGGAGTGGGGAACCGACTACGAGATTAGAGTCAACGGGGTT
GCACCAGGACCGATAGGAGGCACGCCTGGAATGAGTAAGCTTGTACCTGACGAGATCGAA
AACAAAACCCGAGAGTACATGCCTCTGTATAAACTTGGAGAGAA

QA 1 524 1 524
DS 

RD RS1BL70JQ 718 0 0
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GGAGGGCCTGGTAGAGACTCATCAAGCAGCGGTGGTTCCATACTCAACATAAGTGCTACT
CTGCATTATACGGCTTCTTGGTACCAGATACATGTTTCTGCAGCCAAGGCAGCAGTTGAT
GCTACGACAAGGAACTTGGCATTGGAGTGGGGAACCGACTACGAGATTAGAGTCAACGGG
GTTGCACCAGGACCGATAGGAGGCACGCCTGGAATGAGTAAGCTTGTACCTGACGAGATC
GAAAACAAAACCCGAGAGTACATGCCTCTGTATAAACTTGGAGAGAAGTGGGATATCGCC
ATGGCTGCAATCTACCTCAGCTGTGATACTGGGAAATATGTGAATGGACTAACAATGGTG
GTTGATGGAGGATTGTTTCTTAGCAAGCCTCGCCATTTGGCAAAAGAAGCTGTGAAGGAA
CTATCACGTGTTGTCGAGAAGAGGTCTAGGGCCAAGCCTGTTGGTCTGCCGACCAGTAAA
CTTTGAAGAGCATTTTGAGTTTCTCATCTCAAACATTAAGTGTGTGTTGTTGGGTTATTT
GATTGTTTTACATTGAAGACAAATAAAATGGTGGTGCTAAGATTCCCCCTTCATAGTT

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1FU20JQ C 1
AF RS1FU20TF U 1
BS 1 342 RS1FU20TF

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CACGTAAAGAAGAAGGATATCAGGAAGTTCCTTGATGGTATCTATGTAAGCAAGAAGAGC
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QA 1 342 1 342
DS 

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CACGTAAAGAAGAAGGATATCAGGAAGTTCCTTGATGGTATCTATGTAAGCAAGAAGAGC
AAGATTGTTGAAGATGAATAGACAGAGTATATTCTCGTCATTACATCTTTTGAATGTTTA
GTTTTGTTTTACAGACCAAAGCACCCGTGTTGCGAAACTTAGCTTCTCCTTTGTTCCTTT
CTGCTGGAGATTTTTATTTACTTGACAAGTTTTTGGAGACCC

QA 1 342 1 342
DS 



AS 1 3

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CTGAGCTGATCGAACCAGCAGTCAAGGGCACTATAAACGTCCTAGAAACATGCTCCAAAG
TGTCTTCTGTCAAGAGGGTCATTTTAACGTCGTCCATGGCCACACTTCTTTCTCCTAATT
TCCCCTTGGGACCGAACGTCTTACTAGACGAAACAACCTTCTCTGATCCAAGTGTTTGTG
AGGAGGAAAAGCAATGGTACATACTCTCCAAGACTTTGGCCGAAAATGCGGCATGGACGT
TTGCCAAGGACAACAACTTGGACTTGGTCGTAATGAATCCAGGACTCGTTATTGGACCAG
TCCTACAACCAACTATTAATTTCTCAGTAGATGTGGTTGTAGATTTTATAAAAGGTAAGA
ACACTTTTAACAGGAAGCATCACAGACTTGTCGACGTGAGGGATGTTGCTCTAGCTCATG
TCAAGGCACTCGAGACTCCTTCAGCCAAAGGCAGATACATCATTGATGCTCCTATTGTCA
CAACGGAGGAGATTGAGAAAATTCTACGTGAATTTTTTCCTGATTTGTGTATTGCTCATG
AGTAAGTATTATCTTCTTATCATTTTATTTATTAATGCAATGATCCTTTTTCTATTCTAC
AAACCTAACAAACTCTTATAACTTTTAATAGGAATGAAGGCATTGATATGAATTCAATGA
CTTACAAAGTAGATGTAGAAAAGGTGAAAAGTTTGGGGATCGAGTTCACTCCTATAGAAA
CAAGCCTTAGAGACACTGTTCTTAGCCTCAAAGAGAAACATCTTGTGTGATCATCCCCTA
TGAATATATGCTTTTGTGTTTGTTTTTTTACTTACAATAATCATATAGACTCTAAATGTT
TAATAGTCCCTCTGATAATGTAAATAGTTTTAACTAAAAGCATATGCTTAATTAAGAAAA
TTGTTATACTTCAAAAAATATCATTTAATATATAATAGATGTAATTTAACTAATAC


BQ
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25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BL31TF U 1
AF RS1GN53JQ U 366
AF RS1GN53TF C 358
BS 1 438 RS1BL31TF
BS 439 439 RS1GN53JQ
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BS 663 897 RS1GN53JQ
BS 898 1136 RS1GN53TF

RD RS1BL31TF 662 0 0
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CTGAGCTGATCGAACCAGCAGTCAAGGGCACTATAAACGTCCTAGAAACATGCTCCAAAG
TGTCTTCTGTCAAGAGGGTCATTTTAACGTCGTCCATGGCCACACTTCTTTCTCCTAATT
TCCCCTTGGGACCGAACGTCTTACTAGACGAAACAACCTTCTCTGATCCAAGTGTTTGTG
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TTGCCAAGGACAACAACTCGGACTTGGTCGTAATGAATCCAGGACTCGTTATTGGACCAG
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ACACTTTTAACAGGAAGCATCACAGACTTGTCGACGTGAGGGATGTTGCTCTAGCTCATG
TCAAGGCACTCGAGACTCCTTCAGCCAAAG*CAGATACATCATTGATGCTCCTATTGTCA
CA

QA 1 662 1 662
DS 

RD RS1GN53JQ 532 0 0
GTCC
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ACAGGAAGCATCACAGACTTGTCGACGTGAGGGATGTTGCTCTAGCTCATGTCAAGGCAC
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AGATTGAGAAAATTCTACGTGAATTTTTTCCTGATTTGTGTATTGCTCATGAGTAAGTAT
TATCTTCTTATCATTTTATTTATTAATGCAATGATCCTTTTTCTATTCTACAAACCTAAC
AAACTCTTATAACTTTTAATAGGAATGAAGGCATTGATATGAATTCAATGACTTACAAAG
TAGATGTAGAAAAGGTGAAAAGTTTGGGGATCGAGTTCACTCCTATAG

QA 5 532 5 532
DS 

RD RS1GN53TF 779 0 0
TTTTTTTTGTCC
AGCAATGGTACATACTCTCCAAGACTTGG**CGAAAATGCGGCATGGACGTTTGCCAAGG
ACAACAACTTGGACTTG*TCGTAATGAATCCAGGACTCGTTATTGGACCAGTCCTACAAC
CAACTATTAATTTCTCAGTAGATGTGGTTGTAGATTTTATAAAAGGTAAGAACACTTTTA
ACAGGAAGCATCACAGACTTGTCGACGTGAGGGATGTTGCTCTAGCTCATGTCAAGGCAC
TCGAGACTCCTTCAGCCAAAGGCAGATACATCATTGATGCTCCTATTGTCACAACGGAGG
AGATTGAGAAAATTCTACGTGAATTTTTTCCTGATTTGTGTATTGCTCATGAGTAAGTAT
TATCTTCTTATCATTTTATTTATTAATGCAATGATCCTTTTTCTATTCTACAAACCTAAC
AAACTCTTATAACTTTTAATAGGAATGAAGGCATTGATATGAATTCAATGACTTACAAAG
TAGATGTAGAAAAGGTGAAAAGTTTGGGGATCGAGTTCACTCCTATAGAAACAAGCCTTA
GAGACACTGTTCTTAGCCTCAAAGAGAAACATCTTGTGTGATCATCCCCTATGAATATAT
GCTTTTGTGTTTGTTTTTTTACTTACAATAATCATATAGACTCTAAATGTTTAATAGTCC
CTCTGATAATGTAAATAGTTTTAACTAAAAGCATATGCTTAATTAAGAAAATTGTTATAC
TTCAAAAAATATCATTTAATATATAATAGATGTAATTTAACTAATAC

QA 13 779 13 779
DS 



AS 1 2

CO CL3572Contig1 590 2 17 U
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GCTGAGTGTCTACTCAGCAACAAGTCACGATTACAAAAGACAATCAAACAAGACAAATCA
ACCTTCAACGTTTAGAAGAAAAAAAACATAACTTACGGGAGACAAAGAGTTAACTTTGAA
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TGATTTGGAAGGAGCCAAGGCTTTGCTGTAGATCTGCTCACCCACGAGGTACACGCAGAA
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GTGCTTCCTCCATTCGTCTCTTCGCCGGAAAAACTCGCCGGTAGTACCTAAAGGCTTCGC
CATTTTCTTTCCGGTGTTCGATTGGAATCTCCTGCGGCCGACGACCGTCC


BQ
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AF RS1CI10TF C 1
AF RS1BS47JQ U 44
BS 1 43 RS1CI10TF
BS 44 155 RS1BS47JQ
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RD RS1CI10TF 590 0 0
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GCTGAGTGTCTACTCAGCAACAAGTCACGATTACAAAAGACAATCAAACAAGACAAATCA
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CCCAACAAGCTTTAAAATTCAACAGAGAAATCGAAAAACTTGTGTCCAACACAACCAACA
TATTATTAATAAAAGCCCAGAAGAAGCATTTGCGTTCATCTTGTGCCTACTGTTTCCAGC
AACTGATCAAAAGCCATTTCAGTGAGAAGGAGCAGGCTGTTTTTGATTGTGGTGAGATGA
TGATTTGGAAGGAGCCAAGGCTTTGCTGTAGATCTGCTCACCCACGAGGTACACGCAGAA
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CATTTTTTTTCCGGTGTTCGATTGGAATCTCCTGCGGCCGACGACCGTCC

QA 1 590 1 590
DS 

RD RS1BS47JQ 522 0 0
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TCAAACAAGACAAATCAACCTTCAACGTTTAGAAGAAAAAAAACATAACTTA*GGGAGAC
AAAGAGTTAACTTTGAACCCAACAAGCTTTAAAATTCAACAGAAAAATCGAAAAACTTGT
GTCCAACACAACCAACATATTATTAATAAAGGCCCAGAAGAAGCATTTGCGTTCATCTTG
TGCCTACTGTTTCCAGCAACTGATCAAA*GCTATT*CAGTGAGAAGGAGCAGGCTGCTTT
TGATTATGGTGAGACGATGATTTGGAAGGAGCCACGGCTTTGCTGTAGATCTGCTCACCC
ACGAGGTACACGCAGAAGGCAGCGACGCCGATGCCGAGCCCGGGAAGAGCGTGCCTCATT
TGATTCGAAAGCATCGGGTGCTTCCTCCATTCGTCTCTTCGCCGGAAAAACTCGCCGGTA
GTACCTAAAGGCTTCGCCATTTTCTTTCCGGTGTTCGATT
CC

QA 1 520 1 520
DS 



AS 1 3

CO CL3573Contig1 718 3 10 U
GGGGCTAAAGCTTCATCAAATCAAATCCGAACTCATCCATGGCGATTTCTCAAGCTCAGC
CTCTGCTTCTTCTCCTCTTCTCGCTCTTCCTCTTGCCTTCTTTGCGCGCCACTTCTTTCC
ACAACTGCGATAAGAGGCTCGATCCCGTTAAGGTCAAGGGTGTGGAGATCTCTCCTGACC
CTGTTGTGAGTGGCGAAGCCGCTACATTTAAGATCACTGGTTCTACTGATGAAGACATCT
CTGGAGGAAAAGTAGTGATCAGTGTTTCATTATTTGGAGTTCATATCCATACCGAAACAC
ATGATCTCTGCGATGAGTCTTCCTGCCCGATCGCACCTGGCAGCTTTGTCCTTTCTCATT
CCCAAACACTGCCTTCTATTACACCCCCCGGTACTTATACGCTCGAGATGACGATAAACG
ACAAGGATGGCGGGCGACTGGCCTGCATCAGCTTCAAATTCAAGATCACATTGTTTTCCA
CGGTTTCTGCTAGTTAAGTTCTCCTGTGAAAATATGTTTGCCTCTTTTGTGAACCTCCTC
TCTCTGTCTCGTAGACTTTT*GTGTGTTGTCCAAATAAAAATGCTCCTTTGAGGCTTGTG
AACCTCTCTCTCGTAGACTCTGTGTGGTGTCCAAATAACATACCAATCTCAATATTTTGT
TTCTCTGTATTCATGACGTTCTATCTGCTCCTTCACTTAATATTCAGTAATATCGTTT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D325TF U 27
AF RS1CD79JQ C 1
AF RS1CD79TF U 1
BS 1 28 RS1CD79TF
BS 29 404 RS1D325TF
BS 405 405 RS1CD79TF
BS 406 479 RS1D325TF
BS 480 480 RS1CD79TF
BS 481 589 RS1D325TF
BS 590 699 RS1CD79TF
BS 700 700 RS1CD79JQ
BS 701 709 RS1CD79TF
BS 710 718 RS1CD79JQ

RD RS1D325TF 563 0 0
GG
GAACTCATCCATGGCGATTTCTCAAGCTCAGCCTCTGCTTCTTCTCCTCTTCTCGCTCTT
CCTCTTGCCTTCTTTGCGCGCCACTTCTTTCCACAACTGCGATAAGAGGCTCGATCCCGT
TAAGGTCAAGGGTGTGGAGATCTCTCCTGACCCTGTTGTGAGTGGCGAAGCCGCTACATT
TAAGATCACTGGTTCTACTGATGAAGACATCTCTGGAGGAAAAGTAGTGATCAGTGTTTC
ATTATTTGGAGTTCATATCCATACCGAAACACATGATCTCTGCGATGAGTCTTCCTGCCC
GATCGCACCTGGCAGCTTTGTCCTTTCTCATTCCCAAACACTGCCTTCTATTACACCCCC
CGGTACTTATACGCTCAAGATGACGATAAACGACAAGGATGGCGGGCGACTGGCCTGCAT
CAGCTTCAAATTCAAGATCACATTGTTTTCCTCGGTTTCTGCTAGTTAAGTTCTCCTGTG
AAAATATGTTTGCCTCTTTTGTGAACCTCCTCTCTCTGTCTCGTAGACTTTT*GTGTGTT
GTCCAAATAAAAATGCTCCTT

QA 3 563 3 563
DS 

RD RS1CD79JQ 718 0 0
GGGGCTAAAGCTTCATCAAATCAAATCCGAACTCATCCATGGCGATTTCTCAAGCTCAGC
CTCTGCTTCTTCTCCTCTTCTCGCTCTTCCTCTTGCCTTCTTTGCGCGCCACTTCTTTCC
ACAACTGCGATAAGAGGCTCGATCCCGTTAAGGTCAAGGGTGTGGAGATCTCTCCTGACC
CTGTTGTGAGTGGCGAAGCCGCTACATTTAAGATCACTGGTTCTACTGATGAAGACATCT
CTGGAGGAAAAGTAGTGATCAGTGTTTCATTATTTGGAGTTCATATCCATACCGAAACAC
ATGATCTCTGCGATGAGTCTTCCTGCCCGATCGCACCTGGCAGCTTTGTCCTTTCTCATT
CCCAAACACTGCCTTCTATTACACCCCCCGGTACTTATACGCTCGAGATGACGATAAACG
ACAAGGATGGCGGGCGACTGGCCTGCATCAGCTTCAAATTCAAGATCACATTGTTTTCCA
CGGTTTCTGCTAGTTAAGTTCTCCTGTGAAAATATGTTTGCCTCTTTTGTGAACCTCCTC
TCTCTGTCTCGTAGACTTTT*GTGTGTTGTCCAAATAAAAATGCTCCTTTGAGGCTTGTG
AACCTCTCTCTCGTAGACTCTGTGTGGTGTCCAAATAACATACCAATCTCAATATTTTGT
TTCTCTGTATTCATGACGTTCTATCTGCTCCTTCACTTAATATTCAGTAATATCGTTT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1CD79TF 717 0 0
GGGGCTAAAGCTTCATCAAATCAAATCCGAACTCATCCATGGCGATTTCTCAAGCTCAGC
CTCTGCTTCTTCTCCTCTTCTCGCTCTTCCTCTTGCCTTCTTTGCGCGCCACTTCTTTCC
ACAACTGCGATAAGAGGCTCGATCCCGTTAAGGTCAAGGGTGTGGAGATCTCTCCTGACC
CTGTTGTGAGTGGCGAAGCCGCTACATTTAAGATCACTGGTTCTACTGATGAAGACATCT
CTGGAGGAAAAGTAGTGATCAGTGTTTCATTATTTGGAGTTCATATCCATACCGAAACAC
ATGATCTCTGCGATGAGTCTTCCTGCCCGATCGCACCTGGCAGCTTTGTCCTTTCTCATT
CCCAAACACTGCCTTCTATTACACCCCCCGGTACTTATACGCTCGAGATGACGATAAACG
ACAAGGATGGCGGGCGACTGGCCTGCATCAGCTTCAAATTCAAGATCACATTGTTTTCCA
CGGTTTCTGCTAGTTAAGTTCTCCTGTGAAAATATGTTTGCCTCTTTTGTGAACCTCCTC
TCTCTGTCTCGTAGACTTTTTGTGTGTTGTCCAAATAAAAATGCTCCTTTGAGGCTTGTG
AACCTCTCTCTCGTAGACTCTGTGTGGTGTCCAAATAACATACCAATCTCAATATTTTGT
TTCTCTGTATTCATGACGTTCTATCTGCTCCTTCACTTA*TATTCAGTA
TATCGTTT

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 3

CO CL3574Contig1 562 3 5 U
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CGATCTCATGTCGATCGGATCTATGACCTTATCTTCGTCACCATCTAGCAGCTTATATTG
CTATGGTCATTATATACAAAAGAAATTTAAGAAAAAAAAGTAAACACATATATGATATAT
CTTTAAACTAAGTCTTCCATCTTCAGTATTATTTAACGACAAAATTTTGGAAAAAAGATA
GAGAGACCGCAGAGTCCTTTCTTCTAGTCCAACTCATCGGCCTCCTCAGCCCTAATTCTT
TCTGCTGTTTTATTACGAGATTGCTCAACACCTCCTTTCTTTTTCTCTACCTTACCATAC
TTGGTCTGCTGATTCTTGTTAGCATTATCACTACTTTTTCTTTTGTTTTTGCTGTTTTTA
TTATCATCACT*CCTCTTTTAGATTTAGCAGAGCCATCACGCCCTTCTTTACCGT*ATTC
TTCTTCTTCTTCTTTGATTCTCCTTTTTTGTTTTTCTTATTATCGCTCCCCTTGTCAGAA
CTTTTATTACTTTTGGTGGAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GI08JQ U 10
AF RS1GI08TF C 10
AF RS1FJ78JQ U 1
BS 1 431 RS1FJ78JQ
BS 432 432 RS1GI08JQ
BS 433 474 RS1FJ78JQ
BS 475 476 RS1GI08JQ
BS 477 562 RS1FJ78JQ

RD RS1GI08JQ 528 0 0
GC
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CGATCGGATCTATGACCTTATCTTCGTCACCATCTAGCAGCTTATATTGCTATGGTCATT
ATATACAAAAGAAATTTAAGAAAAAAAAGTAAACACATATATGATATATCTTTAAACTAA
GTCTTCCATCTTCAGTATTATTTAACGACAAAATTTTGGAAAAAAGATAGAGAGACCGCA
GAGTCCTTTCTTCTAGTCCAACTCATCGGCCTCCTCAGCCCTAATTCTTTCTGCTGTTTT
ATTACGAGATTGCTCAACACCTCCTTTCTTTTTCTCTACCTTACCATACTTGGTCTGCTG
ATTCTTGTTAGCATTATCACTACTTTTTCTTTTGTTTTTGCTGTTTTTATTATCATCACT
*CCTCTTTTAGATTTAGCAGAACCATCACGCCCTTCTTTACCGT*ATTCTTCTTCTTCTT
CTTTGATTCTCCTTTTTTGTTTTTCTTATTATCGCTCCCCTTGTC
C

QA 3 527 3 527
DS 

RD RS1GI08TF 528 0 0
GC
CAAATACTTTATTGATAAGAAAAAATCAATTACAAAAAAATAAAGATCACGATCTCATGT
CGATCGGATCTATGACCTTATCTTCGTCACCATCTAGCAGCTTATATTGCTATGGTCATT
ATATACAAAAGAAATTTAAGAAAAAAAAGTAAACACATATATGATATATCTTTAAACTAA
GTCTTCCATCTTCAGTATTATTTAACGACAAAATTTTGGAAAAAAGATAGAGAGACCGCA
GAGTCCTTTCTTCTAGTCCAACTCATCGGCCTCCTCAGCCCTAATTCTTTCTGCTGTTTT
ATTACGAGATTGCTCAACACCTCCTTTCTTTTTCTCTACCTTACCATACTTGGTCTGCTG
ATTCTTGTTAGCATTATCACTACTTTTTCTTTTGTTTTTGCTGTTTTTATTATCATCACT
*CCTCTTTTAGATTTAGCAGAGCCATCACGCCCTTCTTTACCGT*ATTCTTCTTCTTCTT
CTTTGATTCTCCTTTTTTGTTTTTCTTATTATCGCTCCCCTTGTC
C

QA 3 527 3 527
DS 

RD RS1FJ78JQ 562 0 0
AACGAGAATGACAAATACTTTATTGATAAGAAAAAATCAATTACAAAAAAATAAAGATCA
CGATCTCATGTCGATCGGATCTATGACCTTATCTTCGTCACCATCTAGCAGCTTATATTG
CTATGGTCATTATATACAAAAGAAATTTAAGAAAAAAAAGTAAACACATATATGATATAT
CTTTAAACTAAGTCTTCCATCTTCAGTATTATTTAACGACAAAATTTTGGAAAAAAGATA
GAGAGACCGCAGAGTCCTTTCTTCTAGTCCAACTCATCGGCCTCCTCAGCCCTAATTCTT
TCTGCTGTTTTATTACGAGATTGCTCAACACCTCCTTTCTTTTTCTCTACCTTACCATAC
TTGGTCTGCTGATTCTTGTTAGCATTATCACTACTTTTTCTTTTGTTTTTGCTGTTTTTA
TTATCATCACTTCCTCTTTTAGATTTAGCAGAGCCATCACGCCCTTCTTTACCGCCATTC
TTCTTCTTCTTCTTTGATTCTCCTTTTTTGTTTTTCTTATTATCGCTCCCCTTGTCAGAA
CTTTTATTACTTTTGGTGGAAG

QA 1 562 1 562
DS 



AS 1 2

CO CL3575Contig1 804 2 12 U
GGAGACACACACGCACAGCTTTATAAAGAGAAGACAAACTGTGAATTTATTAATTTTTTA
AATTGAAAAAAATGGGAAGCGAAGGGACGATTGTGAGGAAGCCAAGGTTTCTGTGTCTAC
ATGGATTCCGTACGAGCGGAGAGATAATGAAGATACAGCTTCACAAGTGGCCTAAATCTG
TTATCGACCGACTCGATCTCGTGTTTCTCGATGCGCCTTTTCCTTGTCAAGGCAAATCTG
ATGTCGAAGGCATCTTCGATCCTCCTTATTACGAGTGGTTCCAGTTTAACAAGGAATTTA
ATGAGTATACGAATTTCGAGAAATGTTTGGAGTATATAGAGGATAGTATGATTAAGCTTG
GCCCCTTTGATGGTCTCATTGGCTTTTCTCAGGGTGCAATTTTGTCTGGAGGATTACCAG
GACTGCAAGCTAGGGGAATTGCACTCCAGAAAGTACCAAAGATCAAGTTCATCATCATTA
TTGGAGGAGCTATGTTCAAATCCACCAAGGTCGCCAAGGATGCGTATTCATCTACCATGG
ACATTCCCCCCCTCCACTTTCTAGGAGAGACTGATTTCTTGAAACCTTACGGAACTGAAC
TGATAGACTTGTTCAAGAATCCGGTGGTAGTTAATCATCCTAAAGGCCATACAGTCCCAA
GACTTGATGACAAGAGCTTAGAGAAAGTTACTGCATTCATCGACACCATTGAGCATCTGC
TAATGGAGGAACTCAAGATTGGTGAAGAAGCCACTACTAATAAGCCAGAATAGAACAACC
CCCTTATAGTGGTAATATATAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1C214TF U 1
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ATGGATTCCGTACGAGCGGAGAGATAATGAAGATACAGCTTCACAAGTGGCCTAAATCTG
TTATCGACCGACTCGATCTCGTGTTTCTCGATGCGCCTTTTCCTTGTCAAGGCAAATCTG
ATGTCGAAGGCATCTTCGATCCTCCTTATTACGAGTGGTTCCAGTTTAACAAGGAATTTA
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GACTGCAAGCTAGGGGAATTGCACTCCAGAAAGTACCAAAGATCAAGTTTATCATCATTA
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ACATTCCCCCCCTCCACTTTCTAGGAGAGACTGATTTCTTGAAACCTTACGGAACTGAAC
TGATAGACTTGTTCAAGAATCCGGTGGTAGTTAATCATCCTAAAG*CCATACAGTCCCAA
GACTTGATGAGAAGAGCTTAGAGAAAGTTACTGCATTCATCGACACCATTGAGCATCTGC
TAATGGAGGA
C

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DS 

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ACCAAGGTCGCCAAGGATGGGTATTCATTTACCATGGACATTCCCTCCCTCCACTTTTTA
GGAGAGACTGATTTCTTGAAACCTTACGGAACTGAACTGATAGACTTGTTCAAGAATCCG
GTGGTAGTTAATCATCCTAAAGGCCATACAGTCCCAAGACTTGATGACAAGAGCTTAGAG
AAAGTTACTGCATTCATCGACACCATTGAGCATTTGCTAATGGAGGAACTCAAGATTGGT
GAAGAAGCCACTACTAATAAGCCAGAATAGAACAACCCCCTTATAGTGGTAATATATAAG
A

QA 1 421 1 421
DS 



AS 1 3

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CAATTTAACACAAAAACATTTTAAGAATACAAAACATACAGTAAAAAAATATTTTTTTTT
TTTGGAATAGTCAGAAGTCATGGCCATCTCCTATATAAAGCTTAGTCCATCTTCTTCTCC
ACACAAACCAATTCACTTCCCTCTTCTTCTTCCAAACCCAAATATTTTTAAAATGACACC
CTGCATCCACACCTCCAATACCCATCTTTCTCAAGACGATAATTCTCGGTTCCGTTACAT
GAACCTCTTCCCTGATCGGATTTCACGAACACCCATCACGAAAACTTCAAACTCAAGCTC
CCTGGACGGTGATGATGTCTGGATTAAGATGATGGAAGAAGCTAAATCAAACGTCGAGCA
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CGCTTTGGCGAACATTCTCTCCGTAAGGCTAAGCACTTTAACCTTACCGAGCAACACC*T
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AGACCTAATAGCAGCAAAGGAAAGAGACCCGGCTTGCTTAAGCTACGTCCACTGCTTCCT
AAGCTTCAAAGGCTTCCTCGCCTGCCAAGCTCATCGCATCGCTCACAAGCTCTGGACGCA
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GATCGGTGAGACGGCGGTGGTCGGAGACAACGTTTCGATCTACACGGGTGACGCTGGGAG
GGACGGGAAACAGGCGGCGATAGCATCG


BQ
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AF RS1B508JQ U 1
AF RS1B508TF C 1
AF RS1H564TF U 183
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BS 563 928 RS1H564TF

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C

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DS 

RD RS1B508TF 563 0 0
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CAATTTAACACAAAAACATTTTAAGAATACAAAACATACAGTAAAAAAATATTTTTTTTT
TTTGGAATAGTCAGAAGTCATGGCCATCTCCTATATAAAGCTTAGTCCATCTTCTTCTCC
ACACAAACCAATTCACTTCCCTCTTCTTCTTCCAAACCCAAATATTTTTAAAATGACACC
CTGCATCCACACCTCCAATACCCATCTTTCTCAAGACGATAATTCTCGGTTCCGTTACAT
GAACCTCTTCCCTGATCGGATTTCACGAACACCCATCACGAAAACTTCAAACTCAAGCTC
CCTGGACGGTGATGATGTCTGGATTAAGATGATGGAAGAAGCTAAATCAAACGTCGAGCA
AGAACCCATTTTGTCAAGCTACTATTACTCTTCCATTACATCCCATCGGTCGTTAGCTTC
CGCTTTGGCGAACATTCTCTCCGTAAGGCTAAGCACTTTAACCTTACCGAGCAACACC*T
CTTCGAGCTGTTCATCAGCGTC
C

QA 1 562 1 562
DS 

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GG
AAACCAATTCACTTCCCTCTTCTTCTTCCAAACCCAAATATTTTTAAAATGACACCCTGC
ATCCACACCTCCAATACCCATCTTTCTCAAGACGATAATTCTCGGTTCCGTTACATGAAC
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AGAAAGATCCTCTCTTTACCCATCCAGAACAGAGTATCCGAAGCTTTCGCCGTCGATATC
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GGTGAGACGGCGGTGGTCGGAGACAACGTTTCGATCTACACGGGTGACGCTGGGAGGGAC
GGGAAACAGGCGGCGATAGCATCG

QA 3 746 3 746
DS 



AS 1 3

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TAGGCCTGTTACCGAATCTGGTCCCATTCCTTTGTATGTTGAGCTTCTCTCCGGAGGTGA
TCCGATGGGGAAAGATATTGCGGAGGAATGTGTTTTGTATACTAGCTGTGGCTGAGGGTA
ATACTGTTTTGATAGCGGAGCAGCTTGTGAGGATCTTGAGAGAGGGAGATGAGGAAGCCA
AGTTTGCTGCTTCTGATGTGTTGTGGGATCTTGCTGGTTATAGGCGCCCTGTGTCTGTTA
TTAGAGACTCTGGTGCGATGCCTTTGCTGGTGGAGCTTGTGAGAGATGGGTCGGTTGAGT
TTAAAGAGAGGATTTCTGGAGCTATAATTCAGTTGTGTTACAACGAGAACGACCGTGAGG
CTTTGTCTGAGTCTGGTATGGTACCGATTCTGATTGAATGGCTGGGGGATGAGTCTGAAG
AGCTTAGGGATAATGCGGCTGAGGCGCTTATTAATTTCTCTGAAGACCAAGATGATTATG
GTGGAGTGCGTGAGGCTTTAAGCCGTCCTGTGATTCAGAGCAGACTTGCTAGAATCAGAG
CCTCTAATGAACTTTTGGTTAGGTCAATGCGAAGGGCTACAATCGATCCTTATTTTCCCT
GATGAGCAAATCCGACCTGTTTTGATTTATGTTTATAATATAAATTTCGAAAATGTTGTT


BQ
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AF RS1CR59TF U 1
AF RS1FE37TF U 11
AF RS1CR59JQ C 360
BS 1 759 RS1CR59TF
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DS 

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GG
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TGGAGATCGTGACACGTGAGTTGAACACGTGGGAAGATGATGATGATGATTCGAGTAATA
GACGCTACTTGCTAGAGATCCTCACCGCCTTGACGACGATACAAGAGAGCAGACGCGTTC
TCGTTCACAACGGAGGGTTGAGAAGTTTCTCCTCGAAGCGGTGCGTCGAGAGAGAGAGAG
AGCTTGTCACGCTATTGGGTTGATCGGTGGTACTAGGGGGTGCAGGCGGTTGCTGGTTGA
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QA 3 811 3 811
DS 

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AAAAGACGAAGCTTTTAGCTGGTAATGCCTTGGGGATCATAGCGGGTCAGACCGAGTACG
TTAGGCCTGTTACCGAATCTGGTCCCATTCCTTTGTATGTTGAGCTTCTCTCCGGAGGTG
ATCCGATGGGGAAAGATATTGCGGAGGAATGTGTTTTGTATACTAGCTGTGGCTGAGGGT
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AAGTTTGCTGCTTCTGATGTGTTGTGGGATCTTGCTGGTTATAGGCGCTCTGTGTCTGTT
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GAGCTTAGGGATAATGCGGCTGAGGCGCTTATTAATTTCTCTGAAGACCAAGATGATTAT
GGTGGAGTGCGTGAGGCTTTAAGCCGTCCTGTGATTCAGAGCAGACTTGCTAGAATCAGA
GCCTCTAATGAACTTTTGGTTAGGTCAATGCGAAGGGCTACAATCGATCCTTATTTTCCC
TGATGAGCAAATCCGACCTGTTTTGATTTATGTTTATAATATAAATTTCGAAAATGTTGT
T

QA 1 841 1 841
DS 



AS 1 3

CO CL3578Contig1 1471 3 11 U
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TCGTGTCTCGGAAACCTTTTTCTATCGCCTTCTCCTCATCCCTTATCCCGGAAAATCACT
CCAATCTTTGTCGGCGTCTCTCGGGTGCGGAGGAGGCCCACCAGCGCGCTGAGGGAATGG
CGGGAGTACGAAGACGCGGTGAAGAGAAAAGATCTGGCGGGGGCTCTCAGATTCCTCAAA
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CCTGCTCCTGGGGGTCTTGATTGGGAGGTATTAGATGCGTGTTTGAATGCAGATGATATG
AGACTTGTTGGGAATGCCTTTAGGTTTCTCAAGGACAGAGGTCTTCTCCCCAATTTCGCC
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AGCATTGCTTTGGCTGCTTTTCTCGGTGGAATCTCCTATCTTCTTTCTCAAGACATTGAT
CTTCGCCCTAACCTTGCTGCCCTTTTGGGTCTTGCTTTCATGGATTCCATTCTTCTCGGT
GGCACCTGCTTTGCCCAAATTTCATGCTACTGGCCTCCCCATAAGCGTCGTGTCATTGTT
CACGAAGCTGGTCATCTTCTTGTTGCATACCTCATGGGCTGCCCTATCCGTGGTGTCATT
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AAGTGGCACAAGGCCGCACATCGGGCCGCTGTTGAAGCTCTGCAAGTGGGAAGTCCTCTT
AGCATTGTGATACGAAGGATTGAGGAAGCTATGTCTCCAACCAGGTGACCATAATAATCG
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ATAGCTTCAAGAAATTGGTTGTACAGTAACCAATCACTTGAAAACTGTGTAGTTAGTTGC
ATTATTGTATCTAAACATAAAGTGTGGCTAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CD37TF U 1
AF RS1DP44TF U 311
AF RS1CD37JQ C 755
BS 1 699 RS1CD37TF
BS 700 700 RS1DP44TF
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BS 799 812 RS1CD37TF
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BS 819 974 RS1DP44TF
BS 975 1471 RS1CD37JQ

RD RS1CD37TF 812 0 0
GGATCATCTTTTGCAAATTCCGGCGACACCCCTAAAATGGCCTCCTCCTTGTCTCCGTCG
TCGTGTCTCGGAAACCTTTTTCTATCGCCTTCTCCTCATCCCTTATCCCGGAAAATCACT
CCAATCTTTGTCGGCGTCTCTCGGGTGCGGAGGAGGCCCACCAGCGCGCTGAGGGAATGG
CGGGAGTACGAAGACGCGGTGAAGAGAAAAGATCTGGCGGGGGCTCTCAGATTCCTCAAA
ACCGTCCAAGTCATCGATAAACAGCCAAGTGGGGAGGTGGAATCCATGGTTGCAACTCCT
CCTGCTCCTGGGGGTCTTGATTGGGAGGTATTAGATGCGTGTTTGAATGCAGATGATATG
AGACTTGTTGGGAATGCCTTTAGGTTTCTCAAGGACAGAGGTCTTCTCCCCAATTTCGCC
AAGTTCACCAATATTGTTTTGGAGGGCACAAGAGAGGTCACACCTACTGTCCTCATGTCT
GCAACTGGCTTGGAAGTGAGTAAACTTGCACCGAAGAAGTGGGGTCTCTCTGATAGCTCC
AGCATTGCTTTGGCTGCTTTTCTCGGTGGAATCTCCTATCTTCTTTCTCAAGACATTGAT
CTTCGCCCTAACCTTGCTGCCCTTTTGGGTCTTGCTTTCATGGATTCCATTCTTCTCGGT
GGCACCTGCTTTGCCCAAATTTCATGCTACTGGCCTCCC*ATAAGCGTCGTGTCATTGTT
CACGAAGCTGG***TCTTCTTGTTGCATACCTCATGGGCTGCCCTATCCGTGGTGTCATT
TTGGATCCCATTGTTGC*ATGCAAATGGGAGT

QA 1 812 1 812
DS 

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GGAATGCCTTTAGGTTTCTCAAGGACAGAGGTCTTCTCCCCAATTTCGCCAAGTTCACCA
ATATTGTTTTGGAGGGCACAAGAGAGGTCACACCTACTGTCCTCATGTCTGCAACTGGCT
TGGAAGTGAGTAAACTTGCACCGAAGAAGTGGGGTCTCTCTGATAGCTCCAGCATTGCTT
TGGCTGCTTTTCTCGGTGGAATCTCCTATCTTCTTTCTCAAGACATTGATCTTCGCCCTA
ACCTTGCTGCCCTTTTGGGTCTTGCTTTCATGGATTCCATTCTTCTCGGTGGCACCTGCT
TTGCCCAAATTTCATGCTACTGGCCTCCCCATAAGCGTCGTGTCATTGTTCACGAAGCTG
GTCATCTTCTTGTTGCATACCTCATGGGCTGCCCTATCCGTGGTGTCATTTTGGATCCCA
TTGTTGCCATGCAAATGGGAGTTCAGG*ACAGGCTGGAACCCAATTCTGGGATCAAAAGA
TGGAGAGTGAGATTGCTGAGGGACGTCTTAGCGGTACCTCCTTTGATAGGTATAGCATGG
TTCTTTTTGCTGGTATTGCAGCTGAAGCACTTGTTTATGGTGAAGCTGAGGGTGGGGAGA
ATGA

QA 1 664 1 664
DS 

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AGGGACAGGCTGGAACCCAATTCTGGGATCAAAAGATGGAGAGTGAGATTGCTGAGGGAC
GTCTTAGCGGTACCTCCTTTGATAGGTATAGCATGGTTCTTTTTGCTGGTATTGCAGCTG
AAGCACTTGTTTATGGTGAAGCTGAGGGTGGGGAGAATGATGAAAATCTTTTCAGGAGCA
TCTCTTTACTCCTGGAACCACCATTATCCGTGGCTCAGATGTCGAATCAAGTCAGGTGGT
CTGTGCTACAATCTTACTATCTGCTCAAGTGGCACAAGGCCGCACATCGGGCCGCTGTTG
AAGCTCTGCAAGTGGGAAGTCCTCTTAGCATTGTGATACGAAGGATTGAGGAAGCTATGT
CTCCAACCAGGTGACCATAATAATCGAGACAGAAGCAGATAAACTCAGAAATAAACAACC
TGGAATGGCGACAAAGATGTTTTATTTTTTTTGGATCCATGTTCAAGTAAGTTAAGTATC
TTTATCCACTGAGGGAGATGTTGAGGACGTGATAATAGTAGTCTTCTCTTGCCTCATAAT
TACTCACTTGTTCAAGCAAGCTTTTGATAGCTTCAAGAAATTGGTTGTACAGTAACCAAT
CACTTGAAAACTGTGTAGTTAGTTGCATTATTGTATCTAAACATAAAGTGTGGCTAT

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 3

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GGGAGTTGGAGCAAACGACGAAGCAAAGCTTACGATGGCAAGGATTAAGGTTCATGAGCT
TAGAGAGAGATCGAAGACGGATCTTCAGAGCCAGCTTCAGGAGTTCAAGGCTGAGCTCGC
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AAGAGAAGCATACAAGAACAAGAAGTTCTTGCCTCTCGATCTTCGTCCCATGAAGACACG
TGCTATCCGTAGACGTCTCACCAAGCATCAGTCTTCTTTGAAGACAGAGCGTGAGAAGAA
GAAAGAGATGTATTTCCCTCTGAGGAAGTATGCTATCAAAGTCTAGTTTCAATGTTTCAT
TCTCCAGGATTCCTTACTGGGAATGATTCAGCTTTTTGATTGTTCACTTATTTTGTCCAC
CTTTGTTTTTTTACTCAAGTTTTGTCATGTAACAGTCAAATCTATCTCTCACTCCTCGAA
AACATTGTTTCGTAATAATTGAAATTGAACCAGTTCTCG


BQ
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AF RS1A081TF U 1
AF RS1A081TV U 1
AF RS1FR09TF U 50
BS 1 627 RS1A081TF
BS 628 639 RS1FR09TF

RD RS1A081TF 627 0 0
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GGGAGTTGGAGCAAACGACGAAGCAAAGCTTACGATGGCAAGGATTAAGGTTCATGAGCT
TAGAGAGAGATCGAAGACGGATCTTCAGAGCCAGCTTCAGGAGTTCAAGGCTGAGCTCGC
CCTCCTCCGTGTCGCTAAAGTCACCGGTGGTGCCTCTAACAAGCTTTCCAAAATCAAGGT
CGTGAGGAAATCCATTGCTCAGGTATTGACAGTGATCTCACAGAAGCAGAAATTAGCACT
AAGAGAAGCATACAAGAACAAGAAGTTCTTGCCTCTCGATCTTCGTCCCATGAAGACACG
TGCTATCCGTAGACGTCTCACCAAGCATCAGTCTTCTTTGAAGACAGAGCGTGAGAAGAA
GAAAGAGATGTATTTCCCTCTGAGGAAGTATGCTATCAAAGTCTAGTTTCAATGTTTCAT
TCTCCAGGATTCCTTACTGGGAATGATTCAGCTTTTTGATTGTTCACTTATTTTGTCCAC
CTTTGTTTTTTTACTCAAGTTTTGTCATGTAACAGTCAAATCTATCTCTCACTCCTCGAA
AACATTGTTTCGTAATAATTGAAATTG

QA 1 627 1 627
DS 

RD RS1A081TV 629 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGCGACACTT
GGGAGTTGGAGCAAACGACGAAGCAAAGCTTACGATGGCAAGGATTAAGGTTCATGAGCT
TAGAGAGAGATCGAAGACGGATCTTCAGAGCCAGCTTCAGGAGTTCAAGGCTGAGCTCGC
CCTCCTCCGTGTCGCTAAAGTCACCGGTGGTGCCTCTAACAAGCTTTCCAAAATCAAGGT
CGTGAGGAAATCCATTGCTCAGGTATTGACAGTGATCTCACAGAAGCAGAAATTAGCACT
AAGAGAAGCATACAAGAACAAGAAGTTCTTGCCTCTCGATCTTCGTCCCATGAAGACACG
TGCTATCCGTAGACGTCTCACCAAGCATCAGTCTTCTTTGAAGACAGAGCGTGAGAAGAA
GAAAGAGATGTATTTCCCTCTGAGGAAGTATGCTATCAAAGTCTAGTTTCAATGTTTCAT
TCTCCAGGATTCCTTACTGGGAATGATTCAGCTTTTTGATTGTTCACTTATTTTGTCCAC
CTTTGTTTTTTTACTCAAGTTTTGTCATGTAACAGTCAAATCTATCTCTCACTCCTCGAA
AACATTGTTTCGTAATAATTGAAATTG
AA

QA 1 627 1 627
DS 

RD RS1FR09TF 590 0 0
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GCTGAGCTCGCCCTCCTCCGTGTCGCTAAAGTCACCGGTGGTGCCCCTAACAAGCTTTCC
AAAATCAAGGTCGTGAGGAAATCCATTGTTCAGGTATTGACAGTGATCTCACAGAAGCAG
AAATTAGCACTAAGAGAAGCATACAAGAACAAGAAGTTCTTGCCTCTCGATCTTCGTCCC
AAGAAGACACGTGCTATCCGTAGACGTCTCACCAAGCATCAGTCTTCTTTGAAGACAGAG
CGTGAGAAGAAGAAAGAGATGTATTTCCCTCTGAGGAAGTATGCTATCAAAGTCTAGTTT
CAATGTTCCATTCTCCAGGATTCCTTACTAGGAATGATTCAGCTTTTTGATTGTTCACTT
ATTTTGTCCACCTTTGTTTTTTTACTCAAGTTTTGTCATGTAACAGTCAAATCTATCTCT
CACTCCTCGAAAACATTGTTTCGTAATAATTGAAATTGAACCAGTTCTCG

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 2

CO CL3580Contig1 1316 2 2 U
GGGTCTGAAACTCACAAAAAAAAAAAACTTACTCCGTCTCCGGCGATGGCTACCGGTGAC
CAAAGCAAGAAGAGAAAGCAGCGTTATCTCCCTCAGAATAGACCAGCGAAGAAGAAGGGA
GCTTACCCCTTGAAGCCAGGAGTACAAGGTTTCTTCATCTCCTGCGACGGCGGACGCGAA
CACCAAGCTTCTCAGGAAGCTATCAACGTCATTGATTCCTTTTTTGAGGAGCTAATGCAT
GGGACTGGCTTGAAAGTAAACTCCTCTGGGTTGCTTGAGAACCCCGTGAACAAAAAGGTT
ACGTTTCACTATAGCGAGGACGAGGATGAAGAAGATGTGGAGGAAGATGAGGGTAATAAC
GGCGAGGAAGAGGGAAATAAAGGGGATGGAGATGAGACTGAAGTCAGTAAAGGAGGTGAT
AATCAAGTGAAGGAGAAAGAAGTAGCAAGGGAAGGCTCATGTGAAGTCAAACAAGTGGAA
GAAACTAAGACTGAGAAGGACGAAGAAGATGAAGTGAAGGAAAAGAACGGTGTTGAAGAA
CCTCCAAGGAAGAAGACGTGTACGGAAGAAGCAAGCGAGTCAACGAAAGTAGACGGGAAC
GCAGAGAAGTCTATTGATAAGCTGATTGATGCTGAACTAAAAGAGCTCGGAGACAAGAGT
AAGAGACGGTTTATGAAGTTAGACCCTGGTTGCAACGGCATTGTCTTCATCCAAATGAAA
AGGAGAGATGGTGACCCAAGTCCTAAAGATATTGTACAGCATGGATTGACTTCTGCTGCT
GCAACTAAGAAGCATATGTCAAGGTTCATCCTAAGACTTGTGCCAATCGAAGTGTCGTGT
TATCCTTCAGAGGAAGAGATTTCAAGAGCCATCAAGCCTCTTTTAGAACAGTATTTTCCC
GTTGAGACTGATAAACCCCGGAAATTTGCTGTGTTGTATGGATCGCGTGCAAACACAGGC
GTTGATAGGATGATGGTAATAAACACGGTGGCGAAATCTATGCCTGCACCTCACAAAGTT
GATTTGAGCAATCCAGAGATGTCCATCGTAGTTGAAATTGTTAAGACAGTATGCTTAATT
GGGGTGGTAGAGAAGTACAAGGAGCTTGCAAAGTACAATTTCAGGCAGCTCACGTCGACC
AAATGACAATCTCAAGAGTCCAAGACTAGGATGCTTCTATAGTTCTATGTTTACTGGTAG
TCTTATAGATTATTCTGGCTTTTAACTTATGACAATGGTTGAAGTTGTCAGTTACATTTT
ATGTCTGATCAATAAATTTTTCTCTTTGATGAGTTTTGCTGTCTATCAGCCAGTAT


BQ
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1ED73JQ C 368
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RD RS1C262TF 787 0 0
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GTAAAGGGCGTGTTACGCTGCTCGGTGATTCTATTCATGCTATGCAGCCTAATATGGGTC
AAGGTGGATGCATGGCCATTGAGGATAGTTTTCAACTAGGATTGGAGCTTGAAGCAGCAT
GGAAACAGAGTGTTGAAACTAATACACCTGTTGATGTTGTTTCCTCTTTGAGAAGATACG
AGGAATCTAGAAGACTAAG**TTGCTATTATCCATGGAATGGCGAGAATGGCTGCAATTA
TGGCTTCCACTTACAAAGCATACTTAGGTGTTGGGCTTGGTCCTCTCTCTTTCTTGACCA
AGTTTAGAGTACCGCATCCGGGAAGAGTTGGTGGGAGATTCTTCATTGACATTGCTATGC
CTCTGATGCTTAACTGGGTCCTTGGGGGTAACAGTGAGAAGCTCGAAGGAAGGCCACCTA
GTTGCAGACTCACTGACAAAGCTGATGACCGCCTTCGTGAGTGGTTTGAAGACGACGAAG
CTCTTGAACGTACTATTAACGGAGAATGGTATCTTATTCCACATGGCAACGAGTGTAGCG
TTTCGGAAACATTACGTCTAACCAAAGATGAAGAACAGCCTTGCATTGTCGGAAGTGAAC
CAGACCAAGATTTTCCTGGAACGCACATTGTGATCCCTTCCCCTCAG*TATCGA*GATGC
ATGCGCGTGTA*TCTACAAAGATGGAGCTTTCTTCTTGATGGATCTTCGA*GCGAACACG
GGAC
TAT

QA 1 784 1 784
DS 

RD RS1ED73TF 660 0 0
G
GAAGATACGAGGAATCTAGAAGACTAAGAGTTGCTATTATCCATGGAATGGCGAGAATGG
CTGCAATTATGGCTTCCACTTACAAAGCATACTTAGGTGTTGGGCTTGGTCCTCTCTCTT
TCTTGACCAAGTTTAGAGTACCGCATCCGGGAAGAGTTGGTGGGAGATTCTTCATTGACA
TTGCTATGCCTCTGATGCTTAACTGGGTCCTTGGGGGTAACAGTGAGAAGCTCGAAGGAA
GGCCACCTAGTTGCAGACTCACTGACAAAGTTGATGACCGCCTTCGTGAGTGGTTTGAAG
ACGACGAAGCTCTTGAACGTACTATTAACGGAGAATGGTATCTTATTCCACATGGCAACG
AGTGTAGCGTTTCGGAAACATTACGTCTAACCAAAGATGAAGAACAGCCTTGCATTGTCG
GAAGTGAACCAGACCAAGATTTTCCTGGAACGCACATTGTGATCCCTTCCCCTCAGGTAT
CGAAGATGCATGCGCGTGTAATCTACAAAGATGGAGCTTTCTTCTTGATGGATCTTCGAA
GCGAACACGGGACCTATCTCACCGATGACGAAGGAGGAAAATACAGAGTGACACCAAACT
TCCCAACCCGGTTTAGATCGTCCGATATCATCGAGTTTGGTTCGGATAAGAAG
CAGCAT

QA 2 654 2 654
DS 

RD RS1ED73JQ 803 0 0
AGTACCGCATCCGGGAAGAGTTGGTGGGAGATTCTTCATTGACATTGCTATGCCTCTGAT
GCTTAACTGGGTCCTTGGGGGTAACAGTGAGAAGCTCGAAGGAAGGCCACCTAGTTGCAG
ACTCACTGACAAAGTTGATGACCGCCTTCGTGAGTGGTTTGAAGACGACGAAGCTCTTGA
ACGTACTATTAACGGAGAATGGTATCTTATTCCACATGGCAACGAGTGTAGCGTTTCGGA
AACATTACGTCTAACCAAAGATGAAGAACAGCCTTGCATTGTCGGAAGTGAACCAGACCA
AGATTTTCCTGGAACGCACATTGTGATCCCTTCCCCTCAGGTATCGAAGATGCATGCGCG
TGTAATCTACAAAGATGGAGCTTTCTTCTTGATGGATCTTCGAAGCGAACACGGGACCTA
TCTCACCGATAACGAAGGAGGAAAATACAGAGTGACACCAAACTTCCCAACCCGGTTTAG
ATCGTCCGATATCATCGAGTTTGGTTCGGATAAGAAGGCAGCATTTAGGGTCAAGGTGAT
CAGGACAACTCCGAAATTGACGAGAAGGGATGAGAAGAGTGACGGTAAATTGCTTCAGGC
TGCTTGATACTTAAGTAACCCGACGCTGAAATCTAAGGAAAAAAGAATCAGTTTGGCAGA
TAATTTGTGTAGTAATTGTCACAGAAAAAAGGAAGTTTATATATTCCTTGCATTGCAATG
TATATAGTCTGAAACACATGATAATTATACAGAACGTTTTCTCTTCATTTGCTTGTCAAA
CTATAAAACTTGTTTTACTTCCT

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 3

CO CL3583Contig1 1232 3 8 U
GGAAAGTTTTAAAATTTTATTATCTCTCTCAATCTCTTTCTCTTTCTTGTCCCGGAGCAG
TCTTGTCTGAATCCCGGAATTGTCCGAATTCGAGACTCTTCGGTGTAAGTCTTTTTAAGA
GAGGAAGCGAATTTTGATGGCGGCGAGTGCGAATCCGCCGGGGAACAATCAGGAAGGATC
GTCGGCGGCTCAGAAGGTGACGTCTTCATCTCCGGCGGTGGCGGCTACGAATGGTGGTGT
GGATAATGGTGGTAATAAGGCGGCGGTGGATAATTCAGAGACGATAAGCGCGTTGAGGCA
TAATCCAGGGATCTCTGTGGATTGGACTCATGAAGAGCAATCTCTATTGGAAGATTTGCT
CGCAAAGTACGCGTCAGAGCCTACTATTGTTCGTTATGCCAAGATTGCGATGAAGATGAA
GGATAAAACTGTCAGAGATGTTGCTTTGCGTTGTAGATGGATGACTAAAAAGGAAAATGG
AAAGCGTAGAAAAGAAGATCACTCGTCAAGGAAGAGCAAAGATAAGAAAGAAAAGACTAC
AGACTCTTCAGCCAAGTCCTCATCTCACATGAATGTGCATCCGAATGGTCCTTCATATCC
TCCTCCTATGATGCCTTTAGATACTGATGATGGCATTTCATATAAAGCTATTGGTGG*TG
TGAGTGGAGACCTTCTCGAACAAAATGCTCAGATGTTCAACCAAGTTTCCACAAATTTCT
CAGCTTTCCAGATACATGAGAACGTCAATATCTTGTGCAAAGCGAGGGACAATATCCTCT
CAATCTTGAACGACTTGAATGACTTGCCAGAGGTTATGAAGCAGATGCCACCTCTTCCTG
TGAAGGTGAACGAAGAGCTGGCTAATTCAATCCTCCCTCGCCCGCCCCATCAAAAGAAGT
CGTGATGGGTTACTATAGAGTCATCTATGGTTTGGTTTGACCAAAAAAGGTACCCTCTTC
ACACACCAGGAGCAGTGAAGAAAAGGAAATAAATCGTGGGATGTAGAGAGAGTTCCCACG
TAATGGATGATGATTGGATGCAGGTTTTTTTACTTGCTCATAGAGTTACTACTAGTCTCT
TTTGCAGTTTCAGTCGTCTCTGGATGTTTTTTTGTTTTTTTAGCAAATGGTGAATTGATA
CATGTGAGTAGAGTTGTATTGTGTTGTTTAGGATGTGAATAGATTTCTACTGTTAATGGT
AAAAGTCTGTGTGTAAAATTGGTTTCAAGCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AL92TF U 1
AF RS1AL92JQ C 471
AF RS1AC40TF U 453
BS 1 657 RS1AL92TF
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BS 990 1232 RS1AC40TF

RD RS1AL92TF 808 0 0
GGAAAGTTTTAAAATTTTATTATCTCTCTCAATCTCTTTCTCTTTCTTGTCCCGGAGCAG
TCTTGTCTGAATCCCGGAATTGTCCGAATTCGAGACTCTTCGGTGTAAGTCTTTTTAAGA
GAGGAAGCGAATTTTGATGGCGGCGAGTGCGAATCCGCCGGGGAACAATCAGGAAGGATC
GTCGGCGGCTCAGAAGGTGACGTCTTCATCTCCGGCGGTGGCGGCTACGAATGGTGGTGT
GGATAATGGTGGTAATAAGGCGGCGGTGGATAATTCAGAGACGATAAGCGCGTTGAGGCA
TAATCCAGGGATCTCTGTGGATTGGACTCATGAAGAGCAATCTCTATTGGAAGATTTGCT
CGCAAAGTACGCGTCAGAGCCTACTATTGTTCGTTATGCCAAGATTGCGATGAAGATGAA
GGATAAAACTGTCAGAGATGTTGCTTTGCGTTGTAGATGGATGACTAAAAAGGAAAATGG
AAAGCGTAGAAAAGAAGATCACTCGTCAAGGAAGAGCAAAGATAAGAAAGAAAAGACTAC
AGACTCTTCAGCCAAGTCCTCATCTCACATGAATGTGCATCCGAATGGTCCTTCATATCC
TCCTCCTATGATGCCTTTAGATACTGATGATGGCATTTCATATAAAGCTATTGGTGGGTG
TGAGTGGAGACCTTCTCGAACAAAATGCTCAGATGTTCAACCAAGTTTCCACAAATTTCT
CAGCTTTCCAGATACATGAGAACGTCAATATCTTGTGCAAAGCGAGGGACAATATCCTCT
CAATCTTGA*CGACTTGAATGACTTGCC

QA 1 808 1 808
DS 

RD RS1AL92JQ 667 0 0
AGGAAAATGGAAAGCGTAGAAAAGAAGATCACTCGTCAAGGAAGAGCAAAGATAAGAAAG
AAAAGACTACAGACTCTTCAGCCAAGTCCTCATCTCACATGAATGTGCATCCGAATGGTC
CTTCATATCCTCCTCCTATGATGCCTTTAGATACTGATGATGGCATTTCATATAAAGCTA
TTGGTGG*TGTGAGTGGAGACCTTCTCGAACAAAATGCTCAGATGTTCAACCAAGTTTCC
ACAAATTTTTCAGCTTTCCAGATACATGAGAACGTCAATATCTTGTGCAAAGCGAGGGAC
AATATCCTCTCAATCTTGAACGACTTGAATGACTTGCCAGAGGTTATGAAGCAGATGCCA
CCTCTTCCTGTGAAGGTGAACGAAGAGCTGGCTAATTCAATCCTCCCTCGCCCGCCCCAT
CAAAAGAAGTCGTGATGGGTTACTATAGAGTCATCTATGGTTTGGTTTGACCAAAAAAGG
TACCCTCTTCACACACCAGGAGCAGTGAAGAAAAGGAAATAAATCGTGGGATGTAGAGAG
AGTTCCCACGTAATGGATGATGATTGGATGCAGGTTTTTT*ACTTGCTCATAGAGTTACT
ACTAGTCTCTTTTGCAGTTTCAGTCGTCTCTGGATGTTTTTTTGTTTTTTTAGCAAATGG
TGAATTG

QA 1 667 1 667
DS 

RD RS1AC40TF 780 0 0
GTAGATGGATGACTAAAAAGGAAAATGGAAAGCGTAGAAAAGAAGATCATTCGTCAAGGA
AGAGCAAAGATAAGAAAGAAAAGACTACCGACTCTTCAGCCAAGTCCTCATCTCACATGA
ATGTGCATCCGAATGGTCCTTCATATCCTCCTCCTATGATGCCTTTAGATACTGATGATG
GCATTTCATATAAAGCTATTGGTGG*TGTGAGTGGAGACCTTCTCGAACAAAATGCTCAG
ATGTTCAACCAAGTTTCCACAAATTTCTCAGCTTTCCAGATACATGAGAACGTCAATATC
TTGTGCAAAGCGAGGGACAATATCCTCTCAATCTTGAACGACTTGAATGACTTGCCAGAG
GTTATGAAGCAGATGCCACCTCTTCCTGTGAAGGTGAACGAAGAGCTGGCTAATTCAATC
CTCCCTCGCCCGCCCCATCAAAAGAAGTCGTGATGGGTTACTATAGAGTCATCTATGGTT
TGGTTTGACCAAAAAAGGTACCCTCTTCACACACCAGGAGCAGTGAAGAAAAGGAAGTAA
ATCGTGGGATGTAGAGAGAGTTCCCACGTAATGGATGATGATTGGATGCAGGTTTTTTTA
CTTGCTCATAGAGTTACTACTAGTCTCTTTTGCAGTTTCAGTCGTCTCTGGATGTTTTTT
TGTTTTTTTAGCAAATGGTGAATTGATACATGTGAGTAGAGTTGTATTGTGTTGTTTAGG
ATGTGAATAGATTTCTACTGTTAATGGTAAAAGTCTGTGTGTAAAATTGGTTTCAAGCTG

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 3

CO CL3584Contig1 776 3 5 U
AATAACAAAACCCTTCTTCATCATATCATCTTTCTTGGTGCACAAGTATCGATACCAAAG
GTGTTTTACCTCTTAAAACCTAACTTCTAATTAAACAATTTTGAGTTGCACTCGGAGGTT
AAATATTATGATAAAACAACTTATCCACATCGAGAAAAAAACGACACAACTGACGCAATG
ACACATAGATAGAGAGAGAGTTTAGTTGTTTTTAGATTAAAGAAACCCTACACGAAATTT
GTAGTTTGATATCCCTCCTCCTCCACTGCAGATCAATCGATAAGGAACACTACTAGATTC
CGTTGACTCGATAGGCTGTTACTTTCAGGACGAAGTCTCTGGTTCTGAACAGCTCGAAGA
CGCAGACGTCACCTTCTCCAAGGTTGTTCTCCAGGGTGAACTCGTACCATCCTTGGCTGA
ACTTGGCCCTCCCTGCTTTGTAAAGGCATCTCACTGGCCATTGTTTCTCCCCGAGCTGGA
CCTTGATGAACCCCGAGATCCCACTTAAGTACTTCTCAGCAAAACCAGAAGGCAGATACA
TGATGCAGCCTCTGTATAGATAAGATGGTCGGAGAACAACTCTGAAGAAAGGGTTTGTTG
GCTCGAACGTTTTGGCTGCATTGATGGCCCTCTCTCTTTCCTCTGCAGTCACCGTTCTCT
TTCTAGCAGAAGCACTCTCGTAGAACTTAGAACGGCTCTCTGGGTCATCATCTCGTGGAG
CAGATGAGTTTATCTCCTCAGGAACAGTGTTCTTCTTCTTCCTCCCTCTCTTTTTA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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DS 

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DS 



AS 1 3

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BQ
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G
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CTTGAACACTGAGGAAACATTAATTTACAAAATGTTTTTTTTTTATTTTCATCTTCTTAC
TTG

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TTCGAGATCTATAGGAGATATGTACATGAAACGGCCAGAGTTTAACAGGGAACCGATTGC
TCAGAAGTTTAGGCTTGCAGAGCCGATGAAGAGACCTTTGATGTCTGCAACACCAACCAT
ACTCTCTCATCCGCTGCACCCTAATGACTCGTTCCTCATCTTTGCGTCTGATGGTCTTTG
GGAACATTTGAGTAACGAGAAAGCAGTTGAGATTGTTCATAGCCATCCTCGCGCTGGAAG
TGCAAAGAGGCTGATAAAAGCGGCTCTTCAAGAGGCAGCGAGGAAAAGAGAGATGAGGTA
TTCAGATTTAAGGAAGATTGACAAGAAAGTGAGACGCCATTTTCATGATGACATCACGGT
TATAGTAGTGTTCTTGAACCATGACCTCATCTCAAGAGGCCACACGAACACAACAACCCA
AGACTCAGCACTCTCGGTCCGGAGTGCTCTTGAACACTGAGGAAACATTAATTTACAAAA
TGTTTTTTTTTTATTTTCATCTTCTTACTTGGATGGTTTATATGACACTTCTTCTGCGTA
GAAGGTAATAAAATACACTGGGCAAATATCAAAATGTGGAAACGGCGTATCAGTACGTAA
TGAGTTGTGTTGTATTAAGCGGGGTATGTTTGGTTTCATTTTCAAGTCTGCATAG

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

CO CL3586Contig1 1061 2 4 U
GCGAAACAACGCAAGACTTGTACATTTTAAGCATTTGGCCAAAAACTTTCCACAGGTAGA
CAAATCCGGCAAAAAACACATACAAGAGACCAGTTTTGGTTAATGACGAAAACTTGCAAT
CTGAAAACCGGATCCTTACCAGGTGGTGGTCCTTAAACCGCGGTTATCACCCGGTTTAAA
CACTTATTTTCCCAACTATGAGCTTTTTTTTAGGTCAAACTGGCGAAACAGCTATCAGAC
CTAGACAAAACATTTGGAACACAATCATCTTCATCTTTAGAAGGACTACTAGGCATTGAT
CTAAGCACTCTTGGAGAATCCAAGCTTCTTCTCAAGATCTGTCTCATCGCAAAAATCAAA
TGTCCAGTCGGATTAGGAGGTGGGCTTGAGCATTTGAACTTGTAACACGTGTTCATGTGC
CTTGCCATAGCTTCCTCTGGAGTTAGCAATCGTTTAGTTCTTATAACCTCGTACTTAACA
GCTTCAGAACAAAGACCACAGATCCATTTACCCATGTAACGCTCTCTGATCATCTCTATG
TACGATTGTGTACACTCCTCGGTTAATCCGCAGCAGTCACACGTCACGGGCTCAGGCTCG
TCGCCCGAGATTTGTGTTGTAGGCGATGGAGACGGCTGTTGAGAGGCGATCATGACCTCT
GTTGTTGAAATCAGCATCGTTGGATCACTTAGTAGACTTGTGGTCATGGTTTCTTGATTT
TTTAAACCCAGTAGAAAACGATGAGAAGGTAACGCAAACTCTCTTATGATCTTCTGAAAC
AGATGAGAGACTTGAAAAGAAAAACTTTTTTTTTGGTTTTCTTGATGCGAATTGATTACT
ACTATGATCTTTCGTTAACCCACTCTCCGTCTTCTAGGTTACCTTCTTCACCAAGAAAGA
TTTCACAAAACAAGACCATTGCAAGAACAGTAGATTAAAAGACACCAATTAAATCTTTTT
TCTTTTCTTCTTTATATCAAAATTTAAAAAGTTATGCTTTCTTTACCGCACAGAAGTTTC
AGAAGGAAGAGGGAAATATTTAGAGAGACAGAGAATGTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FD30JQ U 1
AF RS1BU29TF C 332
BS 1 419 RS1FD30JQ
BS 420 420 RS1BU29TF
BS 421 574 RS1FD30JQ
BS 575 1061 RS1BU29TF

RD RS1FD30JQ 574 0 0
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CTGAAAACCGGATCCTTACCAGGTGGTGGTCCTTAAACCGCGGTTATCACCCGGTTTAAA
CACTTATTTTCCCAACTATGAGCTTTTTTTTAGGTCAAACTGGCGAAACAGCTATCAGAC
CTAGACAAAACATTTGGAACACAATCATCTTCATCTTTAGAAGGACTACTAGGCATTGAT
CTAAGCACTCTTGGAGAATCCAAGCTTCTTCTCAAGATCTGTCTCATCGCAAAAATCAAA
TGTCCAGTCGGATTAGGAGGTGGGCTTGAGCATTTGAACTTGTAACACGTGTTCATGTGT
CTTGCCATAGCTTCCTCTGGAGTTAGCAATCGTTTAGTTCTTATAACCTCGTACTTAACA
GCTTCAGAACAAAGACCACAGATCCATTTACCCATGTAACGCTCTCTGATCATCTCTATG
TACGATTGTGTACACTCCTCGGTTAATCCGCAGC

QA 1 574 1 574
DS 

RD RS1BU29TF 730 0 0
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ATTTGAACTTGTAACACGTGTTCATGTGCCTTGCCATAGCTTCCTCTGGAGTTAGCAATC
GTTTAGTTCTTATAACCTCGTACTTCACAGCTTCAGAACAAAGACCACAGATCCATTTAC
CCATGTAGCGCTCTCTGATCATCTCTATGTACGATTGTGTACACTCCTCGGTTAATCCGC
AGCAGTCACACGTCACGGGCTCAGGCTCGTCGCCCGAGATTTGTGTTGTAGGCGATGGAG
ACGGCTGTTGAGAGGCGATCATGACCTCTGTTGTTGAAATCAGCATCGTTGGATCACTTA
GTAGACTTGTGGTCATGGTTTCTTGATTTTTTAAACCCAGTAGAAAACGATGAGAAGGTA
ACGCAAACTCTCTTATGATCTTCTGAAACAGATGAGAGACTTGAAAAGAAAAACTTTTTT
TTTGGTTTTCTTGATGCGAATTGATTACTACTATGATCTTTCGTTAACCCACTCTCCGTC
TTCTAGGTTACCTTCTTCACCAAGAAAGATTTCACAAAACAAGACCATTGCAAGAACAGT
AGATTAAAAGACACCAATTAAATCTTTTTTCTTTTCTTCTTTATATCAAAATTTAAAAAG
TTATGCTTTCTTTACCGCACAGAAGTTTCAGAAGGAAGAGGGAAATATTTAGAGAGACAG
AGAATGTGCC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 3

CO CL3587Contig1 649 3 8 U
GGAAAAACAATTAATTCAAAATAATAAAAACAAAATGCTGTTCCCTTCAAAGATCATCAC
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ATCAGACTGCTGCGTGGGAGTCAAATCATTGAACCAAATGACTCAGACCACACCGGACCG
CCGACAAGTCTGTGAGTGCCTTAAATCTGCGGCTAGGGATATCACTGGCCTCAACACCGA
CCTTGTGGCCACACTCCCTACAACTTGTGGTGTTTCAGTTCCCTACCCCATTCGTTTTAG
CACCAATTGTGACACTATATCGGCTACCGTGTGAAGGAGGCTGGAGATGTACGACTAATC
AAAGTTGCAAGCTTTTACCTAAATAATAATATTATGCCCTTTTCAAAATAATAATAATAA
TAATAATGTTATGCTGTTATTTCCCATTTTATGAGTTCATTCTCTTATTATGTAATCATC
CATTGCATATGGCAATAACGACAAAGGAACTCTTTCTTGCTCCTTTTTCTTTTCGGCACT
TTGATGATGTATGTACGCATACCGTAGTACCATCAGGGATACTGGACAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1DN44TF U 1
AF RS1FL21TF U 1
AF RS1FL21JQ C 85
BS 1 482 RS1DN44TF
BS 483 485 RS1FL21TF
BS 486 582 RS1DN44TF
BS 583 595 RS1FL21TF
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BS 638 638 RS1FL21JQ
BS 639 649 RS1FL21TF

RD RS1DN44TF 582 0 0
GGAAAAACAATTAATTCAAAATAATAAAAACAAAATGCTGTTCCCTTCAAAGATCATCAC
ATGCCTCCTCGTCCTAATCGTCTGCATGGCAGCCCCATCAGAGTCAGCCATAACGTGTGG
GACAGTGACAAGCACACTGGCACGGTGTGTGGGCTACTTGACCAACAGTGGTCCATTGCC
ATCAGACTGCTGCGTGGGAGTCAAATCATTGAACCAAATGACTCAGACCACACCGGACCG
CCGACAAGTCTGTGAGTGCCTTAAATCTGCGGCTAGGGATATCACTGGCCTCAACACCGA
CCTTGTGGCCACACTCCCTACAACTTGTGGTGTTTCAGTTCCCTACCCCATTCGTTTTAG
CACCAATTGTGACACTATATCGGCTACCGTGTGAAGGAGGCTGGAGATGTACGACTAATC
AAAGTTGCAAGCTTTTACCTAAATAATAATATTATGCCCTTTTCAAAATAATAATAATAA
TA***ATGTTATGCTGTTATTTCCCATTTTATGAGTTCATTCTCTTATTATGTAATCATC
CATTGCATATGGCAATAACGACAAAGGAACTCTTTCTTGCTC

QA 1 582 1 582
DS 

RD RS1FL21TF 649 0 0
GGAAAAACAATTAATTCAAAATAATAAAAACAAAATGCTGTTCCCTTCAAAGATCATCAC
ATGCCTCCTCGTCCTAATCGTCTGCATGGCAGCCCCATCAGAGTCAGCCATAACGTGTGG
GACAGTGACAAGCACACTGGCACGGTGTGTGGGCTACTTGACCAACAGTGGTCCATTGCC
ATCAGACTGCTGCGTGGGAGTCAAATCATTGAACCAAATGACTCAGACCACACCGGACCG
CCGACAAGTCTGTGAGTGCCTTAAATCTGCGGCTAGGGATATCACTGGCCTCAACACCGA
CCTTGTGGCCACACTCCCTACAACTTGTGGTGTTTCAGTTCCCTACCCCATTCGTTTTAG
CACCAATTGTGACACTATATCGGCTACCGTGTGAAGGAGGCTGGAGATGTACGACTAATC
AAAGTTGCAAGCTTTTACCTAAATAATAATATTATGCCCTTTTCAAAATAATAATAATAA
TAATAATGTTATGCTGTTATTTCCCATTTTATGAGTTCATTCTCTTATTATGTAATCATC
CATTGCATATGGCAATAACGACAAAGGAACTCTTTCTTGCTCCTTTTTCTTTTCG*CACT
TTGATGATGTATGTACGCATACCGTAGTACCATCAGG*ATACTGGACAC

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1FL21JQ 565 0 0
CATGGCAGCCCCATCAGAGTCAGCCATAACGTGTGGGACAGTGACAAGCACACTGGCACG
GTGTGTGGGCTACTTGACCAACAGTGGTCCATTGCCATCAGACTGCTGCGTGGGAGTCAA
ATCATTGAACCAAATGACTCAGACCACACCGGACCGCCGACAAGTCTGTGAGTGCCTTAA
ATCTGCGGCTAGGGATATCACTGGCCTCAACACCGACCTTGTGGCCACACTCCCTACAAC
TTGTGGTGTTTCAGTTCCCTACCCCATTCGTTTTAGCACCAATTGTGACACTATATCGGC
TACCGTGTGAAGGAGGCTGGAGATGTACGACTAATCAAAGTTGCAAGCTTTTACCTAAAT
AATAATATTATGCCCTTTTCAAAATAATAATAATAATAATAATGTTATGCTGTTATTTCC
CATTTTATGAGTTCATTCTCTTATTATGTAATCATCCATTGCATATGGCAATAACGACAA
AGGAACTCTTTCTTGCTCCTTTTTCTTTTCGGCACTTTGATGATGTATGTACGCATACCG
TAGTACCATCAGGGATACTGGACAC

QA 1 565 1 565
DS 



AS 1 3

CO CL3588Contig1 1225 3 4 U
TTCTCAGAGCAGAGAAGAAAGAAAAGAACAGAGAGAGAGATCGTCGTCAAATTCATCCAT
GGCTACGCTCTTCACCACCACCACAACAACCTCTCGTCCTTTCTCCGCAAATCCTACCAA
GACCTTCTCTCCTTCTCTCTCCCTAAAACCCAATGCTCTCTCCTTCTCACTACCCCACCA
CCGTCCCAAGCCTCTCCGGTTTTCCAGAATCCGATCCTCGGATTCAGACTCCGAACCGGA
AGGCGGGTATTCGATTACAGACGAATGGGGCGAGGAACCGGTCGAACCGTTATCTCAGCC
GGATAACTCTTCGTCCGCGATCTCAGACGAATGGGGAGAGAAATCCGAACCCGTACCCGA
GGAGACAGTGACCCGGTTCGCGGGATCGGATCCTCCGACGAACGAGGACGAGTGGGAGGA
AAGTGATGATGGAGGAGGAGTCGACAAGACTCGGGAGCTGAAGAGGTGTTTGGCGGACAC
GGTGTACGGAACCGAATTAGGGTTCCGAGCTGGGTCTGAAGTCCGCGCGGAGGTTTTGGA
GATCGTGAATCAGTTGGAAGCTCTTAATCCTACTCAGGCTCCGGTTGAGAATCCGGACCT
CCTCGATGGCAATTGGGTTTTGCTGTACACTGCGTTCTCTGAGTTGCTTCCTCTTCTAGC
TGCGGGCTCCACACCTTTGTTGAAAGTGAAGAGTATAACTCAGTCTATAGACACAAAGAG
TCTCACTATAGACAACTCCACCACTCTCTCCAGCCCCTTTGCTGACTTCTCCTTCACTGC
TACTGCTTCTTTTGAAGTTCGAAGCCCTTCGAGAATTGAGGTTTCTTTCAAAGAAGGTAC
GCTGAAGCCTCCAGAGATCAAGTCAAGTGTGGATCTCCCGGAGAGCGTGGGTGTCTTCGG
GCAGGAGGTTAACCTATCGTTCCTGAAGCAGTCTTTGAACCCTTTACAAGATGTGGCGGC
AAACATTTCGCGGGCAATCTCTGGTCAGCCACCTCTCAAGCTTCCGTTTCCGGGAAACCG
TGGCAGCTCTTGGCTCTTGACCACTTATCTCGACAAGGATCTCAGGATTTCGAGAGGAGA
CGGTGGGCTTTTCGTGCTTGCTAGAGAAGGAAGCTCCCTGCTTGAGCTCTGAAATATTTA
TATACCAAGCAGGCTTCTTGTAAAAACAGTACTCACTAGAGGGATCATCATAATAATAAG
AATGCTGAATGCAAATTATTGGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B908TF U 1
AF RS1B908JQ C 398
AF RS1FJ82TF U 791
BS 1 749 RS1B908TF
BS 750 790 RS1B908JQ
BS 791 1213 RS1FJ82TF
BS 1214 1225 RS1B908JQ

RD RS1B908TF 749 0 0
TTCTCAGAGCAGAGAAGAAAGAAAAGAACAGAGAGAGAGATCGTCGTCAAATTCATCCAT
GGCTACGCTCTTCACCACCACCACAACAACCTCTCGTCCTTTCTCCGCAAATCCTACCAA
GACCTTCTCTCCTTCTCTCTCCCTAAAACCCAATGCTCTCTCCTTCTCACTACCCCACCA
CCGTCCCAAGCCTCTCCGGTTTTCCAGAATCCGATCCTCGGATTCAGACTCCGAACCGGA
AGGCGGGTATTCGATTACAGACGAATGGGGCGAGGAACCGGTCGAACCGTTATCTCAGCC
GGATAACTCTTCGTCCGCGATCTCAGACGAATGGGGAGAGAAATCCGAACCCGTACCCGA
GGAGACAGTGACCCGGTTCGCGGGATCGGATCCTCCGACGAACGAGGACGAGTGGGAGGA
AAGTGATGATGGAGGAGGAGTCGACAAGACTCGGGAGCTGAAGAGGTGTTTGGCGGACAC
GGTGTACGGAACCGAATTAGGGTTCCGAGCTGGGTCTGAAGTCCGCGCGGAGGTTTTGGA
GATCGTGAATCAGTTGGAAGCTCTTAATCCTACTCAGGCTCCGGTTGAGAATCCGGACCT
CCTCGATGGCAATTGGGTTTTGCTGTACACTGCGTTCTCTGAGTTGCTTCCTCTTCTAGC
TGCGGGCTCCACACCTTTGTTGAAAGTGAAGAGTATAACTCAGTCTATAGACACAAAGAG
TCTCACTATAGACAACTCCACCACTCTCT

QA 1 749 1 749
DS 

RD RS1B908JQ 828 0 0
ACGAACGAGGACGAG*GGGAGGAAAGTGATGATGGAGGAGGAGTCGACAAGACTCGGGAG
CTGAAGAGGTGTTTGGCGGACACGGTGTACGGAACCGAATTAGGGTTCCGAGCTGGGTCT
GAAGTCCGCGCGGAGGTTTTGGAGATCGTGAATCAGTTGGAAGCTCTTAATCCTACTCAG
GCTCCGGTTGAGAATCCGGACCTCCTCGATGGCAATTGGGTTTTGCTGTACACTGCGTTC
TCTGAGTTGCTTCCTCTTCTAGCTGCGGGCTCCACACCTTTGTTGAAAGTGAAGAGTATA
ACTCAGTCTATAGACACAAAGAGTCTCACTATAGACAACTCCACCACTCTCTCCAGCCCC
TTTGCTGACTTCTCCTTCACTGCTACTGCTTCTTTTGAAGTTCGAAGCCCTTCGAGAATT
GAGGTTTCTTTCAAAGAAGGTACGCTGAAGCCTCCAGAGATCAAGTCAAGTGTGGATCTC
CCGGAGAGCGTGGGTGTCTTCGGGCAGGAGGTTAACCTATCGTTCCTGAAGCAGTCTTTG
AACCCTTTACAAGATGTGGCGGCAAACATTTCGCGGGCAATCTCTGGTCAGCCACCTCTC
AAGCTTCCGTTTCCGGGAAACCGTGGCAGCTCTTGGCTCTTGACCACTTATCTCGACAAG
GATCTCAGGATTTCGAGAGGAGACGGTGGGCTTTTCGTGCTTGCTAGAGAAGGAAGCTCC
CTGCTTGAGCTCTGAAATATTTATATACCAAGCAGGCTTCTTGTAAAAACAGTACTCACT
AGAGGGATCATCATAATAATAAGAATGCTGAATGCAAATTATTGGATC

QA 1 828 1 828
DS 

RD RS1FJ82TF 423 0 0
TTTGAAGTTCGAAGCCCTTCGAGAATTGAGGTTTCTTTCAAAGAAGGTACGCTGAAGCCT
CCAGAGATCAAGTCAAGTGTGGATCTCCCGGAGAGCGTGGGTGTCTTCGGGCAGGAGGTT
AACCTATCGTTCCTGAAGCAGTCTTTGAACCCTTTACAAGATGTGGCGGCAAACATTTCG
CGGGCAATCTCTGGTCAGCCACCTCTCAAGCTTCCGTTTCCGGGAAACCGTGGCAGCTCT
TGGCTCTTGACCACTTATCTCGACAAGGATCTCAGGATTTCGAGAGGAGACGGTGGGCTT
TTCGTGCTTGCTAGAGAAGGAAGCTCCCTGCTTGAGCTCTGAAATATTTATATACCAAGC
AGGCTTCTTGTAAAAACAGTACTCACTAGAGGGATCATCATAATAATAAGAATGCTGAAT
GCA

QA 1 423 1 423
DS 



AS 1 3

CO CL3589Contig1 483 3 7 U
GAAGAAAGAAATAAAGCTAACTTCAATTTGTTCGAGAAACATGTCGAAGACACCAGCAGA
GAAACAAGAGTTACCACTAGAAACGAGTCCGTACACAAAGTACGAGGATATTGAAGATTA
CAAGAAGAACGCTTATGGAACTTCTGGTCACCAGGAAGTTAAGCCAGGCCAAGGCGGTGG
CGCAACGGACGCACCAACGCTCTCAGGCAGTGCTCCTCCCTCCGCTATAGATTCAGCTAA
CCAACAAGCTAAGAAGTGAATCACACATTATCACATAACAAACATGTCCCCTTGCTTTCT
TATATGATGCTTTTGCGATAGTTGATTTGTTTTTTTTTCTTATCTGTTGTTATGATCCAA
TCCAATCTAATCAATTGATCGATGCTGAAGTCTAAGAGAATTTGACCATCTTCCGACAGA
TTATACGCTACATGTATAAAAATATTAGATAAAGAATAACATATGTTCCAAGTCCTAACG
CTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1B747JQ C 39
AF RS1B747TF U 39
AF RS1DS48TF U 1
BS 1 186 RS1DS48TF
BS 187 187 RS1B747TF
BS 188 275 RS1DS48TF
BS 276 276 RS1B747TF
BS 277 287 RS1DS48TF
BS 288 288 RS1B747TF
BS 289 483 RS1DS48TF

RD RS1B747JQ 437 0 0
GG
ATGTCGAAGACACCAGCAGAGAAACAAGAGTTACCACTAGAAACGAGTCCGTACACAAAG
TACGAGGATATTGAAGATTACAAGAAGAACGCTTATGGAACTTCTGGTCACCAGGAAGTT
AAGCCAGGCCAAGGCGGTGGCGCAACGGACGCACCAACGCTCTCAGGCAGTGCTCCTCCC
TCCGCTATAGATTCAGCTAACCAACAAGCTAAGAAGTGAATCACACATTATCACATAACA
AACATGTCCCCTTGCTTTCTTATATGATGCTTTTGCGATAGTTGATTTGTTTTTTTTTCT
TATCTGTTGTTATGATCCAATCCAATCTAATCAATTGATCGATGCTGAAGTCTAAGAGAA
TTTGACCATCTTCCGACAGATTATACGCTACATGTATAAAAATATTAGATAAAGAATAAC
ATATGTTCCAAGTCC

QA 3 437 3 437
DS 

RD RS1B747TF 437 0 0
GG
ATGTCGAAGACACCAGCAGAGAAACAAGAGTTACCACTAGAAACGAGTCCGTACACAAAG
TACGAGGATATTGAAGATTACAAGAAGAACGCTTATGGAACTTCTGGTCACCAGGAAGTT
AAGCCAGGCCAAGGCGGTGGCGCAACGGACGCACCAACGCTCTCAGGCAGTGCTCCTCCC
TCCGCTATAGATTCAGCTAACCAACAAGCTAAGAAGTGAATCACACATTATCACATAACA
AACATGTCCCCTTGCTTTCTTATATGATGCTTTTGCGATAGTTGATTTGTTTTTTTTTCT
TATCTGTTGTTATGATCCAATCCAATCTAATCAATTGATCGATGCTGAAGTCTAAGAGAA
TTTGACCATCTTCCGACAGATTATACGCTACATGTATAAAAATATTAGATAAAGAATAAC
ATATGTTCCAAGTCC

QA 3 437 3 437
DS 

RD RS1DS48TF 483 0 0
GAAGAAAGAAATAAAGCTAACTTCAATTTGTTCGAGAAACATGTCGAAGACACCAGCAGA
GAAACAAGAGTTACCACTAGAAACGAGTCCGTACACAAAGTACGAGGATATTGAAGATTA
CAAGAAGAACGCTTATGGAACTTCTGGTCACCAGGAAGTTAAGCCAGGCCAAGGCGGTGG
CGCAACAGACGCACCAACGCTCTCAGGCAGTGCTCCTCCCTCCGCTATAGATTCAGCTAA
CCAACAAGCTAAGAAGTGAATCACACATTATCACAGAACAAACATGTTCCCTTGCTTTCT
TATATGATGCTTTTGCGATAGTTGATTTGTTTTTTTTTCTTATCTGTTGTTATGATCCAA
TCCAATCTAATCAATTGATCGATGCTGAAGTCTAAGAGAATTTGACCATCTTCCGACAGA
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CTG

QA 1 483 1 483
DS 



AS 1 3

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ATTTACAAAAAGTGGCTTTCGGAGCTGAAACATTATGCGCCTAGCATCCCCATTGTGCTC
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CCACATGTTATCTCTCTCTTCTCTTTTGCGTATCATTCTATGATCCATTATAAATACATT
TATCATGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EP68JQ C 1
AF RS1EP68TF U 1
AF RS1A977TF U 26
BS 1 623 RS1EP68TF
BS 624 848 RS1A977TF

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QA 1 623 1 623
DS 

RD RS1A977TF 823 0 0
GG
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GCGTATCATTCTATGATCCATTATAAATACATTTATCATGT

QA 3 823 3 823
DS 



AS 1 2

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GTGTTGTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BB78TF U 1
AF RS1DA06TF U 61
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CCAAATGGTTGTTCAATCGATTGACCA

QA 1 747 1 747
DS 

RD RS1DA06TF 788 0 0
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TGTTGTCGGATTGAACTTCGACTTTGCTCTTTTGAATTTCACAAAGCACTCATCGTATAT
GATCTACAACGTCTGCCTCTACTTTAGCCCCTTTATTCAGAAACAGTACTTTGACACTTA
TGGAGACACAGAGATGATACCTGTGGCTGCAAATGATGTTGCATTCTCAATCCATGCTGT
CTTAGTGACAGCAGTTACCCTCTTCCAGATCTGTATCTATGAACGTGGAACTCAAAAAGT
ATCGAGATTTGCAACAGGTCTTGTGATCCTTGTCTGGGGGTTTGCAGCTACCTGTTTCTT
CATTGCTTTACCTACACGTTCTTGGCTCTGGCTCATTACCCTCTTCAACTCGATTCAGGT
TTGCATGACATGCGTCAAGTACATTCCACAGGCGAAGATGAACTTTACTAGGAAGAGCAC
AGTAGGCTGGAGCATTGAGAATATTCTTCTCGATTTTTGTGGAGGAGTCTCTAATTATCT
CCAAATGGTTGTTCAATCGATTGACCAATGTTCTTGGGTGAATTTCTATGGGAACATTGG
AAAGACTCTTCTCTCACTAGTCACAATATTTTCGATCTCATCTTCATGTTTCAACACTAC
GTGTTGTA

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 3

CO CL3592Contig1 943 3 5 U
GGATATACAAAAGGATTAAGATACACGAAGAGGAAGAGAGACTTCGATCTCAGCAAGTTC
TCTTCATTTTCCACCGACGTATGACTAAATCATTATGCCCATATAATGATTAAAAGATTT
TTCCATCCCCTATATATTAAAGGAGAAGCATTTTTAAGGCTTTCCTTAAACGGTTTTCAC
CAGAATGCATGAGAAGGCTCCGTTCCACGTGTCAGTCTATGAGCGTTTTAAAAAAAACGC
AACAGTTATTGCCTAACTTTCTTTCCTTTTTAGCATATATGACAAGGAACAAAACGACTA
ATTTTTTCATAGCTTTGTCGACGTAAACAAAAATTTACAAACCTTTCACGCGAGTTACAC
TTTCACTTACAGAGAAATCGGGTGAACTCGAGTTGATATTGAAGCAGGCCAACTCGAGTT
GGTGGTGGTGGTAGCAGCAAAGACGCAGAAGGTTCTTCTAATCATATTCCTCCTGATGGT
TCAACTCCACCAAGAAGGCTACATCGAAACGGAGGAAGCTAAAAGGATCAATAGGAGGAG
AAGGGTCGGTGAAGAAATCATCAAAAGGAAAACCCGAGAGTTCAGTTGATGATACATGTA
ATGATTTTATCTGAGAGATACATAAAAAACGAAAACATGAAAATGTAACTCGTGAGGCCA
CCTCCGTGTGAGAGTTTGTTTTAGTTTGTTGACTGCTCAAGAAGGGAAACAAAAACTGGC
TCACAAGAAAAAACATTTTTTGAAGGAAAGGGAACAGAAAGAAATGCATATAAACTATGT
GAATCAATCATCTATTAGATTGTTTTATTTTATTTTTTTGGGGTCTATTCCTTGCGAAGA
TCTATGCACACAAAACTAATCGCAGTCACAAGACACGTTTATTTCTTGCTCACACATGTG
ATGAGACCTTCGGATCTACATTGTCTGTAATGTCTTCCACTTT


BQ
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AF RS1CY40TF U 1
AF RS1BT04TF U 377
AF RS1CY40JQ C 267
BS 1 658 RS1CY40TF
BS 659 659 RS1BT04TF
BS 660 697 RS1CY40TF
BS 698 706 RS1BT04TF
BS 707 943 RS1CY40JQ

RD RS1CY40TF 697 0 0
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TCTTCATTTTCCACCGACGTATGACTAAATCATTATGCCCATATAATGATTAAAAGATTT
TTCCATCCCCTATATATTAAAGGAGAAGCATTTTTAAGGCTTTCCTTAAACGGTTTTCAC
CAGAATGCATGAGAAGGCTCCGTTCCACGTGTCAGTCTATGAGCGTTTTAAAAAAAACGC
AACAGTTATTGCCTAACTTTCTTTCCTTTTTAGCATATATGACAAGGAACAAAACGACTA
ATTTTTTCATAGCTTTGTCGACGTAAACAAAAATTTACAAACCTTTCACGCGAGTTACAC
TTTCACTTACAGAGAAATCGGGTGAACTCGAGTTGATATTGAAGCAGGCCAACTCGAGTT
GGTGGTGGTGGTAGCAGCAAAGACGCAGAAGGTTCTTCTAATCATATTCCTCCTGATGGT
TCAACTCCACCAAGAAGGCTACATCGAAACGGAGGAAGCTAAAAGGATCAATAGGAGGAG
AAGGGTCGGTGAAGAAATCATCAAAAGGAAAACCCGAGAGTTCAGTTGATGATACATGTA
ATGATTTTATCTGAGAGATACATAAAAAACGAAAACATGAAAATGTAACTCGTGAGGC*A
CCTCCGTGTGAGAGTTTGTTTTAGTTTGTTGACTGCT

QA 1 697 1 697
DS 

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GG
CGGGTGAACTCGAGTTGATATTGAAGCAGGCCAACTCGAGTTGGTGGTGGTGGTAGCAGC
AAGGACGCAGAAGGTTCTTCTAATCATATTCCTCCTGATGGTTCAACTCCACCAAGAAGG
CTACATCGAAACGGAGGAAACTAAAAGGATCAATAGGAGGAGAAGGGTCGGTGAAGAAAT
CATCAAGAGGAAAACCCGAGAGTTCAGTTGATGATACATGTAATGATTTTATCTGAGAGA
TACATAAAAAACGAAAACATGAAAATGTAACTCGTGAGGCCACCTCCGTGTGAGAGTTTG
TTTTAGTTTGTTGACTGCTCAAGAAGGG

QA 3 330 3 330
DS 

RD RS1CY40JQ 677 0 0
TTTTTAGCATATATGACAAGGAACAAAACGACTAATTTTTTCATAGCTTTGTCGACGTAA
ACAAAAATTTACAAACCTTTCACGCGAGTTACACTTTCACTTACAGAGAAATCGGGTGAA
CTCGAGTTGATATTGAAGCAGGCCAACTCGAGTTGGTGGTGGTGGTAGCAGCAAAGACGC
AGAAGGTTCTTCTAATCATATTCCTCCTGATGGTTCAACTCCACCAAGAAGGCTACATCG
AAACGGAGGAAGCTAAAAGGATCAATAGGAGGAGAAGGGTCGGTGAAGAAATCATCAAAA
GGAAAACCCGAGAGTTCAGTTGATGATACATGTAATGATTTTATCTGAGAGATACATAAA
AAACGAAAACATGAAAATGTAACTCGTGAGGCCACCTCCGTGTGAGAGTTTGTTTTAGTT
TGTTGACTGCTCAAGAAGGGAAACAAAAACTGGCTCACAAGAAAAAACATTTTTTGAAGG
AAAGGGAACAGAAAGAAATGCATATAAACTATGTGAATCAATCATCTATTAGATTGTTTT
ATTTTATTTTTTTGGGGTCTATTCCTTGCGAAGATCTATGCACACAAAACTAATCGCAGT
CACAAGACACGTTTATTTCTTGCTCACACATGTGATGAGACCTTCGGATCTACATTGTCT
GTAATGTCTTCCACTTT

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 3

CO CL3593Contig1 1116 3 11 U
GGGGAAGTCTTTGCAAAACATAAAAACAGAACATGTTCTCACTACCAACTAGTTCGACCG
TTCTGTGTCTTGAAACAATGAGCACTCTTTTGAGTAACTTCCATTTTGCACCTCACGATT
CTCTAAATTACAAAATCTCCCCTTTTCCCAAAAGATTATCATCCTTCACCAACAACAACC
CTCGCCTCCCCATCAAGAACACTCGAATCTCCTGCAACAGTTTGAGAATGGATTCGTCAG
ATAATAACATTTCCGCTTGTGCACAGCAACCGAAGAAGATGGAGATTCCGAACAGCCACG
ACGAGAAGCTCGTGGGTCTCCTTCACGAAACCGGTTCGAAAGAAGTTGTGGTCTTGTGCC
ATGGATTTCGATCCAGCAAGAATCACCAAATCATGAAGAATGTGGCTGCTGCTTTGGAGA
AAGAAGGGATCAGTGCGTTCCGTTTTGATTTCTCTGGAAATGGAGAGAGTGAAGGCAGTT
TCTATTATGCTAACTATAACCATGAAGCTGATGATCTACGTTCTGTCATCCAACACTTGT
CTGACATGAACCGTGTGGTTCCTATCATTCTTGGGCACAGTAAAGGAGGTGATGTGGTTC
TCCTCTATGCCTCCAAGCATCATGAAATCAGTAATGTGATCAATCTCTCGGGACGCTATG
ATCTGAAGAAAGGCATAAGAGAGCGACTTGGGGATGACTTTTTGGAAAGAATTAAAGAAC
AAGGATTCATTGATGTTAACAATGGAAAATCCAGCTACAGTGTTACGGAGGAGAGTTTAA
TGGAGAGGTTAGGCACTGATATGCATGAAGCTTGCCTCAAGATTGACAAAGGTTGCAGGG
TCTTGACGGTTCATGGAACAGATGACGAGGTAATAACCGTGGAAGATGCCAAGGAGTTTG
CGAAGATCATACCAAACCACAAGCTAGAGATTGTGGAAGGAGCTGATCATCGTTATACTG
ACCATCAAAGTCAGTTGGTTTCAACTGTTATGGAGTTCATAAACACAGTCATTGTCAAGA
ACAACTAGTTTTTTAATTTTTTTTTTTTTACCTTGGAGAATTGTTCATGGTACACTTTAC
ATTGTTGTTTGCAATTAAAAGGGAAACATTGATTGG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EC65TF U 1
AF RS1AA65TF U 477
AF RS1EC65JQ C 603
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BS 582 617 RS1AA65TF
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BS 709 721 RS1AA65TF
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BS 861 861 RS1EC65JQ
BS 862 881 RS1AA65TF
BS 882 1116 RS1EC65JQ

RD RS1EC65TF 581 0 0
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TTCTGTGTCTTGAAACAATGAGCACTCTTTTGAGTAACTTCCATTTTGCACCTCACGATT
CTCTAAATTACAAAATCTCCCCTTTTCCCAAAAGATTATCATCCTTCACCAACAACAACC
CTCGCCTCCCCATCAAGAACACTCGAATCTCCTGCAACAGTTTGAGAATGGATTCGTCAG
ATAATAACATTTCCGCTTGTGCACAGCAACCGAAGAAGATGGAGATTCCGAACAGCCACG
ACGAGAAGCTCGTGGGTCTCCTTCACGAAACCGGTTCGAAAGAAGTTGTGGTCTTGTGCC
ATGGATTTCGATCCAGCAAGAATCACCAAATCATGAAGAATGTGGCTGCTGCTTTGGAGA
AAGAAGGGATCAGTGCGTTCCGTTTTGATTTCTCTGGAAATGGAGAGAGTGAAGGCAGTT
TCTATTATGCTAACTATAACCATGAAGCTGATGATCTACGTTCTGTCATCCAACACTTGT
CTGACATGAACCGTGTGGTTCCTATCATTCTTGGGCACAGT

QA 1 581 1 581
DS 

RD RS1AA65TF 405 0 0
G
GTTTCTATTATGCTAACTATAACCATGAAGCTGATGATCTACGTTCTGTCATCCAACACT
TGTCTGACATGAACCGTGTGGTTCCTATCATTCTTGGGCACAGTAAAGGAGGTGATGTGG
TTCTCCTCTATGCCTCCAAGTATCATGAAATCAGTAATGTGATCAATCTCTCGGGACGCT
ATGATCTGAAGAAAGGCATAAGAGAGCGACTTGGGGATGACTTTTTGGAACGAATTAAAG
AACATGGATTCATTGATGTTAACAATGGAAAATCCAGCTACAGTGTTACGGAGGAGAGTT
TAATGGAGAGGTTAGGCACTGATATGCATGAAGCTTGCCTCAAGATTGACAAAGGTTGCA
GGGTCTTGACGGTTCATGGAACATATGACGAGGTAATAACCGTG

QA 2 405 2 405
DS 

RD RS1EC65JQ 514 0 0
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TTGAAGAAAGGCATAAGAGAGCGACTTGGGGATGACTTTTTGGAAAGAATTAAAGAACAA
GGATTCATTGATGTTAACAATGGAAAATCCAGCTACCGTGTTACGGAGGAGAGTTTAATG
GAGAGGTTAGGCACTGATATGCATGAAGCTTGCCTCAAGATTGACAAAGGTTGCAGGGTC
TTGACGGTTCATGGAACAGATGACGAGGTAATAACCGTGGAAGATGCCAAGGAGTTTGCG
AAGATCATACCAAACCACAAGCTAGAGATTGTGGAAGGAGCTGATCATCGTTATACTGAC
CATCAAAGTCAGTTGGTTTCAACTGTTATGGAGTTCATAAACACAGTCATTGTCAAGAAC
AACTAGTTTTTTAATTTTTTTTTTTTTACCTTGGAGAATTGTTCATGGTACACTTTACAT
TGTTGTTTGCAATTAAAAGGGAAACATTGATTGG

QA 1 514 1 514
DS 



AS 1 3

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TTGAGAAAATGGCATCAAAGTTGCTACAGCTGAAATCAAAAGCGTGTGAAGCATCAAAGT
TTGTGTCCAAGCACGGGACTAGTTACTACAAACAGTTACTGGAGAAGAACAAGCACTATA
TCCAGGAGCCAGCCACTGTTGAGAAATGCCAAGACTTGTCTAAGCAGCTTCTCTACACTC
GTCTTGCTAGCATTCCTGGACGTTCTGAGTCGTTCTGGAAGGAAGTAGATCACGTGAAGG
GGTTGTGGAAGAACCGGGCGGATCTGAAGGTTGAAGATGCTGGGATTGCAGCACTTTTTG
GTCTTGAATGCTTCGCTTGGTACTGTGCGGGCGAGATCGTTGGAAGAGGCTTCACTTTCA
CCGGCTACTACCCTTGAAGCAAACAAAAAGCAAACATGCCTTTTCATGGCTGTGATATTT
TAGCAAAAGTTTAAAATTTTTATATCTGTCTTTGGATAGTTAAGTACACACTTAACTAAT
CATTGTTACTCATGCCTAGCTCTTAATAATAATATCAGTCGACAACTTGTTTGCTTATTT
TT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1BV64TF U 57
AF RS1D764TF U 1
AF RS1B238TF U 194
BS 1 157 RS1D764TF
BS 158 158 RS1BV64TF
BS 159 391 RS1D764TF
BS 392 392 RS1B238TF
BS 393 436 RS1D764TF
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BS 450 581 RS1D764TF
BS 582 602 RS1B238TF

RD RS1BV64TF 288 0 0
T
TTTTTGAGAAAATGGCATCAAAGTTGCTACAGCTGAAATCAAAAGCGTGTGAAGCATCAA
AGTTTGTGTCCAAGCACGGGACTAGTTACTACAAACAGTTACTGGAGAAGAACAAGCATT
ATATCCAGGAGCCAGCCACTGTTGAGAAATGCCAAGACTTGTCTAAGCAGCTTCTCTACA
CTCGTCTTGCTAGCATTCCTGGACGTTCTGAGTCGTTCTGGAAGGAAGTAGATCACGTGA
AGGGCTTGTGGAAGAACCGGGCAGATCTGAAGGTTGAAGATGCTGGG

QA 2 288 2 288
DS 

RD RS1D764TF 581 0 0
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TTGAGAAAATGGCATCAAAGTTGCTACAGCTGAAATCAAAAGCGTGTGAAGCATCAAAGT
TTGTGTCCAAGCACGGGACTAGTTACTACAAACAGTTGCTGGAGAAGAACAAGCACTATA
TCCAGGAGCCAGCCACTGTTGAGAAATGCCAAGACTTGTCTAAGCAGCTTCTCTACACTC
GTCTTGCTAGCATTCCTGGACGTTCTGAGTCGTTCTGGAAGGAAGTAGATCACGTGAAGG
GGTTGTGGAAGAACCGGGCGGATCTGAAGGTTGAAGATGCTGGGATTGCAGCACTTTTTG
GTCTTGAATGCTTCGCTTGGTACTGTGCGGGTGAGATCGTTGGAAGAGGCTTCACTTTCA
CCGGCTACTACCCTTGGAGCAAACAAAA*GCAAACATGCCTTTTCATGGCTGTGATATTT
TAGCAAAAGTTTAAAATTTTTATATCTGTCTTTGGATAGTTAAGTACACACTTAACTAAT
CATTGTTACTCATGCCTAGCTCTTAATAATAATATCAGTCG

QA 1 581 1 581
DS 

RD RS1B238TF 409 0 0
G
ACTGTTGAGAAATGCCAAGACTTGTCTAAGCGGCTTCTCTACACTCGTCTTGCTAGCATT
CCTGGACGTTCTGAGTCGTTCTGGAAGGAAGTAGATCACGTGAAGGGGTTGTGGAAGAAC
CGGGCGGATCTGAAGGTTGAAGATGCTGGGATTGCAGCACTTTTTGGTCTTGAATGCTTC
GCTTGGTACTGTGCGGGCGAGATCGTTGGAAGAGGCTTCACTTTCACCGGCTACTACCCT
TGAAGCAAACAAAAAGCAAACATGCCTTTTCATGGCTGTGATATTTTAGCAAAAGTTTAA
AATTTTTATATCTGTCTTTGGATAGTTAAGTACACACTTAACTAATCATTGTTACTCATG
CCTAGCTCTTAATAATAATATCAGTCGACAACTTGTTTGCTTATTTTT

QA 2 409 2 409
DS 



AS 1 3

CO CL3595Contig1 672 3 3 U
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AAGTGGAGCTACCAAGATGGCGTATGAACTAACTGAGCAAAAGAAAGTTGGGTTAGGCCT
CATTGGGTTTGGTTTATCCTTTTCGTTTCTTGGTGTCATCTTGTACTTTGACAGAGGGTT
GCTCGCTCTTGGAAACTTATTTTGGTTGATAGGTGTTGGCCTTTTACTTGGTCGGCAATC
AACTTGGAGACTATTTACCAACGTCAATAACTTGAAGGGCACAGTGTGTTTCGTGCTAGG
ACTCTTTCTTATATTTGTACGGTGGCCAATAATCGGCATTATCCTTGAGATGTATGGTTG
CATCGTCCTATTCGGTGGATTTTGGTCGACGGTAAAGATGTTTCTTTCCCAGATTCCTTT
TGTTGGATGGATGATACAGTATCCTCTCATGGTTGTTGAGCAACTTGTACGAGGTTCTCG
TTGAAAAAGATCCATCTCGCTCCTCTTCATGCACCTCAAAAAAGGCCTCTCTCTAGAATT
CCAAAACAACTGCTGCTTTACTTTTTTTTTATTTTCTTTTAGAAACAGAATCTAATCCTT
TTACCTTGTTTTTTTGGACATGACAGAGTCTTTGCTCTGTTTCACATTCTAACATTCTTT
CTATATATATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A825JQ C 298
AF RS1A825TF U 1
AF RS1A754TF U 39
BS 1 232 RS1A825TF
BS 233 233 RS1A754TF
BS 234 672 RS1A825TF

RD RS1A825JQ 220 0 0
AGGATTCTTTCTTATATTTGTACGGTGGCCAATAATCGGCATTATCCTTGAGATGTATGG
TTGCATCGTCCTATTCGGTGGATTTTGGTGGACGGTAAAGATGTTTCTTTCCCAGATTCC
TTTTGTTGGATGGATGATACAGTATCCTTTCATGGTTGTTGAGCAACTTGTACGAGGTTT
TCGTTGAAAAAGATCCATCTCGTTCCTCTTCATGCACCTC

QA 1 220 1 220
DS 

RD RS1A825TF 672 0 0
GGTCAAAAGAATCGGGAGAGCCTCGCTTCTGTCTGCATTCGCCCACTCACTACGATCTCA
AAGTGGAGCTACCAAGATGGCGTATGAACTAACTGAGCAAAAGAAAGTTGGGTTAGGCCT
CATTGGGTTTGGTTTATCCTTTTCGTTTCTTGGTGTCATCTTGTACTTTGACAGAGGGTT
GCTCGCTCTTGGAAACTTATTTTGGTTGATAGGTGTTGGCCTTTTACTTGGTTGGCAATC
AACTTGGAGACTATTTACCAACGTCAATAACTTGAAGGGCACAGTGTGTTTCGTGCTAGG
ACTCTTTCTTATATTTGTACGGTGGCCAATAATCGGCATTATCCTTGAGATGTATGGTTG
CATCGTCCTATTCGGTGGATTTTGGTCGACGGTAAAGATGTTTCTTTCCCAGATTCCTTT
TGTTGGATGGATGATACAGTATCCTCTCATGGTTGTTGAGCAACTTGTACGAGGTTCTCG
TTGAAAAAGATCCATCTCGCTCCTCTTCATGCACCTCAAAAAAGGCCTCTCTCTAGAATT
CCAAAACAACTGCTGCTTTACTTTTTTTTTATTTTCTTTTAGAAACAGAATCTAATCCTT
TTACCTTGTTTTTTTGGACATGACAGAGTCTTTGCTCTGTTTCACATTCTAACATTCTTT
CTATATATATCC

QA 1 672 1 672
DS 

RD RS1A754TF 634 0 0
GG
GCCCACTCACTACGATCTCAAAGTGGAGCTACCAAGATGGCGTATGAACTAACTGAGCAA
AAGAAAGTTGGGTTAGGCCTCATTGGGTTTGGTTTATCCTTTTCGTTTCTTGGTGTCATC
TTGTACTTTGACAGAGGGTTGCTCGCTCTTGGAAACTTATTTTGGTTGATAGGTGTTGGC
CTTTTACTTGGTCGGCAATCAACTTGGAGACTATTTACCAACGTCAATAACTTGAAGGGC
ACAGTGTGTTTCGTGCTAGGACTCTTTCTTATATTTGTACGGTGGCCAATAATCGGCATT
ATCCTTGAGATGTATGGTTGCATCGTCCTATTCGGTGGATTTTGGTCGACGGTAAAGATG
TTTCTTTCCCAGATTCCTTTTGTTGGATGGATGATACAGTATCCTCTCATGGTTGTTGAG
CAACTTGTACGAGGTTCTCGTTGAAAAAGATCCATCTCGCTCCTCTTCATGCACCTCAAA
AAAGGCCTCTCTCTAGAATTCCAAAACAACTGCTGCTTTACTTTTTTTT*ATTTTCTTTT
AGAAACAGAATCTAATCCTTTTACCTTGTTTTTTTGGACATGACAGAGTCTTTGCTCTGT
TTCACATTCTAACATTCTTTCTATATATATCC

QA 3 634 3 634
DS 



AS 1 3

CO CL3596Contig1 842 3 3 U
CTTTGTTCCAATCATCAACATCACATTTTGTTAGTAATCATCATTACACCTAACATTTTG
AGACCACTCTTTCTCTCTTCTGTTATGTTTGATAATCAGTTTTCAATGAAAATAGTGTAG
CATAGTACATATTCTTGATTCATATCTGGTTCCCAAGATCAAGAGTATGTATTGCCATTT
TGAACGGACAAGGCTTAATAAACTGCGAACATC*TATTCTTCGGCCAAACTCCGATCAGT
TTATCGCCTGTACCGATGTCGTTTAAAGTTGAAGTACAGGTGCAAAATCCCACGCTCAAA
TGTGCACTTAAAACCTTTCTTGTGAGAATACTCCCATTCTTTGTTCACAATCCGGAACGC
AATGTCTTCATAAGGCGGACCAGCATGAAACCGGATCATACAAGTTTCGGAGCTAGTCCC
ATCTTTTTCTATAGTGTACGTGGGAGCCTTGATCTTATCTACTAAATCTGGATAGAAGAT
GTTAAACTTGTACCCTTGAACGGTTTTTGGAGGCGGGTTATCGTGATCATAGTGCGTTTG
GTTATACTTATTCCACTCGTAACCTGTGTGAACTCGGTTGAAGTACTTCGGTTTTCTTGG
CCGGTACTTGTCATGCCACCAGTATACCTCGGAGTCAAGGTTCACTTCAGCACTAGTGCC
AAATACAGCATCACCTTCATCCATTGGTCCCATTGCTTTCATTGCTTTAAACTCCAAGTT
ATCTTCCACAGGTGCTGGTTTTGAGACCATAGCTTCTTCGATCCGTTTCTTTTGTTTCTC
CAACACAATCATTCGTTTCAGTTCCAGTAGCTTCTTGTCTTCCTCAGGATCGATTGCTTC
TC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1B988JQ U 1
AF RS1EB96JQ U 8
AF RS1B988TF C 105
BS 1 723 RS1B988JQ
BS 724 751 RS1EB96JQ
BS 752 842 RS1B988TF

RD RS1B988JQ 723 0 0
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CATAGTACATATTCTTGATTCATATCTGGTTCCCAAGATCAAGAGTATGTATTGCCATTT
TGAACGGACAAGGCTTAATAAACTGCGAACATC*TATTCTTCGGCCAAACTCCGATCAGT
TTATCGCCTGTACCGATGTCGTTTAAAGTTGAAGTACAGGTGCAAAATCCCACGCTCAAA
TGTGCACTTAAAACCTTTCTTGTGAGAATACTCCCATTCTTTGTTCACAATCCGGAACGC
AATGTCTTCATAAGGCGGACCAGCATGAAACCGGATCATACAAGTTTCGGAGCTAGTCCC
ATCTTTTTCTATAGTGTACGTGGGAGCCTTGATCTTATCTACTAAATCTGGATAGAAGAT
GTTAAACTTGTACCCTTGAACGGTTTTTGGAGGCGGGTTATCGTGATCATAGTGCGTTTG
GTTATACTTATTCCACTCGTAACCTGTGTGAACTCGGTTGAAGTACTTCGGTTTTCTTGG
CCGGTACTTGTCATGCCACCAGTATACCTCGGAGTCAAGGTTCACTTCAGCACTAGTGCC
AAATACAGCATCACCTTCATCCATTGGTCCCATTGCTTTCATTGCTTTAAACTCCAAGTT
ATC

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1EB96JQ 744 0 0
CCAATCATCAACATCACATTTTGTTAGTAATCATCATTACACCTAACATTTTGAGACCAC
TCTTTCTCTCTTCTGTTATGTTTGATAATCAGTTTTCAATGAAAATAGTGTAGCATAGTA
CATATTCTTGATTCATATCTGGTTCCCAAGATCAAGAGTATGTATTGCCATTTTGAACGG
ACAAGGCTTAATAAACTGCGAACATCGTATTCTTCGGCCAAACTCCGATCAGTTTATCGC
CTGTACCGATGTCGTTTAAAGTTGAAGTACAGGTGCAAAATCCCACGCTCAAATGTGCAC
TTAAAACCTTTCTTGTGAGAATACTCCCATTCTTTGTTCACAATCCGGAACGCAATGTCT
TCATAAGGCGGACCAGCATGAAACCGGATCATACAAGTTTCGGAGCTAGTCCCATCTTTT
TCTATAGTGTACGTGGGAGCCTTGATCTTATCTACTAAATCTGGATAGAAGATGTTAAAC
TTGTACCCTTGAACGGTTTTTGGAGGCGGGTTATCGTGATCATAGTGCGTTTGGTTATAC
TTATTCCACTCGTAACCTGTGTGAACTCGGTTGAAGTACTTCGGTTTTCTTGGCCGGTAC
TTGTCATGCCACCAGTATACCTCGGAGTCAAGGTTCACTTCAGCACTAGTGCCAAATACA
GCATCACCTTCATCCATTGGTCCCATTGCTTTCATTGCTTTAAACTCCAAGTTATCTTCC
ACAGGTGCTGGTTTTGAGACCATA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1B988TF 738 0 0
CAATG
AAATAGTGTAGCATAGTACATATC**TGATTCATATCTGGTTCCCAAGATCAAGAGTATG
TATTGCCATTTTGAACGGACAAGGCTTAATAAACTGGGAACATC*TATTCTTCGGCCAAA
CTCCGATCAGTTTATCGCCTGTACCGATGTCGTTTAAAGTTGAAGTACAGGTGCAAAATC
CCACGCTCAAATGTGCACTTAAAACCTTTCTTGTGAGAATACTCCCATTCTTTGTTCACA
ATCCGGAACGCAATGTCTTCATAAGGCGGACCAGCATGAAACCGGATCATACAAGTTTCG
GAGCTAGTCCCATCTTTTTCTATAGTGTACGTGGGAGCCTTGATCTTATCTACTAAATCT
GGATAGAAGATGTTAAACTTGTACCCTTGAACGGTTTTTGGAGGCGGGTTATCGTGATCA
TAGTGCGTTTGGTTATACTTATTCCACTCGTAACCTGTGTGAACTCGGTTGAAGTACTTC
GGTTTTCTTGGCCGGTACTTGTCATGCCACCAGTATACCTCGGAGTCAAGGTTCACTTCA
GCACTAGTGCCAAATACAGCATCACCTTCATCCATTGGTCCCATTGCTTTCATTGCTTTA
AACTCCAAGTTATCTTCCACAGGTGCTGGTTTTGAGACCATAGCTTCTTCGATCCGTTTC
TTTTGTTTCTCCAACACAATCATTCGTTTCAGTTCCAGTAGCTTCTTGTCTTCCTCAGGA
TCGATTGCTTCTC

QA 6 738 6 738
DS 



AS 1 3

CO CL3597Contig1 1215 3 5 U
TTTTTTTTCTTCTCCTTCCTTACTCTCTCGATCAATGGCTTCTCTTTTTTCTTTTTCTTC
TCTCCTTCAACCAAAAGTCTCTGTTTCTTCTCCCCTTAGACCAAAAGCTGTAAAGACTTC
GATTTCAGCTCCTCAGACACAGACAATAACGGAAGGACTTGAAGAAAAATTCGGACGAAA
AGGCATAAAATTCTCGGAACCAAACATGGTCGAGCTCAAGGTCAGAAACGGAAGCTCTTT
AAAGCTGAGTCTATCGGACGCTCATGTTGTTTCATATCAACCAAAAGTGTACTGGAAAGA
CGATGGGTTCGAGGAAGTCCTTTACACAGTATAGGACGGTAATAAAACCAGAGGCGAGGT
TGGTCTTGTCATCATAAACGAAGAAGAAAAAGCTTCTTCAGTACTATCAGGTTGTAATTG
GACTGTTAAAGACACTGATTCAGACGCCATTGACGCTATTCAGATTGAATTGAGCTGCAC
GGCCGGATTTCTTGACATAACGTACATCGTCTCTCTCTATCCAGTAAGCATAGCAACAGC
AGTGGTGGTGAAGAACAACGGTCGCAAACCGGTTTCCCTTAAACCGGGGATTATAAGTTC
CTTGAGATTCAAGAAACGGAGTGGTGCTGGAATTCAAGGGCTTAAGGGCTGCTCCTATTG
CCCCAGTCCTCCACTATCTTCGCCTTTCGAGCTACTGTCTCCTTCTGAGGCAATGAAGGC
GGACTCTTCCGGGTGGTTCGGGTCAGAAGATGGGGAAAAACCAGGGATTTGGGCAGTTGA
AGACTCTGTTATTACACTTCTTGAGAAGAAGATGAGTAGAGTCTATGGCGCCCATCCGGC
TGAGAGACTTAAGGCCGTCTACAACACTCCACCTTCTAAATATGAAACCATTGATCAGGG
ACGAGGATTGTTCTTCAGGATGATAAGGATGGGGTTCGAGGACATGTACGTGGGATCCCC
AGGATCAATGTGGGACAAGTTTGGGAAGCAACAATATTTTGTGTGCACGGGTCCTGCATC
TATGCTCGTTCCCATTGATGTTGGTGCCGGTGAAACCTGGAGAGGAGCAATGGTAATTGA
ACATGATAATTTGTAAACTTCTTTTACTATATATCTATCATCTTTATTTTCTTACTTATT
TTTGTCATTCTGCAACAAATATGATGTTGTTTCATACTGTATATATGAAAAGTCACAACT
ACAAGTGCATTCCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BT81TF U 1
AF RS1BT81JQ C 487
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GACTGTTAAAGACACTGATTCAGACGCCATTGACGCTATTCAGATTGAATTGAGCTGCAC
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CTTGAGATTCAAGAAACGGAGTGGTGCTGGAATT

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CGTTCCCATTGATGTTGGTGCCGGTGAAACCTGGAGAGGAGCAATGGTAATTGAACATGA
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GCATTCCAC

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TTGGGCAGTTGAAGACTCTGTTATTACACTTCTTGAGAAGAAGATGAGTAGAGTCTATGG
CGCCCATCCGGCTGAGAGACTTAAGGCCGTCTACAACACTCCACCTTTTAAATATGAAAC
CATTGATCAGGGACGAGGATTGTTCTTCAGGATGATAAGGATGGGGTTCGAGGACATGTA
CGTGGGATCCCCAGGATCAATGTGGGACAAGTTTGGGAAGCAACAATATTTTGTGTGCAC
GGGTCCTGCATCTATGCTCGTTCCCATTGATGTTGGTGCCGGTGAAACCTGGAGAGGAGC
AATGGTAATTGAACATGATAATTTGTAAACTTCTTTTACTATATATCTATCATCTTTATT
TTCTTACTTATTTTTGTCATTCTGCAACAAATATGATGTTGTTTCATACTGTATATATGA
AAAGTCACAACTACAAGT

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DS 



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TTCACCAATGTGTCATCCATGGTGAAATCCGAGCTCCAGGGAACGAACAATCAGATGGAT
CTGTTGGAGAAGATGAACGCGAGAGTTGCGGCGGAGTACGATGATTTGGGTGACGTGGCG
GCTGGGCTCAGAGTTTTCGCGGAGCAGATGATGTTGAAAAGCGGGGGCTTTGACGAGTTC
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CTCGATCGCTATGTCTCTGTCCTCGAATCCAAAATTCGAGCATCGCCGCTCAAATGATTC
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TTAATTACCGAATTATTTATTTTATTAGTTAGAAAAAAGGTCTGATGGGCTTAAGAAATC
AACCTCGGAAGATAGTAGTTACGACTACAAGTAGCTTTAGCTCTTGTCTCATTGTTATTC
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ACTATTGCTTGGTAGCTAAGCTTAAAATGGGTTCATCTGAGAAGAGGAGTTCAAAGGATG
TCGTCATGAGTGACATACCAACCTTGAGTGCTGAGAATCTCCAGAAAAATCTGAAAATCA
TTCAAAACAGCCGGACCTTTCTGTCTATTATCGCTGGAGTCCTTGCAGGAATAATCGGAT
TCACGAGCTTAACCGGTTTTGTGTTTTACTTTGTGGTGATGCTGATCACATCAGTTGGGC
TCATTGCCAAGGCAGGCTTCTTCTCAGCAGACTTGTTGTACTTTGATTCATCGAATCGGC
TCCTTTTTGATGGCTTCCTTGGTGGCCTTATGTCCTTTGTGCTCTTCTGGACATTTGCTT
ACGACTTGGTGCACATATTCTGAGGGGATCTTCAGCTGCAAACGATGATGGTGGAAACAA
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GAGAATGTTTTATCTGTCTCTCTTTTGTTAACAACAGATTATGAATCTGTCTTTGCTTTT
ATCGTTTCAAATATACTTTGAGATCA


BQ
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EH66TF U 1
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RD RS1EH66TF 588 0 0
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TGTCTATTGTCTATTGTCTCTGTTTCAATCTCTATACTAAATTCTGTT

QA 1 588 1 588
DS 

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GG
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ATTAGTTGTGTTTCTCTGTTGTCTATTGTCTATTGTCTCTGTTTCAATCTCTATACTAAA
TTCTGTTACAAAAGTATATTTAATTACCGAATTATTTATTTTATTAGTTAGAAAAAAGGT
CTGATGGGCTTAAGAAATCAACCTCGGAAGATAGTAGTTACGACTACAAGTAGCTTTAGC
TCTTGTCTCATTGTTATTCCTCAAATTCCCTCAAGAAAGCAAAGCCCTGCGTTGATCGAT
CTTCCTGGTCTCGTTTCTAACTATTGCTTGGTAGCTAAGCTTAAAATGGGTTCATCTGAG
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CTTGCAGGAATAATCGGATTCACGAGCTTAACCGGTTTTGTGTTTTACTTTGTGGTGATG
CTGATCACATCAGTTGGGCTCATTGCCAAGGCAGGCTTCTTCTCAGCAGACTTGTTGTAC
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CTCTTCTGGACATTTGCTTACGACTTGGTGCACATATTCTGAGGGGATCTTCAGCTGCAA
ACGATGATGGTGGAAACAA*GAGAGAAA*GTAGTAGTT
GTGAGTTTGTT

QA 3 820 3 820
DS 

RD RS1BN78JQ 755 0 0
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TAAGAAATCAACCTCGGAAGATAGTAGTTACGACTACAAGTAGCTTTAGCTCTTGTCTCA
TTGTTATTCCTCAAATTCCCTCAAGAAAGCAAAGCCCTGCGTTGATCGATCTTCCTGGTC
TCGTTTCTAACTATTGCTTGGTAGCTAAGCTTAAAATGGGTTCATCTGAGAAGAGGAGTT
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TGAAAATCATTCAAAACAGCCGGACCTTTCTGTCTATTATCGCTGGAGTCCTTGCAGGAA
TAATCGGATTCACGAGCTTAACCGGTTTTGTGTTTTACTTTGTGGTGATGCTGATCACAT
CAGTTGGGCTCATTGCCAAGGCAGGCTTCTTCTCAGCAGACTTGTTGTACTTTGATTCAT
CGAATCGGCTCCTTTTTGATGGCTTCCTTGGTGGCCTTATGTCCTTTGTGCTCTTCTGGA
CATTTGCTTACGACTTGGTGCACATATTCTGAGGGGATCTTCAGCTGCAAACGATGATGG
TGGAAACAAAGAGAGAAAAGTAGTAGTTTGTGAGTTTTGTTTTTGCAGCCTTCAAAGTAT
AAAAGATTGGAGAATGTTTTATCTGTCTCTCTTTTGTTAACAACAGATTATGAATCTGTC
TTTGCTTTTATCGTTTCAAATATACTTTGAGATCA

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 3

CO CL3599Contig1 800 3 5 U
GAGAAAGCTGTCCGCAAAGTGTATGGTTGTTGCTACAACTAAATTTAGTCGTTTTTCACA
TCGGGGATAAATCTGTTGCGTAGTAAGCCCTATAGGTTGCATTATTTACAATACAACAAG
AACATGTGAAAAACAAATTAAGTTTTGGAAACAATGTTTGCATGATAAACTGCAAAATGA
ATCTATGACATCATTCCCCGGCAAGCATACTCGAACAAAGTCTGAACTGTGCCTTTCGCT
GATGCTTCATTTGGTAGGCTAAGAAGCCTAGAAACCCTGGAGAAACCGATATCATGTTTC
ATCAGGTAACTAGGCTCAGGTTCTGCTTCAGGTTCCAGACCAAATTGTTTCTGTTTGTTA
CTGGTTCTAGTCAGCGCCCATTGCATAGCCCATATGGCAAGGGGACGCATGTAAGTCAGT
GATCTATACTGATCATTCGTGTTCCAAGCTTCAGGAGTCTGAAACGAGTAACCTAGTCCG
GTTTCTGACCAGGCGGCTTCATATACCCCACTCGCAGTCTGAAACGCCTTGTCAACTAAA
CCTTCTTGGATCATTGTTGCAGACAGAGCGTAAGTCACACCAGACCATATCTCTCGTGAT
TGCATCGACGCTGTATCAACTTTCCCATCAGGGTGCATCCCGTTTACCGCCCCTCGTTTT
CCATCTTTAATCTTCATCACATTGAAGTTGAAAACTTTCTCCAAAGCCTTTCTAGCCTTG
TCTTCATCTACAATAGGCATAAGACCGGAGGCTCTCGCGTACCATTGTCCAGCTAGTTGA
TCGGCTTGTATAGATGAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G339TF C 6
AF RS1G339JQ U 10
AF RS1C520JQ U 1
BS 1 196 RS1C520JQ
BS 197 197 RS1G339JQ
BS 198 574 RS1C520JQ
BS 575 575 RS1G339JQ
BS 576 800 RS1C520JQ

RD RS1G339TF 627 0 0
TTTT
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AATCTGTTGCGTAGTAAGCCCTATAGGTTGCATTATTTACAATACAACAAGAACATGTGA
AAAACAAATTAAGTTTTGGAAACAATGTTTGCATGATAAACTGCAAAATGAATCTATGAC
ATCATTCCCCGGCAAGCATACTCGAACAAAGTCTGAACTGTGCCTTTCGCTGATGCTTCA
TTTGGTAGGCTAAGAAGCCTAGAAACCCTGGAGAAACCGATATCATGTTTCATCAGGTAA
CTAGGCTCAGGTTCTGCTTCAGGTTCCAGACCAAATTGTTTCTGTTTGTTACTGGTTCTA
GTCAGCGCCCATTGCATAGCCCATATGGCAAGGGGACGCATGTAAGTCAGTGATCTATAC
TGATCATTCGTGTTCCAAGCTTCAGGAGTCTGAAACGAGTAACCTAGTCCGGTTTCTGAC
CAGGCGGCTTCATATACCCCACTCGCAGTCTGAAACGCCTTGTCAACTAAACCTTCTTGG
ATCATTGTTGCAGACAGAGCGTAAGTCACACCAGACCATATCTCTCGTGATTGCATCGAC
GCTGTATCAACTTTCCCATCAG
C

QA 5 626 5 626
DS 

RD RS1G339JQ 623 0 0
GTCCGCAAAGTGTATGGTTGTTGCTACAACTAAATTTAGTCGTTTTTCACATCGGGGATA
AATCTGTTGCGTAGTAAGCCCTATAGGTTGCATTATTTACAATACAACAAGAACATGTGA
AAAACAAATTAAGTTTTGGAAACAATGTTTGCATGATAAACTGCAAAATGAATCTATGAC
ATCATTCCCCGGCAAGCATACTCGAACAAAGTCTGAACTGTGCCTTTCGCTGATGCTTCA
TTTGGTAGGCTAAGAAGCCTAGAAACCCTGGAGAAACCGATATCATGTTTCATCAGGTAA
CTAGGCTCAGGTTCTGCTTCAGGTTCCAGACCAAATTGTTTCTGTTTGTTACTGGTTCTA
GTCAGCGCCCATTGCATAGCCCATATGGCAAGGGGACGCATGTAAGTCAGTGATCTATAC
TGATCATTCGTGTTCCAAGCTTCAGGAGTCTGAAACGAGTAACCTAGTCCGGTTTCTGAC
CAGGCGGCTTCATATACCCCACTCGCAGTCTGAAACGCCTTGTCAACTAAACCTTCTTGG
ATCATTGTTGCAGACAGAGCGTAAGTCACACCAGACCATATCTCTCGTGATTGCATCGAC
GCTGTATCAACTTTCCCATCAG
C

QA 1 622 1 622
DS 

RD RS1C520JQ 800 0 0
GAGAAAGCTGTCCGCAAAGTGTATGGTTGTTGCTACAACTAAATTTAGTCGTTTTTCACA
TCGGGGATAAATCTGTTGCGTAGTAAGCCCTATAGGTTGCATTATTTACAATACAACAAG
AACATGTGAAAAACAAATTAAGTTTTGGAAACAATGTTTGCATGATAAACTGCAAAATGA
ATCTATGACATCATTCTCCGGCAAGCATACTCGAACAAAGTCTGAACTGTGCCTTTCGCT
GATGCTTCATTTGGTAGGCTAAGAAGCCTAGAAACCCTGGAGAAACCGATATCATGTTTC
ATCAGGTAACTAGGCTCAGGTTCTGCTTCAGGTTCCAGACCAAATTGTTTCTGTTTGTTA
CTGGTTCTAGTCAGCGCCCATTGCATAGCCCATATGGCAAGGGGACGCATGTAAGTCAGT
GATCTATACTGATCATTCGTGTTCCAAGCTTCAGGAGTCTGAAACGAGTAACCTAGTCCG
GTTTCTGACCAGGCGGCTTCATATACCCCACTCGCAGTCTGAAACGCCTTGTCAACTAAA
CCTTCTTGGATCATTGTTGCAGACAGAGCGTAAGCCACACCAGACCATATCTCTCGTGAT
TGCATCGACGCTGTATCAACTTTCCCATCAGGGTGCATCCCGTTTACCGCCCCTCGTTTT
CCATCTTTAATCTTCATCACATTGAAGTTGAAAACTTTCTCCAAAGCCTTTCTAGCCTTG
TCTTCATCTACAATAGGCATAAGACCGGAGGCTCTCGCGTACCATTGTCCAGCTAGTTGA
TCGGCTTGTATAGATGAGCT

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 2

CO CL3600Contig1 1088 2 8 U
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ATCAGCTTTATGTGATTCGCATTCCAAATTGTTTGAGGAACCAGATGCAGCTGGTTCTAA
ATCTTTCTTCACTGAGATTATTGCTTCAGTGTCAGACATCAAATTTGCTAAAGAAGGAAG
ATACTTACTTAGCCGTGACTACATGACACTTAAGTTATGGGACATCAACATGGATTCAGG
TCCGGTATCAACTTTCCAGGTTCATGAATATCTGAAACCGAAGCTCTGTGATTTATATGA
AAATGATTCCATCCTTGACAATTTCGAGTGTTGCATAAGTGGCAATGGATTGCGAGCAGC
TACAGGTTCTTACAGCAATCTGTTCCGTGTGTTTGGTGTTTCTCCGGGAAGTACTGAGAC
TGCAACGTTGGAAGCAAGCAGAAACCCGATGAGGAGACATGTCCCAGTTCCCTCAAGGCC
ATCCAAACTAGGCAGTATACTAGGTAGAGGAGGATCAGAGAGTACTGCTGGAGTCGATGG
GAATAGCAGCAATGCTCTTGATTACACAACGAAGTTGCTGCATCTTGCTTGGCATCCAAA
TGAGAACTTAATTGCTTGCGCTGCTGGAAATAGCTTGTACATGTACTGTGCTTAACCACC
CCCCATACTCAGCAAAAAAACAAAAGAAGAAGCTAAAAAGGGGCATTTTTTCTGCTTCTG
GACTCTGTTTTCATGGTTCCTTGTGGGGATTGCTATCATCATCATCATCATCATCATCAT
TAAGCTCTGTAATCATCATGTTGGGAGTTCTGGAAAGGCAAGCAGTGAAAACTCAATTAT
TTTTATCTATTTTGAAAGTGTAGAATTCACCTGGAAACAACTTTTTACAGGCCAAGAAAA
AGATAATCCGATTGGGAAAAATCGTGATTTTAGTAAAATGCTAATCTCATATGACTTTTG
GATTGGATATAGATTTATATTCTTTTACAATCTTTTCTTGGTCTTGTGTAATCATTTGTT
TTATTGATTCTTTTGATGAACTTGTTTTAGTTTGTTGACTTGCTTAAAATAATACCATTT
TATTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DH54TF U 1
AF RS1AF12JQ C 357
BS 1 426 RS1DH54TF
BS 427 427 RS1AF12JQ
BS 428 444 RS1DH54TF
BS 445 445 RS1AF12JQ
BS 446 583 RS1DH54TF
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BS 585 616 RS1DH54TF
BS 617 1088 RS1AF12JQ

RD RS1DH54TF 616 0 0
GTGCAACGTGCTAGCTTACAGCAGTACCAAAGGCTCGATTCGCCTGATTGATCTGCGCCA
ATCAGCTTTATGTGATTCGCATTCCAAATTGTTTGAGGAACCAGATGCAGCTGGTTCTAA
ATCTTTCTTCACTGAGATTATTGCTTCAGTGTCAGACATCAAATTTGCTAAAGAAGGAAG
ATACTTACTTAGCCGTGACTACATGACACTTAAGTTATGGGACATCAACATGGATTCAGG
TCCGGTATCAACTTTCCAGGTTCATGAATATCTGAAACCGAAGCTCTGTGATTTATATGA
AAATGATTCCATCCTTGACAATTTCGAGTGTTGCATAAGTGGCAATGGATTGCGAGCAGC
TACAGGTTCTTACAGCAATCTGTTCCGTGTGTTTGGTGTTTCTCCGGGAAGTACTGAGAC
TGCAACTTTGGAAGCAAGCAGAAATCCGATGAGGAGACATGTCCCAGTTCCCTCAAGGCC
ATCCAAACTAGGCAGTATACTAGGTAGAGGAGGATCAGAGAGTACTGCTGGAGTCGATGG
GAATAGCAGCAATGCTCTTGATTACACAACGAAGTTGCTGCAT*TTGCTTGGCATCCAAA
TGAGAACTTAATTGCT

QA 1 616 1 616
DS 

RD RS1AF12JQ 732 0 0
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AGACTGCAACGTTGGAAGCAAGCAGAAACCCGATGAGGAGACATGTCCCAGTTCCCTCAA
GGCCATCCAAACTAGGCAGTATACTAGGTAGAGGAGGATCAGAGAGTACTGCTGGAGTCG
ATGGGAATAGCAGCAATGCTCTTGATTACACAACGAAGTTGCTGCATCTTGCTTGGCATC
CAAATGAGAACTTAATTGCTTGCGCTGCTGGAAATAGCTTGTACATGTACTGTGCTTAAC
CACCCCCCATACTCAGCAAAAAAACAAAAGAAGAAGCTAAAAAGGGGCATTTTTTCTGCT
TCTGGACTCTGTTTTCATGGTTCCTTGTGGGGATTGCTATCATCATCATCATCATCATCA
TCATTAAGCTCTGTAATCATCATGTTGGGAGTTCTGGAAAGGCAAGCAGTGAAAACTCAA
TTATTTTTATCTATTTTGAAAGTGTAGAATTCACCTGGAAACAACTTTTTACAGGCCAAG
AAAAAGATAATCCGATTGGGAAAAATCGTGATTTTAGTAAAATGCTAATCTCATATGACT
TTTGGATTGGATATAGATTTATATTCTTTTACAATCTTTTCTTGGTCTTGTGTAATCATT
TGTTTTATTGATTCTTTTGATGAACTTGTTTTAGTTTGTTGACTTGCTTAAAATAATACC
ATTTTATTTACC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 3

CO CL3601Contig1 741 3 22 U
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TTATAGGGCACAATATTAGTGCTACAGACAAACAACAAGTAACATATTACAACAAACCAA
ACAAGAAAAGAAAGGCTTCTGGGGAAATTTAATTCTTAAGCTTTATAATTAAGGAGTAGG
CTTCAACGTGTTGGCAACATCAATCACAAAACGGTATCTAACGTCAGCCTTCTCGAGCCG
TTCCATGGCAGTGTTGACATAATCTGCAGAGATAAGCTCAATGTCTGCCGTGATGTTGTG
TTTTCCGGCCAGATCCATCATCTCTTGAGTCTCTTTTATCCCTCCTACCATACTTCCAAC
CACCATCTTCTTCCCCACGATGAGAGGCATAACCGGAAGCTCAAGTGGTTTATCAGGTGC
ACCAAGCATAATTAGTTTACCGTTATATTTAAGCAAATCAAAAAGCGGGAGAAGTGAATG
AGTCGCAGATACGGTATCAACAATACCATCCATAGTCCCCATTACATCCTTCATCTGCTC
CGGGTCACGGCTCACCAAGAACAGATCCGCACCAAGCCGATTAATGGCCTCGTCTCTCTT
CCTATCCGAAGTACTAATAACCGTAACCTTAGTACCCATAGCCTTAGCAAATTTCACAGC
TACATGACCTAAGCCACCTAGGCCCACCACACCGATGTGTATACCCGGCTTGAGGAGCCC
GTGATACTTCATCGGGGAATA


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DV36JQ U 1
AF RS1EQ04JQ U 1
AF RS1EQ04TF C 1
BS 1 13 RS1DV36JQ
BS 14 14 RS1EQ04JQ
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BS 98 98 RS1EQ04JQ
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BS 359 389 RS1DV36JQ
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BS 427 500 RS1DV36JQ
BS 501 501 RS1EQ04JQ
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BS 603 610 RS1DV36JQ
BS 611 741 RS1EQ04JQ

RD RS1DV36JQ 610 0 0
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CTTATCCGAA

QA 1 610 1 610
DS 

RD RS1EQ04JQ 741 0 0
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TTATAGGGCACAATATTAGTGCTACAGACAAACAACAAGTAACATATTACAACAAACCAA
ACAAGAAAAGAAAGGCTTCTGGGGAAATTTAATTCTTAAGCTTTATAATTAAGGAGTAGG
CTTCAACGTGTTGGCAACATCAATCACAAAACGGTATCTAACGTCAGCCTTCTCGAGCCG
TTCCATGGCAGTGTTGACATAATCTGCAGAGATAAGCTCAATGTCTGCCGTGATGTTGTG
TTTTCCGGCCAGATCCATCATCTCTTGAGTCTCTTTTATCCCTCCTACCATACTTCCAAC
CACCATCTTCTTCCCCACGATGAGAGGCATAACCGGAAGCTCAAGTGGTTTATCAGGTGC
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AGTCGCAAATACGGTATCAACAATACCATCCATAGTCCCCATTACATCCTTCATCTGCTC
CGGGTCACGGCTCACCAAGAACAGATCCGCACCAAGCCGATTAATGGCCTCGTCTCTCTT
CCTATCCGAAGTACTAATAACCGTAACCTTAGTACCCATAGCCTTAGCAAATTTCACAGC
TACATGACCTAAGCCACCTAGGCCCACCACACCGATGTGTATACCCGGCTTGAGGAGCCC
GTGATACTTCATCGGGGAATA

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1EQ04TF 741 0 0
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ACAAGAAAAGAAAGGCTTCTGGGGAAATTTAATTCTTAAGCTTTATAATTAAGGAGTAGG
CTTCAACGTGTTGGCAACATCAATCACAAAACGGTATCTAACGTCAGCCTTCTCGAGCCG
TTCCATGGCAGTGTTGACATAATCTGCAGAGATAAGCTCAATGTCTGCCGTGATGTTGTG
TTTTCCGGCCAGATCCATCATCTCTTGAGTCTCTTTTATCCCTCCTACCATACTTCCAAC
CACCATCTTCTTCCCCACGATGAGAGGCATAACCGGAAGCTCAAGTGGTTTATCAGGTGC
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AGTCGCAGATACGGTATCAACAATACCATCCATAGTCCCCATTACATCCTTCATCTGCTC
CGGGTCACGGCTCACCAAGAACAGATCCGCACCAAGCCGATTAATGGCCTCGTCTCTCTT
CCTATCCGAAGTACTAATAACCGTAACCTTAGTACCCATAGCCTTAGCAAATTTCACAGC
TACATGACCTAAGCCACCTAGGCCCACCACACCGATGTGTATACCCGGCTTGAGGAGCCC
GTGATACTTCATCGGGGAATA

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 3

CO CL3602Contig1 493 3 2 U
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TCTCTGGATGATCAAAATAAATGAACTGGAAAGACATTCTTTTGGATTGATAAATGATTT
AACCGGGGCTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F075TF U 1
AF RS1F075JQ C 44
AF RS1BJ75TF U 27
BS 1 468 RS1F075TF
BS 469 493 RS1BJ75TF

RD RS1F075TF 470 0 0
TCCTCTTTTCTCCTACACAAACACAATCTTCTCACCGTTCGTCTTCTGATCAGATCAGAT
CATATCAGATCAGCCATGGAGGATGAGATTGAGTTGAAAACTGCCCCTGCTGATTTCCGG
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ACAACTGCAAAGGGAGAGGACTCCAATGAATGCGAGAGGTTCGCCAAGTACTACCGCGCT
CTCTGCCCTGGAGAACGGGTTGACAAGTGGAATGAGCAGAGGGAGACCGGAACTTTCCCT
GGTCCTCTCTGATTTGAGCAAGATCAGGCTCTCTTTTATCATTTTATGCTTTAAGGCCAG
AAGAAGGTCGTGTGGATGGATTGATTGTTGAAACCCCAACTCTTTCGTTTTTAAACGTTT
TCTCTGGATGATCAAAATAAATGAACTGGAAAGACATTCTTTTGGATT
AT

QA 1 468 1 468
DS 

RD RS1F075JQ 427 0 0
TTT
TGATCAGATCAGATCATATCAGATCAGCCATGGAGGATGAGATTGAGTTGAAAACTGCCC
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AGTTCCACAGGTGTACAACTGCAAAGGGAGAGGACTCCAATGAATGCGAGAGGTTCGCCA
AGTACTACCGCGCTCTCTGCCCTGGAGAACGGGTTGACAAGTGGAATGAGCAGAGGGAGA
CCGGAACTTTCCCTGGTCCTCTTTGATTTGAGCAAGATCAGGCTCTCTTTTATCATTTTA
TGCTTTAAGGCCAGAAGAAGGTCGTGTGGATGGATTGATTGTTGAAACCCCAACTCTTTC
GTTTTTAAACGTTTTCTCTGGATGATCAAAATAAATGAACTGGAAAGACATTCTTTTGGA
TT
AT

QA 4 425 4 425
DS 

RD RS1BJ75TF 467 0 0
TCTTCTCACCGTTCGTCTTCTGATCAGATCAGATCATATCAGATCAGCCATGGAGGATGA
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CTGTTTCACCCGCTACATTGAGTTCCACAGGTGTGCAACTGCAAAGGGAGAGGACTCCAA
TGAATGCGAGAGGTTCGCCAAGTACTACCGCGCTCTCTGCCCTGGAGAATGGGTTGACAA
GTGGAATGAGCAGAGGGAGACCGGAACTTTCCCTGGTCCTCTCTGATTTGAGCAATATCA
GGCTCTCTTTTATCATTTTATGCTTTAAGGCCAGAAGAAGGTCGTGTGGATGGATTGATT
GTTGAAACCCCAACTCTTTCGTTTTTAAACGTTTTCTCTGGATGATCAAAATAAATAAAC
TGGAAAGACATTCTTTTGGATTGATAAATGATTTAACCGGGGCTGAC

QA 1 467 1 467
DS 



AS 1 2

CO CL3603Contig1 1064 2 2 U
GGGCCGAACCAACTACCCATCGGGAACCCCTAAAGAGCAACAAAAGCCTCCTCTCTTGCC
TTCTTCTTCTAGAAATCTCTATTTACTTTCAAATTCAATTTCTCAATTAAAAAAAAAAAA
TGGTGATTAATTCGTCAAGAACCAAATCAAGCGGACCGGTGCTACGCTCCGTATCACCGT
CCGGTCGTTTCTACGGCGGCGTATCGTCTCCTTCCTCATCAGGCTTCGCTTCCTCCACAA
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GATCCGCGTCTCCTACGCGCGTGAACCTCTTCTCATCAACGCCATTAAACCAGTCGTTCC
GTTACTCCATCGACAACAGATCTGTATCCCCGAACCAATCCGTCGCCGTTTCGAAGAAGC
CGAGCAGCAATAAGATCGCCGATTCTAGGAGGAGGACGTGTATGTGTTCGCCGACGACTC
ACCCCGGATCGTTCCGGTGCGGTCTGCACAAGAACGTGGCGAATCCGCACGGCCAGGGCG
CCGCGACGGCGTATTCGTCGAATAACGGATTGAACATGCGGAGGTCGGCTATGACGAACT
CGCTGGTGAGGATCGGTGGGGTCGAAGGGGAGTGGGTGAGAAGAGCGTTGACGACGCTGA
TAAGGCCTTCGTCTCATCAGCTCAAGAGGCGATCTGCTTATCAGCCCAGGCCTAGCAGGC
TATCGTCTATGTCCAAAGCGGAAGAAGGTGCCTGATTTGTCTTTTTTTCAGGTTTGTTCT
TGTGTTTGAATCAGCCAACAGAAAAAATCTGTATTTCCGGATAGATCCGGCAGAAGAAGT
CCGGATCCGAAGCGAGCTGGATTTGCGCGGACGGGTCGAGTCAAATTGGACCGAATTATG
TAAACCGGAGATTGAAAACGACACCGTCTTAAAAAGACTTTGTTATGTTGGATGAAGATG
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ATATCTTAGAACAAATATAAAAAAAAAATCGAACAGCAGTGTTG


BQ
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AF RS1EP41TF U 1
AF RS1EP41JQ C 382
BS 1 718 RS1EP41TF
BS 719 1064 RS1EP41JQ

RD RS1EP41TF 727 0 0
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TTCTTCTTCTAGAAATCTCTATTTACTTTCAAATTCAATTTCTCAATTAAAAAAAAAAAA
TGGTGATTAATTCGTCAAGAACCAAATCAAGCGGACCGGTGCTACGCTCCGTATCACCGT
CCGGTCGTTTCTACGGCGGCGTATCGTCTCCTTCCTCATCAGGCTTCGCTTCCTCCACAA
GCTCCAGCTTCTCGTCAACATCCTTCTTCAGCAACAGCCGTCAACAACAGCACCACCACA
GATCCGCGTCTCCTACGCGCGTGAACCTCTTCTCATCAACGCCATTAAACCAGTCGTTCC
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CGAGCAGCAATAAGATCGCCGATTCTAGGAGGAGGACGTGTATGTGTTCGCCGACGACTC
ACCCCGGATCGTTCCGGTGCGGTCTGCACAAGAACGTGGCGAATCCGCACGGCCAGGGCG
CCGCGACGGCGTATTCGTCGAATAACGGATTGAACATGCGGAGGTCGGCTATGACGAACT
CGCTGGTGAGGATCGGTGGGGTCGAAGGGGAGTGGGTGAGAAGAGCGTTGACGACGCTGA
TAAGGCCTTCGTCTCATCAGCTCAAGAGGCGATCTGCTTATCAGCCCAGGCCTAGCAG
GCTATCGTC

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DS 

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ATTCTAGGAGGAGGACGTGTATGTGTTCGCCGACGACTCACCCCGGATCGTTCCGGTGCG
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TCAAGAGGCGATCTGCTTATCAGCCCAGGCCTAGCAGGCTATCGTCTATGTCCAAAGCGG
AAGAAGGTGCCTGATTTGTCTTTTTTTCAGGTTTGTTCTTGTGTTTGAATCAGCCAACAG
AAAAAATCTGTATTTCCGGATAGATCCGGCAGAAGAAGTCCGGATCCGAAGCGAGCTGGA
TTTGCGCGGACGGGTCGAGTCAAATTGGACCGAATTATGTAAACCGGAGATTGAAAACGA
CACCGTCTTAAAAAGACTTTGTTATGTTGGATGAAGATGAGATTGTACCTAGGACTCATA
TGATGATTTCGAAGCAGATAATGTTTCCCTAAGCAGAAAATATCTTAGAACAAATATAAA
AAAAAAATCGAACAGCAGTGTTG

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

CO CL3604Contig1 1012 2 8 U
GGCTCTTCGTTCTTGGCAATGATTTTCGGCTTCAACTAGCTACGGAGCAAAGAATGGTGA
AGCGGCGGAGATAGAGAGATCTGTGTTGTTCTCTTTACATCTCCATAGCTTCTTCATTCA
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CTCGCTTCATCTCTCGAGAGATCTATCTCGTCTCCCCCAGAGTCTGCTGCTGCTGCTGCT
GTGACCACCGTCTTTGACGGTAGATCTCCCCCCGAGATCACCATTTCAGACTACTTGACC
CGCATTTACAACTACTCACGCTGCAGCCCTTCTTGCTTTGTGGTCGCCTACATCTACATT
CATCAGTTTCTCCACCTCACCCGGTCTCACCTCACCCCTCTTAATGTCCACCGCCTTCTC
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ACCACTGCACGCTGATCAGCGAGGATTTCATTCGCGTGGCAACTGTAAGAATAGGGTTTT
TTGGTTTGTGTGTTTTTTGGTAGTGTGATCAATCATTCTTTTGCACAATTTGATTCTTGT
GAGCAGGCAAAAATTCACAAACCTTTAAATTTTTGTCTAGTATAAAGTTTCT


BQ
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AF RS1F570TF U 1
AF RS1F570JQ C 210
BS 1 684 RS1F570TF
BS 685 685 RS1F570JQ
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GGCTCTTCGTTCTTGGCAATGATTTTCGGCTTCAACTAGCTACGGAGCAAAGAATGGTGA
AGCGGCGGAGATAGAGAGATCTGTGTTGTTCTCTTTACATCTCCATAGCTTCTTCATTCA
TTCAATCTCTCGTTGAACAAATTCGGCTAATCGAGTTAAAAAAAAATGGAGACTCTGGCA
AGTGATGATGATCCTGGATTGATTGATTCGGGTGTGTATCTAAGGCTAGGGCTTCTTATT
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CTCGCTTCATCTCTCGAGAGATCTATCTCGTCTCCCCCAGAGTCTGCTGCTGCTGCTGCT
GTGACCACCGTCTTTGACGGTAGATCTCCCCCCGAGATCACCATTTCAGACTACTTGACC
CGCATTTACAACTACTCACGCTGCAGCCCTTCTTGCTTTGTGGTCGCCTACATCTACATT
CATCAGTTTCTCCACCTCACCCGGTCTCACCTCACCCCTCTTAATGTCCACCGCCTTCTC
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TACGCCAGAGTAGGAGGTGTGAGCACGAGAGAGCTCAACAGATTGGAGATGAAGCTCTTG
TTCGCCCTTGATTTCAAGCTTCAG*TTGATCCTCACACCTTTCACTCCCACTGTTGTCAT
TTAGAGGAACACAACAGCAGCGACGACGACG*CTTCCACATCGACTGGCCTATAAA**GA
GCATGCCGACTCAGCAA

QA 1 797 1 797
DS 

RD RS1F570JQ 803 0 0
GGGTGTGTATCTAAGGCTAGGGCTTCTTATTGCAGAGAAGGGCAACAAGCGTTTGCAGAA
GAAGCAGCCACCACCCGCACTTCTCTCACGTCTCGCTTCATCTCTCGAGAGATCTATCTC
GTCTCCCCCAGAGTCTGCTGCTGCTGCTGCTGTGACCACCGTCTTTGACGGTAGATCTCC
CCCCGAGATCACCATTTCAGACTACTTGACCCGCATTTACAACTACTCACGCTGCAGCCC
TTCTTGCTTTGTGGTCGCCTACATCTACATTCATCAGTTTCTCCACCTCACCCGGTCTCA
CCTCACCCCTTTTAATGTCCACCGCCTTCTCGTTACAAGTGTCATGTTATCTGCCAAAGT
TTTCGATGACAGGTATTACAACAATGCTTACTACGCCAGAGTAGGAGGTGTGAGCACGAG
AGAGCTCAACAGATTGGAGATGAAGCTCTTGTTCGCCCTTGATTTCAAGCTTCAGGTTGA
TCCTCACACCTTTCACTCCCACTGTTGTCATTTAGAGGAACACAACAGCAGCGACGACGA
CGGCTTCCACATCGACTGGCCTATAAAAGAAGCATGCCGACTCAGCAAAGAGTCTTGGCG
TAAGGCCACACCAGAGTCTGTCTGCTCTCAAACCACTGCACGCTGATCAGCGAGGATTTC
ATTCGCGTGGCAACTGTAAGAATAGGGTTTTTTGGTTTGTGTGTTTTTTGGTAGTGTGAT
CAATCATTCTTTTGCACAATTTGATTCTTGTGAGCAGGCAAAAATTCACAAACCTTTAAA
TTTTTGTCTAGTATAAAGTTTCT

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 3

CO CL3605Contig1 630 3 4 U
GGAGATAAAACGTTTTAAGATGAGAAAAGTCAAATACAAGCCTTGTAATAATTTT*GCCC
AAACGAACATAAATCTCAACAGACAGATGTGGTCTCTACCTAACCAAACAATAACAAGAT
AAGTGGTTTTGGGTTTAGTGTTTCCATTGTTGGTTCTGTAATAAATGATATTGGACTTAA
GCTTTTCCCTTCAAGATCTCCTCAATGAGCTCAGCTGCTTCCTCGACTGTCGCAATATTC
TGTGCTTTATCCTCCGCCATTTCAATATCAAAGGCTTCCTCCAGGCCCATCACAATCTCC
ACCGTATCAAGAGAATCAGCACCAAGTGCAGCAAATTTGGTGGCAGCCGTAACTTCATCG
CCCGCTTTAAGTGAGAGTTGCTTTTTGACGACTTCACACACTTTGTCCACTGTCTCTGGT
TTTGCAGCGCAAGAAACGCTCAAGCGAGTAGGAAGCGGGCGAAGCGTAAAAGAAAGATTG
TTTCTGCTTCCCTGACTAAAAAATCTAACCGCAGTTGCCATTTGGCGAGGACGAGCCTGC
GGGGAAGTAGAGGCAGTAGCCATGGAAGCCATGAATACAAAGGAGGGAGAGAGAGATATC
GTAGTGAGACGGAGGAGGCGGGGAAGGCCC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BJ01JQ U 3
AF RS1AP88JQ U 1
AF RS1AP88TFB C 1
BS 1 534 RS1AP88JQ
BS 535 535 RS1BJ01JQ
BS 536 611 RS1AP88JQ
BS 612 630 RS1AP88TFB

RD RS1BJ01JQ 565 0 0
CGG
TAAAAAGTTTTAAGATGAAAAAAGTCAAATACAAGCCTTGTAATAATTTTTGCCCAAACA
AACATAAATCTCAACAGACAGATGTGGTCTCTACCTAACCAAACAATAACAAGATAAGTG
GTTTTGGGCTTCGTGTTTCCATTGTTGGTTCTGTAATAAATGATATTGGACTTAAGCTTT
TTCCTTCAAGATCTCCTCAATGAGCTCAGCTGCTTCCTCGACTGTCGCAATATTCTGTGC
TTTATCCTCCGCCATTTCAATATCAAACGCTTCCTCCAGGCCCATCACAATCTCCACCGT
ATCAAGAAAATCAGCACCAAGTGCAGCAAATTTGGTGGCAGCCGTAACTTCGTCGCCGGC
TTTAAGTGAGAGTTGCTTTTTGACGACTTCACACACTTTGTCCACTGTCTCAGGTTTTGC
AGCGCAAGAAACGCTCAAGCGGGTAGGAAGCTGGCGAAGCGTAAAAGAAAGATTGTTTCT
GCTTCCCTGGCTAAAACATCTAACCGCAGTTGCCATTTGGCGAGGACGAGCCTGCAGGGA
AGTAGAGGCAGCAGCCATGGAA

QA 4 565 4 565
DS 

RD RS1AP88JQ 611 0 0
GGAGATAAAACGTTTTAAGATGAGAAAAGTCAAATACAAGCCTTGTAATAATTTT*GCCC
AAACGAACATAAATCTCAACAGACAGATGTGGTCTCTACCTAACCAAACAATAACAAGAT
AAGTGGTTTTGGGTTTAGTGTTTCCATTGTTGGTTCTGTAATAAATGATATTGGACTTAA
GCTTTTCCCTTCAAGATCTCCTCAATGAGCTCAGCTGCTTCCTCGACTGTCGCAATATTC
TGTGCTTTATCCTCCGCCATTTCAATATCAAAGGCTTCCTCCAGGCCCATCACAATCTCC
ACCGTATCAAGAGAATCAGCACCAAGTGCAGCAAATTTGGTGGCAGCCGTAACTTCATCG
CCCGCTTTAAGTGAGAGTTGCTTTTTGACGACTTCACACACTTTGTCCACTGTCTCTGGT
TTTGCAGCGCAAGAAACGCTCAAGCGAGTAGGAAGCGGGCGAAGCGTAAAAGAAAGATTG
TTTCTGCTTCCCTGACTAAAAAATCTAACCGCAGTTGCCATTTGGCGAGGACGAACCTGC
GGGGAAGTAGAGGCAGTAGCCATGGAAGCCATGAATACAAAGGAGGGAGAGAGAGATATC
GTAGTGAGACG

QA 1 611 1 611
DS 

RD RS1AP88TFB 630 0 0
GGAGA
TAAAACGTTTTAAGATGAGAAAAGTCAAATACAAGCCTTGTAATAATTTT*GCCCAAACG
AACATAAATCTCAACAGACAGATGTGGTCTCTACCTAACCAAACAATAACAAGATAAGTG
GTTTTGGGTTTAGTGTTTCCATTGTTGGTTCTGTAATAAATGATATTGGACTTAAGCTTT
TCCCTTCAAGATCTCCTCAATGAGCTCAGCTGCTTCCTCGACTGTCGCAATATTCTGTGC
TTTATCCTCCGCCATTTCAATATCAAAGGCTTCCTCCAGGCCCATCACAATCTCCACCGT
ATCAAGAGAATCAGCACCAAGTGCAGCAAATTTGGTGGCAGCCGTAACTTCATCGCCCGC
TTTAAGTGAGAGTTGCTTTTTGACGACTTCACACACTTTGTCCACTGTCTCTGGTTTTGC
AGCGCAAGAAACGCTCAAGCGAGTAGGAAGCGGGCGAAGCGTAAAAGAAAGATTGTTTCT
GCTTCCCTGACTAAAAAATCTAACCGCAGTTGCCATTTGGCGAGGACGAGCCTGCGGGGA
AGTAGAGGCAGTAGCCATGGAAGCCATGAATACAAAGGAGGGAGAGAGAGATATCGTAGT
GAGACGGAGGAGGCGGGGAAGGCCC

QA 6 630 6 630
DS 



AS 1 3

CO CL3606Contig1 661 3 8 U
GTAAACGATCAACGATGGAAATGGATGGATCGAGCTCATAAAGTAACACCATGTTGTAGA
GTAATAGCCTTCGTGAGACTTGATAGTTAAGAGGCAGCTTTGGTCTCTCCTAACCAAATC
AAAAAATAAAAATAAAGAGATGGTGGAACCTGAGCTGAGATTGAATCTCTTCTGCCACCA
CACAACCCGAAGAAGCTGACAAAAAGTCACTCTTTGTTTAGTACTTTAGGTACTTTTAAA
TACACCTCATCAAAGCTTGGAATCGAAGCTCTTATACTATCCCTGTTCTCAAATGTTTCA
GGAGCATCCTCTCGCAAATTTCCACCTTCCATTTCTGCTCTAATAGCTGGCTCCACACAG
CTAACATCAACTTGTTGAAGTTGACCAAACCAGTGGATGACTTGACGAATCTTAGCACCA
CATTCCTCAATCTCGGAAGGAGTGAGGGAGATTCGAGCTGTCTCAGCTAGACGGAATACG
TCCGGCGGCTGAAGAACGGAGGGGTTCGTGTCAGACGAGAAGCATCGAGCTATTCTTCTA
CTATGTCTTTGGAAGCTGAGACTTGAAGACGAAGAAAAGGTTGAGACTTTGATTTGGATC
ATGCGCGGTGGTGAAGCAGAGAGAACGGCAAGCAAAGCTCTGATCGCCATCGCTTTTATT
G


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1AR17JQ U 33
AF RS1GM07JQ U 5
AF RS1AR17TFB C 1
BS 1 5 RS1AR17TFB
BS 6 34 RS1GM07JQ
BS 35 35 RS1AR17TFB
BS 36 435 RS1AR17JQ
BS 436 512 RS1GM07JQ
BS 513 513 RS1AR17TFB
BS 514 651 RS1GM07JQ
BS 652 661 RS1AR17TFB

RD RS1AR17JQ 403 0 0
AGC
TCATAAAGTAACACCATGTTGTAGAGTAATAGCCTTCGTGAGACTTGATAGTTAAGAGGC
AGCTTTGGTCTCTCCTAACCAAATCAAAAAATAAAAATAAAGAGATGGTGGAACCTGAGC
TGAGATTGAATCTCTTCTGCCACCACACAACCCGAAGAAGCTGACAAAAAGTCACTCTTT
GTTTAGTACTTTAGGTACTTTTAAATACACCTCATCAAAGCTTGGAATCGAAGCTCTTAT
ACTATCCCTGTTCTCAAATGTTTCAGGAGCATCCTCTCGCAAATTTCCACCTTCCATTTC
TGCTCTAATAGCTGGCTCCACACAGCTAACATCAACTTGTTGAAGTTGACCAAACCAGTG
GATGACTTGACGAATCTTAGCACCACATTCCTCAATCTCG

QA 4 403 4 403
DS 

RD RS1GM07JQ 649 0 0
G
CGATCAACGATGGAAATGGATGGATCGAGTTCATAAAGTAACACCATGTTGTAGAGTAAT
AGCCTTCGTGAGACTTGATAGTTAAGAGGCAGCTTTGGTCTCTCCTAACCAAATCAAAAA
ATAAAAATAAAGAGATGGTGGAACCTGAGCTGAGATTGAATCTCTTCTGCCACCACACAA
CCCGAAGAAGCTGACAAAAAGTCACTCTTTGTTTAGTACTTTAGGTACTTTTAAATACAC
TTCATCAAAGCTTGGAATCGAAGCTCTTATACTATCCCTGTTCTCAAATGTTTCAGGAGC
ATCCTCTCGCAAATTCCCACCTTCCATTTCTGCTCTAATAGCTGGCTCCACACAGCTAAC
ATCAACTTGTTGAAGTTGACCAAACCAGTGGATGACTTGACGAATCTTAGCACCACATTC
CTCAATCTCGGAAGGAGTGAGGGAGATTCGAGCTGTCTCAGCTAGACGGAATACGTCCGG
CGGCTGAAGAACGGAGGGGTTCGTGTCGGACGAGAAGCATCGAGCTATTCTTCTACTATG
TCTTTGGAAGCTGAGACTTGAAGACGAAGAAAAGGTTGAGACTTTGATTTGGATCATGCG
CGGTGGTGAAGCAGAGAGAACGGCAAGCAAAGCTCTGATCGCCATC
CC

QA 2 647 2 647
DS 

RD RS1AR17TFB 661 0 0
GTAAACGATCAACGATGGAAATGGATGGATCGAGCTCATAAAGTAACACCATGTTGTAGA
GTAATAGCCTTCGTGAGACTTGATAGTTAAGAGGCAGCTTTGGTCTCTCCTAACCAAATC
AAAAAATAAAAATAAAGAGATGGTGGAACCTGAGCTGAGATTGAATCTCTTCTGCCACCA
CACAACCCGAAGAAGCTGACAAAAAGTCACTCTTTGTTTAGTACTTTAGGTACTTTTAAA
TACACCTCATCAAAGCTTGGAATCGAAGCTCTTATACTATCCCTGTTCTCAAATGTTTCA
GGAGCATCCTCTCGCAAATTTCCACCTTCCATTTCTGCTCTAATAGCTGGCTCCACACAG
CTAACATCAACTTGTTGAAGTTGACCAAACCAGTGGATGACTTGACGAATCTTAGCACCA
CATTCCTCAATCTCGGAAGGAGTGAGGGAGATTCGAGCTGTCTCAGCTAGACGGGATACG
TCCGGCGGCTGAAGAACGGAGGGGTTCGTGTCAGACGAGAAGCATCGAGCTATTCTTCTA
CTATGTCTTTGGAAGCTGAGACTTGAAGACGAAGAAAAGGTTGAGACTTTGATTTGGATC
ATGCGCGGTGGTGAAGCAGAGAGAACGGCAAGCAAAGCTCTGGTCGCCATCGCTTTTATT
G

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 3

CO CL3607Contig1 1263 3 2 U
GGATTGCTTGGTGAAGAAGAGGGTCTTTTGATTGGTTTTTTCTTTCTCTACGGTAGCTAA
TCGAATCAAAAAGATTTTTGGCCTTCGTCGTCTCTGTTTGCAACCCTAAACTCTCTCTCT
CTCCGACACGTTTGTTTTGGATCTCTTCCCAAAACTGTTCTTTTTTTTTTCTGTTTTGGT
AATAATGCGACCGTTTATGTCTGGCTCGAGAGCTTTGTTCCTTGGTGTCAACGCTCCGAG
GTTCTTAAAGAATGTCCTGATGGCTCTTTCGACGCTGAACTCGAGATTGGTTTCAAGTTT
CTTGTCGAGAGTTACATCTCCCATGTTGAGTTCGAAAGACCCAAATGGATTAAGACAACA
GCGAGAGACACCGGCCTGTTTGACCATTTGATCAACCTCTGGCAGTTCAAGCCAGGTCCC
ATTCCAGGAACCTGCGAGCTTTCTATTCTTGTCGATTTCAAATTCAACTCACCTCTCTAT
CGCCAGGTGGCTTCGATGTTCTTAAAAGAGGTAGCAACAAGGCTCATTGGGGCGTTTAGT
GACCGATGCCGACTTGTGTATGGTCCTGGAGTTCCTGTCGATGCAAACTCATATGAACAA
AAAGCTTGATACATATAATCCTATAATCTATTAAATGAAACTAACAATTATCAGGTTAGT
TTGCATGTTGTTTGCTAGAGAGAGAGCGATTACCCCATAGCTTTTTGTTGCAATTTTTTT
TCATATATGAATTGCTTTTGCATTATCAACACATTAGATGTTTGTTTAAATGTAAAAGCT
GAATTTAATTACATCCTTTTCTCCTTTTCTTTTGGGAGTCTTATTCACAAAATGTCTTTT
TTTTAGTGTAGATTATGAATCAGTGATGATCACAACGCACATGCTGACGTATGTGGTAGC
ATAACTTGTAGGAATAAGCTTTCAAAAGCTTTAAAAATTAAGTAGGGAGGAATTCGATTA
GATAGAAATTGAACATTGTAAAGGGGAAATCAGAGATGTTAAGGTGTCAGTCAGAATCTA
GTCATAACCATTGAACTCAAATGAAGAAATGGTCTTCTTCAGTCCGGTGTGTTAGTCCTG
TAAGTGATGCTTCTTCCTAAAAACCGATGTTCCATTTGATTGTATGTGGTTAAAATAAAT
TCTGTTAAACGACAAAATTTGAGCTTACATATCTTTGGAAGAGATGGATACTTCAATGCA
TAAGTTTTTTGTGCCCCACGTGTATCATATTCTTATCTTCCAAGTCTGGTGCAAATGAAG
AAC


BQ
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C

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TTCTTATCTTCCAAGTCTGGTGCAAATGAAGAAC

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DS 



AS 1 3

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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CE73TF U 1
AF RS1CE73JQ C 517
AF RS1DK29TF U 1019
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ACAGCCTTGCCTTTATCTCCGGTTAACCATCAGTTATGTCGGAGAAGCAACAGGTTCTGG
TACAAAGCTATGTCTCCCCGGTTCTGTCCGCCCAGTTTCTTGGTTTCTTCGCCCTGTTGC
CTCGGCGTGAAAGGAATCGGCTTGTCAAGTCAGTTACGGGCTCGCCACCCTCTGATCTCT
TCAGCGGCTTCGACTGATTATCTATTGCATGACGTTGGAGCCACCGTGGCAGTTCTTGGT
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AGATTGAGCAGAAAGCTTGTGCATATACTCTCAGGTCTGCTTTTCGTGCTCTCGTGGCCA
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CTAAGGCTTGTTGTCAACGGACTATCTGTCTCCCCCAACTCCACGCTAATCAAATCAGTC
ACTAGGGAAGGAAGACCAGAAGAGTTGCTTAAAGGTCCATTGTTCTACGTTCTAGCCCTT
CTCGTTGCTGCGGTTTTCTTCTGGAGAGATTCTCCTACCGGTATGATCTCGTTGGCAATG
ATGTGTGGTGGC

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DS 

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TCAATGTTCATATTCGGCTTTTTCATTTCTATCGGATTACTTTACTATTACTCGAGCCTT
GGGTACCTTCACATGAACTGGGAAACGACCTTTACTAGAGTCGCCATAGTCTCACTGGTT
GCTACGTTGGTGGAGTCACTACCCATCACCGATCAAATAGACGACAACATTTCGGTTCCT
CTGGCTACTATTTTGGCTGCTTACCTAAGTTTTGGATATTACATTCATCCCTCCTAAACT
GTATAAGCTGTATTTGTATGTAGCTGTAAACTGGGCGAGTCCACGTCCATTAGCCCGTAT
CCATTTGTCCATTTATTGTTTGTGGACAAAGAGTGACCATGTCCATTAAAACCATGTCCA
TTAAGAACCATATCCACTAAAACCCATATTTTTATGGGCTGCCATAGAGTCCATAATACA
CCGTATAAGAAAACTTTAGATTTTAATT
C

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TGGACAAAGAGTGACCATGTCCATTAAAACCATGTCCATTAAGAACCATATCCACTAAAA
CCCATATTTTTATGGGCTGCCATAGAGTCCATAATACACCGTATAAGAAAACTTTAGATT
TTAATTTATAAGCCTATAATTTATAAGCATATAATTATATATACAAGTTCATAAAATTAA
AATTAATCTACAAATACAACAATTTTGGTTTTGGCAAGAAAACTTGATTTTGCGGTTTTA
GCGGAAAAATTCGATTTTACGATTTTGGCGGGAAAACCTGATTTTCCGGTTATGACGGGA
AATCCCGATTGCGGTTTTGGTAGGAAAACTCGATTTTGCAGTTTTGGCGGGAAAATCAAT
TTTGCGGTTTTGGCCGGAAAACCCGATTTTATGGTTTTGGCAGGAAAACCTGATTTTCGG
TTTTGGCGGGAAAACCTGATTTTACGGTTTTAGCGGGAAAATCCGATTTTACGGTTTTGA
CAGGAAAACCCGATTTTACGGTTTTGGCGGGAAAATCCGATTTTTTGGTTTTGGCGGGAA
ATCCTGATTTTACGGTTTTGGCGGGATAACCCGATTTTACGTTTTGGCGGGAAAACCCGA
TTTTCCGGTTTGGCGGG

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 3

CO CL3609Contig1 846 3 2 U
GAAAATAAAAAGCACATCTGCTTCAACTTGCATAGCTCAAAATACACTTGAACACATAAG
AAAATAATCTAACAAAATCGACATATATAATATATATCACATTAAACTCTTAGCCATACA
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GAAAATTAGTACTTTTTACCATATGCATTAATCAAGGACAATGCGTTGCTGGTTTCCTGG
CCCATGTTAACGATTCTAGCCCGAACCGAGTTTTTGATCCGTCCATCCATAAATCGACCC
GAGAACCCATCGGAGCAAGTGTTCTCATCAGTCAAAGCAGCACTAGTCCAAGTCTGAGCA
TTACTCATGTGGAACGCAAACTGTTCTTGATTCTTGGCACTAGCACATAGCTTCATTTCT
TGGACCGACTTGGTCAAACGTTCGATGGTATCATTGATCTCCTCGACGCAGTCCTTGATG
GCTTCAACCTCACGCTTCTTAAGGGTCTTGAAACGCGTCAGACGCGCGACAAAGAGCTTC
GTGGATTGGACTCGGTTTAGGGTAACGGCTAGAGCGGTCTCGGCTAAGCGTTGAGGGCTT
GTTTGGATGGCGTTTGCGTAGGCGGATAAGGAACGGAAGCACACGGTTGGGTATGTGGTC
GTTTTGCAAGAGGATTGGATGAAGTTTACGGCTTTTTGGGAAGCTCCGGCCGGTGAGGCT
GCGGTGAGCTCCAGCGAGAAGAAGTAGGAGATTGAGATGATTAGAAAGAGAGTTTGATAT
AGTTTTGCCATTGTTGTTTCTTGTGAGAGAGATAGAGAGAATGGGTGAGATAGTTGAGTT
TGTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1CX60JQ U 1
AF RS1GH83JQ U 113
AF RS1CX60TF C 132
BS 1 637 RS1CX60JQ
BS 638 846 RS1CX60TF

RD RS1CX60JQ 637 0 0
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AAAATAATCTAACAAAATCGACATATATAATATATATCACATTAAACTCTTAGCCATACA
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GAAAATTAGTACTTTTTACCATATGCATTAATCAAGGACAATGCGTTGCTGGTTTCCTGG
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TTACTCATGTGGAACGCAAACTGTTCTTGATTCTTGGCACTAGCACATAGCTTCATTTCT
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GTTTGGATGGCGTTTGCGTAGGCGGATAAGGAACGGA

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TTACTATTTATATATA
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GTACTTTTTACCAAATGCATTAATCAAGGACAATGCGTTGCTGGTTTCCTGGCCCATGTT
AACGATTCTAGCCCGAACCGAGTTCTTGATCCGTCCATCCCTAAATCGACCCGAGAACCC
ATCGGAGCAAGTGTTCTCATCAGTCAAAGCAGCACTAGTCCATGTCTGAGCATTACTCAT
GTGGAACGCAAACTGTTCTTGATTCTTGGCACTAGCACATAGCTTCATCTCTTGGACCGA
CTTGATCAAACGTTCGATGGTATCATTGATCTCCTCGACGCAGTCCTTGACGGCTTCAAC
CTCACGCTTCTTAAGGGTCTTGAAACGCGTCAGACGCGAGACAAAGAGCTTCGTGGATTG
GACTCGGCTTAGGGTAACGGCTAGAGCGGTCTCGGCTAAGCGTTGAGGGCTTGTTTGGAT
GGCGTTT

QA 17 503 17 503
DS 

RD RS1CX60TF 715 0 0
ATATATTTGAGATGGTACATGAAATAGAACATTTCTTAAGTACTAATTTGAAAATTAGTA
CTTTTTACCATATGCATTAATCAAGGACAATGCGTTGCTGGTTTCCTGGCCCATGTTAAC
GATTCTAGCCCGAACCGAGTTTTTGATCCGTCCATCCATAAATCGACCCGAGAACCCATC
GGAGCAAGTGTTCTCATCAGTCAAAGCAGCACTAGTCCAAGTCTGAGCATTACTCATGTG
GAACGCAAACTGTTCTTGATTCTTGGCACTAGCACATAGCTTCATTTCTTGGACCGACTT
GGTCAAACGTTCGATGGTATCATTGATCTCCTCGACGCAGTCCTTGATGGCTTCAACCTC
ACGCTTCTTAAGGGTCTTGAAACGCGTCAGACGCGCGACAAAGAGCTTCGTGGATTGGAC
TCGGTTTAGGGTAACGGCTAGAGCGGTCTCGGCTAAGCGTTGAGGGCTTGTTTGGATGGC
GTTTGCGTAGGCGGATAAGGAACGGAAGCACACGGTTGGGTATGTGGTCGTTTTGCAAGA
GGATTGGATGAAGTTTACGGCTTTTTGGGAAGCTCCGGCCGGTGAGGCTGCGGTGAGCTC
CAGCGAGAAGAAGTAGGAGATTGAGATGATTAGAAAGAGAGTTTGATATAGTTTTGCCAT
TGTTGTTTCTTGTGAGAGAGATAGAGAGAATGGGTGAGATAGTTGAGTTTGTGTC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 3

CO CL3610Contig1 700 3 13 U
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TTTCTGTTACCATCTCCACATAAATTACAAACCAAAGCAAAAATAGCCCTTTTCGCCATG
AAAAATCCATAAAAAGAAAGAGAGAGAAGAAGAAACTGCAAAGGGGTTTGGTTTATAGAC
GGGTTCCATTTTGCCTTCCGTTTTAGGCTTTAGCAGCTTCTGCAGGAGCAGTGGCTTTGT
TGGCAATGAGCTGCTCATAGAGATCTCTGATCTTCAATCCAACAATGGTCTGGAAAAGAC
CTGTCCCATTGTTGCTACCAGGGAAATCAGCATGTTTGAGCATCTGTTGAGTAACTTCAC
CGTAAAATTTGGTCGATAGGTTGCTCAGATGGCTCTCCACGTAAATCAGCTCGTCCAGTC
TATCAAACTGCCCATCCATCTCCACAACCGAAACCTCATGGTCGAAGTAGGAATCAGGTG
CATAGTCGAACTTGATGCCAAGGTAGGAGCAGGTGAGTTTGCGACCGCAAGGGATCCACG
AGATGGTTGAACCTTCATCAAATAGGTAAACGGGGCTAAAGTACTTGACACCTTCCTTCA
TTATCAATCTCACTCTCAACACTTTGCCTTCATTGTCATCTGGAATCAGCTGTGTTGGAA
GCACTTCTATCACCGCGTCCGCGTACTGCTTTTGTGGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BK29JQ U 5
AF RS1BK29TF C 5
AF RS1AL31JQ U 1
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BS 107 107 RS1BK29JQ
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RD RS1BK29JQ 596 0 0
CGC
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C

QA 4 595 4 595
DS 

RD RS1BK29TF 596 0 0
CGC
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C

QA 4 595 4 595
DS 

RD RS1AL31JQ 700 0 0
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AAAAATCCATAAAAAGAAAGAGAGAGAAGAAGAAACTGCAAAGGGGTTTGGTTTATAGAA
GGGTTCTATTTTGCCTTCCGTTTTAGGCTTTAGCAGCTTCTGCAGGAGCAGTGGCTTTGT
TGGCAATGAGCTGCTCATAGAGATCTCTGATCTTCAATCCAACAATGGTCTGGAAAAGAC
CTGTTCCATTGTTGCTACCAGGGAAATCAGCATGTTTGAGCATCTGTTGAGTAACTTCAC
CGTAAAATTTGGTCGATAGGTTGCTCAGATGGCTCTCCACGTAAATCAGCTCGTCCAGTC
TATCAAACTGCCCATCCATCTCCACAACCGAAACCTCATGGTCGAAGTAGGAATCAGGTG
CATAGTCCAACTTGATGCCAGGGTAGGAGCAGGTGAGTTTGCGACCGCAAGGGATCCACG
AGATGGTTGAACCTTCATCAAATAGGTAAACGGGGCTAAAGTACTTGACACCTTCCTTCA
TTATCAATCTCACTCTCAACACTTTGCCTTCATTGTCATCTGGAATCAGCTGTGTTGGAA
GCACTTCTATCACCGCGTCCGCGTACTGCTTTTGTGGGTC

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 3

CO CL3611Contig1 1035 3 29 U
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AGGACAGGGTGTCTCAGTCCGTTGCAAGGGCGGACAGTGGCTCTAAAATCGTTGATTCAT
TGAAGGCTGAATCTGTTGAAAGCGGCGAAAAGATGAGCAACGTAAATGCGTTGATGAACG
AAGATAGTGTTCACCCATCATTGTCGTGCAATGCGATTGTGTGTTCTGGTTTTGAAGCAT
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GTGGATGGCAATTAACTCTCGATGCCCTTGATTCGTTCCAGTCGCTCGAGAATGCTCAAA
TCCAACCAATGGAATCAGAATCAGCTGCATCTCTTTGCAAGGATGATCACCGCACTCCTC
CCCAGAAGCTCTTGAAACGCCACTCTTTTATCAGCCGCCATGGGAAAAAATAAGAAATCT
AATTGCAAGGTACTATTGCAAAAAAAGACGTTCGATTTCAGACGATATATAAATAGACCA
GTATGGTCACTGGGTTAGGTTCTTTAGCTTGGGTTCATCTCTTAGCAGTATAAATAAAAG
AACTCTGCATAAATCTTTCGGGTCTGCAACTTGTGTTTTTTTCTTTGTTTTTTCTTCAAG
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TATTTGATTCTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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CAGTTGCGGAAGTCATAGAAAATCTAGGACAATGCGGTGAATTCGCACCAGACCAAGGCG
TTACTGATGATTTCGTTCCTGAGGAAATGGACAGGGAAGGTAGTAGGCTCGGGGATATTC
AGGACAGGGTGTCTCAGTCCGTTGCAAGGGCGGACAGTGGCTCTAAAATCGTTGATTCGT
TGAAGGCTGAATCTGTTGAAAGCGGCGAAAAGATGAGCAACGTAAATGCGTTGATGAACG
AAGATAGTGTTCACCCATCATTGTCGTGCAATGCGATTGTGTGTTCTGGTTTTGAAGCAT
CTAAAGAAGAAGTGACCCAGACGTGGAACGAGTCTCCGCTCAACGCTGGCTTTGCACTCC
CTGGATCAAGTTACACTGCTAATGACCAAGGACCTCCGAACGGAGATAGCAATGATGAAA
TTGTGGAATTTGATCCAATAAAGTATCACAACTGTTACTGCCCTTGGGTAAATGAAAATG
TGGCTGCTGCTGGATGTAGCAGCAACAGCTCGAGCTCTTCAAGTATCGCTGAGGCGCTTT
GTGGATGGCAATTAACTCTCGATGCCCTGGATTCGTTCCAGTCACTCGAGAATGCTCAAA
TCCAACCAATGGAATCAGAATCAGCTGCATCTCTTTGCAAGGATGATCACCGCACTCCTT
CC*AGAAGCTCTTGAAACGCCACTCTTTTATCAGCCGCCATGGAAAAAA

QA 1 769 1 769
DS 

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GGCTCTAAAATCGTTGATTCATTGAAGGCTGAATCTGTTGAAAGCGGCGAAAAGATGAGC
AACGTAAATGCGTTGATGAACGAAGATAGTGTTCATCCATCATTGTCGTGCAATGCGATT
GTGTGTTCTGGTTTTGAAGCATCTAAAGAAGAAGTGACACAGACATGGAACGAGTCTCCG
CTCAACGCTGGCTTTGCACTCCCTGGATCAAGTTACACTGCTAATGATCAAGGGCCTCCG
AACGGAGATAGCAATGATGAAATTGTGGAATTTGACCCAATAAAGTATCACAACTGTTAC
TGCCCTTGGGTAAATGAAAACGTGGCTGCTGCTGGATGTAGCAGCAACAGCTCGAGCTCT
TCAAGTATCGCTGAGGCGCTTTGTGGATGGCAATTAACTCTCGATGCCCTTGATTCGTTC
CAGTCGCTCGAGAATGCTCAAATCCAACCAATGGAATCAGAATCAGCTGCATCTCTTTGC
AAGGATGATCACCGCACTCCTCCCCAGAAGCTCTTGAAACGCCACTCTTTTATCAGCCGC
CATGGGAAAAAATAAGAAATCTAATTGCAAGGTACTATTGCAAAAAAAGACGTTCGATTT
CAGACGATATATAAATAGACCAGTATGGTCACTGG*TTAGGTTCT

QA 1 645 1 645
DS 

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TTGTGTGTTCTGGTTTTGAAGCATCTAAAGAAGAAGTGACACAGACATGGAACGAGTCTC
CGCTCAACGCTGGCTTTGCACTCCCTGGATCAAGTTACACTGCTAATGATCAAGGGCCTC
CGAACGGAGATAGCAATGATGAAATTGTGGAATTTGACCCAATAAAGTATCACAACTGTT
ACTGCCCTTGGGTAAATGAAAACGTGGCTGCTGCTGGATGTAGCAGCAACAGCTCGAGCT
CTTCAAGTATCGCTGAGGCGCTTTGTGGATGGCAATTAACTCTCGATGCCCTTGATTCGT
TCCAGTCGCTCGAGAATGCTCAAATCCAACCAATGGAATCAGAATCAGCTGCATCTCTTT
GCAAGGATGATCACCGCACTCCTCCCCAGAAGCTCTTGAAACGCCACTCTTTTATCAGCC
GCCATGGGAAAAAATAAGAAATCTAATTGCAAGGTACTATTGCAAAAAAAGACGTTCGAT
TTCAGACGATATATAAATAGACCAGTATGGTCACTGGGTTAGGTTCTTTAGCTTGGGTTC
ATCTCTTAGCAGTATAAATAAAAGAACTCTGCATAAATCTTTCGGGTCTGCAACTTGTGT
TTTTTTCTTTGTTTTTTCTTCAAGTTTGTGTAGTAGTCAAGTTAAAGATACCTAAACAGA
GGTGAGAGGTGATACTCAATCTTATATTTGATTCTTGTT

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 3

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GATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTCTGGTCCTGGTGCAAATTCAAGTAGAAGCAAGAGT
CTGCTGCCCATCCCAATCAAGTAGAAATGCCTTTAACATATGCCGTCTTCAGATACCCAA
GTCAATTTGTCTACCCGCTAGCGGATGCATAGAAGTTTCCGGAAATGTCTGCCCTTCAGG
ATATCCCAACGACATTCTCGAAAACTCTGGTAATAATGTCAACGAATACTGCAAGTTGGG
GTGTACATCCTCGGTGTGTGGTGTCATGACCACTGTCCATAACTCGGGTGCAAGTGAAGT
TGTGAATGAAGCGTTTGAACAGTGTGCCAAAGCATGTGCTACTTTCTGCAACAAGGGCTC
TATTAAGCCTGAAGCTGAAACTGCCTAAAGAAGCATATCTACGAAGGGGAGTATCACATC
CAAGCGTTTGTTGGTCTTGTATGAAATGTGCTAAAAATGCTAGACTTTGTACTGCTAGTA
TTTTAATGAGTTGTTTCTGGTTTGTGTATGCTTTTAGAAGGTTAACGATCCTAGATTGTA
TACGCCTTCTACTTGCTATCATCTAAATAAATGAATAATGTGTGGGCTAAAGAAAAAAAA


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F814JQ C 1
AF RS1F814TF U 1
AF RS1EE01TF U 2
BS 1 1 RS1F814JQ
BS 2 660 RS1F814TF

RD RS1F814JQ 648 0 0
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GATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTCTGGTCCTGGTGCAAATTCAAGTAGAAGCAAGAGT
TTGCTGCCCATCCCAATCAAGTAGAAATGCCTTTAACATATGCCGTCTTCAGATACCCAA
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ATATCCCAACGACATTCTTGAAAACTTTGGTAATAATGTCAACGAATACTGCAAGTTGGG
GTGTACATCCTCGGTGTGTGGTGTCATGACCACTGTCCATAACTCGGGTGCAAGTGAAGT
TGTGAATGAAGCGTTTGAACAGTGTGCCAAAGCATGTGCTACTTTTTGCAACAAGGGCTT
TATTAAGCCTGAAGCTGAAACTGCCTAAAGAAGCATATTTACGAAGGGGAGTATCACATC
CAAGCGTTTGTTGGTCTTGTATGAAATGTGCTAAAAATGCTAGACTTTGTACTGCTAGTA
TTTTAATGAGTTGTTTTTGGTTTGTGTATGCTTTTAGAAGGTTAACGATCCTAGATTGTA
TACGCCTTCTACTTGCTATCATTTAAATAAATGAATAATGTGTGGGCT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1F814TF 660 0 0
G
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ATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTCTGGTCCTGGTGCAAATTCAAGTAGAAGCAAGAGTC
TGCTGCCCATCCCAATCAAGTAGAAATGCCTTTAACATATGCCGTCTTCAGATACCCAAG
TCAATTTGTCTACCCGCTAGCGGATGCATAGAAGTTTCCGGAAATGTCTGCCCTTCAGGA
TATCCCAACGACATTCTCGAAAACTCTGGTAATAATGTCAACGAATACTGCAAGTTGGGG
TGTACATCCTCGGTGTGTGGTGTCATGACCACTGTCCATAACTCGGGTGCAAGTGAAGTT
GTGAATGAAGCGTTTGAACAGTGTGCCAAAGCATGTGCTACTTTCTGCAACAAGGGCTCT
ATTAAGCCTGAAGCTGAAACTGCCTAAAGAAGCATATCTACGAAGGGGAGTATCACATCC
AAGCGTTTGTTGGTCTTGTATGAAATGTGCTAAAAATGCTAGACTTTGTACTGCTAGTAT
TTTAATGAGTTGTTTCTGGTTTGTGTATGCTTTTAGAAGGTTAACGATCCTAGATTGTAT
ACGCCTTCTACTTGCTATCATCTAAATAAATGAATAATGTGTGGGCTAAAGAAAAAAAA

QA 2 660 2 660
DS 

RD RS1EE01TF 654 0 0
GATCAAAATACAAGCTCATAATTTTAAGTGTATTGTTGAACAATGGAAGGCAAAGGTGTG
ATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTCTGGTCCTGGTGCAAATTCAAGTAGAAGCAAGAGTC
TGCTGCCCATCCCAATCAAGTAGAAATGCCTTCAACATATGCCGTCTTCAGATACCCAAG
TCAATTTGTCTACCCGCTAGCGGATGCATAGAAGTTTCCGGAAATGTCTGCCCTTCAGGA
TATCCCAACGACATTCTCGAAAACTCTGGTAATAATGTCAACGAATACTGCAAGTTGGGG
TGTACATCCTCGGTGTGTGGTGCCATGACCACTGTCCATAACTCGGGTGCAAGTGAAGTT
GTGAATGAAGCGTTTGAACAGTGTGCCAAAGCATGTGCTACTTTCTGCAACAAGGGCTCT
ATTGAGCCTGAAGCTGAAACTGCCTAAAGAAGCATATCTACGAAGGGGAGTATCACATCC
AAGCGTTTGTTGGTCTTGTATGAAATGTGCTAAAAATGCTAGACTTTGTACTGCTAGTAT
TTTAATGAGTTGTTTCTGGTTTGTGTATGCTTTTAGAAGGTTAACGATCCTAGATTGCAT
ACGCCTTCTACTTGCTATCATCTAAATAAATGAATAATGTGTGGGCT
TTTTTAC

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 3

CO CL3613Contig1 1330 3 4 U
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AAAACCTTAGAGAGCGAAGTTAATGGGATTCGGCTTAGAGAACATCAAATCAATCTCCGG
CGGGTGGAGCGCGGCGGCGCGTTCCTGTGACGCTTGTCAATCAGTATCCGCCGCCGTGTT
CTGCCGAGTTGACTCAGCTTTCTTATGCATCACTTGCGACGCAAGGATCCACTCCTACAC
GCGCCACGAGCGCGTGTTCCTCTGCGAAGTCTGCGAACAAGCTCCCGCCGCCGTCACCGG
CAAAGCCGATGCCGCCGCTCTCTGCGTCACCTGCGACTCCGACATCCACTCTGCTAACCC
ACTCGCTAGCCGCCATGAACGCGTCCCCGTCGAGTCGTTCTTCGACTCACCCGTCGCCAA
AATCTCAGCCTCGGTCTGTGCCCGTGGCTGCTCCCTAACGACTTCAACGAACCTGCTAAA
ACCGAGATGAAACCTTCTGAGTTCGTGTTTTCCGATTTCGATAGACTCATCGACTTCGAG
TATCCAAACACTTTCAATCATCAGCCGCTGCATAACAGTTCCGGAGCAGACAGCCTTGTC
CCCGTTCAGACAAAAACAGAGCCTCTTCCGTTGACTAAAAACGATCACTGCTTCGACATA
GACTTCTGCAGATCAAAGCTCTCTGCTTTCACCTACCCAACTCAATCAATCAGCCACAGT
GTTTCGACTTCGTCTCTCGAATACGGCGTGGTACCCGACGGGAACACCTCGTCGGAAATC
TCGATTCCGGTTAACCGGAACACCACCTCGACGGCGACCACCGGGGATCAAGCGAGCTCC
ATGAACAGGGAGGCAAGGGTTTTGAGGTACAGAGAGAAGCGCAAGAACAGGAAGTTCGAG
AAGACGATCCGTTACGCTTCGAGGAAAGCTTACGCGGAGTCACGGCCCAGGATCAAAGGC
CGGTTCGCGAAACGAACGGAGACCGAAAACGACGACGTTTTCTTAAGTCATGTTTACGCT
TCAGCCGCACAGTACGGCGTCGTACCAACGTTCTGATTCTAGTCTACGGACGAATCATCA
TCCATCATCACCTGGAAACTCCCTTTCTTCCACCGTCGATTTACCGTTTGGTGTATTGTA
TTTTATCATAGTGAGTCTTACTCTAGACAAACAATTTATCCTTTTTTACTGCTTCGTCCT
TTTACTTTTTATTTTACCGTCTCTCTCACTGCCACTGTAAGACTGTAACTTTTCTTTTCT
GTTTTTGTAATGCTTATTTTTATTTAGTAAAGTTTTATAAAATAATATAATTTGGTGATT
ACATTTCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G311TF U 32
AF RS1DP42TF U 1
AF RS1DP42JQ C 622
BS 1 298 RS1DP42TF
BS 299 299 RS1G311TF
BS 300 741 RS1DP42TF
BS 742 1330 RS1DP42JQ

RD RS1G311TF 314 0 0
TTTTTCTCTCGTGAAAGAAAGAACAAAACAAAACCTTAGAGAGCGAAGTTAATGGGATTC
GGCTTAGAGAACATCAAATCAATCTCCGGCGGGTGGAGCGCGGCGGCGCGTTCCTGTGAC
GCTTGTCAATCAGTATCCGCCGCCGTGTTCTGCCGAGTTGACTCAGCTTTCTTATGCATC
ACTTGCGACGCAAGGATCCACTCCTACACGCGCCACGAGCGCGTGTTCCTCTGCGAAGTC
TGCGAACAAGCTCCCGCCGCCGTCACCGGCAAAGCCGATGCCGCCGCTCTCTGCGTCACC
TGCGACTCCGACAT

QA 1 314 1 314
DS 

RD RS1DP42TF 741 0 0
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AAAACCTTAGAGAGCGAAGTTAATGGGATTCGGCTTAGAGAACATCAAATCAATCTCCGG
CGGGTGGAGCGCGGCGGCGCGTTCCTGTGACGCTTGTCAATCAGTATCCGCCGCCGTGTT
CTGCCGAGTTGACTCAGCTTTCTTATGCATCACTTGCGACGCAAGGATCCACTCCTACAC
GCGCCACGAGCGCGTGTTCCTCTGCGAAGTCTGCGAACAAGCTCCCGCCGCCGTCACCTG
CAAAGCCGATGCCGCCGCTCTCTGCGTCACCTGCGACTCCGACATCCACTCTGCTAACCC
ACTCGCTAGCCGCCATGAACGCGTCCCCGTCGAGTCGTTCTTCGACTCACCCGTCGCCAA
AATCTCAGCCTCGGTCTGTGCCCGTGGCTGCTCCCTAACGACTTCAACGAACCTGCTAAA
ACCGAGATGAAACCTTCTGAGTTCGTGTTTTCCGATTTCGATAGACTCATCGACTTCGAG
TATCCAAACACTTTCAATCATCAGCCGCTGCATAACAGTTCCGGAGCAGACAGCCTTGTC
CCCGTTCAGACAAAAACAGAGCCTCTTCCGTTGACTAAAAACGATCACTGCTTCGACATA
GACTTCTGCAGATCAAAGCTCTCTGCTTTCACCTACCCAACTCAATCAATCAGCCACAGT
GTTTCGACTTCGTCTCTCGAA

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1DP42JQ 709 0 0
CCTCTTCCGTTGACTAAAAACGATCACTGCTTCGACATAGACTTCTGCAGATCAAAGCTC
TCTGCTTTCACCTACCCAACTCAATCAATCAGCCACAGTGTTTCGACTTCGTCTCTCGAA
TACGGCGTGGTACCCGACGGGAACACCTCGTCGGAAATCTCGATTCCGGTTAACCGGAAC
ACCACCTCGACGGCGACCACCGGGGATCAAGCGAGCTCCATGAACAGGGAGGCAAGGGTT
TTGAGGTACAGAGAGAAGCGCAAGAACAGGAAGTTCGAGAAGACGATCCGTTACGCTTCG
AGGAAAGCTTACGCGGAGTCACGGCCCAGGATCAAAGGCCGGTTCGCGAAACGAACGGAG
ACCGAAAACGACGACGTTTTCTTAAGTCATGTTTACGCTTCAGCCGCACAGTACGGCGTC
GTACCAACGTTCTGATTCTAGTCTACGGACGAATCATCATCCATCATCACCTGGAAACTC
CCTTTCTTCCACCGTCGATTTACCGTTTGGTGTATTGTATTTTATCATAGTGAGTCTTAC
TCTAGACAAACAATTTATCCTTTTTTACTGCTTCGTCCTTTTACTTTTTATTTTACCGTC
TCTCTCACTGCCACTGTAAGACTGTAACTTTTCTTTTCTGTTTTTGTAATGCTTATTTTT
ATTTAGTAAAGTTTTATAAAATAATATAATTTGGTGATTACATTTCTCT

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 2

CO CL3614Contig1 684 2 15 U
GGAATCAATAGTTTCTTCTCATCACCTTTGTCTTCCTCCACCTGTCCTTAACCACAGTCT
TATCTGCCACCGTGTTCCTTCGATCCGCCTCCCAAGCCATCGTTCTACTTCTACCACATC
CCTCCGCCTCTTCAACTGCGCAGCAGCGAGTCGGGAGAGTGAAATAATGGCACCAGCAGG
TAAAGAAGATGGACAAGATCCGAGAATCCCTAAGATCGCCTCTTCCATTAGAGTCATCCC
CGACTTCCCTAAACCAGGGATCATGTTTCAGGACATAACCACGCTACTTCTCGACACGGA
GGCGTTTAGGGATACTATTGATATATTTGTTGAACGATACAAAGGCAAAGACATCTCTGT
TGTTGCAGGTGTTGAAGCAAGAGGTTTCATTTTTGGCCCTCCTATTGCCTTGGCTATTGG
TGCCAAGTTTGTACCCATGAGGAAGCCCAAGAAGCTACCTGGGGAAGTTATATCTGTGGA
GTATTCATTGGAGTATGGAACAGACACGATGGAGATGCATGTAGGTGCAGTAGAGCCTGG
TGAACGTGCTATCGTCATAGATGACCTCATTGCCACGGGTGGGACTCTCGCTGCTGCAAT
CCGACTACTCGAGCGAGTAGGAGTGGAGATAGTGGAGTGTGCATGCGTGATTGAGTTACC
AGAGCTCAAGGGAAGGGAGAAACT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AL45TF U 1
AF RS1DS17TF U 1
BS 1 195 RS1AL45TF
BS 196 196 RS1DS17TF
BS 197 240 RS1AL45TF
BS 241 241 RS1DS17TF
BS 242 279 RS1AL45TF
BS 280 280 RS1DS17TF
BS 281 345 RS1AL45TF
BS 346 346 RS1DS17TF
BS 347 543 RS1AL45TF
BS 544 544 RS1DS17TF
BS 545 582 RS1AL45TF
BS 583 583 RS1DS17TF
BS 584 625 RS1AL45TF
BS 626 626 RS1DS17TF
BS 627 684 RS1AL45TF

RD RS1AL45TF 684 0 0
GGAATCAATAGTTTCTTCTCATCACCTTTGTCTTCCTCCACCTGTCCTTAACCACAGTCT
TATCTGCCACCGTGTTCCTTCGATCCGCCTCCCAAGCCATCGTTCTACTTCTACCACATC
CCTCCGCCTCTTCAACTGCGCAGCAGCGAGTCGGGAGAGTGAAATAATGGCACCAGCAGG
TAAAGAAGATGGACAGGATCCGAGAATCCCTAAGATCGCCTCTTCCATTAGAGTCATCCC
TGACTTCCCTAAACCAGGGATCATGTTTCAGGACATAACTACGCTACTTCTCGACACGGA
GGCGTTTAGGGATACTATTGATATATTTGTTGAACGATACAAAGGGAAAGACATCTCTGT
TGTTGCAGGTGTTGAAGCAAGAGGTTTCATTTTTGGCCCTCCTATTGCCTTGGCTATTGG
TGCCAAGTTTGTACCCATGAGGAAGCCCAAGAAGCTACCTGGGGAAGTTATATCTGTGGA
GTATTCATTGGAGTATGGAACAGACACGATGGAGATGCATGTAGGTGCAGTAGAGCCTGG
TGAGCGTGCTATCGTCATAGATGACCTCATTGCCACGGGTGGTACTCTCGCTGCTGCAAT
CCGACTACTCGAGCGAGTAGGAGTGTAGATAGTGGAGTGTGCATGCGTGATTGAGTTACC
AGAGCTCAAGGGAAGGGAGAAACT

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1DS17TF 666 0 0
GGAATCAATAGTTTCTTCTCATCACCTTTGTCTTCCTCCACCTGTCCTTAACCACAGTCT
TATCTGCCACCGTGTTCCTTCGATCCGCCTCCCAAGCCATCGTTCTACTTCTACCACATC
CCTCCGCCTCTTCAACTGCGCAGC***GAGTCGGGAGAGTGAAATAATGGCACCAGCAGG
TAAAGAAGATGGGCAAGATCCGAGAATCCCTAAGATCGCCTCTTCCATTAGAGTCATCCC
CGACTTCCCTAAACCAGGGATCATGTTTCAGGACATAACCACGCTTCTTCTCGACACGGA
GGCGTTTAGGGATACTATTGATATTTTTGTTGAACGATACAAAGGCAAAGACATTTCTGT
TGTTGCAGGTGTTGAAGCAAGAGGTTTCATTTTTGGCCCTCCTATTGCCTTGGCTATTGG
TGCCAAGTTTGTACCCATGAGGAAGCCCAAGAAGCTACCTGGG*AAGTTATATCTGTGGA
GTATTCATTGGAGTATGGAACAGACACGATGGAGATGCATGTAGGTGCAGTAGAGCCTGG
TGAACGTGCTATCGTCATAGATGACCTCATTGCCACTGGTGGGACTCTCGCTGCTGCAAT
CCGACTACTTGAGCGGGTGGGAGTGGAGATAGTGGAGTGTGCATGCGTGATTGAGTTACC
AGAGCT

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 3

CO CL3615Contig1 511 3 3 U
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AAAATGGGCACAGCCACTTTCGTAGAGATCCTTCTTGCTATCCTCTTGCCTCCTCTCGGC
GTCTTTCTCAAGTTTGGTTGCAATGTTGAGTTTTGGATATGTCTGATATTGACGCTGTTT
GGTTATATTCCCGGGATCATCTACGCTCTTTATGCCATCACCAAGGAGTAAGGACTGATT
GTTTCTAGCTCCACTGTTCTCTCCTTTTGGTCTTTCCTTAGGGAGGGAACATGCGGCTTC
ACCGTGTTAACTCATTGGGAGTGATTCATCATTTGTTTTATGTTATGAGCAATTATATTT
CATTATTGTATTTTGCATTATTATAATTTATGTGATATGAAAAAAGCCTTTTGAATAGTT
GGAAATTGGATCATACCGTCTGACTAAGACAATCATAATGTTGAAATACATGTATCGAAG
TTTAGTCAAATTTGAACTTTTCACTTGGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C137JQ C 1
AF RS1C137TF U 1
AF RS1G715TF U 5
BS 1 6 RS1C137JQ
BS 7 413 RS1C137TF
BS 414 511 RS1G715TF

RD RS1C137JQ 413 0 0
GGATCCAGAGTAGTTATCTTACAACTTAGTAGCTCAGCTTTAAGAAATTCCAAGAGCTTC
AAAATGGGCACAGCCACTTTCGTAGAGATCCTTCTTGCTATCCTCTTGCCTCCTCTCGGC
GTCTTTCTCAAGTTTGGTTGCAATGTTGAGTTTTGGATATGTCTGATATTGACGCTGTTT
GGTTATATTCCCGGGATCATCTACGCTCTTTATGCCATCACCAAGGAGTAAGGACTGATT
GTTTCTAGCTCCACTGTTCTCTCCTTTTGGTCTTTCCTTAGGGAGGGAACATGCGGCTTC
ACCGTGTTAACTCATTGGGAGTGATTCATCATTTGTTTTATGTTATGAGCAATTATATTT
CATTATTGTATTTTGCATTATTATAATTTATGTGATATGAAAAAAGCCTTTTG

QA 1 413 1 413
DS 

RD RS1C137TF 413 0 0
GGATCC
AGAGTAGTTATCTTACAACTTAGTAGCTCAGCTTTAAGAAATTCCAAGAGCTTCAAAATG
GGCACAGCCACTTTCGTAGAGATCCTTCTTGCTATCCTCTTGCCTCCTCTCGGCGTCTTT
CTCAAGTTTGGTTGCAATGTTGAGTTTTGGATATGTCTGATATTGACGCTGTTTGGTTAT
ATTCCCGGGATCATCTACGCTCTTTATGCCATCACCAAGGAGTAAGGACTGATTGTTTCT
AGCTCCACTGTTCTCTCCTTTTGGTCTTTCCTTAGGGAGGGAACATGCGGCTTCACCGTG
TTAACTCATTGGGAGTGATTCATCATTTGTTTTATGTTATGAGCAATTATATTTCATTAT
TGTATTTTGCATTATTATAATTTATGTGATATGAAAAAAGCCTTTTG

QA 7 413 7 413
DS 

RD RS1G715TF 507 0 0
GG
AGAGTAGTTATCTTACAACTTAGTAGCTCAGCTTTAAGAAATTCCAAGAGCTTCAAAATG
GGCACAGCCACTTTCGTAGAGATCCTTCTTGCTATCCTCTTGCCTCCTCTCGGCGTCTTT
CTCAAGTTTGGTTGCA*TGTTGAGTTTTGGATATGTCTGATATTGACGCTGTTTGGTTAT
ATTCCCGGGATCATCTACGCTCTTTATGCCATCACCAAGGAGTAAGGACTGATTGTTTCT
AGCTCCACTGTTCTCTCCTTTTGGTCTTTCCTTAGGGAGGGAACATGCGGCTTCACCGTG
TTAACTCATTGGGAGTGATTCATCATTTGTTTTATGTTATGAGCAATTATATTTCATTAT
TGTATTTTGCATTATTATAATTTATGTGATATGAAAAAAGCCTTTTGAATAGTTGGAAAT
TGGATCATACCGTCTGACTAAGACAATCATAATGTTGAAATACATGTATCGAAGTTTAGT
CAAATTTGAACTTTTCACTTGGTCT

QA 3 507 3 507
DS 



AS 1 3

CO CL3616Contig1 1054 3 10 U
GGAACCACACAACATAGAAGCAAAACAAAAACCATTTGCTGGAAAGGAAAAAACAAAGAA
AGGAAAAAACAAAGAAATAAGTAATGGCCAAGGACGTGGAAGCCGTTGCCGGAGAAGGGT
TTCAGACAAGAGACTATCAAGACCCGCCGCCAGCGCCTCTGTTTGATCCGGAGGAGCTGA
CGAAGTGGTCTTTTTACCGAGCAGTCATCGCCGAGTTCGTAGCTACTCTCCTCTTCTTAT
ACATCACCGTTTTGACAGTCATCGGTTATAAGGTTCAGACAGATAGTACTGCTGGCGGCG
TTGACTGCGGTGGAGTTGGAATCCTTGGTATTGCTTGGGCCTTCGGTGGCATGATCTTCA
TTCTCGTCTACTGCACCGCCGGTATCTCCGGTGGTCACATAAACCCAGCAGTGACATTTG
GGTTACCCTTGGCCCGAAAAGTATCCTTGGTTAGAGCCATATTGTACATGGTAGCTCAGT
GTTTGGGTGCAATTTGTGGAGTTGGGTTTGTCAAAGCCTTCCAAAGTGCTTACTACGTCC
GTTACGGCGGTGGAGCCAACTCTCTAGCCGATGGCTACAGCACGGGTACTGGCCTGGCTG
CAGAGATCATCGGTACTTTCGT*CTTGTCTACACAGTCTTCTCGGCCACTGATCCTAAAC
GCAGTGCCAGAGACTCCCACGTTCCAGTGTTGGCTCCACTTCCTATTGGATTTGCGGTAT
TCATGGTACACTTGGCTACCATTCCCATCACCGGAACTGGAATAAATCCTGCGAGGAGTT
TCGGAGCAGCCGTCATCTTCAACGAGAGCAAGCCATGGGATGATCACTGGATCTTTTGGC
TGGGACCATTCATTGGAGCTGCGATTGCTGCAGTCTACCACCAGTTTGTTCTTAGAGCTT
CAGGTTCCAAGTCTCTAGGGTCTTTCAGAAGTGCTGCAAACGTCTAATAAACGCTTTTGC
CCACCAAAACGCATTCTGAAATAATAAGATGATAACTACAAATAGTTATCTTTTCTTTAT
GTACAAATTATCTAAATCAAATCTCTGTTTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GX35TF U 4
AF RS1DB24TF U 1
AF RS1GX35JQ C 373
BS 1 260 RS1DB24TF
BS 261 261 RS1GX35TF
BS 262 388 RS1DB24TF
BS 389 389 RS1GX35TF
BS 390 426 RS1DB24TF
BS 427 427 RS1GX35TF
BS 428 622 RS1DB24TF
BS 623 623 RS1GX35TF
BS 624 747 RS1DB24TF
BS 748 1054 RS1GX35JQ

RD RS1GX35TF 662 0 0
GCG
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AAACAAAGAAATAAGTAATGGCCAAGGACGTGGAAGCCGTTGCCGGAGAAGGGTTTCAGA
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GGTCTTTTTACCGAGCAGTCATCGCCGAGTTCGTAGCTACTCTCCTCTTCTTATACATCA
CCGTTTTGACAGTCATCGGTTATAAGGTTCAGACAGATAGTACTGCTGGCGGCGTTGACT
GCGGTGGAGTTGGAATCCTTGGTATTGCTTGGGCCTTCGGTGGCATGATCTTCATTCTCG
TCTACTGCACCGCCGGTATCTCCGGTGGTCACATAAACCCAGCAGTGACATTTGGGTTAC
CCTTGGCCCGAAAAGTATCCTTGGTTAGAGCCATATTGTACATGGTAGCTCAGTGTTTGG
GTGCAATTTGTGGAGTTGGGTTTGTCAAAGCCTTCCAAAGTGCTTACTACGTCCGTTACG
GCGGTGGAGCCAACTCTCTAGCCGATGGCTACAGCACGGGTACTGGCCTGGCTGCAGAGA
TCATCGGTACTTTCGT*CTTGTCTACACAGTCTTCTCGGCCACTGATCCTAAACGCAGT

QA 4 662 4 662
DS 

RD RS1DB24TF 747 0 0
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AGGAAAAAACAAAGAAATAAGTAATGGCCAAGGACGTGGAAGCCGTTGCCGGAGAAGGGT
TTCAGACAAGAGACTATCAAGACCCGCCGCCAGCGCCTCTGTTTGATCCGGAGGAGCTGA
CGAAGTGGTCTTTTTACCGAGCAGTCATCGCCGAGTTCGTAGCTACTCTCCTCTTCTTAT
ACATCACCGTTTTGACAGTCGTCGGTTATAAGGTTCAGACAGATAGTACTGCTGGCGGCG
TTGACTGCGGTGGAGTTGGAATCCTTGGTATTGCTTGGGCCTTCGGTGGCATGATCTTCA
TTCTCGTCTACTGCACCGCCGGTATCTCTGGTGGTCACATAAACCCAGCAGTGACATTTG
GGTTACTCTTGGCCCGAAAAGTATCCTTGGTTAGAGCCATATTGTACATGGTAGCTCAGT
GTTTGGGTGCAATTTGTGGAGTTGGGTTTGTCAAAGCCTTCCAAAGTGCTTACTACGTCC
GTTACGGCGGTGGAGCCAACTCTCTAGCCGATGGCTACAGCACGGGTACTGGCCTGGCTG
CAGAGATCATCGGTACTTTCGTTCTTGTCTACACAGTCTTCTCGGCCACTGATCCTAAAC
GCAGTGCCAGAGACTCCCACGTTCCAGTGTTGGCTCCACTTCCTATTGGATTTGCGGTAT
TCATGGTACACTTGGCTACCATTCCCA

QA 1 747 1 747
DS 

RD RS1GX35JQ 682 0 0
GCACCGCCGGTATCTCCGGTGGTCACATAAACCCAGCAGTGACATTTGGGTTACCCTTGG
CCCGAAAAGTATCCTTGGTTAGAGCCATATTGTACATGGTAGCTCAGTGTTTGGGTGCAA
TTTGTGGAGTTGGGTTTGTCAAAGCCTTCCAAAGTGCTTACTACGTCCGTTACGGCGGTG
GAGCCAACTCTCTAGCCGATGGCTACAGCACGGGTACTGGCCTGGCTGCAGAGATCATCG
GTACTTTCGT*CTTGTCTACACAGTCTTCTCGGCCACTGATCCTAAACGCAGTGCCAGAG
ACTCCCACGTTCCAGTGTTGGCTCCACTTCCTATTGGATTTGCGGTATTCATGGTACACT
TGGCTACCATTCCCATCACCGGAACTGGAATAAATCCTGCGAGGAGTTTCGGAGCAGCCG
TCATCTTCAACGAGAGCAAGCCATGGGATGATCACTGGATCTTTTGGCTGGGACCATTCA
TTGGAGCTGCGATTGCTGCAGTCTACCACCAGTTTGTTCTTAGAGCTTCAGGTTCCAAGT
CTCTAGGGTCTTTCAGAAGTGCTGCAAACGTCTAATAAACGCTTTTGCCCACCAAAACGC
ATTCTGAAATAATAAGATGATAACTACAAATAGTTATCTTTTCTTTATGTACAAATTATC
TAAATCAAATCTCTGTTTTCTC

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 2

CO CL3617Contig1 563 2 2 U
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CAAGAAGACTTTTGCTGAGGAAGTTAACGCTGCTTTCAGGGATGCAGCTGAGAAAGAGCT
TAAAGGTATACTCGATGTCTGCGATGAGCCTCTTGTCTCTGTTGACTTCAGGTGCTCTGA
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TTTAATATGATTCGGAATGTAGAATTGTAGTTCCCGAGTTTATGTATTTGTGATCTACAA
TTTTATAGTAATAAACTTTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1EK04TF U 1
AF RS1EK04JQ C 37
BS 1 561 RS1EK04TF
BS 562 563 RS1EK04JQ

RD RS1EK04TF 563 0 0
GGCAAGCCACCGTGATCTGAGGAGAGCAAGAGCAGCTGCTTTGAACATCGTTCCGACATC
GACAGGAGCAGCCAAGGCCGTGGCTCTAGTGCTCCCTAACCTCAAAGGAAAGCTCAACGG
AATCGCATTGCGTGTGCCAACTCCCAACGTCTCAGTGGTTGACTTGGTCGTGCAGGTCTC
CAAGAAGACTTTTGCTGAGGAAGTTAACGCTGCTTTCAGGGATGCAGCTGAGAAAGAGCT
TAAAGGTATACTCGATGTCTGCGATGAGCCTCTTGTCTCTGTTGACTTCAGGTGCTCTGA
TGTTTCCTCCACCATTGATTCTTCTCTCACAATGGTTATGGGAGATGATATGGTTAAAGT
TATTGCTTGGTATGATAATGAATGGGGTTACTCTCAGAGAGTTGTTGATTTGGCTGACAT
TGTTGCCAATAACTGGAAGTGAACAAGACTCAACTTTTGATGTCTTGGCTCCATTTTTTC
TTTAATATGATTCGGAATGTAGAATTGTAGTTCCCGAGTTTATGTATTTGTGATCTACAA
TTTTATAGTAATAAACTTTAT
CC

QA 1 561 1 561
DS 

RD RS1EK04JQ 527 0 0
TGCTTTGAACATCGTTCCGACATCGACAGGAGCAGCCAAGGCCGTGGCTCTAGTGCTCCC
TAACCTCAAAGGAAAGCTCAACGGAATCGCATTGCGTGTGCCAACTCCCAACGTCTCAGT
GGTTGACTTGGTCGTGCAGGTCTCCAAGAAGACTTTTGCTGAGGAAGTTAACGCTGCTTT
CAGGGATGCAGCTGAGAAAGAGCTTAAAGGTATACTCGATGTTTGCGATGAGCCTCTTGT
CTCTGTTGACTTCAGGTGCTCTGATGTTTCCTCCACCATTGATTCTTCTCTCACAATGGT
TATGGGAGATGATATGGTTAAAGTTATTGCTTGGTATGATAATGAATGGGGTTACTTTCA
GAGAGTTGTTGATTTGGCTGACATTGTTGCCAATAACTGGAAGTGAACAAGACTCAACTT
TTGATGTCTTGGCTCCATTTTTTCTTTAATATGATTCGGAATGTAGAATTGTAGTTCCCG
AGTTTATGTATTTGTGATCTACAATTTTATAGTAATAAACTTTATCC

QA 1 527 1 527
DS 



AS 1 3

CO CL3618Contig1 999 3 4 U
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CGAGTCAGAAAGGCTTTGATGACTCAAGGTTCATATTAGGGAAAGGAGAGTGAGGGGTTC
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CATCATCGAGCAAAAAGAAAAACGATGCCGTATTGCGAGGTTGTGAAAGAACACGTCGAC
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 20 20 20 
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DS 



AS 1 3

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BQ
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20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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RD RS1C841JQ 741 0 0
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TTCAAGTAGTTATAAAGTAGATAGATAATGATAAATAACAGCAACCTTTTAACCCTTAAT
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TCCGCTCTTAGCTCCAGCTCATGTATGAAATTCTTTTGTATGTCTTGTTGACTTTTGTTC
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TTGAAAGTGTTTTCCATTTCTTCCTCAAGACTACGCAGCTCCTGAATATCAAGTTCATCC
AAACACTCACCTAGCCTCTGCTTAATCTGAGTCCGGAGCTTTCTATTAGTTTCCAACAGC
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GTTTGGTACAGATCTATGATC

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DS 

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GATAGATAATGATAAATAACAGCAACCTTTTAACCCTTAATCATTCAAGAAGGTGGAAGG
TAATGATGTCAGAGGCAGATGGTGCATGGAGGGCATGGTTGGGGTAATGGTGATTATGGT
TTTGATGGTAACGAAGAGCATAAGCACGTGATCCTTCGATTTGATATCCAAGAACCGAGT
CGTAGTCGCCTCCATTGTCTACTAGGCCATAGTGAGGATCTTCCGCTCTTAGCTCCAGCT
CATGTATGAGATTCTTTTGTATGTCTTGTTGACTTTTGTTCTTTTTCTTGGTGGTTTCGA
TCTGATTCCCAAGGGATTTGAACTTGCGCTCACGAACGAGTTTGAAAGTGTTTTCCATTT
CTTCCTCAAGACTACGCAGCTCCTGAATATCAAGTTCATCCAAACACTCACCTAGCCTCT
GCTTAATCTGAGTCCGGAGCTTTCTATTAGTTTCCAACAGCTTCCTCTTGGTTTCTTGCA
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QA 1 823 1 823
DS 

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TCCATTGTCTACTAGGCCATAGTGAGGATCTTCCGCTCTTAGCTCCAGCTCATGTATGAG
ATTCTTTTGTATGTCTTGTTGACTTTTGTTCTTTTTCTTGGTGGTTTCGATCTGATTCCC
AAGGGATTTGAACTTGCGCTCACGAACGAGTTTGAAAGTGTTTTCCATTTCTTCCTCAAG
ACTACGCAGCTCCTGAATATCAAGTTCATCCAAACACTCACCTAGCCTCTGCTTAATCTG
AGTCCGGAGCTTTCTATTAGTTTCCAACAGCTTCCTCTTGGTTTCTTGCATTCTCTCATA
GTGAGCGCTCCAAACATCAACATCGGAAACCGTTTGGTACAGATCTATGATCTCCTTTGT
TGTGGTGTTAGGGCTTATAAACTCATGAAGCTTGTTGGAGCTAGAGAACATGATAATCGA
AACCCTAGCATCACACAAAACCGTAAGCTCGTGAGCCTTCTTGAACAGACCATTTCTTCT
CTTGGAATACGTCACTTGTCGGTTGGTCTGGTTCTCTATTCTCTTGATCTGGATCTTCCC
TCTCGCCATTATTCTTTCTTTTTAGTTTCTGTTTATCTTTTGTTCC

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 3

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GCAGCAAACAATTTGGCATGTAAAAGTACTACATAGCCAAGAATCATAAACCCTTTTGTA
TCAAAACCCCTAAAACGAAAACACACAATTTAATCTAATTACAAATCTTATATTATAGAC
CGTAATACCTGAATACAACACGCACACCAAATGCAATAGACACCAATCCTATAGACAAAA
TACAATCTTGCAAGATCTTTAATTCCTTTAATTTGTTTTAACAACGTCTCTTAAATCTTC
CTTTTTGAACCCTTTCCCAACAATATCAAGCAACTCCTCTTCTTCTCTCACACCATTCAC
CCTACCATTCCTCACCTGGTCGACCAAAGGACCATACGACCAGCTACATATCACGTAATA
TATCACATTGATGAAACTCATAATCGCCAGTAGCCAGTAATAATAGTTGTAATGACCCTT
GTTAATGTTGTCTGAAACCCAACTATCTTCACCATTTCTCGAGGTGAGCTCATTGACGGC
GTTGAGGACCACACTAGCCAATAGACTAGCCACAGCCATACCTAGACCAAACAGAGACGC
TGCGATGCTAGACATGCTTTTAGGAAACTCGGTGTAGAAAAACTCGGTCTGTCCTATCGC
GGTCAGAGCTTCTGCTAGCCCATGTAACACATATTGTGGCACGAGCCACATCGCCGAGAT
GTCTACAATAGCATTAGCATTGTTTGCATACCCTTGGCTTAAAGCTTTCTTCCTTCTAAA
GGTCTCCACCATTGCGGATATCGCCATTGCTAAGAATGACATGAATAGCCCTAATCCCAT
TCTTAGCTTAACGCTTAGTCTAAATGTTCTTCCTCGGATCTTTGAAGCTAATGGGATGAC
GGCACGGTCATATAGAACAACCCACATAGCTAGGGCTATGATGGTGAACATACCGAATGA
TCCAGCTGGTACTTGAAAGCTTGAACCATGACGGCTCAAGCGCCTGTCCATGGAAGTAGC
TTGCAGCAGCTGAAATGAGCTTTGGCTAGTGTTTATGGACATCATAATACCTGTGGACCA
TATCGGTATGACTTTTATCAATGCCTTAAGCTCCTCTACTTTGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FL03JQ U 1
AF RS1AI25JQ U 77
AF RS1AI25TF C 306
BS 1 312 RS1FL03JQ
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BS 337 337 RS1AI25JQ
BS 338 375 RS1FL03JQ
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BS 707 929 RS1AI25JQ
BS 930 1067 RS1AI25TF

RD RS1FL03JQ 706 0 0
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CGTAATACCTGAATACAACACGCACACCAAATGCAATAGACACCAATCCTATAGACAAAA
TACAATCTTGCAAGATCTTTAATTCCTTTAATTTGTTTTAACAACGTCTCTTAAATCTTC
CTTTTTGAACCCTTTCCCAACAATATCAAGCAACTCCTCTTCTTCTCTCACACCATTCAC
CCTACCATTCCTGACCTGGTCGACCAGAGGACCATAAGACCAGCTACATATCACGTAATA
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GTTAATGTTGTCTGAAACCCAACTATCTTCACCATTTCTCGAGGTGAGCTCATTGACGGC
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GGTAAGAGCTTCTGCTAGCCCATGTAACACATATTGTGGCACGAGCCACATCGCCGAGAT
GTCTACAATAGCATTAGCATTGTTTGCATACCCTTGGCTTAAAGCT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RS1AI25JQ 853 0 0
AACACACA
ACAATTTAATCTAATTACAAATCTTATATTATAGACCTTAATACCTGAGTACAACACGCA
CACCAAATGCAATAGACACCAATCCTATAGACAAAATACAATCTTGCAAGATCTTTAATT
CCTTTAATTTGTTTTAACAACGTCTCTTAGATCTTCCTTTTTGAACCCTTTCCCAACAAT
GTCAAGCAACTCCTCTTCTTCTCTCACACCATTCACCCTACCATTCCTCACCTGGTCGAC
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ATCTTCACCATTTCTCGAGGTGAGCTCATTGACGGCGTTGAGGACCACACTAGCCAATAG
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AAACTCGGTGTAGAAAAACTCGGTCTGTCCTATCGCGGTCAGAGCTTCTGCTAGCCCATG
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TGCATACCCTTGGCTTAAAGCTTTCTTCCTTCTAAAGGTCTCCACCATTGCGGATATCGC
CATTGCTAAGAATGACATGAATAGCCCTAATCCCATTCTTAGCTTAACGCTTAGTCTAAA
TGTTCTTCCTCGGATCTTTGAAGCTAATGGGATGACGGCACGGTCATATAGAACAACCCA
CATAGCTAGGGCTATGATGGTGAACATACCGAATGATCCAGCTGGTACTTGAAAGCTTGA
ACCAT

QA 9 853 9 853
DS 

RD RS1AI25TF 762 0 0
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CATTGATGAAACTCATAATCGCCAGTAGCCAGTAATAATAGTTGTAATGACCCTTGTTAA
TGTTGTCTGAAACCCAACTATCTTCACCATTTCTCGAGGTGAGCTCATTGACGGCGTTGA
GGACCACACTAGCCAATAGACTAGCCACAGCCATACCTAGACCAAACAGAGACGCTGCGA
TGCTAGACATGCTTTTAGGAAACTCGGTGTAGAAAAACTCGGTCTGTCCTATCGCGGTCA
GAGCTTCTGCTAGCCCATGTAACACATATTGTGGCACGAGCCACATCGCCGAGATGTCTA
CAATAGCATTAGCATTGTTTGCATACCCTTGGCTTAAAGCTTTCTTCCTTCTAAAGGTCT
CCACCATTGCGGATATCGCCATTGCTAAGAATGACATGAATAGCCCTAATCCCATTCTTA
GCTTAACGCTTAGTCTAAATGTTCTTCCTCGGATCTTTGAAGCTAATGGGATGACGGCAC
GGTCATATAGAACAACCCACATAGCTAGGGCTATGATGGTGAACATACCGAATGATCCAG
CTGGTACTTGAAAGCTTGAACCATGACGGCTCAAGCGCCTGTCCATGGAAGTAGCTTGCA
GCAGCTGAAATGAGCTTTGGCTAGTGTTTATGGACATCATAATACCTGTGGACCATATCG
GTATGACTTTTATCAATGCCTTAAGCTCCTCTACTTTGTCCC

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 3

CO CL3621Contig1 707 3 7 U
GGAAAAATGTCTTACGCAGTAGCAGCAGGGCCTCTCTTCTTCCCGTCTACTGTGAGCGTC
CGATCTCCGGCTAACATCCTTCTCCGTCCCTCTAATCCTTGCCGGCTTCTTGTTCCTCCG
ACGAATGGCGCAGCGAGCACCAAGAACGGCGCGCGCAGGCAAATGAAGAGGACATTTGTA
GTAGCAAATGCTTTGCCTGTGGAGGACGACGGTGTTTCACTCGGCACCATGAAGCTTCCT
GTAGATACCGATCTTCCAAGATTCGAAACTCTTCTCTTTCAGTGGGCGAACAGTCTTTGC
CAAGGAGCCAACATACCTCTCCCTGTTCCTCTCAAGGTGGATAGAATAAGTGGAGGAGCG
AGGTTAGGATTCATAGTGATGGAAGATGAAGGCAAAACCGATGTTCCGGTTTACATAGAC
TGCTTGGTTTACCAAAGCACAGAGAGTGGTTCAGGTTCAGGACCAGTCTTCCGAGCTACA
CGTAATGGGAGGAAGAAAGATAAGGCACCTCCAGGAGAAGAAAGAATCATGAGAAGTCTC
TTGGGAGCACTCAAACGAGCTGTGGAACTTGCTCGAGTCTCATAAAAACTATACTTGCCT
GACATCATTTCTCCTTGTACTTAATGTCTTTGCATCGTCATTTATGTAAGAATCAGATTG
GTCGATAGTTTATATACAAACAATAATAGAGTCCAACCTATATTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1G932TF U 1
AF RS1CB10TF U 41
AF RS1G932JQ C 356
BS 1 103 RS1G932TF
BS 104 104 RS1CB10TF
BS 105 280 RS1G932TF
BS 281 281 RS1CB10TF
BS 282 588 RS1G932TF
BS 589 690 RS1CB10TF
BS 691 707 RS1G932JQ

RD RS1G932TF 588 0 0
GGAAAAATGTCTTACGCAGTAGCAGCAGGGCCTCTCTTCTTCCCGTCTACTGTGAGCGTC
CGATCTCCGGCTAACATCCTTCTCCGTCCCTCTAATCCTTGCCTGCTTCTTGTTCCTCCG
ACGAATGGCGCAGCGAGCACCAAGAACGGCGCGCGCAGGCAAATGAAGAGGACATTTGTA
GTAGCAAATGCTTTGCCTGTGGAGGACGACGGTGTTTCACTCGGCACCATGAAGCTTCCT
GTAGATACCGATCTTCCAAGATTCGAAACTCTTCTCTTTCTGTGGGCGAACAGTCTTTGC
CAAGGAGCCAACATACCTCTCCCTGTTCCTCTCAAGGTGGATAGAATAAGTGGAGGAGCG
AGGTTAGGATTCATAGTGATGGAAGATGAAGGCAAAACCGATGTTCCGGTTTACATAGAC
TGCTTGGTTTACCAAAGCACAGAGAGTGGTTCAGGTTCAGGACCAGTCTTCCGAGCTACA
CGTAATGGGAGGAAGAAAGATAAGGCACCTCCAGGAGAAGAAAGAATCATGAGAAGTCTC
TTGGGAGCACTCAAACGAGCTGTGGAACTTGCTCGAGTCTCATAAAAA

QA 1 588 1 588
DS 

RD RS1CB10TF 650 0 0
G
CCCGTCTACTGTGAGCGTCCGATCTCCGGCTAACATCCTTCTCCGTCCCTCTAATCCTTG
CCGGCTTCTTGTTCCTCCGACGAATGGCGCAGCGAGCACCAAGAACTGCGCGCGCAGGCA
AATGAAGAGGACATTTGTAGTAGCAAATGCTTTGCCTGTGGAGGACGACGGTGTTTCACT
CGGCACCATGAAGCTTCCTGTAGATACCGATCTTCCAAGATTCGAAACTCTTCTCTTTCA
GTGGGCGAACAGTCTTTGCCAAGGAGCCAACATACCTCTCCCTGTTCCTCTCAAGGTGGA
TAGAATAAGTGGAGGAGCGAGGTTAGGATTCATAGTGATGGAAGATGAAGGCAAAACCGA
TGCTCCGGTTTACATAGACTGCTTGGTTTACCAAAGCACAGAGAGTGGTTCAGGTTCAGG
ACCAGTCTTCCGAGCTACACGTAATGTGAGGAAGAAAGATAAGGCACCTCCAGG*GAAGA
AAGAATCATGAGAAGTCTCTTGGGAGCACTCAAACGAGCTGTGGAACTTGCTCGAGTCTC
ATAAAAACTATACTTGCCTGACATCATTTCTCCTTGTACTTAATGTCTTTGCATCGTCAT
TTATGTAAGAATCAGATTGGTCGATAGTTTATATACAAACAATAATAGA

QA 2 650 2 650
DS 

RD RS1G932JQ 352 0 0
GAGCGAGGTTAGGATTCATAGTGATGGAAGATGAAGGCAAAACCGATGTTCCGGTTTACA
TAGACTGCTTGGTTTACCAAAGCACAGAGAGTGGTTCAGGTTCAGGACCAGTCTTCCGAG
CTACACGTAATGGGAGGAAGAAAGATAAGGCACCTCCAGGAGAAGAAAGAATCATGAGAA
GTTTCTTGGGAGCACTCAAACGAGCTGTGGAACTTGCTCGAGTCTCATAAAAACTATACT
TGCCTGACATCATTTCTCCTTGTACTTAATGTCTTTGCATCGTCATTTATGTAAGAATCA
GATTGGTCGATAGTTTATATACAAACAATAATAGAGTCCAACCTATATTTGC

QA 1 352 1 352
DS 



AS 1 2

CO CL3622Contig1 1160 2 12 U
GAAGAGGGTAGCGAGTTGTCTACGCGTGATCTGCAGAAAATAGTACAGGCTTTGCCACAA
TATGGAGAGCAAGTTGACAAACTATCCACTCATGTAGAGATAGCTGGAAAAATTAACAGA
ATAATCAGAGACATGGGACTTAGGGATCTAGGGCAGCTAGAACAAGATCTAGTTTTCGGA
GACGCAGCTGCCAAGGACGTTATCAATTTCCTCAGGACAAATCAGGACACAAACCCGGAG
AACAAGTTACGACTATTGGTGATTTATGCAACGGTGTACCCGGAGAAGTTCGAAGGTGAC
AAAGGCGTGAAGCTAATGCAGCTTGCTAAGTTATCACCCGTGGATATGAAAGTTATAAGC
AACATGCAACTGATAGCTGGATCTCCAGAAAACAAGGCTAAGTCTGGTAGTTTCTCCCTC
AAATTTGACACCGGAAAGACAAAACAAGCAAACAGGAAAGATAGGTCTGGTGAAGAAGAA
ACGTGGCAACTGTTCCGGTTTTATCCCATGCTCGAGGAGCTACTTGAGAAACTTGTGAAA
GGAGATCTGCCCAAAAGCGACTATTTATGCATGAACCAATCGAGTCATAAGGAGGAGGAG
AGTGAAACCCGAACAGGATCAGTTAGGAAGAGCGCTGCAGCTCCTACAACGGTTCCAGAG
CGTAAAGCCACCCCTCATTCTATGAGATCAAGACGGACTGCAACTTGGGCACGTCCTCAT
GCTTCTGACGATGGATATTCCAGTGACTCAGTGCTGAAAAGTGCTTCACTGGACTTGAAG
AGACTGGGGCAACGCATCTTTGTGTTCATTATTGGTGGGGCAACTCGATCCGAGCTCCGA
GTTTGCCACAAGTTGACAAGCAGTTTGAGGAGAGAAGTGGTACTAGGCTCCACTAGTTTC
GACGATCCCCCACAATACATCACGAAGCTGAAACTACTGTCGGAGAAAGACATAGCAGGG
GCTCCTGCTCAGCCCTTCAAACCACAATACTGGTGAACTTGACGCAGCAGCTCAAGTCTT
GAAACCTTTTAGGACAAATTCCACTTGTTATTTTGTTCTTGTTTCTCCAACTCTTTACCT
TTTGCTTCTTTTCCTTATTTTTATTTTTCCTTTTCATTTGATGGACGTTATTCTACATGT
CACAATTAACTCTATATAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BL25TF U 1
AF RS1BI28TF U 520
BS 1 551 RS1BL25TF
BS 552 552 RS1BI28TF
BS 553 606 RS1BL25TF
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BS 658 665 RS1BL25TF
BS 666 666 RS1BI28TF
BS 667 669 RS1BL25TF
BS 670 670 RS1BI28TF
BS 671 805 RS1BL25TF
BS 806 1160 RS1BI28TF

RD RS1BL25TF 805 0 0
GAAGAGGGTAGCGAGTTGTCTACGCGTGATCTGCAGAAAATAGTACAGGCTTTGCCACAA
TATGGAGAGCAAGTTGACAAACTATCCACTCATGTAGAGATAGCTGGAAAAATTAACAGA
ATAATCAGAGACATGGGACTTAGGGATCTAGGGCAGCTAGAACAAGATCTAGTTTTCGGA
GACGCAGCTGCCAAGGACGTTATCAATTTCCTCAGGACAAATCAGGACACAAACCCGGAG
AACAAGTTACGACTATTGGTGATTTATGCAACGGTGTACCCGGAGAAGTTCGAAGGTGAC
AAAGGCGTGAAGCTAATGCAGCTTGCTAAGTTATCACCCGTGGATATGAAAGTTATAAGC
AACATGCAACTGATAGCTGGATCTCCAGAAAACAAGGCTAAGTCTGGTAGTTTCTCCCTC
AAATTTGACACCGGAAAGACAAAACAAGCAAACAGGAAAGATAGGTCTGGTGAAGAAGAA
ACGTGGCAACTGTTCCGGTTTTATCCCATGCTCGAGGAGCTACTTGAGAAACTTGTGAAA
GGAGATCTGCCTAAAAGCGACTATTTATGCATGAACCAATCGAGTCATAAGGAGGAGGAG
AGTGAATCCCGAACAGGATCAGTTAGGAAGAGCGCTGCAGCTCCTACAACGGTTCCGGAG
CGTAAGGCCGCCCCTCATTCTATGAGATCAAGACGGACTGCAACTTGGGCACGTCCTCAT
GCTTCTGACGATGGATATTCCAGTGACTCAGTGCTGAAAAGTGCTTCACTGGACTTGAAG
AGACTGGGGCAACGCATCTTTGTGT

QA 1 805 1 805
DS 

RD RS1BI28TF 641 0 0
G
TACTTGAGGAACTTGTGAAAGGAGATCTGTCCAAAAGCGACTATTTATGCATGAACCAAT
CGAGTCATAAGGAGGAGGAGAGTGAAACCCGAACAGGATCAGTTAGGAAGAGCGCTGCAG
CTCCTACAGCGGTTCCAGAGCGTAAAGCCACCCCTCATTCTATGAGATCAAGACGGACTG
CAACTTGGGCACGTCCTCATGCTTCTGACGATGGATATTCCAGTGACTCAGTGCTGAAAA
GTGCTTCACTGGACTTGAAGAGGCTGGGGCAACGCATCTTTGTGTTCATTATTGGTGGGG
CAACTCGATCCGAGCTCCGAGTTTGCCACAAGTTGACAAGCAGTTTGAGGAGAGAAGTGG
TACTAGGCTCCACTAGTTTCGACGATCCCCCACAATACATCACGAAGCTGAAACTACTGT
CGGAGAAAGACATAGCAGGGGCTCCTGCTCAGCCCTTCAAACCACAATACTGGTGAACTT
GACGCAGCAGCTCAAGTCTTGAAACCTTTTAGGACAAATTCCACTTGTTATTTTGTTCTT
GTTTCTCCAACTCTTTACCTTTTGCTTCTTTTCCTTATTTTTATTTTTCCTTTTCATTTG
ATGGACGTTATTCTACATGTCACAATTAACTCTATATAAT

QA 2 641 2 641
DS 



AS 1 3

CO CL3623Contig1 728 3 5 U
GGAGCCGAACTCAACAACATACGTAGACAAGAGTCTTGGGAGTAAGAATCAGAAGGAAGG
CAAAAATGGTTCGCAGCATAAACCCTAAGAAGGCAAAGAGGAAGAACAAGAAGAAGGGAG
AAGCGTCGTCTTCGTCGTCGGTACCGTCGATGCCAACAAGGGTTTGGCAGCCAGGTGTGG
ATAAGCTAGAAGAAGGAGAAGAGCTTCAGTGCGACCCTTCTGCTTACAATTCCCTTCATG
GCTTCCATGTTGGTTGGCCCTGTTTGAGTTTTGACATCTTAGGTGATAAGTTGGGTTTGA
ATCGAACTGAGTTTCCTCACACTTTGTATATGGTGGCTGGG*ACTCAGGCTGAGAAAGCA
CCTTCGAACTCCATCGGATTATTTAAAATCAGCAACGTATCTGGCAAGAGACGCGATGTA
GTGCCCAAGAAGGTAGTGAATGGTGATGATGATATGGAGGATGAGGATGACGAAGATGAG
GACAGTGACAGCGATGAGGAAAGCGAAGATGGAGCTTCGACTGCTCCAGTTATTCAGGTC
CGCAGAGTTGCTCACCATGGATGTGTCAACCGCATTCATGCAATGCCACAAAATCCTCAT
ATCTGTGTCTCTTGGGCAGATTCTGGTCATGTTCAAGTGTGGGACATGAGCTCTCATCTT
AATGCTTTAGCAGAGTCAGAAACAGAAGTAAAGATGGAACTTCACCGGCTCTGAACCAAG
CACCCTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FD32TF U 201
AF RS1E562TF U 27
AF RS1BJ66TF U 1
BS 1 346 RS1BJ66TF
BS 347 347 RS1E562TF
BS 348 566 RS1BJ66TF
BS 567 567 RS1E562TF
BS 568 728 RS1BJ66TF

RD RS1FD32TF 319 0 0
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TGTTTGAGTTTTGACATCTTAGGTGATAAGTTGGGTTTGAATCGAACTGAGTTTCCTCAC
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QA 1 319 1 319
DS 

RD RS1E562TF 659 0 0
GG
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QA 3 659 3 659
DS 

RD RS1BJ66TF 728 0 0
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CAAAAATGGTTCGCAGCATAAACCCTAAGAAGGCAAAGAGGAAGAACAAGAAGAAGGGAG
AAGCGTCGTCTTCGTCGTCGGTACCGTCGATGCCAACAAGGGTTTGGCAGCCAGGTGTGG
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GCTTCCATGTTGGTTGGCCCTGTTTGAGTTTTGACATCTTAGGTGATAAGTTGGGTTTGA
ATCGAACTGAGTTTCCTCACACTTTGTATATGGTGGCTGGG*ACTCGGGCTGAGAAAGCA
CCTTCGAACTCCATCGGATTATTTAAAATCAGCAACGTATCTGGCAAGAGACGCGATGTA
GTGCCCAAGAAGGTAGTGAATGGTGATGATGATATGGAGGATGAGGATGACGAAGATGAG
GACAGTGACAGCGATGAGGAAAGCGAAGATGGAGCTTCGACTGCTCCAGTTATTCAGGTC
CGCAGAGTTGCTCACCATGGATGTGTTAACCGCATTCATGCAATGCCACAAAATCCTCAT
ATCTGTGTCTCTTGGGCAGATTCTGGTCATGTTCAAGTGTGGGACATGAGCTCTCATCTT
AATGCTTTAGCAGAGTCAGAAACAGAAGTAAAGATGGAACTTCACCGGCTCTGAACCAAG
CACCCTTA

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 3

CO CL3624Contig1 844 3 12 U
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TTCAACGAAGACAACGATCTTGGGACGATAGTGAAGAGGACAGTGCACAACAACTTCTCA
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GCTGCTGCTAGTAGATTGGAGGAAGCAGGTTACGATAACATTGCTTGTGTAGCATCAGGG
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TTAC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1AY56TF U 1
AF RS1BB08TF U 1
AF RS1AY56JQ C 63
BS 1 63 RS1AY56TF
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RD RS1AY56TF 733 0 0
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GCTGCTGCTAGTAGATTGGAGGAAGCAGGTTACGATAACATTGCTTGTGTAGCATCAGGG
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GTCTGTGCTTTGT*GTTCATAACGTTCTTCCCTGAC*AGGCAGAGAAGCTGTTTC*TTCA
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QA 1 733 1 733
DS 

RD RS1BB08TF 733 0 0
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TTCACCAGTGATCTCGGGACAAGGAGGTTGAAAGCGGTGAGCTGGTCCGGAAAGAGCGTC
TCTGGTAACAATAATATCCGCCGGAGAAGTCTGAGAGTTGCGGCTGAGGTGAAGTTCGTG
AATGCAGAGGAAGCGAAGAAGTTGATAGCAGCGGAAGGTTACAAGGTTGTGGATGTAAGA
GACAAGACTCAGTTCGAGAGAGCTCATATAAAGTCTTGCCACCACATCCCTCTCTTCATC
TTCAACGAAGACAACGATCTTGGGACGATAGTGAAGAGGACAGTCCACAACAACTTCTCA
GGGCTCTTCTTTGGATTGCCCTTCACGAAACTGAATCCGGAGTTCGTTAAATCCGTTAGA
AACGAGTTTTCACAGGACAGCAAACTGTTACTGGTTTGCCAAGAAGGTCTCAGATCTGCA
GCTGCTGCTAG***ATTGGAGGAAGCAGGTTACGATAACATTGCTTGTGTAACATCAGGG
TTACAGTCTGTTAAACCAGGGACATTTGAGTCGGTTGGTTCAACGGAGTTGCAGAATGCA
GGCAAGGCAGGGCTTATCACAATTCAAGGCAAGATCTCAGCTGTCTTAG*AACAGTGCTC
GTCTGTGCTTTGTTGTTCATAACGTTCTTCCCTGACCAGGCAGAAAAGCTGTTTCCTTCA
AGCTAAGACGAGA

QA 1 733 1 733
DS 

RD RS1AY56JQ 782 0 0
CG
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QA 3 782 3 782
DS 



AS 1 3

CO CL3625Contig1 705 3 12 U
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TTGATTTCTTCAATCAAATCGCAAACGGAGAAATTTGGCGTAGAGATTAACATTTGTAAT
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TGAGAATTCGAAAGAAGCAGAGCATTAGAGACCATGAAAATGTTTCTTCTTTCTTTATCA
TCTTATGGCTACCTACTACTACGTTTGTGATTGTAACGTTACTCTTTTAAATATGCTAGT
ATTGTTGTTTAGTTACGATGCGAAACACAAGAACCAACTTTAGCG


BQ
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GG
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TTTAGCG

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DS 



AS 1 3

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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EJ35TF U 1
AF RS1CQ51TF U 208
AF RS1H618JQB C 951
BS 1 577 RS1EJ35TF
BS 578 578 RS1CQ51TF
BS 579 683 RS1EJ35TF
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BS 685 749 RS1EJ35TF
BS 750 977 RS1CQ51TF
BS 978 978 RS1H618JQB
BS 979 1012 RS1CQ51TF
BS 1013 1410 RS1H618JQB

RD RS1EJ35TF 753 0 0
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TTGCTCTCGTTGTTCTTCTTCTTCATCTATGCATCCTTTCTGCAGCAGTGGGTGACGAGA
TCGTGTCGAGATTTCAGGAGTATCTCCGAATCGACACGGTTCATCCAAATCCAGATTACT
ACAAAGCCGTTGACTTTATAAACACTCAGGTCAAATCACTCTCCCTCGAATCTCAGACGA
CTGAGTTCGTTAAGGGAAAGCCGCATATCCTCCTCAAGTGGGTTGGCTCCGACCCAACTC
TACCTGCCCTTCTACTCAACTCCCACACCGATGTCGTTCCCTTCGAGGAATCCAAGTGGA
TCCACCACCCACTCCAAGCTCACATGGACAAGCAGGGAGACATATATGCGAGAGGTTCGC
AGGACATGAAGTGCGTTGGGATGCAGTATCTGGAGGCCATACGCAAGCTCCAGGCTTCTG
GCTTTCACCCAATCCGATCCGTCTATCTCTCCTTCGTCCCCGATGAGGAGATCGGCGACC
ACGATGGAGCCGAGAAGTTCACCGAATCTCACCTCTTTAAGACCTTGAACGTCGGTATCG
TCCTCGACGAAGGTCTGCCATCGCCTAGTAAGAGTTACAGAGTATTCTATGGAGAGAGGA
GTCCCTGGTGGCTTGTGATTAAG*CTAAAGGACCCCCTGGCCACGGTGCCAAGCTCTATG
ACAACTCTGCTATGGAGAATCTCCTCAAA
GTAT

QA 1 749 1 749
DS 

RD RS1CQ51TF 817 0 0
GGGC
CAAATCACTCTCCCTCGAATCTCAGACGACTGAGTTCGTTAAGGGAAAGCCGCATATCCT
CCTCAAGTGGGTTGGCTCCGACCCAACTCTACCTGCCCTTCTACTCAACTCCCACACCGA
TGTCGTTCCCTTCGAGGAATCCAAGTGGATCCACCACCCACTCCAAGCTCACATGGACGA
GCAGGGAGACATATATGCGAGAGGTTCGCAGGACATGAAGTGCGTTGGGATGCAGTATCT
GGAGGCCATACGCAAGCTCCAGGCTTCTGGCTTTCACCCAATCCGATCCGTCTATCTCTC
CTTCGTCCCCGATGAGGAGATCGGCGGCCACGATGGAGCCGAGAAGTTCACCGAATCTCA
CCTCTTCAAGACCTTGAACGTCGGTATCGTCCTCGACGAAGGTCTGCCATCGCCTAGTAA
GAGTTACAGAGTATTCTATGGAGAGAGGAGTCCCTGGTGGCTTGTGATTAAGGCTAAAGG
ACCCCCTGGCCACGGTGCCAAGCTCTATGACAACTCTGCTATGGAGAATCTCCTCAAAAG
TATTGAGAGTATTCGTCGATTCAGAGCTTCCCAATTCGATCTTCTCAAAGCTGGTGGCAC
TGCTGAAGGCGATGTCGTCTCCGTCAACATGGCCTTCCTCAAGGCTGGCACACCCTCCCC
AACTGGTTTCGTGATGAATCTGCAACCTTCTGAGCTGAAGCTGGTTTCGACATTCGTATC
CCTCCCACCTTTGATTCTGATCACTTGAAAGACGTTTGGTGGAGGA*TGGGCTCCCGCCG
CACGCAACATGTCCTTTGAGT
CAAGCAGAAGCA

QA 5 805 5 805
DS 

RD RS1H618JQB 460 0 0
ATCACTTGAAAGACGTTTGGTGGAGGAATGGGCTCCCGCCGCACGCAACATGTCCTTTGA
GTTCAAGCGGAAGCATTCGGGGGAACCCCTCGTTACAGCAGCAGATGATTCAAATTCTTG
GTGGAGGCTCTTGGAAAATGCTGTCAAGGAAGCCGGAGGCGGGACTAGTAAGCCTGAGAT
TTTTTCTGCATCAACAGATGCTCGCTACTTCCGGATAGCTGGCGTGCCTGCGTTTGGCTT
CTCTCCCATTTCAAACACCCGGAGTTTGCTTCATGACCACAACGAGTATTTGGGTAAAGC
TGAGTACTTGAAGGGCATTGAGGTGTATGTTTCAGTAATCCAAGCTTATGCATCATATGA
AAGCAAGAGTACTGGTTCACGAGATGAGTTATAAGGGTCCTCTGTCCTCCTTTATTGTTG
CATGCATGACACAACATTTGAGCTTCAAGTCTTGCTGTCC

QA 1 460 1 460
DS 



AS 1 2

CO CL3627Contig1 793 2 7 U
AGTTGGTTCTGTTTCAAGAATGTTTTCAAGTTTTCAACCTTGTGAGAACAATAGAGCTGT
TGTTGAATCAGCTGTTCCACCGGTTGCTCTTCAGGCTTTTGCTTTTCTCAGTGAAAACAC
CGCCGCGCAGTCTGTTGTTGCTTCGATTGCGTCTGACCCAAAGGTGTGGGACGCTGTAAT
GGAAAACAAGGATCTCATGAAATTTCTCGAGACCAACACTGCTTCAACTAAGGATGAAGC
TGACAATGACGACAAATCTGAACTTTCAAGCGAGACTGAAAGTGAAGAAGAGAGTGAAGC
AAAGCCAAAGCCAATCCAGCTCATGGAGATTCTGCGAGACATGAAGCTGAAAGCTGTTCA
AATGATGGAAAATGTGTCTTCCTACTTTGGGGGTTTGTTCAGGACAGAGTCATTTACAGA
GGGTGGACAAGAGAGGAAGAGGATGTTGCTCAACGACCCTACTACCCTCTTTGGATTAGC
TGTTTGCGTTATCTTCATGGTAGTTCTGAAACGTGCTTAAGAAGTTCCAGTTTCTTTCGA
ACTTGCCGATATAGCTTAATAACAACTACTGTGATCTTGTTCTGCTGCTTTTATTATGGT
TTAGAGTTTTTCTCAAATGTTTATTTTATTTTTCTGTTGTTTGGAATGGTTTGGAACTTG
GCTTTGATATATTATAATAAATAAAAAGTATGCTTTGGTATATGTATTGCAATTTATAAG
TTTCTATCCCATGTAAATCAAATTTGTAATAGAAAATTAAAATGATGAATGTATATGAGA
CTTTCAAAGTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F401TF U 271
AF RS1B627JQ C 1
BS 1 271 RS1B627JQ
BS 272 361 RS1F401TF
BS 362 363 RS1B627JQ
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BS 372 698 RS1F401TF
BS 699 793 RS1B627JQ

RD RS1F401TF 429 0 0
G
GAGACTGAAAGTGAAGAAGAGAGTGAAGCAAAGCCAAAGCCAATCCAGCTCATGGAGATT
CTGCGAGACATGAAGCTGAAAGCTGTTCAAG*GATGGAAGATGTGTCTTCCTACTTTGGG
GGTTTGTTCAGGACAGAGTCATTTACAGAGGGTGGACAAGAGAGGAAGAGGATGTTGCTC
AACGACCCTACTACCCTCTTTGGATTAGCTGTTTGCGTTATCTTCATGGTAGTTCTGAAA
CGTGCTTAAGAAGTTCCAGTTTCTTTCGAACTTGCCGATATAGCTTAATAACAACTACTG
TGATCTTGTTCTGCTGCTTTTATTATGGTTTAGAGTTTTTCTCAAATGTTTATTTTATTT
TTCTGTTGTTTGGAATGGTTTGGAACTTGGCTTTGATATATTATAATAAATAAAAAGTAT
GCTTTGG
C

QA 2 428 2 428
DS 

RD RS1B627JQ 793 0 0
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TGTTGAATCAGCTGTTCCACCGGTTGCTCTTCAGGCTTTTGCTTTTCTCAGTGAAAACAC
CGCCGCGCAGTCTGTTGTTGCTTCGATTGCGTCTGACCCAAAGGTGTGGGACGCTGTAAT
GGAAAACAAGGATCTCATGAAATTTCTCGAGACCAACACTGCTTCAACTAAGGATGAAGC
TGACAATGACGACAAATCTGAACTTTCAAGCGAGACTGAAAGTGAAGAAGAGAGTGAAGC
AAAGCCAAAGCCAATCCAGCTCATGGAGATTTTGCGAGACATGAAGCTGAAAGCTGTTCA
AATGATGGAAAATGTGTCTTCCTACTTTGGGGGTTTGTTCAGGACAGAGTCATTTACAGA
GGGTGGACAAGAGAGGAAGAGGATGTTGCTCAACGACCCTACTACCCTCTTTGGATTAGC
TGTTTGCGTTATCTTCATGGTAGTTCTGAAACGTGCTTAAGAAGTTCCAGTTTCTTTCGA
ACTTGCCGATATAGCTTAATAACAACTACTGTGATCTTGTTCTGCTGCTTTTATTATGGT
TTAGAGTTTTTCTCAAATGTTTATTTTATTTTTCTGTTGTTTGGAATGGTTTGGAACTTG
GCTTTGATATATTATAATAAATAAAAAGTATGCTTTGGTATATGTATTGCAATTTATAAG
TTTCTATCCCATGTAAATCAAATTTGTAATAGAAAATTAAAATGATGAATGTATATGAGA
CTTTCAAAGTGAG

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

CO CL3628Contig1 945 2 12 U
GATCTGTTAGGTCGGGCGAATAGGTTAGAGGAGGCAGCAAGGATGGTACAAGACATGAGG
ACTGAACCAGGGCCTAAGGTCTGGGGTTCCCTTCTTGGATCTTGTAGAATTCACGGTAAC
GTTGAGCTGGCAGAGCGTGCGAGTAGAAGGCTTTTTGCTCTTGAGCCGAAAAATGCAGGG
AACTATGTGCTGTTGGCAGACATTTACGCAGAAGCTCAGATGTGGGATAAGGTTAAGAAA
GTGAAGAAGCTTCTAGAATACAGAGGACTGCAGAAGCTGCCTGGTCGGTGCTGGATGGAA
GTGAGGAGAAAAATGTACTCGTTTGTCTCGGTGGATGAGTTCAATCCTCTAATGGAACAG
ATTCATGCTCTCTTGGTTAAGTTAGCAGAAGATATGAAGGAGAAAGGGTACATACCGCAG
ACCAAAGGCGTGTTGTATGATCTTGAGACGGAAGAGAAAGAGCGGATAGTGTTGGGACAC
AGTGAGAAACTGGCGTTGGCATTTGGGCTGATAAATACAGCGAAAGGAGAACCGATAAGG
ATCACCAAGAACTTGCGTTTGTGTGAGGACTGTCACTTGTTTACAAAGTTCATCTCAAAG
TTTATGGAAAAGGAGATTTTGGTAAGAGATGTGAACCGGTTTCATCGGTTTAAGAATGGT
GTTTGTTCTTGTGGAGATTACTGGTAACACTTAGGGGTTTATACGTTTGCTTGTGAATAA
TGAGCAAGGGAGAGATGTCCACTTGAGCTCCCTCTTGGACCTAATCAGGCCAAAGAAATG
ACAAGCAGGTTAGGCTTTACAAAATTTTCATTTAATATATGCCAACAATATCTGTTGGGG
ATCATTGATTGTTATAGCATACGTATTGTACTTTAGCGGCTGGAATAACGTTCCAAACAC
GACTGGTCTTAAACCGATCGGTTTAGGAACTGGATTGATTTGCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FJ76TF U 1
AF RS1DS84JQ C 172
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GTTGAGCTGGCAGAGCGTGCGAGTAGAAGGCTTTTTGCTCTTGAGCCGAAAAATGCAGGG
AACTATGTGCTGTTGGCAGACATTTACGCAGAAGCTCAGATGTGGGATAAGGTTAAGAAA
GTGAAGAAGCTTCTAGAATACAGAGGACTGCAGAAGCTGCCTGTTCGGTGCTGGATGGAA
GTGAGGAGAAAAATGTACTCGTTTGTCTCGGTGGATGAGTTCAATCCTCTAATGGAACAG
ATTCATGCTCTCTTGGTTAAGTTAGCAGAAGATATGAAGGAGAAAGGGTACATACCGCAG
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AGTGAGAAACTGGCGTTGGCATTTGGGCTGATAAATACAGCGAAAGGAGAACCGATAAGG
ATCACCAAGAACTTGCGTTTGTGTGAGGACTGTCACTTGTTTACAAAGTTCATCTCAAAG
TTTATGGAAAAGGAGATTTTGGTAAGAGATGTGAACCGGTTTCATCGGTTTAAGAATGGT
GTTTGTTCTTGTGGAGAT*ACTGGTA*CACTTAGGG*TTTATACGTTTGCTTGTGA*TAA
TGAGCAAGGGAGAGATGTCCACTTGAGCTCCCTCTTGGAC
TAATCAGCCAAAAAA

QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1DS84JQ 774 0 0
AATGCAGGGAACTATGTGCTGTTGGCAGACATTTACGCAGAAGCTCAGATGTGGGATAAG
GTTAAGAAAGTGAAGAAGCTTCTAGAATACAGAGGACTGCAGAAGCTGCCTGGTCGGTGC
TGGATGGAAGTGAGGAGAAAAATGTACTCGTTTGTCTCGGTGGATGAGTTCAATCCTCTA
ATGGAACAGATTCATGCTCTCTTGGTTAAGTTAGCAGAAGATATGAAGGAGAAAGGGTAC
ATACCGCAGACCAAAGGCGTGTTGTATGATCTTGAGACGGAAGAGGAAGAGCGGATAGTG
TTGGGACACAGTGAGAAACTGGCGTTGGCGTTTGGGCTGATAAATACAGCGAAAGGAGAA
CCGATAAGGATCACCGAGAACTTGCGTTTGTGTGAGGACTGTCACTTGTTTACAAAGTTC
ATCTCAAAGTTTATGGAAAAGGAGATTTTGGTAAGAGATGTGAACCGGTTTCATCGGTTT
AAGAATGGTGTTTGTTCTTGTGGAGATTACTGGTAACACTTAGGGGTTTATACGTTTGCT
TGTGAATAATGAGCAAGGGAGAGATGTCCACTTGAGCTCCCTCTTGGACCTAATCAGGCC
AAAGAAATGACAAGCAGGTTAGGCTTTACAAAATTTTCATTTAATATATGCCAACAATAT
CTGTTGGGGATCATTGATTGTTATAGCATACGTATTGTACTTTAGCGGCTGGAATAACGT
TCCAAACACGACTGGTCTTAAACCGATCGGTTTAGGAACTGGATTGATTTGCCT

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 3

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AAAGGAGGAGACGAAGATTTGTTAACACTCAGGGGCAAAAAGAGAGAGAGAAAGATGCAG
ATCTTCGTGAAAACCCTCACCGGAAAAACGATAACCCTAGAGGTGGAGAGCAGCGACACC
ATCGACAATGTCAAAGCCAAAATCCAGGACAAAGAAGGTATACCACCGGACCAACAAAGG
CTCATCTTCGCCGGTAAGCAGCTTGAAGACGGCCGAACCCTAGCCGATTACAACATCCAG
AAAGAGTCTACTCTCCATCTCGTCTTGAGGCTCAGAGGTGGCACCATGATCAAGGTCAAG
ACCCTCACCGGCAAAGAAATCGAGATTGATATCGAACCAACCGACACTATTGACCGTATC
AAGGAACGTGTCGAAGAGAAAGAAGGCATCCCTCCCGTCCAACAAAGGCTTATCTATGCA
GGGAAGCAGCTTGCTGATGACAAAACGGCCAAAGACTACAACATAGAGGGTGGCTCTGTT
CTTCATTTGGTTCTTGCTCTTAGGGGTGGTGGTTGTGTTTGAAATCAAAACATGTATCTT
TCTCTTCTTATCTATATTTGAAATATTTATCATCTTTTCTCTGATTGTGTTTTGGACTTC
ATATGAACCCCCTGATTTGATATGATGATATTGGCATGTTGGTTCAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AW16TF U 1
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BS 1 383 RS1AW16TF
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ATCTTCGTGAAAACCCTCACCGGAAAAACGATAACCCTAGAGGTGGAGAGCAGCGACACC
ATCGACAATGTCAAAGCCAAAATCCAGGACAAAGAAGGTATACCACCGGACCAACAAAGG
CTCATCTTCGCCGGTAAGCAGCTTGAAGACGGCCGAACCCTAGCCGATTACAACATCCAG
AAAGAGTCTACTCTCCATCTCGTCTTGAGGCTCAGAGGTGGCACCATGATCAAGGTCAAG
ACCCTCACCGGCAAAGAAATCGAGATTGATATCGAACCAACCGACACTATTGACCGTATC
AAGGAACGTGTCGAAGAGAAAGA

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DS 

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CCACCGGACCAACAAAGGCTCATTTTCGCCGGTAAGCAGCTTGAAGACGGCCGAACCCTA
GCCGATTACAACATCCAGAAAGAGTTTACTCTCCATCTCGTCTTGAGGCTCAGAGGTGGC
ACCATGATCAAGGTCAAGACCCTCACCGGCAAAGAAATCGAGATTGATATCGAACCAACC
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ATAGAGGGTGGCTCTGTTCTTCATTTGGTTCTTGCTCTTAGGGGTGGTGGTTGTGTTTGA
AATCAAAACATGTATCTTTCTCTTTTTATCTATATTTGAAATATTTATCATCTTTTCTCT
GATTGTGTTTTGGACTTCATATGAACCCCCTGATTTGATATGATGATATTGGCATGTTGG
TT

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DS 

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G
GGCCGAACCCTAGCCGATTACAACATCCAGAAAGAGTCTACTCTCCATCTCGTCTTGAGG
CTCAGAGGTGGCACCATGATCAAGGTCAAGACTCTCACCGGCAAAGAAATCGAGATTGAT
ATCGAACCAACCGACACTATTGACCGTATCAAGGAACGTGTCGAAGAGAAAGAAGGCATC
CCTCCCGTCCAACAAAGGCTTATCTATGCAGGGAAGCAGCTTGCTGATGACAAAACTGCC
AAAGACTACAACATAGAGGGTGGCTCTGTTCTTCATTTGGTTCTTGCTCTTAGGGGTGGT
GGTTGTGTTTGAAATCAAAACATGTATCTTTCTCTTCTTATCTATATTTGAAATATTTAT
CATCTTTTCTCTGATTGTGTTTTGGACTTCATATGAACCCCCTGATTTGATATGATGATA
TTGGCATGTTGGTTCAAAA

QA 2 440 2 440
DS 



AS 1 3

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ACGCTGCAGCCGAAACCGAAAACGATTTACGGCTTTGGGACAGTAAACTTCGGTGGTTAT
TCGGTGAATTCTCACGGCGTCTCTCTCCGGCGAAGCGCCGTGATCGTGTCGGCCATCACC
GGCGCTTCAGGGACTGAAACTGCTGATTTGCTAGAGACGGTGAAAGTCTCGGACTTGAGA
GGAAACGAGATTCCCATCTCTGATTTATGGAAGGATAGGAAAGCCGTTGTTGCATTCGCT
CGTCATTTCGGCTGCGTGCTGTGTCGGAAACGAGCAGCTTATCTTGCGGAAAAGAAGGAT
GTGATGGATGCCTCTGGTGTTACTCTTGTTCTCATTGGACCTGGAAGTATCGATCAGGCC
AAAACTTTTGTGGAACAGACGAAATTTGAAGGAGAGGTGTATGCGGATCCAAACCACGCA
TCATACGAGGCGCTTAAGTTTGCTTCAGGGGTTTCTGTCACATTTACTCCCAAAGCTGCT
ATGAAGATAATAGAGTCTTACATGGAAGGATACCGCCAAGACTGGAAACTCTCGTTTATG
AAAGATACTGTTGAAAGAGGCGGCTGGCAACAAGGTGGAATCCTAGTTGCTGGGCCTGGG
AAAAACAACATCTCTACATCCGCAAGGACAAAGAAGCTGGAGATGATCCGCCTGTTGAAG
AGATCATAAAAGCGTGTTGCGCTTAAAAAGACATTATTGTTCTTTATCGTAGAGTCAAGA
CTCTCTCCTCTCCTCCTCTAGTTTTATAGGGGACATAACACTTTGATATACTGCGTTCAG
TAAGACGTGTTCATTTGGTATGTATTTGTAAAGACGTAAAACCCGATACATATTGGGGTG
TAGTGTATACATCTCTCCTTGTCGTTGCAGTAAAGCTTGGTCAAAATTTGATAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GZ51TF U 14
AF RS1FK24TF U 1
AF RS1FK24JQ C 262
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G
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ACCGAAAACGATTTACGGCTTTGGGACAGTAAACTTCGGTGGTTATTCGGTGAATTCTCA
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TGGTGTTACTCTTGTTCTCATTGGACCTGGAAGTATCGATCAGGCCAAAACTTTTGTGGA
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TAAGTTTGCT

QA 2 491 2 491
DS 

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GGGGAGCCACCACCAACAATGGTTGTTTCGCTCTCGTCGTCGTCGACGGTCACTCCCATT
ACGCTGCAGCCGAAACCGAAAACGATTTACGGCTTTGGGACAGTAAACTTCGGTGGTTAT
TCGGTGAATTCTCACGGCGTCTCTCTCCGGCGAAGCGCCGTGATCGTGTCGGCCATCACC
GGCGCTTCAGGGACTGAAACTGCTGATTTGCTAGAGACGGTGAAAGTCTCGGACTTGAGA
GGAAACGAGATTCCCATCTCTGATTTATGGAAGGATAGGAAAGCCGTTGTTGCATTCGCT
CGTCATTTCGGCTGCGTGCTGTGTCGGAAACGAGCAGCTTATCTTGCGGAAAAGAAGGAT
GTGATGGATGCCTCTGGTGTTACTCTTGTTCTCATTGGACCTGGAAGTATCGATCAGGCC
AAAACTTTTGTGGAACAGACGAAATTTGAAGGAGAGGTGTATGCGGATCCAAACCACGCA
TCATACGAGGCGCTTAAGTTTGCTTCAGGGGTTTCTGTCACATTTACTCCCAAAGCTGCT
ATGAAGATAATAGAGTCTTACATGGAAGGATACCGCCAAGACTGGAAACTCTCGTTTATG
A

QA 1 601 1 601
DS 

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TGTCGGAAACGAGCAGCTTATCTTGCGGAAAAGAAGGATGTGATGGATGCCTCTGGTGTT
ACTCTTGTTCTCATTGGACCTGGAAGTATCGATCAGGCCAAAACTTTTGTGGAACAGACG
AAATTTGAAGGAGAGGTGTATGCGGATCCAAACCACGCATCATACGAGGCGCTTAAGTTT
GCTTCAGGGGTTTCTGTCACATTTACTCCCAAAGCTGCTATGAAGATAATAGAGTCTTAC
ATGGAAGGATACCGCCAAGACTGGAAACTCTCGTTTATGAAAGATACTGTTGAAAGAGGC
GGCTGGCAACAAGGTGGAATCCTAGTTGCTGGGCCTGGGAAAAACAACATCTCTACATCC
GCAAGGACAAAGAAGCTGGAGATGATCCGCCTGTTGAAGAGATCATAAAAGCGTGTTGCG
CTTAAAAAGACATTATTGTTCTTTATCGTAGAGTCAAGACTCTCTCCTCTCCTCCTCTAG
TTTTATAGGGGACATAACACTTTGATATACTGCGTTCAGTAAGACGTGTTCATTTGGTAT
GTATTTGTAAAGACGTAAAACCCGATACATATTGGGGTGTAGTGTATACATCTCTCCTTG
TCGTTGCAGTAAAGCTTGGTCAAAATTTGATAC

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 3

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CCATCCACCAACAATTGATACTCGGAAGTCGGAAGAAAACAGATGACTGATAAAATAAAG
TGGTAAAACTCCACTAGTGTACAGAACCATACTACAATTTTCAAGTCTTGCCAAGGAAAC
AACTGTTTCGAGTTATTTTTTCAACACAAATCGCTAATAACTCAACGAAGATCCTTAAAA
AGTTTTGCCAAGAAGGAAACAACATGTTCAAGGTCTCAGTGCGGCTTTGTGGACCATGGT
TTCCTTGTGAATTTGGTGGCAACTCTTCTCAACAAGATCTAAGAGCTTCTCCAAATTCAC
TGCCCACGAGTTGAGAATCTCGTTGCTGTCCTTTGCGATCTGGAAGCACACGATTCCTGA
TGGTCTGTCTATTTTTGCAATTAGTGCTTTCGACACAACCATCTCTGAGAGATGCTTCTC
CGCCTCCTCAATACTTAGGCATAGAAGCTCCGCAAGTCTCTTTAAGGTTATCCTTGAGTA
GTACTTAGAGACGACGAGAATATTGTGTTCAATGATTCTCAGCTTCAGATCTTCACCAGC
TTTGTCACCCAAAGAGCCTCCAACCATGCTTTTTTCGTTCTCAAACTCACCCTTGTATTT
GTTCCAGAGAGCTGTCCATTGAATAACCTCCATTGTCACAACCTGTTTTAGAAGCATCTT
GAAATCAGGAATTTCTGATAAGTTTTTATCTTCCAAAGTTGCATTGAGCAAGCTTGATTG
CATTGGATCATGAGGTGCCAAGACCAAAAACCAGCAGATCTTCCTCAGAACTGGAATCCA
CTGCTCTGGAGTTTCTTTTACAGAAGGGATGTCATATATTGCCTTGTAGCTACGGCAGAT
TTCAAGGTACTCATTGTTATGAGAGTAATACCGAATCATTAGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GK27JQ U 1
AF RS1BD96JQ U 32
AF RS1AF07TF C 29
BS 1 302 RS1GK27JQ
BS 303 303 RS1BD96JQ
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BS 410 745 RS1GK27JQ
BS 746 886 RS1AF07TF

RD RS1GK27JQ 750 0 0
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TGGTAAAACTCCACTAGTGTACAGAACCATACTACAATTTTCAAGTCTTGCCAAGGAAAC
AACTGTTTCGAGTTATTTTTTCAACACAAATCGCTAATAACTCAACGAAGATCCTTAAAA
AGTTTTGCCAAGAAGGAAACAACATGTTCAAGGTCTCAGTGCGGCTTTGTGGACCATGGT
TTCCTTGTGAATTTGGTGGCAACTCTTCTCAACAAGATCTAAGAGCTTCTCCAAATTCAC
TGACCACGAGTTGAGAATCTCGTTGCTGTCCTTTGCGATCTGGAAGCACACGATTCCTGA
TGGTCTGTCTATTTTTGCAATTAGTGCTTTCGACACAACCATCTCTGAAAGATGCTTCTC
CGCCTCCTCAATACTTAGGCATAGAAGCTCCGCAAGTCTCTTTAAGGTTATCCTTGAGTA
GTACTTAGAGACGACGAGAATATTGTGTTCAATGATTCTCAGCTTCAGATCTTCACCAGC
TTTGTCACCCAAAGAGCCTCCAACCATGCTTTTTTCGTTCTCAAACTCACCCTTGTATTT
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GAAATCAGGAATTTCTGATAAGTTTTTATCTTCCAAAGTTGCATTGAGCAAGCTTGATTG
CATTGGATCATGAGGTGCCAAGACC
AAAAA

QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1BD96JQ 714 0 0
GT
AGAAAACAGATGACTGATAAAATAAAGTGGTAAAACTCCACTAGTGTACAGAACCATACT
ACAATTTTCAAGTCTTGCCAAGGAAACAACTGTTTCGAGTTATTTTTTCAACACAAATCG
CTAATAACTCAACGAAGATCCTTAAAAAGTTTTGCCAAGAAGGAAACAACATGTTAAAGG
TCTCAGTGCGGCTTTGTGGACCATGGTTTCCTTGTGAATTTGGTGGCAACTCTTCTCAAC
AAGATCTAAGAGCTTCTCCAAATTCACTGCCCACGAGTTGAGAATCTCGTTGCTGTCCTT
TGCGATCTGGAAGCACACGATTCCTGATGGTCTGTCTATTTTTGCAATTAGTGCTTTCGA
CACAACCATCTCTGAGAGATGCTTCTCCGCCTCCTCAATACTTAGGCATAGAAGCTCCGA
AAGTCTCTTTAAGGTTATCCTTGAGTAGTACTTAGAGACGACGAGAATATTGTGTTCAAT
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TTCGTTCTCAAACTCACCCTTGTATTTATTCCAGAGAGCTGTCCATTGAATAACCTCCAT
TGTCACAACCTGTTTTAGAAGCATCTTGAAATCAGGAATTTCTGATAAGTTTTTATCTTC
CAAAGTTGCATTGAGCAAGCTTGATTGCATTGGATCATGAGGTGCCAAGACC

QA 3 714 3 714
DS 

RD RS1AF07TF 858 0 0
TCGGA
AGAAAACAGATGACTGATAAAATAAAGTGGTAAAACTCCACTAGTGTACAGAACCATACT
ACAATTTTCAAGTCTTGCCAAGGAAACAACTGTTTCGAGTTATTTTTTCAACACAAATCG
CTAATAACTCAACGAAGATCCTTAAAAAGTTTTGCCAAGAAGGAAACAACATGTTCAAGG
TCTCAGTGCGGCTTTGTGGACCATGGTTTCCTTGTGAATTTGGTGGCAACTCTTCTCAAC
AAGATCTAAGAGCTTCTCCAAATTCACTGCCCACGAGTTGAGAATCTCGTTGCTGTCCTT
TGCGATCTGGAAGCACACGATTCCTGATGGTCTGTCTATTTTTGCAATTAGTGCTTTCGA
CACAACCATCTCTGAGAGATGCTTCTCCGCCTCCTCAATACTTAGGCATAGAAGCTCCGC
AAGTCTCTTTAAGGTTATCCTTGAGTAATACTTAGAGACGACGAGAATATTGTGTTCAAT
GATTCTCAGCTTCAGATCTTCACCAGCTTTGTCACCCAAAGAGCCTCCAACCATGCTTTT
TTCGTTCTCAAACTCACCCTTGTATTTGTTCCAGAGAGCTGTCCATTGAATAACCTCCAT
TGTCACAACCTGTTTTAGAAGCATCTTGAAATCAGGAATTTCTGATAAGTTTTTATCTTC
CAAAGTTGCATTGAGCAAGCTTGATTGCATTGGATCATGAGGTGCCAAGACCAAAAACCA
GCAGATCTTCCTCAGAACTGGAATCCACTGCTCTGGAGTTTCTTTTACAGAAGGGATGTC
ATATATTGCCTTGTAGCTACGGCAGATTTCAAGGTACTCATTGTTATGAGAGTAATACCG
AATCATTAGCTCC

QA 6 858 6 858
DS 



AS 1 3

CO CL3632Contig1 817 3 3 U
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GAACTAAACCAGAAACATTCAAACCAAATTGAAATGAAACTCTCAAGCAAACATGTTCTT
TTTCTCAGAGAAGACTCTTATGGGCTTCAAGAGCTGAAGCTGTTATTTATATATATCCTT
AATGGGCCATTTAAGGGAGGATAGGGGTGATGGGGTCAGGTTGAAGAGCTTTGTGAACAA
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GACGCCCAACGTATTTGATGTCGCTGAAGCTTCCTCTGTTCAGTGCTTTCATGGCCGTGC
AAAGCCTTGGTGCTATATACTGATATCCTCCCATGTTCATCGGCTCTTCTTGACACCACA
CTATCTCTGCATTTGGATATCGCTTTAGTTCTCTCTGAATGAGATCGTAAGGGAATGGAC
AAAGCTGTTCTACTCTGCAGATGGCTATGTCGTTTGTTCCAGACTTTTGTCGCTCTTCGT
CAAGCTCGTAGTAAACCTTCCCAGAGCAGAGGACTAGACGTCGGATACCTTCTTCAAGAT
CCGAGTGACCACTTTGATCTTTAATCAACCGTTTAAACCTGGTTCCTTGCTTGTCAAAAC
CAGGATGTCCTTTAACATCATCGAACTCCGAGAGGTTAGATACACACTTCTTGTGTCGAA
GCAAGTTTTTAGGAGCCATCACTATAAGAGGCTTGCGGAAATCCCTGTGTATCTGGCGAC
GCAGAACGTGGAAGTAGTTTGCAGGTGTAGTAACATT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GT48JQ U 2
AF RS1BN26JQ U 2
AF RS1BN26TF C 1
BS 1 8 RS1BN26TF
BS 9 716 RS1BN26JQ
BS 717 817 RS1BN26TF

RD RS1GT48JQ 496 0 0
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ATTTAAGGGAGGATAGGGGTGATGGGGTCAGGTTGAAGAGCTTTGTGAACAAGATCGGTT
TGCTCCTTAACATGAAGCTGGTAAAAACCAGTGGCTGTAGCAGCTGAAGGAAGACGCCCA
ACGTATTTGATGTCGCTGAAGCTTCCTCTGTTCAGTGCTTTCATGGCCGTGCAAAGCCTT
GGTGCTATATACTGATATCCTCCCATGTTCATCGGCTCTTCTTGACACCACACTATCTCT
GCATTTGGATATCGCTTTAGTTCTCTCTGAATGGGATCGTAAGGGAATGGACAAAGCTGT
TCTACTCTG

QA 8 496 8 496
DS 

RD RS1BN26JQ 715 0 0
GTAATAT
TTTGAAACGGAGAAAATATTTATGTTTGATTACATCATTTTTATTGATAACCGAACTAAA
CCAGAAACATTCAAACCAAATTGAAATGAAACTCTCAAGCAAACATGTTCTTTTTCTCAG
AGAAGACTCTTATGGGCTTCAAGAGCTGAAGCTGTTATTTATATATATCCTTAATGGGCC
ATTTAAGGGAGGATAGGGGTGATGGGGTCAGGTTGAAGAGCTTTGTGAACAAGATCGGTT
TGCTCCTTAACATGAAGCTGGTAAAAACCAGTCGCTGTAGCAGCTGAAGGAAGACGCCCA
ACGTATTTGATGTCGCTGAAGCTTCCTCTGTTCAGTGCTTTCATGGCCGTGCAAAGCCTT
GGTGCTATATACTGATATCCTCCCATGTTCATCGGCTCTTCTTGACACCACACTATCTCT
GCATTTGGATATCGCTTTAGTTCTCTCTGAATGAGATCGTAAGGGAATGGACAAAGCTGT
TCTACTCTGCAGATGGCTATGTCGTTTGTTCCAGACTTTTGTCGCTCTTCGTCAAGCTCG
TAGTAAACCTTCCCAGAGCAGAGGACTAGACGTCGGATACCTTCTTCAAGATCCGAGTGA
CCACTTTGATCTTTAATCAACCGTTTAAACCTGGTTCCTTGCTTGTCAAAACCAGGATGT
CCTTTAACATCATCGAACTCCGAGAGGTTAGATACACACTTCTTGTGT

QA 8 715 8 715
DS 

RD RS1BN26TF 817 0 0
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GAACTAAACCAGAAACATTCAAACCAAATTGAAATGAAACTCTCAAGCAAACATGTTCTT
TTTCTCAGAGAAGACTCTTATGGGCTTCAAGAGCTGAAGCTGTTATTTATATATATCCTT
AATGGGCCATTTAAGGGAGGATAGGGGTGATGGGGTCAGGTTGAAGAGCTTTGTGAACAA
GATCGGTTTGCTCCTTAACATGAAGCTGGTAAAAACCAGTCGCTGTAGCAGCTGAAGGAA
GACGCCCAACGTATTTGATGTCGCTGAAGCTTCCTCTGTTCAGTGCTTTCATGGCCGTGC
AAAGCCTTGGTGCTATATACTGATATCCTCCCATGTTCATCGGCTCTTCTTGACACCACA
CTATCTCTGCATTTGGATATCGCTTTAGTTCTCTCTGAATGAGATCGTAAGGGAATGGAC
AAAGCTGTTCTACTCTGCAGATGGCTATGTCGTTTGTTCCAGACTTTTGTCGCTCTTCGT
CAAGCTCGTAGTAAACCTTCCCAGAGCAGAGGACTAGACGTCGGATACCTTCTTCAAGAT
CCGAGTGACCACTTTGATCTTTAATCAACCGTTTAAACCTGGTTCCTTGCTTGTCAAAAC
CAGGATGTCCTTTAACATCATCGAACTCCGAGAGGTTAGATACACACTTCTTGTGTCGAA
GCAAGTTTTTAGGAGCCATCACTATAAGAGGCTTGCGGAAATCCCTGTGTATCTGGCGAC
GCAGAACGTGGAAGTAGTTTGCAGGTGTAGTAACATT

QA 1 817 1 817
DS 



AS 1 3

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GACACAATTCTCTTTTCACTCGTTCGACGAGAAAAAACAAAAAAAATCTAAAAGGGATCG
ATTTGCCTCGCCATGTCTGGAGAAGAAGAAGAGAACGCCGCCGAGCTTAAGATCGGAGAC
GAGTTTTTGAAGGCGAAGTGCTTAATGAACTGTGAGGTCTCTTTGATCCTCGAGCACAAG
TATGAACAGCTTCAGCAAGTCTCCGAGGATCCTATGAATCAAGTTTCTCAAGTGTTTGAG
AAGTCTCTGCAGTATGTGAAGCGTTTTAGCCGGTACAAGAATCCAGATGCTGTTAGACAA
GTTCGAGAAATCCTGAGTAGACATCAACTCACTGAGTTTGAGCTCTGTGTTCTTGGCAAT
CTCTGTCCTGAAACTGCTGAAGAAGCAGTGGCTATGGTTCCTTCTCTCAAGACAAAAGGA
AGAGCTCATAGTGATGAAGCGATTGAGAAGATGCTCAATGATCTCTCCCTTGTCAAGAGA
TTTGAGTAGTGCAGAAAGTTCTCGAGATCTAAGATTATAAACAGTTTAATTTGAGGGTGT
TATATTCACCTTTTAGATGATGTCTTGAGTTAATTTTTCATGTCTGAAATTTAAAGCTTT
CCAGAATCTCTAGAATGATAACTTCTTTTAATGAAATGTAGTTTACAATA


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1DC44TF U 1
AF RS1EI16TF U 2
AF RS1DC44JQ C 50
BS 1 584 RS1DC44TF
BS 585 615 RS1EI16TF
BS 616 650 RS1DC44JQ

RD RS1DC44TF 584 0 0
GACACAATTCTCTTTTCACTCGTTCGACGAGAAAAAACAAAAAAAATCTAAAAGGGATCG
ATTTGCCTCGCCATGTCTGGAGAAGAAGAAGAGAACGCCGCCGAGCTTAAGATCGGAGAC
GAGTTTTTGAAGGCGAAGTGCTTAATGAACTGTGAGGTCTCTTTGATCCTCGAGCACAAG
TATGAACAGCTTCAGCAAGTCTCCGAGGATCCTATGAATCAAGTTTCTCAAGTGTTTGAG
AAGTCTCTGCAGTATGTGAAGCGTTTTAGCCGGTACAAGAATCCAGATGCTGTTAGACAA
GTTCGAGAAATCCTGAGTAGACATCAACTCACTGAGTTTGAGCTCTGTGTTCTTGGCAAT
CTCTGTCCTGAAACTGCTGAAGAAGCAGTGGCTATGGTTCCTTCTCTCAAGACAAAAGGA
AGAGCTCATAGTGATGAAGCGATTGAGAAGATGCTCAATGATCTCTCCCTTGTCAAGAGA
TTTGAGTAGTGCAGAAAGTTCTCGAGATCTAAGATTATAAACAGTTTAATTTGAGGGTGT
TATATTCACCTTTTAGATGATGTCTTGAGTTAATTTTTCATGTC

QA 1 584 1 584
DS 

RD RS1EI16TF 614 0 0
GG
ACAATTCTCTTTTCACTCGTTCGACGAGAAAAAACAAAAAAAATCTAAAAGGGATCGATT
TGCCTCGCCATGTCTGGAGAAGAAGAAGAGAACGCCGCCGAGCTTAAGATCGGAGACGAG
TTTTTGAAGGCGAAGTGCTTAATGAACTGTGAGGTCTCTTTGATCCTCGAGCACAAGTAT
GAACAGCTTCAGCAAGTCTCCGAGGATCCTATGAATCAAGTTTCTCAAGTGTTTGAGAAG
TCTTTGCAGTATGTGAAGCGTTTTAGCCGGTACAAGAATCCAGATGCTGTTAGACAAGTT
CGAGAAATCCTGAGTAGACATCAACTCACTGAGTTTGAGCTCTGTGTTCTTGGCAATCTC
TGTCCTGAAACTGCTGAAGAAGCAGTGGCTATGGTTCCTTCTCTCAAGACAAAAGGAAGA
GCTCATAGTGATGAAGCGATTGAGAAGATGCTCAATGATCTCTCCCTTGTCAAGAGATTT
GAGTAGTGCAGAAAGTTCTCGAGATCTAAGATTATAAACAGTTTAATTTGAGGGTGTTAT
ATTCACCTTTTAGATGATGTCTTGAGTTAATTTTTCATGTCTGAAATTTAAAGCTTTCCA
GAATCTCTAGAA

QA 3 614 3 614
DS 

RD RS1DC44JQ 601 0 0
AAAAGGGATCGATTTGCCTCGCCATGTCTGGAGAAGAAGAAGAGAACGCCGCCGAGCTTA
AGATCGGAGACGAGTTTTTGAAGGCGAAGTGCTTAATGAACTGTGAGGTCTCTTTGATCC
TCGAGCACAAGTATGAACAGCTTCAGCAAGTCTCCGAGGATCCTATGAATCAAGTTTCTC
AAGTGTTTGAGAAGTCTCTGCAGTATGTGAAGCGTTTTAGCCGGTACAAGAATCCAGATG
CTGTTAGACAAGTTCGAGAAATCCTGAGTAGACATCAACTCACTGAGTTTGAGCTCTGTG
TTCTTGGCAATCTCTGTCCTGAAACTGCTGAAGAAGCAGTGGCTATGGTTCCTTCTCTCA
AGACAAAAGGAAGAGCTCATAGTGATGAAGCGATTGAGAAGATGCTCAATGATCTCTCCC
TTGTCAAGAGATTTGAGTAGTGCAGAAAGTTCTCGAGATCTAAGATTATAAACAGTTTAA
TTTGAGGGTGTTATATTCACCTTTTAGATGATGTCTTGAGTTAATTTTTCATGTCTGAAA
TTTAAAGCTTTCCAGAATCTCTAGAATGATAACTTCTTTTAATGAAATGTAGTTTACAAT
A

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 2

CO CL3634Contig1 969 2 4 U
GGATCCCCTAAAATGGAGATTACGGAGCGGAGGGACGATGATGAGATCAGAGACTCAAAA
GATTCTGCAAACATGGACAACATCAAGTCGCAGTATGCCACCGACTCCTTTTCCGATGAA
CGCTACTCTCGCGACCTCAAGGATGGTCTCCATCCTCTACGGTACAAGTTTGCGATTTGG
TACACACGTCGAACACCAGGGGTCAGGAGCCTGACATCTTACGAGGATAACATTAAGAAG
ATTGTCGAGTTCAGCACTGTTGAAGGTTTTTGGGCTTGTTACTGTCACCTTGCTCGTTCT
CCTCTCTTGCCTAATCCAACAGATCTTCATTTCTTTAAGGATGGGATTCGACCCTTGTGG
GAGGATGGTGCCAACTGCAATGGTGGAAAGTGGATCATACGTTTCCCCAAGGTTGTATCT
GCTCGCTTCTGGGAGGATCTGCTTCTTGCGTTGGTAGGAGACCAGCTTGATGATGCTGAA
AACATTTGTGGGGCAGTGCTGAGTGTCCGCATCAACGAAGACATCATTAGTGTATGGAAC
CGCAATGCTTCTGATCATCACGCGGTGATGGGGTTGAGAGACTCAATCAAGCGGCATTTG
AAGCTGCCTCATGCTTATGTCATGGAGTACAAGCCACACGATGCTTCTCTTCGCGACAAC
TCATCCTACAGAAACACATGGCTGAGAGGATAGGTTCGAAGTTGACCAATTGTGTCACGT
GATACGGGAAGCTCTCCTGCAATGATATCACTGGCTTTGAATCTCAGCAATGAAAAATCC
TGGCTAATTCTGCAGCAGTAGTTTTTCATTCGTTTTCTGGTTTCTTGATGTCGTTGTTAC
CTTCAGTGGTGAGTCTTGTTTGAAACTCTATTGTTTCATTTTCAAAAGAAAACTTGAGCT
TACTTGCTGGTTTTACATTGTTATGACTTGTCTTGAACATTATGTCAATATACAATTTGA
CTTCCTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GF11TF U 1
AF RS1G705JQ C 469
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BS 520 667 RS1GF11TF
BS 668 969 RS1G705JQ

RD RS1GF11TF 667 0 0
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TACACACGTCGAACACCAGGGGTCAGGAGCCTGACATCTTACGAGGATAACATTAAGAAG
ATTGTCGAGTTCAGCACTGTTGAAGGTTTTTGGGCTTGTTACTGTCACCTTGCTCGTTCT
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GAGGATGGTGCCAACTGCAATGGTGGAAAGTGGATCATACGTTTCCCCAAGGTTGTATCT
GCTCGCTTCTGGGAGGATCTGCTTCTTGCGTTGGTAGGAGACCAGCTTGATGATGCTGAA
AACATTTGTGGGGCAGTGCTGAGTGTCCGCATCAACGAGGACATCATTAGTGTATGGAAC
CGCAATGCTTCTGATCATCACGCGGTGATGGGGTTGAGAGACTCAATCAAGCGGCATTTG
AAGCTGCCTCATGCTTATGTCATGGAGTACAAGCCACACGATGCTTCTCTTCGCGACAAC
TCATCCT

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DS 

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AGTGTATGGAACCGCAATGCTTCTGATCATCAGGCGGTGATGGGGTTGAGAGACTCAATC
AAGCGGCATTTGAAGCTGCCTCATGCTTATGTCATGGAGTACAAGCCACACGATGCTTCT
CTTCGCGACAACTCATCCTACAGAAACACATGGCTGAGAGGATAGGTTCGAAGTTGACCA
ATTGTGTCACGTGATACGGGAAGCTCTCCTGCAATGATATCACTGGCTTTGAATCTCAGC
AATGAAAAATCCTGGCTAATTCTGCAGCAGTAGTTTTTCATTCGTTTTCTGGTTTCTTGA
TGTCGTTGTTACCTTCAGTGGTGAGTCTTGTTTGAAACTCTATTGTTTCATTTTCAAAAG
AAAACTTGAGCTTACTTGCTGGTTTTACATTGTTATGACTTGTCTTGAACATTATGTCAA
TATACAATTTGACTTCCTGCG

QA 1 501 1 501
DS 



AS 1 3

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AATGGCTGGTCTAATGAAGTTGGCATGCTTGGTCTTGGCCTGCATGATTGTGGCTGGTCC
AATCGCAACGAACGCGGCTCTTAGCTGTGGAACCGTTAACAGTAACTTGGCAGCATGCAT
TGGCTACTTGACCCAAAATGTGCCCCTCCCCAGAGGTTGCTGCACCGGCGTTACTAATCT
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GACCGGATGAAGAAACTCAAGCGGACGTACGAATCTAATATAATGTATGAGAGAGTACTA
AATAAAATGTTTGAATGGTTGTTTTTCTGGTGTTCTAAAATTTCATGTTTTCTCTTCTGT
TGTGTCGTTCTTTTACTTTGGTCGTATGTACTATTTTCGTAGTCCACGTACGTTATATGA
AGTTTCAGATCCAGGGTTTGCGT


BQ
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AF RS1CU46JQ C 1
AF RS1CU46TF U 1
AF RS1B475TF U 97
BS 1 622 RS1CU46TF
BS 623 623 RS1B475TF

RD RS1CU46JQ 613 0 0
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AATCGCAACGAACGCGGCTTTTAGCTGTGGAACCGTTAACAGTAACTTGGCAGCATGCAT
TGGCTACTTGACCCAAAATGTGCCCCTCCCCAGAGGTTGCTGCACCGGCGTTACTAATTT
GAACAACATGGCCCGTACAACCCCTGACCGTCAGCAAGCTTGTCGTTGCCTTGTTGGAGC
CGCTAACTCCTTCCCTAGTCTCAACGCTGCCCGTGCTTCTGGGCTTCCTAAGGCATGTGG
AGTCAATATTCCTTACAAAATCAGCAAAAGCACCAACTGCAACACCGTTAGATGAGCGGC
GACCGGATGAAGAAACTCAAGCGGACGTACGAATCTAATATAATGTATGAGAGAGTACTA
AATAAAATGTTTGAATGGTTGTTTTTCTGGTGTTCTAAAATTTCATGTTTTCTCTTCTGT
TGTGTCGTTCTTTTACTTTGGTCGTATGTACTATTTTCGTAGTCCACGTACGTTATATGA
AGTTTCAGATCCA

QA 1 613 1 613
DS 

RD RS1CU46TF 622 0 0
GGACTCATCACTACACACTTCTCATTTTGCAAACAATCAATAGCCCCTACAACTAAGAAA
AATGGCTGGTCTAATGAAGTTGGCATGCTTGGTCTTGGCCTGCATGATTGTGGCTGGTCC
AATCGCAACGAACGCGGCTCTTAGCTGTGGAACCGTTAACAGTAACTTGGCAGCATGCAT
TGGCTACTTGACCCAAAATGTGCCCCTCCCCAGAGGTTGCTGCACCGGCGTTACTAATCT
GAACAACATGGCCCGTACAACCCCTGACCGTCAGCAAGCTTGTCGTTGCCTTGTTGGAGC
CGCTAACTCCTTCCCTAGTCTCAACGCTGCCCGTGCTTCTGGGCTTCCTAAGGCATGTGG
AGTCAATATTCCTTACAAAATCAGCAAAAGCACCAACTGCAACACCGTTAGATGAGCGGC
GACCGGATGAAGAAACTCAAGCGGACGTACGAATCTAATATAATGTATGAGAGAGTACTA
AATAAAATGTTTGAATGGTTGTTTTTCTGGTGTTCTAAAATTTCATGTTTTCTCTTCTGT
TGTGTCGTTCTTTTACTTTGGTCGTATGTACTATTTTCGTAGTCCACGTACGTTATATGA
AGTTTCAGATCCAGGGTTTGCG

QA 1 622 1 622
DS 

RD RS1B475TF 527 0 0
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TAACAGTAACTTGGCAGCATGCATTGGCTACTTGACCCAAAATGTGCCCCTCCCCAGAGG
TTGCTGCACCGGCGTTACTAATCTGAACAACATGGCCCGTACAACCCCTGACCGTCAGCA
AGCTTGTCGTTGCCTTGTTGGAGCCGCTAACTCCTTCCCTAGTCTCAACGCTGTCCGTGC
TTCTGGGCTTCCTAAGGCATGTGGAGTCAATATTCCTTACAAAATCAGCAAAAGCACCAA
CTGCAACACCGTTAGATGAGCGGCGACCGGATGAAGAAACTCAAGCGGACGTACGAATCT
AATATAATGTATGAGAGAGTACTAAATAAAATGTTTGAATGGTTGTTTTTCTGGTGTTCT
AAAATTTCATGTTTTCTCTTCTGTTGTGTCGTTCTTTTACTTTGGTCGTATGTACTATTT
TCGTAGTCCACGTACGTTATATGAAGTTTCAGATCCAGGGTTTGCGT

QA 1 527 1 527
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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ATCACTGGCTCGCCTGTGTTATACATCACATATATCATATAATGCTCTGTTTCATAGTCT
AAAAACAAAACTAGGGGTTTAGGTTCATCAAAGACTTTGAAACAAAAGATGAAATCAATC
ATCATTATATCCAAGGCTAGTAAAAACAACATGATAAACCTTCTTTGAAGGACAGCACCA
CCAGAATGTTTACCAACTTGGGGCTTGTTTTTGCCCGCATTTCTTACATGAAATCATCTT
CGAGTTCTTGAATAGACTTGTTGCTTGAAGCAATGTCTTTGTTGGACGTCATTTTATCAA
TTACCATTAACCCCTTGTAACTCCTCATATCTGCTTGCCTCTCCTTCTCAAGCCTCTCAA
TATCTTCACGTTTCTTCTTCTCCCTCAGGTGTTGTTTCCTCTCAGCTCTTTCCGCAGCAT
TCACTGCTTCTCTCTCGGCTCTCAGATCAGGGGTTCTCTCAACTTTCGTTTTGTTCAACC
TGTTAATTATCTCATTGACTCGCTTCTCCACTCTGATAGTCCGAACCATCTTAGAATTGT
GGAAGCCAACTTGACCAACATCCATAGAGGCAGTCTTCTTCAAGTTGGACCACGGAGTGT
ACACAACATCAACGTTGTTGACCTTGTTGCCTTGAATGGAATTAGCTTTCACAAGCTGAG
CACAATCCTCCAGCACACCTTCGCTTATGTCATCAAAGCCTTGGCCTTTGTGAAGCCTCA
AGTAAACGTGAGCTGACGACATTTTATCAACGTGAAACCAGACGTCTTCGGGGAAGCCGT
ACTTGATGAGCTCCTCGTTCTCGAACTTATCGAGCCCCATGAAGATGGTGTAGTCCCCAG
CATCTGGTCTGCCTTGAAGTAGAGCACCATAATCGCTCCGATTCGAGAAGCGAACCAAAT
CGAAAATCTAGGGTTTCCCCCTCTCTCTCTCTCACTTCTCTATCTCTCCTCTCCCTCTCT
TCCCTACAAGTTTCGACGATGAAGAAAGAAATGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DN49JQ U 1
AF RS1BR24TF C 403
BS 1 472 RS1DN49JQ
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RD RS1DN49JQ 667 0 0
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ATCACTGGCTCGCCTGTGTTATACATCACATATATCATATAATGCTCTGTTTCATAGTCT
AAAAACAAAACTAGGGGTTTAGGTTCATCAAAGACTTTGAAACAAAAGATGAAATCAATC
ATCATTATATCCAAGGCTAGTAAAAACAACATGATAAACCTTCTTTGAAGGACAGCACCA
CCAGAATGTTTACCAACTTGGGGCTTGTTTTTGCCCGCATTTCTTACATGAAATCATCTT
CGAGTTCTTGAATAGACTTGTTGCTTGAAGCAATGTCTTTGTTGGACGTCATTTTATCAA
TTACCATTAACCCCTTGTAACTCCTCATATCTGCTTGCCTCTCCTTCTCAAGCCTCTCAA
TATCTTCACGTTTCTTCTTCTCCCTCAGGTGTTGTTTCCTCTCAGCTCTTTCTGCAGCAT
TCACTGCTTCTCTCTCGGCTCTCAGATCAGGGGTTCTCTCAACTTTTGTTTTGTTCAATC
TGTTAATTATTTCATTGACTCGCTTCTCCACTCTGATAGTCCGGACCATCTTTGAATTGT
GGAAGCCAACTTGACCAACATCCATAGAGGCAGTCTTCTTCAAGTTGGACCACGGAGTGT
ACACAAC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RS1BR24TF 655 0 0
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CAGCTCTTTCCGCAGCATTCACTGCTTCTCTCTCGGCTCTCAGATCAGGGGTTCTCTCAA
CTTTCGTTTTGTTCAACCTGTTAATTATCTCATTGGCTCGCTTCTCCACTCTGATAGTCC
GAACCATCTTAGAATTGTGGAAGCCAACTTGACCAACATCCATAGAGGCAGTCTTCTTCA
AGTTGGACCACGGAGTGTACACAACATCAACGTTGTTGACCTTGTTGCCTTGAATGGAAT
TAGCTTTCACAAGCTGAGCACAATCCTCCAGCACACCTTCGCTTATGTCATCAAAGCCTT
GGCCTTTGTGAAGCCTCAAGTAAACGTGAGCTGACGACATTTTATCAACGTGAAACCAGA
CGTCTTCGGGGAAGCCGTACTTGATGAGCTCCTCGTTCTCGAACTTATCGAGCCCCATGA
AGATGGTGTAGTCCCCAGCATCTGGTCTGCCTTGAAGTAGAGCACCATAATCGCTCCGAT
TCGAGAAGCGAACCAAATCGAAAATCTAGGGTTTCCCCCTCTCTCTCTCTCACTTCTCTA
TCTCTCCTCTCCCTCTCTTCCCTACAAGTTTCGACGATGAAGAAAGAAATGGTCC

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 2

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TCTCTCGACTTCCCAGAGAAAGAAAAAAGATGTGGTTTTTCGGATCGAAAGGAGCATCTG
GATTCTCGGCTCGTTCCACAGCAGAAGAAGTCACACATGGTGTCGACGGAACTGGCCTCA
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TGCGTGGTGTGCACGTTGTCATGGCGGTGAGGAACACTGGCTCTGGTGCTAAAGTCAAAG
AAGATATCGTCAACCGTGTCCCTGGAGCTAAACTAGATGTCATGGAGTTAGATCTCAGCT
CTATGGACTCTGTCAGGAAGTTCGCTTCTGATTACAAATCATCTGGTCGTCCACTCAACC
TCCTGATCAACAACGCTGGGATAATGGCATGTCCTTTTATGCTCTCTAAGGACAACATCG
AGCTGCAATTCGCGACCAACCATTTAGGTCATTTTCTGTTGACAAAGCTTCTGCTTGATA
CAATGAAGAACACATCACGCGAGAGCAAGAGGGAAGGCAGGATTGTGAATCTATCATCAG
AAGCTCATCGGTTCTCGTATCCACAAGGAGTCCGCTTTGATAAGATCAACGACCAGTCAA
GTTACAGTAGTATGCGAGCTTATGGACAGTCTAAACTCTGCAATGTATTGCACGCCAACG
AGCTTGCAAAGCAACTGAAGGAAGATGGAGTCAATATAACAGCAAACTCACTTCATCCAG
GAGCCATTATGACAAATCTTGGGCGCTACTTCAACGGCTATTTGGCTGGAGCTGTTGGTG
CAGTGGCTAAATATGTTCTCAAGACTGTTCCGCAGGGGGCCGCGACGACTTGCTACGTGG
CATTGAATCCTCAGGTTACAGGAGTTACAGGGGAATACTTCTTGGATAGCAACATTGCTA
AACCGTTATCACTTGCCAAAGATTCAGAGTTGGCCAAGAAGGTTTGGGAGTTCAGCACTA
AGCTTACCAAGACCCAGTCAGGAGAAAGTAGTTCTTGAAACTAGAATGTTTAGTGAATCT
TTACGTTGTGATTTCTATTTGAGTATTTACCAAAGTAAATAAAATGTAATAACAAATCTG
AATCATCTCAACTCTACAAAATGTTGGTTT


BQ
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AF RS1C162TF U 1
AF RS1C162JQ C 472
BS 1 729 RS1C162TF
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BS 731 739 RS1C162TF
BS 740 1170 RS1C162JQ

RD RS1C162TF 754 0 0
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TGCGTGGTGTGCACGTTGTCATGGCGGTGAGGAACACTGGCTCTGGTGCTAAAGTCAAAG
AAGATATCGTCAACCGTGTCCCTGGAGCTAAACTAGATGTCATGGAGTTAGATCTCAGCT
CTATGGACTCTGTCAGGAAGTTCGCTTCTGATTACAAATCATCTGGTCGTCCACTCAACC
TCCTGATCAACAACGCTGGGATAATGGCATGTCCTTTTATGCTCTCTAAGGACAACATCG
AGCTGCAATTCGCGACCAACCATTTAGGTCATTTTCTGTTGACAAAGCTTCTGCTTGATA
CAATGAAGAACACATCACGCGAGAGCAAGAGGGAAGGCAGGATTGTGAATCTATCATCAG
AAGCTCATCGGTTCTCGTATCCACAAGGAGTCCGCTTTGATAAGATCAACGACCAGTCAA
GTTACAGTAGTATGCGAGCTTATGGACAGTCTAAACTCTGCAATGTATTGCACGCCAACG
AGCTTGCAA*GCAACTGAA
GGAGATGGAGTCATA

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1C162JQ 699 0 0
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TGCTTGATACAATGAAGAACACATCACGCGAGAGCAAGAGGGAAGGCAGGATTGTGAATC
TATCATCAGAAGCTCATCGGTTCTCGTATCCACAAGGAGTCCGCTTTGATAAGATCAACG
ACCAGTCAAGTTACAGTAGTATGCGAGCTTATGGACAGTCTAAACTCTGCAATGTATTGC
ACGCCAACGAGCTTGCAAAGCAACTGAAGGAAGATGGAGTCAATATAACAGCAAACTCAC
TTCATCCAGGAGCCATTATGACAAATCTTGGGCGCTACTTCAACGGCTATTTGGCTGGAG
CTGTTGGTGCAGTGGCTAAATATGTTCTCAAGACTGTTCCGCAGGGGGCCGCGACGACTT
GCTACGTGGCATTGAATCCTCAGGTTACAGGAGTTACAGGGGAATACTTCTTGGATAGCA
ACATTGCTAAACCGTTATCACTTGCCAAAGATTCAGAGTTGGCCAAGAAGGTTTGGGAGT
TCAGCACTAAGCTTACCAAGACCCAGTCAGGAGAAAGTAGTTCTTGAAACTAGAATGTTT
AGTGAATCTTTACGTTGTGATTTCTATTTGAGTATTTACCAAAGTAAATAAAATGTAATA
ACAAATCTGAATCATCTCAACTCTACAAAATGTTGGTTT

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 3

CO CL3639Contig1 748 3 1 U
AAGATGAACCGTATGGAGACATATACTTGCAGAACAGAGGAAATATCTATCTCAACCACA
ACATGAACATCAACACACTGTAATTAATAATGATATGACTCAGGAGAATTACGCAAAAAC
CAAAACATATTTCAACCACAACATGAACATCAACACACTTCACAAAAGAAACATGAAAAA
AACCTGCAATTTTCTGCAGTTTGCAACACCACTCCCCAGCAAATCGGATAGCGAGAGGAA
GAAGAGAGAAGGTCTTGAACAGCATTCATGGTGGGCATAGCTGGAATAGCTCCTCTATTA
GCTTCTTCTCATCATTGAGAAGAGTGAGATCAGAAGCTAAGCTGTTCAATAGACCGCTCA
CAAATGCATCTCCTGCACCGGTTGTATCCACTGCTTTTACTTTTACTCCACCGACTTTAC
AACTCCTGAGTGTTGTATCTACAGCCATTAGTTTCTTATTGGAACTTGGAGGGAGTTTTA
CGACCACGGTGGTGACGGAGGAGGGAAGAAAGAGCATGGCGGAGGAGAAGCGATGAGATG
AAGCCCAAAGGAAGTCGGCGATGAGGCCGAAGGCTAAAAGGGCGAGGAATGAAGCGAACA
CAAGGCGCCCATAACTCTGCTTTCCCGCTGGCTTCACCATATCTCTCTCTGTCTTTCTCT
AAATTGCATCTCCCCAAAGGGTTTCACGAGCTTCAAGCAAAGGTTAAACCTTTGGATTCA
GTCGAAACGAAACACAATGGTGTTGGCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1FJ33JQ U 25
AF RS1AX61TF C 74
AF RS1AX61JQ U 1
BS 1 748 RS1AX61JQ

RD RS1FJ33JQ 448 0 0
G
CTTGCAGAACAGAGGAAATATCTATCTCAACCACAACATGAACATCAACACACTGTAATT
AATAATGATATGACTCAGGAGAATTACGCAAAAACCAAAACATATTTCAACCACAACATG
AACATCAACACACTTCACAAAAGAAACATGAAAAAAACCTGCAATTTTCTGCAGTTTGCA
ACACCACTCCCCAGCAAATCGGATAGCGAGAGGAAGAAAAAAGAAGGTCTTGAACAGCAT
TCATGGTGGGCATAGCTGGAATAGCTCCTCTCTTAGCTTCTTCTCATCATTGAGAAGAGT
GAGATCAGAAGCTAAGCTGTTCAATAGACCGCTCACAAATGCATCTCCTGCACCGGTTGT
ATCCACTGCTTTTACTTTTACTCCACCAACTTTACAACTCCTGAGTGTTGTATCTACAGC
CATTAGTTTCTT
CTGAAACAACAAGAA

QA 2 433 2 433
DS 

RD RS1AX61TF 495 0 0
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AACCACAACATGAACATCAACACACTTCACAAAAGAAACATGAAAAAAACC*GCAATTTT
CTGCAGTTTGCAACACCACTCCCCAGCAAATCGGATAGCGAGAGGAAGAAGAGAGAAGGT
CTTGAACAGCATTCATGGTGGGCATAGCTGGAATAGCTCCTCTATTAGCTTCTTCTCATC
ATTGAGAAGAGTGAGATCAGAAGCTAAGCTGTTCAATAGACCGCTCACAAATGCATCTCC
TGCACCGGTTGTATCCACTGCTTTTACTTTTACTCCACCGACTTTACAACTCCTGAGTGT
TGTATCTACAGCCATTAGTTTCTTATTGGAACTTGGAGGGAGTTTTACGACCACGGTGGT
GACGGAGGAGGGAAGAGAGAGCATGGCGGAGGAGAAGCGATGAGATGAAGCCCAAAGGAA
GTCGGCGATGAGGCC

QA 1 495 1 495
DS 

RD RS1AX61JQ 748 0 0
AAGATGAACCGTATGGAGACATATACTTGCAGAACAGAGGAAATATCTATCTCAACCACA
ACATGAACATCAACACACTGTAATTAATAATGATATGACTCAGGAGAATTACGCAAAAAC
CAAAACATATTTCAACCACAACATGAACATCAACACACTTCACAAAAGAAACATGAAAAA
AACCTGCAATTTTCTGCAGTTTGCAACACCACTCCCCAGCAAATCGGATAGCGAGAGGAA
GAAGAGAGAAGGTCTTGAACAGCATTCATGGTGGGCATAGCTGGAATAGCTCCTCTATTA
GCTTCTTCTCATCATTGAGAAGAGTGAGATCAGAAGCTAAGCTGTTCAATAGACCGCTCA
CAAATGCATCTCCTGCACCGGTTGTATCCACTGCTTTTACTTTTACTCCACCGACTTTAC
AACTCCTGAGTGTTGTATCTACAGCCATTAGTTTCTTATTGGAACTTGGAGGGAGTTTTA
CGACCACGGTGGTGACGGAGGAGGGAAGAAAGAGCATGGCGGAGGAGAAGCGATGAGATG
AAGCCCAAAGGAAGTCGGCGATGAGGCCGAAGGCTAAAAGGGCGAGGAATGAAGCGAACA
CAAGGCGCCCATAACTCTGCTTTCCCGCTGGCTTCACCATATCTCTCTCTGTCTTTCTCT
AAATTGCATCTCCCCAAAGGGTTTCACGAGCTTCAAGCAAAGGTTAAACCTTTGGATTCA
GTCGAAACGAAACACAATGGTGTTGGCC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL3640Contig1 1002 2 2 U
GGATTCTCTAATCGAATCTGAAAGCTTCTTAACATCTGCGTGAAATCGAATCGGAGAAGA
TGACTGACGAACACAAACACGACGAACCTGTAACCGTTTCTGAGCCAGCTGTCGAGATTG
TGGAGAGGGAATCGCTGATGGACAAAATATCGGAGAAGCTCCACCACGACGGTTCTTCGT
CGTCAGATGACGAAGACGACAAGAAGAAGAAGAACTCTCCAGAGAGCTCTCCGTCCTCGA
TGAAATCGAAAGTCTACCGCTTGTTCGGAAGAGAGAAGCCTGTCCACAAGGTCCTCGGCG
GCGGAAAACCGGCGGATATATTTATGTGGAAGAACAAGAAGGTGTCTGGTGGTGTACTCG
GTGGTGCTACAGCCGCTTGGGTTCTCTTTGAGTTGATGGAGTATCATCTCCTCACTCTCC
TCTGCCACGTCATGATTGTTGTGCTCGCTGTGTTGTTTCTCTGGTCTAATGCCACCGTGT
TTATTAACAAGTCTCCACCGAAGATTCCTGAAGTTCATATCCCTGAGGAGCCTATTCTCC
AGCTTGCGTCTGGGCTCAGGATCGAGATCAATAGAGGGTTCTCTTCTCTTCGTGAGATTG
CCTCTGGAAGGGATCTCAAGAAGTTTGTTACTGCTACGACAAGTACGAAGACAAAGTCGA
CCCGTTGGGTGAGAAAGCGATGATCGAGATCAAGAAGCAGTATGCAGTGTTGGACGAGAA
GGTGTTGAGCAAGATCCCCTTAGGCCCGTTGAAGAACAAGAAGAAAGATTAGGTTTACAT
TCGTCGATTAGAAAGAACGAACACGGTGTTGTGAAATGGTGTCGAAGCTATGTGTTAGAT
ATCTTTTAATATGTTATTTGGTTTTTTGTTAATTGTTGGTGAACGTGGAGGTGATACAGT
TAGTGTTGGTTGCTCTCTCTATATATGACCAAGAAGTTTAAGATACTTGAATGTTCAACA
TTGCAGTCTCGTGTTTTAAGATTGTTAATTTCGTTTTGATAC


BQ
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AF RS1E627TF U 1
AF RS1E627JQ C 151
BS 1 349 RS1E627TF
BS 350 1002 RS1E627JQ

RD RS1E627TF 349 0 0
GGATTCTCTAATCGAATCTGAAAGCTTCTTAACATCTGCGTGAAATCGAATCGGAGAAGA
TGACTGACGAACACAAACACGACGAACCTGTAACCGTTTCTGAGCCAGCTGTCGAGATTG
TGGAGAGGGAATCGCTGATGGACAAAATATCGGAGAAGCTCCACCACGACGGTTCTTCGT
CGTCAGATGACGAAGACGACAAGAAGAAGAAGAACTCTCCAGAGAGCTCTCCGTCCTCGA
TGAAATCGAAAGTCTACCGCTTGTTCGGAAGAGAGAAGCCTGTCCACAAGGTCCTCGGCG
GCGGAAAACCGGCGGATATATTTATGTGGAAGAACAAGAAGGTGTCTGG

QA 1 349 1 349
DS 

RD RS1E627JQ 852 0 0
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AGAACTCTCCAGAGAGCTCTC*GTCCTCGATGAAATCGAAAGTCTACCGCTTGTTCGGAA
GAGAGAAGCCTGTCCACAAGGTCCTCGGCGGCGGAAAACCGGCGGATATATTTATGTGGA
AGAACAAGAAGGTGTCTGGTGGTGTACTCGGTGGTGCTACAGCCGCTTGGGTTCTCTTTG
AGTTGATGGAGTATCATCTCCTCACTCTCCTCTGCCACGTCATGATTGTTGTGCTCGCTG
TGTTGTTTCTCTGGTCTAATGCCACCGTGTTTATTAACAAGTCTCCACCGAAGATTCCTG
AAGTTCATATCCCTGAGGAGCCTATTCTCCAGCTTGCGTCTGGGCTCAGGATCGAGATCA
ATAGAGGGTTCTCTTCTCTTCGTGAGATTGCCTCTGGAAGGGATCTCAAGAAGTTTGTTA
CTGCTACGACAAGTACGAAGACAAAGTCGACCCGTTGGGTGAGAAAGCGATGATCGAGAT
CAAGAAGCAGTATGCAGTGTTGGACGAGAAGGTGTTGAGCAAGATCCCCTTAGGCCCGTT
GAAGAACAAGAAGAAAGATTAGGTTTACATTCGTCGATTAGAAAGAACGAACACGGTGTT
GTGAAATGGTGTCGAAGCTATGTGTTAGATATCTTTTAATATGTTATTTGGTTTTTTGTT
AATTGTTGGTGAACGTGGAGGTGATACAGTTAGTGTTGGTTGCTCTCTCTATATATGACC
AAGAAGTTTAAGATACTTGAATGTTCAACATTGCAGTCTCGTGTTTTAAGATTGTTAATT
TCGTTTTGATAC

QA 1 852 1 852
DS 



AS 1 3

CO CL3641Contig1 789 3 10 U
GGGGAGTCCACTCGAAGAAGCCTTTATAATAAGGAATCTATCGCAATTTAGGAAACTCTT
ATGTAGTAGGTGGTGGTGTCAATCATCTTCTTCTTCTTCTAGGGTTCTTATTTAGCTATG
AAGCTCCTCTGCATCTCTTCTTCTTCCCCGCCAAAATGTATCTTTTAATTCGCGAAAACT
AGGGTTTTTTTTTGTTCCTCTTTTCTCGCTTGATTTTATTGCAATTTTGTAACATTTTGG
GGGAGATGAAGAAGATCTTCGTAGGTCCAGGAACTGTGTGTGGTCTGCTACTGAGAATCG
GACAATGTGCTTCTTCTGCTGCTTCCATCGGCTTTATGGTCTCTGCCACCGACTTCTCTG
GTCGCACTGCTTTCTGCTACTTGATTGCTTCGATGGGTCTTCAATTGCTGTGGAGCTTTG
CCCTCGCGTGTCTTGATGTTTATGCTCTGAGGACCAAGAAAGATCTCCAAAACCCAATCT
TGGTCAGCTTATTCGTCGTTGGTGATTGGGTGACTGCAATGTTATCTCTTGCAGCTGCGT
GTTCATCGGCAGGAGTTGTGGTCTTATACGCCAAAGATCTCAAGTATTGTGATGTACACA
CCCAGCTTTCATGTCTTAGGTATGAAGTCGCTGTGGCGCTTTCTTTCGTTACTCGGGTTC
AGATTGCCCTTTCTTCTCATGTCACGTTTTGGATCTTAGCCTCGGTTTAGTTTCTTTAAA
TGTTGCAATTGACTTTGTTAACACAATGACATTTTGCTTCAAATCGAATTCATCAATGTT
TCTTAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1AL19JQ C 298
AF RS1AL06TF U 1
AF RS1AL19TF U 194
BS 1 287 RS1AL06TF
BS 288 288 RS1AL19TF
BS 289 599 RS1AL06TF
BS 600 600 RS1AL19TF
BS 601 653 RS1AL06TF
BS 654 654 RS1AL19TF
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BS 764 787 RS1AL06TF
BS 788 789 RS1AL19TF

RD RS1AL19JQ 444 0 0
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CTGGTCGCACTGCTTTCTGCTACTTGATTGCTTCGATGGGTCTTCAATTGCTGTGGAGCT
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TCTTGGTCAGCTTATTCGTCGTTGGTGATTGGGTGACTGCAATGTTATCTCTTGCAGCTG
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AAATGTTGCAATTGACTTTGTTAA

QA 1 444 1 444
DS 

RD RS1AL06TF 787 0 0
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ATGTAGTAGGTGGTGGTGTCAATCATCTTCTTCTTCTTCTAGGGTTCTTATTTAGCTATG
AAGCTCCTCTGCATCTCTTCTTCTTCCCCGCCAAAATGTATCTTTTAATTCGCGAAAACT
AGGGTTTTTTTTTGTTCCTCTTTTCTCGCTTGATTTTATTGCAATTTTGTAACATTTTGG
GGGAGATGAAGAAGATCTTCGTAGGTCCAGGAACTGTGTGTGGTCTGTTACTGAGAATCG
GACAATGTGCTTCTTCTGCTGCTTCCATCGGCTTTATGGTCTCTGCCACCGACTTCTCTG
GTCGCACTGCTTTCTGCTACTTGATTGCTTCGATGGGTCTTCAATTGCTGTGGAGCTTTG
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TGGTCAGCTTATTCGTCGTTGGTGATTGGGTGACTGCAATGTTATCTCTTGCAGCTGCGT
GTTCATCGGCAGGAGTTGTGGTCTTATACGCCAAAGATCTCAAGTATTGTGATGTACACG
CCCAGCTTTCATGTCTTAGGTATGAAGTCGCTGTGGCGCTTTCTTTCGTTACTTGGGTTC
AGATTGCCCTTTCTTCTCATGTCACGTTTTGGATCTTAGCCTCGGTTTAGTTTCTTTAAA
TGTTGCAATTGACTTTGTTAACACAATGACATTTTGCTTCAA*TCGAATTCATCAATGTT
TCTTAAG

QA 1 787 1 787
DS 

RD RS1AL19TF 596 0 0
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GATCTTCGTAGGTCCAGGAACTGTGTGTGGTCTGCTACTGAGAATCGGACAATGTGCTTC
TTCTGCTGCTTCCATCGGCTTTATGGTCTCTGCCACCGACTTCTCTGGTCGCACTGCTTT
CTGCTACTTGATTGCTTCGATGGGTCTTCAATTGCTGTGGAGCTTTGCCCTCGCGTGTCT
TGATGTTTATGCTCTGAGGACCAAGAAAGATCTCCAAAACCCAATCTTGGTCAGCTTATT
CGTCGTTGGTGATTGGGTGACTGCAATGTTATCTCTTGCAGCTGCGTGTTCATCGGCAGG
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TCTTAGGTATGAAGTCGCTGTGGCGCTTTCTTTCGTTACTCGGGTTCAGATTGCCCTTTC
TTCTCATGTCACGTTTTGGATCTTAGCCTCGGTTTAGTTTCTTTAAATGTTGCAATTGAC
TTTGTTAACACAATGACATTTTGCTTCAAATCGAATTCATCAATGTTTCTTAAGCC

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 2

CO CL3642Contig1 884 2 4 U
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ATCGGGACCATTTACTCGGTCACGGTGCCTGTTAGGAGGGTGAAAGCAGAGTACCAAGAC
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CAGGTTCGTGACACTCTCATTGTATATATATGCGAGTTCTCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FR35TF U 1
AF RS1FR35JQ C 172
BS 1 728 RS1FR35TF
BS 729 729 RS1FR35JQ
BS 730 785 RS1FR35TF
BS 786 884 RS1FR35JQ

RD RS1FR35TF 785 0 0
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GATTTCGTGGAGATTGAGTCGGAGGAGAAAGTTCAGCTTAACGTCTCCACGGACGGTGAC
ATCGGGACCATTTACTCGGTCACGGTGCCTGTTAGGAGGGTGAAAGCAGAGTACCAAGAC
GTGGACGAAGCTGGATCGATAACCAACGTGGAGTACAAAGATACAGTTGATGGTTCCGTG
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TTATT

QA 1 785 1 785
DS 

RD RS1FR35JQ 713 0 0
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ATCAACATGAGCTTTTTTGACCGGTTAAACCTAGCGTGGAAGATAGTCCTCCCTTCCCAC
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GGTTCCGTGGATGTCAGGTTCGATTTTTATGTTCCAGAGTGATAACTAGGCATTGTCTTA
TTATTAGAGTTATTTTCTTGAACTATGTCTTTGTTTGTTTGTTTTCGTGTTGAAGTTTTA
GTACTAAGACAGGTTCGTGACACTCTCATTGTATATATATGCGAGTTCTCTCT

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 3

CO CL3643Contig1 1248 3 8 U
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TGTTTGTTGTTGATCATCTTCCCTTCACTGTCTGTAACTGTCTTTTTTTTTCTTACATGC
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ATGGAGCAGAACCTGTGTTGTTCAATGTTCTCAGTTTACCTATGCGTCAGGGTGAGAAGC
CATGTCCATTTTACCTGCGAACGGGAACATGCAGATTCGGAGTTCCTTGCAGATTCCACC
ATCCTCAACCTGATAATGGAGGACATTCTACTGCTGCATATGGGACGTCTAGTTTTCCTT
CTGCAGGTGGATTAACAATGATGTCTGCATATGGAGCTTTGACTCGTCCACAACTTCCTC
AGTCCTATGTTCCTTTCATGGTGTCACCCTCTCAAGGCCTTTTGGCTCCTCAAAGCTGGG
CCACTTACATGGGACAACCAGCTTGTGGTAACGTCAAGTCTTATGGATTCTGCAAGTTTG
GACCAAACTGCAACTTGGACCATTCAGTGCTGCCATACCCAGGCTTTACCATGCCTTATG
TTTCACCTGTTTTATCAAATTATCAGAGGATCACACCATCTCCAAGCCGCTCTGGTTCAA
AGACCAACGACAAACCTGATGTTAAGAAAGACATGTTGAGACTTAGAAACCAGACGATGA
TTCTAAACGATTAACTCCCAAATGAAGAAATGATCGTCATCACCATGATCACATTCACAG
CTTTCAAAGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCCCATTTTTTGTTAGC
TTTTGTGGGAAGATGAGTGGAGGTGGAAGTATTTCTCTCTTTTGTATGGAAACAATATAG
GACTCTCCTGTTTTCGTTTGTTTTGACTCTGTTAATAAAATTTACATG


BQ
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AF RS1F889TF U 1
AF RS1EA53TF U 297
AF RS1EA53JQ C 452
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AGTCCTATGTTC*TTTCATGGTGTCACCCTCTCAAGGCC

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DS 

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G
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TTCTGAAGACAGGAGCTTGTAAGTATGGTTCAACTTGTAAATACCATCACCCAAAGGACA
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AGCCATGTCCATTTTACCTGCGAACGGGAACATGCAGATTCGGAGTTCCTTGCAGATTCC
ACCATCCTCAACCTGATAATGGAGGACATTCTACTGCTGCATATGGGACGTCTAGTTTTC
CTTCTGCAGGTGGATTAACAATGATGTCTGCATATGGAGCTTTGACTCGTCCACAACTTC
CTCAGTCCTATGTTCCTTTCATGGTGTCACCCTC

QA 2 455 2 455
DS 

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CAGATTCGGAGTTCCTTGCAGATTCCACCATCCTCAACCTGATAATGGAGGACATTCTAC
TGCTGCATATGGGACGTCTAGTTTTCCTTCTGCAGGTGGATTAACAATGATGTCTGCATA
TGGAGCTTTGACTCGTCCACAACTTCCTCAGTCCTATGTTCCTTTCATGGTGTCACCCTC
TCAAGGCCTTTTGGCTCCTCAAAGCTGGGCCACTTACATGGGACAACCAGCTTGTGGTAA
CGTCAAGTCTTATGGATTCTGCAAGTTTGGACCAAACTGCAACTTGGACCATTCAGTGCT
GCCATACCCAGGCTTTACCATGCCTTATGTTTCACCTGTTTTATCAAATTATCAGAGGAT
CACACCATCTCCAAGCCGCTCTGGTTCAAAGACCAACGACAAACCTGATGTTAAGAAAGA
CATGTTGAGACTTAGAAACCAGACGATGATTCTAAACGATTAACTCCCAAATGAAGAAAT
GATCGTCATCACCATGATCACATTCACAGCTTTCAAAGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCTCTGCCCATTTTTTGTTAGCTTTTGTGGGAAGATGAGTGGAGGTGGAAGTA
TTTCTCTCTTTTGTATGGAAACAATATAGGACTCTCCTGTTTTCGTTTGTTTTGACTCTG
TTAATAAAATTTACATG

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 3

CO CL3644Contig1 948 3 19 U
GGCCGATCACTTGTACCGTATGGACTACGAGAAGTTCATTCAAGCGCATCGTGAGACCGA
CGCTGATATCACTGTTGCTGCTCTTCCTATGGATGAGAAGCGAGCTACGGCTTTTGGATT
GATGAAGATTGATGACGAAGGAAGGATCATTGAGTTTGCTGAGAAGCCTAAAGGAGAGCA
GTTAAAGGCTATGAAGGTTGATACAACAATCTTGGGACTTGATGACGAAAGAGCCAAAGA
GATGCCTTTTATTGCTAGTATGGGAATATATGTTGTTAGCAAGAATGCGATGTTGGACTT
GCTTAGAGACCAGTTCCCTGGAGCTAATGACTTTGGGAGTGAAGTTATCCCTGGTGCTAC
TGATCTCGGACTGAGAGTGCAAGCTTATCTGTATGATGGATACTGGGAAGACATTGGTAC
CATTGAAGCGTTTTACAATGCGAATCTTGGGATCACCAAGAAACCAGTACCAGATTTCAG
CTTCTACGACCGTTCAGCACCAATCTACACACAGCCTCGGTACTTACCTCCATCCAAGAT
GCTTGATGCTGATGTTACCGACAGTGTGATCGGTGAAGGTTGTGTCATCAAGAATTGCAA
AATCCACCATTCCGTGATTGGTCTTCGGTCTTGCATATCGGAGGGTGCTATAATAGAAGA
CACCTTGTTGATGGGTGCAGACTACTACGAGACTGATGCGGATAGGAGACTCCTGGCTGC
AAAAGGCAGCATTCCGATTGGCATTGGCCGAGACTCACACATTAAAAGAGCTATCATTGA
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TGCCAGAGAGACGGATGGATACTTCATCAAGAGCGGCATTGTTACGGTGATCAAGGATGC
TCTCATTCCTAGTGGAACTGTTATTTAAGAGACACCACCCCCTTTGAC


BQ
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20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C639TF U 1
AF RS1GZ38TF U 129
AF RS1C639JQ C 482
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BS 871 879 RS1GZ38TF
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GTTAAAGGCTATGAAGGTTGATACAACAATCTTGGGACTTGATGACGAAAGAGCCAAAGA
GATGCCTTTTATTGCTAGTATGGGAATATATGTTGTTAGCAAGAATGTGATGTTGGACTT
GCTTAGAGACCAGTTCCCTGGAGCTAATGACTTTGGGAGTGAAGTTATCCCTGGTGCTAC
TGATCTCGGACTGAGAGTGCAAGCTTATCTGTATGATGGGTATTGGGAAGACATTGGTAC
CATTGAGGCGTTTTACAATGCGAATCTTGGGATCACCAAGAAACCAGTACCAGATTTCAG
CTTCTACGACCGTTCAGCACCAATCTACACACAGCCTCGGTACTTACCTCCATCCAAGAT
GCTTGATGCTGATGTTACCGACAGTGTGATCGGTGAAGGTTGTGTCATCAAGAATTGCAA
AATCCACCATTCCGTGATTGGTCTTCGGTCTTGCATATCGGAGGGTGCTATAATAGAAGA
CACCTTGTTGATGGGTGCAGACTACTACGAGACTGATGCGGATAGGAGACTCCTGGCTGC
AAAAG*CAGCATTCCGATTGGCATTGGCCGAGACTCACACATTAAAAGAGCTATCATTGA
CA

QA 1 782 1 782
DS 

RD RS1GZ38TF 753 0 0
G
TGATGACGAAGGAAGGATCATTGAGTTTGCTGAGAAGCCTAAAGGAGAGCAGTTAAAGGC
TATGAAGGTTGATACAACAATCTTGGGACTTGATGACGAAAGAGCCAAAGAGATGCCTTT
TATTGCTAGTATGGGAATATATGTTGTTAGCAAGAATGCGATGTTGGACTTGCTTAGAGA
CCAGTTCCCTGGAGCTAATGACTTTGGGAGTGAAGTTATCCCTGGTGCTACTGATCTCGG
ACTGAGAGTGCAAGCTTATCTGTATGATGGATACTGGGAAGACATTGGTACCATTGAAGC
GTTTTACAATGCTAATCTTGGGATCACCAAGAAACCAGTACCAGATTTCAGCTTCTACGA
CCGTTCAGCACCAATCTACACACAGCCTCGGTACTTACCTCCATCCAAGATGCTTGATGC
TGATGTTACCGACAGTGTGATCGGTGAAGGTTGTGTCATCAAGAATTGCAAAATCCACCA
TTCCGTGATTGGTCTTCGGTCTTGCATATCGGAGGGTGCTATAATAGAAGACACCTTGTT
GATGGGTGCAGACTACTACGAGACTGATGCGGATAGGACACTCCTGGCTGCAAAAGGCAG
CATTCCGATTGGCATTGGCCGAGACTCACACATTAAAAGAGCTATCATTGACAAGAATGC
TCGTATTGGTGACAACGTCAAGATCATCAACACGGACAATGTGCA*GAAGCTGCTAGAGA
GACGGATGGATACTTCATCA*GAGCGGCAT
GT

QA 2 751 2 751
DS 

RD RS1C639JQ 467 0 0
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CTTGATGCTGATGTTACCGACAGTGTGATCGGTGAAGGTTGTGTCATCAAGAATTGCAAA
ATCCACCATTCCGTGATTGGTCTTCGGTCTTGCATATCGGAGGGTGCTATAATAGAAGAC
ACCTTGTTGATGGGTGCAGACTATTACGAGACTGATGCGGATAGGAGACTCCTGGCTGCA
AAAGGCAGCATTCCGATTGGCATTGGCCGAGACTCACACATTAAAAGAGCTATCATTGAC
AAGAATGCTCGTATTGGTGACAACGTCAAGATCATCAACACGGACAATGTGCAAGAAGCT
GCCAGAGAGACGGATGGATACTTCATCAAGAGCGGCATTGTTACGGTGATCAAGGATGCT
CTCATTCCTAGTGGAACTGTTATTTAAGAGACACCACCCCCTTTGAC

QA 1 467 1 467
DS 



AS 1 3

CO CL3645Contig1 487 3 1 U
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CGAAATGGCGAAGAGAACCAAGAAGGTCGGGATCGTCGGCAAGTACGGTACTCGTTATGG
AGCGAGTATCAGGAAGCAGATTAAGAAGATGGAGGTCAGCCAGCACAGCAAGTACTTCTG
CGAGTTCTGCGGCAAGTACGGTGTCAAGCGAAAGGCTGTTGGTATTTGGGGATGCAAGGA
CTGCGGCAAGGTCAAGGCCGGTGGTGCTTACACCATGAACACCGCTAGTGCCGTCACCGT
TAGAAGCACAATCAGGAGGTTGAGGGAACAGATCGAGGGTTAATTTGTCTCAGTCATAAT
TTTGCTTATTTGCTGTGACAATTGTGGTTTTCAAGTACTACTATGCTTTTCTGTTTTTGA
TTCAAGACAGTTGTTTACATTTAGCCGTGGATCAGTTATTCTGTGACAACTATGTTTTTG
CTCTGCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 10 

AF RS1ED41TF U 1
AF RS1EZ16JQ C 48
AF RS1EZ16TF U 1
BS 1 487 RS1ED41TF

RD RS1ED41TF 487 0 0
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AGCGAGTATCAGGAAGCAGATTAAGAAGATGGAGGTCAGCCAGCACAGCAAGTACTTCTG
CGAGTTCTGCGGCAAGTACGGTGTCAAGCGAAAGGCTGTTGGTATTTGGGGATGCAAGGA
CTGCGGCAAGGTCAAGGCCGGTGGTGCTTACACCATGAACACCGCTAGTGCCGTCACCGT
TAGAAGCACAATCAGGAGGTTGAGGGAACAGATCGAGGGTTAATTTGTCTCAGTCATAAT
TTTGCTTATTTGCTGTGACAATTGTGGTTTTCAAGTACTACTATGCTTTTCTGTTTTTGA
TTCAAGACAGTTGTTTACATTTAGCCGTGGATCAGTTATTCTGTGACAACTATGTTTTTG
CTCTGCT

QA 1 487 1 487
DS 

RD RS1EZ16JQ 440 0 0
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GCAAGTACTTTTGCGAGTTTTGCGGCAAGTACGGTGTCAAGCGAAAGGCTGTTGGTATTT
GGGGATGCAAGGACTGCGGCAAGGTCAAGGCCGGTGGTGCTTACACCATGAACACCGCTA
GTGCCGTCACCGTTAGAAGCACAATCAGGAGGTTGAGGGAACAGATCGAGGGTTAATTTG
TCTCAGTCATAATTTTGCTTATTTGCTGTGACAATTGTGGTTTTCAAGTACTACTATGCT
TTTCTGTTTTTGATTCAAGACAGTTGTTTACATTTAGCCGTGGATCAGTTATTCTGTGAC
AACTATGTTTTTGCTCTGC
C

QA 1 439 1 439
DS 

RD RS1EZ16TF 487 0 0
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CGAAATGGCGAAGAGAACCAAGAAGGTCGGGATCGTCGGCAAGTACGGTACTCGTTATGG
AGCGAGTATCAGGAAGCAGATTAAGAAGATGGAGGTCAGCCAGCACAGCAAGTACTTCTG
CGAGTTCTGCGGCAAGTACGGTGTCAAGCGAAAGGCTGTTGGTATTTGGGGATGCAAGGA
CTGCGGCAAGGTCAAGGCCGGTGGTGCTTACACCATGAACACCGCTAGTGCCGTCACCGT
TAGAAGCACAATCAGGAGGTTGAGGGAACAGATCGAGGGTTAATTTGTCTCAGTCATAAT
TTTGCTTATTTGCTGTGACAATTGTGGTTTTCAAGTACTACTATGCTTTTCTGTTTTTGA
TTCAAGACAGTTGTTTACATTTAGCCGTGGATCAGTTATTCTGTGACAACTATGTTTTTG
CTCTGC
C

QA 1 486 1 486
DS 



AS 1 3

CO CL3646Contig1 714 3 6 U
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AAAAAGTCGGGATTATTTATCTAAAAAAAGTCAATAGCTACGGTCTACCCATAAAAAGAG
CTACGTCTTGCCACAGCTCCACCATCAAAGCTTTAGCTCAACTACTGATTTGATCAGACA
TTTATGTTGCTCCATCAATATAAATCCATTATGTCCCCATTCTGCACCTTGTGAGTCATG
GAGCTCCCAACACTCAACTCCATTAATAACATCATAACCTGTCAACAAGAGACAGTGGAT
GGGAAACTTTTCAAAGTTCCTCATGTGACAATCCATCTCATGGGGACGATAAACTCCTTT
TCCATCTGTGTCATCATAAAAATACTTAAATCCTGGAAGGTATTCGACTGTCACTGGGAC
AGGTGATACTGCTAAAAGCTTTTTAATGAACCTCTCAAAATCTTCATGATCTGAAGCATC
ATCACCCCTAGGACGGCGGTGGACCTTCATTTTCTTCACATAGCTCTTCATAAAAGAAGA
AGCGTTCCTAATCCTGTTGATCCCTTCTCCAGATGCTTGATGGGCAGCATCAACACCGTT
AAGAAGAATATCAACGGTCAGATCATCTCCAGATTCACCAAATATTTTTTTTTTGTCTTT
GTCACTTCCCGGTTCAATGGGGATAATCTTTCCTACCATATCAGTTTCGAAGCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BB55JQ U 1
AF RS1CZ82JQ U 17
AF RS1EB33JQ U 12
BS 1 233 RS1BB55JQ
BS 234 234 RS1EB33JQ
BS 235 349 RS1BB55JQ
BS 350 350 RS1EB33JQ
BS 351 541 RS1BB55JQ
BS 542 714 RS1EB33JQ

RD RS1BB55JQ 541 0 0
GGAAGTTAAATAAGAACTTCGTTAAAGATTTAAGTTAAGAAAATCTTACAAAACCAAAAA
AAAAAGTCGGGATTATTTATCTAAAAAAAGTCAATAGCTACGGTCTACCCATAAAAAGAG
CTACGTCTTGCCACAGCTCCACCATCAAAGCTTTAGCTCAACTACTGATTTGATCAGACA
TTTATGTTGCTCCATCAATATAAATCCATTATGTCCCCATTCTGCACCTTGTGCGTCATG
GAGCTCCCAACACTCAACTCCATTAATAACATCATAACCTGTCAACAAGAGACAGTGGAT
GGGAAACTTTTCAAAGTTCCTCATGTGACAATCCATCTCATGGGGACGAAAAACTCCTTT
TCCATCTGTGTCATCATAAAAATACTTAAATCCTGGAAGGTATTCGACTGTCACTGGGAC
AGGTGATACTGCTAAAAGCTTTTTAATGAACCTCTCAAAATCTTCATGATCTGAAGCATC
ATCACCCCTAGGACGGCGGTGGACCTTCATTTTCTTCACATAGCTCTTCATAAAAGAAGA
A

QA 1 541 1 541
DS 

RD RS1CZ82JQ 586 0 0
CTTCGTTAAAGATTTAAGTTAAAAAAATCTTACAAAACCAAAAAAAAAAGTCGGGATTAT
TTATCTAAAAAAAGTCAATAGCTACGGTCTACCCATAAAAAGAGCTACGTCTTGCCACAG
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AATATAAATCCATTATGTCCCCATTCTGCACCTTGTGAGTCATGGAGCTCCCAACACTCA
ACTCCATTAATAACATCATAACCTGTCAACAAGAGACAGTGGATGGGAAACTTTTCAAAG
TTCCTCATGTGACAATCCATCTCATGGGGACGATAAACTCCTTTTCCATCTGTGTCATCA
TAAAAATACTTAAATCCTGGAAGGTATTCGACTGTCACTGGGACAGGTGATACTGCTAAA
AGCTTTTTAATGAACCTCTCAAAATCTTCATGATCTGAAGCATCATCACCCCTAGGACGG
CGGTGGACCTTCATTTTCTTCACATAGCTCTTCATAAAAGAAGAAGCGTTCCTAATCCTG
TTGATCCCTTCTCCAGATGCTTGATGGGCAGCATCAACACCGTTAA

QA 1 586 1 586
DS 

RD RS1EB33JQ 703 0 0
AAAAA
CTTCGTTAAAGATTTAAGTTAAGAAAATCTTACAAAGCCAAAAAAAAA*GTCGGGATTAT
TTATCTAAAAAAAGTCAATAGCTACGGTCTACCCATAAAAAGAGCTCCGTCTTGCCACAG
CTCCACCATCAAAGCTTTAGCTCAACTACTGATTTGATCAGACATTTATGTTGCTCCATC
AATATAAATCCATTATGTCCCCATTCTGCACCTTGTGAGTCATGGAGCTCCCAACACTCA
ACTCCATTAATAACATCATAACCTGTCAACAAGAGACAGTGGATGGGAAACTTTTCAAAG
TTCCTCATGTGACAATCCATCTCATGGGGACGATAAACTCCTTTTCCATCTGTGTCATCA
TAAAAATGCTTAAATCCTGGAAGGTATTCGACTGTCACTGGGTCAGGTGATACTGCTAAA
AGCTTTTTAATGAACCTCTCAAAATCTTCATGATCTGAAGCATCATCACCCCTAGGACGG
CGGTGGACCTTCATTTTCTTCACATAGCTCTTCATAAAAGAAGAAGCGTTCCTAATCCTG
TTGATCCCTTCTCCAGATGCTTGATGGGCAGCATCAACACCGTTAAGAAGAATATCAACG
GTCAGATCATCTCCAGATTCACCAAATATTTTTTTTTTGTCTTTGTCACTTCCCGGTTCA
ATGGGGATAATCTTTCCTACCATATCAGTTTCGAAGCA

QA 6 703 6 703
DS 



AS 1 2

CO CL3647Contig1 873 2 8 U
GGATCATAAGAACAAACTTTTCAAGGAGAGGAAAAGCTGCACAAAGTTTGATCGATTGAT
AGCCAAAAGTACTGAAAAAACAAACCCTTTGATCTTAGAGGAAGAGAAAAGATGTGGGCA
GCTTCGTGTCTCGCATCGTGCTGTGCTGCTTGTGCATGCGATGCTTGCCGTACTGTTGTC
TCTAGTATCAGCAGACGTTCCGCTAGGATTGCTTACTGTGGTCTCTTTGCACTTTCCTTA
ATCGTTTCATGGATTCTTCGTGAGGTTGCTGCTCCTCTCATGGAGAAGCTCCCTTGGATT
AACCATTTTCACAAGACACCTGATCGTAAATGGTTTGAGACAGATGCTGTCTTGCGTGTC
AGCTTAGGCAATTTCGTCTTTTTCTCGATTCTATCGGTTATGATGATTGGTGTCAAGACT
CAGAAAGACCCTCGTGATGGTATTCACCACGGTGGTTGGATGATGAAAGTTATCTCCTGG
TTCATTTTGGTTATCTTTATGTTCTTCCTTCCCAATGAAGTCATCAGCTTTTATGAGTCG
ATGTCAAAGTTTGGTGCTGGATTTTTTCTTCTTGTTCAAGTTGTGCTTCTTTTAGATTTC
GTTCATGGGTGGAATGACACATGGGTTGGCTACGACGAGCAGTTCTGGTATGCTGCGTTG
CTCGTTGTTTCTCTTGTATGTTACTTGGCAACGTTCGTCTTCTCTGGACTTCTCTTCCAC
TGGTTTACTCCATCTGGACATGATTGTGGGCTCACACTTTCTTCATTGTCATGACTCTGA
TATTTGTATTGTCTTTGCTGTTGTGGTTTGCATCCCGCTGTCGTGGAAGCATTTCGCCAG
CGTCAGTTTATCTTTCTACTGCATGTACCTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AX90TF U 1
AF RS1ER43TF U 4
BS 1 327 RS1AX90TF
BS 328 328 RS1ER43TF
BS 329 612 RS1AX90TF
BS 613 613 RS1ER43TF
BS 614 655 RS1AX90TF
BS 656 656 RS1ER43TF
BS 657 669 RS1AX90TF
BS 670 873 RS1ER43TF

RD RS1AX90TF 669 0 0
GGATCATAAGAACAAACTTTTCAAGGAGAGGAAAAGCTGCACAAAGTTTGATCGATTGAT
AGCCAAAAGTACTGAAAAAACAAACCCTTTGATCTTAGAGGAAGAGAAAAGATGTGGGCA
GCTTCGTGTCTCGCATCGTGCTGTGCTGCTTGTGCATGCGATGCTTGCCGTACTGTTGTC
TCTAGTATCAGCAGACGTTCCGCTAGGATTGCTTACTGTGGTCTCTTTGCACTTTCCTTA
ATCGTTTCATGGATTCTTCGTGAGGTTGCTGCTCCTCTCATGGAGAAGCTCCCTTGGATT
AACCATTTTCACAAGACACCTGATCGTGAATGGTTTGAGACAGATGCTGTCTTGCGTGTC
AGCTTAGGCAATTTCGTCTTTTTCTCGATTCTATCGGTTATGATGATTGGTGTCAAGACT
CAGAAAGACCCTCGTGATGGTATTCACCACGGTGGTTGGATGATGAAAGTTATCTCCTGG
TTCATTTTGGTTATCTTTATGTTCTTCCTTCCCAATGAAGTCATCAGCTTTTATGAGTCG
ATGTCAAAGTTTGGTGCTGGATTTTTTCTTCTTGTTCAAGTTGTGCTTCTTTTAGATTTC
GTTCATGGGTGGGATGACACATGGGTTGGCTACGACGAGCAGTTCTGGTATGCTGTGTTG
CTCGTTGTT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RS1ER43TF 870 0 0
GGG
TAAGAACAAACTTTTCAAGGAGAGGAAAAGCTGCACAAAGTTTGATCGATTGATAGCCAA
AAGTACTGAAAAAACAAACCCTTTGATCTTAGAGGAAGAGAAAAGATGTGGGCAGCTTCG
TGTCTCGCATCGTGCTGTGCTGCTTGTGCATGCGATGCTTGCCGTACTGTTGTCTCTAGT
ATCAGCAGACGTTCCGCTAGGATTGCTTACTGTGGTCTCTTTGCACTTTCCTTAATCGTT
TCATGGATTCTTCGTGAGGTTGCTGCTCCTCTCATGGAGAAGCTCCCTTGGATTAACCAT
TTTCACAAGACACCTGATCGTAAATGGTTTGAGACAGATGCTGTCTTGCGTGTCAGCTTA
GGCAATTTCGTCTTTTTCTCGATTCT*TCGGTTATGATGATTGGTGTCAAGACTCAGAAA
GACCCTCGTGATGGTATTCACCACGGTGGTTGGATGATGAAAGTTATCTCCTGGTTCATT
TTGGTTATCTTTATGTTCTTCCTTCCCAATGAAGTCATCAGCTTTTATGAGTCGATGTCA
AAGTTTGGTGCTGGATTTTTTCTTCTTGTTCAAGTTGTGCTTCTTTTAGATTTCGTTCAT
GGTTGGAATGACACATGGGTTGGCTACGACGAGCAGTTCTGGTATGCTGCGTTGCTCGTT
GTTTCTCTTGTATGTTACTTGGCAACGTTCGTCTTCTCTGGACTTCTCTTCCACTGGTTT
ACTCCATCTGGACATGATTGTGGGCTCACACTTTCTTCATTGTCATGACTCTGATATTTG
TATTGTCTTTGCTGTTGTGGTTTGCATCCCGCTGTCGTGGAAGCATTTCGCCAGCGTCAG
TTTATCTTTCTACTGCATGTACCTCTG

QA 4 870 4 870
DS 



AS 1 3

CO CL3648Contig1 478 3 1 U
GGATCCACTTATCGTTTAAAACCTTCATCAAGACAAAAAACAACTTCTAGAGAAAATGTC
TTGCTGCGGAGGAAACTGTGGTTGCGGAGCTGGCTGCAAGTGCGTTGGTTGCGGAGGTTG
CAAAATGTACCCAGACTTGGGTTTCTCCGGCGAGATGACCACCACCGAGACTGTTGTCCT
CGGCGTTGCTCCGGCGATGAACTCTCAGTACGAGGCTTCCGGTGAGACTTTCGTCTCCGA
GAACGATGCCTGCAAATGTGGATCTGACTGCAAGTGCAACCCTTGCACCTGCAAATGAAG
AATCATATAAAACCCTAAGAGTCTGGATGTTGTGTAATAATGGCTCTGATTTCTCCGGTT
GTTTTGCCGGCGACATGAGTCTTGTTCTTCTGTGTGTGTGTTTATGGTTTGGTCATAAGA
TATCTCTGTAAGTTGTATCTCTGTGACTATATATATAAACCAAAATTATTATGGGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RS1E013TF U 1
AF RS1AV59JQ C 65
AF RS1AV59TF U 65
BS 1 478 RS1E013TF

RD RS1E013TF 478 0 0
GGATCCACTTATCGTTTAAAACCTTCATCAAGACAAAAAACAACTTCTAGAGAAAATGTC
TTGCTGCGGAGGAAACTGTGGTTGCGGAGCTGGCTGCAAGTGCGTTGGTTGCGGAGGTTG
CAAAATGTACCCAGACTTGGGTTTCTCCGGCGAGATGACCACCACCGAGACTGTTGTCCT
CGGCGTTGCTCCGGCGATGAACTCTCAGTACGAGGCTTCCGGTGAGACTTTCGTCTCCGA
GAACGATGCCTGCAAATGTGGATCTGACTGCAAGTGCAACCCTTGCACCTGCAAATGAAG
AATCATATAAAACCCTAAGAGTCTGGATGTTGTGTAATAATGGCTCTGATTTCTCCGGTT
GTTTTGCCGGCGACATGAGTCTTGTTCTTCTGTGTGTGTGTTTATGGTTTGGTCATAAGA
TATCTCTGTAAGTTGTATCTCTGTGACTATATATATAAACCAAAATTATTATGGGTTT

QA 1 478 1 478
DS 

RD RS1AV59JQ 412 0 0
G
GCGGAGGAAACTGTGGTTGCGGAGCTGGCTGCAAGTGCGTTGGTTGCGGAGGTTGCAAAA
TGTACCCAGACTTGGGTTTTTCCGGCGAGATGACCACCACCGAGACTGTTGTCCTCGGCG
TTGCTCCGGCGATGAACTCTCAGTACGAGGCTTCCGGTGAGACTTTCGTCTCCGAGAACG
ATGCCTGCAAATGTGGATCTGACTGCAAGTGCAACCCTTGCACCTGCAAATGAAGAATCA
TATAAAACCCTAAGAGTCTGGATGTTGTGTAATAATGGCTCTGATTTCTCCGGTTGTTTT
GCCGGCGACATGAGTCTTGTTTTTCTGTGTGTGTGTTTATGGTTTGGTCATAAGATATCT
CTGTAAGTTGTATCTCTGTGACTATATATATAAACCAAAATTATTATGGGT

QA 2 412 2 412
DS 

RD RS1AV59TF 412 0 0
G
GCGGAGGAAACTGTGGTTGCGGAGCTGGCTGCAAGTGCGTTGGTTGCGGAGGTTGCAAAA
TGTACCCAGACTTGGGTTTCTCCGGCGAGATGACCACCACCGAGACTGTTGTCCTCGGCG
TTGCTCCGGCGATGAACTCTCAGTACGAGGCTTCCGGTGAGACTTTCGTCTCCGAGAACG
ATGCCTGCAAATGTGGATCTGACTGCAAGTGCAACCCTTGCACCTGCAAATGAAGAATCA
TATAAAACCCTAAGAGTCTGGATGTTGTGTAATAATGGCTCTGATTTCTCCGGTTGTTTT
GCCGGCGACATGAGTCTTGTTCTTCTGTGTGTGTGTTTATGGTTTGGTCATAAGATATCT
CTGTAAGTTGTATCTCTGTGACTATATATATAAACCAAAATTATTATGGGT

QA 2 412 2 412
DS 



AS 1 3

CO CL3649Contig1 849 3 11 U
CGCACAGCCAACCACATAACATATGGTAACTCTATTTTAAGTATGCGTCTCTTGTCACAA
TTTGCTTTTTTATTCTGTTATCATAATAATCTTAAGATATAATAAGAAAAAGAAGGAAAA
ACATGAGAACGATCATAAGTGAAGTCATGGCGAATGTCGCTAAAGCACAAATGTCTTGGA
ACACAAAACTTTTGTTACAGGCTGTTGATCTCAAGATTCTGTTTATACAGCAGCTTTTAC
ACTTTGTGGCGTTGTCGAAGCTGGACTTTCGACCTTAGCTGCTTTAAACAGTTCGTCTAC
AACTTCAGATAAAGTTGGATGTGCATGAACTGCAAGTTTTATGTCCTGAATGCGTGTTCC
CAACGCGATGGCGTTGGATGCTTCATGGATGAAATCAGCTGCATGCAACCCAAAGATATG
AACTCCTAGGATTTCACCATTGTCAGGTCTGTATATCATCTTAGCGAGTCCTTCACCCTC
ATTTTCGGCAAGAGCCTTTGTGTTTGCCTTGAAACTTGTCTTGGCAATACTTACTTTAAA
TAC*TCTTTCTCAGCTTTCTCTCTCGCTTGAGGCTCTGTCAATCCCACCATGCTGATTTC
AGGATGAGTAAAACAAGCGGCTGGGATGCTAAGATGATTCAGCACATGATCTCTACCTGT
GACTTGCTCCACCACAGAAATTCCTTGGGCACTGGCTGCATGAGCAAGCATCAGCTTCCC
ATTGGCATCACCGATGCAGTACAAGTGCGGAACCAGCTTTCCATTTCCATCGATAACACG
CATTCACTCATCAACTGGTATAAAACCTCTCTGCGTGCTACATTGATGTTTTCCAGGCCA
AGACCATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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C

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CACCCTCATTTTCGGCAAGAGCCTTTGTGTTTGCCTTGAAACTTGTCTTGGCAATACTTA
CTTTAAATAC*TCTTTCTCAGCTTTCTCTCTCGCTTGAGGCTCTGTCAATCCCACCATGC
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TACCTGTGACTTGCTCCACCACAGAAATTCCTTGGGCACTGGCTGCATGAGCAAGCATCA
GCTTCCC
C

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BQ
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AF RS1A348JQ U 1
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DS 

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TAAGGCTCGAGATTGGTCCAAGGTTAGGCGATCAGAAGTTTGGTGTTGCATTCATGTTTG
TGGAATCAGGTTGATATGCCTCTTCTGTTCCTTTTTTTTACTTTGACTTTGCTTCTGAAT
TGAATGTCCTTGGTTGCTCGCTATTAGCTGATAGTGTTTTTGGTGTTTTTTATATATATA
TTTTTAGCTTCTTAAAGGAAGATGTATTTGAGTGAGATTCTGAGGTTGGGTAATTGTTTT
GCTGGGGGTATTGATGTTAGTACGGTTGCTGAAATTGGTCAGTGTTCCAGCGCTGTGGTG
CCTTCGGTGCCTGCTCCCGGTATTATCATGGGTCTCACCAGTGTACCAGCTCCTGTACTG
TCTACTGAACCTTGTCAGGGAGGTGATAATGCTTCTGGAAAAAAAGTTGTTGTTGCTGGT
GGTAAGAAGGTCGATGGTTCGCAAGCTGGGAAAGAAGTTGCTAATGCGAAGAAACAATAT
GTTGCTGTTCGTTCGCCGAAAGAGGCGCCTTCATCAAAGTATTGTAAACTTGTCCCTTCT
GGGTTGAGCTGTCTTTGGTAGTTGAGCCGTCTTTAGCGGTTTAGCCGAATCTTTATGCGG
ATAAAGTTACTTTTTTCAGCCGTTTGAATGTGCATTCAACGG

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1A348TF 726 0 0
GTTGTTGTTGCTGGTGGTAAGAAGGTCGATGGTTCGCAAGCTGGGAAAGAAGTTGCTAAT
GCGAAGAAACAATATGTTGCTGTTCGTTCGCCGAAAGAGGCGCCTTCATCAAAGTATTGT
AAACTTGTCCCTTCTGGGTTGAGCTGTCTTTGGTAGTTGAGCCGTCTTTAGCGGTTTAGC
CGAATCTTTATGCGGATAAAGTTACTTTTTTCAGCCGTTTGAATGTGCATTCAACGGTAA
GAGGGTCGCAGTGTGGAGAGCTCTTCAAGTAGTTTCAATCGTCTGGTGGTGTTGGTGGTT
GCACTTTTGATGAGGCTCATTGTGACGAGTGGTATCGAGAATTCCCTCGTCACTTGGCTA
TTGTGAGGAGCTTCTTCTTTCTCTCTATTATTTATTTTTTTTAGAGAACTCATTGTATGA
TTTGGTGCAGGCTACGAATTTCTCGAACAAGTTGGTGTATAACCAAGGTGAGGAGCTCCC
TGTTGTCAAGGCGGAGCTTGAAAAAAGAAGGCCGAGCTTGCTGTTGCAAATGATAAGAAT
GACTGTTCTGAGGAGATTGCGGTTTGGCGTGAGAAGTATGAGGCTGAGAAGAAGGTTTCT
TTGGCAGCTTTGGGAGAAGTGGAAAACTCACTGCAAAGATCCCCGGCCGTAATGGCCGAA
TTCCCGGGCATATGTCCGGTACCGTCGACTGATAACTTCGTATAATGTATGCTATACGAA
GTTATG

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 3

CO CL3651Contig1 824 3 7 U
GGCTCCTCCTCACCGTCCTCCAATTTGCTACGCAAAAAAACAATTTAAAAGTCTTTTAAT
TTCTGCTCGATTATTCAAACCTCCCGGCGAGGAAGAAAGAAGAAGAAGAGAAATGGCGAT
TTGCATGTGTTGTGAGTCGCAGATTGTACCGAAATCGATAGTGAATCCATGGATATCTCC
GAGGAGAACGAAGCTAGGTTTCGTAGCGATCCGTCCGAGTTCGACCACGATTCGCCGTTT
TCCAGTCACCGTCAGGGCATCGGCGGTTGATTCCCCCGAGAGCTCTTCCAATTTCGCTAA
GCGTATGGAACAAGCCTGGCTTATCTCTCAGCAACCAAGACCAGTTGGGTGTTCATCGTG
CAATTCAAAGGGTCATGTTGAATGCAAATGGTGTGCGGGTACAGGATTCTTCATCCTCGG
TGATAACATGCTTTGCCAGGTTCCTTCAAGGAATACTTCTTGTGTTATCTGCTCCGGGAA
GGGTTCTGCTTGCTGTAGCGATTGTAAGGGAACTGGGTTCCGTGCCAAGTGGTTGGAAAA
GCCTCCAGTGCCATTGTAGTTGATGAACAAAAGCAAGTTAAGTGTTTTGGTTCGTACATG
ATTTATATACGGAGTACAAATGCTTACATTGATTCAAGCGTAATATGAATACATTTTCTT
TGTACATGTATTGTGTATAAATTTATCAATATATGTTCATTTATTATTCATTTCCCTTTG
TTCTGTCTGTACTACTTAATGTGATTTCTTCTCTTTAGTTGTTCTATTTGTAAATGACAA
CAGACAAAACCTTAACTCCCTTAAGAGAGTTGATTTACTTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F187TF U 1
AF RS1AI04TF U 31
AF RS1F187JQ C 22
BS 1 608 RS1F187TF
BS 609 644 RS1AI04TF
BS 645 645 RS1F187JQ
BS 646 688 RS1AI04TF
BS 689 689 RS1F187JQ
BS 690 702 RS1AI04TF
BS 703 824 RS1F187JQ

RD RS1F187TF 608 0 0
GGCTCCTCCTCACCGTCCTCCAATTTGCTACGCAAAAAAACAATTTAAAAGTCTTTTAAT
TTCTGCTCGATTATTCAAACCTCCCGGCGAGGAAGAAAGAAGAAGAAGAGAAATGGCGAT
TTGCATGTGTTGTGAGTCGCAGATTGTACCGAAATCGATAGTGAATCCATGGATATCTCC
GAGGAGAACGAAGCTAGGTTTCGTAGCGATCCGTCCGAGTTCGACCACGATTCGCCGTTT
TCCAGTCACCGTCAGGGCATCGGCGGTTGATTCCCCCGAGAGCTCTTCCAATTTCGCTAA
GCGTATGGAACAAGCCTGGCTTATCTCTCAGCAACCAAGACCAGTTGGGTGTTCATCGTG
CAATTCAAAGGGTCATGTTGAATGCAAATGGTGTGCGGGTACAGGATTCTTCATCCTCGG
TGATAACATGCTTTGCCAGGTTCCTTCAAGGAATACTTCTTGTGTTATCTGCTCCGGGAA
GGGTTCTGCTTGCTGTAGCGATTGTAAGGGAACTGGGTTCCGTGCCAAGTGGTTGGAAAA
GCCTCCAGTGCCATTGTAGTTGATGAACAAAAGCAAGTTAAGTGTTTTGGTTCGTACATG
ATTTATAT

QA 1 608 1 608
DS 

RD RS1AI04TF 672 0 0
GGCA
AAAAAACAATTTAAAAGTCTTTTAATTTCTGCTCGATTATTCAAACCTCCCGGCGAGGAA
GAAAGAAGAAGAAGAGAAATGGCGATTTGCATGTGTTGTGGTTCGCAGATTGTACCGAAA
TCGATAGTGAATCCATGGATATCTCCGAGGAGAACGAAGCTAGGTTTCGTAGCGATCCGT
CCGAGTTCGACCACGATTCGCCGTTTTCCAGTCACCGTCAGGGCATCGGCGGTTGATTCC
CCCGAGAGCTCTTCCAATTTCGCTAAGCGTATGGAACAAGCCTGGCTTATCTCTCAGCAA
CCAAGACCAGTTGGGTGTTCATCGTGCAATTCAAAGGGTCATGTTGAATGCAAATGGTGT
GCGGGTACAGGATTCTTCATCCTCGGTGATAACATGCTTTGCCAGGTTCCTTCAAGGAAT
ACTTCTTGTGTTATCTGCTCCGGGAAGGGTTCTGCTTGCTGTAGCGATTGTAAGGGAACT
GGGTTCCGTGCCAAGTGGTTGGAAAAGCCTCCAGTGCCATTGTAGTTGATGAACAAAAGC
AAGTTAAGTGTTTTGGTTCGTACATGATTTATATACGGAGTACAAATGCTTACATTGATT
CAAGCGTAATTTGAATACATTTTCTTTGTACATGTATTGTGTATAAATTTATCA*TATAT
GTTCATTT

QA 5 672 5 672
DS 

RD RS1F187JQ 803 0 0
AATTTGCTACGCAAAAAA*CAATTTAAAAGTCTTTTAATTTCTGCTCGATTATTCAAACC
TCCCGGCGAGGAAGAAAGAAGAAGAAGAGAAATGGCGATTTGCATGTGTTGTGAGTCGCA
GATTGTACCGAAATCGATAGTGAATCCATGGATATCTCCGAGGAGAACGAAGCTAGGTTT
CGTAGCGATCCGTCCGAGTTCGACCACGATTCGCCGTTTTCCAGTCACCGTCAGGGCATC
GGCGGTTGATTCCCCCGAGAGCTCTTCCAATTTCGCTAAGCGTATGGAACAAGCCTGGCT
TATCTTTCAGCAACCAAGACCAGTTGGGTGTTCATCGTGCAATTCAAAGGGTCATGTTGA
ATGCAAATGGTGTGCGGGTACAGGATTCTTCATCCTCGGTGATAACATGCTTTGCCAGGT
TCCTTCAAGGAATACTTCTTGTGTTATCTGCTCCGGGAAGGGTTCTGCTTGCTGTAGCGA
TTGTAAGGGAACTGGGTTCCGTGCCAAGTGGTTGGAAAAGCCTCCAGTGCCATTGTAGTT
GATGAACAAAAGCAAGTTAAGTGTTTTGGTTCGTACATGATTTATATACGGAGTACAAAT
GCTTACATTGATTCAAGCGTAATATGAATACATTTTCTTTGTACATGTATTGTGTATAAA
TTTATCAATATATGTTCATTTATTATTCATTTCCCTTTGTTCTGTCTGTACTACTTAATG
TGATTTCTTCTCTTTAGTTGTTCTATTTGTAAATGACAACAGACAAAACCTTAACTCCCT
TAAGAGAGTTGATTTACTTTGCC

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

CO CL3652Contig1 459 2 2 U
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ATGCATAGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCGTTGTTCTAATTAGCTTTTC
TGCTTTTGAAGAACAAACGATGGTGGAAGGGCAGAAGACATGCAAGAGGAAGCCTGGGTC
AGGGACAAAAACTTGTATGAAGGATGATCATTGCCGGTTTTGCATCACAAACGAGAAAGC
AATACGTGGTACTTGCGATTATAAATTCCCTCTACGCCAGTGTTACTGCCACTTTCCATG
TTAATCAACAGAGCCGTGCCAAGACATTTTTATGCCCTATGCCAAATAAGTATTATATAA
CAATATTTTATTAAATTGTTTTTGATAAATAATATTAAATAATTTTGAAAAAAAACTTGT
ATAGAATTAAAATAAATGTTGACTATCTATGTTTTAAGC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AX88JQ C 1
AF RS1AX88TF U 1
BS 1 2 RS1AX88JQ
BS 3 459 RS1AX88TF

RD RS1AX88JQ 459 0 0
AGGGATACAATACACATAACATACCTTCAAATTAAAAAAAAAAAAAGTAAAAAGTAAAAC
ATGCATAGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCGTTGTTCTAATTAGCTTTTC
TGCTTTTGAAGAACAAACGATGGTGGAAGGGCAGAAGACATGCAAGAGGAAGCCTGGGTC
AGGGACAAAAACTTGTATGAAGGATGATCATTGCCGGTTTTGCATCACAAACGAGAAAGC
AATACGTGGTACTTGCGATTATAAATTCCCTCTACGCCAGTGTTACTGCCACTTTCCATG
TTAATCAACAGAGCCGTGCCAAGACATTTTTATGCCCTATGCCAAATAAGTATTATATAA
CAATATTTTATTAAATTGTTTTTGATAAATAATATTAAATAATTTTGAAAAAAAACTTGT
ATAGAATTAAAATAAATGTTGACTATCTATGTTTTAAGC

QA 1 459 1 459
DS 

RD RS1AX88TF 459 0 0
AG
GGATACAATACACATAACATACCTTCAAATTAAAAAAAAAAAAAGTAAAAAGTAAAACAT
GCATAGCTAAGTTTGCTTCCATCATCACCTTCCTCTTCGTTGTTCTAATTAGCTTTTCTG
CTTTTGAAGAACAAACGATGGTGGAAGGGCAGAAGACATGCAAGAGGAAGCCTGGGTCAG
GGACAAAAACTTGTATGAAGGATGATCATTGCCGGTTTTGCATCACAAACGAGAAAGCAA
TACGTGGTACTTGCGATTATAAATTCCCTCTACGCCAGTGTTACTGCCACTTTCCATGTT
AATCAACAGAGCCGTGCCAAGACATTTTTATGCCCTATGCCAAATAAGTATTATATAACA
ATATTTTATTAAATTGTTTTTGATAAATAATATTAAATAATTTTGAAAAAAAACTTGTAT
AGAATTAAAATAAATGTTGACTATCTATGTTTTAAGC

QA 3 459 3 459
DS 



AS 1 3

CO CL3653Contig1 1426 3 15 U
GGGAAAGGAAAGGAAAAAAATGGCAAAAGCGAAGCAACAGAAATCATCTAAGCCTAAGAA
ACAACCGCGTCAGGTGGAGAAGAAGAAGAAGAAGGAAGGAAAGGATTGTGATCTCTCACA
GTTCGTGCTCAACTTGACTCCTTAGGTCTTAAGATCATCCAAGTAACCGCCGACGGTAAC
TGCTTCTTCAGGTCACTCGCCGATCAATTGGAAGGCAATGAGGATGAACACAGCAAGTAC
CGTAGCATGGTTGTACAGTACATAGTTAAGAATCGTGAAATGTTTGAGCCTTTTATCGAA
GACGATGTTCCGTTTGAGGATTACTGTAAAACAATGGATGATGATGGGACTTGGGCTGGG
AATATGGAGTTACAAGCTGCTTCTCTTGTCACACGTAGTAACATATGTATCCACAGGAGT
ATGTCACCTCGTTGGTATATACGCAACTTTGAAGATGCAAGAACCCGCATGACCCATCTG
TCTTACCATGATGGGGAACATTACAATAGTGTGCGTTCCAAGGAAGATGCTTGTGGTGGA
CCAGCTAGGCCTGTTGTGATTGAGGCTGATGCTAAAGTAACAGCAGCATCTAAACAAGCC
AAAGCCACTGAGGGAAAGTCCAAGAACAGAAGTGATAAGTGTGATGTGGATGCTGGGGCT
GTCAAAGTAGTCATGTCTGGTAGTTGTTGTAACAATGCTGAGAAAGCTGAACAGGTTCTA
GTACAAGTAAACGGTGATGTGGATGCTGCGATAGAATTTTTGATAGCAGAGCAAGGAATG
GAGTCAATGATTGAAAATGATTCAGAAACTGCTTCTGCGGCAATGGAAACCACCGAGCAA
CTCAGAGAAGCAATTGAGACGATCAGTGAGGATGAATCAGGCAGCTTCAGTAATATAGAG
ACAGTCCTTGCCAAGTGCAGCTTGGATGATAAGAAGATCCCCAGAAATAAATCATGTCCA
TGTGGTTCAAAGAAAATACAAGTCCTGCTGCGGAACAGCAGCCGGGAGATCCTCTGTAAA
ACTGTTAGTGAGCCAAACAATGGAGTCGAAGAAGGGGAGAAAGAATCTGAGGAGAGGAAC
ATCGAATGAAGTTGAGACAAATGCACCAGACGTGGGTGCTCTTTGTATATAATTAAGTCT
CACTCTCACACACACAGAAAAACATAAAGGGGGAAAGAAGATGATCTTTTGAGCATGGAT
TTAGTATTTGACATAACAGCTTGCTCAGAGTCAAAGAAACTTTTTAAGAGGATAGGCGGA
AGAAGAGGTGGTGGAGATGACATGCGCATATCAAATTATCAATATAATTATTGTTTGTCT
CTTCTCTAATAAATATTTTTGTCTACGAATATATACCCTGTGTATGCTAAATTATTTTAA
TCAGATTCTGATAAATTTATGCGAAAGATACTATCGACTTCCTGAC


BQ
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G
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ATCAGATTCTGATAAATTTATGCGAAAGATACTATCGACTTCCTGAC

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DS 



AS 1 3

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GCTTCTACAAACACGAGGCGTTGAAAACAACGCTGGACCC


BQ
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AF RS1FI77JQ U 20
AF RS1FD89JQ U 1
AF RS1FI77TF C 172
BS 1 209 RS1FD89JQ
BS 210 210 RS1FI77JQ
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BS 345 642 RS1FD89JQ
BS 643 940 RS1FI77TF

RD RS1FI77JQ 310 0 0
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TGCTCAGAATCTGAGTTTTATAGATTTTTTTTTTCGAATTCTCAGAGCTGAAGGGGTTGA
GATTTAGTAAAGACAAAGACTCCTCCACCTCCAACGGATCGACCCAAGAGCATGTTATTA
TCGAGATAAGAGAGGTAATACAATCCACCTACAGACCTCCCTCCTGGACTGGTTGCTGTT
ACTGGAATCTGAGCATTGAAAGTACGTATAAACTGCAGAATCTGAAGGTTTAAGAACGAG
CGTGGAA
AAA

QA 1 307 1 307
DS 

RD RS1FD89JQ 642 0 0
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GAATCAGCTAACATAATAATGCTCAAAATCTGAGTTTTATAGATTTTTTTTTTCGAATTC
TCAGAGCTGAAGGGGTTGAGATTTAGTAAAGACAAAGACTCCTCCACCTCCAACGGATCG
ACCCAAGAGCATGTTATTATCGAGATAAGGGAGGTAATACAATCCACCTACAGACCTCCT
TCCTGGACTGGTTGCTGTTACTGGAATCTGAGCATTGAAAGTACGTATAAACTGCAAAAT
CTGAAGGTTTAAAAACGAGCGTGGAAAAATTGCAGGTGCGAGAGGAGATTGAACCTGCTC
ATTGATATTAATGTTTCTAACACTTATCTCTTCAAACTGAAGGTAGATGTTTCGACTAGA
GACCTTATCGAACTTGGCAGTAACAACAAGTGTTGCACCTTCTTGCTCCTCTAGCAAGCT
TGGAAGACTCCACTGAACAACATTTCTAATGATCCCACCGTCTGATCGATCTCTGCACTC
AAACTTCTGAAAGATCTGACCAACCTGAAAGAAGGGAAATCTTGAGGCAGCTTCAAAGAG
AACAACAACATCAGGAGCAGACGTATACTGTAGCCTCCATGT

QA 1 642 1 642
DS 

RD RS1FI77TF 769 0 0
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AGACCTCCCTCCTGGACTGGTTGCTGTTACTGGAATCTGAGCATTGAAAGTACGTATAAA
CTGCAGAATCTGAAGGTTTAAGAACGAGCGTGGAAGAATTGCAGGTGCGAGAAGAGATTG
AACCTGCTCATTGATATTAATGTTTCTAACACTTATCTCTTCAAACTGAAGGTAGATGTT
TCGACTAGAGACCTTATCGAACTTGGCAGTAACAACAAGTGTTGCACCTTCTTGCTCCTC
TAGCAAGCTTGGAAGACTCCACTGAACAACATTTCTAATGATCCCACCGTCTGATCGATC
TCTGCACTCAAACTTCTGAAAGATCTGACCAACCTGAAAGAAGGGAAATCTTGAGGCAGC
TTCAAAGAGAACAACAACATCAGGAGCAGACGTATACTGTAGCCTCCATGTTCCATCTAA
CTTCATTAGATCAATGGCTTCACCGCCGTTAAACCCTTCCACAGTCACCAGAGCCTCCTC
GATAACAGAGCGTTGATCAGAAGTGGCAGTGAGGCCTCGTTGAGTTTCTTGAACAGCTCT
GAGTAGATCGTGTTTCTTGTATTCTAAGTCAAGTTCACTGTCCACGACCTTAGCTGTCGG
GTCTCCAGAAGCTACTCGACATGAAAATCTCTTTCTATGATCGGTATTGAAGTTTAGGCC
GAAAGGTTTGCTTCTACAAACACGAGGCGTTGAAAACAACGCTGGACCC

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

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TCAGATTCACCTCAAATCCGAGGGCATCACTCGCCGTCCACAACAACCACCACCAACCGA
TCTCCATCACTCGAAATCTTATACCCAAACTCAAACCACCATCTCCCGCCGCGAAATTCA
GGTGCTCAGCGTCGTCGTCGGCGCTCACGCCGCAGCTCAGAGATACGCTGGAGAAGCTGG
TGAACTCGGAGAAAGTCGTGTTATTCATGAAAGGCACGAGGGATTTCCCCATGTGCGGAT
TCTCGAACACGGTGGTGCAGATCCTGAAGAATCTCAACGTCCCCTTCGAAGACGTGAACA
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GTTTTGTAACAATGCTATTTGATCGTATTGTGTGATGGATCTAGTTATAGCTATGTGCTT
GAATCTATACATTATAAAAGTC


BQ
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AF RS1FP44TF U 1
AF RS1FP44JQ C 28
BS 1 682 RS1FP44TF

RD RS1FP44TF 682 0 0
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CGCCGTCTGTAACTCCCACCGCCGTCGTTTCCTCCTCAATTGTCAACAAACCACAGTCTT
TCAGATTCACCTCAAATCCGAGGGCATCACTCGCCGTCCACAACAACCACCACCAACCGA
TCTCCATCACTCGAAATCTTATACCCAAACTCAAACCACCATCTCCCGCCGCGAAATTCA
GGTGCTCAGCGTCGTCGTCGGCGCTCACGCCGCAGCTCAGAGATACGCTGGAGAAGCTGG
TGAACTCGGAGAAAGTCGTGTTATTCATGAAAGGCACGAGGGATTTCCCCATGTGCGGAT
TCTCGAACACGGTGGTGCAGATCCTGAAGAATCTCAACGTCCCCTTCGAAGACGTGAACA
TTCTCGAGAACGAGATGCTGAGGCAAGGGCTGAAAGAGTACTCCAATTGGCCCACGTTTC
CTCAGCTTTACATCGACGGCGAGTTCTTCGGTGGCTGTGACATCACTCTCGAGGCGTTTC
AGAGTGGGGAGTTGCAGGAAGTTGTTGAAAGAGCTATTTGTTCTTGATGCTTGTCTTTGG
GTTTTGTAACAATGCTATTTGATCGTATTGTGTGATGGATCTAGTTATAGCTATGTGCTT
GAATCTATACATTATAAAAGTC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1FP44JQ 655 0 0
TCTAC
GAAAAAATGGCTCTCCAACCTGTCAAAACGCCGTCTGTAACTCCCACCGCCGTCGTTTCC
TCCTCAATTGTCAACAAACCACAGTCTTTCAGATTCACCTCAAATCCGAGGGCATCACTC
GCCGTCCACAACAACCACCACCAACCGATCTCCATCACTCGAAATCTTATACCCAAACTC
AAACCACCATCTCCCGCCGCGAAATTCAGGTGCTCAGCGTCGTCGTCGGCGCTCACGCCG
CAGCTCAGAGATACGCTGGAGAAGCTGGTGAACTCGGAGAAAGTCGTGTTATTCATGAAA
GGCACGAGGGATTTCCCCATGTGCGGATTCTCGAACACGGTGGTGCAGATCCTGAAGAAT
CTCAACGTCCCCTTCGAAGACGTGAACATTCTCGAGAACGAGATGCTGAGGCAAGGGCTG
AAAGAGTACTCCAATTGGCCCACGTTTCCTCAGCTTTACATCGACGGCGAGTTTTTCGGT
GGCTGTGACATCACTCTCGAGGCGTTTCAGAGTGGGGAGTTGCAGGAAGTTGTTGAAAGA
GCTATTTGTTCTTGATGCTTGTCTTTGGGTTTTGTAACAATGCTATTTGATCGTATTGTG
TGATGGATCTAGTTATAGCTATGTGCTTGAATCTATACATTATAAAAGTC

QA 6 655 6 655
DS 



AS 1 2

CO CL3656Contig1 788 2 24 U
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CCGGAGATCTCATCAGAATGAGTAACGCGCTTCTCGACATCGATCCTATCGATCTTCAAT
TCCCTTTTGAATTGAAGAAACAGATCTCTTGCTCTCTCTATTTAGCTAACAAAACCGACG
ATTACGTCGCCTTCAAGGTAAAAACGACGAATCCGAAGAAGTATTGTGTGAGACCTAACA
CTGGCGTTGTGCTTCCCAGATCCTCTTCTGAAGTTCTAGTGACGATGCAAGCGCAAAAGG
AAGCTCCAGGTGATATGCAGTGCAAGGACAAGTTCTTGCTTCAGTGTGTTGTCTCTACTC
CCGGAGTCACTCCCAAGGATGTTACTCCTGAGATGTTTAGTAAAGAGGCAGGGCATCGAG
TTGAGGAGACTAAATTGAGAGTTGTCTACGTTGATCCACCTCGCCCACCGTCCCCGGTGC
GTGAAGAAGGGTCAGAAGAGGGCTCTTCGCCTAGAGCCTCAGTCTCTGACAATGGGGCCT
CTGATTTTACTGCTGCTCCAAGATTTAGCGTGGACAGGGTTGAACCTCAGGAAAACTCAT
CAGAGGCGAGAGCTCTCATCACAAGGCTCACGGAGGAAAAGAACTCTGCGATTCAACTGA
ACAACAGACATCAACAAGAATTGGAGAAGTTGAAGCGTGAAAGCAAGAGAAGTCAGAGTG
GTGGTGGAATCCCGTTCATGTACGTTCTTCTGGTGGGACTAATCGGCTAATCTTGGGATA
CATTATGA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BP55TF U 1
AF RS1H529TF U 16
BS 1 47 RS1BP55TF
BS 48 48 RS1H529TF
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BS 166 199 RS1BP55TF
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BS 435 559 RS1BP55TF
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BS 671 674 RS1BP55TF
BS 675 788 RS1H529TF

RD RS1BP55TF 674 0 0
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CCGGAGATCTCATCAGAATGAGTAACGCGCTTCTCGACATCGATCCTATCGATCTTCAAT
TCCCTTTTGAATTGAAGAAACAGATCTCTTGCTCTCTCTATTTATCTAACAAAACCGACG
ATTACGTCGCCTTCAAGGTTAAAACGACGAATCCGAAGAAGTATTGTGTGAGACCTAACA
CTGGCGTTGTGCTTCCCAGATCCTCTTCTGAAGTTCTAGTGACGATGCAAGCGCAGAAGG
AAGCTCCAGGTGATATGCAGTGCAAGGACAAGTTCTTGCTTCAGTGTGTTGTCTCTACTT
CCGGTGTCACTGCCAAGGATGTTACTCCTGAGATGTTTAGTAAAGAGGCAGGGCATCGAG
TTGAGGAGACTAAGTTGAGAGTTGTCTACGTTGATCCACCTCGCCCACCGTCCCCGGTGC
GTGAAGAAGGGTCAGAAGAGGGCTCTTCGCCTAGAGCCTCAGTCTCTGACAATGGGGCCT
CTGATTTTACTGCTGCTCCGAGATTTAGCGTGGACAGGGTTGAACCTCAGGAAAACTCAT
CAGAGGCGAGAGCTCTCATCACAAGGCTCACGGAGGAAAAGAACTCTGCGATTCAACTGA
ACAACAGACTTCAA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1H529TF 773 0 0
GG
ATCGACGCCAAAACTCTCTTCGCCGGAAAAAGATTTTAACTCACCGGAGATCTTATCAGA
ATGAGTAACGCGCTTCTCGACATCGATCCTATCGATCTTCAATTCCCTTTTGAATTGAAG
AAACAGATCTCTTGCTCTCTCTATTTAGCTAACAAAACCGACGATTACGTCGCCTTCAAG
GTAAAAACGACGAATCCGAAGAAGTATTGTGTGAGGCCTAACACTGGCGTTGTGCTTCCC
AGATCCTCTTCTGAAGTTCTAGTGACGATGCAAGCGCAAAAGGAAGCTCCAGGTGATATG
CAGTGCAAGGACAAGTTCTTGCTTCAGTGTGTTGTCTCTACTCCTGGAGTCACTCCCAAG
GATGTTACTCCTGAGATGTTTAGTAAAGAGGCAGGGCATCGAGTTGAGGAGACTAAATTG
AGAGTTGTCTACGTTGATCCACCTCGTCCACCGTCCCCGGTGCGTGAAGAAGGGTCTGAA
GAGGGCTCTTCGCCTAGAGCTTCTGTCTCTGACAATGGGGCTTCTGATTTTACTGCTGCT
CCAAGATTTAGCGTGGACAGGGTTGAACCTCAGGAAAACTCATCAGAGGCGAGAGCTCTC
ATCACAAGGCTCACGGAGGAAAAGAACTCTGCGATTCAACTGAGCAACAGACATCAACAA
GAATTGGAGAAGTTGAAGCGTGAAAGCAAGAGAAGTCAGAGTGGTGGTGGAATCCCGTTC
ATGTACGTTCTTCTGGTGGGACTAATCGGCTAATCTTGGGATACATTATGA

QA 3 773 3 773
DS 



AS 1 2

CO CL3657Contig1 629 2 2 U
GCAGTTTCACTTGTTCGCACGGGAAAAAATGCCGGCAGGACATGGAGTTCGTGCTCGAAC
GAGGGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAATCCCATTGTCCACTTACCT
CAGAACCTTCAAGGTCGGCGATTACGTCGATGTTAAAGTGAACGGTGCGATCCACAAGGG
CATGCCTCACAAGTTCTACCATGGTCGTACTGGCCGTGTCTGGAACGTCACCAAACGTGC
CGTTGGTGTCGAAGTCAACAAACAGATCGGAAACAGGATCATAAAGAAGAGGCTTCACGT
GCGTGTGGAGCATGTGCAGCAGTCCAGATGTGCTGAGGAGTTCAAACTAAGGAAGAAGAA
GAATGATGAGATCAAAACTGCAGCCAAAGCTAGGGGCGAGACGATAAGCACCAAGAGGCA
GCCTAAAGGACCCAAACCTGGATTCATGGTTGAAGGTATGACCTTGGAGACAGTCACCCC
AATTCCATACGACGTCGTCAACGATCTCAAAGGAGGCTATTAGTTCTTACTTTTCTTCCC
TATTCTTGCTGTCTGTTTTTGGAACTCTGCATTTGTAACGAATTAAAATTCTTATATGAT
TTATATGAGAAATTTTAGCAATTCAAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E365TF U 1
AF RS1E365JQ C 222
BS 1 616 RS1E365TF
BS 617 629 RS1E365JQ

RD RS1E365TF 616 0 0
GCAGTTTCACTTGTTCGCACGGGAAAAAATGCCGGCAGGACATGGAGTTCGTGCTCGAAC
GAGGGATCTGTTCGCGAGGGGGTTCAGGAAGAAGGGTACAATCCCATTGTCCACTTACCT
CAGAACCTTCAAGGTCGGCGATTACGTCGATGTTAAAGTGAACGGTGCGATCCACAAGGG
CATGCCTCACAAGTTCTACCATGGTCGTACTGGCCGTGTCTGGAACGTCACCAAACGTGC
CGTTGGTGTCGAAGTCAACAAACAGATCGGAAACAGGATCATAAAGAAGAGGCTTCACGT
GCGTGTGGAGCATGTGCAGCAGTCCAGATGTGCTGAGGAGTTCAAACTAAGGAAGAAGAA
GAATGATGAGATCAAAACTGCAGCCAAAGCTAGGGGCGAGACGATAAGCACCAAGAGGCA
GCCTAAAGGACCCAAACCTGGATTCATGGTTGAAGGTATGACCTTGGAGACAGTCACCCC
AATTCCATACGACGTCGTCAACGATCTCAAAGGAGGCTATTAGTTCTTACTTTTCTTCCC
TATTCTTGCTGTCTGTTTTTGGAACTCTGCATTTGTAACGAATTAAAATTCTTATATGAT
TTATATGAGAAATTTT

QA 1 616 1 616
DS 

RD RS1E365JQ 408 0 0
GGAACGTCACCAAACGTGCCGTTGGTGTCGAAGTCAACAAACAGATCGGAAACAGGATCA
TAAAGAAGAGGCTTCACGTGCGTGTGGAGCATGTGCAGCAGTCCAGATGTGCTGAGGAGT
TCAAACTAAGGAAGAAGAAGAATGATGAGATCAAAACTGCAGCCAAAGCTAGGGGCGAGA
CGATAAGCACCAAGAGGCAGCCTAAAGGACCCAAACCTGGATTCATGGTTGAAGGTATGA
CCTTGGAGACAGTCACCCCAATTCCATACGACGTCGTCAACGATCTCAAAGGAGGCTATT
AGTTCTTACTTTTCTTCCCTATTCTTGCTGTCTGTTTTTGGAACTCTGCATTTGTAACGA
ATTAAAATTCTTATATGATTTATATGAGAAATTTTAGCAATTCAAATT

QA 1 408 1 408
DS 



AS 1 2

CO CL3658Contig1 510 2 5 U
AGGTTATAACAGCAATTCGCTTAGACAAGAAGTAAAGTAGAAGCTAGTTTAAACACCAAA
GTAGGTCTTACAACATGAAGGAGACGACATAAGAAACACATAGAAACCATACAGATGACA
GGACAGGAAGACTGGCAACACTGAAACTGTGAACTAACATCTTTTCATTTAGAAGGAGTC
TTCGAGTCTCTAGATTTTGTTAAACGCAACAATGTCGACGCTTTGGATGTACTCGTTGTT
AGGCTCTGAGGTGAGATGGTCTTCAATGAGGTTGTCCACAGAGACAAGGTCATCATCAAT
TGTCATCATTATAGTGAGTTTCTTTATCCCGTAACCAACCGGTACCAGTTTCGAAGCTCC
CCAATAAAGACCAGGCATCTGAACACTACGGACAGCTTCTTCCAACTTCTTCATATCGGT
TTCACCATCCCACGGCTTAACATCAAGTAGGACAGACGACTTTCCACTCTGTTTAGGTTT
CTTGGTATCCTTCTTAGCAGCTTCCCTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C642JQ U 240
AF RS1BR66TF C 1
BS 1 239 RS1BR66TF
BS 240 243 RS1C642JQ
BS 244 244 RS1BR66TF
BS 245 355 RS1C642JQ
BS 356 510 RS1BR66TF

RD RS1C642JQ 116 0 0
TAGGTTCTGAGGTGAGATGGTCTTCAATGAGGTTGTCCACAGAGACAAGGTCATCATCAA
TTGTCATCATTATAGTGAGTTTCTTTATCCCGTAACCAACCGGTACCAGTTTCGAA

QA 1 116 1 116
DS 

RD RS1BR66TF 510 0 0
AGGTTATAACAGCAATTCGCTTAGACAAGAAGTAAAGTAGAAGCTAGTTTAAACACCAAA
GTAGGTCTTACAACATGAAGGAGACGACATAAGAAACACATAGAAACCATACAGATGACA
GGACAGGAAGACTGGCAACACTGAAACTGTGAACTAACATCTTTTCATTTAGAAGGAGTC
TTCGAGTCTCTAGATTTTGTTAAACGCAACAATGTCGACGCTTTGGATGTACTCGTTGTT
AGGCTCTGAGGTGAGATGGTCTTCAATGAGGTTGTCCACAGAGACAAGGTCATCATCAAT
TGTCATCATTATAGTGAGTTTCTTTATCCCGTAACCAACCGGTACCAGTTTCGAAGCTCC
CCAATAAAGACCAGGCATCTGAACACTACGGACAGCTTCTTCCAACTTCTTCATATCGGT
TTCACCATCCCACGGCTTAACATCAAGTAGGACAGACGACTTTCCACTCTGTTTAGGTTT
CTTGGTATCCTTCTTAGCAGCTTCCCTCTC

QA 1 510 1 510
DS 



AS 1 3

CO CL3659Contig1 1024 3 14 U
CGCTTCTCCAAACATACTACTAATTGATGATTATCTAAGGAAGTATTTTACATAATACAA
GACTGCTTCATTCAACCATAACAAACCATAGTTTTTGTCTGCCAACCATAATAAAAAAAA
AACAACACTAGAAATTAACCTTGCAAAATGTCTGATTTTCGTTTCCACCTCCAAAGAACA
ATGTAAAATTCGAATTATTGGTTTTTCTCACCTGTGTTTGCGTTTGGATGGTGGCATGTT
TCTCATGCTGCTGCTGCCGCCTCCACCGCTGCTTCTGCCTCCCCCACCGCTGGTTCCAGG
ACGGGATTTCCCAAACGCTCTCATCTTCCTTCTCTTCCTCTCTTCCTCACTGTCAGACTC
AGCTCCATGCTCTCTGTCTGCGTTAGTAGCCTCTCTCTCCAGCTCGTCCCATGTCTTACC
TTTCTCTTCCTCTGATTCTTCCTCAGAGTCCTCTTCATCTTCGTCCTCTGACTCAACCAG
TGAAGCGCTGTCTGAATCCTCGTCCTCTGACTCAGACTCCACCTCCACATCTGACGCCTC
ATATTCTTTGTCTGACTCCTCAGACCCACCAGATTCTGAATCGCCTCCGTCCAAGTTCAA
AAACTCCCATCCACCTTCCTCTACAAAGCTCTGTGGATCATCAGTGATTGTCTTAAGGAT
CTGCCTCCAGTTCAGATTCAGTTTGCTCTCGTAGTACTTTATATCAGTAGTGTCAAGCCA
TTCCTTTATCCCTTCTAGAGACGTAGTGGGAATAGAGTCAACCCTGAGAACATCCTTCTT
GAAGTCCTTGAAGATAATGACCATGTCAAAGTTCTTCTGCCCAAACCCAACTCTCTCCAG
ATTCACAATCTCAATCTCATTCAAACTGACCACAAAAAACGGCATTTCAGTGATCTCAAC
AAGGCAGCTGGAGGTCGGGATGATGAAAGCATTCGTCTTGTGCGGTACACCATAGAACCC
AAGCTCCCTCAGAGGCTGATCAAACTCAAGGTCCAAACTTGCAAACTGGGGTTGTTGCCA
CATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 
15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1DZ09JQ U 1
AF RS1DX52JQ U 16
AF RS1DX52TF C 423
BS 1 113 RS1DZ09JQ
BS 114 114 RS1DX52JQ
BS 115 174 RS1DZ09JQ
BS 175 175 RS1DX52JQ
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BS 645 727 RS1DZ09JQ
BS 728 1024 RS1DX52TF

RD RS1DZ09JQ 727 0 0
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GACTGCTTCATTCAACCATAACAAACCATAGTTTTTGTCTGCCAACCATAATAGAAAAAA
AACAACACTAGAAATTAACCTTGCAAAATGTCTGATTTTCGTTTCCACCTCCAAGGAACA
ATGTAGAATTCGAATTATTGGTTTTTCTCACCTGTGTTTGCGTTTGGATGGTGGCATGTT
TCTCATGCTGCTGCTGCCGCCTCCACCGCTGCTTCTGCCTCCTCCACCGCTGGTTCCAGG
ACGGGATTTCCCAAACGCTCTCATCTTCCTTCTCTTCCTCTCTTCCTCACTGTCAGACTC
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TTTCTCTTCCTCTGATTCTTCCTCAGAGTCCTCTTCATCTTCGTCCTCTGACTCAACCAG
TGAAGCGCTGTCTGAATCCTCGTCCTCTGACTCAGACTCCACCTCCACATCTGACGCCTC
ATATTCTTTGTCTGACTCCTCAGACCCACCAGATTCTGAATCGCTTCCGTCCAAGTTCAA
AAACTCCCATCCACCTTCCTCTACAAAGCTCTGTGGATCATCAATGATTGTCTTAAGGAT
CTGCCTCCAGTTCAGATTCAGTTTGCTCTCGTAGTACTTTATATCAGTAGTGTCAAGCCA
TTCCTTT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1DX52JQ 712 0 0
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CCATAACAAACCATAGTTTTTGTCTGCCAACCATAATAAAAAAAAAACAACACTAGAAAT
TAACCTTGCAAAATGTCTGATTTTCGTTTCCACCTCCAAAGAACAATGTAAAATTCGAAT
TATTGGTTTTTCTCACCTGTGTTTGCGTTTGGATGGTGGCATGTTTCTCATGCTGCTGCT
GCCGCCTCCACCGCTGCTTCTGCCTCCCCCACCGCTGGTTCCAGGACGGGATTTCCCAAA
CGCTCTCATCTTCCTTCTCTTCCTCTCTTCCTCACTGTCAGACTCAGCTCCATGCTCTCT
GTCTGCGTTAGTAGCCTCTCTCTCCAGCTCGTCCCATGT***ACCTTTCTCTTCCTCTGA
TTCTTCCTCAGAGTCCTCTTCATCTTCGTCCTCTGACTCAACCAGTGAAGCGCTGTCTGA
ATCCTCGTCCTCTGACTCAGACTCCACCTCCACATCTGACGCCTCATATTCTTTGTCTGA
CTCCTCAGACCCACCAGATTCTGAATCGCCTCCGTCCAAGTTCAAAAACTCCCATCCACC
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ATTCAGTTTGCTCTCGTAGTACTTTATATCAGTAGTGTCAAGCCATTCCTTT

QA 1 712 1 712
DS 

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AAGCGCTGTCTGAATCCTCGTCCTCTGACTCAGACTCCACCTCCACATCTGACGCCTCAT
ATTCTTTGTCTGACTCCTCAGACCCACCAGATTCTGAATCGCCTCCGTCCAAGTTCAAAA
ACTCCCATCCACCTTCCTCTACAAAGCTCTGTGGATCATCAGTGATTGTCTTAAGGATCT
GCCTCCAGTTCAGATTCAGTTTGCTCTCGTAGTACTTTATATCAGTAGTGTCAAGCCATT
CCTTTATCCCTTCTAGAGACGTAGTGGGAATAGAGTCAACCCTGAGAACATCCTTCTTGA
AGTCCTTGAAGATAATGACCATGTCAAAGTTCTTCTGCCCAAACCCAACTCTCTCCAGAT
TCACAATCTCAATCTCATTCAAACTGACCACAAAAAACGGCATTTCAGTGATCTCAACAA
GGCAGCTGGAGGTCGGGATGATGAAAGCATTCGTCTTGTGCGGTACACCATAGAACCCAA
GCTCCCTCAGAGGCTGATCAAACTCAAGGTCCAAACTTGCAAACTGGGGTTGTTGCCACA
TC

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 2

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ATGTCTGAGAAAAAGGGAAGGAAAGAGGAAGTGGTGACCAGAGAGTACACCATCAACCTC
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AGGAAGTTTGCAGAGAAAGCCATGGGGACAAAGGACGTTAGGGTGGACGTGAAGTTGAAC
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GAAGGGACTAGTCCTGTCATTTAGACAAGTTTTGTGGGGTTTTAAAAAATTTCTTGTTGT
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TATTTGAAATTTGCTAATAA


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FK21TF U 3
AF RS1DG59TF U 1
BS 1 11 RS1DG59TF
BS 12 12 RS1FK21TF
BS 13 27 RS1DG59TF
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BS 29 52 RS1DG59TF
BS 53 53 RS1FK21TF
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BS 133 278 RS1DG59TF
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BS 280 332 RS1DG59TF
BS 333 333 RS1FK21TF
BS 334 392 RS1DG59TF
BS 393 393 RS1FK21TF
BS 394 463 RS1DG59TF
BS 464 464 RS1FK21TF
BS 465 620 RS1DG59TF

RD RS1FK21TF 468 0 0
GG
GTTCTCTCGACGTTCTTCAAGCCCTAAGGTAAGAGTACATCACAGACAAAGAGAAGATGT
CTGAGAAAAAGGGAAGGAAAGAGGAAGTGGTGACCAGAGAGTACACCATCAACCTCCACA
GACGCCTCCACAGCTGCACCTTTAAGAAGAAGGCACCAAAGGCCATCAAGGAGATCAGGA
AGTTTGCCGAGAAAGCCATGGGGACAAAGGACGTTAGGGTGGACGTGAAGTTGAACAAGC
AGATATGGAGCAAAGGAATCAGAGGTCCTCCAAGAAGGATTAGGGTCCGTGTTGCGCGCA
AGAGAAACGACGACGAAGACGCAAAGGAAGAGTTTTTCTCACTCGTGACTGTTGCTGAGA
TCCCTGCTGAAGGACTCAGTGGACTTGGCACTAAGGTCATCGATGAGGAGGATTGAGAAG
GGACTAGTCCTGTCATTTAGACAAGTTTTGTGGGTTTTTAAAAA
AA

QA 3 466 3 466
DS 

RD RS1DG59TF 620 0 0
GGCTGTTCTCTTGACGTTCTTCAAGCC*TAAGGTAAGAGTACATCACAGACAGAGAGAAG
ATGTCTGAGAAAAAGGGAAGGAAAGAGGAAGTGGTGACCAGAGAGTACACCATCAACCTC
CACAGACGCCTTCACAGCTGCACCTTTAAGAAGAAGGCACCAAAGGCCATCAAGGAGATC
AGGAAGTTTGCAGAGAAAGCCATGGGGACAAAGGACGTTAGGGTGGACGTGAAGTTGAAC
AAGCAGATATGGAGCAAAGGAATCAGAGGTCCTCCAAGGAGGATCAGGGTCCGTGTTGCG
CGCAAGAGAAACGACGACGAAGACGCAAAGGAGGAGTTTTTCTCACTCGTGACCGTTGCT
GAGATCCCTGCTGAAGGACTCAGTGGACTTGGTACTAAGGTCATCGATGAGGAGGATTGA
GAAGGGACTAGTCCTGTCATTTAGACAAGTTTTGTGGGGTTTTTAAAAATTTCTTGTTGT
TTTCGTTCAAAAATCTTCAGTATTTTCTTTGTAGTGTGACTGATGCAGTTTATTGGAAAG
ACTCGTTTTCTTCGGTAAGACCTTGAGATGAACCTGTTTGTGTTCTTGTCTTCTGCATTT
TATTTGAAATTTGCTAATAA

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 2

CO CL3661Contig1 638 2 3 U
AATTGAATCTTTGCCACGTTAAGTTTAGTAATTAGCTTCTTAAAATGTCTTACACCAGCT
TGTGTTTATATCTCATAATGTCAAAGAACTAAGATGAGAAAAGCCTAGTCAATCAATGTG
ACTTGGAGATCAGCCAGAGACCAAGCTAAGCTTGTTGATGACGATGCTTTGGTTTACAAA
ACAAGCCTGAAGGTGAGGTTAATACGAGTGCCCTCTGCCTTTGCACGCTTCGGCACAGAA
TGAATCCAGTCCCTTTGCGTGTATCCCCTCATCACCAGCAATGATCCATGCTTCAATGTG
AAACTATGTTGATCCTCTCCTCTGCTGCTTTTCTTTAACCTCTTCTTCGCTGGTCCATCA
TCTCCTCTTTTCTCATGAGAAGAGTCTCCTTGAAGTTTCTTTTTCTTGAGCACAAAGTCA
CGTTCGCATCCAAAAGAGAGGGAAGCAATTTCAGGAGTAGGACCGTAAAGTTTTTCATCA
TCTGAATGCCAACCAACATAGTCATTGACACCTTTGTACCTATTCAAAAGCAAGCTGTTG
AATCTGCTTCCAGGAAGGGCTTCGCAAATAGCATCTAGGATCTCCTTGAGAGGTGGAAAA
TCATCCCAGGAATAGGCATCAGGTCGATATCCACTGTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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BQ
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AATTGTGCATGATGGGCGCTTGCAAGAAGATGCAGCACGGAGATATTTTCAGCAGCTTAT
CAATGCTGTTGATTACTGCCACAGCAGGGGAGTTTACCACAGAGACTTAAAGCCGGAAAA
CTTGCTTTTAGATGCTCAAGGCAATCTGAAAGTCTCTGATTTTGGATCGAGTGCCTTGTC
CAGACAAGTCAGGGGAGATGGTCTTCTTCACACTGCATGCGGAACTCCGAACTATGCTGC
TCCTGAGGTTCTTAATGATCAAGGCTATGATGGGGCAACCGCAGACTTGTGGTCTTGTGG
AGTGACACTCTTTGTACTACTTGCTGGTTATTTGCCTTTCGAGGATTCTAATCTCATGAC
TCTCTATAAAA*GATAACAGCTGCTGAATATAACTTTCCTCCTTGGCTCTCTCCTGGTGC
CAAGAACTTGATCCACCGAATCTTGGATCCAAACC

QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1H654TF 779 0 0
A
GTAAATACGAGGTCGGGAAAACGATTGGACAAGGCACTTTTGCTAAAGTTAGGTATGCTA
AGAACACCGAGACTGGTGAATCGGTGGCTCTTAAGATTCTTGACAAAGAGAAGGTTCTCA
AGAACAAGATGTCTGAACAGATAAGGAGAGAAATCTCAACTATGAAGCTGATAAACCATC
CTAATGTAGTGCGCCTCTATGAGGTTTTGGCGAGCAAGACAAAGATATACATTGTCCTCG
AATTCGGCATTGGTGGAGAGCTTTTTGACAAAATTGTGCATGATGGGCGCTTGCAAGAAG
ATGCAGCACGGAGATATTTTCAGCAGCTTATCAATGCTGTTGATTACTGCCACAGCAGGG
GAGTTTACCACAGAGACTTAAAGCCGGAAAACTTGCTTTTAGATGCTCAAGGCAATCTGA
AAGTCTCTGATTTTGGATTGAGTGCCTTGTCCAGACAAGTCAGGGGAGATGGTCTTCTTC
ACACTGCATGCGGAACTCCGAACCATGCTGCTCCTGAGGTTCTTAATGATCAAGGCTATG
ATGGGGCACCCGCAGACTTGTGGTCTTGTGGAGTGATACTCTTTGTACTACTTGCTGGTT
ATTTGCCTTTCGAGGATTCTAATCTCATGACTCTCTATAAAAAGATAACAGCTGCTGAAT
ATAACTTTCCTCCTTGGCTCTCTCCTGGTGCCAAGAACTTGATCCACCGAATCT*GGATC
CAAACCCG*TGACTCGTATCACAATTCA*GAGATTCTGGAAGATGTGTGGTTCA
GAAA

QA 2 775 2 775
DS 

RD RS1CH20JQ 824 0 0
TTCGAGGATCT
ATCTCATGACTCTCTATAAAA*GATAACAGCTGCTGAATATA*CTTTCCTCCTTGGCTCT
CTCCTGGTGCCAAGAACTTGATCCACCGAATCTTGGATCCAAACCCGGTGACTCGTATCA
CAATTCAAGAGATTCTGGAAGATGTGTGGTTCAAGAAAAATTACAAGCCAGCTGTCTTCG
AGGAGAAAGAAGAAGCAAACTTGGATGATGTAGAAGCTGTTTTCAAAGACTCAGAAGAGC
ATCATGTCACAGAAAAGAAAGAGGAGCAGCCGACTTCAATGAATGCCTTTGAGTTGATAT
CAATGTCGAGAGCTCTGGATCTGGGGAACTTGTTTGAAGAAGAAGAGGGGTACAAAAGAG
AAACAAGATTTGCAGCTACGGGCGCTGCTAATGAATTAGTCCAGAAGATTGAAGAAGCTT
CTAAGCCTCTTGGTTTCGATATTCAGAAGAAAAACTATAAGATGAGACTTGAAAACGTGA
ATGCAGGAAGGAAAGGAAACCTAAAAGTGGCGACTGAGATATTTCAAGTATCACCGTCTC
TTCATATGGTGGAAGTCCGGAAAACTAAAGGAGATACATTAGAGTTCCATAAGTTCTACA
AGAAGCTCTCGACCACACTTAACGATGTGGTTTGGAAATCCGGCGAGAGCTCTGGACTTA
ACAACAAATAAGAACAAAACTCTGGACTCGATCAAATCTGTTTGGCTCTCTTATTCTGTA
TTATCTTTTGTTTCTTGTTTCTTTTTATTGGACTCGATTCTTTTGAACAATTTTAAATAT
CGAAGTATGTGCGGTAAGGTGTTTATTATATAT

QA 12 824 12 824
DS 



AS 1 3

CO CL3664Contig1 832 3 4 U
CTAAAAGCAATGTCGAGGCGATGGGCGAGAGTAGCCGGATTGTTCAGAAGCAAGAGTTTC
ATCGGAGCGGACAAGACCGGTAACAAGTACTTCTCCAGGATGGAGGAGATCGACGGTCTG
GTGAAGGAGAAGCGATGGGTTGTCTTTAGACGAGAAGAGGACCCAACCTCTGTTCCTGTT
GAATGGATATGTTGGCTGAACTTGAAGCAAGGCGTGAGCGTGTGAAGCTTAATGTTGCTC
GTCTCAAGAAAGAAGAGGAGGAGAGGAAAGCCCGAGAAGGAACTGGCCGCAAAATCACGA
CCATCGGTAAAGTTGAGGGTCCAGATTTGACAAGCTTTGTTCGCCATTTCCCACCGGATT
CTAAAGGTGATAAAAGAGAGGATGCTAGTGAAGAAGCAGATCAATCAAGGGTCAAGGAAC
ATGAACCCCAGATAGTTACTGCAGAACCACCCGAACCAAAGACAACAGAGCCATCAGGGT
CCGGATCATCATTTAGGCCCGGGACCTGGCAGCCACCATCCTAAACTCATCTCAATATCT
CATGTTCACGCTCGCAGTAACAACCAACAAAGTTGTTTTGTCCAATCTTCTGTTTGTTGT
AGTCTATTGTGTTTGAATCTTACATATTATTCAGAGAGAGAGAGAGCTTGTGAGGACCCT
AAAATGTGCGGCCTTTCACACGTTGTTATTGAGGACTTAGAAGAGTCAAAAATGAAAAGC
CATCTCTCACCTTATGATTTGTTTTGTTTGGTGAGAGTTGTCTCTTGGCATTGTGCTCGA
GACTTTGATTTTCTTTGTGCCTTAATAGCTTAAGAAGAGTCCTATCATTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FF84TF U 1
AF RS1FF84JQ C 106
AF RS1E275TF U 278
BS 1 711 RS1FF84TF
BS 712 712 RS1E275TF
BS 713 765 RS1FF84TF
BS 766 832 RS1E275TF

RD RS1FF84TF 765 0 0
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ATCGGAGCGGACAAGACCGGTAACAAGTACTTCTCCAGGATGGAGGAGATCGACGGTCTG
GTGAAGGAGAAGCGATGGGTTGTCTTTAGACGAGAAGAGGACCCAACCTCTGTTCCTGTT
GAATGGATATGTTGGCTGAACTTGAAGCAAGGCGTGAGCGTGTGAAGCTTAATGTTGCTC
GTCTCAAGAAAGAAGAGGAGGAGAGGAAAGCCCGAGAAGGAACTGGCCGCAAAATCACGA
CCATCGGTAAAGTTGAGGGTCCAGATTTGACAAGCTTTGTTCGCCATTTCCCACCGGATT
CTAAAGGTGATAAAAGAGAGGATGCTAGTGAAGAAGCAGATCAATCAAGGGTCAAGGAAC
ATGAACCCCAGATAGTTACTGCAGAACCACCCGAACCAAAGACAACAGAGCCATCAGGGT
CCGGATCATCATTTAGGCCCGGGACCTGGCAGCCACCATCCTAAACTCATCTCAATATCT
CATGTTCACGCTCGCAGTAACAACCAACAAAGTTGTTTTGTCCAATCTTCTGTTTGTTGT
AGTCTATTGTGTTTGAATCTTACATATTATTCAGAGAGAGAGAGAGCTTGTGAGGACCCT
AAAATGTGCGGCCTTTCACACGTTGTTATTGAGGACTTAGAAGAGTCAAAA*TGAAAAGC
CATCTCTCACCTTATGATTTGTTTTGTTTGGTGAGAGTTGTCTCT

QA 1 765 1 765
DS 

RD RS1FF84JQ 664 0 0
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ACCTCTGTTCCTGTTGAATGGATATGTTGGCTGAACTTGAAGCAAGGCGTGAGCGTGTGA
AGCTTAATGTTGCTCGTCTCAAGAAAGAAGAGGAGGAGAGGAAAGCCCGAGAAGGAACTG
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ATTTCCCACCGGATTTTAAAGGTGATAAAAGAGAGGATGCTAGTGAAGAAGCAGATCAAT
CAAGGGTCAAGGAACATGAACCCCAGATAGTTACTGCAGAACCACCCGAACCAAAGACAA
CAGAGCCATCAGGGTCCGGATCATCATTTAGGCCCGGGACCTGGCAGCCACCATCCTAAA
CTCATCTCAATATTTCATGTTCACGCTCGCAGTAACAACCAACAAAGTTGTTTTGTCCAA
TCTTCTGTTTGTTGTAGTCTATTGTGTTTGAATCTTACATATTATTCAGAGAGAGAGAGA
GCTTGTGAGGACCCTAAAATGTGCGGCCTTTCACACGTTGTTATTGAGGACTTAGAAGAG
TCAAAAATGAAAAGCCATCTCTCACCTTATGATTTGTTTTGTTTGGTGAGAGTTGTCTCT
TGGC

QA 1 660 1 660
DS 

RD RS1E275TF 555 0 0
G
GGAACTGGCCGCAAAATCACGACCATCGGTAAAGTTGAGGGTCCAGATTTGACAAGCTTT
GTTCGCCATTTCCCACCGGATTCTAAAGGTGATAAAAGAGAGGATGCTAGTGAAGAAGCA
GATCAATCAAGGGTCAAGGAACATGAACCCCAGATAGTTACTGCAGAACCACCCGAACCA
AAGACAACAGAGCCATCAGGGTCCGGATCATCATTTAGGCCCGGGACCTGGCAGCCACCA
TCCTAAACTCATCTCAATATCTCATGTTCACGCTCGCAGTAACAACCAACAAAGTTGTTT
TGTCCAATCTTCTGTTTGTTGTAGTCTATTGTGTTTGAATCTTACATATTATTCAGAGAG
AGAGAGAGCTTGTGAGGACCCTAAAATGTGCGGCCTTTCACACGTTGTTATTGAGGACTT
AGAAGAGTCAAAAATGAAAAGCCATCTCTCACCTTATGATTTGTTTTGTTTGGTGAGAGT
TGTCTCTTGGCATTGTGCTCGAGACTTTGATTTTCTTTGTGCCTTAATAGCTTAAGAAGA
GTCCTATCATTCAC

QA 2 555 2 555
DS 



AS 1 2

CO CL3665Contig1 595 2 2 U
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AGTCATCTTCAAGATTCAGTACGTAACGAACTGGCCAGACAGCGACAGGAGAATGAGCAA
GCACATCAACTGGATCAGAGATCTCTACAGTTTCATGACTCCTTATGTCTCTGCGAATCC
GCGACAAGCTTACGTGAACTACCGTGATCTAGACCTGGGACAGAACAAAAAGAACTGTGA
GTCGGGCATCAACCAAGCTCAAGTCTGGGGAGCTAGTTACTTCAAAGGAAATTTCGAGAG
GTTGGTGAAGATTAAAACAAAGGTTGATCCTAACAATTTCTTCAGACATGAACAGAGTAT
CCCACCTATGCTGGTTCGAAACTGAAGCTCAAGAATATCAAATTAGAATAAAGTAGAAGA
GATCAGATTATGGTTCTTCTATATTTCAGATAAAATGTTTTAGCTAATAATATTAAGGCA
AGCATGTAGTGGACTTTGTTTTAACCTAAAATTCGAAGCGTTGCTTCTTATGAGTCAGAC
AAGTTGTTTTTAATTAGTTCCCAGTTCCTTGATCAACTTTACTACTCTAGAATCG


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FL90JQ C 1
AF RS1FL90TF U 1
BS 1 1 RS1FL90JQ
BS 2 595 RS1FL90TF

RD RS1FL90JQ 595 0 0
GTACGGAGGAATGATGGCGAAGATCCCTGAATCGCAGATACCATTTCCGCATAGAAAGGG
AGTCATCTTCAAGATTCAGTACGTAACGAACTGGCCAGACAGCGACAGGAGAATGAGCAA
GCACATCAACTGGATCAGAGATCTCTACAGTTTCATGACTCCTTATGTCTTTGCGAATCC
GCGACAAGCTTACGTGAACTACCGTGATCTAGACCTGGGACAGAACAAAAAGAACTGTGA
GTCGGGCATCAACCAAGCTCAAGTTTGGGGAGCTAGTTACTTCAAAGGAAATTTCGAGAG
GTTGGTGAAGATTAAAACAAAGGTTGATCCTAACAATTTCTTCAGACATGAACAGAGTAT
CCCACCTATGCTGGTTCGAAACTGAAGCTCAAGAATATCAAATTAGAATAAAGTAGAAGA
GATCAGATTATGGTTTTTCTATATTTCAGATAAAATGTTTTAGCTAATAATATTAAGGCA
AGCATGTAGTGGACTTTGTTTTAACCTAAAATTCGAAGCGTTGCTTCTTATGAGTCAGAC
AAGTTGTTTTTAATTAGTTCCCAGTTCCTTGATCAACTTTACTACTCTAGAATCG

QA 1 595 1 595
DS 

RD RS1FL90TF 595 0 0
G
TACGGAGGAATGATGGCGAAGATCCCTGAATCGCAGATACCATTTCCGCATAGAAAGGGA
GTCATCTTCAAGATTCAGTACGTAACGAACTGGCCAGACAGCGACAGGAGAATGAGCAAG
CACATCAACTGGATCAGAGATCTCTACAGTTTCATGACTCCTTATGTCTCTGCGAATCCG
CGACAAGCTTACGTGAACTACCGTGATCTAGACCTGGGACAGAACAAAAAGAACTGTGAG
TCGGGCATCAACCAAGCTCAAGTCTGGGGAGCTAGTTACTTCAAAGGAAATTTCGAGAGG
TTGGTGAAGATTAAAACAAAGGTTGATCCTAACAATTTCTTCAGACATGAACAGAGTATC
CCACCTATGCTGGTTCGAAACTGAAGCTCAAGAATATCAAATTAGAATAAAGTAGAAGAG
ATCAGATTATGGTTCTTCTATATTTCAGATAAAATGTTTTAGCTAATAATATTAAGGCAA
GCATGTAGTGGACTTTGTTTTAACCTAAAATTCGAAGCGTTGCTTCTTATGAGTCAGACA
AGTTGTTTTTAATTAGTTCCCAGTTCCTTGATCAACTTTACTACTCTAGAATCG

QA 2 595 2 595
DS 



AS 1 3

CO CL3666Contig1 1024 3 5 U
GATGGATCCGGCTCATGTCCCTATCTCTCATGACAGAACTGACTTCACTGCTAAAAGAGA
AGATGCGCAGCCGCTTGTCTTTGAGGTCACGGAGAGAACTAACCGTGGTTTCGCGGGGAC
TTGGGGACGGGAGAAGGCGGAAAAGGGAGTAATTTACTCCGGTTCAGTGCTCCATGTGTT
CTGCAGAACAACCGAGAGTTTGAGGGAAAGGACGGGGTGAAGAACTACTTTTCAGGGCTG
TTTCTTTGTAGACCTACAGGACAGGGGAAGTCTATGCTTATAGTTAGGTTTGGTGTCACG
AAAAGATCGCCTTTGGTTCAGGTGTTACCTCTATGGTTCTGGCATCAGAGTGCATGCAAG
GTCTTTGAACAGGACATGGGGTTCCTATCGTCACAAAACGAGGTTTTGATGAAGGAGAAT
GTACCAACAAAGGAGTTGTATCTTAACCTAAAGTCATCAGACACGTGGGTTGCTGAATAT
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TCTCTCCCTAAGGTCCCTCCTGTGGTGGAACACGCCCCTGCGGGACTCATTGCAGGTCTC
TCGGCTTCTTACCCTGCAAAAGGTGGAGTTGGTACTATGCACGCTCCCAATTTGGCTAAC
CGCTACTTCAGACATGTGATCCATTGTAGAAGCTGCAGCAAAGTGATCAAATCTTTTGAA
CTCTGGAAAAATATCCTCTTTGGCACAGCCGTGGCCTTGACGGCTTTGGCCATTATGGTG
GTTAGTAGGCAGTGGAAGGCTGTACTGTTAGGTTCAGCTGCGTTGTGCTCAGCTTCAGCT
TATGCTTGCTTAAGAGCTATACAAATGAACACCAATAACTTCATTAGAACACACAGAAGG
CTATGAAAAAATGTGTACCGGCATGGCATGTCTCTTCTTCCTACCAATTTGTATTTCTAT
AAAATACTATTTTGCTTGTGATCATGAAGTTTATATGTTGCAAAAACTTGAGCCATTTCT
TCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1BI38TF U 1
AF RS1BI38JQ C 335
AF RS1FB20TF U 709
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BS 741 741 RS1BI38JQ
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GTACCAACAAAGGAGTTGTATCTTAACCTAAAGTCATCAGACACGTGGGTTGCTGAATAT
AGAAAGTGGATGGACAAAGTTGGTCATGGGATGCCTTACCATTTCGGGCATAGGACAATC
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CTATGCAGGCTCCCAATTTGGCTAACCGCTACTTCAGACATGTGATCCATTGTAGAAGCT
GCAGCAAAGTGATCAAATCTTTTGAACTCTGGAAAAATATCCTCTTTGGCACAGCCGTGG
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QA 1 629 1 629
DS 

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G
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CAGCTTCAGCTTATGCTTGCTTAAGAGCTATACAAATGAACACCAATAACTTCATTAGAA
CACACAGAAGGCTATGAAAAAATGTGTACCGGCATGGCATGTCTCTTCTTCCTACCAATT
TGTATTTCTATAAAATACTATTTTGCTTGTGATCATGAAGTTTATATGTTGCAAAAACTT
GAGCCATTTCTTCTC

QA 2 316 2 316
DS 



AS 1 3

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TCATCTTTCTCCAATGGCTGCCATTACCGCATTCTCTGCTCTCTCCAGCCCCATCTCTCC
TCTTACGGCGTCTCCTTTACTCAGTTCCCCTCCATCTCTCTCCAGATTCCCAAACGCGTC
TCTGTTTCCCTCGCTCTATACCTCTCGCTGGAGAAAGATCCCGATGATCCAGGCGTGTTC
TTCTATTAGCGACGGAGATGAAACGGTCGAAGAAACAGGAAGCGGTTATGAGGAGAGTAA
AGAGGAGACTCTGATGCTATCAGTCTCTCCTCTGCCTCTCCTCCTCGTTGCAGCCCTCCC
TGGAGCTGGGACTGTAAGATCTGTTATTGGTCCCTTTGTGGAGATTGTGAAGTCACTGAA
CCTACCTGATTGGCTTGTTCATTGGGGTCATCCTGGGAACATGGCAGTGGTTCTTTTTGC
TATGGGTGGATATGGAACATACCTAGGCTTCCGGATTCGTTATTCAGATGACATTGAGGA
GAAGGCAAAGGCGAAAGATCTGCACCCAAAGCTTCTAGCAGGAATGTTTTTCTTTTTTGC
CCTTGGAGCCACTGGTGGTATCACATCCCTCCTTACCTCAGACAAACCCATCTTCGAAAG
TCCGCACGCTGTTACAGGATTCATAGGTCTTGCTCTCTTGACGATTCAAACAGTCTTACC
AACTTTGTTCAAGGAGAAGCCTGAGCTGAGGGGAGTGCACGGGATCCTGGGGAGTGGGAT
AATGGCGCTTTTCCTAGTCCATGCTGCTTTCTGACTTCAGCTTGGTCTCAGTTACTGATC
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GATTTTATATATAGAGGTCAAAAAGTTTGTAAAATAATTTGAACATTGTTTGTCTTTGTT
TATAATTTGTTTATGTTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GT69TF U 1
AF RS1A576TF U 81
AF RS1GT69JQ C 164
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RD RS1GT69TF 685 0 0
GGACTTCCCCTTCACCTTTACCAACACATACACACTGCACACCACGAGACTACTTAACAC
TCATCTTTCTCCAATGGCTGCCATTACCGCATTCTCTGCTCTCTCCAGCCCCATCTCTCC
TCTTACGGCGTCTCCTTTACTCAGTTCCCCTCCATCTCTCTCCAGATTCCCAAACGCGTC
TCTGTTTCCCTCGCTCTATACCTCTCGCTGGAGAAAGATCCCGATGATCCAGGCGTGTTC
TTCTATTAGCGACGGAGATGAAACGGTCGAAGAAACAGGAAGCGGTTATGAGGAGAGTAA
AGAGGAGACTCTGATGCTATCAGTCTCTCCTCTGCCTCTCCTCCTCGTTGCAGCCCTCCC
TGGAGCTGGGACTGTAAGATCTGTTATTGGTCCCTTTGTGGAGATTGTGAAGTCACTGAA
CCTACCTGATTGGCTTGTTCATTGGGGTCATCCTGGGAACATGGCAGTGGTTCTTTTTGC
TATGGGTGGATATGGAACATACCTAGGCTTCCGGATTCGTTATTCAGATGACATTGAGGA
GAAGGCAAAGGCGAAAGATCTGCACCCAAAGCTTCTAGCAG*AATGTTTTTCTTTTTTGC
CCTTGGAGCCACTGGTGGTATCACATCCCTCCTTACCTCAGACAAACCCATCTTCGAAAG
TCCGCACGCTGTTACAGGATTCAT
A

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1A576TF 604 0 0
CCATTACCGCATTCTCTGCTCTCTCCAGCCCCATCTCTCCTCTTACGGCGTCTCCTTTAC
TCAGTTCCCCTCCATCTCTCTCCAGATTCCCAAACGCGTCTCTGTTTCCCTCGCTCTATA
CCTCTCGCTGGAGAAAGATCCCGATGATCCAGGCGTGTTCTTCTATTAGCGACGGAGATG
AAACGGTCGAAGAAACAGGAAGCGGTTATGAGGAGAGTAAAGAGGAGACTCTGATGCTAT
CAGTCTCTCCTCTGCCTCTCCTCCTCGTTGCAGCCCTCCCTGGAGCTGGGACTGTAAGAT
CTGTTATTGGTCCCTTTGTGGAGATTGTGAAGTCACTGAACCTACCTGATTGGCTTGTTC
ATTGGGGTCATCCTGGGAACATGGCAGTGGTTCTTTTTGCTATGGGTGGATATGGAACAT
ACCTAGGCTTCCGGATTCGTTATTCAGATGACATTGAGGAGAAGGCAAAGGCGAAAGATC
TGCACCCAAAGCTTCTAGCAGGAATGTTTTTCTTTTT*GCCCTTGGAGCCACTGGTGGTA
TCACATCCCTCCTTACCTCAGACAAACCCATCTTCGAAAGTCCGCACGCTGTTACAGGAT
TCAT

QA 1 604 1 604
DS 

RD RS1GT69JQ 818 0 0
AGATTCCCAAACGCGTCTCTGTTTCCCTCGCTCTATACCTCTCGCTGGAGAAAGATCCCG
ATGATCCAGGCGTGTTCTTCTATTAGCGACGGAGATGAAACGGTCGAAGAAACAGGAAGC
GGTTATGAGGAGAGTAAAGAGGAGACTCTGATGCTATCAGTCTCTCCTCTGCCTCTCCTC
CTCGTTGCAGCCCTCCCTGGAGCTGGGACTGTAAGATCTGTTATTGGTCCCTTTGTGGAG
ATTGTGAAGTCACTGAACCTACCTGATTGGCTTGTTCATTGGGGTCATCCTGGGAACATG
GCAGTGGTTCTTTTTGCTATGGGTGGATATGGAACATACCTAGGCTTCCGGATTCGTTAT
TCAGATGACATTGAGGAGAAGGCAAAGGCGAAAGATCTGCACCCAAAGCTTCTAGCAGGA
ATGTTTTTTTTTTTTGCCCTTGGAGCCACTGGTGGTATCACATCCCTCCTTACCTCAGAC
AAACCCATCTTCGAAAGTCCGCACGCTGTTACAGGATTCATAGGTCTTGCTCTCTTGACG
ATTCAAACAGTCTTACCAACTTTGTTCAAGGAGAAGCCTGAGCTGAGGGGAGTGCACGGG
ATCCTGGGGAGTGGGATAATGGCGCTTTTCCTAGTCCATGCTGCTTTCTGACTTCAGCTT
GGTCTCAGTTACTGATCTCCTCCTCCTCTCATTTGTTTTTTTTTATTCTTCTTCAGCTGC
ATGTAACGACTTGAGGAGATTTTATATATAGAGGTCAAAAAGTTTGTAAAATAATTTGAA
CATTGTTTGTCTTTGTTTATAATTTGTTTATGTTTTAT

QA 1 818 1 818
DS 



AS 1 2

CO CL3668Contig1 755 2 14 U
GGGGAGAAGAAGCAAACTTTGAACCTCCGTCGTCAGGAAAAAAAAAGAGAAAACAGATCG
GAGGAGGAAGTAGACATATCCCCGGAGAGAGAGAGTCACAGATTAACTAGCTAGTAAGCA
ATGGATGTGATAAAGACGCAACAGATATCAGCGAGAACCATCGAGAAGGTTGTCGTTCAT
CCACTCGTCTCGCTCAGCATCGTCGACCATTACAACCGCGTCGCCAAGGACTCGCGCAAG
CGCGTCGTCGGCGTTCTTCTAGGGAGCAGCTCCCGTGGTGTCGTCGACGTCACCAACAGC
TACGCAGTGCCATTTGAGGAAGATGACAAAGACCCAAGTATCTGGTTTCTTGATCACAAC
TACCATGAGTCAATGTTCCACATGTTCAAGAGAATTAATGCGAAGGAGCATGTTGTAGGT
TGGTACAGCACAGGCCCTAAACTACGAGAGAATGATTTAGACGTTCATGCGCTCTTCAGT
GGATATGTTCCAAATCCAGTGCTAGTCATTATTGATGTCCAGCCTAAAGAACTGGGAATC
CCCACTAAAGCTTACTATGCAGTTGAGGAGGTCAAGGAGAATGCTACTCAGAAAAGCCAG
AAAGTCTTCGTTCACGTATCTACAGAAATTGCTGCTCACGAAGTCGAGGAAATCGGCGTG
GAACATTTGCTGAGGGATGTGAAAGACACAACTATCAGTACCCTGGCGACTGAGTTACTG
CCAAACTTACTGCTTTGAAGGGCTGGACGCACGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G772TF U 1
AF RS1ED20TF U 28
BS 1 194 RS1G772TF
BS 195 195 RS1ED20TF
BS 196 233 RS1G772TF
BS 234 234 RS1ED20TF
BS 235 269 RS1G772TF
BS 270 270 RS1ED20TF
BS 271 458 RS1G772TF
BS 459 459 RS1ED20TF
BS 460 614 RS1G772TF
BS 615 615 RS1ED20TF
BS 616 638 RS1G772TF
BS 639 639 RS1ED20TF
BS 640 738 RS1G772TF
BS 739 755 RS1ED20TF

RD RS1G772TF 738 0 0
GGGGAGAAGAAGCAAACTTTGAACCTCCGTCGTCAGGAAAAAAAAAGAGAAAACAGATCG
GAGGAGGAAGTAGACATATCCCCGGAGAGAGAGAGTCACAGATTAACTAGCTAGTAAGCA
ATGGATGTGATAAAGACGCAACAGATATCAGCGAGAACCATCGAGAAGGTTGTCGTTCAT
CCACTCGTCTCGCTTAGCATCGTCGACCATTACAACCGCGTCGCCAAGGACTCTCGCAAG
CGCGTCGTCGGCGTTCTTCTAGGGAGCAGTTCCCGTGGTGTCGTCGACGTCACCAACAGC
TACGCAGTGCCATTTGAGGAAGATGACAAAGACCCAAGTATCTGGTTTCTTGATCACAAC
TACCATGAGTCAATGTTCCACATGTTCAAGAGAATTAATGCGAAGGAGCATGTTGTAGGT
TGGTACAGCACAGGCCCTAAACTACGAGAGAATGATTTGGACGTTCATGCGCTCTTCAGT
GGATATGTTCCAAATCCAGTGCTAGTCATTATTGATGTCCAGCCTAAAGAACTGGGAATC
CCCACTAAAGCTTACTATGCAGTTGAGGAGGTCAAGGAGAATGCTACTCAGAAAAGCCAG
AAAGTCTTCGTTCATGTATCTACAGAAATTGCTGCTCATGAAGTCGAGGAAATCGGCGTG
GAACATTTGCTGAGGGATGTGAAAGACACAACTATCAGTACCCTGGCGACTGAGTTACTG
CCAAACTTACTGCTTTGA

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1ED20TF 728 0 0
GTCGTCAGAA
AAAAAAAAAGAGAAAACAGATCGGAGGAGGAAGTAGACATATCCCCGGAGAGAGAGAGTC
ACAGATTAACTAGCTAGTAAGCAATGGATGTGATAAAGACGCAACAGATATCAGCGAGAA
CCATCGAGAAGGTTGTCGTTCATCCACTCGTCTTGCTCAGCATCGTCGACCATTACAACC
GCGTCGCCAAGGACTCGCGCAAGCGCGTCGTCGGTGTTCTTCTAGGGAGCAGCTCCCGTG
GTGTCGTTGACGTCACCAACAGCTACGCAGTGCCGTTTGAGGAAGATGACAAAGACCCAA
GTATCTGGTTTCTTGATCACAACTACCATGAGTCAATGTTCCACATGTTCAAGAGAATTA
ATGCGAAGGAGCATGTTGTAGGTTGGTACGGCACAGGCCCTAAACTACGAGAGAATGATT
TAGACGTTCATGCGCTCTTCAGTGGTTATGTTCCAAATCCAGTGTTGGTCATTATTGATG
TCCAGCCTAAAGAACTGGGAATCCCCACTAAAGCTTACTATGCAGTTGAGGAGGTCAAGG
AGAATGCTACTCAGAAAAGCCAGAAAGTCTTCGTTCACGTATCTACAGAAATTGCTGCTC
ACGAAGTCGAGGAAATCGGCGTGGAACATTTGCTGAGGGATGTGAAAGACACAACTATCA
GTACCCTGGCGACTGAGTTACTGCCAAACTTACTGCTTTGAAGGGCTGGACGCACGTC

QA 11 728 11 728
DS 



AS 1 2

CO CL3669Contig1 1046 2 2 U
GCAGATCCATTTTGCAAAACATCCTCAAATAAGCGAGCTTCTTTGGGAGCACTGGTTTCA
GAGACTTCTGCATAGTTACTAAATGGACTTTCCTTAGCGGTTTCCTCGGGGGAAACATCC
TCAAAGGCTGTATTACAAAAGTTATAGCAACATCCAAATCAGAAGCTTAGAAAATGAGAA
AGCAAGAAGGATACAAGAGAAAGGCTTTTTTTTCTGAAACAGAAGAGAATCTACCGTAGT
TCTTTTCTTCTTTCTTGGCTTTGTTTTCCTCTAAGACAACACTTGGCTTATCCACTTCTA
TATTCTTTACAGGGGCAGGCTGCGGCTTAGTCGAAGGAGGTGTGTCTACTTTTGTCGCTG
TTACATCAACAGTAGCACTTGAAGACTGGGATTGAGATTGGAACGGAGAGGGAGTAGGAG
TTGTTTGGGGAGGAAATGGAAAAGGAAAAGGCGATCCTGTTCCTGGTGCTGTCGGGAATC
CAGGATTGTTAAACTGGCTGTTCTGCGTGTTCATCTGGTTCATCATTGTCTTCATAGCTG
TTTGCATTGCATATTTCTTTAAGTTTGAAGTTGCCCATGAGAACAAAGCTGATAGCCCAA
CCCCAACACCAATCCAGAAAAGTGGTGATCCTATGGTGGTTGATGATGACGATGAAGATG
GTGGTGGCACTGCCGCACTAGGGTAAGCAACAACAGAGGATGTCTGCTGATCACGACTCG
AAGAAAAAATACTCGCAAAAGCTTTGCTCCTGTGCTTCATCACAACCACAGTTTCCCCAG
CGTTCTCCGGAGATTTAGAGGTTTTGGAGCAACGGAGGGTGATTCTAGGAGTCCGGCGCG
AAAACCCTACTGGGGTAGTTGTAAGCGAGGAAGTGAAATTGCGTCCGATTAACAACTTGG
GAGAAGAAGAAGAAGAAGATGATGAAGACGAAACTAGGGTTAGGTTCTCCATGTTTATTA
CTGCAATGAAGAAACAGAAGACAATTCTGGTGGAGAAGGTTCGACAGATATGATGAGGAA
GAAGAGACACTACCACTCTTTGGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TCAAAGGCTGTATTACAAAAGTTATAGCAACATCCAAATCAGAAGCTTAGAAAATGAGAA
AGCAAGAAGGATACAAGAGAAAGGCTTTTTTTTCTGAAACAGAAGAGAATCTACCGTAGT
TCTTTTCTTCTTTCTTGGCTTTGTTTTCCTCTAAGACAACACTTGGCTTATCCACTTCTA
TATTCTTTACAGGGGCAGGCTGCGGCTTAGTCGAAGGAGGTGTGTCTACTTTTGTCGCTG
TTACATCAACAGTAGCACTTGAAGACTGGGATTGAGATTGGAACGGAGAGGGAGTAGGAG
TTGTTTGGGGAGGAAATGGAAAAGGAAAAGGCGATCCTGTTCCTGGTGCTGTCGGGAATC
CAGGATTGTTAAACTGGCTGTTCTGCGTGTTCATCTGGTTCATCATTGTCTTCATAGCTG
TTTGCATTGCATATTTCTTTAAGTTTGAAGTTGCCCATGAGAACAAAGCTGATAGCCCAA
CCCCAACACCAATCCAGAAAAGTGGTGATCCTATGGTGGTTGATGATGACGATGAAGATG
GTGGTGGCACTGCCGCACTAGGGTAAGCAACAACAGAGGATGTCTGCTGATCACGACT

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DS 

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GTGATCCTATGGTGGTTGATGATGACGATGAAGATGGTGGTGGCACTGCCGCACTAGGGT
AAGCAACAACAGAGGATGTTTGCTGATCACGACTCGAAGAAAAAATACTCGCAAAAGCTT
TGCTCCTGTGCTTCATCACAACCACAGTTTCCCCAGCGTTCTCCGGAGATTTAGAGGTTT
TGGAGCAACGGAGGGTGATTCTAGGAGTCCGGCGCGAAAACCCTACTGGGGTAGTTGTAA
GCGAGGAAGTGAAATTGCGTCCGATTAACAACTTGGGAGAAGAAGAAGAAGAAGATGATG
AAGACGAAACTAGGGTTAGGTTCTCCATGTTTATTACTGCAATGAAGAAACAGAAGACAA
TTCTGGTGGAGAAGGTTCGACAGATATGATGAGGAAGAAGAGACACTACCACTCTTTGGT
CT

QA 1 542 1 542
DS 



AS 1 2

CO CL3670Contig1 856 2 36 U
GAGTGACAAAGTTTATGAGTACATATTGTTCCGTGGTACTGATATCAAGGATTTGCAAGT
CAAAGCTTCTCCTCCAGCTCCACCTACTCTTAACAATGACCCTGCTATCATTCAGTCTCA
CTACCCTAGCCCGATCACACCAGGTAATGAAGTTCACTGAAGATTTTGATTTCACAGCAA
TGAATGAAAAGTTCAATAAGGATGAAGTATGGGGTCATCTTGGGAAGAGCACCAATGGTG
ATGGCGACGATGATTACCCAGTCGTAGATGAACCGGAGGTGCCTAAAATCGAGGTCAAAC
CTGTTTACAACAAAGACGACTTTTTCGATAGCCTCTCGTCAAATTCCGGTGACAGAGACT
CCCAAAATCCAAGGCCTAGGTTCTCAGAGCTACGGAAACTAGATACTGAGACATTTGGTG
AGTCCTCAAGATTCAGAGGAGGCCGAGGAGGGCGTGGTGGTTATGGTCGAAACGGTCATT
CCCGTGGTGGTTATGGTGGTCGTGGCTATGGCGGCTATAATGGACGTGGCGGTGGTGGAG
GCTACGGGTATGGTGGTCGTGGCCAAGGGAGAGGCGTGTGAAATAGTACTACCCTAAAAG
TTGTGCTAAAAGGATTTCTAAAAGACTCGGGAATCCGATGGAGCTCATCATACTTTTGAG
TGCTTTTGGTATGTTGCAATAAAACAAAACACTTAAAAAGAGTCTTTATGTAATACATTT
TGTTGTTAGAGAAACCCCACCTGCGTGGTTTTCGAGTGTATCAATTTGATTTGCGATCTT
TTGTTATAAGAACTCCGTCTTTCAGTATTCAATGACATTTCCTTTTGTTTCTTTATAATA
CCGTCTTTCAGTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E317TF U 1
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TGAATGAAAAGTTCAATAAGGATGAAGTATGGGGTCATCTTGGGAAGAGCACCAATGGTG
ATGGTGACGATGATTACCCAGTCGTAGATGAGCCGGAGGTGCCTAAAATCGAGGTCAAAC
CTGTTTACAACAAAGACGACTTTTTCGATAGCCTCTCGTCAAATTCCGGTGACCGAGATT
CCCAAAATCCAAGGCCTAGGTTCTCAGAGCTACGTAAACTAGATACTGAGACATTTGGTG
AGTCCTCAAGATTCAGAGGAGGCCGAGGAGGGCGTGGTGGTTGTGGTCGAAACGGTCATT
CCCGTGGTGGTTATGGTGGTCGTGGCTATGGCGGCTATAATGGACGTGGCGGTGGTGGAG
GCTACGGGTATGGTGGTCGTGGCCAAGG*AGAGGCGTGTGAAATAGTACTACCCTAAAAG
TTGTGCTAAGAGGATTTCTAAAAGACTCTGGAATCCGATGGAGCTCATCATACTTT*GAG
TGCTTTTGGTATGTTGCAATAAAACAAAACACTTGA**AGAGTCTT*ATGTAATGCATTT
TGTTGTTAGAGAA*CCCCACCTGTGT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1DH89JQ 733 0 0
GAGCAGGG
CGATCACACCAGGTAATGAAGTTCACTGAAGATTTTGATTTCACAGCAATGAATGAAAAG
TTCAATAAGGATGAAGTATGGGGTCATCTTGGGAAGAGCACCAATGGTGATGGCGACGAT
GATTATCCAGTCGTAGATGAACCTGAGGTGCCTAAAATCGAGGTCAAACCTGTTTACAAC
AAAGACGACTTTTTCGATAGCCTCTCGTCAAATTCCGGTGACAGAGACTCCCAAAATGCA
AGGCCTAGGTTCTCAGAGCTACGGAAACTAGATACTGAGACATTTGGTGAGTTCTCAAGA
TTCAGAGGAGGCCGAGGAGGGCGTGGTGGTTATGGTCGAAACGGTCATTCCCGTGGTGGT
TATGGTGGTCGTGGCTATGGCGGCTATAATGGGCGTGGCGGTGGTGGAGGCTACGGGTAT
GGTGGTCGTGGCCAAGGGAGAGGCGTGTGAAATAGTACTACCCTAAAAGTTGTGCTAAAA
GGATTTCTAAAAGACTCGGGAATCCGATGGAGCTCATCGTACTTTTGAGTGCTTTTGGTA
TGTTGCAATAAAACAAA*CACTTAAAAAGAGTCTTTATGTATTAC*TTTTGTTGTTAGAG
AAACCCCCCCTGCGTGGTTTTCGAGTGTATCAATTTGATTTGCGATCTTTTGTTATAAGA
ACTCCGTCTTTCAGTATTCAATGACATTTCCTTTTGTTTCTTTATAATACCGTCTTTCAG
TATCC

QA 9 733 9 733
DS 



AS 1 3

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GGATAATTCCTCATTCGTTGTCTCTCTCTCAAAAGATATATACAAAGTATAGGTTAGGGA
GAAAGAGAGAGAGAGATAGAGTGTATGATGGAGATAACGCCAAAAAGGTATTGGCGGAGG
TGGAAAGGATACGAGAAGCTTGATGGATCATCAACGGCGGGTCGAAGGAATGGAAAACGG
GTCAAAATGGATCCGACCAAGAAGAAACGCCTTTGGAAGATCAAGATTATGCCAAAACTG
AAAATTCTCAGAAGAGCGTCGGCTAAGAAGTTTCTGGTCTGGTTACAGGACTCTTATGTT
AATATGATGATGAAGTTGGCGAACTCACGGGCCGTAGGAGCTTCTGGATACGGTGGATCC
GGTTTTGGGTCGGGTCGTCAGATGAAGGAGTACGATGAGAAAATGCTTGTAGAGATTTAC
AAGACGATATTGATGGCGCAGTCTCAGGGGAAACTCACGCACCACGACACAGCTAATAAG
CTTCCAGCTGAGCCAGCGGTTGTCTCTGTTTATCCTGTTGTTAGGTTAAACCCGGGTCAA
TGATGACACAAGCCTAACCTCCGAGTGGAGGTATAGCCCACGGATAGACCCTCTCCTGGA
CATTCAAATGAGTCGAAAACAATGGACCCATATCCGTGTGGCCAGTGAGAATCGAATCTG
GGACCATATTGAGGCCGAAACTCTCTCAAGTACCTTTGACTTGTTTGATATTACTTTTCA
AGATTGCTGATAGCAAAGTTGTGATTTTGATCTCTATTAAATAAATATAAAAAAAGTTAT
TAT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1E377TF U 1
AF RS1DN94TF U 4
AF RS1DN94JQ C 27
BS 1 73 RS1E377TF
BS 74 75 RS1DN94TF
BS 76 179 RS1E377TF
BS 180 180 RS1DN94TF
BS 181 189 RS1E377TF
BS 190 190 RS1DN94TF
BS 191 245 RS1E377TF
BS 246 246 RS1DN94TF
BS 247 286 RS1E377TF
BS 287 287 RS1DN94TF
BS 288 521 RS1E377TF
BS 522 675 RS1DN94TF
BS 676 676 RS1DN94JQ
BS 677 720 RS1DN94TF
BS 721 721 RS1DN94JQ
BS 722 736 RS1DN94TF
BS 737 737 RS1DN94JQ
BS 738 764 RS1DN94TF
BS 765 783 RS1DN94JQ

RD RS1E377TF 521 0 0
GGATAATTCCTCATTCGTTGTCTCTCTCTCAAAAGATATATACAAAGTATAGGTTAGGGA
GAAAGAGAGAGAG**ATAGAGTGTATGATGGAGATAACGCCAAAAAGGTATTGGCGGAGG
TGGAAAGGATACGAGAAGCTTGATGGATCATCAACGGCGGGTCGAAGGAATGGAAAACGA
GTCAAAATGAATCCGACCAAGAAGAAACGCCTTTGGAAGATCAAGATTATGCCAAAACTG
AAAATCCTCAGAAGAGCGTCGGCTAAGAAGTTTCTGGTCTGGTTACGGGACTCTTATGTT
AATATGATGATGAAGTTGGCGAACTCACGGGCCGTAGGAGCTTCTGGATACGGTGGATCC
GGTTTTGGGTCGGGTCGTCAGATGAAGGAGTACGATGAGAAAATGCTTGTAGAGATTTAC
AAGACGATATTGATGGCGCAGTCTCAGGGGAAACTCACGCACCACGACACAGCTAATAAG
CTTCCAGCTGAGCCAGCGGTTGTCTCTGTTTATCCTGTTGT

QA 1 521 1 521
DS 

RD RS1DN94TF 767 0 0
GG
ATTCCTCATTCGTTGTCTCTCTCTCAAAAGATATATACAAAGTATAGGTTAGGGAGAAAG
AGAGAGAGAGATAGAGTGTATGATGGAGATAACGCCAAAAAGGTATTGGCGGAGGTGGAA
AGGATACGAGAAGCTTGATGGATCATCAACGGCGGGTCGAAGGAATGGAAAACGGGTCAA
AATGGATCCGACCAAGAAGAAACGCCTTTGGAAGATCAAGATTATGCCAAAACTGAAAAT
TCTCAGAAGAGCGTCGGCTAAGAAGTTTCTGGTCTGGTTACAGGACTCTTATGTTAATAT
GATGATGAAGTTGGCGAACTCACGGGCCGTAGGAGCTTCTGGATACGGTGGATCCGGTTT
TGGGTCGGGTCGTCAGATGAAGGAGTACGATGAGAAAATGCTTGTAGAGATTTACAAGAC
GATATTGATGGCGCAGTCTCAGGGGAAACTCACGCACCACGACACAGCTAATAAGCTTCC
AGCTGAGCCAGCGGTTGTCTCTGTTTATCCTGTTGTTAGGTTAAACCCGGGTCAATGATG
ACACAAGCCTAACCTCCGAGTGGAGGTATAGCCCACGGATAGACCCTCTCCTGGACATTC
AAATGAGTCGAAAACAATGGACCCATATCCGTGTGGCCAGTGAGAATCGAATCTGGGACC
ATATTGAGGC*GAAACTCTCTCAAGTACCTTTGACTTGTTTGATATTACTTTTCA*GATT
GCTGATAGCAA*GTTGTGATTTTGATCTCTATTAAATAA
TATAAA

QA 3 761 3 761
DS 

RD RS1DN94JQ 757 0 0
TCTCAAAAGATATATACAAAGTATAGGTTAGGGAGAAAGAGAGAGAGAGATAGAGTGTAT
GATGGAGATAACGCCAAAAAGGTATTGGCGGAGGTGGAAAGGATACGAGAAGCTTGATGG
ATCATCAACGGCGGGTCGAAGGAATGGAAAACGGGTCAAAATGGATCCGACCAAGAAGAA
ACGCCTTTGGAAGATCAAGATTATGCCAAAACTGAAAATTCTCAGAAGAGCGTCGGCTAA
GAAGTTTCTGGTCTGGTTACAGGACTCTTATGTTAATATGATGATGAAGTTGGCGAACTC
ACGGGCCGTAGGAGCTTCTGGATACGGTGGATCCGGTTTTGGGTCGGGTCGTCAGATGAA
GGAGTACGATGAGAAAATGCTTGTAGAGATTTACAAGACGATATTGATGGCGCAGTCTCA
GGGGAAACTCACGCACCACGACACAGCTAATAAGCTTCCAGCTGAGCCAGCGGTTGTCTC
TGTTTATCCTGTTGTTAGGTTAAACCCGGGTCAATGATGACACAAGCCTAACCTCCGAGT
GGAGGTATAGCCCACGGATAGACCCTCTCCTGGACATTCAAATGAGTCGAAAACAATGGA
CCCATATCCGTGTGGCCAGTGAGAATCGAATCTGGGACCATATTGAGGCCGAAACTCTCT
CAAGTACCTTTGACTTGTTTGATATTACTTTTCAAGATTGCTGATAGCAAAGTTGTGATT
TTGATCTCTATTAAATAAATATAAAAAAAGTTATTAT

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 3

CO CL3672Contig1 935 3 2 U
AGATCGTCTCAAAAATTGGAATGGCTCCACAAGTTTCCTAACGCCAAACTCGGACAGGGA
TACGGAATGACGGAAGCAGGTCCGGTGCTAGCAATGTCGTTAGGGTTCGCAAAAGAGCCG
TTTCCGGTGAAGTCAGGAGCTTGTGGTACGGTGGTTAGAAACGCCGAGATGAAGATCATC
GATCCAGACACCGGAGACTCACTTTCCAAAAACAAACCTTGAGAGATTTGCATCCGTGGT
CAACAGATCATGAAAGGTTACCTCAACAACCCGGAGGCTACAGCAGAGACCATAGACAAA
GAAGGTTGGCTTCACACGGGAGATATCGGGTTGATCGATGACGATGACGAGCTTTTCATT
GTCGATAGATTGAAAGAGATTATCAATTACAAAGGTTTTCAAGTGGCTCCCGCTGAGCTA
GAGGCTCTCCTCATCGGTCATCAGGATATCACCGATGTCGCCGTCGTCGGTATGAAAGAA
GAGGCTGCTGGTGAAGTTCCCGTTGCGTTTGTTGTGAAATCCAAGGATTCAGAGTTATCA
GAAGATGAAGTGAAACAATTTGTGGCGAAACAGGTTGTGTTTTACAAGAGAATCAACAAA
GTGTTTTTCACTGAGTCCATACCTAAAGCTCCATCAGGGAAGATATTGAGGAAAGATTTG
AGGGCAAAACTAGCAAATGGGTTGGTGAACTAATGAATTAAAAGCAAATATGTTTCATTG
TGTATATACATACAAGTGTGTGTGACGAAGGAAGAAGAAGAACTCATACGGATCAACCAA
TGTCTGTTTGCTTTTGTTTGTTTCTTGTTGTTATCTTTGATTCATGTACTGAGCCTTTTT
TTAATGAAAGGTGGTTTCTCTTTTTGGGTTTCATGTAACTTGTGCTGGAGAAAACCAGCC
GACCTTTTTCATAAAATAAATCACCCGGATTATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CF94TF U 199
AF RS1BS81TF U 1
AF RS1BS81JQ C 196
BS 1 575 RS1BS81TF
BS 576 935 RS1BS81JQ

RD RS1CF94TF 301 0 0
G
CACTTTCCAAAAACAAACCTGGAGAGATTTGCATCCGTGGTCAACAGATCATGAAAGGTT
ACCTCAACAACCCGGAGGCTACAGCAGAGACCATAGACAAAGAAGGTTGGCTTCACACGG
GAGATATCGGGTTGATCGATGACGATGACGAGCTTTTCATTGTCGATAAATTGAAAGAGA
TTATCAAGTACAAAGGTTT*CAAGTGGCTCCCTCTGAGCTAGAGGCTCTCCTCATCGGTC
ATCAGGATATCACCGATGTCGCCGTCGTCGGTATGAAAGAAGAGGCTGCTGGTGAA
TTCC

QA 2 297 2 297
DS 

RD RS1BS81TF 581 0 0
AGATCGTCTCAAAAATTGGAATGGCTCCACAAGTTTCCTAACGCCAAACTCGGACAGGGA
TACGGAATGACGGAAGCAGGTCCGGTGCTAGCAATGTCGTTAGGGTTCGCAAAAGAGCCG
TTTCCGGTGAAGTCAGGAGCTTGTGGTACGGTGGTTAGAAACGCCGAGATGAAGATCATC
GATCCAGACACCGGAGACTCACTTTCCAAAAACAAACCTTGAGAGATTTGCATCCGTGGT
CAACAGATCATGAAAGGTTACCTCAACAACCCGGAGGCTACAGCAGAGACCATAGACAAA
GAAGGTTGGCTTCACACGGGAGATATCGGGTTGATCGATGACGATGACGAGCTTTTCATT
GTCGATAGATTGAAAGAGATTATCAATTACAAAGGTTTTCAAGTGGCTCCCGCTGAGCTA
GAGGCTCTCCTCATCGGTCATCAGGATATCACCGATGTCGCCGTCGTCGGTATGAAAGAA
GAGGCTGCTGGTGAAGTTCCCGTTGCGTTTGTTGTGAAATCCAAGGATTCAGAGTTATCA
GAAGATGAAGTGAAACAATTTGTGGCGAAACAGGT
GTGTTT

QA 1 575 1 575
DS 

RD RS1BS81JQ 740 0 0
GACT
CACTTTCCAAAAACAAACCTTGAGAGATTTGCATCCGTGGTCAACAGATCATGAAAGGTT
ACCTCAACAACCCGGAGGCTACAGCAGAGACCATAGACAAAGAAGGTTGGCTTCACACGG
GAGATATCGGGTTGATCGATGACGATGACGAGCTTTTCATTGTCGATAGATTGAAAGAGA
TTATCAATTACAAAGGTTTTCAAGTGGCTCCCGCTGAGCTAGAGGCTCTCCTCATCGGTC
ATCAGGATATCACCGATGTCGCCGTCGTCGGTATGAAAGAAGAGGCTGCTGGTGAAGTTC
CCGTTGCGTTTGTTGTGAAATCCAAGGATTCAGAGTTATCAGAAGATGAAGTGAAACAAT
TTGTGGCGAAACAGGTTGTGTTTTACAAGAGAATCAACAAAGTGTTTTTCACTGAGTCCA
TACCTAAAGCTCCATCAGGGAAGATATTGAGGAAAGATTTGAGGGCAAAACTAGCAAATG
GGTTGGTGAACTAATGAATTAAAAGCAAATATGTTTCATTGTGTATATACATACAAGTGT
GTGTGACGAAGGAAGAAGAAGAACTCATACGGATCAACCAATGTCTGTTTGCTTTTGTTT
GTTTCTTGTTGTTATCTTTGATTCATGTACTGAGCCTTTTTTTAATGAAAGGTGGTTTCT
CTTTTTGGGTTTCATGTAACTTGTGCTGGAGAAAACCAGCCGACCTTTTTCATAAAATAA
ATCACCCGGATTATGT

QA 5 740 5 740
DS 



AS 1 2

CO CL3673Contig1 290 2 1 U
GCTCGTTGCGGCAATTCAGCAGCCACACACACCACACATATGAACACACTCTGATAGTTT
CGGTGCATTTTAGCAAAAACATGCAGTGTTTATGCTAAAATACGCACCGAGAGCTAAATG
TGAGATAACTTTCACCCCTTTTCTCTCACCACTTGAATATTCCGACACAGTTCTCTCCAT
TCTCTCCGAAGAAAAAAAAATCGAATCTTTCTGTCTGAATTAGTGAGAGCTTCCTTCTTA
GTTATTCTGCGAGCGGCGTTTCTCTGGAACATTATTAGAAAATCGAGTAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AL50JQ C 1
AF RS1AL50TF U 1
BS 1 290 RS1AL50TF

RD RS1AL50JQ 290 0 0
GCTCGTTGCGGCAATTCAGCAGCCACACACACCACACATATGAACACACTTTGATAGTTT
CGGTGCATTTTAGCAAAAACATGCAGTGTTTATGCTAAAATACGCACCGAGAGCTAAATG
TGAGATAACTTTCACCCCTTTTCTCTCACCACTTGAATATTCCGACACAGTTCTCTCCAT
TCTCTCCGAAGAAAAAAAAATCGAATCTTTCTGTCTGAATTAGTGAGAGCTTCCTTCTTA
GTTATTCTGCGAGCGGCGTTTCTCTGGAACATTATTAGAAAATCGAGTAG

QA 1 290 1 290
DS 

RD RS1AL50TF 290 0 0
GCTCGTTGCGGCAATTCAGCAGCCACACACACCACACATATGAACACACTCTGATAGTTT
CGGTGCATTTTAGCAAAAACATGCAGTGTTTATGCTAAAATACGCACCGAGAGCTAAATG
TGAGATAACTTTCACCCCTTTTCTCTCACCACTTGAATATTCCGACACAGTTCTCTCCAT
TCTCTCCGAAGAAAAAAAAATCGAATCTTTCTGTCTGAATTAGTGAGAGCTTCCTTCTTA
GTTATTCTGCGAGCGGCGTTTCTCTGGAACATTATTAGAAAATCGAGTAG

QA 1 290 1 290
DS 



AS 1 3

CO CL3674Contig1 864 3 9 U
GGTTATTCAATGTGTAAGAATAAAGATCAGAAATATCTTAAACCCAAAACAACTCATGTA
TTGGTCATTATGATAATTGATGAGCGCCACTTAACAACAAGCTTTAAAATCATGAACTTA
TATAATCTTTAGGAGCTTACAACAACGTTGGACTCATGCTTTTTTGTCACTTATTTAGAT
TTGCCTTTGCCTTTTCCCTTGCCTTGACCCTTCTTAGCGTCTAGCTTAGCTTGAATCCTA
GCAGCTGCAGCAGCTTTTGCTTCTTCTCTCTTTTTCTTATCATCCTCTTTAGCAGCTGCA
GCAATCTCTCTCTGCTTCTTCAGATCTTCTAGCCTAGCTCTATCCTCAGAAACACTTCCA
ACACTAGCACCTTTCCTCGGTCTACAAGCAACCAATTCCACTTCAAATATCAAAGTTGCA
TCAGGTGGGATGTCAGGAGGAGATCCACCACTTCCGTAAGCATACTCTGGCTTACATGTG
ATTTTCGCAACTTCCCCAACCTTCATGGTCTTAAGCGCAATATCCCATGACCGGATAACA
CTGCCTGAACCCAATTCAAAGGAGAAAACCAGATTGTCTTCGCGTGTAGTGTCAAAAACC
TTCCCATCTTCAGCCAATATACCCTCATAGTGAACATCGACGACAGGAAAATCATCAGAA
GGTGCAATAGCATCAGGTTTAGCTCTCCTTACAATCTGTTTCAAGACGCCTCCATCTCCA
CTCAAATCAATCTCATCCCCCATACTGATTTAAGGATTTAAGGAAAGACGAACAGTCTCC
GATACGATACCGTCACGGAAGAAGCGACTGAGAAGAAGCGGCGAAGTTATAATAACCGGA
AAGAGATCGGTGGCCATAGACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FF69JQ U 1
AF RS1C874JQ U 49
AF RS1C874TF C 109
BS 1 84 RS1FF69JQ
BS 85 85 RS1C874JQ
BS 86 232 RS1FF69JQ
BS 233 233 RS1C874JQ
BS 234 309 RS1FF69JQ
BS 310 310 RS1C874JQ
BS 311 435 RS1FF69JQ
BS 436 598 RS1C874JQ
BS 599 864 RS1C874TF

RD RS1FF69JQ 435 0 0
GGTTATTCAATGTGTAAGAATAAAGATCAGAAATATCTTAAACCCAAAACAACTCATGTA
TTGGTCATTATGATAATTGATGAGTGCCACTTAACAACAAGCTTTAAAATCATGAACTTA
TATAATCTTTAGGAGCTTACAACAACGTTGGACTCATGCTTTTTTGTCACTTATTTAGAT
TTGCCTTTGCCTTTTCCCTTGCCTTGACCCTTCTTAGCGTCTAGCTTAGCTTAAATCCTA
GCAGCTGCAGCAGCTTTTGCTTCTTCTCTCTTTTTCTTATCATCCTCTTTAGCAGCTGCA
GCAATCTCTATCTGCTTCTTCAGATCTTCTAGCCTAGCTCTATCCTCAGAAACACTTCCA
ACACTAGCACCTTTCCTCGGTCTACAAGCAACCAATTCCACTTCAAATATCAAAGTTGCA
TCAGGTGGGATGTCA

QA 1 435 1 435
DS 

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ATCATGAACTTATATAATCTTTAGGAGCTTACAACAACGTTGGACTCATGCTTTTTTGTC
ACTTATTTAGATTTGCCTTTGCCTTTTCCCTTGCCTTGACCCTTCTTAGCGTCTAGCTTA
GCTTGAATCCTAGCAGCTGCAGCAGCTTTTGCTTCTTCTCTCTTTTTCTTATCATCCTCT
TTAGCAGCTGCAGCAATCTCTCTCTGCTTCTTCAGATCTTCTAGCCTAGCTCTATCCTCA
GAAACACTTCCAACACTAGCACCTTTCCTCGGTCTACAAGCAACCAATTCCACTTCAAAT
ATCAAAGTTGCATCAGGTGGGATGTCAGGAGGAGATCCACCACTTCCGTAAGCATACTCT
GGCTTACATGTGATTTTCGCAACTTCCCCAACCTTCATGGTCTTAAGCGCAATATCCCAT
GACCGGATAACACTGCCTGAACCCAATTCAAAGGAGAAAACCAGATTGTCTTCGCGTGTA
GTGTCAAAAA

QA 1 550 1 550
DS 

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ACTTATTTAGATTTGCCTTTGC*TTTTCCCTTGCCTTGACCCTTCTTAGCGTCTAGCTTA
GCTTGAATCCTAGCAGCTGCAGCAGCTTTTGCTTCTTCTCTCTTTTTCTTATCATCCTCT
TTAGCAGCTGCAGCAATCTCTCTCTGCTTCTTCAGATCTTCTAGCCTAGCTCTATCCTCA
GAAACACTTCCAACACTAGCACCTTTCCTCGGTCTACAAGCAACCAATTCCACTTCAAAT
ATCAAAGTTGCATCAGGTGGGATGTCAGGAGGAGATCCACCACTTCCGTAAGCATACTCT
GGCTTACATGTGATTTTCGCAACTTCCCCAACCTTCATGGTCTTAAGCGCAATATCCCAT
GACCGGATAACACTGCCTGAACCCAATTCAAAGGAGAAAACCAGATTGTCTTCGCGTGTA
GTGTCAAAAACCTTCCCATCTTCAGCCAATATACCCTCATAGTGAACATCGACGACAGGA
AAATCATCAGAAGGTGCAATAGCATCAGGTTTAGCTCTCCTTACAATCTGTTTCAAGACG
CCTCCATCTCCACTCAAATCAATCTCATCCCCCATACTGATTTAAGGATTTAAGGAAAGA
CGAACAGTCTCCGATACGATACCGTCACGGAAGAAGCGACTGAGAAGAAGCGGCGAAGTT
ATAATAACCGGAAAGAGATCGGTGGCCATAGACTCC

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 3

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TTTGTTACCTCAAGAAAGAGAATCAATGGCGCCCAAGGCAGAGAAGAAGCCCGCGGAGAA
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CAAGGAAGCCGGCGGCGCGGGAGGTGACAAGAAGAAGAAGATGAAGAAGAAGAGCGTGGA
GACGTACAAGATCTACATCTTCAAGGTCCTGAAGCAGGTCCACCCCGACATCGGGATCTC
GAGCAAGGCGATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGATATCTTCGAGAAGCTCGCCGG
CGAGTCGTCGAAGCTTGCGAGGTACAACAAGAAGCCGACCATCACTTCTAGGGAGATTCA
GACCGCGGTGAGGCTTGTGTTGCCTGGAGAGTTGGCGAAACACGCTGTCTCGGAGGGAAC
CAAGGCCGTTACCAAGTTTACGAGCTCTTAAGTTATATGAGTTAGGGTTTTCCCTCTTGA
TAATTCAATGTCTGAATTAGATTTAGAAAAATGTTCTTTTCATGTTTTTCCAGTATCGTT
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CTTATTTTATAATCGAAGTCTGTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EG57TF U 1
AF RS1DF55TF U 59
AF RS1ED26JQ C 304
BS 1 320 RS1EG57TF
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BS 525 649 RS1EG57TF
BS 650 687 RS1DF55TF

RD RS1EG57TF 649 0 0
GGAACGCAATAACAAAGCATTTCCCAAACCTAATCTAAATCGAATCTCAGATTTGTGCTT
TTTGTTACCTCAAGAAAGAGAATCAATGGCGCCCAAGGCAGAGAAGAAGCCCGCGGAGAA
GAAACCAGCCGAGGAGAAAGCTCCGGCGGAGAAGAAACCAAAGGCCGGGAAGAAGCTCCC
CAAGGAAGCCGGCGGCGCGGGAGGTGACAAGAAGAAGAAGATGAAGAAGAAGAGCGTGGA
GACGTACAAGATCTACATCTTCAAGGTCCTGAAGCAGGTCCACCCCGACATCGGGATCTC
GAGCAAGGCGATGGGGATCACGAACAGCTTCATCAACGATATCTTCGAGAAGCTCGCCGG
CGAGTCGTCGAAGCTTGCGAGGTACAACAAGAAGCCGACCATCACTTCTAGGGAGATTCA
GACCGCGGTGAGGCTTGTGTTGCCTGGAGAGTTGGCGAAACACGCTGTCTCGGAGGGAAC
CAAGGCCGTTACCAAGTTTACGAGCTCTTAAGTTATATGAGTTGGGGTTTTCCCTCTTGA
TAATTCAATGTCTGAATTAGATTTAGAAAAATGTTCTTTTCATGTTTTTCCAGTATCGTT
TTCGTTTGCAGTCTCGTTTTGTAATTACAGGTATTGATATGTCTGAATC

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1DF55TF 629 0 0
TTTTTGTTACCTCAAGAAAGAGAATCAATGGCGCCCAAGGCAGAGAAGAAGCCCGCGGAG
AAGAAACCAGCCGAGGAGAAAGCTCCGGCGGAGAAGAAACCAAAGGCCGGGAAGAAGCTC
CCCAAGGAAGCCGGCGGCGCGGGAGGTGACAAGAAGAAGAAGATGAAGAAGAAGAGCGTG
GAGACGTACAAGATCTACATCTTCAAGGTCCTGAAGCAGGTCCACCCCGACATCGGGATC
TCGAGCAAGGCGATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGATATCTTCGAGAAGCTCGCC
GGCGAGTCGTCGAAGCTTGCGAGGTACAACAAGAAGCCGACCATCACTTCTAGGGAGATT
CAGACCGCGGTGAGGCTTGTGTTGCCTGGAGAGTTGGCGAAACACGCTGTCTCGGAGGGA
ACCAAGGCCGTTACCAAGTTTACGAGCTCTTAAGTTATATGAGTTAGGGTTTTCCCTCTT
GATAATTCAATGTCTGAATTAGATTTAGAAAAATGTTCTTTTCATGTTTTTCCAGTATCG
TTTTCGTTTGCAGTCTCGTTTTGTAATTACAGGTATTGATATGTCTGAATCTATGTTATT
CTCTTATTTTATAATCGAAGTCTGTGTTT

QA 1 629 1 629
DS 

RD RS1ED26JQ 365 0 0
G
AAGGCGATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGATATTTTCGAGAAGCTCGCCGGCGAG
TCGTCGAAGCTTGCGAGGTACAACAAGAAGCCGACCATCACTTCTAGGGAGATTCAGACC
GCGGTGAGGCTTGTGTTGCCTGGAGAGTTGGCGAAACACGCTGTCTCGGAGGGAACCAAG
GCCGTTACCAAGTTTACGAGCTCTTAAGTTATATGAGTTAGGGTTTTCCCTCTTGATAAT
TCAATGTCTGAATTAGATTTAGAAAAATGTTCTTTTCATGTTTTTCCAGTATCGTTTTCG
TTTGCAGTCTCGTTTTGTAATTACAGGTATTGATATGTCTGAATCTATGTTATTCTCTTA
TTTT

QA 2 365 2 365
DS 



AS 1 3

CO CL3676Contig1 618 3 11 U
GGCCATTTCTGTGGAGCATATGCAAGTGCTTTGGCAGAAAAGTCTAGTGGAATGAATGAT
GTTGACATCATGAACAATGCTCTTCAACTCTACAACAAGCTT*ACAAGAAGAAGTTTACC
CTAAACTATGCATGGAGTGTGTTGAAAAATGAACAGAAATGGTGCAGCCTTGCATTGATG
AACCCTACTAGCAATACATCAAGCAAGAAGAGAAAAGATTTGGATGCTGCACCATCTGTA
GGATCTGTTGTTGGTGAAGAAGAGAGGAGGCCTCCTGGTATAAAGGCAATGAAAGCCAAA
AGGTACAAAGGTAAAGACAAAGTGGCACAATCAGCAGAGTATCCTGACATCTGGGAGAAC
AAACAGAAGGATAATGAGGCTAAAAAAGAACTCCAAAAGATGTCCATTCTTGACAGTCTA
ATTGCCAAGACACAACCACTTGATGAAGATGAAAAAGCTCTTAAGAAGAAGCTAATGGCT
GAACTATTCTAACTAGCTCACAAGTTTATTGTGATATGTAGTTCTGAAGTATATTTCTCA
AACTATTTCTTGTTTTAACTATGTATTTCTTGTTTTAGCTATGTATCTCATAAGTACAAT
GTGTTGCTGCTTCTATTT


BQ
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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A

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BQ
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AF RS1GI32JQ U 1
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DS 

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CGAAAACAAAAAAAAACGAAAACCAAACACACATGTAGTTAGACTCTAGAATCCTTCATT
GGCTCCTAGTAGTCATCGCTGTCGGTATCATTTTCATCATCGCTCATCATGTCTTGCATC
TCATCTTTGGCTTCTAGTTTTATACATTTGTACCACCTTGCACATGCAATGTACACCACC
AGGTCAATGCTGGTCAAAGCGGCCAGGAGGAAATAGAATCTGTCCAAGTGACCTTTGTTG
AGGTTCCTTGGTATCCAACCGGGCATGTGATCCTCCGTAGAGATCTTCACCACCATTGTC
ACCAACAAGCTACTCACAAAGTTCCCCATCGACATTGACATCATGCACAGAGCGCTCCCG
AAGCTCTTTAGTCCGTCTGGTGTCTGCGCGTTGAAGAACTCAAGCTGACCAACGTACATG
AACACTTCTGATGCTCCGATTAGCGAGTATTGTGGAACCTGCCAGAAGATGCTTAGTGAG
CTTGAGCCATCACAGTGAGTGCAATTCTTGTCTGCGTATTTAAGTCTAAAGCATTCAACA
ACCCCAGCTGCAACCATAGCTAAGATAGCAATCACAAGACCGATGCCCATCCTGTGAAGC
TCGGTGATTCCCTTTGTTCCATCCTTCTTCTTGAATCTGTTGGCTAGTGGCTCCAGAACT
CTGCGGTATATGAATATGAACAAGGCGACGCTAAGGATGTCGAAACTGGACATACTTGCC
GGAGGGATTTTGAAATCCGAGACAGTTGTCTTCATCGCTGCGCCTCGCTCCACAAACAGA
GAGGCCATTTGAGTGAAGACCACCGAGTAGATGATAGTGCAGAGCCAAATCG

QA 1 892 1 892
DS 

RD RS1AO38TFB 810 0 0
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ACAAGACCGATGCCCATCCTGTGAAGCTCGGTGATTCCCTTTGTTCCATCTTTCTTCTTG
AATCTGTTGGCTAGTGGCTCCAGAACTCTGCGGTATATGAATATGAACAAGGCGACGCTA
AGGATGTCGAAACTGGACATACTTGCCGGAGGGATTTTGAAATCCGAGACAGTTGTCTTC
ATCGCTGCGCCTCGCTCCACAAACAGAGAGGCCATTTGAGTGAAGACCACCGAGTAGATG
ATAGTGCAGAGCCAAATCGGCATCAGTCTAAGAATACACTTGACTTCCTCAACTTGTGTC
ACTGGACAAAGCCTCCACGGATTCACTCCGCCTTGTTTCTTGTCATCAAGATCTCTTGCT
GTGATGTACGCTGCCCTGTCCAAGAACTTGAATTCATCTGTGTGAACTATCCTCCTCCCT
GTATCTCCTGAAGCATTCTTGCCTTGTCTATCTTCATCATACATCTCCTCTCTCCCTCTA
GACGGCGCCTCCATAGATGATTTCTTAGTTGCAGCCACCAAAACTTGGCAAAACCTCGAA
AGAGGGTTCCCCGTAGGCTTGAAGTTTCGGTATCTCGGTGTTCCAACGAGGAAAAGAATC
AAAGCCAAGATGGCAGAGCCAGTGGACGCCCAAAACCCGAGTGCCCACATCCCTTCATCT
TCAAAGTATCCCAAGATTGTGTTTTTCGTAACTGATAGGAGAGAATGATAACAGAGGACG
AATTGAAGAAGGAAGAAGTAGAAAGAAAGT

QA 1 810 1 810
DS 



AS 1 3

CO CL3678Contig1 704 3 2 U
AGAGCAAACTATTTGCATCACTCTTATATA*TCTTTAACGTGTTCATACACATGATACAC
CTCTGGAAAATAAGCAACCATAATAGACAGCAAAGTAGCACGTAAGACTATAGTTTTAAT
TTCCAAGCTGCCATGAAAATAAATAATTTCTAATTTTGCTCTTCTTATCTTATCCACAAG
CGATGCAAGACTTATGTAGTAATGCCCAAATGGAATGCCAAAGTTGCATGTTTGTGAAAA
AGAAGAAGCTTAAAGCAGATACTTGTGAAAACCAAGTCTTTTCCATGGCTCCTCCTTTAC
TAGATTTCTCTTCTAACCATGTCCACAATTGACGAATCGACTGTTTATATAAATGCATCC
AGAGAGATTCTATCGCCTTGGTTAAGGGGGAGAAGATTCTTCCAAGGATACACAACCAGT
GATGGACCCACCGGCTGGCATGCACATCGGTTTGGTCTCTCTCCAATTCAGAGGCATATC
CAAA*GGGTTACACACCCTTACGACAGACAATCTCACAATGTCAAACCTCCCTGCTCCTG
ACTCTTCCCATTTAAGTACCTTCCCTCCTATAACATAGAGCTCATCCCTCAGAGCCGCGA
AACCGTATCCAAAGGCCTCTAACTCTCTCGGGTGATTAGAGAGAACAACAGACGGAACCG
AACCAACATTGTACCATTGTCCTTCCTCTGTATCCCTCGTCTTG


BQ
10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CW64JQ U 1
AF RS1CW64TF C 1
AF RS1DA57JQ U 1
BS 1 538 RS1CW64JQ
BS 539 704 RS1DA57JQ

RD RS1CW64JQ 540 0 0
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CGATGCAAGACTTATGTAGTAATGCCCAAATGGAATGCCAAAGTTGCATGTTTGTGAAAA
AGAAGAAGCTTAAAGCAGATACTTGTGAAAACCAAGTCTTTTCCATGGCTCCTCCTTTAC
TAGATTTCTCTTCTAACCATGTCCACAATTGACGAATCGACTGTTTATATAAATGCATCC
AGAGAGATTCTATCGCCTTGGTTAAGGGGGAGAAGATTCTTCCAAGGATACACAACCAGT
GATGGACCCACCGGCTGGCATGCACATCGGTTTGGTCTCTCTCCAATTCAGAGGCATATC
CAAA*GGGTTACACACCCTTACGACAGACAATCTCACAATGTCAAACCTCCCTGCTCC
CC

QA 1 538 1 538
DS 

RD RS1CW64TF 540 0 0
AG
AGCAAACTATTTGCATCACTCTTATATA*TCTTTAACGTGTTCATACACATGATACACCT
CTGGAAAATAAGCAACCATAATAGACAGCAAAGTAGCACGTAAGACTATAGTTTTAATTT
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ATGCAAGACTTATGTAGTAATGCCCAAATGGAATGCCAAAGTTGCATGTTTGTGAAAAAG
AAGAAGCTTAAAGCAGATACTTGTGAAAACCAAGTCTTTTCCATGGCTCCTCCTTTACTA
GATTTCTCTTCTAACCATGTCCACAATTGACGAATCGACTGTTTATATAAATGCATCCAG
AGAGATTCTATCGCCTTGGTTAAGGGGGAGAAGATTCTTCCAAGGATACACAACCAGTGA
TGGACCCACCGGCTGGCATGCACATCGGTTTGGTCTCTCTCCAATTCAGAGGCATATCCA
AA*GGGTTACACACCCTTACGACAGACAATCTCACAATGTCAAACCTCCCTGCTCC
CC

QA 3 538 3 538
DS 

RD RS1DA57JQ 704 0 0
GA
AGCAAACTATTTGCATCACTCTTATATAATCTTTAACGTGTTCATACACATGATACACCT
CTGGAAAATAAGCAACCATAATAGACAGCAAAGTAGCACGTAAGACTATAGTTTTAATTT
CCAAGCTGCCATGAAAATAAATAATTTCTAATTTTGCTCTTCTTATCTTATCCACAAGCG
ATGCAAGACTTATGTAGTAATGCCCAAATGGAATGCCAAAGTTGCATGTTTGTGAAAAAG
AAGAAGCTTAAAGCAGATACTTGTGAAAACCAAGTCTTTTCCATGGCTCCTCCTTTACTA
GATTTCTCTTCTAACCATGTCCACAATTGACGAATCGACTGTTTATATAAATGCATCCAG
AGAGATTCTATCGCCTTGGTTAAGGGGGAGAAGATTCTTCCAAGGATACACAACCAGTGA
TGGACCCACCGGCTGGCATGCACATCGGTTTGGTCTCTCTCCAATTCAGAGGCATATCCA
AAAGGGTTACACACCCTTACGACAGACAATCTCACAATGTCAAACCTCCCTGCTCCTGAC
TCTTCCCATTTAAGTACCTTCCCTCCTATAACATAGAGCTCATCCCTCAGAGCCGCGAAA
CCGTATCCAAAGGCCTCTAACTCTCTCGGGTGATTAGAGAGAACAACAGACGGAACCGAA
CCAACATTGTACCATTGTCCTTCCTCTGTATCCCTCGTCTTG

QA 3 704 3 704
DS 



AS 1 3

CO CL3679Contig1 1541 3 9 U
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TTGCACAACTGGAGAAGTCAGATTACGTCTCTCTATGGTGGACCGTTGGAATTCCTATTT
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CAGGATCAAGTTGAAGCTAAGGTTGTTATTGCTGGTTTAGCTACGACTTGCAGCCAGAAA
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AAAAATCCAGAGATATTTATTCAAACTGGGTATCCTCTAGACTTGCCCTCTGGAACTCTT
GGAAGTTATTGCATCTATGAGTACCACATGCCTTGCTCAATGGGATTTGCAACTGGTGGG
AGAACATTCTTTTTATGGGGAGGATGCATGATGATGCATGCTGATGATTTCAGACAAGAC
CGCTATGGTGTTGTCTCTGGCTTACGTGATGGTGGATACTCAGATGATATGACACTTGCC
TCTCTAGCAGGTGCCCACAAGAGGCTCATTACATCTCCTCCTGTTACTGTTTTCCCTCAT
CCTCTTGCAAGTGATTTAAGCTTTGGACGGTACTGGAACTACTTGAGAAAGCAAACTTTT
GTGCTAGAGTCTTACATATCCAATGTTAACTGGATAATGAACAAGGTTTTGTTTGCCGTC
CACTGTTATCTATCATGGGGGTTTTGTTGCACCATATATTATGGCTGTCGTCCACATCAC
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GTGGAATTTGACAAGACGAGAAGTGACGCTATGCAATTGGTTATCCCCCGAGGCTCCCCG
TCTCTCTCTTGCACCTTACAACTGGGGACTTATATTCATAGCAATGCTAGTGGACAACTT
TCTATACCCGATCTCAGCATTCCGTTCTCACTTTTCTCAATCCATAAACTGGTCTGGAAC
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TTCTTTCTTAAGCTCATTGGGAAGAAATTTTGCTCACTGGCGACAACCAAAGAAGTTTGA
TCTTTAAAAAGTTCGGTTTCTTTTTTCTTTTTAATACAGTACAGTAGAGAAGCGAAGTTC
CCATTGATTCTTTGATATGTTTTGTGATTCTTTTTTCCAGAGGAAGGGGAGGGGAAGATT
TGGTCTTATGTTTTTTCTATTAACCTTATTTTTTTCCTTGGGTACAAAATTATTATTGGT
GACGAAGAAATGCATTATTCCCCTCTGGGAAATTTTAATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
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AF RS1G368TF U 1
AF RS1DG23TF U 244
AF RS1DG23JQ C 781
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CCTCTTGCAAGTGAT

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DS 

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G
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ATGGTGTTGTCTCTGGCTTACGTGATGGTGGATACTCAGATGATATGACACTTGCCTCTC
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GGTATGTCTCTTGTTATCATGCTGGCAATCTGCACCTTCATCGAACTTCTTTCAATGTGG
AATTTGACAAGACGAGAAGTGACGCTATGCAATTGGTTATC

QA 2 762 2 762
DS 

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ATCAGCTTTAAGAATCTACATCAAGGGCTATCATCAACTTGAAGACACGACCACTGCTTC
TTGTGGTATGTCTCTTGTTATCATGCTGGCAATCTGCACCTTCATCGAACTTCTTTCAAT
GTGGAATTTGACAAGACGAGAAGTGACGCTATGCAATTGGTTATCCCCCGAGGCTCCCCG
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TCTATACCCGATCTCAGCATTCCGTTCTCACTTTTCTCAATCCATAAACTGGTCTGGAAC
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TCTTTAAAAAGTTCGGTTTCTTTTTTCTTTTTAATACAGTACAGTAGAGAAGCGAAGTTC
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GACGAAGAAATGCATTATTCCCCTCTGGGAAATTTTAATTC

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DS 



AS 1 3

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TTGGCTAAGTGCTAATAAAGAGCATTTCTAAAATTCCTAAAAATAATTTGCAAACGAATC
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ACAACTTCATTGCGGCAAGTCTTGTCACAAGGATAAGCACAGTCTATGAGCTTTGCTCCT
CCTCTTTCGAAATACCAATCTCCCACAGCTGTTGCAATCCTCTTGTTCTTAACAGCAGGA
GAATTTTTGGTATACCATGTGTTATGATTCTCTGTTAGGCATTGAACAAAGCACGAGTTA
ATAAACATTCCGTTCTTACTTGGCTTTCCAAAACCACTGATTAGATTCACCATACGAGTC
CTGAAACCGTGCAAAAACTCGATCTGAGATGCATTGCACTTGGCGATGTTAAATCTACAG
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GAATCATATGCAGCATTTAGAATAAACAATGGATTCTTGACTTGGTTTATTAGGTTTTGT
GCGAAAAAACACGAAGTTGAATTTAGACGTCCTAAACAGTCATTAGGGAGCTGTGTTGCA
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AACATATTCGTAAACTTATCACAGTGTAATATCGCTGCAAGACCTCCGGCAGAACATCCA
GAGAGCAGAACCTGTTTTGCAGAACGTATTCCTTTCCCCATCAACTCTACCATAGCAGCT
GTCCATATTCGCATTCCTCTAAACTGAAGTTTTGCAGCCTTATTTTCAATGTCTCCAATA
AAGGATCCACCGTCACAGTATCTAATTTTTACTCTATTCCAGTTATAAAAGTCTGGATTT
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GATCCATGACTAGTTGTTTTCATGTTTACACAACTTTTAATGGTACCACACCATTGACCT
CCCTCCAATTGGACGAGCCAATTCTTTGTTCCTGAACCAGACCTGGGATGAAAATGATAT
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AAGAGAAGGAGACCAAATGAAGTCAGACTCCATACAAGCTTCTTCATTGCAAAGGAGACA
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GTGACGTGAGAGGG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CT10JQ U 21
AF RS1AL33JQ U 1
AF RS1AL33TF C 715
BS 1 62 RS1AL33JQ
BS 63 63 RS1CT10JQ
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BS 338 493 RS1AL33JQ
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BS 495 804 RS1AL33JQ
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RD RS1CT10JQ 747 0 0
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CTTGTCACAAGGATAAGCACAGTCTATGAGCTTTGCTCCTCCTCTTTCGAAATACCAATC
TCCCACAGCTGTTGCAATCCTCTTGTTCTTAACGGCAGGAGAATTTTTGGTATACCATGT
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AATAAACAATGGATTCTTGACTTGGTTTATTAGGTTTTGTGCGAAAAAACACGAAGTTGA
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ATCTGCATATAAACGGCTAAGAGGTTGACCTCCAGAGACATCAGTGGCATCAAGGAAAAG
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DS 

RD RS1AL33JQ 804 0 0
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TGTAGATGAATCCCTAATTTATTATTTTAAGAAAAAGGAAAACAATTTAAATATCATTCG
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CCTCTTTCGAAATACCAATCTCCCACAGCTGTTGCAATCCTCTTGTTCTTAACAGCAGGA
GAATTTTTGGTATACCATGTGTTATGATTCTCTGTTTGGCATTGAACAAAGCACGAGTTA
ATAAACATTCCGTTCTTACTTGGCTTTCCAAAACCACTGATTAGATTCACCATACGAGTC
CTGAAACCGTGCAAAAACTCGATCTGAGATGCATTGCACTTGGCGATGTTAAATCTACAG
TCAGACCAACTTCCACTTGGATCGGCAGATTTAGGAGTTAAACTCTCTTGGATCTGCCAC
GAATCATATGCAGCATTTAGAATAAACAATGGATTCTTGACTTGGTTTATTAGGTTTTGT
GCGAAAAAACACGAAGTTGAATTTAGACGTCCTAAACAGTCATTAGGGAGCTGTGTTGCA
ATATTCTGTAATTTTACTACATCTGCATATAAACGGCTAAGAGGTTGACCTCCAGAGACA
TCAGTGGCATCAAGGAAAAGGCAAGCATCACTCAGACATTTTACTCTGGTGGAAGGATCA
AACATATTCGTAAACTTATCACAG

QA 1 804 1 804
DS 

RD RS1AL33TF 800 0 0
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CATCCAGAGAGCAGAACCTGTTTTGCAGAACGTATTCCTTTCCCCATCAACTCTACCATA
GCAGCTGTCCATATTCGCATTCCTCTAAACTGAAGTTTTGCAGCCTTATTTTCAATGTCT
CCAATAAAGGATCCACCGTCACAGTATCTAATTTTTACTCTATTCCAGTTATAAAAGTCT
GGATTTTCTGCGGCTTTGTCACTTAAAATTCCTGTAAAAGGTAACTGTTTTTCCATATAC
TTGGACGATCCATGACTAGTTGTTTTCATGTTTACACAACTTTTAATGGTACCACACCAT
TGACCTCCCTCCAATTGGACGAGCCAATTCTTTGTTCCTGAACCAGACCTGGGATGAAAA
TGATATCCGGGAAGACTTCCATCTAGACACACTGCTCCATTTTCAGTTCCAGATTGAATG
ATAGTGAGTGGTACCCGTAGAAGCTTTGCTTCAGAATGAACATCATTTTCAACCATCTTC
GTTCCATTAAAATCTGTGAACCTTTCTATTTCGTCATACTCCATCACCCCATTTACAGGA
AGCATTAAGAGAAGGAGACCAAATGAAGTCAGACTCCATACAAGCTTCTTCATTGCAAAG
GAGACACAAGGTGTCTTAGAATTGACCAAAAACTTGGTTTATTTGGAAACGTATATGCGA
ATGAGAGTGACGTGAGAGGG

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 3

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GAGTTCTAACTCTCTCAACGGATATAACACTAACGCCGTTGCCTTTGACGGAACCGTCGA
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CCCCAACGGAGGAGGAGGGAGAAGCAAGGCGTCGTTTATGATGTGGAGGATGTGCAATCC
TGTCCACGTGCTGAGAGTCCATTGGATACCGTGTTTGTTGGCGCTAGGAGTTCTGTTCTT
CACGGGCGTAGAGGAGTACATGATCC*AGATGATTCCTCCGAGTTCTGAACCGTTCGATA
TTGGTTTTGTGGCGACGCGCTCCCTGTATCGCCTCTTGGCTTCTTCACCTGATCTAAATA
CCGTTTTAGCCGCTCTAAACACGGTGTTCGTAGGGATGCAAACGACATATATTGTATGGA
CATGGTTGATGGAAGGACGACCAAGAGCGATCATCTCGGCTTGCTTCATGTTTACTTGTC
GTGGCATTCTTGGTTACTCTACTCAGCTCCCTCTTCCTCAGGATTTTCTAGGATCAGGGG
TAGATTTTCCGGTAGGAAACGTCTCGTTCTTCCTCTTCTACTCAGGCCATGTCGCAGGGT
CGACGATAGCATCCTTGGACATGAGGAGAATGAAGAGGTTGAGACTAGCCTTGCTTTTTG
ACATCCCCAATGTATTACAATCGATCGGGCTTCTCGGGACGAGAGGACAATACACGATCG
ATCTTGCTGTCGGAGTTGGCGCTGGGGTTCTCTTTGACTCACTGGCTGGAAAATACGAAG
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TATTAATTTTTTTTCTAAAAGTTTTTAGCCTGGACATATTTAACGTAGTTGAAATCTAAT
TTGTTAAATTTACTTTCTTTCAAATTGCTCTAATTAAAATATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GE56TF U 1
AF RS1AO90TFB U 109
AF RS1AO90JQ C 274
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TAGATTTTCCGGTAGGAAACGTCTCGTTCTTCCTCTTCTACTCAG*CCATGTCGCAGGGT
CGACGATAGCATCCTTGGACATGAGGAGAATGAAGAGGT*GAGACTAGCCTTGCTTTTTG
ACATCCTCAATGTATTACAATCGATCAG*CTTCTCGGGACGAGAG*ACA*TACACGATCG
ATCTTGCTGTCG
AGTTGGC

QA 1 792 1 792
DS 

RD RS1AO90TFB 767 0 0
G
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GTTCTGTTCTTCACGGGCGTAGAGGAGTACATGATCC*AGATGATTCCTCCGAGTTCTGA
ACCGTTCGATATTGGTTTTGTGGCGACGCGCTCCCTGTATCGCCTCTTGGCTTCTTCACC
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TATTGTATGGACATGGTTGATGGAAGGACGACCAAGAGCGATCATCTCGGCTTGCTTCAT
GTTTACTTGTCGTGGCATTCTTGGTTACTCTACTCAGCTCCCTCTTCCTCAGGATTTTCT
AGGATCAGGGGTAGATTTTCCGGTAGGAAACGTCTCGTTCTTCCTCTTCTACTCAGGCCA
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AAAATACGAAGAGATGATGAGCAAGAGACACAATGTAG
CAATAGTC

QA 2 759 2 759
DS 

RD RS1AO90JQ 730 0 0
TTTGTTGGCGCTAGGAGTTCTGTTCTTCACGGGCGTAGAGGAGTACATGATCCCAGATGA
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TCTTGGCTTCTTCACCTGATCTAAATACCGTTTTAGCCGCTCTAAACACGGTGTTCGTAG
GGATGCAAACGACATATATTGTATGGACATGGTTGATGGAAGGACGACCAAGAGCGATCA
TCTCGGCTTGCTTCATGTTTACTTGTCGTGGCATTCTTGGTTACTCTACTCAGCTCCCTC
TTCCTCAGGATTTTCTAGGATCAGGGGTAGATTTTCCGGTAGGAAACGTCTCGTTCTTCC
TCTTCTACTCAGGCCATGTCGCAGGGTCGACGATAGCATCCTTGGACATGAGGAGAATGA
AGAGGTTGAGACTAGCCTTGCTTTTTGACATCCCCAATGTATTACAATCGATCGGGCTTC
TCGGGACGAGAGGACAATACACGATCGATCTTGCTGTCGGAGTTGGCGCTGGGGTTCTCT
TTGACTCACTGGCTGGAAAATACGAAGAGATGATGAGCAAGAGACACAATGTAGGCAATA
GTCCTAGTTTGATTTCGGATCGCTAGTTATTAATTTTTTTTCTAAAAGTTTTTAGCCTGG
ACATATTTAACGTAGTTGAAATCTAATTTGTTAAATTTACTTTCTTTCAAATTGCTCTAA
TTAAAATATG

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

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GGAAAGATATGAGTTCCATAGGAGTATATGCCCTCTCTTCTCCGGCTAAATTTCACCGTC
GCCGGGAAAAAGCACAGACTTTTACTCCGACCCACTTCCCTAATCCAAATGGGTTTCCAT
CTCCGTGGAGAAAGTCTCGACCTTTCGCTCCCAAACTCTCCCAATCTCTCAGTTTCGCTT
CTCCCTCTTCACACCTCCCTCTCGTACGCTCCTCGCCGTCTCCTCCTTCTTCCAAGGGTT
TCCTCCAGAATCTAGCGAGAAAAGCTGCGGTTTTGCTCGTCGGGTCGTTTGTCCTCCTGC
TAGGGTTCTCTTCTTCGAGACCTGCTTTAGCGCTGCCCACTGCGAGTACCGCGAGCTCTC
AATCGGAGGAAGAAGAAATGTTGGAGAAGGTTCTGGAAAGCGAGCCGGAGAACATGGAGG
CGATGAAGGCCGTTTTGTATAAGAAGACGAGGAGAGGGAAGACAGAAGACGCTGTCAAGC
ACGTCGAGAAGCTGATTAAGTTAGAGCCTCGTGAGGTTGAGTGGAAGCTTCTCGAAGCGC
TTTGCTACGAGACGATGGGACAGTTGAGCAAAGCCAAGAGATTGTTTAAGAATATTCTCA
AAGATAACCCTCTTCTTATCAGAGCTTTGCACGGTCTAGCTATGGTAATGCACAAGTCTC
ATGACGACTCTTCTGTCTTTGATATGCTGAATGAAGCTATGGAAGTTGCTAGACAAGGAA
ACCGAGTTACCGAGGAGAGAAACATTCAAGTCTTGATCGGCCAAATGCATATTGTCAAGG
GTCAATTTGAAGAAAGTCTAAAGATATTTCAAGAGATGGTGAATGATAACCCTCGAGATT
TTAGACCAAAACACTTTCAAAGCTAAATTTACTCACGGGAAGTAGTGAATCAACGGCTGG
TTTATCTTTCTTAAAAAGCTTCATCAGTTGAAATTTTGTTCCTGGAAGCAACATGTGTCG
TTTTAAAGACAAAACCGCTCTCAGCGCAGGCAGTGTCCACTGCTGCTTATGGAACCATGG
AGAAGGCAGCTTTTGTTATTTCTTTTTTTATTTCTCCATTTGCACTGGCTTAGTATAATC
TGACATGAAAGGTTTTAACTTTCTTTGTTCAGTATCTTATTATCTCTGGTGTGCGATTGT
TGTTGATTCATCTCTTGAACTCTTCCACC


BQ
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AF RS1BQ79TF U 1
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GTTTTAACTTTCTTTGTTCAGTATCTTATTATCTCTGGTGTGCGATTGTTGTTGATTCAT
CTCTTGAACTCTTCCACC

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DS 



AS 1 3

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CCTTCTTCCACGGGAACTCCATAAGCGCTCCCGTGACTCCACCACCGGCTCGAAGCCCTA
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ATTGAGAGAAAAAAGGGAAAAGAAAAGAAAAACATTTTCGAACCC


BQ
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AF RS1EF06TF U 11
AF RS1DC72TF U 1
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TTCTCCTACTTTCAGCTTAGTCTCGAGAAACCCGTTTTTCGACAAAGAGGCTTTTAAAAT
GGGAGATTGTAATTCGCCAATGTGGACTCCAGGACAAAGTGGAAACTGCTCTCCAGCTAT
TCCTGCTGGTGTTGATCAAACCTCTGACGTGCCAATGGCTGA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RS1DC72TF 698 0 0
GGCGAAGACGCGCGATTGCGGCTAAGATCTTCGCGGGGCTTAGGATTCATGGGAACTTTA
ATCTGCCGAAACACTGCGATAACAACGAAGCTCTCAAAGCTCTTTGCAACGAAGCTGGTT
GGACCGTAGAGGAAGACGGAACTACTTACCGTAAGGGATGCAAACCAATGGATCGAATGG
AACTCATGAATGGTTCCACTTCAGTGAGTCCATGCTCATCTTACCAGCCCAGCCCTCGTG
GTTCCTACAATCCAAGCCCTTCATCTTCCTCATTCCCTAGTCCTACAAACATATTCGGTG
ATGCTAACTCACTAATCCCATGGCTCAAGAACCTCTCTTCAAACTCCCCTTCCAAGCTTC
CCTTCTTCCACGGGAACTCCATAAGCGCTCCCGTGACTCCACCACTGGCTCGAAGCCCTA
CTCGTGACCAAGTGACCATCCCTGAATCTGGATGGCTTTCTGGAATGCAAACCCCACAGA
GCGGACCGTCTTCTCCTACTTTCAGCTTAGTCTCGAGAAACCCGTTTTTCGACAAAGAGG
CTTTTAAAATGGGAGATTGTAATTCGCCAATGTGGACTCCAGGACAAGGTGGAAACTGCT
CTCCAGCTATTCCTGCTGGTGTTGATCAAACCTCTGACGTGCCAATGGCTGATGGAATGG
CGGCAGAGTTTGCGTTTGGGATGGTGAAGCCTTGGGAA

QA 1 698 1 698
DS 

RD RS1DC72JQ 421 0 0
TTTTTCGACAAAGAGGCTTTTAAAATGGGAGATTGTAATTCGCCAATGTGGACTCCAGGA
CAAGGTGGAAACTGCTCTCCAGCTATTCCTGCTGGTGTTGATCAAACTTCTGACGTGCCA
ATGGCTGATGGAATGGCGGCAGAGTTTGCGTTTGGGATGGTGAAGCCTTGGGAAGGAGAA
AGGATACATGGAGAATGCGTTTCAGATGATTTAGAACTCACACTTGGAAATTCAAGAACC
AGATGATGATTTTTAGAGAAGAATCAAAACATCGTTTGCTATCAATCATCTCTCTCTTAT
CAAATTAGTTTATCTCTTGCTTTTTCATTTCATCTTTGTTTGTCTGTTTTTTTTACCAGT
GTGATGATTAAAGGTGATTGAGAGAAAAAAGGGAAAAGAAAAGAAAAACATTTTCGAACC
C

QA 1 421 1 421
DS 



AS 1 3

CO CL3684Contig1 839 3 4 U
GCTATAAAAATCTTATTTGTACACTTCAAAAGAGGATTTTGACCGTTTTGATTACAATTA
CACAACAACCAATGATTTGGTTTTCAGTATTACACACACACAAGCAACAGTTTCAAAGAG
CTTTTCATTTTCATATGCTGATAGAGAGATGAAGAACAGGGATCAACAAACACTTCCCAT
TGCTCAGGTCCGAGTTCGTGTTCTGCTGTTTTAAACTGAATAAGAGATCATAGGTTTACT
TGATCATGCATCAGGCAACATGATGCAGTCAATGGCTCGCTTGCATATTCCTGTCATCGT
TGCTTCTGGTCCATATACCTCTAGAGGAACACCGAGTTCATCCCCCAGAGCACGCATTCT
AGCCAGACCAGTCTGGTAATTAGGACCACCTCTTCTTACGTAAATGTGCATTCTTGATGC
TTTCAGCCTTGTTTCCTTTTCTCTTAGAGCGCGGATGATACCGTTGAAAGTAGCTGCCAC
GTCGGTAAAATTGGCAATGCCACCTCCAATGAGAAGAGCTCGTTTGCGTCCATCAGGATC
AGCAGTAGCACAATCAATGACAACTCTAGCGTAATGTAACACCTCTTCCTCGTTAGGTGC
TCCACTATACTCCGCGTAGTTCCCGAGCTCTGATGCGTAGCCTAAATCTCCAACTGTATC
AGCGTATATGACGCTAGCACCGCCTCCAGCTACCATAGTCCAAATGCGACCTTTAGGATT
CAAAACAGTAAACTTCAAAGAAGCACTTGTCTTCTCATCTAAACCATGGATGAAGCTCTC
CGTTGGACTGAGTACCCTTCCAAATGGCAGAGGAAATTCATGTCTCCCCACTTGTTGAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CG74JQ U 1
AF RS1CG74TF C 74
AF RS1H191JQB U 1
BS 1 225 RS1CG74JQ
BS 226 226 RS1H191JQB
BS 227 646 RS1CG74JQ
BS 647 839 RS1H191JQB

RD RS1CG74JQ 646 0 0
GCTATAAAAATCTTATTTGTACACTTCAAAAGAGGATTTTGACCGTTTTGATTACAATTA
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CTTTTCATTTTCATATGCTGATAGAGAGATGAAGAACAGGGATCAACAAACACTTCCCAT
TGCTCAGGTCCGAGTTCGTGTTCTGCTGTTTTAAACTGAATAAGAAATCATAGGTTTACT
TGATCATGCATCAGGCAACATGATGCAGTCAATGGCTCGCTTGCATATTCCTGTCATCGT
TGCTTCTGGTCCATATACCTCTAGAGGAACACCGAGTTCATCCCCCAGAGCACGCATTCT
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QA 1 646 1 646
DS 

RD RS1CG74TF 651 0 0
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TATGCTGATAGAGAGATGAAGAACAGGGATCAACAAACACTTCCCATTGCTCAGGTCCGA
GTTCGTGTTCTGCTGTTTTAAACTGAATAAGAGATCATAGGTTTACTTGATCATGCATCA
GGCAACATGATGCAGTCAATGGCTCGCTTGCATATTCCTGTCATCGTTGCTTCTGGTCCA
TATACCTCTAGAGGAACACCGAGTTCATCCCCCAGAGCACGCATTCTAGCCAGACCAGTC
TGGTAATTAGGACCACCTCTTCTTACGTAAATGTGCATTCTTGATGCTTTCAGCCTTGTT
TCCTTTTCTCTTAGAGCGCGGATGATACCGTTGAAAGTAGCTGCCACGTCGGTAAAATTG
GCAATGCCACCTCCAATGAGAAGAGCTCGTTTGCGTCCATCAGGATCAGCAGTAGCACAA
TCAATGACAACTCTAGCGTAATGTAACACCTCTTCCTCGTTAGGTGCTCCACTATACTCC
GCGTAGTTCCCGAGCTCTGATGCGTAGCCTAAATCTCCAACTGTATCAGCGTATATGACG
CTAGCACCGCCTCCAGCTACCATAGTCCAAATGCGACCTTTAGGATTCAAA

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1H191JQB 839 0 0
GCTATAAAAATCTTATTTGTACACTTCAAAAGAGGATTTTGACCGTTTTGATTACAATTA
CACAACAACCAATGATTTGGTTTTCAGTATTACACACACACAAGCAACAGTTTCAAAGAG
CTTTTCATTTTCATATGCTGATAGAGAGATGAAGAACAGGGATCAACAAACACTTCCCAT
TGCTCAGGTCCGAGTTCGTGTTCTGCTGTTTTAGACTGAATAAGAGATCATAGGTTTACT
TGATCATGCATCAGGCAACATGATGCAGTCAATGGCTCGCTTGCATATTCCTGTCATCGT
TGCTTCTGGTCCATATACCTCTAGAGGAACACCGAGTTCATCCCCCAGAGCACGCATTCT
AGCCAGACCAGTCTGGTAATTAGGACCACCTCTTCTTACGTAAATGTGCATTCTTGATGC
TTTCAGCCTTGTTTCCTTTTCTCTTAGAGCGCGGATGATACCGTTGAAAGTAGCTGCCAC
GTCGGTAAAATTGGCAATGCCACCTCCAATGAGAAGAGCTCGTTTGCGTCCATCAGGATC
AGCAGTAGCACAATCAATGACAACTCTAGCGTAATGTAACACCTCTTCCTCGTTAGGTGC
TCCACTATACTCCGCGTAGTTCCCGAGCTCTGATGCGTAGCCTAAATCTCCAACTGTATC
AGCGTATATGACGCTAGCACCGCCTCCAGCTACCATAGTCCAAATGCGACCTTTAGGATT
CAAAACAGTAAACTTCAAAGAAGCACTTGTCTTCTCATCTAAACCATGGATGAAGCTCTC
CGTTGGACTGAGTACCCTTCCAAATGGCAGAGGAAATTCATGTCTCCCCACTTGTTGAA

QA 1 839 1 839
DS 



AS 1 2

CO CL3685Contig1 678 2 2 U
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TCTCCCATCAGCCTCCGTTCCCTCCCCTTAGCCAACACTCAGACCATCTTCGGTCTCAAG
TCAGGAACCGCACGCGGCGGACGCGTCACTGCCATGGCCACATACAAGGTCAAGTTCATC
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GGTAAAGTTGTGTCTGGTTCCGTTGACCAGTCTGACCAGAGCTTCCTCGATGATGACCAG
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TTTCATAATCATTCGTGTCTTTTTACATTTTGAGTTGAGTTTGTTGTTTACTTTAGTATA
ATCTATTGTCGTCTGCTGTAATTGTTCTTGGTTTGGAACATCTTTTGGTAAGATCAATGG
ATAACTGTTTTAAACTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1BK04JQ C 1
AF RS1BK04TF U 1
BS 1 676 RS1BK04TF
BS 677 678 RS1BK04JQ

RD RS1BK04JQ 678 0 0
GGAACACAACACACAGAGAAACCAAGAAAAATTCTCAGATTCTCTAAAAAAACAAAAGAA
ATGGCTTCCACAGCTCTCTCAAGCGCCATCGTCGGAACATCCTTCATCCGCCGTCAAACG
TCTCCCATCAGCCTCCGTTCCCTCCCCTTAGCCAACACTCAGACCATTTTCGGTCTCAAG
TCAGGAACCGCACGCGGCGGACGCGTCACTGCCATGGCCACATACAAGGTCAAGTTCATC
ACTCCAGAAGGAGAGCAAGAGGTTGAGTGCGACGACGACGTTTACGTCCTCGACGCTGCG
GAGGAAGCAGGGATCGACTTGCCTTACTCTTGCCGTGCCGGTTCTTGCTCGAGCTGTGCA
GGTAAAGTTGTGTCTGGTTCCGTTGACCAGTCTGACCAGAGCTTCCTCGATGATGACCAG
ATTGCTGAAGGGTTTGTCCTGACTTGTGCGGCTTATCCTACTTCTGATGTTACCATTGAG
ACCCACAAAGAAGAAGACATGGTTTAAGACAAAAGCTCCGTAACATGCTGGTTTTGATGG
TTTCATAATCATTCGTGTCTTTTTACATTTTGAGTTGAGTTTGTTGTTTACTTTAGTATA
ATCTATTGTCGTCTGCTGTAATTGTTCTTGGTTTGGAACATCTTTTGGTAAGATCAATGG
ATAACTGTTTTAAACTTT

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1BK04TF 678 0 0
GGAACACAACACACAGAGAAACCAAGAAAAATTCTCAGATTCTCTAAAAAAACAAAAGAA
ATGGCTTCCACAGCTCTCTCAAGCGCCATCGTCGGAACATCCTTCATCCGCCGTCAAACG
TCTCCCATCAGCCTCCGTTCCCTCCCCTTAGCCAACACTCAGACCATCTTCGGTCTCAAG
TCAGGAACCGCACGCGGCGGACGCGTCACTGCCATGGCCACATACAAGGTCAAGTTCATC
ACTCCAGAAGGAGAGCAAGAGGTTGAGTGCGACGACGACGTTTACGTCCTCGACGCTGCG
GAGGAAGCAGGGATCGACTTGCCTTACTCTTGCCGTGCCGGTTCTTGCTCGAGCTGTGCA
GGTAAAGTTGTGTCTGGTTCCGTTGACCAGTCTGACCAGAGCTTCCTCGATGATGACCAG
ATTGCTGAAGGGTTTGTCCTGACTTGTGCGGCTTATCCTACTTCTGATGTTACCATTGAG
ACCCACAAAGAAGAAGACATGGTTTAAGACAAAAGCTCCGTAACATGCTGGTTTTGATGG
TTTCATAATCATTCGTGTCTTTTTACATTTTGAGTTGAGTTTGTTGTTTACTTTAGTATA
ATCTATTGTCGTCTGCTGTAATTGTTCTTGGTTTGGAACATCTTTTGGTAAGATCAATGG
ATAACTGTTTTAAACT
TT

QA 1 676 1 676
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3687Contig1 741 3 8 U
TTAATAAAAAAAAAAAAAATCACTTAAACGCAATAACTGCGCCAAGTGCTATTTTTATTC
AGGGTTTTGCTACTTCAGGCCTTTTAAACAACATGCCTCAGTCTGCAATATTAGTACCAG
CTCTCCAGTCCCAGTGGTTAATGATGCACGTAAGTATGATGATCTTAGGCTATGGCGCTC
TGTTATGCGGATCATTATTATCAATAGCTCTTCTAGTCATTACATTTCGCAAGATCGGAT
CTACTTTTTGGAAAAATAATATGAAAATAAAATTTTTATTAAATGAATTTTCTTCTTTTG
ATGTACTTTACTACATAAACGAAAGAAATTCTATTTTACTACAACAAAACATTAATTTTA
GTTTTTCTAGAAATTATTATAGGTATCAATTGATTGAACAATTAGATTATTGGAGTTTTC
GTATTATTAGTCTCGGATTTATCTTTTTAACCGTCGGCATTCTTTCAGGAGCTGTATGGG
CTAATGAAACGTGGGGTTCATATTGGAATTGGGATCCGAAAGAAACCTGGGCATTTATTA
CTTGGACCATCTTCGCAATTTATTTACATATTAAAACAAATAGGAATGCTCGAGGTATAA
ATTCTGCAATTGTGGCTTCGCTAGGTTTTCTTTTAATTTGGATATGCTATTTTGGCGTCA
ATCTTTTAGGAATAGGTTTACATAGTTATGGTTCATTTACATCGAATTAACTAAAACATT
AACAAAAAAAGAAAAGAATCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1FV43TF U 313
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AF RS1B376JQ C 1
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G
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QA 2 408 2 408
DS 

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G
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QA 2 553 2 553
DS 

RD RS1B376JQ 741 0 0
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CTAATGAAACGTGGGGTTCATATTGGAATTGGGATCCGAAAGAAACCTGGGCATTTATTA
CTTGGACCATCTTCGCAATTTATTTACATATTAAAACAAATAGGAATGCTCGAGGTATAA
ATTCTGCAATTGTGGCTTCGCTAGGTTTTCTTTTAATTTGGATATGCTATTTTGGCGTCA
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AACAAAAAAAGAAAAGAATCC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 3

CO CL3688Contig1 1187 3 5 U
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AAGTTGCATCAGACTTGAGTAGACTCTCAGAAGTACATTCAGTTTTTGTCGACTCCAAAT
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TGTTAACACTTTCAACAACAGGGCCCGTCTCATCTCCAGATTTCTTC


BQ
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AF RS1EH08JQ U 1
AF RS1CE54JQ U 22
AF RS1EH08TF C 390
BS 1 753 RS1EH08JQ
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BS 818 1187 RS1EH08TF

RD RS1EH08JQ 753 0 0
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CTACAGTTTGTAACGTTTTTATGCTAAAAAAAGACAGAAAAGGTTTTTAAAAGGAAAGAA
AAAAAAACAAGTTAGGCAAGAAAAATAGGTTGGAACTTTACAAAAGCGACATGATGAGGA
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ACTCTTGTTGTTGCAAAGCTATCGCCAGTTGTAGATCAGAGTTGACTTCTACGCCTGTGT
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CACTTGCACCAGTTGTGCTGCTGTCTATCTTGAACTCCTTGAAAGTAGCAGTCATGAACG
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TGTTGCGGAAAAAGACACAGAGTTCACGTTCTTTAAGACCTTCTTGCAAGCGAAAGAGTC
CACAAAAGGTTAATTGACTGGCACTATTCTTCA

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DS 

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GG
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GCAGTATTTGTGACTGCGTTTTGTTCATCCCACGTGCCACTTGCACCAGTTGTGCTGCTG
TCTATCTTGAACTCCTTGAAAGTAGCAGTCATGAACGCAGTGTCACCATGAACCTCATTA
AGCTTTTCCCATACTAAATCAGGCTGATTCAGGTAACCTTGATCTGTAGCCAAAAGATAA
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TCACGTTCTTTAAGACCTTCTTGCAAGCGAAAGAGTCCACAAAAGGTTAATTGACTGGCA
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TTACCTTCAGAAGA

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DS 

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TTTGTGACTGCGTTT*GTTCATCCCACGTGCCACTTGCACCAGTTGTGCTGCTGTCTATC
TTGAACTCCTTGAAAGTAGCAGTCATGAACGCAGTGTCACCATGAACCTCATTAAGCTTT
TCCCATACTAAATCAGGCTGATTCAGGTAACCTTGATCTGTAGCCAAAAGATAAAGTTCA
CCTTCGTACTTGAACATGGTGCAGAAATGATTGTTGCGGAAAAAGACACAGAGTTCACGT
TCTTTAAGACCTTCTTGCAAGCGAAAGAGTCCACAAAAGGTTAATTGACTGGCACTATTC
TTCAGGAAGTTCCTGATTACTTCACCTTCTTTTGCTGTGAGCCCATCCGTGCCCTTACCT
TCAGAAGAAGAATCATCAACATTCTTCTCATCCCTTTTCCCAAGAAGTGACTCACCTTCG
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TCATACATGGGTTCATCACTAGATATGGGTGAAGTTAAAGCATCGGGTACATCGTCATGC
TGGGATTTGCAAGTGAGATCTGGATTAACAGAAGTTGCATCAGACTTGAGTAGACTCTCA
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GAAGTTAACTCAGCGACAGCCTTTTCGTTACTGTTAACACTTTCAACAACAGGGCCCGTC
TCATCTCCAGATTTCTTC

QA 1 798 1 798
DS 



AS 1 3

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TATCAAATCTGAAAAACATAAAAAACATAAAAAATCACATAGGCCGTAGCAAATTAAGTA
CGGCTACTATGTCGAATGATCCTGTCTTTTTGCCAAGAGATGAAAGATGGAGGATCAGAT
GTTTGAAGCATTCAAAGCCATGAATTTGCATTGTTCATTCAAGGCCAGAATCTGAGCTTC
TTTCTTGTCAAGAAGAGCGGTTAGCTTCACGTTCTCCTCCATCAGCTTTTGAATTTCTAC
CTCTTTCTGCGCTTTCTCGCCTTCCAGCTGTGCAGACTTAGCAACCAGCATTGCTTCGAT
AGTTTTGAATTGCCTTTCCGATGAACGAAGTGTCTCAACAGCATTGGTGGAAGTATTGAC
GTAATTTCTAAGTGATTCAAACTCCGTCTTCACACGACGGAGCTCCTCTTCTTTCTCAAC
AGCTTCCTCCCTATCTCTCCTACTGGCTTCAACCAACGTCTTGATTATCTCCATTGTTTT
GTTGAGAACACCTTTATTACCAAGCACTATCTGTTTCATCCCATCCACACTCGATAACAA
ATGCTCGATTTCGACTGTCTTCCTTCTAATTTCTTCCTCACCTATAATCACCCTCTCCTT
ATGGAACGACGCTTCGGATTCTGCCGCTGTGACCCTCCTCAGAAGAGACTCCAGCACATC
AGCGACCATCTGTATGAATTGGATCATCTTCAAAGTACAAGCTCCATCCCGTATGACCAA
GGAGTCTTGGTTCTTCTCGCTAGTTCCAGGAAACGTATCTTCTTCCCCTGGACTATGAAA
AGTTAGAAGAGTGATGATGTCCTTGGCCACTTCGGAAACTGAACCATCATCTTCTAGTGG
TAACTGTTCAGCACCGAGCGACTCATGTGCTAGAAGATCAGGAACGGCCAACAGAGCTTT
TGACCTCAAATAGTGTAAGCTGGCTGCAGCTGATTTGACCCTATCTAGCAGAACACCCAA
CTCTTCAGCTTGTAAATCACAATCTACATGATGCAGTTGACCAAATTTCATCTCAAGGCT
TTCTCTTGATGATGAATCATGTGCAGCAGCAGCCATACCTATTCCCAATCTCTTTTTCCA
GAAACTAAACATGAATAAAACCTTATCTCAGGAGATTATGTTTCGAGATTTGCTCCGGTC
GATTCGAGTCTCGTCGCCGATTGGCTGAGATCCC


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AF72JQ U 3
AF RS1B630JQ U 1
AF RS1B630TF C 549
BS 1 668 RS1B630JQ
BS 669 1234 RS1B630TF

RD RS1AF72JQ 217 0 0
C
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CAAATCTGAAAAACATAAAAAACATAAAAA*TCACATAGGCCGTAGCAAATTAAGTACGG
CTACTATGTCGAATGATCCTGTCTTTTTGCCAAGAGATGAAAGATGGAGGATCAGATGTT
TGAAGCATTCAAAGCCATGAATTTGCATTGTTCATT

QA 2 217 2 217
DS 

RD RS1B630JQ 668 0 0
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TATCAAATCTGAAAAACATAAAAAACATAAAAAATCACATAGGCCGTAGCAAATTAAGTA
CGGCTACTATGTCGAATGATCCTGTCTTTTTGCCAAGAGATGAAAGATGGAGGATCAGAT
GTTTGAAGCATTCAAAGCCATGAATTTGCATTGTTCATTCAAGGCCAGAATCTGAGCTTC
TTTCTTGTCAAGAAGAGCGGTTAGCTTCACGTTCTCCTCCATCAGCTTTTGAATTTCTAC
CTCTTTCTGCGCTTTCTCGCCTTCCAGCTGTGCAGACTTAGCAACCAGCATTGCTTCGAT
AGTTTTGAATTGCCTTTCCGATGAACGAAGTGTCTCAACAGCATTGGTGGAAGTATTGAC
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AGCTTCCTCCCTATCTCTCCTACTGGCTTCAACCAACGTCTTGATTATCTCCATTGTTTT
GTTGAGAACACCTTTATTACCAAGCACTATCTGTTTCATCCCATCCACACTCGATAACAA
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ATGGAACG

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1B630TF 686 0 0
ACA
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CGACTGTCTTCCTTCTAATTTCTTCCTCACCTATAATCACCCTCTCCTTATGGAACGACG
CTTCGGATTCTGCCGCTGTGACCCTCCTCAGAAGAGACTCCAGCACATCAGCGACCATCT
GTATGAATTGGATCATCTTCAAAGTACAAGCTCCATCCCGTATGACCAAGGAGTCTTGGT
TCTTCTCGCTAGTTCCAGGAAACGTATCTTCTTCCCCTGGACTATGAAAAGTTAGAAGAG
TGATGATGTCCTTGGCCACTTCGGAAACTGAACCATCATCTTCTAGTGGTAACTGTTCAG
CACCGAGCGACTCATGTGCTAGAAGATCAGGAACGGCCAACAGAGCTTTTGACCTCAAAT
AGTGTAAGCTGGCTGCAGCTGATTTGACCCTATCTAGCAGAACACCCAACTCTTCAGCTT
GTAAATCACAATCTACATGATGCAGTTGACCAAATTTCATCTCAAGGCTTTCTCTTGATG
ATGAATCATGTGCAGCAGCAGCCATACCTATTCCCAATCTCTTTTTCCAGAAACTAAACA
TGAATAAAACCTTATCTCAGGAGATTATGTTTCGAGATTTGCTCCGGTCGATTCGAGTCT
CGTCGCCGATTGGCTGAGATCCC

QA 4 686 4 686
DS 



AS 1 3

CO CL3690Contig1 1140 3 7 U
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ACTATGCATTATTTTGACTGCTCTTGTCTCCATCGCCGGAGCAAAAGTCCCGGCCATCAT
TGTCTTCGGCGACTCTTCCGTAGACTCCGGCAATAACAACTTCATACAAACCATGGCCAG
AGCCAACTTCGAACCTTATGGCCGCGACTTCCCTGGTGGCCGCCCCACCGGCCGCTTTTG
CAACGGCCGTCTCTCCTCCGATTTCACTTCCGAGGCTTTCGGTCTTAAACCGACTGTCCC
GGCCTATCTTGATCCGTCCTACAATATCTCTGATTTCTCCACCGGAGTTTGCTTCGCCTC
CGCCGGCACCGGTTATGATAATTCCACCGCCGGCGTGCTAGGTGTGATTCCTTTATGGAA
AGAAGTCGAGTACTACAAGGAATACCAACACAAACTGGCCGCCTATCTCGGCCGCCGCAA
AGCCGCAAACATCATCAAAGAGTCGCTGTACCTAGTCAGCATAGGAACCAACGACTTCTT
AGAGAATTATTACACATTACCGGACAGGAGATCTCAGTTTAGCATCAGTCAGTACCAAGA
CTTTCTCATAGGTATCGCCGAGGTGTTTTTAAAGGATCTTTACAAACTTGGTGCTCGAAA
AATGTCTTTCACCGGAATCTCTCCAATGGGATGTCTACCACTGGAAAGAGTGACGAATTT
TGACGACCCTTTCAGCTGTGCTACGAGTTACAATGACCTGGCGATTGATTTTAATGGGAG
GTTGAGGAGATTAGTGAGGAAGTTGAATCAAGAACTCAATGGAATGAAGATATACTTCGC
TAATCCCTATGATATCATTTGGGATATTGTTACAAAACCATCGCGTTACGGTCTAGAGGT
ATCTAGTTCTGCGTGCTGTGGAACTGGATTGTTCGAGATGGGGTTTCTTTGCGGCCAGGA
CAATCCGTTAACTTGCAGTGATGCAAATAAGTTTGTTTTTTGGGACGCTTTTCATCCGAC
CGAGAGGACTAATCAGATTGTGTCTGATTACTTTTTTAAACATCTAAAGAATCTCTTTTC
ATTAATCCTTATTCACATATCTACGAGTATATTCGTTTATATGAATCCAGGTTCATTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E186TF U 1
AF RS1F409TF U 103
AF RS1F409JQ C 385
BS 1 115 RS1E186TF
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BS 868 1140 RS1F409JQ

RD RS1E186TF 558 0 0
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TAAACCGACTGTCCCGGCCTATCTTGATCCGTCCTACAATATCTCTGATTTCTCCACCGG
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GTT

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AS 1 3

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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 

AF RS1A605JQ C 1
AF RS1DU36TF U 255
AF RS1A605TF U 1
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RD RS1A605JQ 831 0 0
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TG

QA 1 829 1 829
DS 

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T

QA 1 575 1 575
DS 

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AATAAGACCCAGTTTGCA*TTTCTACA*TATATATCTGTTTGTTTGTTTGAAA

QA 1 833 1 833
DS 



AS 1 3

CO CL3692Contig1 878 3 6 U
GGAGATCCAAAATTACTTCAACTTCGATTATTGCAGTCTTCGACTTCCTTTTACCTTTCT
CCTTCGTCTTCTCTCTCTCTCGAGATTCATGTAACACAAAAGATTTGTGTAAACCCTCTC
CATTGAAGATAATGGCGAAAACCAATGGAGTTATTATCCCGACGATAGACTTGGGGGAGG
AGGTTTCATACAAGATCCTGAACCAGAAAATCCGCGAAGCCAGCGAGAGGTGGGGATGCT
TCAGAGCGATCAACCATGGAGTTTCGCTGTCTTTGATGTCCGACATGAAGAAGACCGTTA
TCGATCTCTTCGAACGTCCGCATGAGGTGAAAGTGCGTAACGCAGACGTGTTACTAGGGA
GTGGTTACAGGGCTCCTAACGAAATTAATCCTTATTACGAAGCGTTGGGTCTCTACGACA
TGGCTTCTCCTCAAGCTGTCAACACCTTTTGTGACCAGCTAGAGGCTTCTGCGGATCAAA
GGGACATAATGGTAAAATATGCGAAAGCTATCGATGGACTTGCAAAGGATCTAGCAAGGA
GGTTAGCAGAGAGCTACGGCTTGGACGATACAAACTTCTTCGAAGGATGGCCGAGCCAGT
TCCGGATCAACAAGTATCATTTCCAACCAGAAACGGTCGGGAAACTCGGTGTCCAGTTAC
ACACCGATTCAGGCTTCTTGACGATTCTTCAAGACGACGAAAACGTCGGTGGGCTCGAAG
CAATGGACAATTCTTCGGGAACGTTCTTTCCCATAAGCCCGTTGCCGAACACGCTTGCTA
TCAACCTCGGGGACATGGCTACGATCTGGAGCAATGGGAGTTGTGCAACGTGAAGCATAG
AGTGCAGTGCACGAAGCGACGAGAGTTTCTATCGCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FW29TF U 18
AF RS1BS42TF U 1
AF RS1AV23TF U 114
BS 1 199 RS1BS42TF
BS 200 200 RS1FW29TF
BS 201 549 RS1BS42TF
BS 550 551 RS1FW29TF
BS 552 669 RS1BS42TF
BS 670 878 RS1AV23TF

RD RS1FW29TF 624 0 0
GG
AACTTCGATTATTGCAGTCTTCGACTTCCTTTTACCTTTCTCCTTCGTCTTCTCTCTCTC
TCGAGATTCATGTAACACAAAAGATTTGTGTAAACCCTCTCCATTGAAGATAATGGCGAA
AACCAATGGAGTTATTATCCCGACGATAGACTTGGGGGAGGAGGTTTCATACAAGATCCT
GAACCAGAAAATCCGCGAAGCCAGCGAGAGGTGGGGATGCTTCAGAGCGATCAACCATGG
AGTTTCGCTGTCTTTGATGTCCGACATGAAGAAGACCGTTATCGATCTCTTCGAACGTCC
GCATGAGGTGAAAGTGCGTAACGCAGACGTGTTACTAGGGAGTGGTTACAGGGCTCCTAA
CGAAATTAATCCTTATTACGAAGCGTTGGGTCTCTACGACATGGCTTCTCCTCAAGCTGT
CAACACCTTTTGTGACCAGCTAGAGGCTTCTGCGGATCAAAGGGACATAATGGTAAAATA
TGCGAAAGCTATCGACGGACTTGCAAAGGATCTAGCAAGGAGGTTAGCAGAGAGCTACGG
CTTGGACGATACAAACTTCTTCGAAGGATGGCCGAGCCAGTTCCGGATCAACAAGTATCA
TTTCCAACCAGAAACGGTCGGG

QA 3 624 3 624
DS 

RD RS1BS42TF 669 0 0
GGAGATCCAAAATTACTTCAACTTCGATTATTGCAGTCTTCGACTTCCTTTTACCTTTCT
CCTTCGTCTTCTCTCTCTCTCGAGATTCATGTAACACAAAAGATTTGTGTAAACCCTCTC
CATTGAAGATAATGGCGAAAACCAATGGAGTTATTATCCCGACGATAGACTTGGGGGAGG
AGGTTTCATACAAGATCCTCAACCAGAAAATCCGCGAAGCCAGCGAGAGGTGGGGATGCT
TCAGAGCGATCAACCATGGAGTTTCGCTGTCTTTGATGTCCGACATGAAGAAGACCGTTA
TCGATCTCTTCGAACGTCCGCATGAGGTGAAAGTGCGTAACGCAGACGTGTTACTAGGGA
GTGGTTACAGGGCTCCTAACGAAATTAATCCTTATTACGAAGCGTTGGGTCTCTACGACA
TGGCTTCTCCTCAAGCTGTCAACACCTTTTGTGACCAGCTAGAGGCTTCTGCGGATCAAA
GGGACATAATGGTAAAATATGCGAAAGCTATCGATGGACTTGCAAAGGATCTAGCAAGGA
GGTTAGCAGC*AGCTACGGCTTGGACGATACAAACTTCTTCGAAGGATGGCCGAGCCAGT
TCCGGATCAACAAGTATCATTTCCAACCAGAAACGGTCGGGAAACTCGGTGTCCAGTTAC
ACACCGATT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RS1AV23TF 765 0 0
G
CCTCTCCATTGAAGATAATGGCGAAAACCAATGGAGTTATTATCCCGACGATAGACTTGG
GGGAGGAGGTTTCATACAAGATCCTGAACCAGAAAATCCGCGAAGCCAGCGAGAGGTGGG
GATGCTTCAGAGCGATCAACCATGGAGTTTCGCTATCTTTGATGTCCGACATGAAGAAGA
CCGTTATCGATCTCTTCGAACGTCCGCATGAGGTGAAAGTGCGTAACGCAGACTTGTTAC
TAGGGAGTGGTTACAGGGCTCCTAACGAAATTAATCCTTATTACGAAGCGTTGGGTCTCT
ACGACATGGCTTCTCCTCAAGCTGTCAACACCTTTTGTGACCAGCTAGAGGCTTCTGCGG
ATCAAAGGGACATAATGGTAAAATATGCGAAAGCTATCGATGGACTTGCAAAGGATCTAG
CAAGGAGGTTAGCAGAGAGCTACGGCTTGGACGATACAAACTTCTTCGAAGGATGGCCGA
GCCAGTTCCGGATCAACAAGTATCATTTCCAACCAGAAACGGTCGGGAAACTCGGTGTCC
AGTTACACACCGATTCAGGCTTCTTGACGATTCTTCAAGACGACGAAAACGTCGGTGGGC
TCGAAGCAATGGACAATTCTTCGGGAACGTTCTTTCCCATAAGCCCGTTGCCGAACACGC
TTGCTATCAACCTCGGGGACATGGCTACGATCTGGAGCAATGGGAGTTGTGCAACGTGAA
GCATAGAGTGCAGTGCACGAAGCGACGAGAGTTTCTATCGCTTC

QA 2 765 2 765
DS 



AS 1 2

CO CL3693Contig1 850 2 2 U
GGGGCTCCAGAGGATCGTCCAAATCGAAAAAAAATGGGAACCTTGGGAAGAGCGATCTAC
ACAGTGGGTAACTGGATCCGCGGGACTGGCCAAGCTCTTGATCGCGTCGGCTCTCTTCTC
CAAGGGAGCCACCGCTTGGAAGAACACCTATCGAGGCATAGGACGTTGATGAGTGTGTTT
GATAAATCTCCATTGGTGGATAAGGATGCGTTCGTGGCTCCGAGTGCCTCTGTTATTGGT
GATGTTCAGATCGGGAAAGGCTCTTCTATTTGGTATGGCTGTGTTCTTCGAGGTGATGTG
AATAACATCAGTGTTGGATCCGGGACGAATATCCAAGACAATTCTCTTGTACATGTTGCA
AAAACCAACCTAGCTGGCAAGGAATTACCTACTACTATTGGGGACAATGTCACTATAGGT
CATAGTGCTGTCATACATGGGTGTACTGTCGAGGATGAGGCTTTTGTTGGCATGGGAGCC
ACACTACTCGATGGTGTGGTTGTTGAGAAGCATGCCATGGTTGCTGCCGGTTCCCTTGTG
AGGGAGAACACTCGAATCCCTTCCTGAGAGGTATGGGGAGGAAACCCAGCAAAGATCATG
AGAAAGTTAACAGATGAAGAGATGGCATATATTTCAGCTTTGTTTTTAAGACAAAGATTG
ATTTTCTGGAAAGTCGAGAGAGATATTATCTTTTGGTTTTGCCTTTTTCCTCCCGAGTAA
ACATGGGATTATCATATTCTTGCTCAATAAAGCCGAACATAACTTGTACTGTTGCGTTAT
GTCACATGTCTTTGATGAACAATTTCAGAAAGAGGAACGAGCTGCATTAATTTATGATTG
TTTTATACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E426TF U 1
AF RS1E426JQ C 119
BS 1 451 RS1E426TF
BS 452 850 RS1E426JQ

RD RS1E426TF 451 0 0
GGGGCTCCAGAGGATCGTCCAAATCGAAAAAAAATGGGAACCTTGGGAAGAGCGATCTAC
ACAGTGGGTAACTGGATCCGCGGGACTGGCCAAGCTCTTGATCGCGTCGGCTCTCTTCTC
CAAGGGAGCCACCGCTTGGAAGAACACCTATCGAGGCATAGGACGTTGATGAGTGTGTTT
GATAAATCTCCATTGGTGGATAAGGATGCGTTCGTGGCTCCGAGTGCCTCTGTTATTGGT
GATGTTCAGATCGGGAAAGGCTCTTCTATTTGGTATGGCTGTGTTCTTCGAGGTGATGTG
AATAACATCAGTGTTGGATCCGGGACGAATATCCAAGACAATTCTCTTGTACATGTTGCA
AAAACCAACCTAGCTGGCAAGGAATTACCTACTACTATTGGGGACAATGTCACTATAGGT
CATAGTGCTGTCATACATGGGTGTACTGTCG

QA 1 451 1 451
DS 

RD RS1E426JQ 732 0 0
TCCAAGGGAGCCACCGCTTGGAAGAACACCTATCGAGGCATAGGACGTTGATGAGTGTGT
TTGATAAATCTCCATTGGTGGATAAGGATGCGTTCGTGGCTCCGAGTGCCTCTGTTATTG
GTGATGTTCAGATCGGGAAAGGCTCTTCTATTTGGTATGGCTGTGTTCTTCGAGGTGATG
TGAATAACATCAGTGTTGGATCCGGGACGAATATCCAAGACAATTCTCTTGTACATGTTG
CAAAAACCAACCTAGCTGGCAAGGAATTACCTACTACTATTGGGGACAATGTCACTATAG
GTCATAGTGCTGTCATACATGGGTGTACTGTCGAGGATGAGGCTTTTGTTGGCATGGGAG
CCACACTACTCGATGGTGTGGTTGTTGAGAAGCATGCCATGGTTGCTGCCGGTTCCCTTG
TGAGGGAGAACACTCGAATCCCTTCCTGAGAGGTATGGGGAGGAAACCCAGCAAAGATCA
TGAGAAAGTTAACAGATGAAGAGATGGCATATATTTCAGCTTTGTTTTTAAGACAAAGAT
TGATTTTCTGGAAAGTCGAGAGAGATATTATCTTTTGGTTTTGCCTTTTTCCTCCCGAGT
AAACATGGGATTATCATATTCTTGCTCAATAAAGCCGAACATAACTTGTACTGTTGCGTT
ATGTCACATGTCTTTGATGAACAATTTCAGAAAGAGGAACGAGCTGCATTAATTTATGAT
TGTTTTATACCC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL3694Contig1 975 2 4 U
GGATACGATGGAGTCTACAGGATTGAAAAGTGCTGGCGAAAAGTTGGAGTTCAGGGCAAG
AGAGTTTGTCGTTACCTTTTTGTCAGGTGTGACAACGAACCAGCCCCATGGACCAGTGAT
GAGCATGGTGATCGTCCACGACCTCTGCCTTCTATTCCAGAGCTTAAGAAGGCTACTGAG
ATGTTTGTGAGAAAGGAAAGCCCATCATGGGATTTTGATGAAGCTGATGGTCGTTGGAAG
TGGATGAAGTCTCCACCTGCTAGCAAAAAGGCGATTGCTGCTTTGGATCCTGCAGAGAGG
AAGAGGGCGAGGAAGGGGGCAGGAAACAATAGGGACAAATTTCTCAAAGAATTTGGTTGC
CAAATCTGTCGGGAAGTCATGAGCTCTCCAGTGACAACGCCTTGCGCTCACAACTTCTGC
AAGGAATGCCTAACTGGTAAATTTGCTGGGATAACTCAAGTGAGGCAGAGGAGCAGAGGT
GGGCGTACTCTGCGTGCACAGAAGAACGTCATGAAATGTCCTTGCTGCCCAAATGACATT
TCTGACTTCCTTCAGAACCCACAGGTGAATAGAGAATTGATGGATGTGATAGAGGAGGTG
AAGAAGAAGAAAGAGCTGGAGGAGCGAGAAGATGAAGTAAAGTCTGAAAATTCCGCTGAA
GAAGAAGATGACCAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAGGAGGAAGAAGACGAAGAAGAGGAG
GAGGAAGAAGAATCTGAGGTTCATGTTTCAGAAGATGAGCCAGCAGCCAAGAAGATCAAA
CTCTCAGCTTAAATATGATGAACTCTCTCTCTCTGTTATGGTTTTAATGCTTTTGGGTAC
TTATTGCAAACTTATTTATTTTGGTATTTATGCAGACAAACATGTCACTTCAGTTCTATT
ATTCTATGTAGTATAAGTTATGCTTTTAGTATACAGTCTTGTCCCTCACTTTAGTTCTAT
TATTCTATGTAGTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AGAGTTTGTCGTTACCTTTTTGTCAGGTGTGACAACGAACCAGCCCCATGGACCAGTGAT
GAGCATGGTGATCGTCCACGACCTCTGCCTTCTATTCCAGAGCTTAAGAAGGCTACTGAG
ATGTTTGTGAGAAAGGAAAGCCCATCATGGGATTTTGATGAAGCTGATGGTCGTTGGAAG
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CAAATCTGTCGGGAAGTCATGAGCTCTCCAGTGACAACGCCTTGCGCTCACAACTTCTGC
AAGGAATGCCTAACTGGTAAATTTGCTGGGATAACTCAAGTGAGGCAGAGGAGCAGAGGT
GGGCGTACTCTGCGTGCACAGAAGAACGTCATGAAATGTCCTTGCTGCCCAAATGACATT
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G

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DS 

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AGGAAACAATAGGGACAAATTTCTCAAAGAATTTGGTTGCCAAATCTGTCGGGAAGTCAT
GAGCTCTCCAGTGACAACGCCTTGCGCTCACAACTTCTGCAAGGAATGCCTAACTGGTAA
ATTTGCTGGGATAACTCAAGTGAGGCAGAGGAGCAGAGGTGGGCGTACTCTGCGTGCACA
GAAGAACGTCATGAAATGTCCTTGCTGCCCAAATGACATTTCTGACTTCCTTCAGAACCC
ACAGGTGAATAGAGAATTGATGGATGTGATAGAGGAGGTGAAGAAGAAGAAAGAGCTGGA
GGAGCGAGAAGATGAAGTAAAGTCTGAAAATTCCGCTGAAGAAGAAGATGACCAAGAAGA
AGAAGAAGAGGAAGAGGAGGAAGAAGACGAAGAAGAGGAGGAGGAAGAAGAATCTGAGGT
TCATGTTTCAGAAGATGAGCCAGCAGCCAAGAAGATCAAACTCTCAGCTTAAATATGATG
AACTCTCTCTCTCTGTTATGGTTTTAATGCTTTTGGGTACTTATTGCAAACTTATTTATT
TTGGTATTTATGCAGACAAACATGTCACTTCAGTTCTATTATTCTATGTAGTATAAGTTA
TGCTTTTAGTATACAGTCTTGTCCCTCACTTTAGTTCTATTATTCTATGTAGTAT

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 3

CO CL3695Contig1 970 3 4 U
GGGCCTCACCTTCGCGTGTGCACACGCGTGTCTTGTTTCTTTATGGTTGCTTTTTCTCGT
TATCTAGACACACGATTCTTCCGTTCAGAAGAGAGATTATAAAGAAAAAGTCAGTTTCAA
TTGCTTGCCTGTGTTTCGGTTCTGTCTGAACGGTCATTCATCATCATCGTCGTCCCCATT
ACTCCATTAAACCTTTTTCTTGAATCATTACTTGCTTGTGAACGATGAGAAGCCAACAGA
GAGATCAAGACTCGAGGGCTTTCTACGATCTCTCGGCTCTTGTCCTGAGCCTCCTCCGCT
CTCCTCCTGTCCCGATTTCTCTCCCCGATCATCATCATCACTTCCCGGATTCGCCGATGA
TGATGAGTAGTCCGCAGCATCGGTCGCTTTCGATGGCGCATATAACTCCCTCCGGATTCG
CGTCGCTGCTGCTGGGTATATCGGTGGCTCTGATGCTCTGTGGATCTGTGACTTTCTTCA
TCGGCTTCCTCTTGCTGCCGTGGGTCCTGGCTCTCATCGTGGTTCTTTATGTTGCTGGGA
TCGTGTCTCTCATTTCCATGGCTGGGAGGTCCATCCTCTCTTACCTCTTGACGCCGCCTC
CTTCTTTC*CATCCATGAAGGAGATTTCTGAATGGAAGCTGTTGTGAAGCGTGACGAACA
AACTTCTTGAAATGGCTCTCCTTTGTTAATCCGGAAGCAGAGGACAAAGAAGATGGATTA
AATATATCAACGCAAAATCCAATTAGAGTTTTTCTATATATGTTCTTTTATCTGTATTTT
GGGGGGTGGGGATTATGTGTGGATATATTTGGGAGTTTCTATAGATTTTTTTTTACTTTC
TAAAAAATATTTTCTATTTTATTGTTAGAGAAATGGGAAAAGCCTGAGTTTGTGCTTTTT
TCCATGGATGGTTTTATTGTTATGTGACATTATTTCTTTTAGAAAAAATAATCATACAAA
AGATTATAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F038TF U 79
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AF RS1AC12JQ C 225
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GG
CCGTTCAGAAGAGAGATTATAAAGAAAAAGTCAGTTTCAATTGCTTGTCTGTGTTTCGGT
TCTGTCTGAACGGTCATTCATCATCATCGTCGTCCCCATTACTCCATTAAACCTTTTTCT
TGAATCATTACTTGCTTGTGAACGATGAGAAGCCAACAGAGAGATCAAGACTCGAGGGCT
TTCTACGATCTCTCGGCTCTTGTCCTGAGCCTCCTCCGCTCTCCTCCTGTCCCGATTTCT
CTCCCCGATCATCATCATCACTTCCCGGATTCGCCGATGATGATGAGTAGTCCGCAGCAT
CGGTCGCTTTCGATGGCGCATATAACTCCCTCCGGATTCGCGTCGCTGCTGCTGGGTATA
TCGGTGGCTCTGATGCTCTGTGGATCTGTGACTTTCTTCATCGGCTTCCTCTTGCTGCCG
TGGGTCCTGGCTCTCATCGTGGTTCTTTATGTTGCTGGGATCGTGTCTCTCATTTCCATG
GCTGGGAGGTCCATCCTCTCTTACCTCTTGACGCCGCCTCCTTCTTTTTCATATATGAAG
GAGATTTCTGAATGGAAGCTGTTGTGAAGCGTGACGAACAAACTTCTTGAAATGGCTCTC
CTTTGTTAA

QA 3 611 3 611
DS 

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TATCTAGACACACGATTCTTCCGTTCAGAAGAGAGATTATAAAGAAAAAGTCAGTTTCAA
TTGCTTGCCTGTGTTTCGGTTCTGTCTGAACGGTCATTCATCATCATCGTCGTCTCCATT
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GAGATCAAGACTCGAGGGCTTTCTACGATCTCTCGGCTCTTGTCCTGAGCCTCCTCCGCT
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DS 

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DS 



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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DT59TF U 1
AF RS1GF41TF U 8
AF RS1DT59JQ C 531
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GGATTTTCCGTTTAGTCTCTATTCTCCCTGTATGTGCTTTGTTTCTTGTTCTTCCTCTGT
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DS 

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GG
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CAATAATGTCGGTATCTTATTGTTACTTCTTGCCACCTAGAATAAAGTCCGGGATTTTCC
GTTTAGTCTCTATTCTCCCTGTATGTGCTTTGTTTCTTGTTCTTCCTCTGTTCTTGTCCT
TTCCACTTTTCTCCTCCCCCGCATCGATTTTGCTAATACTTGCCGATTTGAAACTCATCC
TCTTTTCCTTTGATCGAGGTCCTCTTTTTCCATTACCCTCAAATATCTTGTTATTCATCT
GCTTCACCTGTCTACCCATTCAGCGTCAAAAGAACCCTAAACCTCAAGATCAATTGCGCA
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ACCTCCTAGTCTCT
GCAAGTC

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DS 

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GGATTCGTAGCAACGTGACGGAAATGCTTCAATGAAGCCTCATTGCTACTTGATTTCTTA
AGACGCAAGTTAATTTTTTTGTACCTTAAGACGCAGGTTATTTCATTGAACTAACTTGAT
AGTTATTGTTATTTGTAATCACATTGTTTCGTGTTACAAAAAAAAAAATCACATTGTTTC
TTAAAATTTTGAATAAAAACATACAAAAATGTATCACATTATTAC

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DS 



AS 1 3

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TGGTCTTGTTTGGTCTTTCAAACCCAAAAGAAAAAAA*GAAGAAAAACACAAAAGCAAGA
GTCGAAACAACAACTAGAGAGAGCGAACCACCGGTTCCTTCACTCCTCTTCAGTGCTTGC
TGCACTCAGATCAACAGTTAAGTCCAGTTGCTTTCCAGTGATAAGAGTATACATGTTCAA
CACATCAGCAACAGTTGTCTCGAAGTGTGTTGTAGCATCATAGCTGGTTGATATAAAGCA
GTTGTCCAACTCAGGTTCGTTGACAGGCTCGTATCTGTCATACACGTCGAAAAATATCTC
ATCAACGGGAAC*AAAAGATCAATTCCAGCCTTTAGCTCAGTTTGAGGGTTATCAGTCTC
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AACTCTGCCAATCTTTCTAACCTTGTTGGGAAGGTAAGAAGGGTCACACACAATCTTTTT
GCATCTTGCAGTCTCTCCCTCAGATGTTACACCAGTAACCTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1GI77JQ U 28
AF RS1EC01JQ U 1
AF RS1EC01TF C 29
BS 1 704 RS1EC01JQ

RD RS1GI77JQ 603 0 0
A
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AGAAAAAAAAGAAGAAAAACGCAAAGGCAAGAGTCGAAACAACAACTAGAGAGAGCGAAC
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GTTGTAGCATCATAGCTGGTTGATATAAAGCAGTTGTCCAACTCAGGTTCGTTGACAGGC
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CGGGCAAGCTGCTTCTGAGGTATGATGACCTGTACCGAGTGAGAGTCATTGGTGTATGGA
ATAGGGTGGCTCATAATAGCAATGGCACGAGCAACTCTGCCAATCTTTCTAACCTTGTTG
GG

QA 2 603 2 603
DS 

RD RS1EC01JQ 704 0 0
AATGACTAATGACAGAGAAGAAGTCTTAAACGAATTCAACATTAAGGGTATCATGACCAC
TGGTCTTGTTTGGTCTTTCAAACCCAAAAGAAAAAAA*GAAGAAAAACACAAAAGCAAGA
GTCGAAACAACAACTAGAGAGAGCGAACCACCGGTTCCTTCACTCCTCTTCAGTGCTTGC
TGCACTCAGATCAACAGTTAAGTCCAGTTGCTTTCCAGTGATAAGAGTATACATGTTCAA
CACATCAGCAACAGTTGTCTCGAAGTGTGTTGTAGCATCATAGCTGGTTGATATAAAGCA
GTTGTCCAACTCAGGTTCGTTGACAGGCTCGTATCTGTCATACACGTCGAAAAATATCTC
ATCAACGGGAAC*AAAAGATCAATTCCAGCCTTTAGCTCAGTTTGAGGGTTATCAGTCTC
TGCATCTGTCGACACAAATGCTATGAACTTTCCCTTGGGAGCCACGTTGTGTGAGTACGA
ACAGCAGAAGACATACATGTCAGATTTGCGGGCAAGCTGCTTCTGAGGTATGATGACCTG
TACCGAGTGAGAGTCATTGGTGTTTGGAATAGGGTGGCTCATAATAGCAATGGCACGAGC
AACTCTGCCAATCTTTCTAACCTTGTTGGGAAGGTAAGAAGGGTCACACACAATCTTTTT
GCATCTTGCAGTCTCTCCCTCAGATGTTACACCAGTAACCTTAC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1EC01TF 676 0 0
AACGAATTCAACATTAAGGGTATCATGACCACTGGTCTTGTTTGGTCTTTCAAACCCAAA
AGAAAAAAA*GAAGAAAAACACAAAAGCAAGAGTCGAAACAACAACTAGAGAGAGCGAAC
CACCGGTTCCTTCACTCCTCTTCAGTGCTTGCTGCACTCAGATCAACAGTTAAGTCCAGT
TGCTTTCCAGTGATAAGAGTATACATGTTCAACACATCAGCAACAGTTGTCTCGAAGTGT
GTTGTAGCATCATAGCTGGTTGATATAAAGCAGTTGTCCAACTCAGGTTCGTTGACAGGC
TCGTATCTGTCATACACGTCGAAGAATATCTCATCAACGGGAAC*AAAAGATCAATTCCA
GCCTTTAGCTCAGTTTGAGGGTTATCAGTCTCTGCATCTGTCGACACAAATGCTATGAAC
TTTCCCTTGGGAGCCACGTTGTGTGAGTACGAACAGCAGAAGACATACATGTCAGATTTG
CGGGCAAGCTGCTTCTGAGGTATGATGACCTGTACCGAGTGAGAGTCATTGGTGTTTGGA
ATAGGGTGGCTCATAATAGCAATGGCACGAGCAACTCTGCCAATCTTTCTAACCTTGTTG
GGAAGGTAAGAAGGGTCACACACAATCTTTTTGCATCTTGCAGTCTCTCCCTCAGATGTT
ACACCAGTAACCTTAC

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 3

CO CL3698Contig1 910 3 22 U
GGGAGTGAGAGTCTTGAGAAAATTATAGAGAGCATCGAGAGAGTTTCTTCTTCAATGGCG
AACCTTCCCACCGTTCTCGTTACCGGCGCCAGTGGCAGAACAGGCCAGATTGTGTACAAG
AAGCTGAAGGAGAGGTCAGACAAGTTTGTGGCGAAGGGTTTAGTGAGAACTCCTGAAGGG
AAAGACAAGATTGGAGGAGAAGCTGATGTTTTCATTGGTGATATAAGGGATGCTGATAGC
ATTACCCCTGCTGTTCAAGGGATCGATGCGCTTGTGATTCTCACTAGCGCTGTCCCCAAA
ATGAAACCTGGTTTTGATCCCACCAAAGGTGGAAGACCTGAGTTCATGTTCGATGATGGA
CAATACCCTGAACAGGTTGATTGGATTGGCCAGAAGAACCAAATAGATGCTGCCAAGGTT
GCTGGTGTGAAGCATATTGTCTTGGTTGGGTCCATGGGTGGAACAAATCCGGATCATCCT
CTGAACAAACTGGGAAATGGGAACATTCTGGTTTGGAAGAGGAAATCTGAACAGTACCTT
GCTGATTCTGGAACTCCTTACACAATAATCAGAGCTGGAGGACTTCTAGACAAAGAGGGA
GGTGCACGAGAGCTCCTCGTTGGTAAAGATGACGAGCTTCTTCAAACAGACACTAAAACC
GTCCCCAGGGCTGATGTTGCTGAAGTCTGCATTCAGGCATTGCTGTTCGAGGAATCAAAG
AATAAAGCTTTTGATCTGGGCTCAAAGCCAGAGGGAACCAGTTCTCCCACTAAAGACTTT
AAGGCTCTCTTCTCTCAAGTCACCGCTCGTTTTTAAAATCTTTTATCGCTACTGAATCCA
TTTGGGATGTAATGTACCAAACCAGTTAAAATAAAATATCCGGGTACACTATGAGTAGAA
TCAATAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CO84TF U 1
AF RS1EG51JQ C 443
AF RS1EG51TF U 319
BS 1 359 RS1CO84TF
BS 360 360 RS1EG51TF
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GTCCCCAGGGCTGATGTTGCCGAAGTCTGCAT

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DS 

RD RS1EG51JQ 348 0 0
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AAGTTTGCATTCAGGCATTGCTGTTCGAGGAATCAAAGAATAAAGCTTTTGATCTGGGCT
CAAAGCCAGAGGGAACCAGTTCTCCCACTAAAGACTTTAAGGCT
TTTT

QA 1 344 1 344
DS 

RD RS1EG51TF 592 0 0
G
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ATTGGATTGGCCAGAAGAACCAAATAGATGCTGCCAAGGTTGCTGGTGTGAAGCATATTG
TCTTGGTTGGGTCCATGGGTGGAACAAATCCGGATCATCCTCTGAACAAACTGGGAAATG
GGAACATTCTGGTTTGGAAGAGGAAATCTGAACAGTACCTTGCTGATTCTGGAACTCCTT
ACACAATAATCAGAGCTGGAGGACTTCTAGACAAAGAGGGAGGTGCACGAGAGCTCCTCG
TTGGTAAAGATGACGAGCTTCTTCAAACAGACACTAAAACCGTCCCCAGGGCTGATGTTG
CTGAAGTCTGCATTCAGGCATTGCTGTTCGAGGAATCAAAGAATAAAGCTTTTGATCTGG
GCTCAAAGCCAGAGGGAACCAGTTCTCCCACTAAAGACTTTAAGGCTCTCTTCTCTCAAG
TCACCGCTCGTTTTTAAAATCTTTTATCGCTACTGAATCCATTTGGGATGTAATGTACCA
AACCAGTTAAAATAAAATATCCGGGTACACTATGAGTAGAATCAATAAAAA

QA 2 592 2 592
DS 



AS 1 3

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AAACTACAGACTGAATGAATGAATGAATGTTTTGAATCTCATCTACCATTATTGTCATTA
GACCACATCATCTAACTCCAACTTAAAACCAAGCAGAGCTAACAAAAAATACTGGCAAGA
GAACAACTTCAAAGCTAAAACGTGCCTTACAAGCAGAAGAGGTCTTCCCAGCCTTATCAG
CAGCTTCAATCTTCTCATTATCAGCGCTTGGAGTAGGTGCAGGAAAATCAACTTCAGGTG
TCTCTGCTTCAGGTGTCTCTGCTTCAGGTGTAAGTTTTGGATTATTACTATCTGAAACAT
TGTCTTCATCCCCTGGTCCAGGAGCTGGAGCTGAAGGGGTTGCAACTGATGGGAAATGGA
CCTGGAGCCATTGCAGCATGCATAGGAAATGGAGCCGGAGCTGGAGCTGGAGCCAAAGGA
ACGGGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D204JQ U 1
AF RS1D204TF C 1
AF RS1DF45JQ U 7
BS 1 262 RS1D204JQ
BS 263 487 RS1DF45JQ

RD RS1D204JQ 262 0 0
CGAACCGTGTAACAAGTTCAACAGAACAATGATCACACTCGTCTCTCTTCTTGGTAAAGA
AAACTACAGACTGAATGAATGAATGAATGTTTTGAATCTCATCTACCATTATTGTCATTA
GACCACATCATCTAACTCCAACTTAAAACCAAGCAGAGCTAACAAAAAATACTGGCAAGA
GAACAACTTCAAAGCTAAAACGTGCCTTACAAGCAGAAGAGGTCTTCCCAGCCTTATCAG
CAGCTTCAATCTTCTCATTATC

QA 1 262 1 262
DS 

RD RS1D204TF 262 0 0
CGAACCGT
GTAACAAGTTCAACAGAACAATGATCACACTCGTCTCTCTTCTTGGTAAAGAAAACTACA
GACTGAATGAATGAATGAATGTTTTGAATCTCATCTACCATTATTGTCATTAGACCACAT
CATCTAACTCCAACTTAAAACCAAGCAGAGCTAACAAAAAATACTGGCAAGAGAACAACT
TCAAAGCTAAAACGTGCCTTACAAGCAGAAGAGGTCTTCCCAGCCTTATCAGCAGCTTCA
ATCTTCTCATTATC

QA 9 262 9 262
DS 

RD RS1DF45JQ 481 0 0
AC
GTAACAAGTTCAACAAAACAATGATCACACTCGTCTCTCTTCTTGGTAAAAAAAACTACA
AACTGAATGAATGAATGAATGTTTTGAATCTCATCTACCATTATTGTCATTAAACCACAT
CATCTAACTCCAACTTAAAACCAAGCAAAGCTAACAAAAAATACTAGCAAGAAAACAACT
TCAAAGCTAAAACGTGCCTTACAAGCAAAAAAGGTCTTCCCAGCCTTATCAGCAGCTTCA
ATCTTCTCATTATCAGCGCTTGGAGTAGGTGCAGGAAAATCAACTTCAGGTGTCTCTGCT
TCAGGTGTCTCTGCTTCAGGTGTAAGTTTTGGATTATTACTATCTGAAACATTGTCTTCA
TCCCCTGGTCCAGGAGCTGGAGCTGAAGGGGTTGCAACTGATGGGAAATGGACCTGGAGC
CATTGCAGCATGCATAGGAAATGGAGCCGGAGCTGGAGCTGGAGCCAAAGGAACGGGTG

QA 3 481 3 481
DS 



AS 1 3

CO CL3700Contig1 759 3 12 U
CTATCTACGGGGGGGAGAAAGCATTGGTTTCTGTGCTCACATTCTAGGATCTTCTAAGCG
AGGGCAACAGATCAGCGCCTTCGAGTGATGGCTACTGGAGAGGAGAAACCAGTGATGGTA
GTTGGTGTGGACGAAAGTGAGCAGAGCACCTACGCAATAGAGTGGACTCTCGATCGTTTC
TTCGCTCCCTACGCTCCCAATTTCCCTTTCAAGCTCATCATCGTCCACGCCAAACCTAAC
GCCGTCTCCGCCGTTGGTCTCGCTGGCCCCGGTACTGCGGAGGTTGTGCCTTATGTTGAT
GCTGATTTGAAGCATACCGCTGTTAAGGTTGTCGAGAAAGCCAAATCACTCTGTCAGAGC
AAGTCGGTTCATGGCGCAATGATAGAAGTTTTTGAAGGCGATGCGAGGAACATCCTGTGC
GAGGTTGTTGATAAACACCATGCTTCTCTTCTCGTTGTAGGAAGCCACGGTTATGGAGCT
ATCAAGAGGGCGGTTCTCGGTAGCGTCAGTGATTACTGTGCTCACCATGCTCATTGCTCG
GTGATGATCGTGAAGAAGCCTAAGATCAAGGTCTGAATCAATTACCTCACTCAAAGTATT
GTCAGACTCGGTGAGAAGTGAAATAATGTTAGCTTCCATGTGTGAAGTGATCCAAGACAA
TCCATTTATGTTTGTAATTGTGTTATACATGTGCTCTTGTTTTAGTATACCTCCTAAACT
ATAACTTCATGTTTAATAATATCGTGGGTTATCTTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BU77TF U 1
AF RS1FB68JQ C 67
AF RS1FB68TF U 67
BS 1 76 RS1BU77TF
BS 77 77 RS1FB68TF
BS 78 158 RS1BU77TF
BS 159 159 RS1FB68TF
BS 160 254 RS1BU77TF
BS 255 255 RS1FB68TF
BS 256 335 RS1BU77TF
BS 336 336 RS1FB68TF
BS 337 659 RS1BU77TF
BS 660 660 RS1FB68TF
BS 661 697 RS1BU77TF
BS 698 759 RS1FB68TF

RD RS1BU77TF 697 0 0
CTATCTACGGGGGGGAGAAAGCATTGGTTTCTGTGCTCACATTCTAGGATCTTCTAAGCG
AGGGCAACAGATCAGCACCTTCGAGTGATGGCTACTGGAGAGGAGAAACCAGTGATGGTA
GTTGGTGTGGACGAAAGTGAGCAGAGCACCTACGCAATGGAGTGGACTCTCGATCGTTTC
TTCGCTCCCTACGCTCCCAATTTCCCTTTCAAGCTCATCATCGTCCACGCCAAACCTAAC
GCCGTCTCCGCCGT*GGTCTCGCTGGCCCCGGTACTGCGGAGGTTGTGCCTTATGTTGAT
GCTGATTTGAAGCATACCGCTGTTAAGGTTGTCGA*AAAGCCAAATCACTCTGTCAGAGC
AAGTCGGTTCATGGCGCAATGATAGAAGTTTTTGAAGGCGATGCGAGGAACATCCTGTGC
GAGGTTGTTGATAAACACCATGCTTCTCTTCTCGTTGTAGGAAGCCACGGTTATGGAGCT
ATCAAGAGGGCGGTTCTCGGTAGCGTCAGTGATTACTGTGCTCACCATGCTCATTGCTCG
GTGATGATCGTGAAGAAGCCTAAGATCAAGGTCTGAATCAATTACCTCACTCAAAGTATT
GTCAGACTCGGTGAGAAGTGAAATAATGTTAGCTTCCATGTGTGAAGTGATCCAAGACA*
TCCATTTATGTTTGTAATTGTGTTATACATGTGCTCT

QA 1 697 1 697
DS 

RD RS1FB68JQ 693 0 0
G
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TGGACGAAAGTGAGCAGAGCACCTACGCAATAGAGTGGACTCTCGATCGTTTCTTCGCTC
CCTACGCTCCCAATTTCCCTTTCAAGCTCATCATCGTCCACGCCAAACCTAACGCCGTCT
CCGCCGTTGGTCTCGCTGGCCCCGGTACTGCGGAGGTTGTGCCTTATGTTGATGCTGATT
TGAAGCATACCGCTGTTAAGGTTGTCGAGAAAGCCAAATCACTCTGTCAGAGCAAGTCGG
TTCATGGCGCAATGATAGAAGTTTTTGAAGGCGATGCGAGGAACATCCTGTGCGAGGTTG
TTGATAAACACCATGCTTCTCTTCTCGTTGTAGGAAGCCACGGTTATGGAGCTATCAAGA
GGGCGGTTCTCGGTAGCGTCAGTGATTACTGTGCTCACCATGCTCATTGCTCGGTGATGA
TCGTGAAGAAGCCTAAGATCAAGGTCTGAATCAATTACCTCACTCAAAGTATTGTCAGAC
TCGGTGAGAAGTGAAATAATGTTAGCTTCCATGTGTGAAGTGATCCAAGACAATCCATTT
ATGTTTGTAATTGTGTTATACATGTGCTCTTGTTTTAGTATACCTCCTAAACTATAACTT
CATGTTTAATAATATCGTGGGTTATCTTTCTC

QA 2 693 2 693
DS 

RD RS1FB68TF 693 0 0
G
CAGATCAGCGCCTTCGAGTGATGGCTACTGGAGAGGAGAAACCAGTGATGGTAGTTGGTG
TGGACGAAAGTGAGCAGAGCACCTACGCAATAGAGTGGACTCTCGATCGTTTCTTCGCTC
CCTACGCTCCCAATTTCCCTTTCAAGCTCATCATCGTCCACGCCAAACCTAACGCCGTCT
CCGCCGTTGGTCTCGCTGGCCCCGGTACTGCGGAGGTTGTGCCTTATGTTGATGCTGATT
TGAAGCATACCGCTGTTAAGGTTGTCGAGAAAGCCAAATCACTCTGTCAGAGCAAGTCGG
TTCATGGCGCAATGATAGAAGTTTTTGAAGGCGATGCGAGGAACATCCTGTGCGAGGTTG
TTGATAAACACCATGCTTCTCTTCTCGTTGTAGGAAGCCACGGTTATGGAGCTATCAAGA
GGGCGGTTCTCGGTAGCGTCAGTGATTACTGTGCTCACCATGCTCATTGCTCGGTGATGA
TCGTGAAGAAGCCTAAGATCAAGGTCTGAATCAATTACCTCACTCAAAGTATTGTCAGAC
TCGGTGAGAAGTGAAATAATGTTAGCTTCCATGTGTGAAGTGATCCAAGACAATCCATTT
ATGTTTGTAATTGTGTTATACATGTGCTCTTGTTTTAGTATACCTCCTAAACTATAACTT
CATGTTTAATAATATCGTGGGTTATCTTTCTC

QA 2 693 2 693
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL3702Contig1 537 2 2 U
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GACGCTAAAGGCGAAGAGTAAGTGTAACCTGTTTGTTGTCGGGAGAAACGCGGCGGTTGT
GCCGTTGTTAATAGTACGGATTGTCCCGAGTTAGGACCGGTTGGACGTTTGTTGTCGTCT
TCGGAGTTTTCGACTACTGCGTCGGTGCTTGTTGTTCAGGGATATGATTCGGCTGCGGAT
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ACCGTTTGATGGAGATCTATAACTTACTTACAGAACAAGAAAAGTTGTCTCTCTGTTTTT
TTTTATTTTTTGCCTCGCGGAATATTTTTGTTGGGACTTGGGAGTTTCCTGAGTCTTGTT
TTGTATTTCTCGCTAAAAATAATGGTTGTCATCATCATACTAACATTAGATTTTTTATGG
ACATTGAAAATCGACTTGAAATTTCTTAAACCGAAATCAAACCACCCATTTTCTATT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AN79JQ C 1
AF RS1AN79TF U 1
BS 1 1 RS1AN79JQ
BS 2 537 RS1AN79TF

RD RS1AN79JQ 537 0 0
GGGGAATGAGTCGTTGGCCTACGAGGAGAGAGTCGTTGAGAGCAAAGACGACGTTCACGC
GACGCTAAAGGCGAAGAGTAAGTGTAACCTGTTTGTTGTCGGGAGAAACGCGGCGGTTGT
GCCGTTGTTAATAGTACGGATTGTCCCGAGTTAGGACCGGTTGGACGTTTGTTGTCGTCT
TCGGAGTTTTCGACTACTGCGTCGGTGCTTGTTGTTCAGGGATATGATTCGGCTGCGGAT
ACACGGCCGGTTGATGAAGACGAGAGTTACGAGCAGTCTTCTAGAGAAATTGGAGACTCA
ACCGTTTGATGGAGATCTATAACTTACTTACAGAACAAGAAAAGTTGTCTCTCTGTTTTT
TTTTATTTTTTGCCTCGCGGAATATTTTTGTTGGGACTTGGGAGTTTCCTGAGTCTTGTT
TTGTATTTCTCGCTAAAAATAATGGTTGTCATCATCATACTAACATTAGATTTTTTATGG
ACATTGAAAATCGACTTGAAATTTCTTAAACCGAAATCAAACCACCCATTTTCTATT

QA 1 537 1 537
DS 

RD RS1AN79TF 537 0 0
G
GGGAATGAGTCGTTGGCCTACGAGGAGAGAGTCGTTGAGAGCAAAGACGACGTTCACGCG
ACGCTAAAGGCGAAGAGTAAGTGTAACCTGTTTGTTGTCGGGAGAAACGCGGCGGTTGTG
CCGTTGTTAATAGTACGGATTGTCCCGAGTTAGGACCGGTTGGACGTTTGTTGTCGTCTT
CGGAGTTTTCGACTACTGCGTCGGTGCTTGTTGTTCAGGGATATGATTCGGCTGCGGATA
CACGGCCGGTTGATGAAGACGAGAGTTACGAGCAGTCTTCTAGAGAAATTGGAGACTCAA
CCGTTTGATGGAGATCTATAACTTACTTACAGAACAAGAAAAGTTGTCTCTCTGTTTTTT
TTTATTTTTTGCCTCGCGGAATATTTTTGTTGGGACTTGGGAGTTTCCTGAGTCTTGTTT
TGTATTTCTCGCTAAAAATAATGGTTGTCATCATCATACTAACATTAGATTTTTTATGGA
CATTGAAAATCGACTTGAAATTTCTTAAACCGAAATCAAACCACCCATTTTCTATT

QA 2 537 2 537
DS 



AS 1 2

CO CL3703Contig1 1172 2 4 U
GGACTGTTTACTCTCATACTCTGCAACTTCGAGATCATCAACTAAGCTTAAAGTTTCACC
TTTTCCACGTTATTAAGCTTTGACGAAAAAGAATGGCTACAACATCACCACTGTACGATC
GGCTTAAGGCTGCTGAGCCCTTCTTCTTGTTGGCTGGTCCAAATGTTATCGAATCTGAGG
AACATATTCTTCGTATGGCTAAGCACATCAAAGATATTGCCACAAAAGTTGAGTTGCCCC
TGGTTTTCAAGTCAAGTTTTGATAAAGCTAACAGAACTTCCTCAAAGTCGTTCCGAGGTC
CTGGCATGGCTCAGGGTCTCAAGTGTGAAGAAGTTGGCAAGGTTGCAGATATCATTCAAA
TACCAGCATTCTTATGTCGCCAGACAGATCTTCTGGTAGCGGCTGCCCAAACCGGGAAAA
TTATCAATATTAAGAAAGGACAATTTTGTGCTCCTTCTGTCATGGAAAATTCGGCCGAGA
AGATCAGACTTGCTGGGAATCCAAATGTGATGGTTTGTGAAAGAGGAACCATGTTTGGAT
ACAATGATTTGATAGTTGATCCAAGAAACTTGGAATGGATGAGGGAAGCTAATTGCCCTG
TTCTTGCTGATATAACCCATTCACTACAACAACCTTGTGGCAGAAAGTTGGACGGTGGTG
GTGTTGCTAGTGGAGGGCTTCGGGAGTTAATACCTTGCATTGCGAGAACTGCTGTAGCAG
TTGGCGTCGATGGAATTTTCATGGAGGTTCATGATGATCCTCTAAGTGCTCCAGTCGATG
GTCCAACTCAGTGGCCTTTGTGTCATTTAGAAGAACTCTTGGAGGAGCTCATCGCGATTG
CTAGGGTCACAAAAGAGAAGCAGGGGTTCCAAATTGATTTAACACCTTACCGCGATTAGG
ATTGGAGGTGTTGTAATGCGAGTGGCATGGCATCTCCTCTTCATATGTACTATCCACACA
CGGAACGGGGAGAATACATCTCTTCATAAGAGTGTTTGTCTTTGTTTTTTCAAAATAAAT
AGACAATACATCTGATTCTCACTTGGGTTTGTCTTTTCTACTTTTCCAAACTTGGACATT
TGTTTTCTCGGATTGGTTTGCCTTTGTTGTTTTTCCTTTGAGTCAAAAAAAAAAAGAATT
GAGTCTTGGTTACAATGATAAATACTTCATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F641TF U 1
AF RS1F641JQ C 307
BS 1 654 RS1F641TF
BS 655 655 RS1F641JQ
BS 656 676 RS1F641TF
BS 677 1172 RS1F641JQ

RD RS1F641TF 677 0 0
GGACTGTTTACTCTCATACTCTGCAACTTCGAGATCATCAACTAAGCTTAAAGTTTCACC
TTTTCCACGTTATTAAGCTTTGACGAAAAAGAATGGCTACAACATCACCACTGTACGATC
GGCTTAAGGCTGCTGAGCCCTTCTTCTTGTTGGCTGGTCCAAATGTTATCGAATCTGAGG
AACATATTCTTCGTATGGCTAAGCACATCAAAGATATTGCCACAAAAGTTGAGTTGCCCC
TGGTTTTCAAGTCAAGTTTTGATAAAGCTAACAGAACTTCCTCAAAGTCGTTCCGAGGTC
CTGGCATGGCTCAGGGTCTCAAGTGTGAAGAAGTTGGCAAGGTTGCAGATATCATTCAAA
TACCAGCATTCTTATGTCGCCAGACAGATCTTCTGGTAGCGGCTGCCCAAACCGGGAAAA
TTATCAATATTAAGAAAGGACAATTTTGTGCTCCTTCTGTCATGGAAAATTCGGCCGAGA
AGATCAGACTTGCTGGGAATCCAAATGTGATGGTTTGTGAAAGAGGAACCATGTTTGGAT
ACAATGATTTGATAGTTGATCCAAGAAACTTGGAATGGATGAGGGAAGCTAATTGCCCTG
TTCTTGCTGATATAACCCATTCACTACAACAACCTTGTGGCAGAAAGTTGGACG*TGGTG
GTGTTGCTAGTGGAGG
C

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1F641JQ 866 0 0
AT
GCTCAGGGTCTCAAGTGTGAAGAAGT*GGCAAGGT*GCAGATATCATTCAAATACCAGCA
TTCTTATGTCGCCAGACAGATCTTCTGGTAGCGGCTGCCCAAACCGGGAAAATTATCAAT
ATTAAGAAAGGACAATTTTGTGCTCCTTCTGTCATGGAAAATTCGGCCGAGAAGATCAGA
CTTGCTGGGAATCCAAATGTGATGGTTTGTGAAAGAGGAACCATGTTTGGATACAATGAT
TTGATAGTTGATCCAAGAAACTTGGAATGGATGAGGGAAGCTAATTGCCCTGTTCTTGCT
GATATAACCCATTCACTACAACAACCTTGTGGCAGAAAGTTGGACGGTGGTGGTGTTGCT
AGTGGAGGGCTTCGGGAGTTAATACCTTGCATTGCGAGAACTGCTGTAGCAGTTGGCGTC
GATGGAATTTTCATGGAGGTTCATGATGATCCTCTAAGTGCTCCAGTCGATGGTCCAACT
CAGTGGCCTTTGTGTCATTTAGAAGAACTCTTGGAGGAGCTCATCGCGATTGCTAGGGTC
ACAAAAGAGAAGCAGGGGTTCCAAATTGATTTAACACCTTACCGCGATTAGGATTGGAGG
TGTTGTAATGCGAGTGGCATGGCATCTCCTCTTCATATGTACTATCCACACACGGAACGG
GGAGAATACATCTCTTCATAAGAGTGTTTGTCTTTGTTTTTTCAAAATAAATAGACAATA
CATCTGATTCTCACTTGGGTTTGTCTTTTCTACTTTTCCAAACTTGGACATTTGTTTTCT
CGGATTGGTTTGCCTTTGTTGTTTTTCCTTTGAGTCAAAAAAAAAAAGAATTGAGTCTTG
GTTACAATGATAAATACTTCATTC

QA 3 866 3 866
DS 



AS 1 2

CO CL3704Contig1 444 2 1 U
GGAGAGAAGAAAACACACAACACATACCATATTGAAGCTTTTCACAGAAACTTCAGAAGA
GCTTAAAACAGAATGGGAACAGCTACTTTTATAGATATTCTTCTTGCTATCCTCTTGCCT
CCTCTTGGCGTCTTTCTCAGATATGGTTGCGGGGTTGAGTTTTGGATATGTTTGGTTTTG
ACGCTGCTTGGGTATCTTCCTGGGATCCTCTACGCCCTTTATGTCCTCACCAAATGATCA
TTCACCTCCATCTACCCTCTCTTACTGTATCTTCATCTCCTTGAACTGCTGGTTCGTCGT
GTTTTCATCTCGTTGTGTGACTGATTCATCTTTTCTTTCATCAGGGGTTTATCGCTGTTG
TGTTTGCATTGTTATATAATTTCTCTTAATCCTTCTTTTGCGTGAAGAGCTTGTTTATTC
GATTCTTTAATTAGTATTTACTAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DN40TF U 1
AF RS1FK45TF U 1
BS 1 444 RS1DN40TF

RD RS1DN40TF 444 0 0
GGAGAGAAGAAAACACACAACACATACCATATTGAAGCTTTTCACAGAAACTTCAGAAGA
GCTTAAAACAGAATGGGAACAGCTACTTTTATAGATATTCTTCTTGCTATCCTCTTGCCT
CCTCTTGGCGTCTTTCTCAGATATGGTTGCGGGGTTGAGTTTTGGATATGTTTGGTTTTG
ACGCTGCTTGGGTATCTTCCTGGGATCCTCTACGCCCTTTATGTCCTCACCAAATGATCA
TTCACCTCCATCTACCCTCTCTTACTGTATCTTCATCTCCTTGAACTGCTGGTTCGTCGT
GTTTTCATCTCGTTGTGTGACTGATTCATCTTTTCTTTCATCAGGGGTTTATCGCTGTTG
TGTTTGCATTGTTATATAATTTCTCTTAATCCTTCTTTTGCGTGAAGAGCTTGTTTATTC
GATTCTTTAATTAGTATTTACTAG

QA 1 444 1 444
DS 

RD RS1FK45TF 425 0 0
GGAGAGAAGAAAACACACAACACATACCATATTGAAGCTTTTCACAGAAACTTCAGAAGA
GCTTAAAACAGAATGGGAACAGCTACTTTTATAGATATTCTTCTTGCTATCCTCTTGCCT
CCTCTTGGCGTCTTTCTCAGATATGGTTGCGGGGTTGAGTTTTGGATATGTTTGGTTTTG
ACGCTGCTTGGGTATCTTCCTGGGATCCTCTACGCCCTTTATGTCCTCACCAAATGATCA
TTCACCTCCATCTACCCTCTCTTATTGTATCTTCATCTCCTTGAACTGCTGGTTCGTCGT
GTTTTCATCTCGTTGTGTGACTGATTCATCTTTTCTTTCATCAGGGGTTTATCGCTGTTG
TGTTTGCATTGTTATATAATTTCTCTTAATCCTTCTTTTGCGTGAAGAGCTTGTTTATTC
GATTC

QA 1 425 1 425
DS 



AS 1 3

CO CL3705Contig1 680 3 9 U
GGGCTTTGTGGAAAGATAAAAATTATCATATATGGGCACTCATACGAAAAAAGCCCAAGG
CCTAGTTTACGGATACATATAATTAAACAACAAAGGAAACTTAAGAGGCAAGAAAACAAC
ACAGTCCATAAATAAATAAATAAAAGCCCTAATAATGAGTCGTCAAACGAATTAAAAGAA
GTGAAATCTTTCAATCTTTTCTTCCCTGAGGGAACTCATCTTCGTTTCAAATCTCTGGAG
ATAGCTCTGATGGTGGAAGGTGTAGTCCTACAGCATCCTCCTATAAGTTTAGCTCCAAGG
TCACGCCATTTCGGTGCAAACATCTCAAACTCAGCATCACCAAAGCATTGCGATGGCAGC
CATTTTTTGGCTTTCCCGTCCCAAACCTCTCCACTATTTGGGTACACAACGATGGCCTTC
TTGGTAAGCTTGGAGAATTTGCGAATGAAATTGTCCATGAACTGAGGAGGTGCGCAGTTA
ATGCCAACAGCGCAAATGTTGTTGCTTTTGTTAAGGGTTTCAAGGCATTCCTCAAAGCTC
TCACCTGAAGGAGCATTCTCACCATCTACAGATGTGAAGCAGATCCACGCTGGGGTTTGC
ACATTCTCTTCCTCCAGCACCTCAACGCACGCCTGAGCCTCGAGTTTATTAGGTATGGTT
TCGAAAGCGAGAAGATCTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GC31JQ U 73
AF RS1FH17JQ U 8
AF RS1EZ55JQ U 1
BS 1 214 RS1EZ55JQ
BS 215 215 RS1FH17JQ
BS 216 325 RS1EZ55JQ
BS 326 326 RS1FH17JQ
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BS 436 518 RS1EZ55JQ
BS 519 519 RS1FH17JQ
BS 520 680 RS1EZ55JQ

RD RS1GC31JQ 506 0 0
ATACATATAATTAAACAACAAAGGAAACTTAAGAGGCAAGAAAACAACACAGTCCATAAA
TAAATAAATAAAAGCCCTAATAATGAGTCGTCAAACGAATTAAAAGAAGTGAAATCTTTC
AATCTTTTCTTCCCTGAGGGAACTCATCTTCGTTTCAAATATCTGGAGATAGCTCTGATG
GTGGAAGGTGTAGTCCTACCGCATCCTCCTATAAGTTTAGCTCCAAGGTCACGCCATTTC
GGTGCAAACATCTCAAACTCAGCATCACCAAAGCATTGCGATGGCAGCCATTTTTTGGCT
TTCCCGTCCCAAACCTCTCCACTATTTGGGTACACAACGATGGCCTTCTTGGTAAGCTTG
GAGAATTTGCGAATGAGATTGTCCATGAACTGAGGAGGTGCGCAGTTAATGCCAACAGCG
CAAATGTTGTTGCTTTTGTTAAGGGTTTCAAG*CATTCCTCAAAGCTCTCACCTGAAGGA
GCATTCTCACCATCTACAGATGTGAA

QA 1 506 1 506
DS 

RD RS1FH17JQ 615 0 0
GC
GGAAAGATAAAAATTATCATATATGGGCACTCATACGAAAAAAGCCCAAGGCCTAGTTTA
CGGATACATATAATTAAACAACAAAGGAAACTTAAGAGGCAAGAAAACAACACAGTCCAT
AAATAAATAAATAAAAGCCCTAATAATGAGTCGTCAAACGAATTAAAAGAAGTGAAATCT
TTCAATCTTTTCTTCCCTGAGGGAACTCATCTTCGTTTCAAATCTCTGGAGATAGCTCTG
ATGGTGGAAGGTGTAGTCCTACAGCATCCTCCTATAAGTTTAGCTCCAAGGTCACGCCAT
TTCGGTGCAAACATCTCAAACTCAGCATCACCAAAGCATTGCGATGGCAGCCATTTTTTG
GCTTTCCCGTCCCAAACCTCTCCACTATTTGGGTACACAACGATGGCCTTCTTGGTAAGC
TAGGAGAATTTGCGAACGAAATTGTCCATGAACTGAGGAGGTGCGCAGTTAATGCCAACA
GCGCAAATGTTGTTGCTTTTGTTAAGGGTTTCAAGGCATTCCTCAAAGCTCTCACCTGAA
GGAGCATTATCACCATCTACAGATGTGAAGCAGATCCACGCTGGGGTTTGCACATTCTCT
TCCTCCAGCACCT

QA 3 615 3 615
DS 

RD RS1EZ55JQ 680 0 0
GGGCTTTGTGGAAAGATAAAAATTATCATATATGGGCACTCATACGAAAAAAGCCCAAGG
CCTAGTTTACGGATACATATAATTAAACAACAAAGGAAACTTAAGAGGCAAGAAAACAAC
ACAGTCCATAAATAAATAAATAAAAGCCCTAATAATGAGTCGTCAAACGAATTAAAAGAA
GTGAAATCTTTCAATCTTTTCTTCCCTGAGGGAATTCATCTTCGTTTCAAATCTCTGGAG
ATAGCTCTGATGGTGGAAGGTGTAGTCCTACAGCATCCTCCTATAAGTTTAGCTCCAAGG
TCACGCCATTTCGGTGCAAACATCTAAAACTCAGCATCACCAAAGCATTGCGATGGCAGC
CATTTTTTGGCTTTCCCGTCCCAAACCTCTCCACTATTTGGGTACACAACGATGGCCTTC
TTGGTAAGCTTGGAAAATTTGCGAATGAAATTGTCCATGAACTGAGGAGGTGCGCAGTTA
ATGCCAACAGCGCAAATGTTGTTGCTTTTGTTAAGGGTCTCAAGGCATTCCTCAAAGCTC
TCACCTGAAGGAGCATTCTCACCATCTACAGATGTGAAGCAGATCCACGCTGGGGTTTGC
ACATTCTCTTCCTCCAGCACCTCAACGCACGCCTGAGCCTCGAGTTTATTAGGTATGGTT
TCGAAAGCGAGAAGATCTGG

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL3706Contig1 914 2 4 U
AGAGGAAGGGCATATGCTGGGTTTCGTTGATGCTTTGGTGCCGTTTGGAGATTTGTTGAG
CACGTCCAGAAAGTGGGCTTTAGACATTGCCCCTAAGGCGTCGAGGTCCCGAATGTGAAT
GCACAAACAAGAAGGGGAGCTTAAAAGTAATCAGCAAATAAAACGTCTGAAACAACTACA
TGGAGAGGTTGAAAGTGTTAAGTCACTAAATGAGAGAATAAATCACTCTCTATTGTTAAT
TCTCAAAGCAACAGTTAATAAGGTGTTTTGTTTTAAACTTTTAAGCACTTGAAAAGACGA
ATTATTATGTTCTTCATAAAACGTTTGTAGGGACTTCATTCTCATGTAATTGTTCGAATG
GTTAAGAATATAGTAAAACTACCTAATGCAGATATATAAACTTCGTTGTTTTGGTCAAAG
CTAATATTACATCTTTTGTAAAATCGGGACTTTATTATTATGTTACTCTCTAATGTTACA
GAAGTTGAAAGAGAACCTCAAGACATAATAAACAAGTATGTTCCAGCAATCTAAAACCAT
CAACAGAACGCAAGAAAACTAACAAGTAATAATAAATAACTCGTGTAGTAAAGAAACAAA
GCTCTCCAAAAATCTGCAAGAGGCTTTTAAAGAGGAGACAAGAAAAATTATGGTAACATT
ACCTCGGAAAATGAGGCGGGGGTGAGGTAGATTTCAGCTTTGTTGTTTATGTTCTCTCTG
GTAAGCTATTGTTGTCCTAAGTAGGGTGTAATTTATTGATTCTGAGGGTCTTTCTTCTCC
GGTAAAGCTGGAGTTTATGAGATGCTGCTGAGTGGTTGAGGTACTAGTTGTGGTCGTTGG
CTGCACGGCTGTGGTTTGCTGAGTGTAGTTGAGCAGTGGTTCGTGAGCTCATCACACTGG
TGGTATTTGCTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EJ30JQ C 1
AF RS1AE32TF U 84
BS 1 91 RS1EJ30JQ
BS 92 330 RS1AE32TF
BS 331 331 RS1EJ30JQ
BS 332 914 RS1AE32TF

RD RS1EJ30JQ 395 0 0
AGAGGAAGGGCATATGCTGGGTTTCGTTGATGCTTTGGTGCCGTTTGGAGATTTGTTGAG
CACGTCCAGAAAGTGGGCTTTAGACATTGCCCCTAAGGGGTCGAGGTCCCGAATGTGAAT
GCCCAAACAAGAAGGGGAGCTTAAAAGTAATCAGCAAATAAAACGTTTGAAACAACTACA
TGGAGAGGTTGAAAGTGTTAAGTCACTAAATGAGAGAATAAATCACTCTTTATTGTTAAT
TTTCAAAGCAACAGTTAATAAGGTGTTTTGTTTTAAACTTTTAAGCACTTGAAAAGACGA
ATTATTATGTTTTTCATAAAACGTTTGTAGGGACTTCATTTTCATGTAATTGTTCGAATG
GTTAAGAATATAGTAAAACTACCTAATGCAGATAT

QA 1 395 1 395
DS 

RD RS1AE32TF 831 0 0
AGAGTGAA
CCTAAGGCGTCGAGGTCCCGAATGTGAATGCACAAACAAGAAGGGGAGCTTAAAAGTAAT
CAGCAAATAAAACGTCTGAAACAACTACATGGAGAGGTTGAAAGTGTTAAGTCACTAAAT
GAGAGAATAAATCACTCTCTATTGTTAATTCTCAAAGCAACAGTTAATAAGGTGTTTTGT
TTTAAACTTTTAAGCACTTGAAAAGACGAATTATTATGTTCTTCATAAAACGTTTGTAGT
GACTTCATTCTCATGTAATTGTTCGAATGGTTAAGAATATAGTAAAACTACCTAATGCAG
ATATATAAACTTCGTTGTTTTGGTCAAAGCTAATATTACATCTTTTGTAAAATCGGGACT
TTATTATTATGTTACTCTCTAATGTTACAGAAGTTGAAAGAGAACCTCAAGACATAATAA
ACAAGTATGTTCCAGCAATCTAAAACCATCAACAGAACGCAAGAAAACTAACAAGTAATA
ATAAATAACTCGTGTAGTAAAGAAACAAAGCTCTCCAAAAATCTGCAAGAGGCTTTTAAA
GAGGAGACAAGAAAAATTATGGTAACATTACCTCGGAAAATGAGGCGGGGGTGAGGTAGA
TTTCAGCTTTGTTGTTTATGTTCTCTCTGGTAAGCTATTGTTGTCCTAAGTAGGGTGTAA
TTTATTGATTCTGAGGGTCTTTCTTCTCCGGTAAAGCTGGAGTTTATGAGATGCTGCTGA
GTGGTTGAGGTACTAGTTGTGGTCGTTGGCTGCACGGCTGTGGTTTGCTGAGTGTAGTTG
AGCAGTGGTTCGTGAGCTCATCACACTGGTGGTATTTGCTGAT

QA 9 831 9 831
DS 



AS 1 2

CO CL3707Contig1 926 2 2 U
GGATCGGACCAATGAGCTTGAAGATGAGCTAAAACATAGAGAGAGAGAGAGAGGACAAGT
TGGAAAGCGATCAAGAAGGAAGAATGAGCGAAGGGTCAAGCGGAGAAGTGAAGAATAGGA
GGGTAATGGAAGAGAAATCGGAAGAGAGAGGGGTGGCGAAAGGAAGATCGTGCAAAGGAT
ACCTTTACTACTCTTCAACTCTCAAATCCAAGGATAAGAATCCTCGCTGCGTCGGCATCC
CTCGTACTCTCCGTCAAGTTCCTGATTACGTCGTAGGACAATCTGAAGCTGAAGCTTCTA
AAGAAGGGCGCACCTTAGCTGATTTTTACTACGGATGCTTGGGTTATTCCGTTTACATGA
CTGACAAAGACTCCTCTACTGCCATGAAGCAACAGACCAAGACCCAACTTCCCGTTTGTC
TCGGCCTTGAGATACTAGCAGATAGAAGAGCTGCTTCATCAAGCAACACTTCATCTATTC
CTGCCCGCGCTCAAAACAGAAATGATTCTCGGGAGTTGCCTCAGCACCAGAACCATAGAC
CAACTTCAATCCCAAAACCAACCCCAACCCCAACCCCAGCTACTGCTACAAACACTGAAA
ACGGCTTCATAACGAGGTTCACAAGAAATGCAAACCTGGTAGCAGCAGGGGTGATGAAGA
ACCTGAAGAGAGTGGGTAATTATGTCAAAGAGCATTTGGACGACTCCTTGGATGATCATC
AAAAGCGGCCTAAATAAATAAAATCTCTGTGGTGAGAAATCAAAAAAAAAAGAAAAACAG
AAAAACACATGTGACGGTCAACAAGATATGAATGATTCGACACTTTTTGAAAACTCCTTT
TGGATTCTCATAATAATAATAAAAAAAAATGGATGTATTGATATATATCTTTTTACGAGC
ACGAGAATTGAAATGTGTTCACCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CE63TF U 1
AF RS1CC52JQ C 245
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BS 631 926 RS1CC52JQ

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TGGAAAGCGATCAAGAAGGAAGAATGAGCGAAGGGTCAAGCGGAGAAGTGAAGAATAGGA
GGGTAATGGAAGAGAAATCGGAAGAGAGAGGGGTGGCGAAAGGAAGATCGTGCAAAGGAT
ACCTTTACTACTCTTCAACTCTCAAATCCAAGGATAAGAATCCTCGCTGCGTCGGCATCC
CTCGTACTCTCCGTCAAGTTCCTGATTACGTCGTAGGACAATCTGAAGCTGAAGCTTCTA
AAGAAGGGCGCACCTTAGCTGATTTTTACTACGGATGCTTGGGTTATTCCGTTTACATGA
CTGACAAAGACTCCTCTACTGCCATGAAGCAACAGACCAAGACCCAACTTCCCGTTTGTC
TCGGCCTTGAGATACTAGCAGATAGAAGAGCTGCTTCATCAAGCAACACTTCATCTATTC
CTGCCCGCGCTCAAAACAGAAATGATTCTCGGGAGTTGCCTCAGCACCAGAACCATAGAC
CAACTTCAATCCCAAAACCAACCCCAACCCCAACCCCAGCTACTGCTACAAACACTGAAA
ACGGCTTCATAACGAGGTTCACAAGAAATG

QA 1 630 1 630
DS 

RD RS1CC52JQ 682 0 0
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AGGGCGCACCTTAGCTGATTTTTACTACGGATGTTTGGGTTATTCCGTTTACATGACTGA
CAAAGACTCCTCTACTGCCATGAAGCAACAGACCAAGACCCAACTTCCCGTTTGTCTCGG
CCTTGAGATACTAGCAGATAGAAGAGCTGCTTCATCAAGCAACACTTCATCTATTCCTGC
CCGCGCTCAAAACAGAAATGATTCTCGGGAGTTGCCTCAGCACCAGAACCATAGACCAAC
TTCAATCCCAAAACCAACCCCAACCCCAACCCCAGCTACTGCTACAAACACTGAAAACGG
CTTCATAACGAGGTTCACAAGAAATGCAAACCTGGTAGCAGCAGGGGTGATGAAGAACCT
GAAGAGAGTGGGTAATTATGTCAAAGAGCATTTGGACGACTCCTTGGATGATCATCAAAA
GCGGCCTAAATAAATAAAATCTCTGTGGTGAGAAATCAAAAAAAAAAGAAAAACAGAAAA
ACACATGTGACGGTCAACAAGATATGAATGATTCGACACTTTTTGAAAACTCCTTTTGGA
TTCTCATAATAATAATAAAAAAAAATGGATGTATTGATATATATCTTTTTACGAGCACGA
GAATTGAAATGTGTTCACCTCC

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 2

CO CL3708Contig1 838 2 20 U
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ATCCATGGTGGGCAAGGGGGAACTACATTTGACTGGCCAACTAGGAGATGTTATCAAAGA
ATCTGCTCAATTAGCTCTTACATGGGTAAGAGCACGTGCGTCGGATTTCAAGCTAGCACT
TGCAGGAGACATGAATGTTCTCGATGGAAGAGACATCCACATTCACTTTCCTGCTGGTGC
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CGTCCTACCCGTTGGTGGCATCAAAGATAAGATATTGGCTGCACATCGTTACGGAATCAA
GAGAGTGATTCTACCGCAGAGGAACTCGAAGGACTTGGTTGAAGTACCCGCCGCTGTACT
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AGGAGGTTGTCCATGGCGGAACCACTCTAAATTATGACAAAAACATGACCCAAAGTCCCA
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BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1EG01TF U 1
AF RS1CU31JQ C 6
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RD RS1EG01TF 680 0 0
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CGTCCTACCCGTTGGTGGCATCAAAGATAAGATATTGGCTGCACATCGTTACGGAATCAA
GAGAGTGATTCTACCGCAGAGGAACTCGAAGGACTTGGTTGAAGTACCCGCCGCTGTACT
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AGGAGGTTGTCCATGGCGGAACCACTCTAAATTATGACAAAAACATGACCCAAAGTCCCA
AAACTCTTATCGCCTCTAAG

QA 1 680 1 680
DS 

RD RS1CU31JQ 833 0 0
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GAGACATGAATGTTCTCGATGGAAGAGACATCCACATTCACTTTCCTGCTGGTGCCGTCC
CGAAAGACGGACCTTCAGCGGGAGTGACTTTGGTGACAGCTCTGGTTTCGCTGTTCAGTC
AGAAACGCGTTAGAGCAGACACAGCCATGACCGGAGAAATGACACTCAGAGGTCTCGTCC
TACCCGTTGGTGGCATCAAAGATAAGATATTGGCTGCACATCGTTACGGAATCAAGAGAG
TGATTCTACCGCAGAGGAACTCGAAGGACTTGGTTGAAGTACCCGCCGCTGTACTTTCCA
GCCTTGAGGTGATATTGGCAAAGAGAATGGAAGACGTTTTGGAGAATGCATTTGAAGGAG
GTTGTCCATGGCGGAACCACTCTAAATTATGACAAAAACATGACC*********AAAACT
CT*ATCGTCTCTAAGAGCCACAGGTCGTCTTTGGCTCACTCGGTAAGGTACCTTCAGAAT
GTCTGCATCTCCTTTGCTTTCTCTCTTTCACTCAGATCTCTCATCTGTATTGTAAGTGTG
TGTATGTAATGAGTTTCAAATTTATCATCTAATTTAATTTACCCGTCTCTCAC

QA 1 833 1 833
DS 



AS 1 3

CO CL3709Contig1 785 3 6 U
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AAGAAAGAGTACTACAGAGATTTTAGCTTTTTAAAGAGTGTAGCAGAAGAACACAAGTCG
TTCCATCATCATCATCATAACAAGAAGAGAGAAGTAAATCACATTCTGGAATAACCAAAG
CTATTCTCATACTGAGTCATGAACTCGTCGTTGAACTTCTTGAAACTGTCCATGATCTCT
GGCATCTCTTCTTCCGCAGGCAAGATCGTTGTCCTCAGATGGAACACACCTTCTTTCTGT
CCGAAGCCAGAGCCAGGCACTGTGGAGATTCCTGTGGCTTCTAAGAGCTTCAAACAGTAG
AAAACATCTGGCACTTTTCCTGCTTGTTTAGCAGCTTGGAGAGCACCCGGAGGTAACCGT
ATTTGAGGAAACGAATACATCGCACCTTCTGTGAAATTGCAGACAACGTTTTTGCAGCTG
TTGAATCCATCAGTCATGATCCTTGCTCTTCTTCTCAAAGATTCAAGAATCCCCTTGCTT
TCACGGGCGAACTGGTAATATGAAATGTCTCCAGGCTTTGGAGGACTAACCATCAAACCC
ATAAAGATCTGCGCAGAGACATTCGGACTCAGGGCGATTGATGCAACCTTGTATATCTCT
TCAACAACCCTGGGAGGTATGTTGGTCATCTCAAAGTAACCACCTCGCTGTCCACATTCT
CCCCAGTAACCTTTAGAGACAGTGTAGAAAGATACAAGCTGGACTTCTTTGCTGAACGGC
GAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 

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CTTCTTGAAACTGTCCATGATCTCTGGCATCTCTTCTTCCGCAGGCAAGATCGTTGTCCT
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DS 

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AAGAAAGAGTACTACAGAGATTTTAGCTTTTTAAAGAGTGTAGCAGAAGAACACAAGTCG
TTCCATCATCATCATCATAACAAGAAGAGAGAAGTAAATCACATTCTGGAATAACCAAAG
CTATTCTCATACTGAGTCATGAACTCGTCGTTGAACTTCTTGAAACTGTCCATGATCTCT
GGCATCTCTTCTTCCGCAGGCAAGATCGTTGTCCTCAGATGGAACACACCTTCTTTCTGT
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QA 1 774 1 774
DS 

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AGAGAGAAAG
AGAGTACTACAGAGATTT*AGCTTTTAAAAGAGTGTAGCAGAAGAACACAA*TAGTTGTT
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CTCTTCTTCCGCAGGCAAGATCGTTGTCCTCAGATGGAACACACCTTCTTTCTGTCCAAA
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DS 



AS 1 3

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BQ
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AF RS1CL47TF U 1
AF RS1A976TF U 4
AF RS1A976JQ C 740
BS 1 639 RS1CL47TF
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RD RS1CL47TF 705 0 0
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TCTTTGTTAAGGACGCCCCTCGTCAACGTACCCTCGCTGATATCATCATCAAGAAAATCA
AAGACAATGATGCTCACTTAGCTGAAGAAGAGCGTCCAGATCCTGAGTTGGACCCTAAAG
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CGAAAGCGTTTGTGCTGATTACTAAGATGGAGCGCTGGG*AGGATGTCTTGTACT*GACC
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GAA

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DS 

RD RS1A976TF 851 0 0
GGGC
AAAAGAAAAAAAGAAGAAAATTCTTGAATTCTCACAGCAAAGAATGGCGAAGAAACGTGA
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CGAGAGAAACCCCAGTGGTGCTGTGTTTGCTGCTGCTGCCGCCAAGACTGCGGAATAGGA
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CTACCACCAAGAGGAGGAGATCAACGAGGACGACGAGAAGCTGTTCGAGTCCTTCTTTGT
TAAGGACGCCCCTCGTCAACGTACTCTCGCTGATATCATCATCAAGAAAATCAAAGACAA
TGATGCTCACTTAGCTGAAGAAGAGCGTCCAGATCCTGAGTTGGACCCTAAAGTAACTAA
ATTATACAAAGGCGTTGCCAAGATCATGAGTGAGTACACGATTGGGAAAATGCCGAAAGC
GTTTGTGCTGATTACTAAGATGGAGCGCTGGGGAGGATGTCTTGTACTTGACCGAGCCGG
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ACAGCCAGATTCAGCGGTTTTACAGCCACGTTTTGCTTCCTCGAGTGAGAGAAGATATTA
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TTAGTGC

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DS 

RD RS1A976JQ 858 0 0
CAGCGG
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ATTTTGCTTTATACCAGTCTTTGAAGAAGTCACTCTACAAGCTTAGTGCATTCAATAAAG
GCATTCTTTTCCCGCTTTGTAAGTCGGGTACATGCAGTCTTAGAGAAGCTGTGATTATAG
GGAGCATTCTCGAAAAGTGTTCTATCCCTATGCTTCACTCATGTGTTGCTTTGCTGAACC
TAGCTGAGATGGAGTATTGTGGAACAACAAGCTACTTTATAAAAACTCTTTTGGAGAAGA
AATATTGTATGCCGTATCGAGTGCTTGATGCATTGGTTGCTCACTTCATGAGATTTGTGG
ATGAGATAAGAGTTATGCCCGTGATTTGGCACCAGTCTCTTCTTACTTTTGTGCAACGGT
ACAAGTATGAGCTACTAAAGGAAGACAAAGAGCATTTCCAAACTCTCCTCAAGAGGCAAA
GGCACCATCTTGTTACTCCGGAGATCCTGAGAGAGCTTCAGGGTAGCAGAAACCGTGGAG
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AAGAAGACAGGTTTGACATTCCAGAGGTGCCAATGGAAGAGGACTGATTCATTTCATTGT
GTTTGGTACTGGAAGAAACCAAGACAAGTCTAAAATTCCAGTTTTGTCGTATGCTTTTTT
TTTGCTTAGTTATACAGTAAGAAATGATTATCTTTCTATTACGTGTAGTTTGAATCTTTA
AACATGGTTTCACTCTTTGTTGTAATCCAAACTTTTGTATTATGTTCATGTTTCATCAAG
TAGTATTTAAGG

QA 7 858 7 858
DS 



AS 1 3

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AAGACTTGAGTTTTGTGGGAAAGAGATTCAAAACAGAGACAGCGAAAAAGAAAGGAGGAC
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GTGTCAGGTAGATCAATATCAGCGTTCCAACACTTGATAAGATGGAGAAAAGGATGACGA
TTTTCCTAGAATCAAACGAAGCAGCACGCTTGTATCTTCTCCACCTGTTGGTTGGTGCAT
CATGGCATCTCTCGGAGATAGCTTTATCAGTGGTCATGCTTGCTTGTCTCTGCAATACCT
TTTGCAT**GAAGAGTCTCGGACTTGAGATTTCCAAGGACTCCACCGTCGTGGGGCTCAG
CACCGTTGCCTTTCTCGAGGTTAATGTCGACGACGCATGACTGGTAGGAATCAGTGCCAC
CAAGCAGAACATTGATGCGGTTCTGAGTCTTCTGACAGTTGAGTTGGGCATCGATGAACA
TCTGATTTTTAGAAGGAAGCAGAGCCTTGACGAAGCTAAAGAGAGTGAAGTGAGGGACGA
GGGTATTGCCTTGGTCAGGTAAGACTGAGATAGTACACACGTCTTGTACAAGTGAAGTGT
CTTGTTTCAAAGGGAATGCAGCCTCCTCCTCCTCCTCCTTAACAAGAAGAAGAGGAGAAA
CATCTATGGCGCAGTGGATAGGCTTAGGTGGTGGCTTGAAGCTTGGATACTTGAGTGGTG
AGTTACTATCTGCGAATTGCTGCTTCCTCCCTTCACCAGTGGCGGTGGCCATCGCAGCAG
AGAGAATCGGAGAAGCGGTTTTTTTCAAGAGAGGAGGAGGAAGACGAAAGAACAATGCAT
GTAAAGAAGAAGCTTCCTCGTGACGGCAGATTCAGAGAGAGAAAGAAGAACTGTGTGGAG
AGAGAGAGAGATAGAAAGTTCGAAGCAGCTCTTTATCTCTACTCCTTTTACGCTTAGGGC
CCGGGCGTGATCCGCCTGTGAATGCCTTCCTTCTTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EH22JQ U 1
AF RS1DI26JQ U 1
AF RS1EH22TF C 290
BS 1 106 RS1DI26JQ
BS 107 107 RS1EH22JQ
BS 108 134 RS1DI26JQ
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BS 765 812 RS1DI26JQ
BS 813 1057 RS1EH22TF

RD RS1EH22JQ 669 0 0
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TTTGCAT**GAAGAGTCTCGGACTTGAGATTTCCAAGGACTCCACCGTCGTGGGGCTCAG
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GGGTATTGCCTTGGTCAGGTAAGACTGAGATAGTACACACGTCTTGTACAAGTGAAGTGT
CTTGTTTCA

QA 1 669 1 669
DS 

RD RS1DI26JQ 812 0 0
CTCGCAAGTGTTATTCACAGAAAATGTGTCGACTTATCAACATTATGAAGCTTGGAACAG
AAGACTTGAGTTTTGTGGGAAAGAGATTCAAAACAGAGACAGCGAAGAAGAAAGGAGGAC
AGTGATACAGTTTAGACTACAAATGATTGAAGCTATTGTCTCCGCTTTGCCTCACTCTCA
GTGTCAGGTAGATCAATATCAGCGTTCCAACACTTGATAAGATGGAGAAAAGGATGACGA
TTTTCCTAGAATCAAACGAAGCAGCACGCTTGTATCTTCTCCACCTGTTGGTTGGTGCAT
CATGGCATCTCTCGGAGATAGCTTTATCAGTGGTCATGCTTGCTTGTCTCTGCAATACCT
TTTGCATATGAAGAGTCTCGGACTTGAGATTTCCAAGGACTCCACCGTCGTGGGGCTCAG
CACCGTTGCCTTTCTCGAGGTTAATGTCGACGACGCATGACTGGTAGGAATCAGTGCCAC
CAAGCAGAACATTGATGCGGTTCTGAGTCTTCTGACAGTTGAGTTGGGCATCGATGAACA
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GGGTATTGCCTTGGTCAGGTAAGACTGAGATAGTACACACGTCTTGTACAAGTGAAGTGT
CTTGTTTCAAAGGGAATGCAGCCTCCTCCTCCTCCTCCTTAACAAGAAGAAGAGGAGAAA
CATCTATGGCGCAGTGGCTAGGCTTAG*TGGTGGCTTGAAGCT*GGATACTTGAGTGGTG
AGTTACTATCTGCGAATTGCTGCTTCCTCCCT

QA 1 812 1 812
DS 

RD RS1EH22TF 768 0 0
TGGTT
GTGCATCATGGCATCTCTCGGAGATAGCTTTATCAGTGGTCATGCTTGCTTGTCTCTGCA
ATACCTTT*GCAT**GAAGAGTCTCGGACTTGAGATTTCCAAGGACTCCACCGTCGTGGG
GCTCAGCACCGTTGCCTTTCTCGAGGTTAATGTCGACGACGCATGACTGGTAGGAATCAG
TGCCACCAAGCAGAACATTGATGCGGTTCTGAGTCTTCTGACAGTTGAGTTGGGCATCGA
TGAACATCTGATTTTTAGAAGGAAGCAGAGCCTTGACGAAGCTAAAGAGAGTGAAGTGAG
GGACGAGGGTATTGCCTTGGTCAGGTAAGACTGAGATAGTACACACGTCTTGTACAAGTG
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GAGAAACATCTATGGCGCAGTGGATAGGCTTAGGTGGTGGCTTGAAGCTTGGATACTTGA
GTGGTGAGTTACTATCTGCGAATTGCTGCTTCCTCCCTTCACCAGTGGCGGTGGCCATCG
CAGCAGAGAGAATCGGAGAAGCGGTTTTTTTCAAGAGAGGAGGAGGAAGACGAAAGAACA
ATGCATGTAAAGAAGAAGCTTCCTCGTGACGGCAGATTCAGAGAGAGAAAGAAGAACTGT
GTGGAGAGAGAGAGAGATAGAAAGTTCGAAGCAGCTCTTTATCTCTACTCCTTTTACGCT
TAGGGCCCGGGCGTGATCCGCCTGTGAATGCCTTCCTTCTTCC

QA 6 768 6 768
DS 



AS 1 3

CO CL3712Contig1 732 3 1 U
GTAAAACGATAATCATAATTATAATCTGTATCCACTTCCTATAACAATCTACTTACAAAG
ATTTGATTTCGAATCATCTCCAATCTTTAATCGTCTGATACTATTTTCCTACCAAACCCA
TGAGATTAAGAAAGATTAAACGTGTTTGCCTTCCATCCTGGCCGTAGGTGATTTAGTCGG
GTTAATTCTATCCCACGTAAGGAGAGAAGAGATCAAAACGACCAAGAGTCTTTGTCGTGT
CCTCCAAAATCAATGTCTCATGTTCCACTTGCTCTTTGTCTTCTGCTCTTCAGCACGATT
GGAGCCATCAGCATCCATATGTATACGCAAACCGCAACCCACTCGTTCACAATCCTCACC
CAAGTACTCGTCCATCCCACGTCAATCGTCCACTTTTTCATGGGGTGATGAGTGTTCCAA
CCGATGAGTAGCATAGCGAAGTACATTGCTCCTGTCGCAAACACAAAATGGAAGAATCCA
TATCCATATGGAACACGATCTTCCTCCACTTCTTCTTCTTCTCCTTCACTATGCACATCT
TTCTTGAATTGGAAACATTGAGAGTCTATTCCTGTTGAAAATGTGGCAATCACCATTGCC
AATAACGCAACCACAAAGCTAATGATTGTAAGCCAGTCCGTTCTGTTTGAAGCTGCTGCT
TTTCTGTTGCAGTTTTCTCCCACTGGTTCACTTCGAATGGCGCACCAGCAGATAAAGACA
ACATAGAGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AU37JQ U 6
AF RS1FA92JQ U 1
AF RS1FA92TF C 1
BS 1 732 RS1FA92JQ

RD RS1AU37JQ 708 0 0
ACGATAATCATAATTATAATCTGTATCCACTTCCTATAACAATCTACTTACAAAGATTTG
ATTTCGAATCATCTCCAATCTTTAATCGTCTGATACTATTTTCCTACCAAACCCATGAGA
TTAAGAAAGATTAAACGTGTTTGCCTTCCATCCTGGCCGTAGGTGATTTAGTCGGGTTAA
TTCTATCCCACGTAAGGAGAGAAGAGATCAAAACGACCAAGAGTCTTTGTCGTGTCCTCC
ACAATCAATGTCTCATGTTCCACTTGCTCTTTGTCTTCTGCTCTTCAGCACGATTGGAGC
CATCAGCATCCATATGTATACGCAAACCGCAACCCACTCGTTCACAATCCTCACCCAAGT
ACTCGTCCATCCCACGTCAATCGTCCACTTTTTCATGGGGTGATGAGTGTTCCAACCGAT
GAGTAGCATAGCGAAGTACATTGCTCCTGTCGCAAACACAAAATGGAAGAATCCATATCC
ATATGGAACACGATCTTCCTCCACTTCTTCTTCTTCTCCTTCACTATGCACATCTTTCTT
GAATTGGAAACATTGAGAGTCTATTCCTGTTGAAAATGTGGCAATCACCATTGCCAATAA
CGCAACCACAAAGCTAATGATTGTAAGCCAGTCCGTTCTGTTTGAAGCTGCTGCTTTTCT
GTTGCAGTTTTCTCCCACTGGTTCACTTCGAATGGCGCACCAGCAGAT

QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1FA92JQ 732 0 0
GTAAAACGATAATCATAATTATAATCTGTATCCACTTCCTATAACAATCTACTTACAAAG
ATTTGATTTCGAATCATCTCCAATCTTTAATCGTCTGATACTATTTTCCTACCAAACCCA
TGAGATTAAGAAAGATTAAACGTGTTTGCCTTCCATCCTGGCCGTAGGTGATTTAGTCGG
GTTAATTCTATCCCACGTAAGGAGAGAAGAGATCAAAACGACCAAGAGTCTTTGTCGTGT
CCTCCAAAATCAATGTCTCATGTTCCACTTGCTCTTTGTCTTCTGCTCTTCAGCACGATT
GGAGCCATCAGCATCCATATGTATACGCAAACCGCAACCCACTCGTTCACAATCCTCACC
CAAGTACTCGTCCATCCCACGTCAATCGTCCACTTTTTCATGGGGTGATGAGTGTTCCAA
CCGATGAGTAGCATAGCGAAGTACATTGCTCCTGTCGCAAACACAAAATGGAAGAATCCA
TATCCATATGGAACACGATCTTCCTCCACTTCTTCTTCTTCTCCTTCACTATGCACATCT
TTCTTGAATTGGAAACATTGAGAGTCTATTCCTGTTGAAAATGTGGCAATCACCATTGCC
AATAACGCAACCACAAAGCTAATGATTGTAAGCCAGTCCGTTCTGTTTGAAGCTGCTGCT
TTTCTGTTGCAGTTTTCTCCCACTGGTTCACTTCGAATGGCGCACCAGCAGATAAAGACA
ACATAGAGTCCC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1FA92TF 732 0 0
GTAAA
ACGATAATCATAATTATAATCTGTATCCACT*CCTATAACAATCTACTTACAAAGATTTG
ATTTCGAATCATCTCCAATCTTTAATCGTCTGATACTATTTTCCTACCAAACCCATGAGA
TTAAGAAAGATTAAACGTGTTTGCCTTCCATCCTGGCCGTAGGTGATTTAGTCGGGTTAA
TTCTATCCCACGTAAGGAGAGAAGAGATCAAAACGACCAAGAGTCTTTGTCGTGTCCTCC
AAAATCAATGTCTCATGTTCCACTTGCTCTTTGTCTTCTGCTCTTCAGCACGATTGGAGC
CATCAGCATCCATATGTATACGCAAACCGCAACCCACTCGTTCACAATCCTCACCCAAGT
ACTCGTCCATCCCACGTCAATCGTCCACTTTTTCATGGGGTGATGAGTGTTCCAACCGAT
GAGTAGCATAGCGAAGTACATTGCTCCTGTCGCAAACACAAAATGGAAGAATCCATATCC
ATATGGAACACGATCTTCCTCCACTTCTTCTTCTTCTCCTTCACTATGCACATCTTTCTT
GAATTGGAAACATTGAGAGTCTATTCCTGTTGAAAATGTGGCAATCACCATTGCCAATAA
CGCAACCACAAAGCTAATGATTGTAAGCCAGTCCGTTCTGTTTGAAGCTGCTGCTTTTCT
GTTGCAGTTTTCTCCCACTGGTTCACTTCGAATGGCGCACCAGCAGATAAAGACAACATA
GAGTCCC

QA 6 732 6 732
DS 



AS 1 3

CO CL3713Contig1 717 3 3 U
GGAAGCCCATACGATCGCAAGTAAAAGGCAAACGCCGCCTTTAGGGAGCTGCGGCGATAA
GTCTTGGTTGGTGGATAATCGATTTCACCCATGGCGTCGCTTCCCTCTGCGAGTTTGCTT
CCTTCTCCATCTCTCGTCGTTCTATCCCCCACGAAGATCTCCTCCTCCTCGCGCTCGATT
GATTGCTCTTCGTCCCGTGCCCATGGTTTCTCGTCCGTCCCCCGTTCTTCGCCTAGCCTT
CGGATGACTAGAAGAGCAAATCACAATAAGCTGCAAGTCGTGGCTATGGCTCCTGAGGAA
GAAAAGCTCACCCGTCGCAATCCTCTCGATTTCCCTATTGAGTGGGAGAGACCTAAACCT
GGGAGGAGGCCTGATATTTTCCCCAAGTTTAGCCCAATGAAGACACCATTGCCACCGCCC
ATGCCTTATGATCCTCCAGCAGAAGACGAAGAAGAAGAGGAAGAGAAGAAAGAAGAGGAA
GAAGAGAACCCTGACCAAGAAGAAGAGGAACAACCTGAGAAGCAACCATAGTTTTTTATA
GTTTCGAAATCTAAGTCTGTTTCCGAGTTTTGTATTGTTTTTTTTTGAAGGAGAAACAAA
AAAGAATCAATCAATCGTTCTCACTTTTTGTAGCTAGGATCAAATCTCATGCTCGTGTTA
CTCGTGTGCTATGTTTCGTGTAATAGCGATACACTATCGTTTATTCTAATCCTCTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A421TF U 132
AF RS1DP53TF U 64
AF RS1DN85TF U 1
BS 1 210 RS1DN85TF
BS 211 211 RS1DP53TF
BS 212 717 RS1DN85TF

RD RS1A421TF 452 0 0
TCTCGTCGTTCTATCCCC*ACGAAGACCTCCTCCTCCTCGCGCTCGATTGATTGCTCTTC
GTCCCGTGCCCATGGTTTCTCGTCCGTCCCCCGTTCTTCGCCTAGCCTTCGGATGACTAG
AAGAGCAAATCACAATAAGCTGCAAGTCGTGGCTATGGCTCCTGAGGAAGAAAAGCTCAC
CCGTCGCAATCCTCTCGATTTCCCTATTGAGTGGGAGAGACCTAAACCTGGGAGGAGGCC
TGATATTTTCCCCAAGTTTAGCCCAATGAAGACACCATTGCCACCGCCCATGCCTTATGA
TCCTCCAGCAGAAGACGAAGAAGAAGAGGAAGAGAAGAAAGAAGAGGAAGAAGAGAACCC
TGACCAAGAAGAAGAGGAACAACCTGAGAAGCAACCATAGTTTTTTATAGTTTCGAAATC
TAAGTCTGTTTCCGAGTTTTGTATTGTTTTTT

QA 1 452 1 452
DS 

RD RS1DP53TF 540 0 0
TTGGTTGGTGGATAATCGATTTCACCCATGGCGTCGCTTCCCTCTGCGAGTTTGCTTCCT
TCTCCATCTCTCGTCGTTCTATCCCCCACGAAGATCTCCTCCTCCTCGCGCTCGATTGAT
TGCTCTTCGTCCCGTGCCCATGGTTTCTCGTCCGTCCCCCGTTCTTCGCCTAGCCTTCGG
ATGACTAGAAGAGCAAATCACAATAAGCTGCAAGTCGTGGCTATGGCTCCTGAGGAAGAA
AAGCTCACCCGTCGCAATCCTCTCGATTTCCCTATTGAGTGGGAGAGACCTAAACCTGGG
AGGAGGCCTGATATTTTCCCCAAGTTTAGCCCAATGAAGACACCATTGCCACCGCCCATG
CCTTATGATCCTCCAGCAGAAGACGAAGAAGAAGAGGAAGAGAAGAAAGAAGAGGAAGAA
GAGAACCCTGACCAAGAAGAAGAGGAACAACCTGAGAAGCAACCATAGTTTTTTATAGTT
TCGAAATCTAAGTCTGTTTCCGAGTTTTGTATTGTTTTTTTTTGAAGGAGAAACAAAAAA

QA 1 540 1 540
DS 

RD RS1DN85TF 717 0 0
GGAAGCCCATACGATCGCAAGTAAAAGGCAAACGCCGCCTTTAGGGAGCTGCGGCGATAA
GTCTTGGTTGGTGGATAATCGATTTCACCCATGGCGTCGCTTCCCTCTGCGAGTTTGCTT
CCTTCTCCATCTCTCGTCGTTCTATCCCCCACGAAGATCTCCTCCTCCTCGCGCTCGATT
GATTGCTCTTCGTCCCGTGCCCATGGTTTCACGTCCGTCCCCCGTTCTTCGCCTAGCCTT
CGGATGACTAGAAGAGCAAATCACAATAAGCTGCAAGTCGTGGCTATGGCTCCTGAGGAA
GAAAAGCTCACCCGTCGCAATCCTCTCGATTTCCCTATTGAGTGGGAGAGACCTAAACCT
GGGAGGAGGCCTGATATTTTCCCCAAGTTTAGCCCAATGAAGACACCATTGCCACCGCCC
ATGCCTTATGATCCTCCAGCAGAAGACGAAGAAGAAGAGGAAGAGAAGAAAGAAGAGGAA
GAAGAGAACCCTGACCAAGAAGAAGAGGAACAACCTGAGAAGCAACCATAGTTTTTTATA
GTTTCGAAATCTAAGTCTGTTTCCGAGTTTTGTATTGTTTTTTTTTGAAGGAGAAACAAA
AAAGAATCAATCAATCGTTCTCACTTTTTGTAGCTAGGATCAAATCTCATGCTCGTGTTA
CTCGTGTGCTATGTTTCGTGTAATAGCGATACACTATCGTTTATTCTAATCCTCTCG

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 2

CO CL3714Contig1 865 2 2 U
GGAGGGTTCTTCCTCCTATCGACTGCGGCGGCGACGAGGAGGCCGAGAAAAACCGACACT
GCGGTGGAGAAGCCATCTTTTCAAAAACCCTTTTACATTGACTTTCGATTTACCAAGTGT
CGGCGATGGCCTCGATCTCGACATGGTTCAGATACATGGCGCACAAGCTTGAGTATTCTC
TCACCCTCAGTCTCAAGAGTCATAGGAGAGAAAAACTGAGTGACCGAGAACTCATTCAAA
TCATCTTCAAGAATCTCTTCCATGGGAAGATAACCTACTTACATTCGGGCAAAGGACCAG
AAATGTCCCCAACCATGGCAGCACACGAGAACACTCTTCTTGTCCGCAAAATACCGATTG
CTAACACGAGGTATCTGTACGTTGGAGATGCTGTGGTCTTAAAGGACCCAAACGATTCGA
CAAGTATCTGGTGAGAAGATTAGCAGCTGTGGAAGGGTTCGAAATGGTATCAGGTGATGC
AAAAGAGGAGCCTTTTGTTCTCGACAAGGATCAGTGTTGGGTTGTTGCTGAAAACAAGGA
TATCAAACCCAAGGAAGCATACGATAGTCGAACGTTTGGTCCAGTTTCAACAGCAGACAT
TGTTGGAAGAGCTATATATTGTCTGAGAACCGCCGTGGATCATGGTCCCGTCCGAAACAG
TCAAACTGCGATGGGACAAGATTCTCCAATCCTGGCAGTAGAGTTGGACGTGGACGAGAT
GGCTAAAAACCACAAGGCACAATAAAGAGTAACACTTACTTGCTTTTTTGTGTCAAATCT
TAAATTGCGTTATTTGTTTTGAGATATGAGTAAAACAAATAAACCATACAATGATGATGA
TGAATCAGAAAATTTCACGTTCCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D508TF U 1
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TATCAAACCC

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DS 

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QA 1 531 1 531
DS 



AS 1 3

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BX26JQ U 1
AF RS1A944JQ U 251
AF RS1H245TF C 30
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RD RS1BX26JQ 498 0 0
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AAA

QA 1 495 1 495
DS 

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DS 

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AACTCCCTCTACCTCAGCCATCGACCTTGCATATGAACGAGAAGAAGAAGACCCAACGCT
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QA 1 669 1 669
DS 



AS 0 0

AS 1 3

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BQ
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AF RS1DE28JQ C 1
AF RS1DE28TF U 1
AF RS1DF26TF U 1
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ATCCGCCGCCTCGGTTGCATTGCCGGCTCTTGGCTCTTTGGTTGGGGCTTCCCTTGTGTC
CCTATTCAACTACTACTTGCACTAAGCTATGTCTCATTATGTAATAATACTATTTATGTG
ATCTTTTTCATTTCCTACCTATTTCCATTTCACTTGTTTATTAATAAAACTGAGAAAATA
ATTCAAGA
GC

QA 1 368 1 368
DS 

RD RS1DF26TF 383 0 0
GGAGGCCTGCAAGAACTTCAGAACACACACAAAAAAAAAAACTAAGTAAAAAGAAGAAAA
AGCCTTCCAGGTCTCAACAATGGAGATGAAGAAGATCGTTTGCGGTGTGCTTTTCGCTGC
TGCCTCCATGACCGCCGTCATGGCTATTGAGGAAGCCGGAGCTCCGGCTCCAGGACCCGC
ATCCGCCGCCTCGGTTGCATTGCCGGCTCTTGGCTCTTTGGTTGGGGCTTCCCTTGTGTC
CCTATTCAGCTACTACTTGCACTAAGCTATGTCTCATTATGTAATAATACTATTTATGTG
ATCTTTTTCATTTCCTACCTATTTCCATTTCACTTGTTTATTAATAAAACTGAGAAAATA
ATTCAAGAATAAACTTTCTTTTG

QA 1 383 1 383
DS 



AS 1 3

CO CL3718Contig1 984 3 8 U
GGAAAAGAAAACAGAAAGAAAGAGAAAAGAAGTATGGGAAGGTCACCGTGTTGCGAGAAA
GCTCACACAAACAAAGGAGCATGGACGAAAGAAGAGGACGAGAGGCTCACAGCTTACATT
AAAGCTCATGGCGAAGGCTGCTGGAGATCTCTCCCCAAAGCCGCCGGCCTTCTTCGGTGT
GGCAAAAGCTGCCGTCTCCGGTGGATCAACTATCTCCGGCCTGACCTTAAGCGTGGAAAC
TTCACCGAGGAAGAGGACGAGCTCATAATCAAGCTCCATAGCCTTCTTGGAAACAAATGG
TCGCTTATTGCCGGGAGATTACCGGGAAGAACAGATAACGAGATAAAGAATTATTGGAAC
ACACATATACGAAGAAAGCTTATAAACAGAGGGATCGATCCAACGACTCATAGACCAGTC
CAAGAATCATCATCAGCTTCTCATGATTCTAAACCTACACAGCTAGAAGCAATAACGAAT
AACACCACTCACATATCCTTCACTTCTACTCCAAAGATGGAAAGCACAAGTTTCCAAGTA
AAGCCAGAGAAAATTTCAATGCTTACGTTCAAAGAGGAAAAAGACGAGTCCCCGATTGAA
GCAAAGTTGCCAGATCTGAATCTTGAGCTCAG*ATCAGTCTTCCTGATGTTGTTGATCAT
CGTCATCAAGTCTTGGTCGTGGGAGAGGGAAAGTCAACAAGGGCGAGGTGTTTCAGGTGC
AGTTTAGGGATGATAAACGGCATGGAGTGCAGGTGCGGAAGCATGAGGTGCGATGTAGTT
GGAGGTAGCAGCGGCAGTGGCAAGGGGAGTGACATCAGCAACGGATTCGATTTTTTAGGG
TTGGCAACGAGAGAGACTACTACTTCTCTTTTAGGTTCTCGAAGTTTGGAGATGATATAA
TATTTTGTCAAGTTATGCTTAGTGCGTAACTGTACACACTTTTTTTTTTTTTGCCTAGAG
AATTAATTTGAAGGTAACACTATT


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EF91TF U 1
AF RS1ES68TF U 2
AF RS1ES68JQ C 230
BS 1 100 RS1EF91TF
BS 101 101 RS1ES68TF
BS 102 362 RS1EF91TF
BS 363 363 RS1ES68TF
BS 364 487 RS1EF91TF
BS 488 488 RS1ES68TF
BS 489 696 RS1EF91TF
BS 697 984 RS1ES68JQ

RD RS1EF91TF 698 0 0
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GCTCACACAAACAAAGGAGCATGGACGAAAGAAGAGGACGGGAGGCTCACAGCTTACATT
AAAGCTCATGGCGAAGGCTGCTGGAGATCTCTCCCCAAAGCCGCCGGCCTTCTTCGGTGT
GGCAAAAGCTGCCGTCTCCGGTGGATCAACTATCTCCGGCCTGACCTTAAGCGTGGAAAC
TTCACCGAGGAAGAGGACGAGCTCATAATCAAGCTCCATAGCCTTCTTGGAAACAAATGG
TCGCTTATTGCCGGGAGATTACCGGGAAGAACAGATAACGAGATAAAGAATTATTGGAAC
ACGCATATACGAAGAAAGCTTATAAACAGAGGGATCGATCCAACGACTCATAGACCAGTC
CAAGAATCATCATCAGCTTCTCATGATTCTAAACCTACACAGCTAGAAGCAATAACGAAT
AACACCATTCACATATCCTTCACTTCTACTCCAAAGATGGAAAGCACAAGTTTCCAAGTA
AAGCCAGAGAAAATTTCAATGCTTACGTTCAAAGAGGAAAAAGACGAGTCCCCGATTGAA
GCAAAGTTGCCAGATCTGAATCTTGAGCTCAG*ATCAGTCTTCCTGATGTTGTTGATCAT
CGTCATCAAGTCTTGGTCGTGGGAGAGGGAAAGTCA
CA

QA 1 696 1 696
DS 

RD RS1ES68TF 678 0 0
GG
AAAGAAAACAGAAAGAAAGAGAAAAGAAGTATGGGAAGGTCACCGTGTTGCGAGAAAGCT
CACACAAACGAAGGAGCATGGACGAAAGAAGAGGACGAGAGGCTCACAGCTTACATTAAA
GCTCATGGCGAAGGCTGCTGGAGATCTCTCCCCAAAGCCGCCGGCCTTCTTCGGTGTGGC
AAAAGCTGCCGTCTCCGGTGGATCAACTATCTCCGGCCTGACCTTAAGCGTGGAAACTTC
ACCGAGGAAGAGGACGAGCTCATAATCAAGCTCCATAGCCTTCTTGGAAACAAATGGTCG
CTTATTGCCGGGAGATTACCGGGAAGAACAGATAACGAGATAAAGAATTATTGGAACACA
CATATACGAAGAAAGCTTATAAACAGAGGGATCGATCCAACGACTCATAGACCAGTCCAA
GAATCATCATCAGCTTCTCATGATTCTAAACCTACACAGCTAGAAGCAATAACGAATAAC
ACCACTCACATATCCTTCACTTCTACTCCAAAGATGGAAAGCACAAGTTTCCAAGTAAAG
CCAGAGAAAATTTCAATGCTTACGTTCAAAGAGGAAAAAGACGAGTCCCCGATTGAAGCA
AAGTTGCCAGATCTGAATCTTGAGCTCAG*ATCAGTCTTCCTGATGTTGTTGATCATCGT
CATCAAGTCT
GGTCGT

QA 3 672 3 672
DS 

RD RS1ES68JQ 755 0 0
AGCGTGGAAACTTCACCGAGGAAGAGGACGAGCTCATAATCAAGCTCCATAGCCTTCTTG
GAAACAAATGGTCGCTTATTGCCGGGAGATTACCGGGAAGAACAGATAACGAGATAAAGA
ATTATTGGAACACACATATACGAAGAAAGCTTATAAACAGAGGGATCGATCCAACGACTC
ATAGACCAGTCCAAGAATCATCATCAGCTTCTCATGATTCTAAACCTACACAGCTAGAAG
CAATAACGAATAACACCACTCACATATCCTTCACTTTTACTCCAAAGATGGAAAGCACAA
GTTTCCAAGTAAAGCCAGAGAAAATTTCAATGCTTACGTTCAAAGAGGAAAAAGACGAGT
CCCCGATTGAAGCAAAGTTGCCAGATTTGAATCTTGAGCTCAGGATCAGTCTTCCTGATG
TTGTTGATCATCGTCATCAAGTCTTGGTCGTGGGAGAGGGAAAGTCAACAAGGGCGAGGT
GTTTCAGGTGCAGTTTAGGGATGATAAACGGCATGGAGTGCAGGTGCGGAAGCATGAGGT
GCGATGTAGTTGGAGGTAGCAGCGGCAGTGGCAAGGGGAGTGACATCAGCAACGGATTCG
ATTTTTTAGGGTTGGCAACGAGAGAGACTACTACTTCTCTTTTAGGTTCTCGAAGTTTGG
AGATGATATAATATTTTGTCAAGTTATGCTTAGTGCGTAACTGTACACACTTTTTTTTTT
TTTGCCTAGAGAATTAATTTGAAGGTAACACTATT

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL3719Contig1 518 2 3 U
CATAGGAAAGCATACGATTGTATTACCCAGGAAGACAATCAATCAAAGTAAAAGGATAAT
GTTTTGTTCTTTATTTGGCTCACAGAACTTCAAAGATAAATCATAAACTGATTACTAGCA
AAAGATAGATATAATCATTTCTTCTTGAATAGGAAGTGTGAAATCATCCACTCTTCTCCA
TTGTTGTATCCAAAAAGCTCAGCAACAGCCATGAAAAAGGTTCTCCAGTAAACCATCCAC
TTCACTGCCTCCTCTTTCCCATAAGTCATTTCCATTATCTCCCTATTGCAACTATCTCCT
TGTCCATTCTTTTGAGCCACTCTTCACTGGTCCTTGCATAATGTTTTCCGTTTAGGAGCC
GATGATCCACAATCGAAACATCGTCTTGGAAATAGAGGAAAAAATTCCCCGACGGCATTG
TTCCTCCACTAAAGAAGTATCTTGTGATCCAGTCATCGTCATGCACATCCTCAAAGTGGT
AAGCAAATGTCTTATGGCAGAAATAGTGAACAAACAGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GT71JQ U 1
AF RS1GL62JQ U 1
BS 1 407 RS1GL62JQ
BS 408 408 RS1GT71JQ
BS 409 518 RS1GL62JQ

RD RS1GT71JQ 441 0 0
CATAGGAAAGCATACGATTGTATTACCCAGGAAGACAATCAATCAAAGTAAAAGGATAAT
GTTTTGTTCTTTATTTGGCTCACAGAACTTCAAAGATAAATCATAAACTGATTACTAGCA
AAAGATAGATATAATCATTTCTTCTTGAATAGGAAGTGTGAAATCATCCACTCTTCTCCA
TTGTTGTATCCAAAAAGCTCAGCAACAGCCATGAAGAAGGTTCTCCAGTAAACCATCCAC
TTCACTGCCTCCTCTTTCCCATAAGTCATTTCCATTATCTCCCTATTGCAACTATCTCCT
TGTCCATTCTTTTGAGCCACTCTTCACTGGTCCTTGCATAATGTTTTCCGTTTAGGAGCC
GATGATCCACAATCGAAACATCGTCTTGGAAATAGAGGAAAAAATTCCCCGACGGCATTG
TTCCTCCACTAAAGAAGTATC

QA 1 441 1 441
DS 

RD RS1GL62JQ 518 0 0
CATAGGAAAGCATACGATTGTATTACCCAGGAAGACAATCAATCAAAGTAAAAGGATAAT
GTTTTGTTCTTTATTTGGCTCACAGAACTTCAAAGATAAATCATAAACTGATTACTAGCA
AAAGATAGATATAATCATTTCTTCTTGAATAGGAAGTGTGAAATCATCCACTCTTCTCCA
TTGTTGTATCCAAAAAGCTCAGCAACAGCCATGAAAAAGGTTCTCCAGTAAACCATCCAC
TTCACTGCCTCCTCTTTCCCATAAGTCATTTCCATTATCTCCCTATTGCAACTATCTCCT
TGTCCATTCTTTTGAGCCACTCTTCACTGGTCCTTGCATAATGTTTTCCGTTTAGGAGCC
GATGATCCACAATCGAAACATCGTCTTGGAAATAGAGGAAAAAATTCGCCGACGGCATTG
TTCCTCCACTAAAGAAGTATCTTGTGATCCAGTCATCGTCATGCACATCCTCAAAGTGGT
AAGCAAATGTCTTATGGCAGAAATAGTGAACAAACAGA

QA 1 518 1 518
DS 



AS 1 2

CO CL3720Contig1 758 2 10 U
GGGTTGGGGGCTTGAGATTCGATTCGGTGGACTCCGACTCTTGAGCAATTGTCAAAAGCT
TTTCTCCTTCCTTCCTTCAACTTTTTCAACGATCCCAAAGTCGAAATCGAAAGAAAGAGA
CAGAGAGAGAGAGAGCTACTGTTCTGTATTTTGATTCCCTCCCCTTCCCCTCCCCCTTGA
TTGTCTTTTAATTAATGTTTCTCTGTCCTTGTCGAAGCAACAACCTCTGATTCTACTTTT
TTGATTGGAACTGTTTCAGATCTGAAGACAGTTGTGTTGAAGTCTGTTTTTTTTTTTGTT
GGAGAATCGGGATTTGGGTTAACGGAGGTCGTCTGAGAGAAGTTCAACGGAGATGCCGGA
GGAGGAGTCGATATCAAATTCAGGCTCTACGATGGCTCCGACATCGGACCCTTTCGCTAT
TCAGCTGCCTCTACTGTTGATTTTTTGAAGCAAAGGGTCGTCTCTGATTGGCCCAAAGGC
AAAACAGTTGTTCCAAAGGGGATAAACGAAGTAAAGCTGATCAGCTCGGGTAAGATCTTG
GAGAACAACAAGACTGTTAGCCAGTGTAAGACTCCATTTGGAGAGACTGCAGGTGGTGGA
GTTACTGTGATGCATGTTGTTGTACAGCCTTCTCCAGCTAAAACTAAATCAGAGAAGAAG
GTCGATAAAGCACCAAAGTCGGTTATATGCACATGCACCATTTTGTGAAGGGGGCAAGAC
ATGTATCATACAGACCATCCTCAACTCTTCAGGTACAG


BQ
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DS 

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DS 



AS 1 3

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BQ
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G
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TGGAACAGAAGTGGAGTGCTTTAAAGCATTGAAGAGGCAAGAAGAGATGGCTGCGTCTTT
CAGGAAGAAGAATCTGGAGGAAGAAGTGATAAAGCAAAAGGAGACGGAGCGGAAACTGCA
AGCACGCTATGGGGAGCTGTTGTCAACGCTTGAAAAAGCAGAGGAGTTAATGGTCGGATT
CCGAGCACAAGCACTGAAACAGGCGGATGTCGTCGAGGATTCTCACGAACCAAAAGAAGC
TAAACTAGCCACTGGAGAGGAAGTGGACGTAGCCATTTCCATGGACGCTTCTGCGTAAAC
ATCAATCTTTACGTACTTGAGTTTTGTATTGGTTCCATGTTTTAAGGAGACGCAGCTTGA
CTTTGTATGAGT

QA 2 793 2 793
DS 

RD RS1DT62JQ 751 0 0
GGCTGACAAAATGATTAAGGAGGAGGCACAATTTCTTTGCGCGGCAATGGGAAACGAGAG
CAAGACATTTGACGAGTTCGTAGTAGCTCACGACGATTGCGTAAAGGATATCATGTACTT
CCCCACTCGAAATGCTTACGGGCCCTCAAGTGTTGCCGTGAAGGCAGAGAAAGTTGCAGC
GTTGCAAGTGGAGATGGAGAATGCGAAGAAAAAGATGGAGGAAGATGAGAAGAAGGCAGA
ACACATGAAGGCTAAGTATAAAACTTATACAAAGGGTCATGAGAAAAGGGCAGAGACTGT
GTGGAGCCAAATAGAGGCGAGTCTAAAGCAGATTGAGATTGGTGGAACAGAAGTGGAGCG
CTTTAAAGCATTGAAGAGGCAAGAAGAGATGGCTGCGTCTTTCAGGAAGAAGAATCTGGA
GGAAGAAGTGATAAAGCAAAAGGAGACGGAGCGGAAACTGCAAGCACGCTATGGGGAGCT
GTTGTCAACGCTTGAAAAAGCAGAGGAGTTAATGGTCGGATTCCGAGCACAAGCACTGAA
ACAGGCGGATGTCGTCGAGGATTCTCACGAACCAAAAGAAGCTAAACTAGCCACTGGAGA
GGAAGTGGACGTAGCCATTTCCATGGACGCTTCTGCGTAAACATCAATCTTTACGTACTT
GAGTTTTGTATTGGTTCCATGTTTTAAGGAGACGCAGCTTGACTTTGTATGAGTAAAATG
ACTTTGTAAAGGATGTGATGCTCTTTTGTAC

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 3

CO CL3722Contig1 549 3 2 U
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TTGATAAGCATGGAGGGTTTCGAGTTCATCATCGACAGGGAAGCCGCCATGGTTTCTCAT
ACTATCCGGAGCATGCTCACTTCTCCAGGTGGCTTTTCGGAATCGAAAGATGGTGTGGTG
ACTTTCCCTGATATCAGCACCACGATTCTAGAGAAGATCTGCCAGTACTTCTATTGGTCT
CTACAGTACTCCAGAGGCAAAGAGACGGAGTTCCACATCGAGCCTGAACTGACTCTGGAG
CTAATGATGGCTGCTAATTATCTTCACACCTGAAAGACTAACATAAACATGTAAAATCCC
TGGAGCACTTATGTGGGGTTATAAGACATTTGACAAAAATTGAGTTCTTGAAGAACTATT
GAATAGCTCCAAGGGAAACTCGTCTACTTTGTTTACTAGTTAATGACTATTTAATGCAAA
CATCAAAGTTCCTGTGGCGTTATTCGTTGCTTATGTTCAAATAGCTTACATTGCTTTTGT
AATAAGCAA


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DE45TF U 1
AF RS1G694JQ C 6
AF RS1G694TF U 6
BS 1 501 RS1DE45TF
BS 502 549 RS1G694TF

RD RS1DE45TF 501 0 0
GGGCCTAAGCCGACGCGAGAGACGACGACGACGAGGAAGAATATGAGGGAGACGGTGAAG
TTGATAAGCATGGAGGGTTTCGAGTTCATCATCGACAGGGAAGCCGCCATGGTTTCTCAT
ACTATCCGGAGCATGCTCACTTCTCCAGGTGGCTTTTCGGAATCGAAAGATGGTGTGGTG
ACTTTCCCTGATATCAGCACCACGATTCTAGAGAAGATCTGCCAGTACTTCTATTGGTCT
CTACAGTACTCCAGAGGCAAAGAGACGGAGTTCCACATCGAGCCTGAACTGACTCTGGAG
CTAATGATGGCTGCTAATTATCTTCACACCTGAAAGACTAACATAAACATGTAAAATCCC
TGGAGCACTTATGTGGGGTTATAAGACATTTGACAAAAATTGAGTTCTTGAAGAACTATT
GAATAGCTCCAAGGGAAACTCGTCTACTTTGTTTACTAGTTAATGACTATTTAATGCAAA
CATCAAAGTTCCTGTGGCGTT

QA 1 501 1 501
DS 

RD RS1G694JQ 544 0 0
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AAGCATGGAGGGTTTCGAGTTCATCATCGACAGGGAAGCCGCCATGGTTTCTCATACTAT
CCGGAGCATGCTCACTTCTCCAGGTGGCTTTTCGGAATCGAAAGATGGTGTGGTGACTTT
CCCTGATATCAGCACCACGATTCTAGAGAAGATCTGCCAGTACTTCTATTGGTCTCTACA
GTACTCCAGAGGCAAAGAGACGGAGTTCCACATCGAGCCTGAACTGACTCTGGAGCTAAT
GATGGCTGCTAATTATCTTCACCCCTGAAAGACTAACATAAACATGTAAAATCCCTGGAG
CACTTATGTGGGGTTATAAGACATTTGACAAAAATTGAGTTCTTGAAGAACTATTGAATA
GCTCCAAGGGAAACTCGTCTACTTTGTTTACTAGTTAATGACTATTTAATGCAAACATCA
AAGTTCCTGTGGCGTTATTCGTTGCTTATGTTCAAATAGCTTACATTGCTTTTGTAATAA
GCAA

QA 1 544 1 544
DS 

RD RS1G694TF 544 0 0
TAAGCCGACGCGAGAGACGACGACGACGAGGAAGAATATGAGGGAGACGGTGAAGTTGAT
AAGCATGGAGGGTTTCGAGTTCATCATCGACAGGGAAGCCGCCATGGTTTCTCATACTAT
CCGGAGCATGCTCACTTCTCCAGGTGGCTTTTCGGAATCGAAAGATGGTGTGGTGACTTT
CCCTGATATCAGCACCACGATTCTAGAGAAGATCTGCCAGTACTTCTATTGGTCTCTACA
GTACTCCAGAGGCAAAGAGACGGAGTTCCACATCGAGCCTGAACTGACTCTGGAGCTAAT
GATGGCTGCTAATTATCTTCACACCTGAAAGACTAACATAAACATGTAAAATCCCTGGAG
CACTTATGTGGGGTTATAAGACATTTGACAAAAATTGAGTTCTTGAAGAACTATTGAATA
GCTCCAAGGGAAACTCGTCTACTTTGTTTACTAGTTAATGACTATTTAATGCAAACATCA
AAGTTCCTGTGGCGTTATTCGTTGCTTATGTTCAAATAGCTTACATTGCTTTTGTAATAA
GCAA

QA 1 544 1 544
DS 



AS 1 2

CO CL3723Contig1 1107 2 2 U
GATTGAATTCCGAAAGAGATAATAATAAATAAAAACACCTAATAGTCGATGGCGGATTCG
GATGATCTAGAGAGTGGAAGAACCGCCGTAATAGTCGACATTGGAGTTGAAGGCGGCGGT
GGCGCCGCGGTGGAAGAGAGGGAGAAGCTAGCGGAGTTGGAACGAATATCAGTGTTGGAT
TTCGATCTGCTTTGCTCGACGGTGGCGCTTCAGAATCAGGGGAAGTGGAGGAAACTCGAG
AGCTCCGACGGCCAAGATAAAGAATATGGCGGCGGCGTTTTACGGCTTTGGGAAAGTGAT
GTTATGGACTGCCTCGAGGCGGTTTTTCTATAATAGTTTTATTTTATCTTTTGTCTTTTA
GCTCTCCGTGCTACAGATCCGGGAAGAACATAACAAGGACCGGCTTTTGGTTCTTGCTTT
CTTCAAGGAGTCAGGGTGCCGTTCATATGATTCTTATCATCGGTCTCCTATTCGACGTTG
CAGCTTTTGCTGTAACTAAAAAGGCATTGCTTTCTCTACCTGGCTGGTGCTTTCGTCGTT
TTGATTGCGTCATACTTGGTGTTCTTTCATATGCAGATAAGAAAGAAGTTTGACATTAGA
GTAAGCCTCCTTCTTCCCCGTGAGTGTGTTTTCCACAAGTGACGGCGGCGATGCCGGGGA
TCAAGAGGTGTGAGCAGGTGATAGACAAGCAGAAGGCTTGAGTGATGATGTTGATGCGAG
GTAAGTTCCATTGGCGAACAGACTACTTACGGTGAAGAAGCCTGTTCCAAACAACTTAAA
AATGATGAGTAACTACATTTCTTGCAGAGGCGGTAGTAGTAGTAGTAGAACAACGCCGAT
TACTCAAAAAGCTTCATTTACTCCGAATCCTAGTGGAGGAGGAAGTCTGATTAAAAACTT
CATTCAACCGACTACGATCGGTTAATAACACAATCTGAAGCTCGTACATTGGCAGTTTGT
ATGGATTATGGTTTCTCTTTTGTATTCTTTCTTTCATAAAGAACAATAACTATACATAAA
GTTATTATATATACTATAGGAATTGGACAAAACGGTAAATCCAATTGCCTAGGAAAAACA
TCAAACCTAATAAAAAAGATTTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FM55TF U 1
AF RS1FB86JQ C 480
BS 1 640 RS1FM55TF
BS 641 1107 RS1FB86JQ

RD RS1FM55TF 640 0 0
GATTGAATTCCGAAAGAGATAATAATAAATAAAAACACCTAATAGTCGATGGCGGATTCG
GATGATCTAGAGAGTGGAAGAACCGCCGTAATAGTCGACATTGGAGTTGAAGGCGGCGGT
GGCGCCGCGGTGGAAGAGAGGGAGAAGCTAGCGGAGTTGGAACGAATATCAGTGTTGGAT
TTCGATCTGCTTTGCTCGACGGTGGCGCTTCAGAATCAGGGGAAGTGGAGGAAACTCGAG
AGCTCCGACGGCCAAGATAAAGAATATGGCGGCGGCGTTTTACGGCTTTGGGAAAGTGAT
GTTATGGACTGCCTCGAGGCGGTTTTTCTATAATAGTTTTATTTTATCTTTTGTCTTTTA
GCTCTCCGTGCTACAGATCCGGGAAGAACATAACAAGGACCGGCTTTTGGTTCTTGCTTT
CTTCAAGGAGTCAGGGTGCCGTTCATATGATTCTTATCATCGGTCTCCTATTCGACGTTG
CAGCTTTTGCTGTAACTAAAAAGGCATTGCTTTCTCTACCTGGCTGGTGCTTTCGTCGTT
TTGATTGCGTCATACTTGGTGTTCTTTCATATGCAGATAAGAAAGAAGTTTGACATTAGA
GTAAGCCTCCTTCTTCCCCGTGAGTGTGTTTTCCACAAGT

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1FB86JQ 628 0 0
GCAGCTTTTGCTGTAACTAAAAAGGCATTGCTTTCTCTACCTGGCTGGTGCTTTCGTCGT
TTTGATTGCGTCATACTTGGTGTTCTTTCATATGCAGATAAGAAGGAAGTTTGACATTAG
AGTAAGCCTCCTTCTTCCCCGTGAGTGTGTTTTCCACAAGTGACGGCGGCGATGCCGGGG
ATCAAGAGGTGTGAGCAGGTGATAGACAAGCAGAAGGCTTGAGTGATGATGTTGATGCGA
GGTAAGTTCCATTGGCGAACAGACTACTTACGGTGAAGAAGCCTGTTCCAAACAACTTAA
AAATGATGAGTAACTACATTTCTTGCAGAGGCGGTAGTAGTAGTAGTAGAACAACGCCGA
TTACTCAAAAAGCTTCATTTACTCCGAATCCTAGTGGAGGAGGAAGTCTGATTAAAAACT
TCATTCAACCGACTACGATCGGTTAATAACACAATCTGAAGCTCGTACATTGGCAGTTTG
TATGGATTATGGTTTCTCTTTTGTATTCTTTCTTTCATAAAGAACAATAACTATACATAA
AGTTATTATATATACTATAGGAATTGGACAAAACGGTAAATCCAATTGCCTAGGAAAAAC
ATCAAACCTAATAAAAAAGATTTTCTCC

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 3

CO CL3724Contig1 532 3 3 U
CATTAATCACACATTACGTTTACGTTTAGAGGCAAAGAACTCAAACGGATGTTCGTCATA
TATATTGTGCAGAAACTATTGGAGAGATAATGATACTGCTCTTTTCATAATTAAACACTT
GTACCGCGAGTTACCAGACGAACCAAACTCACCCACTGAGTCCACCGATGTAGACAATAC
TCCAAAAGACTCAAGTACACATCATAGCTGGATAGACAGAAGTGAGACTGATGATGCT*A
TGAAGAGCTTCCTTTAACATTCTCCAACAGAGAAAGCTTCTATGAAGAAGCCAAGAAATA
CGTGAAGAAACCTTAAAACACGATGACCATAGACTGATTTTGTTTTTGTTTACATTGCAG
AATGTAACATATAGTGTGTAGATAATGTGTAAAAAGAAAAACTCAGGCTCCATGGTTTTA
ACTTATTGTAATCATAATCTCACGACATAATAAAGAAACAGTTGAAAGGCTCCTTTAGGC
TTATTTTTCGACCTTAGGTGAGCTTTTGTCAGGTCTGGAGTTGGAGATGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G623JQ C 108
AF RS1G623TF U 108
AF RS1GA05JQ U 1
BS 1 238 RS1GA05JQ
BS 239 239 RS1G623TF
BS 240 532 RS1GA05JQ

RD RS1G623JQ 364 0 0
G
AATTAAACACTTGTACCGCGAGTTACCAGACGAACCAAACTCACCCACTGAGTCCACCGA
TGTAGACAATACTCCAAAAGACTCAAGTACACATCATAGCTGGATAGACAGAAGTGAGAC
TGATGATGCT*ATGAAGAGCTTCCTTTAACATTCTCCAACAGAGAAAGCTTCTATGAAGA
AGCCAAGAAATACGTGAAGAAACCTTAAAACACGATGACCATAGACTGATTTTGTTTTTG
TTTACATTGCAGAATGTAACATATAGTGTGTAGATAATGTGTAAAAAGAAAAACTCAGGC
TCCATGGTTTTAACTTATTGTAATCATAATCTCACGACATAATAAAGAAACAGTTGAAAG
GC
C

QA 2 363 2 363
DS 

RD RS1G623TF 364 0 0
G
AATTAAACACTTGTACCGCGAGTTACCAGACGAACCAAACTCACCCACTGAGTCCACCGA
TGTAGACAATACTCCAAAAGACTCAAGTACACATCATAGCTGGATAGACAGAAGTGAGAC
TGATGATGCT*ATGAAGAGCTTCCTTTAACATTCTCCAACAGAGAAAGCTTCTATGAAGA
AGCCAAGAAATACGTGAAGAAACCTTAAAACACGATGACCATAGACTGATTTTGTTTTTG
TTTACATTGCAGAATGTAACATATAGTGTGTAGATAATGTGTAAAAAGAAAAACTCAGGC
TCCATGGTTTTAACTTATTGTAATCATAATCTCACGACATAATAAAGAAACAGTTGAAAG
GC
C

QA 2 363 2 363
DS 

RD RS1GA05JQ 532 0 0
CATTAATCACACATTACGTTTACGTTTAGAGGCAAAGAACTCAAACGGATGTTCGTCATA
TATATTGTGCAGAAACTATTGGAGAGATAATGATACTGCTCTTTTCATAATTAAACACTT
GTACCGCGAGTTACCAGACGAACCAAACTCACCCACTGAGTCCACCGATGTAGACAATAC
TCCAAAAGACTCAAGTACACATCATAGCTGGATAGACAGAAGTGAGACTGATGATGCTGA
TGAAGAGCTTCCTTTAACATTCTCCAACAGAGAAAGCTTCTATGAAGAAGCCAAGAAATA
CGTGAAGAAACCTTAAAACACGATGACCATAGACTGATTTTGTTTTTGTTTACATTGCAG
AATGTAACATATAGTGTGTAGATAATGTGTAAAAAGAAAAACTCAGGCTCCATGGTTTTA
ACTTATTGTAATCATAATCTCACGACATAATAAAGAAACAGTTGAAAGGCTCCTTTAGGC
TTATTTTTCGACCTTAGGTGAGCTTTTGTCAGGTCTGGAGTTGGAGATGCTT

QA 1 532 1 532
DS 



AS 1 3

CO CL3725Contig1 451 3 6 U
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GCCTAAGCAAATCCACGATATTAAGGACTTCCTTTTGACAGCGAGGAGGAAAGATGCTCG
ATCTGTGAAGATCAAGAAAAGCAAAGACATTGTCAAGTTCAAGGTCAGATGCTCAAAGTA
CCTCTACACTTTCTGCGTCTTTGACCAAGAGAAAGCCGACAAGCTTAAGCAGTCCCTTCC
TCCAGGTTTGAGTGTGCAAGACCTTTGAAGATGAAGATGCCTTGGTGATCAATCTTCTGT
GCCATTTTTATTTTTTCCCCTAGAAGAAGTTTCTTTGTGTCCTCGTAGTGAAATTAAACC
TAGAGTTTTCAGTATGCTCCAGTGTGACTGGTTATGAATTGATTCAGTTTTTAATATCAG
ATAAGGTCTCGCTCTTGATTTAATTTTTAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FG54TF U 1
AF RS1AU91JQ C 5
AF RS1AU91TF U 5
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RD RS1FG54TF 441 0 0
GGCTTTATATTTTGACGACCGTGTTCTTGCGGCGTTAGCTTAAACAACAGGTCCGACAAT
GCCTAAGCAAATCCACGATATTAAGGACTTCCTTTTGACAGCGAGGAGGAAAGATGCTCG
ATCTGTGAAGATCAAGAAAAGCAAAGACATTGTCAAGTTCAAGGTCAGATGCTCAAAGTA
CCTCTACACTTTCTGCGTCTTTGACCAAGAGAAAGCCGACAAGCTTAAGCAGTCCCTTCC
TCCAGGTTTGAGTGTGCAAGACCTTTGAAGATGAAGATGCCTTGGTGATCAATCTTCTGT
GCCATTTTTATTTTTTCCCCTAGAAGAAGTTGCTTTGTGTCCTCGTAGTGAAATTAAACC
TAGAGTTTTCAGTATGCTCCAGTGTGACTGGTTATGAATTGATTCAGTTTTTAATATCAG
ATAAGGTCTCGCTCTTGATTT

QA 1 441 1 441
DS 

RD RS1AU91JQ 447 0 0
GG
ATATTTTGACGACCGTGTTCTTGCGGCGTTAGCTTAAACAACAGATCCGACAATGCCTAA
GCAAATCCACGATATTAAGGACTTCCTTTTGACAGCGAGGAGGAAAGATGCTCGATCTGT
GAAGATCAAGAAAAGCAAAGACATTGTCAAGTTCAAGGTCAGATGCTCAAAGTACCTCTA
CACTTTCTGCGTCTTTGACCAAGAGAAAGCCGACAAGCTTAAGCAGTCCCTTCCTCCAGG
TTTGAGTGTGCAAGACCTTTGAAGATGAAGATGCCTTGGTGATCAATCTTCTGTGCCATT
TTTATTTTTTCCCCTAGAAGAAGTTTCTTTGTGTCCTCGTAGTGAAATTAAACCTAGAGT
TTTCAGTATGCTCCAGTGTGACTGGTTATGAATTGATTCAGTTTTTAATATCAGATAAGG
TCTCGCTCTTGATTTAATTTTTAAT

QA 3 447 3 447
DS 

RD RS1AU91TF 447 0 0
GG
ATATTTTGACGACCGTGTTCTTGCGGCGTTAGCTTAAACAACAGATCCGACAATGCCTAA
GCAAATCCACGATATTAAGGACTTCCTTTTGACAGCGAGGAGGAAAGATGCTCGATCTGT
GAAGATCAAGAAAAGCAAAGACATTGTCAAGTTCAAGGTCAGATGCTCAAAGTACCTCTA
CACTTTCTGCGTCTTTGACCAAGAGAAAGCCGACAAGCTTAAGCAGTCCCTTCCTCCAGG
TTTGAGTGTGCAAGACCTTTGAAGATGAAGATGCCTTGGTGATCAATCTTCTGTGCCATT
TTTATTTTTTCCCCTAGAAGAAGTTTCTTTGTGTCCTCGTAGTGAAATTAAACCTAGAGT
TTTCAGTATGCTCCAGTGTGACTGGTTATGAATTGATTCAGTTTTTAATATCAGATAAGG
TCTCGCTCTTGATTTAATTTTTAAT

QA 3 447 3 447
DS 



AS 1 3

CO CL3726Contig1 747 3 2 U
CATTATAAACACAATATTCATATTATAAAGTATAAACAAGTTTATAAAACTTTTTAAACG
AACATTTTTTTCTTGTTCTTAAAGAAATCCGACTTTACAAATAGCGCCAACAAATCTTGG
ACACAGCATACTAAACCATAGTTCCTTCTCCCAACTTACGATAAACCGAACCTCACACCA
TTAACCCTAAACCATGACCCAAAACTACCGATTGATTCTCCGGTTTATTCACTAATCACT
ATATATATCAATGCATACCACACTTCTATGTACACGAATGGCACATAGGTAAGATAGACA
CTATGGCTGGTCTTACCTCACGGAACACTAAAAGGGTATGCTCTCAGGATCGACAAATCC
AGCTAGCAGTGCGCCAAAGAGCCAAAGCATGAGTGCGAACACTATTACTGTCCGCAGCAC
TTGGCTACATACGTTCAGGCTCGGGTCTCCCTCAAAGGCTAAATCAGGTGTCAGGACGTC
GTAACTCCAGCGGCTGGTGTCGTCTAGCTGCTCTGTCTCCCTCGAGCTTCCTATCTTGCT
TCTCGTGTGAGTTTGTGGTTGTGGTGAATCTTGTCCGCTGAGATTTGAGCATCTTTTGCA
GTTGCAGTCGCTGCCAAGGTACGAAGGAAGCGTCTGGAGATATTCGGAGAGGACTCGGTG
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AGTCTGAGAAATGACTCGGACAACAGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BV49JQ U 1
AF RS1CP66JQ U 1
AF RS1C178JQ U 56
BS 1 737 RS1BV49JQ
BS 738 747 RS1C178JQ

RD RS1BV49JQ 742 0 0
CATTATAAACACAATATTCATATTATAAAGTATAAACAAGTTTATAAAACTTTTTAAACG
AACATTTTTTTCTTGTTCTTAAAGAAATCCGACTTTACAAATAGCGCCAACAAATCTTGG
ACACAGCATACTAAACCATAGTTCCTTCTCCCAACTTACGATAAACCGAACCTCACACCA
TTAACCCTAAACCATGACCCAAAACTACCGATTGATTCTCCGGTTTATTCACTAATCACT
ATATATATCAATGCATACCACACTTCTATGTACACGAATGGCACATAGGTAAGATAGACA
CTATGGCTGGTCTTACCTCACGGAACACTAAAAGGGTATGCTCTCAGGATCGACAAATCC
AGCTAGCAGTGCGCCAAAGAGCCAAAGCATGAGTGCGAACACTATTACTGTCCGCAGCAC
TTGGCTACATACGTTCAGGCTCGGGTCTCCCTCAAAGGCTAAATCAGGTGTCAGGACGTC
GTAACTCCAGCGGCTGGTGTCGTCTAGCTGCTCTGTCTCCCTCGAGCTTCCTATCTTGCT
TCTCGTGTGAGTTTGTGGTTGTGGTGAATCTTGTCCGCTGAGATTTGAGCATCTTTTGCA
GTTGCAGTCGCTGCCAAGGTACGAAGGAAGCGTCTGGAGATATTCGGAGAGGACTCGGTG
GAAAGTTTCCCCTTCAATTCTCAGTTTCTTGCGTGTGGTTGGTCTGAGAATTTGTATGAA
AGTCTGAGAAATGACTC
GGACA

QA 1 737 1 737
DS 

RD RS1CP66JQ 737 0 0
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AACATTTTTTTCTTGTTCTTAAAGAAATCCGACTTTACAAATAGCGCCAACAAATCTTGG
ACACAGCATACTAAACCATAGTTCCTTCTCCCAACTTACGATAAACCGAACCTCACACCA
TTAACCCTAAACCATGACCCAAAACTACCGATTGATTCTCCGGTTTATTCACTAATCACT
ATATATATCAATGCATACCACACTTCTATGTACACGAATGGCACATAGGTAAGATAGACA
CTATGGCTGGTCTTACCTCACGGAACACTAAAAGGGTATGCTCTCAGGATCGACAAATCC
AGCTAGCAGTGCGCCAAAGAGCCAAAGCATGAGTGCGAACACTATTACTGTCCGCAGCAC
TTGGCTACATACGTTCAGGCTCGGGTCTCCCTCAAAGGCTAAATCAGGTGTCAGGACGTC
GTAACTCCAGCGGCTGGTGTCGTCTAGCTGCTCTGTCTCCCTCGAGCTTCCTATCTTGCT
TCTCGTGTGAGTTTGTGGTTGTGGTGAATCTTGTCCGCTGAGATTTGAGCATCTTTTGCA
GTTGCAGTCGCTGCCAAGGTACGAAGGAAGCGTCTGGAGATATTCGGAGAGGACTCGGTG
GAAAGTTTCCCCTTCAATTCTCAGTTTCTTGCGTGTGGTTGGTCTGAGAATTTGTATGAA
AGTCTGAGAAATGACTC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RS1C178JQ 692 0 0
AAACGAACATTTTTTTCTTGTTCTTAAAGAAATCCGACTTTACAAATAGCGCCAACAAAT
CTTGGACACAGCATACTAAACCATAGTTCCTTCTCCCAACTTACGATAAACCGAACCTCA
CACCATTAACCCTAAACCATGACCCAAAACTACCGATTGATTCTCCGGTTTATTCACTAA
TCACTATATATATCAATGCATACCACACTTCTATGTACACGAATGGCGCATAGGTAAGAT
AGACACTATGGCTGGTCTTACCTCACGGAACACTAAAAGGGTCTGCTCTCAGGATCGACA
AATCCAGCTAGCAGTGCGCCAAAGAGCCAAAGCATGAGTGCGAACACTATTGCTGTCCGC
AGCACTTGGCTACATACGTTCAGGCTCGGGTCTCCCTCAAAGGCTAAATCAGGTGTCTGG
ACGTCGTAACTCCAGCGGCTGGTGTCGTCTAGCTGCTCTGTCTCCC*CGAGCTTCCTATC
TTGCTTCTCGTGTGAGTTTGTGGTTGTGGTGAATCTTGTCCGCTGAGATTTGAGCATCTT
TTGCAGTTGCAGTCGCTGCCAAGGTACGAAGGAAGCGTCTGGAGATATTCGGAGAGGACT
CGGTGGAAAGTTTCCCCTTCAATTCTCAGTTTCTTGCGTGTGGTTGGTCTGAGAATTTGT
ATGAAAGTCTGAGAAATGACTCGGACAACAGG

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 3

CO CL3727Contig1 674 3 2 U
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TTGAGCTGACCTTGGAGGCACTGGTTGAATAGAAGAGGCAGCTGTGTTTTGGGTTTGAAA
CCTCCAAAAACAGAGGCAGTGATTGATCTGCCTTGGAAGAGCTCCATGGGATGTATAGGG
GGAAGCTGTGGGCTTGCGTGAACGCCAAGCAACACTGTCTTACCCACTCCAGAGTGTGTT
GACAGAAAAGCCTCTCGAAGTGCTTCAATTCTTCCCGCACACTCGAAGCTGTACTCCACT
CCTCCCTCTGTTATCTCCATCACTCTCTCATGAACCGTCTTGTCACATTCCTTTAGGTTT
ATGAACTCACTGATCCCTGCTTCTCTCCCTAATGGGAACTTGTCAGGGTTGATGTCAATC
CCAATTATTTTTGAGGCCCCCCTTGCTTTTGCACCCTCAGCTACCGCAAGCCCAACAGCA
CCCAGCCCAAAGAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GX40JQ U 1
AF RS1GX40TF C 1
AF RS1F136JQ U 81
BS 1 451 RS1GX40JQ
BS 452 674 RS1F136JQ

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AGTTGCATGGCTTTGCTAATATCATTGAAAGGAAGCTGGTGAGAGATGAAGAGGTCTAGA
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GGAAGCTGTGGGCTTGCGTGAACGCCAAGCAACACTGTCTTACCCACTCCAGAGTGTGTT
GACAGAAAAGCCTCTCGAAGTGCTTCAATTC

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DS 

RD RS1GX40TF 451 0 0
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CAAGGTAATACAGTAGGAAAACATAATCAAATCATCATTACGACAACTTGTAACGCACAT
AAATAGGAAATAGATTATCAAAGGCGGATAAGACAACGGAGAGCCTTGCCTTGGTGGAGG
AGTTGCATGGCTTTGCTAATATCATTGAAAGGAAGCTGGTGAGAGATGAAGAGGTCTAGA
TTGAGCTGACCTTGGAGGCACTGGTTGAATAGAAGAGGCAGCTGTGTTTTGGGTTTGAAA
CCTCCAAAAACAGAGGCAGTGATTGATCTGCCTTGGAAGAGCTCCATGGGATGTATAGGG
GGAAGCTGTGGGCTTGCGTGAACGCCAAGCAACACTGTCTTACCCACTCCAGAGTGTGTT
GACAGAAAAGCCTCTCGAAGTGCTTCAATTC

QA 1 451 1 451
DS 

RD RS1F136JQ 594 0 0
C
CATAATCAAATCATCATTACGACAACTTGTAACGCACATAAATAGGAAATAGATTATCAA
AGGCGGATAAAACAACGGAGAGCCTTGCCTTGGTGGAGGAGTTGCATGGCTTTGTTAATA
TCATTGAAAGGAAGCTGGTGAGAGATGAAGAGGTCTAGATTGAGCTGACCTTGGAGGCAC
TGGGTGAATAGAAGAGGCAGCTGTGTTTTGGGTTTGAAACCTCCAAAAACAGAGGCAGTG
ATTGATCTGCCTTGGAAGAGCTCCATGGGATGGATAGGGAGAAGCTGTGGGCTTGCGTGA
ACGCCAAGCAACACTGTCTTCCCCACTCCAGAGTGTGTTGACAAAAAAGCCTCTCGAAGT
GCTTCAATTCTTCCCGCACACTCGAAGCTGTACTCCACTCCTCCCTCTGTTATCTCCATC
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TCTCTCCCTAATGGGAACTTGTCAGGGTTGATGTCAATCCCAATTATTTTTGAGGCCCCC
CTTGCTTTTGCACCCTCAGCTACCGCAAGCCCAACAGCACCCAGCCCAAAGAT

QA 2 594 2 594
DS 



AS 1 3

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GGAAAAACACACATAAAAGAGAGAGACAGAGAATATGAAAGAAGAATGAACAGCGAGGAA
GAGAAGACGGTGTGTGTGACAGGAGCTTCAGGTTACATCGCTTCATGGATCGTAAAGCTT
CTCCTTCTTCGTGGCTACACCGTGAAAGCCTCTGTTCGTGATCCAAATGATCCAAGGAAA
ACAGAGCATTTGCTTGCATTAGAAGGTGCAGAGGAAAGGCTTCAATTGTTCAAAGCAAAC
TTGTTAGAAGAAGGCTCTTTCGATTCAGCCATTGATGGCTGCCAAGGTGTTTTCCACACC
GCCTCACCATTCTATCACGATGTCAAAGATCCTCAGGCTGAGTTACTAGATCCAGCTGTG
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CTGTCCAAGACATTAGCTGAAAACGCAGCGTGGAAGTTCGCCAAAGAGAACGATATGCAG
TTGGTTTCTATAAACGCAGCAATGG*TGATTGGTCCTCTTTTACAACCAACGCTCAATAC
TAGTGCTGCTGCAGTACTGAGTTTGATCAAAG*AGCACAGACGTTTCCTAATGCGACATT
TGGG*TGGGTTAACGTTAAAGATGTAGCAAACGCTCATATTCAAGCGTTTGAGAATCCAG
ATGCTAATGGAAGATACTGTTTAGTGGAGAGAGTTGCTCATTACTCTGAAGTTGTTAACA
TTTTGCATGATCTTTACCCTGATTTTCAACTCCCTGAGAAGTGTTCAGATGAAAAGATAT
TTATTCCAACCTACAAAGTGTCTAAAGAGAAAGCAGAGTTTCTTGGGATTGAGTTTGTGC
CATTAGAGGTTATCATAAAGGAGACTGTTGAGAGTTTGCAAGACAAAGGGTTCATCAGAT
TTTGAGTTTCAAGCCAGAGCCTAAATTGGATGTGTTTGTGTTTCGTTTTTTTTTTTTCTA
TAATTTGGTGGTTGTTTCTTTTCCTTAATTTAGATATGGACTACAATGTTGCCTATTGAC
ATTTTGAAAGTTTGTTTTCTTGGCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EB69TF U 1
AF RS1EY73TF U 9
AF RS1EY73JQ C 465
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BS 726 765 RS1EB69TF
BS 766 1167 RS1EY73JQ

RD RS1EB69TF 765 0 0
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GAGAAGACGGTGTGTGTGACAGGAGCTTCAGGTTACATCGCTTCATGGATCGTAAAGCTT
CTCCTTCTTCGTGGCTACACCGTGAAAGCCTCTGTTCGTGATCCAAATGATCCAAGGAAA
ACAGAGCATTTGCTTGCATTAGAAGGTGCAGAGGAAAGGCTTCAATTGTTCAAAGCAAAC
TTGTTAGAAGAAGGCTCTTTCGATTCAGCCATTGATGGCTGCCAAGGTGTTTTCCACACC
GCCTCACCATTCTATCACGATGTCAAAGATCCTCAGGCTGAGTTACTAGATCCAGCTGTG
AAAGGAACAATCAATGTTCTAATCACTTGCTTGAAGACTCCCTCTGTTAAGAGAGTCGTC
TTAACCTCATCTATAGCAGCTGTGGCTTTCAATGGCATGCCTCGAACACCCGATACCATA
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CTGTCCAAGACATTAGCTGAAAACGCAGCGTGGAAGTTCGCCAAAGAGAACGATATGCAG
TTGGTTTCTATAAACGCAGCAATGGGTGATTGGTCCTCTTTTACAACCAACGCTCAGTAC
TAGTGCTGCTGCAGTACTGAGTTTGATCAAAG*AGCACAGACGTTTCCTA*TGCGACATT
TGGGGTGGGTTAACGTTAAAGATGTAGCAAACGCTCATATTCAAG

QA 1 765 1 765
DS 

RD RS1EY73TF 727 0 0
GG
ACATAAAAGAGAGAGACAGAGAATATGAAAGAAGAATGAACAGCGAGGAAGAGAAGACGG
TGTGTGTGACAGGAGCTTCAGGTTACATCGCTTCATGGATCGTAA*GCTTCTCCTTCTTC
GTGGCTACACCGTGAAAGCCTCTGTTCGTGATCCAAATGATCCAAGGAAAACAGAGCATT
TGCTTGCATTAGAAGGTGCAGAGGAAAGGCTTCAATTGTTCAAAGCAAACTTGTTAGAAG
AAGGCTCTTTCGATTCAGCCATTGATGGCTGCCAAGGTGTTTTCCACACCGCCTCACCAT
TCTATCACGATGTCAAAGATCCTCAGGCTGAGTTACTAGATCCAGCTGTGAAAGGAACAA
TCAATGTTCTAATCACTTGCTTGAAGACTCCCTCTGTTAAGAGAGTCGTCTTAACCTCAT
CTATAGCAGCTGTGGCTTTCAATGGCATGCCTCGAACACCCGATACCATAGTTGATGAGT
CATGGTTCACTGATCCTGAATATTGCAGAGCTGCCAAGCTATGGTATGTACTGTCCAAGA
CATTAGCTGAAAACGCAGCGTGGAAGTTCGCCAAAGAGAACGATATGCAGTTGGTTTCTA
TAAACGCAGCAATGG*TGATTGGTCCTCTTTTACAACCAACGCTCAATACTAGTGCTGCT
GCAGTACTGAGTTTGATCAAAG*AGCACAGACGTTTCCTAATGCGACATTTGGG*TGGGT
TAACG

QA 3 727 3 727
DS 

RD RS1EY73JQ 703 0 0
AACACCCGATACCATAGTTGATGAGTCATGGTTCACTGATCCTGAATATTGCAGAGCTGC
CAAGCTATGGTATGTACTGTCCAAGACATTAGCTGAAAACGCAGCGTGGAAGTTCGCCAA
AGAGAACGATATGCAGTTGGTTTCTATAAACGCAGCAATGG*TGATTGGTCCTCTTTTAC
AACCAACGCTCAATACTAGTGCTGCTGCAGTACTGAGTTTGATCAAAGGAGCACAGACGT
TTCCTAATGCGACATTTGGG*TGGGTTAACGTTAAAGATGTAGCAAACGCTCATATTCAA
GCGTTTGAGAATCCAGATGCTAATGGAAGATACTGTTTAGTGGAGAGAGTTGCTCATTAC
TCTGAAGTTGTTAACATTTTGCATGATCTTTACCCTGATTTTCAACTCCCTGAGAAGTGT
TCAGATGAAAAGATATTTATTCCAACCTACAAAGTGTCTAAAGAGAAAGCAGAGTTTCTT
GGGATTGAGTTTGTGCCATTAGAGGTTATCATAAAGGAGACTGTTGAGAGTTTGCAAGAC
AAAGGGTTCATCAGATTTTGAGTTTCAAGCCAGAGCCTAAATTGGATGTGTTTGTGTTTC
GTTTTTTTTTTTTCTATAATTTGGTGGTTGTTTCTTTTCCTTAATTTAGATATGGACTAC
AATGTTGCCTATTGACATTTTGAAAGTTTGTTTTCTTGGCACC

QA 1 703 1 703
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL3730Contig1 1005 2 2 U
GAGCTCATAGCTAAACTGAGGCACCGTCATTTGGTTAGTGTGCTAGGGCACTGCTTTGAG
TGCTACTTAGATGATTCGACAGTCAGCAGAATGTTCTTCGTCTTTGAGTATGTCCCAAAT
GGAGAACTCAGGAGCTGGATCTCAGGTGGGCATATGGGAAGATTGCTTACTTGGGAACAG
CGCATAAGCATAGCCATAGGTGTAGCAAAAGGGATCCAGTTCTTGCATGCTGGTATTGTG
CCTGGTGTTTATGATAACAACCTGAGAATAACAGACGTTTTGCTTGATAATAACCTCGCT
GCAAAAATCAGTAGCTATAACCTTCCATTACTTATGGAAGGTCTGGGAAAGGTGGGGCAA
GTAGTATCTCGAACCTGTCCCAAAGGCACTCCAAGCATCAAAGAAGATGATAAAATAGAT
ATCTATGACTTTGGAGTGATCTTGCTTGAGCTAATAGTGGGAAGACCTTTGAGAGCAAAG
GGTCAAGTCGATGTTCTAAAAGAGCAGTTACATGCAAGCATCTCAGCGGATGATGGAGCG
CGTAGGAGCATGGTGGATCCAACGGTCCATAAAACTTGTTCAGACCAATCACTAAAGACA
ATGATGGAAATATGTGTAAGGTGTCTCATCAAAGACCCTTTAGAGCGGCCTTCCATTGAA
GATGTCCTGTGGAATCTTCAGTTTGCTTCTCAAGTCCAAGAAGGTTGGCTACAAAACAGC
AATCCTCCGAGCATTCGCGGCTCGCCTTCTCCTGCAGCTTCCTCTCTTCCTCCTCCCTCT
CGTTTGCACATAACAACAATCGAATCTCCCCGAGATTCAGGATATGAAGAACACGAGAGA
TAGGGATACAAGAGTTTTGGTTTGGTTAATTAGTTGTGTGCTCTTTCTATGTAGAGGAAC
CTAACAATAAACTGGTTATCTCATTAAAAAAATAAACTACCAACTCTACATATATCTTGG
TATACCGTATACTGTTGATTACTATATATATTATTCTCTTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DO81TF U 1
AF RS1DO81JQ C 246
BS 1 698 RS1DO81TF
BS 699 1005 RS1DO81JQ

RD RS1DO81TF 698 0 0
GAGCTCATAGCTAAACTGAGGCACCGTCATTTGGTTAGTGTGCTAGGGCACTGCTTTGAG
TGCTACTTAGATGATTCGACAGTCAGCAGAATGTTCTTCGTCTTTGAGTATGTCCCAAAT
GGAGAACTCAGGAGCTGGATCTCAGGTGGGCATATGGGAAGATTGCTTACTTGGGAACAG
CGCATAAGCATAGCCATAGGTGTAGCAAAAGGGATCCAGTTCTTGCATGCTGGTATTGTG
CCTGGTGTTTATGATAACAACCTGAGAATAACAGACGTTTTGCTTGATAATAACCTCGCT
GCAAAAATCAGTAGCTATAACCTTCCATTACTTATGGAAGGTCTGGGAAAGGTGGGGCAA
GTAGTATCTCGAACCTGTCCCAAAGGCACTCCAAGCATCAAAGAAGATGATAAAATAGAT
ATCTATGACTTTGGAGTGATCTTGCTTGAGCTAATAGTGGGAAGACCTTTGAGAGCAAAG
GGTCAAGTCGATGTTCTAAAAGAGCAGTTACATGCAAGCATCTCAGCGGATGATGGAGCG
CGTAGGAGCATGGTGGATCCAACGGTCCATAAAACTTGTTCAGACCAATCACTAAAGACA
ATGATGGAAATATGTGTAAGGTGTCTCATCAAAGACCCTTTAGAGCGGCCTTCCATTGAA
GATGTCCTGTGGAATCTTCAGTTTGCTTCTCAAGTCCA

QA 1 698 1 698
DS 

RD RS1DO81JQ 760 0 0
TGTTTATGATAACAACCTGAGAATAACAGACGTTTTGCTTGATAATAACCTCGCTGCAAA
AATCAGTAGCTATAACCTTCCATTACTTATGGAAGGTCTGGGAAAGGTGGGGCAAGTAGT
ATCTCGAACCTGTCCCAAAGGCACTCCAAGCATCAAAGAAGATGATAAAATAGATATCTA
TGACTTTGGAGTGATCTTGCTTGAGCTAATAGTGGGAAGACCTTTGAGAGCAAAGGGTCA
AGTCGATGTTCTAAAAGAGCAGTTACATGCAAGCATCTCAGCGGATGATGGAGCGCGTAG
GAGCATGGTGGATCCAACGGTCCATAAAACTTGTTCAGACCAATCACTAAAGACAATGAT
GGAAATATGTGTAAGGTGTCTCATCAAAGACCCTTTAGAGCGGCCTTCCATTGAAGATGT
CCTGTGGAATCTTCAGTTTGCTTCTCAAGTCCAAGAAGGTTGGCTACAAAACAGCAATCC
TCCGAGCATTCGCGGCTCGCCTTCTCCTGCAGCTTCCTCTCTTCCTCCTCCCTCTCGTTT
GCACATAACAACAATCGAATCTCCCCGAGATTCAGGATATGAAGAACACGAGAGATAGGG
ATACAAGAGTTTTGGTTTGGTTAATTAGTTGTGTGCTCTTTCTATGTAGAGGAACCTAAC
AATAAACTGGTTATCTCATTAAAAAAATAAACTACCAACTCTACATATATCTTGGTATAC
CGTATACTGTTGATTACTATATATATTATTCTCTTTTTCC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 3

CO CL3731Contig1 707 3 14 U
GGAAGGCGAAAAAGGAAGGATGGGCTCCATTGAAGAAGAATCACCTCTCATCGAAGAAGG
TTTAATCTCACAGGAACCAAAACTGTATGCTCAAGATGGTTCAGTGGACCTTCATGGAAA
CCCACCACTCAAGGAGAAAACAGGCAACTGGAAAGCTTGTCCTTTCATCTTAGGCAATGA
ATGCTGCGAGAGGCTAGCTTACTATGGTATTGCTGGGAATCTAATCACTTACCTCACCAC
TAAACTCCACCAAGGAAACGTTTCCGCTGCTACAAACGTCACCACATGGCAAGGCACTTG
TTATCTCACCCCTCTCATTGGTGCTGTCTTAGCCGATGCTTACTGGGGCAGATACTGGAC
CATCGCTTGTTTCTCCGGCATTTACTTCATCGGGATGTCTGCGCTAACTCTCTCAGCGTC
AGTT*CCAGCACTGAAGCCAGCGGAATGCATT*GGTGATTT*CTGTCCATCAGCAACACC
AGCTCAGTACGCAATGTTCTTT*GGCGGGCTTTACCTGATCGCCCTCGGCACTGGAGGCA
TCAAACCATGCGTCTCATCCTTCGGTGCAGACCAGTTCGATGACACTGACTCTCGCGAAC
GAGTGAAAAAAGCTTCCTTCTTCAACTGGTTCTACTTCTCCATCAACATCGGAGCACTAG
TCTCTTCTAGTCTTCTTGTCTGGATCCAAGAGAACCGCGGCTGGGGT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D312TF U 1
AF RS1AE78TF U 1
AF RS1GL36TF U 1
BS 1 157 RS1AE78TF
BS 158 159 RS1D312TF
BS 160 190 RS1AE78TF
BS 191 191 RS1D312TF
BS 192 424 RS1AE78TF
BS 425 425 RS1D312TF
BS 426 452 RS1AE78TF
BS 453 453 RS1D312TF
BS 454 461 RS1AE78TF
BS 462 462 RS1D312TF
BS 463 502 RS1AE78TF
BS 503 503 RS1D312TF
BS 504 676 RS1AE78TF
BS 677 707 RS1GL36TF

RD RS1D312TF 597 0 0
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TTATCTCACCCCTCTCATTGGTGCTGTCTTAGCCGATGCTTACTGGGGCAGATACTGGAC
CATCGCTTGTTTCTCCGGCTTTTACTTCATCGGGATGTCTGCGCTAACTCTCTCAGCGTC
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TCAAACCATGCGTCTCATCCTTCGGTGCAGACCAGTTCGATGACACTGACTCTCGCG

QA 1 597 1 597
DS 

RD RS1AE78TF 676 0 0
GGAAGGCGAAAAAGGAAGGATGGGCTCCATTGAAGAAGAATCACCTCTCATCGAAGAAGG
TTTAATCTCACAGGAACCAAAACTGTATGCTCAAGATGGTTCAGTGGACCTTCATGGAAA
CCCACCACTCAAGGAGAAAACAGGCAACTGGAAAGCT**TCCTTTCATCTTAGGCAATGA
ATGCTGCGAGGGGCTAGCTTACTATGGTATTGCTGGGAATCTAATCACTTACCTCACCAC
TAAACTCCACCAAGGAAACGTTTCCGCTGCTACAAACGTCACCACATGGCAAGGCACTTG
TTATCTCACCCCTCTCATTGGTGCTGTCTTAGCCGATGCTTACTGGGGCAGATACTGGAC
CATCGCTTGTTTCTCCGGCATTTACTTCATCGGGATGTCTGCGCTAACTCTCTCAGCGTC
AGTTTCCAGCACTGAAGCCAGCGGAATGCATTTGGTGATTTTCTGTCCATCAGCAACACC
AGCTCAGTACGCAATGTTCTTTTGGCGGGCTTTACCTGATCGCCCTCGGCACTGGAGGCA
TCAAACCATGCGTCTCATCCTTCGGTGCAGACCAGTTCGATGACACTGACTCTCGCGAAC
GAGTGAAAAAAGCTTCCTTCTTCAACTGGTTCTACTTCTCCATCAACATCGGAGCACTAG
TCTCTTCTAGTCTTCT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1GL36TF 707 0 0
GGAAGGCGAAAAAGGAAGGATGGGCTCCATTGAAGAAGAATCACCTCTCATCGAAGAAGG
TTTAATCTCACAGGAACCAAAACTGTATGCTCAAGATGGTTCAGTGGACCTTCATGGAAA
CCCACCACTCAAGGAGAAAACAGGCAACTGGAAAGCTTGTCCTTTCATCTTAGGCAATGA
ATGCTGCGAGAGGCTAGCTTACTATGGTATTGCTGGGAATCTAATCACTTACCTCACCAC
TAAACTCCACCAAGGAAACGTTTCCGCTGCTACAAACGTCACCACATGGCAAGGCACTTG
TTATCTCACCCCTCTCATTGGTGCTGTCTTAGCCGATGCTTACTGGGGCAGATACTGGAC
CATCGCTTGTTTCTCCGGCATTTACTTCATCGGGATGTCTGCGCTAACTCTCTCAGCGTC
AGTT*CCAGCACTGAAGCCAGCGGAATGCATT*GGTGATTT*CTGTCCATCAGCAACACC
AGCTCAGTACGCAATGTTCTTT*GGCGGGCTTTACCTGATCGCCCTCGGCACTGGAGGCA
TCAAACCATGCGTCTCATCCTTCGGTGCAGACCAGTTCGATGACACTGACTCTCGCGAAC
GAGTGAAAAAAGCTTCCTTCTTCAACTGGTTCTACTTCTCCATCAACATCGGAGCACTAG
TCTCTTCTAGTCTTCTTGTCTGGATCCAAGAGAACCGCGGCTGGGGT

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 3

CO CL3732Contig1 572 3 5 U
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TCTTATAATTTTGTTCCTTACAAAGACACTTACACAAACCTTTATATGTTTGGACTATGA
TAAGATAAAAGGAAAATAAAAAAAGTCAATATCTAAATGTTAAAAACAGCCTTCGCTTTA
AGAAAGCTCAAAAACAAGAAGCTGAGATTCCAAACTAGGAACATCATTAATCACCAGACA
TCTCTGAGGTATCTTCCTTCAGTTTGAAGTTTCTTAACTATAGCCTCTGCCTCTGACGAA
CTCGCACCTTCCTGCTCCTGAACAATGGTGTGTAGAGTCCTGTGGACATCTCTCGCCATG
CCCTTAGCATCACCACATACATAGAGATAACCTTTTTCCTTTATTAGGTTCCACACTTGC
GCAGCCTTCTCTATCATCTTATGTTGAACATACTCCTTCTGTGCTCCCTCACGAGAGAAT
GCCACGATGAGCTCAGAGATCACCCCTTGATCAACAAAACTATTGAGTTCATCCTCGTAA
ATAAAGTCCATCCGTCTGTTTCTACACCCAAA


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FY06JQ U 1
AF RS1AH04TF C 3
AF RS1AH04JQ U 3
BS 1 215 RS1FY06JQ
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RD RS1FY06JQ 572 0 0
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TCTTATAATTTTGTTCCTTACAAAGACACTTACACAAACCTTTATATGTTTGGACTATGA
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TCTCTGAGGTATCTTCCTTCAGTTTGAAGTTTCTTAACTATAGCCTCTGCCTCTGACGAA
CTCGCACCTTCCTGCTCTTGAACAATGGTGTGTAGAGTCCTGTGGACATCTCTCGCCATG
CCCTTAGCATCACCACATACATAGAGATAACCTTTTTCCTTTATTAGGTTCCACACTTGC
GCAGCCTTCTCTATCATCTTATGTTGAACATACTCCTTCTGTGCTCCCTCACGAGAGAAT
GCCACGATGAGCTCAGAGATCACCCCTTGATCAACAAAACTATTGAGTTCATCCTCGTAA
ATAAAGTCCATCCGTCTGTTTCTACACCCAAA

QA 1 572 1 572
DS 

RD RS1AH04TF 541 0 0
AG
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TGAGGTATCTTCCTTCAGTTTGAAGTTTCTTAACTATAGCCTCTGCCTCTGACGAACTCG
CACCTTCCTGCTCCTGAACAATGGTGTGTAGAGTCCTGTGGACATCTCTCGCCATGCCCT
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CCTTCTCTATCATCTTATGTTGAACATACTCCTTCTGTGCTCCCTCACGAGAGAATGCCA
CGATGAGCTCAGAGATCACCCCTTGATCAACAAAACTATTGAGTTCATCCTCGTAAAT
A

QA 3 540 3 540
DS 

RD RS1AH04JQ 540 0 0
AG
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ATAATTTTGTTCCTTACAAAGACACTTACACAAACCTTTATATGTTTGGACTATGATAAG
ATAAAAGGAAAATAAAAAAAGTCAATATCTAAATGTTAAAAACAGCCTTCGCTTTAAGAA
AGCTCAAAAACAAGAAGCTGAGATTCCAAACTAGGAACATCATTAATCACCAGACATCTC
TGAGGTATCTTCCTTCAGTTTGAAGTTTCTTAACTATAGCCTCTGCCTCTGACGAACTCG
CACCTTCCTGCTCCTGAACAATGGTGTGTAGAGTCCTGTGGACATCTCTCGCCATGCCCT
TAGCATCACCACATACATAGAGATAACCTTTTTCCTTTATTAGGTTCCACACTTGCGCAG
CCTTCTCTATCATCTTATGTTGAACATACTCCTTCTGTGCTCCCTCACGAGAGAATGCCA
CGATGAGCTCAGAGATCACCCCTTGATCAACAAAACTATTGAGTTCATCCTCGTAAAT

QA 3 540 3 540
DS 



AS 1 2

CO CL3733Contig1 283 2 2 U
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ACAACTCCTGAAACAAGCTTTTAAATAAAGCCTTACATTTGCG


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AV74JQ C 1
AF RS1AV74TF U 1
BS 1 2 RS1AV74JQ
BS 3 283 RS1AV74TF

RD RS1AV74JQ 283 0 0
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TCATCACCAAGCTCACCGCTGGATTCACTGAGGAAGACGCCAAGAACTCAAAGTTCGTCC
AACAACACAGGCGGTGATCACTTGTGTTTATGAAAACTATTCCGCCAGCGCTTCTGCTTT
CAAACCTATTCCAATAACATCAGAAGAGAGACTCTTCTCTTTTCCTTTCATATTTTTTTC
ACAACTCCTGAAACAAGCTTTTAAATAAAGCCTTACATTTGCG

QA 1 283 1 283
DS 

RD RS1AV74TF 283 0 0
GG
AAGAGGGAATGGAAACGTTGCTGGCCGTTTCTCACCGGTTTCGCCGTAACCGGCGTCCTC
ATCACCAAGCTCACCGCTGGATTCACTGAGGAAGACGCCAAGAACTCAAAGTTCGTCCAA
CAACACAGGCGGTGATCACTTGTGTTTATGAAAACTATTCCGCCAGCGCTTCTGCTTTCA
AACCTATTCCAATAACATCAGAAGAGAGACTCTTCTCTTTTCCTTTCATATTTTTTTCAC
AACTCCTGAAACAAGCTTTTAAATAAAGCCTTACATTTGCG

QA 3 283 3 283
DS 



AS 1 3

CO CL3734Contig1 941 3 7 U
TTTTCCAAGCTGAATAGAGTTATCTACCTACTGCCCGTGAATTTTGAACTACTTGTGCTC
CTTCCAAAAGCCCCATTTATTTGCATTTTCAAACTAAGCGTAGTTGTGCCATCCACGCTG
AGTTTGTGGGGGAATATTGAAGACAAGCCCAAAACAAGTCATGAAGTCCATTATAAGCCC
ATGTGTTTGGGGTTCTCTTTGCAAGTAGTGTCATATAAATATTGTTTTTTGGTGTTTAGA
GTTGTAATCTTGGCTGCTGAGAAAGCAGCCTCCTTACCATTTTATATGTTATCGATCTTT
ATATTTTAGCTCTTGCAGACAAACTTCCAAGCTTCTTCCTTTCTATTTTCTGCACTTAAA
TAAAGCTTTAATAAGCTATTTATATTTCAATAAATCTCTGTTTTATATTTATCTTCATGG
TATCAGAGCATCAGGGATTAGATCCTGAGGCTCATATTATTCTCCTCTAGTTTTCATATA
AAAAAAAAAAAAAAAAAATCTTGTTCGAGCAACTTACTACCTAGAGTAATCAACACAGTC
CAAGCCCTAACCAGAGACGACTGGATCTACTGCTGCAGTTACTCAGCCTGAGAGAGCCAC
AACGAAGCTTTCTCTGAAGCAAGCAGATGATGCCTCAAGATAAAGCTGAAGACTTCAACG
CTCCTTACTGGGCCAGACAAAGCCCGTTATCGGCCTAGGTGCAGGTCTGGAGCAAAAGAG
AAGAACGCTCCTGCCGTGTCTTCATCAGCATAAATCTTCTGGTATTTTATAAATGGTTTA
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TATGGCTACAAGTTCCTGGTTTAATGGAATGATGAAGAGAATAGCTGGTTTTAGAATGCA
AAGTTTTGGTAGCATATGGATTGGGAATAGAGAGTTGAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1GW76JQ C 1
AF RS1FA55TF U 244
AF RS1GW76TF U 313
BS 1 245 RS1GW76JQ
BS 246 494 RS1FA55TF
BS 495 498 RS1GW76TF
BS 499 603 RS1FA55TF
BS 604 604 RS1GW76TF
BS 605 813 RS1FA55TF
BS 814 941 RS1GW76TF

RD RS1GW76JQ 302 0 0
TTTTCCAAGCTGAATAGAGTTATCTACCTACTGCCCGTGAATTTTGAACTACTTGTGCTC
CTTCCAAAAGCCCCATTTATTTGCATTTTCAAACTAAGCGTAGTTGTGCCATCCACGCTG
AGTTTGTGGGGGAATATTGAAGACAAGCCCAAAACAAGTCATGAAGTCCATTATAAGCCC
ATGTGTTTGGGGTTCTCTTTGCAAGTAGTGTCATATAAATATTGTTTTTTGGTGTTTAGA
GTTGTAATCTTGGCTGCTGAGAAAGCAGCCTCCTTACCATTTTATATGTTATCGATCTTT
A
C

QA 1 301 1 301
DS 

RD RS1FA55TF 570 0 0
GG
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TTAGCTCTTGCAGACAAACTTCCAAGCTTCTTCCTTTCTATTTTCTGCACTTAAATAAAG
CTTTAATAAGCTATTTATATTTCAATAAATCTCTGTTTTATATTTATCTTCATGGTATCA
GAGCATCAGGGATTAGATCCTGAGGCTCATATTATTCTCCTCTAGTTTTCATATAAAAAA
AAAAAAAAA****TCTTGTTCGAGCAACTTACTACCTAGAGTAATCAACACAGTCCAAGC
CCTAACCAGAGACGACTGGATCTACTGCTGCAGTTACTCAGCCTGAGAGAGCCACAACTA
AGCTTTCTCTGAAGCAAGCAGATGATGCCTCAAGATAAAGCTGAAGACTTCAACGCTCCT
TACTGGGCCAGACAAAGCCCGTTATCGGCCTAGGTGCAGGTCTGGAGCAAAAGAGAAGAA
CGCTCCTGCCGTGTCTTCATCAGCATAAATCTTCTGGTATTTTATAAATGGTTTAGGGCT
ATAGGCTTCCATTCTGGGAAGATAACGA

QA 3 570 3 570
DS 

RD RS1GW76TF 629 0 0
GG
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GCTATTTATATTTCAATAAATCTCTGTTTTATATTTATCTTCATGGTATCAGAGCATCAG
GGATTAGATCCTGAGGTTCATATTATTCTCCTCTAGTTTTCATATAAAAAAAAAAAAAAA
AAAATCTTGTTCGAGCTACTTACTACCTAGAGTAATCAACACAGTCCAAGCCCTAACCAG
AGACGACTGGATCTACTGCTGTAGTTACTCAGCCTGAGAGAGCCACAACGAAGCTTTCTC
TGAAGCAAGCAGATGATGCCTCAAGATAAAGCTGAAGACTTCAACGCTCCTTACTGGGCC
AGACAAAGCCCGTTATCGGCCTAGGTGCAGGTCTGGAGCAAAAGAGAAGAACGCTCCTGC
CGTGTCTTCATCAGCATAAATCTTCTGGTATTTTATAAATGGTTTAGGGCTATAGGCTTC
CATTCTGGGAAGATAACGATTAGGCTGGATTGGGTTTGCTAGGATGTATGGCTACAAGTT
CCTGGTTTAATGGAATGATGAAGAGAATAGCTGGTTTTAGAATGCAAAGTTTTGGTAGCA
TATGGATTGGGAATAGAGAGTTGAGAT

QA 3 629 3 629
DS 



AS 1 2

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AAGTTCAGTGAGCAAAGAAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTAAAGGCCACAAGTGAG
ATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATTGAGGTTAACACAAAGCTTGCCGATTCACCT
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TGATCAAGAGAAATTTGATTT


BQ
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AF RS1AZ38JQ C 1
AF RS1AZ38TF U 1
BS 1 650 RS1AZ38TF
BS 651 651 RS1AZ38JQ
BS 652 681 RS1AZ38TF

RD RS1AZ38JQ 681 0 0
GGGAGCTCTCTTTCTTTACCATTTTCTCACATTACTTTGAGAAAACAAGAAAGACATGGC
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ATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTGTTGGAAGGACT
CAAGTATGCAAACTCACATGAGTGGGTCAAACATGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCAT
CAGTGACCATGCCCAGGACCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCAGAAGAGAA
AAGTTCAGTGAGCAAAGAAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTAAAGGCCACAAGTGAG
ATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATTGAGGTTAACACAAAGCTTGCCGATTCACCT
GGTTTGATCAACTCAAGCCCTTATGAAGAAGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAAC
CCGGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAAAGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGATGAA
GACGCTGCTCACTAGAGGAATTCAGAGCAACACAAGAAAGATCATGCCTAAAGTTTCCGT
CTGTTTCACTTGTCGATGTTTCTTTACATCTATCTCAGCTTGTATCAGGGGTGATACTAA
TGATCAAGAGAAATTTGATTT

QA 1 681 1 681
DS 

RD RS1AZ38TF 681 0 0
GGGAGCTCTCTTTCTTTACCATTTTCTCACATTACTTTGAGAAAACAAGAAAGACATGGC
ACTGAGAATGTGGGCTTCTTCCACAGCAAACGCTCTCAGGCTCTCCTCTTCTGCATCCAA
ATCTCATCTCCTTCCAGCTTTCTCCATCTCCAGATGCTTCTCCTCAGTGTTGGAAGGACT
CAAGTATGCAAACTCACATGAGTGGGTCAAACATGAAGGCTCAGTGGCTACTATTGGCAT
CAGTGACCATGCCCAGGACCATTTAGGAGAAGTTGTGTTTGTGGAGCTGCCAGAAGAGAA
AAGTTCAGTGAGCAAAGAAAAAACTTTGGAGCAGTGGAGAGTGTAAAGGCCACAAGTGAG
ATTATATCTCCAATCTCTGGTGAAGTCATTGAGGTTAACACAAAGCTTGCCGATTCACCT
GGTTTGATCAACTCAAGCCCTTATGAAGAAGGTTGGATGATAAAGGTGAAACCAAGCAAC
CCGGCAGAGTTGGAATCCTTGATGGGTCCAAAGGAATACACCAAGTTCTGCGAAGATGAA
GACGCTGCTCACTAGAGGAATTCAGAGCAACACAAGAAAGATCATGCCTAAAGTTTCCGT
CTGTTTCACTTGTCGATGTTTCTTTACATCTATCTCAGCTTGTATCAGGG*TGATACTAA
TGATCAAGAGAAATTTGATTT

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

CO CL3736Contig1 911 2 10 U
GAAATGGCAAAGTATCTAAAAACACACGTGTCGCCTCAATTACCACCTGAGGTTCGTGAA
GCCTTCATCGCCGCGGTTGAAATGGGTAATAATATCAAAACCATGCCGAACCGAAGCATG
CCAGCTGATCCGGTTCCTATCCCTGGAGCACTTCTTCTAGGCGATGCATTCAATATGCGA
CATCCGTTAACCGGTGGTGGGATGACAGTGGCGTTGGCGGATATAGTTGTGCTCCGTGAT
CTTCTGAGACCAATTCGCAGTCTTAAAGACAAAGAAGCACTCTCTAAGTACATTGAATCA
TTCTACACACTTCGAAAACCTGTAGCTTCCACCATTAATACATTGGCGGGTGCGCTGTAC
AAGGTCTTCTCGGCATCTGCAGATGAAGCGAAAACAAAAATGCGTGAAGCTTGCTTTGAT
TATCTTAGCCTTGGAGGTGTTTGCTCATCTGGTCCGGTTGCGTTGCTCTCTGGTTTGAAC
CCTCGTCCTCTGAGTTTAGTTCTCCACTTCTTCGCTGTGGCGATCTTTGCTGTTGGTCGT
TTGATGCTACCATTTCCTTCGATTAAAAGCTTCTGGCTTGGAGCTAGGGTCATCTCGAGT
GCTTCAGGAATCATCTTCCCCATAATTAAAGCAGAGGGAGTTAGGCAAATGTTCTTCCCT
CGTACCATTGCTGCCATATACCGCACTCCTCCCCCTCAATGATTCATTACATTGAATGAT
CAAAGCTATTCAGGCAAATTCTATTAACTTTTGTCTTATATCTCTGTTGATTAATGATAA
TCATTGTGGATATTTAGACAAGACATCTCTGGAACAAAAGTGTAACATAGCTCCCTTAGT
ATATGTATGATTGAGAGCAAAGATTCTTGTAAGTGCATCAATGTAGAAAAAGAAAAAACA
AAGTTAGCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FS05TF U 1
AF RS1CN59JQ C 148
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TCATTG

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DS 

RD RS1CN59JQ 764 0 0
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DS 



AS 1 3

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BQ
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AF RS1E939TF U 1
AF RS1FV08JQ C 22
AF RS1FV08TF U 22
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RD RS1E939TF 712 0 0
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ATATCTGAACGTTTTTTCCCGCAGATAGATAACAAAAA***AACTTGATTAAACTGGTAT
CTTGTTTTAAGAGTTCGTCTCTCTCAAATATAG**TTTTGTTTCGAGATGA
T

QA 1 711 1 711
DS 

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GG
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QA 3 692 3 692
DS 

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GG
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ATTTATAAGTATGTCAAAGATCACAAGCCTGATGCAAGAAGAGGTAACGTTAGGAGAGGT
TCCAGAGACGAGAGAAGACGCATTTTCGGTCAATAATCATGTGTTGGATATTTGTCGGAA
AAGAAAGAGATCAGATGAAGTAGAAGAAGAAGAACTTGTGGAGGAAGAAAACGACGGGTT
CAAAACACCGACCCGTCCGGAAAATAGAATCCCTGAGGTCAGAGTGTGCCCACCGGCGCC
GAGGAAAGGCGAAAAGGAATACTCGGCGATACACAGAGGTAACACAATGTGGTGCCGTAG
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TATTTTATTATGACCATTTTTAGGTCACGTTCGGAAAATATCTGAACGTTTTTTCCCGCA
GATAGATAACAAAAAAAAAACTTGATTAAACTGGTATCTTGTTTTAAGAGTTCGTCTCTC
TCAAATATAGGTTTTTGTTTCGAGATGA
CG

QA 3 690 3 690
DS 



AS 1 3

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TAC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RS1FM52JQ U 82
AF RS1AQ50TFB C 1
AF RS1AQ50JQ U 6
BS 1 5 RS1AQ50TFB
BS 6 483 RS1AQ50JQ

RD RS1FM52JQ 319 0 0
A
GTCAAAGATACATCCATGAAAATGCAACATACAGTTCCAGTTGCCTGCTTCTTTACATAA
ATACTATTTCTTCTCCACATTTCACTTATTCAAAACTTTACTTGGGTAAAGTAGGAGGAT
TATTCAACTTAACATGAAGCTTACCAAAACCAAAACATACTTTAAATCTCATTATGAGTG
ACTTTCTTAAACTCTCTGTTTCTCTGGTCACTAAATAGCTTAGGCGTGCATCTCGCTTGA
CATGGGTGCAAGAGCTTCCGTCATGGTTTCTTTATCTACCATGTGTTTGTCTTGTCCTGC
AACGTAAGGAGGACAATG

QA 2 319 2 319
DS 

RD RS1AQ50TFB 483 0 0
CTACCACCATAATAACTCTTTATTTTAAATTTTAAGAAAATAACACACTATTATACAAGC
TTGGGGCCATTAAAAACTCATTGTCAAAGATACATCCATGAAAATGCAACATACAGTTCC
AGTTGCCTGCTTCTTTACATAAATACTATTTCTTCTCCACATTTCACTTATTCAGAACTT
TACTTGGGTAAAGTAGGAGGATTATTCAACTTAACATGAAGCTTACCAAAACCAAAACAT
ACTTTAAATCTCATTATGAGTGACCTTCTTAGACTCTCTGTTTCTCTGGTCACTAAATAG
CTTAGGCGTGCATCTCGCTTGACATGGGTGCAAGAGCTTCCGTCATGGTTTCTTTATCTA
CCATGTGTTTGTCTTGTCCTGCAACGTAAGGAGGACAATGTGGACACTCTGGTGGCTGGT
ATATAGGTGGATGATAGTATGGCACGCTTGGGGTGCACCCACCGGTTTGGCATCCACCAG
TAC

QA 1 483 1 483
DS 

RD RS1AQ50JQ 478 0 0
ACCATAATAACTCTTTATTTTAAATTTTAAGAAAATAACACACTATTATACAAGCTTGGG
GCCATTAAAAACTCATTGTCAAAGATACATCCATGAAAATGCAACATACAGTTCCAGTTG
CCTGCTTCTTTACATAAATACTATTTCTTCTCCACATTTCACTTATTCAGAACTTTACTT
GGGTAAAGTAGGAGGATTATTCAACTTAACATGAAGCTTACCAAAACCAAAACATACTTT
AAATCTCATTATGAGTGACCTTCTTAAACTCTCTGTTTCTCTGGTCACTAAATAGCTTAG
GCGTGCATCTCGCTTGACATGGGTGCAAGAGCTTCCGTCATGGTTTCTTTATCTACCATG
TGTTTGTCTTGTCCTGCAACGTAAGGAGGACAATGTGGACACTCTGGTGGCTGGTATATA
GGTGGATGATAGTATGGCACGCTTGGGGTGCACCCACCGGTTTGGCATCCACCAGTAC

QA 1 478 1 478
DS 



AS 1 3

CO CL3739Contig1 401 3 3 U
GGCTCTTTCTCAGATTTAGGGTTTCTCTCTGTTGTCGGCTCGGTCCCAGAACCAAGATCG
CAGTGCTTCAAGATGCCGTCGCACAAGTCATTCATGATCAAGAAGAAGCTTGCCAAGAAA
ATGAGGCAGAACAGGCCAATCCCTCACTGGATTCGTCTTCGCACTGACAATACCATCAGG
TACAACGCAAAGCGTAGACACTGGCGCAGAACCAAGCTTGGATTCTAAGCTGTCTTACCT
TCGCCTATTTGTGAAATCTCTGTTCTTTCTAAGACATTGTTTTCCTTTGTTTGGTTCTTT
AGTGTTTTGTTTTCTCAGTTTTGATTGTGTCAGTTGCATTGTTCACAGTTTTGTAAGACA
ATCTTTTGATCAATTATGTTTCCAGACTATCTATCCAAGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1GI82TF U 1
AF RS1DO36JQ C 10
AF RS1DO36TF U 10
BS 1 273 RS1GI82TF
BS 274 274 RS1DO36TF
BS 275 401 RS1GI82TF

RD RS1GI82TF 401 0 0
GGCTCTTTCTCAGATTTAGGGTTTCTCTCTGTTGTCGGCTCGGTCCCAGAACCAAGATCG
CAGTGCTTCAAGATGCCGTCGCACAAGTCATTCATGATCAAGAAGAAGCTTGCCAAGAAA
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TACAACGCAAAGCGTAGACACTGGCGCAGAACCAAGCTTGGATTCTAAGCTGTCTTACCT
TCGCCTATTTGTGAAATCTCTGTTCTTTCTAAGGCATTGTTTTCCTTTGTTTGGTTCTTT
AGTGTTTTGTTTTCTCAGTTTTGATTGTGTCAGTTGCATTGTTCACAGTTTTGTAAGACA
ATCTTTTGATCAATTATGTTTCCAGACTATCTATCCAAGCG

QA 1 401 1 401
DS 

RD RS1DO36JQ 382 0 0
GG
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CAGGCCAATCCCTCACTGGATTCGTCTTCGCACTGACAATACCATCAGGTACAACGCAAA
GCGTAGACACTGGCGCAGAACCAAGCTTGGATTTTAAGCTGTCTTACCTTCGCCTATTTG
TGAAATCTCTGTTCTTTTTAAGACATTGTTTTCCTTTGTTTGGTTCTTTAGTGTTTTGTT
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AATTATGTTTCCAGACTATC

QA 3 382 3 382
DS 

RD RS1DO36TF 382 0 0
GG
AGATTTAGGGTTTCTCTCTGTTGTCGGCTCGGTCCCAGAACCAAGATCGCAGTGCTTCAA
GATGCCGTCGCACAAGTCATTCATGATCAAGAAGAAGCTTGCCAAGAAAATGAGGCAGAA
CAGGCCAATCCCTCACTGGATTCGTCTTCGCACTGACAATACCATCAGGTACAACGCAAA
GCGTAGACACTGGCGCAGAACCAAGCTTGGATTCTAAGCTGTCTTACCTTCGCCTATTTG
TGAAATCTCTGTTCTTTCTAAGACATTGTTTTCCTTTGTTTGGTTCTTTAGTGTTTTGTT
TTCTCAGTTTTGATTGTGTCAGTTGCATTGTTCACAGTTTTGTAAGACAATCTTTTGATC
AATTATGTTTCCAGACTATC

QA 3 382 3 382
DS 



AS 1 2

CO CL3740Contig1 597 2 1 U
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TTCAATCAAAGTAGCCAGCTTCCTAATCCAAAGCAGTTGATTTGTCTGTTAAAGCATTTT
TCTTTCTTGTTGAAAAACTCTTGCTACATTAGAGTTTTTTTGTTAGAATTTGTAAAACTT
GTTGACTATAGTCATTCGTCATCAAAATATGACATTAACTAAACGATGAACTTACTATAA
TATTGCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAAG
CCAAACAAATTTAAGATGCTCTTATTTAATCTTTTTTTTTCTTTTGTTATTTAATTAAAC
AAAGATTATTGACAATTCCGAAGTAATTGATTCTTGCTCTCTATGCTTGGTTTTATTTTC
TCTTGCTTGTTCTGAATATTCATCTAGTGAGAGATTGCAGTATAAGACCTTTCTTAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DH50JQ C 1
AF RS1DH50TF U 1
BS 1 597 RS1DH50TF

RD RS1DH50JQ 597 0 0
GGGATCATGCATCTGTCCAGCTCAACATTGGTCATTTAGATGCTGATGGCGTCTACACCG
GGCAATTCACTACCTTTGCTCTCTGTGGTTTTGTTCGTGCCCAGGTCTGTGAATGTGATA
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TTCAATCAAAGTAGCCAGCTTCCTAATCCAAAGCAGTTGATTTGTCTGTTAAAGCATTTT
TCTTTCTTGTTGAAAAACTCTTGCTACATTAGAGTTTTTTTGTTAGAATTTGTAAAACTT
GTTGACTATAGTCATTCGTCATCAAAATATGACATTAACTAAACGATGAACTTACTATAA
TATTGCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAAG
CCAAACAAATTTAAGATGCTCTTATTTAATCTTTTTTTTTCTTTTGTTATTTAATTAAAC
AAAGATTATTGACAATTCCGAAGTAATTGATTCTTGCTCTCTATGCTTGGTTTTATTTTC
TCTTGCTTGTTCTGAATATTCATCTAGTGAGAGATTGCAGTATAAGACCTTTCTTAC

QA 1 597 1 597
DS 

RD RS1DH50TF 597 0 0
GGGATCATGCATCTGTCCAGCTCAACATTGGTCATTTAGATGCTGATGGCGTCTACACCG
GGCAATTCACTACCTTTGCTCTCTGTGGTTTTGTTCGTGCCCAGGTCTGTGAATGTGATA
CACTCTTAGTCTAATGGACTCTAAATGCTTGTGTCCCCGCTTCCCAACCACTTTGTTAAT
TTCAATCAAAGTAGCCAGCTTCCTAATCCAAAGCAGTTGATTTGTCTGTTAAAGCATTTT
TCTTTCTTGTTGAAAAACTCTTGCTACATTAGAGTTTTTTTGTTAGAATTTGTAAAACTT
GTTGACTATAGTCATTCGTCATCAAAATATGACATTAACTAAACGATGAACTTACTATAA
TATTGCAGGGAGACGCAGACAGTGGCGTGGACAGGCTGTGGCAGAAGAAGAAGGTCGAAG
CCAAACAAATTTAAGATGCTCTTATTTAATCTTTTTTTTTCTTTTGTTATTTAATTAAAC
AAAGATTATTGACAATTCCGAAGTAATTGATTCTTGCTCTCTATGCTTGGTTTTATTTTC
TCTTGCTTGTTCTGAATATTCATCTAGTGAGAGATTGCAGTATAAGACCTTTCTTAC

QA 1 597 1 597
DS 



AS 1 2

CO CL3741Contig1 713 2 4 U
TAAGGAGAAGAAACTGAGAGTTGAAGATGCTTTGAATGCTACAAAGGCGGCTGTGGAAGA
AGGTATTGTTGTTGGAGGTGGATGCACTCTGCTAAGACTTGCATCCAAAGTGGACGCGAT
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GAGCTACCCTTTGAAGTTAATCGCCAAGAACGCTGGTGTTAATGGTAGCGTTGTCAGCGA
AAAGGTACTCTCTAGCGACAACGCAAAGCACGGCTACAACGCAGCAACAGGCAAATACGA
AGATCTAATGGCTGCAGGAATCATTGATCCAACCAAAGTTGTGAGATGTTGCTTAGAGCA
TGCATCATCTGTGGCAAAGACATTCTTGATGTCCGATTGTGTGGTCGTGGAGATCAAGGA
GCCTGAATCAGCAGCTCCTGCTGGTAACCCTATGGGAAACTCAGGTTATGGTTTCTAAGT
TAGCCATCTGTGAGGAAGAAAATGCCAAGGCCAAGTTCTTTATTTAGTAATCTGAAACGT
CTTTTATTTTTTCTGATGTAAAACTTCTTCATTTTCAAAGTCAACAGTCGCCGGATAGTT
CCATTGTGATTCATATCTTTAGTTATCTTTTTGGGGTTTGTTCACAATCAGTTTTACAGT
TGAAAGAAAAACTAAGAGGAGTATTATTTTGATGTGAACACAACTTTTAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1G423JQ C 1
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CTTTTATTTTTTCTGATGTAAAACTTCTTCATTTTCAAAGTCAACAGTCGCCGGATAGTT
CCATTGTGATTCATATCTTTAGTTATCTT
G

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DS 

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G
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GCAACAGGCAAATACGAAGATCTAATGGCTGCAGGAATCATTGATCCAACCAAAGTTGTG
AGATGTTGCTTAGAGCATGCATCATCTGTGGCGAAGACATTCTTGATGTCCGATTGTGTG
GTCGTGGAGATCAAGGAGCCTGAATCAGCAGCTCCTGCTGGTAACCCTATGGGAAACTCA
GGTTATGGTTTCTAAGTTAGCCATCTGTGAGGAAGAAAATGCCAAGGCCAAGTTCTTTAT
TTAGTAATCTGAAACGTCTTTTATTTTTTCTGATGTAAAACTTCTTCATTTTCAAAGTCA
ACAGTCGCCGGATAGTTCCATTGTGATTCATATCTTTAGTTATCTTTTTGGGGTTTGTTC
ACAATCAGTTTTACAGTTGAAAGAAAAACTAAGAGGAGTATTATTTTGATGTGAACACAA
CTTTTAAAAA

QA 2 491 2 491
DS 



AS 1 3

CO CL3742Contig1 1601 3 7 U
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AGACCTCGACAAGCTTCTTCTCAGATCTGGGAACCTCGTCGGCCCCGGCTTCTTTCCCGG
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ATTGGGGTGTGAGCTCCTCAAGGACTTGGCTCTCTCAGGGTTTCGTAACCTGGATGTGAT
TGACATGGATCGAATCGAGGTCACCAATCTCAATCGCCAGTTCCTCTTCAGACTTGAGGA
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GGAGATTGTGCCGCATTTTTCACGTATTGAAGACAAAGAGCTTGAGTTTTATAGCGATTT
TAATATCATTGCTCTTGGTCTTGATTCGATTGAAGCTCGGAGATACATCAATGGTGTAGC
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GGTGGATGGGGGAACCGAAGGTTTCAAGGGTCATGCTAGAGTTATCGTCCCTGGTGTTAC
ACCCTGTTTTGAGTGCACCATTTGGCTTTTCCCACCTCAAGTCAAGTTTCCTTTGTGCAC
TCTCGCAGAAACCCCTAGGAATGCTGCTCATTGCATTGAGTATGCTCATCTCATTAAGTG
GCATGAGTTCATGGTGGGAAATCATTTGATTCTGATGAGCCGGAACATATGAAGTGGGTC
TATGATGAGGCTATCAAGAGAGCCGAGCTTTTTGGAATTCCGGGTGTCACATACTCTCTC
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GCAGCTTGTGCACTTGAAACCTTGAAGATTGTTTCTGGATGTAGCAAAACACTTGCAAAT
TATCTTACGTATAACGGTGGAGAGGGTCTCCACACTAAAGTGACCGAATTTGAGAGAGAC
AAGAAGCGTCTTGTATGTGGTCCGGGTATTCTGATTGAGCTGGACACCTCAATTACTTTG
CAAAAGTTCATTGAAATGCTTGAAGAACATCCGAAGCTTCTATTGTCGAAAGCAAGTGTG
AAACACGGCAAAGACAGCCTCTACATGCAGGCGCCTCCTGTTTTAGAAGAAATGCACAGA
CCAAACCTAAGCAAGCCGCTCTATGACCTCATGGGAAGAGTCGAGAAGGACACTGTTCAC
GTGTTTGGCACATCCCTCAAGAACTAAGAGAAACAGTCGAGCTTAACGAAGCTAAGGGTT
GTTTTCAAAGAAGTTGATGGTGTTGCAGACATGGATACAGCCATTTGGAGAACGAACTTT
AAGAGAAAAACACCCTTTTGATCGCTGCAAGAGCCATTAAGATAGTTGGGAAGTCCCATT
TTCATTATTGGTCTTTTTTTTTGGTTTCTGTCGTTAAATAGATGTGACAGCAAATCCTAA
GAGCCTGAAACAGATGGGTTTATATGATTATTCTTAACCTC


BQ
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AF RS1DF78TF U 1
AF RS1FR49TF U 520
AF RS1DF78JQ C 888
BS 1 584 RS1DF78TF
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RD RS1DF78TF 584 0 0
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TTTCGCTGAATAAACCGACACTCTCTATCTAATGGATGCTTCTCCTCAGAGTAAGTCGAG
AGACCTCGACAAGCTTCTTCTCAGATCTGGGAACCTCGTCGGCCCCGGCTTCTTTCCCGG
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ATTGGGGTGTGAGCTCCTCAAGGACTTGGCTCTCTCAGGGTTTCGTAACCTGGATGTGAT
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TGTGGGAAAGCCTAAGGCAGAGGTAGCTGCAAAGCGTGTGATGGAGAGAGTGAGCGGAGT
GGAGATTGTGCCGCATTTTTCACGTATTGAAGACAAAGAGCTTGAGTTTTATAGCGATTT
TAATATCATTGCTCTTGGTCTTGATTCGATTGAAGCTCGGAGATACATCAATGGTGTAGC
TTGTGGCTTTCTTGAGTATGATGAAGATGATACCCCGAGGAGTG

QA 1 584 1 584
DS 

RD RS1FR49TF 707 0 0
GG
GATACATCAATGGTGTAGCTTGTGGCTTTCTTGAGTATGATGAAGATGATACCCCGAGGA
GTGAAACAATCAAGCCGATGGTGGATGGGGGAACCGAAGGTTTCAAGGGTCATGCTAGAG
TTATCGTCCCTGGTGTTACACCCTGTTTTGAGTGCACCATTTGGCTTTTCCCACCTCAAG
TCAAGTTTCCTTTGTGCACTCTCGCAGAAACCCCTAGGAATGCTGCTCATTGCATTGAGT
ATGCTCATCTCATTAAGTGGCATGAGTTCATGGTGGGAAATCATTTGATTCTGATGAGCC
GGAACATATGAAGTGGGTCTATGATGAGGCTATCAAGAGAGCCGAGCTTTTTGGAATTCC
GGGTGTCACATACTCTCTCACACAAGGTGTGGTTAAAAACATCATACCGGCGATTGCATC
CACCAACGCGATTATATCCGCAGCTTGTGCACTTGAAACCTTGAAGATTGTTTCTGGATG
TAGCAAAACACTTGCAAATTATCTTACGTATAACGGTGGAGAGGGTCTCCACACTAAAGT
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GGACACTGTTCACGTGTTTGGCACATCCCTCAAGAACTAAGAGAAACAGTCGAGCTTAAC
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GAGAACGAACTTTAAGAGAAAAACACCCTTTTGATCGCTGCAAGAGCCATTAAGATAGTT
GGGAAGTCCCATTTTCATTATTGGTCTTTTTTTTTGGTTTCTGTCGTTAAATAGATGTGA
CAGCAAATCCTAAGAGCCTGAAACAGATGGGTTTATATGATTATTCTTAACCTC

QA 1 714 1 714
DS 



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ATGAATAAAAGTTGATGTGAGCTCATATCTCTCTTATTACTTACTTTCTGGCATGGTGTG
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BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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BS 469 473 RS1BZ23TF

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AATACACATTTAAAAGGGGACCATGTCTCTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTAAT
ATGAATAAAAGTTGATGTGAGCTCATATCTCTCTTATTACTTACTTTCTGGCATGGTGTG
TGATGTAATGGTTCTATGTCCCCTTATCCTCTAATACATCATGTTATC
C

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DS 

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C

QA 5 468 5 468
DS 

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GG
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CACATTTAAAAGGGGACCATGTCTCTCTTTTCTCCTCCTTTTAACTAAAATGTAATATGA
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GTAATGGTTCTATGTCCCCTTATCCTCTAATACATCATGTTATCTACAT

QA 3 471 3 471
DS 



AS 0 0

AS 1 3

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CGAGTATCGCGAAGAAAGACATTCAGAACGCAGCTGTGGTTCACTATAACGGGAACATGA
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TACTTTCGGGTTCAAAGCACTTTTGTTATTCCGAAGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1B806TF U 1
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CCATACATGTGGAGAACGTGGATGAGTTCAAGTGGCTCAATTCATCTTACTGCCCTGTTC
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CAGGCTCTTCGAATCTCAAGTACAGAAGCCCGAAGTACCTTTCCATGTTAAATCACTTGA
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TCATCGTCCAGAAAGACCTTACTCCGCTCTGGGAAGTCAACCTGAACGGAAAAGTCAACG
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TGTTCGACCTTAAG*AGTGGAAGA*GAGAGATATCACTGGTAT

QA 1 763 1 763
DS 

RD RS1DF22TF 771 0 0
G
GGAGAACGTGGATGAGTTCAAGTGGCTCAATTCATCTTACTGCCCTGTTCTTCGCCAGCT
CGAATCTTCAGCAATGAAAGAATACTATTTCAAAGCAGATCACCCAAGCTCAGGCTCTTC
GAATCTCAAGTACAGAAACCCGAAGTACCTTTCCATGTTAAATCACTTGAGATTCTATCT
CCCTGATCTTTATCCCAAGCTGAACAAGATCCTGTTCTTGGACGACGACATCATCGTCCA
GAAAGACCTTACTCCGCTCTGGGAAGTCAACCTGAACGGAAAAGTCAACGGTGCAGTCGA
AACCTGCGGGGAGAGTTTCCACAGGTTCGACAAGTATCTCAACTTCTCGAACCCTCACAT
CGCCAGGAACTTCAATCCAAACGCTTGTGGATGGGCTTATGGGATGAACATGTTCGACCT
TAAGGAGTGGAAGAAGAGAGATATCACTGGTATCTACCATAAGTGGCAGAACATGAATGA
GAACAGGACACTGTGGAAGCTAGGGACACTACCACCAGGATTAATAACGTTTTACGGACT
AACACACCCTTTGGACAAGTCGTGGCACGTGTTGGGACTTGGTTATAACCCGAGTATCGC
GAAGAAAGACATTCAGAACGCAGCTGTGGTTCACTATAACGGGAACATGAAACCATGGTT
GGAGTTGGCTATGTCTAAGTATCGACCGTATTGGAC*AAGTACATCAAGTTTGATCACCC
TTATCTTCGTAGATGCAACCTTCATGAATAAAATTAAATTATCAA
TCGTT

QA 2 766 2 766
DS 

RD RS1B806JQ 634 0 0
GTCGAAACCTGCGGGGAGAGTTTCCACAGGTTCGACAAGTATTTCAACTTCTCGAACCCT
CACATCGCCAGGAACTTCAATCCAAACGCTTGTGGATGGGCTTATGGGATGAACATGTTC
GACCTTAAGGAGTGGAAGAAGAGAGATATCACTGGTATTTACCATAAGTGGCAGAACATG
AATGAGAACAGGACACTGTGGAAGCTAGGGACACTACCACCAGGATTAATAACGTTTTAC
GGACTAACACACCCTTTGGACAAGTCGTGGCACGTGTTGGGACTTGGTTATAACCCGAGT
ATCGGGAAGAAAGACATTCAGAACGCAGCTGTGGTTCACTATAACGGGAACATGAAACCA
TGGTTGGAGTTGGCTATGTTTAAGTATCGACCGTATTGGACCAAGTACATCAAGTTTGAT
CACCCTTATTTTCGTAGATGCAACCTTCATGAATAAAATTAAATTATCAAATCGTTATTA
GATGATTTGAGGTAATTACTCGTAATCTTATGTTGTTTTCCCCATGGCGTTAATCTTTTA
TTTTTACACATTGTTTATTGTTTATTCATATCTTTCTTTAGTCATATTATTTTCTTACTT
TCGGGTTCAAAGCACTTTTGTTATTCCGAAGTTT

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 2

CO CL3746Contig1 778 2 2 U
TTTTCGTTTAGTAATTAGAATGCAATTTAGCACTTAATGTGATTCTGTGTGTAGAAAACA
TATAATCACCTTGTTCATTCAAATACACCCCTTACAAGCCATCAGATGAAACCTGGGAAG
ATCCTACGTAATATTAACTATATCATTGTTCTTGGATAAGAGTATGGAGGGCTCTTTCAA
CATATTCAAATGGTTGTCCAGCATACAGCTTTAGTTGCCGCTTCTTCACAACAATCACAT
TCTTGCCACCAGAACTTACTTCGTTATAAAGATCCTTGGTTGATATGGGAACTACATTGG
CGCTGAAATCCTCCAAGTCTTCAAAAACTGACTCCAGCAGATAAGAGAAGTTTATTGCAT
CACTTTGATCCTCAAATGCAATCATGTGTGAAACTTCGGCCTTGTTTTGTTCCATAGGTT
CGGTCCTCATAGTAAAGTACCCTTCAAATACTTCTTGGTCAATACTACTCCGCATAAAAA
TTCTCAGCACATAGGGAAGCTTAAGCCACCAAGTTTTATTCTGTTTCTCCTTAACTCTTC
CCATGGAGTTTCCTTTCCTGACTTCTCCATGTTGGCCACTCCTACCAAATCCAGAACCAG
CTTCCGTATTTGGCTTTCGATTGTCAGAATTGTTTGACTTCATAACTTGGTTTGATGGTC
GCCTTTGCTCAGACCCCTGAGCAGCACCAGAAATCATTTTGGAATCTGAAGGCCCTGCCA
CTTTTGATTCCTCTTCAGCGCTCTTCAAACCATCTCTTGAGTCACCAACATTGCCATC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BR28TF C 1
AF RS1BR28JQ U 5
BS 1 4 RS1BR28TF
BS 5 778 RS1BR28JQ

RD RS1BR28TF 778 0 0
TTTTCGTTTAGTAATTAGAATGCAATTTAGCACTTAATGTGATTCTGTGTGTAGAAAACA
TATAATCAC*TTGTTCATTCAAATACACCC*TTACAAGCCATCAGATGAAACCTGGGAAG
ATCCTACGTAATATTAACTATATCATTGTTCTTGGATAAGAGTATGGAGGGCTCTTTCAA
CATATTCAAATGGTTGTCCAGCATACAGCTTTAGTTGCCGCTTCTTCACAACAATCACAT
TCTTGCCACCAGAACTTACTTCGTTATAAAGATCCTTGGTTGATATGGGAACTACATTGG
CGCTGAAATCCTCCAAGTCTTCAAAAACTGACTCCAGCAGATAAGAGAAGTTTATTGCAT
CACTTTGATCCTCAAATGCAATCATGTGTGAAACTTCGGCCTTGTTTTGTTCCATAGGTT
CGGTCCTCATAGTAAAGTACCCTTCAGATACTTCTTGGTCAATACTACTCCGCATAAGAA
TTCTCAGCACATAGGGAAGCTTAAGCCACCAAGTTTTATTCTGTTTCTCCTTAACTCTTC
CCATGGAGTTTCCTTTCCTGACTTCTCCATGTTGGCCACTCCTACCAAATCCAGAACCAG
CTTCCGTATTTGGCTTTCGATTGTCAGAATTGTTTGACTTCATAACTTGGTTTGATGGTC
GCCTTTGCTCAGACCCCTGAGCAGCACCAGAAATCATTTTGGAATCTGAAGGCCCTGCCA
CTTTTGATTCCTCTTCAGCGCTCTTCAAACCATCTCTTGAGTCACCAACATTGCCATC

QA 1 778 1 778
DS 

RD RS1BR28JQ 774 0 0
CGTTTAGTAATTAGAATGCAATTTAGCACTTAATGTGATTCTGTGTGTAGAAAACATATA
ATCACCTTGTTCATTCAAATACACCCCTTACAAGCCATCAGATGAAACCTGGGAAGATCC
TACGTAATATTAACTATATCATTGTTCTTGGATAAGAGTATGGAGGGCTCTTTCAACATA
TTCAAATGGTTGTCCAGCATACAGCTTTAGTTGCCGCTTCTTCACAACAATCACATTCTT
GCCACCAGAACTTACTTCGTTATAAAGATCCTTGGTTGATATGGGAACTACATTGGCGCT
GAAATCCTCCAAGTCTTCAAAAACTGACTCCAGCAGATAAGAGAAGTTTATTGCATCACT
TTGATCCTCAAATGCAATCATGTGTGAAACTTCGGCCTTGTTTTGTTCCATAGGTTCGGT
CCTCATAGTAAAGTACCCTTCAAATACTTCTTGGTCAATACTACTCCGCATAAAAATTCT
CAGCACATAGGGAAGCTTAAGCCACCAAGTTTTATTCTGTTTCTCCTTAACTCTTCCCAT
GGAGTTTCCTTTCCTGACTTCTCCATGTTGGCCACTCCTACCAAATCCAGAACCAGCTTC
CGTATTTGGCTTTCGATTGTCAGAATTGTTTGACTTCATAACTTGGTTTGATGGTCGCCT
TTGCTCAGACCCCTGAGCAGCACCAGAAATCATTTTGGAATCTGAAGGCCCTGCCACTTT
TGATTCCTCTTCAGCGCTCTTCAAACCATCTCTTGAGTCACCAACATTGCCATC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 3

CO CL3747Contig1 909 3 8 U
GGAACCATCACACGAAGAACAGAGACGACACTTTCTTCTCCCGGAAATATCTCATCTCAA
AAAAAAAGAAAATCTTTTCCGTCAATGTCTTCTCGCCGGAGAGTTCTTCTGAAGGTTATC
ATCCTCGGTGATAGCGGGGTTGGCAAGACATCGTTGATGAATCAGTTTGTGAATCGCAAG
TTTAGCAATCAGTATAAAGCTACGATTGGAGCTGATTTCTTGACCAAAGAGGTTCAAATC
GATGACAGGATCTTCACTTTACAGATTTGGGATACTGCTGGGCAAGAAAGGTTCCAAAGT
CTGGGAGTTGCTTTCTACAGAGGATCTGATTGTTGTGTTCTTGTTAACGATGTCAATGTT
ATGAAGTCTTTCGAGAATCTTAATAACTGGAGAGAAGAGTTCTCGATTCAGGCTAGTCCA
TCAGATCCTGAGAACTTCCCCTTTGTCGTGTTGGGGAATAAGACCGATATTGACGGTGGC
AAGAGCCGAGTGGTTTCTGAGAAGAAAGCAAAGGCATGGTGTGCATCTAAAGGTAACATT
CCTTACTTTGAGACATCGGCTAAAGAAGGATTCAATGTCGACGCGGCTTTCGAATGCATC
ACCAAGAATGCCTTCAAGAATGAACCTGAAGAAGAACCGTACATGCCTGACACTATTGAT
GTTGCTAGAGGTCAGCAACAAAGATCAACAGGGTGTGAATGCTAAATCGAGTTTGTTGCA
GAGGGTTACCATACAACTATAAAGTTAATTTCAGTTCATTGATTCACAGATTCTAAAGGA
TTGAGTTCCTTTTCTTTTACAATTCAGACACAATATAATGTCACAAAACTCTCATCTATG
ATCTTTCTCTGTCTCTTCTTGTGTATACATTGCCTTTGAACTTGATTACAATTCATCTTT
AGCAGAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GZ01TF U 1
AF RS1AB48TF U 77
AF RS1AB48JQ C 125
BS 1 324 RS1GZ01TF
BS 325 325 RS1AB48TF
BS 326 403 RS1GZ01TF
BS 404 404 RS1AB48TF
BS 405 557 RS1GZ01TF
BS 558 558 RS1AB48TF
BS 559 686 RS1GZ01TF
BS 687 909 RS1AB48JQ

RD RS1GZ01TF 686 0 0
GGAACCATCACACGAAGAACAGAGACGACACTTTCTTCTCCCGGAAATATCTCATCTCAA
AAAAAAAGAAAATCTTTTCCGTCAATGTCTTCTCGCCGGAGAGTTCTTCTGAAGGTTATC
ATCCTCGGTGATAGCGGGGTTGGCAAGACATCGTTGATGAATCAGTTTGTGAATCGCAAG
TTTAGCAATCAGTATAAAGCTACGATTGGAGCTGATTTCTTGACCAAAGAGGTTCAAATC
GATGACAGGATCTTCACTTTACAGATTTGGGATACTGCTGGGCAAGAAAGGTTCCAAAGT
CTGGGAGTTGCTTTCTACAGAGGAGCTGATTGTTGTGTTCTTGTTAACGATGTCAATGTT
ATGAAGTCTTTCGAGAATCTTAATAACTGGAGAGAAGAGTTCTTGATTCAGGCTAGTCCA
TCAGATCCTGAGAACTTCCCCTTTGTCGTGTTGGGGAATAAGACCGATATTGACGGTGGC
AAGAGCCGAGTGGTTTCTGAGAAGAAAGCAAAGGCATGGTGTGCATCTAAAGGTAACATT
CCTTACTTTGAGACATCTGCTAAAGAAGGATTCAATGTCGACGCGGCTTTCGAATGCATC
ACCAAGAATGCCTTCAAGAATGAACCTGAAGAAGAACCGTACATGCCTGACACTATTGAT
GTTGCTAGAGGTCAGCAACAAAGATC

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1AB48TF 610 0 0
G
TCCGTCAATGTCTTCTCGCCGGAGAGTTCTTCTGAAGGTTATCATCCTCGGTGATAGCGG
GGTTGGCAAGACATCGTTGATGAATCAGTTTGTGAATCGCAAGTTTAGCAATCAGTATAA
AGCTACGATTGGAGCTGATTTCTTGACCAAAGAGGTTCAAATCGATGACAGGATCTTCAC
TTTACAGATTTGGGATACTGCTGGGCAAGAAAGGTTCCAAAGTCTGGGAGTTGCTTTCTA
CAGAGGATCTGATTGTTGTGTTCTTGTTAACGATGTCAATGTTATGAAGTCTTTCGAGAA
TCTTAATAACTGGAGAGAAGAGTTCTCGATTCAGGCTAGTCCATCAGATCCTGAGAACTT
CCCCTTTGTCGTGTTGGGGAATAAGACCGATATTGACGGTGGCAAGAGCCGAGTGGTTTC
TGAGAAGAAAGCAAAGGCATGGTGTGCATCTAAAGGTAACATTCCTTACTTTGAGACATC
GGCTAAAGAAGGATTCAATGTCGACGCGGCTTTCGAATGCATCACCAAGAATGCCTTCAA
GAATGAACCTGAAGAAGAACCGTACATGCCTGACACTATTGATGTTGCTAGAGGTCAGCA
ACAAAGATC

QA 2 610 2 610
DS 

RD RS1AB48JQ 785 0 0
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GCAATCAGTATAAAGCTACGATTGGAGCTGATTTCTTGACCAAAGAGGTTCAAATCGATG
ACAGGATCTTCACTTTACAGATTTGGGATACTGCTGGGCAAGAAAGGTTCCAAAGTCTGG
GAGTTGCTTTCTACAGAGGATCTGATTGTTGTGTTCTTGTTAACGATGTCAATGTTATGA
AGTCTTTCGAGAATCTTAATAACTGGAGAGAAGAGTTCTCGATTCAGGCTAGTCCATCAG
ATCCTGAGAACTTCCCCTTTGTCGTGTTGGGGAATAAGACCGATATTGACGGTGGCAAGA
GCCGAGTGGTTTCTGAGAAGAAAGCAAAGGCATGGTGTGCATCTAAAGGTAACATTCCTT
ACTTTGAGACATCGGCTAAAGAAGGATTCAATGTCGACGCGGCTTTCGAATGCATCACCA
AGAATGCCTTCAAGAATGAACCTGAAGAAGAACCGTACATGCCTGACACTATTGATGTTG
CTAGAGGTCAGCAACAAAGATCAACAGGGTGTGAATGCTAAATCGAGTTTGTTGCAGAGG
GTTACCATACAACTATAAAGTTAATTTCAGTTCATTGATTCACAGATTCTAAAGGATTGA
GTTCCTTTTCTTTTACAATTCAGACACAATATAATGTCACAAAACTCTCATCTATGATCT
TTCTCTGTCTCTTCTTGTGTATACATTGCCTTTGAACTTGATTACAATTCATCTTTAGCA
GAACC

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 3

CO CL3748Contig1 376 3 1 U
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CTACGCTCACAGTTCTTTGTTCGGAGTAATATCGATTGCTCAGAAAAGAGGACCACAGCA
AAAAGTACCTCCTTGTCGACGCTACCTTCAGAGAAACATAGCATGTAACAGGGAAGGGAA
GATTGTAGTGCTGAATGTTCTAAAAAGAGGAATGGACTTGGTGAATGTATTGGCTTATCA
AAAGAAGGAGGAAAACTTTGTTCTTGTTTTTATCAAATGAATAAAAACAATTCTTGTTCT
CCGTAATCTTTTATCTACATTGGAACTTAAATAATACTTATAATAATACACACCTTTATC
AATAGAGAAATAATAA


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FV42JQ C 1
AF RS1FV42TF U 1
AF RS1CA32TF U 1
BS 1 376 RS1CA32TF

RD RS1FV42JQ 304 0 0
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CTACGCTCACAGTTCTTTGTTCGGAGTAATATCGATTGCTCAGAAAAGAGGACCACAGCA
AAAAGTACCTCCTTGTCGACGCTACCTTCAGAGAAACATAGCATGTAACAGGGAAGGGAA
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AAAGAAGGAGGAAAACTTTGTTCTTGTTTTTATCAAATGAATAAAAACAATTCTTGTTCT
CCGT

QA 1 304 1 304
DS 

RD RS1FV42TF 304 0 0
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CTACGCTCACAGTTCTTTGTTCGGAGTAATATCGATTGCTCAGAAAAGAGGACCACAGCA
AAAAGTACCTCCTTGTCGACGCTACCTTCAGAGAAACATAGCATGTAACAGGGAAGGGAA
GATTGTAGTGCTGAATGTTCTAAAAAGAGGAATGGACTTGGTGAATGTATTGGCTTATCA
AAAGAAGGAGGAAAACTTTGTTCTTGTTTTTATCAAATGAATAAAAACAATTCTTGTTCT
CCGT

QA 1 304 1 304
DS 

RD RS1CA32TF 376 0 0
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CTACGCTCACAGTTCTTTGTTCGGAGTAATATCGATTGCTCAGAAAAGAGGACCACAGCA
AAAAGTACCTCCTTGTCGACGCTACCTTCAGAGAAACATAGCATGTAACAGGGAAGGGAA
GATTGTAGTGCTGAATGTTCTAAAAAGAGGAATGGACTTGGTGAATGTATTGGCTTATCA
AAAGAAGGAGGAAAACTTTGTTCTTGTTTTTATCAAATGAATAAAAACAATTCTTGTTCT
CCGTAATCTTTTATCTACATTGGAACTTAAATAATACTTATAATAATACACACCTTTATC
AATAGAGAAATAATAA

QA 1 376 1 376
DS 



AS 1 3

CO CL3749Contig1 526 3 1 U
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TCTCGAGAAAAATGTCTTGCTGCGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTGCCTGCACGTGCG
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CCACGAGTGAGACTTTTGTCTCTGGCGTTGCACCGGCTATGAAGAACCAGTACGAGGCTT
CCGGCGAGAGTAACGCCGAGAACGATGGATGTACATGCAAGTGTGGATCTGACTGCAAGT
GTGATCCTTGCACCTGTAAATGAGTAAAACCCTTTTTAAGAAAGGCAGAGATAATCAGTT
TGTCTTTTTAGTTAAGTAATAATACTACCGCAATGATCGTTTTATTAGGTTTTGCTTTTT
ATGTTTAATAATGGGCTGCAACGTTGCCTTTCTTTCGTTTGTGTGTTTGGTCTGTCTCTG
CCAATTTGTGACCATTATATATGATGAGCCACTTTGATTTATCTCC


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GK50TF U 1
AF RS1CR26JQ C 2
AF RS1CR26TF U 2
BS 1 526 RS1GK50TF

RD RS1GK50TF 526 0 0
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TCTCGAGAAAAATGTCTTGCTGCGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTGCCTGCACGTGCG
TCAACGGTTGTTGTGGAGGTTGCAAAAAGTACCCTGACTTAGGCTTTTCCGGCGAGACAA
CCACGAGTGAGACTTTTGTCTCTGGCGTTGCACCGGCTATGAAGAACCAGTACGAGGCTT
CCGGCGAGAGTAACGCCGAGAACGATGGATGTACATGCAAGTGTGGATCTGACTGCAAGT
GTGATCCTTGCACCTGTAAATGAGTAAAACCCTTTTTAAGAAAGGCAGAGATAATCAGTT
TGTCTTTTTAGTTAAGTAATAATACTACCGCAATGATCGTTTTATTAGGTTTTGCTTTTT
ATGTTTAATAATGGGCTGCAACGTTGCCTTTCTTTCGTTTGTGTGTTTGGTCTGTCTCTG
CCAATTTGTGACCATTATATATGATGAGCCACTTTGATTTATCTCC

QA 1 526 1 526
DS 

RD RS1CR26JQ 517 0 0
GGA
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GAGAAAAATGTCTTGCTGCGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTGCCTGCACGTGCGTCAA
CGGTTGTTGTGGAGGTTGCAAAAAGTACCCTGACTTAGGCTTTTCCGGCGAGACAACCAC
GAGTGAGACTTTTGTCTCTGGCGTTGCACCGGCTATGAAGAACCAGTACGAGGCTTCCGG
CGAGAGTAACGCCGAGAACGATGGATGTACATGCAAGTGTGGATCTGACTGCAAGTGTGA
TCCTTGCACCTGTAAATGAGTAAAACCCTTTTTAAGAAAGGCAGAGATAATCAGTTTGTC
TTTTTAGTTAAGTAATAATACTACCGCAATGATCGTTTTATTAGGTTTTGCTTTTTATGT
TTAATAATGGGCTGCAACGTTGCCTTTCTTTCGTTTGTGTGTTTGGTCTGTTTCTGCCAA
TTTGTGACCATTATATATGATGAGCCACTTTGAT

QA 4 517 4 517
DS 

RD RS1CR26TF 517 0 0
GGA
TTTGCGATAAAACTTTTGGTTAATTCTCTTTCGAGTTGGGATCTTTCTTTAAACTTTCTC
GAGAAAAATGTCTTGCTGCGGAGGAAACTGTGGTTGTGGATCTGCCTGCACGTGCGTCAA
CGGTTGTTGTGGAGGTTGCAAAAAGTACCCTGACTTAGGCTTTTCCGGCGAGACAACCAC
GAGTGAGACTTTTGTCTCTGGCGTTGCACCGGCTATGAAGAACCAGTACGAGGCTTCCGG
CGAGAGTAACGCCGAGAACGATGGATGTACATGCAAGTGTGGATCTGACTGCAAGTGTGA
TCCTTGCACCTGTAAATGAGTAAAACCCTTTTTAAGAAAGGCAGAGATAATCAGTTTGTC
TTTTTAGTTAAGTAATAATACTACCGCAATGATCGTTTTATTAGGTTTTGCTTTTTATGT
TTAATAATGGGCTGCAACGTTGCCTTTCTTTCGTTTGTGTGTTTGGTCTGTCTCTGCCAA
TTTGTGACCATTATATATGATGAGCCACTTTGAT

QA 4 517 4 517
DS 



AS 1 3

CO CL3750Contig1 743 3 2 U
AGATGAATATTAATTGTGCATTCTTTCAGAAAACAGAATTGTTTAGATATTTAACACAAT
ATTTGGAAATGTATTCTTTACTTTGAACAACTTCTTCTGTATTTCAGCTTTGGTCAAAAA
TAAACCCCAAAATAATCACTTTTATCATCCTGAATTCATGATCATGATCCTGATCATTAA
AGTGATTCAGCTAGTAGCTTGAAGCTTTAAGCCGCCAGCATCTGATGCTCTAGGTTTAAC
GGTGAATGCGATCACGTGAGAAGAAGATGATTCTGATTCCATCTTGAAAGGTACCTCAAA
CTGAACAGACTGGTACAAGAAAACCTCGTCTTCTTTGCAATAGTACACCTTGCAACTGAT
TTTTCCAATAGAAGCAGAAGTTGAAGATTGTCTATAATGAAGCACCGTAGAACCTTCAGG
GCCAAGGATTCCTTCCAATGGTTCGACCGTTACTGCGTCTTCAGGCTCAACATCAACCAC
AAACTTACTCCGCGCTTCCTTGGAGAAATGGTAGCCATCTGGTAATGAGATTTTAAGATT
CAAATCTCCTTCACGAGATGTAACAGCATCCACTGTGACAATCTTTGTATCGGCCGAGGC
ACGTTTCCTCAAACGTTTCAAGGATTTTGCCTTTGGCATTGGCGGTTGAACGCCTTTTAA
CTCCAGTGTACGAATCTCTACATCTTCTTTGTTGTTCAAATCTATGTATCGTATAAGACT
ATTGTTTGTATCCGCAACAAAAA


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GT95JQ U 1
AF RS1GT95TF C 153
AF RS1GG57JQ U 3
BS 1 671 RS1GT95JQ
BS 672 743 RS1GG57JQ

RD RS1GT95JQ 672 0 0
AGATGAATATTAATTGTGCATTCTTTCAGAAAACAGAATTGTTTAGATATTTAACACAAT
ATTTGGAAATGTATTCTTTACTTTGAACAACTTCTTCTGTATTTCAGCTTTGGTCAAAAA
TAAACCCCAAAATAATCACTTTTATCATCCTGAATTCATGATCATGATCCTGATCATTAA
AGTGATTCAGCTAGTAGCTTGAAGCTTTAAGCCGCCAGCATCTGATGCTCTAGGTTTAAC
GGTGAATGCGATCACGTGAGAAGAAGATGATTCTGATTCCATCTTGAAAGGTACCTCAAA
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CTCCAGTGTAC
C

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C

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DS 

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C
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GAATGCGATCACGTGAGAAGAAGATGATTCTGATTCCATCTTGAAAGGTACCTCAAACTG
AACAGACTGGTACAAGCAAACCTCGTCTTCTTTGCAATAGTACACCTTGCAACTGATTTT
TCCAATAGAAGCAGAAGTTGAAGATTGTCTATAATGAAGCACCGTAAAACCTTCAGGGCC
AAGGATTCCTTCCAATGGTTCGACCGTTACTGCGTCTTCAGGCTCAACATCAACCACAAA
CTTACTCCGCGCTTCCTTGGAGAAATGGTAGCCATCTGGTAATGAGATTTTAAGATTCAA
ATCTCCTTCACGAGATGTAACAGCATCCACTGTGACAATCTTTGTATCGGCCGAGGCACG
TTTCCTCAAACGTTTTAAGGATTTTGCCTTTGGCATTGGCGGTTGAACGCCTTTTAACTC
CAGTGTACGAATCTCTACATCTTCTTTGTTGTTCAAATCTATGTATCGTATAAGACTATT
GTTTGTATCCGCAACAAAAA

QA 2 741 2 741
DS 



AS 1 3

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AGAGATCGCCGATCAAAACTTCTTCCGCTACTGCCTCCTCGCCCTAATTTACTCCGGCCC
ACCCACCGCCATCGCTCTCAAATTCCTCCAAGCTCCTTACGGCAAACACAACCGCACCGG
ATGGGGCCCCACTTTATCTCCCCCACTCGCTTGGTTCCTCATGGAGAGCCCCACCTTATG
GCTCTCCCTCCTCCTCTTCCCCTTCGGCCGCCACTTTCTCAATCCAAAATCTCTCCTCCT
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CCGCAGCTCCTCCCCGAGTAAAAAGGGCTTTCCGATCAGCGTCGCCGCCATGGCGTTCAC
CTTTAATCTCTTCAACGCCTATATCCAGGCGAGGTACGTTTCTCATTACAAGAACGACTA
CGAAGTACAGTGGTTCTGGTGGCGGTTTATCGTTGGTTCGGTGATCTTCGTAACCGGTAT
GTGGATTAACATCACGTCGGACCGGACTCTGGTACGGCTGAAGAGGGAGCACTACGGAGT
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GGTGGTCGAGTGGTTCGGCTGGGGTGTAATGACTTGGTCTTGGCCCGGGATTGGATTTTT
TCTGTACACGTGTTCCAACTTGATCCCGCGCGCACATGCGAGCCACATATGGTACAATGA
CAAGTTTAGAGCCGAGTACCCCAAGACTCGGAAAGCTGTTATTCCTTTTGTGTTCTGAAG
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TAGTTCTCTTAATTTTGGTTTATTGTTCCGGTTTATGTTGGTGTGTTCTTCAGTAGTGCA
AAACTGTGTGTCATTAAGACAAAAGGTTTGAATAAAAGAGTGCCACGTCAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1B281TF U 601
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RD RS1DT54TF 796 0 0
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CGAAGTACAGTGGTTCTGGTGGCGGTTTATCGTTGGTTCGGTGATCTTCGTAACCGGTAT
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*CTGTACACGTGTTCCAACTTGATCCCGCGCGCACATGCGAGCCACATATGGTACA*TGA
CA*GTTTAGAGCCGAG

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DS 

RD RS1DT54JQ 696 0 0
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CGCCTATATCCAGGCGAGGTACGTTTCTCATTACAAGAACGACTACGAAGTACAGTGGTT
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CGGCTGGGGTGTAATGACTTGGTCTTGGCCCGGGATTGGATTTTTTCTGTACACGTGTTC
CAACTTGATCCCGCGCGCACATGCGAGCCACATATGGTACAATGACAAGTTTAGAGCCGA
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QA 1 696 1 696
DS 

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GG
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TGGTCGAGTGGTTCGGCTGGGGTGTAATGACTTGGTCTTGGCCCGGGATTGGATTTTTTC
TGTACACGTGTTCCAACTTGATCCCGCGCGCACATGCGAGCCACATATGGTACAATGACA
AGTTTAGAGCCGAGTACCCCAAGACTCGGAAAGCTGTTATTCCTTTTGTGTTCTGAAGAA
AAGAAGAAACCATTTAACCCTTTTCTAATTTAGCTTCGTCTAGATTCAGTAACCGGTTTA
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QA 3 409 3 409
DS 



AS 1 3

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GTTCACAAGACAACATAGAACAAGTCTCCAAAAACACACACATTCATTCATTTACCAATT
CACACGATCCAAGAGAGAGTCTTCCGGATCTCAGACCCGACCCGACCGACACTCTCCCTA
AGAGAAACCGGGCAGTTATTCCTAACAGCAGTGAGATTATAAGGCGAAGTATCGGTCGCA
AGCCATTGCTCAACTTCAAAGCTTTGCTTCGAGCACTTAGCGTGGACTCCTGCCGTCGTG
ACCTCCACGTAGTTAACATACCAACCGTGGTGGTCGCCAGAGCCGTCGGAGGTCAGATTC
AACGAACAGACTGGGCTTGGAAGACACGGTGCTTTCCCACTGAAAATGTCGAGATTACCC
CTCTCGTAGTACTTGTAACCTGGTCCCATTAGCCCACCCCATGCCTCTAGGTTTCGGATC
CCAATGTAGTCTCCGTATTTGTCGTAGATTCTAGCGCTTATGATCGATTCAGTGCCGGCT
TTCCAGATCGATCCGGTCCTGAGGTAGAATGTGTACACACATTCTGCATCATCGTCGCCG
AATGAGACTGAGGAGAAGGTGGCGATGACGAGGAGGACGGAGAGGAGGAGAACGTCGCAG
CGAGCCATTATTGGTGATATGAATGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E937JQ U 1
AF RS1FW72JQ U 29
AF RS1FW72TF C 97
BS 1 273 RS1E937JQ
BS 274 637 RS1FW72JQ
BS 638 688 RS1FW72TF

RD RS1E937JQ 273 0 0
GGATCAACAAAAACTGAAAATTTTATTTGATCGAATCATTTTTCTTTATTGCAATCACAC
GTTCACAAGACAACATAGAACAAGTCTCCAAAAACACACACATTCATTCATTTACCAATT
CACACGATCCAAGAGAGAGTCTTCCGGATCTCAGACCCGACCCGACCGACACTCTCCCTA
AGAGAAACCGGGCAGTTATTCCTAACAGCAGTGAGATTATAAGGCGAAGTATCGGTCGCA
AGCCATTGCTCAACTTCAAAGCTTTGCTTCGAG

QA 1 273 1 273
DS 

RD RS1FW72JQ 609 0 0
GATCGAATCATTTTTCTTTATTGCAATCACACGTTCACAAGACAACATAGAACAAGTCTC
CAAAAACACACACATTCATTCATTTACCAATTCACACGATCCAAGAGAGAGTCTTCCGGA
TCTCAGACCCGACCCGACCGACACTCTCCCTAAGAGAAACCGGGCAGTTATTCCTAACAG
CAGTGAGATTATAAGGCGAAGTATCGGTCGCAAGCCATTGCTCAACTTCAAAGCTTTGCT
TCGAGCACTTAGCGTGGACTCCTGCCGTCGTGACCTCCACGTAGTTAACATACCAACCGT
GGTGGTCGCCAGAGCCGTCGGAGGTCAGATTCAACGAACAGACTGGGCTTGGAAGACACG
GTGCTTTCCCACTGAAAATGTCGAGATTACCCCTCTCGTAGTACTTGTAACCTGGTCCCA
TTAGCCCACCCCATGCCTCTAGGTTTCGGATCCCAATGTAGTCTCCGTATTTGTCGTAGA
TTCTAGCGCTTATGATCGATTCAGTGCCGGCTTTCCAGATCGATCCGGTCCTGAGGTAGA
ATGTGTACACACATTCTGCATCATCGTCGCCGAATGAGACTGAGGAGAAGGTGGCGATGA
CGAGGAGGA

QA 1 609 1 609
DS 

RD RS1FW72TF 592 0 0
CACACATTCATTCATTTACCAATTCACACGATCCAAGAGAGAGTCTTCCGGATCTCAGAC
CCGACCCGACCGACACTCTCCCTAAGAGAAACCGGGCAGTTATTCCTAACAGCAGTGAGA
TTATAAGGCGAAGTATCGGTCGCAAGCCATTGCTCAACTTCAAAGCTTTGCTTCGAGCAC
TTAGCGTGGACTCCTGCCGTCGTGACCTCCACGTAGTTAACATACCAACCGTGGTGGTCG
CCAGAGCCGTCGGAGGTCAGATTCAACGAACAGACTGGGCTTGGAAGACACGGTGCTTTC
CCACTGAAAATGTCGAGATTACCCCTCTCGTAGTACTTGTAACCTGGTCCCATTAGCCCA
CCCCATGCCTCTAGGTTTCGGATCCCAATGTAGTCTCCGTATTTGTCGTAGATTCTAGCG
CTTATGATCGATTCAGTGCCGGCTTTCCAGATCGATCCGGTCCTGAGGTAGAATGTGTAC
ACACATTCTGCATCATCGTCGCCGAATGAGACTGAGGAGAAGGTGGCGATGACGAGGAGG
ACGGAGAGGAGGAGAACGTCGCAGCGAGCCATTATTGGTGATATGAATGTCC

QA 1 592 1 592
DS 



AS 1 3

CO CL3753Contig1 755 3 6 U
TTTTTTTTGAGCTTACGGAGGCGATCTCATGGCAATGGAGATGGCTGTAGACGCGGCAGG
CGAGTTAGGCTTCCCTTACTGGAATCCTCTCCGACGAAGGTTTCCTCCCGATTCTCCTTT
CTTCGCTTCCGGAAATGTCGAGCGCGAACTACTCGCTAAACAGGTGGCATTGGACTTAAC
AGAAGACGAAATTAACAATCTGCAGATTGTAGTGGATACTGAAAGCAGAAGAATCTCGTG
TCCCATTGTTGGCTGCCCTGAGCGCCTGAAATCTCTGGACAGTTTTGAAGATCACTACAA
GGCACGGCACACTGCGGCTTGTTCAGTATGCTCAAGGGTCTACCCTACTTCTCGCTTGCT
AAGTATACACATTTCTGAAGCACATGACTCTTTCTTTCAAGCTAAAGTTGCTCGGGGCTA
TGACATGTACGAATGCCTCGTGGAAGGGTGTGGATTGAAGTTCAAGAACTACAAAGCCAG
GCATCGTCACTTAGTTGACAAACACAAGTTCCCAACGACGTTCGAATTCTTCAAGAGGAC
CCAACTCTCTAAGAAGCGAAGAGAGAAACTTCAGAGGCAACGTGTACCAAAGCTGAAACA
CGAAGAAGACAAGGAAGATGCTTCTTCGGACGCCATGGAAGTGGAAGACAAAGCCAACCT
TGACGGTCTCGTCTCAGCACTGTCCACGCTCACCACCTCAGACACAACTCCTTCGAATGT
CAGCTTCGGGAGACGCCATGGTCGTGGGCTGACCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DE78TF U 1
AF RS1F284JQ C 315
AF RS1F284TF U 1
BS 1 396 RS1DE78TF
BS 397 397 RS1F284TF
BS 398 432 RS1DE78TF
BS 433 433 RS1F284TF
BS 434 609 RS1DE78TF
BS 610 755 RS1F284TF

RD RS1DE78TF 609 0 0
TTTTTTTTGAGCTTACGGAGGCGATCTCATGGCAATGGAGATGGCTGTAGACGCGGCAGG
CGAGTTAGGCTTCCCTTACTGGAATCCTCTCCGACGAAGGTTTCCTCCCGATTCTCCTTT
CTTCGCTTCCGGAAATGTCGAGCGCGAACTACTCGCTAAACAGGTGGCATTGGACTTAAC
AGAAGACGAAATTAACAATCTGCAGATTGTAGTGGATACTGAAAGCAGAAGAATCTCGTG
TCCCATTGTTGGCTGCCCTGAGCGCCTGAAATCTCTGGACAGTTTTGAAGATCACTACAA
GGCACGGCACACTGCGGCTTGTTCAGTATGCTCAAGGGTCTACCCTACTTCTCGCTTGCT
AAGTATACACATTTCTGAAGCACATGACTCTTTCTTCCAAGCTAAAGTTGCTCGGGGCTA
TGACATGTACGAGTGCCTCGTGGAAGGGTGTGGATTGAAGTTCAAGAACTACAAAGCCAG
GCATCGTCACTTAGTTGACAAACACAAGTTCCCAACGACGTTCGAATTCTTCAAGAGGAC
CCAACTCTCTAAGAAGCGAAGAGAGAAACTTCAGAGGCAACGTGTACCAAAGCTGAAACA
CGAAGAAGA

QA 1 609 1 609
DS 

RD RS1F284JQ 357 0 0
CGGCTTGTTCAGTATGCTCAAGGGTCTACCCTACTTCTCGCTTGCTAAGTATACACATTT
TTGAAGCACATGACTCTTTCTTTCAAGCTAAAGTTGCTCGGGGCTATGACATGTACGAAT
GCCTCGTGGAAGGGTGTGGATTGAAGTTCAAGAACTACAAAGCCAGGCATCGTCACTTAG
TTGACAAACACAAGTTCCCAACGACGTTCGAATTTTTCAAGAGGACCCAACTCTTTAAGA
AGCGAAGAGAGAAACTTCAGAGGCAACGTGTACCAAAGCTGAAACACGAAGAAGACAAGG
AAGATGCTTTTTCGGACGCCATGGAAGTGGAAGACAAAGCCAACCTTGACGGTCTCG

QA 1 357 1 357
DS 

RD RS1F284TF 755 0 0
TTTTTTTTGAGCTTACGGAGGCGATCTCATGGCAATGGAGATGGCTGTAGACGCGGCAGG
CGAGTTGGGCTTCCCTTACTGGAATCCTCTCCGACGAAGGTTTCCTCCCGATTCTCCTTT
CTTCGCTTCCGGAAATGTCGAGCGCGAACTACTCGCTAAACAGGTGGCATTGGACTTAAC
AGAAGACGAAATTAACAATCTGCAGATTGTAGTGGATACTGAAAGCAGAAGAATCTCGTG
TCCCATTGTTGGCTGCCCTGAGCGCCTGAAATCTCTGGACAGTTTTGAAGATCACTACAA
GGCACGGCACACTGCGGCTTGTTCAGTATGCTCAAGGGTCTACCCTACTTCTCGCTTGCT
AAGTATACACATTTCTGAAGCACATGACTCTTTCTTTCAAGCTAAAGTTGCTCGGGGCTA
TGACATGTACGAATGCCTCGTGGAAGGGTGTGGATTGAAGTTCAAGAACTACAAAGCCAG
GCATCGTCACTTAGTTGACAAACACAAGTTCCCAACGACGTTCGAATTCTTCAAGAGGAC
CCAACTCTCTAAGAAGCGAAGAGAGAAACTTCAGAGGCAACGTGTACCAAAGCTGAAACA
CGAAGAAGACAAGGAAGATGCTTCTTCGGACGCCATGGAAGTGGAAGACAAAGCCAACCT
TGACGGTCTCGTCTCAGCACTGTCCACGCTCACCACCTCAGACACAACTCCTTCGAATGT
CAGCTTCGGGAGACGCCATGGTCGTGGGCTGACCT

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL3754Contig1 484 2 2 U
GGACGGTAAAGAGAGAAAGTAACGAGTAGACAGAGATATATAGAGCAGAGAAGATGGCAT
TCGCAACGAAATCAGTTTCTTCTTTCGCCATCATTTTCATACTCGTTTTGGTTATCTTTG
AAGTGCCGGAGATAGAAGCGCATGATGACGAGTGCCTGCTAGAATACGGCGGCGATGTGG
GTTTCAGCTTCTGTGCGCCTGAGATATTTCCGTCGTTTTGTTATACAAATTGCCGTAAGG
ACAAGGGCGCACAAGGTGGAACATGCATTTGGGGAGATTACGGTACCGTTGATGTTAAAT
GCTTATGCGACTACTGCAGCGACATACCTAATGACAAGATTCTAAGTGGTGGTATTTGAA
TCCTGCATGTGTCATCATTGGTTTGGTGTAATAATATATGTGGAAAAGATCTAAGTACCA
ATGTAAATGACGAATATTTGAAATAAAAAAGCCCGAAGTAATGAGGCTCCCATGGTTTGA
AGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1FJ80TF U 1
AF RS1GJ73TF U 63
BS 1 435 RS1FJ80TF
BS 436 484 RS1GJ73TF

RD RS1FJ80TF 435 0 0
GGACGGTAAAGAGAGAAAGTAACGAGTAGACAGAGATATATAGAGCAGAGAAGATGGCAT
TCGCAACGAAATCAGTTTCTTCTTTCGCCATCATTTTCATACTCGTTTTGGTTATCTTTG
AAGTGCCGGAGATAGAAGCGCATGATGACGAGTGCCTGCTAGAATACGGCGGCGATGTGG
GTTTCAGCTTCTGTGCGCCTGAGATATTTCCGTCGTTTTGTTATACAAATTGCCGTAAGG
ACAAGGGCGCACAAGGTGGAACATGCATTTGGGGAGATTACGGTACCGTTGATGTTAAAT
GCTTATGCGACTACTGCAGCGACATACCTAATGACAAGATTCTAAGTGGTGGTATTTGAA
TCCTGCATGTGTCATCATTGGTTTGGTGTAATAATATATGTGGAAAAGATCTAAGTACCA
ATGTAAATGACGAAT

QA 1 435 1 435
DS 

RD RS1GJ73TF 422 0 0
GG
AACGAAATCAGTTTCTTCTTTCGCCATCATTTTCATACTCGTTTTGGTTATCTTTGAAGT
GCCGGAGATAGAAGCGCATGATGACGAGTGCCTGCTAGAATACGGCGGCGATGTGGGTTT
CAGCTTCTGTGCGCCTGAGATATTTCCGTCGTTTTGTTATACAAATTGCCGTAAGGACAA
GGGCGCACAAGGTGGAACATGCATTTGGGGAGATTACGGTACCGTTGATGTTAAATGCTT
ATGCGACTACTGCAGCGACATACCTAATGACAAGATTCTAAGTGGTGGTATTTGAATCCT
GCATGTGTCATCATTGGTTTGGTGTAATAATATATGTGGAAAAGATCTAAGTACCAATGT
AAATGACGAATATTTGAAATAAAAAAGCCCGAAGTAATGAGGCTCCCATGGTTTGAAGGT

QA 3 422 3 422
DS 



AS 1 3

CO CL3755Contig1 1347 3 11 U
GGGACCAGACGTGGTAAACTACAGAAATGCACTTTCTGTTTGTGATAATCACAAAATAAC
CCAACCCTAAATTAACCTTTTCTCCTCTTCTGATTTACCGTCGGCAAAAAAAATCTGCAT
ATCTAATGCCTACCTCTTTTCTGAAAACTTCAATTCACCGTTTCAAGTAGCAGCTCATTC
TCTAATCGAACCATTTCCGTCGGATCCATCGCTTTCCGAAGGTTTGGAAGTGGACAACAA
CAAGTCAAGAACAATGTCGCAGCTACTAATTGTGTGACTAAGAAACGAACATAACCTGAG
TCGCACTCTCAGGTCGCTGGTCGCGGGTCGCTGCGACCGGGAAAAGAACAGGACCGTCAT
TACCACTTTCGTTCTGTATTTGTGTTTCGAAAGCTCTAGGTATTTTCGCTTCTGGATTTG
AAGCTGGAGTTCAAGCCGCCATAATATTCTCTCATCTGTTTCGTCTCTTTAGTAATAACG
AAAAGAACTGAGCAAGAACGCGGAGAGATGGGGAAACGGGGGAGGAGCTAACAAGCTTAC
AAAAGCTCAAGGAGGACCTAATCTCAAGTCTGTGCTCAGACACGAGCACTTGAAGAATCT
CGCTCTCTGGTCTACCGGCGGAGATTCTCCCATCCCGTCCTTAGCTACTTTCTTCGGTCG
GCGTCTCGCAGCCGATGGACAAGCTTCCGACATTCCTCACGATCCTGACCTCTTCTCTTG
TCAAAGGTGTGAGACTTTTCTTCAGCCTGGCTTCAATTGTAATGTTAGAATCGACAAGGT
TTCGGCTAATAAGAAGAAACACATGAGGAGAAGGTACAAGAAGAAGCCTAACATGTTTCT
GCCTCAGAACAATGTAGTTTACTACTGCAACTTGTGTTCTCACCGTAATCTCAAGAGAGG
TACTACAAAAGGTCAGATGAAAGACATGTACCCGCCCAAGCCGAAAACAACTCGTCCACG
TCCCAAGATTGATAAAGAGGTGACGGTGGTGGTAGCGCCTCAAGAAATCCAACTTCCTTG
TTCACCTGAAAGAAGAGTTGAGAATGTTAGTGTTGTGGTGAATACACCAAGGCCAATGCT
TACACTGGAGAGAGAGAAGAGAATAAGGAAATCCAAAAGTAAGAAACCAGTTGAGCCGGA
AAGTGTTCCTGAGAAAAAAGCAACAGTTGGTGGTGTTGGTGGAGGATCGAATAAGAGGAA
GAGAAAAGCATGGACAAGTATGAAGGAGTTGTCTGAGACTACTACAACAAACAAGGGTTC
CAGTTCTGTAAACTTTAAAATACCCCTTCTCTTGTGATTTTCTTCTATGTGATATCTGAC
CCAACACTAAGTGAAGTTTTTCGAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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BQ
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20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ES20TF U 7
AF RS1FV68TF U 1
AF RS1FV68JQ C 128
BS 1 636 RS1FV68TF
BS 637 637 RS1FV68JQ
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BS 771 771 RS1FV68JQ
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BS 782 782 RS1FV68JQ
BS 783 814 RS1FV68TF
BS 815 898 RS1FV68JQ

RD RS1ES20TF 600 0 0
GG
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CGGACTCAGATTCATTCCTTGAAGCGTTCGAACCTCCCTCTTCAGTACTCCCTCCCGTAT
AAGGCCAATTCACGGAGCAGAAGTAGAAGATTGGGACTCACCGTAAGCTCCGTTTCATCG
CCCAGAGTTGAGCTCCGTACTGGACCCGATGATCTCATTTCATCCCTCCTCTCCAAGGTT
GCGAACAGCGATGGAGGTGTGACACTCACCCCTGAGGAACACAAGGAAGTGGCACAAGTA
GCTGGGGAGCTTCAGAAGTATTGTGTGAGCGAGCCTGTTAAATGCCCTCTCATTTTCGGA
GATTGGGACGTGGTGTACTGTTCTAGACCGACCTCTCCTGGTGGAGGCTACAGAAGTGTG
ATAGGCCGACTCTTCTTCAGAACTAAAGAGATGATCCAAGGTATTGATTCTCCTGATACC
GTGAGGAACAGAGTTTCCTTCACTGCTCTTGGTTTTCTCGATGGAGATGTCTCTTTGACA
GGGAAGCTGAACGTGCTGGACAGTGAGTGGGTTCAGGTGATATTCGAGCCTCCGGAAC

QA 3 600 3 600
DS 

RD RS1FV68TF 814 0 0
GTCTCTATAGAGCAACAATGGCTACGGCTGCTTCTTCCCTTGCGATTGCGTCGTCCTTCT
CCGAACAACGGACTCAGATTCATTCCTTGAAGCGTTCGAACCTCCCTCTTCAGTACTCCC
TCCCGTATAAGGCCAATTCACGGAGCAGAAGTAGAAGATTGGGACTCACCGTAAGCTCCG
TTTCATCGCCCAGAGTTGAGCTCCGTACTGGACCCGATGATCTCATTTCATCCCTCCTCT
CCAAGGTTGCGAACAGCGATGGAGGTGTGACACTCACCCCTGAGGAACACAAGGAAGTGG
CACAAGTAGCTGGGGAGCTTCAGAAGTATTGTGTGAGCGAGCCTGTTAAATGCCCTCTCA
TTTTCGGAGATTGGGACGTGGTGTACTGTTCTAGACCGACCTCTCCTGGTGGAGGCTACG
GAAGTGTGATAGGCCGACTCTTCTTCAGAACTAAAGAGATGATCCAAGGTATTGATTCTC
CTGATACCGTGAGGAACAGAGTTTCCTTCACTGCTCTTGGTTTTCTCGATGGAGATGTCT
CTTTGACAGGGAAGCTGAACGTGCTGGACAGTGAGTGGGTTCAGGTGATATTCGAGCCTC
CGGAACTAAAGGTGGGATCGTTGGAGTTTAAATACG*TTTCGAAAGCGAAGTGAAGCTTC
AGATCACGTACGTTGATGAGAAACTTAG*TTGGGAATAG*CTCTAGAGGATCATTGTTCG
TCTTTAGGAGGCGTCAATAATTAATACATTATATGAACTTC*ATTTCTCT*CTCTCCCAG
T*CTGTATCACTCAATGCAAATTCACTACAGAAA

QA 1 814 1 814
DS 

RD RS1FV68JQ 771 0 0
TAAGGCCAATTCACGGAGCAGAAGTAGAAGATTGGGACTCACCGTAAGCTCCGTTTCATC
GCCCAGAGTTGAGCTCCGTACTGGACCCGATGATCTCATTTCATCCCTCCTCTCCAAGGT
TGCGAACAGCGATGGAGGTGTGACACTCACCCCTGAGGAACACAAGGAAGTGGCACAAGT
AGCTGGGGAGCTTCAGAAGTATTGTGTGAGCGAGCCTGTTAAATGCCCTCTCATTTTCGG
AGATTGGGACGTGGTGTACTGTTCTAGACCGACCTCTCCTGGTGGAGGCTACGGAAGTGT
GATAGGCCGACTCTTCTTCAGAACTAAAGAGATGATCCAAGGTATTGATTCTCCTGATAC
CGTGAGGAACAGAGTTTCCTTCACTGCTCTTGGTTTTCTCGATGGAGATGTCTCTTTGAC
AGGGAAGCTGAACGTGCTGGACAGTGAGTGGGTTCAGGTGATATTCGAGCCTCCGGAACT
AAAGGTGGGATCGTTGGAGTTTAAATACGGTTTCGAAAGCGAAGTGAAGCTTCGGATCAC
GTACGTTGATGAGAAACTTAGGTTGGGAATAGGCTCTAGAGGATCATTGTTCGTCTTTAG
GAGGCGTCAATAATTAATACATTATATGAACTTCCATTTCTCTTCTCTCCCAGTTCTGTA
TCACTCAATGCAAATTCACTACAGAAAAGAAGAAACAACACATGGGTGTACCTGCGAGAG
TGTTTTAAGATGGAAACATTGTTGTGTAATGTAAACTTCTATCCAAAAGGG

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 3

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CTTCCTCTGCGAGATCCTTCATCACCACAAAACCTCAGCCTATTGATTCGTTTCTACCCA
AACCACAGCTAGAGAATGCGGGTGGGTGTTCTTACACGGTGATCATTAAGACAAGCTGTT
CCTCGGTGTCTTACACCAGAGATAAGATCAGTATCGCGTTTGGTGATGTCTACGGCAACG
AGGTATACGTGAAGAGACTAGACGATCCACACTCGAGGGCATTTGAAAGGTGTTCTTCGG
ACACATACAAGATAACAGGACTGTGTATGCATGACGTCTGTTATCTCTACCTACTCAGAC
AAGGATACGACGGCTGGAAACCAGAGAACGTCAAGATCTATGGCTCGTACATCAGATCAG
CCACTTTCTACTATAACCTCTTCTTGCCTAACTCTGTTTGGTACGGCTTTAACGTCTGCA
ACGGCATTGCCAAGTCTTCTCAGCCCAACATTGCCTCCGTTGCAGCTATGTAAAACTGAA
CGAGAAGCAATCTGTTTCGAGTGTATTTGTGAGGGGAAAAAAACATGTAATTTTAAAAGT
TAAAAAAGCTTTAAATCAAATAAATGCAATGTGGTTTACAAGGACTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BP38TF U 1
AF RS1E125TF U 1
AF RS1E125JQ C 177
BS 1 381 RS1BP38TF
BS 382 382 RS1E125TF
BS 383 432 RS1BP38TF
BS 433 433 RS1E125TF
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RD RS1BP38TF 615 0 0
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TAGGAAAAATGCTCAGGTGGTTAGCTTTGTTTCTGTTTGTCTTATGCTGTCTCACAACGT
CTTCCTCTGCGAGATCCTTCATCACCACAAAACCTCAGCCTATTGATTCGTTTCTACCCA
AACCACAGCTAGAGAATGCGGGTGGGTGTTCTTACACGGTGATCATTAAGACAAGCTGTT
CCTCGGTGTCTTACACCAGAGATAAGATCAGTATCGCGTTTGGTGATGTCTACGGCAACG
AGGTATACGTGAAGAGACTAGACGATCCACACTCGAGGGCATTTGAAAGGTGTTCTTCGG
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AAGGATACGACGACTGGAAACCAGAGAACGTCAAGATCTATGGCTCGTACATCAGATCAG
CCACTTTCTACTATAACCTCTTCTTGCCTAACTCTGTTTGGTACGGCTTTAACGTCTGCA
ACGGCATTGCCAAGTCTTCTCAGCCCAACATTGCCTCCGTTGCAGCTATGTAAAACTGA*
CGAGAAGCA
TCTGTT

QA 1 609 1 609
DS 

RD RS1E125TF 638 0 0
TTTTTTTGGTCCTAACCACTAAGATCTGAACTTTTTGTTCATCTCCAAACCTTTTCAACT
TAGGAAAAATGCTCAGGTGGTTAGCTTTGTTTCTGTTTGTCTTATGCTGTCTCACAACGT
CTTCCTCTGCGAGATCCTTCATCACCACAAAACCTCAGCCTATTGATTCGTTTCTACCTA
AACCACAGCTAGAGAATGCGGGTGGGTGTTCTTACACGGTGATCATTAAGACAAGCTGTT
CCTCGGTGTCTTACACCAGAGATAAGATCAGTATCGCGTTTGGTGATGTCTACGGCAACG
AGGTATACGTGAAGAGACTAGACGATCCACACTCGAGGGCATTTGAAAGGTGTTCTTCGG
ACACATACAAGATAACAGGACTGTGTATGCATGACGTCTGTTATCTCTACCTACTCAGAC
AAGGATACGACGGCTGGAAACCAGAGAACGTCAAGATCTATGGCTCGTACATCAGATCAG
CCACTTTCTACTATAACCTCTTCTTGCCTAACTCTGTTTGGTACGGCTTTAACGTCTGCA
ACGGCATTGCCAAGTCTTCTCAGCCCAACATTGCCTCCGTTGCAGCTATGTAAAACTGAA
CGAGAAGCAATCTGTTTCGAGTGTATTTGTGAGGGGAA

QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1E125JQ 531 0 0
CCT
AAACCACAGCTAGAGAATGCGGGTGGGTGTTCTTACACGGTGATCATTAAGACAAGCTGT
TCCTCGGTGTCTTACACCAGAGATAAGATCAGTATCGCGTTTGGTGATGTTTACGGCAAC
GAGGTATACGTGAAGAGACTAGACGATCCACACTCGAGGGCATTTGAAAGGTGTTTTTCG
GACACATACAAGATAACAGGACTGTGTATGCATGACGTCTGTTATCTCTACCTACTCAGA
CAAGGATACGACGGCTGGAAACCAGAGAACGTCAAGATTTATGGCTCGTACATCAGATCA
GCCACTTTTTACTATAACCTTTTCTTGCCTAACTCTGTTTGGTACGGCTTTAACGTTTGC
AACGGCATTGCCAAGTTTTTTCAGCCCAACATTGCCTCCGTTGCAGCTATGTAAAACTGA
ACGAGAAGCAATTTGTTTCGAGTGTATTTGTGAGGGGAAAAAAACATGTAATTTTAAAAG
TTAAAAAAGCTTTAAATCAAATAAATGCAATGTGGTTTACAAGGACTC

QA 4 531 4 531
DS 



AS 1 2

CO CL3758Contig1 744 2 2 U
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CAAGGTGATGATATCAGATGAGTGTGCCGGCTGCACGAAGGAGGCGTTCCATTTTGATCT
TAGCGGTAAGGCATTTGGTGCATTGGCCAAACGTGGCAAAGGCGATGAATTACGTAACCT
TGGAGAACTAAAGGTTAGGTACAAACGTGCATGTTGCAAACATCCTAAGAGTAAAATAGC
TATTCATGTCGACGCCGAAGCAAACCCTTACTACATGTCGTTCGCCGTTAAGTTTGCAAA
CGGTGATGGAAACTTTGCATGCGTGGAGATTCAACCGGCTGGTGGAGAATACTTGAAAAT
GGACGAGATGAGATCCGCCGTTCGGAAACTTAACCCAGGCTGTGCATTGAAAGGTCCGTT
CAACGTCCGGCTTACCTCCGCAGTGACCAAAAAAGTGATCGTTGCTAAAGCTGTTATCCC
GGAGAAATGGAGTCCCGGTGCTATTTACCATTCCCTCGTTAACTTCGCCACTCCCAAGAA
ACGTAGTCCCAAGAAACATTAATGATTGATTTTTTCCCTTCACACAAATAGTAATGTTTG
GGAAAAAAACGAGGGGTGTTGCGGTTGCTAGTAAATTGTTTTGATAATTGTAACATTGGT
TATGTAATTCATATGGGGTAAGAGTTGTACTTGGATGGCCTACAAAGCCCATGATTTTTT
TCATATATAAACCGATTTGGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FS92TF U 1
AF RS1FS92JQ C 122
BS 1 602 RS1FS92TF
BS 603 744 RS1FS92JQ

RD RS1FS92TF 602 0 0
GGGTTGTGGGGCATGTTATAGGCTTGTATGTGACCATCCATTATGCAACAAAAGACCGAT
CAAGGTGATGATATCAGATGAGTGTGCCGGCTGCACGAAGGAGGCGTTCCATTTTGATCT
TAGCGGTAAGGCATTTGGTGCATTGGCCAAACGTGGCAAAGGCGATGAATTACGTAACCT
TGGAGAACTAAAGGTTAGGTACAAACGTGCATGTTGCAAACATCCTAAGAGTAAAATAGC
TATTCATGTCGACGCCGAAGCAAACCCTTACTACATGTCGTTCGCCGTTAAGTTTGCAAA
CGGTGATGGAAACTTTGCATGCGTGGAGATTCAACCGGCTGGTGGAGAATACTTGAAAAT
GGACGAGATGAGATCCGCCGTTCGGAAACTTAACCCAGGCTGTGCATTGAAAGGTCCGTT
CAACGTCCGGCTTACCTCCGCAGTGACCAAAAAAGTGATCGTTGCTAAAGCTGTTATCCC
GGAGAAATGGAGTCCCGGTGCTATTTACCATTCCCTCGTTAACTTCGCCACTCCCAAGAA
ACGTAGTCCCAAGAAACATTAATGATTGATTTTTTCCCTTCACACAAATAGTAATGTTTG
GG

QA 1 602 1 602
DS 

RD RS1FS92JQ 623 0 0
AGCGGTAAGGCATTTGGTGCATTGGCCAAACGTGGCAAAGGGGATGAATTACGTAACCTT
GGAGAACTAAAGGTTAGGTACAAACGTGCATGTTGCAAACATCCTAAGAGTAAAATAGCT
ATTCATGTTGACGCCGAAGCAAACCCTTACTACATGTCGTTCGCCGTTAAGTTTGCAAAC
GGTGATGGAAACTTTGCATGGGTGGAGATTCAACCGGCTGGTGGAGAATACTTGAAAATG
GACGAGATGAGATCCGCCGTTTGGAAACTTAACCCAGGCTGTGCATTGAAAGGTCCGTTC
AACGTCCGGCTTACCTCCGCAGTGACCAAAAAAGTGATCGTTGCTAAAGCTGTTATCCCG
GAGAAATGGAGTCCCGGTGCTATTTACCATTCCCTCGTTAACTTCGCCACTCCCAAGAAA
CGTAGTCCCAAGAAACATTAATGATTGATTTTTTCCCTTCACACAAATAGTAATGTTTGG
GAAAAAAACGAGGGGTGTTGCGGTTGCTAGTAAATTGTTTTGATAATTGTAACATTGGTT
ATGTAATTCATATGGGGTAAGAGTTGTACTTGGATGGCCTACAAAGCCCATGATTTTTTT
CATATATAAACCGATTTGGTTTG

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 3

CO CL3759Contig1 671 3 9 U
GAAAATATTCACAAACACAAACAACACTCTTAATTCTTTTTAAAAGACACTAATGACGAT
AAGTTCGAAAACCCAATCTCACCTAATCCTTCCGGTCATCGACTTCTCGATTCCAAACCT
CAAACCGGAAACCCAAGAGTGGGAATCGGTGAGAGCCCAAGTCCGAACAGCCCTAGAAGA
GTACGGATGTTTCGAGGCCTTGTTCGACGGAGCTTCAGTGGAGCTACGGAAGGCACTGTT
CGAGGCATCGGAAGAATTTTTCGATTTACCTCTGGAAACCAAACTGAGAATAAAGTCTGA
CGAACTCTACAAAGGATACGCTGGTCAGCATCCGACTCTACCTTTATACGAGGCTATTGG
CTGTGACGCAGAGAATCCTCAAACTGTCGACGAATTAACCTACAAGCTTTGGCCTCAAGG
CAACGTCACCTTCAGCAATAACGTTCAGTCATTCGCGGTGAATTTAATAGCACTAGACGT
GAAGGTGAGGACGATGATCATGGAGAGTTTCGGTCTCGAGAAATACCTCGTCGAGGAGCA
CCTTAACTCAGCGAGGAAACGCTTTGGTCTCATCAAATATAGAGGACTTGACGAGAACGA
GAGGAGCAGCCAGGCCTCACCCTCATATCGATAGCATTTCTTACATACTTTGTCAAATGA
CGTAGTAGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EX58TF U 283
AF RS1DD67TF U 4
AF RS1CS54TF U 1
BS 1 61 RS1CS54TF
BS 62 62 RS1DD67TF
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BS 480 671 RS1CS54TF

RD RS1EX58TF 215 0 0
G
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TTATACGAGGCTATTGGCTGTGACGCAGAGAATCCCCAAACTGTCGACGAATTAACCTAC
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TTAATAGCACTAGACGTGAAGGTGAGGACGATGA

QA 2 215 2 215
DS 

RD RS1DD67TF 571 0 0
GGG
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ATGTTTCGAGGCCTTGTTCGACGGAGCTTCAGTGGAGCTACGGAAGGCACTGTTCGAGGC
ATCGGAAGAATTTTTCGATTTACCTCTGGAAACCAAACTGAGAATAAAGTCTGACGAACT
CTACAAAGGATACGCTGGTCAGCATCCGACTCTACCTTTATACGAGGCTATTGGCTGTGA
CGCAGAGAATCCTCAAACTGTCGACGAATTAACCTACAAGCTTTGGCCTCAAGGCAACGT
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GAGGACGATGATCATGGAGAGTTTCGGTCTCGAGAAATACCTCGTCGAGGAGCACCTTAA
CTCAGCGAGGAA*CGCTTTGGTCTCATC

QA 4 571 4 571
DS 

RD RS1CS54TF 671 0 0
GAAAATATTCACAAACACAAACAACACTCTTAATTCTTTTTAAAAGACACTAATGACGAT
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GTACGGATGTTTCGAGGCCTTGTTCGACGGAGCTTCAGTGGAGCTACGGAAGGCACTGTT
CGAGGCATCGGAAGAATTTTTCGATTTACCTCTGGAAACCAAACTGAGAATAGAGTCTGA
CGAACTCTACAAAGGATACGCTGGTCAGCATCCGACTCTACCTTTATACGAGGCTATTGG
CTGTGACGCAGAGAATCCTCAAACTGTCGACGAATTAACCTACAAGCTTTGGCCTCAAGG
CAACGTCACCTTCAGCAATAACGTTCAGTCATTCGCGGTGAATTTAATAGCATTAGACAT
GAAGGTGAGGACGATGATCATGGAGAGTTTCGGTCTCGAGAAATACCTCGTCGAGGAGCA
CCTTAACTCAGCGAGGAAACGCTTTGGTCTCATCAAATATAGAGGACTTGACGAGAACGA
GAGGAGCAGCCAGGCCTCACCCTCATATCGATAGCATTTCTTACATACTTTGTCAAATGA
CGTAGTAGATG

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 3

CO CL3760Contig1 1256 3 5 U
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GCTGTTGTTGTTCTTCTTCACGAAGAGCCGATGTTGATAATGGACCTCCCTACTATTACT
ATCCGAGAGCAACAGAAGAGCGTGTTCCTTTATCTTCCGCTCTTAACAGGACTTCCTCTA
CAATCTCCTCTGGTGTTGTTGTGGTTGACACAAACCTAGAGACTTCATCTCCTGATGCTT
ATATACCACCACCACTCCCTACTCCTTTCGATGTGTCTATAGGTGTTCCTCAAACTCCAG
AAATCCGTGAAGAGTCTGCTTGTGTTGATATAAGAGAAGTCTCAGTTGAAGCCGCTAATA
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CAAGGAAATGGTGTTTGACTCTCCCCTCGACTAGAAACCTGCAAGTACCCACAGCTTAGA
AGACTCGTTTCGGCTCTGAATCCCAAAAAAAAAACGAAGAAACATAAAAGAAAAGAAAAG
AAAGATGATTTTGCTTAAATCACAAAAAGTCAATAAAACTACTCGATTCGGTTAAATTAT
TGAAAACAAGATCTGACAGTAACCAACATGGTTCTCGCACACGTACTTGTCCCAAAAGAC
GTCTCCTTTGGACAATGTAATTCAGCAAGGATAAGAAGATAAGGAGTGTCATGTAATCAT
GCTAAACTATGTCAATTTCTTTATTATTTATGGTATGAATAATTTATGAGAATCGGTGAA
GTATACTGTTTCGTGAATTATGTAAAGTTTTAATTAAATGGAGCTGAAGATTAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CB24TF U 1
AF RS1DX08JQ C 122
AF RS1DD83TF U 806
BS 1 516 RS1CB24TF
BS 517 517 RS1DX08JQ
BS 518 625 RS1CB24TF
BS 626 806 RS1DX08JQ
BS 807 1256 RS1DD83TF

RD RS1CB24TF 625 0 0
GGGAGTTTGATAGAGCGCACGATAAACAACACAGCAGCGCAAAAGCAGAGAGGGGACGAA
AAAGAAGGTTTAGATAAAGCAACAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAGTTTGATTTTG
AGATTTCGAACTTCCCTCTTCCTGATTCAATCTCGAGAAAGGTGGCATAGATGCAGAGTC
TTCGGTTTTTGGAATTGTGATAAAGAACACACAAAACAAAAAAAAACATAATGGGAGGCT
GCTGTTGTTGTTCTTCTTCACGAAGAGCCGATGTTGATAATGGACCTCCCTACTATTACT
ATCCGAGAGCAACAGAAGAGCGTGTTCCTTTATCTTCCGCTCTTAACAGGACTTCCTCTA
CAATCTCCTCTGGTGTTGTTGTGGTTGACACAAACCTAGAGACTTCATCTCCTGATGCTT
ATATACCACCACCACTCCCTACTCCTTTCGATGTGTCTATAGGTGTTCCTCAAACTCCAG
AAATCCGTGAAGAGTCTGCTTGTGTTGATATAAGAGGAGTCTCAGTTGAAGCCGCTAATA
CCGAGTCAGCTCAAGAAACAGTCGATGGTATCACTCTAGGGGTTCCAACTACAACATGCC
CGTGTAAAGAAACAGAAAGCAAACT

QA 1 625 1 625
DS 

RD RS1DX08JQ 803 0 0
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TCGGTTTTTGGAATTGTGATAAAGAACACACAAAACAAAAAAAAACATAATGGGAGGCTG
CTGTTGTTGTTCTTCTTCACGAAGAGCCGATGTTGATAATGGACCTCCCTACTATTACTA
TCCGAGAGCAACAGAAGAGCGTGTTCCTTTATCTTCCGCTCTTAACAGGACTTCCTCTAC
AATCTCCTCTGGTGTTGTTGTGGTTGACACAAACTTAGAGACTTCATCTCCTGATGCTTA
TATACCACCACCACTCCCTACTCCTTTCGATGTGTCTATAGGTGTTCCTCAAACTCCAGA
AATCCGTGAAGAGTCTGCTTGTGTTGATATAAGAGAAGTTTCAGTTGAAGCCGCTAATAC
CGAGTCAGCTCAAGAAACAGTCGATGGTATCACTCTAGGGGTTCCAACTACAACATGCCC
GTGTAAAGAAACAGAAAGCAAACTACAGGCAGAGATTGATCTTGAATCTACTGAAGATAT
AGACCCCAAGAAGCTATCGAAAGACGTCTTTGTACCAATAGAGGAAGAGAGGATTGTCCC
ATATGCTTGGAAGAGTATGATATGGATAACCCGAAACTTCTAGCCAAATGTGAGCACCAT
TTTCACCTGGCATGCATTTTAGAATGGATGGAGAGAAGTGAAACTTGCCCCGTCTGCAAC
AAGGAAATGGTGTTTGACTCTCCCCTCGACTAGAAACCTGCAAGTACCCACAGCTTAGAA
GACTCGTTTCGGCTCTGAATCCC

QA 1 803 1 803
DS 

RD RS1DD83TF 451 0 0
G
GGATGGAGAGAAGTGAAACTTGCCCCGTCTGCAACAAGGAAATGGTGTTTGACTCTCCCC
TCGACTAGAAACCTGCAAGTACCCACAGCTTAGAAGACTCGTTTCGGCTCTGAATCCCAA
AAAAAAAACGAAGAAACATAAAAGAAAAGAAAAGAAAGATGATTTTGCTTAAATCACAAA
AAGTCAATAAAACTACTCGATTCGGTTAAATTATTGAAAACAAGATCTGACAGTAACCAA
CATGGTTCTCGCACACGTACTTGTCCCAAAAGACGTCTCCTTTGGACAATGTAATTCAGC
AAGGATAAGAAGATAAGGAGTGTCATGTAATCATGCTAAACTATGTCAATTTCTTTATTA
TTTATGGTATGAATAATTTATGAGAATCGGTGAAGTATACTGTTTCGTGAATTATGTAAA
GTTTTAATTAAATGGAGCTGAAGATTAATG

QA 2 451 2 451
DS 



AS 1 2

CO CL3761Contig1 832 2 12 U
GGTCTCCATCAGAGTTGGCAAACCATCCTCTTATGAAGGAGCCTTATGATATGACACGCG
ATAGAGAGCGCAAACGTGCGTTGTCAATGGTCTTGTCCCAGAGTAGACACCAAGAGAAGA
AGGATGCTGAGATTCTTGCTGAGGCTAAGAGAATCACAGAGATGCGTTTGGCCGCGCGTT
GTGCGGCAGAGCCTGATGTGCCTGCGAATGAGAATATCGGTAGTGTATCTCCATCTTCTA
ATTCTCAACTTCCTGCAACTGCCGTGGCTCCATCCACGCTATGGCAGATTATACATCTAC
CCTTGCTTCTCTGCGCATGCTTCATGTGTACTTAAGAACCTATGGACTTGAACAAATGGT
CCAAGCTGCAAGCTCTGCTGTTGGTCTTCGAACGATCAAGCGTGTTGAGCAGACTCTGCA
AGATCTCGGGGTTAATTTAAAGCCAAAGGTTCCTACAAAAACTGTATGCGATGAGCATCT
CGAATTACGAAAAGAAATCCTAACACTACTGAATCTTCAGAAGCAGTATAAAGAATCAGA
AGGTTCATCACACCGTGAAGGGACATATGCCGCAATGCCAGATACTCCAAAGGATCGCGT
TTTCGCATCTGAGCCATTCAGTTTTGGAGGTGAAAGACCAATCAAGAAAGAACAAAAGCG
CAAGGGTCCTGGAAGACAATCAGATACTCCTTCACCAGCTCATAAGCGGCCCAGAAAAAT
GAAAGCATCTGATCTCTAAGTCCAATAGAAATACTGATTCCAATTTTTCATGTCTATGTA
ATTTTCAGTCAGACGCTGCAATATCTATCAGTTGTTGAATTGTCCCAATGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1EO25TF U 1
AF RS1EO25JQ C 49
BS 1 718 RS1EO25TF
BS 719 719 RS1EO25JQ
BS 720 742 RS1EO25TF
BS 743 743 RS1EO25JQ
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BS 763 764 RS1EO25JQ
BS 765 784 RS1EO25TF
BS 785 785 RS1EO25JQ
BS 786 800 RS1EO25TF
BS 801 801 RS1EO25JQ
BS 802 818 RS1EO25TF
BS 819 832 RS1EO25JQ

RD RS1EO25TF 824 0 0
GGTCTCCATCAGAGTTGGCAAACCATCCTCTTATGAAGGAGCCTTATGATATGACACGCG
ATAGAGAGCGCAAACGTGCGTTGTCAATGGTCTTGTCCCAGAGTAGACACCAAGAGAAGA
AGGATGCTGAGATTCTTGCTGAGGCTAAGAGAATCACAGAGATGCGTTTGGCCGCGCGTT
GTGCGGCAGAGCCTGATGTGCCTGCGAATGAGAATATCGGTAGTGTATCTCCATCTTCTA
ATTCTCAACTTCCTGCAACTGCCGTGGCTCCATCCACGCTATGGCAGATTATACATCTAC
CCTTGCTTCTCTGCGCATGCTTCATGTGTACTTAAGAACCTATGGACTTGAACAAATGGT
CCAAGCTGCAAGCTCTGCTGTTGGTCTTCGAACGATCAAGCGTGTTGAGCAGACTCTGCA
AGATCTCGGGGTTAATTTAAAGCCAAAGGTTCCTACAAAAACTGTATGCGATGAGCATCT
CGAATTACGAAAAGAAATCCTAACACTACTGAATCTTCAGAAGCAGTATAAAGAATCAGA
AGGTTCATCACACCGTGAAGGGACATATGCCGCAATGCCAGATACTCCAAAGGATCGCGT
TTTCGCATCTGAGCCATTCAGTTTTGGAGGTGAAAGACCAATCAAGAAAGAACAAAAGCG
CAAGGGTCCTGGAAGACAATCAGATACTCCTTCACCAGCTCATAAGCGGCCCAGAAAA*T
GAAAGCATCTGATCTCTAAGTC*AATAGAAATACTGATTCCA**TTTTCATGTCTATGTA
ATTT*CAGTCAGACGCTGCA*TATCTATCAGTTGTTGA
TTGTCC

QA 1 818 1 818
DS 

RD RS1EO25JQ 784 0 0
ATATGACACGCGATAGAGAGCGCAAACGTGCGTTGTCAATGGTCTTGTCCCAGAGTAGAC
ACCAAGAGAAGAAGGATGCTGAGATTCTTGCTGAGGCTAAGAGAATCACAGAGATGCGTT
TGGCCGCGCGTTGTGCGGCAGAGCCTGATGTGCCTGCGAATGAGAATATCGGTAGTGTAT
CTCCATCTTCTAATTCTCAACTTCCTGCAACTGCCGTGGCTCCATCCACGCTATGGCAGA
TTATACATCTACCCTTGCTTCTCTGCGCATGCTTCATGTGTACTTAAGAACCTATGGACT
TGAACAAATGGTCCAAGCTGCAAGCTCTGCTGTTGGTCTTCGAACGATCAAGCGTGTTGA
GCAGACTCTGCAAGATCTCGGGGTTAATTTAAAGCCAAAGGTTCCTACAAAAACTGTATG
CGATGAGCATCTCGAATTACGAAAAGAAATCCTAACACTACTGAATCTTCAGAAGCAGTA
TAAAGAATCAGAAGGTTCATCACACCGTGAAGGGACATATGCCGCAATGCCAGATACTCC
AAAGGATCGCGTTTTCGCATTTGAGCCATTCAGTTTTGGAGGTGAAAGACCAATCAAGAA
GGAACAAAAGCGCAAGGGTCCTGGAAGACAATCAGATACTCCTTCACCAGCTCATAAGCG
GCCCAGAAAAATGAAAGCATCTGATCTCTAAGTCCAATAGAAATACTGATTCCCATTTTT
CATGTCTATGTAATTTTCAGTCAGACGCTGCAATATCTATCAGTTGTTGAATTGTCCCAA
TGAC

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 2

CO CL3762Contig1 1330 2 2 U
AAGCACAAAAATCTCCAAAATAGTACTTAGGATCAACCATTCATTACACATAAGAAAGAA
AACACACACAAAAGTGAATTTGATTATTTATTAAACAAAGAGTGGGAGCACATCTCATTG
ATGTGTGAAGATGTGCCTTGGTTATTAGCAGCCAATGCTGCCATTCAAGAAGATGCAGCA
ACGATAGGCATCTGAGTAACCCAATCAAACTTGTCGCGGCTGCTGTGTTTGCGAGAAGAA
GCTTGCTTCTCGTCCTTGCCACTACGAGAGGAATTAGAGCTGTCTTTGCCCTTCTGTCCT
TTCTTTCCGTTCTTCCTGTGGCTGTCTTTGCTCTTTGATTTCTGCTGCTGCTGCAGCTGC
TTCTTGTTTCTTGTGTGCGAGGCAATGGAGGGAGGAGGATCATACACGTCATCCGCCCAT
GAAACACTCGTCTTCCTCAGTGACAAGCCATGCTTCTCCCGGCTGCCTTTTATGGCGGGG
ATGAGAACAACTGGTGTATTAGTAACGTTCTCATCCTTGTCTTCATCATCTGAAGACTTG
GAAGGTAAAGAAGAAGCTAAAGTGGATTTGCCGAGATCCTCAGCGGCAGCTGATTCTAGC
TCATTATTCGAATCTGATGATTCTTCATTAACAGTTTGGTTTATATAACCAGTTTCATCG
CCATCGGGTTCCATAGATTCTTCAGATCAGGATGCGAGTAATGCTTGGAGCCATTGGAGC
ATTGCGTGGGACTCGAAGCCAAGATGTCAAAGTCTTCACCTTTACCAGAAACAGAGCTCA
TATCCAACTATATATTCAACCAAGTAGTAGTAGTAACTTTCGTGGGTATGCAAAATCAAA
CACACCAAAGATCAAGTAAAGTTTGCGTCTTTTTCGATGATGGAGCTAAGGAGAATCTCA
GAGAGATCAGAGGAGGAGGAGAGAAGAAGAGAGGGAGGAGGAGATGTTAACTAAGATTAC
CACGCCAATCAGACTTTTGAAGAGGTTTAAGACGATGGGAAGACAAACCAGAATGATAAG
GAGTCAAGGAAGGAGCCAAAAGGAGAAGCTTTGAGGGCACCGAAGGCATTATATCTCTAT
GCTCTTCTGTAACCCTATTACCCAACGGAGAAGCCCTACTTCTCTAATTTCGAATCCTGA
ACAGAGATCTCAGAGATTTTGATAAGGGGAAGCAAAAACCAAAAAAGAGAGAAGAAGGAT
GATTCTCTACGAGCAGAGACAGATATGTATCAGATCATGGAAAGCAGACCAAAAATCTAA
GGACAAGAGATAGATAGATTTGCGTCTTGAGGAGGAGGAAGACGACAAAGAGGGGACAAG
CTAATTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GL20JQ U 1
AF RS1DW17TF C 629
BS 1 685 RS1GL20JQ
BS 686 1330 RS1DW17TF

RD RS1GL20JQ 685 0 0
AAGCACAAAAATCTCCAAAATAGTACTTAGGATCAACCATTCATTACACATAAGAAAGAA
AACACACACAAAAGTGAATTTGATTATTTATTAAACAAAGAGTGGGAGCACATCTCATTG
ATGTGTGAAGATGTGCCTTGGTTATTAGCAGCCAATGCTGCCATTCAAGAAGATGCAGCA
ACGATAGGCATCTGAGTAACCCAATCAAACTTGTCGCGGCTGCTGTGTTTGCGAGAAGAA
GCTTGCTTCTCGTCCTTGCCACTACGAGAGGAATTAGAGCTGTCTTTGCCCTTCTGTCCT
TTCTTTCCGTTCTTCCTGTGGCTGTCTTTGCTCTTTGATTTCTGCTGCTGCTGCAGCTGC
TTCTTGTTTCTTGTGTGCGAGGCAATGGAGGGAGGAGGATCATACACGTCATCCGCCCAT
GAAACACTCGTCTTCCTCAGTGACAAGCCATGCTTCTCCCGGCTGCCTTTTATGGCGGGG
ATGAGAACAACTGGTGTATTAGTAACGTTCTCATCCTTGTCTTCATCATCTGAAGACTTG
GAAGGTAAAGAAGAAGCTAAAGTGGATTTGCCGAGATCCTCAGCGGCAGCTGATTCTAGC
TCATTATTCGAATCTGATGATTCTTCATTAACAGTTTGGTTTATATAACCAGTTTCATCG
CCATCGGGTTCCATAGATTCTTCAG

QA 1 685 1 685
DS 

RD RS1DW17TF 702 0 0
TC
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GATGCGAGTAATGCTTGGAGCCATTGGAGCATTGCGTGGGACTCGAAGCCAAGATGTCAA
AGTCTTCACCTTTACCAGAAACAGAGCTCATATCCAACTATATATTCAACCAAGTAGTAG
TAGTAACTTTCGTGGGTATGCAAAATCAAACACACCAAAGATCAAGTAAAGTTTGCGTCT
TTTTCGATGATGGAGCTAAGGAGAATCTCAGAGAGATCAGAGGAGGAGGAGAGAAGAAGA
GAGGGAGGAGGAGATGTTAACTAAGATTACCACGCCAATCAGACTTTTGAAGAGGTTTAA
GACGATGGGAAGACAAACCAGAATGATAAGGAGTCAAGGAAGGAGCCAAAAGGAGAAGCT
TTGAGGGCACCGAAGGCATTATATCTCTATGCTCTTCTGTAACCCTATTACCCAACGGAG
AAGCCCTACTTCTCTAATTTCGAATCCTGAACAGAGATCTCAGAGATTTTGATAAGGGGA
AGCAAAAACCAAAAAAGAGAGAAGAAGGATGATTCTCTACGAGCAGAGACAGATATGTAT
CAGATCATGGAAAGCAGACCAAAAATCTAAGGACAAGAGATAGATAGATTTGCGTCTTGA
GGAGGAGGAAGACGACAAAGAGGGGACAAGCTAATTTTCC

QA 3 702 3 702
DS 



AS 1 3

CO CL3763Contig1 695 3 11 U
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GGAAATCATGGGATTAAAGCAGAGACATTAACTGATGTCGGAGACCCTAAAGAGCCAATC
CACAAGATAATTCAAGAGCGAATGATCAATTTATTAGTCATGAGCGACGGCGATCAACAA
ACCTCAAGTCTTAAAAAGTGTTTACACAATACACATTGTTCTCTTCTTGTCGTGGAGAAA
GGAATTCGTATAAATTAGTGATTCGATAAATTAATGATGGTACGAACCACTAAGATCTTT
TATAATTGTATGCATGTGGTTAAGTAAAATATATGATATTGTGGGGTTATTGAACTAATA
GAATATGATATTATTGTACATATCATATCTTGCCCATACGTGGATGCCTTGGACCTAACC
TGTATAATAGAAAATCAATAATTAAATTGGTTAAA


BQ
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AF RS1DS86JQ C 3
AF RS1DS86TF U 3
AF RS1DK13TF U 1
BS 1 98 RS1DK13TF
BS 99 99 RS1DS86TF
BS 100 189 RS1DK13TF
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BS 191 398 RS1DK13TF
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BS 600 600 RS1DS86TF
BS 601 695 RS1DK13TF

RD RS1DS86JQ 591 0 0
GGGTAACACAAACTTGAAGAAGATGAAGAATGTTATGGTGGTTATTGACGAGAGCAGCTC
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CTCAAGTCTTAAAAAGTGTTTACACAATACACATTGTTCTCTTCTTGTCGTGGAGAAAGG
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TAATTGTATGCATGTGGTTAAGTAAAATATATGATATTGTGGGGTTATTGA

QA 1 591 1 591
DS 

RD RS1DS86TF 615 0 0
GGGTAACACAAACTTGAAGAAGATGAAGAATGTTATGGTGGTTATTGACGAGAGCAGCTC
AAGTTATGATTTACTCGTTTGGGTCCTTGAAAATCTCCAAGATATAAGTAACAGCAATAA
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GTTGGGAATTGCACAGCTTTTCTATCCATTTTCACCCAGGGCAGAACTTATAAGACTAGC
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CAAGATAATTCAAGAGCGAATGATCAATTTATTAGTCATGAGCGACGGCGATCAACAAAC
CTCAAGTCTTAAAAAGTGTTTACACAATACACATTGTTCTCTTCTTGTCGTGGAGAAAGG
AATTCGTATAAATTAGTGATTCGATAAATTAATGATGGTACGAACCACTAAGATCTTTTA
TAATTGTATGCATGTGGTTAAGTAAAATATATGATATTGTGGGGTTATTGAACTAATAGA
ATATGATATTATTGT

QA 1 615 1 615
DS 

RD RS1DK13TF 695 0 0
AGGGGTAACACAAACTTGAAGAAGATGAAGAATGTTATGGTGGTTATTGACGAGAGCAGC
TCAAGTTATGATTTACTCGTTTGGGTCCTTGAAAATCTTCAAGATATAAGTAACAGCAAT
AAACTTTTGATATTTGCAAAACAGCCACAAAGTTTTGTTGGTCCTATCTCGCTCTCTTCA
TCGTTGGGATTTGCACAGCTTTTCTATCCATTTTCACCCAGGGCAGAACTTATAAGACTA
GCTCAAGAAAAGAATATGAAGATTGCTTTGGGTATATTAGAGAAAGCCAAGAAGATAAGT
GGAAATCATGGGATTAAAGCAGAGACATTAACTGATGTCGGAGACCCTAAAGAGCCAATC
CACAAGATAATTCAAGAGCGAATGATCAATTTATTAGTTATGAGCGACGGCGATCAACAA
ACCTCAAGTCTTAAAAAGTGTTTACACAATACACATTGTTCTCTTCTTGTCGTGGAGAAA
GGAATTCGTATAAATTAGTGATTCGATAAATTAATGATGGTACGAACCACTAAGATCTTT
TATAATTGTATGCATGTGGTTATGTAAAATATATGATATTGTGGGGTTATTGAACTAATG
GAATATGATATTATTGTACATATCATATCTTGCCCATACGTGGATGCCTTGGACCTAACC
TGTATAATAGAAAATCAATAATTAAATTGGTTAAA

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 3

CO CL3764Contig1 666 3 10 U
GATTCTTTTCAAAGCACAAACTCACATTCACAAATCAACTCGAAAAAGATCGAAGAAGAG
AGACTCAGAAATGGCTTCTACCTCCGCTGTAGCATCGGTCATGCCACTCACCCAAAACCG
ATCATCTTCGGCGAAAACCATTGCTTTTCTCAAACCACTGCCTTTGAAACCATCTAAGGC
GTCCTCCTTCTCCGTAGCCATGCCTTCACGGAAGTTTCAAGTGAATGCGTCTAACCTGAA
GATGGAGAAGGCTGTGAGCGGCTTAGCAGCGGCAGCTCTCACCGTCTCCATGGTGATCCC
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BQ
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DS 



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BQ
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BS 54 75 RS1A540TF
BS 76 76 RS1EX19TF
BS 77 184 RS1A540TF
BS 185 185 RS1EX19TF
BS 186 205 RS1A540TF
BS 206 206 RS1EX19TF
BS 207 246 RS1A540TF
BS 247 247 RS1EX19TF
BS 248 261 RS1A540TF
BS 262 262 RS1EX19TF
BS 263 264 RS1A540TF
BS 265 265 RS1EX19TF
BS 266 291 RS1A540TF
BS 292 292 RS1EX19TF
BS 293 294 RS1A540TF
BS 295 295 RS1EX19TF
BS 296 534 RS1A540TF
BS 535 535 RS1EX19TF
BS 536 734 RS1A540TF
BS 735 787 RS1EX19TF
BS 788 1333 RS1EX19JQ

RD RS1A540TF 734 0 0
GGACACAACATAAACCCAATCTCCACACACTCACTCACTCACTCAGACAAAAGAGAAACA
AATGGCGAAATCTCCGGAGACAGAGCATCCGAACAAAGCCTTTGGTTGGGCTGCCAAAGA
CAAATCTGGTCTACTCTCTCCTTTCCATTTCTCCAGAAGAGACAATGGTGACAATGATGT
GACAGTGAAAATCTTGTATTGTGGATTGTGCCACACTGATTTGCATACCATCAAAAACGA
CTGGGGTTTCTCCTATTATCCTGTCGTTCCAGGGCATGAAATAGTTGGAATCGCTACAAA
AGTTGGCAAAAACGTGACTAAATTCAGAGAAGGAGACCGTGTAGGAGTAGGAGTGATCAC
TGGTTCTTGCCAATCTTGCGAATCTTGTGACCAAGATCTTGAAAACTACTGTCCCCAAAT
GTCTTTCACCTACAACTCCATTGGATCCGATGGAACCAAGACATACGGTGGATATTCGGA
GTCCATTGTGGTCGACCAACGGTTTGTTTTACAGTTTCCCGAGGGATTACCTAGTGATTC
TGGTGCGCCTTTGCTGTGTGCCGGAATCACTGTGTATAGTCCAATGAAGTACTATGGTAT
GACCGAGCCAGGGAAGCATTTGGGTGTGGCTGGACTTGGTGGGCTTGGTCATGTTGCTGT
CAAGATTGGTAAAGCTTTTGGTTTGAAAGTTACTGTGATTAGTTCTTCTCCTAATAAAGA
AGATGAAGCCATTA

QA 1 734 1 734
DS 

RD RS1EX19TF 806 0 0
GGACACAACATAAACCCAATCTCCAC****TCCCTCACTCACTCAGACAAAACAGAAACA
AATGGCGAAATCTCCAGAGACAGAGCATCCGAACAAAGCCTTTGGTTGGGCTGCCAAAGA
CAAATCTGGTCTGCTCTCTCCTTTCCATTTCTCCAGAAGAGACAATGGTGACAATGATGT
GACACTGAAAATCTTGTATTGTGGAGTGTGCCACACTGATTTGCATACCATCAAAAACGA
CTGGGGCTTCTCCTATTATCCAGTAGTTCCAGGGCATGAAATAGTTGGAATAGCCACAAG
AGTTGGCAAAAACGTGACTAAATTCAGAGAAGGAGACCGTGTAGGAGTAGGAGTGATCAC
TGGTTCTTGCCAATCTTGCGAATCTTGTGACCAAGATCTTGAAAACTACTGTCCCCAAAT
GTCTTTCACCTACAACTCCATTGGATCCGATGGAACCAAGACCTACGGTGGATATTCGGA
GTCCATTGTGGTCGACCAACGGTTTGTTTTACAGTTTCCCGAGGGATTACCTAGCGATTC
TGGTGCGCCTTTGCTGTGTGCTGGAATCACTGTGTATAGTCCAATGAAGTACTATGGTAT
GACCGAGCCAGGGAAGCATTTGGGTGTGGCTGGACTTGGTGGGCTTGGTCATGTTGCTGT
CAAGATTGGTAAAGCTTTTGGTTTGAAAGTTACTGTGATTAGTTCTTCTCCTAATAAAGA
AGATGAAGCCATTAATCGTCTTGGTGCTGATTCGTTTCTTGTCTCATCTGATCCTCAGAA
GATGAAG
CTGCATAGGACATGGACTA

QA 1 787 1 787
DS 

RD RS1EX19JQ 684 0 0
CATGTTGCTGTCAAGATTGGTAAAGCTTTTGGTTTGAAAGTTACTGTGATTAGTTCTTCT
CCTAATAAAGAAGATGAAGCCATTAATCGTCTTGGTGCTGATTCGTTTCTTGTCTCATCT
GATCCTCAGAAGATGAAGGCTGCAATAGGAACAATGGACTACATTATCGATACCGTTTCA
GCAGTACATGCTCTGTTTCCATTACTTGGTTTACTCAAAGTCAATGGAAAGCTAGTCACT
TTAGGCTTACCTGAGAAGCCTCTTGAGCTACCAATCTTCCCTCTTGTTCTCGGAAGGAAA
ATGGTGGGAGGAAGTGACATTGGAGGAATGAAGGAGACACAGGAGATGCTTGAGTTTTGC
GCTAAGCATAACATAACGGCAGATATTGAGCTGATCAAGATGGATGAGATTAACACTGCA
ATGGAGAGGCTTGCTAAGGCTGATGTTAGGTACAGGTTCGTGATCGACGTGGCTAACTCC
TTGAGCCCTCCATGACTTAGCCGAATTTAAGAGTTGACCCTGGAGGAGTTTGTATCTTGT
GCTTCTGTTGTCTTCGTGTTATCTTCGTTTTCTACTATTATGTTTTTAGTGAACTGGTTT
CTTCTGAAACAAGTCACTTTAAGTTGTCAGAGAACGTCTCTCTGTGTTTCCTTTTCATGA
TATAATAAGTATTTCTGATTAGAG

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 3

CO CL3766Contig1 585 3 10 U
AGGGGATTCCTCTCCAAATCTAAAGTAATTAAAGAAGAAGAAGGATGGCCAACACTTTTG
TGAGGTCTGGTTATATTCTTGCTATTCTGTTTGCTATCGTCGTTGCAGCTACTGGAAACA
GATTGTATCCGAAGCCTCAGCTGAACGGTGAACAAGTTGACCATTCCATCCTCCACTCTG
CCTTTTCACTAACAGGAGGACCACTATACGGTACATGTTTGTACTACCAATTCGTTTATG
ACTGCAACGATTGCAACAAAAAGTGCAAACAAAATAACAGCAACTGGTGGGGACAGTGTA
CTATGTGGCCGTTCCGTGATTGCTACTGCTATTACAACTGTTGATAGCCAAATCATGATC
ATATATAAATCTATATATTACTCAAGTTTGTGACAAGAAAAAAAGACACGGAGAGTATTT
TCCGTATGTCAAATCCTCGTATGTGCTTGCTGTGTGTTTTGGATGCTTTTCTATTTTACC
ATGTTTGATAATTATTCTGTATGTTTGTTTGTTTCTCTTGAGTTCGTTGTAATGCAGGGT
TCTTGTTGATGTTTAATGAGTACCTTTATGCAAATAATTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EG18TF U 1
AF RS1BR74TF U 3
AF RS1BR74JQ C 100
BS 1 62 RS1EG18TF
BS 63 63 RS1BR74TF
BS 64 184 RS1EG18TF
BS 185 185 RS1BR74TF
BS 186 219 RS1EG18TF
BS 220 220 RS1BR74TF
BS 221 403 RS1EG18TF
BS 404 404 RS1BR74TF
BS 405 577 RS1EG18TF
BS 578 585 RS1BR74JQ

RD RS1EG18TF 580 0 0
AGGGGATTCCTCTCCAAATCTAAAGTAATTAAAGAAGAAGAAGGATGGCCAACACTTTTG
TGGGGTCTGGTTATATTCTTGCTATTCTGTTTGCTATCGTCGTTGCAGCTACTGGAAACA
GATTGTATCCGAAGCCTCAGCTGAACGGTGAACAAGTTGACCATTCCATCCTCCACTCTG
CCTTGTCACTAACAGGAGGACCACTATACGGTACATGTTCGTACTACCAATTCGTTTATG
ACTGCAACGATTGCAACAAAAAGTGCAAACAAAATAACAGCAACTGGTGGGGACAGTGTA
CTATGTGGCCGTTCCGTGATTGCTACTGCTATTACAACTGTTGATAGCCAAATCATGATC
ATATATAAATCTATATATTACTCAAGTTTGTGACAAGAAAAAA*GACACGGAGAGTATTT
TCCGTATGTCAAATCCTCGTATGTGCTTGCTGTGTGTTTTGGATGCTTTTCTATTTTACC
ATGTTTGATAATTATTCTGTATGTTTGTTTGTTTCTCTTGAGTTCGTTGTAATGCAGGGT
TCTTGTTGATGTTTAATGAGTACCTTTATGCAAATAA
AAA

QA 1 577 1 577
DS 

RD RS1BR74TF 581 0 0
GGC
ATTCCTCTCCAAATCTAAAGTAATTAAAGAAGAAGAAGGATGGCCAACACTTTTGTGAGG
TCTGGTTATATTCTTGCTATTCTGTTTGCTATCGTCGTTGCAGCTACTGGAAACAGATTG
TATCCGAAGCCTCAGCTGAACGGTGAACAAGTTGACCATTCCATCCTCCACTCTGCCTTT
TCACTAACAGGAGGACCACTATACGGTACATGTTTGTACTACCAATTCGTTTATGACTGC
AACGATTGCAACAAAAAGTGCAAACAAAATAACAGCAACTGGTGGGGACAGTGTACTATG
TGGCCGTTCCGTGATTGCTACTGCTATTACAACTGTTGATAGCCAAATCATGATCATATA
TAAATCTATATATTACTCAAGTTTGTGACAAGAAAAAAAGACACGGAGAGTATTTTCCGT
ATGTCAAATCCTCGTATGTGCTTGCTGTGTGTTTTGGATGCTTTTCTATTTTACCATGTT
TGATAATTATTCTGTATGTTTGTTTGTTTCTCTTGAGTTCGTTGTAATGCAGGGTTCTTG
TTGATGTTTAATGAGTACCTTTATGCAAATAA
TTTCTT

QA 4 575 4 575
DS 

RD RS1BR74JQ 486 0 0
TCGTTGCAGCTACTGGAAACAGATTGTATCCGAAGCCTCAGCTGAACGGTGAACAAGTTG
ACCATTCCATCCTCCACTTTGCCTTTTCACTAACAGGAGGACCACTATACGGTACATGTT
TGTACTACCAATTCGTTTATGACTGCAACGATTGCAACAAAAAGTGCAAACAAAATAACA
GCAACTGGGGGGGACAGTGTACTATGTGGCCGTTCCGTGATTGCTACTGCTATTACAACT
GTTGATAGCCAAATCATGATCATATATAAATTTATATATTACTCAAGTTTGTGACAAGAA
AAAAAGACACGGAGAGTATTTTCCGTATGTCAAATCCTCGTATGTGCTTGCTGTGTGTTT
TGGATGCTTTTTTATTTTCCCATGTTTGATAATTATTCTGTATGTTTGTTTGTTTTTCTT
GAGTTGGTTGTAATGCAGGGTTTTTGTTGATGTTTAATGAGTACCTTTATGCAAATAATT
TTTTTT

QA 1 486 1 486
DS 



AS 1 2

CO CL3767Contig1 744 2 7 U
GGGATGGGAAGAGGATTCTGAGAACTAGAAGGAGACATTGATGGAGGAAGTAGGCAGACC
GGGAGTCTTCGTCGTCGGTTCCTCTGGTGTCGGCAAGCGCACCCTTCTCTCGCGATTGCT
CTCTGTCGATTTTGAGGATTCATCATCTCAAACCGAAGTTCATGACTGGACGATTAACAC
CAAGTATTACTCTGCGGATGTATCTGTTTGGATATCACATATTTCCGATGACTACTCTCT
CCCTCATCCTCACTCACATCCACTTGTGGCGTTAGTTTTGGTCTTCGACTTGACTCAGCT
GTCAACTCTTGTTGCTCTTCAAGACTGGGTTTCTCATGCTGCAGACATCAACAGTCTTGA
TATATTGTTGTGCATTGGGAACAAAGTTGATCTTGTCCCTCATCACCCTGCTCATGATGA
ATATAGAAGACGTCTTTTGAAAGCAACTGACTCCTCCTCTACAGATCTGTATGATGAGTT
TGGCATCTCCCAAAGTGAAGGAAGTAGCTTGCTGGGGAGCGACGATACATCACTGGATAT
CAGGGGAACTTGTCTTGAGTGGTGCCGCAACAACAACATCGAGTTCATTGAGGCTTGTGC
ATCTAATCCTGATTTTGACAAGTGTTTATCAGTCGATGGGGATTCTCAAGGGGTTGAACG
TCTGTTTGGTGCTCTTTCGCACATATGTGGCCTGGAATGATTCTCAATCGGGTGATAGAT
AAATGAGCCCGTGTTACCTCATGG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FZ21TF U 5
AF RS1DK22TF U 1
BS 1 141 RS1DK22TF
BS 142 142 RS1FZ21TF
BS 143 304 RS1DK22TF
BS 305 305 RS1FZ21TF
BS 306 519 RS1DK22TF
BS 520 520 RS1FZ21TF
BS 521 744 RS1DK22TF

RD RS1FZ21TF 671 0 0
G
GGGAAGAGGATTCTGAGAACTAGAATGAGACATTGATGGAGGAAGTAGGCAGACCGGTAG
TCTTCGTCGTCGGTTCCTCTGGTGTCGGCAAGCGCACCCTTCTCTCGCGATTGCTCTCTG
TCGATTTTGAGGATTCATCATCTCAAACCGAAGTTCATGACTGGACGATTAACACCAAGT
ATTACTCTGCGGATGTATCTGTTTGGATATCACATATTTCCGATGACTACTCTCTCCCTC
ATCCTCACTCACATCCACTTGTGGCGTTAGTTTTGGTCTTCGACTTGACTCAGCTGTCAA
CTCTTGTTGCTCTTCAAGACTGGGTTTCTCATGCTGCAGACATCAACAGTTTTGATATAT
TGTTGTGCATTGGGAACAAAGTTGATCTTGTCCCTCATCACCCTGCTCATGATGAATATA
GAAGACGTCTTTTGAAAGCAACTGACTCCTCCTCTACAGATCTGTATGATGAGTTTGGCA
TCTCCCAAAGTGAAGGAAGTAGCTTGCTGGGGAGCGACGATACATCACTGGATATCAGGG
GAACTTGTCTTGAGTGGTGCCGCAACAACAACATCGAGTTCATTGAGGCTTGTGCATCTA
ATCCTGATTTTGACAAGTGTTTATCAGTCGATGGGGATTCTCAAGGGGTTGAACGTCTGT
TTGGTGCTCT

QA 2 671 2 671
DS 

RD RS1DK22TF 744 0 0
GGGATGGGAAGAGGATTCTGAGAACTAGAAGGAGACATTGATGGAGGAAGTAGGCAGACC
GGGAGTCTTCGTCGTCGGTTCCTCTGGTGTCGGCAAGCGCACCCTTCTCTCGCGATTGCT
CTCTGTCGATTTTGAGGATTCGTCATCTCAAACCGAAGTTCATGACTGGACGATTAACAC
CAAGTATTACTCTGCGGATGTATCTGTTTGGATATCACATATTTCCGATGACTACTCTCT
CCCTCATCCTCACTCACATCCACTTGTGGCGTTAGTTTTGGTCTTCGACTTGACTCAGCT
GTCATCTCTTGTTGCTCTTCAAGACTGGGTTTCTCATGCTGCAGACATCAACAGTCTTGA
TATATTGTTGTGCATTGGGAACAAAGTTGATCTTGTCCCTCATCACCCTGCTCATGATGA
ATATAGAAGACGTCTTTTGAAAGCAACTGACTCCTCCTCTACAGATCTGTATGATGAGTT
TGGCATCTCCCAAAGTGAAGGAAGTAGCTTGCTGGGGAGTGACGATACATCACTGGATAT
CAGGGGAACTTGTCTTGAGTGGTGCCGCAACAACAACATCGAGTTCATTGAGGCTTGTGC
ATCTAATCCTGATTTTGACAAGTGTTTATCAGTCGATGGGGATTCTCAAGGGGTTGAACG
TCTGTTTGGTGCTCTTTCGCACATATGTGGCCTGGAATGATTCTCAATCGGGTGATAGAT
AAATGAGCCCGTGTTACCTCATGG

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL3768Contig1 1036 2 2 U
GGGGGCTCTCTCTAACAACACTCGCTCGACGACCATGGCGGTCTCATTTAACACAACCCT
TCACCAGTCATCTCTGAGTCCGTGCTGTAGCATCAAGCTTTACTCTGGGTTGAAGCCTCA
ATCTTCAAGCTTTTTAAGAAATGGGTATCAGAATTTGAACAAGGAGTTCTATGGCAGGAT
TCACAAGAGTTTGCAATCCGGGACGGGGAAAGCGAGTAGGTCAAGGGTGAAGATGATGCC
TATAGGTACACCTAGAGTTCCCTACCGAAACAGAGAGGAAGGCACTTGGCAATGGGTTGA
TATTTGGAACGCCCTTTATCGAGAGCGTGTGATCTTCATTGGACAAAACATAGACGAAGA
GTTTAGCAACCAGATATTAGCAACTATGTTGTATCTCGATACTCTTGATGACTCTAGGAG
GATTTATATGTACCTTAATGGACCTGGCGGCGATCTAACTCCAAGTCTAGCTATCTATGA
TACGATGAAGAGCTTGAAAAGTCCGGTTGGGACACATTGTGTTGGGCTTGCCTATAACCT
TGCTGGTTTTCTTCTTGCTGCCGGTGAAAAGGGTCAACGGTTTGCGATGCCATTGTCAAG
AATCTCCCTCCAGTCACCAGCTGGTGCAGCCCGTGGTCAGGCTGATGATATCCAAAATGA
AGCGAAAGAGCTTTCAAGGATAAGAGATTACCTTTTCAACGAACTAGCCAAGAATACAGG
ACAGCCTGCGGAAACGATCTTCAAAGACTTGAGCAGAATGAAGAGGTTCAACGCAGAAGA
AGCTATTGAGTACGGACTTATCGATAAGATTGTTAGACCACCGCGCATCAAAGCCGACGC
TCCTCGCCAAGACGATACCTCAGGCCTCGGTTAATCTGTTTTTTTTTGTTTTTCACTTTG
TAATGTCATAGTTTAACAAGCTTAAAGTTGATTGTTCCTTGTTGTGATTGTTACCGAATT
AAAATCACTTTGCTTGTTATTTTTCCCCACTGGGTTCTACAAACATTTTTAAAGCTGAAG
TGAGATGAACATTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BH34TF U 1
AF RS1BH34JQ C 318
BS 1 637 RS1BH34TF
BS 638 1036 RS1BH34JQ

RD RS1BH34TF 637 0 0
GGGGGCTCTCTCTAACAACACTCGCTCGACGACCATGGCGGTCTCATTTAACACAACCCT
TCACCAGTCATCTCTGAGTCCGTGCTGTAGCATCAAGCTTTACTCTGGGTTGAAGCCTCA
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TCACAAGAGTTTGCAATCCGGGACGGGGAAAGCGAGTAGGTCAAGGGTGAAGATGATGCC
TATAGGTACACCTAGAGTTCCCTACCGAAACAGAGAGGAAGGCACTTGGCAATGGGTTGA
TATTTGGAACGCCCTTTATCGAGAGCGTGTGATCTTCATTGGACAAAACATAGACGAAGA
GTTTAGCAACCAGATATTAGCAACTATGTTGTATCTCGATACTCTTGATGACTCTAGGAG
GATTTATATGTACCTTAATGGACCTGGCGGCGATCTAACTCCAAGTCTAGCTATCTATGA
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TGCTGGTTTTCTTCTTGCTGCCGGTGAAAAGGGTCAACGGTTTGCGATGCCATTGTCAAG
AATCTCCCTCCAGTCACCAGCTGGTGCAGCCCGTGGT

QA 1 637 1 637
DS 

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TAGCAACTATGTTGTATCTCGATACTCTTGATGACTCTAGGAGGATTTATATGTACCTTA
ATGGACCTGGCGGCGATCTAACTCCAAGTCTAGCTATCTATGATACGATGAAGAGCTTGA
AAAGTCCGGTTGGGACACATTGTGTTGGGCTTGCCTATAACCTTGCTGGTTTTTTTCTTG
CTGCCGGTGAAAAGGGTCAACGGTTTGCGATGCCATTGTCAAGAATCTCCCTCCAGTCAC
CAGCTGGTGCAGCCCGTGGTCAGGCTGATGATATCCAAAATGAAGCGAAAGAGCTTTCAA
GGATAAGAGATTACCTTTTCAACGAACTAGCCAAGAATACAGGACAGCCTGCGGAAACGA
TCTTCAAAGACTTGAGCAGAATGAAGAGGTTCAACGCAGAAGAAGCTATTGAGTACGGAC
TTATCGATAAGATTGTTAGACCACCGCGCATCAAAGCCGACGCTCCTCGCCAAGACGATA
CCTCAGGCCTCGGTTAATCTGTTTTTTTTTGTTTTTCACTTTGTAATGTCATAGTTTAAC
AAGCTTAAAGTTGATTGTTCCTTGTTGTGATTGTTACCGAATTAAAATCACTTTGCTTGT
TATTTTTCCCCACTGGGTTCTACAAACATTTTTAAAGCTGAAGTGAGATGAACATTTGG

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 3

CO CL3769Contig1 894 3 12 U
GGGTGACACCAACCGACGGCTATGGCAACCATTTTCAGATTCTCACTTGGTCTACTCCCG
GTTTCCGCCGCCTTGACATGTTGCTCAATCCGGTTCCCCGTTTCAAGACCCGCTTCGTTG
AACCGTAATCTGTATCATTTATCTTCTTCTTCTTCTTCTTTTAAGACCAAAGCAGGTTGG
CTACTGGGCCTCGGGGACAACAAGAAAAAGAAAGTGGATTTACCGGATCTCGTGGCAGCT
GGAGATCCGGTTCTCCACGAAAAGGCCCGAGAAGTCGACCCGGAAGAAATCGGGTCGGAG
CGTATTCAGAAGATAATTGATGATATGGTTAAAGTAATGAGATTGGCTCCTGGAGTTGGC
CTTGCTGCTCCTCAGATTGGTGTCCCCTTAAGAATCATTGTTCTTGAAGATACAAAAGAG
TATATTAGTTACGCATCAAAGGAGGAGACTTTTGCTCAAGACAGACGTCCCTTTGATCTT
ATGGTAATGGTGAATCCGGAGCTTAAAGCGAGTAGCGACAAGAAAGCTCTCTTCTTTGAA
GGATGTGTGAGTGTTGATGGATTCAGAGCTGTGGTGGAGAGACACCTTGAAGTGGTAGTG
ACAGGCTACGATCGTCAAGGGAAGCAGATTCAG*TGAATGCTTCAG*CTGGCAAGCGAGG
ATTTTGCAGCATGAGTGTGATCATTTGGATGGTTATCTTTATGTCGATAAGATGATACCA
CGCACTTTTAGGACAGTCGATAACTTGGACTTGTCTCTAGCAGAAGGCTGTCCTAAACTC
GGACCTCAATGACATAGATATTAAGTTTGTTATGTAATGTAATGCTTTACTTCCTAAACT
CTCTAAAGATCGAGTGAGCTTCATGTCTTCAAAGGTTGTCTTTTACGGACAGTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1FI58TF U 1
AF RS1GS52TF U 6
AF RS1GS52JQ C 74
BS 1 161 RS1FI58TF
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RD RS1FI58TF 762 0 0
GGGTGACACCAACCGACGGCTATGGCAACCATTTTCAGATTCTCACTTGGTCTACTCCCG
GTTTCCGCCGCCTTGACATGTTGCTCAATCCGGTTCCCCGTTTCAAGACCCGCTTCGTTG
AACCGTAATCTGTATCATTTATCTTCTTCTTCTTCTTCTTTGAAGACCAAAGCAGGTTGG
CTACTGGGCCTCGGGGACAACAAGAAAAAGAAAGTGGATTTACCGGATCTCGTGGCAGCT
GGAGATCCGGTTCTCCACGAAAAGGCCCGAGAAGTCGACCCGGAAGAAATCGGGTCGGAG
CGTATTCAGAAGATAATTGATGATATGGTTAAAGTAATGAGATTGGCTCCTGGAGTTGGC
CTTGCTGCTCCTCAGATTGGTGTCCCCTTAAGAATCATTGTTCTTGAAGATACAAAAGAG
TATATTAGTTACGCATCAAAGGAGGAGACTTTTGCTCAAGACAGACGTCCCTTTGATCTT
ATGGTAATGGTGAATCCGGAGCTTAAAGCGAGTAGCGACAAGAAAGCTCTCTTCTTTGAA
GGATGTGTGAGTGTTGATGGATTCAGAGCTGTGGTGGAGAGACACCTTGAAGTGGTAGTG
ACAGGCTACGATCGTCAAGGGAAGCAGATTCAG*TGAATGCTTCAG*CTGGCAAGCGAGG
ATTTTGCAGCATGAGTGTGATCATTTGGATGGT*ATCTTTATGTCGATA*GATGATACCA
CGCACTTTTAGGACAGTCGATA*CTTGGACTTGCCTCTAG
CA

QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1GS52TF 755 0 0
GG
ACCAACCGACGGCTATGGCAACCATTTTCAGATTCTCACTTGGTCTACTCCCGGTTTCCG
CCGCCTTGACATGTTGCTCAATCCGGTTCCCCGTTTCAAGACCCGCTTCGTTGAACCGTA
ATCTGTATCATTTATCTTCTTCTTCTTCTTCTTTTAAGACCAAAGCAGGTTGGCTACTGG
GCCTCGGGGACAACAAGAAAAAGAAAGTGGATTTACCGGATCTCGTGGCAGCTGGAGATC
CGGTTCTCCACGAAAAGGCCCGAGAAGTCGACCCGGAAGAAATCGGGTCGGAGCGTATTC
AGAAGATAATTGATGATATGGTTAAAGTAATGAGATTGGCTCCTGGAGTTGGCCTTGCTG
CTCCTCAGATTGGTGTCCCCTTAAGAATCATTGTTCTTGAAGATACAAAAGAGTATATTA
GTTACGCATCAAAGGAGGAGACTTTTGCTCAAGACAGACGTCCCTTTGATCTTATGGTAA
TGGTGAATCCGGAGCTTAAAGCGAGTAGCGACAAGAAAGCTCTCTTCTTTGAAGGATGTG
TGAGTGTTGATGGATTCAGAGCTGTGGTGGAGAGACACCTTGAAGTGGTAGTGACAGGCT
ACGATCGTCAAGGGAAGCAGATTCAG*TGAATGCTTCAG*CTGGCAAGCGAGGATTTTGC
AGCATGAGTGTGATCATTTGGATGGTTATCTTTATGTCGATAAGATGATACCACGCACTT
TTAG*ACAGTCGATAACTTGGACTTGTCTCTAG

QA 3 755 3 755
DS 

RD RS1GS52JQ 821 0 0
TGACATGTTGCTCAATCCGGTTCCCCGTTTCAAGACCCGCTTCGTTGAACGGTAATCTGT
ATCATTTATCTTCTTCTTCTTCTTCTTTTAAGACCAAAGCAGGTTGGCTACTGGGCCTCG
GGGACAACAAGAAAAAGAAAGTGGATTTACCGGATCTCGTGGCAGCTGGAGATCCGGTTC
TCCACGAAAAGGCCCGAGAAGTCGACCCGGAAGAAATCGGGTCGGAGCGTATTCAGAAGA
TAATTGATGATATGGTTAAAGTAATGAGATTGGCTCCTGGAGTTGGCCTTGCTGCTCCTC
AGATTGGTGTCCCCTTAAGAATCATTGTTCTTGAAGATACAAAAGAGTATATTAGTTACG
CATCAAAGGAGGAGACTTTTGCTCAAGACAGACGTCCCTTTGATCTTATGGTAATGGTGA
ATCCGGAGCTTAAAGCGAGTAGCGACAAGAAAGCTCTCTTCTTTGAAGGATGTGTGAGTG
TTGATGGATTCAGAGCTGTGGTGGAGAGACACCTTGAAGTGGTAGTGACAGGCTACGATC
GTCAAGGGAAGCAGATTCAGGTGAATGCTTCAGGCTGGCAAGCGAGGATTTTGCAGCATG
AGTGTGATCATTTGGATGGTTATCTTTATGTCGATAAGATGATACCACGCACTTTTAGGA
CAGTCGATAACTTGGACTTGTCTCTAGCAGAAGGCTGTCCTAAACTCGGACCTCAATGAC
ATAGATATTAAGTTTGTTATGTAATGTAATGCTTTACTTCCTAAACTCTCTAAAGATCGA
GTGAGCTTCATGTCTTCAAAGGTTGTCTTTTACGGACAGTA

QA 1 821 1 821
DS 



AS 1 3

CO CL3770Contig1 668 3 1 U
GGTAGACTCTAAAAATACCCTTGGTACTTTATTGACGATCTCACAAAGATGTAATCTCAG
TGAATTTGAGTTTACTGATTCATCTTTTACAGAATCGATTCCCTACGAGAATATCTGGAG
TTCAGTATGTCTGGAAGCACAGGAGAACGTTCTTTTGCTGATATTATTACCAATATTCGA
TACTGGGTCATTCATAGCATTACTATACCTTCCCTATTCATTGCGGGCTGGTTATTCGTC
AGCATCGGTTTAGCTTACGACGTGTTTGGGAGCCCTCGCCCAAACGAGTATTTTACAGAG
AGCCGACAAGGCATTCCATTAATAACAGGCCGTTTTGATTCCTTGGAACAACTCGACGAA
TTTAGTAGATCTTTTTAGGAGGACCCAATGACTATAGATAGGACCTATCCAATTTTTACA
GTGCGCTGGTTGGCTGTTCATGGACTAGCTGTACCTACCGTTTTTTTTTGGGGTCAATAT
CAGCAATGCAGTTCATCCAACGATAAACCGAATTCAATTATAGAGCTATGACACAATCAA
ATCCGAACGAACAAAATGTTGAATTAAATCGTACCAGTCTCTATTGGGGG*TTATTACCC
ATTTTTGTACTTGCTGTTTTATTTTCGAATTATTTCTTCAATTAAAATTAAGAAAAGAGC
GTAGAATA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 10 10 10 

AF RS1GC56TF U 1
AF RS1GC56JQ C 79
AF RS1GQ53TF U 1
BS 1 668 RS1GC56TF

RD RS1GC56TF 668 0 0
GGTAGACTCTAAAAATACCCTTGGTACTTTATTGACGATCTCACAAAGATGTAATCTCAG
TGAATTTGAGTTTACTGATTCATCTTTTACAGAATCGATTCCCTACGAGAATATCTGGAG
TTCAGTATGTCTGGAAGCACAGGAGAACGTTCTTTTGCTGATATTATTACCAATATTCGA
TACTGGGTCATTCATAGCATTACTATACCTTCCCTATTCATTGCGGGCTGGTTATTCGTC
AGCATCGGTTTAGCTTACGACGTGTTTGGGAGCCCTCGCCCAAACGAGTATTTTACAGAG
AGCCGACAAGGCATTCCATTAATAACAGGCCGTTTTGATTCCTTGGAACAACTCGACGAA
TTTAGTAGATCTTTTTAGGAGGACCCAATGACTATAGATAGGACCTATCCAATTTTTACA
GTGCGCTGGTTGGCTGTTCATGGACTAGCTGTACCTACCGTTTTTTTTTGGGGTCAATAT
CAGCAATGCAGTTCATCCAACGATAAACCGAATTCAATTATAGAGCTATGACACAATCAA
ATCCGAACGAACAAAATGTTGAATTAAATCGTACCAGTCTCTATTGGGGG*TTATTACCC
ATTTTTGTACTTGCTGTTTTATTTTCGAATTATTTCTTCAATTAAAATTAAGAAAAGAGC
GTAGAATA

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1GC56JQ 586 0 0
TTCATCTTTTACAGAATCGATTCCCTACGAGAATATCTGGAGTTCAGTATGTCTGGAAGC
ACAGGAGAACGTTCTTTTGCTGATATTATTACCAATATTCGATACTGGGTCATTCATAGC
ATTACTATACCTTCCCTATTCATTGCGGGCTGGTTATTCGTCAGCATCGGTTTAGCTTAC
GACGTGTTTGGGAGCCCTCGCCCAAACGAGTATTTTACAGAGAGCCGACAAGGCATTCCA
TTAATAACAGGCCGTTTTGATTCCTTGGAACAACTCGACGAATTTAGTAGATCTTTTTAG
GAGGACCCAATGACTATAGATAGGACCTATCCAATTTTTACAGTGCGCTGGTTGGCTGTT
CATGGACTAGCTGTACCTACCGTTTTTTTTTGGGGTCAATATCAGCAATGCAGTTCATCC
AACGATAAACCGAATTCAATTATAGAGCTATGACACAATCAAATCCGAACGAACAAAATG
TTGAATTAAATCGTACCAGTCTCTATTGGGGG*TTATTACCCATTTTTGTACTTGCTGTT
TTATTTTCGAATTATTTCTTCAATTAAAATTAAGAAAAGAGCGTAG

QA 1 586 1 586
DS 

RD RS1GQ53TF 667 0 0
GGTAGACTCTAAAAATACCCTTGGTACTTTATTGACGATCTCACAAAGATGTAATCTCAG
TGAATTTGAGTTTACTGATTCATCTTTTACAGAATCGATTCCCTACGAGAATATCTGGAG
TTCAGTATGTCTGGAAGCACAGGAGAACGTTCTTTTGCTGATATTATTACCAGTATTCGA
TACTGGGTCATTCATAGCATTACTATACCTTCCCTATTCATTGCGGGCTGGTTATTCGTC
AGCACCGGTTTAGCTTACGACGTGTTTGGGAGCCCTCGCCCAAACGAGTATTTTACAGAG
AGCCGACAAGGCATTCCATTAATAACAGGCCGTTTTGATTCTTTGGAACAACTCGACGAA
TTTAGTAGATCTTTTTAGGAGGACCCAATGACTATAGATAGGACCTATCCAATTTTTACA
GTGCGCTGGTTGGCTGTTCATGGACTAGCTGTACCTACCGTTTTTTTTTGGGGTCAATAT
CAGCAATGCAGTTCATCCAACGATAAACCGAATTCAATTATAGAGCTATGACACAATCAA
ATCCGAACGAACAAAATGTTGAATTAAATCGTACCAGTCTCTATTGGGGGGTTATTACTC
ATTTTTGTACTTGCTGTTTTATTTTCGAATTATTTCTTCAATTAAAATTAAGAAAAGAGC
GTAG
AAT

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 3

CO CL3771Contig1 1274 3 14 U
GTGACGGCGTCGCTCAAGAATCTCTCTGAGCTCGTCAGCAACTGTTCGGCGATATTCGCG
GCGAGCAGTGGCAGCGACGGGAACGATTTCGCCGGAGTGCCGATACAGAACAGGAGGCTT
CTTGAAGTAGGAGGGGACAAGAACTCGAAGTTCCCGAGATGGACCAAGAGAAGAGAGCGT
GAGATACTGGAAATGCCAGTGTCCCAGATTCAAGCTGATATCATCGTCTCGAAAGACGGC
AACGGCACGTGCAAGACTATTTCGGAAGCCATCAAGAAAGCTCCTCAGTACAGTCCTCAC
CGGACTATTATCTACGTGAAAGCCGGAAGGTACGAAGAAGACAACCTCAAAGTCGGTAGG
AAAAAAATTAATTTGATGTTCGTTGGAGATGGGAAGGGTAAAACTATCATTTCGGGAGGG
AAAAGTATTTTTGACAACATGACCACTTTTCACACGGCGACGTTTGCTGCCACTGGAGCT
GGATTTATTGCAAGGGACATCACATTTGAAAATTGGGCTGGTCCGGCGAAGCATCAGGCA
GTCGCTCTCCGTGTCGGGGCTGACCACGCGGTGATCTATCGATGCAATATAATTGGTTAT
CAAGACACGCTCTATGTTCATTCAAACCGACAATTCTTTCGTGAGTGCGATATCTACGGT
ACAGTCGATTTCATCTTCGGTAATGCAGCTGTGGTGCTACAGAACTGTAGCATCTACGCA
CGCAAACCCATGGATTTTCAGAAAAACACGATCACAGCTCAGAACAGAAAAGACCCAAAC
CAAAACACCGGTATGTCGATACATGCATCTAGGATTTTGGCGACACCTGATCTCCAAGCC
AGCAACGGTACTTTCCAGACGTATCTAGGCCGGCCCTGGAAGCAATTCTCTAGGACAGTT
TACATGTTATCGTATATCGAGAAACATGTACACACAAGAGGTTGGCTCGAATGGAACACA
AGTTCATTTGCTTTAGATACTTTATATTACGGAGAGTATTTGAATACTGGACCCGGGTCG
GCTCTTGCGCAACGTGTGAAGTGGCCAGGATATCGGGTCATTAATTCGACGGCTGAGGCT
AACCGTTTTACGGTGGCAGAATTCATATATGGTTCGTCGTGGTTGCCTTCAACAGGCGTT
TCGTTCTTGGCCGGACTGAACATTTAGATAAAGAAAATAATATTGCTTTTGTTTCCGATG
CATTGTTTCATTCTTACGTCCTTATATTAATGGACATATGATTAATCCTATATATGTATG
TTTTAACTTTTTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DW74TF U 1
AF RS1EN51TF U 530
AF RS1BZ70TF U 494
BS 1 560 RS1DW74TF
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BS 562 657 RS1DW74TF
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BS 1019 1019 RS1EN51TF
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RD RS1DW74TF 770 0 0
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GCGAGCAGTGGCAGCGACGGGAACGATTTCGCCGGAGTGCCGATACAGAACAGGAGGCTT
CTTGAAGTAGGAGGGGACAAGAACTCGAAGTTCCCGAGATGGACCAAGAGAAGAGAGCGT
GAGATACTGGAAATGCCAGTGTCCCAGATTCAAGCTGATATCATCGTCTCGAAAGACGGC
AACGGCACGTGCAAGACTATTTCGGAAGCCATCAAGAAAGCTCCTCAGTACAGTCCTCAC
CGGACTATTATCTACGTGAAAGCCGGAAGGTACGAAGAAGACAACCTCAAAGTCGGTAGG
AAAAAAATTAATTTGATGTTCGTTGGAGATGGGAAGGGTAAAACTATCATTTCGGGAGGG
AAAAGTATTTTTGACAACATGACCACTTTTCACACGGCGACGTTTGCTGCCACTGGAGCT
GGATTTATTGCAAGGGACATCACATTTGAAAATTGGGCTGGTCCGGCGAAGCATCAGGCA
GTCGCTCTCCGTGTCGGGGCGGACCACGCGGTGATCTATCGATGCAATATAATTGGTTAT
CAAGACACGCTCTATGTTCATTCAAACCGACAATTCTTTCGTGAGTGCGATATCTACAGT
ACAGTCGATTTCATCTTCG*TAATGCAGCTGTGGTGCTACAGAACTGTAGCATCTACGCA
CGCAAACCCATGGATTT*CAGAAAA*CACGATCACAGCTCAGAACAGAAA

QA 1 770 1 770
DS 

RD RS1EN51TF 601 0 0
G
GCATCAGGCAGTCGCTCTCCGTGTCGGGGCTGACCACGCGGTGATCTATCGATGCAATAT
AATTGGTTATCAAGACACGCTCTATGTTCATTCAAACCGACAATTCTTTCGTGAGTGCGA
TATCTACGGTACAGTCGATTTCATCTTCGGTAATGCAGCTGTGGTGCTACAGAACTGTAG
CATCTACGCACGCAAACCCATGGATTTTCAGAAAAACACGATCACAGCTCAGAACAGAAA
AGACCCAAACCAAAACACCGGTATGTCGATACATGCATCTAGGATTTTGGCGACACCTGA
TCTCCAAGCCAGCAACGGTACTTTCCAGACGTATCTAGGCCGGCCCTGGAAGCAATTCTC
TAGGACAGTTTACATGTTATCGTATATCGAGAAACATGTACACACAAGAGGTTGGCTCGA
ATGGAACACAAGTTCATTTGCTTTAGATACTTTATATTACGGAGAGTATTTGAATACTGG
ACCCGGGTCGGCTCTTGCGCAACGTGTGAAGTGGCCAGGATATCGGGTCATTAATTCGAC
GGCTGAGGCTAACCGTTTTACGGTGGCAGAATTCATATATGGTTCGTCGTGGTTGCCTTC

QA 2 601 2 601
DS 

RD RS1BZ70TF 781 0 0
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TCGGGGCTGACCACGCGGTGATCTATCGATGCAATATAATTGGTTATCAAGACACGCTCT
ATGTTCATTCAAACCGACAATTCTTTCGTGAGTGCGATATCTACGGTACAGTCGATTTCA
TCTTCGGTAATGCAGCTGTGGTGCTACAGAACTGTAGCATCTACGCACGCAAACCCATGG
ATTTTCAGAAAAACACGATCACAGCTCAGAACAGAAAAGACCCAAACCAAAACACCGGTA
TGTCGATACATGCATCTAGGATTTTGGCGACACCTGATCTCCAAGCCAGCAACGGTACTT
TCCAGACGTATCTAGGCCGGCCCTGGAAGCAATTCTCTAGGACAGTTTACATGTTATCGT
ATATCGAGAAACATGTACACACAAGAGGTTGGCTCGAATGGAACACAAGTTCATTTGCTT
TAGATACTTTATATTACGGAGAGTATTTGAATACTGGACCCGGGTTGGCTCTTGCGCAAC
GTGTGAAGTGGCCAGGATATCGGGTCATTAATTCGACGGCTGAGGCTAACCGTTTTACGG
TGGCAGAATTCATATATGGTTCGTCGTGGTTGCCTTCAACAGGCGTTTCGTTCTTGGCCG
GACTGAACATTTAGATAAAGAAAATAATATTGCTTTTGTTTCCGATGCATTGTTTCATTC
TTACGTCCTTATATTAATGGACATATGATTAATCCTATATATGTATGTTTTAACTTTTTA
A

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 3

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GGATTGCATCTCCTCTCATAGAAACAAGCGAAGCCAAAGGGATAAAAAGAAAAGAAAAAA
AACAATGGAGTCCAGCAGAGGAGGAGGAGGTGGAATCCAGCAGTTGCTTGCTGCTGAACA
AGAAGCTCAACACATTGTCAATGCTGCTAGGACCGCAAAGATGGCAAGGCTGAAGCAAGC
CAAGGAAGAGGCTGAGAAAGAGATTGCCGAATACAAGGCTAAGACAGAGCAAGACTTCCA
GAGGAAACTTGAAGAGACAAGTGGAGACTCGGGTGCGAATGTGAAGAGGCTGGAGCAAGA
GACTGATGCCAAAATCGAACAGCTCAAGAACGAAGCTTCCAGGATTTCCAATGATGTTGT
GGATATGCTCCTCAAACATGTCACCACTGTCAAGAACTGAGAGTCATTTATAACTTTGAG
TTTCTGCTCTCTGTTTCTGGATGGATTGAAGAGACTTAATAAATCTCATATTATATTTGT
TGCTATGAGTTACTTCCTCCGTTTTGAATTATATGTCGTTTTGGAGCAAAATTTTCGTTT
CAAAATAAGTGTCGTTTTATGATTTCAAT


BQ
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AF RS1A732JQ C 1
AF RS1A732TF U 1
AF RS1CJ52TF U 16
BS 1 566 RS1A732TF
BS 567 569 RS1CJ52TF

RD RS1A732JQ 524 0 0
GGATTGCATCTCCTCTCATAGAAACAAGGGAAGCCAAAGGGATAAAAAGAAAAGAAAAAA
AACAATGGAGTCCAGCAGAGGAGGAGGAGGTGGAATCCAGCAGTTGCTTGCTGCTGAACA
AGAAGCTCAACACATTGTCAATGCTGCTAGGACCGCAAAGATGGCAAGGCTGAAGCAAGC
CAAGGAAGAGGCTGAGAAAGAGATTGCCGAATACAAGGCTAAGACAGAGCAAGACTTCCA
GAGGAAACTTGAAGAGACAAGTGGAGACTCGGGTGCGAATGTGAAGAGGCTGGAGCAAGA
GACTGATGCCAAAATCGAACAGCTCAAGAACGAAGCTTCCAGGATTTCCAATGATGTTGT
GGATATGCTCCTCAAACATGTCACCACTGTCAAGAACTGAGAGTCATTTATAACTTTGAG
TTTCTGCTCTCTGTTTCTGGATGGATTGAAGAGACTTAATAAATCTCATATTATATTTGT
TGCTATGAGTTACTTCCTCCGTTTTGAATTATATGTCGTTTTGG

QA 1 524 1 524
DS 

RD RS1A732TF 566 0 0
GGATTGCATCTCCTCTCATAGAAACAAGCGAAGCCAAAGGGATAAAAAGAAAAGAAAAAA
AACAATGGAGTCCAGCAGAGGAGGAGGAGGTGGAATCCAGCAGTTGCTTGCTGCTGAACA
AGAAGCTCAACACATTGTCAATGCTGCTAGGACCGCAAAGATGGCAAGGCTGAAGCAAGC
CAAGGAAGAGGCTGAGAAAGAGATTGCCGAATACAAGGCTAAGACAGAGCAAGACTTCCA
GAGGAAACTTGAAGAGACAAGTGGAGACTCGGGTGCGAATGTGAAGAGGCTGGAGCAAGA
GACTGATGCCAAAATCGAACAGCTCAAGAACGAAGCTTCCAGGATTTCCAATGATGTTGT
GGATATGCTCCTCAAACATGTCACCACTGTCAAGAACTGAGAGTCATTTATAACTTTGAG
TTTCTGCTCTCTGTTTCTGGATGGATTGAAGAGACTTAATAAATCTCATATTATATTTGT
TGCTATGAGTTACTTCCTCCGTTTTGAATTATATGTCGTTTTGGAGCAAAATTTTCGTTT
CAAAATAAGTGTCGTTTTATGATTTC

QA 1 566 1 566
DS 

RD RS1CJ52TF 554 0 0
GG
ATAGAAACAAGCGAAGCCAAAGGGATAAAAAGAAAAGAAAAAAA*CAATGGAGTCCAGCA
GAGGAGGAGGAGGTGGAATCCAGCAGTTGCTTGCTGCCGAACAAGAAGCTCAACACATTG
TCAATGCTGCTAGGACCGCAAAGATGGCAAGGCTGAAGCAAGCCAAGGAAGAGGCTGAGA
AAGAGATTGCCGAATACAAGGCTAAGACAGAGCAAGACTTCCAGAGGAAACTTGAAGAGA
CAAGTGGAGACTCGGGTGCGAATGTGAAGAGGCTGGAGCAAGAGACTGATGCCAAAATCG
AACAGCTCAAGAACGAAGCTTCCAGGATTTCCAATGATGTTGTGGATATGCTCCTCAAAC
ATGTCACCACTGTCAAGAACTGAGAGTCATTTATAACTTTGAGTTTCTGCTCTCTGTTTC
TGGATGGATTGAAGAGACTTAATAAATCTCATATTATATTTGTTGCTATGAGTTACTTCC
TCCGTTTTGAATTATATGTCGTTTTGGAGCAAAATTTTCGTTTCAAAATAAGTGTCGTTT
TATGATTTCAAT

QA 3 554 3 554
DS 



AS 1 3

CO CL3773Contig1 723 3 2 U
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GATTGTGAAAAACTCATGGGGAACAAGCTGGGGAGAGAGCGGATACATAAGGATGGAGCG
TAACATTGCGTCTTCAGCAGGAAAATGTGGAATCGCTGTCGAGCCTTCATATCCGATCAA
GAACGGCCAAAACCCACCAAACCCTGGACCTTCACCTCCATCTCCCGTCACGCCTCCGAC
CCAATGTGACAGTTACTACACATGTCCTGAGAGCAACACTTGTTGTTGTCTTTTTGATTA
TGGCAAGTATTGCCTTGCTTGGGGATGTTGCCCACTAGAAGCAGCCACATGTTGTGATGA
CAACTATAGTTGCTGCCCTCACGAGTACCCCGTTTGTGACCTCGATCAGGGAACTTGTTT
AATGAGCAAGAACAGTCCTTTTAGTATCAAGGCCATAAAGCGCAAGCCCGCAACACCATT
CTGGTCGCAGAGCAGGAAGAACATTGTGTAAGAAGATGGTGACACTGCACATTTGTTTCT
TCAGAGAGGATTCTGACTCATATGAGCAAAGAGATCTCTGTAGAGATTTGTCAAATGATT
GTATGTTGTTGTTTATGACATAAGATACATAAAATGCAGCTTTTGGGTATTGTGTATATA
TTAAAAAAAAACATAAGTTGCATTTAGTATCTTAGTTGGGTTTCAGTGATATATAAAATT
TAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 

AF RS1E360TF U 1
AF RS1E360JQ C 51
AF RS1CL60TF U 180
BS 1 641 RS1E360TF
BS 642 723 RS1CL60TF

RD RS1E360TF 641 0 0
GGATCTAGACCACGGAGTTTTGGCGGTCGGGTACGGAACAGAGAGCGGCAAAGACTATTG
GATTGTGAAAAACTCATGGGGAACAAGCTGGGGAGAGAGCGGATACATAAGGATGGAGCG
TAACATTGCGTCTTCAGCAGGAAAATGTGGAATCGCTGTCGAGCCTTCATATCCGATCAA
GAACGGCCAAAACCCACCAAACCCTGGACCTTCACCTCCATCTCCCGTCACGCCTCCGAC
CCAATGTGACAGTTACTACACATGTCCTGAGAGCAACACTTGTTGTTGTCTTTTTGATTA
TGGCAAGTATTGCCTTGCTTGGGGATGTTGCCCACTAGAAGCAGCCACATGTTGTGATGA
CAACTATAGTTGCTGCCCTCACGAGTACCCCGTTTGTGACCTCGATCAGGGAACTTGTTT
AATGAGCAAGAACAGTCCTTTTAGTATCAAGGCCATAAAGCGCAAGCCCGCAACACCATT
CTGGTCGCAGAGCAGGAAGAACATTGTGTAAGAAGATGGTGACACTGCACATTTGTTTCT
TCAGAGAGGATTCTGACTCATATGAGCAAAGAGATCTCTGTAGAGATTTGTCAAATGATT
GTATGTTGTTGTTTATGACATAAGATACATAAAATGCAGCT

QA 1 641 1 641
DS 

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GGATGGAGCGTAACATTGCGTCTTCAGCAGGAAAATGTGGAATCGCTGTCGAGCCTTCAT
ATCCGATCAAGAACGGCCAAAACCCACCAAACCCTGGACCTTCACCTCCATCTCCCGTCA
CGCCTCCGACCCAATGTGACAGTTACTACACATGTCCTGAGAGCAACACTTGTTGTTGTC
TTTTTGATTATGGCAAGTATTGCCTTGCTTGGGGATGTTGCCCACTAGAAGCAGCCACAT
GTTGTGATGACAACTATAGTTGCTGCCCTCACGAGTACCCCGTTTGTGACCTCGATCAGG
GAACTTGTTTAATGAGCAAGAACAGTCCTTTTAGTATCAAGGCCATAAAGCGCAAGCCCG
CAACACCATTTTGGTCGCAGAGCAGGAAGAACATTGTGTAAGAAGATGGTGACACTGCAC
ATTTGTTTCTTCAGAGAGGATTTTGACTCATATGAGCAAAGAGATCTCTGTAGAGATTTG
TCAAATGATTGTATGTTGTTGTTTATGACATAAGATACATAAAATGCAGCT
TTTGGAG

QA 1 591 1 591
DS 

RD RS1CL60TF 544 0 0
T
GAACGGCCAAAACCCACCAAACCCTGGACCTTCACCTCCATCTCCCGTCACGCCTCCGAC
CCAATGTGACAGTTACTACACATGTCCTGAGAGCAACACTTGTTGTTGTCTTTTTGATTA
TGGCAAGTATTGCCTTGCTTGGGGATGTTGCCCACTAGAAGCAGCCACATGTTGTGATGA
CAACTATAGTTGCTGCCCTCACGAGTACCCCGTTTGTGACCTCGATCAGGGAACTTGTTT
AATGAGCAAGAACAGTCCTTTTAGTATCAAGGCCATAAAGCGCAAGCCCGCAACACCATT
CTGGTCGCAGAGCAGGAAGAACATTGTGTAAGAAGATGGTGACACTGCACATTTGTTTCT
TCAGAGAGGATTCTGACTCATATGAGCAAAGAGATCTCTGTAGAGATTTGTCAAATGATT
GTATGTTGTTGTTTATGACATAAGATACATAAAATGCAGCTTTTGGGTATTGTGTATATA
TTAAAAAAAAACATAAGTTGCATTTAGTATCTTAGTTGGGTTTCAGTGATATATAAAATT
TAT

QA 2 544 2 544
DS 



AS 1 3

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TTTTAGGCTCTTTCACTTCCACTACTATTTTCTTTTGTAACACTTTTTCCACTACTATAT
ATACACAAAGTTAAATGGCAATGAAATGCATCGCAACTTTCCCTCAAAGGTTCAATGATA
ACAAAACCAAAGAGGATCCTTCAATCTTCGATGCAAATCTCCTGAATCAGCTATCAAACC
ACATACCTCAAGAGTTCGTATGGCCCGACCACGAGAAACCTTCCACGGATGTTCAACCTC
TCCAAGCCCCTCTCATAGACCTCGCCGGTTTCCTCTCGGGCGACTCGTTCTTGGCCTCGG
AAGCTACTAGACTCGTCTCTGAGGCTTCGAAGAAACATGGCTTCTTCCTAGTTACTAACC
ACGGTGTTGAAGAAACGCTCTCGTCTCGTGCCTATCTATTTATGGACTCTTTCTTTAAGG
CTCCGGCTTGTGAGAAACAAAAGGCTCAGAGGACTTGGGGCGACTCCTCCGGTTACGCTA
GTAGCTTCGTCGGGAGACTCTCCTCTAAGCTCCCCTGGAAGGAAACGCTGTCGTTTAAGT
TCTCTCCCCAGGAGAAGTGCCAATCCCAAACCGTCAAAGACTTTGTTTCTAATAAAATGG
GAGTTGAATACCAAAATTTCGGGAAAGTCTATCAAGAATACGCTGAGGCCATGAATATTC
TCTCATTAAAAATCATGGAGCTTCTTGGAAAGAGTCTTGGAATCGAGAGGAGACATTTTA
GAGAATTTTTCGAAGACAACGAGTCCATACTACGGTTGAATTATTACCCGCAGTGCAACC
AACCGGAGCTTACATTAGGGACAGGACCTCACTGCGACCCAACGTCTCTAACCATACTTC
ATCAACACCAAGTCGCTGGTCTTCAAGTGTTCGTGGACAACAAATGGCAATCCATTCCTC
CTAACCCTCAAGCATTTGTGGTGAATATAGGCGACACTTTCATGAGTTGTTTGCATCGGG
CGGTGGTGAACAGGGAGAGAGAAAGGAAGACATTCGCATTCTTCCTATGTCCGAAAGGAG
ACAAAATTGTGAAGCCACCAAAAGAACTAGTAGGAGTGATGTCTGGTGAAAGAGAATATC
CTGATTTTACGTGGTCTATGTTTCTTAAGTTCACACAGGAGCATTATAGATCAGACATGA
ACACTCTTGAAGAGTTCTCAAATTGGCTTAAGAACAGAAAAAGTTTCTAAAATGAGAAGA
CAATGATGTGGCCCAGAAGTGGACTTGTAGTTATGTAGAGAGCTTTCGCAAGGGTTAAGA
GATAAGATGTTCAAGACTAGTTAATGAACCTTTTTTTTTTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GR21TF U 53
AF RS1B409TF U 1
AF RS1B409JQ C 636
BS 1 354 RS1B409TF
BS 355 355 RS1GR21TF
BS 356 703 RS1B409TF
BS 704 1363 RS1B409JQ

RD RS1GR21TF 555 0 0
GGAT
TTTCTTTTAGGCTCTTTCACTTCCACTACTATTTTCTTTTGTAACACTTTTTCCACTACT
ATATATACACAAAGTTAAATGGCAATGAAATGCATCGCAACTTTCCCTCAAAGGTTCAAT
GATAACAAAACCAAAGAGGATCCTTCAATCTTCGATGCAAATCTCCTGAATCAGCTATCA
AACCACATACCTCAAGAGTTCGTATGGCCCGACCACGAGAAACCTTCCACGGATGTTCAA
CCTCTCCAAGCCCCTCTCATAGACCTCGCCGGTTTCCTCTCGGGCGACTCGTTCTTGGCC
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AACCACGGTGTTGAAGAAACGCTCTTGTCTCGTGCCTATCTATTTATGGACTCTTTCTTT
AAGGCTCCGGCTTGTGAGAAACAAAAGGCTCAGAGGACTTGGGGCGACTCCTCCGGTTAC
GCTAGTAGCTTCGTCGGGAGATTCTCCTCTAAGCTCCCCTGGAAGGAAACGCTGTCGTTT
AAGTTCTCTCC

QA 5 555 5 555
DS 

RD RS1B409TF 703 0 0
GGACCGCTATATTTATTTATATCCCACAGAAGACCTTTAGAGGATCTTTCATTTTATTTC
TTTTAGGCTCTTTCACTTCCACTACTATTTTCTTTTGTAACACTTTTTCCACTACTATAT
ATACACAAAGTTAAATGGCAATGAAATGCATCGCAACTTTCCCTCAAAGGTTCAATGATA
ACAAAACCAAAGAGGATCCTTCAATCTTCGATGCAAATCTCCTGAATCAGCTATCAAACC
ACATACCTCAAGAGTTCGTATGGCCCGACCACGAGAAACCTTCCACGGATGTTCAACCTC
TCCAAGCCCCTCTCATAGACCTCGCCGGTTTCCTCTCGGGCGACTCGTTCTTGGTCTCGG
AAGCTACTAGACTCGTCTCTGAGGCTTCGAAGAAACATGGCTTCTTCCTAGTTACTAACC
ACGGTGTTGAAGAAACGCTCTCGTCTCGTGCCTATCTATTTATGGACTCTTTCTTTAAGG
CTCCGGCTTGTGAGAAACAAAAGGCTCAGAGGACTTGGGGCGACTCCTCCGGTTACGCTA
GTAGCTTCGTCGGGAGACTCTCCTCTAAGCTCCCCTGGAAGGAAACGCTGTCGTTTAAGT
TCTCTCCCCAGGAGAAGTGCCAATCCCAAACCGTCAAAGACTTTGTTTCTAATAAAATGG
GAGTTGAATACCAAAATTTCGGGAAAGTCTATCAAGAATACGC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1B409JQ 728 0 0
AAAGACTTTGTTTCTAATAAAATGGGAGTTGAATACCAAAATTTCGGGAAAGTCTATCAA
GAATACGCTGAGGCCATGAATATTCTCTCATTAAAAATCATGGAGCTTCTTGGAAAGAGT
CTTGGAATCGAGAGGAGACATTTTAGAGAATTTTTCGAAGACAACGAGTCCATACTACGG
TTGAATTATTACCCGCAGTGCAACCAACCGGAGCTTACATTAGGGACAGGACCTCACTGC
GACCCAACGTCTCTAACCATACTTCATCAACACCAAGTCGCTGGTCTTCAAGTGTTCGTG
GACAACAAATGGCAATCCATTCCTCCTAACCCTCAAGCATTTGTGGTGAATATAGGCGAC
ACTTTCATGAGTTGTTTGCATCGGGCGGTGGTGAACAGGGAGAGAGAAAGGAAGACATTC
GCATTCTTCCTATGTCCGAAAGGAGACAAAATTGTGAAGCCACCAAAAGAACTAGTAGGA
GTGATGTCTGGTGAAAGAGAATATCCTGATTTTACGTGGTCTATGTTTCTTAAGTTCACA
CAGGAGCATTATAGATCAGACATGAACACTCTTGAAGAGTTCTCAAATTGGCTTAAGAAC
AGAAAAAGTTTCTAAAATGAGAAGACAATGATGTGGCCCAGAAGTGGACTTGTAGTTATG
TAGAGAGCTTTCGCAAGGGTTAAGAGATAAGATGTTCAAGACTAGTTAATGAACCTTTTT
TTTTTGAT

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 3

CO CL3775Contig1 1135 3 2 U
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AAAGCATTGGAATACAAATTATTACATAAGCAGAAATATGCGACATATGCTGAAGACAAA
TCATTTGTAGAAGTGAAGATTGACGTTGCTTTCTTCTGCAGTAAGCCTTACACGCTAACA
GAACATTAGATCTGTTATTTTCCTTCTTGAAAATTCGTCTCACTCTAATACGATTGGTAT
GCCATTTTGGCATTTTATTTTTTGTCCAAATCGTATAGAAAAAACCCATTGCATCCAGAA
CATGCTCTAGAAAATTGACACGGGTAATCCATATCTGTGTTCTTGTGATGAAAGTAGATT
CTATACCTTCCTTATACTGCTGATATGTTAACCATTTGATCTTCCGTGAGTCCCATCTAT
ATGATGGCTTATACTGACTTTCAGATTGATTCCCTCTCTTCAGAAAAACATGCCAAGGCG
GCTTTCGTGGTGGTCGTCTCTTCCATAAACATTGAAGCCCTCGAACGAAGATGTCGGTAG
AGGGGAAATCATCGTGCAATGTACTACACAAACAAACGTCGGTAGAAGTAGACTTCAAAA
AATGTTGTCCATTCACCGGGAAGAAACTCCTCCATAGGAAGAGATAATGAACTTCAAACA
CACCATCACGTCTCTTTACTATCTTCTCCCAATTAAAGCCAGTGATAAGAATCATGGATA
TAAATATTGGCATTATTGGGTAGAAGCAACGACGAGAAAACTGAACTTAAGAATCTTGTG
GAGCTTGGCAACAGGTTCAACGGTCTTGTGTGGTGTCTGGTCTTCAGCTGCTGGAACTTC
CTTATCAGAGAAAGCAAGACATGTACCAATTGTCTCCAGGTATTCTCCAACCAGCTTGAT
TTTCCCATCAATGGTCAATATGGGATTCAAAGTATCCACCTGAGAGAGTATAAGGAGCGT
CTGAAGGGATGTCAATGTGCCTCGAAACATCGTCAAGATCCATCAGAACATATTCTTCTT
CATCTTCTTTACTCACTTTCCCCGATTCATCACTCATCTTTTTCTCAATCTGAGTTCACC
GGTACAGAACTGCAGTTGGAGAGAGAGGGCCAAGGGTATTGTTTTGTGACTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D734JQ U 359
AF RS1D733JQ U 1
AF RS1D733TF C 373
BS 1 786 RS1D733JQ
BS 787 1135 RS1D733TF

RD RS1D734JQ 101 0 0
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AAATGATGGCTTATACTGACTTTCAGATTGATTCCCTCTCT

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DS 

RD RS1D733JQ 786 0 0
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AAAGCATTGGAATACAAATTATTACATAAGCAGAAATATGCGACATATGCTGAAGACAAA
TCATTTGTAGAAGTGAAGATTGACGTTGCTTTCTTCTGCAGTAAGCCTTACACGCTAACA
GAACATTAGATCTGTTATTTTCCTTCTTGAAAATTCGTCTCACTCTAATACGATTGGTAT
GCCATTTTGGCATTTTATTTTTTGTCCAAATCGTATAGAAAAAACCCATTGCATCCAGAA
CATGCTCTAGAAAATTGACACGGGTAATCCATATCTGTGTTCTTGTGATGAAAGTAGATT
CTATACCTTCCTTATACTGCTGATATGTTAACCATTTGATCTTCCGTGAGTCCCATCTAT
ATGATGGCTTATACTGACTTTCAGATTGATTCCCTCTCTTCAGAAAAACATGCCAAGGCG
GCTTTCGTGGTGGTCGTCTCTTCCATAAACATTGAAGCCCTCGAACGAAGATGTCGGTAG
AGGGGAAATCATCGTGCAATGTACTACACAAACAAACGTCGGTAGAAGTAGACTTCAAAA
AATGTTGTCCATTCACCGGGAAGAAACTCCTCCATAGGAAGAGATAATGAACTTCAAACA
CACCATCACGTCTCTTTACTATCTTCTCCCAATTAAAGCCAGTGATAAGAATCATGGATA
TAAATATTGGCATTATTGGGTAGAAGCAACGACGAGAAAACTGAACTTAAGAATCTTGTG
GAGCTT

QA 1 786 1 786
DS 

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ACTGACTT*CAGATTGATTCCCTCTCTTCAGAGAAACATGCCAAGGCGGCTTTCGTGGTG
GTCGTCTCTTCCATAAACATTGAAGCCCTCGAACGAAGATGTCGGTAGAGGGGAAATCAT
CGTGCAATGTACTACACAAACAAACGTCGGTAGAAGTAGACTTCAAAAAATGTTGTCCAT
TCACCGGGAAGAAACTCCTCCATAGGAAGAGATAATGAACTTCAAACACACCATCACGTC
TCTTTACTATCTTCTCCCAATTAAAGCCAGTGATAAGAATCATGGATATAAATATTGGCA
TTATTGGGTAGAAGCAACGACGAGAAAACTGAACTTAAGAATCTTGTGGAGCTTGGCAAC
AGGTTCAACGGTCTTGTGTGGTGTCTGGTCTTCAGCTGCTGGAACTTCCTTATCAGAGAA
AGCAAGACATGTACCAATTGTCTCCAGGTATTCTCCAACCAGCTTGATTTTCCCATCAAT
GGTCAATATGGGATTCAAAGTATCCACCTGAGAGAGTATAAGGAGCGTCTGAAGGGATGT
CAATGTGCCTCGAAACATCGTCAAGATCCATCAGAACATATTCTTCTTCATCTTCTTTAC
TCACTTTCCCCGATTCATCACTCATCTTTTTCTCAATCTGAGTTCACCGGTACAGAACTG
CAGTTGGAGAGAGAGGGCCAAGGGTATTGTTTTGTGACTATCC

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 3

CO CL3776Contig1 929 3 11 U
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TCATCGGAAGCATCATCTCGGCGATGGGTTGGCTGACGAGATTCTTAACAGCGGTAGCGT
TTTTAGCCGCCGGAGTAATATTCTCACCGGAGACATTCGGATCGCTGTCGAAGGGGGAGA
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GGGGAGCTGCTCTCTGGGCTACCTTCATCGGCGGAATCATCATGTTCAAGAACTTACCGA
GGCATCAGTTCGGTAACCTTCAGAGCAAGATGTTTCCAGCTTATTTCACTCTTGTTGGTT
CTTGCTGCGCCATTTCACTCTCTGCCTTTGGGTATCTGCATCCATGGAAGTCATCTTCTT
CTGTGGAGAAGTATCAGCTAGGGTTCCTTGTCTCGGCTTTTGCTTTCAATCTCACTAATT
TGCTCGTCTTCACTCCCATGACCATCGATATGATGAAGCAAAGGCACAAAGTAGAGAGAG
AGAACAACATTGGAGATGAAGTTGGTTGGTCCAAGAACAGGGAGAAGGCAAAGACTATCC
CTCAGCTAGCTGCCATGAACAAGAAGTTTGGTATGATTCACGGGTTATCATCTCTCGCTA
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TTGCTTTGTAAGATTATTATACCAGAAGGTGAAACAGTTTGTTATAATGATATCGTTTTT
TTTTCTTTTAAACACTAGATGTTTTCTTTTTTTTTGAAATAATTGATGTGTGAATACTAT
TACAGAAGAGTAATGCCTAAGTTTTACCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DF50TF U 1
AF RS1AH28TF U 63
AF RS1AH28JQ C 417
BS 1 82 RS1DF50TF
BS 83 83 RS1AH28TF
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RD RS1DF50TF 733 0 0
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TCATCGGAAGCATCATCTCGGCTATGGGTTGGCTGACGAGATTCTTAACAGCGGTAGCGT
TTTTAGCCGCCGGAGTAATATTCTCACCGGAGACATTCGGATCGCTGTCGAAGGGGGAGA
ATTCGGCGAAGGTTTTGATATTGGTGAAGCTAGCTCATCTACTCAGCTTCGCTACAGCTT
GGGGAGCTGCTCTCTGGGCTACCTTCATCGGCGGAATCATCATGTTC**GAACTTACCGA
GGCATCAGTTCGGTAACCTTCAGAGCAAGATGTTTCCAGCTTATTTCACTCTTGTTGGTT
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TGCTCGTCTTCACTCCCATGACCATCGATATGATGAAGCAAAGGCACAAAGTAGAGAGAG
AGAACAACATTGGAGATGAAGTTGGTTGGTCCAAGAACAGGGAGAAGGCAAAGACTATCC
CTCAGCTAGCTGCCATGAACAAGAAGTTTGGTATGATTCACGGGTTATCATCTCTCGCTA
ACATCTTCTCTTTTGGAAGCCTTGCCATGCATTCTTGGTACCTTGCTGGGA*GATGGATC
TCTAAATTTCTTG

QA 1 733 1 733
DS 

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TTAGCCGCCGGAGTAATATTCTCACCGGAGACATTCGGATCGCTGTCGAAGGGGGAGAAT
TCGGCGAAGGTTTTGATATTGGTGAAGCTAGCTCATCTACTCAGCTTCGCTACAGCTTGG
GGGGCTGCTCTCTGGGCTACCTTCATCGGCGGAATCATCATGTTCAAGAACTTACCGAGG
CATCAGTTCGGTAACCTTCAGAGCAAGATGTTTCCAGCTTATTTCACTCTTGTTGGTTCT
TGCTGCGCCATTTCACTCTCTGCCTTTGGGTATCTGCATCCATGGAAGTCATCTTCTTCT
GTGGAGAAGTATCAGCTAGGGTTCCTTGTCTCGGCTTTTGCTTTCAATCTCACTAATTTG
CTCGTCTTCACTCCCATGACCATCGATATGATGAAGCAAAGGCACAAAGTAGAGAGAGAG
AACAACATTGGAGATGAAGTTGGTTGGTCCAAGAACAGGGAGAAGGCAAAGACTATCCCT
CAGCTAGCTGCCATGAACAAGAAGTTTGGTATGATTCACGGGTTATCATCTCTCGCTAAC
ATCTTCTCTTT*GGAAGCCTTGCCATGCATTCTTGGTACCTTGCTGGGAAGATGGATCTC
TAAATTTCTTGTCACAAAACGTCTGAGCTTTTATGCCTCCCTTCATGAATAAAATCTCTT
GCTTTGTA
GATTATATACC

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1AH28JQ 513 0 0
TCTTCTGTGGAGAAGTATCAGCTAGGGTTCCTTGTCTCGGCTTTTGCTTTCAATCTCACT
AATTTGCTCGTCTTCACTCCCATGACCATCGATATGATGAAGCAAAGGCACAAAGTAGAG
AGAGAGAACAACATTGGAGATGAAGTTGGTTGGTCCAAGAACAGGGAGAAGGCAAAGACT
ATCCCTCAGCTAGCTGCCATGAACAAGAAGTTTGGTATGATTCACGGGTTATCATCTCTC
GCTAACATTTTCTCTTT*GGAAGCCTTGCCATGCATTCTTGGTACCTTGCTGGGAAGATG
GATCTTTAAATTTCTTGTCACAAAAGGTTTGAGCTTTTATGCCTCCCTTCATGAATAAAA
TCTCTTGCTTTGTAAGATTATTATACCAGAAGGTGAAACAGTTTGTTATAATGATATCGT
TTTTTTTTCTTTTAAACACTAGATGTTTTCTTTTTTTTTGAAATAATTGATGTGTGAATA
CTATTACAGAAGAGTAATGCCTAAGTTTTACCT

QA 1 513 1 513
DS 



AS 1 2

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GGGGTGTTCGTTTTCGGGATTGAACGCGCTTTACGACAACGGGGGAGGCGACGTGTGGAT
CAATGAGAACCGTTTCAGGATCGTGAGGCAGCTCGGCGAAGGCGGATTCGCGTTCGTGTT
TCTGGTGAAGGAGATTGTCGCCGACGCTTCGTCCGGTGGCGGTCTGGCGTCGAAAGTCAA
GGATCCAGCTCATCTCTCCGATGATGGAACTTATGCGATGAAGAAAGTTCTGATTCAGAA
CAAGGAGCAGCTGGAACTGGTGCGGGAGGAGATTCGTGTTTCGTCTCTGTTCAGCCACCC
TAATTTGCTTCCTCTCCTTGATCATGCCATTATTCCTGTTAAGGGTAGTGGCCAAGAGGG
AGCTGGGAAACACGAGGCCTTCCTGCTGTTTCCTGTTCACCTGGATGGGACCTTGCTGGA
TAATTCCACAGCTATGAAGGCTAAGAAGGAAACATTCTCAACAACTGATGTCTTGCATAT
ATTTCGTCAGCTTTGTGATGGACTCAAACACATGCACTCTCTGGAGCCACCATATGCTCA
CAACGATGTCAAACCTGGAAACGTGCTGTTAACACGTAGGAAAGGACAGACTCCTCTTGC
GATTTTGATGGACTTTGGGAGTGCTCGTCCTGCACGGAAGCAAATCCGCTCCCGTCAGGA
GGCCTTACAGTTACAGGAATGGACATCTGAACATTCTTCAGCACCGTTTAGAGCTCCCGA
GCTCTGGGATTGCCCAAGCCATGCGGATATTGATGAGAGAACTGATATCTGGTCACTAGG
CTGCACACTATACGCAATAATGTACGGTGTGTCTCCGTTTGAATATGTATTTGAAGAATC
TGATGGAAGTCTTCAGCTTGCAATCGTTAACGCTAAGATCAAATGGCCAAAGGCAGGACC
AAAGGCTTCGTATCCTGAAGCACTTCACCAGTTCGTGACTTGGATGCTGCAACCTCAGGC
TGCGGTTCGACCTCGCATGACGATATCATCATCCATGTCGACAAATTGATCGCAAAATTC
ACCAAGTGATTCCCTATTCAGGTGGTATAATCTAAAGAGTTTAAAAGAAAAAGGATTTTA
ATATACATTACTTGCTCTCTTTATTTATATGTTTAGCTATTTTGAAAATTCCCATATTAG
ATACATATTAAACCACATAATATTTTCGTTTTATCTATTTGTAAGACTTCTTTTTAAAAT
AATGTTATTTATCAGACAGATAACAATTTTATATATGTTTTTAATTGCTGTT


BQ
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AF RS1C179TF U 1
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RD RS1C179TF 635 0 0
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CAATGAGAACCGTTTCAGGATCGTGAGGCAGCTCGGCGAAGGCGGATTCGCGTTCGTGTT
TCTGGTGAAGGAGATTGTCGCCGACGCTTCGTCCGGTGGCGGTCTGGCGTCGAAAGTCAA
GGATCCAGCTCATCTCTCCGATGATGGAACTTATGCGATGAAGAAAGTTCTGATTCAGAA
CAAGGAGCAGCTGGAACTGGTGCGGGAGGAGATTCGTGTTTCGTCTCTGTTCAGCCACCC
TAATTTGCTTCCTCTCCTTGATCATGCCATTATTCCTGTTAAGGGTAGTGGCCAAGAGGG
AGCTGGGAAACACGAGGCCTTCCTGCTGTTTCCTGTTCACCTGGATGGGACCTTGCTGGA
TAATTCCACAGCTATGAAGGCTAAGAAGGAAACATTCTCAACAACTGATGTCTTGCATAT
ATTTCGTCAGCTTTGTGATGGACTCAAACACATGCACTCTCTGGAGCCACCATATGCTCA
CAACGATGTCAA*CCTGGAAACGTGCTGTTAACAC

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1AT33JQ 795 0 0
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TCTCTGGAGCCACCATATGCTCACAACGATGTCAAACCTGGAAACGTGCTGTTAACACGT
AGGAAAGGACAGACTCCTCTTGCGATTTTGATGGACTTTGGGAGTGCTCGTCCTGCACGG
AAGCAAATCCGCTCCCGTCAGGAGGCCTTACAGTTACAGGAATGGACATCTGAACATTCT
TCAGCACCGTTTAGAGCTCCCGAGCTCTGGGATTGCCCAAGCCATGCGGATATTGATGAG
AGAACTGATATCTGGTCACTAGGCTGCACACTATACGCAATAATGTACGGTGTGTCTCCG
TTTGAATATGTATTTGAAGAATCTGATGGAAGTCTTCAGCTTGCAATCGTTAACGCTAAG
ATCAAATGGCCAAAGGCAGGACCAAAGGCTTCGTATCCTGAAGCACTTCACCAGTTCGTG
ACTTGGATGCTGCAACCTCAGGCTGCGGTTCGACCTCGCATGACGATATCATCATCCATG
TCGACAAATTGATCGCAAAATTCACCAAGTGATTCCCTATTCAGGTGGTATAATCTAAAG
AGTTTAAAAGAAAAAGGATTTTAATATACATTACTTGCTCTCTTTATTTATATGTTTAGC
TATTTTGAAAATTCCCATATTAGATACATATTAAACCACATAATATTTTCGTTTTATCTA
TTTGTAAGACTTCTTTTTAAAATAATGTTATTTATCAGACAGATAACAATTTTATATATG
TTTTTAATTGCTGTT

QA 1 795 1 795
DS 



AS 1 3

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TGACGGACAATGAGTACGACAGCATAGGAACCGTAGCTTACTGGTGGACCCACGCAATAA
TTTCCGACAAAACCTACAAGTCAATCCTCAAAAACTGCAATTTCAAGGCTGAGAAAGTTT
CCGACGACTGCGACACGGCCGTTAACTACGCCATGAACCACGAGTTCGGTGACATTGACC
AATACAGCATTTACACTCCAACGTGCGTGGCTTCGAAACAGAAGAAGACTGATTTCTTAC
GTATGAAAAACACAGTCTTGCGTAGACGACGGTCTGGTTACGACCCTTGCACGGAGAGCT
ACGCAGAGAAGTATTATAACCGTCTTGATGTTCAGAGAGCTATGCATGCTAATGTCACTG
GGATTCGCTATAAATGGACAGCATGCAGTGATGTTCTGATCAGGAACTGGAAAGACTCCG
ACAAGACGATGTTACCGGTTTACAAGGAACTTGCAGCAGCTGGTTTGAGGATCTGGGTTT
TCAGTGGTGATACAGATTCGGTGGTACCAGTGACGGCGACACGGTTTTCCCTAAGCCATC
TCAATCTCCCGGTGAAAACTCCTTGGTACCCTTGGTACTCCGGTAACCAGGTGGGAGGAT
GGACAGAGGTATACAAGGGACTGACCTTTGCAACAGTAAGAGGGGCGGGGCACGAGGTGC
CTTTATTCGAACCAAAGCGTGCTCTCATTCTTTTCAAATCGTTCTTGGCCGGAAAAGAGC
TTCCAAAATCTTATTAGTAACCTAAAAACATAGAGTAAGAGAAAATATCTCCAACAAGCA
CAATCCAGCTACCAGATTAGGATCCAATTCCGAGTAAACTCGGAGTTATTGTTTTTTTTC
TTCTTCTAATTTCTGTTTTAAAGCTTTGATTCATTTCCACAATTTGGAAATCACAAAACG
ATTTGAGAATATTCAAGGAATTGTTTATAAGTTAAAGAAGTACAAGGGTTTC


BQ
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1EP54TF U 1
AF RS1E343TF U 314
AF RS1EP54JQ C 272
BS 1 752 RS1EP54TF
BS 753 753 RS1E343TF
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BS 833 918 RS1E343TF
BS 919 1072 RS1EP54JQ

RD RS1EP54TF 807 0 0
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ACTACAAAGCTTTCTCAAAACCCATAATCAATCTCAAAGGATTCATGGTGGGGAACGCAG
TGACGGACAATGAGTACGACAGCATAGGAACCGTAGCTTACTGGTGGACCCACGCAATAA
TTTCCGACAAAACCTACAAGTCAATCCTCAAAAACTGCAATTTCAAGGCTGAGAAAGTTT
CCGACGACTGCGACACGGCCGTTAACTACGCCATGAACCACGAGTTCGGTGACATTGACC
AATACAGCATTTACACTCCAACGTGCGTGGCTTCGAAACAGAAGAAGACTGATTTCTTAC
GTATGAAAAACACAGTCTTGCGTAGACGACGGTCTGGTTACGACCCTTGCACGGAGAGCT
ACGCAGAGAAGTATTATAACCGTCTTGATGTTCAGAGAGCTATGCATGCTAATGTCACTG
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ACAAGACGATGTTACCGGTTTACAAGGAACTTGCAGCAGCTGGTTTGAGGATCTGGGTTT
TCAGTGGTGATACAGATTCGGTGGTACCAGTGACGGCGACACGGTTTTCCCTAAGCCATC
TCAATCTCCCGGTGAAAACTCCTTGGTACCCTTGGTACTCCGGTAACCAGGTGGGAGGAT
GGACAGAGGTATACAAGGGACTGACCTTTGCA*CAGTAAGAGGG*CGGGGCACGAGGTGC
*TTTATTCGAAC*AAAGCGTGCTCTCA

QA 1 807 1 807
DS 

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TTATAACCGTCTTGATGTTCAGAGAGCTATGCATGCTAATGTCACTGGGATTCGCTATAA
ATGGACAGCATGCAGTGATGTTCTGATCAGGAACTGGAAAGACTCCGACAAGACGATGTT
ACCGGTTTACAAGGAACTTGCAGCAGCTGGTTTGAGGATCTGGGTTTTCAGTGGTGATAC
AGATTCGGTGGTACCAGTGACGGCGACACGGTTTTCCCTAAGCCATCTCAATCTCCCGGT
GAAAACTCCTTGGTACCCTTGGTACTCCGGTAACCAGGTGGGAGGATGGACAGAGGTATA
CAAGGGACTGACCTTTGCAACAGTAAGAGGGGCGGGGCACGAGGTGCCTTTATTCGAACC
AAAGCGTGCTCTCATTCTTTTCAAATCGTTCTTGGCCG*AAAAGAGCTTCCAAAATCTTA
TTAGTAACCTAAAAACATAGAGTAAGAGAAAATATCTCCAACAAGCACAATCCAGCTACC
AGATT

QA 1 605 1 605
DS 

RD RS1EP54JQ 801 0 0
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TTCGAAACAGAAGAAGACTGATTTCTTACGTATGAAAAACACAGTCTTGCGTAGACGACG
GTCTGGTTACGACCCTTGCACGGAGAGCTACGCAGAGAAGTATTATAACCGTCTTGATGT
TCAGAGAGCTATGCATGCTAATGTCACTGGGATTCGCTATAAATGGACAGCATGCAGTGA
TGTTCTGATCAGGAACTGGAAAGACTCCGACAAGACGATGTTACCGGTTTACAAGGAACT
TGCAGCAGCTGGTTTGAGGATCTGGGTTTTCAGTGGTGATACAGATTCGGTGGTACCAGT
GACGGCGACACGGTTTTCCCTAAGCCATCTCAATCTCCCGGTGAAAACTCCTTGGTACCC
TTGGTACTCCGGTAACCAGGTGGGAGGATGGACAGAGGTATACAAGGGACTGACCTTTGC
AACAGTAAGAGGGGCGGGGCACGAGGTGCCTTTATTCGAACCAAAGCGTGCTCTCATTCT
TTTCAAATCGTTCTTGGCCGGAAAAGAGCTTCCAAAATCTTATTAGTAACCTAAAAACAT
AGAGTAAGAGAAAATATCTCCAACAAGCACAATCCAGCTACCAGATTAGGATCCAATTCC
GAGTAAACTCGGAGTTATTGTTTTTTTTCTTCTTCTAATTTCTGTTTTAAAGCTTTGATT
CATTTCCACAATTTGGAAATCACAAAACGATTTGAGAATATTCAAGGAATTGTTTATAAG
TTAAAGAAGTACAAGGGTTTC

QA 1 801 1 801
DS 



AS 1 2

CO CL3779Contig1 1034 2 2 U
GGAAGAAAAAAAAAAAACTAATAAAGACAATAATTCACTCCTCTGGATCATCGTCTATCT
TCTGGTTCTGGTTCTCAGATCCTTGAATCGAGAAGAAGCATTTGAACACTCGTATCAGTG
AGATTTTTTGTAATTGGAGAAGAAGGAACCAGGGCGGAGATGGTGAAGATGACATTGATA
GCTCGTGTTACTGACGGTTTGCCTCTAGCAGAGGGACTCGACGATGGTCGTGACTTACCA
GATTCCGACATGTATAAGCAACAGGTTAAGTCTCTGTTCAAGAATCTCTCCCGAGGTCAT
AACGAAGCTTCACGAATGTCTGTTGAAACTGGCCCTTATGTTTTCCATTACATCATAGAA
GGACGTGTTTGCTACTTGACGATGTGTGACCGCTCTTACCCGAAGAAACTCGCGTTCCAG
TACCTGGAAGATCTCAAGAATGAGTTCGAACGTGTCAATGGGCCTAACATTGAAACTGCT
GCTAGACCTTATGCTTTTATTAAATTTGATACTTTCATACAGAAAACCAAGAAACTGTAC
CAAGACACTCGTACGCAACGAAATATCGCCAAGTTGAATGATGAACTCTATGAGGTCCAT
CAGATAATGACGCGGAATGTGCACGAAGTCTTAGGTGTTGGTGAAAAGCTGGACCAGGTG
AGCGAGATGTCGAGTAGGCTAACTTCTGAATCTCGTATATATGCTGATAAAGTTAAAGAT
TTGAATCGCCAGGCTTTGATCAGGAAATGGGCACCAGTAGCGATCGTGTTGGGTGTAGTT
TTCCTTCTTTTCTGGGTCAAGAACAAGCTATGGTAAAGAGACAGGAGGAACCTAAAGCTA
TTTTCGTAATTTAGCAGACTTTTCCGGACATATATCAGCCTGATTCCGGCGCCTCCAAAA
TATCTTCTTTCTTTCAAAAGAGAAACTTCGACACATTTTGTACTTCTGTAGTATGCAAAC
CTGTTATGAGACTGCTCATATTATCATCATCCGTTTATATACTTCAAACTTGATTCTCAA
ATGTCCTTTTATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H736TF U 1
AF RS1C030JQ C 163
BS 1 631 RS1H736TF
BS 632 1034 RS1C030JQ

RD RS1H736TF 631 0 0
GGAAGAAAAAAAAAAAACTAATAAAGACAATAATTCACTCCTCTGGATCATCGTCTATCT
TCTGGTTCTGGTTCTCAGATCCTTGAATCGAGAAGAAGCATTTGAACACTCGTATCAGTG
AGATTTTTTGTAATTGGAGAAGAAGGAACCAGGGCGGAGATGGTGAAGATGACATTGATA
GCTCGTGTTACTGACGGTTTGCCTCTAGCAGAGGGACTCGACGATGGTCGTGACTTACCA
GATTCCGACATGTATAAGCAACAGGTTAAGTCTCTGTTCAAGAATCTCTCCCGAGGTCAT
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GGACGTGTTTGCTACTTGACGATGTGTGACCGCTCTTACCCGAAGAAACTCGCGTTCCAG
TACCTGGAAGATCTCAAGAATGAGTTCGAACGTGTCAATGGGCCTAACATTGAAACTGCT
GCTAGACCTTATGCTTTTATTAAATTTGATACTTTCATACAGAAAACCAAGAAACTGTAC
CAAGACACTCGTACGCAACGAAATATCGCCAAGTTGAATGATGAACTCTATGAGGTCCAT
CAGATAATGACGCGGAATGTGCACGAAGTCT

QA 1 631 1 631
DS 

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AATCTCTCCCGAGGTCATAACGAAGCTTCACGAATGTCTGTTGAAACTGGCCCTTATGTT
TTCCATTACATCATAGAAGGACGTGTTTGCTACTTGACGATGTGTGACCGCTCTTACCCG
AAGAAACTCGCGTTCCAGTACCTGGAAGATCTCAAGAATGAGTTCGAACGTGTCAATGGG
CCTAACATTGAAACTGCTGCTAGACCTTATGCTTTTATTAAATTTGATACTTTCATACAG
AAAACCAAGAAACTGTACCAAGACACTCGTACGCAACGAAATATCGCCAAGTTGAATGAT
GAACTCTATGAGGTCCATCAGATAATGACGCGGAATGTGCAGGAAGTCTTAGGTGTTGGT
GAAAAGCTGGACCAGGTGAGCGAGATGTCGAGTAGGCTAACTTCTGAATCTCGTATATAT
GCTGATAAAGTTAAAGATTTGAATCGCCAGGCTTTGATCAGGAAATGGGCACCAGTAGCG
ATCGTGTTGGGTGTAGTTTTCCTTCTTTTCTGGGTCAAGAACAAGCTATGGTAAAGAGAC
AGGAGGAACCTAAAGCTATTTTCGTAATTTAGCAGACTTTTCCGGACATATATCAGCCTG
ATTCCGGCGCCTCCAAAATATCTTCTTTCTTTCAAAAGAGAAACTTCGACACATTTTGTA
CTTCTGTAGTATGCAAACCTGTTATGAGACTGCTCATATTATCATCATCCGTTTATATAC
TTCAAACTTGATTCTCAAATGTCCTTTTATCG

QA 1 872 1 872
DS 



AS 1 3

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CACTATGTAACGAAGACGCTCTAGGGGTCCAGAAATGACCCCCGCGTGGGCCGGCATTGA
TGCCACGTGCTGAAAGTTCATGCGGTTTGGCAAAAATACAAACCATTTTTTTGAGTTTCC
TTGCTTGGCCCACAACCCACATCCGGTTTAAATGCCCCATAACCTTTTCAATGATAAAAC
CGGGTTAATAAAGCCTTCAAATTCTGCGGGAATCTCCACCGTGAGACCAACCAAATCGAT
CGGTTCTCTCTCACACGCCTCCAGAGGAAACCTCAACGGCGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA
GGAGGAGGAAGAAGAACTTCCGGTTTCTATGTCTTCGACCGGTTTAACCGGAGCGGCTTG
TTCGGGTAGTGTGGACATATATTCGGGTTGAACCGGAGCTCTGCAAAGAGGGCAAGTGGA
ACTGGAGCGGAACCAGGTATCAATGCAATCGACGTGAAAAGCGTGGCCACATTTCGGGAG
GAGACGGCCTTTGTCGTCTTCCTCGAACTCCGACAAGCAAACGGAACACTCCTCCAGTGG
CGATTGATGAGTCTCCGAGGAGTAAACGAAGATCGGAATCTTCTCGAGGACCGCTGGATC
GAGAGGGGTGAGAGAGGAGGAGGAGATGGTTGAGGCGGAGAGAGAAAGGATGTGAGCACA
AATCCGGCGGCGAATGCGACGGTTCTGACGACGGAATAGCCATCTGGCGTAGCTGTGGAA
GCAGATTATCATAACCAGGGCGACGGAGAGGATGATGACGGAGGAAATCATGATTTTGCC
ACTGAGAGCGTGGCCTGGAGAAGCGTGGCTGATGCTCCCCCACATTGGCTTGCTGCTTTC
TTCTGCTATTCCCATGGTTTCTATTTATATATAGAGAGAGAGAGAGAAAGACAACGGATA
TAAAAGGAAAAGATTTAGGCAGAGAGAGTATAGCTGCTTATTATGTGTCCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AU71JQ U 124
AF RS1AZ89JQ U 1
AF RS1AZ89TF C 440
BS 1 152 RS1AZ89JQ
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RD RS1AU71JQ 214 0 0
TATTTAACGAAAAAC
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ACATCCGGTTTAAATGCCCCATAACCTTTTCAATGATAAAACCGGGTTAATAAAGCCTTC
AAATTCTGCGGGAATCTCC

QA 16 214 16 214
DS 

RD RS1AZ89JQ 765 0 0
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TTGCTTGGCCCACAAGCCACATCCGGTTTAGATGCTCCATAACCTTTTCAATGATAAAAC
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CGGTTCTCTCTCACACGCCTCCAGAGGAAACCTCAACGGCGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA
GGAGGAGGAAGAAGAACTTCCGGTTTCTATGTCTTCGACCGGTTTAACCGGAGCGGCTTG
TTCGGGTAGTGTGGACATATATTCGGGTTGAACCGGAGCTCTGCAAAGAGGGCAAGTGGA
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GAGACGGCCTTTGTCGTCTTCCTCGAACTCCGACAAGCAAACGGAACACTCCTCCAGTGG
CGATTGATGAGTCTCCGAGGAGTAAACGAAGATCGGAATCTTCTCGAGGACCGCTGGATC
GAGAGGGGTGAGAGAGGAGGAGGAGATGGTTGAGGCGGAGAGAGA

QA 1 765 1 765
DS 

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TATTCGGGTTGAACCGGAGCTCTGCAAAGAGGGCAAGTGGAACTGGAGCGGAACCAGGTA
TCAATGCAATCGACGTGAAAAGCGTGGCCACATTTCGGGAGGAGACGGCCTTTGTCGTCT
TCCTCGAACTCCGACAAGCAAACGGAACACTCCTCCAGTGGCGATTGATGAGTCTCCGAG
GAGTAAACGAAGATCGGAATCTTCTCGAGGACCGCTGGATCGAGAGGGGTGAGAGAGGAG
GAGGAGATGGTTGAGGCGGAGAGAGAAAGGATGTGAGCACAAATCCGGCGGCGAATGCGA
CGGTTCTGACGACGGAATAGCCATCTGGCGTAGCTGTGGAAGCAGATTATCATAACCAGG
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TCTATTTATATATAGAGAGAGAGAGAGAAAGACAACGGATATAAAAGGAAAAGATTTAGG
CAGAGAGAGTATAGCTGCTTATTATGTGTCCC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 3

CO CL3781Contig1 721 3 15 U
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CCAGTCCGGAGAACAGCCTTATTACGGCCCTTAATGTCTGGTTTGGAAGTTTACTTTCTT
GTGAAAGTTTCCATGCTGATGTACATGCAGGGAACTTATGGTTGTTGCGTGATGGCCGGA
TTGGGTTTCTTGATTTTGGCATTGTTGGTCGGATATCACCCAAAACATGGGCTGCCATGG
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AAATGGGTGCCACAAATATAGATGTTGATGCCAAAGCTTTTGCAAGGGACTTGGAAAAGA
TGTTCTCTTCTATCCAGGAACTAGATACAGAGGTAGTAGTGGCTACAGGTTCAGGCAGAA
CTGCTGCTGCTGCTAACGTGGTTGTCGATGAGAGACAGATGAATGCTCTTTTCCTTGACC
TGGTGCGGGTTAGCGAATCATATGGGCTGAAGTTCCCGAGGGAGTTTGCTCTTCTAATGA
AGCAGCTTCTCTATTTTGATCGGTACACAAGACTCTTAGCTCCAAACATGAACATGCTGC
AGGATCAGCGAATCTCTGTCGTGTCCAACAGGAGGACGAACCGATATAAGGACAGCTTTA
ACTAAGTTCATACTGATATATACTTCATTCTTATGTACAAGTGGTAAAGTTATAGTAGAT
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RS1F220TF U 1
AF RS1DQ20TF U 90
AF RS1DQ20JQ C 93
BS 1 426 RS1F220TF
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CTT
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AGGACGAACCGATATAAGGACAGCTTTAACTAAGTTCATACTG

QA 4 586 4 586
DS 

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AATGTCTGGTTTGGAAGTTTACTTTCTTGTGAAAGTTTCCATGCTGATGTACATGCAGGG
AACTTATGGTTGTTGCGTGATGGCCGGATTGGGTTTCTTGATTTTGGCATTGTTGGTCGG
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AAAGCTTTTGCAAGGGACTTGGAAAAGATGTTCTCTTCTATCCAGGAACTAGATACAGAG
GTAGTAGTGGCTACAGGTTCAGGCAGAACTGCTGCTGCTGCTAACGTGGTTGTCGATGAG
AGACAGATGAATGCTCTTTTCCTTGACCTGGTGCGGGTTAGCGAATCATATGGGCTGAAG
TTCCCGAGGGAGTTTGCTCTTCTAATGAAGCAGCTTCTCTATTTTGATCGGTACACAAGA
CTCTTAGCTCCAAACATGAACATGCTGCAGGATCAGCGAATCTCTGTCGTGTCCAACAGG
AGGACGAACCGATATAAGGACAGCTTTAACTAAGTTCATACTGATATATACTTCATTCTT
ATGTACAAGTGGTAAAGTTATAGTAGATT

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 2

CO CL3782Contig1 767 2 3 U
GGGAAAAGCAAAAAAAAAGGAGTAGAGTTAACCAATATAATAACTAAAAAAACAAAGAAG
ATTGTAAGATAAAGCTGATTTGAAGTTCACATTGCAAGAAGAGAATCTGCTTATAACAAA
AAAAAAAAGAGAGATATAAGAGACGACCTTGCTAAGTCTTTGGTTTCTTCTTGATAACAC
AACTACTACTATGTACAGATTCAGCAACACAGTGATAGGAGTCTTAAACCTCCTCAGCTT
ACTAGCTTCAATACCAATCATAGGAGCCGCTCTATGGAAGGCAAGAAGCAGCACAACTTG
CGAGAACTTCCTCCAAACTCCTCTACTCGTTATAGGTTTCATCATACTCTTAGTATCCCT
CGCCGGGTTCATAGGAGCATGTTTCAACGTGGCATGGGCTCTTTGGGTTTACTTAGTGGT
CATGATTTTCCTCATCGCGACTCTTATGGGTCTAACTCTGTTTGGTCTGGTGGTGACGAG
CCAAGGAGGTGGTGTGGAAGTACCAGGGAGGGTTTATAAAGAGTACAGGCTTGGAGATTA
TCATCCATGGCTGAGAGAAAGAGTTAGAGATCCTCAGTATTGGATCTCTATAAGAAGCTG
TATCTTGAGTTCCAAGACTTGTGCTAAGATTGAATCTTGGACTACACTTGATTACTTCCA
AAGAGACATGACTTCTGTCAGTCGGGATGTTGTAGCCACCGACGCGTGCACGTACGAGAC
CGGAGTATAGTAGAGGAGATGATTGCTATAGATGGACATGGTATTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GN58TF U 174
AF RS1AX76TF U 1
BS 1 511 RS1AX76TF
BS 512 512 RS1GN58TF
BS 513 767 RS1AX76TF

RD RS1GN58TF 387 0 0
GG
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AGCTTACTAGCTTCAATACCAATCATAGGAGCCGCTCTATGGAAGGCAAGAAGCAGCACA
ACTTGCGAGAACTTCCTCCAAACTCCTCTACTCGTTATAGGTTTCATCATACTCTTAGTG
TCCCTCGCCGGGTTCATAGGAGCATGTTTCAACGTGGCATGGGCTCTTTGGGTTTACTTA
GTGGTCATGATTTTCCTCATCGCGACTCTTATGGGTCTAACTCTGTTTGGTCTGGTGGTG
ACGAGCCAAGGAGGTGGTGTGGAA*TACCAGGGAGGGTT*ATAAAGAG*ACAGGCTTGGA
GATTATCATCCATGGCTGAGAGAAA

QA 3 387 3 387
DS 

RD RS1AX76TF 767 0 0
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AAAAAAAAGAGAGATATAAGAGACGACCTTGCTAAGTCTTTGGTTTCTTCTTGATAACAC
AACTACTACTATGTACAGATTCAGCAACACAGTGATAGGAGTCTTAAACCTCCTCAGCTT
ACTAGCTTCAATACCAATCATAGGAGCCGCTCTATGGAAGGCAAGAAGCAGCACAACTTG
CGAGAACTTCCTCCAAACTCCTCTACTCGTTATAGGTTTCATCATACTCTTAGTATCCCT
CGCCGGGTTCATAGGAGCATGTTTCAACGTGGCATGGGCTCTTTGGGTTTACTTAGTGGT
CATGATTTTCCTCATCGCGACTCTTATGGGTCTAACTCTGTTTGGTCTGGTGGTGACGAG
CCAAGGAGGTGGTGTGGAAGTACCAGGGAGGTTTTATAAAGAGTACAGGCTTGGAGATTA
TCATCCATGGCTGAGAGAAAGAGTTAGAGATCCTCAGTATTGGATCTCTATAAGAAGCTG
TATCTTGAGTTCCAAGACTTGTGCTAAGATTGAATCTTGGACTACACTTGATTACTTCCA
AAGAGACATGACTTCTGTCAGTCGGGATGTTGTAGCCACCGACGCGTGCACGTACGAGAC
CGGAGTATAGTAGAGGAGATGATTGCTATAGATGGACATGGTATTGA

QA 1 767 1 767
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3784Contig1 875 3 6 U
TTTTTGTTAGTATTTGCAAACACGACTAGCACGAGGCTATGGATTATACAGGCAAGAAAC
TGAAGAAACGTAACTTAGAAGCTGAGAAACGACTCAAGAAGGTGGAACAAGATTATCTCC
ACACAAGCCAAAAGTACACAGAAACAGATTCACAGTTTCAGAGCTTAACCAGTGAGAGAA
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TAAATAAACTACAAGAGCCTCTTGACAAGATACCTTCAACAGAAGAAACCATTGATCATA
GCCTACAATTCTCGATGTCCAACAGCTTTGAAATCTTGGAACAAGAACAATGCCAGAAGC
TGGACTGTGAAGCAATACGTGATTTCAGAGACGTTAGCCGCGAGCTCTACTACATTCAAA
GAAAAATGCCAAGGAGTGAGAGCAGAAGATCTATACAGAGTCTCTTAAATGAGGTTAAAG
AGAAAAACAAGTGTAGAGAAAGAGCTCTGTTAACTTGTACACTGGGTTTGTAGCCCTACA
AGTTGTGAAAGTTTGAAAAAATCTGTGGAGATGGAAATAAAAGTTCTAAAGAAGCTGATC
AGAGAGCTTCAAAAAGACTGGGAAGACAAACTGCAGATTAGGCAATGTGCAAGGAAAAGA
AACACCTATCTGGACAATGGGACGAAGAAAAAAAGTACATGCTCGACGGTACTAAGAAAA
AGAGTGAGAGGAGGATAGGTACATATCCTGAGGCTGAATATATCAAGATGGTGAATGATA
TAACTTGCCATGATTGGATGTAATGTATAATTTCATCTTCATAGTTTCACATGCAACATG
TACTCACAAAAGAGTGGTCTCTCAAGTCACAGATC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H302TF U 1
AF RS1C963TF U 1
AF RS1H302JQB C 534
BS 1 525 RS1C963TF
BS 526 526 RS1H302TF
BS 527 614 RS1C963TF
BS 615 615 RS1H302JQB
BS 616 639 RS1C963TF
BS 640 875 RS1H302JQB

RD RS1H302TF 544 0 0
TTTTTGTTAGTATTTGCAAACACGACTAGCACGAGGCTATGGATTATACAGGCAAGAAAC
TGAAGAAACGTAACTTAGAAGCTGAGAAACGACTCAAGAAGGTGGAACAAGATTATCTCC
ACACAAGCCAAAAGTACACAGAAACAGATTCACAGTTTCAGAGCTTAACCAGTGAGAGAA
GGCGTGCGGACAGTCTCTTTTACTCGGCTGCAAAATTCATTGGCTGGTGCAACAATCTAG
TAAATAAACTACAAGAGCCTCTTGACAAGATACCTTCAACAGAAGAAACCATTGATCATA
GCCTACAATTCTCGATGTCCAACAGCTTTGAAATCTTGGAACAAGAACAATGCCAGAAGC
TGGACTGTGAAGCAATACGTGATTTCAGAGACGTTAGCCGCGAGCTCTACTACATTCAAA
GAAAAATGCCAAGGAGTGAGAGCAGAAGATCTATACAGAGTCTCTTAAATGAGGTTAAAG
AGAAAAACAAGTGTAGAGAAAGAGCTCTGTTAACTTGTACACTGGGTTTGTAGCCCTACA
AGTT

QA 1 544 1 544
DS 

RD RS1C963TF 639 0 0
TTTTTGTTAGTATTTGCAAACACGACTAGCACGAGGCTATGGATTATACAGGCAAGAAAC
TGAAGAAACGTAACTTAGAAGCTGAGAAACGACTCAAGAAGGTGGAACAAGATTATCTCC
ACACAAGCCAAAAGTACACAGAAACAGATTCACAGTTTCAGAGCTTAACCAGTGAGAGAA
GGCGTGCGGACAGTCTCTTTTACTCGGCTGCAAAATTCATTGGCTGGTGCAACAATCTAG
TAAATAAACTACAAGAGCCTCTTGACAAGATACCTTCAACAGAAGAAACCATTGATCATA
GCCTACAATTCTCGATGTCCAACAGCTTTGAAATCTTGGAACAAGAACAATGCCAGAAGC
TGGACTGTGAAGCAATACGTGATTTCAGAGACGTTAGCCGCGAGCTCTACTACATTCAAA
GAAAAATGCCAAGGAGTGAGAGCAGAAGATCTATACAGAGTCTCTTAAATGAGGTTAAAG
AGAAAAACAAGTGTAGAGAAAGAGCTCTGTTAACTTGTACACTGG*TTTGTAGCCCTACA
AGTTGTGAAAGTTTGAAAAAATCTGTGGAGATGGAAATAAAAGTTCTAAAGAAGCTGATC
AGAGAGCTTCAAAA*GACTGGGAAGACAAACTGCAGATT

QA 1 639 1 639
DS 

RD RS1H302JQB 342 0 0
CCCTACAAGTTGTGAAAGTTTGAAAAAATCTGTGGAGATGGAAATAAAAGTTTTAAAGAA
GCTGATCAGAGAGCTTCAAAAAGACTGGGAAGACAAACTGCAGATTAGGCAATGTGCAAG
GAAAAGAAACACCTATCTGGACAATGGGACGAAGAAAAAAAGTACATGCTCGACGGTACT
AAGAAAAAGAGTGAGAGGAGGATAGGTACATATCCTGAGGCTGAATATATCAAGATGGTG
AATGATATAACTTGCCATGATTGGATGTAATGTATAATTTCATCTTCATAGTTTCACATG
CAACATGTACTCACAAAAGAGTGGTCTCTCAAGTCACAGATC

QA 1 342 1 342
DS 



AS 1 3

CO CL3785Contig1 553 3 5 U
GGACAATTACTTTCCTCATTTCCTCTCCCATTGCCGTCGTCTTCGAAAACTAACTCTTTA
GCTTTCCGCTTCCCATCAACTTCTGCAAAAAAATGAAGGTTGTTGCTGCTTTCTTACTGG
CCGTTTTGAGCGGAAAAGCTTCCCCAAACAGTGCCGATATTAAGAATATCCTCGGATCAG
TTGGTGCTGAAGGTGAAGATGCTCAGATTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAGTGGGAAAG
ACTGTGCTGAGCTCATTGCTGCTGGAAGGGAGAAGTTGGCTTCTGTTCCAAGTGGTGGTG
GTGTTGCCATGACTTCTGCTCCTGCTGCTGCTGGTGGCGGTGCTGCTCCTGCTGCTGAGG
CCAAGAAGGAAGAGAAGAAAGAAGAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGCC
TGTTCGAGTAAAGAAGCCGTTTTTTTTTTTCCGTTTTGAATTCTATATGATGTTTAGTTT
GTACTCGGATTTTTCTCTAAGACATTGCTGGAATTTTTACACAATTAGTAAGCTGCGGTC
TTTTCGATCTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1B192TF U 27
AF RS1GF28TF U 1
AF RS1DR88TF U 28
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GGG
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GCTGGTGGCGGTGCTGCTCCTGCTGCTGAGGCCAAGAAGGAAGATAAGAAAGAAGAGAAG
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GGGATTTT
ACA

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DS 

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CCGTTTTGAGCGGAAAAGCTTCCCCAAACAGTGCCGATATTAAGAATATCCTCGGATCAG
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GTACTCGGATTTTTCTCTAAGACATTGCTGGAATTTTTACACAATTAGTAAGCTGCGGTC
TTTTTGATCTTAC

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DS 

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GG
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AAAATGAAGGTTGTTGCTGCTTTCTTACTGGCCGTTTTGAGCGGAAAAGCTTCCCCAAAC
AGTGCCGATATTAAGAATATCCTCGGATCAGTTGGTGCTGAAGGTGAAGATGCTCAGATT
GAGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAGTGGGAAAGACTGTGCTGAGCTCATTGCTGCTGGAAGG
GAGAAGTTGGCTTCTGTTCCAAGTGGTGGTGGTGTTGCCATGACTTCTGCTCCTGCTGCT
GCTGGTGGCGGTGCTGCTCCTGCTGCTGAGGCCAAGAAGGAAGAGAAGAAAGAAGAGAAG
GAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGCCTGTTCGAGTAAAGAAGCCGTTTTTTTTT*
*CCGTTTTGAATTCTATATGATGTTTAGTTTGTACTCGGATTTTTCTCTAAGACATTGCT
GGAATTTTTACACAATTAGTAAGCTGCGGTCTTTTCGATCT

QA 3 523 3 523
DS 



AS 1 2

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BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B110TF U 1
AF RS1EM25TF U 1
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*AGTTTGCATTGCTTGTTTTTATTTCTCTTTTTTTCCGATGATTTTTTTCCACCTGAGAA
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QA 1 696 1 696
DS 

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TTTTTCTTGGGCACTTCCCAAGTTTTCTTTTTTCTTCTACGAACTCTTTTTGTGGGCATT
TCACAAAACCAAATAATTATTTCCTTTTAGTCTCAAAATT*GCATTAAATTTATAAAAAT
GGGAAACTGTTTGAATGGAGGAAACAACGTTACAAGAGTGGTTCAAAAAGACCAAGAAGT
GAAGAACAACAGAAAAGATCGGAAAGTGAAGATTGTTCTGAGAAGAGATGAGTTAGAGAA
ACTCATCCTCTTCCAGTTAAACGCCGGTGGTGACGTCCAAGGCAAGGGAGAAACAACTTT
GGCTTCTTTCGGGGACTTTCTCAGGGAACTAGAGGCGGAGAGATTCGCCGGAGAAGCTGC
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TTAGAGAATTAATTAAGGTTTTATTTAATTTCTTTCTCTAAGATAGGATTTTTGTGGGGG
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GTGTTTTGTTCTCAATGTGAGATATCTT

QA 1 688 1 688
DS 



AS 0 0

AS 1 3

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AGAAATGCTTTCGAAGAACGTAACACGATCCTTTGTTCGCTGCAACTGTATAAACTGGGA
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TGAACATATCTGCCAATGTCTGAGAGTTGTTGCCGGTGATTGCGTGCCAGGAAAAGAGTA
ACAGAGTTTTTGGTGATCACATAGATAAACAATGCTGGTAATCTGATGTTATTTTTGGGG
TGACACACAGATAAACAATGGTGGTAATAAAATTATACGTTATCAGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RS1DR72JQ C 49
AF RS1DR72TF U 1
AF RS1FP24TF U 7
BS 1 525 RS1DR72TF
BS 526 529 RS1FP24TF

RD RS1DR72JQ 411 0 0
TATTAATTGAGCAAGACTGACTCTCCAAGTCATAATCTTTATCAAATTTTGAATCATGAA
GGGTACTACTTTGGTTATGGTATCTTGTGTTTTCATATGTTTCATTCTGAGTCATGGGAA
AGACGGGGATTGTTGGGATGAAATCCCATTCCCTGGAAAATGCAGCAAACATGGAAAAAA
AGAATGCTTCAAAGAAATGCTTTCGAAGAACGTAACACGATCCTTTGTTCGCTGCAACTG
TATAAACTGGGAACATGACAAATCAAGTGAGGAAGGACATGTTGTAAAACATAGTCAGGA
GCATACAGAGCATGAACATATCTGCCAATGTTTGAGAGTTGTTGCCGGTGATTGCGTGCC
AGGAAAAGAGTAACAGAGTTTTTGGTGATCACATAGATAAACAATGCTGGT

QA 1 411 1 411
DS 

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AAGACTGACTCTCCAAGTCATAATCTTTATCAAATTTTGAATCATGAAGGGTACTACTTT
GGTTATGGTATCTTGTGTTTTCATATGTTTCATTCTGAGTCATGGGAAAGACGGGGATTG
TTGGGATGAAATCCCATTCCCTGGAAAATGCAGCAAACATGGAAAAAAAGAATGCTTCAA
AGAAATGCTTTCGAAGAACGTAACACGATCCTTTGTTCGCTGCAACTGTATAAACTGGGA
ACATGACAAATCAAGTGAGGAAGGACATGTTGTAAAACATAGTCAGGAGCATACAGAGCA
TGAACATATCTGCCAATGTCTGAGAGTTGTTGCCGGTGATTGCGTGCCAGGAAAAGAGTA
ACAGAGTTTTTGGTGATCACATAGATAAACAATGCTGGTAATCTGATGTTATTTTTGGGG
TGACACACAGATAAACAATGGTGGTAATAAAATTATACGTTATCA
TT

QA 1 525 1 525
DS 

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GG
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CTCTCCAAGTCATAATCTTTATCAAATTTTGAATCATGAAGGGTACTACTTTGGTTATGG
TATCTTGTGTTTTCATATGTTTCATTCTGAGTCATGGGAAAGACGGGGATTGTTGGGATG
AAATCCCATTCCCTGGAAAATGCAGCAAACATGGAAAAAAAGAATGCTTCAAAGAAATGC
TTTCGAAGAACGTAACACGATCCTTTGTTCGCTGCAACTGTATAAACTGGGAACATGACA
AATCAAGTGAGGAAGGACATGTTGTAAAACATAGTCAGGAGCATACAGAGCATGAACATA
TCTGCCAATGTCTGAGAGTTGTTGCCGGTGATTGCGTGCCAGGAAAAGAGTAACAGAGTT
TTTGTTGATCACATAGATAAACAATGCTGGTAATCTGATGTTATTTTTGGGGTGACACAT
AGATAAACAATGGTGGTAATAAAATTATACGTTATCAGTTT

QA 3 523 3 523
DS 



AS 1 3

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GAAAGAAAAAAAAA**CACTCAAAAGTTCATATCTATTATAAACAGTTAAAAATGAAGTC
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GGAGAACACGAATTCGGATGTATACGAGATAGATTACAGGGTACCGGAGACTCATAACTC
TAGACCTCCGCCGGAGACTCTGCACGGCAAGCGACCGTTCATTCACCATAAAACCTCTGC
GGCTGGATCCGCCGGCGCTCATGTTGGAGGACAGCACTAGAAAGAGATTTTTCAAGGAAG
AGGAGAGAGACTAAGAAACTGAGAGTGAAAGAGGAAGTATATAAGTTTGTATAAGATGCA
AGTACATAATTATTTATACAGTAATTATATTTAATCATATGATCATCGATGTCATCATGT
CCGGTATTTTCTTCATGTACCGTTCTATCTTTTTTTTTT*GGGTCTGAATTTCTTGGAAG
AAAACTCAAATTAATTCGGGTAATGTGTCGCCATATCAATATCAGTGTCGTTCTCAGAT


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1AP07TFB U 1
AF RS1F622TF U 4
AF RS1FH73TF U 4
BS 1 74 RS1AP07TFB
BS 75 76 RS1F622TF
BS 77 122 RS1AP07TFB
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BS 283 283 RS1F622TF
BS 284 519 RS1AP07TFB
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BS 521 547 RS1AP07TFB
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RD RS1AP07TFB 547 0 0
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QA 1 547 1 547
DS 

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AAAAAAAAA**CACTCAAAAGTTCATATCTATTATAAACAGTTAAAAATGAAGTCGACCG
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ACACGAATTCGGATGTATACGAGATAGATTACAGGGTACCGGAGACTCATAACTCTAGAC
CTCCGCCGGAGACTCTGCACGGCAAGCGACCGTTCATTCACCATAAAACCTCTGCGGCTG
GATCCGCCGGCGCTCATGTTGGAGGACAGCACTAGAAAGAGATTTTTCAAGGAAGAGGAG
AGAGACTAAGAAACTGAGAGTGAAAGAGGAAGTATATAAGTTTGTATAAGATGCAAGTAC
ATAATTATTTATACAGTAATTATATTTAATCATATGATCATCGATGTCATCATGTCCGGT
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TCAAATTAATTCGGGTAATGTGTCGCCATATCAATATCAGTGTCGTTCTCAGAT

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DS 



AS 1 3

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TCGTCATGATCATCATCAAATCAGTTTGGATTATAATGAAAAACCACCCGAGTGTTCTAT
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CTCTGTTTTTAAGCAGTTATAGTTATTCCTTTTGTACAAATTGGTTTTGTCATAAAGTCC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BJ88TF U 1
AF RS1EA52TF U 37
AF RS1EA52JQ C 609
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CCACGAATAGCATTTGGACTGTTGATCTCGCATATTTACTGCAAAGGTTCTGCGTGGAAT
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CTGGCGTTAT
TATACAGATCAGTAGTAT

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DS 

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GG
AATTAGAGCAATCATAGGATTCCGTCGCTCTCTACAGCTTTCGTCTCCTCCCTTTATCCA
AACCGTTTGATTATATTATTTTCCAGGAGAAGAAAAAATAGGAGGAATTATATCAGGGAA
TTATTGCTTCTCCCTAACGCCTTTAGAAGCGTCTTGCATCGTAAGCAAAGGTCCAAGCAG
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CAGAGACTTGGGTTTAAATTTTATTCCATGTGGCCTCTATGTTTTCTGCTCAACAAGATA
TTGAAAGTCCAAGAGAGGAATCAGGGGAGATCAGAGGAAGAAGA***GCATGATGGAGAT
TCCATTTCTCCTAAATATTCCCACTTTGTAACAACAACTAGTCATGGAAAAAACCTCAAT
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TGTGGCCTCGCTTGTGTTCTCATGGTTCTCCGAGCTACCGG*ATCACTACCTGCTCTATT
CAGGAGTTGGCCGACATTTGCTCCACTAATAGCATTTGGACTGTTGATCTCGCATATTTA
CTGCAAAGGTTCTGCGTGGAATTTTCTTATTGCACAATCACTTTCGGAGCGAATCCAAAT
TACTCCATTGAGGAATTCTACAAG*AACAGCTCCCTGA*GATCTGCTCCGTGTGGATTTA
CTCTTCGGAAA*GCACATGAATCTGGCGTTAT*ATACAGTGCAGATCAGTTAGTATC
ATGA

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DS 

RD RS1EA52JQ 804 0 0
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TGCACAATCACTTTCGGAGCGAATCCAAATTACTCCATTGAGGAATTCTACAAGGAACAG
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ATTATACAGTGCAGATCAGTTAGTATCCATGAGATTTCTTGTTTGCTATTGTCTGGGAAC
TATATCGCCATTGCATTAGTCGATCAGGACAAGCTAAGCAAGTCTTGGTTGGAGGAAGTG
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CTTCTCCTGATAAACTTGGAGAACATTAAGAAGCAGAAAGAATAATTTCTCATCGTCATG
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ATGAATGCATATAACATTTGATCG

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 3

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CCCTGTTTATAGAGATATGAAAAAAAGGGAGCATGTGTATGTGTTTAGATAAGAGTGCCC
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ATGGCCTTTAATTGCTCCCCCTC


BQ
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15 15 0 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 0 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B422JQ U 1
AF RS1DP39JQ U 1
AF RS1B422TF C 68
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DS 

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G
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TCTCTCTCGCTGCCTCTTGCACATTGTCGCTGTTTATGATCTTGACATTGTCACCGATAC
GTGCGTTTTTGTCAATGATGGCTCTTTTGATGTGCGAGTTTTTCCCGATACCTATGGGTA
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DS 

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GCATCTCCTTGGCTCTCTTATCATCAAGACCTAGAATCGTTGTATCGACCTTCATGGCCT
TTAATTGCTCCCCCTC

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 3

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AGTTCATCAACTCAATCTCAGCCGTCGGATCCAAACACCCCTCCGTCTCCGGTTGGTGGA
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AGTCCGTTATAAAATCCGCCGTCGCTTCAAGATCTCGGCCGTTGCCGGTGAATCCCAAAG
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ATGGTACCGGAGGTGGTGGTTCGTACACTGGACAGATGTTGAACGACGATCGTGGTGCCA
CGTATAATGTTAACGGGATCCGACGGCGGTATTTGATCCAGTGGTTATGGAACCACGTGG
TTAGTTACTGTACCGGACCCAATAAGCTTGATTAGTGATTGTTTTAATGTTGCTGTTTGT
GTCTTTATTTTGTATGTCGGGATCTTTCGGAGTTCGAGTTCGATGGATAAGTGGGGCTTT
TGTGTGGGAGAAAATTGTCGATGTGTAATGCATAATTAAATTAGTTAATGATAGTTTAAG
TTTGTTGATTATGTGGAAAATGTCAATTATGTTATTATGTTTACATATGTAACATATGAT
TCATATTGGCTTATCTTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CM90TF U 1
AF RS1EJ48JQ C 438
AF RS1EJ48TF U 302
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RD RS1CM90TF 715 0 0
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AGGTAAAGTGGTGTGTGTAACAGGAGCATCAGGTTACATCGCTTCTTGGCTTGTCAAGTT
CCTCCTTAGCCGTGGCTACACCGTCAAGGCATCCGTCCGTGACCCCAGTGATCCGAAAAA
GACACAACACTTGGTTTCGTTGGAAGGTGCGAAGGAGAGACTTCACTTGTTCAAAGCAGA
TCTTTTGGAACAAGGGTCGTTCGACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGAAC
TTGTAAAGAGATTAAAGAACACGACTTACACGACAAAACGAGACAAGAATCCAAGAGAGC
ACACGACGTTAATTAGAAAAAATGTCCATATTCTTCCTGTCACTCTTTCTTTTTGCCACT
TCTTTGTATGTTTCCTGCACAAACCTAACAGCTTACGATGTTGTCCAAAAATACAAGTTA
CCACGAGGAATACTACCAGAAGGTGTCATTGACTACGACCTAAACCACAAAACTGGCTTT
TTCAAAGTCTATTTCAACAACACGTGTCGGTTCCCAATCGAGGGATACAAGGTCAAGTAC
CAACCTATTGTCTCTGGCTTCATAAAAAACGGACGGATCAGTACGCTGATGGGCGTAAGC
GTCAAATTGCTTTACTTCTGGCTCAGCATCGGGGAG*TGACTAGTGACGGC
AGGA

QA 1 711 1 711
DS 

RD RS1EJ48JQ 513 0 0
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AGAAGGTGTCATTGACTACGACCTAAACCACAAAACTGGCTTTTTCAAAGTCTATTTCAA
CAACACGTGTCGGTTCCCAATCGAGGGATACAAGGTCAAGTACCAACCTATTGTTTCTGG
CTTCATAAAAAACGGACGGATCAGTAGGCTGATGGGCGTAAGCGTCAAATTGCTTTACTT
CTGGCTCAGCATCGGGGAGGTGACTAGTGACGGCCAGGAACTCGAACTCTCAGTTGGTGC
TGCTTCGGAAGAATTCTCGGTGCATCATTTCGACAGGAGCCCACAGTGTGGTTGTGGGTT
TTATTGTCGTGAGCTCAAATTTTCCCTCTAAAGCTAATGGGCCTCCAAGTTGTTATGAAT
AAAATAAATAAATAACCACTTTACCTAATAGATTAGACTAAAACTCGAGTGGTTTGTGGT
GCTATGGATTGGTGACTGAATAAATTGCAGTAC

QA 1 513 1 513
DS 

RD RS1EJ48TF 668 0 0
G
GTAAAGAGATTAAAGAACACGACTTACACGACAAAACGAGACAAGAATCCAAGAGAGCAC
ACGACGTTAATTAGAAAAAATGTCCATATTCTTCCTGTCACTCTTTCTTTTTGCCACTTC
TTTGTATGTTTCCTGCACAAACCTAACAGCTTACGATGTTGTCCAAAAATACAAGTTACC
ACGAGGAATACTACCAGAAGGTGTCATTGACTACGACCTAAACCACAAAACTGGCTTTTT
CAAAGTCTATTTCAACAACACGTGTCGGTTCCCAATCGAGGGATACAAGGTCAAGTACCA
ACCTATTGTCTCTGGCTTCATAAAAAACGGACGGATCAGTAGGCTGATGGGCGTAAGCGT
CAAATTGCTTTACTTCTGGCTCAGCATCGGGGAGGTGACTAGTGACGGCCAGGAACTCGA
ACTCTCAGTTGGTGCTGCTTCGGAAGAATTCTCGGTGCATCATTTCGACAGGAGCCCACA
GTGTGGTTGTGGGTTTTATTGTCGTGAGCTCAAATTTTCCCTCTAAAGCTAATGGGCCTC
CAAGTTGTTATGAATAAAATAAATAAATAACCACTTTACCTAATAGATTAGACTAAAACT
CGAGTGGTTTGTGGTGCTATGGATTGGTGACTGAATAAATTGCAGTACTAAAACTTTATC
CAAAAAA

QA 2 668 2 668
DS 



AS 1 2

CO CL3794Contig1 1174 2 6 U
GGAACAAAAGCATCACTTGCTAAAGCTTAGAGATCTACAATAAGTCGTCTAGAAACATCC
CTGATAAAGAGAGAGTTAAGGCCTTAGGGGTAAAAACATATTATTTCAATCCCCAAAGGC
AGGCAAGCATGGCTTAGCGAAAAGTCACAGAAAACAAAACATAACAAGCCTTTAGTTTCG
TTGCCTTTAAACCGAGAAAGATGATCCTAAGGTGAAAGTTTTGAAAGCCGATTACTACTA
CTTAATTACTAAGAGAGAGCCAAGTTGGAGATAACAGACAGCTGCTGCACATTAGAGAAG
ATGCTTCTTCGACCTAACAGAAGAACATGGAGTTGGCAACGTTGTCTTTGAGTTTTGGGA
GCTGCGCAACAGAAACAGGTCCTGGAGCTGTCACGCCACCATGGCTTGAGGACGTCTCTG
ACTGATCTTCAAACTTCATGAACGTCCCTAGCTGAACAGCTGCCAAGTGAGCATAGCAGA
TCGGTGCAACAACAGAAATGGCAGTCGTGCTTCTTTGGTACACGTAAGAGAGCGAGTGGA
CGAGCTCTTGAAGCTCATCAGGTGAGAAATGGATCTCATCATACAGGACATGGTAATGGG
TAGGACGTGTTGTTCCAATCATGCCAGCGTGCGCACAGAGATAGAAATCGTTGTTCTTTG
GCTGACAGATTTTGCTGTCGATGATTGTCCCTGGAGGAACGTTGTCAGGAGAGTTTGTCT
GGAAAAACTTGGTGTGGTGATTCTTTTGAGCCACCAACAACAGAAACTTTGGATTCCAGT
TCTCATCTAGAAGCTTGCAGGCCTCAATGATCTGATCTAGTTCAATGTTCAGAACCTGGT
TGAACTGAGATTCGCTAACACCATCCCTGAAGATTATGATATGCTCTGGCTTTCTCTTGC
CCGAGCTGGTGTAGAAATCTACCAGCAACTCCTTGATTATGCCATCATCTTCTGTTCCAT
TCTTCTTGACCAGTGACTCAATCATCTCAGCTTTTGAAGGCTGTGTGCGAACAGATGCTC
TGTATTTCGAGACTAGAGGCCACTGCCTTGAACTCACCACAGCAGCAATGGACGGGACAT
CAGACTGTCCAGGAGATCCATGTGAGACATCCATCCCAAGGATGATGGTTGGAACCTTCG
AGATCACCGTAAACGCAGGGGTGCGCTCAACACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EB74JQ U 1
AF RS1BE38TF C 372
BS 1 430 RS1EB74JQ
BS 431 431 RS1BE38TF
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BS 447 507 RS1EB74JQ
BS 508 1174 RS1BE38TF

RD RS1EB74JQ 507 0 0
GGAACAAAAGCATCACTTGCTAAAGCTTAGAGATCTACAATAAGTCGTCTAGAAACATCC
CTGATAAAGAGAGAGTTAAGGCCTTAGGGGTAAAAACATATTATTTCAATCCCCAAAGGC
AGGCAAGCATGGCTTAGCGAAAAGTCACAGAAAACAAAACATAACAAGCCTTTAGTTTCG
TTGCCTTTAAACCGAGAAAGATGATCCTAAGGTGAAAGTTTTGAAAGCCGATTACTACTA
CTTAATTACTAAGAGAGAGCCAAGTTGGAGATAACAGACAGCTGCTGCACATTAGAGAAG
ATGCTTCTTCGACCTAACAGAAGAACATGGAGTTGGCAACGTTGTCTTTGAGTTTTGGGA
GCTGCGCAACAGAAACAGGTCCTGGAGCTGTCACGCCACCATGGCTTGAGGACGTCTCTG
ACTGATCTTCGAACTTCATGAACGTTCCTAGCTGAACAGCTGCCAAGTGAGCATAGCAGA
TCGGTGCAACAACAGAAATGGCAGTCG

QA 1 507 1 507
DS 

RD RS1BE38TF 803 0 0
AGAGATT
GTCCTGGAGCTGTCACGCCACCATGGCTTGAGGACGTCTCTGACTGATCTTCAAACTTCA
TGAACGTCCCTAGCTGAGCAGCTGCCAAGTGAGCATAGCAGATCGGTGCAACAACAGAGA
TGGCGGTCGTGCTTCTTTGGTACACGTAAGAGAGCGAGTGGACGAGCTCTTGAAGCTCAT
CAGGTGAGAAATGGATCTCATCATACAGGACATGGTAATGGGTAGGACGTGTTGTTCCAA
TCATGCCAGCGTGCGCACAGAGATAGAAATCGTTGTTCTTTGGCTGACAGATTTTGCTGT
CGATGATTGTCCCTGGAGGAACGTTGTCAGGAGAGTTTGTCTGGAAAAACTTGGTGTGGT
GATTCTTTTGAGCCACCAACAACAGAAACTTTGGATTCCAGTTCTCATCTAGAAGCTTGC
AGGCCTCAATGATCTGATCTAGTTCAATGTTCAGAACCTGGTTGAACTGAGATTCGCTAA
CACCATCCCTGAAGATTATGATATGCTCTGGCTTTCTCTTGCCCGAGCTGGTGTAGAAAT
CTACCAGCAACTCCTTGATTATGCCATCATCTTCTGTTCCATTCTTCTTGACCAGTGACT
CAATCATCTCAGCTTTTGAAGGCTGTGTGCGAACAGATGCTCTGTATTTCGAGACTAGAG
GCCACTGCCTTGAACTCACCACAGCAGCAATGGACGGGACATCAGACTGTCCAGGAGATC
CATGTGAGACATCCATCCCAAGGATGATGGTTGGAACCTTCGAGATCACCGTAAACGCAG
GGGTGCGCTCAACACC

QA 8 803 8 803
DS 



AS 1 2

CO CL3795Contig1 635 2 34 U
GAAAAATGTTGATATAAAACGTGCAAAAGCAGCTTCTTCAAGCTCTGGTTAAAGGAATAG
AGCTTTAGTGTACAAGAAGAAAGGATGCACACTGTGTATGTACCCTGAAACAATACTGTT
AAAAGTATAATCATAAACATCGCTTTCACACTGAAACAACCTTTTTTGTTCTCGTGCCTA
GTTTGTTTATTCCTCTCGATGTTTCATAAAAATATACCATTGAAGGGCATAACAGTTCCT
AAATAAAACTCACAAATATTGTTCTCATGAAAGTTGAATTGGTTCCCCACATAAACTCCC
TAACTCCTCTTCCAACAGTTTATGCAACTTTGCTTCTGTCCTCCGGTAAATCCACGCATT
ACCATCACGGTCCCAGTCAAATCTAGACGGGCCACCGACAGGTGAAAACATCCAAATTTG
TCGGTTAGGAGTTTGCTTATTGAGTACATACGTGCCTAAAGATCCAAGCTTAAGCGTGAA
AACTTCATTCCCATAATCAATGTCAAAACCATCAATCTGGACATTATCACCATAATCCTC
AATCTTCTCAAGAAGGTGATTGATAGTGGCATTGGCTAATCTGTGGAACTCATCCTCCTG
CAAAATCGAACTGTAATCGATAGGAGCAGGACCTT


BQ
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G749JQ U 1
AF RS1B588JQ U 72
BS 1 103 RS1G749JQ
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RD RS1G749JQ 592 0 0
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AGCTTTAGTGTACAAGAAGAAAGGATGCACACTGTGTATGTACGCTGAGACAATACTGTT
AAAAGTATAATCATAAACATCGCTTTCACACTGAAACAACCTTTTTTGTTCTCGTGCCTA
GTTTGTTTATTCCTCTCGATGTTTCATAGAGATATACCATTGAAGGGCATAACAGTTCCT
AGATAAAACTCACAAATATTGTTCTCATGAGAGTTGAATTGGTTCGCCACATAGACTCTC
TAACTCCTCTTCCAACAGTTTATGCAACTTTGCTTCTGTCCTCCGGTAAATCCACGCATT
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AACTTCATTCCCATAATCAATGTCGAAACCATCAATCTGGACATTATCACCATAATCCTC
AATCTTCTCAAGAAGGTGATTGATAGTGGCATTGGCTAATCTGTGGAACTCA

QA 1 592 1 592
DS 

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ACAAAAAA
AAAGGATGCACACTGTGTATGTACCCTGAAACAATACTGTTAAAAGTATAATCATAAACA
TCGCTTTCACACTGAAACAACCTTTTTTGTTCTCGTGCCTAGTTTGTTTATTCCTCTCGA
TGTTTCATAAAAATATACCATTGAAGGGCATAACAGTTCCTAAATAAAACTCACAAATAT
TGTTCTCATGAAAGTTGAATTGGTTCCCCACGTAAACTCCCTAACTCCTCTTCCAACATT
TTATGCAACTTTGCTTCTGTCCTCCGGTAAATCCACGCATTACCATCACGGTCCCAGTCA
AATCTAGACGGGCCACCGACAGGTGAAAACATCCAAATTTGTCGGTTAGGAGTTTGCTTA
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ATGTCAAAACCATCAATCTGGACATTATCACCATAATCCTCAATCTTCTCAAGAAGGTGA
TTGATAGTGGCATTGGCTAATCTGTGGAACTCATCCTCCTGCAAAATCGAACTGTAATCG
ATAGGAGCAGGACCTT

QA 9 564 9 564
DS 



AS 1 3

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CTTACTTAATTCATTAGACAGATTCTACGGTCTATCATTCTCAACCTCGTCCTTTCTTCC
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TACCTCAACCGAACAGTTTCTGAACGCTTTGAAAGATGCGGGAGATAGATTAGTTATCGT
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ATTTGATCGTTTCAATGTATATATGTTAACTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1AC60TF U 6
AF RS1FB42TF U 1
AF RS1FB42JQ C 1
BS 1 6 RS1FB42JQ
BS 7 710 RS1FB42TF
BS 711 754 RS1FB42JQ

RD RS1AC60TF 500 0 0
G
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TTATGGAAGTTGGTGTGGTTCTTGCCGAGCAATGTTCCCTAAGCTGTGCAAAACAGCGGA
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AAGCTTGAACGTCGAGGTG

QA 2 500 2 500
DS 

RD RS1FB42TF 712 0 0
GGAGGC
GAAAGTCTTTCACTTTGCGCGATTCATGTCTCCTCCTCCGACAGCTTTTCGATCGCTTTA
CGCTTCCTCATCTTCTATTCGTACACCGATTTCTCCACCAATCCGAATCATACCCTTACT
TAATTCATTAGACAGATTCTACGGTCTATCATTCTCAACCTCGTCCTTTCTTCCTTCAAA
TCTAGTTTTCTCAACAAGGAAGCAGTTTCTCTGTATAGAGGTACAAGCTTTAGCTGCTGA
AACAGAACAGCCAAAATGGTGGGAGAAGAAAGCAGGGCCAAACATGATCGACGTTACCTC
AACCGAACAGTTTCTGAACGCTTTGAAAGATGCGGGAGATAGATTAGTTATCGTTGATTT
TTATGGAACTTGGTGTGGTTCTTGCCGAGCAATGTTCCCTAAGCTGTGCAAAACAGCGGA
AGAACACCCTGAAATCTTGTTCCTTAAAGTAAACTTTGATGAGAACAAGTCACTCTGCAA
AAGCTTGAACGTCAAGGTGTTACCATACTTCCACTTGTACCGCGGCTCTGATGGCCAAGT
CGATTCCTTCTCCTGCTCTCTCGCAAGGTTTAAGAAACTCAGAGAGGCTATAGAGAGACA
TAGTGTAGGAATTAGCAGTGACAACCACTCTTCTTCGGTTTCTGAGCAAATTGAAGATTC
AACTTCAAGCCTGTAATCAACCAATGTCTGGATCTGATTGAAAA
GT

QA 7 710 7 710
DS 

RD RS1FB42JQ 754 0 0
GGAGGCGAAAGTCTTTCACTTTGCGCGATTCATGTCTCCTCCTCCGACAGCTTTTCGATC
GCTTTACGCTTCCTCATCTTCTATTCGTACACCGATTTCTCCACCAATCCGAATCATACC
CTTACTTAATTCATTAGACAGATTCTACGGTCTATCATTCTCAACCTCGTCCTTTCTTCC
TTCAAATCTAGTTTTCTCAACAAGGAAGCAGTTTCTCTGTATAGAGGTACAAGCTTTAGC
TGCTGAAACAGAACAGCCAAAATGGTGGGAGAAGAAAGCAGGGCCAAACATGATCGACGT
TACCTCAACCGAACAGTTTTTGAACGCTTTGAAAGATGCGGGAGATAGATTAGTTATCGT
TGATTTTTATGGAACTTGGTGTGGTTCTTGCCGAGCAATGTTCCCTAAGCTGTGCAAAAC
AGCGGAAGAACACCCTGAAATCTTGTTCCTTAAAGTAAACTTTGATGAGAACAAGTCACT
CTGCAAAAGCTTGAACGTCAAGGTGTTACCATACTTCCACTTGTACCGCGGCTCTGATGG
CCAAGTCGATTCCTTCTCCTGCTCTCTCGCAAGGTTTAAGAAACTCAGAGAGGCTATAGA
GAGACATAGTGTAGGAATTAGCAGTGACAACCACTTTTTTTCGGTTTTTGAGCAAATTGA
AGATTCAACTTCAAGCCTGTAATCAACCAATGTCTGGATCTGATTGAAAAAGTTTTATTT
ATTTGATCGTTTCAATGTATATATGTTAACTGCC

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 3

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TCTTGATCCTTGTGCTCTGCGTTCACGTAGCTCACTCTTTCTACCTCCCAGGTGTAGCTC
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AGACTCAGCTTCCTTATTCGTATTACTCGCTTCCTTTTTGTCAACCTAACAAGATTGTTG
ATAGTACTGAGAATCTTGGTGAAGTGCTTCGTGGTGACCGCATTGAAAATGCCCCTTATT
CGTTTAAGATGCGGGATGCACAGATGTGCAATGTTCTCTGCCGGGTCACTCTTGATGACA
AGACTGCCAAAGCCTTCAAAGAAAAGATTGATGATGAGTACCGTGTCAACATGATCCTCG
ACAATATTCCTCTCGTGGTTCCAATCGAAAGAGGGGATCCGGGTTCTCCCGCTGTTGTCT
ATCAGCTTGGCTATCATGTTGGTCTTAAAGGCCAGTATGAAGGGAGCAAAGAGC


BQ
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AF RS1AW52TF U 1
AF RS1AW73JQ C 1
AF RS1AW73TF U 1
BS 1 534 RS1AW52TF

RD RS1AW52TF 534 0 0
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TCTTGATCCTTGTGCTCTGCGTTCACGTAGCTCACTCTTTCTACCTCCCAGGTGTAGCTC
CTCAGGACTTCGAGAAGGGTGATGAGCTGAAGGTTAAAGTGAATAAACTAACCTCCATCA
AGACTCAGCTTCCTTATTCGTATTACTCGCTTCCTTTTTGTCAACCTAACAAGATTGTTG
ATAGTACTGAGAATCTTGGTGAAGTGCTTCGTGGTGACCGCATTGAAAATGCCCCTTATT
CGTTTAAGATGCGGGATGCACAGATGTGCAATGTTCTCTGCCGGGTCACTCTTGATGACA
AGACTGCCAAAGCCTTCAAAGAAAAGATTGATGATGAGTACCGTGTCAACATGATCCTCG
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QA 1 534 1 534
DS 

RD RS1AW73JQ 534 0 0
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TCTTGATCCTTGTGCTCTGCGTTCACGTAGCTCACTCTTTCTACCTCCCAGGTGTAGCTC
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AGACTCAGCTTCCTTATTCGTATTACTCGCTTCCTTTTTGTCAACCTAACAAGATTGTTG
ATAGTACTGAGAATCTTGGTGAAGTGCTTCGTGGTGACCGCATTGAAAATGCCCCTTATT
CGTTTAAGATGCGGGATGCACAGATGTGCAATGTTTTCTGCCGGGTCACTCTTGATGACA
AGACTGCCAAAGCCTTCAAAGAAAAGATTGATGATGAGTACCGTGTCAACATGATCCTCG
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QA 1 534 1 534
DS 

RD RS1AW73TF 534 0 0
CCACAGCCATGGGTATGGAGCTTAGGAGAAAATCGAAAACTTGTAGATCCTCCGCGATCG
TCTTGATCCTTGTGCTCTGCGTTCACGTAGCTCACTCTTTCTACCTCCCAGGTGTAGCTC
CTCAGGACTTCGAGAAGGGTGATGAGCTGAAGGTTAAAGTGAATAAACTAACCTCCATCA
AGACTCAGCTTCCTTATTCGTATTACTCGCTTCCTTTTTGTCAACCTAACAAGATTGTTG
ATAGTACTGAGAATCTTGGTGAAGTGCTTCGTGGTGACCGCATTGAAAATGCCCCTTATT
CGTTTAAGATGCGGGATGCACAGATGTGCAATGTTCTCTGCCGGGTCACTCTTGATGACA
AGACTGCCAAAGCCTTCAAAGAAAAGATTGATGATGAGTACCGTGTCAACATGATCCTCG
ACAATATTCCTCTCGTGGTTCCAATCGAAAGAGGGGATCCGGGTTCTCCCGCTGTTGTCT
ATCAGCTTGGCTATCATGTTGGTCTTAAAGGCCAGTATGAAGGGAGCAAAGAGC

QA 1 534 1 534
DS 



AS 1 3

CO CL3798Contig1 1330 3 13 U
GGCAGGGATCCAGTCACAGGGCTCTCTTGAGCAATCATCTCCTACCTCCTCCCAAGAGAA
GTCAAAGGAAGAGGAAGACTCATCATCTTTGACTGATGATTCTGACTCTGATTCTGATTC
TAAGTCGGTTCCTGATGATGAAGATGGTGACGAGGCATTGATCCGTAGGATGGCTGATCT
AGAGCTTGAGCTTCAAGAAACTAAACAGAAGCTCCTTCTCCAGCAAGAAAATGTTAACAA
CAACACTGATCTCCTTCGCAAGATTACTGTATATGAAGGAGAGCTTAGAGATGCTAATGA
AAAGATTCGTATGCATGAAGAAGAGATTGCTAATCTGAAGATTGAGCTTCAGAGCTGCAT
GTCCTCTGGCACTGATGCTCAGGTTGATTTGGATAAAGAGGAAACTGAAGATGATGCAGC
AACTGCTATAAAATTTCAGGCCTTAGAGGAAGAGCTGAGTTCCGTGGAAGAGAAGCTTCA
GGGCTTTGAGAAAGAGGTTTCTTGTCTGAGAAGCGAGCTTGAGATCAGTAAAGCTTCAGA
GGAGAAGCTTCAAGGAGAGCTTGAGTTGGCTCAAAATGATGCTGATGCTCACAGAAACAA
GGTCAATGCTGAGAAGAAAGAAGTGTTGAGGTTGCAAGAGAGGATGGCAATGGTGGAAAC
CAGTTTACAGGACAGAGATAACGAGATAAGGGAACTGAAAGGTGCAGTCTCTGACACTGA
AGAGAAGATAACCACGGTGAAAGAACATATGAAGGGAGAAATGTCAAAGCTACTTGAAGA
ACGCAGCCAACTTGAAGAGAAACTGAGAGAGATGGAATCACATATAAGGCTGATCACGGA
AGAGAAAGCTGAAATGGAGGAGAAGTTTAGAGGAGAATCCGAGAAGATAAGTGTAATGAG
AGATGAGAGTGATGTGCTAAGAGAAGAGAGTGGGAAAAAAGAAGAAAAGATAAAGGAAAT
GGAAAAGCATATGAAGGAGCTTCACATGGAGCAAGTGAGGCTGAGAAGACGATCTAGTGA
GCTTTCAGAGGAAGTGGAGAAGACAAGAGTGGCTGCATCAGAAGTGGCTGATCAGAAAAG
AGAAGCGATAAGACAATTGTGTGTGTCTCTTGACTATTACAAAGATGGGTATGAGAGGCT
TTGGAAGGCTGTTGCAGGACCTAAGAGAAGAGTGGTCTTAGCTTAATTAATATAAGAGTA
GTGCAAGGACAATAACTATGTGTGTTCTTTTGAACTTAAAATGTTTGTTTTAAGGGCTAC
TTGTTGAAATAAGGCTGAAAATGAATAATGTATGTTGATATTAGTATATATGAATATGGT
AATATCTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BY76TF U 1
AF RS1G663TF U 586
AF RS1BY76JQ C 583
BS 1 689 RS1BY76TF
BS 690 743 RS1G663TF
BS 744 744 RS1BY76JQ
BS 745 936 RS1G663TF
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BS 1056 1056 RS1BY76JQ
BS 1057 1086 RS1G663TF
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BS 1088 1231 RS1G663TF
BS 1232 1330 RS1BY76JQ

RD RS1BY76TF 689 0 0
GGCAGGGATCCAGTCACAGGGCTCTCTTGAGCAATCATCTCCTACCTCCTCCCAAGAGAA
GTCAAAGGAAGAGGAAGACTCATCATCTTTGACTGATGATTCTGACTCTGATTCTGATTC
TAAGTCGGTTCCTGATGATGAAGATGGTGACGAGGCATTGATCCGTAGGATGGCTGATCT
AGAGCTTGAGCTTCAAGAAACTAAACAGAAGCTCCTTCTCCAGCAAGAAAATGTTAACAA
CAACACTGATCTCCTTCGCAAGATTACTGTATATGAAGGAGAGCTTAGAGATGCTAATGA
AAAGATTCGTATGCATGAAGAAGAGATTGCTAATCTGAAGATTGAGCTTCAGAGCTGCAT
GTCCTCTGGCACTGATGCTCAGGTTGATTTGGATAAAGAGGAAACTGAAGATGATGCAGC
AACTGCTATAAAATTTCAGGCCTTAGAGGAAGAGCTGAGTTCCGTGGAAGAGAAGCTTCA
GGGCTTTGAGAAAGAGGTTTCTTGTCTGAGAAGCGAGCTTGAGATCAGTAAAGCTTCAGA
GGAGAAGCTTCAAGGAGAGCTTGAGTTGGCTCAAAATGATGCTGATGCTCACAGAAACAA
GGTCAATGCTGAGAAGAAAGAAGTGTTGAGGTTGCAAGAGAGGATGGCAATGGTGGAAAC
CAGTTTACAGGACAGAGATAACGAGATAA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1G663TF 646 0 0
G
GCTCACAGAAACAAGGTCAATGCTGAGAAGAAAGAAGTGTTGAGGTTGCAAAAGAGGATG
GTAATGGTGGAAACCAGTTTACAGGAGAGAGATAACGAGATAAGGGAACTGAAAGGTGCA
GTCTCTGACACTGAAGAGAAGATAACCACGGTGAAAGCACATATGAAGGGAGAAATGTCA
AAGCTACTTGAAGAACGCAGCCAACTTGAAGAGAAACTGAGAGAGATGGAATCACATATA
AGGCTGATCACGGAAGAGAAAGCTGAAATGGAGGAGAAGTTTAGAGGAGAATCCGAGAAG
ATAAGTGTAATGAGAGATGAGAGTGATGTGCTAAGAGAAGAGAGTGGGAAGAAAGAAGAG
AAGATAAAGGAAATGGAAAAGCATATGAAGGAGCTTCACATGGAGCAAGTGAGGCTGAGA
AGACGATCTAGTGAGCTTTCAGAGGAAGTGGAGAAGACAAGAGTGGCTGTATCAGAAGTG
GCTGATCAGAAAAGAGAAGCTATAAGACAATTGTGTGTGTCTCTTGACTATTACAAAGAT
GGGTATGAGAGGCTTTGGAAGGCTGTTGCAGGACCTAAGAGAAGAGTGGTCTTAGCTTAA
TTAATATAAGAGTAGTGCAAGGACAATAACTATGTGTGTTCTTTT

QA 2 646 2 646
DS 

RD RS1BY76JQ 748 0 0
TGAT
GCTCACAGAAACAAGGTCAATGCTGAGAAGAAAGAAGTGTTGAGGTTGCAAGAGAGGATG
GCAATGGTGGAAACCAGTTTACAGGACAGAGATAACGAGATAAGGGAACTGAAAGGTGCA
GTCTCTGACGCTGAAGAGAAGATAACCACGGTGAAAGAACATATGAAGGGAGAAATGTCA
AAGCTACTTGAAGAGCGCAGCCAACTTGAAGAGAAACTGAGAGAGATGGAATCACATATA
AGGCTGATCACGGAAGAGAAAGCTGAAATGGAGGAGAAGTTTAGAGGAGAATCCGAGAAG
ATAAGTGTAATGAGAGATGAGAGTGATGTGCTAAGAGAAGAGATTGGGAAAAGAGAAGAA
AAGATAAAGGAAATGGAAAAGCATATGCAGGAGCTTCACATGGAGCAAGTGAGGCTGAGA
AGACGGTCTAGTGAGCTTTCAGAGGAAGTGGAGAAGGCAAGAGTGGCTGCATCAGAAGTG
GCTGATCAGAAAAGAGAAGCGATAAGACAATTGTGTGTGTCTCTTGACTATTACAAAGAT
GGGTATGAGAGGCTTTGGAAGGCTGTTGCAGGACCTAAGAGAAGAGTGGTCTTAGCTTAA
TTAATATAAGAGTAGTGCAAGGACAATAACTATGTGTGTTCTTTTGAACTTAAAATGTTT
GTTTTAAGGGCTACTTGTTGAAATAAGGCTGAAAATGAATAATGTATGTTGATATTAGTA
TATATGAATATGGTAATATCTCAC

QA 5 748 5 748
DS 



AS 1 3

CO CL3799Contig1 898 3 3 U
GGAAGCTGAAACCTGCAGAAATCTCGTGATCATGACATACCAGATCACAAGATTTTCTTT
TACTATTAATCATAACTTCATGAAACATAACATGTCGCTGGTTTACGTCCAGAGATAACA
GAGGAAGACATCAAACGAAAACAGAGCATAACACGTAGTACAACATAAATTACGAGAATA
AGACATCAACTCAAAGCCCCTCTTGGAAAGTAACTCCACTGGGCTTCAGCCATAATCCTC
CTTGGATAAGCTTTGCGACAGTAAACTTATCAGCCTCTTTTGAGTCTTTAATAACTCTAT
ATCCTTTCCATGTAACTCTCTTGCTCGTATCCGCTCCAGGCCCATTATTCGCATACTCTC
CGTAGTACAATGTGGAGAGAGCGAAATCACCGTCCCATGGGAACCAACCGGCCGGATCAA
TGTGGCTGTCGATGAAAGACTGCATGATCACTGTCCTTGAGTACAACTTCCACGGCCGTC
CAAGGTACGTCTTCACAGATCCTTTCACCGGAGCAAGATCAGAGCTAGCAGTTAGTTTAC
ATTTTTGGAACGAGATGGCTGTGTTCTGGTTCGGATCCTCCCGTCCCTGAGCCGTCAGCA
TGTTCTTCTGCCCAGCACCGGGCTTCCGCGCCACGATGTCGCAGTTTTGAAATACGACCG
CTGAGTTTCCGAATATAAAGTCTACGGTACCCGTTATGAAGCTGTCGCGGTAGAATTGTC
GCAGGGTGTGAGCGTAGAGCGTGTCTTGATACGCGTCTATGCGGCAACGGTTTATGACCG
ATTGGTCAGCACTCACGCGGAGAGCCACAGCCTGATGCTTTGATGGTCCGGCCGTGTTCT
GGAACCATATGTCTTGTGCCATAAACCCATCACCATTGGCAGCTACTGTTGCAGATCT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G023JQ U 1
AF RS1BM21JQ U 3
AF RS1BM21TF C 226
BS 1 482 RS1G023JQ
BS 483 762 RS1BM21JQ
BS 763 898 RS1BM21TF

RD RS1G023JQ 482 0 0
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CTTGGATAAGCTTTGCGACAGTAAACTTATCAGCCTCTTTTGAGTCTTTAATAACTCTAT
ATCCTTTCCATGTAACTCTCTTGCTCGTATCCGCTCCAGGCCCATTATTCGCATACTCTC
CGTAGTACAATGTGGAGAGAGCGAAATCACCGTCCCATGGGAACCAACCGGCCGGATCAA
TGTGGCTGTCGATGAAAGACTGCATGATCACTGTCCTTGAGTACAACTTCCACGGCCGTC
CA

QA 1 482 1 482
DS 

RD RS1BM21JQ 760 0 0
GG
GCTGAAACCTGCAGAAATCTCGTGATCATGACATACCAGATCACAAGATTTTCTTTTATT
ATTAATCATAACTTCATGAAA*ATAACATGTCGCTGGTTTACGTCCAGAGATAACAGAGG
AGGACATCAAACGAAAACAGAGCATAACACGTAGTACAACATAAATTACGAGAATAAGAC
ATCAACTCAAAGCCCCTCTTGGAAAGTAACTCCACTGGGCTTCAGCCATAATCCTCCTTG
GATAAGCTTTGCGACAGTAAACTTATCAGCCTCTTTTGAGTCTTTAATAACTCTATATCC
TTTCCATGTAACTCTCTTGCTCGTATCCGCTCCAGGCCCATTATTCGCATACTCTCCGTA
GTACAATGTGGAGAGAGCGAAATCACCGTCCCATGGGAACCAACCGGCCGGATCAATGTG
GCTGTCGATGAAAGACTGCATGATCACTGTCCTTGAGTACAACTTCCACGGCCGTCCAAG
GTACGTCTTCACAGATCCTTTCACCGGAGCAAGATCAGAGCTAGCAGTTAGTTTACATTT
TTGGAACGAGATGGCTGTGTTCTGGTTCGGATCCTCCCGTCCCTGAGCCGTCAGCATGTT
CTTCTGCCCAGCACCGGGCTTCCGCGCCACGATGTCGCAGTTTTGAAATACGACCGCTGA
GTTTCCGAATATAAAGTCTACGGTACCCGTTATGAAGCTGTCGCGGTAGAATTGTCGCAG
GGTGTGAGCGTAGAGCGTGTCTTGATACGCGTCTATGC

QA 3 760 3 760
DS 

RD RS1BM21TF 673 0 0
TCAGCCATAATCCTC*TTGGATAAGCTTTGCGACAGTAAACTTATCAGCCTCTTTTGAGT
CTTTAATAACTCTATATCCTTTCCATGTAACTCTCTTGCTCGTATCCGCTCCAGGCCCAT
TATTCGCATACTCTCCGTAGTACAATGTGGAGAGAGCGAAATCACCGTCCCATGGGAACC
AACCGGCCGGATCAATGTGGCTGTCGATGAAAGACTGCATGATCACTGTCCTTGAGTACA
ACTTCCACGGCCGTCCAAGGTACGTCTTCACAGATCCTTTCACCGGAGCAAGATCAGAGC
TAGCAGTTAGTTTACATTTTTGGAACGAGATGGCTGTGTTCTGGTTCGGATCCTCCCGTC
CCTGAGCCGTCAGCATGTTCTTCTGCCCAGCACCGGGCTTCCGCGCCACGATGTCGCAGT
TTTGAAATACGACCGCTGAGTTTCCGAATATAAAGTCTACGGTACCCGTTATGAAGCTGT
CGCGGTAGAATTGTCGCAGGGTGTGAGCGTAGAGCGTGTCTTGATACGCGTCTATGCGGC
AACGGTTTATGACCGATTGGTCAGCACTCACGCGGAGAGCCACAGCCTGATGCTTTGATG
GTCCGGCCGTGTTCTGGAACCATATGTCTTGTGCCATAAACCCATCACCATTGGCAGCTA
CTGTTGCAGATCT

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 3

CO CL3800Contig1 773 3 6 U
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AAAACATCTCCGTAAAATGACAATGGTAATCACATATATCACATAGATATGATTATATTA
TTACCTTTTCTATTTTAGAAGCTACATAGAAAACTTCGAGTTCATATTGTTGA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1ET67TF U 1
AF RS1ET67JQ C 1
AF RS1AX43TF U 54
BS 1 553 RS1ET67TF
BS 554 559 RS1AX43TF
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BS 671 773 RS1AX43TF

RD RS1ET67TF 553 0 0
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CTTTGGCAGGCTGTTTATTGCAAACCCGGATCTGGTTTCTCGGTTTAAGGTTGATGCGAA
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TTATTCCTTCTTG

QA 1 553 1 553
DS 

RD RS1ET67JQ 695 0 0
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GGTAGTGAAAGGTGTGGTTTCAGCGATAGGAGCTAGTAAAGTTGGTGTGAGGATATCTCC
AGCAATAGACCATCTCGATGCAACTGATTCTGACCCACTATCCCTCGGGCTAGCCGTGGT
TGATCTGCTCAACAAGTTACAGAACGATACTGGCTCCAAGCTAGCTTACCTCCATGTAAC
ACAGCCTCGGTACCACGCTTATGGGCAAACAGAATCTGGAAGGCAAGGTAGTGATGAGGA
AGAAGCTAAGTTAATGAAGAGCTTGCGTACGGCTTACAATGGAACATTTATGTCTAGTGG
AGGTTTCAACAAGGAGCTTGGCATGCAAGCCATTCAGCAAGGGGATGCTGATTTGGTTTC
CTTTGGCAGGCTGTTTATTGCAAACCCGGATCTGGTTTCTCGGTTTAAGGTTGATGCGAA
GTTGAATAAATATGATCGGAAGACGTTTTACACTCAAGACCCAGTTGTTGGCTACACAGA
TTATTCCTTCTTGGCTCCAATTTCTCGCCTCTGAGTTTGGAGAAACGAGGAGAAGATTCA
TAGATATATCTACATCAATTCATTGATGTTATGTTGTTTATTGATGTTGTAGAAAACCAA
AAAACATCTCCGTAAAATGACAATGGTAATCACAT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1AX43TF 720 0 0
G
ACTCCAGGTAGTGAAAGGTGTGGTTTCAGCCATAGGAGCTAGTAAAGTTGGTGTGAGGAT
ATCTCCAGCAATAGACCATCTCGATGCAACTGATTCTGACCCACTATCCCTCGGGCTAGC
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TGCGAAGTTGAATAAATATGATCGGAAGACGTTTTACACTCAAGATCCAGTTGTTGGCTA
CACAGATTATTCCTTCTTGGCTCCAGTTTCTCGCCTCTGAGTTTGGAGAAACGAGGAGAA
GATTCATAGATATATCTACATCAATTCATTGATGTTATGTTGTTTATTGATGTTGTAGAA
AACCAAAAAACATCTTCGTAAAATGACAATGGTAATCACATATATCACATAGATATGATT
ATATTATTACCTTTTCTATTTTAGAAGCTACATAGAAAACTTCGAGTTCATATTGTTGA

QA 2 720 2 720
DS 



AS 1 2

CO CL3801Contig1 1357 2 6 U
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TGGTTGGGAGGATGAGATCGACACTGGGAGATTTAGTTCAAACCGGATAGGTGGACACAG
AATAGGATTCAAACACAAACACAAAGCTCAAGCAAAACCTCAGCATTAGAGTTTCAGCCG
CGGAGATTCAACATAAACTAAAGTAAGATTCCAAATTCGTCCTTTTGATCGTTGAGATCC
TCTGTTAGATCTTACGTTTTGGACCCAACCCTCCAAGGGTTTGTCCTCTAGGCTTCTCGA
TCTTGTGGAGAGAGTTATAGTGAAGCTCATGCACGATGCTTCTCTCCCTCTCCACTACCT
CTCCGGCAACTTCGTTCCTGTCCGCGATGAAACTCCCCCGGTCAAGGATCTCCTTGTCGT
CCATGGATTTCTTCCAGAATGCTTGAATGGTGAATTTGTGAGGGTTGGTCCAAATCCCAA
GTTTGATTCCGTCGCTGGATATCACTGGTTTGATGGAGATGGGTACGCCAACTCTTTATT
GTTTCATCTTCTCATCAAAACTTAGGGGCTGCTGCTTATTCTCTATCTTTCATTAATCTC
ACACGAATCTTACTTCATGTCTCACCCACCTTAATACTGCAGGATGATACATGGTGTACG
CATCAAAGATGGGAAAGCAACTTATGTTTCTCGATATGTTAAGACATCACGCCTCAAGCA
GGAAGAGTTTTTCGGAGCTGCCAAATTCATGAAGGTCTGAGATCTTGTGTTTATATATAT
ACTTATCATTTGTGGGATCATTTTGTCTTCTTTTACTTCTTACAGATTGGGGACCTTAAG
GGTTTTCTCGGATTGCTCATGGTCTATCTGCAACAGCTCAGAACCAAACTTAATGTATTG
GACGTCTCTTATGGACATGGAACTGGTTGTGCTGTTACTTGGCTTTCTATATTAGGAGCA
CAGAAGGAAGTATGTAAACAGAAATACACTTTGCAAATGCCCAAGTTCTTTGTCGACGAG
ATTGAAGTTGAGATGATTCAGTTGAAATAAAGAGGGAGCTGGATGACCAAACTGAGTGTT
AACAGAAAAAATAGAAGACCATAAGTTGAGAGATTCTGGGATTGTAGCCTACTAATGAGA
CGCTGCCAATTTGGGTAAGTAACTAAAGACTGCTCGATGTATCTTATGTGATCTCAGAAA
CAAATGAGGTCTGTGATCTGTTCTTTTTTTTAATCATTTTTAGCTTCTTTTTCTTTGTAG
CTTTCTTACTTTTAGTCTCAAATTTTTGTGCTCATCTATTTTTTGCTAGCGAGATACCTT
TTCCAGCATATTATATCGACAGTTAGCGATTGTATGA


BQ
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AF RS1A815TF U 504
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TGGTTGGGAGGATGAGATCGACACTGGGAGATTTAGTTCAAACCGGATAGGTGGACACAG
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TCTGTTAGATCTTACGTTTTGGACCCAACCCTCCAAGGGTTTGTCCTCTAGGCTTCTCGA
TCTTGTGGAGAGAGTTATAGTGAAGCTCATGCACGATGCTTCTCTCCCTCTCCACTACCT
CTCCGGCAACTTCGTTCCTGTCCGCGATGAAACTCCCCCGGTCAAGGATCTCCTTGTCGT
CCATGGATTTCTTCCAGAATGCTTGAATGGTGAATTTGTGAGGGTTGGTCCAAATCCCAA
GTTTGATTCCGTCGCTGGATATCACTGGTTTGATGGAGATGGGTACGCCAACTCTTTATT
GTTTCATCTTCTCATCAAAACTTAGGGGCTGCTGCTTATTCTCTATCTTTCGTTAATCTC
ACACGAATCTTACTTCGTGTCTCACCCACCTTAATACT

QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1A815TF 854 0 0
GG
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GGGCTGCTGCTTATTCTCTATCTTTCATTAATCTCACACGAATCTTACTTCATGTCTCAC
CCACCTTAATACTGCAGGATGATACATGGTGTACGCATCAAAGATGGGAAAGCAACTTAT
GTTTCTCGATATGTTAAGACATCACGCCTCAAGCAGGAAGAGTTTTTCGGAGCTGCCAAA
TTCATGAAGGTCTGAGATCTTGTGTTTATATATATACTTATCATTTGTGGGATCATTTTG
TCTTCTTTTACTTCTTACAGATTGGGGACCTTAAGGGTTTTCTCGGATTGCTCATGGTCT
ATCTGCAACAGCTCAGAACCAAACTTAATGTATTGGACGTCTCTTATGGACATGGAACTG
GTTGTGCTGTTACTTGGCTTTCTATATTAGGAGCACAGAAGGAAGTATGTAAACAGAAAT
ACACTTTGCAAATGCCCAAGTTCTTTGTCGACGAGATTGAAGTTGAGATGATTCAGTTGA
AATAAAGAGGGAGCTGGATGACCAAACTGAGTGTTAACAGAAAAAATAGAAGACCATAAG
TTGAGAGATTCTGGGATTGTAGCCTACTAATGAGACGCTGCCAATTTGGGTAAGTAACTA
AAGACTGCTCGATGTATCTTATGTGATCTCAGAAACAAATGAGGTCTGTGATCTGTTCTT
TTTTTTAATCATTTTTAGCTTCTTTTTCTTTGTAGCTTTCTTACTTTTAGTCTCAAATTT
TTGTGCTCATCTATTTTTTGCTAGCGAGATACCTTTTCCAGCATATTATATCGACAGTTA
GCGATTGTATGA

QA 3 854 3 854
DS 



AS 1 3

CO CL3802Contig1 832 3 15 U
GCAAGAACAAGAAAAATGTATAAATTCGAAAATTATATATATTTTAAGAATATATTAGAC
ATAGATACAACACAGTAGATAAATTTCATACTTTTCAAATATGAAATTAAAGTTAAA*CA
ATATATTTTTTTTCCTCGTATTTCATACGTGAGACAAACAAAAAGTGAATCTTACAACTT
CATCCCCCCGCATATTTATCCTACCGAAAGTGAACGTTGTATTTTTCCCCTTTTACATGA
ACACGTACTAGTCTTTTTCAATTTTATATGATTTATAGTCCAAGGTTGACGGGAACATTA
GCTTCTTGAATCCAGTCAACGGGAGCCAACCAGTTAGCGACAGTGTACTGATTAACCTCA
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CGGTTGTTGAACTCAATGTACTTACATGTCTTGTGGAAACTTTCCCCATCCCAAACTTTC
CATCCTTCAGGTGTAATCACATCACCGATCTCGCTGTTGATGACCGCGGTGGTGGAGTAC
TTCTTCCACGGCCTTCCCAAGTATGACTGAACGGTTAACCTCTCTGCCTGTAGTTTCTTG
TCTGGAACGATTTTGCAGTTCTGGAGGACGATACCGATTTTCATGGATAATCCCTTCTCG
TTTCCGTCGGCTGTGACGGTGTTGAATTGGTTCTTGTTTCCTTTACGGACAACAATCATT
GAGTTTTGGATGACGGTTGCTCCTTTTCCGAAGATGAAATCGATTGTTCCTGAGACGACG
ATGTTTCTGTAGAACTGACGACATTGTTAGCGTATAGAGTGTCTTGGTAGCC


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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A824JQ U 54
AF RS1A824TF C 54
AF RS1CX54JQ U 1
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CC

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TAAA*CAATATATTTTTTTTCCTCGTATTTCATACGTGAGACAAACAAAAAGTGAATCTT
ACAACTTCATCCCCCCGCATATTTATCCTACCGAAAGTGAACGTTGTATTTTTCCCCTTT
TACATGAACACGTACTAGTCTTTTTCAATTTTATATGATTTATAGTCCAAGGTTGACGGG
AACATTAGCTTCTTGAATCCAGTCAACGGGAGCCAACCAGTTAGCGACAGTGTACTGATT
AACCTCAGATGCAGACTTGGCGATCTTAACCCAGTCAACTCTTTTGTTAGTTTTAGCTCC
CC

QA 1 360 1 360
DS 

RD RS1CX54JQ 832 0 0
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ATAGATACAACACAGTAGATAAATTTCATACTTTTCAAATATGAAATTAAAGTTAAAACA
ATATAATTTTTTTCCTCATATTTCATACGTGAGACAAACAAAAAGTGAATCTTACAACTT
CATCCCCCCGCATATTTATCCTACCGAAAGTGAACGTTGTATTTTTCCCCTTTCACATGA
ACACGTACTAGTCTTTTTCAATTTTATATGGTTTATAGTCCAAGGTTGACGGGAACATTA
GCTTCTTGAATCCAGTCAACGGGAGCCAACCAGTTAGCCACAGTGTACTGATTAACCTCA
GATGCAGACTTGGCGATCTTAACCCAGTCAACTCTTTTGTTAGTCTTAGCTCCTGGTCCA
CGGTTGTTGAACTCAATGTACTTACATGTCTTGTGGAAACTTTCCCCATCCCAAACTTTC
CATCCTTCAGGTGTAATCACATCACCGATCTCGCTGTTGATGACCGCGGTGGTGGAGTAC
TTCTTCCACGGCCTTCCCAAGTATGACTGAACGGTTAACCTCTCTGCCTGTAGTTTCTTG
TCTGGAACGATTTTGCAGTTCTGGAGGACGATACCGATTTTCATGGATAATCCCTTCTCG
TTTCCGTCGGCTGTGACGGTGTTGAATTGGTTCTTGTTTCCTTTACGGACAACAATCATT
GAGTTTTGGATGACGGTTGCTCCTTTTCCGAAGATGAAATCGATTGTTCCTGAGACGACG
ATGTTTCTGTAGAACTGACGACATTGTTAGCGTATAGAGTGTCTTGGTAGCC

QA 1 832 1 832
DS 



AS 1 3

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ACCATCATTACTAGGGCGCCTTCTTCTGCTTATACCTAGCGGCAGAGAAAAAGTAAACCG
CCATGTTCACGAGGCTAAGCCCAGCCAAAAGCCAGAAGTAGTAATCAAGATGACCCGAGT
TCAGATTATCCGAGATCCAACCTTGTTCACCGTTCCTCGTCGTGAAATAAGTCACCAGCG
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ACAGGCTTCGCATTGCATCTGGAGACTGGTCATAGAAAAACTCCAGCTGC*CCTATGAAG
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TGTATCTCAGTGAACCCTTTGTCTACTCCAGTGAACCGTCTAGCCAAAGGGACGATGAAC
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CGTATCA


BQ
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20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1GL36JQ U 60
AF RS1D312JQ U 1
AF RS1AE78JQ U 20
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BS 706 907 RS1AE78JQ

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DS 

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ACCATCATTACTAGGGCGCCTTCTTCTGCTTATACCTAGCGGCAGAGAAAAAGTAAACCG
CCATGTTCACGAGGCTAAGCCCAGCCAAAAGCCAGAAGTAGTAATCAAGATGACCCGAGT
TCAGATTATCCGAGATCCAACCTTGTTCACCGTTCCTCGTCGTGAAATAAGTCACCAGCG
TGAGGATCAACGAGCTCAAGTAGTTCCCAAGAGCATTGGTCAAAAGAGCCAAAGCACTGC
ACAGGCTTCGCATTGCATCTGGAGACTGGTCATAGAAAAACTCCAGCTGC*CCTATGAAG
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TGTATCTCAGTGAACCCTTTGTCTACTCCAGTGAACCGTCTAGCC

QA 1 705 1 705
DS 

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GC
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GCTGAGAAGATGATCCCTGAAGCCCATATAGGGAACATTCGTATCA

QA 3 888 3 888
DS 



AS 1 3

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CTTTGCGGAGGCATTAGTGGCGGAAGCAGAGGTAGACAAAGACGTGGTTGCTATTCATGC
AGCCATGGGAGGTGGGACAGGGTTGAATCTCTTCCAACGTCGCTTCCCAACTAGATGTTT
CGATGTGGGAATAGCGGAACAGCATGCAGCTACTTTTGCTGCTGGCTTAGCATGTGAGGG
ACTCAAGCCCTTCTGTGCAATCTATTCCTCTTTCATGCAGCGTGCTTATGACCAGGTTGT
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TGCTGCTATCGATGACCGTCCTTCTTGTTTCCGTTACCCTAGAGGTAACGGTATTGGCGT
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GGCTGTGATGCTCCAAGAACGTGGATTGAACGTAACCGTAGCAGATGCACGGTTCTGTAA
GCCGTTGGACCGTGCTCTCATTCGCAGCTTAGCTAAGTCTCACGAGGTGCTGATCACGGT
TGAAGAAGGTTCTATTGGAGGGTTTGGATCGCATGTGGTTCAGTTTCTTGCATTGGATGG
TCTTCTCGATGGGAAGCTCAAGTGGAGACCAATGGTATTGCCTGATAGTTACATTGACCA
CGGTTCACCAGCTGATCAAATGGCTGAAGCTGGACTCATGCCGTCTCATGTAGCAGCAAC
TGCGCTTAACTTAATCGGAGCACCAAGGGAAGCTCTGTATTGAGAGTATAAACATATACA
AGAAGCAAGTCATTTGGCTGAGATGGTAAAGACAATGTTTGCAAAGATTAGTTGTAATGT
AACTGACGCGACCGCGTCTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FT70TF U 1
AF RS1BY41TF U 199
AF RS1FT70JQ C 572
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CGGACTCTACTATATTGGACCAGTCGATGGACACAACATAGATGATTTGGTAGCCATTCT
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GGGAGCTGATGGTCCAACACATTGTGGAGCGTTTGATGTTACGTTTATGGCTTGTCTTCC
TAACATGATAGTGATGGCTCCATCG

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DS 

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G
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GGGTTGAATCTCTTCCAACGTCGCTTCCCAACTAGATGTTTCGATGTGGGAATAGCGGAA
CAGCATGCAGCTACTTTTGCTGCTGGCTTAGCATGTGAGGGACTTAAGCCCTTCTGTGCA
ATCTATTCCTCTTTCATGCAGCGTGCTTATGACCAGGTTGTACATGATGTGGATTTGCAG
AAGTTACCGGTGAGATTTGCGATGGATAGAGCTGGACTAGTGGGAGCTGATGGTCCAACA
TATTGTGGAGCGTTTGATGTTACGTTTATGGCTTGTCTTCCTAACATGATAGTGATGGCT
CCATCGGATGAAGCAGAGCTGTTTAACATTGTTGCAACCGCTGCTGCTATCGATGACCGT
CCTTCTTGTTTCCGTTACCCTAGAGGTAACGGTATTGGCGTTGCGTTACCTCCAGGAAAC
AAAGGTGTTCCTGTTGAGGTTGGGAAAGGTAGGATCTTAAAAGAAGGGGAGAGGGTTGCT
TTGCTGGGGTATGGCTCAGCGGTTCAGAGCTGTTTAGGAGCGGCTGTGATGCTCCAAGAA
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ATTCGCAGCTTAGCTAAGTCTCACGAG*TGCTGATCACG
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DS 

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CGTTACCCTAGAGGTAACGGTATTGGCGTTGCGTTACCTCCAGGAAACAAAGGTGTTCCT
GTTGAGGTTGGGAAAGGTAGGATCTTAAAAGAAGGGGAGAGGGTTGCTTTGCTGGGGTAT
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GTAACCGTAGCAGATGCACGGTTCTGTAAGCCGTTGGACCGTGCTCTCATTCGCAGCTTA
GCTAAGTCTCACGAGGTGCTGATCACGGTTGAAGAAGGTTCTATTGGAGGGTTTGGATCG
CATGTGGTTCAGTTTCTTGCATTGGATGGTCTTCTCGATGGGAAGCTCAAGTGGAGACCA
ATGGTATTGCCTGATAGTTACATTGACCACGGTTCACCAGCTGATCAAATGGCTGAAGCT
GGACTCATGCCGTCTCATGTAGCAGCAACTGCGCTTAACTTAATCGGAGCACCAAGGGAA
GCTCTGTATTGAGAGTATAAACATATACAAGAAGCAAGTCATTTGGCTGAGATGGTAAAG
ACAATGTTTGCAAAGATTAGTTGTAATGTAACTGACGCGACCGCGTCTTTCG

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 3

CO CL3805Contig1 751 3 6 U
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CGTCTCTCTGTTAGTGGCCTTCACCGTTCTTTCACTCTGTTTACACACTTCAACATCAGA
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CTTTGAGTTTCTCAGCTTCACCTCCTCTGGAGGCTATTATGTCTCCTGATATCTCTCCTC
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CGACAATCCCCTCGAGCCTTAGTCCACCAAATCCAGATGCCGTCTCTCCTCTTGACTCTT
CTCCGGTGGGGTCTCCTCTTCCGGTTTCTTCCTCTGTTTCTTTGGTCTCCTTGACACCAC
TCTCTCTGCTTCTTGTCTTCCTCGTGTTTATGCTACCTTACTGCAGACTCTAATAAATTA
TTGTGGAAAATAAGCCCTATTTGACATCTTGTTCAAAACAAAAAAAAAAA**GGAAAAAA
AGAATTCACAATGTATTCTTCTTTTTACTCTATTCTTCTCATGGAACTTTATTTTTCTTT
GTATAATATATAATGTTTACACTTCTTTTAATTATTGTTCGGGTGAGGCTCTCTGCAATC
TGGCCGGTGCAGACCGTGCAGTTGTTGTACTTGTAACAGTGATATATGGGTTTTGTGTAT
GGATTGGATCCAATTATGAATAATCTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
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25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CD20JQ C 29
AF RS1DP90TF U 1
AF RS1CN31TF U 29
BS 1 482 RS1DP90TF
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RD RS1CD20JQ 574 0 0
GG
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TTCACTCTGTTTACACACTTCAACATCAGAGTTCCTAGAGTTTCAGCTCTCCACCATATC
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AGGCTATTATGTCTCCTGATATCTCTCCT**GTTCCCTACTCCAGGCTCAAGCGAAATGT
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ATCCAGATGCCGTCTCTCCTCTTGACTCTTCTCCGGTGGGGTCTCCTCTTCCGGTTACTT
CCTCTGTTTCTTTGGTCTCCT***CACCACTCTCTCTGCTTCTTGTCTTCCTCGTGTTTA
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GTTCAAAACAAAAAAAAAG***GAAAAAAAAGAATTCACAACGTATTCTTCTTTTTACTC
TATTCTTCTCATGGAACTTTATTTTTCTTTGT

QA 3 574 3 574
DS 

RD RS1DP90TF 725 0 0
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CGTCTCTCTGTTAGTGGCCTTCACCGTTCTTTCACTCTGTTTACACACTTCAACATCAGA
GTTCCTAGAGTTTCAGCTCTCCACCATATCAGCTGCACCTTCGTTTTT*GCCTGAAGCTC
CTTTGAGTTTCTCAGCTTCACCTCCTCTGGAGGCTATTATGTCTCCTGATATCTCTCCTC
TGTTCCCTACTCCAGGCTCAAGCGAAATGTCTCCTTCTCCGTCAGGATCTTTTGACATGC
CGACAATCCCCTCGAGCCTTAGTCCACCAAATCCAGATGCCGTCTCTCCTCTTGACTCTT
CTCCGGTGGGGTCTCCTCTTCCGGTTTCTTCCTCTGTTTCTTTGGTCTCCTTGACACCAC
TCTCTCTGCTTCTTGTCTTCCTCGTGTTTATGCTACCTTACTGCAGACTCTAATAAATTA
TTATGGAAAATAAGCCCTATTTGACATCTTGTTCAAAACAAAAAAAAAAA**GGAAAAAA
AGAATTCACAATGTATTCTTCTTTTTACTCTATTCTTCTCATGGAACTTTATTTTTCTTT
GTATAATATATAATGTTTACACTTCTTTTAATTATTGTTCGGGTGAGGCTCTCTGCAATC
TGGCCGGTGCAGACCGTGCAGTTGTTGTACTTGTAACAGTGATATATGGGTTT*GTGTAT
GGAT
G

QA 1 724 1 724
DS 

RD RS1CN31TF 723 0 0
GG
GACTCATTCACAGGAAGAAACCATGGCCGTCGTCTCTCTGTTAGTGGCCTTCACCGTTCT
TTCACTCTGTTTACACACTTCAACATCAGAGTTCCTAGAGTTTCAGCTCTCCACCATATC
AGCTGCACCTTCGTTTTT*GCCTGAAGCTCCTTTGAGTTTCTCAGCTTCACCTCCTCTGG
AGGCTATTATGTCTCCTGATATCTCTCCTCTGTTCCCTACTCCAGGCTCAAGCGAAATGT
CTCCTTCTCCGTCAGGATCTTTTGACATGCCGACAATCCCCTCGAGCCTTAGTCCACCAA
ATCCAGATGCCGTCTCTCCTCTTGACTCTTCTCCGGTGGGGTCTCCTCTTCCGGTTTCTT
CCTCTGTTTCTTTGGTCTCCTTGACACCACTCTCTCTGCTTCTTGTCTTCCTCGTGTTTA
TGCTACCTTACTGCAGACTCTAATAAATTATTGTGGAAAATAAGCCCTATTTGACATCTT
GTTCAAAACAAAAAAAAAAAAGGGAAAAAAAGAATTCACAATGTATTCTTCTTTTTACTC
TATTCTTCTCATGGAACTTTATTTTTCTTTGTATAATATATAATGTTTACACTTCTTTTA
ATTATTGTTCGGGTGAGGCTCTCTGCAATCTGGCCGGTGCAGACCGTGCAGTTGTTGTAC
TTGTAACAGTGATATATGGGTTTTGTGTATGGATTGGATCCAATTATGAATAATCTCTCC
C

QA 3 723 3 723
DS 



AS 1 2

CO CL3806Contig1 855 2 4 U
GGATTCTTACAAAACTATTATCATTCAGACCAAACTGAAAAAAGGAAGAGAGAGAGAAAG
GAGAGAGAGAGAGGGATTCATCATCAACCCATCTTCCCTCCTTCCTGTGGATCTCAAGTT
TCTGGGTTTCCCTGGGTTGATCTGATCAAGATTCGAAGAGTGACAAAGGAATAATCTTTA
TTTCTCCACAAATTCTAATGGCCACGGTGGGCGTAGAGCCTACTGCCGCGGTTAGAGATT
CTAATGGAAACGTTGCTACTGATGTTGATAGATTACCTGAAGAGATGAATCACATGAAAA
TTCAAGATGATAAAGAAATGGAAGCTACAATCGTAAACGGCAATGTCACAGAGACTGGTC
ATATAATAGTTACTACAATAGGTGGAAGAAATGGCCAACCAAAGCAGACAATCAGTTACA
TGGCAGAGAGAGTTGTTGGACATGGCTCCTTTGGCGTTGTCTTCCAAGCGAAATGTTTAG
AGACAGGAGAAACTGTAGCGATAAAGAAAGTGTTGCAAGACCGTAGGTACAAGAACCATG
AGCTTAAAGGTGTGCCTGTGGGGATGGTGGCTAGGTTAGTACCTGAACATGCGAGGAAGC
AGTGTCCATGGCTCGGTTTATGATTTTATATCTGTTGTTATCTGCAAACACAAAACTAGA
AGAGGGAAGAGTCCAAGATATTCATTAATCTTCTCTGTTTTGTTACTATTATTCAATCTC
TAGTCCTGGTGATTTTGTAACCCTTTTGTTTGTTATAATGAGTAGGGAGAGAGTGAATTA
TTGTGGGGGTGGGGTTATGATCTTGTAAAAGTCAACAAACAAATGTTTTTAAAAAAGAGT
TTGGTGTTTTCTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FB03TF U 1
AF RS1FB03JQ C 60
BS 1 735 RS1FB03TF
BS 736 736 RS1FB03JQ
BS 737 757 RS1FB03TF
BS 758 855 RS1FB03JQ

RD RS1FB03TF 761 0 0
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GAGAGAGAGAGAGGGATTCATCATCAACCCATCTTCCCTCCTTCCTGTGGATCTCAAGTT
TCTGGGTTTCCCTGGGTTGATCTGATCAAGATTCGAAGAGTGACAAAGGAATAATCTTTA
TTTCTCCACAAATTCTAATGGCCACGGTGGGCGTAGAGCCTACTGCCGCGGTTAGAGATT
CTAATGGAAACGTTGCTACTGATGTTGATAGATTACCTGAAGAGATGAATCACATGAAAA
TTCAAGATGATAAAGAAATGGAAGCTACAATCGTAAACGGCAATGTCACAGAGACTGGTC
ATATAATAGTTACTACAATAGGTGGAAGAAATGGCCAACCAAAGCAGACAATCAGTTACA
TGGCAGAGAGAGTTGTTGGACATGGCTCCTTTGGCGTTGTCTTCCAAGCGAAATGTTTAG
AGACAGGAGAAACTGTAGCGATAAAGAAAGTGTTGCAAGACCGTAGGTACAAGAACCATG
AGCTTAAAGGTGTGCCTGTGGGGATGGTGGCTAGGTTAGTACCTGAACATGCGAGGAAGC
AGTGTCCATGGCTCGGTTTATGATTTTATATCTGTTGTTATCTGCAAACACAAAACTAGA
AGAGGGAAGAGTCCAAGATATTCATTAATCTTCTCTGTTTTGTTACTATTATTCAATCTC
TAGTCCTGGTGATTT*GTAACCCTTTTGTTTGTTATA
TGAG

QA 1 757 1 757
DS 

RD RS1FB03JQ 796 0 0
GGAGAGAGAGAGAGG
GATTCATCATCAACCCATCTTCCCTCCTTCCTGTGGATCTCAAGTTTCTGGGTTTCCCTG
GGTTGATCTGATCAAGATTCGAAGAGTGACAAAGGAATAATCTTTATTTCTCCACAAATT
CTAATGGCCACGGTGGGCGTAGAGCCTACTGCCGCGGTTAGAGATTCTAATGGAAACGTT
GCTACTGATGTTGATAGATTACCTGAAGAGATGAATCACATGAAAATTCAAGATGATAAA
GAAATGGAAGCTACAATCGTAAACGGCAATGTCACAGAGACTGGTCATATAATAGTTACT
ACAATAGGTGGAAGAAATGGCCAACCAAAGCAGACAATCAGTTACATGGCAGAGAGAGTT
GTTGGACATGGCTCCTTTGGCGTTGTCTTCCAAGCGAAATGTTTAGAGACAGGAGAAACT
GTAGCGATAAAGAAAGTGTTGCAAGACCGTAGGTACAAGAACCATGAGCTTAAAGGTGTG
CCTGTGGGGATGGTGGCTAGGTTAGTACCTGAACATGCGAGGAAGCAGTGTCCATGGCTC
GGTTTATGATTTTATATCTGTTGTTATCTGCAAACACAAAACTAGAAGAGGGAAGAGTCC
AAGATATTCATTAATCTTCTCTGTTTTGTTACTATTATTCAATCTCTAGTCCTGGTGATT
TTGTAACCCTTTTGTTTGTTATAATGAGTAGGGAGAGAGTGAATTATTGTGGGGGTGGGG
TTATGATCTTGTAAAAGTCAACAAACAAATGTTTTTAAAAAAGAGTTTGGTGTTTTCTGC
C

QA 16 796 16 796
DS 



AS 1 3

CO CL3807Contig1 645 3 15 U
GGACTAAAGTCATTCTCTTCACCATGGCCACTTTTCTCTGTTTCCTTTTTTTCTCTTCGG
TAGCCCTGTCTCTCGTTCTAGTTTCGGTCACAGCAGAATCCCTCGAACGTGATTTCTTGC
GTCATAAAAAAGAGAAGCTAACTCATTTTAGAGTGTATTGGCACGACATCTTGGACGGCA
AAGATCCAACTTCTGTCTCAATAATGAATCCTCCGAAAAACTACACGGGAGCAACTGGCT
TTGGCCTCACTCGTATGATTGATAATCCATTAACGTTGTCCCCGGAGTTAAGCTCCAAAA
TGGTTGGAAGGGCACAAGGGTTTTATGCAGCGTCATCTAAAGAAGAGGTGGGATTGTTGA
TGGCTATGAACTTCGCGATTCTGGACGGAAAGTACAGTGGAAGTACGATCACAGTGTTTG
GACGAAACTCTGTGCTTGATAAAGTGAGGGAGATGCCAGTGATCGGAGGCAGTGGACTTT
TTCGATTTGCTAGAGGTTATGTTCAGGCAAGAACACATGTATTTGATATCAAGACAGGGA
ACGCTGTTGTCGAGTATAATTGTTATGTTTTGCACTACTAATTATATTATTGTGGTTTAT
TATATGTATTTTTCCTGAAACTATTACACTCTATGGCAGTTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1F723TF U 1
AF RS1GX67TF U 13
AF RS1GX67JQ C 56
BS 1 58 RS1F723TF
BS 59 59 RS1GX67TF
BS 60 331 RS1F723TF
BS 332 333 RS1GX67TF
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BS 644 645 RS1GX67JQ

RD RS1F723TF 635 0 0
GGACTAAAGTCATTCTCTTCACCATGGCCACTTTTCTCTGTTTCCTTTTTTTCTCTTCTG
TAGCCCTGTCTCTCGTTCTAGTTTCGGTCACAGCAGAATCCCTCGAACGTGATTTCTTGC
GTCATAAAAAAGAGAAGCTAACTCATTTTAGAGTGTATTGGCACGACATCTTGGACGGCA
AAGATCCAACTTCTGTCTCAATAATGAATCCTCCGAAAAACTACACGGGAGCAACTGGCT
TTGGCCTCACTCGTATGATTGATAATCCATTAACGTTGTCCCCGGAGTTAAGCTCCAAAA
TGGTTGGAAGGGCACAAGGGTTTTATGCAGCCGCATCTAAAGAAGAGGTGGGATTGTTGA
TGGCTATGAACTTCGCGATTCTGGACGGAAAGTACAGTGGAAGTACGATCACACTGTTTG
GACGAAACTCTGTGCTTGATAAAGTGAGGGAGATGCCAGTGATCGGAGGCAGTGGACTTT
TTCGATTTGCTAGAGGTTATGTTGAGGCAAGAACACATGTATTTGATATCAACACAGGGA
ACGCTGTTGTCGAGTATAATTGTTATGTTTTGCACTACTAATTATATTATTGTGGTTTAT
TATATGTATTTTTCTTGAAACTATTACACTCTATG

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1GX67TF 631 0 0
GG
CTCTTCACCATGGCCACTTTTCTCTGTTTCCTTTTTTTCTCTTCGGTAGCCCTGTCTCTC
GTTCTAGTTTCGGTCACAGCAGAATCCCTCGAACGTGATTTCTTGCGTCATAAAAAAGAG
AAGCTAACTCATTTTAGAGTGTATTGGCACGACATCTTGGACGGCAAAGATCCAACTTCT
GTCTCAATAATGAATCCTCCGAAAAACTACACGGGAGCAACTGGCTTTGGCCTCACTCGT
ATGATTGATAATCCATTAACGTTGTCCCCGGAGTTAAGCTCCAAAATGGTTGGAAGGGCA
CAAGGGTTTTATGCAGCGTCATCTAAAGAAGAGGTGGGATTGTTGATGGCTATGAACTTC
GCGATTCTGGACGGAAAGTACAGTGGAAGTACGATCACAGTGTTTGGACGAAACTCTGTG
CTTGATAAAGTGAGGGAGATGCCAGTGATCGGAGGCAGTGGACTTTTTCGATTTGCTAGA
GGTTATGTTCAGGCAAGAACACATGTATTTGATATCAAGACAGGGAACGCTGTTGTCGAG
TATAATTGTTATGTTTTGCACTACTAATTATATTATTGTGGTTTATTATATGTATTTTTC
CTGAAACTATTACACTCTATGGCAGTTTT

QA 3 631 3 631
DS 

RD RS1GX67JQ 590 0 0
TTCG
GTAGCCCTGTCTCTCGTTCTAGTTTCGGTCACAGCAGAATCCCTCGAACGTGATTTCTTG
CGTCATAAAAAAGAGAAGCTAACTCATTTTAGAGTGTATTGGCACGACATCTTGGACGGC
AAAGATCCAACTTCTGTCTCAATAATGAATCCTCCGAAAAACTACACGGGAGCAACTGGC
TTTGGCCTCACTCGTATGATTGATAATCCATTAACGTTGTCCCCGGAGTTAAGCTCCAAA
ATGGTTGGAAGGGCACAAGGGTTTTATGCAGCGTCATCTAAAGAAGAGGTGGGATTGTTG
ATGGCTATGAACTTCGCGATTCTGGACGGAAAGTACAGTGGAAGTACGATCACAGTGTTT
GGACGAAACTCTGTGCTTGATAAAGTGAGGGAGATGCCAGTGATCGGAGGCAGTGGACTT
TTTCGATTTGCTAGAGGTTATGTTCAGGCAAGAACACATGTATTTGATATCAAGACAGGG
AACGCTGTTGTCGAGTATAATTGTTATGTTTTGCACTACTAATTATATTATTGTGGTTTA
TTATATGTATTTTTCCTGAAACTATTACACTCTATGGCAGTTTTCT

QA 5 590 5 590
DS 



AS 1 2

CO CL3808Contig1 1309 2 4 U
GGCAAGCCATCATCCCGATAACTTCATCTCTCTATCATCTGAGGTGGTCTAGATGATGGA
GTTGGGTTCTCTCTTCCCCACCCTCTATCTCCCTGATCTCTTACTTTTCATAGCGCCGCT
CTGGATCGCTGTCCTTGTCGGGGTTTTGGTGGGTTGGCTCTGGAGACCAAGCTGGGCCAG
ACAAGACAAACTCTTCACCTTCTTCAACAACAACAACACCAACGACCTTAATCTCCCCGC
TACTACCACCGTCGAATCTCGCCAGCTACATAAAGAGAAATCGGGGTTTGTGACGGGCGA
TGATTTCAGGCATTTATGGAACTTGGTCGAGGTCAAAGACGCCGGTCCTTCATGGATTCA
GATGATGGACCGGTCTACTCCTACCTTCTCTTACCAAGCTTGGAGACGCGATCCTCGCGA
CGGTCCCCCTCAGTACCGTAGCAGAACCGTGTTCGAAGACGCCACTCCTGAGATGGTGAG
GGACTTCTTCTGGGATGATGACTTCCGTTCCGAATGGGACGATATGCTCTTGTTTTCTTC
TACGCTCGAGTCTTGTAAAGACACTGGCACTATGGTTGTTCAGTGGGTCCGCAAGTTCCC
TTTCTTTTGTAGCGACAGGGAGTATATCATTGGCAGGAGAATATGGGACGCTGGTCGAGT
CTTTTACTGCGTTACAAAGGGAGTACCATACCCGTCTGTACCACGACAGAGCAAGCCACG
GCGTGTTGACTTGTACTATTCAAGCTGGTGCATCCGTGCAGTTGAATCGGAAAGAGGGGA
TGGTGAGATGACATCTTGCGAGGTTCTACTTTTTCACCACGAGGATATGGGAATACCGTG
GGAGATAGCAAAGCTCGGGGTGAGACAGGGGATGTGGGGTGCGGTGAAGAAGATAGAGCC
AGGGCTACGTGCATATCAGAGGGCTAGAGCAGCAGGAGCAGGTTTATCACCGAGCGCATT
GATGGCTCAGATCAACACCAAAGTGAGTGCGGAGGAGTTTATGAACGAGAGGGATTCGAC
GGGAGAGGTTGGAGGAGATGAGAAGCCGTCGTCTGGGAAAAGCATACCGAAGATACTAGT
GGTGGGAGGGGCGATTGCGCTTGCGTGTACGCTGGACAAAGGGCTGTTGATGAAGGCGGT
GATATTCGGAGTGGCGAGGAGGTTTGCAAGAATGGGGAAGAGGATGTAGGAGGGATGAAT
GTGTACATTGTGTGAGATGGTCACTCTCCTTTTGCAATTCCAAATAGAGAAAGAAAGAAA
GAATGTTTCATTAGTCTTGGTGAATGTATCAATCATGTAAAAGCAAAGA


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AF RS1AN07TF U 1
AF RS1AN07JQ C 513
BS 1 772 RS1AN07TF
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GTTGGGTTCTCTCTTCCCCACCCTCTATCTCCCTGATCTCTTACTTTTCATAGCGCCGCT
CTGGATCGCTGTCCTTGTCGGGGTTTTGGTGGGTTGGCTCTGGAGACCAAGCTGGGCCAG
ACAAGACAAACTCTTCACCTTCTTCAACAACAACAACACCAACGACCTTAATCTCCCCGC
TACTACCACCGTCGAATCTCGCCAGCTACATAAAGAGAAATCGGGGTTTGTGACGGGCGA
TGATTTCAGGCATTTATGGAACTTGGTCGAGGTCAAAGACGCCGGTCCTTCATGGATTCA
GATGATGGACCGGTCTACTCCTACCTTCTCTTACCAAGCTTGGAGACGCGATCCTCGCGA
CGGTCCCCCTCAGTACCGTAGCAGAACCGTGTTCGAAGACGCCACTCCTGAGATGGTGAG
GGACTTCTTCTGGGATGATGACTTCCGTTCCGAATGGGACGATATGCTCTTGTTTTCTTC
TACGCTCGAGTCTTGTAAAGACACTGGCACTATGGTTGTTCAGTGGGTCCGCAAGTTCCC
TTTCTTTTGTAGCGACAGGGAGTATATCATTGGCAGGAGAATATGGGACGCTGGTCGAGT
CTTTTACTGCGTTACAAAGGGAGTACCATACCCGTCTGTACCACGACAGAGCAAGCCACG
GCGTGTTGACTTGTACTATTCAAGCTGGTGCATCCGTGCAGTTGAATCGGAA*GAGGGGA
TGGTGAGATGACATCTTGCGAGGTTCTACTTTT
CACACGAGATAT

QA 1 813 1 813
DS 

RD RS1AN07JQ 797 0 0
AATGGGACGATATGCTCTTGTTTTCTTCTACGCTCGAGTCTTGTAAAGACACTGGCACTA
TGGTTGTTCAGTGGGTCCGCAAGTTCCCTTTCTTTTGTAGCGACAGGGAGTATATCATTG
GCAGGAGAATATGGGACGCTGGTCGAGTCTTTTACTGCGTTACAAAGGGAGTACCATACC
CGTCTGTACCACGACAGAGCAAGCCACGGCGTGTTGACTTGTACTATTCAAGCTGGTGCA
TCCGTGCAGTTGAATCGGAAAGAGGGGATGGTGAGATGACATCTTGCGAGGTTCTACTTT
TTCACCACGAGGATATGGGAATACCGTGGGAGATAGCAAAGCTCGGGGTGAGACAGGGGA
TGTGGGGTGCGGTGAAGAAGATAGAGCCAGGGCTACGTGCATATCAGAGGGCTAGAGCAG
CAGGAGCAGGTTTATCACCGAGCGCATTGATGGCTCAGATCAACACCAAAGTGAGTGCGG
AGGAGTTTATGAACGAGAGGGATTCGACGGGAGAGGTTGGAGGAGATGAGAAGCCGTCGT
CTGGGAAAAGCATACCGAAGATACTAGTGGTGGGAGGGGCGATTGCGCTTGCGTGTACGC
TGGACAAAGGGCTGTTGATGAAGGCGGTGATATTCGGAGTGGCGAGGAGGTTTGCAAGAA
TGGGGAAGAGGATGTAGGAGGGATGAATGTGTACATTGTGTGAGATGGTCACTCTCCTTT
TGCAATTCCAAATAGAGAAAGAAAGAAAGAATGTTTCATTAGTCTTGGTGAATGTATCAA
TCATGTAAAAGCAAAGA

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 3

CO CL3809Contig1 1015 3 15 U
GGGAACTAAACTTAGTTACTAATTATATAGATTAATAATCTATGAGATCTTCTTTCCTTT
GGTAGAAAGCAAAAGCAATGAATAATCTGCCAGAGGACTGCATCGCTAAGATCCTTTCCT
TGACTACGCCTCGAGACGTTTGCCGATCATCGGCTGTCTCCAGGTGTTTCAGATCCGCCG
CTGACACCGACCATGTCTGGAATCACTTCTTACCTTCCGAGTTCCCCGAGGGTTTTAGGG
CACCTGAGGGTCTTCCCACCAAGAAACACCTCTTCTTCTCCCTCGTCCATAACCCTCTCC
TTCTCCACGGTTCCCAATTGAGCTTTTCGCTGGAGAGAAGTACTGGTAACAAGTGCTACA
TGATGGCTGCTAGGGCCTTGAATATTACTTGGGGACATGATCAAAGATACTGGCAGTGGA
TCTCTCTTCCTGATGCCAGGTTCAAAGAAGTGGCTGCGCTTAAAATGGTATGGTGGCTTG
ACATCACTGGAAAAATCAACATAAACCTTCTCTCTGATGACACCCTCTACGCCGCTTACC
TTGTCTTTAAGTGGAACCTTGATCCCTACGGTTTTCGCCAGCCCGTATAGGCATCCCTTG
TTTTGGCTGGCACCGAGCATGATGATGTCCAGCCTTCCATGGTCAGTCTCATGCAGAATC
CGGGAAGCGAACAACGTCAGCGCGCTGAGCTGAGAAGTGACGACTGGTACGAGGTAGAGT
TGGGACAGTTCTTCAAAAGGAGAGGAGATATGGGTGAAATAGAGATGAGCCTCAAGGAGA
CAAAGAGGCCTTTTGAGAAGAAAGGTCTTATCGTCCATGGAATTGAGATTAGACCAGTAC
TGCCCTAATTATATCCTACTGCTAATAACACCTTTTGCTTTTCGCAATTGTTGTTCTCAG
TGTTGTGTTATCTTCTTCTCTTCTTATTTTCCCCTGCTTCTTTGTTTTTTTTTTTCTATA
TTGATGCAGAAAACAATTGTATTTCAGTTTGATGGTTGCTTTGTTATTCAGAATA


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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BG57TF U 1
AF RS1E446TF U 60
AF RS1E446JQ C 274
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RD RS1BG57TF 737 0 0
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TGGGACAGTTCTTCAAA

QA 1 737 1 737
DS 

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G
GGTAGAAAGCAAAAGCAATGAATAATCTGCCAGAGGACTGCATCGCTAAGATCCTTTCCT
TGACTACGCCTCGAGACGTTTGCCGATCATCGGCTGTCTCCAGGTGTTTCAGATCCGCCG
CTGACACCGACCATGTCTGGAATCACTTCTTACCTTCCGAGTTCCCCGAGGGTTTTAGGG
CACCTGAGGGTCTTCCCACCAAGAAACACCTCTTCTTCTCCCTCGTCCATAACCCTCTCC
TTCTCCACGGTTCCCAATTGAGCTTTTCGCTGGAGAGAAGTACTGGTAACAAGTGCTACA
TGATGGCTGCTAGGGCCTTGAATATTACTTGGGGACATGATCAAAGATACTGGCAGTGGA
TCTCTCTTCCTGATGCCAGGTTCAAAGAAGTGGCTGCGCTTAAAATGGTATGGTGGCTTG
ACATCACTGGAAAAATCAACATAAACCTTCTCTCTGATGACACCCTCTACGCCGCTTACC
TTGTCTTTAAGTGGAACCTTGATCCCTACGGTTTTCGCCAGCCCGTATAGGCATCCCTTG
TTTTGGCTGGCACCGAGCATGATGATGTCCAGCCTTCCATGGTCAGTCTCATGCAGAATC
CGGGAAGCGAACAACGTCAGCGCGCTGAGCTGAGAAGTGACGACTGGTACGAG*TAGAGT
TGGGACAGTTCTTCAAAAG*AGAGGAGATATGGGTGAAATAGAGATGAGCCTCA
GAGA

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DS 

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GACATGATCAAAGATACTGGCAGTGGATCTCTCTTCCTGATGCCAGGTTCAAAGAAGTGG
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CTGATGACACCCTTTACGCCGCTTACCTTGTCTTTAAGTGGAACCTTGATCCCTACGGTT
TTCGCCAGCCCGTATAGGCATCCCTTGTTTTGGCTGGCACCGAGCATGATGATGTCCAGC
CTTCCATGGTCAGTTTCATGCAGAATCCGGGAAGCGAACAAGGTCAGCGCGCTGAGCTGA
GAAGTGACGACTGGTACGAGGTAGAGTTGGGACAGTTCTTCAAAAGGAGAGGAGATATGG
GTGAAATAGAGATGAGCCTCAAGGAGACAAAGAGGCCTTTTGAGAAGAAAGGTCTTATCG
TCCATGGAATTGAGATTAGACCAGTACTGCCCTAATTATATCCTACTGCTAATAACACCT
TTTGCTTTTCGCAATTGTTGTTCTCAGTGTTGTGTTATCTTCTTCTCTTCTTATTTTCCC
CTGCTTCTTTGTTTTTTTTTTTCTATATTGATGCAGAAAACAATTGTATTTCAGTTTGAT
GGTTGCTTTGTTATTCAGAATA

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 3

CO CL3810Contig1 831 3 25 U
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AAGAATCAATCTTCATTACACATACATTCTTTACATCTTGGATAACGGTAAACACTGCGT
CCCGTTGGTCTAACCAACACATGTTTGGTTTGCCTAACGTTCTTTCTCACTCTCTGCTCA
AACACTTTCCACTCTATAGTATTGTTCTTCAACAATATGTCCGAGAATCTCCTTTTGTTC
GGTCTGATTGTCGGCATCTTCCCAGCTCCGTAATAAATCCTGTAACCGGAAACCAGAGAC
GACAGCTGGCTCCCTGAATCCGTCATTGCAAATGCGTCCGACGCAGCGCAACCAATGAAA
TCAAGAACCGCAAGCTGAGAAGAGTGGTTCTTGAAAGGCTCTAGCTCTGTTTCAGAGAGT
ACATTCTCTTTAGTAACAAGGTTCGGGTAAAGACTCGTTAAAGCTGCTAAACGTTTCGTC
CCACCGTATATATTCGCACCAGCCACGAACACACGGGTCTTGCGGTTGAAACCGAGACCC
GCAAGCATAAGAACAGCTTCTTCAGGTGATAACGGACAAAGCCCTTCCGTCCTCAAATCT
TCAGGAGATGGCATTTTCTTGGTCTTTGTAAGATTAGCAAGCGTTGGGAAATGCTTTTCT
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GCCACCATATCGATTTCGAACCGGAGATGGACTGCTAGATACTTTGAAGCCTTGTGGAGA
GGACCAGCCTTCTTGTCCAATATGAATGATGCGTATTTTGGACCGACCAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1AM77JQ U 1
AF RS1A654JQ U 54
AF RS1FU71TF C 157
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RD RS1AM77JQ 831 0 0
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CCACCGTATATATTCGCACCAGCCACGAACACACGGGTCTTGCGGTTGAAACCGAGACCC
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TCAGGAGATGGCATTTTCTTGGTCTTTGTAAGATTAGCAAGCGTTGGGAAATGCTTTTCT
CGGTAAGCTGATAGCTCCGTCTTTTCAGCGTCGCCTCCACCGAAGTAACAAAGAGAATGA
GCCACCATATCGATTTCGAACCGGAGATGGACTGCTAGATACTTTGAAGCCTTGTGGAGA
GGACCAGCCTTCTTGTCCAATATGAATGATGCGTATTTTGGACCGACCAGA

QA 1 831 1 831
DS 

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CTGCTCAAACACTTTCCACTCTATAGTATTGTTCTTCAACAATATGTCCGAGAATCTCCT
TTTGTTCGGTCTGATTGTCGGCATCTTCCCAGCTCCGTAATAAATCCTGTAACCGGAAAC
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AATGAAATCAAGAACCGCAAGCTGAGAAGAGTGGTTCTTGAAAGGCTCTAGCTCTGTTTC
AAAGAGTACATTCTCTTTAGTAACAAGGTTCGGGTAAAGACTCGTTAAAGCTGCTAAACG
TTTCGTCCCACCGTATATATTCGCACCAGCCACGAACACACGGGTCTTGCGGTTGAAACC
GAGACCCGCAAGCATAAGAACAGCTTCTTCAGGTGATAACGGACAAAGCCCTTCCGTCCT
CAAATCTTCAGGAGATGGCATTTTCTTGGTCTTTGTAAGATTAGCAAGCGTTGGGAAATG
CTTTTCTCGGTAAGCTGATAGCTCCGTCTTTTCAGCGTCGCCTCCACCGAAGTAACAAAG
AGAATGAGCCACCATATCGATTTCGAACCGGAGATGGACTGCTAGATACTTTGAAGCCTT
GTGGAGAGGACCAGCCTTCTTGTCCAATATGAATGATGCGTATTTTGGACCGACCAGA

QA 1 778 1 778
DS 

RD RS1FU71TF 644 0 0
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ATGTCCGAGAATCTCCTTTTGTTCGGTCTGATTGTCGGCATCTTCCCAGCTCCGTAATAA
ATCCTGTAACCGGAAACCAGAGACGACAGCTGGCTCCCTGAATCCGTCATTGCAAATGCG
TCCGACGCAGCGCAACCAATGAAATCAAGAACCGCAAGCTGAGAAGAGTGGTTCTTGAAA
GGCTCTAGCTCTGTTTCAGAGAGTACATTCTCTTTAGTAACAAGGTTAGGG*AAAGACTC
GTTAAAGCTGCTAAACGTTTCGTCCCACCGTATATATTCGCAC**GCCACGAACACACGG
GTCTTGCGGTTGAAACCGAGACCCGCAAGCATAAGAACAGCTTCTTCAGGTGATAACGGA
CAAAGCCCTTCCGTCCTCAAATCTTCAGGAGATGGCATTTTCTTGGTCTTTGTAAGATTA
GCAAGCGTTGGGAAATGCTTTTCTCGGTAAGCTGATAGCTCCGTCTTTTCAGCGTCGCCT
CCACCGAAGTAACAAAGAGAATGAGCCACCATATCGATTTCGAACCGGAGATGGACTGCT
AGATACTTTGAAGCCTTGTGGAGAGGACCAGCCTTCTTGTCCA
C

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 3

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AGAGGACTCTCGATCATCGCGACTCACCGTCCTCTGCCTATTCTCCGCCGTTTACTCCCA
GTCCGTCGGTTTCGCCGCCGATTTCATGCCGTTCGAGACAGAGTGCACTGGCTCCATCGC
CGAGTGCTCGACGGCGACGGGGTCAGAGTTCGAGATGGACTCTGAGATAAACAGGCGCAT
CTTAGCGACGACGAGGTACATAAGCTACGGTGCGCTTAGGAGAAACACAGTTCCATGCTC
GCGCCGCGGCGCGTCTTACTACAATTGCCGACGTGGAGCTCAGGCCAACCCTTACTCTCG
TGGCTGTAGCGCCATCACTCGTTGCAGGCGATGATCTCTATCTCTCTGTATCTCAAATTC
TTTTGTTTTAAATTATATACAATTTTTCAGATCTTTCTTTTTTTTGTTTGTTGTTTCCTG
GTGGTCACTTATGTTTATAATTCCATTGCAATACAATTTCGTAAACTCAAGCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BF69TF U 130
AF RS1DT21JQ C 1
AF RS1DT21TF U 1
BS 1 129 RS1DT21TF
BS 130 273 RS1BF69TF
BS 274 533 RS1DT21TF

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QA 1 533 1 533
DS 

RD RS1DT21TF 533 0 0
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AGAGGACTCTCGATCATCGCGACTCACCGTCCTCTGCCTATTCTCCGCCGTTTACTCCCA
GTCCGTCGGTTTCGCCGCCGATTTCATGCCGTTCGAGACAGAGTGCACTGGCTCCATCGC
CGAGTGCTCGACGGCGACGGGGTCAGAGTTCGAGATGGACTCTGAGATAAACAGGCGCAT
CTTAGCGACGACGAGGTACATAAGCTACGGTGCGCTTAGGAGAAACACAGTTCCATGCTC
GCGCCGCGGCGCGTCTTACTACAATTGCCGACGTGGAGCTCAGGCCAACCCTTACTCTCG
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TTTTGTTTTAAATTATATACAATTTTTCAGATCTTTCTTTTTTTTGTTTGTTGTTTCCTG
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QA 1 533 1 533
DS 



AS 1 2

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CCGATATATCTCCCGAGTTCCAGATTCCTGGTCCCGAAGGCATTACGAAGATGAGAGCTG
CTTGCGAGCTCGCTGCTCGGGTTCTAACCTTTGCAGGAACTTTGGTTAAACCATCTGTGA
CGACTAATGAGATAGACAAAGCGGTGCACGATATGATCGTCGAAGCTGGTGCTTATCCTT
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CGGTTACTTGGATGGTTACATGGAGATACATCAAGAACTTTCTTCTGTGGAGAGTAAATG
AAGTTTAAACGACTTGTACAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1DG41TF U 1
AF RS1AS35TF U 44
BS 1 352 RS1DG41TF
BS 353 353 RS1AS35TF
BS 354 612 RS1DG41TF
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RD RS1DG41TF 798 0 0
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AGCTGGAGAAAACTTCAAAAGTTAGGAGAAACCCACCGTTACGACGTGGAAGGGTATCAC
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GCCACGGGATACCGGATTCTCGTCAGCTACAGAATGGAGATATAATAAACATCGATGTCA
CGGTTACTTGGATGGTTACATGGAGATACATCAAGAACTTTTTTCTGTGGAGAGTAAATG
AAG
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QA 1 783 1 783
DS 

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TCTGGCGTGTTACCCGATATATCTCCCGAGTTCCAGATTCCTGGTCCCGAAGGCATTACG
AAGATGAGAGCTGCTTGCGAGCTCGCTGCTCGGGTTCTAACCTTTGCAGGAACTTTGGTT
AAACCATCTGTGACGACTAATGAGATAGACAAAGCGGTGCACGATATGATCGTCGAAGCT
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AACATCGATGTTACGTTTACTTGGATGGTTACATGGAGATACATCAA*AACTTTCTTCTG
TGGAGAGTAA*TGAAGTTTAAACGACTTGTACAGA

QA 5 759 5 759
DS 



AS 1 3

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CTTCTCTCTTTCTCGATTCTCCCGCCTCCGTCTCCTCACGCAGAAATATCCCAATCGCCG
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AATGGTCATGGAGAGGAATCAAATCATTTGCAATGGGGGAGCTGGAAGCTAGGAAGCTCA
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TTACTTCCAAGTTCTTGAGGGCTCATAAGATAACGCTTTACAAAGTCCGTGAAGAAACAG
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AAGATACACAAAGAGCTCTTGACTCTGCTGTCAATCAGAATCTCAAAGCAGGTGGTATTG
GGGAAATAATGCCAGCCCATATATTGCTGGGAATCTGGTATGAAGTTGAATCTCCTGGTC
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TATGCCATCTTAATTTTCATACG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D407TF U 1
AF RS1H162TF U 1
AF RS1D407JQ C 163
BS 1 156 RS1D407TF
BS 157 157 RS1H162TF
BS 158 570 RS1D407TF
BS 571 577 RS1H162TF
BS 578 578 RS1D407JQ
BS 579 766 RS1H162TF
BS 767 803 RS1D407JQ

RD RS1D407TF 570 0 0
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TGGCGAACTTAAAGATCGATTCTTTCTACAACCAGAAACTATCTTCTCCATCACACTTCT
TCTCCACAAAAAATCCATTAAAATCCCTGAACCTGATGAATCCATGGATGGGCGGTGATT
CTTCTCTCTTTCTCGATTCTCCCGCCTCCGTCTCCTCACGCAGAAATATCCCAATCGCCG
TCGTTTCCAGCTTACCCACCGCGAATCCAGAATCTGCGGTTTCTGATGCGAAAAAGCCAA
AATGGTCATGGAGAGGAATCAAATCATTTGCAATGGGGGAGCTGGAAGCTAGGAAGCTCA
AGTATCCCAACACTGGTACTGAATCACTTCTCATGGGTATCTTGGTTGAAGGGACTAGTT
TTACTTCCAAGTTCTTGAGGGCTCATAAGATAACGCTTTACAAAGTCCGTGAAGAAACAG
TCAAGTTACTAGGTAAAGCTGATTTGTATTCCTTCAGCCCTGAACATCCTCCTTTAACCC
AAGATACACAAAGAGCTCTTGACTCTGCTG

QA 1 570 1 570
DS 

RD RS1H162TF 766 0 0
GGAAGCACCACTTTCTCAGTCCTTTCTCCGCGACAGAAATGGCTGCTCAATCTTTTACTT
TGGCGAACTTAAAGATCGATTCTTTCTACAACCAGAAACTATCTTCTCCATCACACTTCT
TCTCCACAAAAAATCCATTAAAATCCCTGAACCTGACGAATCCATGGATGGGCGGTGATT
CTTCTCTCTTTCTCGATTCTCCCGCCTCCGTCTCCTCACGCAGAAATGTCCCAATCGCCG
TCGTTTCCAGCTTACCCACCGCGAATCCAGAATCTGCGGTTTCTGATGCGAAAAAGCCAA
AATGGTCATGGAGAGGAATCAAATCATTTGCAATGGGGGAGCTGGAAGCTAGGAAGCTCA
AGTATCCCAACACTGGTACTGAATCACTTCTCATGGGTATCTTGGTTGAAGGGACTAGTT
TTACTTCCAAGTTCTTGAGGGCTCATAAGATAACGCTTTACAAAGTCCGTGAAGAAACAG
TCAAGTTACTAGGTAAAGCTGATTTGTATTCCTTCAGCCCTGAACATCCTCCTTTAACCC
AAGATGCACAAAGAGCTCTTGACTCTGCTGTCAATCATAATCTCAAAGCAGGTGGTATTG
GGGAAATAATGCCAGCCCATATATTGCTGGGAATCTGGTATGAAGTTGAATCTCCTGGTC
ACAAGATACTGGCAACTCTTGGTTTCACTGATGAAAAAGCTAAAGAGTTAGAGTCCTTTG
CCTCTGAATCTGGATTTCTTGATGAATAGTGTGTCTTTGTTACATT

QA 1 766 1 766
DS 

RD RS1D407JQ 641 0 0
CATGGATGGGCGGTGATTCTTCTCTCTTTCTCGATTCTCCCGCCTCCGTCTCCTCACGCA
GAAATATCCCAATCGCCGTCGTTTCCAGCTTACCCACCGCGAATCCAGAATCTGCGGTTT
CTGATGCGAAAAAGCCAAAATGGTCATGGAGAGGAATCAAATCATTTGCAATGGGGGAGC
TGGAAGCTAGGAAGCTCAAGTATCCCAACACTGGTACTGAATCACTTCTCATGGGTATCT
TGGTTGAAGGGACTAGTTTTACTTCCAAGTTCTTGAGGGCTCATAAGATAACGCTTTACA
AAGTCCGTGAAGAAACAGTCAAGTTACTAGGTAAAGCTGATTTGTATTCCTTCAGCCCTG
AACATCCTCCTTTAACCCAAGATACACAAAGAGCTCTTGACTCTGCTGTCAATCAGAATC
TCAAAGCAGGTGGTATTGGGGAAATAATGCCAGCCCATATATTGCTGGGAATCTGGTATG
AAGTTGAATCTCCTGGTCACAAGATACTGGCAACTCTTGGTTTCACTGATGAAAAAGCTA
AAGAGTTAGAGTCCTTTGCCTCTGAATCTGGATTTCTTGATGAATAGTGTGTCTTTGTTA
CATTTATCGTCCTCCATTTATGCCATCTTAATTTTCATACG

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 3

CO CL3814Contig1 790 3 2 U
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TGCTGAAGGTAATGTGGTTGCTAGGAATGATAACTCAGGTGTCACTTTGGAAGGACCCAA
GGATCTTCCTCCACAGCTAGACTTAAACGGACGTGAAAGAGGTTCAGGGAGCGCAAACAG
TGTGGGTTCGAGCACTACAAAACCGAAATCTCCATGGATGCCTTTCCCTACTCTATTTGC
AGCGATCTCACATAAGATTGCAGAGAAAGACATGTCTTTCATTAATGCTGACTACCAACA
ACTAAGGGAAAAGAAGATAACGCGAGGAGAGTTTGTGAGGAAGCTGCGAGGGATTGTAGG
AGATGATCTGCTTAGGTCCACCATAACAGCACTTCAAAACCAGTTGAAGAAGGAGATTCC
TGGAAGCCACGAGGAAGGTGCAGGTGAGGTGGGTTGTAAAAGTAATTTGGGAATGTGATA
ATGACGACGAATATCATAAGGAAGCTGCTTTATATCTATCTATCTACCCTGGCCTTTGTG
GTTCTCCTTTTGACTTTTATAATATAAAATCTTAAGAGTATATTAGTAGTAGACTTTTGG
GTCTGGGTCGGGGGGTAAGAGTTGTTGAATGTGCCGACTATTCTGTCGTGGAAAAAATCC
TTTTTAAAAGTCTGTTGATGACGTTGGGTCTTTTGCTTTTATTAGCTGCAAAACGTTGTT
GTGGAATTCGTTGAACCTTGACAAAAACTTGGTCCTTGAGTCTATCGTGAAACTTAACTA
CTTTTTGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H141TF U 1
AF RS1G783TF U 121
AF RS1G783JQ C 178
BS 1 655 RS1H141TF
BS 656 790 RS1G783JQ

RD RS1H141TF 655 0 0
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TGCTGAAGGTAATGTGGTTGCTAGGAATGATAACTCAGGTGTCACTTTGGAAGGACCCAA
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AGATGATCTGCTTAGGTCCACCATAACAGCACTTCAAAACCAGTTGAAGAAGGAGATTCC
TGGAAGCCACGAGGAAGGTGCAGGTGAGGTGGGTTGTAAAAGTAATTTGGGAATGTGATA
ATGACGACGAATATCATAAGGAAGCTGCTTTATATCTATCTATCTACCCTGGCCTTTGTG
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GTCTGGGTCGGGGGGTAAGAGTTGTTGAATGTGCCGACTATTCTGTCGTGGAAAA

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1G783TF 512 0 0
GGATCTTCCTCCACAGCTAGACTTAAACGGACGTGAAAGAGGTTCAGGGAGCGCAAACAG
TGTGGGTTCGAGCACTACAAAACCGAAATCTCCATGGATGCCTTTCCCTACTCTATTTGC
AGCGATCTCACATAAGATTGCAGAGAAAGACATGTCTTTCATTAATGCTGACTACCAACA
ACTAAGGGAAAAGAAGATAACGCGAGGAGAGTTTGTGAGGAAGCTGCGAGGGATTGTAGG
AGATGATCTGCTTAGGTCCACCATAACAGCACTTCAAAACCAGTTGAAGAAGGAGATTCC
TGGAAGCCACGAGGAAGGTGCAGGTGAGGTGGGTTGTAAAAGTAATTTGGGAATGTGATA
ATGACGACGAATATCATAAGGAAGCTGCTTTATATCTATCTATCTACCCTGGCCTTTGTG
GTTCTCCTTTTGACTTTTATAATATAAAATCTTAAGAGTATATTAGTAGTAGACTTTTGG
GTCTGGGTCGGGGGGTAAGAGTTGTTGAATGT

QA 1 512 1 512
DS 

RD RS1G783JQ 613 0 0
CAGTGTGGGTTCGAGCACTACAAAACCGAAATCTCCATGGATGCCTTTCCCTACTCTATT
TGCAGCGATCTCACATAAGATTGCAGAGAAAGACATGTCTTTCATTAATGCTGACTACCA
ACAACTAAGGGAAAAGAAGATAACGCGAGGAGAGTTTGTGAGGAAGCTGCGAGGGATTGT
AGGAGATGATCTGCTTAGGTCCACCATAACAGCACTTCAAAACCAGTTGAAGAAGGAGAT
TCCTGGAAGCCACGAGGAAGGTGCAGGTGAGGTGGGTTGTAAAAGTAATTTGGGAATGTG
ATAATGACGACGAATATCATAAGGAAGCTGCTTTATATCTATCTATCTACCCTGGCCTTT
GTGGTTCTCCTTTTGACTTTTATAATATAAAATCTTAAGAGTATATTAGTAGTAGACTTT
TGGGTCTGGGTCGGGGGGTAAGAGTTGTTGAATGTGCCGACTATTCTGTCGTGGAAAAAA
TCCTTTTTAAAAGTCTGTTGATGACGTTGGGTCTTTTGCTTTTATTAGCTGCAAAACGTT
GTTGTGGAATTCGTTGAACCTTGACAAAAACTTGGTCCTTGAGTCTATCGTGAAACTTAA
CTACTTTTTGGCC

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 3

CO CL3815Contig1 884 3 8 U
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CTTCCTGGATTCCTTGATTCTATCTTAGGAATCCGAGCTGGCGAGTCAAAGTCATTCTCG
CTTGTGTTTCCTGAATCATGGAAGCAAGAAAGTCTCCGTGGTCAGCGTGCTCAGTTCACT
GTGGACTGTAAGGAACTATTCTACAGAGATTTACCAACTTTAGATTATTCACTTGCTGAT
AAATTGCTACCTGGATGCACCACTTTGAAAGAGGTTGAAGAAACTCTGACTAAAAGATGC
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CGAAATATGGTTGAAGTAGAGATTCCTCAATCTTTATTTGAGGAACAAGGAAGACAGTTT
TATGGAGCTAGGCTTCTAGAGATTCAGGGAAACATGAAGCTCACAGAAGAACAATTGGCT
TCTCTTTCAAGTCAAAAATCAGTAAATGAGTTTCTAGAAACTCAAAGAGAGAGCATTACT
AACATTATCAAGCAGAATCTGGCTGTTGGAGATATCTTCAAGCGCGAAAACTTAGAGTTC
TCAACAGATGAACTAGTTAAAGAAGTGGAGAACTCGGTCACAGAATTCAAGAAACATAAA
CAAGAGTACGATGAGGAACGTGTGAAAGATCAGGTACAAGAGATTTTGGAAGGAGCAAAA
GTGCTGGAGTGGTTGAAAGAACGAGCTGAAATTCAATACATTACTACTAGTTGATTAGCA
CAGCTATTTTATGTATGATCGGCATGTTCTGTTTGTTTTTTCACGAGCATTTTTCTTTGG
AATCCTCCTAAATGAGAGAAACGGTTATAATTTGACTAGTTGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BY85JQ C 591
AF RS1BY85TF U 1
AF RS1AS12TF U 487
BS 1 531 RS1BY85TF
BS 532 532 RS1AS12TF
BS 533 693 RS1BY85TF
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BS 714 843 RS1BY85TF
BS 844 884 RS1AS12TF

RD RS1BY85JQ 130 0 0
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GAAACATAAACAAGAGTACGATGAGGAACGTGTGAAAGATCAGGTCCAAGAGATTTTGGA
AG
GAGCAAAA

QA 1 122 1 122
DS 

RD RS1BY85TF 843 0 0
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CTTGTGTTTCCTGAATCATGGAAGCAAGAAAGTCTCCGTGGTCAGCGTGCTCAGTTCACT
GTGGACTGTAAGGAACTATTCTACAGAGATTTACCAACTTTAGATTATTCACTTGCTGAT
AAATTGCTACCTGGATGCACCACTTTGAAAGAGGTTGAAGAAACTCTGACTAAAAGATGC
CAAGAGATGGAGGAGGAAGCCAAGGAGCAAGCAACAGACAACGCCATCCTTGAACAAATA
CGAAATATGGTTGAAGTAGAGATTCCTCAATCTTTATTTGAGGAACAAGGAAGACAGTTT
TATGGAGCTAGGCTTCTAGAGATTCAGGGAAACATGAAGCTCACAGAAGAACAATTGGCT
TCTCTTTCAAGTCAAAAATCAGTAAATGAGTTTCTAGAAACTCAAAGAGAGGGCATTACT
AACATTATCAAGCAGAATCTGGCTGTTGGAGATATCTTCAAGCGCGAAAACTTAGAGTTC
TCAACAGATGAACTAGTTAAAGAAGTGGAGAACTCGGTCACAGAATTCAAGAAACATAAA
CAAGAGTACGATGAGGAACGTGTGAAAGATCAG*TACAAGAGATTTTGGAAG*AGCAAAA
GTGCTGGAGTGGTTGAAAGAACGAGCTGAAATTCAATACATTACTACTAGTTGATTAGCA
CAGCTATTTTATGTATGATCGGCATGTTCTGTTTGTTTTTTCACGAGCATTTTTCTTTGG
AAT

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DS 

RD RS1AS12TF 398 0 0
GG
AAGTCAAAAATCAGTAAATGAGTTTCTAGAAACTCAAAGAGAGAGCATTACTAACATTAT
CAAGCAGAATCTGGCTGTTGGAGATATCTTCAAGCGCGAAAACTTAGAGTTCTCAACAGA
TGAACTAGTTAAAGAAGTGGAGAACTCGGTCACAGAATTCAAGAAACATAAACAAGAGTA
CGATGAGGAACGTGTGAAAGATCAGGTACAAGAGATTTTGGAAGGAGCAAAAGTGCTGGA
GTGGTTGAAAGAACGAGCTGAAATTCAATACATTACTACTAGTTGATTAGCACAGCTATT
TTATGTATGATCGGCATGTTCTGTTTGTTTTTTCACGAGCATTTTTCTTTGGAATCCTCC
TAAATGAGAGAAACGGTTATAATTTGACTAGTTGAA

QA 3 398 3 398
DS 



AS 1 3

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TTCTCTCAACTCTTAGGCTCCCCTATCATTCAATGTCTTCATCTTAATCTAGCCAATAAA
TGTTATTCTCATTTAACCCAAAAATTCTGCCGACCTCTCTATTTCCATCATGCCAAACCT
ATAAATTGGAGAAAGTTGAGAGTTGGAGAAGACAAACCTCTGGTGAATACTTTCTCATAG
GATTCTCCGCTATCATTCGCCGAATCCGAGGCGAAGAAAAGTGGAATGGAGATAGCAGGG
CCCGTTGTAGCATGTGTGGCCTATCTAGCCTTCAATATACAGTGAATGTTGTAAAGGACC
TTGAACTCTTCGCTCATCATGCTGGACGCAAAATTGTGAATATGGACGATGTTATTCTCT
CCGCGCACAGAAACGATAATTTAGCTTCGTCTTTGAGGTCATTGGACAATGAGCCACAGG
CAAAGGAGCCACAACCTGAGAGGAAACGCAAGAAAGTGTCAACCAAGAAAGATGACAAAG
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TCTATGCATTCTTTTTTTGCTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FH37TF U 1
AF RS1BO17TF U 44
AF RS1FH37JQ C 1
BS 1 45 RS1FH37TF
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BS 475 475 RS1FH37TF
BS 476 569 RS1BO17TF
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BS 680 698 RS1BO17TF
BS 699 742 RS1FH37JQ

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TTCTCTCAACTCTTAGGCTCCCCTATCATTCAATGTCTTCATCTTAATCTAGCCAATAAA
TGTTATTCTCATTTAACCCAAAAATTCTGCCGACCTCTCTATTTCCATCATGCCAAACCT
ATAAATTGGAGAAAGTTGAGAGTTGGAGAAGACAAACCTCTGGTGAATACTTTCTCATAG
GATTCTCCGCTATCATTCGCCGAATCCGAGGCGAAGAAAAGTGGAATGGAGATAGCAGGG
CCCGTTGTAGCATGTGTGGCCTATCTAGCCTTCAATATACAGTGAATGTTGTAAAGGACC
TTGAACTCTTCGCTCATCATGCTGGACGCAAAATTGTGAATATGGACGATGTTATTCTCT
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CAAGTAGTAGCAATGCTATTCGCACCAACCGATCTCTAAATCTTCAGCTTCATTGCATAC
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QA 1 652 1 652
DS 

RD RS1BO17TF 655 0 0
GG
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AATCTAGCCAATAAATGTTATTCTCATTTAACCCAAAAATTCTGCCGACCTCTCTATTTC
CATCATGCCAAACCTATAAATTGGAGAAAGTTGAGAGTTGGAGAAGACAAACCTCTGGTG
AATACTTTCTCATAGGATTCTCCGCTATCATTCGCCGAAGCCGAGGCGAAGAAAAGTGGA
ATGGAGATAGCAGGGCCCGTTGTAGCATGTGTGGCCTATCTAGCCTTCAATATACAGTGA
ATGTTGTAAAGGACCTTGAACTCTTCGCTCATCATGCTGGACGCAAAATTGTGAATATGG
ACGATGTTATTCTCTCCGCGCACAGAAACGATAATTTAGCTTCGTCTTTGAGGTCATTGG
ACAATGAGCTACAGGCAAAGGAGCCACAACCTGAGAGGAAACGCAAGAAAGTGTCAACCA
AGAAAGATGACAAAGCAAGTAGTAGCAATGCTATTCGCACCAACTGATCTCTAAATCTTC
AGCTTCATTGCATACGTTCAAAAAGTTCTTAAATATCCTGAAAGTCTTTCTGCAATTTTA
TACAAGAATTTTCATTAACTCTCTTACTCTAAA*TCTTAATATATATATTGTA

QA 3 655 3 655
DS 

RD RS1FH37JQ 742 0 0
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TTCTCTCAACTCTTAGGCTCCCCTATCATTCAATGTCTTCATCTTAATCTAGCCAATAAA
TGTTATTCTCATTTAACCCAAAAATTCTGCCGACCTCTCTATTTCCATCATGCCAAACCT
ATAAATTGGAGAAAGTTGAGAGTTGGAGAAGACAAACCTCTGGTGAATACTTTCTCATAG
GATTCTCCGCTATCATTCGCCGAATCCGAGGCGAAGAAAAGTGGAATGGAGATAGCAGGG
CCCGTTGTAGCATGTGTGGCCTATCTAGCCTTCAATATACAGTGAATGTTGTAAAGGACC
TTGAACTCTTCGCTCATCATGCTGGACGCAAAATTGTGAATATGGACGATGTTATTCTCT
CCGCGCACAGAAACGATAATTTAGCTTCGTCTTTGAGGTCATTGGACAATGAGCCACAGG
CAAAGGAGCCACAACCTGAGAGGAAACGCAAGAAAGTGTCAACCAAGAAAGATGACAAAG
CAAGTAGTAGCAATGCTATTCGCACCAACCGATCTCTAAATCTTCAGCTTCATTGCATAC
GTTCAAAAAGTTCTTAAATATCCTGAAAGTCTTTCTGCAATTTTATACAAGAATTTTCAT
TAACTCTCTTACTCTAAAATCTTAATATATATATTGTATTAGGCCACGTATTTTACAGAA
TCTATGCATTCTTTTTTTGCTC

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 3

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TTAAAAATGGCGTACGAGGAGAACTTTCAGAAAACTTCCGGACCCAAGTATGATTGTCTT
TTATTCGATATAGATGATACTCTTTACCCTTTCAGTTCTGGTCTCGCTACGCTTGTTAAA
AACAACATTCAAGAGTATATGACCCAGAAACTTGGTATTGAAGAAGATAAAGTCCAAGAA
CTTTGTCTTTCGCTTTACAAAATCTATGGAACTACTATGGCTGGTCTCAAGGCTGTGGGT
TATGACTTTGACTATGACGATTTCCATCGTTTTGTTCATGGGAGATTGCCATACACAACA
CTCAAGCCTGACCCTGTTCCGAGGAACATTATTCTCAGCTTGCCTATTCGCAAAGTGGTA
TTCACCAATGCAGACAAGGCTCATGCAGCCAAGATCATTGCTAGGCTAGGCCTAGAGGAC
TGCTTTGAAAGAATCATATCTTTCGAGACTCTCAACCCAAACACCAAAACTGAATCTCCT
GTTGCTGCTAGTAAAACCAGAGAGATCTTCGACATAAGCAGTTACATGGCAAATCCTGAC
CCAAGCGTTGAACTCCCAAAGACTCCGGTTGTTTGTAAACCATCTGAGGGAGCATTCGAA
CAGGTTTTCAAGATGACCAACATCAATCCTCACAAGACATTGTTCTTTGATGACAGCATC
CGTAACATTCAAACCGGGAAACGTGTGGGTCTCCACACTGTATGGGTTGGGACCTCACAC
AAAGCTGAAGGGGTGGATATTGCGTTGGAGCATATTCACAACATACGTGAAGCTTTTCCT
GAACTGTGGGATGCTGCTGACGACAAAGCCGAGGAGATTAGAGCCAGGCAGAAGGTTGCC
ATTGAAACCATAGCTTAAAACAAACATTTCATTTCAGCTGCTGATAGTAACACATTTTTT
ATCATCACTATACTCACTCTTTGAGGAGAAAAAAAATAATAAGTGTAATTTAAAGCAAGC
CTTTTATTGAGAGAAACATGGAATGTAATGAAACAAGTTGAGTTTTATTTTAATTTGATA
ATATAAAAAAAATGAATGCAAACATCTTTTTATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FM42TF U 1
AF RS1GE94TF U 44
AF RS1FM42JQ C 568
BS 1 354 RS1FM42TF
BS 355 355 RS1GE94TF
BS 356 677 RS1FM42TF
BS 678 678 RS1GE94TF
BS 679 728 RS1FM42TF
BS 729 731 RS1GE94TF
BS 732 752 RS1FM42TF
BS 753 785 RS1GE94TF
BS 786 1115 RS1FM42JQ

RD RS1FM42TF 752 0 0
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TTAAAAATGGCGTACGAGGAGAACTTTCAGAAAACTTCCGGACCCAAGTATGATTGTCTT
TTATTCGATATAGATGATACTCTTTACCCTTTCAGTTCTGGTCTCGCTACGCTTGTTAAA
AACAACATTCAAGAGTATATGACCCAGAAACTTGGTATTGAAGAAGATAAAGTCCAAGAA
CTTTGTCTTTCGCTTTACAAAATCTATGGAACTACTATGGCTGGTCTCAAGGCTGTGGGT
TATGACTTTGACTATGACGATTTCCATCGTTTTGTTCATGGGAGATTGCCATACGCAACA
CTCAAGCCTGACCCTGTTCCGAGGAACATTATTCTCAGCTTGCCTATTCGCAAAGTGGTA
TTCACCAATGCAGACAAGGCTCATGCAGCCAAGATCATTGCTAGGCTAGGCCTAGAGGAC
TGCTTTGAAAGAATCATATCTTTCGAGACTCTCAACCCAAACACCAAAACTGAATCTCCT
GTTGCTGCTAGTAAAACCAGAGAGATCTTCGACATAAGCAGTTACATGGCAAATCCTGAC
CCAAGCGTTGAACTCCCAAAGACTCCGGTTGTTTGTAAACCATCTGAGGGAGCATTCGAA
CAGGTTTTCAAGATGAC*AACATCAATCCTCACAAGACATTGTTCTTTGATGACAGCATC
CGTAACATC**AACCGGGAAACGTGTGGGTCT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RS1GE94TF 742 0 0
GG
CTATCAACTTGGTAATTAAAAATGGCGTACGAGGAGAACTTTCAGAAAACTTCCGGACCC
AAGTATGATTGTCTTTTATTCGATATAGATGATACTCTTTACCCTTTCAGTTCTGGTCTC
GCTACGCTTGTTAAAAACAACATTCAAGAGTATATGACCCAGAAACTTGGTATTGAAGAA
GATAAAGTCCAAGAACTTTGTCTTTCGCTTTACAAAATCT**GGAACTACTATGGCTGGT
CTCAAGGCTGTGGGTTATGACTTTGACTATGACGATTTCCATCGTTTTGTTCATGGGAGA
TTGCCATACACAACACTCAAGCCTGACCCTGTTCTGAGGAACATTATTCTCAGCTTGCCT
ATTCGCAAAGTGGTATTCACCAATGCAGACAAGGCTCATGCAGCCAAGATCATTGCTAGG
CTAGGCCTAGAGGACTGCTTTGAAAGAATCATATCTTTCGAGACTCTCAACCCAAACACC
AAAACTGAATCTCCTGTTGCTGCTAGTAAAACCAGAGAGATCTTCGACATAAGCAGTTAC
ATGGCAAATCCTGACCCAAGCGTTGAACTCCCAAAGACTCCGGTTGTTTGTAAACCATCT
GAAGGAGCATTCGAACAGGTTTTCAAGATGACCAACATCAATCCTCACAAGACATTGTTC
TTTGATGACAGCATCCGTAACATTCAAACCGGGAAACGTGTGGGTCTCCACACTGTATGG
GTTGGGACCTCACACAAAGC

QA 3 742 3 742
DS 

RD RS1FM42JQ 548 0 0
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GTTGTTTGTAAACCATCTGAGGGAGCATTCGAACAGGTTTTCAAGATGACCAACATCAAT
CCTCACAAGACATTGTTCTTTGATGACAGCATCCGTAACATTCAAACCGGGAAACGTGTG
GGTCTCCACACTGTATGGGTTGGGACCTCACACAAAGCTGAAGGGGTGGATATTGCGTTG
GAGCATATTCACAACATACGTGAAGCTTTTCCTGAACTGTGGGATGCTGCTGACGACAAA
GCCGAGGAGATTAGAGCCAGGCAGAAGGTTGCCATTGAAACCATAGCTTAAAACAAACAT
TTCATTTCAGCTGCTGATAGTAACACATTTTTTATCATCACTATACTCACTCTTTGAGGA
GAAAAAAAATAATAAGTGTAATTTAAAGCAAGCCTTTTATTGAGAGAAACATGGAATGTA
ATGAAACAAGTTGAGTTTTATTTTAATTTGATAATATAAAAAAAATGAATGCAAACATCT
TTTTATTC

QA 1 548 1 548
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGAAACTGACGGTACGGAAGAGAACCGGTGGAAGGTGAAGAGCAACGACGCCGGGGTGAG
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TCTGACTCGAAACATGATGACGCCACCACTCTTCCACTCACTCCCGCCTCGCAGGTTCAC
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AGCTCCACCTTCAAACGTGACCGAGGACCGTATGGTCACTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1ES13TF U 1
AF RS1DE49TF U 41
BS 1 268 RS1ES13TF
BS 269 269 RS1DE49TF
BS 270 738 RS1ES13TF
BS 739 762 RS1DE49TF

RD RS1ES13TF 741 0 0
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AATGGAGGACCGTGTGAGACTCATATGCAAACGAACCGTAGTGAGCACGAAACCGGTTGA
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TCTAGTATACTATTACCGGACTTCCAAGACTAGAGAACCGGGAGAAATCACCAAAAAACT
AAGGGAATCATTAGCATACACTCTCAATTGTTATCCTATTGTAACCGGGAGATTGGTTAA
GGAAACTGACGGTACGGAAGAGAACCGGTGGAAGGTGAAGAGCAACGACGCCGGGGTGAG
AATGGTGGAGGCGAGAGCTACCGGGACGGTTGAGGAATGGCGTAGGAGTGTGAATAGAGA
GGAAGAGCTTAAGCTTGTTCATTGGGAGGACATGTATCACCTTCCTTACTATTGGTCTAC
CTTTTATGTTCAGGTGACTGAGTTTGAGAGCGGTGGGTTAGCTATTGGGTTAAGTTGTAC
TCATCTGTTAGCTGATCCAGTTTGTGCAATGATGTTTATTAGAACATGGGCAGATTTAAC
TCTGACTCGAAACATGATGACGCCACCACTCTTCCACTCACTCCCGCCTCGCAGGTTCAC
CAGCCATAAGCTCTCTAACAACCAACTTCTTAGCCATTACATCAGATCTTTCTCCCTAAC
AGCTCCACCTTCAAACGT
GAC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1DE49TF 722 0 0
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GTGAGCACGAAACCGGTTGAACAAGGGCGATTGTACCGGTTCTCAGTATTCGACCACGTC
ATGGAACCTAATCACATCCGTCTAGTATACTATTACCGGACTTCCAAGACTAGAGAACCG
GGAGAAATCACCAAAAAACTAAGGGAATCATTAGCATACACTCTCAATCGTTATCCTATT
GTAACCGGGAGATTGGTTAAGGAAACTGACGGTACGGAAGAGAACCGGTGGAAGGTGAAG
AGCAACGACGCCGGGGTGAGAATGGTGGAGGCGAGAGCTACCGGGACGGTTGAGGAATGG
CGTAGGAGTGTGAATAGAGAGGAAGAGCTTAAGCTTGTTCATTGGGAGGACATGTATCAC
CTTCCTTACTATTGGTCTACCTTTTATGTTCAGGTGACTGAGTTTGAGAGCGGTGGGTTA
GCTATTGGGTTAAGTTGTACTCATCTGTTAGCTGATCCAGTTTGTGCAATGATGTTTATT
AGAACATGGGCAGATTTAACTCTGACTCGAAACATGATGACGCCACCACTCTTCCACTCA
CTCCCGCCTCGCAGGTTCACCAGCCATAAGCTCTCTAACAACCAACTTCTTAGCCATTAC
ATCAGATCTTTCTCCCTAACAGCTCCACCTTCAAACGTGACCGAGGACCGTATGGTCACT
AC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 3

CO CL3820Contig1 786 3 9 U
AACAAAAAAGCACGTGCAGCAATGGATTGAAGGTTAAAACTTCCAACATATCTAGTAATA
ATACAGTAATGCTTACACGAGGAAAAAGGAATTAAAGATATAAAGAATATTCCCTTTGAT
CACACCTTACTTCCAAGCCACAGCATCGATGTCATCTCTTGCTTGTTTGTAAAGCTCGAG
TCGTTTGGCTAAGGTTCCTCTTCGTTCCATTAGTTGTGGGCCTTCGTCCAACATCCCCCC
CCAGCTTCTCCTTCTCTTTCCTGCCGACTTGGGCGTAAAAAAAGTTGAGGAGCGATCTCT
TAGCTTCTCTAACTTGGCAGTAAACAACAGCTTTGGGAAAAAAGATTCTCAATGTATCAC
ACACCATGTTTATGTACCCACTCACGTTGGATCCGATCTTCCTGAAGCGATTATCGGAGT
GGATGTCTGCGTTTTGTGGTGGGGCATTTTTCGGGTTTGGTTTCTCTTTCTCGGGTTCAA
GGTGAAGTTTTCTGAAAAACTCAACCGTGAGGTAGCTGGACTCCATGTCCACCAAACGCA
AAACTGTTTTCCTGCTTTCGTCTCTGAATCTTTCGAGAGCTTCGTTAGCAGCAGCTGCTA
TATCACTTGCTAGAGTTGGGAATCGCTTCAGCTCCTCTGTTTCTGAAATCGACTTTCTGA
CCAGCTCTTTCAGTACAAAATGCACTGCATCGAAGGTGGCTTCTGCTGGTCCTTTGAAAT
AGCTAATGGAACCATCAATGAGCCTTCTGTATCCTTGTTCAGGAGCAATAAGATGTGGCT
GGTAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1C833JQ U 1
AF RS1A556JQ U 552
AF RS1C833TF C 152
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C*AGCTTCTCCTTCTCTTTCCTGCCGACTTGGGCGTAAAAAAAGTTGAGGAGCGATCTCT
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ACACCATGTTTATGTACCCCCTCCCGTTGGATCCGATCTTCCTGAAGCGATTATCGGAGT
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AAACTGTTTTCCTGCTTT

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AGTACAAAATGCACTGCAT

QA 1 139 1 139
DS 

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AGTTGTGGGCCTTCGTCCAACATCCCCCCCCAGCTTCTCCTTCTCTTTCCTGCCGACTTG
GGCGTAGAAGAAGTTGAGGAGCGATCTCTTAGCTTCTCTAACTTGGCAGTAAACAACAGC
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CGGGTTTGGTTTCTCTTTCTCGGGTTCAAGGTGAAGTTTTCTGAAGAACTCAACCGTGAG
GTAGCTGGACTCCATGTCCACCAGACGCAGAACTGTTTTCCTGCTTTCGTCTCTGAATCT
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CTCCTCTGTTTCTGAAATCGACTTTCTGACCAGCTCTTTCAGTACAAAATGCACTGCATC
GAAGGTGGCTTCTGCTGGTCCTTTGAAATAGCTAATGGAACCATCAATGAGCCTTCTGTA
TCCTTGTTCAGGAGCAATAAGATGTGGCTGGTAAC

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

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TGCGTCGAACACGTCCTCCAATCAAAAGACTCCTCTTCTTCCCCTGTGGCCACTGCGACC
CACTCCCAAAAATCAAACCTTTACCTCGTTTTCGAGTACCTCGACACGGATCTCAAGAAG
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AGGTTTATGTTCCAGCTTTGTAAAGGCGTGGCGCATTGTCATAGCCACGGCGTGCTTCAC
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GCATCACACGCTGGCAAATTGCAATCTTGTATTACTGATCACACTCTGGCAAGTTGATTG
CTCAGCATCATGGTGATTTTATTTTTCTGGTGTCTCCTGTATTGTGTGTGTTTGAGGATG
CAATGTGTTCTGCAAGAGTGAACTTTTTATTCTTAAAATGGCCAATTTGGTTTTCCGGTA
TGAACAAACATATCATCGAAGATGAGTTCATTC


BQ
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AF RS1BM93TF U 1
AF RS1BM93JQ C 520
BS 1 789 RS1BM93TF
BS 790 790 RS1BM93JQ
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BS 794 826 RS1BM93TF
BS 827 1233 RS1BM93JQ

RD RS1BM93TF 826 0 0
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AAGGTCGGCGAAGGAACATACGGGAAAGTCTACAAAGCCATCGAGAAAGACACCGGAAAG
CTCGTCGCTTTAAAGAAAACCCGCCTCGAGATGGACGAAGAAGGCATACCACCAACCGCT
CTCCGCGAGATCTCCCTCCTCCAGATGCTCTCTCAATCGATCTACATCGTCCGCCTCCTC
TGCGTCGAACACGTCCTCCAATCAAAAGACTCCTCTTCTTCCCCTGTGGCCACTGCGACC
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TTCGTCGATTCTTACAGAAAGGGCCCCAACCCGAGGCCGCTCGAGGCCGATCTCGTGATG
AGGTTTATGTTCCAGCTTTGTAAAGGCGTGGCGCATTGTCATAGCCACGGCGTGCTTCAC
CGTGATCTCAAGCCGCAGAATCTTTTGCTGGATAAGGAGAGAGGGGTTTTGAAGATTGCT
GATTTGGGTTTCGGTCGTGCTTTCACTGTTCCTTTGAAGTCTTACACTCATGAGATTGTT
ACGCTTTGGTATAGAGCTCCTGAGGTTCTGCTTGGCTCTGCTCATTACTCCACTGGGGTT
GACATGTGGTCTGTTGGATGCATCTTTGCTGAGATGATTCGGAGGCAAGCTCTTTTCCCT
GGTGACTCCGAGTTTCAGCAGTTACTTCATATCTTCAGATTGCTAGGAACACCTACTGAG
AAGCAATGGGCCTGTGTGATGACTCTGCTTGGCTGGCATGTGTATC

QA 1 826 1 826
DS 

RD RS1BM93JQ 714 0 0
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TCTTACACTCATGAGATTGTTACGCTTTGGTATAGAGCTCCTGAGGTTCTGCTTGGCTCT
GCTCATTACTCCACTGGGGTTGACATGTGGTCTGTTGGATGCATCTTTGCTGAGATGATT
CGGAGGCAAGCTCTTTTCCCTGGTGACTCCGAGTTTCAGCAGTTACTTCATATCTTCAGA
TTGCTAGGAACACCTACTGAGAAGCAATGGCCTGGTGTGATGACTCTGCTTGGCTGGCAT
GTGTATCCCAAATGGGAGCCGCAAGACTTGTCACGTGCTGTTCCTTCTCTATCCCCTGAA
GGAGTTGATCTTCTCACGAATATGCTGAGGTACAATCCAGCTGAAAGAATTTCAGCGAAA
GCAGCTCTTGACCATCCCTACTTTGATAGCTTTGACAAATCTCAGTTCTGAAGCTGCACC
TGTCTGATCAAAAACTCTATGGCATCACACGCTGGCAAATTGCAATCTTGTATTACTGAT
CACACTCTGGCAAGTTGATTGCTCAGCATCATGGTGATTTTATTTTTCTGGTGTCTCCTG
TATTGTGTGTGTTTGAGGATGCAATGTGTTCTGCAAGAGTGAACTTTTTATTCTTAAAAT
GGCCAATTTGGTTTTCCGGTATGAACAAACATATCATCGAAGATGAGTTCATTC

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL3822Contig1 1021 2 6 U
GGAGCGCCGTCCATTTGCAGAAACCACCCATTTGGACGAACCATGGCCCCGAAGAAAGGA
GTCAAGGTTGCTGCCAAGAAGAAGACGGAGAAAGTAACGAACCCTCTATTCGAGAGGAGG
CCTAAGCAATTTGGTATTGGTGGAGCTCTTCCACCCAAGAAGGATCTTACCCGCTACATC
AAATGGCCTAAGTCTATCCGTCTTCAAAGGCAGAAGAGGATCCTTAAGCAGAGGTTGAAG
GTCCCACCCGCCCTTAATCAGTTCACCAAGACTCTCGACAAGAATCTTGCGACCAGCCTC
TTCAAGATCCTTCTCAAGTATAGGCCAGAGGACAAAGCCGCCAAGAAAGAGCGTCTTGTC
AAGAAGGCTCAAGCTGAAGCTGAGGGAAAGCCTTCTGAATCTAAGAAGCCTATTGTTGTG
AAATACGGCCTTAACCATGTGACCTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCACAGCTTGTTGTC
ATTGCTCATGATGTCGACCCTATCGAGTTGGTTGTCTGGTTGCCTGCTCTCTGCAGGAAG
ATGGAAGTCCCTTACTGCATTGTCAAAGGCAAATCTCGTCTTGGAGCTGTGGTTCACCAA
AAGACTGCTGCTTGCTTGTGTTTGACCACTGTCAAGAATGAGGACAAGCTTGAGTTCAGC
AAAATCCTCGAAGCCATCAAGGCAAACTTCAACGACAAGTACGAAGAGTACAGGAAGAAA
TGGGGAGGAGGCATAATGGGATCCAAATCTCAGGCCAAGACAAAGGCCAAGGAAAGAGTA
CTTGCAAAGGAGGCTGCCCAGAGGAATAATTAATAAGGGTCTTTTTGAGTGTTTAGATTG
TCTCTTCAATTTGTTGTTCAAAAAAGGATTCTCTTTTTTTTTTTGTTGGAAGTTGGAACT
ATCGTGTATGGATATGTTTTGCACCCTCTTCAGACAGTTTTCAAGCTCTATGATCGTTTT
GGTCTCAGGCACTTCGACTAGTCTTGAAAGACAAACAAGAATCAGAGATAGTTAACGTTG
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1H163TF U 1
AF RS1C217JQ C 260
BS 1 459 RS1H163TF
BS 460 460 RS1C217JQ
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BS 644 691 RS1H163TF
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AAATACGGCCTTAACCATGTGACCTACCTCATCGAGCAGGACAAGGCACAGCTTGTTGTC
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AAGACTGCTGCTTGCTTGTGTTTGACCACTGTCAAGAATGAG*ACAAGCTTGAGTTCAGC
AAAATCCTCGAAGCCATCAAGGCAAACTTCA
ACGACAAGTACGA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1C217JQ 762 0 0
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ATAGGCCAGAGGACAAAGCCGCCAAGAAAGAGCGTCTTGTCAAGAAGGCTCAAGCTGAAG
CTGAGGGAAAGCCTTCTGAATCTAAGAAGCCTATTGTTGTGAAATACGGCCTTAACCATG
TGACCTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCACAGCTTGTTGTCATTGCTCATGATGTCGACC
CTATCGAGTTGGTTGTCTGGTTGCCTGCTCTCTGCAGGAAGATGGAAGTCCCTTACTGCA
TTGTCAAAGGCAAATCTCGTCTTGGAGCTGTGGTTCACCAAAAGACTGCTGCTTGCTTGT
GTTTGACCACTGTCAAGAATGAGGACAAGCTTGAGTTCAGCAAAATCCTCGAAGCCATCA
AGGCAAACTTCAACGACAAGTACGAAGAGTACAGGAAGAAATGGGGAGGAGGCATAATGG
GATCCAAATCTCAGGCCAAGACAAAGGCCAAGGAAAGAGTACTTGCAAAGGAGGCTGCCC
AGAGGAATAATTAATAAGGGTCTTTTTGAGTGTTTAGATTGTCTCTTCAATTTGTTGTTC
AAAAAAGGATTCTCTTTTTTTTTTTGTTGGAAGTTGGAACTATCGTGTATGGATATGTTT
TGCACCCTCTTCAGACAGTTTTCAAGCTCTATGATCGTTTTGGTCTCAGGCACTTCGACT
AGTCTTGAAAGACAAACAAGAATCAGAGATAGTTAACGTTGG

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL3823Contig1 765 2 6 U
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ATCGTCGTCTTACTACGAGGGGAAGCTGGTCCAGGATTGTATTTTAGATTTTCATCAAGA
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CTTTTTATTTGTCCGAGTCAGCATTAAGTGTAAGAAGTACAGGTGTATAAATATGTCATT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DR28TF U 1
AF RS1H438TF U 483
BS 1 521 RS1DR28TF
BS 522 522 RS1H438TF
BS 523 653 RS1DR28TF
BS 654 655 RS1H438TF
BS 656 693 RS1DR28TF
BS 694 765 RS1H438TF

RD RS1DR28TF 695 0 0
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ATCGTCGTCTTACTACGAGGGGAAGCTGGTCCAGGATTGTATTTTAGATTTTCATCAAGA
GCTCATGATTGCTTGGGTTTCTTGCACCATGGTTCCAGGCTATTAGGTTGGTGGTCGATT
GATGAAGGAAGCCGGGAGGAACAAGCTCGACTATACATTGATCAAGAATCTGGTTACAAT
ACCTTCAGTGGTCATCGGCCTGAGATAGTCAAGAAAATGCCAAAGGAAGATCTTGCTGAA
GAGGTGTGGAGACTTCAAGCTGCTCTTGGTGAACAAACCGAAATCACAAAATTCAGCCAG
CAAGAGTATGAAAGACTGCAAAATGAAAAAGTGCTGTGTAGGGTTTGCTTTGAAAAAGAA
ATCAGTTTGGTACTGCTTCCATGTAGACATCGTGTTCTCTGCAGAACCTGTTCAGACAAG
TGTATAAAGTGTCCGATATGTCGTGTAGCCATTGAAGAACGTCTACCTGTATACGACGTT
TGACTGTGTCCAACTTTGGCCCATGTTCGTGATTAGGATTTGAGGTTTTATGTTCCAAAC
AATGATTCCTTTTCTTACCATGCCGTGTTCCCAAGCTTTTGGATGTGTTTTTT**TGAAT
CTTTTTATTTGTCCGAGTCAGCATTAAGTGTAA
GA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RS1H438TF 283 0 0
G
ATAAAGTGTCCGATATGTCGTGTAGCCATTGAAGAACGACTACCTGTGTACGACGTTTGA
CTGTGTCCAACTTTTGCCCATGTTCGTGATTAGGATTTGAGGTTTTATGTTCCAAACAAT
GATTCCTTTTCTTACCGTGCCGTGTTCCCAAGCTTTTGGATGTGTTTTTTGCTGAATCTT
TTTATTTGTCCGAGTCAGCATTAAGTGTAAGAAGTACAGGTGTATAAATATGTCATTTTG
TAGAAAACTATTAACATACAATCACTTACTTACCTTGGTTGT

QA 2 283 2 283
DS 



AS 1 3

CO CL3824Contig1 784 3 2 U
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TATC


BQ
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10 10 10 10 

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TGATGGGTGGGATCGGGATCATAATGCTGGATCTGGCGTTGGATAAGAATCGAGCTAAGA
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ACTTTTTGTGTTTCTTTAAAAGCTTTGTGTGTTCACTGAAACCGGATTCTCTACTTAGTT
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G

QA 1 759 1 759
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GG
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DS 



AS 1 3

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TCATCCAGATTCACTTCTCCCTCTTCCTTTGCACGAGTAGGCATGTAACTTATTCTGAAC
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BQ
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BS 155 195 RS1C279JQ
BS 196 196 RS1AW67JQ
BS 197 345 RS1C279JQ
BS 346 346 RS1AW67JQ
BS 347 392 RS1C279JQ
BS 393 393 RS1AW67JQ
BS 394 458 RS1C279JQ
BS 459 459 RS1AW67JQ
BS 460 473 RS1C279JQ
BS 474 474 RS1AW67JQ
BS 475 480 RS1C279JQ
BS 481 482 RS1AW67JQ
BS 483 768 RS1C279JQ
BS 769 769 RS1AW67JQ
BS 770 785 RS1C279JQ
BS 786 825 RS1AW67JQ
BS 826 1147 RS1C279TF

RD RS1C279JQ 786 0 0
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CTTTTAATTTAAACCCACAGACAAATTTTTCTTTCCGGAACCAAGTGTTGACAAGTATGT
CCCATACACGTTTGAGAATTAATGGATTCAATTGCAAAAAGCATTCAAGATTGCATATTT
TTCCAATTTTTTTTT*GAAGTTTATTTACGACATTTATCCATATACCAATCTACTCTTTT
ATTCCCAATGTTTTGTTATATTCAGAGTAGGAGAGGGACCTGGCTTGCTTTGAATTGAAT
CAAAACGTGATTGTTCTGAAAAGCTCTGGCTTTGGCATTCCTTCCGTTGCTCTCCATATT
ATGTTCTCCAGTTTCTCACATAACTTCTTGTAGAACTTGTGGTATTCAAGTGTTTCACCA
GCAGCCTTTCTAACGTCTACCATGAAAAGTGATGGTGCTACCTCATAAACCTCTATCACA
**AGCAAATTGCCCTGCCAATCCCTCCAGCCTTGTCTTGAAGTTGCGCGTATGAGCCCTA
AAACCCATTGAGGTTGCAACAGCCTCAATGTTAGCAATTATCACACTAGGCTCCCTTCTA
GAAACAAAACGGGTTTGCCTTTTCACAAAATCCTGTCGCCTGTCAAATAGTGCTGATAGG
TTTAAGCCTTGTGATAAGGTAATCATCTCAAAGGCATTCATCATCAGGGGTCCCTCATAT
CTTCTCTCTATATTCTCCGTTACATAACTTCCCTCAATTCCATCAAAA*CTGCACGAATA
TCATC
G

QA 1 785 1 785
DS 

RD RS1AW67JQ 760 0 0
AG
TTTAAACCCACAGACAAATTTTTCTTTCCGGAACCAAGTGTTGACAAGTATGTCCCATAC
ACGTTTGAGAATTAATGGATTCAATTACAAAAA*CATTCAAGATTGCATATTTTTCCAAT
TTTTTTTTTGAAGTTTATTTACGACATTTATCCATATACCAATCTACTCTTT*ATTCC*A
ATGTTTTGTTATATTCAGAGTAGGAGAGGGACCTGGCTTGCTTTGAATTGAATCAAAACG
TGATTGTTCTGAAAAGCTCTGGCTTTGGCATTCCTTCCCTTGCTCTCCATATTATGTTCT
CCAGTTTCTCACATAACTTCTTGTAAAACTTGTGGTATTCAAGTGTTTCACCAGCAGCCT
TTCTAACGTCTACCATGAAAAGTGATGGTGCCACCTCATAAACCTCGATCACAACAGCAA
ATTGCCCTGCCAATCCCTCCAGCCTTGTCTTGAAGTTGCGCGTATGAGCCCTAAAACCCA
TTGAGGTCGCAACAGCCTCAATGTTAGCAATTATCACACTAGGCTCCCTTCTAGAAACAA
AACGGGTTTGCCTTTTAACAAAATCCTGTCGCCTGTCAAATAGTGCTGATAGGTTTAAGC
CTTGTGATAAGGTAATCATCTCAAAGGCATTCATCATCAGGGGTCCCTCATATCTTCTCT
CTATATTCTCCGCTACATAACTTCCCTCAATTCCATCAAAAACTGCACGAATATCATCCA
GATTCACTTCTCCCTCTTCCTTTGCACGAGTAGGCATG

QA 3 760 3 760
DS 

RD RS1C279TF 650 0 0
CAATCCCTCCAGCTTTGTCTTGAAGTTGCGCGTATGAGCCCTAAAACCCATTGAGGTTGC
AACAGCCTCAATGTTAGCAATTATCACACTAGGCTCCCTTCTAGAAACAAAACGGGTTTG
CCTTTTCACAAAATCCTGTCGCCTGTCAAATAGTGCTGATAGGTTTAAGCCTTGTGATAA
GGTAATCATCTCAAAGGCATTCATCATCAGGGGTCCCTCATATCTTCTCTCTATATTCTC
CGTTACATAACTTCCCTCAATTCCATCAAAAACTGCACGAATATCATCGAGATTCACTTC
TCCCTCTTCCTTTGCTCGAGTAGGCATGTAACTTATTCTGAACCACCGATCATTCCTAAT
TCCTTGGATTTGAATACGTGTTTTGGGATTGGGGTCAAGTATCCTCTGTATTAAAGACTT
CACGTCTGCAGAGAACCACTGTGGACAAGAAGACTCTGCTGCACCAATTTTTCTGTACAA
AGATGGAAGATCAGTCTCAGAGAAGGGTAAGAATCCAGCCATGATGACGAAAAGAATAAC
CCCGCAAGACCAAATATCTGCTGCTGAACCATCGTAGCCTTGGCCATTGAGTACCTCTGG
AGCTGCATAGTTTGGAGTTCCACACGTGGTCCGCAAAATTTCTACTCCTC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 3

CO CL3826Contig1 471 3 12 U
GTAAGATAAAATGAATCCATAAACAATGAATAATGATGATAATACATACAAAGCACACAT
AGAAACGGATGGTAAAATTAAGAATACTACAACACTCTATAGCTTTAGAATCAAACCACA
CGAACAAATCATTAACAAAAACAACAAAAATTAATAGAGGAGAAAAAATGAATGATAAAT
GGTTGTTTTTGGCTCAAAAGAGAAGACCAGAGGCCAAAGCAACAACAGATGCAAACAATG
CTGGTACGAACATAGTAGCATCCGAAGTTGGGCTTGGAGCTGGAGCTTCCACTGTGGCAG
CCGCCACTTGTCCTACGGCTGAGAAAGCCACAGCAAAGATCATGAAAACAACCATCATCT
TCACCTCCATTGCTTCTCTTTGATTGTACGAAGAAGAACAAGAAAAAATTAAAAGAAGGA
AAGATTATGTTCTTCTTTAGTGTGTATGTGTTTGTGCTATGATGATAATCC


BQ
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RS1B672JQ U 1
AF RS1BH60JQ U 4
AF RS1BH60TF C 4
BS 1 30 RS1B672JQ
BS 31 31 RS1BH60JQ
BS 32 40 RS1B672JQ
BS 41 41 RS1BH60JQ
BS 42 122 RS1B672JQ
BS 123 123 RS1BH60JQ
BS 124 417 RS1B672JQ
BS 418 418 RS1BH60JQ
BS 419 420 RS1B672JQ
BS 421 421 RS1BH60JQ
BS 422 466 RS1B672JQ
BS 467 471 RS1BH60JQ

RD RS1B672JQ 468 0 0
GTAAGATAAAATGAATCCATAAACAATGAAAAATGATGATGATACATACAAAGCACACAT
AGAAACGGATGGTAAAATTAAGAATACTACAACACTCTATAGCTTTAGAATCAAACCACA
CGCACAAATCATTAACAAAAACAACAAAAATTAATAGAGGAGAAAAAATGAATGATAAAT
GGTTGTTTTTGGCTCAAAAGAGAAGACCAGAGGCCAAAGCAACAACAGATGCAAACAATG
CTGGTACGAACATAGTAGCATCCGAAGTTGGGCTTGGAGCTGGAGCTTCCACTGTGGCAG
CCGCCACTTGTCCTACGGCTGAGAAAGCCACAGCAAAGATCATGAAAACAACCATCATCT
TCACCTCCATTGCTTCTCTTTGATTGTACGAAGAAGAACAAGAAAAAATTAAAAGAAAGA
GAGATTATGTTCTTCTTTAGTGTGTATGTGTTTGTGCTATGATGAT
CC

QA 1 466 1 466
DS 

RD RS1BH60JQ 468 0 0
AGATAAAATGAATCCATAAACAATGAATAATGATGATAATACATACAAAGCACACATAGA
AACGGATGGTAAAATTAAGAATACTACAACACTCTATAGCTTTAGAATCAAACCACACGA
ACAAATCATTAACAAAAACAACAAAAATTAATAGAGGAGAAAAAATGAATGATAAATGGT
TGTTTTTGGCTCAAAAGAGAAGACCAGAGGCCAAAGCAACAACAGATGCAAACAATGCTG
GTACGAACATAGTAGCATCCGAAGTTGGGCTTGGAGCTGGAGCTTCCACTGTGGCAGCCG
CCACTTGTCCTACGGCTGAAAAAGCCACAGCAAAGATCATGAAAACAACCATCATCTTCA
CCTCCATTGCTTCTCTTTGATTGTACGAAGAAGAACAAGAAAAAATTAAAAGAAGGAAAG
ATTATGTTCTTCTTTAGTGTGTATGTGTTTGTGCTATGATGATAATCC

QA 1 468 1 468
DS 

RD RS1BH60TF 468 0 0
AGATAAAATGAATCCATAAACAATGAATAATGATGATAATACATACAAAGCACACATAGA
AACGGATGGTAAAATTAAGAATACTACAACACTCTATAGCTTTAGAATCAAACCACACGA
ACAAATCATTAACAAAAACAACAAAAATTAATAGAGGAGAAAAAATGAATGATAAATGGT
TGTTTTTGGCTCAAAAGAGAAGACCAGAGGCCAAAGCAACAACAGATGCAAACAATGCTG
GTACGAACATAGTAGCATCCGAAGTTGGGCTTGGAGCTGGAGCTTCCACTGTGGCAGCCG
CCACTTGTCCTACGGCTGAGAAAGCCACAGCAAAGATCATGAAAACAACCATCATCTTCA
CCTCCATTGCTTCTCTTTGATTGTACGAAGAAGAACAAGAAAAAATTAAAAGAAGGAAAG
ATTATGTTCTTCTTTAGTGTGTATGTGTTTGTGCTATGATGAT
AATCC

QA 1 463 1 463
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3828Contig1 813 3 15 U
GAATAATGTTTTATTAATATAAGTGAAAAAAACTAAACCATGTATCATTTTGAACATAGG
AAGTTTCTTGACAATCAACAAAGGAGGATTTTTAATACGCTTAAATAATTATTTTCCTCC
TTCCCCAACTTATTACCTCCATTACTAATAGTTTGGTTTCTTGACAGACAAGCAAAACAA
CACATGGGAAGTAGAAAACATCCAAATTTTTGTCTTGAATAAAACAAATAAAACAATTTG
ATTGAAGCAGGTAACTCTCCGAGTCCTTCTCGTACCTTATCTTATATATATGCACATAAG
CAGAAGAGGGCAAAAGAA*GATCATCATCACCCACTCACTCGTCTTCGTTTCCGAGGAGA
GTGAAAGTGAAGGGATCAAACTTGTAGCCATCGCCTTCGTAGAACTTGTTCTGATACTCC
ACCCAGTGAAGACGCAGTGCGTGAAGGAACGCGCTCAAAGTCTCCATCACCAGAAGCACT
CCCACCGTTGCAAATATGAAGACGAGGAGCCCAACGATGAGAATCAATATATTGTTGAAA
CTCAAAGCCATAAGGAGGACCTTCTCGTAGAAGACTGACGACAACTCCGAGTGTGCAAGA
CTGAGGGCCCAGAGACGAAGATAAGAAGCTGTGTTGGAAACAGCTCCAAGCACAAACTCA
ATGGTGTGAATGAGCTGGTGCACAAAGATTTCGCTGAATTCAAACTCCTCGTGTCCATGA
GCTCCCCCGTTTGTTTCTACCTGAAGACTCTCATCTGTCTCCTCAAGCTGTGCGTATGAC
TGACCTTGATGTCTAGCTTCATGTTGTTTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AT68JQ U 89
AF RS1AK45TF C 1
AF RS1DE17JQ U 116
BS 1 88 RS1AK45TF
BS 89 94 RS1AT68JQ
BS 95 95 RS1AK45TF
BS 96 285 RS1AT68JQ
BS 286 286 RS1AK45TF
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BS 521 521 RS1DE17JQ
BS 522 569 RS1AT68JQ
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BS 571 572 RS1AT68JQ
BS 573 573 RS1DE17JQ
BS 574 610 RS1AT68JQ
BS 611 813 RS1DE17JQ

RD RS1AT68JQ 522 0 0
TTTTTAGTACGCTTAAATAATTATTTTCCTCCTTCCCCAACTTATTACCTCCATTACTAA
TAGTTTGGTTTCTTGACAGACAAGCAAAACAACACATGGGAAGTAGAAAACATCCAAATT
TTTGTCTTGAATAAAACAAATAAAACAATTTGATTGAAGCAGGTAACTCTCCGAGTCCTT
CTCGTACCTTATCTTATGTATATGCACATAAGCAGAAGAGGGCAAAAGAA*GATCATCAT
CACCCACTCACTCGTCTTCGTTTCCGAGGAGAGTGAAAGTGAAGGGATCAAACTTGTAGC
CATCGCCTTCGTAAAACTTGTTCTGATACTCCACCCAGTGAAGACGCAGTGCGTGAAGGA
ACGCGCTCAAAGTCTCCATCACCAGAAGCACTCCCACCGTTGCAAATATGAAGACGAGGA
GCCCAACGATGAAAATCAATATATTGTTGAAACTCAAAGCCATAAGGAGGACCTTCTCGT
AAAAAACTGACGACAACTCCGAGTGTGCAAGACTGAGGGCCC

QA 1 522 1 522
DS 

RD RS1AK45TF 683 0 0
GAATAATGTTTTATTAATATAAGTGAAAAAAACTAAACCATGTATCATTTTGAACATAGG
AAGTTTCTTGACAATCAACAAAGGAGGATTTTTAATACGCTTAAATAATTATTTTCCTCC
TTCCCCAACTTATTACCTCCATTACTAATAGTTTGGTTTCTTGACAGACAAGCAAAACAA
CACATGGGAAGTAGAAAACATCCAAATTTTTGTCTTGAATAAAACAAATAAAACAATTTG
ATTGAAGCAGGTAACTCTCCGAGTCCTTCTCGTACCTTATCTTATATATATGCACATAAG
CAGAAGAGGGCAAAAGAA*GATCATCATCACCCACTCACTCGTCTTCGTTTCCGAGGAGA
GTGAAAGTGAAGGGATCAAACTTGTAGCCATCGCCTTCGTAGAACTTGTTCTGATACTCC
ACCCAGTGAAGACGCAGTGCGTGAAGGAACGCGCTCAAAGTCTCCATCACCAGAAGCACT
CCCACCGTTGCAAATATGAAGACGAGGAGCCCAACGATGAGAATCAATATATTGTTGAAA
CTCAAAGCCATAAGGAGGACCTTCTCGTAGAAGACTGACGACAACTCCGAGTGTGCAAGA
CTGAGGGCCCAGAGACGAAGATAAGAAGCTGTGTTGGAAACAGCTCCAAGCACAAACTCA
ATGGTGTGAATGAGCTGGTG
TAC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RS1DE17JQ 698 0 0
CCTCCTTCCCCAACTTATTACCTCCATTACTAATAGTTTGGTTTCTTGACAGACAAGCAA
AACAACACATGGGAAGTAGAAAACATCCAAATTTTTGTCTTGAATAAAACAAATAAAACA
ATTTGATTGAAGCAGGTAACTCTCCGAGTCCTTCTCGTACCTTATCTTAT**ATATGCAC
ATACGCAGAAGAGGGCAAAAGAAAGATCATCATCACTCACTTACTCGTCTTCGTTTCCGA
GGAGAGTGAAAGTGAAGGGATCAAACTTGTAGCCATCGCCTTCGTAGAACTTGTTCTGAT
ACTCCACCCAGTGAAGACGCAGTGCGTGAAGGAACGCGCTCAAAGTCTCCATCACCAGAA
GCACTCCCACCGTCGCAAATATGAAGACGAGGAGCCCAACGATGAGAATCAATATATTGT
TGAAACTCAAAGCCATAAGGAGAACCTTCTCGTAGAAGACTGACGACAACTCCGAGTGTG
CAAGACTGAGGGCCCAGAGACGAAGATAAGAAGCTGTGTTGGAAACAGCTCCAAGCACAA
ACTCAATGGTGTGAATGAGCTGGTGCACAAAGATTTCGCTGAATTCAAACTCCTCGTGTC
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ATGACTGACCTTGATGTCTAGCTTCATGTTGTTTCTTC

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DS 



AS 0 0

AS 1 3

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TTGACAAAAAGACTGGTCTTATCAAGGTTGATCGAATCTTGTACTCATCGGTTGTTTATC
CTCACAACTACGGATTCATCCCAAGGACATTGTGTGAAGACAACGATCCTCTTGATGTTC
TTGTCCTCATGCAGGAACCAGTGCTTCCAGGATGTTTTCTTCGTGCTAGAGCCATTGGAT
TAATGCCCATGATTGATCAGGGAGAGATGGACGACAAGGTCATAGCCGTATGTGCAGACG
ATCCAGAGTACAAACATTTCACCGACATCAAACAACTCGCTCCTCACCGCCTCTCAGAAA
TCCGCCGTTTCTTCGAAGACTACAAGAAGAACGAGCACAAGGAGGCGGCTGTAAACGATT
TCTTGCCATCGGAGAAAGCACATGAAGCAATCCAGTACTCCATGTAACATTCCCCAAAAC
CATAAACCTAAAAATCTGCCAAACTTTTGATAAATATTGGAAAAGAGAGTAATGAATGTA
TAATCGTGTAATGAATTTATAGGGATCTGTACGCTGAGTATATTCTCCATACCTTGAGGA
GATGAACCAACAACAACACGTTATCTTCACATACACGGAAAAAAGTTTACGCTTCCAGTA
TCCCCCTGCAATAAAATATTTTTACGGAATTTATTATTTTGAATATTCATTTTCCCGACT
TATTTTGAATACCCATAGTTACATACATATGTTCAAATTTTCCAGTTTTGTGTTGTTCAA
ATTTTTTTTTTTCGTTCTTTTTCTTGTGATGTTGCAATTTTGTTGATTTGTGTAATTTGA
AACTGATACAAACTTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ES48TF U 1
AF RS1FV22TF U 1
AF RS1FV22JQ C 402
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QA 1 560 1 560
DS 

RD RS1FV22TF 688 0 0
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CTCCATTAGTCTTCAACGTGGTGGTTGAGATCACAAAGGGGAGCAAAGTGAAATATGAAC
TTGACAAAAAGACTGGTCTTATCAAGGTTGATCGAATCTTGTACTCATCGGTTGTTTATC
CTCACAACTACGGATTCATCCCAAGGACATTGTGTGAAGACAACGATCCTCTTGATGTTC
TTGTCCTCATGCAGGAACCAGTGCTTCCAGGATGTTTTCTTCGTGCTAGAGCCATTGGAT
TAATGCCCATGATTGATCAGGGAGAGATGGACGACAAGGTCATAGCCGTATGTGCAGACG
ATCCAGAGTACAAACATTTCACCGACATCAAACAACTCGCTCCTCACCGCCTCTCAGAAA
TCCGCCGTTTCTTCGAAGACTACAAGAAGAACGAGCACAAGGAGGCGGCTGTAAACGATT
TCTTGCCATCGGAGAAAGCACATGAAGCAATCCAGTACTCCATGTAACATTCCCCAAAAC
CATAAACCTAAAA*TCTGCCAAACTTTT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RS1FV22JQ 635 0 0
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CCTCACCGCCTTTCAGAAATCCGCCGTTTTTTCGAAGACTACAAGAAGAACGAGCACAAG
GAGGCGGCTGTAAACGATTTCTTGCCATCGGAGAAGGCACATGAAGCAATCCAGTACTCC
ATGTAACATTCCCCAAAACCATAAACCTAAAAATCTGCCAAACTTTTGATAAATATTGGA
AAAGAGAGTAATGAATGTATAATCGTGTAATGAATTTATAGGGATCTGTACGCTGAGTAT
ATTCTCCATACCTTGAGGAGATGAACCAACAACAACACGTTATCTTCACATACACGGAAA
AAAGTTTACGCTTCCAGTATCCCCCTGCAATAAAATATTTTTACGGAATTTATTATTTTG
AATATTCATTTTCCCGACTTATTTTGAATACCCATAGTTACATACATATGTTCAAATTTT
CCAGTTTTGTGTTGTTCAAATTTTTTTTTTTCGTTCTTTTTCTTGTGATGTTGCAATTTT
GTTGATTTGTGTAATTTGAAACTGATACAAACTTC

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 3

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ATTCCGCTGCAGTCTCTGCGACAACAGTCGAGATTCCGAAGCCTGTAGAGGAAGCACC*G
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GATAGTCTTACCGGAGTAGGACTTGTTGATCAAATGGGAAACTTCTTCTGCAAAACGCTC
TTGTTTGTGGCTGTAGCTGGAGTTCTTTTCATTCGCAAGAACGAAGATTTAGATAAGCTC
AAGGGTCTATTTGAAGAGACGACGTTGTATGACAAGCAGTGGCAAGCGGCTTGGAAAGAG
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GATCTTGAGATAGTGACATCTATTTGGCTTTG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1DY15TF U 1
AF RS1AH25TF U 191
AF RS1AH25JQ C 224
BS 1 453 RS1DY15TF
BS 454 454 RS1AH25TF
BS 455 508 RS1DY15TF
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RD RS1DY15TF 589 0 0
GGGAGAGCAACAAAATGTCCATATCCATGGCGCTATTCTCTCCTCCGATCACTTCGTCAC
TCCAAAACCCTAATCTCACCCCCAAGATCTCACTCTCACTCTCTCTCCTCTCCACAAAGC
GCTTCTCCCTCCTCTCCGTCACCCGAGCTTCCTCCTCCGACAACGGTGCGTCGACGCCCG
ATTCCGCTGCAGTCTCTGCGACAACAGTCGAGATTCCGAAGCCTGTAGAGGAAGCACC*G
GTCAAATCTCCGCCGGCGGAAAGCTCCTCCGCGTCTGAAAACGGAGGAGAAGAGACTGAT
CTGCCAACCACAACCACGACGGAGATCAAGTTTCAGGATGCGAAGTGGGTTAATGGGACT
TGGGATCTCAAACAGTTCGAGAAAGACGGGAAAACAGATTGGGATTCTGTAATTGTCGCT
GAGGCAAAGAGGAGGAAGTGGCTTGAAGATAACTCAGAAACAACTACTAACGCCGAGCCT
GTTCTCTTCGATACCTCCATCATTCCATTGTGGGCATGGATGAAGAGATACCATCTACCA
GAAGCTGAACTCCTCAATGGCCGTGCTGCGATGATTGGGTTCTTCATGG

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1AH25TF 741 0 0
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CGCCGGCGGAAAGCTCCTCCGCGTCTGAAAACGGAGGAGAAGAGACTGATCTGCCAACCA
CAACCACGACGGAGATCAAGTTTCAGGATGCGAAGTGGGTTAATGGGACTTGGGATCTCA
AACAGTTCGAGAAAGACGGGAAAACAGATTGGGATTCTGTAATTGTCGCTGAGGCAAAGA
GGAGGAAGTGGCTTGAAGATAACCCAGAAACAACTACTAACGCCGAGCCTGTTCTCTTCG
ATACCTCCATCATTCCATGGTGGGCATGGATGAAGAGATACCATCTACCAGAAGCTGAAC
TCCTCAATGGCCGTGCTGCGATGATTGGGTTCTTCATGGCTTACTTTGTTGATAGTCTTA
CCGGAGTAGGACTTGTTGATCAAATGGGAAACTTCTTCTGCAAAACGCTCTTGTTTGTGG
CTGTAGCTGGAGTTCTTTTCATTCGCAAGAACGAAGATTTAGATAAGCTCAAGGGTCTAT
TTGAAGAGACGACGTTGTATGACAAGCAGTGGCAAGCGGCTTGGAAAGAGCCGGAATCAT
CATCATCATCGACGGTTTCTTCGAAGAAGTGAACAGAAACTTTCTCGCTTTTTGTTTCCT
CTTTGTTATGTGATGTTTGTGATCAGTGATAATTTCTTTATTGTATTACTGATCTTGAGA
TAGTGACATCTATTTGGCTTT

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1AH25JQ 709 0 0
TGTAGAGGAAGCACCCGGTCAAATCTCCGCCGGCGGAAAGCTCCTCCGCGTCTGAAAACG
GAGGAGAAGAGACTGATCTGCCAACCACAACCACGACGGAGATCAAGTTTCAGGATGCGA
AGTGGGTTAATGGGACTTGGGATCTCAAACAGTTCGAGAAAGACGGGAAAACAGATTGGG
ATTCTGTAATTGTCGCTGAGGCAAAGAGGAGGAAGTGGCTTGAAGATAACCCAGAAACAA
CTACTAACGCCGAGCCTGTTCTTTTCGATACCTCCATCATTCCATGGTGGGCATGGATGA
AGAGATACCATTTACCAGAAGCTGAACTCCTCAATGGCCGTGCTGCGATGATTGGGTTTT
TCATGGCTTACTTTGTTGATAGTCTTACCGGAGTAGGACTTGTTGATCAAATGGGAAACT
TTTTTTGCAAAACGCTCTTGTTTGTGGCTGTAGCTGGAGTTCTTTTCATTCGCAAGAACG
AAGATTTAGATAAGCTCAAGGGTTTATTTGAAGAGACGACGTTGTATGACAAGCAGTGGC
AAGCGGCTTGGAAAGAGCCGGAATCATCATCATCATTGACGGTTTTTTCGAAGAAGTGAA
CAGAAACTTTCTCGCTTTTTGTTTCCTCTTTGTTATGTGATGTTTGTGATCAGTGATAAT
TTCTTTATTGTATTACTGATCTTGAGATAGTGACATCTATTTGGCTTTG

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 2

CO CL3832Contig1 784 2 4 U
GGGACTTTCTCTCTTCTCTCTCTCTCTCCAGCAAAATAAAAAAACAGGAGTTTCACAATG
TGTGACTCAGATTATCTCTCTCGCTGCTCCTCATACGAGGCAGACGTTGATTCAGACTCC
GACATCTCTACCTCCAGCTCATGCTCCTCGTACAATGGCTGTGGTGGTGAGTTGAAAGCG
ACGAAGAGACTGGAGAAGAAGAAGAGCAATGTGTTGCTTGAGGGTTACGTTATTGATGAT
GCAGCGGTTAACGATGATTTGAAGAGGACCAAGAGCTTAACAGACGATGATCTCGAGGAG
CTTAAAGGCTGTGTAGATCTAGGTTTTGGGTTCAACTACGAGGAGATTCCTGAGCTTTGT
AATACTTTACCTGCTCTTGAGCTTTGTTACTCGATGAGTCAGAAGTTTATGAATCAAGAT
CATTCGCCTGAGAAGAAACAACCGACGATGCTTGAGTCTCAAGTTAGTCCTATAGCTAGC
TGGAAGATCTCTAGTCCTGGGGACAATCCTGATGATGTCAAAGCAAGGTTGAAGTTCTGG
GCACAAGCTGTGGCATGTACTGTGAGATTATGCACTTGAGAAAGAACTTCCATCTTGATT
TTGAAGCAATTCAAAGCTTTGATGGATCAAAGAAGAATGAACACAAGACCATTGCTGCAG
GAGTGATATCTCTTTTATATGCCGTTCTGTTTCAGCTTTTATGAGACTGACCTGCTTGAA
ACACCCCATTTGCTGTATGAGTTATGTAATGCTCAATGCTTAATGATCAAGAAAAGATTT
TGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1C956TF U 1
AF RS1C956JQ C 122
BS 1 660 RS1C956TF
BS 661 661 RS1C956JQ
BS 662 715 RS1C956TF
BS 716 784 RS1C956JQ

RD RS1C956TF 715 0 0
GGGACTTTCTCTCTTCTCTCTCTCTCTCCAGCAAAATAAAAAAACAGGAGTTTCACAATG
TGTGACTCAGATTATCTCTCTCGCTGCTCCTCATACGAGGCAGACGTTGATTCAGACTCC
GACATCTCTACCTCCAGCTCATGCTCCTCGTACAATGGCTGTGGTGGTGAGTTGAAAGCG
ACGAAGAGACTGGAGAAGAAGAAGAGCAATGTGTTGCTTGAGGGTTACGTTATTGATGAT
GCAGCGGTTAACGATGATTTGAAGAGGACCAAGAGCTTAACAGACGATGATCTCGAGGAG
CTTAAAGGCTGTGTAGATCTAGGTTTTGGGTTCAACTACGAGGAGATTCCTGAGCTTTGT
AATACTTTACCTGCTCTTGAGCTTTGTTACTCGATGAGTCAGAAGTTTATGAATCAAGAT
CATTCGCCTGAGAAGAAACAACCGACGATGCTTGAGTCTCAAGTTAGTCCTATAGCTAGC
TGGAAGATCTCTAGTCCTGGGGACAATCCTGATGATGTCAAAGCAAGGTTGAAGTTCTGG
GCACAAGCTGTGGCATGTACTGTGAGATTATGCACTTGAGAAAGAACTTCCATCTTGATT
TTGAAGCAATTCAAAGCTTTGATGGATCAAAGAAGAATGAACACAAGACCATTGCTGCAG
*AGTGATATCTCTTTTATATGCCGTTCTGTTTCAGCTTTTATGAGACTGACCTGC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1C956JQ 663 0 0
ACATCTCTACCTCCAGCTCATGCTCCTCGTACAATGGCTGTGGTGGTGAGTTGAAAGCGA
CGAAGAGACTGGAGAAGAAGAAGAGCAATGTGTTGCTTGAGGGTTACGTTATTGATGATG
CAGCGGTTAACGATGATTTGAAGAGGACCAAGAGCTTAACAGACGATGATCTCGAGGAGC
TTAAAGGCTGTGTAGATCTAGGTTTTGGGTTCAACTACGAGGAGATTCCTGAGCTTTGTA
ATACTTTACCTGCTCTTGAGCTTTGTTACTCGATGAGTCAGAAGTTTATGAATCAAGATC
ATTCGCCTGAGAAGAAACAACCGACGATGCTTGAGTCTCAAGTTAGTCCTATAGCTAGCT
GGAAGATCTCTAGTCCTGGGGACAATCCTGATGATGTCAAAGCAAGGTTGAAGTTCTGGG
CACAAGCTGTGGCATGTACTGTGAGATTATGCACTTGAGAAAGAACTTCCATCTTGATTT
TGAAGCAATTCAAAGCTTTGATGGATCAAAGAAGAATGAACACAAGACCATTGCTGCAGG
AGTGATATCTCTTTTATATGCCGTTCTGTTTCAGCTTTTATGAGACTGACCTGCTTGAAA
CACCCCATTTGCTGTATGAGTTATGTAATGCTCAATGCTTAATGATCAAGAAAAGATTTT
GCC

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 3

CO CL3833Contig1 761 3 14 U
GGACAGCAGTTTAGGCACTTCCTCTGTCCCGCATCTTCTCCTCGTTCCTATAGCCTTTCT
CCGTTGCTACCATCGATCGTCGTAGACCTCTATTTTCTTTCCAACGTCTAGCATTCCGTC
GAGATAGGTCAAAATCGAGGATACAATGAACAAATACGTGTACATATATTTTGAATTCGA
ACGTCGCGTGTATGGTGTATTGTTGAAGGCATCAGTGGACGATATAACTTTGTCAATGGT
GAAAGATAAGATCTATAAAAAGCTTGCGTTGGATGAAAGTACGGAGAAACTGGAGTTGGG
CTACGTTCCGATGGTGGTTGGATGTGAGGAACGGTTAACTCTCGGTGATGATGAGGATTT
GTATGTTTATCTAATGCACATGGATAAAAGGAACCGTAGATGTCTTTTGTTTTTGGAGAC
CACTAGTATATCGGAACAGCCAGACCAACTGTCGAGAGTGAGTGGGTTAAAGTCTATTCG
GTATGAACTACCTAGAGTTGCAGCCAAATGAAGGATGATCGGGTGGATTTTGACATAAAC
CGGTGGTTCGGGGGTGTTACAGTCAGGACCAGCAGTTAGTGTCTCATGATGTTAAGAGCA
GTTAGTCTATGGTTCTGCTTTTTTTTTTCTTACATGCTCCTTAGTTTTTATCAGAGGGTT
GTTTTGTATGGGAGTGGATTGGTGTAAGCTCGACAGTTTTCGTTCCCGCTACATATTGTC
TGAAACTTGCTTCCTTAGAAATTTTAATTTTTAGTGTTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1E135TF U 1
AF RS1GD86TF U 25
AF RS1GD86JQ C 108
BS 1 66 RS1E135TF
BS 67 67 RS1GD86TF
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GAAAGATAAGATCTATAAAAAGCTTGCGTTGGATGAAAGTACGGAGAAACTGGAGTTGAG
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GTATGTTTATCTAATGCACATGGATAAAAGGAACCGTAGATGTCTTTTGTTTTTGGAGAC
CACTAGTATATCGGAACAGCCAGACCGACTGTCGAGAGTGAGTGGGTTAAAGTCTATTCG
GTATGAACTACCTAGAGTTGCAGCCAAATGAAGGATGATCGGGTGGATTTTGACATAAAC
CGGTGGT

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GGG
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CTCTATTTTCTTTCCAACGTCTAGCATTCCGTCGAGATAGGTCAAAATCGAGGATACAAT
GAACAAATACGTGTACATATATTTTGAATTCGAACGTCGCGTGTATGGTGTATTGTTGAA
GGCATCAGTGGACGATATAACTTTGTCAATGGTGAAAGATAAGATCTATAAAAAGCTTGC
GTTGGATGAAAGTACGGAGAAACTGGAGTTGGGCTACGTTCCGATGGTGGTTGGATGTGA
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AAGGAACCGTAGATGTCTTTTGTTTTTGGAGACCACTAGTATATCGGAACAGCCAGACCA
ACTGTCGAGAGTGAGTGGGTTAAAGTCTATTCGGTATGAACTACCTAGAGTTGCAGCCAA
ATGAAGGATGATCGGGTGGATTTTGACATAAACCGGTGGTTCGGGGGTGTTACAGTCAGG
ACCAGCAGTTAGTGTCTCATGATGTTAAGAGCAGTTAGTCTATGGTTCTGCTTTTTTTTT
TCTTACATGCTCCTTAGTTTTTATCAGAGGGTTGTTTTGTATGGGAGTGGATTGGTGTAA
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TTTTTAGTGTTTGT

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DS 

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ATTTTGAATTCGAACGTCGCGTGTATGGTGTATTGTTGAAGGCATCAGTGGACGATATAA
CTTTGTCAATGGTGAAAGATAAGATCTATAAAAAGCTTGCGTTGGATGAAAGTACGGAGA
AACTGGAGTTGGGCTACGTTCCGATGGTGGTTGGATGTGAGGAACGGTTAACTCTCGGTG
ATGATGAGGATTTGTATGTTTATCTAATGCACATGGATAAAAGGAACCGTAGATGTCTTT
TGTTTTTGGAGACCACTAGTATATCGGAACAGCCAGACCAACTGTCGAGAGTGAGTGGGT
TAAAGTCTATTCGGTATGAACTACCTAGAGTTGCAGCCAAATGAAGGATGATCGGGTGGA
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TTATCAGAGGGTTGTTTTGTATGGGAGTGGATTGGTGTAAGCTCGACAGTTTTCGTTCCC
GCTACATATTGTCTGAAACTTGCTTCCTTAGAAATTTTAATTTTTAGTGTTTGT

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DS 



AS 1 3

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ACCAAATTTAGGTAGATAATCAAAACGAAAAATGATACTCTTAATATATACTCTTAGTTT
GCTTTGCTCTTCTTTTTTTTTTGGACAGCAGTTTTGTTCACTTTGCTCTTCTCATGGTAA
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ATGGCAGATCTTCTTCCACTAACCTCATTACCACCAACTCTTTTTGAGCAGCTTTGATAA
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GTTCAGCTCTGCTGAGTTAGCATCAGAGATTACGTAGCTACAATATGCGAGAACATTGGA
GTTCATGGCTGCCATTAGAAAACCCTGTTGTTTCTCCTGTCTTGATTGGTTGGTTGTTAA
ACTTTTTTCAAAGAGGATAAATTTGAGGCCTGCCTTTTTTTTTCTCTTCTCCTGCAACAA
AAAGAGAAACAATTAAACTTCTAAAAATCATCTATACAAAAATTGTAGTTTCCTCTATTC
TACGTGTCATTCACACGTGTGACTGGTTTCTTCTCCCACCCACGCGTGCGCACATACTTC
ATTGATTTCTCTACCATGTTACAACTATGAAAAAAGGGTTTCCCCAAAACTCATGGTTTT
TAGGCGTTTTAACCCAAACATACGAATTGCTTTTTTCTGTAAAATAGCTAAAGGACATCA
TAATATTCCATTTAAGACTATTCTGTATTTATACTGCTTATGACAGAAAACACAAAAGAG
AGACATTTCCACTTTCTTGATCCAACCATGTTAATAAAAAAGAAAAAAGAGAAAACAAAA
TGTTACCAACAATGGATCATGGGGAAAACTGAATTCAACATACATAAAACAAAGGCTTAC
CTCTTCCCCCTACGGAAACCAGAGTAATAACCAAAGACGATACCTAAAAAATATAATGGC
AACTAATTATATGATTCAGGTTTCATAAAGAAGTGAAGCAAAGAGATTAGGATACCTGTT
GCTTTTCTACTAAGAGAATAATTGTCAGCGTACTTTCAACATGTAAGTATAAGACAATAA
TAACAGAACCTGAAACGATCAACCACCTGCTTTTCCAAAACAAACACAAACACACAATTA
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TGAACCAGGAAAAAAACTTCCTTTTCTCTTCCATGACAGCGTTAGAGCCTCTTCTTGCCA
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ACCTGTTCTATATCGAAGCAGAGGCTCTTTAGGGTTTCTTGATCGTCTTCTAGAAGCTGA
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CGGATTAAGAGATTCCAATAATCGCTCTTCCTTGCTTATGGAATCCCAAAGGACCACTCT
GTTTCCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GX03JQ U 1
AF RS1EH91JQ U 531
AF RS1EH91TF C 888
BS 1 690 RS1GX03JQ
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RD RS1GX03JQ 719 0 0
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QA 1 719 1 719
DS 

RD RS1EH91JQ 738 0 0
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AAGACAATAATAACAGAACCTGAAACGATCAACCACCTGCTTTTCCAAAACAAACACAAA
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GCCTGTTATCTGAACCAG

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1EH91TF 740 0 0
AAGAG
AAACAAAATGTTACCAACAATGGATCATGGG*AAAACTGAATTCAACATACATAAAACAA
AGGCTTACCTCTTCGCCCTACGGAAACCAGAGTAATAACCAAAGACGATACCTAAAAAAT
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TACCTGTTGCTTTTCTACTAAGAGAATAATTGTCAGCGTACTTTCAACATGTAAGTATAA
GACAATAATAACAGAACCTGAAACGATCAACCACCTGCTTTTCCAAAACAAACACAAACA
CACAATTAAGCCTCAAGTCTCTCTTTGTTTTTCATTCAAACTTTACTTTACTTTACTTGC
CTGTTATCTGAACCAGGAAAAAAACTTCCTTTTCTCTTCCATGACAGCGTTAGAGCCTCT
TCTTGCCACAAGTCAGAGAGCCTTGTAATAAGAAATGAGAAGGGCGTAGGGAGATGGATC
GGTGACTGACCTGTTCTATATCGAAGCAGAGGCTCTTTAGGGTTTCTTGATCGTCTTCTA
GAAGCTGAGGTTCGCGGTCAGAGGAAGTGAAAGCAATGTAATTGCAGAGAGGACGGTAGT
GATCGAGTAGTTCGTTTTCTTTTAATCAATGGTAAGCATCAGATTAGAGAGCGCCGACGA
AGCCATGGCGGATTAAGAGATTCCAATAATCGCTCTTCCTTGCTTATGGAATCCCAAAGG
ACCACTCTGTTTCCC

QA 6 740 6 740
DS 



AS 1 3

CO CL3835Contig1 779 3 12 U
GGAGAGGAGACATGGAGGATCTTGTGGGACTTCTTAGAATCCGAGTGAAAAGAGGGACTA
ATCTTGTTAGTCGAGACTCTCAGAGCAGCGACCCTTTCGTCGTCATAACTATGGGTCCTC
AGACATTGAAGACTAGTCGTGTGGAAAATAACTGTAACCCTGAGTGGAACGACGAATTGA
CGCTTGCATTCAATGATCATAATCAACCTGTGAATCTCGAAGTTTATGATAAAGATACAT
TCACTTCCCATGACAAGATGGGAGATGCGGAAATAGACGTCAGGCCGTTTCTTGAGATCC
AAGCAATGGGTCTTCAAGAACTACCTGATGGAACCGAGGTCAAGAGAGTGAAGCCGAGTA
CAGACAATTGTTTGGTTGAAGAGAGCAGAATCGTTTTCAGTAATGGAAAGATCGTCCAAG
ACATGATTCTCAAGCTGAGAAATGTCGAAAGAGGTGAGGTTGAGATTCAAATTGAGTGGA
TCAGTGTTCCATAGGGTCAAGGGATCTTTGAAATAAGACATGAAAAACAACTATTGTGAA
TTTTTTTTTTTTTTAACTATTGTGAATTGAATTGTACGCACACCGGAAGAGTGCAAATCT
ATTTACTCCTCAGGCATTAGGCGTTTGTTTGACCTCTCTGGACATTCAGAGTTCCAGAGG
GCGAGGCACATTCTCGTCAATCTTCCTGCTTCTGCGTTACATGTTCAGTTATCATCAAGA
AGCTCTTGAACTCTTTCCATCACATCTCCTTCTATATATATATTTTTAATTAATCTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C736TF U 1
AF RS1GO73TF U 33
AF RS1GO73JQ C 437
BS 1 536 RS1C736TF
BS 537 537 RS1GO73TF
BS 538 552 RS1C736TF
BS 553 554 RS1GO73TF
BS 555 613 RS1C736TF
BS 614 614 RS1GO73TF
BS 615 632 RS1C736TF
BS 633 633 RS1GO73TF
BS 634 727 RS1C736TF
BS 728 728 RS1GO73JQ
BS 729 740 RS1C736TF
BS 741 779 RS1GO73JQ

RD RS1C736TF 740 0 0
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ATCTTGTTAGTCGAGACTCTCAGAGCAGCGACCCTTTCGTCGTCATAACTATGGGTCCTC
AGACATTGAAGACTAGTCGTGTGGAAAATAACTGTAACCCTGAGTGGAACGACGAATTGA
CGCTTGCATTCAATGATCATAATCAACCTGTGAATCTCGAAGTTTATGATAAAGATACAT
TCACTTCCCATGACAAGATGGGAGATGCGGAAATAGACGTCAGGCCGTTTCTTGAGATCC
AAGCAATGGGTCTTCAAGAACTACCTGATGGAACCGAGGTCAAGAGAGTGAAGCCGAGTA
CAGACAATTGTTTGGTTGAAGAGAGCAGAATCGTTTTCAGTAATGGAAAGATCGTCCAAG
ACATGATTCTCAAGCTGAGAAATGTCGAAAGAGGTGAGGTTGAGATTCAAATTGAGTGGA
TCAGTGTTCCATAGGGTCAAGGGATCTTTGAAATAAGACATGAAAAACAACTATTGCGAA
TTTTTTTTTTTT**AACTATTGTGAATTGAATTGTACGCACACCGGAAGAGTGCAAATCT
ATTTACTCCTCAGACATTAGGCGTTTGTTTGATCTCTCTGGACATTCAGAGTTCCAGAGG
GCGAGGCACATTCTCGTCAATCTTCCTGCTTCTGCGTTACATGTTCAGTTATCATCAAGA
AGCTCTTTAACTCTTTCCAT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RS1GO73TF 698 0 0
GGG
AGAATCCGAGTGAAAAGAGGGACTAATCTTGTTAGTCGAGACTCTCAGAGCAGCGACCCT
TTCGTCGTCATAACTATGGGTCCTCAGACATTGAAGACTAGTCGTGTGGAAAATAACTGT
AACCCTGAGTGGAACGACGAATTGACGCTTGCATTCAATGATCATAATCAACCTGTGAAT
CTCGAAGTTTATGATAAAGATACATTCACTTCCCATGACAAGATGGGAGATGCGGAAATA
GACGTCAGGCCGTTTCTTGAGATCCAAGCAATGGGTCTTCAAGAACTACCTGATGGAACC
GAGGTCAAGAGAGTGAAGCCGAGTACAGACAATTGTTTGGTTGAAGAGAGCAGAATCGTT
TTCAGTAATGGAAAGATCGTCCAAGACATGATTCTCAAGCTGAGAAATGTCGAAAGAGGT
GAGGTTGAGATTCAAATTGAGTGGATCAGTGTTCCATAGGGTCAAGGGATCTTTGAAATA
AGACATGAAAAACAACTATTGTGAATTTTTTTTTTTTTTAACTATTGTGAATTGAATTGT
ACGCACACCGGAAGAGTGCAAATCTATTTACTCCTCAGGCATTAGGCGTTTGTTTGACCT
CTCTGGACATTCAGAGTTCCAGAGGGCGAGGCACATTCTCGTCAATCTTCCTGCTTCTGC
GTTACATGTTCAGTTATCATCAAGAAGCTCTT
GAA

QA 4 695 4 695
DS 

RD RS1GO73JQ 343 0 0
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TCAAGGGATCTTTGAAATAAGACATGAAAAACAACTATTGTGAATTTTTTTTTTTTTTAA
CTATTGTGAATTGAATTGTACGCACACCGGAAGAGTGCAAATCTATTTACTCCTCAGGCA
TTAGGCGTTTGTTTGACCTCTCTGGACATTCAGAGTTCCAGAGGGCGAGGCACATTCTCG
TCAATCTTCCTGCTTTTGCGTTACATGTTCAGTTATCATCAAGAAGCTCTTGAACTCTTT
CCATCACATCTCCTTCTATATATATATTTTTAATTAATCTCCT

QA 1 343 1 343
DS 



AS 1 3

CO CL3836Contig1 941 3 5 U
GGAGATCCTTTGAGAGATCATCGGAAAGTGATGACGGTCGCGGCGGGGATAGGGTACGCG
CTTCTTGCTCTGGGACCCTCTCTTTCGCTCTTCGTCTCCGTCATCTCCAGAAAGCCCTTC
CTCATCCTCACTCTTCTCTCCAGTACGTTGGTGTGGCTTGTGAGCCTGATCGTCTTGTCT
GGACTGTGGAGGCCGTTCCTCCCTCTGAAAGCCAATGTGGTGTGGCCTTATGCTTTACTT
GTTCTCTCCTCTGTTTGCTTCCAGGAAGCTCTTCGCTTTCTTTTCTGGAAGCTCTACATG
AGGCTTGAAGATGTCTTGGATTCCTTTGCGGATCGGATCTCTAGGCCCCGCTTGTTTCTC
ACTGATAAGCTCCAGATTGCTCTCGCTGGTGGTTTAGGTCATGGTGTGGCTCATGCTGTC
TTCTTTTGTTTGAGTCTCTTAACTCCCGCATTTGGTCCAGCCACATTCTACGTCGACAGA
TGTTCGAAAGTCCCATTCTTTCTCGTCTCTGCAATCATTGCTCTTGCATTTGTCACGATC
CACACATTCTCGATGGTCATTGCTTTCGAAGGGTATGCAAAAGGAAACAGAGTAGATCAA
GTTATAGTTCCAGTCATACACCTTTCTGCTGGAATGTTGACATTGGTGAATTTTGCATCG
GAAGGCTGTATGATTGGCGTTCCTCTTCTTTACCTTGTGGCATCACTGACTCTTCTGCAT
TGTGGAAAGATGGTTTGGCAAAGGCTTATCGAAAGCCGGAACCAAAGTGGCTCGACCTTA
CGGTGATCTAGCCTCAGGCTCAGTCTTTTAGGCTTTATCCTCTTTAACTGCGTCAAAACT
TAAATGTTATGTTCTTTTTTCTTTCTTAACGCAACTATGATCCTGTATTATCGAAACTTT
GACAAAATTTGATCTACTTTTTATAAACTTATATTTAACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EB11TF U 1
AF RS1EB11JQ C 180
AF RS1DU94TF U 394
BS 1 660 RS1EB11TF
BS 661 728 RS1DU94TF
BS 729 729 RS1EB11JQ
BS 730 931 RS1DU94TF
BS 932 941 RS1EB11JQ

RD RS1EB11TF 660 0 0
GGAGATCCTTTGAGAGATCATCGGAAAGTGATGACGGTCGCGGCGGGGATAGGGTACGCG
CTTCTTGCTCTGGGACCCTCTCTTTCGCTCTTCGTCTCCGTCATCTCCAGAAAGCCCTTC
CTCATCCTCACTCTTCTCTCCAGTACGTTGGTGTGGCTTGTGAGCCTGATCGTCTTGTCT
GGACTGTGGAGGCCGTTCCTCCCTCTGAAAGCCAATGTGGTGTGGCCTTATGCTTTACTT
GTTCTCTCCTCTGTTTGCTTCCAGGAAGCTCTTCGCTTTCTTTTCTGGAAGCTCTACATG
AGGCTTGAAGATGTCTTGGATTCCTTTGCGGATCGGATCTCTAGGCCCCGCTTGTTTCTC
ACTGATAAGCTCCAGATTGCTCTCGCTGGTGGTTTAGGTCATGGTGTGGCTCATGCTGTC
TTCTTTTGTTTGAGTCTCTTAACTCCCGCATTTGGTCCAGCCACATTCTACGTCGACAGA
TGTTCGAAAGTCCCATTCTTTCTCGTCTCTGCAATCATTGCTCTTGCATTTGTCACGATC
CACACATTCTCGATGGTCATTGCTTTCGAAGGGTATGCAAAAGGAAACAGAGTAGATCAA
GTTATAGTTCCAGTCATACACCTTTCTGCTGGAATGTTGACATTGGTGAATTTTGCATCG

QA 1 660 1 660
DS 

RD RS1EB11JQ 762 0 0
TGGACTGTGGAGGCCGTTCCTCCCTCTGAAAGCCAATGTGGTGTGGCCTTATGCTTTACT
TGTTCTCTCCTCTGTTTGCTTCCAGGAAGCTCTTCGCTTTCTTTTCTGGAAGCTCTACAT
GAGGCTTGAAGATGTCTTGGATTCCTTTGCGGATCGGATCTCTAGGCCCCGCTTGTTTCT
CACTGATAAGCTCCAGATTGCTCTCGCTGGTGGTTTAGGTCATGGTGTGGCTCATGCTGT
CTTCTTTTGTTTGAGTCTCTTAACTCCCGCATTTGGTCCAGCCACATTTTACGTCGACAG
ATGTTCGAAAGTCCCATTCTTTCTCGTCTCTGCAATCATTGCTCTTGCATTTGTCACGAT
CCACACATTCTCGATGGTCATTGCTTTCGAAGGGTATGCAAAAGGAAACAGAGTAGATCA
AGTTATAGTTCCAGTCATACACCTTTCTGCTGGAATGTTGACATTGGTGAATTTTGCATC
GGAAGGCTGTATGATTGGCGTTCCTTTTCTTTACCTTGTGGCATCACTGACTTTTTTGCA
TTGTGGAAAGATGGTTTGGCAAAGGCTTATCGAAAGCCGGAACCAAAGTGGCTCGACCTT
ACGGTGATCTAGCCTCAGGCTCAGTCTTTTAGGCTTTATCCTCTTTAACTGCGTCAAAAC
TTAAATGTTATGTTCTTTTTTCTTTCTTAACGCAACTATGATCCTGTATTATCGAAACTT
TGACAAAATTTGATCTACTTTTTATAAACTTATATTTAACAC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1DU94TF 538 0 0
GGG
GGTCATGGTGTGGCTCATGCTGTCTTCTTTTGTTTGAGTCTCTTAACTCCCGCATTTGGT
CCAGCCACATTCTACGTCGACAGATGTTCGAAAGTCCCATTCTTTCTCATCTCTGCAATC
ATTGCTCTTGCATTTGTCACGATCCACACATTCTCGATGGTCATTGCTTTCGAAGGGTAT
GCAAAAGGAAACAGAGTAGATCAAGTTATAGTTCCAGTCATACACCTTTCTGCTGGAATG
TTGACATTGGTGAATTTTGCATCGGAAGGCTGTATGATTGGCGTTCCTCTTCTTTACCTT
GTGGCATCACTGACTCTTCTGCATTGTGGAAATATGGTTTGGCAAAGGCTTATCGAAAGC
CGGAACCAAAGTGGCTCGACCTTACGGTGATCTAGCCTCAGGCTCAGTCTTTTAGGCTTT
ATCCTCTTTAACTGCGTCAAAACTTAAATGTTATGTTCTTTTTTCTTTCTTAACGCAACT
ATGATCCTGTATTATCGAAACTTTGACAAAATTTGATCTACTTTTTATAAACTTA

QA 4 538 4 538
DS 



AS 1 3

CO CL3837Contig1 550 3 2 U
GGGTTCCTCTCTTCACTAAAACACTGCCACACAAACAGAGAGAGAAAGACAAAGAGAAAG
AGAGAGAGATACCAATGGCTACCAGCATGATCACGTTTGGCGTGGGGATATGTTACACCA
GCCAGCTTCCATTCAAGCGAGTCACCGTTGAAACGGGGAGGAAGCAGCAGAGAATGGCGG
TGGTGAGAGCAGAAGGCGGAGGAGGAGGAGGAGGAATCAATCCAGAGATCAGAAAAAACG
AGGAGAAGGTGGTGGACTCTGTCGTGGTCACCGAGCTTTCCAAAAACATAACTCCATATT
GCAGGTGTTGGCGGTCGGGGACATTTCCTTTATGTGATGGGAGTCATATGAAGCACAACA
AAGTTAATGGAGATAACGTTGGCCCTCTCCTTCTTAAAAAGCAGTAGTTTTTTTTTT**C
ATTAATAAGTTTCTCAAAAATTATCTTTGAAGTGATGTATTAAGGTACTCAGTCCAAACA
CTATCTATCCCATTCATTATCTTGTGAAACAATGTTAAGGTTTTCGATCAGCAATTATTT
TTTTTATATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GI94TF U 1
AF RS1CV67TF U 24
AF RS1GI94JQ C 65
BS 1 543 RS1GI94TF
BS 544 550 RS1GI94JQ

RD RS1GI94TF 550 0 0
GGGTTCCTCTCTTCACTAAAACACTGCCACACAAACAGAGAGAGAAAGACAAAGAGAAAG
AGAGAGAGATACCAATGGCTACCAGCATGATCACGTTTGGCGTGGGGATATGTTACACCA
GCCAGCTTCCATTCAAGCGAGTCACCGTTGAAACGGGGAGGAAGCAGCAGAGAATGGCGG
TGGTGAGAGCAGAAGGCGGAGGAGGAGGAGGAGGAATCAATCCAGAGATCAGAAAAAACG
AGGAGAAGGTGGTGGACTCTGTCGTGGTCACCGAGCTTTCCAAAAACATAACTCCATATT
GCAGGTGTTGGCGGTCGGGGACATTTCCTTTATGTGATGGGAGTCATATGAAGCACAACA
AAGTTAATGGAGATAACGTTGGCCCTCTCCTTCTTAAAAAGCAGTAGTTTTTTTTTT**C
ATTAATAAGTTTCTCAAAAATTATCTTTGAAGTGATGTATTAAGGTACTCAGTCCAAACA
CTATCTATCCCATTCATTATCTTGTGAAACAATGTTAAGGTTTTCGATCAGCAATTATTT
TTT
TTATATC

QA 1 543 1 543
DS 

RD RS1CV67TF 522 0 0
GG
GCCACACAAACAGAGAGAGAAAGACAAAGAGAAAGAGAGAGAGATACCAATGGCTACCAG
CATGATCACGTTTGGCGTGGGGATATGTTACACCAGCCAGCTTCCATTCAAGCGAGTCAC
CGTTGAAACGGGGAGGAAGCAGCAGAGAATGGCGGTGGTGAGAGCAGAAGGCGGAGGAGG
AGGAGGAGGAATCAATCCAGAGATCGGAAAAAACGAGGAGAAGGTAGTGGACTCTGTCGT
GGTCACCGAGCTTTCCAAAAACATAACTCCATATTGCAGGTGTTGGCGGTCGGGGACATT
TCCTTTATGTGATGGGAGTCATATGAAGCACAACAAAGCTAATGGAGATAACGTTGGCCC
TCTCCTTCTTAAAAAGCAGTAGTTTTTTTTTTTTCATTAATAAGTTTCTCAAAAATTATC
TTTGAAGTGATGTATTAAGGTACTCAGTCCAAACACTATCTATCCCATTCATTATCTTGT
GAAACAATGTTAAGGTTTTCGATCAGCAATTATTTTTT
GC

QA 3 520 3 520
DS 

RD RS1GI94JQ 486 0 0
AGAGATACCAATGGCTACCAGCATGATCACGTTTGGCGTGGGGATATGTTACACCAGCCA
GCTTCCATTCAAGCGAGTCACCGTTGAAACGGGGAGGAAGCAGCAGAGAATGGCGGTGGT
GAGAGCAGAAGGCGGAGGAGGAGGAGGAGGAATCAATCCAGAGATCAGAAAAAACGAGGA
GAAGGTGGTGGACTCTGTCGTGGTCACCGAGCTTTCCAAAAACATAACTCCATATTGCAG
GTGTTGGCGGTCGGGGACATTTCCTTTATGTGATGGGAGTCATATGAAGCACAACAAAGT
TAATGGAGATAACGTTGGCCCTCTCCTTCTTAAAAAGCAGTAGTTTTTTTTTT**CATTA
ATAAGTTTCTCAAAAATTATCTTTGAAGTGATGTATTAAGGTACTCAGTCCAAACACTAT
CTATCCCATTCATTATCTTGTGAAACAATGTTAAGGTTTTCGATCAGCAATTATTTTTTT
TATATC

QA 1 486 1 486
DS 



AS 1 3

CO CL3838Contig1 812 3 11 U
AACAAGATGATTGAAACGGCGGAGCAAACCGGCGTTCAAGGCCGTATCGTCAACGTCACG
TCGGTGATCCATAGCTGGTTCTCTGGCGATATGCTGATATATGTCGCCGATATCTCCCGA
AGCAATAGAAACTACGACGCGACCCGAGCTTACGCGCTCTCCAAGCTAGCTAACGTTCTC
CACACCATAGAGCTTTCCCGGATTCTCCATAAAATGGATGCTAATGTAACGGCCAACTGC
GTTCATCCTGGAATCGTGAGAACACGTCTCACACGAGACCGAGACGGCCTCATCACTGAT
TTAGTCTTCTTTTTAACCTCCAAGCTATTGAAGTCTGTTCCTCAGGCAGCAGCAACGACA
TGCTACGTAGCAACGAGTCCGAGATTGAGGAACGTGTGTGGCAAATACTTTTCAGACTGC
AATGAAGCTCGAACTTCCAAATCTGGATCGTGCAATCTTAAAGCTCAGAGACTGTGGACT
GCTTCTGAGTTGTTGGTTTCTCCAGCTTCCACTCCCAACGTTTATCAAACCTTTAACTTC
TTTTTAATCAGCGATGCTGTGTATGTCTAAATCCCAAGCCCTGTTAAAAGACCTAGAGCA
TTACTTTATAATATATGTGTATATATATAGCAATATATGTTCGTTTGTGTGTGTAGTGTG
TATAAGCCATGCCTCCATATTATATTATATGTGGTTGTGTGTTTTCTTTATGTAAATATA
GTTGTAGGGTTTTGTAAAATCTAGCTGTGTCTTTGTTATGTAATTCCTACCTACATCAAT
CTAGCACAATCAATATATAAAGAATAACTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A562TF U 1
AF RS1FX43JQ C 181
AF RS1FX43TF U 181
BS 1 537 RS1A562TF
BS 538 538 RS1FX43TF
BS 539 541 RS1A562TF
BS 542 542 RS1FX43TF
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BS 681 681 RS1FX43TF
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BS 687 728 RS1A562TF
BS 729 806 RS1FX43TF
BS 807 812 RS1FX43JQ

RD RS1A562TF 733 0 0
AACAAGATGATTGAAACGGCGGAGCAAACCGGCGTTCAAGGCCGTATCGTCAACGTCACG
TCGGTGATCCATAGCTGGTTCTCTGGCGATATGCTGATATATGTCGCCGATATCTCCCGA
AGCAATAGAAACTACGACGCGACCCGAGCTTACGCGCTCTCCAAGCTAGCTAACGTTCTC
CACACCATAGAGCTTTCCCGGATTCTCCATAAAATGGATGCTAATGTAACGGCCAACTGC
GTTCATCCTGGAATCGTGAGAACACGTCTCACACGAGACCGAGACGGCCTCATCACTGAT
TTAGTCTTCTTTTTAACCTCCAAGCTATTGAAGTCTGTTCCTCAGGCAGCAGCAACGACA
TGCTACGTAGCAACGAGTCCGAGATTGAGGAACGTGTGTGGCAAATACTTTTCAGACTGC
AATGAAGCTCGAACTTCCAAATCTGGATCGTGCAATCTTAAAGCTCAGAGACTGTGGACT
GCTTCTGAGTTGTTGGTTTCTCCAGCTTCCACTCCCAACGTTTATCAAACCTTTAACCTC
TCTTTAATCAGCGATGCTGTGTATGTCTAAATCCCAAGCCCTGTTAAAAGACCTAGAGCA
TTACTTTATAATATATGTGTATATATATAGCAATATATGTTCGTTTGTGTGTGTAGTGTG
TATAAGCCATGCCTCCATAT*ATAT*ATATGTGGTTGTGTGTTTTCTTTATGTAAATATA
GTTGTAGG
TTTGT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1FX43JQ 632 0 0
AGG
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CATCCTGGAATCGTGAGAACACGTCTCACACGAGACCGAGACGGCCTCATCACTGATTTA
GTCTTCTTTTTAACCTCCAAGCTATTGAAGTCTGTTCCTCAGGCAGCAGCAACGACATGC
TACGTAGCAACGAGTCCGAGATTGAGGAACGTGTGTGGCAAATACTTTTCAGACTGCAAT
GAAGCTCGAACTTCCAAATCTGGATCGTGCAATCTTAAAGCTCAGAGACTGTGGACTGCT
TCTGAGTTGTTGGTTTCTCCAGCTTCCACTCCCAACGTTTATCAAACCTTTAACTTCTTT
TTAATCAGCGATGCTGTGTATGTCTAAATCCCAAGCCCTGTTAAAAGACCTAGAGCATTA
CTTTATAATATATGTGTATATATATAGCAATATATGTTCGTTTGTGTGTGTAGTGTGTAT
AAGCCATGCCTCCATATTATATTATATGTGGTTGTGTGTTTTCTTTATGTAAATATAGTT
GTAGGGTTTTGTAAAATCTAGCTGTGTCTTTGTTATGTAATTCCTACCTACATCAATCTA
GCACAATCAATATATAAAGAATAACTTTG

QA 4 632 4 632
DS 

RD RS1FX43TF 626 0 0
AGG
ACCATAGAGCTTTCCCGGATTCTCCATAAAATGGATGCTAATGTAACGGCCAACTGCGTT
CATCCTGGAATCGTGAGAACACGTCTCACACGAGACCGAGACGGCCTCATCACTGATTTA
GTCTTCTTTTTAACCTCCAAGCTATTGAAGTCTGTTCCTCAGGCAGCAGCAACGACATGC
TACGTAGCAACGAGTCCGAGATTGAGGAACGTGTGTGGCAAATACTTTTCAGACTGCAAT
GAAGCTCGAACTTCCAAATCTGGATCGTGCAATCTTAAAGCTCAGAGACTGTGGACTGCT
TCTGAGTTGTTGGTTTCTCCAGCTTCCACTCCCAACGTTTATCAAACCTTTAACTTCTTT
TTAATCAGCGATGCTGTGTATGTCTAAATCCCAAGCCCTGTTAAAAGACCTAGAGCATTA
CTTTATAATATATGTGTATATATATAGCAATATATGTTCGTTTGTGTGTGTAGTGTGTAT
AAGCCATGCCTCCATATTATATTATATGTGGTTGTGTGTTTTCTTTATGTAAATATAGTT
GTAGGGTTTTGTAAAATCTAGCTGTGTCTTTGTTATGTAATTCCTACCTACATCAATCTA
GCACAATCAATATATAAAGAATA

QA 4 626 4 626
DS 



AS 1 3

CO CL3839Contig1 683 3 2 U
AAATTTTAAATCACTCTAATTCAAAATATTTTCAGTTCAAAGATGAAAACAAAGAATGAG
AGCATGTAATCTCCTCTCTCTAGCTACACTTGAAACACTTCTACAACCAAAGTACTAAAA
CAAATAATACCAATAACCGGATATAACCAGACCCGCCGGTACATACACTTCTCCGGTTAC
TACAACACTGAAAGTTACAGTACTAGTAGTAGTAGCGCGAGAGCAAACGTTGCCAAGAAA
GGAAGATGGCAGATAGAAACGATAAGTGCGTTTGCGTTCCCTCCCACTTGACTTGCGGGT
CCTAACGCAGGAGGAAAGTTTCCTCCCGTTCCGTTTGCGTTTAAGCTTCCCGTATAAGCA
CATGTTCTATAGCTAGGATCTCTAGGGGTAGTGATGGCAGTACCATCAAAGTCACAAGTC
CCACCAGCACTCTTCATCTTCTGGTGATAATCATTATAAGCAAAAGAAGCATGGCTCTTG
ATATCGTTCGGTAGATAACAAGGCTGTCTCGGCTGAAGCGCAGCGCAGTTAGCTCGGCCC
TGTCCACAAGCCCAGTTCAAACCGTCCTCCAACTTATCATCATCAGCATCAGCTTTCGCC
ACACAGAACAACGTCGTCCCGTTCAAATCAGCTGAGTTGCCGCCGCCGCCACCGCTTAAG
CCGAGAGGATAAACAGAAGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CL86JQ U 1
AF RS1AR80JQ U 13
AF RS1AR80TFB C 13
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BS 616 683 RS1AR80JQ

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DS 



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BQ
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20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C937TF U 2
AF RS1CU94JQ C 1
AF RS1CU94TF U 1
BS 1 1 RS1CU94JQ
BS 2 84 RS1C937TF
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RD RS1C937TF 593 0 0
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QA 1 593 1 593
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TTT
G

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DS 

RD RS1CU94TF 617 0 0
G
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TCATCGCACAATCCGTCTCTCGTTCCCGTCTCGTGGATATTTCTGAGCGTTAGTTTCACC
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AATCCGACGATTCCGGTTTCACATCGAACAATCTATGGGTGGGTAGCATCACGATGGATA
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CGTATTCGTCCCGTGGATTCGCGTTTATATACTACAGACACGTGGAGGAAGCGGTGGCGG
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GACCGGTTTGTTCTTATCTCTTTGATTCGTTAGGTTTATATATCAACTTTGATTTTGTTT
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TTTGATTGTTTTATTA

QA 2 617 2 617
DS 



AS 1 3

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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G
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TCTACTGTGGTTTTTGCCAAGAAGCTTGCCCTGTTGATGCAATCGTGGAAGGACCCAACT
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CTCTCTAGTCT

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AS 1 3

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AAGAAAGGAACCCAATAATCTTTGAATAAAATATTCAAACAAGAGATTAAATCCGGTTTA
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GCAGGATCAAACATATTCTTCAATAGAAGACATTCACTTGGCTGACCAATAGGCTCTGAC
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CGATCCAGCTTCTGCATAAGCAGAACCCTCGATTGCGCATTTAGAGCCAGTCCGCCTCCA
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AATCTTTGGATAAAATATTCAAACAAGAGATTAAATCCGGTTTAAGGTTTTATACCAAGT
CAAAAAAGAACTAAAAAAACTTGGCTTCCCCTGTAACTCACGCCTTGGCTTTGGCTTCAT
ATACATGTGGAGGCAAGAAAGTTGCAAATATCATCTTCTGTGCAAACCATCTCATGTGCA
TCGCTCTTTGAGCTGCCATTGCCGCCTGCACTGATTCAAACCGCAGGTACACAAAACCTA
AGCTGTTCTTGTCTACATAAATATGCTTGACTTCGCCATACTTGGAGCATTCATCGTGAA
CGTCTTCTTTAATTTCTTCATCAAAACCAGGTTCGGTCTCCGTTGCAGGATCAAACATAT
TCTTCAATAAAAGACATTCACTTGGCTGACCAATAGGCTCTGACATAACAGAAGGGAGTG
CTGTTGTCGGAAGCACTGATGTTGGGAAACCAGGATTCATGCCTGGCTGAT

QA 1 531 1 531
DS 

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AAGAAAGGAACCCAATAATCTTTGAATAAGATATTCAGACAAGAGATTAAATCCGGTTTA
AGGTTTTATACCAAGTCAGAAAAGAACTAGAAAAACCTGGCTTCCCCTGTAACT**CGCC
TTGGCTTTGGCTTCATATACATGTGGAGGCAAGAAAGTTGCAGATATCATCTTCTGTGCA
AACCATCTCATGTGCATCGCTCTTTGAGCTGCCATTACCGCCTGCACTGATTCAAACCGC
AGGTACACAAAACCTAAGCTGTTCTTGTCTACATAAATATGCTTGACTTCGCCATACTTG
GAGCATTCATCGTGAACGTCTTCTTTAATTTCTTCATCAAAACCAGGTTCGGTCTCCGTT
GCAGGATCAAACATATTCTTCAATAGAAGACATTCACTTGGCTGACCAATAGGCTCTGAC
ATAACAGAAGGGAGTGCTGTTGTCGGAAGCACTGATGTTGGGAAACCAGGATTCATGCCT
GGTTGATTCAGAGCTGTTCCATTTAGCGCTGGTACTCCAATACTTGCTGCGAGACCTGTA
CGATCCAGCTTCTGCATAAGCAGAACCCTCGATTGCGCATTTAGAGCCAGTCCGCCTCCA
TCATCATCATCAAAATCAGCAGATTTTGGATTACCGTCTTGTGTGCCAATATGATCAGCG
ACAGAGGAAACCTTAATTGTCCTTCCAGCAATCTCCAATTTTCCGTTTAAG*CTATTTGT
GCTGCCTTTGA*TGCTCAACTTGCGCAAACTGGATAAACC

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DS 

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AATATGCTGAC
TCGCCATACTTGGAGCAT*CATCGTGAACGTCTTCTTTA*TTTCTTCATCAAA*CCAGGT
TCGGTCTCCGT*GCAGGATCAAACATATTCTTCAATAGAAGACATTCACTTGGCTGACCA
ATAGGCTCTGACATAACAGAAGGGAGTGCTGTTGTCGGAAGCACTGATGTTGGGAAACCA
GGATTCATGCCTGGCTGATTCAGAGCTGTTCCATTTAGCGCTGGTACTCCAATACTTGCT
GCGAGACCTGTACGATCCAGCTTCTGCATAAGCAGAACCCTCGATTGCGCATTTAGAGCC
AGTCCGCCTCCATCATCATCATCAAAATCAGCAGATTTTGGATTACCGTCTTGTGTGCCA
ATATGATCAGCGACAGAGGAAACCTTAATTGTCCTTCCAGAAATCTCCAATTTTCCGTTT
AAGGCTATTTGTGCTGCCTTTGAATGCTCAACTTGCGCAAACTGGATAAACCCAAAACCC
TTGCACTGCCCAGTTTCAAGGTCACGTGGAAGCTGAACAAGCTCAACAGGACCAAACGGC
TCAAAAATCTGTCTAAGCTGCAACTCTGTCATGTTGAAATGCAAGTTCCCCACATACAGC
TTCCTATCAACAGGGCCAGTACCACCGCCTGCAGTAGTATTGGATTGAGCCAAATTCTTT
TCAGCTTCAGAGGGCTTAACCATCACAGGTTGTCCAAGAAATAGCTGTCCAGACATAGCT
ATGGCCATTGGAACCGACATAACATCATAAAACTCGATATACCTGCAAGTCAAAAGAGAT
ACTTGACATCAGAGTACACATC

QA 12 813 12 813
DS 



AS 1 3

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ACTTTACAAGTTTATATTGAGAGAGTCCAGAGTAATGGAGAAGAACATTAAGTTTCCTGT
TGTAGACTTGTCTAAGCTCAATGGTGAAGAGAGAGACCAAACCATGGCTTTGATCGACGA
TGCTTGTCAAAACTGGGGCTTCTTTGAGCTGCTAAACCATGGAATACCATATGATCTAAT
GGACAACATTGAGAGGATGACTAAGGAACACTACAAGAAGTTTATGGAACAAAAGTTTAA
GGAAATGCTTCGTTCCAAAGGTTTAGATACTCTTGAGACCGAAGTGGAAAATATCGATTG
GGAAAGCACTTTCTTCCTTCGCCATCTCCCTCAGACCAATCTTTATGACATCCCTAATAT
GTCAGAAGAATACCGAGCGGCTATGAAAGATTTTGGGAAGAGGCTAGAGAACCTAGCAGA
AGAACTGTTGGATTTGCTGTGTGAGAATCTAGGATTGGAGAAAGGGTATTTGAAGAAGGT
GTTTCGTGGTACGAAGGGTCCAACTTTTGGGACAAAGGTTAGCAACTATCCACCATGTCC
TAATCCTGAAATGGTCAAAGGTCTTAGGGCCCACACAGATGCAGGAGGCCTCATCTTGTT
GTTTCAAGACGATAAAGTCAGTGGCCTTCAGCTTCTCAAAGATGGTGTCTGGGTTGATGT
TCCTCCACTCAAGCACTCCATTGTCATCAATCTTGGTGACCAACTTGAGGTGATAACAAA
CGGGAAGTACAAGAGCGTAATGCATCGTGTAATGACTCAAAAAGAAGGAAACAGGATGTC
TATTGCGTCGTTCTACAACCCTGGAAGCGATGCCGAGATCTCTCCGGCGCAGTCTCTTGT
GGGCAAAGAATCGGAGTACCCGAGTTTTGTGTTTGACGACTACATGAAACTCTATGCCGG
AGTCAAGTTCCAGCCTAAGGAGCCACGGTTTGAGGCCATGAAAAATGCTGCAGCAACCAA
GGATGCGAATCCGGTTGCCGCGGTGAAGACATTCTAATTGGAAGTGGGGTATTCTATGAA
GGCAAGAAAGATGAAAAATAACAAAGTGGGTTTGATATGTGGGTAATAACGCAATAAGTA
TTGAAGTTAATGTTATTAGAAGCAAAAACTAAGTGACTAGTGATCACTGGTGTGGTTAAG
TAAGTGTGGGGGTGTTTTTAAAACATATGAATATTGAAAAAAAGACTTAAAATGAATATT
AAAAGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FT57TF U 1
AF RS1FQ34TF U 319
AF RS1FT57JQ C 520
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BS 1067 1067 RS1FT57JQ
BS 1068 1068 RS1FQ34TF
BS 1069 1069 RS1FT57JQ
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BS 1073 1073 RS1FT57JQ
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BS 1126 1269 RS1FT57JQ

RD RS1FT57TF 640 0 0
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TGCTTGTCAAAACTGGGGCTTCTTTGAGCTGCTAAACCATGGAATACCATATGATCTAAT
GGACAACATTGAGAGGATGACTAAGGAACACTACAAGAAGTTTATGGAACAAAAGTTTAA
GGAAATGCTTCGTTCCAAAGGTTTAGATACTCTTGAGGCCGAAGTGGAAAATATCGATTG
GGAAAGCACTTTCTTCCTTCGCCATCTCCCTCAGACCAATCTTTATGACATCCCTAATAT
GTCAGAAGAATACCGAGCGGCTATGAAAGATTTTGGGAAGAGGCTAGAGAACCTAGCAGA
AGAACTGTTGGATTTGCTGTGTGAGAATCTAGGATTGGAGAAAGGGTATTTGAAGAAGGT
GTTTCGTGGTACGAAGGGTCCAACTTTTGGGACAAAGGTTAGCAACTATCCACCATGTCC
TAATCCTGAAATGGTCAAAGGTCTTAGGGCCCACACAGAT

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1FQ34TF 822 0 0
G
GGTTTAGATACTCTTGAGACCGAAGTGGAAAATATCGATTGGGAAAGCACTTTCTTCCTT
CGCCATCTCCCTCAGACCAATCTTTATGACATCCCTAATATGTCAGGAGAATACCGAGCG
GCTATGAAAGATTTTTGGAAGAGGCTAGAGAACCTAGCAGAAGAACTGTTGGATTTGCTG
TGTGAGAATCTAGGATTGGAGAAAGGGTATTTGAAGAAGGTGTTTCGTGGTACGAAGGGT
CCAACTTTTGGGACAAAGGTTAGCAACTATCCACCATGTCCTAATCCTGAAATGGTCAAA
GGTCTTAGGGCCCACACAGATGCAGGAGGCCTCATCTTGTTGTTTCAAGACGATAAAGTC
AGTGGCCTTCAGCTTCTCAAAGATGGTGTCTGGGTTGATGTTCCTCCACTCAAGCACTCC
ATTGTCATCAATCTTGGTGATCAACTTGAGGTGATAACAAACGGGAAGTACAAGAGCGTA
ATGCATCGTGTAATGACTCAAAAAGAAGGAAACAGGATGTCTATTGCGTCGTTCTACAAC
CCTGGAAGCGATGCCGAGATCTCTCCGGCGCAGTCTCTTGTGGGCAAAGAATCGGAGTAC
CCGAGTTTTGTGTTTGACGACTACATGAAACTCTATGCCGGAGTCAAGTTCCAGCCTAAG
*AGCCACGGTTTGAGGCCATGAAAA*TGCTGCAGCAACCAAG*ATGCGA*TCCG*TTGCC
GCGGTGGAGACAT*CTAATTGGAAGTGTG*TAT*CTATGAAG**CAGAAAGATGAAAA*T
AACAAAGTGG*TTTGATATGTGGGTA
TACGCAATAAGTATT

QA 2 807 2 807
DS 

RD RS1FT57JQ 750 0 0
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TAGCAACTATCCACCATGTCCTAATCCTGAAATGGTCAAAGGTCTTAGGGCCCACACAGA
TGCAGGAGGCCTCATCTTGTTGTTTCAAGACGATAAAGTCAGTGGCCTTCAGCTTCTCAA
AGATGGTGTCTGGGTTGATGTTCCTCCACTCAAGCACTCCATTGTCATCAATCTTGGTGA
CCAACTTGAGGTGATAACAAACGGGAAGTACAAGAGCGTAATGCATCGTGTAATGACTCA
AAAAGAAGGAACCAGGATGTTTATTGCGTCGTTCTACAACCCTGGAAGCGATGCCGAGAT
CTTTCCGGCGCAGTCTCTTGTGGGCAAAGAATCGGAGTACCCGAGTTTTGTGTTTGACGA
CTACATGAAACTTTATGCCGGAGTCAAGTTCCAGCCTAAGGAGCCACGGTTTGAGGCCAT
GAAAAATGCTGCAGCAACCAAGGATGCGAATCCGGTTGCCGCGGTGAAGACATTCTAATT
GGAAGTGGGGTATTCTATGAAGGCAAGAAAGATGAAAAATAACAAAGTGGGTTTGATATG
TGGGTAATAACGCAATAAGTATTGAAGTTAATGTTATTAGAAGCAAAAACTAAGTGACTA
GTGATCACTGGTGTGGTTAAGTAAGTGTGGGGGTGTTTTTAAAACATATGAATATTGAAA
AAAAGACTTAAAATGAATATTAAAAGTTGC

QA 1 750 1 750
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3845Contig1 716 3 3 U
AAACATTTTTCTTAATCATTTTGATAGTTTATTTGCACTTCATTCGATCTTTAAAGGGAT
TTACCCATGTAAAGGCATACATAATAAATCAAAAGAACTGTTGAAAAATATAAAAGGAAT
GCTCAGAGGATATAGACCAGGAGCTTCTACAACGCTGAGAGAAGATCAGACTCTGACAAA
AGCAGACACTAACCCATGCCCTTGTTGTTCTTTGAACACTGAGACAAGATCATTAACTAA
ATCATCAACCAACGTAGATACTATCTCTCCCTCGATGTCAATGCCTTCTTCATAAGTCTC
CCTCTCGAAATCAAGCCAACTCCCTTCCAAACTGCTCATCTCTTTGTCAACAAGCTCGTC
CATCATCATCTCCCTCATCTTCTTCAACCCTTGAACCTCTCTGTTCAGTTCCTCAGCTAA
CCAATCTCTATGTTCAAACAGAATCCCCTCTTTCCCCAATATCCCTCTGCAGGTACCCCT
AACCATCTGCTCGCATTTAAGTGTTAAGGAGTTATTGACAAAATCAAATACAGTCCTTCT
CCTGAGCCTGGCTGCTGTTGCTTCTCCACGACCCTCCATTTCATCAAAGAGGCTCGCAGG
TAATATATCAGCAGCCATTCCCAAAGAAAACTCTTTCACCATCAGTTGGTCAGAACCGAG
GATATCAGATATGTACTCAAGCTCCCAGTCTAGCCTTTCTTCGTCTTCTGAATAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1DO61JQ U 1
AF RS1CQ95TF C 13
AF RS1CQ95JQ U 13
BS 1 271 RS1DO61JQ
BS 272 272 RS1CQ95JQ
BS 273 716 RS1DO61JQ

RD RS1DO61JQ 716 0 0
AAACATTTTTCTTAATCATTTTGATAGTTTATTTGCACTTCATTCGATCTTTAAAGGGAT
TTACCCATGTAAAGGCATACATAATAAATCAAAAGAACTGTTGAAAAATATAAAAGGAAT
GCTCAGAGGATATAGACCAGGAGCTTCTACAACGCTGAGAGAAGATCAGACTCTGACAAA
AGCAGACACTAACCCATGCCCTTGTTGTTCTTTGAACACTGAGACAAGATCATTAACTAA
ATCATCAACCAACGTAGATACTATCTCTCCCACGATGTCAATGCCTTCTTCATAAGTCTC
CCTCTCGAAATCAAGCCAACTCCCTTCCAAACTGCTCATCTCTTTGTCAACAAGCTCGTC
CATCATCATCTCCCTCATCTTCTTCAACCCTTGAACCTCTCTGTTCAGTTCCTCAGCTAA
CCAATCTCTATGTTCAAACAGAATCCCCTCTTTCCCCAATATCCCTCTGCAGGTACCCCT
AACCATCTGCTCGCATTTAAGTGTTAAGGAGTTATTGACAAAATCAAATACAGTCCTTCT
CCTGAGCCTGGCTGCTGTTGCTTCTCCACGACCCTCCATTTCATCAAAGAGGCTCGCAGG
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GATATCAGATATGTACTCAAGCTCCCAGTCTAGCCTTTCTTCGTCTTCTGAATAAG

QA 1 716 1 716
DS 

RD RS1CQ95TF 676 0 0
TAATCATTTTGATAGTTTATTTGCACTTCATTCGATCTTTAAAGGGATTTACCCATGTAA
AGGCATACATAATAAATCAAAAGAACTGTTGAAAAATATAAAAGGAATGCTCAGAGGATA
TAGACCAGGAGCTTCTACAACGCTGAGAGAAGATCAGACTCTGACAAAAGCAGACACTAA
CCCATGCCCTTGTTGTTCTTTGAACACTGAGACAAGATCATTAACTAAATCATCAACCAA
CGTAGATACTATCTCTCCCTCGATGTCAATGCCTTCTTCATAAGTCTCCCTCTCGAAATC
AAGCCAACTCCCTTCCAAACTGCTCATCTCTTTGTCAACAAGCTCGTCCATCATCATCTC
CCTCATCTTCTTCAACCCTTGAACCTCTCTGTTCAGTTCCTCAGCTAACCAATCTCTATG
TTCAAACAGAATCCCCTCTTTCCCCAATATCCCTCTGCAGGTACCCCTAACCATCTGCTC
GCATTTAAGTGTTAAGGAGTTATTGACAAAATCAAATACAGTCCTTCTCCTGAGCCTGGC
TGCTGTTGCTTCTCCACGACCCTCCATTTCATCAAAGAGGCTCGCAGGTAATATATCAGC
AGCCATTCCCAAAGAAAACTCTTTCACCATCAGTTGGTCAGAACCGAGGATATCAGATAT
GTACTCA
GCTCCCAGC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RS1CQ95JQ 677 0 0
TAATCATTTTGATAGTTTATTTGCACTTCATTCGATCTTTAAAGGGATTTACCCATGTAA
AGGCATACATAATAAATCAAAAGAACTGTTGAAAAATATAAAAGGAATGCTCAGAGGATA
TAGACCAGGAGCTTCTACAACGCTGAGAGAAGATCAGACTCTGACAAAAGCAGACACTAA
CCCATGCCCTTGTTGTTCTTTGAACACTGAGACAAGATCATTAACTAAATCATCAACCAA
CGTAGATACTATCTCTCCCTCGATGTCAATGCCTTCTTCATAAGTCTCCCTCTCGAAATC
AAGCCAACTCCCTTCCAAACTGCTCATCTCTTTGTCAACAAGCTCGTCCATCATCATCTC
CCTCATCTTCTTCAACCCTTGAACCTCTCTGTTCAGTTCCTCAGCTAACCAATCTCTATG
TTCAAACAGAATCCCCTCTTTCCCCAATATCCCTCTGCAGGTACCCCTAACCATCTGCTC
GCATTTAAGTGTTAAGGAGTTATTGACAAAATCAAATACAGTCCTTCTCCTGAGCCTGGC
TGCTGTTGCTTCTCCACGACCCTCCATTTCATCAAAGAGGCTCGCAGGTAATATATCAGC
AGCCATTCCCAAAGAAAACTCTTTCACCATCAGTTGGTCAGAACCGAGGATATCAGATAT
GTACTCAAGCTCCCAG
C

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL3846Contig1 860 2 2 U
GGTTAAACCAATTCCTTCTCTGTTCTTTATCTTGAGGTGAAAATGGCTAGCGACGAAGTG
AAGGTGATCGGTGCATGGGCGAGTCCTTTTGTGATGAGGCCGAGGATTGCTCTGAACCTC
AAGTCTGTTTCCTACGAGTTCCTCCAGGAGACATTTGGTTCTAAGAGCGAGTTGCTTCTT
AAATCAAACCCGGTTCACAAGAAGATTCCCGTTCTGATTCATGCTGACAAACCGGTTTGT
GAATCTAACATCATCGTTGAGTATGTTGATGAGACTTGGAGCACATCTGGACCGTCCATG
CTACCTTCTAATCCTTATGACCGAGCCATCGCTCGGTTCTGGGCTGCCTACATTGACGAA
AAGTGGTTTCCCTCTCTAAAAAGTATCCTACAAGCTGAGGGAGAAGAAGAGAAGAAAGCT
GTGCTAGCTCAAGTGGAAGAAGGGACCGCGCTTCTCGAGAAGGCCTTCATCGATTGCAGC
AAAGGAAAACCATTCTTCAACGGTGAACACGTTGGTTACCTCGACATTGCATTCGGGTGC
TTCCTTGGTTGGTTGAGAGTCACCGAGTTGGCAGCTGGTCATAAAGTTCTTGATGAGGCC
AAGACTCCTTCTCTATCCAAATGGGCTGAGCAATTTTGTAACGATCCTGCTGTGAAACCT
GTCATGCCCGACACTGCAACTCTGGCTGAATTCGCTAAGAAGATTTTCGCCAAGCCTGCG
GCCTAAGTTGATGGTTGTGGTCCTTGTGTATTTGTGGGATGAGTTCTTGCAAGAATAAAA
TGAGAGTGATAGTACTTACTTATTTATGTTTTAATTTTATTTAGCATTGTTGCTAAGTGT
ATTTGGGATATTAAGTTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1H360TF U 1
AF RS1H360JQB C 216
BS 1 570 RS1H360TF
BS 571 860 RS1H360JQB

RD RS1H360TF 570 0 0
GGTTAAACCAATTCCTTCTCTGTTCTTTATCTTGAGGTGAAAATGGCTAGCGACGAAGTG
AAGGTGATCGGTGCATGGGCGAGTCCTTTTGTGATGAGGCCGAGGATTGCTCTGAACCTC
AAGTCTGTTTCCTACGAGTTCCTCCAGGAGACATTTGGTTCTAAGAGCGAGTTGCTTCTT
AAATCAAACCCGGTTCACAAGAAGATTCCCGTTCTGATTCATGCTGACAAACCGGTTTGT
GAATCTAACATCATCGTTGAGTATGTTGATGAGACTTGGAGCACATCTGGACCGTCCATG
CTACCTTCTAATCCTTATGACCGAGCCATCGCTCGGTTCTGGGCTGCCTACATTGACGAA
AAGTGGTTTCCCTCTCTAAAAAGTATCCTACAAGCTGAGGGAGAAGAAGAGAAGAAAGCT
GTGCTAGCTCAAGTGGAAGAAGGGACCGCGCTTCTCGAGAAGGCCTTCATCGATTGCAGC
AAAGGAAAACCATTCTTCAACGGTGAACACGTTGGTTACCTCGACATTGCATTCGGGTGC
TTCCTTGGTTGGTTGAGAGTCACCGAGTTG

QA 1 570 1 570
DS 

RD RS1H360JQB 645 0 0
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TTGGAGCACATCTGGACCGTCCATGCTACCTTCTAATCCTTATGACCGAGCCATCGCTCG
GTTCTGGGCTGCCTACATTGACGAAAAGTGGTTTCCCTCTCTAAAAAGTATCCTACAAGC
TGAGGGAGAAGAAGAGAAGAAAGCTGTGCTAGCTCAAGTGGAAGAAGGGACCGCGCTTCT
CGAGAAGGCCTTCATCGATTGCAGCAAAGGAAAACCATTTTTCAACGGTGAACACGTTGG
TTACCTCGACATTGCATTCGGGTGCTTCCTTGGTTGGTTGAGAGTCACCGAGTTGGCAGC
TGGTCATAAAGTTCTTGATGAGGCCAAGACTCCTTCTCTATCCAAATGGGCTGAGCAATT
TTGTAACGATCCTGCTGTGAAACCTGTCATGCCCGACACTGCAACTCTGGCTGAATTCGC
TAAGAAGATTTTCGCCAAGCCTGCGGCCTAAGTTGATGGTTGTGGTCCTTGTGTATTTGT
GGGATGAGTTCTTGCAAGAATAAAATGAGAGTGATAGTACTTACTTATTTATGTTTTAAT
TTTATTTAGCATTGTTGCTAAGTGTATTTGGGATATTAAGTTTGT

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 3

CO CL3847Contig1 1046 3 25 U
GGAAGACACAACAGATGTTGAACTGCTCGTCGGCGTTCCAAAGAGTAGCAGCCTCCTTAA
TAATGTTCATGGCTCCCAAGTTAAAACCTCAGCGACTACTCCATCAAAGTATTGCAGAGA
GTGGTGGCGGTGAGCAAGTGGTTAAGAAAGCTAGGACGATGACTACCCAATCCTCAATGA
AAGATGCTTTCTCTGCATACGCTGATTATCTCAACAACTTCAATGAGAAACGAGAGAGAG
TGGTGAAGGCAAGTCGTGACATCACTATGAACAGTAAAAAAAGTCATCTTTCAGGTTCAC
AGGCTCAGTAAAGACAACAAAGAGGAGGTTCTGGAGAAAGCAGGGAAAGATTTAGAAGCA
GTGAGGGAACAACACTTTGCCCGGCTGATGAAAGAGCTTCAGGGCACTGATTTTTGGAAG
CTCCGGCGAGCTTATTCCCCAGGGGTGCAGGAGTACGTTGAAGCTGCAACGTTTTACAAG
TTCTGTGTGTCCGGAACACTCTCTACTCTCGATGAGATTAACGCCACGCTTTTACCGCTT
AGTGACCCTTCTTTAGAGCCGCTGCAGATCAACATCCTTGACTATATTCTCGGGCTTGCG
GATTTGACTGGAGAGCTAATGAGGATGGCGATTGGTCGGATATCAGACGGTGAAGTCGAG
TTCGCGCAGAGGATTTGTCAGTTTGTCAGACAGATTCATAGGGAACTGTTGCTTGTTGTG
CCTCAGATGGATGAGAGTTACGACATGAAGTCAAAGATGGAAGTGATGCTTCAAAGTGTG
ATCAAAATAGAGAATGCTTGCTTTAGCGTTCACGTGAGAGGATCAGAGTATATTCCGCTG
CTTGGAGATGATGCACCAACGCCATTCCTATTGGGAGGTGCTGATGTTAAATGATTTAAG
AAGTGAGTTCGGACACAACTCTAGGATCTTGTTAAGGTTGGTATGTTTTTTGGCCGTTAT
TGTGAGAAAACGAGGATCACTTTAGTATGGATGCTATGTTGCAAGACTTTCAACATTTTA
AGTATGAATGGTATTTGTTCTTGTTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RS1DT46TF U 1
AF RS1A688JQ C 203
AF RS1A688TF U 203
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GTGAGGGAACAACACTTTGCCCGCCTGATGAAAGAGCTTCAAGGCACTGATTTTTGGAAG
CTCCGGCGAGCTTATTCCCCAGGGGTGCAGGAGTATGTTGAAGCTGCAACGTTTTACAAG
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AGTGACCCTTCTTTAGAGCCGCTGCAGATCAACATCCTTGACTATATTCTCGGGCTTGCG
GATTTGACTGGAGAGCTAATGAGGATGGCGATCGGTCGGATATCAGATGGTGAAGTCGAG
TTCGCGCAGAGGATTTGTCAGTTTGTCAGACAGATTCATAGGGAA

QA 1 705 1 705
DS 

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G
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TACTCTCGATGAGATTAACGCCACGCTTTTACCGCTTAGTGACCCTTCTTTAGAGCCGCT
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GATGGCGATTGGTCGGATATCAGACGGTGAAGTCGAGTTCGCGCAGAGGATTTGTCAGTT
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AGTATGGATGCTATGTTGCAAGACTTTCAACATTTTAAGTATGAATGGTATTTGTTCTTG
TTC

QA 2 844 2 844
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G
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ACTATGAACAGTAAAAAAAGTCATCTTTCAGGTTCACAGGCTCAGTAAAGACAACAAAGA
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GGTGCAGGAGTACGTTGAAGCTGCAACGTTTTACAAGTTCTGTGTGTCCGGAACACTCTC
TACTCTCGATGAGATTAACGCCACGCTTTTACCGCTTAGTGACCCTTCTTTAGAGCCGCT
GCAGATCAACATCCTTGACTATATTCTCGGGCTTGCGGATTTGACTGGAGAGCTAATGAG
GATGGCGATTGGTCGGATATCAGACGGTGAAGTCGAGTTCGCGCAGAGGATTTGTCAGTT
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CATGAAGTCAAAGATGGAAGTGATGCTTCAAAGTGTGATCAAAATAGAGAATGCTTGCTT
TAGCGTTCACGTGAGAGGATCAGAGTATATTCCGCTGCTTGGAGATGATGCACCAACGCC
ATTCCTATTGGGAGGTGCTGATGTTAAATGATTTAAGAAGTGAGTTCGGACACAACTCTA
GGATCTTGTTAAG*TTGGTATGTTTTTTGGCCGTTATTGTGAGAAAACGAGGATCACTTT
AGTATGGATGCTATGTTGCAAGACTTTCA*CATTTTAAGTATGAATGGTATTTGTTCT
GTTC

QA 2 839 2 839
DS 



AS 1 3

CO CL3848Contig1 723 3 5 U
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GCGGTTCATAGGAGATGACAATGGAAACGTGAAAGGGCTTGAACTTGTGCGTGTGAGTTG
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CGAAGCGGATCTTGTTTTCTTGGCCATGGGATTCCTTGGACCTGAGCCAACACTTGCTGA
GAAGCTAGGACTAGAATGCGACAACAGGTCGAACTTCAAGGCGGAGTACGGCAGATTCTC
CACAACTGTGGAAGGTGTTTTTGCAGCGGGGGATTGTCGGAGAGGCCAGTCTTTGGTGGT
ATGGGCCATCTCAGAAGGACGTCAAGCTGCATCTCAGGTGGACAAGTTCCTCAGCAAAGA
CGAGGATGACCTAGTTGGCGCAAAGCTCGAACAAAATCTCAACGAGATGAAGCACCGACA
CTAGGGAGAAAGCCTTGAATCTGAAGCAAAAGTCGAGAAGAATCGAAGAAATGCTTTTTA
GGGTTTCTTTTGTCTTTTGTTTATTATCGTTCATATAGTAATAATGAGTATGGATTACAT
TTTTCTTGGTAGGGTTTCTTCCTTAGCTTTATTTTGTTAATGCTTTTGGAATTGAATTTC
TTTTGTTTTTCTCTATGACTTTGCTTTGGATTTGAACATAAGGAATGGCAATGCAAAAAA
AAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1FU94TF U 123
AF RS1GF88JQ C 48
AF RS1GF88TF U 1
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BS 703 703 RS1GF88JQ
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RD RS1FU94TF 529 0 0
G
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GGATGACCTAGTTGGCGCAAAGCTCGAACAAAATCTCAACGAGATGAAGCACCGACACTA
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TTTCTTTTGTCTTTTGTTTATTATCGTTCATATAGTAATAATGAATATGGATTACATTTT
TCTTGGTAGGGTTTCTTCCTTAGCTTTATTTTGTTAATGCTTTTGGAA

QA 2 529 2 529
DS 

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CTGAGGAGATAATCGAAGCGGATCTTGTTTTCTTGGCCATGGGATTCCTTGGACCTGAGC
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ACGGCAGATTCTCCACAACTGTGGAAGGTGTTTTTGCAGCGGGGGATTGTCGGAGAGGCC
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TCCTCAGCAAAGACGAGGATGACCTAGTTGGCGCAAAGCTCGAACAAAATCTCAACGAGA
TGAAGCACCGACACTAGGGAGAAAGCCTTGAATCTGAAGCAAAAGTCGAGAAGAATCGAA
GAAATGCTTTTTAGGGTTTCTTTTGTCTTTTGTTTATTATCGTTCATATAGTAATAATGA
GTATGGATTACATTTTTCTTGGTAGGGTTTCTTCCTTAGCTTTATTTTGTTAATGCTTTT
GGAATTGAATTTCTTTTGTTTTTCTCTATGACTTTGCTTTGGATTTGAACATAAGGAATG
GCAATGC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RS1GF88TF 723 0 0
GCACCAAGAAGCTGCGACCAAGTTTGGAAAAGATCCTAGAACATATGAAGTCTTGACCAA
GCGGTTCATAGGAGATGACAATGGAAACGTGAAAGGGCTTGAACTTGTGCGTGTGAGTTG
GGAGAAGGATGAATCCGGAAGGTTCCAGTTCAAGGAGATTGAAGGCTCTGAGGAGATAAT
CGAAGCGGATCTTGTTTTCTTGGCCATGGGATTCCTTGGACCTGAGCCAACACTTGCTGA
GAAGCTAGGACTAGAATGCGACAACAGGTCGAACTTCAAGGCGGAGTACGGCAGATTCTC
CACAACTGTGGAAGGTGTTTTTGCAGCGGGGGATTGTCGGAGAGGCCAGTCTTTGGTGGT
ATGGGCCATCTCAGAAGGACGTCAAGCTGCATCTCAGGTGGACAAGTTCCTCAGCAAAGA
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CTAGGGAGAAAGCCTTGAATCTGAAGCAAAAGTCGAGAAGAATCGAAGAA*TGCTTTTTA
GGGTTTCTTTTGTCTTTTGTTTATTATCGTTCATATAGTAATAATGAGTATGGATTACAT
TTTTCTTGGTAGGGTTTCTTCCTTAGCTTTATTTTGTTAATGCTTTTGGAATTGAATTTC
TTTTGTTTTTCTCTATGACTTTGCTTTGGATTTGAACATAAG*AATGGCAATGCAAAAAA
AAA

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 3

CO CL3849Contig1 1151 3 6 U
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TTTGAATTTTTTTTTCAAAAATGTTTGATCATCTGAAACTGGCGCGATGCTTCAGCTTCA
CGGCATCGCGCGATTGGTTATTCAAACAATCATTCTCAAACGCCGGTCTCTGTTCCGTCA
TCACCGATCTCTCCCACAACAATCCCCTCTCATCGACGACGACGTCTATGCATTGTTGGA
TCCCTAAATCTCCAAACCGATCGAAACCTAATCTCCTCCTCCTCCACGGCTTCGGGGCAA
ACGCAATGTGGCAATACGGAGAACACCTCCGAGCTCTCACAGGCCGGTTCAACGTATACG
TCCCTGACCTCCTCTTCTTCGGTTTATCTTCCACGTCGGAACCGAACCGGTCCGAATCTT
TCCAGGCTCAATGTCTGATGAGGCTAATGGAAGCGCTTGGTGTCAAGAGGATGAGCATTG
TTGGAATCAGCTACGGTGGATTTGTAGGGTACAGTTTAGCGGCGCAGTTTCCGGAGAAAG
TGGAGAAGATTGTGCTGTGCTGCGCAGGGGTTTGCCTTGAGGAGAAAGATATGGAGGATG
GGTTGTTTAAGGTTCCGAATCTTGAAGAAGCCACTGGGATTTTGATTCCTCAGACGCCGG
AGAAGCTTAAGGAGCTTATTAGATTCTCTTTCGTTAAGCCTATCAAAGGTGTTCCATCGT
TTTTTCTTTGGGACTTTATAGATGTAATGTGTATGGAGTTTGTAGAGGAGAAGAGAGATT
TGATCAAATCATACTTAAAGATCGGAGACTTTCAGATCTTCCTAGGATCAAACAGAAATC
TTTGATCATATGGGGAGAAGAAGATCAAATATTTCCACTTGAGCTTGGTTACAGATTAAA
AAGACATATAGGAGACAATGCAGAGATAATGGTGATCAAGAAGGCAGGACATGCTGTGAA
TTTGGAGAAGTCTAAAGAGTTCCTCAAGCACTTGAAATCCTTTCTCATTGACTCTTTGTG
AACTACTGTTTTGTTTATCTATTCTTATAGATTGATAACCAATAGTTCCTCGAACACTTG
AGATCTTCTAATCTCTCATTGACTCTTTATGAACTACTGTATTTTTTTTTAATTAGTGAA
CTACTGTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TGTGCTGC

QA 1 488 1 488
DS 

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TCACCGATCTCTCCCACAACAATCCCCTCTCATCGACGACGACGTCTATGCATTGTTGGA
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ACGCAATGTGGCAATACGGAGAACACCTCCGAGCTCTCACGGGCCGGTTCAACGTATACG
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QA 1 637 1 637
DS 

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TGAATTTGGAGAAGTCTAAAGAGTTCCTCAAGCACTTGAAATCCTTTCTCATTGACTCTT
TGTGAACTACTGTTTTGTTTATCTATTCTTATAGATTGATAACCAATAGTTCCTCGAACA
CTTGAGATCTTCTAATCTCTCATTGACTCTTTATGAACTACTGTATTTTTTTTTAATTAG
TGAACTACTGTTTTT

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 3

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AAATCAGACCTTGCCCTTCCACAAACCCAGGATGTGTATCAACGAACCCCACCTCTTCTT
CCTTCACATTTCCATTGACGATCCCAGAAACTGATACACAGGATCCAATCCAGAAACTGA
AGGAAGCAATAACCAAAACCCAGAAGAATCCCAAGTTTGTAGTTATTGAAGATAAACCAG
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CACTTTACAAGTTCAGATACTGAGAGACGGTGTATGAGTTTCTTTTGAGGATCAAAGAAA
AGCTATGAATGGGAGAGCCTTTAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CN95TF U 117
AF RS1EP27TF U 1
AF RS1CN95JQ C 252
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BS 658 864 RS1CN95JQ

RD RS1CN95TF 283 0 0
G
AACCCTCATCATCCCCTTCTACAGTCTCTCTATTACCAAAGCTAATATCTTTTGCTCTTG
CCCTCTCTCTAAACTCCTCATCTGCCCCTGCTGCCTTAGCCATTCCTTCTCTCTCCTCTT
CTCAGCCTCTCACTACTCCTTTCACCCAATCCAAGTTCAACCAGACCGGTCTTCTCAATG
GAAAAATCAGACCTTGCCCTTCCACAAACCCAGGATGTGTATCAACGAACCCCACCTCTT
CTTCCTTCACATTTCCATTGACGATCCCAGAAACTGATACAC

QA 2 283 2 283
DS 

RD RS1EP27TF 657 0 0
GGGATACAAACATGACTTTGGTCGCCAATTTGCAACTCAACATTCTTCCGCAACGGCCGA
GAAGCAGCTGCACCACCAAGCTCGTGTGTTCATTGAAAAACTCAACAACAACACAACAAC
CCTCATCATCCTCTTCTACAATCTCTCTATTACCAAAGCTAATATCTTTCGCTCTTGCCC
TCTCTCTAAACTCCTCATCTGCCCCTGCTGCCTTGGCCATTCCTTCTCTCTCCTCTTCTC
AGCCTCTCACCACTCCTTTCACCCAATCCAAGTTCAACCAGACCGGTCTTCTCAATGGAA
AAATCAGACCTTGCCCTTCCACAAACCCAGGATGTGTATCGACGAACCCCACCTCTTCTT
CCTTCACATTTCCATTGACGATCCCAGAAACTGATACACAGGATCCAATCCAGAAACTGA
AGGACGCAATAGCCAAAACCCAGAAGAATCCCAAGTTTGTAGTTATTGAGGATAAACCAG
AAGGGAGATATTTGGAGGCGGAGGTAGAAGGAGGAGGATTTAACCAGGGCAGAGATGTGA
TGGAGTTTCTGGTGAAGGGAGATGTGGTTGCTTACAGGTGTATGGCTACTAAGGTTACGT
TTGTGTACCCATTCACCACTGCTTTTGGAGACTCCAAGGGACAAGAGGAGAGGATGA

QA 1 657 1 657
DS 

RD RS1CN95JQ 613 0 0
ACTCCTTTCACCCAATCCAAGTTCAACCAGACCGGTCTTCTCAATGGAAAAATCAGACCT
TGCCCTTCCACAAACCCAGGATGTGTATCAACGAACCCCACCTCTTCTTCCTTCACATTT
CCATTGACGATCCCAGAAACTGATACACAGGATCCAATCCAGAAACTGAAGGAAGCAATA
ACGAAAACCCAGAAGAATCCTAAGTTTGTGGTTATTGAAGATAAACCAGAAGGGAGATAT
TTGGAGGCGGAGGTAGAAGGAGGAGGATTTAATCAGAGCAGAGATGTGATGGAGTTTCTG
GTGAAGGGAGATGTGGTTGCTTACAGGTGTATGGCTACTAAGGTTACGTTTGTGTATCCT
TTCACCACTGCTTTTGGAGACTCCAAGGGACAGGAGGAGAGGATGAAGAAGCTCTTGATG
AGCTTGGTTGGTTTGCTCCTACCTTTGACATGGAGGAGTCTTCTCTTAATGCCTTCCCTT
ATAACAATTAGCTGCTTCGTCTTTTTTCTTTTGTTTGTTTTTAATTTATCACTTTACAAG
TTCAGATACTGAGAGACGGTGTATGAGTTTCTTTTGAGGATCAAAGAAAAGCTATGAATG
GGAGAGCCTTTAC

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 3

CO CL3851Contig1 779 3 4 U
GTCCACACAAAAAAAAAAAAAAATGGCTCTCACCTTGAGCACCGGTGGCGGAGGAGCTAG
CCTCCGCTCCATAGACCTCACGAATTCTTCTCGTAATCCCTTCTCCACCTCCAAACTCCA
TTACCCATCGAGAGCCCGTCTTCACATAGTCTCTGCCTCCAAAAAAACATCCTCCCAAAC
CGGTCGGTTCGACAGCAAGAAGCGTCGGACCCTCGTCCCGACAACAACAACCAAAGAACA
GCCGGAAGAAAGCAACGGTCTCTACGACGAGAACCCGCCTTCTCAGCTCGAAACCGCCTA
CGACGATGACGACGAAGATAGGTTTGCGGTGAACACACGCTTCAGAGGCGATCCAAAAGA
CGCGCCAAAGATTTCGGTTAAGGATCTTCCCGGGCTTGAACCGGATCCATTCGAAGGTCC
TCAGTGGGATGGTTTAGGGTTCTTCGTTCAATACCTATGGGCTTTCGGGATCCTCTTCGC
GTTAATCTCCGGTGCTATTGCGGCGGGGACGTACAACGAAGGTGCGACGGACTTCAAGGA
GACGCCAGTGTATAAGGAGGCGATGGAGTCACGTGACCTTCTTGATGAATCAGAGGGTTC
GAACTCTGAAGATGTGTTCGAGTCTAATCCGACAGAAGTGGCGCCTAGTTTGGAATAGTT
TTTAAGTTCTATGTGCTTTAGATGTGTTTGAAGCATATCATGAGCTTCTTGTGTTCATAA
ATGTTACAGAATCAAAAAGCTAAAGTGATTACTAAACCAAGAGTTCTGTTTTTTTTACG


BQ
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AF RS1AI40TF U 1
AF RS1BA66JQ C 508
AF RS1BA66TF U 508
BS 1 675 RS1AI40TF
BS 676 676 RS1BA66TF
BS 677 769 RS1AI40TF
BS 770 779 RS1BA66TF

RD RS1AI40TF 769 0 0
GTCCACACAAAAAAAAAAAAAAATGGCTCTCACCTTGAGCACCGGTGGCGGAGGAGCTAG
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TTACCCATCGAGAGCCCGTCTTCACATAGTCTCTGCCTCCAAAAAAACATCCTCCCAAAC
CGGTCGGTTCGACAGCAAGAAGCGTCGGACCCTCGTCCCGACAACAACAACCAAAGAACA
GCCGGAAGAAAGCAACGGTCTCTACGACGAGAACCCGCCTTCTCAGCTCGAAACCGCCTA
CGACGATGACGACGAAGATAGGTTTGCGGTGAACACACGCTTCAGAGGCGATCCAAAAGA
CGCGCCAAAGATTTCGGTTAAGGATCTTCCCGGGCTTGAACCGGATCCATTCGAAGGTCC
TCAGTGGGATGGTTTAGGGTTCTTCGTTCAATACCTATGGGCTTTCGGGATCCTCTTCGC
GTTAATCTCCGGTGCTATTGCGGCGGGGACGTACAACGAAGGTGCGACGGACTTCAAGGA
GACGCCAGTGTATAAGGAGGCGATGGAGTCACGTGACCTTCTTGATGAATCAGAGGGTTC
GAACTCTGAAGATGTGTTCGAGTCTAATCCGACAGAAGTGGCGCCTAGTTTGGAATAGTT
TTTAAGTTCTATGTGTTTTAGATGTGTTTGAAGCATATCATGAGCTTCTTGTGTTCATAA
ATGTTACAGAATCAAAAAGCTAAAGTGATTACTAAACCAAGAGTTCTGT

QA 1 769 1 769
DS 

RD RS1BA66JQ 272 0 0
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GTCACGTGACCTTCTTGATGAATCAGAGGGTTCGAACTCTGAAGATGTGTTCGAGTCTAA
TCCGACAGAAGTGGCGCCTAGTTTGGAATAGTTTTTAAGTTCTATGTGCTTTAGATGTGT
TTGAAGCATATCATGAGCTTCTTGTGTTCATAAATGTTACAGAATCAAAAAGCTAAAGTG
ATTACTAAACCAAGAGTTCTGTTTTTTTTACG

QA 1 272 1 272
DS 

RD RS1BA66TF 272 0 0
GACGTACAACGAAGGTGCGACGGACTTCAAGGAGACGCCAGTGTATAAGGAGGCGATGGA
GTCACGTGACCTTCTTGATGAATCAGAGGGTTCGAACTCTGAAGATGTGTTCGAGTCTAA
TCCGACAGAAGTGGCGCCTAGTTTGGAATAGTTTTTAAGTTCTATGTGCTTTAGATGTGT
TTGAAGCATATCATGAGCTTCTTGTGTTCATAAATGTTACAGAATCAAAAAGCTAAAGTG
ATTACTAAACCAAGAGTTCTGTTTTTTTTACG

QA 1 272 1 272
DS 



AS 1 2

CO CL3852Contig1 896 2 2 U
GGCGACAAGAAGCTATGGGAAGTCGCAGGTCACAAGAAAGACGGTGACAAACCTTTCATC
ACATTCAAATATCACAGCGGCGATGGAGAAGAAGGCTATCCCGGTGCTGTTACTGTCACG
GCGACATACACTCTCACGTCAGCCACGACCATGAGACTCGACATGGAGGCAGTTCCTGAG
AACAAAGACACTCCCATCAATTTAGCTCAACATACATACTGGAACTTATCGGGTCACGAC
TCAGGAAACATTCTTGACCACAGGATCCAAATCTGGGGTTCTCATATCACCCCCGTGGAT
CAACACTCAGTTCCTACAGGAGAGCTCTTGCCGGTGAAAGGAACTCCTTTCGATTTCACC
GAGGAGAAACGGATAGGAGAGCGTATAGGAGAGGTGGGAATTGGGTACTATCACAACTAC
GTGTTGGGCTGTCCTGATCAAGAGAAAGACGGACTGAAACACGTGGCGAGGCTTAGAGAC
GGTGAGAGCTCAAGGGTGATGGACTTGTGGACCGATGCTCCCGGTGTGCAGTTTTATACG
GGGAACTATGTGGATGGAGTGGTGGGGAAAGGGAATGCGGTTTATGGGAAGCATTCAGGT
GTGTGCCTTGAGACGCAAGGGTTCCCGAACGCGATTAATCAGAATAGTTTCCCGTGTGTT
GTAGTTAAGGCAGGTGAGAAGTACAAGCACACTATGCTGTTTGAGTTTTCAGCTTGAGTG
AAACTGGTGGTAGTGATGGTGCTGGATGGATGTGTTTTAGGTGTTAGATTTTGGGATAAA
TAAAATGCCGGTTCGTTGGTTCATAGAACCGGAAAAGAGTAATTGTAGTTTTATCTTTTG
TCACTATGATCTCCATATTGAATTTCTTTTAGTACTGATTTATTATTTTATCACAG


BQ
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AF RS1CH12TF U 1
AF RS1CH12JQ C 277
BS 1 587 RS1CH12TF
BS 588 896 RS1CH12JQ

RD RS1CH12TF 587 0 0
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GCGACATACACTCTCACGTCAGCCACGACCATGAGACTCGACATGGAGGCAGTTCCTGAG
AACAAAGACACTCCCATCAATTTAGCTCAACATACATACTGGAACTTATCGGGTCACGAC
TCAGGAAACATTCTTGACCACAGGATCCAAATCTGGGGTTCTCATATCACCCCCGTGGAT
CAACACTCAGTTCCTACAGGAGAGCTCTTGCCGGTGAAAGGAACTCCTTTCGATTTCACC
GAGGAGAAACGGATAGGAGAGCGTATAGGAGAGGTGGGAATTGGGTACTATCACAACTAC
GTGTTGGGCTGTCCTGATCAAGAGAAAGACGGACTGAAACACGTGGCGAGGCTTAGAGAC
GGTGAGAGCTCAAGGGTGATGGACTTGTGGACCGATGCTCCCGGTGTGCAGTTTTATACG
GGGAACTATGTGGATGGAGTGGTGGGGAAAGGGAATGCGGTTTATGG

QA 1 587 1 587
DS 

RD RS1CH12JQ 620 0 0
GGTTCTCATATCACCCCCGTGGATCAACACTCAGTTCCTACAGGAGAGCTCTTGCCGGTG
AAAGGAACTCCTTTCGATTTCACCGAGGAGAAACGGATAGGAGAGCGTATAGGAGAGGTG
GGAATTGGGTACTATCACAACTACGTGTTGGGCTGTCCTGATCAAGAGAAAGACGGACTG
AAACACGTGGCGAGGCTTAGAGACGGTGAGAGCTCAAGGGTGATGGACTTGTGGACCGAT
GCTCCCGGTGTGCAGTTTTATACGGGGAACTATGTGGATGGAGTGGTGGGGAAAGGGAAT
GCGGTTTATGGGAAGCATTCAGGTGTGTGCCTTGAGACGCAAGGGTTCCCGAACGCGATT
AATCAGAATAGTTTCCCGTGTGTTGTAGTTAAGGCAGGTGAGAAGTACAAGCACACTATG
CTGTTTGAGTTTTCAGCTTGAGTGAAACTGGTGGTAGTGATGGTGCTGGATGGATGTGTT
TTAGGTGTTAGATTTTGGGATAAATAAAATGCCGGTTCGTTGGTTCATAGAACCGGAAAA
GAGTAATTGTAGTTTTATCTTTTGTCACTATGATCTCCATATTGAATTTCTTTTAGTACT
GATTTATTATTTTATCACAG

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 3

CO CL3853Contig1 1124 3 7 U
GGATATACCCAAATCATAAACCCTCTCCTCTTTCGTCTCTCTCTCTCATTTCTTAATTTT
TTCTTGGGGAGCAAGATGGGAAGTCAAGCAGCGGTTTCTTTCCTCACGAACTTAGCGAAG
GCGGCCTTCGGTCTCGGAGTGTCTGCGACGGTTCTGTCCTCGTCTCTCTACACTGTCGAT
GGTGGCGAGAGAGCGGTGCTCTTCGATCGGTTCCGAGGAGTGTTGGATCAGACCGTCGGC
GAAGGGACTCACTTCCTGATACCCATTCTCCAGAGGCCTCACATCTTCGACATCCGCACG
AAGCCACACACTTTCTCCTCCGTGTCCGGTACCAAGGATCTCCAGATGGTTAATCTCACC
CTTCGTGTTCTCTCTCGCCCCGAGGTTTCGCGTCTGCCCACCATTTTCCAAACATTGGGT
CTCGAGTATGACGAAAAGGTTCTTCCCTCCATTGGAAACGAGGTCTTGAAGGCTGTGGTT
GCTCAGTTCAATGCTGACCAGCTCCTCACTGAGCGTCCTCAAGTGTCGGCACTTGTCCGT
GACTCTCTCATTAAGAGAGCTAGGGACTTCAACATTGAGCTCGACGATGTTGCCATCACG
CACTTGTCATACGGTATGGAGTTCTCGAGGGCTGTGGAGGCGAAGCAAGTGGCTCAGCAC
GAAGCCGAGAGGTCCAAGTTTGTGGTGATGAAGGCTGATCAGGAGAGGAGAGCTGCGGTT
ATTAGAGCTGAAGGTGAGAGTGAAGCTGCTCAGTTGATATCTGATGCGACTGCTAAAGCA
GGGATGGGGCTGATCGAGCTCAGGAGGATTGAGGCTTCGAGGGAGGTTGCAGCTACACTG
GCTAGGTCTCCGAACGTGGCCTACTTACCCGGTGGTCAAAGCATGCTCTTTAACCTGAAC
GCTGGTCGTTGAGCAAGCGAGTGATGGGAAGAGGAGAGCTTAAGTGACAAGGAAAACGAT
GGAGTTGTGAATTTATCCTTTCTTTCTGATGAACAATGTGAAAAAAATTAACTTTTAAGT
TGCTATATTGAGCCTTTTAGGTTATTTCTGTTTTGAATCCGAGGCTAAAGTTTTTTTTGT
TATAACACTGTTTCCTCTCCCCTCTACTATGGATTTGTTTGGCC


BQ
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AF RS1G346TF U 1
AF RS1C885TF U 23
AF RS1G346JQ C 520
BS 1 305 RS1G346TF
BS 306 306 RS1C885TF
BS 307 307 RS1G346TF
BS 308 308 RS1C885TF
BS 309 656 RS1G346TF
BS 657 691 RS1C885TF
BS 692 1124 RS1G346JQ

RD RS1G346TF 656 0 0
GGATATACCCAAATCATAAACCCTCTCCTCTTTCGTCTCTCTCTCTCATTTCTTAATTTT
TTCTTGGGGAGCAAGATGGGAAGTCAAGCAGCGGTTTCTTTCCTCACGAACTTAGCGAAG
GCGGCCTTCGGTCTCGGAGTGTCTGCGACGGTTCTGTCCTCGTCTCTCTACACTGTCGAT
GGTGGCGAGAGAGCGGTGCTCTTCGATCGGTTCCGAGGAGTGTTGGATCAGACCGTCGGC
GAAGGGACTCACTTCCTGATACCCATTCTCCAGAGGCCTCACATCTTCGACATCCGCACG
AAGCCCCGCACTTTCTCCTCCGTGTCCGGTACCAAGGATCTCCAGATGGTTAATCTCACC
CTTCGTGTTCTCTCTCGCCCCGAGGTTTCGCGTCTGCCCACCATTTTCCAAACATTGGGT
CTCGAGTATGACGAAAAGGTTCTTCCCTCCATTGGAAACGAGGTCTTGAAGGCTGTGGTT
GCTCAGTTCAATGCTGACCAGCTCCTCACTGAGCGTCCTCAAGTGTCGGCACTTGTCCGT
GACTCTCTCATTAAGAGAGCTAGGGACTTCAACATTGAGCTCGACGATGTTGCCATCACG
CACTTGTCATACGGTATGGAGTTCTCGAGGGCTGTGGAGGCGAAGCAAGTGGCTCA

QA 1 656 1 656
DS 

RD RS1C885TF 675 0 0
GGGTCTCTCTCTC
TCTCTCTCTCTCATTTCTTAATTTTTTCTTGGGGAGCAAGATGGGAAGTCAAGCAGCGGT
TTCTTTCCTCACGAACTTAGCGAAGGCGGCCTTCGGTCTCGGAGTGTCTGCGACGGTTCT
GTCCTCGTCTCTCTACACTGTCGATGGTGGCGAGAGAGCGGTGCTCTTCGATCGGTTCCG
AGGAGTGTTGGATCAGACCGTCGGCGAAGGGACTCACTTCCTGATACCCATTCTCCAGGG
GCCTCACATCT**GACATCCGCACGAAGCCACACACTTTCTCCTCCGTGTCCGGTACTAA
GGATCTCCAGATGGTTAATCTCACCCTTCGTGTTCTCTCTCGCCCCGAGGTTTCGCGTCT
GCCCACCATTTTCCAAACATTGGGTCTCGAGTATGACGAAAAGGTTCTTCCCTCCATTGG
AAACGAGGTCTTGAAGGCTGTGGTTGCTCAGTTCAATGCTGATCAGCTCCTCACTGAGCG
TCCTCAAGTGTCGGCACTTGTCCGTGACTCTCTCATTAAGAGAGCTAGGGACTTCAACAT
TGAGCTCGACGATGTTGCCATCACGCACTTGTCATACGGTATGGAGTTCTCGAGGGCTGT
GGAGGCGAAGCAAGTGGCTCAGCACGAAGCCGAGAGGTCCAAGTTTGTGGTGATGA
GGCTGA

QA 14 669 14 669
DS 

RD RS1G346JQ 605 0 0
CAAGTGTCGGCACTTGTCCGTGACTCTCTCATTAAGAGAGCTAGGGACTTCAACATTGAG
CTCGACGATGTTGCCATCACGCACTTGTCATACGGTATGGAGTTCTCGAGGGCTGTGGAG
GCGAAGCAAGTGGCTCAGCAGGAAGCCGAGAGGTCCAAGTTTGTGGTGATGAAGGCTGAT
CAGGAGAGGAGAGCTGCGGTTATTAGAGCTGAAGGTGAGAGTGAAGCTGCTCAGTTGATA
TCTGATGCGACTGCTAAAGCAGGGATGGGGCTGATCGAGCTCAGGAGGATTGAGGCTTCG
AGGGAGGTTGCAGCTACACTGGCTAGGTCTCCGAACGTGGCCTACTTACCCGGTGGTCAA
AGCATGCTCTTTAACCTGAACGCTGGTCGTTGAGCAAGCGAGTGATGGGAAGAGGAGAGC
TTAAGTGACAAGGAAAACGATGGAGTTGTGAATTTATCCTTTCTTTCTGATGAACAATGT
GAAAAAAATTAACTTTTAAGTTGCTATATTGAGCCTTTTAGGTTATTTCTGTTTTGAATC
CGAGGCTAAAGTTTTTTTTGTTATAACACTGTTTCCTCTCCCCTCTACTATGGATTTGTT
TGGCC

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 3

CO CL3854Contig1 868 3 6 U
GAAGGATCGGCATCTCCGGAAACCATACGTTATCAACCTCATGGATCAACTCACGCTAAT
GGGTGTCACACAATATTACGCTTTTGTTGAAGAGAGACAGAAGGTTCACTGCCTCAACAC
ACTTTTCTCTAAGCTGCAAATAAACCAATCGATAATCTTTTGCAACTCTGTTAATCGCGT
CGAACTGTTGGCTAAGGAAATTACAGAACTCGGTTATTCGTGCTTCTACATTCATGCGAA
GATGGTTCAAGACCATAGGAACAGAGTGTTCCATGAGTTTCGCAATGGTGCTTGCAGAAA
TCTCTGCACCGATCTGTTTACTCGTGGAATTGATATTCAAGCTGTGAATGTAGTGATTAA
CTTTGATTTTCCGAGGACTTCTGAGTCGTATCTACACAGGGTGGGCCGATCAGGACGGTT
TGGACACCTTGGGTTGGCTGTGAATTTGGTAACATATGAGGACCGTTTCAAAATGTATCA
GACTGAGCAAGAACTTGGCACTGAAATCAAACCAATTCCTTCTCAGATCGATCAAGCAAT
CTACTGCCAGTAAACCTGTAAACACACGAGAAAATGTTACCACCCGACGAGTCACAGTGT
TGATGAAAATGGTGTTTCTCAAGCTAGGAGGTGAGGCAACTGATACTTGGCGGTTTATGT
ACAATACAATTCGTTACGGATACGAACCAGAGTGGTTTGGTTTATAATCTTTCTCTAGAC
TTTGTTTCGTCTTTTACTGAAATATGTTAACGTTGCACATTTATCTTTGACTTGGCAGTC
AAGTAATAAAGACAAAATAAGTAAGACTCTCCTACTCTTTTCCGTGTTGGGTTTTTATCT
AAATGACTACTGTATTTGCTTTAAGCCT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1EH62TF U 1
AF RS1EH62JQ C 306
AF RS1CU64TF U 413
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BS 798 868 RS1CU64TF

RD RS1EH62TF 799 0 0
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CTTTGATTTTCCGAGGACTTCTGAGTCGTATCTACACAGGGTGGGCCGATCAGGACGGTT
TGGACACCTTGGGTTGGCTGTGAATTTGGTAACATATGAGGACCGTTTCAAAATGTATCA
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TTTGTTTCGTCTTTTACTGAAATATGTTAACGTTGCACATT*ATCTTTGACTTGGCAGTC
AAGTAA*AAAGACAAAA
AA

QA 1 797 1 797
DS 

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ACCTTGGGTTGGCTGTGAATTTGGTAACATATGAGGACCGTTTCAAAATGTATCAGACTG
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GCCAGTAAACCTGTAAACACACGAGAAAATGTTACCACCCGACGAGTCACAGTGTTGATG
AAAATGGTGTTTCTCAAGCTAGGAGGTGAGGCAACTGATACTTGGCGGTTTATGTACAAT
ACAATTCGTTACGGATACGAACCAGAGTGGTTTGGTTTATAATCTTTCTCTAGACTTTGT
TTCGTCTTTTACTGAAATATGTTAACGTTGCACATTTATCTTTGACTTGGCAGTCAAGTA
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ACTACTGTATTTGCTTTAAGCC

QA 1 562 1 562
DS 

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CACAGTGTTGATGAAAATGATGTTTCTCAAGCTAGGAGGTGAGGCAACTGATACTTGGCG
GTTTATGTACAATACAATTCGTTACGGATACGAACCAGAGTGGTTTGGTTTATAATCTTT
CTCTAGACTTTGTTTCGTCTTTTACTGAAATATGTTAACGTTGCACATTTATCTTTGACT
TGGCAGTCAAGTAATAAAGACAAAATAAGTAAGACTCTCCTACTCTTTTCCGTGTTGGGT
TTTTATCTAAATGACTACTGTATTTGCTTTAAGCCT

QA 1 456 1 456
DS 



AS 1 2

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CAGACGCGATGCTGGAGCTTTCTGTCTTGCTCCTAGGACAGTCACGTTCGGTGGATTCGT
CGATAAATCTATTACCAATTTCAACAGACTAAGGTTATCTGGTTTGAAGACTAGAGCATC
AAATGCTACTGCTGTTGTGAATGCAAATGCTGCTGATTCGGACAAAGTTCCAACACCAGT
GGTCATAATCGACCAAGATTCTGACCCTGATGCGACCGTCGTTGAAGTTACATTCGGAGA
CCGTCTTGGAGCCCTACTTGACACTATGAATGCGCTCAAGAACTTGGGGCTGAATGTCGT
CAAGGCTAATGTCTACCTAGACTCTTCCGGCAAGCACAACAAATTTGCCATTACTAAAGC
GGATAGTGGAAGAAAAGTAGAAGACCCTGAATTGCTTGAGGCCATCCGTCTCACTGTCAT
CAACAACATGCTCGAGTTTCATCCTGAATCAAGTTCTCAATTGGCAATGGGAGCAGCTTT
TGGTGTTCTTCCACCAACTGAACTGGTTGATGTGGACATTGCAACACACATAAGCATTAA
AGATGATGGATCAGACCGCAGTTTACTATACATAGAAACAGCAGATAGGCCTGGGCTGTT
AGTTGAGCTGGTGAAAATCATTTCAGATATCAGCGTTGCTGTCGAATCTGGAGAATTTGA
CACCGAGGGTTTGTTGGCTAAGGTAAAGTTCCACGTAAGTTACAAAACAAAGCTTTAATC
AAGCCTCTCCAGCAGGTTATTGCTAATAGTCTGAGGTATTTCTTGAGGCGTCCATCAACT
GACGAGTCAAGTTTCTGAAATGCTATTTACTGAAAAATGAAGTCACATTCCATATGACTG
CTTTTTACCACTTCTTTTTTATTTTACATTTTGACAAAAATAAGCTGTTTCTTTTTAGTT
GCCTTATCTCATACATCTGTAGTAGCAACATTCTCTGTTTCAATATCAAATTTACTTACA
TT


BQ
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10 10 

AF RS1GR53TF U 1
AF RS1GR53JQ C 579
BS 1 703 RS1GR53TF
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RD RS1GR53TF 753 0 0
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TCCCCTCTCTAGCGTTTTCCTCATTCTTTCTTGTTTTTGCTTCGGATTCAAGTCAGATAA
TATGGTGGCTGCTGCTATGGCCTCTGCTTCTGCTCCTTGTTTCACTGATGCTCGCGTTAT
CAGACGCGATGCTGGAGCTTTCTGTCTTGCTCCTAGGACAGTCACGTTCGGTGGATTCGT
CGATAAATCTATTACCAATTTCAACAGACTAAGGTTATCTGGTTTGAAGACTAGAGCATC
AAATGCTACTGCTGTTGTGAATGCAAATGCTGCTGATTCGGACAAAGTTCCAACACCAGT
GGTCATAATCGACCAAGATTCTGACCCTGATGCGACCGTCGTTGAAGTTACATTCGGAGA
CCGTCTTGGAGCCCTACTTGACACTATGAATGCGCTCAAGAACTTGGGGCTGAATGTCGT
CAAGGCTAATGTCTACCTAGACTCTTCCGGCAAGCACAACAAATTTGCCATTACTAAAGC
GGATAGTGGAAGAAAAGTAGAAGACCCTGAATTGCTTGAGGCCATCCGTCTCACTGTCAT
CAACAACATGCTCGAGTTTCATCCTGAATCAAGTTCTCAATTGGCAATGGGAGCAGCTTT
TGGTGTTCTTCCACCAACTGAACTGGTTGATGTGGACATTGCA*CACACATAAGCAT*AA
AGATGATGGATCAGACCGCAGTTTACTATACAT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1GR53JQ 564 0 0
AGGCCATCCGTCTCACTGTCATCAACAACATGCTCGAGTTTCATCCTGAATCAAGTTCTC
AATTGGCAATGGGAGCAGCTTTTGGTGTTCTTCCACCAACTGAACTGGTTGATGTGGACA
TTGCAACACACATAAGCATTAAAGATGATGGATCAGACCGCAGTTTACTATACATAGAAA
CAGCAGATAGGCCTGGGCTGTTAGTTGAGCTGGTGAAAATCATTTCAGATATCAGCGTTG
CTGTCGAATCTGGAGAATTTGACACCGAGGGTTTGTTGGCTAAGGTAAAGTTCCACGTAA
GTTACAAAACAAAGCTTTAATCAAGCCTCTCCAGCAGGTTATTGCTAATAGTCTGAGGTA
TTTCTTGAGGCGTCCATCAACTGACGAGTCAAGTTTCTGAAATGCTATTTACTGAAAAAT
GAAGTCACATTCCATATGACTGCTTTTTACCACTTCTTTTTTATTTTACATTTTGACAAA
AATAAGCTGTTTCTTTTTAGTTGCCTTATCTCATACATCTGTAGTAGCAACATTCTCTGT
TTCAATATCAAATTTACTTACATT

QA 1 564 1 564
DS 



AS 1 3

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AGGCCACTAAGCAAAGAGGAAAAGCAAGAGAAAAAGAAGCAACGTTTGGCTGCAATAGGA
GAAGACTTATTAGCCATTGCAGCTGATCAACCTTTCCGGTTCCCAGCCACATTCACATTT
GTTGTTAGAGCCTTTTCAGTATTGGATGGCATCGGCAAAGGTCTTGACCCCCGGTTTGAT
ATAACAGAGATTGCAAAACCATATGCTTTGGAATTGCTACGGTTCCGGGAAGCTGGAGTT
GAAGTTGTAGTGAAGGACCTGAGAACGAGATGGGACAGACAGTCACAAGCATTCTACAAT
CTATTTAGGCAAGCTGATAGAGTTGAAAAGCTAGCTGTAATCATCCAACGACTTGAGCAA
GGTGATTTGAAGCTTAGAGTCCGAGCATTGGAGTCTTAGAGGGCATTTCAACGTGTGGCA
ACTGTTCAAAAGACAATTGGAAGTGCTGTTGCTGCAGGAAGTTTAGTCAATCTCGCAACG
ATTTTGTATCTGAATTCTTTAAAAACACCAGCTAATATAGCATACACAGTCTGTGCTTTC
TTCAGCCTCCAAGTTCTAATCGGAGTTATAAAAGTCAAGAAGTTC*ACCAACGTGAAAAA
CTGATCACTGGAACAGCTTAAAGAAACCTTGCTTGATGTAGTAAAGCTATTTTGTGCTTA
GAAGCCACAATGAATCTCCCATAGAAGCTTTCCACTGGAGTGATGATGATTTCTTTGGTC
TGCCAAGTGAAGATAATTCTTATGGAAGCTTTAGAGGCAAGAGATGGTAAAAACAGTGAA
CGACCAGTTTCTATATCTCCTGTTTTTTTTTCTTTCTGAAAGTTTGATTTTTGGGCATTT
TATCAACAGAGCCACTTGTAATGGTGGTAGAGATGTAGTAGACATTAGGTAAACTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BY57TF U 1
AF RS1H215JQB C 421
AF RS1H215TF U 421
BS 1 585 RS1BY57TF
BS 586 586 RS1H215TF
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BS 709 709 RS1H215TF
BS 710 772 RS1BY57TF
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BS 821 821 RS1H215TF
BS 822 845 RS1BY57TF
BS 846 897 RS1H215TF

RD RS1BY57TF 847 0 0
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GAAGACTTATTAGCCATTGCAGCTGATCAACCTTTCCGGTTCCCAGCCACATTCACATTT
GTTGTTAGAGCCTTTTCAGTATTGGATGGCATCGGCAAAGGTCTTGACCCCCGGTTTGAT
ATAACAGAGATTGCAAAACCATATGCTTTGGAATTGCTACGGTTCCGGGAAGCTGGAGTT
GAAGTTGTAGTGAAGGACCTGAGAACGAGATGGGACAGACAGTCACAAGCATTCTACAAT
CTATTTAGGCAAGCTGATAGAGTTGAAAAGCTAGCTGTAATCATCCAACGACTTGAGCAA
GGTGATTTGAAGCTTAGAGTCCGAGCATTGGAGTCTTAGAGGGCATTTCAACGTGTGGCA
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ATTTTGTATCTGAATTCTTTAAAAACACCAGCTAATATAGCATACACAGTCTGTGCTTTC
TTCAGCCTCCAAGTTCTAATCGGAGTTATAAAAGTCAAGAAGTTCGACCAACGTGAAAAA
CTGATCACTGGAACAGCTTAAAGAAACCTTGCTTGATGTAGTAAAGCTATTTTGTGCTTA
GAAGCCACAATGAATCTCCCATAGAAGCTTTCCACTGGAGTGATGATGGTTTCTTTGGTC
TGCCAAGTGAAGATAATTCTTATGGAAGCTTTAGAGGCAAGAGATGGTAAAA*CAGTGAA
CGACCAGTTTCTATATCTCCTGTTTTTTTTTCTTTCTGAA*GTTTGATTTTTGGGCATTT
TATCA
CA

QA 1 845 1 845
DS 

RD RS1H215JQB 477 0 0
G
CTGTTCAAAAGACAATTGGAAGTGCTGTTGCTGCAGGAAGTTTAGTCAATCTCGCAACGA
TTTTGTATCTGAATTCTTTAAAAACACCAGCTAATATAGCATACACAGTCTGTGCTTTCT
TCAGCCTCCAAGTTCTAATCGGAGTTATAAAAGTCAAGAAGTTC*ACCAACGTGAAAAAC
TGATCACTGGAACAGCTTAAAGAAACCTTGCTTGATGTAGTAAAGCTATTTTGTGCTTAG
AAGCCACAATGAATCTCCCATAGAAGCTTTCCACTGGAGTGATGATGATTTCTTTGGTCT
GCCAAGTGAAGATAATTCTTATGGAAGCTTTAGAGGCAAGAGATGGTAAAAACAGTGAAC
GACCAGTTTCTATATCTCCTGTTTTTTTTTCTTTCTGAAAGTTTGATTTTTGGGCATTTT
ATCAACAGAGCCACTTGTAATGGTGGTAGAGATGTAGTAGACATTAGGTAAACTCT

QA 2 477 2 477
DS 

RD RS1H215TF 477 0 0
G
CTGTTCAAAAGACAATTGGAAGTGCTGTTGCTGCAGGAAGTTTAGTCAATCTCGCAACGA
TTTTGTATCTGAATTCTTTAAAAACACCAGCTAATATAGCATACACAGTCTGTGCTTTCT
TCAGCCTCCAAGTTCTAATCGGAGTTATAAAAGTCAAGAAGTTC*ACCAACGTGAAAAAC
TGATCACTGGAACAGCTTAAAGAAACCTTGCTTGATGTAGTAAAGCTATTTTGTGCTTAG
AAGCCACAATGAATCTCCCATAGAAGCTTTCCACTGGAGTGATGATGATTTCTTTGGTCT
GCCAAGTGAAGATAATTCTTATGGAAGCTTTAGAGGCAAGAGATGGTAAAAACAGTGAAC
GACCAGTTTCTATATCTCCTGTTTTTTTTTCTTTCTGAAAGTTTGATTTTTGGGCATTTT
ATCAACAGAGCCACTTGTAATGGTGGTAGAGATGTAGTAGACATTAGGTAAACTCT

QA 2 477 2 477
DS 



AS 1 3

CO CL3857Contig1 740 3 9 U
AGCTTTAAATATCTTGTTTTCTCACTTGTTCGAAAAGTAAAACCGGTAAGCAGAACATCG
CTTAAATAAACCTAACTTAAAAAGGTTAAAACCATGATTGATATAAGATAGAAAACGAAA
AACAAACAAAGAAACAGCCAACAACCCCTTTATTCATAACAATATTTGGTCAACCTCATA
AGAAGACCAATATCTCATAATTTCCCCGACCAGACCAACTAAACCCGAACCACACATACG
AAGAACCACCAAAGCTTGGTCCTTTTTTTCTTCTCAGTACCTGTAGTGAACAGGCTTGTA
GGGACCTTCAACGGGTATGCTGACGTAGTCAGACTGGTCCTTGGTGAGCTTGGTGAGTCT
AGCACCGAGCTTGCCCAAGTGAAGTGCAGCTACCTTCTCATCCAAGTGCTTAGGCAGAAC
ATACACCTTCTTCTCATACTTCCCACTCGACTTCTCGTTCCATAGCTCAAGCTGTGCAAT
CACCTGGTTGGTGAATGAGCACGACATCACGAAACTTGGGTGTCCAGTAGCACATCCCAA
GTTCATAGGACGACCCTCGGCTAGCACAATGATGCCTGACTTGGTGTCCGGAAACACCCA
CCTATCAGTCTGTGGCTTGATGGTGATACGTTTCACACCAGGGAAAGTCTCGAGTCCGAG
CATGTCGATTTCGTTGTCAAAGTGACCAATGTTGCAGACAATGGCGTTGTTCTTCATCTT
CCTCATGTGGTCGACCATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GE61JQ U 1
AF RS1EI77JQ U 39
AF RS1EI77TF C 58
BS 1 158 RS1GE61JQ
BS 159 159 RS1EI77JQ
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BS 234 234 RS1EI77JQ
BS 235 453 RS1GE61JQ
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BS 455 527 RS1GE61JQ
BS 528 656 RS1EI77JQ
BS 657 740 RS1EI77TF

RD RS1GE61JQ 527 0 0
AGCTTTAAATATCTTGTTTTCTCACTTGTTCGAAAAGTAAAACCGGTAAGCAGAACATCG
CTTAAATAAACCTAACTTAAAAAGGTTAAAACCATGATTGATATAAGATAGAAAACGAAA
AACAAACAAAGAAACAGCCAACAACCCCTTTATTCATACCAATATTTGGTCAACCTCATA
AGAAGACCAATATCTCATAATTTCCCCGACCAGACCAACTAAACCCGAACCACGCATACG
AAGAACCACCAAAGCTTGGTCCTTTTTTTCTTCTCAGTACCTGTAGTGAACAGGCTTGTA
GGGACCTTCAACGGGTATGCTGACGTAGTCAGACTGGTCCTTGGTGAGCTTGGTGAGTCT
AGCACCGAGCTTGCCCAAGTGAAGTGCAGCTACCTTCTCATCCAAGTGCTTAGGCAGAAC
ATACACCTTCTTCTCATACTTCCCACTCGACTTATCGTTCCATAGCTCAAGCTGTGCAAT
CACCTGGTTGGTGAATGAGCACGACATCACGAAACTTGGGTGTCCAG

QA 1 527 1 527
DS 

RD RS1EI77JQ 618 0 0
AAAACCGGTAAGCAGAACATCGCTTAAATAAACCTAACTTAAAAAGGTTAAAACCATGAT
TGATATAAGATAGAAAACGAAAAACAAACAAAGAAACAGCCAACAACCCCTTTATTCATA
ACAATATTTGGTCAACCTCATAAGAAGACCAATATCTCATAATTTCCCCGACCAGACCAA
CTAAACCCGAACCACACATACGAAGAACCACCAAAGCTTGGTCCTTTTTTTCTTCTCAGT
ACCTGTAGTGAACAGGCTTGTAGGGACCTTCAACGGGTATGCTGACGTAGTCAGACTGGT
CCTTGGTGAGCTTGGTGAGTCTAGCACCGAGCTTGCCCAAGTGAAGTGCAGCTACCTTCT
CATCCAAGTGCTTAGGCAGAACATACACCTTCTTCTCATACTTCCCACTCGACTTCTCGT
TCCATAGCTCAAGCTGTGCAATCACCTGGTTGGTGAATGAGCACGACATCACGAAACTTG
GGTGTCCAGTAGCACATCCCAAGTTCATAGGACGACCCTCGGCTAGCACAATGATGCCTG
ACTTGGTGTCCGGAAACACCCACCTATCAGTCTGTGGCTTGATGGTGATACGTTTCACAC
CAGGGAAAGTCTCGAGTC

QA 1 618 1 618
DS 

RD RS1EI77TF 683 0 0
TCGCTTAAATAAAC*TAACTTAAAAAGGTTAAAACCATGATTGATATAAGATAGAAAACG
AAAAACAAACAAAGAAACAGCCAACAACCCCTTTATTCATAACAATATTTGGTCAACCTC
ATAAGAAGACCAATATCTCATAATTTCCCCGACCAGACCAACTAAACCCGAACCACACAT
ACGAAGAACCACCAAAGCTTGGTCCTTTTTTTCTTCTCAGTACCTGTAGTGAACAGGCTT
GTAGGGACCTTCAACGGGTATGCTGACGTAGTCAGACTGGTCCTTGGTGAGCTTGGTGAG
TCTAGCACCGAGCTTGCCCAAGTGAAGTGCAGCTACCTTCTCATCCAAGTGCTTAGGCAG
AACATACACCTTCTTCTCATACTTCCCACTCGACTTCTCGTTCCATAGCTCAAGCTGTGC
AATCACCTGGTTGGTGAATGAGCACGACATCACGAAACTTGGGTGTCCAGTAGCACATCC
CAAGTTCATAGGACGACCCTCGGCTAGCACAATGATGCCTGACTTGGTGTCCGGAAACAC
CCACCTATCAGTCTGTGGCTTGATGGTGATACGTTTCACACCAGGGAAAGTCTCGAGTCC
GAGCATGTCGATTTCGTTGTCAAAGTGACCAATGTTGCAGACAATGGCGTTGTTCTTCAT
CTTCCTCATGTGGTCGACCATGC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 3

CO CL3858Contig1 1016 3 10 U
AGGGTCAGTTGAAAAGACGTTTGGACTTTGGAGAAACGTATTACACTGCAACAATTCATT
ATTCAAGACGAAAAGTTCCATTGAACTAAACGCATTCAACTGCCAAAAAAACTGAACATA
GGTTTCAAAACAACATGAGAAAAAACTTGTCTGCTTCGAAGACATAAAAACAAGAAGTAT
CTTAAAGAGACGATGATAAGGTTTGACAAAAAAGAGAGGCATTCCAACGAGTCATCTTCT
AGGCGACAGGGATCATCTCAGGGTAATCTACGGCTGTGAGGGGAGCTTCTGGTAGAAGTG
CAGCCGGAGCAGCAACCTGAGCGGGAGCAGAGCTAACATCATCTTCCTTGGGAGAATGGA
TGATGACAACATCAGGCAATGGTGTCTTTGGTCCCAATACTCCCTTAGGGTCCCAGTCAA
GCATGACCTTGACCTTGATTCCGAGCACACCCTGTCTGAGCAGAACATGTCTGACTGCGG
AGTCGATGTACTCTTTGGTGGGTTGACCAGAGGAAACCATGTAACCGTCCTTGAATTTCA
TGGACTTGGCACGAGCTGCACGAAGCTTTCCACTCACAATGACCTCACATCCCTTAGCGC
CACTCTCCATGACGAATCTCAAGACACCATAGCATGCCCTGCGAACGGCAAGACCACCGA
GGAGCTTGTAACGGAGAGACTCAGCCTGAGCGATGGCACAGAGACCTCTGTTGGCAACCT
TCTCAGCGTAAAGCTCAACACTGTCTTGAGGGAATCTGAACCTCTTCTGAACAAGGGACG
TAAACTCTCTGATTCTCCTTCCCTTCTCACCGAGAACATTTTGAGTACGAGTGGCTCTGA
TGATAATCTCAGTCCTCATGGGAGTGACCCTAACCTCCACACCTGAGTAACCATCCTCTG
CTAGCTCCCTAGTTAGCACCTCGTTCAACTCAGCGTAGAACACACCGTCCGCCACAAACT
TCCTCTTCTTGCTGATTTGCGTCGCCATGATGATGTTCAAGTCGCGAAAACCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EB17JQ U 60
AF RS1FC15JQ U 1
AF RS1EB17TF C 270
BS 1 165 RS1FC15JQ
BS 166 166 RS1EB17JQ
BS 167 433 RS1FC15JQ
BS 434 434 RS1EB17JQ
BS 435 739 RS1FC15JQ
BS 740 740 RS1EB17TF
BS 741 760 RS1FC15JQ
BS 761 761 RS1EB17TF
BS 762 770 RS1FC15JQ
BS 771 1016 RS1EB17TF

RD RS1EB17JQ 598 0 0
GC
TTCAAGACGAAAAGTTCCATTGAACTAAACGCATTCAACTGCCAAAAAAACTGAACATAG
GTTTCAAAACAACATGAGAAAAAACTTGTCTGCTTCGAAGACATAAAAACAAGAAGTATC
TTAAAGAGACGATGATAAGGTTTGACAAAAAAGAGAGGCATTCCAACGAGTCATCTTCTA
GGCGACAGGGATCATCTCAGGGTAATCTACGGCTGTGAGGGGAGCTTCTGGTAGAAGTGC
AGCCGGAGCAGCAACCTGAGCGGGAGCAGAGCTAACATCATCTTCCTTGGGAGAATGGAT
GATGACAACATCAGGCAATGGTGTCTTTGGTCCCAATACTCCCTTAGGGTCCCAGTCAAG
CATGACCTTGACCTTGATTCCGAGCACACCCTGTCTGAACAGAACATGTCTGACTGCGGA
GTCGATGTACTCTTTGGTGGGTTGACCAGAGGAAACCATGTAACCGTCCTTGAATTTCAT
GGACTTGGCACGAGCTGCACGAAGCTTTCCACTCACAATGACCTCACATCCCTTAGCGCC
ACTCTCCATGACGAATCTCAAGACACCATAGCATGCCCTGCGAACGGCAAGACCAC

QA 3 598 3 598
DS 

RD RS1FC15JQ 770 0 0
AGGGTCAGTTGAAAAGACGTTTGGACTTTGGAGAAACGTATTACACTGCAACAATTCATT
ATTCAAGACGAAAAGTTCCATTGAACTAAACGCATTCAACTGCCAAAAAAACTGAACATA
GGTTTCAAAACAACATGAGAAAAAACTTGTCTGCTTCGAAGACATGAAAACAAGAAGTAT
CTTAAAGAGACGATGATAAGGTTTGACAAAAAAGAGAGGCATTCCAACGAGTCATCTTCT
AGGCGACAGGGATCATCTCAGGGTAATCTACGGCTGTGAGGGGAGCTTCTGGTAGAAGTG
CAGCCGGAGCAGCAACCTGAGCGGGAGCAGAGCTAACATCATCTTCCTTGGGAGAATGGA
TGATGACAACATCAGGCAATGGTGTCTTTGGTCCCAATACTCCCTTAGGGTCCCAGTCAA
GCATGACCTTGACTTTGATTCCGAGCACACCCTGTCTGAGCAGAACATGTCTGACTGCGG
AGTCGATGTACTCTTTGGTGGGTTGACCAGAGGAAACCATGTAACCGTCCTTGAATTTCA
TGGACTTGGCACGAGCTGCACGAAGCTTTCCACTCACAATGACCTCACATCCCTTAGCGC
CACTCTCCATGACGAATCTCAAGACACCATAGCATGCCCTGCGAACGGCAAGACCACCGA
GGAGCTTGTAACGGAGAGACTCAGCCTGAGCGATGGCACAGAGACCTCTGTTGGCAACCT
TCTCAGCGTAAAGCTCAACGCTGTCTTGAGGGAATCTGAATCTCTTCTGA

QA 1 770 1 770
DS 

RD RS1EB17TF 747 0 0
ACGGCTGTGAGGGGAGCTTCTGGTAGAAGTGCAGCCGGAGCAGCAAC*TGAGCGGGAGCA
GAGCTAACATCATCTTCCTTGGGAGAATGGATGATGACAACATCAGGCAATGGTGTCTTT
GGTCCCAATACTCCCTTAGGGTCCCAGTCAAGCATGACCTTGACCTTGATTCCGAGCACA
CCCTGTCTGAGCAGAACATGTCTGACTGCGGAGTCGATGTACTCTTTGGTGGGTTGACCA
GAGGAAACCATGTAACCGTCCTTGAATTTCATGGACTTGGCACGAGCTGCACGAAGCTTT
CCACTCACAATGACCTCACATCCCTTAGCGCCACTCTCCATGACGAATCTCAAGACACCA
TAGCATGCCCTGCGAACGGCAAGACCACCGAGGAGCTTGTAACGGAGAGACTCAGCCTGA
GCGATGGCACAGAGACCTCTGTTGGCAACCTTCTCAGCGTAAAGCTCAACACTGTCTTGA
GGGAATCTGAACCTCTTCTGAACAAGGGACGTAAACTCTCTGATTCTCCTTCCCTTCTCA
CCGAGAACATTTTGAGTACGAGTGGCTCTGATGATAATCTCAGTCCTCATGGGAGTGACC
CTAACCTCCACACCTGAGTAACCATCCTCTGCTAGCTCCCTAGTTAGCACCTCGTTCAAC
TCAGCGTAGAACACACCGTCCGCCACAAACTTCCTCTTCTTGCTGATTTGCGTCGCCATG
ATGATGTTCAAGTCGCGAAAACCCTCC

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 3

CO CL3859Contig1 554 3 6 U
GGATCTCTGTGGCGGCCTGAGCTTTGCGAAAATGGTTCAACGGCTTGTTTACCGATCACG
CCACTCTTACGCCACCAAATCAAACCAACACCGCATCGTCAAAACTCCTGGTGGGAAGTT
GACTTTCCAGACGACGAAGAAGAGAGCTAGTGGACCTAAGTGCCCTGTCACTGGCAAGCG
AATCCAAGGGATTCCTCATCTGAGACCTGCTGAGTACAAGAGGTCGAGGTTGTCGAGGAA
CAGGAGAACAGTGAACCGTGCATATGGTGGTGTTCTCTCTGGGCTAGCTGTTAAAGACAG
GATCGTTAGGGCGTTCTTGGTTGAAGAGCAGAAGATTGTGAAGAAGGTTTTGAAGCTTCA
GAAGTTTAAGGAGAAGACTGCACCAAAGAGTTAGATAACTTCTTTTGTGGAGAGTTTTGC
AGTAAAGTGATGTGTGAGAGGAATATGTCTTTGTAAGGGAGATCGTTAGACATGAGTGAG
TTTGATTCACCAGATTTTGTTATTTTGACTTCAGTTGAGATATTACTTTTCATGACTTTG
GTTTACCAATTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1GL82TF U 1
AF RS1BR39TF U 7
AF RS1BR39JQ C 20
BS 1 437 RS1GL82TF
BS 438 438 RS1BR39TF
BS 439 474 RS1GL82TF
BS 475 475 RS1BR39TF
BS 476 533 RS1GL82TF
BS 534 554 RS1BR39TF

RD RS1GL82TF 533 0 0
GGATCTCTGTGGCGGCCTGAGCTTTGCGAAAATGGTTCAACGGCTTGTTTACCGATCACG
CCACTCTTACGCCACCAAATCAAACCAACACCGCATCGTCAAAACTCCTGGTGGGAAGTT
GACTTTCCAGACGACGAAGAAGAGAGCTAGTGGACCTAAGTGCCCTGTCACTGGCAAGCG
AATCCAAGGGATTCCTCATCTGAGACCTGCTGAGTACAAGAGGTCGAGGTTGTCGAGGAA
CAGGAGAACAGTGAACCGTGCATATGGTGGTGTTCTCTCTGGGCTAGCTGTTAAAGACAG
GATCGTTAGGGCGTTCTTGGTTGAAGAGCAGAAGATTGTGAAGAAGGTTTTGAAGCTTCA
GAAGTTTAAGGAGAAGACTGCACCAAAGAGTTAGATAACTTCTTTTGTGGAGAGTTTTGC
AGTAAAGTGATGTGTGA*AGGAATATGTCTTTGTAAGGGAGATCGTTAGACATGGGTGAG
TTTGATTCACCAGATTTTGTTATTTTGACTTCAGTTGAGATATTACTTTTCAT

QA 1 533 1 533
DS 

RD RS1BR39TF 548 0 0
GGGA
GGCGGCCTGAGCTTTGCGAAAATGGTTCAACGGCTTGTTTACCGATCACGCCACTCTTAC
GCCACCAAATCAAACCAACACCGCATCGTCAAAACTCCTGGTGGGAAGTTGACTTTCCAG
ACGACGAAGAAGAGAGCTAGTGGACCTAAGTGCCCTGTCACTGGCAAGCGAATCCAAGGG
ATTCCTCATCTGAGACCTGCTGAGTACAAGAGGTCGAGGTTGTCGAGGAACAGGAGAACA
GTGAACCGTGCATATGGTGGTGTTCTCTCTGGGCTAGCTGTTAAAGACAGGATCGTTAGG
GCGTTCTTGGTTGAAGAGCAGAAGATTGTGAAGAAGGTTTTGAAGCTTCAGAAGTTTAAG
GAGAAGACTGCACCAAAGAGTTAGATAACTTCTTTTGTGGAGAGTTTTGCAGTAAAGTGA
TGTGTGAGAGGAATATGTCTTTGTAAGGGAGATCGTTAGACATGAGTGAGTTTGATTCAC
CAGATTTTGTTATTTTGACTTCAGTTGAGATATTACTTTTCATGACTTTGGTTTACCAAT
TACC

QA 5 548 5 548
DS 

RD RS1BR39JQ 535 0 0
AGCTTTGCGAAAATGGTTCAACGGCTTGTTTACCGATCACGCCACTCTTACGCCACCAAA
TCAAACCAACACCGCATCGTCAAAACTCCTGGTGGGAAGTTGACTTTCCAGACGACGAAG
AAGAGAGCTAGTGGACCTAAGTGCCCTGTCACTGGCAAGCGAATCCAAGGGATTCCTCAT
CTGAGACCTGCTGAGTACAAGAGGTCGAGGTTGTCGAGGAACAGGAGAACAGTGAACCGT
GCATATGGTGGTGTTCTCTCTGGGCTAGCTGTTAAAGACAGGATCGTTAGGGCGTTCTTG
GTTGAAGAGCAGAAGATTGTGAAGAAGGTTTTGAAGCTTCAGAAGTTTAAGGAGAAGACT
GCACCAAAGAGTTAGATAACTTCTTTTGTGGAGAGTTTTGCAGTAAAGTGATGTGTGAGA
GGAATATGTCTTTGTAAGGGAGATCGTTAGACATGAGTGAGTTTGATTCACCAGATTTTG
TTATTTTGACTTCAGTTGAGATATTACTTTTCATGACTTTGGTTTACCAATTACC

QA 1 535 1 535
DS 



AS 1 3

CO CL3860Contig1 881 3 7 U
GGAATCGAAAAAAAAAGTCTGAAAAGCTCAAAGAAGACGATGAAGCTCGAGTTTACGACA
ACGTTCTCACTCATTTCGGCTCTCTTCTTCTTGTTTCTAACAACGGAGCTAATTCCAGTG
AGTGAAGCCGTGTGGCTCAAAGTACCCAAGACGGGAACAAAGTGCGTGTCGGAGGAAATC
CAGAGCAAGGTCGTCGTCTTGGCAGATTACCTCGTCATCTCCGAAGAGCATTCCATCTTC
CCTACTGTCTCCGTTAAGGTTACATCACCATATGGAAATGTTTTGCACCATAACGAAAAC
GCAACGCATGGTCAGTTTGCATTTACAACCCAAGAATCAGGTACCTACTTGGCTTGTTTC
GACCCCGTAGGAAACAGTCATGGTAACAAAGATTTTAGCATCAACCTTGACTGGAAAACT
GGTATCGCCGCCAAGGATTGGGACTCCATTGCTAGAAAAGAGAAAATCGAGGGTGTGGAG
CTGGAGCTAAGGAAACTGGAAGGTGCAGTTGAGGGCATACATGACAATCTACTTTACTTA
AAAGACAGAGAAGCGGAGATGAGGATTGTGAGTGAAAAAACAAACTCGCGAGTCGCATGG
TTCAGTATAATGTCGCTAGGCATCTGCATTGTGGTCTCTGGTTTGCAGATTTTGTATTTG
AAGCAATACTTTGAAAGGAAGAAGCTTATTTAGATCAGGTGAGAGGGATGATCCATGGAC
GGACACTAGAAACCAACACTTTCCTTTGCTTTCCTTCTTATAACAACACTCTTTTGAACT
CATAGTGTAAATCTTTTTTTTTCTCCACTCATTTAACTTGTAATATGTCTCGAGATTTGA
TAATTATATAACTAGACTCTAATAATCAGAAACTTAACTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FR95TF U 1
AF RS1CP48TF U 5
AF RS1FR95JQ C 133
BS 1 101 RS1FR95TF
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RD RS1FR95TF 695 0 0
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ACGTTCTCACTCATTTCGGCTCTCTTCTTCTTGTTTCTAACGACGGAGCTAATTCCAGTG
AGTGAAGCCGTGTGGCTCAAAGTACCCAAGACGGGAACAAAGTGCGTGTCGGAGGAAATC
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GACCCCGTAGGAAACAGTCATGGTAACAAAGATTTTAGCATCAACCTTGACTGGAAAACT
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TTCAGTATAATGTCGCTAGGCATCTGCATTGTGGTCTCTGGTTTGCAGATTTTGTATTTG
AAGCAATACTTTGAAAGGAAGAAGCTTATTTAGAT

QA 1 695 1 695
DS 

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GGA
AAAAAAAAAGTCTGAAAAGCTCAAAGAAGACGATGAAGCTCGAGTTTACGACAACGTTCT
CACTCATTTCGGCTCTCTTCTTCTT***TCTAACACCGGAGCTAATTCCAGTGAGTGAAG
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AGGTCGTCGTCTTGGCAGATTACCTCGTCATCTCCGACGAGCATTCCATCTTCCCTACTA
TCTCCGTTAAGGTTACATCACCATATGGAAATGTTTTGCACCATAACGAAAACGCAACGC
ATGGTCAGTTTGCATTTACAACCCAAGAATCAGGTACCTACTTGGCTTGTTTCGACCCCG
TAGGAAACAGTCATGGTAACAAAGATTTTAGCATCAACCTTGACTGGAAAACTGGTATCG
CCGCCAAGGATTGGGACTCCATTGCTAGAAAAGAGAAAATCGAGGGTGTGGAGCTGGAGC
TAAGGAAACTGGAAGGTGCAGTTGAGGGCATACATGACAATCTACTTTACTTAAAAGACA
GAGAAGCGGAGATGAGGATTGTGAGTGAAAAAACAAACTCGCGAGTCGCATGGTTCAGTA
TAATGTCGCTAGGCATCTGCATTGTGGTCTCTGGTTTGCAGATTTTGTATTTGAAGCAAT
ACTTTGAAAGGAAGAAGCTTATTTAGATCAGGTGA**GGGATGATCCATGGACGGAC
GGACACTA

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DS 

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GTTAAGGTTACATCACCATATGGAAATGTTTTGCACCATAACGAAAACGCAACGCATGGT
CAGTTTGCATTTACAACCCAAGAATCAGGTACCTACTTGGCTTGTTTCGACCCCGTAGGA
AACAGTCATGGTAACAAAGATTTTAGCATCAACCTTGACTGGAAAACTGGTATCGCCGCC
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AAACTGGAAGGTGCAGTTGAGGGCATACATGACAATCTACTTTACTTAAAAGACAGAGAA
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TCGCTAGGCATCTGCATTGTGGTCTCTGGTTTGCAGATTTTGTATTTGAAGCAATACTTT
GAAAGGAAGAAGCTTATTTAGATCAGGTGAGAGGGATGATCCATGGACGGACACTAGAAA
CCAACACTTTCCTTTGCTTTCCTTCTTATAACAACACTCTTTTGAACTCATAGTGTAAAT
CTTTTTTTTTCTCCACTCATTTAACTTGTAATATGTCTCGAGATTTGATAATTATATAAC
TAGACTCTAATAATCAGAAACTTAACTAC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 3

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ATAAAACGTAAGGAACCGGAAGGCACAACTAGTAGTCTATCTTTAGAAGATGAGAAACCA
AAGCTCAGAACCAAGAAAAACCGATCTTCTGGAGTCGGTGAAGTTGCTGAAAAAACAACT
GAAGAGAAAATGGAATCATCCACGGAGCAGATGGCAGAGGAACCGAAGTACGGTGGGGAG
GCCGACGAAGTGAAATCAGAATCAGAAGGAAAGTCAAGGAAAGAAGGCGAGGATGATGAG
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GCTGTTGACAAGTCTGATTCTGAGGGGAAACAAGAGGAGACTGAAGCTGAAGAAGATGCT
GGGGATTCTGAGGCCTCTGACAATGAGACTCTGGGAGCGTGGAAAAGTAAAGTGGCCAAG
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AGAAGTTGCCGTGTTTGGCCTCTATTAGTATTGGGGTTTATTATCTATGGT


BQ
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10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CM92TF U 1
AF RS1AU95TF U 1
AF RS1CM92JQ C 365
BS 1 574 RS1AU95TF
BS 575 575 RS1CM92JQ
BS 576 591 RS1AU95TF

RD RS1CM92TF 292 0 0
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GCCGACGAAGTGAAATCAGAATCAGAAGGAAAGTCAAGGAAAGAAGGCGAGG

QA 1 292 1 292
DS 

RD RS1AU95TF 591 0 0
GAGAGGGATGAAGACCCAATTCCTACTACGCCAAAAGGGAAAAGAACTCCAAAGAAAAAC
ATAAAACGTAAGGAACCGGAAGGCACAACTAGTAGTCTATCTTTAGAAGATGAGAAACCA
AAGCTCAGAACCAAGAAAAACCGATCTTCTGGAGTCGGTGAAGTTGCTGAAAAAACAACT
GAAGAGAAAATGGAATCATCCACGGAGCAGATGGCAGAGGAACCGAAGTACGGTGGGGAG
GCCGACGAAGTGAAATCAGAATCAGAAGGAAAGTCAAGGAAAGAAGGCGAGGATGATGAG
GAAGCTGATTTGCAGGAGGCAAACGCAGAGTCGAGTGGGGACTCTGAGGAGAAAGAAACT
GCTGTTGACAAGTCTGATTCTGAGGGGAAACAAGAGGAGACTGAAGCTGAAGAAGATGCT
GGGGATTCTGAGGCCTCTGACAATGAGACTCTGGGAGCGTGGAAAAGTAAAGTGGCCAAG
TCAAGCTCGAGAAAATCAGCATAGGTTTCTGCATGCCATAATGTAGAATAAATACACCAA
AGAAGTTGCCGTGTTTGGCCTCTATTAGTATTGGTGTTTATTATCTATGGT

QA 1 591 1 591
DS 

RD RS1CM92JQ 217 0 0
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ATTTTGAGGCCTTTGACAATGAGACTCTGGGAGCGTGGAAAAGTAAAGTGGCCAAGTCAA
GCTCGAGAAAATCAGCATAGGTTTTTGCATGCCATAATGTAGAATAAATACCCCAAAGAA
GTTGCCGTGTTTGGCCTTTATTAGTATTGGGGTTT
TT

QA 1 215 1 215
DS 



AS 1 2

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GGGAACACAGAAACAAGAAAAACAAAACACAAAGTTTACGAGTTTCGTTTGAGAGCTCAA
AGGTTCCAGATTTCAAAAGAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTCTCCAGAATCATTTCT
AGATCAATAGCGGTTCTGTCATTGGTGAGAAGATGCCGGATCATCTGAGTTTATGCACGG
ATCGTCTCATAACGGGTGAGAGCTTGGAGTCAGAAAAGGATTGTGGAGAAAGTTCTTGTC
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CTTGCAATGGCAGTTTGAAGTATGCGCACCGCAAGTGTGTTCAGCGTTGGTGTAATGAGA
AAGGCGACATTGTCTGCGAAATATGCCACCAGCCTTATCAATCTGGATATACAGCACCTC
CACCTCCTCCTCCTGATGAAACTATAATTCACATTGGTGAGGATTGGGAGACTGGAGTTC
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ACATCATGGCATGGGCCATTGGAATTCTCCAGCGCCGGAGGCAAAGACAGGAAGCTGCTG
CTCTAGCTGCCGCGGAAGTTGCCTTCATGATACACGGTGGTGTGCCTCAACGCAGGGGAC
TTCATTTTGCTTTATCGCCAGAGCGGCCGCCAGTATCCAACCCAACACCAGTCTGATCCT
TCTCCCAGCAATGATTCTCCGGTAAGACTATTAAGACAAAACCCTGAACTTGGTTGTAAG
AACTTTCCACCTACTTATGCTTCTTCTTCACATGTTTTATCATTTTGCTCGTATGTTTAT
GTTCTCTGAATCTGTTAAATGTTACTTCTCTACTTTTAAATGTTGGCAAAGCTCTCGGGG
CATTATGTACAGTTTTATTGTTACTATGGTTTTTTTCTGATATTAATATCGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1E291TF U 1
AF RS1E291JQ C 419
BS 1 627 RS1E291TF
BS 628 1074 RS1E291JQ

RD RS1E291TF 627 0 0
GGGAACACAGAAACAAGAAAAACAAAACACAAAGTTTACGAGTTTCGTTTGAGAGCTCAA
AGGTTCCAGATTTCAAAAGAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTCTCCAGAATCATTTCT
AGATCAATAGCGGTTCTGTCATTGGTGAGAAGATGCCGGATCATCTGAGTTTATGCACGG
ATCGTCTCATAACGGGTGAGAGCTTGGAGTCAGAAAAGGATTGTGGAGAAAGTTCTTGTC
CTCAAGGCGGCAGAGATGTGGCTTCCTCTTCTTCTTCTTCGTCTGCGTCTGTCGATGAAG
CTGAAGATGCCAGGAAGTACTATGCTGTTGTTACTGCAGAAGAGGAACCGCTTCTCCAGT
CTGTTGAGTGCCGTATTTGCCAGGAGGAAGATATCACTAACAACTTGGAGGCTCCTTGTG
CTTGCAATGGCAGTTTGAAGTATGCGCACCGCAAGTGTGTTCAGCGTTGGTGTAATGAGA
AAGGCGACATTGTCTGCGAAATATGCCACCAGCCTTATCAATCTGGATATACAGCACCTC
CACCTCCTCCTCCTGATGAAACTATAATTCACATTGGTGAGGATTGGGAGACTGGAGTTC
ACTTGGACTTGAGCGACCCGCGCATTC

QA 1 627 1 627
DS 

RD RS1E291JQ 656 0 0
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GAAAGGCGACATTGTCTGCGAAATATGCCACCAGCCTTATCAATCTGGATATACAGCACC
TCCACCTCCTCCTCCTGATGAAACTATAATTCACATTGGTGAGGATTGGGAGACTGGAGT
TCACTTGGACTTGAGCGACCCGCGCATTCTAGCAATGGCTGCTGGTTTTCTCCTGCCATG
TTACATCATGGCATGGGCCATTGGAATTCTCCAGCGCCGGAGGCAAAGACAGGAAGCTGC
TGCTCTAGCTGCCGCGGAAGTTGCCTTCATGATACACGGTGGTGTGCCTCAACGCAGGGG
ACTTCATTTTGCTTTATCGCCAGAGCGGCCGCCAGTATCCAACCCAACACCAGTCTGATC
CTTCTCCCAGCAATGATTCTCCGGTAAGACTATTAAGACAAAACCCTGAACTTGGTTGTA
AGAACTTTCCACCTACTTATGCTTCTTCTTCACATGTTTTATCATTTTGCTCGTATGTTT
ATGTTCTCTGAATCTGTTAAATGTTACTTCTCTACTTTTAAATGTTGGCAAAGCTCTCGG
GGCATTATGTACAGTTTTATTGTTACTATGGTTTTTTTCTGATATTAATATCGTCC

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 3

CO CL3863Contig1 756 3 4 U
TTCTGCTGCTTACATTATACACATCTTCTCTCTCTCTCTGGTAGCCATGGCTTCGGCTAC
TTTCTCTGTGGCCAAACCATCTCTTCAGGGTTTCTCTGACTTCTCAGGACTCAGAAACTC
CTCTGCTCTTCCCTTGGGCAAGAAAACTTCTTCTGATGAGTTTGTTTCCTTCGTCAGTTT
CCAGACTTCTGCAATGGGAAGCAATGGAGGATACAGGAAAGGAGTGACCGAGGCGAAGCT
AAAGGTAGCCATCAATGGATTCGGTAGGATCGGTAGGAACTTCTTGAGATGTTGGCATGG
TCGCAAAGACTCTCCTCTTGATGTCATTGCCATTAACGACACTGCAGGTCTCGAAGAAGA
CTTTCGCTGAGGAAGTCAACGCTGCCTTCAGGGATGCGGCTGAGAAAGAGCTTAAAGGTA
TACTCGATGTCTGCGATGAGCCTCTTGTCTCTGTCGACTTCAGGTGCTCTGATGTGTCGT
CCACCATTGATTCTTCTCTGACCATGGTTATGGGAGATGATATGGTTAAAGTGATTGCTT
GGTATGATAACGAATGGGGTTACTCGCAGAGAGTCGTTGATTTGGCTGACATTGTTGCCA
ATAACTGGAAGTGAAGAAAGACTCAACTGTTGATGTTGTTCTGCTCCATTTTTTATTTTA
CTGTTATTATTATGATTCGGAATGTATAATTGTAGTTCCTGAGTTTATATGTATTTGTGC
TCTTCAAATTTTAATAGTAAAAAAGCTTTATATTCG


BQ
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AF RS1AX47TF U 3
AF RS1AX47JQ C 1
AF RS1CI21TF U 571
BS 1 2 RS1AX47JQ
BS 3 570 RS1AX47TF
BS 571 751 RS1CI21TF
BS 752 756 RS1AX47JQ

RD RS1AX47TF 663 0 0
CTGCTGCTTACATTATACACATCTTCTCTCTCTCTCTGGTAGCCATGGCTTCGGCTACTT
TCTCTGTGGCCAAACCATCTCTTCAGGGTTTCTCTGACTTCTCAGGACTCAGAAACTCCT
CTGCTCTTCCCTTGGGCAAGAAAACTTCTTCTGATGAGTTTGTTTCCTTCGTCAGTTTCC
AGACTTCTGCAATGGGAAGCAATGGAGGATACAGGAAAGGAGTGACCGAGGCGAAGCTAA
AGGTAGCCATCAATGGATTCGGTAGGATCGGTAGGAACTTCTTGAGATGTTGGCATGGTC
GCAAAGACTCTCCTCTTGATGTCATTGCCATTAACGACACTGCAGGTCTCGAAGAAGACT
TTCGCTGAGGAAGTCAACGCTGCCTTCAGGGATGCGGCTGAGAAAGAGCTTAAAGGTATA
CTCGATGTCTGCGATGAGCCTCTTGTCTCTGTCGACTTCAGGTGCTCTGATGTGTCGTCC
ACCATTGATTCTTCTCTGACCATGGTTATGGGAGATGATATGGTTAAAGTGATTGCTTGG
TATGATAACGAATGGGGTTACTCGCAGAGAGTCGTTGATTTGGCTGACATTGTTGCCAAT
AACTGGAAGTGAAGAAAGACTCAACTGTTGATGTTGTTCTGCTCCATTTTT*ATTTTACT
GTT

QA 1 663 1 663
DS 

RD RS1AX47JQ 756 0 0
TTCTGCTGCTTACATTATACACATCTTCTCTCTCTCTCTGGTAGCCATGGCTTCGGCTAC
TTTCTCTGTGGCCAAACCATCTCTTCAGGGTTTCTCTGACTTCTCAGGACTCAGAAACTC
CTCTGCTCTTCCCTTGGGCAAGAAAACTTCTTCTGATGAGTTTGTTTCCTTCGTCAGTTT
CCAGACTTCTGCAATGGGAAGCAATGGAGGATACAGGAAAGGAGTGACCGAGGCGAAGCT
AAAGGTAGCCATCAATGGATTCGGTAGGATCGGTAGGAACTTCTTGAGATGTTGGCATGG
TCGCAAAGACTCTCCTCTTGATGTCATTGCCATTAACGACACTGCAGGTCTCGAAGAAGA
CTTTCGCTGAGGAAGTCAACGCTGCCTTCAGGGATGCGGCTGAGAAAGAGCTTAAAGGTA
TACTCGATGTTTGCGATGAGCCTCTTGTCTCTGTCGACTTCAGGTGCTCTGATGTGTCGT
CCACCATTGATTCTTCTCTGACCATGGTTATGGGAGATGATATGGTTAAAGTGATTGCTT
GGTATGATAACGAATGGGGTTACTCGCAGAGAGTCGTTGATTTGGCTGACATTGTTGCCA
ATAACTGGAAGTGAAGAAAGACTCAACTGTTGATGTTGTTTTGCTCCATTTTTTATTTTA
CTGTTATTATTATGATTCGGAATGTATAATTGTAGTTCCTGAGTTTATATGTATTTGTGC
TCTTCAAATTTTAATAGTAAAAAAGCTTTATATTCG

QA 1 756 1 756
DS 

RD RS1CI21TF 181 0 0
GAGTCGTTGATTTGGCTGACATTGTTGCCAATAACTGGAAGTGAAGAAAGACTCAACTGT
TGATGTTGTTCTGCTCCATTTTTTATTTTACTGTTATTATTATGATTCGGAATGTATAAT
TGTAGTTCCTGAGTTTATATGTATTTGTGCTCTTCAAATTTTAATAGTAAAAAAGCTTTA
T

QA 1 181 1 181
DS 



AS 1 3

CO CL3864Contig1 489 3 5 U
GGAGGCCGTCGATACACTCTACCGACAAGCGAAAGAGACGACACAAAGCGATGGGAAAAG
CTTCGGGAGCGAAACAGGCGACTGTTGTGGTTGCAGCTTTGGCTTTTGGTTGGTTAGCGA
TAGAGATCGCCTTCAAGCCTTTCCTCGACAAACTCCGCTCCTCGATCGACAAATCCGATC
CGGCCAAAGATCCCGATGACTCCGACAAAGACGCCTCCTTCGCCGCCGCTGCAGCTAGCT
CTGAGACGTGACGGTCTTCCGCGTAGGGTATTTGAATAAGGGTTTGTTAGGTTAAAATCT
GTGCGTTCAACTTTGAACTAAAACCTAAACAGTTTTGTTATATTTGCATAATTATATGTT
TTCTACTCATTTTGATGCGTCCTATAACCATTCAGTATTCGAAATCACAAAGATTGTTTC
AAATCATATATAGCAGATTAACCATGGAAGTAAGAAACGTATACATATGCAGAGACCATA
ACATTTTTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GA59JQ C 19
AF RS1GA59TF U 19
AF RS1DL38TF U 1
BS 1 50 RS1DL38TF
BS 51 51 RS1GA59TF
BS 52 163 RS1DL38TF
BS 164 164 RS1GA59TF
BS 165 489 RS1DL38TF

RD RS1GA59JQ 333 0 0
GG
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TTCCTCGACAAACTCCGCTCCTCGATCGACAAATCCGATCCGGCCAAAGATCCCGATGAC
TCCGACAAAGACGCCTCCTTCGCCGCCGCTGCAGCTAGCTCTGAGACGTGACGGTCTTCC
GCGTAGGGTATTTGAATAAGGGTTTGTTAGGTTAAAATCTGTGCGTTCAACTTTGAACTA
AAACCTAAACAGTTTTGTTATATTTGCATAA

QA 3 333 3 333
DS 

RD RS1GA59TF 333 0 0
GG
ACCGACAAGCGAAAGAGACGACACAAAGCGATGGGAAAAGCTTCGGGAGCGAAACAGGCG
ACTGTTGTGGTTGCAGCTTTGGCTTTTGGTTGGTTAGCGATAGAGATCGCCTTCAAGCCT
TTCCTCGACAAACTCCGCTCCTCGATCGACAAATCCGATCCGGCCAAAGATCCCGATGAC
TCCGACAAAGACGCCTCCTTCGCCGCCGCTGCAGCTAGCTCTGAGACGTGACGGTCTTCC
GCGTAGGGTATTTGAATAAGGGTTTGTTAGGTTAAAATCTGTGCGTTCAACTTTGAACTA
AAACCTAAACAGTTTTGTTATATTTGCATAA

QA 3 333 3 333
DS 

RD RS1DL38TF 489 0 0
GGAGGCCGTCGATACACTCTACCGACAAGCGAAAGAGACGACACAAAGCGGTGGGAAAAG
CTTCGGGAGCGAAACAGGCGACTGTTGTGGTTGCAGCTTTGGCTTTTGGTTGGTTAGCGA
TAGAGATCGCCTTCAAGCCTTTCCTCGACAAACTCCGCTCCTCAATCGACAAATCCGATC
CGGCCAAAGATCCCGATGACTCCGACAAAGACGCCTCCTTCGCCGCCGCTGCAGCTAGCT
CTGAGACGTGACGGTCTTCCGCGTAGGGTATTTGAATAAGGGTTTGTTAGGTTAAAATCT
GTGCGTTCAACTTTGAACTAAAACCTAAACAGTTTTGTTATATTTGCATAATTATATGTT
TTCTACTCATTTTGATGCGTCCTATAACCATTCAGTATTCGAAATCACAAAGATTGTTTC
AAATCATATATAGCAGATTAACCATGGAAGTAAGAAACGTATACATATGCAGAGACCATA
ACATTTTTG

QA 1 489 1 489
DS 



AS 1 2

CO CL3865Contig1 906 2 2 U
GGAAAATACAAATTTCTAAAATTAGATTGGAGCTGGAGAGTCATTTTCTCTGCGAAACTC
GCGGCTTGCTCTACAGTAGATCCTTCTTCGAAAGGGATAGATAGGCTAAAGGAAGATGGG
GCTTAACTTCACGAAGCTGTTCAGCAGGCTTTTCGCCAAGAAAGAAATGAGGATTCTGAT
GGTAGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACCACTATCTTGTACAAGCTCAAGCTTGGCGAAAT
TGTCACCACCATCCCCACCATCGGATTCAATGTGGAGACTGTTGAGTACAAGAACATCAG
TTTCACTGTTTGGGATGTGGGAGGTCAGGACAAGATTCGCCCCCTGTGGAGGCACTACTT
CCAGAACACTCAAGGTCTTATATTCGTGGTTGATAGCAACGACAGGGACCGAGTTGTGGA
GGCTAGGGATGAGTTACATCGCATGTTGAACGAGGATGAACTGAGGGATGCTGTCCTTCT
AGTGTTTGCTAACAAACAAGATCTTCCCAACGCAATGAATGCTGCAGAAATAACCGACAA
GCTTGGCCTTCACTCTCTTCGCCAGCGCCACTGGTACATTCAAAGCACATGTGCCACATC
TGGGGAAGGTCTTTATGAAGGCCTTGATTGGCTCTCCAACAACATCGCTAACAAGGCATG
ATGGAGCTGCTGGAACACGTTCTTGCAACTTGAAAGAGATCATTAGTGATTGCGGAGAAG
AGAAATAAGAAACGAGTATTGTGTCTGATGTTGTTTCAACTGTCTGTTGATTTTTCTGAC
CTTTACCTGTGTAGCCTCCAAAACTCACCTCTACTCTTTTTACCCGTTTAATGGATTTGT
GTTTTAAGTTTTTATTTTTACTTTTACAATTTCGTTTGTGTTTCCAAATATTGAAGCTTG
GTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1DM41TF U 1
AF RS1DM41JQ C 237
BS 1 606 RS1DM41TF
BS 607 906 RS1DM41JQ

RD RS1DM41TF 606 0 0
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GCGGCTTGCTCTACAGTAGATCCTTCTTCGAAAGGGATAGATAGGCTAAAGGAAGATGGG
GCTTAACTTCACGAAGCTGTTCAGCAGGCTTTTCGCCAAGAAAGAAATGAGGATTCTGAT
GGTAGGTCTTGATGCTGCTGGTAAGACCACTATCTTGTACAAGCTCAAGCTTGGCGAAAT
TGTCACCACCATCCCCACCATCGGATTCAATGTGGAGACTGTTGAGTACAAGAACATCAG
TTTCACTGTTTGGGATGTGGGAGGTCAGGACAAGATTCGCCCCCTGTGGAGGCACTACTT
CCAGAACACTCAAGGTCTTATATTCGTGGTTGATAGCAACGACAGGGACCGAGTTGTGGA
GGCTAGGGATGAGTTACATCGCATGTTGAACGAGGATGAACTGAGGGATGCTGTCCTTCT
AGTGTTTGCTAACAAACAAGATCTTCCCAACGCAATGAATGCTGCAGAAATAACCGACAA
GCTTGGCCTTCACTCTCTTCGCCAGCGCCACTGGTACATTCAAAGCACATGTGCCACATC
TGGGGA

QA 1 606 1 606
DS 

RD RS1DM41JQ 670 0 0
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TCAGTTTCACTGTTTGGGATGTGGGAGGTCAGGACAAGATTCGCCCCCTGTGGAGGCACT
ACTTCCAGAACACTCAAGGTCTTATATTCGTGGTTGATAGCAACGACAGGGACCGAGTTG
TGGAGGCTAGGGATGAGTTACATCGCATGTTGAACGAGGATGAACTGAGGGATGCTGTCC
TTCTAGTGTTTGCTAACAAACAAGATCTTCCCAACGCAATGAATGCTGCAGAAATAACCG
ACAAGCTTGGCCTTCACTCTTTTCGCCAGCGCCACTGGTACATTCAAAGCACATGTGCCA
CATCTGGGGAAGGTCTTTATGAAGGCCTTGATTGGCTCTCCAACAACATCGCTAACAAGG
CATGATGGAGCTGCTGGAACACGTTCTTGCAACTTGAAAGAGATCATTAGTGATTGCGGA
GAAGAGAAATAAGAAACGAGTATTGTGTCTGATGTTGTTTCAACTGTCTGTTGATTTTTC
TGACCTTTACCTGTGTAGCCTCCAAAACTCACCTCTACTCTTTTTACCCGTTTAATGGAT
TTGTGTTTTAAGTTTTTATTTTTACTTTTACAATTTCGTTTGTGTTTCCAAATATTGAAG
CTTGGTAAGC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 3

CO CL3866Contig1 1051 3 8 U
GGACTCAATTCATTTCGCACACAGTCAACAATGAAAAGCCTCATTATCGTCGTCGTAGCT
CTCCTCTGTGTCATTGTTTCACCGTCCACAGCGATGGGAGGTTGGCCAAAACCTTCAGAA
GTCTCTAATGAGGAGAAGCTGATGAATGCCGGCCAACCACAACCCCACTTATACGCTGGT
AATTTCAATTTCGGAGATTCCAAAGTATGGAAATGTACCCATAACAACGGATCTGGAGCC
GCCATTTCTATTAGTTACCCTTCACCTCCTCAACCACCCTCACGAAAGCCAACAACTCCG
TCATCTCCCCCGGCTCCTAAGACGGCTCCGCCACCACTTAAACCCTCACCTCCACGTCCA
ACTCCAAAGAAGTCTCCTCCACCTCCTAACCCATCACCTCCGCCTCCTAAACCCTCACCT
CCGCCTCCAGCTCCAAAAAAGTCTCCTCCGCCTTATAAACCATCCCCTCCACCGACTCCT
AAAAAGTCTCCGCCATCACCTACACCATCACCTCCGCGTCCAGCTCTAAAAAAGTCTCCT
CCACCTCCTAACCCATCATCTCTGACTCCAAATCAGTCTCCCCCACTTCCTAAAACCTCC
ACTCTGATCATTCCCTCTCTACCACCGCCACACGAATCAATCCCAGCACAATCCCCTCCA
ACAGAGCCAACAACGCCATCAACTCCATGGCCTCATTATCAGAATTGGAATCCGTGGGGA
CATTTCATTAACTGCATGGCCGAATTTGGGCCGTCTGCAGTATGTAAGCAACAGATAGAG
CTAAGTTACTACACAGGGAGATTTCGTGTAACTGACCAATGCTGCAACATTTTCGTCAAC
ATGGGAAATGAGTGTTCTGATGTCATTTTGGGCTTTTACGACGATCGCTACTTCCTTCCT
TTACTTCGCTGCACTTGCCACGTCAAGATCTACTAACTCCTATTTGGGTCCCTCTTCCCA
TTAGGGCTTTTTTTTCTTATTTTAGGTTCTTTAGTCATGTACTTTTGGTTATTTTCAGAA
AAAAATAATAAAAAGTTTCTTCCTTTTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AG94TF U 79
AF RS1BW74TF U 1
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GC

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DS 

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TCCTTTTTTAC

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DS 



AS 1 3

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GTTATCGTCTTGCCTTTCCCGGGACAAGGCCACATAACTCCATTGTCTCAGTTCTGCAAA
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BQ
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AF RS1GG24TF U 1
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AGG
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CCTAAGGCTCTCGTGTACGACTCCACCATGCCGTGGCTTCTTGATGTAGCTCACGCTCAT
GGTTTGAGCGGTGCCGCGTTCTTCACGCAACCTTGGCTTGTCTCGGCTATTTACTACCAT
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TTCCCTTCGTTTCCTATATTGAATGCGAATGACTTGCCGTCTTTCCTCTGCGAGTCTTCC
TCTTACCCCAATATACTAAGGATTGTGGTTGATCAGCTCTCAAACATTGATCGTGTGGAC
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TGGGAGTTCCAATGATTGGTATGCCTCATTGGACAGATCAACTTACAAATGCTAAGTTCG
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GGTTTTTCC

QA 1 849 1 849
DS 



AS 1 3

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CTGCTACAGAACAAAGGAGGAGGAGCAAGATCAATGATAGATTTCAAATGTTGAGACAAC
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ATATTCAATTCTTACAGGAGAAAACAAGCAAGTACGAGACTCCCTACCAAGGATGGAATC
ACGATCCTGCGAAGCTATCGAATTGGCAAAGAAACAACCAACATCTAGTACCTGAAGGAA
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CAACAACGCCTCAAGGCGTTGTTACAGACCGTCCAGAAACACTGAACCGAGCAACGCCAA
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CGGGCAACATCAGTATATCAAGTGTTTACTCACAAGGATTGGTGAAAACACTAAGAGAAG
CATTGGAGAACTCAGGAGTGGACTTAACAAAAGCAAGCATCTCTGTCGAAATCGAGCTTG
CTAAACAATCATCTTCCTTCAAGGATCATGAACTCCGTGGACCGGTCTCTCGAACTGGAA
ACGATGACGACGCCAAGCAAAGTCGGAAACCAAAACGGCTCAAGACGAACAACACAAGTT
AAAAAAAAAGCATCACAGTCGGGTATAATAACCCCAAAGTTGAAACGTCTGTTTTCATTC
TTCTTTATCTCAAAACAGGGCTTTCTTTTTCAAAAATTTATAGATATATTCAATCTTAAA
ATTTTCTTACTTTGTACATTGGAAACTACAATTTTTATAATTTTTTTCTCGTGGGGCCAT
AATCTTTTGAGGAGGCCTAAGACTAGGGAGACCCGGTTATGCTTACCGCATTTTTATGAC
TCTGTTCTCAATTCTTCTTTGGAGTAAGATCATTAAGTGGGAGGCTTTCAATGTATAAGC
TTCCTGTGATAAAACATTTTGTTTGTTACTGGTTATCAAAACTCAAAGGTGATATATTTA
TGTGTGTGTTATCTTTTAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DY16TF U 1
AF RS1E629TF U 428
AF RS1E629JQ C 509
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RD RS1DY16TF 671 0 0
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CGGGCAACATCAGTACATCAAGTGTTTACTCACAAGGATTGGTGAAAACACTAAGAGAAG
CATTGGAGAAC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1E629TF 755 0 0
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CGTAACTCATTTGCACACAAGAGTCGCAGCATCAGAGACGGTAGAGCCAAGCGAGAGTTC
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CGACGCCAAGCAAAGTCGGAAACCAAAACGGCTCAAGACGAACAACACAAGTTAAAAAAA
AAGCATCACAGTCGGGTATAATAACCCCAAAGTTGAAACGTCTGTTTTCATTCTTCTTTA
TCTCAAAACAGGGCTTTCTTTTTCAAAAATTTATAGATATATTCAATCTTAAAATTTTCT
TACTTTGTACATTGGAAACTACAATTTTTATAATTTTTTTCTCGTGGGGCCATAATCTTT
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GATAAA*CATTTTGTTTGTTACTGGT
ATCAAACTC

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1E629JQ 711 0 0
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CTCACAAGGATTGGTGAAAACACTAAGAGAAGCATTGGAGAACTCAGGAGTGGACTTAAC
AAAAGCAAGCATCTCTGTCGAAATCGAGCTTGCTAAACAATCATCTTCCTTCAAGGATCA
TGAACTCCGTGGACCGGTCTCTCGAACTGGAAACGATGACGACGCCAAGCAAAGTCGGAA
ACCAAAACGGCTCAAGACGAACAACACAAGTTAAAAAAAAAGCATCACAGTCGGGTATAA
TAACCCCAAAGTTGAAACGTCTGTTTTCATTTTTCTTTATCTCAAAACAGGGCTTTCTTT
TTCAAAAATTTATAGATATATTCAATCTTAAAATTTTCTTACTTTGTACATTGGAAACTA
CAATTTTTATAATTTTTTTCTCGTGGGGCCATAATCTTTTGAGGAGGCCTAAGACTAGGG
AGACCCGGTTATGCTTACCGCATTTTTATGACTCTGTTCTCAATTCTTCTTTGGAGTAAG
ATCATTAAGTGGGAGGCTTTCAATGTATAAGCTTCCTGTGATAAAACATTTTGTTTGTTA
CTGGTTATCAAAACTCAAAGGTGATATATTTATGTGTGTGTTATCTTTTAG

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 3

CO CL3869Contig1 499 3 3 U
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CTTGATGGTATCTCTGAATGGTTGTTACCTGAGAAATTAAACGAATCTTCGATCTGATGG
CAAAATGGCTCCTATGTCTATTAAACCCATCATGGCTCAAGTGAGGTCCATGATCCGCAG
TATTCCTACACCCTCCACGGAGGTGACTTCCCGACCAGTGTTCTGGGAGGCCACGATGGG
TACGTACGCGGTTTATGCCCAATGGATATATTACCAGATGTTTAAAGAGAGGAAACTGTA
GGAAGCTCTTGATGATGTGTTTAACCAAACTGTGGGTGGGTGGGGTGTTTTTAATAACTT
ATTTTAAAGACTGATGTAATAATTGTTCCAGCTACAATTGAGATTGAGATTGTGTTTTGC
TTTACGTTGAGATTATGGTTTGCTTTTCCTTTGAGATTGTGTTTCCCAAACTTGAATCAA
CAAAAGAATAATTGGAACC


BQ
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AF RS1AS64TF U 266
AF RS1EU22JQ C 1
AF RS1EU22TF U 1
BS 1 266 RS1EU22TF
BS 267 449 RS1AS64TF
BS 450 499 RS1EU22TF

RD RS1AS64TF 184 0 0
G
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AAACTGTGGGTGGGTGGGGTGTTTTTAATAACTTATTTTAAAGACTGATGTAATAATTGT
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TCC

QA 2 184 2 184
DS 

RD RS1EU22JQ 499 0 0
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CTTGATGGTATCTCTGAATGGTTGTTACCTGAGAAATTAAACGAATCTTCGATCTGATGG
CAAAATGGCTCCTATGTCTATTAAACCCATCATGGCTCAAGTGAGGTCCATGATCCGCAG
TATTCCTACACCCTCCACGGAGGTGACTTCCCGACCAGTGTTCTGGGAGGCCACGATGGG
TACGTACGCGGTTTATGCCCAATGGATATATTACCAGATGTTTAAAGAGAGGAAACTGTA
GGAAGCTCTTGATGATGTGTTTAACCAAACTGTGGGTGGGTGGGGTGTTTTTAATAACTT
ATTTTAAAGACTGATGTAATAATTGTTCCAGCTACAATTGAGATTGAGATTGTGTTTTGC
TTTACGTTGAGATTATGGTTTGCTTTTCCTTTGAGATTGTGTTTCCCAAACTTGAATCAA
CAAAAGAATAATTGGAACC

QA 1 499 1 499
DS 

RD RS1EU22TF 499 0 0
GCGACGCGTCTTCGTGTGAGTCACTCTCTCCTCTCTATTTCAAAACTCGGAACTCGATCT
CTTGATGGTATCTCTGAATGGTTGTTACCTGAGAAATTAAACGAATCTTCGATCTGATGG
CAAAATGGCTCCTATGTCTATTAAACCCATCATGGCTCAAGTGAGGTCCATGATCCGCAG
TATTCCTACACCCTCCACGGAGGTGACTTCCCGACCAGTGTTCTGGGAGGCCACGATGGG
TACGTACGCGGTTTATGCCCAATGGATATATTACCAGATGTTTAAAGAGAGGAAACTGTA
GGAAGCTCTTGATGATGTGTTTAACCAAACTGTGGGTGGGTGGGGTGTTTTTAATAACTT
ATTTTAAAGACTGATGTAATAATTGTTCCAGCTACAATTGAGATTGAGATTGTGTTTTGC
TTTACGTTGAGATTATGGTTTGCTTTTCCTTTGAGATTGTGTTTCCCAAACTTGAATCAA
CAAAAGAATAATTGGAACC

QA 1 499 1 499
DS 



AS 1 3

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GGGTCATTGGCACGTGCCGGTAAGGTGAGAGGGCAGACACCGAAGGTAGCGAAACAAGAT
AAGAAGAAGAAACCCAGAGGACGTGCTCACAAGCGTCTTCAGCACAATCGCCGTTTCGTT
ACCGCCGTTGTTGGTTTCGGTAAGAAGAGAGGACCAAACTCTTCCGAGAAGTAGAGGATA
GATTTGCTTTGAAAGAAACTCTTTCTTCTTTGCTATTTTGTATCCTTGGGGATGTTTTCT
TTGTTTGTTTTAAGTCGTGTTTCTCTGGAACTTGTGTTGTGTAACTCTATGCAATGAAAT
AGGACCATTTACTTTTCCATCTGATTCTC


BQ
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AF RS1CU63TF U 1
AF RS1AB62TF U 4
AF RS1EL43TF U 13
BS 1 44 RS1CU63TF
BS 45 45 RS1AB62TF
BS 46 372 RS1CU63TF
BS 373 389 RS1AB62TF

RD RS1CU63TF 376 0 0
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GGGTCATTGGCACGTGCCGGTAAGGTGAGAGGGCAGACACCGAAGGTAGCGAAACAAGAT
AAGAAGAAGAAACCCAGAGGACGTGCTCACAAGCGTCTTCAGCACAATCGCCGTTTCGTT
ACCGCCGTTGTTGGTTTCGGTAAGAAGAGAGGACCAAACTCTTCCGAGAAGTAGAGGATA
GATTTGCTTTGAAAGAAACTCTTTCTTCTTTGCTATTTTGTATCCTTGGGGATGTTTTCT
TTGTTTGTTTTAAGTCGTGTTTCTCTGGAACTTGTGTTGTGTAACTCTATGCAATGAAAT
AGGACCATTTAC
TTTT

QA 1 372 1 372
DS 

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GG
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CGTTGTTGGTTTCGGTAAGAAGAGAGGACCAAACTCTTCCGAGAAGTAGAGGATAGATTT
GCTTTGAAAGAAACTCTTTCTTCTTTGCTATTTTGTATCCTTGGGGATGTTTTCTTTGTT
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CATTTACTTTTCCATCTGATTCTC

QA 3 386 3 386
DS 

RD RS1EL43TF 361 0 0
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GGTTTCGGTAAGAAGAGAGGACCAAACTCTTCCGAGAAGTAGAGGATAGATTTGCTTTGA
AAGAAACTCTTTCTTCTTTGCTATTTTGTATCCTTGGGGATGTTTTCTTTGTTTGTTTTA
AGTCGTGTTTCTCTGGAACTTGTGTTGTGTAACTCTATACAATGAAATAGGACCATTTAC
C

QA 1 360 1 360
DS 



AS 1 2

CO CL3871Contig1 1026 2 6 U
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TTTAAAGCATTTTAATGATTATAAATATGATGAAATAAAGGTTTGTTCAAAGGATCGATC
AAAGCATGGTCGAGGAGATGTGATCAATGGGGAAAGGATTTCCCATGACATTGTCCATGA
AGTAATGGTGAGGATGTGTTGCGTCCATTACTACAAACTGCATATCCTCCGATGGTTTCC
AATGCCTTTTCCTCTGGTTTATGAACCAACTGTTTATCTGTTTCTGGTCCAGCCCGGTTG
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ACCAGTCAAGTAGTTGTTGGCAAGCTTCCTTAGGAAGCTTTCCTTTCTTCCTCTTCTTCA
TGAACTCTTGCTTGAGACTGCCTAAGTAACCACTGTACTTGCGCAAGAGCTGTCCTTTAA
GCTCCCTATCCTCTGCCGGCGGATCTACAAATTCATTGTTCATATCGACTTCTTCCTCAG
ATGACCCATTGTTGTTTCTCTCAATAGCTGCCTCTCCATAACCAGAGAAGGAGGAAGGCG
AGGAGAGAGAAAGGGATTTGAATTGACACTCAACGTGTTGAAGGAAGACCATAGCTTCTT
TAAAAGGTTTAGAGAGTTCTTGCTCGTACTTCACGAGCATTTCACAGTAAGCTTCCATGA
ACTGATCAAGCCCTGGATCTTCACCTAAAGACCCTGTGGGTCCCATCGACGCTGCAGCTG
CTGCCGCAGACGAGCATGTTTCTTCCAGCCTCGTCTGCACTTCCGGTGGGGCTCCCACCT
TCTGGCAATTGACATAGGCGAGCAAGAGGCGGTGGTAGTGAGGATGAGCCATGATTTTGG
CCTTGA


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1H418JQB U 1
AF RS1C181TF C 375
BS 1 432 RS1H418JQB
BS 433 433 RS1C181TF
BS 434 501 RS1H418JQB
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BS 503 659 RS1H418JQB
BS 660 1026 RS1C181TF

RD RS1H418JQB 659 0 0
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CTGAAATTACAAGTCACACAACACAACCCATATATAATTAGGGTAAACATTAAAAGCTTG
TTCATCAGTCGGAACGATCAACGTTCCTAAGTATTCCAAGAAACCATAGATTATACATAT
TTTAAAGCATTTTAATGATTATAAATATGATGAAATAAAGGTTTGTTCAAAGGATCGATC
AAAGCATGGTCGAGGAGATGTGATCAATGGGGAAAGGATTTCCCATGACATTGTCCATGA
AGTAATGGTGAGGATGTGTTGCGTCCATTACTACAAACTGCATATCCTCCGATGGTTTCC
AATGCCTTTTCCTCTGGTTTATGAACCAACTGTTTATCTGTTTCTGGTCCAGCCCGGTTG
ATTCCGCTAGTGCTAACTTTTGCTGCTCCGAAGGGTAAGGCCATTTGTAGTGTCGGCTCC
ACCAGTCAAGTAGTTGTTGGCGAGCTTCCTTAGGAAGCTTTCCTTTCTTCCTCTTCTTCA
TGAACTCTTGCTTGAGACTGCCTAAGTAACCACTGTACTTGCGCAAGAGCTGTCCTTTAA
GCTCCCTATCCTCTGCCGGCGGATCTACAAATTCATTGTTCATATCGACTTCTTCCTCA

QA 1 659 1 659
DS 

RD RS1C181TF 652 0 0
TGGTTTATGAACCAATTGTTTATCTGTTTCTGGTCCAGCCCGGTTGATTCCGCTAGTGAT
AACTTTTGCTGCTCCGAAGGGTAAGGCCATTTGTAGTGTCGGCTCCACCAGTCAAGTAGT
TGTTGGCAAGCTTCCTTAGGAAGCTTTCCTTTCTTCCTCTTCTTCATGAACTCTTGCTTG
AGACTGCCTAAGTAACCACTGTACTTGCGCAAGAGCTGTCCTTTAAGCTCCCTATCCTCT
GCCTGCGGATCTACAAATTCATTGTTCATATCGACTTCTTCCTCAGATGACCCATTGTTG
TTTCTCTCAATAGCTGCCTCTCCATAACCAGAGAAGGAGGAAGGCGAGGAGAGAGAAAGG
GATTTGAATTGACACTCAACGTGTTGAAGGAAGACCATAGCTTCTTTAAAAGGTTTAGAG
AGTTCTTGCTCGTACTTCACGAGCATTTCACAGTAAGCTTCCATGAACTGATCAAGCCCT
GGATCTTCACCTAAAGACCCTGTGGGTCCCATCGACGCTGCAGCTGCTGCCGCAGACGAG
CATGTTTCTTCCAGCCTCGTCTGCACTTCCGGTGGGGCTCCCACCTTCTGGCAATTGACA
TAGGCGAGCAAGAGGCGGTGGTAGTGAGGATGAGCCATGATTTTGGCCTTGA

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 3

CO CL3872Contig1 1090 3 3 U
GGATTCAATTTGTGTCTGTGAACAAAAAGGCAAAAAAAGAAGATGGGTTTAATCAAAGAG
AAAGAGATGGAGATGCCAGTCATTGATTTTAGTGAACTGGATGGAGAAAACAGAACCAAC
ACTATGTCACTTCTTGATCATGCATGTGATAAGTGGGGCTTCTTCATGGTTGATAATCAT
GGAATTGATAAAGAATTGATGGAGAAAGTAAAAAAGCTGATTAACTCTCATTATGAGGAG
CATTTGAAAGAGAAGTTTTACCAGTCAGAGATGGTCAAGGCTTTGAGTGAAGGCAAAACC
TCAGATGCTGATTGGGAAAGCACTTTCTTCGTTTGGCATAAGCCGACTTCAAACATATCC
AAAGTCCCAAACATTTCAGATGAACTCATCAAGACAATGGATGAATATGTTTCTCAATTG
CACAAGTTTGCAGAAAGGCTCTCTAAACTCATGTGTGAAAATCTTGGTCTCCCTCAAGAA
CACATAATGAATGCGTTCTCCGGTCTAGACGGTCCAGTTTTTGGGACAAAAGTGGCTAAA
TACCCAGAATGTCCTCGTCCAGAGCTCATTAGAGGGCTGAGAGAACATACTGATGCTGGA
GGAATCATATTTCTCTTGCAGGATGATCAAGTGCCTGGTCTTGAGTTCTTAAAAGATGTA
AGTGGATTCATATCCCACCATCTGAGAACAATACCATTTTTGTCAATACTGGTGATCAAC
TCGAGATATTGAGTAATGGAAGGTACAAGAGTGTTGTACACCGTGTAATGTCGATGAAGC
AGGGAAGTAGACTGTCGATAGCTACATTTTACAATCCAGCTGGTGATGCTATAATATCTC
CAGCTAAAGAGCTATTGTACCCAAGTGGCTACCGGTTCCAAGACTACCTTAAGCTTTATT
CAACCACTAAGTTTGGAGACAAAGGCTCTAGATTTCATACCATGAAGAAAATGGAGAATG
GGGATTCCGTCTAGGATGTATCTGAACGTAACGCTTCTGTATTTCACATAAAATTCTATT
TTTATCAAAACTTTGTCTTCTTCTTGTGTATCTTTCATAAAGGAATAACAATTATGTAAG
GATCATGCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GT83TF U 1
AF RS1DP93TF U 5
AF RS1DP93JQ C 298
BS 1 200 RS1GT83TF
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BS 599 1090 RS1DP93JQ

RD RS1GT83TF 200 0 0
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AAAGAGATGGAGATGCCAGTCATTGATTTTAGTGAACTGGATGGAGAAAACAGAACCAAC
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GGAATTGATAAAGAATTGAT

QA 1 200 1 200
DS 

RD RS1DP93TF 594 0 0
GG
AATTTGTGTCTGTGAACAAAAAGGCAAAAAAAGAAGATGGGTTTAATCAAAGAGAAAGAG
ATGGAGATGCCAGTCATTGATTTTAGTGAACTGGATGGAGAAAACAGAACCAACACTATG
TCACTTCTTGATCATGCATGTGATAAGTGGGGCTTCTTCATGGTTGATAATCATGGAATT
GATAAAGAATTGATGGAGAAAGTAAAAAAGCTGATTAACTCTCATTATGAGGAGCATTTG
AAAGAGAAGTTTTACCAGTCAGAGATGGTCAAGGCTTTGAGTGAAGGCAAAACCTCAGAT
GCTGATTGGGAAAGCACTTTCTTCGTTTGGCATAAGCCGACTTCAAACATATCCAAAGTC
CCAAACATTTCAGATGAACTCATCAAGACAATGGATGAATATGTTTCTCAATTGCACAAG
TTTGCAGAAAGGCTCTCTAAACTCATGTGTGAAAATCTTGGTCTCCCTCAAGAACACATA
ATGAATGCGTTCTCCGGTCTAGACGGTCCAGTTTTTGGGACAAAAGTGGCTAAATACCCA
GAATGTCCTCGTCCAGAGCTCATTAGAGGGCTGAGAGAACATACTGATGCTG

QA 3 594 3 594
DS 

RD RS1DP93JQ 793 0 0
ACCTCAGATGCTGATTGGGAAAGCACTTTCTTCGTT*GGCATAAGC*GACTTCAAACATA
TCCAAAGTCCCAAACATTTCAGATGAACTCATCAAGACAATGGATGAATATGTTTCTCAA
TTGCACAAGTTTGCAGAAAGGCTCTCTAAACTCATGTGTGAAAATCTTGGTCTCCCTCAA
GAACACATAATGAATGCGTTCTCCGGTCTAGACGGTCCAGTTTTTGGGACAAAAGTGGCT
AAATACCCAGAATGTCCTCGTCCAGAGCTCATTAGAGGGCTGAGAGAACATACTGATGCT
GGAGGAATCATATTTCTCTTGCAGGATGATCAAGTGCCTGGTCTTGAGTTCTTAAAAGAT
GTAAGTGGATTCATATCCCACCATCTGAGAACAATACCATTTTTGTCAATACTGGTGATC
AACTCGAGATATTGAGTAATGGAAGGTACAAGAGTGTTGTACACCGTGTAATGTCGATGA
AGCAGGGAAGTAGACTGTCGATAGCTACATTTTACAATCCAGCTGGTGATGCTATAATAT
CTCCAGCTAAAGAGCTATTGTACCCAAGTGGCTACCGGTTCCAAGACTACCTTAAGCTTT
ATTCAACCACTAAGTTTGGAGACAAAGGCTCTAGATTTCATACCATGAAGAAAATGGAGA
ATGGGGATTCCGTCTAGGATGTATCTGAACGTAACGCTTCTGTATTTCACATAAAATTCT
ATTTTTATCAAAACTTTGTCTTCTTCTTGTGTATCTTTCATAAAGGAATAACAATTATGT
AAGGATCATGCCG

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

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GAAGTCAGAGGCCCCGTGATCCAGTCTCCCATCAGAACCGAAGATGATCTCAAGAAACTG
CACCCTATCGATCTCGACAAGTTTCGGTTCGTTGGAGACTCGTTAAAGATTCTGAGAGGA
GAGGTCGGAGGGAATGCTGCTGTTTTGGGTTTCGTTGGAGCGCCTTGGACGATAGCGACT
TATATAGTTGAAGGAGGAACGACTCGGACGTATACGGTGATCAAGAGTATGTGTCATGCT
GCACCTAATGTGCTGAGAGCTCTCTTGTCTCATTTGACCAAAGCTATTACGGAGTATGTT
GTGTACCAAGTCGAGCACGGAGCTCACTGCATTCAGATATTTGATTCGTGGGGTGGACAG
TTGACTCCTGAGATGTGGGAGCGTTGGTCCAAACCTTACATCGAGGAGATTATTCATGAT
GTAAAGAGAAGATGTCCAGAGACGCCGATAGTTTTCTACATAAATGGAAACGGTGGACTT
CTTGAGCGGATGAAAGGAACAGGAGCTGATGTTATTGGACTTGACTGGACTGTAGATATG
GCTGATGGGAGGAGGAGACTGGGGAGCGATGTTAGCGTGCAGGGGAACGTTGATCCAGCT
TACCTATTCTTTCCGCTTCCTGCTTTAACCGAAGAAATCCAAAGAGTGGTGAAGAGTGCT
GGACCAAAAGGGCATATACTCAACTTAGGACACGGTGTCTTGGTAGGGACGCCAGAGGAA
GCCGTGGCTCATTTTTTTGAAACCGCGAGGAGTTTGGATTACAAAACGTTTTTCCAAAAC
CGTGTTCCTGCAGAATTTGAATTGGTTGCCTGAGGGGAGGGTAATGTTGAATAGACAGGA
ATCAGAGAAAATCTTTCTGTTTCCGACTCATAATTTTATCCTAGAGTGAGTGACTTGCTT
TGAGAACATTTGACACTGTCCTAGTTTTTTAACTCTTTAACAGTGTCTTGAGTTGCTCAT
TGAAAATTTTCCCTGTTTGTTTTCTCGATCTTTATTTGTTGTATTTTCTATGTGAAACCA
AGTAGCTTGTTTTGTATCATGAACTGAAAAAAAAAAGAACGCCTCTTATCTCAGTTTGAT
TTGGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B041TF U 1
AF RS1B041JQ C 432
BS 1 638 RS1B041TF
BS 639 1148 RS1B041JQ

RD RS1B041TF 638 0 0
GTCATCTTCTCAGACATCCTCACTCCCTTACCCGCCTTCGGCGTCCCTTTCGACATCGAA
GAAGTCAGAGGCCCCGTGATCCAGTCTCCCATCAGAACCGAAGATGATCTCAAGAAACTG
CACCCTATCGATCTCGACAAGTTTCGGTTCGTTGGAGACTCGTTAAAGATTCTGAGAGGA
GAGGTCGGAGGGAATGCTGCTGTTTTGGGTTTCGTTGGAGCGCCTTGGACGATAGCGACT
TATATAGTTGAAGGAGGAACGACTCGGACGTATACGGTGATCAAGAGTATGTGTCATGCT
GCACCTAATGTGCTGAGAGCTCTCTTGTCTCATTTGACCAAAGCTATTACGGAGTATGTT
GTGTACCAAGTCGAGCACGGAGCTCACTGCATTCAGATATTTGATTCGTGGGGTGGACAG
TTGACTCCTGAGATGTGGGAGCGTTGGTCCAAACCTTACATCGAGGAGATTATTCATGAT
GTAAAGAGAAGATGTCCAGAGACGCCGATAGTTTTCTACATAAATGGAAACGGTGGACTT
CTTGAGCGGATGAAAGGAACAGGAGCTGATGTTATTGGACTTGACTGGACTGTAGATATG
GCTGATGGGAGGAGGAGACTGGGGAGCGATGTTAGCGT

QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1B041JQ 717 0 0
GATGTGGGAGCGTTGGTCCAAACCTTACATCGAGGAGATTATTCATGATGTAAAGAGAAG
ATGTCCAGAGACGCCGATAGTTTTCTACATAAATGGAAACGGTGGACTTCTTGAGCGGAT
GAAAGGAACAGGAGCTGATGTTATTGGACTTGACTGGACTGTAGATATGGCTGATGGGAG
GAGGAGACTGGGGAGCGATGTTAGCGTGCAGGGGAACGTTGATCCAGCTTACCTATTCTT
TCCGCTTCCTGCTTTAACCGAAGAAATCCAAAGAGTGGTGAAGAGTGCTGGACCAAAAGG
GCATATACTCAACTTAGGACACGGTGTCTTGGTAGGGACGCCAGAGGAAGCCGTGGCTCA
TTTTTTTGAAACCGCGAGGAGTTTGGATTACAAAACGTTTTTCCAAAACCGTGTTCCTGC
AGAATTTGAATTGGTTGCCTGAGGGGAGGGTAATGTTGAATAGACAGGAATCAGAGAAAA
TCTTTCTGTTTCCGACTCATAATTTTATCCTAGAGTGAGTGACTTGCTTTGAGAACATTT
GACACTGTCCTAGTTTTTTAACTCTTTAACAGTGTCTTGAGTTGCTCATTGAAAATTTTC
CCTGTTTGTTTTCTCGATCTTTATTTGTTGTATTTTCTATGTGAAACCAAGTAGCTTGTT
TTGTATCATGAACTGAAAAAAAAAAGAACGCCTCTTATCTCAGTTTGATTTGGTTTG

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 3

CO CL3874Contig1 828 3 7 U
GGAATGTATTTGTTTTAATTCTGTCATTATTGTTAATCCCATTGGATCGAGATTCCATGG
CGATGTCTCCCTTCCTTCCTCTCAGATCTATAAATGTGAGCGGGTTGAGAGCACGATGGA
TATTCAGTTTATCATTTTATTGAGCGTAGACAGATTCTCAAAAGTTTCTTTCTCTGCCGC
TGTTGTTTCCGCGTTTGATGCTCTCCTCCTCGGAAGATCCGCCAGTCTCATAAGATTCTG
GGAGGCTCTCCCTCTCTCTTTGATCATCTTTTACCAGGCTTGAGCAGGAATCTAGGCTCC
AGGGGGAGTTCTGCTCTCATGCCAACCATAGAAGGCATAGCCGTACACATCGGCGTCCGA
GAAAGCCTGAAAAGGATTCCAGCAAAGAGATGGAACCTCTAGGAGACTTTTGGGATGAGG
TAGGTCTCACTCTATCCGTAGACGAGTCCAAGTCATGTTCAGGTTAATAAGCGTAGACGC
ATCAATAGTTTCAAGAGGAGGGATGCGAAGAGATTAGTGATGTTTCGTCTATGTTAGTTA
AAGACCATGTATTAAGGTTACTTGATTGACATAGATAAGTACATATGGTTACTTCGTCAG
CTCTAAATGGAAGGGAAATCATGGTGGTCACTAATTCTCTGCAGGACCTTTTTCATGTAA
TATATTGTCATTTTGTTCATCTGTGTTGTTGGAGAGTTATATTTATTCTACTAGGTGTTG
TAGAATGTTTTTGGGGCTATCATCATTGAAGACTAGCTCCACGCGGTACATGTAATATGT
GGATATCTGTGGTCTTGAGTGATTCTTACATATAGTAGGTTAGGTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D258TF U 1
AF RS1FC03TF U 398
AF RS1D258JQ C 79
BS 1 612 RS1D258TF
BS 613 613 RS1FC03TF
BS 614 620 RS1D258TF
BS 621 646 RS1FC03TF
BS 647 647 RS1D258JQ
BS 648 709 RS1FC03TF
BS 710 828 RS1D258JQ

RD RS1D258TF 623 0 0
GGAATGTATTTGTTTTAATTCTGTCATTATTGTTAATCCCATTGGATCGAGATTCCATGG
CGATGTCTCCCTTCCTTCCTCTCAGATCTATAAATGTGAGCGGGTTGAGAGCACGATGGA
TATTCAGTTTATCATTTTATTGAGCGTAGACAGATTCTCAAAAGTTTCTTTCTCTGCCGC
TGTTGTTTCCGCGTTTGATGCTCTCCTCCTCGGAAGATCCGCCAGTCTCATAAGATTCTG
GGAGGCTCTCCCTCTCTCTTTGATCATCTTTTACCAGGCTTGAGCAGGAATCTAGGCTCC
AGGGGGAGTTCTGCTCTCATGCCAACCATAGAAGGCATAGCCGTACACATCGGCGTCCGA
GAAAGCCTGAAAAGGATTCCAGCAAAGAGATGGAACCTCTAGGAGACTTTTGGGATGAGG
TAGGTCTCACTCTATCCGTAGACGAGTCCAAGTCATGTTCAGGTTAATAAGCGTAGACGC
ATCAATAGTTTCAAGAGGAGGGATGCGAAGAGATTAGTGATGTTTCGTCTATGTTAGTTA
AAGACCATGTATTAAGGTTACTTGATTGACATAGATAAGTACATATGGTTACTTCGTCAG
CTCTAAATGGAAAGGAAATC
GTG

QA 1 620 1 620
DS 

RD RS1FC03TF 312 0 0
TCTAGGAGACTTT**GGATAAGGTAGGTCTCACTCTATCCGTAGACGAGTCCAAGTCATG
TTCAGGTTAATAAGCGTAGACGCATCAATAGTTTCAAGAGGAGGGATGCGAAGAGATTAG
TGATGTTTCGTCTATGTTAGTTAAAGACCATGTATTAAGGTTCCTTGATTGACATAGATA
AGTACATATGGTTACTTCGTCAGCTCTAAATGGAAGGGAAATCATGGTGGTCACTAATTC
TCTGCAGGATCTTTTTCATGTAATATATTGTCATTTTGTTCATCTGTGTTGTTGGAGAGT
TATATTTATTCT

QA 1 312 1 312
DS 

RD RS1D258JQ 750 0 0
CTCTCAGATCTATAAATGTGAGCGGGTTGAGAGCACGATGGATATTCAGTTTATCATTTT
ATTGAGCGTAGACAGATTCTCAAAAGTTTCTTTCTCTGCCGCTGTTGTTTCCGCGTTTGA
TGCTCTCCTCCTCGGAAGATCCGCCAGTCTCATAAGATTCTGGGAGGCTCTCCCTCTCTC
TTTGATCATCTTTTACCAGGCTTGAGCAGGAATCTAGGCTCCAGGGGGAGTTCTGCTCTC
ATGCCAACCATAGAAGGCATAGCCGTACACATCGGCGTCCGAGAAAGCCTGAAAAGGATT
CCAGCAAAGAGATGGAACCTCTAGGAGACTTTTGGGATGAGGTAGGTCTCACTCTATCCG
TAGACGAGTCCAAGTCATGTTCAGGTTAATAAGCGTAGACGCATCAATAGTTTCAAGAGG
AGGGATGCGAAGAGATTAGTGATGTTTCGTCTATGTTAGTTAAAGACCATGTATTAAGGT
TACTTGATTGACATAGATAAGTACATATGGTTACTTCGTCAGCTCTAAATGGAAGGGAAA
TCGTGGTGGTCACTAATTCTCTGCAGGACCTTTTTCATGTAATATATTGTCATTTTGTTC
ATCTGTGTTGTTGTAGAGTTATATTTATTCTACTAGGTGTTGTAGAATGTTTTTGGGGCT
ATCATCATTGAAGACTAGCTCCACGCGGTACATGTAATATGTGGATATCTGTGGTCTTGA
GTGATTCTTACATATAGTAGGTTAGGTGTT

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL3875Contig1 548 2 1 U
TCGATAAGGATGGAGATGGTTGCATCACCACCAAGGAGCTCGGGACCGTGATGAGGTCTC
TAGGACAAAACCCGACAGAAGCTGAGCTCCAAGACATGATCAACGAGGTTGATGCTGACG
GGAACGGGACCATTGACTTCCCTGAGTTTCTGAACCTGATGGCGAGGAAGATGAAGGACA
CTGACTCAGAGGAAGAGCTCAAGGAAGCGTTCAGGGTTTTCGACAAAGACCAGAACGGTT
TCATCTCTGCTGCTGAGCTTCGACACGTGATGACTAACCTCGGGGAGAAGCTGACCGACG
AGGAGGTTGATGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATG
ATGAGTTCGTCAAAGTCATGATGGCTAAGTGAGACAGAATCTTATCAAAACGATTTATGA
TGTCTGCGACATGTTTTCGCTTTCTTTCCGGTCTGTTATTTGTGTTTTGCTTTTGGTTAG
TGTTATGTGAAGTATGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTGACAATTTGATGTTCTCTCG
TTTTTATT


BQ
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CTGACTCAGAGGAAGAGCTCAAGGAAGCGTTCAGGGTTTTCGACAAAGACCAGAACGGTT
TCATCTCTGCTGCTGAGCTTCGACACGTGATGACTAACCTCGGGGAGAAGCTGACCGACG
AGGAGGTTGATGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGCGATGGTCAGATCAACTATG
ATGAGTTCGTCAAAGTCATGATGGCTAAGTGAGACAGAATCTTATCAAAACGATTTATGA
TGTCTGCGACATGTTTTCGCTTTCTTTCCGGTCTGTTATTTGTGTTTTGCTTTTGGTTAG
TGTTATGTGAAGTATGAACTCATGGTTTGCATTATCCTTTGACAATTTGATGTTCTCTCG
TTTTTATT

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DS 



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CTCTTATAATTCTTCATCCTTCTCCGTCTTTGCTCTCCCGTCGCTTTGCGATTTGATCTG
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CTCAACCAAAGACATGTGCTTCACCAGCATTTAGCTCTCTTAATTTCACCAGAACTGGGC
CAAACTCTCAGAGTGATAGATTAAGTATTCATCGGTTGGCATTGGTACATGGGAATCACA
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ATATTGCCGACCCTCCTAGGACCTTGGCGTACGATCTTGTTCAAGGGGCTCTTGTGAAGT
GGAGATGGAAGGAGGACAAGTCTGTTCCAGATACACCTACTGCTGTTCTTCTACATGGGA
TTTTAGGCAGCGGCAAAAACTGGGGCACTTTTGCTCGAAGATTGGCTCATGAGTTCCCAA
CTTGGCAGTTTCTCTTGGTAGACTTGCGTTGCCATGGGGACTCAGCGTCTCTCAAGAAGA
GAGGTCCACACTCTGTTGCTACAACTGCTTCTGATGTTCTAAAACTTGTTGGTCAGTTGA
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CTGGAAAGGTTCGTGCAGGAGGAGATGGAGAGGATCATCCACGAGACTCATATCATTTCT
ACGTACATTGCCTAAAGTGGTCCCATCAAAGCGAGAAGTTTTAAACGCTCTTATCAAAGA
AGGCTTTTCGAATGATGTCGCACAGTGGGTTGTTACTAATTTGAGACCTACTGGACCATC
GTGCTCTAGCTTTTCGTGGACATTTGACTTAGACGGGATCTCCCAACTTTATCAGTCCTA
CGAAGACACAAATTTATGGAACTTTGTTGAGAACCTGCCAAGAGGAGTACATGTGAATTT
TCTTAAAGCGGAAAGAAGCTTGCACCGTTGGGCACTAGAAGACCTTCAACGGATCCACTC
CGCTGAAGAGATCGCCTCTGAAGAAGGCGGCGGCGTAGAAATGCATGTCCTGGAAGATGC
CGGTCACTGGGTTCACACGGATAACCCGGATGGTCTCTTCAGGATCTTGTCCTCTTCATT
TCAGGTTCTCAGAGCCTAGAGGTGCGGAACGGTTTAGGTTATGCCTTTTTTGTTGTTTGA
TATATACTTGTGGAGAAGTTGTCTTAAGTATGTCTGACAGTGTCCGTGTAATGTTTTGGT
GACGTATGTAACAAGTAAAAACATATATTGAATCATCCTATTGTTCTTGATTATTATGTC
CTTTACATTGTTTTTTC


BQ
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AF RS1BA05TF U 1
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RD RS1BA05TF 788 0 0
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GGGAGAGGGAGAGGCCAAGAGGTGGAGAAGCCACCACCACATTGCCTTCGCTTTCTCCGC
CTCTTATAATTCTTCATCCTTCTCCGTCTTTGCTCTCCCGTCGCTTTGCGATTTGATCTG
TCGCAATGTCGGCGATCTCGTGCTCCACGGCTAGCTCTAGCGGTGGATGTGGATTGAGGT
CTCAACCAAAGACATGTGCTTCACCAGCATTTAGCTCTCTTAATTTCACCAGAACTGGGC
CAAACTCTCAGAGTGATAGATTAAGTATTCATCGGTTGGCATTGGTACATGGGAATCACA
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ATATTGCCGACCCTCCTAGGACCTTGGCGTACGATCTTGTTCAAGGGGCTCTTGTGAAGT
GGAGATGGAAGGAGGACAAGTCTGTTCCAGATACACCTACTGCTGTTCTTCTACATGGGA
TTTTAGGCAGCGGCAAAAACTGGGGCACTTTTGCTCGAAGATTGGCTCATGAGTTCCCAA
CTTGGCAGTTTCTCTTGGTAGACTTGCGTTGCCATGGGGACTCAGCGTCTCTCAAGAAGA
GAGGTCCACACTCTGTTGCTACAACTGCTTCTGATGT*CTAAAACTTGTTGGTCAGTTGA
GTT**ACACCTCGGGTCCTTGTTGGTCACAGCTTTGGAGGGAAAGTTGTTT*AAGCATGG
TGGAGCA
G

QA 1 787 1 787
DS 

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GG
GTCGCTTTGCGATTTGATCTGTCGCAATGTCGGCGATCTCGTGCTCCACGGCTAGCTCTA
GCGGTGGATGTGGATTGAGGTCTCAACCAAAGACATGTGCTTCACCAGCATTTAGCTCTC
TTAATTTCACCAGAACTGGGCCAAACTCTCAGAGTGATAGATTAAGTATTCATCGGTTGG
CATTGGTACATGGGAATCACAAGGCAAGAGGAACAACTATACGTATGGCATTAGTCGACG
AAAGACAATCAACTGGCCAAAATATTGCCGACCCTCCTAGGACCTTGGCGTACGATCTTG
TTCAAGGGGCTCTTGTGAAGTGGAGATGGAAGGAGGACAAGTCTGTTCCAGATACACCTA
CTGCTGTTCTTCTACATGGGATTTTAGGCAGCGGCAAAAACTGGGGCACTTTTGCTCGAA
GATTGGCTCATGAGTTCCCAACTTGGCAGTTTCTCTTGGTAGACTTGCGTTGCCATGGGG
ACTCAGCGTCTCTCAAGAAGAGAGGTCCACACTCTGTTGCTACAACTGCTTCTGATGTTC
TAAAACTTGTTGGTCAGTTGAGGTTAACACCTCGGGTCCTTGTTGGTCACAGCTTTGGAG
GGAAAGTTGTTTTAAGCATGGTGGAGCAAGCGGCCAAGCCTCTTCCTCGACCAGTCCGAG
CTTGGGTGTTGGATGCTACTC

QA 3 683 3 683
DS 

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CCTCGACCAGTCCGAGCTTGGGTGTTGGATGCTACTCCTGGAAAGGTTCGTGCAGGAGGA
GATGGAGAGGATCATCCACGAGACTCATATCATTTCTACGTACATTGCCTAAAGTGGTCC
CATCAAAGCGAGAAGTTTTAAACGCTCTTATCAAAGAAGGCTTTTCGAATGATGTCGCAC
AGTGGGTTGTTACTAATTTGAGACCTACTGGACCATCGTGCTCTAGCTTTTCGTGGACAT
TTGACTTAGACGGGATCTCCCAACTTTATCAGTCCTACGAAGACACAAATTTATGGAACT
TTGTTGAGAACCTGCCAAGAGGAGTACATGTGAATTTTCTTAAAGCGGAAAGAAGCTTGC
ACCGTTGGGCACTAGAAGACCTTCAACGGATCCACTCCGCTGAAGAGATCGCCTCTGAAG
AAGGCGGCGGCGTAGAAATGCATGTCCTGGAAGATGCCGGTCACTGGGTTCACACGGATA
ACCCGGATGGTCTCTTCAGGATCTTGTCCTCTTCATTTCAGGTTCTCAGAGCCTAGAGGT
GCGGAACGGTTTAGGTTATGCCTTTTTTGTTGTTTGATATATACTTGTGGAGAAGTTGTC
TTAAGTATGTCTGACAGTGTCCGTGTAATGTTTTGGTGACGTATGTAACAAGTAAAAACA
TATATTGAATCATCCTATTGTTCTTGATTATTATGTCCTTTACATTGTTTTTTC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3878Contig1 784 3 2 U
GAAGAAAAGTGGCTACGTCATATAATGAGTTAAACAATGTGCTCTCGCTCTCTAACACAC
TGGCTGAGAAACAACAATGATAGTATGTTTGGATTGTAATCAAAATACTAAAACAGAGGC
AGTGCACATGTGCTAAACATTCAAAGGCATAAAATCTTCCTACCTCTATTTGGACCAAAT
AGCAAGTTTTGGGGTAGATTTATCCAATCATAGTACGCTTTCTTCCTCGTTGCCTCACTT
GAGCGAGCTTGTTGAACGTAGCTGACCATTGCTTTGAGGACTTCCTATATGCTGTCAGTA
TACGATCCATCACGTTTCCGCATGAAGAATGCATTGAGAGCAAGGCTCTTTCGAGTACAT
ATAGATCAACAGCTTTGTCTTCCGGCAAGGTCGACGTGAACCTCAACCCGAAATCAATCA
GTACCAGCTGATTTGTACCGCTTCGGACTAACATGTTTGAAGTGGTCAAGTCACCGTGAG
ACAAGCCACCGTCATGGAGCTTAGCGATGGCCTCACCAATCTGAGCAGCGATATCATCCA
ACCGTTCCTCGACTATCCCGTTAGCACCAAACTCTAGGAAAACGTCTTTGATAGAGACGC
CCTCGATGTACTCGAGGGTCAAGGAATGAAGCAGAGGATCCTTGTTTTATCAGAAGGAGA
GGTTCCTTCCCAACGTGGTCTCTCTCACTATCCATCATCCTAAGTTTCTTGGAGCAACTT
CCACAAACGTCGCAAGGAAGGAGGCGGAGGAGGAGAACAACGAAGAAAACTCTGTTAACA
ATCC


BQ
10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1FN34JQ U 1
AF RS1AL02JQ U 1
AF RS1AL02TF C 1
BS 1 735 RS1AL02JQ
BS 736 784 RS1AL02TF

RD RS1FN34JQ 329 0 0
AAAA
AAAAGTGGCTACGTCATATAATGAGTTAAACAATGTGCTCTCACTCTCTAACACACTGGC
TGAAAAACAACAATGATAGTATGTTTGGATTGTAATCAAAATACTAAAACAGAGGCAGTG
CACATGTGCTAAACATTCAAAGGCATAAAATCTTCCTACCTCTATTTGGACCAAATAGCA
AGTTTTGGGGTAAATTTATCCAATCATAGTACGCTTTCTTCCTCGTTGCCTCACTTGAGC
GAGCTTGTTGAACGTAGCTGACCATTGCTTTGAGGACTTCCTATATGCTGTCAGTATACG
ATCCATCACGTTTCCCCATGAA
AAA

QA 5 326 5 326
DS 

RD RS1AL02JQ 735 0 0
GAAGAAAAGTGGCTACGTCATATAATGAGTTAAACAATGTGCTCTCGCTCTCTAACACAC
TGGCTGAGAAACAACAATGATAGTATGTTTGGATTGTAATCAAAATACTAAAACAGAGGC
AGTGCACATGTGCTAAACATTCAAAGGCATAAAATCTTCCTACCTCTATTTGGACCAAAT
AGCAAGTTTTGGGGTAGATTTATCCAATCATAGTACGCTTTCTTCCTCGTTGCCTCACTT
GAGCGAGCTTGTTGAACGTAGCTGACCATTGCTTTGAGGACTTCCTATATGCTGTCAGTA
TACGATCCATCACGTTTCCGCATGAAGAATGCATTGAGAGCAAGGCTCTTTCGAGTACAT
ATAGATCAACAGCTTTGTCTTCCGGCAAGGTCGACGTGAACCTCAACCCGAAATCAATCA
GTACCAGCTGATTTGTACCGCTTCGGACTAACATGTTTGAAGTGGTCAAGTCACCGTGAG
ACAAGCCACCGTCATGGAGCTTAGCGATGGCCTCACCAATCTGAGCAGCGATATCATCCA
ACCGTTCCTCGACTATCCCGTTAGCACCAAACTCTAGGAAAACGTCTTTGATAGAGACGC
CCTCGATGTACTCGAGGGTCAAGGAATGAAGCAGAGGATCCTTGTTTTATCAGAAGGAGA
GGTTCCTTCCCAACGTGGTCTCTCTCACTATCCATCATCCTAAGTTTCTTGGAGCAACTT
CCACAAACGTCGCAA

QA 1 735 1 735
DS 

RD RS1AL02TF 784 0 0
GAAG
AAAAGTGGCTACGTCATATAATGAGTTAAACAATGTGCTCTCGCTCTCTAACACACTGGC
TGAGAAACAACAATGATAGTATGTTTGGATTGTAATCAAAATACTAAAACAGAGGCAGTG
CACATGTGCTAAACATTCAAAGGCATAAAATCTTCCTACCTCTATTTGGACCAAATAGCA
AGTTTTGGGGTAGATTTATCCAATCATAGTACGCTTTCTTCCTCGTTGCCTCACTTGAGC
GAGCTTGTTGAACGTAGCTGACCATTGCTTTGAGGACTTCCTATATGCTGTCAGTATACG
ATCCATCACGTTTCCGCATGAAGAATGCATTGAGAGCAAGGCTCTTTCGAGTACATATAG
ATCAACAGCTTTGTCTTCCGGCAAGGTCGACGTGAACCTCAACCCGAAATCAATCAGTAC
CAGCTGATTTGTACCGCTTCGGACTAACATGTTTGAAGTGGTCAAGTCACCGTGAGACAA
GCCACCGTCATGGAGCTTAGCGATGGCCTCACCAATCTGAGCAGCGATATCATCCAACCG
TTCCTCGACTATCCCGTTAGCACCAAACTCTAGGAAAACGTCTTTGATAGAGACGCCCTC
GATGTACTCGAGGGTCAAGGAATGAAGCAGAGGATCCTTGTTTTATCAGAAGGAGAGGTT
CCTTCCCAACGTGGTCTCTCTCACTATCCATCATCCTAAGTTTCTTGGAGCAACTTCCAC
AAACGTCGCAAGGAAGGAGGCGGAGGAGGAGAACAACGAAGAAAACTCTGTTAACAATCC

QA 5 784 5 784
DS 



AS 1 3

CO CL3879Contig1 455 3 7 U
GGGCGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAGAAGGACAAGAAGAAGGTAACTACCGAAGGA
GAAGTGAAGACAGAGGAGGAG*AGAAGAAAGGGTTTATGGATAAGCTGAAGGAGAAGCTT
CCTGGACACGGGAAGAAGCCTGAAGATGCTCCAGCCGCACCGGTTGTTGCACCTCCGGTG
GAGGAAGCGCATCCGGTGGAGAAGAAGGGGATCTTGGAGAAGATTAAGGAGAAGCTTCCA
GGGTACCATCCCAAGACTGTAGAGGAGGAAAAGAAGGATAAGGATGATCATTAAAGATAT
GAAATCATGATGTGTTCTTGTGTTGAATGATATGATCATCTTTTGCTTTTGTGTTGTTG*
AAGTTTGTTGGCTTTTTATTATTTCCTTTGTTGATTTCAGCTTTTCCTTGTTATGTGTTG
TATATGATAATTTCAAAGGTGTTTTAATGGTATGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1EZ30TF U 1
AF RS1GO56JQ C 27
AF RS1GO56TF U 27
BS 1 81 RS1EZ30TF
BS 82 82 RS1GO56TF
BS 83 253 RS1EZ30TF
BS 254 254 RS1GO56TF
BS 255 359 RS1EZ30TF
BS 360 360 RS1GO56TF
BS 361 455 RS1EZ30TF

RD RS1EZ30TF 455 0 0
GGGCGAAGATGGTGTGAAGAGGAAGAAGAGAAGGACAAGAAGAAGGTAACTACCGAAGGA
GAAGTGAAGACAGAGGAGGAGGAGAAGAAAGGGTTTATGGATAAGCTGAAGGAGAAGCTT
CCTGGACACGGGAAGAAGCCTGAAGATGCTCCAGCCGCACCGGTTGTTGCACCTCCGGTG
GAGGAAGCGCATCCGGTGGAGAAGAAGGGGATCTTGGAGAAGATTAAGGAGAAGCTTCCA
GGGTACCATCCCATGACTGTAGAGGAGGAAAAGAAGGATAAGGATGATCATTAAAGATAT
GAAATCATGATGTGTTCTTGTGTTGAATGATATGATCATCTTTTGCTTTTGTGTTGTTGG
AAGTTTGTTGGCTTTTTATTATTTCCTTTGTTGATTTCAGCTTTTCCTTGTTATGTGTTG
TATATGATAATTTCAAAGGTGTTTTAATGGTATGA

QA 1 455 1 455
DS 

RD RS1GO56JQ 429 0 0
GGAAGAAGGACAT
AAGAAGGTAACTACCGAAGGAGAAGTGAAGACAGAGGAGGAG*AGAAGAAAGGGTTTATG
GATAAGCTGAAGGAGAAGCTTCCTGGACACGGGAAGAAGCCTGAAGATGCTCCAGCCGCA
CCGGTTGTTGCACCTCCGGTGGAGGAAGCGCATCCGGTGGAGAAGAAGGGGATCTTGGAG
AAGATTAAGGAGAAGCTTCCAGGGTACCATCCCAAGACTGTAGAGGAGGAAAAGAAGGAT
AAGGATGATCATTAAAGATATGAAATCATGATGTGTTCTTGTGTTGAATGATATGATCAT
CTTTTGCTTTTGTGTTGTTG*AAGTTTGTTGGCTTTTTATTATTTCCTTTGTTGATTTCA
GCTTTTCCTTGTTATGTGTTGTATATGATAATTTCAAAGGTGTTTTAATGGTATGA

QA 14 429 14 429
DS 

RD RS1GO56TF 429 0 0
GGAAGAAGGACAT
AAGAAGGTAACTACCGAAGGAGAAGTGAAGACAGAGGAGGAG*AGAAGAAAGGGTTTATG
GATAAGCTGAAGGAGAAGCTTCCTGGACACGGGAAGAAGCCTGAAGATGCTCCAGCCGCA
CCGGTTGTTGCACCTCCGGTGGAGGAAGCGCATCCGGTGGAGAAGAAGGGGATCTTGGAG
AAGATTAAGGAGAAGCTTCCAGGGTACCATCCCAAGACTGTAGAGGAGGAAAAGAAGGAT
AAGGATGATCATTAAAGATATGAAATCATGATGTGTTCTTGTGTTGAATGATATGATCAT
CTTTTGCTTTTGTGTTGTTG*AAGTTTGTTGGCTTTTTATTATTTCCTTTGTTGATTTCA
GCTTTTCCTTGTTATGTGTTGTATATGATAATTTCAAAGGTGTTTTAATGGTATGA

QA 14 429 14 429
DS 



AS 1 3

CO CL3880Contig1 1313 3 17 U
GGAAGAGAAAGGAAAGAGAAGAAACCATTTCATCCGCCGGTCTATGCTTCTCCTCTCCCA
ATCTCTTCTAGGGTTTAGTGGTTGACCCCTTCTTCCCTCTAATGGGTGCCGTCGCCATCA
ATCGCAAGCGCACGGAAGATTCCATGAACTTCAACCAACAATCCCCATCCCAATCTTCGA
ACAAGAAACGCAGATCCTCCTTCGAGTTCAATGCTTGATTCGATGTCTTTAGTTAGTCAA
GAGAAGGCTTCTACAGATGCAGCTTCCAGCCTCGCAGCCTATAAGAAGCTTTTGGAGAGT
GCTGAGAGGAGGAACCCAAAGTTGGAAGCTTTGGGGTTTGAGATTTTTTTTAACGAGAAG
AAGTTGTCGCAGCTTCGTCTGTCTCGTCCTAAGCCTCTCGAGAAGCCTCTCAAGAAGGTG
CCTGATGAACCGTTTATACCTCTCACTGAGGAGGAGAAGGATGAAGTCTACCGTGCCTTT
TCTGGTAAAAATAGAAGGAAAGTCTTGGTTACTCATGCGAATTCAAACATTGATATTACT
GGTGAAGTTCTTCAATGTCTTACACCATCTGCATGGCTAAACGATGAGGTTATCAATGTC
TATCTCGAACTACTCAAAGAAAGAGAAACCAGAGAGCCCAAAAAGTATTTGAAGTGTCAT
TTCTTTAATACCTTTTTCTACAAAAAGCTAGTAAGCGACTCTGGTTATAATTATAAAGCT
GTTAGAAGATGGACTACGCAGAGAAAGTTGGGATATGCTCTTATTGACTGTGACATGATA
TTTGTTCCCATCCACAGGGGTGTACATTGGACCTTGGCAGTTATTAACAACAGGGATCGC
AAGTTCTTGTATCTCGATTCACTAAATGGAGTTGATTCCAAGATTTTGAATGCTCTGGCG
AAATATTTGACCGATGAAGCTAAGGAAAAAAGTGGAAAAGACATTGATGTGAGTTCGTGG
GACATGGAATTTGTTGAAGACCTTCCCCAACAACAAAATGGGTATGACTGTGGAATGTTT
ATGCTTAAGTACATCGACTTCTTCAGTAGAGGGCTGGGGCTATACTTCAGCCAGGAACAT
ATGCCATACTTCCGGCTAAGAACGGCTAAAGAGATTCTGAGACTATGTGCTGACTGAAGT
TGCGTGGGCTATTATGCATGTCAAATTTTAGGAGTGCTGTTTTGCTTTCCTTTGTTGATT
TGTTCAAGCTTTAAAATTTTCTACTCCTTTTAGGCAGTGAAAGCATCTTGTCTTGTGATC
TATTAAAATTGAAAACTGAAGTACAAATTAGAATTAACCTATTAAATTTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 
25 25 25 25 5 5 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DH28TF U 1
AF RS1AY28TF U 446
AF RS1AY28JQ C 455
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RD RS1DH28TF 775 0 0
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ATCTCTTCTAGGGTTTAGTGGTTGACCCCTTCTTCCCTCTAATGGGTGCCGTCGCCATCA
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GAGAAGGCTTCTACAGATGCAGCTTCCAGCCTCGCAGCCTATAAGAAGCTTTTGGAGAGT
GCTGAGAGGAGGAACCCAAAGTTGGAAGCTTTGGGGTTTGAGATTTTTTTTAACGAGAAG
AAGTTGTCGCAGCTTCGTCTGTCTCGTCCTAAGCCTCTCGAGAAGCCTCTCAAGAAGGTG
CCTGATGAACCGTTTATACCTCTCACTGAGGAGGAGAAGGATGAAGTCTACCGTGCCTTT
TCTGGTAAAAATAGAAGGAAAGTCTTGGTTACTCATGCGAATTCAAACATTGATATTACT
GGCGAAGTTCTTCAATGTCTTACACCATCTGCATGGCTAAACGATGAGGTTATCAATGTC
TATCTCGAACTACTCAAAGAAAGAGAAACCAGAGAGCCCAAAA*GTATTTGAAGTGTCAT
TTCTTCAATACTTTTTTCTACAAAAAGCTAGTAAGCGACTCTGGTTATAATTATAAAGCT
GTTAGAAGATGGACTACGCAGAGAAAGTTGGGATATGCTCTTATTGACTGTGACA

QA 1 775 1 775
DS 

RD RS1AY28TF 718 0 0
G
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GGTTACTCATGCGAATTCAAACATTGATATTACTGGTGAAGTTCTTCAATGTCTTACACC
ATCTGCATGGCTAAACGATGAGGTTATCAATGTCTATCTCGAACTACTCAAAGAAAGAGA
AACCAGAGAGCCCAAAAAGTATTTGAAGTGTCATTTCTTTAATACCTTTTTCTACAAAAA
GCTAGTAAGCGACTCTGGTTATAATTATAAAGCTGTTAGAAGATGGACTACGCAGAGAAA
GTTGGGATATGCTCTTATTGACTGTGACATGATATTTGTTCCCATCCACAGGGGTGTACA
TTGGACCTTGGCAGTTATTAACAACAGGGATCGCAAGTTCTTGTATCTCGATTCACTAAA
TGGAGTTGATTCCAAGATTTTGAATGCTCTGGCGAAATATTTGACCGATGAAGCTAAGGA
AAAAAGTGGAAAAGACATTGATGTGAGTTCGTGGGACATGGAATTTGTTGAAGACCTTCC
CCAACAACAAAATGGGTATGACTGTGGAATGTTTATGCTTAAGTACATCGACTTCTTCAG
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TAAAGAGAT*CTGAGACTATGTGCTGACTGAAGTTGCGTGGGCTAT*ATGCATGTCA

QA 2 718 2 718
DS 

RD RS1AY28JQ 859 0 0
GAG
AGGATGAAGTCTACCGTGC*TTTTCTGT**AAAATAGAAGGAAAGTCTTGGTTACTCATG
CGAAT*CAAACATTGATATTACTGGTGAAGTTCTTCAATGTCTTACACCATCTGCATGGC
TAAACGATGAGGTTATCAATGTCTATCTCGAACTACTCAAAGAAAGAGAAACCAGAGAGC
CCAAAAAGTATTTGAAGTGTCATTTCTTTAATACCTTTTTCTACAAAAAGCTAGTAAGCG
ACTCTGGTTATAATTATAAAGCTGTTAGAAGATGGACTACGCAGAGAAAGTTGGGATATG
CTCTTATTGACTGTGACATGATATTTGTTCCCATCCACAGGGGTGTACATTGGACCTTGG
CAGTTATTAACAACAGGGATCGCAAGTTCTTGTATCTCGATTCACTAAATGGAGTTGATT
CCAAGATTTTGAATGCTCTGGCGAAATATTTGACCGATGAAGCTAAGGAAAAAAGTGGAA
AAGACATTGATGTGAGTTCGTGGGACATGGAATTTGTTGAAGACCTTCCCCAACAACAAA
ATGGGTATGACTGTGGAATGTTTATGCTTAAGTACATCGACTTCTTCAGTAGAGGGCTGG
GGCTATACTTCAGCCAGGAACATATGCCATACTTCCGGCTAAGAACGGCTAAAGAGATTC
TGAGACTATGTGCTGACTGAAGTTGCGTGGGCTATTATGCATGTCAAATTTTAGGAGTGC
TGTTTTGCTTTCCTTTGTTGATTTGTTCAAGCTTTAAAATTTTCTACTCCTTTTAGGCAG
TGAAAGCATCTTGTCTTGTGATCTATTAAAATTGAAAACTGAAGTACAAATTAGAATTAA
CCTATTAAATTTTCTT

QA 4 859 4 859
DS 



AS 1 3

CO CL3881Contig1 792 3 7 U
GTCTTCGGTTATGGATTACGGGTCGGGTCATGTTCACCCGACCAAAGCTATGGATCCGGG
ACTAGTCTACGATATCACATCTTACGATTACATCAACTTCTTGTGTAACTCCAACTACAC
GGGATCCAATATTGTGACAATAACCCGACGGAAAGCTGACTGCGATGGTGCTAGACGAGT
GGGACATGTTGGGAACTTGAATTATCCGTCGTTCTCAGTCGTGTTTCAGCAGTATGGTGA
GAGTAAAATGTCGACACATTTCATTAGGACAGTGACCAATGTAGGTGATTCTGACTCGGT
TTATGAGGTTAAGATTACGCCACCGAGAGGGACGAACGTGACGGTTGCGCCGGAGAAGCT
ATCGTTCAGACGTGTTGGTCAGAAACTGAGTTTTGTTGTTAGAGTTAAGACTGCGGAGGT
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ACGAAATGTTACAAGTCCTTTGGTGGTTACTCTTCAACAACCTCTGTGAAGGGCTTTTTT
AGGATTTATAGACCAGAAAATCGTGGCCTCATTGTTTTTGTTTTATAAAATGTGAAAGTA
AGAGATCATAAGCTCTTGTTGCTGTAATGTCTAAGATCGTTATTGGGTTCATGTAATATA
TAACGTTCATTTGATGATGTGGGCTTTTAACGAGGCTTGTAGAGCTTAAAACTCTGAGCC
CAAATCTTTTACTTTTGTTTCGAGATGTTTGTTTTCTTGTTCAAGGTGAATATATTATGA
TTCCATTATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C933TF U 1
AF RS1CK22TF U 34
AF RS1CK22JQ C 37
BS 1 179 RS1C933TF
BS 180 180 RS1CK22TF
BS 181 548 RS1C933TF
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ACTAGTCTACGATATCACATCTTACGATTACATCAACTTCTTGTGTAACTCCAACTACAC
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GGGACATGTTGGGAACTTGAATTATCCGTCGTTCTCAGTCGTGTTTCAGCAGTATGGTGA
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ATCGTTCAGACGTGTTGGTCAGAAACTGAGTTTTGTTGTTAGAGTTAAGACTGCGGAGGT
GAAACTGTCACCAGGAGCTACAAATGTTGAGACTGGTCATATAGTTTGGTCGGATGGGAA
ACGAAATGTTACAAGTCCTTTGGTGGTTACTCTTCAACAACCTCTGTGAAGGGCTTTTTT
AGGATTTAGAGACCAGAAAATCGTGGCCTCATTGTTTTTGTTTTATAAAATGTGAAAGTA
AGAGATCATAAGCTCTTGTTGCTGTAATGTCTAAGATCGTTATTGGGTTCATGTAATATA
TAACGTTCAT

QA 1 670 1 670
DS 

RD RS1CK22TF 658 0 0
GCA
CCCGACCAAAGCTATGGATCCGGGACTAGTCTACGATATCACATCTTACGATTACATCAA
CTTCTTGTGTAACTCCAACTACACGGGATCCAATATTGTGACAATAACCCGACGGAAAGC
TGACTGCGATGGTGCTAGACGAGTGGGACATGTTGGGAACTTGAATTATCCGTCGTTCTC
AGTCGTGTTTCAGCAGTATGGTGAGAGTAAAATGTCGACACATTTCATTAGGACAGTGAC
CAATGTAGGTGATTCTGACTCGGTTTATGAGGTTAAGATTACGCCACCGAGAGGGACGAA
CGTGACGGTTGCGCCGGAGAAGCTATCGTTCAGACGTGTTGGTCAGAAACTGAGTTTTGT
TGTTAGAGTTAAGACTGCGGAGGTGAAACTGTCACCAGGAGCTACAAATGTTGAGACTGG
TCATATAGTTTGGTCGGATGGGAAACGAAATGTTACAAGTCCTTTGGTGGTTACTCTTCA
ACAACCTCTGTGAAGGGCTTTTTTAGGATTTATAGACCAGAAAATCGTGGCCTCATTGTT
TTTGTTTTATAAAATGTGAAAGTAAGAGATCATAAGCTCTTGTTGCTGTAATGTCTAAGA
TCGTTATTGGGTTCATGTAATATATAACGTTCATTTGATGATGTGGGCTTTTAAC

QA 4 658 4 658
DS 

RD RS1CK22JQ 756 0 0
CCCGACCAAAGCTATGGATCCGGGACTAGTCTACGATATCACATCTTACGATTACATCAA
CTTCTTGTGTAACTCCAACTACACGGGATCCAATATTGTGACAATAACCCGACGGAAAGC
TGACTGCGATGGTGCTAGACGAGTGGGACATGTTGGGAACTTGAATTATCCGTCGTTCTC
AGTCGTGTTTCAGCAGTATGGTGAGAGTAAAATGTCGACACATTTCATTAGGACAGTGAC
CAATGTAGGTGATTCTGACTCGGTTTATGAGGTTAAGATTACGCCACCGAGAGGGACGAA
CGTGACGGTTGCGCCGGAGAAGCTATCGTTCAGACGTGTTGGTCAGAAACTGAGTTTTGT
TGTTAGAGTTAAGACTGCGGAGGTGAAACTGTCACCAGGAGCTACAAATGTTGAGACTGG
TCATATAGTTTGGTCGGATGGGAAACGAAATGTTACAAGTCCTTTGGTGGTTACTCTTCA
ACAACCTCTGTGAAGGGCTTTTTTAGGATTTATAGACCAGAAAATCGTGGCCTCATTGTT
TTTGTTTTATAAAATGTGAAAGTAAGAGATCATAAGCTCTTGTTGCTGTAATGTCTAAGA
TCGTTATTGGGTTCATGTAATATATAACGTTCATTTGATGATGTGGGCTTTTAACGAGGC
TTGTAGAGCTTAAAACTCTGAGCCCAAATCTTTTACTTTTGTTTCGAGATGTTTGTTTTC
TTGTTCAAGGTGAATATATTATGATTCCATTATTTC

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL3882Contig1 366 2 1 U
GGATATTTGCATCGCCGTAAGCAACTCTAGCCGAGCAGATCTATCCGACGCAGAGATGGC
CAAGTCGAAGAATCACACAGCGCACAACCAGTCTGCCAAGGCACACAAGAACGGAATCAA
GAAGCCTAGGAGACACCGTCACACTCCCACCAGAGGAATGGACCCTAAGTTCTTGAGGAA
CCAGAGGTACGCGAGGAAGCACAACGTTAAGAGCGGCGAGAATGCTAGCGCTGAAGAATA
AGCTTTTTTGATTTTGTATGAGAATACATTTTGATGTTTTTTTTTTTAATTTTAATGAAG
TTGAGACTGTTTCAGTTCGTTTTGATTATGTTTTACGTACTCGTTTTATCCAGGCCTTGA
TTTACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RS1DG83JQ C 1
AF RS1DG83TF U 1
BS 1 366 RS1DG83TF

RD RS1DG83JQ 366 0 0
GGATATTTGCATCGCCGTAAGCAACTCTAGCCGAGCAGATCTATCCGACGCAGAGATGGC
CAAGTCGAAGAATCACACAGCGCACAACCAGTCTGCCAAGGCACACAAGAACGGAATCAA
GAAGCCTAGGAGACACCGTCACACTCCCACCAGAGGAATGGACCCTAAGTTCTTGAGGAA
CCAGAGGTACGCGAGGAAGCACAACGTTAAGAGCGGCGAGAATGCTAGCGCTGAAGAATA
AGCTTTTTTGATTTTGTATGAGAATACATTTTGATGTTTTTTTTTTTAATTTTAATGAAG
TTGAGACTGTTTCAGTTCGTTTTGATTATGTTTTACGTACTCGTTTTATCCAGGCCTTGA
TTTACC

QA 1 366 1 366
DS 

RD RS1DG83TF 366 0 0
GGATATTTGCATCGCCGTAAGCAACTCTAGCCGAGCAGATCTATCCGACGCAGAGATGGC
CAAGTCGAAGAATCACACAGCGCACAACCAGTCTGCCAAGGCACACAAGAACGGAATCAA
GAAGCCTAGGAGACACCGTCACACTCCCACCAGAGGAATGGACCCTAAGTTCTTGAGGAA
CCAGAGGTACGCGAGGAAGCACAACGTTAAGAGCGGCGAGAATGCTAGCGCTGAAGAATA
AGCTTTTTTGATTTTGTATGAGAATACATTTTGATGTTTTTTTTTTTAATTTTAATGAAG
TTGAGACTGTTTCAGTTCGTTTTGATTATGTTTTACGTACTCGTTTTATCCAGGCCTTGA
TTTACC

QA 1 366 1 366
DS 



AS 1 3

CO CL3883Contig1 1152 3 17 U
GGAAGGAATGTGGAGGAGGCAGAGGGAGAGGAAGAGAGGTCTTCTTCGTTGCCAGTGCAA
GGTCCTGCGTGTAACGCGACGACAGATAAGTTGATTGGTTGGCATGTTTTCAACACGTTG
CCTTACGCGGGGAAGAGTGCGGTTTATATAGATGATGTAGCTGCGGTTTTGCCGCAGAAG
CTGGAGTGGTGTGGGTTTGTGTTGAACTCGAGGATGCTTTGGGATGACGCTGAGAGTAAG
CCGGAGTGGGTTAAGGAGTTTGGTTTGTTGAATGAGAACGATGGTGTGGAGAGTCCTTTG
TCTCTCTTGAATGATCCTTCCATGGTGGAGCCTCTTGGAAGCTGTGGAAGACAGGTTCTG
CTTTGGTGGCTTCGCGTTGAAGCACGCGCTGATAGCAAGTTCCCTCCCGGATGGATAATT
GATCCTCCGTTAGAAATCACAGTGGCGGCTAAACGAACTCCATGGCCAGATGTTCCTCCT
GAGCCACCTACTAAAAAGAATGATCAAATGCCATTATCACAAGGCGACAATGTGGTAGTG
ATACCAAAGCACCAGCAGCAGCAACAACAACGCTCTACCAAAGTCCGGAAACCGAAACGC
AGAAGCAAGAGAAATAAACACGAAGCTAAACCAACCGATACGACAACACAAGTTTCTTCT
TCCACTAAACATCATCAAGAAAGAAACTGAGGAAGAATAGAGATGATTGACAAGAAGAAG
ATCCTTTCTACTATTTTATTATCATTCATTTGTTTGCCAAAGTGTTTTTTTTTTAGAGAA
ATGTCAGAAGAGATCATCTTATTCTCCTCCAGATACCGCAAATATAAAGAATCAACGGAG
AAGAAGAAGCAAGAACCAGGAATTATCAGATTTATGATGATGGAGCTACCACAACAAAAG
GGTATACGGGTTTTTCGGGGAATGAATGATGATCATTCGTTTATTTTCATTATCTTTTCT
TTTCGGGTCTTATAAGAACTTATCTGTATTTTAGTAACAAAGGATTGCTTGTTTCAATGT
TCTTGAAGTGACAACAAAAGGCTTTAAGAAACAAAAAAACTTTGGGTTGTATAGTTTTTT
AATTTGTAAGCATATCTCTCGATCCATTTCTGTTTTATCACTCCCACTAATTCGAAGCCT
CTGATTTATCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 10 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DM93TF U 1
AF RS1G124TF U 310
AF RS1DM93JQ C 424
BS 1 691 RS1DM93TF
BS 692 693 RS1G124TF
BS 694 696 RS1DM93TF
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BS 773 961 RS1G124TF
BS 962 1152 RS1DM93JQ

RD RS1DM93TF 782 0 0
GGAAGGAATGTGGAGGAGGCAGAGGGAGAGGAAGAGAGGTCTTCTTCGTTGCCAGTGCAA
GGTCCTGCGTGTAACGCGACGACAGATAAGTTGATTGGTTGGCATGTTTTCAACACGTTG
CCTTACGCGGGGAAGAGTGCGGTTTATATAGATGATGTAGCTGCGGTTTTGCCGCAGAAG
CTGGAGTGGTGTGGGTTTGTGTTGAACTCGAGGATGCTTTGGGATGACGCTGAGAGTAAG
CCGGAGTGGGTTAAGGAGTTTGGTTTGTTGAATGAGAACGATGGTGTGGAGAGTCCTTTG
TCTCTCTTGAATGATCCTTCCATGGTGGAGCCTCTTGGAAGCTGTGGAAGACAGGTTCTG
CTTTGGTGGCTTCGCGTTGAAGCACGCGCTGATAGCAAGTTCCCTCCCGGATGGATAATT
GATCCTCCGTTAGAAATCACAGTGGCGGCTAAACGAACTCCATGGCCAGATGTTCCTCCT
GAGCCACCTACTAAAAAGAATGATCAAATGCCATTATCACAAGGCGACAATGTGGTAGTG
ATACCAAAGCACCAGCAGCAGCAACAACAACGCTCTACCAAAGTCCGGAAACCGAAACGC
AGAAGCAAGAGAAATAAACACGAAGCTAAACCAACCGATACGACAACACAAGTTTCTTCT
TCCACTAAACATCATCAAGAAAGAAACTGAG**AGA*TAGAGATGATTGACA*GAG**AG
ATCCTTTCTACTATTT*ATTATCATTCATT*GTTTGCCAA*GTGTTTTTTTT
AGAGAATGTC

QA 1 772 1 772
DS 

RD RS1G124TF 652 0 0
G
ATGATCCTTCCATGGTGGAGCCTCTTGGAAGCTGTGGAAGACAGGTTCTGCTTTGGTGGC
TTCGCGTTGAAGCACGCGCTGATAGCAAGTTCCCTCCCGGATGGATAATTGATCCTCCGT
TAGAAATCACAGTGGCGGCTAAACGAACTCCATGGCCAGATGTTCCTCCTGAGCCACCTA
CTAAAAAGAATGATCAAATGCCATTATCGCAAGGCGACAATGTGGTAGTGATACCAAAGC
ACCAGCAGCAGCAACAACAACGTTCTACCAAAGTCCGGAAACCGAAACGCAGAAGCAAGA
GAAATAAACACGAAGCTAAACCAACCGATACGACAACACAAGTTTCTTCTTCCACTAAAC
ATCATCAAGAAAGAAACTGAGGAAGAATAGAGATGATTGACAAGAAGAAGATCCTTTCTA
CTATTTTATTATCATTCATTTGTTTGCCAAAGTGTTTTTTTTTTAGAGAAATGTCAGAAG
AGATCATCTTATTCTCCTCCAGATACCGCAAATATAAAGAATCAACGGAGAAGAAGAAGC
AAGAACCAGGAATTATCAGATTTATGATGATGGAGCTACCACAACAAAAGGGTATACGGG
TTTTTCGGGGAATGAATGATGATCATTCGTTTATTTTCATTATCTTTTCTT

QA 2 652 2 652
DS 

RD RS1DM93JQ 729 0 0
CCTCCGTTAGAAATCACAGTGGCGGCTAAACGAACTCCATGGCCAGATGTTCCTCCTGAG
CCACCTACTAAAAAGAATGATCAAATGCCATTATCACAAGGCGACAATGTGGTAGTGATA
CCAAAGCACCAGCAGCAGCAACAACAACGCTCTACCAAAGTCCGGAAACCGAAACGCAGA
AGCAAGAGAAATAAACACGAAGCTAAACCAACCGATACGACAACACAAGTTTCTTCTTCC
ACTAAACATCATCAAGAAAGAAACTGAGGAAGAATAGAGATGATTGACAAGAAGAAGATC
CTTTCTACTATTTTATTATCATTCATTTGTTTGCCAAAGTGTTTTTTTTT*AGAGAAATG
TCAGAAGAGATCATCTTATTCTCCTCCAGATACCGCAAATATAAAGAATCAACGGAGAAG
AAGAAGCAAGAACCAGGAATTATCAGATTTATGATGATGGAGCTACCACAACAAAAGGGT
ATACGGGTTTTTCGGGGAATGAATGATGATCATTCGTTTATTTTCATTATCTTTTCTTTT
CGGGTCTTATAAGAACTTATCTGTATTTTAGTAACAAAGGATTGCTTGTTTCAATGTTCT
TGAAGTGACAACAAAAGGCTTTAAGAAACAAAAAAACTTTGGGTTGTATAGTTTTTTAAT
TTGTAAGCATATCTCTCGATCCATTTCTGTTTTATCACTCCCACTAATTCGAAGCCTCTG
ATTTATCTT

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 3

CO CL3884Contig1 715 3 2 U
GCCTTTTCCAGGGGATAAAGCCTCGAGACGTATCAGAATGTTAAATGACATTTATCTATG
GGTAAGGGACTCTCAAAGGTTCACCAGTTCTTATGAAGCAAGTTTGTTCGTGTTCGGAGA
TCAGTTCAAAGATGACGCCTACTACATCCACATGCTTCAAAAGTTGAATGAACTGCGTTA
CGATGTTTTCTTAGTCACTCCCACTCCGGATATCAACAATCCAGAAACTCCAGAATGGCC
GCGATTGCTACTAAATAAAGGAGCATCCTGGTTGACTGATGATACTGGCGACGAACCCAC
CCCCCAAATGCATCATCACGAAGCCCAAGTTTTTGGTGATCAAACCAGCGAAAGCTCTCA
AGATTCAGAGCCCGAAGAGATGCAGACCGAGGACATGTCCCATCGCCCACTAAGATTGCT
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BQ
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CCCCCAAATGCATCATCACGAAGCCCAAGTTTTTGGTGATCAAACCAGCGAAAGCTCTCA
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TCCCCTGTATCGCTGGGATCCTTTTACTCGCATGTACAAACTTAAAAGCCTATTCCCCAA
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GCATGGCCATTAAACTACGGTTTAGCCAATTAAAGATTGTGCCTTTTTTCTAATAACCAA
GTTTTAGCGTTTGCGTTTTTGATCTGCATTCCGTGATTCAC

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DS 

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TTTCCA
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GATGACGCCTACTACATCCACATGCTTCAAAAGTTGAATGAACTGCGTTACGATGTTTTC
TTAGTCACTCCCACTCCGGATATCAACAATCCAGAAACTCCAGAATGGCCGCGATTGCTA
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CATCATCACGAAGCCCAAGTTTTTGGTGATCAAACCAGCGAAAGCTCTCAAGATTCAGAG
CCCGAAGAGATGCAGACCGAGGACATGTCCCATCGCCCACTAAGATTGCTAATAGAGCAA
GGACCTGCCTGGGAAAACGATGCCGTCGAAGAAGATTCACCTGACGACCTTCCCCTGTAT
CGCTGGGATCCTTTTACTCGCATGTACAAACTTAAAAGCCTATTCCCCAAAAAGAAGCAT
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TAAACTACGGTTTAGCCAATTAAAGATTGTGCCTTTTTTCTAATAACCAAGTTTTAGCGT
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QA 7 711 7 711
DS 

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TCTCAAAGGTTCACCAGTTCTTATGAAGCAAGTTTGTTCGTGTTCGGAGATCAGTTCAAA
GATGACGCCTACTACATCCACATGCTTCAAAAGTTGAATGAACTGCGTTACGATGTTTTC
TTAGTCACTCCCACTCCGGATATCAACAATCCAGAAACTCCAGAATGGCCGCGATTGCTA
CTAAATAAAGGAGCATCCTGGTTGACTGATGATACTGGCGACGAACCCACCCCCCAAATG
CATCATCACGAAGCCCAAGTTTTTGGTGATCAAACCAGCGAAAGCTCTCAAGATTCAGAG
CCCGAAGAGATGCAGACCGAGGGCATGTC**ATCGCCCACTAAGATTGCTAATAGAGCAA
GGACCTGCCTGGGAAAACGATGCCGTCGAAGAAGATTCACCTGACGACCTTCCCCTGTAT
CGCTGGGATCCTTTTACTCGCATGTACAAACTTAAAAGCCTATTCCCCAAAAATAAGCAT
CAACCCCATGCCGTGGCAGAATAAGAAACACCACCTCAGAAACTTGCCACGCATGGCCAT
TGAACTACGGTTTAGCCAATTAAAGATTGTGCCTTTTTTCTAATAACCAAGTTTTAGCGT
TTGCGTTTTTGATC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 3

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GGGTATATTTATTTGAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTAGACAATCACTTGCT
CTTCTCTATTCCATCACCATCATTTAATCTCAACACTACTCTCTTCTTTCATCCGCCACC
GTATAATTTAAGAGCTGATATAGAAAACATGAGCAGAACAGAGACAGTGGGCTTGACCAG
AGGAGGAATGTTGCAGTCAAGTAGTTGCAATCGCCTTATGAAATGTTCTGAGTCCTTCAA
GAGGGAGAATGTGATTAGCAACGGTGGTTCAGCTAAAGTGAGGGGAAGCTTGGAGCGCAA
GAAATCAAAGAGTTTTAAGGAAGGAGAAAGCTATCCTTCTTGTCTCATAACGGAGGCTCC
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GAAGATTGCTCATTACGGCAGATCCAAATCAACCCTAACTGACTTCAACTCATCCAAAGT
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AATGGGAGGTGTTGTAGAGAATGCTACAAAGATCATAGAGGTCAAGAAAACGTTCGGGTC
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AGGCCACAAGATTCCTGTCAAGACATCGAAGTCGGAGAGCATAAGCAAAGACATGGTCCG
TCGAGGCTTCCGGTTCGTGGGTCCCACTGTGGGTCACTCCTTCATGCAAGCCGCTGGTTT
AACCAATGACCACTTGCTCACTTGTTACCGTCACATTCCTTGCACTCTCCTCACTACTAA
TCCTTAATTTTTGTTTTTATTTTCTATTTCTTTACTTAATTGAAAGTGTTGTTTTTTAAA
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TTAGTTTGGCAATGTAAGATAATCCAGCTGGTTTTAATTTGTTTTTTTTCTTTTGCTTCG
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TGTGACAGTTTGAAATAGTAAT


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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GV11TF U 1
AF RS1H034TF U 67
AF RS1H034JQB C 611
BS 1 115 RS1GV11TF
BS 116 116 RS1H034TF
BS 117 144 RS1GV11TF
BS 145 145 RS1H034TF
BS 146 557 RS1GV11TF
BS 558 558 RS1H034TF
BS 559 659 RS1GV11TF
BS 660 709 RS1H034TF
BS 710 1342 RS1H034JQB

RD RS1GV11TF 659 0 0
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CTTCTCTATTCCATCACCATCATTTAATCTCAACACTACTCTCTTCTTTCATCCGTCACC
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GAGGGAGAATGTGATTAGCAACGGTGGTTCAGCTAAAGTGAGGGGAAGCTTGGAGCGCAA
GAAATCAAAGAGTTTTAAGGAAGGAGAAAGCTATCCTTCTTGTCTCATAACGGAGGCTCC
TGGGAGTATAGCCGCCGTGAGGAGGGAGCAAGTGGCTGCACAGCAAGCCCTAAGGAGACT
GAAGATTGCTCATTACGGCAGATCCAAATCAACCCTAACTGACTTCAACTCATCCAAAGT
TGTCCCTCTTATTCACCCTCAACCTCACCCTCAAAGATGCAGCTTCCTTACCCCTACTTC
TGATCCTGTTTACGTTGTCTACCATGATGAAGAATGGGGAGTCCCTGTCCATGATGACAG
GACTTTGTTCGAGCTGCTAACCCTCAGTGGCGCACAAGTAGGTTCTGATTGGACGTCAA

QA 1 659 1 659
DS 

RD RS1H034TF 643 0 0
G
ATTCCATCACCATCATTTAATCTCAACACTGCTCTCTTCTTTCATCCGCCACCGTATAAT
TTAAGAGCTGATATAGAAAACATGAGCAGAACGGAGACAGTGGGCTTGACCAGAGGAGGA
ATGTTGCAGTCAAGTAGTTGCAATCGCCTTATGAAATGTTCTGAGTCCTTCAAGAGGGAG
AATGTGATTAGCAACGGTGGTTCAGCTAAAGTGAGGGGAAGCTTGGAGCGCAAGAAATCA
AAGAGTTTTAAGGAAGGAGAAAGCTATCCTTCTTGTCTCATAACGGAGGCTCCTGGGAGT
ATAGCCGCCGTGAGGAGGGAGCAAGTGGCTGCACAGCAAGCCCTAAGGAGACTGAAGATT
GCTCATTACGGCAGATCCAAATCAACCCTAACTGACTTCAACTCATCCAAAGTTGTCCCT
CTTATTCACCCTCAACCTCACCCTCAAAGATGCAGCTTCCTTACCCCTACTTCTGATCCT
GTTTACGTTGCCTACCATGATGAAGAATGGGGAGTCCCTGTCCATGATGACAGGACTTTG
TTCGAGCTGCTAACCCTCAGTGGCGCACAAGTAGGTTCTGATTGGACGTCAACCTTGAGA
AAACGCCATGACTTTAAGAAGGTGTTTATGGAGTTTGAGGCA

QA 2 643 2 643
DS 

RD RS1H034JQB 732 0 0
GAGCTGCTAACCCTCAGTGGCGCACAAGTAGGTTCTGATTGGACGTCAACCTTGAGAAAA
CGCCATGACTTTAAGAAGGTGTTTATGGAGTTTGAGGCAGAAGCGGTTGCCAAACTTAAC
GAGAAAGAGATGAATGCAATAAGCATCGAATACAAAATAGAGATGAGTAAAATGGGAGGT
GTTGTAGAGAATGCTACAAAGATCATAGAGGTCAAGAAAACGTTCGGGTCACTAGAGAGA
TACCTTTGGGGTTTTGTGAACAACAAGCCCATCTCCACGAACTACAATTTAGGCCACAAG
ATTCCTGTCAAGACATCGAAGTCGGAGAGCATAAGCAAAGACATGGTCCGTCGAGGCTTC
CGGTTCGTGGGTCCCACTGTGGGTCACTCCTTCATGCAAGCCGCTGGTTTAACCAATGAC
CACTTGCTCACTTGTTACCGTCACATTCCTTGCACTCTCCTCACTACTAATCCTTAATTT
TTGTTTTTATTTTCTATTTCTTTACTTAATTGAAAGTGTTGTTTTTTAAAACTTTCGTAT
GATTTGTGCACAACAAATGTAAGTGTAGGACAAAATGGGTTGAATGTTTTTTAGTTTGGC
AATGTAAGATAATCCAGCTGGTTTTAATTTGTTTTTTTTCTTTTGCTTCGGTGTGAGTTT
TTTTTCTTTCTAATCACATGTATAAGGGTTTTTTTTTCATGTATGTGTGGTGTGACAGTT
TGAAATAGTAAT

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 3

CO CL3886Contig1 773 3 4 U
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AAAGAGAAAGAGTCACATGCAGTTTAAGAACTCTGGGTGCGATAATAAAAAAAGTCAATC
AGTTTTCTGCAGCAGCACTTGCAGCACTCAAGTCCACAGATAAATCAAGAGTCTTTCCAG
TGATTTTGGTGTACATCTCTAGTACATCCGCAACTGTACTCTCGAAATGTGTTGTTGCAT
CATAAGTACCAGAGATGAAGCAGTTATCTTCTTCTTGTTGATTGGTAGGAACGTATGTGT
CATAAGAATGGTAGAAGATCTCATCTGTAGGTCCAAGCAATTCGATTCCTGGTTTAAGCT
CTTCCTCTGGATTGTCAGTTTCAGCTTCTGCAGACACAAAAGCAATGTATTTGCCCTTTG
GTGCCACGTTGTGAGCGTATGAACAACAGAACAAGTACATGTCTGATTTGCGGCCGAGTT
GCTTTTGAGGAAGAATGATTTGAACCGAGTGAGCATCGTTGGTGTCTGGAATAGGATGGC
TCATTATACACACCGCTCGAGCCACCTTCCCAACTTTCTTAACCTTGTCAGACAAGTAAG
AAGGATCACAGACAACTTTCTTGCATTTAGCAGTTTCTCCTGCGGAAGTGACACCAATAG
CTTTTCCAGAGCTATCAAACTCAACCTTGCATTCAGGCTTGTTTAGCATGTAAGTCCCAC
CATAAACAGCGCTCAAACGCGCAAAAGCCTGTGGCAACTCTCCTAGACCGTAC


BQ
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AF RS1DC24JQ U 1
AF RS1DC24TF C 1
AF RS1C468JQ U 38
BS 1 56 RS1DC24JQ
BS 57 57 RS1C468JQ
BS 58 588 RS1DC24JQ
BS 589 773 RS1C468JQ

RD RS1DC24JQ 589 0 0
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AAAGAGAAAGAGTCACATGCAGTTTAAGAACTCTGGGTGCGATAATAAAAAAAGTCAATC
AGTTTTCTGCAGCAGCACTTGCAGCACTCAAGTCCACAGATAAATCAAGAGTCTTTCCAG
TGATTTTGGTGTACATCTCTAGTACATCCGCAACTGTACTCTCGAAATGTGTTGTTGCAT
CATAAGTACCAGAGATGAAGCAGTTATCTTCTTCTTGTTGATTGGTAGGAACGTATGTGT
CATAAGAATGGTAGAAGATCTCATCTGTAGGTCCAAGCAATTCGATTCCTGGTTTAAGCT
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GTGCCACGTTGTGAGCGTATGAACAACAGAACAAGTACATGTCTGATTTGCGGCCGAGTT
GCTTTTGAGGAAGAATGATTTGAACCGAGTGAGCATCGTTGGTGTCTGGAATAGGATGGC
TCATTATACACACCGCTCGAGCCACCTTCCCAACTTTCTTAACCTTGT
C

QA 1 588 1 588
DS 

RD RS1DC24TF 588 0 0
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AAAGAGAAAGAGTCACATGCAGTTTAAGAACTCTGGGTGCGATAATAAAAAAAGTCAATC
AGTTTTCTGCAGCAGCACTTGCAGCACTCAAGTCCACAGATAAATCAAGAGTCTTTCCAG
TGATTTTGGTGTACATCTCTAGTACATCCGCAACTGTACTCTCGAAATGTGTTGTTGCAT
CATAAGTACCAGAGATGAAGCAGTTATCTTCTTCTTGTTGATTGGTAGGAACGTATGTGT
CATAAGAATGGTAGAAGATCTCATCTGTAGGTCCAAGCAATTCGATTCCTGGTTTAAGCT
CTTCCTCTGGATTGTCAGTTTCAGCTTCTGCAGACACAAAAGCAATGTATTTGCCCTTTG
GTGCCACGTTGTGAGCGTATGAACAACAGAACAAGTACATGTCTGATTTGCGGCCGAGTT
GCTTTTGAGGAAGAATGATTTGAACCGAGTGAGCATCGTTGGTGTCTGGAATAGGATGGC
TCATTATACACACCGCTCGAGCCACCTTCCCAACTTTCTTAACCTTGT

QA 1 588 1 588
DS 

RD RS1C468JQ 736 0 0
GGTACTTTAAACTGTATCAGAATAAAGAGAAAGAGTCACATGCAGTTTAAGAACTCTGGG
TGCGATAATAAAAAAAGTCAATCAGTTTTCTGCAACAGCACTTGCAGCACTCAAGTCCAC
AGATAAATCAAGAGTCTTTCCAGTGATTTTGGTGTACATCTCTAGTACATCCGCAACTGT
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TTGATTGGTAGGAACGTATGTGTCATAAGAATGGTAGAAGATCTCATCTGTAGGTCCAAG
CAATTCGATTCCAGGTTTAAGCTCTTCCTCTGGATTGTCAGTTTCAGCTTCTGCAGACAC
AAAAGCAATGTATTTGCCCTTTGGTGCCACGTTGTGAGCGTATGAACAACAGAACAAGTA
CATGTCTGATTTGCGGCCGAGTTGCTTTTGAGGAAGAATGATTTGAACCGAGTGAGCATC
GTTGGTGTCTGGAATAGGATGGCTCATTATACACACCGCTCGAGCCACCTTCCCAACTTT
CTTAACCTTGTCAGACAAGTAAGAAGGATCACAGACAACTTTCTTGCATTTAGCAGTTTC
TCCTGCGGAAGTGACACCAATAGCTTTTCCAGAGCTATCAAACTCAACCTTGCATTCAGG
CTTGTTTAGCATGTAAGTCCCACCATAAACAGCGCTCAAACGCGCAAAAGCCTGTGGCAA
CTCTCCTAGACCGTAC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 3

CO CL3887Contig1 931 3 3 U
GGATCTCAAATCAATATACCTAACATTGGAGAAATCTCGAACTTAACCATTCAAAATAAA
ATTACAATTTAAATAAAAAATCGGTAACGTATTTCTCACCAAGCATATACTATAAGAAAG
AATCGAAAGTTGGTAAAATATGCTGGGATAATAAAATGCTTTAAACACCTTTCTTAGATT
TGAAGCAAAGACAAAGAACCTATGATTGTTGTTGTGACTTTGTTCTCAAGAAGCCTCCAG
ACAAAACAAAAGCTTTTAGCTTAAGCTTTGTATGTCCATTTTTCTATTTTGTTTCTGAAG
TTGCGTTAGATGAATACCAAAGCTTCTTCTGGCAAATCAAGAGCTTCTCACTCTCTGATT
CCGACTCTGTTTTCTCCTTACGGCAACTCCATCTCAGTTCTTTAGCGACTGATGCAATGG
TGTCCGCGAAGTAGCTTGATTCTCGTATGATCGCATACCCGTTTGGACGCAAGATCCGAT
CCATTTCCAGCATTACATATTTCATCTCACACCTTTGGTTTTCAGATGTAAACAGCCCAT
CAACGTGAAGAAGATCGTAAGTTCTCGGATATGTCGAGAAAGCTTCACACCAGTCGTGGT
AAGTTCCAATCAATCCACGATCAAACACAACGGGAAGTGTATTTGCAGCGTAAGAAGAGA
CAACGTTCATAACCCACAGAGGATCATCGACCAGAGCAGCAGCTAAACCACCATAAGCAG
TGTTCATATCCATCACATTCCCGGATCTTATCAGAGCCAACAGCTGGTAACAGCTTCTTG
TAATGCTTAGCCCTCGTTTTCCATTTGCTATCGTCTCGCTTAAACAAGCCACCATTTCCT
CCAGGAACATCAGAGATCCTTTCAGGAGTTGAGTGCAACCTCTCCGGCCACTTGGGAGTA
GATTCCAATCTGTCTTCTTAAGCTTAGGGCC


BQ
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AF RS1DI83JQ U 1
AF RS1BI95JQ U 18
AF RS1DI83TF C 330
BS 1 684 RS1DI83JQ
BS 685 780 RS1BI95JQ
BS 781 931 RS1DI83TF

RD RS1DI83JQ 684 0 0
GGATCTCAAATCAATATACCTAACATTGGAGAAATCTCGAACTTAACCATTCAAAATAAA
ATTACAATTTAAATAAAAAATCGGTAACGTATTTCTCACCAAGCATATACTATAAGAAAG
AATCGAAAGTTGGTAAAATATGCTGGGATAATAAAATGCTTTAAACACCTTTCTTAGATT
TGAAGCAAAGACAAAGAACCTATGATTGTTGTTGTGACTTTGTTCTCAAGAAGCCTCCAG
ACAAAACAAAAGCTTTTAGCTTAAGCTTTGTATGTCCATTTTTCTATTTTGTTTCTGAAG
TTGCGTTAGATGAATACCAAAGCTTCTTCTGGCAAATCAAGAGCTTCTCACTCTCTGATT
CCGACTCTGTTTTCTCCTTACGGCAACTCCATCTCAGTTCTTTAGCGACTGATGCAATGG
TGTCCGCGAAGTAGCTTGATTCTCGTATGATCGCATACCCGTTTGGACGCAAGATCCGAT
CCATTTCCAGCATTACATATTTCATCTCACACCTTTGGTTTTCAGATGTAAACAGCCCAT
CAACGTGAAGAAGATCGTAAGTTCTCGGATATGTCGAGAAAGCTTCACACCAGTCGTGGT
AAGTTCCAATCAATCCACGATCAAACACAACGGGAAGTGTATTTGCAGCGTAAGAAGAGA
CAACGTTCATAACCCACAGAGGAT

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1BI95JQ 763 0 0
AT
CTAACATTGGAGAAATCTCGAACTTAACCATTCAAAATAAAATTACAATTTAAATAAAAA
ATCGGTAATGTATTTCTCACCAAGCATATACTATAAGAAAGAATCGAAAGTTGGTAAAAT
ATGCTGGGATAATAAAATGCTTTAAACACCTTTCTTAGCTTTGAAGCAAAGACAAAGAAC
CTATGATTGTTGTTGTGACTTTGTTCTCAAGAAGCCTCCAGACAAAACAAAAGCTTTTAG
CTTAAGCTTTGTATGTCCATTTTTCTATTTTGTTTCTGAAGTTGCGTTAGATGAATACCA
AAGCTTCTTCTGGCAAATCAAGAGCTTCTCACTCTCTGATTCCGACTCTATTTTCTCCTT
ACGGCAACTCCATCTCAGTTCTTTAGCGACTGATGCAATGGTGTCCGCGAAGTAGCTTGA
TTCTCGTATGATCGCATACCCGTTTGGACGCAAGATCCGATCCATTTCCAGCATTACATA
TTTCATCTCACACCTTTGGTTTTCAGATGTAAACAGCCCATCAACGTGAAGAAGATCGTA
AGTTCTCGGATATGTCGAGAAAGCTTCACACCAGTCGTGGTAAGTTCCAATCAATCCACG
ATCAAACACAACGGGAAGCGTATTTGCAGCGTAAGAAGAGACAACGTTCATAACCCACAG
AGGATCATCGACCAGAGCAGCAGCTAAACCACCATAAGCAGTGTTCATATCCATCACATT
CCCGGATCTTATCAGAGCCAACAGCTGGTAACAGCTTCTTG

QA 3 763 3 763
DS 

RD RS1DI83TF 602 0 0
TGGCAAATCAAGAGCTTCTCACTCTCTGATTCCGACTCTGTTTTCTCCTTACGGCAACTC
CATCTCAGTTCTTTAGCGACTGATGCAATGGTGTCCGCGAAGTAGCTTGATTCTCGTATG
ATCGCATACCCGTTTGGACGCAAGATCCGATCCATTTCCAGCATTACATATTTCATCTCA
CACCTTTGGTTTTCAGATGTAAACAGCCCATCAACGTGAAGAAGATCGTAAGTTCTCGGA
TATGTCGAGAAAGCTTCACACCAGTCGTGGTAAGTTCCAATCAATCCACGATCAAACACA
ACGGGAAGTGTATTTGCAGCGTAAGAAGAGACAACGTTCATAACCCACAGAGGATCATCG
ACCAGAGCAGCAGCTAAACCACCATAAGCAGTGTTCATATCCATCACATTCC*GGATCTT
ATCAGAGCCAACAGCTGGTAACAGCTTCTTGTAATGCTTAGCCCTCGTTTTCCATTTGCT
ATCGTCTCGCTTAAACAAGCCACCATTTCCTCCAGGAACATCAGAGATCCTTTCAGGAGT
TGAGTGCAACCTCTCCGGCCACTTGGGAGTAGATTCCAATCTGTCTTCTTAAGCTTAGGG
CC

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 2

CO CL3888Contig1 1057 2 2 U
GGGGATTCACAGAAGATCTCAAATCGAAATCGAAAATCGAAAAAAGATGATCAGAAGAAG
AATCTCTTCGATCATTTCATCGTCTCTCATCAATTCTCCATTTCATCACTCCGCCAAGCC
CAGATTCATCGTCTCTTCGCCGCTTCTTCAATGCCGTCGATCTCCGATCCTGACTCAAGC
TCCTCCTACCTTCGCGGGAAGAAGAGTTCCGTCGTTCGAGGGGATCAGGGCTTACAGTTT
GCTGAGCCTGAACGATCTGAGAGACAATGTGCCGAGAAAGCTGAAGACGAGGAAAGGAAG
AGGTATCGGGTCTGGGAAAGGCAAAACGGCGGGGAGAGGTCACAAGGGGCAGAAGGCGAG
AGGGACGATGAAGTTCGGTTTCGAAGGTGGGCAGACTCCTTTACGACGCCGTTTGCCTAA
ACGTGGCTTCAAGAACAAGTTTAAGCTCCACTTTCAGCCGGTTGGTTTGGGGAAGATCGC
TAAACTCATAAACGCCGGGCAGATAGATTCACATGAGTTAATCACGATGAAAACGCTCAA
GGATGTGGGAGCTATCGGAAAGCAAATAGAAGACGGAGTGAGACTGATGGGTCGTGGTGC
TGATGAGATCAAATGGCCACTTCATTTCGAGGTTTCGAGAGTGACAGTTAGGGCCAAGGA
GGTGGTAGAAGCAGCAGGAGGATCGGTGAGAAGAGTGTATTACAACAAATTGGGGTTGAG
GGCATTACTTCGACCGGAATGGTTTGAGAAGAAAGGAAGGCTATTGCCAAAAGCAGCCAG
ACCGCCTCCTAAGCAACAAGATAGGGTCGATAGCATCGGACGTCTTCCTGCTCCGAAGAA
ACCCATCCCTTTCTATGCAGCTGAGGAAAACAAAGTTGAGTCTCCTGTTGAATCATGATT
TCGGTTAGTTTTTTTTAACTTTTGATGTTTTGGTTTAAGTTGTTCGTGTTGTTTCTTGGT
CTTGTTCTTACAAGAACAAAAATTGAGGATGGTCGGTGGACCAAATAATGTCATTCACGT
TTTGAATTTTTATGGACTTATAAGTTCTTAAGCAAAC


BQ
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AF RS1BB05TF U 1
AF RS1BB05JQ C 201
BS 1 648 RS1BB05TF
BS 649 1057 RS1BB05JQ

RD RS1BB05TF 648 0 0
GGGGATTCACAGAAGATCTCAAATCGAAATCGAAAATCGAAAAAAGATGATCAGAAGAAG
AATCTCTTCGATCATTTCATCGTCTCTCATCAATTCTCCATTTCATCACTCCGCCAAGCC
CAGATTCATCGTCTCTTCGCCGCTTCTTCAATGCCGTCGATCTCCGATCCTGACTCAAGC
TCCTCCTACCTTCGCGGGAAGAAGAGTTCCGTCGTTCGAGGGGATCAGGGCTTACAGTTT
GCTGAGCCTGAACGATCTGAGAGACAATGTGCCGAGAAAGCTGAAGACGAGGAAAGGAAG
AGGTATCGGGTCTGGGAAAGGCAAAACGGCGGGGAGAGGTCACAAGGGGCAGAAGGCGAG
AGGGACGATGAAGTTCGGTTTCGAAGGTGGGCAGACTCCTTTACGACGCCGTTTGCCTAA
ACGTGGCTTCAAGAACAAGTTTAAGCTCCACTTTCAGCCGGTTGGTTTGGGGAAGATCGC
TAAACTCATAAACGCCGGGCAGATAGATTCACATGAGTTAATCACGATGAAAACGCTCAA
GGATGTGGGAGCTATCGGAAAGCAAATAGAAGACGGAGTGAGACTGATGGGTCGTGGTGC
TGATGAGATCAAATGGCCACTTCATTTCGAGGTTTCGAGAGTGACAGT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1BB05JQ 857 0 0
AAGAAGAGTCCGTCG
TCGAGGGGATCAGG*CTTACAGTT*GCTGAGC*TGAACGATCTGAGAGACAATGTGCCGA
GAAAGCTGAAGACGAGGAAAGGAAGAGGTATCGGGTCTGGGAAAGGCAAAACGGCGGGGA
GAGGTCACAAGGGGCAGAAGGCGAGAGGGACGATGAAGTTCGGTTTCGAAGGTGGGCAGA
CTCCTTTACGACGCCGTTTGCCTAAACGTGGCTTCAAGAACAAGTTTAAGCTCCACTTTC
AGCCGGTTGGTTTGGGGAAGATCGCTAAACTCATAAACGCCGGGCAGATAGATTCACATG
AGTTAATCACGATGAAAACGCTCAAGGATGTGGGAGCTATCGGAAAGCAAATAGAAGACG
GAGTGAGACTGATGGGTCGTGGTGCTGATGAGATCAAATGGCCACTTCATTTCGAGGTTT
CGAGAGTGACAGTTAGGGCCAAGGAGGTGGTAGAAGCAGCAGGAGGATCGGTGAGAAGAG
TGTATTACAACAAATTGGGGTTGAGGGCATTACTTCGACCGGAATGGTTTGAGAAGAAAG
GAAGGCTATTGCCAAAAGCAGCCAGACCGCCTCCTAAGCAACAAGATAGGGTCGATAGCA
TCGGACGTCTTCCTGCTCCGAAGAAACCCATCCCTTTCTATGCAGCTGAGGAAAACAAAG
TTGAGTCTCCTGTTGAATCATGATTTCGGTTAGTTTTTTTTAACTTTTGATGTTTTGGTT
TAAGTTGTTCGTGTTGTTTCTTGGTCTTGTTCTTACAAGAACAAAAATTGAGGATGGTCG
GTGGACCAAATAATGTCATTCACGTTTTGAATTTTTATGGACTTATAAGTTCTTAAGCAA
AC

QA 16 857 16 857
DS 



AS 1 3

CO CL3889Contig1 847 3 8 U
CATCAAACCTCATCATTATCAAAATATTCAAACCTAACCCCAACTCAAACCATGTCTTCT
TCCGACTGTCCGTCACCGTTACCCACCGCCCCGAAACTTCAAATTGATTCCGTTACTTTT
CCACCGTCCGTCATCTCACCGGCTTCCTCCAACACTCTCTTCCTCGGTGGCGCAGGTGTG
CGAGGTTTGGAAATTCAAGGAAAGTTTGTGATCTTCACCGTCATCGGAGTTTACCTAGAT
CCTGTCTCTGTACCGTCACTCTCCGTTAAGTGGGAAGGTAAAACGACAGAGGAACTAACG
GAATCCGTCCCTTTCTTCCGTGAAATCGTCACAGGTGCGTTTGAGAAATTCATTAAAGTG
ACGATGAAGCTGCCGTTAACGGGACAGCAATATTCAGAGAAAGTAACGGAGAACTGTGTG
GCGATATGGAAATCGTTAGGGATTTACACAGACTCTGAGGCTAAAGCAGTGGAGAGGTTC
TTGGAAGTCTTCAAGGACGAAACGTTCCCTCCTGGTGCTTCCATCCTCTTCGCTCTCTCC
CCCGAAGGCTCTCTTACGGTTGCGTTTTCGAAAGATGATAGCATTCCTGAAACGGGAAAA
GCAGTGATCGAAAATAAGTTGTTGGCAGAGGCAGTTCTTGAATCGATCATTGGAAAGAAC
GGTGTGTCTCCTGGGGCTAGGTTGAGGGTTGCCGAGAGATTGGCTCAGCTGATGAAGGAG
AATAAGGTCGAAGAAGATGCAACAAAGACTGATCAAGAGGAAGCTAACGATCTCTCCCTG
GCCAAAGAAAACTGATCCTGTGGGAGATTTTTATGTTTCTATGCTTAATAACATTGTGTT
TAGTTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CU83TF U 1
AF RS1CD54TF U 1
AF RS1CD54JQ C 167
BS 1 650 RS1CD54TF
BS 651 651 RS1CD54JQ
BS 652 670 RS1CD54TF
BS 671 671 RS1CD54JQ
BS 672 700 RS1CD54TF
BS 701 701 RS1CD54JQ
BS 702 713 RS1CD54TF
BS 714 847 RS1CD54JQ

RD RS1CU83TF 564 0 0
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TCCGACTGTCCGTCACCGTTACCCACCGCCCCGAAACTTCAAGTTGATTCCGTTACTTTT
CCACCGTCCGTCATCTCACCGGCTTCCTCCAACCCTCTCTTCCTCGGTGGCGCAGGTGTG
CGAGGTTTGGAAATTCAAGGAAAGTTTGTGATCTTCACCGTCATCGGAGTTTACCTAGAT
CCTGTCTCTGTACCGTCACTCTCCGTTAAGTGGGAAGGTAAAACGACAGAGGAACTAACG
GAATCCGTCCCTTTCTTCCGTGAAATCGTCACAGGTTCGTTTGAGAAATTCATTAAAGTG
ACGATGAAGCTGCCGTTAACGGGACAGCAATATTCAGAGAAAGTAACGGAGAACTGTGTG
GCGATATGGAAATCGTTAGGGATTTACACAGACTCTGAAGCTAAAGCAGTGGAGAGGTTC
TTGGATGTCTTCAAGGACGAAACGTTCCCTCCTGGTGCTTCCATCCTCTTCGCTCTCTCC
CCTGAAGGCTCTCTTACGGTTGCG

QA 1 564 1 564
DS 

RD RS1CD54TF 713 0 0
CATCAAACCTCATCATTATCAAAATATTCAAACCTAACCCCAACTCAAACCATGTCTTCT
TCCGACTGTCCGTCACCGTTACCCACCGCCCCGAAACTTCAAATTGATTCCGTTACTTTT
CCACCGTCCGTCATCTCACCGGCTTCCTCCAACACTCTCTTCCTCGGTGGCGCAGGTGTG
CGAGGTTTGGAAATTCAAGGAAAGTTTGTGATCTTCACCGTCATCGGAGTTTACCTAGAT
CCTGTCTCTGTACCGTCACTCTCCGTTAAGTGGGAAGGTAAAACGACAGAGGAACTAACG
GAATCCGTCCCTTTCTTCCGTGAAATCGTCACAGGTGCGTTTGAGAAATTCATTAAAGTG
ACGATGAAGCTGCCGTTAACGGGACAGCAATATTCAGAGAAAGTAACGGAGAACTGTGTG
GCGATATGGAAATCGTTAGGGATTTACACAGACTCTGAGGCTAAAGCAGTGGAGAGGTTC
TTGGAAGTCTTCAAGGACGAAACGTTCCCTCCTGGTGCTTCCATCCTCTTCGCTCTCTCC
CCCGAAGGCTCTCTTACGGTTGCGTTTTCGAAAGATGATAGCATTCCTGAAACGGGAAAA
GCAGTGATCGAAAATAAGTTGTTGGCAGAGGCAGTTCTTGAATCGATCAT*GGAAAGAAC
GGTGTGTCTC*TGGGGCTAGGTTGAGGGTTGCCGAGAGAT*GGCTCAGCTGAT

QA 1 713 1 713
DS 

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GAGTTTACCTAGATCCTGTCTCTGTACCGTCACTCTCCGTTAAGTGGGAAGGTAAAACGA
CAGAGGAACTAACGGAATCCGTCCCTTTCTTCCGTGAAATCGTCACAGGTGCGTTTGAGA
AATTCATTAAAGTGACGATGAAGCTGCCGTTAACGGGACAGCAATATTCAGAGAAAGTAA
CGGAGAACTGTGTGGCGATATGGAAATCGTTAGGGATTTACACAGACTCTGAGGCTAAAG
CAGTGGAGAGGTTCTTGGAAGTCTTCAAGGACGAAACGTTCCCTCCTGGTGCTTCCATCC
TCTTCGCTCTCTCCCCCGAAGGCTCTCTTACGGTTGCGTTTTCGAAAGATGATAGCATTC
CTGAAACGGGAAAAGCAGTGATCGAAAATAAGTTGTTGGCAGAGGCAGTTCTTGAATCGA
TCATTGGAAAGAACGGTGTGTCTCCTGGGGCTAGGTTGAGGGTTGCCGAGAGATTGGCTC
AGCTGATGAAGGAGAATAAGGTCGAAGAAGATGCAACAAAGACTGATCAAGAGGAAGCTA
ACGATCTCTCCCTGGCCAAAGAAAACTGATCCTGTGGGAGATTTTTATGTTTCTATGCTT
AATAACATTGTGTTTAGTTCC

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

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CTATCTTATTCTTTTAACTCAATAACTTCACTCAAGTCCTGTAGGAATACTTTGTTCATG
TCTGTAAAAATTTTCAGGATCAAACTTAGCTTTAATCTTCACCAACCTCTCAAAGTTTCC
CTTGAAGTATTTATTCCCCCATTCTCTTGCATCACTCCCCTTGCCATTCATCCCCAAATC
AAAATCTCCATAGTTTAAATACGCTGCTCTCGGGCTTTTTGACACATACTTCTCCATGTA
ACTATACATATCCCTCATCCACTCCATAC


BQ
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AF RS1B518JQ U 181
AF RS1B518TF C 1
BS 1 180 RS1B518TF
BS 181 308 RS1B518JQ
BS 309 389 RS1B518TF

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CTTGAAGTATTTATTCCCCCATTCTCTTGCATCACTCCCCTTGCCATTCATCCCCAAATC
AAAATCTC
CA

QA 1 128 1 128
DS 

RD RS1B518TF 389 0 0
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TTCTAGACACAAAACACAAAAGTAACAAAAGTATTTCCTAAAACAATCCCAAACCACACA
CTATCTTATTCTTTTAACTCAATAACTTCACTCAAGTCCTGTAGGAATACTTTGTTCATG
TCTGTAGAAATTTTCAGGATCAAACTTAGCTTTAATCTTCACCAACCTCTCAAAGTTTCC
CTTGAAGTATTTATTCCCCCATTCTCTTGCATCACTCCCCTTGCCATTCATCCCCAAATC
AAGATCTCCATAGTTTAAATACGCTGCTCTCGGGCTTTTTGACACATACTTCTCCATGTA
ACTATACATATCCCTCATCCACTCCATAC

QA 1 389 1 389
DS 



AS 1 3

CO CL3891Contig1 1251 3 14 U
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AGAGTCGATCTCTGAGTTAGCTAAATCGCAGGGAGGGACGTTTACTGAGATTGAGGCGAA
GTCATCATGTCTTCGGATCCTGAAAAGATGATGTCCAAAGCCGACAAGATGACAAAACTC
ACGCTTACTAGGTGGAGTGCTGACTGGAGAGGTGCTACTGAGTTGTATGAGCAAGCAGCA
AATGGCTTCAGGGCATCAAGCAAATATGAAAAAGCTAAAGTGGCTCTCGAGAAAGCTTCC
AAAGGACAAGAAATGCAATCTTCTCCCTGGGATGCTGCAAAGCATATGGAGTCTGCCGCT
GCCCTAGCGCAGAAGCTAAGTATCTGGAACGAAGTTGCTGATTTTTATAGAAAGGCGTCT
GAGCTGTATGTTGAGTGTGGAAGGGCACAACCCGCATCAGATGCTCATGGAAAGGCTGCT
CGTGCTTTGGAAGAAGTCAAACCTGAAGATGCCATCCAACTGTACACCGATGCTTGTGAA
ATTCTTGAAGAAGATGGAAGGGACCAGATGGCTTTTGATCTGTACCGTGCTTGTGCTAGT
GTTTACATAAAACTCGAGAAGTTCGCAGATGCTGCAACCTTTTTCTTAAGATTGGGTGTA
GCAGCTGACAAGTGTGACGCCACAAATAGCCAGTGTAAGGCATATCTTAGTGCAATCATT
GTATATCTGTATGGCCATGACCTGAAGCAGGCTGAAAAATGCTACAACGATTGTTCTCAG
ATTGATGCTTTTCTGAAGAGTGATCAGAACCGAACTGCTAGCAGACTGCTCACAGCCTAT
AATGAAGGTGACATCGAAGAAATCAAGAAAGTGGCGTGTTCAAGCACTGTCAACAATTTG
GATCATGCGATCATCAAGTTGGCGAGAAAGCTACCCACAGGAGATGTCACTGCAGTTCAG
ATGAATGCTGGTGATGATCTCGACGAGGATGATCTCACTTGAAGATTCTTCTCTTTGTAC
AGATTTCAGATTCCTACACTTTGCTTATGTTCAAGCCAAACTACTTAAAACAAAGTTATC
ATTTTAGTCCAAACCTTCCTTGTGTGAATGAATGATTGGCTATAAAGGCTCTGAGTTCAG
ATGTGTGCTTTGTTCCTCCACTAAATCCACAGTGGGTTACCACTTGAACACTCTTTTAGC
ACAGGCTGGTAAATTTCTTCATTTGACAATAAATATGATACAGTTGTTACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GM40TF U 1
AF RS1AL62TF U 4
AF RS1GM40JQ C 553
BS 1 51 RS1GM40TF
BS 52 52 RS1AL62TF
BS 53 311 RS1GM40TF
BS 312 312 RS1AL62TF
BS 313 466 RS1GM40TF
BS 467 467 RS1AL62TF
BS 468 699 RS1GM40TF
BS 700 700 RS1AL62TF
BS 701 714 RS1GM40TF
BS 715 715 RS1AL62TF
BS 716 735 RS1GM40TF
BS 736 736 RS1AL62TF
BS 737 745 RS1GM40TF
BS 746 1251 RS1GM40JQ

RD RS1GM40TF 745 0 0
TTTTTGGCTAAAGAAACAACCTTTGATCTGAGAGAGTGGGAGCGGCGATTGTAGAATTGG
AGAGTCGATCTCTGAGTTAGCTAAATCGCAGGGAGGGACGTTTACTGAGATTGAGGCGAA
GTCATCATGTCTTCGGATCCTGAAAAGATGATGTCCAAAGCCGACAAGATGACAAAACTC
ACGCTTACTAGGTGGAGTGCTGACTGGAGAGGTGCTACTGAGTTGTATGAGCAAGCAGCA
AATGGCTTCAGGGCATCAAGCAAATATGAAAAAGCTAAAGTGGCTCTCGAGAAAGCTTCC
AAAGGACAAGAGATGCAATCTTCTCCCTGGGATGCTGCAAAGCATATGGAGTCTGCCGCT
GCCCTAGCGCAGAAGCTAAGTATCTGGAACGAAGTTGCTGATTTTTATAGAAAGGCGTCT
GAGCTGTATGTTGAGTGTGGAAGGGCACAACCCGCATCAGATGCTCTTGGAAAGGCTGCT
CGTGCTTTGGAAGAAGTCAAACCTGAAGATGCCATCCAACTGTACACCGATGCTTGTGAA
ATTCTTGAAGAAGATGGAAGGGACCAGATGGCTTTTGATCTGTACCGTGCTTGTGCTAGT
GTTTACATAAAACTCGAGAAGTTCGCAGATGCTGCAACCTTTTTCTTAAGATTGGGTGTA
GCAGCTGACAAGTGTGACGCCACAAATAGCCAGTGTAAG*CATATCTTAGTGCA*TCATT
GTATATCTGTATGGC*ATGACCTGA

QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1AL62TF 743 0 0
GG
GGCTAAAGAAACAACCTTTGATCTGAGAGAGTGGGAGCGGCGATTGCAGAATTGGAGAGT
CGATCTCTGAGTTAGCTAAATCGCAGGGAGGGACGTTTACTGAGATTGAGGCGAAGTCAT
CATGTCTTCGGATCCTGAAAAGATGATGTCCAAAGCCGACAAGATGACAAAACTCACGCT
TACTAGGTGGAGTGCTGACTGGAGAGGTGCTACTGAGTTGTATGAGCAAGCAGCAAATGG
CTTCAGGGCATCAAGCAAATATGAAAAAGCTAAAGTGGCTCTCGAGAAAGCTTCCAAAGG
ACAAGAAATGCAGTCTTCTCCCTGGGATGCTGCAAAGCATATGGAGTCTGCCGCTGCCCT
AGCGCAGAAGCTAAGTATCTGGAACGAAGTTGCTGATTTTTATAGAAAGGCGTCTGAGCT
GTATGTTGAGTGTGGAAGGGCACAACCCGCATCAGATGCTCATGGAAAGGCTGCTCGTGC
TTTGGAAGAAGTCAAACCTGAAGATGCCATCCAACTGTACACCGATGCTTGTGAAATTCT
TGAAGAAGATGGAAGGGACCAGATGGCTTTTGATCCGTACCGTGCTTGTGCTAGTGTTTA
CATAAAACTCGAGAAGTTCGCAGATGCTGCAACCTTTTTCTTAAGATTGGGTGTAGCAGC
TGACAAGTGTGACGCCACAAATAGCCAGTGTAAGGCATATCTTAGTGCAATCATTGTATA
TCTGCATGGCCATGACCTGA
A

QA 3 742 3 742
DS 

RD RS1GM40JQ 699 0 0
GATGGAAGGGACCAGATGGCTTTTGATCTGTACCGTGCTTGTGCTAGTGTTTACATAAAA
CTCGAGAAGTTCGCAGATGCTGCAACCTTTTTCTTAAGATTGGGTGTAGCAGCTGACAAG
TGTGACGCCACAAATAGCCAGTGTAAGGCATATCTTAGTGCAATCATTGTATATCTGTAT
GGCCATGACCTGAAGCAGGCTGAAAAATGCTACAACGATTGTTCTCAGATTGATGCTTTT
CTGAAGAGTGATCAGAACCGAACTGCTAGCAGACTGCTCACAGCCTATAATGAAGGTGAC
ATCGAAGAAATCAAGAAAGTGGCGTGTTCAAGCACTGTCAACAATTTGGATCATGCGATC
ATCAAGTTGGCGAGAAAGCTACCCACAGGAGATGTCACTGCAGTTCAGATGAATGCTGGT
GATGATCTCGACGAGGATGATCTCACTTGAAGATTCTTCTCTTTGTACAGATTTCAGATT
CCTACACTTTGCTTATGTTCAAGCCAAACTACTTAAAACAAAGTTATCATTTTAGTCCAA
ACCTTCCTTGTGTGAATGAATGATTGGCTATAAAGGCTCTGAGTTCAGATGTGTGCTTTG
TTCCTCCACTAAATCCACAGTGGGTTACCACTTGAACACTCTTTTAGCACAGGCTGGTAA
ATTTCTTCATTTGACAATAAATATGATACAGTTGTTACC

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 3

CO CL3892Contig1 861 3 5 U
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ACAGCCATGGTTAATTATGCGACCGCAGCTAATTTCATGGCTCCACTGCCTGGTTATCCC
GTTGAGCAGATGTGTAAGATCATCGACGGATTCCCTCGGGGATCAAGTAATCTCGACCGT
GCCTTTGCTGCTGCAAGCTTATACTACAACTATTCGGGTTCACAAAAATGCTTTGAGCTT
GAACAACCTACTGATGATCATGGTCTCGACGGTTGGGGATGGCAGGCGTGTACGGAGATG
GTGATGCCAATGAGCTGCTCGAACGAGAGCATGTTCCCACCGTACGAAAATGACTATGAG
GGATTCGAAGAACAATGCATGAGTAGATACGGAGTCAAGCCTCGGCCACATTGGATCACC
ACAGAGTTTGGCGGGAAGAGAATAGAGACAGTGTTGAAGAGGTTTGGAAGCAACATTATA
TTCTCCAATGGGATGCAGAATCCCTGGAGCCGTGGAGGGGTACTGAAGAACATTCCGAGC
AGCATTATCGCGCTTGTGACCAAGAAAGGTGCGCACCATGCGGATCTCAGGGCAGCTACG
AAAGGCGACCCGGAGTGGCTTAAAGAGCAGAGGAGGCAAGAGGTGGCCATCATAGAGAAA
TGGATCAGCGAGTATTACAGAGATTTGAAAGAAGAAGACTAAAAGTTTAAGAAGACCAAT
AGAAAGCCAAAAGTTCATTGCACAAGATTAGCAAACAAAGGCTTTTGTGTGTTTGGTCAT
CTAGTTTGAGATTCAGTTGAAGTGTAATAAATCAAAACTTGATGTTTATGAAACTAAACA
AATTGTAAAGAATAGCGAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DR94TF U 1
AF RS1AP56TFB U 166
AF RS1DR94JQ C 154
BS 1 534 RS1DR94TF
BS 535 701 RS1AP56TFB
BS 702 702 RS1DR94JQ
BS 703 720 RS1AP56TFB
BS 721 861 RS1DR94JQ

RD RS1DR94TF 535 0 0
GGCAAAGGCCTTCAATCACAATATTCAGCAAGAGATTGGTTAATGGGAGCGTTTGTTTAT
ACAGCCATGGTTAATTATGCGACCGCAGCTAATTTCATGGCTCCACTGCCTGGTTATCCC
GTTGAGCAGATGTGTAAGATCATCGACGGATTCCCTCGGGGATCAAGTAATCTCGACCGT
GCCTTTGCTGCTGCAAGCTTATACTACAACTATTCGGGTTCACAAAAATGCTTTGAGCTT
GAACAACCTACTGATGATCATGGTCTCGACGGTTGGGGATGGCAGGCGTGTACGGAGATG
GTGATGCCAATGAGCTGCTCGAACGAGAGCATGTTCCCACCGTACGAAAATGACTATGAG
GGATTCGAAGAACAATGCATGAGTAGATACGGAGTCAAGCCTCGGCCACATTGGATCACC
ACAGAGTTTGGCGGGAAGAGAATAGAGACAGTGTTGAAGAGGTTTGGAAGCAACATTATA
TTCTCCAATGGGATGCAGAATCCCTGGAGCCGTGGAGGGGTACTGAAGAACATT
T

QA 1 534 1 534
DS 

RD RS1AP56TFB 555 0 0
G
GTAATCTCGACCGTGCCTTTGCTGCTGCAAGCTTATACTACAACTATTCGGGTTCACAAA
AATGCTTTGAGCTTGAACAACCTACTGATGATCATGGTCTCGACGGTTGGGGATGGCAGG
CGTGTACGGAGATGGTGATGCCAATGAGCTGCTCGAACGAGAGCATGTTCCCACCGTACG
AAAATGACTATGAGGGATTCTAAGAACAATGCATGAGTAGATACGGAGTCAAGCCTCGGC
CACATTGGATCACCACAGAGTTTGGCGGGAAGAGAATAGAGACAGTGTTGAAGAGGTTTG
GAAGCAACATTATATTCTCCAATGGAATGCAGGATCCCTGGAGCCGTGGAGGGGTACTGA
AGAACATTCCGAGCAGCATTATCGCGCTTGTGACCAAGAAAGGTGCGCACCATGCGGATC
TCAGGGCAGCTACGAAAGGCGACCCGGAGTGGCTTAAAGAGCAGAGGAGGCAAGAGGTGG
CCATCATAGAGAAATGGATCAGCGAGTATTACAGAGATTTGAAAGAAGAAGACTACAAGT
TTAAGAAGACCAAT

QA 2 555 2 555
DS 

RD RS1DR94JQ 708 0 0
CCTCGGGGATCAAGTAATCTCGACCGTGCCTTTGCTGCTGCAAGCTTATACTACAACTAT
TCGGGTTCACAAAAATGCTTTGAGCTTGAACAACCTACTGATGATCATGGTCTCGACGGT
TGGGGATGGCAGGCGTGTACGGAGATGGTGATGCCAATGAGCTGCTCGAACGAGAGCATG
TTCCCACCGTACGAAAATGACTATGAGGGATTCGAAGAACAATGCATGAGTAGATACGGA
GTCAAGCCTCGGCCACATTGGATCACCACAGAGTTTGGCGGGAAGAGAATAGAGACAGTG
TTGAAGAGGTTTGGAAGCAACATTATATTCTCCAATGGGATGCAGAATCCCTGGAGCCGT
GGAGGGGTACTGAAGAACATTTCGAGCAGCATTATCGCGCTTGTGACCAAGAAAGGTGCG
CACCATGCGGATCTCAGGGCAGCTACGAAAGGCGACCCGGAGTGGCTTAAAGAGCAGAGG
AGGCAAGAGGTGGCCATCATAGAGAAATGGATCAGCGAGTATTACAGAGATTTGAAAGAA
GAAGACTAAAAGTTTAAGAAGACCAATAGAAAGCCAAAAGTTCATTGCACAAGATTAGCA
AACAAAGGCTTTTGTGTGTTTGGTCATCTAGTTTGAGATTCAGTTGAAGTGTAATAAATC
AAAACTTGATGTTTATGAAACTAAACAAATTGTAAAGAATAGCGAGAG

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 3

CO CL3893Contig1 581 3 12 U
GGGTCGCTCGCTCTCACCTCCTCTTTTCCGCAAAGCGCTTCACAAGCCAAAGAAAAAAA*
*GTCAATATCAGTGGTGGATGATGGCGAGGAGAATCGGTGGAACCGGGAAAAATAGGGGG
GAAGACTCAACCATCTTGGGGAGGATCTCCAACTCCGAGATCGTATCTCACGGAAGACGC
GCCGCCGGAGAAGCCGTCGGAGTGTCGAAGAAATTGCTGTGGAGCACCGGAAAAGCGGCG
TGGATCGCTGGTACGACGATTCTCATCCTCGTTGTTCCGTTGATCATCGAGATGGATCGT
GAAGCGCAGCTCAACGAAATAGATCTTCAACAGGCTAGTCTCCTCGGAGCTCCGGCGCAG
CCTATGCAAAGGGGTTTCTAGTTAAACCCTATGAACTGAGGGTTCTTGCTGTTTTGTCTG
TTTTTTTTTTCTTTTACTAGTTTCTATTGTGGTTTTGTCGGATTTGGATTCTTATAACAT
GTTGTGATTTCTTTGAATGGCTTAACCTGCTTAAAACATTGATGGTGTTCGTCTTCACGT
TATCATTAAACACCTCTGTTTCGATGCTAGAATTATTTGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1GM24TF U 1
AF RS1G782JQ C 8
AF RS1G782TF U 8
BS 1 59 RS1GM24TF
BS 60 61 RS1G782TF
BS 62 88 RS1GM24TF
BS 89 89 RS1G782TF
BS 90 258 RS1GM24TF
BS 259 259 RS1G782TF
BS 260 420 RS1GM24TF
BS 421 421 RS1G782TF
BS 422 429 RS1GM24TF
BS 430 430 RS1G782TF
BS 431 489 RS1GM24TF
BS 490 581 RS1G782TF

RD RS1GM24TF 491 0 0
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AGTCAATATCAGTGGTGGATGATGGCGAAGAGAATCGGTGGAACCGGGAAAAATAGGGGG
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GCCGCCGGAGAAGCCGTCGGAGTGTCGAAGAAATTGCTGTGGAGCACCGGAAAAGCGGCG
TGGATCGCTGGTACGACGTTTCTCATCCTCGTTGTTCCGTTGATCATCGAGATGGATCGT
GAAGCGCAGCTCAACGAAATAGATCTTCAACAGGCTAGTCTCCTCGGAGCTCCGGCGCAG
CCTATGCAAAGGGGTTTCTAGTTAAACCCTATGAACTGAGGGTTCTTGCTGTTTTGTCTG
GTTTTTTTT*CTTTTACTAGTTTCTATTGTGGTTTTGTCGGATTTGGATTCTTATAACAT
GTTGTGATT
CC

QA 1 489 1 489
DS 

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GG
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TCTTTTACTAGTTTCTATTGTGGTTTTGTCGGATTTGGATTCTTATAACATGTTGTGATT
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ACACCTCTGTTTCGATGCTAGAATTATTTGGG

QA 3 574 3 574
DS 

RD RS1G782TF 574 0 0
GG
GCTCTCACCTCCTCTTTTCCGCAAAGCGCTTCACAAGCCAAAGAAAAAAA**GTCAATAT
CAGTGGTGGATGATGGCGAGGAGAATCGGTGGAACCGGGAAAAATAGGGGGGAAGACTCA
ACCATCTTGGGGAGGATCTCCAACTCCGAGATCGTATCTCACGGAAGACGCGCCGCCGGA
GAAGCCGTCGGAGTGTCGAAGAAATTGCTGTGGAGCACCGGAAAAGCGGCGTGGATCGCT
GGTACGACGATTCTCATCCTCGTTGTTCCGTTGATCATCGAGATGGATCGTGAAGCGCAG
CTCAACGAAATAGATCTTCAACAGGCTAGTCTCCTCGGAGCTCCGGCGCAGCCTATGCAA
AGGGGTTTCTAGTTAAACCCTATGAACTGAGGGTTCTTGCTGTTTTGTCTGTTTTTTTTT
TCTTTTACTAGTTTCTATTGTGGTTTTGTCGGATTTGGATTCTTATAACATGTTGTGATT
TCTTTGAATGGCTTAACCTGCTTAAAACATTGATGGTGTTCGTCTTCACGTTATCATTAA
ACACCTCTGTTTCGATGCTAGAATTATTTGGG

QA 3 574 3 574
DS 



AS 1 3

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1G271TF U 1
AF RS1DY26JQ C 17
AF RS1DY26TF U 17
BS 1 87 RS1G271TF
BS 88 88 RS1DY26TF
BS 89 218 RS1G271TF
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BS 220 674 RS1G271TF
BS 675 675 RS1DY26TF
BS 676 702 RS1G271TF

RD RS1G271TF 702 0 0
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GAATGACTCGCCGTGACCATTCTGATGTGTCCAACCAGTTGTACGCAAACTATGCCATCG
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TGCTGTATTTAGAGTTTCTGGACAAATTTGAGAGGAAGTTTGTGATGCAAGGAGCATACG
ATACAAGAAACATCTTCCAGTCACTTGATTTGGCATGGACACTGCTCCGTATCTTCCCAC
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CTAGCTAAGCCTTTTAAAGGAACCTCCTTGCTGCTCCCTTCTCATCTTATTTGGAACTTA
AATCATGTCGAGAGAAGAAAAAACTCAGAGATTCGTGAATTTGGGATTTATTCTTTTGCT
TCTTTTTTTCACTTGTATTTACAATAAAGGCTTGTGTAGGGAGACTTCGTACCAAACCGC
TATTTATAAGCCTGTTTATGTTTGTGTTTTTGTCTTCCAAACTGGGTGAATCATGTCTTT
TTTGCTGCTGTGTA*TAAGATCTATCCCCTATATATATGTGC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RS1DY26JQ 675 0 0
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TCTGGACAAATTTGAGAGGAAGTTTGTGATGCAAGGAGCATACGATACAAGAAACATCTT
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AAGGAACCTCCTTGCTGCTCCCTTCTCATCTTATTTGGAACTTAAATCATGTCGAGAGAA
GAAAAAACTCAGAGATTCGTGAATTTGGGATTTATTCTTTTGCTTCTTTTTTTCACTTGT
ATTTACAATAAAGGCTTGTGTAGGGAGACTTCGTACCAAACCGCTATTTATAAGCCTGTT
TATGTTTGTGTTTTTGTCTTCCAAACTGGGTGAATCATGTCTTTTTTGCTGCTGTGTA
ATAAGGATCTATTCCCT

QA 1 658 1 658
DS 

RD RS1DY26TF 674 0 0
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CCATTCTGATGTGTCCAACCAGTTGTACGCAAACTATGCCATCGGTAAGGATGTTCAAGC
CATGAAAGCTGTAGTTGGAGAATAAGCTCTGTCTTCAGAAGATCTGCTGTATTTAGAGTT
TCTGGACAAATTTGAGAGGAAGTTTGTGATGCAAGGAGCATACGATACAAGAAACATCTT
CCAGTCACTTGATTTGGCATGGACACTGCTCCGTATCTTCCCACGTGAGCTTCTTCACCG
TATCCCTGCCAAAACACTTGATCAGTTCTACAGCCGCGACTCCACTAGCTAAGCCTTTTA
AAGGAACCTCCTTGCTGCTCCCTTCTCATCTTATTTGGAACTTAAATCATGTCGAGAGAA
GAAAAAACTCAGAGATTCGTGAATTTGGGATTTATTCTTTTGCTTCTTTTTTTCACTTGT
ATTTACAATAAAGGCTTGTGTAGGGAGACTTCGTACCAAACCGCTATTTATAAGCCTGTT
TATGTTTGTGTTTTTGTCTTCCAAACTGGGTGAATCATGTCTTTTTTGCTGCTGTGTAAT
AAGATCTATTCCCT

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 3

CO CL3895Contig1 889 3 5 U
GGATCAAACCGGTTAATAGATTTTCTGAGAAGCAGGACACATATCTTGAAACACATGGCA
GCGATTTCTCCATGGCTTTCTTCTCCACAGAGCTTCTCGAGTCCCCGCGTTTCCACTCGG
TATAGTAAGATCACTACATGTCCTCAATCCTTCTCAGCAAGATGCACATCACTTCCTCCT
GCTGTCGTCGTCTCTGCTCTCGACAGTTCCATCGAGGAACAACATCAGATACTGCCAAGA
GATGAGGTTGGGATGAAGAGAAGGGAAGTCATGTTGAACATAGCTTCTTCCTCTGCTTTC
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AAACCAGCAGGAGTTACTGCGAAGCTAGTTGATAGCAGATCTTCCAAAGGGTTCTATTAC
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ATGGCAACTAACGGTTGGTACAACCGTTTATACACTGTCACTGGACAATTTAATGACGAA
GAATCTGCTGATCAAAGCTCCAAGATCCAGAAGGCAGTCAAGTCTTTCAAATTCATCTGA
GAATATCATTCCCCTCACATTGATAAAACATTTTGTTTACTGAACAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1G790TF U 1
AF RS1B389TF U 212
AF RS1G790JQ C 601
BS 1 609 RS1G790TF
BS 610 610 RS1B389TF
BS 611 671 RS1G790TF
BS 672 863 RS1B389TF
BS 864 889 RS1G790JQ

RD RS1G790TF 671 0 0
GGATCAAACCGGTTAATAGATTTTCTGAGAAGCAGGACACATATCTTGAAACACATGGCA
GCGATTTCTCCATGGCTTTCTTCTCCACAGAGCTTCTCGAGTCCCCGCGTTTCCACTCGG
TATAGTAAGATCACTACATGTCCTCAATCCTTCTCAGCAAGATGCACATCACTTCCTCCT
GCTGTCGTCGTCTCTGCTCTCGACAGTTCCATCGAGGAACAACATCAGATACTGCCAAGA
GATGAGGTTGGGATGAAGAGAAGGGAAGTCATGTTGAACATAGCTTCTTCCTCTGCTTTC
TTACTTCCATCCATCGTTTCACCTGCATTTGCAGAGACAAATGCATCGGAGGCTTTCCGT
GTGTACACAGATGAAGCTAACAAGTTCGAGATATCAATTCCACAAGACTGGCAAGTCGGA
CAAGCAGCAGAACCTAACGGGTTCAAGTCAATCACAGCTTTTTACCCTGATGAAACTTCA
TCATACAATGTGAGCGTAGCGATCACTGGACTAGGTCCAGATTTCACTAGGATGGAATCT
TTTGGAAAGGTCGAAGCTTTTGCAGAAACACTGGTCAGTGGATTGGATAGAAGCTGGCAG
AAACCAGCACGAGTTACTGCGAAGCTAGTTGATAGCAGATCTTCCAAAGGGTTCTATTAC
ATTGAGTATAC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1B389TF 652 0 0
G
CGAGGAACAACATCAGATACTGCCAAGAGATGAGGTTGGGATGAAGAGAAGGGAAGTCAT
GTTGAACATAGCTTCTTCCTCTGCTTTCTTACTTCCATCCATCGTTTCACCTGCATTTGC
AGAGACAAATGCATCGGAGGCTTTCCGTGTGTACACAGATGAAGCTAACAAGTTCGAGAT
ATCAATTCCACAAGGCTGGCAAGTCGGACAAGCAGCAGAACCTAACGGGTTCAAGTCAAT
CACAGCTTTTTACCCTGATGAAACTTCATCATACAATGTGAGCGTAGCGATCACTGGACT
AGGTCCAGATTTCACTAGGATGGAATCTTTTGGAAAGGTCGAAGCTTTTGCAGAAACACT
GGTCAGTGGATTGGATAGAAGCTGGCAGAAACCAGCAGGAGTTACTGCGAAGCTAGTTGA
TAGCAGATCTTCCAAAGGGTTCTATTACATTGAGTATACATTACAAAACCCTGGAGAAGC
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CACTGTCACTGGACAATTTAATGACGAAGAATCTGCTGATCAAAGCTCCAAGATCCAGAA
GGCAGTCAAGTCTTTCAAATTCATCTGAGAATATCATTCCCCTCACATTGA

QA 2 652 2 652
DS 

RD RS1G790JQ 289 0 0
AAACCAGCAGGAGTTACTGCGAAGCTAGTTGATAGCAGATCTTCCAAAGGGTTCTATTAC
ATTGAGTATACATTACAAAACCCTGGAGAAGCTCGTAAGCATTTGTACTCTGCAATTGGG
ATGGCAACTAACGGTTGGTACAACCGTTTATACACTGTCACTGGACAATTTAATGACGAA
GAATCTGCTGATCAAAGCTCCAAGATCCAGAAGGCAGTCAAGTCTTTCAAATTCATCTGA
GAATATCATTCCCCTCACATTGATAAAACATTTTGTTTACTGAACAATT

QA 1 289 1 289
DS 



AS 1 2

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CGTCATAAAGGGACGTCCCTGCAAGGTAGTTGAGGTTTCGACTTCCAAGACTGGAAAGCA
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GTATAGAGGATACTATCATTATCATTTTGACAGAGTCAAATGTTTTATAAGAAAAAGTTC
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AGACACACCTTATCTTATCTTACTGATTTGGCC


BQ
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AF RS1FC42TF U 1
AF RS1FC42JQ C 1
BS 1 584 RS1FC42TF
BS 585 753 RS1FC42JQ

RD RS1FC42TF 584 0 0
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TGTGTGTGGATCAAATCGGTGGAAGATGTCGGACGAGGAGCACCACTTTGAGTCAAGCGA
CGCTGGAGCTTCAAAGACCTATCCTCAGCAAGCTGGTAACATCCGTAAGGGCGGCTACAT
CGTCATAAAGGGACGTCCCTGCAAGGTAGTTGAGGTTTCGACTTCCAAGACTGGAAAGCA
CGGTCACGCCAAGTGTCACTTTGTTGCTATCGATATCTTCACTTCTAAGAAGCTAGAAGA
TATTGTTCCTTCTTCCCACGACTGTGATGTTCCACATGTGAACCGTACTGACTATCAGTT
GATTGATATCTCTGAAGATGGCTTTGTCAGTCTTCTTACTGACAATGGTAGCACTAAGGA
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GAAGGAAGTTGCTCCCAAGTAACAATAATGATAAAGTGTGCATT

QA 1 584 1 584
DS 

RD RS1FC42JQ 753 0 0
GGTTCAAAAGGTTCTATAAAAACTGAATGTCACTCGATTGACTTTGCCACAACGTTTTCG
TGTGTGTGGATCAAATCGGTGGAAGATGTCGGACGAGGAGCACCACTTTGAGTCAAGCGA
CGCTGGAGCTTCAAAGACCTATCCTCAGCAAGCTGGTAACATCCGTAAGGGCGGCTACAT
CGTCATAAAGGGACGTCCCTGCAAGGTAGTTGAGGTTTCGACTTCCAAGACTGGAAAGCA
CGGTCACGCCAAGTGTCACTTTGTTGCTATCGATATCTTCACTTCTAAGAAGCTAGAAGA
TATTGTTCCTTCTTCCCACGACTGTGATGTTCCACATGTGAACCGTACTGACTATCAGTT
GATTGATATCTCTGAAGATGGCTTTGTCAGTCTTCTTACTGACAATGGTAGCACTAAGGA
TGATCTCAAGCTCCCAACAGATGAAACTCTCCTCACACAGCTCAAGTCTGGATTTGAAGA
GGGAAAGGATATAGTTGTGTCTGTCATGTCTGCAATGGGAGAGGAGCAGATGTGTGCCCT
GAAGGAAGTTGCTCCCAAGTAACAATAATGATAAAGTGTGCATTCCCCTCTGCTCTACTA
GTATAGAGGATACTATCATTATCATTTTGACAGAGTCAAATGTTTTATAAGAAAAAGTTC
GGTCTTTTCTTCTTCTTAATCTTCATAATAAATATTTTAAAGCCCAATGTTTCATGCAAA
AGACACACCTTATCTTATCTTACTGATTTGGCC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 3

CO CL3897Contig1 1133 3 10 U
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GCTGTGCCGTGTTTTGCATTATCCAAGAATGATTCCTATGTGATGTCAGCATCTGGAGGA
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CCTGCTGCAACGTTTCCGGCTTTTCACCCTCAGGACAACAATATAATTGCAATTGGAATG
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GGACATTCCAAGAGAATAACCGGCCTCGCCTTCTCCAACGTGCTAAACGTTCTGGTTTCG
TCTGGAGCAGACGCTCAGATTTGTGTATGGAACACCGATGGATGGGAGAAGCAGAGGAGC
AAGGTTCTGCAAGTTCCACAGGGAAGATCAACGGGTGCTCTTTCAGACACGCGTGTTCAG
TTTCATCAAGATCAAGTACACTTCCTCGTGGTCCATGAAACTCAGCTCGCTATATACGAA
ACAACCAAGCTTGAATGCATGAAACAGTGGCCTGTGCGTGAATCATTAGCTCCAATCACA
TATGCCACATTCCCATGTGATAGCCAATTGATATACGCAAGTTTCATGGATGCTACAATA
TGTGTCTTCACCTCTGCAAACCTTCGACTGCGTTGCAGAGTCAATCCCTCTGCTTATCTG
CCTGCTTCTTTCAGCAACTCGAACGTCCACCCGCTGGTGATAGCAGCTCATCCGCAAGAA
TCCAATATGTTTGCTGTGGGTCTTTCAGACGGTGGGGTCCATATATTTGAGCCGCTCGAG
TCGGAAGGTAAATGGGGAGTGGCTCCACCACCTGAGAATGGCTCATCCAGCGCTTTGGCG
TCTACACCTTCCGTTGGAGCTTCCGCATCCGATCAGCCTCAGAGATGATGATATATGAGA
CAGAACCTGCTCCAGTATGTTTATTTTTGTTTGTTTGGGAAGAAAGCATTCTAGCAAGGG
TGAGTGTATTAATGTAACATAAATATCTATAGCAAGGTGAAACAGTTTCCTAATTGGTTG
ATTCGTTGGTACTTTTGTTTTTGAATAGTGAATAATCGTTGTTGCTTGCTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EK91TF U 63
AF RS1ER29TF U 1
AF RS1ER29JQ C 404
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G
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CCTGCTGCAACGTTTCTGGCTTTTCACCCTCAGGACAACAATATAATTGCAATTGGAATG
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AGTTTCCTAATTGGTTGATTCGTTGGTACTTTTGTTTTTGAATAGTGAATAATCGTTGTT
GCTTGCTTCT

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 3

CO CL3898Contig1 967 3 27 U
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CATTGTAAAGTAAATTACCGAAAGACTAATATGTATATGCAATTTATCATATGGTATCTT
CTTCTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1EK76TF U 1
AF RS1GR85TF U 1
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TCGTCCATCTTCGATGTTCCTGTGTGGTCCATGTACTGCAACGGACGGAAGATGGGGTTT
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TTGTGCCGTTGGATGAGGAGGAGCAGACGCTTTACTTGAGAGCGAGGTTCGAGCGAGTCA
CTGGGTCGAGTGACTCGGAATCGTTTCATATGATGAATCCTGGTGGTAGTTATGGACAGG
AGCTTAGTATATTTCTTTTGAGATCTTGAGATGCTGAGTATAGTTTGATTATATTATATT
GAGATTCTTGTCAGCTTTCGTGTTTCCTTTTTTAAATTCATGTACATTGTAAAGTAAATT
ACCGAAAGACTAATATGTATATGCAATTTATCATATGGTATCTTCTTCTCC

QA 1 531 1 531
DS 



AS 1 2

CO CL3899Contig1 530 2 2 U
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CAGAAGAAGAAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCAAAAGGAGAAGGTGAACAACATGGTGTTG
TTTGATCAGGCTACTTACGACAAGCTTCTCACTGAAGCTCCCAAGTTCAAGCTCATCACC
CCTTCCATTCTCTCCGACCGTATGAGGATCAACGGGTCTCTAGCAAGGAAGGCCATCAGG
GAGTTAATGGCAAAAGGTGTGATCAGGATGGTCGCTGCTCACTCTAGCCAGCAGATCTAC
ACTCGTGCCACCAACACCTAAACAAATTTGCTTTTGTCAATGGTTTGATACTTCTTTTCG
CTCCTTTGTACTCGAGAAACTCTTTTAGAATGCTTTTTGGATGTTTTGTCTACTTAATTT
TGAACCATTTTCTATTTTTGCTCTCAGTAGTCTTATCATAATTTCATTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1H171JQB C 1
AF RS1H171TF U 1
BS 1 8 RS1H171JQB
BS 9 530 RS1H171TF

RD RS1H171JQB 530 0 0
GGTCCCGAGAGCTTCTTCATATTTCGGCCTCTAATCTACTCAACATTCAACATCATGGCG
CCAAAGAAGGATAAGGTTCCGCCGCCGTCATCGAAGCCGGCCAAATCCGGAGGTGGAAAA
CAGAAGAAGAAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCAAAAGGAGAAGGTGAACAACATGGTGTTG
TTTGATCAGGCTACTTACGACAAGCTTCTCACTGAAGCTCCCAAGTTCAAGCTCATCACC
CCTTCCATTCTCTCCGACCGTATGAGGATCAACGGGTCTCTAGCAAGGAAGGCCATCAGG
GAGTTAATGGCAAAAGGTGTGATCAGGATGGTCGCTGCTCACTCTAGCCAGCAGATCTAC
ACTCGTGCCACCAACACCTAAACAAATTTGCTTTTGTCAATGGTTTGATACTTCTTTTCG
CTCCTTTGTACTCGAGAAACTCTTTTAGAATGCTTTTTGGATGTTTTGTCTACTTAATTT
TGAACCATTTTCTATTTTTGCTCTCAGTAGTCTTATCATAATTTCATTCG

QA 1 530 1 530
DS 

RD RS1H171TF 530 0 0
GGTCCCGA
GAGCTTCTTCATATTTCGGCCTCTAATCTACTCAACATTCAACATCATGGCGCCAAAGAA
GGATAAGGTTCCGCCGCCGTCATCGAAGCCGGCCAAATCCGGAGGTGGAAAACAGAAGAA
GAAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCAAAAGGAGAAGGTGAACAACATGGTGTTGTTTGATCA
GGCTACTTACGACAAGCTTCTCACTGAAGCTCCCAAGTTCAAGCTCATCACCCCTTCCAT
TCTCTCCGACCGTATGAGGATCAACGGGTCTCTAGCAAGGAAGGCCATCAGGGAGTTAAT
GGCAAAAGGTGTGATCAGGATGGTCGCTGCTCACTCTAGCCAGCAGATCTACACTCGTGC
CACCAACACCTAAACAAATTTGCTTTTGTCAATGGTTTGATACTTCTTTTCGCTCCTTTG
TACTCGAGAAACTCTTTTAGAATGCTTTTTGGATGTTTTGTCTACTTAATTTTGAACCAT
TTTCTATTTTTGCTCTCAGTAGTCTTATCATAATTTCATTCG

QA 9 530 9 530
DS 



AS 1 3

CO CL3900Contig1 719 3 5 U
GGACGTGAAGAACAATCTCCACCTCAGCTTCGGGAGAAGGAAAGACATGAGCCAAAAGAA
GCAGAGGAGAAGCTTTCCTCTGTTCCTACAACAACCTCTCAAGAACCAGACCTTGAGAAG
CCTGAAACTGACAACCAACAACCAAACTTATTAGTGGGAGATTCTTTGGAAGACAACAAA
CTTATCTCCAGTGGATTTGGAGAGACGAGTTTCTCAGCAGCAGAAGCAGTTTCAATCTCA
GGTCATATAACGTACACAGGACCAATTGCATTCTCTGGAAGCCTCTCTGTTCGTTCTGAT
GCAAGCACAACAAGTGGAAGATCCTTTGCTTTCCCAGTATTACAGTCAGAATGGAACAGT
AGTCCTGTAAGAATGGCCAAACCAGAGAAGAGAAGACAGAAAGGATGGAGACAGATTCTC
CTTTGCTGTAGATCCTCTTGATGAACTACTTCAAAAGCTACTTTACTTTGAAGCTCAGAG
GAAGAAGGAGATATGACATTTTACAATATTTTTCTTTTAAAAGGGATGTTTTATATTTTA
AATGCTGAAGTAAATATTTTTCTCTTTTTTTTGGGTGGTTTATAGTTATGCCATGGTGTG
TGTAGTTGGCATTTTGGAAGTAGTATTAACAGCTAGGTGGTTTTGATATTGGTTAAAGAT
GCAACATGGTCGGTGTTATGTAACCGATGAGTTTATTATAACTTCATTTTCATTCATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RS1AQ44TFB U 1
AF RS1B572JQ C 36
AF RS1B572TF U 36
BS 1 419 RS1AQ44TFB
BS 420 420 RS1B572TF
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BS 640 640 RS1B572TF
BS 641 719 RS1AQ44TFB

RD RS1AQ44TFB 719 0 0
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GCAGAGGAGAAGCTTTCCTCTGTTCCTACAACAACCTCTCAAGAACCAGACCTTGAGAAG
CCTGAAACTGACAACCAACAACCAAACTTATTAGTGGGAGATTCTTTGGAAGACAACAAA
CTTATCTCCAGTGGATTTGGAGAGACGAGTTTCTCAGCAGCAGAAGCAGTTTCAATCTCA
GGTCATATAACGTACACAGGACCAATTGCATTCTCTGGAAGCCTCTCTGTTCGTTCTGAT
GCAAGCACAACAAGTGGAAGATCCTTTGCTTTCCCAGTATTACAGTCAGAATGGAACAGT
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CTTTGCTGTAGATCCTCTTGATGAACTACTTCAAAAGCTACTTTACTTTGAAGCTCAGAG
GAAGAAGGAGATATGACATTTTACAATATTTTTCTTTTAAAAGGGATGTTTTATATTTTA
AATGCTGAAGTAAATATTTTTCTCTTTTTTTTGGGTGGTTTATAGTTATGCCATGGTGTG
TGTAGTTGGCATTTTGGAAGTAGTATTAACAGCTAGGTGTTTTTGATATTGGTTAAAGAT
GCAACATGGTCGGTGTTATGTAACCGATGAGTTTATTATAACTTCATTTTCATTCATGC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RS1B572JQ 670 0 0
GAAGGAAAGACATGAGCCAAAAGAAGCAGAGGAGAAGCTTTCCTCTGTTCCTACAACAAC
CTCTCAAGAACCAGACCTTGAGAAGCCTGAAACTGACAACCAACAACCAAACTTATTAGT
GGGAGATTCTTTGGAAGACAACAAACTTATCTCCAGTGGATTTGGAGAGACGAGTTTCTC
AGCAGCAGAAGCAGTTTCAATCTCAGGTCATATAACGTACACAGGACCAATTGCATTCTC
TGGAAGCCTCTCTGTTCGTTCTGATGCAAGCACAACAAGTGGAAGATCCTTTGCTTTCCC
AGTATTACAGTCAGAATGGAACAGTAGTCCTGTAAGAATGGCCAAACCAGAGAAGAGAAG
ACAGAAAGGATGGAGACAGATTCTCCTTTGCTGTAGATCCTCTTGATGAACTACTTCAAA
AGCTACTTTACTTTGAAGCTCAGAGGAAGAAGGAGATATGACATTTTACAATATTTTTCT
TTTAAAAGGGATGTTTTATATTTTAAATGCTGAAGTAAATATTTTTCTCTTTTTTTTGGG
TGGTTTATAGTTATGCCATGGTGTGTGTAGTTGGCATTTTGGAAGTAGTATTAACAGCTA
GGTGGTTTTGATATTGGTTAAAGATGCAACATGGTCGGTGTTATGTAACCGATGAGTTTA
TTATAACTTC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RS1B572TF 680 0 0
GAAGGAAAGACATGAGCCAAAAGAAGCAGAGGAGAAGCTTTCCTCTGTTCCTACAACAAC
CTCTCAAGAACCAGACCTTGAGAAGCCTGAAACTGACAACCAACAACCAAACTTATTAGT
GGGAGATTCTTTGGAAGACAACAAACTTATCTCCAGTGGATTTGGAGAGACGAGTTTCTC
AGCAGCAGAAGCAGTTTCAATCTCAGGTCATATAACGTACACAGGACCAATTGCATTCTC
TGGAAGCCTCTCTGTTCGTTCTGATGCAAGCACAACAAGTGGAAGATCCTTTGCTTTCCC
AGTATTACAGTCAGAATGGAACAGTAGTCCTGTAAGAATGGCCAAACCAGAGAAGAGAAG
ACAGAAAGGATGGAGACAGATTCTCCTTTGCTGTAGATCCTCTTGATGAACTACTTCAAA
AGCTACTTTACTTTGAAGCTCAGAGGAAGAAGGAGATATGACATTTTACAATATTTTTCT
TTTAAAAGGGATGTTTTATATTTTAAATGCTGAAGTAAATATTTTTCTCTTTTTTTTGGG
TGGTTTATAGTTATGCCATGGTGTGTGTAGTTGGCATTTTGGAAGTAGTATTAACAGCTA
GGTGGTTTTGATATTGGTTAAAGATGCAACATGGTCGGTGTTATGTAACCGATGAGTTTA
TTATAACTTCATTTTCATTC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 3

CO CL3901Contig1 1195 3 5 U
GGAAATTAAAAGCAAAAACCTCTCTGCCATCTCTCTGTTCTCACCCCAAAATGGCCTATA
CTCACCGTTTCGCTATTCTTCTCATCCTCCTCTCCGCCACCGTCGGCTTCTCCTCCGCCG
CGTTGGTGGAAGAGCAGCCTCTCGTGCTCAAGTACCACAACGGCATTCTCCTGAAAGGAA
ACGTCACTCTCAACCTCGTTTGGTACGGGAAGTTCACCTCGATCCAACGCTCCATCGTCG
TCGACTTCATCCGCTCTCTCAGCTCCTCCGCCGTCGCAGCAAAAGGTCCATCCGTCGCTT
CGTGGTGGAAGACGACGGAGAAGTACAAAGGCGGCTCGTCGAATATCGTTGTCGGGAAAC
AGCTCCTCCTCGAGAACTACCCACTCGGAAAATCCTTGAAGAATCCTTACCTCAGAGCTC
TGTCGGGGAAGCTCAACGGAGGAGGGGGCGTTCGGTCGATAACCGTCGTTATAACGGCGA
AAGACGTCGCCGTCGAAGGGTTCTGCATGAACCGGTGCGGGACTCACGGCGCGAAGGCCC
GTTCCGTCAACAGCGGAGCTTACGTCTGGGTCGGTAACTCTGAGACGCAGTGTGCTGGCT
ACTGCGCGTGGCCATTTCGTCAGCCTATCTACGGACCTCAGTCTCCGCCTTTGATCGCGC
CTAACGGAGACGTCGGTGTCGACGGGATGATTATAAACCTAGCGACTCTACCGGTTAACA
CCGTCACGAACCCGTTTAAAACCGGTTACTTTGATGCCGAGGATCAAGAGGCCGTCTCGG
TCTGTACCGGGAAGTTCGGGTCCGGTGCTTACCCGGGCTACGCGGGTCGGGTTCTCGTGG
ACAAGACTACCGGGGCTAGTTACAACGCTCTAGGTCTCGCCGGGAGGAAATATCTTTTGC
CAGCGATGTGGGACCCGCAGACTTCGAAGTGTAAGACTTTGGTTTGAGTTTAGACTGTCT
GGAAATTGACACGTGGCAATAAATCAATGGAGATGGCGAGTTGAAGCTTATCGGAGCCAA
AGAAAAGCTGTGTAGATATCTATCTTGTCTGATTGTACGGAAGAGTTTGGGGAAAGGGGA
TGTGTTTCCTTTGTCGTTTTGTGTGACGTGTACATTCGATCCTGGAGATGTGTGAAATGA
TGGTTTATATATCTAATTTAATGCCGATAATAAAATCGATTTGTAGTTTCCCCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CA86TF U 1
AF RS1CA86JQ C 415
AF RS1GQ20TF U 475
BS 1 660 RS1CA86TF
BS 661 661 RS1GQ20TF
BS 662 687 RS1CA86TF
BS 688 1172 RS1GQ20TF
BS 1173 1195 RS1CA86JQ

RD RS1CA86TF 687 0 0
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CTCACCGTTTCGCTATTCTTCTCATCCTCCTCTCCGCCACCGTCGGCTTCTCCTCCGCCG
CGTTGGTGGAAGAGCAGCCTCTCGTGCTCAAGTACCACAACGGCATTCTCCTGAAAGGAA
ACGTCACTCTCAACCTCGTTTGGTACGGGAAGTTCACCTCGATCCAACGCTCCATCGTCG
TCGACTTCATCCGCTCTCTCAGCTCCTCCGCCGTCGCAGCAAAAGGTCCATCCGTCGCTT
CGTGGTGGAAGACGACGGAGAAGTACAAAGGCGGCTCGTCGAATATCGTTGTCGGGAAAC
AGCTCCTCCTCGAGAACTACCCACTCGGAAAATCCTTGAAGAATCCTTACCTCAGAGCTC
TGTCGGGGAAGCTCAACGGAGGAGGGGGCGTTCGGTCGATAACCGTCGTTATAACGGCGA
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GTTCCGTCAACAGCGGAGCTTACGTCTGGGTCGGTAACTCTGAGACGCAGTGTGCTGGCT
ACTGCGCGTGGCCATTTCGTCAGCCTATCTACGGACCTCAGTCTCCGCCTTTGATCGCGC
*TAACGGAGACGTCGGTGTCGACGGGA

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1CA86JQ 781 0 0
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CGGCGAAAGACGTCGCCGTCGAAGGGTTCTGCATGAACCGGTGCGGGACTCACGGCGCGA
AGGCCCGTTCCGTCAACAGCGGAGCTTACGTCTGGGTCGGTAACTCTGAGACGCAGTGTG
CTGGCTACTGCGCGTGGCCATTTCGTCAGCCTATCTACGGACCTCAGTCTCCGCCTTTGA
TCGCGCCTAACGGAGACGTCGGTGTCGACGGGATGATTATAAACCTAGCGACTCTACTGG
TTAACACCGTCACGAACCCGTTTAAAACCGGTTACTTTGATGCCGGGGATCAAGAGGCCG
TCTCGGTCTGTACCGGGAAGTTCGGGTCCGGTGCTTACCCGGGCTACGCGGGTCGGGTTC
TCGTGGACAAGACTACCGGGGCTAGTTACAACGCTCTGGGTCTCGCCGGGAGGAAATATC
TTTTGCCAGCGATGTGGGACCCGCAGACTTCGAAGTGTAAGACTTTGGTTTGAGTTTAGA
CTGTCTGGAAATTGACACGTGGCAATAAATCAATGGAGATGGCGAGTTGAAGCTTATCGG
AGCCAAAGAAAAGCTGTGTAGATATCTATCTTGTCTGATTGTACGGAGGAGTTTGGGGAA
*GGGGATGTGTTTCCTTTGTCGTTTTGTGTGACGTGTACATTCGATCCTGGAGATGTGTG
AAATGATGGTTTATATATCTAATTTAATGCCGATAATAAAATCGATTTGTAGTTTCCCCC
G

QA 1 781 1 781
DS 

RD RS1GQ20TF 698 0 0
G
GGCGAAAGACGTCGCCGTCGAAGGGTTCTGCATGAACCGGTGCGGGACTCACGGCGCGAA
GGCCCGTTCCGTCAACAGCGGAGCTTACGTCTGGGTCGGTAACTCTGAGACGCAGTGTGC
TGGCTACTGCGCGTGGCCATTTCGTCAGCCTATCTACGGACCTCAGTCTCCGCCTTTGAT
CGCGCCTAACGGAGGCGTCGGTGTCGACGGGATGATTATAAACCTAGCGACTCTACCGGT
TAACACCGTCACGAACCCGTTTAAAACCGGTTACTTTGATGCCGAGGATCAAGAGGCCGT
CTCGGTCTGTACCGGGAAGTTCGGGTCCGGTGCTTACCCGGGCTACGCGGGTCGGGTTCT
CGTGGACAAGACTACCGGGGCTAGTTACAACGCTCTAGGTCTCGCCGGGAGGAAATATCT
TTTGCCAGCGATGTGGGACCCGCAGACTTCGAAGTGTAAGACTTTGGTTTGAGTTTAGAC
TGTCTGGAAATTGACACGTGGCAATAAATCAATGGAGATGGCGAGTTGAAGCTTATCGGA
GCCAAAGAAAAGCTGTGTAGATATCTATCTTGTCTGATTGTACGGAAGAGTTTGGGGAAA
GGGGATGTGTTTCCTTTGTCGTTTTGTGTGACGTGTACATTCGATCCTGGAGATGTGTGA
AATGATGGTTTATATATCTAATTTAATGCCGATAATA

QA 2 698 2 698
DS 



AS 1 3

CO CL3902Contig1 677 3 1 U
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CTTACCTGTCGGGAACAAAACAACAAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAAGCTTTTCTAA
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TCTTAGCTGGTACTTGCCACAGTGCCAAGATGCAGAGGACCATTATCGTGCTAAGGAACT
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TCTCAAAGAAGGCTTTCACTGGAATGTAAGGAGGGATTTTCTTGGATAGTGTTGAGATCT
ACTACTATTTTATCCATTTTATCTATGGAGAATTTCACATTGAATTTTCAAGATTTTAAT
GCACTAAGATTTTGTCT


BQ
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AF RS1ES69TF U 6
AF RS1FL26TF U 1
AF RS1FL26JQ C 27
BS 1 677 RS1FL26TF

RD RS1ES69TF 561 0 0
GG
ATGAAAGCATAAAGCCGTCGCTGCCGCTCTATCCGTCCCCTCTCTACTACATTCTTGCCT
GTCGGGAACAAAACAGCA*GCCATGGCGGAACAGACTGAGAAAGCTTTTCTAAAGCAACC
CAAGGTCTTCCTCAGCTCCAAGACATCAGGCAAGGGAAAGCGACCTGGGAAGGGTGGAAA
CAGATTTGTGAAGAACATCGGCTTGGGCTTCAAGACTCCTCGCGAAGCCATTTCAGGAAC
TTACATTGACAGTAAATGTCCCTTCACTGGAACTGTATCTATTAGAGGCCGTATCTTAGC
TGGTACTTGCCACAGTGCCAAGATGCAGAGAACCATTATCGTGCGAAGGAATTACCTTCA
CTTTGTCAAGAAGTACCAGAGGTATGAGAAGAGGCATTCGAACATCCCAGCTCATGTCTC
ACCTTGTTTCCGTGTCAAGGAAGGTGACCATGTCATCATTGGCCAATGCAGGCCATTGTC
CAAGACTGTGAGGTTCAATGTGTTTAAGGTGATACCAGCCGGTGCTTCTGCTTTCTCAAA
GAAGGCTTTCACTGGAATG

QA 3 561 3 561
DS 

RD RS1FL26TF 677 0 0
GGGTTTCATGAAAGCATAAAGCCGTCGCTGCCGCTCTATCCGTCCCCTCTCTACTACATT
CTTACCTGTCGGGAACAAAACAACAAGCCATGGCGGAACAGACTGAGAAAGCTTTTCTAA
AGCAACCTAAGGTCTTCCTCAGCTCCAAGACATCAGGCGAGGGAAAGCGACCTGGGAAGG
GTGGAAACAGATTTGTGAAGAACATCGGCTTGGGCTTCAAGACTCCTCGCTAAGCCATTT
CAGGAACTTACATTGACAGTAAATGTCCCTTCACTGGAACTGTTTCTATTAGAGGCCGTA
TCTTAGCTGGTACTTGCCACAGTGCCAAGATGCAGAGGACCATTATCGTGCTAAGGAACT
ACCTTCACTTTGTCAAGAAGTATCAGAGGTATGAGAAGAGGCATTCGAACATCCCAGCTC
ATGTCTCACCTTGCTTCCGTGTCAAGGAAGGCGACCATGTCATCATTGGCCAATGCAGGC
CATTGTCCAAGACTGTGAGGTTCAATGTGTTGAAGGTGATACCAGCTGGTGCTTCTGCTT
TCTCAAAGAAGGCTTTCACTGGAATGTAAGGAGGGATTTTCTTGGATAGTGTTGAGATCT
ACTACTATTTTATCCATTTTATCTATGGAGAATTTCACATTGAATTTTCAAGATTTTAAT
GCACTAAGATTTTGTCT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RS1FL26JQ 651 0 0
GCTGCCGCTCTATCCGTCCCCTCTCTACTACATTCTTACCTGTCGGGAACAAAACAACAA
GCCATGGCGGAACAGACTGAGAAAGCTTTTCTAAAGCAACCTAAGGTCTTCCTCAGCTCC
AAGACATCAGGCGAGGGAAAGCGACCTGGGAAGGGTGGAAACAGATTTGTGAAGAACATC
GGCTTGGGCTTCAAGACTCCTCGCTAAGCCATTTCAGGAACTTACATTGACAGTAAATGT
CCCTTCACTGGAACTGTTTCTATTAGAGGCCGTATCTTAGCTGGTACTTGCCACAGTGCC
AAGATGCAGAGGACCATTATCGTGCTAAGGAACTACCTTCACTTTGTCAAGAAGTATCAG
AGGTATGAGAAGAGGCATTCGAACATCCCAGCTCATGTCTCACCTTGCTTCCGTGTCAAG
GAAGGCGACCATGTCATCATTGGCCAATGCAGGCCATTGTCCAAGACTGTGAGGTTCAAT
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TAAGGAGGGATTTTCTTGGATAGTGTTGAGATCTACTACTATTTTATCCATTTTATCTAT
GGAGAATTTCACATTGAATTTTCAAGATTTTAATGCACTAAGATTTTGTCT

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 3

CO CL3903Contig1 1210 3 16 U
CCATAACCTTTTGGCTCTATTTTTCTTTGTCGTGCTTTTTAGCCTGAATTTGATAGGTAA
ATGTATGTTACACTAAAAAAAAAGATAGGTAAATTTGTAAAAAAAAAGAGAGTACTAGTA
CAAGGAATTGTAAGTAAAACAAGTAGCGACGATGGACACAACACAAGTGACCAGAGACGG
AAGCAAAGTGACATTCAAAAGCATATCCCGTCCAAAGTAACCGGCCACGGTAATGGTCAC
GTCAGCAATCACACGTGCGATCGTGCCTGCCTCCGTCGAAAGCAAACCTCCGTTGTAAGC
CCCTCTCGATAGCCTCGACGACATAACCCTCGAGAGCAACGACAAGTTGACACCTTCAAG
AACTTCTGCAAAGACAAACATGATGAGTCCGGAGCAAACGTATTGTGGCACAGTGTACGG
AACAAGGATATTGAAGCTGAATAGTATTCCGACACAAACCATAATCTCGGACACCAACAG
AATTTGCCGGTCCTCAAACATGTTGCTGATATAGCTTCCAATAACGATGTTTACAGGAAG
AACCGTGAGACCGAGACAAGCCAAGAAGATAGCAACCGAGCTAGTGGACCAACCGAAGTA
GTAAGTGGTGATGACACTAGATTCAGAGAGAAGAATCTCCATTGCATACTTAAGCATAAA
GTATATCAACAGTTGAACCTTTACTGAAGGTGTAAGTAACCTATAAGCAGCTCCAATGGA
GTTAACAGGTGCACGAGATTCCTCAGAAGCTTCTTCACTACCATCTTCATCTTCATCTTC
AACCTGTTCTTCTATTTCTTCTGATGTAATCAGCAATGGCTGTTTAATGACTGCCTCCAG
ATTCCCATCTTGAACAGCTTCAGAGCTATTAGAATCCTTTGAAGTACTATGACTCTCCTC
AGGCTCAAGCACAGGCTCTCGGAACGAAATAGCTAACCAGACTAAGTACACAAGCCAAGC
AATGGCCATAACCCAACCAGGCAATGTATTTTGGTTAAACGTAAGCTTATAGATCTTGAA
TCTGATCTGCAATAGACCAGCAAGAGCAGGACCACACGCCATTCCTAGTGCACTTGCACT
TACAAAACCAGCTGAAGCCTGCATCCTTATCTTTAACGGTACACAGTCACTAATATACCT
CCTGTTCACTGCTCTCGCCGATCCCAACCCACAGAAAAGCCGGCCAATCAAGAGAACAGC
TATTGAGTTC


BQ
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TC

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BQ
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DS 

RD RS1H715JQB 594 0 0
GAGAATCCCAACAAGACAGCTTTACTCGCCGGAGAACCCTGTCAACGCTTATAACACTCA
CGGCCATCGTCCCCACGTCATCAGCATTAGCACAGGAGAAATGGGGGACGAGATCATTCA
TAAAGGAGAAATACTTTCAGCCAGGGTTATCGCCGGAGGACGCTGCGGCTCGTATAAAAC
AGACGGCTGAAGGATTAAAAGACATGAGGGAGATGTTGGACCATATGTCGTGGAGGTACG
TCATCTTTTACTTACGATTAAAACAGGCTTATCTGTCTCAGGATCTGACCAACGCCATGA
ACATCTTGCCGGAGAGTCGCCGGAATGATTACGTTCTAGCCGCAAACCAACTAGTGGAAA
ACATGAGTGAGTTGGACTTTTACGTACGGACGCCAAAGGTTTACGAGTCGTATCTCTACT
ACGAGAAGACATTGAAATCGATAGACGACGTGGTGGAGCTTCTTGCTTAATTTTATTTGT
GTTGTATATGATATATATCTCTCTTCACATGAAATCTCTGTACTCATTACATTATGTTAT
GTCACATTACATCTTATATAATGTGAAGAAATTCAAGAAGCGGTTAGGACTTCC

QA 1 594 1 594
DS 



AS 1 3

CO CL3905Contig1 674 3 6 U
GAGCCTTTTGTAGCTTCTGGCTTATCATTCACGCCACTTCCAGTGATGCATGGAGAAGAC
TATGTCTGTCTTGGCTTCCTTTTTGGAGAAAAATCAAGAGTGGCGTATATATCCGATGTG
TCACGCTTTCTTCCAAGCACTGAGTATGTTATATCGAAATCTGGTGGTGGACAACTGGAT
CTCCTTATCTTGGACACATTATATAAGACAGGATCCCACAACACACACTTATGTTTCCCA
CAGACACTAGAGACGATCAAAAGACTGAGTCCGAAAAGGGCTCTTTTAATCGGAATGACT
CACGAGTTTGATCACCACAAAGACAATGAGTTTCTTGAAGAATGGTCTAAAAGGGAAGGG
ATTTCGGTAAAACTTGCATATGATAGCTTGAGAGTCCCAGTCGATCTATGAAGAGGCTGA
ACATCTAAATTTGAAGATGAGGATGCTTGCTTGTGTGGGTCTTCTTGTCTTAAGATACAG
AGAGAGAGCTTCATATCAAGATTATCACAAAAAGATTTTTGTTTTGTTATTTGTTACCTT
AAGTTTGGATTCTTTGTATTCCTTAAGTTATAGTTTAGGATTTAACCCTTGATTATTATC
TTTTGATCGTTTTTTTTTTCAGATATACCTGTTAAAATAGTAACTAAAGAAAGAAAACAG
TTCATCTTAAAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GG40TF U 1
AF RS1B350TF U 215
AF RS1C205TF U 215
BS 1 265 RS1GG40TF
BS 266 266 RS1B350TF
BS 267 384 RS1GG40TF
BS 385 385 RS1B350TF
BS 386 500 RS1GG40TF
BS 501 674 RS1B350TF

RD RS1GG40TF 500 0 0
GAGCCTTTTGTAGCTTCTGGCTTATCATTCACGCCACTTCCAGTGATGCATGGAGAAGAC
TATGTCTGTCTTGGCTTCCTTTTTGGAGAAAAATCAAGAGTGGCGTATATATCCGATGTG
TCACGCTTTCTTCCAAGCACTGAGTATGTTATATCGAAATCTGGTGGTGGACAACTGGAT
CTCCTTATCTTGGACACATTATATAAGACAGGATCCCACAACACACACTTATGTTTCCCA
CAGACACTAGAGACGATCAAAAGACCGAGTCCGAAAAGGGCTCTTTTAATCGGAATGACT
CACGAGTTTGATCACCACAAAGACAATGAGTTTCTTGAAGAATGGTCTAAAAGGGAAGGG
ATTTCGGTAAAACTTGCATATGATGGCTTGAGAGTCCCAGTCGATCTATGAAGAGGCTGA
ACATCTAAATTTGAAGATGAGGATGCTTGCTTGTGTGGGTCTTCTTGTCTTAAGATACAG
AGAGAGAGCTTCATATCAAG

QA 1 500 1 500
DS 

RD RS1B350TF 460 0 0
G
CCACAACACACACTTATGTTTCCCACAGACACTAGAGACGATCAAAAGACTGAGTCCGAA
AAGGGCTCTTTTAATCGGAATGACTCACGAGTTTGATCACCACAAAGACAATGAGTTTCT
TGAAGAATGGTCTAAAAGGGAAGGGATTTCGGTAAAACTTGCATATGATAGCTTGAGAGT
CCCAGTCGATCTATGAAGAGGCTGAACATCTAAATTTGAAGATGAGGATGCTTGCTTGTG
TGGGTCTTCTTGTCTTAAGATACAGAGAGAGAGCTTCATATCAAGATTATCACAAAAAGA
TTTTTGTTTTGTTATTTGTTACCTTAAGTTTGGATTCTTTGTATTCCTTAAGTTATAGTT
TAGGATTTAACCCTTGATTATTATCTTTTGATCGTTTTTTTTTTCAGATATACCTGTTAA
AATAGTAACTAAAGAAAGAAAACAGTTCATCTTAAAACT

QA 2 460 2 460
DS 

RD RS1C205TF 454 0 0
G
CCACAACACACACTTATGTTTCCCACAGACACTAGAGACGATCAAAAGACTGAGTCCGAA
AAGGGCTCTTTTAATCGGAATGACTCACGAGTTTGATCACCACAAAGACAATGAGTTTCT
TGAAGAATGGTCTAAAAGGGAAGGGATTTCGGTAAAACTTGCATATGATAGCTTGAGAGT
CCCAGTCGATCTATGAAGAGGCTGAACATCTAAATTTGAAGATGAGGATGCTTGCTTGTG
TGGGTCTTCTTGTCTTAAGATACAGAGAGAGAGCTTCATATCAAGATTATCACAAAAAGA
TTTTTGTTTTGTTATTTGTTACCTTAAGTTTGGATTCTTTGTATTCCTTAAGTTATAGTT
TAGGATTTAACCCTTGATTATTATCTTTTGATCGTTTTTTTTTTCAGATATACCTGTTAA
AATAGTAACTAAAGAAAGAAAACAGTTCATCTT

QA 2 454 2 454
DS 



AS 1 2

CO CL3906Contig1 1158 2 2 U
GGAGGGTACGGAACGATGATGAGAAAGTACGGCTTGTCTGTGGACAACGTTGTCGGCTCA
GGAATCATTGACTCAAACGGGAATATCTATACCGATCGAGTTTCGATGGGAGAAGATCGT
TTCTGGGCGATTCGAGGAGGTGGGGCGGCGAGTTTCGGCATCGTGCTGGGATACAGGATC
CGACTTGTCCCGGTGCCGGAGAGAGTTACGGTGTTTAGTGTCGGAAAAACCGTCGGAGAA
GGAGCTTTGGATCTTATAACGAAGTGGCAGAGTTTCGCCCACAGTACAGATCGGAACATG
TTCGTGAGGCTGTCGTTGACTATAGTCAACGGGACGAAGGCTGGTGAAAAGACGGTTTTA
GCCTCCTTCGTTGGGATGTATTTAGGTGGGTCGAGTAAGACGTTGAACGTGATGAACCGG
GATTTCCCGGAACTAAAGCTGAAGAAAACCGATTGTACCGAAATGAGATGGATCGATTCG
GTTCTTTTTTGGGCCGGTTATCCGATCGGTACACCAACTTCCGTACTGTTGGACACGACA
GTTACAAAAAAGTTGTTCATGAAACGTAAATCAGACTACGTGAAGCAGCCCATTTCGAGA
ACCGGTCTTGATTTGATACTCAAGAAACTGGTGGAAGTTGAGAAAGTTGAAATGAATTGG
AATCCGTATGGAGGAAGAATGGGTGAGATCACGAGTTCGAGGACGCCATTCCCACATAGA
GCAGGCAACTTGTTCAACATTGAGTATGTTATAGACTGGTCAGAAGCTGGAGATGCCGTG
GAGAAGGATTACTTGTCACGTGCAAGAGAGATGCATGGGTTCATGGCCCCGTACGTGTCT
AGTAATCCGAGGGAGGCGTATCTTAATTACCGTGATCTTGACATAGGGTCAGGCGGTAAT
TCAACCACGTACGAAGGAGGTAAAGTCTATGGAGCTAAATATTTCAAAGACAATTTCGAG
AGGTTGGTGAATATTAAATCCATCTATGATGAGATAAACTTCTGGAGGAACGAACAAAGT
ATTCCGGTTCGGAAATAATAAGTACGGACACGATCACAGAAGTGTTGTGTAATTTGCGAA
ATGAATGAATTAAGTTTTTCAGCAAGTAAAGCAAGAAATATGTATTAAAATTCTGTTCAA
TAAAATGTTGTGAGATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EQ70TF U 1
AF RS1D273JQ C 447
BS 1 651 RS1EQ70TF
BS 652 1158 RS1D273JQ

RD RS1EQ70TF 652 0 0
GGAGGGTACGGAACGATGATGAGAAAGTACGGCTTGTCTGTGGACAACGTTGTCGGCTCA
GGAATCATTGACTCAAACGGGAATATCTATACCGATCGAGTTTCGATGGGAGAAGATCGT
TTCTGGGCGATTCGAGGAGGTGGGGCGGCGAGTTTCGGCATCGTGCTGGGATACAGGATC
CGACTTGTCCCGGTGCCGGAGAGAGTTACGGTGTTTAGTGTCGGAAAAACCGTCGGAGAA
GGAGCTTTGGATCTTATAACGAAGTGGCAGAGTTTCGCCCACAGTACAGATCGGAACATG
TTCGTGAGGCTGTCGTTGACTATAGTCAACGGGACGAAGGCTGGTGAAAAGACGGTTTTA
GCCTCCTTCGTTGGGATGTATTTAGGTGGGTCGAGTAAGACGTTGAACGTGATGAACCGG
GATTTCCCGGAACTAAAGCTGAAGAAAACCGATTGTACCGAAATGAGATGGATCGATTCG
GTTCTTTTTTGGGCCGGTTATCCGATCGGTACACCAACTTCCGTACTGTTGGACACGACA
GTTACAAAAAAGTTGTTCATGAAACGTAAATCAGACTACGTGAAGCAGCCCATTTCGAGA
ACCGGTCTTGATTTGATACTCAAGAAACTGGTGGAAGTTGAGAAAGTTGAA
A

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1D273JQ 712 0 0
AACCGATTGTACCGAAATGAGATGGATCGATTCGGTTCTTTTTTGGGCCGGTTATCCGAT
CGGTACACCAACTTCCGTACTGTTGGACACGACAGTTACAAAAAAGTTGTTCATGAAACG
TAAATCAGACTACGTGAAGCAGCCCATTTCGAGAACCGGTCTTGATTTGATACTCAAGAA
ACTGGTGGAAGTTGAGAAAGTTGAAATGAATTGGAATCCGTATGGAGGAAGAATGGGTGA
GATCACGAGTTCGAGGACGCCATTCCCACATAGAGCAGGCAACTTGTTCAACATTGAGTA
TGTTATAGACTGGTCAGAAGCTGGAGATGCCGTGGAGAAGGATTACTTGTCACGTGCAAG
AGAGATGCATGGGTTCATGGCCCCGTACGTGTCTAGTAATCCGAGGGAGGCGTATCTTAA
TTACCGTGATCTTGACATAGGGTCAGGCGGTAATTCAACCACGTACGAAGGAGGTAAAGT
CTATGGAGCTAAATATTTCAAAGACAATTTCGAGAGGTTGGTGAATATTAAATCCATCTA
TGATGAGATAAACTTCTGGAGGAACGAACAAAGTATTCCGGTTCGGAAATAATAAGTACG
GACACGATCACAGAAGTGTTGTGTAATTTGCGAAATGAATGAATTAAGTTTTTCAGCAAG
TAAAGCAAGAAATATGTATTAAAATTCTGTTCAATAAAATGTTGTGAGATAT

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 3

CO CL3907Contig1 757 3 6 U
GGACGCAAACCGTAAACCGCTACAAAACCGGAATAAAAAGGAAAGATAATTTCGTGGTAG
TTTGTTAAGAATCCGATGGACTCGTCGTCGTCACCAGCAGCAGGGGCAGCAGCAGCGAAG
CCGGGGAGAGGCGCAGGAGGAAGAAAAGGAGGTGATCGGAAGAAGAGCGTTTCCAAGTCG
GCCAAGGCTGGTCTCCAGTTTCCCGTCGGCCGTATCTCTCGTTACTTGAAGAAAGGCCGT
TACGCGATCAGGTACGGCGCCGGTGCTCCCGTTTACCTCGCCGCCGTTCTCGAGTACCTC
GCCGCCGAGGTTTTGGAGCTTGCGGGGAACGCAGCGAGGGACAACAAGAAGAACAGGATA
AACCCGAGGCATCTTTGCTTGGCGATAAGGAACGATGAGGAGTTGGGGAAGCTGCTTCAC
GGAGTCACCATCGCGAGCGGTGGAGTTCTTCCGAACATCAACCCGGTGCTTCTTCCCAAG
AGATCTGCATCTCAAACTGAGAAGCCTGAGAAAGCTGCTAAGGCTGCTAAATCTCCCAAG
AAGGCTTAACTGTTGCTGCTGTGATGCGTTTGTTATATCAAATCTAGAAGAAGAACGACT
TGTTTTTTTTTT*AGGGATTGTGTAGGTTGGTTGCGTTCTATGTTTACTCTCTCTGTTTG
TGGTTTGTTTATGGATCCTCGGATGGCAAGATTATGTGTTACAGCCATTTTGTAATGAAT
GAACTAATTTCTGGGTTATCTTCTACTCAGTTTCCCA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FR24TF U 1
AF RS1C681TF U 1
AF RS1C681JQ C 91
BS 1 7 RS1C681TF
BS 8 8 RS1FR24TF
BS 9 616 RS1C681TF
BS 617 617 RS1FR24TF
BS 618 673 RS1C681TF
BS 674 757 RS1C681JQ

RD RS1FR24TF 650 0 0
GGACGCAAACCGTAAACCGCTACAAAACCGGAATAAAAAGGAAAGATAATTTCGTGGTAG
TTTTTTAAGAATCCGATGGACTCGTCGTCGTCACCAGCAGCAGGAGCAGCAGCAGCGAAG
CCGGGGAGAGGCGCAGGAGGAAGAAAAGGAGGTGATCGGAAGAAGAGCGTTTCCAAGTCG
GCCAAGGCTGGTCTCCAGTTTCCCGTCGGCCGTATCTCTCGTTACTTGAAGAAAGGCCGT
TACGCGATCAGGTACGGCGCCGGTGCTCCCGTTTACCTCGCCGCCGTTCTCGAGTACCTC
GCCGCCGAGGTTTTGGAGCTGGCGGGGAACGCAGCGAGGGACAACAAGAAGAACAGGATA
AACCCGAGGCATCTTTGCTTGGCGATAAGGAACGATGAGGAGTTGGGGAAGCTGCTTCAC
GGAGTCACCATCGCGAGCGGTGGAGTTCTTCCGAACATCAGCCCGGTGCTTCTTCCCAAG
AGATCTGCATCTCAAACTGAGAAGCCTGAGAAAGCTGCTAAGGCTGCTAAATCTCC*AAG
AAGGCTTAACTGTTGCTGCTGTGATGCGTTTGTTATATCAAATCTAGAAGAAGAACGACT
TGTTTTTTTTTT*AGGGATTGTGTAGGTTGGTTGCGTTCTATGTTTACTC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RS1C681TF 673 0 0
GGACGCAGACCGTAAACCGCTACAAAACCGGAATAAAAAGGAAAGATAATTTCGTGGTAG
TTTGTTAAGAATCCGATGGACTCGTCGTCGTCACCAGCAGCAGGGGCAGCAGCAGCGAAG
CCGGGGAGAGGCGCAGGAGGAAGAAAAGGAGGTGATCGGAAGAAGAGCGTTTCCAAGTCG
GCCAAGGCTGGTCTCCAGTTTCCCGTCGGCCGTATCTCTCGTTACTTGAAGAAAGGCCGT
TACGCGATCAGGTACGGCGCCGGTGCTCCCGTTTACCTCGCCGCCGTTCTCGAGTACCTC
GCCGCCGAGGTTTTGGAGCTTGCGGGGAACGCAGCGAGGGACAACAAGAAGAACAGGATA
AACCCGAGGCATCTTTGCTTGGCGATAAGGAACGATGAGGAGTTGGGGAAGCTGCTTCAC
GGAGTCACCATCGCGAGCGGTGGAGTTCTTCCGAACATCAACCCGGTGCTTCTTCCCAAG
AGATCTGCATCTCAAACTGAGAAGCCTGAGAAAGCTGCTAAGGCTGCTAAATCTCCCAAG
AAGGCTTAACTGTTGCTGCTGTGATGCGTTTGTTATATCAAATCTAGAAGAAGAACGACT
TGTTTTTTTTTT*AGG*ATTGTGTAGGTTGGTTGCGTTCTATGTTTACTCTCTCTGTTTG
TGGTTTGTTTATG

QA 1 673 1 673
DS 

RD RS1C681JQ 667 0 0
TCACCAGCAGCAGGGGCAGCAGCAGCGAAGCCGGGGAGAGGCGCAGGAGGAAGAAAAGGA
GGTGATCGGAAGAAGAGCGTTTCCAAGTCGGCCAAGGCTGGTCTCCAGTTTCCCGTCGGC
CGTATCTCTCGTTACTTGAAGAAAGGCCGTTACGCGATCAGGTACGGCGCCGGTGCTCCC
GTTTACCTCGCCGCCGTTCTCGAGTACCTCGCCGCCGAGGTTTTGGAGCTTGCGGGGAAC
GCAGCGAGGGACAACAAGAAGAACAGGATAAACCCGAGGCATCTTTGCTTGGCGATAAGG
AACGATGAGGAGTTGGGGAAGCTGCTTCACGGAGTCACCATCGCGAGCGGTGGAGTTCTT
CCGAACATCAACCCGGTGCTTCTTCCCAAGAGATCTGCATCTCAAACTGAGAAGCCTGAG
AAAGCTGCTAAGGCTGCTAAATCTCCCAAGAAGGCTTAACTGTTGCTGCTGTGATGCGTT
TGTTATATCAAATCTAGAAGAAGAACGACTTGTTTTTTTTTTTAGGGATTGTGTAGGTTG
GTTGCGTTCTATGTTTACTCTCTCTGTTTGTGGTTTGTTTATGGATCCTCGGATGGCAAG
ATTATGTGTTACAGCCATTTTGTAATGAATGAACTAATTTCTGGGTTATCTTCTACTCAG
TTTCCCA

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 2

CO CL3908Contig1 429 2 2 U
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ATGATTTCTGGATGGATTTCTGCGAGTGTATGTCTAATTGCAGAGAGCCCAAGGATTGTT
CTCTTCTTCGTGAAGACTACCTCGAGTGTCTTCACCATTCCAAAGAGTTCCAAAGAAGAA
ACAGGATATACAAAGAGGAACAACGTAAACTAAGAGCAGCTTCTAGGAAAGGCCAAGATA
CCGGCACTGATGCCACTCATCACTAGTCATCACTAGTCGTGAAGTTAAGCCAAGTTTTCA
TCTTTCGTAAACGGGAAGAAGAAGAATAATGAAAAGTTTCGTGAAGATTCTCTGTATGTT
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TTCTGTCTC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DW25JQ C 1
AF RS1DW25TF U 1
BS 1 2 RS1DW25JQ
BS 3 429 RS1DW25TF

RD RS1DW25JQ 429 0 0
GGGAGTTTTATTCAACAATGGCGTCGGGGTGGGGAATAACGGGGAACAAAGGGAGATGTT
ATGATTTCTGGATGGATTTCTGCGAGTGTATGTCTAATTGCAGAGAGCCCAAGGATTGTT
CTCTTCTTCGTGAAGACTACCTCGAGTGTCTTCACCATTCCAAAGAGTTCCAAAGAAGAA
ACAGGATATACAAAGAGGAACAACGTAAACTAAGAGCAGCTTCTAGGAAAGGCCAAGATA
CCGGCACTGATGCCACTCATCACTAGTCATCACTAGTCGTGAAGTTAAGCCAAGTTTTCA
TCTTTCGTAAACGGGAAGAAGAAGAATAATGAAAAGTTTCGTGAAGATTCTCTGTATGTT
GTGTGTCAAAACTCCTTTTGATTGTTTTCACTTTGCTTCTGCAACTGCAATGAATGATTA
TTCTGTCTC

QA 1 429 1 429
DS 

RD RS1DW25TF 429 0 0
GG
GAGTTTTATTCAACAATGGCGTCGGGGTGGGGAATAACGGGGAACAAAGGGAGATGTTAT
GATTTCTGGATGGATTTCTGCGAGTGTATGTCTAATTGCAGAGAGCCCAAGGATTGTTCT
CTTCTTCGTGAAGACTACCTCGAGTGTCTTCACCATTCCAAAGAGTTCCAAAGAAGAAAC
AGGATATACAAAGAGGAACAACGTAAACTAAGAGCAGCTTCTAGGAAAGGCCAAGATACC
GGCACTGATGCCACTCATCACTAGTCATCACTAGTCGTGAAGTTAAGCCAAGTTTTCATC
TTTCGTAAACGGGAAGAAGAAGAATAATGAAAAGTTTCGTGAAGATTCTCTGTATGTTGT
GTGTCAAAACTCCTTTTGATTGTTTTCACTTTGCTTCTGCAACTGCAATGAATGATTATT
CTGTCTC

QA 3 429 3 429
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL3910Contig1 714 3 2 U
GAGGAACGGTTACAAGATATGTCCTTGTCTGCCATTAAGGAATATTACAGTGCCCGAGAT
GAGAAGGAGATTGGTTTATGCATAAAAGACATGAATTCACCAGCTTTCCACCCAACAATG
ATTTCTCTGTGGGTTACTGATTCTTTTGAGAGAAAAGATAAAGAAAGGGATCTCTTAGCA
AAGCTCCTTGTTAACCTTGTGAAGTCTGCTGACAACGACTTAACCGGAGCCGAACTAGTG
AAAGGGTTTGAAACCGTTTTGACGACACTGGAGGATGCTGTGAATGATGCTCCAAAAGCA
GCAGAGTTTCTAGGCAAAATCTTCGGTAAAAGTGTGACCGAGAATGTAGTGACATTGGCA
CAGATTGGTCGGCTAATACGTGAAGGAGGAGAAGAACCAGGAAGTCTGGTGGAGTTTGGG
TTAGGAGGTGATGTTCTTGGGAGTGTGTTGGAGACAATAAAGTCAGAAGCAGGAGAAGAA
GCTTTTGTTGAGATTCAAAGGAGCTCAGGTCTGATGATTGAAGATTTCAAACCTCCTGCA
CCTAACAGGTCTAAGATATTAGATAAATTTACTTAGGAATCCAAAAATGTACGGAGCCAT
CTTTTGACCGTTCT*GTTGCTCTGTCTCTCT**TTTTTTTTCAAGTGCTTCAACAAACTA
ATCTGTTAAAAAAGGAGTTTCTCTATTTTATTTATTATAATATCAAAACCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GR34TF U 1
AF RS1DH94TF U 14
AF RS1GR34JQ C 106
BS 1 707 RS1GR34TF
BS 708 714 RS1GR34JQ

RD RS1GR34TF 713 0 0
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GAGAAGGAGATTGGTTTATGCATAAAAGACATGAATTCACCAGCTTTCCACCCAACAATG
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TTAGGAGGTGATGTTCTTGGGAGTGTGTTGGAGACAATAAAGTCAGAAGCAGGAGAAGAA
GCTTTTGTTGAGATTCAAAGGAGCTCAGGTCTGATGATTGAAGATTTCAAACCTCCTGCA
CCTAACAGGTCTAAGATATTAGATAAATTTACTTAGGAATCCAAAAATGTACGGAGCCAT
CTTTTGACCGTTCT*GTTGCTCTGTCTCTCT**TTTTTTTTCAAGTGCTTCAACAAACTA
ATCTGTTAAAAAAGGAGTTTCTCTATTTTATTTATTATAATATCAAA
CCTTCC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1DH94TF 698 0 0
G
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TTTATGCATAAAAGACATGAATTCACCAGCTTTCCACCCAACAATGATTTCTCTGTGGGT
TACTGATTCTTTTGAGAGAAAAGATAAAGAAAGGGATCTCTCAGCAAAGCTCCTTGTTAA
CCTTGTGAAGTCTGCTGACAACGACTTAACCGGAGCCGAACTAGTGAAAGGGTTTGAAAC
CGTTTTGACGACACTGGAGGATGCTGCGAATGATGCTCCAAAAGCAGCAGAGTTTCTAGG
CAAAATCTTCGGTAAAAGTGTGACCGAGAATGTAGTGACATTGGCACAGATTGGTCGGCT
AATACGTGAAGGAGGAGAAGAACCAGGAAGTCTGATGGAGTTTGGGTTAGGAGGTGATGT
TCTTGGGAGTGTGTTGGAGACAATAAAGTCAGAAGCAGGAGAAGAAGCCTTTGTTGAGAT
TCAAAGGAGCTCAGGTCTGAGGATTGAAGATTTCAAACCTCCTGCACCTAACAGGTCTAA
GATATTAGATAAATTTACTTAGGAATC*AAAAATGTACGGAGCCATCTTTTGACCGTTCT
TGTTGCTCTGTCTCTCTCTTTTTTTTTCAAGTGCTTCAACAAACTAATCTGTTAAAAAAG
*AGTTTCTCTATTTTATTTATTATAATATCAAA
ACCT

QA 2 694 2 694
DS 

RD RS1GR34JQ 609 0 0
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AGGGATCTCTTAGCAAAGCTCCTTGTTAACCTTGTGAAGTCTGCTGACAACGACTTAACC
GGAGCCGAACTAGTGAAAGGGTTTGAAACCGTTTTGACGACACTGGAGGATGCTGTGAAT
GATGCTCCAAAAGCAGCAGAGTTTCTAGGCAAAATCTTCGGTAAAAGTGTGACCGAGAAT
GTAGTGACATTGGCACAGATTGGTCGGCTAATACGTGAAGGAGGAGAAGAACCAGGAAGT
CTGGTGGAGTTTGGGTTAGGAGGTGATGTTCTTGGGAGTGTGTTGGAGACAATAAAGTCA
GAAGCAGGAGAAGAAGCTTTTGTTGAGATTCAAAGGAGCTCAGGTCTGATGATTGAAGAT
TTCAAACCTCCTGCACCTAACAGGTTTAAGATATTAGATAAATTTACTTAGGAATCCAAA
AATGTACGGAGCCATCTTTTGACCGTTCT*GTTGCTCTGTCTCTCT**TTTTTTTTCAAG
TGCTTCAACAAACTAATCTGTTAAAAAAGGAGTTTCTCTATTTTATTTATTATAATATCA
AAACCTTCC

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 3

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TCTCCCTAGTTTCATCCATCTCTTTTGCCTCTGTTCAAGACTTTTGTGTAGCTGATCCCA
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ATTTCGCATTCTCCGGCCTCGCCAAAGCTGGAAACACATCGAACATCATTAAAGCCGCGG
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GTCTTGACTTAGCAGGTGGTGGTGTCATCCCTCTTCACACTCATCCTGGTGCGTCTGAGG
TTCTTGTAGTCATACAAGGAACCATCTGCGCCGGGTTTATTTCCTCTGCTAATAAGGTAT
ACTTGAAGACTCTCCAGAGAGGGGATTCTATGGTGTTTCCTCAAGGGCTTCTTCATTTTC
AGCTTAACTCTGGGAAAGGTCCTGCCTTGGCCTTTGTTGCCTTTGGAAGCTCATCCCCGG
GACTTCAGATTCTACCATTTGCTCTGTTTGCAAATGATTTGCCTTCAGAACTCGTTGAAG
CTACCACCTTCCTTAGTGATGAACAAGTTAAGAAGCTTAA*GGGCGTGCTTGGAGGAACT
AACTAAGCTTCTCTTTCGTTTTATTTTTCTAAGTTTTTGTGTGTGAGTGCGTTTATGCGT
TTTTTTCGAGTTGGTTTAGCATTCTGATTTTTACCGTAATGGTTGTCTTTCTTTTTTGTT
GTTATTGTTCTCAATGTCTCATTTTATTATCTCTTTGGGTTAAATTTTAATAAGTAATTG
CAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1H154TF U 1
AF RS1FP95TF U 21
AF RS1H154JQB C 382
BS 1 187 RS1H154TF
BS 188 188 RS1FP95TF
BS 189 679 RS1H154TF
BS 680 766 RS1FP95TF
BS 767 843 RS1H154JQB

RD RS1H154TF 679 0 0
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TTCTTGTAGTCATACAAGGAACCATCTGCGCCGGGTTTATTTCCTCTGCTAATAAGGTAT
ACTTGAAGACTCTCCAGAGAGGGGATTCTATGGTGTTTCCTCAAGGGCTTCTTCATTTTC
AGCTTAACTCTGGGAAAGGTCCTGCCTTGGCCTTTGTTGCCTTTGGAAGCTCATCCCCGG
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CTACCACCTTCCTTAGTGATGAACAAGTTAAGAAGCTTAA*GGGCGTGCTTGGAGGAACT
AACTAAGCTTCTCTTTCGT

QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1FP95TF 746 0 0
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TCTTTTGCCTCTGTTCAAGACTTTTGTGTAGCTGATCCCAAGGGTCCTCAAAGCCCATCA
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GCTTTCGCAGGCACCAATGGCCTTGGAGTCTCGATGGCTCGTCTTGACTTAGCAGGTGGT
GGTGTCATCCCTCTTCACACTCATCCTGGTGCGTCTGAGGTTCTTGTAGTCATACAAGGA
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GGGGATTCTATGGTGTTTCCTCAAGGGCTTCTTCATTTTCAGCTTAACTCTGGGAAAGGT
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GCTCTGTTTGCAAATGATTTGCCTTCAGAACTCGTTGAAGCTACCACCTTCCTTAGTGAT
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TTATTTTTCTAAGTTTTTGTGTGTGAGTGCGTTTATGCGTTTTTTTCGAGTTGGTTTAGC
ATTCTGATTTTTACCGTAATGGTTGT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1H154JQB 462 0 0
CCATTTGCGCCGGGTTTATTTCCTCTGCTAATAAGGTATACTTGAAGACTCTCCAGAGAG
GGGATTTTATGGTGTTTCCTCAAGGGCTTCTTCATTTTCAGCTTAACTCTGGGAAAGGTC
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CTCTGTTTGCAAATGATTTGCCTTCAGAACTCGTTGAAGCTACCCCCTTCCTTAGTGATG
AACAAGTTAAGAAGCTTAA*GGGCGTGCTTGGAGGAACTAACTAAGCTTCTCTTTCGTTT
TATTTTTCTAAGTTTTTGTGTGTGAGTGCGTTTATGCGTTTTTTTCGAGTTGGTTTAGCA
TTCTGATTTTTACCGTAATGGTTGTCTTTCTTTTTTGTTGTTATTGTTCTCAATGTCTCA
TTTTATTATCTCTTTGGGTTAAATTTTAATAAGTAATTGCAC

QA 1 462 1 462
DS 



AS 1 3

CO CL3912Contig1 733 3 23 U
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AAGCTCCATAGCCCTTTTCTTGGCTCTCAACCTCATGTTCTTCACAACAATCTCCGCATG
CGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCCAAGCCAACTCCTAA
ACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCAAGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGG
TGTCTGCGCCAATGTGCTCAGTGGCCTCCTCGACTTGACCCTCGGCAAGCCACCGGTCAA
GCCATGCTGCAGCCTCATCCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGCAC
CGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTCCCAATCTCTCTAAGTCTTCT
CCTCAATGTTTGCAGTAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAATCGTATCATA
TGTAATTTCAGTACACGAATGTGTATATTTATCTTCTTGTTTTGGACAGACAAGGTGATT
CTATTTACTCTTATTATTGTGTCCCTCTATATTTGTGTTCTTATTACAATCTTCTTGTTA
TGGGGTTCATTGGAGCCAAATTGTGTCTCTATCCGGATGATCCTTACGATTCTTGAAGTT
AACAGTTCCATTATTTCCCGTTACTCTTTATATTGGGGTAATTGTTGTACTATGATCCTA
TGAAAATAAATCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E262TF U 1
AF RS1GD84TF U 1
AF RS1GD84JQ C 99
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BS 262 309 RS1E262TF
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CGGTAGCTGCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCCAAGCCAACTCCTAA
ACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCAATGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAATCTTGG
TGTCTGCGCCAATGTACTCAATGGCCTCCTCGACTTGACCCTCGGCAAGCCACCGGTCAA
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CGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACCTCCCAATCTCTCCAAGTCTTCT
CCTCAATGTTTGCAGCAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCCAGTGCTAAGCAATCGTACCATA
TGTAATTTCAGTACACGAATGTGTATATTTATCTTCTTGTTTTGGACAGA

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DS 

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GGACATTT
AATTCACCCACAACATAGCTAGTGGAACAGCGTATTCTAAAAA**TGGCTTCAAGCTCCA
TAGCCCTTTTCTTGGCTCTCAACCTCATGTTCTTCACAACAATCTCCGCATGCGGTAGCT
GCACTCCTTGCGGAGGAGGTTGCCCCTCTCCCAAGCCCAAGCCAACTCCTAAACCAACCC
CAAGCCCTAGCTCTGGCAAGGGAAAGTGCCCTAAAGATACCCTCAAGCTTGGTGTCTGCG
CCAATGTGCTCAGTGGCCTCCTCGACTTGACCCTCGGCAAGCCACCGGTCAAGCCATGCT
GCAGCCTCATCCAAGGACTCGCTGATGTTGAAGCAGCCGTTTGTCTCTGCACCGCTCTTA
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CAGTACACGAATGTGTATATTTATCTTCTTGTTTTGGACAGACAAGGTGATTCTATTTAC
TCTTATTATTGTGTCCCTCTATATTTGT

QA 9 576 9 576
DS 

RD RS1GD84JQ 635 0 0
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CCAAGCCCAAGCCAACTCCTAAACCAACCCCAAGCCCTAGCTCTGGCAAGGGAAAGTGCC
CTAAAGATACCCTCAAGCTTGGTGTCTGCGCCAATGTGCTCAGTGGCCTCCTCGACTTGA
CCCTCGGCAAGCCACCGGTCAAGCCATGCTGCAGCCTCATCCAAGGACTCGCTGATGTTG
AAGCAGCCGTTTGTCTCTGCACCGCTCTTAAGGCTAACGTTCTTGGAATCAACTTGAACC
TCCCAATCTCTCTAAGTCTTCTCCTCAATGTTTGCAGTAAACAAGTTCCTCCTGGCTTCC
AGTGCTAAGCAATCGTATCATATGTAATTTCAGTACACGAATGTGTATATTTATCTTCTT
GTTTTGGACAGACAAGGTGATTCTATTTACTCTTATTATTGTGTCCCTCTATATTTGTGT
TCTTATTACAATCTTCTTGTTATGGGGTTCATTGGAGCCAAATTGTGTCTCTATCCGGAT
GATCCTTACGATTCTTGAAGTTAACAGTTCCATTATTTCCCGTTACTCTTTATATTGGGG
TAATTGTTGTACTATGATCCTATGAAAATAAATCA

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 3

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GACGGTTTACGTAACCCGGAAAGTGTAGCCAACAACTCCGTTTTAGCATTCAAAACAGCT
CTTTGGTTTTGGATGACCGAACAGACTCCTAAACCGTCTTGCTATGATGTCATTGTCAAC
CGGTACAGACCGACCAAAGCAGATATGGCAGCAAACCGGACCAGTGGTTTCGGTTTAACA
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CGGGTCGGGTATTTCCAAAGATATGCTAAGTTGTTTGATGCCAACACAGGACCTTACTTA
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ACTCTTTAATCTGAGGATGAGAGATATAAATGTTTTACATCATTTACTT


BQ
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AF RS1DR13TF U 1
AF RS1FY29TF U 1
AF RS1DR13JQ C 313
BS 1 112 RS1DR13TF
BS 113 113 RS1FY29TF
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BS 683 1009 RS1DR13JQ

RD RS1DR13TF 686 0 0
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GAAGTGGCTGCGTTTTTGGCGCAGATATCTCACGAGACAACAGGTGGTTGGGCCACGGCA
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TATTGTGATGCTTCAAATACGGAGTGGCCTTGTTTCCCTGGCAAATCTTATAAAGGAAGA
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GACGGTTTACGTAACCCGGAAAGTGTAGCCAACAACTCCGTTTTAGCATTCAAAACAGCT
CTTTGGTTTTGGATGACCGAACAGACTCCTAAACCGTCTTGCTATGATGTCATTGTCAAC
CGGTACAGACCGACCAAAGCAG
ATAT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1FY29TF 682 0 0
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TCCTATAGACGTGCACCGATCACGAGGCTAGTCTCAAAATCTCTCTACGACTCAATCTTC
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GAGGCTACAAGGTGGTTCCCGAAGTTCGGGAGCGTAGGAGGCACTATGACAAGGAGGCGT
GAAGTGGCTGCGTTTTTGGCGCAGATATCTCACGAGACAACAGGTGGTTGGGCCACGGCA
CCGGATGGACCGTACGCGTGGGGGCTGTGTTTTAAAGAGGAAGTGAGTCCACAGAGTAAT
TATTGTGATGCTTCAAATACGGAGTGGCCTTGTTTCCCTGGCAAATCTTATAAAGGAAGA
GGTCCCATTCAACTTTCTTGGAATTACAATTACGGTCAGGCGGGTCGAGCATTGGGTTTT
GACGGTTTACGTAACCCGGAAAGTGTAGCCAACAACTCCGTTTTAGCATTCAAAACAGCT
CTTTGGTTTTGGATGACCGAACAGACTCCTAAACCGTCTTGCCATGATGTCATGGTCAAC
CGGTACAGACCTACCTAAGCAG

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1DR13JQ 697 0 0
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GAGGATGAGAGATATAAATGTTTTACATCATTTACTT

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 3

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AAATCTTTTTCGGTTTGTTGACATTTAGTTTTGGAACCTTAACTACATAAACCTTCTGCT
CTGATCAGAACAAGTGAAAATTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 10 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EX70JQ C 138
AF RS1CK60TF U 1
AF RS1EX70TF U 85
BS 1 108 RS1CK60TF
BS 109 109 RS1EX70TF
BS 110 242 RS1CK60TF
BS 243 243 RS1EX70TF
BS 244 378 RS1CK60TF
BS 379 379 RS1EX70TF
BS 380 584 RS1CK60TF
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BS 599 599 RS1EX70TF
BS 600 610 RS1CK60TF
BS 611 625 RS1EX70TF

RD RS1EX70JQ 302 0 0
TTT
TTAGCGAAGAGGAGAAAGCTGCTGAGAATGTTTTCATCAAGAAAATGGAGCAAGAGAAGC
TTGAGAAGATAGCTAGACAGGGTCCGGGAGAACAAGCAGCAAGTGGGGGAGCCAAGGCTA
GTGGTGGTGGTGGTGGAACATCATCAGCTGAATCAGGGCCAAAAGTGTCAGAAGACAAGG
ACAGAAACTATGCGGTTGTGGCAGGTGTGGTCGCTGTTGTTGGAGCCATTGGTTGGTATA
TGAAATCAGGTGGAAAGAAGCAGCAGCCAGAGGTTCAAGAGTGAAGAATGATGGG
GGTA

QA 4 298 4 298
DS 

RD RS1CK60TF 616 0 0
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TACTTACTTGTTCATTATTACCGTGGCAACCAGAAGCGCTTTCAGATTTGTGTCTCGCAG
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GAAAATGGAGCAAGAGAAGCTTGAGAAGATAGCTAGACAGGGTCCGGGAGAACAAGCAGC
AAATGGAGGAGCCAAGGCTAGTGGTGGTGGTGGTGGAACATCATCAGCTGAATCAGGGCC
AAAAGTGTCAGAAGACAAGGACAGAAACTATGCGGTTGTGGCAGGTGTGGTCGCTGTTGT
TGGAGCCATTGGTTGGTACATGAAATCAGGTGGAAAGAAGCAGCAGCCAGAGGTTCAAGA
GTGAAGAATGATGGGAGTAGCGAGTGAATAAAACAGAGAGTGGTATCTTTTACTAATTCC
TCTCTTATGAGAAACTTTGGAATGGCTACTACTCTCTCTTTTCTTTTGGTTTTGGTTTCC
AAATCTTTTTCGGTTTGTTGACATTTAGTTTTGGAACCTTAACTGCATAACTCTTCTGTT
CTGATCAGAA
TGAATG

QA 1 610 1 610
DS 

RD RS1EX70TF 541 0 0
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CGAAGAGGAGAAAGCTGCTGAGAATGTTTTCATCAAGAAAATGGAGCAAGAGAAGCTTGA
GAAGATAGCTAGACAGGGTCCGGGAGAACAAGCAGCAAGTGGAGGAGCCAAGGCTAGTGG
TGGTGGTGGTGGAACATCATCAGCTGAATCAGGGCCAAAAGTGTCAGAAGACAAGGACAG
AAACTATGCGGTTGTGGCAGGTGTGGTCGCTGTTGTTGGAGCCATTGGTTGGTATATGAA
ATCAGGTGGAAAGAAGCAGCAGCCAGAGGTTCAAGAGTGAAGAATGATGGGAGTAGCGAG
TGAATAAAACAGAGAGTGGTATCTTTTACTAATTCCTCTCTTATGAGAAACTTTGGAATG
GCTACTACTCTCTCTTTTCTTTTGGTTTTGGTTTCCAAATCTTTTTCGGTTTGTTGACAT
TTAGTTTTGGAACCTTAACTACATAAACCTTCTGCTCTGATCAGAACAAGTGAAAATTCT
C

QA 1 541 1 541
DS 



AS 1 2

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TAGGGTGGAGCCGCTGCGAAGGTCTCCACCCACTGGAAACTGCAACGAGACGGAGTAAAC
GAGATTCATAAGCGTCTTATAAGGTACTTCTCTATCAAATTTCGTGAATCGGAAAGGTCA
TGGTGTTTGACCTCTACGACGGTTCTGTCGCTCTGGTTCCTCAAGGTTGTTCGGCGGCGC
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AGTTTGTTTCTCTCCGGCCCAGACCTCTGCCTCAAACACTTCTGAAAGGAGGAGTATGCA
GCGTCTCAGACTTGAGTGGTGGCGGATCTCGCAGGGACAGTAGCGCTAAGGTTTTACTTT
TTAGAGTCAGATCTCAGATCCGGCGAGTTGGAGCTGCGGAACACCTCCGTGGGTGATTAA
TTGAAGGAAACATATGGCGGATCTAGTGCTGGCTTGGACACTCGGCCGTCAAAATTTTCG
GTAACCGGTGTTTACGGGAGGAGGGAGAAATCTTCCATAGCCTTTTAACTTTTTCTGCTT
CTTTGTTCTGTAGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ED84TF U 1
AF RS1BG03TF C 160
BS 1 170 RS1ED84TF
BS 171 171 RS1BG03TF
BS 172 641 RS1ED84TF
BS 642 737 RS1BG03TF

RD RS1ED84TF 641 0 0
GGGTTAATGGCTTAATGCTTAGTGCAAGTTTGCAAAGCAAAACGAGAGAAAAGTCCTTGA
GAGGCAAGTGGATTTTACACTCATCATCAATTTTTCTCTAATTCATCTTATTGTGGTTTT
TAGGGTGGAGCCGCTGCGAAGGTCTCCACCCACTGGAAACTGCAACGAGATGGAGTAAAC
GAGATTCATAAGCGTCTTATAAGGTACTTCTCTATCAAATTTCGTGAATCGGAAAGGTCA
TGGTGTTTGACCTCTACGACGGTTCTGTCGCTCTGGTTCCTCAAGGTTGTTCGGCGGCGC
TTCTTGTTAGAAGACGAGGAGGAGGTTGTCGGAAGCCAATAGATAGTCATCGGGGTTAAA
TCTTGTCGTTAGAGAAGTTTTGGTTTCGGTGGATCTTTCTCAACAGATGGCGGTCTCTTC
AGTTTGTTTCTCTCCGGCCCAGACCTCTGCCTCAAACACTTCTGAAAGGAGGAGTATGCA
GCGTCTCAGACTTGAGTGGTGGCGGATCTCGCAGGGACAGTAGCGCTAAGGTTTTACTTT
TTAGAGTCAGATCTCAGATCCGGCGAGTTGGAGCTGCGGAACACCTCCGTGGGTGATTAA
TTGAAGGAAACATATGGCGGATCTAGTGCTGGCTTGGACAC

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1BG03TF 578 0 0
AAT
CAACGAGACGGAGTAAACGAGATTCATAAGCGTCTTATAAGGTACTTCTCTATCAAATTT
CGTGAATCGGAAAGGTCATGGTGTTTGACCTCTACGACGGTTCTGTCGCTCTGGTTCCTC
AAGGTTGTTCGGCGGCGCTTCTTGTTAGAAGACGAGGAGGAGGTTGTCGGAAGCCAATAG
ATAGTCATCGGGGTTAAATCTTGTCGTTAGAGAAGTTTTGGTTTCGGTGGATCTTTCTCA
ACAGATGGCGGTCTCTTCAGTTTGTTTCTCTCCGGCCCAGACCTCTGCCTCAAACACTTC
TGAAAGGAGGAGTATGCAGCGTCTCAGACTTGAGTGGTGGCGGATCTCGCAGGGACAGTA
GCGCTAAGGTTTTACTTTTTAGAGTCAGATCTCAGATCCGGCGAGTTGGAGCTGCGGAAC
ACCTCCGTGGGTGATTAATTGAAGGAAACATATGGCGGATCTAGTGCTGGCTTGGACACT
CGGCCGTCAAAATTTTCGGTAACCGGTGTTTACGGGAGGAGGGAGAAATCTTCCATAGCC
TTTTAACTTTTTCTGCTTCTTTGTTCTGTAGTTCC

QA 4 578 4 578
DS 



AS 1 3

CO CL3916Contig1 1049 3 17 U
GGGATAAATGACTTTAGTTCATAAAAAAGGGGGAAGGGTATAATAAATGAACACACGTAC
TCACTCTCTTTTCACCAAACAGAAAAGATAAACAGATACTTTCTTCAACAATAAGCTTGG
GACAAACAACAAAAAGACAAAATATAGTAAAAGATATATTAAACACATGTTCTCGTCTCT
CGAGTTTGCCAAGTTGCAAAGCACGCTAAAATTTCCCACAAAAATGATCTCACTCTTGGA
CACTTCATACACCCTGTGACCACAAATTCCCATATCTCTCTTCTGTCAGTGATAACCAGC
ATGTAGTATGGCCACAAAAACTTTAATCAATCCAGAGACCACAAAAATGGGAAGAAAGGA
AAAAAAAA*TTGTGAGAACACGCTGCAAAAATAAAACAATGTACGTTTCAGTGAACATAA
CTTGAAACAAAAGAACACAAACCAATGATGCCATAACAGAGAGTGACAAGTTTGAGGCCG
CATGTGGCCTTGCTTCCTTCGTGTATCCGTTTAAGCAGCTCGTAGCATTCTTTTTTGGCA
TGTGGAATCCTCACTGAGGTTAAGCTCCGACGCATCAAGCCGCTCTATCTTTAGTACTCT
GTACACTCCATTACCATTCCAACCAATCATATAGAAATTCTCTCTCAACGTTCCTTGATG
TTTAGCGAAAACCTCATTGTACTTTATTTGAAAATCAGACTTCTCAGAATGAAGCTTCTT
GTAATCAGAAACTGAAGGACCTCCTAGCTTCTGTTGGATGAATTCTAAAGCAGAGGATGG
CTTGTCATTCTGCTCATACAGAGCATTTAGAACTACATTCAAATCCCGCATTGTTCCAGA
ACTTTGGTGAAAGAATCAAGAACTCCATTGTAATTTTACATACCTGAACTTGGAAAACTG
AGATAGTTTAACCTTAACGTTATATTCAGGTTACTTAGTGCTTCGGCAAGCCAATAGCGG
AGATGAGCGGCTGAGCGGGAGATCATCAATGTGGCCTCTTTTTAGTGTATATATTTTGCG
TATTCCATGATCTGCTGGATTAAAGGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1FI67JQ U 1
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RD RS1FI67JQ 567 0 0
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BQ
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AF RS1E562JQ U 1
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QA 1 767 1 767
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QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 3

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BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BT41TF U 3
AF RS1BT41JQ C 522
AF RS1H632TF U 1
BS 1 184 RS1H632TF
BS 185 185 RS1BT41TF
BS 186 242 RS1H632TF
BS 243 243 RS1BT41TF
BS 244 252 RS1H632TF
BS 253 253 RS1BT41TF
BS 254 540 RS1H632TF
BS 541 541 RS1BT41TF
BS 542 558 RS1H632TF
BS 559 559 RS1BT41TF
BS 560 675 RS1H632TF

RD RS1BT41TF 643 0 0
TTCTCATTCATTCATCAATCATCTCTAAACCCTAGATTCGTCCCGTTGAAGAAGAGGAGA
TGCTGCGAGTTGCAGGGAGGAGGCTTTTGTCTGTACAGCAGAGATCTTCGACTGCGACCA
CCTTCGTCCTGTCCCGAGATCATACCATCGACTCATCTTCCTCCGCCACCCCCAGATCTG
TTCCATCTCCTGATCTCTCGTCTTTCAATTCTTACCACAGGAGCCTTATAAGAGGTTTCG
CTTCTCAAGTCCTCACCCAAGGAAGTGAGGTAGGTTTTGCTTCGGAAGTCCCAGCAACCG
TGGAGGCTGTCAAGACACCCAACTCAAAGATTGTCTATGATGACCACAACCATGAGCGTT
ACCCGCCTGGTGACCCTAGCAAGCGTGCATTCGCCTATTTCGTCCTTTCTGGTGGGAGGT
TTGTCTACGCCTCTGTTCTCCGCCTTCTTGTTCTGAAGCTCATTGTCAGCATGTCCGCGA
GTAAAGATGTCCTTGCACTCGCATCCCTCGAGGTCGACCTTGGGAGCATCGAACCGGGGA
CTACTGTCACGGTGAAAGTGGCGTGGAAA*GCCCGTGTTCATCAGGCGAAGAACAGAGGA
TGACATCAAGCTGGCCA*CAGTGTGGATCTTGGAACTCTGAGA

QA 1 643 1 643
DS 

RD RS1BT41JQ 104 0 0
TG
GGGAGCATCGAACCGGGGACTACTGTCACGGTGAAAGTGGCGTGGAAAAGCCCGTGTTCA
TCAGGCGAAGAACAGAGGATGACATCAAGCTGGCCA
ACAGTG

QA 3 98 3 98
DS 

RD RS1H632TF 675 0 0
GATTCTCATTCATTCATCAATCATCTCTAAACCCTAGATTCGTCCCGTTGAAGAAGAGAA
GATGCTGCGAGTTGCAGGGAGGAGGCTTTTGTCTGTACAGCAGAGATCTTCGACTGCGAC
CACCTTCGTCCTGTCCCGAGATCATACCATCGACTCATCTTCCTCCGCCACCCCCAGATC
TGTTTCATCTCCTGATCTCTCGTCTTTCAATTCTTACCACAGGAGCCTTATAAGAGGTTT
CGTTTCTCAAGTTCTCACCCAAGGAAGTGAGGTAGGTTTTGCTTCGGAAGTCCCAGCAAC
CGTGGAGGCTGTCAAGACACCCAACTCAAAGATTGTCTATGATGACCACAACCATGAGCG
TTACCCGCCTGGTGACCCTAGCAAGCGTGCATTCGCCTATTTCGTCCTTTCTGGTGGGAG
GTTTGTCTACGCCTCTGTTCTCCGCCTTCTTGTTCTGAAGCTCATTGTCAGCATGTCCGC
GAGTAAAGATGTCCTTGCACTCGCATCCCTCGAGGTCGACCTTGGGAGCATCGAACCGGG
AACTACTGTCACGGTGAA*GTGGCGTGGAAA*GCCCGTGTTCATCAGGCGAAGAACAGAG
GATGACATCAAGCTGGCCAACAGTGTGGATCTTGGAACTCTGAGAGACCCACAGAAGATG
CGGTGAGGGTAAGAA

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 3

CO CL3919Contig1 1024 3 8 U
GTGGGAATGCGGCTGGAACAATGGGGGCTACTGCTCAAAGCTTGTGGAAGTTCAACGTTG
TTCAGACTGGAACTCACCACGCTTTAAACCCGGATCCATATAGAGGTGTGTTTGGTTCTG
ACGGAGAGAAGTATGCAAGAGATGTGCAAGATCTCATCCAATATGGCACTACCGGACACA
TTGCTGGTTTCATCTGTGAAGCTATACAGGGAGTTGGAGGGATTGTGGAACTAGCTCCAG
GCTATTTGTCAGCAGCTTACGACATTGTGAAGAAGGCTGGAGGATTGTTCATTGCTGATG
AAGTACAGTCTGGATTCGCTCGCACTGGAGACTTCTGGGGATTTGAGGCTCACAACGTTG
TCCCTGACATAGTTACCATGGCAAAGGGAATTGGGAATGGGTTTCCTTTGGGAGCGGTTG
TGACAACTCCGGAGATAGCAGGAGTGCTGACTCGGCGATGCTACTTCAACACATTTGGTG
GGAATGCTGTGTCTACTACAGCAGGTCTCGCTGTTCTGAATGTGATTGAGAAAGAGAAGC
TTCAGGAGAATGCTTCAATGGTCGGATCTTATCTTAAAGGAAAACTCAATCAGCTGAAAG
AGAAACATGAAATTATTGGGGACGTACGTGGAAGAGGACTGATGCTTGGAGTAGAGCTGG
TAAGTGATCGCAAGCTCAAGACTCCTGCAACTGCTGAGACTCTGCACATCATGGATCAAA
TGAAAGAGTTGGGTGTGTTGGTTGGAAAAGGAGGCTATTTTGGAAACGTGTTTAGAATCA
CACCACCTCTCTGCTTCACTAAGGAAGACGCAGATTATCTTGTGGAAGCGATGGACTACT
CGATCTCCAAGATGTGAAGGAAACAAAAGAAAAGTAGTATAAAATGTCTCTTTGTGGGAG
ATTAATAAGTTGTGGTATAATTATGCTTGTAACTTTGCTTCAAACAACTACAATGATTGA
TGAGCCAACATCTCGTTGCTTCTCAATCCCTCTGTTTTCTTAATCAAAAACGTATTTTTC
TTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1D758TF U 1
AF RS1D758JQ C 368
AF RS1E856TF U 616
BS 1 678 RS1D758TF
BS 679 679 RS1E856TF
BS 680 689 RS1D758TF
BS 690 690 RS1E856TF
BS 691 719 RS1D758TF
BS 720 720 RS1E856TF
BS 721 746 RS1D758TF
BS 747 1024 RS1E856TF

RD RS1D758TF 746 0 0
GTGGGAATGCGGCTGGAACAATGGGGGCTACTGCTCAAAGCTTGTGGAAGTTCAACGTTG
TTCAGACTGGAACTCACCACGCTTTAAACCCGGATCCATATAGAGGTGTGTTTGGTTCTG
ACGGAGAGAAGTATGCAAGAGATGTGCAAGATCTCATCCAATATGGCACTACCGGACACA
TTGCTGGTTTCATCTGTGAAGCTATACAGGGAGTTGGAGGGATTGTGGAACTAGCTCCAG
GCTATTTGTCAGCAGCTTACGACATTGTGAAGAAGGCTGGAGGATTGTTCATTGCTGATG
AAGTACAGTCTGGATTCGCTCGCACTGGAGACTTCTGGGGATTTGAGGCTCACAACGTTG
TCCCTGACATAGTTACCATGGCAAAGGGAATTGGGAATGGGTTTCCTTTGGGAGCGGTTG
TGACAACTCCGGAGATAGCAGGAGTGCTGACTCGGCGATGCTACTTCAACACATTTGGTG
GGAATGCTGTGTCTACTACAGCAGGTCTCGCTGTTCTGAATGTGATTGAGAAAGAGAAGC
TTCAGGAGAATGCTTCAATGGTCGGATCTTATCTTAAAGGAAAACTCAATCAGCTGAAAG
AGAAACATGAAATTATTGGGGACGTACGTGGAAGAGGACTGATGCTTGGAGTAGAGCTGG
TAAGTGATCGCAAGCTCA*GACTCCTGCA*CTGCTGAGACTCTGCACATCATGGATCAA*
TGAAAGAGTTGGGTGTGTTGGTTGGA

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1D758JQ 587 0 0
CATAGTTACCATGGCAAAGGGAATTGGGAATGGGTTTCCTTTGGGAGCGGTTGTGACAAC
TCCGGAGATAGCAGGAGTGCTGACTCGGCGATGCTACTTCAACACATTTGGTGGGAATGC
TGTGTCTACTACAGCAGGTCTCGCTGTTCTGAATGTGATTGAGAAAGAGAAGCTTCAGGA
GAATGCTTCAATGGTCGGATCTTATCTTAAAGGAAAACTCAATCAGCTGAAAGAGAAACA
TGAAATTATTGGGGACGTACGTGGAAGAGGACTGATGCTTGGAGTAGAGCTGGTAAGTGA
TCGCAAGCTCAAGACTCCTGCAACTGCTGAGACTCTGCACATCATGGATCAAATGAAAGA
GTTGGGTGTGTTGGTTGGAAAAGGAGGCTATTTTGGAAACGTGTTTAGAATCACACCACC
TCTCTGCTTCACTAAGGAAGACGCAGATTATCTTGTGGAAGCGATGGACTACTCGATCTC
CAAGATGTGAAGGAAACAAAAGAAAAGTAGTATAAAATGTCTCTTTGTGGGAGATTAATA
AGTTGTGGTATAATTATGCTTGTAACTTTGCTTCAAACAAC
CAAAAA

QA 1 581 1 581
DS 

RD RS1E856TF 409 0 0
TTGGGGACGTACGTGGAAGAGGACTGATGCTTGGAGTAGAGCTTGTAAGTGATCGCAAGC
TCAAGACTCCTGCAACTGCCGAGACTCTGCACATCATGGATCAAATGAAAGAGTTGGGTG
TGTTGGTTGGAAAAGGAGGCTATTTTGGAAACGTGTTTAGAATCACACCACCTCTCTGCT
TCACTAAGGAAGACGCAGATTATCTTGTGGAAGCGATGGACTACTCGATCTCCAAGATGT
GAAGGAAACAAAAGAAAAGTAGTATAAAATGTCTCTTTGTGGGAGATTAATAAGTTGTGG
TATAATTATGCTTGTAACTTTGCTTCAAACAACTACAATGATTGATGAGCCAACATCTCG
TTGCTTCTCAATCCCTCTGTTTTCTTAATCAAAAACGTATTTTTCTTAT

QA 1 409 1 409
DS 



AS 1 3

CO CL3920Contig1 1221 3 5 U
GGACCCCATTCCATCATCCCTCATTCATTTATCATAACCAAAAACCATTATATGTATTTT
TCTATTGTTTTCCCTTATGAATAAGCCAAAGAAAAAAGATACATATTTTCTATTAGTTTT
TCTTATAATATGAAAAGCAAAAAAAAAAAGATTGTGGAGGAATATTAATACATGCCCACT
TCACATCTAGTTTTGTGCAGCCCTCTTTCTAAAGCTTCTCTCTGACAATGGAAACCATAG
AGAAGAGTGTTTCTCAAGTAACCTTAACCTCCTCCGCCATCTTCACCGTATCTTCCTCCG
CCGCCCCAGCCTCATTATCCTCATCTACAACATCTTCTTCTTCCTCTTCATCAACAACTT
ATAACTCTAAAAGAAAAGCATCTCCAAGATCATTAGAAGTTCACGACGATGATGATGATA
ACGTCGTGAAACGGCGGAAGATAAGCGGCGGAGATAAGCATCCAACCTATAGAGGAGTAC
GGATGAGGAGTTGGGGGAAATGGGTGTCCGAGATTAGAGAGCCGAGGAAGAAATCAAGAA
TCTGGCTCGGAACTTATCCAACGGCTGAGATGGCAGCTCGAGCTCACGACGTAGCATCTT
TAGCCATTAAAGGTACAACGGCTCATCTCAATTTTCCTGGATTATCCGGGGAGCTTCCTC
GTCCCGTCACAAATTCTCCTAAAGACATTCAAGCGGCTGCGACCGCAGCTGCAGTGAATT
GGCAAGACTTCGGCGCAAATAGCCTCCGTGTGAGTAGTTCCGATGTAGCTGAATCAGCTG
AAGCCGAGCCGAGTCGAGTAGTGATGGCTCAGTCGTTGTCAGGTAGTGCGGGGTTTTCTT
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AAAAAGACAATGAGGAAGAGAAGTTGTTTGATTTGCCGGATTTGTTTACGGACGAGATGA
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BQ
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AF RS1H184TF U 1
AF RS1EA48TF U 193
AF RS1EA48JQ C 528
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GG
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CGAGTAGTGATGGCTCAGTCGTTG

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DS 



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GAACGGAGCATCAATCTCTCCCCTCCTTCGACTGATGCTGTGAATGGGACGACGAGGACT
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ATGGTTCCAACTAAATCAGCTAGAGCCAGGGTCAACAACAAGCCTCAGAGCCCATCAAGT
GGTAGTGGTACCACACAGGAGAACGATGGCTTTACGGCTAAGAAACGCCTCTCGTATCCT
GCTTCGCCTGCGTTGCCTAAACCACGGCGGTTCTCAGCTCCGCCTAAGGCGGAGAGTGGC
GGCGTCGTCACCGTGACCAACGGAGGAGGAAGCTGAGGTATTTCTATTTATTACTGTCTT
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GTATGTTTGTTATACGTTCACTTTCAGTTTGGTAATTCATTTGTGCAGAGTGTAAACGCG
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10 10 10 10 

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GGTACCACACAGGAGAACGATGGCTT

QA 1 626 1 626
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AATAAACTTCATTATTCGACGATAAGGTTACCGAAAAAAA

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DS 



AS 1 3

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GTCAGGGTGATCTTGGACGTGCCCTGAAGAGGTTTTTGGCTGTGGAGAAGCACTATACTG
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CATATGTCGACATGCTTAAGTTCCAAGACCGATTACACTCATTCCCATATTTCCACAAAG
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AGGCAGAAGAAAGAGCAAAGAAAGAAGCTGAGAGTAAGAGTTAAGAATCAACTGCCGGTG
GAGTTTCTAAGTCTGGCAAAAAAAATGTGAAGCCTGTAGATCCAGATCCTCATGGGCAAA
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AGCATTCACCTAATTCTTTGGAGACTCATCTAGTCTCTTTTGAGGTTAACATGAGAAAAC
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AATTGCAGAATAAATCACTAACGGAGTAA


BQ
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AF RS1AP33TFB U 1
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AF RS1GR47TF U 563
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ATCAGGTGACCTTGGCTGAGAAAACTGCTGTTTTATTCACAAAAGAGGGGGATCAGATCA
ACAATCTTCATGACATGCAGTGCATGTGGTATGATCTTGCATCTGGAGATAGCTACTTCC
GTCAGGGTGATCTTGGACGTGCCCTGAAGAGGTTTTTGGCTGTGGAGAAGCACTATACTG
ACATTTCTGAAGATCAGTTTGATTTCCACTCGTACTGTCTAAGAAAAATGACTTTGCGTT
CATATGTCGACATGCTTAAGTTCCAAGACCGATTACACTCATTCCCATATTTCCACAAAG
CAGCAATCAGAGCTA

QA 1 675 1 675
DS 

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GCTACTGGAAGTTACCCAGGAAGTGATGTGAAAGAGCCCCCGTCAACTCTATTGTGGACT
TTGTTTTTCTTGGCCCAGCATTACGACAAGCGTGGTCAATATGATGTTGCCCTTGGTAAA
ATTGACGAGGCCATTGCTCATACACCCACAGTGATTGATCTGTACTCTGTCAAGAGCCGA
ATAATGAAGCATGCAGGAGACTTGACTTCAGCTGCCGCACTTGCCGATGAAGCTAGATGC
ATGGACTTAGCAGATCGCTATATAAACAGTGAATGTGTTAAGCGTATGCTGCAAGCAGAT
CAGGTGACCTTGGCTGAGAAAACTGCTGTTTTATTCACAAAAGAGGGGGATCAGATCAAC
AATCTTCATGACATGCAGTGCATGTGGTATGATCTTGCATCTGGAGATAGCTACTTCCGT
CAGGGTGATCTTGGACGTGCCCTGAAGAGGTTTTTGGCTGTGGAGAAGCACTATACTGAC
ATTTCTGAAGATCAGTTTGATTTCCACTCGTACTGTCTAAGAAAAATGACTTTGCGTTCA
TATGTCGACATGCTTAAGTTCCAAGACCGATTACACTCATTCCCATATTTCCACAAAGCA
GCAATCAGAGCTATCAGGTGCTACCTGAAATTGCACGATTCTCCCAAATCAACTGCTGAA
GAAGATGGAATGTCAAAGATGGCTCCTGCTCAGAAGAAGAA

QA 1 761 1 761
DS 

RD RS1GR47TF 667 0 0
G
TTCCACTCGTACTGTCTTAGAAAAATGACTTTGCGTTCATATGTCGACATGCTTAAGTTC
CAAGACCGATTACACTCATTCCCATATTTCCACAAAGCAGCAATCAGAGCTATCAGGTGC
TACCTGAAATTGCACGATTCTCCCAAATCAACTGCTGAAGAAGATGGAATGTCAAA*ATG
GCTCCTGCTCAGAAGAAGAAAATGAAGAAGCAGAAAAAGGCAGAAGAAAGAGCAAAGAAA
GAAGCTGAGAGTAAGAGTTAAGAATCAACTGCCGGTGGAGTTTCTAAGTCTGGCAAAAAA
AATGTGAAGCCTGTAGATCCAGATCCTCATGGGCAAAAGTTAATTCAGGTGGAAGAGCCA
ATGGCAGAGGCTTCAAAGTACTTGAGACTTCTCCAGAAGCATTCACCTAATTCTTTGGAG
ACTCATCTAGTCTCTTTTGAGGTTAACATGAGAAAACAAAAGTTTCTGCTTGCATTCCAG
GCTGTCAAGCAAATGCTTAAATTGGATGCGGAGAACCCTGATTCACATCGTTCCCTGATC
AAATTCTTGCTCAAGACAGAATCGACAAGTGCTCCAACGACCGAAGCTGAGAAACTTCGT
TGGAGTGTCCTTGAGGCTGAGCGCCCATCAATCAGTCAATTGCAGAATAAATCACTAACG
GAGTAA

QA 2 667 2 667
DS 



AS 1 3

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GAACCTTGAGAGGAGTCTGAGCGCTTTGTGGGGAAAGCTTGCATCTGAGATATTAATGCA
GAACTGGGACATTGCATTTGAAGAGATTAACCGTGTTAAAGATATTATTGACTCAAAGAG
TTTTGCGTCACCGTTAAACCAAGTGCAGAACAGGATTTGGTTGATGCATTGGGGTCTCTA
TATCTTTTTCAACCATGATAACGGAAGGACTCAAATCATTGATCTTTTTAACCAAGACAA
GTATCTGAACGCCATACAAACGAGTGCTCCACACTTGCTGCGTTACTTGGCAACTGCTTT
CGTTGTCAACAAAAGGAAAAGGCCTCAACTGAAAGAGTTCATTAAGGTCATTCAACAAGA
GCACTACTCCTACAAAGATCCTATTGTGGAGTTCCTGGCATGTGTGTTTGTCAATTATGA
CTTTGATGGGGCTCAAAAGAAGATGAAAGAGTGTGAAGAGGTCATTGTGAATGACCCATT
CCTTGGAAAGCGAGTAGAGAATGGAAACTTTTCAACTGTTCCACTGAGAGATGAGTTTCT
TGAAAATGCCCGCCTCTTTATCTTCGAAACCTATTGCAGAATTCATCAGAGAATTGACAT
GGGGG*TACTTGCTGAGAAATTGAATCTGAACTATGAAGAGGCAGAGAGATGGATTGTGA
ACCTTATCCGCACCTCAAAGCTCGATGCCAAGATTGATTCCGAGTCGGGAACCGTAATCA
TGGAGCCTACTCAACCCAACGTGCACGAGCAGTTGATTAACCACACCAAAGCCTTATCAG
GACGGACTTACAAGTTAGTGACTCAGCTCTTAGAACACACACAGGGGCAAGCAGCTCGTT
AATCACAGTTTTGCTGTCGACTCTGTCTATCCTTAGACCCTTTCCTTGATAATCATCAGT
TTGTTTTGTCTGGAATCAATTGTTTTTGATCTTTGAATCATGCCCACACACATGGTCATC
TTTGCAGAAATTCTATTTAATATTGGATTCAGAACTTTTCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DH67TF U 1
AF RS1DH67JQ C 237
AF RS1BM26TF U 550
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BS 606 606 RS1BM26TF
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BS 805 1003 RS1BM26TF

RD RS1DH67TF 756 0 0
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GAACTGGGACATTGCATTTGAAGAGATTAACCGTGTTAAAGATATTATTGACTCAAAGAG
TTTTGCGTCACCGTTAAACCAAGTGCAGAACAGGATTTGGTTGATGCATTGGGGTCTCTA
TATCTTTTTCAACCATGATAACGGAAGGACTCAAATCATTGATCTTTTTAACCAAGACAA
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CTTTGATGGGGCTCAAAAGAAGATGAAAGAGTGTGAAGAGGTCATTGTGAATGACCCATT
CCTTGGAAAGCGAGTAGAGAATGGAAACTTTTCAACTGTTCCACTGAGAGATGAGTTTCT
TGAAAATGCCCGCCTCTTTATCTTCGAAACCTATTGCAGAATTCATCAGAGAATTGACAT
GGGGGGTACTTGCTGAGAAATTGAATCTGAACTATGAAGAGGCAGAGAGATGGATTGTGA
ACCTTATCCGCACCTCAAAGCTCGATGCCA*GATTGATTCCGAGTCGG*AACCGTAATCA
TGGAGCCTACTCAACCCAACGTGCACGAGCAGTTGA

QA 1 756 1 756
DS 

RD RS1DH67JQ 761 0 0
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CTTTCGTTGTCAACAAAAGGAAAAGGCCTCAACTGAAAGAGTTCATTAAGGTCATTCAAC
AAGAGCACTACTCCTACAAAGATCCTATTGTGGAGTTCCTGGCATGTGTGTTTGTCAATT
ATGACTTTGATGGGGCTCAAAAGAAGATGAAAGAGTGTGAAGAGGTCATTGTGAATGACC
CATTCCTTGGAAAGCGAGTAGAGAATGGAAACTTTTCAACTGTTCCACTGAGAGATGAGT
TTCTTGAAAATGCCCGCCTCTTTATTTTCGAAACCTATTGCAGAATTCATCAGAGAATTG
ACATGGGGG*TACTTGCTGAGAAATTGAATTTGAACTATGAAGAGGCAGAGAGATGGATT
GTGAACCTTATCCGCACCTCAAAGCTCGATGCCAAGATTGATTCCGAGTCGGGAACCGTA
ATCATGGAGCCTACTCAACCCAACGTGCACGAGCAGTTGATTAACCACACCAAAGCCTTA
TCAGGACGGACTTACAAGTTAGTGACTCAGCTCTTAGAACACACACAGGGGCAAGCAGCT
CGTTAATCACAGTTTTGCTGTTTACTCTGTCTATCCTTAGACCCTTTCCTTGATAATCAT
CAGTTTGTTTTGTCTGGAATCAATTGTTTTTGATCTTTGAATCATGCCCACACACATGGT
CGTCTTTGCAGAAATTCTATTTAATATTGGATTCAGAACT
G

QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1BM26TF 454 0 0
G
CGCCTCTTTATCTTCGAAACCTATTGCAGAATTCATCAGAGAATTGACATGGGGG*TACT
TGCTGAGAAATTGAATCTGAACTATGAAGAGGCAGAGAGATGGATTGTGAACCTTATCCG
CACCTCAAAGCTCGATGCCAAGATTGATTCCGAGTCGGGAACCGTAATCATGGAGCCTAC
TCAACCCAACGTGCACGAGCAGTTGATTAACCACACCAAAGCCTTATCAGGACGGACTTA
CAAGTTAGTGACTTAGCTCTTAGAACACACACAGGGGCAAGCAGCTCGTTAATCACAGTT
TTGCTGTCGACTCTGTCTATCCTTAGACCCTTTCCTTGATAATCATCAGTTTGTTTTGTC
TGGAATCAATTGTTTTTGATCTTTGAATCATGCCCACACACATGGTCATCTTTGCAGAAA
TTCTATTTAATATTGGATTCAGAACTTTTCTTG

QA 2 454 2 454
DS 



AS 1 2

CO CL3924Contig1 858 2 4 U
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CCAATCTCGGCGCCTCTCTTCCTCCACCTTCAATAATACAACAGGATATCGTCGGTCCAT
AGCAAGGACATGGCCACCACCATCATCAGTTATACCTAAGGTCAGATTCCCCGAGGTTTC
ATCCTTAAACCAGAGAAGCTTTGCATCATCATCTGGAGGAGCAAAGACTAGAGAAGACAA
TGATGATGATGATGATGAGCACAAGATCAGCATCGGACCGCAAGAGTGGAAACAAGAGGA
CGGTGGAGGAGGTGTGGTTTACCACGGCCCAATCTCATCCACCATAAAGAAAGTCAAACT
CCTCTCCCTCTCCACCTGCTGCCTCTCCGTCTCCCTCTGCCCCGTCATCACTTTCATGAC
CTCCCCGGGCCTCAACGTGATCATGAAAGGCGCCGTCGCCTCCACCGTGATCTTCCTCAG
CGCTTCCACGACCGCCGCGTTGCACTGGTTCGTCAGCCCTTACGTCCACAGGCTGAGGTG
GGTGCCTGGCTCGGACACGTTCGAGGTCGAGATGATGACTTGGCTCGCGACGTTTGCGCC
CAAGACGCTGAAGTTCTCGGACGTGCGTTATCCGGACACGCAGAGGCCGTTCGTGAGCTT
CAAGGCGGATGGGAATTACTACTTTGTGGATGCGGAGCATTGTCCTAACAAGGCGTTGTT
GGCTAGGCTCACTCCTCCCAAGGATGCACATGACTCTGCTTTCAAGAACTTGTGATCCAT
TTCCTTTTCTTTAATATCATACTTTTGTTGGGGTTTGTAACTCTTTTGTGGCCTTGGACT
ACCCGGAAAATGGCAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FZ57TF U 1
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CGGTGGAGGAGGTGTGGTTTACCACGGCCCAATCTCATCCACCATAAAGAAAGTCAAACT
CCTCTCCCTCTCCACCTGCTGCCTCTCCGTCTCCCTCTGCCCCGTCATCACTTTCATGAC
CTCCCCGGGCCTCAACGTGATCATGAAAGGCGCCGTCGCCTCCACCGTGATCTTCCTCAG
CGCTTCCACGACCGCCGCGTTGCACTGGTTCGTCAGCCCTTACGTCCACAGGCTGAGGTG
GGTGCCTGGCTCGGACACGTTCGAGGTCGAGATGATGACTTGGCTCGCGACGTTTGCGCC
CAAGACGCTGAAGTTCTCGGACGTGCGTTATCCGGACACGCAGAGGCCGTTCGTGAGCTT
CAAGGCGGATGGGAATTACTACTTTGTGGATGCGGAGCATTGTCCTAACAAG*CGTTGTT
GGCTAGGCTCACTC

QA 1 734 1 734
DS 

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GGACCGCAAGAGTGGAAACAAGAGGACGGTGGAGGAGGTGTGGTTTACCACGGCCCAATC
TCATCCACCATAAAGAAAGTCAAACTCCTCTCCCTCTCCACCTGCTGCCTCTCCGTCTCC
CTCTGCCCCGTCATCACTTTCATGACCTCCCCGGGCCTCAACGTGATCATGAAAGGCGCC
GTCGCCTCCACCGTGATCTTCCTCAGCGCTTCCACGACCGCCGCGTTGCACTGGTTCGTC
AGCCCTTACGTCCACAGGCTGAGGTGGGTGCCTGGCTCGGACACGTTCGAGGTCGAGATG
ATGACTTGGCTCGCGACGTTTGCGCCCAAGACGCTGAAGTTTTCGGACGTGCGTTATCCG
GACACGCAGAGGCCGTTCGTGAGCTTCAAGGCGGATGGGAATTACTACTTTGTGGATGCG
GAGCATTGTCCTAACAAGGCGTTGTTGGCTAGGCTCACTCCTCCCAAGGATGCACATGAC
TCTGCTTTCAAGAACTTGTGATCCATTTCCTTTTCTTTAATATCATACTTTTGTTGGGGT
TTGTAACTCTTTTGTGGCCTTGGACTACCCGGAAAATGGCAAAT

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 3

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TTTTTAAACCCTTTTTCTCTCTTCGTCTTCCTTCTAAACTTCAAAAATAATCAGAAATTG
CTACGTGTATTTCTTTCGTCTGCGAGATTCATCTGCTGCTGAGAAAAAAGGAATAGGGGC
ATGGAAGAAGAAGCAAACGCAACGAGGTACTGGTGCCACATGTGTTCCCAAACCGTGAAC
GCGGTGGTGATGGAAGATGAGATCAAATGCACCCTCTGTCGAAGCGGCTTTATTGAAGAG
ATGGATGATCGGAGGAGAGCAACAAACAACGCTTCAATCCTGGCTCCCATCTTAATGGAA
ATGATCAACAACTCTTCGTCTTCTGCTACAAGGAACCTTAGCGCTGAGACTCTGAACGAA
ATAATCCGAAACAACAACAAAACACGCTCTGTTTCCGTTGTGCAACTGCTTCATGGAGTA
AGACCACTTGAACCCGAGAGTAGCAGCAGAGATGATAATGGGGCGGATAGAGAGAGAGGA
GGACGCATGATCTTCATCGATCCGCATCGTCAAATCATCGCCATCCCGAGCTCTCTCGTT
AGGGATTCCATCCCTACTGGTTCTTCTCTGAGCGACTATTTCATCGGTCCTGGATTCGAA
GCCCTGCTTCAGCGTTTAGCGGAGAATGATCCCAACAGATACGGAACTCCTCCAGCTCGT
AAAGAAGATGTTGAGTCTTTGGCTACTGTCAGAATCCAGGATCCGAGTCTGCAGTGTTCT
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TTCCATGCTGACTGCTTGCTCCCGTGGCTTGAGCTTCACAGTTCGTGCCCTGTTTGTAGG
TATCAGTTACCTACCGCAGATGAGACTAATAAGACTACCGGTGAAGAAACAAATGAAAAC
AATGAAGTTAATGAGTCCTCTGCTACAGGCAGTAGCCAGGGAACTGAGAACAGCGATGCA
AACCGTCTCGAAGGAGAAGAGGAGAACGATGATGGTAATAGGAACGCATTCTCCATCCCA
TGGCCGTTTAGCAGCTTTATCTCGTCCTTGTTCTCTCAAGACAGAAATTCATCAAATTGA
AAATGATACCTGAGGCAGCAACATTAGACTTTTTACTCTATGATCATGAGACCACGGTTC
ATCTTTTTTTTTTTTGTCTGTACATACAGCTTCTCGGATTTGGTTGAATGCTAGCTCCTC
GTTGAAAAACAGAAGTATGTTTTGAACAGTTGTTGCTCTTTGATTTTAAGAAACATTGCA
GTATCTTGTTTAGTCAACGATCGCATTCACATGCAAA


BQ
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AF RS1D123TF U 1
AF RS1C130TF U 37
AF RS1D123JQ C 631
BS 1 98 RS1D123TF
BS 99 99 RS1C130TF
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BS 380 380 RS1C130TF
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BS 382 382 RS1C130TF
BS 383 407 RS1D123TF
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RD RS1D123TF 638 0 0
TTTTTAAACCCTTTTTCTCTCTTCGTCTTCCTTCTAAACTTCAAAAATAATCAGAAATTG
CTACGTGTATTTCTTTCGTCTGCGAGATTCATCTGCTGTTGAGAAAAAAGGAATAGGGGC
ATGGAAGAAGAAGCAAACGCAACGAGGTACTGGTGCCACATGTGTTCCCAAACCGTGAAC
GCGGTGGTGATGGAAGATGAGATCAAATGCACCCTCTGTCGAAGCGGCTTTATTGAAGAG
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ATAATCCGAAACAACAACAGACCACGCTCTGTTTCCGTTGTGCAACTTCTTCATGGAGTA
AGACCACTTGAACCCGAGAGTAGCAGCAGAGATGATAATGGGGCGGATAGAGAGAGAGGA
GGACGCATGATCTTCATCGATCCGCATCGTCAAATCATCGCCATCCCGAGCTCTCTCGTT
AGGGATTCCATCCCTACTGGTTCTTCTCTGAGCGACTATTTCATCGGTCCTGGATTCGAA
GCCCTGCTTCAGCGTTTAGCGGAGAATGATCCCAA
GAG

QA 1 635 1 635
DS 

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GGACTTC
AAAATAATCATAAATTGCTACGTGTTTTTCTTTTGTCTGTGAGATTCATCTGGTGCTGAG
AAAAAAGGAATAGGGGCATGGAAGAAGAAGCAAACGCAACGAGGTACTGGTGCCACATGT
GTTCCCAAACCGTGAACGCGGTGGTGATGGAAGATGAGATCAAATGCATCCTCTGTCGTA
GCGGCTTTATTGAAGAGATGGATGATGGGAGGAGAGCAACAAACAACGCTTCAATCCTGG
CTCCCATCTTAATGGAAATGATCAACAACTCTTCGTCTTCTGCTACAAGGAACCTTAGCG
CTGAGACTCTGAACGAAATAATCCGAAACAACAACAACAGACGCTCTGTTTCCGTTGTGC
AACTGCTTCATGGAGTAAGACCACTTGAACCCGAGAGTAGCAGCAGAGATGATAATGGGG
CGGATAGAGAGAGAGGAGGACGCATGATCTTCATCGATCCGCATCGTCAAATCATCGCCA
TCCCGAGCTCTCTCGTTAGGGATTCCATCCCTGCTGGTTCTTCTCTGAGCGACTATTTCA
TCGGTCCTGGATTCGAAGCCCTGCTTCAGCGTTTAGCGGAGAATGATCCCAACAGATACG
GAACTCCTCCAGCTCGTAAAGAAGATGTTGAGTCTTTGGCTACTGTCAGAATCCAGGATC
CGAGTCTGCAGTGTTCTGTGTGTTTGGATGATTTTGAGGTTGGGATCGAG
CTAACAGATGCC

QA 8 717 8 717
DS 

RD RS1D123JQ 667 0 0
CCCAAGAGATACGGAACTCCTCCAGCTCGTAAAGAAGATGTTGAGTCTTTGGCTACTGTC
AGAATCCAGGATCCGAGTCTGCAGTGTTCTGTGTGTTTGGATGATTTTGAGGTTGGGATC
GAGGCTAAACAGATGCCATGTAAGCATAGCTTCCATGCTGACTGCTTGCTCCCGTGGCTT
GAGCTTCACAGTTCGTGCCCTGTTTGTAGGTATCAGTTACCTACCGCAGATGAGACTAAT
AAGACTACCGGTGAAGAAACAAATGAAAACAATGAAGTTAATGAGTCCTCTGCTACAGGC
AGTAGCCAGGGAACTGAGAACAGCGATGCAAACCGTCTCGAAGGAGAAGAGGAGAACGAT
GATGGTAATAGGAACGCATTCTCCATCCCATGGCCGTTTAGCAGCTTTATCTCGTCCTTG
TTCTCTCAAGACAGAAATTCATCAAATTGAAAATGATACCTGAGGCAGCAACATTAGACT
TTTTACTCTATGATCATGAGACCACGGTTCATCTTTTTTTTTTTTGTCTGTACATACAGC
TTCTCGGATTTGGTTGAATGCTAGCTCCTCGTTGAAAAACAGAAGTATGTTTTGAACAGT
TGTTGCTCTTTGATTTTAAGAAACATTGCAGTATCTTGTTTAGTCAACGATCGCATTCAC
ATGCAAA

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 3

CO CL3926Contig1 588 3 7 U
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TGGTGAAGAAGAGGTCTGCCAAATTCATCAGACCCCAGAGTGATCGCAGAATCACCGTCA
AGGAAAGCTGGAGGAGGCCAAAGAGTATTGATTCCAGGGTGAGGAGGAAGTTCAAAGGTG
TGACCTTGATGCCCAATGTTGGTTACGGATCTGACAAGAAGACTCGTCACTATCTCCCCA
ACGGATTCAAGAAGTTTGTTGTTCACAACTCTGCTGATCTTGAGTTACTCATGATGCACA
ACAG*********GACATACTGTGCCGAGATTGCTCGCAATGTATCAACAAAGAAGAGGA
AAGCCATTGTGGAGAGAGCTTCCCAGCTTGACATCGTCGTTACCAACAGGCTTGCTAGGT
TGCGTAGCCAGGAAGACGAGTGATGAACGAAAGCCCTATGTTTCTTTTATCTGTCTTTAT
TGGCAAATTTCTCAGTTGATCATAACTTAATTTTTGCGGATTAAAGAGTTAAAGACTGAA
TGTTTTTATGGGTTTCTGTTTTCAATATATGACCACCAATTCACAATC


BQ
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AF RS1CD38TF U 1
AF RS1DD90JQ C 1
AF RS1DD90TF U 1
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BS 144 144 RS1DD90TF
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QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 3

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ATACGCTGCACCTTATGCACACTGGGCTGAAGTGTTGCTTCTTGGAATCCCAACGTTTAT
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AAGTGTGTCGGGGCTGGGTTTTGTTCTTTTCTCGCATTTTATTTAGTTTATGTTGTTTGT
CATGGAGAAGGAATTGACATGTCATCAAAGCC


BQ
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AF RS1EE82TF U 1
AF RS1DL36TF U 147
AF RS1EE82JQ C 558
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BS 715 715 RS1DL36TF
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BS 743 780 RS1EE82TF
BS 781 841 RS1DL36TF
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RD RS1EE82TF 780 0 0
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AGCTCCTCTCCCTCTGGTTCTCGTCGAGCTGGCTCGATCCGCTTCTGGGTGGTTCGACCG
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ATACGCTGCACCTTATGCACACTGGGCTGAAGTGTTGCTTCTTGGAATCCCAACGTTTAT
GGGACCAGCGATTGCTCCTGGTCACATGATAACCTTTTGGTTGTGGATAGCTTTAAAGCA
AATTGAG*CTATAGAGACGCACAGTGGATATGATTTTCCATGGAGTC*AACAAA*TACAT
CCCTTTCTATGGTGGTGCTGA*TACCATGACTACCATCACTACGTTGGAGGACAAAGCCA

QA 1 780 1 780
DS 

RD RS1DL36TF 695 0 0
G
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GCTGGCTCGATCCGCTTCTGGGTGGTTCGACCGGTACAAGATCCAACCCAAAGTAAACTA
CTCCTCGTCCGACATGTTCGGATGTTACAAAGACGTCATGAAGATGTTCATCCTCGTCGT
TGGTCCATTACAACTCGTTTCTTATCCTTCCATTCAGATGATTGGGATACGATCTGGTTT
ACCATTACCAACATTTTCAGAGATGCTGCCACAGTTGTTCGTCTACTTCTTGATAGAAGA
CTACACAAACTATTGGGTACATAGATTTTTCCACAGTAAGTGGGGATACGAGAACATTCA
TCGCGTTCATCACGAGTACACAGCTCCTATTGGATACGCTGCACCTTATGCACACTGGGC
TGAAGTGTTGCTTCTTGGAATCCCAACGTTTATGGGACCAGCGATTGCTCCTGGTCACAT
GATAACCTTTTGGTTGTGGATAGCTTTAAGGCAAATTGAGGCTATAGAGACGCACAGTGG
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TGACTACCATCACTACGTTGGAGGACAAAGCCACAGCAACTTCGCTTCAGTTTTTACTTA
TTGTGACTACATTTATGGAACTGACAAGGGTTAC

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DS 

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CTGGTCACATGATAACCTTTTGGTTGTGGATAGCTTTAAGGCAAATTGAGGCTATAGAGA
CGCACAGTGGATATGATTTTCCATGGAGTCCAACAAAATACATCCCTTTCTATGGTGGTG
CTGAATACCATGACTACCATCACTACGTTGGAGGACAAAGCCACAGCAACTTCGCTTCAG
TTTTTACTTATTGTGACTACATTTATGGAACTGACAAGGGTTACCGATTCCAAAAGAAGC
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CCGATTAGTAAATTAAAATATGGTCCTGATGAAGAAGTTATGTGTGGAGAAGATGTAGGC
AAATCTACCCAGCTTCACGAAAGAAAAAGATAAGGGGAGTAGTAGTAGTTGATATTTTTC
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ACATGAAAACTGCTACTTCGGACAAATGTGGGTCATGATATATAAGTGTGTCGGGGCTGG
GTTTTGTTCTTTTCTCGCATTTTATTTAGTTTATGTTGTTTGTCATGGAGAAGGAATTGA
CATGTCATCAAAGCC

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 3

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CCTTTTATATGTTTCTCCTCTTAAATATTTACACGTATGCCTCGGTGGATATAGACCTAG
AGAACATGTGGAACTAAAAGCTAACACACTCACTTTTGACAGCGTGTTAGCGTGTAATTG
CTTTGAATTAAAGTATGTATGGGGGGAAACGGGAGTGAAGAGATTGATTCTATACTATTA
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ACCTTCTTCATACACACTTGTCAAATAGTTATGCATCTCTATCACACCCCGTTGGTCAAG
CTCTGCTACTTCGTTCATGACGCCTTTGAACCAATCGAAAGAGCCTTGTTCTCTTGTGAC
CCAATAGAAGTAAGCATTTGTGGTTTTTAATATTTTTTTTCCTCTCGGTGTATTAGCATT
GTTGCCGCTGTTGCTTCCTGTGCTGTTCTCTGATGATCTACTAAAATCAGAGGTTGAATC
CGCTTGCTCCTCCATTTTAACAATGTTGTTGAGCAAATCTTTCAAGATACTGATAAATGG
AGTTGCACCAATGCCAAGACCAACTAATAAGAGAACATCATATTTTCTATAGTCTTGTGC
TGGTGCACCATACGGTCCATCTATCAACAGCTTTGGCAAACTTTTCTTTGTTGTTTCATC
GGCTCTAAGAAGTCCACTTTTACCGGCAACCGGTGGCTCACACACTTCAGAGAATACTCT
TTTGAGTTCTTGAGTCCAATCTCCGAGCTGTCTAATGTGGATACTGAGGTAATCATCTCC
AGGTGCTGAAGTAATGGAGAATGGATGCCATTCAAATGGAGAAACTGCTGGACATTGAAC
GAACATGTACTGTCCACTTTTGTAACGAAACTGAGATGGTTTCGACATTTGCAGCGTCAG
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GTACCTAAGTGTTCTTTCTCCACCATAGAGTAAAACTGGTACTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FS06JQ U 33
AF RS1BH33JQ U 1
AF RS1BH33TF C 590
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BS 470 470 RS1FS06JQ
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RD RS1FS06JQ 633 0 0
G
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AGTGAAGAGATTGATTCTATACTATTACTTGGCTTTAGGTTTCTTCCTTCTTGTCTTTTA
AAAATGCTCCTTGTGGAACTCAAACTTCGTTGAACCCTTTTGGTTGAATGTGTTGCATAG
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TCTGACACTAGTGCCAAAAACAATGTCGACTCCATTTTTGGCATGGTTAAAAACTTGAAC
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ATCGAAAGAACCTTGTTCTCTTGTGACCCAAT

QA 2 633 2 633
DS 

RD RS1BH33JQ 766 0 0
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CCTTTTATATGTTTCTCCTCTTAAATATTTACACGTATGCCTCGGTGGATATAGACCTAG
AGAACATGTGGAACTAAAAGCTAACACACTCACTTTTGACGGCGTGTTAGCGTGTAATTG
CTTTGAATTAAAGTATGTATGGGGG*AAACGGGAGTGAAGAGATTGATTCTATACTATTA
CGTGGCTTTAGGTTTCTTCCTTCTTGTCTTTTAGAAATGCTCCTTGTGGAACTCAAACTT
CGTTGAACCCTTTTGGTTGAATGTGTTGCATAGTTTGTTAAGCTCTTTGCCTAGAACCGG
TACTCCGCAGTAAAACACTCCTATTCTTGCATTGCAGTGCTTGGAACTTAGCTTAGAGAG
AACCTTTTTCCAGTTGGGTCTTGCAAAGTGTGTCCTGACACTAGTGCCAGAAACAATATC
GACTCCATTTTTGGCATGGTTAAGAGCTTGAACCATTGTAATGAGAGCAGAACGAGCATC
ACCTTCTTCATACACACTTGTCAAATAGTTATGCATCTCTATCACACCCCGTTGGTCAAG
CTCTGCTACTTCGTTCATGACGCCTTTGAACCAATCGAAAGAGCCTTGTTCTCTTGTGAC
CCAATAGAAGTAAGCATTTGTGGTTTTTAATATTTTTTTTCCTCTCGGTGTATTAGCATT
GTTGCCGCTGTTGCTTCCTGTGCTGTTCTCTGATGATCTACTAAAA

QA 1 766 1 766
DS 

RD RS1BH33TF 716 0 0
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TCTCTTGTGACCCAATAGAAGTAAGCATTTGTGGTTTTTAATATTTTTTT*CCTCTCGGT
GTATTAGCATTGTTGCCGCTGTTGCTTCCTGTGCTGTTCTCTGATGATCTACTAAAATCA
GAGGTTGAATCCGCTTGCTCCTCCATTTTAACAATGTTGTTGAGCAAATCTTTCAAGATA
CTGATAAATGGAGTTGCACCAATGCCAAGACCAACTAATAAGAGAACATCATATTTTCTA
TAGTCTTGTGCTGGTGCACCATACGGTCCATCTATCAACAGCTTTGGCAAACTTTTCTTT
GTTGTTTCATCGGCTCTAAGAAGTCCACTTTTACCGGCAACCGGTGGCTCACACACTTCA
GAGAATACTCTTTTGAGTTCTTGAGTCCAATCTCCGAGCTGTCTAATGTGGATACTGAGG
TAATCATCTCCAGGTGCTGAAGTAATGGAGAATGGATGCCATTCAAATGGAGAAACTGCT
GGACATTGAACGAACATGTACTGTCCACTTTTGTAACGAAACTGAGATGGTTTCGACATT
TGCAGCGTCAGAATGTTACCAGGATATATAGCAACCTTTAGAAGTCGAACCGAATAAGAA
CCGGACCGGAAGTACCTAAGTGTTCTTTCTCCACCATAGAGTAAAACTGGTACTGC

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 3

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TTCTCATGTTTCATCGCTCTTTCATCATCAAGAAAATCATTAACCAGCCATCCTCCTCCA
ACAAACCTTCCAAGATCCGGTTTTCGATTAAGTCTACAACACGTAGACTCCGGTAAAAAC
CTCACAAAGATCCAAAAGATCCAAAGAGGTATTAACCGCGGATTCCACAGGCTAAACAGG
TTAGGAGCTGCAGCTGTTTTGTCTGTATCATCTAGTCCTGATGATACCAACAACATCAAA
GCACCTACTCATGGAGGAAGCGGCGAGTTTCTTGTGGATTTAGCTATAGGAAACCCTCCG
GCTAAATACTCTGCTATATTAGATACCGGTAGTGACCTCATATGGACGCAATGCAAGCCT
TGCACCGAATGTTACGACCAACCATCTCCTATTTTCGACCCGAAAAGGTCTTCTTCTTAC
ACAAAAGTTGGATGCTCTTCTGGTCTTTGCTATGCCTTGCCTCGGTCTACTTGCAACCGA
GACGAAGGAGCTTGTGAGTATTCGTATACCTATGGAGACTACTCGTCCACAAGAGGGGTC
TTGGCCAAAGAAACGTTCACTTTCGGTGGCGAAAACTCTGTTTCGGGTATAGGGTTTGGG
TGTGGGGATGAGAAC


BQ
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DS 



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CATTATGACT


BQ
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AF RS1EW69TF U 1
AF RS1DJ01TF U 438
AF RS1DJ01JQ C 884
BS 1 638 RS1EW69TF
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GAGTTATTTTTCTTTTATTTGTTGGAAGGGGGAAAGTTACAGTTTTCTTGTTTTTTTTTT
TCTTTTGTAAATCATCACATATAGAGAAAAAAGGTTAAAAAACTTTGATGTGGGTAGAGT
TTTGATTCTGGGGGGAAGTAATTAATCAGATGGCTCAACAGAGACAGTTTCAGATGGAAG
GTGGTAATAACGATACAAAGCTGACGAAAATCTTCGTGGGAGGATTAGCATGGGAGACTC
AGAAAGATACAATGAGACGTTACTTCGAACAGTTTGGTGAAATCGTTGAAGCTGTCGTCA
TTACTGATAAGAACACTGGAAGATCCAAAGGCTATGGCTTTGTGACGTTTATGGAAGCAG
ATGCAGCTATGAGAGCATGTCAGAATATGAATCCTGTGATCGATGGAAGAAGAGCTAATT
GCAATCTTGCTTTTCTTGGTGCTCACAAACCTCGTCCTCCTACTTCTCCTAGACATGGAA
CAGGGAGATTTAGGTCACCAGGAGGAGCAGGATTGGCTTCTCCTTCTCCTCAGTTTCGAG
GCTCTTCTTCTTCTTCCTCTGCTTTTGTTCATCATCATCAACA
CACACACATTGG

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1DJ01TF 790 0 0
GGAAGATCCAAAGGCTATGGCTTTGTGACGTTTATGGAAGCAGATGCAGCTATGAGAGCA
TGTCAGAATATGAATCCTGTGATCGATGGAAGAAGAGCTAATTGCAATCTTGCTTTTCTT
GGTGCTCACAAACCTCGTCCTCCTACTTCTCCTAG*CATGGAACAGGGAGATTTAGGTCA
CCAGGAGGAGCAGGATTGGTTGCTCCTTCTCCTCAGTTTCGAGGCTCTTCTTCTTCTTCC
TCTGCTTTTGTTCATCATCATCAACAACAACACATTGGTCAATTCCCATTTCCTTACTCT
GCTTACGGATTTTCTGGTTATTCTCAAGAGGGATTGTACCCAATGAATTACTACAATCAT
CAACCCTATGGAGGACAACAGTATTCACCATATATGGGACCTCCATCATCAGGATCAACA
GGAATGTTCCATGGTTACTATCCTTACTATCCTCAATACGATCCAACTCAAAGTAGTAAT
CATGCTCAAACTCCTCACCAACATCATCAAGCAATTCAGCTCTCAGCCTCCTCCACCACC
AATCCTCTCACTCCCAACCTCTCTGGCTCTATCATTAGCATCTTCGGCTTCATCTTCTTC
CTCTTTGTCAACCTCCACTTCAGCTGCAACCTCTGCAACAAAAACAGTAGTTATTACTAC
ACCAGCAGCAGCTGAAGCTAGCAACAAAGATGGTCATGAAGCAAATACCCCCTCCTCCAT
CAAGATAGAGAACTGATTCAGTACTACAATAGCAGAGCAAGGGACTACTACATTGTGCAC
TAACTCATGA

QA 1 790 1 790
DS 

RD RS1DJ01JQ 747 0 0
CTATCCTCAATACGATCCAACTCAAAGTAGTAATCATGCTCAAACTCCTCACCAACATCA
TCAAGCAATTCAGCTCTCAGCCTCCTCCACCACCAATCCTCTCACTCCCAACCTCTCTGG
CTCTATCATTAGCATCTTCGGCTTCATCTTCTTCCTCTTTGTCAACCTCCACTTCAGCTG
CAACCTCTGCAACAAAAACAGTAGTTATTACTACACCAGCAGCAGCTGAAGCTAGCAACA
AAGATGGTCATGAAGCAAATACCCCCTCCTCCATCAAGATAGAGAACTGATTCAGTACTA
CAATAGCAGAGCAAGGGACTACTACATTGTGCACTAACTCATGATCAATCTCTCCAACAT
GTTCTAGCTAAAAACATTTATTCATATCATTTATAGGATTCTAGAGTCTCTTAATTAGTA
CCTAGGAGGAGGAAGAAGAAGAAAGAAACCATCCTTCACATTCATTGTTTTATTTATTTT
CATGATTCATATTGCATTTTAGGTTAAAAGAATCAAAGAGAAGGCATTGGTAGCCTTTTT
CTGGATTATTGGATTGATGCAGAAAGCATCATTCAACATTACATTAATTTGGGGATTTAT
TTTTTAGGGTCAGAAGAATTGTTTTATGTCTTCTTCTGAACTCAAACATGATTTAAAAGC
TTCGGATGAGCTTGAAATCTCTTTTTTTTCTTTCATATTTGTAATGGTCTTAAGTCTTAT
TGCTTGTTCTTGTTCTTCATTATGACT

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

CO CL3931Contig1 812 2 2 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGACAAAAGA
GGAGAAGGAGACTACGATTTTAACAAAGATGAGGATCACTGTGATGACCGCTGGCGAACA
AATCATTACCCTTGACGTCGATTCACACGAAACCGTTGAGAATGTTAAAGCCCTGCTCGA
AGTTGAGGCGAGTGTCCCGATTCAGCAGCAGCAGCTCTTGTATAATGGAAACGAGATGAG
GAACTCTGATAAATTGAGTGCATTGGGTGTAAAGGACGATGATTTATTGATGATGATGGT
CTCCAACGCCTCTTCTGGTAGTGCGGCGGGGAATGATTTGGGTATGAATCCTGATGGGTC
AGCTTCCAACCCTGCAGCTTTTCAGCAACACATTCGGGGTGATTCTAATATTATGGGACA
GTTATTCCAGACGGATCCTGAGCTTGCACAAGTTATCTCTGGAAGCGATTTAAACAAGTT
ACAGGATGTTTTGCGTTCACGGCATCAACAGCGATCTGTGGTGCAGCGTCAGAAGGAGGA
GGAACTCGCCCTTTTGTATGCAGATCCTTTCGATGTTGAAGCACAGAAAAAAATCGAAGC
TGCAATTCGTCAGAAAGGAATTGATGAGAACTGGGAAGCTGCCCTTGAACATAATCCCGA
AGGTTTTGCTAGGGTGATAATGCTGTATGTGGATATGGAGGTCAATGGTATACCCCTAAA
GGCTTTTGTTGATAGTGGTGCTCAATCTACAATCATATCCAAGAGTTGTGCTGAGAGATG
CGGATTGCTGAGACTCATGGATCAACGGTATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A234TF U 1
AF RS1A234TV U 177
BS 1 804 RS1A234TF
BS 805 812 RS1A234TV

RD RS1A234TF 811 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGACAAAAGA
GGAGAAGGAGACTACGATTTTAACAAAGATGAGGATCACTGTGATGACCGCTGGCGAACA
AATCATTACCCTTGACGTCGATTCACACGAAACCGTTGAGAATGTTAAAGCCCTGCTCGA
AGTTGAGGCGAGTGTCCCGATTCAGCAGCAGCAGCTCTTGTATAATGGAAACGAGATGAG
GAACTCTGATAAATTGAGTGCATTGGGTGTAAAGGACGATGATTTATTGATGATGATGGT
CTCCAACGCCTCTTCTGGTAGTGCGGCGGGGAATGATTTGGGTATGAATCCTGATGGGTC
AGCTTCCAACCCTGCAGCTTTTCAGCAACACATTCGGGGTGATTCTAATATTATGGGACA
GTTATTCCAGACGGATCCTGAGCTTGCACAAGTTATCTCTGGAAGCGATTTAAACAAGTT
ACAGGATGTTTTGCGTTCACGGCATCAACAGCGATCTGTGGTGCAGCGTCAGAAGGAGGA
GGAACTCGCCCTTTTGTATGCAGATCCTTTCGATGTTGAAGCACAGAAAAAAATCGAAGC
TGCAATTCGTCAGAAAGGAATTGATGAGAACTGGGAAGCTGCCCTTGAACATAATCCCGA
AGGTTTTGCTAGGGTGATAATGCTGTATGTGGATATGGAGGTCAATGGTATACCCCTAAA
GGCTTTTGTTGATAGTGGTGCTCAATCTACAATCATATCCAAGAGTTGTGCTGAGAGATG
CGGATTGCTGAGACTCATGGATCA
ACGGTAT

QA 1 804 1 804
DS 

RD RS1A234TV 636 0 0
TCGAAGTTGAGGCGAGTGTCCCGATTCAGCAGCAGCAGCTCTTGTATAATGGAAACGAGA
TGAGGAACTCTGATAAATTGAGTGCATTGGGTGTAAAGGACGATGATTTATTGATGATGA
TGGTCTCCAACGCCTCTTCTGGTAGTGCGGCGGGGAATGATTTGGGTATGAATCCTGATG
GGTCAGCTTCCAACCCTGCAGCTTTTCAGCAACACATTCGGGGTGATTCTAATATTATGG
GACAGTTATTCCAGACGGATCCTGAGCTTGCACAAGTTATCTCTGGAAGCGATTTAAACA
AGTTACAGGATGTTTTGCGTTCACGGCATCAACAGCGATCTGTGGTGCAGCGTCAGAAGG
AGGAGGAACTCGCCCTTTTGTATGCAGATCCTTTCGATGTTGAAGCACAGAAAAAAATCG
AAGCTGCAATTCGTCAGAAAGGAATTGATGAGAACTGGGAAGCTGCCCTTGAACATAATC
CCGAAGGTTTTGCTAGGGTGATAATGCTGTATGTGGATATGGAGGTCAATGGTATACCCC
TAAAGGCTTTTGTTGATAGTGGTGCTCAATCTACAATCATATCCAAGAGTTGTGCTGAGA
GATGCGGATTGCTGAGACTCATGGATCAACGGTATA

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

CO CL3932Contig1 1310 2 6 U
TTTTTCTTCTTCGATCCCGAAAAGATGTTGAAGCTCTCGTGTAATGCGACTGATAAGTTA
CAGAGCCTCTTCTCGCATTCTCATCAACCGGATCCGTTGTTACATCGGAGAAGAACCGTC
TCCTCCTCCGTGTCGTGTTCTCATCTGAGGAAAACGGTTTTGGATCCTTTGAGAGCGACC
GTATCTGCTGATCAAGGAAGCGTGATTCGAGCAGAACAGGGTCTGGGTACTCTCGCGGAT
CAGCTCCGATTAGGTAGCTTGACGGAGGATGGTTTGTCGTATAAGGAGAAGTTCATCGTC
AGATCCTACGAAGTTGGGAGTAACAAAACCGCCACTGTCGAAACCATCGCTAATCTTTTG
CAGGAGGTGGGATGTAATCATGCCCAAAGCGTTGGATTTTCGACAGATGGGTTTGCGACA
ACACCGACAATGAGGAAACTGCATCTCATTTGGGTCACTGCGAGAATGCACATTGAGATC
TACAAGTACCCTGCTTGGGGCGATGTGGTTGAGATAGAGACATGGTGTCAGAGTGAAGGA
AGGATCGGGACTCGGCGTGATTGGATTCTTAAGGATGTTGCTACGGGTGAAGTCACTGGC
CGTGCTACAAGCAAGTGGGTTATGATGAACCAAGACACAAGACGGCTTCAGAAAGTGTCT
GACGATGTTCGGGACGAGTACTTGGTCTTCTGTCCTAAAGATCTCAGATTAGCATTTCCT
GAGGAGAATAACAGAAGCTTGAAGAAGATCCCAAAACTCGAAGATCCAGCTCAGTATTCG
ATGATTGGGCTTAAGCCTAGACGAGCTGATCTCGACATGAACCAGCATGTCAATAATGTC
ACCTATATTGGATGGGTTCTTGAGAGCATACCTCAAGAAATTGTAGACACGCACGAACTT
CAGGTCATAACTCTGGATTACAGAAGAGAATGTCAACAAGACGATGTGGTGGATTCACTC
ACTACCACCACCTCAGAGATTGGTGGGACCAATGGCTCTGCGACATCAGCCCCGCAGGAC
CACAACGATAGCCAGTTCTTACATCTCCTAAGGTTGTCTGGAGATGGTCAAGAGATCAAC
CGCGGGACAACCCTGTGGAGAAAGAAGCCCTCCAACTTCTAAACCACTTCGTTCTCAAGT
TTCTTTCTGTGTTGCTGATGGTTTTGTTTCACGAGTCTAGTCAAGTCTCATTGTTTTTTT
TTAATATAAGTTTGGGTTAGACTAGAGAGAACTGGAATTATTGGAGTAGTCTTTGTGGAA
CCTTATGAGTTTTCGCTCTTGTTTCTGTACAAATCTTGAGGATTTAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 0 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BN34TF U 1
AF RS1BN34JQ C 559
BS 1 820 RS1BN34TF
BS 821 822 RS1BN34JQ
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BS 833 835 RS1BN34JQ
BS 836 842 RS1BN34TF
BS 843 1310 RS1BN34JQ

RD RS1BN34TF 851 0 0
TTTTTCTTCTTCGATCCCGAAAAGATGTTGAAGCTCTCGTGTAATGCGACTGATAAGTTA
CAGAGCCTCTTCTCGCATTCTCATCAACCGGATCCGTTGTTACATCGGAGAAGAACCGTC
TCCTCCTCCGTGTCGTGTTCTCATCTGAGGAAAACGGTTTTGGATCCTTTGAGAGCGACC
GTATCTGCTGATCAAGGAAGCGTGATTCGAGCAGAACAGGGTCTGGGTACTCTCGCGGAT
CAGCTCCGATTAGGTAGCTTGACGGAGGATGGTTTGTCGTATAAGGAGAAGTTCATCGTC
AGATCCTACGAAGTTGGGAGTAACAAAACCGCCACTGTCGAAACCATCGCTAATCTTTTG
CAGGAGGTGGGATGTAATCATGCCCAAAGCGTTGGATTTTCGACAGATGGGTTTGCGACA
ACACCGACAATGAGGAAACTGCATCTCATTTGGGTCACTGCGAGAATGCACATTGAGATC
TACAAGTACCCTGCTTGGGGCGATGTGGTTGAGATAGAGACATGGTGTCAGAGTGAAGGA
AGGATCGGGACTCGGCGTGATTGGATTCTTAAGGATGTTGCTACGGGTGAAGTCACTGGC
CGTGCTACAAGCAAGTGGGTTATGATGAACCAAGACACAAGACGGCTTCAGAAAGTGTCT
GACGATGTTCGGGACGAGTACTTGGTCTTCTGTCCTAAAGATCTCAGATTAGCATTTCCT
GAGGAGAATAACAGAAGCTTGAAGAAGATCCCAAAACTCGAAGATCCAGCTCAGTATTCG
ATGATTGGGCTTAAGCCTAGACGAGCTGATCTCGACATGA**CAGCATGTCA**TATGTC
ACT
ATATGGAT

QA 1 843 1 843
DS 

RD RS1BN34JQ 752 0 0
GATTGGATTCTTAAGGATGTTGCTACGGGTGAAGTCACTGGCCGTGCTACAAGCAAGTGG
GTTATGATGAACCAAGACACAAGACGGCTTCAGAAAGTGTCTGACGATGTTCGGGACGAG
TACTTGGTCTTCTGTCCTAAAGATCTCAGATTAGCATTTCCTGAGGAGAATAACAGAAGC
TTGAAGAAGATCCCAAAACTCGAAGATCCAGCTCAGTATTCGATGATTGGGCTTAAGCCT
AGACGAGCTGATCTCGACATGAACCAGCATGTCAATAATGTCACCTATATTGGATGGGTT
CTTGAGAGCATACCTCAAGAAATTGTAGACACGCACGAACTTCAGGTCATAACTCTGGAT
TACAGAAGAGAATGTCAACAAGACGATGTGGTGGATTCACTCACTACCACCACCTCAGAG
ATTGGTGGGACCAATGGCTCTGCGACATCAGCCCCGCAGGACCACAACGATAGCCAGTTC
TTACATCTCCTAAGGTTGTCTGGAGATGGTCAAGAGATCAACCGCGGGACAACCCTGTGG
AGAAAGAAGCCCTCCAACTTCTAAACCACTTCGTTCTCAAGTTTCTTTCTGTGTTGCTGA
TGGTTTTGTTTCACGAGTCTAGTCAAGTCTCATTGTTTTTTTTTAATATAAGTTTGGGTT
AGACTAGAGAGAACTGGAATTATTGGAGTAGTCTTTGTGGAACCTTATGAGTTTTCGCTC
TTGTTTCTGTACAAATCTTGAGGATTTAAGCC

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 3

CO CL3933Contig1 959 3 8 U
GGGGTGTATAATGTCGTGTGTCTTTTAGCTGCTTAATACGGATCCTATTCGGGTTTATCC
CGACCCGGAGAAAAGAAGCGTAGGACACGTGACAAAACTCCATTAGTATAAGTGTATAAC
GTATGATCCGAGTGAATGAAGCCAAAAAAGAGATAGACACCGCAGCTCAGCTTTCGTTTT
CGGTCCAATCGCTTTTACAACTTTTTCTTACAAGTCGTACACGTCTCTCTCTCCTCCTAT
AAAGATTCCGTGATCAAAGGTATTTGGAAAACTCAGTTCTTCGATAACAAGAGAGAGGTA
GATGGGTTCTTCGAGCAAAGAGTACGAGTTTCTGAGTGAGATTGGGTTGACCTCTCACAA
CATTGGAAACTACGTTGGTGGCAAGTGGCAAGGCAACGGACCTCTTGTTTCTACTCTGAA
TCCTGCTAACAATCAGCCAATTGCTCAAGTTGTGGAAGCTTCTCTGGAAGATTACGAGCA
AGGTCTCAAAGCTTGTGAGGAAGCAGCTAAAGTATGGATGCAGGTTCCTGCTCCAAAGAG
AGGTGATATTGTGAGACAAATTGGAGATGCCCTAAGATCCAAACTTGACTTTCTTGGCCG
TCTTCTTTCTCTTGAAATGGGAAAGATCCTCGCTGAAGGCATCGGAGAAGTCCAGGAAGT
GATTGACATGTGTGACTTTGCTGTTGGTTTGAGCCGACAACTCAATGGATCAGTCATTCC
TTCCGAACGCCCAAACCATATGATGTTGGAGATGTGGAATCCTCTTGGCATTGTTGGTGT
CATCACAGCGTTTAACTTCCCATGTGCAGTTCTTGGTTGGAATGCTTGTATTGCACTTGT
CTGTGGAAACTGTGTGGTCTGGAAAGGTGCTCCAACTACACCGTTGATTACCATCGCAAT
GACCAAACTAGTAGCTGAAGTCTTAGAGAAGAATCATTTACCCGGTGCCATTTTCACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GC51TF U 1
AF RS1GN09TF U 150
AF RS1C523TF U 265
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RD RS1GC51TF 651 0 0
GGGGTGTATAATGTCGTGTGTCTTTTAGCTGCTTAATACGGATCCTATTCGGGTTTATCC
CGACCCGGAGAAAAGAAGCGTAGGACACGTGACAAAACTCCATTAGTATAAGTGTATAAC
GTATGATCCGAGTGAATGAAGCCAAAAAAGAGATAGACACCGCAGCTCAGCTTTCGTTTT
CGGTCCAATCGCTTTTACAACTTTTTCTTACAAGTCGTACACGTCTCTCTCTCCTCCTAT
AAAGATTCCGTGATCAAAGGTATTTGGAAAACTCAGTTCTTCGATAACAAGAGAGAGGTA
GATGGGTTCTTCGAGCAAAGAGTACGAGTTTCTGAGTGAGATTGGGTTGACCTCTCACAA
CATTGGAAACTACGTTGGTGGCAAGTGGCAAGGCAACGGACCTCTTGTTTCTACTCTGAA
TCCTGCTAACAATCAGCCAATTGCTCAAGTTGTGGAAGCTTCTCTGGAAGATTACGAGCA
AGGTCTCAAAGCTTGTGAGGAAGCAGCTAAAGTATGGATGCAGGTTCCTGCTCCAAAGAG
AGGTGATATTGTGAGACAAATTGGAGATGCCCTAAGATCCAAACTTGACTTTCTTGGCCG
TCTTCTTTCTCTTGAAATGGGAAAGATCCTCGCTGAAG*CATCGGAGAAGT

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1GN09TF 646 0 0
GG
GATAGACGCCGCAGCTCAGCTTTCGTTTTCGGTCCAATCGCTTTTACAACTTTTTCTTAC
AAGTCGTACACGTCTCTCTCTCCTCCTATAAAGATTCCGTGATCAAAGGTATTTGGAAAA
CTCAGTTCTTCGATAACAAGAGAGAGGTAGATGGGTTCTTCGAGCAAAGAGTACGAGTTT
CTGAGTGAGATTGGGTTGACCTCTCACAACATTGGAAACTACGTTGGTGGCAAGTGGCAA
GGCAACGGACCTCTTGTTTCTACTCTGAATCCTGCTAACAATCAGCCAATTGCTCAAGTT
GTGGAAGCTTCTCTGGAAGATTACGAGCAAGGTCTCAAAGCTTGTGAGGAAGCAGCTAAA
GTATGGATGCAGGTTCCTGCTCCAAAGAGAGGTGATATTGTGAGACAAATTGGAGATGCC
CTAAGATCCAAACTTGACTTTCTTGGCCGTCTTCTTTCTCTTGAAATGGGAAAGATCCTC
GCTGAAGGCATCGGAGAAGTTCAGGAAGTGATTGACATGTGTGACTTTGCTGTTGGTTTG
AGCCGACAACTCAATGGATCAGTCATTCCTTCCGAACGTCCAAACCATATGATGTTGGAG
ATGTGGAATCCTCTTGGCATTGTTGGTGTCATCACAGCGTTTAA

QA 3 646 3 646
DS 

RD RS1C523TF 695 0 0
GGA
AAAACTCAGTTCTTCGATAACAAGAGAGAGGTAGATGGGTTCTTCGAGCAAAGAGTACGA
GTTTCTGAGTGAGATTGGGTTGACCTCTCACAACATTGGAAACTACGTTGGTGGCAAGTG
GCAAGGCAACGGACCTCTTGTTTCTACTCTGAATCCTGCTAACAATCAGCCAATTGCTCA
AGTTGTGGAAGCTTCTCTGGAAGATTACGAGCAAGGTCTCAAAGCTTGTGAGGAAGCAGC
TAAAGTATGGATGCAGGTTCCTGCTCCAAAGAGAGGTGATATTGTGAGACAAATTGGAGA
TGCCCTAAGATCCAAACTTGACTTTCTTGGCCGTCTTCTTTCTCTTGAAATGGGAAAGAT
CCTCGCTGAAGGCATCGGAGAAGTCCAGGAAGTGATTGACATGTGTGACTTTGCTGTTGG
TTTGAGCCGACAACTCAATGGATCAGTCATTCCTTCCGAACGCCCAAACCATATGATGTT
GGAGATGTGTAATCCTCTTGGCATTGTTGGTGTCATCACAGCGTTTAACTTCCCATGTGC
AGTTCTTGGTTGGAATGCTTGTATTGCACTTGTCTGTGGAAACTGTGTGGTCTGGAAAGG
TGCTCCAACTACACCGTTGATTACCATCGCAATGACCAAACTAGTAGCTGAAGTCTTAGA
GAAGAATCATTTACCCGGTGCCATTTTCACTG

QA 4 695 4 695
DS 



AS 1 3

CO CL3934Contig1 768 3 8 U
AAACTAAAACATGAATCTTTTGTTATTATTTAAGATCTTTTAAAGACACTATAAACAATC
CAGACAGAACAAGAAAGAGTATGAGTCTTTGTGATTACAAAACCAAACAAGTTAAGATCT
TTTACAGATTGGGTAGGTCTTAAAAAGAATTAGCAAAAAGAATAGCCTGTCTACATCTAG
CTCTAGCTTGTTCAATCCTCTCACTAAGAGTCTCTTCCTTAACCGAAGCTTTAACCATAG
CCAAATCCACCTCCATCAACTTCAAAACCCTAAAAAGTTCAGTCACCATCCTCTCTTCAA
CCTCACCTTCGTCTCTCAGAACCTCAGCTTCTTCCCTCGCTCTCTCCGCGACTATCTCAC
CAGCTTTAGCCAAAAGCTCCTTGGAACCGAACTCTCTCGCCATCAACCCTTCGAACTTCT
CCAAGAAGTCCATTATCACGTACCCTTTTGGTTTCTCCAAGTTTATCTCTTTCGTTCTCT
TCCAGCCAATCTCGAAGTTCGGTGGCTCTGGCTTCTCGATCCCTCTTTGTTTCCTGTCGC
GTATGATCTCGGATCTTCGACGTT*CTCGATGGGGAACTTCTCGGCGCTCGTGGTGTTGA
TTGAGTCGGGTGAAGGTGTGAGCTCGAGGAACTGATCTTTTGGTTCTGGGTTTGAAGAGC
ACTTCACTGTTCGACGAGTGTTGAAGGTATAGGTTCTTTTGAGATACGTAGGCGAAGAGA
GAAGTTGAGGAACAAGAAGTGTGGAAGCCATTGGTTTTTTGAGCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FL45JQ U 1
AF RS1BL64JQ U 75
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CTCTAGCTCTCTCCGCGACTATCTCACCAGCTTTAGCCAAAAGCTCCTTGGAACCGAACT
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TCTCCAAGTTTATCTCTTTCGTTCTCTTCCAGCCAATCTCGAAGTTCGGTGGCTCTGGCT
TCTCGATCCCTCTTTGTTTCCTGTCGCGTATGATCTCGGATCTTCGACGTT*CTCGATGG
GGAACTTCTCGGCGCTCGTGGTGTTGATTGAGTCGGGTGAAGGTGTGAGCTCGAGGAACT
GATCTTTTGGTTCTGGGTTTGAAGAGCACTTCACTGTTCGACGAGTGTTGAAGGTATAGG
TTCTTTTGAGATACGTAGGCGAAGAGAGAAGTTGAGGAACAAGAAGTGTGGAAGCCATTG
GTTTTTTGAGCTTCC

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DS 



AS 1 3

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AGCTCTCCAGAGGCAAAGAAAAGGTCGCTTTTTAAACTTTTTTTCTTAATAAATAAACCA
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BQ
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AF RS1BF23TF U 1
AF RS1ED60TF U 364
AF RS1ED60JQ C 954
BS 1 469 RS1BF23TF
BS 470 470 RS1ED60TF
BS 471 660 RS1BF23TF
BS 661 661 RS1ED60TF
BS 662 684 RS1BF23TF
BS 685 1036 RS1ED60TF
BS 1037 1718 RS1ED60JQ

RD RS1BF23TF 687 0 0
GTATTGCAGAGAAAATCAAGCGACACTTCAATCTTGATAAACATGTCAAGAAACTTCAGG
GCTGATGTTTTGAGAGAAAACACAGAAGCCGTTTTCGCGGCCTGTGAGGTTACTCATGCT
AGATGGGCAAAGTTACTAGGAGTTCGTGCTCTTCTTCATCCAAAATTGAAATTGCAGGAG
TTCATGAGCATTTATGATCTCACCCAAGAATTTATAACAGCTACGGAAAAGATTGGCGGA
CGGTTGGGATCTAGTATTCGTGGGACGCTGCAGTCACAAGCCAAAGCCTTTGTAGATTCC
CAGCATGAAGCTCGGATGACAAAACTGAAAGCTGTCCTTGATCAAGAAACATGGGATGAG
ATCGATGTTCCCGAAGAATTCCAATCCATAATCGGTTCTCTTTTCGCATCCCAGCAGTTG
ATTTCTAGGAAAGCTGATGATGCTGATACTATAACATACCACAGAAACCTGCTCACTCCC
AACGGATCTCTCACGTCAGGAACTGAAGATCAAAATACTGAACTACGAAATGAAAATTCT
GAATCTAGTGAAGGTCCTGCAGTCAGTAGTGCACAAGTGAAATCCACAGTTTCACCTGAG
TCTCTTGAAAGAAGCAAGGCTGGTGTATCTTCAGTTGCGAATAATCAAAGTAATCAGAAG
*CGCACGGAAAATCTAACCTTTTT
ATC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1ED60TF 673 0 0
GATGTTCCCGAAGAATTCCAATCCATAATCGGTTCTCTTTTCGCATCCCAGCAGTTGATT
TCTAGGAAAGCTGATGATGCTGATACTATAACATACCACAGAAACCCGCTCACTCCCAAC
GGATCTCTCACGTCAGGAACTGAAGATCAAAATACTGAACTACGAAATGAAAATTCTGAA
TCTAGTGAAGGTCCTGCAGTCAGTAGTGCACAAGTGAAATCCACAGTTTCACCTGAGTCT
CTTGAAAGAAGCAAGGCTGGTGTATCTTCAGTTGCGAATAATCAAAGTAATCAGAAGGCG
CACGGAAAATCTAACCTTTTTTATCAAGGAGTTGGTTACCACATGGTAAACTGTGGGTTA
ATATTACTCAAGATGTTGTCAGAATACATTGACATGAGTAATTCTTTGCCAGCTTTGTCC
TCGGAAGTCGTTCTTCGTGTTGTTGAAGTGTTGAGATTTCTCAACACTAGGACATGCCAA
CTTGTTCTGGGGGCTGGTGCTATGCAGGTTTCTGGTCTAAAGTCCATAAAGGCGAAACAC
TTGGCACTTGCAAGTCAAGTAATCGACTTCACTTACACTATTGTTCCTGAATCCAGAAGA
ATTCTGTTTTCAAAAGTACCTGAGACGAGAAAGCCACTGTTGTCAGTAGAGATTGATAGA
GTCGCTCACGATT

QA 1 673 1 673
DS 

RD RS1ED60JQ 765 0 0
ATCCAGAAGAATTCTGTTTTCAAAAGTACCTGAGACGAGAAAGCCACTGTTGTCAGTAGA
GATTGATAGAGTCGCTCAGGATTATAGGGTTCATCGAGATGAAATATACGCGAAACTGGT
CCAGATAATGAGAGAAAGACTGTTGGCGCATCTTCATGGGTTGCCGAAAGTTGTTGAGAG
CTGGAACAGACCGCCAGACAGCAGTAAACAAACTAAAGAGTTTGCCTGGCCACTCACAAG
GGAAGTTGGCTACCTACATCGGGTCTTATCCGAGACATTGCACGAAGCAGATGTTAAAGC
AATCTTCAGGCAGGTGATTTCAATCATCCACACACAAACTTCTCAAACCCTTTCTAACTT
GGAGATAAGCTCTCCAGAGGCAAAGAAAAGGTCGCTTTTTAAACTTTTTTTCTTAATAAA
TAAACCAACTTAACTTGTGTAATAAACATGCCTCTCGTTTTAACTAGGCTGAAGCTTCAC
GTTGAGCTTATCCTCAAATGCATCCGATCGTTACCATCCGACAATGCCAATGAATCAGGC
ATCCCAAACTGGGGACAACTAGATGAATTCTTTGCACAACACTTTAAAGAAGAAGAAGAG
GGAGGCGAAGCTGAGTGATGAAGGCATCATTGTACATCGATTTGTTTCCTCTCACTCTTC
CTATATAAAGTGAAAGAAAAAAAACTCAAGAGTTTTGGTATGAGGATAAGATTGCTCGTC
TTGTAGATTTAAGTTACAGGTAACAAGTTCCTTCCTTCATGCCTC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL3936Contig1 930 2 2 U
GGAACTCCAAGGTTGGGAAACTGCTGGAATGTGATTTTGGGGAGAGCAAGTGTCACGCAC
CGAGCAGCATTATGCACATGTTTCAAGGCTCTCTCTTCTGTCTTCAGCCGCAGGGGGACT
CTTACACACGGAGATCGGCTTTTGACTCGATGCTCGCGGGGTGCATACCTGTTTTCTTCC
ACCCGGGATCAGCCTACACTCAGTACACGTGGCATCTGCCCAAGAACTACACGACCTACT
CGGTGTTCATCCCTGAGGATGATATCCGGAAGAGAAACATGAGCATCGAGGAACGACTCC
TCCAGATTCCACCGGAGCAGGTCAAGATCATGAGGGAGAACGTGATAAAACTCATCCCAG
GGCTGATCTACGCAGACCCGAGATCAGAACTGGAGACGCTCAAGGATGCGTTTGATGTCT
CGGTGGAGGCCATCATTGACAAGGTGACTCGGTTAAGGAAGAACATGATCGAGGGTCGAA
CCGAGTATGACAACTTCGTGGAGGAGAACAGCTGGAAGTATGCGTTGCTGGAGGAAGGCC
AGCGGGAAGCTGTGGGACACGTGTGGGACCCGTTCTTCTCGGAACCGAAGCCTGGAGAAG
ATAGCAGCAGCGAAGGGAATGGAGGCACGACCATTTCGGCAGATGCAGCTAAGAATTCAT
GGAAGAGTGAACAAAGAGATAAGACACAGTAAAGAACCAACCAACATTTTGTTTACGGTT
TTTGAGATATAGCTTTTGGTTATATCATTGTTGTTATACGGACAAAGAGAAAAGAAAAGA
ATGATCTATTATTTTGTTGTTGTATTTGGTATCAAAAATGTAGTTTCTCCAGGTTCATAG
AGATCAGTTTGTTTCAGCATCTTGTTGTATCAGCATCAGCAACCCACAGAGATTAATAAT
TGCAAGTGACCCCTTTCAAGTTTTAAGCTC


BQ
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AF RS1D284TF U 1
AF RS1D284JQ C 367
BS 1 611 RS1D284TF
BS 612 930 RS1D284JQ

RD RS1D284TF 611 0 0
GGAACTCCAAGGTTGGGAAACTGCTGGAATGTGATTTTGGGGAGAGCAAGTGTCACGCAC
CGAGCAGCATTATGCACATGTTTCAAGGCTCTCTCTTCTGTCTTCAGCCGCAGGGGGACT
CTTACACACGGAGATCGGCTTTTGACTCGATGCTCGCGGGGTGCATACCTGTTTTCTTCC
ACCCGGGATCAGCCTACACTCAGTACACGTGGCATCTGCCCAAGAACTACACGACCTACT
CGGTGTTCATCCCTGAGGATGATATCCGGAAGAGAAACATGAGCATCGAGGAACGACTCC
TCCAGATTCCACCGGAGCAGGTCAAGATCATGAGGGAGAACGTGATAAAACTCATCCCAG
GGCTGATCTACGCAGACCCGAGATCAGAACTGGAGACGCTCAAGGATGCGTTTGATGTCT
CGGTGGAGGCCATCATTGACAAGGTGACTCGGTTAAGGAAGAACATGATCGAGGGTCGAA
CCGAGTATGACAACTTCGTGGAGGAGAACAGCTGGAAGTATGCGTTGCTGGAGGAAGGCC
AGCGGGAAGCTGTGGGACACGTGTGGGACCCGTTCTTCTCGGAACCGAAGCCTGGAGAAG
ATAGCAGCAGC

QA 1 611 1 611
DS 

RD RS1D284JQ 564 0 0
TCT
ACGCAGACCCGAGATCAGAACTGGAGACGCTCAAGGATGCGTTTGATGTCTCGGTGGAGG
CCATCATTGACAAGGTGACTCGGTTAAGGAAGAACATGATCGAGGGTCGAACCGAGTATG
ACAACTTCGTGGAGGAGAACAGCTGGAAGTATGCGTTGCTGGAGGAAGGCCAGCGGGAAG
CTGTGGGACACGTGTGGGACCCGTTCTTTTCGGAACCGAAGCCTGGAGAAGATAGCAGCA
GCGAAGGGAATGGAGGCACGACCATTTCGGCAGATGCAGCTAAGAATTCATGGAAGAGTG
AACAAAGAGATAAGACACAGTAAAGAACCAACCAACATTTTGTTTACGGTTTTTGAGATA
TAGCTTTTGGTTATATCATTGTTGTTATACGGACAAAGAGAAAAGAAAAGAATGATCTAT
TATTTTGTTGTTGTATTTGGTATCAAAAATGTAGTTTCTCCAGGTTCATAGAGATCAGTT
TGTTTCAGCATCTTGTTGTATCAGCATCAGCAACCCACAGAGATTAATAATTGCAAGTGA
CCCCTTTCAAGTTTTAAGCTC

QA 4 564 4 564
DS 



AS 1 3

CO CL3937Contig1 888 3 2 U
CACACTGAAACATTGATTGATTGATATTCAAAGGTGGAATACAAGTTTAAGACACAAAGC
CAGCGCGTAATGGTTACGCCTAGAGTCAAGAGCTAGCAAGAACTAAACAGCTTCTTCTAG
AGACAAGAGACAACAGAAACAGAGAGTTCTCTGATGCCAACAACATATAAAAACAAACGA
TTTGATAAGTTGAAACCAAAATCTAAATCAACCCAGAAGATATTCTAGAAGGTGACCCAA
TGCAAAGTGGAGGATTGGAGATAGACACATCGACTGCCAAACGTTATTAGGGAAGAACCG
GCTCGAACCTCTATCTACTGTTCCGGAACCGTACCAGGAACCACGAAGAAGAGCCGTAGA
AGCAACCCAGAGATATGAACAGGCGCACCTTGTAACATTCAAACCCCATGGCAGGATGCA
GATAACAGAGAGCCGTAGCTCTTTCTCCTTAGAATCAAGTCGGAGAGCCCAGCCTGAACC
AAACGAACCAAGAACCTAAGGAGTCTGTTCCGTCGCTACGACACCAAGGAGAAGCGTAAC
CTCCAGAAACGACAGGATCACCACAGAAGCACAAAACGAAGCTCACAAACAGATCGAAGA
AGAGAGAGAGCGAAGGACCGAAACCCTTAACGTCATACCTCAGCCCAGCCTTCAGATCTG
TCAATCTAGATCTGGTTTCTAAACATCATCAAATCGAACCAAAAGACAAGCAATGAAAAG
AAAAAAGAAAAACTAAATAGACAATTTACAAACCCAACCGACGGTGGCACCGTAGCGCCT
AACCGCCGGCCGGTGAAACAGAATCCTTTAGTTTCTAGACATAAGGCGGAGAGAAAAGTC
TAGAGAGAGAGAGTTTTGAAAACAGACCAGAAGAAGCTGTATCCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D677JQ U 33
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AF RS1D677TF C 223
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DS 

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DS 

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A
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AGGCGGAGAGAAAAGTCTAGAGAGAGAGAGTTTTGAAAACAGACCAGAAGAAGCTGTATC
CTTCC

QA 2 666 2 666
DS 



AS 1 3

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TGAGATTATGATCACAATTTTTGGTGACAATATTTTTTACAACAACAACAAGCAAAATAT
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AAACCTAACACAACACCCGTAACCTCATTGTTGTATGTAACAGCTAAACAATTAAAATCA
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CAAAAAAGCTTGGATAGGTGAAGGTGAGGACTTAAGCTTTCTCCTATGGACATAAGAATC
CAACCCAGTTGTCTTTTACTTTAGGCAATCACAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A375TF U 1
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AF RS1A375JQ C 443
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DS 

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GAGA

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ACAAACCCATGACCACAACGACAACAAACAACACTCACAAACCTAACACAACACCCGTAA
CCTCATTGTTGTATGTAACAGCTAAACAATTAAAATCACAACCATAAAAGAAAGACAAAC
CTGAACTCCACCGTCAGAAGCAGCACAAGGCTGAAGAATGGGACCAGGATTGGTACCGCC
ACTGATCTCAGAGCGAGTCGTCCACTCACTCACTCGCTCGGTGTTGGGGACGTCTTTGAA
ACTTGGTAATGCTTCATAAGGAGTGAAGACTCCATTGTTGTTGCTCTTTAGATTCACATC
AGAAGAAGAAGAAACAGGAGGAGCGTTGTTCTTTGTCTCTCTCTGGTTTCTGGTTTCTTG
TGGAACAAATGATTGTAGTTTCTCATACTCTTCTGGTAATAGAGTCGATACCTGCAGATA
ACATTTGCAAGAAAATGTAAAGAATTATGATACAGCTTCAAAAAAGCTTGGATAGGTGAA
GGTGAGGACTTAAGCTTTCTCCTATGGACATAAGAATCCAACCCAGTTGTCTTTTACTTT
AGGCAATCACAAGC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

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GGACTCGCACCACGCGTCGCTAGGACGTCGGACTTTGGAGGAGATTCGTCAAAAGAGAGC
GGCGCAAAGGCTCAGCAAAACTTCTTCAGGTCCAGATCTTAGCGAGATTCCGATTCCTGC
CGCTGGGATCAGAAAATCCGAGAGCGAGAATCGGCTTTCTGAGACAGATGTTGGTGCTTT
ATATTCTCAGCTCAAAGAGCTGCAGAAGAAGAACGCAGACATGGAGGAGCGTAACAAAAT
GTTGTACTCCAAGCTTCAGACAAAGGAAGCTGAGAACGAATCACTTGAGACTCGGTTGAA
CGTGCTAGAACATAACACAGTGCCATCTCTAAGAAAAGCTCTCAAGGAAATTGCAATGGA
GAAAGACGCTGCTGTTGTTTCACGAGAGGATCTCTCAGCACAAATTAGGACTCTGAAGAA
ACGTGTTAAGGATGCTGAGGAGGAACAATATCGAGCAGAGGAAGATGCAGCATCTCTCAG
AGCAGAGCTTAACTCGATGCAACAGCAAACAATGGGTACTTCATTCGCTGGAGTTTCCCC
GGACCAAGTATTAGAGAAGGAGATGGCTAAACTAAAATTAGAATTACAGAAAGAATCAAT
GTTGAGGCAGCAAGAACAAAAGCGTGTAGCTGAAGAGCAAACACGAGTTGCCTCGTTAAT
GTCTGAAAAGCAGGAACTGGAACAGAAAGTTTCAGCTTTATCCAGCGGTCCCTCAGAAGC
GTCAGAGTCGAATCAGAAAGTATTTTCAGTGGAAGATAAAGAGATACTCGAGAAGCAGTT
GCATGATATGGCTGTTGCACTTGAAAGACTGGAGAGTAGTAGACAAAGCTTCTCATGGAG
ATTGACAACCAATCATCTGAAAAGAGAGCTTTTTGAGGAGACTCAAACCTCTCGGCTTCA
TATCAGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CI65TF U 1
AF RS1CJ03TF U 190
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ATATTCTCAGCTCAAAGAGCTGCAGAAGAAGAATGCAGACATGGAGGAGCGTAACAAAAT
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GTCTGAAA
GCAGAAC

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1CJ03TF 780 0 0
G
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AAGCTTCAGACAAAGGAAGCTGAGAACGAATCACTTGAGACTCGGTTGAATGTGCTAGAA
CATAACACAGTGCCATCTCTAAGAAAAGCTCTCAAGGAAATTGCAATGGAGAAAGACGCT
GCTGTTGTTTCACGTGAGGATCTCTCAGCACAAGTTAGGACTCTGAAGAAACGTGTTAAG
GATGCTGAGGAGGAACAATATCGAGCAGAGGAAGATGCAGCATCTCTCAGAGCAGAGCTT
AACTCGATGCAACAGCAAACAATGGGTACTTCATTCGCTGGTGTTTCCCCGGACCAAGTA
TTAGAGAAGGAGATGGCTAAACTAAAATTAGAATTACAGAAAGAATCAATGTTGAGGCAG
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AATCAGAAAGTATTTTCAGTGGAAGATAAAGAGATACTCGAGAAGCAGTTGCATGATATG
GCTGTTGCACTTGAAAGACTGGAGAGTAGTAGACAAAGCTTCTCATGGAGATTGACAACC
AATCATCTGAAAAGAGAGCTTTTTGAGGAGACTCAAACCTCTCGGCTTCATATCAGATC

QA 2 780 2 780
DS 



AS 1 3

CO CL3940Contig1 772 3 1 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGCGTCATCC
CTTCTCCATTCAGTACACTTAACAACCTCATCAACCGATTCAAAGCCCAAGGCTTGTCCG
CACGTGACATGGTCGCTCTCTCTGGTGCTCACACCATTGGACAAGCCAACTGTCTCACTT
TCAGGAACCGTATCTACAACGAGAGCAACATTAACCGCTCTTTCGCCTTAACCAGACGTA
AGAACTGTCCTGCTACCTCTGGCTCTGGCGACAACAAGAAAGCACCTCTTGACATCGGCT
CTCCCACAAGATTTGACCATAGCTACTATAATCAGCTTCTCGATAAAAGGGGTCTCCTGA
CGTCAGATCAGGTCCTTTTCAACGGCGGTGGCACGGACTCATTGGTCAAAACGTACAGCC
GCAGTCTGAACACCTTCTACCGTGACTTCGTGAGGGCTATGATCAAGATGGGCGATATCA
AGCCCCTTACTGGATCCAATGGTCAGATCCGCAGAAACTGTCGCAGGCCCAATTAAATCT
CTTACCATAAAAGCCTGTCAGGATCAATAATCCTTATTTTCCAGCAATCATTTCATCGAA
CTGTATTTATTTTTTATTTGTTTTTGTGTGTTTCTTCTTCGTCAACATAAAGCGAATGTT
GTCTAAAAGTTTGTTGCTATAAAGTTTTCATTTACTTTCTCATCTTCTCTCACTTTGGCT
CTAGAAGAATTATTCAAAGCCATAAGCTTTAAATGCAATTGTGTAGTTGATT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1A114TF U 1
AF RS1D081TF U 50
AF RS1A114TV U 1
BS 1 772 RS1A114TF

RD RS1A114TF 772 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGCGTCATCC
CTTCTCCATTCAGTACACTTAACAACCTCATCAACCGATTCAAAGCCCAAGGCTTGTCCG
CACGTGACATGGTCGCTCTCTCTGGTGCTCACACCATTGGACAAGCCAACTGTCTCACTT
TCAGGAACCGTATCTACAACGAGAGCAACATTAACCGCTCTTTCGCCTTAACCAGACGTA
AGAACTGTCCTGCTACCTCTGGCTCTGGCGACAACAAGAAAGCACCTCTTGACATCGGCT
CTCCCACAAGATTTGACCATAGCTACTATAATCAGCTTCTCGATAAAAGGGGTCTCCTGA
CGTCAGATCAGGTCCTTTTCAACGGCGGTGGCACGGACTCATTGGTCAAAACGTACAGCC
GCAGTCTGAACACCTTCTACCGTGACTTCGTGAGGGCTATGATCAAGATGGGCGATATCA
AGCCCCTTACTGGATCCAATGGTCAGATCCGCAGAAACTGTCGCAGGCCCAATTAAATCT
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CTGTATTTATTTTTTATTTGTTTTTGTGTGTTTCTTCTTCGTCAACATAAAGCGAATGTT
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AF RS1DD41TF U 721
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QA 1 569 1 569
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QA 3 689 3 689
DS 



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BQ
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TGGGCTAAGGCAAAAGACCCCTAACTTACGTGTGTAACACGGTGGTGTCATTTTGCCCGC
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GCATCGCCTTCTTCCGCTGTGCTGAAAAGTGTTTGATCCGAGCAGTCTAAGGAAGCCCCA
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GTACAATAATCTGCTAAGGAGGACTGACCGCCTTTGTTAGCC

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DS 



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BQ
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AF RS1FP22TF U 1
AF RS1FP22JQ C 191
BS 1 599 RS1FP22TF
BS 600 955 RS1FP22JQ

RD RS1FP22TF 599 0 0
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CGAGCGCACGGATACGGGTTCGGGTCTACTACGGCGGTGTCTCTTCCACGTCTACGCTTC
CGATTCGTTTCACCTCACCGTCCATGCGACGGACTTTATCTCCGGCGCCTGGGAGACGAT
CCTCTCCGTCTCTCAGCTAGACGATATGAGGGATAGTGTGGGCGTTGGTGGCTCGTGGTC
CGAGTTCCTCGATTACACTGTTGCTTCCTTGAAATCCGGAAACGTGAAGCTTCTCCTCGG
TGATCATTCACTTTCAAATGGTGTAGAGAGGGCGAGATTAGTTTGTCAGAAGGCGAAAGG
AATGCCTCGCGTAGTAGTTCCTCTAACAAAGATGACTGACTCAGCTGCTGCTAGTGAGGC
CATGGCAACTCTGTCTCTCGAGTTGTTCAGAGCTTTCAAGAGAAAGCAACACTTTCAAGG
GGAAACGAGTACTTTATCTGAGGCAATTGATGAAAAAGATAAGAGGGATGATGCTACTCA
TAACCAACTGGAACGATACTGCTCTGGTAAACTAGATGTTATGATGGCTCCATCACTAG

QA 1 599 1 599
DS 

RD RS1FP22JQ 765 0 0
TCTCAGCTAGACGATATGAGGGATAGTGTGGGCGTTGGTGGCTCGTGGTCCGAGTTCCTC
GATTACACTGTTGCTTCCTTGAAATCCGGAAACGTGAAGCTTCTCCTCGGTGATCATTCA
CTTTCAAATGGTGTAGAGAGGGCGAGATTAGTTTGTCAGAAGGCGAAAGGAATGCCTCGC
GTAGTAGTTCCTCTAACAAAGATGACTGACTCAGCTGCTGCTAGTGAGGCCATGGCAACT
CTGTCTCTCGAGTTGTTCAGAGCTTTCAAGAGAAAGCAACACTTTCAAGGGGAAACGAGT
ACTTTATCTGAGGCAATTGATGAAAAAGATAAGAGGGATGATGCTACTCATAACCAACTG
GAACGATACTGCTCTGGTAAACTAGATGTTATGATGGCTCCATCACTAGATAACCGGAAA
GACTCTCCCGCCAAGCAATCTAAACCTTCTAAACGAGTACCTGCTCACCGGAGAACACGA
AAACGAGGTGCTCTTCTGCAGGATTCAGATGAAGAGGATGGCTAAACGGAACTGAAAAAT
ATCCTCAAGATGGCACTTTAAACTCGAAACATCAGCTATCAGTAACAATCTTGGATCTCC
TGAGGAGTTCTGCTTAATGCTCATAATAGTTTCCCAGATTTCTCTCCTCATTGGGTGAAA
TGGACATGTAAACATTCCATGTAACGTTATAGTACTACATTCCTAGTGAACACATTTTAG
AATCCTTTTCTGGAGGCTAACGAAGAAATCAAATGGAATCTTGCT

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 3

CO CL3944Contig1 790 3 11 U
CACTCAAAGACTTGACTCTTTCTTCATTTATTATTTTCTGTTAGAACGTTTAAACACAAA
TTCATGAACTTTCGCACAAACATACAGAGAAGCATAACGAAACCAAAGACAAGTCTACAC
AAAAGGAAGAAAGCATTTCTCAGACTCGGTAGTTCTGAGGTAGAGGCATAACACCGTCAA
AGAAATCACCAAAATAGCCAGGTGGTTCATGTACAAGTCTTGCTATGATGTCTCTGAGAG
TGATGAGTCCTTCCAGGTTACCTGAATCATCCACCACATACATCCTATGGATCTTCTCAG
CGTCTAGCATCAAAATCAGTTCCTTCAGCGTATGGTTCTTAGTGCACGCAATGACACCAC
TCAAGATAGGTGCTGAGGTATCTCCATGCTTCTCCAGATGCTCCCTAACCGCTACTAAGA
AGTTCTTCGTTGTGATTGACCTGTAGTCATGGTAGATCTCTGGTGCAGTGAGGAGAAAGT
GAACATCTCTAAGGCTAATGTTGCCTACTGGCTTCTCAGTTTGTCTTTCAACAACGGGTA
AGCCTCCGATTCTCTTTCTCCTCATCAGCTTGAACGCCTGAAGAACTGGTTCATCTTCAT
AAATCTTTATGATATGATCTTTTGACATAGTGGGAAGACCGACTTCAGATAGAGTTTTGA
CTCCCCAATCTTCAAACCAGTGAAGCCCAGCGCATTCTGCTAGCATATGGATAACTCCTG
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TTTTGTACTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C404TF C 1
AF RS1C404JQ U 3
AF RS1C193JQ U 1
BS 1 125 RS1C193JQ
BS 126 126 RS1C404JQ
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BS 453 453 RS1C404JQ
BS 454 790 RS1C193JQ

RD RS1C404TF 614 0 0
CA
CTCAAAGACTTGACTCTTTCTTCATTTATTATTTTCTGTTAGAACGTTTAAACACAAATT
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TCTAGCATCAAAATCAGTTCCTTCAGCGTATGGTTCTTAGTGCACGCAATGACACCACTC
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ATCTTTATGAT
C

QA 3 613 3 613
DS 

RD RS1C404JQ 612 0 0
CTCAAAGACTTGACTCTTTCTTCATTTATTATTTTCTGTTAGAACGTTTAAACACAAATT
CATGAACTTTCGCACAAACATACAGAGAAGCATAACGAAACCAAAGACAAGTCTACACAA
AAGGAAGAAAGCATTTCTCAGACTCGGTAGTTCTGAGGTAGAGGCATAACACCGTCAAAG
AAATCACCAAAATAGCCAGGTGGTTCATGTACAAGTCTTGCTATGATGTCTCTGAGAGTG
ATGAGTCCTTCCAGGTTACCTGAATCATCCACCACATACATCCTATGGATCTTCTCAGCG
TCTAGCATCAAAATCAGTTCCTTCAGCGTATGGTTCTTAGTGCACGCAATGACACCACTC
AAGATAGGTGCTGAGGTATCTCCATGCTTCTCCAGATGCTCCCTAACCGCTACTAAGAAG
TTCTTCGTTGTGATTGACCTGTAGTCATGGTAGATCTCTGGTGCAGTGAGGAGAAAGTGA
ACATCTCTAAGGCTAATGTTGCCTACTGGCTTCTCAGTTTGTCTTTCAACAACGGGTAAG
CCTCCGATTCTCTTTCTCCTCATCAGCTTGAACGCCTGAAGAACTGGTTCATCTTCATAA
ATCTTTATGAT
C

QA 1 611 1 611
DS 

RD RS1C193JQ 790 0 0
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AAAAGAAAGAAAGCATTTCTCAGACTCGGTAGTTCTGAGGTAGAGGCATAACACCGTCAA
AGAAATCACCAAAATAGTCAGGGGGCTCATGTACAAGTCTTGCTATGATGTCTCTGAGAG
TGATGAGTCCTTCCAGGTTACCTGAATCATCCACCACATACATCCTATGGATCTTCTCAG
CGTCTAGCATCAAAATCAGTTCCTTCAGCGTATGGTTCTTAGTGCACGCAATGACACCAC
TCAAGATAGGTGCTGAGGTATCTCCATGCTTCTCCAGATGCTCCCTAACCGCTACTAAGA
AGTTCTTCGTTGTGATTGACCTGTAGTCATGG*AGATCTCTGGTGCAGTGAGGAGAAAGT
GAACATCTCTAAGGCTAATGTTGCCTACTGGCTTCTCAGTTTGTCTTTCAACAACGGGTA
AGCCTCCGATTCTCTTTCTCCTCATCAGCTTGAACGCCTGAAGAACTGGTTCATCTTCAT
AAATCTTTATGATATGATCTTTTGACATAGTGGGAAGACCGACTTCAGATAGAGTTTTGA
CTCCCCAATCTTCAAACCAGTGAAGCCCAGCGCATTCTGCTAGCATATGGATAACTCCTG
ACTGTGTGATTATGTTCTCAATCTTTGCTTCCCCTAGATCAACCACTGGGATGCTCTTCA
TTTTGTACTT

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 2

CO CL3945Contig1 875 2 6 U
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ATCGTTGGTAAAGATAAAGATCAGTGAGTCATCTTTCTCCTTCTTCTCTCGAGAACAGAT
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TCCAGCCTCTCGTTCAAAACCCATCTGCTGAATTGGAGATACCGGCCAAGAACGCACCGG
TGACGATATCGGCGACAGAGCAGCAGCAGAAACGGCCGAACCGGTGTACCACGTGCAGGA
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GGTATCCGGAGGTCCATGGATGCACCTTCGATTTCAAATTGGCCGGTCGCGAAGAGATCG
CGAAAGCGAACCCGCTGGTCAAAGCGGCGAAGCTTCAGAAGATTTGATCAGAGCCGTTCG
ATGCGTTGACCTTTTCGTCTTCAAGACGCGTCTGTCCCATAGATGTGTGTTATATGATTG
ATCTCAGCCGTTCATCATGGGTTATTTAATGTAAAAGATATGTATTTACGATGAGACATG
CGTCATGTGGGTTGTTAGGATGGAGACGCTTTCCCCTATCTTCCCAATTGATTTTCTTTG
CCCCCAAAAAGAAATAAGATATTCTCTTGTTGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D043TF U 1
AF RS1D043JQ C 234
BS 1 697 RS1D043TF
BS 698 698 RS1D043JQ
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BS 768 792 RS1D043TF
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RD RS1D043TF 794 0 0
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CGTCATGTGGGT
GT

QA 1 792 1 792
DS 

RD RS1D043JQ 642 0 0
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CCGATGATCCAGCCTCTCGTTCAAAACCCATCTGCTGAATTGGAGATACCGGCCAAGAAC
GCACCGGTGACGATATCGGCGACAGAGCAGCAGCAGAAACGGCCGAACCGGTGTACCACG
TGCAGGAAGCGGGTCGGGTTGACCGGGTTCAAGTGCCGGTGCGGGGTGACGTTTTGCGGG
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CCGTTCGATGCGTTGACCTTTTCGTCTTCAAGACGCGTCTGTCCCATAGATGTGTGTTAT
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QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 3

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BQ
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AF RS1AJ13JQ U 1
AF RS1AJ13TF C 1
AF RS1BL75JQ U 52
BS 1 319 RS1AJ13JQ
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QA 1 393 1 393
DS 

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TCCCTTGAATGGACCTTACACCAAATGTTTTACTGAAG

QA 1 758 1 758
DS 



AS 0 0

AS 1 3

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BQ
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AF RS1CI87JQ U 1
AF RS1FM27JQ U 1
AF RS1FM27TF C 1
BS 1 98 RS1CI87JQ
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RD RS1CI87JQ 319 0 0
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DS 

RD RS1FM27JQ 337 0 0
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AACATGCAGCCTCTTGACAGTTGATACAAACATCTCCCAAGGAACATCTCCGACCAAAAC
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QA 1 337 1 337
DS 

RD RS1FM27TF 319 0 0
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AACATGCAGCCTCTTGACAGTTGATACAAACATCTCCCAAGGAACATCTCCGACCAGAAC
TTTATCTCCTTCAGTGTCT

QA 1 319 1 319
DS 



AS 1 2

CO CL3949Contig1 416 2 3 U
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GTTTGTTTATGGTGATAGATACAGTCGTGGACCACATCCTCCAACGAGTTAATACAGAGC
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AGTTGGTGAGCCCATATGTGGAGGAGATGAGGGAAGAGGATATAGAAGCCGAGCCAGTGG
TCCTTATGATAGGCCGAGCCTAAGTGGTGGTAGTTATCCATTGTCCTCTACTTTTAACAT
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TGTGGTAACTGTTAAGGTTTAATACTATTTAAAAAAATTCAATGGTTTATGTGATT


BQ
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AF RS1GD13TF U 1
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GTTTGTTTATGGTGATAGATACAGTCGTGGACCACATCCTCCAACGAGTTAATACAGAGC
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TGAGGGAAGAGGATATAGAAGCCGAGCCAGTGGTCCTTATGATAGGCCGAGCCTAAGTGG
TGGTAGTTATCCATTGTCCTTTACTTTTAACATTATTAAGGCATGAACGAAATGATATTG
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TTTAAAAAAATTCAATGGTTTATGTGATT

QA 1 269 1 269
DS 



AS 1 3

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TCTTCCGTAAATCACCGATTCACTTCGGCTTGCAGAGCTTTTACACAGAAGAAGCTCGAA
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TTTGATATGGTCACTCAGCACAGGAAAGATGGTAAATTGACTTATGAAGATCTCGTTATC
GCCAAGGCAACCTACGAGAAAGTAACTGATGATGAGATTGCTGAGTTTATTTACCAGACT
TTAGATGTCAATGGCAATGGCGTCCTGACTAGGTCAGATTTGGAGTTGGTCCTTGTGGTG
GTCTTCAAGAGTGTCTTCTCCACTAGCTCTGATGCGGAATACAAGGAGATGGGTGGATGC
GCTTCTCAACGCTGCTTCTTTTCTCTAAATCCACTGGTGGTGGTGATGATAAAGGAATGT
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GCTTGCTTACACCGCCCAGTCCAGCGAGACCTGGATATCAAGTCCCGCATCTGCTTTACG
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GATGCGCTCTTCCTCACCACGAGCTTCAAGAGTGGAAACTCCTCTATCACAGTTCTTTAC
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TGTTGATCATCAAAGACAGAGAAGGCTGTGTGTATGGAGGATACGCCTTTCAGCCTTGGG
AGAGGCACAGCGATTTTTACGTAGACATGAAGTCTTTTCTTTTCCAGCTTTACCCTAATG
CCTCCATCTTCCGCCCAACTGGAGCCAACACCAACATCCAATGGTGTGCTACGAACTTCG
CATCAGAGAACATCCCAAACGGCATAGGATTCGGAGGAAAGATCAACCACTTTGGTCTGT
TTTTATCCTCGAGCTTCGACCAAGGCCAGACGTTTTCCTGCACTACTTTTGGTAGCCCGA
GTCTCTCCAAGTCCAGCAGGATACAGCCAGAAGTGATCGAATGCTGGGGGATAGTTCAGG
CCTCCGACGAACTAGACACGCAACATAACGCTGTTAAAGGTACTGTTCTAGAGAGGTTTA
AGGAAGATCGCAACATGCTCAAACTAGTCGGCATGGCTAGCAACTCGAATGAGTGAGAGA
GATTCAAAGAGTGTTTCATTAAATACAATGCGTGTGTTCCTACTAATATATACTTTTCAT
GTACCATAAAAGAGTGTTGAAAACCATATAATAAAACTGTTTCATGAT


BQ
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AF RS1C170TF U 1
AF RS1AJ70TF U 434
AF RS1AJ70JQ C 618
BS 1 472 RS1C170TF
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BS 778 788 RS1AJ70TF
BS 789 1428 RS1AJ70JQ

RD RS1C170TF 777 0 0
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TCTTCCGTAAATCACCGATTCACTTCGGCTTGCAGAGCTTTTACACAGAAGAAGCTCGAA
GATCTCAAAACACTCTTCACCTCCCTCGCTTCTCAATCTCAAAGCAATGACGACTCATAC
GCCTCCTACTCTGTTTTCCAGACCTACTTTGGTCTGAGTGGTGCGTTAGGAGAGAGGATG
TTTGATATGGTCACTCAGCACAGGAAAGATGGTAAATTGACTTATGAAGATCTCGTTATC
GCCAAGGCAACCTACGAGAAAGTAACTGATGATGAGATTGCTGAGTTTATTTACCAGACT
TTAGATGTCAATGGCAATGGCGTCCTGACTAGGTCAGATTTGGAGTTGGTCCTTGTGGTG
GTCTTCAAGAGTGTCTTCTCCACTAGCTCTGATGCGGAATACAAGGAGATGG*TGGATGC
GCTTCTCAACGCTGCTTCTTT*CTCTAAATCCACTGGTGGTGGTGATGATAAAGGAATGT
CTTTTGAAGATTTCAGAAGCTGGTGCTCACACGTTCCTACTGTCAGAAAGTTTCTCGGAA
GCTTGCTTACACCGCCCAGTCCAGCGAGACCTGGATATCAAGTCCCGCATCTGCTTTACG
ACGAGGATACTGTGGATTCAAATATACTTCTGTTGAAGATAGAATACGCTTGGCATATCG
GAGGCGCTCTTCCTCACCACGAGCTTCAAGAGTGGAA*CTCCTGTATCACAGTTCTT

QA 1 777 1 777
DS 

RD RS1AJ70TF 358 0 0
TTCCTC
CCACTAGCTCTGATGCGGAATACAAGGAGATGGGTGGATGCGCTTCTCAACGCTGCTTCT
TTTCTCTAAATCCACTGGTGGTGGTGATGATAAAGGAATGTCTTTTGAAGATTTCAGAAG
CTGGTGCTCACACGTTCCTACTGTCAGAAAGTTTCTCGGAAGCTTGTTTACACCGCCCAG
TCCAGCGAGACCTGGATATCAAGTCCCGCATCTGCTTTACGACGAGGATACTGTGGATTC
AAATATACTTCTGTTGAAGAAAGAATACGCTTGGCATATCGGATGCGCTCTTCCTCACCA
CGAGCTTCA*GAGTGGAAACTCCTCTATCACAGTTCTTTACACGGTCAA
GCT

QA 7 355 7 355
DS 

RD RS1AJ70JQ 811 0 0
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TCAAATATACTTCTGTTGAAGAAAGAATACGCTTGGCATATCGGATGCGCTCTTCCTCAC
CACGAGCTTCAAGAGTGGAAACTCCTCTATCACAGTTCTTTACACGGTCAAAGCTTCAAC
ACATTCCTCGGTCACACTTCAAACACTGGTATGTCTGCATCCGTGTTGATCATCAAAGAC
AGAGAAGGCTGTGTGTATGGAGGATACGCCTTTCAGCCTTGGGAGAGGCACAGCGATTTT
TACGTAGACATGAAGTCTTTTCTTTTCCAGCTTTACCCTAATGCCTCCATCTTCCGCCCA
ACTGGAGCCAACACCAACATCCAATGGTGTGCTACGAACTTCGCATCAGAGAACATCCCA
AACGGCATAGGATTCGGAGGAAAGATCAACCACTTTGGTCTGTTTTTATCCTCGAGCTTC
GACCAAGGCCAGACGTTTTCCTGCACTACTTTTGGTAGCCCGAGTCTCTCCAAGTCCAGC
AGGATACAGCCAGAAGTGATCGAATGCTGGGGGATAGTTCAGGCCTCCGACGAACTAGAC
ACGCAACATAACGCTGTTAAAGGTACTGTTCTAGAGAGGTTTAAGGAAGATCGCAACATG
CTCAAACTAGTCGGCATGGCTAGCAACTCGAATGAGTGAGAGAGATTCAAAGAGTGTTTC
ATTAAATACAATGCGTGTGTTCCTACTAATATATACTTTTCATGTACCATAAAAGAGTGT
TGAAAACCATATAATAAAACTGTTTCATGAT

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 3

CO CL3951Contig1 1037 3 2 U
GGAACTCATCGTCACCGTGGTTTCTCCGCTTCCTCTCCACCGTCGTCTCGTCGTCATCAA
TTCCCCACAGTGATCATCGTCACCGTCGGCTGAGACAAGGGAAATGGAGAATTTGGAAGA
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ACCGACTCAGCTCTATGCCGCCGTTGGTGTTCTCGTGTTTACAACCATTTTGCTCCTCCT
ATCCTTTCGGTTGGTGGGACGTACCATATCCAACACTGTACTCCTTTCTGGGCTGAGTGG
AAGTGGAAAGACTGTGCTCTTCTATCAACCCCGAGATGGATCATCGCATCAGGGCACTGT
AACATCAATGGAACCGAATGAAGGCACTTTTGTTCTTCACTCTGAAAACGCTAAGAAGGG
AAAAGTCAAGCCTGTTCATCTTGTTGATGTTCCTGGGCACTCTCGGCTTCGACCCAAGCT
TGAAGAGTTCTTGCCCCAAGCAGCTGCTATTGTGTTCGTTGTAGACGCCTTGGAGTTCCT
CCCTAACTGTCGTGCAGCTTCAGAGTACTTATACGACATTCTGACCAACGCCAACGTTGT
CAAGAAGAAGATACCAGTCCTCCTTTGCTGTAACAAGACAGATAAACTCACCGCACACAC
CAAGGAGTTCATTAGGAAGCAGATGGAGAAAGAAATTGAGAAACTAAGGGCTTCGAGGAG
TGCAGTATCTTCAGCTGACGTAGCCAATGACTTCACCATTGGGATCGAAGGAGAAGCGTT
CTCCTTCTCGCATTGCAGTAACAAAGTCACTGTCGCTGAAGCATCTGGACTCAATGGAGA
AACTGTCCAGATCCAAGACTTCGTTCGAGAACACATCAAGCCCTGAGTGAGAGCCCACAT
CTACATCCGTAGATTGAATCCTTATCATTAGGCTTCTTAATGACTTGGTCTGTGACTGTG
ATTGGAGTTCAGAGATCTTTTTTTTGTATATGAATTGTTGTCAGACATCTTTCGAAAAGT
TAAAAGGACTTTAGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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ACCGACTCAGCTCTATGCCGCCGTTGGTGTTCTCGTGTTTACAACCATTTTGCTCCTCCT
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AAGTGGAAAGACTGTGCTCTTCTATCAACCCCGAGATGGATCATCGCATCAGGGCACTGT
AACATCAATGGAACCGAATGAAGGCACTTTTGTTCTTCACTCTGAAAACGCTAAGAAGGG
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CAAGGAGTTCA

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CAAGGAGTTCATTAGGAAGCAGATGGAGAAAGAAATTGAGAAACTAAGGGCTTCGAGGAG
TGCAGTATCTTCAGCTGACGTAGCCAATGACTTCACCATTGGGATCGAAGGAGAAGCGTT
CTCCTTCTCGCATTGCAGTAACAAAGTCACTGTCGCTGAAGCATCTGGACTCAATGGAGA
AACTGTCCAGATCCAAGACTTCGTTCGAGAACACATCAAGCCCTGAGTGAGAGCCCACAT
CTACATCCGTAGATTGAATCCTTATCATTAGGCTTCTTAATGACTTGGTCTGTGACTGTG
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TAAAAGGACTTTAGGAC

QA 1 617 1 617
DS 



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AS 0 0

AS 1 3

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CTCCGGGAAATATTACAACCGAGTCTGGAAATTTCAAGAAAAGGAAGTTTGGTTGCGTCG
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TGAAGAATAAAGCGAAGAAAGAACAGAACAGCTGCTCTAACGATTCATCAAAAGTGACGA
AAGACTCGCAGAGAACGGATTATATTCATGTTCGTGCACGGAGAGGCCAAGCCACCGATA
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AAGATTTAGTTCCTGGATGCGACAAGATCACAGGCAAAGCAGGGATGCTTGATGAGATCA
TTAACTATGTTCAGTCTCTTCAGCGACAAGTCGAGTTCCTATCGATGAAGCTAGCAACTG
TTAGTCCAAGGCTGGATTTCAACATCGATGACATTTTTGCCAAAGAGGTTGTCTCAGCTC
CAATGACGAACTTACCAAACACTGTGATGCCACCTCACATGATAGTGAATTCCGGTTATC
CTCATGATATGGTTGATTCCGGTTATGTTCATTTCAATCCAATGCAGCAAGTGGTTGCTA
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ATGTGCAGAATCTTTATAGCAGTCTAGGTGTTTGATTTAAAAGCGTTCCTTAGTTCTAGA
CCATTGTCAGGTTCTCTGGATACATGCAGCTTATTTTTTTCAAGTGGGAAGATCAAACTC
ATATTATTTTCATCAGAAAAGAGAGCAAAGTTAGCAGTTATTTACTAATCTCAGTAAATT
AACTTAAGATTTTCAGCCCATCATTGTAGTATCAGAGACAAGAGTGTGTATACAGTATTG
TGTGTATAGATGCCAAACAATAATATCTATTTTTCTTATCATAATTTTT


BQ
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TGAAGAATAAAGCGAAGAAAGAACAGAACAGCTGCTCTAACGATTCATCAAAAGTGACGA
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AAGATTTAGTTCCTGGATGCGACAAGATCACAGGCAAAGCAGGGATGCTTGATGAGATCA
TTAACTATGTTCAGTCTCTTCAGCGACAAGTCGAGTTCCTATCGATGAAGCTAGCAACTG
TTAGTCCAAGGCTGGATTTCAACATCGATGACATTTTTGCCAAAGAGGTTGTCTCAGCTC
CAATGACGAACTTACCAAACACTGTGATGCCACCTCACATGATAGTGAATTCCGGTTATC
CTCATGATATGGTTGATTCCG*TTATGTTCATTTCAATCCAATGCAGCAAGTGGTTGCTA
GTTCTGATCCACTGTCATGTTTCA
CAATGGT

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CAGCGACAAGTCGAGTTCCTATCGATGAAGCTAGCAACTGTTAGTCCAAGGCTGGATTTC
AACATCGATGACATTTTTGCCAAAGAGGTTGTTTCAGCTCCAATGACGAACTTACCAAAC
ACTGTGATGCCACCTCACATGATAGTGAATTCCGGTTATCCTCATGATATGGTTGATTCC
GGTTATGTTCATTTCAATCCAATGCAGCAAGTGGTTGCTAGTTCTGATCCACTGTCATGT
TTCAACAATGGTCAATCAGCTGCTACTGTGTGGGACTCTGATGTGCAGAATCTTTATAGC
AGTCTAGGTGTTTGATTTAAAAGCGTTCCTTAGTTCTAGACCATTGTCAGGTTCTCTGGA
TACATGCAGCTTATTTTTTTCAAGTGGGAAGATCAAACTCATATTATTTTCATCAGAAAA
GAGAGCAAAGTTAGCAGTTATTTACTAATTTCAGTAAATTAACTTAAGATTTTCAGCCCA
TCATTGTAGTATCAGAGACAAGAGTGTGTATACAGTATTGTGTGTATAGATGCCAAACAA
TAATATCTATTTTTCTT

QA 1 797 1 797
DS 

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ATTACGGTGAATTCCGGTTATCCTCATGATATGGTTGATTCCGGTTATGTTCATTTCAAT
CCAATGCAACAAGTGGTTGCTAGTTCTGATCCACTGTCATGTTTCAACAATGGTCAATCA
GCTGCTACTGTGTGGGACTCTGGTGTGCAGAATCTTTATAGCAGTCTAGGTGTTTGATTT
AAAAGCGTTCCTTAGTTCTAGACCATTGTCAGGTTCTCTGGATACATGCAGCTTATTTTT
TTCAAGTGGGAAGATCAAACTCATATTATTTTCATCAGAAAAGAGAGCAAAGTTAGCAGT
TATTTACTAATCTCAGTAAATTAACTTAAGATTTTCAGCCCATCATTGTAGTATCAGAGA
CAAGAGTGTGTATACAGTATTGTGTGTATAGATGCCAAACAATAATATCTATTTTTCTTA
TCATAATTTTT

QA 1 491 1 491
DS 



AS 1 3

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GCATAGTTTCAAAATTGGATTAGGGCATTGTTAAACGTTAGACCGGCACTGACCACTGGT
GAGAAAAAAAAAAAAATCAACAATCGCAAAAGCAACATATAAAAAAGCCAGAACATGTTT
GCTTTGTGGTAATGAGTGATTCACTTCTTAGCTTGTTGGTTAGCTGAATCTATAGTGGAG
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BQ
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AF RS1C966TF C 1
AF RS1FY51JQ U 28
AF RS1C966JQ U 85
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GAGAAAAAAAAAAAAATCAACAATCGCAAAAGCAACATATAAAAAAGCCAGAACATGTTT
GCTTTGTGGTAATGAGTGATTCACTTCTTAGCTTGTTGGTTAGCTGAATCTATAGTGGAG
GGAGGAGCACTGCCGGAGAGGGTGGATGCGTCGGTTGCGCCACCGCCTTGGCCAGGCTTA
ACCTCCTGGTGACCAGAAGTTCCATAAGCGTTCTTCTTGTAATCTTCAATATCCTCGTAC
TTTGTGTACGGACTCGTTTCTAGTGGTAACTCTTGTTTCTCTGGTGGTGTCTTCGACATG
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DS 

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TTCTTAGCTTGTTGGTTAGCTGAATCTATAGTGGAGGGAGGAGCACTGCCGGAAAGGGTG
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TAAGCGTTCTTCTTGTAATCTTCAATATCCTCGTACTTTGTGTACGGACTCGTTTCTAGT
GGTAACTCTTGTTTCTCTGGTGGTGTCTTCGACATGTTTTTGAACAAAGGTTAGCTTTAT
TTCTTTCTTGTGTAAAGAGTAAAGACAGTATCC

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DS 



AS 1 3

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TGCAACTCCAGCTACTGCTGGGTTCCTCTCCTCTGTTCCTCCTTGGAAGGCGCCTAGGAG
ATTTCATGTTAGGTCTTCACTTGACGCAGACGTTTCCGACATGAGTGTTAACGCTCCAAA
GGGGCTGTTTCCTCCAGAGCCTGTACCTTACAAGGGACCGAAGCTGAAAGTAGCTATCAT
AGGAGCTGGACTTGCTGGCATGTCAACTGCTGTTGAGCTTCTCGATCAGGGTCACGAGGT
GGATATATATGATTCAAGGACTTTCATTGGTGGCAAAGTTGGTTCTTTTGTAGATAGACG
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CTTGATGAAAAAGGTGGGAGCTGATAAGAACCTTCTTGTCAAAGACCACACTCATACATT
TATAAACAAAGGCAGCGAAATTGGAGAGCTTGATTTTCGGTTTCCTGTTGGAGCTCCAAT
TCACGGTATCCGCGCCTTTTTAGTCACAAATCAACTCAAGCCATATGACAAGCTGAGGAA
CTCACTAGCTCTTGCATTGAGCCCTGTCGTTAAAGCTCTTGTTAACCCTGATGGAGCAAT
GCAAGACATTCGCAACCTAGACAGCATAAGTTTCTCGGATTGGTTCCTCTCTAAAGGTGG
GACGAGGGCGAGTATCCAGAGAATGTGGGATCCTGTTGCGTACGCACTCGGTTTCATAGA
CTGTGATAACATGAGTGCAAGTTGCATGCCTACCATATTCTCGTTATTCGCCACGAAAAC
AGAAGCTTCTTTGTTGCGTATGCTCAAGGGCTCCCCTGATGTTTACTTGAGTGGTCCTAT
CAAACAATACATCACAGATAGAGGTGGCAGAATCCATCTAAGGTGGGGTTGCAGGGAGAT
ACTTTATGATAAATCAGCAGATGGAGAAACTTATGTCACAGGACTAGCAGTTTCCAAGGC
TACGGACAAGAAGCTTTCTCCTTCAGATGAGCTAAGTCTTGTCTAATGATTTGAATATTG
TCATCGTACAACAATGTGTAGAGAGAACTCTTATAGTGTTCACAACGAAAAAGACATTTT
GTATTATCATCACAACAACACTCTCTTGAAATTCAAAGATTATTATC


BQ
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AF RS1CX87TF U 1
AF RS1EV39TF U 29
AF RS1EV39JQ C 469
BS 1 608 RS1CX87TF
BS 609 778 RS1EV39TF
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RD RS1CX87TF 608 0 0
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GTCACTCCCTTTACTTCTTCCTTCTTCCTTCTTCATCTAAAGCTTTTTAACCGAATAAAA
AAATAATTGCTGTTATCTCAGAGTTGATTGATTCTCTATGGCTTCATCGATCGTTTTCGC
TGCAACTCCAGCTACTGCTGGGTTCCTCTCCTCTGTTCCTCCTTGGAAGGCGCCTAGGAG
ATTTCATGTTAGGTCTTCACTTGACGCAGACGTTTCCGACATGAGTGTTAACGCTCCAAA
GGGGCTGTTTCCTCCAGAGCCTGTACCTTACAAGGGACCGAAGCTGAAAGTAGCTATCAT
AGGAGCTGGACTTGCTGGCATGTCAACTGCTGTTGAGCTTCTCGATCAGGGTCACGAGGT
GGATATATATGATTCAAGGACTTTCATTGGTGGCAAAGTTGGTTCTTTTGTAGATAGACG
AGGGAACCACATCGAAATGGGTCTACATGTCTTCTTCGGATGCTATAACAATCTCTTCCG
CTTGATGAAAAAGGTGGGAGCTGATAAGAACCTTCTTGTCAAAGACCACACTCATACATT
TATAAACA

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DS 

RD RS1EV39TF 789 0 0
GG
ATCTTCGCGACAAAGTTTGTTCTATCTCTCGTCACTCCCTTTACTTCTTCCTTCTTCCTT
CTTCATCTAAAGCTTTTTAACCGAATAAGAAAATAATTGCTGTTATCTCATAGTTGATTG
ATTCTCTATGGCTTCATCGATCGTTTTCGCTGCAACTCCAGCTACTGCTGGGTTCCTCTC
CTCTGTTCCTCCTTGGAAGGCGCCTAGGAGATTTCATGTTAGGTCTTCACTTGACGCAGA
CGTTTCCGACATGAGTGTTAACGCTCCAAAGGGGCTGTTTCCTCCAGAGCCTGTACCTTA
CAAGGGACCGAAGCTGAAAGTAGCTATCATAGGAGCTGGACTTGCTGGCATGTCAACTGC
TGTTGAGCTTCTCGATCAGGGTCACGAGGTGGATATATATGATTCAAGGACTTTCATTGG
TGGCAAAGTTGGTTCTTTTGTAGATAGACGAGGGAACCACATCGAAATGGGTCTACATGT
CTTCTTCGGATGCTATAACAATCTCTTCCGCTTGATGAAAAAGGTGGGAGCTGATAAGAA
CCTTCTTGTCAAAGACCACACTCATACATTTATAAACAAAGGCAGCGAAATTGGAGAGCT
TGATTTTCGGTTTCCTGTTGGAGCTCCAATTCACGGTATCCGCGCCTTTTTAGTCACAAA
TCAACTCAAGCCATATGACAAGCTGAGGAACTCACTAGCTCTTGCATTGAGCCCTGTCGT
TAAAGCTCTTGTTAACCCTGATGGAGCA*TGCAAGACATTCGCA*CCTAGACAGCATAAG
TTTCTCG

QA 3 789 3 789
DS 

RD RS1EV39JQ 839 0 0
TGTAGATAGACGAGGGAACCACATCGAAATGGGTCTACATGTCTTCTTCGGATGCTATAA
CAATCTCTTCCGCTTGATGAAAAAGGTGGGAGCTGATAAGAACTTTCTTGTCAAAGACCA
CACTCATACATTTATAAACAAAGGCAGCGAAATTGGAGAGCTTGATTTTCGGTTTCCTGT
TGGAGCTCCAATTCACGGTATCCGCGCCTTTTTAGTCACAAATCAACTCAAGCCATATGA
CAAGCTGAGGAACTCACTAGCTCTTGCATTGAGCCCTGTCGTTAAAGCTCTTGTTAACCC
TGATGGAGCAATGCAAGACATTCGCAACCTAGACAGCATAAGTTTCTCGGATTGGTTCCT
CTCTAAAGGTGGGACGAGGGCGAGTATCCAGAGAATGTGGGATCCTGTTGCGTACGCACT
CGGTTTCATAGACTGTGATAACATGAGTGCAAGTTGCATGCCTACCATATTCTCGTTATT
CGCCACGAAAACAGAAGCTTCTTTGTTGCGTATGCTCAAGGGCTCCCCTGATGTTTACTT
GAGTGGTCCTATCAAACAATACATCACAGATAGAGGTGGCAGAATCCATCTAAGGTGGGG
TTGCAGGGAGATACTTTATGATAAATCAGCAGATGGAGAAACTTATGTCACAGGACTAGC
AGTTTCCAAGGCTACGGACAAGAAGCTTTCTCCTTCAGATGAGCTAAGTCTTGTCTAATG
ATTTGAATATTGTCATCGTACAACAATGTGTAGAGAGAACTCTTATAGTGTTCACAACGA
AAAAGACATTTTGTATTATCATCACAACAACACTCTCTTGAAATTCAAAGATTATTATC

QA 1 839 1 839
DS 



AS 1 3

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GAACAAAAAAAAAGGTTCTGTAGATACATCAAACTAATACATATTTGTATATACAGAACA
AGACAACAGGCATTACACATGGATGATGATGGATCTTACATTATATCCATGGCGTCACTA
CTACTACTACAAAGAGAAAACAACCTAGCCCTTAAAGAAAGATTGTGGAAACCTTAGATC
CCCAGGTTTCCCCACGGTGTTGTTCTTCGTCTTGTTACTACACTGTTGAACTAAATAATC
ACAGCTGCTGCTTTGCTTACTACTTTCCTCCTGTTCCTGTCTTGCTGATGCTGTCATAGT
CATCGTCTCTTTAGGTTTTGGTTTCACAACTGGTTCATTTGACCCTGTTATAGGGATTGC
GCCCGTCAGTGTTTTTATAGCAAAGTCGATACACGGGTCTTTCCACATATCCATACCCGG
TGACTCGGTAGAAACTGTTGGCGTCTCTGGGAAAAAGGTGGCTCCTTTCTGCTTGGCATG
ATTGGTATTTGGATCAGAAGAGATTGCTGCAGTGTTGTTGGGAAGATGAAGGGTGTCTCC
GGTCAGTGTTTTGATAGCAAAAGCAATGCAAGGATCTTTCCAAAGATCTGCTAGAGTTGA
GTCAAATGCTGCAGAGGAGGAGGAGAAGGTGTTGTTATTGTTATTCATCTCCATCACTTC
TGAGCTTGTGCCTCTAACAACAGACGATTCAAACAAGTTGTTGCTTAGTTTATTTCTCAT
CTGTGTGACATTTCCGTTATCATAAGTTGCTTTTGGACTGGTAACTTTGTTACCCTTTGA
TCCAAATCTTTTGCCTGCTGCTCTTCTCACGCTTTGTTGCACAAGTTTTGCGAGATAGTG
GTGATACTGGCGACATCTCTTCCTTTTGCTTGTAACCATCAAGACAAAAAACTGGATTCA
GTTCCGCCTCAGATGTCGTCAGTGGCATCTTCATCTTTTTCTTGTCTACTGGTTTACCCA
TCTTTCCTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DJ26JQ U 1
AF RS1BW05JQ U 33
AF RS1DJ26TF C 341
BS 1 208 RS1DJ26JQ
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GAACAAAAAAAAAGGTTCTGTAGATACATCAAACTAATACATATTTGTATATACAGAACA
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CCCAGGTTTCCCCACGGTGTTGTTCTTCGTCTTGTTACTACACTGTTGAACTAAATAATC
ACAGCTGCTGCTTTGCTTACTACTTTCCTCCTGTTCCTGTCTTGCTGATGCTGTC

QA 1 355 1 355
DS 

RD RS1BW05JQ 527 0 0
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TAAAGAAAGATTGTGGAAACCTTAGATCCCCAGGTTTCCCCACGGTGTTGTTCTTCGTCT
TGTTACTACACTGTTGAACTAAATAATCACAGCTGCTGCTTTGCTTACTACTTTCCTCCT
GTTCCTGTCTTGCTGATGCTGTCATAGTCATCGTCTCTTTAGGTTTTGGTTTCACAACTG
GTTCATTTGACCCTGTTATAGGGATTGCGCCCGTCAGTGTTTTTATAGCAAAGTCGATAC
ACGGGTCTTTCCACATATCCATACCCGGTGACTCGGTAGAAACTGTTGGCGTCTCTGGGA
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AAA

QA 1 524 1 524
DS 

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TTCCACATATCCATACCCGGTGACTCGGTAGAAACTGTTGGCGTCTCTGGGAGAAAGGTG
GCTCCTTTCTGCTTGGCATGATTGGTATTTGGATCAGAAGAGATTGCTGCAGTGTTGTTG
GGAAGATGAAGGGTGTCTCCGGTCAGTGTTTTGATAGCAAAAGCAATGCAAGGATCTTTC
CAAAGATCTGCTAGAGTTGAGTCAAATGCTGCAGAGGAGGAGGAGAAGGTGTTGTTATTG
TTATTCATCTCCATCACTTCTGAGCTTGTGCCTCTAACAACAGACGATTCAAACAAGTTG
TTGCTTAGTTTATTTCTCATCTGTGTGACATTTCCGTTATCATAAGTTGCTTTTGGACTG
GTAACTTTGTTACCCTTTGATCCAAATCTTTTGCCTGCTGCTCTTCTCACGCTTTGTTGC
ACAAGTTTTGCGAGATAGTGGTGATACTGGCGACATCTCTTCCTTTTGCTTGTAACCATC
AAGACAAAAAACTGGATTCAGTTCCGCCTCAGATGTCGTCAGTGGCATCTTCATCTTTTT
CTTGTCTACTGGTTTACCCATCTTTCCTATCC

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 2

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GGAAAAGTCAACATTTACTGTAAAGAAATAAAAGATCTATAACAATGAAATTTTCATATT
CTTTATCCAAACGATTTTCTTTTCCTATTTTTTTCATGCAATTTCTCATGATACATAGTG
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TATAACTCTGGAAGTGAGTACGAGAAAAACCTCAACTGGATCTTCCACTACATTCGTACT
AGGCCTTTTGAGAATGTCGGTTTCACACAAAAAAGTAATCTAACCACGGCAGAAAATTCT
GCTTCTGTCGTTCTCCAATGTCGTGGTGACTCTTATGGATCTAAATCTTATGGGTCTAAA
TGTCGTACATGCCTTGACACCGCAATTTTGGGGTTCCGTAAGAGATGTCCGAGTATCAAA
GGAGGAATGATATGGTACGACCAATGTTTTCTCTATGTTAGTACGATCTATATAGAAAAT
CCAAGCAAGACTAATTACGAGAATATTTTTTTCTATGCACAATCCAAACAACGTGAGAGG
GGATGCAAAACTGTTTGCCAAGAAAACATTGGATTTTTTTCTCTGAGCTAACACTTAAAG
TCAAGAAAACCACCAGAGACGGCATTCGCGTCATATTTTACGCGGCTGGGAAAAAAAGCT
CGGGGAAAATACATTATATGCAATGGTGCAATGTATAGAACTAACAATAAATTGTAAAAC
TTGTTTGACATGGAGTATCACAAAACTTTTCAAGAATGATGACATTAAACAAGGAGGGAG
AGTTTTTGGTTCGAACTGTGATGTAAGGTATGAACTATACCCTTTTTTAAGATTTGTTAA
GCACTTTTAAGGTGGTGTTGAATACATCCTCTTCATAATTTCTA


BQ
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AGAGACGGCATTCGCGTCATATTTTACGCGGCTGGGAAAAAAAGCTCGGGGAAAATACAT
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AS 1 3

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BO85TF U 1
AF RS1GG94TF U 28
AF RS1BO85JQ C 613
BS 1 40 RS1BO85TF
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RD RS1BO85TF 710 0 0
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CTTTAAGGCCTTTGCGTCCTCTTTCTTTCTCCGTAGCTGCCGCAGCAATGGATGGTAATG
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TGAAGAACGCCAACGTGCTTAAGCTCCCAGATGATTCTCCTAAAGTTTCACTCTTTTTAG
CTTCCGAGATTAAGAATCTGGATGATGATGATTCCTTCAATCTTTCACTCTTCATGAACT
CGCTTTCAACTTCTCGGTTCGGTCGGTTTCTCATTTGGTCTCCTCGCTTGTCTTCCACTC
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A

QA 1 709 1 709
DS 

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G
TCCGGTGACCTCACCATTTTCCGTACTTTTCGTCACCTCTGCGGTTTTCTGTGTCAGTTA
TATGCAAGTGGCGAACTTGTCGCGTTTCATCTCTTTAAGGCCTTTGCGTCCTCTTTCTTT
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GTCCTCTGTTGAGAACGATACAGCAAAGCGTTTGAAGAACGCCAACGTGCTTAAGCTCCC
AGATGATTCTCCTAAAGTTTCACTCTTTTTAGCTTCCGAGATTAAGAATCTGGATGATGA
TGATTCCTTCAATCTTTCACTCTTCATGAACTCGCTTTCAACTTCTCGGTTCGGTCGGTT
TCTCATTTGGTCTCCTCGCTTGTCTTCCACTCACGATCTTGTTTCTCATAACTTTTCTGA
GCTTCCGGTTGGTTCAGTTTGTGTCTCAGACATTCAGTTTAAGGGTAGAGGCAGAACAAA
GAATGTCTGGGAATCCCCAAAGGGCTGTCTGATGTATTCCTTTACGTTAGAAATGGAAGA
TGGTCGAATCGTGCCTTTGATTCAATATGTTGTTTCTCTTGCTGTTACCGAGGCAGTGAA
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TCTTTACTTGA*TGGCCTTAA

QA 2 682 2 682
DS 

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TAAAGTGGCCCAATGATCTTTACTTGAATGGCCTTAAACTCGGAGGCATTTTGTGTACCT
CTACCTACAGATCTAGAAAATTTCACGTTAGTGTTGGTGTGGGATTGAATGTGGACAACG
ATCAACCCACCACATGCTTAAACGCTGTACTAAAAGAGATATCTCCTGCTGCATCAATTC
TACTTAAAAGAGAAGAAATTATAGCTGCCTTCTTTCATAAATTCGAGAAATTCTTTGATC
TTTTCTTGGACCAAGGTTTTAAATCTCTAGAGGAGCTTTACTACAGGACATGGCTTCACA
GCGGGCAAAGAGTGATCGTTGAAGATAAAATAGAGGACCAAGTTGTTCAAAACGTTGTGA
CTATCCAGGGTTTGACATCTTCGGGATATCTGCTGGCTATTGGAGATGATTATCAAATGT
ATGAGCTTCACCCTGATGGCAATAGTTTTGACTTTTTCAAAGGTCTAGTCCGAAGAAAAA
TATGATCCTTCTTCTTTGGGGAAGGAGATGTTAGCACCACCCCCATGGAACAAGGACTAA
TCTCTGTTTTCGCCAACTGAAAAGTGTTTATTTATATATTACTGTGGTGTTGTCCCTTAT
TTGAGCTATTTCCTTGTATCCAAAATTCCAAATTGTGTGTGTAATACACTATGAAAATGT
TTCTTGAAATAAGCATTGTACCAAAAGGAGATTTAC

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 3

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GAGATAATTTGTAAAGAAGAATGATATAATAACAAAAGAAAGTACAAAATTTCAAGAGCT
GTCCTAACAGAATAAAAAGATCATACATAAGCTGTGTTGTGAGTTACATTGCGACACACT
TTTGTGATGTCAGCAGAGGAAACAGATTGACTTTGTTCTCGTCACGTCACGGTCTTCTAG
ACCTTTGAGGAACCATCTGACTGCGAGGTGCTCTGAAGCATAAGTCATGAACGAAACTAG
AACCATTGCTACTGCTATCATCAGACCCAACCTCAAAAATAAAGCGGTAACCCCTAACAT
ATAGGGCAAAGAAATGGCAGCAAGAGCCAAAAACACCATTCCTAATCCATAATACCATGT
AGTGAAGTCACACGACGCATCTGCCCGCTGATGACCTTTTCCTGAATCATCCAACGATGA
TTCTGGAGATCCTGATTGAACTGCTACTTTCTTCCCATACTGGAACACAATAAGTAGGAA
GCCACCGTATAATAGGAAGAAGATTGTAAATGTCCACTCATACATCAAAATCAAGCCAGT
CCATGGCATGATTTGCCTCGGCACAATCATAAAGGAAACTCCAATCGATGTCAACACTGC
TACAAAACAGACGACAACTGAAACTGACCCCAAGTATTGAGGAACCTTAGAGTAGGAGCC
AGCGTGAAGTTGATAGTTTGGATTCATGGTAGACAATGTCGACACACCACTATAACCAAG
TGTTCCATTAGATCTGACTTTGTAATAAAGATGTCTGATCTGATTGCATACAGAGTTCCT
GCACAATGAACCCAAGAAGTCACGTCCCTGTATGGAACGATAAGTGCAGAACAAGAGCCC
ACAAAGTGGTAACAAGAAAAGGAGCTTGACGATGAACTCATCATTTGGGGTTTTTCCACC
TCCAGTTCCAGGAAGAGTCTCCTCAAGCCCTACCCTAATGCTATGCCACGCCTCAACAGG
TTTTACAAGCCACGCTGTCCACCAATCCCAAGGCTTAAGAGGACCCAAAGTGTAGTGAAT
AATGTGAAGTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E754JQ U 1
AF RS1FM48JQ U 11
AF RS1FM48TF C 407
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RD RS1E754JQ 729 0 0
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CCATGGCATGATTTGCCTCGGCACAATCATAAAGGAAACTCCAATCGATGTCAACACAGC
TACAAAACAGACGACAACTGAAACTGACCCCAAGTATTGAGGAACCTTAGAGTAGGAGCC
AGTGTGAAGTTGATAGTTTGGATTCATGGTAGACAATGTCGACACACCACTATAACCAAG
TGTTCCATT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RS1FM48JQ 824 0 0
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AATAAAAAGATCATACATAAGCTGTGTTGTGAGTTACATTGCGACACACTTTTGTGATGT
CAGCAGAGGAAACAGATTGACTTTGTTCTCGTCACGTCACGGTCTTCTAGACCTTTGAGG
AACCATCTGACTGCGAGGTGCTCTGAAGCATAAGTCATGAACGAAACTAGAACCATTGCT
ACTGCTATCATCAGACCCAACCTCAAAAATAAAGCGGTAACCCCTAACATATAGGGCAAA
GAAATGGCAGCAAGAGCCAAAAACACCATTCCTAATCCATAATACCATGTAGTGAAGTCA
CACGACGCATCTGCCCGCTGATGACCTTTTCCTGAATCATCCAACGATGATTCTGGAGAT
CCTGATTGAACTGCTACTTTCTTCCCATACTGGAACACAATAAGTAGGAAGCCACCGTAT
AATAGGAAGAAGATTGTAAATGTCCACTCATACATCAAAATCAAGCCAGTCCATGGCATG
ATTTGCCTCGGCACAATCATAAAGGAAACTCCAATCGATGTCAACACTGCTACAAAACAG
ACGACAACTGAAACTGACCCCAAGTATTGAGGAACCTTAGAGTAGGAGCCAGCGTGAAGT
TGATAGTTTGGATTCATGGTAGACAATGTCGACACACCACTATAACCAAGTGTTCCATTA
GATCTGACTTTGTAATAAAGATGTCTGATCTGATTGCATACAGAGTTCCTGCACAATGAA
CCCAAGAAGTCACGTCCCTGTATGGAACGATAAGTGCAGA
CAGA

QA 1 820 1 820
DS 

RD RS1FM48TF 628 0 0
TCATCCAACGATGATTCTGGAGATC*TGATTGAACTGCTACTTTCTTCCCATACTGGAAC
ACAATAAGTAGGAAGCCACCGTATAATAGGAAGAAGATTGTAAATGTCCACTCATACATC
AAAATCAAGCCAGTCCATGGCATGATTTGCCTCGGCACAATCATAAAGGAAACTCCAATC
GATGTCAACACTGCTACAAAACAGACGACAACTGAAACTGACCCCAAGTATTGAGGAACC
TTAGAGTAGGAGCCAGCGTGAAGTTGATAGTTTGGATTCATGGTAGACAATGTCGACACA
CCACTATAACCAAGTGTTCCATTAGATCTGACTTTGTAATAAAGATGTCTGATCTGATTG
CATACAGAGTTCCTGCACAATGAACCCAAGAAGTCACGTCCCTGTATGGAACGATAAGTG
CAGAACAAGAGCCCACAAAGTGGTAACAAGAAAAGGAGCTTGACGATGAACTCATCATTT
GGGGTTTTTCCACCTCCAGTTCCAGGAAGAGTCTCCTCAAGCCCTACCCTAATGCTATGC
CACGCCTCAACAGGTTTTACAAGCCACGCTGTCCACCAATCCCAAGGCTTAAGAGGACCC
AAAGTGTAGTGAATAATGTGAAGTTTGC

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 3

CO CL3961Contig1 1221 3 8 U
ACTCCATTTTTAACTTTCTCTCATTTTATTACACGAAAAAACATTACTACAAAACTACTC
CTATCCGCATCGTATCGTTATTGTTTCGTTGCCGCCTAAAAAGCAGCTGATTTTTGCCCA
AAAATCATCGGTACTCCAGTACGTGGTTCACCGACAACCTAAACCGATATATGGTTCGTA
AACAAGTATGGAGTTGCCCCAACTCCTAACAGTAGACCGTTGGTTTACATTCACTGTGAA
ACTCTATTCATCTTCTTTTCATCCTCCAACCCGGAAACCGGTTTTAGTAAATTGGGCAAT
CTAACCGGACCGCCATAACCTACACTCGGTTCGCTCGCAGATGGGTTTCCCGCATATCGA
ACCGGTACAAAACCACCATTGGCTTCTCCAACCAAGGGAGATTCCCCGGAGCTAGCAGCT
GCTCTCGGCGACAATCCTTGGAAAACGAGGACGAAGAAGAAGATAGCGGTGAGAAGGGTG
GCTAAGACATTGCCGAGAGAAGAAGACGCAGCTTTAGCCTCTCTCGATTTCTTCAAAGCT
CTCATACGTTCCACCCTCGCGCGTTTCAGCATCGCCAGCTCAGCTATCTCCCGCATCAGT
TTCTGATCCGCTGCGTCCAGCGACGGTCCACGCGGCGGCCTAGGAGGTTTCGACGCTGAT
TTCTTCCGTTCGCTCCTCCCCCATTCCGGTTTACTGATCGCACATTTAACCGGAGTAGCA
TCGTGGTTTTCCAACGAACCGGGAGTTTCTTCTCCGGTTATTACCGGTTTGCTATCCGGA
GACATGTGTGTCAATGGCTTCTCCGGCGATTTTGTATAAACATTTTGGCAATCTAAGATT
CCTCTCTCAAGATCAACATCGAAATCGAGACTCAGTCCCATGATCTCGCTAGATTTACTC
ACTCAAGAACAAGAAAAAAGAACCTAAGTTCTTGTAACTGGATCAAGATCTATCTCCAGT
AGAGGCGAATGAACACACACACACACACCAAATGTGTCTCTATAGGGTTTCCTTTTCTTT
TATTCACGCTTTGTGTCGCCTTTTAATACCCAAAGCAAGTAAAGAATGAATTACAGCTAA
CGTCACGTCTCCTCAAAAATAAATAGGATCAACAATCACGTGGTATTGATAAATAAAGTC
GGAAAAAACAAAAGTAAAGACTGGATTAGGATTAAAAGAGTATGAAAGGAGCTTGAAGTT
TTGTTGATGTTTTTATCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AAAATCATCGGTACTCCAGTACGTGGTTCACCGACAACCTAAACCGATATATGGTTCGTA
AACAAGTATGGAGTTGTCCCAACTCCTAACAGTAGACCGTTGGTTTACATTCACTGTGAA
ACTCTATTCATCTTCTTTTCATTCTCCAACCCGGAAACCGGTTTTAGTAAATTGGGCAAT
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TTCTTCCGTTCGCTCCTCCCCCATTCCGGTTTACTGATCGCACATTTAACCGGAGTAGCA
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DS 

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AACCTAAGTTCTTGTAACTGGATCAAGATCTATCTCCAGTAGAGGCGAATGAACACACAC
ACACACACCAAATGTGTCTCTATAGGGTTTCCTTTTCTTTTATTCACGCTTTGTGTCGCC
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AAATAGGATCAACAATCACGTGGTATTGATAAATAAAGTCGGAAAAAACAAAAGTAAAGA
CTGGATTAGGATTAAAAGAGTATGAAAGGAGCTTGAAGTTTTGTTGATGTTTTTATCTCC
C

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 3

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AAGTAATCAAACCATCACTGATTCCTAATTAACAATCAACTTAGTTGTAAAAATGTTGAC
CTCTTAACCAATTAATTTCCCCATTTTTTTATAACCCTTACTACTTCCTATAAACTCGTA
TCTCACCCAAACAAAAAAACATCAACACACACACACACACACACAGATCCACCACCATGG
AGAGTTCTCCCTTCCTCCTCCTCGCCACCGTCCTCCTCCTCCTCACAGCCACTCCCGGAA
CCCATTCTCAGCCAGCCGCGGCACCTGCTCCACCAGGACCCACAAACGTTACTAAAATCC
TCGAAAAAGCAGGCCAGTTCACGGTCTTCATCAGACTACTCAAATCAACCGGCGTTGCTA
ACCAACTCTACGGCCAACTCAACAACTCCGACAACGGAATCACTATCTTCGCGCCGAGCG
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BQ
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AF RS1CA90JQ U 1
AF RS1CA90TF C 327
AF RS1AD16TF U 199
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BS 394 394 RS1AD16TF
BS 395 758 RS1CA90JQ
BS 759 1072 RS1AD16TF

RD RS1CA90JQ 761 0 0
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AAGTAATCAAACCATCACTGATTCCTAATTAACAATCAACTTAGTTGTAAAAATGTTGAC
CTCTTAACCAATTAATTTCCCCATTTTTTTATAACCCTTACTACTTCCTATAAACTCGTA
TCTCACCCAAACAAAAAAACATCAACACACACACACACACACACAGATCCACCACCATGG
AGAGTTCTCCCTTCCTCCTCCTCGCCACCGTCCTCCTCCTCCTCACAGCCACTCCCGGAA
CCCATTCTCAGCCAGCCGCGGCACCTGCTCCACCAGGACCCACAAACGTTACTAAAATCC
TCGAAAAAGCAGGCCAGTTCACGGTCTTCATCAAACTACTCAAATCAACCGGCGTTGCTA
ACCAACTCTACGGCCAACTCAACAACTCCGACAACGGAATCACTATCTTCGCGCCGAGCG
ACTCCTCCTTCTCCAGTCTCAAAGCCGGAACCCTAAACTCCTTAACCGACGAGCAACAAG
TGGAGCTAGTTCAGTTTCACGTCATACCAAGTTACGTCTCTTCCTCAAACTTCCAAACGC
TAAGTAACCCTCTCCGGACTCAGGCCGGTGACTCCGCCGACGGACATTTCCCTCTCAACA
TCACCACCAGTGGCAATACCGTAAATATCACCTCCGGTGTAACCAACACCACCGTCTCCG
GTAATGTATACAGCGATGGACAGCTAGCTGTTTATCAG
TTG

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1CA90TF 618 0 0
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TTCATCAGACTACTCAAATCAACCGGCGTTGCTAACCAACTCTACGGCCAACTCAACAAC
TCCGACAACGGAATCACTATCTTCGCGCCGAGCGACTCCTCCTTCTCCAGTCTCAAAGCC
GGAACCCTAAACTCCTTAACCGACGAGCAACAAGTGGAGCTAGTTCAGTTTCACGTCATA
CCAAGTTACGTCTCTTCCTCAAACTTCCAAACGCTAAGTAACCCTCTCCGGACTCAGGCC
GGTGACTCCGCCGACGGACATTTCCCTCTCAACATCACCACCAGTGGCAATACCGTAAAT
ATCACCTCCGGTGTAACCAACACCACCGTCTCCGGTAATGTATACAGCGATGGACAGCTA
GCTGTTTATCAGGTTGATAAGGTTTTGCTTCCTCAGCAAGTTTTCGACCCTCGTCCTCCT
GCGCCTGCTCCGGCTCCGACGGTAGCGAAGACGAAGAAGAAGAAGGATGATGGTGATAGT
TCCGATGATGATTCTCCGGCGGACGCTTCGTATGCTTTGCGTGAAGTTGGTTCTGTTCGT
AACGACGTGTTGGTTT
CC

QA 1 616 1 616
DS 

RD RS1AD16TF 874 0 0
GG
ATCAACACACACACACACACACACAGATCCACCACCATGGAGAGTTCTCCCTTCCTCCTC
CTCGCCACCGTCCTCCTCCTCCTCACAGCCACTCCCGGAACCCATTCTCAGCCAGCCGCG
GCACCTGCTCCACCAGGACCCACAAACGTTACTAAAATCCTCGAAAAAGCGGGCCAGTTC
ACGGTCTTCATCAGACTACTCAAATCAACCGGCGTTGCTAACCAACTCTACGGCCAACTC
AACAACTCCGACAACGGAATCACTATCTTCGCGCCGAGCGACTCCTCCTTCTCCAGTCTC
AAAGCCGGAACCCTAAACTCCTTAACCGACGAGCAACAAGTGGAGCTAGTTCAGTTTCAC
GTCATACCAAGTTACGTCTCTTCCTCAAACTTCCAAACGCTAAGTAACCCTCTCCGGACT
CAGGCCGGTGACTCCGCCGACGGACATTTCCCTCTCAACATCACCACCAGTGGCAATACC
GTAAATATCACCTCCGGTGTAACCAACACCACCGTCTCCGGTAATGTATACAGCGA*GGA
CAGCTAGCTGTTTATCAGGTTGATAAGGTTTTGCTTCCTCAGCAAGTTTTCGACCCTCGT
CCTCCTGCGCCTGCTCCGGCTCCGACGGTAGCGAAGACGAAGAAGAAGAAGGATGATGGT
GATAGTTCCGATGATGATTCTCCGGCGGACGCTTCGTATGCTTTGCGTGAAGTTGGTTCT
GTTCGTAACGACGTGTTGGTTTGCGTCATTAGTATATCGCTTGCGTGGTTTTATTTGTGA
TGATATGTTGTTCTATTATTATTACTCATGCTTTTTATTTCTTATGATTTTGAGTATTAT
TTTTTCTGTTGATTTCATGCTTTTGTGTTTGA

QA 3 874 3 874
DS 



AS 1 2

CO CL3963Contig1 971 2 2 U
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CACGAATATGGCGACTCAGATTAGCAAGAAGAGAAAGTTTGTAGCGGACGGTGTGTTCTA
CGCCGAATTGAACGAGGTTTTGACTAGGGAGCTGGCGGAGGATGGATACTCAGGTGTGGA
GGTTAGGGTTACTCCGATGAGGACTGAGATTATCATCAGAGCCACACGTACTCAAAATGT
TCTCGGTGAGAAAGGGAGGAGGATCAGGGAGTTGACATCTCTTGTACAGAAGAGATTCAG
GTTTCCTCAAGACAGTGTTGAGCTTTACGCTGAAAAGGTTGCCAACAGAGGTCTCTGTGC
CATTGCTCAGGCCGAGTCTCTACGTTACAAACTTCTCGGTGGTCTTGCTGTTCGCAGGGC
TTGCTATGGTGTCTTGAGGTTCGTCATGGAGAGTGGAGCTAAGGGCTGTGAGGTGATTGT
GAGTGGAAAGCTACGTGCAGCGCGTGCCAAGTCCATGAAATTCAAGGACGGTTACATGGT
TTCATCTGGTCAACCTACCAAGGAGTACATCGATTCTGCTGTCAGACATGTTCTCCTTAG
ACAGGGCGTGCTCGGAATCAAAGTCAAGGTCATGCTTGACTGGGACCCTAAGGGAGTAAC
GGGACCGAAGACACCACTGCCCGATGTTGTGATCATCCATGCTCCCAAGGAAGAAGATTT
TAACTCTGCACCTGCTCAGGTTACTGCTCCTGCTGCTGCTCTTTTACCGGAAGCTCCCCT
CACAGCTGTAGATTACCCTGAGATGATCCCAGTCGCCTAGAAAAAGACCTTTTACTGCTA
TTCCATGTGGTTTTGTTCTTTTTCTTTTGTTCAACTTTTCTCACCTCTCTTTTGACAGGT
TTTAGTTTCTTGTATCTTCGAATCAGACACCTTTTCCTCAAATCGATTTCTATAAATTAT
CTTAAGTTTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DM84TF U 1
AF RS1DM84JQ C 311
BS 1 627 RS1DM84TF
BS 628 971 RS1DM84JQ

RD RS1DM84TF 627 0 0
GGGACTGCTCATCTTCTTCTTACACTGTTAGGGTTTCAGCTGTCGGCAGATTTACATTTC
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CGCCGAATTGAACGAGGTTTTGACTAGGGAGCTGGCGGAGGATGGATACTCAGGTGTGGA
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TCTCGGTGAGAAAGGGAGGAGGATCAGGGAGTTGACATCTCTTGTACAGAAGAGATTCAG
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CATTGCTCAGGCCGAGTCTCTACGTTACAAACTTCTCGGTGGTCTTGCTGTTCGCAGGGC
TTGCTATGGTGTCTTGAGGTTCGTCATGGAGAGTGGAGCTAAGGGCTGTGAGGTGATTGT
GAGTGGAAAGCTACGTGCAGCGCGTGCCAAGTCCATGAAATTCAAGGACGGTTACATGGT
TTCATCTGGTCAACCTACCAAGGAGTACATCGATTCTGCTGTCAGACATGTTCTCCTTAG
ACAGGGCGTGCTCGGAATCAAAGTCAA

QA 1 627 1 627
DS 

RD RS1DM84JQ 661 0 0
GACAGTGTTGAGCTTTACGCTGAAAAGGTTGCCAACAGAGGTCTCTGTGCCATTGCTCAG
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ACACCACTGCCCGATGTTGTGATCATCCATGCTCCCAAGGAAGAAGATTTTAACTCTGCA
CCTGCTCAGGTTACTGCTCCTGCTGCTGCTCTTTTACCGGAAGCTCCCCTCACAGCTGTA
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TTTTGTTCTTTTTCTTTTGTTCAACTTTTCTCACCTCTCTTTTGACAGGTTTTAGTTTCT
TGTATCTTCGAATCAGACACCTTTTCCTCAAATCGATTTCTATAAATTATCTTAAGTTTC
C

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 3

CO CL3964Contig1 1238 3 13 U
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AGATGTGTAATCTCACTAAAGACAATGTCTCTAGCCAAAGCGGTTTCGTGCGTAAGGAAA
AGAGAGCTTATTTTCAGAGATATTGGACGTGGGCCGATGTAGCAAGAGCGCTAACCGTTA
CGATCGTTCACTTTTTGTGTCTCCTGGCGCCATTATACTACAAATGGGAAGCGTTACGGT
TCGGTTTGATTCTCGTCTCAGTGACTAACCTGCTCATCACATTCTCGTACCACAGGAACT
TGGCTCATCGGAGCTTTAAGCTCCCAAAGTGGCTTGAATATCCTATTGCTTACGCTGCTG
TTTTCGCTCTTCAGGGTGATCCATTGGATTGGGTGAGCATACATAGGTTCCACCACCAGT
TCACAGATTCAGATCGAGACCCACATAGCCCTAAGGAAGGATTTTTGTTCAGCCATGTCA
TGTGGATATTTGACACGCTTTATATAAAATATAAGTGTGGTGGACGTAACAACGTGATGG
ACTTGAAGCAGCAATGGTTCTATAGGTTTCTACGCAAGACGATTGGTTTCCACGTCTTAA
TGTTTTGGACCGTTCTCTATCTCTACGGTGGTTTACCTTACCTTACTTGCGGCGGGGGCG
TTGGAGGTGTGCTAGGGTATCACGTGACATGGCTTGTAAACTCAGCATGCCATATTTGTG
GTTCGAGGTCGTGGAAAACTAAAGACACATCTCGTAATGTTTGGTGGCTAAGCTTATTTA
CGATGGGAGAGAGTTGACACAACAACCACCACGCGTTTCAGTCATCGGCGAGGCAAGGAT
TGGAGTGGTGGCAGATAGATATCACTTGGTACCTCATTCGACTACTTGAGGTTTTCGGAT
TAGCCACCGATGTGAAATTGCCTTCGGAATACCAAAAACAGAAGTTGGCTCTCTCTGGTT
GATGTTATTTCAAGATTTGAGTTATTCACATGAGAAACAAAGCAGAAATTTATTTAAAGA
GTGATTTAAGTTATATAGTAAAATCGATTAGAATTACAGTATTCATATAAGTTGAGAATA
AACTTATTTTCCAGATTATGGTTGTTTTCCAAAATAGGTGAATGTTTACTTCTGTCTTAA
TAGTAGACTTGAAAATGTCCTTGATCAAGTACTATATTCTTAAAAATCATTAGTTTGATG
TTTGGTTTTAAATGAATATTTGCATCTTGTTTAGTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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G
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BQ
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DS 

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CTTCCACTCGAGACTTTTCTAGGCAAATCGCTGCTACTGATTAAAACTGGTGTAGGTAGT
GAAGGCGGTGGAGGTGAAAAACTAGGCACTGGAGGTTTTTGCCTTGCAAATCTCTCTTGT
TCTGCTCGATGATATCTCTGAATTACAAAATTACGTCTCTCGCAATCAAGGAACATGCTT
ACTGTCCAGTTTGTTTTTGCAGCAATCTTGTCTCTTACCGTCGAGAAGCTGATTTGATCT
CTAGAAGTAAATCGGTCTACTTCGTTGAACCAAAGACAAGTGAAGAGGTTGCTAATCGGA
ACATGCTCTCTTAAAATGACACACCCCTCCGGAACGTCGCTTGTGATTGGGAGCTTTGCA
ACAGAATAAGGGGTTAGCCCTTCATTCTTGTAGAAATCCACTTGAAAGTCGATAGAGGCA
TTATCATATTTACCAGCAGCTTTATTTGCTTCAGCCTCCACGAAAACATCAAATCTTCTG
TAATGTATAGAGATAGCAAAAGTAGCATTTTTCCTCCACAAGAACCTTTCAAGAATTTGA
TGTGGAC

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 3

CO CL3966Contig1 879 3 3 U
GATGAAAGGTCATAATCCTCTAGAAAGAAACAGAGATTTTCAAAGTAAAAAAAAAATGCT
TAAAAAACACACAAAACATTGATGACAATTTTTTCGTTTTAGTAAAACATTGAACAAAGG
AAGAAGATTAGACAAAGCTCACTAACTTCAACAATGGCCATAACAAACAATAAAGAAAAA
ACCTCCAAAGGCTACTTCTATGTGGTGAGCATTGAGCTTGTTGACCCATGAAATCACAAA
CTACCAGGGAAAAAGCAACAATCTCTAAGCGTCTCTCATGCTAATGTTCAGACTGTTTCT
CATCGTCCTTCTTCCAACCCCAGCGTTTCCCTTTTGCATCATCTCCACAAACTCACCATA
ATCAATCTGTCCATCATTGTTTTGATCAACTTCTTTGATGATGTCTTCAAGGAAAACATC
AGTCATACTATGTTCAACACACGCTTGTTGCAGCTCGTCTATCGTTATGTAACCACTTCC
GTCTTTGTCAAAGTACCTAAACGCAGCTACAAGATGTTCTTCCCTCTCCAGCTTGTTGAG
ATGTATGGTCGCTGCAATGAACTCGCTGTAATCTATTGTCCCGCTGTTGTCCACATCAGC
CGCTTCCATAAGATCATGGATCTCTGTGTCTTTCAGAGTAGATCCATATTTCCTCAGACC
AGCTTTGAGTTCATCAAAGGTGATTGCACCGCTGTTATCAGTATCCATCGCTTGAAACAT
TTCTCTTAAGCCAGCAATCTCTTCTTCGGAGAGACTCTCAGCTATCACCTTCAAAGCCAT
CTTCTTTAGTTTATTCATTGCAGAGAACTGCTTGATTCTAGACAGACAGCTGGATCAAGT
GGTCTATCTGGTGCACACCGTTCTCACAGATCATGGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CX02JQ U 42
AF RS1DP89JQ U 80
AF RS1D374JQ U 1
BS 1 62 RS1D374JQ
BS 63 63 RS1CX02JQ
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RD RS1CX02JQ 599 0 0
CAAAGT
AAAAAAAAATGCTTAAAAAACACACAAAACATTGATGACAATTTTTTCGTTTTAGTAAAA
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TCAGACTGTTTCTCATCGTCCTTCTTCCAACCCCAGCGTTTCCCTTTTGCATCATCTCCA
CAAACTCACCATAATCAATCTGTCCATCATTGTTTTGATCAACTTCTTTGATGATGTCTT
CAAGGAAAACATCAGTCATACTATGTTCAACACACGCTTGTTGCAGCTCGTCTATCGTTA
TGTAACCACTTCCGTCTTTGTCAAAGTACCTAAACGCAGCTACAAGATGTTCTTCCCTCT
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TGTCCACATCAGCCGCTTCCATAAGATCATGGATCTCTGTGTCTTTC
AGAGTA

QA 7 593 7 593
DS 

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TTTTTTCGTTTTAGTAAAACATTGTACAAAGGAAGAAGATTAGACAAAGCTCACTAACTT
CAACAATGGCCATAACAAACAATAAAGAAAAAACCTCCAAAGGCTACTTCTATGTGGTGA
GCATTGAGCTTGTTGACCCATGAAATCACAAACTACCAGGGAAAAAGCAACAATCTCTAA
GCGTCTCTCATGCTAATGTTCAGACTGTTTCTCATCGTCCTTCTTCCAACCCCAGCGTTT
CCCTTTTGCATCATCTCCACAAACTCACCATAATCAATCTGTCCATCATTGTTTTGATCA
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TGCAGCTCGTCTATCGTTATGTAACCACTTCCGTCTTTGTCAAAGTACCTAAACGCAGCT
ACAAGATGTTCTTCCCTCTCCAGCTTGTTGAGATGTATGGTCGCTGCAATGAACTCGCTG
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TCTTTC

QA 10 555 10 555
DS 

RD RS1D374JQ 879 0 0
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AAGAAGATTAGACAAAGCTCACTAACTTCAACAATGGCCATAACAAACAATAAAGAAAAA
ACCTCCAAAGGCTACTTCTATGTGGTGAGCATTGAGCTTGTTGACCCATGAAATCACAAA
CTACCAGGGAAAAAGCAACAATCTCTAAGCGTCTCTCATGCTAATGTTCAGACTGTTTCT
CATCGTCCTTCTTCCAACCCCAGCGTTTCCCTTTTGCATCATCTCCACAAACTCACCATA
ATCAATCTGTCCATCATTGTTTTGATCAACTTCTTTGATGATGTCTTCAAGGAAAACATC
AGTCATACTATGTTCAACACACGCTTGTTGCAGCTCGTCTATCGTTATGTAACCACTTCC
GTCTTTGTCAAAGTACCTAAACGCAGCTACAAGATGTTCTTCCCTCTCCAGCTTGTTGAG
ATGTATGGTCGCTGCAATGAACTCGCTGTAATCTATTGTCCCGCTGTTGTCCACATCAGC
CGCTTCCATAAGATCATGGATCTCTGTGTCTTTCAGAGTAGATCCATATTTCCTCAGACC
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CTTCTTTAGTTTATTCATTGCAGAGAACTGCTTGATTCTAGACAGACAGCTGGATCAAGT
GGTCTATCTGGTGCACACCGTTCTCACAGATCATGGATG

QA 1 879 1 879
DS 



AS 1 3

CO CL3967Contig1 606 3 4 U
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CTGATCCACTCACCGTAGACTACAACGACTCTCCCCTTTCTGTTTTCCCAGCTGAAGCAT
GTGAAGTAATCAGCGGTTACGCCTGTTCTGCTGATATTTACCCTGAAGTCAAGCTTGAAA
CAAAGCCAGTCTCACCTCCCGTGGCGTCAGAGCCTGTAGACCGAGAATACCTAGAGTATA
ACAACCCCAAAACAGTTTTCCCCGCAGAGGCTTGTGATGATCTTGGAGGAGAGTTCTGCG
AACCTGACTATCAAAAAGATGTCTACTAGAAAGAAGAAGCAAGATTTTATATGATGTGAA
TATGTGTGTTGTTGTATCTCTACTAGTCTCTGTAACCACTCTTAGTATATGAAGTCTAGC
TTCACTTAATCAATGAATGTGAATCAGACACAAGTCCCGAAAGTCAAACAAAAGGTTGAC
ATTGAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1GL93TF U 1
AF RS1EN05TF U 1
AF RS1G204TF U 68
BS 1 87 RS1EN05TF
BS 88 88 RS1GL93TF
BS 89 548 RS1EN05TF
BS 549 606 RS1G204TF

RD RS1GL93TF 323 0 0
GGAAGCCAATCTTCTTTCAGAAAAAAATAAAAATGCAGGGAGCATTGTGCATCAAACCAA
CCATTCTTCCACTTTCTTCTCCAAAGCTCACTCTTCTTCTTCCTCAGACCATCTCCACCA
CCAAAGCTTCAAGACTCTCCTCTCTCAGACTCAGACCAAACTCATCATCACCTTCAACCT
CTGATCCACTCACCGTAGACTACAACGACTCTCCCCTTTCTGTTTTCCCAGCTGAAGCAT
GTGAAGTAATCAGCGGTTACGCCTGTTCTGCTGATATTTACCCTGAAGTCAAGCTTGAAA
CAAAGCCAGTCTCACCTCCCGTG

QA 1 323 1 323
DS 

RD RS1EN05TF 548 0 0
GGAAGCCAATCTTCTTTCAGAAAAAAATAAAAATGCAGGGAGCATTGTGCATCAAACCAA
CCATTCTTCCACTTTCTTCTCCAAAGCCCACTCTTCTTCTTCCTCAGACCATCTCCACCA
CCAAAGCTTCAAGACTCTCCTCTCTCAGACTCAGACCAAACTCATCATCACCTTCAACCT
CTGATCCACTCACCGTAGACTACAACGACTCTCCCCTTTCTGTTTTCCCAGCTGAAGCAT
GTGAAGTAATCAGCGGTTACGCCTGTTCTGCTGATATTTACCCTGAAGTCAAGCTTGAAA
CAAAGCCAGTCTCACCTCCCGTGGCGTCAGAGCCTGTAGACCGAGAATACCTAGAGTATA
ACAACCCCAAAACAGTTTTCCCCGCAGAGGCTTGTGATGATCTTGGAGGAGAGTTCTGCG
AACCTGACTATCAAAAAGATGTCTACTAGAAAGAAGAAGCAAGATTTTATATGATGTGAA
TATGTGTGTTGTTGTATCTCTACTAGTCTCTGTAACCACTCTTAGTATATGAAGTCTAGC
TTCACTTA

QA 1 548 1 548
DS 

RD RS1G204TF 539 0 0
G
CCACTTTCTTCTCCAAAGCTCACTCTTCTTCTTCCTCAGACCATCTCCACCACCAAAGCT
TCAAGACTCTCCTCTCTCAGACTCAGACCAAACTCATCATCACCTTCAACCTCTGATCCA
CTCACCGTAGACTACAACGACTCTCCCCTTTCTGTTTTCCCAGCTGAAGCATGTGAAGTA
ATCAGCGGTTACGCCTGTTCTGCTGATATTTACCCTGAAGTCAAGCTTGAAACAAAGCCA
GTC*CACCTCCCGTGGCGTCAGAGCCTGTAGACCGAGAATACCTAGAGTATAACAACCCC
AAAACAGTTTTCCCCGCAGAGGCTTGTGATGATCTTGGAGGAGAGTTCTGCGAACCTGAC
TATCAAAAAGATGTCTACTAGAAAGAAGAAGCAAGATTTTATATGATGTGAATATGTGTG
TTGTTGTATCTCTACTAGTCTCTGTAACCACTCTTAGTATATGAAGTCTATCTTCACTTA
ATCAATGAATGTGAATCAGACACAAGTCCCGAAAGTCAAACAAAAGGTTGACATTGAT

QA 2 539 2 539
DS 



AS 1 3

CO CL3968Contig1 483 3 5 U
GGACCAAACCTTTGTTTCTTCCAAGTCTTGTCAAAATCTCTCGCCTAATTCTTGATATAA
TGAATTCGATGTTCAGTGCCTTCGACGCCATGTGCGCAGAGATTATGGGCAAGAAAGTCA
CCGCTGCCTCTTTCATCTACAACCCTGCTTCTTCCGCCGGTCAAACCGCGTCTTCTTCAC
TTAAGAAAGACGAAAAGGCTACAAACTTGGCGGCGAAGCAACCGAGGTGTGCTTTGGAGC
TCGACGGGATCCACTGCTTCGAGACCATCGTTCTTGATTCCAGTAACAGATCTTCCTGAG
TCTTTGTGTTTTCTTCTTTTTTTTT***CTTTTTTATGTAAATACAATTTTCGAAAAAAA
TCAAACTATTCATCGTTTGTGATTGGTTCATTCTATTTTGCTGTTTTATGATTTTCTCTC
TTGTGTTCGTTTTCAGATTCTTGATTTTTTATATAATACATAAAAAAGGAAGAAATTATT
CTT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EX89TF U 1
AF RS1FA88TF U 1
AF RS1CO86TF U 1
BS 1 196 RS1CO86TF
BS 197 197 RS1EX89TF
BS 198 325 RS1CO86TF
BS 326 328 RS1EX89TF
BS 329 483 RS1CO86TF

RD RS1EX89TF 389 0 0
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TCTTTGTGTTTTCTTCTTTTTTTTT***CTTTTTTATGTAAATACAATTTTCGAAAAAAA
TCAAACTATTCATCGTTTGTGATTGGTTC

QA 1 389 1 389
DS 

RD RS1FA88TF 389 0 0
GGACCAAACCTTTGTTTCTTCCAAGTCTTGTCAAAATCTCTCGCCTAATTCTTGATATAA
TGAATTCGATGTTCAGTGCCTTCGACGCCATGTGCGCAGAGATTATGGGCAAGAAAGTCA
CCGCTGCCTCTTTCATCTACAACCCTGCTTCTTCCGCCGGTCAAACCGCGTCTTCTTCAC
TTAAGAAAGACGAAAAGGCTACAAACTTGGCGGCGAAGCAACCGAGGTGTGCTTTGGAGC
TCGACGGGATCCACTGCTTCGAGACCATCGTTCTTGATTCCAGTAACAGATCTTCCTGAG
TCTTTGTGTTTTCTTCTTTTTTTTT***CTTTTTTATGTAAATACAATTTTCGAAAAAAA
TCAAACTATTCATCGTTTGTGATTGGTTC

QA 1 389 1 389
DS 

RD RS1CO86TF 483 0 0
GGACCAAACCTTTGTTTCTTCCAAGTCTTGTCAAAATCTCTCGCCTAATTCTTGATATAA
TGAATTCGATGTTCAGTGCCTTCGACGCCATGTGCGCAGAGATTATGGGCAAGAAAGTCA
CCGCTGCCTCTTTCATCTACAACCCTGCTTCTTCCGCCGGTCAAACCGCGTCTTCTTCAC
TTAAGAAAGACGAAAAAGCTACAAACTTGGCGGCGAAGCAACCGAGGTGTGCTTTGGAGC
TCGACGGGATCCACTGCTTCGAGACCATCGTTCTTGATTCCAGTAACAGATCTTCCTGAG
TCTTTGTGTTTTCTTCTTTTTTTTTTTTCTTTTTTATGTAAATACAATTTTCGAAAAAAA
TCAAACTATTCATCGTTTGTGATTGGTTCATTCTATTTTGCTGTTTTATGATTTTCTCTC
TTGTGTTCGTTTTCAGATTCTTGATTTTTTATATAATACATAAAAAAGGAAGAAATTATT
CTT

QA 1 483 1 483
DS 



AS 1 2

CO CL3969Contig1 810 2 24 U
GGCCCTTTCATAAAACGAACATCTCCGCCAGATAAAACTCCGATCTCTCCTCGCCTGAAG
ATGCAGTACTTCTACATATTGATCGTATCTATACTCCTCACCCTTAATTTCAAGGGTGAA
GCCAGTGTCTCTGTTTTCTTCATTGATGGATCCAACAACCAATACCTTCGTCCACCATCA
CAGCAGGCGCTTCCCATGTCGCTCTCTCAAGTATCTGCATCAGTCTCTGCCTTGTTGGGT
TTCGCACCTCCACCTACTTTAACACCTGATGGCTCATCCATGCTGAACAAGATTCTTAAA
CCTAATCCATTTGAGAGGCCTCGTGCTGCTTTTGTGCTAGAAATCGCTGGAACTGATGAT
GCGCTTATGGAAACCTTACCTAGTCATTCTTTGTTGGGCAATGCTGTGAGAGGCAGTATC
AGTTCTGATTCTTACAAAGCTGATATTGAACTTCCAGAAAGTGAAGTAGATGTTGTGTCT
GTCAATGAACCCTTAAATGATGCGACTGACAAAGACATGAACGAGTTTGCATCTTGGTTG
GGCGGATCATATGTTGCTGCTGGATCTGCTGAACCATTGACTGGATTGCTGAGTATCCCT
CTGGTCGGTGCGGCTAACGTTGAGTTCCATTTGGAAAAGGAAGCAGAGAGGAAATTTGCT
TTGAACCTTTTGGAACTATATAAGAATGTCAAACGAGCTGTCAACCTTCATGAGGATTTA
TCTCATCCTGAATTAACAGTTGGGCGCTTTGGCGGTATCGATGCTTTAGCACAGAGTATG
GACAGTATGGCTAGAAAGGGATGAATGTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A944TF U 1
AF RS1BX26TF U 10
BS 1 68 RS1A944TF
BS 69 69 RS1BX26TF
BS 70 284 RS1A944TF
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BS 771 810 RS1BX26TF

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ATGCAGTATTTCTACATATTGATCGTATCTATACTCCTCACCCTTAATTTCAAGGGTGAA
GCCAGTGTCTCTGTTTTCTTCATTGATGGATCCAACAACCAATACCTTCGTCCACCATCA
CAGCAGGCGCTTCCCATGTCGCTCTCTCAAGTATCTGCATCAGTCTCTGCCTTGTTGGGT
TTCGCACCTCCACCTACTTTAACACCTGATGGCTCATCCATGCTTAACAAGATTCTTAAA
CCTAATCCATTTGAGAGGCCTCGTGCTGCTTTTGTGCTAGAAATCGCTGGAGCTGATGAT
GCGCTTGTGGAAACTTTACCTAGTCATTCTTTGTTGGGCAATGCTGTGAGAGGCAGTATC
AGTTCTGATTCTTACAAGGCTGATATTGAACTTCCAGAAAGTGAAGTAGATGTTGTGTCT
GTCAATGAACCCTTGAATGATGCGACTGACAAAGACATGAACGAGTTTGCATCTTGGTTG
GGTGGATCATATGTTGCT***GGGTCTGCTGAACCATTGACTGGATTGCTGAGTATCCCT
CTGGTTGGTGCGGCTAACGTTGAGTTCCATTTGGAAAAGGAAGCAGAGAGGAAATTTGCT
TTGAACCTTTTGGAACTATATAAGAATGTCAAACGAGCTGTCAACCTTCATGAGGATTTA
TCTCATCCTGAATTAACAGTTGGGCGCTTTGGCGGTATCGATGCTTTAGC

QA 1 770 1 770
DS 

RD RS1BX26TF 801 0 0
GGGGATTA
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ATTGATCGTATCTATACTCCTCACCCTTAATTTCAAGGGTGAAGCCAGTGTCTCTGTTTT
CTTCATTGATGGATCCAACAACCAATACCTTCGTCCACCATCACAGCAGGCGCTTCCCAT
GTCGCTCTCTCAAGTATCTGCATCAGTGTCTGCCTTGTTGGGTTTCGCACCTCCAGCTAC
TTTAACACCTGATGGCTCATCCATGCTGAACAAGATTCTTAAACCTAATCCATTTGAGAG
GCCTCGTGCTGCTTTTGTGCTAGAAATCGCTGGAATTGATGATGCGCTTATGGAAACCTT
ACCTAGTCATTCTTTGTTGGGCAATGCTGTGAGAGGCAGTATCAGTTCTGATTCTTACAA
AGCTGATATTGAACTTCCAGAAAGTGAAGTAGCTGTTGTGTCTGTCAATGAACCCTTAAC
TGATGCGACTGACAAAGACATGAACGAGTTTGCATCTTGGTTGGGCGGATCATATGTTGC
TGCTGGATCTGCTGAACCATTGACTGGATTGCTGAGTATCTCTCTGGTCGGTGCGGCTAA
CGTTGAGTTCCATTTGGAAAAGGAAGCAGAGAGGAAATTTGCTTTGAACCTTTTGGAACT
ATATAAGAATGTCGAACGAGCTGTCAACCTTCATGAGGATTTATCTCATCCTGAATTAAC
AGTTGGGCGCTTTGGTGGTATCGATGCTTTAGCACAGAGTATGGACAGTATGGCTAGAAA
GGGATGAATGTAT

QA 9 801 9 801
DS 



AS 1 3

CO CL3970Contig1 742 3 14 U
ATATATAACTATGGTGGCTAATGTTTTACTCGTGGTAATCAAATAATAATCATGGAGACA
TGGACAACATTTGGCTATTCAGTAAATATTTAAATCCAATTAAAAAACAGAGCAGGAAAG
ACTTTTGGTTTTGGTCACTAGGACATCATTTTCCGAACTTGAGCCAATAGTCCTTTCTCT
TATTCTCTCTTAATCATAGCGAGTAAGAAGTCATTGAGGTTATCGATCGGACAAGGCAGG
CACCAGTGGACACAGTCGTTGTACAAAGACACATTAGCCTCGGGGAGATGTCCGTAGCGG
CTAGGGTGACCATCGGGTCTAAGCCACATCGCTTGAGTCGTGTCTAGTAGTCTAAACCTC
CTTCCTTTCCTCTTGGCTTCTTTTTCAGCTCTCTCAAACTCCTCCACCTGAATCCTGTGT
AGCTTCCTTGTCACCTCGTCCTGAGTCTCGTTCCCCTGATAAGGTCCTTTCCTCAAACAG
TCCCCTCCTTCGTTCCATAACCCACCCTCGAAATGCGATGGTAAAAATGTTCGTAAATAC
ATCACGCCCTCGAATGTCTCCGAGTCCAAGATCGCTTTAAACGCTGTTCTAAACGCTTTT
CTGTACCCGTAAAACATCGAGAAATCGGTTATGTTTGGTAACTGGCAATAACGGCAACCA
ACGATGGTATTGTTCTCGTAGTAGACCATTGGCCGAAAATGCCAATGACCTGAGGAGATG
ATCACGTAGTCGAAGTCTCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1EM87JQ U 1
AF RS1AQ11JQ U 28
AF RS1AQ11TFB C 136
BS 1 181 RS1EM87JQ
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BS 183 206 RS1EM87JQ
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BS 278 360 RS1EM87JQ
BS 361 361 RS1AQ11JQ
BS 362 640 RS1EM87JQ
BS 641 641 RS1AQ11JQ
BS 642 692 RS1EM87JQ
BS 693 742 RS1AQ11JQ

RD RS1EM87JQ 692 0 0
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TGGACAACATTTGGCTATTCAGTAAATATTTAAATCCAATTAAAAAACAGAGCAGGAAAG
ACTTTTGGTTTTGGTCACTAGGACATCATTTTCCGAACTTGAGCCAATAGTCCTTTCTCT
TCTTCTCTCTTAATCATAGCGAGTAAAAAGTCATTGAGGTTATCGATCGGACCAGGCAGG
CACCAGTGGACACAGTCGTTGTACAAAGACACATTACCCTCGGGGAGATGTCCGTAGCGG
CTAGGGTGACCATCGGGTCTAAGCCACATCGCTTGAGTCGTGTCTAGTAGTCTAAACCTC
TTTCCTTTCCTCTTGGCTTCTTTTTCAGCTCTCTCAAACTCCTCCACCTGAATCCTGTGT
AGCTTCCTTGTCACCTCGTCCTGAGTCTCGTTCCCCTGATAAGGTCCTTTCCTCAAACAG
TCCCCTCCTTCGTTCCATAACCCACCCTCGAAATGCGATGGTAAAAATGTTCGTAAATAC
ATCACGCCCTCGAATGTCTCCGAGTCCAAGATCGCTTTAAACGCTGTTCTAAACGCTTTT
CTGTACCCGTAAAACATCGAGAAATCGGTTATGTTTGGTAGCTGGCAATAACGGCAACCA
ACGATGGTATTGTTCTCGTAGTAGACCATTGG

QA 1 692 1 692
DS 

RD RS1AQ11JQ 715 0 0
G
CTCGTGGTAATCAAATAATAATCATGGAGACATGGACAACATTTGGCTATTCAGTAAATA
TTTAAATCCAATTAAAAAACAGAGCAGGAAAGACTTTTGGTTTTGGTCACTAGGACATCA
TTTTCCGAACTTGAGCCAATAGTCCTTTCTCTTATTCTCTCTTAATCATAGCGAGTAAGA
AGTCATTGAGGTTATCGATCGGACAAGGCAGGCACCAGTGGACACAGTCGTTGTACAAAG
ACACATTAGCCTCGGGGAGATGTCCGTAGCGGCTAGGGTGACCATCGGGTCTAAGCCACA
TCGCTTGAGTCGTGTCTAGTAGTCTAAACCTCCTTCCTTTCCTCTTGGCTTCTTTTTCAG
CTCTCTCAAACTCCTCCACCTGAATCCTGTGTAGCTTCCTTGTCACCTCGTCCTGAGTCT
CGTTCCCCTGATAAGGTCCTTTCCTCAAACAGTCCCCTCCTTCGTTCCATAACCCACCCT
CGAAATGCGATGGTAAAAATGTTCGTAAATACATCACGCCCTCGAATGTCTCCGAGTCCA
AGATCGCTTTAAACGCTGTTCTAAACGCTTTTCTGTACCCGTAAAACATCGAGAAATCGG
TTATGTTTGGTAACTGGCAATAACGGCAACCAACGATGGTATTGTTCTCGTAGTAGACCA
TTGGCCGAAAATGCCAATGACCTGAGGAGATGATCACGTAGTCGAAGTCTCCTC

QA 2 715 2 715
DS 

RD RS1AQ11TFB 607 0 0
CACTAGGACATCATTTTCCGAACTTGAGCCAATAGTCCTTTCTCTTATTCTCTCTTAATC
ATAGCGAGTAAGAAGTCATTGAGGTTATCGATCGGACAAGGCAGGCACCAGTGGACACAG
TCGTTGTACAAAGACACATTAGCCTCGGGGAGATGTCCGTAGCGGCTAGGGTGACCATCG
GGTCTAAGCCACATCGCTTGAGTCGTGTCTAGTAGTCTAAACCTCCTTCCTTTCCTCTTG
GCTTCTTTTTCAGCTCTCTCAAACTCCTCCACCTGAATCCTGTGTAGCTTCCTTGTCACC
TCGTCCTGAGTCTCGTTCCCCTGATAAGGTCCTTTCCTCAAACAGTCCCCTCCTTCGTTC
CATAACCCACCCTCGAAATGCGATGGTAAAAATGTTCGTAAATACATCACGCCCTCGAAT
GTCTCCGAGTCCAAGATCGCTTTAAACGCTGTTCTAAACGCTTTTCTGTACCCGTAAAAC
ATCGAGAAATCGGTTATGTTTGGTAACTGGCAATAACGGCAACCAACGATGGTATTGTTC
TCGTAGTAGACCATTGGCCGAAAATGCCAATGACCTGAGGAGATGATCACGTAGTCGAAG
TCTCCTC

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 2

CO CL3971Contig1 1011 2 6 U
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TTTCGCGTAACCGTGATCTTAGTGAATTGCCTGAAGAAATTTGCAGCTTGACTTCCTTGC
AATACCTCAATTTATCATACACAAGTATAAGTTCGTTATCAGTTGGTTTGAAGAGGTTAA
GGAAACTAATAAGCCTGGACCTGGAGTTTACCTGGCTTACAAACATTGATGGGATAGGAA
CAAGCTTACCAAATCTTCAGGTCTTGAAACTATATCATTCTAGTGTTCAATTTGATGCAA
GTTCAATCGAAGAGCTTCAACTTTTAGAGCACTTGAAGATTTTAACAGGAAACGTGATAG
ATGCTTTAATGTTGGAAAGTATCCAAAGAGTGGAGCGACTGGCGAGTTGTGTTCAACGCC
TTTGGATTATCAGTTGTTTCACCAAAGTTGTAACGTTGAACACGGTAGCTTTGGGTGGTT
TTCGAGAACTTAATATTGAGTTGTCCGAAATTTCAGAGATAAAGATAGACTGGAAAAACA
AAGAGAAGGAAGATTTTTTATGTAACAGTTTTCCATGCTTCAAGAACCTTTCAAGTATTT
TTTTACGCAATTTGGAAGGTCCAAAAGAATTGACCTGGTTATTGTTTGCTCCAAATTTCA
AGCATTTACATGTGGGAAGTTCAGGAAGCCTAGAAGAAATAATAAATACGGAGAAGGGAA
TGCGTATTGGCAATGTGCATCCTGACATGAAGGTTCCTTTTCAGAAGCTAGAATCCCTCA
GTTCAAGGGGTTTGGACAAATTAAAGATGATATGCTCAACTCCTCCGGCTTTTCCATCCC
TGAAAATTTTGTTGTGGAACACTGCCGAAATCTGCCGAGAGCCGCCAGGGAGAGTTTCCG
AGAGCATGAACAGGAATAATGAAGTTGATGAATGAGGCTCCGAAGCCCCCCTGTATATGT
CATATGTGTGTGAGTGTATCCTTTCAGTTTTTAAACTTGGTTTTGGTGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1F028TF U 1
AF RS1CG06JQ C 261
BS 1 268 RS1F028TF
BS 269 269 RS1CG06JQ
BS 270 342 RS1F028TF
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BS 344 363 RS1F028TF
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RD RS1F028TF 369 0 0
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TTTCGCGTAACCGTGATCTTAGTGAATTGCCTGAAGAAATTTGCAGCTTGACTTCCTTGC
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GGAAACTAATAAGCCTGGACCTGGAGTTTACCTGGCTTACAAACATTGATGGGATAGGAA
CAAGCTTACCAAATCTTCAGGTCTTGAAGCTATATCATTCTAGTGTTCAATTTGATGCAA
GTTCAATCGAAGAGCTTCAACTTTTAGAGCACTTGAAGATTT*AACAGGAAACGTGATAG
ATG
TTTAAT

QA 1 363 1 363
DS 

RD RS1CG06JQ 751 0 0
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CTTTTAGAGCACTTGAAGATTTTAACAGGAAACGTGATAGATGCTTTAATGTTGGAAAGT
ATCCAAAGAGTGGAGCGACTGGCGAGTTGTGTTCAACGCCTTTGGATTATCAGTTGTTTC
ACCAAAGTTGTAACGTTGAACACGGTAGCTTTGGGTGGTTTTCGAGAACTTAATATTGAG
TTGTCCGAAATTTCAGAGATAAAGATAGACTGGAAAAACAAAGAGAAGGAAGATTTTTTA
TGTAACAGTTTTCCATGCTTCAAGAACCTTTCAAGTATTTTTTTACGCAATTTGGAAGGT
CCAAAAGAATTGACCTGGTTATTGTTTGCTCCAAATTTCAAGCATTTACATGTGGGAAGT
TCAGGAAGCCTAGAAGAAATAATAAATACGGAGAAGGGAATGCGTATTGGCAATGTGCAT
CCTGACATGAAGGTTCCTTTTCAGAAGCTAGAATCCCTCAGTTCAAGGGGTTTGGACAAA
TTAAAGATGATATGCTCAACTCCTCCGGCTTTTCCATCCCTGAAAATTTTGTTGTGGAAC
ACTGCCGAAATCTGCCGAGAGCCGCCAGGGAGAGTTTCCGAGAGCATGAACAGGAATAAT
GAAGTTGATGAATGAGGCTCCGAAGCCCCCCTGTATATGTCATATGTGTGTGAGTGTATC
CTTTCAGTTTTTAAACTTGGTTTTGGTGTTG

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 3

CO CL3972Contig1 721 3 5 U
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GGAATAACGATGAAAAGTAGCGACGCCTTATCGAAGTTGGCTCTACACTTGTCCTCTTCC
GAGGTCTATTTCCGGCGAGCTTACGGCGATGATGGAGTCTTTTGTTATTGCTGGGCCACC
GTGTTGACACTTTTCTTCATTCTTCTCTGCCAGATTCTCCGGAAAGTTCGATTCTTTACT
CATGTTCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTGCTGTTGTATCAGCTTCTCAATCTTCG
ATGAGCTCCCAATCATCAAGAATCTCTACACTTGTTTCTGATGAAGACCTAAAAGACCTT
ATTGAAAAACTGGGGGAGAGAAGTGATGATACCGATATTTGGGAACATGTTATTCAGAAA
AGCAACCCTCGCGTATCTTACACTGCCAAATGCTGCAAACCACAAGATGGTGGTCCTATG
AAGTACTTAAGCACCACGGTTTTTGAGGACTGCTCGCCAGAGGTTCTGAGGGACTTTTAC
ATGGACAATGAGTACAGGAAACAGTGGGATAAGACTGTGGTCGAGCACGAGCAGTTGCAG
GTAGATAGTAACAGCGGAATAGAGATTGGTCGCACCGTAAAGAAGTTTCCTTTGTTGACA
CCAAGGGAGTATGTGTTGGCTTGGAGGTTGTGGGAGGGGACGGACAAGTTTTATTGTTTC
A


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 

AF RS1GJ70TF U 1
AF RS1DK75TF U 38
AF RS1BI86TF U 67
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GGAATAACGATGAAAAGTAGCGACGCCTTATCGAAGTTGGCTCTACACTTGTCCTCTTCC
GAGGTCTATTTCCGGCGAGCTTACGGCGATGATGGAGTCTTTTGTTATTGCTGGGCCACC
GTGTTGACACTTTTCTTCATTCTTCTCTGCCAGATTCTCCGGAAAGTTCGATTCTTTACT
CATGTTCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTGCTGTTGTATCAGCTTCTCAATCTTCG
ATGAGCTCCCAATCATCAAGAATCTCTACACTTGTTTCTGATGAAGACCTAAAAGACCTT
ATTGAAAAACTGGGGGAGAGAAGTGATGATACCGATATTTGGGAACATGTTATTCAGAAA
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AAGTACTTAGGCACCACGGTTTTTGAGGACTGCTCGCCAGAGGTTCTGAGGGACTTTTAC
ATGGACAATGAGTACAGGAAACAGTGGGATAAGACTGTGGTCGAGCACGAGCAGTT

QA 1 596 1 596
DS 

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G
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GGCTCTACACTTGTCCTCTTCCGAGGTCTATTTCCGGCGAGCTTACGGCGATGATGGAGT
CTTTTGTTATTGCTGGGCCACCGTGTTGACACTTTTCTTCATTCTTCTCTGCCAGATTCT
CCGGAAAGTTCGATTCTTTACTCATGTTCCTTCTTCTTCTTCTTCTTC***CTCTGCTGT
TGTATCAGCTTCTCAATCT*CGATGAGCTCCCAATCATCAAGAATCTCTACACTTGTTTC
TGATGAAGACCTAAAAGACCTTATTGAAAAACTGGGGGAGAGAAGTGATGATACCGATAT
TTGGGAACATGTTATTCAGAAAAGCAACCCTCGCGTATCTTACACTGCCAAATGCTGCAA
ACCACAAGATGGTGGTCCTATGAAGTACTTAAGCACCACGGTTTTTGAGGACTGCTCGCC
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QA 2 655 2 655
DS 

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G
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ATTTCCGGCGAGCTTACGGCGATGATGGAGTCTTTTGTTATTGCTGGGCCACCGTGTTGA
CACTTTTCTTCATTCTTCTCTGCCAGATTCTCCGGAAAGTTCGATTCTTTACTCATGTTC
CTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTGCTGTTGTATCAGCTTCTCAATCTTCGATGAGCT
CCCAATCATCAAGAATCTCTACACTTGTTTCCGATGAAGACCTAAAAGACCTTATTGAAA
AACTGGGGGAGAGAAGTGATGATACCGATATTTGGGAACATGTTATTCAGAAAAGCAACC
CTCGCGTATCTTACACTGCCAAATGCTGCAAACCACAAGATGGTGGTCCTATGAAGTACT
TAAGCACCACGGTTTTTGAGGACTGCTCGCCAGAGGTTCTGAGGGACTTTTACATGGACA
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GTAACAGCGGAATAGAGATTGGTCGCACCGTAAAGAAGTTTCCTTTGTTGACACCAAGGG
AGTATGTGTTGGCTTGGAGGTTGTGGGAGGGGACGGACAAGTTTTATTGTTTCA

QA 2 655 2 655
DS 



AS 1 2

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AATTTTAAAGAGAAAGACTAAAAACGCAGACATTGTTGATTTTTGATAAGACAAAGGACG
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GTTGTAGTCGGCAAGGGTGCGACCATCCTCAAGCTGCTTTCCAGCGAAAATGAAACGCTG
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CGAACTCTCCACCTCCAGTGTGATGGTCTTACCAGTCAAGGTCTTAACGAAGATCTGCAT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GZ76JQ U 1
AF RS1H184JQB U 89
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RD RS1GZ76JQ 620 0 0
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ACAGAGTTCCACGATTATTCAAGAGAGGCTTATAATGCCTCAAACACACAAACCATGATG
AATTTTAAAGAGAAAGACTAAAAACGCAGACATTGTTGATTTTTGATAAGACAAAGGACG
AGAGACTTAAAAACCACCACGGAGACGCAACACCAAGTGAAGGGTCGACTCCTTCTGGAT
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G
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CAAGCTGCTTTCCAGCGAAGATGAAACGCTGCTGGTCTGGAGGGATCCCTTCCTTGTCTT
GGATCTTGGCTTCCACGTTATCAATCGTGTCCGAACTCTCCACCTCCAGTGTGATGGTCT
TACCAGTCAAGGTCTTAACGAAGATCTGCATACCTCCACGTAGACGCAAGACCAAGTGGA
GCGTAAACTCCTTCTGGATGTTGTAGTCAGCCAAGGTGCGACCATCTTCCAACTGCTTGC
CGGCAAAGATCAAACGCTGCTGGTCCGGTGGGATCCCCTCCTTGTCTTGGATCTTTGCTT
TAACGTTGTCAATGGTGTCGGAACTCTCCACCTCAAGAGTGATGGTCTTTCCGGTCAGTG
TCTTAACGAAAATCTGCATACCACCACGTAGACGCAAGACCAAGTGGAGAGTTGACTCCT
TTTGAATGTTGT

QA 2 673 2 673
DS 



AS 1 2

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GTAAATCCGTTCCAATTGTTAAAGGAGGCGAGCAGACAAAGATGGAAGAAGGAGAATTTT
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GCCACTACATGAAGAACTTCGATGCTGGTCATGTCCCTTTGAGGTTGCCTAGAGCAAAAC
AGCTCCTCGCCACTATCAACAACAACTCCTCGACTCTAGCTTTCTGCAGAAGGTACTTGG
ACCGCACTGGTGAAACCAAATACTTAATGGCTTTAAAGAACCTGTGCGATGCTGGCATTG
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CAATCTTACTCCGACCGACTTGCAAGGAAGTTGTGTCCAAGGGAGATGACTACTGATTCA
TCAGTTCCTCTGTGGTTTCTGTTCTTTTCTTTCATATCATATGTACTGTGATTGAGATTC
AGATCCTCTGTTTTTTCATATCATATACTGTTCTTGAGAGTTGAGATTGTAGTTGTACAC
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GTCTGTTCAAAATTTTTTTTTTTCATTGAAAATGAATTACCC


BQ
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AF RS1DT07JQ C 1
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DS 

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G
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TCTGTTCAAAATTTTTTTTTTTCATTGAAAATGAATTACCC

QA 2 702 2 702
DS 



AS 1 3

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BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AC75JQ U 37
AF RS1AC75TF C 3
AF RS1F285JQ U 1
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QA 1 146 1 146
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QA 1 578 1 578
DS 

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QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 3

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FY12JQ U 6
AF RS1FY12TF C 6
AF RS1DC84JQ U 1
BS 1 19 RS1DC84JQ
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RD RS1FY12JQ 424 0 0
AA
AAATAAGTCAAGAGAGCATTTAGATTATAGAGTTACAAGTAGGTATCAAACTTATTGTAT
GTATCTCAAGAAGCATGTTTAATAATAATATTACATTCGCACTCAAAATCACATTCACAA
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TAGCATCATCTAGCTCTGATCGAAGCTTGTCTGCAGTAATTGTGCTAGTTACAGGTTCAT
CAGATCGATTACCATTTATATCCCTCCGGGTTTCGCTACCAAGCAATGTCAGCTGCTTCT
GC

QA 3 424 3 424
DS 

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AG
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GTATCTCAAGAAGCATGTTTAATAATAATATTACATTCGCACTCAAAATCACATTCACAA
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CTAAGTTGGTCAGTGGTCGAAGGTCCCATGAAGCAGAGTGTTGTGTTTCCTCAGGTTTGA
TAAAAGGTAGAGTGATCTCATTGATCATTAATTCTCCACAGAAGGGGCATTCGCTGGCGA
TAGCATCATCTAGCTCTGATCGAAGCTTGTCTGCAGTAGTTGTGCTAGTTACAGGTTCAT
CAGATCGATTACCATTTATATCCCTCCGGGTTTCGCTACCAAGCAATGTCAGCTGCTTCT
GCAGATCGAGTATATGCTCGGCTTGCTCCTCGTGTGCACAGCTTGTGACGTGTGTGATCA
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ATGAAGTATATCCCTG
C

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DS 

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TTCACAACTCCAAAGCTATCACGGTGTTACACAAATCAAACAGGTAAAGAAATGGTCCTC
TGGTTCGCTAAGTTGGTCAGTGGTCGAAGGTCCCATGAAGCAAAGTGTTGTGTTTCCTCA
GGTTTGATAAAAGGTAGAGTGATCTCATTGATCATTAATTCTCCACAGAAGGGGCATTCG
CTGGCGATAGCATCATCTAGCTCTGATCGAAGCTTGTCTGCAGTAGTTGTGCTAGTTACA
GGTTCATCAGATCGATTACCATTTATATCCCTCCGGGTTTCGCTACCAAGCAATGTCAGC
TGCTTCTGCAGATCGAGTATATGCTCGGCTTGCTCCTCGTGTGCACAGCTTGTGACGTGT
GTAATCAAGCACTGCGCATGGAAAGAGTGCCCACAAGGAAAAACATAAAAAGGAGCCAGT
GGTCCGGATGAAGTATATACCTGAGCCATTCTGAAATCCCCGGTCATCGTCAAGATTTTA
CGTTTACAAACCCCGCATTCCTCTTCACGGCCGATTACAGCATATCTTTGAGTTAGGGCA
CTGATATCATTTCTAATATTATCTGCACCACGTGTGGCATCATTCATCTCCTCTTTCAAT
TGTTCTATTTGCTTGTTGTA

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 3

CO CL3977Contig1 1233 3 10 U
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GAAGATCCGTGAGCTCAAAGATGACTACGCCAAGTTCGAGCTTCGCGACACCGATGTTTC
CATGGCGAACGCTCTCCGTCGCGTTATGATCTCCGAAGTCCCAACGGTCGCAATCGATCT
GGTGGAAATCGAGGTTAATTCCTCTGTTCTCAACGACGAGTTCATCGCTCATCGATTAGG
TCTAATCCCTCTCACTAGCGAACGTGCGATGAGCATGCGCTTCTCTCGAGACTGCGATGC
TTGCGATGGAGATGGACAGTGCGAGTTTTGCTCTGTTGAGTTTCATCTTAGAGCTAAATG
TATCACTGACCAAACCCTAGATGTTACTAGTAGGGATCTCTACAGTGCTGATCCTACTGT
CACTACTGTTGATTTCGGTCTCGATTCATCTGGAGCTGACTCAAGCGAGCAAAGGGGCAT
TATCATAGTGAAACTGAGACGTGGACAAGAACTGAAGCTTAGGGCGATAGCAAGGAAAGG
AATTGGGAAAGATCACGCTAAATGGTCTCCTGCAGCCACTGTTACGTTCATGTATGAGCC
TGACATTGTTATCAATGAAGATATGATGGACACTTTGACTGACGAGGAAAAGATTGACTT
GATTGAGAGCAGCCCGACCAAAGTTTTTGACTTTGATGCAGTCACCAGACAGGTTGTGGT
GGTCGACCCAGAAGCATACACTTACGATGAAGAAGTGATCAAGAAAGCAGAAGCCATGGG
GAAACCAGGGCTCATTGAGATCCGTCCGAAAGATGACAGTTTTATATTCACTGTTGAATC
CACAGGTGCAGTGAAGGCTTCGCAGCTGGTACTAAATGCCATTGATCTCCTGAAGCAGAA
GCTCGATGCAGTCCGTCTCTCTGACGACACTGTTGAGGCTGATGATCAGTTTGGCGAACT
AGGTGCACATATGCGTGGAGGTTGAGCGTGTGGTTAATTTGGGATCTCCATGTTTTTCCC
GTTTGTTTCGGGTTTGAGTTTATGTTGGACCAGGGCAATCTATTTTCCGTAGCGGTACAC
TCTTGTTAGATAACAACTTGTGAAGCAGTGGTCTTCTGTTCTTGCCCCTTCAAACTTAAC
CTTCCTTTCTTCAATCTTGTTATTACTTGATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DE15TF U 1
AF RS1FO78JQ C 589
AF RS1FO78TF U 589
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BS 717 717 RS1FO78TF
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BS 814 1233 RS1FO78TF

RD RS1DE15TF 817 0 0
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TATCATAGTGAAACTGAGACGTGGACAAGAACTGAAGCTTAGGGCGATAGCAAGGAAAGG
AATTGGGAAAGATCACGCTAAATGGTCTCCTGCAGCCACTGTTACGTTCATGTATGAGCC
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GGTCGACC*AGAAGCATACACTTACGATGAAGA
CGTG

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DS 

RD RS1FO78JQ 645 0 0
G
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TCAAACTTAACCTTCCTTTCTTCAATCTTGTTATTACTTGATTC

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DS 

RD RS1FO78TF 645 0 0
G
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ATGTATGAGCCTGACATTGTTATCAATGAAGATATGATGGACACTTTGACTGACGAGGAA
AAGATTGACTTGATTGAGAGCAGCCCGACCAAAGTTTTTGACTTTGATGCAGTCACCAGA
CAGGTTGTGGTGGTCGACCCAGAAGCATACACTTACGATGAAGAAGTGATCAAGAAAGCA
GAAGCCATGGGGAAACCAGGGCTCATTGAGATCCGTCCGAAAGATGACAGTTTTATATTC
ACTGTTGAATCCACAGGTGCAGTGAAGGCTTCGCAGCTGGTACTAAATGCCATTGATCTC
CTGAAGCAGAAGCTCGATGCAGTCCGTCTCTCTGACGACACTGTTGAGGCTGATGATCAG
TTTGGCGAACTAGGTGCACATATGCGTGGAGGTTGAGCGTGTGGTTAATTTGGGATCTCC
ATGTTTTTCCCGTTTGTTTCGGGTTTGAGTTTATGTTGGACCAGGGCAATCTATTTTCCG
TAGCGGTACACTCTTGTTAGATAACAACTTGTGAAGCAGTGGTCTTCTGTTCTTGCCCCT
TCAAACTTAACCTTCCTTTCTTCAATCTTGTTATTACTTGATTC

QA 2 645 2 645
DS 



AS 1 3

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AAACCAAGTTTTCTTCCTAAATCATCAAAACAAAACCCATAAGGCGAATCCATCAGCGTC
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TACTCCTTATCATCCACCCGTTTTATCGCTTTGTCGGGAAAGATATGATGACTGATCTGA
GTTACCCTCTAAAGAGCAACACCGTACCAATCTGGTCTGTCCCGATCTATGCGATGTTGT
TGCCATTGGTAATCTTCATATCTATTTACTTCCGTAGAAGAGATGTATACGACCTTCATC
ATGCGGTGCTAGGTCTGTTATACTCTGTTCTGGTGACGGCAGTACTTACAGATTCAATAA
AGAATGCTGTTGGTAGACCACGCCCTGACTTCTTCTGGCGTTGTTTTCCTGATGGCAAAG
CTGTTTTTGATAGCCTCGGAGATGTGATATGCCATGGTGATAAAAGTGTCATAAGGGAAG
GGCACAAAAGTTTCCCAAGCGGACACACCTCTTGGTCTTTTGCGGGTCTAGGATTCTTGT
CGCTGTATTTATCAGGGAAGATTCAAGTATTCGACGGTAAAGGCCACGTTGCGAAGCTAT
GCATTGTCATACTCCCTCTGCTAGTTGCTGCTCTTGTTGGTATTTCCCGTGTAGATGACT
ATTGGCATCACTGGCAAGACGTGTTTGCAGGAGGCTTGCTAGGTCTCGTGGTCTCTACGT
TCTGTTATCTTCAATTCTTTCCGCCACCATATCACACCGAAGCTTGGGGGACATATGCTT
ACTTCCAAGTGTTGGAGGCGGCACGAGCGCAAGCGCAAGCAGCAGAGAATGGAGCGGCTC
AGGGAGGCAACGGTGAAGAGGAAGACGGAGGGTTTATGGGTTTACATTTGGTGGATAATC
CGAGTATGAGGAGAGAAGATGTTGAGGCTGGTAGAAGCTGAGATATGAAAGAAACACTGA
AGCTGGTTCGGTAGATTCTTTGTTTGTTTTGGTTTAACTGGTTAGACCCAGGTCTATTAA
ATAAAGTTTTATTGATTTTCACTTGTTCAGTTGGGACTAATCGAACCATAGGTTTTTTTA
TCAACTTTGAACCATAATTAATGACTTTTGATGTCGCTTATAAATGAAGAATTGTTTTTC
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RS1C069TF U 1
AF RS1DI77TF U 83
AF RS1C069JQ C 544
BS 1 327 RS1C069TF
BS 328 328 RS1DI77TF
BS 329 672 RS1C069TF
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BS 811 1261 RS1C069JQ

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AAACCAAGTTTTCTTCCTAAATCATCAAAACAAAACCCATAAGGCGAATCCATCAGCGTC
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CGCTGTATTTAT

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DS 

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GGAGG
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GCGCTCACACTGTGAGGTCCCATGGAATGACACTTGCAAGGACTCACATGCATGACTGGA
TCATACTCGTACTACTCGTTATCCTTGAGTGCATACTCCTTATCATCCACCCGTTTTATC
GCTTTGTCGGGAAAGATATGATGACTGATCTGAGTTACCCTCTAAAGAGTAACACCGTAC
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TTCTGGTGACGGCAGTACTTACAGATTCAATAAAGAATGCTGTTGGTAGACCACGCCCTG
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TATTCGACGGTAAAGGCCACGTTGCGAAGCTATGCATTGTCATACTCCCTCTGCTAGTTG
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CAG
AGCTTGCT

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DS 

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ACAAAAGTTTCCCAAGCGGACACACCTCTTGGTCTTTTGCGGGTCTAGGATTCTTGTCGC
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TTGTCATACTCCCTCTGCTAGTTGCTGCTCTTGTTGGTATTTCCCGTGTAGATGACTATT
GGCATCACTGGCAAGACGTGTTTGCAGGAGGCTTGCTAGGTCTCGTGGTCTCTACGTTCT
GTTATCTTCAATTCTTTCCGCCACCATATCACACCGAAGCTTGGGGGACATATGCTTACT
TCCAAGTGTTGGAGGCGGCACGAGCGCAAGCGCAAGCAGCAGAGAATGGAGCGGCTCAGG
GAGGCAACGGTGAAGAGGAAGACGGAGGGTTTATGGGTTTACATTTGGTGGATAATCCGA
GTATGAGGAGAGAAGATGTTGAGGCTGGTAGAAGCTGAGATATGAAAGAAACACTGAAGC
TGGTTCGGTAGATTCTTTGTTTGTTTTGGTTTAACTGGTTAGACCCAGGTCTATTAAATA
AAGTTTTATTGATTTTCACTTGTTCAGTTGGGACTAATCGAACCATAGGTTTTTTTATCA
ACTTTGAACCATAATTAATGACTTTTGATGTCGCTTATAAATGAAGAATTGTTTTTCT

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 3

CO CL3979Contig1 1148 3 5 U
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GACACTCTCTCACTTGAAATCTATCTAGAAAGCAAACATAAGATTTAAATTACCAACATA
ACATAGTAACAGCTCAAAGGATCAGATCATCCGGTATAACCGGAGACCCGAGCTTCACTC
TTGTACCGCACTGTATCAGTGCTGAGACCACTGTATGTTCTTGATATCAATACCTTCTTT
AACCATCTCATAAAGCGGACTCATCTCCCTCAACTTCTCAACCTGTCTAACCGTAAGCTC
CACCGCTTTATCAATCTCCTCCTCCGTGGTAAACCTACCAATCCCAAACCTAATCGAAGT
GTGAGCCATGTCCTCATCCACACCCAAAGCTCTCAACACATAAGACGGCTCCAAACTCGC
ACTCGTGCAAGCACTTCCACTAGACACCGCAACTTCCTTCAAACCCATCAGCAAACTCTC
CCCTTCCACATAAGCAAACGACAGATTCAGATTCCCAGCGTACCGACTCTCCAACGAACC
GTTCACCACAACACCATCAAGCTTCTCCCTAACCCCATTCAGCAACCTCTCCTGCAACTT
CTTGATCCACTTCTCATCATACTCCATCTCCTTCATCGCCAGCTCGCAAGCAACCCCGAA
CCCAACAACCTGCTGCGTAGCCAACGTCCCACTCCTAAGCCCCCTATCCTGACCTCCACC
GTTCATCAACGGCTCGAGTCTCACCCTCGGCCTCCTCCTAACGTACATAGCGCCAACACC
TTTCGGTCCGTAGATCTTGTGCCCACTCATCGACATGAAACTAACGTTCCACTTCTCAAC
ATCAACAGGTATCTTCCCTATAGCCTGAGCAGCGTCCGTATGAAACGGAACCTTATGCTC
TTTGCAAATCCTACCAATCTCCTCCATAGGTTGCACCACGCCAATCTCATTATTCACAGC
CATAACCGAAACTAAACCGGTATCCGGTCTAATCGCCTCCTTTAACATCTCTAAATCAAC
TAAACCGTCGGTTTTAACCGGTAAGTAAGTCACCTTGAACCCTTCCTGCTGGAGATGCCT
GCAGGAATCGAGAACGCACTTGTGCTCGGTCTGCGTGGTGATCACGTGCCTCTTCTTATC
CTTGTAGA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DF85JQ U 1
AF RS1DF86JQ U 1
AF RS1DF86TF C 528
BS 1 547 RS1DF85JQ
BS 548 775 RS1DF86JQ
BS 776 776 RS1DF86TF
BS 777 790 RS1DF86JQ
BS 791 1148 RS1DF86TF

RD RS1DF85JQ 547 0 0
AGAAACTCAAAGTTTTGTTCGTGCTCTGTTGTTTATTACAAAACCATATAAATAAAGACA
GACACTCTCTCACTTGAAATCTATCTAGAAAGCAAACATAAGATTTAAATTACCAACATA
ACATAGTAACAGCTCAAAGGATCAGATCATCCGGTATAACCGGAGACCCGAGCTTCACTC
TTGTACCGCACTGTATCAGTGCTGAGACCACTGTATGTTCTTGATATCAATACCTTCTTT
AACCATCTCATAAAGCGGACTCATCTCCCTCAACTTCTCAACCTGTCTAACCGTAAGCTC
CACCGCTTTATCAATCTCCTCCTCCGTGGTAAACCTACCAATCCCAAACCTAATCGAAGT
GTGAGCCATGTCCTCATCCACACCCAAAGCTCTCAACACATAAGACGGCTCCAAACTCGC
ACTCGTGCAAGCACTTCCACTAGACACCGCAACTTCCTTCAAACCCATCAGCAAACTCTC
CCCTTCCACATAAGCAAACGACAGATTCAGATTCCCAGCGTACCGACTCTCCAACGAACC
GTTCACC

QA 1 547 1 547
DS 

RD RS1DF86JQ 790 0 0
AGAAACTCAAAGTTTTGTTCGTGCTCTGTTGTTTATTACAAAACCATATAAATAAAGACA
GACACTCTCTCACTTGAAATCTATCTAGAAAGCAAACATAAGATTTAAATTACCAACATA
ACATAGTAACAGCTCAAAGGATCAGATCATCCGGTATAACCGGAGACCCGAGCTTCACTC
TTGTACCGCACTGTATCAGTGCTGAGACCACTGTATGTTCTTGATATCAATACCTTCTTT
AACCATCTCATAAAGCGGACTCATCTCCCTCAACTTCTCAACCTGTCTAACCGTAAGCTC
CACCGCTTTATCAATCTCCTCCTCCGTGGTAAACCTACCAATCCCAAACCTAATCGAAGT
GTGAGCCATGTCCTCATCCACACCCAAAGCTCTCAACACATAAGACGGCTCCAAACTCGC
ACTCGTGCAAGCACTTCCACTAGACACCGCAACTTCCTTCAAACCCATCAGCAAACTCTC
CCCTTCCACATAAGCAAACGACAGATTCAGATTCCCAGCGTACCGACTCTCCAACGAACC
GTTCACCACAACACCATCAAGCTTCTCCCTAACCCCATTCAGCAACCTCTCCTGCAACTT
CTTGATCCACTTCTCATCATACTCCATCTCCTTCATCGCCAGCTCGCAAGCAACCCCGAA
CCCAACAACCTGCTGCGTAGCCAACGTCCCACTCCTAAGCCCCCTATCCTGACCTCCACC
GTTCATCAACGGCTCGAGTCTCACCCTCGGCCTCCTCCTAACGTACATAGCGCCA*CACC
TTTCGGTCCG

QA 1 790 1 790
DS 

RD RS1DF86TF 621 0 0
TCTCCAACGAACCGTTCACCACAACACCATCAAGCTTCTCCCTAACCCCATTCAGCAACC
TCTCCTGCAACTTCTTGATCCACTTCTCATCATACTCCATCTCCTTCATCGCCAGCTCGC
AAGCAACCCCGAACCCAACAACCTGCTGCGTAGCCAACGTCCCACTCCTAAGCCCCCTAT
CCTGACCTCCACCGTTCATCAACGGCTCGAGTCTCACCCTCGGCCTCCTCCTAACGTACA
TAGCGCCAACACCTTTCGGTCCGTAGATCTTGTGCCCACTCATCGACATGAAACTAACGT
TCCACTTCTCAACATCAACAGGTATCTTCCCTATAGCCTGAGCAGCGTCCGTATGAAACG
GAACCTTATGCTCTTTGCAAATCCTACCAATCTCCTCCATAGGTTGCACCACGCCAATCT
CATTATTCACAGCCATAACCGAAACTAAACCGGTATCCGGTCTAATCGCCTCCTTTAACA
TCTCTAAATCAACTAAACCGTCGGTTTTAACCGGTAAGTAAGTCACCTTGAACCCTTCCT
GCTGGAGATGCCTGCAGGAATCGAGAACGCACTTGTGCTCGGTCTGCGTGGTGATCACGT
GCCTCTTCTTATCCTTGTAGA

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 3

CO CL3980Contig1 559 3 6 U
GGACATCTAACATTTTCTCACTCTCACAAAGCAAAACACAGAGTAAAGTAACTATGAAGC
TAATGAACAGACAGAGTTTGAAGAGAAACCAGTTTATGAAATGGGGAAAGCAGATAGGAA
GCTCAACTACGGCTTCAGCAACGCTAGCAAACTCAGAGGACAGAACTACGGTAGTGGCGT
TTGCGTTCTCATGTTGTGGGAAGCCTCCTCGTGTTCTCCTGAAGCAGTTTGTTTGGAGGT
TAAAATCGCGTTTGAGGTTGTCGAGGAAGAGTGATCATAATAACAATATTCAGTATAGCT
ATGATCTCCGGAGCTATCATCTGAACTTCGACGACGGTTGGTCTAGTCGATGGTAATTTC
AAACAAACAAAATTTAGTAACACATAAGGAGCCTTTGTTTTTCATATTTGTGTATATACT
TAGAATGTTGATCTGGAAACTATGTTTTGATTATATATTTGTGTTTTCTTGCGTGAAAAA
TTGCAAGGTCTGCTAATTTTTCATCAATGTGCTTTTTAATTTGTATAGTTGTTGATCCAA
ATGCATTTTCTATTTGACC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 

AF RS1FN21TF U 1
AF RS1GQ13TF U 1
AF RS1GQ13JQ C 55
BS 1 74 RS1FN21TF
BS 75 75 RS1GQ13TF
BS 76 540 RS1FN21TF
BS 541 541 RS1GQ13TF
BS 542 556 RS1FN21TF
BS 557 559 RS1GQ13JQ

RD RS1FN21TF 556 0 0
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TAATGAACAGACAGGGTTTGAAGAGAAACCAGTTTATGAAATGGGGAAAGCAGATAGGAA
GCTCAACTACGGCTTCAGCAACGCTAGCAAACTCAGAGGACAGAACTACGGTAGTGGCGT
TTGCGTTCTCATGTTGTGGGAAGCCTCCTCGTGTTCTCCTGAAGCAGTTTGTTTGGAGGT
TAAAATCGCGTTTGAGGTTGTCGAGGAAGAGTGATCATAATAACAATATTCAGTATAGCT
ATGATCTCCGGAGCTATCATCTGAACTTCGACGACGGTTGGTCTAGTCGATGGTAATTTC
AAACAAACAAAATTTAGTAACACATAAGGAGCCTTTGTTTTTCATATTTGTGTATATACT
TAGAATGTTGATCTGGAAACTATGTTTTGATTATATATTTGTGTTTTCTTGCGTGAAAAA
TTGCAAGGTCTGCTAATTTTTCATCAATGTGCTTTTTAATTTGTATAGTTGTTGATCCAA
*TGCATTTTCTATTTG

QA 1 556 1 556
DS 

RD RS1GQ13TF 559 0 0
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TAATGAACAGACAGAGTTTGAAGAGAAACCAGTTTATGAAATGGGGAAAGCAGATAGGAA
GCTCAACTACGGCTTCAGCAACGCTAGCAAACTCAGAGGACAGAACTACGGTAGTGGCGT
TTGCGTTCTCATGTTGTGGGAAGCCTCCTCGTGTTCTCCTGAAGCAGTTTGTTTGGAGGT
TAAAATCGCGTTTGAGGTTGTCGAGGAAGAGTGATCATAATAACAATATTCAGTATAGCT
ATGATCTCCGGAGCTATCATCTGAACTTCGACGACGGTTGGTCTAGTCGATGGTAATTTC
AAACAAACAAAATTTAGTAACACATAAGGAGCCTTTGTTTTTCATATTTGTGTATATACT
TAGAATGTTGATCTGGAAACTATGTTTTGATTATATATTTGTGTTTTCTTGCGTGAAAAA
TTGCAAGGTCTGCTAATTTTTCATCAATGTGCTTTTTAATTTGTATAGTTGTTGATCCAA
ATGCATTTTCTATTTG
ACC

QA 1 556 1 556
DS 

RD RS1GQ13JQ 505 0 0
TGAAGCTAATGAACAGACAGAGTTTGAAGAGAAACCAGTTTATGAAATGGGGAAAGCAGA
TAGGAAGCTCAACTACGGCTTCAGCAACGCTAGCAAACTCAGAGGACAGAACTACGGTAG
TGGCGTTTGCGTTCTCATGTTGTGGGAAGCCTCCTCGTGTTCTCCTGAAGCAGTTTGTTT
GGAGGTTAAAATCGCGTTTGAGGTTGTCGAGGAAGAGTGATCATAATAACAATATTCAGT
ATAGCTATGATCTCCGGAGCTATCATCTGAACTTCGACGACGGTTGGTCTAGTCGATGGT
AATTTCAAACAAACAAAATTTAGTAACACATAAGGAGCCTTTGTTTTTCATATTTGTGTA
TATACTTAGAATGTTGATCTGGAAACTATGTTTTGATTATATATTTGTGTTTTCTTGCGT
GAAAAATTGCAAGGTCTGCTAATTTTTCATCAATGTGCTTTTTAATTTGTATAGTTGTTG
ATCCAAATGCATTTTCTATTTGACC

QA 1 505 1 505
DS 



AS 1 3

CO CL3981Contig1 1431 3 7 U
TATTATTATTAAGAATTAGATTCAGATACACATGCAAGAAGAAAATAAATTATAAATCGA
GAATGCAACCTTATGGCAATATACACAGAAACACATCCACATGTCTGGTCACAAAAAGTG
TCATCCTTCTCTTAAAACATTCAAATAAGACTGGCTTTGATGATACACACAAAAAAATGA
AAACGATCAACGTGAAAATTTATCGGTGTCCACTTGACGTTTTGAAGCTTTATTTTATGT
CTTAATCGAGCTTAACGTTTGAATATAGGAGCGTGTCCTTCGTCAAAGGCATGTACATAA
GGAAGTACACCCCAAGGATAGTTGCAATGAGAAGGATTATTCCAGTTAACCATGCAAGCG
TCAGCCTAACAAGTATAACTTGAGCGATAATGGCTGCACTTGGAAATCCCTCTACCTCAG
CCATTGACCGTGCAGATGAACCATAAGAAGAAGACCCAACGCTTAGGAGATTAGCGGTTT
CTTGATTTACTCTCTCATCAAGGAGGATCACTCCAACAATTTGGCCTTTGTGAGATGTCT
CCAACAGATCGAATAGCTTTGATAGTGTGGCAAGCAGTACATCCATCCCTCGCTTGGCCA
TACCTTGTCCATACTCCTGTGCCAAAGCATCGATACCGCCAAAGCGTCCAACCGTTAACT
CAGCAGGTCTCTCAATACCATGAGCTAAATCCTCATGAAGAGTGACTACCCCTCTTATAT
TCTTATATAAAGCCAAAAGGTTCGATGCAAATTTTCTCTCTGCTTCCTTTTCCAAATGGA
ACTCCACCTTCGCACCACCAGACAGAGGGATACTAAGCAATCCAGTCAATGGTTCAACAG
AGCCAGCGACATATGATCCACCTAACCAAGATGCAAACTCATTCATGTCTTTGTCAGTCA
CATCAGATGAGGGTTCATTGACAGACATAACAGCCACTCCAGTTTCTGGAAGTTCAATAT
CAGCTTTTCCAGAATTGGAATTGATACTTCCTCTTATGGCATTGTCCAAGAAAGAATGAC
TAGGTAAGGTTTCCACAAGCGCATCATCAGCTCCAGCGATTTCTAGCACAAAAGCAGCAC
GAGGCCTCTCAAATGGATTGGGTTTTAGAATCTTGTTCAGCTTGGAGGAGCCATCAGGTG
TCAAACTAGATGGAGGTGCAAAACCCAACAAGGCAGACACAGCTGCAGATACTTCAGAGA
GAGACATGGGAAGCGCCTGCTCTGAAGGGGGACGAAGGTATTGGTTGTTGGATCCATCAA
TGAAGAAAACAGAACCACTGGCTTCTCCCCTGGAATTGAGGGTGAGAAGCAGAGAGACGA
CGAATATGTACAAAGCTTGCATCTTTAGAACCAGAAAGGGGGGGAGAGAGAGAGATCGGA
GTTAATCTGGCGAGAGAGATGTTTAAGGGAGGAGAGACAAGACAAAGCCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BY43JQ U 1
AF RS1DJ47JQ U 1
AF RS1BY43TF C 671
BS 1 30 RS1BY43JQ
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BS 32 468 RS1BY43JQ
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BS 739 747 RS1DJ47JQ
BS 748 1431 RS1BY43TF

RD RS1BY43JQ 470 0 0
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GAATGCAACCTTATGGCAATATACACAGAAACACATCCACATGTCTGGTCACAAAAAGTG
TCATCCTTCTCTTAAAACATTCAAATAAGACTGGCTTTGATGATACACACAAAAAAATGA
AAACGATCAACGTGAAAATTTATCGGTGTCCACTTGACGTTTTGAAGCTTTATTTTATGT
CTTAATCGAGCTTAACGTTTGAATATAGGAGCGTGTCCTTCGTCAAAGGCATGTACATAA
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TCAGCCTAACAAGTATAACTTGAGCGATAATGGCTGCACTTGGAAATCCCTCTACCTCAG
CCATTGACCGTGCAGATGAACCATAAGAAGAAGACCCAACGCTTAGGA
AA

QA 1 468 1 468
DS 

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GAATGCAACCTTATGGCAATATACACAGAAACACATCCACATGTCTGGTCACAAAAAGTG
TCATCCTTCTCTTAAAACATTCAAATAAGACTGGCTTTGATGATACACACAAAAAGATGA
AAACGATCAACGTGAAAATTTATCGGTGTCCACTTGACGTTTTGAAGCTTTATTTTATGT
CTTAATCGAGCTTAACGTTTGAATATAGGAGCGTGTCCTTCGTCAAAGGCATGTACATAA
GGAAGTACACCCCAAGGATAGTTGCAATGAGAAGGATTATTCCAGTTAACCATGCAAGCG
TCAGCCTAACAAGTATAACTTGAGCGATAATGGCTGCACTTGGAACTCCCTCTACCTCAG
CCATTGACCGTGCAGATGAACCATAAGAAGAAGACCCAACGCTTAGGAGATTAGCGGTTT
CTTGATTTACTCTCTCATCAAGGAGGATCACTCCAACAATTTGGCCTTTGTGAGATGTCT
CCAACAGATCGAATAGCTTTGATAGTGTGGCAAGCAGTACATCCATCCCTCGCTTGGCCA
TACCTTGTCCATACTCCTGTGCCAAAGCATCGATACCGCCAAAGCGTCCAACCGTTAACT
CAGCAGGTCTCTCAATACCATGAGCTAAATCCTCATGAAGAGTGACTACCCCTCTTATAT
TCTTATATAAAGCCAAA*GGTTCGATG

QA 1 747 1 747
DS 

RD RS1BY43TF 761 0 0
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AGCCAAAAGGTTCGATGCAAATTTTCTCTCTGCTTCCTTTTCCAAATGGAACTCCACCTT
CGCACCACCAGACAGAGGGATACTAAGCAATCCAGTCAATGGTTCAACAGAGCCAGCGAC
ATATGATCCACCTAACCAAGATGCAAACTCATTCATGTCTTTGTCAGTCACATCAGATGA
GGGTTCATTGACAGACATAACAGCCACTCCAGTTTCTGGAAGTTCAATATCAGCTTTTCC
AGAATTGGAATTGATACTTCCTCTTATGGCATTGTCCAAGAAAGAATGACTAGGTAAGGT
TTCCACAAGCGCATCATCAGCTCCAGCGATTTCTAGCACAAAAGCAGCACGAGGCCTCTC
AAATGGATTGGGTTTTAGAATCTTGTTCAGCTTGGAGGAGCCATCAGGTGTCAAACTAGA
TGGAGGTGCAAAACCCAACAAGGCAGACACAGCTGCAGATACTTCAGAGAGAGACATGGG
AAGCGCCTGCTCTGAAGGGGGACGAAGGTATTGGTTGTTGGATCCATCAATGAAGAAAAC
AGAACCACTGGCTTCTCCCCTGGAATTGAGGGTGAGAAGCAGAGAGACGACGAATATGTA
CAAAGCTTGCATCTTTAGAACCAGAAAGGGGGGGAGAGAGAGAGATCGGAGTTAATCTGG
CGAGAGAGATGTTTAAGGGAGGAGAGACAAGACAAAGCCCC

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

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GACGCAATCTTTTCTGTCACAAATCTTACAGGTTTCCTTCTCCCCACTTTGTAATTAATT
TGTATCATTCATTCGCAAAGATTCGATCTTTCAATGAAATTAAACAAAGATTCTTTCTGG
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TTTGATTCCTTCGATAATCTCATACTTTCTATTCCTGAGTTTGATTCATCCGCTTCTTTC
CGAGAAACCCGACCCGGAGGAAGCCATGAGAGTCCATCCAATCCACAACAACAACAACAC
CTTGATCCACCACCATCTCCATAACCCAACCCGAGAACCCGGAAAGAATCTCCGTCGTCT
ACCGCACATCTTCAACCGCGTTCTCGAGCTTCCGTTGAGGTCCGAAGCGGATGTTACCGT
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GATGAGGGCGTACGTGGTGGATATCCATCCGGGTATAACCAAGATCGTTGTGAGGACGAA
TGGGTTGTCGTTGGGTTTGTCGTTGGACGAGTTGGAGCTTGATGTCTGGCGTTTTAGGCT
TCCGGAGACGACGAGGGCTGAGCTTGTTACGGTGGTTTGTGTTGACGGGGTTTTGGTTGT
TACCGTTCCGAAGATGGACGATGGTGGTGGTTTTGGACAAGGTATTGGAAGTGGGAGGCT
TGTTCTTGTTCAGTAATACAGTTTGGTTTATGTAATGATGTCTTAAAATCATTTGCTTTT
TTTTTTGAATGTTTGATTTCAAGAAACAAAACCTCGTTTCTTTCATATATTTGTTGTTAG
CCTTCTTTTTTTTGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DV93TF U 1
AF RS1DV93JQ C 364
BS 1 657 RS1DV93TF
BS 658 915 RS1DV93JQ

RD RS1DV93TF 657 0 0
GGGACCGCCTTCTGCACCCATTCATAAATTAAAGAAAAAAAAAAAGAAAAAGGAGAGAAA
GACGCAATCTTTTCTGTCACAAATCTTACAGGTTTCCTTCTCCCCACTTTGTAATTAATT
TGTATCATTCATTCGCAAAGATTCGATCTTTCAATGAAATTAAACAAAGATTCTTTCTGG
TCATAAAAACCGAACCTTTAATTCATCTCTCGTTATCTCTTCTTCTTCTTCTTTTATGGT
TTTGATTCCTTCGATAATCTCATACTTTCTATTCCTGAGTTTGATTCATCCGCTTCTTTC
CGAGAAACCCGACCCGGAGGAAGCCATGAGAGTCCATCCAATCCACAACAACAACAACAC
CTTGATCCACCACCATCTCCATAACCCAACCCGAGAACCCGGAAAGAATCTCCGTCGTCT
ACCGCACATCTTCAACCGCGTTCTCGAGCTTCCGTTGAGGTCCGAAGCGGATGTTACCGT
GGAAGAGAGACCCGATTGTTTCAGATTCGTGGCGGAGACGGAGGGCGTCTGCGGCGGAGA
GATGAGGGCGTACGTGGTGGATATCCATCCGGGTATAACCAAGATCGTTGTGAGGACGAA
TGGGTTGTCGTTGGGTTTGTCGTTGGACGAGTTGGAGCTTGATGTCTGGCGTTTTAG

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DS 

RD RS1DV93JQ 552 0 0
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GCACATCTTCAACCGCGTTCTCGAGCTTCCGTTGAGGTCCGAAGCGGATGTTACCGTGGA
AGAGAGACCCGATTGTTTCAGATTCGTGGCGGAGACGGAGGGCGTCTGCGGCGGAGAGAT
GAGGGCGTACGTGGTGGATATCCATCCGGGTATAACCAAGATCGTTGTGAGGACGAATGG
GTTGTCGTTGGGTTTGTCGTTGGACGAGTTGGAGCTTGATGTCTGGCGTTTTAGGCTTCC
GGAGACGACGAGGGCTGAGCTTGTTACGGTGGTTTGTGTTGACGGGGTTTTGGTTGTTAC
CGTTCCGAAGATGGACGATGGTGGTGGTTTTGGACAAGGTATTGGAAGTGGGAGGCTTGT
TCTTGTTCAGTAATACAGTTTGGTTTATGTAATGATGTCTTAAAATCATTTGCTTTTTTT
TTTGAATGTTTGATTTCAAGAAACAAAACCTCGTTTCTTTCATATATTTGTTGTTAGCCT
TCTTTTTTTTGT

QA 1 552 1 552
DS 



AS 1 3

CO CL3983Contig1 655 3 8 U
GGGACCACCAGAAGATTCGTATCCTTAAAAAAAAAAAAATCCCCAGTCGATTCAGAACCC
TAAGCGGTGCCATCCTCACCTCAACTATGGCTGAACCCGATTCTCCCCCTCCTCCTCAGC
TGAACTTACCTTCTTTCGTCGTCAACCTGTTCCCCTTCCTCAAACCTAAGTCTCCTGCTT
CTTCTGCTAACGTTGCCGATGGTGGTCCTAAACCCGCGGGAGGGGATAAGGAGACTCAGA
ACTCGACGGTCACTTTCCCTTACAATCCTCCCAAGAGCACTGAGCCACTCAAGGTTGAAG
CCGAGCCTAGCTCCGGGACCACTTCCAATTCCCTCGTCATTTGGCAGGTATATGCACTTG
GAGGGTTTCTTGTCCTGAAGTGGGCTTGGGCGAGATGGAATGAGAGGAACGAGAAAAAGA
AGTCAACGGATGATGATGATGATGATCAAGCTCCTCATCCTGAAGATGATTGATTGATGA
TGAAGGCCAAGAAGAAAATGAATCTTTTACCCCCATTTTGGTTCTGTATAGCAGCAAAAA
CACCCTTTCAGATTTTCTTATATTCCATTGTATCTCTACTCAAGACTATTGAGTTTCTTC
TACTTCTGTAATGACTACTACGATTCCCCTCTCTCAATCCAGTTTTTTTTTCCCC


BQ
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AF RS1G503TF U 1
AF RS1E258JQ C 49
AF RS1E258TF U 49
BS 1 223 RS1G503TF
BS 224 224 RS1E258TF
BS 225 626 RS1G503TF
BS 627 627 RS1E258JQ
BS 628 638 RS1G503TF
BS 639 639 RS1E258JQ
BS 640 653 RS1G503TF
BS 654 655 RS1E258JQ

RD RS1G503TF 655 0 0
GGGACCACCAGAAGATTCGTATCCTTAAAAAAAAAAAAATCCCCAGTCGATTCAGAACCC
TAAGCGGTGCCATCCTCACCTCAACTATGGCTGAACCCGATTCTCCCCCTCCTCCTCAGC
TGAACTTACCTTCTTTCGTCGTCAACCTGTTCCCCTTCCTCAAACCTAAGTCTCCTGCTT
CTTCTGCTAACGTTGCCGATGGTGGTCCTAAACCCGCGGGAGGAGATAAGGAGACTCAGA
ACTCGACGGTCACTTTCCCTTACAATCCTCCCAAGAGCACTGAGCCACTCAAGGTTGAAG
CCGAGCCTAGCTCCGGGACCACTTCCAATTCCCTCGTCATTTGGCAGGTATATGCACTTG
GAGGGTTTCTTGTCCTGAAGTGGGCTTGGGCGAGATGGAATGAGAGGAACGAGAAAAAGA
AGTCAACGGATGATGATGATGATGATCAAGCTCCTCATCCTGAAGATGATTGATTGATGA
TGAAGGCCAAGAAGAAAATGAATCTTTTACCCCCATTTTGGTTCTGTATAGCAGCAAAAA
CACCCTTTCAGATTTTCTTATATTCCATTGTATCTCTACTCAAGACTATTGAGTTTCTTC
TACTTCTGTAATGACTACTACGATTCTCCTCTCTCAATTCAGTTTTTTTTTCC
TC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RS1E258JQ 607 0 0
GGG
TCAGAACCCTAAGCGGTGCCATCCTCACCTCAACTATGGCTGAACCCGATTCTCCCCCTC
CTCCTCAGCTGAACTTACCTTCTTTCGTCGTCAACCTGTTCCCCTTCCTCAAACCTAAGT
CTCCTGCTTCTTCTGCTAACGTTGCCGATGGTGGTCCTAAACCCGCGGGAGGGGATAAGG
AGACTCAGAACTCGACGGTCACTTTCCCTTACAATCCTCCCAAGAGCACTGAGCCACTCA
AGGTTGAAGCCGAGCCTAGCTCCGGGACCACTTCCAATTCCCTCGTCATTTGGCAGGTAT
ATGCACTTGGAGGGTTTCTTGTCCTGAAGTGGGCTTGGGCGAGATGGAATGAGAGGAACG
AGAAAAAGAAGTCAACGGATGATGATGATGATGATCAAGCTCCTCATCCTGAAGATGATT
GATTGATGATGAAGGCCAAGAAGAAAATGAATCTTTTACCCCCATTTTGGTTCTGTATAG
CAGCAAAAACACCCTTTCAGATTTTCTTATATTCCATTGTATCTCTACTCAAGACTATTG
AGTTTCTTCTACTTCTGTAATGACTACTACGATTCCCCTCTCTCAATCCAGTTTTTTTTT
CCCC

QA 4 607 4 607
DS 

RD RS1E258TF 580 0 0
GGG
TCAGAACCCTAAGCGGTGCCATCCTCACCTCAACTATGGCTGAACCCGATTCTCCCCCTC
CTCCTCAGCTGAACTTACCTTCTTTCGTCGTCAACCTGTTCCCCTTCCTCAAACCTAAGT
CTCCTGCTTCTTCTGCTAACGTTGCCGATGGTGGTCCTAAACCCGCGGGAGGGGATAAGG
AGACTCAGAACTCGACGGTCACTTTCCCTTACAATCCTCCCAAGAGCACTGAGCCACTCA
AGGTTGAAGCCGAGCCTAGCTCCGGGACCACTTCCAATTCCCTCGTCATTTGGCAGGTAT
ATGCACTTGGAGGGTTTCTTGTCCTGAAGTGGGCTTGGGCGAGATGGAATGAGAGGAACG
AGAAAAAGAAGTCAACGGATGATGATGATGATGATCAAGCTCCTCATCCTGAAGATGATT
GATTGATGATGAAGGCCAAGAAGAAAATGAATCTTTTACCCCCATTTTGGTTCTGTATAG
CAGCAAAAACACCCTTTCAGATTTTCTTATATTCCATTGTATCTCTACTCAAGACTATTG
AGTTTCTTCTACTTCTGTAATGACTACTACGATTC
CC

QA 4 578 4 578
DS 



AS 1 2

CO CL3984Contig1 817 2 2 U
TCCTAGGCGGGATAATTGCAAACTGTGCAAAAAAATCTAGGCATATTACCATCCCCCCCC
CGGGCCGAAATTCCAACAACCCCTCTCTGTGTTGTTGACTCTTGAGATGAGTGATGAAAT
CATTACATGTATGGTAAACAGCATCCCATACTTGGCAAATGCAGAGAGGTTTATCTACTA
CCGGCGCATAGCCGCCACTTGGTGGTTTGGTGTAACTACATAAAGTTTCCCACACAAACT
CTTTGACAAACACTTTCTCACGTTGATTGCCAAAGATTGTTAATGGCCCAACATCTTTTG
GATATGCACAAAACTTGTTGAATTCAGAAAATTCCTGAATACACAGGCTCATAAAACCAT
CACCGGATATAACCATTATGTTCCTAGAACCTGGACGTTGGGGTTGAAGCTTCTCATCGT
CACACCATTCGTGCAGATAACCAATTAAGTGGTTCGCACCGCAAGGGGCGTGAATAAGAA
TGATTCCAGAGGAAGCGATCTTTTCCAAGATGTCACTAGATATGTATTCTAGGTTGCCCA
TGGCATAAATGATCGTTTTAGTCGGACGACTAATCTGCTTTTCCAACCCAGATACTATAC
ACTGACGGACATAACGAGGGTCAACATCAGCGGGAACCGGACACGTGTTGATGTCCCACC
ACACTCCCGTCATCGGCGGTCGATACCACCCACCACCTCCTCCTTCCATATCGCAACGAA
TTTGATCCTAAAGTTAGGGTTTCCTGCAACTTTGACCGAGCGAGAGAAAGAGATCTATCT
ATTAGCCGCACGCAAGTTCTCTACCGACCTTTCAGCC


BQ
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AF RS1FY17JQ U 1
AF RS1DQ71TF C 69
BS 1 154 RS1FY17JQ
BS 155 817 RS1DQ71TF

RD RS1FY17JQ 154 0 0
TCCTAGGCGGGATAATTGCAAACTGTGCAAAAAAATCTAGGCATATTACCATCCCCCCCC
CGGGCCGAAATTCCAACAACCCCTCTCTGTGTTGTTGACTCTTGAGATGAGTGATGAAAT
CATTACATGTATGGTAAACAGCATCCCATACTTG

QA 1 154 1 154
DS 

RD RS1DQ71TF 749 0 0
ATTCCA
AACAACCCCTCTCTGTGTTGT*GACTCTTGAGATGAGTGATGGAATCATTACATGTATGG
TAAACAGCATCGCATACTTGGCAAATGCAGAGAGGTTTATCTACTACCGGCGCATAGCCG
CCACTTGGTGGTTTGGTGTAACTACATAAAGTTTCCCACACAAACTCTTTGACAAACACT
TTCTCACGTTGATTGCCAAAGATTGTTAATGGCCCAACATCTTTTGGATATGCACAAAAC
TTGTTGAATTCAGAAAATTCCTGAATACACAGGCTCATAAAACCATCACCGGATATAACC
ATTATGTTCCTAGAACCTGGACGTTGGGGTTGAAGCTTCTCATCGTCACACCATTCGTGC
AGATAACCAATTAAGTGGTTCGCACCGCAAGGGGCGTGAATAAGAATGATTCCAGAGGAA
GCGATCTTTTCCAAGATGTCACTAGATATGTATTCTAGGTTGCCCATGGCATAAATGATC
GTTTTAGTCGGACGACTAATCTGCTTTTCCAACCCAGATACTATACACTGACGGACATAA
CGAGGGTCAACATCAGCGGGAACCGGACACGTGTTGATGTCCCACCACACTCCCGTCATC
GGCGGTCGATACCACCCACCACCTCCTCCTTCCATATCGCAACGAATTTGATCCTAAAGT
TAGGGTTTCCTGCAACTTTGACCGAGCGAGAGAAAGAGATCTATCTATTAGCCGCACGCA
AGTTCTCTACCGACCTTTCAGCC

QA 7 749 7 749
DS 



AS 1 3

CO CL3985Contig1 634 3 5 U
GGATCATCGAACAGATCTGATCGCCCCGAGTCGTCGTCTCTTCTCTCTCGATTCCAACAA
AAAAAACAATGGCTGAGGCAGCAACAGCTTTGAGGAAGCCTGTGTTCACCAAGGTTAATG
AGCTGAGACCAGGAACCAATGGTCACTCTCTGAACGTGAAAGTTGTCAGCACGAAGATGG
TGATGCAGAGAGGTGGTGGAGGTCGTCCCAGTGGTCCTCAGGCTCGTCAGATGCGGATTG
CTGAGTGTCTTGTTGGTGATGAGACTGGCATCATTATCTTTACTGCCAGAAACGATCAAG
TGGATTTGATGAAAGAAGGCAAGGTTGTGACCCTGCGCAACGCCAAGATCGACATGTACA
AGGGATCTATGAGGCTTGCAGTTGATAGATGGGGACGCGTTGAAGTCGCTGAGGAGGATG
CCACAGGCATCACCGTCAAGGAAGATAACAATCTTTCCCTCATCGAGTATGAGCTTGTGA
ACGTTGAAGCTTGATTTAGTTTCAGCCAACTGAAAGAAAGCAGAGTGACTCACAAGACTT
ATATTCTCTAGTTGTAGAAGCAATAGCATCTCTCTCTCTCTCTAGTCTCTACTCTGCTTT
GAGTTTTTGCTTATCAGAATTTGCAGGTGGGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CY66JQ C 248
AF RS1D245TF U 1
AF RS1CY66TF U 26
BS 1 549 RS1D245TF
BS 550 550 RS1CY66TF
BS 551 581 RS1D245TF
BS 582 583 RS1CY66TF
BS 584 634 RS1D245TF

RD RS1CY66JQ 335 0 0
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GATGAAAGAAGGCAAGGTTGTGACCCTGCGCAACGCCAAGATCGACATGTACAAGGGATC
TATGAGGCTTGCAGTTGATAGATGGGGACGCGTTGAAGTCGCTGAGGAGGATGCCACAGG
CATCCCCGTCAAGGAAGATAACAATCTTTCCCTCATCGAGTATGAGCTTGTGAACGTTGA
AGCTTGATTTAGTTTCAGCCAACTGAAAGAAAGCAGAGTGACTCACAAGACTTATATTCT
CTAGTTGTAGAAGCAATAGCATCTCTCTCTCTCT
C

QA 1 334 1 334
DS 

RD RS1D245TF 634 0 0
GGATCATCGAACAGATCTGATCGCCCCGAGTCGTCGTCTCTTCTCTCTCGATTCCAACAA
AAAAAACAATGGCTGAGGCAGCAACAGCTTTGAGGAAGCCTGTGTTCACCAAGGTTAATG
AGCTGAGACCAGGAACCAATGGTCACTCTCTGAACGTGAAAGTTGTCAGCACGAAGATGG
TGATGCAGAGAGGTGGTGGAGGTCGTCCCAGTGGTCCTCAGGCTCGTCAGATGCGGATTG
CTGAGTGTCTTGTTGGTGATGAGACTGGCATCATTATCTTTACTGCCAGAAACGATCAAG
TGGATTTGATGAAAGAAGGCAAGGTTGTGACCCTGCGCAACGCCAAGATCGACATGTACA
AGGGATCTATGAGGCTTGCAGTTGATAGATGGGGACGCGTTGAAGTCGCTGAGGAGGATG
CCACAGGCATCACCGTCAAGGAAGATAACAATCTTTCCCTCATCGAGTATGAGCTTGTGA
ACGTTGAAGCTTGATTTAGTTTCAGCCAACTGAAAGAAAGCAGAGTGACTCACAAGACTT
ATATTCTCT*GTTGTAGAAGCAATAGCATCTCTCTCTCTCT**AGTCTCTACTCTGCTTT
GAGTTTTTGCTTATCAGAATTTGCAGGTGGGGTT

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1CY66TF 597 0 0
GG
GAGTCGTCGTCTCTTCTCTCTCGATTCCAACAAAAAAAACAATGGCTGAGGCAGCAACAG
CTTTGAGGAAGCCTGTGTTCACCAAGGTTAATGAGCTGAGACCAGGAACCAATGGTCACT
CTCTGAACGTGAAAGTTGTCAGCACGAAGATGGTGATGCAGAGAGGTGGTGGAGGTCGTC
CCAGTGGTCCTCAGGCTCGTCAGATGCGGATTGCTGAGTGTCTTGTTGGTGATGAGACTG
GCATCATTATCTTTACTGCCAGAAACGATCAAGTGGATTTGATGAAAGAAGGCAAGGTTG
TGACCCTGCGCAACGCCAAGATCGACATGTACAAGGGATCTATGAGGCTTGCAGTTGATA
GATGGGGACGCGTTGAAGTCGCTGAGGAGGATGCCACAGGCATCACCGTCAAGGAAGATA
ACAATCTTTCCCTCATCGAGTATGAGCTTGTGAACGTTGAAGCTTGATTTAGTTTCAGCC
AACTGAAAGAAAGCAGAGTGACTCACAAGACTTATATTCTCTAGTTGTAGAAGCAATAGC
ATCTCTCTCTCTCTCTAGTCTCTACTCTGCTTTGAGTTTTTGCTTATCAGAATTT

QA 3 597 3 597
DS 



AS 1 3

CO CL3986Contig1 798 3 12 U
GCGGAGATGAACACGGGTCAGCAGTACATGTTCTCGGATCCGGATCCGTATCTGGACTAC
GGGACTGTTTATCCGAAGGTGGAGTCGCAGGAGCAGAACAGCTCCGGCACCACCGACGGT
GTGGTTCCAGTGGAGAATAGGACGGTTAAGGTGGCGACGGCGGTGAACGAGAACTGCTAC
GAGCTTGATTTCACCGGAGGATCTAAAGGCTTTACTTACGGTTACAACTCCATTAGCCAC
AGC***GTATCGTCATCCTCATTGGAAGTGGGAGTGGTGCCAGATGGCGGCTCTGTGGCC
GACGTTTCATACCCTTACGGAGGTGGTGCAACGAGTGTAACCGATCCGGGAACTCAAAGG
GCAGTTCCGCTAACGGCAGCGGAGAGAGAGGCGAGAGTAATGAGGTACAGAGAGAAGAGG
AAGAACAGGAAGTTCGAGAAGACGATAAGGTATGCTTCGAGGAAAGCGTATGCGGAGATG
AGACCTAGGATCAAGGGAAGGTTTGCAAAGCGGACTGATACGAATGAGAGCAGCAACGAC
GTGGTTGTTGGTCATGGCGGTGGTATCTTTAGCGGGTTTGGACTTGTACCTACATTTTAG
AGATTGCTGAATGCTGAGTGAGAGAGAGACTCTTAATATGTGGGTACTTTGTTTGGTGTT
TTAGTAATAATGTTTTATTAACAAACTTTTGTCTTTTAAGAGTTGTTTTGTTTTATTTAT
GTTGATGTAATCTTTTATATTTTCGTGTATATATGATTATGTGATTCTGAACAAGTTTTT
GTGTATGCAATGTTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BR15TF U 1
AF RS1ED82JQ C 122
AF RS1ED82TF U 122
BS 1 243 RS1BR15TF
BS 244 246 RS1ED82TF
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BS 584 644 RS1BR15TF
BS 645 798 RS1ED82TF

RD RS1BR15TF 644 0 0
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GGGACTGTTTATCCGAAGGTGGAGTCGCAGGAGCAGAACAGCTCCGGCACCACCGACGGT
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GACGTTTCATACCCTTACGGAGTTGGTGCAACGAGTGTAACCGATCCGGGAACTCAAAGG
GCAGTTCCGCTAACGGCAGCGGAGAGAGAGGCGAGAGTAATGAGGTACAGAGAGAAGAGG
AAGAACAGGAAGTTCGAGAAGACGATAAGGTATGCTTCGAGGAAAGCGTATGCGGAGATG
AGACCTAAGATCAAGGGAAGGTTTGCAAAGCGGACTGATACGAATGAGAGCAGCAACGAC
GTGGTTTTTGGTCATGGCGGTGGTATCTTTAGCGGGTTTGGATTTGTACCTACATTTTAG
AGATTGCTGAATGCTGAGTGAGAGAGAGACTCTTAATATGTGGG

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1ED82JQ 671 0 0
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AGCTTGATTTCACCGGAGGATCTAAAGGCTTTACTTACGGTTACAACTCCATTAGCCACA
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GACCTAGGATCAAGGGAAGGTTTGCAAAGCGGACTGATACGAATGAGAGCAGCAACGACG
TGGTTGTTGGTCATGGCGGTGGTATCTTTAGCGGGTTTGGACTTGTACCTACATTTTAGA
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TTGATGTAATCTTTTATATTTTCGTGTATATATGATTATGTGATTCTGAACAAGTTTTTG
TGTATGCAATG

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1ED82TF 677 0 0
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AGCTTGATTTCACCGGAGGATCTAAAGGCTTTACTTACGGTTACAACTCCATTAGCCACA
GC***GTATCGTCATCCTCATTGGAAGTGGGAGTGGTGCCAGATGGCGGCTCTGTGGCCG
ACGTTTCATACCCTTACGGAGGTGGTGCAACGAGTGTAACCGATCCGGGAACTCAAAGGG
CAGTTCCGCTAACGGCAGCGGAGAGAGAGGCGAGAGTAATGAGGTACAGAGAGAAGAGGA
AGAACAGGAAGTTCGAGAAGACGATAAGGTATGCTTCGAGGAAAGCGTATGCGGAGATGA
GACCTAGGATCAAGGGAAGGTTTGCAAAGCGGACTGATACGAATGAGAGCAGCAACGACG
TGGTTGTTGGTCATGGCGGTGGTATCTTTAGCGGGTTTGGACTTGTACCTACATTTTAGA
GATTGCTGAATGCTGAGTGAGAGAGAGACTCTTAATATGTGGGTACTTTGTTTGGTGTTT
TAGTAATAATGTTTTATTAACAAACTTTTGTCTTTTAAGAGTTGTTTTGTTTTATTTATG
TTGATGTAATCTTTTATATTTTCGTGTATATATGATTATGTGATTCTGAACAAGTTTTTG
TGTATGCAATGTTTTAT

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 3

CO CL3987Contig1 1112 3 2 U
GGATGCATCAATCTCATTACTATTATTGTTTACACGATGATGAAAGCCATGAGAGTTGGA
TTAGCGATGACACTGCTTACGACCATAACGGTTCTTACCATAGTCACTGCACAGCTCGAG
GACCAGCAACCACCTCCACCGATGTTACCCGAGGAAGAAGTGGGAGGATGTAGCAGGACA
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ATCCCACCGACCGAGTCATGTTGCTCTGCTGTTGTCACACTTGGTCGCCCTTGCCTTTGC
CTCCTCGCCAACGGACCTCCGCTCTCAGGCATTGACCGCACCATGGCTCTTCAGCTTCCT
CAGAGATGCTCTGCTAATTTCCCTCCTTGCGATATCATTAACTAGGAGTCTAGGAGGAAA
CCTATCATCCTTTCTTTTCTTTTTGTTATTTTTCTCATTTACCTTCTTCCACTCTAATAA
ATACGCTGTTGAGATTGTTATTGTACCGGTCTTCAAAAACATTATAACAAAGAAATAAGA
ATAGAAATCTCAGTCAATTCCAATCCCAACTGATATAGATCTATTTGCAAACAATCCAAA
CCCAAAACCAAACAAAAACATTATATCTTTTAATAGAAAAGCAAAGATCAGCTGGGGCTT
GGTGGGGTGAGAGATAGCTCATGATTGTCTGCAGCACACTGAATGGTTCTTAATAATAAG
CTTTCCTTGGATTTCCCAGTGGGTTGGGTCTGTGTTTGTAACCAAGCATCATTCGCTTCT
TGTACTGCTCGTATATATCATCTTCAGGGTTAACCTCTCCTGGAGCAGAAGCCCCAACTC
CCAAGTTGTTAGTCTTTACATCGCCTGCCATTATCGGGTCTGCCATACCCTTTCTAGAGC
TTCCTATACCTTCACCTTCTTTCCAACCCATTTTTGACAAGAGCTTATGTCCCACATTAT
CTGCTTGGATCTTAGCCTTCTCAGCTGCCTCCTTTGTGGCTTTCAATGCAGCTACATCGT
CACACTTTGCAAGGAACTTATCTAGCTCCTCCGGTGGGATATAATCACCCATGTGATGAC
CTCTCTTTCCGGAGTCTGTCGAGGGAATAGCA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FB05JQ C 1
AF RS1FB05TF U 1
AF RS1CC07JQ U 454
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CTCCTCGCCAACGGACCTCCGCTCTCAGGCATTGACCGCACCATGGCTCTTCAGCTTCCT
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ATAGAAATCTCAGTC

QA 1 555 1 555
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GCACACTGAATGGTTCTTAATAATAAGCTTTCCTTGGATTTCCCAGTGGGTTGGGTCTGT
GTTTGTAACCAAGCATCATTCGCTTCTTGTACTGCTCGTATATATCATCTTCAGGGTTAA
CCTCTCCTGGAGCAGAAGCCCCAACTCCCAAGTTGTTAGTCTTTACATCGCCTGCCATTA
TCGGGTCTGCCATACCCTTTCTAGAGCTTCCTATACCTTCACCTTCTTTCCAACCCATTT
TTGACAAGAGCTTATGTCCCACATTATCTGCTTGGATCTTAGCCTTCTCAGCTGCCTCCT
TTGTGGCTTTCAATGCAGCTACATCGTCACACTTTGCAAGGAACTTATCTAGCTCCTCCG
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QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

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ATTCACAGCGTGGAGCTGAAGCTGAAGGCAATGCTTTTCGGCGCTGAATGATAGATGCAA
ATATCATTCCATTACAACAGTGTCTCATTTTCGAAATGTAACAAATTGTACGTTTAAAAA
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TTGT


BQ
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10 10 10 10 

AF RS1G966TF U 1
AF RS1DG64JQ C 123
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GACCCAGTGAGAAGTATAGGACCCACTCTCCTTACCGCGGCAGCCGTTTGGAAAGGGAAA
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QA 1 675 1 675
DS 

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GT

QA 1 842 1 842
DS 



AS 1 3

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CAGAGGCTGTGAAGACCGAAGCAACCGTCGAAGCTGTTGATGAGACTGAGCCACCAAAAC
AAGAGGAGGTTGCACCAGCCAGTGACACCAAAACCAACGAAGAGCCTCTTGTAACCCTTT
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GCTGTTGTTGTAATGCTATTGTTGTCACACATGCACCTTATGAAATGACCAACTTCTTGT
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BQ
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C366TF U 2
AF RS1C366JQ C 2
AF RS1G787TF U 1
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BS 152 152 RS1C366TF
BS 153 207 RS1G787TF
BS 208 208 RS1C366TF
BS 209 210 RS1G787TF
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BS 303 376 RS1G787TF
BS 377 377 RS1C366TF
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TCTTTCATTCGACACCATGGGAGGCTGTGCAAGCAAACCTAAGGAGTCTGATATCCTTGA
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CG

QA 1 598 1 598
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CGGAGACACAGAAGGAAGCTGAACCAGCCAAACCAGCTGAGGCTGAGGCTGAGGCAGCTC
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AAGAGGAGGTTGCACCAGCCAATGACACCAAAACCAACGAAGAGCCTCTTGTAACCCTTT
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GCTGTTGTTGTAATGCTATTGTTGTCACACATGCACCTTATGAAATGACCAACTTCTTGT
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QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 3

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BQ
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AF RS1G906TF U 3
AF RS1DD75TF U 1
AF RS1DD75JQ C 121
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RD RS1G906TF 646 0 0
G
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GAGATTCACGGTGCTGATTGCGGCAGTGGTACTGGCCATTGTAGTGGCGGTGCCTGAAGT
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ACATTACTATCTTCTCGACGGAAAGGGTGGCTGTTACGGCGGCATGAAGCTCGCTGTTAA
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CATGGCCACTGGTGTTGCTCAGTTCGTGATCCCGTTTGCTCTTTTCTCTGTTTCCCCGGT
GTGGGACGCCATCTTAAGGATGTGGTAAATGACCAATGCTCGGTCCGAGTCGGACCTCTT
TAGTTGGAATCCATTTTCGAGTTTAAAGAAACATCAAATTCTTTT

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QA 1 765 1 765
DS 

RD RS1DD75JQ 686 0 0
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CAAACATTACTATCTTCTCGACGGAAAGGGTGGCTGTTACGGCGGCATGAAGCTCGCTGT
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TTCCATGGCCACTGGTGTTGCTCAGTTCGTGATCCCGTTTGCTCTTTTCTCTGTTTCCCC
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CTTTAGTTGGAATCCATTTTCGAGTTTAAAGAAACATCAAATTCTTTTTCAGGGAAAGCA
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TAATCTTTTGTTTTGTATGTCTCTTTGAAATCAATTGTTGAAAAAATGTTGTATTTTGAT
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QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 3

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GCAAACGATTAGAAAAGACCGGTCTTTGTTTAGAGCCAAACCGTTATTACAACGTAGATT
GTCCATCACAACTTTGGCCTCCTTCGTCTTCTTGTCATATCTGATCACTCTTCCCGACCG
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GAAGTAGAAGACATCTTCCTCTTCGTCAAGATCCCCTTGGCTTGCAAACATAACTTTGCG
ACCTTCGGCCCCGTCCACAACCAACTCGGCCAATCCTCCCT


BQ
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GTGGTCCCTGCCCTGATCATAACACTCGGCTCCCTTGTCCTTCCTGACACTCCAAATTCA
ATGATCGAGCGAGGTATGCACGAGGAGGCCAAAACCAAGCTCAGACGTATCCGTGGCGTC
GATGACGTTAGCCAAGAGTTTGACGATTTAGTCGAAGTTAGTAAAGAGTCTCAGTCGATA
GAGAACCCATGGACTAACCTCCTCCGCCGTAAATACCGGCCGCATCTCACCATGGCCATT
ATGATTCCATTCTTTCAGCAGCTCACCGGGATCAATGTGATTATGTTTTACGCTCCTGTT
TTGTTCAACACCATTGGTTTCACTAA

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1ER87TF 792 0 0
G
CGAGGAGGCCAAAACCAAGCTCAGACGTATCCGTGGCGTCGATGACGTTAGCCAAGAGTT
TGACGATTTAGTCGAAGCTAGTAAAGAGTCTCAGTCGATAGAGAACCCATGGACTAACCT
CCTCCGCCGTAAATACCGGCCGCATCTCACCATGGCCATTATGATTCCATTCTTTCAGCA
GCTCACCGGGATCAATGTGATTATGTTTTACGCTCCTGCTTTGTTCAACACCATTGGTTT
CACTAACGACGCTTCTCTCATGTCTGCCGTGGTCACTGGCTCGGTCAACGTCGCCGCTAC
TGTTGTGTCGATCTACGGTGTCGACAGGTGGGGACGTAGGTTTCTCTTTCTTGAAGGCGG
TACACAAATGCTTATATGCCAGGCTGTGGTTGCTGCATGCATCGGGGCCAAGTTTGGGGT
AGACGGGACCCCTGGTGAGCTACCAAAGTGGTATGCTATAGTGGTTGTAACTTTTATATG
CATCTATGTGGCCGGTTTCGCATGGTCATGGGGTCCGCTAGGGTGGTTAGTACCTAGTGA
GATCTTCCCGTTGGAGATAAGTTCGGCCGCGCAGAGTATAACAGTGTCCGCGAACATGAT
CTTCACTTTCATAATCGCTCAGATCTTCTTGACGATGCTTTGTCATTTGAAGTTTGGGTT
GTTCCTTGTGTTCGCCTTCTTCGTGGTGGTGATGTCTATTTTCGTCTACATATTCTTGCA
GAGACGAAAGGATTCCGATTGAGTAAATGGGTCAAGTGTGGAGGTCACACTGGTATTGGT
CAAGTTCGTGG

QA 2 792 2 792
DS 



AS 1 2

CO CL3993Contig1 849 2 2 U
GGTGATTAGAATCTGGTTATGGCGGAGACATCTGCGCTTCTCTTCTCTCACCTCACCATC
TCTCGCGTCTTGGCCACGACCGCTTCTTCTTCTCGATTCTCTCTTCTTTCTCGCGCTCGG
CCTTCTCGTTCGGCTCGATTTGCAGCTAAGTCATCGCCGCATTACGGTAGCTTCTCCGAT
GACGATGCCTTCTTCCCATGGTCCGATGGAGATAAAGGCATTGAATGGGTTCATGAAGAA
AGAATCACACTTTTCACCTCTGATGGGCTAATTCAGATTGGTGGCAACATGGTTCCTCGT
CGCATCAATTCTTCTAGTAAGAAACATGGGAGGTCCAAGAAACATCCAAAGTTTCAGGAA
AGTTCTTACATGGATCCTGCCCAAGGACTATGCCTTGGAGCTCTTTTCGACATCGCTGCT
ACAAACGGACTTGATATGGGAAGAAGACTCTGTATCTATGGATTCTGTCGCTCCGTTGAG
ATGCTCAGTGATGTTGTTGAAGACACTGTCTTAGAATATGGTGGAGAGGTTGTTGCTGCA
GAGAAAGAGAGCAAAGGGGGTTTACAAGAGAAGTTAAAAATGTCAGTGGCCGTTCCATAT
CTCTGGGGAGTTCCTCCCACTGCAGAGAGGCTTCACCTTGCGGTTCGAACTGGTGGAGGC
ATTGTTGACAAAGTTTATTGGCAATGGGATTTCTTGTGAATCATCATGAAACTTCTATAA
TAATGGTGCTCTAACCTCACAAGTCACAAGTGTTTTATAAATCATTCATTGTACAGAACT
TTACACTTGGTATAAATTCCCTAATTGTATTCAACTACAGATTCGGTGGGGATGATCTGT
TTTAAAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AQ14TFB U 1
AF RS1AQ14JQ C 144
BS 1 621 RS1AQ14TFB
BS 622 849 RS1AQ14JQ

RD RS1AQ14TFB 621 0 0
GGTGATTAGAATCTGGTTATGGCGGAGACATCTGCGCTTCTCTTCTCTCACCTCACCATC
TCTCGCGTCTTGGCCACGACCGCTTCTTCTTCTCGATTCTCTCTTCTTTCTCGCGCTCGG
CCTTCTCGTTCGGCTCGATTTGCAGCTAAGTCATCGCCGCATTACGGTAGCTTCTCCGAT
GACGATGCCTTCTTCCCATGGTCCGATGGAGATAAAGGCATTGAATGGGTTCATGAAGAA
AGAATCACACTTTTCACCTCTGATGGGCTAATTCAGATTGGTGGCAACATGGTTCCTCGT
CGCATCAATTCTTCTAGTAAGAAACATGGGAGGTCCAAGAAACATCCAAAGTTTCAGGAA
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ACAAACGGACTTGATATGGGAAGAAGACTCTGTATCTATGGATTCTGTCGCTCCGTTGAG
ATGCTCAGTGATGTTGTTGAAGACACTGTCTTAGAATATGGTGGAGAGGTTGTTGCTGCA
GAGAAAGAGAGCAAAGGGGGTTTACAAGAGAAGTTAAAAATGTCAGTGGCCGTTCCATAT
CTCTGGGGAGTTCCTCCCACT

QA 1 621 1 621
DS 

RD RS1AQ14JQ 706 0 0
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CGATGGAGATAAAGGCATTGAATGGGTTCATGAAGAAAGAATCACACTTTTCACCTCTGA
TGGGCTAATTCAGATTGGTGGCAACATGGTTCCTCGTCGCATCAATTCTTCTAGTAAGAA
ACATGGGAGGTCCAAGAAACATCCAAAGTTTCAGGAAAGTTCTTACATGGATCCTGCCCA
AGGACTATGCCTTGGAGCTCTTTTCGACATCGCTGCTACAAACGGACTTGATATGGGAAG
AAGACTCTGTATCTATGGATTCTGTCGCTCCGTTGAGATGCTCAGTGATGTTGTTGAAGA
CACTGTCTTAGAATATGGTGGAGAGGTTGTTGCTGCAGAGAAAGAGAGCAAAGGGGGTTT
ACAAGAGAAGTTAAAAATGTCAGTGGCCGTTCCATATCTCTGGGGAGTTCCTCCCACTGC
AGAGAGGCTTCACCTTGCGGTTCGAACTGGTGGAGGCATTGTTGACAAAGTTTATTGGCA
ATGGGATTTCTTGTGAATCATCATGAAACTTCTATAATAATGGTGCTCTAACCTCACAAG
TCACAAGTGTTTTATAAATCATTCATTGTACAGAACTTTACACTTGGTATAAATTCCCTA
ATTGTATTCAACTACAGATTCGGTGGGGATGATCTGTTTTAAAAGC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL3994Contig1 954 2 2 U
GGACACAACACAACACAACACCTTCTTCTCTTTTCCCCCATTATCTCCTTCCTTCCTTCT
CCGACAATGGCTACTTTCCTAACAGCTGTCGTTTCAATCAAACCCACACTCTTCTCATTC
CACTCCGAGTCCTCCCCCTCTTTGCAATCTCAAACCAATGCATTCGCTCTCAAGGCCAAA
GCCTTTCCTTCTGTCCCCACAGCCATCTCTCTTCCACGGACCTCCAGGATGAGACTCATC
CCTCGCGCAACGTTGGAGACGGAAGAAAAACCCGCTTTGGACCCTAACGCAGAATCCTCA
AGACGCGTCTACATCGGAAACATACCAAGAACCGTAACTAACGAACAGCTCACCAAACTC
GTCGAAGAGCACGGCGCCGTTGAACAAGTCCAGGTGATGTATGATAAGTACTCAGGAAGA
AGCCGTAGGTTTGGTTTCGCTACAATGAAATCAGTTGAAGATGCCAATGCTGTCATTGAG
AAGTTGAACGGCACTACAATTGAAGGACGTGAGGTGAAGGTTAATATTACAGAGAAGCCT
ATAGAATTATCATCATCATCATCGTCTCCTGATTTGTCGCTGCTTCAGTCTGAAGGTGCA
GCTTTTGTGGATAGTCCTTACAAAGTGTATGTAGGGAATCTAGCAAAGAGTGTTACTAAA
GAGATGCTTGAGAGTTTGTTTTCTGAGAAAGGGAAAGTTCTGAGTGCTAAGGTTTCGAGA
GTGCCTGGTACTTCCAAATCTACTGGGTTTGGGTTTGTTACGTTTTCTTCTGATGAAGAT
GTCGAAGCTGCTATTTTGGCTCTTAACAACTCTTTGCTGGAAGGACAGAAGATTCGGGTG
AACAAGGCGTAGTGTGTGAGAGAGGGCGAGTCTTTTGGCAGAATCGTTTTTGTGTTGTAT
TGAGGAGTTTGTAATGCAAAACATTTAGAGCATAGTATCATTATCTTTGTAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DS33TF U 1
AF RS1DS33JQ C 226
BS 1 665 RS1DS33TF
BS 666 954 RS1DS33JQ

RD RS1DS33TF 672 0 0
GGACACAACACAACACAACACCTTCTTCTCTTTTCCCCCATTATCTCCTTCCTTCCTTCT
CCGACAATGGCTACTTTCCTAACAGCTGTCGTTTCAATCAAACCCACACTCTTCTCATTC
CACTCCGAGTCCTCCCCCTCTTTGCAATCTCAAACCAATGCATTCGCTCTCAAGGCCAAA
GCCTTTCCTTCTGTCCCCACAGCCATCTCTCTTCCACGGACCTCCAGGATGAGACTCATC
CCTCGCGCAACGTTGGAGACGGAAGAAAAACCCGCTTTGGACCCTAACGCAGAATCCTCA
AGACGCGTCTACATCGGAAACATACCAAGAACCGTAACTAACGAACAGCTCACCAAACTC
GTCGAAGAGCACGGCGCCGTTGAACAAGTCCAGGTGATGTATGATAAGTACTCAGGAAGA
AGCCGTAGGTTTGGTTTCGCTACAATGAAATCAGTTGAAGATGCCAATGCTGTCATTGAG
AAGTTGAACGGCACTACAATTGAAGGACGTGAGGTGAAGGTTAATATTACAGAGAAGCCT
ATAGAATTATCATCATCATCATCGTCTCCTGATTTGTCGCTGCTTCAGTCTGAAGGTGCA
GCTTTTGTGGATAGTCCTTACAAAGTGTATGTAGGGAATCTAGCAAAGAGTGTTACTAAA
GAGAT
GCTTGAG

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1DS33JQ 729 0 0
AGGAT
GAGACTCATCCCTCGCGCAACGTTGGAGACGGAAGAAAAACCCGCTTTGGACCCTAACGC
AGAATCCTCAAGACGCGTCTACATCGGAAACATACCAAGAACCGTAACTAACGAACAGCT
CACCAAACTCGTCGAAGAGCACGGCGCCGTTGAACAAGTCCAGGTGATGTATGATAAGTA
CTCAGGAAGAAGCCGTAGGTTTGGTTTCGCTACAATGAAATCAGTTGAAGATGCCAATGC
TGTCATTGAGAAGTTGAACGGCACTACAATTGAAGGACGTGAGGTGAAGGTTAATATTAC
AGAGAAGCCTATAGAATTATCATCATCATCATCGTCTCCTGATTTGTCGCTGCTTCAGTC
TGAAGGTGCAGCTTTTGTGGATAGTCCTTACAAAGTGTATGTAGGGAATCTAGCAAAGAG
TGTTACTAAAGAGATGCTTGAGAGTTTGTTTTCTGAGAAAGGGAAAGTTCTGAGTGCTAA
GGTTTCGAGAGTGCCTGGTACTTCCAAATCTACTGGGTTTGGGTTTGTTACGTTTTCTTC
TGATGAAGATGTCGAAGCTGCTATTTTGGCTCTTAACAACTCTTTGCTGGAAGGACAGAA
GATTCGGGTGAACAAGGCGTAGTGTGTGAGAGAGGGCGAGTCTTTTGGCAGAATCGTTTT
TGTGTTGTATTGAGGAGTTTGTAATGCAAAACATTTAGAGCATAGTATCATTATCTTTGT
AATC

QA 6 729 6 729
DS 



AS 1 2

CO CL3995Contig1 1035 2 10 U
GCAGCACACACAGCTTCCGTGCTTGCAAGTTGGGAATTCTAACAGGCCAAATTATCTACC
AATGGAGGTATGCAAGATTGTTGAGGGTCAGAGATACTCAAAAAGGTTGAACGAGAGACA
GATCACTGCTTTGCTGAAGGTGACTTGTCAGCGCCCCCAAGAACGAGAGAAAGATATCTT
GCGGATGGTGGAGCTAAATGATTACAGTCACGATCCGTATGCTAAGGAGTTTGGTGTCAA
GATAAGTGCGTCTCTTGCTTCTGTTGAAGCTCGAATTCTGCCTCGCTGGAAGCAGGTTAT
CAGCCACCAGTGACGTTTGTGGTGGTGCAGAAGCGCCATCACACGAGGCTGTTTGCGCAA
AACCATAATGATCGTAATTCAGTGGATAGAAGTGGCAACATTTTACCAGGAACTGTCGTG
GATTCAAAGATATGTCACCCCACAGAGTTCGACTTTTATCTCTGTAGCCATGCTGGTATT
CAGGGCACTTCTCGACCTGCTCATTACCATGTTCTTTGGGACGAGAACAACTTCTCTGCT
GATGGACTCCAATCTCTGACTAATAACTTATGTTACACGTATGCTAGATGCACTCGTTCT
GTATCCATTGTGCCGCCTGCGTACTATGCTCATCTAGCAGCGTTCAGGGCTCGGTTCTAC
ATGGAGCCAGAGACATCAGACAGTGGTTCGATGGCTAGCGGGAGCATGGCACGTGGAGGT
GGTATGGGTGGTAGAAACATGCGTGGGCCTCACGTGAACGCTGCTGTGAGACCACTCCCA
CCTTTGAAAGACAACGTGAAGCGAGTTATGTTCTACTGCTGATTCAGTTCAGCTCTTTAT
CTTATCTCCTATGAGCTATTATGACTCTCATCGCCCAAATAAAATGTTTCAAGACTTTTC
CATGAAACTCTTATGTCTACGTATCTTGTGTGGTGTGGTACTTACTGAAGTTATCATAAG
TTCGAGTGAATGTTTTGGATATTTTACGTTCTGCCACTCTTTTGAGTATGAAATGCTTTA
TGGGTTTTTAGTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FZ49TF U 1
AF RS1B761JQ C 268
BS 1 298 RS1FZ49TF
BS 299 299 RS1B761JQ
BS 300 443 RS1FZ49TF
BS 444 444 RS1B761JQ
BS 445 506 RS1FZ49TF
BS 507 507 RS1B761JQ
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BS 522 522 RS1B761JQ
BS 523 591 RS1FZ49TF
BS 592 1035 RS1B761JQ

RD RS1FZ49TF 591 0 0
GCAGCACACACAGCTTCCGTGCTTGCAAGTTGGGAATTCTAACAGGCCAAATTATCTACC
AATGGAGGTATGCAAGATTGTTGAGGGTCAGAGATACTCAAAAAGGTTGAACGAGAGACA
GATCACTGCTTTGCTGAAGGTGACTTGTCAGCGCCCCCAAGAACGAGAGAAAGATATCTT
GCGGATGGTGGAGCTAAATGATTACAGTCACGATCCGTATGCTAAGGAGTTTGGTGTCAA
GATAAGTGCGTCTCTTGCTTCTGTTGAAGCTCGAATTCTGCCTCGCTGGAAGCAGGTTGT
CAGCCACCAGTGACGTTTGTGGTGGTGCAGAAGCGCCATCACACGAGGCTGTTTGCGCAA
AACCATAATGATCGTAATTCAGTGGATAGAAGTGGCAACATTTTACCAGGAACTGTCGTG
GATTCAAAGATATGTCACCCCACGGAGTTCGACTTTTATCTCTGTAGCCATGCTGGTATT
CAGGGCACTTCTCGACCTGCTCATTATCATGTTCTTTGGGATGAGAACAACTTCTCTGCT
GATGGACTCCAATCTCTGACTAATAACTTATGTTACACGTATGCTAGATGC

QA 1 591 1 591
DS 

RD RS1B761JQ 768 0 0
GCTGTATGAGCTTGATGC
CTGGAAGCAGGTTATCAGCCACCAGTGACGTTTGTGGTGGTGCAGAAGCGCCATCACACG
AGGCTGTTTGCGCAAAACCATAATGATCGTAATTCAGTGGATAGAAGTGGCAACATTTTA
CCAGGAACTGTCGTGGATTCAAAGATATGTCACCCCACAGAGTTCGACTTTTATCTCTGT
AGCCATGCTGGTATTCAGGGCACTTCTCGACCTGCTCATTACCATGTTCTTTGGGACGAG
AACAACTTCTCTGCTGATGGACTCCAATCTCTGACTAATAACTTATGTTACACGTATGCT
AGATGCACTCGTTCTGTATCCATTGTGCCGCCTGCGTACTATGCTCATCTAGCAGCGTTC
AGGGCTCGGTTCTACATGGAGCCAGAGACATCAGACAGTGGTTCGATGGCTAGCGGGAGC
ATGGCACGTGGAGGTGGTATGGGTGGTAGAAACATGCGTGGGCCTCACGTGAACGCTGCT
GTGAGACCACTCCCACCTTTGAAAGACAACGTGAAGCGAGTTATGTTCTACTGCTGATTC
AGTTCAGCTCTTTATCTTATCTCCTATGAGCTATTATGACTCTCATCGCCCAAATAAAAT
GTTTCAAGACTTTTCCATGAAACTCTTATGTCTACGTATCTTGTGTGGTGTGGTACTTAC
TGAAGTTATCATAAGTTCGAGTGAATGTTTTGGATATTTTACGTTCTGCCACTCTTTTGA
GTATGAAATGCTTTATGGGTTTTTAGTTAC

QA 19 768 19 768
DS 



AS 1 3

CO CL3996Contig1 890 3 13 U
CAGATTAGAATGAGCGGTGCGTTATTCAGAAATGTCGCCGCCGACACCGCACGGCTGATA
CGGCGGAACGCGGCTGCGGAAATTAAGCAACTGCAATCCAAGCCTTATTTCCGCTCACCT
CAGCTCCTCGGTAGAGCAAAGGAAACCGGAATCTCACTTCCGTCTTCTCCTTCCGGCCTC
TGTTCATCGGCGAAGGTGGGATTCGTAGGATGGTATCTTGGTATGGTGAAATCACGACCG
GTCATCACCAAAAGTGTCACTTCCTCGATTATTCACGTTGCCGCCGATTTGTCTTCTCAG
ACAATTTCGAAAAAATCTTCCGAGTCTTACGACTTGTTGAGAACAGCAAGGATGGGAGGA
TATGGTCTACTGGTCTTGGGTCCAACACTTCATTATTGGTTCAACTTCATGTCAAGACTC
TTCCCAAAACAAGATTTGATCACTACCTTCAAGAAAATGGCCATGGGACAAGCGATCTAC
GGGCCTATCATGACCGTTGTTTTCTTCTCCTTGAACGCTTCCCTACAGGGGGAAAGTGGT
TCGGATATAGTTGCAAGATTGAAAAGGGACGTAATCCCTGCAATGTTTAACGGTGTCATG
TATTGGCCTCTTTGTGATTTTATAACATTCAGGTTCTTCCCCGTTCACTTACAGCCTCTT
GTAAGCAACTCGTTTTCATATCTCTGGACAATCTACATGACGTACATGGCAAACCGCGAA
AAACCTGCAGTGATTTCAGCTGAAACAATATAATACCTTCTACGCTATCTTGCGCATTGC
ATTGCCACTCTATTTAGATTTAGGTTGGTTGGTTATAAGATTTTATAAGACCACACATGT
AATGATTTTTGTTGCCGCAACTACCATTCATTTTTGTGATATCAATATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EM51TF U 1
AF RS1CQ56TF U 115
AF RS1EM51JQ C 391
BS 1 273 RS1EM51TF
BS 274 274 RS1CQ56TF
BS 275 632 RS1EM51TF
BS 633 633 RS1CQ56TF
BS 634 690 RS1EM51TF
BS 691 691 RS1CQ56TF
BS 692 722 RS1EM51TF
BS 723 723 RS1CQ56TF
BS 724 745 RS1EM51TF
BS 746 746 RS1CQ56TF
BS 747 784 RS1EM51TF
BS 785 798 RS1CQ56TF
BS 799 890 RS1EM51JQ

RD RS1EM51TF 784 0 0
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CGGCGGAACGCGGCTGCGGAAATTAAGCAACTGCAATCCAAGCCTTATTTCCGCTCACCT
CAGCTCCTCGGTAGAGCAAAGGAAACCGGAATCTCACTTCCGTCTTCTCCTTCCGGCCTC
TGTTCATCGGCGAAGGTGGGATTCGTAGGATGGTATCTTGGTATGGTGAAATCACGACCG
GTCATCACCAAAAGTGTCACTTCCTCGATTATTTACGTTGCCGCCGATTTGTCTTCTCAG
ACAATTTCGAAAAAATCTTCCGAGTCTTACGACTTGTTGAGAACAGCAAGGATGGGAGGA
TATGGTCTACTGGTCTTGGGTCCAACACTTCATTATTGGTTCAACTTCATGTCAAGACTC
TTCCCAAAACAAGATTTGATCACTACCTTCAAGAAAATGGCCATGGGACAAGCGATCTAC
GGGCCTATCATGACCGTTGTTTTCTTCTCCTTGAACGCTTCCCTACAGGGGGAAAGTGGT
TCGGATATAGTTGCAAGATTGAAAAGGGACGTAATCCCTGCAATGTTTAACGGTGTCATG
TATTGGCCTCTTTGTGATTTTATAACATTCAG*TTCTTCCCCGTTCACTTACAGCCTCTT
GTAAGCAACTCGTTTTCATATCTCTGGACA*TCTACATGACGTACATGGCAAACCGCGAA
AA*CCTGCAGTGATTTCAGCTGAAA*AATATAATACCTTCTACGCTATCTTGCGCATTGC
ATTG

QA 1 784 1 784
DS 

RD RS1CQ56TF 684 0 0
TCACCTCAGCTCCTCGGTAGAGCAAAGGAAACCGGAATCTCACTTCCGTCTTCTCCTTCC
GGTCTCTGTTCATCGGCGAAGGTGGGATTCGTAGGATGGTATCTTGGTATGGTGAAATCA
CGACCGGTCATCACCAAAAGTGTCACTTCCTCGATTATTCACGTTGCCGCCGATTTGTCT
TCTCAGACAATTTCGAAAAAATCTTCCGAGTCTTACGACTTGTTGAGAACAGCAAGGATG
GGAGGATATGGTCTACTGGTCTTGGGTCCAACACTTCATTATTGGTTCAACTTCATGTCA
AGACTCTTCCCAAAACAAGATTTGATCACTACCTTCAAGAAAATGGCCATGGGGCAAGCG
ATCTACGGGCCTATCATGACCGTTGTTTTCTTCTCCTTGAACGCTTCCCTACAGGGGGAA
AGTGGTTCGGATATAGTTGCAAGATTGAAAGGGGACGTAATCCCTGCAATGTTTAACGGT
GTCATGTATTGGCCTCTTTGTGATTTTATAACATTCAGGTTCTTCCCCGTTCACTTACAG
CCTCTTGTAAGCAACTCGTTTTCATATCTCTGGACAATCTACATGACGTACATGGCAAAC
CGCGAAAAACCTGCAGTGATTTCAGCTGAAACAATATAATACCTTCTACGCTATCTTGCG
CATTGCATTGCCACTCTATTTAGA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1EM51JQ 500 0 0
CATTATTGGTTCAACTTCATGTCAAGACTCTTCCCAAAACAAGATTTGATCACTACCTTC
AAGAAAATGGCCATGGGACAAGCGATCTACGGGCCTATCATGACCGTTGTTTTCTTCTCC
TTGAACGCTTCCCTACAGGGGGAAAGTGGTTCGGATATAGTTGCAAGATTGAAAAGGGAC
GTAATCCCTGCAATGTTTAACGGTGTCATGTATTGGCCTCTTTGTGATTTTATAACATTC
AGGTTTTTCCCCGTTCACTTACAGCCTCTTGTAAGCAACTCGTTTTCATATTTCTGGACA
ATTTACATGACGTACATGGCAAACCGCGAAAAACCTGCAGTGATTTCAGCTGAAACAATA
TAATACCTTTTACGCTATCTTGCGCATTGCATTGCCACTCTATTTAGATTTAGGTTGGTT
GGTTATAAGATTTTATAAGACCACACATGTAATGATTTTTGTTGCCGCAACTACCATTCA
TTTTTGTGATATCAATATTT

QA 1 500 1 500
DS 



AS 1 2

CO CL3997Contig1 839 2 26 U
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GGGCTGCAAACCACTGTTCTCTGCAAGAGCCATAGGCTCTAATTCAACACCCCCGACCCA
TCTGACAGCAGGCAAATTCCTGTGCATCAAAAGATGGTTGGCCTCATCATCGAATCCCCA
TTGGCAAACAACCAGTGTTGCACCAACATCCTTGCATTTCTGGACCATCTCATCGAAGTA
TTGCTGCTCTTGCTTCCGCAATGTCTCAAACTTCTCCACTGTGTCAATGTCCACCTTATG
CTTAGTCTTGGGCTTCGGTAGCTCAAACGGGCAAGACAAAATGGCAATGTGGGCATCTTC
AATCTGCTTTGGCATCTGAGGATGACTCATGTCTTTGTCAACCAGTATCCCATATATAAG
CTCAGTGTCCTCCAAGTTTCCCCCCACTTTGCCCTCGATTTTGATCAGATCCAAGTTAAC
ATCCTTTCTCTCTAGATCAGCAACAGCAAGAACTGCTTTCACAGCAATCTCAGCTAAACT
CCGCTTGCATCGATTCACAATCTTAGAGGAGAGAGTAGTCATGCATGTTTGAACCAACGG
CTCGTAGTTATCATTGTCGAATTCAAACTTTTGAGAGATACGCTCCAAATGCTCAACCGC
AACTCTAGAAGCCATCTCATACCCCTCAGCAACACGGATAGGATGAATCCCCCTATCTAG
CTGACGTTCAGCTTGCTCCAGAAGCGCACCAGCCATGACAACAACACCCGTCGTGCCGTC
ACCGATCTCATAATCCTGACTCCGAGACAGCTCCACCATAAGTTTCGCGATCTGGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C570JQ U 1
AF RS1BH92TF C 124
BS 1 159 RS1C570JQ
BS 160 160 RS1BH92TF
BS 161 188 RS1C570JQ
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BS 190 255 RS1C570JQ
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BS 260 267 RS1C570JQ
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BS 269 408 RS1C570JQ
BS 409 409 RS1BH92TF
BS 410 444 RS1C570JQ
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BS 446 462 RS1C570JQ
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BS 683 723 RS1C570JQ
BS 724 839 RS1BH92TF

RD RS1C570JQ 723 0 0
GTGCCAAATGATTTTTCACGCACCATACCAGCCTTCCCTAGCTTCTCTGCAAGAGCCATA
GGGCTGCAAACCACTGTTCTCTGCAAGAGCCATAGGCTCTAATTCAACACCCCCGACCCA
TCTGACAGCAGGCAAATTCCTGTGCATCAAAAGATGGTTTGCCTCATCATCGAATCCCCA
TTGGCAAATAACCAGTGTTGCACCAACATCCTTGCATTTCTGGACCATCTCATCGAAGTA
TTGCTGCTCTTGCTTGCGTAATGTCTCGAACTTCTCCACTGTGTCAATGTCCACCTTATG
CTTAGTCTTGGGCTTCGGTAGCTCAAACGGGCAAGACAAAATGGCAATGTGGGCATCTTC
AATCTGCTTTGGCATCTGAGGATGACTCATGTCTTTGTCAACCAGTATTCCATATATAAG
CTCAGTGTCCTCCAAGTTTCCCCCGACTTTGCCCTCGATTTTTATCAGATCCAAGTTAAC
ATCTTTTCTCTCTAGATCAGCAACCGCAAGAACTGCTTTCACAGCAATCTCAGCTAAACT
CCGCTTGCATCGATTCACAATCTTAGAGGAGAGAGTAGTCATGCATGTTTGAACCAACGG
CTCGTAGTTATCATTGTCGAATTCAAACTTTTGAGATATACGCTCCAAATGCTCAACCGC
AACTCTAGAAGCCATCTCATATCCCTCAGCAACACGGATAGGATGAATCCCCCTATCTAG
CTG

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1BH92TF 716 0 0
GACAGCAGGCAAATTC*TGTGCATCAAAAGATGGTTG**CTCATCATCGAATCCCCATTG
GCAAACAACCAGTGTTGCACCAACATCCTTGCATTTCTGGACCATCTCATCGAAGTATTG
CTGCTCTTGCTTCCGCAATGTCTCAAACTTCTCCACTGTGTCAATGTCCACCTTATGCTT
AGTCTTGGGCTTCGGTGGCTCAAACGGGCAAGTCAAAATGGCAATGTGGGCATCTTCAAT
CTGCTTTGGCATCTGAGGATGACTCATGTCTTTGTCAACCAGTATCCCATATATAAGCTC
AGTGTCCTCCAAGTTTCCCCCCACTTTGCCCTCGATTTTGATCAGATCTAAGTTAACATC
CTTTCTCTCTAGATCCGCAACAGCAAGAACTGCTTTCACAGCAATCTCAGCTAAACTGCG
CTTGCATCGATTCACAATCTTAGAGGAGAGAGTAGTCATGCATGTTTGAACCAACGGCTC
GTAGTTATCATTGTCGAATTCAAACTTTTGAGAGATGCGCTCCAAATGCTCAACCGCAAC
TCTGGAAGCCATCTCATACCCCTCAGCAACACGGATAGGATGAATCCCCCTATCTAGCTG
ACGTTCAGCTTGCTCCAGAAGCGCACCAGCCATGACAACAACACCCGTCGTGCCGTCACC
GATCTCATAATCCTGACTCCGAGACAGCTCCACCATAAGTTTCGCGATCTGGTTGC

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 3

CO CL3998Contig1 607 3 1 U
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ATGTAGTTCCTATCGACTCAGCTGATACGCTTCCAATTATATACGAACGTGGTTTGTTTG
GAATATACCATGACTGGTGCGAATCATTCAGCACTTACCCTCGAACTTACGACCTTCTTC
ATGCTGATCATCTTTTCTCTGCTCTGAAGAAGAGGTGCAACTTGGTGTCGGCAATGGCTG
AAGTGGACAGGATTCTTAGACCACAAGGAACTTTTATAGTAAGAGATGACATGGAAACAA
TAGGAGAAATAGAGAAGATGGTGAAATCGATGAAATGGAATGTAAGAATGACACATTCCA
AAGATGGAGAAGGAGTGCTCTCTGTTCAGAAGTCACTGTGGCGTCCTACAGAGTTCGAGG
CAATTACATCGGCAATAGTCTAAGAGGTGAAGGAAACGAAGAAGAATGTGTTTTTTATAT
TTTATTATAGTTGTATGATTAAAGTTGTTTCTTTTATGATCACATTGATTAGTCCAATAC
TTGTATCCTTTTCCTTTGCATTGACAAAAATTGTATGCAAGACAATTATCTCAAAACTGT
AAACTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CB43JQ C 230
AF RS1CB43TF U 230
AF RS1BG40TF U 1
BS 1 607 RS1BG40TF

RD RS1CB43JQ 314 0 0
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CATGGAAACAATAGGAGAAATAGAGAAGATGGTGAAATCGATGAAATGGAATGTAAGAAT
GACACATTCCAAAGATGGAGAAGGAGTGCTCTCTGTTCAGAAGTCACTGTGGCGTCCTAC
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GTTTTTTATATTTTATTATAGTTGTATGATTAAAGTTGTTTCTTTTATGATCCCATTGAT
TAGTCCAATACTTG

QA 1 314 1 314
DS 

RD RS1CB43TF 350 0 0
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CATGGAAACAATAGGAGAAATAGAGAAGATGGTGAAATCGATGAAATGGAATGTAAGAAT
GACACATTCCAAAGATGGAGAAGGAGTGCTCTCTGTTCAGAAGTCACTGTGGCGTCCTAC
AGAGTTCGAGGCAATTACATCGGCAATAGTCTAAGAGGTGAAGGAAACGAAGAAGAATGT
GTTTTTTATATTTTATTATAGTTGTATGATTAAAGTTGTTTCTTTTATGATCACATTGAT
TAGTCCAATACTTGTATCCTTTTCCTTTGCATTGACAAAAATTGTATGC
C

QA 1 349 1 349
DS 

RD RS1BG40TF 607 0 0
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ATGTAGTTCCTATCGACTCAGCTGATACGCTTCCAATTATATACGAACGTGGTTTGTTTG
GAATATACCATGACTGGTGCGAATCATTCAGCACTTACCCTCGAACTTACGACCTTCTTC
ATGCTGATCATCTTTTCTCTGCTCTGAAGAAGAGGTGCAACTTGGTGTCGGCAATGGCTG
AAGTGGACAGGATTCTTAGACCACAAGGAACTTTTATAGTAAGAGATGACATGGAAACAA
TAGGAGAAATAGAGAAGATGGTGAAATCGATGAAATGGAATGTAAGAATGACACATTCCA
AAGATGGAGAAGGAGTGCTCTCTGTTCAGAAGTCACTGTGGCGTCCTACAGAGTTCGAGG
CAATTACATCGGCAATAGTCTAAGAGGTGAAGGAAACGAAGAAGAATGTGTTTTTTATAT
TTTATTATAGTTGTATGATTAAAGTTGTTTCTTTTATGATCACATTGATTAGTCCAATAC
TTGTATCCTTTTCCTTTGCATTGACAAAAATTGTATGCAAGACAATTATCTCAAAACTGT
AAACTTA

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 3

CO CL3999Contig1 1080 3 4 U
GGACTGCGTCTTTCTCTGTACAAACTCTCTCTCTCGACAACCAAAGAAGAAAAAGCGAAG
CAAAGATGTTCAGGAACCAGTACGACACGGACGTGACAACATGGAGTCCCACTGGCCGTC
TTTTCCAAGTAGAGTACGCCATGGAAGCCGTCAAGCAAGGCTCCGCCGCGATCGGACTCA
GATCTCGCTCCCATGTCGTCCTCGCCTCTGTCAATAAAGCCCAATCCGAGCTCTCTTCTC
ACCAAAGAAAGATCTTCAAAGTCGATGACCACATCGGTGTCGCCATCGCTGGTCTCACCG
CC*GATGGCCGTGTTCTGTCTCGTTACATGAGATCTGAATCC*ATCAATCACTCTTTCAC
CTACGAGTCTCCTCTCCCCGTTGGCCGTCTCGTCGTTCGTCTTGCTGATAAGGCCCAGGT
ATGTACCCAACGGTCATGGAAACGACCTTATGGTGTGGGTTTACTGGTTGGTGGACTGGA
CGAGTCAGGAGCCCATCTCTACTACAACTGCCCCAGCGGAAACTACTTTGAATATCAAGC
TTTCGCTATTGGTTCTCGTTCACAAGCTGCGAAAACTTATCTAGAACGAAGATTCGAGAG
CTTCAATGAGTCATCAAGAGAAGATCTGATCAAAGATGCTATTTTGGCCATAAAGGGAAA
CTTTGCAAGGAGAGACACTCAAGAGCTCGCTCTGCACGGTTTCTGTTCTAGGAGTCGATG
AACCGTTCCACTTCTTGGACCAAGAAAGCATACAGAAGGTGATTGATACGTTTGAGAAGG
TTCCCGAGGAAGAGGAGGATGGTGGTGAGGGTGAGGCCGAGGCTGAAGCTGCTGCTGCAC
CTGCGGAACAAGGTGGTGCAGGTGATCAAGATGCTGCACCAATGGAAATGTGAGCAAGTG
AGAGTGTTAGCGTTTGATCTACAAATAACGAGGTGTTGGTTATAACTGTGTCGTCTTTAG
CTCTTTGGTGTCAAAGTTCCATGCTGAGTTTAAAAGAGTCTATGTCCCAAGTACTTTGGC
TTTTTACTCCCGTGAAATCTTTCTTTTTCTTTTTGTGGTTACAACTTTCAGTTGGTTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 0 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
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AF RS1BQ24TF U 186
AF RS1AP57TFB U 1
AF RS1AP57JQ C 244
BS 1 244 RS1AP57TFB
BS 245 245 RS1BQ24TF
BS 246 754 RS1AP57TFB
BS 755 1080 RS1AP57JQ

RD RS1BQ24TF 463 0 0
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AGGAAGATCTTCAAAGTCGATGACCACATCGGTGTCGCTATCGCTGGTCTCACCGCC*GA
CGGCCGTGCTCTGTCTCGTTACATGAGATCTGAATCC*ATCAATCACTCTTTCACCTACG
AGTCTCCTCTCCCCGTTGGCCGTCTCGTCGTTCGTCTTGCTGATAAGGCTCAGGTATGTA
CCCAACGGTCATGGAAACGACCTTATGGTGTGGGTTTACTGGTTAGTGGACTGGACGAGT
CAGGAGCCCATCTCTACTACAACTGCCTCAGCGGAAACTACTTTGAATATCAAGCATTCG
CTATTGGTTCTCGTTCACAAGCTGCGAAAACTTATCTAGAACGGAGATTCCAGAGCTTCA
GTGAGTCATCAAGAGAAGATCTGATAAAAGATGCTATTTTGGC

QA 1 463 1 463
DS 

RD RS1AP57TFB 754 0 0
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CAAAGATGTTCAGGAACCAGTACGACACGGACGTGACAACATGGAGTCCCACTGGCCGTC
TTTTCCAAGTAGAGTACGCCATGGAAGCCGTCAAGCAAGGCTCCGCCGCGATCGGACTCA
GATCTCGCTCCCATGTCGTCCTCGCCTCTGTCAATAAAGCCCAATCCGAGCTCTCTTCTC
ACCAGAGAAAGATCTTCAAAGTCGATGACCACATCGGTGTCGCCATCGCTGGTCTCACCG
CC*GATGGCCGTGTTCTGTCTCGTTACATGAGATCTGAATCC*ATCAATCACTCTTTCAC
CTACGAGTCTCCTCTCCCCGTTGGCCGTCTCGTCGTTCGTCTTGCTGATAAGGCCCAGGT
ATGTACCCAACGGTCATGGAAACGACCTTATGGTGTGGGTTTACTGGTTGGTGGACTGGA
CGAGTCAGGAGCCCATCTCTACTACAACTGCCCCAGCGGAAACTACTTTGAATATCAAGC
TTTCGCTATTGGTTCTCGTTCACAAGCTGCGAAAACTTATCTAGAACGAAGATTCGAGAG
CTTCAATGAGTCATCAAGAGAAGATCTGATCAAAGATGCTATTTTGGCCATAAAGGGAAA
CTTTGCAAGGAGAGACACTCAAGAGCTCGCTCTGCACGGTTTCTGTTCTAGGAGTCGATG
AACCGTTCCACTTCTTGGACCAAGAAAGCATACA

QA 1 754 1 754
DS 

RD RS1AP57JQ 837 0 0
AGAGA
AAGATCTTCAAAGTCGATGACCACATCGGTGTCGCCATCGCTGGTCTCACCCCCCGATGG
CCGTGTTCTGTCTCGTTACATGAGATCTGAATCCCATCAATCACTCTTTCACCTACGAGT
CTCCTCTCCCCGTTGGCCGTCTCGTCGTTCGTCTTGCTGATAAGGCCCAGGTATGTACCC
AACGGTCATGGAAACGACCTTATGGTGTGGGTTTACTGGTTGGTGGACTGGACGAGTCAG
GAGCCCATCTCTACTACAACTGCCCCAGCGGAAACTACTTTGAATATCAAGCTTTCGCTA
TTGGTTCTCGTTCACAAGCTGCGAAAACTTATCTAGAACGAAGATTCGAGAGCTTCAATG
AGTCATCAAGAGAAGATCTGATCAAAGATGCTATTTTGGCCATAA*GGGAAACTTTGCAA
GGAGAGACACTCAAGAGCTCGCTCTGCACGGTTTCTGTTTTAGGAGTCGATGAACCGTTC
CACTTCTTGGACCAAGAAAGCATACAGAAGGTGATTGATACGTTTGAGAAGGTTCCCGAG
GAAGAGGAGGATGGTGGTGAGGGTGAGGCCGAGGCTGAAGCTGCTGCTGCACCTGCGGAA
CAAGGTGGTGCAGGTGATCAAGATGCTGCACCAATGGAAATGTGAGCAAGTGAGAGTGTT
AGCGTTTGATCTACAAATAACGAGGTGTTGGTTATAACTGTGTCGTCTTTAGCTCTTTGG
TGTCAAAGTTCCATGCTGAGTTTAAAAGAGTCTATGTCCCAAGTACTTTGGCTTTTTACT
CCCGTGAAATCTTTCTTTTTCTTTTTGTGGTTACAACTTTCAGTTGGTTACT

QA 6 837 6 837
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CTTAATCCGCCATGGCTTCGTCGGCGCTCTCTAATCTGATGCTTACCATTGATTAAAAGA
AAACGAACTACTCGATCACTACCGTCCTCTCTGCAATTACATTGCTTTCACTTCCTCTGA
CCGCGAACCTCAGCTTCTAGAAGACGATCAAGAAACCCTAAAGAGCCTCTGCTTCGATAT
AGAACAGGTCAGTCACCGATCCATCTCCCTACGCCCTTCTCATTTCTTATTACAAGGCTC
TCTGACTTGTGGCAAGAAGAGGCTCTAACGCTGTCATGGAAGAGAAAAGGAAGTTTTTTT
CCTGGTTCAGACAACAGGTGGTTGATCGTTTCAGGTTCTGTTATTATTGTCTTATACTTA
CATGTTGAAAGTACGCTGACAATTATTCTCTTAGTAGAAAAGCAACAGGTATCGTCTTTG
GTTATTACTCTGGTTTCCGTAGGGCGAAGAGGAGAAGAGAAAAAAAAAGGCAGGCCTCAA
ATTTATCCTCTTTGAAAAAAGTTTAACAACCAACCAATCAAGACAGGAGAAACAACAGGG
TTTTCTAATGGCAGCCATGAACTCCAATGTTCTCACATATTGTAGCTACGTAATCTCTGA
TGCTAACTCAGCAGAGCTGAACCAGAGAGCGGGTTTAGTGAATTCATCAGTTGGGTTTGG
TCAGAAGAAACTACAGTTCCTGTTATCAAAGCTGCTCAAAAAGAGTTGGTGGTAATGAGG
TTAGTGGAAGAAGATCTGCCATGGTTATCTTAGCTGCTACACTCTTCTCCTCTGCTTCCG
CTAATGCTTGGGTCGTTGATGATTACCATGAGAAGAGCAAAGTGAACAAAACTGCTGTCC
AAAAAAAAAAGAAGAGCAAAGCAAACTAAGAGTATATATTAAGAGTATCATTTTTCGTTT
TGATTATCTACCTAAATTTGGTTTGTAGAACCCAATGTTTTGTGTGACTACATTTGAAGC
TATATAAAACAATGTTTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D071TF U 1
AF RS1D071JQ C 360
BS 1 415 RS1D071TF
BS 416 1040 RS1D071JQ

RD RS1D071TF 415 0 0
GGGAGAAACAGAGTGGTCCTTTGGGATTCCATAAGCAAGGAAGAGCGATTATTGGAATCT
CTTAATCCGCCATGGCTTCGTCGGCGCTCTCTAATCTGATGCTTACCATTGATTAAAAGA
AAACGAACTACTCGATCACTACCGTCCTCTCTGCAATTACATTGCTTTCACTTCCTCTGA
CCGCGAACCTCAGCTTCTAGAAGACGATCAAGAAACCCTAAAGAGCCTCTGCTTCGATAT
AGAACAGGTCAGTCACCGATCCATCTCCCTACGCCCTTCTCATTTCTTATTACAAGGCTC
TCTGACTTGTGGCAAGAAGAGGCTCTAACGCTGTCATGGAAGAGAAAAGGAAGTTTTTTT
CCTGGTTCAGACAACAGGTGGTTGATCGTTTCAGGTTCTGTTATTATTGTCTTAT

QA 1 415 1 415
DS 

RD RS1D071JQ 681 0 0
TCCTGGTTCAGACAACAGGTGGTTGATCGTTTCAGGTTCTGTTATTATTGTCTTATACTT
ACATGTTGAAAGTACGCTGACAATTATTCTCTTAGTAGAAAAGCAACAGGTATCGTCTTT
GGTTATTACTCTGGTTTCCGTAGGGCGAAGAGGAGAAGAGAAAAAAAAAGGCAGGCCTCA
AATTTATCCTCTTTGAAAAAAGTTTAACAACCAACCAATCAAGACAGGAGAAACAACAGG
GTTTTCTAATGGCAGCCATGAACTCCAATGTTCTCACATATTGTAGCTACGTAATCTCTG
ATGCTAACTCAGCAGAGCTGAACCAGAGAGCGGGTTTAGTGAATTCATCAGTTGGGTTTG
GTCAGAAGAAACTACAGTTCCTGTTATCAAAGCTGCTCAAAAAGAGTTGGTGGTAATGAG
GTTAGTGGAAGAAGATCTGCCATGGTTATCTTAGCTGCTACACTCTTCTCCTCTGCTTCC
GCTAATGCTTGGGTCGTTGATGATTACCATGAGAAGAGCAAAGTGAACAAAACTGCTGTC
CAAAAAAAAAAGAAGAGCAAAGCAAACTAAGAGTATATATTAAGAGTATCATTTTTCGTT
TTGATTATCTACCTAAATTTGGTTTGTAGAACCCAATGTTTTGTGTGACTACATTTGAAG
CTATATAAAACAATGTTTCAC

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 3

CO CL4002Contig1 777 3 1 U
GCGATAAACCAAAATACTCTGCAGGTTTTATTGAACTGATTGTTACAATTGAGTTTGCTA
CATACATAAACGCATTAAGGTAAACTAATGAGAAGAGGATTGAATATGAGAGCTAAAACT
CTATTACTCAATCAGATTTAGCCTTAGGTTTCTCTTGTTCTTCGGTGAGAGGCTTAAACA
CGACATTGAAGAACCAAACAGCAAGCAATGTCGCCTTTATAGGTCCAAGCCAATACACAA
GTAAATGCTCCTGTGTTATATGCTCACCGCGTGCATAAGCCCATCCCATAACCGCTGCTG
GATTCATGCATCCGCCGGTTAGATCAGCTCCAAGAACATGGAGACTTAATTTAGCAATGC
TACCAATCCAAGTCTTCATGAAGAAACTTCCAGGGATCTTTCTTGCTAGTCCCAGTGAGA
GCATTACAATGAAGAATGTTAGTACCCCCTCGGTTAAAGCACCGTGATGGATCGCTACAT
TTAGTTTTGGTCCTTTCCCAATCTCAGGGAAAACATGGATGATATGTTTAACCCCAAGGA
TTGATCCCATCACCTCAACGGGTATTCGAACCAGGACGGTGAAGATGAAACTACCGAAGC
CACCGGTGACACCGGCAGCCAAAGCGGTCAAAAGGTTGTAAAGTCCGCCTTTGGTGAGTT
TCTGAAGGAAAGCGAAGACGAACATGGAGATGACGGAGAATAGATACCGGACGATCTCGC
CGGTGGTGTCTTTCCGGCTGAATCCGAGTACTCAGTGAACTAAGATGTTGACAAGAA


BQ
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AF RS1GK10JQ U 15
AF RS1GK10TF C 15
AF RS1FT94JQ U 1
BS 1 777 RS1FT94JQ

RD RS1GK10JQ 313 0 0
G
ACTCTGCAGGTTTTATTGAACTGATTGTTACAATTGAGTTTGCTACATACATAAACGCAT
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AAACAGCAAGCAATGTCGCCTTTATAGGTCCAAGCCAATACACAAGTAAATGCTCCTGTG
TTATATGCTCACCGCGTGCATAAGCCCATCCCATAACCGCTGCTGGATTCATGCATCCGC
CGGTTAGATCA
C

QA 2 312 2 312
DS 

RD RS1GK10TF 313 0 0
G
ACTCTGCAGGTTTTATTGAACTGATTGTTACAATTGAGTTTGCTACATACATAAACGCAT
TAAGGTAAACTAATGAGAAGAGGATTGAATATGAGAGCTAAAACTCTATTACTCAATCAG
ATTTAGCCTTAGGTTTCTCTTGTTCTTCGGTGAGAGGCTTAAACACGACATTGAAGAACC
AAACAGCAAGCAATGTCGCCTTTATAGGTCCAAGCCAATACACAAGTAAATGCTCCTGTG
TTATATGCTCACCGCGTGCATAAGCCCATCCCATAACCGCTGCTGGATTCATGCATCCGC
CGGTTAGATCA
C

QA 2 312 2 312
DS 

RD RS1FT94JQ 777 0 0
GCGATAAACCAAAATACTCTGCAGGTTTTATTGAACTGATTGTTACAATTGAGTTTGCTA
CATACATAAACGCATTAAGGTAAACTAATGAGAAGAGGATTGAATATGAGAGCTAAAACT
CTATTACTCAATCAGATTTAGCCTTAGGTTTCTCTTGTTCTTCGGTGAGAGGCTTAAACA
CGACATTGAAGAACCAAACAGCAAGCAATGTCGCCTTTATAGGTCCAAGCCAATACACAA
GTAAATGCTCCTGTGTTATATGCTCACCGCGTGCATAAGCCCATCCCATAACCGCTGCTG
GATTCATGCATCCGCCGGTTAGATCAGCTCCAAGAACATGGAGACTTAATTTAGCAATGC
TACCAATCCAAGTCTTCATGAAGAAACTTCCAGGGATCTTTCTTGCTAGTCCCAGTGAGA
GCATTACAATGAAGAATGTTAGTACCCCCTCGGTTAAAGCACCGTGATGGATCGCTACAT
TTAGTTTTGGTCCTTTCCCAATCTCAGGGAAAACATGGATGATATGTTTAACCCCAAGGA
TTGATCCCATCACCTCAACGGGTATTCGAACCAGGACGGTGAAGATGAAACTACCGAAGC
CACCGGTGACACCGGCAGCCAAAGCGGTCAAAAGGTTGTAAAGTCCGCCTTTGGTGAGTT
TCTGAAGGAAAGCGAAGACGAACATGGAGATGACGGAGAATAGATACCGGACGATCTCGC
CGGTGGTGTCTTTCCGGCTGAATCCGAGTACTCAGTGAACTAAGATGTTGACAAGAA

QA 1 777 1 777
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL4004Contig1 1184 3 13 U
GGCTCTCTCTCTCTCTGAGCTTTCCATGAAAAGCGTCGGGAAAATGGGGAAATACATAAA
GAAGAGCAAACTCGACGGAGGAGAATCTCTATCTCTAATGGACGTCTCTCCTTCTCCCCT
CGGTGTCCTCACTCGAGCTAAATCCCTAGCTCTCCAGCGCCGCCTTCAAAAACCCTCCTC
GCCTTCTTCCCCCTCGCCGTCGAAACAGAAGACGACGGCGGATTGCGGCGGAGGCTCGTA
TCTTCAGCTAAGGAGTCGTCGGCTACAGAAGAAGCCGCCGATTGTAGTGATTCGTCGGAG
GAAGAAGCAGCGGAGGGTCCGAAACCCTAATTCCCAAAATCAGGATTCGGGTCGTGGGTC
TGGTGGTGGTGACGGGTCTAGGTCGGATTCGGTTGCTGAGAGTGCTGTGTGTGGTAAAGC
TAAGGACTTTAATGGTGAAATCAACATGGATGAGCTTCATGACAGTGAAAGGACCACAAG
GGAATCCACGCCATGCAGTTTGATGAGAAAACCGGAAACCGTCACAAGCCCGGGTTCATC
TCCGAAGCTTAACAATGATGTAAGTGACAACAGCAACGAGAGAGAAGAGAGTTTGTCGGG
AAGCCGTGGTCACCTACCGACCACACCTGAAATGGATGAGTTCTTCTCTGGTGCTGAAGA
AGAACAACAAAAGCAATTCATTGACAAGTACAACTTTGATCCTGTGAACGAACAACCACT
ACCAGGACGGTTTGAATGGAAGAAGTTAGATGATTAGAGACAACAAAACGATAGGGTGGT
GGGGGTGTTAATAGTTAACAAGTCTATATTAACATTTTCCTGCTAATTATCGGTTTGATC
TTTTATTTCCATCATCCGTTCCTTTAACTTGTAAAGAACTTAGGACCAAAAAAACCCATG
TAGCGTTGTGTCTGTAACATAAGTGGCTGAGAAGGGTTTGTGTAACACACAACTGATACC
AATCCTTTTCAGTTCTAAACAGATCACCTTAGTAGTAGTAGTAGTACTAAACCATAAGTG
GGAGGTTAACCCAAAGTCTGTTGGGGTTTAGCGTTTAGGGGTTTAGAGTTCTTTCGGTTA
ATGGTTTAGTGGTCTTTTCATAACTCTTTGTCTTGTATCCATTTGTGGTGTATACATGTA
CTGATCTGAAAACTCATTTCAATAAAGACTTATCCTTCTCTGTC


BQ
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25 25 25 25 25 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C313TF U 1
AF RS1AU83TF U 58
AF RS1AU83JQ C 338
BS 1 202 RS1C313TF
BS 203 203 RS1AU83TF
BS 204 461 RS1C313TF
BS 462 462 RS1AU83TF
BS 463 513 RS1C313TF
BS 514 515 RS1AU83TF
BS 516 703 RS1C313TF
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BS 730 730 RS1AU83JQ
BS 731 746 RS1AU83TF
BS 747 1184 RS1AU83JQ

RD RS1C313TF 725 0 0
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GAAGAGCAAACTCGACGGAGGAGAATCTCTATCTCTAATGGACGTCTCTCCTTCTCCCCT
CGGTGTCCTCACTCGAGCTAAATCCCTAGCTCTCCAGCGCCGCCTTCAAAAACCCTCCTC
GCCTTCTTCCCCCTCGCCGTCGTAACAGAAGACGACGGCGGATTGCGGCGGAGGCTCGTA
TCTTCAGCTAAGGAGTCGTCGGCTACAGAAGAAGCCGCCGATTGTAGTGATTCGTCGGAG
GAAGAAGCAGCGGAGGGTCCGAAACCCTAATTCCCAAAATCAGGATTCGGGTCGTGGGTC
TGGTGGTGGTGACGGGTCTAGGTCGGATTCGGTTGCTGAGAGTGCTGTGTGTGGTAAAGC
TAAGGACTTTAATGGTGAAATCAACATGGATGAGCTTCATGGCAGTGAAAGGACCACAAG
GGAATCCACGCCATGCAGTTTGATGAGAAAACCA*AAACCGTCACAAGCCCGGGTTCATC
TCCGAAGCTTAACAATGATGTAAGTGACAACAGCAACGAGAGAGAAGAGAGTTTGTCGGG
AAGCCGTGGTCACCTACCGACCACACCTGAAATGGATGAGTTCTTCTCTGGTGCTGAAGA
AGAACAACAAAAGCAATTCATTGACAAGTACAACTTTGATCCTTTGAACGAACAACCACT
ACCAG

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1AU83TF 702 0 0
G
AAGAAGAGCAAACTCGACGGAGGAGAATCTCTATCTCTAATGGACGTCTCTCCTTCTCCC
CTCGGTGTCCTCACTCGAGCTAAATCCCTAGCTCTCCAGCGCCGCCTTCAAAAACCCTCC
TCGCCTTCTTCCCCCTCGCCGTCGAAACAGAAGACGACGGCGGATTGCGGCGGAGGCTCG
TATCTTCAGCTAAGGAGTCGTCGGCTACAGAAGAAGCCGCCGATTGTAGTGATTCGTCGG
AGGAAGAAGCAGCGGAGGGTCCGAAACCCTAATTCCCAAAATCAGGATTCGGGTCGTGGG
TCTGGTGGTGGTGACGGGTCTAGGTCGGATTCGGTTGCTGAGAGTGCTGTGTGTGGTAAA
GCTAAGGACTTTAATGGTGAAATCAACATGGATGAGCTTCATGACAGTGAAAGGACCACA
AGGGAATCCACGCCATGCAGTTTGATGAGAAAACCGGAAACCGTCACAAGCCCGGGTTCA
TCTCCGAAGCTTAACAATGATGTAAGTGACAACAGCAACGAGAGAGAAGAGAGTTTGTCG
GGAAGCCGTGGTCACCTACCGACCACACCTGAAATGGATGAGTTCTTCTCTGGTGCTGAA
GAAGA*CAACAAAAGCAATTCATTGACAAGTACAACTTTGATCCTGTGAACGAACA*CCA
CTACCAGGACG*TTTGAATGGAAGAAGT
AGATGATAGAGAC

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DS 

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GAGAGTGCTGTGTGTG*TAAAGCTAAGGACTTTAATGGTGAAATCAACATGGATGAGCTT
CATGACAGTGAAAGGACCACAAGGGAATCCACGCCATGCAGTTTGATGAGAAAACCGGAA
ACCGTCACAAGCCCGGGTTCATCTCCGAAGCTTAACAATGATGTAAGTGACAACAGCAAC
GAGAGAGAAGAGAGTTTGTCGGGAAGCCGTGGTCACCTACCGACCACACCTGAAATGGAT
GAGTTCTTCTCTGGTGCTGAAGAAGAACAACAAAAGCAATTCATTGACAAGTACAACTTT
GATCCTGTGAACGAACAACCACTACCAGGACGGTTTGAATGGAAGAAGTTAGATGATTAG
AGACAACAAAACGATAGGGTGGTGGGGGTGTTAATAGTTAACAAGTCTATATTAACATTT
TCCTGCTAATTATCGGTTTGATCTTTTATTTCCATCATCCGTTCCTTTAACTTGTAAAGA
ACTTAGGACCAAAAAAACCCATGTAGCGTTGTGTCTGTAACATAAGTGGCTGAGAAGGGT
TTGTGTAACACACAACTGATACCAATCCTTTTCAGTTCTAAACAGATCACCTTAGTAGTA
GTAGTAGTACTAAACCATAAGTGGGAGGTTAACCCAAAGTCTGTTGGGGTTTAGCGTTTA
GGGGTTTAGAGTTCTTTCGGTTAATGGTTTAGTGGTCTTTTCATAACTCTTTGTCTTGTA
TCCATTTGTGGTGTATACATGTACTGATCTGAAAACTCATTTCAATAAAGACTTATCCTT
CTCTGTC

QA 1 847 1 847
DS 



AS 1 3

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GTTGTTCGATCCATGGCCAGTGTTCTCCAAGAGGGAGTGGAAACGTACTTGGCCGTTTCT
CACCGGATTCGCCGTAACAGGCGTCCTCATCACCAAGCTCACCGCTGGATTCACTGAGGA
AGACGCCAAGAACTCCAAGTTCGTCCAACAACACAGGCGGTGATCGACTGATGTGAAATC
TACTTCGAAGAGTGCTTCTGGCTTTCAAACTTTATTCTAATAAACATAAAAAGAGAGAAT
CCTACATACTTGTTCTGTGATCTCTCGTTTCCTTTCATTTTTTTTGTCTTTTTCACAACT
CTCTAAACAGTGCAAGTTTGAAATGGATTGGTTCCAATCTTTTTCCCCATATGTTTGAAA
TGGATTTCGATTTCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 
25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FI87JQ C 16
AF RS1FI87TF U 16
AF RS1AU35TF U 1
BS 1 86 RS1AU35TF
BS 87 87 RS1FI87TF
BS 88 437 RS1AU35TF

RD RS1FI87JQ 236 0 0
GG
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CAGGGGTCCTCATCACCAAGCTCACCGCTGGATTCACTGAGGAAGACGCCAAGAACTCCA
AGTTCGTCCAACAACACAGGCGGTGATCGACTGATGTGAAATTTACTTCGAAGA

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DS 

RD RS1FI87TF 386 0 0
GG
ACCAACATTTCGAGAGAGAGAGAGAGATTTTGAGAGAGATGAGGTTGTTCGATCCATGGC
CAGTGTTCTCCAAGAGGGAGTGGAAACGTACTTGGCCGTTTCTCACCGGATTCGCCGTAA
CAGGCGTCCTCATCACCAAGCTCACCGCTGGATTCACTGAGGAAGACGCCAAGAACTCCA
AGTTCGTCCAACAACACAGGCGGTGATCGACTGATGTGAAATCTACTTCGAAGAGTGCTT
CTGGCTTTCAAACTTTATTCTAATAAACATAAAAAGAGAGAATCCTACATACTTGTTCTG
TGATCTCTCGTTTCCTTTCATTTTTTT*GTCTTTTTCACAACTCTCTAAACAGTGCAAGT
TTGAAATGGATTGGTTCCAATCTT

QA 3 386 3 386
DS 

RD RS1AU35TF 437 0 0
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CACCGGATTCGCCGTAACAGGCGTCCTCATCACCAAGCTCACCGCTGGATTCACTGAGGA
AGACGCCAAGAACTCCAAGTTCGTCCAACAACACAGGCGGTGATCGACTGATGTGAAATC
TACTTCGAAGAGTGCTTCTGGCTTTCAAACTTTATTCTAATAAACATAAAAAGAGAGAAT
CCTACATACTTGTTCTGTGATCTCTCGTTTCCTTTCATTTTTTTTGTCTTTTTCACAACT
CTCTAAACAGTGCAAGTTTGAAATGGATTGGTTCCAATCTTTTTCCCCATATGTTTGAAA
TGGATTTCGATTTCTCT

QA 1 437 1 437
DS 



AS 1 3

CO CL4006Contig1 1144 3 8 U
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GTTCCAAGAAGCTCTTCTGTTTCCTTATGGTCGTTGACGAGGTCTCTCTAGATTTCTTAA
GATCCAACACTAGTGTGAGTCAAGATGTTCAAGGAGGCCGTTGGGTTGGCATTTGGCGTC
TTATCCTACTCAAAACTCCTCCTTATGATGAACCTAGGAGGAACGGTAAAGTCCCCAAAA
TCTTAACTCACCGCTTATTCCCTCAAGCACGCTACAGCATTTGGATTGATGCCAAAATGG
AGCTTATCCTTGATCCCTTGCTCATTTTAGAAAGGTATTTGTGGCGTGGGAAGCATACCT
TTGCCATTGCTCAACACAAACATCACCGAAACATATATGAGGAAGCTGATGCGTGTAAGA
GGAGAAAGCGTTATGCCCGACCTCTCGTTGATCTTCACATGAAAATTTATCGGTTCGAGG
GTTTAGAACCATGGAGCATCAAGAAGAGCACTGTTAGTGATGTTCCAGAGGGAGCGGTGA
TAATAAGAGAACACACTGCAATGAACAATCTGTTCAGCTGCCTGTGGTTCAACGAGGTAC
ACCTGTTAACACCGAGGGACCAGCTTAGCTTTGGGTACGTAGTGGACAGACTAAAAGGAG
CCTTCAAGGTGTTCATGTTTCAGAACTGTGAGTACAACTCTCTCTTTGAACTGCACCCTC
ACATCAGAGAACATTCCTCAAAGATAGAGTGGGTCAAGAGTCTAAAGGAACTGAAAGGGA
AAGGAGAGAGTTTGAAGGAGAGCAGAGGAGGCTTTGGGCTATGGACTCCATACCCTGGGG
ATCTCGATTCCGTTGAGCTGCCAAAGGTAGTAAGAACTTCTAAAGCTGGTTGATAGAGCC
CAAGAAACGTTTGAGCGTGTGCTTCTCTGGGGATGAGGATGGGGTGCTTAAATTCCAAAT
TTTTACAAGCTTTGTTAAAAACATGCACACTTCTTTTTAAAAACCATTTTTGTAGATTCA
ACAGTGTAAAAGAAAGAAAACATGATTAGCATAGCTCAAGGGGTTTAAATACATTTTGGA
GAGCGCTGCTACTCCGACCACGGCTTTCATGGGCCTGACGTCTAACTGAATGTGTCCAAT
TAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 

AF RS1E488TF U 1
AF RS1E488JQ C 354
AF RS1C442TF U 466
BS 1 657 RS1E488TF
BS 658 658 RS1C442TF
BS 659 734 RS1E488TF
BS 735 781 RS1C442TF
BS 782 782 RS1E488JQ
BS 783 946 RS1C442TF
BS 947 947 RS1E488JQ
BS 948 1144 RS1C442TF

RD RS1E488TF 737 0 0
GTGCCACTGGGATTTTCGATGCTTATGATCAACCTCACCAGCCTTCTAACATTAGCGACC
GTTCCAAGAAGCTCTTCTGTTTCCTTATGGTCGTTGACGAGGTCTCTCTAGATTTCTTAA
GATCCAACACTAGTGTGAGTCAAGATGTTCAAGGAGGCCGTTGGGTTGGCATTTGGCGTC
TTATCCTACTCAAAACTCCTCCTTATGATGAACCTAGGAGGAACGGTAAAGTCCCCAAAA
TCTTAACTCACCGCTTATTCCCTCAAGCACGCTACAGCATTTGGATTGATGCCAAAATGG
AGCTTATCCTTGATCCCTTGCTCATTTTAGAAAGGTATTTGTGGCGTGGGAAGCATACCT
TTGCCATTGCTCAACACAAACATCACCGAAACATATATGAGGAAGCTGATGCGTGTAAGA
GGAGAAAGCGTTATGCCCGACCTCTCGTTGATCTTCACATGAAAATTTATCGGTTCGAGG
GTTTAGAACCATGGAGCATCAAGAAGAGCACTGTTAGTGATGTTCCAGAGGGAGCGGTGA
TAATAAGAGAACACACTGCAATGAACAATCTGTTCAGCTGCCTGTGGTTCAACGAGGTAC
ACCTGTTAACACCGAGGGACCAGCTTAGCTTTGGGTACGTAGTGGACAGACTAAAAG*AG
CCTTCAAGGTGTTCATGTTTCAGAACTGTGAGTACAACTCTCTCTTTGAACTGCACCCTC
ACATCAGAGAACAT
CCT

QA 1 734 1 734
DS 

RD RS1E488JQ 770 0 0
CATACCTTTGCCATTGCTCAACACAAACATCACCGAAACATATATGAGGAAGCTGATGCG
TGTAAGAGGAGAAAGCGTTATGCCCGACCTCTCGTTGATCTTCACATGAAAATTTATCGG
TTCGAGGGTTTAGAACCATGGAGCATCAAGAAGAGCACTGTTAGTGATGTTCCAGAGGGA
GCGGTGATAATAAGAGAACACACTGCAATGAACAATCTGTTCAGCTGCCTGTGGTTCAAC
GAGGTACACCTGTTAACACCGAGGGACCAGCTTAGCTTTGGGTACGTAGTGGACAGACTA
AAAGGAGCCTTCAAGGTGTTCATGTTTCAGAACTGTGAGTACAACTCTCTCTTTGAACTG
CACCCTCACATCAGAGAACATTCCTCAAAGATAGAGTGGGTCAAGAGTCTAAAGGAACTG
AAAGGGAAAGGAGAGAGTTTGAAGGAGAGCAGAGGAGGCTTTGGGCTATGGACTCCATAC
CCTGGGGATCTCGATTCCGTTGAGCTGCCAAAGGTAGTAAGAACTTCTAAAGCTGGTTGA
TAGAGCCCAAGAAACGTTTGAGCGTGTGCTTCTCTGGGGATGAGGATGGGGTGCTTAAAT
TCCAAATTTTTACAAGCTTTGTTAAAAACATGCACACTTCTTTTTAAAAACCATTTTTGT
AGATTCAACAGTGTAAAAGAAAGAAAACATGATTAGCATAGCTCAAGGGGTTTAAATACA
TTTTGGAGAGCGCTGCTACTCCGACCACGGCTTTCATGG
CCTGGACGTCT

QA 1 759 1 759
DS 

RD RS1C442TF 679 0 0
G
TTATCGGTTCGAGGGTTTAGAACCATGGAGCATCAAGAAGAGCACTGTTAGTGATGTTCC
AGAGGGAGCGGTGATAATAAGAGAACACACTGCAATGAACAATCTGTTCAGCTGCCTGTG
GTTCAACGAGGTACACCTGTTAACACCGAGGGACCAGCTTAGCTTTGGGTACGTAGTGGA
CAGACTAAAAGGAGCCTTCAAGGTGTTCATGTTTCAGAACTGTGAGTACAACTCTCTCTT
TGAATTGCACCCTCACATCAGAGAACATTCCTCAAAGATAGAGTGGGTCAAGAGTCTAAA
GGAACTGAAAGGGAAGGGAGAGAGTTTGAAGGAGAGCAGAGGAGGCTTTGGGCTATGGAC
TCCATACCCTGGGGATCTCGATTCCGTTGAGCTGCCAAAGGTAGTAAGAACTTCTAAAGC
TGGTTGATAGAGCCCAAGAAACGTTTGAGCGTGTGCTTCTCTGGGGATGAGGATGGGGTG
TTTAAATTCCAAATTTTTACAAGCTTTGTTAAAAACATGCACACTTCTTTTTAAAAACCA
TTTTTGTAGATTCAACAGTGTAAAAGAAAGAAAACATGATTAGCATAGCTCAAGGGGTTT
AAATACATTTTGGAGAGCGCTGCTACTCCGACCACGGCTTTCATGGGCCTGACGTCTAAC
TGAATGTGTCCAATTAGC

QA 2 679 2 679
DS 



AS 1 3

CO CL4007Contig1 863 3 6 U
GCCATATTGAATAAGCCTCTTCTATTAGAAGTTCGGTTGGTATAATAGACATTAAAATAG
CTCAATCCACTGACCCATATGGGCCCAAACTTGGACGCGTTATTAGTTCTCAGACGCAGT
TCCGGCCCGAAGCAACTCGGAAATTCTATTCAAGCTCCAGCTCTCTTCAGCTGCCTCAAA
CCAAGACACAGATACTTATGCTAGTAAAAATGAAACATCCAATACATTAAAAAGAAAAAA
CTTGAAAAACTATATCATCCATAGGTTCTTTCACTTCAACGAACAATACTTTTACTACAA
TCTTATTAACTAGGAAACTTATCATCAACAAGATGAGCCAACCAGGTCACAGATGTATAA
AACAATCTGAAACAGAAAAGAAAGCTTACCATGTCTTCCTTCATATGAACTTCACCGGGG
GAAAGCAACTCTCCTGAATCTGATACCATAAGCGATGAGATAACTAAGACTACGCCTAAT
AAGACAAGCACATTTTGACATATACATCATATAGAGAGAGCTTCAGAAATCCATCACTAA
AACGACTGTCAAAGTAATCATATCATATGGTGGTTCCTTGTTCTCCAATAGAATCATTCT
CTGATGCATCTTCAACCTTCTCAATCGCCATCTCATTTCCCTTACTCTGATCCATACCAA
CCATAACCGGATTGGCTTCCTCGCATTGTTCAAAACCCTTTTCACCCTGTTCCTTACCAA
TAGTATGTTGGGTCTCTTTTGCTTCATCCGCTTTGCTCTTGCTGTCATTATTTTCTTTCG
CCCCAACATCCTGCATACAAACGTATTCTGCAACAACAAGATTCTCCTTTGTATCCCCAC
TAGTACGTGCATCAGACCCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FM26JQ U 1
AF RS1FM26TF C 132
AF RS1G196JQ U 442
BS 1 248 RS1FM26JQ
BS 249 249 RS1FM26TF
BS 250 421 RS1FM26JQ
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BS 442 852 RS1G196JQ
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RD RS1FM26JQ 421 0 0
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CTCAATCCACTGACCCATATGGGCCCAAACTTGGACGCGTTATTAGTTCTCAGACGCAGT
TCCGGCCCGAAGCAACTCGGAAATTCTATTCAAGCTCCAGCTCTCTTCAGCTGCCTCAAA
CCAAGACACAGATACTTATGCTAGTAAAAATGAAACATCCAATACATTAAAAAGAAAAAA
CTTGAAAA*CTATATCATCCATAGGTTCTTTCACTTCAACGAACAATACTTTTACTACAA
TCTTATTAACTAGGAAACTTATCATCAACAAGATGAGCCAACCAGGTCACAGATGTATAA
AACAATCTGAAACAGAAAAGAAAGCTTACCATGTCTTCCTTCATATGAACTTCACCGGGG
G

QA 1 421 1 421
DS 

RD RS1FM26TF 732 0 0
GCAACTCGGAGATTCTATTCAAGCTCCAGCTCTCT*CAGCTGCCTCAAACCAAGACACAG
ATACTTATGCTAGTAAAAATGAAACATCCAATACATTAAAAAGAAGAAACTTGAAAAACT
ATATCATCCATAGGTTCTTTCACTTCAACGAACAATACTTTTACTACAATCTTATTAACT
AGGAAACTTATCATCAACAAGATGAGCCAACCAGGTCACAGATGTATAAAACAATCTGAA
ACAGAAAAGAAAGCTTACCATGTCTTCCTTCATATGAACTTCACCGGGGGAAAGCAACTC
TCCTGAATCTGATACCATAAGCGATGAGATAACTAAGACTACGCCTAATAAGACAAGCAC
ATTTTGACATATACATCATATAGAGAGAGCTTCAGAGATCCATCACTAAAACGACTGTCA
AAGTAATCATATCATATGGTGGTTCCTTGTTCTCCAATAGAATCATTCTCTGATGCATCT
TCAACCTTCTCAATCGCCATCTCATTTCCCTTACTCTGATCCATACCAACCATAACCGGA
TTGGCTTCCTCGCATTGTTCAAAACCCTTTTCACCCTGTTCCTTACCAATAGTATGTTGG
GTCTCTTTTGCTTCATCCGCTTTGCTCTTGCTGTCATTATTTTCTTTCGCCCCAACATCC
TGCATACAAACGTCTTCTGCAACAACAAGATTCTCCTTTGTATCCCCACTAGTACGTGCA
TCAGACCCTCCC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1G196JQ 411 0 0
GATACCATAAGCGATGAGATAACTAAGACTACGCCTAATAAGACAAGCACATTTTGACAT
ATACATCATATAGAGAGAGCTTCAGAAATCCATCACTAAAACGACTGTCAAAGTAATCAT
ATCATATGGTGGTTCCTTGTTCTCCAATAGAATCATTCTCTGATGCATCTTCAACCTTCT
CAATCGCCATCTCATTTCCCTTACTCTGATCCATACCAACCATAACCGGATTGGCTTCCT
CGCATTGTTCAAAACCCTTTTCACCCTGTTCCTTACCAATAGTATGTTGGGTCTCTTTTG
CTTCATCCGCTTTGCTCTTGCTGTCATTATTTTCTTTCGCCCCAACATCCTGCATACAAA
CGTATTCTGCAACAACAAGATTCTCCTTTGTATCCCCACTAGTACGTGCAT

QA 1 411 1 411
DS 



AS 1 3

CO CL4008Contig1 1132 3 7 U
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GATGAAGCGAATCTGTGGTATCAAGAACCTCCTCCTCTCCCTAAGAGGAAGCTCGAACCA
CCTGTCTATTCTCCTCCACCTTCACCCGTGAAAGAAGAAGAAGCTTATTCCTCCGAAGAA
GACATGGATCCGGTCGAACGAGAAAAGTATCGCCTTCAAACTGTGGAGTCTTGTGGTTTC
GATGTTGACTTCTACAACCATATATTTAACGGGATAGTTCCCAGCGGATGCACTCATTAC
GACACACTCTTTGCAAAGGCAGGACTCCATTGTCACAATCTTGAAAAGGGGAAGAAGTAC
CAGCTGAAGCGTGTAGTTAAAGTGAACGCTGAAATCGCTTCGCTTTACAACTCCTATTCG
ACATCAGAGGTGATAGACCCTGTAGACAACTCACTGCACACTTTCCAAACCATGGTCACG
GATGCAGGGAAGGCGAAGAAGGCAAGCTTGATACTGTTGACTAAAATTTGCAGAATCAAG
CCTCAAGTACCAGGCCTTGGAGATGCAACTGTGTTTTGGGACTTTAATGCTATAGATGAC
TTCTATAAAACTGATATGCCTGATTGGCCTTTCAATGATGGTCTTGATAACCCACACCTT
GTTGAGGTGAAAGAATCTGAGTTGCTAGACAATGAATGGATTTATCTATATGCTGAAGCT
GCATTGTTCTCCGAATGGCGCTCCGAAATGAGTGATTATACGCCGTTTGAGATGAAGAGA
GTAATGGTACAAACGAAGGAAGACCATGTAGAGTCCAGTGTGAAGCTTAAGTCGAGCAAT
GCAATCTTCTACATGATTTTCAAGGTTCGTGGAGGTGGTCCCTTGTGTAGAGGCATAGTA
AGAAAAACAAGTGATGGAAAAACAGGACACTTGCGTCTCGAAGCTAGATGTTGGATCGAC
GACATGTCAAACTAATCGTGACTAGTAATCTTATATTCTTGTTACTTATTAGTTGATCTT
GCTATGTTTTAAGTCATGTAGCTAGTTAGCAATGCTTGTTTCTGTCCACTAGATTTGACT
TCTTTTATGTAAAATGATCTATATTTAAGATAAGCTTTTCTTGTTCATTTAT


BQ
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AF RS1H149TF U 1
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AF RS1EO56TF U 418
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GATGTTGACTTCTACAACCATATATTTAACGGGATAGTTCCCAGCGGATGCACTCATTAC
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TACTGTTGACTAAAATTTGCAGAATCAAGCCTCAAGTACCAGGCCTTGGAGATGCAACTG
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G
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CGGATGCAGGGAAGGCGAAGAAGGCAAGCTTGATACTGTTGACTAAAATTTGCAGAATCA
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CTTCTTTTATGTAAAATGATCTATATTTAAGATAAGCTTTTCTTGT

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DS 



AS 1 2

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CTACAATCTCCCGTCGATCGTTCCTACTCCTCTTCCTCCCGGTGTAGCTCCGATTCCAAT
CACTCCAATCCATCCCGTCTACTTGCCTACTACACAGTCCTCAACCGGAGATGTTCGGAC
GCTTTTCGTCGCCGGACTTCCCCAAGACGTCAAGCCCCGGGAGATCTACAATCTCTTCCG
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GGTGTTTGATCTTGAGAAGCATTCTACTCTTCACATTGATCTTGCTAAATCAAACCCTAA
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TCAGCTGCTCAGTGAAGCACTACATGCTCTTCAAGGACAGTGCTTTACTCATCCCT


BQ
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AF RS1AA46TF U 1
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GG
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TCCTCTTCCTCCCGGTGTAGCTCCGATTCCAATCACTCCAATCCATCCCGTCTACTTGCC
TACTACACAGTCCTCAACCGGAGATGTTCGGACGCTTTTCGTCGCCGGACTTCCCCAAGA
CGTCAAGCCCCGGGAGATCTACAATCTCTTCCGTGAGTTCCCAGGATACGAAACTTCGCA
TCTCCGTACCTCAGATGGAGCCAAGCCCTTTGCGTTTGCTGTGTTCTCGGATCTCCAATC
AGCTTTAGCGGTGATGCATGCCCTCAATGGAATGGTGTTTGATCTTGAGAAGCATTCTAC
TCTTCACATTGATCTTGCTAAATCAAACCCTAAATCTAAGCGTTCAAGAACAGATGATGG
CAGGGAGAGCTTGAAAAGGACCAAGTCTTGGAGCAACACTCCCGAGTCTGGTTTTGGCAG
CTTTCACACTCCTGGAATGAGTACTTCTTCTCACAACACTATTGGTTATTCACCTCCACA
AAGTAAAGGAGTTGCTAATGTTGCTGGGAGGGCAATGACTACTAGAAAATCTAATAATGC
TGCAGAACCTTGTCCAACACTTTTCATTGCAAATTTGGGAC*AAATTGCACTGAACCTGA
GTTAGTTCAAGTTTTCT
GAGTGCCG

QA 3 679 3 679
DS 

RD RS1AA46TF 836 0 0
GGCGTCTCCAGTTTCTGCCGGCGACTCGACAATGGATGAGTTGTCAGCTTACTACTCTCA
CTACAATCTCCCGTCGATCGTTCCTACTCCTCTTCCTCCTGGTGTAGCTCCGATTCCAAT
CCCTCCAATCCATCCCGTCTACTTGCCTACTACACAGTCCTCAACCGGAGATGTTCGGAC
GCTTTTCGTCGCCGGACTTCCCGAAGACGTCAAGCCCCGGGAGATCTACAATCTCTTCCG
TGAGTTCCCAGGATACGAAACTTCGCATCTCCGTACCTCAGATGGAGCCAAGCCCTTTGC
GTTTGCTGTGTTCTCGGATCTCCAATCAGCTTTAGCGGTGATGCATGCCCTCAATGGAAT
GGTGTTTGATCTTGATAAGCATTCTACTCTTCACATTGATCTTGCTAAATCAAACCCTAA
ATCTAAGCGTTCAAGAACAGATGATGGCAGGGAGAGCTTGAAAAAGACCAAGTCTTGGAG
CAACACTCCCGAGTCTGGTTTTGGCAGCTTTCACACTCCTGGAATGAGTAGTTCTGGTCA
CAACACTATTGGTTATTCACCTCCACAAAGTCAAGGAGTTGCTAATGTTGCTGGGAGGGC
AATGACTACTAGAAAATCTAATAATGCTGCAGAACCTTGTCCAACACTTTTCATTGCAAA
TTTGGGACCAAATTGCACTGAACCTGAGTTAGTTCAAGTTTTCTCGAGATGCCGTGGATT
CTTGAAGCTGAAATTCAGGCACATATGGGTACTTCTGTTGCATTTGTTGATTTTCAGATG
TCAGCTGCTCAGTGAAGCACTACATGCTCTTCAAGGACAGTGCTTTACTCATCCCT

QA 1 836 1 836
DS 



AS 1 3

CO CL4010Contig1 939 3 21 U
GGTCTCCACACCAAACCTCTCCTCTCTCTCCCTCTCTTCGCATCTCAAAGAACAAACAAC
AGAAAGAAAAACAAAAGAATAACAAGAAAATGGAGGACTCGACTAGAAAGCCTTATTTCA
TAGAAGAAGAAGACGATGGATTGGTTTCTCTAGCAGAGATGGAAGCTGGAGTTTCTTCTC
CTTCTTCTTGTTACAAAAACACGAACCAGTACCATCTTCAGAGTTATTATTATAATTA**
****CCATCAGTACTCTGTTTCATCACCCAGATCTGTTGTTGTCTCTGGAAAATTCCATG
ATTTTAGATTCGACAATAGCTGTTTCGGACAACAATCATCAGTTCCTCATTTCTTGGACT
CCTGTTTCCTCTGTAAGGAGCGTCTTGGTCATAACAAAGACATCTTCATGTACAGAGGAG
ACACACCGTTCTGTAGCGAGGTGTGTAGAGAAGAACAGATAAAGAGAGACGAGTCGAAAG
AGAAGAAAAAGAATCTGTCTTCATCTGTGAAAGCTATGAGAAGAAATGAAAAGAGAAGCT
CTTCTTCT******CCAACTAGATCTCGTGACTATGCTTTCCATTCTGGAACTGTCGCTG
CTGCTTAGTTTATAATATCTCTTTTAGTTAATATTCCATGGCAAAACAAAAACCAAGAAA
ATCCATTCAAGCCAATTGCCGTAAAAGTTGGTTAATGGTTTGAATTTAAAAACTCCTTTT
CAAGGGTTTGTCCTTTTTCGTTTTTATTAGATTTTATTTTGCATAAAGAAAAAAAAATCA
TGCAATTTTGGGAGTACAAGAAAACTGTGGCTAAACGTTTGCCTGTGTGAATTTGGTACA
TCTTTTTTTTGTTAATATGTGAAAAACAAAAATATATGTAATGTGAACATCATCATCAGC
CTGGCTGTTCTTTTATTTTTTAATGATGGAATTGTAGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GK62TF U 1
AF RS1EB59TF U 5
AF RS1EB59JQ C 185
BS 1 201 RS1GK62TF
BS 202 202 RS1EB59TF
BS 203 238 RS1GK62TF
BS 239 244 RS1EB59TF
BS 245 377 RS1GK62TF
BS 378 378 RS1EB59TF
BS 379 477 RS1GK62TF
BS 478 478 RS1EB59TF
BS 479 548 RS1GK62TF
BS 549 554 RS1EB59TF
BS 555 595 RS1GK62TF
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BS 597 611 RS1GK62TF
BS 612 613 RS1EB59TF
BS 614 627 RS1GK62TF
BS 628 685 RS1EB59TF
BS 686 686 RS1EB59JQ
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BS 712 712 RS1EB59JQ
BS 713 722 RS1EB59TF
BS 723 939 RS1EB59JQ

RD RS1GK62TF 627 0 0
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TAGAAGAAGAAGACGATGGATTGGTTTCTCTAGCAGAGATGGAAGCTGGAGTTTCTTCTC
CTTCTTCTTGTTACAAAAACATGAACCAGTACCATCTTCAGAGTTATTATTATAATTATA
ATTACCATCAGTACTCTGTTTCATCACCCAGATCTGTTGTTGTCTCTGGAAAATTCCATG
ATTTTAGATTCGACAATAGCTGTTTCGGACAACAATCATCAGTTCCTCATTTCTTGGACT
CCTGTTTCCTCTGTAAGAAGCGTCTTGGTCATAACAAAGACATCTTCATGTACAGAGGAG
ACACACCGTTCTGTAGCGAGGTGTGTAGAGAAGAACAGATAAAGAGAGACGAGTCGAGAG
AGAAGAAAAAGAATCTGTCTTCATCTGTGAAAGCTATGAGAAGAAATGAAAAGAGAAGCT
CTTCTTCTTCTTCTCCAACTAGATCTCGTGACTATGCTTTCCATTCTGGAACTGTTGCTG
CTGCTTAGTTTCCAATATCTCTTTTAG

QA 1 627 1 627
DS 

RD RS1EB59TF 718 0 0
GG
CACACCAAACCTCTCCTCTCTCTCCCTCTCTTCGCATCTCAAAGAACAAACAACAGAA*G
AAAAACAAAAGAATAACAAGAAAATGGAGGTCTCGACTAGAAAGCCTTATTTCATAGAAG
AAGAAGACGATGGATTGGTTTCTCTAGCAGAGATGGAAGCTGGAGTTTCTTCTCCTTCTT
CTTGTTACAAAAACACGAACCAGTACCATCTTCAGAGTTATTATTATAATTA******CC
ATCAGTACTCTGTTTCATCACCCAGATCTGTTGTTGTCTCTGGAAAATTCCATGATTTTA
GATTCGACAATAGCTGTTTCGGACAACAATCATCAGTTCCTCATTTCTTGGACTCCTGTT
TCCTCTGTAAGGAGCGTCTTGGTCATAACAAAGACATCTTCATGTACAGAGGAGACACAC
CGTTCTGTAGCGAGGTGTGTAGAGAAGAACAGATAAAGAGAGACGAGTCGAAAGAGAAGA
AAAAGAATCTGTCTTCATCTGTGAAAGCTATGAGAAGAAATGAAAAGAGAAGCTCTTCTT
CT******CCAACTAGATCTCGTGACTATGCTTTCCATTCTGGAACTGTCGCTGCTGCTT
AGTTTATAATATCTCTTTTAGTTAATATTCCATGGCAAAACAAAAACCAAGAAAATCCAT
TCAAGCCAATTGCCGTAAA*GTTGGTTAATGGTTTGAATTTAAAA*CTCCTTTTCA

QA 3 718 3 718
DS 

RD RS1EB59JQ 755 0 0
TTCTTGTTACAAAAACACGAACCAGTACCATCTTCAGAGTTATTATTATAATTA******
CCATCAGTACTCTGTTTCATCACCCAGATCTGTTGTTGTCTCTGGAAAATTCCATGATTT
TAGATTCGACAATAGCTGTTTCGGACAACAATCATCAGTTCCTCATTTCTTGGACTCCTG
TTTCCTCTGTAAGGAGCGTCTTGGTCATAACAAAGACATCTTCATGTACAGAGGAGACAC
ACCGTTCTGTAGCGAGGTGTGTAGAGAAGAACAGATAAAGAGAGACGAGTCGAAAGAGAA
GAAAAAGAATCTGTCTTCATCTGTGAAAGCTATGAGAAGAAATGAAAAGAGAAGCTCTTC
TTCT******CCAACTAGATCTCGTGACTATGCTTTCCATTCTGGAACTGTCGCTGCTGC
TTAGTTTATAATATCTCTTTTAGTTAATATTCCATGGCAAAACAAAAACCAAGAAAATCC
ATTCAAGCCAATTGCCGTAAAAGTTGGTTAATGGTTTGAATTTAAAAACTCCTTTTCAAG
GGTTTGTCCTTTTTCGTTTTTATTAGATTTTATTTTGCATAAAGAAAAAAAAATCATGCA
ATTTTGGGAGTACAAGAAAACTGTGGCTAAACGTTTGCCTGTGTGAATTTGGTACATCTT
TTTTTTGTTAATATGTGAAAAACAAAAATATATGTAATGTGAACATCATCATCAGCCTGG
CTGTTCTTTTATTTTTTAATGATGGAATTGTAGCG

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 3

CO CL4011Contig1 1967 3 3 U
GGACGGTGTGAGGACGGTGGTGTAATGGCCCAACACGGTGTTACTCCTCCGGCTGATGAT
GAAGAAGAACAAGTATGGAGCTGGGGGGCAGGAACGGACGGTCAACTAGGGACTGCCACG
CTGCAAGACGAGCATCTCCCGCAGCTTCTCTCACTGACGCCACTTGCTTCAGTATCAATG
CTCGCATGTGGCGGCGCTCACGTCATCGCCTTGACTTCTGGTGGTAAGGTGTTGACATGG
GGAAGGGGAAACTCAGGTCAATTAGGACATGGAGACATCCTCGACTCCTCTTTGCCTAAA
CCAGTATCTTTCTTCGACGACTATGTTGTAACTCAAGCCTCAGCTGGATGGAGCCACTCT
GCTTTTGTTTCAGATTCCGGTTGCCTATTCACATGTGACAATGGCTCATTTGGTCAGCTT
GGTCATAGTGATAACATGTCACTTTTCTCTCCAGCTAAAGTCTCTTACTTTGTCGATAAG
ACTGTGAAGATGGTAGCTTGTGGTATGCGCCACTCACTTGTCCTGTTCGCAGGGAATCAA
GTGTGCGGATTCGGTTCTGGAAAACGCGGACAGCTTGGTTTCTCATCAGACAAAACAAAG
TCACTAGTAAATCTTCCATGTGTTGTCTCTGGATTAGAAGATGTTGAGGTTGTTCGTATA
GCAGCTAATGGAGACCATAGTGCAGCTATCTCCGCTGATGGACAGATGTTCAGTTGGGGA
AGAGGATTCAGCGGCAGTCCTGATGTTCAAACCCCTCAGTGTTTGCCTTCATCTCTTTCT
TTCAGAGAAGTTGCTTTAGGATGGAATCATGCTCTGTTACTAACCGTGGATGGCCAAGTT
TTCAAGCTTGGTAACACTCTTGATAAACAATCCGAGAAGCAACAACTGCAAGTAAATTCC
TCTGAACCTCTCTTGGAGAAAGTTCCAGGCTTTGATGGAGTTAAAGTTGTGCAAATTGCA
GCTGGAGCAGAGCACTCTGCTGCTCTAACAGAGAATGGAGAAGTTCAGACATGGGGATGG
GGTGAACATGGTCAGCTAGGTATTGGAAACACCAATGATCAGAACAATCCTCAACTGGTG
AGACTGGGAAGTGTAGACAAGCGGAGGAAAGAGACCAAAGTATATTGCGGAAGTGGTTTT
ACCTATGTAGTAAGGCGAATACAACAGCTTTCCTCTTCATCATAGAAATGTATGTATCAT
ATCGTATGACATATCTAATGTGTAACACTGTACAATGCGGGAAGTCAATTGTTTGCTTTG
CTTTATTCTCGTCAGAGGAACATTGTCATTACAATGATTGAAAATTTTGAGATATACAGA
TTTTTTTTCTTCTTAATTTCTTGTTTTGTCAAGATTTAAAAACCTAGCTCTACTGCTTTC
CTTACTCTACATGAAAGTGAAATCCCAAAAGAAACTAAAACCCTACTGATTCAGCTCATG
CTCCATAGATGGTGGGATTAGCTCTAAAATGTTGTTGCCTTAGACCTCACGAGTCACGAG
ATGATGAGCAGATTGTTTTCATATCCATCACAAGTAACAATGGGTCGAAGCGGGTCCACT
TTCCACTGGCCATCAACTATGAACTTTATCTGGTACTTTCCAGGATATAGCTTCAGTGAC
AAAGAGAAGACTCCGTTCTGTGCTTTCTTCATTTTCCTCTGGGTTGACCAACCGTCAAAT
GAACCCGTTAGTAGAACTTCTGAGGCTGAGTTAGGCCACACTATGGATGCAGTCCGGAGT
AGCCGTAAAGCTCTCCTAGCATGATCTATTTTTCTCTGTTTCTCCCGTACAATCCTCTGT
GCGTCTATTATTGCCATAGACATCTTTCCTTCAAGAACAGCTAGCTTTGCCCTTGTAGAC
CGTAGCTTGTTCTGCGCATATATGATTTCATTCTCTTTGAACTCCCAATCATCATTGAGG
TTCTCCAAGTTCTCAGAATTTGTCTCACTATCCTTTCTTGCCACAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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ATGTATCATATCGTATGACATATCTAATGTGTAACACTGTACAATGCGGGAAGTCAATTG
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ATATACAGATTTTTTTTCTTCTT

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TAAAAACCTAGCTCTACTGCTTTCCTTACTCTACATGAAAGTGAAATCCCAAAAGAAACT
AAAACCCTACTGATTCAGCTCATGCTCCATAGATGGTGGGATTAGCTCTAAAATGTTGTT
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CACACTATGGATGCAGTCCGGAGTAGCCGTAAAGCTCTCCTAGCATGATCTATTTTTCTC
TGTTTCTCCCGTACAATCCTCTGTGCGTCTATTATTGCCATAGACATCTTTCCTTCAAGA
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TTGAACTCCCAATCATCATTGAGGTTCTCCAAGTTCTCAGAATTTGTCTCACTATCCTTT
CTTGCCACAAC

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AS 1 3

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TCCCCAATCGATTCGTGCGAAGCCGATCTCTACATCTCCTTCGATCTCTCTCTTTTGAGC
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ATAATTTCTTTTAGGATGCTCTGCTTTGGGTTGTTTTTTATCGTCGCTTTTACAGTCCCC
TTGGTTAAAGTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DT70TF U 1
AF RS1BA67TF U 11
AF RS1BA67JQ C 386
BS 1 213 RS1DT70TF
BS 214 214 RS1BA67TF
BS 215 699 RS1DT70TF
BS 700 700 RS1BA67JQ
BS 701 709 RS1DT70TF
BS 710 1153 RS1BA67JQ

RD RS1DT70TF 712 0 0
GGGAGGAAAACCACATTCCCCCTTTCTCCCAAACTCTCGAAGACGATAAAATCCCTAATT
TCCCCAATCGATTCGTGCGAAGCCGATCTCTACATCTCCTTCGATCTCTCTCTTTTGAGC
TTTCATCTGATTTAATTGAGCTGAAGATGTCGGACCCTTTGAGTATGTCTCTTGACGATA
TGGTGAAGAGGAGCAAGGCCGCTAAAAAGTCTGTTGGTAAAGGAGTCTCCCGCGGTGGAT
CTGGAGCTAAAGGTTTAACCGGAGGTGGAAGGGGAGCTGGTGGACCTGTTCGTAGAGGTC
CTCTTGCTGTGAAGGCTAGGCCATCATCCTTTTCCAACAAGCTTAACCGCAGGAAGAAGA
ACTTGCCATGGCAGAATGGTTTGTTTGAAGAAAGCATGAGATCCGTTGGAGTAACCGGCA
TAGAAGTTGGAACCACTGTTTATGTTACCAACCTCGATCAGGGAGTCACTAATGAAGATA
TCAGGGAACTCTTTGGTGAGATTGGAGAGATGAAAAGATATGCAATTCACTATGACCAGA
ACGGGCGTCCAAATGGCTCGGCGGAAGTTGTGTATATGAGAAGAAGTGATGCATTTCAAG
CTATGAAGAGATACAACAATGTTCTGTTGGATGGAAAGTCAATGAAATTGGAGATTCTGG
GTGGAAACAATGAG*TTGCTCCTGCTGCAGCTCGTGTTA*TGTAACCGG
TTG

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1BA67TF 690 0 0
GG
ACATTCCCCCTTTCTCCCAAACTCTCGAAGACGATAAAATCCCTAATTTCCCCAATCGAT
TCGTGCGAAGCCGATCTCTACATCTCCTTCGATCTCTCTCTTTTGAGCTTTCATCTGATT
TAATTGAGCTGAAGATGTCGGACCCTTTGAGTATGTCTCTTGACGATATGGTGAAGAGGA
GCAAGGCCGCTAAAAAGTCTGGTGGTAAAGGAGTCTCCCGCGGTGGATCTGGAGCTAAAG
GTTTAACCGGAGGTGGAAGGGGAGCTGGTGGACCTGTTCGTAGAGGTCCTCTTGCTGTGA
AGGCTAGGCCATCATCCTTTTCCAACAAGCTTAACCGCAGGAAGAAGAACTTGCCATGGC
AGAATGGTTTGTTTGAAGAAAGCATGAGATCCGTTGGAGTAACCGGCATAGAAGTTGGAA
CCACTGTTTATGTTACCAACCTCGATCAGGGAGTCACTAATGAAGATATCAGGGAACTCT
TTGGTGAGATTGGAGAGATGAAAAGATATGCAATTCACTATGACCAGAACGGGCGTCCAA
ATGGCTCGGCGGAAGTTGTGTATATGAGAAGAAGTGATGCATTTCAAGCTATGAAGAGAT
ACAACAATGTTCTGTTGGATGGAAAGTCAATGAAATTGGAGATTCTGGGTGGAAACAATG
AG*TTGCTCCTGCTGCAGCTCGTGTTA
A

QA 3 689 3 689
DS 

RD RS1BA67JQ 768 0 0
TGAAGAAAGCATGAGATCCGTTGGAGTA*CCGGCATAGAAGTTGGAACCACTGTTTATGT
TACCAACCTCGATCAGGGAGTCACTAATGAAGATATCAGGGAACTCTTTGGTGAGATTGG
AGAGATGAAAAGATATGCAATTCACTATGACCAGAACGGGCGTCCAAATGGCTCGGCGGA
AGTTGTGTATATGAGAAGAAGTGATGCATTTCAAGCTATGAAGAGATACAACAATGTTCT
GTTGGATGGAAGGTCAATGAAATTGGAGATTCTGGGTGGAAACAATGAGGTTGCTCCTGC
TGCAGCTCGTGTTAATGTAACCGGGTTGAACGGAAGGATGAAGAGAACTGTTTCCATTGG
ACAAGGAGTTAGAGGTGGGAGAGGAAGAGGAAGAAGTGCAGCTCCTTCTATTAGACACCT
TCCAATTGGCAACCAACAAGGAGGTGGTGTGAGAAGTGGCCGAGGAGGGTTTCGTGGTAG
AGGCCGAGGCCAAGCCGGTGGTGGAAGAGGGAATAAAGGCGGCCGAGGCGGAAAGAAGGC
GGTGGAGAAGTCGGCTGAAGAACTAGACAAGGATCTTGAAACCTATCACGCAGAAGCGAT
GAACATCTCTTAAGCAAACGCGATGTCTCTGCATCTTGCTGTGTGCTTTGTCCTTGTTTA
ATGTTGTCTTTTTCTTTCTGGATTACCCTCTTGCTATAATTTCTTTTAGGATGCTCTGCT
TTGGGTTGTTTTTTATCGTCGCTTTTACAGTCCCCTTGGTTAAAGTTT

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL4013Contig1 623 2 2 U
TACGTGAAGGTAGACGACGACGTACATGTCAACTTAGGAATGCTCGTTACCACACTAGCG
AGATATCAATCAAGACCGAGGGTTTACATTGGATGCATGAAGTCTGGTCCGGTTCTTTCA
CTAAAGGGAGTGAAGTACCACGAGCCAGAGTACTGGAAGTTTGGAGAAGAAGGGAACAAG
TACTTTAGACATGCGACTGGACAGATTTACGCAATCTCTAAAGACTTAGCTGCGTACATC
TTTACTAACCAGGGAATACTGCACAGGTACGCGAACGAAGACGTGTCGTTAGGAGCGTGG
ATGCTAGGGTTAGAGGTGGAGCATGTGGACGAGAGGTCAATGTGTTGCGGGACGCCACCG
GATTGTCAGTGGAAAGCGCAGGCCGGGAACGTGTGTGCTGCGTCATTCGATTGGTCATGC
AGTGGGATTTGTAAGTCGGTTGATCGGATGGCACGTGTGCACCGCGCTTGCGCGGAAGGA
GACACTCCTCTCTCTAATTTTCGCTTCTTCTTCTGAGTTGGTTGCCTTTGTGGAATGAAT
AAGGAGACGTTAATAAAAATGATATTTTTGTTGGTGTCGAACAATTGCCCAATTGGTTAT
ATGAGCATTGACTTTATAGGTCT


BQ
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AF RS1B420JQ C 1
AF RS1A071TF U 398
BS 1 397 RS1B420JQ
BS 398 623 RS1A071TF

RD RS1B420JQ 579 0 0
TACGTGAAGGTAGACGACGACGTACATGTCAACTTAGGAATGCTCGTTACCACACTAGCG
AGATATCAATCAAGACCGAGGGTTTACATTGGATGCATGAAGTCTGGTCCGGTTCTTTCA
CTAAAGGGAGTGAAGTACCACGAGCCAGAGTACTGGAAGTTTGGAGAAGAAGGGAACAAG
TACTTTAGACATGCGACTGGACAGATTTACGCAATCTCTAAAGACTTAGCTGCGTACATC
TTTACTAACCAGGGAATACTGCACAGGTACGCGAACGAAGACGTGTCGTTAGGAGCGTGG
ATGCTAGGGTTAGAGGTGGAGCATGTGGACGAGAGGTCAATGTGTTGCGGGACGCCACCG
GATTGTCAGTGGAAAGCGCAGGCCGGGAACGTGTGTGCTGCGTCGTTCGATTGGTCATGC
AGTGGGATTTGTAAGTCGGTTGATCGGATGGCACGTGTGCACCGCGCTTGCGCGGAAGGA
GACACTCCTCTCTCTAATTTTCGCTTCTTTTTTTGAGTTGGTTGCCTTTGTGGAATGAAT
AAGGAGACGTTAATAAAAATGATATTTTTGTTGGTGTCG

QA 1 579 1 579
DS 

RD RS1A071TF 226 0 0
CTGCGTCATTCGATTGGTCATGCAGTGGGATTTGTAAGTCGGTTGATCGGATGGCACGTG
TGCACCGCGCTTGCGCGGAAGGAGACACTCCTCTCTCTAATTTTCGCTTCTTCTTCTGAG
TTGGTTGCCTTTGTGGAATGAATAAGGAGACGTTAATAAAAATGATATTTTTGTTGGTGT
CGAACAATTGCCCAATTGGTTATATGAGCATTGACTTTATAGGTCT

QA 1 226 1 226
DS 



AS 1 3

CO CL4014Contig1 647 3 12 U
GGATTCTCCCTCAGACCAAGCAACAAGTTTTCTCAAAGAAGATATCATAATGAGCTACGA
CTACGGGAAGGTTCCGCCTGAAACGTATCCTCCTCCAGGTTACCAATCTCAGTATCCTCC
CCCGCCTCCGGTATATCCTCCGTCGCACCATCACGAAGGATATCCTCAACACCCACACGG
ATATCCATCGTATCCACCACCACGACCGCCTTCACGTCCTCCTTACGAAGGGGGATATCA
GGAGTACTTCTCCGGTGGCTTTCCTCCTCCTCCTCCACCTCCGCCGCAGCAATACAATCA
GTGTCATCATGATCATCACTATTACCAGGACTCTAACTCTGGTTGCACCCCTT*CCTCCG
TGGCTGTCTCGCTACTCTCTGTTGCTGTTGTCTGTTAGACGATATCTTCGTCTAAGATTG
GAGAGTTACTCAATTCTCATAAAAAACTTATATGATTTGGTGTATGTTTCTTTCTCGAAG
CTGTCAATCTATACTTAAAAGATTACTCCATTGGGTGTTGGAATGAGCTTACAAAGCCAT
GATACCAAAACCATAGCTTATTGGCATTCATTTATAGTTTGTATGCTTTATTTGAACACA
AGCAGCTTGAGTATTGATAACAACTTTAATCTACATGCTAATTTTTC


BQ
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AF RS1H319TF U 1
AF RS1AT27JQ C 11
AF RS1AT27TF U 11
BS 1 271 RS1H319TF
BS 272 274 RS1AT27TF
BS 275 349 RS1H319TF
BS 350 350 RS1AT27TF
BS 351 353 RS1H319TF
BS 354 354 RS1AT27TF
BS 355 387 RS1H319TF
BS 388 388 RS1AT27TF
BS 389 528 RS1H319TF
BS 529 529 RS1AT27TF
BS 530 602 RS1H319TF
BS 603 647 RS1AT27TF

RD RS1H319TF 602 0 0
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CTACGGGAAGGTTCCGCCTGAAACGTATCCTCCTCCAGGTTACCAATCTCAGTATCCTCC
CCCGCCTCCGGTATATCCTCCGTCGCACCATCACGAAGGATATCCTCAACACCCACACGG
ATATCCATCGTATCCACCACCACGACCGCCTTCACGTCCTCCTTACGAAGGGGGATATCA
GGAGTACTTCTCCGGTGGCTTTCCTCCTCCT***CCACCTCCGCCGCAGCAATACAATCA
GTGTCATCATGATCATCACTATTACCAGGACTCTAACTCTGGTTGCACCTCTTTCCTCCG
TGGCTGTCTCGCTACTCTCTGTTGCTGCTGTCTGTTAGACGATATCTTCGTCTAAGATTG
GAGAGTTACTCAATTCTCATAAAAAACTTATATGATTTGGTGTATGTTTCTTTCTCGAAG
CTGTCAATCTATACTTAAAAGATTACTCCATTGGGTGTTGGAATGAGCCTACAAAGCCAT
GATACCAAAACCATAGCTTATTGGCATTCATTTATAGTTTGTATGCTTTATTTGAACACA
AG

QA 1 602 1 602
DS 

RD RS1AT27JQ 637 0 0
GG
AGACCAAGCAACAAGTTTTCTCAAAGAAGATATCATAATGAGCTACGACTACGGGAAGGT
TCCGCCTGAAACGTATCCTCCTCCAGGTTACCAATCTCAGTATCCTCCCCCGCCTCCGGT
ATATCCTCCGTCGCACCATCACGAAGGATATCCTCAACACCCACACGGATATCCATCGTA
TCCACCACCACGACCGCCTTCACGTCCTCCTTACGAAGGGGGATATCAGGAGTACTTCTC
CGGTGGCTTTCCTCCTCCTCCTCCACCTCCGCCGCAGCAATACAATCAGTGTCATCATGA
TCATCACTATTACCAGGACTCTAACTCTGGTTGCACCCCTT*CCTCCGTGGCTGTCTCGC
TACTCTCTGTTGCTGTTGTCTGTTAGACGATATCTTCGTCTAAGATTGGAGAGTTACTCA
ATTCTCATAAAAAACTTATATGATTTGGTGTATGTTTCTTTCTCGAAGCTGTCAATCTAT
ACTTAAAAGATTACTCCATTGGGTGTTGGAATGAGCTTACAAAGCCATGATACCAAAACC
ATAGCTTATTGGCATTCATTTATAGTTTGTATGCTTTATTTGAACACAAGCAGCTTGAGT
ATTGATAACAACTTTAATCTACATGCTAATTTTTC

QA 3 637 3 637
DS 

RD RS1AT27TF 637 0 0
GG
AGACCAAGCAACAAGTTTTCTCAAAGAAGATATCATAATGAGCTACGACTACGGGAAGGT
TCCGCCTGAAACGTATCCTCCTCCAGGTTACCAATCTCAGTATCCTCCCCCGCCTCCGGT
ATATCCTCCGTCGCACCATCACGAAGGATATCCTCAACACCCACACGGATATCCATCGTA
TCCACCACCACGACCGCCTTCACGTCCTCCTTACGAAGGGGGATATCAGGAGTACTTCTC
CGGTGGCTTTCCTCCTCCTCCTCCACCTCCGCCGCAGCAATACAATCAGTGTCATCATGA
TCATCACTATTACCAGGACTCTAACTCTGGTTGCACCCCTT*CCTCCGTGGCTGTCTCGC
TACTCTCTGTTGCTGTTGTCTGTTAGACGATATCTTCGTCTAAGATTGGAGAGTTACTCA
ATTCTCATAAAAAACTTATATGATTTGGTGTATGTTTCTTTCTCGAAGCTGTCAATCTAT
ACTTAAAAGATTACTCCATTGGGTGTTGGAATGAGCTTACAAAGCCATGATACCAAAACC
ATAGCTTATTGGCATTCATTTATAGTTTGTATGCTTTATTTGAACACAAGCAGCTTGAGT
ATTGATAACAACTTTAATCTACATGCTAATTTTTC

QA 3 637 3 637
DS 



AS 1 3

CO CL4015Contig1 919 3 4 U
GGAGAGTATTGGAGCTCCCATTGAACGTGTGCTTGATTTCATCCTGGGATGGCATTTGCA
TCCAACAACTTACGGAGACTATCCACAGTCGATGAAGGATCGCATTGGTCATAGATTGCC
AAAGTTCACTGAAGCTGAAAAGAGAATCCTAAAGAACTCTGCAGATTTTGTCGGAATGAA
TTATTATACATCATTGTTTGGTGCTAATATGAAGACAGGTGATTCCAAGAACCCGAGTTG
GACGACCGACTCCCTTGTTCAGTGGGAAAGTAAGACTGTGGATGGATACAAGATTGGTAG
CAAGCCTGCCGGTGGGAAACTGGATGTGTATTCAAGAGGAATGAGGAAGCTTTTGAAGTA
TATCAAGGACAACTATGGAGACCCAGAAATTATGATTACCGAGAATGGATATGGAGAGGA
TCTTGGAGACTTACACAATGACGTCGCAGTTGGAACAAATGATCACAACAGGAAATATTA
TCTCCAGAGGCATCTTTTGAGTTTGCATGAAGCCATATGCGACGACAAGGTTAAAGTTAC
TGGATACTACGTGTGGTCTTTGATGGACAACTTTGAGTGGCAAGATGGTTACAAGGCTAG
GTTCGGGCTTTACTACATCGATTTCCAAAACAATTTGACCCGTCATCAGAAAGTTTCCGG
CAAATGGTATGCTGATTTTCTTAAGCCGGGATTTCCAACATCCAAGATATTGAGGGAAGA
ACTCTAAGATCAAGAATCCAAATCCTGAATCCTCTGAAGAATAAGTTAACGTATTGCAAG
GGTCTTGTTATTGAGGATACTATCTGTTTTGTGTGTATTATGGATCATCTTTATCGTTTT
TATCTATGCTTTCTTTCATGTTAGCCTGCTTGAGGTTCTGTAGTAGCCATCGTATTAATA
AGATGTTGTTTACGTCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1E207TF U 1
AF RS1GT89JQ C 345
AF RS1GT89TF U 345
BS 1 399 RS1E207TF
BS 400 400 RS1GT89TF
BS 401 523 RS1E207TF
BS 524 919 RS1GT89TF

RD RS1E207TF 523 0 0
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TCCAACAACTTACGGAGACTATCCACAGTCGATGAAGGATCGCATTGGTCATAGATTGCC
AAAGTTCACTGAAGCTGAAAAGAGAATCCTAAAGAACTCTGCAGATTTTGTCGGAATGAA
TTATTATACATCATTGTTTGGTGCTAATATGAAGACAGGTGATTCCAAGAACCCGAGTTG
GACGACCGACTCCCTTGTTCAGTGGGAAAGTAAGACTGTGGATGGATACAAGATTGGTAG
CAAGCCTGCCGGTGGGAAACTGGATGTGTATTCAAGAGGAATGAGGAAGCTTTTGAAGTA
TATCAAGGACAACTATGGAGACCCAGAAATTATGATTACTGAGAATGGATATGGAGAGGA
TCTTGGAGACTTACACAATGACGTCGCAGTTGGAACAAATGATCACAACAGGAAATATTA
TCTCCAGAGGCATCTTTTGAGTTTGCATGAAGCCATATGCGAC

QA 1 523 1 523
DS 

RD RS1GT89JQ 575 0 0
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ACAAGGTTAAAGTTACTGGATACTACGTGTGGTCTTTGATGGACAACTTTGAGTGGCAAG
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QA 1 575 1 575
DS 

RD RS1GT89TF 575 0 0
GGAAGCTTTTGAAGTATATCAAGGACAACTATGGAGACCCAGAAATTATGATTACCGAGA
ATGGATATGGAGAGGATCTTGGAGACTTACACAATGACGTCGCAGTTGGAACAAATGATC
ACAACAGGAAATATTATCTCCAGAGGCATCTTTTGAGTTTGCATGAAGCCATATGCGACG
ACAAGGTTAAAGTTACTGGATACTACGTGTGGTCTTTGATGGACAACTTTGAGTGGCAAG
ATGGTTACAAGGCTAGGTTCGGGCTTTACTACATCGATTTCCAAAACAATTTGACCCGTC
ATCAGAAAGTTTCCGGCAAATGGTATGCTGATTTTCTTAAGCCGGGATTTCCAACATCCA
AGATATTGAGGGAAGAACTCTAAGATCAAGAATCCAAATCCTGAATCCTCTGAAGAATAA
GTTAACGTATTGCAAGGGTCTTGTTATTGAGGATACTATCTGTTTTGTGTGTATTATGGA
TCATCTTTATCGTTTTTATCTATGCTTTCTTTCATGTTAGCCTGCTTGAGGTTCTGTAGT
AGCCATCGTATTAATAAGATGTTGTTTACGTCAGC

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 3

CO CL4016Contig1 813 3 29 U
GGTGCGGTCAAGCAGTTCGAAGACAACTATCCCGAGTTCGCCACTAGAGAGTTGTTCATT
AATGTCCCATGGTGGTACATTCCTTATTACAAAACATTCGGATCTATCATCACATCGCCA
AGGACTAGAAGCAAGATGGTCCTTGCTGGTCCACCCAAGTCTGTTGACACCATTTTCAAA
TACATCTCTCCTGAACAAGTCCCGGTTAAGTATGGCGGACTTAGCAATGATCTTTCTTTA
ACCACTGGCGACACTGTCACCGAAGCCATTGTTAAACCAGCAGCTAAATACACCATAGAG
TTGCCTGCTTCTGAGGCTTGCACACTCTCGTGGGAGCTTAGGGTTTTGGGTGCAGATGTG
AGCTATGGGGCTCAGTTTGAACCGACCGCAGAGGGAAGCTATGTTGTGATTGTTTCTAAA
AACCGTAAGATTGGGTTAACTGATGAGCCGGTGATAACCGATTCATTTAAGGTGGGTGAA
CTAGGGAAAATTGTGATCACAATCGATAACCAGACTTCCAAGAAGAAGAAAGTGCTTTAC
AGGTTCAAAACGCAACCAAGGTCTGATCTTTGAAATCATATCCGAGACCATATATCACTT
GCCACAACCCAAATCTAACGAGGAAGTTTTTGGGAGAACAAATTTTTAATTAATTTAATT
AGTTTCTTATTTGATATGTAATTTTGAAATCTCAAAAGCTGGTTGTGTGTTTGCTGGAAT
TGTTTGCTTTGTTTTCAGTATTGGGATTGTTTTGAGTGTGGAGAATATGTGATTAAAATC
CAAAAGCAAAAGAAAAATAAACTTTGTTTCATT


BQ
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25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FM64TF U 1
AF RS1A702TF U 12
AF RS1A702JQ C 29
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BS 87 87 RS1A702TF
BS 88 153 RS1FM64TF
BS 154 154 RS1A702TF
BS 155 185 RS1FM64TF
BS 186 186 RS1A702TF
BS 187 212 RS1FM64TF
BS 213 213 RS1A702TF
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BS 232 232 RS1A702TF
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BS 370 370 RS1A702TF
BS 371 387 RS1FM64TF
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BS 490 523 RS1FM64TF
BS 524 780 RS1A702TF
BS 781 813 RS1A702JQ

RD RS1FM64TF 523 0 0
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AATGTCCCATGGTGGTACATTCCTTACTACAAAACATTCGGATCTATCATCACATCGCCA
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TACATTTCTCCTGAACAAGTCCCGGTTAAGTACGGCGGACTTAGCAATGATATTTCTTTA
ACCACTGGTGACACTATCACCGAAGCCATTGTTAAACCAGCAGCTAACTACACCATAGAG
TTGCCTGCTTCTGAGGCTTGCACACTCTCGTGGGAGCTTAGAGTTTTGGGTGCAGATGTG
AGCTATGGGACTCAGTTTGAACCGACCACAGAGGGAAGCTATGTTGTGATTGTTTCTAAA
AACCGTAAGATTGGGTTAACTGATGAGCCGGTGATAACCGATTCATTTAAGGTGGGTGAA
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QA 1 523 1 523
DS 

RD RS1A702TF 769 0 0
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GTGGTACATTCCTTATTACAAAACATTCGGATCTATCATCACATCGCCAAGGACTAGAAG
CAAGATGGTCCTTGCTGGTCCACCCAAGTCTGTTGACACCATTTTCAAATACATCTCTCC
TGAACAAGTCCCGGTTAAGTATGGCGGACTTAGCAATGATCTTTCTTTAACCACTGGCGA
CACTGTCACCGAAGCCATTGTTAAACCAGCAGCTAAATACACCATAGAGTTGCCTGCTTC
TGAGGCTTGCACACTCTCGTGGGAGCTTAGGGTTTTGGGTGCAGATGTGAGCTATGGGGC
TCAGTTTGAACCGACCGCAGAGGGAAGCTATGTTGTGATTGTTTCTAAAAACCGTAAGAT
TGGGTTAACTGATGAGCCGGTGATAACCGATTCATTTAAGGTGGGTGAACTAGGGAAAAT
TGTGATCACAATCGATAACCAGACTTCCAAGAAGAAGAAAGTGCTTTACAGGTTCAAAAC
GCAACCAAGGTCTGATCTTTGAAATCATATCCGAGACCATATATCACTTGCCACAACCCA
AATCTAACGAGGAAGTTTTTGGGAGAACAAATTTTTAATTAATTTAATTAGTTTCTTATT
TGATATGTAATTTTGAAATCTCAAAAGCTGGTTGTGTGTTTGCTGGAATTGTTTGCTTTG
TTTTCAGTATTGGGATTGTTTTGAGTGTGGAGAATATGTGATTAAAATC

QA 1 769 1 769
DS 

RD RS1A702JQ 785 0 0
ATCCCGAGTTCGCCACTAGAGAGTTGTTCATTAATGTCCCATGGTGGTACATTCCTTATT
ACAAAACATTCGGATCTATCATCACATCGCCAAGGACTAGAAGCAAGATGGTCCTTGCTG
GTCCACCCAAGTCTGTTGACACCATTTTCAAATACATCTCTCCTGAACAAGTCCCGGTTA
AGTATGGCGGACTTAGCAATGATCTTTCTTTAACCACTGGCGACACTGTCACCGAAGCCA
TTGTTAAACCAGCAGCTAAATACACCATAGAGTTGCCTGCTTTTGAGGCTTGCACACTCT
CGTGGGAGCTTAGGGTTTTGGGTGCAGATGTGAGCTATGGGGCTCAGTTTGAACCGACCG
CAGAGGGAAGCTATGTTGTGATTGTTTCTAAAAACCGTAAGATTGGGTTAACTGATGAGC
CGGTGATAACCGATTCATTTAAGGTGGGTGAACTAGGGAAAATTGTGATCACAATCGATA
ACCAGACTTCCAAGAAGAAGAAAGTGCTTTACAGGTTCAAAACGCAACCAAGGTTTGATC
TTTGAAATCATATCCGAGACCATATATCACTTGCCACAACCCAAATCTAACGAGGAAGTT
TTTGGGAGAACAAATTTTTAATTAATTTAATTAGTTTCTTATTTGATATGTAATTTTGAA
ATCTCAAAAGCTGGTTGTGTGTTTGCTGGAATTGTTTGCTTTGTTTTCAGTATTGGGATT
GTTTTGAGTGTGGAGAATATGTGATTAAAATCCAAAAGCAAAAGAAAAATAAACTTTGTT
TCATT

QA 1 785 1 785
DS 



AS 0 0

AS 1 3

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TCCAGGATGGTGGCGTTTGTGGTACACGCGCTCGCCGTCGTCGCCTCGGTGATGGTGTTT
GTTTGGTCAATATGTTACAGACGTGGATTTGCGTGGGAATCTACCAACAAGACCCTTATC
TTCAATCTTCATCCTGTTTTGACGCTAATCAGCTTAGTAATACTGGGAGGCGAAGCAATT
ATAAGTTACAAATCGCTTACATTTGAGAAACGAGCGTACAAATTGATCCACCTTGTTCTC
CACGCAATCGCCATTGTTCTCGGAATCTTGGGAATCTATGCTGCTTTCAAGCACCATAAC
GAGAAACACATCCCAAATCTCTATACTATCCATTCTTGGGTTGGTATTGGTGTCATTGTC
CTTTACTCTCTCCAGTGGCTGTATAGCTTTATTGTTTACTTCTTCCCTGGAGGATCATCA
ACTCTCAGAAGGGACTTTCTTCCGTGGCACATTTTCCTCGGTGTCTTTGTCTATGTTCTT
GCAGTTGGAAACTCGGTGTTAGGGTTTCTTGAAAAGCTTACTTTCTTGGAAAAGTCAGGG
CTTGACAAGTTTGGATCAGAAGCATTCCTTGTCAACTTCATGGCTATTATCACTATTCTG
TTTGGTACTTTTGTGCTACTCATTGTTTACTCCAAGGCTCCTCCTTCAGATGAAGAAGAT
AACTATAGTTACTCAGCAATATGGTGACCTCTTCGATTTTACTTTCCTTTGAAGTTTGTT
TGTTTTAAACCTAATAACGCCACTTTCTTCTGTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FM37TF U 1
AF RS1GJ36TF U 1
AF RS1FM37JQ C 108
BS 1 56 RS1FM37TF
BS 57 57 RS1GJ36TF
BS 58 595 RS1FM37TF
BS 596 814 RS1FM37JQ

RD RS1FM37TF 595 0 0
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TCCAGGATGGTGGCGTTTGTGGTACACGCGCTCGCCGTCGTCGCCTCGGTGATGGTGTTT
GTTTGGTCAATATGTTACAGACGTGGATTTGCGTGGGAATCTACCAACAAGACCCTTATC
TTCAATCTTCATCCTGTTTTGACGCTAATCAGCTTAGTAATACTGGGAGGCGAAGCAATT
ATAAGTTACAAATCGCTTACATTTGAGAAACGAGCGTACAAATTGATCCACCTTGTTCTC
CACGCAATCGCCATTGTTCTCGGAATCTTGGGAATCTATGCTGCTTTCAAGCACCATAAC
GAGAAACACATCCCAAATCTCTATACTATCCATTCTTGGGTTGGTATTGGTGTCATTGTC
CTTTACTCTCTCCAGTGGCTGTATAGCTTTATTGTTTACTTCTTCCCTGGAGGATCATCA
ACTCTCAGAAGGGACTTTCTTCCGTGGCACATTTTCCTCGGTGTCTTTGTCTATGTTCTT
GCAGTTGGAAACTCGGTGTTAGGGTTTCTTGAAAAGCTTACTTTCTTGGAAAAGT

QA 1 595 1 595
DS 

RD RS1GJ36TF 552 0 0
GGATCATTTCTCGGACAACAAAGAAGATTATAAAGACCAAACATATCTGTCGGAACAAAC
TCCAGGATGGTGGCGTTTGTGGTACACGCGCTCGCCGTCGTCGCCTCGGTGATGGTGTTT
GTTTGGTCAATATGTTACAGACGTGGATTTGCGTGGGAATCTACCAACAAGACCCTTATC
TTCAATCTTCATCCTGTTTTGACGCTAATCAGCTTAGTAATACTGGGAGGCGAAGCAATT
ATAAGTTACAAATCGCTTACATTTGAGAAACGAGCGAACAAATTGATCCACCTTGTTCTC
CACGCAATCGCCATTGTTCTCGGAATCTTGGGAATCTATGCTGCTTTCAAGCACCATAAC
GAGAAACACATCCCAAATCTCTATACTATCCATTCTTGGGTTGGTATTGGTGTCATTGTC
CTTTACTCTCTCCAGTGGCTGTATAGCTTTATTGTTTACTTCTTCCCTGGAGGATCATCA
ACTCTCAGAAGGGACTTTCTTCCGTGGCACATTTTCCTCGGTGTCTTTGTCTATGTTCTT
GCAGTTGGAAAC

QA 1 552 1 552
DS 

RD RS1FM37JQ 707 0 0
GGTGATGGTGTTTGTTTGGTCAATATGTTACAGACGTGGATTTGCGTGGGAATCTACCAA
CAAGACCCTTATCTTCAATCTTCATCCTGTTTTGACGCTAATCAGCTTAGTAATACTGGG
AGGCGAAGCAATTATAAGTTACAAATCGCTTACATTTGAGAAACGAGCGTACAAATTGAT
CCACCTTGTTCTCCACGCAATCGCCATTGTTCTCGGAATCTTGGGAATCTATGCTGCTTT
CAAGCACCATAACGAGAAACACATCCCAAATCTCTATACTATCCATTCTTGGGTTGGTAT
TGGTGTCATTGTCCTTTACTCTCTCCAGTGGCTGTATAGCTTTATTGTTTACTTCTTCCC
TGGAGGATCATCAACTCTCAGAAGGGACTTTCTTCCGTGGCACATTTTCCTCGGTGTCTT
TGTCTATGTTCTTGCAGTTGGAAACTCGGTGTTAGGGTTTCTTGAAAAGCTTACTTTCTT
GGAAAAGTCAGGGCTTGACAAGTTTGGATCAGAAGCATTCCTTGTCAACTTCATGGCTAT
TATCACTATTCTGTTTGGTACTTTTGTGCTACTCATTGTTTACTCCAAGGCTCCTCCTTC
AGATGAAGAAGATAACTATAGTTACTCAGCAATATGGTGACCTCTTCGATTTTACTTTCC
TTTGAAGTTTGTTTGTTTTAAACCTAATAACGCCACTTTCTTCTGTC

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 3

CO CL4019Contig1 1140 3 18 U
GCTTGCATCTTAAAATGCTTCATTAAAACTAAAAACTGGAGTAGCTTCTCAAAATTATCA
CAAATTCTACAAAATATATATATCTTACAACAAAAATACAATATTTTATTGTCTTCTCTT
ATAACTCGAGTCTTCAAACTAAAAATTACAGTTATAAACTGCTTCAGCGACCCTAAGCCA
TTTTGTTCCAGTACCAATGAATTCCTAAAAAAAACTAAAAACAAACAGCGAGCTCAACAA
CTCTTAAAATCAGTCACTTCTCATATTGAGCTCGTATGAACAACCGACCATGCATGCTCA
TGATGGCATTTGTATGATGCGGATCGATTCTTGCTGGTAAAACAACAATCTTTTTGAATG
GTGTAATGCCCCAAGGATTGTCAAGCTGCTCAGGTTCCCCTATTATAATCAGCCCTCCTG
CAGGATCTGATTGAATTCGAATCTCATTGCGAAAAAGTCCAGGCACCAATGCAAAAACCT
CAAAGGATTCTCTAGTTTCTTTGACAGTTATCTTCACCCAGTCAGCAAGAGGTCCATCAT
CAATAACGTCAGCAACCGACTGTTTTTCTGCTTCTTGTGAAACAACAAGGTCCATGGAAT
TTGGTGTTCTGGGTTTCGGCAGACCAATGTTCTTGAGTTTCTTGTGTTTTGGGGTTGAGT
TTAAACCCATATCCTCTCCAGAATCATCAAGGCGATGTGCCTGCCAACCTTGCATAGCAC
GAGCTGCAGAATCTCTCCGTGCCCTGCCTGATCCCGAACCTTGATGGCCCATGACCTCTT
TGTCGAGGCTTGGAGACAGATTGAGTGTTGGACCAGGAAGGTTAAGGTCACCATTTTTCC
TTAAATGCTTTTCGTACTCCAAAAGTGCCTTCTCATAGAAATTGCGGAATGTGTAGGAGA
TTGTTGTGCATGTCTTTGGAGGGTTGAAGGATTCTCCAACTTGCCGCCAGAGCTTTGATG
TCGGTGACCACTTCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCTTGCAATTGCATTTCC
TTATCATCCTCCATATCTGTTTCTGCAGCGACGGCGCCGCAAGGGAAGGGTGAGACTTCC
GGTGGCGTGCTAGGGTTTGCAGACGGAGAAATTGAAAGAAGATGCTGAGCGAGAGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

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DS 

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G
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AATGGACTTGAAGGAGCTTAAGATGGGTTATAACATTGACCAGCACGACTATTCTGTACG
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CGAAATAGGAGAGCTTGCGACTGAGGAAAGTAAGAACTTTCGGGACAGAAACTTGTTTAT
TGTCTTGGTGCCAAACAAGGAAGTTGTTCGGAAAGCACAAGAACCATCCCCTAAAAAGAA
GAAAAAGCCAGCAGATGATGAAGTTTCAGCTGCAGGTATAGCTGCAACTTAAAAAATATA
TGAATATATGATGCACAATTGCTAAAGGTATAAAGTCACAGAGAGTTTGATAAATGTCTT
TGTATAGTTTCC*TTTCTACTATGCTTCTTGCATTCCCATCTATCTGTA
CA

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DS 

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CATGATTGGTATAGTTTCCAAGGAGGAAGCTGTTCGAAGAGCTGAAGAAGCTGAGCTTGA
TCTGGTGATTCTTTCGCCGGATGCAGATCCTCCGGTTGTCAGAATGATGGATTACAGTAA
ATATAGATACGAACAGCAAAAGCGAAAAAAGGAACAGCAGAAGAAAACAACTCGAATGGA
CTTGAAGGAGCTTAAGATGGGTTATAACATTGACCAGCACGACTATTCTGTACGCATGAG
AGCAGCCCGAAAGTTTTTGCAAGATGGTGACAAGGTTAAAGTGATTGTGAACATGAAAGG
CAGGGAAAACGAGTTCAGAAATATTGCTATTGAGCTCCTCAGACGTTTTCAGACCGAAAT
AGGAGAGCTTGCGACTGAGGAAAGTAAGAACTTTCGGGACAGAAACTTGTTTATTGTCTT
GGTGCCAAACAAGGAAGTTGTTCGGAAAGCACAAGAACCATCCCCTAAAAAGAAGAAAAA
GCCAGCAGATGATGAAGTTTCAGCTGCAGGTATAGCTGCAACTTAAAAAATATATGAATA
TATGATGCACAATTGCTAAAGGTATAAAGTCACAGAGAGTTTGATAAATGTCTTTGTATA
GTTTCCCTTTCTACTATGCTTCTTGCATTCCCATCTATCTGTAACCATAGAAAAGTATTT
GAATGAAGATTTTTCGTATATACCT

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 2

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CCAATTTCTAGGTCACCAATCTGAACACAAAACCCCTAATCCCGGCGTTTCGCTCGCCAA
TTTCTCCCTCCCTTGGTCTACTCCTCCTTCAGTATCTCGTCTCCATCTATCAAAACCCAG
AAATCTCACCTCTTGCTTCTCCGCTACTATCCAAGAGCCAATCCTCGAGTCTTCTTCTTC
TTCTTCTGAAGAGATTTCGAAAACCAGATTGATTGCTCAAAACGTTCCTTGGACCTCTAC
ACCCGAAGACATAAGGTCCCTGTTCGAGAAATACGGCAATGTCGTCGACGTTGAGATGTC
TATGCACAAGAAGGAAAGGAACCGAGGTTTGGTTTTCATTGAAATGGCTTCTCCTGAAGA
AGCTGCATCAGCTCTTCAAGCTCTCGAATCCTATGAATATGAGGGTCGTCGTTTGAAGGT
AGCCTATGCAAAGGCCAAAAAGAAGAAAACTTATGCTCCTCGTGAGAAGCCTACGCCGGT
GCCTACCTTCAATTTGTTTGTTGCAAACTTGGCATTTGAAGCAAGGGCCAAGCATCTTAA
GGAGTTCTTTGATGCGGACACTGGTAACGTTGTCTCCACTGAAGTTATATTCCATGAAAA
TCCTAGGAGGTCTAGTGGTTACGGCTTTGTCTCTTTCAAAACCAAGAAAATGACCGATGC
AGCGCTCCTTGAGTTCCAAGGAAAGGATTTCATGGGAAGACCAATCCGATTAGCTCGTAG
CAAACAGTTTGTGAAGTTTCAAGCAAAAGAAGGGTTGCAGCCACCTGATGAAGGATTATT
TGGGGTTGGGTATCGGAATTGAAGAGAAAACTTTGAGCTTTTGACAAACAAGAGGAGCGG
ATACATTACAACTACCAACCTTGAGTAAGTGGTGCAGAAGTAAGAAGTACAAGAACGATC
TAGTTAGAACAAAACCCATGTGGCTCTAAGAACTTGTTTTGTTAAGTTAACACAATGTTC
TTATTTTTCTATTGGTTTTGATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A479TF U 1
AF RS1A479JQ C 194
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TATGCACAAGAAGGAAAGGAACCGAGGTTTGGTTTTCATTGAAATGGCTTCTCCTGAAGA
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CAA*CAGTTTGTGAAGTT
TCAGCAAA

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DS 

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AGGTCCCTGTTCGAGAAATACGGCAATGTCGTCGACGTTGAGATGTCTATGCACAAGAAG
GAAAGGAACCGAGGTTTGGTTTTCATTGAAATGGCTTCTCCTGAAGAAGCTGCATCAGCT
CTTCAAGCTCTCGAATCCTATGAATATGAGGGTCGTCGTTTGAAGGTAGCCTATGCAAAG
GCCAAAAAGAAGAAAACTTATGCTCCTCGTGAGAAGCCTACGCCGGTGCCTACCTTCAAT
TTGTTTGTTGCAAACTTGGCATTTGAAGCAAGGGCCAAGCATCTTAAGGAGTTCTTTGAT
GCGGACACTGGTAACGTTGTCTCCACTGAAGTTATATTCCATGAAAATCCTAGGAGGTCT
AGTGGTTACGGCTTTGTCTCTTTCAAAACCAAGAAAATGACCGATGCAGCGCTCCTTGAG
TTCCAAGGAAAGGATTTCATGGGAAGACCAATCCGATTAGCTCGTAGCAAACAGTTTGTG
AAGTTTCAAGCAAAAGAAGGGTTGCAGCCACCTGATGAAGGATTATTTGGGGTTGGGTAT
CGGAATTGAAGAGAAAACTTTGAGCTTTTGACAAACAAGAGGAGCGGATACATTACAACT
ACCAACCTTGAGTAAGTGGTGCAGAAGTAAGAAGTACAAGAACGATCTAGTTAGAACAAA
ACCCATGTGGCTCTAAGAACTTGTTTTGTTAAGTTAACACAATGTTCTTATTTTTCTATT
GGTTTTGATAC

QA 1 851 1 851
DS 



AS 1 3

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TGGATTCTCAGATTAAGCACGCCGTGGTGGTCAAAGTGATGGGACGTACTGGATCCAGGG
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CCAAGGGACCCGTGAGAGAAGGTGACATCTTCACTTTGCTCGAGTCTGAGAGAGAAGCTA
GGAGACTTCGTTGATTCGTCTTGTTCCTTTCTCCACTACAGAACTATGTCTGCTTATCTT
GCTCTTTTTTTTTTTGTTTTCTGTGACTGGATTAGTGATTATGCATTCGAACTGAATTTT
GTTTTTGCTGTAAGACATTTCATGGATTGATTTTTGTTCTGGTCTTATCATATTGTTGTC
TGAACC


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1A767JQ C 6
AF RS1A767TF U 6
AF RS1DT95TF U 1
BS 1 18 RS1DT95TF
BS 19 19 RS1A767TF
BS 20 209 RS1DT95TF
BS 210 210 RS1A767TF
BS 211 426 RS1DT95TF

RD RS1A767JQ 400 0 0
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TTTCAGATTAAGCACGCCGTGGTGGTCAAAGTGATGGGACGTACTGGATCCAGGGGTCAG
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DS 

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GCATCGCCGCTAAGCTTTCTCACCTCCGTCTCTCACCGAGCCGTCGTCTTCAGAATGGAT
TCTCAGATTAAGCACGCCGTGGTGGTCAAAGTGATGGGACGTACTGGATCCAGGGGTCAG
GTGACTCAGGTTCGAGTGAAGTTCACTGACTCTGATCGTTACATTATGAGAAACGCCAAG
GGACCCGTGAGAGAAGGTGACATCTTCACTTTGCTCGAGTCTGAGAGAGAAGCTAGGAGA
CTTCGTTGATTCGTCTTGTTCCTTTCTCCACTACAGAACTATGTCTGCTTATCTTGCTCT
TTTTTTTTTTGTTTTCTGTGACTGGATTAGTGATTATGCATTCGAACTGAATTTTGTTTT
TGCTGTAAGACATTTCATGGATTGATTTTTGTTCTGGTCT

QA 1 400 1 400
DS 

RD RS1DT95TF 426 0 0
TTTTTGCATCGCCGCTAAACTTTCTCACCTCCGTCTCTCACCGAGCCGTCGTCTTCAGAA
TGGATTCTCAGATTAAGCACGCCGTGGTGGTCAAAGTGATGGGACGTACTGGATCCAGGG
GTCAGGTGACTCAGGTTCGAGTGAAGTTCACTGACTCTGATCGTTACATTATGAGAAACG
CCAAGGGACCCGTGAGAGAAGGTGACATCCTCACTTTGCTCGAGTCTGAGAGAGAAGCTA
GGAGACTTCGTTGATTCGTCTTGTTCCTTTCTCCACTACAGAACTATGTCTGCTTATCTT
GCTCTTTTTTTTTTTGTTTTCTGTGACTGGATTAGTGATTATGCATTCGAACTGAATTTT
GTTTTTGCTGTAAGACATTTCATGGATTGATTTTTGTTCTGGTCTTATCATATTGTTGTC
TGAACC

QA 1 426 1 426
DS 



AS 1 3

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ACAAGACCGACTTTTTCACTGACAAGTTCGGTGTGAGGTCAATCAGGGACAACAACGATG
AGCTGATGGGTGCTGTACCTACAAGTTAGTATCATCAGTCAAGCGCTCATCTTCGTCACA
AGATCAAGGAGCTGGTCGTTCGTCGAACGTCCTGGGGCGCTTCTGATGATTGCATTCGTC
ATTGCACAACTTGTTGCGACTTTGATTGCAGTGTACGCTGACTGGACATTTGCAAAGGTG
AAGGGTATCGGTTGGGGATGGGCTGGTGTGATTTGGGTTTACAGCATTGTTACATACTTC
CCATAAGACCTTTTGAAGTTTGCCATCCGATACATCTTGAGTGGAAAGGCTTGGACCAGC
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ATCTTCCCAGAGAAAGGAGGTTACAGAGAGCTGTCTGAGATCGCCGAGCAAGCTAAGAGA
AGGGCCGAGATAGCAAGGCTTAGGGAGCTTCACACATTGAAGGGACATGTTGAATCAGTC
GCAAAGCTGAAGGGCTTGGACATTGACACAGCCGGGCATCACTACACTGTGTAATTGCAG
TTGCACAGACGTTTTACCAAAACCAACCCATCATGACTCCTCTTCGTTTTTTTTTCTTCT
GAAGTCGCAATAGAGGGAAGAGAACTCTGTGTATTGCCATAACTCTTCCAAAAACTCGTT
TTATTGTTAGTCATTTGTACCTCTAAACTTGTACTCTGAGCTTAAGAAACAAGGCTTTTC
TGCCTTGGTGGTTTGTCACTTTGGCTACGACCTGTTTTAATGGCTTAATATGAGCTTCTT
ACTCTCTTGTTTCCGGTTATGGTTGTTTGATCAGTTCCATCTCGAGTCTAATACTTGAAT
CATATTATTTTATTCTCATTAAAAAATTAAAACGAATTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FZ85TF U 1
AF RS1FK41TF U 541
AF RS1FZ85JQ C 376
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AGATCAAGGAGCTGGTCGTTCGTCGAACGTCCTGGGGCGCTTCTGATGATTGCATTCGTC
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AAGGGTATCGGTTGGGGATGGGCTGGTGTGATTTGGGTTTACAGCATTGTTACATACTTC
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ATCTTCC*AGAGAAAGGAGGTTACAGAGAGCTGTCTGAGATCGCCG

QA 1 586 1 586
DS 

RD RS1FK41TF 365 0 0
G
TCTTCCCAGAGAAATGAGGTTACAGAGAGCTGTCTGAGATCGCCGAGCAAGCTAAGAGAA
GGGCCGAGATAGCAAGGCTTAGGGAGCTTCACACATTGACGGGACATGTTGAATCAGTCG
CAAAGCTGAAGGGCTTGGACATTGACACAGCTGGGCATCACTACACTGTGTAATTGCAGT
TGCACAGACGTTTTACCAAAACCAACCCATCATGACTCCTCTTCGTTTTTTTTTCTTCTG
AAGTCGCAATAGAGGGAAGAGAACTCTGTGTATTGCCATAACTCTTCCAAAAACTCGTTT
TATTGTTAGTCATTTGTACCTCTAAACTTGTACTCTGAGCTTAAGAAACAAGGCTTTTCT
GCC
C

QA 2 364 2 364
DS 

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GCTCAGAGGACACTGCACGGTCTCCAGCCTAAAGAAGAGGCCAACATCTTCCCAGAGAAA
GGAGGTTACAGAGAGCTGTCTGAGATCGCCGAGCAAGCTAAGAGAAGGGCCGAGATAGCA
AGGCTTAGGGAGCTTCACACATTGAAGGGACATGTTGAATCAGTCGCAAAGCTGAAGGGC
TTGGACATTGACACAGCCGGGCATCACTACACTGTGTAATTGCAGTTGCACAGACGTTTT
ACCAAAACCAACCCATCATGACTCCTCTTCGTTTTTTTT*CTTCTGAAGTCGCAATAGAG
GGAAGAGAACTCTGTGTATTGCCATAACTCTTCCAAAAACTCGTTTTATTGTTAGTCATT
TGTACCTCTAAACTTGTACTCTGAGCTTAAGAAACAAGGCTTTTCTGCCTTGGTGGTTTG
TCACTTTGGCTACGACCTGTTTTAATGGCTTAATATGAGCTTCTTACTCTCTTGTTTCCG
GTTATGGTTGTTTGATCAGTTCCATCTCGAGTCTAATACTTGAATCATATTATTTTATTC
TCATTAAAAAATTAAAACGAATTGAT

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 3

CO CL4024Contig1 750 3 15 U
GAATGCGAAACCAAAATTACGTAATAAATATAGTTTCTTAACAAAACATGCCCAAAAAAA
AAGACAAAAACAATATTTTTAACTTTTAAACAAGTAATAAAACCAAGACTTTAACTCAGT
GATCCAAATAAACAAAAAGCAGAAACACCAAAAATAATTTATCAAATATCTCGTGAGAAG
GCAATTCCGCCTACGTCGAAACTTCAATGCGCAGAGACCTCAAACATTTTGCCTTACATG
TAGTTTCACACAACATTCCTTTGGCCGATTTTTGAAATTTTGTTTTTACTGTTGCTTGCA
CTCAGGAGGCCTCTCCCCCTGTTGTCC*ATCGTTAAGCTGAGGCCTGCCTCCTTTCTTGT
GTAGG*ATAGACGGCTTCTTTTTGGTCTTGCTTACTTCTTCTT*CTTCCTCATCTTCATC
ATCGTCTT*CTTCCTCATCCTCATCCTCATCATCTTCTTCATCCTCATCTTCGTCCTCAT
CAATATAATCATCTTCATCGTCATTGTCTATGTCAAAACTCCTCTCCTTCAATAGCCTCG
CCAGTAAACCATGAGACAGCATGGGGTGTAATCTTCTCCCGGATTGTAGAACCAATGTCA
TAATCTTGTTCCATCAGATTCTGAAGTTCTTCAGCTCTGTCCTCGTCGATGTCTTCATCA
TCATCAGGAACTTGGGGAGGATTGAAGAAGTTGAAGAAACTTTCACAGTCTTCAGTTTTG
GTGATTGGCTTGGCATTCTTCGCACCTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BN39JQ U 306
AF RS1BN39TF C 226
AF RS1F058JQ U 1
BS 1 276 RS1F058JQ
BS 277 277 RS1BN39TF
BS 278 286 RS1F058JQ
BS 287 287 RS1BN39TF
BS 288 318 RS1F058JQ
BS 319 319 RS1BN39JQ
BS 320 399 RS1F058JQ
BS 400 400 RS1BN39JQ
BS 401 486 RS1F058JQ
BS 487 487 RS1BN39JQ
BS 488 517 RS1F058JQ
BS 518 518 RS1BN39TF
BS 519 567 RS1F058JQ
BS 568 569 RS1BN39TF
BS 570 750 RS1F058JQ

RD RS1BN39JQ 212 0 0
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*AAAAACGGCTTCTTTTTGGTCTTGCTTACTTCTTCTT*CTTCCTCATCTTCATCATCGT
CTT*CTTCCTCATCCTCATCCTCATCATCTTCTTCATCCTCATCTTCGTCCTCATCAATA
TAATCATCTTCATCGTCATTGTCTATGTCAAA

QA 1 212 1 212
DS 

RD RS1BN39TF 362 0 0
ATTTTGCCTTACATGTAGTTTCACACAACATTCCTTTGGCCGATTTTTGAAATTTTGTTT
TTACTGTTGCTTGCACTCAGGAGGCCTCTCCCCCTGTTGTCCCATCGTTAAGCTGAGGCC
TGCCTCCTTTCTTGTGTAGGGATAGACGGCTTCTTTTTGGTCTTGCTTACTTCTTCTTTC
TTCCTCATCTTCATCATCGTCTTTCTTCCTCATCCTCATCCTCATCATTTTCTTCATCCT
CATCTTCGTCCTCATCAATATAATCATCTTCATCGTCATTGTCTATGTCAAAACTCCTCT
CCTTCAATAGCCTCGCCAGTAAACCATGAGACAGCATGGGGTGTAATCTTCTCCCGGATT
GT

QA 1 362 1 362
DS 

RD RS1F058JQ 750 0 0
GAATGCGAAACCAAAATTACGTAATAAATATAGTTTCTTAACAAAACATGCCCAAAAAAA
AAGACAAAAACAATATTTTTAACTTTTAAACAAGTAATAAAACCAAGACTTTAACTCAGT
GATCCAAATAAACAAAAAGCAGAAACACCAAAAATAATTTATCAAATATCTCGTGAGAAG
GCAATTCCGCCTACGTCGAAACTTCAATGCGCAGAGACCTCAAACATTTTGCCTTACATG
TAGTTTCACACAACATTCCTTTGGCCGATTTTTGAA*TTTTGTTTT*ACTGTTGCTTGCA
CTCAGGAGGCCTCTCCCCTTGTTGTCC*ATCGTTAAGCTGAGGCCTGCCTCCTTTCTTGT
GTAGG*ATAGACGGCTTCTTTTTGGTCTTGCTTACTTCTCCTT*CTTCCTCATCTTCATC
ATCGTCTT*CTTCCTCATCCTCATCCTCATCATCTTCTTCATCCTCATCTTCGTCCTCAT
CAATATCATCATCTTCATCGTCATTGTCTATGTCAAA*CTCCTCTCCTTCAATAGCCTCG
CCAGTAAACCATGAGACAGCATGGGGT**AATCTTCTCCCGGATTGTAGAACCAATGTCA
TAATCTTGTTCCATCAGATTCTGAAGTTCTTCAGCTCTGTCCTCGTCGATGTCTTCATCA
TCATCAGGAACTTGGGGAGGATTGAAGAAGTTGAAGAAACTTTCACAGTCTTCAGTTTTG
GTGATTGGCTTGGCATTCTTCGCACCTTTC

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 3

CO CL4025Contig1 725 3 1 U
GGAACGAGAAAGATATCTAAAGTTCATCTTCTTCTCTGTTCTCTAAACACTCTCATGGTA
TCAGAGCTTCAGTCGGTTCATGGGAGTCACTCTTATCTTTTTCTAGCTTCCGCTTGCTAA
CCATTTTGAAGTCATCACCTTTGCTGCTGTTTCTGTTATCTACGGCTGAAACCCAATCTT
GTCAAAGATTAAACAAGCTTCATCCTTTATGTTTCATACATCTTTCTCTCAGTCATGGAG
TTTTCCAACAGTCGAGAGCTTGTGTTCGATGAGAAACTCTGCAAGTGAAGCTTGATTTGT
TCGTTGTTCTTCATTTGCTCGTTTTACTGAAGTCAGAAAGGATGGAGCTTGCCGTTGGTT
AAGAGTCTTAAGACCAGACAGCACAGCACAAGCCACTGTCAGAGTACTACGAGGACAACA
TTGAAATGGTTCCAGTCCGTGTCCATACTGTCCTGCTCTCAACTTTGCAAACCGCACCTG
CCCTCAAGGAGCACGTCAAATCTGTTTATCTATGGTATGCATCTGTTCTTTTCTCTGCGA
CAGAACAAGTGAATGTCCGTTTGATAGATTGAGAATGATGTTAGCTGGCTGGTTTTAGAT
AAGGAATCGTGAGGTTGATTAAATTAGTAGGTTGCGGTTAGTTTCAATGATGGGGTTGTT
ACTGCAAGTTGGTGTTTTTGATTGGTGCACACAAGATGTTTGATACAATGCCAAAGAGAA
AGTCA


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 

AF RS1AP34TFB U 1
AF RS1B713TF U 2
AF RS1H405TF U 1
BS 1 725 RS1AP34TFB

RD RS1AP34TFB 725 0 0
GGAACGAGAAAGATATCTAAAGTTCATCTTCTTCTCTGTTCTCTAAACACTCTCATGGTA
TCAGAGCTTCAGTCGGTTCATGGGAGTCACTCTTATCTTTTTCTAGCTTCCGCTTGCTAA
CCATTTTGAAGTCATCACCTTTGCTGCTGTTTCTGTTATCTACGGCTGAAACCCAATCTT
GTCAAAGATTAAACAAGCTTCATCCTTTATGTTTCATACATCTTTCTCTCAGTCATGGAG
TTTTCCAACAGTCGAGAGCTTGTGTTCGATGAGAAACTCTGCAAGTGAAGCTTGATTTGT
TCGTTGTTCTTCATTTGCTCGTTTTACTGAAGTCAGAAAGGATGGAGCTTGCCGTTGGTT
AAGAGTCTTAAGACCAGACAGCACAGCACAAGCCACTGTCAGAGTACTACGAGGACAACA
TTGAAATGGTTCCAGTCCGTGTCCATACTGTCCTGCTCTCAACTTTGCAAACCGCACCTG
CCCTCAAGGAGCACGTCAAATCTGTTTATCTATGGTATGCATCTGTTCTTTTCTCTGCGA
CAGAACAAGTGAATGTCCGTTTGATAGATTGAGAATGATGTTAGCTGGCTGGTTTTAGAT
AAGGAATCGTGAGGTTGATTAAATTAGTAGGTTGCGGTTAGTTTCAATGATGGGGTTGTT
ACTGCAAGTTGGTGTTTTTGATTGGTGCACACAAGATGTTTGATACAATGCCAAAGAGAA
AGTCA

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1B713TF 723 0 0
GAACGAGAAAGATATCTAAAGTTCATCTTCTTCTCTGTTCTCTAAACACTCTCATGGCAT
CAGAGCTTCAGTCGGTTCATGGGAGTCACTCTTATCCTTT*CTAGCTTCCGCTTGCTAAC
CATTTTGAAGTCATCACCTTTGCTGCTGTTTCTGTTATCTACGGCTGAAACCCAATCTTG
TCAAAGATTAAACAAGCTTCATCCTTTATGTTTCATACATCTTTCTCTCAGTCATGGAGT
TTTCCAACAGTCGAGAGCTTGTGTTCGATGAGAAACTCTGCAAGTGAAGCTTGATTTGTT
CGTTGTTCTTCATTTGCTCGTTTTACTGAAGTCAGAAAGGATGGAGCTTGCCGTTGGTTA
AGAGTCTTAAGACCAGACAGCACAGCACAAGCCACTGTCAGAGTACTACGAGGACAACAT
TGAAATGGTTCCAGTCCGTGTCCATACTGTCCTGCTCTCAACTTTGCAAACCGCACCTGC
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AGAACAAGTGAATGTCCGTTTGATAGATTGAGAATGATGTTAGCTGGCTGGTTTTAGATA
AGGAATCGTGAGGTTGATTAAATTAGTAGGTTGCGGTTAGTTTCAATGATGGGGTTGTTA
CTGCAAGTTGGTGTTTTTGATTGGTGCACACAAGATGTTTGATACA*TGCCAAAGAGAAA
GTC

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1H405TF 724 0 0
G
GAACGAGAAAGATATCTAAAGTTCATCTTCTTCTCTGTTCTCTAAACACTCTCATGGTAT
CAGAGCTTCAGTCGGTTCATGGGAGTCACTCTTATCTTTTTCTAGCTTCCGCCTGCTAAC
CATTTTGAAGTCATCACCTTTGCTGCTGTTTCTGTTATCTACGGCTGAAACCCAATCTTG
TCAAAGATTAAACAAGCTTCATCCTTTATGTTTCATACATCTTTCTCTCAGTCATGGAGT
TTTCCAACAGTCGAGAGCTTGTGTTCGATGAGAAACTCTGCAAGTGAAGCTTGATTTGTT
CGTTGTTCTTCATTTGCTCGTTTTACTGAAGTCAGAAAGGATGGAGCTTGCCGTTGGTTA
AGAGTCTTAAGACCAGACAGCACAGCACAAGCCACTGTCAGAGTACTACGGGGACAACAT
TGAAATGGTTCCATTCCGTGTCCATACTGTCCTACTCTCAACTTTGCAAACCGCACCTGC
CCTCAAGGAGCACGTCAAATCTGTTTATCTATGGTATGCATCTGTTCTTTTCTCTGCGAC
AGAACAAGTGAATGTCCGTTTGATAGATTGAGAATGATGTTAGCTGGCTGGTTTTAGATA
AGGAATCGTGAGGTTGATTAAATTAGTAGGTTGCGGTTAGTTTCAATGATGGGGTTGTTA
CTGCAAGTTGGTGTTTTTGATTGGTGCACACAAGATGTTTGATACAATGCCAAAGAGAAA
GTC

QA 2 724 2 724
DS 



AS 1 2

CO CL4026Contig1 660 2 3 U
TTGGGGGCCAAGACTTTCTTTACAAATTTGAACTAGAACTTTCTTTTACTTATCCCTAGT
GCCTTAATCTCTTTTGAGTTCTTAGAGTCTACCCTTTCTTTCACCACTTTTCACACTCCC
AAGATCAAACTTTACAACACTCTCATCCCATCCTAGAAGCTAGACAACATGAGTCTTAAA
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TAAAGCTTTCCAAAAAGACCTCACTCAACAATCAATGATGGCTCGAAAGGAGGGAAGGGT
TTTAGGGAATGGACTACCACTTGAGTTTGTCAAAAAGATTGGCAAAATAGGTGGGACAAC
TCAAGTGTGTATAGCCATGATTTAGTACACAAAAGACCATAAGCATGAAGCATTAAGATC
ATTCAATTCATATAAGATTGGAGTTGGCTTCAAAGATGAGAAGTTTCAACAATCAATGAG
TTTCAAGAGGAGTTTCAAGGCTCGAAGTCTACAAGTTTTCAAAAGAGTGCTCAAGCTACT
TGTCATGATTACAAAGGGTATCAAATTGAGTACTTAGCATGAGCTCTTTACAAGGTTGAC
TCCCAATGCATGAATGCAACCTATATGCTTCTAGACTCAATCCTAAAGATGCAAATGAAC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GC55JQ U 3
AF RS1GC55TF C 1
BS 1 2 RS1GC55TF
BS 3 588 RS1GC55JQ
BS 589 660 RS1GC55TF

RD RS1GC55JQ 586 0 0
GGGGGCCAAGACTTTCTTTACAAATTTGAACTAGAACTTTCTTTTACTTATCCCTAGTGC
CTTAATCTCTTTTGAGTTCTTAGAGTCTACCCTTTCTTTCACCACTTTTCACACTCCCAA
GATCAAACTTTACAACACTCTCATCCCATCCTAGAAGCTAGACAACATGAGTCTTAAAGC
TAGCAAATAATGGAGACCAAGCATTGTCGATCCCAATACTCTCAACATTATGCACATGTA
AAGCTTTCCAAAAAGACCTCACTCAACAATCAATGATGGCTCGAAAGGAGGGAAGGGTTT
TAGGGAATGGACTACCACTTGAGTTTGTCAAAAAGATTGGCAAAATAGGTGGGACAACTC
AAGTGTGTATAGCCATGATTTAGTACACAAAAGACCATAAGCATGAAGCATTAAGATCAT
TCAATTCATATAAGATTGGAGTTGGCTTCAAAGATGAGAAGTTTCAACAATCAATGAGTT
TCAAGAGGAGTTTCAAGGCTCGAAGTCTACAAGTTTTCAAAAGAGTGCTCAAGCTACTTG
TCATGATTACAAAGGGTATCAAATTGAGTACTTAGCATGAGCTCTT

QA 1 586 1 586
DS 

RD RS1GC55TF 660 0 0
TTGGGGGCCAAGACTTTCTTTACAAATTTGAACTAGAACTTTCTTTTACTTATCCCTAGT
GCCTTAATCTCTTTTGAGTTCTTAGAGTCTACCCTTTCTTTCACCACTTTTCACACTCCC
AAGATCAAACTTTACAACACTCTCATCCCATCCTAGAAGCTAGACAACATGAGTCTTAAA
GCTAGCAAATAATGGAGACCAAGCATTGTCGATCCCAATACTCTCAACATTATGCACATG
TAAAGCTTTCCAAAAAGACCTCACTCAACAATCAATGATGGCTCGAAAGGAGGGAAGGGT
TTTAGGGAATGGACTACCACTTGAGTTTGTCAAAAAGATTGGCAAAATAGGTGGGACAAC
TCAAGTGTGTATAGCCATGATTTAGTACACAAAAGACCATAAGCATGAAGCATTAAGATC
ATTCAATTCATATAAGATTGGAGTTGGCTTCAAAGATGAGAAGTTTCAACAATCAATGAG
TTTCAAGAGGAGTTTCAAGGCTCGAAGTCTACAAGTTTTCAAAAGAGTGCTCAAGCTACT
TGTCATGATTACAAAGGGTATCAAATTGAGTACTTAGCATGAGCTCTTTACAAGGTTGAC
TCCCAATGCATGAATGCAACCTATATGCTTCTAGACTCAATCCTAAAGATGCAAATGAAC

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL4027Contig1 536 2 2 U
ACCGAAACATTTATCAATGTAAACAAGAAAGCAGAATTGTTTTTCATAGAAAGATGAGAA
ATTGGAGATGTTTAACAAGTTGCAGCATCTGTTCGAATAGAGTTACAGTGAGAAAAAGTG
AATGGAAAGACTCTAGTTGGAGAAGAGGGACTCGTCGATGTCGATTTTGATCTCCTCGTC
GTTCTCAAACTTATCCTTCCTCGGTGGAGCAGGAGGGACAGGAACTCTCTGTGGCCCTCT
TCCTTTATTCTTGTTCCTTGGCCTCGCATTCCCGAAAGAGTGATTGAAACGCTTTCCTCT
CGCTGTTTTGCGGTCACCTCGGCCACAGTACACAAGTGGAACTGAGCTGGATGATGACGA
GGCGGAGAGATACAGTTGCTGAGGGAAGCAAGAGAGAGACACGCCGAGAGTTTCCAAGTG
AGACGATGATAGCCTCGGAGATGTTGCGACGGTGGTGACTCGCGGAGGAGCTCCGAGTAG
AAGCGACGCCATCGCCGTGAATGTCTGTCTGAGGAGGAGGATAAGGTTGAAATGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AO65TFB C 1
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BS 42 536 RS1AO65JQ

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GTTCTCAAACTTATCCTTCCTCGGTGGAGCAGGAGGGACAGGAACTCTCTGTGGCCCTCT
TCCTTTATTCTTGTTCCTTGGCCTCGCATTCCCGAAAGAGTGATTGAAACGCTTTCCTCT
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CC

QA 1 534 1 534
DS 

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GTTACAGTGAGAAAAAGTGAATGGAAAGACTCTAGTTGGAGAAGAGGGACTCGTCGATGT
CGATTTTGATCTCCTCGTCGTTCTCAAACTTATCCTTCCTCGGTGGAGCAGGAGGGACAG
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GATTGAAACGCTTTCCTCTCGCTGTTTTGCGGTCACCTCGGCCACAGTACACAAGTGGAA
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CGCCGAGAGTTTCCAAGTGAGACGATGATAGCCTCGGAGATGTTGCGACGGTGGTGACTC
GCGGAGGAGCTCCGAGTAGAAGCGACGCCATCGCCGTGAATGTCTGTCTGAGGAGGAGGA
TAAGGTTGAAATGCC

QA 1 495 1 495
DS 



AS 1 3

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GTCTGAGATTACTCCTCCTCTGTGTCCGTCGCCGCCGAGATCAGTAGATCGACACACAGA
GATGGCTATGTCTCAGGTGGTGAACACGTACCCGCTTTCGAACTACAGCTTCGGAACTAA
AGAACCGAAGCTCGAAAAGGACACCTCCGTCGCCGACCGTCTCGCTCGTATGAAAATCAA
CTATATGAAAGAGGGCATGAGGACTAGCGTTGATGCGATTCTGCTGGTACAAGAACACAA
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CCTGAAGCCTGGAGAAAATGAAGTTGAAGGCCTGAAAAGAAAGTTGACTAGTAAGCTTGG
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GCGTCCAAACTTTGAAACCATGATGTACCCGTACTGCCCTCCTCACATAACCAAACCAAA
GGAATGCAAGAGACTCTACATTGTTCACTTGTCTGAGAAAGAGTACTTTGCAGTGCCCAA
AAACTTGAAGCTCTTGGCCGTCCCTTTGTTCGAACTCTATGACAATGTTCAGAGATATGG
ACCTGTTATATCAACCATTCCTCAACAGCTATCCAGATTCCATTTCAACATGATTAGTTC
ATAATCCGACTTGGTATTCAAGAACAAAGAAACCTATCCGATGGTAAAGTTACTTAGGCA
CAGTAGAGAGCTGTCGCTACTTGACCTTATAGACTTGTTTGGTTCATTCAAGTTTCAGCA
CACAAGAAGACTATTGATCTTGTATTTTCAAACGCATTAGTCATTATTCGATTAACGGCT
GTCTTGTTGAATGATACTTTTTATGTTTGTGGTATGTATGAAACAGAACAAGCTAGGCCA
TGCTAAAACTTATTTGTTGGACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FC43TF U 42
AF RS1H556TF U 1
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RD RS1FC43TF 696 0 0
GG
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GTAGATCGATACACAGAGATGGCTATGTCTCAGGTGGTGAACACGTACCCGCTTTCGAAC
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AAACTTCCTGGTGGTCGCCTGAAGCCTGGAGAAAATGAAGTTGAAGGCCTGAAAAGAAAG
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CACATAACCAAGCCAAAGGAATGCAAGAGACTCTACATTGTTCACTTGTCTGAGAAAGAG
TACTTTGCAGTGCCCAAAAACTTGAATCTCTTGGCTGTTCCTTTGTTCGAACTCTATGAC
AATGTTCAGAGATATGGACCTGTTATATCAACCATTCCTCAACAGCTATCCAGATTCCAT
TTCA*CATGATTAGTTCATAATCCGACTTGGTAT

QA 3 696 3 696
DS 

RD RS1H556TF 811 0 0
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GTCTGAGATTACTCCTC***TGTGTCCGTCGCCGCCGAGATCAGTAGATCGACACACAGA
GATGGCTATGTCTCAGGTGGTGAACACGTACCCGCTTTCGAACTACAGCTTCGGAACTAA
AGAACCGAAGCTCGAAAAGGACACCTCCGTCGCCGACCGTCTCGCTCGTATGAAAATCAA
CTATATGAAAGAGGGCATGAGGACTAGCGTTGATGCGATTCTGCTGGTACAAGAACACAA
CCATCCTCACATACTTCTCCTGCAAATTGGGAACACATTCTGCAAACTTCCTGGTGGTCG
CCTGAAGCCTGGAGAAAATGAAGTTGAAGGCCTGAAAAGAAAGTTGACTAGTAAGCTTGG
AGGCAATTCGGCTGGTCTTGTACCTGACTGGAAGGTAGGAGAATGTGTTGCGACATGGTG
GCGTCCAAACTTTGAAACCATGATGTACCCTTACTGCCCTCCTCACATCACGAAACCAAA
GGAATGCAAGAGACTCTACATTGTTCACTTGTCTGAGAAAGAGTACTTTGCAGTGCCCAA
AAACTTGAAGCTCTTGGCCGTCCCTTTGTTCGAACTCTATGACAATGTTCAGAGATATGG
ACCTGTTATATCAACCATTCCTCAACAGCTATCCAGATTCCATTTCAACATGATTAGTTC
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CAGTAGAGAGCTGTCGCTACTTGACCTTATA

QA 1 811 1 811
DS 

RD RS1FC43JQ 371 0 0
TTGGCTGTT
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AACAAAGAAACCTATCCGATGGTAAAGTTACTTAGGCACAGTAGAGAGCTGTCGCTACTT
GACCTTATAGACTTGTTTGGTTCATTCAAGTTTCAGCACACAAGAAGACTATTGATCTTG
TATTTTCAAACGCATTAGTCATTATTCGATTAACGGCTGTCTTGTTGAATGATACTTTTT
ATGTTTGTGGTATGTATGAAACAGAACAAGCTAGGCCATGCTAAAACTTATTTGTTGGAC
CG

QA 10 371 10 371
DS 



AS 1 3

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GGTCTCCTTCCCCACCACGTTCCTCCTCCGTCTGCTCAACAGCACTACGGTTACCGGCAA
CCGCCTCCTTACGCTGCTCCTCCACCACAGATGTGGAATCCACAAGCGCCGCCACCAAGC
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GATGAGAGTTTCCTCTACAGTTGTTTTGCTCACACCGGAGAGGTTCTTTCTGTTAAAGTC
ATCCGTAACAAGCAGACATCTCAGGTTGAAGGCTACGGTTTCATCGAGTTTGTATCTCAC
GCTGCTGCTGAACGAGCTCTACAAACATACAACAGCACTCCCGTCCCTGGCCTTCCTGAT
CAGCTCTTTAGATTGAACTGGGCCTCGTTGGGCTCTGGTGATAAACGTGACGATTCACCG
GATTACACTATCTTCGTTGGTGATCTCGCCGCTGATGTTACAGACTATGTCTTGCTAGAG
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GGGCGTACAAAGGGATATGGTTTCGTTAGGTTTTCTGATGAGAGTGAACAGATTCGTGCA
ATGACTGAGATGAACGGTGTTCCTTGTTCGACAAGGCCTATGAGGATTGGGCCAGCTGCT
AGCAAAAAAGGTGTGTCTGGTCAGAGAGATTCATACCAGAGTGCTGCTTCAGGGGTTCCA
ACCGATAATGATCCCAATAACACAACCGTTTTTGTTGGTGGATTAGATCCCACTGTGACA
GATGATCATCTAAAGAATGTCTTTAGCCAGTATGGCGAGATTGTGCATGTGAAAATACCT
GCCGGAAAGCGCTGTGGATTCGTTCAGTTTTCTGAGAAAAGCTGTGCAGAGGAAGCAATT
AGGACGTTGAATGGAACGCAGTTGGGTGGAACAACCGTCAGGCTATCATGGGGACGAAGT
CCTTCATCTAAACAGGCGGCGGATCCGAGTCAGTATTATTACGGTGGGTATGGACAAAGT
CGGGAGCATTATGGATACTCCATGCCGCAAGATCCTAACGCATATTACGGAGGCTACCCT
GGCGGGTATCAGCAGCCACCACAGGTGGGGCAGCAACCACCTCAGCAGCCACCACAGCAG
CAACAAGTCGGGTTCAGCTACTAGCTGGCGAGAGTGTTTTTAGCTCCACTGTTTGTTGTT
TGTTTACTTTGTCATGAAACAGACGCAGTTGACCTCTCTCTCTCTCTCTTTAGGACAGTT
TCTTTTGCTCAGCACTGATACTAAAGGAGTGTGAAGAGATTTGACTCTTAATAATGCTTT
GTGTGCTTCTGTTTTCTTTATTTCTTTTCCTTGCTTTAGAAGTGTAGAACATGAACGGCT
ATAATAAGATTTTAAGCTTCCATTTATAAAATAGCCAATCATGTTCTAC


BQ
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A

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G
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DS 



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ATCTGTTTTTTTCACGGGTTAGATAGAGAGGGAGGATGTCGACACCAGCAAGGAAGAGGT
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BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DS50TF U 1
AF RS1DS50JQ C 5
AF RS1EP11TF U 569
BS 1 699 RS1DS50TF
BS 700 779 RS1EP11TF

RD RS1DS50TF 706 0 0
GGGATCGCACGGTGAAACCCAAGAACCGGCCCCCACCGTCGGTCATCGCCTCCACACAGA
TGTTCTCTTGAAAACCTCTTCCTTTAATCGCCAGCTTATTATTACTCAACAAACAACAAG
ATCTGTTTTTTTCACGGGTTAGATAGAGAGGGAGGATGTCGACACCAGCAAGGAAGAGGT
TGATGAGGGATTTCAAGAGGTTGCAGCAAGACCCACCTGCTGGTATCAGCGGTGCTCCAC
AAGACAATAACATCATGCTCTGGAACGCTGTCATATTCGGGCCTGATGACACACCATGGG
ATGGAGGTACTTTCAAACTGTCACTGCAGTTCTCTGAAGATTATCCTAATAAACCTCCAA
CAGTTCGTTTTGTGTCACGGATGTTTCATCCAAATATTTATGCAGATGGGAGTATTTGCT
TGGACATTCTGCAAAACCAGTGGAGCCCTATATATGATGTTGCTGCTATACTTACCTCCA
TCCAGTCGCTGCTCTGTGACCCTAATCCGAATTCTCCTGCAAACTCGGAAGCCGCTCGGA
TGTACAGCGAAAGCAAGCGTGAGTACAACAGAAGAGTGCGCGATGTTGTTGAGCAAAGCT
GGACTGCTGACTAGTTGTGTTGTTTGTTTGTTGTAATCTTTGTAACTCTCTCCTACTCTC
AAAATGTCACCTTTAAAAGCAACAAACTTTCACTTATCT
AAAAAAA

QA 1 699 1 699
DS 

RD RS1DS50JQ 695 0 0
TCGCACGGTGAAACCCAAGAACCGGCCCCCACCGTCGGTCATCGCCTCCACACAGATGTT
CTCTTGAAAACCTCTTCCTTTAATCGCCAGCTTATTATTACTCAACAAACAACAAGATCT
GTTTTTTTCACGGGTTAGATAGAGAGGGAGGATGTCGACACCAGCAAGGAAGAGGTTGAT
GAGGGATTTCAAGAGGTTGCAGCAAGACCCACCTGCTGGTATCAGCGGTGCTCCACAAGA
CAATAACATCATGCTTTGGAACGCTGTCATATTCGGGCCTGATGACACACCATGGGATGG
AGGTACTTTCAAACTGTCACTGCAGTTCTCTGAAGATTATCCTAATAAACCTCCAACAGT
TCGTTTTGTGTCACGGATGTTTCATCCAAATATTTATGCAGATGGGAGTATTTGCTTGGA
CATTCTGCAAAACCAGTGGAGCCCTATATATGATGTTGCTGCTATACTTACCTCCATCCA
GTCGCTGCTCTGTGACCCTAATCCGAATTCTCCTGCAAACTCGGAAGCCGCTCGGATGTA
CAGCGAAAGCAAGCGTGAGTACAACAGAAGAGTGCGCGATGTTGTTGAGCAAAGCTGGAC
TGCTGACTAGTTGTGTTGTTTGTTTGTTGTAATCTTTGTAACTCTCTCCTACTCTCAAAA
TGTCACCTTTAAAAGCAACAAACTTTCACTTATCT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1EP11TF 211 0 0
G
AGAAGAGTGCGCGATGTTGTTGAGCAAAGCTGGACTGCTGACTAGTTGTGTTGTTTGTTT
GTTGTAACCTTTGTAACTCTCTCTTACTCTCAAAATGTCACCTTTAAA*GCAACAAACTT
TCACTTATCTTTTCCATTCATGTCTTTTGTGTTTTCAAAACTCTTTTAGTGTGTGGAGAT
TTATGATCTTCCTTGAACCTGTTTCTTGCT

QA 2 211 2 211
DS 



AS 1 2

CO CL4031Contig1 470 2 2 U
GAAAGGATAACGTCCTGACTGTTGGAGGAGGAGAGGTCTCGGTTCCCTTTTTGCAAGAGA
AAGACCTCCCTTCTCGCTTCTTGGATGAAGGTGGTGTTCCGAATCAAGCATCTAGCTCTG
GAGCAGCGGTTCCTTCTGGGTTTACAGAGAAGAGTAGTAACACAGTTGCAAGCCCAGCGA
GTCAACCTTCAAGATCAGAGGGACCTGAGTTTGAAGCTAAGATAGCAAAGCTTGTGGAGT
TGGGCTTCTCGAGAGAAGCAGTGGTACAAGCTCTGAGATTGTTTGAAGGAAACGAAGAAC
AAGCTGCTGGGTTTCTCTTTGGCGGCTGAAGATTATTAGAGAAATAAAATTGTCCCATAA
ACCAAAAACACCAAACAAACTGTGATTTTATAAAGAGAGACTCTTTTCAAACTGCCTTCA
TTATTTGTATCTTATTACCTCTTCTTTACAAAACATAGCAATTGTGTACC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1E435JQ C 1
AF RS1E435TF U 1
BS 1 4 RS1E435JQ
BS 5 470 RS1E435TF

RD RS1E435JQ 470 0 0
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AAGACCTCCCTTCTCGCTTCTTGGATGAAGGTGGTGTTCCGAATCAAGCATCTAGTTCTG
GAGCAGCGGTTCCTTCTGGGTTTACAGAGAAGAGTAGTAACACAGTTGCAAGCCCAGGGA
GTCAACCTTCAAGATCAGAGGGACCTGAGTTTGAAGTTAAGATAGCAAAGCTTGTGGAGT
TGGGCTTCTCGAGAGAAGCAGTGGTACAAGTTCTGAGATTGTTTGAAGGAAACGAAGAAC
AAGCTGCTGGGTTTTTCTTTGGCGGCTGAAGATTATTAGAGAAATAAAATTGTCCCATAA
ACCAAAAACACCAAACAAACTGTGATTTTATAAAGAGAGACTCTTTTCAAACTGCCTTCA
TTATTTGTATCTTATTACCTCTTCTTTACAAAACATAGCAATTGTGTACC

QA 1 470 1 470
DS 

RD RS1E435TF 470 0 0
GGAA
GGATAACGTCCTGACTGTTGGAGGAGGAGAGGTCTCGGTTCCCTTTTTGCAAGAGAAAGA
CCTCCCTTCTCGCTTCTTGGATGAAGGTGGTGTTCCGAATCAAGCATCTAGCTCTGGAGC
AGCGGTTCCTTCTGGGTTTACAGAGAAGAGTAGTAACACAGTTGCAAGCCCAGCGAGTCA
ACCTTCAAGATCAGAGGGACCTGAGTTTGAAGCTAAGATAGCAAAGCTTGTGGAGTTGGG
CTTCTCGAGAGAAGCAGTGGTACAAGCTCTGAGATTGTTTGAAGGAAACGAAGAACAAGC
TGCTGGGTTTCTCTTTGGCGGCTGAAGATTATTAGAGAAATAAAATTGTCCCATAAACCA
AAAACACCAAACAAACTGTGATTTTATAAAGAGAGACTCTTTTCAAACTGCCTTCATTAT
TTGTATCTTATTACCTCTTCTTTACAAAACATAGCAATTGTGTACC

QA 5 470 5 470
DS 



AS 1 3

CO CL4032Contig1 789 3 9 U
GGAAAACGTTTTCACCATTATCATCTTATTATCGAAAGTTCGAACACAAGGATATGAATT
TAACAAAATAAACAGAAAAGACAACATTTGGAAACTGAGTTTTGCTCCGCAGCTACTTAT
TAAGATCCGACTCGAAAACAGAAAAGGAATCTTCAAAATGAGGGAAGTAGCCAGAAAACC
TGAAAAAAGGAAAGCTTTCTAGACAGCAATCCCAAGGGATTTCTTGAACTTCTCAACCTC
AAGATAGACAGTTGAGTAAGGCAAGAACTCAGAGAAGTAATCTCCACTAAGGTGGTTAAT
GGCAACAGCCAGTTTCGGGATCTCCAAGGTTTCCTCATTGGTGAGTGTTCGAATAAACCT
TGCTGGACTGCCTCCCCAGAGTTCACCAGATGGGATTCTCCTCCCAGGTGGAACAACGGA
ACCAGCTTCCAGGATTGACCGGGTCTCCACCAGGGAACCTTCCATCAAAATCGAGTGTTG
CCCGATGATGCACTCGGGTTCGATAGTGCATGATCTTAAAAGACTGTATGCACCAACCGT
CACATACCTATCGATCAATGTCTCTGCTGGTAATCCTGTTGGGGACGACCAGGCGGCATG
AACAACACACCGTTCCTGGACGTTAGAGCAGAAGCCAAGGGTGATCTTGTTGAGATCTCC
CCTCAAAACGGCACCGTTCCAGACCGATGACCCGTCCCAGACTGTGACCTGACCGGCCAA
CACAACGTTCGGTGCCACGTAGGCGTCGACTGCGACCTTGGGTAGCCACTGTCCCAGAGG
AATGATCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D263JQ U 1
AF RS1GU22JQ U 38
AF RS1D263TF C 184
BS 1 82 RS1D263JQ
BS 83 83 RS1GU22JQ
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BS 275 475 RS1D263JQ
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BS 521 521 RS1D263TF
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BS 628 789 RS1D263TF

RD RS1D263JQ 475 0 0
GGAAAACGTTTTCACCATTATCATCTTATTATCGAAAGTTCGAACACAAGGATATGAATT
TAACAAAATAAACAGAAAAGACTACATTTGGAAACTGAGTTTTGCTCCGCAGCTACTTAT
TAAGATCCGACTCGAAAACAGAAAAGGAATCTTCAAAATGAGGGAAGTAGCCAGAAAACC
TGAAAAAAGGAAAGCTTTCTAGACAGCAATCCCAAGGGATTTCTTGAACTTCTCAACCTC
AAGATAGACAGTTGAGTAAGGCAAGAACTCAGAAAAGTAATCTCCACTAAGGTGGTTAAT
GGCAACAGCCAGTTTCGGGATCTCCAAGGTTTCCTCATTGGTGAGTGTTCGAATAAACCT
TGCTGGACTGCCTCCCCAGAGTTCACCAGATGGGATTCTCCTCCCAGGTGGAACAACGGA
ACCAGCTTCCAGGATTGACCGGGTCTCCACCAGGGAACCTTCCATCAAAATCGAG

QA 1 475 1 475
DS 

RD RS1GU22JQ 590 0 0
GTTCGAACACAAGGATATGAATTTAACAAAATAAACAGAAAAGACAACATTTGGAAACTG
AGTTTTGCTCCGCAGCTACTTATTAAGATCCGACTCGAAAACAGAAAAGGAATCTTCAAA
ATGAGGGAAGTAGCCAGAAAACCTGAAAAAAGGAAAGCTTTCTAGACAGCAATCCCAAGG
GATTTCTTGAACTTCTCAACCTCAAGATAAACAGTTGAGTAAGGCAAGAACTCAGAGAAG
TAATCTCCACTAAGGTGGTTAATGGCAACAGCCAGTTTCGGGATCTCCAAGGTTTCCTCA
TTGGTGAGTGTTCGAATAAACCTTGCTGGATTGCCTCCCCAGAGTTCACCAAATGGGATT
CTCCTCCCAGGTGGAACAACGGAACCAGCTTCCAGGATTGACCGGGTCTCCACCAGGGAA
CCTTCCATCAAAATCGAGTGTTGCCCGATGATGCACTCGGGTTCGATAGTGCATGATCTT
AAAGGACTGTATGCACCAACCGTCACATACCTATCGATCAATGTCTCTGCTGGTAATCCT
GTTGGGGACGACCAGGCGGCATGAACAACACACCGTTCCTGGACGTTAGA

QA 1 590 1 590
DS 

RD RS1D263TF 606 0 0
G
AAAAGGAAAGCTTTCTAGACAGCAATCCCAAGGGATTTCTTGAACTTCTCAACCTCAAGA
TAGACAGTTGAGTAAGGCAAGAACTCAGAGAAGTAATCTCCACTAAGGTGGTTAATGGCA
ACAGCCAGTTTCGGGATCTCCAAGGTTTCCTCATTGGTGAGTGTTCGAATAAACCTTGCT
GGACTGCCTCCCCAGAGTTCACCAGATGGGATTCTCCTCCCAGGTGGAACAACGGAACCA
GCTTCCAGGATTGACCGGGTCTCCACCAGGGAACCTTCCATCAAAATCGAGTGTTGCCCG
ATGATGCACTCGGGTTCGATAGTGCATGATCTTAAAAGACTGTATGCACCAACCGTCACA
TACCTATCGATCAATGTCTCTGCTGGTAATCCTGTTGGGGACGACCAGGCGGCATGAACA
ACACACCGTTCCTGGACGTTAGAGCAGAAGCCAAGGGTGATCTTGTTGAGATCTCCCCTC
AAAACGGCACCGTTCCAGACCGATGACCCGTCCCAGACTGTGACCTGACCGGCCAACACA
ACGTTCGGTGCCACGTAGGCGTCGACTGCGACCTTGGGTAGCCACTGTCCCAGAGGAATG
ATCTC

QA 2 606 2 606
DS 



AS 1 3

CO CL4033Contig1 1111 3 7 U
GGTTGAAATTCCTAATTTGTGGTACCTACTGTGTGTGACTGGTCACAGATGAGTAGCAGC
AGCCGATGGAATCGTACGATCTACGTTGGGAACTTGCCTGGTGATATTCGCATGAGAGAA
GTTGAAGATCTCTTCTACAAGTATGGACCCATTGTGGACATTGATTTGAAGATTCCACCG
AGACCTCCCGGTTATGCTTTTGTCGAGTACGAAGATCCTCGTGATGCAGATGATGCTATT
TATGGACGGGATGGGTATGACTTTGATGGATGTCGACTTCGGGTTGAGATTGCACATGGT
GGTCGTAGAGGTTCATCATCATCGGTGGATAGGTACAGCAGCAGCTACAGTGGGAGCCGT
GCACCTTCTAGACGTTCCGACTATCGTGTGCTTGTGACGGGATTGCCGTCGTCTGCTTCC
TGGCAGGACCTTAAGGACCACATGCGCAAAGCTGGAGATGTCTGTTTTTCTGAAGTTTTT
CGCGACCGTGGAGGCATGTCTGGGGTTGTGGATTATAGCAACTATGATGATATGAAGTAT
GCTATACGGAAGCTTGATGATTCTGAGTTTCGAAATGCTTTCTCTAGAGCTTATATACGG
GTGAGAGAATATGAGTCGAGGAGTATGAGTCGCAGCCCATACTATTCTAGAAGAAGCAGG
AGTCGAAGCTATAGCTATAGTAGCAGAAGTGTATCACCTGCTAAATCGAGATCTGCCCGT
TCTCGAACTCCTCTTTCTCGTTCTCCAACGCCGCGTAGCCCAGTCTCAAGGTCCCGGTCG
AGATCAAGATCAAATTCTCCAGTTCCATCCGTGAGATCTGATTAAAAAGGAAAGCTGGTG
ACCGGGAATAGAAGACCGCCGTATCCAAATCGACTCGTGCTTCTTCTCAGGGTCTACCGT
CCACTATAATAATCTGATTTGGAGTTGAGTTGTATCTCGAATGAACGATTAACGATAATA
ATGTGTGTTCTATTTCAAAACTTTAGTTGGTCTGTTATTGTGTCTCTTTGCAATGAACCG
AACCTCTGAAAAAAAAGCTATTTTTATAGATTGTGGTTACTTGGAAAACGTTTGTATCGT
TTTATACAGCGTTTGATAATCATTTTGAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DE25TF U 1
AF RS1AF09TF U 54
AF RS1AF09JQ C 371
BS 1 180 RS1DE25TF
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BS 656 825 RS1AF09TF
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RD RS1DE25TF 655 0 0
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GGACCTCCCGGTTATGCTTTTGTCGAGTACGAAGATCCTCGTGATGCAGATGATGCTATT
TATGGACGGGATGGGTATGACTTTGATGGATGTCGACTTCGGGTTGAGATTGCACATGGT
GGTCGTAGAGGTTCATCATCATCGGTGGATAGTTACAGCAGCAGCTACAGTGGGAGCCGT
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CGCGACCGTGGAGGCATGTCTGGGGTTGTGGATTATAGCAACTATGATGATATGAAGTAT
GCTATACGGAAGCTTGATGATTCTGAGTTTCGAAATGCTTTCTCTAGAGCTTATATACGG
GTGAGAGAATATGAGTCGAGGAGTATGAGTCGCAGCCCATACTATTCTAGAAGAA

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1AF09TF 772 0 0
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GAGAGAAGTTGAAGATCTCTTCTACAAGTATGGACCCATTGTGGACATTGATTTGAAGAT
TCCACCGAGACCTCCCGGTTATGCTTTTGTCGAGTACGAAGATCCTCGTGATGCAGATGA
TGCTATTTATGGACGGGATGGGTATGACTTTGATGGATGTCGACTTCGGGTTGAGATTGC
ACATGGTGGTCGTAGAGGTTCATCATCATCGGTGGATAGGTACAGCAGCAGCTACAGTGG
GAGCCGTGCACCTTCTAGACGTTCCGACTATCGTGTGCTTGTGACGGGATTGCCGTCGTC
TGCTTCCTGGCAGGACCTTAAGGACCACATGCGCAAAGCTGGAGATGTCTGTTTTTCTGA
AGTTTTTCGCGACCGTGGAGGCATGTCTGGGGTTGTGGATTATAGCAACTATGATGATAT
GAAGTATGCTATACGGAAGCTTGATGATTCTGAGTTTCGAAATGCTTTCTCTAGAGCTTA
TATACGGGTGAGAGAATATGAGTCGAGGAGTATGAGTCGCAGCCCATACTATTCTAGAAG
AAGCAGGAGTCGAAGCTATAGCTATAGTAGCAGAAGTGTATCACCTGCTAAATCGAGATC
TGCCCGTTCTCGAACTCCTCTTTCTCGTTCTCCAACGCCGCGTAGCCCAGTCTCAAGGTC
CCGGTCGAGATCAAGATCAAATTCTCCAGTTCCATCCGTGAGATCTGATTAA

QA 1 772 1 772
DS 

RD RS1AF09JQ 741 0 0
GACGTTCCGACTATCGTGTGCTTGTGACGGGATTGCCGTCGTCTGCTTCCTGGCAGGACC
TTAAGGACCACATGCGCAAAGCTGGAGATGTCTGTTTTTCTGAAGTTTTTCGCGACCGTG
GAGGCATGTCTGGGGTTGTGGATTATAGCAACTATGATGATATGAAGTATGCTATACGGA
AGCTTGATGATTCTGAGTTTCGAAATGCTTTCTCTAGAGCTTATATACGGGTGAGAGAAT
ATGAGTCGAGGAGTATGAGTCGCAGCCCATACTATTCTAGAAGAAGCAGGAGTCGAAGCT
ATAGCTATAGTAGCAGAAGTGTATCACCTGCTAAATCGAGATCTGCCCGTTCTCGAACTC
CTCTTTCTCGTTCTCCAACGCCGCGTAGCCCAGTCTCAAGGTCCCGGTCGAGATCAAGAT
CAAATTCTCCAGTTCCATCCGTGAGATCTGATTAAAAAGGAAAGCTGGTGACCGGGAATA
GAAGACCGCCGTATCCAAATCGACTCGTGCTTCTTCTCAGGGTCTACCGTCCACTATAAT
AATCTGATTTGGAGTTGAGTTGTATCTCGAATGAACGATTAACGATAATAATGTGTGTTC
TATTTCAAAACTTTAGTTGGTCTGTTATTGTGTCTCTTTGCAATGAACCGAACCTCTGAA
AAAAAAGCTATTTTTATAGATTGTGGTTACTTGGAAAACGTTTGTATCGTTTTATACAGC
GTTTGATAATCATTTTGAACT

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL4034Contig1 847 2 10 U
TTCATTAAAATCCCAAGAGTCAAAAAGATACAATTTTGGATAAACTACAAAGTACAAAGC
ATTATACGTGTACATCCCCTACAACAAGTTATAACACGTGTCAGGATAGAACCATGCATT
TTGAATTCTCTGCTACTTCGGGATCTTGAAGTCATCTCCGGCGACTCCGTCTCTAGACCA
CCAACGCAACTCGTTCTTCCCTTCTTTGATGCTTCAATGATTTCCAGAAACTGTACCCTT
TGAACTCATCCTTTCACCATCATCCGTAGCTTCAGTTCAGATTTCATTATTCTCACCGAT
TATTAAAACTGGGAAAGTTCAATCGATTTTGAGTAAATCCTATGCTGGACCATCAAAAGA
TGCCAACTTTACTGAATTTCTCACCCATCGATTAAATAGAATCCAACTCCTCTTCATCAT
TTCCGCCCGAGAACTAAACCTATGAAACACAAGCTTAAGAATAAACTTTTGTTCTCGATT
AAGAAAAGAATCCAAGCAGATCAGAGAAAACAGAATTCCAAACCAAAACAAACGGGATTA
AACTTAATTTGTGAAAGGGGGATAGCATCCGGATAAAACCGGAAGTTTTATCAATCCGAT
CTAATCCAGACAAACATAATAACCATGAAGAACAAAGCTGGATCCGGATTGAAGAACACA
ACAAAAAAAGTCGCCGAGCGAAATATATAAAAGTCGCCTATGCGAAATCTAAATCCGCTA
ACGGAAAACAAAAATCGATCCTTGGATCGAATATATTACATCAAAACAGAGGAGCTAATC
TCGAATCTTTCCTTTAAAAGATATTGAAATGATGAACAGAGGAAAAGGTCGAGAGAGAAA
TCTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G606JQ U 1
AF RS1EB91TF C 205
BS 1 235 RS1G606JQ
BS 236 236 RS1EB91TF
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RD RS1G606JQ 553 0 0
TTCATTAAAATCCCAAGAGTCAAAAAGATACAATTTTGGATAAACTACAAAGTACAAAGC
ATTATACGTGTACATCCCCTACAACAAGTTATAACACGTGTCAGGATAGAACCATGCATT
TTGAATTCTCTGCTACTTCGGGATCTTGAAGTCATCTCCGGCGACTCCGTCTCTAGACCA
CCAACGCAACTCGTTCTTCCCTTCTTTGATGCTTCAATGATTTCCAGAAACTGTATCCTT
TGAGCTCATCCTTTCACCATCATCCGTAGCTTCAGTTCAGATTTCATTATTCTCACCGAT
TATTAAAACTGGGAAAGTTCAATCGATTTTGAGTAAATCCTATGCTGGACCATCAAAAGA
TGCCAACTTTACTGAATTTCTCACCCATCGATTAAATAGAATCCAACTCCTCTTCATCAT
TTCCGCCCGAGAACTAAACGTATGAAACACAAGCTTAAGAATAAACTTTTGTTCTCGATT
AAGAAAAGAATCCAAGCAGATCGGAGAAAACAGAATTCCAAACCAAAACAAACGGGATTA
AACTTAATTTGTG

QA 1 553 1 553
DS 

RD RS1EB91TF 643 0 0
TTTGATGCTTCAATGATTTCCAGACACTGTACCCTTTGAACTCATCCTTTCACCATCATC
CGTAGCTTTAGTTCAGATTTCATTATTCTCACCGATTATTAAAACTGGGAAAGTTTAATC
GATTTTGAGTAAATCCTATGCTGGACCATCAAAAGATGCCAACTTTACTGAATTTCTCAC
CCATCGATTAAATAGAATCCAACTCCTCTTCATCTTTTCCGCTCGAGAACTAAACCTATG
AAACACAAGCTTAAGAATAAACTTTTGTTCTCGATTAAGAAAAGAATTCAAGCAGATCAG
GGAAAACAGAATTCCAAACCAAAACAAACGGGATTAAACTTAATTTGTGAAAGGGGGATA
GCATCCGGATAAAACCGGAAGTTTTATCAATCCGATCTAATCCAGACAAACATAATAACC
ATGAAGAACAAAGCTGGATCCGGATTGAAGAACACAACAAAAAAAGTCGCCGAGCGAAAT
ATATAAAAGTCGCCTATGCGAAATCTAAATCCGCTAACGGAAAACAAAAATCGATCCTTG
GATCGAATATATTACATCAAAACAGAGGAGCTAATCTCGAATCTTTCCTTTAAAAGATAT
TGAAATGATGAACAGAGGAAAAGGTCGAGAGAGAAATCTCTCC

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 3

CO CL4035Contig1 678 3 16 U
GGAGAACAGCAATGGCTTCTTGTTCTTCCATCTCCTTCTCATGCGCACCTTCACTCTTCT
CCACCAAACCCATCAACCATTCTTCTTCACCAAGGCTGCTCTCCTCTAAATTCCTCGGAA
CCCGAAACTTAAAGCTTCGGATCCGACCCAACAGACTCGGACCCTCCAACGGTTCAAGAA
CCACCTGCTGGTTCAAGTTCGGCAAGAACGGCGTCGATGCTGAAAGTGCAGGAATCTATG
GCAGTCAGACACGCGATGACTTCGACAAAGACGACGTTGAACAATATTTCAATTACATGG
GGATGCTTGCGGTAGAAGGCACCTATTCAAAGATGGAAGCACTTCTAAACCTAAAAATTC
ATCCCGTTGATATTCTACTGATGTTGGCAGCCACAGAAGGTGACAAACCGAAGATAGAGG
AGCTGCTTAGAGCTGGCGCTAGCTACTCGGTCAAGGATGCTGATGGAAGAACCGCTCTTG
ACAGAGCTAACAGTGAAGAGATTCGTGACTTGATCCTTGGCTACTCCTCTCAGAAGGCTT
GACGTGACTTGATCCTCGGCTACTCCACTCAGAAGGCTTGGATATCATCTTTAGTCTGAA
GTTATGTTTCTGAGTTATTATAAAGAATGTTGTGCTAGGACAAACTGTCTTTATGGGTTC
CGCGGATGAGTAGGTTAT


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FX86TF U 1
AF RS1DF07TF U 2
AF RS1DF07JQ C 100
BS 1 138 RS1FX86TF
BS 139 139 RS1DF07TF
BS 140 248 RS1FX86TF
BS 249 249 RS1DF07TF
BS 250 336 RS1FX86TF
BS 337 337 RS1DF07TF
BS 338 527 RS1FX86TF
BS 528 528 RS1DF07TF
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BS 581 581 RS1DF07TF
BS 582 638 RS1FX86TF
BS 639 639 RS1DF07TF
BS 640 669 RS1FX86TF
BS 670 678 RS1DF07JQ

RD RS1FX86TF 670 0 0
GGAGAACAGCAATGGCTTCTTGTTCTTCCATCTCCTTCTCATGCGCACCTTCACTCTTCT
CCACCAAACCCATCAACCATTCTTCTTCACCAAGGCTGCTCTCCTCTAAATTCCTCGGAA
CCCGAAACTTAAAGCTTCTGATCCGACCCAACAGACTCGGACCCTCCAACGGTTCAAGAA
CCACCTGCTGGTTCAAGTTCGGCAAGAACGGCGTCGATGCTGAAAGTGCAGGAATCTATG
GCAGTCAGGCACGCGATGACTTCGACAAAGACGACGTTGAACAATATTTCAATTACATGG
GGATGCTTGCGGTAGAAGGCACCTATTCAAAGATGGGAGCACTTCTAAACCTAAAAATTC
ATCCCGTTGATATTCTACTGATGTTGGCAGCCACAGAAGGTGACAAACCGAAGATAGAGG
AGCTGCTTAGAGCTGGCGCTAGCTACTCGGTCAAGGATGCTGATGGAAGAACCGCTCTTG
ACAGAGCTAACAGTGAAGAGATTCGTGACTTGATCCTTGGCTACTCCACTCAGAAGGCTT
GACGTGACTTGATCCTTGGCTACTCCACTCAGAAGGCTTGAATATCATCTTTAGTCTGAA
GTTATGTTTCTGAGTTATTATAAAGAATGTTGTGCTAGAACAAACTGTCTTTATGGGTTC
CGCGGATGA
G

QA 1 669 1 669
DS 

RD RS1DF07TF 668 0 0
GG
GAACAGCAATGGCTTCTTGTTCTTCCATCTCCTTCTCATGCGCACCTTCACTCTTCTCCA
CCAAACCCATCAACCATTCTTCTTCACCAAGGCTGCTCTCCTCTAAATTCCTCGGAACCC
GAAACTTAAAGCTTCGGATCCGACCCAACAGACTCGGACCCTCCAACGGTTCAAGAACCA
CCTGCTGGTTCAAGTTCGGCAAGAACGGCGTCGATGCTGAAAGTGCAGGAATCTATGGCA
GTCAGACACGCGATGACTTCGACAAAGACGACGTTGAACAATATTTCAATTACATGGGGA
TGCTTGCGGTAGAAGGCACCTATTCAAAGATGGAAGCACTTCTAAACCTAAAAATTCATC
CCGTTGATATTCTACTGATGTTGGCAGCCACAGAAGGTGACAAACCGAAGATAGAGGAGC
TGCTTAGAGCTGGCGCTAGCTACTCGGTCAAGGATGCTGATGGAAGAACCGCTCTTGACA
GAGCTAACAGTGAAGAGATTCGTGACTTGATCCTTGGCTACTCCTCTCAGAAGGCTTGAC
GTGACTTGATCCTCGGCTACTCCACTCAGAAGGCTTGGATATCATCTTTAGTCTGAAGTT
ATGTTTCTGAGTTATTATAAAGAATGTTGTGCTAGGACAAACTGTCTTTATGGGTTCCGC
GGATGA

QA 3 668 3 668
DS 

RD RS1DF07JQ 579 0 0
TCTCCTCTAAATTCCTCGGAACCCGAAACTTAAAGCTTCGGATCCGACCCAACAGACTCG
GACCCTCCAACGGTTCAAGAACCACCTGCTGGTTCAAGTTCGGCAAGAACGGCGTCGATG
CTGAAAGTGCAGGAATCTATGGCAGTCAGACACGCGATGACTTCGACAAAGACGACGTTG
AACAATATTTCAATTACATGGGGATGCTTGCGGTAGAAGGCACCTATTCAAAGATGGAAG
CACTTCTAAACCTAAAAATTCATCCCGTTGATATTCTACTGATGTTGGCAGCCACAGAAG
GTGACAAACCGAAGATAGAGGAGCTGCTTAGAGCTGGCGCTAGCTACTCGGTCAAGGATG
CTGATGGAAGAACCGCTCTTGACAGAGCTAACAGTGAAGAGATTCGTGACTTGATCCTTG
GCTACTCCTCTCAGAAGGCTTGACGTGACTTGATCCTCGGCTACTCCACTCAGAAGGCTT
GGATATCATCTTTAGTCTGAAGTTATGTTTCTGAGTTATTATAAAGAATGTTGTGCTAGG
ACAAACTGTCTTTATGGGTTCCGCGGATGAGTAGGTTAT

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

CO CL4036Contig1 654 2 2 U
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CTGTATCTTTCTCACTCTCTCTCGCAATGGAAGCTCAACACCTCCATGGCAAGCCTCTAG
CTGAAGGAGAATGGTCCACAGGATTCTGTGATTGCTTCTCCGACTGCAAAAACTGTTGTA
TCACATGCTGGTGTCCATGTATTACATTTGGCCAAGTCGCTGAGATTGTAGATCAAGGAT
CAACCACGTGTGGCACGGCTGGAGCACTATACGCGTTAATAAACGCAGTAACGGGTTGCG
CATGTATATACTCGTGTTTCTATCGTGGAAAGATGAGAGCTCAATACAATATCGAAGGCA
GTGATTGTGGAGACTGCCTAAAACATTTCTTCTGCGAGCTCTGTGCTCTCACCCAACAAT
ACCGTGAACTCAAGAACCGCGGTTTCAATATGGATCTTGGATGGGCGGGGAACGTACAGA
GGTAGCAAAACCAAGGCACCGAGATGGGTGCTCCTGTCTTTCAAGGTGGCATGAACCGTT
AAGACTAATTCTTTATATGTAATTTATTCGGTCATACTCATAATAAACGAGGTTTTAGTC
CTCTGTGTGTTTCTGTAATATGCTTCTGAATTATGAATGAAAGTGATTTTATTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RS1CD07JQ C 1
AF RS1CD07TF U 1
BS 1 650 RS1CD07TF
BS 651 654 RS1CD07JQ

RD RS1CD07JQ 654 0 0
GGAAAGACCTTAAACATATTGTTTTGTTTAAAAGTTAGTTTCTTTTCTTTTTTCCTCTCT
CTGTATCTTTCTCACTCTCTCTCGCAATGGAAGCTCAACACCTCCATGGCAAGCCTCTAG
CTGAAGGAGAATGGTCCACAGGATTCTGTGATTGCTTTTCCGACTGCAAAAACTGTTGTA
TCACATGCTGGTGTCCATGTATTACATTTGGCCAAGTCGCTGAGATTGTAGATCAAGGAT
CAACCACGTGTGGCACGGCTGGAGCACTATACGCGTTAATAAACGCAGTAACGGGTTGCG
CATGTATATACTCGTGTTTCTATCGTGGAAAGATGAGAGCTCAATACAATATCGAAGGCA
GTGATTGTGGAGACTGCCTAAAACATTTTTTTTGCGAGCTCTGTGCTCTCACCCAACAAT
ACCGTGAACTCAAGAACCGCGGTTTCAATATGGATCTTGGATGGGCGGGGAACGTACAGA
GGTAGCAAAACCAAGGCACCGAGATGGGTGCTCCTGTCTTTCAAGGTGGCATGAACCGTT
AAGACTAATTCTTTATATGTAATTTATTCGGTCATACTCATAATAAACGAGGTTTTAGTC
CTCTGTGTGTTTCTGTAATATGCTTTTGAATTATGAATGAAAGTGATTTTATTT

QA 1 654 1 654
DS 

RD RS1CD07TF 654 0 0
GGAAAGACCTTAAACATATTGTTTTGTTTAAAAGTTAGTTTCTTTTCTTTTTTCCTCTCT
CTGTATCTTTCTCACTCTCTCTCGCAATGGAAGCTCAACACCTCCATGGCAAGCCTCTAG
CTGAAGGAGAATGGTCCACAGGATTCTGTGATTGCTTCTCCGACTGCAAAAACTGTTGTA
TCACATGCTGGTGTCCATGTATTACATTTGGCCAAGTCGCTGAGATTGTAGATCAAGGAT
CAACCACGTGTGGCACGGCTGGAGCACTATACGCGTTAATAAACGCAGTAACGGGTTGCG
CATGTATATACTCGTGTTTCTATCGTGGAAAGATGAGAGCTCAATACAATATCGAAGGCA
GTGATTGTGGAGACTGCCTAAAACATTTCTTCTGCGAGCTCTGTGCTCTCACCCAACAAT
ACCGTGAACTCAAGAACCGCGGTTTCAATATGGATCTTGGATGGGCGGGGAACGTACAGA
GGTAGCAAAACCAAGGCACCGAGATGGGTGCTCCTGTCTTTCAAGGTGGCATGAACCGTT
AAGACTAATTCTTTATATGTAATTTATTCGGTCATACTCATAATAAACGAGGTTTTAGTC
CTCTGTGTGTTTCTGTAATATGCTTCTGAATTATGAATGAAAGTGATTTT
ATTT

QA 1 650 1 650
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4038Contig1 497 2 2 U
GGAAGGTTGAAGCAAAGAACGCACTTGAGAACTATGCTTACAACATGAGGAACACTATCC
GTGATGAGAAGATAGGTGAGAAGCTTCCTGCTGCAGACAAGAAGAAGATTGAGGATTCGG
TTGAGGAGGCAATCCAGTGGCTTGATGGCAACCAGACTGCTGAAGCAGACGAGTTTGAAG
ACAAGATGAAAGAGTTGGAGAGTGTCTGCAATCCCATCATAGCTAAGATGTATCAAGGAG
CTGGTGGTGATGCAGGTGGCCCCTCTGGAATGGATGACGATGAAGCTCCTCCTTCTACCG
GAGGTGCTGGTCCCAAGATTGAGGAAGTCGACTAAGCTGGTGCATTCTTTTGCTTTGATG
GTCTGAATTTTCAGTCTTGTTGGGTTTTATGTTCTGTTTTATTTTTGAGCTATGTACTAC
TCTCTCTATTATCTTGTGGACCTTTTTTCTTTATTTAGTGTCATCACTCTGTTTTTATGG
ATTCCAGTTTCTTGGCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AF27JQ C 1
AF RS1AF27TF U 1
BS 1 1 RS1AF27JQ
BS 2 497 RS1AF27TF

RD RS1AF27JQ 497 0 0
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GTGATGAGAAGATAGGTGAGAAGCTTCCTGCTGCAGACAAGAAGAAGATTGAGGATTCGG
TTGAGGAGGCAATCCAGTGGCTTGATGGCAACCAGACTGCTGAAGCAGACGAGTTTGAAG
ACAAGATGAAAGAGTTGGAGAGTGTCTGCAATCCCATCATAGCTAAGATGTATCAAGGAG
CTGGTGGTGATGCAGGTGGCCCCTCTGGAATGGATGACGATGAAGCTCCTCCTTCTACCG
GAGGTGCTGGTCCCAAGATTGAGGAAGTCGACTAAGCTGGTGCATTCTTTTGCTTTGATG
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TCTCTCTATTATCTTGTGGACCTTTTTTCTTTATTTAGTGTCATCACTCTGTTTTTATGG
ATTCCAGTTTCTTGGCC

QA 1 497 1 497
DS 

RD RS1AF27TF 497 0 0
G
GAAGGTTGAAGCAAAGAACGCACTTGAGAACTATGCTTACAACATGAGGAACACTATCCG
TGATGAGAAGATAGGTGAGAAGCTTCCTGCTGCAGACAAGAAGAAGATTGAGGATTCGGT
TGAGGAGGCAATCCAGTGGCTTGATGGCAACCAGACTGCTGAAGCAGACGAGTTTGAAGA
CAAGATGAAAGAGTTGGAGAGTGTCTGCAATCCCATCATAGCTAAGATGTATCAAGGAGC
TGGTGGTGATGCAGGTGGCCCCTCTGGAATGGATGACGATGAAGCTCCTCCTTCTACCGG
AGGTGCTGGTCCCAAGATTGAGGAAGTCGACTAAGCTGGTGCATTCTTTTGCTTTGATGG
TCTGAATTTTCAGTCTTGTTGGGTTTTATGTTCTGTTTTATTTTTGAGCTATGTACTACT
CTCTCTATTATCTTGTGGACCTTTTTTCTTTATTTAGTGTCATCACTCTGTTTTTATGGA
TTCCAGTTTCTTGGCC

QA 2 497 2 497
DS 



AS 1 3

CO CL4039Contig1 817 3 12 U
GGGCTCCATAGTATTAAACGGTATTACAAGAGATATTCGGCCACACCTTAACAGCATTTG
GCTCAAAAGTTACTCTTTCACTTTGCTTACACCACTAAACGCAGTTACAAGAAAAAAGCA
CAACCCATGAAGCATATAGCAAGCTGCCTTTCTGTGCAGGACTAAAGAGTCCTCAAGGGA
AACACATAACAATATCAATCTCTCAGGTTGAGATAATAAGAAAATATTTCACCTACGAGC
AAGTCTCTGCCCTGCTCCAACCATTAAGGCCTTGCCGATAGCACTTGAATGAAGCCCACA
AGCCAAAGCAACTCCTCCTACAGCGATCCATTTCCAATCTACATTGAACTGCTCCTTTTG
TCTCCTTGCCTTCTCCATGGCTTCTCCTCTCTCTTCTTCCTCCTCCTCTACTCTCGATGT
TTCCACCAAATCCATGTTCAGCTTTGAGGTGACTCCTGCCATTTGAGCGCTCCGTGACAG
AGCCACCCCTGGCTTTCTAGCACTCTGATACGCCCTTAACCCGGAGTTTAGCTTTTTGAC
GGCTCCCCACATGCCATGACGGACACCTAGCTTCGCTACGTCTTTTGGGATTCCCATGTC
TTCGCAGTGGACAAGAGAGACTTCACAAGCTGTCATTTGTCCATCCCCTTTTCGAGATTC
AACTGATTTGATTATCCAGCTTGAGAAATAAAGCTCCACTCGCCTTGGCTTATCACGCTT
TGGTAGAGTTGGATACGGAACTCCCTTAGTGACAGCATAATACTTCTTTCCAGATTCCCA
TATTCTCCTACCAATGATGTACTCCCGGTCACTACAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1GZ21JQ U 1
AF RS1GW37JQ U 61
AF RS1BC02TF C 150
BS 1 102 RS1GZ21JQ
BS 103 103 RS1GW37JQ
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BS 550 609 RS1GW37JQ
BS 610 817 RS1BC02TF

RD RS1GZ21JQ 446 0 0
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GCTCAAAAGTTACTCTTTCACTTTGCTTACACCACTAAACGCGGTTACAAGAAAAAAGCA
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AAGTCTCTGCCCTGCTCCAACCATTAAGGCCTTGCCGATAGCACTTGAATGAAACCCACA
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TCTCCTTGCCTTCTCCATGGCTTCTCCTCTCTCTTCTTCCTCCTCCTCTACTCTCGATGT
TTCCACCAAATCCATGTTCAACTTTG

QA 1 446 1 446
DS 

RD RS1GW37JQ 549 0 0
C
CTCAAAAGTTACTCTTTCACTTTGCTTACACCACTAAACGCAGTTACAAGAAGAAAGCAC
AACCCATGAAGCATATAGCAAGCTGCCTTTCTGTGCAGGACTAAAGAGTCCTCAAGGGAA
ACACATAACAATATCAATCTCTCAGGTTGAGATAATAAGAAAATATTTCACCTACGAGCA
AGTCTCTGCCCTGCTCCAACCATTAAGGCCTTGCCGATAGCACTTGAATGAAGCCCACAA
GCCAAAGCAACTCCTCCTACAGCGATCCATTTCCAATCTACATTGAACTGCTCCTTTTGT
CTCCTTGCCTTCTCCATGGCTTCTCCTCTCTCTTCTCCCTCCTCCTCTACTCTCGATGTT
TCCACCAAATCCATGTTCAGCTTTGTGGTGACTCCTGCCATTTGAGCGCTCCGTGACAGA
GCCACCCCTGGCTTTCTAGCACTCTGATACGCCCTTAACCCGGAGTTTAGCTTTTTGACG
GCTCCCCGCATGCCATGACGGACACCTAGCTTCGCTACGTCTTTTGGGATTCCCATGTCT
TCGCAGTG

QA 2 549 2 549
DS 

RD RS1BC02TF 668 0 0
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GAGATAATAAGAAAATATTTCACCTACGGGCAAGTCTCTGCCCTGCTCCAACCATTAAGG
CCTTGCCGATAGCACTTGAATGAAGCCCACAAGCCAAAGCAACTCCTCCTACAGCGATCC
ATTTCCAATCTACATTGAACTGCTCCTTTTGTCTCCTTGCCTTCTCCATGGCTTCTCCTC
TCTCTTCTTCCTCCTCCTCTACTCTCGATGTTTCCACCAAATCCATGTTCAGCTTTGAGG
TGACTCCTGCCATTTGAGCGCTCCGTGACAGAGCCACCCCTGGCTTTCTAGCACTCTGAT
ACGCCCTTAACCCGGAGTTTAGCTTTTTGACGGCTCCCCACATGCCATGACGGACACCTA
GCTTCGCTACGTCTTTTGGGATTCCCATGTCTTCGCAGTGGACAAGAGAGACTTCACAAG
CTGTCATTTGTCCATCCCCTTTTCGAGATTCAACTGATTTGATTATCCAGCTTGAGAAAT
AAAGCTCCACTCGCCTTGGCTTATCACGCTTTGGTAGAGTTGGATACGGAACTCCCTTAG
TGACAGCATAATACTTCTTTCCAGATTCCCATATTCTCCTACCAATGATGTACTCCCGGT
CACTACAG

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

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ATTCTTCCCGGACTTATCCACTGTCGGCAGGACGGACATAATCTTCTTCTGCTCCCCAAA
TAACCCTATCAGTGCTGCTGCCACGAGGGAGCAACTGACTCAGTTAGTACAGTTTGCAAA
GAAGAATGGATCAATCATAGTGTATGATTCAGCTTATGCAATGTACACGTCTGATGATAA
CCCACGCTCTATTTTCGAAATCCCTGGAGCAGAGGAGGTCGCTATGGAGACAGCTTCCTT
CAGCAAATACGCCGGTTTCACTGGAGTTAGACTTGGTTGGACAGTCATCCCCAAACAGCT
TCTCTATTCAGACGGCTTCCCTGTTGCAAAAGACTTCAACCGAATCGTCTGCACTTGTTT
CAACGGTGCATCTAATATCTCTCAAGCCGGTGCTCTTGCTTGCCTAACACCAGAAGGACT
AGAGGCGATGCAGAAGGTGGTTGGGTTCTACAAAGAAAACACAAACATAATCATCGACAC
GTTCACTTCTCTTGGCTATGATGTATACGGAGGGAAGAACGCGCCTTACGTTTGGGTTCA
CTTCCCAAACCAAAGCTCGTGGGATGTGTTTGCCGAGATTCTGGAGAAGACTCATGTGGT
TACGACTCCAGGGAGTGGGTTTGGACCAGGAGGTGAAGGGTTTGTTCGTGTTAGCGCCTT
TGGTCACAGAGAGAACATCTTGGAGGCGTGTCGGAGATTCAAGCAGCTTTACAAATGAAT
AAGATTCTTGTAATCATCATTCATCATATCGTTATCCTCCTTTTATGAACCATGACTGAA
AAAAATAATATCGTCTCCTTTGTTTTCTTGAATTGTAGCAACTAAGAAACAAATGTTTGC
AATCATAGCGAGAGGAACGTTAATGCGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CN16TF U 1
AF RS1CN16JQ C 154
BS 1 707 RS1CN16TF
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BS 709 727 RS1CN16TF
BS 728 990 RS1CN16JQ

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TAACACAGATGTGCAGAAGTATGGGAACATTCAGTACATGAGATGCACTCCAGAGAATGG
ATTCTTCCCGGACTTATCCACTGTCGGCAGGACGGACATAATCTTCTTCTGCTCCCCAAA
TAACCCTATCAGTGCTGCTGCCACGAGGGAGCAACTGACTCAGTTAGTACAGTTTGCAAA
GAAGAATGGATCAATCATAGTGTATGATTCAGCTTATGCAATGTACACGTCTGATGATAA
CCCACGCTCTATTTTCGAAATCCCTGGAGCAGAGGAGGTCGCTATGGAGACAGCTTCCTT
CAGCAAATACGCCGGTTTCACTGGAGTTAGACTTGGTTGGACAGTCATCCCCAAACAGCT
TCTCTATTCAGACGGCTTCCCTGTTGCAAAAGACTTCAACCGAATCGTCTGCACTTGTTT
CAACGGTGCATCTAATATCTCTCAAGCCGGTGCTCTTGCTTGCCTAACACCAGAAGGACT
AGAGGCGATGCAGAAGGTGGTTGGGTTCTACAAAGAAAACACAAACATAATCATCGACAC
GTTCACTTCTCTTGGCTATGATGTATACGGAGGGAAGAACGCGCCTTACGTTTGGGTTCA
CTTCCCAAACCAAAGCTCGTGGGATGTGTTTGCCGAGATTCTGGAGA*GACTCATGTGGT
TACGACT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1CN16JQ 837 0 0
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ACTGACTCAGTTAGTACAGTTTGCAAAGAAGAATGGATCAATCATAGTGTATGATTCAGC
TTATGCAATGTACACGTCTGATGATAACCCACGCTCTATTTTCGAAATCCCTGGAGCAGA
GGAGGTCGCTATGGAGACAGCTTCCTTCAGCAAATACGCCGGTTTCACTGGAGTTAGACT
TGGTTGGACAGTCATCCCCAAACAGCTTCTCTATTCAGACGGCTTCCCTGTTGCAAAAGA
CTTCAACCGAATCGTCTGCACTTGTTTCAACGGTGCATCTAATATCTCTCAAGCCGGTGC
TCTTGCTTGCCTAACACCAGAAGGACTAGAGGCGATGCAGAAGGTGGTTGGGTTCTACAA
AGAAAACACAAACATAATCATCGACACGTTCACTTCTCTTGGCTATGATGTATACGGAGG
GAAGAACGCGCCTTACGTTTGGGTTCACTTCCCAAACCAAAGCTCGTGGGATGTGTTTGC
CGAGATTCTGGAGAAGACTCATGTGGTTACGACTCCAGGGAGTGGGTTTGGACCAGGAGG
TGAAGGGTTTGTTCGTGTTAGCGCCTTTGGTCACAGAGAGAACATCTTGGAGGCGTGTCG
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ATCCTCCTTTTATGAACCATGACTGAAAAAAATAATATCGTCTCCTTTGTTTTCTTGAAT
TGTAGCAACTAAGAAACAAATGTTTGCAATCATAGCGAGAGGAACGTTAATGCGTCG

QA 1 837 1 837
DS 



AS 1 3

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TCTCCCGAAGTTGTATGCCAAGACGCAGTACTGTGTCTCATGTGCTATCCACTCTCACGT
CGTGAGAGTCCGTTCCCGCACCAACCGTAGGGTTCGTACCCCACCTCCACGTTTTGTCAG
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TGCCCCTGCTGCTGCTCGTGCTTAAAGACTGCAAGAAGCTGGCAACTCAAAAATCTTTAT
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AAAGATAATTTCGTCATGTCTACCTTTGAATGCTTGGAGACTATTTATCAGTTTGTTTTG
A


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10 

AF RS1AK64JQ C 1
AF RS1AK64TF U 1
AF RS1FP60TF U 10
BS 1 589 RS1AK64TF
BS 590 601 RS1FP60TF

RD RS1AK64JQ 589 0 0
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TTCCAACTGCGGGAAATGCTGTCCCAAGGATAAGGCGATCAAGAGGTTCATCGTCAGGAA
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TCTCCCGAAGTTGTATGCCAAGACGCAGTACTGTGTCTCATGTGCTATCCACTCTCACGT
CGTGAGAGTCCGTTCCCGCACCAACCGTAGGGTTCGTACCCCACCTCCACGTTTTGTCAG
ACGCAAGGAGGATGCTCCCAAGCCTGGACAGCCTGGTCAGGCCGCTCGCCCTGCTGGTGG
TGCCCCTGCTGCTGCTCGTGCTTAAAGACTGCAAGAAGCTGGCAACTCAAAAATCTTTAT
ATTCTAGTTTCAGTCTCAGGGTTGTCTAGAATTTTTGAAGATGCTTTCTACATTTGGTTT
AAAGATAATTTCGTCATGTCTACCTTTGAATGCTTGGAGACTATTTATC

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1AK64TF 589 0 0
GGAACGAAAAAGAAACGCGAATAGGCTTTGTTCTAACTCTCCACACTGCAACATGACTTT
CAAGCGCAGGAACGGTGGAAGGAACAAGCACAACCGTGGTCATGTGAACCCCATCAGGTG
TTCCAACTGCGGGAAATGCTGTCCCAAGGATAAGGCGATCAAGAGGTTCATCGTCAGGAA
CATCGTTGAACAAGCTGCCATCAGAGATGTTCAAGAAGCCAGTGTGTACGATGGTTACAC
TCTCCCGAAGTTGTATGCCAAGACGCAGTACTGTGTCTCATGTGCTATCCACTCTCACGT
CGTGAGAGTCCGTTCCCGCACCAACCGTAGGGTTCGTACCCCACCTCCACGTTTTGTCAG
ACGCAAGGAGGATGCTCCCAAGCCTGGACAGCCTGGTCAGGCCGCTCGCCCTGCTGGTGG
TGCCCCTGCTGCTGCTCGTGCTTAAAGACTGCAAGAAGCTGGCAACTCAAAAATCTTTAT
ATTCTAGTTTCAGTCTCAGGGTTGTCTAGAATTTTTGAAGATGCTTTCTACATTTGGTTT
AAAGATAATTTCGTCATGTCTACCTTTGAATGCTTGGAGACTATTTATC

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1FP60TF 592 0 0
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CGGGAAATGCTGTCCCAAGGATAAGGCGATCAAGAGGTTCATCGTCAGGAACATCGTTGA
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GTTGTATGCCAAGACTCAGTACTGTGTCTCATGTGCTATCCACTCTCACGTCGTGAGAGT
CCGTTCCCGCACCAACCGTAGGGTTCGTACCCCACCTCCACGTTTCGTCAGACGCAAGGA
GGATGCTCCCAAGCCTGGACAACCTGGTCAGGCCGCTCGCCCTGCTGGTGGTGCCCCTGC
TGCTGCTCGTGCTTAAAGACTGCAAGAAGCTGGCAACTCAAAAATCTTTATATTCTAGTT
TCAGTCTCAGGGTTGTCTAGAATTTTTGAAGATGCTTTCTACATTTGGTTTAAAGATAAT
TTCGTCATGTCTACCTTTGAATGCTTGGAGACTATTTATCAGTTTGTTTTGA

QA 1 592 1 592
DS 



AS 1 2

CO CL4042Contig1 951 2 6 U
TTTGTAGTAGTTCTGGCAATCCACATCAACCTGAGAGAGAGCTCCTATCGGCGTCACTGT
AATATATCCTTCTCGTAGGAAGTGAAGATCAGTGCCTTCTTCAACCACCACTGTCCTTAG
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GGCAGAAGGGACATCATAAATGAAGGCTTCACGAGCACCAGCAACAGTTCCAGAGTAGAC
GATGTTATATCCACAGTTGCTACCCACGTTTATACCACTAAGAACCAGGTCAGGAAGAGA
AGGGAAGAGTGCTTCCGATATGCCCAAACCAGTGCAATCCGCAGGGGTTCCAGAAACGGC
ATAGGCCTCAGCTCCTTCAATGTCAACTCTTTTGCAGTAAGAGGTCTGCTCCATATGATA
CTGTGACTTACAGCAGACTTCTCCGAATCGGGAGCGCAGACGCGGACTTGGTAGAGGTTG
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TTGATCATTATGATCGGGCGGTCACCGGAGATGCGATCTTCGCCGTTAATCGCCATCGCT
CTCTCTATATCTTATTAATAAGAGTCTTATTAGATAAGAGAAGGAAGACCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1H095JQB U 1
AF RS1FK70TF C 314
BS 1 339 RS1H095JQB
BS 340 340 RS1FK70TF
BS 341 357 RS1H095JQB
BS 358 358 RS1FK70TF
BS 359 461 RS1H095JQB
BS 462 951 RS1FK70TF

RD RS1H095JQB 461 0 0
TTTGTAGTAGTTCTGGCAATCCACATCAACCTGAGAGAGAGCTCCTATCGGCGTCACTGT
AATATATCCTTCTCGTAGGAAGTGAAGATCAGTGCCTTCTTCAACCACCACTGTCCTTAG
CTCTCTCTTGAACAAACGGCTATCATCTTTTGAATGATGAGCAGATGTGTGGTTGTTGTT
GTCTGAAACCACTCCTGAATCTGTTTCCATTGACATTGTTGACAACATCTTTGCACCTTG
TGCTTCCTCCTCCACTTGTCTCCATCCCATTCTACCCAAGCTTTTTCCTTGTCTAGTTAG
CTTGTAACCCTTATGGTTAGCAATATCAGTAGGCAAATCGATATTCAGAAAGCAGTTTGT
TGGGTGAGTTTTGTTCTTGATGGCAGTGAGCATGCCGTTGATAATAGGCAAACAAGCTTG
GGCAGCAAGGACAAAATCATTAGCATTGATGTCTCCACGCT

QA 1 461 1 461
DS 

RD RS1FK70TF 638 0 0
TGGTTAGCAATATCAGTAGGCAAATCAATATTCAGAAAGCAGTTAGTTGGGTGAGTTTTG
TTCTTGATGGCAGTGAGCATGCCGTTGATAATAGGCAAACAAGCTTGGGCAGCGAGGACA
AAATCATTAGCATTGATGTCTCCACGCTTCCAATCATAAGAAATGGAGGCAGAAGGGACA
TCATAAATGAAGGCTTCACGAGCACCAGCAACAGTTCCAGAGTAGACGATGTTATATCCA
CAGTTGCTACCCACGTTTATACCACTAAGAACCAGGTCAGGAAGAGAAGGGAAGAGTGCT
TCCGATATGCCCAAACCAGTGCAATCCGCAGGGGTTCCAGAAACGGCATAGGCCTCAGCT
CCTTCAATGTCAACTCTTTTGCAGTAAGAGGTCTGCTCCATATGATACTGTGACTTACAG
CAGACTTCTCCGAATCGGGAGCGCAGACGCGGACTTGGTAGAGGTTGGTGGAGACGAGGA
CGCTAACGAGAGAGCGGAGACCAGGCGCGTCTATCCCGTCGTCATTGTTGATCATTATGA
TCGGGCGGTCACCGGAGATGCGATCTTCGCCGTTAATCGCCATCGCTCTCTCTATATCTT
ATTAATAAGAGTCTTATTAGATAAGAGAAGGAAGACCC

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

CO CL4043Contig1 713 2 3 U
TTGTTTTTTCTCAACACATCTTTAGTTTGATCACCTTTTGCTAGTGCACAATCGAAGTAT
CGACTAACAGTATTCAGGAGTAACAAAGTATATATCTTACTCGGAAGCAGCGAGGCTTAC
CAAATGAGACACCAAATCTTCAAGACATGAAAACTGATTCAGTAAACTCTTTTGAAAGTC
TTGACTCTCATCTGAACTCATCTCACTTAAACCTTCGTTGATCCTCTTCATTCCCTTCTG
CAATAACTCCACTCCTCTGCATATTCCTTCTGGAAGTTTCCTTCTCTTGTTCGATTGTTT
CTCTACTTCCAATGATCTCCGCTGCTTTCTTCCTTCTAGAAGCTTCTGCACTGTTGCTTT
GACCTGCGTGCCTTCTTTCGAAAGCATCTCGAGTTCCTCTTGTGAAGGCGTGGTCGAGAG
AAGCGCTTGTTCTTTGTCCAAAAACATCTTTAGTTCCGACATGAACCGCTCTGTTTTTGC
TTCTTTTCCAGAAGCTATATCGAAAGCTAAAGCAGAGTCTTCAGGTACGAATCTCCATAG
CTGGGCACAGCTAGTACGCGGGCAGAAATAACCAAACGCAGTAACCGCGTGGTGTACCAA
AGCCCAGTGGCGTTTCCTGAGAAGCAAATGGTAGAGTTCCCAGACCGCACGGCTCTTTGG
ACAGGTTTCGGTTCCAGACATCGCGTATGTGCCAAGTCCTGACAAGAAGAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CP82JQ U 75
AF RS1DT17JQ U 1
BS 1 319 RS1DT17JQ
BS 320 320 RS1CP82JQ
BS 321 713 RS1DT17JQ

RD RS1CP82JQ 483 0 0
CAGGAGTAACAAAGTATATATCTTACTCGGAAGCAGCGAGGCTTACCAAATGAGACACCA
AATCTTCAAGACATGAAAACTGATTCAGTAAACTCTTTTGAAAGTCTTGACTCTCATCTG
AACTCATCTCACTTAAACCTTCGTTGATCCTCTTCATTCCCTTCTGCAATAACTCCACTC
CTCTGCATATTCCTTCTGGAAGTTTCCTTCTCTTGTTCGATTGTTTCTCTACTTCCAATG
ATCTCCGCTGCTTTCTTCCTTCTAGAAGCTTCTGCACTGTTGCTTTGACCTGCGTGCCTT
CTTTCGAAAGCATCTCGAGTTCCTCTTGTGAAGGCGTGGTCGAGAGAAGCGCTTGTTCTT
TGTCCAAAAACATCTTTAGTTCCGACATGAACCGCTCTGTTTTTGCTTCTTTTCCAGAAG
CTATATCGAAAGCTAAAGCAGCGTCTTCAGGTACGAATCTCCATAGCTGGGCACAGCTAG
TAC

QA 1 483 1 483
DS 

RD RS1DT17JQ 713 0 0
TTGTTTTTTCTCAACACATCTTTAGTTTGATCACCTTTTGCTAGTGCACAATCGAAGTAT
CGACTAACAGTATTCAGGAGTAACAAAGTATATATCTTACTCGGAAGCAGCGAGGCTTAC
CAAATGAGACACCAAATCTTCAAGACATGAAAACTGATTCAGTAAACTCTTTTGAAAGTC
TTGACTCTCATCTGAACTCATCTCACTTAAACCTTCGTTGATCCTCTTCATTCCCTTCTG
CAATAACTCCACTCCTCTGCATATTCCTTCTGGAAGTTTCCTTCTCTTGTTCGATTGTTT
CTCTACTTCCAATGATCTCTGCTGCTTTCTTCCTTCTAGAAGCTTCTGCACTGTTGCTTT
GACCTGCGTGCCTTCTTTCGAAAGCATCTCGAGTTCCTCTTGTGAAGGCGTGGTCGAGAG
AAGCGCTTGTTCTTTGTCCAAAAACATCTTTAGTTCCGACATGAACCGCTCTGTTTTTGC
TTCTTTTCCAGAAGCTATATCGAAAGCTAAAGCAGAGTCTTCAGGTACGAATCTCCATAG
CTGGGCACAGCTAGTACGCGGGCAGAAATAACCAAACGCAGTAACCGCGTGGTGTACCAA
AGCCCAGTGGCGTTTCCTGAGAAGCAAATGGTAGAGTTCCCAGACCGCACGGCTCTTTGG
ACAGGTTTCGGTTCCAGACATCGCGTATGTGCCAAGTCCTGACAAGAAGAGAG

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 3

CO CL4044Contig1 1727 3 5 U
GGATTCTTCTTTGTAGGAGAATTCGAAATCTCCACTCTTTGTCCATCTTCAAAGGTTTCG
ACATTGACTTTTGTATCAATTCGAAGATTACGATTCAAGACCTTGCTCCGGTTCCAAGGA
GGTGCTCTTCATCCAACGACGTGGCGGCTCCGTTACTGCCCAGAGTTCAGAGAGAAGAAG
TTGCTTGCGACGAGTTCAACGGAGCTTCTTTCAGTGGCGCCGTTTTCAATCTCGCCACGA
CGATAATCGGTGCTGGCATCATGGCTCTGCCCGCGACGATGAAGATCTTAGGGCTGGTGC
TCGGGATCACGATGATCGTTGTGATGGCTTTCTTGAGCGATGCCTCTATTGAGTTCTTGC
TTAGGTTTAGTAATATTAAGAAGAGTCGGTCTTACGGTGGCTTGATGGGCGACTCTTTTG
GGAAGCCTGGGAGGGTTTTGCTTCAAGTTGCTGTTTTAGTTAACAACATTGGTGTTTTGA
TTGTCTACATGATCATCATTGGTGATGTGTTGGCTGGAAAGACAGAAGATGGCATCCACC
ATTATGGTGTTCTTGAAGGATGGTTTGGTCACCATTGGTGGAACGGAAGACTTGCTATTC
TTCTCATTACTACTCTTGGTGTCTTTGCTCCTTTGGCTTGCTTCAAACGAATTGATTCTT
TGAGATTTACATCTGCCCTTGGCTCTAGCCGTCGTGTTCCTCATCATCACAGCGGGGATA
TCTATCATGAAGTTTATCAACGGTGGCGTGGCGATGCCAAGATTGTTTCCAGATGTTAGT
GACTTAACATCTTTCTTGAGCCTCTTCACAGTTGTACCTGTTCTCGTCACCGCTTTCACT
TGCCATTACAATGTTCACAGCATACAGAACGAGCTTGACGACGAAACTCAGATACAACCT
GTTGTCAGATCAGCTCTTGTGCTTTGCTCATCTGTATACATAATGATAAGCATTTTTGGT
TTCCTCTTGTTTGGAGACGATACTCTTGATGATGTCCCTTCAAACTTCGACACTGATCTT
GGTATCCCTCTTGGTTCTGTCCTCAACGATGCGGTTCGAGTTAGCTACGCGCTTCATCTT
ATGCTCGTGTTCCCTATTGTTTTCTACCCGTTGAGGATCAACATCGATGGGCTCTTGTTC
CCTTCTGCTCCATCGTTAACCACCTCAAATGTTAGGTTTGGTTGCCTCAGCGCTGGTCTC
ATCTCTGTCATCTTCTTGGGTGCAAACTGCATCCCGAGCATTTGGGATGCGTTCCAGTTC
ACTGGAGCCACTGCTGCTGTTTGTCTCGGATTCATATTCCCAGCTTCTATTATACTAAAG
GATCGTCATGGCGGAGCAACAAGCAGGGACACGATCTTAGGAGTTTTCATGGTTGTTCTT
GCGGTGTTGGCCAATGCTATCGCTATTTACAGCGATGCTTATGCGTTGTTCAAGAGGAAC
GCACCTCGTGAGTGATGTGGAGGATGAGTAAATTGTGCCAGTTTGGGGGTGTTCTTGGAT
GAATAAGGAAAACAAAAGTGTTTGTTTTTATTCCATCTTCTTTTTCTTATGCGAGGTTGA
ATAAGCGAGAAGACAGGACTTGTCTTCTCTTTGTGTGTTGTACCGTTGTTGTTGAGTGTT
GTTTTAGGGTGTATGTACTTCTCTGCTTGCTTGTGGTTTTGTATCACCATGAGTGTAGAA
ACTTTGTATAAAGATCAAATGTAATGCAGAATACATACTTTTTGTGT


BQ
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AF RS1CT48TF U 1
AF RS1DE43TF U 493
AF RS1CT48JQ C 968
BS 1 676 RS1CT48TF
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BS 999 1120 RS1DE43TF
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TTAGGTTTAGTAATATTAAGAAGAGTCGGTCTTACGGTGGCTTGATGGGCGACTCTTTTG
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TTGTCTACATGATCATCATTGGTGATGTGTTGGCTGGAAAGACAGAAGATGGCATCCACC
ATTATGGTGTTCTTGAAGGATGGTTTGGTCACCATTGGTGGAACGGAAGACTTGCTATTC
TTCTCATTACTACTCTTGGTGTCTTTGCTCCTTTGGCTTGCTTCAAACGAATTGATTCTT
TGAGATTTACATCTGC

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DS 

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TTGAAGGATGGTTTGGTCACCATTGGTGGAACGGAAGACTTGCTATTCTTCTCATTACTA
CTCTTGGTGTCTTTGCTCCTTTGGCTTGCTTCAAACGAATTGATTCTTTGAGATTTACAT
CTGCCCTTGGCTCTAGCCGTCGTGTTCCTCATCATCACAGCGGGGATATCTATCATGAAG
TTTATCAACGGTGGCGTGGCGATGCCAAGATTGTTTCCAGATGTTAGTGACTTAACATCT
TTCTTGAGCCTCTTCACAGTTGTACCTGTTCTCGTCACCGCTTTCACTTGCCATTACAAT
GTTCACAGCATACAGAACGAGCTTGACGACGAAACTCAGATACAACCTGTTGTCAGATCA
GCTCTTGTGCTTTGCTCATCTGTATACATAATGATAAGCATTTTTGGTTTCCTCTTGTTT
GGAGACGATACTCTTGATGATGTCCTTTCAAACTTCGACACTGATCTTGGTATCCCTCTT
GGTTCTGTCCTCAACGATGCGGTTCGAGTTAGCTACGCGCTTCATCTTATGCTCGTGTTC
CCTATTGTTTTCTACCCGTTGAGGATCA

QA 1 628 1 628
DS 

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CTCTTGGTTCTGTCCTCAACGATGCGGTTCGAGTTAGCTACGCGCTTCATCTTATGCTCG
TGTTCCCTATTGTTTTCTACCCGTTGAGGATCAACATCGATGGGCTCTTGTTCCCTTCTG
CTCCATCGTTAACCACCTCAAATGTTAGGTTTGGTTGCCTCAGCGCTGGTCTCATCTCTG
TCATCTTCTTGGGTGCAAACTGCATCCCGAGCATTTGGGATGCGTTCCAGTTCACTGGAG
CCACTGCTGCTGTTTGTCTCGGATTCATATTCCCAGCTTCTATTATACTAAAGGATCGTC
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GAAAACAAAAGTGTTTGTTTTTATTCCATCTTCTTTTTCTTATGCGAGGTTGAATAAGCG
AGAAGACAGGACTTGTCTTCTCTTTGTGTGTTGTACCGTTGTTGTTGAGTGTTGTTTTAG
GGTGTATGTACTTCTCTGCTTGCTTGTGGTTTTGTATCACCATGAGTGTAGAAACTTTGT
ATAAAGATCAAATGTAATGCAGAATACATACTTTTTGTGT

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 3

CO CL4045Contig1 679 3 14 U
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TAGGCTTTCTTCTAAGGTCATCATCAAGCTCCTCACTGTCATGCAGAAACACGGTTACAT
TGGTGAGTTTGAGTACGTTGATGATCACAGGTCTGGTAAGATTGTTGTTGAGCTCAACGG
AAGACTTAACAAATGTGGTGTCATCAGTCCCCGTTTTGATGTCGGAGTTAAAGAGATTGA
AAGCTGGACCGCTCGTCTTCTTCCTTCCAGACAGTTTGGCTACATTGTTCTAACAACCTC
AGCCGGTATCATGGACCACGAAGAGGCCAGGAGAAAGAACGTTGGTGGCAAGGTTCTTGG
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CTCTGTTTGCTTTCACAGATAATTTTGTTTCTTTTTGGTTTTGCTTCAAAAGTTATTTGA
AGACTTGCTATGTAGACAG


BQ
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AF RS1GC22TF U 1
AF RS1DT13JQ C 5
AF RS1DT13TF U 5
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BS 532 546 RS1GC22TF
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GGCTGCCACTTCAATCTCCAAGTGTTTTGATCTTTGAAAGATGGTGAGAATCAGTGTGCT
TAACGATGGTCTGAAGAGTATGTACAATGCCGAGAAGAGAGGCAAGAGGCAGGTCATGAT
TAGGCCTTCTTCTAAGATCATCATCAAGTTCCTCACTGTCATGCAGAAACACGGTTACAT
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AGCCGGTATCATGGACCACGAAGAGGCCAGGAGAAAGAACGTTGGTGGCAAGGTTCTTGG
ATTCTTTTACTGAACTTCAAGAGAATCTTCTTTGTCCAGGGTTTTATACTTTGCTTCTCC
TTTTGGCGAGATGAGGATTTCGATTGAGCTCAATGTTAAGAGAGTAGTAGACGTTTGTTT
CTCTGTTTGCTTTCACAGATAATTTTGTTTCTTTTTGGTTTTGCTTCAAA*GTTATTTGA
AGACTTG

QA 1 667 1 667
DS 

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GG
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CACTTCAATCTCCAAGTGTTTTGATCTTTGAAAGATGGTGAGAATCAGTGTGCTTAACGA
TGGTCTGAAGAGTATGTACAATGCCGAGAAGAGAGGCAAGAGGCAGGTCATGATTAGGCT
TTCTTCTAAGGTCATCATCAAGCTCCTCACTGTCATGCAGAAACACGGTTACATTGGTGA
GTTTGAGTACGTTGATGATCACAGGTCTGGTAAGATTGTTGTTGAGCTCAACGGAAGACT
TAACAAATGTGGTGTCATCAGTCCCCGTTTTGATGTCGGAGTTAAAGAGATTGAAAGCTG
GACCGCTCGTCTTCTTCCTTCCAGACAGTTTGGCTACATTGTTCTAACAACCTCAGCCGG
TATCATGGACCACGAAGAGGCCAGGAGAAAGAACGTTGGTGGCAAGGTTCTTGGATTCTT
TTACTGAACTTCAAGAGAATCTTCTTTGTCCAGGGTTTTATACTCTGCTTCTCCTTTTGG
TGAGATGAGGATTTCGATTGAGCTCAATGTTAAGAGAGTAGTAGACGTTTGTTTCTCTGT
TTGCTTTCACAGATAATTTTGTTTCTTTTTGGTTTTGCTTCAAAAGTTATTTGAAGACTT
G
C

QA 3 663 3 663
DS 

RD RS1DT13TF 675 0 0
GG
GTATGTAGTAGCTCAACTTTGTTTCTTCGTCTTTAGCAGAGGAGAGCTTTGTGCGGCTGC
CACTTCAATCTCCAAGTGTTTTGATCTTTGAAAGATGGTGAGAATCAGTGTGCTTAACGA
TGGTCTGAAGAGTATGTACAATGCCGAGAAGAGAGGCAAGAGGCAGGTCATGATTAGGCT
TTCTTCTAAGGTCATCATCAAGCTCCTCACTGTCATGCAGAAACACGGTTACATTGGTGA
GTTTGAGTACGTTGATGATCACAGGTCTGGTAAGATTGTTGTTGAGCTCAACGGAAGACT
TAACAAATGTGGTGTCATCAGTCCCCGTTTTGATGTCGGAGTTAAAGAGATTGAAAGCTG
GACCGCTCGTCTTCTTCCTTCCAGACAGTTTGGCTACATTGTTCTAACAACCTCAGCCGG
TATCATGGACCACGAAGAGGCCAGGAGAAAGAACGTTGGTGGCAAGGTTCTTGGATTCTT
TTACTGAACTTCAAGAGAATCTTCTTTGTCCAGGGTTTTATACTCTGCTTCTCCTTTTGG
TGAGATGAGGATTTCGATTGAGCTCAATGTTAAGAGAGTAGTAGACGTTTGTTTCTCTGT
TTGCTTTCACAGATAATTTTGTTTCTTTTTGGTTTTGCTTCAAAAGTTATTTGAAGACTT
GCTATGTAGACAG

QA 3 675 3 675
DS 



AS 1 2

CO CL4046Contig1 1009 2 2 U
GGACACTTCTCAATTCTAAAACCCCAAGCTTTGCCGACGGGACCCGATCGTGATCTCCTT
CTTAAAACCTAACTTCGTCGTCGATTCAGAGCTTTAGCTAAGTAGTACTTGAAAGAAAAT
GAGTTTCAACAAAGTTCCCAACGTCCCAGGATCTCCAGCTCTCTCTGCGCTTCTTAAGGT
CAGCGTTATTGGTGGGCTTGGTGTCTATGCAATTACCAATAGCCTCTACAATGTCGAGGG
TGGACATCGTGCTGTCATGTTCAACCGTTTAACTGGTATCAAGGAAAAGGTGTACCCGGA
AGGAACACATTTTATGTTGCCATGGTTTGAGAGGCCAATCATCTATGACGTCCGTGCACG
ACCCTATCTTGTTGAGAGCACCACCGGTAGTCATGACCTTCAGATGGTGAAAATTGGACT
TAGAGTTCTCACTCGTCCCATGGGTGACCGTTTGCCTCAGATTTACCGAACCCTAGGCGA
GAATTACAGTGAAAGGGTTCTTCCTTCCATCATCCATGAAACTCTGAAGGCTGTGGTGGC
TCAGTACAATGCAAGCCAGCTGATCACTCAGAGAGAAGCTGTGAGCAGAGAGATACGCAA
GATTCTAACGGAGAGAGCTTCTAACTTCGACATTGCTCTTGATGATGTCTCCATCACAAC
TCTCACGTTCGGAAAAGAGTTCACTGCTGCAATCGAGGCAAAACAAGTCGCTGCGCAGGA
AGCTGAACGGGCTAAGTTCATTGTGGAGAAGGCCGAGCAAGACAAGAGAAGTGCGGTTAT
CCGTGCAGAGGGAGAAGCTAAAAGTGCTCAACTTATCGGACAAGCCATTGCAAACAATCA
TGCATTCATAACACTGAGAAAGATTGAAGCTGCCAGAGAGATTGCTCAGACCATTGCACA
GTCAGCTAACAAGGTGTACTTAAGCTCCAATGATCTCTTGCTAAACCTTCAAGGGATGAA
CTTGGAGCCTAGCCCTAAGAAGTAAAAGGAAGGAAATAGTAAGTTCCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AP60TFB U 1
AF RS1AP60JQ C 523
BS 1 714 RS1AP60TFB
BS 715 1009 RS1AP60JQ

RD RS1AP60TFB 714 0 0
GGACACTTCTCAATTCTAAAACCCCAAGCTTTGCCGACGGGACCCGATCGTGATCTCCTT
CTTAAAACCTAACTTCGTCGTCGATTCAGAGCTTTAGCTAAGTAGTACTTGAAAGAAAAT
GAGTTTCAACAAAGTTCCCAACGTCCCAGGATCTCCAGCTCTCTCTGCGCTTCTTAAGGT
CAGCGTTATTGGTGGGCTTGGTGTCTATGCAATTACCAATAGCCTCTACAATGTCGAGGG
TGGACATCGTGCTGTCATGTTCAACCGTTTAACTGGTATCAAGGAAAAGGTGTACCCGGA
AGGAACACATTTTATGTTGCCATGGTTTGAGAGGCCAATCATCTATGACGTCCGTGCACG
ACCCTATCTTGTTGAGAGCACCACCGGTAGTCATGACCTTCAGATGGTGAAAATTGGACT
TAGAGTTCTCACTCGTCCCATGGGTGACCGTTTGCCTCAGATTTACCGAACCCTAGGCGA
GAATTACAGTGAAAGGGTTCTTCCTTCCATCATCCATGAAACTCTGAAGGCTGTGGTGGC
TCAGTACAATGCAAGCCAGCTGATCACTCAGAGAGAAGCTGTGAGCAGAGAGATACGCAA
GATTCTAACGGAGAGAGCTTCTAACTTCGACATTGCTCTTGATGATGTCTCCATCACAAC
TCTCACGTTCGGAAAAGAGTTCACTGCTGCAATCGAGGCAAAACAAGTCGCTGC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RS1AP60JQ 487 0 0
TCTGAAG
GCTGTGGTGGCTCAGTACAATGCAAGCCAGCTGATCACTCAGAGAGAAGCTGTGAGCAGA
GAGATACGCAAGATTCTAACGGAGAGAGCTTCTAACTTCGACATTGCTCTTGATGATGTC
TCCATCACAACTCTCACGTTCGGAAAAGAGTTCACTGCTGCAATCGAGGCAAAACAAGTC
GCTGCGCAGGAAGCTGAACGGGCTAAGTTCATTGTGGAGAAGGCCGAGCAAGACAAGAGA
AGTGCGGTTATCCGTGCAGAGGGAGAAGCTAAAAGTGCTCAACTTATCGGACAAGCCATT
GCAAACAATCATGCATTCATAACACTGAGAAAGATTGAAGCTGCCAGAGAGATTGCTCAG
ACCATTGCACAGTCAGCTAACAAGGTGTACTTAAGCTCCAATGATCTCTTGCTAAACCTT
CAAGGGATGAACTTGGAGCCTAGCCCTAAGAAGTAAAAGGAAGGAAATAGTAAGTTCCAT

QA 8 487 8 487
DS 



AS 1 3

CO CL4047Contig1 749 3 7 U
GATTTCAAAAACATTCCTATGGCCGACATGGAGATTGTGCTTCCTGAGAAAAGAAATCCT
GGACTGACTCCAATGGATTGGGTCAAATTTCTGATATCTGCCGTAGTTGGTCTGGTTGCC
GTGGTTACTTCAGTTGAGATGCCGAAAGCAGACCCATGGGTAATCTTTGCAGTTCTCTCC
ACAGTGGTTGGTTATTGTGCCAAAACATACTTCACTTTCCAGCAGAACATGGCAACGTAC
CAGAACTTGATAACGCAATCCATGTATGATAAACAACTAGACAGCGGGAAGGGAACGCTA
TTACACTTGTGCGATGACGTTATTCAGCAAGAAGTAAAAGAGGTGATGATTTCCTTCTAC
ATACTAATGGAGCAGGGGAAAGCTACCTTGGAGGATCTGGATCTGAGAC*TGAGGAACTG
ATAAAGGAAGAGTTTGGTGAGAGGTGTAACTTTGATGTGGATGATGCAGTCCAGAAGCTA
GAGAAGTTGGGGATCGTTGCCCGTGACACCATTGGAAGGTACTACTGCATGGGGCTGAAG
CGAGCCAACGAGATCATAGGGACCACCACCGAGGAGCTTGTCCTGAAGGCCAAACAGGGC
GTCACTCCTTCTTGAACTTACCACCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTTTAACA
TTTGTTCTCTCATTTCAGTAAAGCTCTAAATGACGAAAGTGATATCGGTTGTTTACAAAA
TCCAAACGCAACAAACCAATTCACCGTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1G306TF U 23
AF RS1CH05TF U 1
AF RS1CH05JQ C 75
BS 1 71 RS1CH05TF
BS 72 72 RS1G306TF
BS 73 689 RS1CH05TF
BS 690 690 RS1G306TF
BS 691 719 RS1CH05TF
BS 720 720 RS1CH05JQ
BS 721 749 RS1CH05TF

RD RS1G306TF 691 0 0
G
CGACATGGAGATTGTGCTTCCTGAGAAAAGAAATCCTGGACTGACTCCAATGGATTGGGT
CAAATTTCTGATATCTGCCGTAGTTGGTCTGGTTGCCGTGGTTACTTCAGTTGAGATGCC
GAAAGCAGACCCATGGGTAATCTTTGCAGTTCTCTCCACAGTGGTTGGTTATTGTGCCAA
AACATATTTCACTTTCCAGCAGAACATGGCAACGTACCAGAACTTGATAACGCAATCCAT
GTATGATAAACAACTAGACAGCGGGAAGGGAACGCTATTACACTTGTGCGATGACGTTAT
TCAGCAAGAAGTAAAAGAGGTGATGATTTCCTTCTACATACTAATGGAGCAGGGGAAAGC
TACCTTGGAGGATCTGGATCTGAGATGTGAGGAACTGATAAAGGAAGAGTTTGGTGAGAG
GTGTAACTTTGATGTGGATGATGCAGTCCAGAAGCTAGAGAAGTTGGGGATCGTTGCCCG
TGACACCATTGGAAGGTACTACTGCATGGGGCTGAAGCGAGCCAACGAGATCATAGGGAC
CACCACCGAGGAGCTTGTCCTGAAGGCCAAACAGGGCGTCACTCCTTCTTGAACTTACCA
CCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTTTAACATTTGTTCTCTCATTTCAGTAAAA
CTCTAAATGACGAAAGTGATATCGGTTGTT

QA 2 691 2 691
DS 

RD RS1CH05TF 749 0 0
GATTTCAAAAACATTCCTATGGCCGACATGGAGATTGTGCTTCCTGAGAAAAGAAATCCT
GGACTGACTCCTATGGATTGGGTCAAATTTCTGATATCTGCCGTAGTTGGTCTGGTTGCC
GTGGTTACTTCAGTTGAGATGCCGAAAGCAGACCCATGGGTAATCTTTGCAGTTCTCTCC
ACAGTGGTTGGTTATTGTGCCAAAACATACTTCACTTTCCAGCAGAACATGGCAACGTAC
CAGAACTTGATAACGCAATCCATGTATGATAAACAACTAGACAGCGGGAAGGGAACGCTA
TTACACTTGTGCGATGACGTTATTCAGCAAGAAGTAAAAGAGGTGATGATTTCCTTCTAC
ATACTAATGGAGCAGGGGAAAGCTACCTTGGAGGATCTGGATCTGAGAC*TGAGGAACTG
ATAAAGGAAGAGTTTGGTGAGAGGTGTAACTTTGATGTGGATGATGCAGTCCAGAAGCTA
GAGAAGTTGGGGATCGTTGCCCGTGACACCATTGGAAGGTACTACTGCATGGGGCTGAAG
CGAGCCAACGAGATCATAGGGACCACCACCGAGGAGCTTGTCCTGAAGGCCAAACAGGGC
GTCACTCCTTCTTGAACTTACCACCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTTTAACA
TTTGTTCTCTCATTTCAGTAAAGCTCTAA*TGACGAAAGTGATATCGGTTGTTTACAAA*
TCCAAACGCAACAAACCAATTCACCGTAA

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DS 

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TTGTGCCAAAACATACTTCACTTTCCAGCAGAACATGGCAACGTACCAGAACTTGATAAC
GCAATCCATGTATGATAAACAACTAGACAGCGGGAAGGGAACGCTATTACACTTGTGCGA
TGACGTTATTCAGCAAGAAGTAAAAGAGGTGATGATTTCCTTCTACATACTAATGGAGCA
GGGGAAAGCTACCTTGGAGGATCTGGATCTGAGAC*TGAGGAACTGATAAAGGAAGAGTT
TGGTGAGAGGTGTAACTTTGATGTGGATGATGCAGTCCAGAAGCTAGAGAAGTTGGGGAT
CGTTGCCCGTGACACCATTGGAAGGTACTACTGCATGGGGCTGAAGCGAGCCAACGAGAT
CATAGGGACCACCACCGAGGAGCTTGTCCTGAAGGCCAAACAGGGCGTCACTCCTTCTTG
AACTTACCACCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTTTAACATTTGTTCTCTCATT
TCAGTAAAGCTCTAAATGACGAAAGTGATATCGGTTGTTTACAAAATCCAAACGCAACAA
ACCAATTCACCGT

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 3

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TGCAAAAAGAACCAAAAATTTGAGTGACAGTGAGTGAATATGTTCAGCATGATCTCTCGC
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TTGTTTTTTTTCGTTATTGTCAATAAAACAAGAAAAGGAGAAGTATGAAGCATCCCCTTA
AGCTGCTGCCTCCTTGGAGATCTTCTCTGCCTTGGCAACCACCTCGTCGATGCCACCAAC
CATGTAAAATGATTGTTCAGGAAGATCATCGTACTTGCCATCCAGCAAACCCTGGAAACT
GTTGATGTTTTCCTTCAGGTCGACGTATTTTCCTGGGGCACCCGTGAAGATCTCAGCAAC
ATGGAATGGCTGACTCAAGAATCTCTGGATCTTACGGGCACGAGCGACGGTAAGCTTGTC
ATCTTCACTCAGCTCATCCATTCCAAGAATGGCAATAATATCTTGCAGATTCTTGTAGTT
CTGTAGCACTTTCTGCACGCCACGAGCCGTGTTGTAGTGCTCCTCACCCAAAATGTGAGG
GGAAAGCATGCGGGATGTTGAATCCAGAGGATCCACAGCAGGATAGATACCAAGCTCAGA
AATCTGTCTCGAGAGCACAGTTGTGGCATCCAAGTGAGCGAAAGTTGTGGCTGGAGCAGG
ATCTGTCAGATCGTCAGCAGGGACATAGATGGCTTGGACTGATGTGATGGAACCTTTCTT
GGTGGTTGTGATTCGCTCTTGAAGAGCACCAAGATCAGAAGCCAAAGCTGGCTGGTAACC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BU90JQ U 35
AF RS1DJ68JQ U 1
AF RS1BU90TF C 241
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QA 1 681 1 681
DS 

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TTGTTTTTTTTCGTTATTGTCAATAAAACAAGAAAAGGAGAAGTATGAAGCATCCCCTTA
AGCTGCTGCCTCCTTGGAGATCTTCTCTGCCTTGGCAACCACCTCGTCGATGCCACCAAC
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ATCTGTCAGATCGTCAGCAGGGACATAGATGGCTTGGACT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1BU90TF 660 0 0
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GTTGATGTTTTCCTTCAGGTCGACGTATTTTCCTGGGGCACCCGTGAAGATCTCAGCAAC
ATGGAATGGCTGACTCAAGAATCTCTGGATCTTACGGGCACGAGCGACGGTAAGCTTGTC
ATCTTCACTCAGCTCATCCATTCCAAGAATGGCAATAATATCTTGCAGATTCTTGTAGTT
CTGTAGCACTTTCTGCACGCCACGAGCCGTGTTGTAGTGCTCCTCACCCAAAATGTGAGG
GGAAAGCATGCGGGATGTTGAATCCAGAGGATCCACAGCAGGATAGATACCAAGCTCAGA
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ATCTGTCAGATCGTCAGCAGGGACATAGATGGCTTGGACTGATGTGATGGAACCTTTCTT
GGTGGTTGTGATTCGCTCTTGAAGAGCACCAAGATCAGAAGCCAAAGCTGGCTGGTAACC
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QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 3

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ATGATCCTGAAGGATATGCTCCATCGGGCATCAAGGCTCGAGCTTCTGACAAGTTCTACT
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ATCTGCAAGAGGAGCTGCGACGTGAGAGAGAGCGCAGCAAGGCACTTGAAGCTGAGGTTG
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AAAAATGTATCTCTATTTGATTAATGGCTCGACCTGCATTAGGGGGTTGAATGCATGTTG
TAGATTAGTGTAAGTGTTTGGCCTTCGATTTTTTCTTCTCATTTTTCTTTTCATTTTTAC
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TCCATGTAAAAAAAAACAACCAGAATGAGTAATAATTTGTGCTGACTTGCTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BY27JQ C 115
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DS 

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CTCTCTA
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TGGCTATGCTCCAAGGCGAAACAAAAACGAGCATGGTCACAGAGACACATCACCCGAAAA
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AAGTTCATATCAGAATCATAGAGGGGACAATGGTGTGTCAGGGAAAGATAGTTCAATGTA
TCTGCAAGAGGAGCTGCGACGTGAGAGAGAGCGCAGCAAGGCACTTGAAGCTGAGGTTGA
ATTAGCAAGGCAGAAAATAGAAGAAATGAGCAAAGAGCGAGAGAATCTAATCGAAATATT
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GGCATCAAACACAATCGAAGAGTTGTTGAATAAGATTAAAATGCTGGAGGGATCTAAAGG
CCCGAGCTGGAGACGTTAGGCATTGAACTTTCATATTACTGGAAGTTACAAATTATCAAA
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CCATGTAAAAAAAAACAACCAGAATGAGTAATAATTTGTGCTGACTTGCTAG

QA 8 779 8 779
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T
TTTTTTCTTCTCATTTTTCTTTTCATTTTTACAAACTGGCGAATTTCTAGCTGTAGCATA
AGCCAGTTGTCATGTCTGTAACATTAGTGATTTCCATGTAAAAAAAAACAACCAGAATGA
GTAATAATTTGTGCTG

QA 2 137 2 137
DS 



AS 1 3

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CTTTCACCGTTAAATGTGTTGTATGTAACGTTTACCTTCAAGGTTTTTGACTGGTTCTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 
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AF RS1B362TF U 1
AF RS1BE01TF U 93
AF RS1BE01JQ C 481
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TGTTC

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1BE01TF 783 0 0
GG
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CGTTTACC

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DS 

RD RS1BE01JQ 420 0 0
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GTCCTTACCACATGTACTGTGGGATAGTGCAGAGGATCACGGACGGGAAAGCTGGCGTCC
TGTTCGAAGGAGGGAACTGGGACCGTCTCATAACGTTCAGGCTTGAAGAGCTGGAAAGGA
GAGAGAAAGGACCACCGGGTAAGAATCCAAAGTCTTGTGTTCTTGAGCCTCTTATCGAAC
AGATGCAAAACGAGGCAGCATCATAAGTTGGATCTCTTTCTCTAATCTCTCTACTCTTTG
CTTTCACCGTTAAATGTGTTGTATGTAACGTTTACCTTCAAGGTTTTTGACTGGTTCTGG

QA 1 420 1 420
DS 



AS 1 3

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AGTACATGAACCTAGTGTTGGATGAAGCTGAAGAAGTTAGCATCAAGAAGAACACCAGGA
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AGTAATGTCTGTTCTCAACACTCTCTCGAGGATTAGTGGATCTGCGTTTCGACTATCTCC
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TCGAATTGTTTCACAATTTATTAAAAATCGATATTTGCTGC


BQ
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25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1AO11JQ C 1
AF RS1CD06TF U 1
AF RS1AO11TFB U 1
BS 1 27 RS1CD06TF
BS 28 28 RS1AO11TFB
BS 29 67 RS1CD06TF
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BS 423 567 RS1CD06TF
BS 568 581 RS1AO11TFB

RD RS1AO11JQ 581 0 0
CCGAAGCGTTGAGAGAGAGAATTCAAACGTCGGCAGCGATGGCGAGCACCAAAGTCCAGA
GGATTATGACCCAACCTATCAACTTGATTTTTAGGTTTCTTCAAAGTAAAGCTAGGATCC
AGATTTGGCTTTTTGAGCAGAAAGATCTCAGGATTGAAGGAAGGATTACTGGTTTTGACG
AGTACATGAACCTAGTGTTGGATGAAGCTGAAGAAGTTAGCATCAAGAAGAACACCAGGA
AACCACTTGGAAGGATTCTGCTTAAAGGAGACAACATCACTCTGATGATGAACACGGGAA
AGTAATGTCTGTTCTCAACACTCTCTCGAGGATTAGTGGATCTGCGTTTCGACTATCTCC
AAAGCTTTTGCTAAATATATGTTGAGTTAAGTTCTTCTTCAGTTGACTGATAATACCTTC
TCTTCATGATCGTGTAATATTGCAATGTAGTGACAAGTTTGAGAAATTATGGAACTTGGT
GGTTGAATCTTATTAGTAACACTGTTTTTCTTTTGTTTGGAGTATTGTATTACAAAAGAG
TCGAATTGTTTCACAATTTATTAAAAATCGATATTTGCTGC

QA 1 581 1 581
DS 

RD RS1CD06TF 567 0 0
CCGAAGCGTTGAGAGAGAGAATTCAAATGTCGGCAGCGATGGCGAGCACCAAAGTCCAGA
GGATTATTACCCAACCTATCAACTTGATTTTTAGGTTTCTTCAAAGTAAAGCTAGGATCC
AGATTTGGCTTTTTGAGCAGAAAGATCTCAGGATTGAAGGAAGGATTACTGGTTTTGACG
AGTACATGAACCTAGTGTTGGATGAAGCTGAAGAAGTTAGCATCAAGAAGAACACCAGGA
AACCACTTGGAAGGATTCTGCTTAAAGGAGACAACATCACTCTGATGATGAACACGGGAA
AGTAATGTCTGTTCTCAACACTCTCTCGAGGATTAGTGGATCTGCGTTTCGACTATCTCC
AAAGCTTTTGCTAAATATATGTTGAGTTAAGTTCTTCTTCAGTTGACTGATAATACCTTC
TTTTCATGATCGTGTAATATTGCAATGTAGTGACAAGTTTGAGAAATTATGGAACTTGGT
GGTTGAATCTTATTAGTAACACTGTTTTTCTTTTGTTTGGAGTATTGTATTACAAAAGAG
TCGAATTGTTTCACAATTTATTAAAAA

QA 1 567 1 567
DS 

RD RS1AO11TFB 581 0 0
CCGAAGCGTTGAGAGAGAGAATTCAAACGTCGGCAGCGATGGCGAGCACCAAAGTCCAGA
GGATTATGACCCAACCTATCAACTTGATTTTTAGGTTTCTTCAAAGTAAAGCTAGGATCC
AGATTTGGCTTTTTGAGCAGAAAGATCTCAGGATTGAAGGAAGGATTACTGGTTTTGACG
AGTACATGAACCTAGTGTTGGATGAAGCTGAAGAAGTTAGCATCAAGAAGAACACCAGGA
AACCACTTGGAAGGATTCTGCTTAAAGGAGACAACATCACTCTGATGATGAACACGGGAA
AGTAATGTCTGTTCTCAACACTCTCTCGAGGATTAGTGGATCTGCGTTTCGACTATCTCC
AAAGCTTTTGCTAAATATATGTTGAGTTAAGTTCTTCTTCAGTTGACTGATAATACCTTC
TCTTCATGATCGTGTAATATTGCAATGTAGTGACAAGTTTGAGAAATTATGGAACTTGGT
GGTTGAATCTTATTAGTAACACTGTTTTTCTTTTGTTTGGAGTATTGTATTACAAAAGAG
TCGAATTGTTTCACAATTTATTAAAAATCGATATTTGCTGC

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

CO CL4052Contig1 821 2 4 U
GGTACCAAATCAACATCTCTAATCTATTACTACATGATCGGACAGCTTATGAACCTCAAG
GAGACAGAGCTCTGTCTCGGCCTCCCCGGGGCCGCTGAAACCCTCGATACTCCAGCCAGA
TCGGCGGTGGGGAACAAGAGAGGCTTTTCCGAGACCGTTGATCTCATGCTCAATCTTCAG
TCCAACAAAGAAGGAGCCATCGATCTTAACAACGCTACAGCTTCTAAACAGAAAACTCTT
CTCAAAAACACTGTTAAGCCTCCTGCTAAATCCCAAGTGGTGGGATGGCCACCAGTGAGG
AACTCCAGGAAAAACATAATGACTAATCAGAAAACAAGCGGTGCGGAGGATGCCAGCAGC
GAGAAGGCCGGAAATGGTGGTGGAGGAGCCACCGGAGCTGCATTGGTGAAGGTATCCATG
GACGGAGCACCCTACCTAAGGAAAGTTGACCTCAAGATATACAAAAGCTATCAGGATCTC
TCTGATGCTTTGGCCAAAATGTTCAGTTCCTTCACTATGGGAAACTATGGAGCACAAGGA
ATGATCGATTTCATGAACGAGACCAAGCTCATGGATCTTCTGAACAGTTCTGATTATGTT
CCAAGCTACGAGGACAAAGATGGCGACTGGATGCTAGTCGGCGATGTCCCATGGGAAATG
TTTGTCGAGTCATGCAGACGTTTGCGCATTATGAAAGGGATCTGAAGCAATTGGACTTGC
TCCGAGAGCAATGGAGAAGTATTCCAAGAACAGATCATAAATTTTATATTAAGAAAAAAG
AATCTTCAGTGTTCATCATATGACGAGCTCTGATTATTGTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B045TF U 1
AF RS1FY80TF U 34
BS 1 695 RS1B045TF
BS 696 696 RS1FY80TF
BS 697 735 RS1B045TF
BS 736 821 RS1FY80TF

RD RS1B045TF 735 0 0
GGTACCAAATCAACATCTCTAATCTATTACTACATGATCGGACAGCTTATGAACCTCAAG
GAGACAGAGCTCTGTCTCGGCCTCCCCGGGGCCGCTGAAACCCTCGATACTCCAGCCAGA
TCGGCGGTGGGGAACAAGAGAGGCTTTTCCGAGACCGTTGATCTCATGCTCAATCTTCAG
TCCAACAAAGAAGGAGCCATCGATCTTAACAACGCTACAGCTTCTAAACAGAAAACTCTT
CTCAAAAACACTGTTAAGCCTCCTGCTAAATCCCAAGTGGTGGGATGGCCACCAGTGAGG
AACTCCAGGAAAAACATAATGACTAATCAGAAAACAAGCGGTGCGGAGGATGCCAGCAGC
GAGAAGGCCGGAAATGGTGGTGGAGGAGCCACCGGAGCTGCATTGGTGAAGGTATCCATG
GACGGAGCACCCTACCTAAGGAAAGTTGACCTCAAGATATACAAAAGCTATCAGGATCTC
TCTGATGCTTTGGCCAAAATGTTCAGTTCCTTCACTATGGGAAACTATGGAGCACAAGGA
ATGATCGATTTCATGAACGAGACCAAGCTCATGGATCTTCTGAACAGTTCTGATTATGTT
CCAAGCTACGAGGACAAAGATGGCGACTGGATGCTAGTCGGCGATGTCCCATGGGAAATG
TTTGTCGAGTCATGCAGACGTTTGCGCATTATGAA*GGGATCTGAAGCAATTGGACTTGC
TCCGAGAGCAATGGA

QA 1 735 1 735
DS 

RD RS1FY80TF 788 0 0
GG
GATCGGACAGCTTATGAACCTCAAGGAGACAGAGCTCTGTCTCGGCCTCCCCGGGGCCGC
TGAAACCCTCGATACTCCAGCCAGATCGGCGGTGGGGAACAAGAGAGGCTTTTCCGAGAC
CGTTGATCTCATGCTCAATCTTCAGTCCAACAAAGAAGGAGCCATCGATCTTAACAACGC
TACAGCTTCTAAACAGAAAACTCTTCTCAAAAACACTGTTAAGCCTCCTGCTAAATCCCA
AGTGGTGGGATGGCCACCAGTGAGGAACTCCAGGAAAAACATAATGACTAATCAGAAAAC
AAGCGGTGCGGAGGATGCCAGCAGCGAGAAGGCCGGAAATGGTGGTGGAGGAGCCACCGG
AGCTGCATTGGTGAAGGTATCCATGGACGGAGTACCCTACCTAAGGAAAGTTGACCTCAA
GATATACAAAAGCTATCAGGATCTCTCTGATGCTTTGGCCAAAATGTTCAGTTCCTTCAC
TATGGGAAACTATGGAGCACAAGGAATGATCGATTTCATGAACGAGACCAAGCTCATGGA
TCTTCTGAACAGTTCTGATTATGTTCCAAGCTACGAGGACAAAGATGGCGACTGGATGCT
AGTCGGCGATGTCCCATGGGAAATGTTTGTCGAGTCATGCAGACGTTTGCGCATTATGAA
AGGGATCTGAAGCAATTGGACTTGCTCCGAGAGCAATGGAGAAGTATTCCAAGAACAGAT
CATAAATTTTATATTAAGAAAAAAGAATCTTCAGTGTTCATCATATGACGAGCTCTGATT
ATTGTA

QA 3 788 3 788
DS 



AS 1 3

CO CL4053Contig1 1004 3 9 U
GGATTGGTGAAGGGGACAGAGAAGAAGAGTATTTTAGCCTTTTCTTTCCTAGATTTTGAG
CGGTCTTATCTTTACTTATCCACCTCAGATTACCATGTCTACGGTTCCGGTGAAGCCACT
ACCACCGGTTGGCTTATATCCTATTCGCCGGAACCTCGCTAGTACGACGACTTCGAAGTC
TCAGGCAATGCTCACCTCCGTTCCAAGCAAGCATATTATCGGGTTGTCTACTTATAATAG
ATGCTTTGAATTTAAATCTTGGAGCCAGATGAGGAATCCAGCGTTTTTAAGCCACCGTCG
GCGAGTTAGCACGGTGGTGGCTTCAGCCGGAAACATGACTGCACCGTCGTCTTGGGACTC
TTGGATGCCAGATAAGAAGGCGGCGGCGACGACTCTATTGCTGAGTGACGTCATTTGGCC
CGCAGCTGGAGGGTTTGCGGCGATGGCAATAATGGGAAGAATGGATCAAATGTTATCTCC
AAAAGGGATTACAATGTCTGTTGCACCACTTGGTGCCGTCTGCGCCATTCTTTTCACTAG
TCCATCTGCTCCCGCTGCTCGGAAATACAATATCTTTTTATCTCAAATAGCTTGTGCTGC
GATTGGAGTGGTAGCGCTCTCCGTATTCGGTCCAGGTTGGCTTGCCCGGAGCGTTGCCCT
CGCCGCTTCTATCGGTTTTATGGTCATTGCTCGTGCCAATCACCCTCCTGCGGCGAGCCT
ACCACTA*TGTTCATAGATGGAGCAAAGTTCCATCACTTGAATTTCTGGTACGCATTGTT
CCCAGGGGCAGCCGCATGTGTCATTCTATGCCTTATCCAATCAGTCGTGTGCTACTTGAA
GGAAAACATAAAATTTTGATGAACATCAAGCGACACATATTGATCGAATGATATATATAA
ATAAGTGTACAAATATACACATATTGATGGAACCATTGTGAATGTATTTTGTTTATTTAT
GTATATTCATTCCCTTGTACGTATAAATACGTTTTTTTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 5 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1B783TF U 1
AF RS1CF20TF U 66
AF RS1CF20JQ C 614
BS 1 517 RS1B783TF
BS 518 518 RS1CF20TF
BS 519 552 RS1B783TF
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BS 554 744 RS1B783TF
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BS 787 787 RS1CF20JQ
BS 788 839 RS1CF20TF
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RD RS1B783TF 744 0 0
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CGGTCTTATCTTTACTTATCCACCTCAGATTACCATGTCTACGGTTCCGGTGAAGCCACT
ACCACCGGTTGGCTTATATCCTATTCGCCGGAACCTCGCTAGTACGACGACTTCGAAGTC
TCAGGCAATGCTCACCTCCGTTCCAAGCAAGCATATTATCGGGTTGTCTACTTATAATAG
ATGCTTTGAATTTAAATCTTGGAGCCAGATGAGGAATCCAGCGTTTTTAAGCCACCGTCG
GCGAGTTAGCACGGTGGTGGCTTCAGCCGGAAACATGACTGCACCGTCGTCTTGGGACTC
TTGGATGCCAGATAAGAAGGCGGCGGCGACGACTCTATTGCTGAGTGACGTCATTTGGCC
CGCAGCTGGAGGGTTTGCGGCGATGGCAATAATGGGAAGAATGGATCAAATGTTATCTCC
AAAAGGGATTACAATGTCTGTTGCACCACTTGGTGCCTTCTGCGCCATTCTTTTCACTAG
TCCATCTGCTCCTGCTGCTCGGAAATACAATATCTTTTTATCTCAAATAGCTTGTGCTGC
GATTGGAGTGGTAGCGCTCTCCGTATTCGGTCCAGGTTGGCTTGCCCGGAGCGTTGCCCT
CGCCGCTTCTATCGGTTTTATGGTCATTGCTCGTGCCAATCACCCTCCTGCGGCGAGCCT
ACCACTA*TGTTCATAGATGGAGC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1CF20TF 778 0 0
GG
ATCTTTACTTATCCACCTCAGATTACCATGTCTACGGTTCCGGTGAAGCCACTACCACCG
GTTGGCTTATATCCTATTCGCCGGAACCTCGCTAGTACGACGACTTCGAAGTCTCAGGCA
ATGCTCACCTCCGTTCCAAGCAAGCATATTATCGGGTTGTCTACTTATAATAGATGCTTT
GAATTTAAATCTTGGAGCCAGATGAGGAATCCAGCGTTTTTAAGCCACCGTCGGCGAGTT
AGCACGGTGGTGGCTTCAGCCGGAAACATGACTGCACCGTCGTCTTGGGACTCTTGGATG
CCAGATAAGAAGGCGGCGGCGACGACTCTATTGCTGAGTGACGTCATTTGGCCCGCAGCT
GGAGGGTTTGCGGCGATGGCAATAATGGGAAGAATGGATCAAATGTTATCTCCAAAAGGG
ATTACAATGTCTGTTGCACCACTTGGTGCCGTCTGCGCCATTCTTTTCACTAGTCCATCT
GCTCCCGCTGCTCGGAAATACAATATCTTTTTATCTCAAATAGCTTGTGCTGCGATTGGA
GTGGTAGCGCTCTCCGTATTCGGTCCAGGTTGGCTTGCCCGGAGCGTTGCCCTCGCCGCT
TCTATCGGTTTTATGGTCATTGCTCGTGCCAATCACCCTCCTGCGGCGAGCCTACCACTA
*TGTTCATAGATGGAGCAAAGTTCCATCACTTGAATTTCTGGTACGCATTGTTCCCAGGT
GCAGCCGCATGTGTCATTCTATGCCTTATCCAATCAGTCGTGTGCTACTTGA
GAAA

QA 3 774 3 774
DS 

RD RS1CF20JQ 391 0 0
GCGCTCTCCGTATTCGGTCCAGGTTGGCTTGCCCGGAGCGTTGCCCTCGCCGCTTTTATC
GGTTTTATGGTCATTGCTCGTGCCAATCACCCTCCTGGGGGGAGCCTACCACTAATGTTC
ATAGATGGAGCAAAGTTCCATCACTTGAATTTTTGGTACGCATTGTTCCCAGGGGCAGCC
GCATGTGTCATTTTATGCCTTATCCAATCAGTCGTGTGCTACTTGAAGGAAAACATAAAA
TTTTGATGAACATCAAGCGACACATATTGATCGAATGATATATATAAATAAGTGTACAAA
TATACACATATTGATGGAACCATTGTGAATGTATTTTGTTTATTTATGTATATTCATTCC
CTTGTACGTATAAATACGTTTTTTTTTTTTT

QA 1 391 1 391
DS 



AS 1 3

CO CL4054Contig1 1113 3 22 U
ATGATTTACGGTACTTTGATTTTATTTTATTTAACAAAGTATAATAATCCCAACTTAAAT
CGAGACCTCATAGAGAAAAGGAGAAAGAAAAGATTACTCAAAAGAAGTTGATTGTTAAAT
AAGAGAGTGGTCAGAAAAAATATACAGCAAACCACTACTATTAAAAGCGTCCCTCTCTAC
CTTTGGGGCATCATTTTCATGTAAATGATGATCCTCTTCCTAAATAAATTTTCCAGAAGC
CTACTACCTCTTTGTTTTCCCTCTCTTTTTTTGTTCAACTTTCTTTTAACCAAAAACCCT
GTACAAGTCTCCAAAGGGATTCTTCTATGTAAGGGGAATCGAGATCATTTTTGATGAAAC
AAACGGTGCCTTGTTGTGTATGGTAAAAGCCTGTTTCGATTTGATTCTTATCATCCCTGA
AGAGCTCGCACAGCGTCTGAAATTTCCATTAGTTGCTGCTCTGCTTTCGCTTTCCAACTC
ACCAACTCTTTCAACGTTTACTGAGAATTAATATTTGGGTCCTCAATATCTGATCTTGGA
CCTGCAGTCATCGAAGAACCTGGAGTCAACTCAGCTTTGTCCTGATTGGAGCTTCTGGAA
TCTCCCCTGGTCATGCAGCTCTCTGTCGTCCTCTGCATTTCGGAGTTGAGCACTGACTGC
TCCTCAAACCACATATGGTCCTGGAAAGAGCTTTTGCGAGCATTTGGTGGAAGCAAGTAG
GTATCGGGCCTGACAGCCTCTGCCTCCGGTAGAGCATCGATAAGGTCAGTATCAACATCC
CATGGTTCAAAACCGTCCCCAGTGAAATCATCCAAGTTGGTACTATGCAATAAATGTTCC
CAGTTTTGAGGATTTGGACTGAAGGAATTGCTCCCATTTGCCTGCCGACTGTTGTGCGAG
TTTGAAATTCCCACCAGCTGCTGTTCTACTTTATCTTTCCACGAAACTAATTCCTTAACC
ATGCACTGTGTCGATGCCAAAGAATTTGAGATATCCGCAATTTGCTTATCAGTCTTTACC
CTACAACTCACAAAATCCTTGATTAATTTCTCATTTGCATCAGCATTATTTGGTAATTCT
GGCTTGGATATATGTTTTTTTAAATCACTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DF32JQ U 130
AF RS1FO06JQ U 1
AF RS1DF32TF C 504
BS 1 135 RS1FO06JQ
BS 136 136 RS1DF32JQ
BS 137 188 RS1FO06JQ
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BS 204 204 RS1DF32JQ
BS 205 237 RS1FO06JQ
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BS 335 335 RS1DF32JQ
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BS 715 746 RS1FO06JQ
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BS 765 765 RS1DF32TF
BS 766 791 RS1FO06JQ
BS 792 1113 RS1DF32TF

RD RS1DF32JQ 297 0 0
GTCAGAAAAAATATACAGCAAACCACTACTATTAAAAGCGTCCCTCTCTACCTTTGGGGC
ATCATTTTCATGTAAATGATGATCCTCTTCCTAAATAAATTTTCCAGAAGCCTACTACCT
CTTTGTTTTCCCTCTCTTTTTTTGTTCAACTTTCTTTTAACCAAAAACCCTGTACAAGTC
TCCAAAGGGATTCTTCTATGTAAGGGGAATCGAGATCATTTTTGATGAAACAAACGGTGC
CTTGTTGTGTATGGTAAAAGCCTGTTTCGATTTGATTCTTATCATCCCTGAAGAGCT

QA 1 297 1 297
DS 

RD RS1FO06JQ 796 0 0
ATGATTTACGGTACTTTGATTTTATTTTATTTAACAAAGTATAATAATCCCAACTTAAAT
CGAGACCTCATAGAGAAAAGGAGAAAGAAAAGATTACTCAAAAGAAGTTGATTGTTAAAT
AAGAGAGTGGTCAGAGAAAATATACAGCAAACCACTACTATTAAAAGCGTCCCTCTCTAC
CTTTGGGGTATCATTTTCATGTAGATGATGATCCTCTTCCTAAATAAATTTTCCAGATGC
CTACTGCCTCTTTGTTTTCCCTCTCTTTTTTTGTTCAACTTTCTTTTAACCAGAAACCCT
GTACAAGTCTCCAAAGGGATTCTTCTATGTAAGGTGAATCGAGATCATTTTTGATGAAAC
AAACGGTGCCTTGTTGTGTATGGTAAAAGCCTGTTTCGATTTGATTCTTATCATCCCTGA
AGAGCTCGCACAGCGTCTGAAATTTCCATTAGTTGCTGCTCTGCTTTCGCTTTCCAACTC
ACCAACTCTTTCAACGTTTACTGAGAATTAATATTTGGGTCCTCAATATCTGATCTTGGA
CCTGCAGTCATCGAAGAACCTGGAGTCAACTCAGCTTTGTCCTGATTGGAGCTTCTGGAA
TCTCCCCTGGTCATGCAGCTCTCTGTCGTCCTCTGCATTTCGGAGTTGAGCACTGACTGC
TCCTCAAACCACATATGGTCCTGGAAAGAGCTTTTGCGAGCATTTGGTGGAAGTAAGTAG
GTATCGGGCCTGACAGCCTCTGCCTCTGGTAGAGCATCGATAAG*TCAGTATCAACATCC
CATGGTTCAAA
CCGTC

QA 1 791 1 791
DS 

RD RS1DF32TF 610 0 0
AGAATTAATATTTGGGTCCTCAATATCTGATCTTGGACCTGCAGTCATCGAAGAACCTGG
AGTCAACTCAGCTTTGTCCTGATTGGAGCTTCTGGAATCTCCCCTGGTCATGCAGCTCTC
TGTCGTCCTCTGCATTTCGGAGTTGAGCACTGACTGCTCCTCGAACCACATATGGTCCTG
GAAAGAGCTTTTGCGAGCATTTGGTGGAAGCAAGTAGGTATCGGGCCTGACAGCCTCTGC
CTCCGGTAGAGCATCGATAAGGTCAGTATCAACATCCCATGGTTCAAAACCGTCCCCAGT
GAAATCATCCAAGTTGGTACTATGCAATAAATGTTCCCAGTTTTGAGGATTTGGACTGAA
GGAATTGCTCCCATTTGCCTGCCGACTGTTGTGCGAGTTTGAAATTCCCACCAGCTGCTG
TTCTACTTTATCTTTCCACGAAACTAATTCCTTAACCATGCACTGTGTCGATGCCAAAGA
ATTTGAGATATCCGCAATTTGCTTATCAGTCTTTACCCTACAACTCACAAAATCCTTGAT
TAATTTCTCATTTGCATCAGCATTATTTGGTAATTCTGGCTTGGATATATGTTTTTTTAA
ATCACTCTTC

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 3

CO CL4055Contig1 747 3 1 U
CAAAACATGGACCAATCCATAGTTCTTTCTCTAGCACTAGCCTCACTCTTGGTCGGAGTC
GTCTCAGCTCGTGACTGGAACATCTTGAACCAGCTCAAAGGACTGTCTTCATCTTCAAGC
CAAAACGGTATTGTTTCTTCAGGGGTCTCGACGAACTTGAAACGTTACTGCGAAAGCTGG
AGGATCAACGTGGAAGTACACAACATCAGAAACTTCGATGTGGTGCCTCAGGAGTGCGTG
TCGCACGTCAAGAA*GTACATGACGTCATCGCAGTACGAGGACGACGTGGAGAGAGCCGT
TGATGAGGTGATCCTTCATTTCGGGAGCATGTGCTGTACCAAGACCAAGTGTGATGGCAT
GGACGCTTGGATCTTTGACATTGATGACATGCTTCTCTCTACCATTCCTTACCACGAGAA
CAATGGCTACTTTGGAGGAGAGAAATTGAACTCTACTAAATTCGAGG*ACTGGATGAGGA
AGAGGAAAGCACCAGCAGTGCCACACATGGTGAAACTGTACCAAGACATCAGAGAAAGAG
GCATCAAGATCTTCTTGGTCTCTTCCCGTAAAGAATATCTCAGATCTGCCACCGTTGACA
ACCTCATCCAAGCTGGT*ACTATGGCTGGTCCAACCTCATTCTCAGGGGAATAGAAGATG
AGCACAAAGAAGTTAAAGAGTACATGTCAGAGAAGAGAGCATGGGTGGATGGGTCTTGGT
TACAGAGTCTGGGGGAGTGATGGGAAG


BQ
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BQ
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AA
CAAC

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G
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ATCAGTTTATACTTTCCAGGATCAAGAGCTATCTTCTCTGGGGACACCTTGTTTAGCTTA
TCATGTGGTAAACTCTTTGAAGGTACCCCTAAGCAGATGCTTGCTTCTCTCAAAAAGATC
ATATCTTTACCAGATGACACAAGCATATACTGTGGTCATGAATACACACTGAGTAACTCC
AAGTTTGCATTGTCTATAGAGCCAAACAACGAAGTACTTCAGTCTTATGTTGCTCATGTT
GCAGAGCTCCGTAAAAAGAAATTACCTACGATTCCAACAACACTGAAGATGGAGAAAGCT
TGTAACCCATTCCTCCGCAGTTCGAATACAGATATTCGTCGAGCTTTAGGTATTTCAGAG
ACTGCAGATGAAGCAGAAGCTTTGGCTATTATCCGAGAAGCAAAGGATAATTTCAAAGCT
TACGCTTTTTCTCCCGAGGGGCAATTCTTTGGTTTGCATCTGTTTCCTCCGACAAAACAA
AAGACAGAAAGAGAGAGAGAGAGACAGAGAGACAGAGAGAGATATGTTTACTTTTGATGT
AAAACATCTA
TGTTGG

QA 2 731 2 731
DS 

RD RS1FE55JQ 698 0 0
AAGGATGGTGAAAAGTGGATGTTTGCTGGTCATGAAGTCCATGTTATGGATACTCCTGGC
CACACTAAAGGCCATATCAGCTTATACTTTCCAGGATCAAGAGCTATCTTCTCTGGGGAC
ACCTTGTTTAGCTTGTCTTGTGGTAAACTCTTTGAAGGTACCCCTAAGCAGATGCTTGCT
TCTCTCAAAAAGATCATATCTTTACCAGATGACACAAGCATATACTGTGGTCATGAATAC
ACACTGAGTAACTTTAAGTTTGCATTGTCTATAGAGCCAAACAACGAAGTACTTCAGTTT
TATGCGGCTCATGTTGCAGAGCTCCGTAAAAAGAAATTACCTACGATTCCAACAACACTG
AAGATGGAGAAAGCTTGTAACCCATTCCTCCGCAGTTCGAATACATATATTCGTCGGGCT
TTAGGTATTTCAGAGACTGCAGATGAAGCAGAAGCTTTGGCTATTATCCGAGAAGCAAAG
GATAATTTCAAAGCTTAGGCTTTTTCTCCCGAGGGGCAATTCTTTGGTTTGCATCTGTTT
CCTCCGACAAAAACAAAAAGACA****GAAAGAGAGAGACAGAGAGACAGAGAGAGATAT
GTTTACTTTTGATGTAAAACATCTAATGTTGGTACTCATTAACACTGCAATTAGGTTTTG
GTTGATGATTTTTCAACAAATAATATTTACCTTTTTAT

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 3

CO CL4057Contig1 820 3 17 U
GGACAGAGTTGCAAAATATCAGCAATTTTGTAACAAAAATATTCAGCATGGGATATCGTT
TAGCACTCGTTTGCGCCGCTATCGTGTTGCTAAGCATCTCCGGCTTAAGCCATGCCGGAG
TCACCAGTAGCTACACCAGAGTAGCTGAACCTTCTGAAGAGATGCCACTCGAAACCTTCC
CTCCTCCTGCCGGCTTAAATGCTCCAGAACAAGTTCATATAACGCAGGGAGATCACAACG
GTCGAGGTATGATAATCTCGTGGGTGACGCCAACAAACGATGATGGTTCTAACATCGTTA
AATACTGGATCGCGGATAGGAATGAGAGCACAAACGAGAGTGCTGAAGCATCAACATCGT
CCTACACATACTACGACTACACCTCTGGTTTTCTTCATCACGCCACTATTAAAGGGCTTG
AGTACGATACTAAGTATTTCTACGAGCTTGGATCCGGTCGTTCCACTAGACGATTCTCCT
TCACGACTCCTCCTAAAGCCGGTCCCGATGTTCCCTACACATTTGGCGTCATTGGTGATC
TAGGGCAAACCTATGCCTCTAACCAGACATTGTATCATTACATGTCGAACCCTAAAGGCC
AAGCTGTTCTTTTTGTCGGAGACTTGTCGTACGCAGATGACCACCCGAACCACGACCAAA
GAAAATGGGATTCTTATGGCCGATTCGTTGAACCAAGTGCTGCGTATCAGCCTTGGATAT
GGGCTGCAGGAACATGAAATAGATATGCACCATCATAGCGAGACTCAGCTTTCAGCCGTA
CAAAACCGTACACGTCCCTACAGAGCTCGAGAGCACTCTC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F131TF U 2
AF RS1F131JQ C 159
AF RS1GE18TF U 1
BS 1 89 RS1GE18TF
BS 90 90 RS1F131TF
BS 91 109 RS1GE18TF
BS 110 110 RS1F131TF
BS 111 202 RS1GE18TF
BS 203 203 RS1F131TF
BS 204 273 RS1GE18TF
BS 274 274 RS1F131TF
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BS 287 320 RS1GE18TF
BS 321 321 RS1F131TF
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BS 323 323 RS1F131TF
BS 324 518 RS1GE18TF
BS 519 519 RS1F131JQ
BS 520 820 RS1GE18TF

RD RS1F131TF 390 0 0
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AGCACTCGTTTGCTCCGCTATCGTGTTGCTAAGCATCTCCGGCTTAAGCCATGCCGGAGT
CACCAGTAGCTACACCAGAGTAGCTGAACCTTCTGAAGAGATGCCACTCGAAACCTTCCC
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ATACTGGATCGCGGATAGGAATGAGAGCACAAACGAGAGTGCTGAAGCATCAACATCGTC
CTACACATACTACGACTACACCTCTGGTTT

QA 1 390 1 390
DS 

RD RS1F131JQ 499 0 0
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AGTGCTGAAGCATCAACATCGTCCTACACATACTACGACTACACCTCTGGTTTTTTTCAT
CACGCCACTATTAAAGGGCTTGAGTACGATACTAAGTATTTTTACGAGCTTGGATCCGGT
CGTTCCACTAGACGATTTTCCTTCACGATTCCTCCTAAAGCCGGTCCCGATGTTCCCTAC
ACATTTGGCGTCATTGGTGATTTAGGGCAAACCTATGCCTCTAACCAGACATTGTATCAT
TACATGTCGAACCCTAAAGGCCAAGCTGTTCTTTTTGTTGGAGACTTGTCGTACGCAGAT
GACCACCCGAACCCCGACC

QA 1 499 1 499
DS 

RD RS1GE18TF 820 0 0
GGACAGAGTTGCAAAATATCAGCAATTTTGTAACAAAAATATTCAGCATGGGATATCGTT
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TCACCAGTAGCTACACCAGAGTAGCTGAACCTTCTGAAGAGATGCCACTCGAAACCTTCC
CTCCTCCTGCCGGCTTAAATGCCCCAGAACAAGTTCATATAACGCAGGGAGATCACAACG
GTCGAGGTATGATAATCTCGTGGGTGACGCCAATAAACGATGATGATTCTAACATCGTTA
AATACTGGATCGCGGATAGGGACGAGAGCACAAACGAGAGTGCTGAAGCATCAACATCGT
CCTACACATACTACGACTACACCTCTGGTTTTCTTCATCACGCCACTATTAAAGGGCTTG
AGTACGATACTAAGTATTTCTACGAGCTTGGATCCGGTCGTTCCACTAGACGATTCTCCT
TCACGACTCCTCCTAAAGCCGGTCCCGATGTTCCCTACGCATTTGGCGTCATTGGTGATC
TAGGGCAAACCTATGCCTCTAACCAGACATTGTATCATTACATGTCGAACCCTAAAGGCC
AAGCTGTTCTTTTTGTCGGAGACTTGTCGTACGCAGATGACCACCCGAACCACGACCAAA
GAAAATGGGATTCTTATGGCCGATTCGTTGAACCAAGTGCTGCGTATCAGCCTTGGATAT
GGGCTGCAGGAACATGAAATAGATATGCACCATCATAGCGAGACTCAGCTTTCAGCCGTA
CAAAACCGTACACGTCCCTACAGAGCTCGAGAGCACTCTC

QA 1 820 1 820
DS 



AS 1 3

CO CL4058Contig1 1206 3 3 U
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CTCTTCCCCGTCACGGATCCGTTCAATAACTGTGCTCTCCAAAAGGAAACTCTCCGCTTG
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CACAGATCTCACCGGCACTGAATGGTGTGAGAAACAAATGGAGAATGTTCTTTGTCTTGG
GAGGAGAAAAGTTAGCAAAGCTATGAAACTTGGCCAGGCTCGTCACTTGGAGCTTGAAGA
AGAGGTAGTTAAAAGGGTGCGAGTAAAAGTTGAATCAAATGAAGATAAGTGGGCCTTGAA
GCTACTCAGTTCCATTGCTGCCGTTAATCAGTTCTTGTTTGAAGGACGAACTCGTGAATT
GCTACTCGTAGGATTTGTTGGAGGTCAGTGGATTGTGGGAGTTATAGATGAGGTTAGAAA
GGCATCTACTGAAGACTCTTCTGATACTGGACCCTTATTGTCTGATACCAAGACTCGAGT
CCGTGACACACTCCCAGCTGAGCCACAAAGAAGGAACGGAAGGCTACAGGTAATGCTTTA
CAAGCTTCTTTGGGACACTGTTGTCAAAGAAGAGTTCCCCTCGACACGTTTTTTCAACTA
CTTCGCTTTAAACCGTCACGAGGTCTTGTCGCAAGATGTCAGAGATAATATTGCCGATGC
AGGAATCTCAGCACAGACTCTTGAAGAGATAGTTAGGTACTATGAGAGTACTTTTAAGAT
GCTTCCAGTTGCAAATGATCAATTACTACTACGGTACGAGTTTCAGAAAGACCGATCTAT
AATAGCTGAGATTAGATTCACTCATGATCCTGAGTGGGTGATGAGCAAATACAAAGAAGT
CATTGAGTTTTGGAGAAGTGAAAGAGAAGCTGAGTACACTCCTGAAGAAGAACGTTGGAA
ATGTCGGTACTGCCAGTTTGCTAAATCTTGCCCTGGAAATCCAAGTCTTGAATCACCACC
TGCTACGAGCTCACCACCAAGAGAGCCTCCTTCTTTAGCAAGCTAACATGTGTTTCATCA
AACGCTTCTATGTTGCTTGCTAACATGTGTTTGTTGAGTGGTTAAACCGTGGTTCGATTA
GGATTGATTCTGCATACCGAGATTGATAATATGTTGTACACACAACTCGTATGTACCATT
GTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1BM85TF U 1
AF RS1BM85JQ C 520
AF RS1DD55TF U 881
BS 1 633 RS1BM85TF
BS 634 881 RS1BM85JQ
BS 882 1206 RS1DD55TF

RD RS1BM85TF 633 0 0
AATGGCTATCCTCGACGCAGCCTTTGCCGCCACCCGCTCCTTCCTCCCTTCCGCGACCCG
CTCTTCCCCGTCACGGATCCGTTCAATAACTGTGCTCTCCAAAAGGAAACTCTCCGCTTG
CTCCTCGGATATCGAAGACTCTCTCCTGCATCGGTTTAGAAAGAACCAAGCTCTGGGTGT
CACAGATCTCACCGGCACTGAATGGTGTGAGAAACAAATGGAGAATGTTCTTTGTCTTGG
GAGGAGAAAAGTTAGCAAAGCTATGAAACTTGGCCAGGCTCGTCACTTGGAGCTTGAAGA
AGAGGTAGTTAAAAGGGTGCGAGTAAAAGTTGAATCAAATGAAGATAAGTGGGCCTTGAA
GCTACTCAGTTCCATTGCTGCCGTTAATCAGTTCTTGTTTGAAGGACGAACTCGTGAATT
GCTACTCGTAGGATTTGTTGGAGGTCAGTGGATTGTGGGAGTTATAGATGAGGTTAGAAA
GGCATCTACTGAAGACTCTTCTGATACTGGACCCTTATTGTCTGATACCAAGACTCGAGT
CCGTGACACACTCCCAGCTGAGCCACAAAGAAGGAACGGAAGGCTACAGGTAATGCTTTA
CAAGCTTCTTTGGGACACTGTTGTCAAAGAAGA

QA 1 633 1 633
DS 

RD RS1BM85JQ 670 0 0
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AAGGCTACAGGTAATGCTTTACAAGCTTCTTTGGGACACTGTTGTCAAAGAAGAGTTCCC
CTCGACACGTTTTTTCAACTACTTCGCTTTAAACCGTCACGAGGTCTTGTCGCAAGATGT
CAGAGATAATATTGCCGATGCAGGAATCTCAGCACAGACTCTTGAAGAGATAGTTAGGTA
CTATGAGAGTACTTTTAAGATGCTTCCAGTTGCAAATGATCAATTACTACTACGGTACGA
GTTTCAGAAAGACCGATCTATAATAGCTGAGATTAGATTCACTCATGATCCTGAGTGGGT
GATGAGCAAATACAAAGAAGTCATTGAGTTTTGGAGAAGTGAAAGAGAAGCTGAGTACAC
TCCTGAAGAAGAACGTTGGAAATGTCGGTACTGCCAGTTTGCTAAATCTTGCCCTGGAAA
TCCAAGTCTTGAATCACCACCTGCTACGAGCTCACCACCAAGAGAGCCTCCTTCTTTAGC
AAGCTAACATGTGTTTCATCAAACGCTTCTATGTTGCTTGCTAACATGTGTTTGTTGAGT
GGTTAAACCGTGGTTCGGTTAGGATTGATTCTGCATACCGAGATTGATAATATGTTGTAC
ACACAACTCG

QA 1 670 1 670
DS 

RD RS1DD55TF 326 0 0
G
TGAGCAAATACAAAGAAGTCATTGAGTTTTGGAGAAGTGAAAGAGAAGCTGAGTACACTC
CTGAAGAAGAACGTTGGAAATGTCGGTACTGCCAGTTTGCTAAATCTTGCCCTGGAAATC
CAAGTCTTGAATCACCACCTGCTACGAGCTCACCACCAAGAGAGCCTCCTTCTTTAGCAA
GCTAACATGTGTTTCATCAAACGCTTCTATGTTGCTTGCTAACATGTGTTTGTTGAGTGG
TTAAACCGTGGTTCGATTAGGATTGATTCTGCATACCGAGATTGATAATATGTTGTACAC
ACAACTCGTATGTACCATTGTTGCC

QA 2 326 2 326
DS 



AS 1 3

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GCATTTTGGTCCATCATAAGAAGGAGCAGAGCCATGTAGAAGAGCATAAGGAGTCTGTCC
ATGGAGTAACGGCGATGGTGTTCGTTAATAACGTGAGCCACCGTGAGAATACTTTCACCC
CAAAACATGACCGGCAAATTTGCTTGAAATAACAGAGCGCGAGCCACATTAAGTATATGT
CGATGCGTGCGTTCCACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGCCGTGCCCGCT
TGCTAAGAAGGGTTTTGAGGGTTTCGCAGTTTCTGCAGTCTTCTCTCCTCTCCGATCTCT
TCGTCTTCTCCACAGGATCCCCAAAGATGAAGCTCGTCAGGTTTTTGATGAAGTTGAACA
ATGAGACTGTGTCGATCGAGCTGAAGAACGGAACTGTGGTCCATGGAACCGCCACTGGTG
TTGATGTGAGCATGAACACTCACTTGAAGACGGTTAAAATGACTCTCAAGGGGAAGAATC
CAGTGACAATGGACCATTTAAGCTTGAGGGGTAACAACATCCGCTACTACATTCTTCCCG
ATAGCTTGAACCTGGAGACTTTGCTTGTGGAAGACACTCCTCGAGTTAAACCTAAGAAGC
CTGTTGCTGGGAAGCCTGTTGGACGAGGCCGTGGACGTGGTGGTCGTGGGCGTGGTGGGG
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TAATGCGACTTCGTGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1E320TF U 1
AF RS1A704JQ C 228
AF RS1A704TF U 228
BS 1 410 RS1E320TF
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RD RS1E320TF 654 0 0
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CGATGCGTGCGTTCCACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGCCGTGCCCGCT
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TCGTCTTCTCCACAGGATCCCCAAAGATGAAGCTCGTCAGGTTTTTGATGAAGTTGAACA
ATGAGACTGTGTCGATCGAGCTGAAGAACGGAACTGTGGTCCATGGAACCATCACTGGTG
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QA 1 654 1 654
DS 

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CTCTCCGATCTCTTCGTCTTCTCCACAGGATCCCCAAAGATGAAGCTCGTCAGGTTTTTG
ATGAAGTTGAACAATGAGACTGTGTCGATCGAGCTGAAGAACGGAACTGTGGTCCATGGA
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TACATTCTTCCCGATAGCTTGAACCTGGAGACTTTGCTTGTGGAAGACACTCCTCGAGTT
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GGGCGTGGTGGGGCTGGTCGTGGTAGAGGTCGCTAAGTTTCAGCAAAGCAGTGCACTGGA
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QA 1 630 1 630
DS 

RD RS1A704TF 630 0 0
GGCCGTGCCCGCTTGCTAAGAAGGGTTTTGAGGGTTTCGCAGTTTCTGCAGTCTTCTCTC
CTCTCCGATCTCTTCGTCTTCTCCACAGGATCCCCAAAGATGAAGCTCGTCAGGTTTTTG
ATGAAGTTGAACAATGAGACTGTGTCGATCGAGCTGAAGAACGGAACTGTGGTCCATGGA
ACCGCCACTGGTGTTGATGTGAGCATGAACACTCACTTGAAGACGGTTAAAATGACTCTC
AAGGGGAAGAATCCAGTGACAATGGACCATTTAAGCTTGAGGGGTAACAACATCCGCTAC
TACATTCTTCCCGATAGCTTGAACCTGGAGACTTTGCTTGTGGAAGACACTCCTCGAGTT
AAACCTAAGAAGCCTGTTGCTGGGAAGCCTGTTGGACGAGGCCGTGGACGTGGTGGTCGT
GGGCGTGGTGGGGCTGGTCGTGGTAGAGGTCGCTAAGTTTCAGCAAAGCAGTGCACTGGA
AACAGTTGAAGGCGAGTGAGTTTGAATTTTGTAGGAAGTGGGAACCCTTTGGTGTCTTAG
GAGAATGTACTGAACTATGATGTATTTAGCAACTCTTTGCAAAGGAAACATCTGTGGTAA
GATTTGGGCTGTGTAATGCGACTTCGTGGA

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 3

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GTTAACAGATAAAAAGATAAATTTTGTTTTCTGGAAATAAAAGAGATTCTAGAAGTGTCT
CAAAGGTGCCAAAATGAGGAGTTTTTTTTAATCACCCGATTACATTTAAACACAATCACA
AAAGACCACAAAAGATTCAGAGGTTTGTCATCAGTTTCAGTGTGTTCCGTTCTGATGTTT
TTAGACAATGGGAGGATACTGCTTGGACTGAAGCTTAACCCGTTTCTTGTACTCAACTGC
ATCCTGGATGAAGAGATGATAACCATCAGTCTGTGCAGGGTCAGCGGGATTAGGGGTGTC
AAGTAAATCCTGGATACCGACAAGAATCTGCTTCACCGTGATGGCTGGTCTCCATCCCGA
ATCCTCGTTAAGGATGGAGAGACAGACAGTCCCCGATGGATAGACATTAGGGTGGAAAAA
GCCTTGTGGGAATTTGCATTTGGGAGGCTTGCTCGGATAGTCCTCGCTAAAGTGCATCGT
CAATGGAAAGAATCCACCTTCCCAATCAGTACCGGCTTTACCAGGAATAGTGCAATGCCA
CACCATTAGATTCACAGACCCATCAGCCCCAGTCTCCGGCTTCGCCACAAAACCATGAGG
ATGATTTTTCCTCCACGACTTCCTCTCCTCAGCCAAACGACCACGAGCGATTCCACTAGC
CATCTCTCTCCTCTCTCTCTTAAGACAATCTCTGTTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G468JQ U 13
AF RS1CD36JQ U 1
AF RS1G468TF C 145
BS 1 218 RS1CD36JQ
BS 219 219 RS1G468TF
BS 220 270 RS1CD36JQ
BS 271 271 RS1G468TF
BS 272 396 RS1CD36JQ
BS 397 397 RS1G468TF
BS 398 554 RS1CD36JQ
BS 555 760 RS1G468TF

RD RS1G468JQ 148 0 0
GACCCAAACTTAATCAGTACAATAATAGTAGTAACAAGAATATTAACAGTTAACAGATAA
AAAGATAAATTTTGTTTTCTGGAAATAAAAGAGATTCTAGTAGTGTCTCAAAGGTGCCAA
AATGAGGAGTTTTTTTT
TTATCCCCCCA

QA 1 137 1 137
DS 

RD RS1CD36JQ 554 0 0
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GTTAACAGATAAAAAGATAAATTTTGTTTTCTGGAAATAAAAGAGATTCTAGAAGTGTCT
CAAAGGTGCCAAAATGAGGAGTTTTTTTTAATCACCCGATTACATTTAAACACAATCACA
AAAGACCACAAAAGATTCAGAGGTTTGTCATCAGTTTCGGTGTGTTCCGTTCTGATGTTT
TTAGACAATGGGAGGATACTGCTTGGACTGTAGCTTAACCCGTTTCTTGTACTCAACTGC
ATCCTGGATGAAGAGATGATAACCATCAGTCTGTGCAGGGTCAGCGGGATTAGGGGTGTC
AAGTAAATCCTGGATACCGACAAGAATCTGCTTCACTGTGATGGCTGGTCTCCATCCCGA
ATCCTCGTTAAGGATGGAGAGACAGACAGTCCCCGATGGATAGACATTAGGGTGGAAAAA
GCCTTGTGGGAATTTGCATTTGGGAGGCTTGCTCGGATAGTCCTCGCTAAAGTGCATCGT
CAATGGAAAGAATC

QA 1 554 1 554
DS 

RD RS1G468TF 616 0 0
TTTTTAATCACCCGATTACATTTAAACACAATCACAAAAGACCACAAAAGATTCAGAGGT
TTGTCATCAGTTTTAGTGTGTTCCGTTCTGATGTTTTTAGACAATGGGAGGATACTGCTT
GGACTGAAGCTTAACCCGTTTCTTGTACTCAACTGCATCCTGGATGAAGAGATGATAACC
ATCAGTCTGTGCAGGGTCAGCGGGATTAGGGGTGTCAAGTAAATCCTGTATACCGACAAG
AATCTGCTTCACCGTGATGGCTGGTCTCCATCCCGAATCCTCGTTAAGGATGGAGAGACA
GACAGTCCCCGATGGATAGACATTAGGGTGGAAAAAGCCTTGTGGGAATTTGCATTTGGG
AGGCTTGCTCGGATAGTCCTCGCTAAAGTGCATCGTCAATGGAAAGAATCCACCTTCCCA
ATCAGTACCGGCTTTACCAGGAATAGTGCAATGCCACACCATTAGATTCACAGACCCATC
AGCCCCAGTCTCCGGCTTCGCCACAAAACCATGAGGATGATTTTTCCTCCACGACTTCCT
CTCCTCAGCCAAACGACCACGAGCGATTCCACTAGCCATCTCTCTCCTCTCTCTCTTAAG
ACAATCTCTGTTGTCC

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 3

CO CL4061Contig1 737 3 23 U
TCCATCACCAAAGAGATACACAATCAAATGTACCACAATGTCTCAGCAGAAACTTCAACC
ACTTGTGACATAAGGATGAGGATATAGTATCACCTAAGCTCACTCATTTGGAACCTACAT
TACCCTATCACTCACCCAATCACTTAACCACCATGAGAACAAACTCCTTTCACCACAAAC
GGTGAAAAAGAGTTGCCTCTTCTACCACACTATTACAGAGACAAGACCAAACCTGAAAAC
TAAACCTAAACAAGGATTCCAATTTGACCATAGCCGGAGATCACCATTTGATTGGAATTA
TGACCTTGGATCTTACCGGCTCAACACCGAGGCGCATGTTCCTCCTTTAAGACAGCTTCA
GAGTTCGGTCAATATCCCCAGCCTTACTCAGCGGATGCAAACATCAATGAAGCAGAACTG
ATGAGTCCATACCTTGAATAGCAGATCCGTTTCAGACCAGAATGAGCTCTCCACCAGTTC
GGTGCTTAAACTACCACCAAGGCCTTCTTCATCACTTGATTCTTGAGCTTGGATCCTAAA
CAGAGCCGCCGGGACACAAATGAAACTCCACCAAACAGAAAGTGAAGCTTCCACAAACGC
CCGGAATGAAAAAAAAAGAAAAACGGGTACAGTTGACAGAACCACCAGAGCTCTTCCTAC
AACCTGCAATGAAACAAGTAAGCCCAGAGAAGAGCTTCCAGTAAACGGTACGCCAACTTC
GGAACAGAACGAAGCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BF18JQ U 222
AF RS1ED68JQ U 41
AF RS1BF18TF C 1
BS 1 40 RS1BF18TF
BS 41 134 RS1ED68JQ
BS 135 135 RS1BF18TF
BS 136 225 RS1ED68JQ
BS 226 278 RS1BF18JQ
BS 279 279 RS1ED68JQ
BS 280 350 RS1BF18JQ
BS 351 351 RS1ED68JQ
BS 352 360 RS1BF18JQ
BS 361 361 RS1ED68JQ
BS 362 414 RS1BF18JQ
BS 415 415 RS1ED68JQ
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BS 444 444 RS1ED68JQ
BS 445 454 RS1BF18JQ
BS 455 455 RS1ED68JQ
BS 456 459 RS1BF18JQ
BS 460 460 RS1ED68JQ
BS 461 464 RS1BF18JQ
BS 465 616 RS1ED68JQ
BS 617 617 RS1BF18TF
BS 618 720 RS1ED68JQ
BS 721 737 RS1BF18TF

RD RS1BF18JQ 243 0 0
CAAA
ACCAAACCTGAAAACTAAACCTAAACAAGGATTCCAATTTGACCATAGCCGGAAATCACC
ATTTGATTGGAATTATGACCTTGGATCTTACCGGCTCAACACCGAGGCGCATGTTCCTCC
TTTAAAACAGCTTCAAAGTTCGGTCAATATCCCCAGCCTTACTCAGCGGATGCAAACATC
AATGAAGCAAAACTGATGAGTCCATACCTTGAATAGCAAATCCGTTTCAAACCAAAATG

QA 5 243 5 243
DS 

RD RS1ED68JQ 680 0 0
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CACTCATTTGGAACCTACATTACCCTATCACTCATCCAATCACTTAACCACCATGAGAAC
AAACTCCTTTCACCACAAACGGTGAAAAAGAGTTGCCTCTTCTACCACACTATTACAGAG
ACAAGACCAAACCTGAAAACTAAACCTAAACAAGGATTCCAATTTGACCATAGCCGGAGA
TCACCATTTGATTGGAATTATGACCTTGGATCTTACCGGCTCAACACCGAGGCGCATGTT
CCTCCTTTAAGACAGCTTCAGAGTTCGGTCAATATCCCCAGCCTTATTCAGCGGATGCAA
ACATCAATGAAGCAGAACTGATGAGTCCATACCTTGAATAGCAGATCCGTTTCAGACCAG
AATGAGCTCTCCACCAGTTCGGTGCTTAAACTACCACCAAGGCCTTCTTCATCACTTGAT
TCTTGAGCTTGGATCCTAAACAGAGCCGCCGGGACACAAATGAAACTCCACCAAACAGAA
AGTGAAGCTTCCACAAACGCCCGGAATGAAAAAAAAGGAAAAACGGGTACAGTTGACAGA
ACCACCAGAGCTCTTCCTACAACCTGCAATGAAACAAGTAAGCCCAGAGAAGAGCTTCCA
GTAAACGGTACGCCAACTTC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RS1BF18TF 737 0 0
TCCATCACCAAAGAGATACACAATCAAATGTACCACAATGTCTCAGCAGAGACTTCAACC
ACTTGTGACATAAGGATGAGGATATAGTATCACCTAAGCTCACTCATTTGGAACCTACAT
TACCCTATCACTCACCCAATCACTTAACCACCATGAGAACAAACTCCTTTCACCACAAAC
GGTGAAAAAGAGTTGCCTCTTCTACCACACTATTACAGAGACAAGACCAAACCTGAAAAC
TAAACCTAAACAAGGATTCCAATTTGACCATAGCCGGAGATCACCATTTGATTGGAATTA
TGACCTTGGATCTTACCGGCTCAACACCGAGGCGCATGTTCCTCCTTTAAGACAGCTTCA
GAGTTCGGTCAATATCCCCAGCCTTACTCAGCGGATGCAAACATCAATGAAGCAGAACTG
ATGAGTCCATACCTTGAATAGCAGATCCGTTTCAGACCAGAATGAGCTCTCCACCAGTTC
GGTGCTTAAACTACCACCAAGGCCTTCTTCATCACTTGATTCTTGAGCTTGGATCCTAAA
CAGAGCCGCCGGGACACAAATGAAACTCCACCAAACAGAAAGTGAAGCTTCCACAAACGC
CCGGAATGAAAAAAAAAG******GGGTACAGTTGACAGAACCACCAGAGCTCTTCCTAC
AACCTGCAATGAAACAAGTAAGCCCAGAGAAGAGCTTCCAGTAAACGGTACGCCAACTTC
GGAACAGAACGAAGCGC

QA 1 737 1 737
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL4063Contig1 1022 3 20 U
CTTGGATCACTGGAGAGCTATTAAGGAAGGTTTTGCGTTTGCGCACTGCACAACTTGCAA
GGCACCGTATTATCTTCGAGTACACGGTGCGGGTGATAGGAAATGGAGGACCTTGAAGTT
TCGCTTCTTTGTTACTCGTGACATCTTATCCATCTTTCTTGCTGTTCAGCTTGTGATTGC
TGCGTTGGCATACATGGTCTATTTCATAGATAGCTACCAGCAGTCATGGCTTCGTCATAT
TTGGGGTTTTGACAGTGAGGGCACCTTTTATTACATGTCTGGAGCTTTACTATTCTTTGC
TCTGCTCGGTCTATCTGGATGCTTCATAACTTGCTACGACCGCAGAGTTCGCAATGACCT
TGCTCAGCCTTGCCGTGAACTGTGTCTATGTTGCTGTCAGCCTGGGATATGCACAGACTG
CCATCTACCGGGAACTATTTGTATGTGGGCAGATTGCACAGCATGTACTGAAGGTTGTGC
AAGTGCAGTTAGTGAATGTAGTGGTTGCCTTGGAGGTGCAGGGGAAGCCGGATTGCCATT
GCTCTTCATTATGGCATTAGTAGTTCTTGGTTTGTTTACGGTTATAGGAATACTCTACAG
CGTACTGGTTGCAACCATGGTTGGACAACGTATTTGGC***GCCATTATCACATTCTCGC
TAAAAGAATGCTAACAAAAGAGTATGTGGTTGAGGATGTAGATGGGGAAATGATGGGATC
TGAATGGTCGCCACCCGCTTTACCGTCTGAGCATGTCCAGCAGCTGAAGACGCTTGGCCT
TCTGTGAAAACCATATTGGCTTGTGATTGAATGCTATGGAAAGATTTTTCAACTGCTTAC
AGGGGAATTCACCTGATCAAGATGTGAGAGATAAGACAAAAGTTTGGAGATTATGAATGT
TAGAATCTTAGAGATGCTTCGTATTCGTAAAGAACGATCCCAACTTTAGAGTCAGAGACC
TCCTCCCATTGACGAATTGAGTTTTCATGTCGAATGATTATTCTTAACGGTTTGTTATAT
AG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1A427TF U 1
AF RS1B509JQ C 417
AF RS1B509TF U 417
BS 1 508 RS1A427TF
BS 509 509 RS1B509TF
BS 510 592 RS1A427TF
BS 593 593 RS1B509TF
BS 594 638 RS1A427TF
BS 639 641 RS1B509TF
BS 642 735 RS1A427TF
BS 736 736 RS1B509TF
BS 737 757 RS1A427TF
BS 758 758 RS1B509TF
BS 759 767 RS1A427TF
BS 768 768 RS1B509TF
BS 769 778 RS1A427TF
BS 779 779 RS1B509TF
BS 780 789 RS1A427TF
BS 790 790 RS1B509TF
BS 791 810 RS1A427TF
BS 811 811 RS1B509TF
BS 812 828 RS1A427TF
BS 829 1022 RS1B509TF

RD RS1A427TF 828 0 0
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GGCACCGTATTATCTTCGAGTACACGGTGCGGGTGATAGGAAATGGAGGACCTTGAAGTT
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TGCGTTGGCATACATGGTCTATTTCATAGATAGCTACCAGCAGTCATGGCTTCGTCATAT
TTGGGGTTTTGACAGTGAGGGCACCTTTTATTACATGTCTGGAGCTTTACTATTCTTTGC
TCTGCTCGGTCTATCTGGATGCTTCATAACTTGCTACGACCGCAGAGTTCGCAATGACCT
TGCTCAGCCTTGCCGTGAACTGTGTCTATGTTGCTGTCAGCCTGGGATATGCACAGACTG
CCATCTACCGGGAACTATTTGTATGTGGGCAGATTGCACAGCATGTACTGAAGGTTGTGC
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GCTCTTCATTATGGCATTAGTAGTTCTTGGTTTGTTTACGGTTATAGGAATATTCTACAG
CGTACTGGTTGCAACCATGGTTGGACAACGTATTTGGCAGCGCCATTATCACATTCTCGC
TAAAAGAATGCTAACAAAAGAGTATGTGGTTGAGGATGTAGATGGGGAAATGATGGGATC
TGAATGGTCGCCACC*GCTTTACCGTCTGAGCATGTC*AGCAGCTGA*GACGCTTGGC*T
TCTGTGAAA*CCATATTGGCTTGTGATTGA*TGCTATGGAAAGATTTT

QA 1 828 1 828
DS 

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G
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ATTGCTCTTCATTATGGCATTAGTAGTTCTTGGTTTGTTTACGGTTATAGGAATACTCTA
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CGCTAAAAGAATGCTAACAAAAGAGTATGTGGTTGAGGATGTAGATGGGGAAATGATGGG
ATCTGAATGGTCGCCACCCGCTTTACCGTCTGAGCATGTCCAGCAGCTGAAGACGCTTGG
CCTTCTGTGAAAACCATATTGGCTTGTGATTGAATGCTATGGAAAGATTTTTCAACTGCT
TACAGGGGAATTCACCTGATCAAGATGTGAGAGATAAGACAAAAGTTTGGAGATTATGAA
TGTTAGAATCTTAGAGATGCTTCGTATTCGTAAAGAACGATCCCAACTTTAGAGTCAGAG
ACCTCCTCCCATTGACGAATTGAGTTTTCATGTCGAATGATTATTCTTAACGGTTTGTTA
TATAG

QA 2 606 2 606
DS 

RD RS1B509TF 606 0 0
G
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TGCAAGTGCAGTTAGTGAATGTAGTGGTTGCCTTGGAGGTGCAGGGGAAGCCGGATTGCC
ATTGCTCTTCATTATGGCATTAGTAGTTCTTGGTTTGTTTACGGTTATAGGAATACTCTA
CAGCGTACTGGTTGCAACCATGGTTGGACAACGTATTTGGC***GCCATTATCACATTCT
CGCTAAAAGAATGCTAACAAAAGAGTATGTGGTTGAGGATGTAGATGGGGAAATGATGGG
ATCTGAATGGTCGCCACCCGCTTTACCGTCTGAGCATGTCCAGCAGCTGAAGACGCTTGG
CCTTCTGTGAAAACCATATTGGCTTGTGATTGAATGCTATGGAAAGATTTTTCAACTGCT
TACAGGGGAATTCACCTGATCAAGATGTGAGAGATAAGACAAAAGTTTGGAGATTATGAA
TGTTAGAATCTTAGAGATGCTTCGTATTCGTAAAGAACGATCCCAACTTTAGAGTCAGAG
ACCTCCTCCCATTGACGAATTGAGTTTTCATGTCGAATGATTATTCTTAACGGTTTGTTA
TATAG

QA 2 606 2 606
DS 



AS 1 3

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GGAACTCCACTTAAACCATATTTTCTTAAAACACTTCTTGAAAGGCTAGATATATGGCCA
TGGAAGTTGCTATGGACCTGGAGCTCGATGATGATGTCTTCTATGCAGACATAAGCAAAC
AAATCAATCTATTAATCACAGATGAAGATGAACAGAACCCTATCTCACTTTCTTCTCCTG
TCTCATTCCAGGGTTTGTTCAGAGAAAACTACCAAGCATCAGCAACACCGTATATGATAT
ACCATGAGCAAAATTACAACCAAGTTAGAGAGAGCAAAGGGACAGGAGTGTTCATCCCAA
GATGTTCTCAGCCAAGAAGGAAACAATATAACAATTCTCATCAGAAGAAGCAAGGGAGAT
TCGGTTCCCTCATCCCCAAGCAACAGTATCCTCATCATGTTTATGACAACAACAACAACT
CCACAACTTTCAACAACAACCAAGAAAGCATCACCCTTCATCATGCAGCTTCTACTAACC
AAAGAAGAACCTACAGAGATGCAGCATCTCTGTTCACTTAAGTCTCAATCAAGATTCAAG
ACATGGATTTGTGTCATTAATTTCATATTATATATTGATTATTGATATTTATAGATTTTG
TGTTTGTAAAATCAGCAAATAATAAGAATGAAAGAGGAACCATCAATCTAAAGGGATTTG
GGTGTGATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AN46JQ C 103
AF RS1DZ42TF U 11
AF RS1AN46TF U 1
BS 1 632 RS1AN46TF
BS 633 633 RS1DZ42TF
BS 634 670 RS1AN46TF

RD RS1AN46JQ 531 0 0
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TCTCACTTTCTTCTCCTGTCTCATTCCAGGGTTTGTTCAGAGAAAACTACCAAGCATCAG
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CAGGAGTGTTCATCCCAAGATGTTTTCAGCCAAGAAGGAAACAATATAACAATTTTCATC
AGAAGAAGCAAGGGAGATTCGGTTCCCTCATCCCCAAGCAACAGTATCCTCATCATGTTT
ATGACAACAACAACAACTCCACAACTTTCAACAACAACCAAGAAAGCATCACCCTTCATC
ATGCAGCTTTTACTAACCAAAGAAGAACCTACAGAGATGCAGCATCTCTGTTCACTTAAG
TTTCAATCAAGATTCAAGACATGGATTTGTGTCATTAATTTCATATTATATATTGATTAT
TGATATTTATAGATTTTGTGTTTGTAAAATCAGCAAATAATAAGAATGAA
G

QA 1 530 1 530
DS 

RD RS1DZ42TF 658 0 0
GG
AAACCATATTTTCTTAAAACACTTCTTGAAAGGCTAGATATATGGCCATGGAAGTTGCTA
TGGACCTGGAGCTCGATGATGATGTCTTCTATGCAGACATAAGCAAACAAATCAATCTAT
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GTTTGTTCAGAGAAAACTACCAAGCATCAGCAACACCGTATATGATATACCATGAGCAAA
ATTACAACCAAGTTAGAGAGAGCAAAGGGACAGGAGTGTTCATCCCAAGATGTTCTCAGC
CAAGAAGGAAACAATATAACAATTCTCATCAGAAGAAGCAAGGGAGATTCGGTTCCCTCA
TCCCCAAGCAACAGTATCCTCATCATGTTTATGACAACAACAACAACTCCACAACTTTCA
ACAACAACCAAGAAAGCATCACCCTTCATCATGCAGCTTCTACTAACCAAAGAAGAACCT
ACAGAGATGCAGCATCTCTGTTCACTTAAGTCTCAATCAAGATTCAAGACATGGATTTGT
GTCATTAATTTCATATTATATATTGATTATTGATATTTATAGATTTTGTGTTTGTAAAAT
CAGCAAATAATAAGAATGAAAGAGGAACCATCAATCTAA
GGATTTGGTGTGATTTA

QA 3 641 3 641
DS 

RD RS1AN46TF 670 0 0
GGAACTCCACTTAAACCATATTTTCTTAAAACACTTCTTGAAAGGCTAGATATATGGCCA
TGGAAGTTGCTATGGACCTGGAGCTCGATGATGATGTCTTCTATGCAGACATAAGCAAAC
AAATCAATCTATTAATCACAGATGAAGATGAACAGAACCCTATCTCACTTTCTTCTCCTG
TCTCATTCCAGGGTTTGTTCAGAGAAAACTACCAAGCATCAGCAACACCGTATATGATAT
ACCATGAGCAAAATTACAACCAAGTTAGAGAGAGCAAAGGGACAGGAGTGTTCATCCCAA
GATGTTCTCAGCCAAGAAGGAAACAATATAACAATTCTCATCAGAAGAAGCAAGGGAGAT
TCGGTTCCCTCATCCCCAAGCAACAGTATCCTCATCATGTTTATGACAACAACAACAACT
CCACAACTTTCAACAACAACCAAGAAAGCATCACCCTTCATCATGCAGCTTCTACTAACC
AAAGAAGAACCTACAGAGATGCAGCATCTCTGTTCACTTAAGTCTCAATCAAGATTCAAG
ACATGGATTTGTGTCATTAATTTCATATTATATATTGATTATTGATATTTATAGATTTTG
TGTTTGTAAAATCAGCAAATAATAAGAATGAAGGAGGAACCATCAATCTAAAGGGATTTG
GGTGTGATTT

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

CO CL4065Contig1 692 2 4 U
AATTTATAAACTTGTTTATTGAATCAGGTATCAAATGATAATACCTCTGAATAAACCGAA
AGTAAGTTTTTTCGAAAAATTAATAATAATAATTTGAATAAAAAGACAAAATTAACAAAC
TAAAAATGCACAACCATCCATCGTGTCCTCAGCTTTCGAGCCATTAAAAAGTTAAAATGG
ATTAACGACAACCGCTGGGGGCTCTTCTCGGAAAAAACCAACCTGGTCGTGATAACTTAC
AAAAGGGTTTTCACCTTCAAAATTTCCCGGGGGGTTATAAACACAAATCGCATAAAGGCC
GCCGTTTGAACAATCCACACGTGCGCACCCAACCTTCGTGCTATCTCTCCACACGATCTG
CGTATAGTGTCCACACATTTGCCCCGACTCACACGTGTTACCCCTAACGTCGTAGAACTT
ATTCTCATCGGCCCACACTTTGACAACATCCATGGGCGTCCAGTTATTCTGTCCGGCCCA
AAATATGTTTTCTCCGAACGGACCATTGGAGTGAACAACGTAACGGCGACTAATATGGGA
AACGGAGCTCGTAATTCCCGTCTACAAAGCTCCATTTTTCTCTATAAAAAATAAACAAAA
GAGCGTATAATAATATTCTTTTGTAGGAGAGTTAATTACTCAAATTGTAGGTGAAAGGTG
TAATTAACTCTCCGATTGAATTTGTTGAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GC37JQ U 1
AF RS1F549TF C 77
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AGTAAGTTTTTTCGAAAAATTAATAATAATAATTTGAATAAAAAGACGAAATTAACAAAC
TAAAAATGCACAACCATCCATCGTGTCCTCAGCTTTCGAGCCATTAAAAAGTTAAAATGG
ATTAACGACAACCGCTGGGGGCTCTTCTCGGAAAAAACCAACCTGGTCGTGATAACTTAC
AAAAGGGTTTTCACCTTCAAAATTTCCCGGGGGGTTATAAACACAAATCGCATAAAGGCC
GCCGTTTGAACAATCCACACGTGCGCACCCAACCTTCGTGCTATCTCTCCACACGATCTG
CGTATAGTGTCCACACATTTGCCCCGACTCACACGTGTTACCCCTAACGTC

QA 1 411 1 411
DS 

RD RS1F549TF 616 0 0
AAATTAATAATAATAATTTGAATAAAAAGACAAAATTAACAAACTAAAAATGCACAACCA
TCCATCGTGTCCTCAGCTTTCGAGCCATTAAAAAGTTAAAATGGATTAACGACAACCGCT
GGGGGCTCTTCTCGGAGAAGACCAACCTGGTCGTGATAACTTACAAAAGGGTTTTCACCT
TCAAAATTTCCCGGTGGGTTATAAACACAAATCGCATAAAGGCCGCCGTTTGAACAATCC
ACACGTGCGCACCCAACCTTCGTGCTATCTCTCCACACGATCTGCGTATAGTGTCCACAC
ATTTGCCCCGACTCACACGTGTTACCCCTAACGTCGTAGAACTTATTCTCATCGGCCCAC
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AACGGACCATTGGAGTGAACAACGTAACGGCGACTAATATGGGAAACGGAGCTCGTAATT
CCCGTCTACAAAGCTCCATTTTTCTCTATAAAAAATAAACAAAAGAGCGTATAATAATAT
TCTTTTGTAGGAGAGTTAATTACTCAAATTGTAGGTGAAAGGTGTAATTAACTCTCCGAT
TGAATTTGTTGAGACC

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 2

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CTCTAATGTCCGTAAACGTCAAGGAGGAGCCTGTGCTTGCGCCTAACTGCGATGTCATCG
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AACAGTTTTACTCTACCAAAGACGGAGCAGGTCAAACAAACACTTCTAAGAGTAACTCCG
GTGGGAAAAAAGTTGCTATCTCTCAACCCTCCAAGTGTAGCTCTGCTGGGAAAGGAATAA
CAAGAGGGAAACATGTTTCTAGCCCTGAACTTATGCGTCAGTTTGCTACAATTTTTCGTC
AGATTGCTCAACAAAAATGGGCGTGGCCATTTCTGCAACCTGTTGATGTTAAAGGGCTTG
GACTCGATGATTATCACAAGGTTATAGAGAAGCCAATGGATTTGGGAACTATTAGAACTA
AAATGGAGGCTTCGGAGTACAGCAATGTCCGGGAGATATATGCTGATGTTAGGCTAGTTT
TCAAGAACGCTATGAGATATAACGAAGAGAAAGATGATGTCTATGTGATGGCTGAATCTC
TTTTGGAGAAGTTTGAGGAGAAGTGGCTTACCATTATGCCTAGACTCGTCGAAGAGGAAA
AAAAACAAGCAGAGGAAGAGGCTCAGGATCGTGCGAGTAAGCAGCTTGCTGTGGAGGCTG
CTCAAGCAGAGAAGGCTAGAGATTTAAGCAACGAACTGTATGAGATCGATCAGGAGCTTG
AGAAACTTCGGGAGGTAGTGGTCCAGAAGTGCAGAAAGCTGTCCACTCAAGAAAAGAAGG
GACTTTCTGCAGCTTTAGGTCGTCTCTCTCCTGAGGATCTGTTTAAGGCGCTTAAAATGG
TTTCAGAGGGCAACCCGCAGTTCCCGGCCGGAGCACCAGAAGTGGAGCTTGACATCGATC
TTCAGACTGATGTAACTTTGTGGAGGCTGAAGGTGTTTGTGCAAGAAGCACTGAAAGCAG
CTAACAAGAGCTCTGGTGGAACAAACGCCCAAAACAACAACAATGGTGGAGAGATGAACA
AGACCACTGCGAAAAGAAGGAGAGCGATCTTTGATGCAATTAAAAAGGTTAAAAGAGCCA
AGAAGGCTTGAAATCCCTTTTCTTTTTCTTTCCCTAATATCTCTTTGTATTAATCCGCAA
GGAAAAGATGAAACTGGTGAACATCAAATCTAAATTATCAGA


BQ
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AF RS1AR73JQ C 553
BS 1 717 RS1AR73TFB
BS 718 1302 RS1AR73JQ

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CTCTAATGTCCGTAAACGTCAAGGAGGAGCCTGTGCTTGCGCCTAACTGCGATGTCATCG
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CTTGCGTAGATGTTATTACCGAGAGAGTCAATCAGCTTGAGCAGAAAGTTGTGGAGGTTG
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GTGGGAAAAAAGTTGCTATCTCTCAACCCTCCAAGTGTAGCTCTGCTGGGAAAGGAATAA
CAAGAGGGAAACATGTTTCTAGCCCTGAACTTATGCGTCAGTTTGCTACAATTTTTCGTC
AGATTGCTCAACAAAAATGGGCGTGGCCATTTCTGCAACCTGTTGATGTTAAAGGGCTTG
GACTCGATGATTATCACAAGGTTATAGAGAAGCCAATGGATTTGGGAACTATTAGAACTA
AAATGGAGGCTTCGGAGTACAGCAATGTCCGGGAGATATATGCTGATGTTAGGCTAGTTT
TCAAGAACGCTATGAGATATAACGAAGAGAAAGATGATGTCTATGTGATGGCTGAATCTC
TTTTGGAGAAGTTTGAGGAGAAGTGGCTTACCATTATGCCTAGACTCGTCGAAGAGG

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1AR73JQ 750 0 0
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TTGAGGAGAAGTGGCTTACCATTATGCCTAGACTCGTCGAAGAGGAAAAAAAACAAGCAG
AGGAAGAGGCTCAGGATCGTGCGAGTAAGCAGCTTGCTGTGGAGGCTGCTCAAGCAGAGA
AGGCTAGAGATTTAAGCAACGAACTGTATGAGATCGATCAGGAGCTTGAGAAACTTCGGG
AGGTAGTGGTCCAGAAGTGCAGAAAGCTGTCCACTCAAGAAAAGAAGGGACTTTCTGCAG
CTTTAGGTCGTCTCTCTCCTGAGGATCTGTTTAAGGCGCTTAAAATGGTTTCAGAGGGCA
ACCCGCAGTTCCCGGCCGGAGCACCAGAAGTGGAGCTTGACATCGATCTTCAGACTGATG
TAACTTTGTGGAGGCTGAAGGTGTTTGTGCAAGAAGCACTGAAAGCAGCTAACAAGAGCT
CTGGTGGAACAAACGCCCAAAACAACAACAATGGTGGAGAGATGAACAAGACCACTGCGA
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ACTGGTGAACATCAAATCTAAATTATCAGA

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 3

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GGGTCAGGATCTCGTCAGAAGAAATCGACGGTTAGTTTTGTTTCTCGGGGAAGAAGTAAC
GGTTTGATGATAAGTAACCGACGGTTCAGAACGCCGTCAGCTCTAGGTGAACTGGCTGAC
ACGGTGGCGGAGACAGGCAAATCGGAGATTACGTGGCAAATCATAGTTGGAGCTGTCGCT
GGAGTTACGCCTTTCGTTGTTGCAGGTGTTGAATTCAGCAAAAGAATAATTGAACAGAAG
AGATGTGAAGAGTGTAGAGGATCAGGACTTGTTTTTAGAGACAAGAAGTACTTTCGTTGT
CCAGGATGTGGTGGGTTTCTTCCATGGTAGTCATGGAGAAGATTCTTTACAGGCTGATAA
TGATCTATGATGATGATCTATCTCTGCAAATATGAAGGCAAGAGAGGATAATGGAAGATA
TTCTCGATTACAATTAAATGTTTCCGTATTTTTCAACACATTTT*GGAATTTCGAAAAAA
AAGAATCAAATATATTGTGATAGTTTAAAACTGAAGACCAATATCACTTTCACATATCGA
TAGGTCATAGATTATAGAGGACAATCTTGTTCCATTCCAAAACTAAGAAGAATAAGGCCC
TGTTTGTTTCTCCATTTGTAATTTCCATTCAAATGCTCCATCTATGTGATCTATCTAAAT
GATCCATTCAAATTTTTGCGGTTGTTTGTTTCTCCATTTAGATG


BQ
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A*GAATCAAATATATTGTGATAGTTTAAAACTGAAGACCAATATCACTTTCACATATCG

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GG
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GAGCTGTCGCTGGAGTTACGCCTTTCGTTGTTGCAGGTGTTGAATTCAGCAAAAGAATAA
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ACTTTCGTTGTCCAGGATGTGGTGGGTTTCTTCCATGGCAGTCATGGAGAAGATTCTTTA
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AATGGAAGATATTCTCGATTACAATTAAATGTTTCCGTATTTTTCAACACATTTTTGGAA
TTTCGAAAAAAA
AA

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DS 

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ATATTCTCGATTACAATTAAATGTTTCCGTATTTTTCAACACATTTT*GGAATTTCGAAA
AAAAAGAATCAAATATATTGTGATAGTTTAAAACTGAAGACCAATATCACTTTCACATAT
CGATAGGTCATAGATTATAGAGGACAATCTTGTTCCATTCCAAAACTAAGAAGAATAAGG
CCCTGTTTGTTTCTCCATTTGTAATTTCCATTCAAATGCTCCATCTATGTGATCTATCTA
AATGATCCATTCAAATTTTTGCGGTTGTTTGTTTCTCCATTTAGATG

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DS 



AS 1 3

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GAGATTGAGTTAAATAAACAACACTGGAGTTCCTTATTTGAGCAGTATATGTTTTTCGAG
GCATATAAAAACTACCTTCAGGTTGATGTACAAGCAGCAGATGCTGAAGATTTATTGGCT
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AATGGGATGTTAATGTGCCATCCTCAACCAAATGAGTATGTGGACACTTCCAGGCAGTTT
CAGCATTGTGCTTTTTTTCATGGGATTGCAAAGGGCAGAAGGAGGTGGTGGCCAAGAGTG
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AAAAAACGACAATGAAATGATGGATACAAGGCCAGAGAAACCTGAGAAGCGTGCATCTGT
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GGCTCTTGTTCAAGGCTGTCATGATCTGGCTGAGCCTGTAGGAAAGGATGTGAGACCTGA
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GATGTTGATAAAGAGGAGCGGGAATCCATGTTAGGAGAAATCGCTGATGGTGTTTTGCAG
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CAATGGTGATGAGACCTGCAAATAAAGAAAAGGATATAAAGACC


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AF RS1CG07TF U 1
AF RS1BK83TF U 132
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CAGCATTGTGCTTTTTTTCATGGGATTGCAAAGGGCAGAAGGAGGTGGTGGCCAAGAGTG
TCGACAGTTTGATATACGTGGAACCGTGGACGAGTTCAGGCAAGACGTAAACATGTATAT
GTTTTGGAGACCTGGGATGGACGTATTTGTTTCTCATGTTCGTAGACGGCAGCTTCCGCC
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AAAAAACGACAATGAAATGATGGATACAAGGCCAGAGAAACCTGAGAAGCGTGCATCTGT
TAGTCCACCTAGTGTAGATGTAGTTTCTCCTGAAAGTAGTGCTATCACAACTGGTGGGAC
TCCTCCGATTGGCATTGTG

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DS 

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AATGTGCCATCCTCAACCAAATGAGTATGTGGACACTTCCAGGCAGTTTCAGCATTGTGC
TTTTTTTCATGTGATTGCAAAGGGCAGAAGGAGGTGGTGGCCAAGAGTGTCAACAGTTTG
ATATACGTGGAACCGTGGACGAGTTCAGGCAAGACGTAAACATGTATATGTTTTGGAGAC
CTGGGATGGACGTATTTGTTTCTCATGTTCGTAGACGGCAGCTTCCACCTTTTGTTTTTC
CAAACGGATGTAAAAGATTTCGACTACCCAAGCACCAGAATCAACAAGGTGGAGAACCTG
ATGAGACGGTTGAATCTTTGTCCGCCAATGTTGAGAGACATGCAAAGAGAAAAAACGACA
ATGAAATGATGGATACAAGGCCAGAGAAACCTGAGAAGCGTGCATCTGTTAGTCCACCTA
GTGTAGATGTAGTTTCTCCTGAAAGTAGTGCTATCACAACTGGTGGGACTCCTCCGATTG
GCATTGTGTCAGGGCCTAATGTGGAAGTTGAGGCCGAAAAATTGATCGGTAACAGCACTG
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AAG*CTGTCATGATCTGGCTGAGCCTG

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DS 

RD RS1CG07JQ 758 0 0
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GATTGGCATTGTGTCAGGGCCTAATGTGGAAGTTGAGGCCGAAAAATTGATCGGTAACAG
CACTGAAATTAGAAAAGTTTCTCAAAATGACCAAAACCTGGAAGTGGATAATAGGGCTCT
TGTTCAAGGCTGTCATGATCTGGCTGAGCCTGTAGGAAAGGATGTGAGACCTGATCCTAG
AGTTGTGATAACATGTGAAGGTGGGCATAATAAAGAAAAAGTTCGTGTTGTGGATCTGAA
TCCATCAATGACACTGACGCACAACCTCTTCCAAAGAGACTAAATCTGAATGAGGATGTT
GATAAAGAGGAGCGGGAATCCATGTTAGGAGAAATCGCTGATGGTGTTTTGCAGAATGAA
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GGTGAACATAGAAACTTGCATTCAGATGGATTGTTCAAAAGTGGTTTGTCAGAAGAACTT
CAGTCAAATAATTTACTCATGGGGAGACCTGAAGACGGAGCTAGGTCAGAATCTTTGCAG
AATTCACTAATGAGCAACAGATTGGGCTTGAAGTCGATAGTGTGAGGGTCTCAGCAATGG
TGATGAGACCTGCAAATAAAGAAAAGGATATAAAGACC

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 3

CO CL4069Contig1 1179 3 3 U
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CTTCTTCACCTCTCTTTCTCCTTCTCAACCTTCACTCCAAAAACTCTCTCTTCGTTCCTC
TCCCGCCGTTGCTTGCCTTCCCTCATCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCTCCCCCTC
TCGTTCCGTTCCAACACTTATCCGTAACGAGCCCGTTTTTGCCGCTCCTGCTCCTATCAT
CACCCCTTATTGGAGCGAAGAGATGGGTAGCGAAGCATACGAAGAGGCCATTGAAGCTCT
CAAGAAGCTTATTATCGAGAAGGAGGAGCTAAAGACTGTTGCGGCCGCTAAGGTGGAGCA
GGTCACGGCAGCACTTCAGACAGGTACTTCCTCCGACAAGAAAGCTTTCGACCCCGTCGA
AAACATTAAGCAAGGCTTCATCACTTTCAAAAAGGAGAAATACGAAACCAACCCTGCTTT
GTACGGTGAGCTCGCCAAGGGTCAGAGTCCTAAGTACATGGTGTTTGCTTGTTCCGACTC
GCGTGTGTGTCCATCGCACGTTCTCAACTTTCAGCCAGGAGAGGCCTTCGTTGTCCGTAA
CATAGCCAACATGGTTCCTCCTTTTGACAAGGTCAAATACGGTGGAGTAGGAGCAGCCAT
CGAATACGCTGTTTTGCACCTTAAGGTGGAGAACATTGTGGTGATAGGACACAGCGCTTG
TGGTGGGATCAAGGGACTCATGTCTTTTCCTTTGGATGGAAACAACTCCACTGATTTCAT
AGAGGACTGGGTCAAAATCTGTTTACCAGCCAAGTCAAAAGTCATATCAGAACTTGGGGA
GTCAGCCTTTGAGGACCAGTGTGTCCGATGTGAAAGGGAGGCAGTGAATGTTTCACTAGC
AAACTTGTTGACTTATCCATTCGTGAGAGAAGGACTTGTGAAAGGAACACTTGCTTTGAA
GGGAGGCTACTATGATTTTATAAAGGGTGCTTTTGAGCTTTGGGGACTTGAGTTTGGCCT
CTCCGAAACTAGCTCAGTATGAACCAATCCACCATCATCATCATGAGCATCCATCATCAT
CATATATCTCATTTACATATGTAATTTGTAATGTGCTGAGTTGTTTTCCAATCTTCATGG
TATTCAACTTTCATATAAATAAAAAAGAAAACTCAGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G590TF U 1
AF RS1G590JQ C 421
AF RS1E494TF U 926
BS 1 681 RS1G590TF
BS 682 926 RS1G590JQ
BS 927 1179 RS1E494TF

RD RS1G590TF 681 0 0
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CTTCTTCACCTCTCTTTCTCCTTCTCAACCTTCACTCCAAAAACTCTCTCTTCGTTCCTC
TCCCGCCGTTGCTTGCCTTCCCTCATCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCTCCCCCTC
TCGTTCCGTTCCAACACTTATCCGTAACGAGCCCGTTTTTGCCGCTCCTGCTCCTATCAT
CACCCCTTATTGGAGCGAAGAGATGGGTAGCGAAGCATACGAAGAGGCCATTGAAGCTCT
CAAGAAGCTTATTATCGAGAAGGAGGAGCTAAAGACTGTTGCGGCCGCTAAGGTGGAGCA
GGTCACGGCAGCACTTCAGACAGGTACTTCCTCCGACAAGAAAGCTTTCGACCCCGTCGA
AAACATTAAGCAAGGCTTCATCACTTTCAAAAAGGAGAAATACGAAACCAACCCTGCTTT
GTACGGTGAGCTCGCCAAGGGTCAGAGTCCTAAGTACATGGTGTTTGCTTGTTCCGACTC
GCGTGTGTGTCCATCGCACGTTCTCAACTTTCAGCCAGGAGAGGCCTTCGTTGTCCGTAA
CATAGCCAACATGGTTCCTCCTTTTGACAAGGTCAAATACGGTGGAGTAGGAGCAGCCAT
CGAATACGCTGTTTTGCACCT

QA 1 681 1 681
DS 

RD RS1G590JQ 736 0 0
AAAACA
TAAGCAAGGCTTCATCACTTTCAAAAAGGAGAAATACGAAACCAACC*TGCTTTGTACGG
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GTGTCCATCGCACGTTCTCAACTTTCAGCCAGGAGAGGCCTTCGTTGTCCGTAACATAGC
CAACATGGTTCCTCCTTTTGACAAGGTCAAATACGGTGGAGTAGGAGCAGCCATCGAATA
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GATCAAGGGACTCATGTCTTTTCCTTTGGATGGAAACAACTCCACTGATTTCATAGAGGA
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CTTTGAGGACCAGTGTGTCCGATGTGAAAGGGAGGCAGTGAATGTTTCACTAGCAAACTT
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CTACTATGATTTTATAAAGGGTGCTTTTGAGCTTTGGGGACTTGAGTTTGGCCTCTCCGA
AACTAGCTCAGTATGAACCAATCCACCATCATCATCATGAGCATCCATCATCATCATATA
TCTCATTTACATATGTAATTTGTAATGTGCTGAGTTGTTTTCCAATCTTCATGGTATTCA
ACTTTCATAT

QA 7 736 7 736
DS 

RD RS1E494TF 254 0 0
G
GAGAAGGACTTGTGAAAGGAACACTTGCTTTGAAGGGAGGCTACTATGATTTTATAAAGG
GTGCTTTTGAGCTTTGGGGACTTGAGTTTGGCCTCTCCGAAACTAGCTCAGTATGAACCA
ATCCACCATCATCATCATGAGCATCCATCATCATCATATATCTCATTTACATATGTAATT
TGTAATGTGCTGAGTTGTTTTCCAATCTTCATGGTATTCAACTTTCATATAAATAAAAAA
GAAAACTCAGATG

QA 2 254 2 254
DS 



AS 1 3

CO CL4070Contig1 798 3 21 U
TTTGAATTTCTGTTGAACAAAAAAGGAGAACGCTGACAAAAAAGAGATCAAGTCAATCAT
CTTCTTTTGCATCAACACGAAATTAGGGTTTATCAAAAACACAATTCCTAGAAGCTCCCT
TATCGTGGAAGAAACTATCAGATTCAATATCTCTGATTCAGACCAAACCTCTCTCCCTCT
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACAAGACCGTAGCTTTCCTCAACTGATTTTCCGAC
AAAGCTTAAATTAAAACTTTTATATGTTCTTTGATCCGATGAATTCACATCTCTTCCGCG
TAATCTGTATACTCCACTCGGTAATCGCACTCACGAGCGGAACCCTGATGATGTTCTACG
CAGAGAAAGCTTCCATCTTCGGCCACGGAAGCGACATAGCTAACAAGCTCAAAGGCTCGA
CCCCTCACGACGGGCTCCTCATCCAGATCTCTCAGTCCTTCTCCGGCTTGCTTCTCTTCG
CTATCGGTCTGGTGCTTTTCATGGTCTCCTTCGTGAAAGACAGAGACTTTCACAGCTTCT
TCGCCGGAGGCTCCGTGATTCTCTACGTGCTTATGGCTCTGTGGAGAGTTATGTTCGAGT
GGAAGATTGAAGATCTCGCCTTTGAATGCCCCAAGCAGGCTCTTGGAGATATTGCTTTGG
CTGTCTCTTGGGTTTTCTTCCTTGTTTATACTTGGAGGGAGAAGTATGATTGATTGGTGT
TTTGTTTGTTTGTTTAGTGTAATCTTTAGATCAAAACCATTGTGAAAAAGTTTGGATTCT
GTAAATAAATTTGTTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BP69TF U 1
AF RS1CF51TF U 16
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CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACAAGACCGTAGCTTTCCTCAACTGATTTTCCGAC
AAAGCTTAAATTAAAACTTTTATATGTTCTTCGATCCGATGAATTCACATCTCTTCCGCG
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CCCCTCACGACGATCTCCTCATCCAGATCTCTCAGTCCTTCTCCGGCTTGCTTCTCTTCG
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TTTGCTTGTT

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DS 

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GAAC
AAAAAGGGGAACGCTGACAAAAAAGAGATCAAGTCAATCATCTTCTTTTGCATCAACACG
AAATTAGGGTTTATCAAAAACACAATTCCTAGAAGCTCCCTTATCGTGGAAGAAACTATC
AGATTCAATATCTCTGATTCAGACCAAACCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCACAAGACCGTAGCTTTCCTCAACTGATTTTCCGACAAAGCTTAAATTAAAACTT
TTATATGTTCTTTGATCCGATGAATTCACATCTCTTCCGCGTAATCTGTATACTCCACTC
GGTAATCGCACTCACGAGCGGAACCCTGATGATGTTCTACGCAGAGAAAGCTTCCATCTT
CGGCCACGGAAGCGACATAGCTAACAAGCTCAAAGGCTCGACCCCTCACGACGGGCTCCT
CATCCAGATCTCTCAGTCCTTCTCCGGCTTGCTTCTCTTCGCTATCGGTCTGGTGCTTTT
CATGGTCTCCTTCGTGAAAGACAGAGACTTTCACAGCTTCTTCGCCGGAGGCTCCGTGAT
TCTCTACGTGCTTATGGCTCTGTGGAGAGTTATGTTCGAGTGGAAGATTGAAGATCTCGC
CTTTGAATGCCCCAAGCAGGCTCTTGGAGATATTGCTTTGGCTGTCTCTTGGGTTTTCTT
CCTTGTTTATACTTGGAGGGAGAAGTATGATTGATTGGTGTTTTGTTTGTTTGTTTAGTG
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QA 5 767 5 767
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TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACAAGACCGTAGCTTTCCTCAACTGATTTTCCGACAAAGC
TTAAATTAAAACTTTTATATGTTCTTTGATCCGATGAATTCACATCTCTTCCGCGTAATC
TGTATACTCCACTCGGTAATCGCACTCACGAGCGGAACCCTGATGATGTTCTACGCAGAG
AAAGCTTCCATCTTCGGCCACGGAAGCGACATAGCTAACAAGCTCAAAGGCTCGACCCCT
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TAAATTTGTTGCG

QA 1 733 1 733
DS 



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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1A215JQ U 1
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AF RS1A215TR U 19
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CCAGTAGCTTCCATCTGGCGGGTTTTTTTTTT**TGTTTCTCTGAACCCTTCCTTATGCC
CACACCAGTCCATCGAAGCCAATTTCTAGATTTGACACAGGGCTGTCTCCAAAACCTTGG
TTAAGTGCCTGGGTGTCATCAACTGGATCTACATATGGATCACGC

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DS 

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AACCCTTCCTTATGCCCACACCAGTCCATCGAAGCCAATTTCTAGATTTGACACAGGGCT
GTCTCCAAAACCTTGGTTAAGTGCCTGGGTGTCATCAACTGGATCTACATATGGATCACG
C

QA 1 361 1 361
DS 

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TATGAAGCTGAAAGCTTTCCCATAGGTTATGGAGAGAAGCTCCCAGTAGCTTCCATCTGG
CGGGTTTTTTTTTT**TGTTTCTCTGAACCCTTCCTTATGCCCACACCAGTCCATCGAAG
CCAATTTCTAGATTTGACACAGGGCTGTCTCCAAAACCTTGGTTAAGTGCCTGGGTGTCA
TCAACTGGATCTACATATGGATCACGC

QA 1 387 1 387
DS 



AS 1 3

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TCTTATCTCCCTTGATCGATCGGGTGTCTATTTATATGCCTCCCTGTAATCACCGTTAAC
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AATCTTCCGTTTTTTGTGGTTCCAGGGTTCAAGAGATTCGTGTATTGAGTGAAAAAACAA
AGACAAGTTTTGTGCTCTGTATTTTTGGAAATTTAGTTGATAAACCTCATCGCTATCAAT
GGAGAACGGAGGCTCCACCTCCTCCTCCTCGGGATCATCATCATCATCCCTTCAAGCCTC
TATGCAATAATTTAAACTCTTTGAAACTCAATCGAATTTCTATATGATTGGTTGGAATGG
TAATAGAGTGTATAGAGTACTAAAGATAGACCGTTTTGATGCATCTGAGATTACTCTGAG
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AACAAGGCCACAGGCAGCCTCAAACTGGTCACTCTCTGTTATGGCATCACTGGGTTCATT
AAGTTTTGGGGACCATACTACATGTGGTCACAAGGTCTATGAAGTGTCCAAGATTGAGAT
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TGGTGGACCTTACAAAGGATTTCTTTTTCAGCTATTATTTCAGTATAATGCGTAGTTTCC
ATAAAATTATATGTGACCATGAAAGTGGTGATATTCTCTATAAGAAAATGTTTGTGTGGT
ACGAGTTCTTGACTCGGGGAATTCAACATCATGGACTGTAGCATTTGTGTATGGTTTCTC
TAAGCATGTATGAATCGGATATATATTTTTTGCTCCTCACTGCCAAAGAGAAGAAAGTTT
TCCCGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1BN08TF U 43
AF RS1CH15TF U 1
AF RS1CH15JQ C 363
BS 1 228 RS1CH15TF
BS 229 229 RS1BN08TF
BS 230 623 RS1CH15TF
BS 624 1206 RS1CH15JQ

RD RS1BN08TF 395 0 0
GG
ATCTTCGTTTCTCTGAGTGACGGCGATGACGACTATCGATCTTCTTCGTTAATCCTGTAA
CGGATCGATTTATGATCTCTACTAATGGCTCTTCAATGCGTCGGTCCTTTGTCTACCAAT
TTTAATATTTTGGCATTCTTATCTCCCTTGATCGATCGGGTGTCTATTTATATGCCTCCC
TGTAATCACCGTTAACAAATCTCGCAGTTGTTTCGTTTCAGGAGCATCGGAAGAAGAAGA
AATCTCACTAGATGAGAATCTTCCGTTTTTTGTGGTTCCAGGGTTCAAGAGATTCGTGTA
TTGAGTGAAAAAACAAAGACAAGTTTTGTGCTCTGTATTTTTGGAAATTTAGTTGATAAA
CCTCATCGCTATCAATGGAGAACGGAGGCTCCA

QA 3 395 3 395
DS 

RD RS1CH15TF 623 0 0
ACGGCACCCTACTTTTTTTTTGTAACTTACGGCACCCTACTTCCATCTTCGTTTCTCTGA
GTGACGGCGATGACGACTATCGATCTTCTTCGTTAATCCTGTAACGGATCGATTTATGAT
CTCTACTAATGGCTCTTCAATGCGTCGGTCCTTTGTCTAACAATTTTAATATTTTGGCAT
TCTTATCTCCCTTGATCGATCGGGTGTCTATTTATATGCCTCCCTGTAGTCACCGTTAAC
AAATCTCGCAGTTGTTTCGTTTCAGGAGCATCGGAAGAAGAAGAAATCTCACTAGATGAG
AATCTTCCGTTTTTTGTGGTTCCAGGGTTCAAGAGATTCGTGTATTGAGTGAAAAAACAA
AGACAAGTTTTGTGCTCTGTATTTTTGGAAATTTAGTTGATAAACCTCATCGCTATCAAT
GGAGAACGGAGGCTCCACCTCCTCCTCCTCGGGATCATCATCATCATCCCTTCAAGCCTC
TATGCAATAATTTAAACTCTTTGAAACTCAATCGAATTTCTATATGATTGGTTGGAATGG
TAATAGAGTGTATAGAGTACTAAAGATAGACCGTTTTGATGCATCTGAGATTACTCTGAG
GATTCCACTGCTTATACCAAAAA

QA 1 623 1 623
DS 

RD RS1CH15JQ 844 0 0
GACAAG
TTTGTGCTCTGTATTTT*GGAAATTTAGT*GATAAACCTCATCGCTATCAATG*AGAACG
GAGGCTCCACCTCCTCCTCCTCGGGATCATCATCATCATCCCTTCAAGCCTCTATGCAAT
AATTTAAACTCTTTGAAACTCAATCGAATTTCTATATGATTGGTTGGAATGGTAATAGAG
TGTATAGAGTACTAAAGATAGACCGTTTTGATGCATCTGAGATTACTCTGAGGATTCCAC
TGCTTATACCAAAAAAGAATGCTACGAGTTGCTTAAACGGATATACGAAGACAACAAGGC
CACAGGCAGCCTCAAACTGGTCACTCTCTGTTATGGCATCACTGGGTTCATTAAGTTTTG
GGGACCATACTACATGTGGTCACAAGGTCTATGAAGTGTCCAAGATTGAGATCATTTCTT
TGCGTAATTCTTGCGTGCTTTCCACCATTGCAAATTCAAGAGACGAGAACATGTGTTTTG
TTCTACCTTTTACTATATTATGCCCTTTTTTTTGTTCCGAGCTTATTGTTGAAGAAAGGT
TCTGTTTTACCTTTCTGTTTGGTGACATGAGAGTACAAGAAGCTCCTGTGTATGGTGGAC
CTTACAAAGGATTTCTTTTTCAGCTATTATTTCAGTATAATGCGTAGTTTCCATAAAATT
ATATGTGACCATGAAAGTGGTGATATTCTCTATAAGAAAATGTTTGTGTGGTACGAGTTC
TTGACTCGGGGAATTCAACATCATGGACTGTAGCATTTGTGTATGGTTTCTCTAAGCATG
TATGAATCGGATATATATTTTTTGCTCCTCACTGCCAAAGAGAAGAAAGTTTTCCCGA

QA 7 844 7 844
DS 



AS 1 3

CO CL4073Contig1 702 3 4 U
GGGCTTTATCCAGACGCTCTCTCTCATCATCCACGAAGAAGAAACCCTAGAAAGGCGGTC
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ACGCTGCTCGGAGAAGCGGCGCCGATATCGAATCCGTCAGAAAATACAATGCTGGAACGA
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ACTTAGCTCATGAACGTGTGCCTACTGAGTTGAAGAAGGCAATCATGCATGCCCGAGGTG
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GAGAATACGAGTCTGGGAAGGCAATACCGAACCAGCAGATCCTGATTAAGCTGGAGAGGG
CACTTGGAGCTAAACTCCGTGGAAAAAAGTAATAACATAATCTCCTCAAAAGCTAGTCGC
CGTTTCACTTCAGTCCATATGCTGTAGTGACTGTGTGCCTTGTTT*GATGGTTTAGTAGC
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ACCGTTTTGTCATTATAAATAATCCGCTCGTTCTCTTTGCAT


BQ
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1H113JQB C 1
AF RS1H113TF U 1
AF RS1BI06TF U 290
BS 1 585 RS1H113TF
BS 586 586 RS1BI06TF
BS 587 700 RS1H113TF
BS 701 702 RS1BI06TF

RD RS1H113JQB 700 0 0
GGGCTTTATCCAGACGCTCTCTCTCATCATCCACGAAGAAGAAACCCTAGAAAGGCGGTC
GAAGAAGAAGGAAAGAAGAAGCTATGGCAGGAGTAGGACCGATGACTCAGGATTGGGAGC
CCGTGGTGATCCGTAAGAAAACCCCGAACGCCGCCGCCAAGCGCGACGAGAAGACTGTCA
ACGCTGCTCGGAGAAGCGGCGCCGATATCGAATCCGTCAGAAAATACAATGCTGGAACGA
ACAAGGCGGCTTCAAGCGGCACCTCCTTGAACACCAAGAGGCTTGATGATGACACTGAGA
ACTTAGCTCATGAACGTGTGCCTACTGAGTTGAAGAAGGCAATCATGCATGCCCGAGGTG
AGAAGAAGCTCACCCAGTCCCAACTTGCTCAGCTGATCAATGAGAAGCCACAAGTGATCC
GAGAATACGAGTCTGGGAAGGCAATACCGAACCAGCAGATCCTGATTAAGCTGGAGAGGG
CACTTGGAGCTAAACTCCGTGGAAAAAAGTAATAACATAATCTCCTCAAAAGCTAGTCGC
CGTTTCACTTCAGTCCATATGCTGTAGTGACTGTGTGCCTTGTTT*GATGGTTTAGTAGC
GAGCTCTGCTTGAAATCTTTTATGGTTTGTAAGAAAACAAAGAAACTAAAGCTGCTTTGA
ACCGTTTTGTCATTATAAATAATCCGCTCGTTCTCTTTGC

QA 1 700 1 700
DS 

RD RS1H113TF 702 0 0
GGGCTTTATCCAGACGCTCTCTCTCATCATCCACGAAGAAGAAACCCTAGAAAGGCGGTC
GAAGAAGAAGGAAAGAAGAAGCTATGGCAGGAGTAGGACCGATGACTCAGGATTGGGAGC
CCGTGGTGATCCGTAAGAAAACCCCGAACGCCGCCGCCAAGCGCGACGAGAAGACTGTCA
ACGCTGCTCGGAGAAGCGGCGCCGATATCGAATCCGTCAGAAAATACAATGCTGGAACGA
ACAAGGCGGCTTCAAGCGGCACCTCCTTGAACACCAAGAGGCTTGATGATGACACTGAGA
ACTTAGCTCATGAACGTGTGCCTACTGAGTTGAAGAAGGCAATCATGCATGCCCGAGGTG
AGAAGAAGCTCACCCAGTCCCAACTTGCTCAGCTGATCAATGAGAAGCCACAAGTGATCC
GAGAATACGAGTCTGGGAAGGCAATACCGAACCAGCAGATCCTGATTAAGCTGGAGAGGG
CACTTGGAGCTAAACTCCGTGGAAAAAAGTAATAACATAATCTCCTCAAAAGCTAGTCGC
CGTTTCACTTCAGTCCATATGCTGTAGTGACTGTGTGCCTTGTTTTGATGGTTTAGTAGC
GAGCTCTGCTTGAAATCTTTTATGGTTTGTAAGAAAACAAAGAAACTAAAGCTGCTTTGA
ACCGTTTTGTCATTATAAATAATCCGCTCGTTCTCTTTGC
AA

QA 1 700 1 700
DS 

RD RS1BI06TF 413 0 0
G
GACACTGAGAACTTAGCTCATGAACGTGTGCCTACTGAGTTGAAGAAAGCAATCATGCAT
GCCCGAGGTGAGAAGAAGCTCACCCAGTCCCAACTTGCTCAGCTGATCAATGAGAAGCCA
CAAGTGATCCAAGAATACGAGTCTGGGAAGGCAATACCGAACCAGCAGATCCTGATTAAG
CTGGAGAGGGCACTTGGAGCTAAACTCCGTGGAAAAAAGTAATAACATAATCTCCTCAAA
AGCTAGTCGCCGTTTCACTTCAGTCCATATGCTGTAGTGACTGTGTGCCTTGTTT*GATG
GTT*AGTAGCGAGCTCTGCTTGAAATCTTTTATGGTTTGTAAGAAAACAAAGAAACTAAA
GCTGCTTTGAACCGTTTTGTCATTATAAATAATCCGCTCGTTCTCTTTGCAT

QA 2 413 2 413
DS 



AS 1 3

CO CL4074Contig1 861 3 7 U
GGACCTTAATATCCACAAAATAAAAAATAATTACTAGAGCTTGAGAAAAACCCTAAATGG
CTGAGGGACAACAAAACTCAGGTAACAGCAATGGTGAAAACATCATCCCTCCCGAAGATG
TTGCTAAGTTCCTGCCCAAAACTGTTGAAGAAGGTGGATGGGAAAAATGTTGGGAAGACG
GGGTAACACCATGGGACCAAGGAATAGCCACACCCCTCGTTGTCCATCTTGTTGAATCTT
CTTCTCTTCCTCTTGGTCGTGCTCTTGTCCCCGGCTGTGGCGGAGGTCACGATGTGGTTG
CGATGGCAAGTCCCGAACGTTACGTTGTTGGTTTGGATATTTCTGAAAGTGCCCTCGAGA
AAGCTGCTGAGACTTACGCCTCCTCACCGAAGGCCAAGTACTTTACGTTCGTGAAGGAAG
ACTTCTTCACATGGCGTCCTAGTGAATTATTCGACCTCATCTTCGATTATGTGGTGTTCT
GTGCCATTGAGCCGGAGATGAGAGCTGCATGGGCCAAAACCATGTATGAACTCTTAAAAC
CCGACGGCGGACTCATTACTCTCATGTATCCGATTACCGATCATGATGGTGGACCTCCTT
ACAAAGTAGCTGTCTCTACCTACGAAGATGTTTTGGTTCCGGTAGGATTCAAGGCAGTGT
CCATTGAGGAGAATCCATACTCCATTGCCACTCGTAAGGGTAAAGAGAAGCTCGGTAGGT
GGAAAAAGATCAACTGATCCAAGAAAGATCTCTCTTACTCTTTACTAAGAGTCTTATATG
CATATTCTACCAATGTATTAAGAATGTAATGAATATTCTAAATATTTGCTGATTATTAAT
AATAAACGTAATGTTTCTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
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AF RS1B316TF U 1
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AF RS1AP70TFB U 83
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ACAAAGTAGCTGTCTCTACCTACGA*GATGTTTTGGT

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DS 

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CCTTACAAAGTAGCTGTCTCTACCTACGAAGATGTTTTGGTTCCGGTAGGATTCAAGGCA
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DS 

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G
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CTTGTCCCCGGCTGTGGCGGAGGTCACGATGTGGTTGCGATGGCAAGTCCCGAACGTTAC
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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1AI45TF U 1
AF RS1AI45JQ C 650
BS 1 785 RS1AI45TF
BS 786 1556 RS1AI45JQ

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AAAATCGGATCTTAACAATTTTTTTTGCAAGATGCAGACGACCAACGGCTCAGATTCATC
GTTAGCAACTCCCGGAGCGACGACGCCTCCGCCGCCTCAGCAGTGGCAACAACAACAACA
GCAACATTGGATGGCGGCCATGCAGTATCCAGGCGCAGCGGCTATGATGATGATGCAGCA
GCAACAGATGATGATGTATCCTCACCAATACGTTCCTTACAATTATCAGCAGCAGCAGCA
GCATCCTCACTTCCAATACGCGTCGCATCAACAGCAACACAAGACACATGAGCGCGGATC
TGGAGATGATGTGAAGACTCTATGGATTGGTGATCTTCTTTATTGGATGGACGAGACATA
TCTCCACAACTGCTTTTCTCACACCGGCGAGGTTTCTTCTGTGAAAGTGATTCGTAACAA
GCTAACATGTCAATCAGAAGGGTATGGTTTTGTTGAGTTTCTTTCGCGAGCTGCAGCTGA
AGAGGTTCTTCAGAACTTTAACGGTTCAGTAATGCCAAACTCCGAGCAGCTCTTCCGTCT
AAACTGGGCATCTTTTAGCACTGGTGAGAAGAGAGCAGTTGAGAATGGTCCAGAGCTATC
TATATTCGTTGGAGATTTGTCTCCAGATGTGACCGACACTTTATTGCAAGAGCTCTTTGT
TGAGAGATATCCATCTGTCAAGAGCGCTAAAGTTGTGATCGACTCCAACACTGGCCGGTC
TAAAG
G

QA 1 785 1 785
DS 

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CCAGAGCTATCTATATTCGTTGGAGATTTGTCTCCAGATGTGACCGACACTTTATTGCAA
GAGCTCTTTGTTGAGAGATATCCATCTGTCAAGAGCGCTAAAGTTGTGATCGACTCCAAC
ACTGGCCGGTCTAAAGGTTACGGTTTTGTTAGGTTTGGTGATGAGAACGAGAGATCAAGG
GCTTTGACGGAGATGAATGGAGCTTATTGTTCCAACAGGCAGATGCGTGTAGGTGTTGCG
ACCCCTAAAAGAGCCGTTGCTAATCAGCAACAACAGCATCATCCTTCACAAGCTCTGATA
CTGGCTGGTGGACATGGAGCAAATGGTTACATGGCTCATGGCTCACAGTCTGATGGTTAA
TCAAACAACTCAACTATATTTGTTGGTGGCATTGATCCTGATGTTACAGAAGAAGACCTC
AGACAACCTTTCTCCCAGGTTGGAGAGGTTGTTTCGGTGAAGATCCCAGTAGGCAAAGGA
TGTGGTTTCGTCCAATTAGCTAATAGGAAGAGTGCTGACGATGCCATCCAGAGTTTGAAC
GGGACAGTCATAGGCAAGAACACTGTCAGACTTTCTTGGGGAAGAAGCCCGAACAAGCAG
TGGAGAGGAGACTCGGGGCAGCAGTGGAATGGAGCACAACGAGGACAAGGTTGCAACAAT
GGAGGATATGCTAACCACCACGACTCCAACACCTATCCTGCCGAGACTTGAAGAGAAGAG
AATCAAAAATTGATCATGGTCATATGGTGGTTAAAAAGCCTCTGTCATTGCTAAACTTGT
AGTGGGAAAAAAAAAGAATTGTAGTGGGAAAAAAAAAAGAATTTTCTTAGATGGATTTGA
TTTTGATAGACTTATGCTGTTGTTTGGAGATTCACAAATTTTGGTTACTACTGGTTTCTC
ACAGACT

QA 1 907 1 907
DS 



AS 1 2

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AGTAGGGTGGGTTGGACAGTGATCTTCTGCTCCTCCGATGGCTAGGGGAATACGATCTGC
TACCATCAGACGAGTAGCTCCGACTGCGACTGCGACTGCGAGACTGGCTGATAGACCTTC
GGGGAGAGTAGCTAGGAGACCGATGTCGTCCTCGAGCAGCTCTCAGCCCCAAGTACTTTC
CTGGAGTTGGGGTACGTCCTCTACGACGTCTTGCCTTCTCAACGGTAATGACGCGGCCCA
GGAGAACAGAGTGATCAAGATGCCTGATGCAGCGGTTAGCATCACCAACAGTTTCCATAG
AGATAAAACCAAAACCACGAGTTTCTCTAGTCCGTGGATCAAGGACAAGGTGAACATCAG
TTACCTTTCCCTCTTTAGAGAAATGATCCTCCAGATCTCTTTCCGTAACCCGATGAGACA
ATCCAGTCACATACAAACTGTTACCAGGGTTCTCCGCATCGCTTGAGGCACTCCTGGAGC
GGCTTCTAGAGAGAGACCTTGACACAGACCTTCCACGACGCTTGTCGTAAGGGGATAGTG
AGGGAGAGTATCTTGACCTCCTTGAGTATGACATATCGTAGTAACGCAGAAAGCTCAACA
AAACAAGGATGAACGTTCGAGAACTCTCTGCACCAGACGTTATTAGAGACGTAAACGGAA
GCGGAAGAAGAGAACTCCAGGGAGGCCTCTAGCTCAGCGCTGGCAACTCCAAAAAGGCTT
CAATGTTTCCCTTCCTACTCCGCCATATTTGCTTGAACCGAGCATTCTGTGCAGTGGTCT
GTTGCTGATGTACAGCTTTTGTCAAGAACTGTTCCTTTCTCCGCAATAAACATTCCTTTA
CTGCAACTCTGCTCATCAAGATCAGACTCAAATAAAGAGTGGATGATATCAAGAGGGGTT
TCAGAGTCCGTGAGTGTCTCCAAATGCCGCACTAACACCTTCTTGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1G183TF C 1
AF RS1EG40JQ U 180
BS 1 179 RS1G183TF
BS 180 947 RS1EG40JQ

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CTGGAGTTGGGGTACGTCCTCTACGACGTCTTGCCTTCTCAACGGTAATGACGCGGCCCA
GGAGAACAGAGTGATCAAGATGCCTGATGCAGCGGTTAGCATCACCAACAGTTTCCATAG
AGATAAAACCAAAACCACGAGTTTCTCTAGTCCGTGGATCAAGGACAAGGTGAACATCAG
TTACCTTTCCCTCTTTAGAGAAATGATCCTCCAGATCTCTTTCCGTAACCCGATGAGACA
ATCCAGTCACATACAAACTGTTACCAGGGTTCTCCGCATCGCTTGAGGCACTCCTGGAGC
GGCTTCTAGAGAGAGACCTTGACACAGACCTTCCACGACGCTTGTCGTAAGGGGATAGTG
AGGGAGAGTATCTTGACCTCCTTGAGTATGACATATCGTAGTAACGCAGAAAGCTCAACA
AAACAAGGATGAACGTTCGAGAACTCTCTGCACC
TGAC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1EG40JQ 768 0 0
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AGGAGAACAGAGTGATCAAGATGCCTGATGCAGCGGTTAGCATCACCAACAGTTTCCATA
GAGATAAAACCAAAACCACGAGTTTCTCTAGTCCGTGGATCAAGGACAAGGTGAACATCA
GTTACCTTTCCCTCTTTAGAGAAATGATCCTCCAGATCTCTTTCCGTAACCCGATGAGAC
AATCCAGTCACATACAAACTGTTACCAGGGTTCTCCGCATCGCTTGAGGCACTCCTGGAG
CGGCTTCTAGAGAGAGACCTTGACACAGACCTTCCACGACGCTTGTCGTAAGGGGATAGT
GAGGGAGAGTATCTTGACCTCCTTGAGTATGACATATCGTAGTAACGCAGAAAGCTCAAC
AAAACAAGGATGAACGTTCGAGAACTCTCTGCACCAGACGTTATTAGAGACGTAAACGGA
AGCGGAAGAAGAGAACTCCAGGGAGGCCTCTAGCTCAGCGCTGGCAACTCCAAAAAGGCT
TCAATGTTTCCCTTCCTACTCCGCCATATTTGCTTGAACCGAGCATTCTGTGCAGTGGTC
TGTTGCTGATGTACAGCTTTTGTCAAGAACTGTTCCTTTCTCCGCAATAAACATTCCTTT
ACTGCAACTCTGCTCATCAAGATCAGACTCAAATAAAGAGTGGATGATATCAAGAGGGGT
TTCAGAGTCCGTGAGTGTCTCCAAATGCCGCACTAACACCTTCTTGGG

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 3

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ATTGCACATCCACCTCCGTCGCCGGAATCCTCCAAACTTCCTCTGAACTTACTTTCCTTG
CCGCAGATTATCACCCGTAGAAACCTTATCAAGACTCTCTCCTTATGTCTCGCCGCACCA
TCACTCTCAGTAGCACCAGTCCACGCACGCGGCCTGTTTCAAATGCCGCCTCTCCGTCTC
TCTAATCGTTACTACCTGGTGAGAGCTGGTGAATCTGATTACGAAAGCTTAGGGATCATC
AACACAAACCCGGTGGAGAAAACATCGGTAGATAGCGGATTGTCAGAGAAAGGTAAAAAG
CAGACTGTGAGGGCTGCGTTACAGTTAAAGGCAATGGGGGCATGTGACAGAAACTGTTGG
CTATGGCCTTCCATTACACAGAGAGCTTATCAGGCTGCTGAAATCATCGCCTCCATTAAT
GGGATTAGTCGCAGCTATATAGTTCCGGAATATAGCTTCCTAGATGCTCGTGGTTTAGGA
GCTTACGAAGGCAAGAAGCTAGATTCCATATCAGAAGTGTATGCATTAGACTCGATATCG
ATGAAGACAAAACCTCCTCCTATCAGCGACGGTACCCCTAACGAGAGTGTATCAGATGTA
TTTGTGCGTGTGACGCAGCTAATGTCCATTCTCGAGACTCAGTATTCAGAGGACACGGTC
GTCATTGTATCGCCTGATTCAGACAACTTATCTGTGTTACAAGCTGGTGCTCAAGGTCTC
GACCTTCGAAGGCATTCAGAGTTGTATTTTGGACCAGGAGAAGTAAGGTTGTTGGACGCA
GACAGCATCCCTGTCTATAAGCAACCTGCTTCTGCTGTATATAAATGCACAAACCTACCA
AACTGTGACTAATCTCGCTTCTATTAGTATATACTAAATTGAGATACAGTTATGATTATT
AAAGAGGCATTATGTTGAAGTTAAGTTTAGATTTGCAATGCAAGTGTTAGTAAATTCTAC
TAAAATAGAGTCATAACTGTTTA


BQ
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25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DE20TF U 1
AF RS1EF80TF U 41
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TCT

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DS 

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G
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GTTTA

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DS 



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ATTATTTAGACAGCATAGATAGCTGCTATGCTTATTGTGACTGTTGGTTGTTGTAATCTC
TTGTGTTGTGAGAAATGAAGTTTGCGTTTGTCCC


BQ
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AF RS1DM77TF U 1
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DS 

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TTATCTGGGTTTCGAATATTCTCCATTTCCTCCAATCACAGCACGAAAAGTATTCACCTT
TTTTTT**GTGTGTTTAATGGATGCAACGGCGGAGAAATTCGTTGCTTCACGGCCATCTA
CGGTTGATTCAACGGCGGGGATGAGAGGTTGTGGGCTTGCTAATCTGACGTGGGTCGGTG
TAGACAAGGAGGAGCTGCGCCAGAGGCTGTTGATGCCTGAGTATCTCCGTTTAGCCATGC
GTGACTGTATCAAAAGGAAAGATGCCACGGCCATTCCTGACCATTTGCTTCTTCCTGGTG
GCGGCGTCGCTGATATGGCTCCTTACGCGCCGATGGTCGTGTTTATCAATCCTAAGAGTG
GTGGTCGTCACGGTCCTGTGCTTAAAGAGAGGCTTCAACAGTTGATGAGCGATGAACAGG
TGTTTGATCTGACGGAAGTGAAGCCGCGTGAGTTTGTTAGATACGGTTTGGCGTGTCTGG
AGAAAGTTGCAGCGGAAGGAGATGAATGTGCTAAAGAATGCAGAGCTAGGTTGAGGATTA
TGGTTGCAGGAGGTGATGGTACTGTTGGTTGGGTTCTTGGATGTCTTGGAGAGCTTAACA
AAGATGAAACATCACATATTCCTCCTGTCGGCGTCATCCCTCTCGGTACAG**AATGATC
TCTCCAGGAGTTT
GGGT

QA 1 733 1 733
DS 

RD RS1DS06TF 774 0 0
GTTTATCAATCCTAAAAGTGGTGGTCGTCACGGTCCTGTGCTTAAAGAGAGGCTTCAACA
GTTGATGAGCGATGAACAGGTGTTTGATCTGACGGAAGTGAAGCCACATGAGTTTGTTAG
ATACGGTTTGGCGTGTCTGGAGAAAGTTGCAGCGGAAGGAGATGAATGTGCTAAAGAATG
CAGAGCAAGGTTGAGGATTATGGTTGCAGGAGGTGATGGTACTGTTGGTTGGGTTCTTGG
ATGTCTTGGAGAGCTTAACAAAGATGAAACTTCACATATTCCTCCTGTCGGCGTCATCCC
TCTCGGTACAGGGAATGATCTCTCCAGGAGTTTTGGTTGGGGCGGTTCTTTCCCTTTTGC
TTGGAGATCTGCTGTTAAAAGAACACTCCATCGTGCAAGCATGGATGGCATGCGTCATTT
GTCATGACTGAGCTCATCTCAGCCAAGCACATAGCTCAGGCTGCTGCTGTTAGATTTGAG
CTAAGAGGAGGTGACTGGAAAGATGCCTTCTTGCAAATGGATGGAGAGCCATGGAAGCAA
CCTATGAATCCTGAGTATTCAACGTTTGTGGAGATTAAAAAAGTTCCATTTCAGTCTCTG
ATGATAAATGGTGCATGATCGCTATTCAAAGCTGGATTCTTTTTAGAAAAAAAGCTAATT
GGTTTGGTAATTTGGATATGATTATTTAGACAGCATAGATAGCTGCTATGCTTATTGTGA
CTGTTGGTTGTTGTAATCTCTTGTGTTGTGAGAAATGAAGTTTGCGTTTGTCCC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

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GATTTGGATTCGAGGCAGAACTCGTTTTTAGTGAATCTGGAGAGGATGTTGGATTTGCCG
ACGCCGGAGTTGCCGATGAGGACGATTTTGAACAAGTAATTGTACTCGTGGTTTATTCGA
TTTGCCATTGTTTTCCTTTCAAATCCTAGCGCTTCCGATCAACCCTTTTAGAGCAAAGCT
GAAAGGATCGATAATAGAAATGGTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
TTTTTTTTGAAACAAAGATCTTTCCTTTCTGAAAAATACTGTGGAATGATCACAGTTTCA
ATACAGCAATCTGTAACATAAATCCAAAAAATAAAATAAACTGGGAAGCAAAAAGGTATT
GCTATAATTGCTGAAATCAAGCCAAAAACCAAAAAAAATTGGTAAAAAATCAAACGTGTG
ACTGATTGATATAAGTCATTGAGGGTTAACTAGGTAGAACAGCATCCTTTACTCTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RS1FN37TF C 1
AF RS1FN37JQ U 309
BS 1 321 RS1FN37TF
BS 322 539 RS1FN37JQ

RD RS1FN37TF 535 0 0
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GATTTGGATTCGAGGCAGAACTCGTTTTTAGTGAATCTGGAGAGGATGTTGGATTTGCCG
ACGCCGGAGTTGCCGATGAGGACGATTTTGAACAAGTAATTGTACTCGTGGTTTATTCGA
TTTGCCATTGTTTTCCTTTCAAATCCTAGCGCTTCCGATCAACCCTTTTAGAGCAAAGCT
GAAAGGATCGATAATAGAAATGGTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
TTTTTTTTGAAACAAAGATCTTTCCTTTCTGAGAAATACTGTGGAATGATCACAGTTTCA
ATACAGCAATCTGTAACATAAATCCAAAAAATAAAATAGACTGGGAAGCAAAAAGGTATT
GCTATAATTGCTGAAATCAAGCCAAGAACCAAAAAAAATTGGTAAAAGATCAAACGTGTG
ACTGATTGATATAAGTCATTGAGGGTTAACTAGGTAGAACAGCATCCTTTACTC
C

QA 1 534 1 534
DS 

RD RS1FN37JQ 231 0 0
GAAACAAAAATCT
TTCCTTTCTGAAAAATACTGTGGAATGATCACAGTTTCAATACAGCAATCTGTAACATAA
ATCCAAAAAATAAAATAAACTGGGAAGCAAAAAGGTATTGCTATAATTGCTGAAATCAAG
CCAAAAACCAAAAAAAATTGGTAAAAAATCAAACGTGTGACTGATTGATATAAGTCATTG
AGGGTTAACTAGGTAGAACAGCATCCTTTACTCTTACC

QA 14 231 14 231
DS 



AS 1 3

CO CL4080Contig1 679 3 8 U
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GGGAGATTCCGGAAAAGTCCATCATTATTGATCCTATTTCGCGATTGATCGATCATCCAA
ACACATGAAACAACACTCGGTGAATCGGTCTCCAACGCCTGATGAAGAAGACGAGAAGGA
GGAGCTCACGCTTCGTGAAATCATCAACATCAAGTTGGTGGAGAGTGGAGAGAAAGAGAA
TCTGATGGAGCTGGTGAGAGATAGATTGGTGGAGTCTGGTTGGAAAGATGAGATGAGAAT
CGCTTGCAGGGAGCATGTAAAGAAGAAAGGGAGAAAAGATGTTACAGTCGATGAACTGAT
ACGAGTCATCACTCCCAAAGGCAGAGCTTCAGTACCGGATGCTGTCAAGGAAGAGCTGCT
GAACAGAATCCAAAACTTCATTCGGTCAGCTGCTCTTTAATT*GATCCAAGATCATTTAC
TTACGAAGATGATGGTGGTTTCTACTTGTAACCAACACTACTAACCAATGTATCATCTTT
GCTGTTGTAGAATTAGCCTTTCCTGTTTCAACTCTTTTATGTACCAAATGAAACGATGCC
ATCCTTAGAACTTAGAAGTTAAGCTTTTCATTTAGTACATCTGTTTTGTTTTCCTACACA
AACAAGTTTTACATAAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AK40JQ C 1
AF RS1AK40TF U 150
AF RS1FL51TF U 113
BS 1 124 RS1AK40JQ
BS 125 195 RS1FL51TF
BS 196 196 RS1AK40TF
BS 197 418 RS1FL51TF
BS 419 419 RS1AK40TF
BS 420 557 RS1FL51TF
BS 558 558 RS1AK40TF
BS 559 679 RS1FL51TF

RD RS1AK40JQ 577 0 0
GGATCTTTGTCGTCGTCTGCTTTGTTTTCTTATTTTCTGAACACAGAGTCTGGGTTTGCT
GGGAGATTCCGGAAAAGTCCATCATTATTGATCCTATTTCGCGATTGATCGATCATCCAA
ACACATGAAACAACACTCGGTGAATCGGTCTCCAACGCCTGATGAAGAAGACGAGAAGGA
GGAGCTCACGCTTCGTGAAATCATCAACATCAAGTTGGTGGAGAGTGGAGAGAAAGAGAA
TCTGATGGAGCTGGTGAGAGATAGATTGGTGGAGTCTGGTTGGAAAGATGAGATGAGAAT
CGCTTGCAGGGAGCATGTAAAGAAGAAAGGGAGAAAAGATGTTACAGTCGATGAACTGAT
ACGAGTCATCACTCCCAAAGGCAGAGCTTCAGTACCGGATGCTGTCAAGGAAGAGCTGCT
GAACAGAATCCAAAACTTCATTCGGTCAGCTGCTCTTTAATT*GATCCAAGATCATTTAC
TTACGAAGATGATGGTGGTTTCTACTTGTAACCAACACTACTAACCTATGTATCATCTTT
GCTGTTGTAGAATTAGCCTTTCCTGTTTCAACTCTTT

QA 1 577 1 577
DS 

RD RS1AK40TF 489 0 0
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TCAAGTTGGTGGAGAGTGGAGAGAAAGAGAATCTGATGGAGCTGGTGAGAGATAGATTGG
TGGAGTCTGGTTGGAAAGATGAGATGAGAATCGCTTGCAGGGAGCATGTAAAGAAGAAAG
GGAGAAAAGATGTTACAGTCGATGAACTGATACGAGTCATCACTCCCAAAGGCAGAGCTT
CAGTACCGGATGCTGTCAAGGAAGAGCTGCTGAACAGAATCCAAAACTTCATTCGGTCAG
CTGCTCTTTAATTTGATCCAAGATCATTTACTTACGAAGATGATGGTGGTTTCTACTTGT
AACCAACACTACTAACCAATGTATCATCTTTGCTGTTGTAGAATTAGCCTTTCCTGTTTC
AACTCTTTTATGTACCAAATGAAACGATGCCATCCTTAGAACTTAGAAGTTAAGCTTTT
TCATTTAGCG

QA 1 479 1 479
DS 

RD RS1FL51TF 567 0 0
GATTTATCGATT
ATGAAACAACACTCGGTGAATCGGTCTCCAACGCCTGATGAAGAAGACGAGAAGGAGGAG
CTCACGCTTCGAGAAATCATCAACATCAAGTTGGTGGAGAGTGGAGAGAAAGAGAATCTG
ATGGAGCTGGTGAGAGATAGATTGGTGGAGTCTGGTTGGAAAGATGAGATGAGAATCGCT
TGCAGGGAGCATGTAAAGAAGAAAGGGAGAAAAGATGTTACAGTCGATGAACTGATACGA
GTCATCACTCCCAAAGGCAGAGCTTCAGTACCGGATGCTGTCAAGGAAGAGCTGTTGAAC
AGAATCCAAAACTTCATTCGGTCAGCTGCTCTTTAATT*GATCCAAGATCATTTACTTAC
GAAGATGATGGTGGTTTCTACTTGTAACCAACACTACTAACCAATGTATCATCTTTGCTG
TTGTAGAATTAGCTTTTCCTGTTTCAACTCTTTTATGTACCAAATGAAACGATGCCATCC
TTAGAACTTAGAAGTTAAGCTTTTCATTTAGTACATCTGTTTTGTTTTCCTACACAAACA
AGTTTTACATAAATC

QA 13 567 13 567
DS 



AS 1 3

CO CL4081Contig1 595 3 4 U
GCTTCGCCGTCGCTTCTCACCGGCCCTTCTCTATATCTTTAGCTTTAACAACCCAATGGC
CACTCAAGCTGCAGCTGCTGCCTCTTTCAATGGCAACCTTAAGAAAGCTGTGGCAGGTAT
AAAGCGTATCAATCTCGACGGTCTTCGTTGGCGTGTTTTTGATGCCAAAGGCCAGGTTCT
CGGTAGACTTGCCTCTCAGATCTCTACTGTCCTTCAAGCCAAAGATAAGCCTACTTATTG
TCCTAACCGCGATGATGGCGATATTTGTATCGTTCTCAATGCTAAGGATATCGGCATCAC
CGGTAGAAAGCTCACCGACAAGTTCTACCGCTGGCATACTGGGTACGTTGGACACCTGAA
AGAACGAAGTCTGAAAGATCAGATGGCCAAAGACCCCACCGAGGTCATCCGTAAGGCTGC
CTGGCGCATGCTTCCTACTAACAACTTGCGTGATGACAGAGATCGGAAGCTGAGGATCTT
TGAAGGCAATGAGCATCCTTTTGGGGACAAGCCACTCGAGCCTTTCGTCATGCCTCCTCG
TACCGTGAGAGAGATGCGACCCCGCGCTAGACGTGCTATGATCCGTGCCCAGAAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1F387TF U 1
AF RS1FK62TF U 1
AF RS1G455TF U 1
BS 1 484 RS1F387TF
BS 485 485 RS1FK62TF
BS 486 581 RS1F387TF
BS 582 595 RS1FK62TF

RD RS1F387TF 581 0 0
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TACCGTGAGAGAGATGCGACCCCGCGCTAGACGTGCTATGA

QA 1 581 1 581
DS 

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CACTCAAGCTGCAACTGCTGCCTCTTTCAATGGCAACCTTAAGAAAGCTGTGGCAGGTAT
AAAGCGTATCAATCTCGACGGTCTTCGTTGGCGTGTTTTTGATGCCAAAGGCCAGGTTCT
CGGTAGACTTGCCTCTCAGATCTCTACTGTCCTTCAAGCCAAAGATAAGCCTACTTATTG
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TACCGTGAGAGAGATGCGACCCCGCGCTAGACGTGCTATGATCCGTGCCCAGAAG

QA 1 595 1 595
DS 

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CACTCAAGCTGCAGCTGCTGCCTCTTTCAATGGCAACCTTAAGAAAGCTGTGGCAGGTAT
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TGAAGGCAATGAGCATCCTTTTGGGGACAAGCCACTCGAGCCTTTCGTCATGCCTCCTCG
TACCGTGAGAGAGATGCGACCCCGCGCTAGACGTGCTATGATCCGTGCCCAGAA

QA 1 594 1 594
DS 



AS 1 3

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TTTTGCTGTACTCGCAACTTTTTCTTTCTTTCCTTTTTGTTGTTAGTTACCGTTCGATCT
CTAGTTTCTGTGATGGTTTTTAACGGTGGCGATGCGTCCATTTGTAAAGTTTGTACTGTT
TGGTAAATGATATAGTACTGTATTTTACTTTTACCAAAAAAAA


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EU07TF U 1
AF RS1E638JQ C 1
AF RS1E638TF U 1
BS 1 213 RS1EU07TF
BS 214 214 RS1E638TF
BS 215 402 RS1EU07TF
BS 403 583 RS1E638TF

RD RS1EU07TF 402 0 0
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QA 1 402 1 402
DS 

RD RS1E638JQ 549 0 0
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TGGAACTCCGACGACGCCAGGGTCAGCACGTAAGGAGAACGTGTGGAGGAGTGTGTTTCA
TCCAGGAAGCAACATAGCCACCAGAGGAATGGGTACTAACCTCTTTGATAAGCCTTCTCA
CCCCAACTCTCCCACCGTATACGACTGGCTGTACAGCGACGATACCAGGAGTAAGCACCG
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CTAGTTTCTGTGATGGTTTTTAACGGTGGCGATGCGTCCATTTGTAAGGTTTGTACTGTT
TGGTAAATG

QA 1 549 1 549
DS 

RD RS1E638TF 583 0 0
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TGGACCTAAGCCGGAGCATGGCCTTGGACGTCTCCGCAATAAGATCACCGCTCAACCCAT
AGACATCAAAGGTGTGGGAGAAGGGAGCAGCAGTAAGACTACCCCGGCGGCAGGGAGTCC
TGGAACTCCGACGACGCCAGGGTCAGCACGTAAGGAGAACGTGTGGAGGAGTGTGTTTCA
TCCAGGAAGCAACATAGCCACCAGAGGAATGGGTACTAACCTCTTTGATAAGCCTTCTCA
CCCCAACTCTCCCACCGTATACGACTGGCTGTACAGCGACGATACCAGGAGTAAGCACCG
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TTTTGCTGTACTCGCAACTTTTTCTTTCTTTCCTTTTTGTTGTTAGTTACCGTTCGATCT
CTAGTTTCTGTGATGGTTTTTAACGGTGGCGATGCGTCCATTTGTAAAGTTTGTACTGTT
TGGTAAATGATATAGTACTGTATTTTACTTTTACCAAAAAAAA

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 3

CO CL4083Contig1 654 3 2 U
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CGAGTTTCTATCTGTCTCCTCTTAATCTTTTGGTGCCCGAAATTTTTTCAGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 

AF RS1FQ77TF U 1
AF RS1FC78JQ C 376
AF RS1FC78TF U 376
BS 1 649 RS1FQ77TF
BS 650 654 RS1FC78JQ

RD RS1FQ77TF 649 0 0
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TTAATGTGTCAAGTGAGTCTTGTCTTTGTCCCAATGGTTTAGTAGTAGTGTCTGTATCCA
CGAGTTTCTATCTGTCTCCTCTTAATCTTTTGGTGCCCGAAATTTTTTC

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1FC78JQ 279 0 0
G
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TCCTCTTAATCTTTTGGTGCCCGAAATTTTTTCAGATC

QA 2 279 2 279
DS 

RD RS1FC78TF 279 0 0
G
ATCCAAATGGCGGAAGAGAAAGCACAGAAGATTGCAACTGTTGAGCAAGCTGCTGAACTC
ATCGAAGAGCTCATGCAAGCCAAGAAGTAACTTTAAGTTTAGTTTTACCCTCAAAAATAA
AAACAGAGCAAGGCTTTGAGTTTGTTGTTTTCGTTATGTTCTTTTTAATGTGTCAAGTGA
GTCTTGTCTTTGTCCCAATGGTTTAGTAGTAGTGTCTGTATCCACGAGTTTCTATCTGTC
TCCTCTTAATCTTTTGGTGCCCGAAATTTTTTC
AGATC

QA 2 274 2 274
DS 



AS 1 3

CO CL4084Contig1 641 3 7 U
GGGGAACCCTAGCGAATCTTTCTAAGCTCCTCCTCCCTGAAGGTCGACACTAATAGAGAG
AGAAAGGATGCCTCCGAAAGGGAAAGCAAAGGATGCAGGTCCCGTAGAGAGGCCAATCCT
TGGCCGTTTCTCTTCTCACCTCAAGATCGGAATCGTAGGGTTACCAAACGTGGGAAAGTC
AACACTTTTCAACACCCTAACGAAGCTTTCAATCCCAGCTGAGAACTTCCCCTTTTGTAC
CATTGAGCCCAACGAGGCACGTGTCAACATCCCCGACGACAGGTTTGATTGGCTTTGTCA
TTTGTACAAGCCCAAGAGTGAGATTCCTGCTTTCTTGGAAATTCATGACATTGCTGGCCT
TGTTCGAGGCGCTCATGAAGGACAGGGTCTTGGAAACAACTTCTTGTCTCATATCCGTGC
TGTTGATGGCATCTTCCATGTTCTACGTGCCTTTGAAGATCCTGATATTATTCATGTTGA
TGATATTGTGGATCCTGTTAGAGATTTGGAGACCATTACTGAAGAATTGCGTCTAAAGGA
TATTGAATTCATTAAAAAGAAGATCGAAGATGTCGAGAAGAGCATGAAGAGGAGCAATGA
CAAGGCGCTTAAAGTCGAACTTGACCTCTTGCTAAAGGTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1DC54TF U 348
AF RS1DI43TF U 1
AF RS1AM51TF U 22
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G
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GCGTCTAAAGGATATTGAATTCATTAAAAA

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DS 

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CATTGAGCCCAACGAGGCACGTGTCAACATCCCCGACGACAGGTTTGGTTGGCTTTGTCA
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TGTTCGAGGCGCTCATGAAGGACAGGGTCTTGGAAACAACTTCTTGTCTCATATCCGTGC
TGTTGATGGCATCTTCCATGTTCTACGTGCCTTTGAAGATCCTGATATTATTCATGTTGA
TGATATTGTGGATCCTGTTAGAGATTTGGAGACCATTACTGAAGAATTGCGTCTAAAGGA
TATTGAATTCATTAAAAAGAAGATCGAAGATTTCGAGAAGAGCATGAAGAGGAGCAATGA
CAAGGCGCTTAAAGTCGAACTTGACCTCTTGCTAAAGGTAA

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DS 

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GG
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AAGCAAAGGATGCAGGTCCCGTAGAGAGGCCAATCCTTGGCCGTTTCTCTTCTCACCTCA
AGATCGGAATCGTAGGGTTACCAAACGTGGGAAAGTCAACACTTTTCAACACCCTAACGA
AGCTTTCAATCCCAGCTGAGAACTTCCCCTTTTGTACCATTGAGCCCAACGAGGCACGTG
TCAACATCCCCGGTGACAGGTTTGATTGGCTTTGTCATTTGTACAAGCCCAAGAGTGAGA
TTCCTGCTTTCTTGGAAATTCATGACATTGCTGGCCTTGTTCGAGGCGCTCATGAAGGAC
AGGGTCTTGGAAACAACTTCTTGTCTCATATCCGTGCTGTTGATGGCATCTTCCATGTTC
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ATTTGGAGACCATTACTGAAGAATTGCGTCTAAAGGATATTGAATTCATTAAAAAGAAGA
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ACCTCTTGCTAAAGGTAA

QA 3 620 3 620
DS 



AS 1 3

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ATCTCTTCTTCCGTTTGCCGATTGAATCTTGAAACTGCACCTTGAGCATTTCGATATGGC
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TGTTACTCTTAACGAGAGGAATTTCGCAGCCTTCACAAACAGATCAGCGGCTGCTCATCC
TTGGCATGACTTGGAGATTGGCCCGGAAGCTCCTGCTGTTTTCAACTGTGTTGTTGAAAT
TAGCAAAGGTGGCAAGGTGAAGTACGAGCTAGACAAGAACAGTGGCCTTATCAAGGTTGA
TCGTGTTCTCTACTCATCCATTGTGTACCCACACAACTACGGCTTCATTCCCCGAACCAT
TTGTGAAGACAGTGACCCTATTGATGTCCTTGTACTCATGCAGGAGCCTGTGCTGACTGG
GTCGTTCCTTCGTGCCCGCGCTATTGGTTTAATGCCAATGATTGATCAGGGTGAAAAAGA
CGACAAGATCATTGCAGTTTGCGCTGATGATCCAGAGTTCCGTCATTACAAAGACATCAA
AGAGCTTCCTCCTCACCGTCTAGCTGAGATCCGCCGCTTCTTCGAAGACTACAAGAAGAA
CGAGAACAAGAAAGTCGCTGTTGAAGGTTTCCTCCCTGCTCAAGCTGCCATCGACGCAAT
TAAAGACTCCATGGATCTTTACGCAGCTTACATCAAAGCTGGCTTGCAGCGTTAATGACA
GACCTCGGTCGAGCCCGTTACTCCCGGGTTGCTTTGACTTCACTATCACTGAAGCCTTCT
TATACTCTGCATTCATGGTAAACTTGGTGCATTTTTGCAATGTACATTGAAATACTTTGT
CGAACTGGAAGTTTCTGATGATGACGATTGAGAATTCCAATTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CS57TF U 1
AF RS1BY33TF U 80
AF RS1BY33JQ C 172
BS 1 312 RS1CS57TF
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RD RS1CS57TF 771 0 0
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AGAGCTTCCTCCTCACCGTCTAGCTGAGATCCGCCGCTTCTTCGAAGACTACAAGAAGAA
CGAGAACAAGAAAGTCGCTGTTGAAGGTTTCCTCCCTGCTCAAGCTGCCTTCGACGCAAT
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QA 1 771 1 771
DS 

RD RS1BY33TF 851 0 0
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GGCCCGGAAGCTCCTGCTGTTTTCAACTGTGTTGTTGAAATTAGCAAAGGTGGCAAGGTG
AAGTACGAGCTAGACAAGAACAGTGGCCTTATCAAGGTTGATCGTGTTCTCTACTCATCC
ATTGTGTACCCACACAACTACGGCTTCATTCCCCGAACCATTTGTGAAGACAGTGACCCT
ATTGATGTCCTTGTACTCATGCAGGAGCCTGTGCTGACTGGGTCGTTCCTTCGTGCCCGC
GCTATTGGTTTAATGCCAATGATTGATCAGGGTGAAAAAGACGACAAGATCATTGCAGTT
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CTAGCTGAGATCCGCCGCTTCTTCGAAGACTACAAGAAGAACGAGAACAAGAAAGTCGCT
GTTGAAGGTTTCCTCCCTGCTCAAGCTGCCATCGACGCAATTAAAGACTCCATGGATCTT
TACGCAGCTTACATCAAAGCTGGCTTGCAGCGTTAATGACAGACCTCGGTCGAGCCCGTT
ACTCCCGGGTTGCTTTGACTTCACTATCACTGAAGCCTTCTTATACTCTGCATTCATGGT
AAACTTGGTGCATTTTTGCA*TGTACATTGAAATACTTTGTCGAACTGGAAGTTTCTGAT
GATGACGATTG

QA 1 851 1 851
DS 

RD RS1BY33JQ 774 0 0
GG
ACCCTAATGTTACTCTTAACGAGAGGAATTTCGCAGCCTTCACAAACAGATCAGCGGCTG
CTCATCCTTGGCATGACTTGGAGATTGGCCCGGAAGCTCCTGCTGTTTTCAACTGTGTTG
TTGAAATTAGCAAAGGTGGCAAGGTGAAGTACGAGCTAGACAAGAACAGTGGCCTTATCA
AGGTTGATCGTGTTCTCTACTCATCCATTGTGTACCCACACAACTACGGCTTCATTCCCC
GAACCATTTGTGAAGACAGTGACCCTATTGATGTCCTTGTACTCATGCAGGAGCCTGTGC
TGACTGGGTCGTTCCTTCGTGCCCGCGCTATTGGTTTAATGCCAATGATTGATCAGGGTG
AAAAAGACGACAAGATCATTGCAGTTTGCGCTGATGATCCAGAGTTCCGTCATTACAAAG
ACATCAAAGAGCTTCCTCCTCACCGTCTAGCTGAGATCCGCCGCTTCTTCGAAGACTACA
AGAAGAACGAGAACAAGAAAGTCGCTGTTGAAGGTTTCCTCCCTGCTCAAGCTGCCATCG
ACGCAATTAAGGACTCCATGGATCTTTACGCAGCTTACATCAAAGCTGGCTTGCAGCGTT
AATGACAGACCTCGGTCGAGCCCGTTACTCCCGGGTTGCTTTGACTTCACTATCACTGAA
GCCTTCTTATACTCTGCATTCATGGTAAACTTGGTGCATTTTTGCAATGTACATTGAAAT
ACTTTGTCGAACTGGAAGTTTCTGATGATGACGATTGAGAATTCCAATTTCG

QA 3 774 3 774
DS 



AS 1 3

CO CL4086Contig1 836 3 14 U
ACAAAGGGTGAAGATCTTACATTAACCATACATAAACAAATATTTTAGTAACAAGTTCCA
TGTAACGTTTGGTTGATTTCTTCTTATTTACTTATGAATCTTGCTTCCTCTCCTCTAAAG
ATCTCTTCATGATCCTGACCTTAAGACCATGTTTCATGTACAAAGTAGTTGTAACTCGAG
GCACAACAACATGATCTTGATCAACCTTGATTGAGTAGTTCAACAAGATGGAAGCAGCCA
CCATTTTCATCTGCAAGTAAGCAAATGTTTTCCCAAGACAAAGCCTTGGACCGCCATTGA
ACACAACGTATTTAAACTGATCATCACTCACGTACTGTCCTCCTTGTATCCATCTCTCTG
GTCTAAACGTTTCACAGTCTTCACCCTATATCGATTTCATCCTTCCCACGGCATAGATAG
AGAAGTAAACCCTCGAACCTTTCTCCAAGAGAGTCCCATCCGGAAACACGTCTTCTTCCG
TCGCTTGTTTCATCTCCATTGGTATTGGTGGATAGAGTCTAAGAGTTTCAGACAAGGCCG
CTTGTAGATACACCATGTCGTTTAGCTCCTTGACTGTGAAGTGACAACAACTCTCATCAA
GATTATTGTCTCTTCGGCTCAAGATTTCTGTTATTTCTTGGAGGATCTTGTTTTCCACTT
CAGGATGTTTCGTTATCAACCAGAAGAACCAACAAAGCCCGACAGAACTCGTGTCACGTC
CCGCTAAGATGAAACGTGTGCAGAACTGTCTGAAAAACTTGAGGGTGAACCGATCATTCT
GATTGCCTCTTTTGTGACTTTCTATAAGGATTAGCCTCGAGAGGACATCTGATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1H383TF C 150
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BS 737 740 RS1C870JQ
BS 741 836 RS1H383TF

RD RS1H383JQB 416 0 0
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CGGCATAA

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ATCAACCTTGATTGAGTAGTTCAACAAGATGGAAGCAGACACCATTTTCATCTGCAAGTA
AGCAAATGTTTTCCCAAGGCAAAGCCTTGGACCGCCATTGAACACAACGTATTTAAACTG
ATCATCACTCACGTACTGTCCTCCTTGTATCTATCTCTCTGGTCTAAACGTTTCACAGTC
TTCACCCCATATCGATTTCATCCTTCCCATGGCGTAGATAGAGAAGTAAACCCTCGAACC
TTTCTCCAAGAGAGTCCCATCTGGAAACACGTCTTCTTCCGTCGCTTGTTTCATCTCCAT
TGGTATTGGTGGATAGAGTCTAAGAGTTTCAGACAAGGCCGCTTGTAGGTACACCATGTC
GTTTAGCTCCTTGACTGTGAAGTGACAACAACTCTCATCAAGATTATTGTCTCTTCGGCT
CAAGATTTCTGTTATTTCTTGGAGGATCTTGTTTTCCACTTCAGGATGTTTCGTTATCAA
CCAGAAGAACCAAGAAAGCCCGACAGAACTCGTGTCACGTCCCGCTAAGATGAAACTTGT
G

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DS 

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ATG
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GAGTAGTTCAACAAGATGGAAGCAGCCACCATTTTCATCTGCAAGTAAGCAAATGTTTTC
CCAAGACAAAGCCTTGGACCGCCATTGAACACAACGTATTTAAACTGATCATCACTCACG
TACTGTCCTCCTTGTATCCATCTCTCTGGTCTAAACGTTTCACAGTCTTCACCCTATATC
GATTTCATCCTTCCCACGGCATAGATAGAGAAGTAAACCCTCGAACCTTTCTCCAAGAGA
GTCCCATCCGGAAACACGTCTTCTTCCGTTGCTTGTTTCATCTCCATTGGTATTGGTGGA
TAGAGTCTAAGAGTTTCAGACAAGGCCGCTTGTAGATACACCATGTCGTTTAGCTCCTTG
ACTGTGAAGTGACAACAACTCTCATCAAGATTATTGTCTCTTCGGCTCAAGATTTCTGTT
ATTTCTTGGAGGATCTTTTTTTCCACTTCAGGATGTTTCGTTATCAACCGGAAGAACCAA
CTAAGCCCGACAGAACTCGTGTCACGTCCCGCTAAGATGAAACGTGTGCAGAACTGTCTG
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AGCCTCGAGAGGACATCTGATTTC

QA 4 687 4 687
DS 



AS 1 3

CO CL4087Contig1 1052 3 11 U
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TCTAATGCCTATATGAACAGACCATTCATTTATGCTATGTTATCAGTACCACTGGAGCAA
TGGCTTCCCTTAGCCAAATCTTCCTTATTCTGATGATCATGTCTTCTTCTTCTCCTTTCT
GCTTCGGTGGAAGTCGGAAGGAACTCCGAGATAAAGATGAGAGTTATACACAGTCGAGTT
ATGTTGTTGGATCTAAATCTGTGGACCCGAGACGTGTTCTTCAACTCTCATGGCAACCAA
GGTGAGGGTCTTTCTTTACCGCACATTCTTGTCAGAGGAAGAGTGTGATCATCTGATATC
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TTCAGTAGTTGCTGGAATTGAAGAAAAGATTTCTGCATGGACTTTCCTACCAAGAGAAAA
CAGTAGTCCGATCAAGGTAAGAAGTTACACGTCGGAAAAGACAGGCAAGAAGTTGGATTA
TTTTGGAGACGATTCTAGCTCAGTATGGCATGAATCTCTGTTGGCAACTATCATTCTCTA
CGTCTCAAATACAACTCAAGGTGGAGAGCTTCTCTTCCCATATTCAGAGGTGAAAAGCAC
ACAGAGTTGGTCAGACTGCTCACAGACCGGTAACATTTTAAGACCAGTAAAAGGAAACGC
AGTTCTGTTCTTCACAAGCCACTTGAATGTATCTTTGGATCCAACAAGCACTCATTTTAG
ATGTCCTGTGCTGAAAGGTGAACTGTTGGTGGCAACAAAACTGATATACGCCAAGAAACA
AGCAATAAAGCATGAGGAGAGCGGTGAATGCAGCGATGAAGATGAGAACTGTGGACAATG
GGCTGAGCTTGGAGAATGCAAGAAGAACCCTGTTTATATGATTGGCTCTCCTGATTACTT
TGGTACCTGCAGAAAGAGTTGTAACGCTTGTTGATTCTTGATATCATTCTGATCATATTG
AAAAATAATGGGGGCAGCCATTAATTGAAACG


BQ
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AF RS1BS90TF U 1
AF RS1CS14TF U 67
AF RS1BS90JQ C 304
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TTTTTGCTCATTTCTATCTTTTGTATTTTTTCTCTACCTTTTTACAATGCATGTATCTAA
TCTAATGCCTATATGAACAGACCATTCATTTATGCTATGTTATCAGTACCACTGGAGCAA
TGGCTTCCCTTAGCCAAATCTTCCTTATTCTGATGATCATGTCTTCTTCTTCTCCTTTCT
GCTTCGGTGGAAGTCGGAAGGAACTCCGAGATAAAGATGAGAGTTATACACAGTCGAGTT
ATGTTGTTGGATCTAAATCTGTGGACCCGAGACGTGTTCTTCAACTCTCATGGCAACCAA
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TTTTGGAGACGATTCTAGCTCAGTATGGCATGAATCTCTGTTGGCAACTATCATTCTCTA
CGTCTCAA*TACAACTCAAGGTGGAGAGCTTCTCTTCCCATATTCAGAGGTGAAA*GCAC
ACAGAGTTGGTCAGACTGCTCACAGACCGGTAACATTTTAAGAC
AG

QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1CS14TF 711 0 0
GCCTATATGAACAGACCATTCATTTATGCTATGTTATCAGTACCACTGGAGCAATGGCTT
CCCTTAGCCAAATCTTCCTTATTCTGATGATCATGTCTTCTTCTTCTCCTTTCTGCTTCG
GTGGAAGTCGGAAGGAACTCCGAGATAAAGATGAGAGTTATACACAGTCGAGTTATGTTG
TTGGATCTAAATCTGTGGACCCGAGACGTGTTCTTCAACTCTCATGGCAACCAAGG****
*GTCTTTCTTTACCGCAGATTCTTGTCAGAGGAAGAGTGTGTTCATCTGATATCTCTGAG
AAAGGAGAGTTCAGAGGTTAAGTCAGGGGATGCTGATGGGAAGACGCAACTTGATTCAGT
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TCCGATCAAGGTAAGAAGTTACACGTCGGAAAAGACAGGCAAGGAGTTGGATTATTTTGG
AGAAGATTCTAGCTCAGTATGGCATGAATCTCTGTTGGCAACTATCATTCTCTACGTCTC
AAATACAACTCAAGGTGGAGAGCTTCTCTTCCCATATTCAGAGGTGAAAAGCACACAGAG
TTGGTCAGACTGCTCACAGACCGGTAACATTTTAAGACCAGTAAA*GGAAACGCAGTTCT
GTTCTTCACAAGCCACTTGAATGTATCTTTGGATCCAACAAGCACTCATTT

QA 1 711 1 711
DS 

RD RS1BS90JQ 749 0 0
G
AGGGTCTTTCTTTACCGCACATTCTTGTCAGAGGAAGAGTGTGATCATCTGATATCTCTG
AGAAAGGAGAGTTCAGAGGTTAAGTCGGGGGATGCTGATGGGAAGACGCAACTTGATTCA
GTAGTTGCTGGAATTGAAGAAAAGATTTCTGCATGGACTTTCCTACCAAGAGAAAACAGT
AGTCCGATCAAGGTAAGAAGTTACACGTCGGAAAAGACAGGCAAGAAGTTGGATTATTTT
GGAGACGATTCTAGCTCAGTATGGCATGAATCTCTGTTGGCAACTATCATTCTCTACGTC
TCAAATACAACTCAAGGTGGAGAGCTTCTCTTCCCATATTCAGAGGTGAAAAGCACACAG
AGTTGGTCAGACTGCTCACAGACCGGTAACATTTTAAGACCAGTAAAAGGAAACGCAGTT
CTGTTCTTCGCAAGCCACTTGAATGTATCTTTGGATCCAACAAGCACTCATTTTAGATGT
CCTGTGCTGAAAGGTGAACTGTTGGTGGCAACAAAACTGATATACGCCAAGAAACAAGCA
ATAAAGCATGAGGAGAGCGGTGAATGCAGCGATGAAGATGAGAACTGTGGACAATGGGCT
GAGCTTGGAGAATGCAAGAAGAACCCTGTTTATATGATTGGCTCTCCTGATTACTTTGGT
ACCTGCAGAAAGAGTTGTAACGCTTGTTGATTCTTGATATCATTCTGATCATATTGAAAA
ATAATGGGGGCAGCCATTAATTGAAACG

QA 2 749 2 749
DS 



AS 1 3

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GGATCTAAATACCACCGATCAACTTCACTTTCTCTCTCTCTCGGCTTCACGTTAGCAAAG
ATGGCAGAGAAAGAGTTTGTCGAAGAAGCAGATGTGAAGATCAGAGCTGCTGCGGCGGCT
TCGGATCTTGAACAGATGGCTGCAGAGTCCTCCGCGGTTCCAGATTTCGAGAGAGGGAGG
TTCTACGACGTGTATTCAGCCAGGAGGAACGAGAGGTTGAAGAGGAAGAACGGAGGAGAA
GAAGAAGATGCTGAAGTCAAAGGAACTCTGTACAATCTCGGAGTGGATCCCATGCCGACC
AAGAGAAGAGGAACGTTTAAGAAGAATAAGACGGTGGTTGAGGCATCAACAACAACGCCG
AGGTATTCTCTGAGGAGCACAGTGAACAAAGATAACAAGAAGCCTCTGAGTGTCGCTGTA
AGTACTATGCAAACTGTTAAGAGCACCAGGAGGGTTATGAGTATCTGATGATCCTGCTCT
GCTTCTATCTACTCTTTTTTTTGCTTTTTTTTTGCTTTGCTTTTGGTGATTCTGTCAGGA
AATTGAAGTTTGGGGTTTTGATTTCCTTCTATCTACTCGTTGCAGTATTGTTCTGCTTGT
CGGGATGTCGACATAAATAAACCCATGAAACTTTGTTTGTTTTGTTTTTCTTGAATTACT
CATACATTCAGGTATGCTTTATCTGTGAACTAATGCGTAAAAATGACGTTTTGTGACAGA
GACATGTTTTGATTCTCATCCTCATT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 5 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CB28TF U 3
AF RS1CX59TF U 1
AF RS1CX59JQ C 118
BS 1 14 RS1CX59TF
BS 15 15 RS1CB28TF
BS 16 74 RS1CX59TF
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BS 609 746 RS1CX59JQ

RD RS1CB28TF 416 0 0
AA
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CAGAGAAAGAGTTTGTCGAAGAAGCAGATGTGAAGATCAGAGCTGCTGCGGCGGCTTCGG
ATCTTGAACAGATGGCTGCAGAGTCCTCCGTGGTTCCAGATTTCGAGAGAGGGAGGTTCT
ACGACGTGTATTCATCCAGGAGGAACGAGAGGTTGAAGAGGAAGAACGGAGGATAAGAAG
AAGATGCTGAAGTCAAAGGAACTCTGTACAATCTCGGAGTGGATCCTATGCCGACCAAGA
GAAGAGGAACGTTTAAGAAGAAGAAGACGGTGGTTGAGACATCAACAACAACGCCGAGGT
ATTCTCTGAGGAGCACAGTGAACAAAGATAACAAGAAGCCTCTGAGTGTCGCTG

QA 3 416 3 416
DS 

RD RS1CX59TF 608 0 0
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TTCTACGACGTGTATTCAGCCAGGAGGAACGAGAGGTTGAAGAGGAAGAACGGAGGAGAA
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AAGAGAAGAGGAACGTTTAAGAAGAATAAGACGGTGGTTGAGGCATCAACAACAACGCCG
AGGTATTCTCTGAGGAGCACAGTGAACAAAGATAACAAGAAGCCTCTGAGTGTCGCTGTA
AGTACTATGCAAACTGTTAAGAGCACCAGGAGGGTTATGAGTATCTGATGATCCTGCTCT
GCTTCTATCTACTCTTTTTTTTGCTTTTTTTTTGCTTTGCTTTTGGTGATTCTGTCAGGA
AATTGAAGTTTGGGGTTTTGATTTCCTTCTATCTACTCGTTGCAGTATTGTTCTGCTTGT
CGGGATGT

QA 1 608 1 608
DS 

RD RS1CX59JQ 629 0 0
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AGGTTCTACGACGTGTATTCAGCCAGGAGGAACGAGAGGTTGAAGAGGAAGAACGGAGGA
GAAGAAGAAGATGCTGAAGTCAAAGGAACTCTGTACAATCTCGGAGTGGATCCCATGCCG
ACCAAGAGAAGAGGAACGTTTAAGAAGAATAAGACGGTGGTTGAGGCATCAACAACAACG
CCGAGGTATTTTTTGAGGAGCACAGTGAACAAAGATAACAAGAAGCCTTTGAGTGTCGCT
GTAAGTACTATGCAAACTGTTAAGAGCACCAGGAGGGTTATGAGTATTTGATGATCCTGC
TCTGCTTCTATTTACTCTTTTTTTTGCTTTTTTTTTGCTTTGCTTTTGGTGATTCTGTCA
GGAAATTGAAGTTTGGGGTTTTGATTTCCTTCTATCTACTCGTTGCAGTATTGTTTTGCT
TGTCGGGATGTCGACATAAATAAACCCATGAAACTTTGTTTGTTTTGTTTTTCTTGAATT
ACTCATACATTCAGGTATGCTTTATCTGTGAACTAATGCGTAAAAATGACGTTTTGTGAC
AGAGACATGTTTTGATTCTCATCCTCATT

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 3

CO CL4089Contig1 827 3 5 U
GAGCATAGGAGCAATCAATCATTGCTCCTCTTCAAAATTGAAATGAATTTCATAGCATAT
CTATTTCCTTTTCTATGTATAAGCATCTCACATAGGGGGCAAAGCCTCCCAAATTGGACC
AGTTTCAAGATACTCTGTACAAAGGCATAATAACCAAACCCTAAAAGAACCCTTTCATGA
TATCAAATCCTACCATCCTTTTTTTT**AATTTCACAACATGAAATCTCTAAAAACAAAC
CCCTTTTCAAAGATCTATGATTTCGTTTCGACAATGCCCCTGTTGAAAAGTGAACTTGCT
CTGTTGTTCACCATCCTTTGACTTATCTGAGGATGAGGCCAACCATTCCAGCATATTGAT
CACCATTGGCGTATCATCGAGATAGTACTTGGCCTTGCTCGGTTTCTGACCCACCGTGCA
CGCAAACACCTCTGCAAAAGCGATTGGGGAAACATCTTGGTGCTTCACTATGCTATCAAA
CATGTCTTCATCCGACCTGTCATCACCAATGCACAACAGAAAGTCCGGTCTCTTCCCTTT
GCTGTTCCTCATTGTTGCTATCAAATGCTCCACCACCTTTCCTTTGCTTACTCCCTGAGG
TTTAACTTCTACGATGTGCTGGCCTCTCTTGACAACAACAGGCTCGTTGGCGAGTACGCT
CTCTAGATGATCAAGAAGCTCCTTAGCTTGCCAAGAACCGAAAGAAGGGTCAGCTTCTTG
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GTAGTGTTTCATCACTGGTTCAGCTATCTTCTTCCACCCTAAGTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AJ96JQ U 40
AF RS1AJ96TF C 40
AF RS1A759JQ U 1
BS 1 206 RS1A759JQ
BS 207 208 RS1AJ96JQ
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RD RS1AJ96JQ 633 0 0
GG
AATGAATTTCATAGCATATCTATTTCCTTTTCTATGTATAAGCATCTCACATAGGGGGCA
AAGCCTCCCAAATTGGACCAGTTTCAAGATACTCTGTACAAAGGCATAATAACCAAACCC
TAAAAGAACCCTTTCATGATATCAAATCCTACCATCCTTTTTTTT**AATTTCACAACAT
GAAATCTCTAAAAACAAACCCCTTTTCAAAGATCTATGATTTCGTTTCGACAATGCCCCT
GTTGAAAAGTGAACTTGCTCTGTTGTTCACCATCCTTTGACTTATCTGAGGATGAGGCCA
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CTTTGCTTACTCCCTGAGGTTTAACTTCTACGATGTGCTGGCCTCTCTTGACAACAACAG
GCTCGTTGGCGAGTACGCTCTCTAGATGATC

QA 3 633 3 633
DS 

RD RS1AJ96TF 633 0 0
GG
AATGAATTTCATAGCATATCTATTTCCTTTTCTATGTATAAGCATCTCACATAGGGGGCA
AAGCCTCCCAAATTGGACCAGTTTCAAGATACTCTGTACAAAGGCATAATAACCAAACCC
TAAAAGAACCCTTTCATGATATCAAATCCTACCATCCTTTTTTTT**AATTTCACAACAT
GAAATCTCTAAAAACAAACCCCTTTTCAAAGATCTATGATTTCGTTTCGACAATGCCCCT
GTTGAAAAGTGAACTTGCTCTGTTGTTCACCATCCTTTGACTTATCTGAGGATGAGGCCA
ACCATTCCAGCATATTGATCACCATTGGCGTATCATCGAGATAGTACTTGGCCTTGCTCG
GTTTCTGACCCACCGTGCACGCAAACACCTCTGCAAAAGCGATTGGGGAAACATCTTGGT
GCTTCACTATGCTATCAAACATGTCTTCATCCGACCTGTCATCACCAATGCACAACAGAA
AGTCCGGTCTCTTCCCTTTGCTGTTCCTCATTGTTGCTATCAAATGCTCCACCACCTTTC
CTTTGCTTACTCCCTGAGGTTTAACTTCTACGATGTGCTGGCCTCTCTTGACAACAACAG
GCTCGTTGGCGAGTACGCTCTCTAGATGATC

QA 3 633 3 633
DS 

RD RS1A759JQ 827 0 0
GAGCATAGGAGCAATCAATCATTGCTCCTCTTCAAAATTGAAATGAATTTCATAGCATAT
CTATTTCCTTTTCTATGTATAAGCATCTCACATAGGGGGCAAAGCCTCCCAAATTGGACC
AGTTTCAAGATACTCTGTACAAAGGCATAATAACCAAACCCTAAAAGAACCCTTTCATGA
TATCAAATCCTACCATCCTTTTTTTTTTAATTTCACAACATGAAATCTCTAAAAACAAAC
CCCTTTTCAAAGATCTATGATTTCGTTTCGACAATGCCCCTGTTGAAAAGTGAACTTGCT
CTGTTGTTCACCATCCTTTGACTTATCTGAGGATGAGGCCAACCATTCCAGCATATTGAT
CACCATTGGCGTATCATCGAGATAGTACTTGGCCTTGCTCGGTTTCTGACCCACCGTGCA
CGCAAACACCTCTGCAAAAGCGATTGGGGAAACATCTTGGTGCTTCACTATGCTATCAAA
CATGTCTTCATCCGACCTGTCATCACCAATGCACAACAGAAAGTCCGGTCTCTTCCCTTT
GCTGTTCCTCATTGTTGCTATCAAATGCTCCACCACCCTTCCTTTGCTTACTCCCTGAGG
TTTAACTTCTACGATGTGCTGGCCTCTCTTGACAACAACAGGCTCGTTGGCGAGTACGCT
CTCTAGATGATCAAGAAGCTCCTTAGCTTGCCAAGAACCGAAAGAAGGGTCAGCTTCTTG
GTGGTGCCACACCATTGCACTCTCTTTCTCCTCTATGAATGATCCATCAGTCGCTTCTGT
GTAGTGTTTCATCACTGGTTCAGCTATCTTCTTCCACCCTAAGTCTG

QA 1 827 1 827
DS 



AS 1 2

CO CL4090Contig1 574 2 3 U
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TCAAAATAACCATAAATATTTTAGCAGCCTATATAATAATATATCATCTCAAAATACGTG
ACGATCTGAATGATAATAGACGAACAAATGCTAGACTGAACTCAACATTTGTACTTTTGT
TTTGTATACAAAATAAGGTGCGTAAAATGGTAGAGACTGGTCAAAGGTCCCACCATCATT
CTTCAAATGTCTATACATCCCAACTACTTGAGAGGCTTCATTCCCTTGGCTGCCCTCATG
CTATTGACTGCCATACGAAGACCATCATGAGAGAGTATCAAACGAGACAAACCACCAGTG
CTCAAGCCCAGCAACTTGGCAGAATCAGCGATAGAACCGTCAGAAGCAGAAATAACGTCA
AGCAAAGCTTGCATCCCAGGTCCAAATTTAGGATTGTTGGGACCAATCTGAGAACCAGAA
GAAGAAGATCTAACGGTGGACTTGGGAGGTAGAATCTGAAGAAGCTCTGGAGGAGGAGAA
TAGGCTTCAATGTCCACCTTGTTCCTCACTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DC08JQ U 34
AF RS1DC08TF C 1
BS 1 33 RS1DC08TF
BS 34 479 RS1DC08JQ
BS 480 574 RS1DC08TF

RD RS1DC08JQ 446 0 0
TCCAACACAATCACGACAAAAGGCGACTCAAAATAACCATAAATATTTTAGCAGCCTATA
TAATAATATATCATCTCAAAATACGTGACGATCTGAATGATAATAGACGAACAAATGCTA
GACTGAACTCAACATTTGTACTTTTGTTTTGTATACAAAATAAGGTGCGTAAAATGGTAG
AGACTGGTCAAAGGTCCCACCATCATTCTTCAAATGTCTATACATCCCAACTACTTGAGA
GGCTTCATTCCCTTGGCTGCCCTCATGCTATTGACTGCCATACGAAGACCATCATGAGAG
AGTATCAAACGAGACAAACCACCAGTGCTCAAGCCCAGCAACTTGGCAGAATCAGCGATA
GAACCGTCAGAAGCAGAAATAACGTCAAGCAAAGCTTGCATCCCAGGTCCAAATTTAGGA
TTGTTGGGACCAATCTGAGAACCAGA

QA 1 446 1 446
DS 

RD RS1DC08TF 574 0 0
CCAAAATGGTTCCAACTGTATTAGCTTCAAAGTTCCAACACAATCACGACAAAAGGCGAC
TCAAAATAACCATAAATATTTTAGCAGCCTATATAATAATATATCATCTCAAAATACGTG
ACGATCTGAATGATAATAGACGAACAAATGCTAGACTGAACTCAACATTTGTACTTTTGT
TTTGTATACAAAATAAGGTGCGTAAAATGGTAGAGACTGGTCAAAGGTCCCACCATCATT
CTTCAAATGTCTATACATCCCAACTACTTGAGAGGCTTCATTCCCTTGGCTGCCCTCATG
CTATTGACTGCCATACGAAGACCATCATGAGAGAGTATCAAACGAGACAAACCACCAGTG
CTCAAGCCCAGCAACTTGGCAGAATCAGCGATAGAACCGTCAGAAGCAGAAATAACGTCA
AGCAAAGCTTGCATCCCAGGTCCAAATTTAGGATTGTTGGGACCAATCTGAGAACCAGAA
GAAGAAGATCTAACGGTGGACTTGGGAGGTAGAATCTGAAGAAGCTCTGGAGGAGGAGAA
TAGGCTTCAATGTCCACCTTGTTCCTCACTTTGC

QA 1 574 1 574
DS 



AS 1 2

CO CL4091Contig1 782 2 6 U
GGGCTTAAACTACCTTTAAGAAACTTCAATGATTCAAAAAGGAGAGTAAACTTAGATGGT
AAAAAAGTGGTTAACATGAACAATACAACAACGGAAAGTTCTTAAATAAACCAAAAAGAA
CTACAGAGCAAACAACCCTATAGTAGTTTCAAAAGCCGGTCTGAAAGGCAGAAAAAAAAG
TGGGAACCGAACATCTAAAGCTGATGATTTTAGTAAACTATCTCAGCTCTTCTAGAACCA
CTATTTGGACAAAAAACTTGGAAGCTCAACGCATGTTTCCCTCTCTCAAAACATCGATCA
TGTTGTAGATTCTCTGGTCTGCTTTCAACCGAATCTTTTTGGCAAGGAAAAGCACGGCAT
CAACAGTACCCTCAGCGTATATTGATCTGCCACAGACATTGTGCTGGAACTCGAAGGAGA
CAGTTTCATCAGGTGATGTCAAGTGATAGAGATGGAAAGCGTGGCCAGAGACATGCTCTT
CAGGAACCCCCACCATCTCAACTTGCTGTTTAGGATCCCTAATCAATTGTATCTCATCCA
TGTCGTAAGACACTCCCAGTTCCTGGAAGCAAGAGATGACAGCTTTTGCTGTTCCGGACG
CATCCAATTTGCTAGCTTGATGAGACTCCATCACCTCCAAGGAATAACCAGAAAAGGCTC
CTGGAAACTGCTCAGCCATTATCTCCATCGCCGCAAGAAATGCTACAACCTGTTTACCCA
TCTGTGGAGAAATCACAGCATAGATCCTCGCTTTCTCAACAGTTTCATACAGTTTGTTCC
TC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1FN39JQ U 1
AF RS1F262TF C 140
BS 1 272 RS1FN39JQ
BS 273 273 RS1F262TF
BS 274 350 RS1FN39JQ
BS 351 351 RS1F262TF
BS 352 703 RS1FN39JQ
BS 704 782 RS1F262TF

RD RS1FN39JQ 703 0 0
GGGCTTAAACTACCTTTAAGAAACTTCAATGATTCAAAAAGGAGAGTAAACTTAGATGGT
AAAAAAGTGGTTAACATGAACAATACAACAACGGAAAGTTCTTAAATAAACCAAAAAGAA
CTACAGAGCAAACAACCCTATAGTAGTTTCAAAAGCCGGTCTGAAAGGCAGAAAAAAAAG
TGGGAACCGAACATCTAAAGCTGATGATTTTAGTAAACTATCTCAGCTCTTCTAGAACCA
CTATTTGGACAAAAAACTTGGAAGCTCAACGCGTGTTTCCCTCTCTCAAAACATCGATCA
TGTTGTAGATTCTCTGGTCTGCTTTCAACCGAATCTTTTTGGCAAGGAAAGGCACGGCAT
CAACAGTACCCTCAGCGTATATTGATCTGCCACAGACATTGTGCTGGAACTCGAAGGAGA
CAGTTTCATCAGGTGATGTCAAGTGATAGAGATGGAAAGCGTGGCCAGAGACATGCTCTT
CAGGAACCCCCACCATCTCAACTTGCTGTTTAGGATCCCTAATCAATTGTATCTCATCCA
TGTCGTAAGACACTCCCAGTTCCTGGAAGCAAGAGATGACAGCTTTTGCTGTTCCGGACG
CATCCAATTTGCTAGCTTGATGAGACTCCATCACCTCCAAGGAATAACCAGAAAAGGCTC
CTGGAAACTGCTCAGCCATTATCTCCATCGCCGCAAGAAATGC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1F262TF 643 0 0
ATAGTAGTTTCAAAAGCCGGTCTGAAAGGCAGAAGAAGAAGTGGGAACCGAACATCTAAA
GCTGATGATTTTAGTAAACTATCTCAGCTCTTCTAGAACCACTATTTGGACAAAAAACTT
GGAAGCTCAACGCATGTTTCCCTCTCTCAGAACATCGATCATGTTGTAGATTCTCTGGTC
TGCTTTCAACCGAATCTTTTTGGCAAGGAAAAGCACGGCATCAACAGTACCCTCAGCGTA
TATTGATCTGCCACAGACATTGTGCTGGAACTCGAAGGAGACAGTTTCATCAGGTGATGT
CAAGTGATAGAGATGGAAAGCGTGGCCAGAGACATGCTCTTCAGGAACCCCCACCATCTC
AACTTGCTGTTTAGGATCCCTAATCAATTGTATCTCATCCATGTCGTAAGACACTCCCAG
TTCCTGGAAGCAAGAGATGACAGCTTTTGCTGTTCCGGACGCATCCAATTTGCTAGCTTG
ATGAGACTCCATCACCTCCAAGGAATAACCAGAAAAGGCTCCTGGAAACTGCTCAGCCAT
TATCTCCATCGCCGCAAGAAATGCTACAACCTGTTTACCCATCTGTGGAGAAATCACAGC
ATAGATCCTCGCTTTCTCAACAGTTTCATACAGTTTGTTCCTC

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 2

CO CL4092Contig1 890 2 8 U
GCCAGAGAAAAAAACTAAAAGGATCAAAAACAGGAACTGCAATACTCAAAATACAAAAAT
TCTCAAGATTTCTTCTTAAATGAAATGGTCATCAAACAAAACATGCTTCATCTCTCTTAT
ACATATGGAAACAACAACAAGGGCAAAACATTTCCTAGGTAAAGGAAGAAGAGCCTGCTC
CCTTGGTAGAGGAAGTCACACCTCTGCAACCAGCACCTTCATGCCATTCAAGCATGATTT
CAATCTCGCCGCACTCAACATTGTTGAGCCTAAGGATCATGTCTTGAGTGATCTTACCAT
TGTTCCACACAATGCTACTTTCATCTGATAAACAGTTTTCCCTCGATGGCTGAACCCTTT
TGATAGCGCATCCATTAGGGAGCCTCAAAAGCTCCATCCCCATTTTCAGAGCCTCCAAGT
ATGGTTGAATGTCTACGTTAGCATCTCCCATTTTGTCATCTCCAGTGAACTTGTCCCAGT
CAAACACTGTCAAGCGGATTGGAACATTGGGATCTTTGATTGCAACAGTCATTTCTTAAT
TCCATATTGGATTGCAGTTTTTTCTTCACCACACGTGTCTTCAATGTCTGATCGGCGACG
GTGATAACAACATAAGGATCGCTGCTTCTATGGTCACGAATGGCGAGATTAATACCTCTT
TTGATATGAATTGTTAGCAATCCTAGAGGATTTTGATCCATGGATTTGTCAAGATTCAAG
ATTGGAGAATTTGACGAGGATTCAAGAAGACAACGAGGGAGAATTATAAAAAAAGAAGAA
GAGAGATTTGGGGATGATGATGATGATTGATTGGAAGAAAATGCTTCTCTCTGTTTTCCT
CCTCCACAACTATTCAACACGAACTCTACAACAATTGCTCGGAAATGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GO18JQ U 1
AF RS1DI24TF C 186
BS 1 292 RS1GO18JQ
BS 293 293 RS1DI24TF
BS 294 415 RS1GO18JQ
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RD RS1GO18JQ 753 0 0
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TCTCAAGATTTCTTCTTAAATGAAATGGTCATCAAACAAAACATGCTTCATCTCTCTTAT
ACATATGGAAACAACAACAAGGGCAAAACATTTCCTAGGTAAAGGAAGAAGAGCCTGCTC
CCTTGGTAGAGGAAGTCACACCTCTGCAACCAGCACCTTCATGCCATTCAAGCATGATTT
CAATCTCGCCGCACTCAACATTGTTGAGCCTAAGGATCATGTCTTGAGTGATTTTACCAT
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ATGGTTGAATGTCTACGTTAGCATCTCCCATTTTGTCATCTCCAGTGAACTTGTCCCAGT
CAAACACTGTCAAGCGGATTGGAACATTGGGATCTTTGATTGCAACAGTCATTTCTTAAT
TCCATATTGGATTGCAGTTTTTTCTTCACCACACGTGTCTTCAATGTCTGATCGGCGACG
GTGATAACAACATAAGGATCGCTGCTTCTATGGTCACGAATGGCGAGATTAATACCTCTT
TTGATATGAATTGTTAGCAATCCTAGAGGATTTTGATCCATGGATTTGTCAAGATTCAAG
ATTGGAGAATTTGACGAGGATTCAAGAAGACAA

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1DI24TF 705 0 0
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CTCTGCAACCAGCACTTTCATGCCATTCAAGCATGATTTCAATCTCGCCGCACTCAACAT
TGTTGAGC*TAAGGATCATGTCTTGAGTGATCTTACCATTGTTCCACACAATGCTACTTT
CATCTGATAAACAGTTTTCCCTCGATGGCTGAACCCTTTTGATAGCGCATCCATTAGGGA
GCCTCAAAAGCTCCATCCCCATTTTCGGAGCCTCCAAGTATGGTTGAATGTCTACGTTAG
CATCTCCCATTTTGTCATCTCCAGTGAACTTGTCCCAGTCAAACACTGTCAAGCGGATTG
GAACATTGGGATCTTTGATTGCAACGGTCATTTCTTCATTCCATATTGGATTGCAGTTTT
TT*TTCACCACACGTGTCTTCAATGTCTGATCGGCGACGGTGATAACAACATAAGGATCG
CTGCTTCTATGGTCACGAATGGCGAGATTAATACCTCTTTTGATATGAATTGTTAGCAAT
CCTAGAGGCTTTTGATCCATGTATTTGTCAAGATTCAAGATTGGAGAATTTGACGAGGAT
TCAAGAAGACAACGAGGGAGAATTATAAAAAAAGAAGAAGAGAGATTTGGGGATGATGAT
GATGATTGATTGGAAGAAAATGCTTCTCTCTGTTTTCCTCCTCCACAACTATTCAACACG
AACTCTACAACAATTGCTCGGAAATGTCC

QA 17 705 17 705
DS 



AS 1 2

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TAATCACTACTTTTCATCTCCCTCGAATTCTCAAGATCATCAAATCAATTTTTTTTCATA
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AGATTAAGACAATTCCCCAAATTCCCTACTGAAATAGGTTTATTCGCCGGCGAATTTGAA
GTCTCAAAATGGTTCTTCCTCTCACCAAGAATGTTTGTGTTGTTGGTTGCAGCTGGTACT
GAAGCAAACATGTAAATAACAAAGGGTTTGCTTTTTAAGCTGCAGATTCAGTTGCTTCTC
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BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1EK33TF U 4
AF RS1CU20TF U 1
BS 1 83 RS1CU20TF
BS 84 84 RS1EK33TF
BS 85 383 RS1CU20TF
BS 384 384 RS1EK33TF
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BS 460 465 RS1EK33TF
BS 466 633 RS1CU20TF

RD RS1EK33TF 581 0 0
GG
ACGGCCAAACTTTCTAAAACCTAATAATTGACACTTCGTCTTCAACGTCACAGTTCGGTT
CTGTGTAATCAACTCTTCCGTTCCATCTTCCATCTCTGTA*CCCCCTCATGATCAATCAA
TGATGGTCTTTAATCTGATTTAATCTATCTCCCGTTTATTCTCATCCTATATGAGTAATC
ACTACTTTTCATCTCCCTCGAATTCTCAAGATCATCAAATCAATTTTTTTTCATATCACT
TATTCTCTCCATCAGAAGTTCAACCGACGAACTCTAGCAGACACGGATTTGTTAGAGATT
AAGACAATTCCCCAAATTCCCTACTGAAATAGGTTTATTCGCCGGCGAATTTGAAGTCTC
AAAATGGTTCTTCCTCTCACCAAGAATGTTTGTGTTGTTGGTTGCAGCTGGTACTGAAGC
AAACATGTAAATAACAAAGGGTTTGCTTTTTAAGCTGCAGATTCAGTTGCTTCTCTTACC
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CAGTTATGTATATAGAATTGAGTAATGTTTGGCTTCTCA

QA 3 581 3 581
DS 

RD RS1CU20TF 633 0 0
GGATCACGGCCAAACTTTCTAAAACCTAATAATTGACACTTCGTCTTCAACGTCACAGTT
CGGTTCTGTGTAATCAACTCTTCTGTTCCATCTTCCATCTCTGTAACCCCCTCATGATCA
ATCAATGATGGTCTTTAATCTGATTTAATCTATCTCCCGTTTATTCTCATCCTATATGAG
TAATCACTACTTTTCATCTCCCTCGAATTCTCAAGATCATCAAATCAATTTTTTTTCATA
TCACTTATTCTCTCCATCAGAAGTTCAACCGACGAACTCTAGCAGACACGGATTTGTTAG
AGATTAAGACAATTCCCCAAATTCCCTACTGAAATAGGTTTATTCGCCGGCGAATTTGAA
GTCTCAAAATGGTTCTTCCTCTCGCCAAGAATGTTTGTGTTGTTGGTTGCAGCTGGTACT
GAAGCAAACATGTAAATAACAAAGGGTTTGCTTTTTAAG******ATTCAGTTGCTTCTC
TTACCAAAATTCTGAATAAATCTTCAGCTGCGGTCTCTTTGATTGTGTGGAAGAAAGCAT
TGGTTCAGTTATGTATATAGAATTGAGTAATGTTTGGCTTCTCAGTTTATTGACATAAAG
ATTGCTGTAAAGTGGAAACATGAGCGGACACCT

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 2

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TGCTACTGTGGCTGCCATTGATGCTGACGCCCACAAGTCCGTCTCTCAGGATTATGGCGT
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AGATCGTTTGGATGGTAAAACCACCGGCACAAACACTGGAGGAGGAGGATCCGGTGAGAA
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TCATGTCGACTGTGATGCCGACAAGGCGATACAGAGCAGGTTCAAGGTGAAAGGATTCCC
CACCATCTTGGTCTTTGGTGCTGACAAAAGCAGCCCATTGCCTTATGAGGGTGCTAGATC
TGCATCAGCCATCGAATCTTTTGCCCTGGAACAGCTTGAATCCAATACTGGACCTGTTGA
AGTAACTGAACTAACTGGGCCGGATGCCATGGAAGAGAAGTGTGGTCCTGCTGCTATTTG
CTTTGTTTCTTTCTTACCTGACATTCTGGACTCAAAAGCTGAAGAAAGGAACAAGTATTT
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GGCTGCTGGGAAGCAACCTGATTTGGAGAAGCGTGTTGGTGTTGGAGGATATGGTTACCC
AGCAATGGTAGCCTTGAATGCAAAGAAAGGAGCTTATGCTCCACTTAAAAGCGGTTTTGA
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CATAGACGGAACACTGGAGATAGTGAAGACAGAATCTTGGGATGGTAAGGACGGAGAGGT
GGTCGATGCAGATGAGTTCTCACTTGAAGAACTCATGGCAGATGATTGATGCTGCTGCTG
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GTTTCTTGAAAGATTGTTAAAAATGCTCCAGAAAGGCAGTTATATCATGTCAAAGGGTTG
CAAGAGAGTAACACACTTTTTGATTTCATATTTAGATATAGACAGACTTCGGTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AG76TF U 1
AF RS1AG76JQ C 447
BS 1 756 RS1AG76TF
BS 757 757 RS1AG76JQ
BS 758 766 RS1AG76TF
BS 767 768 RS1AG76JQ
BS 769 801 RS1AG76TF
BS 802 1315 RS1AG76JQ

RD RS1AG76TF 801 0 0
CGGTCATTGTAAATCCTTAACACCAACTTGGGAGAAGGTTGCTACTACTTTGAAAGGTAT
TGCTACTGTGGCTGCCATTGATGCTGACGCCCACAAGTCCGTCTCTCAGGATTATGGCGT
CAGGGGTTTCCCAACTATTAAAGTGTTCGTTCCTGGGAAGCCTCCTGTTGATTATCAAGG
AGCTAGGGATGCTAAAGCCATCTCTCAATTTGTTATCAAGCAGATAAAGGCGTTGTTAAA
AGATCGTTTGGATGGTAAAACCACCGGCACAAACACTGGAGGAGGAGGATCCGGTGAGAA
GAAGAAATCCGAGCCTAGTGCCTCTGTTGAACTCAACTCTAGCAATTTTGACGAGCTGGT
CACTGAAAGCAAAGATCTTTGGATTGTTGAGTTTTTTGCACCTTGGTGTGGACATTGCAA
AAAGCTAGCTCCTGAGTGGAAAAAGGCTGCAAACAAGTTGAAGGGGAATGTCAAACTAGG
TCATGTCGACTGTGATGCCGACAAGGCGATACAGAGCAGGTTCAAGGTGAAAGGATTCCC
CACCATCTTGGTCTTTGGTGCTGACAAAAGCAGCCCATTGCCTTATGAGGGTGCTAGATC
TGCATCAGCCATCGAATCTTTTGCCCTGGAACAGCTTGAATCCAATACTGGACCTGTTGA
AGTAACTGAACTAACTGGGCCGGATGCCATGGAAGAGAAGTGTGGTCCTGCTGCTATTTG
CTTTGTTTCTTTCTTACCTGACATTCTGGACTCAAA*GCTGAAGAA**GAACAAGTATTT
GGAGATGCTATTATCAGTTGC

QA 1 801 1 801
DS 

RD RS1AG76JQ 869 0 0
CTGCAAACAAGT*GAAGGGGAATGTCAAACTAGGTCATGTCGACTGTGATGCCGACAAGG
CGATACAGAGCAGGTTCAAGGTGAAAGGATTCCCCACCATCTTGGTCTTTGGTGCTGACA
AAAGCAGCCCATTGCCTTATGAGGGTGCTAGATCTGCATCAGCCATCGAATCTTTTGCCC
TGGAACAGCTTGAATCCAATACTGGACCTGTTGAAGTAACTGAACTAACTGGGCCGGATG
CCATGGAAGAGAAGTGTGGTCCTGCTGCTATTTGCTTTGTTTCTTTCTTACCTGACATTC
TGGACTCAAAAGCTGAAGGAAGGAACAAGTATTTGGAGATGCTATTATCAGTTGCAGAGA
AGTTTAAGAAGGACCCTTACAGCTTTGTGTGGGTGGCTGCTGGGAAGCAACCTGATTTGG
AGAAGCGTGTTGGTGTTGGAGGATATGGTTACCCAGCAATGGTAGCCTTGAATGCAAAGA
AAGGAGCTTATGCTCCACTTAAAAGCGGTTTTGAGGTTAAACACCTCATAGAATTCGTGA
AGGAAGCTAAGGCAGGAGGAAAAGGGAATTTGCCCATAGACGGAACACTGGAGATAGTGA
AGACAGAATCTTGGGATGGTAAGGACGGAGAGGTGGTCGATGCAGATGAGTTCTCACTTG
AAGAACTCATGGCAGATGATTGATGCTGCTGCTGCCTCCACTGAGTCAAAGGAGCAGTGG
TGAACAGCTCTTTTACCTCACCTGTACGGTTTTAGTTTCTTGAAAGATTGTTAAAAATGC
TCCAGAAAGGCAGTTATATCATGTCAAAGGGTTGCAAGAGAGTAACACACTTTTTGATTT
CATATTTAGATATAGACAGACTTCGGTGT

QA 1 869 1 869
DS 



AS 1 2

CO CL4095Contig1 912 2 6 U
GGAGCTTCGAGTGAAACTTGAAGAAAAACAGATTCGTCATTTCTTACTGTTCGGTCTGAA
AGCTACCTACCTTCCTGTTCCCTGGAGATGTCTGTCTTTGATGATGATTCGTTCGTTATA
CTCGGAGATGATGCATCTGAGTCTGTTCCTCAGGTCTCAGCCCAAGTAGATGATTCGATC
GATGATGACGTTTTCGCGGCGCCGTCTTCAGACTACGGCGGTTACTCTAACGGAGACGAC
GGTCCTATCTTGCCTCCTCCTTCGGAGATGGAGTCTGATGAGGGAGCTGCTCTCAGAGAA
TGGAGAAGCCAGAATGCGATTCAACTTGAGGAGAAGGAGAAGAGAGAAAAGGAGTTGCGG
AACCAAATAATCGAGGAAGCTGATCAGTTCAAAGAGGAGTTCCATAAGAAGAGGGAGTTG
GCTTGTGAAAACAACAAAGCAGCGAACAGGGAGAAACAAAAGCTGTATGTGGAGACCCAA
GAGAAGTTTTACGCGGAAGCAAGCAAGAACTACTGGAAGGCAATAGCAGAGCTAGTGCCT
AAAGAGGTTCCAATTATAGAGAAAACAAGAAGAGGGAAGAAGAAAGAGGAAGATCCCAAG
AAGCCAACAACAATCTCTGTGATTGGACCAAAGCCTGGTAAGCCAACCGATCTCTCGAGA
ATGAGACAGATATTGCTGAAGCTCAAACAGAACCCGCCTGCTCACCTCAAACTCACTCCT
CAACCTCCTCCATCTGAGGCTGCTCCTCCAGAGAATGTTCCTCAAACCAAGCCCGCCGAG
GCTGTTGCTGCTTTTTAGGAAGCCATCTTCGTTTTTGTTATTCGTTTCTTATGTGTTTGT
TATATATACAGCTGAGATATTGTAAGGGGCACATGTGTGTTACTATTATTAACAGTTATG
TTATGTTCGATG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EE87TF U 1
AF RS1EE87JQ C 295
BS 1 705 RS1EE87TF
BS 706 706 RS1EE87JQ
BS 707 722 RS1EE87TF
BS 723 723 RS1EE87JQ
BS 724 738 RS1EE87TF
BS 739 912 RS1EE87JQ

RD RS1EE87TF 742 0 0
GGAGCTTCGAGTGAAACTTGAAGAAAAACAGATTCGTCATTTCTTACTGTTCGGTCTGAA
AGCTACCTACCTTCCTGTTCCCTGGAGATGTCTGTCTTTGATGATGATTCGTTCGTTATA
CTCGGAGATGATGCATCTGAGTCTGTTCCTCAGGTCTCAGCCCAAGTAGATGATTCGATC
GATGATGACGTTTTCGCGGCGCCGTCTTCAGACTACGGCGGTTACTCTAACGGAGACGAC
GGTCCTATCTTGCCTCCTCCTTCGGAGATGGAGTCTGATGAGGGAGCTGCTCTCAGAGAA
TGGAGAAGCCAGAATGCGATTCAACTTGAGGAGAAGGAGAAGAGAGAAAAGGAGTTGCGG
AACCAAATAATCGAGGAAGCTGATCAGTTCAAAGAGGAGTTCCATAAGAAGAGGGAGTTG
GCTTGTGAAAACAACAAAGCAGCGAACAGGGAGAAACAAAAGCTGTATGTGGAGACCCAA
GAGAAGTTTTACGCGGAAGCAAGCAAGAACTACTGGAAGGCAATAGCAGAGCTAGTGCCT
AAAGAGGTTCCAATTATAGAGAAAACAAGAAGAGGGAAGAAGAAAGAGGAAGATCCCAAG
AAGCCAACAACAATCTCTGTGATTGGACCAAAGCCTGGTAAGCCAACCGATCTCTCGAGA
ATGAGACAGATATTGCTGAAGCTCAAACAGAACCCGCCTGCTCAC*TCAAACTCACTCCT
CA*CCTCCTCCATCTGAG
CTGC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1EE87JQ 618 0 0
AGAGAATGGAGAAGCCAGAATGCGATTCAACTTGAGGAGAAGGAGAAGAGAGAAAAGGAG
TTGCGGAACCAAATAATCGAGGAAGCTGATCAGTTCAAAGAGGAGTTCCATAAGAAGAGG
GAGTTGGCTTGTGAAAACAACAAAGCAGCGAACAGGGAGAAACAAAAGCTGTATGTGGAG
ACCCAAGAGAAGTTTTACGCGGAAGCAAGCAAGAACTACTGGAAGGCAATAGCAGAGCTA
GTGCCTAAAGAGGTTCCAATTATAGAGAAAACAAGAAGAGGGAAGAAGAAAGAGGAAGAT
CCCAAGAAGCCAACAACAATTTCTGTGATTGGACCAAAGCCTGGTAAGCCAACCGATCTC
TCGAGAATGAGACAGATATTGCTGAAGCTCAAACAGAACCCGCCTGCTCACCTCAAACTC
ACTCCTCAACCTCCTCCATTTGAGGCTGCTCCTCCAGAGAATGTTCCTCAAACCAAGCCC
GCCGAGGCTGTTGCTGCTTTTTAGGAAGCCATCTTCGTTTTTGTTATTCGTTTCTTATGT
GTTTGTTATATATACAGCTGAGATATTGTAAGGGGCACATGTGTGTTACTATTATTAACA
GTTATGTTATGTTCGATG

QA 1 618 1 618
DS 



AS 1 2

CO CL4096Contig1 1218 2 4 U
GATGGCGGTGAAGAAGAAGATTGAAGATTCACAGAGCAAAGACAGCTATCCATGTGGACA
GCAACCCTTGATTCACAATGGAAAGGTTTTGAAAGATGAAACTACTTTGGTCGAGAACAA
TGTCACCGAGGAGGGTTTTCTTGTTGTCATGCTTAGCAAGAGCAAAACTGCAAGTTCAGC
TGGTTCATCTTCTACTCAGCCTACTTCCACGACCACATCTTCAACTACGCCTGCAGCTCC
GTCTACAACCCAATCTATAGCTGTGCCAGCTGCAGATTCCACTCTTGCCCAAGAACAACC
GGCGGCACAAAGTGAGACCTATGGTCAGACTCCGTCAACTTTAGTTAGTGGCAGTAGTGT
TGAGCAAAGGGTTCAACAAATAATGGAAATGGGAGGAGGCAGCTGGGACGAAGAAACAGT
TATTCGTGCTCTTCGTGCAGCATATTACAACACTGAGAGAGCAGTGGATTATCTATATTC
TGGAATTCCTGAAAGCGAAGATGCTCCACCACTAACTAACATATCGGGAGTAGGAGCTGG
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GCAGCCTATGCTTCTAGAGCTGGGAAAGCAGAACCCACAGCTTCTGAGGCTAATTCAAGA
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GGATGTTTTCGACCAACCCGAGCAAGAGATGCCCCATGCAGTAAACGTTACACCTGCAGA
GCAAGAAGCGATTCAGCGGCTTGAGGCAATGGGATTTGATAGAGCATTAGTGATAGAAGC
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AAAAGTTTTTTTTTTATTACTACTCACATCTTTCATCTAAACCGAACCGTTCATTTTTAA
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AAGAATAATTTGCTTTTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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DS 

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GCTTCTGAGGCTAATTCAAGAGAACCAAGCCGAATTTGTTCAGTTACTCAACGAGCCCTA
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AACCGAACCGTTCATTTTTAACTCTGCTCAGAATCACAGATGATCATATCTTATATTCTT
AACCTCGTCATATTTATCATAAAGAATAATTTGCTTTTC

QA 1 879 1 879
DS 



AS 1 3

CO CL4097Contig1 949 3 8 U
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AGGTCATCATCCTCATCACATGCAAACCATAAACACTGCGACTACCGTCGACTGCGCTAG
TGAACTCCGTCACCGGAGAACTCTCCGTTCATTCATCGAATGCATGCTCCCATACTGTTG
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TTCATCATCATCTTCCTCTTCAGACCACTCCACCTCCTCTTCCTCCCATAGTAATAGCAT
AGTTAGTGGAACTTTCTTCGGACACCGTCGTGGAAGAGTCAGTTTCTGCCTCCAGGACGC
CGCCGTTGGATCTTCTCCGCTTCTCCTCCTTGAACTAGCTGTTCCCACGGCAGCCTTAGC
CAAAGAGATGGATCAAGCAGGTGTTCTACGCATAGCCCTCGAGTGCGACCGTCGTCGAAG
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GGAGCAGACGCTTTACCTGAGAGCGAAGTTCGAGCGAGTCACTGGGTCGAGCGACTCTGA
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GAGATCGTGAGATTCAGTATGGTGTCGTTATATTATTAAAAGATTCTTGTCTTAGTTCAT
GTAGATTGTAAAATTTTAAAAAAAAACAAATTTGAAATTTCATCTTTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CV65TF U 1
AF RS1DK26TF U 5
AF RS1DK26JQ C 338
BS 1 548 RS1CV65TF
BS 549 549 RS1DK26TF
BS 550 576 RS1CV65TF
BS 577 577 RS1DK26TF
BS 578 590 RS1CV65TF
BS 591 591 RS1DK26TF
BS 592 640 RS1CV65TF
BS 641 949 RS1DK26JQ

RD RS1CV65TF 642 0 0
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CTCAAAAAAAGAAAAGAGTGAAATAACCATGAGAACTATGGTTGATTTAGGAAAGCAAAG
AGGTCATCATCCTCATCACATGCAAACCATAAACACTGCGACTACCGTCGACTGCGCTAG
TGAACTCCGTCACCGGAGAACTCTCCGTTCATTCATCGAATGCATGCTCCCATACTGTTG
CACCTACCAACAACCTTCTCCTTCAACCCAAAACGACACCGTTTCAGTCTCTTCCTCTGC
TTCATCATCATCTTCCTCTTCAGACCACTCCACCTCCTCTTCCTCCCATAGTAATAGCAT
AGTTAGTGGAACTTTCTTCGGACACCGTCGTGGAAGAGTCAGTTTCTGCCTCCAGGACGC
CGCCGTTGGATCTTCTCCGCTTCTCCTCCTTGAACTAGCTGTTCCCACGGCAGCCTTAGC
CAAAGAGATGGATCAAGCAGGTGTTCTACGCATAGCCCTCGAGTGCGACCGTCGTCGAAG
CACAAACGGCAGCAACAGTCGAGTGTCGTCGATCTTTGACGTTCCTGTGTGGTCGATGTA
CTGCAACGGAAGGAAGATGGGGTCTGCTGTGAGGAGAAAG
TG

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1DK26TF 639 0 0
GG
ATACCAAAGATAACAATATTCTCTTCTTCTTTAATTTCCCTCTCAACTTAATACCTCAAA
AAAAGAAAAGAGTGAAATAACCATGAGAACTATGGTTGATTTAGGAAAGCAAAGAGGTCA
TCATCCTCATCACATGCAAACCATAAACACTGCGACTACCGTCGACTGCGCTAGTGAACT
CCGTCACCGGAGAACTCTCCGTTCATTCATCGAATGCATGCTCCCATACTGTTGCACCTA
CCAACAACCTTCTCCTTCAACCCAAAACGACACCGTTTCAGTCTCTTCCTCTGCTTCATC
ATCATCTTCCTCTTCAGACCACTCCACCTCCTCTTCCTCCCATAGTAATAGCATAGTTAG
TGGAACTTTCTTCGGACACCGTCGTGGAAGAGTCAGTTTCTGCCTCCAGGACGCCGCCGT
TGGATCTTCTCCGCTTCTCCTCCTTGAACTAGCTGTTCCCACGGCAGCCTTAGCCAAAGA
GATGGATCAAGCAGGTGTTCTACGCATAGCCCTCGAGTGCGACCGTCGTCGAAGCACAAA
CGACAGCAACAGTCGAGTGTCGTCGATCTTCGACGTTCCTGTGTTGTCGATGTACTGCAA
CGGAAAGAAGATGGGGTCTGCTGTGAGGAGAAAG
TGA

QA 3 636 3 636
DS 

RD RS1DK26JQ 612 0 0
TCTTCCTCCCATAGTAATAGCATAGTTAGTGGAACTTTCTTCGGACACCGTCGTGGAAGA
GTCAGTTTCTGCCTCCAGGACGCCGCCGTTGGATCTTCTCCGCTTCTCCTCCTTGAACTA
GCTGTTCCCACGGCAGCCTTAGCCAAAGAGATGGATCAAGCAGGTGTTCTACGCATAGCC
CTCGAGTGCGACCGTCGTCGAAGCACAAACGACAGCAACAGTCGAGTGTCGTCGATCTTC
GACGTTCCTGTGTTGTCGATGTACTGCAACGGAAGGAAGATGGGGTCTGCTGTGAGGAGA
AAGGTGACGGAGAACGACGCCGTTTTCTTGAAGATGATGCAGTCTTTTTCGGTCGGAGCT
GGAGCTGTGCCGTTGGATGAGAAGGAGCAGACGCTTTACCTGAGAGCGAAGTTCGAGCGA
GTCACTGGGTCGAGCGACTCTGAATCGTTTCATATGATGAATCCTGGTTGTAGTTATGGA
CAGGAGCTTAGTATATTTCTTTTGAGATCGTGAGATTCAGTATGGTGTCGTTATATTATT
AAAAGATTCTTGTCTTAGTTCATGTAGATTGTAAAATTTTAAAAAAAAACAAATTTGAAA
TTTCATCTTTTT

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 2

CO CL4098Contig1 815 2 3 U
GGAGATTCAAACGAGAGAGGAGAAGAAGAAGAAGATGGCGGCGACTGTGCACTCTCCGAT
CGTGACGTACGCATCGATGCTATCGCTACTCGCTTTCTGTCCACCTTTCGTTATTCTCCT
ATGGTACACGATGGTTCATCAGGATGGTTCAGTTATCCAGACGTGTAGCTTCTTGTGGGA
GAATGGAGTTCAGGGGCTCATCAACATATGGCCAAGACCCACTGCCATCGCTTGGAAGAT
CATCTTTTGCTACGGAGCATTTGAGGCTGCTCTTCAGCTTCTTCTTCCTGGTAAAAGAGT
TGAAGGTCCGATTTCTCCTACGGGGAACCGACCGGTTTACAAGGCCAATGGTATGGCTGC
TTATTTTGTGACACTAGCCACCTATCTTGGTCTTTGGGTGGTTTGGGATATTCAACCCTG
CAATTGTCTATGATCATTTGGGTGAAATATTTTCGGCGCTGATATTCGGAAGCCTCGTGT
TCTGTGTTTTGTTATACGTAAAGGGTCATGTTGCGCCTTCATCAAGTGATTCTGGTTCAT
GTGGTAACCTGATTATCGACTTCTATTGGGGCATGGAGTTGTATCCTCGAATTGGTAAAA
ACTTCGACATCAAGGTTTTTACTAATTGCAGATTTGGTATGATGTCTTGGGCTGTTCTTG
CCGTCACGTACTGCATTAAACAGTATGAAATAAACGGGAAAGTATCTGATTCAATGTTGG
TGACACTATCCTGATGCTGGTGTATGTCACGAATTTTTCTGGTGGGAAGCGGGTACTGGA
CACCATGGACATCGCACATGACCGAGCTGGATCTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BU18TF U 64
AF RS1DT52TF U 1
BS 1 397 RS1DT52TF
BS 398 398 RS1BU18TF
BS 399 815 RS1DT52TF

RD RS1BU18TF 566 0 0
GACC
TACGCATCGATGCTATCGCTACTCGCTTTCTGTCCACCTTTCGTTATTCTCCTATGGTAC
ACGATGGTTCATCAGGATGGTTCAGTTATCCAGACGTGTAGCTTCTTGTGGGAGAATGGA
GTTCAGGGGCTCATCAACATATGGCCAAGACCCACTGCCATCGCTTGGAAGATCATCTTT
TGCTACGGAGCATTTGAGGCTGCTCTTCAGCTTCTTCTTCCTGGTAAAAGAGTTGAAGGT
CCGATTTCTCCTACGGGGAACCGACCGGTTTACAAGGCCAATGGTATGGCTGCTTATTTT
GTGACACTAGCCACCTATCTTGGTCTTTGGGTGGTTTGGGATATTCAACCCTGCAATTGT
CTATGATCATTTGGGTGAAATATTTTCGGCGCTGATATTCGGAAGCCTCGTGTTCTGTGT
TTTGTTATACGTAAAGGGTCATGTTGCGCCTTCATCAAGTGATTCTGGTTCATGTGGTAA
CCTGATTATCGACTTCTATTGGGGCATGGAGTTGTATCCTCGAATTGGTAAAA*CTTCGA
CATCAAG**TTTTACTAATTGC

QA 5 566 5 566
DS 

RD RS1DT52TF 815 0 0
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CGTGACGTACGCATCGATGCTATCGCTACTCGCTTTCTGTCCACCTTTCGTTATTCTCCT
ATGGTACACGATGGTTCATCAGGATGGTTCAGTTATCCAGACGTGTAGCTTCTTGTGGGA
GAATGGAGTTCAGGGGCTCATCAACATATGGCCAAGACCCACTGCCATCGCTTGGAAGAT
CATCTTTTGCTACGGAGCATTTGAGGCTGCTCTTCAGCTTCTTCTTCCTGGTAAAAGAGT
TGAAGGTCCGATTTCTCCTACGGGGAACCGACCGGTTTACAAGGCCAATGGTATGGCTGC
TTATTTTGTGACACTAGCCACCTATCTTGGTCTTTGG*TGGTTTGGGATATTCAACCCTG
CAATTGTCTATGATCATTTGGGTGAAATATTTTCGGCGCTGATATTCGGAAGCCTCGTGT
TCTGTGTTTTGTTATACGTAAAGGGTCATGTTGCGCCTTCATCAAGTGATTCTGGTTCAT
GTGGTAACCTGATTATCGACTTCTATTGGGGCATGGAGTTGTATCCTCGAATTGGTAAAA
ACTTCGACATCAAGGTTTTTACTAATTGCAGATTTGGTATGATGTCTTGGGCTGTTCTTG
CCGTCACGTACTGCATTAAACAGTATGAAATAAACGGGAAAGTATCTGATTCAATGTTGG
TGACACTATCCTGATGCTGGTGTATGTCACGAATTTTTCTGGTGGGAAGCGGGTACTGGA
CACCATGGACATCGCACATGACCGAGCTGGATCTA

QA 1 815 1 815
DS 



AS 1 3

CO CL4099Contig1 1041 3 15 U
GGATATCTTAATCTACAAAAAGAAAAACCTTCCACTCCAAAACATCAAGAACAATGTTTT
CATCATCTGTCTCAGAACGTACCGTTTTGGTCCTTATCTTGGCCGTAGTAGCCGCCATAC
AACTCTTCTTTATACACAGTGTTGCGTCTGTAAACGAGACCAATGCGTATTTATACCACA
AATGCTTAGAGAAGGATGGGAAATATAAGTCAAAGAGTCTTTACGAGAAAAACCTCAACA
GTCTCATCTCTAACACATCTGTAGAAGATTACATCTATGGCGTCTATGGTTATAGTCCTG
ATACTGTCTACATGGTTATCCAATGTCGTGGTGACTCTTACGGCCCCAAGTGTGATACAT
GCCTGTCCACTGCTTACTCTGAGCCCCGTAAAAGATGTCCTATGAACAAGGGGGCAATCG
TATGGTTTGACCGATGTCTTCTCAGGATTTCTCCGACCACTTTCATAAACGAGATGGATC
TCAAGAACAAGTTCTATATGTACAACAGGAAGAAAGCGAGAGATCC*GGCGTCGTTTAAC
GCTAAGACAAAGACTTTTCTCACCAAGCTAACAAAGGAAGCCACTCGTAAAGGTTCGGAG
AGGTCTCCTGCACAGGAGTATTACGAGCCTGGGGATATGAAGCTTGACGGGAAGATGAAG
CTGTACGGAATGGTGCAGTGCACGCGACTCATATGGAACACAGATTGTACGAAATGTTTG
GATACGATTATTGGGGAGATTCCTAGTTGTTGTGATGGTAAAGAAGGAGGAAGAGTAGTG
AGTGGGAGTTGTAACTTTAGGTATGAGATTTACCCTTTTCTTGACACTAAAAGATGAGAG
CTCCATGTTTTTTTGTGTGTGCTCTCCTTCACTGGGATGCTTTAACATGTTTGTACCAAG
AGAGAATATTTAGTTATTTATTTACATGTTCTTGCTGTACAAAGAGAAGAAGCTGGTCAA
AATGATCTTCTCAGCCTATAATTAAGGCAGTCATGAAAGTGACAATAAGATCTTGCTTGG
AGTTGACAAGCGGTTTTCATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E990TF U 1
AF RS1BX53TF U 21
AF RS1BX53JQ C 247
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G
GAAAAACCTTCCACTCCAAAACATCAAGAACAATGTTTTCATCATCTGTCTCAGAACGTA
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AATGTCGTGGTGACTCTTACGGCCCCAAGTGTGATACATGCCTGTCCACTGCTTACTCTG
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QA 2 769 2 769
DS 

RD RS1BX53JQ 795 0 0
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CCTGCACAGGAGTATTACGAGCCTGGGGATATGAAGCTTGACGGGAAGATGAAGCTGTAC
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ATTATTGGGGAGATTCCTAGTTGTTGTGATGGTAAAGAAGGAGGAAGAGTAGTGAGTGGG
AGTTGTAACTTTAGGTATGAGATTTACCCTTTTCTTGACACTAAAAGATGAGAGCTCCAT
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TATTTAGTTATTTATTTACATGTTCTTGCTGTACAAAGAGAAGAAGCTGGTCAAAATGAT
CTTCTCAGCCTATAATTAAGGCAGTCATGAAAGTGACAATAAGATCTTGCTTGGAGTTGA
CAAGCGGTTTTCATG

QA 1 795 1 795
DS 



AS 1 3

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TACCAACGATAAGCAATCCATAAGGATTTCAATACTAGAAAAGCCCAACCGCTAAAAGAA
AAACAAATAAGTAGCAACACCAAACTAAACCACCCTGAAGAAAAGGCTTTTTGTACTTAT
TAAAATCTCTCATCACTCACTCATAATCACTCAGCAGCAGCGTTTCCCTGAAGAAGACCA
CCCCTTATCTGCGAAGCAATGTCCTTAACAGCACCCGGACCGTGCGGTATGAACACCGAG
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ATGTCCATGACGTCCTTGGAAGACGTCCCTGGAACAGACTCGGAGAAGGCCAGCACGCTG
TTCCTCAGACCGTCCACGATGGCTTGTCTCTGACGTGCTATACCGAGACCCGAAAGGTAC
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TCACTCGCTGCCTCTCTCATTCTTGAAGCAGCATTCTCATTCATAGCTCTATTGACATGC
ACATCAGGCTCGATATCCACAATAAGCGTCTGGACTATCTCATACCCGTAATGCGACATA
GCCTTTTCGAGCTCACTCTCAACGGTTTTCGCAATGTCGTTCTTCTGCTCAAAGGTGGAG
TCTAGATCAAGCTTAGGCACACTTGCTCGGATCACGTCAAAGACATAAGTTTGAATCTGG
TTCCTGGTGTTGCTGAGCTTGTAAAAAGCATCTTGAGCACTCTCAGCTAAAGCACGGTAC
TGAATGGAAGCAACGACGGTGACAAACACATTATCTTTAGTTTTGGTCTCGCAGCGAACA
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AAACAGTGACAACCTGGCTCGAGAACGTCGTCGAACTTCCCGAACGTCTCTTTGATTGCA
ACAGTGGACTGATCGACTTGGACGCATCCTAGAACTTGACCCATTTTTTGTTATTTTTCC
AGAAGCAATGAAATTACACGGAACTGTCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EL19JQ U 1
AF RS1D634JQ U 127
AF RS1D634TF C 385
BS 1 300 RS1EL19JQ
BS 301 301 RS1D634JQ
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RD RS1EL19JQ 467 0 0
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TACCAACGATAAGCAATCCATAAGGATTTCAATACTAGAAAAGCCCAACCGCTAAAAGAA
AAACAAATAAGTAGCAACACCAAACTAAACCACCCTGAAGAAAAGGCTTTTTGTACTTAT
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QA 1 467 1 467
DS 

RD RS1D634JQ 820 0 0
A
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TAAGTAGCAACACCAAACTAAACCACCCTGAAGAAAAGGCTTTTTGTACTTATTAAAATC
TCTCATCACTCACTCATAATCACTCAGCAGCAGCGTTTCCCTGAAGAAGACCACCCCTTA
TCTGCGAAGCAATGTCCTTAACAGCACCCGGACCGTGCGGTATGAACACCGAGTTCGACT
TGGAAGACGCACCAATCTCCTTCAGAGTATCAAAGTACTGAGTGACCAGAACCATGTCCA
TGACGTCCTTGGAAGACGTCCCTGGAACAGACTCGGAGAAGGCCAGCACGCTGTTCCTCA
GACCGTCCACGATGGCTTGTCTCTGACGTGCTATACCGAGACCCGAAAGGTACTTGGACT
CAGCTTCTCCTTCGGCTCTCTTGATCTGAAGTATCTTCTCTGCCTCTGCTTTCTCACTCG
CTGCCTCTCTCATTCTTGAAGCAGCATTCTCATTCATAGCTCTATTGACATGCACATCAG
GCTCGATATCCACAATAAGCGTCTGGACTATCTCATACCCGTAATGCGACATAGCCTTTT
CGAGCTCACTCTCAACGGTTTTCGCAATGTCGTTCTTCTGCTCAAAGGTGGAGTCTAGAT
CAAGCTTAGGCACACTTGCTCGGATCACGTCAAAGACATAAGTTTGAATCTGGTTCCTGG
TGTTGCTGAGCTTGTAAAAAGCATCTTGAGCACTCTCAGCTAAAGCACGGTACTGAATGG
AAGCAACGACG*TGACAAA*ACATTATCTTTAGTTTTGG

QA 2 820 2 820
DS 

RD RS1D634TF 786 0 0
CT
CTTCAGAGTATCAAAGTACTGAGTGACCAGAACCATGTCCATGACGTC*TTGGAAGACGT
CCCTGGAACAGACTCGGAGAAGGCCAGCACGCTGTTCCTCAGAC*GTCCACGATGGCTTG
TCTCTGACGTGCTATACCGAGACCCGAAAGGTACTTGGACTCAGCTTCTCCTTCGGCTCT
CTTGATCTGAAGTATCTTCTCTGCCTCTGCTTTCTCACTCGCTGCCTCTCTCATTCTTGA
AGCAGCATTCTCATTCATAGCTCTATTGACATGCACATCAGGCTCGATATCCACAATAAG
CGTCTGGACTATCTCATACCCGTAATGCGACATAGCCTTTTCGAGCTCACTCTCAACGGT
TTTCGCAATGTCGTTCTTCTGCTCAAAGGTGGAGTCTAGATCAAGCTTAGGCACACTTGC
TCGGATCACGTCAAAGACATAAGTTTGAATCTGGTTCCTGGTGTTGCTGAGCTTGTAAAA
AGCATCTTGAGCACTCTCAGCTAAAGCACGGTACTGAATGGAAGCAACGACGGTGACAAA
CACATTATCTTTAGTTTTGGTCTCGCAGCGAACATCGAGCTGTTGAACACGCAGGGAAAG
GTGACCAGCGACTTGACTCCCTATGCACCAGGGCAAACAGTGACAACCTGGCTCGAGAAC
GTCGTCGAACTTCCCGAACGTCTCTTTGATTGCAACAGTGGACTGATCGACTTGGACGCA
TCCTAGAACTTGACCCATTTTTTGTTATTTTTCCAGAAGCAATGAAATTACACGGAACTG
TCCA

QA 3 786 3 786
DS 



AS 1 3

CO CL4101Contig1 859 3 2 U
GGAGAGTAAATTACTATAAAAAAAATATCAATACAAATATTACAAAACTCTCTAAAACGT
TCAGCTGTTTTTCTTTTTCTTATGGGGTTTTGCAAGAAAGAAACATGTAATAGAAAGAAA
AAAAAACAAACTCAAAACTGAAGCAAGAAGCGAACAAACGGTCTTGAACGATTCAACATC
TAAGCAGCTTGCTGAGCCGAAAGCCTCTTCCTAGCTTCCTCAATGATGGTCAGCTTAATA
CCTTTACCCTTTGGAAGAGACACCCACGGCTTAGTTCCTTTCCCAAGAGTGAACACATTA
CCCAACCTCGTGGCGAACTCATGCCCCGTAGAGTCTTGGATGTGAATCGTCTCAAAGCTT
CCCTTATGCTTCTCACGGTTCTTAATGACACCAACACGCCCTCTGTTTCTACCGCCAGTC
ACCATCACAACGTTGCCGACGTCGAACTTGATGAACTCGACAATCTTGTTCTCCTCGAGG
TCGAGCTTGATGGTGTCGTTCGGTTTGATGAGCGGATCGGGGTAGCGGATGGTGCGACCG
TCGTAAGTGTTGAGGTAAGGGATTCCCTTTCGTCCGAGCAGGATAGCCCTCACCTTGCAA
AGCTTGAACTTTGCTTCCTCATCTCTGATGCAGTGGAGACGGAAACGTCCCTTGGTGTCG
TAAAGAAGACGGAAGCTCTCATTGGTCTTGGGGATGGAGACAACATCCATGAAACCAGCA
GGGTAAGTTTTGTCAGTCCTGACTTTACCATCGACTTGGATATGCCTCTGCATGAGGATG
GAGATGACTTCACGGTATGTCAAAGCATACTTCAACCTGTTCCTGATGATCAGGACAAGA
GGAAGACACTCCCTAGACC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DS78JQ U 1
AF RS1AJ03JQ U 1
AF RS1AJ03TF C 21
BS 1 829 RS1AJ03JQ
BS 830 859 RS1AJ03TF

RD RS1DS78JQ 709 0 0
GGAGAGTAAATTACTATAAAAAAAATATCAATACAAATATTACAAAACTCTCTAAAACGT
TCAGCTGTTTTTCTTTTTCTTATGGGGTTTTGCAAGAAAGAAACATGTAATAAAAAGAAA
AAAAAACAAACTCAAAACTGAAGCAAGAAGCGAACAAACGGTCTTGAACGATTCAACATC
TAAGCAGCTTGCTGAGCCGAAAGCCTCTTCCTAGCTTCCTCAATGATGGTCAGCTTAATA
CCTTTACCCTTTGGAAGAGACACCCACGGCTTAGTTCCTTTCCCAAGAGTGAACACATTA
CCCAACCTCGTGGCGAACTCATGCCCCGTAGAGTCTTGGATGTGAATCGTCTCAAAGCTT
CCCTTATGCTTCTCACGGTTCTTAATGACACCAACACGCCCTCTGTTTCTACCGCCAGTC
ACCATCACAACGTTGCCGACGTCGAACTTGATGAACTCGACAATCTTGTTCTCCTCGAGG
TCGAGCTTGATGGTGTCGTTCGGTTTGATGAGCGGATCGGGGTAGCGGATGGTGCGACCG
TCGTAAGTGTTGAGGTAAGGGATTCCCTTTCGTCCGAGCAGGATAGCCCTCACCTTGCAA
AGCTTGAACTTTGCTTCCTCATCTCTGATGCAGTGGAGACGGAAACGTCCCTTGGTGTCG
TAAAGAAGACGGAAGCTCTCATTGGTCTTGGGGATGGAGACAACATCCA

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1AJ03JQ 829 0 0
GGAGAGTAAATTACTATAAAAAAAATATCAATACAAATATTACAAAACTCTCTAAAACGT
TCAGCTGTTTTTCTTTTTCTTATGGGGTTTTGCAAGAAAGAAACATGTAATAGAAAGAAA
AAAAAACAAACTCAAAACTGAAGCAAGAAGCGAACAAACGGTCTTGAACGATTCAACATC
TAAGCAGCTTGCTGAGCCGAAAGCCTCTTCCTAGCTTCCTCAATGATGGTCAGCTTAATA
CCTTTACCCTTTGGAAGAGACACCCACGGCTTAGTTCCTTTCCCAAGAGTGAACACATTA
CCCAACCTCGTGGCGAACTCATGCCCCGTAGAGTCTTGGATGTGAATCGTCTCAAAGCTT
CCCTTATGCTTCTCACGGTTCTTAATGACACCAACACGCCCTCTGTTTCTACCGCCAGTC
ACCATCACAACGTTGCCGACGTCGAACTTGATGAACTCGACAATCTTGTTCTCCTCGAGG
TCGAGCTTGATGGTGTCGTTCGGTTTGATGAGCGGATCGGGGTAGCGGATGGTGCGACCG
TCGTAAGTGTTGAGGTAAGGGATTCCCTTTCGTCCGAGCAGGATAGCCCTCACCTTGCAA
AGCTTGAACTTTGCTTCCTCATCTCTGATGCAGTGGAGACGGAAACGTCCCTTGGTGTCG
TAAAGAAGACGGAAGCTCTCATTGGTCTTGGGGATGGAGACAACATCCATGAAACCAGCA
GGGTAAGTTTTGTCAGTCCTGACTTTACCATCGACTTGGATATGCCTCTGCATGAGGATG
GAGATGACTTCACGGTATGTCAAAGCATACTTCAACCTGTTCCTGATGA

QA 1 829 1 829
DS 

RD RS1AJ03TF 839 0 0
AAAAATATCAATACAAATATTACAAAACTCTCTAAAACGTTCAGCTGTTTTTCTTTT*CT
TATGGGGTTTTGCAAGAAAGAAACATGTAATAGAAAGAAAAAAAAACAAACTCAAAACTG
AAGCAAGAAGCGAACAAACGGTCTTGAACGATTCAACATCTAAGCAGCTTGCTGAGCCGA
AAGCCTCTTCCTAGCTTCCTCAATGATGGTCAGCTTAATACCTTTACCCTTTGGAAGAGA
CACCCACGGCTTAGTTCCTTTCCCAAGAGTGAACACATTACCCAACCTCGTGGCGAACTC
ATGCCCCGTAGAGTCTTGGATGTGAATCGTCTCAAAGCTTCCCTTATGCTTCTCACGGTT
CTTAATGACACCAACACGCCCTCTGTTTCTACCGCCAGTCACCATCACAACGTTGCCGAC
GTCGAACTTGATGAACTCGACAATCTTGTTCTCCTCGAGGTCGAGCTTGATGGTGTCGTT
CGGTTTGATGAGCGGATCGGGGTAGCGGATGGTGCGACCGTCGTAAGTGTTGAGGTAAGG
GATTCCCTTTCGTCCGAGCAGGATAGCCCTCACCTTGCAAAGCTTGAACTTTGCTTCCTC
ATCTCTGATGCAGTGGAGACGGAAACGTCCCTTGGTGTCGTAAAGAAGACGGAAGCTCTC
ATTGGTCTTGGGGATGGAGACAACATCCATGAAACCAGCAGGGTAAGTTTTGTCAGTCCT
GACTTTACCATCGACTTGGATATGCCTCTGCATGAGGATGGAGATGACTTCACGGTATGT
CAAAGCATACTTCAACCTGTTCCTGATGATCAGGACAAGAGGAAGACACTCCCTAGACC

QA 1 839 1 839
DS 



AS 1 3

CO CL4102Contig1 600 3 20 U
CAGCATCTCTTCTACTGGAAGAACCCTAAAGAACAAAGAGCCATTCTCGTCATTGTACTC
ATGGCTCCTGTTTACGCTGTCAGCTCCTTTTTGGGCTTGCTTGATGCTAAAGGAAGCAAA
CCCTTGTT*CATGTTCCTAGACGCCGTTAAAGATTGCTATGAGGCACTTGTCATTGCTAA
GTTCTTAGAGTTGATGTATAGCTACATCAACATATCCATGAGTGGAATGACTATCCCTGA
TGAGATCAAAGGGAGAGAGATCCACCATTCGTTTCCAATGACGCTGTTCGTTCCCCGGAC
AACGCATCTGGATCACCGCACGCTGACGCAGCTCAAGCATTGGACGTGGCAGTTCTGTAT
CATCCGCCCTGTGTGTTCATTCTTGATGATAGCGCTGCAGCTTCTCGGGGTTTATCCACC
GTGGCTGAGCTGGATCTTCACCGTTATTCTGAACGTCTCGGTGTCACTGGCTTTGTATTC
TCTGGTGAAGTTCTTCCATGTTTTTGCTAAAGAGTTGGAGCCTCATAAGCCCCTTACCAA
GTTCATGTGCATTCAAGGGATAGTCCTCTTCTGCTTTTGGCAGGGAGTAGTGCTGGAGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AK19JQ C 93
AF RS1AK19TF U 1
AF RS1BH67TF U 27
BS 1 35 RS1AK19TF
BS 36 36 RS1BH67TF
BS 37 48 RS1AK19TF
BS 49 49 RS1BH67TF
BS 50 86 RS1AK19TF
BS 87 87 RS1BH67TF
BS 88 300 RS1AK19TF
BS 301 301 RS1BH67TF
BS 302 327 RS1AK19TF
BS 328 328 RS1BH67TF
BS 329 378 RS1AK19TF
BS 379 379 RS1BH67TF
BS 380 424 RS1AK19TF
BS 425 425 RS1BH67TF
BS 426 537 RS1AK19TF
BS 538 538 RS1BH67TF
BS 539 565 RS1AK19TF
BS 566 566 RS1BH67TF
BS 567 584 RS1AK19TF
BS 585 600 RS1BH67TF

RD RS1AK19JQ 156 0 0
GGGCTTGCTTGATGCTAAAGGAAGCAAACCCTTGTTTCATGTTCCTAGACGCCGTTAAAG
ATTGCTATGAGGCACTTGTCATTGCTAAGTTCTTAGAGTTGATGTATAGCTACATCAACA
TATCCATGAGTGGAATGACTATCCCTGATGAGATCA

QA 1 156 1 156
DS 

RD RS1AK19TF 590 0 0
CAGCATCTCTTCTACTGGAAGAACCCTAAAGAACAGAGAGCCATTCTCTTCATTGTACTC
ATGGCTCCTGTTTACGCTGTCAGCTCTTTTTTGGGCTTGCTTGATGCTAAAGGAAGCAAA
CCCTTGTT*CATGTTCCTAGACGCCGTTAAAGATTGCTATGAGGCACTTGTCATTGCTAA
GTTCTTAGAGTTGATGTATAGCTACATCAACATATCCATGAGTGGAATGACTATCCCTGA
TGAGATCAAAGGGAGAGAGATCCACCATTCGTTTCCAATGACGCTGTTCGTTCCCCGGAC
CACGCATCTGGATCACCGCACGCTGACTCAGCTCAAGCATTGGACGTGGCAGTTCTGTAT
CATCCGCCCTGTGTGTTCCTTCTTGATGATAGCGCTGCAGCTTCTCGGGGTTTATCCACC
GTGGTTGAGCTGGATCTTCACCGTTATTCTGAACGTCTCGGTGTCACTGGCTTTGTATTC
TCTGGTGAAGTTCTTCCATGTTTTTGCTAAAGAGTTGGAGCCTCATAAGCCCCTTACGAA
GTTCATGTGCATTCAAGGGATAGTCTTCTTCTGCTTTTGGCAGG
AGTAGT

QA 1 584 1 584
DS 

RD RS1BH67TF 574 0 0
G
AAAGAACAAAGAGCCATTCTCGTCATTGTACTCATGGCTCCTGTTTACGCTGTCAGCTCC
TTTTTGGGCTTGCTTGATGCTAAAGGAAGCAAACACTTGTT*CATGTTCCTAGTCGCCCT
TAAAGATTGCTATGAGGCACTTGTCATTGCTAAGTTCTTGGAGTTGATGTATAGTTACAT
CAACATATCCATGAGTGGAATGATTATCCCTGATGAGATCAAAGGGAGAGAGATCCACCA
TTCGTTTCCAATGACGCTGTTCGTTCCTCGGACAACGCATCTGGATCACCGCACGCTGAC
GCAGCTCAAGCATTGGACGTGGCAGTTCTGTGTTATTCGCCCTGTGTGTTCATTCTTGAT
GATAGCGCTGCAGCTTCTCGGGGTTTATCCACCGTGGCTGAGCTGGATCTTCACCGTTAT
TCTGAACGTTTCGGTGTCACTGGCTTTGTATTCTTTGGTGAAGTTCTTCCATGTTTTTGC
TAAAGAGTTGGATCCTCATAAGCCGCTTACCAAGTTCATGTGCATTCAAGGGATAGTCCT
CTTCTGCTTTTGGCAGGGAGTAGTGCTGGAGGT

QA 2 574 2 574
DS 



AS 1 3

CO CL4103Contig1 1115 3 14 U
GGACCAAATACAAAGATCAAGAGAAAAAAATGGGAGAGATCAAAAGCGGTGAGAAAACGC
GCGTTTTGGTGGTAGGAGCGACGGGTTACTTAGGGAAGAGAATCGTGAGGGCGTGTCTGG
CTGAAGGTCACGAGACTTACGTTTTGCAGCGGCCAGAGATTGGTCTCGACATCGAGAAAG
TCCAACTCCTTCTCTCTTTCAAGAAACTCGGCGCTCGTCTCGTCGAAGCTTCTTTCTCCG
ACCAACAAAGCCTCGTATCAGCGGTGAAACTCGTAGACGTCGTTGTCTCCGCCATGTCGG
GCGTTCACTTCCGTAGCCATAACATCCTTATCCAGCTCAAGCTCGTTGAAGCCATCAAAG
AGGCTGGTAATGTCAAGCGATTTTTACCATCTGAGTTTGGTATGGATCCACCACGTATGG
GACATGCATTACCACCAGGAAGAGAAACGTTTGACCAAAAAATGGAAGTACGTCATGCTA
TTGAAGCTGTCGGAATACCCTACACCTACGTCGTTGGCGCTTGCTTCGCGGCATATTTTG
CCGGAAACTTATCTCAGATGGAAACTTTACTTCCTCCAAAGAAAAAAACTAATATATATG
GAGATGGAAACATAAAAGTGGTGTTCGCCGATGAAGACGATATCGCAAAATACACCGCAA
AAACACTAGACGATCCACGAACAGTGAACAAAACCGTGTATATCAGACCTCAGGACAACG
TTCTCACGCAAAATGAATTGGTTAAAATTTGGGAAAACCTAACCGGAAATGAATTGGAAA
AGAAAAATATTGCTGCAAAAGACTTTCTTACCAACATCGAACACATGGAGATTCCACATC
AAGCAGGGATAGGACATTTTTATCATATCTTCTATGAAGGATGTCTCACTGATCATGAAA
TCAGAGAAGATGAAGAAGCATCAAGTCTCTATCCGGATGTTAAGTACAAGCGTATGGATG
ATTATTTAAGAATGTACCTCTGATTACACTTTGGTCAAAGTCATATCTATGATAAATATG
CATATCATAAGTTTGAAGTTTTTATATTCATGTATTTTTCGTGTTACTCAAAGTTGAATG
TATCATTATGCAAAAAATATAAATGGTTTCTTATT


BQ
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AF RS1H612JQB C 593
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BS 726 1115 RS1H612JQB

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DS 

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AAACACTAGACGATCCACGAACAGTGAACAAAACCGTGTATATCAGACCTCAGGACAACG
TTCTC

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1H612JQB 523 0 0
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TAAATATGCATATCATAAGTTTGAAGTTTTTATATTCATGTATTTTTCGTGTTACTCAAA
GTTGAATGTATCATTATGCAAAAAATATAAATGGTTTCTTATT

QA 1 523 1 523
DS 



AS 1 3

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AGATTCATCCCTTTGACAATTCCGCGAAACAAATCTCGAATTCTGCGATGGCGTCGTCGG
CTGCCGCGACAGCCCGGACGCAGCAGGCGCTCTCTCTCCTCGCCGCTGCCAACAACCACG
GCGATCTGGCAGTGAAGCTCTCGTCTCTCAGGCAGGCGAAGGAGATATTTCTGTCGCTGG
AGCCCTCTCTCTCCGCTGAGATTTTCCCCTATCTCACAGAACTCCACTCCTCGCGTGAAA
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TGCAGTTTCATCATCGTGGTAAAGTTGATCGTTGGGTTGGGGAACTATGGACATGGATGG
TTAAGTTCAAAGATGCTGTCTTTTCTACTGCGTTGGAGCCTGGTAGTGTAAGCGTGAAAG
TTTTGGCGCTAAAGTTTATGGAGACATTTATTTTGCTATGTACTCCTGATGCATCTGATC
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TTACTAGATCTCATACAGTCGGCTGGTCGTTTACCGGGTGCACTGACGATAGCTGTTGTT
AGTTGGTAAGTTTATGTCTGCATCCCACTATTCTTGTGTTCGCTTTGCTTTATATTCCTT
ATGATGTTAGTTTTGCTTGGTAACCTGATTGCTAGACCAAAATGATTGCCCATTATTTTG
CTTGGTAACCTGCATGTCTTCATAAAACGAACCATGTAGAATGTGTCTTGCTGCACTTAT
ATGGGTTTATATGGGTAGTACGATGGGGTGATATTACTAGTATTCATTTGCATAAGTTTG
ATGTGTGCCTCATGTTTGTGAGATACAATAATAAGCAGATGATCTTCCACTTTTAAGTAG
TTTCATAATCAAATAAGCTTTGTAAGACGATTAGCATCAGGGAGAATAAACTGCTGGTTT
CCATTTCTTTGTGTCTACTAAACTTTTGGCTGAGAGAGATAAAGCATGGAGACAGGTCAT
AGCACCGGTTCAACCCATATGATATAGTGGCAGCTAACTGAATCATAGTCCGGGGGAAAA
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GGATATATGCCGCCCGCATATTTTGATACTGTTCAGCTCCAATATACAAGTCATAAAGAC
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TAA


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10 10 10 

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AF RS1A474JQ C 776
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AGTAGTTTCATAATCAAATAAGCTTTGTAAGACGATTAGCATCAGGGAGAATAAACTGCT
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TACCTGGATATATGCCGCCCGCATATTTTGATACTGTTCAGCTCCAATATACAAGTCATA
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CGCTGCTACGTGGTAGAGGGAAGTTTTTTTGGTTTCGTGAACTGGTTGTATATAATAATA
CTTATGACTGTTATGTTGGGATATTGAAAATGTATACACTACAATATTACGGTTTATGCA
CAGTATAA

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DS 



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AGCAATGAAAACATAGTCATGTATGAAGATGCATGGACCTTCCTGGTTCCAGACCTTATC
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GGTATATACAAGGAACTAAAGAACGAAAAGACTACTCCAACTGATGGAGCATCATCTCCT
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TGCAGAACTGTCACTATTCATCACAAACAAGATAATCGAACCATCAAAGGAAGTCGCGCT
CCAGCTTCTCGAGAGTGGTCGTCAAAACCTGCGGGTAAGAAAACTTGGGCTTGATATGCT
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TGAAGCTCTGCGTTATGCTCAGAAGCGTAAGGTGACGAGTGTGCGATCGTCACTGTTTCT
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TGAGACCAGTTCCTCAGTTGCTGTCTGAGAGAGAACTTCTTACCATGTTTTATGTCCTCA
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TCATTAAAAATAAAAAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CW21TF U 1
AF RS1BH71TF U 32
AF RS1BH71JQ C 504
BS 1 47 RS1CW21TF
BS 48 48 RS1BH71TF
BS 49 51 RS1CW21TF
BS 52 52 RS1BH71TF
BS 53 190 RS1CW21TF
BS 191 191 RS1BH71TF
BS 192 195 RS1CW21TF
BS 196 197 RS1BH71TF
BS 198 553 RS1CW21TF
BS 554 554 RS1BH71TF
BS 555 585 RS1CW21TF
BS 586 586 RS1BH71TF
BS 587 594 RS1CW21TF
BS 595 737 RS1BH71TF
BS 738 1217 RS1BH71JQ

RD RS1CW21TF 594 0 0
GGCTCCGACTCATCGTCCCAAGCTGCTAACAAGGAAAACGAAAGCGCTGAATCATCTACA
AGCAATGAAAACATAGTCATGTATGAAGATGCATGGACCTTCCTGGTTCCAGACCTTATC
CTGGATCAGACTAACAAGGTTCTCTGGAGGGTGCATTTGGATCTTGAGGCAATTTCCACT
AGCAGCTCAGGCAGG**GTCTCTTCTAGAGTTTCTACAGCGAAGGAAGTTGGAAGCTAAT
AAGGCCAAACAACTATGCTTGGGGATAGCAAGGGCTCTTATTCTGGAACGCAGACCAGCA
ACTCAGGTTACACAGGCGATAGATGTACTGGTCACAGCATACTCATACTCGGTTAAAGCT
GGTATATACAAGGAACTAAAGAACGAAAAGACTACTCCAACTGATGGAGCATCATCTCCT
GGTAACGAAAGAGGTAGAGCATCTGGAAGCAGTATTGATGAAGAAGAAGAAGTTGAAATA
AATGTACCATCTGGTCCTGCTGATGAGCAGCAGGAATCTCAGCTCTCGTCACCAGCCATT
TCACCTGATGAGCCCTACAAGTTTGTGTTTGCTTCTGTGGAGGAAGCGATGGTT

QA 1 594 1 594
DS 

RD RS1BH71TF 706 0 0
G
GGAAAACGAAAGCGCAGAACCATCTACAAGCAATGAAAACATAGTCATGTATGAAGATGC
ATGGACCTTCCTGGTTCCAGACCTTATCCTGGATCAGACTAACAAGGTTCTCTGGAGGGT
GCATTTGGATCTTGAGGCAATTTCCACTAGCAGCTCAGACAGGACGTCTCTTCTAGAGTT
TCTACAGCGAAGGAAGTTGGAAGCTAATAAGGCCAAACAACTATGCTTGGGGATAGCAAG
GGCTCTTATTCTGGAACGCAGACCAGCAACTCAGGTTACACAGGCGATAGATGTACTGGT
CACAGCATACTCATACTCGGTTAAAGCTGGTATATACAAGGAACTAAAGAACGAAAAGAC
TACTCCAACTGATGGAGCATCATCTCCTGGTAACGAAAGAGGTAGAGCATCTGGAAGCAG
TATTGATGAAGAAGAAGAAGTTGAAATAAATGTACCATCTGGTCCTGCTGATGAGCAGCA
GGAATCTCAGCTCTCGTCACCAGCCATTTCACCTGATGAGCTCTACAAGTTTGTGTTTGC
TTCTGTGGAGGAAACGATGGTTGAGGAATCTGACTACCTAGTTGCTATCATAACTGAGTT
CCTTCGCAGTATAAGCGCAGAGAAACTCAAAGTGGATCTCAACATTTTTTGTGATGACCA
TCAGACTTTTAGCACACAGTAAACGATTTGCAGAACTGTCACTAT

QA 2 706 2 706
DS 

RD RS1BH71JQ 714 0 0
TGAGCAGCAGGAATCTCAGCTCTCGTCACCAGCCATTTCACCTGATGAGCTCTACAAGTT
TGTGTTTGCTTCTGTGGAGGAAACGATGGTTGAGGAATCTGACTACCTAGTTGCTATCAT
AACTGAGTTCCTTCGCAGTATAAGCGCAGAGAAACTCAAAGTGGATCTCAACATTTTTTG
TGATGACCATCAGACTTTTAGCACACAGTAAACGATTTGCAGAACTGTCACTATTCATCA
CAAACAAGATAATCGAACCATCAAAGGAAGTCGCGCTCCAGCTTCTCGAGAGTGGTCGTC
AAAACCTGCGGGTAAGAAAACTTGGGCTTGATATGCTGAGACAGCTCTCGTTGCACCATG
AGTATATCTCTTCCCTTGTGCAAGATGGATGCTATCTTGAAGCTCTGCGTTATGCTCAGA
AGCGTAAGGTGACGAGTGTGCGATCGTCACTGTTTCTGGAAGCAGCATTCGCGTCGAATG
ATATGCAACATTTGGCTGCAATATTAAGGGTCTTGTCGGAATTGATTCCTGGATTCAAAG
AAACTTCAGAGTATTACACGTTCCATGGTCTTCTTAATGAGACCAGTTCCTCAGTTGCTG
TCTGAGAGAGAACTTCTTACCATGTTTTATGTCCTCAATAAACCTAAAATAATGCTTGGT
TGTTGTTTGGATCTTTATAAGGAAACGATTTTCTGGTTCATTAAAAATAAAAAA

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL4106Contig1 815 2 8 U
AGTTGTTAAAACCTTATTTTGGAGACAAATATCAAACGTCAACACAGTATCTATACACTA
TACAAGGAGAGGCTAGTAATACAAAGGAAAGAAAGAGAAACAGATACAAGAAAGGAAGGT
CGTGTTTATATAAGTTGAACAGCTGCAATTGCAGGAATTTTCTCTCTGAGTTTCTGAGTT
ACCGCTACTCGTACTGTCATGACTCCAGCAGCAGGTCCTGTGATTCTTATCTTCACGATA
GGCTCTTCGATCTCCACCCAGCTCAAGCGACCCATCAGCTGTTCCAATTAAGTAAGGCCT
GATCTCTTCCAGCACCTTTTCAATGTTTTCGTCATTGAGTTCAAGGCCAGTCTCTTCATC
TGGAACTGATTCGACAGCCACAATCTCAGGTATCTTTTCCATAAGGCGACGCTCAATACC
CATTTTCATAGTCATAACAGAACTTGGGCATGACCCGCAAGCTCCCTGCAATTTGACTCG
CACAATATTTCCATCGATCTCATGTAATGCCACATTACCACCATCAGACATGAGGTATGG
TCTGATTTCGTCCAGAACGCTCTCTACATTTTCCTCAGTCAGGGGTACTTCCAACAGTGG
GTCTGGGGTTGCCACTGCCTTTACAACTTGAGATCGAGATAATCCTCGGAATCGGTGACG
AGGCCTAGCTAGGACTAGGAGACCAAAAGCGCGATGAGAGCTCAAAATCTGAGCAGAAGA
AAGAAGACGAGAGGACGAGGAAGAGGACGGCTCGAGGCCTAGGGTTCGTGGCGCCGACAT
GGCTGCTGAATTCAGCGCAAACAATTGCATCTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1F102JQ U 1
AF RS1AW89TF C 122
BS 1 239 RS1F102JQ
BS 240 240 RS1AW89TF
BS 241 258 RS1F102JQ
BS 259 259 RS1AW89TF
BS 260 417 RS1F102JQ
BS 418 418 RS1AW89TF
BS 419 546 RS1F102JQ
BS 547 815 RS1AW89TF

RD RS1F102JQ 546 0 0
AGTTGTTAAAACCTTATTTTGGAGACAAATATCAAACGTCAACACAGTATCTATACACTA
TACAAGGAGAGGCTAGTAATACAAAGGAAAGAAAGAGAAACAGATACAAGAAAGGAAGGT
CGTGTTTATATAAGTTGAACAGCTGCAATTGCAGGAATTTTCTCTCTGAGTTTCTGAGTT
ACCGCTACTCGTACTGTCATGACTCCAGCAGCAGGTCCTGTGATTCTTATCTTCACGATC
GGCTCTTCGATCTCCACC*AGCTCAAGCGACCCATCAGCTGTTCCAATTAAGTAAGGCCT
GATCTCTTCCAGCACCTTTTCAATGTTTTCGTCATTGAGTTCAAGGCCAGTCTCTTCATC
TGGAACTGATTCGACAGCCACAATCTCAGGTATCTTTTCCATAAGGCGACGCTCAATGCC
CATTTTCATAGTCATAACAGAACTTGGGCATGACCCGCAAGCTCCCTGCAATTTGACTCG
CACAATATTTCCATCGATCTCATGTAATGCCACATTACCACCATCAGACATGAGGTATGG
TCTGAT

QA 1 546 1 546
DS 

RD RS1AW89TF 694 0 0
CGTG
TTATATAAGT*GAACAGCTGCAATTGCAGGAATTT*CTCTCTGAGTTTCTGAGTTACCGC
TACTCGTACTGTCATGACTCCAGCAGCAGGTCCTGTGATTCTTATCTTCACGATAGGCTC
TTCGATCTCCACCCAGCTCAAGCGACCCATCAGCTGTTCCAATTAAGTAAGGCCTGATCT
CTTCCAGCACCTTTTCAATGTTTTCGTCATTGAGTTCAAGGCCAGTCTCTTCATCTGGAA
CTGATTCGACAGCCACAATCTCAGGTATCTTTTCCATAAGGCGACGCTCAATACCCATTT
TCATAGTCATAACAGAACTTGGGCATGACCCGCAAGCTCCCTGCAATTTGACTCGCACAA
TATTTCCATCGATCTCATGTAATGCCACATTACCACCATCAGACATGAGGTATGGTCTGA
TTTCGTCCAGAACGCTCTCTACATTTTCCTCAGTCAGGGGTACTTCCAACAGTGGGTCTG
GGGTTGCCACTGCCTTTACAACTTGAGATCGAGATAATCCTCGGAATCGGTGACGAGGCC
TAGCTAGGACTAGGAGACCAAAAGCGCGATGAGAGCTCAAAATCTGAGCAGAAGAAAGAA
GACGAGAGGACGAGGAAGAGGACGGCTCGAGGCCTAGGGTTCGTGGCGCCGACATGGCTG
CTGAATTCAGCGCAAACAATTGCATCTCTC

QA 5 694 5 694
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL4108Contig1 1293 3 3 U
TTTTTCTTTCTCCTTTAAAATATTTTGCAATCTTCAAGAAGCTTACCTACACTAAACCAA
ACATGGTGGTTTTATCACAGCACGTTGCTTTAGATAACCACTTATCTGTAATCCCAACAT
ACAAACCGGTTCTGGTCCCCGTCGTGGACCTAACCGACCCAGAAGCCAAAACTCTAATCG
TGAAAGCCTGTGAAGAGTTTGGTTTCTTCAAGGTTGTAAACCACGGAGTCCGACCAGACC
TCATGACCCGGTTAGAGCAGGAGGCTGTCGGCTTCTTCGCCTTGCCACAGTCTCTTAAAA
ACCAGGCCGGTCCGCCTGAACCGTACGGTTATGGTAGTAAACGGATTGGACCAAACGGGG
ACGTAGGATGGATAGAGTATATCCTCCTCAATGCTAACCCTCAGCTCACTTCCTGCAAAA
CCTCCGCTATTTTCCGTCAAACCCCACAAATTTTCCGAGAAGCGGTGGAGGAGTACATGA
AAGAGGTGAAGGAAGTGACGTGCAAAGTGTTGGAGATGGTAGCGGAGGGATTAGGGATAG
AGACAAGGGACACACTGAGTAAGATGGTGAGAGATGAGAAGAGTGACTCTTGCTTGAGAA
TGAACCATTATCCGACGGCGGAGGAAGAGGCGGAGAAGATGGTGAAAGTAGGGTTTGGGG
GAACACACAGACCCACAAATCATCTCAGTGCTACGGTCCAATAACACAGCGGGTCTTCAA
ATCTGTATAAAAGATGGAAGTTGGGGTCGCTGTCCCTCCTGATCAGTCTTCTTTCTTCAT
CAATGTTGGAGATGCTCTTCAGGTTATGACAAACGGGAGGTTCAAGAGTGTAAAACACAG
AGTCTTAGCTGATACAAGGAGATCGAGAGTCTCTATGATATATTTTGGAGGACCCCCGTT
GAGCCAGAAGATTGCTCCATTGCCATGCCTTGTCCCTAAGCAAGAGGATTGGATTTACAA
AGAATTTACTTGGTCTCAATACAAATCTTCAGCATACAAGTCAAAACTTGGTGATTATAG
GCTCGGTCTCTTTGAGAAACAACCTCTTCTCACCCATAGGTCTAATGTATGAGATTAGTC
ATGAACTCATGATGCTTGTATGATAAAAATCATAATTGCAAAAGAAGGAAATGGATAGTG
TTTTAGAGTAGCTTTTTTTATTTATTTTTGGTATGTTTTTTCGTTAGGCACAAAAGCATT
AGGCTTTTGTTAGAGTTTGACCCAACCTACCTTTTGTATCCTTTCTTCTTATTTGTTTGC
TTTCTTGGAAATAACAATTGGTGTGTTTTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G453TF U 1
AF RS1AG88TF U 153
AF RS1AG88JQ C 446
BS 1 612 RS1G453TF
BS 613 799 RS1AG88TF
BS 800 1293 RS1AG88JQ

RD RS1G453TF 612 0 0
TTTTTCTTTCTCCTTTAAAATATTTTGCAATCTTCAAGAAGCTTACCTACACTAAACCAA
ACATGGTGGTTTTATCACAGCACGTTGCTTTAGATAACCACTTATCTGTAATCCCAACAT
ACAAACCGGTTCTGGTCCCCGTCGTGGACCTAACCGACCCAGAAGCCAAAACTCTAATCG
TGAAAGCCTGTGAAGAGTTTGGTTTCTTCAAGGTTGTAAACCACGGAGTCCGACCAGACC
TCATGACCCGGTTAGAGCAGGAGGCTGTCGGCTTCTTCGCCTTGCCACAGTCTCTTAAAA
ACCAGGCCGGTCCGCCTGAACCGTACGGTTATGGTAGTAAACGGATTGGACCAAACGGGG
ACGTAGGATGGATAGAGTATATCCTCCTCAATGCTAACCCTCAGCTCACTTCCTGCAAAA
CCTCCGCTATTTTCCGTCAAACCCCACAAATTTTCCGAGAAGCGGTGGAGGAGTACATGA
AAGAGGTGAAGGAAGTGACGTGCAAAGTGTTGGAGATGGTAGCGGAGGGATTAGGGATAG
AGACAAGGGACACACTGAGTAAGATGGTGAGAGATGAGAAGAGTGACTCTTGCTTGAGAA
TGAACCATTATC

QA 1 612 1 612
DS 

RD RS1AG88TF 647 0 0
ACCGACCCAGAAGCCAAAACTCTAATCGTGAAAGC*TGTGAAGAGTTTGGTTTCTTCAAG
GTTGTAAACCACGGAGTCCGACCAGACCTCATGACCCGGTTAGAGCAGGAGGCTGTCGGC
TTCTTCTTCTTGCCACAGTCTCTTAAAAACCAGGCCGGTCCGCCTGAACCGTACGGTTAT
GGTAGTAAACGGATTGGACCAAACGGGGACGTAGGATGGATAGAGTATATCCTCCTCAAT
GCTAACCCTCAGCTCACTTCCTGCAAAACCTCCGCTATTTTCCGTCAAACCCCACAAATT
TTCCGAGAAGCGGTGGAGGAGTACATGAAAGAGGTGAAGGAAGTGACGTGCAAAGTGTTG
GAGATGGTAGCGGAGGGATTAGGGATAGAGACAAGGGACACACTGAGTAAGATGGTGAGA
GATGAGAAGAGTGACTCTTGCTTGAGAATGAACCATTATCCGACGGCGGAGGAAGAGGCG
GAGAAGATGGTGAAAGTAGGGTTTGGGGGAACACACAGACCCACAAATCATCTCAGTGCT
ACGGTCCAATAACACAGCGGGTCTTCAAATCTGTATAAAAGATGGAAGTTGGGGTCGCTG
TCCCTCCTGATCAGTCTTCTTTCTTCATCAATGTTGGAGATGCTCTT

QA 1 647 1 647
DS 

RD RS1AG88JQ 848 0 0
CA
AAATTTTCCGAGAAGCGGTGGAGGAGTACATGAAAGAGGTGAAGGAAGTGACGTGCAAAG
TGTTGGAGATGGTAGCGGAGGGATTAGGGATAGAGACAAGGGACACACTGAGTAAGATGG
TGAGAGATGAGAAGAGTGACTCTTGCTTGAGAATGAACCATTATCCGACGGCGGAGGAAG
AGGCGGAGAAGATGGTGAAAGTAGGGTTTGGGG*AACACACAGACCCACAAATCATCTCA
GTGCTACGGTCCAATAACACAGCGGGTCTTCAAATCTGTATAAAAGATGGAAGTTGGG*T
CGCTGTCCCTCCTGATCAGTCTTCTTTCTTCATCAATGTTGGAGATGCTCTTCAGGTTAT
GACAAACGGGAGGTTCAAGAGTGTAAAACACAGAGTCTTAGCTGATACAAGGAGATCGAG
AGTCTCTATGATATATTTTGGAGGACCCCCGTTGAGCCAGAAGATTGCTCCATTGCCATG
CCTTGTCCCTAAGCAAGAGGATTGGATTTACAAAGAATTTACTTGGTCTCAATACAAATC
TTCAGCATACAAGTCAAAACTTGGTGATTATAGGCTCGGTCTCTTTGAGAAACAACCTCT
TCTCACCCATAGGTCTAATGTATGAGATTAGTCATGAACTCATGATGCTTGTATGATAAA
AATCATAATTGCAAAAGAAGGAAATGGATAGTGTTTTAGAGTAGCTTTTTTTATTTATTT
TTGGTATGTTTTTTCGTTAGGCACAAAAGCATTAGGCTTTTGTTAGAGTTTGACCCAACC
TACCTTTTGTATCCTTTCTTCTTATTTGTTTGCTTTCTTGGAAATAACAATTGGTGTGTT
TTTCTC

QA 3 848 3 848
DS 



AS 1 3

CO CL4109Contig1 757 3 2 U
GATTGTGTGATCTCTTGGTATGCCCGGATCCAAGGATTATCACCGTGTGTCTAGAAGGAC
TAGAGAACATTCTGAAAGTCGGGGAAGCTGAGAAGGTGACGGGAAACACAGGGGATGCAA
ACGTTTTTGCACAGTTAATCGATGATGCTGAGTGACTAGAGAAGATTGAGAATCTGCAGA
GCCA**ACAACACCGAGATTTATGAGAAGGCAGTGAAGATTCTTGAAACATACTGGCTGG
AAGAGGATGACGAGACTTTACCACCTGGTGATGAGTCTGCTCAGGGATTCCAGTTTGGGG
GTAGCGACGCAGCCGCACCTCCAGGTGGATTCAACTTCAAGTGAAGGAGCTAAGGCATGA
TGATTGAAGAGTCGGAAGGAGGTCAAGAGTCTTGGGGGCACTGGTTTTAAATGGGTCTGA
TTAGAGTCTGGTCTCGTGTTTAAAAAGTCAGATGGGGTGCCTTGGTCAGTCCTGATCTTG
TCTGGTCAGATGGGTGGGATTGAGTCATAAAATAAGCTTTTGTTGGGGAGTTGGGTAGGA
GTCAATGGGAGGGGAACATTTTATGAACTCAGATGGGAAAATTTGGGTGGGAATGTTTTT
TTAATAGTTTTGTTGTTTGATGAGTCTCTGAGGCCTTTGTTACATTTGTTAGTTACTACA
CAACAGTCATTGCAAAGTCAAAAAA*CATAAAAAAGTTGGTCAAACTTTATTTGGTCTTA
TTAGTGGCAAAGAAAGCCACTTGGTGCGTCTCTTTAT


BQ
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AF RS1FR50JQ C 1
AF RS1FR50TF U 1
AF RS1CI64TF U 40
BS 1 695 RS1FR50TF
BS 696 757 RS1CI64TF

RD RS1FR50JQ 703 0 0
GATTGTGTGATCTCTTGGTATGCCCGGATCCAAGGATTATCACCGTGTGTCTAGAAGGAC
TAGAGAACATTCTGAAAGTCGGGGAAGCTGAGAAGGTGACGGGAAACACAGGGGATGCAA
ACGTTTTTGCACAGTTAATCGATGATGCTGAGTGACTAGAGAAGATTGAGAATCTGCAGA
GCCA**ACAACACCGAGATTTATGAGAAGGCAGTGAAGATTCTTGAAACATACTGGCTGG
AAGAGGATGACGAGACTTTACCACCTGGTGATGAGTCTGCTCAGGGATTCCAGTTTGGGG
GTAGCGACGCAGCCGCACCTCCAGGTGGATTCAACTTCAAGTGAAGGAGCTAAGGCATGA
TGATTGAAGAGTCGGAAGGAGGTCAAGAGTCTTGGGGGCACTGGTTTTAAATGGGTCTGA
TTAGAGTCTGGTCTCGTGTTTAAAAAGTCAGATGGGGTGCCTTGGTCAGTCCTGATCTTG
TCTGGTCAGATGGGTGGGATTGAGTCATAAAATAAGCTTTTGTTGGGGAGTTGGGTAGGA
GTCAATGGGAGGGGAACATTTTATGAACTCAGATGGGAAAATTTGGGTGGGAATGTTTTT
TTAATAGTTTTGTTGTTTGATGAGTCTCTGAGGCCTTTGTTACATTTGTTAGTTACTACA
CAACAGTCATTGCAAAGTCAAAAAAACATAAAAAA
AGTTGGTC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1FR50TF 702 0 0
GATTGTGTGATCTCTTGGTATGCCCGGATCCAAGGATTATCACCGTGTGTCTAGAAGGAC
TAGAGAACATTCTGAAAGTCGGGGAAGCTGAGAAGGTGACGGGAAACACAGGGGATGCAA
ACGTTTTTGCACAGTTAATCGATGATGCTGAGTGACTAGAGAAGATTGAGAATCTGCAGA
GCCA**ACAACACCGAGATTTATGAGAAGGCAGTGAAGATTCTTGAAACATACTGGCTGG
AAGAGGATGACGAGACTTTACCACCTGGTGATGAGTCTGCTCAGGGATTCCAGTTTGGGG
GTAGCGACGCAGCCGCACCTCCAGGTGGATTCAACTTCAAGTGAAGGAGCTAAGGCATGA
TGATTGAAGAGTCGGAAGGAGGTCAAGAGTCTTGGGGGCACTGGTTTTAAATGGGTCTGA
TTAGAGTCTGGTCTCGTGTTTAAAAAGTCAGATGGGGTGCCTTGGTCAGTCCTGATCTTG
TCTGGTCAGATGGGTGGGATTGAGTCATAAAATAAGCTTTTGTTGGGGAGTTGGGTAGGA
GTCAATGGGAGGGGAACATTTTATGAACTCAGATGGGAAAATTTGGGTGGGAATGTTTTT
TTAATAGTTTTGTTGTTTGATGAGTCTCTGAGGCCTTTGTTACATTTGTTAGTTACTACA
CAACAGTCATTGCAAAGTCAAAAAA*CATAAAAAA
GTTGGTC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1CI64TF 718 0 0
G
CACCGTGTGTCTAGAAGGACTAGAGAACATTCTGAAAGTCGGGGAAGCTGAGAAGGTGAC
GGGAAACACAGGGGATGCAAACGTTTTTGCACAGTTAATCGATGATGCTGAGGGACTAGA
GAAGATTGAGAATCTGCAGAGCCATGACAACACCGAGATTTATGAGAAGGCAGTGAAGAT
TCTTGAAACATACTGGCTGGAAGAGGATGACGAGACTTTACCACCTGGTGATGAGTCTGC
TCAGGGATTCCAGTTTGGGGGTAGCGACGCAGCCGCACCTCCAGGTGGATTCAACTTCAA
GTGAAGGAGCTAAGGCATGATGATTGAAGAGTCGGAAGGAGGTCAAGAGTCTTGGGGGCA
CTGGTTTTAAATGGGTCTGATTAGAGTCTGGTCTTGTGTTTAAAAAGTCAGATGGGGTGC
CTTGGTCAATCCTGATCTTGTCTGGTCAGATGGGTGGGATTGAGTCATAAAATAAGCTTT
TGTTGGGGAGTTGGGTAGGAGTCAATGGGAGGGGAACATTTTATGAACTCAGATGGGAAA
ATTTGGGTGGGAATGTTTTTTTAATAGTTTTGTTGTTTGATGGGTCTCTGAGGCCTTTGT
TACATTTGTTAGTTACTACACAACAGTCATTGCAAAGTCAAAAAA*CATAAAAAAGTTGG
TCAAACTTTATTTGGTCTTATTAGTGGCAAAGAAAGCCACTTGGTGCGTCTCTTTAT

QA 2 718 2 718
DS 



AS 1 3

CO CL4110Contig1 674 3 12 U
AAAAAGGTAACTAAATTCCTTTGTCTTCTTAATAGTGAAAGATTCAACAATATCATATTA
CACCAAATATCGAGATGACTTATTTTATTAATTGGATAGGGTTATCTACTTAAATCATCT
TCATTCTCCAAGTGCTTAATCGTGATGTGAATACGGATGAAATCTTTCTTTCCACCAACT
TTCCTTGGAAAGCTCATCAAGGCAGTGAAGGTAAAATTTTCCCTGTGCATGTTCCAAATC
CGACATTGTAACCATCTCCCTTGCATACACCTGAAAAGGTCACTTGATCACCGTCTTGAA
AAAACGTCTGAGTTGTTCCGTTCATTGATAAAGGCTTCTGCCCATTCCAAGTTAGCTCAA
GTAGGCACCCGTATGAATCTGGCTCGGGTCCGCTTATGGTTCCGGTTCCAAGGAGATCAC
CAGGCCTCAAATTGCAACCATTAACTGTATGGTGCGCTAGCTGCTGCGTTATGGTCCAAT
ATAAGTTTTGGAAGTTGCTCTTTGTTATTACAGAAAATTCATCCTTGCCAGAAGGTTTGA
GTTGAACCTCCAAGGAGATATCGTAGTTTACAGACTCCTTCTCAGCCAGATATGGCAATG
GAGGTGGATCCTGCTTGGGAGCTTGACAACTGAAAGGTTCAAGCGCATCTAAGGTAACAA
TCCAAGGGGATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FG71JQ U 9
AF RS1DN56JQ U 1
AF RS1D385JQ U 43
BS 1 163 RS1DN56JQ
BS 164 164 RS1FG71JQ
BS 165 182 RS1DN56JQ
BS 183 183 RS1FG71JQ
BS 184 311 RS1DN56JQ
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BS 392 392 RS1FG71JQ
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BS 415 415 RS1FG71JQ
BS 416 558 RS1DN56JQ
BS 559 674 RS1D385JQ

RD RS1FG71JQ 503 0 0
AG
CTAAATTCCTTTGTCTTCTTAATAGTGAAAGATTCAACAATATCATATTACACCAAATAT
CGAGATGACTTATTTTATTAATTGGATAGGGTTATCTACTTAAATCATCTTCATTCTCCA
AGTGCTTAATCGTGATGTGAATACGGATGAAATCTTTCTTTCCACCAACTTTCCTTGGAA
AGCTCATCAAGGCAGTGAAGGTAAAATTTTCCCTGTGCATGTTCCAAATCCGACATTGTA
ACCATCTCCCTTGCATACACCTGAAAAGGTCACTTGATCACCGTCTTGAAAAAACGTCTG
AGTTGTTCCGTTCATTGATAGAGGCTTCTGCCCATTCCAAGTTAGCTCAAGTAGGCACCC
GTATGAATCTGGCTCGGGTCCGCTTATGGTTCCGGTTCCAAGGAGATCACCAGGCCTCAA
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GAAGTTGCTCTTTGTTATTAC

QA 3 503 3 503
DS 

RD RS1DN56JQ 558 0 0
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CACCAAATATCGAGATGACTTATTTTATTAATTGGATAGGGTTATCTACTTAAATCATCT
TCATTCTCCAAGTGCTTAATCGTGATGTGAATACGGATGAAATTTTTCTTTCCACCAACT
TTTCTTGGAAAGCTCATCAAGGCAGTGAAGGTAAAATTTTCCCTGTGCATGTTCCAAATC
CGACATTGTAACCATCTCCCTTGCATACACCTGAAAAGGTCACTTGATCACCGTCTTGAA
AAAACGTCTGAATTGTTCCGTTCATTGATAAAGGCTTCTGCCCATTCCAAGTTAGCTCAA
GTAGGCACCCGTATGAATCTGGCTCGGGTCCCCTTATGGTTCCGGTTCCAAGGAAATCAC
CAGGCCTCAAATTGCAACCATTAACTGTATGGTGCGCTAGCTGCTGCGTTATGGTCCAAT
ATAAGTTTTGGAAGTTGCTCTTTGTTATTACAGAAAATTCATCCTTGCCAGAAGGTTTGA
GTTGAACCTCCAAGGAGA

QA 1 558 1 558
DS 

RD RS1D385JQ 632 0 0
TTCAACAATATCATATTACACCAAATATCGAGATGACTTATTTTATTAATTGGATAGGGT
TATCTACTTAAATCATCTTCATTCTCCAAGTGCTTAATCGTGATGTGAATACGGATGAAA
TCTTTCTTTCCACCAACTTTCCTTGGAAAGCTCATCAAGGCAGTGAAGGTAAAATTTTCC
CTGTGCATGTTCCAAATCCGACCTTGTAACCATCTCCCTTGCATACACCTGAGAAGGTCA
CTTGATCACCATCTTGAAAAAACGTCTGAGTTGTTCCGTTCATTGATAAAGGCTTCTGTC
CATTCCAAGTTAGCTCAAGTAGGCACCCGTACGAATCTGGCTCGGGTCCGCTTATGGTTC
CGGTTCCAAGGAGATCACCAGGCCTCAAATTACAACCATTAACTGTATGGTGCGATAGCT
GCTGCGTTATGGTCCAATATAAGTTTTGGAAGTTGCTCTTTGTTATTACAGAAGATTCAT
CCTTGCCAGAAGGTTTGAGTTGAACCTCCAAGGAGATATCGTAGTTTACAGACTCCTTCT
CAGCCAGATATGGCAATGGAGGTGGATCCTGCTTGGGAGCTTGACAACTGAAAGGTTCAA
GCGCATCTAAGGTAACAATCCAAGGGGATACC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 2

CO CL4111Contig1 952 2 4 U
GGCTTCTCCGCGACATTAGCAAAGTTTCGAGAAAGAAAAAAAGATGAATTTGAACAACGT
GAAAGTGCCGAAGGTGCCAGGAGGTGGTGCAGTATCTGCGTTGCTTAAGATTGGGATTAT
CGGTGGGCTTGGTCCCTACGGTGCCACACACAGTCTCTACAATGTCGACGGAGGTCATCG
AGCCATCATGTTCAACCGTTTAGTCGGTGTTAAAGATAAGGTTTACCCTGAGGGTACACA
CCTTATGGTCCCTTGGTTCGAAAGGCCTGTCATCTATGACGTTCGTGCACGACCTTACCT
TGTTGAGAGTACTTCCGGAAGCCGTGATCTCCAGATGGTGAAAATTGGGCTGAGGGTTCT
CACGCGTCCCATGGCAGACCAGTTACCCGAGATCTACAGAACACTTGGAGAGAACTACAG
CGAGAGAGTTCTGCCTTCTATAATCCACGAGACTTTGAAAGCTGTTGTTGCTCAGTACAA
TGCAAGCCAGCTTATCACTCAGAGAGAGGCGGTCAGTAGGGAGATCAGGAAGATTCTGAC
ACAACGTGCAACAAACTTCAACATCGCGCTTGACGATGTGTCCATCACTACCTTGACTTT
TGGGAAGGAGTTCACAGCTGCCATTGAAGCAAAGCAGGTGGCTGCTCAAGAGGCTGAGAG
GGCTAAGTTCATCGTTGAGAAGGCCGAACAAGACAAAAGGAGTGCAGTTATCCGCGCTCA
GGGAGAAGCCAAGAGTGCTCAGCTCATTGGTCAAGCAATCGCAAACAACCAAGCGTTCAT
AACGCTCAGAAGATCGAGGCGGCAAGAGAGATTGCTCAGACCATAGCTCACTCGGCCACA
AGTGTACCTGAGCTCTGACGATCTTTGCTAACCTACAGAGATGAATTTGGATGTGGATCC
AAGTAGAGAGAGCCTTCTTAAGTAACACATATGTGGTGGTTTGTGTCAGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C894TF U 1
AF RS1C065TF U 163
BS 1 422 RS1C894TF
BS 423 423 RS1C065TF
BS 424 634 RS1C894TF
BS 635 952 RS1C065TF

RD RS1C894TF 634 0 0
GGCTTCTCCGCGACATTAGCAAAGTTTCGAGAAAGAAAAAAAGATGAATTTGAACAACGT
GAAAGTGCCGAAGGTGCCAGGAGGTGGTGCAGTATCTGCGTTGCTTAAGATTGGGATTAT
CGGTGGGCTTGGTCCCTACGGTGCCACACACAGTCTCTACAATGTCGACGGAGGTCATCG
AGCCATCATGTTCAACCGTTTAGTCGGTGTTAAAGATAAGGTTTACCCTGAGGGTACACA
CCTTATGGTCCCTTGGTTCGAAAGGCCTGTCATCTATGACGTTCGTGCACGACCTTACCT
TGTTGAGAGTACTTCCGGAAGCCGTGATCTCCAGATGGTGAAAATTGGGCTGAGGGTTCT
CACGCGTCCCATGGCAGACCAGTTACCCGAGATCTACAGAACACTTGGAGAGAACTACAG
CGGGAGAGTTCTGCCTTCTATAATCCACGAGACTTTGAAAGCTGTTGTTGCTCAGTACAA
TGCAAGCCAGCTTATCACTCAGAGAGAGGCGGTCAGTAGGGAGATCAGGAAGATTCTGAC
ACAACGTGCAACAAACTTCAACATCGCGCTTGACGATGTGTCCATCACTACCTTGACTTT
TGGGAAGGAGTTCACAGCTGCCATTGAAGCAAAG

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1C065TF 790 0 0
G
GTCGACGGAGGTCATCGAGCCATCATGTTCAACCGTTTAGTCGGTGTTAAAGATAAGGTT
TACCCTGAGGGTACACACCTTATGGTTCCTTGGTTCGAGAGGCCTGTCATCTATGACGTT
CGTGCACGACCTTACCTTGTTGAGAGTACTTCCGGAAGCCGTGATCTCCAGATGGTGAAA
ATTGGGCTGAGGGTTCTCACGCGTCCCATGGCAGACCAGTTACCTGAGATCTACAGAACA
CTTGGAGAGAACTACAGCGAGAGAGTTCTGCCTTCTATAATCCACGAGACTTTGAAAGCT
GTTGTTGCTCAGTACAATGCAAGCCAGCTTATCACTCAGAGAGAGGCGGTCAGTAGGGAG
ATCAGGAAGATTCTGACACAACGTGCAACAAACTTCAACATCGCGCTTGACGATGTGTCC
ATCACTACCTTGACTTTTGGGAAGGAGTTCACAGCTGCCATTGAAGCAAAGCAGGTGGCT
GCTCAAGAGGCTGAGAGGGCTAAGTTCATCGTTGAGAAGGCCGAACAAGACAAAAGGAGT
GCAGTTATCCGCGCTCAGGGAGAAGCCAAGAGTGCTCAGCTCATTGGTCAAGCAATCGCA
AACAACCAAGCGTTCATAACGCTCAGAAGATCGAGGCGGCAAGAGAGATTGCTCAGACCA
TAGCTCACTCGGCCACAAGTGTACCTGAGCTCTGACGATCTTTGCTAACCTACAGAGATG
AATTTGGATGTGGATCCAAGTAGAGAGAGCCTTCTTAAGTAACACATATGTGGTGGTTTG
TGTCAGTCT

QA 2 790 2 790
DS 



AS 1 3

CO CL4112Contig1 902 3 3 U
GGAGAGGCATTTTCATTGGCGTATATAGAATGGGAAGAGAAGGACAGAGAGGAAGAATGG
AACATTTGGCTTCTATTGATTGATTTATCAATCAACTCTTCTTCTAAGATCTCGTACCCC
TCTCTCTCTTCTTCTTCTCTCTGTTCGAGTCTGTGATGTTGTGAGGTCTTCGTATCATCA
AACTTAGATCAGCTGCGATCCCACCAAAAAGCAAAGAAGCAAAAGGAGGTATATAGACTT
TTTCTTGCCCTTGTTAAGTCATTTGGTGAGAGGAGAGATTGGCTCTTTGGAGATATATAT
ACATGGCAGAGGTGAAGAAGGATCACTTAGAGATTAAGTTTCCGTCTAAACGATGGTTCA
GATATCGGTCCTAAATCGTTTCCAGATGCTACAACCGTTGCTGCATTGAAAGAAACTGTG
GTTGCTCAATGGCCTCGAGAGAAGGAGAATGGGCCAAAGACAGTGAAAGATGTGAAACTG
ATAAGCGCGGGTAGAATATTGGAGAACAACAAGACGGTTGGAGACTGCAGGAGTCCTGTC
TCCAATCTCTCAGATGCTGTCACCACTATGCATGTCCTCATTCAACCTCAGCTTACTGAA
AA***AGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGCCTAAAGGTGATCTGAACCAGAACAAATGT
GTCTGCTTATGTTTTGGACGCCGGTTATGAAAGAAGACCGAGTAGAGTTCAAAGCTTTGG
CAGATTCACATTCTCTTCTTCAGTCTCTTTGTGTGCGTGTGTGTGGCGGCAACATTGGCT
TTTTGGTCGCTTGAGATTTGGTTTCTAATGTAATTCTGATTCTTAACACAGTGGAATCAT
AGATAACATTTCAAATTTGCAGACTAGAGTGAATCTTTAAGAAATTTTACAGTGGTTTTA
TG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CU21TF U 1
AF RS1GP24TF U 51
AF RS1CU21JQ C 133
BS 1 753 RS1CU21TF
BS 754 779 RS1GP24TF
BS 780 902 RS1CU21JQ

RD RS1CU21TF 753 0 0
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ATAAGCGCGGGTAGAATATTGGAGAACAACAAGACGGTTGGAGACTGCAGGAGTCCTGTC
TCCAATCTCTCAGATGCTGTCACCACTATGCATGTCCTCATTCAACCTCAGCTTACTGAA
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CAGATTCACATTCTCTTCTTCAGTCTCTTTGTG

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1GP24TF 729 0 0
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CGTATCATCAGACTTAGATCAGCTGCGATCCCACCAAAAAGCAAAGAAGCAAAAGGAGGT
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AGATATATATACATGGCAGAGGTGAAGAAGGATCACTTAGAGATTAAGTT*CCGTCTAAA
CGATGGTTCAGATATCGGTCCTAAATCGTTTCCAGATGCTACAGCCGTTGCTGCATTGAA
AGAAACTGTGGTTGCTCAATGGCCTCGAGAGAAGGAGAATGGGCCAAAGACAGTGAAAGA
TGTGAAACTGATAAGCGCGGGTAGAATATTGGAGAACAACAAGACGGTTGGAGACTGCAG
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GCTTACTGAAAAAGCAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGCCTAAAGGTGATCTGAACCA
GAACAAATGTGTCTGCTTATGTTTTGGACGCCGGTTATGAAAGAAGACCGAGTAGAGTTC
AAAGCTTTGGCAGATTCACATTCTCTTCTTCAGTCTCTTTGTGTGCGTGTGTGTGGCGGC
AACATTGGC

QA 1 729 1 729
DS 

RD RS1CU21JQ 770 0 0
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CTGCGATCCCACCAAAAAGCAAAGAAGCAAAAGGAGGTATATAGACTTTTTCTTGCCCTT
GTTAAGTCATTTGGTGAGAGGAGAGATTGGCTCTTTGGAGATATATATACATGGCAGAGG
TGAAGAAGGATCACTTAGAGATTAAGTTTCCGTCTAAACGATGGTTCAGATATCGGTCCT
AAATCGTTTCCAGATGCTACAACCGTTGCTGCATTGAAAGAAACTGTGGTTGCTCAATGG
CCTCGAGAGAAGGAGAATGGGCCAAAGACAGTGAAAGATGTGAAACTGATAAGCGCGGGT
AGAATATTGGAGAACAACAAGACGGTTGGAGACTGCAGGAGTCCTGTCTCCAATCTCTCA
GATGCTGTCACCACTATGCATGTCCTCATTCAACCTCAGCTTACTGAAAA***AGAAAAG
AAGAAGAAGAAGAAGAAGCCTAAAGGTGATCTGAACCAGAACAAATGTGTCTGCTTATGT
TTTGGACGCCGGTTATGAAAGAAGACCGAGTAGAGTTCAAAGCTTTGGCAGATTCACATT
CTCTTCTTCAGTCTCTTTGTGTGCGTGTGTGTGGCGGCAACATTGGCTTTTTGGTCGCTT
GAGATTTGGTTTCTAATGTAATTCTGATTCTTAACACAGTGGAATCATAGATAACATTTC
AAATTTGCAGACTAGAGTGAATCTTTAAGAAATTTTACAGTGGTTTTATG

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 3

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CTTACTGGATCCTCTAGGAAAACTTGTGCAAAACTCAGTGGATGCAAAATCGTTTCTGGG
ACAACATGTCCCCAGGGATATCTACATGAAATTATCGAAAACTCTGGTGATGCTGTCAAT
GAATACTGCAAGTTGGGGTGTGCATCCTCTGTGTGTGGTGGCTTAACCACTCTCCAGGAC
TCCGATGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCAACGACACATGTGCTTAT
TTCTGCACCAAGGGCTCAGCTAAAGCAGTTGAAACTGCCTAACAAGCATATCCACGATCT
ATGTGTTGTTGTTCTCCGTGTTTTTAATTATTGTCGTGTATGTGACAAAATGCTAGACTC
TTATACAATTTCCTGGTAGTCTATCTGACGTAGAAAGTCATCATCGATCCCTAGATTGTC
TATCCCTTCTACTTGCTATATCTAAATAAAGAATAAAGTTTCCTTCTCG


BQ
10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RS1D927TF U 4
AF RS1F013TF U 1
AF RS1D927JQ C 4
BS 1 213 RS1F013TF
BS 214 214 RS1D927TF
BS 215 403 RS1F013TF
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BS 637 637 RS1D927JQ
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RD RS1D927TF 569 0 0
GG
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TTGTTGTTCTCCGTGTTTTTAATTATTGTCGTGTATGTGACAAAATGCTAGACTCTTATA
CAATTTCCTGGTAGTCTATCTGACGT
C

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DS 

RD RS1F013TF 649 0 0
GGACCATTACAAGTTTAAGTGCTCTCTCTACGTACCAAATAAGTAATCAGTCTAAAGATG
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GTCGAAGGAAAGAGTTGTTGCCCGGGCACCACTGCCAGAAACGCATATAATATATGCCGT
CTTACTGGATCCTCTAGGAAAACTTGTGCAAAAATCAGTGGATGCAAAATCGTTTCTGGG
ACAACATGTCCCCAGGGATATCTACATGAAATTATCGAAAACTCTGGTGATGCTGTCAAT
GAATACTGCAAGTTGGGGTGTGCATCCTCTGTGTGTGGTGGCTTAACCACTCTCCAGGAC
TCCGATGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCGACACATGTGCTTAT
TTCTGCACCAAGGGCTCAGCTAAAGCAGTTGAAACTGCCTAACAAGCATATCCACGATCT
ATGTGTTGTTGTTCTCCTTGTTTTTAATAATTGTAGTGTATGTGACAAAATGCTAGACTC
TTATACAATTTCCAGGTAGTCTATCTGACGTAGAAAGTCATCATCGATCCCTAGATTGTC
TATCCCTTCTACTTGCTATATCTAAATAAAGAATAATGTTTCCTTCTCG

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1D927JQ 641 0 0
GG
ATTACAAGTTTAAGTGCTCTCTCTACGTACCAAATAAGTAATCAGTCTAAAGATGGAAGG
CAAAAATGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTCTTGTCATGGCGCAGAATCAAGTCGA
AGGAAAGAGTTGTTGCCCGGGCACCACTGCCAGAAACGCATATAATATATGCCGTCTTAC
TGGATCCTCTAGGAAAACTTGTGCAAAACTCAGTGGATGCAAAATCGTTTCTGGGACAAC
ATGTCCCCAGGGATATCTACATGAAATTATCGAAAACTCTGGTGATGCTGTCAATGAATA
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TGCAAGTGAAATTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCAACGACACATGTGCTTATTTCTG
CACCAAGGGCTCAGCTAAAGCAGTTGAAACTGCCTAACAAGCATATCCACGATCTATGTG
TTGTTGTTCTCCGTGTTTTTAATTATTGTCGTGTATGTGACAAAATGCTAGACTCTTATA
CAATTTCCTGGTAGTCTATCTGACGTCGAAGGTCATCATCGATCCCTAGATTGTCTATCC
CTTCTACTTGCTATATCTAAATAAAGAATAAAGTTTCCT

QA 3 641 3 641
DS 



AS 1 2

CO CL4114Contig1 1182 2 6 U
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TTAAAGCGGAATCTCCTTTGGTTCCTCGTTTCTTCTTCCGATCTCATCTTCTTCTTCTTC
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TCGCCATCCAAGCCGTTCTCTCCCTTTACGCCACCCTCCGTCTTGACCTCGCTGGTCGTG
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ACGGGCAAGTGATCACCATCGGTGCCGAGAGATTCAGGTGCCCAGAGGTTCTGTTCCAGC
CTTCGTTCGTGGGAATGGAAGCTGCTGGAATCCACGAGACGACCTACAACTCGATCATGA
AGTGTGACGTGGATATCAGGAAGGACTTGTACGGTAACATTGTGCTCAGTGGTGGAACCA
CTATGTTCTCGGGTATTGCAGACCGTATGAGCAAAGAGATCACTGCACTTGCACCAAGCA
GCATGAAGATTAAGGTCGTTGCACCTCCGGAGAGGAAGTACAGTGTCTGGATCGGTGGTT
CCATTCTTGCTTCCCTCAGCACATTCCAGCAGATGTGGATCTCCAAGGCTGAGTATGATG
AGGCAGGTCCAGGGATTGTCCACAGAAAATGCTTCTAAGCTGTATCAAGGAGAAAGCTAA
AAGATGGGTTTTATGATTTTTTTTTATATTTGCTTTCTCCATTTGTTTGTTCCATTTCCC
TTTGATTTCGTTTATGTGTGTGACAAACTCTCTGGGTTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H440TF U 1
AF RS1GE64TF U 542
BS 1 583 RS1H440TF
BS 584 584 RS1GE64TF
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BS 694 1182 RS1GE64TF

RD RS1H440TF 701 0 0
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TTAAAGCGGAATCTCCTTTGGTTCCTCGTTTCTTCTTCCGATCTCATCTTCTTCTTCTTC
CGATCTTTCTCCTTCAAAGCTTATTAAAAAATGGCTGAGGCTGATGATATTCAACCAATC
GTCTGTGACAATGGTACCGGAATGGTCAAGGCTGGTTTCGCCGGTGATGATGCTCCCAGG
GCTGTATTCCCGAGTGTTGTTGGTAGGCCAAGATCTGGCATCACACTTTCTACAATGAGC
TCCGTATTGCTCCTGAAGAGCACCCTGTTCTTCTTACCGAGGCTCCTCTTAACCCTAAGG
CCAACAGAGAGAAGATGACCCAGATCATGTTCGAAACTTTCAACTCTCCGGCTATGTATG
TCGCCATCCAAGCCGTTCTCTCCCTTTACGCCACCCTCCGTCTTGACCTCGCTGGTCGTG
ACCTTACTGATTACCTCATGAAGATCCTTACCGAGAGAGGTTACATGTTCACCACAACAG
CAGAGCGGGAAATTGTAAGAGACATCAAGGAGAAGCTTTCCTTTGTCGCTGTCGACTACG
AGCAGGAGATGGAGACCTCCAAAACCAGCTCTTCCATCGAGAAGAACTACGAGTTACCCG
ACGGGCAAGTGATCACCATCGGTGCCGAGAGAT
CAGTGCCC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RS1GE64TF 641 0 0
G
GAGCGGGAAATTGTAAGAGACATCAAGGGGAAGCTTTCCTTCGTCGCTGTCGACTACGAG
CAGGAGATGGAGACCTCCAAAACCAGCTCCTCCATCGAGAAGAACTACGAGTTACCCGAC
GGGCAAGTGATCACCATCGGTGCCGAGAGATTCAGGTGCCCAGAGGTTCTGTTCCAGCCT
TCGTTCGTGGGAATGGAAGCTGCTGGAATCCACGAGACGACCTACAACTCGATCATGAAG
TGTGACGTGGATATCAGGAAGGACTTGTACGGTAACATTGTGCTCAGTGGTGGAACCACT
ATGTTCTCGGGTATTGCAGACCGTATGAGCAAAGAGATCACTGCACTTGCACCAAGCAGC
ATGAAGATTAAGGTCGTTGCACCTCCGGAGAGGAAGTACAGTGTCTGGATCGGTGGTTCC
ATTCTTGCTTCCCTCAGCACATTCCAGCAGATGTGGATCTCCAAGGCTGAGTATGATGAG
GCAGGTCCAGGGATTGTCCACAGAAAATGCTTCTAAGCTGTATCAAGGAGAAAGCTAAAA
GATGGGTTTTATGATTTTTTTTTATATTTGCTTTCTCCATTTGTTTGTTCCATTTCCCTT
TGATTTCGTTTATGTGTGTGACAAACTCTCTGGGTTTTAC

QA 2 641 2 641
DS 



AS 1 2

CO CL4115Contig1 721 2 2 U
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GATCGAAAGAGTTCCAGTTCCAGAGCACGCAGTCCAAAGACCAGTGAGTTCTCCTCGTGA
CCTGAGAACGAGGAAATTCGACCAAAAGGACGTGAGAAGTGTAAGCGACGTTGCCACCAG
ATCCGAAACCCAGAGGCGAAACTGGCGTTATAATTATGATGTCAAGAGCACAAGACAGCA
GCAACCGCAGGCTCAGGAGAAGACGAGGCATCCATCACCAGAGACATGGCGAAAACCAGT
TCCACAGAAACCGGAGTCACCAGACGGAACAGGGCACCGTCCCGGGAAAGCAGCATCTCC
TCTTGAGCTAGCTCAAGCCTACTCTGACCCTAAATCCGGAACAGGAAGCAACAGTTTTAA
CATGAGCCGCAACAACCAAACGCAGCAACCATTCTCTCGGTTGGTAGGATCGACAACAAC
GAAACCAAAGCATATCAATGGCTACTGAGAGATATTGTTCGTTTGTTCTTTATTCGGATT
GTTTTTAGTTCCGACTAATTGGGTCTTTTAAGTTCTCGAGCACGTCTCATGATATACTTC
TTTGTGGGAATGGTATGGGAGATTTGAATGTGATATGGTTTCCCTTTAAGAATGGGGTTG
GATTACATAACCCAACATTTGTGTCTTTTTTCTTTGGTTATACATTTTTTTTCTAACCAC
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 

AF RS1FP11TF U 1
AF RS1FP11JQ C 61
BS 1 621 RS1FP11TF
BS 622 721 RS1FP11JQ

RD RS1FP11TF 622 0 0
GATTGATGAGACTGAGCATCAAAAATTGGAGCAACAGTTAGAAAGGACTGTCCTCAATCC
GATCGAAAGAGTTCCAGTTCCAGAGCACGCAGTCCAAAGACCAGTGAGTTCTCCTCGTGA
CCTGAGAACGAGGAAATTCGACCAAAAGGACGTGAGAAGTGTAAGCGACGTTGCCACCAG
ATCCGAAACCCAGAGGCGAAACTGGCGTTATAATTATGATGTCAAGAGCACAAGACAGCA
GCAACCGCAGGCTCAGGAGAAGACGAGGCATCCATCACCAGAGACATGGCGAAAACCAGT
TCCACAGAAACCGGAGTCACCAGACGGAACAGGGCACCGTCCCGGGAAAGCAGCATCTCC
TCTTGAGCTAGCTCAAGCCTACTCTGACCCTAAATCCGGAACAGGAAGCAACAGTTTTAA
CATGAGCCGCAACAACCAAACGCAGCAACCATTCTCTCGGTTGGTAGGATCGACAACAAC
GAAACCAAAGCATATCAATGGCTACTGAGAGATATTGTTCGTTTGTTCTTTATTCGGATT
GTTTTTAGTTCCGACTAATTGGGTCTTTTAAGTTCTCGAGCACGTCTCATGATATACTTC
TTTGTGGGAATGGTATGGGAG
A

QA 1 621 1 621
DS 

RD RS1FP11JQ 661 0 0
GATCGAAAG
AGTTCCAGTTCCAGAGCACGCAGTCCAAAGACCAGTGAGTTCTCCTCGTGACCTGAGAAC
GAGGAAATTCGACCAAAAGGACGTGAGAAGTGTAAGCGACGTTGCCACCAGATCCGAAAC
CCAGAGGCGAAACTGGCGTTATAATTATGATGTCAAGAGCACAAGACAGCAGCAACCGCA
GGCTCAGGAGAAGACGAGGCATCCATCACCAGAGACATGGCGAAAACCAGTTCCACAGAA
ACCGGAGTCACCAGACGGAACAGGGCACCGTCCCGGGAAAGCAGCATTTCCTCTTGAGCT
AGCTCAAGCCTACTTTGACCCTAAATCCGGAACAGGAAGCAACAGTTTTAACATGAGCCG
CAACAACCAAACGCAGCAACCATTTTTTCGGTTGGTAGGATCGACAACAACGAAACCAAA
GCATATCAATGGCTACTGAGAGATATTGTTCGTTTGTTCTTTATTCGGATTGTTTTTAGT
TCCGACTAATTGGGTTTTTTAAGTTCTCGAGCACGTCTCATGATATACTTCTTTGTGGGA
ATGGTATGGGAGATTTGAATGTGATATGGTTTCCCTTTAAGAATGGGGTTGGATTACATA
ACCCAACATTTGTGTCTTTTTTCTTTGGTTATACATTTTTTTTCTAACCACG

QA 10 661 10 661
DS 



AS 1 2

CO CL4116Contig1 899 2 6 U
ACCAGAAACATAATCATAGGAAAGCAAAACTGAATAAGAAACAGTAAACAAGAAAGTTTT
AGAGTACACAACGCAAAGACGTGCAAGGAAAATTAACCGCAAACCGGTTTCACAGATAAA
TGAAAAGAACACTCTGACCAGGTGAAACATTGAGACGCCTTCAGAGGCTTTACACCTTGC
GGACTTGAATGTTATGAGTCGATTGAGATCTCCAGATTGGTTGTGACCCGCTCTGTACAA
TCGCTATTTCCTCTCCCTTCTTCACCATTCCTTGTTTCAGCAGTGTAGCCAAAGCATTAG
CGAAAGTGTCTTCTGCATCATCTGAGAACTCCATATATATGGGACATACACCTTGATACA
AGGCTAACCTTTGCTGTATTTTTTTCTCGTTTGTGAAGGCATAGATTGTGCCAGAAGGGC
GATAGTGACTTAGCAGTATGGCCATGAAACCAGTTCTGGTGAAGACAACAGTTGAAGTTC
CAAGCGCGTTTGACATCATGGTTGCATGGTATGCAAACATCTCACTCATATGGTTCTTAA
AGGCTTGGTCAAGATTAGCTGGCATTTCACTACTAGTAGTAATGGTGGCTTCTGTTCGCA
GTGCAACTGTATGCATCACTCCAGCAGCTTTCAATGGGAATTTTCCGTGGGCAGTCTCTC
CTGAAAGCATTACTGCATCAGCACCTTCTCTAACGGCAATAGCAATGTCGGAAACCTCCG
CCCGGGTTGGAGTTGGATGAACTATCATACTCTCAAGCATGTTAGTCGCAACGATAACAG
CTTTTCCCATGCTACGGCATAGGTTAATGATCTTCCCCTGAAGTATGGGTACTTCTTCAA
TAGGAAGCTCTGCACCAAGATCACTTCTTGCAACCATTGCCCCATCTGATGCGGTGATC


BQ
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AGAGTACACAACGCAAAGACGTGCAAGGAAAATTAACCGCAAACCGGTTTCACAGATAAA
TGAAAAGAACACTCTGACCAGGTGAAACATTGAGACGCCTTCAGAGGCTTTACACCTTGC
GGACTTGAATGTTATGAGTCGATTGAGATCTCCAGATTGGTTGTGACCCGCTCTGTACAA
TCGCTATTTCCTCTCCCTTCTTCACCATTCCTTGTTTCAGCAGTGTAGCCAAAGCATTAG
CGAAAGTGTCTTCTGCATCATCTGAGAACTCCATATATATGGGACATACACCTTGATACA
AGGCTAACCTTTGCTGTATTTTTTTCTCGTTTGTGAAGGCATAGATTGTGCCAGAAGGGC
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CAAGTGTGTTTGACATCATGGTTGCATGGTATGCAAACATCTCACTCATATGGTTCTTAA
AGGCTTGG
CCA

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ATTTTTTTCTCGTTTGTGAAGGCATAGATTGTGCCAGAAGGGCGATAGTGACTTAGCAGT
ATGGCCATGAAACCAGTTCTGGTGAAGACAACAGTTGAAGTTCCAAGCGCGTTTGACATC
ATGGTTGCATGGTATGCAAACATCTCACTCATATGGTTCTTAAAGGCTTGGTCAAGATTA
GCTGGCATTTCACTACTAGTAGTAATGGTGGCTTCTGTTCGCAGTGCAACTGTATGCATC
ACTCCAGCAGCTTTCAATGGGAATTTTCCGTGGGCAGTCTCTCCTGAAAGCATTACTGCA
TCAGCACCTTCTCTAACGGCAATAGCAATGTCGGAAACCTCCGCCCGGGTTGGAGTTGGA
TGAACTATCATACTCTCAAGCATGTTAGTCGCAACGATAACAGCTTTTCCCATGCTACGG
CATAGGTTAATGATCTTCCCCTGAAGTATGGGTACTTCTTCAATAGGAAGCTCTGCACCA
AGATCACTTCTTGCAACCATTGCCCCATCTGATGCGGTGATC

QA 1 582 1 582
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGGCGGTTGACATCTCACAGCGAACGGGTATGCATCTTTTAACTGTTACAAGTTCCTCTG
GCTCTAATGCCGAGAAACCGCCACAGAAGAAGAAGAAAGTGCATGGTCCGAGGCCATCTT
CGCTCTTGCTACTTCCAGATGAATTATCTCTGAACTGTTTAGCACTCGTGCCTCGATGTT
ACCACCCGTCGGTCTCACTGGTGTCCACAACCTTGAGGCGTCTCATCGCTTCGCCGCAGA
TTTACGTAGAAAGGTCACTACTTCGCCGGACGGAGCACGTCCTTTACGTTGCGCTTAGAT
CTGAAGTTACAGAAACCCCTCGATGGTACACTCTCAATCTCAAACCTTTCGGACAACAAC
AAGCGTCTGGAGTAGTTAAACGCAGTCTGGTTCCTGTCCCGTCGTTCCCTTCGGTTCCTC
CCTGGGGAATGTCTATCGTCACCGTCGGTTCAGAGATTTATGTTATCGGTGGATGCGTCG
ACGAAAAGTTCGTCTCCACTGGGTTTGTCATCGACTGTCCATCGTACACGTGTCGCTTCC
TCCCTAGCATGAAGCAAGAACGCGGCTGCGCCGCCGCAGGAATCGTGGACGGGAAGTTAT
ATGTGATAGGAGGGTGTAACCCTCGGTCTTTGAACTGGGTGGAGGCTTTTGATCTCGAGA
CTCAAACTTGGGAGACTGTGAAAGGGTGAGTACAACAACGTGGAGGTGTACGAGAAAATG
ATTAGGAGTTTCGTGATGGGCGATAAGATCTGCGTCATGGATCGAAAGAGTAGCTTTGTT
TACGATCCCAAAGAAGGAATTTTTGAGAAGGACCCGTTGTTGAACAAACAGTGGAGTGTG
GGTTCTTGCGTCATTGATGACAAGTTGTACTCGTTTGGTCGGAAGAATGCGTTTGGTCGG
AAGAATACTATATGGGAGTTTGATACTGTCGGGAGGGCTTGGAGGGAAGTGAAGGGTCTT
AAAGATCTTCCTGATAAGGCTGAAGGTTCCAAAATGGTGAATTATGGTGGCAAACTTGTG
ATTTTGTGTAACCTTCAAGAGCGTTCGACGGAGATTTGGTATACAGAGATTGAATTGGAA
AGGAGGGAAGGAGGAGAGGTTTGGGGGACCATCTTGTGTTCTAGTCTTGTGCTGGCTTTG
GAAGTTCCATATGTTGTCTTACGTTCTCTAGCTGTGTCATATTGAAAACGTAATGGAGCA
GCTTGGTCTGGTCTGCCGAGATGAAAATCTAAGGGCTGTAAACTATTGGATGTTGAATTT
TCTTGCCCTTGTTTCTTTCTGGAAGTTGTTATATTTATTTATGAATAGCTTTGT


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AF RS1A447TF U 1
AF RS1A447JQ C 548
BS 1 723 RS1A447TF
BS 724 1314 RS1A447JQ

RD RS1A447TF 723 0 0
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GCTCTAATGCCGAGAAACCGCCACAGAAGAAGAAGAAAGTGCATGGTCCGAGGCCATCTT
CGCTCTTGCTACTTCCAGATGAATTATCTCTGAACTGTTTAGCACTCGTGCCTCGATGTT
ACCACCCGTCGGTCTCACTGGTGTCCACAACCTTGAGGCGTCTCATCGCTTCGCCGCAGA
TTTACGTAGAAAGGTCACTACTTCGCCGGACGGAGCACGTCCTTTACGTTGCGCTTAGAT
CTGAAGTTACAGAAACCCCTCGATGGTACACTCTCAATCTCAAACCTTTCGGACAACAAC
AAGCGTCTGGAGTAGTTAAACGCAGTCTGGTTCCTGTCCCGTCGTTCCCTTCGGTTCCTC
CCTGGGGAATGTCTATCGTCACCGTCGGTTCAGAGATTTATGTTATCGGTGGATGCGTCG
ACGAAAAGTTCGTCTCCACTGGGTTTGTCATCGACTGTCCATCGTACACGTGTCGCTTCC
TCCCTAGCATGAAGCAAGAACGCGGCTGCGCCGCCGCAGGAATCGTGGACGGGAAGTTAT
ATGTGATAGGAGGGTGTAACCCTCGGTCTTTGAACTGGGTGGAGGCTTTTGATCTCGAGA
CTCAAACTTGGGAGACTGTGAAAGGGTGAGTACAACAACGTGGAGGTGTACGAGAAAATG
ATT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1A447JQ 767 0 0
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AGGAGGGTGTAACCCTCGGTCTTTGAACTGGGTGGAGGCTTTTGATCTCGAGACTCAAAC
TTGGGAGACTGTGAA*GGGTGAGTACAACAACGTGGAGGTGTACGAGAAAATGATTAGGA
GTTTCGTGATGGGCGATAAGATCTGCGTCATGGATCGAAAGAGTAGCTTTGTTTACGATC
CCAAAGAAGGAATTTTTGAGAAGGACCCGTTGTTGAACAAACAGTGGAGTGTGGGTTCTT
GCGTCATTGATGACAAGTTGTACTCGTTTGGTCGGAAGAATGCGTTTGGTCGGAAGAATA
CTATATGGGAGTTTGATACTGTCGGGAGGGCTTGGAGGGAAGTGAAGGGTCTTAAAGATC
TTCCTGATAAGGCTGAAGGTTCCAAAATGGTGAATTATGGTGGCAAACTTGTGATTTTGT
GTAACCTTCAAGAGCGTTCGACGGAGATTTGGTATACAGAGATTGAATTGGAAAGGAGGG
AAGGAGGAGAGGTTTGGGGGACCATCTTGTGTTCTAGTCTTGTGCTGGCTTTGGAAGTTC
CATATGTTGTCTTACGTTCTCTAGCTGTGTCATATTGAAAACGTAATGGAGCAGCTTGGT
CTGGTCTGCCGAGATGAAAATCTAAGGGCTGTAAACTATTGGATGTTGAATTTTCTTGCC
CTTGTTTCTTTCTGGAAGTTGTTATATTTATTTATGAATAGCTTTGT

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 3

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GGAGATGAACAGCAAGCAAGTCGCAGATGTCTCTTCACTTGTTAAGTCTGCTTGTGATAA
TAACGAGCAGCACGATGGCGAAGTGGATTCTGCTAGGACTGCTGCTGAGAAAGATGTAAC
CAAGAACAGCGATGAGATCATCCAGCAAATTGATGGCATGTCAGAGGACGAGAAAGCGTA
TGTGTCACAAATCTTGAATGATGTCAAGACGCATGAAAAGTCACTCGAAAGTTTCCAAGA
GGATCATTGTTGCCAAGCTAGATGCATTGAGGATAAAGCTCAAGAAACTTTTCAACAAAG
ATATATGGAGTATGAGCCCACAGGCACAACTCCGTCTAAGAGTGAACCAGAGGTGCCAAG
CAAAGACACCATTGAATCACTACGAGCAATGCCTGTGTAGACACTGGTTGAAGTGTTCCG
TGAAAACAACTCTTATGAATCCTTTGCGGACAAGGAATCAAAACCGCAGCAGTTAACACG
GTCGCCTCTCTCACAAGTCAACTAGGGAAACCACCTCTGTTCCATTTCAAAATCGGTGGT
GTGTGTCTGTGTAACTATTTATTTGCGTACACATTTTTGAAAGTGTGGGATCAAATCAAT
GAAGAGTCAGATGCTTCTGACACATCTTCTGAGACAACTAGTCCCTTGTGGGATTCAACT
TCTTTCACCTACATTGAATCAGTCTACATTGTATACTGTATGGTTTCTTATTTCAGTAGT
GGAATAATCTGACATC


BQ
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 

AF RS1H750TF U 1
AF RS1DX58JQ C 229
AF RS1DX58TF U 229
BS 1 311 RS1H750TF
BS 312 312 RS1DX58TF
BS 313 317 RS1H750TF
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BS 319 453 RS1H750TF
BS 454 454 RS1DX58TF
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BS 459 599 RS1H750TF
BS 600 600 RS1DX58TF
BS 601 796 RS1H750TF

RD RS1H750TF 796 0 0
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ATATATGGAGTATGAGCCCACAGGCACAACTCCGTCTAAGAGTGAACCAGAGGTGCCAAG
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GTGTGTCTGTGTAACTATTTATTTGCGTACACATTTTTGAAAGTGTGGGATCAAATCAAT
GAAGAGTCAGATGCTTCTGACACATCTTCTGAGACAACTAGTCCCTTGTGGGATTCAACT
TCTTTCACCTACATTGAATCAGTCTACATTGTATACTGTATGGTTTCTTATTTCAGTAGT
GGAATAATCTGACATC

QA 1 796 1 796
DS 

RD RS1DX58JQ 568 0 0
G
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GAAGTGTTCCGTGAAAACAACTCTTATGAATCCTTTGCGGACAAGGAATCAAAACCGCAG
CAGTTAACACGGTCGCCTCTCTCACAAGTCAACTAGGGAAACCACCTCTGTTCCATTTCA
AAATCGGTGGTGTGTGTCTGTGTAACTATTTATTTGCGTACACATTTTTGAAAGTGTGGG
ATCAAATCAATGAAGAGTCAGATGCTTCTGACACATCTTCTGAGACAACTAGTCCCTTGT
GGGATTCAACTTCTTTCACCTACATTGAATCAGTCTACATTGTATACTGTATGGTTTCTT
ATTTCAGTAGTGGAATAATCTGACATC

QA 2 568 2 568
DS 

RD RS1DX58TF 568 0 0
G
GAGAAAGCGTATGTGTCACAAATCTTGAATGATGTCAAGACGCATGAAAAGTCACTCGAA
AGTTTCCAAGAGGATCATTGTTGCCAAGCTAGATGCATTGAGGATAAAGCTCAAGAAACT
TTTCAACAAAGATATATGGAGTATGAGCCCACAGGCACAACTCCGTCTAAGAGTGAACCA
GAGGTGCCAAGCAAAGACACCATTGAATCACTACGAGCAATGCCTGTGTAGACACTGGTT
GAAGTGTTCCGTGAAAACAACTCTTATGAATCCTTTGCGGACAAGGAATCAAAACCGCAG
CAGTTAACACGGTCGCCTCTCTCACAAGTCAACTAGGGAAACCACCTCTGTTCCATTTCA
AAATCGGTGGTGTGTGTCTGTGTAACTATTTATTTGCGTACACATTTTTGAAAGTGTGGG
ATCAAATCAATGAAGAGTCAGATGCTTCTGACACATCTTCTGAGACAACTAGTCCCTTGT
GGGATTCAACTTCTTTCACCTACATTGAATCAGTCTACATTGTATACTGTATGGTTTCTT
ATTTCAGTAGTGGAATAATCTGACATC

QA 2 568 2 568
DS 



AS 1 2

CO CL4120Contig1 940 2 8 U
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ACCCTAACGAAGTCGGGTTTCGCCATTGAAATCGACGGAGGAAGAGGCGGGTGATTACTA
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TTAAGGACGGTCAGCATCTCTCCGAGGAAGAGCTTCAGCTTCTCTGCGAATACGTGAAAG
AGATTCTGATTGAGGCGCCAAACGTGCAGCCTGTCAACAGTCCAGTCACCGTCTGTGGTG
ATATCCATGGCCAGTTTCATGATCTCATGAAGCTTTTTCAGACCGGAGGTCATGTTCCCC
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TCACTATTCTTCTGCTTCTTAAAGCCAGACATCCAGCCAATATTACACTTCTGCGTGGAA
ATCATGAAAGTAGGCAGCTAACGCAGGTATATGGTTTCTATGACGAGTGCCAAAGGAAGT
ATGGTAACGCTAATGCGTGGCGATATTGCACAGATGTTTTTGACTATCTTACCCTATCAG
CTATTATAGATGGCACAGTTCTATGTGTTCATGGTGGCCTTTCCCCGGATGTCCGGACAA
TTGATCAGATAAGACTGGTCGATAGAAATTGTGAAATTCCCCATGAAGGGCCCTTTTGCG
ATCTTATGTGGAGCGACCCCGAAGATATTGAAACATGGGCTGTTAGTCCACGTGGAGCTG
GCTGGCTTTTCGGATCCAGGGTTACTACTGAGTTCAATCACATCAACAAACTTGATCTAG
TGTGCCGTGCTCACCAACTGGTACAAGAAGGTCTTAAGTACATGTTCCAAGATAAAGCCT
TGTAACTGTGTGGTCTGCACCTAATTACTGCTACCGCTGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FG57TF U 1
AF RS1AZ09TF U 252
BS 1 346 RS1FG57TF
BS 347 347 RS1AZ09TF
BS 348 622 RS1FG57TF
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ACACCAATTACATTTTTATGGGGGACTTTGTGGATAGAGGTTACAACAGCCTTGAAGTCT
TCACTATTCTTCTGCTTCTTAAAGCCAGACATCCAGCCAATATTACACTTCTGCGTGGAA
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ATGGTAACGCTAATGCGTGGCGATATTGCACAGATGTTTTTGACTATCTTACCCTATCAG
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TTGATCAGATAAGACTGGTCGATAGAAATTGTGAAATTCCCCATGAAGGGCC*TTTTGCG
ATCTTATGTGGAGCGACCCCGAAGATATTGAAACATGGGCTGTTAGTCCACGTGGAGC

QA 1 778 1 778
DS 

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GGGGAGT
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TGGGGGACTTTGTGGATAGAGGTTACAACAGCCTTGAAGTCTTCACTATTCTTCTGCTTC
TTAAAGCCAGACATCCAGCCAATATTACACTTCTGCGTGGAAATCATGAAAGTAGGCAGC
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TGGATAGAAATTGTGAAATTCCCCATGAAGGGCCCTTTTGCGATCTTATGTGGAGCGATC
CCGAAGATATTGAAACATGGGCTGTTAGTCCACGTGGAGCTGGCTGGCTTTTCGGATCCA
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TGGTACAAGAAGGTCTTAAGTACATGTTCCAAGATAAAGCCTTGTAACTGTGTGGTCTGC
ACCTAATTACTGCTACCGCTGT

QA 8 689 8 689
DS 



AS 1 3

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ATGAAAAAATACTTGAAAACGACTAAGACAAAGAAAGAGATAAAGGCGAAAAAGTAGTTG
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CCCATCGTATGTATATATTTTAATTGCACATAAATTTAATATTAAATCTAATAGAACTGT
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FG59TF U 7
AF RS1ER41TF U 1
AF RS1FG59JQ C 135
BS 1 39 RS1ER41TF
BS 40 40 RS1FG59TF
BS 41 203 RS1ER41TF
BS 204 204 RS1FG59TF
BS 205 757 RS1ER41TF

RD RS1FG59TF 592 0 0
GG
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QA 3 592 3 592
DS 

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ATTTGGGATTAAACAGAGGGAGATACTGAAACATGAACTAGGGTTTCATGAACGTTATAA
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QA 1 757 1 757
DS 

RD RS1FG59JQ 617 0 0
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ATATTTTAATTGCGCATAAATTTAATATTAAATTTAATAGAACTGTAATATATAAACTAC
GGAAAACTGAATATTGT

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 3

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BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AP36JQ C 1
AF RS1AP36TFB U 1
AF RS1E394TF U 1
BS 1 591 RS1AP36TFB
BS 592 645 RS1E394TF

RD RS1AP36JQ 591 0 0
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TATCTTTTGTTGTGTGAACGTGTTTTGTATTGTTTCTTACGTGTTGTGATG

QA 1 591 1 591
DS 

RD RS1AP36TFB 591 0 0
GGAGGTTTTGGTGGGAGGTAAAGAAGCAAAAAAAAAAACAATGGGGGAGAAGGAAGCAAA
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CAATGCAAAGGTGTACAATGTAACCAAGTTCCTTGAAGACCATCCAGGTGGAGATGAAGT
TCTCCTGTCTTCAACAGGTAAGGATGCAACGGATGATTTTGAGGACGTGGGGCATAGCGA
GAGCGCGAGAGAGATGATGGAACAATACTACGTTGGAGAGATTGATCCGACAACAATCCC
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GATTCGTATCTACACCAAGTCAGCATAGTAGTCTTCTTTTCCATATCTACTATATATAGA
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TATCTTTTGTTGTGTGAACGTGTTTTGTATTGTTTCTTACGTGTTGTGATG

QA 1 591 1 591
DS 

RD RS1E394TF 645 0 0
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GATTCGTATCTACACCAAGTCAGCATAGTAGTCTTCTTTTCCATATCTACTATATATAGA
GAGAGAGAAAGATTTAAGTCTTTTGAGAAGACAAATCTCGAAGTCTCTCCCCTTTGTTCC
TATCTTTTGTTGTGTGAACGTGTTTTGTATTGTTTCTTACGTGTTGTGATGAAGCCGCAT
CTAAACAAGCAGTCTTGCAGAAATGCAGCTGATATTGATCTAATA

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 3

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AGGATACCGGTTTATACGCTCTGAAGAAGATGATTTAAACCCTTCTTGGGAGCAAAGACT
GGTGAAGCGATACTATGATAAACTTTTTAAGGAGTATCCTTTTGATGCATTAAGATGCTT
CCGATACATTTAACACCCTCTGTTAGATAACTTATTCAAGTTACAACTACTTTTTTTTTT
TTGCGTGAGAGTGTGTGGAGGAGTTCATGTCTTTGTATCTCCTTGACTGATTTAATATAC
TGTATAGCTGACATGTCACGATACAAGTCTGGCCAGATGGGTTTAAGATGGAGAACGGAA
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GTTGGCGGGCTATGAGGTGAATTTTTCTTATCATGAAGCTGGTGAACACAAACAAGCCCT
TGTAAAACTCGTTACTTGTGAGAGATGTGCTGAGAAGCTGTACTACAAAAGAAGAAAGGA
GGGTGAAAGATCAGAGAGTAAAGAAAAGAAAAAGCAGCAACGTAAACGGAATCGATCAAG
CAGTGAAGATGACACAGACGAAGAGGAAAGGAGAAAAGGAAAAAAGAACAAGTCCAAGCT
GGAGGGTGATGAGAGAGGAGAAGTCAAGGATGATGAGAACTTCGACGAATTCATGGAAGG
AATGTTTCCGGGGAAGGGTGATAATAACTAGAGTTTCAGAAAGCTGAACTATTTGATTTA
TGTCACAAGGATTACCCTTTTTGTATCATAACCTTAAGACTGAGTCTGGGACCATGAATG
TAAAAGCAATAGAACACAGACCATAACATGAAATACTTTTAATCGTTTTGGGTTCGGGAT
TGATACCTAATATACAACAATAGGACTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AH10TF U 1
AF RS1EI56TF U 347
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RD RS1AH10TF 798 0 0
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TA

QA 1 796 1 796
DS 

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QA 1 627 1 627
DS 

RD RS1EI56JQ 689 0 0
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AAAGCAATAGAACACAGACCATAACATGAAATACTTTTAATCGTTTTGGGTTCGGGATTG
ATACCTAATATACAACAATAGGACTTCCC

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 3

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CCCTCTTATCAAACTTCTATCCTTCAGAGGGAGGATGAGACATGTTCCTCTTTTTTTTGA
TGTAATATATGTTTCTTCGCTTTGGCGAGTACCCTTTCGCGTAGGCGATATCTCTTCTCG
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TTCTAATCCCGTAGGCGACTGGTGCGGTGATCTCTGTTTCTCCCTCACCTTTATTGCCCC
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TGGATGGAGTGTTAATGAGGTTTGATGGATTTCTTTAGCCATATATGGGGTGGATCAAGG
AGAGTCGGCGTTCTATACGGTCCGGCAAATGGTCTCTGCTCATTTTGGTTCAAGTAATCC
TCCGATTAAATTCCGGTGAAGCATGGTATTTCTGGTCAGTTAGCCATGGTTTAGATGGAA
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GGTGGCGACGCTGCGTCAACAATTCCTCATCCTCTTCGGCGGCGCGTCCTAAGCGCGTGA
ACCAAGTCAAAGGCATGCAGATGAGTTGATCAACGCGTCTCTTGCTTCTTCAGATCGACT
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CCAAAACTTAATGTAATATTGGGTTAGTAACAAATGGGGATTGGACCGTTGTATTAAGCT
TGTAAACTTGCCCATTTGGGTTTTAATAAAATGAAAGTCGAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E642TF U 1
AF RS1FZ04TF U 1
AF RS1E642JQ C 203
BS 1 630 RS1E642TF
BS 631 631 RS1FZ04TF
BS 632 678 RS1E642TF
BS 679 942 RS1E642JQ

RD RS1E642TF 689 0 0
GGGAGGTTGTATGAGAGGAACCTCTCTCTTCTCTTAGAGAGAGAAAACGCTCTCTCCTAT
CCCTCTTATCAAACTTCTATCCTTCAGAGGGAGGATGAGACATGTTCCTCTTTTTTTTGA
TGTAATATATGTTTCTTCGCTTTGGCGAGTACCCTTTCGCGTAGGCGATATCTCTTCTCG
CTTGGCGATTTTGTTGTTTTTCTTTTTAGTGTTTCTAGTTGATCTCAGTCGAAGTAGTTC
TTCAAGGATTAAGCTATTCTTCGATGGAGATTAGTGTTATGTGCTTTCCACTTGGTCTTA
TTCTAATCCCGTAGGCGACTGGTGCGGTGATCTCTGTTTCTCCCTCACCTTTATTGCCCC
CTAAAAGAATCAGTCTTTCTTCGATAGATATATTGCCAGTTTGGCGTGAAGAAAGCATCT
TGGATGGAGTGTTAATGAGGTTTGATGGATTTCTTTAGCCATATATGGGGTGGATCAAGG
AGAGTCGGCGTTCTATACGGTCCGGCAAATGGTCTCTGCTCATTTTGGTTCAAGTAATCC
TCCGATTAAATTCCGGTGAAGCATGGTATTTCTGGTCAGTTAGCCATGGTTTAGATGGAA
AGCACCATCAAGCGAAGTTCAACGAGTCCG*TGGCGTAGTTACATTTAATCGAATCTGCT
GGTGGCGACGCTGCGTCA
CATTCTCATCT

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1FZ04TF 694 0 0
GGGAGGTTGTATGAGAGGAACCTCTCTCTTCTCTTAGAGAGAGAAAACGCTCTCTCCTAT
CCCTCTTATCAAACTTCTATCCTTCAGAGGGAGGATGAGACATGTTCCTCTTTTTTT*GA
TGTAATATATGTTTCTTCGCTTTGGCGAGTACCCTTTCGCGTAGGCGATATCTCTTCTCG
CTTGGCGATTTTGTTGTTTTTCTTTTTAGTGTTTCTAGTTGATCTCAGTCGAAGTAGTTC
TTCAAGGATTAAGCTATTCTTCGATGGAGATTAGTGTTATGTGCTTTCCACTTGGTCTTA
TTCTAATCCCGTAGGCGACTGGTGCGGTGATCTCTGTTTCTCCCTCACCTTTATTGCCCC
CTAAAAGAATCAGTCTTTCTTCGATAGATATATTGCCAGTTTGGCGTGAAGAAAGCATCT
TGGATGGAGTGTTAATGAGGTTTGATGGATTTCTTTAGCCATATATGGGGTGGATCAAGG
AGAGTCGGCGTTCTATACGGTCCGGCAAATGGTCTCTGCTCATTTTGGTTCAAGTAATCC
TCCGATTAAATTCCGGTGAAGCATGGTATTTCTGGTCAGTTAGCCATGGTTTAGATGGAA
AGCACCATCAAGCGAAGTTCAACGAGTCCGGTGGCGTAGTTACATTTAATCGAATCTGCT
GGTGGCGACGCTGCGTCA
ACAATTCCTCATCCTC

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1E642JQ 740 0 0
TTTTTAGTGTTTCTAGTTGATCTCAGTCGAAGTAGTTCTTCAAGGATTAAGCTATTCTTC
GATGGAGATTAGTGTTATGTGCTTTCCACTTGGTCTTATTCTAATCCCGTAGGCGACTGG
TGCGGTGATCTCTGTTTCTCCCTCACCTTTATTGCCCCCTAAAAGAATCAGTCTTTCTTC
GATAGATATATTGCCAGTTTGGCGTGAAGAAAGCATCTTGGATGGAGTGTTAATGAGGTT
TGATGGATTTCTTTAGCCATATATGGGGTGGATCAAGGAGAGTCGGCGTTCTATACGGTC
CGGCAAATGGTCTCTGCTCATTTTGGTTCAAGTAATCCTCCGATTAAATTCCGGTGAAGC
ATGGTATTTCTGGTCAGTTAGCCATGGTTTAGATGGAAAGCACCATCAAGCGAAGTTCAA
CGAGTCCGGTGGCGTAGTTACATTTAATCGAATCTGCTGGTGGCGACGCTGCGTCAACAA
TTCCTCATCCTCTTCGGCGGCGCGTCCTAAGCGCGTGAACCAAGTCAAAGGCATGCAGAT
GAGTTGATCAACGCGTCTCTTGCTTCTTCAGATCGACTGACGCGTGTTAAGCTGAAGCGG
CTACGAAGCGGTGGAATAATTTAATTACGTTTGGGCTTCCAAAACTTAATGTAATATTGG
GTTAGTAACAAATGGGGATTGGACCGTTGTATTAAGCTTGTAAACTTGCCCATTTGGGTT
TTAATAAAATGAAAGTCGAC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 3

CO CL4125Contig1 732 3 2 U
GAGAAAGAAAACTCTTTGTGTTCTGTTTTGCTTTTGGATCATTTCTTTGGTTTTGGTTTT
GGTTTTGCATTGCTTGTCCGTGGGGAAGGAAATGAAAGAAAATACGGGAAACCCTCTGCA
TCTCAAGTCGTTGAATCACATATCTCTTCTATGTCGATCCGTGGAGGAGTCCATGAGCTT
TTACCAGCACGTTTTAGGTTTTCTCCCCATCCGGAGACCTGGCTCTTTTGATTTCGATGG
CGCCTGGTTGTTTGGTCATGGAGTTGGGATTCATCTTCTGCAATCTACAGAGCCTGAGAA
ACTACTCAAGAAAACTGAGATCAATCCCAAGGATAATCACATTTCTTTCCAGTGTGAGAG
CATGGGGGCGGTAGAGAAAAAGCTCAAGGAAATGAAAATAGAGTATGTGAGAGCTGTGGT
TGAAGAAGGTGGAATCCAAGTCGACCAGCTCTTCTTCCACGATCCTGATGGCTTTATGAT
TGAGATTTGCAACTGCGATAGCCTCCCTGTTGTGCCTCTGGCAGGAGAGATTGCTCGTTC
ATGCTCTCGTGTCAATATCCACCAGCTGGTCCAGCCACCTCAGATCCACCCCTAGACTCT
TGTCATCTCCCTCTCTGGCTAAAATCTGTTTGGTCAATAATTTGTTAATAACTTGCGTGT
AACATTTTTAATTTGTCTCTTTCACTTGTATGTGTTAAATATTTGCGTGTAATAAGACTC
TCTGTTGAGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DK15TF U 1
AF RS1FR46TF U 105
AF RS1FR46JQ C 147
BS 1 160 RS1DK15TF
BS 161 732 RS1FR46TF

RD RS1DK15TF 160 0 0
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GGTTTTGCATTGCTTGTCCGTGGGGAAGGAAATGAAAGAAAATACGGGAAACCCTCTGCA
TCTCAAGTCGTTGAATCACATATCTCTTCTATGTCGATCC

QA 1 160 1 160
DS 

RD RS1FR46TF 628 0 0
G
GGGAAACCCTCTGCATCTCAAGTCGTTGAATCACATATCTCTTCTATGTCGATCCGTGGA
GGAGTCCATGAGCTTTTACCAGCACGTTTTAGGTTTTCTCCCCATCCGGAGACCTGGCTC
TTTTGATTTCGATGGCGCCTGGTTGTTTGGTCATGGAGTTGGGATTCATCTTCTGCAATC
TACAGAGCCTGAGAAACTACTCAAGAAAACTGAGATCAATCCCAAGGATAATCACATTTC
TTTCCAGTGTGAGAGCATGGGGGCGGTAGAGAAAAAGCTCAAGGAAATGAAAATAGAGTA
TGTGAGAGCTGTGGTTGAAGAAGGTGGAATCCAAGTCGACCAGCTCTTCTTCCACGATCC
TGATGGCTTTATGATTGAGATTTGCAACTGCGATAGCCTCCCTGTTGTGCCTCTGGCAGG
AGAGATTGCTCGTTCATGCTCTCGTGTCAATATCCACCAGCTGGTCCAGCCACCTCAGAT
CCACCCCTAGACTCTTGTCATCTCCCTCTCTGGCTAAAATCTGTTTGGTCAATAATTTGT
TAATAACTTGCGTGTAACATTTTTAATTTGTCTCTTTCACTTGTATGTGTTAAATATTTG
CGTGTAATAAGACTCTCTGTTGAGGTC

QA 2 628 2 628
DS 

RD RS1FR46JQ 586 0 0
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CCATCCGGAGACCTGGCTCTTTTGATTTCGATGGCGCCTGGTTGTTTGGTCATGGAGTTG
GGATTCATCTTCTGCAATCTACAGAGCCTGAGAAACTACTCAAGAAAACTGAGATCAATC
CCAAGGATAATCACATTTCTTTCCAGTGTGAGAGCATGGGGGCGGTAGAGAAAAAGCTCA
AGGAAATGAAAATAGAGTATGTGAGAGCTGTGGTTGAAGAAGGTGGAATCCAAGTCGACC
AGCTCTTTTTCCACGATCCTGATGGCTTTATGATTGAGATTTGCAACTGCGATAGCCTCC
CTGTTGTGCCTCTGGCAGGAGAGATTGCTCGTTCATGCTCTCGTGTCAATATCCACCAGC
TGGTCCAGCCACCTCAGATCCACCCCTAGACTCTTGTCATCTCCCTCTCTGGCTAAAATC
TGTTTGGTCAATAATTTGTTAATAACTTGCGTGTAACATTTTTAATTTGTCTCTTTCACT
TGTATGTGTTAAATATTTGCGTGTAATAAGACTCTCTGTTGAGGTC

QA 1 586 1 586
DS 



AS 1 3

CO CL4126Contig1 1061 3 11 U
GGATCTTCTCTTTGCCTCTTCCCCCTCTCTGTTCTGCTCCACTTCTCTCTCTCGCTCTCT
CTGTCTTTCTCAAAACTTAGTGAGAGGAAAGTGTTAAATTTGTCTTATTTATGCGATAAG
GACCACTTCCACTCTATAAAAACCTCAAAAGTCGCTCACTCTCCTATCTCCCTCCTTTTT
TCTAACTCTTCCCCAGTCCTAAATTGCAACCTGCCATCTCCAATATTCCATCTTTTAACT
TTGTCTTTTAACAGGAATTCATTAAATTTTCTGGGAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGATCAT
TATTCGTAAAGAAAAAAAAATGCAGGATCCAGCAGCTTATTACCAGTCGATGATGGCGAA
ACAACTACATCAGCAACAACAACAACAACAACAACCGCAATTTCCGGACCAAGAACAGTT
AAAGTGTCCTCGCAGTGACTCACCAAACACTAAGTTCTGTTACTACAACAACTACAACCT
CTCACAGCCCCGTCACTTTTGCAAAAGCTGTCGCCGTTACTGGACCAAAGGCGGCGCTCT
CCGTAACGTCCCCGTCGGTGGCGGTTCTCGCAAGAACGCTAAACGATCCACCTCTTCTTC
TACTTCTCCTAACTCCCACAAGAAGGAAACCCGGATGCTGTACGGGTTTCCGATCGGGGA
CCAAGACGTGAAAGGTATGGAGATGGGTGTTGGTGTTGGTGGTGGTGGTGGGAGTTTTAG
CTCGCTTTTGGCGTCGAATATGCAGCTGGGTCTTGGTGGGATCATGCTCGACGGGTCGGG
TTGGGATCCGGGTATGAGTTTGGGTTTGAGGAGGAGCGAAGCAGGTAACGGAGGAGGTGG
TAACCGTTGGACCGATCTGGCTATGAACAGAGTGGAGAAAAACTAAGGATGAATAAGTGG
AGGGGTATTTGGTAAATTTAAAAGCTACAAAACTGATTTTAGATGACTTGAGAGTCCGAT
GTAATGTCATTTTGGTATTATATTCCTCCTGTTACTACTAGTACTCCCTTTTGTTATTTT
ATTTATAAATCAGTTTGTTAAAATTCTAATCTTTGTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DH34TF U 1
AF RS1G849TF U 175
AF RS1G849JQ C 370
BS 1 194 RS1DH34TF
BS 195 195 RS1G849TF
BS 196 282 RS1DH34TF
BS 283 283 RS1G849TF
BS 284 392 RS1DH34TF
BS 393 395 RS1G849TF
BS 396 433 RS1DH34TF
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BS 474 690 RS1G849TF
BS 691 1061 RS1G849JQ

RD RS1DH34TF 473 0 0
GGATCTTCTCTTTGCCTCTTCCCCCTCTCTGTTCTGCTCCACTTCTCTCTCTCGCTCTCT
CTGTCTTTCTCAAAACTTAGTGAGAGGAAAGTGTTAAATTTGTCTTATTTATGCGATAAG
GACCACTTCCACTCTATAAAAACCTCAAAAGTCGCTCACTCTCCTATCTCCCTCCTTTTT
TCTAACTCTTCCCCTGTCCTAAATTGCAACCTGCCATCTCCAATATTCCATCTTTTAACT
TTGTCTTTTAACAGGAATTCATTAAATTTTCTGGGAAAAAAAGAAAAAAAAAGAGATCAT
TATTCGTAAAGAAAAAAAAATGCAGGATCCAGCAGCTTATTACCAGTCGATGATGGCGAA
ACAACTACATCAGCAACAACAACAACAACAAC***CGCAATTTCCGGACCAAGAACAGTT
AAAGTGTCCTCGCTGTGACTCACCAAACACTAAGTTCTGTTACTACAACAACT

QA 1 473 1 473
DS 

RD RS1G849TF 516 0 0
T
TTTTTTCTAACTCTTCCCCAGTCCTAAATTTCAACCTGCCATCTCCAATATTCCATTTTT
TAACTTTGTCTTTTAACAGGAATTCATTAAATTTTCTGGGAAAAAAGAAAAAAAGAAGAG
ATCATTATTCGTAAAGAAAAAAAAATGCAGGATCCAGCAGCTTATTACCAGTCGATGATG
GCGAAACAACTACATCAGCAACAACAACAACAACAACAACCGCAATTTCCGGACCAAGAA
CAGTTAAAGTGTCCTCGCAGTGACTCACCAAACACTAAGTTCTGTTACTACAACAACTAC
AACCTCTCACAGCCCCGTCACTTTTGCAAAAGCTGTCGCCGTTACTGGACCAAAGGCGGC
GCTCTCCGTAACGTCCCCGTCGGTGGCGGTTCTCGCAAGAACGCTAAACGATCCACCTCT
TCTTCTACTTCTCCTAACTCCCACAAGAAGGAAACCCGGATGCTGTACGGGTTTCCGATC
GGGGACCAAGACGTGAAAGGTATGGAGATGGGTGT

QA 2 516 2 516
DS 

RD RS1G849JQ 692 0 0
TCAGCAA
CAACAACAACAACAACAACCGCAATTTCCGGACCAAGAACAGTTAAAGTGTCCTCGCAGT
GACTCACCAAACACTAAGTTCTGTTACTACAACAACTACAACCTCTCACAGCCCCGTCAC
TTTTGCAAAAGCTGTCGCCGTTACTGGACCAAAGGCGGCGCTCTCCGTAACGTCCCCGTC
GGTGGCGGTTCTCGCAAGAACGCTAAACGATCCACCTCTTCTTCTACTTCTCCTAACTCC
CACAAGAAGGAAACCCGGATGCTGTACGGGTTTCCGATCGGGGACCAAGACGTGAAAGGT
ATGGAGATGGGTGTTGGTGTTGGTGGTGGTGGTGGGAGTTTTAGCTCGCTTTTGGCGTCG
AATATGCAGCTGGGTCTTGGTGGGATCATGCTCGACGGGTCGGGTTGGGATCCGGGTATG
AGTTTGGGTTTGAGGAGGAGCGAAGCAGGTAACGGAGGAGGTGGTAACCGTTGGACCGAT
CTGGCTATGAACAGAGTGGAGAAAAACTAAGGATGAATAAGTGGAGGGGTATTTGGTAAA
TTTAAAAGCTACAAAACTGATTTTAGATGACTTGAGAGTCCGATGTAATGTCATTTTGGT
ATTATATTCCTCCTGTTACTACTAGTACTCCCTTTTGTTATTTTATTTATAAATCAGTTT
GTTAAAATTCTAATCTTTGTTTTTT

QA 8 692 8 692
DS 



AS 1 3

CO CL4127Contig1 707 3 2 U
GGGTATTCTCGTAACAATTTACCATTTCGTGGCCATCTCTCTAATCACAAAAACAAAAAT
GGGTCGCCGTAGCTCAGGAGGAAGATCTGCACCTCGTCCCCGTCCTGCTGCTGCACGCAG
CCCCCCTCCTCAAACTGTAAACCGTGCACCTCCTCCAGCACCAGCAGCTCAGGCTAGCGG
TGGCGGTGGCATGCTTTCAGGCATCGGTTCAACTATCGCTCAGGGTATGGCTTTTGGTAC
CGGAAGCGCTGTTGCGCATAGGGCTGTTGATGCTGTAATGGGCCCACGAACCATTCAGCA
TGAAGGTGTTGAGACCGCCTCTGCTCCTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGCCTTCTCAAGCTC
CTGTGACCTTCATGCTAAGGCTTTCCAAGATTGCGTCAGCAGCTATGGAAGCGATATCAG
CAAGTGCCAGTTCTACATGGACATGTTGTCTGAGTGCAGGAAGAACTCCGCTTCCACTAT
TGGTGCCTGATCAAGAAGGCTCATCATGCTTCTTCTTTTCTTTTATTTGCCTTTTTCTTC
TTTTATCTAAGAAACTATTCAGCTGTGAATGCTGAGAATTTGGATGCCCTCAAGCCAAGC
ATACTTTATTTCCAGAACCATAATTTGAATTTGGGTTATTTTCCCATTTCTTAATCGAAT
AATGCATTATGGATGGGTAATAGACTAATAACTAAGCTTTCTCGATT


BQ
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AF RS1AA36TF U 1
AF RS1G146JQ C 418
AF RS1G146TF U 418
BS 1 589 RS1AA36TF
BS 590 707 RS1G146TF

RD RS1AA36TF 589 0 0
GGGTATTCTCGTAACAATTTACCATTTCGTGGCCATCTCTCTAATCACAAAAACAAAAAT
GGGTCGCCGTAGCTCAGGAGGAAGATCTGCACCTCGTCCCCGTCCTGCTGCTGCACGCAG
CCCCCCTCCTCAAACTGTAAACCGTGCACCTCCTCCAGCACCAGCAGCTCAGGCTAGCGG
TGGCGGTGGCATGCTTTCAGGCATCGGTTCAACTATCGCTCAGGGTATGGCTTTTGGTAC
CGGAAGCGCTGTTGCGCATAGGGCTGTTGATGCTGTAATGGGCCCACGAACCATTCAGCA
TGAAGGTGTTGAGACCGCCTCTGCTCCTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGCCTTCTCAAGCTC
CTGTGACCTTCATGCTAAGGCTTTCCAAGATTGCGTCAGCAGCTATGGAAGCGATATCAG
CAAGTGCCAGTTCTACATGGACATGTTGTCTGAGTGCAGGAAGAACTCCGCTTCCACTAT
TGGTGCCTGATCAAGAAGGCTCATCATGCTTCTTCTTTTCTTTTATTTGCCTTTTTCTTC
TTTTATCTAAGAAACTATTCAGCTGTGAATGCTGAGAATTTGGATGCCC

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1G146JQ 290 0 0
G
AGCAAGTGCCAGTTTTACATGGACATGTTGTCTGAGTGCAGGAAGAACTCCGCTTCCACT
ATTGGTGCCTGATCAAGAAGGCTCATCATGCTTCTTCTTTTCTTTTATTTGCCTTTTTCT
TCTTTTATTTAAGAAACTATTCAGCTGTGAATGCTGAGAATTTGGATGCCCTCAAGCCAA
GCATACTTTATTTCCAGAACCATAATTTGAATTTGGGTTATTTTCCCATTTCTTAATCGA
ATAATGCATTATGGATGGGTAATAGACTAATAACTAAGCTTTCTCGATT

QA 2 290 2 290
DS 

RD RS1G146TF 290 0 0
G
AGCAAGTGCCAGTTCTACATGGACATGTTGTCTGAGTGCAGGAAGAACTCCGCTTCCACT
ATTGGTGCCTGATCAAGAAGGCTCATCATGCTTCTTCTTTTCTTTTATTTGCCTTTTTCT
TCTTTTATCTAAGAAACTATTCAGCTGTGAATGCTGAGAATTTGGATGCCCTCAAGCCAA
GCATACTTTATTTCCAGAACCATAATTTGAATTTGGGTTATTTTCCCATTTCTTAATCGA
ATAATGCATTATGGATGGGTAATAGACTAATAACTAAGCTTTCTCGATT

QA 2 290 2 290
DS 



AS 1 2

CO CL4128Contig1 599 2 2 U
GAAATTCAAAAGCGGATATAATAAAAGAAGTACAAGTAACATTTATTCCATTACAAATTG
AAAATAACAATTTCAAAGAATGATATTAAGATAGATGAATATTAAAATAGAGATTATATA
TCAATCAAAGCATTGATAGGTAGATCAAGCACATATGAATCCACGAGGGGTCTTCCTGCC
ACAAGCATTATGAAAAAAACTGAAAGAGACGGGAACATTAAGCTTAATCCCTAAAACATT
TGCCTTTAAGGCGGTACAAAAACAAGCCGCAGCCTCTAAATCAACCAAACCCTTAAGGAG
TGAACAACAAGGCTTGACTGGTGGCGTACCCAATTCGATTTTGAGAAAATCCTTTAGTAC
ATTGGCACAAACGCCAAGTTTGAGGGTTTTTCTTGGGCAGCTTCCTGAGGAGGATGGAGT
TGGGGTGGGCTTGGGTTTAGGTTTGGGAATAGAACCGCAGCCACCGCCACAAGCAGTAGT
TAGAGTGAAAAAGAGGATGTTGAATGTGAGGAAAATTATAAGGGAGGCTGAGATTTTTGA
AGCCATATTTCCAAAGATATAATTCAATTGAGCAAGTTTTAAGCTGGAAGTGTTGCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AP01JQ U 1
AF RS1F413JQ U 23
BS 1 179 RS1AP01JQ
BS 180 599 RS1F413JQ

RD RS1AP01JQ 179 0 0
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AAAATAACAATTTCAAAGAATGATATTAAGATAGATGAATATTAAAATAGAGATTATATA
TCAATCAAAGCATTGATAGGTAGATCAAGCACATATGAATCCACGAGGGGTCTTCCTGC

QA 1 179 1 179
DS 

RD RS1F413JQ 577 0 0
AAAAGAAGTACAAGTAACATTTATTCGATTACAAATTGAAAATAACAATTTCAAAGAATG
ATATTAAGATAGATGAATATTAAAATAGAGATTATATATCAATCAAAGCATTGATAGGTA
GATCAAGCACATATGAATCCACGAGGGGTCTTCCTGCCACAAGCATTATGAAAAAAACTG
AAAGAGACGGGAACATTAAGCTTAATCCCTAAAACATTTGCCTTTAAGGCGGTACAAAAA
CAAGCCGCAGCCTCTAAATCAACCAAACCCTTAAGGAGTGAACAACAAGGCTTGACTGGT
GGCGTACCCAATTCGATTTTGAGAAAATCCTTTAGTACATTGGCACAAACGCCAAGTTTG
AGGGTTTTTCTTGGGCAGCTTCCTGAGGAGGATGGAGTTGGGGTGGGCTTGGGTTTAGGT
TTGGGAATAGAACCGCAGCCACCGCCACAAGCAGTAGTTAGAGTGAAAAAGAGGATGTTG
AATGTGAGGAAAATTATAAGGGAGGCTGAGATTTTTGAAGCCATATTTCCAAAGATATAA
TTCAATTGAGCAAGTTTTAAGCTGGAAGTGTTGCTTT

QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 3

CO CL4129Contig1 897 3 7 U
GGAATCGCAATGTCTGATTTTTATTATTGTCGCCTCTAGTGTGGTTAAACCAGAACTTAA
TGTCATTACATAATCACTATTTGGAGGATATAATTATTATAATTAATAATGATTTGTCAA
GATATATGGATGCCTGATGGATACAGATACTTAAACACCCTCTATGCCGGATTTTATCTC
AAGCCATTGGAACTACGATGAGATTAACAAAGTACTACATCATTGCAATCATTGAGTGGA
TGTTTCTCTTATATAAGGTTTAAATCTTCCTCCGATTGGTAAATCTCCTCCCATTACCCC
TTCTCGATCTCCATCTCTCCTTAATGTCCTCAACTTTCCTCTTCTCCAATTCGTTGCCGT
TTCTTCCTTGATCATCGTCACGGCCTCCTCCTCGGATCCTAGCAGCTTCGGCAAAAAGAT
CTTCAATCATACTCTCCGTTGTTTTAGTGGTGATCCCACGAATGTACCAAGAAAGAGGTG
GTGGTGTAAGAATAGCAGAAGGCTGAAACATCTGATCCATTGTCACCTTCGACCCGACCC
TTCCTCGTCCGTTGGTACAACTATCGTAGTCTTCTTGTGTTTTTGGTTTCAAACGATCAC
ACAAATGTTCGTCTATAAACAATGGCTCCACCCTCCAACAGCCCTCAAACACTTTCATGA
ACATTGTTTTCTCTTGCTTGTAATTTGACATGAGATGTTTTCGGTTTTCTTGGACAATTA
GATGTATAGGGAAAGTTCCAGCCCACCAAAGGAACTTCCAGGCCGCGGCTTGCTTCACCT
CCACGGTCTGCATTGGTCCATCCTCCATCAAAACTTTTCTTGATATGCATTCCTTGATGT
TTTTGAAGTATCGTTTGTTGTCTGGATGAGTGAAAATTTTGTAGACTGACTTAGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 
0 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CQ36JQ U 1
AF RS1CH36JQ U 83
AF RS1CQ36TF C 164
BS 1 196 RS1CQ36JQ
BS 197 197 RS1CH36JQ
BS 198 408 RS1CQ36JQ
BS 409 478 RS1CH36JQ
BS 479 484 RS1CQ36TF
BS 485 807 RS1CH36JQ
BS 808 897 RS1CQ36TF

RD RS1CQ36JQ 408 0 0
GGAATCGCAATGTCTGATTTTTATTATTGTCGCCTCTAGTGTGGTTAAACCAGAACTTAA
TGTCATTACATAATCACTATTTGGAGGATATAATTATTATAATTAATAATGATTTGTCAA
GATATATGGATGCCTGATGGATACAGATACTTAAACACCCTCTATGCCGGATTTTATCTC
AAGCCATTGGAACTACCATGAGATTAACAAAGTACTACATCATTGCAATCATTGAGTGGA
TGTTTCTCTTATATAAGGTTTAAATCTTCCTCCGATTGGTAAATCTCCTCCCATTACCCC
TTCTCGATCTCCATCTCTCCTTAATGTCCTCAACTTTCCTCTTCTCCAATTCGTTGCCGT
TTCTTCCTTGATCATCGTCACGGCCTCCTCCTCGGATCCTAGCAGCTT

QA 1 408 1 408
DS 

RD RS1CH36JQ 725 0 0
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ACAGATACTTAAACACCCTCTATGCCGGATTTTATCTCAAGCCATTGGAACTACGATGAG
ATTAACAAAGTACTACATCATTGCAATCATTGAGTGGATGTTTCTCTTATATAAGGTTTA
AATCTTCCTCCGATTGGTAAATCTCCTCCCATTACCCCTTCTCGATCTCCATCTCTCCTT
AATGTCCTCAACTTTCCTCTTCTCCAATTCGTTGCCGTTTCTTCCTTGATCATCGTCACG
GCCTCCTCCTCGGATCCTAGCAGCTTCGGCAAAAAGATCTTCAATCATACTCTCCGTTGT
TTTAGTGGTGATCCCACGAATGTACCAAGAAAGAGG******TGTAAGAATAGCAGAAGG
CTGAAACATCTGATCCATTGTCACCTTCGACCCGACCCTTCCTCGTCCGTTGGTACAACT
ATCGTAGTCTTCTTGTGTTTTTGGTTTCAAACGATCACACAAATGTTCGTCTATAAACAA
TGGCTCCACCCTCCAACAGCCCTCAAACACTTTCATGAACATTGTTTTCTCTTGCTTGTA
ATTTGACATGAGATGTTTTCGGTTTTCTTGGACAATTAGATGTATAGGGAAAGTTCCAGC
CCACCAAAGGAACTTCCAGGCCGCGGCTTGCTTCACCTCCACGGTCTGCATTGGTCCATC
CTCCA

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1CQ36TF 734 0 0
ATGCCGGATTTTATCTCAAGCCATTGGAACTACGATGAGATTAACAAAGTACTACATCAT
TGCAATCATTGAGTGGATGTTTCTCTTATATAAGGTTTAAATCTTCCTCCGATTGGTAAA
TCTCCTCCCATTACCCCTTCTCGATCTCCATCTCTCCTTAATGTCCTCAACTTTCCTCTT
CTCCAATTCGTTGCCGTTTCTTCCTTGATCATCGTCACGGCCTCCTCCTCGGATCCTAGC
AGCTTCGGCAAAAAGATCTTCAATCATACTCTCCGTTGTTTTAGTGGTGATCCCACGAAT
GTACCAAGAAAGAGGTGGTGGTGTAAGAATAGCAGAAGGCTGAAACATCTGATCCATTGT
CACCTTCGACCCGACCCTTCCTCGTCCGTTGGTACAACTATCGTAGTCTTCTTGTGTTTT
TGGTTTCAAACGATCACACAAATGTTCGTCTATAAACAATGGCTCCACCCTCCAACAGCC
CTCAAACACTTTCATGAACATTGTTTTCTCTTGCTTGTAATTTGACATGAGATGTTTTCG
GTTTTCTTGGACAATTAGATGTATAGGGAAAGTTCCAGCCCACCAAAGGAACTTCCAGGC
CGCGGCTTGCTTCACCTCCACGGTCTGCATTGGTCCATCCTCCATCAAAACTTTTCTTGA
TATGCATTCCTTGATGTTTTTGAAGTATCGTTTGTTGTCTGGATGAGTGAAAATTTTGTA
GACTGACTTAGGAC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 3

CO CL4130Contig1 484 3 5 U
GGACTTCTGCAGTAGTTCTACTCGTTTAGCTTCGGAGCTGCAATTCGCACGACGTCAAGA
TGCCGTCGCACAAGTCTTTCATGATCAAGAAGAAGCTGGCCAAGAAGCAAAGGCAGAACA
GGCCTATTCCTCACTGGATTCGTCTCCGTACCGACAACACCATCAGGTACAACGCCAAGC
GCAGGCACTGGCGTAGAACCAAGCTCGGATTCTAAGTGAAAAGCTTCCTCCCAGAAGTGT
CTTCTTTTCTGTTGTTGGTTTTTAGCATTTCCTCAAGTTTTTATGGATTTACGGTGTGAC
ATTTTCATTTCTCTGTATGACTTTTGTCTCGTTATGTTTGTTACCAAATTTCTATCTATA
AAAAGCACTTCCTAGCAGTTTTGAGTTTTTTTTGTTTATTGGTTGATTCTATACCTTGTT
ATGGCTACTTAGACCCATGGATTAGGATCCAGTTATTGCAGTTGTAGTCTTATATATCAA
AAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1CW02JQ C 7
AF RS1CW02TF U 7
AF RS1BV71TF U 1
BS 1 21 RS1BV71TF
BS 22 22 RS1CW02TF
BS 23 172 RS1BV71TF
BS 173 173 RS1CW02TF
BS 174 484 RS1BV71TF

RD RS1CW02JQ 369 0 0
GG
GCAGTAGTTCTACTCGTTTAGCTTCGGAGCTGCAATTCGCACGACGTCAAGATGCCGTCG
CACAAGTCTTTCATGATCAAGAAGAAGCTGGCCAAGAAGCAAAGGCAGAACAGGCCTATT
CCTCACTGGATTCGTCTCCGTACCGACAACACCATCAGGTACAACGCCAAGCGCAGGCAC
TGGCGTAGAACCAAGCTCGGATTCTAAGTGAAAAGCTTCCTCCCAGAAGTGTCTTCTTTT
CTGTTGTTGGTTTTTAGCATTTCCTCAAGTTTTTATGGATTTACGGTGTGACATTTTCAT
TTCTCTGTATGACTTTTGTCTCGTTATGTTTGTTACCAAATTTCTATCTATAAAAAGCAC
TTCCTAG

QA 3 369 3 369
DS 

RD RS1CW02TF 369 0 0
GG
GCAGTAGTTCTACTCGTTTAGCTTCGGAGCTGCAATTCGCACGACGTCAAGATGCCGTCG
CACAAGTCTTTCATGATCAAGAAGAAGCTGGCCAAGAAGCAAAGGCAGAACAGGCCTATT
CCTCACTGGATTCGTCTCCGTACCGACAACACCATCAGGTACAACGCCAAGCGCAGGCAC
TGGCGTAGAACCAAGCTCGGATTCTAAGTGAAAAGCTTCCTCCCAGAAGTGTCTTCTTTT
CTGTTGTTGGTTTTTAGCATTTCCTCAAGTTTTTATGGATTTACGGTGTGACATTTTCAT
TTCTCTGTATGACTTTTGTCTCGTTATGTTTGTTACCAAATTTCTATCTATAAAAAGCAC
TTCCTAG

QA 3 369 3 369
DS 

RD RS1BV71TF 484 0 0
GGACTTCTGCAGTAGTTCTACCCGTTTAGCTTCGGAGCTGCAATTCGCACGACGTCAAGA
TGCCGTCGCACAAGTCTTTCATGATCAAGAAGAAGCTGGCCAAGAAGCAAAGGCAGAACA
GGCCTATTCCTCACTGGATTCGTCTCCGTACCGACAACACCATCAGGTACAATGCCAAGC
GCAGGCACTGGCGTAGAACCAAGCTCGGATTCTAAGTGAAAAGCTTCCTCCCAGAAGTGT
CTTCTTTTCTGTTGTTGGTTTTTAGCATTTCCTCAAGTTTTTATGGATTTACGGTGTGAC
ATTTTCATTTCTCTGTATGACTTTTGTCTCGTTATGTTTGTTACCAAATTTCTATCTATA
AAAAGCACTTCCTAGCAGTTTTGAGTTTTTTTTGTTTATTGGTTGATTCTATACCTTGTT
ATGGCTACTTAGACCCATGGATTAGGATCCAGTTATTGCAGTTGTAGTCTTATATATCAA
AAAA

QA 1 484 1 484
DS 



AS 1 3

CO CL4131Contig1 691 3 12 U
GGGGACCACAAAGCTTCTTCTCACTTTCGCAATCACATAAAAACCTTTCTTTCTTCCTTT
CTATCCTATCCAAAAAAAGAAGATAAATCGTTTTCAAAATGGCGAAGAAAGGAGGAGGAG
CAACAACACTCGCCGAGGACGCACCGTGGCGTGTCTCCTCGGTAAAACCAGTACCTCGAA
TCAGCCGCTCACCGGTTCTCTCCATCTCTCAAACCCCAGAGACCGATTACGCCATTGCCG
TCATGAAGCATCCGAATCCAGTGGGAGGTGGTTTGGCGATGGAAGCAGTGCTCGAATCTG
CAGGGCCTGAATGCGTTGTTCCTGGTCAAGTCACGCCTCTTCGTCTTCTTGGTGTTAAGG
TGTGGCCTGTTGAAGTTGATCTCAAGTTCCTGGAACCAGTGGGGAAAGAGCTTA**ATGC
TTGGGAAGTTCATGGATAATGCTGTCGACCTTATGAATAAGTCTTTTATCGACCGTTAAG
CACCATGGAAAAGGCGCTAAGGTATACGGCTAGAGTTTTGGAATGGGGAACTTTTAACAG
GCAGAGAAAGATATGATCTGAGAGCAAAGTTGAATATGGTGTGTGTGTGTGTCAGTGTAT
AGAGGATTATCTCCTTTCAAATATTATTACAGACAAAAATCTATATTCTATCAAATCATC
ATTGGTTTGAATTAAAGGATATGCTTAAACC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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AF RS1BX12TF U 28
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CAACAACACTCGCCGAGGACGCACCGTGGCGTGTCTCCTCGGTAAAACCAGTACCTCGAA
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ATTGGTTTGAATTAA*GGATATGCTTAAACC

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DS 

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TACAGACAAAAATCTATATTCTATCAAATCATCATTGGTTTGAATTAAAGGATATGCTTA
AACC

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DS 



AS 1 3

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AACTCGATCCGTTAGATACACTATGGCGACGACCAACGAGCCCGAGCACGAGCACAGAGA
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CGTTGGAAATGAAAAGTCTTGTGTGTGGCACGCACGTGACTTTGCTGATGGTGAACTCAA
GGATGAGCTTTTCTGCATCCGTTTCGCTTCTATTGAGAACTGCAAAGCATTTAGGCAAAA
GTTCAATGAAGTTGCTGAATCTGAAGTAGTAGAGAAAGAAGAGAGCAAAGATGCCTCTGA
CACCGCGGGTCTTCTCGAGAAGCTGAGCGTTGAAGAGTCAAAAACAGAGGAGAAACCTGT
GGAAAAGGAGAAGACTGAAGTGGAAGCAGAGGATAAGAAGAAAAGCGAGCCAGAGAAAGC
TGATGAAGTAAAGAAAACCGAAGAGGCTAGTCCCTCAGCTTAAGTTGCATGAACTTTTAA
GCTCCCAAATCCTGTCGAGGTATTTATAGCTATATCTAGTGTTTGGATACATCTCTCTCT
CGAGTCTACTATTGTCTGGGCACTATCTATCTACACATGTTTTGTTTGAGTCAGATTGCT
TGGGGTCGGGTTTTGCAGTGTCGTTTTTGGGTCTATAGTTTTTGAGTCTGAAAGTGTCGG
TGGAATGATATGAAAGATTTATTTATAAAGTACGTTGGATTCATTGTTTCAAGTTTCTTA
TGGATCGTTTTTTAGATGGTCGTGTTATGGGGATGGAGATGATGGTGTTCGTTCATTAAC
AAGAGTCAGGAACAACAATCATGTTTTCTAATATATGTTATTCCTGACAAGTAAAATTTC
ATTAAGAAATTGACAAGT


BQ
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AF RS1FL02TF U 1
AF RS1BA09TF U 220
AF RS1FL02JQ C 427
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QA 1 530 1 530
DS 

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CGTT
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AAGGAGAGAGGTGGTGGTACTGTGAAGCTGTTGAAGCATAAGAGCACTGGGAAGATTCGT
CTCGTCATGAGGCAATCGAAAACTCTCAAGATCTGTGCTAATCACTTCGTTAAACAGGGG
ATGAGTGTTCAGGAACACGTTGGAAATGAAAAGTCTTGTGTGTGGCACGCACGTGACTTT
GCTGATGGTGAACTCAAGGATGAGCTTTTCTGCATCCGTTTCGCTTCTATTGAGAACTGC
AAAGCATTTATGCAAAAGTTCAATGAAGTTGCTGAATCTGAAGTAGTAGAGAAAGAAGAG
AGCAAAGATGCCTCTGACACCGCGGGTCTTCTCGAGAAGCTGAGCGTTGAAGAGTCAAAA
*CAGAGGAGAAACCTGTGGAAAAGGAGAAGACTGAAGTGGA

QA 5 465 5 465
DS 

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GCTTTTCTGCATCCGTTTCGCTTCTATTGAGAACTGCAAAGCATTTAGGCAAAAGTTCGA
TGAAGTTGCTGAATCTGAAGTAGTAGAGAAAGAAGAGAGCAAAGATGCCTCTGACACCGC
GGGTCTTCTCGAGAAGCTGAGCGTTGAAGAGTCAAAAACAGAGGAGAAACCTGTGGAAAA
GGAGAAGACTGAAGTGGAAGCAGAGGATAAGAAGAAAAGCGAGCCAGAGAAAGCTGATGA
AGTAAAGAAAACCGAAGAGGCTAGTCCCTCAGCTTAAGTTGCATGAACTTTTAAGCTCCC
AAATCCTGTCGAGGTATTTATAGCTATATCTAGTGTTTGGATACATCTCTCTCTCGAGTC
TACTATTGTCTGGGCACTATCTATCTACACATGTTTTGTTTGAGTCAGATTGCTTGGGGT
CGGGTTTTGCAGTGTCGTTTTTGGGTCTATAGTTTTTGAGTCTGAAAGTGTCGGTGGAAT
GATATGAAAGATTTATTTATAAAGTACGTTGGATTCATTGTTTCAAGTTTCTTATGGATC
GTTTTTTAGATGGTCGTGTTATGGGGATGGAGATGATGGTGTTCGTTCATTAACAAGAGT
CAGGAACAACAATCATGTTTTCTAATATATGTTATTCCTGACAAGTAAAATTTCATTAAG
AAATTGACAAGT

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 3

CO CL4133Contig1 1154 3 4 U
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ATAGTTTCGTATGAAAATTAAAAACTGTAAACACCAACAACCAACCTTACTACTATTACT
ATTACAACATTTCTTCGGTTCATAAGTTCTTTTTACTTTTACAAAACAGAATCAACAAAC
TGTAAAACATCATCTAAACTCTCTCTCCATATCAAAAGCATAAGTTACCTCCAAGCACAA
GAGGTGATAAGAGGCTGATTCTTCCACCCTAAATACAACGCTCCATCCCTCTCTTCAAGC
GTATACTTCTCTGAATAACTCTCAAGCAACCCTTTGATCGTCGCGTTCACATAAAAGCTC
AACGGATAAGGCTTGAAACCCGCCATGTGAAACCTCGACCTCCACTTCCCCAAAGGCTCA
TGCCTCTCTTCTCTTTCAACCCCTTCGCAAGCTATAAAATTCACCACCTCCCTAGCCAGA
CAGTGCTGCTCCACATTGATCCTCTCCTTGTGATCCCTAGCGAGCTTCACATCTATGGAC
TCAAAAACCGCCAAGTAATGGTTCATCGTCTCCACAAACCGAGGAAGAAACGGCGCGGTG
TTTGTGTTCGCTTCTTGCTCAACCAGAGTCACAACGTTGGGAGACAAACACTTGACAAGC
CTCAGCAACCTGTCTCTGTGATTCTCCACGGTCACACTCTCGTCAGGCATGTGGTGAAGG
ACAAGAGGGAAGTTAACCGCCAAGGCTTCTCCGTTTCTAACTCCAAGCTTCTCTATTTCC
ACTTCCGTGCAGCACAAGGCAGCTCCGTGAAACTCAAACGGCACACCGCACATCTCAGCA
AGCTTCCCGAGTCTCTGTCCAACTAACTCAAGCCCTCCTTGTCTTGCAAACGATGATCTA
GGATCATCAATCCCCGTGATCCTCACTCTCGGAGGTCCACCAGGACGAGCGCCAAGAGCA
CGGATCAAACTCACCCACTGACCGCCTTGAGAGATCTGAAAATCTATAATATGCACAAAG
CTCTCGTTCTTCACAGCTTCAGCTATAGCTCCGTTGGCAGATTCGTAACCGAACTTGAAG
TAAGGACAAACCTCGTACAAGATGTGCGTGTAGGTAAGAAGCTCAGGACCTGTGGAGTCT
TTGCATCTAAGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C372JQ U 427
AF RS1EE89JQ U 1
AF RS1E903TF C 535
BS 1 649 RS1EE89JQ
BS 650 650 RS1E903TF
BS 651 764 RS1EE89JQ
BS 765 1154 RS1E903TF

RD RS1C372JQ 178 0 0
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TGCTCCACATTGATCCTCTCCTTGTGATCCCTAGCGAGCTTCACATCTATGGACTCAAAA
ACCGCCAAGTAATGGTTCATCGTCTCCACAAACCGAGGAAGAAACGGCGCGGTGTTTG

QA 1 178 1 178
DS 

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TGTAAAACATCATCTAAACTCTCTCTCCATATCAAAAGCATAAGTTACCTCCAAGCACAA
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TGCCTCTCTTCTCTTTCAACCCCTTCGCAAGCTATAAAATTCACCACCTCCCTAGCCAGA
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ACAAGAGGGAAGTTAACCGCCAAGGCTTCTCCGTTTCTAACTCC

QA 1 764 1 764
DS 

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AC
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GGTGTTTGTGTTCGCTTCTTGCTCAACCAGAGTCACAACGTTGGGAGACAAACACTTGAC
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AAGGACAAGAGGGAAGTTAACCGCCAAGGCTTCTCCGTTTCTAACTCCAAGCTTCTCTAT
TTCCACTTCCGTGCAGCACAAGGCAGCTCCGTGAAACTCAAACGGCACACCGCACATCTC
AGCAAGCTTCCCGAGTCTCTGTCCAACTAACTCAAGCCCTCCTTGTCTTGCAAACGATGA
TCTAGGATCATCAATCCCCGTGATCCTCACTCTCGGAGGTCCACCAGGACGAGCGCCAAG
AGCACGGATCAAACTCACCCACTGACCGCCTTGAGAGATCTGAAAATCTATAATATGCAC
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GAAGTAAGGACAAACCTCGTACAAGATGTGCGTGTAGGTAAGAAGCTCAGGACCTGTGGA
GTCTTTGCATCTAAGAGC

QA 3 620 3 620
DS 



AS 1 3

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ATCTCCGCTTCTCTTCTCCTCCGCTTCTCCTCCTCCTCCTCCTCCGGATCCAAACTCTCT
TTCCCCTCGTCATCTCTCTCCTTCACCAGATCTCTCGTCTCTTCCCCGCTTCTCTCTCAG
AAGAGAAGTCAAGCTACGTTGGTGATTCGGAGGAGCTTCAGCTCGGCTGCAACCACCCAA
TGCACAGCAGCTACAGATCCTGAACAGTTGAAGAGTGCTAGAGAAGACATCAAAAAGCTC
CTCAACACCAAGTTTTGCCATCCAATCTTGGTTCGTTTGGGGTGGCATGATGCTGGTACC
TACAACAAGAACATCTCTGAGTGGCCTCAGAGAGGTGGAGCTAATGGCAGTCTCAGATAC
GAGATTGAGCTTAAGCATGCTGCTAATGCTGGTCTTGTAAATGCTTTAAACCTTATTCAG
CACATCAAAGACATGTACTCTGGGATCTCGTACGCTGACCTTTTCCAGCTGGCCAGTGCT
ACTGCTATAGAGGAAGCTGGAGGACCTAAAATACCCATGAAATATGGAAGAGTTGATACC
TCTGGTCCTCATGAATGTCCTGAAGAAGGAAGGCTTCCTGACGCTGGTCCTCCTTCACCT
GCTAATCATCTCAGAGAAGTCTTCTACAGAATGGGTTTAGATGATAAGGACATAGTTGCA
TTATCTGGTGCACACACCTTAGGAAGATCTAGGCCAGAACGTAGTGGTTGGGGGAAGCCA
GAAACGAAGTACACGAAAGAAGGACCGGGAGCACCAGGAGGACAGTCATGGACACCAGAG
TGGTTGAAGTTTGACAATTCTTACTTCACAGAAATCAAGGAAAAGAGAGATGAAGATCTC
CTTGTCCTGCCCACTGATGCTGCCATCTTTGAAGATCCTTCTTTCAAGGTGTATGCTGAG
AAGTATGCTGCAGATCAAGATGCTTTCTTCAAGGATTATGCTGAATCCCATGCGAAACTG
AGCAATCTTGGAGCAAAATTTAACCCTCCTGAGGGTATCATTATCTAGTCGGCATTTAAT
TAACTCTGTCGAGATATCTTTTGGACAATGTTTTTGCACAAAGGAGTTGGTTGAGTTTCC
TTTGCCTTAACTATTGGTCGTTCGTGTCATGGTTGAATTGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AT95TF U 1
AF RS1F613TF U 471
AF RS1AT95JQ C 390
BS 1 612 RS1AT95TF
BS 613 689 RS1F613TF
BS 690 690 RS1AT95JQ
BS 691 1049 RS1F613TF
BS 1050 1183 RS1AT95JQ

RD RS1AT95TF 612 0 0
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ATCTCCGCTTCTCTTCTCCTCCGCTTCTCCTCCTCCTCCTCCTCCGGATCCAAACTCTCT
TTCCCCTCGTCATCTCTCTCCTTCACCAGATCTCTCGTCTCTTCCCCGCTTCTCTCTCAG
AAGAGAAGTCAAGCTACGTTGGTGATTCGGAGGAGCTTCAGCTCGGCTGCAACCACCCAA
TGCACAGCAGCTACAGATCCTGAACAGTTGAAGAGTGCTAGAGAAGACATCAAAAAGCTC
CTCAACACCAAGTTTTGCCATCCAATCTTGGTTCGTTTGGGGTGGCATGATGCTGGTACC
TACAACAAGAACATCTCTGAGTGGCCTCAGAGAGGTGGAGCTAATGGCAGTCTCAGATAC
GAGATTGAGCTTAAGCATGCTGCTAATGCTGGTCTTGTAAATGCTTTAAACCTTATTCAG
CACATCAAAGACATGTACTCTGGGATCTCGTACGCTGACCTTTTCCAGCTGGCCAGTGCT
ACTGCTATAGAGGAAGCTGGAGGACCTAAAATACCCATGAAATATGGAAGAGTTGATACC
TCTGGTCCTCAT

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DS 

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G
CTTATTCAGCACATCAAAGACATGTACTCTGGGATCTCGTACGCTGACCTTTTCCAGCTG
GCCAGTGCTACTGCTATAGAGGAAGCTGGAGGACCTAAAATACCCATGAAATATGGAAGA
GTTGATACCTCTGGTCCTCATGAATGTCCTGAAGAAGGAAGGCTTCCTGACGCTGGTCCT
CCTTCACCTGCTAATCATCTCAGAGAAGTCTTCTACAGTATGGGTTTAGATGATAAGGAC
ATAGTTGCATTATCTGGTGCACACACCTTAGGAAGATCTAGGCCAGAACGTAGTGGTTGG
GGGAAGCCAGAAACGAAGTACACGAAAGAAGGACCGGGAGCACCAGGAGGACAGTCATGG
ACACCAGAGTGGTTGAAGTTTGACAATTCTTACTTCACAGAAATCAAGGAAAAGAGAGAT
GAAGATCTCCTTGTCCTGCCCACTGATGCTGCCATCTTTGAAGATCCTTCTTTCAAGGTG
TATGCTGAGAAGTATGCTGCAGATCAAGATGCTTTCTTCAAGGATTATGCTGAATCCCAT
GCGAAACTGAGCAATCTTGGAGCAAAATTTAACCCTCC

QA 2 579 2 579
DS 

RD RS1AT95JQ 794 0 0
GAGAGGTGGAGCTAATGGCAGTCTCAGATACGAGATTGAGCTTAAGCATGCTGCTAATGC
TGGTCTTGTAAATGCTTTAAACCTTATTCAGCACATCAAAGACATGTACTCTGGGATCTC
GTACGCTGACCTTTTCCAGCTGGCCAGTGCTACTGCTATAGAGGAAGCTGGAGGACCTAA
AATACCCATGAAATATGGAAGAGTTGATACCTCTGGTCCTCATGAATGTCCTGAAGAAGG
AAGGCTTCCTGACGCTGGTCCTCCTTCACCTGCTAATCATTTCAGAGAAGTTTTTTACAG
AATGGGTTTAGATGATAAGGACATAGTTGCATTATTTGGTGCACACACCTTAGGAAGATT
TAGGCCAGAACGTAGTGGTTGGGGGAAGCCAGAAACGAAGTACACGAAAGAAGGACCGGG
AGCACCAGGAGGACAGTCATGGACACCAGAGTGGTTGAAGTTTGACAATTCTTACTTCAC
AGAAATCAAGGAAAAGAGAGATGGAGATCTCCTTGTCCTGCCCACTGATGCTGCCATCTT
TGAAGATCCTTCTTTCAAGGTGTATGCTGAGAAGTATGCTGCAGATCAAGATGCTTTTTT
CAAGGATTATGCTGAATCCCATGCGAAACTGAGCAATCTTGGAGCAAAATTTAACCCTCC
TGAGGGTATCATTATCTAGTCGGCATTTAATTAACTCTGTCGAGATATCTTTTGGACAAT
GTTTTTGCACAAAGGAGTTGGTTGAGTTTCCTTTGCCTTAACTATTGGTCGTTCGTGTCA
TGGTTGAATTGTCG

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 3

CO CL4135Contig1 919 3 11 U
GGCTTCCTTCTTCCTTCTTCTTCTTCCTCGCCGATCGCAACTTCCGTCTTCTCTCAGCAA
ATCCTTTAACGACAATGGATTACGACTTCAGAAACAAGTCAGGTCCCTCCTACGGCCGTC
CTATGTACCCATCTCCTTCTCCATCATCTATGTACACCGGTCCTCCCGGATACCCAAAGA
TCGGTGGCGGCCAACCGTTTTTCCCTCCGCCGCCGGAGAGAACCCCGTCGTTTCAACACA
ACCCCTCTTCATCTGGATTAGGAATCAAGGTGACTCTCAAGCCTGACTATCGTATCACTC
CTCCGCCTCCGTTGTTGCCTCGAGTTGGAGATGTTCCTAGGAGCAGCTTTCAGTTCGATT
TCGGACTAGAAAGGAAGGTTCTTGCTGAGGCGGAGAAGGATAACCCTGATTGGAGCAAGT
TTGGGTCCGACCATCCTCCTCCTCCTCCTCCACCGGCGAACTTTTCACAACCGCCGCCGG
CTAATTTTGCACAACCACCACCGGCACATTCAATGGGTGTAGATCCTGTAGTGATGAAAT
ATGCTGGGCTAAACCGAGAAGCTGTCAACATCGCTGTTGCAAACTATGGTGATAATCCCA
CAAAGGTTCATGAATTTGCAAATGGGTTCAGTGCGATAAGGGAGATGGGGTTCCCAACGA
ACGCTGTTGCAGATGCTCTCTTCATGTTCGAGAACGACACTGAGAAGGCATTGTCACATT
TGCTCCATGGTTCTTCTTGAACTTTTTTTAGACTTTCAAATTATCCTCCTTCTATAGTGT
GTAAGTAAAACATCGAATAATGTAAAAGATTGACAAAAGTATAAACATTGTTTTCTTTCA
CTGTGTAAATGGATGTGAATTGTTTTGGGTGGAGACAAAACTTTGTCAGTAAAGTTATCT
ATTTCACTGCTTCGACTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EV25TF U 1
AF RS1DH15TF U 25
AF RS1DH15JQ C 151
BS 1 303 RS1EV25TF
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RD RS1EV25TF 703 0 0
GGCTTCCTTCTTCCTTCTTCTTCTTCCTCGCCGATCGCAACTTCCGTCTTCTCTCAGCAA
ATCCTTTAACGACAATGGATTACGACTTCAGAAACAAGTCAGGTCCCTCCTACGGCCGTC
CTATGTACCCATCTCCTTCTCCATCATCTATGTACACCGGTCCTCCCGGATACCCAAAGA
TCGGTGGCGGCCAACCGTTTTTCCCTCCGCCGCCGGAGAGAACCCCGTCGTTTCAACACA
ACCCCTCTTCATCTGGATTAGGAATCAAGGTGACTCTCAAGCCTGACTATCGTATCACTC
CTCTGCCTCCGTTGTTGCCTCGAGTTGGAGATGTTCCTAGGAGCAGCTTTCAGTTCGATT
TCGGACTAGAAAGGAAGGTTCTTGCTGAGGCGGAGAAGGATAACCCTGATTGGAGCAAGT
TTGGGTCCGACCATCCTCCTCCTCCTCCTCCACCGGCGAACTTTTCACAACCGCCGCCGG
CTAATTTTGCACAACCACCACCGGCACATTCAATGGGTGTAGATCCTGTAGTGATGAAAT
ATGCTGGGCTAAGCCGAGAAGCTGTCAACATCGCTGTTGCAAACTATGGTGATAATCCCA
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ACGCTGTTGCAGATGCTCTCTTCATGTTCGAGAACGACACTGA

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1DH15TF 738 0 0
GG
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TCTATGTACACCGGTCCTCCCGGATACCCAAAGATCGGTGGCGGCCAACCGTTTTTCCCT
CCGCCGCCGGAGAGAACCCCGTCGTTTCAACACAACCCCTCTTCATCTGGATTAGGAATC
AAGGTGACTCTCAAGCCTGACTATCGTATCACTCCTCCGCCTCCGTTGTTGCCTCGAGTT
GGAGATGTTCCTAGGAGCAGCTTTCAGTTCGATTTCGGACTAGAAAGGAAGGTTCTTGCT
GAGGCGGAGAAGGATAACCCTGATTGGAGCAAGTTTGGGTCCGACCATCCTCCTCCTCCT
CCTCCACCGGCGAACTTTTCACAACCGCCGCCGGCTAATTTTGCACAACCACCACCGGCA
CATTCAATGGGTGTAGATCCTGTAGTGATGAAATATGCTGGGCTAAACCGAGAAGCTGTC
AACATCGCTGTTGCAAACTATGGTGATAATCCCACAAAGGTTCATGAATTTGCAAATGGG
TTCAGTGCGATAAGGGAGATGGGGTTCCCAACGAACGCTGTTGCAGATGCTCTCTTCATG
TTCGAGAACGACACTGAGAAG*CATTGTCACATTTGCTCCATGGTTCTTCTTGAC**TTT
TTTAGACTTTCAAAT
A

QA 3 737 3 737
DS 

RD RS1DH15JQ 769 0 0
TGTACACCGGTCCTCCCGGATACCCAAAGATCGGTGGCGGCCAACCGTTTTTCCCTCCGC
CGCCGGAGAGAACCCCGTCGTTTCAACACAACCCCTCTTCATCTGGATTAGGAATCAAGG
TGACTCTCAAGCCTGACTATCGTATCACTCCTCCGCCTCCGTTGTTGCCTCGAGTTGGAG
ATGTTCCTAGGAGCAGCTTTCAGTTCGATTTCGGACTAGAAAGGAAGGTTCTTGCTGAGG
CGGAGAAGGATAACCCTGATTGGAGCAAGTTTGGGTCCGACCATCCTCCTCCTCCTCCTC
CACCGGCGAACTTTTCACAACCGCCGCCGGCTAATTTTGCACAACCACCACCGGCACATT
CAATGGGTGTAGATCCTGTAGTGATGAAATATGCTGGGCTAAACCGAGAAGCTGTCAACA
TCGCTGTTGCAAACTATGGTGATAATCCCACAAAGGTTCATGAATTTGCAAATGGGTTCA
GTGCGATAAGGGAGATGGGGTTCCCAACGAACGCTGTTGCAGATGCTCTCTTCATGTTCG
AGAACGACACTGAGAAGGCATTGTCACATTTGCTCCATGGTTTTTCTTGAACTTTTTTTA
GACTTTCAAATTATCCTCCTTCTATAGTGTGTAAGTAAAACATCGAATAATGTAAAAGAT
TGACAAAAGTATAAACATTGTTTTCTTTCACTGTGTAAATGGATGTGAATTGTTTTGGGT
GGAGACAAAACTTTGTCAGTAAAGTTATCTATTTCACTGCTTCGACTTG

QA 1 769 1 769
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL4137Contig1 546 3 3 U
GGGCAAAAAAGACCGATATAGTTGTCGAGACAAAGATCACAAATCAGAGGCGAGGAAAGG
AAAGTCTAAACCCTAATTTTCGATCATGCAGGCGAATCTTAGATCCGTGCTCTCTCAGGT
GAGTCGGGGAGGGAGAGATGTTGGGTCTCGCCGTAATTTCGCTTCATACCTTGGAAACAG
TGAGATGAAGGGAGGCAGTCGAAGACGTGTGACCAGGCAGATTAAGGAAAAGATTCATTT
GTTTCGCAAATCTATGACCTATGGATATTGTGCTGTCATGAGTTGGGCAATTATCCAGAT
GTTTGAACACCGTCGAACGGTCGAGATAGATTTGGCTGAAAGATATGGTTCGAAACCAGA
GACGAGCTTCCGTGATGTCCTTGGTTGGATCCGTGGTAACAATTAATATTGTGTTTGATG
CTGCTTGTGTTTAAGTTCGTTTTATGCTGTGTGAACAAAACAAAAATCATAATCTATGGG
CATTACGTTGTATTTGATATATCATTATTCGTTCGGGCTTTCATGTCTAGTGTTTGTTTG
AGCTGC


BQ
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25 25 25 25 25 10 

AF RS1BP83JQ C 1
AF RS1DY45TF U 239
AF RS1BP83TF U 1
BS 1 238 RS1BP83TF
BS 239 545 RS1DY45TF
BS 546 546 RS1BP83JQ

RD RS1BP83JQ 546 0 0
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CATTACGTTGTATTTGATATATCATTATTCGTTCGGGCTTTCATGTCTAGTGTTTGTTTG
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DS 

RD RS1DY45TF 308 0 0
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ATGTTTGAACACCGTCGAACGGTCGAGATAGATTTGGCTGAAAGATATGGTTCGAAACCA
GAGACGAGCTTCCGTGATGTCCTTGGTTGGATCCGTGGTAACAATTAATATTGTGTTTGA
TGCTGCTTGTGTTTAAGTTCGTTTTATGCTGTGTGAACAAAACAAAAATCATAATCTATG
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TGAGCTG
T

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DS 

RD RS1BP83TF 546 0 0
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AAAGTCTAAACCCTAATTTTCGATCATGCAGGCGAATCTTAGATCCGTGCTCTCTCAGGT
GAGTCGGGGAGGGAGAGATGTTGGGTCTCGCCGTAATTTCGCTTCATACCTTGGAAACAG
TGAGATGAAGGGAGGCAGTCGAAGACGTGTGACCAGGCAGATTAAGGAAAAGATTCATTT
GTTTCGCAAATCTATGACCTATGGATATTGTGCTGTCATGAGTTGGGCAATTATCCAGAT
GTTTGAACACCGTCGAACGGTCGAGATAGATTTGGCTGAAAGATATGGTTCGAAACCAGA
GACGAGCTTCCGTGATGTCCTTGGTTGGATCCGTGGTAACAATTAATATTGTGTTTGATG
CTGCTTGTGTTTAAGTTCGTTTTATGCTGTGTGAACAAAACAAAAATCATAATCTATGGG
CATTACGTTGTATTTGATATATCATTATTCGTTCGGGCTTTCATGTCTAGTGTTTGTTTG
AGCTG
C

QA 1 545 1 545
DS 



AS 1 3

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ACATAAAACATTATTATATAAATATAGGGATTGCCTTTTGAAGTTTCAAGTCCAGCAGCC
CCATAATCCAAATGATTCACCTTGCACAAAGACGTCAGCGAAACAGCCCGTGTCATTACC
ACTGCCGTTGTTGTTGTTATCTTGCCCCGAGTGGTGGGTGGGTACAATGCTTGGGAAGTA
AGAGTCGCAGCTGTCTCTTAGTTGATGAGGTGCGTCTTCGTCTAGTACCGCACTCCCTGA
ACTTAACCGGTCCTCTGTTTTGATTGCCGGGTCCATGTTCACCGGATCGAGCTGGTTTGA
TTCCGATACCTGACCAGTAGCTGCCTCTTCTTTGGCTTGGACCTTGCCGGCGAGGGAAGT
CACCTGGGATCTGAGATGATGGTTGTCCTTGAGGATGGAGTCGTAGTTAGAGAGGAGTTG
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GCGACGGTTTTGAAACCAGACGGAAACTTGACGAGGCTGAAGTCCAAGCTTCTTGGCAAG
CTGAGTCTTGCGCTCTGGCTCCGGCTTGTTCTCCGTCTCAAAGCTTTTCTCCAGCAGATG
CACCTGTTCATGAGTAAGGCGACGCTTTTTGTCGGGTGTTTGGTCGTCGTAATAGTCAAC
GTCGTCGTAGAGAAGATCATCAGGAGAGCAAAAGAAGGGCCTTCGTTTCGATGATTCCTC
CTCCATGTTTATCATCGATCCTTGGACGACGGGATTGAGATTAGTGAGGAAGAACATGTT
GCCATGAGAAGTAGACGGATTGAAGAAAAACTTATTGGATTCCATTCGATTCGATTTTAC
CAGCAGAAGAAGAAGGAAGAAGAAACTTAAGAAAGAGAGAGAGGATTGGGGTTGAAAGTA
AAAAAGAGAAAGGTGGAAGACAAAGGGGAATATTAGAAGATGATAAACTTATGGCGGAAG
AAGCTAGTACTCCACACTAATCTTGCCGGACACTCCAACTGACACATGCAAAATCCCATC
ATCAACCGCAATACCCCCCTCCTCAACCAGAGGGAACCACAGATCTATTCAACCAAAAAA
AAGACAAGACAGACTTTGTTTTCTTTATTTCGATTTTTTTTAGTTATCGGATCATCATCA
TCTTAGTTTATCCAAGGACGCAATTCAAATTGCAGAAAGATTAAGAAATAGAAAGAGAGA
GAGACGGAGTTTTCCCCTTAGCCTATCC


BQ
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AF RS1F626JQ U 325
AF RS1C358JQ U 1
AF RS1C358TF C 684
BS 1 734 RS1C358JQ
BS 735 1348 RS1C358TF

RD RS1F626JQ 109 0 0
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TGCCGGGTTCATGTTCACCGGATCGAGCTGGTTTGATTCCGGTACCTGA

QA 1 109 1 109
DS 

RD RS1C358JQ 734 0 0
CCGTTCATAAAAAACATATGTATATATAACCGATAAAACACCGTGTGGAATTGCGGAATT
ACTCCACAAATTTATGCAGAGGGTTACGTCAACATAGACTGTACTTGATAAAACAAACGC
ACATAAAACATTATTATATAAATATAGGGATTGCCTTTTGAAGTTTCAAGTCCAGCAGCC
CCATAATCCAAATGATTCACCTTGCACAAAGACGTCAGCGAAACAGCCCGTGTCATTACC
ACTGCCGTTGTTGTTGTTATCTTGCCCCGAGTGGTGGGTGGGTACAATGCTTGGGAAGTA
AGAGTCGCAGCTGTCTCTTAGTTGATGAGGTGCGTCTTCGTCTAGTACCGCACTCCCTGA
ACTTAACCGGTCCTCTGTTTTGATTGCCGGGTCCATGTTCACCGGATCGAGCTGGTTTGA
TTCCGATACCTGACCAGTAGCTGCCTCTTCTTTGGCTTGGACCTTGCCGGCGAGGGAAGT
CACCTGGGATCTGAGATGATGGTTGTCCTTGAGGATGGAGTCGTAGTTAGAGAGGAGTTG
GTCGTAAGATGACTTGAGGAGATTGAAGTCTCTCTCGAGCTGCTTTGTTTTCCAACGAGC
GCGACGGTTTTGAAACCAGACGGAAACTTGACGAGGCTGAAGTCCAAGCTTCTTGGCAAG
CTGAGTCTTGCGCTCTGGCTCCGGCTTGTTCTCCGTCTCAAAGCTTTTCTCCAGCAGATG
CACCTGTTCATGAG

QA 1 734 1 734
DS 

RD RS1C358TF 665 0 0
GCTTGTTCTCCGTCTCAAAGCTTTTCTCCAGCAGATGCACCTGTTCATGAGTAAGGCGAC
GCTTTTTGTCGGGTGTTTGGTCGTCGTAATAGTCAACGTCGTCGTAGAGAAGATCATCAG
GAGAGCAAAAGAAGGGCCTTCGTTTCGATGATTCCTCCTCCATGTTTATCATCGATCCTT
GGACGACGGGATTGAGATTAGTGAGGAAGAACATGTTGCCATGAGAAGTAGACGGATTGA
AGAAAAACTTATTGGATTCCATTCGATTCGATTTTACCAGCAGAAGAAGAAGGAAGAAGA
AACTTAAGAAAGAGAGAGAGGATTGGGGTTGAAAGTAAAAAAGAGAAAGGTGGAAGACAA
AGGGGAATATTAGAAGATGATAAACTTATGGCGGAAGAAGCTAGTACTCCACACTAATCT
TGCCGGACACTCCAACTGACACATGCAAAATCCCATCATCAACCGCAATACCCCCCTCCT
CAACCAGAGGGAACCACAGATCTATTCAACCAAAAAAAAGACAAGACAGACTTTGTTTTC
TTTATTTCGATTTTTTTTAGTTATCGGATCATCATCATCTTAGTTTATCCAAGGACGCAA
TTCAAATTGCAGAAAGATTAAGAAATAGAAAGAGAGAGAGACGGAGTTTTCCCCTTAGCC
TATCC

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 3

CO CL4139Contig1 750 3 19 U
TTTTTAAAAGAACAAAAAAATAAAAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAAGTCACCATGGC
TAGCGCAAGAAGTTTGGTTGCCAAGGCAAATAACACTTATGTAGGCTCATTAATCTTAAT
GGCCTTGGTGTTAGGTTCTTGCATAGCGAATGGTGAATATCTCGGTGGCCGCCGTAACCT
TGCCGCTGTTGCCGGCAGCGCTACGGTCTTTGATATTACTAAGAATGGAGCAGTGGGAAC
TGGTGCCACCGATTCTTCCAAGGCGTTTCTAAACACATGGATCCAAGTGTGTGCCAGTCC
CACACCAGCAACGCTACTAGTTCCTAAAGGAGAGTTCTTGGCTGGTCCAGTAATTTTTGC
TGGTCCATGCAAGAGCAAAGTGACCGTCGAAGTTCAAGGTACAATCACCGCTCCACCAAG
CGGATACCCGACTCCTGAATGGTTCTTATTCGAACATGTCGATAATGTCGTCCTCACCGG
ACCCGGCACATTCCACGGCAAAGGTGAAGCCGTTTGGAAAGCAGATGGCTGTGGTCAAAA
G*CCAATTGTAATCTTCCTCCAACGTCTCTAAAATTCAGAAACATCTTAAATCTTGACAT
TTCCGGCATTAGCTCGGTCAACGCAAAGCCTTCCACATGTTCTTGGTAAAACTAAAATGT
CAACGTCCAAAACATCAGCTTACTGCTCCGGCTGAAGTCCCACACCGATGGTATCATTGA
GCATGCGTCACGTTCACATCGCTGACAGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 5 5 20 20 5 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G731TF U 1
AF RS1FY67TF U 1
AF RS1CN44TF U 1
BS 1 29 RS1CN44TF
BS 30 32 RS1FY67TF
BS 33 34 RS1CN44TF
BS 35 35 RS1FY67TF
BS 36 37 RS1CN44TF
BS 38 38 RS1FY67TF
BS 39 91 RS1CN44TF
BS 92 92 RS1FY67TF
BS 93 97 RS1CN44TF
BS 98 98 RS1FY67TF
BS 99 427 RS1CN44TF
BS 428 428 RS1FY67TF
BS 429 534 RS1CN44TF
BS 535 535 RS1FY67TF
BS 536 541 RS1CN44TF
BS 542 542 RS1FY67TF
BS 543 671 RS1CN44TF
BS 672 672 RS1FY67TF
BS 673 750 RS1CN44TF

RD RS1G731TF 646 0 0
TTTTTAAAAGAACAAAAAAATAAAAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAAGTCACCATGGC
TAGCGCAAGAAGTTTGGTTGCCAAGGCAAATAACACTTATGTAGGCTCATTAATCTTAAT
GGCCTTGGTGTTAGGTTCTTGCATAGCGAATGGTGAATATCTCGGTGGCCGCCGTAACCT
TGCCGCTGTTGCCGGCAGCGCTACGGTCTTTGATATTACTAAGAATGGAGCAGTGGGAAC
TGGTGCCACCGATTCTTCCAAGGCGTTTCTAAACACATGGATCCAAGTGTGTGCCAGTCC
CACACCAGCAACGCTACTAGTTCCTAAAGGAGAGTTCTTGGCTGGTCCAGTAATTTTTGC
TGGTCCATGCAAGAGCAAAGTGACCGTCGAAGTTCAAGGTACAATCACCGCTCCACCAAG
CGGATACCCGACTCCTGAATGGTTCTTATTCGAACATGTCGATAATGTCGTCCTCACCGG
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G*CCAATTGTAATCTTCCTCCAACGTCTCTAAAATTCAGAAACATCTTAAATCTTGACAT
TTCCGGCATTAGCTCGGTCAACGCAAAGCCTTCCACATGTTCTTGG

QA 1 646 1 646
DS 

RD RS1FY67TF 713 0 0
TTTTTAAAAGAACAAAAAAATAAAAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAAGTCACCATGGC
TAGCGCAAGAAGTTTGGTTGCCAAGGCAAATAACACTTATGTAGGCTCATTAATCTTAAT
GGCCTTGGTGTTAGGTTCTTGCATAGCGAATGGTGAATATCTCGGTGGCCGCCGTAACCT
TGCCGCTGTTGCCGGCAGCGCTACGGTCTTTGATATTACTAAGAATGGAGCAGTGGGAAC
TGGTGCCACCGATTCTTCCAAGGCGTTTCTAAACACATGGATCCAAGTGTGTGCCAGTCC
CACACCAGCAACGCTACTAGTTCCTAAAGGAGAGTTCTTGGCTGGTCCAGTAATTTTTGC
TGGTCCATGCAAGAGCAAAGTGACCGTCGAAGTTCAAGGTACAATCACCGCTCCACCAAG
CGGATACCCGACTCCTGAATGGTTCTTATTCGAACATGTCGATAATGTCGTCCTCACCGG
ACCCGGCACATTCCACGGCAAAGGTGAAGCCGTTTGGAAAGCAGATGGCTGTGGTCAAAA
G*CCAATTGTAATCTTCCTCCAACGTCTCTAAAATTCAGAAACATCTTAAATCTTGACAT
TTCCGGCATTAGCTCGGTCAACGCAAAGCCTTCCACATGTTCTTGGTAAAACTAAAATGT
CAATGTCCAAAACATCAGCTTACTGC*CCGGCTGAAGTCCCACAC
GATGGTAT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RS1CN44TF 750 0 0
TTTTTAAAAGAACAAAAAAATAAAAAAAA***AATAAAAAAAATAAAAAGTCACCATGGC
TAGCGCAAGAAGTTTGGTTGCCAAGGCAAATTACACTAATGTAGGCTCATTAATCTTAAT
GGCCTTGGTGTTAGGTTCTTGCATAGCGAATGGTGAATATCTCGGTGGCCGCCGTAACCT
TGCCGCTGTTGCCGGCAGCGCTACGGTCTTTGATATTACTAAGAATGGAGCAGTGGGAAC
TGGTGCCACCGATTCTTCCAAGGCGTTTCTAAACACATGGATCCAAGTGTGTGCCAGTCC
CACACCAGCAACGCTACTAGTTCCTAAAGGAGAGTTCTTGGCTGGTCCAGTAATTTTTGC
TGGTCCATGCAAGAGCAAAGTGACCGTCGAAGTTCAAGGTACAATCACCGCTCCACCAAG
CGGATACTCGACTCCTGAATGGTTCTTATTCGAACATGTCGATAATGTCGTCCTCACCGG
ACCCGGCACATTCCACGGCAAAGGTGAAGCCGTTTGGAAAGCAGATGGCTGTGGACAAAA
GGCCAATTGTAATCTTCCTCCAACGTCTCTAAAATTCAGAAACATCTTAAATCTTGACAT
TTCCGGCATTAGCTCGGTCAACGCAAAGCCTTCCACATGTTCTTGGTAAAACTAAAATGT
CAACGTCCAAA*CATCAGCTTACTGCTCCGGCTGAAGTCCCACACCGATGGTATCATTGA
GCATGCGTCACGTTCACATCGCTGACAGTT

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL4140Contig1 787 2 10 U
GGGGGTTCCTGCATCATCATCGGCCACTACTAAAGTTGATAACACTGAGGAAGAGGCCAA
GAAGAAAGCTAGACTCGCACGTTTCGGGAAAGATACTAAAGTCGATTCGGCTGAGGAAGA
TAAACGCAAAGCTAGGGCATTAAGGTTTTCAAAACCTGCTTCTGATTCATCTTCGGAATT
ACCTGGGAAGCTTAACATTGGCAAGGAGGCAGCAGGAAACGCTGCATAAGGTTCCTGAAT
AAGGTTCCTTCTATCTTTGTAGTTAGGTAGTGTTCTAGCGTCTTATGATTCCCTCTCTGG
CTGCTTGATTCTCTCTTTTATATTTCTGAATTAGAAGTCCCCCCGGTATGTAGTATCTAT
CTTTATTAAGGTCGAAGTTTGGTCGTGGAGCAAGGTTATGTGGTCATGCAATGATTCTCT
CAGATGGACGGAAGCTAAGTTGTCACCAGATGAGATCATGAGAAATCAATAAAGTAACCT
ATAGTTCTGATTGTCTTAGAAAAGCAAATGTGTTAGGACCTAGGGATTCTGAAGTGGCTG
TTTTCTTAACCTTTTTCCGTGTTACAGGTGCTTAAAGTGGTAAGTTTAGATTGAGTGATG
CCTTTATTTCCTTAAATGCACTGCATGTTGGTATCAAGCATAGGCAGCATCAATAGAGCT
TTTTATACTAGTTGGAAATTGAAAATGTTGAATCTGTTGATTGCTTTCCGAGTTGCCTAA
TTTGCTAGCTTATCTATATATTGTTACGGATCCCATTACAATTTGTCGTTTGGTTTGCTA
TTTATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 

AF RS1CC14TF U 1
AF RS1GF23TF U 221
BS 1 423 RS1CC14TF
BS 424 424 RS1GF23TF
BS 425 643 RS1CC14TF
BS 644 644 RS1GF23TF
BS 645 711 RS1CC14TF
BS 712 712 RS1GF23TF
BS 713 748 RS1CC14TF
BS 749 749 RS1GF23TF
BS 750 783 RS1CC14TF
BS 784 787 RS1GF23TF

RD RS1CC14TF 785 0 0
GGGGGTTCCTGCATCATCATCGGCCACTACTAAAGTTGATAACACTGAGGAAGAGGCCAA
GAAGAAAGCTAGACTCGCACGTTTCGGGAAAGATACTAAAGTCGATTCGGCTGAGGAAGA
TAAACGCAAAGCTAGGGCATTAAGGTTTTCAAAACCTGCTTCTGATTCATCTTCGGAATT
ACCTGGGAAGCTTAACATTGGCAAGGAGGCAGCAGGAAACGCTGCATAAGGTTCCTGAAT
AAGGTTCCTTCTATCTTTGTAGTTAGGTAGTGTTCTAGCGTCTTATGATTCCCTCTCTGG
CTGCTTGATTCTCTCTTTTATATTTCTGAATTAGAAGTCCCCCCGGTATGTAGTATCTAT
CTTTATTAAGGTCGAAGTTTGGTCGTGGAGCAAGGTTATGTGGTCATGCAATGATTCTCT
CAGGTGGACGGAAGCTAAGTTGTCACCAGATGAGATCATGAGAAATCAATAAAGTAACCT
ATAGTTCTGATTGTCTTAGAAAAGCAAATGTGTTAGGACCTAGGGATTCTGAAGTGGCTG
TTTTCTTAACCTTTTTCCGTGTTACAGGTGCTTAAAGTGGTAAGTTTAGATTGAGTGATG
CCTTTATTTCCTTAAATGCACTGCATGTTGGTATCAAGCATAG*CAGCATCAATAGAGCT
TTTTATACTAGTTGGAAATTGAAAATGTTGAATCTGTTGATTGCTTTCCGATTTGCCTAA
TTTGCTAGCTTATCTATATATTGTTACG*ATCCCATTACAATTTGTCGTTTGGTTTGCTA
TTT
TA

QA 1 783 1 783
DS 

RD RS1GF23TF 567 0 0
GCTGCATAAGGTTCCTGAATAAGGTTCCTTCTATCTTTGTAGTTAGGTAGTGTTCTAGCG
TCTTATGATTCCCTCTCTGGCTGCTTGATTCTCTCTTTTATATTTCTGAATTAGAAGTCC
CCCCGGTATGTAGTATCTATCTTTATTAAGGTCGAAGTTTGGTCGTGGAGCAAGGTTATG
TGGTCATGCAATGATTCTCTCAGATGGACGGAAGCTAAGTTGTCACCAGATGAGATCATG
AGAAATCAATAAAGTAACCTATAGTTCTGATTGTCTTAGAAAAGCAAATGTGTTAGGACC
TAGGGATTCTGAAGTGGCTGTTTTCTTAACCTTTTTCCGTGTTACAGGTGCTTAAAGTGG
TAAGTTTAGATTGAGTGATGCCTTTATTTCCTTAAATGCACTGCATGTTGGTATCAAGCA
TAGGCAGCATCAATAGAGCTTTTTATACTAGTTGGAAATTGAAAATGTTGAATCTGTTGA
TTGCTTTCCGAGTTGCCTAATTTGCTAGCTTATCTATATATTGTTACGGATCCCATTACA
ATTTGTCGTTTGGTTTGCTATTTATAT

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 3

CO CL4141Contig1 728 3 5 U
AGCATAGACGCGAGAGAAGGAAGAGGTAGGAAATCAACTCAGCTCCGCTAGTTTCCAAGC
ACCACAGCGTCGATGTCAATAACATTGCACACGAATCTGGGGGATATAAAGTGCGAGATC
TTCTGTGACGAGGTTCCAAAGAGTGCCGAGAACTTTCTGGCGCTATGTGCAAGTGGCTAT
TACGATGGGACTATCTTTCACAGGAACATCAAAGGCTTCATGATCCAAGGCGGAGACCCA
ACCGGTACAGGGAAAGGAGGAACTAGCATCTGGGGAAAGAAATTCAATGACGAGATTCGT
GACTCCCTTAAGCACAATGCAAGAGGGATGCTGTCGATGGCAAACAGTGGCCCAAACACA
AATGGAAGCCAGTTCTTCCTTACCTATGCCAAACAACCTCATCTCAATGGATTATACACC
ATCTTTGGCAAAGTCATCCATGGCTTCGAAGTGCTTGACATTATGGAAAAGACTCAAACA
GGTGCGGGAGATAGGCCGCTTGCTGAGATAAGGCTAAACCGTGTTACAATCCACGCCAAT
CCACTTGCTGCTTAATAAGTCACAATGCCGCTGCCGCAGAGCTGAACCAAAGCCCTATTC
GTTTTTACCTATTAAAAAGTTTGTACTGTGTTTTCTTTTTTTATTATCACTGACTGTGAT
CATCGAGATTAGAAATCCATCATGTCCTGAGAGAGAGAGTCCCAAAGTTCTAGAAAAGTG
ACCATCAA


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 
25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RS1AL90JQ C 196
AF RS1AE61TF U 1
AF RS1AL90TF U 2
BS 1 288 RS1AE61TF
BS 289 289 RS1AL90TF
BS 290 700 RS1AE61TF
BS 701 701 RS1AL90TF
BS 702 728 RS1AE61TF

RD RS1AL90JQ 247 0 0
TTTCACAGGAACATCAAAGGCTTCATGATCCAAGGGGGAGACCCAACCGGTACAGGGAAA
GGAGGAACTAGCATTTGGGGAAAGAAATTCAATGACGAGATTCGTGACTCCCTTAAGCAC
AATGCAAGAGGGATGCTGTGGATGGCAAACAGTGGCCCAAACACAAATGGAAGCCAGTTT
TTCCTTACCTATGCCAAACAACCTCATTTCAATGGATTATACCCCATTTTTGGCAAAGTC
ATCCATG

QA 1 247 1 247
DS 

RD RS1AE61TF 728 0 0
AGCATAGACGCGAGAGAAGGAAGAGGTAGGAAATCAACTCAGCTCCGCTAGTTTCCAAGC
ACCACAGCGTCGATGTCAATAACATTGCACACGAATCTGGGGGATATAAAGTGCGAGATC
TTCTGTGACGAGGTTCCAAAGAGTGCCGAGAACTTTCTGGCGCTATGTGCAAGTGGCTAT
TACGATGGGACTATCTTTCACAGGAACATCAAAGGCTTCATGATCCAAGGCGGAGACCCA
ACCGGTACAGGGAAAGGAGGAACTAGCATCTGGGGAAAGAAATTCAATAACGAGATTCGT
GACTCCCTTAAGCACAATGCAAGAGGGATGCTGTCGATGGCAAACAGTGGCCCAAACACA
AATGGAAGCCAGTTCTTCCTTACCTATGCCAAACAACCTCATCTCAATGGATTATACACC
ATCTTTGGCAAAGTCATCCATGGCTTCGAAGTGCTTGACATTATGGAAAAGACTCAAACA
GGTGCGGGAGATAGGCCGCTTGCTGAGATAAGGCTAAACCGTGTTACAATCCACGCCAAT
CCACTTGCTGCTTAATAAGTCACAATGCCGCTGCCGCAGAGCTGAACCAAAGCCCTATTC
GTTTTTACCTATTAAAAAGTTTGTACTGTGTTTTCTTTTTTTATTATCACTGACTGTGAT
CATCGAGATTAGAAATCCATCATGTCCTGAGAGAGAGAGTTCCAAAGTTCTAGAAAAGTG
ACCATCAA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1AL90TF 722 0 0
GG
ATAGACGCGAGAGAAGGAAGAGGTAGGAAATCAACTCAGCTCCGCTAGTTTCCAAGCATC
ACAGCGTCGATGTCAATAACATTGCACACGAATCTGGGGGATATAAAGTGCGAGATCTTC
TGTGACGAGGTTCCAAAGAGTGCCGAGAACTTTCTGGCGCTATGTGCAAGTGGCTATTAC
GATGGGACTATCTTTCACAGGAACATCAAAGGCTTCATGATCCAAGGCGGAGACCCAACC
GGTACAGGGAAAGGAGGAACTAGCATCTGGGGAAAGAAATTCAATGACGAGATTCGTGAC
TCCCTTAAGCACAATGCAAGAGGGATGCTGTCGATGGCAAACAGTGGCCCAAACACAAAT
GGAAGCCAGTTCTTCCTTACCTATGCCAAACAACCTCATCTCAATGGATTATACACCATC
TTTGGCAAAGTCATCCATGGCTTCGAAGTGCTTGACATTATGGAAAAGACTCAAACAGGT
GCGGGAGATAGGCCGCTTGCTGAGATAAGGCTAAACCGTGTTACAATCCACGCCAATCCA
CTTGCTGCTTAATAAGTCACAATGCCGCTGCCGCAGAGCTGAACCAAAGCCCTATTCGTT
TTTACCTATTAAAAAGTTTGTACTGTGTTTTCTTTTTTTATTATCACTGACTGTGATCAT
CGAGATTAGAAATCCATCATGTCCTGAGAGAGAGAGTCCCAAAGTTCTAGAAAAGTGACC

QA 3 722 3 722
DS 



AS 1 3

CO CL4142Contig1 768 3 2 U
GGAAGCTCATCAACTTTTCTCGAAACTCCAAACTTCATCGTCTTCCTCTGCTTCTCTCTT
CTTGAACTCAAAAAGTTCCCCAAGCAATGCCTCTCTCTCTCCGTCTCGCACCACCTCCTA
CCGCTTTAGCTTCAACCAACGGTGGACTTGGTGGTCCCCTGAAGAAGAAGCAGTGCCGCA
TCCCTTACTCCGGCGTCGCCACCACGAGGATTGGTCTCTGCTCATTGGATTATGGGAAAA
GGGTAGATTCCTATGTGGTGAGGTGTAGCTTAGAGACAGTGAATGTAAGTGTTGGTCAAG
TGACGGAAGTGGATAAGGACACCTTCTGGCCCACCGTTAAAGCCGCCGGTGATAAGATTG
TGGTGCTTGACATGTACACTCAATGGTGTGGTCCATGTAAAGTGATTGCACCTAAGTACA
AAGATTTATCAGAGAAGTACGAGGACGTTGTGTTTCTAAAGCTTGACTGCAACCCTGAAA
ACAGGCCATTAGTAAAGGAGCTAGGGTTAAGAGTGGTTCCAACTTTCAAAATCTTTAAGG
ATAATAAAGTCGTCAAGGAAGTTACCGGTGCCAAATATGATAATCTGGTCGAAGCCATTG
AAACAGCCAGGTCTGCTGCTGGTTTTTCAGGATGAACCAAATCCTCATGTAAAGACTTTA
CCTTACTTGGGTTGTAAAATGTAGTAAACTTTGCTGCTCTTATTTTATTGGAAATGAAAA
GAGTTTTATGTATTAAAATGGTAAAATACAAAATTAAGTTGATGTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DT06TF U 1
AF RS1B356TF U 23
AF RS1B356JQ C 225
BS 1 624 RS1DT06TF
BS 625 768 RS1B356JQ

RD RS1DT06TF 627 0 0
GGAAGCTCATCAACTTTTCTCGAAACTCCAAACTTCATCGTCTTCCTCTGCTTCTCTCTT
CTTGAACTCAAAAAGTTCCCCAAGCAATGCCTCTCTCTCTCCGTCTCGCACCACCTCCTA
CCGCTTTAGCTTCAACCAACGGTGGACTTGGTGGTCCCCTGAAGAAGAAGCAGTGCCGCA
TCCCTTACTCCGGCGTCGCCACCACGAGGATTGGTCTCTGCTCATTGGATTATGGGAAAA
GGGTAGATTCCTATGTGGTGAGGTGTAGCTTAGAGACAGTGAATGTAAGTGTTGGTCAAG
TGACGGAAGTGGATAAGGACACCTTCTGGCCCACCGTTAAAGCCGCCGGTGATAAGATTG
TGGTGCTTGACATGTACACTCAATGGTGTGGTCCATGTAAAGTGATTGCACCTAAGTACA
AAGATTTATCAGAGAAGTACGAGGACGTTGTGTTTCTAAAGCTTGACTGCAACCCTGAAA
ACAGGCCATTAGTAAAGGAGCTAGGGTTAAGAGTGGTTCCAACTTTCAAAATCTTTAAGG
ATAATAAAGTCGTCAAGGAAGTTACCGGTGCCAAATATGATAATCTGGTCGAAGCCATTG
AAACAGCCAGGTCTGCTGCTGGTT
CTT

QA 1 624 1 624
DS 

RD RS1B356TF 604 0 0
GG
ACTCCAAACTTCATCGTCTTCCTCTGCTTCTCTCTTCTTGAACTCAAAAAGTTCCCCAAG
CAATGCCTCTCTCTCTCCGTCTCGCACCATCTCCTACCGCTTTAGCTTCAACCAACGGTG
GACTTGGTGGTCCCCTGAAGAAGAAGCAGTGCCGCATCCCTTACTCCGGCGTCGCCACCA
CGAGGATTGGTCTCTGCTCATTGGATTATGGGAAAAGGGTAGATTCCTATGTGGTGAGGT
GTAGCTTAGAGACAGTGAATGTAAGTGTTGGTCAAGTGACGGAAGTGGATAAGGACACCT
TCTGGCCCACCGTTAAAGCCGCCGGTGATAAGATTGTGGTGCTTGACATGTACACTCAAT
GGTGTGGTCCATGTAAAGTGATTGCACCTAAGTACAAAGATTTATCAGAGAAGTACGAGG
ACGTTGTGTTTCTAAAGCTTGACTGCAACCCTGAAAACAGGCCATTAGTAAAGGAGCTAG
GGTTAAGAGTGGTTCCAACTTTCAAAATCTTTAAGGATAATAAAGTCGTCAAGGAAGTTA
CCGGTGCCAAATATGATAATCTGGTCGAAGCCATTGAAACAGCCAGGTCTGCTGCTGGTT
CT

QA 3 602 3 602
DS 

RD RS1B356JQ 544 0 0
TTGGATTATGGGAAAAGGGTAGATTCCTATGTGGTGAGGTGTAGCTTAGAGACAGTGAAT
GTAAGTGTTGGTCAAGTGACGGAAGTGGATAAGGACACCTTCTGGCCCACCGTTAAAGCC
GCCGGTGATAAGATTGTGGTGCTTGACATGTACACTCAATGGTGTGGTCCATGTAAAGTG
ATTGCACCTAAGTACAAAGATTTATCAGAGAAGTACGAGGACGTTGTGTTTTTAAAGCTT
GACTGCAACCCTGAAAACAGGCCATTAGTAAAGGAGCTAGGGTTAAGAGTGGTTCCAACT
TTCAAAATCTTTAAGGATAATAAAGTCGTCAAGGAAGTTACCGGTGCCAAATATGATAAT
TTGGTCGAAGCCATTGAAACAGCCAGGTTTGCTGCTGGTTTTTCAGGATGAACCAAATCC
TCATGTAAAGACTTTACCTTACTTGGGTTGTAAAATGTAGTAAACTTTGCTGCTCTTATT
TTATTGGAAATGAAAAGAGTTTTATGTATTAAAATGGTAAAATACAAAATTAAGTTGATG
TGTT

QA 1 544 1 544
DS 



AS 1 2

CO CL4143Contig1 437 2 2 U
AGGGTCTCAACTCAACATTCATTCTCAGAGAAGCCGTCTTCCTCTTGTAATCTCTCTCTC
GATCGGACATCATCTTATCCGCGTTTCCAATGTCGAGCCGTTGGTTGCGACCTGAGGTGT
ATCCTTTGTTCGCGGCTACTGGAGTTGCGGTCGGGATCTGCGCGTTTTCGTTGATCAGAA
ACATCACCGGCAATCCTGAAGTCAGATGTACAAAGGAGAATAGGGCAGCTGGGATTTTGG
ATAACCATGCGGAGGGAGAGAAGTACAAGGAAAACTTCCTGAGGAAGTACGTTCGCAACA
AGCACCCTGAGATCATGCCTGGCATCAACAAATTCTTCACTGATCCTAAATACTGAATGA
CAAAACTTTGTTGTTGTTATATTGTTTCTTGGATTGAATCTCTTCACTCTTCCCTATGAT
ATAAACCCTCATTTGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1FT45JQ C 1
AF RS1FT45TF U 1
BS 1 435 RS1FT45TF
BS 436 437 RS1FT45JQ

RD RS1FT45JQ 437 0 0
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GATCGGACATCATCTTATCCGCGTTTCCAATGTCGAGCCGTTGGTTGCGACCTGAGGTGT
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ATAACCATGCGGAGGGAGAGAAGTACAAGGAAAACTTCCTGAGGAAGTACGTTCGCAACA
AGCACCCTGAGATCATGCCTGGCATCAACAAATTCTTCACTGATCCTAAATACTGAATGA
CAAAACTTTGTTGTTGTTATATTGTTTCTTGGATTGAATCTCTTCACTCTTCCCTATGAT
ATAAACCCTCATTTGCC

QA 1 437 1 437
DS 

RD RS1FT45TF 437 0 0
AGGGTCTCAACTCAACATTCATTCTCAGAGAAGCCGTCTTCCTCTTGTAATCTCTCTCTC
GATCGGACATCATCTTATCCGCGTTTCCAATGTCGAGCCGTTGGTTGCGACCTGAGGTGT
ATCCTTTGTTCGCGGCTACTGGAGTTGCGGTCGGGATCTGCGCGTTTTCGTTGATCAGAA
ACATCACCGGCAATCCTGAAGTCAGATGTACAAAGGAGAATAGGGCAGCTGGGATTTTGG
ATAACCATGCGGAGGGAGAGAAGTACAAGGAAAACTTCCTGAGGAAGTACGTTCGCAACA
AGCACCCTGAGATCATGCCTGGCATCAACAAATTCTTCACTGATCCTAAATACTGAATGA
CAAAACTTTGTTGTTGTTATATTGTTTCTTGGATTGAATCTCTTCACTCTTCCCTATGAT
ATAAACCCTCATTTG
CC

QA 1 435 1 435
DS 



AS 1 2

CO CL4144Contig1 774 2 10 U
GGAAGTTGCTTCTAGCTGCCATTGATGAGTACTGTAAAGGAACATATGATTTCTTTTATT
TGCCAATTGACTTCAAGAACAAATGCAATGTGGGATATGCTTTCATCAACCTTACAAAAC
CGGAAAACATTGTCCCGTTGTACAAGGCGTTCAACGGTAAGAAATGGGAAAAATTCAACA
GCGAGGAGGTGGCATCTCTTGCATATGGTCGGATCCAGGGACAATCAGCTCTTATTGCTC
ATTTCCAGAACTCAAGTTTGATGAACGAAGACAAACGTTGCCGGCCTATTCTCTTCCACA
CCACTGGTCCAAATGCTGGTGAGCAGGAACCATTTCCAATGGGTTCGAACATCAGGTCAA
GACCAGGCAAGCGTCGAACAAGTAGGATCGACAACTACACCAACTTTAGCAGCAGCTTTG
AAAACCGAGAAGAGACAGACTCGTTCTAACCTGATGAGCTAGAAAGTTTTCGTGTCATAA
GCCAGACTAACCTTAGGGAGATCTTCTGCTATCAGAGGTAGAAAAAGAAAGGAGACCCAA
AAGATTAAGACGATGGTAAATATACTTGTTCAGGTTGTTTCAGAAGTTTTGTTGTATCAT
CAAACCCCCCAGAGAAATCTTGCTGGCTTTTTTTGGTTTTGTTTTTATTTGGCAAGTTTT
GCGCTTGCAACCAGAGAAAATATTGCTGGGTTGTTTCTAGAAGGATCTTTCTTTGCACTT
TGCTTACAAAATGTAACTTTAACTTCATAAAATCGATGTGTTCAGTTTCTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EO87TF U 1
AF RS1EO87JQ C 289
BS 1 679 RS1EO87TF
BS 680 680 RS1EO87JQ
BS 681 703 RS1EO87TF
BS 704 704 RS1EO87JQ
BS 705 730 RS1EO87TF
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BS 752 752 RS1EO87JQ
BS 753 766 RS1EO87TF
BS 767 774 RS1EO87JQ

RD RS1EO87TF 766 0 0
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GCCAGACTAACCTTAGGGAGATCTTCTGCTATCAGAGGTAGAAAAAGAAAGGAGACCCAA
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CAAACCCCCCAGAGAAATCTTGCTGGCTTTTTTTGGTTTTGTTTTTATTTGGCAAGTTTT
GCGCTTGCAACCAGAGAAA*TATTGCTGGGTTGTTTCTAGAAG*ATCTTTCTTTGCACTT
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QA 1 766 1 766
DS 

RD RS1EO87JQ 486 0 0
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AAGGAGACCCAAAAGATTAAGACGATGGTAAATATACTTGTTCAGGTTGTTTCAGAAGTT
TTGTTGTATCATCAAACCCCCCAGAGAAATCTTGCTGGCTTTTTTTGGTTTTGTTTTTAT
TTGGCAAGTTTTGCGCTTGCAACCAGAGAAAATATTGCTGGGTTGTTTCTAGAAGGATCT
TTCTTTGCACTTTGCTTACAAAATGTAACTTTAACTTCATAAAATCGATGTGTTCAGTTT
CTCTCC

QA 1 486 1 486
DS 



AS 1 3

CO CL4145Contig1 1185 3 17 U
GCTGTAACACCAAAAAGTAAAATTTTATACGATGAAAGTGATTTGAGTCAAACTAGAAAC
AAGCTGTCATACCAAAAGTATAGAGATAAATAAAAATACACGGTGCGACGTGTTTACAGA
CGAAAAGTAAGATAAAATAAATAAAAACCTATTCCGATTGTCTTTGTTCAAACTTTTCAT
TCCACAATCAAAACTGCAAGCAGGTATAAGATTTTAGAAAACCAAAAGGATCATCTCAAA
CTCTCTTTCTACCACAAACACATAAAAAAGCCTTTTTTTCTTTACCTCACACAAGAACTT
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ACCACGCTCACTAGTAGAGCTACTGCTATTAATCACTTCACTTTCCATTGGATTCAAAAA
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ATGGTTAGACTCGTTATCTGAATGGTGGGATGAAGTGGACCCAGCAGTGCTTCGTCTTGT
GTTGGTTGTTTTCGGTTTCTGAGCCCTTGGGAGTGTTTGATCTCCATGTCATTGCTCTTG
CCTGTGGCAGGGTCAAGTTGGGATTCATCTCCTACGTGTACTTTCAAGCCTGAATCAGCA
CCCAACTTGGATGCCAGAATAGTTGCAGCAGCCGCCCTTGCAGCTGGGTCAGGGTCAAAC
CTACGAAGAATATCGAGAGTGGTGAAGTAATTGGTCCTCTCTTTCAACTCATCGATCTTC
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AAGATCCTGAAACTCCTCAGTTTCCAATCCAAATCCTCATCTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DY77JQ U 1
AF RS1F515JQ U 69
AF RS1F515TF C 504
BS 1 108 RS1DY77JQ
BS 109 109 RS1F515JQ
BS 110 170 RS1DY77JQ
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BS 267 416 RS1DY77JQ
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BS 652 831 RS1F515JQ
BS 832 1185 RS1F515TF

RD RS1DY77JQ 651 0 0
GCTGTAACACCAAAAAGTAAAATTTTATACGATGAAAGTGATTTGAGTCAAACTAGAAAC
AAGCTGTCATACCAAAAGTATAGAGATAAATAAAAATACACGGTGCGATGTGTTTACAGA
CGAAAAGTAAGATAAAATAAATAAAAACCTATTCCGATTGTCTTTGTTCAGACTTTTCAT
TCCACAATCAAAACTGCAAGCAGGTATAAGATTTTAGAAGACCAAAAGGATCATCTCAAG
CTCTCTTTCTACCACAAACACATAAGAAAGCCTTTTTTTCTTTACCTCACACAAGAACTT
TTCTTAGCTCTCAGTTGTTTCCGAGGCTTCTCCCACAATCTCGGCAGGGAGTGGACTGTC
ACCACGCTCACTAGTAGAGCTACTGCTATTAATCACTTCACTTTCCATTGGATTCAGAAA
GGCTGTATTAGCAGTAGGAGGAAAAAGTGATTGCTGCTCTTCTGAATGCTTCGGCTTGTT
CAAGGCCCGGCAATGAGGACAATAGTAAGTAGTGTACTCGAAGTCCTCTTTCCGGCAAAG
TCCGTTATGCATATGGCAGTTTCCGCAGATGAGTGCATACGACTGAGTTGGATCTTCACC
AACGAGGAGAGCCGCTATGCGTGAGATCCAGCTACCGTCATGAGCAGCATA

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1F515JQ 763 0 0
CC
ACCAAAAGTATAGAGATAAATAAAAATACACGGTGCGACGTGTTTACAGACGAAAAGTAA
GATAAAATAAATAAAAACCTATTCCGATTGTCTTTGTTCAAACTTTTCATTCCACAATCA
AAACTGCAAGCAGGTATAAGATTTTAGAAAACCAAAAGGATCATCTCAAACTCTCTTTCT
ACCACAAACACATAAAAAAGCCTTTTTTTCTTTACCTCACACAAGAACTTTTCTTAGCTC
TCAGTTGTTTCCGAGGCTTCTCCCACAATCTCGGCAGGGAGTGGACTGTCACCACGCTCA
CTAGTAGAGCTACTGCTATTAATCACTTCACTTTCCATTGGATTCAAAGAGGCTGTATTA
GCAGTAGGAGGAACAAGTGATTGCTGCTCTTCTGAATGCTTCGGCTTGTTCAAGGCCCGG
CAATGAGGACAATAGTAAGTAGTGTACTCGAAGTCCTCTTTCCGGCAAAGTCCGTTATGC
ATATGGCAGTTTTCGCAGATGAGTGCATACGACTGAGTTGGATCTTCACCAACGAGGAGA
GCCGCTATGCGTGAGATCCAGCTACCGTCATGAGCAGCATACCCCTGAGGGTTAAAATGC
TCGAAAGCCATCTGCTGGTTTTGCTCTGTGGTTCCTTCGCTTGTTCCAGAATGGTTAGAC
TCGTTATCTGAATGGTGGGATGAAGTGGACCCAGCAGTGCTTCGTCTTGTGTTGGTTGTT
TTCGGTTTCTGAGCCCTTGGGAGTGTTTGATCTCCATGTCA

QA 3 763 3 763
DS 

RD RS1F515TF 682 0 0
AGTAAGTAGTGTACTCGAAGTCCTCTTTCCGGCAAAGTCCGTTATGCATATGGCAGTTTT
CGCAGATGAGTGCATACGACTGAGTTGGATCTTCACCAACGAGGAGAGCCGCTATGCGTG
AGATCCAGCTACCGTCATGAGCAGCATACCCCTGAGGGTTAAAATGCTCGAAAGCCATCT
GCTGGTTTTGCTCTGTGGTTCCTTCGCTTGTTCCAGAATGGTTAGACTCGTTATCTGAAT
GGTGGGATGAAGTGGACCCAGCAGTGCTTCGTCTTGTGTTGGTTGTTTTCGGTTTCTGAG
CCCTTGGGAGTGTTTGATCTCCATGTCATTGCTCTTGCCTGTGGCAGGGTCAAGTTGGGA
TTCATCTCCTACGTGTACTTTCAAGCCTGAATCAGCACCCAACTTGGATGCCAGAATAGT
TGCAGCAGCCGCCCTTGCAGCTGGGTCAGGGTCAAACCTACGAAGAATATCGAGAGTGGT
GAAGTAATTGGTCCTCTCTTTCAACTCATCGATCTTCCCCAGCATTTCACCTTGAAGCTT
CTCCAATGTGTTTTGATCTCTGCGGTCACACATCCTGGTGAAGCTAACGAGAGAAGAATA
AGTAAGGAAAGAAAGAGCAGGCAAAAGAAACATAGGCAAGATCCTGAAACTCCTCAGTTT
CCAATCCAAATCCTCATCTCTC

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 3

CO CL4146Contig1 777 3 2 U
GGCCCTCCCTCTGGAGGTTTATCAAAGAGGAGACGACGACGACAATGCAGAGATTCTGCA
CTAAGCTGCGTTCGATTTCCCTCCACCCAAATCTGAACCTCTCTTTAACAACTGTTCCTC
GCCGCCTCATCCACCACTCTCCGACTCCTCGGTCAACCCTAGGTTTAGGTTTCGCAACAA
CGACCAAATGGAGTTTCGTTTCTCCCTCGAATCCTCCTACCTCCATCGGATCTCTCTCCG
TTCCTCACTATTTTGTTCAAGTAAGGAATATCACTTCCAAGGATAAAATGGCGAAATGGA
AGAAGAAGTGGAGACCTAGGACTCCAATCACATCCAAAGTCAAGAAAGTCAAGATCAAGT
TTTACTCGTCATACAAAGACAGGTTTAGACCACTGAATGATGGTACCATCCGTCGCTGGA
AAGAAGGAAAGCGCCACAACGCACACTTGAAGTCAAAGAAATCAAAACGTAGATTGAGAC
AGCCTGGACTAGTACCACCAGCATATGCCAAAGTCGTGAAGAAACTCAATTTCTGCAATT
GAGAGATAGAGAATGAAACTGTTCAATCTCTCTTCCAAATTTCCAGATAATTGTCTTTTA
GCTGGTACCCAGGGGTTTTACCAAACTTTAGTTCTTTTTTTGTTTTTGTGTTTCAGTTTT
AACCTTAGCACAAAGTAATAAAATTGTCATTTTTGGTAAATTGCCAACGGATTTGTGACG
GAAGAAAATATTTTGTGCATGTATTTTGTTTGGACTAACGTCTTGCATAACTTCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1FK89TF U 27
AF RS1GK38TF U 1
AF RS1GK38JQ C 221
BS 1 687 RS1GK38TF
BS 688 777 RS1GK38JQ

RD RS1FK89TF 302 0 0
GAGGAGACGACGACGACGATGCGGAGATTCTGCACTAAGCTGCGTTCGATTTCCCTCCAC
CCAAATCTGAACCTCTCTTTAACAACTGTTCCTCGCCGCCTCATCCACCACTCTCCGACT
CCTCGGTCAACCCTAGGTTTAGGTTTCGCAACAACGACCAAATGGAGTTTCGTTTCTCCC
TCGAATCCTCCTACCTCCATCGGATCTCTCTCCGTTCCTCACTATTTTGTTCAAGTAAGG
AATATCACTTCCAAGGATAAAATGGCGAAATGGAAGAAGAAGTGGAGACCTATGACTCCA
AT

QA 1 302 1 302
DS 

RD RS1GK38TF 687 0 0
GGCCCTCCCTCTGGAGGTTTATCAAAGAGGAGACGACGACGACAATGCAGAGATTCTGCA
CTAAGCTGCGTTCGATTTCCCTCCACCCAAATCTGAACCTCTCTTTAACAACTGTTCCTC
GCCGCCTCATCCACCACTCTCCGACTCCTCGGTCAACCCTAGGTTTAGGTTTCGCAACAA
CGACCAAATGGAGTTTCGTTTCTCCCTCGAATCCTCCTACCTCCATCGGATCTCTCTCCG
TTCCTCACTATTTTGTTCAAGTAAGGAATATCACTTCCAAGGATAAAATGGCGAAATGGA
AGAAGAAGTGGAGACCTAGGACTCCAATCACATCCAAAGTCAAGAAAGTCAAGATCAAGT
TTTACTCGTCATACAAAGACAGGTTTAGACCACTGAATGATGGTACCATCCGTCGCTGGA
AAGAAGGAAAGCGCCACAACGCACACTTGAAGTCAAAGAAATCAAAACGTAGATTGAGAC
AGCCTGGACTAGTACCACCAGCATATGCCAAAGTCGTGAAGAAACTCAATTTCTGCAATT
GAGAGATAGAGAATGAAACTGTTCAATCTCTCTTCCAAATTTCCAGATAATTGTCTTTTA
GCTGGTACCCAGGGGTTTTACCAAACTTTAGTTCTTTTTTTGTTTTTGTGTTTCAGTTTT
AACCTTAGCACAAAGTAATAAAATTGT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1GK38JQ 557 0 0
CTCCATCGGATCTCTCTCCGTTCCTCACTATTTTGTTCAAGTAAGGAATATCACTTCCAA
GGATAAAATGGCGAAATGGAAGAAGAAGTGGAGACCTAGGACTCCAATCACATCCAAAGT
CAAGAAAGTCAAGATCAAGTTTTACTCGTCATACAAAGACAGGTTTAGACCACTGAATGA
TGGTACCATCCGTCGCTGGAAAGAAGGAAAGCGCCACAACGCACACTTGAAGTCAAAGAA
ATCAAAACGTAGATTGAGACAGCCTGGACTAGTACCACCAGCATATGCCAAAGTCGTGAA
GAAACTCAATTTCTGCAATTGAGAGATAGAGAATGAAACTGTTCAATCTCTCTTCCAAAT
TTCCAGATAATTGTCTTTTAGCTGGTACCCAGGGGTTTTACCAAACTTTAGTTCTTTTTT
TGTTTTTGTGTTTCAGTTTTAACCTTAGCACAAAGTAATAAAATTGTCATTTTTGGTAAA
TTGCCAACGGATTTGTGACGGAAGAAAATATTTTGTGCATGTATTTTGTTTGGACTAACG
TCTTGCATAACTTCACC

QA 1 557 1 557
DS 



AS 1 2

CO CL4147Contig1 802 2 8 U
GGACATCCAACTTTATCCTCTCTGCCCTCATCTTCCTTCGCTATTTACAGTTGTGCCACT
CTGGTTATGCTAGCTTCCTTGGACCCGGCGAGAAAGATTTGAAAAGCCGCTGAGTTAAGC
ATGCCGGTAAACTCGAAGAACGCTAACCGGAAAGGAGAAACCGAGAAGAGTCGCCGAGGA
AAGCTACAGGAGAAAGCGATGTCGTTTCACGGCAGAGGAACGATGCCTCATCCGAATCCA
GGAGAGCTTCGAAGACCGAAGACTCTACCGGAGTTATTCTCCAGCGGTCGAACCGCCGTC
GTCGAACCGGTTTCTTCTAAACCGCCGCGTCTGACGAAACTGCTCCTCAACGTGACGGTT
CAAGGGAGTTCAGGAGCTCTGCAGATTATAATCTCGCCGGAATCAACCGTGGACGATTTG
ATCGACGCCGCGATTCGTCTTTACGTGAAGGAAGCTCGCCGACCTTTCTTGCCGGAGTCT
GAACCGTCCCGGTTTGATCTCCATTACTCGCAATTCAGCCTCGAAAGTATTGGAAGAGAA
CAGAAGCCGATCTCGCTTGGGTCAAGGAACTTTTTCTTGTGTGGTCGGAAAGAGAACGGA
GGATTGGTCGGGAGTGGATCGTCGGAATCTTGTTCAAAGGAAGCAGAGAAAGCGGGGAAA
ACTGGTTTTCACTGGCTCAAATTCATGGGTTTCTAGAAGTTTTTACCATTTTTAAATTTA
ATTCAAACTTCTATTTTATTTTTTTATTTTTAGGAAATAAATATGGATTTAAGAACTTCG
TGTTACCTTCCTAGGAGGACAA


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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GG
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DS 



AS 1 3

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AATCTGGTACGGCAAATTCAAACCAGCTCAAAGAGCAATCATCTCCGATTTCATCACCTC
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TACTATGGTTTGAGAAGAAAAGTTTCATATTTTGGTTTTGTAGTAGAAAATGATATTATT
TTAGTGTAATTCTTTTATTGTATTCATTAATATTATTCTGAGTTTCTCTTATTGATGTAA
TGAATTTCATATTGCTATATGCATATCAATTAAAATCGAAAAGACTTCTATTTTGTTAGC


BQ
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AF RS1DD28TF U 2
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TTTCAATCATTGAAATACCACAAAGGAGCACTTCTCTCCGGCAAAATCTCCGTTAACCTA
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ACGCAATGT

QA 1 669 1 669
DS 

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A**TTCCCGAGAAAA**AAAAAATCAAAATGTGTTCGTTAGTTTTCAAACTCTTTTTATT
TGTCTCTCTCTTCCAAATCTCAATCTCTGCCAGGAAACTAGCACAAGATGGATCAAACCA
GTTTCAATCATTGAAATACCACAAAGGAGCCCTTCTCTCCGGCAAAATCTCCGTTAACCT
AATCTGGTACGGCAAATTTAAACCAGCTCAGAGAGCAATCATCTCCGATTTCATCACCTC
GCTTTCGCATTCCTCTTCAAAAACTCCAAACCAACCATCTGTCGCCACGTGGTGGAAGAC
CACTGAGAAATACTACAAACTCGCCGCAGGAGACAAAACACCTTCTCCTTCACTCTCACT
CACTCTCAAGTCACAGATCCTCGACGAGACATACTCTCTCGGAAAGTCTCTAACAGACAG
AGATATCCGCAAGTTAGCCTCAAAAGGCGATCAATACGACACGGTCAACGTCGTTTTGAC
TTCAGCTGACGTGGCGGTTACTGGCTTTGGTATGAGTCGATGCGGGACGCACGGACACGC
TCGTGGTAACACGGGTAAACGTGGATCCAAATTCGCTTACATTTGGGTCGGAAACGCCGA
AACGCAATGTCCGGGTCAATGCGCATGGCCATTTCACGCACCTGTGTACG*TCCTCAGAG
CCCGCCGCTCGTGGCGCCGAACAACGATGTGGGACTCGACGGTATGGTGAT*AACTTAGC
TAGTCTT

QA 1 787 1 787
DS 

RD RS1FM47JQ 683 0 0
GACA
CGGTCAACGTCGTTTTGACTTCAGCTGACGTGGCGGTTACTGGCTTTGGTATGAGTCGAT
GCGGGACGCACGGACACGCTCGTGGTAACACGGGTAAACGTGGATCCAAATTCGCTTACA
TTTGGGTCGGAAACGCCGAAACGCAATGTCCGGGTCAATGCGCATGGCCATTTCACGCAC
CTGTGTACGGTCCTCAGAGCCCGCCGCTCGTGGCGCCGAACAACGATGTGGGACTCGACG
GTATGGTGATTAACTTAGCTAGTCTTTTAGCTGGAACCGCAACGAACCCGTTCGGTAATG
GTTATTACCAGGGCCCACAGAGCGCACCGCTCGAAGCTGCGTCCGCGTGTCCCGGCGTTT
ATGGGAAAGGAGCTTATCCTGGCTACGCTGGAAATTTACTTGTTGATTTTACGACGGGAG
GTAGTTTTAATGCGTATGGTGCAAACGGCAGGAAGTTCTTGCTACCTGCGTTGTATGATC
CTACCACGTCAGACTGCTCTACTATGGTTTGAGAAGAAAAGTTTCATATTTTGGTTTTGT
AGTAGAAAATGATATTATTTTAGTGTAATTCTTTTATTGTATTCATTAATATTATTCTGA
GTTTCTCTTATTGATGTAATGAATTTCATATTGCTATATGCATATCAATTAAAATCGAAA
AGACTTCTATTTTGTTAGC

QA 5 683 5 683
DS 



AS 0 0

AS 1 3

CO CL4150Contig1 1080 3 13 U
GGGTTGGTGTCTCTCTCTCTATTGTTTCTTTCTCTGCGAAATTGCGAATCCTCTTCTTTC
TCTGCGAATCCTCGAATCCTCTTCTTTCTCTCTCTCTTTTTTCTCAGTTCATTTTCTTCC
TCATGTCTTCTTCTGAATTTGAATCCGCCTCAGAATTGATCAAGCTGTTTTATGCTGCCC
ATCTCACTTCAAGAGAGAATGAGAGAGATTTGATGATAGGAGATTCTTCTTCTGGTGAAG
GTTTTTCAGAACAACAGTTACTGGAGATACCTCCTGTGAGAAATTCGATCTGTTTTCCAG
AAGAGACTGAGCAGGTGAACATAGCTAGATCTACTGCAAATGACTACCTTCTGGATCCAA
CCTATTCTAGTATCAAAACCAATGTTAACCGGATCATTTCTCAAGACTTTTCATACTTTA
CTTTCAAAGAAGCTTTTAATTACAAAAAAAGGAAGACAATTGGAGGTTGGGATTTTGAAA
ATTGTCCTGTTCCTGAAACATTCACACAAGAAGCGCACTATAAAGAGGTCATACCAAATA
TTGAAAAGTGTCTTAAAAAATGGAAATTTATTGGCCCTTTGGAAGAAGTTGTTGGAGTTG
GTAATACAGGACGTTTAAACGGAGCTCACTACTTGATGCAAGAATCACAACTGACGCTTA
TTGACGAGAGGAAAATAGGTGATGAGAAAGACACAGCTGACAAAGGACTGATTGTGGAGA
TGAGAATAAGAATGGAAGAACACCTCTTGAATTACAACGAGCCAGGAAACATATTGTTGA
TGACGGGAGACATCGATTTTATCGGTATTATCCACGAAGCAAAGAAACTGGGTTTCTTTG
TAATTTTAGCTTACAATGAGGATCACTGGGTTGCCTCAGAACTGAAAGCAGCACCGGATA
AACTTGTTAAATGGAACCAACTTGTGAAAGGTAAAGCGTAGTTCCTTTTAGCTTTTATAA
TGATATTTATGTTTCTCCTCTATAATTTTAAAAGACCCTTGTAAGAGTTGTTGTTATATC
TGTTTGATATTTTATTGTATTGGATCAATCTTTTGTGCTCTATCCAATGATTTATCATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C269TF U 1
AF RS1H344TF U 190
AF RS1C269JQ C 355
BS 1 675 RS1C269TF
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RD RS1C269TF 675 0 0
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TCTGCGAATCCTCGAATCCTCTTCTTTCTCTCTCTCTTTTTTCTCAGTTCATTTTCTTCC
TCATGTCTTCTTCTGAATTTGAATCCGCCTCAGAATTGATCAAGCTGTTTTATGCTGCCC
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GTTTTTCAGAACAACAGTTACTGGAGATACCTCCTGTGAGAAATTCGATCTGTTTTCCAG
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TTGACGAGAGGAAAA

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1H344TF 747 0 0
G
AAGAGAGAATGAGAGAGATTTGATGATAGGAGATTCTTCTTCTGGTGAAGGTTTTTCATA
ACAACAGTTACTGGAGATACCTCCTGTGAGAAATTCGATCTGTTTTCCAGAAGAGACTGA
GCAGGTGAACATAGCTAGATCTACTGCAAATGACTACCTTCTGGATCCAACCTATTCTAG
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TCTTAAAAAATGGAAATTTATTGGCCCTTTGGAAGAAGTTGTTGGAGTTGGTAATACAGG
ACGTTTAAACGGAGCTCACTACTTGATGCAAGAATCACAACTGACGCTTATTGACGAGAG
GAAAATAGGTGATGAGAAAGACACAGCTGACAAAGGACTGATTGTGGAGATGAGAATAAG
AATGGAAGAACACCTCTTGAATTACAACGAGCCAGGAAACATATTGTTGATGACGGGAGA
TATCGATTTTATCGGTATTATCCACGAAGCAAAGAAACTGGGTTTCTTTGTAATTTTAGC
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ATGGAAC*AACTTGTGAAAG
TAAGCG

QA 2 741 2 741
DS 

RD RS1C269JQ 726 0 0
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ACTTTACTTTCAAAGAAGCTTTTAATTACAAAAAAAGGAAGACAATTGGAGGTTGGGATT
TTGAAAATTGTCCTGTTCCTGAAACATTCACACAAGAAGCGCACTATAAAGAGGTCATAC
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GAGTTGGTAATACAGGACGTTTAAACGGAGCTCACTACTTGATGCAAGAATCACAACTGA
CGCTTATTGACGAGAGGAAAATAGGTGATGAGAAAGACACAGCTGACAAAGGACTGATTG
TGGAGATGAGAATAAGAATGGAAGAACACCTCTTGAATTACAACGAGCCAGGAAACATAT
TGTTGATGACGGGAGACATCGATTTTATCGGTATTATCCACGAAGCAAAGAAACTGGGTT
TCTTTGTAATTTTAGCTTACAATGAGGATCACTGGGTTGCCTCAGAACTGAAAGCAGCAC
CGGATAAACTTGTTAAATGGAACCAACTTGTGAAAGGTAAAGCGTAGTTCCTTTTAGCTT
TTATAATGATATTTATGTTTCTCCTCTATAATTTTAAAAGACCCTTGTAAGAGTTGTTGT
TATATCTGTTTGATATTTTATTGTATTGGATCAATCTTTTGTGCTCTATCCAATGATTTA
TCATTG

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 3

CO CL4151Contig1 1453 3 3 U
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TCCTGTCCCCGTTTCTCAGGGAATTGCTAATGCTTCTGTTCCTTCTGCGCCAAAGCAACC
CGGCCGTTCAAACCCTAATCCAACACTAAACCACTCCCGCCAGAGATCATTTAAACGGAA
TGGCGCTTCTTCTGGATCCCCTGCTAATGGTACTGCTCCTCAACCATCACCACAAGGTTC
ACTTGCTGAGTCTCACAACCCTTCTCCCAGAGGCCAGAACCAGAGGAACGGTTTTCCATC
ACAAACCCATGGCGGTGGTGCTGTTGGTGTTGGTGGTGGGACTGACAACGTATCTCAACG
AGACTCGTACAGGAACCAAAACGGTAACCATCACCAAAGTCACGGCGGCAGGCGCAATCA
GGAGCACGGGAATCAAAATTGGACTTTCAGCAGGAGCTTTAATGGGAGAGATGGGAATGC
ACAGTCTCAAAGAGGTGCTCCAGCTTTTGTAAGACATCCACCTCCACCTGTGCAGACAAT
TCCTCCTCAGTTTATGGCAGCTCAGCCTTTTGCCAGCCCTCTGCCTTTCCCTCCTGAATT
GGCATCGCAATATTATCAGCGTATGCCTTTCGTTGCTCCTCTCTCACCTGCACCAGTCTT
CTACCATGTCCAGGATCCTCCTTTGAACATAAAACTTCAGAAGCAAATACATTATTATTT
TAGTGAAGAGAATTTGATTAAAGACATGTATCTTCGTCGGCAGATGGATGATCAGGGTTT
TGTTCCACTGCCTGTGATTGCTGTTTTCAACAAGGTTGCAGAACTCACAGATAGTGTCCA
GCAGATAGCGGATGCTCTACAAGGTTCACCTGTTGTTGAAGTTCAGGGTGACAGAATAAG
GAAACGCTTTAATTGGCAGCATTGGTTGATTCCTCAAGAACCGAACCCTGCGGTCTCGAA
CCCCCAATCTGTTGGTGCAGTAGCGAGCCGAGTTGGGAACTTGGCTCTTGGTGAGAGCTC
GGCAGGTCCAAATGGTGGGTCAAGCAGTCAGCTGCAACCTGCGGGAGCAGAAAACGAAGC
TGTTTCAGATGGTCAGCAACAGTCTCCTGGTGGTGTTCCAGTGAGCAACCGCAATGGCTC
GGATGGTGCAAACCGTTGAAACCATCATGTTTGGAGCTGGTGGTTAGTGTTGGACATGAA
ATAATTTATTATTTCGTCCTGCCTAAAACCAGGAAAAAAAAAACAATAATGAAGGGGGAA
TCCAAAAAAAAAAGAAAAGAGATAAAGGTAAGGCATAAAACCAAAAATAAAAAAGAGACC
CATATGAAAACAAAAAAGGATCAAACATTTGTGATTCTTCTAGCTTTTTCATTTTATGGA
TTTTTTATTATTTTTTTTATTTTGGTTGTTTTGGATGCTAATAACCTTTTTTATGTTTAT
GCTACTTTGTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AA87TF U 1
AF RS1EK43TF U 595
AF RS1EK43JQ C 1112
BS 1 706 RS1AA87TF
BS 707 1222 RS1EK43TF
BS 1223 1453 RS1EK43JQ

RD RS1AA87TF 706 0 0
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TCCTGTCCCCGTTTCTCAGGGAATTGCTAATGCTTCTGTTCCTTCTGCGCCAAAGCAACC
CGGCCGTTCAAACCCTAATCCAACACTAAACCACTCCCGCCAGAGATCATTTAAACGGAA
TGGCGCTTCTTCTGGATCCCCTGCTAATGGTACTGCTCCTCAACCATCACCACAAGGTTC
ACTTGCTGAGTCTCACAACCCTTCTCCCAGAGGCCAGAACCAGAGGAACGGTTTTCCATC
ACAAACCCATGGCGGTGGTGCTGTTGGTGTTGGTGGTGGGACTGACAACGTATCTCAACG
AGACTCGTACAGGAACCAAAACGGTAACCATCACCAAAGTCACGGCGGCAGGCGCAATCA
GGAGCACGGGAATCAAAATTGGACTTTCAGCAGGAGCTTTAATGGGAGAGATGGGAATGC
ACAGTCTCAAAGAGGTGCTCCAGCTTTTGTAAGACATCCACCTCCACCTGTGCAGACAAT
TCCTCCTCAGTTTATGGCAGCTCAGCCTTTTGCCAGCCCTCTGCCTTTCCCTCCTGAATT
GGCATCGCAATATTATCAGCGTATGCCTTTCGTTGCTCCTCTCTCACCTGCACCAGTCTT
CTACCATGTCCAGGATCCTCCTTTGAACATAAAACTTCAGAAGCAA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RS1EK43TF 628 0 0
G
GAATTGGCATCGCAATATTATCAGCGTATGCCTTTCGTTGCTCCTCTCTCACCTGCACCA
GTCTTCTACCATGTCCAGGATCCTCCTTTGAACATAAAACTTCAGAAGCAAATACATTAT
TATTTTAGTGAAGAGAATTTGATTAAAGACATGTATCTTCGTCGGCAGATGGATGATCAG
GGTTTTGTTCCACTGCCTGTGATTGCTGTTTTCAACAAGGTTGCAGAACTCACAGATAGT
GTCCAGCAGATAGCGGATGCTCTACAAGGTTCACCTGTTGTTGAAGTTCAGGGTGACAGA
ATAAGGAAACGCTTTAATTGGCAGCATTGGTTGATTCCTCAAGAACCGAACCCTGCGGTC
TCGAACCCCCAATCTGTTGGTGCAGTAGCGAGCCGAGTTGGGAACTTGGCTCTTGGTGAG
AGCTCGGCAGGTCCAAATGGTGGGTCAAGCAGTCAGCTGCAACCTGCGGGAGCAGAAAAC
GAAGCTGTTTCAGATGGTCAGCAACAGTCTCCTGGTGGTGTTCCAGTGAGCAACCGCAAT
GGCTCGGATGGTGCAAACCGTTGAAACCATCATGTTTGGAGCTGGTGGTTAGTGTTGGAC
ATGAAATAATTTATTATTTCGTCCTGC

QA 2 628 2 628
DS 

RD RS1EK43JQ 342 0 0
GGTGTTCCAGTGAGCAACCGCAATGGCTCGGATGGTGCAAACCGTTGAAACCATCATGTT
TGGAGCTGGTGGTTAGTGTTGGACATGAAATAATTTATTATTTCGTCCTGCCTAAAACCA
GGAAAAAAAAAACAATAATGAAGGGGGAATCCAAAAAAAAAAGAAAAGAGATAAAGGTAA
GGCATAAAACCAAAAATAAAAAAGAGACCCATATGAAAACAAAAAAGGATCAAACATTTG
TGATTCTTCTAGCTTTTTCATTTTATGGATTTTTTATTATTTTTTTTATTTTGGTTGTTT
TGGATGCTAATAACCTTTTTTATGTTTATGCTACTTTGTGAC

QA 1 342 1 342
DS 



AS 1 2

CO CL4152Contig1 926 2 2 U
GGGGACCTGGCACTGAGCTGAAAGTCTGAAACAAACAAACAATTGGATTCCAGAGTTCGT
TCACAATTACCACATGGGGGCATCAGATTCAACGCTATTAGGCGGTCAGGAGAATAGAGG
AGGTGGAGATGTGATAACGACCATCTCTCAACGATCCGAGAAAGTGGATCCCATTCTCGA
TAATCTTAAATCTCTCACAGTTAGTAGGCCAATATTGAAGTCAGCTGCTCCGAGGGAAAG
TAGCTTAACAGATATATTGGTGAGGAAAGCTTTATCGAGCTCCTCTTCCAAAGATACGGT
GGATCCTCAAATACTTGTTGAGCTTTTCTCCATTTACCGTGAATGGCAAGACAGCAAAGC
TCTAGATATTACCACCAGACAGGAAGATATAGAAAACAAGATTGAAGTGGCAGACGCTTT
GGCCTCTAAACTTCTACAGAGGTTTAACCACTCCGTTTCTGCTATGAGGACCACTTCCCA
CCATTTATCCCAAGTTCATGGCCTGCAGGTGGAGCTTGGGGAGCTTAAAGGAAGGTTGAC
TGAGGTAATCAACAACTGCGATACGTTATGTAAAAGAATAAATTCTGAGGGACCTGAATC
TCTTAGGTCAACAGTCACTCCCTTTGTTCTTGCACCACCTCCTGATTCGGTCAGTAGTAG
TACTACTCTCTCTTCTAAACAAGAGCCATAAGAGTCAGTGTCACCATTGATAAGATTGGC
TGAATACTTCTCACTAGTCTTTGATTTTGCATAAATGCAAGATGATGGCTCTACTGCTCT
TCACGCTTTCAGTACTTGTTTTGTTTGTTTGTTTTCCGTTTTGTATAATCGCTCGTGAAC
AATAGGAAGCCAGTTGTTATGACGTAGGAAAATTCATATGTTATATTCTCTTTGATACAA
AATCCACAGTGTATGATGATTTGCAG


BQ
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AF RS1GR23TF U 1
AF RS1GR23JQ C 287
BS 1 570 RS1GR23TF
BS 571 926 RS1GR23JQ

RD RS1GR23TF 570 0 0
GGGGACCTGGCACTGAGCTGAAAGTCTGAAACAAACAAACAATTGGATTCCAGAGTTCGT
TCACAATTACCACATGGGGGCATCAGATTCAACGCTATTAGGCGGTCAGGAGAATAGAGG
AGGTGGAGATGTGATAACGACCATCTCTCAACGATCCGAGAAAGTGGATCCCATTCTCGA
TAATCTTAAATCTCTCACAGTTAGTAGGCCAATATTGAAGTCAGCTGCTCCGAGGGAAAG
TAGCTTAACAGATATATTGGTGAGGAAAGCTTTATCGAGCTCCTCTTCCAAAGATACGGT
GGATCCTCAAATACTTGTTGAGCTTTTCTCCATTTACCGTGAATGGCAAGACAGCAAAGC
TCTAGATATTACCACCAGACAGGAAGATATAGAAAACAAGATTGAAGTGGCAGACGCTTT
GGCCTCTAAACTTCTACAGAGGTTTAACCACTCCGTTTCTGCTATGAGGACCACTTCCCA
CCATTTATCCCAAGTTCATGGCCTGCAGGTGGAGCTTGGGGAGCTTAAAGGAAGGTTGAC
TGAGGTAATCAACAACTGCGATACGTTATG

QA 1 570 1 570
DS 

RD RS1GR23JQ 640 0 0
TCCAAAGATACGGTGGATCCTCAAATACTTGTTGAGCTTTTCTCCATTTACCGTGAATGG
CAAGACAGCAAAGCTCTAGATATTACCACCAGACAGGAAGATATAGAAAACAAGATTGAA
GTGGCAGACGCTTTGGCCTCTAAACTTCTACAGAGGTTTAACCACTCCGTTTCTGCTATG
AGGACCACTTCCCACCATTTATCCCAAGTTCATGGCCTGCAGGTGGAGCTTGGGGAGCTT
AAAGGAAGGTTGACTGAGGTAATCAACAACTGCGATACGTTATGTAAAAGAATAAATTCT
GAGGGACCTGAATCTCTTAGGTCAACAGTCACTCCCTTTGTTCTTGCACCACCTCCTGAT
TCGGTCAGTAGTAGTACTACTCTCTCTTCTAAACAAGAGCCATAAGAGTCAGTGTCACCA
TTGATAAGATTGGCTGAATACTTCTCACTAGTCTTTGATTTTGCATAAATGCAAGATGAT
GGCTCTACTGCTCTTCACGCTTTCAGTACTTGTTTTGTTTGTTTGTTTTCCGTTTTGTAT
AATCGCTCGTGAACAATAGGAAGCCAGTTGTTATGACGTAGGAAAATTCATATGTTATAT
TCTCTTTGATACAAAATCCACAGTGTATGATGATTTGCAG

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 3

CO CL4153Contig1 684 3 9 U
TTTTTTTTGGTGTATAAATGGAACTTTGATATAATGATAAAAAAATATTGTTATAACACA
ATGCTCTTTTCCTTCCTTTTTTATTCAAACTTTACTTGAGTAAAAAAAAACTGAACCTTT
TGCTTCGCTCAAAAAA*TATAATTTGCTAACCAAATCCACGCATTAATTCACCACTCGCT
GGTCTTCTTGGACGTGGCCTTTTTAGTTGAAGAATCTAACACTTGGGAAGATCCTTAGGC
GGTGGCAAAATCGACTGATTGGGTCCTTTGCCGTTCTCCACCAAGAAAGCCATCTTTAAT
CCCCACGTCGTGTGTACCTCCAAGTGACAATGCATGAACCAAACCCCGGGATTATCCGCT
CTGAATCTGATGACAACCCATCCACCAGATGGAACTCCGATTGTGTTCCTCTCAACCGGA
TCAACTAGGTTAAAGTTGTTTGGATCTTTCTTGGGGTTGAAGTTACCTAATCCCCGACCA
ACTTCGAAGAAGTTGAAGCCATGAAGATGAATAGGATGGTTCTCCGCGGCTATGATGCCA
GTATCTTGGAAAACAAGCTGCACCGTGGCGTTGTAAGGTAGCTTGTAAAGCCTCGTCCCT
GTTTCCGTGGCCATGTTCGTGACTGATCCTCCGCTGTAGTTGAAAACGTGCGGTGGGTTC
TTGGGAAAATCCGTTGTGAAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FT86JQ U 9
AF RS1FV30TF C 1
AF RS1FV30JQ U 9
BS 1 8 RS1FV30TF
BS 9 136 RS1FT86JQ
BS 137 137 RS1FV30JQ
BS 138 169 RS1FT86JQ
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BS 171 482 RS1FT86JQ
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BS 525 684 RS1FV30JQ

RD RS1FT86JQ 516 0 0
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TTCCTTCCTTTTTTATTCAAACTTTACTTGAGTAAAAAAAAACTGAACCTTTTGCTTCGC
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TGGACGTGGCCTTTTTAGTTGAAGAATCTAACACTTGGGAAGATCCTTAGGCGGTGGCAA
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CGTGTGTACCTCCAAGTGACAATGCATGAACCAAACCCCGGGATTATCCGCTCTGAATCT
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GTTAAAGTTGTTTGGATCTTTCTTGGGGTTGAAGTTACCTAATCCCCGACCAACCTCGAA
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QA 1 516 1 516
DS 

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TGCTTCGCTCAAAAAA*TATAATTTGCTAACCAAATCCACGCATTAATTCACCACTCGCT
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GGTGGCAAAATCGACTGATTGGGTCCTTTGCCGTTCTCCACCAAGAAAGCCATCTTTAAT
CCCCACGTCGTGTGTACCTCCAAGTGACAATGCATGAACCAAACCCCGGGATTATCCGCT
CTGAATCTGATGACAACCCATCCACCAGATGGAACTCCGATTGTGTTCCTCTCAACCGGA
TCAACTAGGTTAAAGTTGTTTGGATCTTTCTTGGGGTTGAAGTTACCTAATCCCCGACCA
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GTATCTTGGAGAACAAGCTGCACCGTGGCGTTGTAAGGTAGCTTGTAAAGCCTCGTCCCT
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TTGGGAAAATCCGTTGTGAAAACC

QA 1 684 1 684
DS 

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GGTGTATAAATGGAACTTTGATATAATGATAAAAAAATATTGTTATAACACAATGCTCTT
TTCCTTCCTTTTTTATTCAAACTTTACTTGAGTAAAAAAAAACTGAACCTTTTGCTTCGC
TCAAAAAA*TATAATTTGCTAACCAAATCCACGCATTAATTCACCACTCGCTGGTCTTCT
TGGACGTGGCCTTTTTAGTTGAAGAATCTAACACTTGGGAAGATCCTTAGGCGGTGGCAA
AATCGACTGATTGGGTCCTTTGCCGTTCTCCACCAAGAAAGCCATCTTTAATCCCCACGT
CGTGTGTACCTCCAAGTGACAATGCATGAACCAAACCCCGGGATTATCCGCTCTGAATCT
GATGACAACCCATCCACCAGATGGAACTCCGATTGTGTTCCTCTCAACCGGATCAACTAG
GTTAAAGTTGTTTGGATCTTTCTTGGGGTTGAAGTTACCTAATCCCCGACCAACTTCGAA
AAAGTTGAAGCCATGAAGATGAATAGGATGGTTCTCCGCGGCTATGATGCCAGTATCTTG
GAAAACAAGCTGCACCGTGGCGTTGTAAGGTAGCTTGTAAAGCCTCGTCCCTGTTTCCGT
GGCCATGTTCGTGACTGATCCTCCGCTGTAGTTGAAAACGTGCGGTGGGTTCTTGGGAAA
ATCCGTTGTGAAAACC

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

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CTGTGGGATTAAGCAGCTTGAGAGTCTTGTTCTAGAGAGTAATTATAAAGCTGTTCGGTT
CAATCCCTATTTGTGGCCAGCGGGTCAGAAGATGACGAATGCTGTTGGCAAAGCCATGTT
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CACGCTGGATTCTGCAAAGTACCAGAAAATGGTGAGGATAAGGATACTTATACTCAGCTC
ATGGAGCTCTCTAGATTCCCTCAGGTATATGTGAAATTCAGTGCTCTATTCAGGATATCA
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GGGGCAAATCGTGTAATGTGGGGCAGTGACTTCCCATTTGTTGTTCTTGAATGTGGATAC
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TGAAAAGGTTGGATGAGTATGAGCTAATCAAGCAAATAATGGTGGTTATATCATCGAAGA
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AACTAGAGGACGTGAATACTGACGTCTACGGTATTAGTGCTTTGATCGATGTAAGAGTGT
GAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1BN02TF U 1
AF RS1BN02JQ C 226
BS 1 796 RS1BN02TF
BS 797 903 RS1BN02JQ

RD RS1BN02TF 796 0 0
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CACGCTGGATTCTGCAAAGTACCAGAAAATGGTGAGGATAAGGATACTTATACTCAGCTC
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AGAACGGGTTTACCTTATCAGGACCTAACGCCTCTCCTATCTCAAGTTGTGTCCAATTTT
GGGGCAAATCGTGTAATGTGGGGCAGTGACTTCCCATTTGTTGTTCTTGAATGTGGATAC
AAAGAAGCTAAAGAAGCTGTCACCATTATTGCAAAACAAGCATCCTTGTCAAGTTCTGAC
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TGAAAAGGTTGGATGAGTATGAGCTAATCAAGCAAATAATGGTGGTTATATCATCGAAGA
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AGAGTCTGTATTTAAA

QA 1 796 1 796
DS 

RD RS1BN02JQ 678 0 0
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CTATTCAGGATATCAAGAACGGGTTTACCTTATCAGGACCTAACGCCTCTCCTATCTCAA
GTTGTGTCCAATTTTGGGGCAAATCGTGTAATGTGGGGCAGTGACTTCCCATTTGTTGTT
CTTGAATGTGGATACAAAGAAGCTAAAGAAGCTGTCACCATTATTGCAAAACAAGCATCC
TTGTCAAGTTCTGACATGGACTGGATCCTGGGAAAGACTGTGATGCAGCTCTTCCCTGGA
CAATGGGTTCTTCCTTGAAAAGGTTGGATGAGTATGAGCTAATCAAGCAAATAATGGTGG
TTATATCATCGAAGACACATAACTCTGAAGTCTTTTTCATTACCAGACTCCACTAAGTTG
GTATACATTGTTTAAAGAGTCTGTATTTAAAGAGCCTGAAACTTGCTGGTTGATATCATA
ATGCCTTACTATGAAAACTAGAGGACGTGAATACTGACGTCTACGGTATTAGTGCTTTGA
TCGATGTAAGAGTGTGAT

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 2

CO CL4155Contig1 763 2 5 U
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AAGACAAAAGAGACTTGCCATCTCTTCTGGTCTCAGATCTTTATTCATATGTCCAGAAGA
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GCTTTAATGAAACCAGACATAAGCCCCAACTTCACTCCGTGCTTTTCAAAAAAAGCGTCC
TTGTATTGAGATCGGAGATATCAACTTCATTGAAAGTTGTAAGCAACGCAAAAGTGTTTT
GAGAGTCTTTCAACCTAGTCGCCACACGCTTGCGTAGTCTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FM14JQ U 100
AF RS1AO44TFB C 1
BS 1 99 RS1AO44TFB
BS 100 211 RS1FM14JQ
BS 212 212 RS1AO44TFB
BS 213 290 RS1FM14JQ
BS 291 763 RS1AO44TFB

RD RS1FM14JQ 191 0 0
TTTATTCATATGTCCAGAAGAAGCCTCTGGGGATCTTCCACAACATCCTTGATACGGCGC
AAGAAATACACAGCCTCTCTTCCATCAATTAGCCTATGATCATAGGTCAGTGTGACGTAC
ATCATTGGCCTTGGTACTACGCTTCCACCCACAACCATTGGACGTTGCACGATTGAATGC
ATTCCAAGAAT

QA 1 191 1 191
DS 

RD RS1AO44TFB 763 0 0
CTTCGAAGTATCTTTCACAGATTGCATGGTTACCTGAACCGAAACTGGTAAAAAAAAAAA
AAGACAAAAGAGACTTGCCATCTCTTCTGGTCTCAGATCTTTATTCATATGTCCAGAGGA
AGCCTCTGGGGATCTTCCACAACATCCTTGATACGGCGCAAGAAATACACAGCCTCTCTT
CCATCAATTAGCCTATGATCATAGGTCAGTGCGACGTACATCATTGGCCTTGGTACTACG
CTTCCACCCACAACCATTGGACGTTGCACGATTGAATGCATTCCAAGAATAGCAGACTGA
GGAGGGTTGATGATAGGAGTGCTTATGAGACTTCCATAAACACCACCATTTGATACTGTG
AATGATCCTCCAGCCATCTCGTCAATTGATATGGTTCCTTCATTAGCCTTCTTAGCAAGA
GAGTTTATCGTTTTCTCTATGTCCGCAAAGTTCATCTGGTCAGCACCTCTGATGACTGGA
ACCACAAGACCCTTAGAGGTACCAACAGCAATACTGATGTCTACGTAATCTCTGTAAATG
ATATCATCTCCATCGATCACTGCATTTACTACTGGTTGGTGCTGGAGGGCACTAACAGCA
GCTTTAATGAAACCAGACATAAGCCCCAACTTCACTCCGTGCTTTTCAAAAAAAGCGTCC
TTGTATTGAGATCGGAGATATCAACTTCATTGAAAGTTGTAAGCAACGCAAAAGTGTTTT
GAGAGTCTTTCAACCTAGTCGCCACACGCTTGCGTAGTCTTGC

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 3

CO CL4156Contig1 928 3 5 U
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ATCAGTGTACGGATAACCCTCCTAAGCTGGATCCAAACAGCGGGTCGGGTCATGTCGAGA
AAGTGGGCGGCCTCGACAGTTACGTCACTGGCTCACCTCAATCAAAGCTCGGCGTTGTTC
TTGTTTCTCATGTTTTCGGATATGAAACTCCACAACTGAGGAAACTTGCTGACAAAGTTG
CAGAAGCTGGATTCTATGCGGTGGTTCCAGACTTCTTCCATGGAGATCCCTATAATCCTG
CGAATGAGGATCGTCCACTTCCTATCTGGATTAAAGATCACACACAAGATAAGGCTTTTG
AGGAGTCGAAGCCAGTTGTTGATGCCTTGAAGAACAAAGGCATGGCTACAATTGGAGCAG
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TCCAAGACGTTTTAGCTACAAAACCTGAGGTGAAAAGTTTTGTGAAGATATTCCCAAGAG
TTAAACATGGTTGGACTGTTAGGTACGACCCGAATGATCCATCAGAAGTTGTAGCCGCAG
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TTTACACAGAATAATAAAGTAACGAGAGACTTGAGAAGCTGTAAGAAAAATGTTTTAAAT
AAATGATGTAATATATTCAAGCTTCCTTGAGTGTATTCTTATAAACAAGTGTTCTTGCAA
AGGAATAATTGAATCATCAAATGTTTGT


BQ
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AF RS1DB35TF U 1
AF RS1DB35JQ C 303
AF RS1FH90TF U 597
BS 1 458 RS1DB35TF
BS 459 598 RS1DB35JQ
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BS 735 735 RS1DB35JQ
BS 736 928 RS1FH90TF

RD RS1DB35TF 458 0 0
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ATCAGTGTACGGATAACCCTCCTAAGCTGGATCCAAACAGCGGGTCGGGTCATGTCGAGA
AAGTGGGCGGCCTCGACAGTTACGTCACTGGCTCACCTCAATCAAAGCTCGGCGTTGTTC
TTGTTTCTCATGTTTTCGGATATGAAACTCCACAACTGAGGAAACTTGCTGACAAAGTTG
CAGAAGCTGGATTCTATGCGGTGGTTCCAGACTTCTTCCATGGAGATCCCTATAATCCTG
CGAATGAGGATCGTCCACTTCCTATCTGGATTAAAGATCACACACAAGATAAGGCTTTTG
AGGAGTCGAAGCCAGTTGTTGATGCCTTGAAGAACAAAGGCATGGCTACAATTGGAGCAG
TAGGGTTTTGTTGGGGAGCAAAAGTTGCAGTGGAACTG

QA 1 458 1 458
DS 

RD RS1DB35JQ 616 0 0
AATGAGGATCGTCCACTTCCTATCTGGATTAAAGATCACACACAAGATAAGGCTTTTGAG
GAGTCGAAGCCAGTTGTTGATGCCTTGAAGAACAAAGGCATGGCTACAATTGGAGCAGTA
GGGTTTTGTTGGGGAGCAAAAGTTGCAGTGGAACTGGCGAAGCAAGAGCTTGTTAAAGCT
CTTGTTTTGTTACATCCTTCTCGTGTCACGGTGGATGACATTAAGGGTGTCAAGGTTCCA
ATTTCTGTTTTAGGAGCTGAATACGATCAAGTGACTCCTCCAGAACTCGCCAAGCAGTTC
CAAGACGTTTTAGCTACAAAACCTGAGGTGAAAAGTTTTGTGAAGATATTCCCAAGAGTT
AAACATGGTTGGACTGTTAGGTACGACCCGAATGATCCATCAGAAGTTGTAGCCGCAGAG
GAAGCTCACAGTAACATGCTTGTTTGGCTCATCGACCATGTCAAGTGAGAAGCTTTGGTT
TACACAGAATAATAAAGTAACGAGAGACTTGAGAAGCTGTAAGAAAAATGTTTTAAATAA
ATGATGTAATATATTCAAGCTTCCTTGAGTGTATTCTTATAAACAAGTGTTCTTGCAAAG
GAATAATTGAATCA
CC

QA 1 614 1 614
DS 

RD RS1FH90TF 332 0 0
GT
GTTCCAAGACGTTTTAGCTACAAAACCTGAGGTGAAAAGTTTTGTGAAGATATTCCCAAG
AGTTAAACATGGTTGGACTGTTAGGTACGACCCGAATGATCCATCAGAAGTTGTAGCCGC
AGAGGAAGCTCACAGTGACATGCTTGTTTGGCTCATCGACCATGTCAAGTGAGAAGCTTT
GGTTTACACAGAATAATAAAGTAACGAGAGACTTGAGAAGCTGTAAGAAAAATGTTTTAA
ATAAATGATGTAATATATTCAAGCTTCCTTGAGTGTATTCTTATAAACAAGTGTTCTTGC
AAAGGAATAATTGAATCATCAAATGTTTGT

QA 3 332 3 332
DS 



AS 1 2

CO CL4157Contig1 585 2 5 U
GTAGTGAATATTCGTAACGAATTATAACATACAAGGACGCCGATCCAAACGTATGGGCTA
TAGGATCTATATACAAAGAAGAAGAGGCACACTCTCAAATTCTTTAGAACAAAGTTTTAG
AACATTAGTTAAAACCAAGCTCTTCTTATTCAACGAGTTGGCAATTAAAATCAATGGTAT
CCAATTGGAGCTGGAGCTTCCTTTAGCTCGCGACCTTGGTAATGAATATCAGATGCAAAA
TGGTTAACGTCACGGTGATGAGCCTCGTCGGCACGGACCACCATCACCACATCACGAAGG
GTCGCATCAGCAGGGAGCCTCCAGTAATCAATAGCGATAGCCGGAGCAGGAACGTTCTCG
ATGTTACCCTTGTCGAGTTCCTTGAGGAACTCAGTGTACGAGTGGATAGCTTCTTCCTCA
AGGTACCCAACCATACGGTGAGCAAACTTCGGAGAGATCAGGTAACCGAGGAAGTAAGCG
TTGAAGAAGACTCCTTGGACGGTGATGACGAGAGCCCTCTCGTACCATTTGGGTTTAGCG
ACTTCCATGAACGTCATGAGATGCTCCTCTCGTTCTCTGCTTCCT


BQ
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DS 

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ATGTTACCCTTGTCGAGTTCCTTGAGGAACTCAGTGTACGAGTGGATAGCTTCTTCCTCA
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AAAGAGCCATCAAGGTTCTTCATCATAATCATCAACATCATCAGCGATGAAAGCTCTTCT
TCTGACACGACGTCTAGACTCTTGTTCATCAGAAGACTGATTGTTGTTCTCTTCATCTCT
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ATGC


BQ
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20 20 20 

AF RS1G993JQ U 20
AF RS1C005JQ U 1
AF RS1C005TF C 37
BS 1 784 RS1C005JQ

RD RS1G993JQ 723 0 0
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AGC

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TCTGACACGACGTCTAGACTCTTGTTCATCAGAAGACTGATTGTTGTTCTCTTCATCTCT
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ATGC

QA 1 784 1 784
DS 

RD RS1C005TF 748 0 0
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GCTGCTTCTCTCTTCTCCTCCGAAAGAAGACTGTAGTGTGCTAAGCAAGTCCCCTAAATC
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TACCCCTGGATGCTGGAGCCTCGCGTGCTTTCTCAGATCAGAGTAAGTTCCATTGAACTC
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AGCCACCCATTCTTTTATATGTC*ACGGCATAACGGACAAGTAAGCTTCGGTTTGGTTTT
TTTCTTGGTCTGTTACCTCATCAGATGC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 3

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CATACACCTTACGTACGACAAAACCAGGGTTAACTTTGCGTTTGGGAAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AE41JQ U 71
AF RS1GR71JQ U 1
AF RS1AE41TF C 529
BS 1 323 RS1GR71JQ
BS 324 324 RS1AE41JQ
BS 325 328 RS1GR71JQ
BS 329 329 RS1AE41JQ
BS 330 584 RS1GR71JQ
BS 585 1249 RS1AE41TF

RD RS1AE41JQ 316 0 0
TTAAATTGAAACCCGGTTCCATTCCATACCCGAAACCCTACACATACGGTTGAAAGTTTC
AAACCTTAAACACACATTTTCTTACTCTGGTTTCTTGGTGGTTTCAGGATTTTTGTCAAC
ATTTGAGCCATTAGTCGTCTTCAAGGATTCGTCTTCTTTTGCTTTATTCTCTGCTCCACG
AGGACTGGTCAAATTCTTCTCAACGTCCTCACTCTCTGTGCCTTGGGCTGGTTTTTCAGT
GTCTATAGTCAGAATTGAAGCCTCATCCCTGGAGGCATACCATGAATGGCCACAGGCAAT
ACACTCCAGCTGATAA

QA 1 316 1 316
DS 

RD RS1GR71JQ 584 0 0
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TTGATCAATGTTAAATTGAAACCCGGTTCCATTCCATACCCGAAACCCTACACATACGGT
TGAAAGTTTCAAACCTTAAACACACATTTTCTTACTCTGGTTTCTTGGTGGTTTCAGGAT
TTTTGTCAACATTTGAGCCATTAGTCGTCTTCAAGGATTCGTCTTCTTTTGCTTTATTCT
CTGCTCCACGAGGACTGGTCAAATTCTTCTCAACGTCCTCACTCTCTGTGCCTTGGGCTG
GTTTTTCAGTGTCTATAGTCAGAGTTGATACCTCATCCCTGGAGGCATACCATGAATGGC
CACAGGCAATACACTCCAGCTGATAACGATCTCCATGCCCAGCTTGGATGATATCCCTCA
GTCCAACTTTAATTTGACTGCATCTTGAGCATCTTGCATCAGTCATCTGCATTTTTTCCG
CATCGTCAGGCTCATTCTTCTCTGTTTCCTCAGCAGTTAAACCCTCCTTTAACTCAGTGG
GTGACATGCTCAAAATCTTTGCTGGTTCTAACTCGCCATTAAGC

QA 1 584 1 584
DS 

RD RS1AE41TF 721 0 0
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GTCTAGCCAGTAGTGCAGTGTTCTTGAGATTGAAAACCAGTGCCCTCATCCTTTGATTGT
ATTTATGGTAATCAGATGCGAGAGAAACATGTAAAGCCACCTCAAGAGCACACACCGGAG
GAACAGCAGCGTCTGGCCAGAGAAAACTCTCATCCTGCTTTGATGGTTCGGTCTTTGTAT
CTTTATCAGCCTGTTCAAGCTCTGAAGGCATCTTTGCTTCCTCGGCAGCTTGCTTGTTCT
CAGCGGTATAGCAAATGTTCTGGACTGCTTCCAGAAGCTTTGCCAAACACTTGTCACGAT
GAGCATCACCTGTCAGTGAGTTGAACTTCTGCAAGACAGAATGATACTCTGATGAAATAG
CACTTCCAGGGGTCTCAGGTTTAAGAAAGGCATCTTCTTCCTTCCTAACATCAACAGGAG
GTATGTTCACTTTCCGGGAAGATCTTTTAGCCTTAAACATAGCCTCAAGATCAGCATGCA
CCTCCTCAGGTTCAAGGTCAGGAAGATCACCCAATCGGGACATTGACTTTTCAACAAGGA
GGTCAATCTCATGTTGCTTTGTATCTTCGTAATCCTTATCAGTCAACTTCCAAAGCTTCT
TCTCAACAGTATCATACACCTTACGTACGACAAAACCAGGGTTAACTTTGCGTTTGGGAA
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 3

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TTCTCTCTTGTATTGGGACAGCTGTTCTTGCTGTTTGCCTCCGGATCCAAGTGAACAAAG
AAAACAAGGAATTCAAGGATTTGGCACCGGAACGAGCATTTGCTGATTTTGTCCTCTGCA
ACTTGGTCCTGCACTTGGTGATCATCAACTTCCTCGGATAGGTTTCCGTCTCCCATTTTA
CAGGGTTGCTTTCATGTTATGGACTTTTTAGTTGCGACTTCGAAATATAAATGTAGTGTT
GAGATATTTTATATTTCTGTCAAAGAATACTTTTTATGCACTAAACGGAACCCCTGGTTT
TGCCC


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RS1CJ46JQ C 1
AF RS1B945TF U 28
AF RS1CJ46TF U 1
BS 1 29 RS1CJ46TF
BS 30 48 RS1B945TF
BS 49 49 RS1CJ46TF
BS 50 225 RS1B945TF
BS 226 226 RS1CJ46TF
BS 227 481 RS1B945TF
BS 482 482 RS1CJ46TF
BS 483 520 RS1B945TF
BS 521 545 RS1CJ46TF

RD RS1CJ46JQ 539 0 0
GGAGTAGTCGAAAGAAAAAAAGGAGATTTGGGTTTGATCGATCAGTGAGAAGAATGGTGA
AATCGACAAGTAAGGATGCTCAGGATCTGTTCCGATCTCTTCACTCCGCTTATTCCGCTA
CTCCCACTAATCTCAAGATCATTGACCTGTATGTCGTTTTCGCCGTCTTCACTGCTTTGA
TTCAGGTGGCGTATATGGCTTTGGTGGGATCGTTTCCATTTAACTCATTCCTATCTGGAG
TTCTCTCTTGTATTGGGACAGCTGTTCTTGCTGTTTGCCTCCGGATCCAAGTGAACAAAG
AAAACAAGGAATTCAAGGATTTGGCACCGGAACGAGCATTTGCTGATTTTGTCCTCTGCA
ACTTGGTCCTGCACTTGGTGATCATCAACTTCCTCGGATAGGTTTCCGTCTCCCATTTTA
CAGGGTTGCTTTCATGTTATGGACTTTTTAGTTGCGACTTCGAAATATAAATGTAGTGTT
GAGATATTTTATATTTCTGTCAAAGAATACTTTTTATGCACTAAACGGAACCCCTGGTT

QA 1 539 1 539
DS 

RD RS1B945TF 493 0 0
GG
GGGTTTGATCGATCAGTGATAAGAATGGTGAAATCGACAAGTAAGGATGCTCAGGATCTG
TTCCGATCTCTTCACTCCGCTTATTCCGCTACTCCCACTAATCTCAAGATCATTGACCTG
TATGTCGTTTTCGCCGTCTTCACTGCTTTGATTCAGGTGGCGTATATGGCTTTGGTGGGA
TCGTTTCCATTTAACT*ATTCCTATCTGGAGTTCTCTCTTGTATTGGGACAGCTGTTCTT
GCTGTTTGCCTCCGGATCCAAGTGAACAAAGAAAACAAGGAATTCAAGGATTTGGCACCG
GAACGAGCATTTGCTGATTTTGTCCTCTGCAACTTGGTCCTGCACTTGGTGATCATCAAC
TTCCTCGGATAGGTTTCCGTCTCCCATTTTACAGGGTTGCTTTCATGTTATGGACTTTTT
AGTTGCGACTTCGAAATATAAATGTAGTGTTGGGATATTTTATATTTCTGTCAAAGAATA
CTTTTTATGCA

QA 3 493 3 493
DS 

RD RS1CJ46TF 545 0 0
GGAGTAGTCGAAAGAAAAAAAGGAGATTTGGGTTTGATCGATCAGTGAGAAGAATGGTGA
AATCGACAAGTAAGGATGCTCAGGATCTGTTCCGATCTCTTCACTCCGCTTATTCCGCTA
CTCCCACTAATCTCAAGATCATTGACCTGTATGTCGTTTTCGCCGTCTTCACTGCTTTGA
TTCAGGTGGCGTATATGGCTTTGGTGGGATCGTTTCCATTTAACTCATTCCTATCTGGAG
TTCTCTCTTGTATTGGGACAGCTGTTCTTGCTGTTTGCCTCCGGATCCAAGTGAACAAAG
AAAACAAGGAATTCAAGGATTTGGCACCGGAACGAGCATTTGCTGATTTTGTCCTCTGCA
ACTTGGTCCTGCACTTGGTGATCATCAACTTCCTCGGATAGGTTTCCGTCTCCCATTTTA
CAGGGTTGCTTTCATGTTATGGACTTTTTAGTTGCGACTTCGAAATATAAATGTAGTGTT
GAGATATTTTATATTTCTGTCAAAGAATACTTTTTATGCACTAAACGGAACCCCTGGTTT
TGCCC

QA 1 545 1 545
DS 



AS 1 3

CO CL4161Contig1 910 3 22 U
GACCACAGATATCACTGGCGTGTGCTCTCCTCACTTGCCTTGAAACTAGAGCTTCAATCC
CAAAAAAAAAGATGGCTGCTTCAGCTGCTGTAACCGCAAACTACGTCCTCAAGCCACCTC
CATACCCTCTGGATGCTTTGGAGCCGCATATGAGCAAGCAAACTCTAGAATTTCACTGGG
GAAAACACCACAGGGCTTACGTGGACAACCTCAAGAAACAGGTTCTTGGATCCGAGCTTG
AAGGCAAGCCCTTAGAGCATATCATCCAAAACACTTACAACAATGGCGACCTCCTCCCTC
CTTTCAACAACGCTGCTCAGGCGTGGAACCACGAGTTTTTCTGGGAATCAATGAAACCAG
GGGGTGGAGGAAAGCCATCAGGAGAGCTTCTTGCTCTGCTTGAAAGAGATTTCACTTCTT
ATGAGAAGTTTTATGATGAGTTCAATGCTGCTGCTGCCACTCAGTTTGGAGCTGGCTGGG
CCTGGCTTGCTTACGCAGATAACAAACTCAAAGTGGTGAAAACTCCAAATGCTGTGAACC
CCCTTGTGCTCGGCTCTTTCCCATTGCTCACCATTGATGTCTGGGAGCATGCATACTATC
TAGACTTCCAGAACCGGAGACCCGATTACATAAAGACATTCATGAACAATCTTGTGTCTT
GGGAGGCTGTTAGTTCCAGACTTGAG*CTGCCAAG*CTGCTTCTGCTTAAGCAGAGTCAT
CAGACATACTCGGAC*AAAACTCTGACTTCAGTTATGTGCGTCATGCATTACTGAAGTTT
CTTAATAAAATTTGGTCGTGGTTATAAGGACACTGCTCTCTTGTTGTATGGTCCTCATCG
AGTCTTTCATCTTATTTCTTGTTTACTGAGATTTGAATCATCGTGTAATAAAGAACTACC
ATGTTTTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CG15TF U 1
AF RS1GO80TF U 10
AF RS1GO80JQ C 336
BS 1 54 RS1CG15TF
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BS 780 910 RS1GO80JQ

RD RS1CG15TF 788 0 0
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CAAAAAAAAA**TGGCTGCTTCAGCTGCTGTAACCGCAAACTACGTCCTCAAGCCACCTC
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GAAAACACCACAGGGCTTACGTGGACAACCTCAAGAAACAGGTTCTTGGATCCGAGCTTG
AAGGCAAGCCCTTAGAGCATATCATCCAAAACACTTACAACAATGGCGACCTCCTCCCTC
CTTTCAACAACGCTGCTCAGGCGTGGAACCACGAGTTTTTCTGGGAATCAATGAAACCAG
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CCCTTGTGCTCAGCTCTTTCCCATTGCTCACCATTGATGTCTGGGAGCATGCATACTATC
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GGGAGGCTGTTAGTTCCAGACTTGAG*CTGCCAAG*CTGCTTCTGCTTAAGCAGAGTCAT
CAGACATACTCGGAC*AAA*CTCTGACTTCAGTTATGTGCGTTATGCATTACTGAAGTT
CTTAAAAAA

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DS 

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G
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GGATGCTTTGGAGCCGCATATGAGCAAGCAAACTCTAGAATTTCACTGGGGAAAACACCA
CAGGGCTTACGTGGACAACCTCAAGAAACAGGTTCTTGGATCCGAGCTTGAAGGCAAGCC
CTTAGAGCATATCATCCAAAACAGTTACAACAATGGCGACCTCCTCCCTCCTTTCAACAA
CGCTGCTCAGGCGTGGAACCACGAGTTTTTCTGGGAATCAATGAAACCAGGGGGTGGAGG
AAAGCCATCAGGAGAGCTTCTTGCTCTGCTTGAAAGAGATTTCACTTCTTATGAGAAGTT
TTATGATGAGTTCAATGCTGCTGCTGCCACTCAGTTTGGAGCTGGCTGGGCCTGGCTTGC
TTACGCAGATAACAAACTCAAAGTGGTGAAAACTCCAAATGCTGTGAACCCCCTTGTGCT
CGGCTCTTTCCCATTGCTCACCATTGATGTCTGGGAGCATGCATACTATCTAGACTTCCA
GAACCGGAGACCCGATTACATAAAGACATTCATGAACAATCTTGTGTCTTGGGAGGCTGT
TAGTTCCAGACTTGAG*CTGCCAAG*CTGCTTCTGCTTAAGCAGAGTCATCAGACATACT
CGGAC*AAAACTCTGACTTCAGTTATGTGCGTCATGCATTACTGAAGTT

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DS 

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CTGCTTGAAAGAGATTTCACTTCTTATGAGAAGTTTTATGATGAGTTCAATGCTGCTGCT
GCCACTCAGTTTGGAGCTGGCTGGGCCTGGCTTGCTTACGCAGATAACAAACTCAAAGTG
GTGAAAACTCCAAATGCTGTGAACCCCCTTGTGCTCGGCTCTTTCCCATTGCTCACCATT
GATGTCTGGGAGCATGCATACTATCTAGACTTCCAGAACCGGAGACCCGATTACATAAAG
ACATTCATGAACAATCTTGTGTCTTGGGAGGCTGTTAGTTCCAGACTTGAGGCTGCCAAG
GCTGCTTCTGCTTAAGCAGAGTCATCAGACATACTCGGACCAAAACTCTGACTTCAGTTA
TGTGCGTCATGCATTACTGAAGTTTCTTAATAAAATTTGGTCGTGGTTATAAGGACACTG
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AATCATCGTGTAATAAAGAACTACCATGTTTTTTG

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DS 



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GGACTTCAGTGGAGAGGTCTCAGGGTTGGTGCTGGATGTGTAGAGGCTTGTTTTCAAGGA
TTTGGTGAATGAGATCGTGCATGCAGAAACTAGCCGTTTGCAAGCAAAGTCAGGAAGACG
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ACTATTATACAGCAGGATGATAATAATCATATGGTGTGTTATGTAATAACTGGAGTTCTT
GAGATGGTTATTTGAAATAACTGTAAATCAGAGTATAGAGTAAGAAACAATGTTTTGGTA
TGAGGGTATGGATCCATAC


BQ
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AF RS1BJ27TF U 1
AF RS1B644JQ C 186
AF RS1B644TF U 186
BS 1 479 RS1BJ27TF
BS 480 499 RS1B644TF

RD RS1BJ27TF 479 0 0
GATAGAATCACTGCAAAGACAAGCCACGAAGAGATCTGAAAACTTCTTGTTGGAGGAAGA
AGATGATTTTCTGAAGAGTATACTTGCGGAAGATGTGATGATTCGGTCAGGGAACTGGGT
GGACTTCAGTGGAGAGGTCTCAGGGTTGGTGCTGGATGTGTAGAGGCTTGTTTTCAAGGA
TTTGGTGAATGAGATCGTGCATGCAGAAACTAGCCGTTTGCAAGCAAAGTCAGGAAGACG
AAGAACGCTTTTTGCAGAACAGTAGCTAAGATCTGTTTGAAGAAACACTAATTATATATA
TACTCTATTGTCTTTTTCTTTTGCCCTGCTGATTCGCATGTTCGGTTTTGGTTCTTCAGT
ACTATTATACAGCAGGATGATAATAATCATATGGTGTGTTATGTAATAACTGGAGTTCTT
GAGATGGTTATTTGAAATAACTGTAAATCAGAGTATAGAGTAAGAAACAATGTTTTGGT

QA 1 479 1 479
DS 

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G
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GCTTTTTGCAGAACAGTAGCTAAGATCTGTTTGAAGAAACACTAATTATATATATACTCT
ATTGTCTTTTTCTTTTGCCCTGCTGATTCGCATGTTCGGTTTTGGTTCTTCAGTACTATT
ATACAGCAGGATGATAATAATCATATGGTGTGTTATGTAATAACTGGAGTTCTTGAGATG
GTTATTTGAAATAACTGTAAATCAGAGTATAGAGTAAGAAACAATGTTTTGGTATGAGGG
TATGGATCCATAC

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DS 

RD RS1B644TF 314 0 0
G
GAATGAGATCGTGCATGCAGAAACTAGCCGTTTGCAAGCAAAGTCAGGAAGACGAAGAAC
GCTTTTTGCAGAACAGTAGCTAAGATCTGTTTGAAGAAACACTAATTATATATATACTCT
ATTGTCTTTTTCTTTTGCCCTGCTGATTCGCATGTTCGGTTTTGGTTCTTCAGTACTATT
ATACAGCAGGATGATAATAATCATATGGTGTGTTATGTAATAACTGGAGTTCTTGAGATG
GTTATTTGAAATAACTGTAAATCAGAGTATAGAGTAAGAAACAATGTTTTGGTATGAGGG
TATGGATCCATAC

QA 2 314 2 314
DS 



AS 1 3

CO CL4163Contig1 781 3 9 U
AATTAAAAATAGGTTATTTTATGACATTTTTTTTATTTGCATCCAGAAGACACAGAATTA
CATGCACTCTCAAATCTACAATCTGTTTTGCATGAAAATGCTCGTAGTATACATGAGACG
TGCATGTGTATGATGGATTATATGATAATCTCAATCTATATATAGAGAAACAAAAAAATA
TATGGTGATGTAGTTCATTAACATAGCCTTGGAAAATTAGAACTTGAATGGGTATGTCCA
TGTCTCACCAATCTTGATACTACTTCACTCTTCTTTTCCTTGCAAACTTTTTGAGAATTA
TCCATCACTTTATTCCAATGCCTCTTCTCCAAATTCATCTTTATATCATCTTCGAAACCA
TCAACTAATTTATCTGACATCTCAAATCCTTTTAGACGCACCAATATTGGTTTCTCTTCA
ACATACTTACGTGAGTTCCTGGTCTTGTTTAGTTTAATCTTGTCTTCTCTCGAGTGTGGT
GGAGTTTCATTTGATAATTGTTGTGACTTGAGTGCTTGAACTGCAATGTTTGGAGGGATC
TTGGGATTCTTTGCAAGTTGTTTGCATGTCTCCAGTGTTAGTTTCTTGTAGTTTAGGCAT
CGACATAGTTTTGTTCTATCTTCAAATAATAGATTTGGATGAGACTCAAGATAGATATCA
ATGGCTCTGAACAATCCATCAAACCAATCTCTAGCTGAGTCTGGCAAACTCTCTGCACTT
CTAGAAACTTTGACACTTTAAGGTCTGGTCTGGAGATAACTCTCTCAGATACTCATCAAT
C


BQ
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10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1BF61JQ U 2
AF RS1BF61TF C 2
AF RS1CR74JQ U 1
BS 1 50 RS1CR74JQ
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G
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QA 2 658 2 658
DS 

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G
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CATGTGTATGATGGATTATATGATAATCTCAATCTATATATAGAGAAACAAAAAAATATA
TGGTGATGTAGTTCATTAACATAGCCTTGGAAAATTAGAACTTGAATGGGTATGTCCATG
TCTCACCAATCTTGATACTACTTCACTCTTCTTTTCCTTGCAAACTTTTTGAGAATTATC
CATCACTTTATTCCAATGCCTCTTCTCCAAATTCATCTTTATATCATCTTCGAAACCATC
AACTAATTTATCTGACATCTCAAATCCTTTTAGACGCACCAATATTGGTTTCTCTTCAAC
ATACTTACGTGAGTTCCTGGTCTTGTTTAGTTTAATCTTGTCTTCTCTCGAGTGTGGTGG
AGTTTCATTTGATAATTGTTGTGACTTGAGTGCTTGAACTGCAATGTTTGGAGGGATCTT
GGGATTCTTTGCAAGTTGTTTGCATGTCTCCAGTGTTAGTTTCTTGTAGTTTAGGCATCG
ACATAGTTTTGTTCTATCTTCAAATAATAGATTTGGATGAGACTCAAGATAGATATC

QA 2 658 2 658
DS 

RD RS1CR74JQ 781 0 0
AATTAAAAATAGGTTATTTTATGACATTTTTTTTATTTGCATCCAGAAGAAACAGAATTA
CATGCACTCTCAAATCTACAATCTGTTTTGCATGAAAATGCTCGTAGTATACATGAGACG
TGCATGTGTATGATGGATTATATGATAATCTCAATCTATATATAGAGAAACAAAAAAATA
TATGGTGATGTAGTTCATTAACATAGCCTTGGAAAATTAGAACTTGAATGGGTATGTCCA
TGTCTCACCAATCTTGATACTACTTCACTCTTCTTTTCCTTGCAAACTTTTTGAGAATTA
TCCATCACTTTATTCCAATGCCTCTTCTCCAAATTCATCTTTATATCATCTTCGAAACCA
TCAACTAATTTATCTGACATCTCAAATCCTTTTAGACGCACCAATATTGGCTTCTCTTCA
ACATACTTACGTGAGTTCCTGGTCTTGTTTAGTTTAATCTTGTCTTCTCTCGAGTGTGGT
AGAGTTTCATTTGATAATTGTTGTGACTTGAGTGCTTGAACTGCAATGTTTGGAGGGATC
TTGGGATTCTTTGCAAGTTGTTTGCATGTCTCCAGTGTTAGTTTCTTGTAGTTTAGGCAT
CAGCATAGTTTTGTTCTATCTTCAAATAATAGATTTGGATGAGACTCAAGATAGATATCA
ATGGCTCTGAACAATCCATCAAACCAATCTCTAGCTGAGTCTGGCAAACTCTCTGCACTT
CTAGAAACTTTGACACTTTAAGGTCTGGTCTGGAGATAACTCTCTCAGATACTCATCAAT
C

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 3

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TCGCATGGCTCTCCCACACTGAGCATTGATGATAAATTAGAAGCAAGACAATTCTTCCAA
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TGGGACACCGAGTTTCCATCAGTCAACACTGTTCCCCGCAACTCCACCATCCACGATTTC
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GCGAAAAGGGTTAGAGAGTTGCTAATGGGAGGAGGAGGAATGAAGCGTGTTGATGAAGAT
ACAGAGAGAGGACTTGATCATGGAGCTTGGGTTCCTCTCATGTTGATGTATCCTGAAGCA
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ATGGGCAAAGCATTGGCTCCACTGAAAGAAGAAGGCGTTCTTATCATTGGATCTGGAAGT
GCCACTCATAATTTGAAGAAGCTTGACTTTAGTATCACTGATGGATCAGCGGTTCCTTGG
GCTTTAGAGTTCGATCATTGGCTCAGAGACTCTCTCCTACAAG*AAGGTATGGAGATGTG
AATGAGTGGGAAGAGAAAGCTCCAAATGCGAAAATGGCACATCCATGGCCAGAGCATTTC
TACCCATTACACGTTGCAATGGGTGCAGCTGGTGGTGATGACGCCAAGGCAGAGCAAATC
CACACAAGCTGGGAACTTGGGACTCTGTCTTATTCTTCTTATAGCTTCACCTCTTCCCTT
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GTGTAAGGCTATATGGAGAAAGATCGAGAGTGTTATGTTCTCTGTATAAATATGTAATGG
CCAGTGTTGTGTAATGCAAGCAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 10 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 5 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FY57TF U 1
AF RS1EE47TF U 10
AF RS1EE47JQ C 255
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GCCACTCATAATTTGAAGAAGCTTGACTTTAGTATCACTGATGGATCAGCGGTTCCTTGG
GCTTTAGAGTTTGACCATTGGCTCAGAGACTCTCTCCTTCAAG*AAGGTATGGAGATGTG
A*TGAGTGGGAAGAGAA*GCTCCAAATGCGAAA*TGGCACATCCATGGC
AGAGCATTCT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1EE47TF 752 0 0
GG
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TAGAGAGTTGCTAATGGGAGGAGGAGGAATGAAGCGTGTTGATGAAGATACAGAGAGAGG
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CGTTGCAATGGGTGCAGCTGGTGGTGATGA

QA 3 752 3 752
DS 

RD RS1EE47JQ 731 0 0
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AGAGTTGCTAATGGGAGGAGGAGGAATGAAGCGTGTTGATGAAGATACAGAGAGAGGACT
TGATCATGGAGCTTGGGTTCCTCTCATGTTGATGTATCCTGAAGCAGATATACCGGTTTG
TCAACTCTCTGTTCAATCATCTCAAACCGGGACTTACCATTACAACATGGGCAAAGCATT
GGCTCCACTGAAAGAAGAAGGCGTTTTTATCATTGGATCTGGAAGTGCCACTCATAATTT
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TGCAATGGGTGCAGCTGGTGGTGATGACGCCAAGGCAGAGCAAATCCACACAAGCTGGGA
ACTTGGGACTCTGTCTTATTCTTCTTATAGCTTCACCTCTTCCCTTTGAAACATTGCATC
TTTACCTCCTTTCACTTGCTGTGTGACTACTTTTAATGTAAGCACTGTGTAAGGCTATAT
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TGCAAGCAAGC

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 3

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CGGAAAAGTACAGCTTTCAGTTCACAAAAAGTAGATAAATAAACTTTTTAGAAATCGGGT
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AGAGTTTTTAAATCTTCCGGTAACTTAATCATACAACAAAAGCTAAACCCTTGAGTAATC
ATCCTCTAATCAAAAATTCAAAACTAATCCCATACCTTTGACTCTGAGCAAGCTGTTATG
TCAAATACTGAATCCATGCTTAAAAGATCATCTTCTTTCCCCCTTTATGTTTTTCTGTGT
GTGTGAGAGTGAGACTTAATTATATACAAAGAGCGCCCACGTCTGGTGCATTTGTTTCAA
CTTCATTCGATGTTCCTCTCCTCAGATTCTTTCTCCCCTTCTTCGACTCCATTGTTTGGC
TCACTAACAGTTTTACAGAGGATCTCCCGGCTGCTGTTCCGCAGCAGGACTTGTATTTCT
TCTTTGAACCACCTTATTGAAGAAAACAAAACCTTACCCTGCCTTACAGTCTCCAACCTC
GATGCAGCAACAGAGAGAACCTTCATGATATCATAAACAGCCCAATCCTAAAGGAGAAAG
AGAATAAAACAGAAACACTTTAGCAGCAACAAAAAATCAGACTATTTTCACTTAGTCTCT
GCCCTCAAAGAGACACAGGAACCTATATAGAAAGGGTGAAGAAACTTACAACTCGAGCTT
CAAAGACGCTACAAATCTGTGGAGCTTCGTATACAGTACCATCCAAAATATAATACGTTA
GCATCGGTGCAACTTCTCAGGACCATCTCTCTTTTGCTTACGAAAGGCAAACAGGTTTGG
TCAGTAGAATCACTGATCACATACTCTAAGCCTGTCATATATACTGAGAGAAAATTATTA
TCAGAATATGTTAAAACCAAAGATCAATCCTTTGATCTTCCAACACTATCCCAGGAAACA
AACAGAGACCAAAACCATACAATTTTGAAATCGAAGTAGTAAGGAGATGATTACCAAAGT
TGAGAGTGATCGAGAGGATGATTGATCTCCGACGAAAAATCTCGTTGTTGCCCATATGAG
AGACTCAAGAGGGCGATTCAATGCTGCGGAGTGGAGGGAGAAGGGATTCAATTATGCGCA
TAAAGTCGGACCCAATCAAAAATAAATGAGCCGTTTCAGAGAGGAGAAGGGAGAGCCATA
GATGAGCGGAGAAGCTTAAACTTCATTCCAGGCGGAAACCTAAAACATCAGAAGAAAAGC
GACGCGGAGCAACCAAGGCAATATCTGGCCTGATTTGTATAATTAAAAGCCCATAAAATT
AGAAGAAACACACAGATAAACTAAGAAGTCCAGATACGAAATGCAGCGTTTAATTAAAAG
GGGAATACGTGGCGAAGTTCCCCCATGGAGAAAAAAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1C914TF U 1
AF RS1AK17TF U 8
AF RS1C914JQ C 488
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BS 276 786 RS1C914TF
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DS 

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GG
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GCTCCCTAAGCACTGCGACAACAACAAAGTCCTTAAAGCTCTCTGTCTCGAAGCTGGTTG
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ATCAGGAACTCCGACGAACTACAGCACGAACTCATCAATCCAACCAAGTCCACAATCCTC
TGCTTTCCCAAGCCCTGCACCTTCTTACCACGGAAGTCCTGTCTCATCTTCCTTCCCAAG
CCCCACTCGTTACGACGCGAATAACCCTTCCTCGTACCTTCTCCTCCCTTTCCTCCACAA
CATCGCTTCTTCCATCCCATCAAACCTTCCTCCTCTCAGAATCTCCAACAGCGCTCCCGT
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GTCCTACACGCCCGCGGTTGTCATCAAACACCGCCTACGATACCTGAATGCGACGAG
TC

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DS 

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AGCCCCACTCGTTACGACGCGAATAACCCTTCCTCGTACCTTCTCCTCCCTTTCCTCCAC
AACATCGCTTCTTCCATCCCATCAAACCTTCCTCCTCTCAGAATCTCCAACAGCGCTCCC
GTGACTCCTCCGTTATCCTCTCCCACCTCTCGCGGTTCCAAGCGGAGACTCATCACTGAA
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CTTCGCCGACGTTTAACCTTGTTCAGCAGACGTCTATGGACATTGACATGAAAAGACCAG
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TCAATGTTTTTTTCTATGGTGATAATGTTATTTGGAGGTATAATGTGTGTTCAGTCACAT
GATTAAGAAAAGGTTTTTGGAGTTAATGTTATTGTGTTTTTCCTG

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 3

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GGGAGAAGGCTTTTATCAGTTTCGCAGAGATCTTCGACTGCGACCTCCACCTTCGCTCTC
TCCCGAGACCAGAGCAGCGGCTCCTCTTCCGCCACCAGATCTGTCCCCTCTGCAGATCTT
TCACGTTTCGATTCTTACCACCGTAGTAGCCTTATAAGAGGTTTCTCTTCTCAAGTCCTT
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CTTGCATCCCTCGAGGTTGACCTCGGTAGCATCGAACCGGGAACCACTGTCACGGTTAAG
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GGTGATTATGGAGGTGGGTTTTGTCCGTGTCATGGTTCGCATTATGATATCTCTGGAAGG
ATTAGGAAAGGTCCTGCACCCTATAACCTGGAAGTACCAACATACAGCTTCTTGGAAGAG
AACAAGTTACTCATTGGTTGATGAATAATAAAAAGAAAGCACAACAGTCAGCTTCATCTG
TTTGTTTCTTCTTTCCTTTTCTATATTCCAGCAATTTAGAGCGAAGATTGTCTTTTTTTT
TTTGCTTAATAAGAAAAACTTGTCATATTTAATGAGAGTGTACTCGAGCAGTTCTGTTTT
TCGATGATGATGATAGTGAGAGACTCTATTTTGTGTTTATTCATTTATCAATTCCTATAT
GCCCTGTGTATGCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C401TF U 1
AF RS1F010TF U 14
AF RS1C401JQ C 290
BS 1 715 RS1C401TF
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TCCCGAGACCAGAGCAGCGGCTCCTCTTCCGCCACCAGATCTGTCCCCTCTGCAGATCTT
TCACGTTTCGATTCTTACCACCGTAGTAGCCTTATAAGAGGTTTCTCTTCTCAAGTCCTT
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GGTGAT
AT

QA 1 726 1 726
DS 

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ATCTTCTGTGTTGCATCGGGCCGTGAGCGAAGATGCTGCGAGTAGCAGGGAGAAGGCTTT
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GCAGCGGCTCCTCTTCCGCCACCAGATCTGTCCCCTCTGCAGATCTTTCACGTTTCGATT
CTTACCACCGTAGTAGCCTTATAAGAGGTTTCTCTTCTCAAGTCCTTACCCAAGGGAATG
AGGTAGGTTTTGGTTCGGAACCAGCCACGGTCGAGGCTGTCAAAACACACAACTCAAAGA
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TTGCTTATTTCGTCCTTTCCGGTGGGAGGTTTGTCTACGCCTCTGTTCTCCGCCTTCCCG
TTCTCAAGCTTATTGTCAGCATGTCTGCGAGTAAAGATGTCCTTGCACTTGCATCCCTCG
AGGTTGACCTCGGTAGCATCGAACCGGGAACCACTGTCACGGTTAAGTGGCGTGGAAAGC
CCGTGTTCATCAGGAGAAGGACGGAAGATGACATCAAGCTGGCTAATAGTGTGGATCTTG
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TTGTTGGAGTCTGCACTCACTTGGGATGCATCCCTTTGCCTAACGCTGGTGATTATGGAG
GTGGGTTTTGTCCGTGTCATGGTTCGCATTATGATATCTC

QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1C401JQ 805 0 0
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CTGGTGACCCTAGCAAGCGTGCCTTTGCTTATTTCGTCCTTTCCGGTGGGAGGTTTGTCT
ACGCCTCTGTTCTCCGCCTTCTCGTTCTCAAGCTTATTGTCAGCATGTTCGCGAGTAAAG
ATGTCCTTGCACTTGCATCCCTCGAGGTTGACCTCGGTAGCATCGAACCGGGAACCACTG
TCACGGTTAAGTGGCGTGGAAAGCCCGTGTTCATCAGGAGAAGGACGGAAGATGACATCA
AGCTGGCTAATAGTGTGGATCTTGGTTCTTTGAGGGACCCGCAAGAAGATGCGGTGAGGG
TGAAGAATCCGGAATGGCTAGTGGTTGTTGGAGTCTGCACTCACTTGGGATGCATCCCTT
TGCCTAACGCTGGTGATTATGGAGGTTGGTTTTGTCCGTGTCATGGTTCGCATTATGATA
TCTCTGGAAGGATTAGGAAAGGTCCTGCACCCTATAACCTGGAAGTACCAACATACAGCT
TCTTGGAAGAGAACAAGTTACTCATTGGTTGATGAATAATAAAAAGAAAGCACAACAGTC
AGCTTCATCTGTTTGTTTCTTCTTTCCTTTTCTATATTCCAGCAATTTAGAGCGAAGATT
GTCTTTTTTTTTTTGCTTAATAAGAAAAACTTGTCATATTTAATGAGAGTGTACTCGAGC
AGTTCTGTTTTTCGATGATGATGATAGTGAGAGACTCTATTTTGTGTTTATTCATTTATC
AATTCCTATATGCCCTGTGTATGCG

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 3

CO CL4168Contig1 1019 3 13 U
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GATTAATAATACCCTACCAAACATACATTCATGATTTTTTCTTTCTTTCTTAAGGTCTAC
TGATAAGTTGTCAGACAAAGCTTAAAAAGCATAACTCAATCACTCTATAGAGTTTATTTT
CTTACCAAACCCATGAGCATGGCCAGTTGTGGTGCTGATACAAATACATTTAGTACATTA
CATGTGTATGCATTGCCCACAGAACATGCAAATGCATACACAGTCTTCAAAGCAGCCTTT
GCCACACACGTTGAGAGATCTTCTGCCATTTTAACAAGACTATCCGAATGAGCCACGGCA
TTTCACAGAACCACATAAGCATTTCCTCTTTCCATGTAAAAGGCGGCTCCCATCTCTGGT
CTCGGACGTAAGGGAGGAGACTCCATAGTCATAAGTCAACTCAGCCATCGGTGGAATGTG
ACGTATGGCAAAGAAAGCAATGTGGACAACCGATTCACCGTTTCCTTCACAAACAACTGG
CTGCCACAGAACGTTAGGGGAGCAGCTATGGTTCATGAACCGAGCTACGTTTCCAAAACT
CTTGGCATTGATCAGAAGTGGTGATGGGAGATTGAACTCCTCCGGGGTTCCATCTGAA*G
GGTCTTCATCTACCAATGCAGGCTCGTAGTTCCACTTAAACGAGTTATTATAAACACGTG
ATGTGTCGAAAACAAACTCATCATCTTCTTGGTCCGTTCCAAGGTCGCCTCTCTCTTTGA
CCTCGCCAGCGTATTCGCATATGAAAGAGACAGCTCGGATGGGATCCCAAGAACGTAAAC
CCCAACCACGATTGGCTGTCTTGAACACTTCCAGGCGGAACTTCAGCCCCGTCTGAATCA
CTTTGTTTTTGCAAGTGGCGTGACATGGACAGGTTGGGCCACATTCATATACCATTGGCC
TCCGGGAAACAAGCATCACACCGTTAAGGTAAGGGAGGTCACATCCGTTCTTTCGGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B444JQ U 1
AF RS1CQ68JQ U 57
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BS 775 841 RS1CQ68JQ
BS 842 1019 RS1CQ68TF

RD RS1B444JQ 774 0 0
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CTTACCAAACCCATGAGCATGGCCAGTTGTGGTGCTGATACAAATACATTTAGTACATTA
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CTTGGCATTGATCAGAAGTGGTGATGGGAGATTGAACTCCTCCGGGGTTTCATCTGAAAG
GGTCTTCATCTACCAATGCAGGCTCGTAGTTCCACTTAAACGAGTTATTATAAACACGTG
ATGTGTCGAAAACAG*CTCATCATCTTCTTGGTCCGTTCCAAG*TCGCCTCTCT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RS1CQ68JQ 785 0 0
C
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TACTGATAAGTTGTCAGACAAAGCTTAAAAAGCATAACTCAATCACTCTATAGAGTTTAT
TTTCTTACCAAACCCATGAGCATGGCCAGTTGTGGTGCTGATACAAATACATTTAGTACA
TTACATGTGTATGCATTGCCCACAGAACATGCAAATGCATACACAGTCTTCAAAGCAGCC
TTTGCCACACACGTTGAGAGATCTTCTGCCATTTTAACAAGACTATCCGAATGAGCCACG
GCATTTCACAGAACCACATAAGCATTTCCTCTTTCCATGTAAAAGGCGGCTCCCATCTCT
GGTCTCGGACGTAAGGGAGGAGACTCCATAGTCATAAGTCAACTCAGCCATCGGTGGAAT
GTGACGTATGGCAAAAAAAGCAATGTGGACAACCGATTCACCGTTTCCTTCACAAACAAC
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ACTCTTGGCATTGATCAGAAGTGGTGATGGGAGATTGAACTCCTCCGGGGTTCCATCTGA
A*GGGTCTTCATCTACCAATGCAGGCTCGTAGTTCCACTTAAACGAGTTATTATAAACAC
GTGATGTGTCGAAAACAAACTCATCATCTTCTTGGTCCGTTCCAAGGTCGCCTCTCTCTT
TGACCTCGCCAGCGTATTCGCATATGAAAGAGACAGCTCGGATGGGATCCCAAGAACGTA
AACC

QA 2 785 2 785
DS 

RD RS1CQ68TF 694 0 0
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CTCTTTCCATGTAAAAGGCGGCTCCCATCTCTGGTCTCGGACGTAAGGGAGGAGACTCCA
TAGTCATAAGTCAACTCAGCCATCGGTGGAATGTGACGTATGGCAAAGAAAGCAATGTGG
ACAACCGATTCACCGTTTCCTTCACAAACAACTGGCTGCCACAGAACGTTAGGGGAGCAG
CTATGGTTCATGAACCGAGCTACGTTTCCAAAACTCTTGGCATTGATCAGAAGTGGTGAT
GGGAGATTGAACTCCTCCGGGGTTCCATCTGAA*GGGTCTTCATCTACCAATGCAGGCTC
GTAGTTCCACTTAAACGAGTTATTATAAACACGTGATGTGTCGAAAACAAACTCATCATC
TTCTTGGTCCGTTCCAAGGTCGCCTCTCTCTTTGACCTCGCCAGCGTATTCGCATATGAA
AGAGACAGCTCGGATGGGATCCCAAGAACGTAAACCCCAACCACGATTGGCTGTCTTGAA
CACTTCCAGGCGGAACTTCAGCCCCGTCTGAATCACTTTGTTTTTGCAAGTGGCGTGACA
TGGACAGGTTGGGCCACATTCATATACCATTGGCCTCCGGGAAACAAGCATCACACCGTT
AAGGTAAGGGAGGTCACATCCGTTCTTTCGGATC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 3

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GCTAACATCTCCACCTCGTCTCATGATCGTCTCCGATCTTGATCACACCATGGTTGATCA
TCATGACCCTGAGAACCTCTCTCTGCTAAGATTCAATTCACTCTGGGAACACGCTTACCG
CCACGACTCTCTTCTCGTCTTCTCCACCGGAAGATCACCCACCCTTTACAAAGAACTCAG
AAAGGAGAAGCCTTTGCTGACCCCTGACATCACCATCATGTCTGTTGGCACTGAGATCAC
TTATGGTAACTCCATGGTTCCTGATAACGGTTGGGTTGATACTTTGAATAACAAATGGGA
CTTGAATGTTGTCAAAGAAGAGTCCAGCAACTTCTCTGAGTTAACTCTTCAGGCGGAAAC
AGAGCAGAGGCCACACAAGGTTAGCTTTTACGTTGACAAGAGTAAGGCTCAGGATGTGAC
TAAGGAGCTCTCACACCGGTTGGAGAAACGTGGGTTGGATGTGAAAATAATCTACAGTGG
AGGCATGGATTTGGATATCTTACCACAAGGTGCTGGAAAGGGACAAGCGCTTGCTTACCT
CCTCAAGAAGCTCAAGAGCGAAGGGAAACTCCCTCTGAACACTCTCGCTTGTGGTGACTC
CGGGAACGATGCTGAACTCTTTAGCATCCCTGACGTTTACGGCGTCATGGTAAGCAATGC
TCAGGAAGAGCTGTTGAAGTGGCATGCATAGAATGCGAAGGACAACCCGAAGGTGATGCA
TGCGAAGGGGAGGTGTGCGGGTGGGATTATACAAGCCGTTGGTGAGTTCGAGCTCGGTCC
AAACCTTTCTCCGAGAGACGTCTCTGACTTCTTGGAGTGCAGGGTTGAGAATGTCAACCC
TGGTCATGAGGTTGTGAAGTTTTTCTTGTTCTACGAGAGGTGGAGACGTGGTGAGGTTGA
GAACAGCGAGGCGTACGTAGCTAGCCTCAAAGCTTCATGTCACCCTGGTGGTGTGTTTGT
TCATCATCTGGTGCTGAGAAATCTCTGGTGGATACCATTGATGAGCTGCGTAAGTACCAT
GGAGACGAACAAGGAAAGAAGTTTCGGGTTTGGGTAGATCAAGTCTTGGCAACAGAGACC
ACTCATGGGACATGGATTGTAAAGTTTGACAAATGGGAACAGAGTGGGGATGAACGCAGA
GGCTGCACAACCACTGTCAAGTTCACAGCAAAGGAAGGTGAAGGGTTGGTGTGGGAACGT
GTAGAGCAAACTTGGTCTGACGAATTAAAGTTGAAGAAGGATGATAGCAGCTGGATCATC
TGAATCACAATCTCTCTATCTCTACAGATGAAGACTTCTTTCTCTTTCTTCTCTTATGAA
TTTCTGCCATAAAATCATTAAAGCTTTGTCTTGATCACACGAGATCCAATAAAATAGTAT
CTTAGTAGAACTTGGATCTCAAAACTCATCTACATCTCCAAGTTGAATCCGTTTTCTTTA
ACCCTTTTGAACCAACAAAATGGAGTATATGATATTACCAGTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CU70TF U 1
AF RS1DN68TF U 277
AF RS1DN68JQ C 772
BS 1 663 RS1CU70TF
BS 664 923 RS1DN68TF
BS 924 924 RS1DN68JQ
BS 925 962 RS1DN68TF
BS 963 963 RS1DN68JQ
BS 964 994 RS1DN68TF
BS 995 1546 RS1DN68JQ

RD RS1CU70TF 665 0 0
GGAGGAGGGTCCATCTCAATTTGTGGTGAATCGAATTCTCTGTGAGTAATTCATGGAGCG
GCTAACATCTCCACCTCGTCTCATGATCGTCTCCGATCTTGATCACACCATGGTTGATCA
TCATGACCCTGAGAACCTCTCTCTGCTAAGATTCAATTCACTCTGGGAACACGCTTACCG
CCACGACTCTCTTCTCGTCTTCTCCACCGGAAGATCACCCACCCTTTACAAAGAACTCAG
AAAGGAGAAGCCTTTGCTGACCCCTGACATCACCATCATGTCTGTTGGCACTGAGATCAC
TTATGGTAACTCCATGGTTCCTGATAACGGTTGGGTTGATACTTTGAATAACAAATGGGA
CTTGAATGTTGTCAAAGAAGAGTCCAGCAACTTCTCTGAGTTAACTCTTCAGGCGGAAAC
AGAGCAGAGGCCACACAAGGTTAGCTTTTACGTTGACAAGAGTAAGGCTCAGGATGTGAC
TAAGGAGCTCTCACACCGGTTGGAGAAACGTGGGTTGGATGTGAAAATAATCTACAGTGG
AGGCATGGATTTGGATATCTTACCACAAGGTGCTGGAAAGGGACAAGCGCTTGCTTACCT
CCTCAAGAAGCTCAAGAGCGAAGGGAAACTCCCTCTGAACACTCTCGCTTGTGGTGACTC
CGG
AA

QA 1 663 1 663
DS 

RD RS1DN68TF 725 0 0
CATGTCTGTTGGCACTGAGATCACTTATGGTAACTCCATGGTTCCTGATAACGGTTGGGT
TGATACTTTGAATAACAAATGGGACTTGAATGTTGTCAAAGAAGAGTCCAGCAACTTCTC
TGAGTTAACTCTTCAGGCGGAAACTGAGCAGAGGCCACACAAGGTTAGCTTTTACGTTGA
CAAGAGTAAGGCTCAGGATGTGACTAAGGAGCTCTCACACCGGTTGGAGAAACGTGGGTT
GGATGTGAAAATAATCTACAGTGGAGGCATGGATTTGGATATCTTACCACAAGGTGCTGG
AAAGGGACAAGCGCTTGCTTACCTCCTCAAGAAGCTCAAGAGCGAAGGGAAACTCCCTCT
GAACACTCTCGCTTGTGGTGACTCCGGGAACGATGCTGAACTCTTTAGCATCCCTGACGT
TTACGGCGTCATGGTAAGCAATGCTCAGGAAGAGCTGTTGAAGTGGCATGCATAGAATGC
GAAGGACAACCCGAAGGTGATGCATGCGAAGGGGAGGTGTGCGGGTGGGATTATACAAGC
CGTTGGTGAGTTCGAGCTCGGTCCAAACCTTTCTCCGAGAGACGTCTCTGACTTCTTGGA
GTGCAGGGTTGAGAATGTCAACCCTGGTCATGAGGTTGTGAAGTTTT*CTTGTTCTACGA
GAGGTGGAGACGTGGTGAGGTTGAGA*CAGCGAGGCGTACGTAGCTAGCCTCAAAGCT
CATGTCA

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1DN68JQ 775 0 0
GGTGATGCATGCGAAGGGGAGGTGTGCGGGTGGGATTATACAAGCCGTTGGTGAGTTCGA
GCTCGGTCCAAACCTTTCTCCGAGAGACGTCTCTGACTTCTTGGAGTGCAGGGTTGAGAA
TGTCAACCCTGGTCATGAGGTTGTGAAGTTTTTCTTGTTCTACGAGAGGTGGAGACGTGG
TGAGGTTGAGAACAGCGAGGCGTACGTAGCTAGCCTCAAAGCTTCATGTCACCCTGGTGG
TGTGTTTGTTCATCATCTGGTGCTGAGAAATCTCTGGTGGATACCATTGATGAGCTGCGT
AAGTACCATGGAGACGAACAAGGAAAGAAGTTTCGGGTTTGGGTAGATCAAGTCTTGGCA
ACAGAGACCACTCATGGGACATGGATTGTAAAGTTTGACAAATGGGAACAGAGTGGGGAT
GAACGCAGAGGCTGCACAACCACTGTCAAGTTCACAGCAAAGGAAGGTGAAGGGTTGGTG
TGGGAACGTGTAGAGCAAACTTGGTCTGACGAATTAAAGTTGAAGAAGGATGATAGCAGC
TGGATCATCTGAATCACAATCTCTCTATCTCTACAGATGAAGACTTCTTTCTCTTTCTTC
TCTTATGAATTTCTGCCATAAAATCATTAAAGCTTTGTCTTGATCACACGAGATCCAATA
AAATAGTATCTTAGTAGAACTTGGATCTCAAAACTCATCTACATCTCCAAGTTGAATCCG
TTTTCTTTAACCCTTTTGAACCAACAAAATGGAGTATATGATATTACCAGTTTGC

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

CO CL4170Contig1 807 2 3 U
AGTTTCAAACGTTTAATTAAGCAAACAACACATAAATAGAGTTTTCATAAGCAAACAACA
CACATATAAGCTTAAGTAAGTGTCGTAAAGGGAGTACATAGGCGGCTCGAGATTGAAAGG
AGACACACACATTCATAAAGACAAAGGGAATAGATAGTAGATTGGTGATGAGATTACAAA
TCTCGATGATCAATCGATGACCAAAGACATAATCTTTTCCTGAAGATTTGGCTGAATCGG
CTGGACTCTATATCCAAATTGTCCATCGTGATCCCTCATCATCATTCCTCTTGCGTTGCT
AGCTATAGCCATCTCCTGTTGTTGCAGCTGGAAACTGAGTTGACTATTCTCCTCCGCCAA
CATTTTCTCATTTCTCCTTTTTGTCATGAGGTACTCCATCTGGTGGTCTCGGACTTTGTC
TAGGCCGTGTTCAATGGCATGCTCTACGGCCATCAGGTTTTTTAAGTTGAGAGACTGTAT
ATCTTCCCCCTTCAAGTGCCTGAGCTCAAGTTGCAAGTTATCATTCTCTTTCTTGATCCT
ATCAATCTCATTGCTGAGGTTCTCATGCTTAGCATCCCATAGTTTTTTGCCAGATAACTT
CTGGTATTGGTCCAGCATAGCACCAAGATCCATGGAAGGACAACAATAATCAGTCATCTT
ACCATTACTTGCAAAGACTATGAGAGCAACTTTTGCATCGCAAAGAACAGTGATCTCTTT
GGCCTTCTTCACCAACCCATTCCTCCTCTTTGAGAACGTCACCACTCTGTTGTTTGCGTT
TTCTATCCTCTTATCTCTATCTCCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1EN18JQ U 11
AF RS1CE29JQ U 1
BS 1 34 RS1CE29JQ
BS 35 35 RS1EN18JQ
BS 36 807 RS1CE29JQ

RD RS1EN18JQ 246 0 0
GTTTAATTAAGCAAACAACACATAAATAGAGTTTTCATAAGCAAACAACACACATATAAG
CTTAAGTAAGTGTCGTAAAGGGAGTACATAGGCGGCTCGAGATTGAAAGGAGACACACAC
ATTCATAAAGACAAAGGGAATAGATAGTAGATTGGTGATGAGATTACAAATCTCGATGAT
CAATCGATGACCAAAGACATAATCTTTTCCTGAAGATTTGGCTGAATCGGCTGGACTCT
GCGTTGA

QA 1 239 1 239
DS 

RD RS1CE29JQ 807 0 0
AGTTTCAAACGTTTAATTAAGCAAACAACACATACATAGAGTTTTCATAAGCAAACAACA
CACATATAAGCTTAAGTAAGTGTCGTAAAGGGAGTACATAGGCGGCTCGAGATTGAAAGG
AGACACACACATTCATAAAGACAAAGGGAATAGATAGTAGATTGGTGATGAGATTACAAA
TCTCGATGATCAATCGATGACCAAAGACATAATCTTTTCCTGAAGATTTGGCTGAATCGG
CTGGACTCTATATCCAAATTGTCCATCGTGATCCCTCATCATCATTCCTCTTGCGTTGCT
AGCTATAGCCATCTCCTGTTGTTGCAGCTGGAAACTGAGTTGACTATTCTCCTCCGCCAA
CATTTTCTCATTTCTCCTTTTTGTCATGAGGTACTCCATCTGGTGGTCTCGGACTTTGTC
TAGGCCGTGTTCAATGGCATGCTCTACGGCCATCAGGTTTTTTAAGTTGAGAGACTGTAT
ATCTTCCCCCTTCAAGTGCCTGAGCTCAAGTTGCAAGTTATCATTCTCTTTCTTGATCCT
ATCAATCTCATTGCTGAGGTTCTCATGCTTAGCATCCCATAGTTTTTTGCCAGATAACTT
CTGGTATTGGTCCAGCATAGCACCAAGATCCATGGAAGGACAACAATAATCAGTCATCTT
ACCATTACTTGCAAAGACTATGAGAGCAACTTTTGCATCGCAAAGAACAGTGATCTCTTT
GGCCTTCTTCACCAACCCATTCCTCCTCTTTGAGAACGTCACCACTCTGTTGTTTGCGTT
TTCTATCCTCTTATCTCTATCTCCCTC

QA 1 807 1 807
DS 



AS 1 2

CO CL4171Contig1 1115 2 8 U
GGAAGTCGAAGGCTCTCATGTTTTGCAAAACGTTTACGAGTCTCTTGACGTTCACGTTGG
ACAGTCTTTATCAGTTCTTGTGACACTAAATCAACCTTCTAAAGATTATTACATCGTTGC
AAGCTCCCGTTACACAACTTCCAAGCTTTCCGTTACTGGTCTGCTGCGTTATTCCAACTC
TGGCGTCCCGGGGTCTCCTGGTGATCTTCCCACTCCTCCCCCTGAAGATCTTGATTGGTC
CTTGAACCAAGCCAGATCGTTCAGGTGGAACTTAACGGCTAATGCGGCTAGACCGAACCC
TCAAGGATCGTTTCACTACGGAACAATCACTCCGACCAAGTCATTTGTATTCTCAAACTC
GGCTCCTTTGATCAACGGGAAGCAACGGTATGCGGTGAATGGAGTCTCTTATGTCAACTC
GGAGACGCCTCTTAAACTTGCTGATCACTTCAACATCCCCGGAGTTTTCAGCACAAGCGT
TCCTTCTAATGCTCCTGGGGTTGTTGCTACATCAGTTGTTCGAGCATCACTCCATGATTT
CCTCGAAGTTGTGTTTCAGAACAATGAGGAATCAATGCAGTCTTGGCACCTTGACGGTTA
TGACTTCTGGGTCGTTGGATTTGGTTTTGGACAATGGACACCTGAGCAGAGATCTCTATA
CAATCTTGTTGACGCTCTTACTAGACACACAACTCAGGTGTACCCGAAGTCTTGGACAGC
AATCTTGGTGTCGTTGGACAATCAAGGGATGTGGAATATGAGATCGGCTATATGGGAAAG
ACAGTATTTGGGACAGCAGTTTTATCTAAAAGTGTGGGATCCAGTGCAGAGTCTTGCCAA
TGAATATAATCCTCCTGATAATCTTCTTCTTTGTGGCAAAGCTATTGGAAGACGAGTTTA
GAAAGATCATCTTTATAGTGTTCATCTGGTCTTTTTTATTTGAGTTCATTTGTTTTGAGG
GTTTTTCGATTCAGTTTGGTTTGTGGTTTTGTCCAATCTGGTCATGAGAGGTATGGCTGG
TGACATTTGTAGTAACAATACATGGAAGAGAAGAAAAGTTGTCTGTCTTCAGATTGCAGT
TTTAAAATATTCTTTAATACAAAATTATTCTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GR20TF U 1
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ACAGTATTT

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DS 

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ATGGACACCTGAGCAGAGATCTCTATACAATCTTGTTGACGCTCTTACTAGACACACAAC
TCAGGTGTACCCGAAGTCTTGGACAGCAATCTTGGTGTCGTTGGACAATCAAGGGATGTG
GAATATGAGATCGGCTATATGGGAAAGACAGTATTTGGGACAGCAGTTTTATCTAAAAGT
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CAATCTGGTCATGAGAGGTATGGCTGGTGACATTTGTAGTAACAATACATGGAAGAGAAG
AAAAGTTGTCTGTCTTCAGATTGCAGTTTTAAAATATTCTTTAATACAAAATTATTCTTA
CC

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 3

CO CL4172Contig1 797 3 29 U
GGAATCACCTTCTCCTTAGTTTCTGAACCTACCCTCATCGGGTCTCCAAGGGGCCAAGAA
AGAACTGCTTTCTCGGCTTCCCGGAGTCTCACCATCCTCTGTTTTCACGCTTTCTTCATC
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TGTGATGATTTTTCTTT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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TACCTTGGGACTCAAGCAAGGTAAGACCTTGGAGGAATGTAGGAAGATGATAATACAAGT
GGATGTTGATGGTGATGGTAGGGTTAATTACAAGGAGTTTAGACAAATGATGAAGAAGGG
TCAGCTTTTAGCTCAATGAGCTGATGGTTTATATATTTGTTTTCTTTTTGTGTTTACCAT
TTTTCTCTCGCATTCT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1E366TF 750 0 0
GGAATCACCTTCTCCTTAGTTTCTGAACCTACCCTCATCGGGTCTCCAAGGGGCCAAGAA
AGAACTGCTTTCTCGGCTTCCCGGAGTCTCACCATCCTCTGTTTTCACGCTTTCTTCATC
CACACGCAA*CCTCTTACCCAAACCTAACCCTAAAAAATGGATTCCACGGAGCTAAAACG
TGTGTTCCAAATGTTCGACAAGGACGGAGACGGTCGGATCACACAGAAGGAGCTAAACGA
GTCATTCAAAAACCTCGGCATCATAATCCCTGAAAACGAGCTATCGCAGATGATCGAGAA
GATCGATGTGAACGGTGATGGCTGTGTTGACGCTGAAGAGTTCGGAGAGCTTTACAAGTC
GATAATGGTCCAAGGCGAGGATGAGGAGGTAGGAGATGAAGATATGAAGGAAGCGTTCAA
CGTTTTCGATCAGAATGGAGATGGGTTTATTACGGTGGATGAGTTGAAAACCGTCTTGTC
TTCCTTGGGACTCAAGCAAGGTAAGACCTTGGAGGAATGTAGGAAGATGATAATACAAGT
GGATGTTGATGGTGATGGTAGGGTTAATTACAAGGAGTTTAGACAAATGATGAAGAAGGG
TCAGCTTCTAGCTCAATGAGCTGATGGTTTATATATTTGT***CTTTTTGTGTTTACCAT
TTTTCTCTCGCATTCTAGAAG*AAATATCAGATGATCTGTAACTGAACTGTCTTATATAG
TGTCTAGGTT*GCGAGAGCACATTGTAAAA

QA 1 750 1 750
DS 

RD RS1E366JQ 674 0 0
CACGC
AACCTCTTACCCAAACCTAACCCTAAAAAATGGATTCCACGGAGCTAAAACGTGTGTTCC
AAATGTTCGACAAGGACGGAGACGGTCGGATCACACAGAAGGAGCTAAACGAGTCATTCA
AAAACCTCGGCATCATAATCCCTGAAAACGAGCTATCGCAGATGATCGAGAAGATCGATG
TGAACGGTGATGGCTGTGTTGACGCTGAAGAGTTCGGAGAGCTTTACAAGTCGATAATGG
TCCAAGGCGAGGATGAGGAGGTAGGAGATGAAGATATGAAGGAAGCGTTCAACGTTTTCG
ATCAGAATGGAGATGGGTTTATTACGGTGGATGAGTTGAAAACCGTCTTGTCTTCCTTGG
GACTCAAGCAAGGTAAGACCTTGGAGGAATGTAGGAAGATGATAATACAAGTGGATGTTG
ATGGTGATGGTAGGGTTAATTACAAGGAGTTTAGACAAATGATGAAGAAGGGTCAGCTTC
TAGCTCAATGAGCTGATGGTTTATATATTTGT***CTTTTTGTGTTTACCATTTTTCTCT
CGCATTCTAGAAGGAAATATCAGATGATCTGTAACTGAACTGTCTTATATAGTGTCTAGG
TTTGCGAGAGCACATTGTAAAAAATTTAGACCTGTTCGTTTCTAATGTGATTTGTGATGA
TTTTTCTTT

QA 6 674 6 674
DS 



AS 1 3

CO CL4173Contig1 977 3 8 U
GGGCCGTAAACTCAAGAAGAAGGAAGAAGAAGACGAATCCATGGGTCGTGTCATCAGAGC
TCAACGTAAGGGAGCAGGCTCCGTCTTCAAGTCCCACACTCACCACCGCAAGGGCCCCGC
CAAGTTCAGGAGCCTCGATTTCGGCGAGAGAAATGGTTACCTCAAGGGTGTCGTCACGGA
GATCATCCACGATCCGGGTCGCGGTGCTCCGTTAGCCCGCGTCGCCTTCCGTCATCCTTT
CCGTTACAAGAAGCAGAAGGAGCTCTTCGTCGCCGCCGAAGGCATGTACACCGGTCAGTT
CTTGTACTGCGGTAAGAAGGCGACTCTCGTTGTCGGAAATGTTCTGCCTCTCAGATCTAT
CCCCGAGGGAGCTGTTGTCTGCAACGTCGAGCACCATGTCGGTGATCGTGGTGTGCTCGC
TAGAGCTTCTGGAGATTACGCTATCGTTATTTCACATAACCCTGACAACGACACGACAAG
TGTTAAGTTGCCATCTGGATCGAAGAAGATTGTCCCAAGTGGATGCAGGGCCATGATTGG
TCAAGTTGCTGGTGGTGGAAGAACTGAGAAGCCGATGCTCAAGGCGGGTAACGCGTACCA
CAAGTACCGTGTGAAGAGTAACTGCTGGCCTAAGGTTCGTGGTGTGGCTATGAACCCTGT
TGAGCATCCTCACGGAGGAGGTAACCATCAACATATTGGTCACGCCAGTACCGTTCGTCG
TGATGCACCACCCGGGCAAAAGGTTGGTCTTATTGCTGCAAGGAGGACTGGTCGTCTCAG
AGGTCAAGCTGCTGCTCTTGCTTCCAAGCAAGAATAAGGAGAGAGAGTTTCAAGATGATG
AAGTTGTTTACTCTTGTTGGATTTTTGCTGAGACCTTGTTTTGAATCCTTTAGATTTTCT
TTAATCTTCTTTGAGGCCTTTGTCTTCAGGATCAAACCTCCACATTATCATTTTAAATTT
CAGGATTCAGTTTTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FO11TF U 1
AF RS1CX41TF U 37
AF RS1CX41JQ C 145
BS 1 267 RS1FO11TF
BS 268 268 RS1CX41TF
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BS 631 977 RS1CX41JQ

RD RS1FO11TF 630 0 0
GGGCCGTAAACTCAAGAAGAAGGAAGAAGAAGACGAATCCATGGGTCGTGTCATCAGAGC
TCAACGTAAGGGAGCAGGCTCCGTCTTCAAGTCCCACACTCACCACCGCAAGGGCCCCGC
CAAGTTCAGGAGCCTCGATTTCGGCGAGAGAAATGGTTACCTCAAGGGTGTCGTCACGGA
GATCATCCACGATCCGGGTCGCGGTGCTCCGTTAGCCCGCGTCGCCTTCCGTCATCCTTT
CCGTTACAAGAAGCAGAAGGAGCTCTTTGTCGCCGCCGAAGGCATGTACACCGGTCAGTT
CTTGTACTGCGGTAAGAAGGCGACTCTCGTTGTCGGAAATGTTCTGCCTCTCAGATCTAT
CCCCGAGGGAGCTGTTGTCTGCAACGTCGAGCACCATGTCGGTGATCGTGGTGTGCTCGC
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TCAAGTTGCTGGTGGTGGAAGAACTGAGAAGCCGATGCTCAAGGCGGGTAACGCGTACCA
CAAGTACCGTGTGAAGAGGAACTGCTGGCC

QA 1 630 1 630
DS 

RD RS1CX41TF 599 0 0
ATCCATGGGTCGTGTCATCAGAGCTCAACGTAAGGGAGCAGGCTCCGTCTTCAAGTCCCA
CACTCACCACCGCAAGGGCCCCGCCAAGTTCAGGAGCCTCGATTTCGGCGAGAGAAATGG
TTACCTCAAGGGTGTCGTCACGGAGATCATCCACGATCCGGGTCGCGGTGCTCCGTTAGC
CCGCGTCGCCTTCCGTCATCCTTTCCGTTACAAGAAGCAGAAGGAGCTCTTCGTCGCCGC
CGAAGGCATGTACACCGGTCAGTTCTTGTACTGCGGTAAGAAGGCGACTCTCGTTGTCGG
AAATGTTCTGCCTCTCAGATCTATCCCCGAGGGAGCTGTTGTCTGCAACGTCGAGCACCA
TGTCGGTGATCGTGGTGTGCTCGCTAGAGCTTCTGGAGATTACGCTATCGTTATTTCACA
TAACCCTGACAACGACACGACAAGTGTTAAGTTGCCATCTGGATCGAAGAAGATTGTCCC
AAGTGGATGCAGGGCCATGATTGGTCAAGTTGCTGGTGGTGGAAGAACTGAGAAGCCGAT
GCTCAAAGCGGGTAACGCGTACCACAAGTACCGTGTGAAGAGTAACTGCTGGCC
TAAGT

QA 1 594 1 594
DS 

RD RS1CX41JQ 833 0 0
CGAGAGAAATG*TTACCTCAAGGGTGTCGTCACGGAGATCATCCACGATCCGGGTCGCGG
TGCTCCGTTAGCCCGCGTCGCCTTCCGTCATCCTTTCCGTTACAAGAAGCAGAAGGAGCT
CTTCGTCGCCGCCGAAGGCATGTACACCGGTCAGTTCTTGTACTGCGGTAAGAAGGCGAC
TCTCGTTGTCGGAAATGTTCTGCCTCTCAGATCTATCCCCGAGGGAGCTGTTGTCTGCAA
CGTCGAGCACCATGTCGGTGATCGTGGTGTGCTCGCTAGAGCTTCTGGAGATTACGCTAT
CGTTATTTCACATAACCCTGACAACGACACGACAAGTGTTAAGTTGCCATCTGGATCGAA
GAAGATTGTCCCAAGTGGATGCAGGGCCATGATTGGTCAAGTTGCTGGTGGTGGAAGAAC
TGAGAAGCCGATGCTCAAGGCGGGTAACGCGTACCACAAGTACCGTGTGAAGAGTAACTG
CTGGCCTAAGGTTCGTGGTGTGGCTATGAACCCTGTTGAGCATCCTCACGGAGGAGGTAA
CCATCAACATATTGGTCACGCCAGTACCGTTCGTCGTGATGCACCACCCGGGCAAAAGGT
TGGTCTTATTGCTGCAAGGAGGACTGGTCGTCTCAGAGGTCAAGCTGCTGCTCTTGCTTC
CAAGCAAGAATAAGGAGAGAGAGTTTCAAGATGATGAAGTTGTTTACTCTTGTTGGATTT
TTGCTGAGACCTTGTTTTGAATCCTTTAGATTTTCTTTAATCTTCTTTGAGGCCTTTGTC
TTCAGGATCAAACCTCCACATTATCATTTTAAATTTCAGGATTCAGTTTTGGT

QA 1 833 1 833
DS 



AS 1 3

CO CL4174Contig1 953 3 9 U
CCCATCAAACAACACTTTTCAACAAATCTGTAATTATAAATAATACTGACTTCATGACAA
TGCAACTACAAAGAGCCAAATCGTAAGTTTCACAAACAATATAGAAACTAACGAAAACAC
ACATAATAACGCTCTCTGTCTCTCTGAGTTTTAAACTGCATGAGAACAACACAAAGACAA
CATCCAAGAAGCTCCAAAATGATCTCCTTTTGCATGCACCACTCATTTCTGAAACCGTTC
CGATAAGGAAAAGAGAGATCTCATGATTTGGTTTTTAACGGTATGATTCAGTACGTTTAG
GTTTGCTCTGTATCACTTGCTCGATCTTGTCCAGAACATGTGGCGTCAACAATGGGATCA
CATCAACAGCCTTCATGATTTCTTGAATCTGTGACTCCCTTGTGGCACCAGTGATAACAG
AAGACACATTAGGATTTGAAGCACACCACGCGATTGCAAGCTGAGCCAATGTTACACCTA
GCTCATCTGCAATAGGCTTGAGACCACTAACTTTCCTCAGAACATCATCCACAAGTGATC
TATTGGCAAGGTTTTTGTAGTTCTCCAATGCAAATCGGCTGTCCGAAGGAATAGCTCCCT
TGTTGTATTTACCAGTGAGCACACCAGATGCAAGTGGACTCCAAGTAGTGAGACCTATGC
CATGGTTTGTGTACAGAGGAAGAAACTCTGACTCAACCTTGTGCCTAGCGAACATGTTGT
ACTCAGGCTGTTCAACGATTGGACCGACCAGATCCAACCTCTCAGCAGCTCCCCATGCCT
CTGTGATCTGTTGAGCCGACCATTCACTAGTTCCCAAGTAGAAAGCCCAACCCTTATCAA
TCACGTAGTTCATCGCCCTCACCGTCTCTTCTATAGGTGTTGAAGCATCAGGCCTGTGAC
AATAGAGCACATCGACATAGTCCATATCGAGTCGTTTGAGAGAAGCTTTGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BK84JQ U 1
AF RS1AA92JQ U 20
AF RS1BK84TF C 375
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BS 873 953 RS1BK84TF

RD RS1BK84JQ 777 0 0
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CGATAAGGAAAAGAGAGATCTCATGATTTGGTTTTTAACGGTATGATTCAGTACGTTTAG
GTTTGCTCTGTATCACTTGCTCGATCTTGTCCAGAACATGTGGCGTCAACAATGGGATCA
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TATTGGCAAGGTTTTTGTAGTTCTCCAATGCAAATCGGCTGTCCGAAGGAATAGCTCCCT
TGTTGTATTTACCAGTGAGCACACCAGATGCAAGTGGACTCCAAGTAGTGAGACCTATGC
CATGGTTTGTGTACAGAGGAAGAAACTCTGACTCAACCTTGTGCCTAGCGAACATGTTGT
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QA 1 777 1 777
DS 

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CG
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CGTAAGTTTCACAAACAATATAGAAACTAACGAAAACACACATAATAACGCTCTCTGTCT
CTCTGAGTTTTAAACTGCATGAGAACAACACAAAGACAACATCCAAGAAGCTCCAAAATG
ATCTCCTTTTGCATGCACCACTCATTTCTGAAACCGTTCCGATAAGGAAAAGAGAGATCT
CATGATTTGGTTTTTAACGGTATGATTCAGTACGTTTAGGTTTGCTCTGTATCACTTGCT
CGATCTTGTCCAGAACATGTGGCGTCAACAATGGGATCACATCAACAGCCTTCATGATTT
CTTGAATCTGTGACTCCCTTGTGGCACCAGTGATAACAGAAGACACATTAGGATTTGAAG
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TCTCCAATGCAAATCGGCTGTCCGAAGGAATAGCTCCCTTGTTGTATTTACCAGTGAGCA
CACCAGATGCAAGTGGACTCCAAGTAGTGAGACCTATGCCATGGTTTGTGTACAGAGGAA
GAAACTCTGACTCAACCTTGTGCCTAGCGAACATGTTGTACTCAGGCTGTTCAACGATTG
GACCGACCAGATCCAACCTCTCAGCAGCTCCCCATGCCTCTGTGATCTGTTGAGCCGACC
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CCGTCTCTTCT

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DS 

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ATGT
TTTCTTGAATCTGTGACTCCCTTGTGGCACCAGTGATAACAGAAGACACATTAGGATTTG
AAGCACACCACGCGATTGCAAGCTGAGCCAATGTTACACCTAGCTCATCTGCAATAGGCT
TGAGACCACTAACTTTCCTCAGAACATCATCCACAAGTGATCTATTGGCAAGGTTTTTGT
AGTTCTCCAATGCAAATCGGCTGTCCGAAGGAATAGCTCCCTTGTTGTATTTACCAGTGA
GCACACCAGATGCAAGTGGACTCCAAGTAGTGAGACCTATGCCATGGTTTGTGTACAGAG
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TTGGACCGACCAGATCCAACCTCTCAGCAGCTCCCCATGCCTCTGTGATCTGTTGAGCCG
ACCATTCACTAGTTCCCAAGTAGAAAGCCCAACCCTTATCAATCACGTAGTTCATCGCCC
TCACCGTCTCTTCTATAGGTGTTGAAGCATCAGGCCTGTGACAATAGAGCACATCGACAT
AGTCCATATCGAGTCGTTTGAGAGAAGCTTTGGTT

QA 5 579 5 579
DS 



AS 1 3

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CGTCCTCAGGCCGAGTCTTGATAGACGGGAAAGACATAAGGAAGTATAACCTAAAGTCCA
TAAGGAAACACATAGCCATAGTCCCTCAAGAGCCTTGCTTGTTCGGCACGACAATATACG
AAAACATAGCGTACGGACACGAATGCGCGACAGAAGCAGAGATCATACAAGCCGCGACGC
TAGCCAGCGCGCACAAGTTCATATCCGCGTTGCCTGATGGTTACAAGACGTACGTCGGAG
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AGAGATCGGTGCAAGAAGCGTTGGACCAGGCTTGTTCTGGTAGAACGTCTATTGTAGTGG
CTCATAGGCTGTCTACGATAAGGAACGCGCACGTGATCGCGGTGATCGATGATGGTAAAG
TTGCGGAGCAAGGGTCGCATTCTCACCTTCTCAAGAACTATCCTGATGGAATCTACGCGA
GGATGATACAGTTGCAGAGGTTTACGCATACTCAGGTGATTGGTATGGTCAGGGTCGAGT
TCTAGGGTTAAGGAAGATGATGCTTAGTACTTACTGCTTTGGTTATATTATATGAAGAAA
GAACAGAGTTGAAAAAAAAAAGACAACACGCACCAGAACATGTTCTGTAAATGCGAGCTT
ATTTTTTTCTTCTGTTTATGTTGTAATTTTGAGTTTACTTATTTTGGGAACTACGTTTCA
GATTTGATGGTATAGTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1D643TF U 1
AF RS1C691TF U 181
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RD RS1D643TF 676 0 0
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GGATGATACAGTTGCA

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1C691TF 737 0 0
GG
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GCCAGCGCGCACAAGTTCATATCCGCGTTGCCTGATGGTTACAAGACGTACGTCGGAGAG
AGAGGCGTTCAGCTTTCAGGAGGACAGAAACAGAGGATAGCGATCGCTCGTGCCCTGGTG
AGGAAAGCAGAGATCATGCTGCTTGATGAGGCCACGAGTGCTCTTGACGCAGAGTCAGAG
AGATCGGTGCAAGAAGCGTTGGACCAGGCTTGTTCTGGTAGAACGTCTATTGTAGTGGCT
CATAGGCTGTCTACGATAAGGAACGCGCACGTGATCGCGGTGATCGATGATGGTAAAGTT
GCGGAGCAAGGGTCGCATTCTCACCTTCTCAAGAACTATCCTGATGGAATCTACGCGAGG
ATGATACAGTTGCAGAGGTTTACGCATACTCAGGTGATTGGTATGGTCAGGGTCGAGTTC
TAGGGTTAAGGAAGATGATGCTTAGTACTTACTGCTTTGGTTATATTATATGAAGAAAGA
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TTTTT*CTTCTGTTTATGTTGTAATTTTGAGTTTACTTATTTTGG**ACTACGTTTCAGA
TTTGATGGTATAGTA

QA 3 737 3 737
DS 

RD RS1C691JQ 632 0 0
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TTGACGCAGAGTCAGAGAGATCGGTGCAAGAAGCGTTGGACCAGGCTTGTTTTGGTAGAA
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TCGATGATGGTAAAGTTGCGGAGCAAGGGTCGCATTCTCACCTTCTCAAGAACTATCCTG
ATGGAATCTACGCGAGGATGATACAGTTGCAGAGGTTTACGCATACTCAGGTGATTGGTA
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TATTATATGAAGAAAGAACAGAGTTGAAAAAAAAAAGACAACCCGCCCCAGAACATGTTC
TGTAAATGCGAGCTTATTTTTTTCTTCTGTTTATGTTGTAATTTTGAGTTTACTTATTTT
TGGAACTACGTTTCAGATTTGATGGTATAGTA

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 2

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TCCGAGTCTTGACTACTCACACTTTGTATCACTTCCACTAGCCATACACCCTGAGTTAGT
GGGGATGCTGTTCAACTTTCAGAACTCTATACTCGGAAACTATGGCGTATCCGGTGATCA
ACAAGTTGATGAAACCACAAGTGTGGCGGTTGATCTAAAAGCTAATAGTGAGACAAGACA
AGTCAATGTGGATATCAGGAGCATACCACTTGTCAGTTACCCGCCTAAGGCAATAGAAGC
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TTTTCACTTGACTGTGCTTATGCTAAAGCTATGGAACAAAGATAGAATCAATGCGGCCCG
TGATGTTCTGAAGAGTATATCTCCTAGTGTGATGGATGCTTTGGATAACCGGCCGTTATT
CATTAGACTTAAAGGACTGGATTGTATGAGAGGATCACTAGCTAAGGCTCGCGTTCTTTA
CATTCCTGTTGAAGAAATTGGTGATGAAGGCAGGCTTTTACGTGCTTGTAAAGTTATCAC
TGATGCATTTGTGAAAGCTGGACTTGTTCTTGAAAAAGATGCAAACCAAAGCTTGAAGCT
GCACGCGACCGTGATGAACGCTAGGCACAGGAAAAGAAAGGACAAAAGAGAAGATGGATA
CGTTTGATGCAAGGGAGATACATAAACAGTTTGGAAATGAAGATTGGGGAGAGTATCTGA
TCCAAGAAGCTCATCTCTCGCAGCGTTTTGTGTTTGACCAGAGCGGTTATTACCGTTGCT
GTGGTTCCATACCCTTTCCCGGAGAACACAGAGACTGAGAAGAAACGTTAAACCGGTCAG
AATCTCAAGTCTCAAGCTGTACCTGAGTGGCAACATGTCTCAGCTATGTGTGTGACAACA
CTGAAATTTTATAACTGTGAGAAGTGAACCGGATTGTAAAATTGTACCGGCCATCTTGTG
TTACCCAAATAAGCGTCTTCGGTTTGGTTTGTCTTAGTCTTCAATAAACCGAGCTACAAC
GTTCTTGTACCTTTTAAACAGTCAAACTTTAAAGGTTTTTGAATTAG


BQ
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AF RS1C384TF U 1
AF RS1C384JQ C 364
BS 1 680 RS1C384TF
BS 681 1127 RS1C384JQ

RD RS1C384TF 680 0 0
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QA 1 680 1 680
DS 

RD RS1C384JQ 764 0 0
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TCCTGTTGAAGAAATTGGTGATGAAGGCAGGCTTTTACGTGCTTGTAAAGTTATCACTGA
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CGCGACCGTGATGAACGCTAGGCACAGGAAAAGAAAGGACAAAAGAGAAGATGGATACGT
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CTTGTACCTTTTAAACAGTCAAACTTTAAAGGTTTTTGAATTAG

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 3

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CGGGTTTAAAAT


BQ
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AF RS1DS82JQ C 1
AF RS1DS82TF U 1
AF RS1DG09TF U 2
BS 1 3 RS1DS82JQ
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BS 546 672 RS1DG09TF

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CCGAGCTCTTCTTCAGGCAAAGACGCCATGCAAAGAAGATTTTGCGAGCAAGAATTACAC
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CAAGGACTTTGCTTGCCCATTCGCGGAAGCTCTTAATGAAGAAAAGACAGACTGTGCCTC
CACAATGTTCAGCTACATTAATATATATGGTCGTTATCCTCCCGGAATATTCGCAAACAT
GTGCAAAGAAGGCAAAGAAGGGCTCGATTGCACAGACGTGCAGCCTACCTCGTCTGCTCA
TGCATCACTTCCTCTTGTCTCCACACATGCATTGCTTATCACCGTTCTTTTTTTCTACTT
CTTATAAAGACATTTGTTACGATATGACATGAGATATATTATTTATGATGATTCCGTCGT
TAATT

QA 1 545 1 545
DS 

RD RS1DS82TF 545 0 0
GAT
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CCTCGCCTCGTCTCTCCACATCTCTCTTGATGAATTTGAGTCACATCCAGCCGCAAGCCG
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GGACTTTGCTTGCCCATTCGCGGAAGCTCTTAATGAAGAAAAGACAGACTGTGCCTCCAC
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CAAAGAAGGCAAAGAAGGGCTCGATTGCACAGACGTGCAGCCTACCTCGTCTGCTCATGC
ATCACTTCCTCTTGTCTCCACACATGCATTGCTTATCACCGTTCTTTTTTTCTACTTCTT
ATAAAGACATTTGTTACGATATGACATGAGATATATTATTTATGATGATTCCGTCGTTAA
TT

QA 4 545 4 545
DS 

RD RS1DG09TF 671 0 0
GG
AAGCATGGAGATTTCTCCTCATTGTTTGGTTTCTCTTCTTCTAAGCCTCCTTTTGTCTGG
CCTCGCCTCGTCTCTCCACATCTCTCTTGATGAATTTGAGTCACATCCAGCCGCAAGCCG
AGCTCTTCTTCAGGCAAAGACGCCATGCAAATAAGATTTTGCGAGCAAGAATTACACAAT
TATAACGAGCAAATGCAAAGGACCAAACTATCCAGCCAAGGCATGTTGTTCGGCCTTCAA
GGACTTTGCTTGCCCATTCGCGGAAGCTCTTAATGAAGAAAAGACAGACTGTGCCTCCAC
AATGTTCAGCTACATTAATATATATGGTCGTTATCCTCCCGGAATATTCGCAAACATGTG
CAAAGAAGGCAAAGAAGGGCTCGATTGCACAGACGTGCAGCCTACCTCGTCTGCTCATGC
ATCACTTCCTCTTGTCTCCACACATGCATTGCTTATCACCGTTCTTTTTTTCTACTTCTT
ATAAAGACATTTGTTACGATATGACATGAGATATATTATTTATGATGATTCCGTCGTTAA
TTAGTTGTTGAGTGACCCATTTATTCGTTCCTGCAAAACCATAGATGTAAGTTTTGTTTC
TTGTGTTAGGCTCTCGTGAACTGTTTGTTTTCTTCTTTCTAAATAACATGCATTATGCGG
GTTTAAAAT

QA 3 671 3 671
DS 



AS 1 2

CO CL4178Contig1 812 2 8 U
GGAAAGATGAAAAGACGTTTCCTCTTCATCGTTGTTCTCTCTCTCTCCTCAATCTTCATT
CCCTCTCTGATCGCTACTTTCCGCAACGACGACAACATGGACATGCCCGGAGCCGTTCGC
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GAGCATAACAAGAAAGAGAATGCACTGCTAGAGTTTGGGAGAGTGGTGAAGGCGAAAGAG
CAAGTTGTAGCGGGAACGCTGCACCACCTGACTCTGGAGATCATCGAGGCTGGGAAGAAG
AAGCTTTACGAAGCCAAAGTGTGGGTGAAGCCTTGGTTGAACTTCAAGGAGTTACAGGAG
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GATCTTGGCTGCAAGAAAGGTGAGCTTGAATCTGGATGGAGGGAAGTTCCAGGAGATGAT
CCTGAAGTGCAGCACGTTGCTGATCACGCTGTCAAGACCATCCAGCAGAGGTCTAACTCC
TTGTTCCCTTATGAACTCCAGGAGGTTGTTCACGCTAACGCTGAGGTCACCGGGGAGGCT
GCAAAGTACAACATGCTCCTCAAGTTGAAGAGAGGAGAGAAGGAAGAGAAGTTCAAGGTG
GAGGTTCACAAGAACCATGAAAGTGTTCTTCATCTCAACCACATGGAGCAACACCATGAC
TAGTTCTCCTCTCCTCTGCTTATGTAGTATTTGACTGTTTGCTTTGCTCTGTAAGATATT
TTAACTTCTGATGCAACTACTAAACCGTTAAA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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BQ
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BQ
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QA 1 598 1 598
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GAGATCTATTCATATGGATTCGAGAATTACTGGAGGGATGGTCAAAACCGGTTTGATTTT
ATAGTCACATGGGTCATAGTTATTGGGGAAACAGCTACCTTCATAACTCCAGACGAGAAC
ACTCTCTTCTCAAACGGAGAATGGATCCGATACCTTCTCCTTGCAAGAATGTTAAGACTG
ATAAGGCTTCTTATGCACGTCCAGAGATACCGAGCATTTATTGCGACATTCATCACTCTT
ATTCCAAGTTTGATGCCATATTTAGGGACCATCTTCTGCGTGCTGTGTATCTACTGCTCT
ATTGGTGTGCAGGTCTTTGGTGGGCTTGTGAATGCTGGAACAAACAACTCTTCAAAACTG
AGATGGCTGAGGATGACTATCTACTGTTCAACTTCAATGACTATCCCAATGGAATGGTCA
CACTCTTCAATCTGCTAGTGATGGGGAACTGGCAAGTCTGGATGGAGAGCTATAAAGATT
TGACGGGGACATGGTGGAGCATTACGTATTTCGTCAGTTTCTACACCATCACTGTTTTAC
TTCTGTTGAACTTGGTTGTTGCCTTTGTCTTGGAGGCTTTCTTTACTGAGTTGGATCTGG
AGGAAGAGGAGAAATGTCAAGGACAGGATTCTCAAGAAAGAAGAAACCGGCGTCGATCTG
CAGGGCCGAAGTCTAG*AGTCAAAGAGTTGACACACTTCTTCATCACATGTTGGGTGATG
A*CTCAGCAAACCAGAGTGTTCTACTACTGCTGCTACTGATACATAAA*GCCCGTTAAAA
A

QA 1 781 1 781
DS 

RD RS1CN45JQ 555 0 0
GTTCAACTTCAATGACTATCCCAATGGAATGGTCACACTCTTCAATCTGCTAGTGATGGG
GAACTGGCAAGTCTGGATGGAGAGCTATAAAGATTTGACGGGGACATGGTGGAGCATTAC
GTATTTCGTCAGTTTCTACATCATCACTGTTTTACTTCTGTTGAACTTGGTTGTTGCCTT
TGTCTTGGAGGCTTTCTTTACTGAGTTGGATCTGGAGGAAGAGGAGAAATGTCAAGGACA
GGATTCTCAAGAAAGAAGAAACCGGCGTCGATCTGCAGGGTCGAAGTCTAGGAGTCAAAG
AGTTGACACACTTCTTCATCACATGTTGGGTGATGAACTCAGCAAACCAGAGTGTTCTAC
TACTGCTGCTACTGATACATAAAAGCCCGTTAAAAAGGGTTTTTTATTCTCTTTTAATAC
TTTGTTTTTGTGCAATTCTCGGAAGCGTTCTTGATTCTATGTAGAGAGAGAGATCAATAG
AATCTAGAAGTTAAACTTACATTTTTTGCCTGCTCGTGTTCCGTCTCGGTCTGTAATAAT
GACTATACGATGATG

QA 1 555 1 555
DS 



AS 1 2

CO CL4181Contig1 662 2 3 U
AACCATACTAAATAAATTTTTTATATCATTTTGTGAAAAAAGGATGACAAAGGAGATCGT
TCAAACAAAACTCTCAGCTGTTCAGGAAAAATCATTAAACCTACAAGCATTGTCCGAAGC
TCTCAAAACAAGCTTTATAAGAAGTAAAAAATTCATTCAATGGCAGATTCTTCAGGCCTG
TCTGTTTCTCCTCTTGGGACCAGACTTAGCGACTCTAAGACCTTTGCTGATCACGCTGAG
CCTAGCAAGTGCTGCCTTCTTCAAATCAGGCCTGTAGTAGTTGTCCACAACCTGGTTGGC
AACAGCTTTGGCCATCCTGGGGAACTCCTTCTTGAGTACAGACTTGTTAACAGAGAGCTT
AGGCTTGTTTTGCTTCTTGGTCTTGGTGGTTCCGAGTACCACACCTTGCTCCTTGTCAGC
TACTTGAATGGTCACCGTCTTTTTGTTCGCCAAACCAGAGTGTTTGTAGGAGTTGAGGTT
GCAGAGGTTGTTGGTCTCCTTGCTGAACTGAACCTTGGCATTGCCTCTACCGAACTGTTT
GACCAAGAAACAGTTGTTTCTCTTCACTATCTCCCACACCAACTGTCCTGGTACTGTTGT
CATTTCGATTAGATCTCCTAATGGAATGTCAAGCCTCACGAACTAGACAATTGGCTGAGT
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1GE90JQ U 48
AF RS1GE90TF C 1
BS 1 48 RS1GE90TF
BS 49 279 RS1GE90JQ
BS 280 662 RS1GE90TF

RD RS1GE90JQ 235 0 0
C
AAAGGAGATCGTTCAAACAAAACTCTCAGCTGTTCAGGAAAAATCATTAAACCTACAAGC
ATTGTCCGAAGCTCTCAAAACAAGCTTTATAAGAAGTAAAAAATTCATTCAATGGCAGAT
TCTTCAGGCCTGTCTGTTTCTCCTCTTGGGACCAGACTTAGCGACTCTAAGACCTTTGCT
GATCACGCTGAGCCTAGCAAGTGCTGCCTTCTTCAAATCAGGCCTGTAGTA
ATT

QA 2 232 2 232
DS 

RD RS1GE90TF 662 0 0
AACCATACTAAATAAATTTTTTATATCATTTTGTGAAAAAAGGATGACAAAGGAGATCGT
TCAAACAAAACTCTCAGCTGTTCAGGAGAAATCATTAAACCTACAAGCATTGTCCGAAGC
TCTCAAAACAAGCTTTATAAGAAGTAAAAAATTCATTCAATGGCAGATTCTTCAGGCCTG
TCTGTTTCTCCTCTTGGGACCAGACTTAGCGACTCTAAGACCTTTGCTGATCACGCTGAG
CCTAGCAAGTGCTGCCTTCTTCAGATCAGGCCTGTAGTAGTTGTCCACAACCTGGTTGGC
AACAGCTTTGGCCATCCTGGGGAACTCCTTCTTGAGTACAGACTTGTTAACAGAGAGCTT
AGGCTTGTTTTGCTTCTTGGTCTTGGTGGTTCCGAGTACCACACCTTGCTCCTTGTCAGC
TACTTGAATGGTCACCGTCTTTTTGTTCGCCAAACCAGAGTGTTTGTAGGAGTTGAGGTT
GCAGAGGTTGTTGGTCTCCTTGCTGAACTGAACCTTGGCATTGCCTCTACCGAACTGTTT
GACCAAGAAACAGTTGTTTCTCTTCACTATCTCCCACACCAACTGTCCTGGTACTGTTGT
CATTTCGATTAGATCTCCTAATGGAATGTCAAGCCTCACGAACTAGACAATTGGCTGAGT
CC

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

CO CL4182Contig1 1024 2 2 U
GCAAAGTTCAATGTTCTTCCATTTATTGCTTACAAGAACATGTGTTTGCCGCAATGTGCA
TTGGAGAAGGTAAAGAGGATTCCTTTTAACTTTCCTTTCTATAGTTTCATATTCTTTTCT
GTTTGGATTCGTGTAGCTGAGGGATTTGAGTTTAATGGAGAACGAGACAAGTGCAGCTCC
TGAGATAGAAGCTAAGGATCCTGTTTTTGGAGGTGACCTACCAGTGGACATGGATACATG
CGAGGAGGAGCCGATAGGGGAGCAACAAGTGCATATTGGTTTGGATAAAGTAACTCGCAT
CGAGGATGAAGATGAGGCAATGCACACCAACGAAAAAAATGAAGTAATTATGATCGATGA
AGATACAGAGAATGAACGAGAGACAGTCGTTGAACCCATTAGCAACGGTCGTACTACTGG
TAATACATTTCCTACAAGCTCAAGAAGATGGCCAGAGGATGCAAGTGTAAAATGTACAAA
AGATGGAACCTGGTTAATCAGTGTGAGCGGTGATGATGATGATGAGTCAGATATGGTCAA
AGGTCCAGCATTGGCTAAGAAGAATATAAACACAAACCATCCTGCGAGCTCCTGCACAAG
ACACGAGAATGTATGCTGGAAATGTGGAAAAGAAGGAACGTTGTTGATATGTAGCAGAAG
CGAGTGTGAATCAAAAGTTCACAAGGAATGCTCGAACTGTGTGGTTAACTTTGATGAAGA
CGGGAACTTTCACTGTCCTGTATGCTGGTATGATAGAGTCGTTACAGAGTACTTAGAATC
TCAGAAGTTGGTGAGCTCTGCCAAGAGAAAACTGATGAAGTTTATGTCTCTACTTTCATC
AAGAAGCAAGAGACTCAGATCAATCAACGCGATCTGAAACGCCCTCGTGATCTTGTTCGT
GGTGGATTTTGGTTAGGATAGAGTCCTGTTCATATGTGTGCTGGTGTAGAGAATTATAGA
TACTGGGGGTAATATATTCGAAGTGAAAATTAAGAGTGTGAATGGTTATTATTTGAAACT
AGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RS1F474TF U 1
AF RS1F474JQ C 234
BS 1 616 RS1F474TF
BS 617 1024 RS1F474JQ

RD RS1F474TF 616 0 0
GCAAAGTTCAATGTTCTTCCATTTATTGCTTACAAGAACATGTGTTTGCCGCAATGTGCA
TTGGAGAAGGTAAAGAGGATTCCTTTTAACTTTCCTTTCTATAGTTTCATATTCTTTTCT
GTTTGGATTCGTGTAGCTGAGGGATTTGAGTTTAATGGAGAACGAGACAAGTGCAGCTCC
TGAGATAGAAGCTAAGGATCCTGTTTTTGGAGGTGACCTACCAGTGGACATGGATACATG
CGAGGAGGAGCCGATAGGGGAGCAACAAGTGCATATTGGTTTGGATAAAGTAACTCGCAT
CGAGGATGAAGATGAGGCAATGCACACCAACGAAAAAAATGAAGTAATTATGATCGATGA
AGATACAGAGAATGAACGAGAGACAGTCGTTGAACCCATTAGCAACGGTCGTACTACTGG
TAATACATTTCCTACAAGCTCAAGAAGATGGCCAGAGGATGCAAGTGTAAAATGTACAAA
AGATGGAACCTGGTTAATCAGTGTGAGCGGTGATGATGATGATGAGTCAGATATGGTCAA
AGGTCCAGCATTGGCTAAGAAGAATATAAACACAAACCATCCTGCGAGCTCCTGCACAAG
ACACGAGAATGTATGC

QA 1 616 1 616
DS 

RD RS1F474JQ 791 0 0
ATACATGCGAGGAGGAGCCGATAGGGGAGCAACAAGTGCATATTGGTTTGGATAAAGTAA
CTCGCATCGAGGATGAAGATGAGGCAATGCACACCAACGAAAAAAATGAAGTAATTATGA
TCGATGAAGATACAGAGAATGAACGAGAGACAGTCGTTGAACCCATTAGCAACGGTCGTA
CTACTGGTAATACATTTCCTACAAGCTCAAGAAGATGGCCAGAGGATGCAAGTGTAAAAT
GTACAAAAGATGGAACCTGGTTAATCAGTGTGAGCGGTGATGATGATGATGAGTCAGATA
TGGTCAAAGGTCCAGCATTGGCTAAGAAGAATATAAACACAAACCATCCTGCGAGCTCCT
GCACAAGACACGAGAATGTATGCTGGAAATGTGGAAAAGAAGGAACGTTGTTGATATGTA
GCAGAAGCGAGTGTGAATCAAAAGTTCACAAGGAATGCTCGAACTGTGTGGTTAACTTTG
ATGAAGACGGGAACTTTCACTGTCCTGTATGCTGGTATGATAGAGTCGTTACAGAGTACT
TAGAATCTCAGAAGTTGGTGAGCTCTGCCAAGAGAAAACTGATGAAGTTTATGTCTCTAC
TTTCATCAAGAAGCAAGAGACTCAGATCAATCAACGCGATCTGAAACGCCCTCGTGATCT
TGTTCGTGGTGGATTTTGGTTAGGATAGAGTCCTGTTCATATGTGTGCTGGTGTAGAGAA
TTATAGATACTGGGGGTAATATATTCGAAGTGAAAATTAAGAGTGTGAATGGTTATTATT
TGAAACTAGCG

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 3

CO CL4183Contig1 952 3 8 U
GGGCCTCAGAATAAACCTTTTTATTGAAGGAACCTTTATTGAACAATCCAATATAACCTT
TAGGACCAAAGGGCTAAAAGAGAGGTAAGCTTGTAGGGAAACGAACTTGCATCCATTGCT
TCTCATACGTAACCAAATGGCTCCAACCTAACTCCTCCAGTAAACCCAGTTTCATTTCGT
ACAGTTTCTTATTAGCTGTCTCGTTCTCATTTTGGATCATCTCCTCAAGTACCTTCAATG
CAGTTCCAGGTCGAGAGAGCCGTTTCTCTCTTAGAACAGAGAGAGTACAGAACTTCGATG
ATTTCACGTCTACCCATTTCGCCAGTTCTTTGAAATTTTCTTCGAACTTATCCTTTTGGC
TACTTTCTTCTTCTTCTTCCCCTTCATCTTCCTGCTTACCCTTCAAATTCTCGAGTCTCG
CCATGGCTAACCCTTTCTGGTATAGCGCTTCTGCCAGTTGGTCACGGGTCATCTCCATTT
TCTTCTTTAAATTCTCTGCTTCCTCGTCTTCTTGTTCACTTTTTTGTAGCAAGAATCTTG
CTAACTCGTCTACGTCAACGCTGCTTATTACTTCGTTTGCAGCATCTATAATCTCTTCGT
GATGGCTGATTTTGTTCCCAGCTTCAGACCGAGACAGCAAACTTTCTAAGATCTTAGCAA
GCAATCGAGTAGAGTTTGGGTATTAAGACTTGAGACAAGAACACAACTTTCTCCACTCCG
AATGATCTTCCTCAGTTTCTTGCTTTAGATTCCCGAGAAATTTGATCTTTATGTCACGAA
CCTCTTCTTCCAAGCGTTCTGAAACTGATTTACAGCTACTTGAAGCAGAAGCCGCTTTCT
TATCTTCCTCAGGCTTATTTGGTGGAACCACATATGATATCGGATAAGAAACAGGATTAT
CCTTTGGATTCTTCCCTTCTTTATCATCAAAAGACAATTTCCCATATGAGAC


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G852JQ U 2
AF RS1E444JQ U 1
AF RS1G852TF C 359
BS 1 22 RS1E444JQ
BS 23 23 RS1G852JQ
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RD RS1G852JQ 439 0 0
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CATGGCTAACCCTTTCTGG

QA 1 439 1 439
DS 

RD RS1E444JQ 848 0 0
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TCTCATACGTAACCAAATGGCTCCAACCTAACTCCTCCAGTAAACCCAGTTTCATTTCGT
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CAGTTCCAGGTCGAGAGAGCCGTTTCTCTCTTAGAACAGAGAGAGTACAGAACTTCGATG
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TACTTTCTTCTTCTTCTTCCCCTTCATCTTCCTGCTTACCCTTCAAATTCTCGAGTCTCG
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TCTTCTTTAAATTCTCTGCTTCCTCGTCTTCTTGTTCACTTTTTTGTAGCAAGAATCTTG
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GTTGGCTGATTTTGTTCCCAGCTTCAGACCGAGACAGCAAACTTTCTAAGATCTTAGCAA
GCAATCGAGTAGAGTTTGGGTATTAAGACTTGAGACAAGAACACAACTTTCTCCACTCCG
AATGATCTTCCTCAGTTTCTTGCTTTAGATTCCCGAGAAATTTGATCTTTATGTCACGAA
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TATCTTC
T

QA 1 847 1 847
DS 

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TTGGCTACT
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TAACCCTTTCTGGTATAGCGCTTCTGCCAGTTGGTCACGGGTCATCTCCATTTTCTTCTT
TAAATTCTCTGCTTCCTCGTCTTCTTGTTCACTTTTTTGTAGCAAGAATCTTGCTAACTC
GTCTACGTCAACGCTGCTTATTACTTCGTTTGCAGCATCTATAATCTCTTCGTGATGGCT
GATTTTGTTCCCAGCTTCAGACCGAGACAGCAAACTTTCTAAGATCTTAGCAAGCAATCG
AGTAGAGTTTGGGTATTCAGACTTGAGACAAGAACACAACTTTCTCCACTCCGAATGATC
TTCCTCAGTTTCTTGCTTTAGATTCCCGAGAAATTTGATCTTTATGTCACGAACCTCTTC
TTCCAAGCGTTCTGAAACTGATTTACAGCTACTTGAAGCAGAAGCCGCTTTCTTATCTTC
CTCAGGCTTATTTGGTGGAACCACATATGATATCGGATAAGAAACAGGATTATCCTTTGG
ATTCTTCCCTTCTTTATCATCAAAAGACAATTTCCCATATGAGAC

QA 10 594 10 594
DS 



AS 1 2

CO CL4184Contig1 844 2 6 U
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CCAAAGGCTTTTGTCAGTGAATACGCTGTGACTGAAAAAGATGCTGGTAAAGGAAGCCTT
CTCGCCGCTCTTGCAGAAGCTGCCTTTCTCATTGGTCTTGAAAAGAACAGTGACATTGTG
GAAATGGCAAGCTACGCACCACTCTTTGTGAACACAAACGACAGAAGGTGGAACCCTGAT
GCAATAGTCTTCAACTCATCTCATCTATACGGAACACCTAGCTACTGGGTCCAACGGTTC
TTCGCAGAGTCAAGCGGATCAACTCTTCTCACTTCAACACTCAAAGGAAACTCTTCTTCT
TCTCTCGTCGCATCTGCAATCTCATTCAAAAGCAATGGACAAGATTACGTGCGCATCAAG
GCTGTAAACTTTGGAGCTACCTCGGTGAATCTGAAGGTGTTGGTTACAGGATTGGATCCA
AACGTTATGAAAGTGTCTGGATCGAATAAGACAGTACTCACATCTAGCAATGTGATGGAT
GAGAACTCCTTCGCACAGCCAGAGAAGGTTGCGCCACACGAAAGCTTGCTGGAGATGGCT
GAGGAGGATCTTACCGTTGTTCTCCCGCCGCACTCGTTCTCTTCGTTTGATTTGTTGAAG
GAGACTGCGGAGATAAGAATGACGGTTTCTGATTCTTCTTCCACTGTGTGAAAGGAAGAG
AGAAACGATGATGACAAGGAGTATATTAACTTCATGTCGTATAAGTCTCTTGTGGTTAAC
ATGTTAGTTGCGTACGTCGTGTGTATAAATGATAGTAGTTTGGTGAATAAAATTACTTTA
ATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1EI69TF U 1
AF RS1CE66JQ C 122
BS 1 664 RS1EI69TF
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RD RS1EI69TF 813 0 0
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CTCGCCGCTCTTGCAGAAGCTGCCTTTCTCATTGGTCTTGAAAAGAACAGTGACATTGTG
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GCAATAGTCTTCAACTCATCTCATCTATACGGAACACCTAGCTACTGGGTCCAACGGTTC
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TCTCTCGTCGCATCTGCAATCTCATTCAAAAGCAATGGACAAGATTACGTGCGCATCAAG
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GAGGAGGATCTTACCGTTGTTCTCCCGCCGCACTCGTTCTCTTCGTTTGATTTGTTGAAG
GAGATTGCGGAGATAAGAATGACGGTTTCTGATTCTTCTTCCACTGTGTGAAAGGA*GAG
AGAAACGATGATGACAAGGAGTATATTAACTTCATGTCGTATAAGTCTCTTGTGGTTAAC
ATGTTAGTTGCGTACGTCGTGTGTATAAATGAT

QA 1 813 1 813
DS 

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CAATAGTCTTCAACTCATCTCATCTATACGGAACACCTAGCTACTGGGTCCAACGGTTCT
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CTCTCGTCGCATCTGCAATCTCATTCAAAAGCAATGGACAAGATTACGTGCGCATCAAGG
CTGTAAACTTTGGAGCTACCTCGGTGAATCTGAAGGTGTTGGTTACAGGATTGGATCCAA
ACGTTATGAAAGTGTCTGGATCGAATAAGACAGTACTCACATCTAGCAATGTGATGGATG
AGAACTCCTTCGCACAGCCAGAGAAGGTTGCGCCACACGAAAGCTTGCTGGAGATGGCTG
AGGAGGATCTTACTGTTGTTCTCCCGCCGCACTCGTTCTCTTCGTTTGATTTGTTGAAGG
AGACTGCGGAGATAAGAATGACGGTTTCTGATTCTTCTTCCACTGTGTGAAAGGAAGAGA
GAAACGATGATGACAAGGAGTATATTAACTTCATGTCGTATAAGTCTCTTGTGGTTAACA
TGTTAGTTGCGTACGTCGTGTGTATAAATGATAGTAGTTTGGTGAATAAAATTACTTTAA
TCT

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 3

CO CL4185Contig1 574 3 8 U
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TCGGCGTTTGTTTTGACGGCTAACGTTACGGCGGCCACCGGCCCTTCGTCTTCAAGGAAC
TCAGTGTCTTTCCTACCGATGAGAAGGGCTGGTTCCAGACTTGTAGTCAGAGCAGCCGAC
GAGGCGGCTTCAGAAACATCTTCTTCAGAAGGTGCACCAGCAACTGCCGTGGCTCCGGCT
GGAGCTGCTGCCACCAAACCAAAACCGCCTCCGATCGGCCCTAAGAGAGGGTCCAAGGTC
AAGATCCTAAGGAGAGAATCCTATTGGTTCAAGAACGTTGGAGCAGTTGTGGCCGTTGAT
CAGGATCCAAAGACTCGGTACCCTGTTGTGGTCCGGTTCGCGAAAGTGAATTACGCCAAC
ATATCGACCAACAACTATGCGTTGGATGAGGTTGAAGAAGTCAAAGCTTAAAAAATGAGA
GCTGAAAAACAATTGTGCGTACTTTGGTTTAATGTTTATACCATTCTGTCTGTCTGTAAC
TCGACTTATGTACCGACAAGTTTTACCATTATTT


BQ
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 

AF RS1DS51JQ C 1
AF RS1E989TF U 1
AF RS1DS51TF U 1
BS 1 50 RS1E989TF
BS 51 52 RS1DS51TF
BS 53 441 RS1E989TF
BS 442 442 RS1DS51TF
BS 443 497 RS1E989TF
BS 498 498 RS1DS51TF
BS 499 572 RS1E989TF
BS 573 574 RS1DS51JQ

RD RS1DS51JQ 574 0 0
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TCAGTGTCTTTCCTACCGATGAGAAGGGCTGGTTCCAGACTTGTAGTCAGAGCAGCCGAC
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GGAGCTGCTGCCACCAAACCAAAACCGCCTCCGATCGGCCCTAAGAGAGGGTCCAAGGTC
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CAGGATCCAAAGACTCGGTACCCTGTTGTGGTCCGGTTCGCGAAAGTGAATTACGCCAAC
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TCGACTTATGTACCGACAAGTTTTACCATTATTT

QA 1 574 1 574
DS 

RD RS1E989TF 572 0 0
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TCGGCGTTTGTTTTGACGGCTAACGTTACGGCGGCCACCGGCCCTTCGTCTTCAAGGAAC
TCAGTGTCTTTCCTACCGATGAGAAGGGCTGGTTCCAGACTTGTAGTCAGAGCAGCCGAC
GAGGCGGCTTCAGAAACATCTTCTTCAGAAGGTGCACCAGCAACTGCCGTGGCTCCGGCT
GGAGCTGCTGCCACCAAACCAAAACCGCCTCCGATCGGCCCTAAGAGAGGGTCCAAGGTC
AAGATCCTAAGGAGAGAATCCTATTGGTTCAAGAACGTTGGAGCAGTTGTGGCCGTTGAT
CAGGATCCAAAGACTCGGTACCCTGTTGTGGTCCGGTTCGCGAAAGTGAATTACGCCAAC
ATATCGACCAACAACTATGCGCTGGATGAGGTTGAAGAAGTCAAAGCTTAAAAAATGAGA
GCTGAAAAACAATTGTGTGTACTTTGGTTTAATGTTTATACCATTCTGTCTGTCTGTAAC
TCGACTTATGTACCGACAAGTTTTACCATTAT

QA 1 572 1 572
DS 

RD RS1DS51TF 574 0 0
GGGTCGGAACAACAATACGAAGCAAAAAAAATCCCAGAGATGTCGATGATGTCAGCGTCT
TCGGCGTTTGTTTTGACGGCTAACGTTACGGCGGCCACCGGCCCTTCGTCTTCAAGGAAC
TCAGTGTCTTTCCTACCGATGAGAAGGGCTGGTTCCAGACTTGTAGTCAGAGCAGCCGAC
GAGGCGGCTTCAGAAACATCTTCTTCAGAAGGTGCACCAGCAACTGCCGTGGCTCCGGCT
GGAGCTGCTGCCACCAAACCAAAACCGCCTCCGATCGGCCCTAAGAGAGGGTCCAAGGTC
AAGATCCTAAGGAGAGAATCCTATTGGTTCAAGAACGTTGGAGCAGTTGTGGCCGTTGAT
CAGGATCCAAAGACTCGGTACCCTGTTGTGGTCCGGTTCGCGAAAGTGAATTACGCCAAC
ATATCGACCAACAACTATGCGTTGGATGAGGTTGAAGAAGTCAAAGCTTAAAAAATGAGA
GCTGAAAAACAATTGTGCGTACTTTGGTTTAATGTTTATACCATTCTGTCTGTCTGTAAC
TCGACTTATGTACCGACAAGTTTTACCATTAT
TT

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 3

CO CL4186Contig1 828 3 6 U
GGATAAACAAAGCCCCCCTCGTTTGCTTCTTTCATTCATCTAGTTGTTATCTCCACAGAA
AAAAAAATGAGCAACCTTATTAGTTCTCTCGAACTCTCATCTCTTACACTCGAAGACCCA
TGGCCTGCTTTCTAGCCTAATTTTCTTCGAGAATCTTTTTTTTTTTTAATTCTGAACCCT
TCTTGGTTTCTTCATCATCTTTCTAAAACGTTTTCTAAAAATCATGGGGACTGGAGAAAA
AACTCTGAAAAGCTTCCATTTACATCGCAAACAAACGGCCAAAATCAAAGATGTTCCAAA
AGGATGCTTAGCGATCAAAGTTGGATCACAAGGAGAAGAGCAACAAAGATTTATAGTTCC
TATTTTGTATTTTAATCATCCGTTGTTCATGCAGCTCTTGAAAGAAGCAGAAGATGAGTA
TGGATTCGATCAAAAGGGCACCATCACGATCCCTTGCCACGTGGCTGAGTTTCGTTACGT
TCAAGCTTTGATTGATGGAGGGAGAATTGTTTATCATGGTAACAATAACCATCTTCATAG
ACATAGCGGTCGTGACCAGTATCATCCTCTTGTTGGATGTTTCAGAACGTGATGAATGAT
GAGGACGAGGAGGATAAATGAATGCTTGTATGCGCTAAGTTTTCAATCCATGAGGAGTTG
AGGAGCCAAAACTGGCCTAACCCAAGAATAAAATGATTTTTCTGTTTTCTCTTTGATGAT
TTTAGTATTTTCTGTAATTTGTATGGAATTTCAAGTTAAAGAAAGTATTTTCTGATTTTA
TGGTTTATCGTTTTGATGACTGGAGATATCAACAATGACGATGATCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D923TF U 1
AF RS1D923JQ C 168
AF RS1FR32TF U 32
BS 1 498 RS1D923TF
BS 499 545 RS1FR32TF
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RD RS1D923TF 498 0 0
GGATAAACAAAGCCCCCCTCGTTTGCTTCTTTCATTCATCTAGTTGTTATCTCCACAGAA
AAAAAAATGAGCAACCTTATTAGTTCTCTCGAACTCTCATCTCTTACACTCGAAGACCCA
TGGCCTGCTTTCTAGCCTAATTTTCTTCGAGAATCTTTTTTTTTTTTAATTCTGAACCCT
TCTTGGTTTCTTCATCATCTTTCTAAAACGTTTTCTAAAAATCATGGGGACTGGAGAAAA
AACTCTGAAAAGCTTCCATTTACATCGCAAACAAACGGCCAAAATCAAAGATGTTCCAAA
AGGATGCTTAGCGATCAAAGTTGGATCACAAGGAGAAGAGCAACAAAGATTTATAGTTCC
TATTTTGTATTTTAATCATCCGTTGTTCATGCAGCTCTTGAAAGAAGCAGAAGATGAGTA
TGGATTCGATCAAAAGGGCACCATCACGATCCCTTGCCACGTGGCTGAGTTTCGTTACGT
TCAAGCTTTGATTGATGG

QA 1 498 1 498
DS 

RD RS1D923JQ 609 0 0
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GGACTGGAGAAAAAACTCTGAAAAGCTTCCATTTACATCGCAAACAAACGGCCAAAATCA
AAGATGTTCCAAAAGGATGCTTAGCGATCAAAGTTGGATCACAAGGAGAAGAGCAACAAA
GATTTATAGTTCCTATTTTGTATTTTAATCATCCGTTGTTCATGCAGCTCTTGAAAGAAG
CAGAAGATGAGTATGGATTCGATCAAAAGGGCACCATCACGATCCCTTGCCACGTGGCTG
AGTTTCGTTACGTTCAAGCTTTGATTGATGGAGGGAGAATTGTTTATCATGGTAACAATA
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CCATGAGGAGTTGAGGAGCCAAAACTGGCCTAACCCAAGAATAAAATGATTTTTCTGTTT
TCTCTTTGATGATTTTAGTATTTTCTGTAATTTGTATGGAATTTCAAGTTAAA
AGAAAGTTATTTTCGC

QA 1 593 1 593
DS 

RD RS1FR32TF 797 0 0
GG
ATTCATCTAGTTGTTATCTCCACAGAAAAAAAAATGAGCAACCTTATTAGTTCTCTCGAA
CTCTCATCTCTTACACTCGAAGACCCATGGCCTGCTTTCTAGCCTAATTTTCTTCGAGAA
TCTTTTTTTTTT**AATTCTGAACCCTTCTTGGTTTCTTCATCATCTTTCTAAAACGTTT
TCTAAAAATCATGGGGACTGGAGAAAAAACTCTGAAAAGCTTCCATTTACATCGCAAACA
AACGGCCAAAATCAAAGATGTTCCAAAAGGATGCTTAGCGATCAAAGTTGGATCACAAGG
AGAAGAACAACAAAGATTTATAGTTCCTATTTTGTATTTTAATCATCCGTTGTTCATGCA
GCTCTTGAAAGAAGCAGAAGATGAGTATGGGTTCGATCAAAAGGGCACCATCACGATCCC
TTGCCACGTGGCTGAGTTTCGTTACGTTCAAGCTTTGATTGATGGAGGGAGAATTGTTTA
TCATGGTAACAATAACCATCTTCATAGACATATCGGTCGTGACCAGTATCATCCTCTTGT
TGGATGTTTCAGAACGTGATGAATGATGAGGACGAGGAGGATAAATGAATGCTTGTATGC
GCTAAGTTTTCAATCCATGAGGAGTTGAGGAGCCAAAACTGGCCTAACCCAAGAATAAAA
TGATTTTTCTGTTTTCTCTTTGATGATTTTTGTATTTTCTGTAATTTGTATGGAATTTCA
AGTTAAAGAAAGTATTTTCTGATTTTATGGTTTATCGTTTTGATGACTGGAGATATCAAC
AATGACGATGATCAC

QA 3 797 3 797
DS 



AS 1 3

CO CL4187Contig1 746 3 15 U
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TCTCGTTGAAACGTGAGGCTAAGCTTAAAGGTGGTTTCTATGTTGACCCTGAAGCTAAGC
TCTTGTTCATCATCCGTATTCGTGGTATCAATGCTATTGACCCAAAGACAACGAAGATTC
TTCAGCTTTTGCGTCTCAGACAGATCTTCAACGGTGTGTTTCTGAAAGTCAACAAGGCTA
CAATGAACATGCTTCGTCGTGTTGAGCCCTATGTGACCTATGGATTCCCTAACTTGAAGA
GTGTTAAGGAATTGATCTACAAGAGAGGATATGGAAAGCTTAACTCCCAGAGGGTGGCTT
TGACTGACAACTCCATCGTTGAGCAGGCTCTGGGTAAACATGGGATCATCTGCACTGAGG
ATCTGATTCACGAGATTCTAACAGTTGGACCTCATTTCAAGGAGGCCAACAACTTCCTGT
GGCCATTCCAGCTCAAGGCACCCCTCGGCGGTCTTAAGAAAAAGAGGAATCACTACGTTG
AAGGTGGTGATGCCGGCAACCGTGAAAACTTCATCAATGAGCTTATCAGGAGGATGAATT
AGAAGAGATTTCT*GTCGTATTATCTATGAACTTGACTACTTCACCATGTGTTTGCTTCT
GGATTTTGATATTTTCTCTTATGTTAAAAGACATTCGGAGCTTTCTCTGCTATTATTGTG
TTTGGATTTTAGCGGTTGATGATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 
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25 25 25 25 25 25 25 25 25 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BW90TF U 1
AF RS1CX67JQ C 498
AF RS1CX67TF U 498
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BS 590 590 RS1CX67TF
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TTTGGATTTTAGCGGTTGATGATTTT

QA 1 746 1 746
DS 

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QA 1 233 1 233
DS 

RD RS1CX67TF 233 0 0
GCACCCCTCGGCGGTCTTAAGAAAAAGAGGAATCACTACGTTGAAGGTGGTGATGCCGGC
AACCGTGAAAACTTCATCAATGAGCTTATCAGGAGGATGAATTAGAAGAGATTTCT*GTC
GTATTATCTATGAACTTGACTACTTCACCATGTGTTTGCTTCTGGATTTTGATATTTTCT
CTTATGTTAAAAGACATTCGGAGCTTTCTCTGCTATTATTGTGTTTGGATTTT

QA 1 233 1 233
DS 



AS 1 3

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RS1BO73TF U 2
AF RS1GS03JQ C 1
AF RS1GS03TF U 1
BS 1 1 RS1GS03JQ
BS 2 158 RS1BO73TF
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BS 357 419 RS1BO73TF
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RD RS1BO73TF 418 0 0
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QA 1 418 1 418
DS 

RD RS1GS03JQ 691 0 0
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AGCGTTTTCTCTGATGTCGTTTTCACAAAGAGATAAACTATTTTTTTTGGTTTAGGTTGT
TGGAAACTATCACTGATCAGTTTGAGACAGGACGACTTTAGTTCTGTTCTTGTTTATAGC
CTTTGACGGTAAACAAAGAAGTTGATGGTTACAAATTAGGTGTAGTTAGTGAGTTTTATT
TGATTTTATGTTACCCTTTTAGAGAACGCAATCAGATTGACATGTTATGTTATGTTAGAG
TGATGATGAGAATATATAGAATACTCAAAAGAGAAACACAATTGATCTATTTTTGAGCTA
ATATCATTTTGTAATGTCAACATCACTAGTAGTCTCCATAACTGTCTTTGACCCATCTTG
CAAGGTTGAACAAGAACTGTGTGTAGACAAAAGTAGCATGTTGTCCAAGTAACCAATCCC
TCAGATTGTGCAAATATTAAAAAACCATTTAATTTTTATAATTTTAAACCATACATCATT
AATTATTCATCCAGACACATTCTACCCATTAATAAAATAGGCGGCAGGAGACAAATAGTC
ATATAACAAAGAAAAGATTAAATTTAATTTG

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1GS03TF 695 0 0
G
GGTGGCCACGACGATGATGGCGGCTGGAAGCTCCAAGATTCTACGGCTTCATTTCGCCTT
TGAGAACGTCGACGTTGTCTCCGGTGAATATGGCGTGGTTTCACTCAAACTCCAAGGTCA
GCGTTTTCTCTGATGTCGTTTTCACAAAGAGATAAACTATTTTTTTTGGTTTAGGTTGTT
GGAAACTATCACTGATCAGTTTGAGACAGGACGACTTTAGTTCTGTTCTTGTTTATAGCC
TTTGACGGTAAACAAAGAAGTTGATGGTTACAAATTAGGTGTAGTTAGTGAGTCTTATTT
GATTTTATGTTACCCTTTTAGAGAACGCAATCAGATTGACATGTTATGTTATGTTAGAGT
GATGATGAGAATATATAGAATACTCAAAAGAGAAACACAATTGATCTATTTCTGAGCTAA
TATCATTTTGTAATGTCAACATCACTAGTAGTCTCCATAACTGTCTTTGACCCATCTTGC
AAGGTTGAACAAGAACTGTGTGTAGACAAAAGTAGCATGTTGTCCAAGTAACCAATCCCT
CAGATTGTGCAAATATTAAAAAACCATTTAATTTTTATAATTTTAAACCATACATCATTA
ATTATTCATCCAGACACATTCTACCCATTAATAAAATAGGCGGCAGGAGACAAATAGTCA
TATAACAAAGAAAAGATTAAATCTAATTTGAAAA

QA 2 695 2 695
DS 



AS 1 2

CO CL4189Contig1 360 2 9 U
TATAAAATCCATTAATATTGATTAAAAGACGTCTCATTCCAAAAAGCAACAAACTCTGAG
TCCAACAACGATACTTAAAAAAAGCAAAACGTAAAAAACAGACCTAACCCTAGGCAGTGA
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BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B548TF C 1
AF RS1D904JQ U 2
BS 1 1 RS1B548TF
BS 2 217 RS1D904JQ
BS 218 218 RS1B548TF
BS 219 261 RS1D904JQ
BS 262 262 RS1B548TF
BS 263 287 RS1D904JQ
BS 288 288 RS1B548TF
BS 289 315 RS1D904JQ
BS 316 360 RS1B548TF

RD RS1B548TF 360 0 0
TATAAAATCCATTAATATTGATTAAAAGACGTCTCATTCCAAAAAGCAACAAACTCTGAG
TCCAACAACGATACTTAAAAAAAGCAAAACGTAAAAAACAGACCTAACCCTAGGCAGTGA
GCACGACGGCGCCACCAGCCTCCTTGATCTTCTTCTCAGCAGTCTTGGAAATGAGCTTAG
CCTTCACAACAAAAGGCTTCCCCTCAGGCAAATGACCCTTCCCAAGAACCTTAAAGAACC
CGTGCTGCGTCACATCGATCAACGGCACCTTGTCCTTGGTGGACTTCGCCTTCACATCCT
CCGGGACGAGAGACCAGAGCTTGTCGAGGTTGACGATGGGGCAGTAGAACTTGTTGCGGA

QA 1 360 1 360
DS 

RD RS1D904JQ 314 0 0
ATAAAATCCATTAATATTGATTAAAAGACGTCTCATTCCAAAAAGCAACAAACTCTGAGT
CCAACAACGATACTTAAAAAAAGCAAAACGTAAAAAACAGACCTAACCCTAGGCAGTGAG
CACGACGGCGCCACCAGCCTCCTTGATCTTCTTCTCAGCAGTCTTGGAAATGAGCTTAGC
CTTCACAACAAAAGGCTTCCCCTCAGGCAAATGACCTTTCCCAAGAACCTTAAAGAACCC
GTGCTGCGTCACATCGATCA*CGGCACCTTGTCCTTGGTGGACTTC*CCTTCACATCCTC
CGGGACGAGAGACC

QA 1 314 1 314
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GCTCCAACGGTTTGCCTCATTTCTGCTTCAATCACTGAGTTCACTTCAAACAACGCAACC
ACTACACTGCTGGTTCCATTGCTCATCGAGATTGCGAAGAATATGCAAATCCATCCTCTC
CTCCTGATGGTTCCTGGTGCTGTTGGGTCTCAGTTTGCTTTCTTGCTACCCACGGGAACA
CCTTCTAACGTGGTGGGATTCACAACAGGGCATATTGAGATCAAAGACATGATGAAAACA
GGGTTGCCTCTCAAGATGGCAGGAACAGCCTTTCTCTCTGTCTTGATGCCAACCCTTGGG
ACTTACGTGTTTGGATCAAAAGGAGTAGCTTAACTCGATGAGCTGAAGTACTATCGATTC
ATTGTACTATATTCTTACAAAGGAGGGGACATCAGTCACAGGTGAAACGGGAAATTTGGG
GGTGGTCATCAAACCGGCCCATTTTTGTAACCCGGGCGAGTATACTATCCGGTACGATTG
CTTTCTTTTGTGCTTACAACGTACCGGTAAGTTTGGTATTCTTCTTGGTTTCGTGGGCAT
GTATATTGAGAACAAATATGTTAATAGTATAAAATATAAATGTGTATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1E315TF U 1
AF RS1E315JQ C 432
BS 1 480 RS1E315TF
BS 481 481 RS1E315JQ
BS 482 595 RS1E315TF
BS 596 596 RS1E315JQ
BS 597 648 RS1E315TF
BS 649 650 RS1E315JQ

RD RS1E315TF 648 0 0
GTAGCCGAAGTTTTATCCAAAGGGCTTGTGTTTCTAGAAACAGCTCCTTATTGGGCCATC
GCTCCAACGGTTTGCCTCATTTCTGCTTCAATCACTGAGTTCACTTCAAACAACGCAACC
ACTACACTGCTGGTTCCATTGCTCATCGAGATTGCGAAGAATATGCAAATCCATCCTCTC
CTCCTGATGGTTCCTGGTGCTGTTGGGTCTCAGTTTGCTTTCTTGCTACCCACGGGAACA
CCTTCTAACGTGGTGGGATTCACAACAGGGCATATTGAGATCAAAGACATGATGAAAACA
GGGTTGCCTCTCAAGATGGCAGGAACAGCCTTTCTCTCTGTCTTGATGCCAACCCTTGGG
ACTTACGTGTTTGGATCAAAAGGAGTAGCTTAACTCGATGAGCTGAAGTACTATCGATTC
ATTGTACTATATTCTTACAAAGGAGGGGACATCAGTCACAGGTGAAACGGGAAATTTGGG
TGTGGTCATCAAACCGGCCCATTTTTGTAACCCGGGCGAGTATACTATCCGGTACGATTG
CTTTCTTTTGTGCTTACAACGTACCGGTAAGTTTGGTATTCTTCTTGGTTTCGTGTGCAT
GTATATTGAGAACAAATATGTTAATAGTATAAAATATAAATGTGTATT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1E315JQ 219 0 0
TTT
TTACAAAGGGGGGGACATCAGTCACAGGTGAAACGGGAAATTTGGGGGTGGTCATCAAAC
CGGCCCATTTTTGTAACCCGGGGGAGTATACTTTCCGGTACGATTGCTTTTTTTTGTGCT
TACAACGTACCGGTAAGTTTGGTATTTTTTTTGGTTTCGTGGGCATGTATATTGAGAACA
AATATGTTAATAGTATAAAATATAAATGTGTATTTT

QA 4 219 4 219
DS 



AS 1 2

CO CL4192Contig1 795 2 4 U
GGGATTATCAACCTCCTTCTTCTTCTTCGATTCTTCTGTATTTTTAGTGATTTTTTTTAC
TGAATCTTGTTTTTCTGTTAAGAAACAAAACCTAGTCACAGACAAAGAAAAAGCTTTTGT
TCCAGTCCGGTCCTCGGACTCCGTTAATCACAGTAGATGAAACGAAAATTTGCAGTGGAA
TCAACGATTTCTGACCAAGCGATTTTGTGCATTACGCAGCCGAGTTCTATAAATCTATTC
AGTCCGCGCTCATTGCTCGGCTCATCGCGTAATGCAACCGAAGTGGTCCAATTCGCCACG
GAGCTCAACCGAATCACGTTTACCCGGCCGATTAAACGTCTCCGCGACCGATTTTTAGAA
CAGAGCTAAAAACTAAGAAAGTTAGGTAAATTGTTTTCAAGTTCTTATAAAAGCATAAGT
CACTAGGTTATGTGTAAATTGATTTCATATTAGGTAAATTGTATAATAAATTTTACCATA
AGTCACTAGGTTATGTGTTGTGGTTTGGTGAAAAGAAAGCATAATTATTGAAAATTTTAA
GTAGTGTTCCATATTCACCAAATCCACACTTTTAATCGTTTTATGGGTAGTTCAGACGAG
CACCTGATCAATAAAACATCTTTGAAGAGTTTTGTCTTTTCGTACTGAGTCCGACCAAAC
TCAGATGCAACATAGACTTGCCTCCGTTCACAACTCATATTCAGAGATTTAGAGATTTGA
AGCACAAAAAAAGTGTTTTTTTTTTGTTCATGTACTCTCCGATTAGGATAGCCGAATCAT
TTCAGAGTCGGGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FT89TF U 1
AF RS1FT89JQ C 239
BS 1 692 RS1FT89TF
BS 693 693 RS1FT89JQ
BS 694 717 RS1FT89TF
BS 718 795 RS1FT89JQ

RD RS1FT89TF 717 0 0
GGGATTATCAACCTCCTTCTTCTTCTTCGATTCTTCTGTATTTTTAGTGATTTTTTTTAC
TGAATCTTGTTTTTCTGTTAAGAAACAAAACCTAGTCACAGACAAAGAAAAAGCTTTTGT
TCCAGTCCGGTCCTCGGACTCCGTTAATCACAGTAGATGAAACGAAAATTTGCAGTGGAA
TCAACGATTTCTGACCAAGCGATTTTGTGCATTACGCAGCCGAGTTCTATAAATCTATTC
AGTCCGCGCTCATTGCTCGGCTCATCGCGTAATGCAACCGAAGTGGTCCAATTCGCCACG
GAGCTCAACCGAATCACGTTTACCCGGCCGATTAAACGTCTCCGCGACCGATTTTTAGAA
CAGAGCTAAAAACTAAGAAAGTTAGGTAAATTGTTTTCAAGTTCTTATAAAAGCATAAGT
CACTAGGTTATGTGTAAATTGATTTCATATTAGGTAAATTGTATAATAAATTTTACCATA
AGTCACTAGGTTATGTGTTGTGGTTTGGTGAAAAGAAAGCATAATTATTGAAAATTTTAA
GTAGTGTTCCATATTCACCAAATCCACACTTTTAATCGTTTTATGGGTAGTTCAGACGAG
CACCTGATCAATAAAACATCTTTGAAGAGTTTTGTCTTTTCGTACTGAGTCCGACCAAAC
TCAGATGCAACATAGACTTGCCTCCGTTCACA*CTCATATTCAGAGATTTAGAGATT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1FT89JQ 557 0 0
TCAGTCCGCGCTCATTGCTCGGCTCATCGCGTAATGCAACCGAAGTGGTCCAATTCGCCA
CGGAGCTCAACCGAATCACGTTTACCCGGCCGATTAAACGTCTCCGCGACCGATTTTTAG
AACAGAGCTAAAAACTAAGAAAGTTAGGTAAATTGTTTTCAAGTTCTTATAAAAGCATAA
GTCACTAGGTTATGTGTAAATTGATTTCATATTAGGTAAATTGTATAATAAATTTTACCA
TAAGTCACTAGGTTATGTGTTGTGGTTTGGTGAAAAGAAAGCATAATTATTGAAAATTTT
AAGTAGTGTTCCATATTCACCAAATCCACACTTTTAATCGTTTTATGGGTAGTTCAGACG
AGCACCTGATCAATAAAACATCTTTGAAGAGTTTTGTCTTTTCGTACTGAGTCCGACCAA
ACTCAGATGCAACATAGACTTGCCTCCGTTCACAACTCATATTCAGAGATTTAGAGATTT
GAAGCACAAAAAAAGTGTTTTTTTTTTGTTCATGTACTCTCCGATTAGGATAGCCGAATC
ATTTCAGAGTCGGGTTG

QA 1 557 1 557
DS 



AS 1 2

CO CL4193Contig1 477 2 1 U
GGGAACGTGAATCTCCACTCTTGGAGCTTAGAAGCGAGGAGTGTCCCTAAAGGTGTGCAC
TCTTATGGGGCGGTTATGGTGGAGAAGCTTATAGAGGAAGAGGAGGAGGCGAAGAGGAGG
AGGATGAGAAGAGCGAGGGCGTGGGAGATTGTGACTTGCTTTGTGATGACCTTTGGGTCT
ACAGGGCTTGTGTTCTTCGCCATGATGCATATTTGGGCAGCTTTCAAAAGGAACAATCTT
GTGATGACAAAGGAGTTTGAGTATGAGAAGATGGAGAAAATGGAAGCTGTGATGAGTAAA
GCCGATAGCGCAAAATGAAAACAAGTGAAGTAATCAAGTGTTGTGATATCTCTATGTGTG
TTTGTTTAGGATACGATCTTTTATGTAATCAAGTAGATTCTTCCCCCTTGTTTTTCATTT
CATGTGTGAACTTGCAACATTGTTTCTCTATGGCATGTTCAGTTTGTTTCAGTATGG


BQ
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AF RS1GK51JQ C 1
AF RS1GK51TF U 1
BS 1 477 RS1GK51TF

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DS 

RD RS1GK51TF 477 0 0
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CATGTGTGAACTTGCAACATTGTTTCTCTATGGCATGTTCAGTTTGTTTCAGTATGG

QA 1 477 1 477
DS 



AS 1 2

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TATGATATTGTAAATTCCATGAGGACAGAGGAAAGAACAGACCTGAAGCTCCATTCCCTC
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GAAGTTCAAATTAATCCACTATCGATCGTGATGTTATCTTGAAGCAGCATAAAAGTAAAA
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TTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1C045TF U 1
AF RS1C045JQ C 417
BS 1 656 RS1C045TF
BS 657 657 RS1C045JQ
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BS 802 1205 RS1C045JQ

RD RS1C045TF 802 0 0
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GAAGT*CAAAT*AATCCACTATCGATCGTGATGTTATCTTGAAGCAGCATAAAAGTAAA*
CTAACAATCCAGCCAGTTTTT
A

QA 1 801 1 801
DS 

RD RS1C045JQ 789 0 0
AATA
AACCCCAATGAAGAATCCATGTGCGAGTGCAGTTCTTGAGGTGAAACTCAGCTCTTACAC
TGTTCCCATTTGGCAATCCAGTGACAGTGGTCTGAATGAACAAGAAGGTTAAGTCCAAAA
TATGATATTGTAAATTCCATGAGGACAGAGGAAAGAACAGACCTGAAGCTCCATTCCCTC
GATTAGCTGGAAACTATTGGACTTAGAGGTCGCCATGGCAGCTATTCATTAAAAAAAGGT
AACAAGTGAACCTCAACGACATGGAAAACTTATGAATAATCTTAGATAGCAATGAAAATT
GAAGTTCAAATTAATCCACTATCGATCGTGATGTTATCTTGAAGCAGCATAAAAGTAAAA
CTAACAATCCAGCCAGTTTTTTAATGTGTGTACCTTTTGTTAACGTTGGCCTCTCTTCAC
GAAGTTGAGCTGTTTTTACGCGTTAAAAGTAACAAATCTCCAGAGCTCCTTAAGAAATAC
ACAAACTAGTATCAGTACAGTATTTTGTAAACAGTATCAGCAACACAGATGGCACCATAA
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TTCCC

QA 5 789 5 789
DS 



AS 1 2

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AGTAGAGGAAGAGATGGTAAAGCATTCAAAGGCTATAGAAGTGACAAGAGCCATGACTCT
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ATATTATATAATGCATACATAGCTTTTTCAATTCTTATAATTTTGAAGTACTGTTACTAC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1ED61TF U 1
AF RS1ED61JQ C 185
BS 1 631 RS1ED61TF
BS 632 632 RS1ED61JQ
BS 633 665 RS1ED61TF
BS 666 892 RS1ED61JQ

RD RS1ED61TF 672 0 0
GGGGAAAGCTATGCATCAATACCACGAGACACAGAACAGCATCGTGGAGCAAGTTCGAGG
GTTCATCAACAGATCAAGCAAAGGCGAATCAACCTCTGAGCTGCATCGACAAGCTACCCG
TGACTTAGAAGCAGCTGTCTCTTCTTGGCACTCCAGTTTTACTCACGTGATCAAATTCCA
GCGTGACTTCATAAACTCGGTTCACGCATGGTTCAAACTGACCCTTCTTCCGGTTTGCCA
CGAAGACGAAGCAGCCAAAGAGCCAACTGATGCTTACGCCTTCTGCGACGAGTGGAAACT
CGCTCTGGACCGTGCCCCCGACACGGTAGCATCCGAAGCAAACAAAAGCTTCATCAACGT
GGTGCATGTGATATCGGCAAAACAAGCAGATGAACACAAGGTAAAGAAGAGAACAGAGTC
AGCATCAAAAGAGCTGGAGAAGAAAGCTTCGTCTCTCAGAAACCTAGAGAGGAAATACTA
CCAGTCATACTCAATGGTCGGTGTCGGTATACCAGACACAGGACCCGATAACCAACACAT
GTTAGACTCTAGAGACCCGCTAAGCGACAAAAAATCGGAGCTTGAGGTTTGCAGGAGGAG
AGTAGAGGAAGAGATGGTAAAGCATTCAAAG*CTATAGAAGTGACAAGAGCCATGACTCT
GAATA
CTTGCAG

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1ED61JQ 708 0 0
GACTTCATAAACTCGGTTCACGCATGGTTCAAACTGACCCTTCTTCCGGTTTGCCACGAA
GACGAAGCAGCCAAAGAGCCAACTGATGCTTACGCCTTTTGCGACGAGTGGAAACTCGCT
TTGGACCGTGCCCCCGACACGGTAGCATCCGAAGCAAACAAAAGCTTCATCAACGTGGTG
CATGTGATATCGGCAAAACAAGCAGATGAACACAAGGTAAAGAAGAGAACAGAGTCAGCA
TCAAAAGAGCTGGAGAAGAAAGCTTCGTCTTTCAGAAACCTAGAGAGGAAATACTACCAG
TCATACTCAATGGTCGGTGTCGGTATACCAGACACAGGACCCGATAACCAACACATGTTA
GACTCTAGAGACCCGCTAAGCGACAAAAAATCGGAGCTTGAGGTTTGCAGGAGGAGAGTA
GAGGAAGAGATGGTAAAGCATTCAAAGGCTATAGAAGTGACAAGAGCCATGACTTTGAAT
AACTTGCAGACAGGGTTACCTGGTGTGTTCCAAGCTTTAACAAGTTTTTTTGCTATGTTC
ATGGAGTCTCTACAAACGGTGTGCACTCGCTCATACTCTATCAAATAGGACGCATTATAT
TATATAATGCATACATAGCTTTTTCAATTCTTATAATTTTGAAGTACTGTTACTACCGAG
GATTGGTTATTTTGTGAGGGAAGGGTAATAATAATCTATGTTGTGATT

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

CO CL4196Contig1 896 2 2 U
GGGGTGTGTGATCGGTGCCCAGAAAGGACGGACGGTTGAGATCTTCAATAGCTTCGAGCT
TCTGTTAGATCCCACTACTGATACTCTCGATAGATCCTTCTTAGAGAAGAAGCAAGAGCT
CTATCAGAAGGTGTTTCCTAACTACTACATATTGGGATGGTACTCTACTGGAAGCGATGC
TAATGAATCTGACATGAGTATCCACAAAGCTCTGATGGACATTAATGAATCGCCTGTTTA
TGTCCTTTTGAATCCTGCTATCAATCACGCTCAAAAGGATCTCCCTGTTACTATCTATGA
AAGTGAATTCCATGTCATTGATGGGATTCCTCAGCCAATTTTCGTGAATGCAAGCTACAC
AATCGAGACTGTCGAGGCTGAAAGAATATCGGTTGATCATGTTGCACACCTTAAGCCATC
TGATGGAGGCTCAGCAGCGATTCAATTGGCTGCTCATCTCACTGGCATACACAGTGCCAT
CAAGATGCTTAATAGCAGAATCAGAGTGCTCCATCAATACCTTGGCGCAATGCAGAAAGG
TGATATTCCTTGCGACAACTCACTTTTGAGGCAAGTAGCCAGTCTGCTCAGAAGTCTGCC
TGCCGCACAATCAGAAAAGTTTGAAGAGGATTTATTAATGGAGTACAACGACAAATTGCT
GATGTCTTACCTAGCAATGATCACAAATTGTACCAGCAACATGAACGAGGTGGTTGACAA
ATTCAACACTGCATACGAGAGGAACAGTCGAAGAGGCGGTAGGACTCCATTCATGTAGAG
AGATTAGTTTCAGCTTGAAACCCTTTTTTTTTTGCGGTTCCTTAGAGAAATCTAGAACTC
CTAAAGGTATTTCGCTGTTCGGAATCTAAGAGCTAATGACGTTCTTCTTTTAGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DS46TF U 1
AF RS1DI58JQ C 133
BS 1 323 RS1DS46TF
BS 324 896 RS1DI58JQ

RD RS1DS46TF 323 0 0
GGGGTGTGTGATCGGTGCCCAGAAAGGACGGACGGTTGAGATCTTCAATAGCTTCGAGCT
TCTGTTAGATCCCACTACTGATACTCTCGATAGATCCTTCTTAGAGAAGAAGCAAGAGCT
CTATCAGAAGGTGTTTCCTAACTACTACATATTGGGATGGTACTCTACTGGAAGCGATGC
TAATGAATCTGACATGAGTATCCACAAAGCTCTGATGGACATTAATGAATCGCCTGTTTA
TGTCCTTTTGAATCCTGCTATCAATCACGCTCAAAAGGATCTCCCTGTTACTATCTATGA
AAGTGAATTCCATGTCATTGATG

QA 1 323 1 323
DS 

RD RS1DI58JQ 764 0 0
GTTTCCTAACTACTACATATTGGGATGGTACTCTACTGGAAGCGATGCTAATGAATCTGA
CATGAGTATCCACAAAGCTCTGATGGACATTAATGAATCGCCTGTTTATGTCCTTTTGAA
TCCTGCTATCAATCACGCTCAGAAGGATCTCCCTGTTACTATCTATGAAAGTGAATTCCA
TGTCATTGATGGGATTCCTCAGCCAATTTTCGTGAATGCAAGCTACACAATCGAGACTGT
CGAGGCTGAAAGAATATCGGTTGATCATGTTGCACACCTTAAGCCATCTGATGGAGGCTC
AGCAGCGATTCAATTGGCTGCTCATCTCACTGGCATACACAGTGCCATCAAGATGCTTAA
TAGCAGAATCAGAGTGCTCCATCAATACCTTGGCGCAATGCAGAAAGGTGATATTCCTTG
CGACAACTCACTTTTGAGGCAAGTAGCCAGTCTGCTCAGAAGTCTGCCTGCCGCACAATC
AGAAAAGTTTGAAGAGGATTTATTAATGGAGTACAACGACAAATTGCTGATGTCTTACCT
AGCAATGATCACAAATTGTACCAGCAACATGAACGAGGTGGTTGACAAATTCAACACTGC
ATACGAGAGGAACAGTCGAAGAGGCGGTAGGACTCCATTCATGTAGAGAGATTAGTTTCA
GCTTGAAACCCTTTTTTTTTTGCGGTTCCTTAGAGAAATCTAGAACTCCTAAAGGTATTT
CGCTGTTCGGAATCTAAGAGCTAATGACGTTCTTCTTTTAGACT

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL4197Contig1 730 2 2 U
GGGTCATCTTCAAGCTTCTTAACTCCGCCGCCGGCAACCACCTCCATCAACGACAAACTC
TGCCATGGATTCAGCACCTCTTCTCACGACCATCAGCTTCTCCGTCGCATCATCGCCGCA
AGCCCCATGCCTCCACTCTTCTCACGACCACCGCAAGAGAGGATTTTTTTCTCTGTTACA
AAATCTCAAAAAAAAATTAACGGGAATCAAAACCACAGAACTCAGAGAGAGAGAGAGAGA
GAGAGAGATTGAAAGGCAGAGAGGTGACCAGTGTGGTGAGAAGCGGTGGTGGTGGAGACT
ACGGATCTGAGAACCGGTAACAAGGATGACGGCGGCGAGTGTAGATGATGACGACGACCG
AGCTTAAGATCCGTGGCGACAGCAAAGTGATGATGATGAATCTCTCTCGTTTACAAGACA
GAAAGTGAGAGAGATGAAAATCTGAGACTGTGAAGAACTTGAAAGAGAGGAGGAGAAGAG
GCGTGAAAGGAGGAGATGAAAGACGTGAAGAAAAGAAAAAAAATTTAGACCATTAGATCA
AACACTAATCAATGGTTAAGAATTAGTTATCCTTGTATTAAAAAAGCAGCCAATGAAAAA
GAAGTTAGAGGATAACCACAAGATTTATTTATAGCCCTTAGATTAAAAAACAATCAATGG
TGAATGCTTTATTTTGATGGTTAAAATTATATTTTATGTTAAACAGTATTTATATAAAAT
TTTAAATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H102TF U 1
AF RS1H102JQB C 164
BS 1 636 RS1H102TF
BS 637 730 RS1H102JQB

RD RS1H102TF 636 0 0
GGGTCATCTTCAAGCTTCTTAACTCCGCCGCCGGCAACCACCTCCATCAACGACAAACTC
TGCCATGGATTCAGCACCTCTTCTCACGACCATCAGCTTCTCCGTCGCATCATCGCCGCA
AGCCCCATGCCTCCACTCTTCTCACGACCACCGCAAGAGAGGATTTTTTTCTCTGTTACA
AAATCTCAAAAAAAAATTAACGGGAATCAAAACCACAGAACTCAGAGAGAGAGAGAGAGA
GAGAGAGATTGAAAGGCAGAGAGGTGACCAGTGTGGTGAGAAGCGGTGGTGGTGGAGACT
ACGGATCTGAGAACCGGTAACAAGGATGACGGCGGCGAGTGTAGATGATGACGACGACCG
AGCTTAAGATCCGTGGCGACAGCAAAGTGATGATGATGAATCTCTCTCGTTTACAAGACA
GAAAGTGAGAGAGATGAAAATCTGAGACTGTGAAGAACTTGAAAGAGAGGAGGAGAAGAG
GCGTGAAAGGAGGAGATGAAAGACGTGAAGAAAAGAAAAAAAATTTAGACCATTAGATCA
AACACTAATCAATGGTTAAGAATTAGTTATCCTTGTATTAAAAAAGCAGCCAATGAAAAA
GAAGTTAGAGGATAACCACAAGATTTATTTATAGCC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RS1H102JQB 567 0 0
TTTTTTTCTCTGTTACAAAATCTCAAAAAAAAATTAACGGGAATCAAAACCACAGAACTC
AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTGAAAGGCAGAGAGGTGACCAGTGTGGTGAGAAG
CGGTGGTGGTGGAGACTACGGATCTGAGAACCGGTAACAAGGATGACGGCGGCGAGTGTA
GATGATGACGACGACCGAGCTTAAGATCCGTGGCGACAGCAAAGTGATGATGATGAATCT
CTCTCGTTTACAAGACAGAAAGTGAGAGAGATGAAAATCTGAGACTGTGAAGAACTTGAA
AGAGAGGAGGAGAAGAGGCGTGAAAGGAGGAGATGAAAGACGTGAAGAAAAGAAAAAAAA
TTTAGACCATTAGATCAAACACTAATCAATGGTTAAGAATTAGTTATCCTTGTATTAAAA
AAGCAGCCAATGAAAAAGAAGTTAGAGGATAACCACAAGATTTATTTATAGCCCTTAGAT
TAAAAAACAATCAATGGTGAATGCTTTATTTTGATGGTTAAAATTATATTTTATGTTAAA
CAGTATTTATATAAAATTTTAAATTTT

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 2

CO CL4198Contig1 1039 2 4 U
GCTGGAGACACTCGTTGTCTTTTCTTCCCATACTCACCGGAGCATCTGGTTCACTCAATG
TCTAGATCAAAAGACACGAAACCGCATGTGTCCTTCTCCATTAATGCTTCAGTCAAAGAA
GGTCGACATGTGTCGGGATCTGCGTCTGCACTTCTTATTGGAGGGTTTTCTGTAGCAAGG
CCAAACAAGTTGAATATGAACCCGGATTCAAACAAGACCACAATTTCAGTACTAGTAAAC
ACCGATGTTCAAATTAACTGGCAAAACAAAGCAAGGTTGTCGATCAACTTGATCAAGAGA
GAAGATTATGGTATCGCAGGGCGTGCACTATACGAGGTGAATGTGCTAAAAAGATCAGAG
CAGTTCACAGATATAATACTCATCACTCTTCCTGCTACTGGCCAAAGGATAGAAATCGAT
TTCTCCTATGCCACGGGTGAATCCTTAGTAGCGCCGTCTGTGAGAAAAGATGGATACCCT
CATGTGTTTAAGATACTGTGGGGTGTTTTAGTGGTGATTGTATCGGTGATCATCTTGATG
AAAGTGATTGATAATAGACCAATTGGTCCGGCTGGAGCTACTAGAGTTGCAACAAACGGT
GTAGCAGCAACAACAGGAGCACCTGGAACACCAGAAAGAAGAAGTGGTGCAGTGATATAC
CATGAGGAATCTCCAAGAACACCATCACCATTTATGGAGTATGTAAAGAGGACTGTGGAT
GAGACTCCTTACTACAGAAGAGAAGGAAGGAGGAGGTTTAATCCTCAAAACACTATGTAG
AATTTGTTTGTTATGAGTAGTAAACTCTGTTTTTGTTTGTAAACCACCAAACCTTGAGAA
ATGTTTATATCATTTGTGCATTGTTATTTCTTGCTTACTCTTCAGTTGAACTGGATTCGT
ATTTTCTAAACTAGTTATTTGGATTTTTGTTTGATAAGTTTTTTACCTTTTAGATGATTG
TGGATTTTTTTTGAGCAACTAGATGATTTTGGATAAACTTTTAAAAAGTTGTGATTTTAT
CAGCTTACTTGAATTCACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CK25TF U 1
AF RS1CK25JQ C 224
BS 1 668 RS1CK25TF
BS 669 669 RS1CK25JQ
BS 670 702 RS1CK25TF
BS 703 1039 RS1CK25JQ

RD RS1CK25TF 702 0 0
GCTGGAGACACTCGTTGTCTTTTCTTCCCATACTCACCGGAGCATCTGGTTCACTCAATG
TCTAGATCAAAAGACACGAAACCGCATGTGTCCTTCTCCATTAATGCTTCAGTCAAAGAA
GGTCGACATGTGTCGGGATCTGCGTCTGCACTTCTTATTGGAGGGTTTTCTGTAGCAAGG
CCAAACAAGTTGAATATGAACCCGGATTCAAACAAGACCACAATTTCAGTACTAGTAAAC
ACCGATGTTCAAATTAACTGGCAAAACAAAGCAAGGTTGTCGATCAACTTGATCAAGAGA
GAAGATTATGGTATCGCAGGGCGTGCACTATACGAGGTGAATGTGCTAAAAAGATCAGAG
CAGTTCACAGATATAATACTCATCACTCTTCCTGCTACTGGCCAAAGGATAGAAATCGAT
TTCTCCTATGCCACGGGTGAATCCTTAGTAGCGCCGTCTGTGAGAAAAGATGGATACCCT
CATGTGTTTAAGATACTGTGGGGTGTTTTAGTGGTGATTGTATCGGTGATCATCTTGATG
AAAGTGATTGATAATAGACCAATTGGTCCGGCTGGAGCTACTAGAGTTGCAACAAACGGT
GTAGCAGCAACAACAGGAGCACCTGGAACACCAGAAAGAAGAAGTGGTGCAGTGATATAC
CATGAGGA*TCTCCAAGAACACCATCACCATTTATGGAGTAT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RS1CK25JQ 816 0 0
TTTCAGTACTAGTAAACACCGATGTTCAAATTAACTGGCAAAACAAAGCAAGGTTGTCGA
TCAACTTGATCAAGAGAGAAGATTATGGTATCGCAGGGCGTGCACTATACGAGGTGAATG
TGCTAAAAAGATCAGAGCAGTTCACAGATATAATACTCATCACTCTTCCTGCTACTGGCC
AAAGGATAGAAATCGATTTCTCCTATGCCACGGGTGAATCCTTAGTAGCGCCGTCTGTGA
GAAAAGATGGATACCCTCATGTGTTTAAGATACTGTGGGGTGTTTTAGTGGTGATTGTAT
CGGTGATCATCTTGATGAAAGTGATTGATAATAGACCAATTGGTCCGGCTGGAGCTACTA
GAGTTGCAACAAACGGTGTAGCAGCAACAACAGGAGCACCTGGAACACCAGAAAGAAGAA
GTGGTGCAGTGATATACCATGAGGAATCTCCAAGAACACCATCACCATTTATGGAGTATG
TAAAGAGGACTGTGGATGAGACTCCTTACTACAGAAGAGAAGGAAGGAGGAGGTTTAATC
CTCAAAACACTATGTAGAATTTGTTTGTTATGAGTAGTAAACTCTGTTTTTGTTTGTAAA
CCACCAAACCTTGAGAAATGTTTATATCATTTGTGCATTGTTATTTCTTGCTTACTCTTC
AGTTGAACTGGATTCGTATTTTCTAAACTAGTTATTTGGATTTTTGTTTGATAAGTTTTT
TACCTTTTAGATGATTGTGGATTTTTTTTGAGCAACTAGATGATTTTGGATAAACTTTTA
AAAAGTTGTGATTTTATCAGCTTACTTGAATTCACG

QA 1 816 1 816
DS 



AS 1 2

CO CL4199Contig1 721 2 3 U
TACAATATCAACAAGATACAATCCAACAAGGATGATTGATCATATCGATACATCCAAATC
AACAAGAAAACGAGTAGGAGAATCAAGAAGAAGAAGATACGGTCTTGAAGGAGTCCCGAG
GGTGGGTTAATGTGTCTTGGTCGCGGTTCCACTCGGGCGCAGGGGCGTTGACGAAATGGG
CATATAGCTTGTTCTTAGCGCACGTGACGGTTATCAGACTGTGCTTCCCTACTCCATCGA
TCTCGTACAGATAGTACACCTGCCCTGTCTCTTCATCTTTCTTTTCCTCAGACACCACTT
TATCGGCGCTTGCTATCAGATCCTAAAGCTCCACGTCCGACAAGGCAAGGTTGTTGAGGA
TCACACCCCTCGGCGCCAGCTGTCTGAACCCCGACAAGAACGTAAGGTACTCCTTCTCTG
TCCTCTTCTTCGGGTTGTAAAATTCGCTGTCTGTTCCGTTTGTGCCCTTCTCCACTTTCG
ACACCAATCTCTCCTTCCACCCTTCCGGCACGTCGTAAACATACTCCGCCGATGTCTTCC
TGTCCGAGTTCCCTCCGTATCCCCCATAGTTCGCCGCGCTCGCTGCTGTCCCGTAATATA
ATTTGTAAGCTTGGTTTCCCTCACCCGCAGCAGGCAACGCCGGAACCATCGTCAGGACAG
CAGTCGCGGCGACAACGGCAGAAAGAGAGGTTCCTAGACATCGCGATACTATCGCCTTGG
G


BQ
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10 

AF RS1A818JQ U 142
AF RS1A818TF C 1
BS 1 141 RS1A818TF
BS 142 628 RS1A818JQ
BS 629 721 RS1A818TF

RD RS1A818JQ 487 0 0
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ACGTGACGGTTATCAGACTGTGCTTCCCTACTCCATCGATCTCGTACAGATAGTACACCT
GCCCTGTCTCTTCATCTTTCTTTTCCTCAGACACCACTTTATCGGCGCTTGCTATCAGAT
CCTAAAGCTCCACGTCCGACAAGGCAAGGTTGTTGAGGATCACACCCCTCGGCGCCAGCT
GTCTGAACCCCGACAAGAACGTAAGGTACTCCTTCTCTGTCCTCTTCTTCGGGTTGTAAA
ATTCGCTGTCTGTTCCGTTTGTGCCCTTCTCCACTTTCGACACCAATCTCTCCTTCCACC
CTTCCGGCACGTCGTAAACATACTCCGCCGATGTCTTCCTGTCCGAGTTCCCTCCGTATC
CCCCATAGTTCGCCGCGCTCGCTGCTGTCCCGTAATATAATTTGTAAGCTTGGTTTCCCT
CACCCGC

QA 1 487 1 487
DS 

RD RS1A818TF 721 0 0
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AACAAGAAAACGAGTAGGAGAATCAAGAAGAAGAAGATACGGTCTTGAAGGAGTCCCGAG
GGTGGGTTAATGTGTCTTGGTCGCGGTTCCACTCGGGCGCAGGGGCGTTGACGAAATGGG
CATATAGCTTGTTCTTAGCGCACGTGACGGTTATCAGACTGTGCTTCCCTACTCCATCGA
TCTCGTACAGATAGTACACCTGCCCTGTCTCTTCATCTTTCTTTTCCTCAGACACCACTT
TATCGGCGCTTGCTATCAGATCCTAGAGCTCCACGTCCGACAAGGCAAGGTTGTTGAGGA
TCACACCCCTCGGCGCCAGCTGTCTGAACCCCGACAAGAACGTAAGGTACTCCTTCTCTG
TCCTCTTCTTCGGGTTGTAGAATTCGCTGTCTGTTCCGTTTGTGCCCTTCTCCACTTTCG
ACACCAATCTCTCCTTCCACCCTTCCGGCACGTCGTAAACATACTCCGCCGATGTCTTCC
TGTCCGAGTTCCCTCCGTATCCCCCATAGTTCGCCGCGCTCGCTGCTGTCCCGTAGTATA
ATTTGTAAGCTTGGTTTCCCTCACCCGCAGCAGGCAACGCCGGAACCATCGTCAGGACAG
CAGTCGCGGCGACAACGGCAGAAAGAGAGGTTCCTAGACATCGCGATACTATCGCCTTGG
G

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL4200Contig1 1206 2 6 U
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CTTCTTCTTTTTACTTCTCTCTTCCTTAGCTTCTCTGTGCTTCTTGGTCTTCAGGACGTC
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AAGGACATTACAAGAACCGGTTATTACAGTATCAGCAGATGCGGGCTTTGCTTCTAATCA
TTTTCCAACCTACAAACTAGGACCTGATAACCAGATTGTAGAGGAACCAGAAGAAGATGA
GAAAGGTCCATCAGTTAAAGACACTGTCGAGACAGAGAGCGAGTTGTTGTCTGACCAGCA
CAAGCGTCTCTCAGTGCGTGACTTGGCTAGTAAATTTGATAAGAACTTGGCTGCAGCTAT
TACTTTGGCTGATGAGGCGAAATTAAAAGAGGTGGCTTCTTTAGAGGGACATGTTATGTT
GAAGAAGCTAAGAGATGCTTTAGAATACATGAGAGGACGCATGGATGGGCAAAACAAGGA
AGATGTGGAGAAAGCTATCTCTATGGTCGAAGCATTAGCTGTGAAGTTAACTCAAAATGA
AGGTGAGCTAATTCAAGAAAAGTTTGAAGTGAAGAAACTTGGAAACTTCCTCAAGCAGGC
AACAGAAGATGCAAAGAAACTGGTGAACCAGGAAAAGTCATTTGCTTGTGCTGAGATTGA
AAGTGCGAGAGCCGTAGTGCTTAAACTTGGAGAGGCATTTGAAGAACAGGAGAGAAGTTC
TGAAGCTTCTAGAGCTCAGGGACCTGATGTTGAGAAACTGGTCGAGGAGGTCCAAGAAGC
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TGGTTTAAGAAGTCGAATCCAAGAGAAGTATTTGAATTCTATTAAACTTCATCAACAGAT
AAAGAGAGTTGAGGAATCAAAGTCGTGTCCATTTGTTCTGGAAGGCACACAAAGTCTAGG
CTCTTGCTTAAGAATCCATGTCACCTCAGAAAATGCTATAGATCTTTCAAACTGTTCTAT
CCAGTGGTACCGCGCAGCATGTGAAACAAGTAGAAGGGAAGCTATATCTGGTGCCAACCA
ATCAGTATATGCTCCAGAACCATTTGATGTTGGGAGGATATTGCAAGCAGACATTCTCTC
AAGCGG


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1C008TF U 1
AF RS1GF21TF U 488
BS 1 507 RS1C008TF
BS 508 508 RS1GF21TF
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RD RS1C008TF 639 0 0
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CTTCTTCTTTTTACTTCTCTCTTCCTTAGCTTCTCTGTGCTTCTTGGTCTTCAGGACGTC
AGTAGATTACAAAAAAAACTCCAGCAAAAAAATGACGAAAGTGTGTCCTGAAATCGAAGA
AAGGACATTACAAGAACCGGTTATTACAGTATCAGCAGATGCGGGCTTTGCTTCTAATCA
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GAAAGGTCCATCAGTTAAAGACACTGTCGAGACAGAGAGCGAGTTGTTGTCTGACCAGCA
CAAGCGTCTCTCAGTGCGTGACTTGGCTAGTAAATTTGATAAGAACTTGGCTGCAGCTAT
TACTTTGGCTGATGAGGCGAAATTAAAAGAGGTGGCTTCTTTAGAGGGACATGTTATGTT
GAAGAAGCTAAGAGATGCTTTAGAATATATGAGAGGACGCATGGATGGGCAAAACAAGGA
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AGGTGAGCTAATTCAAGAAAAGTTTGAAGTGAAGAAACT

QA 1 639 1 639
DS 

RD RS1GF21TF 719 0 0
G
TAAGAGATGCTTTAGAATACATGAGAGGACGCATGGATGGGCAAAACAAGGAAGATGTGG
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GAGCCGTAGTGCTTAAACTTGGAGAGGCATTTGAAGAACAGGAGAGAAGTTCTGAAGCTT
CTAGAGCTCAGGGACCTGATGTTGAGAAACTGGTCGAGGAGGTCCAAGAAGCTAGACAGA
TCAAACGGATGCATCACCCAACAAAGGTGATGGGCATGCAACATGAGCTTCATGGTTTAA
GAAGTCGAATCCAAGAGAAGTATTTGAATTCTATTAAACTTCATCAACAGATAAAGAGAG
TTGAGGAATCAAAGTCGTGTCCATTTGTTCTGGAAGGCACACAAAGTCTAGGCTCTTGCT
TAAGAATCCATGTCACCTCAGAAAATGCTATAGATCTTTCAAACTGTTCTATCCAGTGGT
ACCGCGCAGCATGTGAAACAAGTAGAAGGGAAGCTATATCTGGTGCCAACCAATCAGTAT
ATGCTCCAGAACCATTTGATGTTGGGAGGATATTGCAAGCAGACATTCTCTCAAGCGG

QA 2 719 2 719
DS 



AS 1 2

CO CL4201Contig1 475 2 1 U
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AGCTCGAGAAGATGATTATCCCTGTACGATGCTTTACATGCGGAAAGGTGATTGGAAACA
AGTGGGATGCCTATCTCGATCTTCTCCAGCTTGACTACACTGAAGGGGACGCACTTGATG
CGCTCAACTTAGTTAGATACTGCTGCAGGCGTATGCTAATGACGCACGTTGATCTGATTG
AGAAGCTTCTCAACTACAACACTCTGGAGAAATCAGACAACAGTTAGAAGCGCATGCAAA
TCTGCTAATATCTATGGAAACTCTCTGTTTTTCTGTGTAAAAACTTGAAATCGATCTGGG
GTTTTGGAAGACTCTAGTGAATTTGTCATATGTATGTCAGTGACTCTATGTGTGATTCAG
TGTTAAAATTTTATGAGCTGAAAGAATTGTTTTCCTTTTGAGTAATTCATCTTTC


BQ
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AF RS1ER03JQ C 1
AF RS1ER03TF U 1
BS 1 475 RS1ER03TF

RD RS1ER03JQ 475 0 0
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QA 1 475 1 475
DS 

RD RS1ER03TF 475 0 0
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AGCTCGAGAAGATGATTATCCCTGTACGATGCTTTACATGCGGAAAGGTGATTGGAAACA
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CGCTCAACTTAGTTAGATACTGCTGCAGGCGTATGCTAATGACGCACGTTGATCTGATTG
AGAAGCTTCTCAACTACAACACTCTGGAGAAATCAGACAACAGTTAGAAGCGCATGCAAA
TCTGCTAATATCTATGGAAACTCTCTGTTTTTCTGTGTAAAAACTTGAAATCGATCTGGG
GTTTTGGAAGACTCTAGTGAATTTGTCATATGTATGTCAGTGACTCTATGTGTGATTCAG
TGTTAAAATTTTATGAGCTGAAAGAATTGTTTTCCTTTTGAGTAATTCATCTTTC

QA 1 475 1 475
DS 



AS 1 2

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TTTTGGACCTCTGATTACTTTCATGTGTTTGTAATACTTACAGAGTTACAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GJ27TF U 1
AF RS1FD78JQ C 63
BS 1 382 RS1GJ27TF
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BS 385 553 RS1GJ27TF
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RD RS1GJ27TF 553 0 0
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TGAATCTTGGGAAGCAAAAACTTCAAACAACAGTTGTGAATAGTAACTTGAACCCGGTAT
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ATGGGAAAGTGAA

QA 1 553 1 553
DS 

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TTGGACCTCTGATTACTTTCATGTGTTTGTAATACTTACAGAGTTACAG

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H648JQB U 13
AF RS1H648TF C 1
BS 1 14 RS1H648TF
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RD RS1H648JQB 203 0 0
AA
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TCCCCGGAAACAACAACAACAACCACAACACAGTAACATAGAATATCTTACAGAAACAAA
CTTCCCCATCCCCTTCAATTTATAAATCACATACTCCGCTTTACTCACACAGCCATTGTT
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AAA

QA 3 200 3 200
DS 

RD RS1H648TF 407 0 0
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CGAACAAGTTCTGGTCCCCGGAAACAACAACAACAACCACAACACAGTAACATAGAATAT
CTTACAGAAACAAACTTCTCCATCTCCTTCAATTTATAAATCACATACTCCGCTTTACTC
ACACAGCCATTGTTATCAATATCCGCAGCAAAGAACTGAGACACAGACATAGCCTCACGC
AGCACTTTCATTGCCCGTTCCCTATTCCTCTTATCAACTCTCGCCTCAGCCAAACACAGA
AAAGCCCGAGCCACGGCTAACGTAGAGACAAGCAGCCACACCGCAGCGAAAAGCCTGCCG
GGCAACGTCTTAAACGCCCTGTCACCATACCCAACGGTAGTAACCGA

QA 1 407 1 407
DS 



AS 1 2

CO CL4204Contig1 525 2 2 U
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TCAAATGTTGTATTTTCTAGACATCTTTTCAGCACTTTATTTATTTCTTTCTTTGACTAT
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TGTGTTTCTTTTCTCTGAGTGAGAGAGAGTTCTTTAGCTCGTTCATCGGTGTGAACCGGC
TAGTTGATTTGGTGGCCAGCCAATCATCTTTGTGTGTCGTTTGGTGGTTAGCCAACACAC
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CTTCTGACGATCCGTTCAATCCATCCCAGTTCCAGAAGTTCCTTCGACTTCTCGGTTCAT
ATCCAACATCCGGCTAAAGTGATCCTTCCCGATTTTGGGTCTATCAAGTGGTATCAGAGC
CACTCAACCGGTACTATCCGTTCATTTTTTTCATCTTTCCATCTT


BQ
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AF RS1AS36TF U 1
AF RS1AS36JQ C 199
BS 1 393 RS1AS36TF
BS 394 525 RS1AS36JQ

RD RS1AS36TF 393 0 0
CGCAACATTGACCAAGACTGCATCAATTTCTACAACTTTGACTCTCTAATAATTATCTAG
TCAAATGTTGTATTTTCTAGACATCTTTTCAGCACTTTATTTATTTCTTTCTTTGACTAT
ATCTACTATAAATATGTAGTCCATTTGATGAATAAAAATCAGATCATTTTGGAGTTTATT
TGTGTTTCTTTTCTCTGAGTGAGAGAGAGTTCTTTAGCTCGTTCATCGGTGTGAACCGGC
TAGTTGATTTGGTGGCCAGCCAATCATCTTTGTGTGTCGTTTGGTGGTTAGCCAACACAC
CTTCATTGCTTCTTTGGTGGTTAGCCTTAGATCGTGGGTATATCAAGAGTCATTCCGCAC
CTTCTGACGATCCGTTCAATCCATCCCAGTTCC

QA 1 393 1 393
DS 

RD RS1AS36JQ 327 0 0
GTGAGAGAGAGTTCTTTAGCTCGTTCATCGGTGTGAACCGGTTAGTTGATTTGGTGGCCA
GCCAATCATCTTTGTGTGTCGTTTGGTGGTTAGCCAACACACCTTCATTGTTTCTTTGGT
GGTTAGCCTTAGATCGTGGGTATATCAAGAGTCATTCCGCACCTTCTGACGATCCGTTCA
ATCCATCCCAGTTCCAGAAGTTCCTTCGACTTCTCGGTTCATATCCAACATCCGGCTAAA
GTGATCCTTCCCGATTTTGGGTCTATCAAGTGGTATCAGAGCCACTCAACCGGTACTATC
CGTTCATTTTTTTCATCTTTCCATCTT

QA 1 327 1 327
DS 



AS 1 2

CO CL4205Contig1 944 2 4 U
GGGTAGCTTTTAAGAAATAAAGGAAGGGGAACAAGAGCAGAAGCTTCTCTCTCAGAATAA
ATCACAAAGAACAAGATTCTTTAATTTCTTTAAAGCCCTTACGAATCTTAAAGGTTGTTA
CTTGCTTTCCTCGGTTAAAAAGAGGAAAGATGTTGTGTAGAATGGTGGTGGTGACCGGCG
GCCGGAAGAAGAAAGCCGGTTCGGTTCCGGTTTATCTGAATGTATACGACCTCACACCCA
TCAATGGCTACGCTTACTGGTTAGGTCTTGGCGTCTACCACTCTGGTGTTGAAGTTCACG
GGGTTGAGTACGGTTTCGGAGCTCACGAGCATTCGACAACAGGGATCTTCGAGGTGGAAC
CGAAGCAGTGTCCAGGTTTCACGTTCAGGAAGTCTATTTTGATTGGGAGAACAGATTTGG
ATCCAGAGAAAGTCCGTGCCTTTATGGAGAAGCTTGCTGAAGACTACAGCGGAAACACTT
ACCATCTCATCACTAAGAACTGTAATCACTTTTGCAACGACGTTTGTGTTCAGCTGACAA
GGAGATCTATCCCTAGTTGGGTTAACCGTCTTGCTCGTTTCGGTTTGTTCTGTAACTGTG
TTCTGCCTGCAGAGCTGAACGAGACGAAGGTGAGGCAGGTTAGGTCAAAAGAGGAGAAGG
TTCCGGAAGCAGAAGAGAGGAAACTTAGGAGCAGGTCAAGTAGATATCCACCTGGACCTT
CGCTTTCTTCGTCGGGGTCTTTAAACCGAAGCAGAAGAGGAGGAGGAGAGAGGAGAAGAC
AATGTCTTCCTCCATCACCACCTGTGAGTGCTTAGGTTTTAGATTCTCCTAGTAAAATCT
TTTTTTGTTTCGTTATTTGATTCGGTTTGTAATGGTTTCAAGAAGTTGTGTTTATGTGAA
CCAAACATTTTTATTGATGGCTAATGGTATAAGATCTTTACATC


BQ
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AF RS1C450TF U 1
AF RS1C450JQ C 191
BS 1 649 RS1C450TF
BS 650 650 RS1C450JQ
BS 651 670 RS1C450TF
BS 671 944 RS1C450JQ

RD RS1C450TF 670 0 0
GGGTAGCTTTTAAGAAATAAAGGAAGGGGAACAAGAGCAGAAGCTTCTCTCTCAGAATAA
ATCACAAAGAACAAGATTCTTTAATTTCTTTAAAGCCCTTACGAATCTTAAAGGTTGTTA
CTTGCTTTCCTCGGTTAAAAAGAGGAAAGATGTTGTGTAGAATGGTGGTGGTGACCGGCG
GCCGGAAGAAGAAAGCCGGTTCGGTTCCGGTTTATCTGAATGTATACGACCTCACACCCA
TCAATGGCTACGCTTACTGGTTAGGTCTTGGCGTCTACCACTCTGGTGTTGAAGTTCACG
GGGTTGAGTACGGTTTCGGAGCTCACGAGCATTCGACAACAGGGATCTTCGAGGTGGAAC
CGAAGCAGTGTCCAGGTTTCACGTTCAGGAAGTCTATTTTGATTGGGAGAACAGATTTGG
ATCCAGAGAAAGTCCGTGCCTTTATGGAGAAGCTTGCTGAAGACTACAGCGGAAACACTT
ACCATCTCATCACTAAGAACTGTAATCACTTTTGCAACGACGTTTGTGTTCAGCTGACAA
GGAGATCTATCCCTAGTTGGGTTAACCGTCTTGCTCGTTTCGGTTTGTTCTGTAACTGTG
TTCTGCCTGCAGAGCTGAACGAGACGAAGGTGAGGCAGGTTAGGTCAAA*GAGGAGAAGG
TTCCGGAAGC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RS1C450JQ 754 0 0
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CGCTTACTGGTTAGGTCTTGGCGTCTACCACTCTGGTGTTGAAGTTCACGGGGTTGAGTA
CGGTTTCGGAGCTCACGAGCATTCGACAACAGGGATCTTCGAGGTGGAACCGAAGCAGTG
TCCAGGTTTCACGTTCAGGAAGTCTATTTTGATTGGGAGAACAGATTTGGATCCAGAGAA
AGTCCGTGCCTTTATGGAGAAGCTTGCTGAAGACTACAGCGGAAACACTTACCATCTCAT
CACTAAGAACTGTAATCACTTTTGCAACGACGTTTGTGTTCAGCTGACAAGGAGATCTAT
CCCTAGTTGGGTTAACCGTCTTGCTCGTTTCGGTTTGTTCTGTAACTGTGTTCTGCCTGC
AGAGCTGAACGAGACGAAGGTGAGGCAGGTTAGGTCAAAAGAGGAGAAGGTTCCGGAAGC
AGAAGAGAGGAAACTTAGGAGCAGGTCAAGTAGATATCCACCTGGACCTTCGCTTTCTTC
GTCGGGGTCTTTAAACCGAAGCAGAAGAGGAGGAGGAGAGAGGAGAAGACAATGTCTTCC
TCCATCACCACCTGTGAGTGCTTAGGTTTTAGATTCTCCTAGTAAAATCTTTTTTTGTTT
CGTTATTTGATTCGGTTTGTAATGGTTTCAAGAAGTTGTGTTTATGTGAACCAAACATTT
TTATTGATGGCTAATGGTATAAGATCTTTACATC

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

CO CL4206Contig1 1243 2 2 U
GGACGTGGTTAGTGTCGGGATCTCGAGATTCGACATCGGTGTTTTGAAAGTCGTCGTCGT
GGGAATCGGTGAAATGGCGGCGAAGCAGATGGAAGAGATACAGAAGAAGCTGGGGAGGCT
TAGTTACGCTAGGGCTAATGCTCCTGCTCAGTCTCTCCTATTCGCTGGGATGGAACGTTA
TGCTCTTCTCGAATGGCTCTTTTTCAAGTTATTAGGAGATAAATCTCCTTTCTCACAGCA
AAATCTCCAAGGAGATGCTGGAGTTCGTGATGAAGAAACTGTTCGTATTCAGTATTTGGC
AGAGATAGCAAAGTTTCTGGGGTTCACACCAACAGTAGATATAGAAACCATTCAAGGACA
TGGAACCTATGAAGATAGAATGGAAATGCTTCGCAACATTGTTGATTTAGTAGAGGCAAG
CCTCTTCTCAGATAATCCAGAATGGAGTATTGATGAGCAGGTTGCCAAAGATATCCAACT
CATAGATGCTATTGCAGAGAGACCTTTGATATTTTCTGAGGAATGCAAATTGTTCCCTGC
TGATGTTCAGATCCAGTCCATATATCCATTACCTGGTGTTTCAGAACTGGAGACAAAACT
CTCAGAACGGGCCAAGATTCTCTCTAATCTTCAGCAAAAAGTCGACGACTTAGCAGCAAA
GCATGCCTACAACCCGGACGAAGAATATGCGGAAGTGGAATGTGAACTAAGGGCTCGTTT
AGAATCGTTTCTTGAAACTGCTAGAGCTTTCAACGCAATCTACACAAAGGAAATACGTCC
ATGGACTCACATGATGGAAGTGCCTCAGCTTCATGGGTTTGGTCCTGCTGCCAACCGCTT
ACTGGAGGCCTATAATATGCTTCTCAAGTTCCTAGGGAACTTGAAGAACCTAAGAGACTC
GCATGCAGCACTTACTATTGGATCATCAGGAACGGTAGCTGGAGAGCCGTCTTCTGTAGC
TAGAATCGTATCTGAGTGTGAAGTCGCATTAACTGTTCTCAATCGAGACCTTGGAATCCT
ATCTGCCTCTATAGCTCGTGAGCAAGGGGAGCGTCTGTAACTGTCACGGTTGATTTACTT
GAAATTAGTTTAGGGCTGTGTTGTGTGATCTCATTAGTTTTAACTCTTTTTTTATCTTGT
GTGTTGCCAAGTTTGTTTTACCGACAAATAGTCTGGTTTCAGGGTTTGTAATAACATCCA
AGATATATTCGTCTAATTAAACAACATCAATTTCATTTCCTAC


BQ
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AF RS1EA55TF U 1
AF RS1EA55JQ C 449
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BS 605 1243 RS1EA55JQ

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GGGAATCGGTGAAATGGCGGCGAAGCAGATGGAAGAGATACAGAAGAAGCTGGGGAGGCT
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AAATCTCCAAGGAGATGCTGGAGTTCGTGATGAAGAAACTGTTCGTATTCAGTATTTGGC
AGAGATAGCAAAGTTTCTGGGGTTCACACCAACAGTAGATATAGAAACCATTCAAGGACA
TGGAACCTATGAAGATAGAATGGAAATGCTTCGCAACATTGTTGATTTAGTAGAGGCAAG
CCTCTTCTCAGATAATCCAGAATGGAGTATTGATGAGCAGGTTGCCAAAGATATCCAACT
CATAGATGCTATTGCAGAGAGACCTTTGATATTTTCTGAGGAATGCAAATTGTTCCCTGC
TGATGTTCAGATCCAGTCCATATATCCATTACCTGGTGTTTCAGAACTGGAGACAAAACT
CTCA

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DS 

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ATATTTTCTGAGGAATGCAAATTGTTCCCTGCTGATGTTCAGATCCAGTCCATATATCCA
TTACCTGGTGTTTCAGAACTGGAGACAAAACTCTCAGAACGGGCCAAGATTCTCTCTAAT
CTTCAGCAAAAAGTCGACGACTTAGCAGCAAAGCATGCCTACAACCCGGACGAAGAATAT
GCGGAAGTGGAATGTGAACTAAGGGCTCGTTTAGAATCGTTTCTTGAAACTGCTAGAGCT
TTCAACGCAATCTACACAAAGGAAATACGTCCATGGACTCACATGATGGAAGTGCCTCAG
CTTCATGGGTTTGGTCCTGCTGCCAACCGCTTACTGGAGGCCTATAATATGCTTCTCAAG
TTCCTAGGGAACTTGAAGAACCTAAGAGACTCGCATGCAGCACTTACTATTGGATCATCA
GGAACGGTAGCTGGAGAGCCGTCTTCTGTAGCTAGAATCGTATCTGAGTGTGAAGTCGCA
TTAACTGTTCTCAATCGAGACCTTGGAATCCTATCTGCCTCTATAGCTCGTGAGCAAGGG
GAGCGTCTGTAACTGTCACGGTTGATTTACTTGAAATTAGTTTAGGGCTGTGTTGTGTGA
TCTCATTAGTTTTAACTCTTTTTTTATCTTGTGTGTTGCCAAGTTTGTTTTACCGACAAA
TAGTCTGGTTTCAGGGTTTGTAATAACATCCAAGATATATTCGTCTAATTAAACAACATC
AATTTCATTTCCTAC

QA 1 795 1 795
DS 



AS 1 2

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CACACAAAACAAACAGAGAGCCTGGGAAGAAAACAAGTGTTCCTTTTCTTATCTTCTTCT
CCTTCAACTTCAAGCCTAAGGGGACATCAATGGCAGAACAGTAACTATCCAAAACTTGGG
CTCAGATTAAAACCAAAAGCAAGTGTGGTGCCTCCGTCTGAATCTGGTGATATCACCACC
TTCCTCCTAGTAAGTGTAGCAATGATCTCAATGTATTTGGTAGCGAACTTTGTGGTTCCG
TCTTTGCTTTTCAAGTCGCTCCAAGGTGAAGAAGAGGGAGACTCTGATTGAACTTGAAGT
TTTTGCTTCTTCTTTTTTTAATTGAAGTTTTTGTTACTCATATGCAAAACTTATCATATT
ATTATTATTTGAGAACAAGCTTAGATGATATCCTTATAATTTGATTGGTTCACC


BQ
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AF RS1EN57TF U 1
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CACACAAAACAAACAGAGAGCCTGGGAAGAAAACAAGTGTTCCTTTTCTTATCTTCTTCT
CCTTCAACTTCAAGCCTAAGGGGACATCAATGGCAGAACAGTAACTATCCAAAACTTGGG
CTCAGATTAAAACCAAAAGCAAGTGTGGTGCCTCCGTCTGAATCTGGTGATATCACCACC
TTCCTCCTAGTAAGTGTAGCAATGATCTCAATGTATTTGGTAGCGAACTTTGTGGTTCCG
TCTTTGCTTTTCAAGTCGCTCCAAGGTGAAGAAGAGGGAGACTCTGATTGAACTTGAAGT
TTTTGCTTCTTCTTTTTTTAATTGAAGTTTTTGTTACTCATATGCAAAACTTATCATATT
ATTATTATTTGAGAACAAGCTTAGATGATATCCTTATAATTTGATTGGTTCACC

QA 1 474 1 474
DS 

RD RS1EN57TF 474 0 0
GGGTGGTGCGCAAGTTATCATCAGCCATTACCTGCGGCCGGTTCCAGCGTCTTGAATCAC
CACACAAAACAAACAGAGAGCCTGGGAAGAAAACAAGTGTTCCTTTTCTTATCTTCTTCT
CCTTCAACTTCAAGCCTAAGGGGACATCAATGGCAGAACAGTAACTATCCAAAACTTGGG
CTCAGATTAAAACCAAAAGCAAGTGTGGTGCCTCCGTCTGAATCTGGTGATATCACCACC
TTCCTCCTAGTAAGTGTAGCAATGATCTCAATGTATTTGGTAGCGAACTTTGTGGTTCCG
TCTTTGCTTTTCAAGTCGCTCCAAGGTGAAGAAGAGGGAGACTCTGATTGAACTTGAAGT
TTTTGCTTCTTCTTTTTTTAATTGAAGTTTTTGTTACTCATATGCAAAACTTATCATATT
ATTATTATTTGAGAACAAGCTTAGATGATATCCTTATAATTTGATTGGTTCACC

QA 1 474 1 474
DS 



AS 1 2

CO CL4208Contig1 1205 2 4 U
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TCGAATCTGAACGTAAAAGAAAATGGGTGAGAACGCCATCTCAGGTAATCTCAAGAATCT
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TGTCTCTAGACTCGGTGGCTCCTCTGCTTTCGTTGGAAAGGTTGGTGATGATGAGTTTGG
ACGAATGCTAGCTGAGATTCTAAGGCTCAACAACGTGGATAACTCCGGGATGGGATTCGA
CAGCGAAGCACGCACTGCTCTCACCTTTGTTACGTTGAGAGGTGATGGAGAGAGGGAGTT
TCTGTTCTTCAGACACCCTAGTGCCGACATGCTTCTCTTGGAGTCTGAGCTTGACAAGAA
CCTGATCCAAAAGGCAAAGATCTTTCATTACGGATCTATCAGTTTGATCGAGGAACCGTG
CCGGTCCACTCAGCTCGCAGCTATGAGAATCGCTAAAGACTCGGGGAGTCTCTTGTCGTA
TGACCCGAATTTGACGTTGCCGTTGTGGCCATCAGAGGAAGCTGCAAGGAAAGAGATCAT
GAGTATCTGGAATCTTGCAGATGTTATAAAGATAAGTGAGGAGGAGATAACATTCCTGAC
CGGTGGAGATGATCCTTATGATGATGAAGTTGTGTTGCAAAAGCTGTTTCATCCAGATCT
TAAGCTTCTTGTTGTCTCAGAAGGAACTAATGGCTGTAGATACTACACTCAGGAGTTTAA
AGGTAAAGTTGGTGGAGTAAAAGTGAAAGCAGTGGATACAACCGGTGCAGGAGATGCATT
CGTGAGCGGTCTAAGGGAAGCGCTTCTATTCGCAAACGCTTGTGGAGCTATTACTGTGAC
AGAGAGAGGAGCTATTCCAGCTATGCCCACCATGAATGCTGTTCAAGACCTTCTCTCTTC
TTCCTCTCGCCCCTGAAAATGCTCAAGAAGTCTTTTTTTTTAATGACTCAACTCATTACC
TTTTTCACTGTATCTTTGTTCCTAATTTGATAGGAACTCGAGAATGTTGTGTGTTTTCTA
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GCTCC


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RS1GX34TF U 1
AF RS1GX34JQ C 502
BS 1 651 RS1GX34TF
BS 652 652 RS1GX34JQ
BS 653 696 RS1GX34TF
BS 697 1205 RS1GX34JQ

RD RS1GX34TF 696 0 0
GGAACTTTCAAATCTTCTCCTCTCCTCTCGCTTCATCTCCCTCTGTTCCCGTCTCGTCTT
TCGAATCTGAACGTAAAAGAAAATGGGTGAGAACGCCATCTCAGGTAATCTCAAGAATCT
CGTGGTCTGTTTCGGTGAAATGCTGATTGATTTCGTGCCAACGGTTGGAGGTGTTTCACT
CGCTGAAGCACCAGCTTTCAAGAAAGCTCCAGGAGGTGCACCTGCAAACGTAGCCGTTGG
TGTCTCTAGACTCGGTGGCTCCTCTGCTTTCGTTGGAAAGGTTGGTGATGATGAGTTTGG
ACGAATGCTAGCTGAGATTCTAAGGCTCAACAACGTGGATAACTCCGGGATGGGATTCGA
CAGCGAAGCACGCACTGCTCTCACCTTTGTTACGTTGAGAGGTGATGGAGAGAGGGAGTT
TCTGTTCTTCAGACACCCTAGTGCCGACATGCTTCTCTTGGAGTCTGAGCTTGACAAGAA
CCTGATCCAAAAGGCAAAGATCTTTCATTACGGATCTATCAGTTTGATCGAGGAACCGTG
CCGGTCCACTCAGCTCGCAGCTATGAGAATCGCTAAAGACTCGGGGAGTCTCTTGTCGTA
TGACCCGAATTTGACGTTGCCGTTGTGGCCATCAGAGGAAGCTGCAAGGAA*GAGATCAT
GAGTATCTGGAATCTTGCAGATGTTATAAAGATAAG

QA 1 696 1 696
DS 

RD RS1GX34JQ 704 0 0
CTTTCATTACGGATCTATCAGTTTGATCGAGGAACCGTGCCGGTCCACTCAGCTCGCAGC
TATGAGAATCGCTAAAGACTCGGGGAGTCTCTTGTCGTATGACCCGAATTTGAGGTTGCC
GTTGTGGCCATCAGAGGAAGCTGCAAGGAAAGAGATCATGAGTATCTGGAATCTTGCAGA
TGTTATAAAGATAAGTGAGGAGGAGATAACATTCCTGACCGGTGGAGATGATCCTTATGA
TGATGAAGTTGTGTTGCAAAAGCTGTTTCATCCAGATCTTAAGCTTCTTGTTGTCTCAGA
AGGAACTAATGGCTGTAGATACTACACTCAGGAGTTTAAAGGTAAAGTTGGTGGAGTAAA
AGTGAAAGCAGTGGATACAACCGGTGCAGGAGATGCATTCGTGAGCGGTCTAAGGGAAGC
GCTTCTATTCGCAAACGCTTGTGGAGCTATTACTGTGACAGAGAGAGGAGCTATTCCAGC
TATGCCCACCATGAATGCTGTTCAAGACCTTCTCTCTTCTTCCTCTCGCCCCTGAAAATG
CTCAAGAAGTCTTTTTTTTTAATGACTCAACTCATTACCTTTTTCACTGTATCTTTGTTC
CTAATTTGATAGGAACTCGAGAATGTTGTGTGTTTTCTAGTTTGTTAATCTCCTGGTTTT
ATGTTAAAGTTGGATTCTGCTACTAGGAACAAAAGTTTTGCTCC

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

CO CL4209Contig1 1001 2 2 U
GAGAGATAAAGAATCTGAATGCGTTTTCAGCTATGAGCAGGGCGATTGGCTATGAGATAA
CAAGACAGGCACTTCTATACAACCAGGGTCAAGCCGACCAGATTGTAACCGAGACTCGTC
TTTGGGACGAAGGAGCTCAGAAAACAGTAACAATGAGGAAGAAAGAAGGGCTAGCTGATT
ACCGCTACTTCCCAGAACCAGATCTTCCTGAAGTGATCCTCACCCAAGAATACGTTGATA
GCATCCGTGCCTCTTTACCGGAACTTCCTGAGGCAAAGCGCAGGAGGTATGAGGCAATGG
GTTTAGGTATTCAAGATGTGCTTTTCCTTGCCAATGACGTCAGTGTTGCAGAATATTTCG
ATCAAGTGATTGGTAAAGGTGCTGATGTTAAGTCGGCAGCAAATTGGCTGATGAGTGATA
TAGCCGCTTACTTGAAAAATGAGGAACTTTCTATCAGTGATGTCAAACTTACTCCTCAAG
AGTTGGCTGAGCTGATAGCTGCAATCAAAGATGAAACCATTAGCGGAAAGATTGGTAAAC
AGATTCTGTTTGAGCTATTGGCCAAAGGTGGAACTGTTCAAGGAATGATTAAGGAAAAAG
ACTTGGTTCAGATAACCGATCCTGTGGAGATTGAGAAGATGATTATGAAAGTGATCTCCG
AATCCCCAAAGCAACTTGAGCAGTACCGAAGTGGGAGGACCAAGCTTCAAGGCTTTTTTT
GCTGGCCAGGTAATGAAAATGTCAAAAGGTAAAGCAAACCCTGCTTTGCTTAACAAGATT
CTCCTGGAGAAACTCGATGCCAAGGAGTGATGATTGATTAAAACGCACAAAATTGGAGAT
GCGATTAGTGAAAGTGTTGTATTGAGTTAAAACGGTTGTTCTTTAGAAATTTTTTGTTGA
ATTTGTTAAGTTTCACAGAGTCTTGTAATGGCAATACAATGCACAATGAATTGGTACAGA
TGATTCTGTTGGAACATGAAATAAAAAAGCTTAGATTTTGC


BQ
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AF RS1E580TF U 1
AF RS1E580JQ C 212
BS 1 694 RS1E580TF
BS 695 1001 RS1E580JQ

RD RS1E580TF 694 0 0
GAGAGATAAAGAATCTGAATGCGTTTTCAGCTATGAGCAGGGCGATTGGCTATGAGATAA
CAAGACAGGCACTTCTATACAACCAGGGTCAAGCCGACCAGATTGTAACCGAGACTCGTC
TTTGGGACGAAGGAGCTCAGAAAACAGTAACAATGAGGAAGAAAGAAGGGCTAGCTGATT
ACCGCTACTTCCCAGAACCAGATCTTCCTGAAGTGATCCTCACCCAAGAATACGTTGATA
GCATCCGTGCCTCTTTACCGGAACTTCCTGAGGCAAAGCGCAGGAGGTATGAGGCAATGG
GTTTAGGTATTCAAGATGTGCTTTTCCTTGCCAATGACGTCAGTGTTGCAGAATATTTCG
ATCAAGTGATTGGTAAAGGTGCTGATGTTAAGTCGGCAGCAAATTGGCTGATGAGTGATA
TAGCCGCTTACTTGAAAAATGAGGAACTTTCTATCAGTGATGTCAAACTTACTCCTCAAG
AGTTGGCTGAGCTGATAGCTGCAATCAAAGATGAAACCATTAGCGGAAAGATTGGTAAAC
AGATTCTGTTTGAGCTATTGGCCAAAGGTGGAACTGTTCAAGGAATGATTAAGGAAAAAG
ACTTGGTTCAGATAACCGATCCTGTGGAGATTGAGAAGATGATTATGAAAGTGATCTCCG
AATCCCCAAAGCAACTTGAGCAGTACCGAAGTGG

QA 1 694 1 694
DS 

RD RS1E580JQ 790 0 0
AGTGATCCTCACCCAAGAATACGTTGATAGCATCCGTGCCTCTTTACCGGAACTTC*TGA
GGCAAAGCGCAGGAGGTATGAGGCAATGGGTTTAGGTATTCAAGATGTGCTTTTCCTTGC
CAATGACGTCAGTGTTGCAGAATATTTCGATCAAGTGATTGGTAAAGGTGCTGATGTTAA
GTCGGCAGCAAATTGGCTGATGAGTGATATAGCCGCTTACTTGAAAAATGAGGAACTTTC
TATCAGTGATGTCAAACTTACTCCTCAAGAGTTGGCTGAGCTGATAGCTGCAATCAAAGA
TGAAACCATTAGCGGAAAGATTGGTAAACAGATTCTGTTTGAGCTATTGGCCAAAGGTGG
AACTGTTCAAGGAATGATTAAGGAAAAAGACTTGGTTCAGATAACCGATCCTGTGGAGAT
TGAGAAGATGATTATGAAGGTGATCTCCGAATCCCCAAAGCAACTTGAGCAGTACCGAAG
TGGGAGGACCAAGCTTCAAGGCTTTTTTTGCTGGCCAGGTAATGAAAATGTCAAAAGGTA
AAGCAAACCCTGCTTTGCTTAACAAGATTCTCCTGGAGAAACTCGATGCCAAGGAGTGAT
GATTGATTAAAACGCACAAAATTGGAGATGCGATTAGTGAAAGTGTTGTATTGAGTTAAA
ACGGTTGTTCTTTAGAAATTTTTTGTTGAATTTGTTAAGTTTCACAGAGTCTTGTAATGG
CAATACAATGCACAATGAATTGGTACAGATGATTCTGTTGGAACATGAAATAAAAAAGCT
TAGATTTTGC

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 2

CO CL4210Contig1 1063 2 2 U
GTTTGGGACGGGTTCGGAATCTATCGAGTTCGGTCGGGGTTAATAAATCTTCAAAGAACC
GGTATAACCCAATATACTTTCGGGTTCGGATCCCAATCGGTTTTTCGGTTTTAAAATATA
TGATTTGTACTTACTTTGTAACCTAAACATAAGTAAAATCGGTTTTTATTGGGTTTCAAA
TACTTAATTTTTACATTTTTGTAACCAAAACATAAGTAAAATCGATTTAAAAATAAGAAA
GGAGCGTCAACCATGATAATTCAAAATCAAACGAAAAGTAAACATATTTATTGATAAAAA
GAAAACCAAATACAGTTAAACCTCTATAAATTAATAATGTTGGGACTACAATAAAACTAT
AATTTTTTATTAATTTAAAGAAGTTATTAATTTATCGATATACTAACTGAATCAAAAATT
CAATTTAGGACTATAAAAATTATATTATTTTATAGAGATTTTTAGTATATATTAATTTAT
AGAGTATTAATTTAAAGAGGTTATACTGTAGATGAAAGCATAAAACGAAAACCACACTCT
CATGAAATAAAAAAAAAATATTGTTTAATGAAAACAAAATCTAAATCTAAATATTTCAAA
TTCAACAGTCACCTTTAACCATTAACTTTCATGTAATAGATAATTATTTTAGATGTTCAA
TATATCTTAATATATTTTAAATACATATTAGGTTTTGAGATCATATTTAATACATATCTG
TATGGGGTTTTGAATGTTTCGGATTTTATCAGATGTCTATTTAGATTCGGGTTTGGTTTG
GATAATACCTATAACCCAAAATACCATAAAACAAAATCCATTCGGTATTTATATCGGGTT
CGGATTGTGCTGGATTCATTTTTTATCAGATCAGATTCGGTTCGGATTTTTGGGTTCGGT
TTATTTGCCCATCCCTAATACAAAGTACAAATTTGTTAGGAGTTCGACAATCAGCCAACA
GCTAATCTAAAACGATTTATTGTATTTTTTTTGTGTATTTTTGGGTGAGTATGGTGAAAT
AATTTTTGGCAGGTCCAAAACTAACTTTGGCAGATAAAATACG


BQ
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AF RS1BZ72TF U 1
AF RS1BZ72JQ C 377
BS 1 671 RS1BZ72TF
BS 672 1063 RS1BZ72JQ

RD RS1BZ72TF 671 0 0
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GGTATAACCCAATATACTTTCGGGTTCGGATCCCAATCGGTTTTTCGGTTTTAAAATATA
TGATTTGTACTTACTTTGTAACCTAAACATAAGTAAAATCGGTTTTTATTGGGTTTCAAA
TACTTAATTTTTACATTTTTGTAACCAAAACATAAGTAAAATCGATTTAAAAATAAGAAA
GGAGCGTCAACCATGATAATTCAAAATCAAACGAAAAGTAAACATATTTATTGATAAAAA
GAAAACCAAATACAGTTAAACCTCTATAAATTAATAATGTTGGGACTACAATAAAACTAT
AATTTTTTATTAATTTAAAGAAGTTATTAATTTATCGATATACTAACTGAATCAAAAATT
CAATTTAGGACTATAAAAATTATATTATTTTATAGAGATTTTTAGTATATATTAATTTAT
AGAGTATTAATTTAAAGAGGTTATACTGTAGATGAAAGCATAAAACGAAAACCACACTCT
CATGAAATAAAAAAAAAATATTGTTTAATGAAAACAAAATCTAAATCTAAATATTTCAAA
TTCAACAGTCACCTTTAACCATTAACTTTCATGTAATAGATAATTATTTTAGATGTTCAA
TATATCTTAAT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1BZ72JQ 687 0 0
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AAATTATATTATTTTATAGAGATTTTTAGTATATATTAATTTATAGAGTATTAATTTAAA
GAGGTTATACTGTAGATGAAAGCATAAAACGAAAACCACACTCTCATGAAATAAAAAAAA
AATATTGTTTAATGAAAACAAAATCTAAATCTAAATATTTCAAATTCAACAGTCACCTTT
AACCATTAACTTTCATGTAATAGATAATTATTTTAGATGTTCAATATATCTTAATATATT
TTAAATACATATTAGGTTTTGAGATCATATTTAATACATATCTGTATGGGGTTTTGAATG
TTTCGGATTTTATCAGATGTCTATTTAGATTCGGGTTTGGTTTGGATAATACCTATAACC
CAAAATACCATAAAACAAAATCCATTCGGTATTTATATCGGGTTCGGATTGTGCTGGATT
CATTTTTTATCAGATCAGATTCGGTTCGGATTTTTGGGTTCGGTTTATTTGCCCATCCCT
AATACAAAGTACAAATTTGTTAGGAGTTCGACAATCAGCCAACAGCTAATCTAAAACGAT
TTATTGTATTTTTTTTGTGTATTTTTGGGTGAGTATGGTGAAATAATTTTTGGCAGGTCC
AAAACTAACTTTGGCAGATAAAATACG

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

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ACCATTGTTGCAACTTTCATTGCTCACCCTGATGATGTTGAGGATGATGATGATGGACTT
GACATGGAAGATGTTAAGCTCGAGACTTACTGAAAACTGTGAATCTCCCTGGTGGTAATT
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CAACTAAAATTGATGAAATTAGTAACCTTTATC


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AF RS1DI36JQ C 1
AF RS1DI36TF U 1
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ACCATTGTTGCAACTTTCATTGCTCACCCTGATGATGTTGAGGATGATGATGATGGACTT
GACATGGAAGATGTTAAGCTCGAGACTTACTGAAAACTGTGAATCTCCCTGGTGGTAATT
AGTTTGTTTAGAGTAATTCCAACCGTGGATATGAAACCTTAGATTGTTTACTTACTTGGT
CAACTAAAATTGATGAAATTAGTAACCTTTATC

QA 1 393 1 393
DS 

RD RS1DI36TF 393 0 0
GAGGATATGACGGAAGCTGAAGCGGAAATACTGATGAAGTTCGGTTGGGTTGCGAACACG
GGACTAGGGACAATGCTAAACTACCGTGACAGAGTGTTTCATGACAGGAAGAGCCATAAA
GAGTCATCAGAATGGAAATCTAAGATATCTAAGCTTCTTGTTGACGGCTATAACAGTGGG
ACCATTGTTGCAACTTTCATTGCTCACCCTGATGATGTTGAGGATGATGATGATGGACTT
GACATGGAAGATGTTAAGCTCGAGACTTACTGAAAACTGTGAATCTCCCTGGTGGTAATT
AGTTTGTTTAGAGTAATTCCAACCGTGGATATGAAACCTTAGATTGTTTACTTACTTGGT
CAACTAAAATTGATGAAATTAGTAACCTTTATC

QA 1 393 1 393
DS 



AS 1 2

CO CL4212Contig1 776 2 10 U
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GGAATTTTCTCACCGCCATATCCACCATAATAACACCTGCAACCTCCCCCCTTATTTCTC
TGCTCCGACATATTTATTCTCTATCATCATCTCTCTCTCTTCAGAAAATCGGTCAAATTC
TCAAAACACACCTCAAAAGTCTCTCTCTTTGGAGGGTTTAAGAATTAAGACCCTCCATGG
ACGGCGGCGGAGTAGCTGACGTGGCAGTGGCCATGACGACGAGGAAGAGGGAGAGACCTT
ACAAGGGCATAAGGATGAGGAAGTGGGGAAAATGGGTTGCGGAGATTCGAGAGCCTAACA
AGCGGACAAGGCTATGGCTCGGCTCTTACTCCACTCCCGAGGCGGCGGCGAGAGCCTACG
ACACGGCGGTTTTCTACCTCAGAGGACCGACGGCGAGGCTTAACTTCCCTGAGCTTCTCA
ACGGAGAGAAATTCTCAGAGGAGGACATGTCGGGTGATACGATTAGGAAAAAGGCGACGG
AGGTCGGTGCTCAGGTAGACGCTTTGGGCACGGCGGTGCTAAATAACCGCCACCGTGTGT
TTGGTCAGAGCAGAGAGAGTGATGATGATAGTAGCAAGAAATATCATCGGAATTATCAAA
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TTGACTTGAATAAGTTACCCGACCCGGAAAGCTCCGATGACTAAGACTGGGAAAGG


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AF RS1A904TF U 1
AF RS1CV06TF U 120
BS 1 142 RS1A904TF
BS 143 143 RS1CV06TF
BS 144 258 RS1A904TF
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BS 505 639 RS1A904TF
BS 640 776 RS1CV06TF

RD RS1A904TF 639 0 0
GGGAAATCCAACTAAATACAACTATCTTCTCTCTTTACTTTTTTTTTTGTCGGTGAATTT
GGAATTTTCTCACCGCCATATCCACCATAATAACACCTGCAACCTCCCCCCTTATTTCTC
TGCTCCGACATATTTATTCTCTGTCATCATCTCTCTCTCTTCAGAAAATCGGTCAAATTC
TCAAAACACACCTCAAAAGTCTCTCTCTTTGGAGGGTTTAAGAATTAAGACCCTCCATGG
ACGGCGGCGGAGTAGCTG***TGGCAGTGGCCATGACGACGAGGAAGAGGGAGATACCTT
ACAAGGGCATAAGGATGAGGAAGTGGGGAAAATGGGTTGCGGAGATTCGAGAGCCTAACA
AGCGGACAAGGCTATGGCTCGGCTCTTACTCCACTCCCGAGGCGGCGGCGAGAGCCTACG
ACACGGCGGTTTTCTACCTCAGAGGACCGACGGCGAGGCTTAACTTCCCTGAGCTTCTCA
ACGGAGAGAAATTCTCAGAGG***ACATGTCGGGTGATACGATTAGGAAAAAGGCGACGG
AGGTCGGTGCTCAGGTAGACGCTTTGGGCACGGCGGTGCTAAATAACCGCCACCGTGTGT
TTGGTCAGAGCAGAGAGAGTGATGATGATAGTAGCAAGA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RS1CV06TF 657 0 0
GG
GCTCCGACATATTTATTCTCTATCATCATCTCTCTCTCTTCAGAAAATCGGTCAAATTCT
CAAAACACACCTCAAAAGTCTCTCTCTTTGGAGGGTTTAAGAATTAAGATCCTCCATGGA
CGGCGGCGGAGTAGCTGACGTGGCAGTGGCCATGACGACTAGGAAGAGGGAGAGACCTTA
CAAGGGCATAAGGATGAGGAAGTGGGGAAAATGGGTTGCGGAGATTCGAGAGCCTAACAA
GCGGACAAGGCTATGGCTCGGCTCTTACTCCACTCCCGAGGCGGCGGCGAGAGCCTACGA
CACGGCGGTTTTCTACCTCAGAGGACCGACGGCGAGGCTTAACTTCCCTGAGCTTCTCAA
CGGAGAGAAATTCTCAGAGGAGGACATGTCGGGTGATACGATTAGGAAAAAGGCGACGGA
GGTCGGTGCTCAGGTAGACGCTTTGGGCACGGCGGTGCTAAATAACCGCCACCGTGTGTT
TGGTCAGAGCAGAGAGAGTGATGATGATAGTAGCAAGAAATATCATCGGAATTATCAAAA
CGGTGAGTTGGAAGAGGATGATAAGAGTTTGAAAAGTGGCGGCTGGTTATTGGAGCGGGT
TGACTTGAATAAGTTACCCGACCCGGAAAGCTCCGATGACTAAGACTGGGAAAGG

QA 3 657 3 657
DS 



AS 1 2

CO CL4213Contig1 1085 2 2 U
ACCAATGCAAATCTTCTGTCACTGTTCTGAAGTTTGGCCATATGAGTTCTGATCTACTTG
CATATGGAGCATCAGATGGAACCTTAACTGTTTGTACTCTCTCGAAGAGCCCTTGTCCTT
AAGCAGTTGACAGGCCACTCTAAAGATGTCACAGATTTTGACTTCTCGTCAAACAATCGG
TACATTGCGTCTTCATCACTTGATAAGACAATACGAGTATGGGAGTTGTCAAGAGGTGTT
TGTATTAGAGTTATATATGGAGTCTCTGCACAGTTTTGTATACGTTTTCACCCTGTTAAT
AACAATTTCCTTTCTGCTGGAAATGCAAACAAGGAAGTCACGGTGTTCAATTTCAGCACT
GGGAGAACTATTAAAACACTGTCGTTCGAGGGTGAGGTGACAGCTATGGACCATGACCAC
ACTGGCCAAATCATTTTCTGTGGTGATGGACAGGGAACTGTATATTCAGTGAGCATGGAT
TCTCATTCGGGTTCATTATCCCGGTCTCATCGCCATCGTACTAATCACAAATCCCCGGTC
ACAACTGTGAAGTATCGAAGCTTCTCCCTCCTGGCATCAGGTCCTGTACTTCTCACATGT
ACTCAGGATGGAAACTTATGTTTCTTCAGTGTTGCGCTTCAGATAAAAGGCTACCTGACA
TTACGTTGCTCCCTCAAATTGGCCCCGAGGATACACAGAATCCAGGCATCGTTTTGCCCA
CTTTTATCCCTAGAGAAAGGAGAGTACATAGTTGCTGGGAGCGAAGACTCGAATGTCTAC
TTCTACGATCTAACCAAACCGAAACACACATGTGTAAACAAGCTACAGGGTCACAGGTTT
CCAGTTATGTGCGTTGCGTGGAACCATGGAGAGAACTTGTTGGCCTCGTCTGATTTTTAC
GGTGTTGTTATTGTATGGAAAAGAGCAAAGACAAGCTCATGAGGTTTGTCTATAATCAGT
ATAAACGAATCGAAATCTGCCAGCCAGTTTTGCCAGTAAAGGATTTTGGTTTCTTGCTTC
ATCTCTGTATCGCTAATCTTAACCATGTGAATTTTCGTTTATAAGTTCTAATTGTGAAAA
CTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RS1A778TF U 1
AF RS1A778JQ C 164
BS 1 647 RS1A778TF
BS 648 1085 RS1A778JQ

RD RS1A778TF 647 0 0
ACCAATGCAAATCTTCTGTCACTGTTCTGAAGTTTGGCCATATGAGTTCTGATCTACTTG
CATATGGAGCATCAGATGGAACCTTAACTGTTTGTACTCTCTCGAAGAGCCCTTGTCCTT
AAGCAGTTGACAGGCCACTCTAAAGATGTCACAGATTTTGACTTCTCGTCAAACAATCGG
TACATTGCGTCTTCATCACTTGATAAGACAATACGAGTATGGGAGTTGTCAAGAGGTGTT
TGTATTAGAGTTATATATGGAGTCTCTGCACAGTTTTGTATACGTTTTCACCCTGTTAAT
AACAATTTCCTTTCTGCTGGAAATGCAAACAAGGAAGTCACGGTGTTCAATTTCAGCACT
GGGAGAACTATTAAAACACTGTCGTTCGAGGGTGAGGTGACAGCTATGGACCATGACCAC
ACTGGCCAAATCATTTTCTGTGGTGATGGACAGGGAACTGTATATTCAGTGAGCATGGAT
TCTCATTCGGGTTCATTATCCCGGTCTCATCGCCATCGTACTAATCACAAATCCCCGGTC
ACAACTGTGAAGTATCGAAGCTTCTCCCTCCTGGCATCAGGTCCTGTACTTCTCACATGT
ACTCAGGATGGAAACTTATGTTTCTTCAGTGTTGCGCTTCAGATAAA

QA 1 647 1 647
DS 

RD RS1A778JQ 922 0 0
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AGTTGTCAAGAGGTGTTTGTATTAGAGTTATATATGGAGTCTCTGCACAGTTTTGTATAC
GTTTTCACC*TGTTAATAACAATTTCCTTTCTGCTGGAAATGCAAACAAGGAAGTCACGG
TGTTCAATTTCAGCACTGGGAGAACTATTAAAACACTGTCGTTCGAGGGTGAGGTGACAG
CTATGGACCATGACCACACTGGCCAAATCATTTTCTGTGGTGATGGACAGGGAACTGTAT
ATTCAGTGAGCATGGATTCTCATTCGGGTTCATTATCCCGGTCTCATCGCCATCGTACTA
ATCACAAATCCCCGGTCACAACTGTGAAGTATCGAAGCTTCTCCCTCCTGGCATCAGGTC
CTGTACTTCTCACATGTACTCAGGATGGAAACTTATGTTTCTTCAGTGTTGCGCTTCAGA
TAAAAGGCTACCTGACATTACGTTGCTCCCTCAAATTGGCCCCGAGGATACACAGAATCC
AGGCATCGTTTTGCCCACTTTTATCCCTAGAGAAAGGAGAGTACATAGTTGCTGGGAGCG
AAGACTCGAATGTCTACTTCTACGATCTAACCAAACCGAAACACACATGTGTAAACAAGC
TACAGGGTCACAGGTTTCCAGTTATGTGCGTTGCGTGGAACCATGGAGAGAACTTGTTGG
CCTCGTCTGATTTTTACGGTGTTGTTATTGTATGGAAAAGAGCAAAGACAAGCTCATGAG
GTTTGTCTATAATCAGTATAAACGAATCGAAATCTGCCAGCCAGTTTTGCCAGTAAAGGA
TTTTGGTTTCTTGCTTCATCTCTGTATCGCTAATCTTAACCATGTGAATTTTCGTTTATA
AGTTCTAATTGTGAAAACTTCG

QA 1 922 1 922
DS 



AS 1 2

CO CL4214Contig1 852 2 6 U
GGAAGAAACATCATGGCATTTCCTGAAACCCATCTCCATATGCCCATCAGATCTATAAGT
CTACCATCAAGAATACACCATCCTTCTGATAAGTTTCAAGCTGCTCTCTCTTAACTTCAG
ACTTGCCAAAACTCATCCTATGACTCTCAATCTCTTCAAGTATCATTATTCAATCTATCC
GAGCTTTACCATTCTCTACACCAGCTCAACCACTCTCTTCCCACCCCTCAAGCCGAACAT
TCTCTTGACGTGTCAGCCACGTTACTAGATTCTTGTGAAGCAGCGAGAAACCTAATCCTC
ACTCTCAGAGAACATCTCCGCAACCTTCAGTCTGCACTTAGGAGAACAGGAAAATCCATG
GACGTTCAGATCAAAGAGTACTTTGTCTTCAGAAAAAAGATCAAGAAAGAGACTAGCAAG
ATTATTCTTGGCCTAAAGAAGCTGGATGGCTCTGAGACCACCGCGTTTGCCGTTTCTCTC
TTGAGGTCTCTTTTCATGTTTCTGTCCACAACAACGTCTATGAAGACAAATACATGTACT
CTCAAATTCTTGTCTAAACTTATTGGTGGGGGTCGTTCATCGTCGTCAATAACGAGCGAG
TTGCAGAATCTTGATTTGGTTTTGCGTTCGGATGGAGACAACTCCAAGGAAGTGAAGAAG
ACTCTGGAGTTATTAGAGGAAAGAACAGAAGGACTTGAAGCTGCACTTGATTCTCTTTTC
AAGTCTCTTGTCCAATATAGAGTTTATTTGCTTAACATTCTTACAACACATTCTTAGTTT
GTTTAGTACTAATTAGCTAATTAGTCTCTAATTGTACACAAAACATATATAGAAATACAT
ACAAGTTCTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BF68TF U 1
AF RS1BF68JQ C 200
BS 1 648 RS1BF68TF
BS 649 649 RS1BF68JQ
BS 650 658 RS1BF68TF
BS 659 659 RS1BF68JQ
BS 660 672 RS1BF68TF
BS 673 852 RS1BF68JQ

RD RS1BF68TF 672 0 0
GGAAGAAACATCATGGCATTTCCTGAAACCCATCTCCATATGCCCATCAGATCTATAAGT
CTACCATCAAGAATACACCATCCTTCTGATAAGTTTCAAGCTGCTCTCTCTTAACTTCAG
ACTTGCCAAAACTCATCCTATGACTCTCAATCTCTTCAAGTATCATTATTCAATCTATCC
GAGCTTTACCATTCTCTACACCAGCTCAACCACTCTCTTCCCACCCCTCAAGCCGAACAT
TCTCTTGACGTGTCAGCCACGTTACTAGATTCTTGTGAAGCAGCGAGAAACCTAATCCTC
ACTCTCAGAGAACATCTCCGCAACCTTCAGTCTGCACTTAGGAGAACAGGAAAATCCATG
GACGTTCAGATCAAAGAGTACTTTGTCTTCAGAAAAAAGATCAAGAAAGAGACTAGCAAG
ATTATTCTTGGCCTAAAGAAGCTGGATGGCTCTGAGACCACCGCGTTTGCCGTTTCTCTC
TTGAGGTCTCTTTTCATGTTTCTGTCCACAACAACGTCTATGAAGACAAATACATGTACT
CTCAAATTCTTGTCTAAACTTATTGGTGGGGGTCGTTCATCGTCGTCAATAACGAGCGAG
TTGCAGAATCTTGATTTGGTTTTGCGTTCGGATGGAGACAACTCCAAG*AAGTGAAGA*G
ACTCTGGAGTTA

QA 1 672 1 672
DS 

RD RS1BF68JQ 653 0 0
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CGTTACTAGATTCTTGTGAAGCAGCGAGAAACCTAATCCTCACTCTCAGAGAACATCTCC
GCAACCTTCAGTCTGCACTTAGGAGAACAGGAAAATCCATGGACGTTCAGATCAAAGAGT
ACTTTGTCTTCAGAAAAAAGATCAAGAAAGAGACTAGCAAGATTATTCTTGGCCTAAAGA
AGCTGGATGGCTCTGAGACCACCGCGTTTGCCGTTTCTCTCTTGAGGTCTCTTTTCATGT
TTCTGTCCACAACAACGTCTATGAAGACAAATACATGTACTCTCAAATTCTTGTCTAAAC
TTATTGGTGGGGGTCGTTCATCGTCGTCAATAACGAGCGAGTTGCAGAATCTTGATTTGG
TTTTGCGTTCGGATGGAGACAACTCCAAGGAAGTGAAGAAGACTCTGGAGTTATTAGAGG
AAAGAACAGAAGGACTTGAAGCTGCACTTGATTCTCTTTTCAAGTCTCTTGTCCAATATA
GAGTTTATTTGCTTAACATTCTTACAACACATTCTTAGTTTGTTTAGTACTAATTAGCTA
ATTAGTCTCTAATTGTACACAAAACATATATAGAAATACATACAAGTTCTCAT

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 2

CO CL4215Contig1 927 2 2 U
TTTTTATTTCAGATCGAGTCAAAAGCTCAAAACTCCAAAAAGAAAGATTGAAAAGAGAAA
CGCATCGTGGGTCTGAGCAACAAGACAAATCTTGAAGGTAAGTGATCAAGTTTTCTGGTT
TCCTCTGTTTCCCAAGCATACTTCAAAGATGGCTCGTCTGTTACTTGAGCCGCAAGCAAA
CGCACCGGCCGAAGTAAACCCTAAAGCCAGAACAGGCTTTAACGACACCTACTTCGACAC
TAATATGGTCATTATTTTAGCCGCTCTGCTCTGCGCTCTGATATGTGCTCTAAGCCTCAA
CTCCGCCTTGCGATGTGTGCTACGCATCACAAGCAGATTCACACCGGATCAAGACGCAGC
CGCTTCAAACGCAAACGTAAACGCAAATACTGGACGTTTAGCGGCTACCACGGGGCTCAA
GAAACGGGCGTTGAAACAAATCCCCGTGGGGTTGTACGGATCAGGGATCATTAACATGAA
AGCTACAGAGTGTTTGATCTGTCTCGGGGATTTCGTGGAAGGAGAGAAAGTTAGGGTTTT
GCCAAAATGTAACCATGGCTTTCACGTGAGGTGCATCGACACTTGGTTGCTTTCACGTGA
CTCTTGTCCTACTTGCAGACAATCTCTTGCCCTTGAGTAACCGTCGCCAATTGGTTGTAG
TTCTCGCCGGGATGATGACGTGGCAGTTTCTGTCGTAGGGTCATAACTTGATGGTTATTT
ATAAACTTTGCTGTGTCTCAGGTGTGATTGGTTGGTTACGTAATATTGTTTCTTATTTTA
CTAGGTCTAAGTTGATGTGATTGTTTGCACATGTATATTCTTGTGCGTTGGTGATTTTTG
TTTGATTGGTTTGGAACTTTGATTTTTTCTTTTTTGAAAATTCGTAAATTTGGAACTTGA
ATTGTAACAGAATGTATTTTTTTTGTT


BQ
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AF RS1GD24TF U 1
AF RS1GD24JQ C 274
BS 1 737 RS1GD24TF
BS 738 927 RS1GD24JQ

RD RS1GD24TF 737 0 0
TTTTTATTTCAGATCGAGTCAAAAGCTCAAAACTCCAAAAAGAAAGATTGAAAAGAGAAA
CGCATCGTGGGTCTGAGCAACAAGACAAATCTTGAAGGTAAGTGATCAAGTTTTCTGGTT
TCCTCTGTTTCCCAAGCATACTTCAAAGATGGCTCGTCTGTTACTTGAGCCGCAAGCAAA
CGCACCGGCCGAAGTAAACCCTAAAGCCAGAACAGGCTTTAACGACACCTACTTCGACAC
TAATATGGTCATTATTTTAGCCGCTCTGCTCTGCGCTCTGATATGTGCTCTAAGCCTCAA
CTCCGCCTTGCGATGTGTGCTACGCATCACAAGCAGATTCACACCGGATCAAGACGCAGC
CGCTTCAAACGCAAACGTAAACGCAAATACTGGACGTTTAGCGGCTACCACGGGGCTCAA
GAAACGGGCGTTGAAACAAATCCCCGTGGGGTTGTACGGATCAGGGATCATTAACATGAA
AGCTACAGAGTGTTTGATCTGTCTCGGGGATTTCGTGGAAGGAGAGAAAGTTAGGGTTTT
GCCAAAATGTAACCATGGCTTTCACGTGAGGTGCATCGACACTTGGTTGCTTTCACGTGA
CTCTTGTCCTACTTGCAGACAATCTCTTGCCCTTGAGTAACCGTCGCCAATTGGTTGTAG
TTCTCGCCGGGATGATGACGTGGCAGTTTCTGTCGTAGGGTCATAACTTGATGGTTATTT
ATAAACTTTGCTGTGTC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RS1GD24JQ 654 0 0
CGCTCTGATATGTGCTCTAAGCCTCAACTCCGCCTTGCGATGTGTGCTACGCATCACAAG
CAGATTCACACCGGATCAAGACGCAGCCGCTTCAAACGCAAACGTAAACGCAAATACTGG
ACGTTTAGCGGCTACCACGGGGCTCAAGAAACGGGCGTTGAAACAAATCCCCGTGGGGTT
GTACGGATCAGGGATCATTAACATGAAAGCTACAGAGTGTTTGATCTGTCTCGGGGATTT
CGTGGAAGGAGAGAAAGTTAGGGTTTTGCCAAAATGTAACCATGGCTTTCACGTGAGGTG
CATCGACACTTGGTTGCTTTCACGTGACTCTTGTCCTACTTGCAGACAATCTCTTGCCCT
TGAGTAACCGTCGCCAATTGGTTGTAGTTCTCGCCGGGATGATGACGTGGCAGTTTCTGT
CGTAGGGTCATAACTTGATGGTTATTTATAAACTTTGCTGTGTCTCAGGTGTGATTGGTT
GGTTACGTAATATTGTTTCTTATTTTACTAGGTCTAAGTTGATGTGATTGTTTGCACATG
TATATTCTTGTGCGTTGGTGATTTTTGTTTGATTGGTTTGGAACTTTGATTTTTTCTTTT
TTGAAAATTCGTAAATTTGGAACTTGAATTGTAACAGAATGTATTTTTTTTGTT

QA 1 654 1 654
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4217Contig1 959 2 2 U
GGGATGATTTATCTCTCTTATTCTTGAGGTTTTGAATAGAGAGAGAGATGGGGAGGGGTA
GGGTTCAGCTGAAGAGGATAGAGAACAAGATCAACAGACAAGTTACTTTCTCAAAGAGAA
GGTCTGGTTTGCTCAAGAAAGCTCATGAGATCTCTGTTCTCTGCGATGCTGAGGTTGCTC
TCATCGTCTTCTCTTCCAAAGGCAAACTCTTCGAATATTCCACCGACTCTTGCATGGAAA
GGATACTTGAACGCTATGATCGCTATTTGTACTCAGATAGACAACTTGTTGGCCGTGACA
TTTCACAGAGTGAAAATTGGGTTCTAGAACATGCAAAGCTCAAGGCAAGAGTTGAGGTAC
TTGAGAAGAACAAGAGGAATTTCATGGGGGAAGATCTTGAATCGTTGAGTTTAAAGGAGC
TTCAAAGCTTGGAGCATCAGCTCGATGCTGCTATCAAGAGCATTAGGTCAAGAAAGAACC
AAGCCATGTTCGAATCCATATCAGCTCTCCAGAAGAAGGACAAGGCCTTGCAAGATCACA
ATAATACGCTCCTCAAAAAGATTAGAGAGAGGGAGAAGAAAACGGGTCCTCGAGAAAGAC
AATTAATCCAATGCACCAACAAGGCTACAATCCTTCAGCCCCAATACTGTTTAACCTCAT
CCAGAGATAGCTTTGTTGGGGGAGAGAACGGTGGTGCATCATCGTTGACGGAACCAAACT
CTCTTCTGCCGGCTTGGATGTTACGCCATACGACGAATAAATAGAGATATCTATATATGA
TAAGATAATTAATGCTCAATATTGATGTATGTTTTAGCTACTCTTGAAAAAATATATATG
CAATGATGGACTTACAATGTCAAGACGTATATTTACGCTGTCATTCTTAAGACCGAAGAT
TGATATTTATCTTTGTGATGATTTTTGATGAATGATGAATGATGAATTGATACTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AV55TF U 1
AF RS1AV55JQ C 200
BS 1 618 RS1AV55TF
BS 619 959 RS1AV55JQ

RD RS1AV55TF 618 0 0
GGGATGATTTATCTCTCTTATTCTTGAGGTTTTGAATAGAGAGAGAGATGGGGAGGGGTA
GGGTTCAGCTGAAGAGGATAGAGAACAAGATCAACAGACAAGTTACTTTCTCAAAGAGAA
GGTCTGGTTTGCTCAAGAAAGCTCATGAGATCTCTGTTCTCTGCGATGCTGAGGTTGCTC
TCATCGTCTTCTCTTCCAAAGGCAAACTCTTCGAATATTCCACCGACTCTTGCATGGAAA
GGATACTTGAACGCTATGATCGCTATTTGTACTCAGATAGACAACTTGTTGGCCGTGACA
TTTCACAGAGTGAAAATTGGGTTCTAGAACATGCAAAGCTCAAGGCAAGAGTTGAGGTAC
TTGAGAAGAACAAGAGGAATTTCATGGGGGAAGATCTTGAATCGTTGAGTTTAAAGGAGC
TTCAAAGCTTGGAGCATCAGCTCGATGCTGCTATCAAGAGCATTAGGTCAAGAAAGAACC
AAGCCATGTTCGAATCCATATCAGCTCTCCAGAAGAAGGACAAGGCCTTGCAAGATCACA
ATAATACGCTCCTCAAAAAGATTAGAGAGAGGGAGAAGAAAACGGGTCCTCGAGAAAGAC
AATTAATCCAATGCACCA

QA 1 618 1 618
DS 

RD RS1AV55JQ 760 0 0
AGGCAAACTCTTCGAATATTCCACCGACTCTTGCATGGAAAGGATACTTGAACGCTATGA
TCGCTATTTGTACTCAGATAGACAACTTGTTGGCCGTGACATTTCACAGAGTGAAAATTG
GGTTCTAGAACATGCAAAGCTCAAGGCAAGAGTTGAGGTACTTGAGAAGAACAAGAGGAA
TTTCATGGGGGAAGATCTTGAATCGTTGAGTTTAAAGGAGCTTCAAAGCTTGGAGCATCA
GCTCGATGCTGCTATCAAGAGCATTAGGTCAAGAAAGAACCAAGCCATGTTCGAATCCAT
ATCAGCTCTCCAGAAGAAGGACAAGGCCTTGCAAGATCACAATAATACGCTCCTCAAAAA
GATTAGAGAGAGGGAGAAGAAAACGGGTCCTCGAGAAGGACAATTAATCCAATGCACCAA
CAAGGCTACAATCCTTCAGCCCCAATACTGTTTAACCTCATCCAGAGATAGCTTTGTTGG
GGGAGAGAACGGTGGTGCATCATCGTTGACGGAACCAAACTCTCTTCTGCCGGCTTGGAT
GTTACGCCATACGACGAATAAATAGAGATATCTATATATGATAAGATAATTAATGCTCAA
TATTGATGTATGTTTTAGCTACTCTTGAAAAAATATATATGCAATGATGGACTTACAATG
TCAAGACGTATATTTACGCTGTCATTCTTAAGACCGAAGATTGATATTTATCTTTGTGAT
GATTTTTGATGAATGATGAATGATGAATTGATACTTTTTT

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

CO CL4218Contig1 974 2 4 U
GGATAACTATTTGCGTAAAAGATCAATAACAATGAAATTTTCACATTCTCTATCCAAACG
ATTTTCATTGCCTATTTTGATCCTACAATTCCTTATCATACATAGTGTTTCATCATTAAA
CCTTACCAATGATTATCTCAACCATAAATGCTTCCTTAATCAAGGGAAGTATAAGTCTGG
TAGTGAGTACGATGAAAACCTCATTTGGATCTTCAATGATATTCGTACAAGTCCTTATGA
GGTAACCGGTTTCTCACGCATAAGTGTTGGAAAAACGCCAGACGATTTTGTCGCCGTCAC
TTCCCAATGTCGTGGTGACACTTATGAGTCTAAATGTCGTACATGCATTAGTACAGCAAT
TTCAGGGTTTCGTAAGAGATGTCCGAGTAACAAAGGGGGAATAATTTGGTACGATCAATG
TCTTCTCTATATTAATACGATCAAAGAAAAAGTTCCAACCCCGATTAATTACAAGAATAT
TATTTCTATGCACAACCCAAATAACGTGAGAGGGGATGCAAAACTGTTTGCTATGAGGGT
GATGGATTTTTTCTCTAAGCTAACACTTAAAGTCAAAAAGACCGCCAAGTATAGCCTCAT
ACTTTATGCGGCAGGGGAAAAAAAGCTCGGAAAAAATAAATTATATGCAATGGTGCAATG
TTTAGAGCTATCAATGAATTGCAAAAGTTGTTTGACATGGAGTATCTCAAAGCTTTTCAA
GAACGAGATTAAACAAGGAGCGAGAGTTTTGGGTACGAACTGTGACGTAAGGTATGAGCT
ATACCCTTTTCTTAGAAGTTAAACATTTTTAAGTTATGTTTTATATTTACTTCTTTTTTT
GCTGAAAGGTAATATCTATTATATATCAATAAAAAGAGTGCTTCAAAAAAAAGATCCAAC
AAAATTGTGTAGAAGTTTAAAATTGAATATTAACAATGATTTTTAACTGACTTGGAATTC
TTGAACCTATAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D346TF U 1
AF RS1D346JQ C 201
BS 1 578 RS1D346TF
BS 579 579 RS1D346JQ
BS 580 605 RS1D346TF
BS 606 974 RS1D346JQ

RD RS1D346TF 605 0 0
GGATAACTATTTGCGTAAAAGATCAATAACAATGAAATTTTCACATTCTCTATCCAAACG
ATTTTCATTGCCTATTTTGATCCTACAATTCCTTATCATACATAGTGTTTCATCATTAAA
CCTTACCAATGATTATCTCAACCATAAATGCTTCCTTAATCAAGGGAAGTATAAGTCTGG
TAGTGAGTACGATGAAAACCTCATTTGGATCTTCAATGATATTCGTACAAGTCCTTATGA
GGTAACCGGTTTCTCACGCATAAGTGTTGGAAAAACGCCAGACGATTTTGTCGCCGTCAC
TTCCCAATGTCGTGGTGACACTTATGAGTCTAAATGTCGTACATGCATTAGTACAGCAAT
TTCAGGGTTTCGTAAGAGATGTCCGAGTAACAAAGGGGGAATAATTTGGTACGATCAATG
TCTTCTCTATATTAATACGATCAAAGAAAAAGTTCCAACCCCGATTAATTACAAGAATAT
TATTTCTATGCACAACCCAAATAACGTGAGAGGGGATGCAAAACTGTTTGCTATGAGGGT
GATGGATTTTTTCTCTAAGCTAACACTTAAAGTCAAAA*GACCGCCAAGTATAGCCTCAT
ACTTT

QA 1 605 1 605
DS 

RD RS1D346JQ 774 0 0
TCATTTGGATCTTCAATGATATTCGTACAAGTCCTTATGAGGTAACCGGTTTCTCACGCA
TAAGTGTTGGAAAAACGCCAGACGATTTTGTCGCCGTCACTTCCCAATGTCGTGGTGACA
CTTATGAGTCTAAATGTCGTACATGCATTAGTACAGCAATTTCAGGGTTTCGTAAGAGAT
GTCCGAGTAACAAAGGGGGAATAATTTGGTACGATCAATGTCTTCTCTATATTAATACGA
TCAAAGAAAAAGTTCCAACCCCGATTAATTACAAGAATATTATTTCTATGCACAACCCAA
ATAACGTGAGAGGGGATGCAAAACTGTTTGCTATGAGGGTGATGGATTTTTTCTTTAAGC
TAACACTTAAAGTCAAAAAGACCGCCAAGTATAGCCTCATACTTTATGCGGCAGGGGAAA
AAAAGCTCGGAAAAAATAAATTATATGCAATGGTGCAATGTTTAGAGCTATCAATGAATT
GCAAAAGTTGTTTGACATGGAGTATCTCAAAGCTTTTCAAGAACGAGATTAAACAAGGAG
CGAGAGTTTTGGGTACGAACTGTGACGTAAGGTATGAGCTATACCCTTTTCTTAGAAGTT
AAACATTTTTAAGTTATGTTTTATATTTACTTCTTTTTTTGCTGAAAGGTAATATCTATT
ATATATCAATAAAAAGAGTGCTTCAAAAAAAAGATCCAACAAAATTGTGTAGAAGTTTAA
AATTGAATATTAACAATGATTTTTAACTGACTTGGAATTCTTGAACCTATAACC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL4219Contig1 1389 2 6 U
TCTGGAAATCAGATCCCCGTCCTTCCGGAACAGTGCTGTTAGGAGAAAAGTCTAAACGTC
CTCGGGGGAACGAGGGATCGGTCAATCGATCTCGGGAAGTGACCCCCAGAGTTTGACGTT
GCGGTGGTTGGGTTGTTGCGTTTAGAGATCTAGTTATCTCTTCGAATCGTTGCTGCCGAG
CAGCTAACTGATGCATTGTACACTCATTTTCCTGAGCTTTGTCTACTAATTGCATCATCA
TCTGACGAATCTCAGAGAGCTGAACCTCCGTTTGATTCGGAGTGGTTTGCTGCTGAGGAT
TCTCGGTGCCTGGAAGCTCGGAGACGGTTCCACCTGATGATCTCGGGTTAGTAACTCCAG
TGGTAGTCTGGCTCGTTCGAGCGCTAGCCGGAAGCTGTTGCCCAGATCGGTGATCGCCAC
GTCGAAGCTCCGGAATTACGAGACTAGAACCTCACATTAAAAATATCAATGTTTTTAAAA
TGTGCATGTTTTAGAGTTTTCAAATTAAAAATATCAATTATGATTATAAAATGTATTGTT
TTATGTAAGTATATATTTCTCGTAATTTTAAACATATAAATTTATATAAATTTAGTAAAG
ACAATTAATTTTTAAAGTTTACAACATTGTTTTTCTAAAACAAATGGAATAGTATTTTAT
ACGATATAAGTATTAAAATTTAATAGATTTTCTTTTATCTGGTTGAAACTCTTCAGATTA
TATGTTCATTTCTAGTTATGATATATCAATCGTACATAATAGATTTGTATGGCTATTATA
CTATGCAGAATATGGATATTCAATGAAGATAACAGAGAAGAGCGATGTGTATAGCTACGG
AGTCGTGGTCCTAGAGGTACTAACGGGGAAGCAACCGATCGATCCACAATACCAGATGGC
CTTCACATAGTAGACTGGGTCAAGAAGATCAGAGATATACAAGTGATCGACCAGGGACTA
CAAGCGAGGCCAGAGTCAGAAGTAGAAGAGGTGATGCAAACGCTAGGAGTTGCACTTTTT
TGCGTTAACCCGATACCTGAAGACAGGCCTACAATGAAAGATGTGGCTGCTATGCTCAGT
GAGATACGTCAAGAAAGAGAGGAACCGATGAAATCTGTTGGGAATAATGGTTGTTCGGGA
AGTTGTAATAACAACGGAGGAGAAGGGAGAGATGGGTCTTTATCAGGCCCGGCGTTGAAC
GAAAACATATGATACGTACGTATTGGGCCTACTATTTTTGTAAAAAAATTAGGACCTATT
TTTTTAATTGTTATTACCTAAAAATCAATTTGACAATTTGTTATGTGTAAGTTGTAGGAC
ATCACTAAAATACAAAGATAATTAAACTTTTTGTATTCTGTGTTATTAAATATGAGTGGA
TTAAAATGC


BQ
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TTT
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CAGAGATATACAAGTGATCGACCAGGGACTACAAGCGAGGCCAGAGTCAGAAGTAGAAGA
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GAAATCTGTTGGGAATAATGGTTGTTCGGGAAGTTGTAATAACAACGGAGGAGAAGGGAG
AGATGGGTCTTTATCAGGCCCGGCGTTGAACGAAAACATATGATACGTACGTATTGGGCC
TACTATTTTTGTAAAAAAATTAGGACCTATTTTTTTAATTGTTATTACCTAAAAATCAAT
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TTTGTATTCTGTGTTATTAAATATGAGTGGATTAAAATGC

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DS 



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CAGTGTTCTCCCCAGACGGCCACCTTTTTCAGGTAGAGTATGCCCTAGAAGCTGTCCGTA
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TGTTGGATCATTAGCCTGTGTTGACGACATTTTCGCTTTAAATCTTAATCGACAATTTT


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AF RS1BJ26TF U 1
AF RS1BJ26JQ C 193
BS 1 653 RS1BJ26TF
BS 654 654 RS1BJ26JQ
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BS 667 959 RS1BJ26JQ

RD RS1BJ26TF 666 0 0
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CTCGGTACATTGCTGGGCTTCAGCAGAAGTACACTCAAAGTGGGGGTGTTAGACCTTTTG
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CTGATCCATCTGGGACGTTCTCTGCTTGGAAGGCTAATGCGACCGGGAGAAACTCGAACT
CGATCAGGGAGTTTCTGGAGAAGAATTATAAAGAAACCTCTGGTCAAGAAACTGTGAAGC
TTGCTATCCGTGCTCTGCTTGAGGTTGTTGAGAGTGGGGGAAAGAACATTGAG*TTGCTC
TGATGA

QA 1 666 1 666
DS 

RD RS1BJ26JQ 767 0 0
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AAAGCCACAGGCTTACGTTGGAGGATCCCGTGACTGTCGAGTACATCACTCGGTACATTG
CTGGGCTTCAGCAGAAGTACACTCAAAGTGGGGGTGTTAGACCTTTTGGTCTTTCCACTC
TTATTGTCGGTTTTGATCCCTACACTCGTATTCCTTCGCTTTATCAGACTGATCCATCTG
GGACGTTTTCTGCTTGGAAGGCTAATGCGACCGGGAGAAACTCGAACTCGATCAGGGAGT
TTCTGGAGAAGAATTATAAAGAAACCTCTGGTCAAGAAACTGTGAAGCTTGCTATCCGTG
CTCTGCTTGAGGTTGTTGAGAGTGGGGGAAAGAACATTGAGGTTGCTCTGATGACACGGG
AGGAAGGTACTCTGAGGCAGCTAGAAGAAGCTGAAATCGATGCTATTGTGGCCGAGATCG
AAGCAGAGAAGGCTGCTGCAGAAGCAGCCAAGAAAGGCCCTTCAAAGGAAATCTGAGCAT
GATGCCAGATCTTTACAATAACGGTCTCAGTTTTCAAGTTGTAACTTTTGGTTCAAATTA
TGTTATTTTGAGGGTTGAATAGAAAATCTTGACTGCGTGAATTTGTTTTGTTGGATCATT
AGCCTGTGTTGACGACATTTTCGCTTTAAATCTTAATCGACAATTTT

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL4221Contig1 1104 2 4 U
TTTTTTTCGGCAATCTTATCGGAAGAGTAAGATTCGAGTTCGTGAATCTAGGGATCTGCA
ACAAACAATGAATCGCCACCACGATCCCAACCCTTTCGATGAGGAGGAAGAAGAAATCGT
CAATCCCTTCTCTAAAGGCGGTGGACGGGTACCTGCTGCATCTAGGCCAGCTGGATTTGG
TCAAAGCCTCGATGCTACTGTTGATATTCCCTTGGATAACATGAATGACTCTTCACAGAA
ACAGAGAAAGCTTGCTGACGGGGAAGCTGAGCTTAGGAAGAAAGAAATGGATATTAAACG
GAGAGAGGATGCTATTGCTAAATCTGGTGTTCAGATAGATGAGAAGAACTGGCCCCCGTT
TTTTCCAATCATACACCATGACATTGCTAATGAGATACCAGTTCATGCTCAGAAGCTCCA
GTACCTGGCCTTTGCTAGTTGGTTAGGTATCGTTTTGTGTCTGGTATTCAATGTGATTGC
AACCATGGTCTGCTGGATTAAAGGCGGAGGTGTGAAGATCTTTTTCCTTGCCACGATATA
TGCGCTGATGGGATGTCCACTTTCTTATGTTGTATGGTACAGGCCTCTCTACCGAGCCAT
GAGGACTGACAGCGCTTTGAAGTTTGGTTGGTTTTTCTTCACCTACTTGATTCACATTGG
CTTCTGCATCGTTGCCGCCATTGCCCCGCCAATCTTTTTCCATGGAAAATCATTAACGGG
TGTGCTTGCAGCAATTGATGTCATCTCAGACAGTGTATTAGCCGGGATCTTCTACTTTAT
CGGCTTTGGTCTCTTCTGCTTGGAGTCACTTTTGAGTCTATGGGTTCTTCAGAAAATTTA
CCTCTACTTTAGGGGAAACAAGTAAAAAGAGAAGGAAGAGAGGATGGTGGTAATTTTCCC
TTTCGGGTAAAAGGTTTGAAGTATGTGCATCTCGTATGAATATAATTACATATTACCATT
GTGTTGAGGTAAATTCTTTAGTTACTATAGTTGCAAGAGTGGTTGTTCAGCTATTTCTTT
AGTGTTTTTTTTTTCTGCAATACCTTTAGTACCAGTGTCGTTCTCTGAACGTTTGGAATT
TTTTCTTGACTAAGTGAACTTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EO14TF U 1
AF RS1EO14JQ C 321
BS 1 765 RS1EO14TF
BS 766 766 RS1EO14JQ
BS 767 798 RS1EO14TF
BS 799 1104 RS1EO14JQ

RD RS1EO14TF 798 0 0
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CAATCCCTTCTCTAAAGGCGGTGGACGGGTACCTGCTGCATCTAGGCCAGCTGGATTTGG
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AACCATGGTCTGCTGGATTAAAGGCGGAGGTGTGAAGATCTTTTTCCTTGCCACGATATA
TGCGCTGATGGGATGTCCACTTTCTTATGTTGTATGGTACAGGCCTCTCTACCGAGCCAT
GAGGACTGACAGCGCTTTGAAGTTTGGTTGGTTTTTCTTCACCTACTTGATTCACATTGG
CTTCTGCATCGTTGCCGCCATTGCCCCGCCAATCTTTTTCCATGGAAAATCATTAACGGG
TGTGCTTGCAGCAATTGATGTCATCTCAGACAGTGTATTAGCCGG*ATCTTCTACTTTAT
CGGCTTTGGTCTCTTCTG

QA 1 798 1 798
DS 

RD RS1EO14JQ 784 0 0
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ACATTGCTAATGAGATACCAGTTCATGCTCAGAAGCTCCAGTACCTGGCCTTTGCTAGTT
GGTTAGGTATCGTTTTGTGTCTGGTATTCAATGTGATTGCAACCATGGTCTGCTGGATTA
AAGGCGGAGGTGTGAAGATCTTTTTCCTTGCCACGATATATGCGCTGATGGGATGTCCAC
TTTCTTATGTTGTATGGTACAGGCCTCTCTACCGAGCCATGAGGACTGACAGCGCTTTGA
AGTTTGGTTGGTTTTTCTTCACCTACTTGATTCACATTGGCTTTTGCATCGTTGCCGCCA
TTGCCCCGCCAATCTTTTTCCATGGAAAATCATTAACGGGTGTGCTTGCAGCAATTGATG
TCATCTCAGACAGTGTATTAGCCGGGATCTTCTACTTTATCGGCTTTGGTCTCTTCTGCT
TGGAGTCACTTTTGAGTCTATGGGTTCTTCAGAAAATTTACCTCTACTTTAGGGGAAACA
AGTAAAAAGAGAAGGAAGAGAGGATGGTGGTAATTTTCCCTTTCGGGTAAAAGGTTTGAA
GTATGTGCATCTCGTATGAATATAATTACATATTACCATTGTGTTGAGGTAAATTCTTTA
GTTACTATAGTTGCAAGAGTGGTTGTTCAGCTATTTCTTTAGTGTTTTTTTTTTCTGCAA
TACCTTTAGTACCAGTGTCGTTCTCTGAACGTTTGGAATTTTTTCTTGACTAAGTGAACT
TTTG

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 2

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GTTGCTCTGTTGGGTTACTGTGTGAACGGGCACGAGAGATTGCTTGTCTACGAGTACATG
CCTCAGGGGAATCTTGGACAACATTTGTTTGAGTATCAAGAACTAGGGTACTCTCCTTTG
ACGTGGAAACAAAGAGTGAGTATCGCTCTAGATTTCGCACGAGGTGTGGAATATCTCCAT
GTCTTAGCTCAGCAGAGCTCCATCCACAGAGATTTAAAGCCTTCTAACATCCTTCTTGGT
GATGACATGAGGGCAAAGGTTGCTGATTTCGGTTTGGTTAAGAATGCACCCGATGGGAAA
TACTCTGTAGACGAGATTAGCTGGCACATTCGGTTATCTAGCACCAGAATACGCCGCAAC
TGGGAGAGTAACAACGAAAGTTGATGTGTTTGCATTTGGAGTTGTTCTTATGGAGATGCT
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GTTCAGAAGAATCCTAATCAACAAAGAAAACATCTCGAAGGAACTCGACCAAACCTTAGA
GGCAGACGAGGAAACATTGGAGAGCATTCACAGGGTTACTGAGCTAGCAGGACATTGCAC
AGCCCGTGAGCCTCAACAGAGACCAGATATGGGCCACGCGGTGAACGTGTTAGGCCCACT
GGTGGAGAAGTGGAAACCGACGAGCCAGGAACAAGAAGAGAGTTTCGGGATCGATGTGGG
CAACATGAGTTTACCTCAAGCTCTACGCAGATGGCAACAAAGCGAAGGAACATCGACTTC
AATGTTCGGTGGCGACTTCTCTTACTTTCAGACACAGTCTAGCATTCCTCCTAAGCCTTC
TGGTTTTAATAGCACGTTCGATTCAACTGATGGCCGGTGACAACAAACTCTTGTGTGTTT
TCAAATCGATGTCACTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTTAAATCTTCTTATTATTTGATG
ATTATATGTCTATATACTGTTAGCACATATGTGATGTATTTGCGTCTGACCACTTGAGCT
TTTGCATTTATTCATTCGTTTAAAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1A525TF U 1
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BS 1 646 RS1A525TF
BS 647 1107 RS1A525JQ

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DS 

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AAATACTCTGTAGACGAGATTAGCTGGCACATTCGGTTATCTAGCACCAGAATACGCCGC
AACTGGGAGAGTAACAACGAAAGTTGATGTGTTTGCATTTGGAGTTGTTCTTATGGAGAT
GCTAACGGGAAGAAAAGCATTAGACGATTCACTACCAGACGAGAAGTGTCATCTAGTCAC
ATGGTTCAGAAGAATCCTAATCAACAAAGAAAACATCTCGAAGGAACTCGACCAAACCTT
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TTCAATGTTCGGTGGCGACTTCTCTTACTTTCAGACACAGTCTAGCATTCCTCCTAAGCC
TTCTGGTTTTAATAGCACGTTCGATTCAACTGATGGCCGGTGACAACAAACTCTTGTGTG
TTTTCAAATCGATGTCACTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTTAAATCTTCTTATTATTTG
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GCTTTTGCATTTATTCATTCGTTTAAAGAG

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DS 



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BQ
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AF RS1EE74JQ C 1
AF RS1EE74TF U 1
BS 1 464 RS1EE74TF

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GAATGTCGTGGTCGAGCTGAAGTACTAGAAAGCTGTCTGTGCATTAGCTTTTTTCTCTCT
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TTCTCTTTGTTGTTTCAGTACCGTTTCTATTGCATCCACATTTC

QA 1 464 1 464
DS 

RD RS1EE74TF 464 0 0
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AAGGCCAGTATGGTGGTGGTGGTGGATACTATGGGTATCCTCCTCGGGGATACGAAGGTT
ACGGATATGCACCTCCTCCTCAGGACCCTAACGCCTACTATGGTGGCTACCCTGGTGGTG
GCTATGGAAACTACCAGCAGCCAGGTGGCTACCAGCAGCAACAGCAGTGAAGCATGATGT
GAATGTCGTGGTCGAGCTGAAGTACTAGAAAGCTGTCTGTGCATTAGCTTTTTTCTCTCT
ACAACTCTTCTTTTTCTTTTGCTTTGTTTCTCTCTCTCGCGTGACAATTGTTGAGTGCCC
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TTCTCTTTGTTGTTTCAGTACCGTTTCTATTGCATCCACATTTC

QA 1 464 1 464
DS 



AS 1 2

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AAGAAGAGTAAGAAGGTTGTCAAGGAAATAGATAGCTCTTCAGTTGATGATAAGAAAAGA
CATTCTCAAGTTTCACCGAAAGCTATTTCAAATGAGAAAATCAAAGTTAAGAAGGGAAAG
TTGAACAAGACTAAGAATAAAAGGATGGCGAATGAGATATCTAGCGGCCCTGTCGATGAT
GAAGATGATCATCTGATAAAAGAAGCTTCTGACGATAAGGCTTCCAGTGAAGCTGTTAAC
ACAGACGTTGCTAATAACGGATCTGAAACAAGAAACCGAAAGTCTAAGAAATCAAACAAA
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GATGTTTATGAAATATCTTCAGGCGATGATGATTGCTCCAGAGGAATGAAAAACTGGGTT
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ATGACTGCTCACGAAGAACGCCTTGAGCAGGAGAAACGAGAGCGAGAAGCTAAAGCAGCA
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TCTGGAACAGCAGTTGGATCTGTTTCTCAGGCTGCTTTGGAAGATAAGGTTGCTAAAAAG
AAAAAGACTGAGATAGTTGGTCATGGCTTCTACCGTTTCCAGAGGCGAGATGCACAACGA
AGTGAACTCTTGGCGCTTCAGAGTAAGTTCGAGGAAGACAAGAAGAGGATACAGCAAATT
CGAGCTGCTCGTAAGTTTAAGCCTTACTAAGAAAACAAACAGATCCTACATGGATCTTTT
ATTAGAGAGGCTTGGGAGAAATACCATGAATTTTTGTACGATCAATTTTTGTAATTGACA
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AGCTTTTTTACCCTTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FF93TF U 1
AF RS1FF93JQ C 570
BS 1 750 RS1FF93TF
BS 751 751 RS1FF93JQ
BS 752 777 RS1FF93TF
BS 778 1216 RS1FF93JQ

RD RS1FF93TF 777 0 0
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TGATTCTCACGAGATATGGAAAGAGGCAAGAAGATGAAGGAAGCCAGAAAGCTCAAGACG
AGAAATCTCCACGACGCTGCAGTGGTTGAGAAAGTGCAGAGGAAGAAGAAAGAAAAAGTT
GAGTATCCTGAAGCTATCTCAACTGAGAAGCCTAATAGAAAGACGGTTGAATTGACGAAG
AAGAAGAGTAAGAAGGTTGTCAAGGAAATAGATAGCTCTTCAGTTGATGATAAGAAAAGA
CATTCTCAAGTTTCACCGAAAGCTATTTCAAATGAGAAAATCAAAGTTAAGAAGGGAAAG
TTGAACAAGACTAAGAATAAAAGGATGGCGAATGAGATATCTAGCGGCCCTGTCGATGAT
GAAGATGATCATCTGATAAAAGAAGCTTCTGACGATAAGGCTTCCAGTGAAGCTGTTAAC
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AGGAAAAAGACCTCTACAAAAGAGAATAAAACTTCTTCAGAAAAGATTGAAGAGGAGGAA
GATGTTTATGAAATATCTTCAGGCGATGATGATTGCTCCAGAGGAATGAAAAACTGGGTT
ACTGAATACCATGAGAGTAGACCCGGTTTAGAAGAGCTGCAGAAGAGAATCGATGACTTC
ATGACTGCTCACGAAGAACGCCTTGAGCAG*AGAAACGAGAGCGAGAAGCTAAAGCA

QA 1 777 1 777
DS 

RD RS1FF93JQ 647 0 0
AACTTCTTCAGAAAAGATTGAAGAGGAGGAAGATGTTTATGAAATATCTTCAGGCGATGA
TGATTGCTCCAGAGGAATGAAAAACTGGGTTACTGAATACCATGAGAGTAGACCCGGTTT
AGAAGAGCTGCAGAAGAGAATCGATGACTTCATGACTGCTCACGAAGAACGCCTTGAGCA
GGAGAAACGAGAGCGAGAAGCTAAAGCAGCAGAAGGTGGATGGACTGTGGTCGTGCATCA
CAAAGGAAGGAAAAAGACAACAGACGCTGAGTCTGGAACAGCAGTTGGATCTGTTTCTCA
GGCTGCTTTGGAAGATAAGGTTGCTAAAAAGAAAAAGACTGAGATAGTTGGTCATGGCTT
CTACCGTTTCCAGAGGCGAGATGCACAACGAAGTGAACTCTTGGCGCTTCAGAGTAAGTT
CGAGGAAGACAAGAAGAGGATACAGCAAATTCGAGCTGCTCGTAAGTTTAAGCCTTACTA
AGAAAACAAACAGATCCTACATGGATCTTTTATTAGAGAGGCTTGGGAGAAATACCATGA
ATTTTTGTACGATCAATTTTTGTAATTGACAATTTCGTGAGCTTTTGTGGGTGTAGCCTC
ATGATTTTCAGTCCGATTAAACAAAAAAGGAAGCTTTTTTACCCTTG

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 2

CO CL4225Contig1 1205 2 2 U
AGGGCACACTCTCTCTCCTCTCTGCTCTACTTTCTCTCCCTCTCTCTCTCTTTCTGAGTG
TAGGATACAAGACAATTGTCACCAAAGCGTAAAGCTGTGTGTGTGGGTTCTCCTTTCCAA
TGTTGTTTTCAGCAAATCATCAGAGAAACAATAGAGTCTCTGCTACAAGCAAGAACAAGA
CTCTCAACAAAGTCTCTTCCATTTCATCCTCATCATCTCCTTCACGCACACAAGACACTC
AGTCCCAAAAGAGATCTCTAGTCACCATGGAAGATGTTTGGAAAAGACATCAACCTTGGT
TCCATCCACAGCCAACATCCACAAGGCAACAATGAGCCAAGGTTTGGGAGCCACAGCCAC
CAGAACCAAAACCCTAACTCCATCTTCCAAGATTTTCTCAACAGGCCTTTGAACCAGGAG
CCAACAATACCCACCATGGGTTGTTCTTCCTCTAATGGAGCTACCACCACTGTAACTGCT
CTCTTGAGCAGCTCTCCTCCTTTGGCACCTCCTGCAACTGTTCTGAGCTTGAATTCTGGA
CCCGGCTTTGAGTTTCTTGATAGCCAAGATCCTCTTGTTACCCCTAACTATAATCTGCAT
AGCCACAATCACCTCAACACCTCGTTTGAAGCTCTGGTTACACCGACTTGTTTTGGTAAG
AAAAGAGGCCAAGAGTCTAATGAAGAAGGTTCAGGGAACAGGAGAAATAAGCGTATGATC
AAGAACAGAGAATCTGCAGCTCGTTCCAGAGCTAGGAAACAGGCTTATACAAACGAGTTA
GAGCTTAAAGTTGCTCAGTTGCAGGCAGAAAATGCTAGACTCATGAGACAACAAGACCAG
TTAAGAATAGCGGCGGAAAATCAGCAACAACCCAAAAAGAACACACTTCAAAGGGCTTCC
ACGGCACCATTTTGAGAAATCTACAACTACAAGTCCTCTTATTTCTCTTTTGGGGATTTA
AGTTAAAAAAATGGAAAAGTTTGTACCTATTTTATTAGCTATAAGTATAACTAAGCTAAA
TTTTTGGAACCTCAAAAGATCTTGAAGGGGAAAGAAGGTGTAAAAAAAGAAAAACCTATG
AAGGATCTTTCCATTTCCTGAGGAACAGGAACACCTGTGGTGGGTCTCTCCTCATGTTCT
TTCTTGTTCACTTCTACTTGTATTCTTGTATAAGTGATACTTTTCCTCTTCTAATGCTAA
TTTTT


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RS1AY44TF U 1
AF RS1AY44JQ C 451
BS 1 653 RS1AY44TF
BS 654 1205 RS1AY44JQ

RD RS1AY44TF 658 0 0
AGGGCACACTCTCTCTCCTCTCTGCTCTACTTTCTCTCCCTCTCTCTCTCTTTCTGAGTG
TAGGATACAAGACAATTGTCACCAAAGCGTAAAGCTGTGTGTGTGGGTTCTCCTTTCCAA
TGTTGTTTTCAGCAAATCATCAGAGAAACAATAGAGTCTCTGCTACAAGCAAGAACAAGA
CTCTCAACAAAGTCTCTTCCATTTCATCCTCATCATCTCCTTCACGCACACAAGACACTC
AGTCCCAAAAGAGATCTCTAGTCACCATGGAAGATGTTTGGAAAAGACATCAACCTTGGT
TCCATCCACAGCCAACATCCACAAGGCAACAATGAGCCAAGGTTTGGGAGCCACAGCCAC
CAGAACCAAAACCCTAACTCCATCTTCCAAGATTTTCTCAACAGGCCTTTGAACCAGGAG
CCAACAATACCCACCATGGGTTGTTCTTCCTCTAATGGAGCTACCACCACTGTAACTGCT
CTCTTGAGCAGCTCTCCTCCTTTGGCACCTCCTGCAACTGTTCTGAGCTTGAATTCTGGA
CCCGGCTTTGAGTTTCTTGATAGCCAAGATCCTCTTGTTACCCCTAACTATAATCTGCAT
AGCCACAATCACCTCAACACCTCGTTTGAAGCTCTGGTTACACCGACTTGTTT
GGTAG

QA 1 653 1 653
DS 

RD RS1AY44JQ 755 0 0
TCTAATGGAGCTACCACCACTGTAACTGCTCTCTTGAGCAGCTCTCCTCCTTTGGCACCT
CCTGCAACTGTTCTGAGCTTGAATTCTGGACCCGGCTTTGAGTTTCTTGATAGCCAAGAT
CCTCTTGTTACCCCTAACTATAATCTGCATAGCCACAATCACCTCAACACCTCGTTTGAA
GCTCTGGTTACACCGACTTGTTTTGGTAAGAAAAGAGGCCAAGAGTCTAATGAAGAAGGT
TCAGGGAACAGGAGAAATAAGCGTATGATCAAGAACAGAGAATCTGCAGCTCGTTCCAGA
GCTAGGAAACAGGCTTATACAAACGAGTTAGAGCTTAAAGTTGCTCAGTTGCAGGCAGAA
AATGCTAGACTCATGAGACAACAAGACCAGTTAAGAATAGCGGCGGAAAATCAGCAACAA
CCCAAAAAGAACACACTTCAAAGGGCTTCCACGGCACCATTTTGAGAAATCTACAACTAC
AAGTCCTCTTATTTCTCTTTTGGGGATTTAAGTTAAAAAAATGGAAAAGTTTGTACCTAT
TTTATTAGCTATAAGTATAACTAAGCTAAATTTTTGGAACCTCAAAAGATCTTGAAGGGG
AAAGAAGGTGTAAAAAAAGAAAAACCTATGAAGGATCTTTCCATTTCCTGAGGAACAGGA
ACACCTGTGGTGGGTCTCTCCTCATGTTCTTTCTTGTTCACTTCTACTTGTATTCTTGTA
TAAGTGATACTTTTCCTCTTCTAATGCTAATTTTT

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL4226Contig1 660 2 3 U
TTCAAGTTTCTCTTCTCATATAATCCAATTATGCATTTAAAGGTAAAAGAAAACTTCATC
AACAAGGAACTGGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAATTGTTAGGGCTGACTGTAGATTTATCT
TCCTCTCGAGAGAGCTTTCTCAGCAGTCTCCATCTCTTCAAGAATCCTCGCCTTCCTCTT
CGCCGGGATCGGAGCCGTCGGTCCAAAACTCACATAATGTCCAGACAAAGCATTCAACGC
CGAGTAGATATCCCTGAAAGACGCTTTCCCGAGAAGAGCTTTCTCCTTCCTGTACTTGGC
AACCCACGAGTTCGACACTTCTCTCAGCTCAGCCACCGCGTCCGCCACATTCGGATCCGT
CCTCTCCATCGAGAGCGTCGTCCGAACTTTGGAGATCACCGCCGACGTATCTTTCACGTA
CTCTTCGTCTTCGGCGGCGGAAGCGGGCGACGGAGCTAGAAACGGGAGCGATTGCGTCAG
TAGAAGCGTCGATGCGGCGGATAAGGAGAGTACATCGCGGCGGAGGAGGTTTTGGCGACG
TGGAGGAGGAAGAGGAGGAGATACGGAGGCGGTGATGACCGGTTTATGCTGCGGTGGAAC
AGGACTGGGTTTGAGAAGAGTAGCTGTCGCTGAAGCTGAAGCCATTGTCGGAACGCGCCC


BQ
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AF RS1GX64JQ U 83
AF RS1GX64TF C 1
BS 1 90 RS1GX64TF
BS 91 554 RS1GX64JQ
BS 555 660 RS1GX64TF

RD RS1GX64JQ 472 0 0
AAAAAAAA
AAATTGTTAGGGCTGACTGTAGATTTATCTTCCTCTCGAGAGAGCTTTCTCAGCAGTCTC
CATCTCTTCAAGAATCCTCGCCTTCCTCTTCGCCGGGATCGGAGCCGTCGGTCCAAAACT
CACATAATGTCCAGACAAAGCATTCAACGCCGAGTAGATATCCCTGAAAGACGCTTTCCC
GAGAAGAGCTTTCTCCTTCCTGTACTTGGCAACCCACGAGTTCGACACTTCTCTCAGCTC
AGCCACCGCGTCCGCCACATTCGGATCCGTCCTCTCCATCGAGAGCGTCGTCCGAACTTT
GGAGATCACCGCCGACGTATCTTTCACGTACTCTTCGTCTTCGGCGGCGGAAGCGGGCGA
CGGAGCTAGAAACGGGAGCGATTGCGTCAGTAGAAGCGTCGATGCGGCGGATAAGGAGAG
TACATCGCGGCGGAGGAGGTTTTGGCGACGTGGAGGAGGAAGAG

QA 9 472 9 472
DS 

RD RS1GX64TF 660 0 0
TTCAAGTTTCTCTTCTCATATAATCCAATTATGCATTTAAAGGTAAAAGAAAACTTCATC
AACAAGGAACTGGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAATTGTTAGGGCTGACTGTAGATTTATCT
TCCTCTCGAGAGAGCTTTCTCAGCAGTCTCCATCTCTTCAAGAATCCTCGCCTTCCTCTT
CGCCGGGATCGGAGCCGTCGGTCCAAAACTCACATAATGTCCAGACAAAGCATTCAACGC
CGAGTAGATATCCCTGAAAGACGCTTTCCCGAGAAGAGCTTTCTCCTTCCTGTACTTGGC
AACCCACGAGTTCGACACTTCTCTCAGCTCAGCCACCGCGTCCGCCACATTCGGATCCGT
CCTCTCCATCGAGAGCGTCGTCCGAACTTTGGAGATCACCGCCGACGTATCTTTCACGTA
CTCTTCGTCTTCGGCGGCGGAAGCGGGCGACGGAGCTAGAAACGGGAGCGATTGCGTCAG
TAGAAGCGTCGATGCGGCGGATAAGGAGAGTACATCGCGGCGGAGGAGGTTTTGGCGACG
TGGAGGAGGAAGAGGAGGAGATACGGAGGCGGTGATGACCGGTTTATGCTGCGGTGGAAC
AGGACTGGGTTTGAGAAGAGTAGCTGTCGCTGAAGCTGAAGCCATTGTCGGAACGCGCCC

QA 1 660 1 660
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGACAAAGTGGCGATGAAGCAACATAACCATTCTTCTATTTTTATATATACATATTTTAT
CGGAGCTGACTTTTCTTTTGGTTTATATGCAGATACCCTATTCTAACGATTTCACCACGA
TGCAGCGAAGAATATGACACAAAAGCTGATGTTTTCTCCTTTGCTTTGATCGTTCAAGAG
ATGATAGAAGGACGAATGCCATTTGCTGAAAAGGAAGACAGTGAAGCTTCAGAAGCTTAT
GCCAGCAAAGAGCGGCCACTGTTCAAAGCTCCATCAAATTGCTTTACCCTCATGGACTTA
AAACGTTGATAGAAGAATGCTGGCAAAATAAACCAGCCAAGCGACCTACTTTCAGAGAGA
TCATTAAACGGCTCGAGTCTATTCTTCATCATATGGGTCACAAACGACAATGGGGGATGA
GGCCGTTGACTTGCTTTCAGAATTTCGAGCACAAGAAGAAACATAACTGGGATATGAGCA
GCCATGACGGCTCATCATCCGGTTCACATTTGTGATTCTTTAACCGGTTCAGAAATGATT
TTTTTTTCTATTCCCTCCGGTTTAGTTTGGTCTTCCCCCTAAAGAACCGAATCTTATTTT
GTCATTTTGTTTTTCACTGATGAAAGTCCGTGTGGTCAAAATTTGGCATTTTATTTATTT
ATAAAATTTGTTGTAAGATATATGATTTTAACCTCAAGATATATTTGCTGTTGTAATTTA
AAATTTTTGCAAAATGTATGATTCCACCTCATTATT


BQ
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AF RS1G967TF U 1
AF RS1G967JQ C 382
BS 1 599 RS1G967TF
BS 600 756 RS1G967JQ

RD RS1G967TF 599 0 0
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CGGAGCTGACTTTTCTTTTGGTTTATATGCAGATACCCTATTCTAACGATTTCACCACGA
TGCAGCGAAGAATATGACACAAAAGCTGATGTTTTCTCCTTTGCTTTGATCGTTCAAGAG
ATGATAGAAGGACGAATGCCATTTGCTGAAAAGGAAGACAGTGAAGCTTCAGAAGCTTAT
GCCAGCAAAGAGCGGCCACTGTTCAAAGCTCCATCAAATTGCTTTACCCTCATGGACTTA
AAACGTTGATAGAAGAATGCTGGCAAAATAAACCAGCCAAGCGACCTACTTTCAGAGAGA
TCATTAAACGGCTCGAGTCTATTCTTCATCATATGGGTCACAAACGACAATGGGGGATGA
GGCCGTTGACTTGCTTTCAGAATTTCGAGCACAAGAAGAAACATAACTGGGATATGAGCA
GCCATGACGGCTCATCATCCGGTTCACATTTGTGATTCTTTAACCGGTTCAGAAATGATT
TTTTTTTCTATTCCCTCCGGTTTAGTTTGGTCTTCCCCCTAAAGAACCGAATCTTATTT

QA 1 599 1 599
DS 

RD RS1G967JQ 375 0 0
TTT
TTCATCATATGGGTCACAAACGACAATGGGGGATGAGGCCGTTGACTTGCTTTCAGAATT
TCGAGCACAAGAAGAAACATAACTGGGATATGAGCAGCCATGACGGCTCATCATCCGGTT
CACATTTGTGATTCTTTAACCGGTTCAGAAATGATTTTTTTTTTTATTCCCTCCGGTTTA
GTTTGGTTTTCCCCCTAAAGAACCGAATTTTATTTTGTCATTTTGTTTTTCACTGATGAA
AGTCCGTGTGGTCAAAATTTGGCATTTTATTTATTTATAAAATTTGTTGTAAGATATATG
ATTTTAACCTCAAGATATATTTGCTGTTGTAATTTAAAATTTTTGCAAAATGTATGATTC
CACCTCATTATT

QA 4 375 4 375
DS 



AS 1 2

CO CL4229Contig1 744 2 1 U
TTTTTCCTTTCTGGAGTTGAGCCCTTTCCCTCTACACGCAGTCGCCTCCGATCACATTTA
TCACCGGTCGCAGTGTACTGGAGTCGAAAATTTCTGATTTCTGCACAAAAATGAATTTCT
TAAACTCAGCAGCATCCTTATGCAGAAGAGTTAGTTTGAGGGAACTTATCACCGAGGTTC
CTGCTTACGGTGGCAGTGGCATCTCCGATTGTTCTTCAAGTGGGTTGAGTTTGGTGTTAA
AGCGTTGGGCTACTAAGAAAACCGCCGGTTCCACCAAGAACGGACGTGACTCTAAGCCCA
AGAATCTCGGCGTCAAGAAGTTCGGAGGAGAGAATGTGATAACGGGAAACATAATAGTCC
GTCAACGTGGAACTCGGTTTCATCCCGGAGACTATGTTGGGATCGGGAAGGACCATACTC
TGTTCGCATTGAAGGAAGGACGAGTCAGGTTCGAGAAAAACAAGATCACTGGACGCAAAT
CGATTCATGTTGATCCTAAGGGAGGTCATGTTCTTCACCCTATCTACACTAAAGCTGCAA
TGGCCAAGTCGACTACGGTGGAGACAGCTTCGTCGTCCTGAAAAGAGATTTGATTCAACA
ATCTAAAGGTGTCTTTGTTTTGTTAGATAACATCTTCTGTTGACTAGAAGATTGTGATAC
TGGTATCTTAGAACAGCAAACACTCGATTCAATAACATCTGCTGTTTTTGTCTCTCTCTT
TAGTAATACATTGTATCCAGTACT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H277TF U 34
AF RS1CP75TF U 1
BS 1 744 RS1CP75TF

RD RS1H277TF 136 0 0
GG
ACGCAGTCGCCTCCGATCACATTTATCACCGGTCGCAGTGTACTGGAGTCGAAAATTTCT
GATTTCTGCACAAAAATGAATTTCTTAAACTCAGCAGCATCCTTATGCAGAAGAGTTAGT
TTGAGGGAACTTAT

QA 3 136 3 136
DS 

RD RS1CP75TF 744 0 0
TTTTTCCTTTCTGGAGTTGAGCCCTTTCCCTCTACACGCAGTCGCCTCCGATCACATTTA
TCACCGGTCGCAGTGTACTGGAGTCGAAAATTTCTGATTTCTGCACAAAAATGAATTTCT
TAAACTCAGCAGCATCCTTATGCAGAAGAGTTAGTTTGAGGGAACTTATCACCGAGGTTC
CTGCTTACGGTGGCAGTGGCATCTCCGATTGTTCTTCAAGTGGGTTGAGTTTGGTGTTAA
AGCGTTGGGCTACTAAGAAAACCGCCGGTTCCACCAAGAACGGACGTGACTCTAAGCCCA
AGAATCTCGGCGTCAAGAAGTTCGGAGGAGAGAATGTGATAACGGGAAACATAATAGTCC
GTCAACGTGGAACTCGGTTTCATCCCGGAGACTATGTTGGGATCGGGAAGGACCATACTC
TGTTCGCATTGAAGGAAGGACGAGTCAGGTTCGAGAAAAACAAGATCACTGGACGCAAAT
CGATTCATGTTGATCCTAAGGGAGGTCATGTTCTTCACCCTATCTACACTAAAGCTGCAA
TGGCCAAGTCGACTACGGTGGAGACAGCTTCGTCGTCCTGAAAAGAGATTTGATTCAACA
ATCTAAAGGTGTCTTTGTTTTGTTAGATAACATCTTCTGTTGACTAGAAGATTGTGATAC
TGGTATCTTAGAACAGCAAACACTCGATTCAATAACATCTGCTGTTTTTGTCTCTCTCTT
TAGTAATACATTGTATCCAGTACT

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL4230Contig1 605 2 12 U
GATGATGAACCGCTTGAGAAGAGAAAGAGAAAGAGACTAATCATGCAGATGAGGTTGATA
TGACAGTTGATGAGGCGCGCGAGGAGCATTACAAGGCTGATGATGCTTCCAGTGCGGTGT
CTCATGAGTCTCGGATTCTGAACACTGAGAAGCTGAAAGAAAGTTCTGATAATTCAACAG
GAACAGCTCAGGAGAACAACACCAACGCCACTGTAATAAGCGAGGTTGAGGAGGTTCAGA
AGGAACCTGTCTTGGAGAAAACAACCACAGAAGTGAAAGATGGTGACAGTGAATCCTCCA
CTTCCGAAGCAAAAAGCGTGGTAAATGAATCCAGAGGTGAAACAATAGTTAATGGCAATT
CAACAGAAGCAGTTCTTGAAGCTTCAGGGTTTCTGCAGAATGAAACAAAAATCATGCAAG
AACGGAGTCAAGAAGATGGTCCACGTCCTTCAGGATCCTCTGATGTACACACCGTTGTCA
AACTTGAGCAGACACGTGATGAATCTGCTCCCAACATCACTGTTTCTGCAAACATTACCA
ACGTAGATCCCATTCAAGATGACTCCAGGAACTCGACTTCAGAGTCTTCTGTAATTGAAA
ACATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 

AF RS1ER12TF U 1
AF RS1GI70TF U 78
BS 1 154 RS1ER12TF
BS 155 155 RS1GI70TF
BS 156 199 RS1ER12TF
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BS 201 205 RS1ER12TF
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BS 340 340 RS1GI70TF
BS 341 472 RS1ER12TF
BS 473 473 RS1GI70TF
BS 474 587 RS1ER12TF
BS 588 605 RS1GI70TF

RD RS1ER12TF 587 0 0
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AGGAACCTGTCTTGGAGAAAACAACCACAGAAGTGAAAGATGGTGACAGTGAATCCTCCA
CTTCCGAAGCAAAAAGCGTGGTAAATGAATCCAGAGGTGGAACAATAGTTAATGGCAATT
CAACAGAAGCAGTTCTTGAAGCTTCAGGGTTTCTGCAGAATGAAACAAAAATCATGCAAG
AACGGAGTCAAGAAGATGGTCCACGTCCTTCAGGATCCTCTGATGTACACACTGTTGTCA
AACTTGAGCAGACACGTGATGAATCTGCTCCCAACATCACTGTTTCTGCAAACATTACCA
ACGTAGATCCCATTCAAGATGACTCCAGGAACTCGACTTCAGAGTCT

QA 1 587 1 587
DS 

RD RS1GI70TF 528 0 0
GGGGAC
GAGCATTACAAGGCTGATGATGCTTCTAGTGCGGTGTCTCATGAGTCTCGGATTCTGAAC
ACTGAGAAGCTGAAAGAAAGTTCTGATAATTCAACAGGAACAGCTCAGGAGAACAACTCC
AACGCCACTGTAATAAGCGAGGTTGAGGAGGTTCAGAAGGAACCTGTCTTGGAGAAAACA
ACCACAGAAGTGAAAGATGGTGACAGTGAATCCTCCACTTCCGAAGCAAAAAGCGTGGTA
AATGAATCCAGAGGTGAAACAATAGTTAATGGCAATTCAACAGAAGCAGTTCTTGAAGCT
TCAGGGTTTCTGCTGAATGAAACAAAAATCATGCAAGAACGGAGTCAAGAAGATGGTCCA
CGTCCTTCAGGATCCTCTGATGTACACACCGTTGTCAAACTTGAGCAGCCACGTGATGAA
TCTGCTCCCAACATCACTGTTTCTGCAAACGTTACCAACGTAGATCCCATTCAAGATGAC
TCCAGGAACTCGACTTCAGAGTCTTCTGTAATTGAAAACATC

QA 7 528 7 528
DS 



AS 1 2

CO CL4231Contig1 472 2 5 U
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GTCTCTTCACTCTGTTTTTAATACATTGCAACTATATAATATATTCCAAACATGAGATCT
TTCTTCAATCTTGAGACATAAAATTATCTTTATTCCTTTTCACAATTTTCAGAATCCAAC
AACTTGAGTACATTGAGCATAAGCATCAGCTTGCATGGCAATAGGGGCTCGAGTAACATG
ATCCGGCAGCTCGAACGCGTCCACTAGCTCCTTAGCTACGTTCCCCACTTGGAAACTCAA
ATACTCGGCCAACTTATGAATCGCCTTGGCTTTGTTAGGCGCCACATAGTCCACGTTACG
GTACGTTCCTATATCCTTCCATATCCGGTCCAATGCGTAAAGATCGCATACTAGTTTCAG
ACCAGCTCTTGCACTTGGGTCCGGACAGTTTCTAACAGCTTCAATGAACTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1C377JQ U 121
AF RS1C377TF C 1
BS 1 120 RS1C377TF
BS 121 218 RS1C377JQ
BS 219 219 RS1C377TF
BS 220 339 RS1C377JQ
BS 340 472 RS1C377TF

RD RS1C377JQ 219 0 0
TTCTTCAATCTTGAGACATAAAATTATCTTTATTCCTTTTCACAATTTTCAGAATCCAAC
AACTTGAGTACATTGAGCATAAGCATCAGCTTGCATGGGAATAGGGGCTCGAGTAACATG
ATCCGGCAGCTCGAACGCGTCCACTAGCTCCTTAGCTACGTTCCCCACTTGGAAACTCAA
ATACTCGGCCAACTTATGAATCGCCTTGGCTTTGTTAGG

QA 1 219 1 219
DS 

RD RS1C377TF 472 0 0
GAACAAGGAACCCCACTTTATAGCATTGAGCAAGGAACAAACAGAATATTCCTCTGTTTA
GTCTCTTCACTCTGTTTTTAATACATTGCAACTATATAATATATTCCAAACATGAGATCT
TTCTTCAATCTTGAGACATAAGATTATCTTTATTCCTTTTCACAATTTTCAGAATCCAAC
AACTTGAGTACATTGAGCATAAGCATCAGCTTGCATGGCAATAGGTGCTCGAGTAACATG
ATCCGGCAGCTCGAACGCGTCCACTAGCTCCTTAGCTACGTTCCTCACTTGGAAACTCAA
ATACTCGGCCAACTTATGAATCGCCTTGGCTTTGTTAGGCGCCACATAGTCCACGTTACG
GTACGTTCCTATATCCTTCCATATCCGGTCCAATGCGTAAAGATCGCATACTAGTTTCAG
ACCAGCTCTTGCACTTGGGTCCGGACAGTTTCTAACAGCTTCAATGAACTTC

QA 1 472 1 472
DS 



AS 1 2

CO CL4232Contig1 567 2 5 U
TTTTTTTTGGATAAGATATTATTTTTTATTTGAATGTTGTACAATATATGAAGAGAAGGG
AACAGGATAAAGATAAGACAATAACATTCAAATAAAATAAAAAGGAACTTGTCAACCCAA
ACTTCATGTTATTATACATTCTTCAGGTAACTCATCCCTGAATTGTCTCCTTTAAAGAAA
AGGATAAATGGACATAATAAACAAACACTTAATTTTCTTCTACAACACTGATTTTGAATC
TCTGATATGTTCTCTTCTCTAAAACCTCCCTCCTTTCTTCATTTCACTTGTACTGAGACT
AGAACTAGTTTCTTTGCCAAAGCTAATTCTCCGGGTCAGGTTGATCAGGTCCCTGTTGCT
GCCACATGGGTTGACCAATATACGGGTTAGGTGGGTATGCACCACCGGGGTTGCCCATAA
CCATTCCCGGGTTCCCTATCGGTCCAGTTCCTGGAGGCAAGTATCCATAAGGGTAGCCAG
CAGCAGCAGCCTCAGGGACAGTCCCCCTTCCCAAGACCTCATCCCTGAGATCCTCTCGAG
GAACAATGTCCACAAGAAAATCAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1H626JQB U 81
AF RS1H626TF C 1
BS 1 80 RS1H626TF
BS 81 153 RS1H626JQB
BS 154 154 RS1H626TF
BS 155 295 RS1H626JQB
BS 296 567 RS1H626TF

RD RS1H626JQB 215 0 0
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CTTCAGGTAACTCCTCCCTGAATTGTCTCCTTTAAAGAAAAGGATAAATGGACATAATAA
ACAAACACTTAATTTTCTTCTACAACACTGATTTTGAATCTCTGATATGTTCTCTTCTCT
AAAACCTCCCTCCTTTCTTCATTTCACTTGTACTG

QA 1 215 1 215
DS 

RD RS1H626TF 567 0 0
TTTTTTTTGGATAAGATATTATTTTTTATTTGAATGTTGTACAATATATGAAGAGAAGGG
AACAGGATAAAGATAAGACAATAACATTCAAATAAAATAAAAAGGAACTTGTCAACCCAG
ACTTCATGTTATTATACATTCTTCAGGTAACTCATCCCTGAATTGTCTCCTTTAAAGAAA
AGGATAAATGGACATAATAAACAAACACTTAGTTTTCTTCTACAACACTGATTTTGAATC
TCTGATATGTTCTCTTCTCTAAAACCTCCCTCCTTTCTTCATTTCACTTGTACTGAGACT
AGAACTAGTTTCTTTGCCAAAGCTAATTCTCCGGGTCAGGTTGATCAGGTCCCTGTTGCT
GCCACATGGGTTGACCAATATACGGGTTAGGTGGGTATGCACCACCGGGGTTGCCCATAA
CCATTCCCGGGTTCCCTATCGGTCCAGTTCCTGGAGGCAAGTATCCATAAGGGTAGCCAG
CAGCAGCAGCCTCAGGGACAGTCCCCCTTCCCAAGACCTCATCCCTGAGATCCTCTCGAG
GAACAATGTCCACAAGAAAATCAAAAA

QA 1 567 1 567
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4234Contig1 865 2 2 U
GGATCCTGAGATCGTCAATACGTGGTGCAACGTTCTTAAAAGAGTACCCAACAGTGCTCT
TTGGCTTCTCCGTTTCCCTGCAGCTGGAGAGATGAGGTTTCGCGCATATGCTGCTGCTCA
TGGAGTGCAGCCTGATCAGATTATCTTCACGGATGTTGCAATGAAGAATGAGCATATAAG
GCGAAGTGTACTTGCAGATGTAATCCTCGACACGCCTCTGTGTAACGGACACACAACCGG
AACAGATGTGCTCTGGGCTGGCGTACCGATGATAACATTGCCACTTGAGAAAATGGCAAC
TCGAGTAGCTGGATCACTCTGTCTCGCAACTGGTCTGGGACATGAGATGATTGTTAATAG
CTTGGAGGAATACGAAGAGAAGGCTGTCTCTTTGGCGCTTAACAAGCCGAAACTTCAAGC
ACTGACTAAGGAACTGAGGGCCAGCCGCTTGACCTGTCCTCTGTTTGACACCATGCGCTG
GGTGAAGAATCTTGAGAGGTCATACTTCAAAATGTGGAACCTCCATTGCTCTGGACAGAA
GCCTCAACACTTTAAAGTAGTGGAGAACGACATGGAGTTCCCACATGACAAATGAAACAA
AAGAGGGGAAAGAAAATTGAGAGCATAAACAAGATTACACTCGGCATTGTATATTAAAAA
GAAAAACAAAACCCCGAAGAGAGTTAGTAGCAGATTGATAAAGTTTATGAGAGGTAGAAA
AGATTATTATTATTATGGAGCTGTATACTATAACAGAAGCTTGCTGTGATGTTATCATTC
AATCACCTATGTTATATCACATGAACAAACAAACATGCCATATCAGTGTGTAATATAAAC
CTCAACGCTTTTAAACTTTTAATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FG49TF U 1
AF RS1FG49JQ C 124
BS 1 587 RS1FG49TF
BS 588 865 RS1FG49JQ

RD RS1FG49TF 587 0 0
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TGGAGTGCAGCCTGATCAGATTATCTTCACGGATGTTGCAATGAAGAATGAGCATATAAG
GCGAAGTGTACTTGCAGATGTAATCCTCGACACGCCTCTGTGTAACGGACACACAACCGG
AACAGATGTGCTCTGGGCTGGCGTACCGATGATAACATTGCCACTTGAGAAAATGGCAAC
TCGAGTAGCTGGATCACTCTGTCTCGCAACTGGTCTGGGACATGAGATGATTGTTAATAG
CTTGGAGGAATACGAAGAGAAGGCTGTCTCTTTGGCGCTTAACAAGCCGAAACTTCAAGC
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GGTGAAGAATCTTGAGAGGTCATACTTCAAAATGTGGAACCTCCATTGCTCTGGACAGAA
GCCTCAACACTTTAAAGTAGTGGAGAACGACATGGAGTTCCCACATG

QA 1 587 1 587
DS 

RD RS1FG49JQ 742 0 0
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AAGTGTACTTGCAGATGTAATCCTCGACACGCCTCTGTGTAACGGACACACAACCGGAAC
AGATGTGCTCTGGGCTGGCGTACCGATGATAACATTGCCACTTGAGAAAATGGCAACTCG
AGTAGCTGGATCACTCTGTCTCGCAACTGGTCTGGGACATGAGATGATTGTTAATAGCTT
GGAGGAATACGAAGAGAAGGCTGTCTCTTTGGCGCTTAACAAGCCGAAACTTCAAGCACT
GACTAAGGAACTGAGGGCCAGCCGCTTGACCTGTCCTCTGTTTGACACCATGCGCTGGGT
GAAGAATCTTGAGAGGTCATACTTCAAAATGTGGAACCTCCATTGCTCTGGACAGAAGCC
TCAACACTTTAAAGTAGTGGAGAACGACATGGAGTTCCCACATGACAAATGAAACAAAAG
AGGGGAAAGAAAATTGAGAGCATAAACAAGATTACACTCGGCATTGTATATTAAAAAGAA
AAACAAAACCCCGAAGAGAGTTAGTAGCAGATTGATAAAGTTTATGAGAGGTAGAAAAGA
TTATTATTATTATGGAGCTGTATACTATAACAGAAGCTTGCTGTGATGTTATCATTCAAT
CACCTATGTTATATCACATGAACAAACAAACATGCCATATCAGTGTGTAATATAAACCTC
AACGCTTTTAAACTTTTAATTC

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL4235Contig1 464 2 1 U
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GAGTGCTTGACTTGGGCAATGAAAGAGATACGGAAGATTGGAATCATGGACGTCCGCTTT
GAGTCGGACTGCCAACTCTTAGTCCGTCTTATCAACCAGCCGCAGGAATGGCCAGCTCTC
GGGTCAGAGCTGGGTGAAATTGATTTTTTGTGCTCTGAATTCTCATCTATTTCTGTTGTT
TTTATTAGTCGTACTGAAAACGTCCGTGCGGACTGCCTGGCCAAGGCAGGACGATCACGC
GATCCGGATTTCTGTTTCTTTGGAGAAAAGGCTCCCCCATGGCTTGCTCACACAGCTAGC
TTGTACGAGCCTTTAGTAGTTTAATAAAGTTCTTAGTTGGGTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DM42JQ C 1
AF RS1DM42TF U 1
BS 1 464 RS1DM42TF

RD RS1DM42JQ 464 0 0
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GATTTTTTCTGTCAACAACAAAATTGTTCCCTAGCTGCCTCACCTATACACGCTGAAACA
GAGTGCTTGACTTGGGCAATGAAAGAGATACGGAAGATTGGAATCATGGACGTCCGCTTT
GAGTCGGACTGCCAACTCTTAGTCCGTCTTATCAACCAGCCGCAGGAATGGCCAGCTCTC
GGGTCAGAGCTGGGTGAAATTGATTTTTTGTGCTCTGAATTCTCATCTATTTCTGTTGTT
TTTATTAGTCGTACTGAAAACGTCCGTGCGGACTGCCTGGCCAAGGCAGGACGATCACGC
GATCCGGATTTCTGTTTCTTTGGAGAAAAGGCTCCCCCATGGCTTGCTCACACAGCTAGC
TTGTACGAGCCTTTAGTAGTTTAATAAAGTTCTTAGTTGGGTGC

QA 1 464 1 464
DS 

RD RS1DM42TF 464 0 0
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GATTTTTTCTGTCAACAACAAAATTGTTCCCTAGCTGCCTCACCTATACACGCTGAAACA
GAGTGCTTGACTTGGGCAATGAAAGAGATACGGAAGATTGGAATCATGGACGTCCGCTTT
GAGTCGGACTGCCAACTCTTAGTCCGTCTTATCAACCAGCCGCAGGAATGGCCAGCTCTC
GGGTCAGAGCTGGGTGAAATTGATTTTTTGTGCTCTGAATTCTCATCTATTTCTGTTGTT
TTTATTAGTCGTACTGAAAACGTCCGTGCGGACTGCCTGGCCAAGGCAGGACGATCACGC
GATCCGGATTTCTGTTTCTTTGGAGAAAAGGCTCCCCCATGGCTTGCTCACACAGCTAGC
TTGTACGAGCCTTTAGTAGTTTAATAAAGTTCTTAGTTGGGTGC

QA 1 464 1 464
DS 



AS 1 2

CO CL4236Contig1 724 2 2 U
GGATTCTCGATTGGAGATTAAAATCAGAAAGGTATCTACGAAAAAAGCAAAAAAAAAGAG
GAACAATCTCAAGAATGGCGGATCAGCTCACCGACGATCAGATCTCTGAGTTCAAGGAAG
CCTTCAGCTTATTCGACGAGGATGGTGACGGTTGTATTACCACCAAGGAGCTTGGAACCG
TGATGCGTTCTCTTGGACAGAACCCAACAGAAGCAGAGCTCCAAGACATGATCAACGAAG
TTGACGCTGACGGTAACGGAACCATTGATTTCCCGGAGTTCTTGAACCTCATGGCACGTA
AGATGAAGGACACCGACTCCGAGGAAGAGCTCAAGGAAGCGTTCCGGGTCTTTGACAAGG
ACCAGAACGGTTTCATCTCAGCTGCTGAGCTCCGTCATGTGATGACAAACCTGGGAGAGA
AGCTCACCGACGAAGAGGTTGATGAGATGATCAAGGAAGCTGATGTTGATGGTGATGGAC
AGATTAACTATGAGGAGTTTGTCAAGGTCATGATGGCTAAGTGATTAAGGTTTTTGTTAC
TAAATACTCTCTTTTATATTTTACTATTATGTTCTAAAGTTTTTTATTCATGGAACTTGG
TTCTGTTTTATGGCTGTTTAAGATGCAAATGTTGTCTCTTTTATGCTCTGTTTTGTGTCC
GAACATTTCAAGTCTTGGTCTTTGTAAGTTTGTAACTTTGGTCTAGTTTCGTGGTGTTTG
TTAT


BQ
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10 10 10 10 

AF RS1ET08TF U 1
AF RS1ET08JQ C 195
BS 1 682 RS1ET08TF
BS 683 724 RS1ET08JQ

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DS 

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GAGTTTGTCAAGGTCATGATGGCTAAGTGATTAAGGTTTTTGTTACTAAATACTCTCTTT
TATATTTTACTATTATGTTTTAAAGTTTTTTATTCATGGAACTTGGTTTTGTTTTATGGC
TGTTTAAGATGCAAATGTTGTTTTTTTTATGCTTTGTTTTGTGTCCGAACATTTCAAGTC
TTGGTCTTTGTAAGTTTGTAACTTTGGTCTAGTTTCGTGGTGTTTGTTAT

QA 1 530 1 530
DS 



AS 1 2

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TTCAAGTCTCCCCCTCTTCTCCTTCCCGATTCTTTCTTTCCTTCAAAAAAAAAGATTCAA
TCTTTCCATCTTCTTATTAACCCTAAAATCCCTAATTTAAAACGCCCTTTACGATTCCTT
TTCCTCTAATCGAACCCGAATCAGTATCTCTCCCCCACCCTCCCCCCAAATTGAATTATG
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CCGCAAGTCCACTCGGGCGCTTTTCCGACGGAGATCTTGCCGGAGTTTCTCTACCTCGGA
AGCTACGACAACGCCTCTCGTTCTGAGGTTCTCAAGACTCAGGGGATTTCTCGAGTTCTT
AATACGGTTCCTATGTGCCAGAATCTCTACAGGAACTCATTCACTTACCATTGCCTCTCT
GATGATAAAGTCCTACAGTTCGATGATGCTATCAAGTTCCTAGACCAATGTGAGAAGGAC
AAGGCACGTGTTCTTGTGCACTGCATGTCAGGGAAAAGCAGATCACCAGCGGTTGTTATA
GCATATTTGATGAAACGTAAAGGGTGGAGACTCGCTGAGAGTCATCAGTGGGTTAAGCAA
CGGAGACCCACAACAGACATAACTCCAGAGTTCTACCAACAACTGGAGGCGTTTGAGCAG
ACTATACTTGGATCAAGAGAAGGGATGATGGCGGCGATGAATATCAACGATCCTCCAACA
TTTGGGTTTGGTTTCCCTAAGGTTAATAATAGTAGTCAAGCGCCAGTCCCTGTGTTCAAC
AATGCTTCTGCTTCTTCTATATTTTCGTCCCCTGCTTCAAGTATCCTTCCTCACGGATTC
ACTTTTGGAGCAGCTCCACCGAAGCCAACAACTGGCGATGATATTACCATGGATGGCTCT
TAATACCAAAATATCTTTTTCTTGCAAGAACATTCTGCTCCGAGGATACTCTCTTTTAAA
AAAAAATTATAAATGGATATTGGTGCAATGCTTGCGAAAGTTTGGGGTTTGGGAGATTAA
GTAAGATGAATCTTTGTTGTTTTGC


BQ
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AF RS1G592TF U 1
AF RS1G592JQ C 426
BS 1 628 RS1G592TF
BS 629 1165 RS1G592JQ

RD RS1G592TF 628 0 0
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TTCCTCTAATCGAACCCGAATCAGTATCTCTCCCCCACCCTCCCCCCAAATTGAATTATG
AGGAAGAGAGAGCGAGAGAACCCTTGTTCCCTTTGTGGGCACTATCACAAGTACGAGGAA
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AGCTACGACAACGCCTCTCGTTCTGAGGTTCTCAAGACTCAGGGGATTTCTCGAGTTCTT
AATACGGTTCCTATGTGCCAGAATCTCTACAGGAACTCATTCACTTACCATTGCCTCTCT
GATGATAAAGTCCTACAGTTCGATGATGCTATCAAGTTCCTAGACCAATGTGAGAAGGAC
AAGGCACGTGTTCTTGTGCACTGCATGT

QA 1 628 1 628
DS 

RD RS1G592JQ 740 0 0
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GGTTCCTATGTGCCAGAATCTCTACAGGAACTCATTCACTTACCATTGCCTCTCTGATGA
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ACCCACAACAGACATAACTCCAGAGTTCTACCAACAACTGGAGGCGTTTGAGCAGACTAT
ACTTGGATCAAGAGAAGGGATGATGGCGGCGATGAATATCAACGATCCTCCAACATTTGG
GTTTGGTTTCCCTAAGGTTAATAATAGTAGTCAAGCGCCAGTCCCTGTGTTCAACAATGC
TTCTGCTTCTTCTATATTTTCGTCCCCTGCTTCAAGTATCCTTCCTCACGGATTCACTTT
TGGAGCAGCTCCACCGAAGCCAACAACTGGCGATGATATTACCATGGATGGCTCTTAATA
CCAAAATATCTTTTTCTTGCAAGAACATTCTGCTCCGAGGATACTCTCTTTTAAAAAAAA
ATTATAAATGGATATTGGTGCAATGCTTGCGAAAGTTTGGGGTTTGGGAGATTAAGTAAG
ATGAATCTTTGTTGTTTTGC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL4238Contig1 677 2 6 U
GGATACGATACTAAGCTTATAAAAATAATCTCATAAAATCAGTTTCTGCAAGCAAATCAT
ACTAATACTAATTTAAGTGAGTACCATACCAACCGATATTGGCCCTGCAACTAACTCCCA
CGAGTATTATTCGTTTTTATCTACAAACTCTTTTTTCTACATCAACCAGAATCCTGAGAT
GCATCCAACATGACCAGGTACTCATTTATAGCTTCGACCTCCTTGTCAAGATTGATATCA
TAAGCCGACAAAGCGTCAACCTTTGCAATCTCTTCTGCTATATCTCCTTCTACCTCAACG
TCCCGCCCTTCCTCCTCACCATCTGCTGTATCTCCTTCTAACTCAGGGTCCTGCTCTTCC
TCCTCACCATTGGGTTCAATCTCATCCGCTGTATCATCTTCCATCTCAAAATCCCCTGTC
TCGGTACCAACTGCATTGTTTGTGCTGCTCGTTGCACCGCCATTTGCTGTAAAAGCAGAA
CCTGAGGCAGAAGCGGTTCCCGCGTTTGCTGCTGGTAAAGATAGTAGCCTTTGGATTATA
TCTTCTCGTCTGCCACCAACCTCCAAAGCAGACCTTGCTTGCCCTCGTTCAAAGCCCATT
GAAACAAGTTCGTCAACTGTTATGCCTACTTGTTGTTCTTGACGTTTTCTTTTCCTCATT
CAATATAAACCTGAATA


BQ
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AAACCTGAATA

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BQ
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CGCTGCTTACACCATCTTGATCCTCGCTGTCAATCTCCACATCACCACCGGCTGATCTAG
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TATTTTGTTTTCTAGAGTGTCTACTTTTACTTAAATCTGTCTGAAACTTGTTTGGGAACA
AACAGATCCCTTTTTGTGTTGTTCATTATGTTTTACTGAAAATGTATTAAAGAATCAGAG
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QA 1 474 1 474
DS 



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CAGCTTGTTTCCGACAAGGCTCTGTTGGATGATCCTGTGTTCCGTCCTCTTGTTGAGAAA
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GAGCTCGGGTTTGCCGACGCTTAACCTGACATGTGTGTGGTGGCGGTCGGAGAGTTCGCA
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BQ
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AF RS1AO23TFB U 1
AF RS1AO23JQ C 386
BS 1 593 RS1AO23TFB
BS 594 955 RS1AO23JQ

RD RS1AO23TFB 593 0 0
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AGCTACCCAACAGTTAGCGAAGATTACCAGAAGGCTATCGAGAAGTGCAAGAGGAAGCTT
AGAGGTTTGAACGCTGAGAAGAACTGTGCACCTATCATGGTCCGCCTCGCATGGCACTCT
GCTGGAACGTTTGATTGTGCATCGAGGACCGGTGGTCCTTTCGGAACAATGAGGTTTGAT
GCGGAGCAAGGTCATGGAGCTAACAGTGGTATCCACATTGCTCTCAGGCTGTTGGAGCCC
ATCAGAGAGCAGTTCCCTACCATCTCTTTCGCTGATTTCCATCAGCTTGCCGGTGTGGTC
GCTGTTGAAGTCACCGGTGGTCCTGAGATCCCTTTCCACCCTGGAAGAGAGGACAAGCCG
CAGCCACCACCAGAGGGACGTCTCCCTGATGCTACAAAGGGATGTGACCACTTGAGGCAG
GTGTTTATGAATCAGATGGGTTTATCTGACCAGGATATCGTCGCTTTATCCGGTGCCCAC
ACTCTGGGAGGATGCCACAAGGATAGGTCTGGTTTCGAAGGTGCTTGGACTTC

QA 1 593 1 593
DS 

RD RS1AO23JQ 570 0 0
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CTGATGCTACAAAGGGATGTGACCACTTGAGGCAGGTGTTTATGAATCAGATGGGTTTAT
CTGACCAGGATATCGTCGCTTTATCCGGTGCCCACATTCTGGGAGGATGCCACAAGGATA
GGTCTGGTTTCGAAGGTGCTTGGACTTCAAACCCTTTTATTTTCGACAACTCTTACTTCA
AGGAGCTCTTGAGCGGTGAGAAGGAAGGTTTTTTTCAGCTTGTTTCCGACAAGGCTCTGT
TGGATGATCCTGTGTTCCGTCCTCTTGTTGAGAAATACGCTGCTGATGAAGAAGTGTTTT
TCGCTGATTACGCTGAGGCACACTTGAAGCTTTTTGAGCTCGGGTTTGCCGACGCTTAAC
CTGACATGTGTGTGGTGGCGGTCGGAGAGTTCGCATTACATTTGAACTTCTTTCATTTGT
TTGCTTAATGTACTCTTGGATTTGCGTAGCTTGTGTTTTTTTTTTGGGCGGTGTTGTGAT
ATTGATTCACATATGTTGCGCTTTTGATGG

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 2

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AGAGAAAGCTAATCAGTCATGGGAAAAGTGCACGGATCTTTGGCTCGTGCCGGTAAAGTA
AGAGGACAGACACCGAAGGTAGCGAAGCAAGATAAGAAGAAGAAACCCCGAGGACGTGCT
CACAAGCGTCTCCAGCACAACCGCCGTTTCGTTACCGCCGTTGTTGGTTTCGGTAAGAAG
AGAGGACCCAACTCTTCTGAGAAGTAGAGAAGATTGATAGATATGCCTGTGAAAGCCGTC
TCATATGGCTTAGTTTGTAACCTTTTGAATTTCCTTTTCGTTTTGTATTAGTCATGTTTC
TTAACTTTATATGTTTTGATTCCAATCTATGAAATACGGTTTTAGTTTTGATCC


BQ
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AF RS1AG65JQ C 1
AF RS1AG65TF U 1
BS 1 414 RS1AG65TF

RD RS1AG65JQ 414 0 0
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AGAGAAAGCTAATCAGTCATGGGAAAAGTGCACGGATCTTTGGCTCGTGCCGGTAAAGTA
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CACAAGCGTCTCCAGCACAACCGCCGTTTCGTTACCGCCGTTGTTGGTTTCGGTAAGAAG
AGAGGACCCAACTCTTCTGAGAAGTAGAGAAGATTGATAGATATGCCTGTGAAAGCCGTC
TCATATGGCTTAGTTTGTAACCTTTTGAATTTCCTTTTCGTTTTGTATTAGTCATGTTTC
TTAACTTTATATGTTTTGATTCCAATCTATGAAATACGGTTTTAGTTTTGATCC

QA 1 414 1 414
DS 

RD RS1AG65TF 414 0 0
GGAAACACTGAGATTACGCACTAGTTTTCAGCTTATTTGCAGCCGTCAGAAGAACGCAGC
AGAGAAAGCTAATCAGTCATGGGAAAAGTGCACGGATCTTTGGCTCGTGCCGGTAAAGTA
AGAGGACAGACACCGAAGGTAGCGAAGCAAGATAAGAAGAAGAAACCCCGAGGACGTGCT
CACAAGCGTCTCCAGCACAACCGCCGTTTCGTTACCGCCGTTGTTGGTTTCGGTAAGAAG
AGAGGACCCAACTCTTCTGAGAAGTAGAGAAGATTGATAGATATGCCTGTGAAAGCCGTC
TCATATGGCTTAGTTTGTAACCTTTTGAATTTCCTTTTCGTTTTGTATTAGTCATGTTTC
TTAACTTTATATGTTTTGATTCCAATCTATGAAATACGGTTTTAGTTTTGATCC

QA 1 414 1 414
DS 



AS 1 2

CO CL4242Contig1 1032 2 2 U
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GAACTATTGCAGAGTCTGGTGCAGAAACACGGTCCAAGAAACTGGTCTTTGATCAGCAAA
TCTATCCCCGGACGCTCCGGCAAATCTTGCCGTCTCCGGTGGTGCAACCAGCTGTCTCCG
GAGGTAGAGCACCGTTCCTTTTCGCCGGAAGAAGACGAGACGATTGTTCGAGCGCACGCT
CGGTTCGGTAACAAGTGGGCGACGATCTCTCGTCTCCTCAGTGGAAGAACCGACAACGCT
ATCAAGAATCATTGGAACTCGACGCTCAAGGAAAATGCAGCGCATTTACATCTGACGGAC
AAAGTGGAAACGGAGGGTATGACGGTAATATAGGAGAAGAACAACCGCTGAAACGTACGG
CGAGTGGTGGTGGTGGTGTGTCTACTGAGTTGTATATGAGCCCCGGAAGTCCTTCTGGAT
CTGACGTCAGCGAGCAATCTGGTGGTGGGCAACACGTGTCTAGATCTGGTGCTGTGAATG
AGATGACGGCGTCATCGTCCGGTGAAGATCCGCCGACGTATCTAAGTTTATCTCTCCCTT
GGAATAATAGACAGAGACGGTTAGAGTCAACGAGTCAACTCAACTAAACGAGGATACGGT
TATTGATAATGGTTACACGGCGGAGCTGTTTCCGGTTAGGAAGGAAGAGGTAGAGGAAGA
GAAAGAGATGTCAGGATTTGGTGGTGAGTTCATGACGGTGGTGCAGGAGATGATTAGGAC
GGAGGTGAGGAGTTACATGGCGGATTTACAGCGAGGGAACGTCGGTGGTGGTGGTGGTGG
TTCGTGTGTTCCGCAAGGTGTAATGAACCTTCGTGTCGGGTTTAGAGAGTTTGTAGTGAA
CCAAATCGGCATTGGGAAGATCGAGTAGAGTGATGACTGATTAGTGAGGCTTCAAAGCTT
TTCATGTATAGAGAAATGGTTAGAGAGAAGCAAATTAAAAATGTTTTGTAATCATATGAT
CTTTCGTGATCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B876TF U 1
AF RS1B876JQ C 487
BS 1 691 RS1B876TF
BS 692 1032 RS1B876JQ

RD RS1B876TF 691 0 0
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GAACTATTGCAGAGTCTGGTGCAGAAACACGGTCCAAGAAACTGGTCTTTGATCAGCAAA
TCTATCCCCGGACGCTCCGGCAAATCTTGCCGTCTCCGGTGGTGCAACCAGCTGTCTCCG
GAGGTAGAGCACCGTTCCTTTTCGCCGGAAGAAGACGAGACGATTGTTCGAGCGCACGCT
CGGTTCGGTAACAAGTGGGCGACGATCTCTCGTCTCCTCAGTGGAAGAACCGACAACGCT
ATCAAGAATCATTGGAACTCGACGCTCAAGGAAAATGCAGCGCATTTACATCTGACGGAC
AAAGTGGAAACGGAGGGTATGACGGTAATATAGGAGAAGAACAACCGCTGAAACGTACGG
CGAGTGGTGGTGGTGGTGTGTCTACTGAGTTGTATATGAGCCCCGGAAGTCCTTCTGGAT
CTGACGTCAGCGAGCAATCTGGTGGTGGGCAACACGTGTCTAGATCTGGTGCTGTGAATG
AGATGACGGCGTCATCGTCCGGTGAAGATCCGCCGACGTATCTAAGTTTATCTCTCCCTT
GGAATAATAGACAGAGACGGTTAGAGTCAACGAGTCAACTCAACTAAACGAGGATACGGT
TATTGATAATGGTTACACGGCGGAGCTGTTT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1B876JQ 546 0 0
TCAGCGAGCAATCTGGTGGTGGGCAACACGTGTCTAGATCTGGTGCTGTGAATGAGATGA
CGGCGTCATCGTCCGGTGAAGATCCGCCGACGTATTTAAGTTTATCTCTCCCTTGGAATA
ATAGACAGAGACGGTTAGAGTCAACGAGTCAACTCAACTAAACGAGGATACGGTTATTGA
TAATGGTTACACGGCGGAGCTGTTTCCGGTTAGGAAGGAAGAGGTAGAGGAAGAGAAAGA
GATGTCAGGATTTGGTGGTGAGTTCATGACGGTGGTGCAGGAGATGATTAGGACGGAGGT
GAGGAGTTACATGGCGGATTTACAGCGAGGGAACGTCGGTGGTGGTGGTGGTGGTTCGTG
TGTTCCGCAAGGTGTAATGAACCTTCGTGTCGGGTTTAGAGAGTTTGTAGTGAACCAAAT
CGGCATTGGGAAGATCGAGTAGAGTGATGACTGATTAGTGAGGCTTCAAAGCTTTTCATG
TATAGAGAAATGGTTAGAGAGAAGCAAATTAAAAATGTTTTGTAATCATATGATCTTTCG
TGATCC

QA 1 546 1 546
DS 



AS 1 2

CO CL4243Contig1 200 2 1 U
GATCTGCCGCCTCGTCTGCATTGCCGGCTCTTGGCTCTCTTGTTGGAGCTTCCCTTGTAT
CCCTTTTCAGCTACTACTTGCACTAAGTTAATACCTTCCTACTATTAATGTGGTCTTTAT
TCATTTGCTACCTATTCCATTTCATTTGTAATTAATAAAACTGAGAAAGTAAATCAAGAA
TAATCTTTCTCTTCTTCATT


BQ
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AF RS1AU22JQ C 1
AF RS1AU22TF U 1
BS 1 200 RS1AU22TF

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DS 

RD RS1AU22TF 200 0 0
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QA 1 200 1 200
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1BB45JQ C 1
AF RS1BB45TF U 1
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TACACTTACACTTGGTCTCATATGCAAATTCTTGGGTTGAGCCAGAACTCTCACTTCGAT
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QA 1 467 1 467
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1E829TF U 1
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DS 



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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FY78TF U 1
AF RS1FY78JQ C 253
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BS 692 692 RS1FY78JQ
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TTTAAGTA
TCACTGCA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1FY78JQ 805 0 0
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TTTGCAATCTGTTCATCACACATCTGGCTTCTCCAACTGCATCAATAATGTAATTTAATA
AATTAAGCTTAGGTGCTTCTTAAACTTTTGGTCGAGGAAGATTGTGGAAGAAGAATTGTG
GCTGTGAAGTCTTTATCTCTAGTTATATTAGTAGGTTTAGAGACTTGTTTGGGATTCATG
TTCCGTGTTTGTGTGTGTTTTCATAGATAAACAAGAAGCTAAAGCGCATGCCAATGACAT
TTCAACTTATTGCGGAAGATTGCTGGAGGAAACGGAAGATGAGCTTGCTGAGGTAATAAA
GAATGGATCGTTAAAAGTAGGAGATGCGCGCAAGGTTCTGTGTCAAACTTTAAGTAATCA
CTGCAGCAAATCAAGTGAAACAGATTCAGAAGATGAGGACGCCGATGACGATGCGGATGA
ATTATAGCTCATTCCGGGGAAATGTCATCACTTTTTTACCAACAAGGTCCGACTACAAAG
ACATTTTTTTACGACTCATTTGTAGCTTATACACCTTTTTCAGCCTTTATGTTCCATCGA
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CTCAAAGACATTTAAATTAGCTTCACAGAACAATGATACTAGTCTAAATTAAATACTAAA
TACAATTAAAACTAGATTGTTTGTC

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 2

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CTTCTTGTGTTTGTGAACTTTGAACGGTCAAACTGCTAAACTATCCT


BQ
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AF RS1GJ76JQ C 1
AF RS1GJ76TF U 1
BS 1 467 RS1GJ76TF

RD RS1GJ76JQ 467 0 0
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CTTCTTGTGTTTGTGAACTTTGAACGGTCAAACTGCTAAACTATCCT

QA 1 467 1 467
DS 

RD RS1GJ76TF 467 0 0
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ATCACAGGAAGACGAGGCCGAAGAAGACTCAGCCTTGGGACATTAAGAGAAAGCCTACAG
TGTATGCTCCTCTTCCTCCTCTCCCTCCGGATTGGTCTCCGCTCGCTGTTTCTTCCAACG
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CTTCTTGTGTTTGTGAACTTTGAACGGTCAAACTGCTAAACTATCCT

QA 1 467 1 467
DS 



AS 1 2

CO CL4248Contig1 759 2 8 U
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CTGTCTCTTTTAGATCCTCTGTTTTCTCCGCCTCCTCTGTTTTTTCTCCTTTTTTCTTCT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1C707TF U 1
AF RS1E349TF U 160
BS 1 518 RS1C707TF
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RD RS1C707TF 649 0 0
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CTGTCTCTTTTAGATCCTCTGTTTTCTCCGCCTCCTCTGTTTTTTCTCCTTTTTTCTTCT
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TATATTTGGTCTGTTGGAGAGAGCCAAGTACTGTTACAATGCAGATACTTATGATCCTAC
TGCCTTCGACATGGATGGTTTCAACGGCTCTTTGGTTGAGTACATGCTC

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1E349TF 600 0 0
GG
ATCATCTGCAGATTATTCTCTGTCTCTTTTAGATCCTCTGTTTTCTCCGCCTCCTCTGTT
TTTTCTCCTTTTTTCTTCTCACATCAATGGAGGCGTCATTGTCGATGATGAAATCGTCCG
TCTCTTCCCCCGCGACTGTGTTCCTCAGCCACCACCATAGACGCACCTCTAGACCTATTT
CTCCCACGTTACACAAAGCTTCCTTCTCTGTTCGCTGTTCTCTCCCTCCCTCGAAGCCTC
CACGCCGCTCCGGAGCCAGCTCAGTTCACGCCGTTATGACTCTCGCTGGATCGTTGATAG
GGAAGAAACGAGTGGATGAGAGCGAGAGTTTGACTCTGGAAGGTATCCGGAACTCTTCGA
TCAGACAAGAGGACAGCATTATATTTGGTCGGTTGGAGAGAGCCAAGT*CTGTTACAATG
CAGATACTTATGATCCTACTGCCTTCGACATGGATGGTTTCAACGGCTCTTTGGTTGAGT
ACATGCTCCAAGGCACCGAGAAGCTTCACGCTAAGGTTGGTAGGTTCAAGAGCCCTGATG
AGCATCCTTTCTTCCCTCAAGATTTACCTGAGCCTATGTTGCCTCCTCTCAGTACCCA

QA 3 600 3 600
DS 



AS 1 2

CO CL4249Contig1 715 2 3 U
TCCGCCATTTCTGCGCGATATAACCAAGACTAAGGACACGATCAACAATCTCGAAGAGAA
TGTCTCTGTTATACTCGGGATGTCCTTGAAGACAGAAGAAATGATCCTCAATGGTGTACA
TCTCCACCTCGTACTTGTCGGAATAAGCTAGTACTTTGGCAGTTTCCGGCAACACTAACA
CTTCGTCCTGGTGCAATTTTATAATCGCTATGCTATCTGGGATCTCGTTTCCGAAGTAAC
TTCCCGGTGTAATCGCATCTTTCACGATGGTTATATCCGCAAGCTTAAGTTCTGGTCCCT
TCCTTGCTCTTCCAACTGTCCCTCCTCTTACTCTGGCTATGATCTGATGACCGAAGCAAA
TGCCAAGAACTTTCTTCTTCATCTCATCAAGTTTCTTGACGATCTCACATAGCTTAAGAA
TCCAAGGGTCATTCTCGAACGAATCATGAGAGCTTCCGCTGATAACAAAACCATCGTACT
TCTCAAGATCCTTTTCCTCAGGAAACTCGCCCTCGACAACCCTAAACGAGTCCCAGTGCT
CTCCTTCGTCTCCAAACGTCTCCACAAACACGTTGTGGTATCCTCCGTACGTTTTCTTCA
CGAACTCTGAATCAAGAGTCGCTAGAAACAGAGCATACTTTTTCTGCTCAACCATTCTCT
CGGGGAAAGAAAACACAAGAGAGAGAGAAAGAGAGAATGATTTGGAGGTAGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F145JQ U 53
AF RS1F145TF C 1
BS 1 58 RS1F145TF
BS 59 529 RS1F145JQ
BS 530 715 RS1F145TF

RD RS1F145JQ 477 0 0
GAAAAA
AATGTCTCTGTTATACTCGGGATGTCCTTGAAGACAGAAGAAATGATCCTCAATGGTGTA
CATCTCCACCTCGTACTTGTCGGAATAAGCTAGTACTTTGGCAGTTTCCGGCAACACTAA
CACTTCGTCCTGGTGCAATTTTATAATCGCTATGCTATCTGGGATCTCGTTTCCGAAGTA
ACTTCCCGGTGTAATCGCATCTTTCACGATGGTTATATCCGCAAGCTTAAGTTCTGGTCC
CTTCCTTGCTCTTCCAACTGTCCCTCCTCTTACTCTGGCTATGATCTGATGACCGAAGCA
AATGCCAAGAACTTTCTTCTTCATCTCATCAAGTTTCTTGACGATCTCACATAGCTTAAG
AATCCAAGGGTCATTCTCGAACGAATCATGAGAGCTTCCGCTGATAACAAAACCATCGTA
CTTCTCAAGATCCTTTTCCTCAGGAAACTCGCCCTCGACAACCCTAAACGA

QA 7 477 7 477
DS 

RD RS1F145TF 715 0 0
TCCGCCATTTCTGCGCGATATAACCAAGACTAAGGACACGATCAACAATCTCGAAGAGAA
TGTCTCTGTTATACTCGGGATGTC*TTGAAGACAGAAGAAATGATCCTCAATGGTGTACA
TCTCCACCTCGTACTTGTCGGAATAAGCTAGTACTTTGGCAGTTTCCGGCAACACTAACA
CTTCGTCCTGGTGCAATTTTATAATCGCTATGCTATCTGGGATCTCGTTTCCGAAGTAAC
TTCCCGGTGTAATCGCATCTTTCACGATGGTTATATCCGCAAGCTTAAGTTCTGGTCCCT
TCCTTGCTCTTCCAACTGTCCCTCCTCTTACTCTGGCTATGATCTGATGACCGAAGCAAA
TGCCAAGAACTTTCTTCTTCATCTCATCAAGTTTCTTGACGATCTCACATAGCTTAAGAA
TCCAAGGGTCATTCTCGAACGAATCATGAGAGCTTCCGCTGATAACAAAACCATCGTACT
TCTCAAGATCCTTTTCCTCAGGAAACTCGCCCTCGACAACCCTAAACGAGTCCCAGTGCT
CTCCTTCGTCTCCAAACGTCTCCACAAACACGTTGTGGTATCCTCCGTACGTTTTCTTCA
CGAACTCTGAATCAAGAGTCGCTAGAAACAGAGCATACTTTTTCTGCTCAACCATTCTCT
CGGGGAAAGAAAACACAAGAGAGAGAGAAAGAGAGAATGATTTGGAGGTAGAGCC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

CO CL4250Contig1 1059 2 4 U
GGGGGTCGACCCGATTCTACAACAATCCCCAAGCCAAGCCACGCGATAATCGGCTTTCTT
CATACCGGAAACTTATCGGAGATCATAGCCACGGAGAAAGAGGATGTGAAGAAGAGTGAA
GATGGATCGCCTGAAATCAAACCGAAACCGATTGTTCAGCTCAGAAATTTTCTCATCGCT
CACAGTCGGTCCCGTGTTCAGTCCAGAGGCTCATTGGGAAATACATGTCAGAAATGGGTG
CAGAAGTCTATTATCAAAAATTCCCATCGTGAAGAGAACCAATTTCACCCACTGCACTTC
TTCTCCGGTCCTGCTTCATATACATTTCTAGGGAATGTCAATTGGGCTTCTTATGGGGTT
AACGTTGCTGGGATTCTAATAGCCCTCGTGGTGACGGAAAAGAGTCTGTTGTGCTGGTTA
CTCCCCATGATTACATAAACGGTGGAGATTATGAGGAGGATTTGTCTTTAGGCATTGCCA
CTTCTTTATTCTCCTTGCTCGCAGGAGTTACCTGTTGCTGCATGGTTAAGCTGGAAAAAT
TAGCTGCTGCTTTGGTTGTGAACGTCGATGGTAAAAGTGAAAGGTTTGAGGACACACTAA
GTATCTATGCAGAGGCATCCAATGGGCAGGTGCCAAAATCTCGACCTCATCAATGTTGTA
AATTACTTAGCGGTGCACAAACAGGGCTTTTATGTTAAGGTGGAGAAGGTTGTATCGTTG
CTTTCCTCTACTTGGCTAAAGATTGTTGGTGAAATATTTAAAGCTGTTACGTTGAATACG
GACTGGAGTTCGGTGTCCCAGTCGCAGACTATCTTGAAGACAGTGCTACCCCCAGCAAGT
TCACTCTACTCGCAGGTAAAAGTGTATAGTTGTATCTGTCTTTAGTTAGATTCTTTTAGT
TGACAGAGAATGTATTATTATTTTTGTATTCTTTCTCATCAGGCCCGTGGTATCCCAACT
GAGTTTTTGTCTTTATAATTTCCTTCTTTTTAATTCGTATGTGAATCTTGTAATGCGTAA
GAACTGCAGTAAATCATTTATGCAGTAGAATTTCTCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AN15TF U 1
AF RS1AN15JQ C 315
BS 1 397 RS1AN15TF
BS 398 398 RS1AN15JQ
BS 399 783 RS1AN15TF
BS 784 1059 RS1AN15JQ

RD RS1AN15TF 783 0 0
GGGGGTCGACCCGATTCTACAACAATCCCCAAGCCAAGCCACGCGATAATCGGCTTTCTT
CATACCGGAAACTTATCGGAGATCATAGCCACGGAGAAAGAGGATGTGAAGAAGAGTGAA
GATGGATCGCCTGAAATCAAACCGAAACCGATTGTTCAGCTCAGAAATTTTCTCATCGCT
CACAGTCGGTCCCGTGTTCAGTCCAGAGGCTCATTGGGAAATACATGTCAGAAATGGGTG
CAGAAGTCTATTATCAAAAATTCCCATCGTGAAGAGAACCAATTTCACCCACTGCACTTC
TTCTCCGGTCCTGCTTCATATACATTTCTAGGGAATGTCAATTGGGCTTCTTATGGGGTT
AACGTTGCTGGGATTCTAATAGCCCTCGTGGTGACGGGAAAGAGTCTGTTGTGCTGGTTA
CTCCCCATGATTACATAAACGGTGGAGATTATGAGGAGGATTTGTCTTTAGGCATTGCCA
CTTCTTTATTCTCCTTGCTCGCAGGAGTTACCTGTTGCTGCATGGTTAAGCTGGAAAAAT
TAGCTGCTGCTTTGGTTGTGAACGTCGATGGTAAAAGTGAAAGGTTTGAGGACACACTAA
GTATCTATGCAGAGGCATCCAATGGGCAGGTGCCAAAATCTCGACCTCATCAATGTTGTA
AATTACTTAGCGGTGCACAAACAGGGCTTTTATGTTAAGGTGGAGAAGGTTGTATCGTTG
CTTTCCTCTACTTGGCTAAAGATTGTTGGTGAAATATTTAAAGCTGTTACGTTGAATACG
GAC

QA 1 783 1 783
DS 

RD RS1AN15JQ 745 0 0
TTCATATACATTTCTAGGGAATGTCAATTGGGCTTCTTATGGGGTTAACGTTGCTGGGAT
TCTAATAGCCCTCGTGGTGACGGAAAAGAGTCTGTTGTGCTGGTTACTCCCCATGATTAC
ATAAACGGTGGAGATTATGAGGAGGATTTGTCTTTAGGCATTGCCACTTCTTTATTCTCC
TTGCTCGCAGGAGTTACCTGTTGCTGCATGGTTAAGCTGGAAAAATTAGCTGCTGCTTTG
GTTGTGAACGTCGATGGTAAAAGTGAAAGGTTTGAGGACACACTAAGTATCTATGCAGAG
GCATCCAATGGGCAGGTGCCAAAATCTCGACCTCATCAATGTTGTAAATTACTTAGCGGT
GCACAAACAGGGCTTTTATGTTAAGGTGGAGAAGGTTGTATCGTTGCTTTCCTCTACTTG
GCTAAAGATTGTTGGTGAAATATTTAAAGCTGTTACGTTGAATACGGACTGGAGTTCGGT
GTCCCAGTCGCAGACTATCTTGAAGACAGTGCTACCCCCAGCAAGTTCACTCTACTCGCA
GGTAAAAGTGTATAGTTGTATCTGTCTTTAGTTAGATTCTTTTAGTTGACAGAGAATGTA
TTATTATTTTTGTATTCTTTCTCATCAGGCCCGTGGTATCCCAACTGAGTTTTTGTCTTT
ATAATTTCCTTCTTTTTAATTCGTATGTGAATCTTGTAATGCGTAAGAACTGCAGTAAAT
CATTTATGCAGTAGAATTTCTCAGC

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 2

CO CL4251Contig1 1462 2 2 U
GGGATGAGAGAGTCGAGTCTACGAGCGTGACCGAGAATATATACATTCAGAGCTCCTTTA
CCACCTTGATCCTTGCATTGCACCCTCATCGACACTCGTCTCACTCTCTCTGTCTCTTTC
CTCTGATCGTGGATTGAGATGGAGACCTTACCCACGACGACGGTTTCGTCTTCTTCTAAA
TCAGAACGACGAGGAAGATCCTCCAAAACCTCCTCCAAGCCCTCCGTTATCATGGCTTTC
TTCTCTTGCGTTGCTTGGCTCTACGTCCTTGGCCGGTTATGGCAAGACGCAGAGAACAGA
GTGATACTCAATAATATGCTTAAGAAGAATTATGATCAGAAGCCTAAGGTTCTTACGGTG
GATGAGAAGCTTATGGTTCTCGGATGCAAAGATCTGGAGAGGAAGATTGTTGAAACTGAA
ATGGAGTTGACTTTGGCTAAGAGCCAAGGCTATCTGAAAAGTGGTTCGTCGTCCAAGAGG
TTGCTTGCTGTAATTGGAGTCTATACTGGCTTTGGAAGCCATTTGAGGAGAAATGCATTT
AGAGGCTCTTTGATGCCACAAGGTGATGCTTTGAAGAAACTTGAGGAAAGAGGAGTTGTC
ATACGTCTTGTGATCGGTCGAAGTCCAAACCGAGGTGATAGCTTAGATCGAAAGATTGAT
GAGGAAGATAGAGCAAGAAGAGATTTTCTGATTCTTGAGAATCACGAGGAGGCACAAGAA
GAGCTACCCAAGAAAGTGAAGTTCTTCTTCAGTGCTGCTGTTCAGAACTGGGATGCAGAG
TTTTACATCAAAGTCGACGATAATATTGACCTAGATCTTGAGGGATTGATTAGCCTCCTT
GAAAGTCGGCGTGGTCAAGATGCGTCTTACATTGGGTGCATGAAGTCTGGGGAAGTTGTT
ACTGAAAAGGGAGGGCAATGGTACGAGCCAGAATGGTGGAAGTTTGGGGACGAGAAATCA
TACTTTCGTCATGCAGCTGGTTCGCTTATAATACTATCCAAGAATTTGGCTCAGTACATA
AACATAAACAGTGGATCGTTGAAGACATATGCATTTGATGATACCTCTATAGGATCTTGG
ATGATTGGTGTTCAGGCAACTTATATAGATGACAATCGCCTTTGCTGTAGCAGCATTAGA
CAAGACAAGGTGTGCTCTGTGGCTTGATCAAAGGGCGCCCTTAACAGTTTATTCCAACTT
AACCTCTCGTGTTTTTGTGGCGATTCGGGTTGGGGAGTTGTTATATTTGTTATTTAGAAT
CAGATTACAATCAGCCATTACTTAGGGCATATACCCAAGAATTTGTAGCTGTGAAGAAAA
AGAAGAAAAGTACATTATAAGTTACAACTGACAAAGAATAGTAGAGAATCAGTTGGACTC
CAGTCCCGAGCTTTAAACTATAGTTTGAGTGATGGAGTAATTTACTTGGAACCTTTATAT
GAAAAGATGCCTGGTTTTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BA08TF U 1
AF RS1BA08JQ C 680
BS 1 744 RS1BA08TF
BS 745 1462 RS1BA08JQ

RD RS1BA08TF 744 0 0
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CCACCTTGATCCTTGCATTGCACCCTCATCGACACTCGTCTCACTCTCTCTGTCTCTTTC
CTCTGATCGTGGATTGAGATGGAGACCTTACCCACGACGACGGTTTCGTCTTCTTCTAAA
TCAGAACGACGAGGAAGATCCTCCAAAACCTCCTCCAAGCCCTCCGTTATCATGGCTTTC
TTCTCTTGCGTTGCTTGGCTCTACGTCCTTGGCCGGTTATGGCAAGACGCAGAGAACAGA
GTGATACTCAATAATATGCTTAAGAAGAATTATGATCAGAAGCCTAAGGTTCTTACGGTG
GATGAGAAGCTTATGGTTCTCGGATGCAAAGATCTGGAGAGGAAGATTGTTGAAACTGAA
ATGGAGTTGACTTTGGCTAAGAGCCAAGGCTATCTGAAAAGTGGTTCGTCGTCCAAGAGG
TTGCTTGCTGTAATTGGAGTCTATACTGGCTTTGGAAGCCATTTGAGGAGAAATGCATTT
AGAGGCTCTTTGATGCCACAAGGTGATGCTTTGAAGAAACTTGAGGAAAGAGGAGTTGTC
ATACGTCTTGTGATCGGTCGAAGTCCAAACCGAGGTGATAGCTTAGATCGAAAGATTGAT
GAGGAAGATAGAGCAAGAAGAGATTTTCTGATTCTTGAGAATCACGAGGAGGCACAAGAA
GAGCTACCCAAGAAAGTGAAGTTC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1BA08JQ 783 0 0
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AGTTCTTCTTCAGTGCTGCTGTTCAGAACTGGGATGCAGAGTTTTACATCAAAGTCGACG
ATAATATTGACCTAGATCTTGAGGGATTGATTAGCCTCCTTGAAAGTCGGCGTGGTCAAG
ATGCGTCTTACATTGGGTGCATGAAGTCTGGGGAAGTTGTTACTGAAAAGGGAGGGCAAT
GGTACGAGCCAGAATGGTGGAAGTTTGGGGACGAGAAATCATACTTTCGTCATGCAGCTG
GTTCGCTTATAATACTATCCAAGAATTTGGCTCAGTACATAAACATAAACAGTGGATCGT
TGAAGACATATGCATTTGATGATACCTCTATAGGATCTTGGATGATTGGTGTTCAGGCAA
CTTATATAGATGACAATCGCCTTTGCTGTAGCAGCATTAGACAAGACAAGGTGTGCTCTG
TGGCTTGATCAAAGGGCGCCCTTAACAGTTTATTCCAACTTAACCTCTCGTGTTTTTGTG
GCGATTCGGGTTGGGGAGTTGTTATATTTGTTATTTAGAATCAGATTACAATCAGCCATT
ACTTAGGGCATATACCCAAGAATTTGTAGCTGTGAAGAAAAAGAAGAAAAGTACATTATA
AGTTACAACTGACAAAGAATAGTAGAGAATCAGTTGGACTCCAGTCCCGAGCTTTAAACT
ATAGTTTGAGTGATGGAGTAATTTACTTGGAACCTTTATATGAAAAGATGCCTGGTTTTT
CTC

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 2

CO CL4252Contig1 469 2 1 U
GACTGGAATCAACAAGAAGAATGGCAAAAGCTATGGAGCTCTGGGTTGGAGAGATGAAAA
AGATGGGTGAGAAGATAAACCATAGAAACCCGTTGATGCAAAACAAGAAGAGTACATCTT
CTATTGTGTCCAAACAACAACAAGGAGAAGAAGAAAGAGGAGTTGCTCAAAATGTGAGAG
AAAAGGATACAACTATGTCTGAGCTCACTGTCTGTCTTCTCATGGACCGTTTTGTTCCAT
GGTGATCCTCCAATATAGTATTTTTTAGATCTCCCCTTTGTTGATGTTTGTTTATATATC
CAGAGTTATATGTATATATATATGTATATAGATGTTGTATATGCAGTCCATGATCTTAAA
TTTCCATGTAAATCTATGAGGGTAATGTGTTTTGAGGGCTATAATTTGTTTTATTAGCCA
ATATACAGTGTTTAATTATTATAATAAAAATGATGACAGCTTTCTTTTG


BQ
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AF RS1B907JQ C 1
AF RS1B907TF U 1
BS 1 469 RS1B907TF

RD RS1B907JQ 469 0 0
GACTGGAATCAACAAGAAGAATGGCAAAAGCTATGGAGCTCTGGGTTGGAGAGATGAAAA
AGATGGGTGAGAAGATAAACCATAGAAACCCGTTGATGCAAAACAAGAAGAGTACATCTT
CTATTGTGTCCAAACAACAACAAGGAGAAGAAGAAAGAGGAGTTGCTCAAAATGTGAGAG
AAAAGGATACAACTATGTTTGAGCTCACTGTCTGTCTTCTCATGGACCGTTTTGTTCCAT
GGTGATCCTCCAATATAGTATTTTTTAGATCTCCCCTTTGTTGATGTTTGTTTATATATC
CAGAGTTATATGTATATATATATGTATATAGATGTTGTATATGCAGTCCATGATCTTAAA
TTTCCATGTAAATCTATGAGGGTAATGTGTTTTGAGGGCTATAATTTGTTTTATTAGCCA
ATATACAGTGTTTAATTATTATAATAAAAATGATGACAGCTTTCTTTTG

QA 1 469 1 469
DS 

RD RS1B907TF 469 0 0
GACTGGAATCAACAAGAAGAATGGCAAAAGCTATGGAGCTCTGGGTTGGAGAGATGAAAA
AGATGGGTGAGAAGATAAACCATAGAAACCCGTTGATGCAAAACAAGAAGAGTACATCTT
CTATTGTGTCCAAACAACAACAAGGAGAAGAAGAAAGAGGAGTTGCTCAAAATGTGAGAG
AAAAGGATACAACTATGTCTGAGCTCACTGTCTGTCTTCTCATGGACCGTTTTGTTCCAT
GGTGATCCTCCAATATAGTATTTTTTAGATCTCCCCTTTGTTGATGTTTGTTTATATATC
CAGAGTTATATGTATATATATATGTATATAGATGTTGTATATGCAGTCCATGATCTTAAA
TTTCCATGTAAATCTATGAGGGTAATGTGTTTTGAGGGCTATAATTTGTTTTATTAGCCA
ATATACAGTGTTTAATTATTATAATAAAAATGATGACAGCTTTCTTTTG

QA 1 469 1 469
DS 



AS 1 2

CO CL4253Contig1 1081 2 4 U
GGAAAGGAAGCAGATCAGCGATACGACTCTCGAGGATCATCTCCGAGACGCTCAAGCATC
TTGATTCTGATTCGAGGAAGAGTGTGAGGTGGTTCGTGATGGGCGATGACGACACGGTGT
TCGTCACGGATAATCTGATTAGGGTTCTGAGGAGTACGACCACGAGCAGATGTATTACAT
CGGGAGCTTGTCGGAATCTCATCTACAGAACATTTTCTTTTCTTATGGGATGGCTTACGG
TGGAGGTGGTTTCGCTATTAGCTATCCCTTGGCTGTGGCTTTGAGCAAGATTCAGGATCG
GTGTATACGGAGGTATCCGGCTTTGTACGGTTCCGATGATCGTATACAAGCTTGTATGGC
TGAGCTTGGAGTTCCATTGACTAAGGAGCAAGGTTTTCATCAATATGACGTCCATGGGAA
CTTATTCGGCCTCCTCGCTGCCCACCCGGTGACACCGTTCGTATCAATGCACCATCTCGA
TGTGGTGGAACCCGTCTTCCCAAACATGACCCGCGTTCGCTCCATCAAAAAACTAACCAC
ACCGATGCAGCTCGACTCGGCCGGACTACTCCAGCAATCAATATGCTACGACAAGTACAA
AAGCTGGACGGTTTCAGTGTCATGGGGATACGCGGTCCAGGTGTTTCGTGGATCGTTCTC
TCCCCGGGAAATGGAAATGCCTTCTAGAACTTTCTTGAACTGGTACAAAAGAGCAGATTA
CACCGCCTATGCATTCAATACAAGGCCAGTGAGTCGCAATTCGTGCCAAAAACCATTCGT
TTTCTACATGTCGGATGCGAATTTTGACAAGCAATTGAACACTACGGTAAGTGTATACAC
GAGGCATAGGGTTCCGCATCCGGCTTGTCGGTGGGAGATGACTAGTCCGGAGGAGATCAA
CACTATAGTAGTCTACAAAAAACCGGACCCTCACCTATGGGACAGGTCACCGAGAAGGAA
TTGTTGCAGAGTATTACAAACGAAGAGGAATAATACATTATGGATCAATGTTGGTGTATG
TAGAGCAGGTGAAGTTACTGAAGTTAAGTAGTTTCTAGTTCTGTAATAAGATGAGATTTG
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RS1B109TF U 1
AF RS1B109JQ C 241
BS 1 709 RS1B109TF
BS 710 710 RS1B109JQ
BS 711 737 RS1B109TF
BS 738 1081 RS1B109JQ

RD RS1B109TF 752 0 0
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CGGGAGCTTGTCGGAATCTCATCTACAGAACATTTTCTTTTCTTATGGGATGGCTTACGG
TGGAGGTGGTTTCGCTATTAGCTATCCCTTGGCTGTGGCTTTGAGCAAGATTCAGGATCG
GTGTATACGGAGGTATCCGGCTTTGTACGGTTCCGATGATCGTATACAAGCTTGTATGGC
TGAGCTTGGAGTTCCATTGACTAAGGAGCAAGGTTTTCATCAATATGACGTCCATGGGAA
CTTATTCGGCCTCCTCGCTGCCCACCCGGTGACACCGTTCGTATCAATGCACCATCTCGA
TGTGGTGGAACCCGTCTTCCCAAACATGACCCGCGTTCGCTCCATCAAAAAACTAACCAC
ACCGATGCAGCTCGACTCGGCCGGACTACTCCAGCAATCAATATGCTACGACAAGTACAA
AAGCTGGACGGTTTCAGTGTCATGGGGATACGCGGTCCAGGTGTTTCGTGGATCGTTCTC
TCCCCGGGAAATGGAAATGCCTTCTAGAACTTTCTTGAACTGGTACAAA*GAGCAGATTA
CACCGCCTATGCATTCA
TACAGGCAGTGAGTC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RS1B109JQ 841 0 0
TACGTGAGTG
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CTCCTCGCTGCCCACCCGGTGACACCGTTCGTATCAATGCACCATCTCGATGTGGTGGAA
CCCGTCTTCCCAAACATGACCCGCGTTCGCTCCATCAAAAAACTAACCACACCGATGCAG
CTCGATTCGGCCGGACTACTCCAGCAATCAATATGTTACGACAAGTACAAAAGCTGGACG
GTTTCAGTGTCATGGGGATACGCGGTCCAGGTGTTTCGTGGATCGTTCTCTCCCCGGGAA
ATGGAAATGCCTTCTAGAACTTTCTTGAACTGGTACAAAAGAGCAGATTACACCGCCTAT
GCATTCAATACAAGGCCAGTGAGTCGCAATTCGTGCCAAAAACCATTCGTTTTCTACATG
TCGGATGCGAATTTTGACAAGCAATTGAACACTACGGTAAGTGTATACACGAGGCATAGG
GTTCCGCATCCGGCTTGTCGGTGGGAGATGACTAGTCCGGAGGAGATCAACACTATAGTA
GTCTACAAAAAACCGGACCCTCACCTATGGGACAGGTCACCGAGAAGGAATTGTTGCAGA
GTATTACAAACGAAGAGGAATAATACATTATGGATCAATGTTGGTGTATGTAGAGCAGGT
GAAGTTACTGAAGTTAAGTAGTTTCTAGTTCTGTAATAAGATGAGATTTGC

QA 11 841 11 841
DS 



AS 1 2

CO CL4254Contig1 870 2 8 U
AGATCATCATAATATCTAGCTCCTCCTTTTGAATCTTCTCCAAAATTATCTTCCGAAAGG
AATAATCCTAATTTCTTCTCTTCTTAATTATTTCCCATGGATATAGAAAAGACCGGTAGC
AGAAGAGAAGAAGAAGAACCCATTGTTCAAAAGCCAAAGCTAGAAAAAGGAAAAGGCAAA
GCTCATGTGTTTGCTCCTCCTATGAACTACAGTCGAATCATGGAAAAACATAAGCAAGAA
AAGGTGAGTATGGCCGGCTGGAAAAGAGGTGTAGCAATCTTTGATTTTGTACTTAGACTG
ATTGCAGCCATTACGGCCATGGCCGCTGCAGCAAAGATGGCAACCACAGAAGAGACTCTC
CCTTTCTTCACTCAGTTCTTGCAGTTCAGTGCTGACTACACCGATTTACCGACGTTGTCG
TCTTTCGTTATAGTAAACTCAATCGTGGGCGGTTACCTAACCCTCTCATTGCCTTTCTCC
ATAGTCTGTATCCTCCGGCCTCTCGCCGTGCCGCCTAGGCTCTTCCTCATCTTATGTGAC
ACGGCGATGATGGGCCTCACGATGGTGGCAGCATCCGCTTCTGCAGCAATAGTTTATTTG
GCGCACAACGGGAATTCAAGCTCGAATTGGCTTCCGGTTTGCCAGCAATTTGGTGACTTT
TGCCAAGGAACGAGGGGCGCCGTGGTGGCTTCCTTTATTGCAGCGGCTCTTTTGATGTTC
CTCGTCATCCTCTCTGCATTTGCTCTTAAAAGATAGACTTGAAAGTTTGCAATTAAAATT
CATTTATGTGAAAATTTGAAAAGGGTCAGATGTATGATTTGGTTTCTTGTGTTGTGTAAA
TCGAATGTACTGAATCATGTTGTTTTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EO67TF U 1
AF RS1EO67JQ C 261
BS 1 663 RS1EO67TF
BS 664 664 RS1EO67JQ
BS 665 674 RS1EO67TF
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BS 752 762 RS1EO67TF
BS 763 870 RS1EO67JQ

RD RS1EO67TF 762 0 0
AGATCATCATAATATCTAGCTCCTCCTTTTGAATCTTCTCCAAAATTATCTTCCGAAAGG
AATAATCCTAATTTCTTCTCTTCTTAATTATTTCCCATGGATATAGAAAAGACCGGTAGC
AGAAGAGAAGAAGAAGAACCCATTGTTCAAAAGCCAAAGCTAGAAAAAGGAAAAGGCAAA
GCTCATGTGTTTGCTCCTCCTATGAACTACAGTCGAATCATGGAAAAACATAAGCAAGAA
AAGGTGAGTATGGCCGGCTGGAAAAGAGGTGTAGCAATCTTTGATTTTGTACTTAGACTG
ATTGCAGCCATTACGGCCATGGCCGCTGCAGCAAAGATGGCAACCACAGAAGAGACTCTC
CCTTTCTTCACTCAGTTCTTGCAGTTCAGTGCTGACTACACCGATTTACCGACGTTGTCG
TCTTTCGTTATAGTAAACTCAATCGTGGGCGGTTACCTAACCCTCTCATTGCCTTTCTCC
ATAGTCTGTATCCTCCGGCCTCTCGCCGTGCCGCCTAGGCTCTTCCTCATCTTATGTGAC
ACGGCGATGATGGGCCTCACGATGGTGGCAGCATCCGCTTCTGCAGCAATAGTTTATTTG
GCGCACAACGGGAATTCAAGCTCGAATTGGCTTCCGGTTTGCCAGCAATTTGGTGACTTT
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QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1EO67JQ 610 0 0
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GGCCGCTGCAGCAAAGATGGCAACCACAGAAGAGACTCTCCCTTTTTTCACTCAGTTTTT
GCAGTTCAGTGCTGACTACACCGATTTACCGACGTTGTCGTCTTTCGTTATAGTAAACTC
AATCGTGGGCGGTTACCTAACCCTCTCATTGCCTTTTTCCATAGTCTGTATCCTCCGGCC
TCTCGCCGTGCCGCCTAGGCTTTTCCTCATTTTATGTGACACGGCGATGATGGGCCTCAC
GATGGTGGCAGCATCCGCTTTTGCAGCAATAGTTTATTTGGCGCACAACGGGAATTCAAG
CTCGAATTGGCTTCCGGTTTGCCAGCAATTTGGTGACTTTTGCCAAGGAACGAGGGGCGC
CGTGGTGGCTTCCTTTATTGCAGCGGCTCTTTTGATGTTCCTCGTCATCCTCTCTGCATT
TGCTCTTAAAAGATAGACTTGAAAGTTTGCAATTAAAATTCATTTATGTGAAAATTTGAA
AAGGGTCAGATGTATGATTTGGTTTCTTGTGTTGTGTAAATCGAATGTACTGAATCATGT
TGTTTTTGTT

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 2

CO CL4255Contig1 1182 2 2 U
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TCTTTTTCAGGCGCAACCAAATAGAAACATAAACACTTAAGAGCATAAACCAACCATAGA
TTCTTGGGACACTTCTTAGTTTTGACCGATTCTGATCCGTTATAGTTGTTTCAAACGACA
CGGTGAAACGTTTGTTCTTATTTAAAATATCATACTCCTCTTTTCTTTCTCCTCCTTCTC
TATCTTGGAAACTAGGGTTCTTCAAGATCCTTTGTGAGCTAAATGGGTGTTGAGAAAATG
GTGTGTTTGGTTTCTCGCACTGGTCGTCAGTTTCAGAGATACAACAAAGGTCGTCGTCAA
GTCGTCGGGTGTATACCGTACAGATTCAAGCTATCAAGTGATGGGAAAATTAGTGATGAA
TTAGAAATTCTTGTTATCTCTTCTCAAAAAGGTCATGCCATGATGTTCCCAAAGGGTGGT
TGGGAGCTTGATGAATCTGTAGAAGAAGCTGCTGCAAGAGAATCTCTCGAAGAAGCTGGA
GTTCTTGGCAATATTGGGCATCAACTAGGAAAATGGGATTTTTTGAGCAAAAGCAGGGGA
ACATATTATGAAGGACTAATGTTCCCTATGCTTGTTACAGAACAACTTGAGCTTTGGCCT
GAACAACATGCTAGGCAAAGAATCTGGATGAATCTAGTTGACGCTAGAGAAGCTTGTAGA
GATTGGTGGATGAAAGAAGCATTAGATGTTTTGGTCGAGAGACTCTCATCACCAATGAAT
CAACCAAGGGAAGAGAAGAATATTTCAATATCTATCGAAACAATGTGCTGATGATTTGCT
ACAAAAAAAATTGCGGCTGATTGTGATGGGAGTTTTATGGACTAATGGATCTCTGTAGAT
AGAAATAGATGTGGTCTCCAATTAGAATTGAGAGAGTGATTTGAAGAGCAGGTGCAGAAC
AGGAACAAAAAAGATGGGTAGATCTTTTAGGTTTAATTTGGAGCAATGAAAAAACATCAT
GATTTAAGAAGTCCTGTGTGTTGTGTTTATAACGTTTCTGCATGATTTACTTAAGGGATG
ATGAAGGATTAGGAAGATAAACAAAGAGTTCAAGCAAGACATGTACAATGCGTTTCCCTC
TGTTTATTTTTTAATCTCATCTCTCTTTAAAATTTGCAATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BN82TF U 1
AF RS1BN82JQ C 449
BS 1 650 RS1BN82TF
BS 651 1182 RS1BN82JQ

RD RS1BN82TF 650 0 0
GGACAACGTTCTTGTCATCTCCTTCATATTCTCCTTCTTTATCTCTCTCTCTCTCTCAAC
TCTTTTTCAGGCGCAACCAAATAGAAACATAAACACTTAAGAGCATAAACCAACCATAGA
TTCTTGGGACACTTCTTAGTTTTGACCGATTCTGATCCGTTATAGTTGTTTCAAACGACA
CGGTGAAACGTTTGTTCTTATTTAAAATATCATACTCCTCTTTTCTTTCTCCTCCTTCTC
TATCTTGGAAACTAGGGTTCTTCAAGATCCTTTGTGAGCTAAATGGGTGTTGAGAAAATG
GTGTGTTTGGTTTCTCGCACTGGTCGTCAGTTTCAGAGATACAACAAAGGTCGTCGTCAA
GTCGTCGGGTGTATACCGTACAGATTCAAGCTATCAAGTGATGGGAAAATTAGTGATGAA
TTAGAAATTCTTGTTATCTCTTCTCAAAAAGGTCATGCCATGATGTTCCCAAAGGGTGGT
TGGGAGCTTGATGAATCTGTAGAAGAAGCTGCTGCAAGAGAATCTCTCGAAGAAGCTGGA
GTTCTTGGCAATATTGGGCATCAACTAGGAAAATGGGATTTTTTGAGCAAAAGCAGGGGA
ACATATTATGAAGGACTAATGTTCCCTATGCTTGTTACAGAACAACTTGA

QA 1 650 1 650
DS 

RD RS1BN82JQ 734 0 0
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CTGCTGCAAGAGAATCTCTCGAAGAAGCTGGAGTTCTTGGCAATATTGGGCATCAACTAG
GAAAATGGGATTTTTTGAGCAAAAGCAGGGGAACATATTATGAAGGACTAATGTTCCCTA
TGCTTGTTACAGAACAACTTGAGCTTTGGCCTGAACAACATGCTAGGCAAAGAATCTGGA
TGAATCTAGTTGACGCTAGAGAAGCTTGTAGAGATTGGTGGATGAAAGAAGCATTAGATG
TTTTGGTCGAGAGACTCTCATCACCAATGAATCAACCAAGGGAAGAGAAGAATATTTCAA
TATCTATCGAAACAATGTGCTGATGATTTGCTACAAAAAAAATTGCGGCTGATTGTGATG
GGAGTTTTATGGACTAATGGATCTCTGTAGATAGAAATAGATGTGGTCTCCAATTAGAAT
TGAGAGAGTGATTTGAAGAGCAGGTGCAGAACAGGAACAAAAAAGATGGGTAGATCTTTT
AGGTTTAATTTGGAGCAATGAAAAAACATCATGATTTAAGAAGTCCTGTGTGTTGTGTTT
ATAACGTTTCTGCATGATTTACTTAAGGGATGATGAAGGATTAGGAAGATAAACAAAGAG
TTCAAGCAAGACATGTACAATGCGTTTCCCTCTGTTTATTTTTTAATCTCATCTCTCTTT
AAAATTTGCAATGT

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL4256Contig1 778 2 8 U
TGGCGCAGCAGCAGCAATCGTTGATCTACAGCTTCGTCGCTCGCGGGACGGTGATCCTCG
TGGAGTTCACTGATTTCAAAGGAAACTTCACCTCCGTCGCCGCACAGTGCCTCCAGAAGC
TCCCTTCTTCCAACAACAAGTTCACCTACAACTGCGACGGTCACACCTTCAACTACCTCG
TCGAAGATGGCTTCACGTACTGTGTTGTTGCGGTTGATTCTGCTGGGAGGCAGATTCCGA
TGGCGTTTTTGGAGAGAGTGAAAGAGGATTTTAACAAGAGATATGGGGGTGGAAAGGCTG
CTACTGCTCAGGCCAACAGTTTGAATAAAGAGTTTGGGTCTAAGCTGAAAGAGCACATGC
AGTATTGTATGGATCATCCTGATGAGATTAGCAAGCTTGCTAAGGTGAAGGCTCAAGTCT
CTGAAGTTAAGGGTGTTATGATGGAAAACATCGAGAAGGTTCTTGACCGTGGTGAGAAAA
TTGAGCTTCTGGTTGACAAAACCGAGAACCTTCGCTCTCAGGCACAAGACTTCAGAACAA
CGGGAACACAGATGAGAAGGAAGATGTGGCTTCAGAACATGAAGATAAAGCTCATAGTTC
TCGCCATCATCGTCGCACTGATTCTTATAATCGTGCTCTCAGTTTGCCATGGCTTCAAGT
GTTAGAAGCACATAAAAAAAAAATCAAAAACACTCTTTGAGATCTTTCTCACTCGGTCAT
CATATTGATTCTAATGTTACCGCTTGAATTGGTTTTGTATAGATAGACACATATATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D344TF U 1
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CTGAAGTTAAGGGTGTTATGATGGAAAACATCGAGAAGGTTCTTGACCGTGGTGAGAAAA
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CGGGAACACAGATGAGAAGGAAGATGTGGCTTCAGAACATGAAGATAAAGCTCATAGTTC
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GTTAGAAGCACA

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DS 

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GTTTTTGGAGAGAGTGAAAGAGGATTTTAACAAGAGATATGGGGGTGGAAAGGCTGCTAC
TGCTCAGGCCAACAGTTTGAATAAAGAGTTTGGGTTTAAGCTGAAAGAGCACATGCAGTA
TTGTATGGATCATCCTGATGAGATTAGCAAGCTTGCTAAGGTGAAGGCTCAAGTCTCTGA
AGTTAAGGGTGTTATGATGGAAAACATCGAGAAGGTTCTTGACCGTGGTGAGAAAATTGA
GCTTCTGGTTGACAAAACCGAGAACCTTCGCTTTCAGGCACAAGACTTCAGAACAACGGG
AACACAGATGAGAAGGAAGATGTGGCTTCAGAACATGAAGATAAAGCTCATAGTTCTCGC
CATCATCGTCGCACTGATTCTTATAATCGTGCTCTCAGTTTGCCATGGCTTCAAGTGTTA
GAAGCACATAAAAAAAAAATCAAAAACACTCTTTGAGATCTTTCTCACTCGGTCATCATA
TTGATTCTAATGTTACCGCTTGAATTGGTTTTGTATAGATAGACACATATATTT

QA 1 594 1 594
DS 



AS 1 2

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ATAACATTTGTCATGTCAAACACTAAAGATGGAGGATAACACATCCAAAAGTCAGGATTG
CATTAAAAATGTGATAACAAACCGGTATTTCAAAACATTTTCTACCAATTCCTTTCCTTT
CCATGGTTGTTACCATAGTCTAACTATTCTCCATCGATCCCATAAAGCCCAAAAGAAAGA
ATGAATAAGGGAAGAGATGATTGTGAGAATCAAGATCAAACTCTCTAGTTTCACTTCAAC
ATGAGCATAATAGAAGGCATAGCAGGAATAAGAAGGAGGATAAAGACGACAATGATTAGA
ATGATAGCGTAACAAGTCCATTTCCTCGAGCTCTTTTGGTACTCCCTCGCATCTTGGAGC
TGATCAGTCCCTCTTCTCACAAACGAACTCGCCTTCGCCACATGACTATCTATATTGTTC
AGTTGCTGCCCTTGCGCTTCCACTAGAGCCGCCATGTCCAAGAAAACTTGGTGCAACTCG
AGTAGATTCTTCTCAATCTCCTTCACTGCATCATGTCTTTCTTGTATCTC


BQ
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AF RS1CG68JQ U 1
AF RS1D949JQ U 110
BS 1 467 RS1CG68JQ
BS 468 468 RS1D949JQ
BS 469 590 RS1CG68JQ

RD RS1CG68JQ 590 0 0
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CATTAAAAATGTGATAACAAACCGGTATTTCAAAACATTTTCTACCAATTCCTTTCCTTT
CCATGGTTGTTACCATAGTCTAACTATTCTCCATCGATCCCATAAAGCCCAAAAGAAAGA
ATGAATAAGGGAAGAGATGATTGTGAGAATCAAGATCAAACTCTCTAGTTTCACTTCAAC
ATGAGCATAATAGAAGGCATAGCAGGAATAAGAAGGAGGATAAAGACGACAATGATTAGA
ATGATAGCGTAACAAGTCCATTTCCTCGAGCTCTTTTGGTACTCCCTCGCATCTTGGAGC
TGATCAGTCCCTCTTCTCACAAACGAACTCGCCTTCGCCACATGACTCTCTATATTGTTC
AGTTGCTGCCCTTGCGCTTCCACTAGAGCCGCCATGTCCAAGAAAACTTGGTGCAACTCG
AGTAGATTCTTCTCAATCTCCTTCACTGCATCATGTCTTTCTTGTATCTC

QA 1 590 1 590
DS 

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TCCTTTCCTTTCCATGGTTGTTACCATAGTCTAACTATTCTCCATCGATCCCATAAAGCC
CAAAAGAAAGAATGAATAAGGGAAGAGATGATTGTGAGAATCAAGATCAAACTCTCTAGT
TTCACTTCAACATGAGCATAATAGAGGGCATAGCAGGAATAAGAAGGAGGATAAAGACGA
CAATGATTAGAATGATAGCGTAACAAGTCCATTTCCTCGAGCTCTTTTGGTACTCCCTCG
CATCTTGGAGCTGATCAGTCCCTCTTCTCACAAACGAACTCGCCTTCGCCACATGACTAT
CTATATTGTTCAGTTGCTGCCCTTGCGCTTCCACTAGAGCCGCCATGTCCAAGAAAACTT
GGTGCAACTCGAGTAGATTCTTCTCAATCTCCTTCACTGCATCATGTCTTTCTT

QA 1 474 1 474
DS 



AS 1 2

CO CL4258Contig1 1132 2 4 U
GGGAGATAGGCAAAGGCGAACAACACTTCCTCTGGAAACGAAATGCCGATTTCTCCTTCC
TTGTTGTCATCCTCTTCCTCAGTCTCTCAGCTCCTCCCTAGACTCCCAAACTCCGCCAGG
TTCAATGCACCCGCTTCACATAGCAGAGCCGTCACCGTCGTGGCAGCATCCGTCACCGAC
CTATCCAGCGTGGACAGCACGACCATCGCCGTGCTGGGAGGAGGATCAGTCGCAGCTCTG
GCGACGATCGTTTCCCTAACGGATCCGGAGAGGAGGCGGAAGCTGCAGGCGGAGGAAGTC
GGAGGAGGAGACAAGGAGGTGGTGAGGGAGTACTTCAACAGCACCGGGTTCGAGCGGTGG
AGGAAGATCTACGGCGAGACCGACGAAGTGAACCGCGTCCAGAAGGATATACGGATCGGC
CACGCCAAAACCGTCGAGAAGACGATGCTCATGCTGACGGAAGAAGGTTCGTTGGCCGGC
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GGTGCGATCGTCTCCGCTAGCGATATCTCTGCAGCTATGGTCGCCGAAGCTGAGATGAAG
GCAAAGCAGCAGTTATCATCTGAGAATCTACCGAGATTTGAAGTGAATGATTTAGAGAGC
CTGAGTGGGAAGTATAACACTGTTGTCTGCCTAGACGTGCTCATACATTACCCTCAGAAC
AAAGCTGACGGGATGATCGCACACCTCGCTTCGTTAGCTGAGAAGAGAGTGATTCTTAGC
TTCGCACCGAAGACGTTCTATTACGATATCTTGAAGAGGATCGGAGAGCTTTTCCCAGGT
CCTTCAAAGGCTACAAGGGCGTATCTACACTCAGAGGCGGATGTTGAAAACGCATTGCGC
AAGGTCGGGTGGAGAATCAGCAAGAGAGGACTCATTACCACCCAGTTCTACTTCTCTAGG
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TATTATTGAGGATAGTGTCTACAAACATGCACTTCTTCAGGACTTGGTCTATAGTTCTGT
AGCTCCTCTTTCACTGTTTAATGTAATCAAATGTAATATGTAACTTGGGGGG


BQ
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AF RS1CD53TF U 1
AF RS1CD53JQ C 436
BS 1 625 RS1CD53TF
BS 626 626 RS1CD53JQ
BS 627 641 RS1CD53TF
BS 642 1132 RS1CD53JQ

RD RS1CD53TF 649 0 0
GGGAGATAGGCAAAGGCGAACAACACTTCCTCTGGAAACGAAATGCCGATTTCTCCTTCC
TTGTTGTCATCCTCTTCCTCAGTCTCTCAGCTCCTCCCTAGACTCCCAAACTCCGCCAGG
TTCAATGCACCCGCTTCACATAGCAGAGCCGTCACCGTCGTGGCAGCATCCGTCACCGAC
CTATCCAGCGTGGACAGCACGACCATCGCCGTGCTGGGAGGAGGATCAGTCGCAGCTCTG
GCGACGATCGTTTCCCTAACGGATCCGGAGAGGAGGCGGAAGCTGCAGGCGGAGGAAGTC
GGAGGAGGAGACAAGGAGGTGGTGAGGGAGTACTTCAACAGCACCGGGTTCGAGCGGTGG
AGGAAGATCTACGGCGAGACCGACGAAGTGAACCGCGTCCAGAAGGATATACGGATCGGC
CACGCCAAAACCGTCGAGAAGACGATGCTCATGCTGACGGAAGAAGGTTCGTTGGCCGGC
GTAACGGTCTGCGACGCTGGTTGCGGAACAGGTCTGCTCTCGATTCCGCTCGCTAAGGAA
GGTGCGATCGTCTCCGCTAGCGATATCTCTGCAGCTATGGTCGCCGAAGCTGAGATGAAG
GCAAAGCAGCAGTTATCATCTGAGA*TCTACCGAGATTTGA
GTGATGAT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1CD53JQ 697 0 0
GAGAAGACGATGCTCATGCTGACGGAAGAAGGTTCGTTGGCCGGCGTAACGGTCTGCGAC
GCTGGTTGCGGAACAGGTCTGCTCTCGATTCCGCTCGCTAAGGAAGGTGCGATCGTCTCC
GCTAGCGATATCTCTGCAGCTATGGTCGCCGAAGCTGAGATGAAGGCAAAGCAGCAGTTA
TCATCTGAGAATCTACCGAGATTTGAAGTGAATGATTTAGAGAGCCTGAGTGGGAAGTAT
AACACTGTTGTCTGCCTAGACGTGCTCATACATTACCCTCAGAACAAAGCTGACGGGATG
ATCGCACACCTCGCTTCGTTAGCTGAGAAGAGAGTGATTCTTAGCTTCGCACCGAAGACG
TTCTATTACGATATCTTGAAGAGGATCGGAGAGCTTTTCCCAGGTCCTTCAAAGGCTACA
AGGGCGTATCTACACTCAGAGGCGGATGTTGAAAACGCATTGCGCAAGGTCGGGTGGAGA
ATCAGCAAGAGAGGACTCATTACCACCCAGTTCTACTTCTCTAGGCTTATCGAAGCAGTT
CCAATGTAGACCAGTTTTGAAAGAAAAAGGCATTCATCTGTTGATTATTATTGAGGATAG
TGTCTACAAACATGCACTTCTTCAGGACTTGGTCTATAGTTCTGTAGCTCCTCTTTCACT
GTTTAATGTAATCAAATGTAATATGTAACTTGGGGGG

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 2

CO CL4259Contig1 790 2 6 U
GGGCAGAAGATGCTGGCCAAGTGGCTAAGCTTCGATCAGCTCTTGAGTCAGTTGACCACA
AAAGAAGAAAGATTTTACAACAAATGAAAAGTGATGCAGCTCTGCTTAACTTGGAAGAAG
GCAGTTCTCCTATTCAAAACCCTTCAACCGCAGCTGAAGACTCAAGATTAGCTTCTCTCT
CTCTCTCTGGATGGCATATTGAAGCAAGTCAAGGATATTACAAGACAAGCATCTGTCCAT
GTTTTGAGTAAAAGCAAGAAAACAGCATTGCTTGAGGCCCTTGATGAACTCACTGAGCGA
ATGCCTTCTCTTCTTGATGTTGATCATCCATGTGCACAAAGAGAAATCTCTACAGCACGC
CAGCTTGTCGAGACAATCCCTGAACAAGAGAACAATAATCTTCTTCTGGAATATTCACAC
GGCCGGAGACCCTCGTTCGAGTCAATATCCTCAGGTGAAACCGATGTGTCGCAGTGGAAC
GTTTTGCAGTTCAACACAGGCTCTTCAGACCCGTTCATCATAAAATGTGGAGGCAACACA
AACTCGGAGCTGGTGATCAAGGCCGATGCACGAGTCCAAGAGCCCAAAGGAGGTGAGCTT
GTCAGAGTTGTCCCGAGACCTTCTGTTCTGGTGAACATGAGCTTAGAGGAAATGAAACAA
ATGTTTACTCAGTTGCCCGAAGCTCTAACCGTGCTGGCTTTAGCTAAAAATGCTGATGCC
ACGAGAGCTCGCTACTCTAGGCTCTACAAAACTCTGGCCATGAAGGTTCCCTCTCTCAGG
GACGTTGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A822TF U 1
AF RS1A822JQ C 289
BS 1 740 RS1A822TF
BS 741 741 RS1A822JQ
BS 742 750 RS1A822TF
BS 751 751 RS1A822JQ
BS 752 765 RS1A822TF
BS 766 790 RS1A822JQ

RD RS1A822TF 770 0 0
GGGCAGAAGATGCTGGCCAAGTGGCTAAGCTTCGATCAGCTCTTGAGTCAGTTGACCACA
AAAGAAGAAAGATTTTACAACAAATGAAAAGTGATGCAGCTCTGCTTAACTTGGAAGAAG
GCAGTTCTCCTATTCAAAACCCTTCAACCGCAGCTGAAGACTCAAGATTAGCTTCTCTCT
CTCTCTCTGGATGGCATATTGAAGCAAGTCAAGGATATTACAAGACAAGCATCTGTCCAT
GTTTTGAGTAAAAGCAAGAAAACAGCATTGCTTGAGGCCCTTGATGAACTCACTGAGCGA
ATGCCTTCTCTTCTTGATGTTGATCATCCATGTGCACAAAGAGAAATCTCTACAGCACGC
CAGCTTGTCGAGACAATCCCTGAACAAGAGAACAATAATCTTCTTCTGGAATATTCACAC
GGCCGGAGACCCTCGTTCGAGTCAATATCCTCAGGTGAAACCGATGTGTCGCAGTGGAAC
GTTTTGCAGTTCAACACAGGCTCTTCAGACCCGTTCATCATAAAATGTGGAGGCAACACA
AACTCGGAGCTGGTGATCAAGGCCGATGCACGAGTCCAAGAGCCCAAAGGAGGTGAGCTT
GTCAGAGTTGTCCCGAGACCTTCTGTTCTGGTGAACATGAGCTTAGAGGAAATGAAACAA
ATGTTTACTCAGTTGCCCGAAGCTCTAACCGTGCTGGCTTTAGCTAAAAATGCTGATGCC
ACGAGAGCTCGCTACTCTAG*CTCTACAAA*CTCTGGCCATGAAG
TTCCC

QA 1 765 1 765
DS 

RD RS1A822JQ 502 0 0
CTCACTGAGCGAATGCCTTCTCTTCTTGATGTTGATCATCCATGTGCACAAAGAGAAATC
TCTACAGCACGCCAGCTTGTCGAGACAATCCCTGAACAAGAGAACAATAATCTTCTTCTG
GAATATTCACACGGCCGGAGACCCTCGTTCGAGTCAATATCCTCAGGTGAAACCGATGTG
TCGCAGTGGAACGTTTTGCAGTTCAACACAGGCTCTTCAGACCCGTTCATCATAAAATGT
GGAGGCAACACAAACTCGGAGCTGGTGTTCAAGGCCGATGCACGAGTCCAAGAGCCCAAA
GGAGGTGAGCTTGTCAGAGTTGTCCCGAGACCTTCTGTTCTGGTGAACATGAGCTTAGAG
GAAATGAAACAAATGTTTACTCAGTTGCCCGAAGCTCTAACCGTGCTGGCTTTAGCTAAA
AATGCTGATGCCACGAGAGCTCGCTACTCTAGGCTCTACAAAACTCTGGCCATGAAGGTT
CCCTCTCTCAGGGACGTTGTTG

QA 1 502 1 502
DS 



AS 1 2

CO CL4260Contig1 465 2 1 U
GGGATCCGAACATCTCCGCGTCATCGTCATCGTTCATCGTCGACATCAGAAGGCGATTCA
GTTAGCTAAACAAGAGAAGGATGGTGGGAAGTGGAGCTCCACAGAGAGGAAGTGCAGCTG
CAGCTGCTAGCATGCGTAGGAGGAAGCCTAGCGGAAGTGGTGGAGGAGGAGCCTCTGGTG
GTGGTGGTGCTGCAGGATCTATGCTTCAGTTCTACACCGATGACGCACCGGGTCTCAAGA
TCTCCCCTAATGTTGTCCTTGTCATGAGCATCGGTTTCATTGCTTTCGTCGCTGTCCTTC
ATGTCATGGGCAAGCTCTACTTTGTCAAGTGATAAGACTAGAGAGCGAGAGTGAGAGCTT
AAGTACACCCAAGTGATTGCTAGTGACCAGAGTTATTAGACAGTGGTTTCAACTCTATGT
TTTCAATTTTTGTGAGAGACTATCTATAAAAAAATGTTCGAGTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1E727JQ C 1
AF RS1E727TF U 1
BS 1 465 RS1E727TF

RD RS1E727JQ 465 0 0
GGGATCCGAACATCTCCGCGTCATCGTCATCGTTCATCGTCGACATCAGAAGGCGATTCA
GTTAGCTAAACAAGAGAAGGATGGTGGGAAGTGGAGCTCCACAGAGAGGAAGTGCAGCTG
CAGCTGCTAGCATGCGTAGGAGGAAGCCTAGCGGAAGTGGTGGAGGAGGAGCCTCTGGTG
GTGGTGGTGCTGCAGGATCTATGCTTCAGTTCTACACCGATGACGCACCGGGTCTCAAGA
TCTCCCCTAATGTTGTCCTTGTCATGAGCATCGGTTTCATTGCTTTCGTCGCTGTCCTTC
ATGTCATGGGCAAGCTCTACTTTGTCAAGTGATAAGACTAGAGAGCGAGAGTGAGAGCTT
AAGTACACCCAAGTGATTGCTAGTGACCAGAGTTATTAGACAGTGGTTTCAACTCTATGT
TTTCAATTTTTGTGAGAGACTATCTATAAAAAAATGTTCGAGTTT

QA 1 465 1 465
DS 

RD RS1E727TF 465 0 0
GGGATCCGAACATCTCCGCGTCATCGTCATCGTTCATCGTCGACATCAGAAGGCGATTCA
GTTAGCTAAACAAGAGAAGGATGGTGGGAAGTGGAGCTCCACAGAGAGGAAGTGCAGCTG
CAGCTGCTAGCATGCGTAGGAGGAAGCCTAGCGGAAGTGGTGGAGGAGGAGCCTCTGGTG
GTGGTGGTGCTGCAGGATCTATGCTTCAGTTCTACACCGATGACGCACCGGGTCTCAAGA
TCTCCCCTAATGTTGTCCTTGTCATGAGCATCGGTTTCATTGCTTTCGTCGCTGTCCTTC
ATGTCATGGGCAAGCTCTACTTTGTCAAGTGATAAGACTAGAGAGCGAGAGTGAGAGCTT
AAGTACACCCAAGTGATTGCTAGTGACCAGAGTTATTAGACAGTGGTTTCAACTCTATGT
TTTCAATTTTTGTGAGAGACTATCTATAAAAAAATGTTCGAGTTT

QA 1 465 1 465
DS 



AS 1 2

CO CL4261Contig1 1019 2 2 U
ATCATGGTTCCCAAAGGTGCAAAGAACACGCTTCTAGAGCGACCTTGGTTCATCGTGCTG
GCTCTAGCTGGTCTTATAGGCGGGGCAGTGCTCATCACCAGTTTCATCCGAGCTACGGAC
AACACTTTATCACTATGTTCCACGGCTGAAACAACTGCAAAATCCATAGCCGAATACACA
GCCACACCAATCCAGCTCCAATCCATCGTCCATTACGCAACCTCACGCACCGTCCCTCAA
CAAACCTTCGCGGAGATCTCTATCTCCTTAGAAGTCCTTAAGGACCGTTCACCTTGCAAT
TTTCTCGTCTTTGGCCTCGGTCGTGACTCCCTCATGTGGGCCTCCCTCAATCCAGGTGGC
ACCACTGTGTTCATGGAGGAGGATCCTGAGTGGATCGAGGCCGTTCTCAAGGACGCACCG
TCCCTAAGAGCCCACCATGTTCAGTATCGGACCCAACTTTCTCAAGCTGACCATCTTCTC
AAAACCTACCGGTCTGAACCTAAATGTTTACCAGCCAACGCTTTCCCAATCCGAGACAAC
GAAAAGTGTCCATTGGCGTTGACTTCACTTCCTGATGAGTTCTATGATACCGAGTGGGAT
CTGATCATGGTGGACGCACCAAAAGGATACTTCGCAACCGCGCCAGGGGGGATGGCAGCC
ATATTCTCCTCAGCTGTCATGGCTCGTAACCGGAAGGGTGCAGGCACGACTCACGTTTTC
CTTCATGACGTTGACCGCAAAGTGGAGAAAGCTTACGCCAACGAGTTCCTATGCGAGAAG
TACAGAGTCAAATCTGCTGGTAGGCTCTGGCACTTCGAAATACCCAACGCTGCTAACATG
AGCGACCAGCCGGGGGATCGGTTTTGCTAGATTGCTCCGATATGCAGTCAGTTCATGGTT
ACTTTTTTTTTTACATTAAACACCGCATACAACTATCCAAAGGCTTCTCATTAAAATAAA
ATCATGTATCCAAAGGCTTCTCAGCGCATACAACTATTGCTATTACTCTTTGTTTTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FI79TF U 1
AF RS1FI79JQ C 495
BS 1 697 RS1FI79TF
BS 698 1019 RS1FI79JQ

RD RS1FI79TF 698 0 0
ATCATGGTTCCCAAAGGTGCAAAGAACACGCTTCTAGAGCGACCTTGGTTCATCGTGCTG
GCTCTAGCTGGTCTTATAGGCGGGGCAGTGCTCATCACCAGTTTCATCCGAGCTACGGAC
AACACTTTATCACTATGTTCCACGGCTGAAACAACTGCAAAATCCATAGCCGAATACACA
GCCACACCAATCCAGCTCCAATCCATCGTCCATTACGCAACCTCACGCACCGTCCCTCAA
CAAACCTTCGCGGAGATCTCTATCTCCTTAGAAGTCCTTAAGGACCGTTCACCTTGCAAT
TTTCTCGTCTTTGGCCTCGGTCGTGACTCCCTCATGTGGGCCTCCCTCAATCCAGGTGGC
ACCACTGTGTTCATGGAGGAGGATCCTGAGTGGATCGAGGCCGTTCTCAAGGACGCACCG
TCCCTAAGAGCCCACCATGTTCAGTATCGGACCCAACTTTCTCAAGCTGACCATCTTCTC
AAAACCTACCGGTCTGAACCTAAATGTTTACCAGCCAACGCTTTCCCAATCCGAGACAAC
GAAAAGTGTCCATTGGCGTTGACTTCACTTCCTGATGAGTTCTATGATACCGAGTGGGAT
CTGATCATGGTGGACGCACCAAAAGGATACTTCGCAACCGCGCCAGGGGGGATGGCAGCC
ATATTCTCCTCAGCTGTCATGGCTCGTAACCGGAAGG
T

QA 1 697 1 697
DS 

RD RS1FI79JQ 525 0 0
TGAACCTAAATGTTTACCAGCCAACGCTTTCCCAATCCGAGACAACGAAAAGTGTCCATT
GGCGTTGACTTCACTTCCTGATGAGTTCTATGATACCGAGTGGGATCTGATCATGGTGGA
CGCACCAAAAGGATACTTCGCAACCGCGCCAGGGGGGATGGCAGCCATATTCTCCTCAGC
TGTCATGGCTCGTAACCGGAAGGGTGCAGGCACGACTCACGTTTTCCTTCATGACGTTGA
CCGCAAAGTGGAGAAAGCTTACGCCAACGAGTTCCTATGCGAGAAGTACAGAGTCAAATC
TGCTGGTAGGCTCTGGCACTTCGAAATACCCAACGCTGCTAACATGAGCGACCAGCCGGG
GGATCGGTTTTGCTAGATTGCTCCGATATGCAGTCAGTTCATGGTTACTTTTTTTTTTAC
ATTAAACACCGCATACAACTATCCAAAGGCTTCTCATTAAAATAAAATCATGTATCCAAA
GGCTTCTCAGCGCATACAACTATTGCTATTACTCTTTGTTTTTGT

QA 1 525 1 525
DS 



AS 1 2

CO CL4262Contig1 736 2 2 U
TTTGAACGTGGCGAAACCGAAGAAAGGTCAGAGCGTCGCCGTTTTCGGTTTAGGTGCTGT
TGGTTTGGCTGCTGCGGAAGGTGCTAGGATGGCTGGTGCTGGTAGGATCATCGGTGTTGA
TCTTAACCCCAAGAGATTCGAGGAAGCTAAGAAGTTCGGTGTGACGGAGTTTGTGAACCC
TAGAGAACATGATAAACCGGTTCAGCAAGTCATAGCTGAGATGACGGACGGTGGTGTGGA
CAGGAGTGTGGAGTGCACTGGAAGCGTTCAAGCTATGATTCAAGCATTCGAATGTGTTCA
CGATGGGTGGGGTGTTGCGGTGCTGGTAGGTGTGCCGAGCAAAGACGATGCGTTCAAGAC
ACATCCGATGAACTTGCTGAACGAGAGGACGCTGAAGGGTACTTTCTTTGGGAACTACAA
ACCCAAAACTGACATTCCTGGGGTGGTGGAGAAGTACATGAACAAGGAGCTGGAGCTTGA
GAAGTTCATCACTCACACAGTGCCCTTCTCTGAGATCAACAAGGCCTTTGACTACATGTT
GAAGGGAGAGAGTATCCGTTGCATCATCACCATGGGTGCTTGAAAAATGAAAACCAAAAA
ACATTCTCCTTTTCAATAATAAAATGTCTACTTATTAGTAGACGACTATCATCTCTTTAT
TGCTTTTGGCTTTTCTACACTGTGTTTTTAAAACTATTATTACCATATCGTTGTACTATT
TTCATTCTATAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FO25JQ C 1
AF RS1C472TF U 293
BS 1 293 RS1FO25JQ
BS 294 736 RS1C472TF

RD RS1FO25JQ 498 0 0
TTTGAACGTGGCGAAACCGAAGAAAGGTCAGAGCGTCGCCGTTTTCGGTTTAGGTGCTGT
TGGTTTGGCTGCTGCGGAAGGTGCTAGGATGGCTGGTGCTGGTAGGATCATCGGTGTTGA
TCTTAACCCCAAGAGATTCGAGGAAGCTAAGAAGTTCGGTGTGACGGAGTTTGTGAACCC
TAGAGAACATGATAAACCGGTTCAGCAAGTCATAGCTGAGATGACGGACGGTGGTGTGGA
CAGGAGTGTGGAGTGCACTGGAAGCGTTCAAGCTATGATTCAAGCATTCGAATGTGTTCA
CGATGGGTGGGGTGTTGCGGTGCTGGTAGGTGTGCCGAGCAAAGACGATGCGTTCAAGAC
ACATCCGATGAACTTGCTGAACGAGAGGACGCTGAAGGGTACTTTCTTTGGGAACTACAA
ACCCAAAACTGACATTCCTGGGGTGGTGGAGAAGTACATGAACAAGGAGCTGGAGCTTGA
GAAGTTCATCACTCACAC

QA 1 498 1 498
DS 

RD RS1C472TF 444 0 0
G
GTGTTCACGATGGGTGGGGTGTTGCGGTGCTGGTAGGTGTGCCGAGCAAAGACGATGCGT
TCAAGACACATCCGATGAACTTGCTGAACGAGAGGACGCTGAAGGGTACTTTCTTTGGGA
ACTACAAACCCAAAACTGACATTCCTGGGGTGGTGGAGAAGTACATGAACAAGGAGCTGG
AGCTTGAGAAGTTCATCACTCACACAGTGCCCTTCTCTGAGATCAACAAGGCCTTTGACT
ACATGTTGAAGGGAGAGAGTATCCGTTGCATCATCACCATGGGTGCTTGAAAAATGAAAA
CCAAAAAACATTCTCCTTTTCAATAATAAAATGTCTACTTATTAGTAGACGACTATCATC
TCTTTATTGCTTTTGGCTTTTCTACACTGTGTTTTTAAAACTATTATTACCATATCGTTG
TACTATTTTCATTCTATAAAAAA

QA 2 444 2 444
DS 



AS 1 2

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GATTTGTTGTAACTTTTCTAAAGATATTTGTGATGTATCAACAATACTCATCAGTTTCAT
TGTGGCTTGTTCTTTTATCTATGTG


BQ
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AF RS1D670JQ C 1
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BS 1 205 RS1D670TF

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TCTTTGCCTGATCTCTGAGAAACCCCAATGGGGGAAATGAGGAAACCATTCGATTTTCAC
GATTTGTTGTAACTTTTCTAAAGATATTTGTGATGTATCAACAATACTCATCAGTTTCAT
TGTGGCTTGTTCTTTTATCTATGTG

QA 1 205 1 205
DS 

RD RS1D670TF 205 0 0
GCAGCTACTATTTGGTAAGCTTAGTGGACAACGATTACATCAGTGGTGATATATTCTCAG
TCTTTGCCTGATCTCTGAGAAACCCCAATGGGGGAAATGAGGAAACCATTCGATTTTCAC
GATTTGTTGTAACTTTTCTAAAGATATTTGTGATGTATCAACAATACTCATCAGTTTCAT
TGTGGCTTGTTCTTTTATCTATGTG

QA 1 205 1 205
DS 



AS 1 2

CO CL4264Contig1 1281 2 2 U
GGCTTTCTGTCGGATCTTGCAACTTCGGTGCGAAAGGAGTCAACGCGATGCTCGAGCATT
GCAAGCTTCTTGAGGAGCTGTCGGTGAAGAGGCTGAGAGGGATTCACGAAGCGGCTGAGT
TGATTCATTTGCCTTCGTCTCCTTCGCTTAGATCTATTTGCTTGAAGGAGCTTGTTAACG
GTCAGGTGTTTGAGCCTTTGGTTGCTGGTACTAGGACGCTGAAGACGCTCAAGATTATAC
GTTGTTTGGGTGATTGGGATATGTTTTACAGATGATCGGTGAAGGAGAGAGTTCGTTGAG
TGAGATTCATCTTGAGAGGCTCCAAGTTAGTTACTTTGGGCTTTCCGCGGTGTCGAAATG
CTCAAAGGTTGAGACTTTGCATATAGTGAAGACACCGGAGTGCTCCAACTTTGGTTTGAT
CGATGTCGCCAAGAGATGCAAGCTGCTGAGGAAGCTTCATATAGATGGTTGGAGGACTAA
TAAGATTGGCGACGAAGGTCTGCTGGCTGTAGCTAGGCACTGCTTGAACTTGCAAGAGTT
AGTGCTGATCGGTGTGAACGCAACGCACAAGAGTATATCAGCGATTGCTTCGAACTGCGA
GAAACTCGAGAGGCTAGCGCTATGCGGGAGTGGAACGATGGGGGATACGGAGATCGCTTG
CATCGCTAAGAAATGCGGGGCGTTGAGGAAGTTCTGTATCAAAGGATGTGCGGTTTCGGA
TCTAGGGATCGAGGCGCTCGCTGCTGGTTGTCCTAACTTGGTGAAGCTGAAGGTGAAGAA
ATGTAAAGTGGTGACTGGAGAGATTGGAGAGTGGCTTAGGGAACAGAGGAGGACGCTTGT
GGTGAGTATGGATGGTGATGAAACGGAAGCAGCGGTTGCGGTTGATGGTGAGAGTGAAGC
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TGGTGGTGGCGGTAGCGGAAACAATGGAGGAAGTAGATTAGCGATGATTAGGTCAAAGTT
TGGGCTCTTTGCTGGAAGGAACTTAGTAAGTTGCAGATTCAGGAGGTGGTCTCATCCTAA
TAATGACAATGGTTCTAGTTCTACTTGATCAGCTATTACAAGTCCCCTATAAAACGAAAA
TTGTCAAAAAAAGCTTTTCTGCCTTCCTGTTTTGATTTCTGTTTGTCTGTAATCCTATTT
CATGTGTGTGTGTGTGTGTGAAAGAAGAAGACTTTGTCAATTAGAAAAGTCCATTCCAAG
GAAGAATGTTATTTGTTTTCC


BQ
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AF RS1DX65TF U 1
AF RS1DX65JQ C 475
BS 1 672 RS1DX65TF
BS 673 1281 RS1DX65JQ

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CGATGTCGCCAAGAGATGCAAGCTGCTGAGGAAGCTTCATATAGATGGTTGGAGGACTAA
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AGTGCTGATCGGTGTGAACGCAACGCACAAGAGTATATCAGCGATTGCTTCGAACTGCGA
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CATCGCTAAGAA
T

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DS 

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CTGCGAGAAACTCGAGAGGCTAGCGCTATGCGGGAGTGGAACGATGGGGGATACGGAGAT
CGCTTGCATCGCTAAGAAATGCGGGGCGTTGAGGAAGTTCTGTATCAAAGGATGTGCGGT
TTCGGATCTAGGGATCGAGGCGCTCGCTGCTGGTTGTCCTAACTTGGTGAAGCTGAAGGT
GAAGAAATGTAAAGTGGTGACTGGAGAGATTGGAGAGTGGCTTAGGGAACAGAGGAGGAC
GCTTGTGGTGAGTATGGATGGTGATGAAACGGAAGCAGCGGTTGCGGTTGATGGTGAGAG
TGAAGCAGCGGTGGAGGAGCCGAGGGTGGGTCAAGCGGGGGAGATTGTTGGTTCAGGTAA
TGGTGGTGGTGGTGGCGGTAGCGGAAACAATGGAGGAAGTAGATTAGCGATGATTAGGTC
AAAGTTTGGGCTCTTTGCTGGAAGGAACTTAGTAAGTTGCAGATTCAGGAGGTGGTCTCA
TCCTAATAATGACAATGGTTCTAGTTCTACTTGATCAGCTATTACAAGTCCCCTATAAAA
CGAAAATTGTCAAAAAAAGCTTTTCTGCCTTCCTGTTTTGATTTCTGTTTGTCTGTAATC
CTATTTCATGTGTGTGTGTGTGTGTGAAAGAAGAAGACTTTGTCAATTAGAAAAGTCCAT
TCCAAGGAAGAATGTTATTTGTTTTCC

QA 1 807 1 807
DS 



AS 1 2

CO CL4265Contig1 1054 2 2 U
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AGTCGCGTTGTCATGGATCACCTCTCTATCAGCTCTCTCGCCTTTCAGCATCTTCGCTGA
TATATGCAACATCATAGCCATGTGTTTCGTTGTGAAAGAGAACGTGGAGATGGTGATTGG
AGGAGACTTCTCGTTTGGTGACAGAACAGCTGTTTCGTCTAGTATTGGAGGGTTACCGTT
CGCTGGAGGTGTTGCTGTGTTTTGTTTTGAGGGTTTTGCGATGACGCTGGCTCTTGAGAA
TTCTATGAAGGATAGAGAAGCTTTCCCTAAGCTGTTGGCTAAAGTGCTTGCTGGGATTAC
GTTTGTTTATGTGTTGTTTGGGTTCTGTGGTTATATGGCTTATGGAGATGAAACTAAGGA
TATTATTACACTCAACCTCCCAAAGAATTGGTCTGCCATTGCCGTGCAGATTGGCTTATG
CGTGGGACTGACGTTTACGTTCCCAATCATGGTACATCCGCTTAACGAGATCATAGAGCA
GAAACTGAAAAGGATAGATTGGCTTCAAAAGCATCATCATCATGAGTACAGCAACGAAAC
AGGTTCGGTCTCTAAATATGTAATATTCACCACGAGAACGCTTTTGGTGGTAGGACTCGC
AGCAATAGCGTCATTAGTCCCGGGGTTTGGTACGTTTGCATCTCTGGTTGGAAGTACTCT
GTGTGCACTCATATCATTTGTGTTACCGGCTTCTTATCACCTCACGCTGCTCGGTCCATC
GCTAAGTCTGTGGAACAAATCAGTTGATGTGTTCATCGTGATTTGCGGGTTGCTCTTTGC
TGTCTATGGTACATACAATACAATCGTTGGAGTGTAACAAAGCGAAGTAAGCGAAAGAAC
ACGCCAACAGAAAGTTGGTCAGAGACTCAGACCAAGAACCATTGTATAGCTGTTTTACAT
GAATTTGATATCAGAAGATAGTGGGATTGGGAAAATCCAAATTGTTGTATAATAATTACA
GGTTTTAAATGTTTGGCAAAAGCATGTTTGGTTC


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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BL05TF U 1
AF RS1BL05JQ C 330
BS 1 794 RS1BL05TF
BS 795 1054 RS1BL05JQ

RD RS1BL05TF 794 0 0
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AGGAGACTTCTCGTTTGGTGACAGAACAGCTGTTTCGTCTAGTATTGGAGGGTTACCGTT
CGCTGGAGGTGTTGCTGTGTTTTGTTTTGAGGGTTTTGCGATGACGCTGGCTCTTGAGAA
TTCTATGAAGGATAGAGAAGCTTTCCCTAAGCTGTTGGCTAAAGTGCTTGCTGGGATTAC
GTTTGTTTATGTGTTGTTTGGGTTCTGTGGTTATATGGCTTATGGAGATGAAACTAAGGA
TATTATTACACTCAACCTCCCAAAGAATTGGTCTGCCATTGCCGTGCAGATTGGCTTATG
CGTGGGACTGACGTTTACGTTCCCAATCATGGTACATCCGCTTAACGAGATCATAGAGCA
GAAACTGAAAAGGATAGATTGGCTTCAAAAGCATCATCATCATGAGTACAGCAACGAAAC
AGGTTCGGTCTCTAAATATGTAATATTCACCACGAGAACGCTTTTGGTGGTAGGACTCGC
AGCAATAGCGTCATTAGTCCCGGGGTTTGGTACGTTTGCATCTCTGGTTGGAAGTACTCT
GTGTGCACTCATATCATTTGTGTTACCGGCTTCTTATCACCTCACGCTGCTCGGTCCATC
GCTAAGTCTGTGGA

QA 1 794 1 794
DS 

RD RS1BL05JQ 725 0 0
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GTTATATGGCTTATGGAGATGAAACTAAGGATATTATTACACTCAACCTCCCAAAGAATT
GGTCTGCCATTGCCGTGCAGATTGGCTTATGCGTGGGACTGACGTTTACGTTCCCAATCA
TGGTACATCCGCTTAACGAGATCATAGAGCAGAAACTGAAAAGGATAGATTGGCTTCAAA
AGCATCATCATCATGAGTACAGCAACGAAACAGGTTCGGTCTCTAAATATGTAATATTCA
CCACGAGAACGCTTTTGGTGGTAGGACTCGCAGCAATAGCGTCATTAGTCCCGGGGTTTG
GTACGTTTGCATCTCTGGTTGGAAGTACTCTGTGTGCACTCATATCATTTGTGTTACCGG
CTTTTTATCACCTCACGCTGCTCGGTCCATCGCTAAGTCTGTGGAACAAATCAGTTGATG
TGTTCATCGTGATTTGCGGGTTGCTCTTTGCTGTCTATGGTACATACAATACAATCGTTG
GAGTGTAACAAAGCGAAGTAAGCGAAAGAACACGCCAACAGAAAGTTGGTCAGAGACTCA
GACCAAGAACCATTGTATAGCTGTTTTACATGAATTTGATATCAGAAGATAGTGGGATTG
GGAAAATCCAAATTGTTGTATAATAATTACAGGTTTTAAATGTTTGGCAAAAGCATGTTT
GGTTC

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL4266Contig1 648 2 4 U
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TCTCTCTTTCTGTTCTAACTCGGCTTGGATCTGTCGGGGCTACTTTCGAGGGACGATGGA
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GAAGTTTCCCATTACATACGACATGCTCGTCGCCACTCAGGTAGGTAAGAAGCTGAGGTC
TCTTTCGAAACATCCTATCGACGAAATCAAAACCGTAGCTACTGATCTTCTCGATATATG
GAAAAAGCTTGTCATCGAAGAGACATCCACGTCTAAGAAGGATGCAAATCCCGCGCCTGT
GAAAGTGCAGAAGCTTCAGAGAGGTGATTCAGCTAAGAGCATCAAGGTAGAGAGAAAAGA
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TCAATCTAGTATGAAAGCTCCAGCTAAGCACCAGCAAGTAATGGGGCA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FS59TF U 1
AF RS1GZ57TF U 1
BS 1 161 RS1FS59TF
BS 162 162 RS1GZ57TF
BS 163 209 RS1FS59TF
BS 210 648 RS1GZ57TF

RD RS1FS59TF 209 0 0
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AAGTGAATTGATTGAATTGTTCGAGGCGG

QA 1 209 1 209
DS 

RD RS1GZ57TF 648 0 0
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CCCCGAACACATCTCATTCTTTCTTCTTCAATCGCAAGTTACAATCTTTCAGTTTTTTTC
TCTCTCTTTCTGTTCTAACTCGGCTTGGATCTGTCGGGGCTACTTTCGAGGGACGATGGA
AAGTGAATTGATTGAATTGTTCGAGGCGGCGAAGAAGGCAGCCGATGCGGCGGCGATCGA
CGGTGTAGCCTCCTCAGGTCCGGAGGTTTCTCGATCTCTCGATGCCCTTAAACAGCTCAA
GAAGTTTCCCATTACATACGACATGCTCGTCGCCACTCAGGTAGGTAAGAAGCTGAGGTC
TCTTTCGAAACATCCTATCGACGAAATCAAAACCGTAGCTACTGATCTTCTCGATATATG
GAAAAAGCTTGTCATCGAAGAGACATCCACGTCTAAGAAGGATGCAAATCCCGCGCCTGT
GAAAGTGCAGAAGCTTCAGAGAGGTGATTCAGCTAAGAGCATCAAGGTAGAGAGAAAAGA
ACCAGTCAACAACGGTGTTAAGATAGAGCATCGTGGTCAGACTGGTGTCAAAGACGAGAA
TCAATCTAGTATGAAAGCTCCAGCTAAGCACCAGCAAGTAATGGGGCA

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 2

CO CL4267Contig1 722 2 2 U
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CTCAGTCTCGTGGTAGCGGTGGCGGCGGAGGAGGCCGTGGAGGTGGCGGTGGTGGATACC
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GAGGCTACGGTGGAGGTGGCAGACGTGATGGTGGTGAAGGTGGAGGTTACGGAGGAGGAA
GCGGTGGTGGTGGTTGGTAATTAGTTTAGGTTTGTGGTTGTTTAATGACTGTTCCGTTTC
TGGTTCGGGTTTATGGTTTCTCTCTATGTGTTGTGATGTTTGGTCCTTCTGCTGTTTTGG
GTGTAACAGTTCGTGATTAGGTATTTGATATCTGGAAACGCAATGTTAAATCACTTTTCG
TG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1F923TF U 1
AF RS1F923JQ C 204
BS 1 672 RS1F923TF
BS 673 722 RS1F923JQ

RD RS1F923TF 672 0 0
GGACACCTTCACTCTTCACTGTAAACCTACATCCCCCTCTCTTTTTATCAATGGCGTCCG
CTGATGTTGAGTACCGGTGCTTCGTCGGAGGTCTAGCATGGGCCACCGATGACAGAGCTC
TCGAGACAGCCTTCTCTCAGTACGGCGACGTTCTCGATTCCAAGATCATTAACGATCGTG
AGACTGGACGATCAAGGGGGTTCGGATTCGTCACTTTCAAGGACGAGAAGTCAATGAGAG
ATGCCATCGAAGCGATGAACGGGCAGGATCTCGACGGTCGCAGCATCACTGTGAACGAGG
CTCAGTCTCGTGGTAGCGGTGGCGGCGGAGGAGGCCGTGGAGGTGGCGGTGGTGGATACC
GCAGCGGAGGTGGTGGTGGTGGTTACGGAGGAGGCGGTGGTGGATACGGTGGTGGAAGAC
GCGAGGGTGGGTACAGTGGTGGAGGAGGTGGTGGTTACTCCTCGAGAGGAGGTGGTGGTG
GAGGCTACGGTGGAGGTGGCAGACGTGATGGTGGTGAAGGTGGAGGTTACGGAGGAGGAA
GCGGTGGTGGTGGTTGGTAATTAGTTTAGGTTTGTGGTTGTTTAATGACTGTTCCGTTTC
TGGTTCGGGTTTATGGTTTCTCTCTATGTGTTGTGATGTTTGGTCCTTCTGCTGTTTTGG
GTGTAACAGTTC

QA 1 672 1 672
DS 

RD RS1F923JQ 519 0 0
GGATTCGTCACTTTCAAGGACGAGAAGTCAATGAGAGATGCCATCGAAGCGATGAACGGG
CAGGATCTCGACGGTCGCAGCATCACTGTGAACGAGGCTCAGTTTCGTGGTAGCGGTGGC
GGCGGAGGAGGCCGTGGAGGTGGCGGTGGTGGATACCGCAGCGGAGGTGGTGGTGGTGGT
TACGGAGGAGGCGGTGGTGGATACGGTGGTGGAAGACGCGAGGGTGGGTACAGTGGTGGA
GGAGGTGGTGGTTACTCCTCGAGAGGAGGTGGTGGTGGAGGCTACGGTGGAGGTGGCAGA
CGTGATGGTGGTGAAGGTGGAGGTTACGGAGGAGGAAGCGGTGGTGGTGGTTGGTAATTA
GTTTAGGTTTGTGGTTGTTTAATGACTGTTCCGTTTTTGGTTCGGGTTTATGGTTTCTCT
CTATGTGTTGTGATGTTTGGTCCTTCTGCTGTTTTGGGTGTAACAGTTCGTGATTAGGTA
TTTGATATCTGGAAACGCAATGTTAAATCACTTTTCGTG

QA 1 519 1 519
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL4271Contig1 1294 2 6 U
GGGTAGCCTCCACCATCTTCCACTCTTTTCGAATTTGCTCCGTCGCCGCTCGGAATCTCC
GTCATACCCTTAGATCGCCCGCAGATATGAACGCCCCTGTTCTCGTTCTCAAGGATTCGT
TGAAGCGTGAATCTGGAACAAAGGTTCACCATGGAAATATCCAAGCTTCCAAGGCTGTGG
CTGATATCATCCGCATCACATTGGGTCCTCGCTCTATGTTAAAGATGCTTCTCGATGCTG
GTGGAGGAATTGTTGTTACCAATGATGGGAATGCTATTTTGCGTGAACTTGATGTTGCTC
ACCCTGCTGCTAAGTCTATGATTGAGTTGAGCCGTACACAGGACGAAGAAGTTGGTGATG
GGACTACATCTGTTATTGTTCTTGCTGGTGAAATGTTACATGTTGCTGAAGCATTTATTG
AGAAGAGTTACCATCCCACAGTCATCTGCCGTGCTTATAACAAGGCTCTTGAGGATGCTA
TCGCTGTTCTTGACAAAATTGCTATGCCAGTCGATGTCAATGACCGTGAAACAGTACTAG
GCTTAGTCAAAAGCTACATAGGAACAAAATTCACTAGCCAGTTTGGTGATCTTATTGCTG
ATTTGGCTATTGATGCCACTACTACTGTTGGTGTTGATCTTGGACAAGGATTAAGGGAGG
TAGATATCAAAAAATACATCAAGGTTGAGAAGGTCCCCGGTGGTCAATTGGAAGACTCCA
AGGTTCTCAAAGGAGTCATGTTCAACAAAGACGTTGTCGCTCCCGGTAAAATGAAGAGAA
AGATTGTCAACCCTAGGATTATTCTTCTCGACTGTCCCCTTGAGTACAAGAAAGGTGAAA
ACCAAACCAACGCTGAGTTGGTCAGAGAAGAGGATTGGGAAGTTCTGCTGAAGCTTGAAG
AGGAGTACATCGAGAACATCTGCGTGCAGATTCTGAAGTTCAAACCCGATTTGGTCATCA
CAGAGAAGGGACTTAGTGACTTAGCTTGTCACTATTTCAGCAAAGCCGGAGTTAGTGCAA
TCCGGAGGCTGAGAAAGACGGACAACAACAGGATTGCTAAGGCGTGTGGGGCTGTGATTG
TGAACAGGCCTGATGAACTTCAGAGTCTGATGTTGGTACAGGCGCTGGCTTGTTTGAGGT
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TACTGTGCTTTTAGAGACAAAGTAAAGATCTTCTCATGAAGTGGAGAGGATCTTCAGATG
CCATGTCTGTTTCGAGAACATCATCAGACCCGAG


BQ
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AF RS1GR42TF U 527
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GTACATCAAGTTTG

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G
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GATTTGGTCATCACAGAGAAGGGACTTAGTGACTTAGCTTGTCACTATTTCAGCAAAGCC
GGAGTTAGTGCAATCCGGAGGCTGAGAAAGACGGACAACAACAGGATTGCTAAGGCGTGT
GGGGCTGTGATTGTGAACAGGCCTGATGAACTTCAGAGTCTGATGTTGGTACAGGCGCTG
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GGATCTTCAGATGCCATGTCTGTTTCGAGAACATCATCAGACCCGAG

QA 2 768 2 768
DS 



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GCACAAGAGATCGATCAACTTTTAAGTTATCTCATCAACAAAGAGAACTCTGAAGGCGTT
GTTCTACTTGGCCATAGCACTGGCTGCCAGGACATTGTGTATTATATGGGAACAAATGCT
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TCTTCCCG


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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DG38TF U 1
AF RS1DG38JQ C 117
BS 1 581 RS1DG38TF
BS 582 908 RS1DG38JQ

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GTTCAACTACTCATGTCTTCTTCCTATTCTGGATTCGGCACTTCCAGTTTGAAACAAGAT
GCACAAGAGATCGATCAACTTTTAAGTTATCTCATCAACAAAGAGAACTCTGAAGGCGTT
GTTCTACTTGGCCATAGCACTGGCTGCCAGGACATTGTGTATTATATGGGAACAAATGCT
GCATGCTCCCGAGCCGTCCGAGCTGCAATTTTGCAGGCACCGGTCAGCGATAGAGAGTAC
AAAGCAACGCTTCCTGAAACACCAGCTATGATAGACTTGGCTGCAAATATGATAAAAGAG
GGACGAGCAGAGGAGCTAATGCCTAGAGAAGCTGATCCTTGTGCTCCAATCTCTGCGTAT
AGATACCACTCCCTCTGCGCTTACATGGGAGACGACGATATGTTTAGTTCTGACCTAAGT
GATGATCAGTTGAAAACTAGACTTGGTCATATGGCTAACACACCTTGTCAGGTGATTTTC
TCCATGGGTGATGAGTATGTACCTGATTATGTCGACAAAAA

QA 1 581 1 581
DS 

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CGTTGTTCTACTTGGCCATAGCACTGGCTGCCAGGACATTGTGTATTATATGGGAACAAA
TGCTGCATGCTCCCGAGCCGTCCGAGCTGCAATTTTGCAGGCACCGGTCAGCGATAGAGA
GTACAAAGCAACGCTTCCTGAAACACCAGCTATGATAGACTTGGCTGCAAATATGATAAA
AGAGGGACGAGCAGAGGAGCTAATGCCTAGAGAAGCTGATCCTTGTGCTCCAATTTCTGC
GTATAGATACCACTCCCTCTGCGCTTACATGGGAGACGACGATATGTTTAGTTCTGACCT
AAGTGATGATCAGTTGAAAACTAGACTTGGTCATATGGCTAACACACCTTGTCAGGTGAT
TTTCTCCATGGGTGATGAGTATGTACCTGATTATGTCGACAAAAAAGCACTGGTTAATAG
GCTAAGTAAAGCAATGGGAGGAGCAGAGAAAGTGGAGGTAGAGCATGGGAATCACTCGCT
CTCCAATAGAGTTCATGAAGCTGTTCAAGCCATTATGAGTTTTGTCAAACGAGAAGGACC
CAGTGGTTGGGATGATCCTTGGAGCTAAATCTTCTTCTTCTTTTTTTTCATTATTTGGAT
GAAAATTATACAAATTTCAATCTCTATGAATTAATTTAATGCGTAGTGTCATTTCTCTTC
CTTGTTACATAATCCCCAAATTCTTTTGTTGCTTTATCTTGTCTTTATACAAAATTGTTT
CTTTTCTTCCCG

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 2

CO CL4273Contig1 795 2 10 U
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AGTAGTTCTTTTTAAATCTTGATGAATGTTCCTATTTTGTGTTATGCTCTTAACCCTCAA
TGATAACTAACTTTAAACGGTGCTTTTATATCTTCAGTTTGGTGCTTTTATATTGTAGAT
CAAACATGCGAAACTCCTACAGATTGTGTGAGTAGTTCCCTTGAATTTTGAATGTTCTCT
GTTTTTGTGTTATGCTCCTCCTACTCTCATTGACCATACTAATCTGCGTTAGTTATATGT
ATGTTGCTCAGAGAAAGGTTATTATTCTAAATTAGTTTGGTGCTTCTGTGTATTATAGAG
TATCTTGTTTCTTATAAAGTCACTTATAGATCAACGTATATGAGAGAGACTCCTGCTGAA
TGTGGTCGTAGATTCCTTATTTCTTGAATGGTAACCCTCAGTGACCATTGTAAACATGTG
AAGTGACATCTTCACAACTCTGCATAGTGGGCTAATGATTACTGTGTTAGATTCTATAAA
TTGTATATGTTGAATTGAGCTTTTACAGCGACTGAAAATTTCTCTGTTATCAAGTCTATA
TCTTTGTCTCCGATTCTTAGCAACATGAACGACACAGATGAAGTCGAGAATCCTGGTAGT
GAAGATGCAGATCAACAGAAGGGTGCAGCCGATAAAGCTCCTACTGCAGCAGATAACGGA
GCAGCAGGCCTTAGACAACACGAAGAAACTGTAGACAAAGAAAGTTCTGAATTCCCTGAA
ATGAGTACAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F828TF U 1
AF RS1F828JQ C 286
BS 1 700 RS1F828TF
BS 701 701 RS1F828JQ
BS 702 727 RS1F828TF
BS 728 728 RS1F828JQ
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BS 739 747 RS1F828TF
BS 748 748 RS1F828JQ
BS 749 775 RS1F828TF
BS 776 795 RS1F828JQ

RD RS1F828TF 787 0 0
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TGATAACTAACTTTAAACGGTGCTTTTATATCTTCAGTTTGGTGCTTTTATATTGTAGAT
CAAACATGCGAAACTCCTACAGATTGTGTGAGTAGTTCCCTTGAATTTTGAATGTTCTCT
GTTTTTGTGTTATGCTCCTCCTACTCTCATTGACCATACTAATCTGCGTTAGTTATATGT
ATGTTGCTCAGAGAAAGGTTATTATTCTAAATTAGTTTGGTGCTTCTGTGTATTATAGAG
TATCTTGTTTCTTATAAAGTCACTTATAGATCAACGTATATGAGAGAGACTCCTGCTGAA
TGTGGTCGTAGATTCCTTATTTCTTGAATGGTAACCCTCAGTGACCATTGTAAACATGTG
AAGTGACATCTTCACAACTCTGCATAGTGGGCTAATGATTACTGTGTTAGATTCTATAAA
TTGTATATGTTGAATTGAGCTTTTACAGCGACTGAAAATTTCTCTGTTATCAAGTCTATA
TCTTTGTCTCCGATTCTTAGCAACATGAACGACACAGATGAAGTCGAGAATCCTGGTAGT
GAAGATGCAGATCAACAGAAGGGTGCAGCCGATAAAGCTC*TACTGCAGCAGATAACGGA
GCAGCAG*CCTTAGACA*CACGAAGAA*CTGTAGACAAAGAAAGTTCTGAATTCC
TGAATGAGTACA

QA 1 775 1 775
DS 

RD RS1F828JQ 510 0 0
GCGTTAGTTATATGTATGTTGCTCAGAGAAAGGTTATTATTCTAAATTAGTTTGGTGCTT
CTGTGTATTATAGAGTATCTTGTTTCTTATAAAGTCACTTATAGATCAACGTATATGAGA
GAGACTCCTGCTGAATGTGGTCGTAGATTCCTTATTTCTTGAATGGTAACCCTCAGTGAC
CATTGTAAACATGTGAAGTGACATCTTCACAACTCTGCATAGTGGGCTAATGATTACTGT
GTTAGATTCTATAAATTGTATATGTTGAATTGAGCTTTTACAGCGACTGAAAATTTTTCT
GTTATCAAGTCTATATCTTTGTTTCCGATTTTTAGCAACATGAACGACACAGATGAAGTC
GAGAATCCTGGTAGTGAAGATGCAGATCAACAGAAGGGTGCAGCCGATAAAGCTCCTACT
GCAGCAGATAACGGAGCAGCAGGCCTTAGACAACACGAAGAAACTGTAGACAAAGATAGT
TCTGAATTCCCTGAAATGAGTACAAAAAAA

QA 1 510 1 510
DS 



AS 1 2

CO CL4274Contig1 1024 2 2 U
GGTTCTAATGGACCAGTTTCACCATGTTTCTGCCGCTTTTCTGGAACTTGAAAAAGGGTA
TCAAGAAGCTATTGAAGATATAACTAAAAGAATGGGTGCAGGAATGGCCAAATTTATTTC
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GGGTTTAGGTTTGTCGAAACTCTTGCTCGCTTCAGGATTAGAAATCCTGACACCAGACTG
GTAGCAGATTTCCAATTCTACAGGTTTATTTCTCCAAAAAACAAACATTATCAAAGATTA
CATTGAAGACGTTAATGAGATACCTAAACCGCGCATGTTTTGGCCTCGTGAGATTTGGGG
AAAATATGTTAACAAGCTCGAGGAGTTAAAAAATGAGGAGAACTCAACAAAAGCAGTGCA
GTGCTTGAATGAAATGGTCACTAATGCATTGATTCATGTTGAAGATTGCTTGAAATCTAT
GGCTGGATTGCGTGATCCTGCAATATTTAAGTCTTGTGCAATCCCACAGATTGTGGCGAT
TGGAACACTTGCATTGTGCTATAACAATGTACAAGTATTTAGAGGCGTCGTGAAACTCAG
GCGAGGTCTAATTGCCAAAGTGATTGATCGCACAAAGACAATGGATGATGTCTATGGTGC
ATTCTATGATTTTTCTCACATGCTAAAGACAAAGGTGGACAAGAACGATCCAAATGCCAA
GAAAACGCTTCAGCGACTGGAAACTATCGAGAAAGTCTGCAGAGAAAATGGAGACCTTCA
CAAGAGAAAATCTTACGTTAACGGCGAAACTCAATCAATGGCTCTCTTTATTTTAATGCT
TGTGCCTCTACTGGCCATACTAGTCTTTGTGTATCTACAGGACCTCTCGAAGATTTTATA
AAACGTCACGTAACGTATCTTTTTCTTGTGGTCCTTTTACAACGCTTAGTTTTGCTCTGT
TTCCATGAGACTCTGTAATTTACTTACTGCCTTCTTTTTCATGTTTTATCGCATCCGTAG
TTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1C159TF U 1
AF RS1C159JQ C 231
BS 1 690 RS1C159TF
BS 691 1024 RS1C159JQ

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GTAGCAGATTTCCAATTCTACAGGTTTATTTCTCCAAAAAACAAACATTATCAAAGATTA
CATTGAAGACGTTAATGAGATACCTAAACCGCGCATGTTTTGGCCTCGTGAGATTTGGGG
AAAATATGTTAACAAGCTCGAGGAGTTAAAAAATGAGGAGAACTCAACAAAAGCAGTGCA
GTGCTTGAATGAAATGGTCACTAATGCATTGATTCATGTTGAAGATTGCTTGAAATCTAT
GGCTGGATTGCGTGATCCTGCAATATTTAAGTCTTGTGCAATCCCACAGATTGTGGCGAT
TGGAACACTTGCATTGTGCTATAACAATGTACAAGTATTTAGAGGCGTCGTGAAACTCAG
GCGAGGTCTAATTGCCAAAGTGATTGATCGCACAAAGACAATGGATGATGTCTATGGTGC
ATTCTATGATTTTTCTCACATGCTAAAGAC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1C159JQ 794 0 0
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TCAAAGATTACATTGAAGACGTTAATGAGATACCTAAACCGCGCATGTTTTGGCCTCGTG
AGATTTGGGGAAAATATGTTAACAAGCTCGAGGAGTTAAAAAATGAGGAGAACTCAACAA
AAGCAGTGCAGTGCTTGAATGAAATGGTCACTAATGCATTGATTCATGTTGAAGATTGCT
TGAAATCTATGGCTGGATTGCGTGATCCTGCAATATTTAAGTCTTGTGCAATCCCACAGA
TTGTGGCGATTGGAACACTTGCATTGTGCTATAACAATGTACAAGTATTTAGAGGCGTCG
TGAAACTCAGGCGAGGTCTAATTGCCAAAGTGATTGATCGCACAAAGACAATGGATGATG
TCTATGGTGCATTCTATGATTTTTCTCACATGCTAAAGACAAAGGTGGACAAGAACGATC
CAAATGCCAAGAAAACGCTTCAGCGACTGGAAACTATCGAGAAAGTCTGCAGAGAAAATG
GAGACCTTCACAAGAGAAAATCTTACGTTAACGGCGAAACTCAATCAATGGCTCTCTTTA
TTTTAATGCTTGTGCCTCTACTGGCCATACTAGTCTTTGTGTATCTACAGGACCTCTCGA
AGATTTTATAAAACGTCACGTAACGTATCTTTTTCTTGTGGTCCTTTTACAACGCTTAGT
TTTGCTCTGTTTCCATGAGACTCTGTAATTTACTTACTGCCTTCTTTTTCATGTTTTATC
GCATCCGTAGTTTG

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

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CACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTGAATGATCCGGTGAAGTGTTCGGATCGCGGCGAC
GTGGGTGGTTCGCCGTCTGCGACGTCGCGAGAAGTCCACTAAACCTTATCATTTAGAGGA
AGGAGAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCGTATCCT
GGAAACAGAACGACCCGAGAACGTTGAAACATCACTCTCGGTGGGCTGGGTTCTCTTACC
GGAATCTATGCCTTCCGATTCCGTGGTTATGTGTTTCGTCCTCGGTCAAGACTTCTGTCT
CAGCCGGGTCGTGCACATAGCTTCCGGATATCACCAAACCCCGGCACTCTGCGTTGATAC
CACTGCTTACGGCCGGGGCAGCATTGTCCGTGGCACAGTTGGATATCTAGACCCTGAGTA
CTATATATCGCAGCAGTTAACGGAGAAGAGTAACGTATATATCTTTGGAGTCATTCTTCT
TGAGCTTATATCAGGCCAAGAAGCCATTTCTAATGAAAACTTCGGTTTCAACTGCAGGAA
CATAGTCCAATGGGCCAAGATGCATATAGACAACGGGGACATAAGAGGGATCATAGATCC
AGCGCTAGCGGAAGACGACTACAGTCTCCAGTCGATGTGGAAGATAGCGGAGAAGTCGTT
GATGTGTGTGAAGCCACACGGGAACATGAGGCCGTCGATGTCTGAGGTGCAGAAGGATAT
ACAAGACGCGATAAGGATGGAGAAGGAAGCTTTGGTGGGAAGAGGAGGGGTGTCGGATGA
GTTTTCAAGGAGCTCGGCGCATTCGTCGTCGTTCAACATGGGGGGGATGCGTGAGAACTA
TGTGTCTATTGATGAGTCTGTCTTGACGCCAACACCTCGGTAGTAGAATAATTGGTTTTG
TATAGGATGCATGATATGCTTGCACACTCCTTAATGTACTTTCACGTTGTTTGGTCTTTC
TTTTAATTTTTAGTTTTTGTTTTTAGTTTTTGAGGGTAAGACTGTTTTTGGAGACTCGAG
CTTACAAGAAATGCTTCGAGCTGGATTTTTATATAATTCTTAGAACTACGTGATTTATTT
GGGATTGTGAATTATTATTTTGTTATTTTTCACTATTTCAAGTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BD38TF U 1
AF RS1BD38JQ C 336
BS 1 701 RS1BD38TF
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BS 703 713 RS1BD38TF
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RD RS1BD38TF 769 0 0
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GGAAACAGAACGACCCGAGAACGTTGAAACATCACTCTCGGTGGGCTGGGTTCTCTTACC
GGAATCTATGCCTTCCGATTCCGTGGTTATGTGTTTCGTCCTCGGTCAAGACTTCTGTCT
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CACTGCTTACGGCCGGGGCAGCATTGTCCGTGGCACAGTTGGATATCTAGACCCTGAGTA
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TGAGCTTATATCAGGCCAAGAAGCCATTTCTAATGAAAACTTCGGTTTCAACTGCAGGAA
CATAGTCCAATGGGCCAAGATGCATATAGACAACGGGGACATAAGAGGGATCATAGATCC
AGCGCTAGCGGAAGACGACTACAGTCTCCAGTCGATGTGGA*GATAGCGGAGA*GTCGTT
GATGTGTGTGAAGC*ACACGGGAACATGAGGCCGTCGATGTCTGAG
TGC

QA 1 766 1 766
DS 

RD RS1BD38JQ 850 0 0
GTGTTCGTCTCGTCAGAC
TCTGTCTCAGCCGGGTCGTGCACATAGCTTCCGGATATCACCAAACCCCGGCACTCTGCG
TTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGCAGCATTGTCCGTGGCACAGTTGGATATCTAGACC
CTGAGTACTATATATCGCAGCAGTTAACGGAGAAGAGTAACGTATATATCTTTGGAGTCA
TTCTTCTTGAGCTTATATCAGGCCAAGAAGCCATTTCTAATGAAAACTTCGGTTTCAACT
GCAGGAACATAGTCCAATGGGCCAAGATGCATATAGACAACGGGGACATAAGAGGGATCA
TAGATCCAGCGCTAGCGGAAGACGACTACAGTCTCCAGTCGATGTGGAAGATAGCGGAGA
AGTCGTTGATGTGTGTGAAGCCACACGGGAACATGAGGCCGTCGATGTCTGAGGTGCAGA
AGGATATACAAGACGCGATAAGGATGGAGAAGGAAGCTTTGGTGGGAAGAGGAGGGGTGT
CGGATGAGTTTTCAAGGAGCTCGGCGCATTCGTCGTCGTTCAACATGGGGGGGATGCGTG
AGAACTATGTGTCTATTGATGAGTCTGTCTTGACGCCAACACCTCGGTAGTAGAATAATT
GGTTTTGTATAGGATGCATGATATGCTTGCACACTCCTTAATGTACTTTCACGTTGTTTG
GTCTTTCTTTTAATTTTTAGTTTTTGTTTTTAGTTTTTGAGGGTAAGACTGTTTTTGGAG
ACTCGAGCTTACAAGAAATGCTTCGAGCTGGATTTTTATATAATTCTTAGAACTACGTGA
TTTATTTGGGATTGTGAATTATTATTTTGTTATTTTTCACTATTTCAAGTTT

QA 19 850 19 850
DS 



AS 1 2

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GCATCTCATTTATTAAGATGAAATGGACACACAAAAACCAACAATCCATGTGAGACTCAT
TCATAATCATTACCAACTTCTCTCTCCCTATCTCTATGTCTATGTGCAAGAGACGGTCTT
TAGTGCAAACAAACAGCGATGGATAGGTAAAATGGTTCTCTTTTCAGAGGAAAATCGGAG
CCATGACAAGAGTAATAGTCGCGAGCATTTTGATGAGTACATGAATGGAAGGACCAGCCG
TGTCCTTGAACGGATCTCCCACTGTATCACCGGTCACGGCCGCTTTGTGGGCTTCACTTC
CTTTGCCACCGAGTGCACCGGTCTCTATGTATTTCTTTGCATTGTCCCAAGCACCACCCG
CTGTGTTTAGGAAAAGTGCCATTAAGATACCACAGACTGTTGCAAACATAAGGCAAGAGG
AATGGCAACGGAGGTGACCTTGTCCATTGGTCCTTTGAGGTAAGTGTGCCTTTGGATACT
CTGGAACAACCTCTGCTTCTCCAGAAGCTTCTCTCTTGGCCTAAACGGAGTTTCTGTCAA
CATTATCTGAGTGAAATTAATCGAGAAGATAAAGGGAGTTAGAGAGAGTGGGAGATGCGC
AGATGGAGAATCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B323JQ U 45
AF RS1B323TF C 1
BS 1 44 RS1B323TF
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BS 255 673 RS1B323TF

RD RS1B323JQ 210 0 0
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TCCATGTGAGACTCATTCATAATCATTACCAACTTCTCTCTCCCTATCTCTATGTCTATG
TGCAAGAGACGGTCTTTAGTGCAAACAAACAGCGATGGATAGGTAAAATGGTTCTCTTTT
CATAGGAAAATCGGAGCCATGACAAGAGTA

QA 1 210 1 210
DS 

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GCATCTCATTTATTAAGATGAAATGGACACACAAAAACCAACAATCCATGTGAGACTCAT
TCATAATCATTACCAACTTCTCTCTCCCTATCTCTATGTCTATGTGCAAGAGACGGTCTT
TAGTGCAAACAAACAGCGATGGATAGGTAAAATGGTTCTCTTTTCAGAGGAAAATCGGAG
CCATGACAAGAGTAATAGTCGCGAGCATTTTGATGAGTACATGAATGGAAGGACCAGCCG
TGTCCTTGAACGGATCTCCCACTGTATCACCGGTCACGGCCGCTTTGTGGGCTTCACTTC
CTTTGCCACCGAGTGCACCGGTCTCTATGTATTTCTTTGCATTGTCCCAAGCACCACCCG
CTGTGTTTAGGAAAAGTGCCATTAAGATACCACAGACTGTTGCAAACATAAGGCAAGAGG
AATGGCAACGGAGGTGACCTTGTCCATTGGTCCTTTGAGGTAAGTGTGCCTTTGGATACT
CTGGAACAACCTCTGCTTCTCCAGAAGCTTCTCTCTTGGCCTAAACGGAGTTTCTGTCAA
CATTATCTGAGTGAAATTAATCGAGAAGATAAAGGGAGTTAGAGAGAGTGGGAGATGCGC
AGATGGAGAATCC

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

CO CL4277Contig1 840 2 4 U
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GGACCCTTCTACACCTTTTCTTCTTCCTCTCTTTCCTTTCCCACCACCACCAAACGTTAA
TTCAAGATTCTCCCTTTAATTTCTAGTCTTATATTGTAACGATGGGAACCGAAGTCATCA
GGCCTCAGAACTGTCTGGTTAACCGGATGAGAGATTCTCCGGCGACCATTTTTCACCATC
CCCGGAGAAACCATCCTCACCGGAAGCCGCCTCTACGACCTGACCAAAGGAGACGGTTCG
GCTCCGTCGACTTCAGAACGACGGCCAAGGACATCGTCATGAGAAGAGGAGAGTCTTTTG
ATTCGTTTTCGAACATCAAGAACCGGAGATCTAATGGACATGAAGTAGTGTCTCCCGACG
ATATCTACGCGGGGTCTTCCATTTTCGTTGTTTCTCCGGCGCCGAGTTCGCTCCCTCTGC
CGTCGTTCTCGAGGAGGGATGCGGACAGCCATGTCGTTGTTGTTTCCGTTGATGATTCGG
CGTCTCAGGATCTCCGGCGACTTCTCCGGCTTGAGTTTTGAGTTAACGCGGGAAAATTAA
TGGGATCGTCAGCTATGTAACGGTTCTCATATGTATTTAAATCTGGGAATCGCCTCCGTT
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TCAGTTATCATGGGAGTTTTCGCGCGATATGGAATTAAAAGAAAATTATTTTTCGAGATC


BQ
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AF RS1AI76TF U 1
AF RS1AI76JQ C 673
BS 1 711 RS1AI76TF
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CGTCTCAGGATCTCCGGCGACTTCTCCGGCTTGAGTTTTGAGTTAACGCGGGAAAATTAA
TGGGATCGTCAGCTATGTAACGGTTCTCATATGTATTTAAATCTGGGAATCGCCTCCGTT
GTTGTTTTTACTAATCTGTCCTTCCTTCGAATAATTTGTTTTAGAAAAGGGTGGGGTCGG
AAATATCGTTAAAAGT

QA 1 736 1 736
DS 

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AAGTACAGGGTCGGATTTAGAAACAAATGTTAAATATTAGCTGACTTTTCAGTTATCATG
GGAGTTTTCGCGCGATATGGAATTAAAAGAAAATTATTTTTCGAGATC

QA 1 168 1 168
DS 



AS 1 2

CO CL4278Contig1 1198 2 2 U
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CTCCCGCCGCCGGAAAACCGCAGTCTCACCACCACCACCACCACCACCACCACCGTAGGG
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CGTCGAGGGTTGAGGTCGGAATGTCTGAACTCCCAGCTGATGTTCAAGATCAGGAGCTGG
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GTTTAGATCCATACGAAAGCAAGGACGAGAGTGCTTTGGACACTGATGACAATGCTCCTG
TAACTTTGAAAGTGAAGCTCTCTGACTCAGATTTGGTCTGGGCTAAAGTAAGGAGCCACC
CATGGTGGCCTGGGCAAGTGTTCGACGCCTCTGCTGCGACAGAAAAGGCGAAGAAGCACT
TCAAGAAAGGAAGCTTTTTAGTTACATACTTCGGAGACTGCTCCTTCGCTTGGAACGATG
CGTCAAAGGTAAAGCCTTTCCGACATCATTTCTCTCAGATGGCGAAGCAGAGTAGCCTGC
CTGGTTTTCTCGATGCCGTTGATTCCGCTTTGGAAGAGGTGTCGAGAAGGGTAGAGTTCG
GTTTGGCTTGTTCTTGTATCTCGGAGGAAGTCTATGAGAGGATCAAGACTCAGAAGATAA
TCAACCCTGGAATCAGAGAGGATTCGAGTAGGATACAAGGGGGAGACAAGGTCTCAAGTG
CTGTCTTCTTTGAACCTGCAAAGCTTGTGGGGTATGTGAAGCGTTTAGCATGCTCTCCAA
GCTATGATGCTTCTTCTGATGAGCTCCAGTTTGTAAGTCAGAGAGCTAGGTTACTGGCTT
TTAGTCGCTGGAAAGGCTATACCGACCTCCCTGAGTTTGAGACACTTGAAGGATCAGTAG
AGTCTGCACCCAAGATATCTCCTGCAGATACTGAAGTGAAAGAGTCTGCTCCTGAACC


BQ
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AF RS1CJ76TF U 1
AF RS1CJ76JQ C 555
BS 1 761 RS1CJ76TF
BS 762 1198 RS1CJ76JQ

RD RS1CJ76TF 761 0 0
GGGAGAAACCCGTTTCTGTCTGGTTCAGTTTGACGTCTTCATCTACTTCAAAGAAACCAC
CTCCCGCCGCCGGAAAACCGCAGTCTCACCACCACCACCACCACCACCACCACCGTAGGG
TTTTAGTCATGTCGACGGAACAAGAACGTATTCAATCGGTGTCCGACGCTGCTTTTGATG
CGTCGAGGGTTGAGGTCGGAATGTCTGAACTCCCAGCTGATGTTCAAGATCAGGAGCTGG
ATGGAGAGAACAAGCAAGAAGACTGCGTTGTTGTTGAACCAAGAGCTTCTTTAGTTGGTG
ATGATCTTGGAATGACCAAGAAAAAAGAATCTGTAAATGGAAAGTCAGATCTGGTCTTAG
AATCAACAACCACTAAGGAAAGTGAGAAGAAGGAAGTCTCAGTTAATGTTGAAAAAGAGG
AACCTGACATGAAGCAAGGAACTGAAGCTGAGAGCTTGGATGATATTGAGTGTTTTACGG
GTTTAGATCCATACGAAAGCAAGGACGAGAGTGCTTTGGACACTGATGACAATGCTCCTG
TAACTTTGAAAGTGAAGCTCTCTGACTCAGATTTGGTCTGGGCTAAAGTAAGGAGCCACC
CATGGTGGCCTGGGCAAGTGTTCGACGCCTCTGCTGCGACAGAAAAGGCGAAGAAGCACT
TCAAGAAAGGAAGCTTTTTAGTTACATACTTCGGAGACTGCTCCTTCGCTTGGAACGATG
CGTCAAAGGTAAAGCCTTTCCGACATCATTTCTCTCAGATG

QA 1 761 1 761
DS 

RD RS1CJ76JQ 644 0 0
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CAAGTGTTCGACGCCTCTGCTGCGACAGAAAAGGCGAAGAAGCACTTCAAGAAAGGAAGC
TTTTTAGTTACATACTTCGGAGACTGCTCCTTCGCTTGGAACGATGCGTCAAAGGTAAAG
CCTTTCCGACATCATTTCTCTCAGATGGCGAAGCAGAGTAGCCTGCCTGGTTTTCTCGAT
GCCGTTGATTCCGCTTTGGAAGAGGTGTCGAGAAGGGTAGAGTTCGGTTTGGCTTGTTCT
TGTATCTCGGAGGAAGTCTATGAGAGGATCAAGACTCAGAAGATAATCAACCCTGGAATC
AGAGAGGATTCGAGTAGGATACAAGGGGGAGACAAGGTCTCAAGTGCTGTCTTCTTTGAA
CCTGCAAAGCTTGTGGGGTATGTGAAGCGTTTAGCATGCTCTCCAAGCTATGATGCTTCT
TCTGATGAGCTCCAGTTTGTAAGTCAGAGAGCTAGGTTACTGGCTTTTAGTCGCTGGAAA
GGCTATACCGACCTCCCTGAGTTTGAGACACTTGAAGGATCAGTAGAGTCTGCACCCAAG
ATATCTCCTGCAGATACTGAAGTGAAAGAGTCTGCTCCTGAACC

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 2

CO CL4279Contig1 1131 2 6 U
GCCCAAGATTCTGTTTCTTGCAACTTTTCTGCTACTTCTCTCTTTCTGGGTAGATGTTTG
CCATCAGGGAAATGGAGAGGAGGATGAGGATGATGAAGATGAAGAAAATAGCATCCAGCA
AATGTTGCTCGAGAAAAGCAAGAGCAAATCAGGTTCTTCCAGTGCAAGTGATCGCAGAAA
GTGCTGCTCTTTCCATGGGATTCATGTCGCACCCGACAAAAGTTTGTTGCTGCTGCGGTT
GTTCTTGTGTTCATCTTAATGATATCATTTGCAATCCTTATCTGGATTGCATCCGGAGAT
ACTTCTGCAGATCCTTCGTTATTGGCTGAGGTGTATGTAGATATTTTTGCTTCAATAATC
CTAATCACTGGAGGAGGTCTATGCTTCTATGGCACGCGTCTGCTCTTTAACCTAAGGAAG
GTCCGGTCGGAACAAGTTTCATCAGAGATGCGAAAGGTATCGGGTTTAGCAGGCGTGTCA
GTGGTATGCTTCACCGTGAGCTCTTTAATCACTCTTTTCACTCACATTCCGCTCTTCTAT
CATTGGAATCCAAACAAGTTACACGGCATCAAGGCATTGGTTCTTCTGATCATATACTAT
TTCATATGTTCGACCTTACCATTAGCTTTCGTTTTATGGGTGTTGAGGGAGTTACCCCCT
GAAAACAATGTGAATAGACAAGAAGAACAAACAAGAATCACTTATGTCAACTACGATACT
GTTGCAAGGCAGCCTCGTCAGCAGTGGACCTCCACAACCGTTTCAAAAAACCAGGTTTCT
AAGGCAAGTCCAATATAACTCAAATGAAACATCATAGCGATTGCCTGAATCAATGTTCTT
CTCTTGTTACCTGGGAAAAACCTCATTGAGTTGCGTAATGGATCTAGCCTGAATATGGTG
TTGTGGTGCTGGAGTGAAACTAGAGCTGAAACAAGCTCGTTTTCTACTCCCTACGTGGCC
TTGGAAACAAGAGTGTGCTTATAAGATATAACTGGAGGTTTAATCCCAGAAAGCTCTGTA
AATATTCTTTTTTGGTTACAGTTTTTTTTACAGTTTTAGTTGCATGATATGTGGAGAGGC
TTGTGGATACACATATGTTCTTACTTCCCAGTAACTTATTGAACCAGTCCC


BQ
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AF RS1GQ66TF U 1
AF RS1GQ66JQ C 512
BS 1 686 RS1GQ66TF
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RD RS1GQ66TF 726 0 0
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CCATCAGGGAAATGGAGAGGAGGATGAGGATGATGAAGATGAAGAAAATAGCATCCAGCA
AATGTTGCTCGAGAAAAGCAAGAGCAAATCAGGTTCTTCCAGTGCAAGTGATCGCAGAAA
GTGCTGCTCTTTCCATGGGATTCATGTCGCACCCGACAAAAGTTTGTTGCTGCTGCGGTT
GTTCTTGTGTTCATCTTAATGATATCATTTGCAATCCTTATCTGGATTGCATCCGGAGAT
ACTTCTGCAGATCCTTCGTTATTGGCTGAGGTGTATGTAGATATTTTTGCTTCAATAATC
CTAATCACTGGAGGAGGTCTATGCTTCTATGGCACGCGTCTGCTCTTTAACCTAAGGAAG
GTCCGGTCGGAACAAGTTTCATCAGAGATGCGAAAGGTATCGGGTTTAGCAGGCGTGTCA
GTGGTATGCTTCACCGTGAGCTCTTTAATCACTCTTTTCACTCACATTCCGCTCTTCTAT
CATTGGAATCCAAACAAGTTACACGGCATCAAGGCATTGGTTCTTCTGATCATATACTAT
TTCATATGTTCGACCTTACCATTAGCTTTCGTTTTATGGGTGTTGAGGGAGTTACCCCCT
GAAAACAATGTGAATAGACAAGAAGA*CAAACAAGAATCACTTATGTCA*CTACGATACT
GTTGCA

QA 1 726 1 726
DS 

RD RS1GQ66JQ 620 0 0
CTCTTTTCACTCACATTCCGCTCTTCTATCATTGGAATCCAAACAAGTTACACGGCATCA
AGGCATTGGTTCTTCTGATCATATACTATTTCATATGTTCGACCTTACCATTAGCTTTCG
TTTTATGGGTGTTGAGGGAGTTACCCCCTGAAAACAATGTGAATAGACAAGAAGAACAAA
CAAGAATCACTTATGTCAACTACGATACTGTTGCAAGGCAGCCTCGTCAGCAGTGGACCT
CCACAACCGTTTCAAAAAACCAGGTTTCTAAGGCAAGTCCAATATAACTCAAATGAAACA
TCATAGCGATTGCCTGAATCAATGTTCTTCTCTTGTTACCTGGGAAAAACCTCATTGAGT
TGCGTAATGGATCTAGCCTGAATATGGTGTTGTGGTGCTGGAGTGAAACTAGAGCTGAAA
CAAGCTCGTTTTCTACTCCCTACGTGGCCTTGGAAACAAGAGTGTGCTTATAAGATATAA
CTGGAGGTTTAATCCCAGAAAGCTCTGTAAATATTCTTTTTTGGTTACAGTTTTTTTTAC
AGTTTTAGTTGCATGATATGTGGAGAGGCTTGTGGATACACATATGTTCTTACTTCCCAG
TAACTTATTGAACCAGTCCC

QA 1 620 1 620
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGGCGTTTGATCCACTGGACGGATCCAGTATTGTGGATACAAACTTCACTGTGGGAACGA
TCTTTGGGGTTTGGCCTGGTGACAAGTTAACAGGAGTCACAGGCGGAGATCAAGTGGCTG
CAGCCATGGGAATCTATGGTCCAAGAACCACCTATGTTGTGGCTATTAAAGGGTTTCCAG
GAACTCGTGAGTTCTTGCTTCTTGATGAAGGGAAATGGCAGCATGTTAAGGAAACAACAG
AGATTAATGAAGGTAAGATGTTCTCACCTGGAAACTTGAGAGCCGCGTTTGACAACTCTG
AATACAGCAAGCTCATTGATTATGTGAAAGAGAAGTACACACTGCGATACACAGGAGGAA
TGGTTCCTGACGTTAACCAGATTATTGTGAAGGAGAAAGGAATCTTCACGAACGTGACTT
CTCCTACGGCTAAGGCAAAGTTGAGGCTGTTGTTCGAAGTGGCTCCTCTTGGCCTGCTCA
TTGAAAATGCTGGTGGGTTCAGCAGTGATGGACACAACTCTGTGCTTGACAAGACCATCG
TCAACCTCGACGATAGAACTCAAGTTGCTTATGGTTCAAAGAACGAGATCATTCGCTTCG
AAGAAACCCTTTACGGAACTTCAAGACTCAAGAATGCTCCCGTTGGAGTTACTGTTTAGA
ACTCCCTTTTAAAATATAAACTGCAAGCATGTTTATTTTTCCTTTTTCCAAAAAAAAAAC
GGATAATGTATGTACTTTTGCTATTGGGTTATATATATGAGAAGCAACAAAACCATCAGC
AATGGTTTTAATG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B766TF U 1
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BS 707 793 RS1B766JQ

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CC

QA 1 706 1 706
DS 

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TGGTTCCTGACGTTAACCAGATTATTGTGAAGGAGAAAGGAATCTTCACGAACGTGACTT
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TTGAAAATGCTGGTGGGTTCAGCAGTGATGGACACAACTCTGTGCTTGACAAGACCATCG
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AAGAAACCCTTTACGGAACTTCAAGACTCAAGAATGCTCCCGTTGGAGTTACTGTTTAGA
ACTCCCTTTTAAAATATAAACTGCAAGCATGTTTATTTTTCCTTTTTCCAAAAAAAAAAC
GGATAATGTATGTACTTTTGCTATTGGGTTATATATATGAGAAGCAACAAAACCATCAGC
AATGGTTTTAATG

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 2

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AGCAGCAACAACTTCATTCATGGTGTTCTTTTCAGCAACAATGTCAGCAGTGCAATACCT
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CTTTTTAATTTGTTTTCTGCAACATTAAAGAGGCTCTAATTTGCTCTCTATGTAAGAGGG
AGATTTGGAGCAAATTGGCTATGTAATGTTTATATGTTTTTTTGTAAAATTTAATAAATT
TGTGGATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CO48TF U 1
AF RS1CO48JQ C 65
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BS 271 729 RS1CO48JQ

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TGGTGGTGGAATGCTTATAAGCCCTCTTCTACTTCAAGCTGGGATACCACCACAGATAAC
AGCAGCAACAACTTCATTCATGGTGTTCTT
C

QA 1 270 1 270
DS 

RD RS1CO48JQ 665 0 0
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GGTGGAATGCTTATAAGCCCTCTTCTACTTCAAGCTGGGATACCACCACAGATAACAGCA
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CTTCTCGGTCTTGTTTTGGTTCAAAAGGCTGTAGCTCAGTTTGGAAGAGCATCCATCATA
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GACATTGTTTCTCATCCCAGATCACGAAACAATATCAACAGTTTTTTTTTGTTCGTCTTT
TTAATTTGTTTTCTGCAACATTAAAGAGGCTCTAATTTGCTCTCTATGTAAGAGGGAGAT
TTGGAGCAAATTGGCTATGTAATGTTTATATGTTTTTTTGTAAAATTTAATAAATTTGTG
GATGT

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1G626JQ U 1
AF RS1B751JQ U 17
BS 1 453 RS1G626JQ
BS 454 454 RS1B751JQ
BS 455 521 RS1G626JQ

RD RS1G626JQ 521 0 0
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CACTGTTGCTCCATTTGCTCATTTCCCGTCTCTGCAACGAGACGAGCACTTTCCTTCTCA
AAGAAATCGAATTCTTGGAGAATCTTAACAAGCTTTGTCGCGTTGTCTTCTTTTATATTC
GCAGGGACCTTCTCTTCGTACCCAGACGCGCTCATCACCTTCTGCAACTTCTCCTTTTGT
TTTTGTAGTTCGTCAATCTTGTTTTTGATCTTTTCTTGCTCAGCTTCTGTGTTAATGGCT
CTGTTAACTTTGAGATATACCTTAAGGTTCTCATTCACCGTCTCAACTGCAGATCCAGGT
GGGGCTGCGTGTTCTCCCTTTAACAGAACCTCTAAGGACGA

QA 1 521 1 521
DS 

RD RS1B751JQ 472 0 0
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TCAAAAACCGGTTCACAATAACATCAAACTTTGTTTCTCAAACCTGAAATGTCTCATATG
CTTTCGTGTCCCATGCAGGACAATAAACTGTGACTTTTGTCTTTCACTGTTGCTCCATTT
GCTCATTTCCCGTCTCTGCAACGAGACGAGCACTTTCCTTCTCAAAGAAATCGAATTCTT
GGAGAATCTTAGCAAGCTTTGTCGCGTTGTCTTCTTTTATATTCGCAGGGACCTTCTCTT
CGTACCCAGACGCGCTCATCACCTTCTGCAACTTCTCCTTTTGTTTTTGTAGTTCGTCAA
TCTTGTTTTTGATCTTTTCTTGCTCAGCTTCTGTGTTAATGGCTCTGTTAACTTTGAGAT
ATACCTTAAGGTTCTCACTCACCGTCTCAACTGCAGATCCAGGTGGGGCTGC

QA 1 472 1 472
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4285Contig1 705 2 3 U
TCTGTAACAGAAGAAGGAAGGAAACTATAAGAAAACTGGACAATGTCTGGAAAAAAAGCC
TCACAAATCAAACGACAAATCCAAGGAGGCTTTTATGCTAAATGGTTATGTAGACATACA
AGCAACCCTATCCTTTGGCTATGCAAGCAAGCACCTACACTTCCTCTTTGTCTCTACCAA
AAGTAAAGCTGGTCCAGACTCGAAACAAAACAACAACAAAATATTACATCCACAGTTTTT
TAACTTATTCATTTGCCAGAGATGACTGACTACTAGGCATCAGGCAACAGTTTCTTGTGA
TTTAAATGGTAGGCTAGAGAAAGAGAGAGAGTCTCAGTATGTGCCATGTGACCAGTAGAG
GAGTTTAGGCTTTCATCTCCTCAGCAACAGCAGAGCCTCCTGCTTTCTCCTTCTCTGCAT
CATCTCCTTTCTTCTTCTCCTCAGCAACAGCAGACCCTCCTGCTTTCTCCTTCTCGACAT
CATGTCCTTTATTCTCCTCCTCAGCAACAGAAGACCCTCCTGCTTTCTCCTTCTCTGCAT
CATCTCCCTTCTTCTCCTCCTCAATACCAGCAGCCACTCCTGCTTTTTCCTTCTCTGAAT
CATCTTCTTTCTTCTCCTCCTCAGCATCAGCAAACCCTCCTGCTTTCTCCTTCTCTGCAT
CATCTTCTTTCCTCTCCTCCTCTTCCTCTTGTTCATCAGCCTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AO32JQ U 54
AF RS1AO32TFB C 1
BS 1 53 RS1AO32TFB
BS 54 258 RS1AO32JQ
BS 259 705 RS1AO32TFB

RD RS1AO32JQ 205 0 0
AAAAGCCTCACAAATCAAACGACAAATCCAAGGAGGCTTTTATGCTAAATGGTTATGTAG
ACATACAAGCAACCCTATCCTTTGGCTATGCAAGCAAGCACCTACACTTCCTCTTTGTCT
CTACCAAAAGTAAAGCTGGTCCAGACTCGAAACAAAACAACAACAAAATATTACATCCAC
AGTTTTTTAACTTATTCATTTGCCA

QA 1 205 1 205
DS 

RD RS1AO32TFB 705 0 0
TCTGTAACAGAAGAAGGAAGGAAACTATAAGAAAACTGGACAATGTCTGGAAAAAAAGCC
TCACAAATCAAACGACAAATCCAAGGAGGCTTTTATGCTAAATGGTTATGTAGACATACA
AGCAACCCTATCCTTTGGCTATGCAAGCAAGCACCTACACTTCCTCTTTGTCTCTACCAA
AAGTAAAGCTGGTCCAGACTCGAAACAAAACAACAACAAAATATTACATCCACAGTTTTT
TAACTTATTCATTTGCCAGAGATGACTGACTACTAGGCATCAGGCAACAGTTTCTTGTGA
TTTAAATGGTAGGCTAGAGAAAGAGAGAGAGTCTCAGTATGTGCCATGTGACCAGTAGAG
GAGTTTAGGCTTTCATCTCCTCAGCAACAGCAGAGCCTCCTGCTTTCTCCTTCTCTGCAT
CATCTCCTTTCTTCTTCTCCTCAGCAACAGCAGACCCTCCTGCTTTCTCCTTCTCGACAT
CATGTCCTTTATTCTCCTCCTCAGCAACAGAAGACCCTCCTGCTTTCTCCTTCTCTGCAT
CATCTCCCTTCTTCTCCTCCTCAATACCAGCAGCCACTCCTGCTTTTTCCTTCTCTGAAT
CATCTTCTTTCTTCTCCTCCTCAGCATCAGCAAACCCTCCTGCTTTCTCCTTCTCTGCAT
CATCTTCTTTCCTCTCCTCCTCTTCCTCTTGTTCATCAGCCTCTC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL4286Contig1 320 2 2 U
GTAAAAGAACGTAATGCTTTTGCCAAGATTCAAGAACCAAGTGAAAAACATAAGAAACAT
ATATATATATATAGTATAGGCAACTTTGAACAAAGAGAGATAATTAGCTGAAAACAAACT
TACCGAAAGAGATCAACCAATCTTTATTAGGAGGCTGTTGAAAATCTACTTTGTTACTAT
TTGAGGGCTTTAACTTGAAGATCACTTTTTTTAAAATCGGAGGTTCTGCAAAGCGATTTC
GATTGTGATGGTAATCTCTCTCACGATCCCTCTCTCTCTCTCTTTGTGTTTTCTCTTCTT
TGTGAGCTTTTGTTCGTGCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CR30TF C 1
AF RS1CR30JQ U 3
BS 1 2 RS1CR30TF
BS 3 320 RS1CR30JQ

RD RS1CR30TF 205 0 0
GTAAAAGAACGTAATGCTTTTGCCAAGATTCAAGAACCAAGTGAAAAACATAAGAAACAT
ATATATATATATAGTATAGGCAACTTTGAACAAAGAGAGATAATTAGCTGAAAACAAACT
TACCGAAAGAGATCAACCAATCTTTATTAGGAGGCTGTTGAAAATCTACTTTGTTACTAT
TTGAGGGCTTTAACTTGAAGATCAC

QA 1 205 1 205
DS 

RD RS1CR30JQ 318 0 0
AAAAGAACGTAATGCTTTTGCCAAGATTCAAGAACCAAGTGAAAAACATAAGAAACATAT
ATATATATATAGTATAGGCAACTTTGAACAAAGAGAGATAATTAGCTGAAAACAAACTTA
CCGAAAGAGATCAACCAATCTTTATTAGGAGGCTGTTGAAAATCTACTTTGTTACTATTT
GAGGGCTTTAACTTGAAGATCACTTTTTTTAAAATCGGAGGTTCTGCAAAGCGATTTCGA
TTGTGATGGTAATCTCTCTCACGATCCCTCTCTCTCTCTCTTTGTGTTTTCTCTTCTTTG
TGAGCTTTTGTTCGTGCC

QA 1 318 1 318
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4288Contig1 765 2 2 U
GGGTTTCAGAAGAATCCGAAAATCTGCAACGTTTTCATCTCGGTCAATGTTGTTATCTTC
TTCCTCATCACCACCTGCATCTGCAAAACTCTTAAACTCTGCCAATGGTTCATCAAGTTC
TTCATCTCCTAAACCCTTCAGACCAGTTATGCGCAGCAGAGAAGCTGATAAACTCGAGGA
AGAAAGACTTCTCCACGTACAATGGCAAGACGTCACGGTAAAGATGGCAGTGGATGCACC
AGCTTCCGTGGCTTACAAGTTATATGCGGACCGTGAATTGTTCCCTAGGTGGATGCCCTT
TTTGTCATCTGTTGAGGCAGTGGAGGGCAGTCCAGATTTATCGAGGTATTTGGTGAAATT
GGAATCTTTTGGAAATAAATTTGAATATTATTTTCTAGCAAAAAATTTAGAGCCAATCCA
GGATCGAAAGCTGCATTGGAGATCTATTGAAGGCTTTGCGAATAGAGGCAGTGTTCGATT
TTTCCCTAGAGGCCCTTCTTCGTGCTTGGAAGAGATCAACTTTTCATTTGAAGTTCCACA
TGCTTTTGCCCCAGTTGCATTCTTAATGAAACCGTTTATGGAGAGGCTTATTCGTGGAGG
ATTGGAACGTTTTGCTGCCTTCGTGAAGACCACTTAAGGCATAAACAAACATTACGTTCT
GTGCATTAATCCAAATAAACTGTTCTTTTTATGTAGTGTGTTTTGTTTTTGCTTTTTGTT
GGGAGGTAACATGTCCAAACATGATGTAATGTTGTTCTTGGTAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DK55TF U 1
AF RS1DK55JQ C 170
BS 1 636 RS1DK55TF
BS 637 765 RS1DK55JQ

RD RS1DK55TF 636 0 0
GGGTTTCAGAAGAATCCGAAAATCTGCAACGTTTTCATCTCGGTCAATGTTGTTATCTTC
TTCCTCATCACCACCTGCATCTGCAAAACTCTTAAACTCTGCCAATGGTTCATCAAGTTC
TTCATCTCCTAAACCCTTCAGACCAGTTATGCGCAGCAGAGAAGCTGATAAACTCGAGGA
AGAAAGACTTCTCCACGTACAATGGCAAGACGTCACGGTAAAGATGGCAGTGGATGCACC
AGCTTCCGTGGCTTACAAGTTATATGCGGACCGTGAATTGTTCCCTAGGTGGATGCCCTT
TTTGTCATCTGTTGAGGCAGTGGAGGGCAGTCCAGATTTATCGAGGTATTTGGTGAAATT
GGAATCTTTTGGAAATAAATTTGAATATTATTTTCTAGCAAAAAATTTAGAGCCAATCCA
GGATCGAAAGCTGCATTGGAGATCTATTGAAGGCTTTGCGAATAGAGGCAGTGTTCGATT
TTTCCCTAGAGGCCCTTCTTCGTGCTTGGAAGAGATCAACTTTTCATTTGAAGTTCCACA
TGCTTTTGCCCCAGTTGCATTCTTAATGAAACCGTTTATGGAGAGGCTTATTCGTGGAGG
ATTGGAACGTTTTGCTGCCTTCGTGAAGACCACTTA

QA 1 636 1 636
DS 

RD RS1DK55JQ 596 0 0
AAACTCGAGGAAGAAAGACTTCTCCACGTACAATGGCAAGACGTCACGGTAAAGATGGCA
GTGGATGCACCAGCTTCCGTGGCTTACAAGTTATATGCGGACCGTGAATTGTTCCCTAGG
TGGATGCCCTTTTTGTCATCTGTTGAGGCAGTGGAGGGCAGTCCAGATTTATCGAGGTAT
TTGGTGAAATTGGAATCTTTTGGAAATAAATTTGAATATTATTTTCTAGCAAAAAATTTA
GAGCCAATCCAGGATCGAAAGCTGCATTGGAGATCTATTGAAGGCTTTGCGAATAGAGGC
AGTGTTCGATTTTTCCCTAGAGGCCCTTTTTCGTGCTTGGAAGAGATCAACTTTTCATTT
GAAGTTCCACATGCTTTTGCCCCAGTTGCATTCTTAATGAAACCGTTTATGGAGAGGCTT
ATTCGTGGAGGATTGGAACGTTTTGCTGCCTTCGTGAAGACCACTTAAGGCATAAACAAA
CATTACGTTCTGTGCATTAATCCAAATAAACTGTTCTTTTTATGTAGTGTGTTTTGTTTT
TGCTTTTTGTTGGGAGGTAACATGTCCAAACATGATGTAATGTTGTTCTTGGTAAA

QA 1 596 1 596
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4290Contig1 706 2 2 U
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AAACACTAAAATCATGATAGTAATAATAAGAATCCTTAAGCCTGAGGTTTGTCCCACTTG
AGTGGCTTCACGACCTCCCAGGTGAAGTCAGGGTCGTCTCTTCCGAAATGCCCATACGCT
GCCGTTTTCAAAAACCTTCCATTGCCTCCTCTCTTCAAGTCCAAGTTGATCGTCATCATC
CCTGGTCTGAAATCAAAGGTCTCTTTCACGATCTTCAGTATCTCCTTGTCTGGAATCAAC
CCAGTTCCGTAAGTGTCCACGAAGACAGCCAACGGCTCGGGAACTCCAATGGCGTAGGAA
ACCTGGACAAGAGCCCTACGAGCCATTCCATTAGCAACCACACTCTTCGCGGCTTGCCTC
ACGATGTAAGCTCCGCTTCTGTCGACTTTGGTCGGGTCTTTCCCTGAGAAAGCACCTCCT
CCGTGAGCTCCCCATCCTCCGTAGGTGTCGATGATGATCTTACGTCCGGTTAAACCGGCA
TCACCGTGTGGTCCACCGATCTCGAACCGGCCTGATGGGTTGAGGTGGAAGATGGTTTTG
TCATCTAGGTACTTCTCTGGGATGATTGGTTTGATCACGTGCTCCT


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GP84TF C 1
AF RS1F760JQ U 4
BS 1 3 RS1GP84TF
BS 4 706 RS1F760JQ

RD RS1GP84TF 223 0 0
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AAACACTAAAATCATGATAGTAATAATAAGAATCCTTAAGCCTGAGGTTTGTCCCACTTG
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QA 1 223 1 223
DS 

RD RS1F760JQ 703 0 0
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CACTAAAATCATGATAGTAATAATAAGAATCCTTAAGCCTGAGGTTTGTCCCACTTGAGT
GGCTTCACGACCTCCCAGGTGAAGTCAGGGTCGTCTCTTCCGAAATGCCCATACGCTGCC
GTTTTCAAAAACCTTCCATTGCCTCCTCTCTTCAAGTCCAAGTTGATCGTCATCATCCCT
GGTCTGAAATCAAAGGTCTCTTTCACGATCTTCAGTATCTCCTTGTCTGGAATCAACCCA
GTTCCGTAAGTGTCCACGAAGACAGCCAACGGCTCGGGAACTCCAATGGCGTAGGAAACC
TGGACAAGAGCCCTACGAGCCATTCCATTAGCAACCACACTCTTCGCGGCTTGCCTCACG
ATGTAAGCTCCGCTTCTGTCGACTTTGGTCGGGTCTTTCCCTGAGAAAGCACCTCCTCCG
TGAGCTCCCCATCCTCCGTAGGTGTCGATGATGATCTTACGTCCGGTTAAACCGGCATCA
CCGTGTGGTCCACCGATCTCGAACCGGCCTGATGGGTTGAGGTGGAAGATGGTTTTGTCA
TCTAGGTACTTCTCTGGGATGATTGGTTTGATCACGTGCTCCT

QA 1 703 1 703
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4292Contig1 725 2 5 U
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CTGAAAAACCATGTCCATATATATGAGTTTTGATTCCTCGACCAATGGCCATAAAAGATA
TACATTAAAAAAAGCTACGATCTTATTGGACATGAAAGCGAAACATATATATAAAGACAC
GATTTTTTCAAAGGGCAGTCATCAAAAGTACCTTTCAAGAAAAAAAAACAAAAGGTAAAT
TTGTGTCATACGTTTCTTTCTTCGATTCCTTGCACTCGAAGCCACAGCCACACTGAGGCG
ACGCCAAGAACTCCTTGATCCCGAAATTAGCCGACGTGATCCCGACGGAAAACTCCATCT
CGTCCCCGTTCCTGATAACCTCGACGATGTTGAGCCACAAGAACAGAACTTTCACCTTGA
TACCAGTCAGTTTCGTGAGCTTGTTCTCGGAGATGTAACCGCTGATCGTCGATTTGTAGT
TCAGCTGGTAAGAACCCACGAGCGAGAAGCTGCATGAGTCTTTGAAATACGCGTGGAATT
TGCCTGTCGATGTGTCTAAATCATAGGAGACGACTCCTTTCGGAAGGATTCCGACGGGGA
AGTTGTAGCTCTGGAGGAGAGAATACGCCGTCGGCGAATCTGATTCGGCGAGTGGAGAAG
GTAGGTGGTAGAGGAAGAGACAAGCAGCGATGAGAATCGGGAGACAAAACATTGGTTTGA
TTTTC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1G472JQ U 5
AF RS1G472TF C 1
BS 1 4 RS1G472TF
BS 5 132 RS1G472JQ
BS 133 133 RS1G472TF
BS 134 488 RS1G472JQ
BS 489 725 RS1G472TF

RD RS1G472JQ 484 0 0
AACTCATTGATCGTCAACATAATGGTGTCATGTAGTAAAGAAACCAATGCAAGTCGCTGA
AAAACCATGTCCATATATATGAGTTTTGATTCCTCGACCAATGGCCATAAAAGATATACA
TTAAAAAA*GCTACGATCTTATTGGACATGAAAGCGAAACATATATATAAAGACACGATT
TTTTCAAAGGGCAGTCATCAAAAGTACCTTTCAAGAAAAAAAAACAAAAGGTAAATTTGT
GTCATACGTTTCTTTCTTCGATTCCTTGCACTCGAAGCCACAGCCACACTGAGGCGACGC
CAAGAACTCCTTGATCCCGAAATTAGCCGACGTGATCCCGACGGAAAACTCCATCTCGTC
CCCGTTCCTGATAACCTCGACGATGTTGAGCCACAAGAACAGAACTTTCACCTTGATACC
AGTCAGTTTCGTGAGCTTGTTCTCGGAGATGTAACCGCTGATCGTCGATTTGTAGTTCAG
CTGG

QA 1 484 1 484
DS 

RD RS1G472TF 725 0 0
TTTTAACTCATTGATCGTCAACATAATGGTGTCATGTAGTAAAGAAACCAATGCAAGTCG
CTGAAGAACCATGTCCATATATATGAGTTTTGATTCCTCGACCAATGGCCATAAGAGATA
TACATTAAAAAAAGCTACGATCTTATTGGACATGAAAGCGAAACATATATATAAAGACAC
GATTTTTTCAAAGGGCAGTCATCAAAAGTACCTTTCAAGAAGAAGAAACAAAAGGTAAAT
TTGTGTCATACGTTTCTTTCTTCGATTCCTTGCACTCGAAGCCACAGCCACACTGAGGCG
ACGCCAAGAACTCCTTGATCCCGAAATTAGCCGACGTGATCCCGACGGAAAACTCCATCT
CGTCCCCGTTCCTGATAACCTCGACGATGTTGAGCCACAAGAACAGAACTTTCACCTTGA
TACCAGTCAGTTTCGTGAGCTTGTTCTCGGAGATGTAACCGCTGATCGTCGATTTGTAGT
TCAGCTGGTAAGAACCCACGAGCGAGAAGCTGCATGAGTCTTTGAAATACGCGTGGAATT
TGCCTGTCGATGTGTCTAAATCATAGGAGACGACTCCTTTCGGAAGGATTCCGACGGGGA
AGTTGTAGCTCTGGAGGAGAGAATACGCCGTCGGCGAATCTGATTCGGCGAGTGGAGAAG
GTAGGTGGTAGAGGAAGAGACAAGCAGCGATGAGAATCGGGAGACAAAACATTGGTTTGA
TTTTC

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL4293Contig1 564 2 11 U
GGGAAATCGGGCGAAAATTAGAAAGTATTGTTTCAGTCGCCGTCGTCGTCGTCGTAAATG
GGAGATGGGTACTGGAACCAGCCTCCGATGTCGTCGATCCCACACGGAGGTCCTCTGAAA
CGTCACCGTTCTGACTTCGAACATGATTACGTGTCACGGGATGAGGACCGAGGTATCCTT
CATTCAGCAAGAGATACGAGAACTATTGGCTCAGCTTATGATCGCTACCTTCAGAGTGCG
CAAACGTCTTCTATGCCATCTGAAGAATCTGGTCGGTTTCATGGTGTCGGCAGAGGAGGT
GGTGACATGGGTGAGCTTATGTCTGGGCGTGGTGGAGTTCAGCATCCAGATTTTGGGCCT
CCAAATGGTCGAGATTTGGGTTTTGGTCAACAAGATTTAGTTGGTACGAGGCCTGGAAGG
GAACTGCTTCGTCTGCCTCCAGATACATCCAACACTCTATTTGTTGAAGGACTTCCTTCT
AATTGCTCCAGGAGGGAAGTATCTCATATATTTCGACCATTTTTGGGATATAAAGAAGCG
AGACTTGTGACCAAAGATACAAAG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EO20TF U 3
AF RS1GY69TF U 1
BS 1 55 RS1GY69TF
BS 56 56 RS1EO20TF
BS 57 114 RS1GY69TF
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BS 189 406 RS1GY69TF
BS 407 407 RS1EO20TF
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BS 446 564 RS1GY69TF

RD RS1EO20TF 486 0 0
GG
AATCGGGCGAAAATTAGAAAGTATTGTTTCAGTCGCCGTCGTCGTCGTCGTAAATGGGAG
ATGGGTACTGGAACCAGCCTCCGATGTCGTCGATCCCACACGGAGGTCCTCTGAAACGTC
ACCGTTCTGACTTCGAACATGATTACGTGTCACGGGATGAGGACCGAGGTATCCTTCATT
CAGCAAGAGATACGAGAACTATTGGCTCAGCTTATGATCGCTACCTTCAGAGTGCGCAAA
CGTCTTCTATGCCATCTGAAGAATCTGGTCGGTTTCATGGTGTCGGCAGAGGAGGTGGTG
ACATGGGTGAGCTTATGTCTGGGCGTGGTGGAGTTCAGCATCCAGATTTTGGGCCTCCAA
ATGGTCGAGATTTGGGTTTTGGTCAACAAGATTTAGTTGGTACGAGGCCTGGAAGGGAAC
TGCTTCGTCTGCCTCCAGATACATCCAACACTCTATTTGTTGAAGGACTTCCTTCTAATT
GCTC

QA 3 486 3 486
DS 

RD RS1GY69TF 564 0 0
GGGAAATCGGGCGAAAATTAGAAAGTATTGTTTCAGTCGCCGTCGTCGTCGTCGTCAATG
GGAGATGGGTACTGGAACCAGCCTCCGATGTCGTCGATCCCACACGGAGGTCCTTTGAAA
CGTCACCGTTCTGACTTCGAACATGATTACGTGTCACGGGATGAGGACCGAGGTATCCTT
CATTCAGTAAGAGATACGAGAACTATTGGCTCAGCTTATGATCGCTACCTTCAGAGTGCG
CAAACGTCTTCTATGCCATCTGAAGAATCTGGTCGGTTTCATGGTGTCGGCAGAGGAGGT
GGTGACATGGGTGAGCTTATGTCTGGGCGTGGTGGAGTTCAGCATCCAGATTTTGGGCCT
CCAAATGGTCGAGATTTGGGTTTTGGTCAACAAGATTTAGTTGGTAGGAGGCCTGGAAGG
GAACTGCTTCGTCTGCCTCCAGATGCATCCAACACTCTATTTGTTGAAGGACTTCCTTCT
AATTGCTCCAGGAGGGAAGTATCTCATATATTTCGACCATTTTTGGGATATAAAGAAGCG
AGACTTGTGACCAAAGATACAAAG

QA 1 564 1 564
DS 



AS 1 2

CO CL4294Contig1 642 2 20 U
GGAAGGAAGCAGAGAGATCCATCGGAGAAGAGAGAGTCAGATAGATTGAGAGAAAGAATG
ACTTCGAGGTACTGGGTGGTGTCTCTACCAGTGAAGGACTCTTCTTCTTCCTCGTTATGG
GATCGCTTACAGGAGCAGATCTCCAAGCATTCCTTCGATACTCCCGTTTATCGGTTCAAC
ATTCCCAATCTTCGTGTTGGAACCTTAGATTCTCTACTCGCTCTAGGCGATGATCTGCTC
AAGTCGAACAGCTTCGTGGAGGGAGTTTCACAGAAGATCAGGAGACAGATCGAGGAGCTG
GAGAAGATTTCTGGTGCTGAGAGCAATGCACTTACAGTTGATGGAGTTCCTGTTGATTCT
TATCTCACCAGGTTTGTCTGGGATGAAGCAAAGTACCCAACAATGTCACCTCTGAAGGAG
GTTGTTGACAATATTCAGTCTCAGGTTGCAAAGATTGAGGATGATCTCAAGGTTCGTGTA
GCTGAATATAACAACATCCGCGGTCAACTCAATGCCATTAACCGAAAGCAAAGCGGAAGT
TTAGCTGTTCGTGACCTATCAAACTTGGTTAAGCCAGAAGATGTTGTCTCGTCAGAACAT
CTCGTGACTCTCCTTGCCGTTGTTCCAAAGTATTCTCAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G407TF U 1
AF RS1EX40TF U 111
BS 1 155 RS1G407TF
BS 156 156 RS1EX40TF
BS 157 185 RS1G407TF
BS 186 186 RS1EX40TF
BS 187 224 RS1G407TF
BS 225 225 RS1EX40TF
BS 226 304 RS1G407TF
BS 305 305 RS1EX40TF
BS 306 389 RS1G407TF
BS 390 390 RS1EX40TF
BS 391 398 RS1G407TF
BS 399 399 RS1EX40TF
BS 400 406 RS1G407TF
BS 407 407 RS1EX40TF
BS 408 449 RS1G407TF
BS 450 450 RS1EX40TF
BS 451 605 RS1G407TF
BS 606 606 RS1EX40TF
BS 607 633 RS1G407TF
BS 634 642 RS1EX40TF

RD RS1G407TF 633 0 0
GGAAGGAAGCAGAGAGATCCATCGGAGAAGAGAGAGTCAGATAGATTGAGAGAAAGAATG
ACTTCGAGGTACTGGGTGGTGTCTCTACCAGTGAAGGACTCTTCTTCTTCCTCGTTATGG
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ATTCCTAATCTTCGTGTTGGAACCTTAGATTCTCTACTCGCTCTCGGCGATGATCTGCTC
AAGTCGAACAGCTTCGTGGAGGGAGTTTCACAGAAGATCAGGAGACAGATCGAGGAGCTG
GAGAGGATTTCTGGTGCTGAGAGCAATGCACTTACAGTTGATGGAGTTCCTGTTGATTCT
TATCTCACCAGGTTTGTCTGGGATGAAGCTAAGTACCCGACAATGTTACCTCTGAAGGAG
GTTGTTGACAATATTCAGTCTCAGGTTGCCAAGATTGAGGATGATCTCAAGGTTCGTGTA
GCTGAATATAACAACATCCGCGGTCAACTCAATGCCATTAACCGAAAGCAAAGCGGAAGT
TTAGCTGTTCGTGACCTATCAAACTTGGTTAAGCCAGAAGATGTTGTCTCGTCAGAACAT
CTCGTTACTCTCCTTGCCGTTGTTCCAAAGTAT

QA 1 633 1 633
DS 

RD RS1EX40TF 532 0 0
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TCGGTTCAACATTCCCAATCTTCGTGTTGGAACCTTAGATTCTCTACTCGCTCTAGGCGA
TGATCTGCTCAAGTCGAACAGCTTCGTGGAGGGAGTTTCTCAGAAGATTAGGAGACAGAT
CGAGGAGCTGGAGAAGATTTCTGGTGCTGAGAGCAATGCCCTTACAGTTGATGGAGTTCC
TGTTGATTCTTATCTCACCAGGTTTGTCTGGGATGAAGCAAAGTACCCAACTATGTCACC
TCTGAAGGAGGTTGTTGACAATATTCAGTCTCAGGTTGCAAAGATTGAGGATGATCTCAA
GGTTCGTGTAGCTGAATATAACAACGTCCGCGGTCAACTCAATGCCATTAACCGAAAGCA
AAGTGGAAGTTTAGCTGTTCGTGACCTATCAAACTTGGTTAAGCCAGAAGATGTTGTCTC
GTCAGAACATCTCGTGACTCTCCTTGCCGTTGTTCCAAAGTATTCTCAAAAA

QA 1 532 1 532
DS 



AS 1 2

CO CL4295Contig1 467 2 1 U
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AGCGTCTTGTTCAGTCCCCCAACTCATTTTTCATGGATGTGAAATGCCAAGGCTGCTTCA
ACATCACTACTGTGTTCAGTCACTCGCAGACCGTTGTTGTATGCGGAAACTGCCAGACAG
TTCTGTGCCAGCCTACAGGAGGAAAAGCTAGGCTCACCGAAGGATGCTCTTTCAGGAAGA
AGTGAGATTGATTTGAAGCTTGAATCGATCAAGACCAGTTTCTTTTTTTTTTTTTTTATG
TTTTTTTGTTTTGATGTTATGTTGCATACCTGTTCTGAAAAGCAACTCGTTGGAGTTTTA
GAGGAAGAAACCTTTGTTGATTTTGGATTTTAAGCTTGGTTATTACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1G728JQ C 1
AF RS1G728TF U 1
BS 1 467 RS1G728TF

RD RS1G728JQ 467 0 0
GGGTTGTCGTTGCCTTCTATCTTCCGCCGTCTCTTGAGATTCTTGCGAAGATGGTTCTTC
AAAACGATATCGATCTTCTTAACCCACCAGCTGAGCTTGAGAAGTGGAAGCACAAGCTCA
AGCGTCTTGTTCAGTCCCCCAACTCATTTTTCATGGATGTGAAATGCCAAGGCTGCTTCA
ACATCACTACTGTGTTCAGTCACTCGCAGACCGTTGTTGTATGCGGAAACTGCCAGACAG
TTTTGTGCCAGCCTACAGGAGGAAAAGCTAGGCTCACCGAAGGATGCTCTTTCAGGAAGA
AGTGAGATTGATTTGAAGCTTGAATCGATCAAGACCAGTTTCTTTTTTTTTTTTTTTATG
TTTTTTTGTTTTGATGTTATGTTGCATACCTGTTCTGAAAAGCAACTCGTTGGAGTTTTA
GAGGAAGAAACCTTTGTTGATTTTGGATTTTAAGCTTGGTTATTACC

QA 1 467 1 467
DS 

RD RS1G728TF 467 0 0
GGGTTGTCGTTGCCTTCTATCTTCCGCCGTCTCTTGAGATTCTTGCGAAGATGGTTCTTC
AAAACGATATCGATCTTCTTAACCCACCAGCTGAGCTTGAGAAGTGGAAGCACAAGCTCA
AGCGTCTTGTTCAGTCCCCCAACTCATTTTTCATGGATGTGAAATGCCAAGGCTGCTTCA
ACATCACTACTGTGTTCAGTCACTCGCAGACCGTTGTTGTATGCGGAAACTGCCAGACAG
TTCTGTGCCAGCCTACAGGAGGAAAAGCTAGGCTCACCGAAGGATGCTCTTTCAGGAAGA
AGTGAGATTGATTTGAAGCTTGAATCGATCAAGACCAGTTTCTTTTTTTTTTTTTTTATG
TTTTTTTGTTTTGATGTTATGTTGCATACCTGTTCTGAAAAGCAACTCGTTGGAGTTTTA
GAGGAAGAAACCTTTGTTGATTTTGGATTTTAAGCTTGGTTATTACC

QA 1 467 1 467
DS 



AS 1 2

CO CL4296Contig1 866 2 4 U
GCATCCCTCTTGCTATTCCGCTTTCTAAGGACTCTTCAGGCTCTGTTACTGCGCTTCTGA
GATGGCCTACTGCTCCACCAGGAATGGATATGCCTGTTGTTGAAGTTTGGAGGAGTGGTG
TCCGGCTCATAGCTAGAAATGTAGATGAGTATATTCACCGGATTCTTGTTGAAGAAGATG
CTCAAGAGTTGTCAGAACCCTACATTGCTTCAGCGGAAGCAGGCGAGAAGCTTTACAAAA
AGGGTGCTTTTGCTGAATCTCAGATTGATAATCTCGATGTCTATGTCTTAAAAAAGGTTG
GTCTGTTTCCTGATGTGTTGGAGCGAAAAGTATTACGACATTTCGATGAAGGAGATCATG
TTTCAGCTATGGTGACAGGAGAATTCTACACAAAGAAAGATCTGTTTCCAGGATTTGGAC
AGCCTTTTGTATATTATGCAAACATACTGCAGAAGGTAGGACGCAATTCAGAAGCAAAAG
AATCGGCCAGAGTAGCACTAAAATCACCTTGGTGGACATTAGGATGTCCTTATGAGGAGG
TTGCTAGTATTGCACAATGGGACGATGAGCAAATCGAATTCATACGAGAGAAAGTGAGTG
ATGAAGGTCGTTTTGAGGATTTGAAGAAAGGTAAAGACCCAATGCAAGTTGCTGTGGACG
TTGCCGCTTTCTCTTGGACTTGGCGTCTATTGAAGGAACATGGTCTGAATCTTTGCACCA
TATTGCTAAATGTTATGAAGAGGCTGGATTAAAGGACATATCTAACTTCATTTTGTACAC
AGATGACAAATGAAAAAAAAAGAACTGTATGTTGTGTAATGATACAAGATTCTTTCATTG
TAATAAATATCAAAAGTTTTGGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FZ10TF U 1
AF RS1FZ10JQ C 283
BS 1 695 RS1FZ10TF
BS 696 696 RS1FZ10JQ
BS 697 750 RS1FZ10TF
BS 751 866 RS1FZ10JQ

RD RS1FZ10TF 750 0 0
GCATCCCTCTTGCTATTCCGCTTTCTAAGGACTCTTCAGGCTCTGTTACTGCGCTTCTGA
GATGGCCTACTGCTCCACCAGGAATGGATATGCCTGTTGTTGAAGTTTGGAGGAGTGGTG
TCCGGCTCATAGCTAGAAATGTAGATGAGTATATTCACCGGATTCTTGTTGAAGAAGATG
CTCAAGAGTTGTCAGAACCCTACATTGCTTCAGCGGAAGCAGGCGAGAAGCTTTACAAAA
AGGGTGCTTTTGCTGAATCTCAGATTGATAATCTCGATGTCTATGTCTTAAAAAAGGTTG
GTCTGTTTCCTGATGTGTTGGAGCGAAAAGTATTACGACATTTCGATGAAGGAGATCATG
TTTCAGCTATGGTGACAGGAGAATTCTACACAAAGAAAGATCTGTTTCCAGGATTTGGAC
AGCCTTTTGTATATTATGCAAACATACTGCAGAAGGTAGGACGCAATTCAGAAGCAAAAG
AATCGGCCAGAGTAGCACTAAAATCACCTTGGTGGACATTAGGATGTCCTTATGAGGAGG
TTGCTAGTATTGCACAATGGGACGATGAGCAAATCGAATTCATACGAGAGAAAGTGAGTG
ATGAAGGTCGTTTTGAGGATTTGAAGAAAGGTAAAGACCCAATGCAAGTTGCTGTGGACG
TTGCCGCTTTCTCTTGGACTTGGCGTCTATTGAAG*AACATGGTCTGAATCTTTGCACCA
TATTGCTAAATGTTATGAAGAGGCTGGATT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RS1FZ10JQ 584 0 0
ATGTCTTAAAAAAGGTTGGTCTGTTTCCTGATGTGTTGGAGCGAAAAGTATTACGACATT
TCGATGAAGGAGATCATGTTTCAGCTATGGTGACAGGAGAATTCTACACAAAGAAAGATC
TGTTTCCAGGATTTGGACAGCCTTTTGTATATTATGCAAACATACTGCAGAAGGTAGGAC
GCAATTCAGAAGCAAAAGAATCGGCCAGAGTAGCACTAAAATCACCTTGGTGGACATTAG
GATGTCCTTATGAGGAGGTTGCTAGTATTGCACAATGGGACGATGAGCAAATCGAATTCA
TACGAGAGAAAGTGAGTGATGAAGGTCGTTTTGAGGATTTGAAGAAAGGTAAAGACCCAA
TGCAAGTTGCTGTGGACGTTGCCGCTTTCTCTTGGACTTGGCGTCTATTGAAGGAACATG
GTCTGAATCTTTGCACCATATTGCTAAATGTTATGAAGAGGCTGGATTAAAGGACATATC
TAACTTCATTTTGTACACAGATGACAAATGAAAAAAAAAGAACTGTATGTTGTGTAATGA
TACAAGATTCTTTCATTGTAATAAATATCAAAAGTTTTGGTTGC

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 2

CO CL4297Contig1 985 2 2 U
GATGGAAGAGGTGATGTTGGAGGCTTCATGTCCTCATACCTGAAAACATTTGAGTCTCTC
AGTCCACGTAATGAGAAGTTAAAAAACAAATGAACACACTTATAGCCAGAATGCTTCTAT
TTCTATATCTCACATTGTGTAAGGTGACAATGGTCTTGGCTTTGGCGGATTAGCTGCACT
TTCTTCTGGTGTAAGGGAAGTGTCTGTCACATTGTTAACAGTTTCTGCTTCTGGCACGGA
AGCAGATTCAGTCGTTTTTCTGCACAAACAACAAGCAAAAAACCTGAGAGATTGTAGAGA
TCGTTTCTCCCTAATCTAGGCATGCTTTTCCAATTCTGGTTTCTTAGATACTTACACACT
ACCATCAACTGTTTCCACCACGTCATTGCCTCCAGGCAACTCTGAGTTTTCTTCTGCAGG
TGCTGTTTTCTTGGGACCGGTTGATGCAGGAGTTGGTGAGGTTAGTGGTTTCAGGTCTGC
GTAACTGCAAAAAAAAAAAAAAAAAACACAGTGAAGACTCTTTGAAGTAACCACAGCCGA
GTTATATATATAGAGCAAGAGGAAAAAGTTGTTACGCTGCATAAGGAGAAAGAGGTCTCA
TTTTTGGTATAACTGGTGCTTCTGCCTCCTCAGTGACACTTATTTCAACTGTTGAGCTTT
CAACAGTACCAGAATCGGTTGGAACAGGCGTCACAGAGTCGCTCTTGCGGATACCCGAAG
CTTTAGGAGTGGGTGATGAAGGGGGTTTTAGATTGTCATAGCTAGCATAAGGAGAAAGAG
GCCTCTCTTTCTTTTCCTCAACTTGTTTCACTTCTACTCCTTCTGGGACATTGACCTCAA
CAGGATTTTCTGGTGGTGGAGCTACATTGGCCTCAACAGGAGCCTGAGTTGCTTTCACCT
CCGGAACCAAGTGGAACCAAGTGCTGTGGCCGGAATAGGAGATGTTGGAGGTTTCAAGTC
TTCATAGCTAATACATTTCCAAAAC


BQ
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AF RS1BF32TF U 1
AF RS1BF32JQ C 476
BS 1 679 RS1BF32TF
BS 680 985 RS1BF32JQ

RD RS1BF32TF 680 0 0
GATGGAAGAGGTGATGTTGGAGGCTTCATGTCCTCATACCTGAAAACATTTGAGTCTCTC
AGTCCACGTAATGAGAAGTTAAAAAACAAATGAACACACTTATAGCCAGAATGCTTCTAT
TTCTATATCTCACATTGTGTAAGGTGACAATGGTCTTGGCTTTGGCGGATTAGCTGCACT
TTCTTCTGGTGTAAGGGAAGTGTCTGTCACATTGTTAACAGTTTCTGCTTCTGGCACGGA
AGCAGATTCAGTCGTTTTTCTGCACAAACAACAAGCAAAAAACCTGAGAGATTGTAGAGA
TCGTTTCTCCCTAATCTAGGCATGCTTTTCCAATTCTGGTTTCTTAGATACTTACACACT
ACCATCAACTGTTTCCACCACGTCATTGCCTCCAGGCAACTCTGAGTTTTCTTCTGCAGG
TGCTGTTTTCTTGGGACCGGTTGATGCAGGAGTTGGTGAGGTTAGTGGTTTCAGGTCTGC
GTAACTGCAAAAAAAAAAAAAAAAAACACAGTGAAGACTCTTTGAAGTAACCACAGCCGA
GTTATATATATAGAGCAAGAGGAAAAAGTTGTTACGCTGCATAAGGAGAAAGAGGTCTCA
TTTTTGGTATAACTGGTGCTTCTGCCTCCTCAGTGACACTTATTTCAACTGTTGAGCTTT
CAACAGTACCAGAATCGGT
G

QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1BF32JQ 510 0 0
TCTGCGTAACTGCAAAAAAAAAAAAAAAAAACACAGTGAAGACTCTTTGAAGTAACCACA
GCCGAGTTATATATATAGAGCAAGAGGAAAAAGTTGTTACGCTGCATAAGGAGAAAGAGG
TCTCATTTTTGGTATAACTGGTGCTTCTGCCTCCTCAGTGACACTTATTTCAACTGTTGA
GCTTTCAACAGTACCAGAATCGGTTGGAACAGGCGTCACAGAGTCGCTCTTGCGGATACC
CGAAGCTTTAGGAGTGGGTGATGAAGGGGGTTTTAGATTGTCATAGCTAGCATAAGGAGA
AAGAGGCCTCTCTTTCTTTTCCTCAACTTGTTTCACTTCTACTCCTTCTGGGACATTGAC
CTCAACAGGATTTTCTGGTGGTGGAGCTACATTGGCCTCAACAGGAGCCTGAGTTGCTTT
CACCTCCGGAACCAAGTGGAACCAAGTGCTGTGGCCGGAATAGGAGATGTTGGAGGTTTC
AAGTCTTCATAGCTAATACATTTCCAAAAC

QA 1 510 1 510
DS 



AS 1 2

CO CL4298Contig1 625 2 20 U
GCTTCTGGAACCCTTTACTTTCGTTGTCTGCGTTTTTGTTATCATCTCTCTCTCTGTCCA
CGGGAAGGAGAGAATCTTAGGAAGTAAAGATGTCTGCAACACAGGAGGAAGACAAGAAGC
CAGGTGGAGACGGAGGAGCTCACATCAATCTCAAGGTTAAGGGACAGGATGGGAATGAGG
TGTTCTTCAGGATCAAGAGAATCACCCAGCTGAAGAAGCTGATGAATGCTTACTGTGACA
GGCAATCAGTGGACATGAACTCCATCGCCTTCTTGTTTGATGGCCGTCGTCTTCGCGCTG
AGCAGACCCCTGATGAGCTTGACATGGAGGATGGTGACGAGATCGATGCAATGCTTCATC
AGACTGGTGGCTTTGGTGGTGGCACTGCTATGGCCTGACACACACTTATCCTTGGTTTAG
TGGTTTCACGATTAGATCTTGTGATATGGATGGTTAAGAAGTAATCGGCATTAGAATTTG
CAGACCTGTTTTTTTTTCATGACCATTTGATTGTCCTTAGAAAACTAATATGGTCACGAA
GGTTTTTAAAATTTAACCTTTGGTTGATTTCTATTTGAATATATTGGATCTTAATGTCCT
ACGACTATTTGCGCTTAAATTCGTC


BQ
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15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1CA22TF U 1
AF RS1D230TF U 88
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RD RS1CA22TF 600 0 0
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CGGGAAGGAGAGAATCTTAGGAAGTAAAGATGTCTGCAACACAGGAGGAAGACAAGAAGC
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TGTTCTTCAGGATCAAGAGGATCACCCAGCTGAAGAAGCTGATGAATGCTTACTGTGACA
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AGCAGACTCCTGATGAGCTTGACATGGAGGATGGTGATGAGATTGATGCAATGCTTCATC
AGACTGGTGGCTTTGGTGGTGGCGCTGCTATGGCCTGACACACACTTATCCTTGGTTTAG
TGGTTTCACGATTAGATCTTGTGATATGGATGGTTAAGAAGTAATCGGCATTAGGATTTG
CAGACTTGTTTTTTTTTCATGACCATT*GATTGTCCTTAGAAAACTAATATGGTCACGAA
GGTTTTTAAAATTTAACCTTTGGTTGATTTCTATTTGAATATATTGGATCTTAATGTCCT

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DS 

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G
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TCTCAAGGTTAAGGGACAGGATGGGAATGAGGTGTTCTTCAGGATCAAGAGAATCACCCA
GCTGAAGAAGCTGATGAATGCTTACTGTGACAGGCAATCAGTGGACATGAACTCCATCGC
CTTCTTGTTTGATGGCCGTCGTCTTCGCGCTGAGCAGACCCCTGATGAGCTTGACATGGA
GGATGGTGACGAGATCGATGCCATGCTTCATCAGACTGGTGGCTTTGGTGGTGGCACTGC
TATGGCCTGACACACACTTATCCTTGGTTTAGTGGTTTCACGATTAGATCTTGTGATATG
GATGGTTAAGAAGTAATCGGCATTAGAATTTGCAGACCTGTTTTTTTTTCATGACCATTT
GATTGTCCTTAGTAAACTAATATGGTCACGAAGGTTTTTAAAATTTAACCTTTGGTTGAT
TTCTATTTGAATATATTGGATCTTAATGTCCTACGACTATTTGCGCTTAAATTCGTC

QA 2 538 2 538
DS 



AS 1 2

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CTCTTCAGAATCCCTCAAAGATTCCAAAAACCTGCGGGGTCAAGCAACCTTCTCTCTTCT
TCGTCTCTATGTTTCTGTACCAGGGCAGAGCTTAACAGAGAAACTGATTATTTTTCTCTT
CCCAAACTCTTCTATGCAAGGTTTCTCGCAACAACTGCAATCGAGAATAAAGAGAACACT
ATCTTCAATAACGAAACCAAGCCTAAGAGGAGAAGAAACATGGTTAGACTGTGGTGGGTT
CCAACGGAAGTTACATGATCATAAGTTTTCTTTAAAGAGGTTATATTAGAAGATGGTTTT
CTTTACGCTAGATCAAAGTTTCCCATTCTTGGCTACATCGGATGGTTTCTTTTTCAAAAG
AGAGGTTACTGGGAGGAGGATTGAGCAGATGTTAAGCTTTGTTTGCTGCTCTCCAGGAAT
GCGGTACCGAGAGTTTTTGGATAGCTTCAGGGATCATCACCAGACAGGGAAGCTGAATCA
TCTAAAGAAGGTTCTAGGCGTGAAAGGCTCTCTATGCTTGCTAAACGAGCTGTTTAGGCT
GCACAAGCATTGCAGCATAAGAAAGAAGTGTCAACAGGAACTACTAAGAGTTACAAGTTT
AAAGCAGGTGACCGAGTCAGGTTTCTAGGTCCTTCTTCATCTGCAATTTTGTCTCTTTAA
GGCCCCCCACTTAGGGGACCAACCATTGGTTTCCAGGGAAAAGTAGTCCTTGCTTTGATA
TTGGATTCGATAGGCCTGTGCCCGATGGCAATTGATCTTGGTGGCTTCTGCCAAGAGGCC
CCTTATCTCATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CV51TF U 1
AF RS1CV51JQ C 204
BS 1 667 RS1CV51TF
BS 668 668 RS1CV51JQ
BS 669 680 RS1CV51TF
BS 681 853 RS1CV51JQ

RD RS1CV51TF 683 0 0
GGACCCACGTTCTACAAGATTAAATTCCCTTTCAATTAATTAGCAAACAAATTCACTATT
CTCTTCAGAATCCCTCAAAGATTCCAAAAACCTGCGGGGTCAAGCAACCTTCTCTCTTCT
TCGTCTCTATGTTTCTGTACCAGGGCAGAGCTTAACAGAGAAACTGATTATTTTTCTCTT
CCCAAACTCTTCTATGCAAGGTTTCTCGCAACAACTGCAATCGAGAATAAAGAGAACACT
ATCTTCAATAACGAAACCAAGCCTAAGAGGAGAAGAAACATGGTTAGACTGTGGTGGGTT
CCAACGGAAGTTACATGATCATAAGTTTTCTTTAAAGAGGTTATATTAGAAGATGGTTTT
CTTTACGCTAGATCAAAGTTTCCCATTCTTGGCTACATCGGATGGTTTCTTTTTCAAAAG
AGAGGTTACTGGGAGGAGGATTGAGCAGATGTTAAGCTTTGTTTGCTGCTCTCCAGGAAT
GCGGTACCGAGAGTTTTTGGATAGCTTCAGGGATCATCACCAGACAGGGAAGCTGAATCA
TCTAAAGAAGGTTCTAGGCGTGAAAGGCTCTCTATGCTTGCTAAACGAGCTGTTTAGGCT
GCACAAGCATTGCAGCATAAGAAAGAAGTGTCAACAGGAACTACTAAGAGTTACAAGTTT
AAAGCAG*TGACCGAGTCAG
TTT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RS1CV51JQ 650 0 0
TCTCGCAACAACTGCAATCGAGAA*AAAGAGAACACTATCTTCAATAACGAAACCAAGC*
TAAGAGGAGAAGAAACATGGTTAGACTGTGGTGGGTTCCAACGGAAGTTACATGATCATA
AGTTTTCTTTAAAGAGGTTATATTAGAAGATGGTTTTCTTTACGCTAGATCAAAGTTTCC
CATTCTTGGCTACATCGGATGGTTTCTTTTTCAAAAGAGAGGTTACTGGGAGGAGGATTG
AGCAGATGTTAAGCTTTGTTTGCTGCTCTCCAGGAATGCGGTACCGAGAGTTTTTGGATA
GCTTCAGGGATCATCACCAGACAGGGAAGCTGAATCATCTAAAGAAGGTTCTAGGCGTGA
AAGGCTCTCTATGCTTGCTAAACGAGCTGTTTAGGCTGCACAAGCATTGCAGCATAAGAA
AGAAGTGTCAACAGGAACTACTAAGAGTTACAAGTTTAAAGCAGGTGACCGAGTCAGGTT
TCTAGGTCCTTCTTCATCTGCAATTTTGTCTCTTTAAGGCCCCCCACTTAGGGGACCAAC
CATTGGTTTCCAGGGAAAAGTAGTCCTTGCTTTGATATTGGATTCGATAGGCCTGTGCCC
GATGGCAATTGATCTTGGTGGCTTCTGCCAAGAGGCCCCTTATCTCATGT

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL4300Contig1 1165 2 2 U
TCAATCTTCTTCATATCACCACATTGTTTGGTGTTGTTTAAATTGTTTGCCAGAGATTAA
AATCAGACTTTATTCTCCATGAATTTAGTCAATTTTAGTAAAGAGAGCTTTTGTATTTGA
ACTTCAACAGTCTTGTAACATATTGACACGCTACTGCTAAAAGGAATGTAGCAAGCAAAT
GAGATATGATCCATTACAGTTTCCAGCTAAGGAATCTTAAGCAATTTTTTAGCCGTTTGA
TATTTTGTAGTCGAAAGACTTGCCTTCATTAACTTGTAGTGTCCCTGCAAAGAATGGAGC
GAATCTCCATAATCGATCTCGGAGGCTGCAAGTCCTGCTCTCTCAACGAATCTCCTAGTA
GCTTTTGCATCTCTGCTGCAAATGCATCGTCTAACATCTGCAAATATGCACCAATTTACG
TAAAGATGAGGTAAAAGTCTTTTGGTCAATGCAATCAAAAGTATAGGGGCCGGCCTTACA
GTGACAGCAACTCTAGAACCCGTGTATCTGTTCTTTTTCCTCTTCTCCAAAAAGCTTAGA
ACAATCTGTCAATAGGGGCAAGAGAAGAAGAGATCAGCTCTCCCCAACACACACACACAA
AAAAAAACTCAGGAGACACTATTGAAACTAGTTACCTCTCCCATACGGTCCCAGTATCCT
CTGGACAATGCGATGAATACATCCGTCCCCCCACAAACGGAATGTAGATGATTCACCGTG
TTGGTGAGCTGCTCCTTCAGGGTTTGCATTTTTATTCCCATGTCTTTTTTTCCAACACTT
TTTTTACACTCCTGAAGAATCTTCTTCAACGTTGTCTCCTTTTGTAGCTTGCTCTGAAGA
AAAAAAAAGAATAGCCGATTACAACATAGACATTTTACTAAATGGGATTCAACAAGATTG
CAAAAAAAAAAACATGGAACTCACATTTTTTACGAGTTTTTCGACTACAGCTTCAAGGTA
ACTTCGAAACCTGGCTCTGAGCAACACCGTCACCTCAGAGAGACGATCGCAAAGAGCTGC
GTTCTCACCATCAGGAATGCACGAAGACCATGCTCTAAATTGAGCCTCTATATCAGGCCG
TAGAACATCAACCATTCTCTTCATAGAGTTTAGTAGAATCCCCAGCTGCATGCACCAGCA
GATATATAAAAAGAAACTTTTCAGC


BQ
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AF RS1AJ53TF U 1
AF RS1AJ53JQ C 562
BS 1 766 RS1AJ53TF
BS 767 1165 RS1AJ53JQ

RD RS1AJ53TF 771 0 0
TCAATCTTCTTCATATCACCACATTGTTTGGTGTTGTTTAAATTGTTTGCCAGAGATTAA
AATCAGACTTTATTCTCCATGAATTTAGTCAATTTTAGTAAAGAGAGCTTTTGTATTTGA
ACTTCAACAGTCTTGTAACATATTGACACGCTACTGCTAAAAGGAATGTAGCAAGCAAAT
GAGATATGATCCATTACAGTTTCCAGCTAAGGAATCTTAAGCAATTTTTTAGCCGTTTGA
TATTTTGTAGTCGAAAGACTTGCCTTCATTAACTTGTAGTGTCCCTGCAAAGAATGGAGC
GAATCTCCATAATCGATCTCGGAGGCTGCAAGTCCTGCTCTCTCAACGAATCTCCTAGTA
GCTTTTGCATCTCTGCTGCAAATGCATCGTCTAACATCTGCAAATATGCACCAATTTACG
TAAAGATGAGGTAAAAGTCTTTTGGTCAATGCAATCAAAAGTATAGGGGCCGGCCTTACA
GTGACAGCAACTCTAGAACCCGTGTATCTGTTCTTTTTCCTCTTCTCCAAAAAGCTTAGA
ACAATCTGTCAATAGGGGCAAGAGAAGAAGAGATCAGCTCTCCCCAACACACACACACAA
AAAAAAACTCAGGAGACACTATTGAAACTAGTTACCTCTCCCATACGGTCCCAGTATCCT
CTGGACAATGCGATGAATACATCCGTCCCCCCACAAACGGAATGTAGATGATTCACCGTG
TTGGTGAGCTGCTCCTTCAGGGTTTGCATTTTTATTCCCATGTCTT
CTTCT

QA 1 766 1 766
DS 

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TTGAAACTAGTTACCTCTCCCATACGGTCCCAGTATCCTCTGGACAATGCGATGAATACA
TCCGTCCCCCCACAAACGGAATGTAGATGATTCACCGTGTTGGTGAGCTGCTCCTTCAGG
GTTTGCATTTTTATTCCCATGTCTTTTTTTCCAACACTTTTTTTACACTCCTGAAGAATC
TTCTTCAACGTTGTCTCCTTTTGTAGCTTGCTCTGAAGAAAAAAAAAGAATAGCCGATTA
CAACATAGACATTTTACTAAATGGGATTCAACAAGATTGCAAAAAAAAAAACATGGAACT
CACATTTTTTACGAGTTTTTCGACTACAGCTTCAAGGTAACTTCGAAACCTGGCTCTGAG
CAACACCGTCACCTCAGAGAGACGATCGCAAAGAGCTGCGTTCTCACCATCAGGAATGCA
CGAAGACCATGCTCTAAATTGAGCCTCTATATCAGGCCGTAGAACATCAACCATTCTCTT
CATAGAGTTTAGTAGAATCCCCAGCTGCATGCACCAGCAGATATATAAAAAGAAACTTTT
CAGC

QA 1 604 1 604
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGGGAATAATAGTTAACCGGTTAATGTCAAAAGTATTTTTGGTACGTCGAGAGGAGCGAT
CATCAAACAGAGAGCTAGAAGAGAAAAAAAAAAAAAGGAAAAAAGAAAGGGATCGTCCCA
ATCCCATGGACAATCTCTGAAAAACCAAATCCATCTGGTAAAATTTCAATCCTGATCCGG
GAGGCTCGATTATTATTTTTGTTGGAAATGGTGTTGGTATTGGCATTGGGGGATATACAT
GTACCCCAAAGAGCGGCTGATCTACCCCCAAAGTTCAAATCCATGCTCGTTCCTGGCAAG
ATTCAACACATCCTCTGCACTGGCAACCTCTCCATCAAAACGATCTGCCCTGATTTGCAT
ATAGTTAGAGGCGAGTTTGACGAAGATGCACGTTACCCCGACACTAAAACCTTGTCTATT
GGCCAATTCAAGCTCGGTCTCTGCCACGGCCACCAGGTGATCCCATGGGGCGATTTAGAC
TCACTAGCTATGCTTCAGAGACAGCTCGACGTGGACATACTTGTCACTGGACATACTCAC
CAGTTCACTGCCTACAAACACGAGGGAGGAGTCGTCATCAACCCGGGCTCTGCTACTGGT
GCTTACAGCACCATTAACCAAGATGTTAACCCGAGCTTTGTTCTTATGGATATCGATGGT
CTTCGTGTTGTCGTCTATGTCTACGAGCTCATCGATGGCGAGGTTAAAGTCGACAAGATC
GATTTCAAGAAGGCCTCCTCCACTTCTGCTCCTTAATCCCGTTTGGAACTTTCTTTAGCT
TCAATAATCTTTATAGACTTTTGGTTTAAGCGTTCTATTTGTTCAACTAATTAAAGATAA
TGTTTGACACTCTTATCATAAAGAAGTTCAA


BQ
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AF RS1GD82TF U 1
AF RS1GD82JQ C 318
BS 1 358 RS1GD82TF
BS 359 359 RS1GD82JQ
BS 360 456 RS1GD82TF
BS 457 871 RS1GD82JQ

RD RS1GD82TF 456 0 0
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CATCAAACAGAGAGCTAGAAGAGAAAAAAAAAAAAAGGAAAAAAGAAAGGGATCGTCCCA
ATCCCATGGACAATCTCTGAAAAACCAAATCCATCTGGTAAAATTTCAATCCTGATCCGG
GAGGCTCGATTATTATTTTTGTTGGAAATGGTGTTGGTATTGGCATTGGGGGATATACAT
GTACCCCAAAGAGCGGCTGATCTACCCCCAAAGTTCAAATCCATGCTCGTTCCTGGCAAG
ATTCAACACATCCTCTGCACTGGCAACCTCTCCATCAAAACGATCTGCCCTGATTTGCTT
ATAGTTAGAGGCGAGTTTGACGAAGATGCACGTTACCCCGACACTAAAACCTTGTCTATT
GGCCAATTCAAGCTCGGTCTCTGCCACGGCCACCAG

QA 1 456 1 456
DS 

RD RS1GD82JQ 554 0 0
CACTGGCAACCTCTCCATCAAAACGATCTGCCCTGATTTGCATATAGTTAGAGGCGAGTT
TGACGAAGATGCACGTTACCCCGACACTAAAACCTTGTCTATTGGCCAATTCAAGCTCGG
TTTCTGCCACGGCCACCAGGTGATCCCATGGGGCGATTTAGACTCACTAGCTATGCTTCA
GAGACAGCTCGACGTGGACATACTTGTCACTGGACATACTCACCAGTTCACTGCCTACAA
ACACGAGGGAGGAGTCGTCATCAACCCGGGCTCTGCTACTGGTGCTTACAGCACCATTAA
CCAAGATGTTAACCCGAGCTTTGTTCTTATGGATATCGATGGTCTTCGTGTTGTCGTCTA
TGTCTACGAGCTCATCGATGGCGAGGTTAAAGTCGACAAGATCGATTTCAAGAAGGCCTC
CTCCACTTCTGCTCCTTAATCCCGTTTGGAACTTTCTTTAGCTTCAATAATCTTTATAGA
CTTTTGGTTTAAGCGTTCTATTTGTTCAACTAATTAAAGATAATGTTTGACACTCTTATC
ATAAAGAAGTTCAA

QA 1 554 1 554
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4304Contig1 964 2 2 U
TTTTTATTTTATTTTATTCTCAGAAAAGCTCATTTTATAGTTTGTTCCTTTCTTCTCTAC
CTCTCACTCCTATAGATCTGTTTCTTTGTTTTCTTACCCTCTTTTGCTTTCACTCTTCTC
TTCCAGTGAGAGAGTGAGAGAGAATGGATAAGCTTTTGTTGCTGGTAGGGCTTACTGTAG
CTTGGCTGATACTAGGAACTCAAGCAAATGAGTATTTAGACTTCAATGTAACAGAGATAG
ACCGCATTGAGGAACTAGAGTTTGGATTCTCCAAATACAGTTCCAATTTGAACCCTTTAT
TAGTTGGTCTCACTTTTATCAGAGGAGCTGACTCAGGAGCTGTTTGTTTGGATGGAACAT
TGCCTGGATACCACTTGCACCGTGGACATGGATCTGGAGCTAATAGCTGGCTCATTCAAT
TAGAGGGAGGAGGATGGTGCAACAACGTCAGGACATGTGTATAGCTCCAACATCAGCTGA
TCCTAGTGGATTTTGGCATGAGTGTAGACTCAACCATGAAAAATGCACCTCTGGACAGAT
GCGGTTCTTGCAAGGATTCAGGGATCAGATGCTGAGAGTAGTTAAGGGCTTCTCAATGTC
TAGACAGAATGGTTTGTTCATAAACTCCTGCTTTGCTCACTGCCAAACCGAGAGGCAAGA
TACTTGGTTTGCAGATGACTCCCCTGTCATAAGGAAAAAGGCGGTGGCAATAGCTGTGGG
TGATTGGTATTTTGATAGAGCAGAAGTGAAGTTAGTTGACTGTCCTTACCCTTGTGACTC
GAGCTGCCACAACTTGGTGTTCAGATGATTGATTATATATACATTAACGTTACAAAGCTT
CTCTCAAATGGAGAGGCTTTTGTATCCTTAAAAGCATTACCAATGCCTCATTGGAGAATT
GTATGATTGATTTTTGCTTTTCTGGAAAACATAAAATAAAACCCCAAAACAAAGTTTTAA
GTGC


BQ
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10 10 10 10 

AF RS1FA65TF U 1
AF RS1FA65JQ C 225
BS 1 687 RS1FA65TF
BS 688 964 RS1FA65JQ

RD RS1FA65TF 687 0 0
TTTTTATTTTATTTTATTCTCAGAAAAGCTCATTTTATAGTTTGTTCCTTTCTTCTCTAC
CTCTCACTCCTATAGATCTGTTTCTTTGTTTTCTTACCCTCTTTTGCTTTCACTCTTCTC
TTCCAGTGAGAGAGTGAGAGAGAATGGATAAGCTTTTGTTGCTGGTAGGGCTTACTGTAG
CTTGGCTGATACTAGGAACTCAAGCAAATGAGTATTTAGACTTCAATGTAACAGAGATAG
ACCGCATTGAGGAACTAGAGTTTGGATTCTCCAAATACAGTTCCAATTTGAACCCTTTAT
TAGTTGGTCTCACTTTTATCAGAGGAGCTGACTCAGGAGCTGTTTGTTTGGATGGAACAT
TGCCTGGATACCACTTGCACCGTGGACATGGATCTGGAGCTAATAGCTGGCTCATTCAAT
TAGAGGGAGGAGGATGGTGCAACAACGTCAGGACATGTGTATAGCTCCAACATCAGCTGA
TCCTAGTGGATTTTGGCATGAGTGTAGACTCAACCATGAAAAATGCACCTCTGGACAGAT
GCGGTTCTTGCAAGGATTCAGGGATCAGATGCTGAGAGTAGTTAAGGGCTTCTCAATGTC
TAGACAGAATGGTTTGTTCATAAACTCCTGCTTTGCTCACTGCCAAACCGAGAGGCAAGA
TACTTGGTTTGCAGATGACTCCCCTGT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1FA65JQ 740 0 0
AATGTAACAGAGATAGACCGCATTGAGGAACTAGAGTTTGGATTCTCCAAATACAGTTCC
AATTTGAACCCTTTATTAGTTGGTCTCACTTTTATCAGAGGAGCTGACTCAGGAGCTGTT
TGTTTGGATGGAACATTGCCTGGATACCACTTGCACCGTGGACATGGATCTGGAGCTAAT
AGCTGGCTCATTCAATTAGAGGGAGGAGGATGGTGCAACAACGTCAGGACATGTGTATAG
CTCCAACATCAGCTGATCCTAGTGGATTTTGGCATGAGTGTAGACTCAACCATGAAAAAT
GCACCTCTGGACAGATGCGGTTCTTGCAAGGATTCAGGGATCAGATGCTGAGAGTAGTTA
AGGGCTTCTCAATGTCTAGACAGAATGGTTTGTTCATAAACTCCTGCTTTGCTCACTGCC
AAACCGAGAGGCAAGATACTTGGTTTGCAGATGACTCCCCTGTCATAAGGAAAAAGGCGG
TGGCAATAGCTGTGGGTGATTGGTATTTTGATAGAGCAGAAGTGAAGTTAGTTGACTGTC
CTTACCCTTGTGACTCGAGCTGCCACAACTTGGTGTTCAGATGATTGATTATATATACAT
TAACGTTACAAAGCTTCTCTCAAATGGAGAGGCTTTTGTATCCTTAAAAGCATTACCAAT
GCCTCATTGGAGAATTGTATGATTGATTTTTGCTTTTCTGGAAAACATAAAATAAAACCC
CAAAACAAAGTTTTAAGTGC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL4305Contig1 918 2 4 U
GCGGTTTTCCAATGGAAAAACTACCGTTGATGAAATTGCTGAGCTACTTGGAATTAGAGA
CGAAACCGGTCAACAGCTGGGACAAAGGGTAACATTTAGTGGACAAGTCCAGAATTATCA
GAACACAGTGGCACAAGGGGTGGAACTCCTTGGAGATGAAAATACAGCAGCTGATTATCT
TAAGAAATGTATTTACTCTGTTGGATTGGGAAGCAATGACTATCTTAATAATTACTTCAT
GCCTCAGTACTATTCCACTAGCAGACAGTACACTCCCGAACAATACGCTGATGATCTTAT
CAATCGTTACAGCGACCAGCTCAATGCACTATACAACTACGGAGCTAGAAAGTTTGCACT
GGTAGGAGTGGGAGCCATAGGGTGTAGCCCGAACGCTCTGGCACAGGGCAGCACCGATGG
AACAACTTGTGTGGAGAGTTTTAACTCGGCCAACCGAATCTTCAACAACAGGCTTAAGTC
TATGGTCCAAGAGCTCAACAACCAGCACTCGGATGCTAAGTTCACCTACATTAATGCTTA
TGGCGTTTTCCAGGACATAATCGCCAACCCCTCTGCTTACGGGTTTAGGGTTACTAACGC
TGCGTGTTGCGGAGTTGGAAGGAACGGAGGTCAGCTAACATGTTTACCGGGACAAGGTCC
GTGCCCGAACCGAAATGAGTACGTGTTTTGGGATGCGTTTCATCCAACGGATGCTGCGAA
TACGATCATTGCTAAGAGATCTTACAATGCGCAATCGTCTTCAGACGTTTATCCAATTGA
TATCTCGGCGTTGGCAAAGCTTTGAAAGAACATATAATAGGAGCTAGAGCTTTCAAACAA
TTGTAATGATTTTCAAGTTCTAAATTCAGTTACTGGAAAAAAGATTCTGAAGTAATGTTA
TATGTGTGCACCCAAATT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C490TF U 1
AF RS1C490JQ C 216
BS 1 656 RS1C490TF
BS 657 657 RS1C490JQ
BS 658 683 RS1C490TF
BS 684 918 RS1C490JQ

RD RS1C490TF 683 0 0
GCGGTTTTCCAATGGAAAAACTACCGTTGATGAAATTGCTGAGCTACTTGGAATTAGAGA
CGAAACCGGTCAACAGCTGGGACAAAGGGTAACATTTAGTGGACAAGTCCAGAATTATCA
GAACACAGTGGCACAAGGGGTGGAACTCCTTGGAGATGAAAATACAGCAGCTGATTATCT
TAAGAAATGTATTTACTCTGTTGGATTGGGAAGCAATGACTATCTTAATAATTACTTCAT
GCCTCAGTACTATTCCACTAGCAGACAGTACACTCCCGAACAATACGCTGATGATCTTAT
CAATCGTTACAGCGACCAGCTCAATGCACTATACAACTACGGAGCTAGAAAGTTTGCACT
GGTAGGAGTGGGAGCCATAGGGTGTAGCCCGAACGCTCTGGCACAGGGCAGCACCGATGG
AACAACTTGTGTGGAGAGTTTTAACTCGGCCAACCGAATCTTCAACAACAGGCTTAAGTC
TATGGTCCAAGAGCTCAACAACCAGCACTCGGATGCTAAGTTCACCTACATTAATGCTTA
TGGCGTTTTCCAGGACATAATCGCCAACCCCTCTGCTTACGGGTTTAGGGTTACTAACGC
TGCGTGTTGCGGAGTTGGAAGGAACGGAGGTCAGCTAACATGTTTACCGGGACAAG*TCC
GTGCCCGAACCGAAATGAGTACG

QA 1 683 1 683
DS 

RD RS1C490JQ 703 0 0
ATGACTATCTTAATAATTACTTCATGCCTCAGTACTATTCCACTAGCAGACAGTACACTC
CCGAACAATACGCTGATGATCTTATCAATCGTTACAGCGACCAGCTCAATGCACTATACA
ACTACGGAGCTAGAAAGTTTGCACTGGTAGGAGTGGGAGCCATAGGGTGTAGCCCGAACG
CTCTGGCACAGGGCAGCACCGATGGAACAACTTGTGTGGAGAGTTTTAACTCGGCCAACC
GAATCTTCAACAACAGGCTTAAGTCTATGGTCCAAGAGCTCAACAACCAGCACTCGGATG
CTAAGTTCACCTACATTAATGCTTATGGCGTTTTCCAGGACATAATCGCCAACCCCTCTG
CTTACGGGTTTAGGGTTACTAACGCTGCGTGTTGCGGAGTTGGAAGGAACGGAGGTCAGC
TAACATGTTTACCGGGACAAGGTCCGTGCCCGAACCGAAATGAGTACGTGTTTTGGGATG
CGTTTCATCCAACGGATGCTGCGAATACGATCATTGCTAAGAGATCTTACAATGCGCAAT
CGTCTTCAGACGTTTATCCAATTGATATCTCGGCGTTGGCAAAGCTTTGAAAGAACATAT
AATAGGAGCTAGAGCTTTCAAACAATTGTAATGATTTTCAAGTTCTAAATTCAGTTACTG
GAAAAAAGATTCTGAAGTAATGTTATATGTGTGCACCCAAATT

QA 1 703 1 703
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4307Contig1 1068 2 2 U
CGGTGTCATCGGTGCGTTGAACTTTTACTTTCCGCCGCTGGTGGTTATCGGTTTGGTGTT
GAGCTTGGCTTGGACGACGGAGGTGATGAGGAACGTTGTGAATCTGACCGTGAGTAGAGT
CGTCGCTCTGTTCTATCTTAGAGGGATGCAGTCTAGTACGAGGCTTAGTTTCCAGAGAGC
CTTGTCTCGTAACTTGGGGAGCGCGTGCTTGGGTTCTCTCTTTGTTCCGACGATCGAAGC
GCTTAGGATCTTGGCGAGAGGGTTGAATCTGCTCAAGGGTGAAGATGAGTTCATGTTTTG
CTGCGCTAACTGCTGTCTTAAACTCATGACGTTCATATTCGAGCATGGCAATGGATGGGC
CTTTGTGCAGATAGCAGCGTATGGGAAAGGGTTTGTGAGGGCGTCACAAGACACGTGGAA
ACTGTTTGAGGATGTAGATATGGTTGAGATTGTAGATGCAGACATAACAAGCTCTATATG
TTTCCTCACAGGGATATGCAGTGGCTGCGTATGTGTTATTGTCGCGGCGGCTTGGACACA
CACAGTTTACAAGCCTTATACAGCCACCATCTCCTTACTTGCTTTCTTCATTGGTTACCT
CATGACGAGGATCTCAATGGCATTGCCTCATGCATGCGTGAGTTGCTACTACGCATGCTA
CGCTGAGAATCCAGAAAGCAGATTCTTTGACAAAACCAAAAAAGATAGACAAGCTTTGAT
CAAAAATGGTCGTGTTGTTGTTCACACACCTAGAGTCCGCCGTGCTCTAGCCTAGCCCGG
CCCTGGCTGCTTAACTCTCTTCTTCTTCTTTCTGTGTCATTCCTGCATAATTGAAATGGT
TAGGTGTTAAAAGAAAATTCAGAAACCATTAGTCTTTTGAAAAAAAGTATTTAAAATTTG
ATAATTAATTTAGTAAATATCTGTGAGGGTGGGGAAGAAAGAATGTGGTTCATGACTTCA
TGCCCTGAACACAATCCAACTAAGCAAAGTTGGTTGAGCCTTTTTTTTTCATTATTGTTG
TTGAAACCTCTTCAATGACTTTCTGTACATATATTTACTTCTTCAATT


BQ
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CC

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TTATTGTTGTTGAAACCTCTTCAATGACTTTCTGTACATATATTTACTTCTTCAATT

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DS 



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AF RS1H243TF U 1
AF RS1H243JQB C 519
BS 1 655 RS1H243TF
BS 656 1278 RS1H243JQB

RD RS1H243TF 655 0 0
TCACTTCCAGTGATTGCTTCACCAACGCATTACCTTTTCCAAATCGTTCGTGATGGCATC
ACTTTCTTAGCTTGCACTCAAGTTGAAATGCCACCACTCATGGCCATCGAGTTTCTTTGC
AGAGTAGCTGATGTTCTGTCTGATTACCTTGGTGGGCTTAACGAAGATCTCGTCAAGGAC
AATTTCATCATTGTCTATGAGCTTTTGGATGAGATGATCGATAATGGCTTCCCCCTCACA
ACAGAACCGAACATCCTGAGGGAAATGATAGCTCCACCGAATCTAGTCAGCAAAATGCTG
AGCGTTGTAACCGGAAATGCTTCCAACGTCAGTGACACGCTCCCTAGTGGAGCTGGCTCT
TGTGTTCCCTGGAGACCTACCGATCCAAAGTACTCTAGCAACGAAGTCTATGTCGACCTT
GTTGAAGAAATGGATGCAATCGTCAACAGGGATGGAGAATTGGTAAAATGCGAGGTTTAT
GGAGAAGTCCAGATGAGTTCTCAGCTCACCGGTTTTCCAGATTTGACATTGTCTTTCGCA
AACCCTTCGGTACTAGAAGACATGAGGTTTCACCCCTGTGTCCGCTTTAGACCTTGGGAG
TCTCATCAAGTCCTCTCCTTTGTCCCTCCTGATGGACAGTTCAAGCTCATGAGTT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1H243JQB 760 0 0
AGATTTGACATTGTCTTTCGCAAACCTTTCGGTACTAGAAGACATGAGGTTTCACCCCTG
TGTCCGCTTTAGACCTTGGGAGTCTCATCAAGTCCTCTCCTTTGTCCCTCCTGATGGACA
GTTCAAGCTCATGAGTTACAGGGTGAAGAAGCTGAAGAACACGACTTTATATGTGAAGCC
TCAGATAACGTCAGATTCCGGCACATGCCGAGTTAGTGTGTTGGTGGGAATCAGAAGCGA
CCCTGGAAAGACGATTGAGTCAATAACACTGAGTTTCCAGCTTCCTCATTGTGTTTCATC
GGCAGATCTCTCATCAAATCATGGAACTGTAACCATCCTCTCTAACAAGATATGTACATG
GACAATAGGGAGAATCCCAAGTGACAAGACTCCATGTTTGTCCGGGACGCTAGCGCTTGA
AACGGGCTTAGAGCGGCTTCATGTGTATCCGACATTCAAAGTTGGGTTCAAGATAATGGG
GATTGCTCTCTCTGGCCTAAGAATCGAGAAACTTGATCTTAAAACTATCCCTCCTCGTTT
GTACAAAGGGTTTCGTGCTCAGACGCGCGCTGGAGAGTTCGACGTCAGATTGTAGTTTTG
TTGCTTTTCAGGTCAAAAGTTCTCGAGACTTATGTCTTTTTTTCTGTTAATGGTTTGTGC
CAAATTGTTTTGTATTTGTTTCAGAAAAAGAACCGATATTTGTTCAGATTACTTACGATA
TCAAAATGCGGAAATGAAAATGGTAATGTTATGTAGGGTT

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

CO CL4309Contig1 1342 2 4 U
CAAAGCAGAAGAAAAGATTTGTATTTTAATGGGGCTGAGGGAATATTTGTGAAAGAACTT
CTTCCTCTCAGACGTAGAAGCTTTGAAGCTTGTGTTTGTGGAAGAGAAAAAAAATGGAGG
AAGTTGAAGCTGCAAACAAAGCAGCAGTTGAAAGCTGTCATGGAGTCTTGAATCTCTTGT
CACAACAAACCAATTATCCTAAATCCCTAATGGTTGAAACAAGAGAAGCAGTTATCAAGT
TCAAGAGAGTAACTTCTCTTTTGACTAGAGGGTTAGGAGGTCAAAGAAAAATCAAGAAAC
TCAACGACAACAACTTCTACAAGTTTATGTCTCCTTTGTTGCCCCAACACATCTTCTTGG
AAAGTCCCGTTTGCAGTAATAATGCTATAACTGGTAGCATTCCAGTTCTAGCACCAAAGC
CTCTTCAGATTGTACCACCTGCTGCTCCTAGTTATGGTGAACAGAGACCGAGTCACCCTC
CACCTATGATTCTTAACAAGAAAATGTGTGTTGACAAGTCGTTTCTGGAGCTAAAGCCAC
CGTCTCTTCGAGCCGTCGATCAAAAACCATACCAGCTTGTACGTAACCACCAGCAAGGAG
TGTACTATCGAAGCAATAGTGGTTTAAATCTGAAGTTTGATGGGTCTGGTGGTGGTAGCT
GCTATTCTCCAAGTGTTTCCAACGGTTCAAGATCGTTTGTTTCATCTCTTAGTATGGATG
GGAGTGTGACTGATTACGATAGAAACTCGTTTCATTTGATCGGACTAGCACCTCAGGGAT
CTGATCATATATCGCAGCATTCCAGGAGGACAAGCTGCTCTGGTAGTTTGAAATGTGGAA
GTAAGAGCAAGTGTCATTGCTCCAAGAAAAGGAAGTTGAGAGTGAAAAGATCGATCAAAG
TACCTGCGATAAGTAACAAGATTGCTGATATACCTCCAGATGAATATTCATGGAGGAAAT
ACGGACAAAAGCCAATAAAGGGTTCTCCTCATCCTAGGGGATACTATAAATGTAGCAGCG
TGAGAGGTTGTCCAGCAAGGAAGCATGTTGAACGTTGTGTAGACGAAACTTCGATGCTTA
TTGTGACTTACGAAGGTGAGCATAACCATGCAAGAATGCTCTCTTCCCAATCAGCTCACA
CCTGATTAACTAAACCGGTCTAGTAGTTGTGATATGCAATTGTATATTCTACTTGAACTT
AGGTTATTTTGCATCACAAGTTTGGCATCAGTCTTATCTATATATAGATATTGTTATAAA
TGGCATAATCTAGCTAGATTGTTTTTTTTTTTTTTTGGTTTGTATCAGATCTTGAACTGA
TGTATCTGATATGATTTGGTGC


BQ
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AF RS1FT15TF U 1
AF RS1FT15JQ C 567
BS 1 681 RS1FT15TF
BS 682 682 RS1FT15JQ
BS 683 712 RS1FT15TF
BS 713 1342 RS1FT15JQ

RD RS1FT15TF 712 0 0
CAAAGCAGAAGAAAAGATTTGTATTTTAATGGGGCTGAGGGAATATTTGTGAAAGAACTT
CTTCCTCTCAGACGTAGAAGCTTTGAAGCTTGTGTTTGTGGAAGAGAAAAAAAATGGAGG
AAGTTGAAGCTGCAAACAAAGCAGCAGTTGAAAGCTGTCATGGAGTCTTGAATCTCTTGT
CACAACAAACCAATTATCCTAAATCCCTAATGGTTGAAACAAGAGAAGCAGTTATCAAGT
TCAAGAGAGTAACTTCTCTTTTGACTAGAGGGTTAGGAGGTCAAAGAAAAATCAAGAAAC
TCAACGACAACAACTTCTACAAGTTTATGTCTCCTTTGTTGCCCCAACACATCTTCTTGG
AAAGTCCCGTTTGCAGTAATAATGCTATAACTGGTAGCATTCCAGTTCTAGCACCAAAGC
CTCTTCAGATTGTACCACCTGCTGCTCCTAGTTATGGTGAACAGAGACCGAGTCACCCTC
CACCTATGATTCTTAACAAGAAAATGTGTGTTGACAAGTCGTTTCTGGAGCTAAAGCCAC
CGTCTCTTCGAGCCGTCGATCAAAAACCATACCAGCTTGTACGTAACCACCAGCAAGGAG
TGTACTATCGAAGCAATAGTGGTTTAAATCTGAAGTTTGATGGGTCTGGTGGTGGTAGCT
GCTATTCTCCAAGTGTTTCCA*CGGTTCAAGATCGTTTGTTTCATCTCTTAG

QA 1 712 1 712
DS 

RD RS1FT15JQ 776 0 0
CCATACCAGCTTGTACGTAACCACCAGCAAGGAGTGTACTATCGAAGCAATAGTGGTTTA
AATCTGAAGTTTGATGGGTCTGGTGGTGGTAGCTGCTATTCTCCAAGTGTTTCCAACGGT
TCAAGATCGTTTGTTTCATCTCTTAGTATGGATGGGAGTGTGACTGATTACGATAGAAAC
TCGTTTCATTTGATCGGACTAGCACCTCAGGGATCTGATCATATATCGCAGCATTCCAGG
AGGACAAGCTGCTCTGGTAGTTTGAAATGTGGAAGTAAGAGCAAGTGTCATTGCTCCAAG
AAAAGGAAGTTGAGAGTGAAAAGATCGATCAAAGTACCTGCGATAAGTAACAAGATTGCT
GATATACCTCCAGATGAATATTCATGGAGGAAATACGGACAAAAGCCAATAAAGGGTTCT
CCTCATCCTAGGGGATACTATAAATGTAGCAGCGTGAGAGGTTGTCCAGCAAGGAAGCAT
GTTGAACGTTGTGTAGACGAAACTTCGATGCTTATTGTGACTTACGAAGGTGAGCATAAC
CATGCAAGAATGCTCTCTTCCCAATCAGCTCACACCTGATTAACTAAACCGGTCTAGTAG
TTGTGATATGCAATTGTATATTCTACTTGAACTTAGGTTATTTTGCATCACAAGTTTGGC
ATCAGTCTTATCTATATATAGATATTGTTATAAATGGCATAATCTAGCTAGATTGTTTTT
TTTTTTTTTTGGTTTGTATCAGATCTTGAACTGATGTATCTGATATGATTTGGTGC

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

CO CL4310Contig1 1191 2 6 U
GGAAAAAGGTCAGCTCTTGATGCCATTCTCTCTGTCGACAACCACCACTCTCCGTCTCAG
ATCTCCTATTCGAAACTCTAGATCGAGAATGTCGACGCCTCCTGTTCTCTCGCTTGCTCT
GCCTTCAGACACTGGTCGTGTTCTTAGTATCCAATCTCACACTGTACAGGGATATGTTGG
TAACAAGTCAGCTGTGTTTCCTCTTCAATTGTTGGGGTATGATGTGGATCCTATCAACTC
GGTACAGTTCTCCAACCATACAGGGTATCCTACATTCAAAGGACAAGTTTTGAATGGTGA
ACAGTTGTGGGAGTTGATTGAAGGCCTTGAAGCAAATGATTTATTGTTCTACACTCACTT
ATTAACAGGCTATATTGGATCTGTATCTTTTCTGAATACAATTTTGGAAGTTATCAATAA
GCTTCGCTCTGTAAACCCGAATCTTACATATGTATGTGATCCGGTGATGGGTGATGAAGG
AAAGTTGTATGTACCTGAAGAATTGGTGCATGTTTATCGTGAGAAGGTAGTTCCCCTGGC
TCCTATGTTGACTCCTAACCAGTTTGAAGCAGAGAAATTAACAGGACTAAGGATAAATTC
TGAGGAAGATGGCAGAGAAGCTTGTGCTATTCTTCATGCAGCTGGTCCTTCAAAGGTGGT
GATCACTAGCATTACTATAGGAGGCCTTCTATTGCTTATTGGAAGCCATCAGAAAGAAAA
GGGCCAGAAGCCTGAGCAATTCAAGATTTTGATAGACAAAATCCCTGCGTATTTTACGGG
AACAGGAGATCTCATGACTGCTCTTCTACTTGGTTGGAGTAATAAATACCCTGACAGTCT
TGACAAGGCTGCCGAGCTTGCAGTTTCAACGTTGCAGGCGCTTCTGCGAAGGACGCTTGA
TGACTACCAACGAGCTGGGTATGATCCCACCTCAAGTAGCTTGGAGATTAGATTGATACA
GAGCCAGAACGAAATTCGAAACCCAAATGTTGAACTGAAAGCTGAGAGATACAGCTGAAG
CAGGTGAAAAAATGTAATCTTAAAATAAGAAAACATAGATATGTTTACGAGGGTAAGTTA
GTTGAGATCTCCTTGTTGGGGATACAACTGTACAATTCTTTTATACAATATAATACAGTT
CAGACTTCAGAGTAAGAGGATTTGAAAGAGCTCATATTATGCATTTAAATC


BQ
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AF RS1AL94TF U 1
AF RS1AL94JQ C 364
BS 1 760 RS1AL94TF
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RD RS1AL94TF 842 0 0
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AAAGTTGTATGTACCTGAAGAATTGGTGCATGTTTATCGTGAGAAGGTAGTTCCCCTGGC
TCCTATGTTGACTCCTAACCAGTTTGAAGCAGAGAAATTAACAGGACTAAGGATAAATTC
TGAGGAAGATGGCAGAGAAGCTTGTGCTATTCTTCATGCAGCTGGTCCTTCAAAGGTGGT
GATCACTAGCATTACTATAGGAGGCCTTCTATTGCTTATTGGAAGCCATCAGAAAGAAAA
GGGCCAGAAGCCTGAGCAATTCAAGATTTTGATAGACAAA*TCCCTGCGTATTTTACGGG
AACAGGAGATCTCATGACTGCTCTTCTACTTGGTTGGAGTAATAA*TACCCTGACAGTCT
TG

QA 1 842 1 842
DS 

RD RS1AL94JQ 828 0 0
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GTTGTATGTACCTGAAGAATTGGTGCATGTTTATCGTGAGAAGGTAGTTCCCCTGGCTCC
TATGTTGACTCCTAACCAGTTTGAAGCAGAGAAATTAACAGGACTAAGGATAAATTCTGA
GGAAGATGGCAGAGAAGCTTGTGCTATTCTTCATGCAGCTGGTCCTTCAAAGGTGGTGAT
CACTAGCATTACTATAGGAGGCCTTCTATTGCTTATTGGAAGCCATCAGAAAGAAAAGGG
CCAGAAGCCTGAGCAATTCAAGATTTTGATAGACAAAATCCCTGCGTATTTTACGGGAAC
AGGAGATCTCATGACTGCTCTTCTACTTGGTTGGAGTAATAAATACCCTGACAGTCTTGA
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GTGAAAAAATGTAATCTTAAAATAAGAAAACATAGATATGTTTACGAGGGTAAGTTAGTT
GAGATCTCCTTGTTGGGGATACAACTGTACAATTCTTTTATACAATATAATACAGTTCAG
ACTTCAGAGTAAGAGGATTTGAAAGAGCTCATATTATGCATTTAAATC

QA 1 828 1 828
DS 



AS 1 2

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AF RS1FA30JQ C 1
AF RS1FA30TF U 1
BS 1 4 RS1FA30JQ
BS 5 478 RS1FA30TF

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ACAACGTACCCTTCCAGGTGTACTATACGTTCAAACCAATATACATGCTTGCGGAACCGT
TCATGCTTGTATCGGCATTTTTCTTCGTCTTTGTGGCTTCTCTTTCTTATGTACACATCG
ATCTCAATATCGCCAAGAAGTAGAAATCTCATAGACAAGTTCATTTTTATATAGACTCCT
AAAAGATGTAGTAGACCCCTTTATAATACTACTTTTTTTTTGGTTAAAAACAAATAATTA
TGTAGTTGCTGTTGACTTTCCTAGTTGTGTATCTTTGCCGCTCTTTGTTTCTAATGAAGT
GAACTGTTGGAGATAGATAGTATTGTTGTTGAGAGTTAATCAAGGACATTTCAACTGC

QA 1 478 1 478
DS 

RD RS1FA30TF 478 0 0
GGGT
CCCTTCTGCTGTTTTGCCCTTCACAGTCAATCAAGACTTACAGGTCAAATACTCATACCT
TGACATCGTGGGAAGAACCGTGGTTGTGTTGCAAAAGGATAATGTAGTTCCCACTCACAA
CGTACCCTTCCAGGTGTACTATACGTTCAAACCAATATACATGCTTGCGGAACCGTTCAT
GCTTGTATCGGCATTCTTCTTCGTCTTTGTGGCTTCTCTTTCTTATGTACACATCGATCT
CAATATCGCCAAGAAGTAGAAATCTCATAGACAAGTTCATTTTTATATAGACTCCTAAAA
GATGTAGTAGACCCCTTTATAATACTACTTTTTTTTTGGTTAAAAACAAATAATTATGTA
GTTGCTGTTGACTTTCCTAGTTGTGTATCTTTGCCGCTCTTTGTTTCTAATGAAGTGAAC
TGTTGGAGATAGATAGTATTGTTGTTGAGAGTTAATCAAGGACATTTCAACTGC

QA 5 478 5 478
DS 



AS 1 2

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TCATTGTCGAAAATCCTCGCTACCGGCCGGCGGTTCGACGTCCTTCGCCACCGTCGGTCC
GGTTACCGTGTCTCTCTTATGTATTTTTAGCTTGTTGCCCTTGGTTGGACTAGGTAATAT
TTAGAGAGCTTTTTAGATCTAGATTTCAGATCCAGAAGATCAGTTGTTTCGGTGGTGACT
GGGTTTCCGTCGGCGTGTTGTCTGGCGTGGTTCCTCCGCTCCTGCTCTGCTTCAACTTCT
AGGGTTCTGTCGGTGGGTCTCTGGAGTCTCGTCTCCGATCTGCTGCTGGACCTCTATCTC
TGTTCTGTAAGTGGTTTCTTCAATCGCTTCTAGTGGTGGTTCTGATGAGGTTAGGTGGTT
ATGCTCTTCCTTGATTTCCTTAGCAACGGAATAGATTCTGTTGTTGGTTGTGTTATCCTG
TGGCTCGAGTTGGGTTCTCCGGCTTGTTGTCAAGGAAGAGGGGTTACGACCCGTTCTAGT
TCTTGGCCGTGGGTGTTTGAAGATTAATGGTGTGTCTCTTCTTCTCCCTGGGGTAGGTTC
GTCTCTGGTTACCTTGCGGCTCTTGGTGTGCTTCCAGAGCAGTAGACTAAGGTGTGGGTG
CTGATCCTCCCCGAATAATGTTCGGCCTTTGAAGTCTTCATCTTCACTCCTCCAGCTTCG
TTGGTTTCTGTTACTTGGTCGGCTGTTCTTTTTGATCTTCTCTAAGCTCTCTAATTGTTA
TTAGTCTTAGGTTTTATGGTCTGTATTTTGTTTCAGAGATTATCTTAACTCTGATTCCTT
TTGACTCTAGAAGAATCGGTTGGTTCTTGCTGGCTTTAGACTCTGAAAGTACCTGCTACT
TGTCAGCTTAGCATTTCACAAATGTATTCTTGTTGTATCCTTTCAAAGTTCAATGAAATT
TCCAGTGCG


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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DB58TF U 1
AF RS1DB58JQ C 195
BS 1 389 RS1DB58TF
BS 390 969 RS1DB58JQ

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TGTTCTGTAAGTGGTTTCTTCAATCGCTT

QA 1 389 1 389
DS 

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GTGTTGTCTGGCGTGGTTCCTCCGCTCCTGCTCTGCTTCAACTTCTAGGGTTCTGTCGGT
GGGTCTCTGGAGTCTCGTCTCCGATCTGCTGCTGGACCTCTATCTCTGTTCTGTAAGTGG
TTTCTTCAGTCGCTTCTAGTGGTGGTTCTGATGAGGTTAGGTGGTTATGCTCTTCCTTGA
TTTCCTTAGCAACGGAATAGATTCTGTTGTTGGTTGTGTTATCCTGTGGCTCGAGTTGGG
TTCTCCGGCTTGTTGTCAAGGAAGAGGGGTTACGACCCGTTCTAGTTCTTGGCCGTGGGT
GTTTGAAGATTAATGGTGTGTCTCTTCTTCTCCCTGGGGTAGGTTCGTCTCTGGTTACCT
TGCGGCTCTTGGTGTGCTTCCAGAGCAGTAGACTAAGGTGTGGGTGCTGATCCTCCCCGA
ATAATGTTCGGCCTTTGAAGTCTTCATCTTCACTCCTCCAGCTTCGTTGGTTTCTGTTAC
TTGGTCGGCTGTTCTTTTTGATCTTCTCTAAGCTCTCTAATTGTTATTAGTCTTAGGTTT
TATGGTCTGTATTTTGTTTCAGAGATTATCTTAACTCTGATTCCTTTTGACTCTAGAAGA
ATCGGTTGGTTCTTGCTGGCTTTAGACTCTGAAAGTACCTGCTACTTGTCAGCTTAGCAT
TTCACAAATGTATTCTTGTTGTATCCTTTCAAAGTTCAATGAAATTTCCAGTGCG

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

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TCTTCAGCTTCTCCTTTTTGGATTCAAACACTTTTCAGAGAACTAATCTCCTATCAAGAG
CTTGTTCTTTTTGAGGATGAAACTGATTGAGAAGACGATGAACAAGTTTACCAAGGCTGA
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GAGCAACGTATCTCTGCCGCCGCCATCGGCTGGTGATTCTGCTACACCATTGGTAGAGGT
TTCCGCCGACGAACTTAACTTGATTCCTCCCTTGAACTTCTCGATGGTCCACAACGGTAT
CTTCCGGTCTGGATTCCCGGACGTGTCTAACTTCTCATTCCTCAAGACTCTTGGTCTTCG
CTCAATCATATCTCTGTGTCCAGAGGCGTATCCTGAGAACAACATGCAGTTCCTCAAATC
TAATGGAATTAAGCTTTTCCAGTTTGGCATTAAAGGCTACAAGGTTTGTGTCTTCTTTTG
CTTTTTATTTTAATTTATTTTATACTGACACTCTCTTGCTACTAAATGTCCATCTATATT
TGCTTGATCATTGTCTTGCTTTGTAATTCTAATTGTTGTCTAAAGCCTGAATATTGTAGA
GGAATATTATATCTCAAAAAATGTGCAGTGTCCCCCAGGATTAGAGAACGAGGTTTGGTT
GCATCTTTGGAACTCTAAGCATCAGAAAGAGGGTTCCTATACAAATGCAAATTCAAAAAC
TTCGGTATTAATCTGAATACTATATGGAAGTTGGTTTCTAATCACAGTTTGAATTGCTTA
ACTGCCTTCTCACTTAGTTTCATGTGTTACTTCAGAGTGGTCATTATCTTTGTCATGTTA
CTTATGATTTAGACTAGAAAGATGGCATTCCATGTGTTGATTTTTGTCTTGACCCTTTTA
AGAGATTATTTTAATCCATATTTTTGTATATGACC


BQ
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AF RS1EY68TF U 1
AF RS1EY68JQ C 202
BS 1 680 RS1EY68TF
BS 681 995 RS1EY68JQ

RD RS1EY68TF 680 0 0
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TCTTCAGCTTCTCCTTTTTGGATTCAAACACTTTTCAGAGAACTAATCTCCTATCAAGAG
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GAGCAACGTATCTCTGCCGCCGCCATCGGCTGGTGATTCTGCTACACCATTGGTAGAGGT
TTCCGCCGACGAACTTAACTTGATTCCTCCCTTGAACTTCTCGATGGTCCACAACGGTAT
CTTCCGGTCTGGATTCCCGGACGTGTCTAACTTCTCATTCCTCAAGACTCTTGGTCTTCG
CTCAATCATATCTCTGTGTCCAGAGGCGTATCCTGAGAACAACATGCAGTTCCTCAAATC
TAATGGAATTAAGCTTTTCCAGTTTGGCATTAAAGGCTACAAGGTTTGTGTCTTCTTTTG
CTTTTTATTTTAATTTATTTTATACTGACACTCTCTTGCTACTAAATGTCCATCTATATT
TGCTTGATCATTGTCTTGCTTTGTAATTCTAATTGTTGTCTAAAGCCTGAATATTGTAGA
GGAATATTATATCTCAAAAA

QA 1 680 1 680
DS 

RD RS1EY68JQ 794 0 0
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GATTCCTCCCTTGAACTTCTCGATGGTCCACAACGGTATCTTCCGGTCTGGATTCCCGGA
CGTGTCTAACTTCTCATTCCTCAAGACTCTTGGTCTTCGCTCAATCATATCTCTGTGTCC
AGAGGCGTATCCTGAGAACAACATGCAGTTCCTCAAATTTAATGGAATTAAGCTTTTCCA
GTTTGGCATTAAAGGCTACAAGGTTTGTGTCTTCTTTTGCTTTTTATTTTAATTTATTTT
ATACTGACACTCTCTTGCTACTAAATGTCCATCTATATTTGCTTGATCATTGTCTTGCTT
TGTAATTCTAATTGTTGTCTAAAGCCTGAATATTGTAGAGGAATATTATATCTCAAAAAA
TGTGCAGTGTCCCCCAGGATTAGAGAACGAGGTTTGGTTGCATCTTTGGAACTCTAAGCA
TCAGAAAGAGGGTTCCTATACAAATGCAAATTCAAAAACTTCGGTATTAATCTGAATACT
ATATGGAAGTTGGTTTCTAATCACAGTTTGAATTGCTTAACTGCCTTCTCACTTAGTTTC
ATGTGTTACTTCAGAGTGGTCATTATCTTTGTCATGTTACTTATGATTTAGACTAGAAAG
ATGGCATTCCATGTGTTGATTTTTGTCTTGACCCTTTTAAGAGATTATTTTAATCCATAT
TTTTGTATATGACC

QA 1 794 1 794
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4315Contig1 1092 2 2 U
GTCGAAGACCACGTGTTGGGTATTATGGCAATAGATGCCGAAACGTAGAGTCCATTGTGG
CATCGGTGGTTCGAGCACATGTCCGGTCCAACCCGGCTAATGCACCCGGGTTTTTGCGTA
TGCATTTTCACGATTGCTTTGTTCGTGGCTGCGATGGGTCAGTTCTCATCGCTGGTAATA
GCACTGAGGGAACAGCCGGTCCAAACCGTTCACTGAGAGGGTTTGAAGCTATTGAAGAAG
CTAAGACTAGGCTTGAGGCTGCTTGTCCTAGAACTGTTTCTTGTGCGGATATTCTCACCA
TTGCTGCACGCGAAGCCGTTGTTTTGACCGGTGGACAAGGGTGGCGAGTGCCATTGGGAC
GTCTGGATGGCCGAATCTCGCAAGCCTCGGACGTGATCTTACCCGGACCATTCGACCCCG
TCGACAAGCAGAAGCGAGACTTTGCTGCTAAAACTCTCAACACATTAGACCTCGTAACTC
TTGTTGGCGGACACACGATAGGAACAGCGGGTTGCGGTTTGGTGAGAGGCAGGTTCTTTA
ATTTCAACGGCACAGGACAACCAGACCCATCAATCGATCCGAGGTTCGTACCATTGGTTC
AGGCTCGATGCCCTCAAACCGGAGACGCATCAGCCCGAGTCGACTTAGACGCTGGTAGTG
TTGGCAGGTTTGACACATCGTTCCTAAGGAACGTGAGGTCAAGCCGTGTGGTACTCCAAT
CCGACCTAGTCTTGTGGAGGGACCCCGAGACACGAGCCATCATAGAACGGTTATTAGGCT
TACGCCGACCATCATTGAGGTTTGGAACAGAGTTCGGGAAGTCGATGGTCAAGATGAGTC
TTATAGACGTTAAGACAGGATCAGATGGGGAGATTCGTAGGGTTTGCTCTAGGATCAACT
GATTAAGAATATGAAAGCACATCAGTGTGTGGTTTGGTTTTAATCTGTGATGGTTAATCA
ATAATCATTTGTTTTATACAATAAGTTTGCTATATCTTCTTGTGGTTTTGATTGCTACGT
TATGAATATTCAAGTGTAAGATTGTAATTGTAACATGAATGTATTATACTATATGATTGT
CATTTGTTTCCT


BQ
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ATCAGTGTGTGGTTTGGTTTTAATCTGTGATGGTTAATCAATAATCATTTGTTTTATACA
ATAAGTTTGCTATATCTTCTTGTGGTTTTGATTGCTACGTTATGAATATTCAAGTGTAAG
ATTGTAATTGTAACATGAATGTATTATACTATATGATTGTCATTTGTTTCCT

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

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TAACTTTTTCGTGTTTAATCCTACTAATTCAATCAACCACGATGAGGTATTGAATGCGTG
GTTAACATCGGTGAGTCGGTGTATTTGCAAGTATAAATAGGCCAGTGCTCCTCTTCTCAA
AATCCTCTTCTCTTCATCTCTTTTAGTATATACTGATTCACCGTGATATGGCTAAGAGTG
TTTTTTTTTGTTTTTTTCTTCTGATTTGAAGTCTGACAGGTGCTCCTCCATTGTTGATGT
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AATCTTTAGGAAGGTCTTCAATGGATTCCGACATGGAGATTGCTCCTCCTGCGTTTTTTT
TGGGTTTGACAACTCTAGAAATCCAAAAAGAAACAGAGCTCTTCAAACTCGGGAGTGTAG
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CCATAAATAGTTGGACAATTCTTTAATCAGCTCTGCAATGTGTGATTGGCAAGTTTGGGC
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CATC


BQ
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AF RS1GN50TF U 1
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BS 756 1144 RS1GN50JQ

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TAACTTTTTCGTGTTTAATCCTACTAATTCAATCAACCACGATGAGGTATTGAATGCGTG
GTTAACATCGGTGAGTCGGTGTATTTGCAAGTATAAATAGGCCAGTGCTCCTCTTCTCAA
AATCCTCTTCTCTTCATCTCTTTTAGTATATACTGATTCACCGTGATATGGCTAAGAGTG
TTTTTTTTTGTTTTTTTCTTCTGATTTGAAGTCTGACAGGTGCTCCTCCATTGTTGATGT
TAGGTTGTTGTGTTTCTGGGAGACCATGGTGGGGAACTCATGTAGCACACATAAAAAATC
AATCTTTAGGAAGGTCTTCAATGGATTCCGACATGGAGATTGCTCCTCCTGCGTTTTTTT
TGGGTTTGACAACTCTAGAAATCCAAAAAGAAACAGAGCTCTTCAAACTCGGGAGTGTAG
GCTTCTATGGAGGTAACATGATTGTAGATCGGAGTGACATAAACAGATGCTGGAGCGTTC
CCATAAATAGTTGGACAATTCTTTAATCAGCTCTGCAATGTGTGATTGGCAAGTTTGGGC
ATACCTGCAAATTTGATCACTCCATGAGCTCTTCTTCTTCTTTACTAAGCTACAACTCTT
GGTTTCTTCACTCACTCACATGCTCCACATACCTTATCCTCTTGAGTCCTCATTGCTCAG
CACATTAGCTCCATCATCATCATCCTCAGATGAAA
TGCTC

QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1GN50JQ 578 0 0
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AGCTCTTCTTCTTCTTTACTAAGCTACAACTCTTGGTTTCTTCACTCACTCACATGCTCC
ACATACCTTATCCTCTTGAGTCCTCATTGCTCAGCACATTAGCTCCATCATCATCATCCT
CAGATGAAAATGCTCTAATATTCACTCTTCGAGCTCTGTTAAACTCAAAACCACAACACA
AGTGGTGGCTGTGAACTGTTGCTGCTGAAGTCTCTCCGTCTTCTTCTTTGACCACCAGCC
TGAGCCATTCTGATCCTGCTGAGACCAAAAAGAATACTCAGCTAGCATTGAGTTTAAGAC
TTCGAAGTTAAAGATGCAAAACTCCAAGGAGAGGTTTTCCCTCTACTTCTATTATTTTCT
CTCTATCGTTCTTTTCTTTTTATCAAACTTGCATGAACTGAGGAACATGAAAGATGACTA
CAAACTATAAAGATGTTTGGGACCAAGTAAGATAGATTGGACTTTAACAAGTTTGTTTTT
AGTATGTGAAAAAAACTAAAATTTTTGTGTATAACATC

QA 1 578 1 578
DS 



AS 1 2

CO CL4317Contig1 507 2 1 U
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CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGCATGATGGTCCTTACAATGTGATAAAGAACTGGA
ACTACACGGCTTTTGTTGAGGCTATTCACAATGGAGAAGGTAAATGCTGGTGCGAAAGTG
AGGTGCGAGGAGGAGCTTGTGAAGGCCATTAGCACGGCGACGAATGAGGAAAAGGAGAGC
TTTTGTTTCATTGAAGTGATTGTGCATAAAGATGACACAAGCAAGGAGCTTTTGGAGTGG
GGATCTAGAGTCTCTGCTGCTAACAGTCGTCCTCCAAATCCTCAGTAGAGTTCGGAGATG
TCCTCATCTTTTATATATTTGCAATTTGGTAGTTCCTTTGTGTTGCTTTATGAAAAGTAG
TTTGTATCCTTAGGAGAAGAGCAGTGTGAGTCTCCTTGAGGATAAAACTTTGATTGCAAA
AGTAAAATTCGGTTAAACTTTGTGTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A194TF U 1
AF RS1A194TV U 37
BS 1 507 RS1A194TF

RD RS1A194TF 507 0 0
CATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATCAGTCGACGGTACCGGACATATGCC
CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGCATGATGGTCCTTACAATGTGATAAAGAACTGGA
ACTACACGGCTTTTGTTGAGGCTATTCACAATGGAGAAGGTAAATGCTGGTGCGAAAGTG
AGGTGCGAGGAGGAGCTTGTGAAGGCCATTAGCACGGCGACGAATGAGGAAAAGGAGAGC
TTTTGTTTCATTGAAGTGATTGTGCATAAAGATGACACAAGCAAGGAGCTTTTGGAGTGG
GGATCTAGAGTCTCTGCTGCTAACAGTCGTCCTCCAAATCCTCAGTAGAGTTCGGAGATG
TCCTCATCTTTTATATATTTGCAATTTGGTAGTTCCTTTGTGTTGCTTTATGAAAAGTAG
TTTGTATCCTTAGGAGAAGAGCAGTGTGAGTCTCCTTGAGGATAAAACTTTGATTGCAAA
AGTAAAATTCGGTTAAACTTTGTGTGT

QA 1 507 1 507
DS 

RD RS1A194TV 471 0 0
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CTTACAATGTGATAAAGAACTGGAACTACACGGCTTTTGTTGAGGCTATTCACAATGGAG
AAGGTAAATGCTGGTGCGAAAGTGAGGTGCGAGGAGGAGCTTGTGAAGGCCATTAGCACG
GCGACGAATGAGGAAAAGGAGAGCTTTTGTTTCATTGAAGTGATTGTGCATAAAGATGAC
ACAAGCAAGGAGCTTTTGGAGTGGGGATCTAGAGTCTCTGCTGCTAACAGTCGTCCTCCA
AATCCTCAGTAGAGTTCGGAGATGTCCTCATCTTTTATATATTTGCAATTTGGTAGTTCC
TTTGTGTTGCTTTATGAAAAGTAGTTTGTATCCTTAGGAGAAGAGCAGTGTGAGTCTCCT
TGAGGATAAAACTTTGATTGCAAAAGTAAAATTCGGTTAAACTTTGTGTGT

QA 1 471 1 471
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4319Contig1 836 2 2 U
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CAATTTTTCTATGTATCCTTCTGCAACATCTCGAATGCTGCTCGCTCCAACGAAATCCAT
TGGCATTAGTATTCCTTCTGCAGCCCAGTAGTAGGACAGTGTCTCCACATCTATTTCGTA
ATCTTCTGGAAAACTAGCTAGGTAAAGGAAGCAATGCTTCAAATAAGCAGGCAGCTCTTC
AAAACTCAGATTCAAAACATAGCCACTCCCTCTAATGATGAAATGCTATCCTTTGAAAAA
GATCCCAACTTTCTTCAAAAGTTAGGCACTCTGGTTTGAAGGTAACACATTGTTTATCAG
CATGTAATGGCACTTCCTCATTGCGAGAAGTCACCCGTGGATTGTGAATGATACGGTTGC
TCCAGATAAATCAGTGGACTTTGAAACAGTCTTGATCGGATTTATATATCTCAATCCAAT
AGAATTTGAGGATTTTTTTAGGGGAAACCTTTTTTGAATAAACTGCTCTGAAACTGAAAA
AAAAAGATTCACTGAGATAGCAAGGTCTGGTCTTCTTTGCCATATCCTACGGTTAGAAGA
AGAGGATAGAGAGATGGAGGGTTATTAGAATGTATCAATAAGTACACAAAGTTTATGCTA
ATATATATCACATATACAAATTTTATGTTGATATGGTGGCAACATCATAGTCGGATTTAA
TTGATTTCAACCAAGGTTAATGGTGTTAATCCGTAATTTATTAAACTTAATAAATTTAAA
TGATTTTTTTCAAAAAACTGATTTATTAATATTAATTAAAAACCTAATTGATTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GP93TF U 1
AF RS1GP93JQ C 231
BS 1 709 RS1GP93TF
BS 710 836 RS1GP93JQ

RD RS1GP93TF 709 0 0
GGATGTTTCAAATCTTAAAGTTTTAACATCTCTTTTAGAAATAATCATGTTTCTCTTCAC
CAATTTTTCTATGTATCCTTCTGCAACATCTCGAATGCTGCTCGCTCCAACGAAATCCAT
TGGCATTAGTATTCCTTCTGCAGCCCAGTAGTAGGACAGTGTCTCCACATCTATTTCGTA
ATCTTCTGGAAAACTAGCTAGGTAAAGGAAGCAATGCTTCAAATAAGCAGGCAGCTCTTC
AAAACTCAGATTCAAAACATAGCCACTCCCTCTAATGATGAAATGCTATCCTTTGAAAAA
GATCCCAACTTTCTTCAAAAGTTAGGCACTCTGGTTTGAAGGTAACACATTGTTTATCAG
CATGTAATGGCACTTCCTCATTGCGAGAAGTCACCCGTGGATTGTGAATGATACGGTTGC
TCCAGATAAATCAGTGGACTTTGAAACAGTCTTGATCGGATTTATATATCTCAATCCAAT
AGAATTTGAGGATTTTTTTAGGGGAAACCTTTTTTGAATAAACTGCTCTGAAACTGAAAA
AAAAAGATTCACTGAGATAGCAAGGTCTGGTCTTCTTTGCCATATCCTACGGTTAGAAGA
AGAGGATAGAGAGATGGAGGGTTATTAGAATGTATCAATAAGTACACAAAGTTTATGCTA
ATATATATCACATATACAAATTTTATGTTGATATGGTGGCAACATCATA

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1GP93JQ 606 0 0
GCAGCTCTTCAAAACTCAGATTCAAAACATAGCCACTCCCTCTAATGATGAAATGCTATC
CTTTGAAAAAGATCCCAACTTTCTTCAAAAGTTAGGCACTCTGGTTTGAAGGTAACACAT
TGTTTATCAGCATGTAATGGCACTTCCTCATTGCGAGAAGTCACCCGTGGATTGTGAATG
ATACGGTTGCTCCAGATAAATCAGTGGACTTTGAAACAGTCTTGATCGGATTTATATATC
TCAATCCAATAGAATTTGAGGATTTTTTTAGGGGAAACCTTTTTTGAATAAACTGCTTTG
AAACTGAAAAAAAAAGATTCACTGAGATAGCAAGGTCTGGTTTTCTTTGCCATATCCTAC
GGTTAGAAGAAGAGGATAGAGAGATGGAGGGTTATTAGAATGTATCAATAAGTACACAAA
GTTTATGCTAATATATATCACATATACAAATTTTATGTTGATATGGTGGCAACATCATAG
TCGGATTTAATTGATTTCAACCAAGGTTAATGGTGTTAATCCGTAATTTATTAAACTTAA
TAAATTTAAATGATTTTTTTCAAAAAACTGATTTATTAATATTAATTAAAAACCTAATTG
ATTTTG

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 2

CO CL4320Contig1 470 2 1 U
GGGCGAAACATTCGTCTACATTGATTATCGTCATTTCGTTTTTAAGGATCTTTGTGTTGT
GGGGCTTAAACTCGATTCGACAGCGAAAACTAGAGATCGAAGCAGTTAGTTATGCCAGGA
GGAGGAGGAGGAGGTGCGCTCAAGTCCTTGAAACCAAAGATCCAATCCGTGGATATCCAA
GCCGCCGCGGGATGGGGTATCGCCGCCGCAGCCGGCGCCATCTGGGTCGTCCAACCTTTT
GATTGGATAAAGAAGACATTCATTGATAAACCAGCGGAAGAGAACTGAGTGAGAGAGATC
ATCAAAGACTCACTGACAAAGTGAGAGGTTTTTTTTTCAGTTTCTAAGTTTGTCATCGCA
TCTCTGCGATGAAGTTGAATAAAGTTTTTGTTATTTTCTGGGGCTTTGTGATTTCATATA
CACTTTTTGTTTATCAAATGATATAACACAAAGGAAAAAAGCATACACTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1FL80JQ C 1
AF RS1FL80TF U 1
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QA 1 470 1 470
DS 

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GGGGCTTAAACTCGATTCGACAGCGAAAACTAGAGATCGAAGCAGTTAGTTATGCCAGGA
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GCCGCCGCGGGATGGGGTATCGCCGCCGCAGCCGGCGCCATCTGGGTCGTCCAACCTTTT
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ATCAAAGACTCACTGACAAAGTGAGAGGTTTTTTTTTCAGTTTCTAAGTTTGTCATCGCA
TCTCTGCGATGAAGTTGAATAAAGTTTTTGTTATTTTCTGGGGCTTTGTGATTTCATATA
CACTTTTTGTTTATCAAATGATATAACACAAAGGAAAAAAGCATACACTC

QA 1 470 1 470
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CTCTTTGGTCCTTGAGCATCTGTGTCTGCACTCTTTTGGTTTTTGTAATCTCTCTCATTT
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BQ
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AF RS1B955JQ C 1
AF RS1B955TF U 1
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QA 1 470 1 470
DS 



AS 1 2

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AAAAGCAAGTCTTC


BQ
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AF RS1BO43TF C 1
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BS 87 314 RS1BO43JQ

RD RS1BO43TF 314 0 0
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AAAAGCAAGTCTTC

QA 1 314 1 314
DS 

RD RS1BO43JQ 228 0 0
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QA 1 228 1 228
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1BP77TF U 1
AF RS1BP77JQ C 477
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RD RS1BP77TF 701 0 0
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CTCGCCTTTCGGATTTTGTCCATTCTCAGCGAAGAACAGTTCTTACCTAACCATAACCGA
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ATAGAAAACTATAATGGGCGTAAACGTGTTGAAGCTGGAGATCTTTGTGAACGCAGAAAT
GGAAGAGGAGTTGACTTGAACCGAAACTGGGGCGTTGACTGGGGCAAGAAAGAAAAAGAT
TATGATCCATATGAAGAGAATCCTGGAACTGCTCCGTTTAGTGAGCCCGAAGCTCAAATA
ATGCGGAAGCTAGCTATCTCATTTGACCCTCACATATGGATAAACGTTCATTCTGGAATG
GAGGCTCTGTTTATGCCATATGACCACAAAAACACAACCCCGGAAGGATTGCCTTCGCAG
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GATGTTGTAAG*ACACCAATGGCTTTCACCTTTGAGATATATGGGGACAACCAGACTTCT
TCACGAGAT*GCTTTAAA*TGTTCAACCCTGTTGATCTACC

QA 1 701 1 701
DS 

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CTATGATGTTGTAAGGACACCAATGGCTTTCACCTTTGAGATATATGGGGACAACCAGAC
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TCTCAACGACTGGTCTGCTGCCTTCTTCACAATTTTCAAATTGGGACCGTTTCATTTAGA
ACAGAACAGTACCAAGGCTGCAGAGAAATGGGTATCCATAGATGAGTATTTGGACGGTTA
TCTGGTGGAAAGGAAGAACAGATATGGGAAGAATATGGAAGTGATCGATGTCGGAATGCA
GGAGATTAAGACTTACTTCAGGCTCTTTTTGTTGTCCTCTGTACTTCTGATGTTCATGTT
CTGTTCCAGAATCGCCAAGAGCAAGTATAGTAGAAACTCCATACCTGTTGTCATGCAATG
AGAAAACTATCGGAGGAAAGTCTCTCTCACCCAGTTAACCCCCTTGTAAGTTAGTAATAT
TTTTTTTTTGGTTTGCAAAAACTTGTATTCCTAATTTATTTGCTGCAGTTTTAGGAACGG
TTTGTGTCACATGATAATTCTTTGGATTTGAGATTTGATTAAAAGGAGATTCGGTTTAG

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 2

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AAAGGCAATTAAGATCCAGGCTGTGTTTAGAGGGTTCCAAGTAAGAAGACAGTACCAGAA
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AGGATTCAGAGGGCTTCAGGTCAGCCAACCTGAGGCGATGGAAGGGACTGACGCGGTGGA
GGATTTCTACAAGACAAGCCAGAAACAAGCAGAGGACAGGCTAGAGAGATCAGTGGTTCG
AGTCCAGGCCATGTTCCGGTCCAAGAAGGCTCAGCAAGATTACAGAAGGATGAAACTGGC
TCATGAAGAAGCTCAGCTGGAATATGATGGGATGCAAGAGCTTGATCACATGGCTATGGA
GAGCTGAATGTGTGATAGTAAAGATAAGTGTTGTGGAACTGTTAAAGTAAAATTTGTGTA
AATGACAAGGGGCAATTTCGACCTTTTCGAAGCTGTTTTCAAAAAAGTTTCAACGGGTAA
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ACAAAGGAGAAGTGAAGTCAATCCCATACAAACCAGGAAGCCGAGGACCAAAAGAAGCTG
ATCAGTTACTGGAGAAAGCGGGTTACCTTCAAACTCATGGCTACATCTGGATCCCTCCTA
CATTATAAACACACAAATACATTTACACAGTACATGCATCAATCCACATGTATATGTATG
TATACGGTAATTAAACAACTAGACATCTCTTCCCTGAATGATCTATCTCTGAGTTCGGTC
ATCGTATGTGAACCTATGTAACTTGTGTTGTTCACTTTGAGAGCTTGTCTTGTGTTTTGC
TTTGTTGTATTAAAACATAATAAGGTTGTTTCCTAGTAG


BQ
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AF RS1DV91TF U 1
AF RS1DV91JQ C 334
BS 1 645 RS1DV91TF
BS 646 646 RS1DV91JQ
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RD RS1DV91TF 825 0 0
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AAAGGCAATTAAGATCCAGGCTGTGTTTAGAGGGTTCCAAGTAAGAAGACAGTACCAGAA
GATAACATGGTCGGTGGGAGTTCTTGAGAAGGCGATTCTGAGGTGGAGACTCAAGAGGAG
AGGATTCAGAGGGCTTCAGGTCAGCCAACCTGAGGCGATGGAAGGGACTGACGCGGTGGA
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AGTCCAGGCCATGTTCCGGTCCAAGAAGGCTCAGCAAGATTACAGAAGGATGAAACTGGC
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GAGCTGAATGTGTGATAGTAAAGATAAGTGTTGTGGAACTGTTAAAGTAAAATTTGTGTA
AATGACAAGGGGCAATTTCGACCTTTTCGAAGCTGTTTTCAAAAA*GTTTCAACGGGTAA
ATCATGGTAAGATCAATTCCTGGAGCTGGGAGATTTTTACACCGTTGTTGCACAG*ATTG
ACAAAG*AGAAGTGAAGTCAATCCCATACAAACCAGGAAGCCGAGGAC*AAAAGAAGCTG
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QA 1 825 1 825
DS 

RD RS1DV91JQ 726 0 0
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TGGAACTGTTAAAGTAAAATTTGTGTAAATGACAAGGGGCAATTTCGACCTTTTCGAAGC
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TTTTTACACCGTTGTTGCACAGGATTGACAAAGGAGAAGTGAAGTCAATCCCATACAAAC
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CTCATGGCTACATCTGGATCCCTCCTACATTATAAACACACAAATACATTTACACAGTAC
ATGCATCAATCCACATGTATATGTATGTATACGGTAATTAAACAACTAGACATCTCTTCC
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ACTTTGAGAGCTTGTCTTGTGTTTTGCTTTGTTGTATTAAAACATAATAAGGTTGTTTCC
TAGTAG

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL4326Contig1 356 2 5 U
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ATAGTCAGAAACATAGATAATAAAAACCCTAATAATCTAAAACATATGCTTAATTATTCT
CCACATCTTCTTTTGGCTCCAACTTTCCCCCTGGGTTCTTTAAAAACTTATATTTGAGCG
TAACGACACCAAGGGCCCATCCAAAGGTTACTCCTGCGACCAAACGGGATGCGTATCCAA
CCATACCAAGATATCCCATTTTTCTCTTGTCACGACAGACGACGGCGAGGCGTTAGGGTG
CGGAAGAGTGACTCAAAAGAAAGAAAGAAAGAGACTCGAAGACGCGGCGTTAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BD29JQ U 30
AF RS1BD29TF C 1
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BS 30 187 RS1BD29JQ
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DS 

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CCACATCTTCTTTTGGCTCCAACTTTCCCCCTGGGTTCTTTAAGAACTTATATTTGAGCG
TAACGACACCAAGGGCCCATCCAAAGGTTACTCCTGCGACCAAACGGGATGCGTATCCAA
CCATACCAAGATATCCCATTTTTCTCTTGTCACGACAGACGACGGCGAGGCGTTAGGGTG
CGGAAGAGTGACTCAAAAGAAAGAAAGAAAGAGACTCGAAGACGCGGCGTTAATCC

QA 1 356 1 356
DS 



AS 1 2

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CGGTAACTTCTGTTCGGACAAGAAGCCTGCAGCTGTGAACTGGATCGAGGGACGTGGCAA
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CGTGGCTGCCTTGGTGGAGCTCAATATGCTCAAGAACCTGACGGGCTCTGCTGTTGCAGG
CTCTCTAGGTGGATTCAACGCACACGCCAGCAACATAGTCTCAGCTGTATTCATAGCTAC
TGGCCAAGATCCAGCTCAAAACGTGGAGAGCTCTCAATGCATCACAATGATGGAAGCCGT
TAATGACGGCAAAGATATTCATGTCTCTGTCACTATGCCATCTATTGAGGTGGGGACAGT
GGGAGGAGGAACACAGCTTGCGTCTCAATCAGCGTGTTTAAACCTGCTGGGAGTTAAAGG
AGCGAGCACGGAGTCTCCGGGGATGAACTCAAGGACGCTAGCGACGATAGTGGCGGGAGC
AGTTTTGGCTGGAGAGTTATCTTTAATGTCAGCAATAGCAGCTGGACAACTTGTGAAGAG
TCACATGAAATACAATAGATCCAGCAGAGACATATCTGGAGCAATGACAGCGACAACAAC
ATGATCATTGTCATCATCTGTGTGGCCAAAACTTGAAGAAGGACAAAATTCTAAAAAAGA
GGCTCATAACTCTCTGGTGGACGTCTTTGAGCCATGTGCCTTGCCTTGCCTTCTTTTGTT
CAATAAAAGTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGGGATTAAGGGTGAGAAAGAGAGAGGGATAAT
ATCTTTCTTCTTTTCTCTAACTCATGGATAATTCATGTTCTTCTTTGATATATATGTCTT
AGCTTTGTCGCGTGTTTGTTAGGAAATGGTGTTTATATGATAAAAAATGTATGCAGTTAC
GTTTTGGGGGCATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BU24TF U 1
AF RS1BU24JQ C 223
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BS 691 975 RS1BU24JQ

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TGGCCAAGATCCAGCTCAAAACGTGGAGAGCTCTCAATGCATCACAATGATGGAAGCCGT
TAATGACGGCAAAGATATTCATGTCTCTGTCACTATGCCATCTATTGAGGTGGGGACAGT
GGGAGGAGGAACACAGCTTGCGTCTCAATCAGCGTGTTTAAACCTGCTGGGAGTTAAAGG
AGCGAGCACGGAGTCTCCGGGGATGAACTCAAGGACGCTAGCGACGATAGTGGCGGGAGC
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TCACATGAAATACAATAGATCCAGCAGAGACATATCTGGAGCAATGACAGCGACAACAAC
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CTTGAA

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DS 

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AATGACAGCGACAACAACATGATCATTGTCATCATCTGTGTGGCCAAAACTTGAAGAAGG
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GCCTTGCCTTCTTTTGTTCAATAAAAGTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGGGATTAAGGGTGA
GAAAGAGAGAGGGATAATATCTTTCTTCTTTTCTCTAACTCATGGATAATTCATGTTCTT
CTTTGATATATATGTCTTAGCTTTGTCGCGTGTTTGTTAGGAAATGGTGTTTATATGATA
AAAAATGTATGCAGTTACGTTTTGGGGGCATGC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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ATGGTCTTTTAAAAGAAAGGATAGGACTTACAAGTTACACTTCTTGGAACTAAAGTTCTC
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GTATTTGACGAGCATACAGACCTGAAACAATCAGATAGCATCTTGTAAGCTTGTTCTGTC
TGTTCTTTGCTCCTACGGCTCGGTAAAAGTGTTGGTACTCTCGATAGATTAGCATAGAGA
ACTGTAATCCAAGATTATTTTAGGCATGGCAGACAATATATGAATTTCACACAACCCAAA
ACAAGTCTATATTAATCATCTCACCGCACTCAGCCAATTGCCCATCTCTTCCAGCTCGAC
CAGCTTCTTGGTAGTATGCTTCCAAGCTCTGCGGTTTCATTATTTCAGTGAGATATAATA
AGATAGATTTGTTTATATATTCTGGTGTACAGAAAAGTTAAATATTAAGATCATATAAAG
AGCTCTTAGAGAGAGACCTGCGGCCAACCATAATGGATGATTTTCCGGACATTTTTCTTG
TCAATTCCCATTCCAAATGCAATTGTGGCAACAACAACCTGAAGGGGAGTACCATAAAGT
CAATATTCCTCCACATGAAGTGGATAACAGAGTAGAACATTTGGGTTGTGTCAGAATACA
ATAGAACATGAAGGTTCCATGTAAGTACCTGCAGCTTCTCTTCGTGAAACTCTTGGTGAA
CTTGTCTGAGATGTTTTTTAGGCAACTGTGGAAAGCAAACAAACTGTTAAAAAAAACAGC
CATAACACCAATTTAAAAACAAAAAAGCATTTAACTAAGAATCCAAGATCTAACCATCAT
AAACTGG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GJ23TF U 1
AF RS1GJ23JQ C 485
BS 1 642 RS1GJ23TF
BS 643 967 RS1GJ23JQ

RD RS1GJ23TF 642 0 0
GATCGCATCTGTTTCATAGATTGGAAAGAATATTACGACAGATTCGCTAGTTTTACCTTA
ATGGTCTTTTAAAAGAAAGGATAGGACTTACAAGTTACACTTCTTGGAACTAAAGTTCTC
CCCAAAGTACTCCACCAGTATTTTCGCTCGACACTGTGAAGTGTTCATTCCGTATCTGCA
TAAGAAAAGTAGAGTGAATGTAAATGAGTACAGAGAAAAGTGAAAGATGGACACACACAC
GTATTTGACGAGCATACAGACCTGAAACAATCAGATAGCATCTTGTAAGCTTGTTCTGTC
TGTTCTTTGCTCCTACGGCTCGGTAAAAGTGTTGGTACTCTCGATAGATTAGCATAGAGA
ACTGTAATCCAAGATTATTTTAGGCATGGCAGACAATATATGAATTTCACACAACCCAAA
ACAAGTCTATATTAATCATCTCACCGCACTCAGCCAATTGCCCATCTCTTCCAGCTCGAC
CAGCTTCTTGGTAGTATGCTTCCAAGCTCTGCGGTTTCATTATTTCAGTGAGATATAATA
AGATAGATTTGTTTATATATTCTGGTGTACAGAAAAGTTAAATATTAAGATCATATAAAG
AGCTCTTAGAGAGAGACCTGCGGCCAACCATAATGGATGATT

QA 1 642 1 642
DS 

RD RS1GJ23JQ 483 0 0
TTCTTGGTAGTATGCTTCCAAGCTCTGCGGTTTCATTATTTCAGTGAGATATAATAAGAT
AGATTTGTTTATATATTCTGGTGTACAGAAAAGTTAAATATTAAGATCATATAAGGAGCT
CTTAGAGAGAGACCTGCGGCCAACCATAATGGATGATTTTCCGGACATTTTTCTTGTCAA
TTCCCATTCCAAATGCAATTGTGGCAACAACAACCTGAAGGGGAGTACCATAAAGTCAAT
ATTCCTCCACATGAAGTGGATAACAGAGTAGAACATTTGGGTTGTGTCAGAATACAATAG
AACATGAAGGTTCCATGTAAGTACCTGCAGCTTCTCTTCGTGAAACTCTTGGTGAACTTG
TCTGAGATGTTTTTTAGGCAACTGTGGAAAGCAAACAAACTGTTAAAAAAAACAGCCATA
ACACCAATTTAAAAACAAAAAAGCATTTAACTAAGAATCCAAGATCTAACCATCATAAAC
TGG

QA 1 483 1 483
DS 



AS 1 2

CO CL4330Contig1 722 2 2 U
GATATTGAGAGTGATCGCGCCCATTGTACCTCACCTAGCAGAAGATGTCTGGCAAAATCT
CCCATTCGAGTACAGAAACGAAGATGGCTCTGCAGCAAAATTTGTCTTTGAACTTAAATG
GCCTCTGTTGAACGAACAATGGCTTTCATTTCCTGCTGAAGATGTTCTCTTCTGGGAAAG
GCTTCTCGAGTTGAGGACCGAGGTGAGCAAAGTGCTGGAGCTTGCACGTAATGGAAAATT
AATCGGTTCCAGTTTAGAAGCAAAGGTGTATCTGCATACCGCCGATGCAAGCATGGCTTC
AAAATTAGTAGAGATGTGTGAAGCTCAGAATGAAGCTGACACGCTGCAACGCATATTCAT
AACATCACAGGTTGAGGTATTGTCGTCAATGGAGAAGGAGATGGTAAGCAGTGTACAGCA
CACAGGAGAGTATGTGGAGGGAGAGAACAAAGTGTGGATTGGTGTATCACGAGCTGAGGG
ATCTAAGTGTGAGAGGTGCTGGAACTACTCAGGCCAGGTTGGGTCGTTTACTGAACATCC
TACTCTCTGTGGACGCTGCTTCAATGTCATTGTTGCTAATCCGCCTGAGCCTGTGTTTGC
AGCCGTGATCAGCTGATTTTGAAATTTGCTTTACACTGTAACAATTTGTTACCCAATGCA
CTGTGTACATTGTCCAACTCATTTTTCTTTCACTGAACTCAATGATAATAATAGAAGCTA
CT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RS1GC84TF U 1
AF RS1GC84JQ C 39
BS 1 508 RS1GC84TF
BS 509 722 RS1GC84JQ

RD RS1GC84TF 508 0 0
GATATTGAGAGTGATCGCGCCCATTGTACCTCACCTAGCAGAAGATGTCTGGCAAAATCT
CCCATTCGAGTACAGAAACGAAGATGGCTCTGCAGCAAAATTTGTCTTTGAACTTAAATG
GCCTCTGTTGAACGAACAATGGCTTTCATTTCCTGCTGAAGATGTTCTCTTCTGGGAAAG
GCTTCTCGAGTTGAGGACCGAGGTGAGCAAAGTGCTGGAGCTTGCACGTAATGGAAAATT
AATCGGTTCCAGTTTAGAAGCAAAGGTGTATCTGCATACCGCCGATGCAAGCATGGCTTC
AAAATTAGTAGAGATGTGTGAAGCTCAGAATGAAGCTGACACGCTGCAACGCATATTCAT
AACATCACAGGTTGAGGTATTGTCGTCAATGGAGAAGGAGATGGTAAGCAGTGTACAGCA
CACAGGAGAGTATGTGGAGGGAGAGAACAAAGTGTGGATTGGTGTATCACGAGCTGAGGG
ATCTAAGTGTGAGAGGTGCTGGAACTAC

QA 1 508 1 508
DS 

RD RS1GC84JQ 684 0 0
CAGAAGATGTCTGGCAAAATCTCCCATTCGAGTACAGAAACGAAGATGGCTCTGCAGCAA
AATTTGTCTTTGAACTTAAATGGCCTCTGTTGAACGAACAATGGCTTTCATTTCCTGCTG
AAGATGTTCTCTTCTGGGAAAGGCTTCTCGAGTTGAGGACCGAGGTGAGCAAAGTGCTGG
AGCTTGCACGTAATGGAAAATTAATCGGTTCCAGTTTAGAAGCAAAGGTGTATCTGCATA
CCGCCGATGCAAGCATGGCTTCAAAATTAGTAGAGATGTGTGAAGCTCAGAATGAAGCTG
ACACGCTGCAACGCATATTCATAACATCACAGGTTGAGGTATTGTCGTCAATGGAGAAGG
AGATGGTAAGCAGTGTACAGCACACAGGAGAGTATGTGGAGGGAGAGAACAAAGTGTGGA
TTGGTGTATCACGAGCTGAGGGATCTAAGTGTGAGAGGTGCTGGAACTACTCAGGCCAGG
TTGGGTCGTTTACTGAACATCCTACTCTCTGTGGACGCTGCTTCAATGTCATTGTTGCTA
ATCCGCCTGAGCCTGTGTTTGCAGCCGTGATCAGCTGATTTTGAAATTTGCTTTACACTG
TAACAATTTGTTACCCAATGCACTGTGTACATTGTCCAACTCATTTTTCTTTCACTGAAC
TCAATGATAATAATAGAAGCTACT

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL4331Contig1 372 2 1 U
GGGGAAGGAGATGTTTGTGTGTTTGAGCTACTCAAAACTCGAGATTTCGTTCTGAAAGTC
ACTGCCTTCCGCGTCAATCAGTACGTTTGACACACTACAAAAAAAGCTATCTGATGTCCT
AAAGTTCAGCTTCATGTAGGGTCTTTTAACTAGTTTATCTATCTCTCTTGCATTTCTTGG
AGAATCAGTCTGGTTCTCTGGGTTTTAGATGTGTTCTGGGTGAAAATTTCAGGTTCCTAT
GTTTCGTTGTTGATAAGTATTTGAGTTTTGGTGCAAAAACTCTCTGTTTGAGTGGTAGTT
TAGGGTCAATAGTAGCGTTATAATTAAGTGCATTGGACTGGTGAGTGAATCACAAGAATG
ATGTTTATGCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1G088TF U 1
AF RS1G088JQ C 174
BS 1 372 RS1G088TF

RD RS1G088TF 372 0 0
GGGGAAGGAGATGTTTGTGTGTTTGAGCTACTCAAAACTCGAGATTTCGTTCTGAAAGTC
ACTGCCTTCCGCGTCAATCAGTACGTTTGACACACTACAAAAAAAGCTATCTGATGTCCT
AAAGTTCAGCTTCATGTAGGGTCTTTTAACTAGTTTATCTATCTCTCTTGCATTTCTTGG
AGAATCAGTCTGGTTCTCTGGGTTTTAGATGTGTTCTGGGTGAAAATTTCAGGTTCCTAT
GTTTCGTTGTTGATAAGTATTTGAGTTTTGGTGCAAAAACTCTCTGTTTGAGTGGTAGTT
TAGGGTCAATAGTAGCGTTATAATTAAGTGCATTGGACTGGTGAGTGAATCACAAGAATG
ATGTTTATGCGC

QA 1 372 1 372
DS 

RD RS1G088JQ 199 0 0
TTCTTGGAGAATCAGTCTGGTTCTCTGGGTTTTAGATGTGTTCTGGGTGAAAATTTCAGG
TTCCTATGTTTCGTTGTTGATAAGTATTTGAGTTTTGGTGCAAAAACTCTCTGTTTGAGT
GGTAGTTTAGGGTCAATAGTAGCGTTATAATTAAGTGCATTGGACTGGTGAGTGAATCAG
AAGAATGATGTTTATGCGC

QA 1 199 1 199
DS 



AS 1 2

CO CL4332Contig1 970 2 2 U
ACCAACGGCTCTCACATTGTCTCTCTGAAATAACTTTCCTTTACACTTTCTCATCGAAGC
AGACATTGTACAATAACCTCCTCTAAAGGATGTCACTTTCTTCCCCCTTCAACGTCATCG
CTTCCTACACACTCAAACCCAAATCCTTCCTCAGAGATTCCAAACTCGTTTCACGGTCTC
ACCACTCCTTTCCTCTCCCTTCCACTCTCCAAACCCACGAACCCTCCTCGAGTTCCAGCG
AGCCAAGCTCAAGTTCGAATCCGAGCTGATGATGCAAGACTCCACCTTTACCTACAGCAT
CGTGAGACCGACGGCTTTCTTCAAGAGCTTAGGCGGACAGGTGGAGATAGTCAAAGACGG
GAAGCCTTACGTGATGTTCGGAGACGGGAAGCTCTGCGCTTGCAAACCCATCAGCGAGGA
GGATTTAGCTTCGTTCATAGCGGACTGCGTGTTGGAAGAGGAGGAGATCAATAAGGTGTT
GCCTATCGGTGGACCAGGGAAGGCGTTGACGCCGTTGGAGCAAGGGGAGATTCTGTTTAG
GATACTAGGGAGAGAGCCCAAGTTCTTGAGAGTGCCTATAGAGATTATGGACTTTGTGAT
TGGTGTTCTTGACGGTGTGGCGAAGGTGTTTCCTGGTGTTGCGGAGGCTGCTGAGTTTGG
GAAGATTGGGAGGTACTATGCTGCGGATAGTATGTTGATTCTTGATCCGGAGACTGGGGA
GTATAGTGAGGAGATGACGCCTAGTTATGGGAAGGATACGCTTGAGGAGTTTTTTGAGAA
AGTTGTTAGGGAAGGGATGGCTGGTCAAGAGCTTGGTGAACAGTTCTTCTAGTTGGGAGA
GAATGTTTCATAAGCTGTGTTAAAAGTGTTGTAACTGTTGAGGTTATAAAATCTGTGAAT
TTGAGAGATTTGTGAATCTGAACAATTATGAAACATTATATATCGCAGGTAATTTTTTCC
TGGATCAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FC02TF U 1
AF RS1FC02JQ C 282
BS 1 752 RS1FC02TF
BS 753 970 RS1FC02JQ

RD RS1FC02TF 752 0 0
ACCAACGGCTCTCACATTGTCTCTCTGAAATAACTTTCCTTTACACTTTCTCATCGAAGC
AGACATTGTACAATAACCTCCTCTAAAGGATGTCACTTTCTTCCCCCTTCAACGTCATCG
CTTCCTACACACTCAAACCCAAATCCTTCCTCAGAGATTCCAAACTCGTTTCACGGTCTC
ACCACTCCTTTCCTCTCCCTTCCACTCTCCAAACCCACGAACCCTCCTCGAGTTCCAGCG
AGCCAAGCTCAAGTTCGAATCCGAGCTGATGATGCAAGACTCCACCTTTACCTACAGCAT
CGTGAGACCGACGGCTTTCTTCAAGAGCTTAGGCGGACAGGTGGAGATAGTCAAAGACGG
GAAGCCTTACGTGATGTTCGGAGACGGGAAGCTCTGCGCTTGCAAACCCATCAGCGAGGA
GGATTTAGCTTCGTTCATAGCGGACTGCGTGTTGGAAGAGGAGGAGATCAATAAGGTGTT
GCCTATCGGTGGACCAGGGAAGGCGTTGACGCCGTTGGAGCAAGGGGAGATTCTGTTTAG
GATACTAGGGAGAGAGCCCAAGTTCTTGAGAGTGCCTATAGAGATTATGGACTTTGTGAT
TGGTGTTCTTGACGGTGTGGCGAAGGTGTTTCCTGGTGTTGCGGAGGCTGCTGAGTTTGG
GAAGATTGGGAGGTACTATGCTGCGGATAGTATGTTGATTCTTGATCCGGAGACTGGGGA
GTATAGTGAGGAGATGACGCCTAGTTATGGGA

QA 1 752 1 752
DS 

RD RS1FC02JQ 689 0 0
CCACCTTTACCTACAGCATCGTGAGACCGACGGCTTTCTTCAAGAGCTTAGGCGGACAGG
TGGAGATAGTCAAAGACGGGAAGCCTTACGTGATGTTCGGAGACGGGAAGCTCTGCGCTT
GCAAACCCATCAGCGAGGAGGATTTAGCTTCGTTCATAGCGGACTGCGTGTTGGAAGAGG
AGGAGATCAATAAGGTGTTGCCTATCGGTGGACCAGGGAAGGCGTTGACGCCGTTGGAGC
AAGGGGAGATTCTGTTTAGGATACTAGGGAGAGAGCCCAAGTTCTTGAGAGTGCCTATAG
AGATTATGGACTTTGTGATTGGTGTTCTTGACGGTGTGGCGAAGGTGTTTCCTGGTGTTG
CGGAGGCTGCTGAGTTTGGGAAGATTGGGAGGTACTATGCTGCGGATAGTATGTTGATTC
TTGATCCGGAGACTGGGGAGTATAGTGAGGAGATGACGCCTAGTTATGGGAAGGATACGC
TTGAGGAGTTTTTTGAGAAAGTTGTTAGGGAAGGGATGGCTGGTCAAGAGCTTGGTGAAC
AGTTCTTCTAGTTGGGAGAGAATGTTTCATAAGCTGTGTTAAAAGTGTTGTAACTGTTGA
GGTTATAAAATCTGTGAATTTGAGAGATTTGTGAATCTGAACAATTATGAAACATTATAT
ATCGCAGGTAATTTTTTCCTGGATCAAGA

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 2

CO CL4333Contig1 1061 2 2 U
GGGGACGTATATATTTGGTGCTTGTTGTGCCACTACCGTCTTCATACCATCTTTCCACAA
TTACCGTATTTGGTCTTTCCTCGGCCTTGCCATGACCACTTACACTGCTTGGTACCTCAC
CATCGCCGCATTTCTCCATGGCCAAGCTGAGGGTGTGACACATTCTGGTCCGACCAAACT
TGTACTGTACTTTACCGGAGCCACCAACATTCTCTATACATTTGGCGGGCACGCTGTGAC
TGTGGAAATAATGCATGCGATGTGGAAACCAAGGAAGTTTAAGAGCATCTACCTGATGGC
GACACTGTACGTCTTCACATTAACGCTTCCGTCAGCGTCCGCCGTTTATTGGGCTTTCGG
CGACCAACTTCTCAACCATTCAAATGCTTTCTCTCTCCTCCCTAAAACGCGTTTCCGTGA
TGCCGCCGTCATCCTCATGCTCATCCATCAGTTTATAACGTTTGGATTTGCGTGTACACC
GTTATACTTCGTATGGGAAAAAGCAATAGGAATGCACCACACCAAAAGCATATGTCTAAG
AGCGATCGTGAGGCTGCCGGTGGTGGTTCCCATATGGTTTTTAGCCATTATTTTCCCATT
TTTTTGGTCCCATAAACTCCGCGGTTGGAGCTCTACTCGTTAGCTTCACCGTCTACATCA
TCCCTGCCTTAGCCCATATGCTCACCTACCGCACCGCCTCTGCCCGTCGGAATGCGGCGG
AGAAGCCGCCGTTCTTTTTGCCAAGCTGGAGCGGAGTTTACGTGATAAATGCATTCGTGG
TGGTTTGGGTGCTTGTTCTAGGGTTCGGCTTTGGAGGATGGGCTAGCATGACCAACTTCA
TCAGGCAAATTGACACTTTTGGCCTCTTTGCCAAGTGCTATCAATGCAAGTCGCCGATTC
CTCCTCCTCCTACTCCGGTCACTGGTAGTAATCACCACCGCCGTTAGTGAAGTATTGAAG
TGTGAGCTTCTTCAGTTTTCTTTTGTTTTTCCTATGTATAAAAAGAAACATACCTATATC
AGCAAATTAACAATGCTACATATATAAATTTGAAATTTGGT


BQ
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AF RS1BH22TF U 1
AF RS1BH22JQ C 335
BS 1 702 RS1BH22TF
BS 703 1061 RS1BH22JQ

RD RS1BH22TF 702 0 0
GGGGACGTATATATTTGGTGCTTGTTGTGCCACTACCGTCTTCATACCATCTTTCCACAA
TTACCGTATTTGGTCTTTCCTCGGCCTTGCCATGACCACTTACACTGCTTGGTACCTCAC
CATCGCCGCATTTCTCCATGGCCAAGCTGAGGGTGTGACACATTCTGGTCCGACCAAACT
TGTACTGTACTTTACCGGAGCCACCAACATTCTCTATACATTTGGCGGGCACGCTGTGAC
TGTGGAAATAATGCATGCGATGTGGAAACCAAGGAAGTTTAAGAGCATCTACCTGATGGC
GACACTGTACGTCTTCACATTAACGCTTCCGTCAGCGTCCGCCGTTTATTGGGCTTTCGG
CGACCAACTTCTCAACCATTCAAATGCTTTCTCTCTCCTCCCTAAAACGCGTTTCCGTGA
TGCCGCCGTCATCCTCATGCTCATCCATCAGTTTATAACGTTTGGATTTGCGTGTACACC
GTTATACTTCGTATGGGAAAAAGCAATAGGAATGCACCACACCAAAAGCATATGTCTAAG
AGCGATCGTGAGGCTGCCGGTGGTGGTTCCCATATGGTTTTTAGCCATTATTTTCCCATT
TTTTTGGTCCCATAAACTCCGCGGTTGGAGCTCTACTCGTTAGCTTCACCGTCTACATCA
TCCCTGCCTTAGCCCATATGCTCACCTACCGCACCGCCTCTG

QA 1 702 1 702
DS 

RD RS1BH22JQ 727 0 0
GCGTCCGCCGTTTATTGGGCTTTCGGCGACCAACTTCTCAACCATTCAAATGCTTTCTCT
CTCCTCCCTAAAACGCGTTTCCGTGATGCCGCCGTCATCCTCATGCTCATCCATCAGTTT
ATAACGTTTGGATTTGCGTGTACACCGTTATACTTCGTATGGGAAAAAGCAATAGGAATG
CACCACACCAAAAGCATATGTCTAAGAGCGATCGTGAGGCTGCCGGTGGTGGTTCCCATA
TGGTTTTTAGCCATTATTTTCCCATTTTTTTGGTCCCATAAACTCCGCGGTTGGAGCTCT
ACTCGTTAGCTTCACCGTCTACATCATCCCTGCCTTAGCCCATATGCTCACCTACCGCAC
CGCCTCTGCCCGTCGGAATGCGGCGGAGAAGCCGCCGTTCTTTTTGCCAAGCTGGAGCGG
AGTTTACGTGATAAATGCATTCGTGGTGGTTTGGGTGCTTGTTCTAGGGTTCGGCTTTGG
AGGATGGGCTAGCATGACCAACTTCATCAGGCAAATTGACACTTTTGGCCTCTTTGCCAA
GTGCTATCAATGCAAGTCGCCGATTCCTCCTCCTCCTACTCCGGTCACTGGTAGTAATCA
CCACCGCCGTTAGTGAAGTATTGAAGTGTGAGCTTCTTCAGTTTTCTTTTGTTTTTCCTA
TGTATAAAAAGAAACATACCTATATCAGCAAATTAACAATGCTACATATATAAATTTGAA
ATTTGGT

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

CO CL4334Contig1 810 2 6 U
GGATACAAACTCTCAAAAAAACCTAATCACATACAGAAAGGCGACTCACTCAATTATGAC
GACGAAACTCAAGGTCGCGGGGACATGGGGAGGCATCTTAGAGGTGGAACTCGAGAGCTG
GACTCTCACCATGCTCAGAGACGAAGTAGCTAAACGATCGGGCCTCGATCCTGAATCGAT
CAAACTAATCTGCGCCGGAAAAATCCTCAAAGACGACAATACTAAGACCCTTGCCCAATT
AGGTATCAAGGAAAACTCGAAGATCCTCTCCAGCCGAGGTGCAGCGCCAGATGAAGGCAA
GGCGATCATCGCTGAGGAAGAAAGGTCAAGACGTCTCTCCCGTCTCAAAGCTGCAGCTAC
AGCGTTATCGAAGAGACACGCGGATGGTTCGTTACCGATGGAAGATTATAACATAGAGCT
GGAGGATCAGGGAGGGCAGCAAGTCAAGTTTGGAACAGAGACTGATCAGAGTGCTGCAAT
GATGGGTCTTATGTTGCATGCTAAGGCAAAGAGTTTAATAGAGACGGACATGTATGTTGA
TGCACTTGAAGTTCTTGCCATGGCAGAGGAATCTTTCTTGCTCTGTGATCCCAAGATTCT
CGAGCTTGTTGACAACATCCCTATAATGGAAATCGACATTGTGTGGTGCTATTTCTTGCT
CCAGGACGTCAAATGCCTGGCAGATGCTGGCTTTCGGCTGGAGAAAGCAAGGAAAGGCCT
CGAGCGTGCTCATGGCAAGGACCTCTCTCGTGTCAGACTCCTTCAAGTTGGTCTATGTCC
AGAATTAGCACTATATGTGAGACTGGAGTT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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ACGACAATACTAAGACCCTTGCCCAATTAGGTATCAAGGAAAACTCGAAGATCCTCTCCA
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DS 



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BQ
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ACGAACCAGACGTACTGCGTTGCTGTGGA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1EN55JQ 711 0 0
AGAGGGCGCCTCCGGTTAGTGAAGCTAGCTGGGGG*ATGTTCTATGGGAACTCTACGCCG
GTTTATTTGCTTCACGTGTCTGGAAGTGGGACTTTTTTGGCGAATGATACGACGAACCAG
ACGTACTGCGTTGCTGTGGATGAGGATGGGGTTGATGTGAAGACGCTTCAGGCTGCGTTG
GATTGGGCTTGTGGGCCGGGGAGAGCTAATTGTAGCGAGATTCAGCCTGGGGAGAGTTGT
TATCAGCCGAATGATGTGAAGGGGCATGTCTTCTTTTGCTTTTAATAGTTATTACCAAAA
GGAAGGGAGGGGTTATGGTTCTTGTGACTTTAAAGGTGCTGCAATGATCACTACTACAGA
CCCAAGTCATGGAAGCTGCATTTTCCCAGGAAGCAAGAAGGTGGGAAACCGAACACAAAC
GGTGGTGAATTCAACCCAAGTCGCCGGGAGTGAAGCCTTCTCAAGGAGTCTCTCAAGAGG
CTTCTGCGTTAGTATTATGATTCTTGTAACTTGTATTTTGTTACCTTTCTGGTGATTGTT
CATTTTTCCACGGTGAGTGACAATTCTCTAGGTTCATAAAAGCTGATTTCTATGAAGTTC
TAGATTTATAAACATTCTATTTTATCATTTTTGTGTAATTTGTTGTTTTGTTCATAGACC
ATTTTAGTCTCTTGTAGGGGAGTAATGTTTTAGAATAAAATGCGCCTTCGT

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

CO CL4337Contig1 878 2 2 U
GGAAACAACCGGACAAAATCGGTGCTTGTTGGTCTTCAAGGTGTTGTCAAGAAAGCTGTC
GGTCTCGGTGGTTGGCATTGGCTGGTGTTGACAAATGGAATAGAAGTAAAGTTGCAGAGG
AATGCACTCAGTGTCCTTGAAGCTCCTACTGGAAACGAAGATGACGATGATCTTGATTTC
GAAAACACACTAAGGAATGGTTCTGATATGATTGTTTCTTTTCCAGCATCTGAGGACACA
CTGAAGCCTCATAAGTCGAAGCTAAGAAGGCAGAGATCATCTCGGTCATCTCACAAGACC
CTGAGCAGGTCTTTATCATCTGACTCCCAATCTAAAAGCTCTGCTTTTACTCCCCCTCAG
AACATGATGAAGGTTGATCTTAGCAAACTGGAGATGCCTGCTTTACTGAAATATTGGCAA
CATTTCAACCTTGTGGATGCAATTCCAAATCCATCAAAGGAGCAACTAATTGACATTGTT
CAGAAACACTTTATGTCTCAGCAAATGGATGAGCTTCAAGTTATTATGGGGTTTGTCCAA
GCTGCAAAGAGAGTGAAGAGAGCGTGCAAGTTGCAATCAAAAGAAGAGGCCAGAAACACT
GATCTTAACTGCATCAGCTAAAAAGAAACAAGCCCTGACTTTTATAACACATCCTGTAAG
TACAGTGATGCCAAACTTGTTTAACCAATTTGTGGCTTGTTGCAGCTAGTTTTAGCTCGT
TCCTTCCGGAGATGTTTGGGTAAGGAGTAGAATGTTTTTTCTTCTTGCTTCTTTGTTTAG
CCGTGTAAAAAAAACCACTAAATGACCCTGATTCCAAGAAACATGACTCTCTAAAGCTCC
CAATTCAAATTAATCTATGTTCTGATATTTGGTTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1FB24TF U 1
AF RS1FB24JQ C 285
BS 1 718 RS1FB24TF
BS 719 878 RS1FB24JQ

RD RS1FB24TF 718 0 0
GGAAACAACCGGACAAAATCGGTGCTTGTTGGTCTTCAAGGTGTTGTCAAGAAAGCTGTC
GGTCTCGGTGGTTGGCATTGGCTGGTGTTGACAAATGGAATAGAAGTAAAGTTGCAGAGG
AATGCACTCAGTGTCCTTGAAGCTCCTACTGGAAACGAAGATGACGATGATCTTGATTTC
GAAAACACACTAAGGAATGGTTCTGATATGATTGTTTCTTTTCCAGCATCTGAGGACACA
CTGAAGCCTCATAAGTCGAAGCTAAGAAGGCAGAGATCATCTCGGTCATCTCACAAGACC
CTGAGCAGGTCTTTATCATCTGACTCCCAATCTAAAAGCTCTGCTTTTACTCCCCCTCAG
AACATGATGAAGGTTGATCTTAGCAAACTGGAGATGCCTGCTTTACTGAAATATTGGCAA
CATTTCAACCTTGTGGATGCAATTCCAAATCCATCAAAGGAGCAACTAATTGACATTGTT
CAGAAACACTTTATGTCTCAGCAAATGGATGAGCTTCAAGTTATTATGGGGTTTGTCCAA
GCTGCAAAGAGAGTGAAGAGAGCGTGCAAGTTGCAATCAAAAGAAGAGGCCAGAAACACT
GATCTTAACTGCATCAGCTAAAAAGAAACAAGCCCTGACTTTTATAACACATCCTGTAAG
TACAGTGATGCCAAACTTGTTTAACCAATTTGTGGCTTGTTGCAGCTAGTTTTAGCTC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1FB24JQ 594 0 0
GTCATCTCACAAGACCCTGAGCAGGTCTTTATCATCTGACTCCCAATTTAAAAGCTTTGC
TTTTACTCCCCCTCAGAACATGATGAAGGTTGATCTTAGCAAACTGGAGATGCCTGCTTT
ACTGAAATATTGGCAACATTTCAACCTTGTGGATGCAATTCCAAATCCATCAAAGGAGCA
ACTAATTGACATTGTTCAGAAACACTTTATGTTTCAGCAAATGGATGAGCTTCAAGTTAT
TATGGGGTTTGTCCAAGCTGCAAAGAGAGTGAAGAGAGCGTGCAAGTTGCAATCAAAAGA
AGAGGCCAGAAACACTGATTTTAACTGCATCAGCTAAAAAGAAACAAGCCCTGACTTTTA
TAACACATCCTGTAAGTACAGTGATGCCAAACTTGTTTAACCAATTTGTGGCTTGTTGCA
GCTAGTTTTAGCTCGTTCCTTCCGGAGATGTTTGGGTAAGGAGTAGAATGTTTTTTCTTC
TTGCTTCTTTGTTTAGCCGTGTAAAAAAAACCACTAAATGACCCTGATTCCAAGAAACAT
GACTCTCTAAAGCTCCCAATTCAAATTAATCTATGTTCTGATATTTGGTTTGTC

QA 1 594 1 594
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4339Contig1 1405 2 6 U
GGGCAATCGCAATTATTTCTCAGCCGAGGAGGAGGATTTAAATCTCCGATCACTACTGTC
CGTATTTATATATCCATTCGTGCTTCTTCTGCTTCGAACCTCAGTTTTCCACTGGTCGAA
CATGGAACAGAAGAGATGGGTGTTCTTGCTGGCAATATTTGCTTGTCTTCTTTTCTTTTC
TCGTGGAAGAGTGGCAGTTCTCAAGTGGGAGACTGATGATGATTCACCTGTTTACAACCA
TACACTTGCCTTAACACTTGTGCAGTATACTTCTGCGGTATATATGTCTGATTTAATCGA
ACTCTTCACTTGGACATGTGAAAGATGCAATGGTTTGACTAAGGGTTTCCAAGTGATAGA
GATAATAGTTGATATTGAGCACTGCTTACAGGGATATGTTGGGGTAGCAAAGGATTTGAA
TGCGATTGTCATTGCATTCCGGGGAACTCAAGAACACAGCATACAAAACTGGGTCTCTGA
CTTGTTCTGGAAACAGCTTGATCTAAATTACCCTGATATGCCAGATGCAATGGTTCACCA
TGGCTTCTATAGTGCTTATCACAATACAACGGTACGTCCTGCAGTTTTGGATGCAGTAAA
ACGAGCGAAGAAGTTCTATGGGGAGGACATCAAGATCATGGTGACTGGTCATTCAATGGG
AGGAGCCATGGCTGCCTTTTGTGGACTAGACCTAGTTGTTAATGAAGGATATGAAAACGT
ACAGGTCATGACATTTGGGCAACCTCGTATTGGGAATGCGGCGTTTGCATCTTATTACAG
TTTGCTTGTGCCTAATACCTTCAGAATCACGCATGACCGAGATATTGTTCCTCATCTGCC
TCCTTTCTTTTATCTTTTCCCTCAGAAAACATACCACCACTTCCCTACAGAGGTGTGGGT
GAGAGATCTCAGTGTTTTGAAAATTGTTCGTTTTGGTATTGAGAAAGTTTGTGACAACAC
CGGTGAAGATCCTACTTGCTGCAGATCGGTAATGGGAAGTAGCATATCTGACCATTTAAC
GTACTTTGGAGTGGAGTTGATGTGCGAGACTTGGAGACAATGCAGTATAGTGATGGGCCA
CGAGTTGGAGAGTTACAGCAGAAGAGATTCCAAGGGTAACATATTCCTCTCCCGGACAGA
TCCCTTCCCGGAGGTAACTGAAACGAAAACTCTATCCACAACCACAACCAGAGTCTCCAG
TATTTAGGAGCTGGTTGATGAGAGTGTTGAGCAAGAGTGGAGTGCTTGCCTGGAAGGGAG
AGTTTGGGAGATTCAGAGGTGGAGGACGAAGGGGGGTTCTTTGATTATTTATGGTCGTGT
AAGATAGTGTACAGATAATAAACTAAGACGTTGTAAATAGGTCGTACTCGTCGGTTGATA
TATAAATAAGAAAGCATGTTAAACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CA02TF U 1
AF RS1CA02JQ C 569
BS 1 707 RS1CA02TF
BS 708 708 RS1CA02JQ
BS 709 743 RS1CA02TF
BS 744 744 RS1CA02JQ
BS 745 773 RS1CA02TF
BS 774 1405 RS1CA02JQ

RD RS1CA02TF 773 0 0
GGGCAATCGCAATTATTTCTCAGCCGAGGAGGAGGATTTAAATCTCCGATCACTACTGTC
CGTATTTATATATCCATTCGTGCTTCTTCTGCTTCGAACCTCAGTTTTCCACTGGTCGAA
CATGGAACAGAAGAGATGGGTGTTCTTGCTGGCAATATTTGCTTGTCTTCTTTTCTTTTC
TCGTGGAAGAGTGGCAGTTCTCAAGTGGGAGACTGATGATGATTCACCTGTTTACAACCA
TACACTTGCCTTAACACTTGTGCAGTATACTTCTGCGGTATATATGTCTGATTTAATCGA
ACTCTTCACTTGGACATGTGAAAGATGCAATGGTTTGACTAAGGGTTTCCAAGTGATAGA
GATAATAGTTGATATTGAGCACTGCTTACAGGGATATGTTGGGGTAGCAAAGGATTTGAA
TGCGATTGTCATTGCATTCCGGGGAACTCAAGAACACAGCATACAAAACTGGGTCTCTGA
CTTGTTCTGGAAACAGCTTGATCTAAATTACCCTGATATGCCAGATGCAATGGTTCACCA
TGGCTTCTATAGTGCTTATCACAATACAACGGTACGTCCTGCAGTTTTGGATGCAGTAAA
ACGAGCGAAGAAGTTCTATGGGGAGGACATCAAGATCATGGTGACTGGTCATTCAATGGG
AGGAGCCATGGCTGCCTTTTGTGGACTAGACCTAGTTGTTAATGAAG*ATATGAAAACGT
ACAGGTCATGACATTTGGGCAAC*TCGTATTGGGAATGCGGCGTTTGCATCTT

QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1CA02JQ 837 0 0
ACGGTACGTCCTGCAGTTT*GGATGCAGTAAAACGAGCGAAGAAGTTCTATGGGGAGGAC
ATCAAGATCATGGTGACTG*TCATTCAATGGGAGGAGCCATGGCTGCCTTTTGTGGACTA
GACCTAGTTGTTAATGAAGGATATGAAAACGTACAGGTCATGACATTTGGGCAACCTCGT
ATTGGGAATGCGGCGTTTGCATCTTATTACAGTTTGCTTGTGCCTAATACCTTCAGAATC
ACGCATGACCGAGATATTGTTCCTCATCTGCCTCCTTTCTTTTATCTTTTCCCTCAGAAA
ACATACCACCACTTCCCTACAGAGGTGTGGGTGAGAGATCTCAGTGTTTTGAAAATTGTT
CGTTTTGGTATTGAGAAAGTTTGTGACAACACCGGTGAAGATCCTACTTGCTGCAGATCG
GTAATGGGAAGTAGCATATCTGACCATTTAACGTACTTTGGAGTGGAGTTGATGTGCGAG
ACTTGGAGACAATGCAGTATAGTGATGGGCCACGAGTTGGAGAGTTACAGCAGAAGAGAT
TCCAAGGGTAACATATTCCTCTCCCGGACAGATCCCTTCCCGGAGGTAACTGAAACGAAA
ACTCTATCCACAACCACAACCAGAGTCTCCAGTATTTAGGAGCTGGTTGATGAGAGTGTT
GAGCAAGAGTGGAGTGCTTGCCTGGAAGGGAGAGTTTGGGAGATTCAGAGGTGGAGGACG
AAGGGGGGTTCTTTGATTATTTATGGTCGTGTAAGATAGTGTACAGATAATAAACTAAGA
CGTTGTAAATAGGTCGTACTCGTCGGTTGATATATAAATAAGAAAGCATGTTAAACC

QA 1 837 1 837
DS 



AS 1 2

CO CL4340Contig1 827 2 2 U
GGAATCTATATATCATCAAAAGTCCCTGAAACCATATATAGTACAGTTATTCTTATCGTC
AATTCTCTCTGTCTAGGTAAATGGGTATATTTCCTGGATTTGGTGCCTGGATCAGTCAGA
ACACTGAACAGCCACGAAAATCTCAAAATGTTGAATCCAAGAAAGTGAGAGAGATGAAAA
GTCACGAGGATAGAGATGACACAAAGGAGCAATTAAAACTATGGAGAGAAGCAGAAAAGA
AAAAACAATGGCTTGAACCTTCCCCTAAGGTGACGAAGATGGAAGTAGTGAATGAATTAG
AATGGGGCTATTGCCATATGAAAATGGAATTCGAACTAGGATTGCCACCTCAGGCAGCTA
AAGAAATGTTAATTAATCCAAACAATCTATCATTCACCAGAATTATCAAACACCACGAGA
ATGGGAAGTCGAAAACGGCTGACAAAGTTTTGGCATGGAAGTTCCTTAGGTGGTCGCGAA
CTATCCTGATAGGTGTTCGTGTACCTAAAATCGCAGACCGAAAATCAATTGTTGTACGTT
ATGACATAGAGAAAAAAGACATGATGAGGTTCATGGAAATGTTTGAGGTTAGCTGTACAC
TGGAGTCAATGTATGTAGATTCAAAACGCTTGTGCAAGAACATGAAGCCGAATAGCCGAG
AAGAATACAAAAAATGTAGTGGTGGACAAGGAAAGATTGCGTCAAAGGTGGAACTGGAAA
TGGTTTTTAAGCCTTCATTTTTTTTCAATGTGCCTCCGGTTTTTTGGTCCATTCGCTGGC
TTACTGTCAAGACCATGAAGGATGTGGCCAGAGATTTCCAAATTCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E536TF U 1
AF RS1E536JQ C 483
BS 1 669 RS1E536TF
BS 670 827 RS1E536JQ

RD RS1E536TF 669 0 0
GGAATCTATATATCATCAAAAGTCCCTGAAACCATATATAGTACAGTTATTCTTATCGTC
AATTCTCTCTGTCTAGGTAAATGGGTATATTTCCTGGATTTGGTGCCTGGATCAGTCAGA
ACACTGAACAGCCACGAAAATCTCAAAATGTTGAATCCAAGAAAGTGAGAGAGATGAAAA
GTCACGAGGATAGAGATGACACAAAGGAGCAATTAAAACTATGGAGAGAAGCAGAAAAGA
AAAAACAATGGCTTGAACCTTCCCCTAAGGTGACGAAGATGGAAGTAGTGAATGAATTAG
AATGGGGCTATTGCCATATGAAAATGGAATTCGAACTAGGATTGCCACCTCAGGCAGCTA
AAGAAATGTTAATTAATCCAAACAATCTATCATTCACCAGAATTATCAAACACCACGAGA
ATGGGAAGTCGAAAACGGCTGACAAAGTTTTGGCATGGAAGTTCCTTAGGTGGTCGCGAA
CTATCCTGATAGGTGTTCGTGTACCTAAAATCGCAGACCGAAAATCAATTGTTGTACGTT
ATGACATAGAGAAAAAAGACATGATGAGGTTCATGGAAATGTTTGAGGTTAGCTGTACAC
TGGAGTCAATGTATGTAGATTCAAAACGCTTGTGCAAGAACATGAAGCCGAATAGCCGAG
AAGAATACA

QA 1 669 1 669
DS 

RD RS1E536JQ 345 0 0
ATCCTGATAGGTGTTCGTGTACCTAAAATCGCAGACCGAAAATCAATTGTTGTACGTTAT
GACATAGAGAAAAAAGACATGATGAGGTTCATGGAAATGTTTGAGGTTAGCTGTACACTG
GAGTCAATGTATGTAGATTCAAAACGCTTGTGCAAGAACATGAAGCCGAATAGCCGAGAA
GAATACAAAAAATGTAGTGGTGGACAAGGAAAGATTGCGTCAAAGGTGGAACTGGAAATG
GTTTTTAAGCCTTCATTTTTTTTCAATGTGCCTCCGGTTTTTTGGTCCATTCGCTGGCTT
ACTGTCAAGACCATGAAGGATGTGGCCAGAGATTTCCAAATTCGG

QA 1 345 1 345
DS 



AS 1 2

CO CL4341Contig1 456 2 2 U
GTAAGCGACACCCAAATAGTGCATTATTATTAAGTCGAGAACCAAGAGTATGCAACGATA
CATTGAGCAAGAAACAAATACCAAATCATACAAAACCAAAACACACAAACTTTCGGTGCT
CCGTTTTATTTTCAAGGGTTTATTGGAAAGCAACAGAAAACTAGCGATTCATAAACTTGA
TCATCGATCCAGCCATAGTCCCTTATTGAATTAAGTGGATGGTGCAAGAAGTGGGCGAAT
CAAGTTAGGAACATGAGCCTGGTGATCCTCAAGACGACCCTTAACACTGTCTCCATCCCA
GCGAACAAGTGTTGGCACTCCGGTGACCTTGAATCGAGGATCGACTCTCCACGGATGCAT
CGGATTCCTCCACGTCGGTCTATCTCCGGCGTAAGCCCGAATAAGATTCACTTCCTCCGG
TGATTCCTCTAGAGTCTTGTAAATCACAGGCTCAGC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EU29TF C 1
AF RS1EU29JQ U 3
BS 1 2 RS1EU29TF
BS 3 456 RS1EU29JQ

RD RS1EU29TF 456 0 0
GTAAGCGACACCCAAATAGTGCATTATTATTAAGTCGAGAACCAAGAGTATGCAACGATA
CATTGAGCAAGAAACAAATACCAAATCATACAAAACCAAAACACACAAACTTTCGGTGCT
CCGTTTTATTTTCAAGGGTTTATTGGAAAGCAACAGAAAACTAGCGATTCATAAACTTGA
TCATCGATCCAGCCATAGTCCCTTATTGAATTAAGTGGATGGTGCAAGAAGTGGGCGAAT
CAAGTTAGGAACATGAGCCTGGTGATCCTCAAGACGACCCTTAACACTGTCTCCATCCCA
GCGAACAAGTGTTGGCACTCCGGTGACCTTGAATCGAGGATCGACTCTCCACGGATGCAT
CGGATTCCTCCACGTCGGTCTATCTCCGGCGTAAGCCCGAATAAGATTCACTTCCTCCGG
TGATTCCTCTAGAGTCTTGTAAATCACAGGCTCAGC

QA 1 456 1 456
DS 

RD RS1EU29JQ 454 0 0
AAGCGACACCCAAATAGTGCATTATTATTAAGTCGAGAACCAAGAGTATGCAACGATACA
TTGAGCAAGAAACAAATACCAAATCATACAAAACCAAAACACACAAACTTTCGGTGCTCC
GTTTTATTTTCAAGGGTTTATTGGAAAGCAACAGAAAACTAGCGATTCATAAACTTGATC
ATCGATCCAGCCATAGTCCCTTATTGAATTAAGTGGATGGTGCAAGAAGTGGGCGAATCA
AGTTAGGAACATGAGCCTGGTGATCCTCAAGACGACCCTTAACACTGTCTCCATCCCAGC
GAACAAGTGTTGGCACTCCGGTGACCTTGAATCGAGGATCGACTCTCCACGGATGCATCG
GATTCCTCCACGTCGGTCTATCTCCGGCGTAAGCCCGAATAAGATTCACTTCCTCCGGTG
ATTCCTCTAGAGTCTTGTAAATCACAGGCTCAGC

QA 1 454 1 454
DS 



AS 1 2

CO CL4342Contig1 830 2 4 U
GGGTGCATGCACACGATCTCCGACCCTCTGTATTGTAACTGAGTTTATGGCTCGGGGGAG
CATTTATGATTACTTGCACGAACAGAAATGCGCTTTCAAACTACAAACTTTGCTTAAAGT
TGCACTTGATGTCGCGAAAGGGATGTGCTATCTGCATCAAAACAATATCATTCACAGGGA
CCTTAAGACTGCAAATCTTCTTATGGATGGACACGGACTTGTCAAGGTTGCTGATTTTGG
AGTTGCCAGGGTACAGATTGAGTCAGGGGTCATGACAGCTGAAACAGGGACTTATCGATG
GATGGCTCCAGAGGTCATTGAACACAAACCTTACAGTCACAAAGTAGATGTGTTCAGTTA
TGCGATAGTGCTATGGGAACTTTTGACTGGTGATATACCATATGCTTTCTTGACTCCACT
ACAAGCGGCTGTTGGCGTTGTTCAGAAGGGGCTTAGACCAAAAATTCCAAAGAAGACACA
CCCAAAAGTGAAGGGACTTCTAGAGAGATGCTGGCAGCAAGAGCCGAAGGAAAGGCCAGA
CTTTGAGGAAATCATAGAAATGATTCAACAGATAATGATTGAGGTAAACGTCGTACCGTG
ATGATCCATCCCCTTACAAGGCGAGATTTCTCAGAGAAAGGAAGTGGTGGTAAAAACAAG
CAGGTTGGAGCATGCAAGCCGTCTACAAAGCCACGTTACTAGTTCTGATCATTCACTCTC
TTACATTTTGATCGTACAGTTTTCTCTATTTTTTCTTTTAGTTGGTTGGTGTGGCTAACT
GAGAGGACCTTGTTTTCACCGTATAGTGTTTTCTCCTTTTAGCTGCTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GR72TF U 1
AF RS1GR72JQ C 296
BS 1 663 RS1GR72TF
BS 664 664 RS1GR72JQ
BS 665 730 RS1GR72TF
BS 731 830 RS1GR72JQ

RD RS1GR72TF 730 0 0
GGGTGCATGCACACGATCTCCGACCCTCTGTATTGTAACTGAGTTTATGGCTCGGGGGAG
CATTTATGATTACTTGCACGAACAGAAATGCGCTTTCAAACTACAAACTTTGCTTAAAGT
TGCACTTGATGTCGCGAAAGGGATGTGCTATCTGCATCAAAACAATATCATTCACAGGGA
CCTTAAGACTGCAAATCTTCTTATGGATGGACACGGACTTGTCAAGGTTGCTGATTTTGG
AGTTGCCAGGGTACAGATTGAGTCAGGGGTCATGACAGCTGAAACAGGGACTTATCGATG
GATGGCTCCAGAGGTCATTGAACACAAACCTTACAGTCACAAAGTAGATGTGTTCAGTTA
TGCGATAGTGCTATGGGAACTTTTGACTGGTGATATACCATATGCTTTCTTGACTCCACT
ACAAGCGGCTGTTGGCGTTGTTCAGAAGGGGCTTAGACCAAAAATTCCAAAGAAGACACA
CCCAAAAGTGAAGGGACTTCTAGAGAGATGCTGGCAGCAAGAGCCGAAGGAAAGGCCAGA
CTTTGAGGAAATCATAGAAATGATTCAACAGATAATGATTGAGGTAAACGTCGTACCGTG
ATGATCCATCCCCTTACAAGGCGAGATTTCTCAGAGAAAGGAAGTGGTGGTAAAAACAAG
CAG*TTGGAGCATGCAAGCCGTCTACAAAGCCACGTTACTAGTTCTGATCATTCACTCTC
TTACATTTTG

QA 1 730 1 730
DS 

RD RS1GR72JQ 535 0 0
CGATGGATGGCTCCAGAGGTCATTGAACACAAACCTTACAGTCACAAAGTAGATGTGTTC
AGTTATGCGATAGTGCTATGGGAACTTTTGACTGGTGATATACCATATGCTTTCTTGACT
CCACTACAAGCGGCTGTTGGCGTTGTTCAGAAGGGGCTTAGACCAAAAATTCCAAAGAAG
ACACACCCAAAAGTGAAGGGACTTCTAGAGAGATGCTGGCAGCAAGAGCCGAAGGAAAGG
CCAGACTTTGAGGAAATCATAGAAATGATTCAACAGATAATGATTGAGGTAAACGTCGTA
CCGTGATGATCCATCCCCTTACAAGGCGAGATTTCTCAGAGAAAGGAAGTGGTGGTAAAA
ACAAGCAGGTTGGAGCATGCAAGCCGTCTACAAAGCCACGTTACTAGTTCTGATCATTCA
CTCTCTTACATTTTGATCGTACAGTTTTCTCTATTTTTTCTTTTAGTTGGTTGGTGTGGC
TAACTGAGAGGACCTTGTTTTCACCGTATAGTGTTTTCTCCTTTTAGCTGCTCTT

QA 1 535 1 535
DS 



AS 1 2

CO CL4343Contig1 979 2 2 U
GGACCCGAAAACATGGCATCTTATTACAGATTCCAATCTGGGTTTTGTCCTCTCTCGCCG
TGTCCCTCTCTTATTGATAACTTCGTCGAACGGATCAAAGACGCTTGTCATTTCCTCGTC
TCCGCTGTTCTTGGCACCATCGTATCTGTGATCTTAACCTTCTTCTTCTCCCTAGTGGGC
ACATTGTTAGGGGCACTTACAGGAGCTTTGATAGGCCAAGAAACAGAGAGCGGGTTCATC
AGAGGAGCAGCCATTGGTGCCATTTCCGGAGCTGTTTTCTCCATAGAGGTCTTTGAATCA
TCCCTCGATCTTTGGAAATCTGATGAGTCTTGTTTCGGGTGCCTTCTCTACTTGATTGAT
GTCATTGTTAGTCTTTTGAGCGGGAGACTCGTAAGGGAGCGCATAGGTCCTGCAATGCTA
AGCGCAGTGCAAAGTCAAATGGGAGCTTTGGATGCATCCTATGACGATCTCTCGAGCCTA
TTCGAGACAGGAGGCCCAAAGGGTCTAACAGGAGACCTTGTTGAGAAGATCCCAAAGTTG
ACTATCACTGGCAACAACAACACAGATGCATCAGAGAGCAGAGACTCCTGTTCTGTTTGT
CTTCAGGATTTCCAGCTAGGTGAAACAGTAAGAAGCTTGCCTCATTGTCATCACATGTTC
CACTTACCTTGCATAGACAAATGGCTCCTTAGGCACGGTTCTTGTCCCATGTGTAGACGT
GACCTCTGATTCTCTCTTCATCGTCCATCTCTCATAATGCAATCAAACCGTGCAGCTCAT
GTACGTCTACACACAGCACTTAGCACCTAATCTGGTGCTCCTCTCAACTTTCATGTAAAG
TACAACACTTTTTTTTATTTTGCTTTGACCATTACACACCCCTTAATATAGGATACCGTC
ATAATGTAATGTTTAGTCAGCAGATGTATATAAGAAACGCAAAAAAAAGAAGAGTTTTCT
ACTTTCTCTTTGTCAAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BO39TF U 1
AF RS1BO39JQ C 217
BS 1 688 RS1BO39TF
BS 689 979 RS1BO39JQ

RD RS1BO39TF 688 0 0
GGACCCGAAAACATGGCATCTTATTACAGATTCCAATCTGGGTTTTGTCCTCTCTCGCCG
TGTCCCTCTCTTATTGATAACTTCGTCGAACGGATCAAAGACGCTTGTCATTTCCTCGTC
TCCGCTGTTCTTGGCACCATCGTATCTGTGATCTTAACCTTCTTCTTCTCCCTAGTGGGC
ACATTGTTAGGGGCACTTACAGGAGCTTTGATAGGCCAAGAAACAGAGAGCGGGTTCATC
AGAGGAGCAGCCATTGGTGCCATTTCCGGAGCTGTTTTCTCCATAGAGGTCTTTGAATCA
TCCCTCGATCTTTGGAAATCTGATGAGTCTTGTTTCGGGTGCCTTCTCTACTTGATTGAT
GTCATTGTTAGTCTTTTGAGCGGGAGACTCGTAAGGGAGCGCATAGGTCCTGCAATGCTA
AGCGCAGTGCAAAGTCAAATGGGAGCTTTGGATGCATCCTATGACGATCTCTCGAGCCTA
TTCGAGACAGGAGGCCCAAAGGGTCTAACAGGAGACCTTGTTGAGAAGATCCCAAAGTTG
ACTATCACTGGCAACAACAACACAGATGCATCAGAGAGCAGAGACTCCTGTTCTGTTTGT
CTTCAGGATTTCCAGCTAGGTGAAACAGTAAGAAGCTTGCCTCATTGTCATCACATGTTC
CACTTACCTTGCATAGACAAATGGCTCC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RS1BO39JQ 763 0 0
CAAGAAACAGAGAGCGGGTTCATCAGAGGAGCAGCCATTGGTGCCATTTCCGGAGCTGTT
TTCTCCATAGAGGTCTTTGAATCATCCCTCGATCTTTGGAAATCTGATGAGTCTTGTTTC
GGGTGCCTTCTCTACTTGATTGATGTCATTGTTAGTCTTTTGAGCGGGAGACTCGTAAGG
GAGCGCATAGGTCCTGCAATGCTAAGCGCAGTGCAAAGTCAAATGGGAGCTTTGGATGCA
TCCTATGACGATCTCTCGAGCCTATTCGAGACAGGAGGCCCAAAGGGTCTAACAGGAGAC
CTTGTTGAGAAGATCCCAAAGTTGACTATCACTGGCAACAACAACACAGATGCATCAGAG
AGCAGAGACTCCTGTTCTGTTTGTCTTCAGGATTTCCAGCTAGGTGAAACAGTAAGAAGC
TTGCCTCATTGTCATCACATGTTCCACTTACCTTGCATAGACAAATGGCTCCTTAGGCAC
GGTTCTTGTCCCATGTGTAGACGTGACCTCTGATTCTCTCTTCATCGTCCATCTCTCATA
ATGCAATCAAACCGTGCAGCTCATGTACGTCTACACACAGCACTTAGCACCTAATCTGGT
GCTCCTCTCAACTTTCATGTAAAGTACAACACTTTTTTTTATTTTGCTTTGACCATTACA
CACCCCTTAATATAGGATACCGTCATAATGTAATGTTTAGTCAGCAGATGTATATAAGAA
ACGCAAAAAAAAGAAGAGTTTTCTACTTTCTCTTTGTCAAGGC

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

CO CL4344Contig1 1090 2 2 U
GGGGCAGAGAGATACGAAGAGAATCACTAAAAAAAGAATATTCCGATGACCGGAGAATTC
GAACTCGGAAACAGTTACCAGATCTGCGACGAGATCGGCCGAGGCCGATTCGGAACGATC
ACTCGCTGTTTCTCTCCCGCGACGAAACAATTCTACGCGTGCAAAACGATCGACAAGCGC
GTGCTCGTCGACGCTCTCGATCGCGAGTGCATAACGACGGAGCCGAGGATCATGGCGATG
CTGCCGCCGCATCCGAACATCGTCAGGATCCACGACCTCTTCGAGACGGAGGACGCTCTC
GCGATCGTCATGGAGCTGGTCGATCCGCCGACGACGATCTACGATCGGCTGATCTCCGCC
GCCGGAGGGAGGCTAACGGAATCGGAAGCAGCCTCGTACGCGAGGAAGATCCTCCGCGCG
GTGGCTCACTGCCACCGCCGCGGCGTGGTGCACCGCGACGTGAAGCCTGACAACGTGCTG
GTCGATCTCGGGAGCGGTGGCGTTAAGCTCTGCGATTTCGGATCGGCGGTGTGGCTCGGC
GGAGAGAAAACGGAGACGGCGGAGGGAGTGGTGGGGGACGCCGTACTATTTAGCGCCGGA
GGTTGTGATGGGGGTGGAGGTACGGTGAGAAGGTGGATGTGTGGAGCGTTGGTGTTGTGA
TATACACTATGCTGGCTGGAGAGCCGCCGTTTAAGGGAGAGACGGCGGAGGAGATATTCG
AGACGATTCTGAGAGAGAATCTTAGGTTTCCACGGAAGGTGTTTGGATCTGTATCGGTAG
AAGCTAAGGATCTGTTGAGGAGAATGATTTGTCGCGATGTTTCCCGGAGATTTTCAGCAG
AAGATGCTCTTCGCCATGCATGGATCATGAACGTGGGAAACATACAAAGCAATTAATCTT
TCTGGTTTCGATATGAATAGATCTTTGATTTGATTAGAGTTAAAGAGTATATATGTGCTC
TCCGTTTCGAGTAATCAAACGTACGTAGCTGTGTTTTAATAATCCTACGGTTTGGCTTCG
GCATTAGAGAGACTGTGTAGCTTGAGAATATTTTGTAACGATATCGGAATAAAATGACTT
TTGAGAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C317TF U 1
AF RS1C317JQ C 193
BS 1 696 RS1C317TF
BS 697 1090 RS1C317JQ

RD RS1C317TF 699 0 0
GGGGCAGAGAGATACGAAGAGAATCACTAAAAAAAGAATATTCCGATGACCGGAGAATTC
GAACTCGGAAACAGTTACCAGATCTGCGACGAGATCGGCCGAGGCCGATTCGGAACGATC
ACTCGCTGTTTCTCTCCCGCGACGAAACAATTCTACGCGTGCAAAACGATCGACAAGCGC
GTGCTCGTCGACGCTCTCGATCGCGAGTGCATAACGACGGAGCCGAGGATCATGGCGATG
CTGCCGCCGCATCCGAACATCGTCAGGATCCACGACCTCTTCGAGACGGAGGACGCTCTC
GCGATCGTCATGGAGCTGGTCGATCCGCCGACGACGATCTACGATCGGCTGATCTCCGCC
GCCGGAGGGAGGCTAACGGAATCGGAAGCAGCCTCGTACGCGAGGAAGATCCTCCGCGCG
GTGGCTCACTGCCACCGCCGCGGCGTGGTGCACCGCGACGTGAAGCCTGACAACGTGCTG
GTCGATCTCGGGAGCGGTGGCGTTAAGCTCTGCGATTTCGGATCGGCGGTGTGGCTCGGC
GGAGAGAAAACGGAGACGGCGGAGGGAGTGGTGGGGGACGCCGTACTATTTAGCGCCGGA
GGTTGTGATGGGGGTGGAGGTACGGTGAGAAGGTGGATGTGTGGAGCGTTGGTGTTGTGA
TATACACTATGCTGGCTGGAGAGCCGCCGTTTAAGG
AGA

QA 1 696 1 696
DS 

RD RS1C317JQ 898 0 0
GCTCTCGATCGCGAGTGCATA*CGACG*AGC*GAGGATCATGGCGATGCTGCCGCCGCAT
CCGAACATCGTCAGGATCCACGACCTCT*CGAGACGGAGGACGCTCTCGCGATCGTCATG
GAGCTGGTCGATCCGC*GACGACGATCTACGATCGGCTGATCTCCGCCGCCGGAGGGAGG
CTAACGGAATCGGAAGCAGCCTCGTACGCGAGGAAGATCCTCCGCGCGGTGGCTCACTGC
CACCGCCGCGGCGTGGTGCACCGCGACGTGAAGCCTGACAACGTGCTGGTCGATCTCGGG
AGCGGTGGCGTTAAGCTCTGCGATTTCGGATCGGCGGTGTGGCTCGGCGGAGAGAAAACG
GAGACGGCGGAGGGAGTGGTGGGG*ACGCCGTACTATTTAGCGCCGGAGGTTGTGATGGG
G*TGGAGGTACGGTGAGAAGGTGGATGTGTGGAGCGTTGGTGTTGTGATATACACTATGC
TGGCTGGAGAGCCGCCGTTTAAGGGAGAGACGGCGGAGGAGATATTCGAGACGATTCTGA
GAGAGAATCTTAGGTTTCCACGGAAGGTGTTTGGATCTGTATCGGTAGAAGCTAAGGATC
TGTTGAGGAGAATGATTTGTCGCGATGTTTCCCGGAGATTTTCAGCAGAAGATGCTCTTC
GCCATGCATGGATCATGAACGTGGGAAACATACAAAGCAATTAATCTTTCTGGTTTCGAT
ATGAATAGATCTTTGATTTGATTAGAGTTAAAGAGTATATATGTGCTCTCCGTTTCGAGT
AATCAAACGTACGTAGCTGTGTTTTAATAATCCTACGGTTTGGCTTCGGCATTAGAGAGA
CTGTGTAGCTTGAGAATATTTTGTAACGATATCGGAATAAAATGACTTTTGAGAGACC

QA 1 898 1 898
DS 



AS 1 2

CO CL4345Contig1 1311 2 6 U
GAAATGCTTGTCTTGTCTAGTTTTAATATAATGTTTATGTTATTGTCATTCAAAAAAAAT
TAATATAATTGTAAAGAACCAACTATCACCACTATGTTAGGAATAATAAAATTTTAACCA
AAAACTTTAATTCCTTTAAAAGCATTTCTATTCCCTTAAAAGAATAAGTTGATACCCCCA
CCTAATCCAAATAAATCTATTTTTGTTTTGGAAACTCATTAATTATATACTATTCATTAC
ATAACAGAGAATAACTTTTAATATTTTAACATATGGACGTTGGCCAAATAATTCTATATA
AATGGGAGAGTATATGTATTATCTATATAAACACACAAGATCAAAACAACATGTTCTCCT
GTATACTAAACTCAGAAGAAAAAGGTAAATATAATACAAAATTTTTTAATTAGTGGAAAA
TTTACAAATAAAAATACTCTGTTGATTAACTAAATGTTAAACTGATTTTAAATTCTTTTT
TATGTGTTGGTTCTTTAGTGAGATCTAAAGATATTTGATCAAAGAATATTGCATCTTCAA
GAAATATAAAAAATGGCAATCAAGAATTCCTTTTCTCTTCTACTATCTTCATTTATGGTG
TTTGCTCTGATCTGCATACCCACAATTTCAGGTAATGTACCTAGGGCATTTTTCAAATAT
GACCCCCTAAAAATATTTAGAAAAATAAAATTAAAAATGAATCTAAATATTTTATTTCAA
TAGTGAAAAATGTAATATTTTTGTTCATTAAAATTATCTAAAGTTATGATATTCTTTAAA
CTTAAGGTAGAATCAGTTTTAGTTAGAAAACTATTTAAAATTTTCAAAATATGTAACAAA
ATTTTGTGATTTTTTTTTAGAAAAATAGATATATTCAAGGAAGATATTTTTATTTTTAAA
AATAGATAGATCTAACGAAAATACATTTGTTATATTAAAATTATTTTTTTCTTCCTTCAG
AATATATTTTAAGGGTACTGTTATTTTCTTACTATCAAAATTATTTTTTTTCAAAATTTA
TATTTTTTTAAAACCACATCATATATAAATATACTTGATTCTTTAAAATTATTTTAAAAA
ATTTATAAATGTTTCCTTCTTTTACATATGTTATTTGGAAAAGGGAAACTTCTAATTAAC
AGAAATTATAAAAATAAAAAAAAGTTAAATCTATTTCAATAATGATAATTAGAAATAATA
TTTTAATGCATTAAAGATACTTATGTAATTAACCATCATATGAACTAATCTAAGAACTAA
TGTGAATACAACATGTAGGAAACTGATGTTCAAATAATATAAGAGAGGTCG


BQ
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AF RS1E544TF U 1
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TATGTGTTGGTTCTTTAGTGGGATCTAAAGATATTTGATCAAAGAATATTGCATCTTCAA
GAAATATAAAAAATGGCAATCAAGAATTCCTTTTCTCTTCTACTATCTTCATTTATGGTG
TTTGCTCTGATCTGCATACCCACAATTTCAG*TAATGTACCTAGGGCATTTTTCAAATAT
GACCCC
TAAAATATTTAGAA

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DS 

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TT
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TTCAAGAAATATAAAAAATGGCAATCAAGAATTCCTTTTCTCTTCTACTATCTTCATTTA
TGGTGTTTGCTCTGATCTGCATACCCACAATTTCAGGTAATGTACCTAGGGCATTTTTCA
AATATGACCCCCTAAAAATATTTAGAAAAATAAAATTAAAAATGAATCTAAATATTTTAT
TTCAATAGTGAAAAATGTAATATTTTTGTTCATTAAAATTATCTAAAGTTATGATATTCT
TTAAACTTAAGGTAGAATCAGTTTTAGTTAGAAAACTATTTAAAATTTTCAAAATATGTA
ACAAAATTTTGTGATTTTTTTTTAGAAAAATAGATATATTCAAGGAAGATATTTTTATTT
TTAAAAATAGATAGATCTAACGAAAATACATTTGTTATATTAAAATTATTTTTTTCTTCC
TTCAGAATATATTTTAAGGGTACTGTTATTTTCTTACTATCAAAATTATTTTTTTTCAAA
ATTTATATTTTTTTAAAACCACATCATATATAAATATACTTGATTCTTTAAAATTATTTT
AAAAAATTTATAAATGTTTCCTTCTTTTACATATGTTATTTGGAAAAGGGAAACTTCTAA
TTAACAGAAATTATAAAAATAAAAAAAAGTTAAATCTATTTCAATAATGATAATTAGAAA
TAATATTTTAATGCATTAAAGATACTTATGTAATTAACCATCATATGAACTAATCTAAGA
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QA 3 838 3 838
DS 



AS 1 2

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AGTCATATGGTTTCAGATCGAGGTTACATTGTGAAATGGGCACCACAGAAGGAAGTACTT
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ATCGGGGAAGCAGTTCCAATGATCTGCAAGCCGTTTTCTGGTTATCCAAAGGTGAATGCG
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GCGGTGGAGAGAGCTGTGAAGAGGTTAATGGTGGGCGAGGAAGGAGAGGAGATGAGGAAG
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TCTACATAATTCACCATGCCTTGCCAGTGAAACAGAAGGTTAAAAAAGCTTATGCTAAAG
AAACCAATGGATGAATAACTTGTGTTGTATTAAGAAATAAATGTACTTTTTCTATTCC


BQ
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AF RS1DW85TF U 1
AF RS1DW85JQ C 493
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BS 680 1198 RS1DW85JQ

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CTCGAGATTTCTCCACCGACTTTCAGTTTGTCACCATACCAGAAAGCTTACCGGAGTCTG
AGTTCAAGAATCTCGGGCCAATACGGTTTCTGCATAAGCTCAACAAAGAGTGTCAGGTGA
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TCTACAACGAGTTCATGTACTTTGCTGAAGCTGCAGCCAAAGAGTTGTATTGAATGGTTG
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AGTCATATGGTTTCAGATC

QA 1 679 1 679
DS 

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ACCATGCCTTGCCAGTGAAACAGAAGGTTAAAAAAGCTTATGCTAAAGAAACCAATGGAT
GAATAACTTGTGTTGTATTAAGAAATAAATGTACTTTTTCTATTCC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

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CGAGATTTTTGTTAATGATCAAGACCAAACTAAGATTACTTTTGCTAATCCGACGGGACT
GTCACGTACTTTCCCCGTCACTGCTTTTGAGGAGGAAGAGAAGTGATTTGTCAACGGTCT
TGAACTTTGCTTTTATTTAGCCATGTTTTGTGTTCGTTCCTTCTCTTTGCTTAGCCATCT
TTCTAGTTATAATAATGATGAAATAATGTTATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AZ22TF U 1
AF RS1AZ22JQ C 77
BS 1 574 RS1AZ22TF

RD RS1AZ22TF 574 0 0
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CTTATCGACCATGAATCTCCCCAGAGGACTTCTCCCTTTGGACAATATGACAGAGATCGG
TCACAACAAAACAACCGGTTACATCTGGATCAAGATCAACAAGAACGTTCAGCATCGGTT
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CGAGATTTTTGTTAATGATCAAGACCAAACTAAGATTACTTTTGCTAATCCGACGGGACT
GTCACGTACTTTCCCCGTCACTGCTTTTGAGGAGGAAGAGAAGTGATTTGTCAACGGTCT
TGAACTTTGCTTTTATTTAGCCATGTTTTGTGTTCGTTCCTTCTCTTTGCTTAGCCATCT
TTCTAGTTATAATAATGATGAAATAATGTTATAG

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DS 

RD RS1AZ22JQ 498 0 0
ATT
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CCCAGAGGACTTTTCCCTTTGGACAATATGACAGAGATCGGTCACAACAAAACAACCGGT
TACATTTGGATCAAGATCAACAAGAACGTTCAGCATCGGTTCAAGGCGATCGGAAGAAAC
GTATCATATGACTCGGAGGTCACTGCGTTCGTGGAGAACCGTCGGATGGGTAGTCTTACG
GGGATCAAGAGCAAAGAGCTTTTTCTTTGGGTTACGATTTCCGAGATTTTTGTTAATGAT
CAAGACCAAACTAAGATTACTTTTGCTAATCCGACGGGACTGTCACGTACTTTCCCCGTC
ACTGCTTTTGAGGAGGAAGAGAAGTGATTTGTCAACGGTCTTGAACTTTGCTTTTATTTA
GCCATGTTTTGTGTTCGTTCCTTCTCTTTGCTTAGCCATCTTTCTAGTTATAATAATGAT
GAAATAATGTTATAG

QA 4 498 4 498
DS 



AS 1 2

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AACCTGAGCCTAGAGCATTACAACGTCGACGCAGAAGAGGGACAAGGAGAAGATGACTGT
GATCCAAAAGCAGGAAAGGAAGGTATAAGGCTCGATCTTACGCTAGCAGAATATGATTAT
AGTCAACCACAGCACAATCAAGAACTCAACCTCATCGACAACTTAGACGCGAGTGAAGCC
ACTCCGAGTTATAAAGGGTCAACTTCCACTGCGCAGAAGCTCTTCTCATGCAACTACTGT
CAAAGAACATTCTACAGCTCACAGGCCCTTGGTGGTCACCAAAACGCTCACAAAAGAGAG
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CATGTCCCGTTCCACGGCCAGTATAGCAACAGATCATTGGGTATTCAGGCCCACTCAATG
AGTCACAAGCTAAGTTCATACAACGCCTTTGGTGCTGGTGAGTATGGTCAGTTCAACTGG
TCAAGGATACCGTTAGCTCAGCAACCAGCCATAGGTAGACTATCTTCAACAGAGAGTCGT
CATCAGATGATGTTTCCACCACCGTTGACTTCAACAAGTGAAAACTTCGGTAGGTTCGAT
GCAGGAACGATTCCAGTAGATTCTGAAGAGGATCAGCAGAAGAACCTTGACTTGTCCCTC
AAACTCTGAGATTCTTGTCTCTTCAATTGTTTTTGTTTGTGCTGGTTTTTTGTTGTCATT
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CTAGCATAGATTTATGTTGTACATGTTTCCATATTTTGTACAAATTTTCAGCTAGACATC
AAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 

AF RS1H570TF U 1
AF RS1H570JQB C 204
BS 1 674 RS1H570TF
BS 675 963 RS1H570JQB

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CATGTCCCGTTCCACGGCCAGTATAGCAACAGATCATTGGGTATTCAGGCCCACTCAATG
AGTCACAAGCTAAGTTCATACAACGCCTTTGGTGCTGGTGAGTATGGTCAGTTCAACTGG
TCAAGGATACCGTTAGCTCAGCAACCAGCCATAGGTAGACTATCTTCAACAGAGAGTCGT
CATCAGATGATGTT
CACACGTGACTC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1H570JQB 760 0 0
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GGCCCTTGGTGGTCACCAAAACGCTCACAAAAGAGAGAGGACTTTGGCTAAGCGAGGGAA
ACAGATGGAAGCTTTCGGCCATTCATATGGTTTTGCTCATGTCCCGTTCCACGGCCAGTA
TAGCAACAGATCATTGGGTATTCAGGCCCACTCAATGAGTCACAAGCTAAGTTCATACAA
CGCCTTTGGTGCTGGTGAGTATGGTCAGTTCAACTGGTCAAGGATACCGTTAGCTCAGCA
ACCAGCCATAGGTAGACTATCTTCAACAGAGAGTCGTCATCAGATGATGTTTCCACCACC
GTTGACTTCAACAAGTGAAAACTTCGGTAGGTTCGATGCAGGAACGATTCCAGTAGATTC
TGAAGAGGATCAGCAGAAGAACCTTGACTTGTCCCTCAAACTCTGAGATTCTTGTCTCTT
CAATTGTTTTTGTTTGTGCTGGTTTTTTGTTGTCATTGATATGTTCACCAGTATTATCCA
AGGGTGTTAGTAAGTATTCTTGTGAATAATATTTTGTCTAGCATAGATTTATGTTGTACA
TGTTTCCATATTTTGTACAAATTTTCAGCTAGACATCAAT

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

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ACGACATACACACCGCTATTACAATTCATACAGTTATGATATATGCCAGACACAGTCACA
CATACCCATGCTAATTTACTTCCACACATCAAAGTTGTTTGTTTATCAGCATTTCCACCT
TTCTTTTTCACAATTTGTGATGTTTCTTTGTTATATTATTTAGAATTTGTGTTTATGGAT
CCATGCATGTGTGTATGGCATAACTTATACACCGATTTTGTTTAACCATATTGTAAAAGA
AAAAGTATGTTTTTTACCAAAAGAAAGAAAAAAGCAAAGATATGGCATTTC


BQ
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AF RS1DE27JQ C 1
AF RS1DE27TF U 1
BS 1 471 RS1DE27TF

RD RS1DE27JQ 471 0 0
TTTTTCTCATCTCTTCTCTTCTTGATAATGTTTTCCTCTCGCCCGTTTAAACACTTCAAA
AGAGGGCAATTTTATTTTCTAATTAATAGCTAGGATTGATGTAAGATTTGCATATCTACA
TGGATCTATTTCTGTGCTGGTTCTGAGAGGCTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTAATCAT
ACGACATACACACCGCTATTACAATTCATACAGTTATGATATATGCCAGACACAGTCACA
CATACCCATGCTAATTTACTTCCACACATCAAAGTTGTTTGTTTATCAGCATTTCCACCT
TTCTTTTTCACAATTTGTGATGTTTCTTTGTTATATTATTTAGAATTTGTGTTTATGGAT
CCATGCATGTGTGTATGGCATAACTTATACACCGATTTTGTTTAACCATATTGTAAAAGA
AAAAGTATGTTTTTTACCAAAAGAAAGAAAAAAGCAAAGATATGGCATTTC

QA 1 471 1 471
DS 

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TTTTTCTCATCTCTTCTCTTCTTGATAATGTTTTCCTCTCGCCCGTTTAAACACTTCAAA
AGAGGGCAATTTTATTTTCTAATTAATAGCTAGGATTGATGTAAGATTTGCATATCTACA
TGGATCTATTTCTGTGCTGGTTCTGAGAGGCTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTAATCAT
ACGACATACACACCGCTATTACAATTCATACAGTTATGATATATGCCAGACACAGTCACA
CATACCCATGCTAATTTACTTCCACACATCAAAGTTGTTTGTTTATCAGCATTTCCACCT
TTCTTTTTCACAATTTGTGATGTTTCTTTGTTATATTATTTAGAATTTGTGTTTATGGAT
CCATGCATGTGTGTATGGCATAACTTATACACCGATTTTGTTTAACCATATTGTAAAAGA
AAAAGTATGTTTTTTACCAAAAGAAAGAAAAAAGCAAAGATATGGCATTTC

QA 1 471 1 471
DS 



AS 1 2

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ACGGAGCAACAAGGCGGAAGAACCATTTTGTCTTTCGGTCGGAACGAGACCCTCTTTTTG
TTCTCCGGCCAAAGATATGGGAACCGGAGGGAAAACGTTCAACGCTCACGTGATCCCGGC
CACGTATCATCACAAGCACGTGCGTCCTATGGCCGGCGACGACTCTGATCTCCGGAGAGG
CATCGGAGAGCTTCTTTCGCGGTGGGGAGGGCTTCAGATGGCCGTGAAGAATAAGTGGGG
AGGCAACGATTCTCTCGAGAAATCTCATGAGCTTGCTCACGATCTTTTGCATCTATTGTC
TCGATCAAATGTGATAACGGTGGATGAGATAGAGAGTTTTCTACATGAGAGCTTGCTTCT
TTCTTTCAACACAGAGATGGAAGATGGCAGCATTGAAGAGGTAGCTGAACAATTGATGAT
ACTCCTTGAAGAGATATGTTTGCGTGGGAATCATTAAGCCAAAGATATCTACAGTTTGAA
TGGATTAATTAGTTTTGGTGGACTATTTGATTGTCCTTTTTGTATAATGTAAGATATAAA
TATGACAACTTGGTGGATGACATGATGTGATTAATCAGACATTTTAGAATATATGAATCC
AAGTTTATGTTTATTTGATATGTAAGCATTCGTAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1G192TF U 1
AF RS1G192JQ C 224
BS 1 694 RS1G192TF
BS 695 696 RS1G192JQ

RD RS1G192TF 694 0 0
TTTTTTCTTTCTCTTTTGTGTTCCCATACGCAAAATCTTCCGGTATCTGTTCTCCGTTAA
ACGGAGCAACAAGGCGGAAGAACCATTTTGTCTTTCGGTCGGAACGAGACCCTCTTTTTG
TTCTCCGGCCAAAGATATGGGAACCGGAGGGAAAACGTTCAACGCTCACGTGATCCCGGC
CACGTATCATCACAAGCACGTGCGTCCTATGGCCGGCGACGACTCTGATCTCCGGAGAGG
CATCGGAGAGCTTCTTTCGCGGTGGGGAGGGCTTCAGATGGCCGTGAAGAATAAGTGGGG
AGGCAACGATTCTCTCGAGAAATCTCATGAGCTTGCTCACGATCTTTTGCATCTATTGTC
TCGATCAAATGTGATAACGGTGGATGAGATAGAGAGTTTTCTACATGAGAGCTTGCTTCT
TTCTTTCAACACAGAGATGGAAGATGGCAGCATTGAAGAGGTAGCTGAACAATTGATGAT
ACTCCTTGAAGAGATATGTTTGCGTGGGAATCATTAAGCCAAAGATATCTACAGTTTGAA
TGGATTAATTAGTTTTGGTGGACTATTTGATTGTCCTTTTTGTATAATGTAAGATATAAA
TATGACAACTTGGTGGATGACATGATGTGATTAATCAGACATTTTAGAATATATGAATCC
AAGTTTATGTTTATTTGATATGTAAGCATTCGTA

QA 1 694 1 694
DS 

RD RS1G192JQ 473 0 0
TCTGATCTCCGGAGAGGCATCGGAGAGCTTCTTTCGCGGTGGGGAGGGCTTCAGATGGCC
GTGAAGAATAAGTGGGGAGGCAACGATTCTCTCGAGAAATCTCATGAGCTTGCTCACGAT
CTTTTGCATCTATTGTCTCGATCAAATGTGATAACGGTGGATGAGATAGAGAGTTTTCTA
CATGAGAGCTTGCTTCTTTCTTTCAACACAGAGATGGAAGATGGCAGCATTGAAGAGGTA
GCTGAACAATTGATGATACTCCTTGAAGAGATATGTTTGCGTGGGAATCATTAAGCCAAA
GATATCTACAGTTTGAATGGATTAATTAGTTTTGGTGGACTATTTGATTGTCCTTTTTGT
ATAATGTAAGATATAAATATGACAACTTGGTGGATGACATGATGTGATTAATCAGACATT
TTAGAATATATGAATCCAAGTTTATGTTTATTTGATATGTAAGCATTCGTAAT

QA 1 473 1 473
DS 



AS 1 2

CO CL4351Contig1 604 2 2 U
CTTTTGTATGTATCTGTTCCTGTTCTCTTCATCTTCTTCTTTCTCTTCACTCTCATTTCT
CTATCTCTCCCATCTCTCTCCAGATTGAAAGTTTACCAATTTCTCTCATGTTTTTTTTTT
TTTTTAGATTTGGTCAACAGATAACATATGAAGATGATACTGGAGGTGACGAAAACTCGC
TGGTGAAGAAAACTCGTCGGTGACGAACGCCGGAGCTCACCGGAGATGATGCACATCGAA
AAGTAACCGGGCGCATGGAGAGGAACCAATGTAAATGAGGCAGAAGAAGAAGATGTATGG
TAGTGGTGCTTAGGGAAGAATGGTGTGCTAGAGGAGTTGAAGGAGCTCGACAGTGAAGAG
TTAGTAGAAGAAGTGTGACAGAGGAGGACACAGAAGAAGCTTTCCGGAGCTGGTGGTGGA
GGAACTGGTGGCGACCATGCGGGAGGAGGAGGAGAAAGCGGCGGCTTAGGGTTAGGATAG
GTTTTTGGTTTAATAGGTCTGGTTTAGTGTGTTTTGGTTTTTACTTAATTTTATTTTAGT
CTGGTTAAGTTTTGTAAACCGGATTCTATTTGTAAACCAATTTAAATTATAAATAAAATT
TAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1B711TF U 1
AF RS1B711JQ C 126
BS 1 281 RS1B711TF
BS 282 604 RS1B711JQ

RD RS1B711TF 281 0 0
CTTTTGTATGTATCTGTTCCTGTTCTCTTCATCTTCTTCTTTCTCTTCACTCTCATTTCT
CTATCTCTCCCATCTCTCTCCAGATTGAAAGTTTACCAATTTCTCTCATGTTTTTTTTTT
TTTTTAGATTTGGTCAACAGATAACATATGAAGATGATACTGGAGGTGACGAAAACTCGC
TGGTGAAGAAAACTCGTCGGTGACGAACGCCGGAGCTCACCGGAGATGATGCACATCGAA
AAGTAACCGGGCGCATGGAGAGGAACCAATGTAAATGAGGC

QA 1 281 1 281
DS 

RD RS1B711JQ 479 0 0
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AAGAAGACTCGTCGGTGACGAACGCCGGAGCTCACCGGAGATGATGCACATCGAAGAGTA
ACCGGGCGCATGGAGAGGAACCAATGTAAATGAGGCAGAAGAAGAAGATGTATGGTAGTG
GTGCTTAGGGAAGAATGGTGTGCTAGAGGAGTTGAAGGAGCTCGACAGTGAAGAGTTAGT
AGAAGAAGTGTGACAGAGGAGGACACAGAAGAAGCTTTCCGGAGCTGGTGGTGGAGGAAC
TGGTGGCGACCATGCGGGAGGAGGAGGAGAAAGCGGCGGCTTAGGGTTAGGATAGGTTTT
TGGTTTAATAGGTCTGGTTTAGTGTGTTTTGGTTTTTACTTAATTTTATTTTAGTCTGGT
TAAGTTTTGTAAACCGGATTCTATTTGTAAACCAATTTAAATTATAAATAAAATTTAAT

QA 1 479 1 479
DS 



AS 1 2

CO CL4352Contig1 407 2 1 U
GCAACATTGCATCGTTATGGGAACACATCTTCCTCTTCATTGTGGTATGAGTTGCAATAC
CTTGAGGCTAAAAGTAGAATGAAAAATGGAGATAGGGTTTGGCAGATTGGGTTTGGAAGT
GGCTTTAAGGCTAACACTGCTGTCTGGAAATGCATCTCCGAGACTGATTCAAAAGACCGA
AATGCATGGTCTGATCGAATCCACTTGTATCCGGTTTGTGGAGATGCTTCAAGTGATTTG
AAAACATAGCTCCTTTCTTGACACTGCTTCACAGAATATATAGTTTATCGAACCCTTCAC
ATTCACTTTAGTTTGCTGAAGGAATGTTTCTGCAGCTGCTCTTAACATTCACTCAAAGAG
TCTTGAGCATCTTCATGCACTGTAGGAAAAAAACTTTCCTTATTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1GT75TF U 1
AF RS1GT75JQ C 34
BS 1 407 RS1GT75TF

RD RS1GT75TF 407 0 0
GCAACATTGCATCGTTATGGGAACACATCTTCCTCTTCATTGTGGTATGAGTTGCAATAC
CTTGAGGCTAAAAGTAGAATGAAAAATGGAGATAGGGTTTGGCAGATTGGGTTTGGAAGT
GGCTTTAAGGCTAACACTGCTGTCTGGAAATGCATCTCCGAGACTGATTCAAAAGACCGA
AATGCATGGTCTGATCGAATCCACTTGTATCCGGTTTGTGGAGATGCTTCAAGTGATTTG
AAAACATAGCTCCTTTCTTGACACTGCTTCACAGAATATATAGTTTATCGAACCCTTCAC
ATTCACTTTAGTTTGCTGAAGGAATGTTTCTGCAGCTGCTCTTAACATTCACTCAAAGAG
TCTTGAGCATCTTCATGCACTGTAGGAAAAAAACTTTCCTTATTCTC

QA 1 407 1 407
DS 

RD RS1GT75JQ 374 0 0
TCTTCATTGTGGTATGAGTTGCAATCCCTTGAGGCTAAAAGTAGAATGAAAAATGGAGAT
AGGGTTTGGCAGATTGGGTTTGGAAGTGGCTTTAAGGCTACCACTGCTGTCTGGAAATGC
ATTTCCGAGACTGATTCAAAAGACCGAAATGCATGGTCTGATCGAATCCACTTGTATCCG
GTTTGTGGAGATGCTTCAAGTGATTTGAAAACATAGCTCCTTTCTTGACACTGCTTCACA
GAATATATAGTTTATCGAACCCTTCACATTCACTTTAGTTTGCTGAAGGAATGTTTCTGC
AGCTGCTCTTAACATTCACTCAAAGAGTCTTGAGCATCTTCATGCACTGTAGGAAAAAAA
CTTTCCTTATTCTC

QA 1 374 1 374
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4354Contig1 891 2 4 U
GGATCGTTCGTTCGATATTGAAGAAACGAAATCTAACGGAGGAGATGATGACAGTGCCGT
GCAATTTCTGCGAATTCTCATCCAGCAGCAGCAGCAGCAGGAGCAGATATGGATGCATCT
TTGAAGAAGAAGGTCTAGATGAAGCAGCAGTGCAGCTCCGGAAAGAAGTCGAGAAATTAC
GACTTTTGATCAAGAGAATGAATGGTAAAGACGAATGTGCTAGCTTCACCGAGCTGACAG
AACTTATAAGTCATCTACGCAGTGTCCAGTGCGTTGTACTGAGCCAACAGGAGAAGGTAA
AGCTAGAAGAAGCTGAAAGGCTGCGCAATGAGAACAAGGAAGCTGAAGCTGAAGCTGGCC
GTGCAAGGAGAGGGGTTTTGGTACCCTGCAACTCCACTATCGGCAGCTCTAAAGAAAATC
AGGAGAAACAAAGCCATGGATCACATCTGCTGAGAATGAAGAGAAATTTTGAGAGGCGAA
ACGCTGAATCCTTTCAGAGCGAGCTTGATAGATTGTGGCTTTTGAACGAGAGGATGAATG
GTAGAAAGCTTCAGGGTATGACTTCCATTGACCTGGCCTACCTTCACTCAAACATATCAT
GTGCTTTGGTGGCTTTGATGGGCCAAACTTCGGGACCAAGAATGGAACAAATGGCCATGC
AGCACCAAGAGGTACCAATCTCTAGGTTGGCTGAGCGCAAGAGATGTTCATCCACTCCCT
TGCAGTTTAGACTTCTTCTCGTCTCAAGAAAGCTCAGAAGATTCCACTACTAAGAGGAGA
GCAAGCAGCCAATCCCCCTTCTTAGTTTTAATAATATTTTATCTTTTATGTAACTGTCTG
ATCAAACCTAGACAATCTCAGGGTTACATTTTTTTTTTTTATTATGTACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1H081TF U 1
AF RS1H081JQB C 553
BS 1 685 RS1H081TF
BS 686 686 RS1H081JQB
BS 687 744 RS1H081TF
BS 745 891 RS1H081JQB

RD RS1H081TF 744 0 0
GGATCGTTCGTTCGATATTGAAGAAACGAAATCTAACGGAGGAGATGATGACAGTGCCGT
GCAATTTCTGCGAATTCTCATCCAGCAGCAGCAGCAGCAGGAGCAGATATGGATGCATCT
TTGAAGAAGAAGGTCTAGATGAAGCAGCAGTGCAGCTCCGGAAAGAAGTCGAGAAATTAC
GACTTTTGATCAAGAGAATGAATGGTAAAGACGAATGTGCTAGCTTCACCGAGCTGACAG
AACTTATAAGTCATCTACGCAGTGTCCAGTGCGTTGTACTGAGCCAACAGGAGAAGGTAA
AGCTAGAAGAAGCTGAAAGGCTGCGCAATGAGAACAAGGAAGCTGAAGCTGAAGCTGGCC
GTGCAAGGAGAGGGGTTTTGGTACCCTGCAACTCCACTATCGGCAGCTCTAAAGAAAATC
AGGAGAAACAAAGCCATGGATCACATCTGCTGAGAATGAAGAGAAATTTTGAGAGGCGAA
ACGCTGAATCCTTTCAGAGCGAGCTTGATAGATTGTGGCTTTTGAACGAGAGGATGAATG
GTAGAAAGCTTCAGGGTATGACTTCCATTGACCTGGCCTACCTTCACTCAAACATATCAT
GTGCTTTGGTGGCTTTGATGGGCCAAACTTCGGGACCAAGAATGGAACAAATGGCCATGC
AGCACCAAGAGGTACCAATCTCTAG*TTGGCTGAGCGCAAGAGATGTTCATCCACTCCCT
TGCAGTTTAGACTTCTTCTCGTCT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1H081JQB 339 0 0
AGGGTATGACTTCCATTGACCTGGCCTACCTTCACTCAAACATATCATGTGCTTTGGTGG
CTTTGATGGGCCAAACTTCGGGACCAAGAATGGAACAAATGGCCATGCAGCACCAAGAGG
TACCAATCTCTAGGTTGGCTGAGCGCAAGAGATGTTCATCCACTCCCTTGCAGTTTAGAC
TTCTTCTCGTCTCAAGAAAGCTCAGAAGATTCCACTACTAAGAGGAGAGCAAGCAGCCAA
TCCCCCTTCTTAGTTTTAATAATATTTTATCTTTTATGTAACTGTCTGATCAAACCTAGA
CAATCTCAGGGTTACATTTTTTTTTTTTATTATGTACTG

QA 1 339 1 339
DS 



AS 1 2

CO CL4355Contig1 472 2 1 U
GGACACAAATTGAATCGCTGCCCTAAGTCCGTTGCAACTGAATCTCGATGGTTTACATAG
TTTCCTGGGACGAGTTCGTTGATCGATCTGTTCAGCTTTTCCGAGCTGATCCCGATTCCG
CTCGGTATGTGGTCAAGTACAGACACTGCGATGGCAAACTGGTTCTCAAGGTTACTGATA
ACAAAGAGTGTCTCAAGTTCAAGACAGACCAAGCACAAGAAGCGAAGAAGATGGAGAAAC
TGAATAACATATTTTTCACACTCATGGCCAGAGGACCTGATGTTGATCTCTCTGAAGTCA
CCGGGAAAGAACCTATGGAGACGCAGCCTGCCAAGAAAGGAAGAGGAAGGAAGCAATAAG
TCTCTGTGAATCTGTTTTTTCTTTTCTTTTCCTCATATTTGGTGTCAAGATTTTTCATCC
ATTTTTTTGTTAAATATTTTGAGATGTTTTTTTAATAGTTACTTTTGCGTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DG73JQ C 1
AF RS1DG73TF U 1
BS 1 472 RS1DG73TF

RD RS1DG73JQ 472 0 0
GGACACAAATTGAATCGCTGCCCTAAGTCCGTTGCAACTGAATCTCGATGGTTTACATAG
TTTCCTGGGACGAGTTCGTTGATCGATCTGTTCAGCTTTTCCGAGCTGATCCCGATTCCG
CTCGGTATGTGGTCAAGTACAGACACTGCGATGGCAAACTGGTTCTCAAGGTTACTGATA
ACAAAGAGTGTCTCAAGTTCAAGACAGACCAAGCACAAGAAGCGAAGAAGATGGAGAAAC
TGAATAACATATTTTTCACACTCATGGCCAGAGGACCTGATGTTGATCTCTCTGAAGTCA
CCGGGAAAGAACCTATGGAGACGCAGCCTGCCAAGAAAGGAAGAGGAAGGAAGCAATAAG
TCTCTGTGAATCTGTTTTTTCTTTTCTTTTCCTCATATTTGGTGTCAAGATTTTTCATCC
ATTTTTTTGTTAAATATTTTGAGATGTTTTTTTAATAGTTACTTTTGCGTTT

QA 1 472 1 472
DS 

RD RS1DG73TF 472 0 0
GGACACAAATTGAATCGCTGCCCTAAGTCCGTTGCAACTGAATCTCGATGGTTTACATAG
TTTCCTGGGACGAGTTCGTTGATCGATCTGTTCAGCTTTTCCGAGCTGATCCCGATTCCG
CTCGGTATGTGGTCAAGTACAGACACTGCGATGGCAAACTGGTTCTCAAGGTTACTGATA
ACAAAGAGTGTCTCAAGTTCAAGACAGACCAAGCACAAGAAGCGAAGAAGATGGAGAAAC
TGAATAACATATTTTTCACACTCATGGCCAGAGGACCTGATGTTGATCTCTCTGAAGTCA
CCGGGAAAGAACCTATGGAGACGCAGCCTGCCAAGAAAGGAAGAGGAAGGAAGCAATAAG
TCTCTGTGAATCTGTTTTTTCTTTTCTTTTCCTCATATTTGGTGTCAAGATTTTTCATCC
ATTTTTTTGTTAAATATTTTGAGATGTTTTTTTAATAGTTACTTTTGCGTTT

QA 1 472 1 472
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4357Contig1 671 2 3 U
TTCATAAAAGGCCTTCCTTTCGTTGAACAGTCTTATAAGCGTCAATGAAGAAACAAATGT
TTCTCTTTTTAAATATGAATAAGCATTGCTACTGATACGTTTTTTTCAGCTTACATAGAT
TGATATAAATCGGAGAATACATGTTCTTGGATCTTAGCATCTAGGTTTGTGTGACTACAG
ACTTGCACTTGATATAAAACATAACCGTGCATGCATTGTAAAACCCCAAAAAAAAAAAAA
GTATACTTGTCATCTTATTACTTATTCTATTCACTAGTTGTGTTTTGGGACTTTGGGACT
TTAAACCCATATGGCTCCGGCTCTTCTTAACAATGCGGCTAGTTGGTTCTTGACTTGGAA
AGTCATTACCTGGTTAGCCCCGCCTATTAGCTGTTCCCCTATGAACACCGCTGGTACACT
CGACTTACACCCCATCTGTGTTAACGCCTTCTCTATCTCCTTCCCGTTAGACAACTGATC
GAGCTCGTACACTGTCATCTTTGCCCCAAATCCGGAGATGAGTGTTTGAATTGAGTGGCT
CATGCAGCAGGAGCTTTTGCTGAAAACCACCACTGGTTTGTCTGCTACTAAATCTCTAAT
GCTTTCCATTTGGTCACGTACGTATATAGAGTGTGAGAAATGTGAGTGAGAAGGAACTTG
AGGATCTCTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ED37JQ U 213
AF RS1ED37TF C 1
BS 1 212 RS1ED37TF
BS 213 427 RS1ED37JQ
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ATGCGGCTAGTTGGTTCTTGACTTGGAAAGTCATTACCTGGTTAGCCCCGCCTATTAGCT
GTTCCCCTATGAACACCGCTGGTACACTCGACTTA

QA 1 215 1 215
DS 

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TTCTCTTTTTAAATATGAATAAGCATTGCTACTGATACGTTTTTTTCAGCTTACATAGAT
TGATATAAATCGGAGAATACATGTTCTTGGATCTTAGCATCTAGGTTTGTGTGACTACAG
ACTTGCACTTGATATAAAACATAACCGTGCATGCATTGTAGAAGCCCAGAAAAAGAAAAA
GTATACTTGTCATCTTATTACTTATTCTATTCACTAGTTGTGTTTTGGGACTTTGGGACT
TTAAACCCATATGGCTCCGGCTCTTCTTAGCAATGCGGCTAGTTGGTTCTTGACTTGGAG
AGTCATTACCTGGTTAGCCCCGCCTATTAGCTGTTCCCCTATGAACACCGCTGGTACACT
CGACTTACACCCCATCTGTGTTAACGCCTTCTCTATCTCCTTCCCGTTAGACAACTGATC
GAGCTCGTACACTGTCATCTTTGCCCCAAATCCGGAGATGAGTGTTTGAATTGAGTGGCT
CATGCAGCAGGAGCTTTTGCTGAAAACCACCACTGGTTTGTCTGCTACTAAATCTCTAAT
GCTTTCCATTTGGTCACGTACGTATATAGAGTGTGAGAAATGTGAGTGAGAAGGAACTTG
AGGATCTCTGT

QA 1 671 1 671
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGAAAACATAAGAAATTCAATTATAAACACCTTCTTCGGAACCCAGGAGACCTAATTTTG
TATAACATAGCCGCTTTTCGAAAACCTATCTAAGCAGATCTTCTCAACTTGTCTCCAATG
GAGGAATACGCGACCACCAAAGGGATGAGTCTGCTGACATTGAATGAAAGTGATGCTAAG
AAAATCAGACCAAAAAACAGCTACATTGGGAGGATTCGTGTGAAGGGATATAACACTGAC
CTTCCCCATGATGATGTAGTAAACGCCTTGAGAAAACATTTCTCTTCATGTGGAGAGATC
ACTGATGTTTACATCAGCGTACTACCCAATAATACTCTCCACAGTTTTGGTTTTGTTTAT
TTTCTCGGAGAAGGGGCAGTGGACAAGGCCTTGCAGCTTAGTGGACGTGACATGGGTGGA
TGGAATGTCATTGCTGATCCTCATCCGTTTCCGGAAGATGCAGACTGCCGACCTGTGTTA
GCAGTTCAAGGATATGACACTAGTCTTAGTAAGACTGATATCAAGAAAGTGTTGACTAGA
CATTTCTCTTCATGTGGAAAGGTCACCAAAATCCGGATTCACAAGCGCATTGGTGCAGCT
GCCGTGTATGTTTATGGAGAATGTGCGGAAGAAAAGGTGCTGAATCTTGATGGGAGCTTC
ATTGGAGAACACAAAATAATTGTTAAGCTTATTAGTGCGCGGAGAATATACACCGTCCAC
CCTCGTTGTCGTCATCGCTGTCCTATCCAAGAATGCTAAGATGACTTCTGAAGAGTAGAA
AAGCTGTCGGATCTACTGGGAGAAGACAAAGACAATCTCTAATTTTTTGTATCTTTGTGA
AATAAATGCAAACCTTCTATCTAGTACTTTTTATGCTTTTTTTTTCTTTTGGACTTCAAA
GTAAACTCTAATAATCGTCTTCTGCTTTCATTGGAACTTTTACGTATTGTATTTTTATTT
TTCAAGCTTTAAACTAAAATCTTAATAATCATGTGCGCAATAATCAATATGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1F784TF U 1
AF RS1F784JQ C 249
BS 1 716 RS1F784TF
BS 717 1014 RS1F784JQ

RD RS1F784TF 716 0 0
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TATAACATAGCCGCTTTTCGAAAACCTATCTAAGCAGATCTTCTCAACTTGTCTCCAATG
GAGGAATACGCGACCACCAAAGGGATGAGTCTGCTGACATTGAATGAAAGTGATGCTAAG
AAAATCAGACCAAAAAACAGCTACATTGGGAGGATTCGTGTGAAGGGATATAACACTGAC
CTTCCCCATGATGATGTAGTAAACGCCTTGAGAAAACATTTCTCTTCATGTGGAGAGATC
ACTGATGTTTACATCAGCGTACTACCCAATAATACTCTCCACAGTTTTGGTTTTGTTTAT
TTTCTCGGAGAAGGGGCAGTGGACAAGGCCTTGCAGCTTAGTGGACGTGACATGGGTGGA
TGGAATGTCATTGCTGATCCTCATCCGTTTCCGGAAGATGCAGACTGCCGACCTGTGTTA
GCAGTTCAAGGATATGACACTAGTCTTAGTAAGACTGATATCAAGAAAGTGTTGACTAGA
CATTTCTCTTCATGTGGAAAGGTCACCAAAATCCGGATTCACAAGCGCATTGGTGCAGCT
GCCGTGTATGTTTATGGAGAATGTGCGGAAGAAAAGGTGCTGAATCTTGATGGGAGCTTC
ATTGGAGAACACAAAATAATTGTTAAGCTTATTAGTGCGCGGAGAATATACACCGT

QA 1 716 1 716
DS 

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TTACATCAGCGTACTACCCAATAATACTCTCCACAGTTTTGGTTTTGTTTATTTTCTCGG
AGAAGGGGCAGTGGACAAGGCCTTGCAGCTTAGTGGACGTGACATGGGTGGATGGAATGT
CATTGCTGATCCTCATCCGTTTCCGGAAGATGCAGACTGCCGACCTGTGTTAGCAGTTCA
AGGATATGACACTAGTCTTAGTAAGACTGATATCAAGAAAGTGTTGACTAGACATTTCTC
TTCATGTGGAAAGGTCACCAAAATCCGGATTCACAAGCGCATTGGTGCAGCTGCCGTGTA
TGTTTATGGAGAATGTGCGGAAGAAAAGGTGCTGAATCTTGATGGGAGCTTCATTGGAGA
ACACAAAATAATTGTTAAGCTTATTAGTGCGCGGAGAATATACACCGTCCACCCTCGTTG
TCGTCATCGCTGTCCTATCCAAGAATGCTAAGATGACTTCTGAAGAGTAGAAAAGCTGTC
GGATCTACTGGGAGAAGACAAAGACAATCTCTAATTTTTTGTATCTTTGTGAAATAAATG
CAAACCTTCTATCTAGTACTTTTTATGCTTTTTTTTTCTTTTGGACTTCAAAGTAAACTC
TAATAATCGTCTTCTGCTTTCATTGGAACTTTTACGTATTGTATTTTTATTTTTCAAGCT
TTAAACTAAAATCTTAATAATCATGTGCGCAATAATCAATATGTTC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

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CGATCTTGATCTCAGTTCCGGTTTTCTTGTCTGGTTCTCGCTTTTATCGGCTCAAGGTTC
CCAGCGGGAGTCCCATCACGACTCTATTCAAGGTCTTAACCGCTGCTTTATACGCTAAGT
ATAAGAAAAGAACTTCAAGAAACGATGTTACGTGTCATACAAGAAACGAATGCAACGACG
ATATAGGCAAGGGAAACGCAGATAGAGATGAAGAGATTCTTGGATCATTCCTCGATGAAG
CTGTGAGAGAGCGTGAATCCTTACCTAGACTGCTCCGTTGCACGGAGGAACAAGTCAAAG
ACGTGAAGATAGCCATCAAGACTTTACCAATTTTCATGTCTACCATTATGCTAAACTGCT
GTCTAGCTCAGCTCTCGACTTTCTCCATCCAACAAGCTTCGACGATGAACACGAAGCTCG
GGTCGTTAACCGTCCCACCTGCAGCATTACCTGTATTCCCAGTCGTCTTCACAATGATCT
TAGCTCCAACGTACAACCACCTCCTCCTCCCTCTCGCTAGAAAAACAACCAAAACCGAAA
CAGGCGTAACCCATCTCCAACGCATTGGAACAGGACTCGTCCTCTCTGTATTAGCAATGG
CCGTCGCAGCCTTGGTCGAAATGAAACGCAAGCTTGTTGTTAAAGAGGTTACTTGCTGCT
CAAGCAACAACGCACCTTTCTCTTATTCTTATTCTTCGCCGCTTCCTATAACGTTTCTTT
GGATAGCTTTACAATATTCGTTTCTTGGATCAGCGGATCTCTTCACTTTAGCAGGTATGA
TGGAGTTTTTCTTCACCGAAGCTCCTTCAACGATGCGTTCCCTTGCGACCTCGCTCTCTT
GGACGTCTCTTGCCATGGGATATCACTTGAGCTCTGTTCTTATCTCGGCTGTTAATTTCG
TCACGGGTTTGAACCAACACAAGCCTTGGCTTTTGGGGAGGAATCTGAACGAGTACCATC
TCGAGAGGTTTTACTGGCTCATGTGTGTGCTTAGTGGGATTAATTTCTTGCATTATCTCT
TTTGGGCTAAGCGTTATACGTACCGGTTCAACCAAAGCTAGCATGAACTAATTAATTGTA
TAGGGAACCTTGTTGTCTGTTAAATTAGCAAATCCATTATGGCTAGGGTATGATATCTTG
GAGAATAAGTTATT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CG81TF U 1
AF RS1CG81JQ C 455
BS 1 733 RS1CG81TF
BS 734 734 RS1CG81JQ
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BS 775 775 RS1CG81JQ
BS 776 789 RS1CG81TF
BS 790 1154 RS1CG81JQ

RD RS1CG81TF 791 0 0
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CCAGCGGGAGTCCCATCACGACTCTATTCAAGGTCTTAACCGCTGCTTTATACGCTAAGT
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ATATAGGCAAGGGAAACGCAGATAGAGATGAAGAGATTCTTGGATCATTCCTCGATGAAG
CTGTGAGAGAGCGTGAATCCTTACCTAGACTGCTCCGTTGCACGGAGGAACAAGTCAAAG
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GTCTAGCTCAGCTCTCGACTTTCTCCATCCAACAAGCTTCGACGATGAACACGAAGCTCG
GGTCGTTAACCGTCCCACCTGCAGCATTACCTGTATTCCCAGTCGTCTTCACAATGATCT
TAGCTCCAACGTACAACCACCTCCTCCTCCCTCTCGCTAGAAAAACAACCAAAACCGAAA
CAGGCGTAACCCATCTCCAACGCATTGGAACAGGACTCGTCCTCTCTGTATTAGCAATGG
CCGTCGCAGCCTTGGTCGAAATGAAACGCAAGCTTGTTGTTAAAGAGGTTACTTGCTGCT
CAAGCAACAACGCACCTTTCTCTTATTCTTATTCTTCGCCGCTTCCTATAACGTTTCTTT
GGATAGCTTTACA*TATTCGTTTCTTGGATCAGCGGATCTCTTCACTTTAGCAG*TATGA
TGGAGTTTT
CT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RS1CG81JQ 700 0 0
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CGCTAGAAAAACAACCAAAACCGAAACAGGCGTAACCCATCTCCAACGCATTGGAACAGG
ACTCGTCCTCTCTGTATTAGCAATGGCCGTCGCAGCCTTGGTCGAAATGAAACGCAAGCT
TGTTGTTAAAGAGGTTACTTGCTGCTCAAGCAACAACGCACCTTTCTCTTATTCTTATTC
TTCGCCGCTTCCTATAACGTTTCTTTGGATAGCTTTACAATATTCGTTTCTTGGATCAGC
GGATCTCTTCACTTTAGCAGGTATGATGGAGTTTTTCTTCACCGAAGCTCCTTCAACGAT
GCGTTCCCTTGCGACCTCGCTCTCTTGGACGTCTCTTGCCATGGGATATCACTTGAGCTC
TGTTCTTATCTCGGCTGTTAATTTCGTCACGGGTTTGAACCAACACAAGCCTTGGCTTTT
GGGGAGGAATCTGAACGAGTACCATCTCGAGAGGTTTTACTGGCTCATGTGTGTGCTTAG
TGGGATTAATTTCTTGCATTATCTCTTTTGGGCTAAGCGTTATACGTACCGGTTCAACCA
AAGCTAGCATGAACTAATTAATTGTATAGGGAACCTTGTTGTCTGTTAAATTAGCAAATC
CATTATGGCTAGGGTATGATATCTTGGAGAATAAGTTATT

QA 1 700 1 700
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4362Contig1 1041 2 4 U
GGATACTAAGAAGAGCTTCTCTCTCATTTCATCATCTCCCCTTGCCGTTGACTCATCTTC
TTCCTCTCTCGCCGTCCCTTGCTTCTTCTCTCGGATTCCACGGTTCCTGAATCTTCGAAT
CGCCACAAGTTTTAAATCAACAACCTCCATGCATCATCCTCGGAGTCTAACGTCTCCACT
CGCCGCCCTAATGTTTCCGGAAAACTCAGTGCTCTCAGATGTCTGCGCGACTGGAATCTC
CGGCGTCGTCGCGTTCTCGTGCCTCGGTTTCTGGGGAGAGATTGGCAAGCGCGGCATCTT
CGACCAGAAACTCATCAGGAAGCTTGTGCACATAAACATTGGCCTTGTTTTTATGCTTTG
CTGGCCGCTCTTCAGTTCTGGACTCCAAGGAGCGCTTTTCGCTTCTCTTATACCTGGACT
AAATATAATAAGGATGCTGCTCCTGGGCCTTGGTGTCTACCAAGACGAAGGAACTATCAA
GTCTATGAGCAGACACGGTGATCGCAGGGAACTACTCAAGGGACCGCTTTATTATGCACT
CTCCATCACATCGGCGTGTATCTTCTATTGGAAGACATCTCCAATAGCCATTGCAGTGAT
ATGCAACCTCTGTGCTGGAGATGGCATGGCTGACATTGTTGGGAGACGACTTGGAACAGA
GAAGCTTCCTTACAACAGAAACAAATCATTAGCTGGTAGCATTGGGATGGCGATCGCAGG
GTTCTCAGCATCCGTTGCGTATATGTATTACTTTGCTTCATTTGGTTACATTGAGAATAG
TGGGTGGGATATGATTCTTCGCTTCTTCATCATCTCTATAGCATCGGCTTTTGTGGAATC
ACTCCCGATAAGCACTGACATTGATGACAATCTTACCGTTTCCTTAACAACTGCATTGGT
CGGTACTCTACTCTTCTAATAGCAGCACTGAGTCTCTTCCCCATGCATCATCAACTACAG
AGTCATCGAGTTTGACTGCCTCTGAAGTAATCTAAATTCTTAGTTCCCACTTGTTAGTGA
TACCTCATATTGTTGTTGTAG


BQ
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AF RS1GG87TF U 1
AF RS1FM34TF U 240
BS 1 261 RS1GG87TF
BS 262 262 RS1FM34TF
BS 263 453 RS1GG87TF
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RD RS1GG87TF 462 0 0
GGATACTAAGAAGAGCTTCTCTCTCATTTCATCATCTCCCCTTGCCGTTGACTCATCTTC
TTCCTCTCTCGCCGTCCCTTGCTTCTTCTCTCGGATTCCACGGTTCCTGAATCTTCGAAT
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CGCCGCCCTAATGTTTCCGGAAAACTCAGTGCTCTCAGATGTCTGCGCGACTGGAATCTC
CGGCGTCGTCGCGTTCTCGTGTCTCGGTTTCTGGGGAGAGATTGGCAAGCGCGGCATCTT
CGACCAGAAACTCATCAGGAAGCTTGTGCACATAAACATTGGCCTTGTTTTTATGCTTTG
CTGGCCGCTCTTCAGTTCTGGACTCCAAGGAGCGCTTTTCGCTTCTCTTATACCTGGACT
AAATATAATAAGGATGCTGCTCCTGGGCCTTGG
AGTTTACCA

QA 1 453 1 453
DS 

RD RS1FM34TF 802 0 0
G
CGGCGTCGTCGCTTTCTCGTGCCTCGGTTTCTGGGGAGAGATTGGCAAGCGCGGCATCTT
CGACCAGAAACTCATCAGGAAGCTTGTGCACATAAACATTGGCCTTGTTTTTATGCTTTG
CTGGCCGCTCTTCAGTTCTGGACTCCAAGGAGCGCTTTTTGCTTCTCTTATACCTGGACT
TAATATAATAAGGATGCTGCTCCTGGGCCTTGGTGTCTACCAAGACGAAGGAACTATCAA
GTCTATGAGCAGACACGGTGATCGCAGGGAACTACTCAAGGGACCGCTTTATTATGCACT
CTCCATCACATCGGCGTGTATCTTCTATTGGAAGACATCTCCAATAGCCATTGCAGTGAT
ATGCAACCTCTGTGCTGGAGATGGCATGGCTGACATTGTTGGGAGACGACTTGGAACAGA
GAAGCTTCCTTACAACAGAAACAAATCATTAGCTGGTAGCATTGGGATGGCGATCGCAGG
GTTCTCAGCATCCGTTGCGTATATGTATTACTTTGCTTCATTTGGTTACATTGAGAATAG
TGGGTGGGATATGATTCTTCGCTTCTTCATCATCTCTATAGCATCGGCTTTTGTGGAATC
ACTCCCGATAAGCACTGACATTGATGACAATCTTACCGTTTCCTTAACAACTGCATTGGT
CGGTACTCTACTCTTCTAATAGCAGCACTGAGTCTCTTCCCCATGCATCATCAACTACAG
AGTCATCGAGTTTGACTGCCTCTGAAGTAATCTAAATTCTTAGTTCCCACTTGTTAGTGA
TACCTCATATTGTTGTTGTAG

QA 2 802 2 802
DS 



AS 1 2

CO CL4363Contig1 951 2 2 U
GGATCCTCAAGGTACGAAGAATCTCTTCTCATTCACTGTCTTTCACGGTTAACAACGACA
ATTGAACATAAAGAAATGGCGGCGACGCAGCTTACATCGTCACTAGTGACTGTGTCAGCG
AGGAGCTTAGCCTCACTGGAAGGTCTCCGTGCTGCTTCGACTGCAAAGTTTTCATCTTTT
GGAACTTTGAAAGCAGGGATCTTTAGGCAGAGTCACTTCCGTCCTTTGGTTGTTAAAGCT
GCTTCTGTGGTTGCTCCTAAGTACACTTCGATTAAGCCATTGGGAGATAGAGTTTTGGTG
AAGATCAAGGAGGCAGAGGAAAAGAGTATGGGAGGTATCTTTCTTCCATCCACAGCTCAA
TCAAAACCTCAAGGAGGTGAAGTCGTTGCTGTGGGTGAAGGACGAACTATTGGGAAGACC
AAAATCGATATCACTGTCCCTACTGGAGCACAGATTATTTACTCCAAATACGCAGGAACT
GAGGTGGAGTTTAACGATGTGAAACATCTCATTCTCAAGGAAGATGATATTGTTAGCCTT
CTCGAGACAGATGACATCAAAGATCTCAAACCCTTGAATGACCGAGTCTTCATCAAGGTT
GCTGAGGCAGAGGAGAAAACAGCTGGAGGGTTGTTGCTGACCGAGACTACCAAAGAGAAG
CCTTTTATTGGAACGGTTATTGCGGCTGGACCAGGTTCTCTAGATGAGGAAGGTAAACTT
CAGCCATTACCTATATCGACTGGAAGCACAGTTCTGTACTCCAAGTATGCAGGCAATGAC
TTCAAGGGCAAAGATGGTTTTAACTACATCGCCCTCAGAGCTTCAGATGTTATGGCTATC
CTTTTTTAGTTTTTTCTTTTTTTTTCGTAACCTGCAACTTGTATCCCAATTGTGGAATTT
TTTTATCCAACGGCCTGAGCATAATTTTGAATAAAAAAGACTTGAGAGTTT


BQ
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AF RS1EQ95TF U 1
AF RS1EQ95JQ C 193
BS 1 664 RS1EQ95TF
BS 665 951 RS1EQ95JQ

RD RS1EQ95TF 664 0 0
GGATCCTCAAGGTACGAAGAATCTCTTCTCATTCACTGTCTTTCACGGTTAACAACGACA
ATTGAACATAAAGAAATGGCGGCGACGCAGCTTACATCGTCACTAGTGACTGTGTCAGCG
AGGAGCTTAGCCTCACTGGAAGGTCTCCGTGCTGCTTCGACTGCAAAGTTTTCATCTTTT
GGAACTTTGAAAGCAGGGATCTTTAGGCAGAGTCACTTCCGTCCTTTGGTTGTTAAAGCT
GCTTCTGTGGTTGCTCCTAAGTACACTTCGATTAAGCCATTGGGAGATAGAGTTTTGGTG
AAGATCAAGGAGGCAGAGGAAAAGAGTATGGGAGGTATCTTTCTTCCATCCACAGCTCAA
TCAAAACCTCAAGGAGGTGAAGTCGTTGCTGTGGGTGAAGGACGAACTATTGGGAAGACC
AAAATCGATATCACTGTCCCTACTGGAGCACAGATTATTTACTCCAAATACGCAGGAACT
GAGGTGGAGTTTAACGATGTGAAACATCTCATTCTCAAGGAAGATGATATTGTTAGCCTT
CTCGAGACAGATGACATCAAAGATCTCAAACCCTTGAATGACCGAGTCTTCATCAAGGTT
GCTGAGGCAGAGGAGAAAACAGCTGGAGGGTTGTTGCTGACCGAGACTACCAAAGAGAAG
CCTT

QA 1 664 1 664
DS 

RD RS1EQ95JQ 759 0 0
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GCTCCTAAGTACACTTCGATTAAGCCATTGGGAGATAGAGTTTTGGTGAAGATCAAGGAG
GCAGAGGAAAAGAGTATGGGAGGTATCTTTCTTCCATCCACAGCTCAATCAAAACCTCAA
GGAGGTGAAGTCGTTGCTGTGGGTGAAGGACGAACTATTGGGAAGACCAAAATCGATATC
ACTGTCCCTACTGGAGCACAGATTATTTACTCCAAATACGCAGGAACTGAGGTGGAGTTT
AACGATGTGAAACATCTCATTCTCAAGGAAGATGATATTGTTAGCCTTCTCGAGACAGAT
GACATCAAAGATCTCAAACCCTTGAATGACCGAGTTTTCATCAAGGTTGCTGAGGCAGAG
GAGAAAACAGCTGGAGGGTTGTTGCTGACCGAGACTACCAAAGAGAAGCCTTTTATTGGA
ACGGTTATTGCGGCTGGACCAGGTTCTCTAGATGAGGAAGGTAAACTTCAGCCATTACCT
ATATCGACTGGAAGCACAGTTCTGTACTCCAAGTATGCAGGCAATGACTTCAAGGGCAAA
GATGGTTTTAACTACATCGCCCTCAGAGCTTCAGATGTTATGGCTATCCTTTTTTAGTTT
TTTCTTTTTTTTTCGTAACCTGCAACTTGTATCCCAATTGTGGAATTTTTTTATCCAACG
GCCTGAGCATAATTTTGAATAAAAAAGACTTGAGAGTTT

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 2

CO CL4364Contig1 920 2 2 U
GGATCGCTGAGCTGATCATTTATCCCCTTGTAAGAGAGTTTCACCATTCATAGTTTTCCT
GAAAATCCTTCCTTACGATCTTTATTCTCTGCTTTCAAGTTTTATATAACTTAGGTCTCA
TTACCATCAAACCTTATTTTCTGGATTACTTTTCATGTCGGGTGACCATATATCATTTTC
TCTTCACCTATTCAGGTAAGCATTTTACTTTTATTAGCTTTCTCAGATCTTTTGGAGCTA
ATTTACGAGTAACACTCATTCATTATCTCTCGATGAGTCCATCTGATCTTTTCTTTTATT
AGTCAACGAATCCAATCTATTAATGAGCTAAGAACAAGACCTTTTTCTTATTTATTTACC
AATTCGAAGATAGAAAAGTAATCATATTAGAATGAACATAAATGATGGTCGATCCTCTTT
TCTGTTTTTCTTTTCTGATTGAGTTGATTCTATAAATTATACTCCCTCTGTTTTCTTTTA
TATGAAAGTTGTAGAGATATGCACTTAAAATGTGAAGCACCCAATACAATACCTTTTCTA
TCATCATCATTTTTTACACTCTATCCTCATCATTTTGTATTGAAACAAAATGATGATTCC
AAAACGACATTTATAACAACAAAAGGGAGGGAGTGATGAACATAAATGAAGAGAGAATTT
TTTTGTTCATTCTTTTCGTTTTTATTCAATATATTTATGTGCTATTAATTACAACAAATA
CTTTCAGATTTAGACAGATTGATTCTTGCGGTCATTGATCACTTTTTTTACATGTATAAT
TACAGAACAAAAAGGTTTGAACGCTGAATGTTTTATTAGAAGAAACAGACAAGTCTGGAA
AAAAAGAATCAACGGGAAATGTCAGAGTTGCTGACTTTGGTGCTGTGTAGCCGGCGGGAG
TAGAGTAAGAAAAGTAACAT


BQ
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AF RS1F520TF U 1
AF RS1F520JQ C 154
BS 1 621 RS1F520TF
BS 622 920 RS1F520JQ

RD RS1F520TF 621 0 0
GGATCGCTGAGCTGATCATTTATCCCCTTGTAAGAGAGTTTCACCATTCATAGTTTTCCT
GAAAATCCTTCCTTACGATCTTTATTCTCTGCTTTCAAGTTTTATATAACTTAGGTCTCA
TTACCATCAAACCTTATTTTCTGGATTACTTTTCATGTCGGGTGACCATATATCATTTTC
TCTTCACCTATTCAGGTAAGCATTTTACTTTTATTAGCTTTCTCAGATCTTTTGGAGCTA
ATTTACGAGTAACACTCATTCATTATCTCTCGATGAGTCCATCTGATCTTTTCTTTTATT
AGTCAACGAATCCAATCTATTAATGAGCTAAGAACAAGACCTTTTTCTTATTTATTTACC
AATTCGAAGATAGAAAAGTAATCATATTAGAATGAACATAAATGATGGTCGATCCTCTTT
TCTGTTTTTCTTTTCTGATTGAGTTGATTCTATAAATTATACTCCCTCTGTTTTCTTTTA
TATGAAAGTTGTAGAGATATGCACTTAAAATGTGAAGCACCCAATACAATACCTTTTCTA
TCATCATCATTTTTTACACTCTATCCTCATCATTTTGTATTGAAACAAAATGATGATTCC
AAAACGACATTTATAACAACA

QA 1 621 1 621
DS 

RD RS1F520JQ 767 0 0
CATGTCGGGTGACCATATATCATTTTCTCTTCACCTATTCAGGTAAGCATTTTACTTTTA
TTAGCTTTCTCAGATCTTTTGGAGCTAATTTACGAGTAACACTCATTCATTATCTCTCGA
TGAGTCCATCTGATCTTTTCTTTTATTAGTCAACGAATCCAATCTATTAATGAGCTAAGA
ACAAGACCTTTTTCTTATTTATTTACCAATTCGAAGATAGAAAAGTAATCATATTAGAAT
GAACATAAATGATGGTCGATCCTCTTTTCTGTTTTTCTTTTCTGATTGAGTTGATTCTAT
AAATTATACTCCCTCTGTTTTCTTTTATATGAAAGTTGTAGAGATATGCACTTAAAATGT
GAAGCACCCAATACAATACCTTTTCTATCATCATCATTTTTTACACTCTATCCTCATCAT
TTTGTATTGAAACAAAATGATGATTCCAAAACGACATTTATAACAACAAAAGGGAGGGAG
TGATGAACATAAATGAAGAGAGAATTTTTTTGTTCATTCTTTTCGTTTTTATTCAATATA
TTTATGTGCTATTAATTACAACAAATACTTTCAGATTTAGACAGATTGATTCTTGCGGTC
ATTGATCACTTTTTTTACATGTATAATTACAGAACAAAAAGGTTTGAACGCTGAATGTTT
TATTAGAAGAAACAGACAAGTCTGGAAAAAAAGAATCAACGGGAAATGTCAGAGTTGCTG
ACTTTGGTGCTGTGTAGCCGGCGGGAGTAGAGTAAGAAAAGTAACAT

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL4365Contig1 686 2 2 U
GGTAAAAAATTCAAATGATATTAAAATTCACCTATAATTGTAAGAACATTTATTTTGAAG
CAAAATTAAAATTTTAAATATAGAGGGAGTATTATTTATATTATTAATTTTTGGCGTTGT
TATGTTTTACAAGTCCCAACACATAGAAACATCCAGCTCAAATACAACATTATCCGGTAC
GTAGATCTCTGGAAGATTAACCGAAGTTGATTCCTTGCGCTAGAGGTAACTCATTCCCAT
AGTTGATCGTGCAAGTGGAACGACGCATATACTGCTTCCAAGAGTCACTACCAGCTTCAC
GACCACCACCGGTCGCTTTCTCACCCCCAAAAGCTCCTCCAATCTCAGCTCCATTCGTCG
GTATGTTCACATTCACTATCCCACAGTCACTTCCCATTGGTCCGATCCATTTGAAGATGT
TCCCGGGGCAACGAGTGAATATAGAGCTGCTTAGACCTTGAGGAACTGAGTTGTTTATCG
CAACAGCTTCTTCAAATGTCTTAAACTTTAGAGCATATAGAACCGGAGCAAACAGCTCTT
CTTTAACTACAGCAGCATCTGATGATATCTCTATTATCGTAGGCTCCACAAAGTTTCCTT
CACCTTCAACTCCTTTACCTCCCGTTAGTACTTTACCGCCCTGGGACTTGATGACTTCGA
TCCCCTTCTCGAAGTTTTTCTTTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1GC51JQ U 1
AF RS1GN09JQ U 76
BS 1 549 RS1GC51JQ
BS 550 686 RS1GN09JQ

RD RS1GC51JQ 549 0 0
GGTAAAAAATTCAAATGATATTAAAATTCACCTATAATTGTAAGAACATTTATTTTGAAG
CAAAATTAAAATTTTAAATATAGAGGGAGTATTATTTATATTATTAATTTTTGGCGTTGT
TATGTTTTACAAGTCCCAACACATAGAAACATCCAGCTCAAATACAACATTATCCGGTAC
GTAGATCTCTGGAAGATTAACCGAAGTTGATTCCTTGCGCTAGAGGTAACTCATTCCCAT
AGTTGATCGTGCAAGTGGAACGACGCATATACTGCTTCCAAGAGTCACTACCAGCTTCAC
GACCACCACCGGTCGCTTTCTCACCCCCAAAAGCTCCTCCAATCTCAGCTCCATTCGTCG
GTATGTTCACATTCACTATCCCACAGTCACTTCCCATTGGTCCGATCCATTTGAAGATGT
TCCCGGGGCAACGAGTGAATATAGAGCTGCTTAGACCTTGAGGAACTGAGTTGTTTATCG
CAACAGCTTCTTCAAATGTCTTAAACTTTAGAGCATATAGAACCGGAGCAAACAGCTCTT
CTTTAACTA

QA 1 549 1 549
DS 

RD RS1GN09JQ 611 0 0
AG
ATATAGAGGGAGTATTATTTATATTATTAATTTTTGGCGTTGTTATGTTTTACAAGTCCC
AACACATAGAAACATCCAGCTCAAATACAACATTATCCGGTACGTAGATCTCTGGAAGAT
TAACCGAAGTTGATTCCTTGCGCTAGAGGTAACTCATTCCCATAGTTGATCGTGCAAGTG
GAACGACGCATATACTGCTTCCAAGAGTCACTACCAGCTTCACGACCACCACCGGTCGCT
TTCTCACCCCCAAAAGCTCCTCCAATCTCAGCTCCATTCGTCGGTATGTTCACATTCACT
ATCCCACAGTCACTTCCCATTGGTCCGATCCATTTGAAGATGTTCCCGGGGCTACGAGTG
AATATAGAGCTGCTTAGACCTTGAGGAACTGAGTTGTTTATCGCAACAGCTTCTTCAAAT
GTCTTAAACTTTAGAGCATATAGAACCGGAGCAAACAGCTCTTCTTTAACTACAGCAGCA
TCTGATGATATCTCTATTATCGTAGGCTCCACAAAGTTTCCTTCACCTTCAACTCCTTTA
CCTCCCGTTAGTACTTTACCGCCCTGGGACTTGATGACTTCGATCCCCTTCTCGAAGTTT
TTCTTTGAT

QA 3 611 3 611
DS 



AS 1 2

CO CL4366Contig1 1043 2 2 U
GGATTTCTGGGTCTTACTTTATTCACATGGTATCAGAGCACCAGTGAGTGGATCTTGGTG
TTATATCTTCTATTTGAGCATCAAAACATTCGGCTTCAGCCTCTCATGGACCACCCATTT
CTTCTTCACGCTCTTGAGAAACAAAGATGTAGTGAAGAACCGTGTGAATGTTCTGAAGCA
TCAGAAGAAAATTACAGTGACTCCGGTGAGTTCAGCCGTTCAAACCGACCAACAAGGGAG
ATTTCAAATCGAGATTTTTCAGCCTCAGCTTGCAAGTGGGTTATCTACAGCTCATCAGAA
CGTGGGTTATCTGCGAACCTAACCAGGAAATCATCAAGCTTTCTCCATCTCTAAATCATG
GTGAATTGACTTATTATCACACAAAAAATGGTTGATTGTTCTCGTGGTGGTTTGCTGGCT
GGTTAGATAGTAGGATTGAAATCAGGAAGCTAGGGAATGCAACTGGAACATACTGGGTTT
TATAATAGTGAGATTAATGGCATCAAGTTTCTGTTTTGATGAGTGCACACAAGATGTTTG
GTTAAATGTCCAAGAGAAAAACAGATTGTGAAATTAAGAATTTTGGTTGCATGAAACAGA
GAGTTGAGGTTTAGACAGTTGTAGGATGAATTTTCTCTTTGGTCGGGAGATAGCTTAGTA
TAGTTAGGAGGATACAAAAAATGCATAACTTCTTGTGAGACAAGTAGTACAAAAGAACCT
AAAGATGTTCTCACACTCATGTCTATTCTCCAAGCTGAATAAAGTCATATACCTACCTCC
CATGGACCTTCAACTACTAATGCTCCTTTCAAAGCTAGTTCTATCTGCATCTTCAAACTT
GGCTCAGCTGCTTGATTCACCACCCAATGCCAAGTTTGTGGGAGGATAATGAAGCCCAAT
TTATGATCCATTAAAAAGCTTTTGTAATCATGTAACTAGGATTTCATAAACCATTATATA
TGTCTTTAGAGTGCTTGCTAGTATGTAACTTTGGCTGCTCTACAAGCAGCCTTCCTTTTA
TCTTTATGAATCAATCTGCAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EU60TF U 1
AF RS1EU60JQ C 331
BS 1 528 RS1EU60TF
BS 529 1043 RS1EU60JQ

RD RS1EU60TF 528 0 0
GGATTTCTGGGTCTTACTTTATTCACATGGTATCAGAGCACCAGTGAGTGGATCTTGGTG
TTATATCTTCTATTTGAGCATCAAAACATTCGGCTTCAGCCTCTCATGGACCACCCATTT
CTTCTTCACGCTCTTGAGAAACAAAGATGTAGTGAAGAACCGTGTGAATGTTCTGAAGCA
TCAGAAGAAAATTACAGTGACTCCGGTGAGTTCAGCCGTTCAAACCGACCAACAAGGGAG
ATTTCAAATCGAGATTTTTCAGCCTCAGCTTGCAAGTGGGTTATCTACAGCTCATCAGAA
CGTGGGTTATCTGCGAACCTAACCAGGAAATCATCAAGCTTTCTCCATCTCTAAATCATG
GTGAATTGACTTATTATCACACAAAAAATGGTTGATTGTTCTCGTGGTGGTTTGCTGGCT
GGTTAGATAGTAGGATTGAAATCAGGAAGCTAGGGAATGCAACTGGAACATACTGGGTTT
TATAATAGTGAGATTAATGGCATCAAGTTTCTGTTTTGATGAGTGCAC

QA 1 528 1 528
DS 

RD RS1EU60JQ 713 0 0
TCATCAAGCTTTCTCCATCTCTAAATCATGGTGAATTGACTTATTATCACACAAAAAATG
GTTGATTGTTCTCGTGGTGGTTTGCTGGCTGGTTAGATAGTAGGATTGAAATCAGGAAGC
TAGGGAATGCAACTGGAACATACTGGGTTTTATAATAGTGAGATTAATGGCATCAAGTTT
CTGTTTTGATGAGTGCACACAAGATGTTTGGTTAAATGTCCAAGAGAAAAACAGATTGTG
AAATTAAGAATTTTGGTTGCATGAAACAGAGAGTTGAGGTTTAGACAGTTGTAGGATGAA
TTTTCTCTTTGGTCGGGAGATAGCTTAGTATAGTTAGGAGGATACAAAAAATGCATAACT
TCTTGTGAGACAAGTAGTACAAAAGAACCTAAAGATGTTCTCACACTCATGTCTATTCTC
CAAGCTGAATAAAGTCATATACCTACCTCCCATGGACCTTCAACTACTAATGCTCCTTTC
AAAGCTAGTTCTATCTGCATCTTCAAACTTGGCTCAGCTGCTTGATTCACCACCCAATGC
CAAGTTTGTGGGAGGATAATGAAGCCCAATTTATGATCCATTAAAAAGCTTTTGTAATCA
TGTAACTAGGATTTCATAAACCATTATATATGTCTTTAGAGTGCTTGCTAGTATGTAACT
TTGGCTGCTCTACAAGCAGCCTTCCTTTTATCTTTATGAATCAATCTGCAACC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

CO CL4367Contig1 603 2 4 U
GCACTCTGAAAACAACAGGGGGAAAAGCGTTGAAGCTGGGTCTAATCTAACATCTCCAGC
GAAAGATTTGGATGCGAGGTCTCCTAAAATTAAACTGGAAGAGGCAGCTGAAGAGCCTGT
CACGGAAACTACTGATAAGAGGAGCGAACGTTTTTGCCGGCACTATCTGTCAAAGCTTGA
TATGTCGGTAGAGCTTGCTGATCCTGAGCTGCTCAAATGCATCAGCTCATTGTTGGATGA
AGAACATCAACGAATTGATGATGGAGCTGCTGTGTTTGTAAATCTCAAGGAAGGTGGGAA
GAGAGTGCCAAAAGGCAACAGTACTTCCTTGGCTACTCTTTCATTGTTTCCTTCTCAAAA
TAGTTCATTGTTTCAGATAGCGATGGAACTCTACAAGGAGCAAAGATTTGAAATGAAGGG
TCTTTCAAATGTTGAGACTCACAGGCCTCCTCAAGCCTCTCCTCCTTCAAGCTTGGCCAA
AGTCGATGTGTTGGATTCAGATATGTCCCATAGGGAAAATCAGGAAGCATCCTTACCTGT
TGATGCGAATCAGGAAGCATCCTTACCTGTTGATGCGGGATTGGAGACGGGAACACAAGT
TGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 

AF RS1E419TF U 1
AF RS1ET53TF U 37
BS 1 252 RS1E419TF
BS 253 253 RS1ET53TF
BS 254 509 RS1E419TF
BS 510 603 RS1ET53TF

RD RS1E419TF 509 0 0
GCACTCTGAAAACAACAGGGGGAAAAGCGTTGAAGCTGGGTCTAATCTAACATCTCCAGC
GAAAGATTTGGATGCGAGGTCTCCTAAAATTAAACTGGAAGAGGCAGCTGAAGAGCCTGT
CACGGAAACTACTGATAAGAGGAGCGAACGTTTTTGCCGGCACTATCTGTCAAAGCTTGA
TATGTCGGTAGAGCTTGCTGATCCTGAGCTGCTCAAATGCATCAGCTCATTGTTGGATGA
AGAACATCAACGGATTGATGATGGAGCTGCTGTGTTTGTAAATCTCAAGGAAGGTGGGAA
GAGAGTGCCAAAAGGCAACAGTACTTCCTTGGCTACTCTTTCATTGTTTCCTTCTCAAAA
TAGTTCATTGTTTCAGATAGCGATGGAACTCTACAAGGAGCAAAGATTTGAAATGAAGGG
TCTTTCAAATGTTGAGACTCACAGGCCTCCTCAAGCCTCTCCTCCTTCAAGCTTGGCCAA
AGTCGATGTGTTGGATTCAGATATGTCCC

QA 1 509 1 509
DS 

RD RS1ET53TF 567 0 0
G
GGGTCTAATCTAACATCTCCAGCGAAAGATTTGGATGCGAGGTCTCCTAAAATTAAACTG
GAAGAGGCAGCTGAAGAGCCTGTCACGGAAACTACTGATAAGAGGAGCGAACGTTTTTGC
CGGCACTATCTGTCAAAGCTTGATATGTCGGTAGAGCTTGCTGATCCTGAGCTGCTCAAA
TGCATCAGCTCATTGTTGGATGAAGAACATCAACGAATTGATGATGGAGCTGCTGTGTTT
GTAAATCTCAAGGAAGGTGGGAAGAGAGTGCCAAAAGGCAACAGTACTTCCTTGGCTACT
CTTTCATTGTTTCCTTCTCAAAATAGTTCATTGTTTCAGATAGCGATGGAACTCTACAAG
GAGCAAAGATTTGAAATGAAGGGTCTTTCAAATGTTGAGACTCACAGGCCTCCTCAAGCC
TCTCCTCCTTCAAGCTTGGCCAAAGTCGATGTGTTGGATTCAGATATGTCCCATAGGGAA
AATCAGGAAGCATCCTTACCTGTTGATGCGAATCAGGAAGCATCCTTACCTGTTGATGCG
GGATTGGAGACGGGAACACAAGTTGA

QA 2 567 2 567
DS 



AS 1 2

CO CL4368Contig1 1348 2 2 U
GAAGAAGCTCAAGGACCATGAGGCTGGAAGAATCTCAAACCGTCTCTTTTATCTCTCCAT
CCCTCCAAATATATTTGTAGACGCTGTGAAATGTGCAAGCTCTTCGGCCTCATCTGTCAA
TGGCTGGACTAGAGTCATCGTTGAGAAACCTTTTGGTCGAGATTCCGAAACCTCTGCTGC
TTTAACCAAATCCCTCAAGCAGTATCTGGAGGAAGATCAAATCTTTAGGATAGACCATTA
CCTAGGAAAGGAGCTGGTGGAGAACTTATCTGTTCTTAGATTCTCGAACCTTATATTCGA
ACCTCTATGGTCAAGGCAGTACATAAGGAACGTTCAGTTCATATTTTCTGAGGACTTTGG
CACTGAAGGACGTGGAGGGTACTTTGACCACTACGGAATCATAAGAGATATAATGCAGAA
TCATCTTCTTCAAATCTTAGCACTCTTTGCCATGGAAACACCTGTTAGTCTAGATGCAGA
GGATATCAGAAACGAAAAGGTTAAGGTTCTACGTTCAATGAGGCCAATACAAATGGAAGA
TGTGGTGATAGGACAGTACTAGAGCCACACCAAGGGAGGAGTGACGTATCCAGGCTACAC
GGATGATAAAACTGTACCGAAAGACAGTCAGACTCCGACGTTTGCAGCTGCCGCTCTTTT
CATTGATAATGCAAGGTGGGACGGTGTGCCTTTTCTGATGAAAGCTGGCAAAGCACTACA
CACCAGGAGGGCAGAGATAAGGGTGCAGTTCAGGCATGTTCCGGGGAATTTGTATAACAG
GAATACTGGTTGTGATCTTGATAATGCTACAAACGAGCTTGTGATCCGTGTTCAGCCGGA
TGAGGCAATCTATTTGAAGATAAACAACAAGGTCCCTGGTTTAGGAATGAGACTAGATCG
CAGTAACTTGAATCTTCTGTACTCTGCAAGGTATTCAAAGGAGATACCAGATGCATATGA
GAGGCTTCTGCTGGATGCAATAGAAGGAGAAAGAAGGTTGTTTATAAGAAGTGACGAGCT
TGATGCAGCTTGGTCACTATTCACTCCATTGCTTAAGGAGATTGAAGAGAAGAGGAGAAT
CCCTGAGTACTATCCTTATGGGAGTCGTGGTCCAGTCGGTGCTCATTATCTAGCTGCTAA
GCACAAGGTTCAATGGGGTGACATGAGTCTTGACCAGTAAAAGAGTCTCATCAAAAGATT
TGTTTTGTATTGTCATATACCTTTGGTATAGATTTGTGTAGGAATCAAGCTTTTTTCTAC
GTCTCTGTTTTCTTTGTTTTTACAAATGTGCTTTTGAAGAATTGATGCATTTGGCTCTGT
ACCATTTAATAATAGCAGCATGAAGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1A503TF U 1
AF RS1A503JQ C 473
BS 1 671 RS1A503TF
BS 672 1348 RS1A503JQ

RD RS1A503TF 671 0 0
GAAGAAGCTCAAGGACCATGAGGCTGGAAGAATCTCAAACCGTCTCTTTTATCTCTCCAT
CCCTCCAAATATATTTGTAGACGCTGTGAAATGTGCAAGCTCTTCGGCCTCATCTGTCAA
TGGCTGGACTAGAGTCATCGTTGAGAAACCTTTTGGTCGAGATTCCGAAACCTCTGCTGC
TTTAACCAAATCCCTCAAGCAGTATCTGGAGGAAGATCAAATCTTTAGGATAGACCATTA
CCTAGGAAAGGAGCTGGTGGAGAACTTATCTGTTCTTAGATTCTCGAACCTTATATTCGA
ACCTCTATGGTCAAGGCAGTACATAAGGAACGTTCAGTTCATATTTTCTGAGGACTTTGG
CACTGAAGGACGTGGAGGGTACTTTGACCACTACGGAATCATAAGAGATATAATGCAGAA
TCATCTTCTTCAAATCTTAGCACTCTTTGCCATGGAAACACCTGTTAGTCTAGATGCAGA
GGATATCAGAAACGAAAAGGTTAAGGTTCTACGTTCAATGAGGCCAATACAAATGGAAGA
TGTGGTGATAGGACAGTACTAGAGCCACACCAAGGGAGGAGTGACGTATCCAGGCTACAC
GGATGATAAAACTGTACCGAAAGACAGTCAGACTCCGACGTTTGCAGCTGCCGCTCTTTT
CATTGATAATG

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1A503JQ 876 0 0
GATGCAGAGGATATCAGAAACGAAAAGGTTAAGGTTCTACGTTCAATGAGGCCAATACAA
ATGGAAGATGTGGTGATAGGACAGTACTAGAGCCACACCAAGGGAGGAGTGACGTATCCA
GGCTACACGGATGATAAAACTGTACCGAAAGACAGTCAGACTCCGACGTTTGCAGCTGCC
GCTCTTTTCATTGATAATGCAAGGTGGGACGGTGTGCCTTTTCTGATGAAAGCTGGCAAA
GCACTACACACCAGGAGGGCAGAGATAAGGGTGCAGTTCAGGCATGTTCCGGGGAATTTG
TATAACAGGAATACTGGTTGTGATCTTGATAATGCTACAAACGAGCTTGTGATCCGTGTT
CAGCCGGATGAGGCAATCTATTTGAAGATAAACAACAAGGTCCCTGGTTTAGGAATGAGA
CTAGATCGCAGTAACTTGAATCTTCTGTACTCTGCAAGGTATTCAAAGGAGATACCAGAT
GCATATGAGAGGCTTCTGCTGGATGCAATAGAAGGAGAAAGAAGGTTGTTTATAAGAAGT
GACGAGCTTGATGCAGCTTGGTCACTATTCACTCCATTGCTTAAGGAGATTGAAGAGAAG
AGGAGAATCCCTGAGTACTATCCTTATGGGAGTCGTGGTCCAGTCGGTGCTCATTATCTA
GCTGCTAAGCACAAGGTTCAATGGGGTGACATGAGTCTTGACCAGTAAAAGAGTCTCATC
AAAAGATTTGTTTTGTATTGTCATATACCTTTGGTATAGATTTGTGTAGGAATCAAGCTT
TTTTCTACGTCTCTGTTTTCTTTGTTTTTACAAATGTGCTTTTGAAGAATTGATGCATTT
GGCTCTGTACCATTTAATAATAGCAGCATGAAGCCC

QA 1 876 1 876
DS 



AS 1 2

CO CL4369Contig1 1045 2 2 U
GGAGGCCTCCCTCTCATCTTCTTATAACTCGTTTCTTCTTTCTCTCCTATCAAACCAGAT
AAAAAAACCTGTGTTTATTGCTCCCAAAACATTGGATATATATTCTCATAAGTTTAGAAA
TTGTTTTTTTTTGTTGGCAATGAGTTGCAATGGATGTAGAGTTCTTCGAAAAGGTTGCAG
CGAAACATGCATCCTTCGTCCTTGCCTTCAATGGATCGAATCCGCCGAGTCACAAGGCCA
CGCCACAGTTTTTGTGGCTAAATTCTTTGGCCGTGCCGGTCTAATGTCTTTCATCTCCGC
CGTACCTGAAGCAAACCGCCCTGCTTTGTTTCAGTCTTTGTTGTTTGAAGCGTGTGGGAG
GACAGTGAATCCGGTTAACGGAGCGGTTGGTATGTTATGGACTGGGAACTGGCACGTGTG
CCAAGCGGCTGTTGAAACCGTTCTTCGTGGCGGAACTTTAAGACCTATGTCAGATCTACT
CGAATCTCCTTCTTTGAACTCCTCAGATGAGTCTACCGAGATCTGGCGGATGCAGCGTCC
AGGCGGTTCCCGGAACGACGAGAACGGTAGAAACCACCATTACTCAAGATCCAAGCTTAC
TACGACGGGGATGAAGGAGTCTCCTGTCAACCGTAAACGATCTAAGACCGAGCGGTCTGA
TTTGGAACTGAACCACGGGTTAGCTCTAACCGGTCCGGTTGACCCGGCTCCTTTTCTTCC
ACCGCCGCCGTTCGGTAAGGCTGTTAACAGTGATCATCCGGGAAGTCCATCGGAGGAGTC
TGTAACGACGTCGTGTTATGAAAATGGATTCAGCGGCAGCGATGGATACAAAAACAAAAA
AGAGAAAAAGTTATTAAACCTTTTTGTTTAAAACCGACGACGCAAACTCTTCGCACCCAG
TTTTTTTTCGACGGTCCTTTTTAGGGTTTTTTTTTGGTGAAGCCGCATAATTATTGGCTA
ACATAATTATTTTCTCTATCGAGAAATATGATATTTTTGGTGATATGAAACCTTCGGCAA
TGAGTATTATTAATAATCTGTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1H190TF U 1
AF RS1H190JQB C 478
BS 1 688 RS1H190TF
BS 689 1045 RS1H190JQB

RD RS1H190TF 688 0 0
GGAGGCCTCCCTCTCATCTTCTTATAACTCGTTTCTTCTTTCTCTCCTATCAAACCAGAT
AAAAAAACCTGTGTTTATTGCTCCCAAAACATTGGATATATATTCTCATAAGTTTAGAAA
TTGTTTTTTTTTGTTGGCAATGAGTTGCAATGGATGTAGAGTTCTTCGAAAAGGTTGCAG
CGAAACATGCATCCTTCGTCCTTGCCTTCAATGGATCGAATCCGCCGAGTCACAAGGCCA
CGCCACAGTTTTTGTGGCTAAATTCTTTGGCCGTGCCGGTCTAATGTCTTTCATCTCCGC
CGTACCTGAAGCAAACCGCCCTGCTTTGTTTCAGTCTTTGTTGTTTGAAGCGTGTGGGAG
GACAGTGAATCCGGTTAACGGAGCGGTTGGTATGTTATGGACTGGGAACTGGCACGTGTG
CCAAGCGGCTGTTGAAACCGTTCTTCGTGGCGGAACTTTAAGACCTATGTCAGATCTACT
CGAATCTCCTTCTTTGAACTCCTCAGATGAGTCTACCGAGATCTGGCGGATGCAGCGTCC
AGGCGGTTCCCGGAACGACGAGAACGGTAGAAACCACCATTACTCAAGATCCAAGCTTAC
TACGACGGGGATGAAGGAGTCTCCTGTCAACCGTAAACGATCTAAGACCGAGCGGTCTGA
TTTGGAACTGAACCACGGGTTAGCTCTA

QA 1 688 1 688
DS 

RD RS1H190JQB 568 0 0
ACTCGAATCTCCTTCTTTGAACTCCTCAGATGAGTCTACCGAGATCTGGCGGATGCAGCG
TCCAGGCGGTTCCCGGAACGACGAGAACGGTAGAAACCACCATTACTCAAGATCCAAGCT
TATTACGACGGGGATGAAGGAGTCTCCTGTCAACCGTAAACGATTTAAGACCGAGCGGTT
TGATTTGGAACTGAACCACGGGTTAGCTCTAACCGGTCCGGTTGACCCGGCTCCTTTTCT
TCCACCGCCGCCGTTCGGTAAGGCTGTTAACAGTGATCATCCGGGAAGTCCATCGGAGGA
GTCTGTAACGACGTCGTGTTATGAAAATGGATTCAGCGGCAGCGATGGATACAAAAACAA
AAAAGAGAAAAAGTTATTAAACCTTTTTGTTTAAAACCGACGACGCAAACTCTTCGCACC
CAGTTTTTTTTCGACGGTCCTTTTTAGGGTTTTTTTTTGGTGAAGCCGCATAATTATTGG
CTAACATAATTATTTTCTCTATCGAGAAATATGATATTTTTGGTGATATGAAACCTTCGG
CAATGAGTATTATTAATAATCTGTTGAC

QA 1 568 1 568
DS 



AS 1 2

CO CL4370Contig1 1008 2 2 U
AATCGGGAGAGCAATGGAGTTTTACGACGAAGACAAGCCAAGAATCGTCTTCCAATCACG
TCCTTCCTCTTCTCGCAAGACGACGGAAGAGGACGACGATCCTAAAACCCCTAACAAGAT
CTCCATCTCAATCTCCGTCGTCCTCTCTCTCGTCACTCTATCACTCTCCTTCTTCTACTT
CGAATCCGAGCCCGCCCCATCGCTCCTCTTATGGCTCGCCATCTCCTTCCTCGTCGGTCC
TTTCGCGCCTCCTTCTCTCACCGGCGGCAAAATCCGCGTCGGTTACGGTCAGATCCTGGA
GCCGGAGCAGCAGATCAACGACGAACACTCCACGGATAACGAACGCGAATCGAGGAGGAA
CAAGAGATCTAACAAAGTGACGAAGAACGATAAACCATCGCCGGAGAATCCACCTCCGGT
TGTGACAACGAGTAAAGTGGCGGATCGAAATGGATCTGTGAAGGAAAGTAAGGAGTGGAG
TGAAGAAGAGATGGAGATTCTGAAGAAGCAGCTTGTAAAGCATCCGGCGGGGAAGCCTGG
GCGGTGGGAAGCTGTGGCGTCTGCGTTTGGAGGGAAGTATAAGACGGAGAGTGTGATCAA
GAAGGCGAAAGAGATTGGAGAGAAGAAAGTGTACGAGAGTGATGATTACGCTCTGTTTTT
GAAGAACAGGAAAGCTTTTTCGGATCCTAGATTGGCTGAAGAAGAAGAAGAGAAGAATGG
GGGAGATGAGGAGAGTTGGAGTAATGGAGAAGACATTGCCCCGCTCAATGCTTTTAAAGC
TTTTCCGAAAGAAGCGGCTATGAGATGGGAGAAGGTTGCAGCTGCAGTTCCTGGGAAGTC
CAAGGCTGCTTGTATGAAGAGAGTTACTGAGCTTAAGAAAGGGTTTAGAAGCTCCAAGTC
TGGTGCCAATTAGCTGGGGAGAAGATCCTCTCTCTTTTTACTTTTCCATTGTACTTGTTC
CCTTAGATGTTTTCTGAATAATTGTATGAGGCTTCGTGATCTCTCCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DV22TF U 1
AF RS1DV22JQ C 398
BS 1 600 RS1DV22TF
BS 601 1008 RS1DV22JQ

RD RS1DV22TF 600 0 0
AATCGGGAGAGCAATGGAGTTTTACGACGAAGACAAGCCAAGAATCGTCTTCCAATCACG
TCCTTCCTCTTCTCGCAAGACGACGGAAGAGGACGACGATCCTAAAACCCCTAACAAGAT
CTCCATCTCAATCTCCGTCGTCCTCTCTCTCGTCACTCTATCACTCTCCTTCTTCTACTT
CGAATCCGAGCCCGCCCCATCGCTCCTCTTATGGCTCGCCATCTCCTTCCTCGTCGGTCC
TTTCGCGCCTCCTTCTCTCACCGGCGGCAAAATCCGCGTCGGTTACGGTCAGATCCTGGA
GCCGGAGCAGCAGATCAACGACGAACACTCCACGGATAACGAACGCGAATCGAGGAGGAA
CAAGAGATCTAACAAAGTGACGAAGAACGATAAACCATCGCCGGAGAATCCACCTCCGGT
TGTGACAACGAGTAAAGTGGCGGATCGAAATGGATCTGTGAAGGAAAGTAAGGAGTGGAG
TGAAGAAGAGATGGAGATTCTGAAGAAGCAGCTTGTAAAGCATCCGGCGGGGAAGCCTGG
GCGGTGGGAAGCTGTGGCGTCTGCGTTTGGAGGGAAGTATAAGACGGAGAGTGTGATCAA

QA 1 600 1 600
DS 

RD RS1DV22JQ 611 0 0
TCGCCGGAGAATCCACCTCCGGTTGTGACAACGAGTAAAGTGGCGGATCGAAATGGATCT
GTGAAGGAAAGTAAGGAGTGGAGTGAAGAAGAGATGGAGATTCTGAAGAAGCAGCTTGTA
AAGCATCCGGCGGGGAAGCCTGGGCGGTGGGAAGCTGTGGCGTTTGCGTTTGGAGGGAAG
TATAAGACGGAGAGTGTGATCAAGAAGGCGAAAGAGATTGGAGAGAAGAAAGTGTACGAG
AGTGATGATTACGCTCTGTTTTTGAAGAACAGGAAAGCTTTTTCGGATCCTAGATTGGCT
GAAGAAGAAGAAGAGAAGAATGGGGGAGATGAGGAGAGTTGGAGTAATGGAGAAGACATT
GCCCCGCTCAATGCTTTTAAAGCTTTTCCGAAAGAAGCGGCTATGAGATGGGAGAAGGTT
GCAGCTGCAGTTCCTGGGAAGTCCAAGGCTGCTTGTATGAAGAGAGTTACTGAGCTTAAG
AAAGGGTTTAGAAGCTCCAAGTCTGGTGCCAATTAGCTGGGGAGAAGATCCTCTCTCTTT
TTACTTTTCCATTGTACTTGTTCCCTTAGATGTTTTCTGAATAATTGTATGAGGCTTCGT
GATCTCTCCAT

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 2

CO CL4371Contig1 845 2 4 U
GGAACCAGAAAAACCTCATTAAATACTTCTACAAGTGTCCATAGAGAGAGAGAGAGAGAG
AGAGAGAGAGAGAGAAGAATGAACGAGATGAGCGAGAGAGAGACTAGTTTCGAAGGATCA
AGCATCAAGAGGATGAGACTCGACGATGATGATGATGACTCACCGGAGAGGACGGTTTCT
TCTTCTTCTTCTTCTCTGGTTTATTCTGCCTCGGATTCTGAAGAAGAGGCTCTTCAGAGC
TCAAGCTGTTCTAGCAGCGATACTCGTCTGCCATTTTTAGATCTCGAGGGTCGTCATCAC
CAAATCTCCGAAACCGAAATATCGTCGTCATTAATCACCATCAATTTCAGAACCCAAGGA
GAAACAGCTGAGATGGACTCTGCGACCATGGAGACGGAGAGGAGAGACGGACAAAAGACA
GAGAAGAAGGAGAAAGCACCGACGCAGGCTGAGCTTGACGACTTCTTCTCGGCGGCGGAG
AGACGCCAACAGAAACGATTCACGGACAAGTACAACTACGACATCGTGAATGATACGCCG
CTTGAAGGTCGTTATGAGTGGGTTAGTCTCAAGCCATAAAAGGCTAAGAAGCAGAAGACA
ACGACGTTGTAGGTACTCTGTGAGTTTTGTCACAGACAGAGAGAATCATAGCTTAGGACC
GTTTTGTTTCGTTATTGTACAGTCGGTCAGTCCTCTCTAGCTTAGCTTATTGTAGTTTCC
TTATTTATCTTCTTATGTTCTTCGTACCATGAGAAACAAAAAAGGACGCTGCTTTCTTTT
CGAAATTTATCATTTTTAATGTCTAGTTTAACTATCAAAATTATAACTGTTGGATTTATT
TTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1FZ63TF U 1
AF RS1FZ63JQ C 274
BS 1 656 RS1FZ63TF
BS 657 657 RS1FZ63JQ
BS 658 745 RS1FZ63TF
BS 746 845 RS1FZ63JQ

RD RS1FZ63TF 745 0 0
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AGAGAGAGAGAGAGAAGAATGAACGAGATGAGCGAGAGAGAGACTAGTTTCGAAGGATCA
AGCATCAAGAGGATGAGACTCGACGATGATGATGATGACTCACCGGAGAGGACGGTTTCT
TCTTCTTCTTCTTCTCTGGTTTATTCTGCCTCGGATTCTGAAGAAGAGGCTCTTCAGAGC
TCAAGCTGTTCTAGCAGCGATACTCGTCTGCCATTTTTAGATCTCGAGGGTCGTCATCAC
CAAATCTCCGAAACCGAAATATCGTCGTCATTAATCACCATCAATTTCAGAACCCAAGGA
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GAGAAGAAGGAGAAAGCACCGACGCAGGCTGAGCTTGACGACTTCTTCTCGGCGGCGGAG
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ACGACGTTGTAGGTACTCTGTGAGTTTTGTCACAGACAGAGAGAATCATAGCTTAG*ACC
GTTTTGTTTCGTTATTGTACAGTCGGTCAGTCCTCTCTAGCTTAGCTTATTGTAGTTTCC
TTATTTATCTTCTTATGTTCTTCGT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1FZ63JQ 572 0 0
TTTTTAGATCTCGAGGGTCGTCATCACCAAATCTCCGAAACCGAAATATCGTCGTCATTA
ATCACCATCAATTTCAGAACCCAAGGAGAAACAGCTGAGATGGACTCTGCGACCATGGAG
ACGGAGAGGAGAGACGGACAAAAGACAGAGAAGAAGGAGAAAGCACCGACGCAGGCTGAG
CTTGACGACTTCTTCTCGGCGGCGGAGAGACGCCAACAGAAACGATTCACGGACAAGTAC
AACTACGACATCGTGAATGATACGCCGCTTGAAGGTCGTTATGAGTGGGTTAGTCTCAAG
CCATAAAAGGCTAAGAAGCAGAAGACAACGACGTTGTAGGTACTCTGTGAGTTTTGTCAC
AGACAGAGAGAATCATAGCTTAGGACCGTTTTGTTTCGTTATTGTACAGTCGGTCAGTCC
TCTCTAGCTTAGCTTATTGTAGTTTCCTTATTTATCTTCTTATGTTCTTCGTACCATGAG
AAACAAAAAAGGACGCTGCTTTCTTTTCGAAATTTATCATTTTTAATGTCTAGTTTAACT
ATCAAAATTATAACTGTTGGATTTATTTTTTC

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 2

CO CL4372Contig1 863 2 2 U
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GGCGATTGCACATTTGTGTAACTGTGAAGAAGCTGTCTTGTCGAAAGAAGAGGACAAGGT
CTCGAAGCTGCCCGGTCAGAATTTCAATGTAAACTTTGCTCATTATTCTGGGTTCGTCAC
AACGAATGAGAAACTGGGAAGAGCGCTCTTCTACTGGCTCTTTGAAGCTGATGAAGATCC
TGCCTCTAAGCCTCTTGTTCTCTGGCTCAATGGAGGACCAGGATGTTCATCAGTTGGGTT
TGGTGAAGCAGAAGAGATAGGACCATTTCACATTAAGCCAGATGGGAAGACTCTTTACCT
TAACCAATATTCTTGGAACCAAGCTGCGAACATTTTGTTCCTTGATGCACCAGTTGGAGT
TGGCTTTTCATACTCAAACACTTCATCTGATTTGCTTACCAATGGTGATAAGAGAACTGC
ACAAGACTCGCTGATATTTCTTCTGAAATGGGTTGAGCGGTATCCGGAGTACAAAGGAAG
AGAGTTTTATATAGTCGGGGAGAGCTATGCGGGGCATTACATTCCTCAGCAGTATGCTGG
TCTAAACTTTGTGACTGTGAGAGGCGCAGGGCATGAAGTTCCTCTGCACAGACCAAAGGA
GGCTCTTGCGCTCTTCAAGGCTTTTATATCTGGAACTCCATTATTGTCCACACCGGAGAA
AAACATCAGGAGCGAGATGTCTGAACTCGTTAGTGACTCGTGATGAGTTCTGATATAATG
AAGATTCTCTCCAGTCAAAACTTTCTAGTCATTGTATGAAGAAGAGAGGGAGAGAATAAA
TAAGAGATTTTTATGTCTTGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BZ93TF U 1
AF RS1BZ93JQ C 263
BS 1 722 RS1BZ93TF
BS 723 863 RS1BZ93JQ

RD RS1BZ93TF 724 0 0
CATACCAAACAAACAACCAATGGCTAAAACCAGAGTATCTTGCTTCGCAATCGTTATTTT
GGCGATTGCACATTTGTGTAACTGTGAAGAAGCTGTCTTGTCGAAAGAAGAGGACAAGGT
CTCGAAGCTGCCCGGTCAGAATTTCAATGTAAACTTTGCTCATTATTCTGGGTTCGTCAC
AACGAATGAGAAACTGGGAAGAGCGCTCTTCTACTGGCTCTTTGAAGCTGATGAAGATCC
TGCCTCTAAGCCTCTTGTTCTCTGGCTCAATGGAGGACCAGGATGTTCATCAGTTGGGTT
TGGTGAAGCAGAAGAGATAGGACCATTTCACATTAAGCCAGATGGGAAGACTCTTTACCT
TAACCAATATTCTTGGAACCAAGCTGCGAACATTTTGTTCCTTGATGCACCAGTTGGAGT
TGGCTTTTCATACTCAAACACTTCATCTGATTTGCTTACCAATGGTGATAAGAGAACTGC
ACAAGACTCGCTGATATTTCTTCTGAAATGGGTTGAGCGGTATCCGGAGTACAAAGGAAG
AGAGTTTTATATAGTCGGGGAGAGCTATGCGGGGCATTACATTCCTCAGCAGTATGCTGG
TCTAAACTTTGTGACTGTGAGAGGCGCAGGGCATGAAGTTCCTCTGCACAGACCAAAGGA
GGCTCTTGCGCTCTTCAAGGCTTTTATATCTGGAACTCCATTATTGTCCACACCGGAGAA
AA
CA

QA 1 722 1 722
DS 

RD RS1BZ93JQ 601 0 0
TGGCTCAATGGAGGACCAGGATGTTCATCAGTTGGGTTTGGTGAAGCAGAAGAGATAGGA
CCATTTCACATTAAGCCAGATGGGAAGACTCTTTACCTTAACCAATATTCTTGGAACCAA
GCTGCGAACATTTTGTTCCTTGATGCACCAGTTGGAGTTGGCTTTTCATACTCAAACACT
TCATTTGATTTGCTTACCAATGGTGATAAGAGAACTGCACAAGACTCGCTGATATTTCTT
CTGAAATGGGTTGAGCGGTATCCGGAGTACAAAGGAAGAGAGTTTTATATAGTCGGGGAG
AGCTATGCGGGGCATTACATTCCTCAGCAGTATGCTGGTCTAAACTTTGTGACTGTGAGA
GGCGCAGGGCATGAAGTTCCTCTGCACAGACCAAAGGAGGCTCTTGCGCTCTTCAAGGCT
TTTATATCTGGAACTCCATTATTGTCCACACCGGAGAAAAACATCAGGAGCGAGATGTCT
GAACTCGTTAGTGACTCGTGATGAGTTCTGATATAATGAAGATTCTCTCCAGTCAAAACT
TTCTAGTCATTGTATGAAGAAGAGAGGGAGAGAATAAATAAGAGATTTTTATGTCTTGGT
T

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 2

CO CL4373Contig1 1030 2 2 U
GGATAGAAAGAGAGTTAGAAATATAGAGAAGAAATCATCACTTACAAAAATATTGTTCCC
TCTTCAGCTCACATGGACACTTCGAGGGACAAACAACTTCCTTCAGATACCTCTTGCATA
GCTTCCTCATCTACAGCTTTTCCATGTCAAGATTCTCTAAACAAGAGCCAAGAACAGAGT
TTCAAAGATGAAGAACCAGGGGCTAACGATTCTAGTCAAGAACATAACAATCAAGAGCTC
AATCTCATCGACTGCATAGATAGCCAGAGTTATAACGGATCTACTACATCCACGGAACAA
AAGCTTTTCTCATGCAACTACTGTCAAAGAACTTTCTATAGTTCACAAGCACTTGGTGGT
CACCAAAACGCACACAAGAGAGAGAGGACTTTGGCAAAAAGAGGGCAACGTCTGGCAGCA
TCAGCCTCAGCTTTTGGACATCCTTACGGTTTCTCTCCAGTTCCTTTCCATGGACAATGC
AACAACAGGTCTTTGGGGATTCAAGCGCATTCGATGACCCACAAGCTAAGTTCGTATAAC
GTGTTTGGTGGTCACTATGGTCATGTCAACTGGTCAAGACAACCTCTTGATCAACAACCA
GCTATAGGTAAACTTCCTTCAATGGATAATTTTCATCATCATCATCATCAGCATCACATG
ATGATGATGATGGATTCTTCAGTAAATTCACGGTCCAATGACATGGCTAGATCATCAAGC
AACATAGGAAGGATTCTAGTAGGGTCGCCGCCTCTTGAACAATGGCAAGGAGGAGTACTG
TTAAGCACTAATCAGGAAGAGCAACAGAAGCTAGACTTATCACTTAAGCTCTAAGATTAC
TTCTTCTTGATTCTTGCATTTAGTATCTTTTATTATGTTTTCATGTGATTGTTATCAATT
TGTACTCTTATGTGTATACTTCTGTCTAATGTACATATTTTCACATATCTACTTAGAGCA
ACATTATTGCTAGGAAAAATTTTAGAGTTCTTAGGTTTTTTTATTATTATTCTGAAGTTA
AGAAACAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GG44TF U 1
AF RS1GG44JQ C 286
BS 1 484 RS1GG44TF
BS 485 1030 RS1GG44JQ

RD RS1GG44TF 484 0 0
GGATAGAAAGAGAGTTAGAAATATAGAGAAGAAATCATCACTTACAAAAATATTGTTCCC
TCTTCAGCTCACATGGACACTTCGAGGGACAAACAACTTCCTTCAGATACCTCTTGCATA
GCTTCCTCATCTACAGCTTTTCCATGTCAAGATTCTCTAAACAAGAGCCAAGAACAGAGT
TTCAAAGATGAAGAACCAGGGGCTAACGATTCTAGTCAAGAACATAACAATCAAGAGCTC
AATCTCATCGACTGCATAGATAGCCAGAGTTATAACGGATCTACTACATCCACGGAACAA
AAGCTTTTCTCATGCAACTACTGTCAAAGAACTTTCTATAGTTCACAAGCACTTGGTGGT
CACCAAAACGCACACAAGAGAGAGAGGACTTTGGCAAAAAGAGGGCAACGTCTGGCAGCA
TCAGCCTCAGCTTTTGGACATCCTTACGGTTTCTCTCCAGTTCCTTTCCATGGACAATGC
AACA

QA 1 484 1 484
DS 

RD RS1GG44JQ 745 0 0
ACATCCACGGAACAAAAGCTTTTCTCATGCAACTACTGTCAAAGAACTTTCTATAGTTCA
CAAGCACTTGGTGGTCACCAAAACGCACACAAGAGAGAGAGGACTTTGGCAAAAAGAGGG
CAACGTCTGGCAGCATCAGCCTCAGCTTTTGGACATCCTTACGGTTTCTCTCCAGTTCCT
TTCCATGGACAATGCAACAACAGGTCTTTGGGGATTCAAGCGCATTCGATGACCCACAAG
CTAAGTTCGTATAACGTGTTTGGTGGTCACTATGGTCATGTCAACTGGTCAAGACAACCT
CTTGATCAACAACCAGCTATAGGTAAACTTCCTTCAATGGATAATTTTCATCATCATCAT
CATCAGCATCACATGATGATGATGATGGATTCTTCAGTAAATTCACGGTCCAATGACATG
GCTAGATCATCAAGCAACATAGGAAGGATTCTAGTAGGGTCGCCGCCTCTTGAACAATGG
CAAGGAGGAGTACTGTTAAGCACTAATCAGGAAGAGCAACAGAAGCTAGACTTATCACTT
AAGCTCTAAGATTACTTCTTCTTGATTCTTGCATTTAGTATCTTTTATTATGTTTTCATG
TGATTGTTATCAATTTGTACTCTTATGTGTATACTTCTGTCTAATGTACATATTTTCACA
TATCTACTTAGAGCAACATTATTGCTAGGAAAAATTTTAGAGTTCTTAGGTTTTTTTATT
ATTATTCTGAAGTTAAGAAACAATG

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 2

CO CL4374Contig1 988 2 2 U
GGAACCTCATTTGTCATAAACTCACTTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCCCCCATGG
AAGAAACCAATGGACAAAGAGAAACTCACAACTTCATGAACGTCAATGTTGAATCCTTTT
CTCAGCTTCCGTTCATCCACCGTACCCGTACTCCTCCCAAAGATAAAACCTCCATGATTC
GTCTCTTCGGCCAAGAGCTCGTTAGAGATAACCCTCGACAAGAAGCCTTCTCTCCAGATC
CTTGTGAAACTACAACAACCAAGATCAACCATGAGAAGAATGTCAAGGAAGATAATAAGG
ACAAGGACAACATCAGTAACAGGAGATTTGAGTGTCACTACTGTTTCAGAAAATTCCCGA
CTTCTCAAGCCCTAGGTGGACACCAAAACGCTCACAAACGCGAACGCCAACACGCCAAAC
GCGGTTCCATGACCCCATACCTTGATCACCATCATTATTATCAGCCTGAGCCTCACCACG
TCTACGGCTTCCTCAACAACTATCACCACCGTCACTATCCCTCGTGGACGACGGAAGCTA
GATTCTACGGTGGTGGTGGTGGTGGACTACAACAAATGCCATCATATTACTCAGGCACTC
TTCTTCCTCCTTCTTCTTCTTCTTCTACCCCACCGACGATCAACGGAAGTCCTTTAGGTT
TCTGGCGTGTACCGCCTTCCACGTCAACAAACGCTATTCATGGAGTTTACTCAGCTTCAC
CAGCTTTAGCGTTTAGGGCCCATGACCAAGAGAGTAGGGAACCGAGTTGGCCCTACAAAT
TGATGAAACCTAATGTGAAAGATCATTTGAGTCTCGATCTTCATCTTTGGTACTTCTTTG
CGTTGGTATATCATTTAAACCTGGCCAACCAATTCTTCTTAGAGTGTTCATTCTTTCTGA
AGAGAACCGGGCAGGATGTGTAGATCTTGAACGTTTGGCTTTTTCTTATTTATTATGAGT
TTATATGATTATAAAATATGTTTATCCT


BQ
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AF RS1GR25TF U 1
AF RS1GR25JQ C 594
BS 1 655 RS1GR25TF
BS 656 988 RS1GR25JQ

RD RS1GR25TF 655 0 0
GGAACCTCATTTGTCATAAACTCACTTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCCCCCATGG
AAGAAACCAATGGACAAAGAGAAACTCACAACTTCATGAACGTCAATGTTGAATCCTTTT
CTCAGCTTCCGTTCATCCACCGTACCCGTACTCCTCCCAAAGATAAAACCTCCATGATTC
GTCTCTTCGGCCAAGAGCTCGTTAGAGATAACCCTCGACAAGAAGCCTTCTCTCCAGATC
CTTGTGAAACTACAACAACCAAGATCAACCATGAGAAGAATGTCAAGGAAGATAATAAGG
ACAAGGACAACATCAGTAACAGGAGATTTGAGTGTCACTACTGTTTCAGAAAATTCCCGA
CTTCTCAAGCCCTAGGTGGACACCAAAACGCTCACAAACGCGAACGCCAACACGCCAAAC
GCGGTTCCATGACCCCATACCTTGATCACCATCATTATTATCAGCCTGAGCCTCACCACG
TCTACGGCTTCCTCAACAACTATCACCACCGTCACTATCCCTCGTGGACGACGGAAGCTA
GATTCTACGGTGGTGGTGGTGGTGGACTACAACAAATGCCATCATATTACTCAGGCACTC
TTCTTCCTCCTTCTTCTTCTTCTTCTACCCCACCGACGATCAACGGAAGTCCTTT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1GR25JQ 395 0 0
GGCACTCTTCTTCCTCCTTCTTCTTCTTCTTCTACCCCACCGACGATCAACGGAAGTCCT
TTAGGTTTCTGGCGTGTACCGCCTTCCACGTCAACAAACGCTATTCATGGAGTTTACTCA
GCTTCACCAGCTTTAGCGTTTAGGGCCCATGACCAAGAGAGTAGGGAACCGAGTTGGCCC
TACAAATTGATGAAACCTAATGTGAAAGATCATTTGAGTCTCGATCTTCATCTTTGGTAC
TTCTTTGCGTTGGTATATCATTTAAACCTGGCCAACCAATTCTTCTTAGAGTGTTCATTC
TTTCTGAAGAGAACCGGGCAGGATGTGTAGATCTTGAACGTTTGGCTTTTTCTTATTTAT
TATGAGTTTATATGATTATAAAATATGTTTATCCT

QA 1 395 1 395
DS 



AS 1 2

CO CL4375Contig1 1105 2 2 U
GAAAACCATGTTGATGGACTTATTCTTTGATCAACTGCCTTGCACTTGGAAGAAGCAGAG
GATACATTTTCATGATTTCATGTTGACTGTTCATAGTCGATTACAAAAGCACAAGGGTTT
ACCAGACCCACTTGAAGTTGTTGCTCAAGAGATAGCTCATGATGCAATCTTACTATGTCT
AGATGAGTTCATGGTAACTGATGTGGCAGATGCTCTGATACTTAACCGACTCTTTGGACA
TCTCTTCAGCAATGGCATAATTCTTGTTGCCACATCGAATAGGAATCCTGATAAACTCTA
TGAAGGAGGACTCCAAAGAGATCTCTTCCTACCTTTCATTGCCTCACTAAAGGAAAGGAA
TGTGGTTCATGAGATTGGCTCAGCCGTTGATTACCGGAAACTAACTTCGGCTGAGCAAGG
ATTCTATTTCATCGGTACAGATCTTTCCACCCTTTTGAAACAGAAGTACCAAGAACTGCT
TGGAGGCAATCTTGTTGCTCGTCCACAGGTAGTAGAAGTGGTCATGGGAAGAAAGTTACA
GGTTCCATTAGGTGCTAAGGGATGTGCATACTTCCCTTTTGAAGAGTTATGCGATCGACC
TCTTGGAGCTGCTGATTACTTCGGACTGTTCAAGAAGTTTCATACTCTTGCATTGGAAGG
AGTACCAGTCTTTGGGCTTCATAACCGGACTGCTGCGTATAGATTCGTCACGCTAGTCGA
TGTGATGTATGAGAACAAAGCAAGGTTGCTGTGTACAGCTGAAGCAACTCCTCAAGAACT
CTTGGAAAAGATTGTAACAATTTCTGACGCGAAATCAATGTCTCCAAGAACATCGTCGAG
ATCAAGAAAGAACGATGTTTCCGAGCTCTGCGTGGACAACGAGTTGGGTTTTGCAAAAGA
TAGAACCATCAGCAGATTAACAGAAATGAACAGTAAGGAGTACTTGGAGCAGCATGCCAT
AACACATAATCTGCAACGCACATAACAAACACACATACAAGTTCCTGTGTTGTTTTCTTC
TTCAAGGGATTGAAGTGTAACTTTGGTTGTATTTTCTGTGTATCATTTGAGAACCATAGA
AAAATATAATACCATTCGTTGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GB07TF U 1
AF RS1GB07JQ C 493
BS 1 605 RS1GB07TF
BS 606 1105 RS1GB07JQ

RD RS1GB07TF 605 0 0
GAAAACCATGTTGATGGACTTATTCTTTGATCAACTGCCTTGCACTTGGAAGAAGCAGAG
GATACATTTTCATGATTTCATGTTGACTGTTCATAGTCGATTACAAAAGCACAAGGGTTT
ACCAGACCCACTTGAAGTTGTTGCTCAAGAGATAGCTCATGATGCAATCTTACTATGTCT
AGATGAGTTCATGGTAACTGATGTGGCAGATGCTCTGATACTTAACCGACTCTTTGGACA
TCTCTTCAGCAATGGCATAATTCTTGTTGCCACATCGAATAGGAATCCTGATAAACTCTA
TGAAGGAGGACTCCAAAGAGATCTCTTCCTACCTTTCATTGCCTCACTAAAGGAAAGGAA
TGTGGTTCATGAGATTGGCTCAGCCGTTGATTACCGGAAACTAACTTCGGCTGAGCAAGG
ATTCTATTTCATCGGTACAGATCTTTCCACCCTTTTGAAACAGAAGTACCAAGAACTGCT
TGGAGGCAATCTTGTTGCTCGTCCACAGGTAGTAGAAGTGGTCATGGGAAGAAAGTTACA
GGTTCCATTAGGTGCTAAGGGATGTGCATACTTCCCTTTTGAAGAGTTATGCGATCGACC
TCTTG

QA 1 605 1 605
DS 

RD RS1GB07JQ 613 0 0
TGTTGCTCGTCCACAGGTAGTAGAAGTGGTCATGGGAAGAAAGTTACAGGTTCCATTAGG
TGCTAAGGGATGTGCATACTTCCCTTTTGAAGAGTTATGCGATCGACCTCTTGGAGCTGC
TGATTACTTCGGACTGTTCAAGAAGTTTCATACTCTTGCATTGGAAGGAGTACCAGTCTT
TGGGCTTCATAACCGGACTGCTGCGTATAGATTCGTCACGCTAGTCGATGTGATGTATGA
GAACAAAGCAAGGTTGCTGTGTACAGCTGAAGCAACTCCTCAAGAACTCTTGGAAAAGAT
TGTAACAATTTCTGACGCGAAATCAATGTCTCCAAGAACATCGTCGAGATCAAGAAAGAA
CGATGTTTCCGAGCTCTGCGTGGACAACGAGTTGGGTTTTGCAAAAGATAGAACCATCAG
CAGATTAACAGAAATGAACAGTAAGGAGTACTTGGAGCAGCATGCCATAACACATAATCT
GCAACGCACATAACAAACACACATACAAGTTCCTGTGTTGTTTTCTTCTTCAAGGGATTG
AAGTGTAACTTTGGTTGTATTTTCTGTGTATCATTTGAGAACCATAGAAAAATATAATAC
CATTCGTTGTTGC

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 2

CO CL4376Contig1 1115 2 2 U
GGGCTCAATCAACAGCTCTCTTCTCCCGCGGCGGGAAAGCCCTTCAAAAGAGCAGCTTCC
TACTTCATAGAGGCTCTCCACAGCTGTCTCCTCCACCACAACAACGCCACCCAACAACAA
CCCCTCCTAAACCCTTACTCCCTCATCTTCAAGATCTCCGCCTACAAATCCTTCTCCGAG
ATCTCCCCCGTCCTCCAGTTCGCCAACTTCACCTCCAACCAAGCCCTCCTCGAGTCCTTC
CACGGCTTCAACCGCCTCCACATCACCGACTTCGACATCGGCTTCGGCGGCCAATGGGCC
TCCCTCACGCAAGAGCTCGTCCTCCGCGACAACACCCCTCCCCTCTCCCTCAAGATCACA
CTCCTCGCTTCTTCTCACGACGACCTCGAGCTCGGCTTCGCTCAAGACAACCTCAAACAC
TTCGCCTCCGAGATCAACATCTCCCTCGACATCCAGGTCCTCACCTTAGACCTCCTCCTC
TCCTTCCCTCCTCCCAACTCCTCCGACAAAGAAGCCGTCGCCGTTAACCTCTCCCCATCC
TCCTTCTCAAACACCCCTTCCCTCCTCCTCCGTTTCGTCAAACACCTCTCCCCGACCATC
ATCGTCTGCTCCGACAGAGGCTGCGAGAGGACCGACCTGCCTTTCCCTCAGCAGCTCATC
CACTCGCTCCAGTCCCACGCCGCTCTCCTCGAGTCCCTCGACGCCGTCAACGCCAGCCTC
GACGCGATGCAGAAGATCGAGAGGTTCCTCGTACAGCCGGAGATCGAGAAGCTCGTCCTC
GACCGTAGTTGTAGCCGCCGTCGTCCGGTCGAAAGGCCGATGATGATGACGTGGCAAGCA
ATGTTCATGCAGATGGGGTTCTCGCCTGTGGCGCACAGCAACTTCACGGAGTCTCAGGCT
GAGTGTTTGGTTCAGAGGACGCCTGTGAGAGGCTTTCACGTCGAGAAGAAACATAACTCT
CTTCTTCTCTGCTGGCAAAGGAGAGAACTCGTCGGCGTCTCCGCCTGGAGATGTCGCTCC
TGAGAATCCATCACCACCCTCTACTTTTTTATTTTTTTATTGTTAAATGTATTCTTAATT
TTAATCTATCATCTAATTATGACATATATTTTCAG


BQ
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AF RS1F512TF U 1
AF RS1F512JQ C 477
BS 1 617 RS1F512TF
BS 618 1115 RS1F512JQ

RD RS1F512TF 617 0 0
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TACTTCATAGAGGCTCTCCACAGCTGTCTCCTCCACCACAACAACGCCACCCAACAACAA
CCCCTCCTAAACCCTTACTCCCTCATCTTCAAGATCTCCGCCTACAAATCCTTCTCCGAG
ATCTCCCCCGTCCTCCAGTTCGCCAACTTCACCTCCAACCAAGCCCTCCTCGAGTCCTTC
CACGGCTTCAACCGCCTCCACATCACCGACTTCGACATCGGCTTCGGCGGCCAATGGGCC
TCCCTCACGCAAGAGCTCGTCCTCCGCGACAACACCCCTCCCCTCTCCCTCAAGATCACA
CTCCTCGCTTCTTCTCACGACGACCTCGAGCTCGGCTTCGCTCAAGACAACCTCAAACAC
TTCGCCTCCGAGATCAACATCTCCCTCGACATCCAGGTCCTCACCTTAGACCTCCTCCTC
TCCTTCCCTCCTCCCAACTCCTCCGACAAAGAAGCCGTCGCCGTTAACCTCTCCCCATCC
TCCTTCTCAAACACCCCTTCCCTCCTCCTCCGTTTCGTCAAACACCTCTCCCCGACCATC
ATCGTCTGCTCCGACAG

QA 1 617 1 617
DS 

RD RS1F512JQ 639 0 0
CCTCTCCTTCCCTCCTCCCAACTCCTCCGACAAAGAAGCCGTCGCCGTTAACCTCTCCCC
ATCCTCCTTCTCAAACACCCCTTCCCTCCTCCTCCGTTTCGTCAAACACCTCTCCCCGAC
CATCATCGTTTGCTCCGACAGAGGCTGCGAGAGGACCGACCTGCCTTTCCCTCAGCAGCT
CATCCACTCGCTCCAGTCCCACGCCGCTCTCCTCGAGTCCCTCGACGCCGTCAACGCCAG
CCTCGACGCGATGCAGAAGATCGAGAGGTTCCTCGTACAGCCGGAGATCGAGAAGCTCGT
CCTCGACCGTAGTTGTAGCCGCCGTCGTCCGGTCGAAAGGCCGATGATGATGACGTGGCA
AGCAATGTTCATGCAGATGGGGTTCTCGCCTGTGGCGCACAGCAACTTCACGGAGTCTCA
GGCTGAGTGTTTGGTTCAGAGGACGCCTGTGAGAGGCTTTCACGTCGAGAAGAAACATAA
CTCTCTTCTTCTCTGCTGGCAAAGGAGAGAACTCGTCGGCGTCTCCGCCTGGAGATGTCG
CTCCTGAGAATCCATCACCACCCTCTACTTTTTTATTTTTTTATTGTTAAATGTATTCTT
AATTTTAATCTATCATCTAATTATGACATATATTTTCAG

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 2

CO CL4377Contig1 1002 2 2 U
GGACGTCCGCTTAAACCCTCGTGCTGAGAGTCTGAGACTGTTTCGCCTTCAACCTTTTTC
TCCCGCCAATAGATTTACAGTACAATAAATTAGGGTTTTCGAAGCTTAATCGTCTCCGAC
TCTGCATCTCCCAGTTTCTAATTCAGAATGGCTGATGAAGAAGCAGAAGCTCTTTCTCAA
TTTGGTATATCGAAGGAGGAAACGGATAAGCTTGTTTCGGAGGTGATAAGATTCATACTC
TTCAAGTCCCATCAAAACTCAGGATGCCCAATTAAAAGAGAAGATTTGACTCAGATTGTT
ACCAAGAACTATCGTCAACGTAACCTCGCCACTCACGTGATCAACGAAGCTAAGACCAAG
CTCTCAACTGTGTTTGGTTATGATTTGAAAGAGCTTCAACGCTCTAGGACTACTTCTAAT
GCTCAAACAAGGCTTCTTCAGTCCCAGAGTAATGCTGACTCTAAATCGTATGTGCTTGTG
AGTCAATTGCCGATTGAAGTGTTCAGGAAACATGTGGTTGAAGAAACAACGAGTCCTATG
ACTGGCTTTACGTTTGCGGTTCTTGCTGTTGTGCAGCTTGCAGGAGGGAAAATACCTGAA
GAAACCCTTTGGCATCATTTGAGGAGAATGGGACTGCACGAAAGCGATGAGCATAATCCT
GTGTTTGGGAGCAACAAGCAGGCCCTAGAGACCTTAGTGCAACAAAGGTTCTTGCATAAG
GAGAAAGTGAGTGGCCCAGAGGGTACTACTCTGTTCTACGATCTTGCTGAGAGAGCTTTA
GATGCGCAAGTTAGCGAGAGAGTGAAAGATTATATTTCACAGATCCTGAAGAATGATGTC
TCTGTTGTTGAGCTCGACTGATTAGTGGAAAATTAAGGATTGGAGACTAACCAGATAGAT
TGGTTCAAGTCTTTGGCTTATGTATTTGTAATATTCCTATGATTATTCAGTGTGAAACTG
TTTTGTGGATTTTAAAAGCAAAAATTAGGATACAATATTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CM35TF U 1
AF RS1CM35JQ C 208
BS 1 674 RS1CM35TF
BS 675 1002 RS1CM35JQ

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TCCCGCCAATAGATTTACAGTACAATAAATTAGGGTTTTCGAAGCTTAATCGTCTCCGAC
TCTGCATCTCCCAGTTTCTAATTCAGAATGGCTGATGAAGAAGCAGAAGCTCTTTCTCAA
TTTGGTATATCGAAGGAGGAAACGGATAAGCTTGTTTCGGAGGTGATAAGATTCATACTC
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ACCAAGAACTATCGTCAACGTAACCTCGCCACTCACGTGATCAACGAAGCTAAGACCAAG
CTCTCAACTGTGTTTGGTTATGATTTGAAAGAGCTTCAACGCTCTAGGACTACTTCTAAT
GCTCAAACAAGGCTTCTTCAGTCCCAGAGTAATGCTGACTCTAAATCGTATGTGCTTGTG
AGTCAATTGCCGATTGAAGTGTTCAGGAAACATGTGGTTGAAGAAACAACGAGTCCTATG
ACTGGCTTTACGTTTGCGGTTCTTGCTGTTGTGCAGCTTGCAGGAGGGAAAATACCTGAA
GAAACCCTTTGGCATCATTTGAGGAGAATGGGACTGCACGAAAGCGATGAGCATAATCCT
GTGTTTGGGAGCAA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1CM35JQ 795 0 0
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CCAATTAAAAGAGAAGATTTGACTCAGATTGTTACCAAGAACTATCGTCAACGTAACCTC
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AGTAATGCTGACTCTAAATCGTATGTGCTTGTGAGTCAATTGCCGATTGAAGTGTTCAGG
AAACATGTGGTTGAAGAAACAACGAGTCCTATGACTGGCTTTACGTTTGCGGTTCTTGCT
GTTGTGCAGCTTGCAGGAGGGAAAATACCTGAAGAAACCCTTTGGCATCATTTGAGGAGA
ATGGGACTGCACGAAAGCGATGAGCATAATCCTGTGTTTGGGAGCAACAAGCAGGCCCTA
GAGACCTTAGTGCAACAAAGGTTCTTGCATAAGGAGAAAGTGAGTGGCCCAGAGGGTACT
ACTCTGTTCTACGATCTTGCTGAGAGAGCTTTAGATGCGCAAGTTAGCGAGAGAGTGAAA
GATTATATTTCACAGATCCTGAAGAATGATGTCTCTGTTGTTGAGCTCGACTGATTAGTG
GAAAATTAAGGATTGGAGACTAACCAGATAGATTGGTTCAAGTCTTTGGCTTATGTATTT
GTAATATTCCTATGATTATTCAGTGTGAAACTGTTTTGTGGATTTTAAAAGCAAAAATTA
GGATACAATATTGGC

QA 1 795 1 795
DS 



AS 1 2

CO CL4378Contig1 930 2 2 U
CCTCCACCGTCGAAGTGTGCTTGCTCCACTTCTGGGAGGCGAAAAACGTCCGCCGTGGTG
GAGAGCTCACGGGCGTCGACATACTTTTGGTTGATTCTCAGAGTTCATCACGAAGGATAA
GCTAAAGGAAGTGATGAAATCGATGGCAGAACTTTGGGAGATGATGATCGGTATCTACAT
TGATGGCAATGGAGACATCTATAATGGCCCAAAACACCTCTCAGGTATAGTATGTATTCA
CTAAAACCTTTTAGTTACAGTGAATATTAATCAACGAGCTCAGATAATAAAAACTACAAA
TGAAATTTGGTTTAGGAATCAGCATGGAATGAACTAATAGAAATATCCAGAGTGTTAGAT
GGGACAGTTTCACATCGAAACTTGAGCTTGAAGATCGTCAGTCACCATCCCTACTTTCAA
ATGGATATCCAAAACATAGACAAATTCTCAGATTAGTCGTCGACAGGTTCAGGAGGTGGT
GACGGTGAGAGATCAGCTGGAGAAGAAAGAGCAAGATTCCAGGATTGTCGAATCAGAGTG
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AGAACGATGCTTGACAATGAGATTCAAGGAGAAGAAGCCTTCAGAAACTTCTCTTGCTGA
AAGAGAAGAAAAGAAACAGAAAGACCAAGCTATGCTCTTCCACAAAAACCAAGGTAGTTA
ATTGCTCATAGAGCAAAGTGTGGAAATTCTTTATCCGAAAAGAAGATGACCGTGCACAAT
GCAATATGTTTCTGTAAAATTACAGGAACTGAAAGTAACACTAGAAACACGTATGTGGGC
TCTACGTGAGATTTCTGAGTGTATCTTGGTTCGTTTATGTTTTTAATTCAGCTTGAGTTA
CAATATGTGTTTATTTAAGACTTTTGGTGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CQ64TF U 1
AF RS1CQ64JQ C 159
BS 1 634 RS1CQ64TF
BS 635 930 RS1CQ64JQ

RD RS1CQ64TF 634 0 0
CCTCCACCGTCGAAGTGTGCTTGCTCCACTTCTGGGAGGCGAAAAACGTCCGCCGTGGTG
GAGAGCTCACGGGCGTCGACATACTTTTGGTTGATTCTCAGAGTTCATCACGAAGGATAA
GCTAAAGGAAGTGATGAAATCGATGGCAGAACTTTGGGAGATGATGATCGGTATCTACAT
TGATGGCAATGGAGACATCTATAATGGCCCAAAACACCTCTCAGGTATAGTATGTATTCA
CTAAAACCTTTTAGTTACAGTGAATATTAATCAACGAGCTCAGATAATAAAAACTACAAA
TGAAATTTGGTTTAGGAATCAGCATGGAATGAACTAATAGAAATATCCAGAGTGTTAGAT
GGGACAGTTTCACATCGAAACTTGAGCTTGAAGATCGTCAGTCACCATCCCTACTTTCAA
ATGGATATCCAAAACATAGACAAATTCTCAGATTAGTCGTCGACAGGTTCAGGAGGTGGT
GACGGTGAGAGATCAGCTGGAGAAGAAAGAGCAAGATTCCAGGATTGTCGAATCAGAGTG
AAAGGAGACGGAGCGAGAAATTCGCGACACTTAAGCAGATGAATTTTACTTCTTATGATC
AGAACGATGCTTGACAATGAGATTCAAGGAGAAG

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1CQ64JQ 772 0 0
AGATGATGATCGGTATCTACATTGATGGCAATGGAGACATCTATAATG*CCCAAAACACC
TCTCAGGTATAGTATGTATTCACTAAAACCTTTTAGTTACAGTGAATATTAATCAACGAG
CTCAGATAATAAAAACTACAAATGAAATTTGGTTTAGGAATCAGCATGGAATGAACTAAT
AGAAATATCCAGAGTGTTAGATGGGACAGTTTCACATCGAAACTTGAGCTTGAAGATCGT
CAGTCACCATCCCTACTTTCAAATGGATATCCAAAACATAGACAAATTCTCAGATTAGTC
GTCGACAGGTTCAGGAGGTGGTGACGGTGAGAGATCAGCTGGAGAAGAAAGAGCAAGAT*
CCAGGATTGTCGAATCAGAGTGAAAGGAGACGGAGCGAGAAATTCGCGACACTTAAGCAG
ATGAATTTTACTTCTTATGATCAGAACGATGCTTGACAATGAGATTCAAGGAGAAGAAGC
CTTCAGAAACTTCTCTTGCTGAAAGAGAAGAAAAGAAACAGAAAGACCAAGCTATGCTCT
TCCACAAAAACCAAGGTAGTTAATTGCTCATAGAGCAAAGTGTGGAAATTCTTTATCCGA
AAAGAAGATGACCGTGCACAATGCAATATGTTTCTGTAAAATTACAGGAACTGAAAGTAA
CACTAGAAACACGTATGTGGGCTCTACGTGAGATTTCTGAGTGTATCTTGGTTCGTTTAT
GTTTTTAATTCAGCTTGAGTTACAATATGTGTTTATTTAAGACTTTTGGTGC

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

CO CL4379Contig1 899 2 4 U
GGATCTTCGTCGTCTCATCTGTCCTCTGCTTCGATAACAAGAGGAAACACAAAAAAAAAT
AAAAAAAATTGGGAGGGATGGGACAAGCATTTCGTAAGCTATTCGATACTTTCTTCGGCA
ATCAAGAGATGAGGGTGGTGATGCTGGGGCTGGATGCTGCTGGGAAAACTACTATTCTCT
ACAAACTTCACATCGGAGAAGTTCTCTCTACTGTTCCCACCATTGGATTCAACGTTGAGA
AAGTTGAGTACAAGAATGTGATGTTCACGGTTTGGGATGTCGGTGGCCAAGAAAAACTCA
GACCTCTTTGGAGGCACTACTTCAATAACACTGATGGTCTTATATACGTGGTAGACTCTT
TGGACCGAGAGAGGCTTGGGAAAGCAAAGCAAGAATTTCAGGAGATCATAAAAGACCCAT
TCATGCTCAACAGTATCATTCTGGTCTTTGCAAACAAACAAGACATGAGAGGAGCCATGT
CACCGAGAGAAGTATGTGAAGGGTTAGGCTTATTTGATCTCAAGAACAGGAAGTGGCACA
TACAAGGAACCTGTGCTCTTCGTGGCGACGGCCTTTATGAAGGCTTGGATTGGTTATCAT
CTACGCTTAAGGATGTCAAAGCCGCTGGATTCACCTCCGTCGGACCCTCGTTCTAACTCT
TTCACGCTGGTATCAAAGCAGTAATCACACCAAAACAAAATCAGAACCACTAAATCCTTT
TGTTAGGGAAGGAATCATCCTTCTCTCATGGTGCCAAACCTTACAATAGACTCAATTTGA
CTACTTTTTTTATTTTATTTTGGATCATGCTGCCATGAGAGCCTTCACTGTATATTATGT
TGATGAAGTTTGTATCATCTCTAAACGTTCCCTTTTGGGGTCATCTTTTGTCCGATTGG


BQ
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AF RS1GH02TF U 1
AF RS1GH02JQ C 228
BS 1 611 RS1GH02TF
BS 612 612 RS1GH02JQ
BS 613 699 RS1GH02TF
BS 700 899 RS1GH02JQ

RD RS1GH02TF 702 0 0
GGATCTTCGTCGTCTCATCTGTCCTCTGCTTCGATAACAAGAGGAAACACAAAAAAAAAT
AAAAAAAATTGGGAGGGATGGGACAAGCATTTCGTAAGCTATTCGATACTTTCTTCGGCA
ATCAAGAGATGAGGGTGGTGATGCTGGGGCTGGATGCTGCTGGGAAAACTACTATTCTCT
ACAAACTTCACATCGGAGAAGTTCTCTCTACTGTTCCCACCATTGGATTCAACGTTGAGA
AAGTTGAGTACAAGAATGTGATGTTCACGGTTTGGGATGTCGGTGGCCAAGAAAAACTCA
GACCTCTTTGGAGGCACTACTTCAATAACACTGATGGTCTTATATACGTGGTAGACTCTT
TGGACCGAGAGAGGCTTGGGAAAGCAAAGCAAGAATTTCAGGAGATCATAAAAGACCCAT
TCATGCTCAACAGTATCATTCTGGTCTTTGCAAACAAACAAGACATGAGAGGAGCCATGT
CACCGAGAGAAGTATGTGAAGGGTTAGGCTTATTTGATCTCAAGAACAGGAAGTGGCACA
TACAAGGAACCTGTGCTCTTCGTGGCGACGGCCTTTATGAAGGCTTGGATTGGTTATCAT
CTACGCTTAAG*ATGTCAAAGCCGCTGGATTCACCTCCGTCGGACCCTCGTTCTAACTCT
TTCACGCTGGTATCAAAGCAGTAATCACACCAAAACAAA
TCA

QA 1 699 1 699
DS 

RD RS1GH02JQ 672 0 0
TTCAACGTTGAGAAAGTTGAGTACAAGAATGTGATGTTCACGGTTTGGGATGTCGGTGGC
CAAGAAAAACTCAGACCTCTTTGGAGGCACTACTTCAATAACACTGATGGTCTTATATAC
GTGGTAGACTCTTTGGACCGAGAGAGGCTTGGGAAAGCAAAGCAAGAATTTCAGGAGATC
ATAAAAGACCCATTCATGCTCAACAGTATCATTCTGGTCTTTGCAAACAAACAAGACATG
AGAGGAGCCATGTCACCGAGAGAAGTATGTGAAGGGTTAGGCTTATTTGATCTCAAGAAC
AGGAAGTGGCACATACAAGGAACCTGTGCTCTTCGTGGCGACGGCCTTTATGAAGGCTTG
GATTGGTTATCATCTACGCTTAAGGATGTCAAAGCCGCTGGATTCACCTCCGTCGGACCC
TCGTTCTAACTCTTTCACGCTGGTATCAAAGCAGTAATCACACCAAAACAAAATCAGAAC
CACTAAATCCTTTTGTTAGGGAAGGAATCATCCTTCTCTCATGGTGCCAAACCTTACAAT
AGACTCAATTTGACTACTTTTTTTATTTTATTTTGGATCATGCTGCCATGAGAGCCTTCA
CTGTATATTATGTTGATGAAGTTTGTATCATCTCTAAACGTTCCCTTTTGGGGTCATCTT
TTGTCCGATTGG

QA 1 672 1 672
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4381Contig1 1408 2 6 U
GGACTGTTTTCCTTTAAAGATCTTTCTGCCGGAACTTGGAACTCCAAAAGACAGTTGAGT
CAACAAAAGGAATTTCAGGTTCAGACATGTCTTATATTCCACCACACAAGCGTCACTCGA
AGGATCCGGACAGGCCTTACCCTGTTCCTGATTCTCTAGCTACAAAATTTAAGAAGAACC
TCCACTTCAACGGTAGTTACAGTGACAAACGCGACCGAGTCCTATACTCAGGAGATTCCA
TCACAAAATGGTTTCTGATTGGCTCCAATGGAATTGAAGATGAGATTCCTCCATCTGCTA
AACTTGTTCCCTTGTCCTCTGATTCTGTCCTATGCAAAAAAGGAAAAAAGCCTTCAATAC
TGATGAACATCAGTGACCGTAATGAGGGAGAAGAAGAAGAAGAAGAGAGAACTAGGTGGC
TGTTAATAGCAGAAAAAGTCCAGGAGGATCTTGTTTTGGCATATGAGCGAGCTAAGACTG
CAATGGATGGAGGTAATCAACATGTATTGAGATTGGTTGCTAGCTTTGGTAAAGACTTCT
TCTATGGGCAAACACCCTCGAATAAGATCTTCTCTACTGATGTCCCAACTTCTTACTTAC
ACCACATCAAGTCTCAGCTTGTGCCAAGACATGGATTCTGCATAGACTCGGAAAAGGAAA
GATACACCGTGAAGGTATCACACTATACTCGTCCCAATGAAACCATTAGCTGTAAGTGTA
CTGTTAAGGAAGATGGGCGGCTCAGTTTGTACAAGATCGAACTTAAACTTGTAAGACATT
TGGTTGTCGATGTATCTTGCATTGATAAGAATCTTGACATGAGGCTAATGCTAGCTGCCA
AAAGGAAAATCACTTCTCTCACTGAGAAATAGATAAGTGACATCAAAGGGCTGCTTGATT
CAGCTAGAGTTGATCCAAATGTGAAAGGTGGTTTAAGGTGGCCGTTTGGTAAATCTTCAT
CTGGGAATGGATACAGTGTCTTTGAATCTTGTCATGTTAAAGCTACAGTCTACAAGAACA
AAACTCTAAGGCTTAGGGTCAGAGAGACTGATAGATTCAATGAGAGCATTGGAACTGGGG
AAGTCAAGAGGGAGGTGATGCTGATGTTCAAAGACATGAACACTAAGTTACAGGAGCAGA
ACATTGACAGGGGTTGTGTTTTGGAAATGCTCAGAGATGTTCTTGGAACCTTGTGTGACT
TCTTGCGTTGTGAAGCCTATCATCTTACATGATAAAGAACGATATGATGTTGATGGTGCT
GTTGAATTTCTCACTATCTTTTCGATTCTGTTGAGCTTTTTGTACTATATATGTGTTTTT
CAAAGTTTCTGTGTGGGTTGTGAAAGATTAAAATGTTGCGTGTTGTCCAAAAACGAATAG
AACTTGTGCTATTGCATTTCTCTTTTAC


BQ
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AF RS1EQ77TF U 1
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DS 

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GGGCGGCTCAGTTTGTACAAGATCGAACTTAAACTTGTAAGACATTTGGTTGTCGATGTA
TCTTGCATTGATAAGAATCTTGACATGAGGCTAATGCTAGCTGCCAAAAGGAAAATCACT
TCTCTCACTGAGAAATAGATAAGTGACATCAAAGGGCTGCTTGATTCAGCTAGAGTTGAT
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AGTGTCTTTGAATCTTGTCATGTTAAAGCTACAGTCTACAAGAACAAAACTCTAAGGCTT
AGGGTCAGAGAGACTGATAGATTCAATGAGAGCATTGGAACTGGGGAAGTCAAGAGGGAG
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CATTTCTCTTTTAC

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DS 



AS 1 2

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AAGCATTAACGCCTACTGCATCACTACTCCCACTCTCCAATTAGATAAGCCATAGCATCT
TCCGAAGTAACCGACTGAAGCGTACTCTATAAATATCTTCGTGGCTTGGGATGAACAGTC
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TTGTTCTCTTCGCCACCATATGTTCCCATTCCCACCGATTTGTACCATAATAACATTTCA
AGCTTGGATTTCGAAACCACCCCAGTTTGGTTTCAGTCATGACGCCCTAATCTATTGAAT
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CACTGATGTACCTTGGAAAAAGGAGGAAGGAGCGAGTCTCCTTAGTCCTTGCACCAGATT
TATGTTCTCAACTGATGAGACCTTTGAAGAGATCACCCCTCAAACTTATGTCTTTAAGCA
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CGAGCAGCCATTACCGAGTTTGAGATATTCAGCAATAACGGTACATGGCTTTGGCATGCT
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CAGGCAATGATCACCCAACAAGTTTCAGATAACTGAATATATTTCTATATATGTTTTCAT
TTCC


BQ
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10 10 10 10 

AF RS1C836TF U 1
AF RS1C836JQ C 609
BS 1 671 RS1C836TF
BS 672 1324 RS1C836JQ

RD RS1C836TF 671 0 0
GGACGTCTATCTCCGACGTCTGTTTCTGTAACCGGTGTAGTAATCGTCGGACATTAATCC
AAGCATTAACGCCTACTGCATCACTACTCCCACTCTCCAATTAGATAAGCCATAGCATCT
TCCGAAGTAACCGACTGAAGCGTACTCTATAAATATCTTCGTGGCTTGGGATGAACAGTC
ACACCAAACCGAAAACCCAAAGGTCTCTCCCTGTGAAGCATAAGATCCATCAGTGGTGAA
TTCAATTACTCTTCTTGCCGATTTGAACATCCAAACTTACTAAATAAGTCAAAAGGATGG
CACAAACAATCTCACTACTGAAGAACTACGGAGAAGCCAACGAAGAACCCAAAGATTTTC
CGATCGCCACATGCACCAAAGCTCCGCCGTAGACAGACCTCCTCTCCGGCGTTCCGTCAG
CAGATAGGTCGATCGTCTTCCACTTCAATTTCACCACTGATCCTCCACCGCACTACCACT
TTGTTCTCTTCGCCACCATATGTTCCCATTCCCACCGATTTGTACCATAATAACATTTCA
AGCTTGGATTTCGAAACCACCCCAGTTTGGTTTCAGTCATGACGCCCTAATCTATTGAAT
TCTCCGTCTATACGAGAGTACACCGAAAGGTCTTCTTATTTACGAGGAAACTACAGTCAT
CACTGATGTAC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1C836JQ 716 0 0
TATACGAGAGTACACCGAAAGGTCTTCTTATTTACGAGGAAACTACAGTCATCACTGATG
TACCTTGGAAAAAGGAGGAAGGAGCGAGTCTCCTTAGTCCTTGCACCAGATTTATGTTCT
CAACTGATGAGACCTTTGAAGAGATCACCCCTCAAACTTATGTCTTTAAGCACTACGCTT
GCGAAGTGTGTTGATTGTTTAATTTGCTTTTTGTGGATGTGGTTGTAGGTCTGTTCCATC
AAACAAATAAGATATAGTTCCATCTTGCTAAGAAGATATAGATAAGGAACCACGAGCAGC
CATTACCGAGTTTGAGATATTCAGCAATAACGGTACATGGCTTTGGCATGCTGTTGGAGC
CAGGACTCAACGGTTCGTCCACATGACTAACTGGTGGTTGATGGATTCATAGAAAAGATT
CCAGCACGTGCTTGATTCTTGTGGTGTAAACAAATCACTGAAGAATGTGGCTTTAAAGAA
GGCAATTACATGATCATAGAAGAGCTGGAGTTGGTGTGGCGTGACCCAACCAATGGCTAC
GTCAAGACTATGACACTCAGTTAGATGGCCTCAATGGAAATGAACCATCTTAGGTATCTT
GTGGAGTGTTTCTTAATTATACCGACCCTAGAAGTGAATCAGATGCCTTTTCCAGGCAAT
GATCACCCAACAAGTTTCAGATAACTGAATATATTTCTATATATGTTTTCATTTCC

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

CO CL4383Contig1 1160 2 2 U
GGAAAGTTGTTGCGGGAAAGCTACCAGGAGCCTTTTACAGAGTTGAAGACATGGAGGCAC
AGAGATTCATCGGGAAATGCCTTGTGCCTGCCTCAAAGAGAGTATCAGCAAGAGAACTAT
TGCAAGACCCGTTTCTCGCGTCTGACGAGTCTTGGATGGTGTACGCAAGTGGCGCTAGGA
ATCTGAAGCCATTCTTGAACGAGAGTGAAATGGACAAACTGAAGTTGTGGAGGATGATGA
GTTAGAAAGGAATCTTGACGCTGAAGATAACAAAATTTATCTGAAACTACCAATCGCAAA
TGAAAACGGTCTTGCAAAAAACGTGTCCTTCTGCTTTGACATCATGAATGATACTTCCAT
TGATGTTGCAACGGAGATGGTGAAAGAACTCGAGATCACGGAATGGGATCCGTTAGAGAT
TGCTAAGATGATTGATGGAGAGATCTCTTCTTTGGTGCCTGGTTGGAGGTCCGAGGAAGA
GGATGATTATCATACTCCTTTTCACTCTTCTTCTTCCTCGCCTTCCTCCTCTCGAGCTTC
ACTCTCTAACTATATGGCTCCAAGCCGTCAAGATTGGCTACAAGATGATTTTCACGATGA
GACGTATTCTCAGAGTTCTTCAAATTCAAGCTCTTACTCCAACCTGAACTACATATCTGT
AGATGAGCACATCATCTCCCAACCTCCTCCTGCTATGAACAGAACTCACAACGTGACAAG
GTTTTGCCCAGATGTTCTACATTCAGGACGAGCCAACATGTACGCAGCAGCTTCGAGTTC
GAGTAACTTGAGATTGGCATCATCAGACAACCGCGTACTCACAAGGAACCGCTCGCTTGT
AGACGTGCAGGGTCAGTTACTGCATCGGTCGCTGGTGGAAGAGGCTAGAAGAAGAAGGTT
GATCAGAACTGTTGGAGACGTTGAAAACGTTGGGTTTCAGTCACCTTACGCTGTTTCCCG
CAAGCCACGGAGCTCAAGGCGTTAGGCTTCTTCTCTCTCTAGTATATGTTTTTATTCATG
TAAACATGTATAAGTAATAATGTGTATAAACAAACTTGCTGGTTCAGAAAATGTAAATAA
GTTACGTGAACCACGTTGGGTGGTAATAGCATGGCGTTCCAGCGTTGCTAAGCAAGCTGA
GTTCGAATCCGCTTACACCT


BQ
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AF RS1GA34TF U 1
AF RS1GA34JQ C 317
BS 1 460 RS1GA34TF
BS 461 1160 RS1GA34JQ

RD RS1GA34TF 460 0 0
GGAAAGTTGTTGCGGGAAAGCTACCAGGAGCCTTTTACAGAGTTGAAGACATGGAGGCAC
AGAGATTCATCGGGAAATGCCTTGTGCCTGCCTCAAAGAGAGTATCAGCAAGAGAACTAT
TGCAAGACCCGTTTCTCGCGTCTGACGAGTCTTGGATGGTGTACGCAAGTGGCGCTAGGA
ATCTGAAGCCATTCTTGAACGAGAGTGAAATGGACAAACTGAAGTTGTGGAGGATGATGA
GTTAGAAAGGAATCTTGACGCTGAAGATAACAAAATTTATCTGAAACTACCAATCGCAAA
TGAAAACGGTCTTGCAAAAAACGTGTCCTTCTGCTTTGACATCATGAATGATACTTCCAT
TGATGTTGCAACGGAGATGGTGAAAGAACTCGAGATCACGGAATGGGATCCGTTAGAGAT
TGCTAAGATGATTGATGGAGAGATCTCTTCTTTGGTGCCT

QA 1 460 1 460
DS 

RD RS1GA34JQ 844 0 0
AAAAACGTGTCCT*CTGCTTTGACATCATGAATGATACTTCCATTGATGT*GCAACGGAG
ATGGTGAAAGAACTCGAGATCACGGAATGGGATCCGTTAGAGATTGCTAAGATGATTGAT
GGAGAGATCTCTTCTTTGGTGCCTGGTTGGAGGTCCGAGGAAGAGGATGATTATCATACT
CCTTTTCACTCTTCTTCTTCCTCGCCTTCCTCCTCTCGAGCTTCACTCTCTAACTATATG
GCTCCAAGCCGTCAAGATTGGCTACAAGATGATTTTCACGATGAGACGTATTCTCAGAGT
TCTTCAAATTCAAGCTCTTACTCCAACCTGAACTACATATCTGTAGATGAGCACATCATC
TCCCAACCTCCTCCTGCTATGAACAGAACTCACAACGTGACAAGGTTTTGCCCAGATGTT
CTACATTCAGGACGAGCCAACATGTACGCAGCAGCTTCGAGTTCGAGTAACTTGAGATTG
GCATCATCAGACAACCGCGTACTCACAAGGAACCGCTCGCTTGTAGACGTGCAGGGTCAG
TTACTGCATCGGTCGCTGGTGGAAGAGGCTAGAAGAAGAAGGTTGATCAGAACTGTTGGA
GACGTTGAAAACGTTGGGTTTCAGTCACCTTACGCTGTTTCCCGCAAGCCACGGAGCTCA
AGGCGTTAGGCTTCTTCTCTCTCTAGTATATGTTTTTATTCATGTAAACATGTATAAGTA
ATAATGTGTATAAACAAACTTGCTGGTTCAGAAAATGTAAATAAGTTACGTGAACCACGT
TGGGTGGTAATAGCATGGCGTTCCAGCGTTGCTAAGCAAGCTGAGTTCGAATCCGCTTAC
ACCT

QA 1 844 1 844
DS 



AS 1 2

CO CL4384Contig1 1127 2 10 U
GGGATAGATATCTCAATTTCCGACCTGAAGCTTTGTGAGAGAGAGAAATCGGTAATGGCA
ATGAGAAGATACGCGTTGTGTTCGATCCTTGTGTTGTCGTTGTTCGTTTCATCCGTAAGA
AGCAAGGAGTCTGTGTTGACATTGGATCACACTAACTTCACCGAAACCATCAGCAAACAC
GACTTCATTGTCGTCGAGTTCTATGCTCCTTGGTGTGGACACTGCAAGCAGCTAGCTCCT
GAGTACGAGAAGGCTGCGTCAGAGTTGAGCAGTCATGTCCCTCCTCTGGTTCTCGCCAAG
ATCGATGCAAGTGATGAAAAAAACAAAGAATTTGCAACCAAGTACTCGGTTCAAGGCTTC
CCAACAGTCAAGATCCTCAGAAACGGAGGGAAAGCTGTTCAAGACTACAACGGACCTCGT
GAATCCGACGGTATCGTTACTTACTTGAAGAAACAGAGCGGGCCTGCTTCTTTTGAAATC
AAGTCAGCTGATGATGCTGCTGAGGTTGTTGGTGACAAGAATGTGGTTGCCGTTGGTGTC
TTCCCTAAACTATCTGGCTCTGAGTTTAACTCTTTCATGGCCACTGCCGAGAAACTACGC
TCTGATTATGATTTCGCACACACCTTAGATGCCAAGCTTCTTCCTCGTGGAGAGTTTGTG
ACAGGACCTGTAGTCAGGCTATTCAAACCGTTCGATGACCTGTTTGTTGATTCCAGGGAC
TTTGTTGGAGAAGCTTTGGAGGAATTTGTCAAAGAATCAAGCATTCCTCTTATCACCGTC
TTTGATAATGATCCAAACAACCACCCTTATGTTCTCAAATTCTTTGAACTCCCTAATACT
AAGGCGTTGTTCTTCATCAACTTCAACGGAGAAGGAGCTGAGTCTCTTAAATCAAAGTAC
CGTGAAGTTGCTGCTTCCAACAAGGGTCATGGTCTTAGCTTCCTTCTCGGTGATGCTGCG
AACAGCCAAGAGGCCTTCCAGCACTATGGAGTGGAAGAGAGTCAAGTTCCTCTCATGATC
CTCCATACAGTGGATGACAAGAAGTACCTGAAAACAAATGTGGAGGTCGACCAGATTGAA
TCTTGGATCAATGACTTCAATGATGGAAAAGTTCCACAGCACAAAAA


BQ
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15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FZ65TF U 1
AF RS1DV92TF U 518
BS 1 547 RS1FZ65TF
BS 548 548 RS1DV92TF
BS 549 664 RS1FZ65TF
BS 665 665 RS1DV92TF
BS 666 677 RS1FZ65TF
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BS 679 713 RS1FZ65TF
BS 714 714 RS1DV92TF
BS 715 731 RS1FZ65TF
BS 732 1127 RS1DV92TF

RD RS1FZ65TF 736 0 0
GGGATAGATATCTCAATTTCCGACCTGAAGCTTTGTGAGAGAGAGAAATCGGTAATGGCA
ATGAGAAGATACGCGTTGTGTTCGATCCTTGTGTTGTCGTTGTTCGTTTCATCCGTAAGA
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GACTTCATTGTCGTCGAGTTCTATGCTCCTTGGTGTGGACACTGCAAGCAGCTAGCTCCT
GAGTACGAGAAGGCTGCGTCAGAGTTGAGCAGTCATGTCCCTCCTCTGGTTCTCGCCAAG
ATCGATGCAAGTGATGAAAAAAACAAAGAATTTGCAACCAAGTACTCGGTTCAAGGCTTC
CCAACAGTCAAGATCCTCAGAAACGGAGGGAAAGCTGTTCAAGACTACAACGGACCTCGT
GAATCCGACGGTATCGTTACTTACTTGAAGAAACAGAGCGGGCCTGCTTCTTTTGAAATC
AAGTCAGCTGATGATGCTGCTGAGGTTGTTGGTGACAAGAATGTGGTTGCCGTTGGTGTC
TTCCCTACACTATCTGGCTCTGAGTTTAACTCTTTCATGGCCACTGCCGAGAAACTACGC
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TTTGTTGGAGA
GCTTG

QA 1 731 1 731
DS 

RD RS1DV92TF 610 0 0
G
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GGCCACTGCCGAGAAACTACGCTCTGATTATGATTTCGCACACACCTTAGATGCCAAGCT
TCTTCCTCGTGGAGAGTTTGTGACAGGACCTGTAGTCAGGCTATTCAAACCGTTCGATGA
CCTGTTTGTTGATTCCAGGGACTTTGTTGGAGAAGCTTTGGAGGAATTTGTCAAAGAATC
AAGCATTCCTCTTATCACCGTCTTTGATAATGATCCAAACAACCACCCTTATGTTCTCAA
ATTCTTTGAACTCCCTAATACTAAGGCGTTGTTCTTCATCAACTTCAACGGAGAAGGAGC
TGAGTCTCTTAAATCAAAGTACCGTGAAGTTGCTGCTTCCAACAAGGGTCATGGTCTTAG
CTTCCTTCTCGGTGATGCTGCGAACAGCCAAGAGGCCTTCCAGCACTATGGAGTGGAAGA
GAGTCAAGTTCCTCTCATGATCCTCCATACAGTGGATGACAAGAAGTACCTGAAAACAAA
TGTGGAGGTCGACCAGATTGAATCTTGGATCAATGACTTCAATGATGGAAAAGTTCCACA
GCACAAAAA

QA 2 610 2 610
DS 



AS 1 2

CO CL4385Contig1 771 2 3 U
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TTATCCATATATATATGTAGCCACATATTTTTCACCATTACATAAAATGTATTAATAAAA
AGACTTTTTCCTTTTAGTTTGATAAAACTATTAAGTTATACACAATTAAAATATATGCTA
TATGTTTGGACCATGCTCGGCTAATCTCCCTTATCCTGGGGGTGTAGCTCCTCCCGCAGG
TGCAGCTCCTCCTGCTGCGGGTGCAGGTGCTGCTCCTCCTGCCGCAGGTACCGCCCCACC
CGTTGGTACACCTTTGAGTAAATTTTTTAACCATTCTGGGATATTTCCGGACGTCTGAAC
TCCACCACCTGGTTTATTTCCAAATGTTCCAAAAAATGATTTTCCTCCCCATGATCCTCC
AAAGCCACCTGAAAACTTAAACATTTTCAATGGTGTTTGGGCTAAGCGGGCCAACGAAGT
TCCTTCCGCTGTCTTGATGAGCCCCAAGATGAGACTAATGGCGGTGATTCCGAGGGTGGC
ACCGGCCGTTAGCCCAGAGGCTAGGAGAGTAGTGGCTATAGTGGCGGGAAGGAGAATTGG
ACTGAATATGAGGAAAAGTGGTGTGGATACAACTAATGCCACGGCTGAACCGGCGAGTGT
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ATCCAACAATGTGCTGAGAAAAGAGAACATTTTGTACAAAATTCTGGATCC


BQ
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AF RS1EH27JQ U 8
AF RS1EH27TF C 1
BS 1 7 RS1EH27TF
BS 8 510 RS1EH27JQ
BS 511 771 RS1EH27TF

RD RS1EH27JQ 503 0 0
CATGTAAACTGATTCTTGATCTTCTTTACTCTGTCTTATTAAAGCTCAGGAAATTATCCA
TATATATATGTAGCCACATATTTTTCACCATTACATAAAATGTATTAATAAAAAGACTTT
TTCCTTTTAGTTTGATAAAACTATTAAGTTATACACAATTAAAATATATGCTATATGTTT
GGACCATGCTCGGCTAATCTCCCTTATCCTGGGGGTGTAGCTCCTCCCGCAGGTGCAGCT
CCTCCTGCTGCGGGTGCAGGTGCTGCTCCTCCTGCCGCAGGTACCGCCCCACCCGTTGGT
ACACCTTTGAGTAAATTTTTTAACCATTCTGGGATATTTCCGGACGTCTGAACTCCACCA
CCTGGTTTATTTCCAAATGTTCCAAAAAATGATTTTCCTCCCCATGATCCTCCAAAGCCA
CCTGAAAACTTAAACATTTTCAATGGTGTTTGGGCTAAGCGGGCCAACGAAGTTCCTTCC
GCTGTCTTGATGAGCCCCAAGAT

QA 1 503 1 503
DS 

RD RS1EH27TF 771 0 0
TTTTTTTCATGTAAACTGAT*CTTGATCT*CTTTACTCTGTCT*ATTAGAGCTCAGGAAA
TTATCCATATATATATGTAGCCACATATTTT*CACCATTACATAAAATGTATTAATAAAA
AGACTTTTTCCTTTTAGTTTGATAAAACTATTAAGTTATACACAATTAGAATATATGCTA
TATGTTTGGACCATGCTCGGCTAATCTCCCTTATCCTGGGGGTGTAGCTCCTCCCGCAGG
TGCAGCTCCTCCTGCTGCGGGTGCAGGTGCTGCTCCTCCTGCCGCAGGTACCGCCCCACC
CGTTGGTACACCTTTGAGTAGATTTTTTAACCATTCTGGGATATTTCCGGACGTCTGAAC
TCCACCACCTGGTTTATTTCCAAATGTTCCAGAAAATGATTTTCCTCCCCATGATCCTCC
AAAGCCACCTGAAAACTTAAACATTTTCAATGGTGTTTGGGCTAAGCGGGCCAACGAAGT
TCCTTCCGCTGTCTTGATGAGCCCCAAGATGAGACTAATGGCGGTGATTCCGAGGGTGGC
ACCGGCCGTTAGCCCAGAGGCTAGGAGAGTAGTGGCTATAGTGGCGGGAAGGAGAATTGG
ACTGAATATGAGGAAAAGTGGTGTGGATACAACTAATGCCACGGCTGAACCGGCGAGTGT
TAGACACGCAAATGCAAATAAGACTACAGAAGTCACGGAAGCAACAACAACCTTAATAAC
ATCCAACAATGTGCTGAGAAAAGAGAACATTTTGTACAAAATTCTGGATCC

QA 1 771 1 771
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4387Contig1 889 2 2 U
GCTAGGGCTATTTGTTCCTCCTGTGGCCTACGGAGCCAACACTGCCAATGTCGCCTGGAA
GTTTCAACCACCGGAAACACAAACGGTGATGACGTAGAAAGAGCGTCCAAGCTTTCTCGA
GCCTCCTTTTGCAGAATCTACCTCGTCACCGCTATCACGGTCTCAGGATTCTGTATTTTC
GCTTTCTTTTGTGTCCAAGCCTTTACCTACGCCCAACCTAGCTGTCACTTGGAGGTCTTA
GTCGACTCATTCTCTATCTCAAACGTTTCAAACGCAACCGCAGATTGGAACGTCAGTTTT
GTCACGAGGAGCCCAGGTAACGACTGCAAAGTCTCTCTCCATACCATTAAATCGCGTCTC
ATCCGAGGTGGCAATCTTATCTCCGAGTCATTCACTCCGGATTATTTCGGGAAACTCGTC
AACGGACAAATAATCGAACCGCTTTCGTATGCCGTTTTCAGAACGGTTGCAACAACGACC
CAAGTAAACGGTTTGGTATGGGATCTTCGGGTCAATTTCGTATCTAAATTTTATGTAAGC
GGTTTGTCATATCCGGATCAAGGTTTCTTGAACGTGAATTGCGATGGCATACCGGTGAAT
TTTACGGTGGATTCGACCGGAAGTGTGAAGGGGTCGTTGTTCGGACGTATGAGGCCGTGT
GAGTATCTGGTACGGAGTAATTATACGGACACAACATTTTAGAACTAGTTTTTTCTTTCT
CCGATCATCCGTCTATATTCTCCTTTTACGAGTTCTATTGGCTTTGATTAGGGTTAGTTG
TTTTGTTTTCTTCGTTAAAAAATAAAAAAAGGTGTTTTGATATCCAGAATCATTTTAAGA
TAAGATGAGATTAAACACACGGTTGTGTTATAAATTTTTTATTACGCCC


BQ
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AF RS1FJ75TF U 1
AF RS1FJ75JQ C 154
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BS 627 889 RS1FJ75JQ

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TTTACGGTGGATTCGACCGGAAGTGT

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DS 

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GCAACCGCAGATTGGAACGTCAGTTTTGTCACGAGGAGCCCAGGTAACGACTGCAAAGTC
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ACTCCGGATTATTTCGGGAAACTCGTCAACGGACAAATAATCGAACCGCTTTCGTATGCC
GTTTTCAGAACGGTTGCAACAACGACCCAAGTAAACGGTTTGGTATGGGATCTTCGGGTC
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TCTATTGGCTTTGATTAGGGTTAGTTGTTTTGTTTTCTTCGTTAAAAAATAAAAAAAGGT
GTTTTGATATCCAGAATCATTTTAAGATAAGATGAGATTAAACACACGGTTGTGTTATAA
ATTTTTTATTACGCCC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

CO CL4388Contig1 1319 2 2 U
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AATGTCTTTTTCTCTCTTGTTTCAGATCTATTTCTCCTTCTCTCTGAACTCTTGCTAGTC
TCTTCACCATCGACCTTATCTCTCTGTGTGCCTTCTTCTCTCACGGCTATCCTCTATGTT
TATCTCTCCCACTGAAATCTCTGACCGTCGTCGACCTCTCCCCTAAGCTTGAACCTTCCT
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ACCTCCACCTCTACCCCCTAACATCGTTCCACATTCTATGGCCTCTAAAGATTTTCTTTT
TGTGGATGGTGATACAGGTTTCAGGTTTATATCTTCCTTGTGCTTTCAATTTCTAGATCT
TGTTTGTGTAGTCTCTCCAATGATTTGCTTTGTTCAAGAGCAGGAAAGTTCTCACCTTTT
GAAGGAATTTCGATCAAAACACTGGCTTGTTACTCTCCTCTTCTCTGTGGTTTCTCTCTG
TTTCTTCTTCCTTGTGTATCTTTCTTTTTAAATTTCCTAAATTTTTCTCTCTTTTTTTTT
GTGAAAGCAAAGTGTCTGGATCTCATAAAAAAAACAATTCTTTTTTATGCTCTGAGTTGT
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GAGTTCATAGTTAAAGGAGGAACTATATAAACGGATGGCTACACTTCAAGATATTGTTGA
ATCAGTTAGAAGTTCTTGGCTCATACAAAACGGGGCTTTATCTTCCAACAAGTGATATCG
ATCTTATATCACTGGTCTTAACCAAGCTGGATCTGATGGTCTCAACGCTAAGTCCAAGGA
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ATTGGAGGATGTGAGCGCAATCCTTGGGTAACATGTAACAAATCAACTTAGTTTAGGTCA
AGTGATCTCAAGACTTCTGTCCATTGTTGGCTCTAGATTTAGTTTTGTTTTATAGGTTTT
GGTTATTTTGTAAACAATTTTGATATATTAAATTTTAAAATATTTTTATTTTGTAAACG


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AF RS1H686TF U 1
AF RS1H686JQB C 553
BS 1 687 RS1H686TF
BS 688 1319 RS1H686JQB

RD RS1H686TF 687 0 0
GGGAAAAAGAAAAAAAAAAACCCTAGTCTGGTTTGGTCTCAGGAAAGCTAGGCGACTTCG
AATGTCTTTTTCTCTCTTGTTTCAGATCTATTTCTCCTTCTCTCTGAACTCTTGCTAGTC
TCTTCACCATCGACCTTATCTCTCTGTGTGCCTTCTTCTCTCACGGCTATCCTCTATGTT
TATCTCTCCCACTGAAATCTCTGACCGTCGTCGACCTCTCCCCTAAGCTTGAACCTTCCT
GGTTTCAGGTTTATGATTTTGTTTTTTGTAGAAACAAGGATGAGAGAAACAAAGATGATA
GAAGCAAATTACGTCATAGCAAATTACGTCATAGCGTTCTCTTTCTCAGGGTTTACCCCC
ACCTCCACCTCTACCCCCTAACATCGTTCCACATTCTATGGCCTCTAAAGATTTTCTTTT
TGTGGATGGTGATACAGGTTTCAGGTTTATATCTTCCTTGTGCTTTCAATTTCTAGATCT
TGTTTGTGTAGTCTCTCCAATGATTTGCTTTGTTCAAGAGCAGGAAAGTTCTCACCTTTT
GAAGGAATTTCGATCAAAACACTGGCTTGTTACTCTCCTCTTCTCTGTGGTTTCTCTCTG
TTTCTTCTTCCTTGTGTATCTTTCTTTTTAAATTTCCTAAATTTTTCTCTCTTTTTTTTT
GTGAAAGCAAAGTGTCTGGATCTCATA

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1H686JQB 767 0 0
ATCAAAACACTGGCTTGTTACTCTCCTCTTCTCTGTGGTTTCTCTCTGTTTCTTCTTCCT
TGTGTATCTTTCTTTTTAAATTTCCTAAATTTTTCTCTCTTTTTTTTTGTGAAAGCAAAG
TGTCTGGATCTCATAAAAAAAACAATTCTTTTTTATGCTCTGAGTTGTCTCAAGTTCCCT
TCATGTTTCTGTAAAAGATTCGAACTGTTTTGGAGTTTTGGTGTTGTGAGGTTTGTTCCT
AAGGCTTGGCCTTTTCTGGGTTTTTGGTTTGGTCAAGTTTTGAGAATCTTCTTGTAGCTT
CTTTAGTTTGTTTCATATCCTTTCTGATTCTTTGTGTGTTTAGAGGTTGAGTTCATAGTT
AAAGGAGGAACTATATAAACGGATGGCTACACTTCAAGATATTGTTGAATCAGTTAGAAG
TTCTTGGCTCATACAAAACGGGGCTTTATCTTCCAACAAGTGATATCGATCTTATATCAC
TGGTCTTAACCAAGCTGGATCTGATGGTCTCAACGCTAAGTCCAAGGACGATGAAGACTG
TGTATGAACAACCTTACTCTTTTACACTTCAATCGTGGAAGTCTGAGTATTGGAGGATGT
GAGCGCAATCCTTGGGTAACATGTAACAAATCAACTTAGTTTAGGTCAAGTGATCTCAAG
ACTTCTGTCCATTGTTGGCTCTAGATTTAGTTTTGTTTTATAGGTTTTGGTTATTTTGTA
AACAATTTTGATATATTAAATTTTAAAATATTTTTATTTTGTAAACG

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL4389Contig1 561 2 1 U
GGAAACAACAAATAATATTCAAATCAGTAAACTAATAAAAATGGAGAGAGCTTTGTGCAT
CAAACCGACCATTCCTCCTCTTTCTTCACCACTTTTTTCTCCAAAGATAACTCTTCTTCC
TCCTCAAACCATCACAAACACTAAGGGTTCAAGACTCTCATCTCTCAGACCAAACGCATC
ATCTCCTACAACCTCTGATCCTCTCACCGTTGACTATGACTCCCTCCTTTCTGTTTTCCC
AGCCGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGATATGCATGCTCAGCTGACATCTACCCTGAAGT
CAAGCTTGAAACAAAGCCCATCTCCCCTCCCGTGACTTCTTCAGAGAACGTAGACCGAGA
ATACCTAGAGTATAACACCCCTAAAACTGTTTTCGTCGCGGAGGCGTGCGATGATCTCGG
AGGAGAGTTCTGTGAACCTGGCTATCAAAAAGATGTCTATTAGAAGAAGCAAAGATTTGA
TGTGATGTTGATATGTGTTTGTATGTATCTCTATGCTAATATAAAGCTAGCTTCACTTAA
TCAAGACTGAAATTGTGAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1H429TF U 1
AF RS1H429JQB C 93
BS 1 561 RS1H429TF

RD RS1H429TF 561 0 0
GGAAACAACAAATAATATTCAAATCAGTAAACTAATAAAAATGGAGAGAGCTTTGTGCAT
CAAACCGACCATTCCTCCTCTTTCTTCACCACTTTTTTCTCCAAAGATAACTCTTCTTCC
TCCTCAAACCATCACAAACACTAAGGGTTCAAGACTCTCATCTCTCAGACCAAACGCATC
ATCTCCTACAACCTCTGATCCTCTCACCGTTGACTATGACTCCCTCCTTTCTGTTTTCCC
AGCCGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGATATGCATGCTCAGCTGACATCTACCCTGAAGT
CAAGCTTGAAACAAAGCCCATCTCCCCTCCCGTGACTTCTTCAGAGAACGTAGACCGAGA
ATACCTAGAGTATAACACCCCTAAAACTGTTTTCGTCGCGGAGGCGTGCGATGATCTCGG
AGGAGAGTTCTGTGAACCTGGCTATCAAAAAGATGTCTATTAGAAGAAGCAAAGATTTGA
TGTGATGTTGATATGTGTTTGTATGTATCTCTATGCTAATATAAAGCTAGCTTCACTTAA
TCAAGACTGAAATTGTGAACC

QA 1 561 1 561
DS 

RD RS1H429JQB 469 0 0
TTTTTTCTCCAAAGATAACTCTTCTTCCTCCTCAAACCATCACAAACACTAAGGGTTCAA
GACTCTCATCTCTCAGACCAAACGCATCATCTCCTACAACCTCTGATCCTCTCACCGTTG
ACTATGACTCCCTCCTTTCTGTTTTCCCAGCCGAAGCATGTGAAGTGATCAGCGGATATG
CATGCTCAGCTGACATCTACCCTGAAGTCAAGCTTGAAACAAAGCCCATCTCCCCTCCCG
TGACTTCTTCAGAGAACGTAGACCGAGAATACCTAGAGTATAACACCCCTAAAACTGTTT
TCGTCGCGGAGGCGTGCGATGATCTCGGAGGAGAGTTCTGTGAACCTGGCTATCAAAAAG
ATGTCTATTAGAAGAAGCAAAGATTTGATGTGATGTTGATATGTGTTTGTATGTATCTCT
ATGCTAATATAAAGCTAGCTTCACTTAATCAAGACTGAAATTGTGAACC

QA 1 469 1 469
DS 



AS 1 2

CO CL4390Contig1 995 2 2 U
GGGCGTTAGAAAGCAATCTCACACCTCTCTTCCCCGGCGACAACGAAGATCATCAACAAC
ATCCATGGCGATAAGGTCAGTAAAAGTTGGGAATCTCTCCTCAGGAGCAACAGAGCATGA
TATCAAAGAGTTCTTCTCTTTTTCTGGTGAAGTTGAAAGTATTGACATCCAAGGTAGCGA
GAGTAGTGCTTATGTCACATTCAAAGATCCTCAAGGAGCAGAGACAGCTGTGCTCTTATC
AGGTGCGAGTATTGCTGATCAGTCAGTCATCATTGAGATGGCTCCTAACTACACTCCACC
TGCTGCCCCTCATGCTGAAACGCAGAGCGGTGATGGAGGCGCTGCAGAATCAGTCGTACA
GAAGGCGGAAGATGTTGTGAGCAGCATGCTAGCAAAGGGTTTCATCCTCGGGAAAGACGC
GGTCGGCAAAGCAAAAGCATTCGATGAGAAACTCGGTTTCACTTCGACCGCAACCGCAGG
AGTTGCTTCCATCGACCAAAAGATCGGTCTAAGCCAAAAATTCACAGCTGGTACGAGCTT
GGTGAACGACAAGATCAAGGAGGTGGATCAAAGCCTCCAGGTTTCGGAGAGGACAAAGTC
TGCGTACGCGTCGGCCGAACAGACGGTGAGCTGCGCAGGAAACGCCGTGATGAAAAACCG
TTACGTGTTGACCGGTGTGACCTGGGCCGCAGGAGCGTTCAGCAGAGTTGCTAAAGCTGC
TGGAGAGGTTAGTCAGAAAACAAAGGAAAAGGTTGAAGCTGAGCAACCACCACCACAACC
GTCACAGTCACAGGAGCAGTTACCTGAAGGGTATGCTCCGATTCATTCGTCTGAATACTC
CAAGAAGTAAACCTCATTACAGTTGAAAAGTTTTTTTTTTTCTCTTTCATGTTGGATTAT
TTGATATGTTATATATAACATAACTATGCTTGGATCTTGTCTATATATAGATTCAATAAT
CCAAACATTTATACATAGAAAGAGATAACCACCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DC67TF U 1
AF RS1DC67JQ C 161
BS 1 636 RS1DC67TF
BS 637 995 RS1DC67JQ

RD RS1DC67TF 636 0 0
GGGCGTTAGAAAGCAATCTCACACCTCTCTTCCCCGGCGACAACGAAGATCATCAACAAC
ATCCATGGCGATAAGGTCAGTAAAAGTTGGGAATCTCTCCTCAGGAGCAACAGAGCATGA
TATCAAAGAGTTCTTCTCTTTTTCTGGTGAAGTTGAAAGTATTGACATCCAAGGTAGCGA
GAGTAGTGCTTATGTCACATTCAAAGATCCTCAAGGAGCAGAGACAGCTGTGCTCTTATC
AGGTGCGAGTATTGCTGATCAGTCAGTCATCATTGAGATGGCTCCTAACTACACTCCACC
TGCTGCCCCTCATGCTGAAACGCAGAGCGGTGATGGAGGCGCTGCAGAATCAGTCGTACA
GAAGGCGGAAGATGTTGTGAGCAGCATGCTAGCAAAGGGTTTCATCCTCGGGAAAGACGC
GGTCGGCAAAGCAAAAGCATTCGATGAGAAACTCGGTTTCACTTCGACCGCAACCGCAGG
AGTTGCTTCCATCGACCAAAAGATCGGTCTAAGCCAAAAATTCACAGCTGGTACGAGCTT
GGTGAACGACAAGATCAAGGAGGTGGATCAAAGCCTCCAGGTTTCGGAGAGGACAAAGTC
TGCGTACGCGTCGGCCGAACAGACGGTGAGCTGCGC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RS1DC67JQ 835 0 0
TA
TGACATCCAAGGTAGCGAGAGTAGTGCTTATGTCACATTCAAAGATCCTCAAGGAGCAGA
GACAGCTGTGCTCTTATCAGGTGCGAGTATTGCTGATCAGTCAGTCATCATTGAGATGGC
TCCTAACTACACTCCAC*TGCTGCCCCTCATGCTGAAACGCAGAGCGGTGATGGAGGCGC
TGCAGAATCAGTCGTACAGAAGGCGGAAGATGTTGTGAGCAGCATGCTAGCAAAGGGTTT
CATCCTCGGGAAAGACGCGGTCGGCAAAGCAAAAGCATTCGATGAGAAACTCGGTTTCAC
TTCGACCGCAACCGCAGGAGTTGCTTCCATCGACCAAAAGATCGGTCTAAGCCAAAAATT
CACAGCTGGTACGAGCTTGGTGAACGACAAGATCAAGGAGGTGGATCAAAGCCTCCAGGT
TTCGGAGAGGACAAAGTCTGCGTACGCGTCGGCCGAACAGACGGTGAGCTGCGCAGGAAA
CGCCGTGATGAAAAACCGTTACGTGTTGACCGGTGTGACCTGGGCCGCAGGAGCGTTCAG
CAGAGTTGCTAAAGCTGCTGGAGAGGTTAGTCAGAAAACAAAGGAAAAGGTTGAAGCTGA
GCAACCACCACCACAACCGTCACAGTCACAGGAGCAGTTACCTGAAGGGTATGCTCCGAT
TCATTCGTCTGAATACTCCAAGAAGTAAACCTCATTACAGTTGAAAAGTTTTTTTTTTTC
TCTTTCATGTTGGATTATTTGATATGTTATATATAACATAACTATGCTTGGATCTTGTCT
ATATATAGATTCAATAATCCAAACATTTATACATAGAAAGAGATAACCACCAG

QA 3 835 3 835
DS 



AS 1 2

CO CL4391Contig1 766 2 10 U
GGATCGGAAAAAGGCAACAACAACCTCTCTATAATGATGTCAGAAATCGAAAGATCCAGT
TTTGACGATGAGAACTCGATTTCTTCTTCATACGGAACAACATCGATCCTTCTTCTTCAG
GTGGGTTTTCCCTTTCTATCGGAGGAAGAAGAGAACATCAGAGAGATGATCGACAGAGAG
ACACAACACTCTCCGAGAGATGATTACTTAGAGAGACTGAGAAGTGGTGATTTGGATTTC
AATGTCATAAACCAAGCCCTTGATTCGATTTTGAAGGCTTGTGAGGAACTTCGATTCGGA
CCAGTGTGTATATGCCTAGCGATTAACTACTTGGATCGTTTCTTATCTGTTCACGACTTG
CCTAGTGGGAAAGCTTGGGCTGTGCAGTTGTTAGCTGTGTCTTGTTTATCCCTGGCTACT
AAAGTTGAGGAAACTAAAGTTCCTGAGTTAAAGCATCTTCAGGTTGGAGATCCTCGGTTC
GTGTTTGAGGCTAAACATGTTCAAAGAATGGAGCTTTTGGTGTTGAACGTATTGAAATGG
AGGTTACGAGCCGTGACGCCCTGCTCTTACGTGAGATACTTTCTGAGTAAGATCTATGGC
TATGATGATCGAGAACTATCCAGCAGACTGATCTCCAGAGTTTTACAAGTGATAGCTAGT
ACAACCAGAGGTATTGACTTTTTGGAGTTTAGAGCTTCAGAGATTAGTGCTGCTGTTGCA
CTTTCTGTTTCTGGAGTCCATACATTACAGTTTGACAAATTTTCCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1F021TF U 1
AF RS1F021JQ C 274
BS 1 670 RS1F021TF
BS 671 671 RS1F021JQ
BS 672 704 RS1F021TF
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BS 761 766 RS1F021JQ

RD RS1F021TF 765 0 0
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GTGGGTTTTCCCTTTCTATCGGAGGAAGAAGAGAACATCAGAGAGATGATCGACAGAGAG
ACACAACACTCTCCGAGAGATGATTACTTAGAGAGACTGAGAAGTGGTGATTTGGATTTC
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AGGTTACGAGCCGTGACGCCCTGCTCTTACGTGAGATACTTTCTGAGTAAGATCTATGGC
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CTTTCTGTTTCTGGAGTC*ATACAT*ACAGTTTGACAAAT
CTCCT

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CTTTTGGTGTTGAACGTATTGAAATGGAGGTTACGAGCCGTGACGCCCTGCTCTTACGTG
AGATACTTTCTGAGTAAGATCTATGGCTATGATGATCGAGAACTATCCAGCAGACTGATC
TCCAGAGTTTTACAAGTGATAGCTAGTACAACCAGAGGTATTGACTTTTTGGAGTTTAGA
GCTTCAGAGATTAGTGCTGCTGTTGCACTTTCTGTTTCTGGAGTCCATACATTACAGTTT
GACAAATTTTCCT

QA 1 493 1 493
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AGAGTGCATTGGACTGGGCTTGCGGTCCTGGGAATGTTGATTGTTCTGCTGTTCAACCAA
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ATTACCAGCAAAGCGGAGCGAGTAGCTTAGATTGCAGCTTCGGAGGAGTCAGCGTTGAAG
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BQ
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AF RS1FN72TF U 1
AF RS1FN72JQ C 201
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BS 677 895 RS1FN72JQ

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AGAGTGCATTGGACTGGGCTTGCGGTCCTGGGAATGTTGATTGTTCTGCTGTTCAACCAA
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ATTACCAGCAAAGCGGAGCGAGTAGCTTAGATTGCAGCTTCGGAGGAGTCAGCGTTGAAG
TTGACAAGGACCCTAGCTATGGTAACTGTCTGTACATGATTGCTCCATCTACCGATGGAA
TGAACAGAACAATGGCGGGTAATATCACGGGAAACATAACTGCCATTGATTCCCCAATGG
CTTCACCTTCTTCGAG

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1FN72JQ 695 0 0
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CCAAGTTCAAGTCCAGGTAACTCAACTGTGATCAGTGGAGGAGGAGGAGGGACCAGGAAA
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TGCGGTCCTGGGAATGTTGATTGTTTTGCTGTTCAACCAAACCAGCCTTGCTTTGAGCCA
GACACTGTTCTCTCACACGCATCGTATGCGTTCAACACTTATTACCAGCAAAGCGGAGCG
AGTAGCTTAGATTGCAGCTTCGGAGGAGTCAGCGTTGAAGTTGACAAGGACCCTAGCTAT
GGTAACTGTCTGTACATGATTGCTCCATCTACCGATGGAATGAACAGAACAATGGCGGGT
AATATCACGGGAAACATAACTGCCATTGATTCCCCAATGGCTTCACCTTTTTCGAGCAGT
GAAGGATACAGACAAATGGTGGTTTCCGTTGCAGTCTCTGTTTTGTTGCCGTGGTGCTTT
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TTTGAGGTGAATTAAACCGTTATTTAACAGAACTTTTGTACCAGTAGTTTCTTGGAAAGA
CTACCCTGGTGATGTAGTAGTATCTGTGTGGTTCG

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

CO CL4394Contig1 907 2 2 U
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AAATAAAAAAGAGAGATGTTCAGTTTTCTCCTGAAGAGAATCTCTTCATCTTCAGCTTCA
GTGCGTCTTTGTGTTTGTGTTTCTGTATCTTTCTTTTGTGTGAGAATAAAAAACAATTTA
GATTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ES70TF U 1
AF RS1ES70JQ C 130
BS 1 602 RS1ES70TF
BS 603 907 RS1ES70JQ

RD RS1ES70TF 602 0 0
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TCTCTCACTCAGGAGTGAAACTTGCTTGCTTGAATCATGGCTTCTCGTATTGCTAAAGAT
GTTACCGAATTGATTGGGAACACCCCTTTGGTTTATCTGAACAATGTGGCTGAAGGATGT
GTTGGTCGTGTCGCCGCTAAGCTCGAGATGATGGAACCTTGCTCCAGTGTCAAAGACAGG
ATTGGTTTTAGCATGATTTCTGATGCAGAGAAAAAGGGTCTGATTAAACCAGGAGAGAGT
GTGTTGATTGAGCCAACGAGTGGAAACACCGGAGTTGGGTTAGCCTTCACGGCTGCTGCC
AAGGGCTACAAGCTTATCAATTGAAAGTGCTATTCTCTCCGGTGGGAAGCCAGGCCCTCA
CAAGATTCAAGGGATAGGTGCTGGTTTTATACCAAGCGTGTTGGAGGTTGATCTTATAGA
TGAAGTTGTTCAAGTTTCAAGTGATGAATCCATCGACATGGCAAGGCTTCTTGCTCTTAA
AGAAGGTCTTCTTGTGGGAATATCATCTGGTGCAGCAGCAGCCGCAGCAATCAAACTTGC
AA

QA 1 602 1 602
DS 

RD RS1ES70JQ 778 0 0
TTGATTGGGAACACCC*TTTGGTTTATCTGAACAATGTGGCTGAAGGATGTGTTGGTCGT
GTCGCCGCTAAGCTCGAGATGATGGAACCTTGCTCCAGTGTCAAAGACAGGATTGGTTTT
AGCATGATTTCTGATGCAGAGAAAAAGGGTCTGATTAAACCAGGAGAGAGTGTGTTGATT
GAGCCAACGAGTGGAAACACCGGAGTTGGGTTAGCCTTCACGGCTGCTGCCAAGGGCTAC
AAGCTTATCAATTGAAAGTGCTATTCTCTCCGGTGGGAAGCCAGGCCCTCACAAGATTCA
AGGGATAGGTGCTGGTTTTATACCAAGCGTGTTGGAGGTTGATCTTATAGATGAAGTTGT
TCAAGTTTCAAGTGATGAATCCATCGACATGGCAAGGCTTCTTGCTCTTAAAGAAGGTCT
TCTTGTGGGAATATCATCTGGTGCAGCAGCAGCCGCAGCAATCAAACTTGCAAAGAGGCC
AGAAAATGCCGGGAAGCTTTTCGTGGCTGTGTTCCCAAGTTTTGGGGAGAGGTACCTGTC
CACTGTACTATTCGATGCCACAAGGAAAGAAGCAGAATCAATGACCTTCGAGGCTTGAAT
TGTCTCCCCTGAAAATTTCATTTTTCTGTTTCTTTTCATTTGAGACGCCAAAAATAAAAA
AGAGAGATGTTCAGTTTTCTCCTGAAGAGAATCTCTTCATCTTCAGCTTCAGTGCGTCTT
TGTGTTTGTGTTTCTGTATCTTTCTTTTGTGTGAGAATAAAAAACAATTTAGATTTTC

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 2

CO CL4395Contig1 1107 2 2 U
GTGACGGAGAACGCCGTGCTTCTAGGTGGACCGAGGATCGAAGATTACCCGGGGGAGACT
TCGTCGGGATGGTACGTGGTGGTGGCGAACAACGCGACGGATGTTGGAATCACCGGCGGA
GGAGCAATCGACGGACAGGGATCGAAATTCGTGGTGAGGTTCGATGAGAGGAAGAACGTG
ATGGTGAGCTGGAATCAAACCGGGGCTTGTTTGGGTGATGAGTGTAGACCTAGGCTTGTT
GGATTCGTTGACTCCACCAATGTTCAAATCTGGAACATCACTCTGCGTGAGCCTGCGTAT
TGGTGTTTGCATATCGTGAGGTGCGAGAACACTTCAATCCACGATGTATCGATCTTTGGC
GATTTCAACACACCAAATAACGATGGCATCGACATAGAAGATTCAAACAATACTTTCATA
ACTCGGTGTCACATCGACACAGGAGATGACGCAATCTGTCCCAAGACATATGCTGCTCCG
CTTTACAACTTAACCGTTACAGACTGCTGGATCCGGACCAAATCCTCCGCCATTAAACTT
GGTAGTGCGAGCTGGTTTGAATTCAAAGGTCTTGTCTTTGATAACATCACCATTTTTGAA
TCTCACAGAGGCCTTGGCATGCAAATACGTGATGGAGGAAATGTGAATGGCATTACATTT
TCAAACATGAACATCAGTACAAGATACTACGATCCGTCCTGGTGGGGAAGAGCAGAACCA
ATATATATAACAACTTGCCCGCGCAGTTCATTTTCAACGGAAGGCTCAATCTCGAGTCTC
CTTTTTGTAAACGTAACAATCGTTTTTGAAAACGGAGTCTTTTTATCTGGCTTTCCGAAC
GGATTACTCACGGACATAAAGTTCAAGAACATGAACATTACTTTGAGAAGATGGAGTAAT
TACACTTCAGGGCTTGTGGATTATAGACCGGGATGTCAAGGTTTAATGAACCATAGCGCC
ACAGCTGGGATCACTATGGAACACGTGAATGGGTTCAGCGTTGAGAATGTTGACTTGAAA
TGGTCAGATGATAATTTGAATGATTGGAATGTTCCTCTCGAATTTAGACCTTCAACCGTG
AATAATGTCTCCTTTGATGGTTTCAGT


BQ
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AF RS1GT02TF U 1
AF RS1AS55JQ C 523
BS 1 585 RS1GT02TF
BS 586 1107 RS1AS55JQ

RD RS1GT02TF 585 0 0
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TCGTCGGGATGGTACGTGGTGGTGGCGAACAACGCGACGGATGTTGGAATCACCGGCGGA
GGAGCAATCGACGGACAGGGATCGAAATTCGTGGTGAGGTTCGATGAGAGGAAGAACGTG
ATGGTGAGCTGGAATCAAACCGGGGCTTGTTTGGGTGATGAGTGTAGACCTAGGCTTGTT
GGATTCGTTGACTCCACCAATGTTCAAATCTGGAACATCACTCTGCGTGAGCCTGCGTAT
TGGTGTTTGCATATCGTGAGGTGCGAGAACACTTCAATCCACGATGTATCGATCTTTGGC
GATTTCAACACACCAAATAACGATGGCATCGACATAGAAGATTCAAACAATACTTTCATA
ACTCGGTGTCACATCGACACAGGAGATGACGCAATCTGTCCCAAGACATATGCTGCTCCG
CTTTACAACTTAACCGTTACAGACTGCTGGATCCGGACCAAATCCTCCGCCATTAAACTT
GGTAGTGCGAGCTGGTTTGAATTCAAAGGTCTTGTCTTTGATAAC

QA 1 585 1 585
DS 

RD RS1AS55JQ 585 0 0
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AACATCACCATTTTTGAATCTCACAGAGGCCTTGGCATGCAAATACGTGATGGAGGAAAT
GTGAATGGCATTACATTTTCAAACATGAACATCAGTACAAGATACTACGATCCGTCCTGG
TGGGGAAGAGCAGAACCAATATATATAACAACTTGCCCGCGCAGTTCATTTTCAACGGAA
GGCTCAATCTCGAGTCTCCTTTTTGTAAACGTAACAATCGTTTTTGAAAACGGAGTCTTT
TTATCTGGCTTTCCGAACGGATTACTCACGGACATAAAGTTCAAGAACATGAACATTACT
TTGAGAAGATGGAGTAATTACACTTCAGGGCTTGTGGATTATAGACCGGGATGTCAAGGT
TTAATGAACCATAGCGCCACAGCTGGGATCACTATGGAACACGTGAATGGGTTCAGCGTT
GAGAATGTTGACTTGAAATGGTCAGATGATAATTTGAATGATTGGAATGTTCCTCTCGAA
TTTAGACCTTCAACCGTGAATAATGTCTCCTTTGATGGTTTCAGT

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 2

CO CL4396Contig1 875 2 2 U
TTTTTTGCTTTCTCCTCATGAAAAACAAAAGCTTAAACACAATGAGCTCACAAACATTCG
AATATCAGCTCAAATCAATGTGTCCCAATATTACACCAGAAGAGGTAGCACGACGGAAAA
AGATCGAGGAAGCAGGCGCCATCATGGCCTTCTTTGCTATCATATGTTTCCTCATATTAT
TCCCTGTCGTTTTCTATTTATTACCACAAGACCGTCCTCATTTCGAGATCAAAATAGTTT
CTATGGATTTCACGGCCGAGCCTAATAATAAGAGTAGCACACAACAAAGTCATTATATTC
CTCTAGTTAGTGCTAGATGGGATTTATTGATAAGAGTCCCTGGAGAACTTGTTGGTAATG
ATATATGTCTTCAAGGAAGCCTCCAAGCTTCTTTCCTTTACAAGAATGTCTCTCTTGTTA
CTTCCTCTATCCAAAGTTACAACGAACTCGAACTAGGCACGCCTCAGCTTCTTAGCGTTT
CTGCGGTTGCTACTGGAGAAGATTTGAGCGGCGCGATTGGTAAAGAGATTATGGAGTCTA
TCAAAGAGAGGAATGAAGTTCAGTTTGGATCGCGGTTGTCTCTTACTGATTGTAGAGAGG
AGACAAAGAAAGGAACGGTGAGCTATGAATGCGATGAAGCCAAGTTGCGGTTTGATCATC
TCGGCTCTGATCAGATTAAGGCCACTGCGCTTGGAGACCACCCTACCTGCATCATTAAAG
AATAGCAAGTTTGTATCAAGCACCTGGCTGCGTTTGTGGACCACCGTACCTTGTTAGTCC
TTTATCTTTAGTTATGCGTAATTGGTGTTGGGTTTTCGTTAATAGATAAGTTTGCTGGCA
AAAAAAAATTCGTTTAATAAAGAGTAATTGCATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1G079TF U 1
AF RS1G079JQ C 469
BS 1 676 RS1G079TF
BS 677 875 RS1G079JQ

RD RS1G079TF 676 0 0
TTTTTTGCTTTCTCCTCATGAAAAACAAAAGCTTAAACACAATGAGCTCACAAACATTCG
AATATCAGCTCAAATCAATGTGTCCCAATATTACACCAGAAGAGGTAGCACGACGGAAAA
AGATCGAGGAAGCAGGCGCCATCATGGCCTTCTTTGCTATCATATGTTTCCTCATATTAT
TCCCTGTCGTTTTCTATTTATTACCACAAGACCGTCCTCATTTCGAGATCAAAATAGTTT
CTATGGATTTCACGGCCGAGCCTAATAATAAGAGTAGCACACAACAAAGTCATTATATTC
CTCTAGTTAGTGCTAGATGGGATTTATTGATAAGAGTCCCTGGAGAACTTGTTGGTAATG
ATATATGTCTTCAAGGAAGCCTCCAAGCTTCTTTCCTTTACAAGAATGTCTCTCTTGTTA
CTTCCTCTATCCAAAGTTACAACGAACTCGAACTAGGCACGCCTCAGCTTCTTAGCGTTT
CTGCGGTTGCTACTGGAGAAGATTTGAGCGGCGCGATTGGTAAAGAGATTATGGAGTCTA
TCAAAGAGAGGAATGAAGTTCAGTTTGGATCGCGGTTGTCTCTTACTGATTGTAGAGAGG
AGACAAAGAAAGGAACGGTGAGCTATGAATGCGATGAAGCCAAGTTGCGGTTTGATCATC
TCGGCTCTGATCAGAT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1G079JQ 407 0 0
TTT
TTAGCGTTTCTGCGGTTGCTACTGGAGAAGATTTGAGCGGCGCGATTGGTAAAGAGATTA
TGGAGTCTATCAAAGAGAGGAATGAAGTTCAGTTTGGATCGCGGTTGTTTCTTACTGATT
GTAGAGAGGAGACAAAGAAAGGAACGGTGAGCTATGAATGCGATGAAGCCAAGTTGCGGT
TTGATCATTTCGGCTCTGATCAGATTAAGGCCACTGCGCTTGGAGACCACCCTACCTGCA
TCATTAAAGAATAGCAAGTTTGTATCAAGCACCTGGCTGCGTTTGTGGACCACCGTACCT
TGTTAGTCCTTTATCTTTAGTTATGCGTAATTGGTGTTGGGTTTTCGTTAATAGATAAGT
TTGCTGGCAAAAAAAAATTCGTTTAATAAAGAGTAATTGCATCC

QA 4 407 4 407
DS 



AS 1 2

CO CL4397Contig1 898 2 2 U
TATAAGTTACAGTTTCTCTTCTTTATAAAAACGGATTCCGTTGTCAATGGCATCAACCTA
AACTTCTCTCTTCTCCTCCTCACTCTGTCTTCATCATTCTCACGCTTTTCTCGCCTTCCT
TTTATCCTTATCCGATAATCCCATCAAAACCCAGTAACCAAAAACACCTCTTTTCCATTT
TTATATTCAGAGATCGAAACCGCCGGCTAAACGCAGATAGAAAAGCAGAAGGAAGAAGAT
GAAGTACGTGCTAGTAACAGGAGGTGTTGTGAGTGGGTTAGGCAAAGGAGTAACAGCAAG
TAGTATCGGTGTTCTCCTTAAAGCTTGTGGTCTTCGTGTTACTTCTATCAAAATCGATCC
CTATCTAAACACTGATGCTGGAACCATGTCTCCTTTTGAGCACGGTGAAGTCTTTGTCTT
GGACGATGGTGGTGAGGTGGATCTTGATCTTGGAAACTACGAGAGGTTCTTAGATATCAA
ATTAACCAGAGACAATAACATCACTACCGGGAAAATTTACCAGCATGTAATTGCTAAAGA
AAGGAAAGGAGATTACTTGGGAAAGACTGTTCAGGTTGTTCCTCATATCACTGATGCAAT
TCAAGAGTGGATAGAGAGAGTTGCTGCTATCCCTGTTGATGGAGAGGAGGGTCCTGCTGA
TATTTGCGTTATCGAATTAGGAGGAACTATAGGTGATATTGAATCCGCACCTTTTATTGA
GGCACTTGGCCAATTCTCTTACCGTGTAGGCACAGGGAATTTCTGTCTGGTCCACGTCAG
CCTCGTGCCTGTTCATCAACATATTGGTCCGAAAAGCGTTTTCGTCAATGGAACCTCCAA
GAAAGCTCCCAATGGCATGGCTGATGTAAGATACAATAACGGATTTTGCAACGTCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AM31TF U 1
AF RS1AM31JQ C 209
BS 1 676 RS1AM31TF
BS 677 898 RS1AM31JQ

RD RS1AM31TF 676 0 0
TATAAGTTACAGTTTCTCTTCTTTATAAAAACGGATTCCGTTGTCAATGGCATCAACCTA
AACTTCTCTCTTCTCCTCCTCACTCTGTCTTCATCATTCTCACGCTTTTCTCGCCTTCCT
TTTATCCTTATCCGATAATCCCATCAAAACCCAGTAACCAAAAACACCTCTTTTCCATTT
TTATATTCAGAGATCGAAACCGCCGGCTAAACGCAGATAGAAAAGCAGAAGGAAGAAGAT
GAAGTACGTGCTAGTAACAGGAGGTGTTGTGAGTGGGTTAGGCAAAGGAGTAACAGCAAG
TAGTATCGGTGTTCTCCTTAAAGCTTGTGGTCTTCGTGTTACTTCTATCAAAATCGATCC
CTATCTAAACACTGATGCTGGAACCATGTCTCCTTTTGAGCACGGTGAAGTCTTTGTCTT
GGACGATGGTGGTGAGGTGGATCTTGATCTTGGAAACTACGAGAGGTTCTTAGATATCAA
ATTAACCAGAGACAATAACATCACTACCGGGAAAATTTACCAGCATGTAATTGCTAAAGA
AAGGAAAGGAGATTACTTGGGAAAGACTGTTCAGGTTGTTCCTCATATCACTGATGCAAT
TCAAGAGTGGATAGAGAGAGTTGCTGCTATCCCTGTTGATGGAGAGGAGGGTCCTGCTGA
TATTTGCGTTATCGAA

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1AM31JQ 690 0 0
AAACGCAGATAGAAAAGCAGAAGGAAGAAGATGAAGTACGTGCTAGTAACAGGAGGTGTT
GTGAGTGGGTTAGGCAAAGGAGTAACAGCAAGTAGTATCGGTGTTCTCCTTAAAGCTTGT
GGTCTTCGTGTTACTTCTATCAAAATCGATCCCTATCTAAACACTGATGCTGGAACCATG
TCTCCTTTTGAGCACGGTGAAGTCTTTGTCTTGGACGATGGTGGTGAGGTGGATCTTGAT
CTTGGAAACTACGAGAGGTTCTTAGATATCAAATTAACCAGAGACAATAACATCACTACC
GGGAAAATTTACCAGCATGTAATTGCTAAAGAAAGGAAAGGAGATTACTTGGGAAAGACT
GTTCAGGTTGTTCCTCATATCACTGATGCAATTCAAGAGTGGATAGAGAGAGTTGCTGCT
ATCCCTGTTGATGGAGAGGAGGGTCCTGCTGATATTTGCGTTATCGAATTAGGAGGAACT
ATAGGTGATATTGAATCCGCACCTTTTATTGAGGCACTTGGCCAATTCTCTTACCGTGTA
GGCACAGGGAATTTCTGTCTGGTCCACGTCAGCCTCGTGCCTGTTCATCAACATATTGGT
CCGAAAAGCGTTTTCGTCAATGGAACCTCCAAGAAAGCTCCCAATGGCATGGCTGATGTA
AGATACAATAACGGATTTTGCAACGTCCTC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

CO CL4398Contig1 1053 2 2 U
GGAGTAGAGAGCATTTTGACTCGTTTTCGGACACATCAAACAAACCATGGCGGCTACTTC
TCTCCGATCTGTAAACCCTACACTGTCCCCACGAACCCTACCATCTCCCAACAGATCACC
TTCCTTCCAATCACCATTCCTCAGATTCGCTCCCGCCTCCGCATCATTCAATCCCAAACC
CCTCGTCACTCGCTCCGCACCATCACCCTTCGTAACCCGCTCCGCCGCCGAGGCGCAGGA
AAGAAAGGCCTTCCACGGCCTCTGCTACGTCGTCGGCGACAACATCGACACGGACCAGAT
CATCCCCGCGGAGTTCCTCACCCTCGTCCCGTCCAACCCCGACGAGTACGTGAAGCTCGG
CTCCCACGCGCTCGTCGGCCTCCCCGCCTCCTACGCGGACCGGTTCGTCGAGCCCGGTGA
GACGAAGACGAAGTACTCGATCGTGATCGGCGGGGAGAACTTCGGGTGCGGGTCGTCCCG
CGAGCACGCGCCGGTGTGTCTCGGAGCGGCGGGGGCGAAGGCGGTGGTGGCGCAGTCGTT
CGCGAGGATCTTTTTCAGGAACTCGGTGGCGACGGGGGAGGTTTATCCGCTGGACTCGGA
GGTTAGGGTTTGCGATGAGTGTAAGACGGGTGACGTGGCGACGGTGGAGCTGAGGGAAGG
GGATAGTGTTTTGATTAATCATACGACGGGGAAAGAGTATAAGCTTAAGGCGATTGGTGA
CGCTGGGCCTGTGATTGACGCTGGTGGTATCTTTGCTTATGCTAGGAAAGCTGGCATGAT
TCCGTCTGCTGCTGCTTGATTTTTCCGACAGGGTCGGTCTCAGTGCATGGCGATGAGAGT
TCTCTTACCACCTAGAAGTATCTTCGAGGGTAAGTGATTTTCAGCTTCCATTCCAATCTT
CTTTTCGTGTCGTCCAATAAAAAGAACAATAAGTAGATGTATGTTACAAGAATTTGTGAA
CCTTAATCTATGTTTTATGGATGTATATTTGACTATTGGTTTAGTCTCTTGTGTTTCAGT
CTATATATTATATCTACTGTGTTTGGATTCTGC


BQ
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AF RS1GE47TF U 1
AF RS1GE47JQ C 442
BS 1 637 RS1GE47TF
BS 638 1053 RS1GE47JQ

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TCTCCGATCTGTAAACCCTACACTGTCCCCACGAACCCTACCATCTCCCAACAGATCACC
TTCCTTCCAATCACCATTCCTCAGATTCGCTCCCGCCTCCGCATCATTCAATCCCAAACC
CCTCGTCACTCGCTCCGCACCATCACCCTTCGTAACCCGCTCCGCCGCCGAGGCGCAGGA
AAGAAAGGCCTTCCACGGCCTCTGCTACGTCGTCGGCGACAACATCGACACGGACCAGAT
CATCCCCGCGGAGTTCCTCACCCTCGTCCCGTCCAACCCCGACGAGTACGTGAAGCTCGG
CTCCCACGCGCTCGTCGGCCTCCCCGCCTCCTACGCGGACCGGTTCGTCGAGCCCGGTGA
GACGAAGACGAAGTACTCGATCGTGATCGGCGGGGAGAACTTCGGGTGCGGGTCGTCCCG
CGAGCACGCGCCGGTGTGTCTCGGAGCGGCGGGGGCGAAGGCGGTGGTGGCGCAGTCGTT
CGCGAGGATCTTTTTCAGGAACTCGGTGGCGACGGGGGAGGTTTATCCGCTGGACTCGGA
GGTTAGGGTTTGCGATGAGTGTAAGACGGGTGACGTG

QA 1 637 1 637
DS 

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CGGAGCGGCGGGGGCGAAGGCGGTGGTGGCGCAGTCGTTCGCGAGGATCTTTTTCAGGAA
CTCGGTGGCGACGGGGGAGGTTTATCCGCTGGACTCGGAGGTTAGGGTTTGCGATGAGTG
TAAGACGGGTGACGTGGCGACGGTGGAGCTGAGGGAAGGGGATAGTGTTTTGATTAATCA
TACGACGGGGAAAGAGTATAAGCTTAAGGCGATTGGTGACGCTGGGCCTGTGATTGACGC
TGGTGGTATCTTTGCTTATGCTAGGAAAGCTGGCATGATTCCGTCTGCTGCTGCTTGATT
TTTCCGACAGGGTCGGTCTCAGTGCATGGCGATGAGAGTTCTCTTACCACCTAGAAGTAT
CTTCGAGGGTAAGTGATTTTCAGCTTCCATTCCAATCTTCTTTTCGTGTCGTCCAATAAA
AAGAACAATAAGTAGATGTATGTTACAAGAATTTGTGAACCTTAATCTATGTTTTATGGA
TGTATATTTGACTATTGGTTTAGTCTCTTGTGTTTCAGTCTATATATTATATCTACTGTG
TTTGGATTCTGC

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 2

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TAAAATCCAACTTGCACAATTCCCCATAAATACCATTTTTAGGAAACTTCTGTTTTCTGA
TTTGGCTGGTCTTTTTTCAGAAAGAAGTGGAGGTTGTTATAATGGTGGCTCATGAGAGGG
TCCATATTCTTCAAAAACCAACATGCATTTGGATAATCTGGTTCTGCCTCTTGGTTTCTA
TCTCTCACCATGGAATAGCATCTTATACATTATCATCATCAGCATCAACCTCAACATCTT
CTTTCAATCTCTCTCTCCCACACCAACACTCATTCCCTGAAGATGTTGTTCTTAATGTTC
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GCTAACGGTCAACGCCGGCGTTTTCGGCGATCCCAGACTCATATAGACTCTGCACACCAA
ACTGGTAGCTCCGCATCCATGTGAACGATGAAAGACGATTGTTGTCTGGCACTACGTGCT
AAACGATCCGCCCTTGAATTCTCCGTCCGTGGTACATGAATGAGCTGTGAGCTTTGGAAA
CTACTTTGTAGACTCTTTATATCCTCCAGATAACTTGCAAATGCTGGCCACTCTTCTGGT
TCCGAAACCATCTTCCCC


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AF RS1CK18TF U 1
AF RS1CK18JQ C 1
BS 1 469 RS1CK18TF
BS 470 678 RS1CK18JQ

RD RS1CK18TF 469 0 0
GGAGATAGAGATTGATAGGGAGGAAACACAAATAAATTCTGTTGACCCTTGATTATTACA
TAAAATCCAACTTGCACAATTCCCCATAAATACCATTTTTAGGAAACTTCTGTTTTCTGA
TTTGGCTGGTCTTTTTTCAGAAAGAAGTGGAGGTTGTTATAATGGTGGCTCATGAGAGGG
TCCATATTCTTCAAAAACCAACATGCATTTGGATAATCTGGTTCTGCCTCTTGGTTTCTA
TCTCTCACCATGGAATAGCATCTTATACATTATCATCATCAGCATCAACCTCAACATCTT
CTTTCAATCTCTCTCTCCCACACCAACACTCATTCCCTGAAGATGTTGTTCTTAATGTTC
AAAGGAAGCTTACGCCCGAGCCACTAGTCTTCAGGCAAAAGCGGCCGGATTCATTGACCA
GCTAACGGTCAACGCCGGCGTTTTCGGCGATCCCAGACTCATATAGACT

QA 1 469 1 469
DS 

RD RS1CK18JQ 678 0 0
GGAGATAGAGATTGATAGGGAGGAAACACAAATAAATTCTGTTGACCCTTGATTATTACA
TAAAATCCAACTTGCACAATTCCCCATAAATACCATTTTTAGGAAACTTCTGTTTTCTGA
TTTGGCTGGTCTTTTTTCAGAAAGAAGTGGAGGTTGTTATAATGGTGGCTCATGAGAGGG
TCCATATTCTTCAAAAACCAACATGCATTTGGATAATCTGGTTCTGCCTCTTGGTTTCTA
TCTCTCACCATGGAATAGCATCTTATACATTATCATCATCAGCATCAACCTCAACATCTT
CTTTCAATCTCTCTCTCCCACACCAACACTCATTCCCTGAAGATGTTGTTCTTAATGTTC
AAAGGAAGCTTACGCCCGAGCCACTAGTCTTCAGGCAAAAGCGGCCGGATTCATTGACCA
GCTAACGGTCAACGCCGGCGTTTTCGGCGATCCCAGACTCATATAGACTCTGCACACCAA
ACTGGTAGCTCCGCATCCATGTGAACGATGAAAGACGATTGTTGTCTGGCACTACGTGCT
AAACGATCCGCCCTTGAATTCTCCGTCCGTGGTACATGAATGAGCTGTGAGCTTTGGAAA
CTACTTTGTAGACTCTTTATATCCTCCAGATAACTTGCAAATGCTGGCCACTCTTCTGGT
TCCGAAACCATCTTCCCC

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 2

CO CL4400Contig1 878 2 4 U
GATCGAGAGACGACGGAGAGCGCTTCGGAATCCGGGAACCGATAAAACGGCGACGTCTTT
CTCTTACCTCGACACGCTCTTCGACTTAAAAATCGAAGGGCGCAAAACGGCGCCATCTAA
CGGAGAGCTCGTGACGTTATGTTCGGAGTTTCTTAACGGCGGGACGGACACGACGGGGAC
GGCGATCGAGTGGGGCATCGCGCAGCTGATCGCGAATCCTGAGATTCAATCTCGGCTCTA
CGATGAGATTAAATCAACGGTGGGAGATCGTGCGGTTGAGGAAAAGGACGTGGACAAGAT
GGTCTTTCTACAAGCCTTCGTTAAGGAGATTCTCCGGAAACATCCGCCGACGTACTTCAC
GCTGACTCACACGGTGACGGAGCCGACGACGGTCGCTGGATACGATGTTCCCGCGGGAAT
CAACGTCGAGTTCTACCTCCCGGGGATAAACGAAGATCCGAAGCTTTGGTCTAACCCGAA
GAAATTCGATCCGGACCGGTTTGCCTCGGGTAAAGAGGATGCGGATATAACCGGAGTAAC
CGGAGTGAAGATGATGCCGTTCGGTGTAGGCCGTCGGATCTGTCCCGGTTTATCGATGGC
GACAGTACACGTGCACTTGATGCTAGCGAAGATGGTTCAAGAGTTTGAGTGGAACGCTTA
TCCGGCGGGAAGCGAGATTGATCTCGCGGGGAAATTGGAGTTCACGGTGGTTATGATGAA
ACCGTTAAGAGCCATGGTTAAACCAAGGGTTTAAATTTATTACTATTATGAAAACGACGT
GTGCTTATATTAAAGGAAGCTATACTTTAAAAATTTGTCTTGTTTTGTGAATTCTAGCAA
AAGATTACATTTGTCGTCAACAGATCAATAAATGATTT


BQ
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AF RS1CD11TF U 1
AF RS1B058TF U 207
BS 1 658 RS1CD11TF
BS 659 659 RS1B058TF
BS 660 693 RS1CD11TF
BS 694 878 RS1B058TF

RD RS1CD11TF 693 0 0
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CTCTTACCTCGACACGCTCTTCGACTTAAAAATCGAAGGGCGCAAAACGGCGCCATCTAA
CGGAGAGCTCGTGACGTTATGTTCGGAGTTTCTTAACGGCGGGACGGACACGACGGGGAC
GGCGATCGAGTGGGGCATCGCGCAGCTGATCGCGAATCCTGAGATTCAATCTCGGCTCTA
CGATGAGATTAAATCAACGGTGGGAGATCGTGCGGTTGAGGAAAAGGACGTGGACAAGAT
GGTCTTTCTACAAGCCTTCGTTAAGGAGATTCTCCGGAAACATCCGCCGACGTACTTCAC
GCTGACTCACACGGTGACGGAGCCGACGACGGTCGCTGGATACGATGTTCCCGCGGGAAT
CAACGTCGAGTTCTACCTCCCGGGGATAAACGAAGATCCGAAGCTTTGGTCTAACCCGAA
GAAATTCGATCCGGACCGGTTTGCCTCGGGTAAAGAGGATGCGGATATAACCGGAGTAAC
CGGAGTGAAGATGATGCCGTTCGGTGTAGGCCGTCGGATCTGTCCCGGTTTATCGATGGC
GACAGTACACGTGCACTTGATGCTAGCGAAGATGGTTCAAGAGTTTGAGTGGAACGCT*A
TCCGGCGGGAAGCGAGATTGATCTCGCGGGGAA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RS1B058TF 672 0 0
G
GATCGCGAATCCTGAGATTCAATCTCGGCTCTACGATGAGATTAAATCAACGGTGGGAGA
TCGTGCGGTTGAGGAAAAGGACGTGGACAAGATGGTCTTTCTACAAGCCTTCGTTAAGGA
GATTCTCCGGAAACATCCGCCGACGTACTTCACGCTGACTCACACGGTGACGGAGCCGAC
GACGGTCGCTGGATACGATGTTCCCGCGGGAATCAACGTCGAGTTCTACCTCCCGGGGAT
AAACGAAGATCCGAAGCTTTGGTCTAACCCGAAGAAATTCGATCCGGACCGGTTTGCTTC
GGGTAAAGAGGATGCGGATATAACCGGAGTAACCGGAGTGAAGATGATGCCGTTCGGTGT
AGGCCGTCGGATCTGTCCCGGTTTATCGATGGCGACGGTACACGTGCACTTGATGCTAGC
GAAGATGGTTCAAGAGTTTGAGTGGAACGCTTATCCGGCGGGAAGCGAGATTGATTTCGC
GGGGAAATTGGAGTTCACGGTGGTTATGATGAAACCGTTAAGAGCCATGGTTAAACCAAG
GGTTTAAATTTATTACTATTATGAAAACGACGTGTGCTTATATTAAAGGAAGCTATACTT
TAAAAATTTGTCTTGTTTTGTGAATTCTAGCAAAAGATTACATTTGTCGTCAACAGATCA
ATAAATGATTT

QA 2 672 2 672
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GTCTCATCTCCTTCACCTTCTCCTCCTATCTCTCTCTCTCTCCCTCAAATCTTTTCAGGC
ATAACTAAATCGAATCATAAGCACTTCAAAGTATAACTAAAACTTCCTGATCTATTAACT
GACAATAGATTCTTGGGCTCTTCTTTATTTCGACAGATTCTAATCCGTTATAGTTGTTAC
AAACGACACGGTGAAACCTTTGTTTTTATATAATATCAGACTCCTACTTCTTCATCTGTG
AAACTTTTAAGCTAAAAATGGGTGTTGAAAAAATGGTGTGTTTGGTTTCTCGCACTGGTC
GTCAGTTTCAGAGATACAACAAAGGTCGTCGCCAAGTCGTCGGATGTATTCCGTACAGAT
TCAAGTTATCAAGCGATGGTAAAATTAGTGACGAGGTAGAAGTTCTTGTTATCTCTTCTC
AAAAAGGTCACGCCATGATGTTCCCTAAGGGTGGTTGGGAGCTTGATGAATCTGTAGAAG
AAGCTGCATCAAGAGAGTCTCTTGAAGAAGCTGGAGTTCTTGGCAACGTAGAGCATCAGT
TAGGAAAATGGGACTTTTTGAGCAAAAGCAGAGGAACATACTATGAAGGACTGATGTTCC
CTTTGCTTGTAACAGAACAACTTGAGCTTTGGCCTGAGCAACATGCTAGGCAAAGAGTCT
GGATGAACGTAGTTGACGCCAGAGAAGCCTGTAGAGATTGGTGGATGAAAGAAGCATTAG
ATGTTTTGGTTGCGAGACTCTCGTCACCAATGATTCAACCAAAGGAAGAGAAGACTCTTT
CCATCTCTATTGAAACAATGTGCTGATGACTGCTGATTGTGATGGGAGTTTTTGGACTAG
TGGGTCTCTGTACATACAAATAGATGGGTTTCAGTTAGTATTGAGACTGCTGAAGATCAA
AACAAATGCAGAGCCGGAAAACAAAAATTATGAGTAGATTTTTAGGTTTAATTTGGAGCA
AAAAATTATCATGTGATTTAACAAGTCTTGTATGTCGTGTTTATAATGTTTCTGCAAGAT
TTGATTAAAGGGACGATGAAGTGTTACGAACCTAAACAAAGAAAGCAAGCAAAAACTGTA
CAACTGTGTTTCCCTCAGTTTATGTTTTT


BQ
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AF RS1AC22TF U 1
AF RS1AC22JQ C 462
BS 1 676 RS1AC22TF
BS 677 1109 RS1AC22JQ

RD RS1AC22TF 676 0 0
GTCTCATCTCCTTCACCTTCTCCTCCTATCTCTCTCTCTCTCCCTCAAATCTTTTCAGGC
ATAACTAAATCGAATCATAAGCACTTCAAAGTATAACTAAAACTTCCTGATCTATTAACT
GACAATAGATTCTTGGGCTCTTCTTTATTTCGACAGATTCTAATCCGTTATAGTTGTTAC
AAACGACACGGTGAAACCTTTGTTTTTATATAATATCAGACTCCTACTTCTTCATCTGTG
AAACTTTTAAGCTAAAAATGGGTGTTGAAAAAATGGTGTGTTTGGTTTCTCGCACTGGTC
GTCAGTTTCAGAGATACAACAAAGGTCGTCGCCAAGTCGTCGGATGTATTCCGTACAGAT
TCAAGTTATCAAGCGATGGTAAAATTAGTGACGAGGTAGAAGTTCTTGTTATCTCTTCTC
AAAAAGGTCACGCCATGATGTTCCCTAAGGGTGGTTGGGAGCTTGATGAATCTGTAGAAG
AAGCTGCATCAAGAGAGTCTCTTGAAGAAGCTGGAGTTCTTGGCAACGTAGAGCATCAGT
TAGGAAAATGGGACTTTTTGAGCAAAAGCAGAGGAACATACTATGAAGGACTGATGTTCC
CTTTGCTTGTAACAGAACAACTTGAGCTTTGGCCTGAGCAACATGCTAGGCAAAGAGTCT
GGATGAACGTAGTTGA

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1AC22JQ 648 0 0
CTTGATGAATCTGTAGAAGAAGCTGCATCAAGAGAGTCTCTTGAAGAAGCTGGAGTTCTT
GGCAACGTAGAGCATCAGTTAGGAAAATGGGACTTTTTGAGCAAAAGCAGAGGAACATAC
TATGAAGGACTGATGTTCCCTTTGCTTGTAACAGAACAACTTGAGCTTTGGCCTGAGCAA
CATGCTAGGCAAAGAGTCTGGATGAACGTAGTTGACGCCAGAGAAGCCTGTAGAGATTGG
TGGATGAAAGAAGCATTAGATGTTTTGGTTGCGAGACTCTCGTCACCAATGATTCAACCA
AAGGAAGAGAAGACTCTTTCCATCTCTATTGAAACAATGTGCTGATGACTGCTGATTGTG
ATGGGAGTTTTTGGACTAGTGGGTCTCTGTACATACAAATAGATGGGTTTCAGTTAGTAT
TGAGACTGCTGAAGATCAAAACAAATGCAGAGCCGGAAAACAAAAATTATGAGTAGATTT
TTAGGTTTAATTTGGAGCAAAAAATTATCATGTGATTTAACAAGTCTTGTATGTCGTGTT
TATAATGTTTCTGCAAGATTTGATTAAAGGGACGATGAAGTGTTACGAACCTAAACAAAG
AAAGCAAGCAAAAACTGTACAACTGTGTTTCCCTCAGTTTATGTTTTT

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 2

CO CL4403Contig1 932 2 2 U
GGATTCACCATTTAGGTCTCTCCCTCTCTCTCCCCTCTCGTCTTTCGTCCGACGAAGAAG
ATCGCTGAGAGATTACTACCGCCGGATTTCCGTTTACCGCGAGATTCTCTTTGGATACGT
TGGAGATCGATCTAGAACCATGAATCCCGAATATGACTATCTGTTCAAGCTTTTGCTTAT
TGGTGACTCTGGTGTTGGTAAATCTTGCTTGCTTCTAAGGTTTGCTGATGATTCTTACCT
TGATAGCTACATCAGTACAATTGGTGTTGACTTTAAAATCCGCACCGTTGAACAAGACGG
AAAGACAATCAAACTCCAGATCTGGGACACAGCAGGCCAAGAACGTTTCAGGACTATCAC
CAGTAGCTACTACAGAGGAGCTCATGGGATCATTGTCACCTATGACGTCACGGACCAAGA
GAGCTTCAACAACGTCAAACAATGGCTGAATGAAATCGACCGTTATGCCAGTGAGAATGT
GAACAAGCTACTGGTTGGGAACAAAAACGACCTCACATCCCAGAAGGTTGTATCCACTGA
GACAGCTCAGGCTTTTGCAGATGAACTTGGGATCCCTTTCTTGGAAACAAGTGCTAAAAA
TGCAACCAATGTTGAAGAAGCTTTCATGGCCATGACTGCTGCTATTAAGACCAGAATGGC
TAGCCAACCAGCTGGAGGCGCCAAGCCACCGACGGTCAATATTCGCGGACAGCCAGTGAA
CCAGCAATCAGGCTGTTGCTCATCTTGATTCTATTAGTCTCAAGAAGTCTATTTGGATCA
TAACACACCATTATAATCATTTGTTTGCATTGCATGTAAGACTTCTCCAATTGACAACTT
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CCCATAAATTCTATAGTGAAAGACCATTTATC


BQ
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TTAAGACCAGAATGGCTAGCCAACCAGCTGGAGGCGCCAAGCCACCGACGGTCAATATTC
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AAGTCTATTTGGATCATAACACACCATTATAATCATTTGTTTGCATTGCATGTAAGACTT
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QA 1 528 1 528
DS 



AS 1 2

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GTGGTCGGCTAGGCTTCCCTCTCTTTAATTCATTCTTCTCAGCGCAACAAGAATGACTAA
TTGTCCTGGAGACTCGAACATGGCTTCTTCTCACTTGGACATTCTCCGTTGCCCATTTTT
GAGGAACATCAATGACCCCACTAACCTCTCCTTCTCTTCATCCTCCTTGCCTGTGCGAGG
ACCAATTTTTGAGGATGGACCCAATTTTGACACTGCATTCAGGCTTTTCCATGGTCAAGA
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GAAATGGAATCCCATGCTGCTTGAAGTAGCAAGTCCTGTTTCTACGTGAGCAGCTAGTGT
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CGATT


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AF RS1FJ38TF U 1
AF RS1FJ38JQ C 459
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BS 795 1265 RS1FJ38JQ

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GTGGTCGGCTAGGCTTCCCTCTCTTTAATTCATTCTTCTCAGCGCAACAAGAATGACTAA
TTGTCCTGGAGACTCGAACATGGCTTCTTCTCACTTGGACATTCTCCGTTGCCCATTTTT
GAGGAACATCAATGACCCCACTAACCTCTCCTTCTCTTCATCCTCCTTGCCTGTGCGAGG
ACCAATTTTTGAGGATGGACCCAATTTTGACACTGCATTCAGGCTTTTCCATGGTCAAGA
TGGTCTTGTCCCTCTCTCTGGAGCGGAGAAGCCTAAGCTTTCCTCTCCTGCATTCAATCC
ACTTGCTGCTAAGGCGGCCACTATCAGTCTCTCCTCCTTTGGACATGGAGGGCCTTTTGG
ATTTGATGCGTTTTCCGACATGTTTAAGAACCAAAAGAGAAAGTCAGACTCTTCCAAAAA
GAAAGATTCTTCCTCTAAGGGAGGAAACCACGAGTCTATGAGTGATGACTGGCTTCAAAC
AGGGAACTGCCCAATCGCTAAATCCTACCGAGCTGTAAGTGGTTTGGCACCGCTCGTAGC
AAAGATCCTGCAACCCCCTCCCGGAATGCAGTACAAGTGTCCTAAAGCAATAGTAGCAGC
TCGAGCAGCCATATCAAAAACCGCTTTCGCCAAGAACCTCCGGCCACAACCTTTATCATC
CAAAGTACTAGTCATCGGGATGCTGGGGATGGCCCTGAACGTGCCCCTAGG*GTTTGGAG
AGAGCACACTGAAA
GTT

QA 1 794 1 794
DS 

RD RS1FJ38JQ 807 0 0
AG
AAGTCAGACTCTTCCAAAAAGAAAGATTCTTCCTCTAAGGGAGGAAACCACGAGTCTATG
AGTGATGACTGGCTTCAAACAGGGAACTGCCCAATCGCTAAATCCTACCGAGCTGTAAGT
GGTTTGGCACCGCTCGTAGCAAAGATCCTGCAACCCCCTCCCGGAATGCAGTACAAGTGT
CCTAAAGCAATAGTAGCAGCTCGAGCAGCCATATCAAAAACCGCTTTCGCCAAGAACCTC
CGGCCACAACCTTTATCATCCAAAGTACTAGTCATCGGGATGCTGGGGATGGCCCTGAAC
GTGCCCCTAGGTGTTTGGAGAGAGCACACTGAAAAGTTCTCGGCATCTTGGTTTATAGCT
CTTCACGCAGCGGTTCCTTTCATAGGAATACTGAGGAAGTCTGTGTTGATGCCTAAAATG
GCGATGGTTTTTACCATAGCAGCGTCTGTTATGGGACAAGTGATCGGGTCAAGAGCAGAG
AGGTATAGGCTTAAGTCGGTAGCTCAGAAGAAACTCACGTTGACAGGACCTGATAAAGTA
GATGGAAGGTGCGGTGTGATGAAATGGAATCCCATGCTGCTTGAAGTAGCAAGTCCTGTT
TCTACGTGAGCAGCTAGTGTGGTCTGCTAAAAGCTTTTGGTTTCTTTTTCGACGAGCTTG
ATATATGTATAGTTGTTTCTATTCTTGTTTCGGCCATTGTATTTGAGAAAGTTTATAAAT
GTTGAATAAGGTAAGAATAAGTGTTATTTTTTCTTCTTTTATACACATTCTATAAGAAAT
GAAAGAAAAATCTACGTCTTCGATT

QA 3 807 3 807
DS 



AS 1 2

CO CL4405Contig1 1097 2 2 U
GGGATTTCATGGGTTTGCTGAGAAGAATCTCAACTCTCTTGGAGCATATTTCATCAGGAT
TCCATCAACCAAATCAGCAATGGAAGGTGGTCAAACTACAGGCAGAAGTTATGACGATGG
CGGTGACTTTGATGGTGTAAGAAAAGTATATGTTAGATTCGATGGCACTGCAATTAGGCA
TATCAAGTTCGACTATGACAAAGCTGGCCAAGTGGAGACGCGTCAGCGAAGTCTTAAGAA
TGGAACAGAATATGAGTTTGCGGTTGATCATCCACGTGAATATATCACATCTGTGTAGGG
AAGCTACGCTGTTACTCAACCTTATGATTGTATCGTCCTTAGGTCTTTAACTTCCAAAAC
ATCAAAAGGGAGAACCTCTCCCACCATCGGAACGGTGACTGGTACCAAGTTCGTGCATGA
GAGGAAAGGAAGTGTTATTGTTGGGTTCCATGGACGAGCAGGTTATTGTGTTGACAGTAT
TGGGGTGTATTACTCTCCTTTCTCTCCTCCTCCTCAACCTTCAGAGAAACTCCAAGGACA
CGGTGGTGATGGAGGAGATTCTTGGGACGATGGCGTTTTCAAAAATGTGAAGAAGATATA
CGTAGGACAAGGAGATGTTGGTATTGCCTGTCTCAAGTTTGAGTACGAGAATGAAACTAG
TGAGGTGGTTGTGGGAAAAGAACATGGAAAGAAAACGTTGCTTGGTTACGAGGAGTTTGA
GCTGGATTATCTGAGTGAGTACATTACATCTGTAGAAGGTTGCTACGATAAGGTACTTGG
AGGGGAAAGTGGAGTTATAACAATGCTTAGGTTCAAGACCAACAAACGCATCTCTCCACC
ATTCGGCCTCGAATCAACTTCCAGCTTCACCATCCAGAAGGAAGGTTACAAGATCGTCGG
GTTCCACGGAAAATTCAGTGCCCTGATTAGTCAGATTGGGGTCCATGTCGTTCCCATCAC
CGAGTGACCAACCATTTGAAGCTATCCAACGAATCGTTGTCTCATACCTGTCTTAGACCG
TTACTTATGTTGCAATATGTATTACTTTGCTATGTGTCATGTTTTTTTTTGAGAAATCTA
TGTATCATGTTGTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GB93TF U 1
AF RS1GB93JQ C 430
BS 1 585 RS1GB93TF
BS 586 1097 RS1GB93JQ

RD RS1GB93TF 585 0 0
GGGATTTCATGGGTTTGCTGAGAAGAATCTCAACTCTCTTGGAGCATATTTCATCAGGAT
TCCATCAACCAAATCAGCAATGGAAGGTGGTCAAACTACAGGCAGAAGTTATGACGATGG
CGGTGACTTTGATGGTGTAAGAAAAGTATATGTTAGATTCGATGGCACTGCAATTAGGCA
TATCAAGTTCGACTATGACAAAGCTGGCCAAGTGGAGACGCGTCAGCGAAGTCTTAAGAA
TGGAACAGAATATGAGTTTGCGGTTGATCATCCACGTGAATATATCACATCTGTGTAGGG
AAGCTACGCTGTTACTCAACCTTATGATTGTATCGTCCTTAGGTCTTTAACTTCCAAAAC
ATCAAAAGGGAGAACCTCTCCCACCATCGGAACGGTGACTGGTACCAAGTTCGTGCATGA
GAGGAAAGGAAGTGTTATTGTTGGGTTCCATGGACGAGCAGGTTATTGTGTTGACAGTAT
TGGGGTGTATTACTCTCCTTTCTCTCCTCCTCCTCAACCTTCAGAGAAACTCCAAGGACA
CGGTGGTGATGGAGGAGATTCTTGGGACGATGGCGTTTTCAAAAA

QA 1 585 1 585
DS 

RD RS1GB93JQ 668 0 0
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TTACTCTCCTTTCTCTCCTCCTCCTCAACCTTCAGAGAAACTCCAAGGACACGGTGGTGA
TGGAGGAGATTCTTGGGACGATGGCGTTTTCAAAAATGTGAAGAAGATATACGTAGGACA
AGGAGATGTTGGTATTGCCTGTCTCAAGTTTGAGTACGAGAATGAAACTAGTGAGGTGGT
TGTGGGAAAAGAACATGGAAAGAAAACGTTGCTTGGTTACGAGGAGTTTGAGCTGGATTA
TCTGAGTGAGTACATTACATCTGTAGAAGGTTGCTACGATAAGGTACTTGGAGGGGAAAG
TGGAGTTATAACAATGCTTAGGTTCAAGACCAACAAACGCATCTCTCCACCATTCGGCCT
CGAATCAACTTCCAGCTTCACCATCCAGAAGGAAGGTTACAAGATCGTCGGGTTCCACGG
AAAATTCAGTGCCCTGATTAGTCAGATTGGGGTCCATGTCGTTCCCATCACCGAGTGACC
AACCATTTGAAGCTATCCAACGAATCGTTGTCTCATACCTGTCTTAGACCGTTACTTATG
TTGCAATATGTATTACTTTGCTATGTGTCATGTTTTTTTTTGAGAAATCTATGTATCATG
TTGTTGTT

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL4406Contig1 1101 2 2 U
GGGATACCTGAACACGCCACTAGCTTCGCCTTGAAGCCTACCAAGGGTCCTGGAGTCGAG
GAGTCTGAACCTTATAGGCTGTTTAACCTAGATGTCTTTGAATACGAGCACGAATCACCG
TTTGGGCTTTACGGATCGATCCCATTCATGGTTTCACATGGGAAGTCTGGTAAAACTTCG
GGGTTTTTCTGGTTGAATGCTGCGGAGATGCAGATTGATGTCTTGGCTAATGGATGGGAT
GCAGAGAGTGGTATTGCATTGCCGTCGAGTGATAGTAGGATTGATACGTTGTGGATGAGC
GAGGCGGGGATTGTGGACACGTTCTTTTTCGTAGGGCCTGAGCCGAAGGATGTTGTGAAG
CAGTATGCAAGTGTGACAGGTACTTCAGCGATGCCTCAGTTGTTTGCTACTGGTTATCAC
CAGTGTAGGTGGAACTACAAGGATGAGGAGGATGTGGCACAGGTGGACTCGAAATTCGAT
GAGCATGATATTCCTTATGATGTTCTCTGGCTTGACATCGAGCATACAGATGGGAAGAGA
TACTTTACGTGGGATAGTGCATTGTTTCCGAATCCGGAGGAGATGCAGAAGAAACTGGCT
GCAAAGGGTAGGCGGATGGTGACCATTGTGGATCCTCATATCAAGAGGGATGACTCCTAC
TTCTTGCATAAAGAGGCTACTCAGATGGGACACTATGTCAAGGATTCGTCTTCACAAGGT
AGCCTCTCTTCCCGATGTTTAATCGACAGAATTATCCTCTTGGGATACACCTCTGGTCCG
AAATCTGCACTGGTCGAACCTTTGAATCAGAAGGCTGAGATTGAGATGGGACCATTGCGA
ATGGGTGGGCTAGTGGTTTCCTCCGGTACAAAGGTCTTGACTATCCGCAAACCAGGTGTC
CGAGTGGACCAAGACTGGACCGTTAAGGTTCTGTGATTGACGAACCATTTTTCCTTGTGG
CCGACGGAGTTTGCATACCTTTTCTTATAATATTTTGGGAGTTTTAGACTTAAGTAGTTG
CAAGAGCTAACAGACTGAGAGTCGTTTGCATGGTTGTTTAAGAGTTTAGCGTTTTGATAA
TGTCATGGTTTCGTACTTAAA


BQ
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AF RS1A922TF U 1
AF RS1A922JQ C 635
BS 1 790 RS1A922TF
BS 791 1101 RS1A922JQ

RD RS1A922TF 790 0 0
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GAGTCTGAACCTTATAGGCTGTTTAACCTAGATGTCTTTGAATACGAGCACGAATCACCG
TTTGGGCTTTACGGATCGATCCCATTCATGGTTTCACATGGGAAGTCTGGTAAAACTTCG
GGGTTTTTCTGGTTGAATGCTGCGGAGATGCAGATTGATGTCTTGGCTAATGGATGGGAT
GCAGAGAGTGGTATTGCATTGCCGTCGAGTGATAGTAGGATTGATACGTTGTGGATGAGC
GAGGCGGGGATTGTGGACACGTTCTTTTTCGTAGGGCCTGAGCCGAAGGATGTTGTGAAG
CAGTATGCAAGTGTGACAGGTACTTCAGCGATGCCTCAGTTGTTTGCTACTGGTTATCAC
CAGTGTAGGTGGAACTACAAGGATGAGGAGGATGTGGCACAGGTGGACTCGAAATTCGAT
GAGCATGATATTCCTTATGATGTTCTCTGGCTTGACATCGAGCATACAGATGGGAAGAGA
TACTTTACGTGGGATAGTGCATTGTTTCCGAATCCGGAGGAGATGCAGAAGAAACTGGCT
GCAAAGGGTAGGCGGATGGTGACCATTGTGGATCCTCATATCAAGAGGGATGACTCCTAC
TTCTTGCATAAAGAGGCTACTCAGATGGGACACTATGTCAAGGATTCGTCTTCACAAGGT
AGCCTCTCTTCCCGATGTTTAATCGACAGAATTATCCTCTTGGGATACACCTCTGGTCCG
AAATCTGCAC

QA 1 790 1 790
DS 

RD RS1A922JQ 467 0 0
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ATGTCAAGGATTCGTCTTCACAAGGTAGCCTCTCTTCCCGATGTTTAATCGACAGAATTA
TCCTCTTGGGATACACCTCTGGTCCGAAATCTGCACTGGTCGAACCTTTGAATCAGAAGG
CTGAGATTGAGATGGGACCATTGCGAATGGGTGGGCTAGTGGTTTCCTCCGGTACAAAGG
TCTTGACTATCCGCAAACCAGGTGTCCGAGTGGACCAAGACTGGACCGTTAAGGTTCTGT
GATTGACGAACCATTTTTCCTTGTGGCCGACGGAGTTTGCATACCTTTTCTTATAATATT
TTGGGAGTTTTAGACTTAAGTAGTTGCAAGAGCTAACAGACTGAGAGTCGTTTGCATGGT
TGTTTAAGAGTTTAGCGTTTTGATAATGTCATGGTTTCGTACTTAAA

QA 1 467 1 467
DS 



AS 1 2

CO CL4407Contig1 1231 2 2 U
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TGATCCGATCCGCCATGGAAGAAGAGAAGAAGGTAGAATCGACGAACAAGAATGTTAAGA
AGGTCAATCTACTCGACCACAACTCCATCAAGCACATGCTCGACGAGTCCGTCTCCGATG
TTGTGAAACAAGAGGGATGGGAGCGATTATACGGTGGATTGGCTCCGTCTCTCGCTGGCA
CTGCCGCGTCACAGGGTGTGTACTATTACTTCTACCAAGTGTTTCGGAGTCAAGCGGAAG
CTGCAGCTCTTCTACAAAGCAAGCAAGGTTTGGGTGACGGATCCGTTGGGATGCTTGCTT
CGCTTCTAGTGGCTGCATTGGCTGGAGCAGTTAATGTTCTGATGACGAATCCAATTTGGG
TGATTGTTACACGCATGCAGACCCACAGGAAAATGCCACAAACTCAAAAGACAGTCTCTG
AGTCACCTCCTTCTGAGATAGAAGAAGTTCTGGTTCCAGTTGAGCCGCGCCCATATGGAA
CCTTTAACACGATTCGAGACGTTTACGATGAGTCTGGAGTGATTGGGTTCTGGAAAGGTG
TAATTCCTACATTGATCATGGTAAGTAATCCATCAATGCAATTTATGTTGTACGAGACAA
TGCTAGCAAAGCTGAAGAAAAGACGTGCCTTGAAGAGTAGCATCACCGTGACCGCTTGGG
AGACGTTTCTACTAGGAGCTTGGCTAAACTCGGAGCTACAGTCACAACTTATCCTCTCTT
GGTTGTAAAGTCGAGACTTCAAGCCAAACAGGTCACAACAGGGGACCAAAGACATCAGTA
CAAAGGAACGCTGGATGCGATTCTGAAGATGATTAGATATGAAGGGCTTTACGGGTTCTA
CAAAGGGATGAGCACAAAGATTGTTCAGAGCGTTTTATCTGCTGCAGTTCTGTTCGTGAT
CAAGGAAGAGCTTGTCAAGGGAGCCAAGCTGTTGCTCTCTAACACGACTTCTAGCAAAGT
GGAGTCCAAGCTTTCCTGAGGCTCAATCAAGCTAGGATTTTAGAAAAATAAGATTGAAAT
AAATTAGTAGATTAAAATTAAACGTCCAATAATTTCTTGATTAGTTATTACACCATCAGG
AATGGTGTTCATTTCCTGATCGTTGCAAATTGATTTTTGTATTTTCCTGCAAAACTATTG
GTTTGTATGATTCTATATCTTAAAATTTGGC


BQ
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AF RS1EA90TF U 1
AF RS1EA90JQ C 517
BS 1 672 RS1EA90TF
BS 673 1231 RS1EA90JQ

RD RS1EA90TF 672 0 0
GGAAATCACCACACTCTGCGTTCTCGAGAGCATTTGAATCTCCGAAGAGACCTAGAGATC
TGATCCGATCCGCCATGGAAGAAGAGAAGAAGGTAGAATCGACGAACAAGAATGTTAAGA
AGGTCAATCTACTCGACCACAACTCCATCAAGCACATGCTCGACGAGTCCGTCTCCGATG
TTGTGAAACAAGAGGGATGGGAGCGATTATACGGTGGATTGGCTCCGTCTCTCGCTGGCA
CTGCCGCGTCACAGGGTGTGTACTATTACTTCTACCAAGTGTTTCGGAGTCAAGCGGAAG
CTGCAGCTCTTCTACAAAGCAAGCAAGGTTTGGGTGACGGATCCGTTGGGATGCTTGCTT
CGCTTCTAGTGGCTGCATTGGCTGGAGCAGTTAATGTTCTGATGACGAATCCAATTTGGG
TGATTGTTACACGCATGCAGACCCACAGGAAAATGCCACAAACTCAAAAGACAGTCTCTG
AGTCACCTCCTTCTGAGATAGAAGAAGTTCTGGTTCCAGTTGAGCCGCGCCCATATGGAA
CCTTTAACACGATTCGAGACGTTTACGATGAGTCTGGAGTGATTGGGTTCTGGAAAGGTG
TAATTCCTACATTGATCATGGTAAGTAATCCATCAATGCAATTTATGTTGTACGAGACAA
TGCTAGCAAAGC

QA 1 672 1 672
DS 

RD RS1EA90JQ 715 0 0
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GAGTGATTGGGTTCTGGAAAGGTGTAATTCCTACATTGATCATGGTAAGTAATCCATCAA
TGCAATTTATGTTGTACGAGACAATGCTAGCAAAGCTGAAGAAAAGACGTGCCTTGAAGA
GTAGCATCACCGTGACCGCTTGGGAGACGTTTCTACTAGGAGCTTGGCTAAACTCGGAGC
TACAGTCACAACTTATCCTCTCTTGGTTGTAAAGTCGAGACTTCAAGCCAAACAGGTCAC
AACAGGGGACCAAAGACATCAGTACAAAGGAACGCTGGATGCGATTCTGAAGATGATTAG
ATATGAAGGGCTTTACGGGTTCTACAAAGGGATGAGCACAAAGATTGTTCAGAGCGTTTT
ATCTGCTGCAGTTCTGTTCGTGATCAAGGAAGAGCTTGTCAAGGGAGCCAAGCTGTTGCT
CTCTAACACGACTTCTAGCAAAGTGGAGTCCAAGCTTTCCTGAGGCTCAATCAAGCTAGG
ATTTTAGAAAAATAAGATTGAAATAAATTAGTAGATTAAAATTAAACGTCCAATAATTTC
TTGATTAGTTATTACACCATCAGGAATGGTGTTCATTTCCTGATCGTTGCAAATTGATTT
TTGTATTTTCCTGCAAAACTATTGGTTTGTATGATTCTATATCTTAAAATTTGGC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

CO CL4408Contig1 953 2 4 U
GGGGGGGACGAAAAAGGTTTTCTGTCGAGAAAAGGTGTGCGGAAAAAAAAAGGTTAAGCA
TAGATGAAGAGTCTTCGGGTTATACAGTTGTGATAAAGAAAGAATAAAAATGGGAGGTTG
CTGCTGTTGTTCTTCACTAAGAGCTGATCTTCATAATGCTCCTCCCTACTATTACTATCC
GAGAGCAACAGAAGAGCGAGTTCCTTTATCTTCCGCTCATACAATCTCCTCTGGTGTTGT
TGTGGTTGACACAAACTTAGAGACTTCATCCCCCGATACTTATATACCACCACCACTGCC
TACTCCTTTCGATGTGGCCATCTGTGTTCCCCACACACCAGGAAACGCTGAAGGGACTGC
TTGTTTTGATATTAGAGAGGTTTCAGTGGAAACCGCTAATACAGTCTTAGCTCAAGGAAC
AGTCGATGGTATCACTCTCGGGGTTCCAGCTACATGCCCTTGTAAAGAAACAGAAAGCAA
ACTACAGACAGAGATTGAAGATATAGACCCCAAGAAGCTATCAAAAGATGTCTTTGTACC
AATGGAGGAAGTGGAGGATTGTCCCATTTGTTTGGAAGAATATGATATGGAGAACCCGAA
ACTTGTAGCAAACTGTGAGCACCATTTTCATCTGGCATGCATTCTAGAATGGATGGAGAG
AAGTGAAACCTGCCCCGTTTGCAACAAAGAAACGGTGTTTGACTCTCCCCTTGACTAGCA
ACCTGCAAGTACCACAGCAGAAAGAAAACGGAAAAAGGAGAAGAAATTTAAAAGGAAAGA
TGGTAAGAGAATACACTAGAGTAACGTTCTTGATTTACAAGTCGCATATTACAAATCAAA
TCAGTGTTCATATACATAGATGCTTGTACAGAGACATTCGAAGTCGACTACCAAAAAAAG
ACTATTAAGATAAGAATTTAGGGGTTAATTATGCTTTAAGACCCGCTTCTGTG


BQ
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AF RS1E379TF U 1
AF RS1E379JQ C 374
BS 1 694 RS1E379TF
BS 695 695 RS1E379JQ
BS 696 707 RS1E379TF
BS 708 953 RS1E379JQ

RD RS1E379TF 707 0 0
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CTGCTGTTGTTCTTCACTAAGAGCTGATCTTCATAATGCTCCTCCCTACTATTACTATCC
GAGAGCAACAGAAGAGCGAGTTCCTTTATCTTCCGCTCATACAATCTCCTCTGGTGTTGT
TGTGGTTGACACAAACTTAGAGACTTCATCCCCCGATACTTATATACCACCACCACTGCC
TACTCCTTTCGATGTGGCCATCTGTGTTCCCCACACACCAGGAAACGCTGAAGGGACTGC
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AGTCGATGGTATCACTCTCGGGGTTCCAGCTACATGCCCTTGTAAAGAAACAGAAAGCAA
ACTACAGACAGAGATTGAAGATATAGACCCCAAGAAGCTATCAAAAGATGTCTTTGTACC
AATGGAGGAAGTGGAGGATTGTCCCATTTGTTTGGAAGAATATGATATGGAGAACCCGAA
ACTTGTAGCAAACTGTGAGCACCATTTTCATCTGGCATGCATTCTAGAATGGATGGAGAG
AAGTGAAACCTGCCCCGTTTGCAACAAAGAAACG*TGTTTGACTCTC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1E379JQ 580 0 0
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ACTCTCGGGGTTCCAGCTACATGCCCTTGTAAAGAAACAGAAAGCAAACTACAGACAGAG
ATTGAAGATATAGACCCCAAGAAGCTATCAAAAGATGTCTTTGTACCAATGGAGGAAGTG
GAGGATTGTCCCATTTGTTTGGAAGAATATGATATGGAGAACCCGAAACTTGTAGCAAAC
TGTGAGCACCATTTTCATCTGGCATGCATTCTAGAATGGATGGAGAGAAGTGAAACCTGC
CCCGTTTGCAACAAAGAAACGGTGTTTGACTCTCCCCTTGACTAGCAACCTGCAAGTACC
ACAGCAGAAAGAAAACGGAAAAAGGAGAAGAAATTTAAAAGGAAAGATGGTAAGAGAATA
CACTAGAGTAACGTTCTTGATTTACAAGTCGCATATTACAAATCAAATCAGTGTTCATAT
ACATAGATGCTTGTACAGAGACATTCGAAGTCGACTACCAAAAAAAGACTATTAAGATAA
GAATTTAGGGGTTAATTATGCTTTAAGACCCGCTTCTGTG

QA 1 580 1 580
DS 



AS 1 2

CO CL4409Contig1 976 2 2 U
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TCGATAGATTGTTGTTGGCGATTGCAAAGATTGATTAAGAGAGTTGAGTTTTGTGATCGG
AGATAATGGATTGGGGAAATGTGACGGTTGAGGATCTGGTGGATGCTCTACGAGAGGTTG
ACTGGTCGTCGCCGCCGCGTCCGCTATCGGAGTTCTTCTCAAGGTTCACCGTTCCTAAAT
CTTTCGCTAAATGGGATAGCCGCCTCAAGTGCAATCTCTACTACTACCGAACGAACTACT
TCATCATGATCGTCTTTATACTTGGATTGGGATTTCTTACAAGGCCTCTCGCCATTCTCT
CTGCCCTTTTGACGGCACTAACTGTGGCATTCCTAAATGACAGCTTTGCAGGTTCCTTTA
GTGAGAAGGCCACACGAACCATCAGAAGATTCTCCCCACCTTTAGCTGCTAAAATGAGAC
CTCCATTGGCGCCTGTCATCCGTGGACGTCCATCAGCTAAGAGAGCAATCTATATCTGTG
GCCAACCCCGTTGGGTCTTTGTCTTGGTATCCTCACTTGTGAGTTTCCCCTTTGGTATAT
CTCATGTGGTTTGTTCACTGTCTCTTTGGCACTACTCATTGGGCTTCTTGCTACGATTCT
TCATGCAACCTTGAGAACACCCAACTTGAAGGCACGTCTTAACACCTTCAGGGAGGAATT
TCGAGCAGTGTGGCGTAACTACAGTGAGATCTAGAGTAATATAAGCTCGAGCAGAGTATT
GCTGTTGCTCTGTAATCTCTTTGATTTTTTTTTTTTTGTTTTTAGCTCCATGACTCGGAT
TCTGTTTCTTGATTTGGTTTCTGCTCTCTGTCGTAGCAGTCTTTTGTTTAAGCACTTGTA
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TCGTTTGAAAGCGTGC


BQ
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AF RS1DN07TF U 1
AF RS1DN07JQ C 363
BS 1 690 RS1DN07TF
BS 691 976 RS1DN07JQ

RD RS1DN07TF 690 0 0
GGATCTTCTCTTCTCTTGTCTTCTCTTCGAGGAAGCTTTGATTTGATCGTAAATTCGTAA
TCGATAGATTGTTGTTGGCGATTGCAAAGATTGATTAAGAGAGTTGAGTTTTGTGATCGG
AGATAATGGATTGGGGAAATGTGACGGTTGAGGATCTGGTGGATGCTCTACGAGAGGTTG
ACTGGTCGTCGCCGCCGCGTCCGCTATCGGAGTTCTTCTCAAGGTTCACCGTTCCTAAAT
CTTTCGCTAAATGGGATAGCCGCCTCAAGTGCAATCTCTACTACTACCGAACGAACTACT
TCATCATGATCGTCTTTATACTTGGATTGGGATTTCTTACAAGGCCTCTCGCCATTCTCT
CTGCCCTTTTGACGGCACTAACTGTGGCATTCCTAAATGACAGCTTTGCAGGTTCCTTTA
GTGAGAAGGCCACACGAACCATCAGAAGATTCTCCCCACCTTTAGCTGCTAAAATGAGAC
CTCCATTGGCGCCTGTCATCCGTGGACGTCCATCAGCTAAGAGAGCAATCTATATCTGTG
GCCAACCCCGTTGGGTCTTTGTCTTGGTATCCTCACTTGTGAGTTTCCCCTTTGGTATAT
CTCATGTGGTTTGTTCACTGTCTCTTTGGCACTACTCATTGGGCTTCTTGCTACGATTCT
TCATGCAACCTTGAGAACACCCAACTTGAA

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1DN07JQ 614 0 0
GCCCTTTTGACGGCACTAACTGTGGCATTCCTAAATGACAGCTTTGCAGGTTCCTTTAGT
GAGAAGGCCACACGAACCATCAGAAGATTCTCCCCACCTTTAGCTGCTAAAATGAGACCT
CCATTGGCGCCTGTCATCCGTGGACGTCCATCAGCTAAGAGAGCAATCTATATCTGTGGC
CAACCCCGTTGGGTCTTTGTCTTGGTATCCTCACTTGTGAGTTTCCCCTTTGGTATATCT
CATGTGGTTTGTTCACTGTCTCTTTGGCACTACTCATTGGGCTTCTTGCTACGATTCTTC
ATGCAACCTTGAGAACACCCAACTTGAAGGCACGTCTTAACACCTTCAGGGAGGAATTTC
GAGCAGTGTGGCGTAACTACAGTGAGATCTAGAGTAATATAAGCTCGAGCAGAGTATTGC
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TGTTTCTTGATTTGGTTTCTGCTCTCTGTCGTAGCAGTCTTTTGTTTAAGCACTTGTAAA
GCCAGCTTGTTTGCTGTTGTTTCCCCCCCCAAAACCCTTTTAATATACAATCCTAGAGTC
GTTTGAAAGCGTGC

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 2

CO CL4410Contig1 721 2 4 U
GATCCTTAGTTTGTTGAGTATAACTCCGTCCCATCCCTTGAGTAGATAAACACTGAAACA
CCGAATCATGTTATCTCTTTTGCAGAGAGATAAATAAGAAGCCAAGTTTAGTACGTAGAG
ATTAAAAGAAAGCTCCAAGAGATGGAAGATCAAGAACAGCAGAAGAATTCACGAGTTGTT
AAAGTCGATTCTGCAGAATCATGGAACTTTTATGTGAGTCAAGCCAAGAATCAGGCTTGT
CCTATCGTGGCTCATTTCACAGCATCATGGTGTATTCCTTCTGTGTTTATGAACTCGTTC
TTCGAAGATATTGCATCTAGCTATAAGGATGCTCTGTTTCTTATAGTTGATGTTGATGAA
GTCAAGGAAGTGGCGAGACGGCTAGAGGTAAAGGCGATGCCGACTTTTATGTTCTTGAAG
GATGGTAATACGATGGACAAACTGGTGGGCGCAAACCCTGATGAAATCAAGAAAAGGGTC
GACGGTTTCGTTCAGTCCTCACACCTTGTTTAGAATAATATTGATACATGGTAAGAGAAC
TCAATCCTAATAAAGTTTGTGTAAAAGTGTGTTTTAGTTTGTGTGAAGTGTACTTATAGC
TTGTGTAAAGTGTATTTGTAGCTTGTGTAACTTGTATTTTTACTCGTTTGGTTTGTGACT
TTTTTAGTATAAGGTTTGTGTAAAAATGTTTGTGTAATATATATGTATATAATCCAGGAG
A


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RS1EZ57TF U 1
AF RS1EZ57JQ C 337
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BS 465 465 RS1EZ57JQ
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BS 674 721 RS1EZ57JQ

RD RS1EZ57TF 680 0 0
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CCTATCGTGGCTCATTTCACAGCATCATGGTGTATTCCTTCTGTGTTTATGAACTCGTTC
TTCGAAGATATTGCATCTAGCTATAAGGATGCTCTGTTTCTTATAGTTGATGTTGATGAA
GTCAAGGAAGTGGCGAGACGGCTAGAGGTAAAGGCGATGCCGACTTTTATGTTCTTGAAG
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GACGGTTTCGTTCAGTCCTCACACCTTGTTTAGAATAATATTGATACATGGTAAGAGAAC
TCAATCCTAATAAAGTTTGTGTAAAAGTGTGTTTTAGTTTGTGTGAAGTGTACTTATAGC
TTGTGTAAAGTGTATTTGTAGCTTGTGTAACTTGTATTTTTACTCGTTTGGTTTGTGACT
TTTTTAGTATAAG
TTTGTGT

QA 1 673 1 673
DS 

RD RS1EZ57JQ 385 0 0
TTTT
TTATAGTTGATGTTGATGAAGTCAAGGAAGTGGCGAGACGGCTAGAGGTAAAGGCGATGC
CGACTTTTATGTTCTTGAAGGATGGTAATACGATGGACAAACTGGTGGGCGCAAACCCTG
ATGAAATCAAGAAAAGGGTCGACGGTTTCGTTCAGTCCTCACCCCTTGTTTAGAATAATA
TTGATACATGGTAAGAGAACTCAATCCTAATAAAGTTTGTGTAAAAGTGTGTTTTAGTTT
GTGTGAAGTGTACTTATAGCTTGTGTAAAGTGTATTTGTAGCTTGTGTAACTTGTATTTT
TACTCGTTTGGTTTGTGACTTTTTTAGTATAAGGTTTGTGTAAAAATGTTTGTGTAATAT
ATATGTATATAATCCAGGAGA

QA 5 385 5 385
DS 



AS 1 2

CO CL4411Contig1 1101 2 4 U
ACAGTTTTGTTTCCTTTGCAGAGAGCTAAGACATGGAACCAACAGAGAAACCATCGACCA
AACCGTCCTCTCGGACTCTCCCTAGAGACACTCGTGGCTCTCTCGAAGTATTCAACCCAT
CAACCTTCCCGACCAGACCTGATAACCCTGTCTTCCGTCCAGAACCACCAACGTGGGAAA
ACTGGAGCTATCCACGTGACAGCCCCCAACCCCAAATCCAACCTCTGTCTGAGCCAGCTC
CCTCTATTCCGGTTCGGTCTGAAGAAATCGCCGTCACAACCTCATGGATGGCTCTGAAGG
ATCCATCACCGGAGAAAATCTCCAAGAAGACGATCACCGCCGAGAAACCACAGGTTGCAG
CTGTGGCAGCGGAGCAGAGAGCGGCGGAGTGGGGACTTGTTTTGAAGACTGATACTAAGA
CGGGAAAGCCACAGGGAGTGAGCGTGAGGAACTCAGGTGGGGCAGAGAATGATCCGAACG
GTAAGAAGACTTCGCAGCGAAACTCAAGCAATTCTTGCCGGAGCTCCGGTGAAATGTCTG
ACGGAGATGTCGCCGGCGGGAGAGGTGGGATCCCGAGGGTATCGGAAGATCTGAAAGATG
CCTTGTCTACGTTTCAACAAACATTTGTTGTTTCAGATGCTACCAAACCTGATTACCCGA
TTATGTATGCTAGTGCCGGTTTCTTCAACATGACCGGTTACACTTCCAAAGAGGTCGTCG
GCAGAAACTGCCGATTTTTACAAGGATCAGGGACGGATGCAGATGAGTTAGCGAAGATAA
GAGAATCATTATCTGCTGGGAATAATTATTGTGGGCGTTTATTGAATTACAAGAAAGATG
GGACTTCATTTTGGAGTCTTCTCACGATTGCGCCCATTAAAGACGAGAGTGGCAAAGTCC
TCAAATTTATTGGGTTAGTCCCTTAATACACTTTTGTTTTACCCGTTTAAGTCCTTTATT
TATTCGTTTTTCAAAATTCCATCCTTATGATGGGACTTGAGTTGATTCTGTGGACCTGTG
GTGATTGCGTTGCTTTCTCCGCAATAATTCTAACAGTTGTCGTTGGCTTATCTGATCATC
GTCGACCCAACGGCCTTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BP01TF U 1
AF RS1BP01JQ C 342
BS 1 616 RS1BP01TF
BS 617 617 RS1BP01JQ
BS 618 675 RS1BP01TF
BS 676 1101 RS1BP01JQ

RD RS1BP01TF 675 0 0
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AACCGTCCTCTCGGACTCTCCCTAGAGACACTCGTGGCTCTCTCGAAGTATTCAACCCAT
CAACCTTCCCGACCAGACCTGATAACCCTGTCTTCCGTCCAGAACCACCAACGTGGGAAA
ACTGGAGCTATCCACGTGACAGCCCCCAACCCCAAATCCAACCTCTGTCTGAGCCAGCTC
CCTCTATTCCGGTTCGGTCTGAAGAAATCGCCGTCACAACCTCATGGATGGCTCTGAAGG
ATCCATCACCGGAGAAAATCTCCAAGAAGACGATCACCGCCGAGAAACCACAGGTTGCAG
CTGTGGCAGCGGAGCAGAGAGCGGCGGAGTGGGGACTTGTTTTGAAGACTGATACTAAGA
CGGGAAAGCCACAGGGAGTGAGCGTGAGGAACTCAGGTGGGGCAGAGAATGATCCGAACG
GTAAGAAGACTTCGCAGCGAAACTCAAGCAATTCTTGCCGGAGCTCCGGTGAAATGTCTG
ACGGAGATGTCGCCGGCGGGAGAGGTGGGATCCCGAGGGTATCGGAAGATCTGAAAGATG
CCTTGTCTACGTTTCA*CAAACATTTGTTGTTTCAGATGCTACCAAACCTGATTACCCGA
TTATGTATGCTAGTG

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1BP01JQ 760 0 0
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TTGAAGACTGATACTAAGACGGGAAAGCCACAGGGAGTGAGCGTGAGGAACTCAGGTGGG
GCAGAGAATGATCCGAACGGTAAGAAGACTTCGCAGCGAAACTCAAGCAATTCTTGCCGG
AGCTCCGGTGAAATGTCTGACGGAGATGTCGCCGGCGGGAGAGGTGGGATCCCGAGGGTA
TCGGAAGATCTGAAAGATGCCTTGTCTACGTTTCAACAAACATTTGTTGTTTCAGATGCT
ACCAAACCTGATTACCCGATTATGTATGCTAGTGCCGGTTTCTTCAACATGACCGGTTAC
ACTTCCAAAGAGGTCGTCGGCAGAAACTGCCGATTTTTACAAGGATCAGGGACGGATGCA
GATGAGTTAGCGAAGATAAGAGAATCATTATCTGCTGGGAATAATTATTGTGGGCGTTTA
TTGAATTACAAGAAAGATGGGACTTCATTTTGGAGTCTTCTCACGATTGCGCCCATTAAA
GACGAGAGTGGCAAAGTCCTCAAATTTATTGGGTTAGTCCCTTAATACACTTTTGTTTTA
CCCGTTTAAGTCCTTTATTTATTCGTTTTTCAAAATTCCATCCTTATGATGGGACTTGAG
TTGATTCTGTGGACCTGTGGTGATTGCGTTGCTTTCTCCGCAATAATTCTAACAGTTGTC
GTTGGCTTATCTGATCATCGTCGACCCAACGGCCTTTTTC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4413Contig1 738 2 3 U
GATTACACTTTTGTTTTTTTATTATGATAGAGGACCCAAATCGCTTAAACGATTTCATGT
GAATACCAAACCAATTATTAAGAATTCGAAATAAAGCCAGCTTGCTCCAAGAAACAGCAG
TAGACTAGTCTCCCTTTTACCACTCATGAAATCATTCTGAATCAAACGGAGAGTTCGGTC
CTGGAGATCAAGACACCATCACTATCAGCGTAAAGCCACTCTCCATCTCTAATCAAAGTT
CCTCCAATATAAACCGGCACATTCTTCTCACCATGACCTTTCTTACTAGACTTGAGTGGG
TTAGAGCCCAATGCCCTAACCCCGACATCGCAGTCATTGATCTCATCCACATCTCTAACG
CATCCATTCACCACAATCCCTGCCCACCCGTTGTTCTGAGCTAACTGCCCGAGGTTTCCT
CCAACAAGCGCGCATCTCATGCTTCCACCACCGTCTATAACCAAGACTCCACCTTCTCCT
TTGGTCTCTAGTTGGTTTCTGACCAGGACATTGTCTTCAAAGACCTTGAGTGTCACGATT
GGTCCTGAGAAGCATCTTCTTTGGCCATACATCTTGAAGATTGGGTGGAGAGCGCGTAGG
TCTCCGTTTGATATTAGTTCTGCGTTGCTGTCACACGCTTCTGCTGTTGCAAATGCAGCC
ATGGAAGATTGTGCGTGCCGAGCGTGTGTATTCAGTGAGAGAGAGAAGAGGTCCAAAGCT
TTCAACTTTCTGCTACCC


BQ
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AF RS1BE25JQ U 24
AF RS1BE25TF C 1
BS 1 23 RS1BE25TF
BS 24 353 RS1BE25JQ
BS 354 738 RS1BE25TF

RD RS1BE25JQ 330 0 0
ATGATAGAGGACCCAAATCGCTTAAACGATTTCATGTGAATACCAAACCAATTATTAAGA
ATTCGAAATAAAGCCAGCTTGCTCCAAGAAACAGCAGTAGACTAGTCTCCCTTTTACCAC
TCATGAAATCATTCTGAATCAAACGGAGAGTTCGGTCCTGGAGATCAAGACACCATCACT
ATCAGCGTAAAGCCACTCTCCATCTCTAATCAAAGTTCCTCCAATATAAACCGGCACATT
CTTCTCACCATGACCTTTCTTACTAGACTTGAGTGGGTTAGAGCCCAATGCCCTAACCCC
GACATCGCAGTCATTGATCTCATCCACATC

QA 1 330 1 330
DS 

RD RS1BE25TF 738 0 0
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GAATACCAAACCAATTATTAAGAATTCGAAATAAAGCCAGCTTGCTCCAAGAAACAGCAG
TAGACTAGTCTCCCTTTTACCACTCATGAAATCATTCTGAATCAAACGGAGAGTTCGGTC
CTGGAGATCAAGACACCATCACTATCAGCGTAAAGCCACTCTCCATCTCTAATCAAAGTT
CCTCCAATATAAACCGGCACATTCTTCTCACCATGACCTTTCTTACTAGACTTGAGTGGG
TTAGAGCCCAATGCCCTAACCCCGACATCGCAGTCATTGATCTCATCCACATCTCTAACG
CATCCATTCACCACAATCCCTGCCCACCCGTTGTTCTGAGCTAACTGCCCGAGGTTTCCT
CCAACAAGCGCGCATCTCATGCTTCCACCACCGTCTATAACCAAGACTCCACCTTCTCCT
TTGGTCTCTAGTTGGTTTCTGACCAGGACATTGTCTTCAAAGACCTTGAGTGTCACGATT
GGTCCTGAGAAGCATCTTCTTTGGCCATACATCTTGAAGATTGGGTGGAGAGCGCGTAGG
TCTCCGTTTGATATTAGTTCTGCGTTGCTGTCACACGCTTCTGCTGTTGCAAATGCAGCC
ATGGAAGATTGTGCGTGCCGAGCGTGTGTATTCAGTGAGAGAGAGAAGAGGTCCAAAGCT
TTCAACTTTCTGCTACCC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

CO CL4414Contig1 589 2 1 U
GGAAGCGTGATGAGTCTGAGTCTGATTCTGGAGATAGAAAGAGAAGGAGGTCGAAGAAGC
GGAGGACGCATAAGAGGAGGAGTTTGAGTGAGTCTGAGGACGAGGACGAGGAGGAAAGGA
GGAATAAGAGGAGGGGGAGAAAGAGAGGTGATGATTCTGATGATTCTTCTGATGATGAGG
ATGATGGCCGGAGACGGGTTAAGAGAAAGAGTAGGAAGGAGAAGAGGAGGAGGGGAAGCA
GGCGTAATGATTCTGATTCTGATTCATCTGAGGATGAGGGAAGAGGTAGAAGGCAGAAGC
GTAGGAACAAAGTGGCGGCGTCTTCTGACTCTGATGTTTCAGGCGATGATGGTTTACGCG
TTGGAAGGAGTTCTTCTAAGAGGTACGAGAAGAAGAGCAGGAAACGTCATCACAGGAGGA
AAGACTGAAGTTAAGATCGATCCGGTTCTGTCGTTTTTGGATATCCATTTTATCTCTATA
TATCAATCTATGTATAATGTTGAATGATGAAGCCTGCCTATAGGATTTGATTTGTGTTGG
ACTCCTGTGGTATACTTGTTTCAAGAATGTGTTATTGAGATAGTGTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1H009TF U 1
AF RS1H009JQB C 261
BS 1 589 RS1H009TF

RD RS1H009TF 589 0 0
GGAAGCGTGATGAGTCTGAGTCTGATTCTGGAGATAGAAAGAGAAGGAGGTCGAAGAAGC
GGAGGACGCATAAGAGGAGGAGTTTGAGTGAGTCTGAGGACGAGGACGAGGAGGAAAGGA
GGAATAAGAGGAGGGGGAGAAAGAGAGGTGATGATTCTGATGATTCTTCTGATGATGAGG
ATGATGGCCGGAGACGGGTTAAGAGAAAGAGTAGGAAGGAGAAGAGGAGGAGGGGAAGCA
GGCGTAATGATTCTGATTCTGATTCATCTGAGGATGAGGGAAGAGGTAGAAGGCAGAAGC
GTAGGAACAAAGTGGCGGCGTCTTCTGACTCTGATGTTTCAGGCGATGATGGTTTACGCG
TTGGAAGGAGTTCTTCTAAGAGGTACGAGAAGAAGAGCAGGAAACGTCATCACAGGAGGA
AAGACTGAAGTTAAGATCGATCCGGTTCTGTCGTTTTTGGATATCCATTTTATCTCTATA
TATCAATCTATGTATAATGTTGAATGATGAAGCCTGCCTATAGGATTTGATTTGTGTTGG
ACTCCTGTGGTATACTTGTTTCAAGAATGTGTTATTGAGATAGTGTTGT

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1H009JQB 329 0 0
GATTCATCTGAGGATGAGGGAAGAGGTAGAAGGCAGAAGCGTAGGAACAAAGTGGCGGCG
TCTTCTGACTCTGATGTTTCAGGCGATGATGGTTTACGCGTTGGAAGGAGTTCTTCTAAG
AGGTACGAGAAGAAGAGCAGGAAACGTCATCACAGGAGGAAAGACTGAAGTTAAGATCGA
TCCGGTTCTGTCGTTTTTGGATATCCATTTTATCTCTATATATCAATCTATGTATAATGT
TGAATGATGAAGCCTGCCTATAGGATTTGATTTGTGTTGGACTCCTGTGGTATACTTGTT
TCAAGAATGTGTTATTGAGATAGTGTTGT

QA 1 329 1 329
DS 



AS 1 2

CO CL4415Contig1 1259 2 10 U
GGTTCCCAAATTCAAGAGAGGGAGAAAAGAACAGCGCCGCACAAGAGAGAAGAAGAAGAA
GAAAACTTTACCGTCGCCGATCTCTCTCCGTGGTAGGCCGTGCTCGTCACCGCCGCTACG
TGAGGGAGGATCTCCTCGACCTCTTCAGTTTGATCTAAGTTTTATCTGGTATCATCGTTT
TGGGTGAAGGTTTCCATCTCAGTCTAGTGAGTTCTAGTTTGGTTCTGTCTCAAGTAGTCT
CAGAGTCTTTTGTGGTTGATTTGGTGCTTGAATCCCTTTAGTATTTGTCGATTGGGTGAG
TTACTGTAGAAGAGACCTCTGTGGTGGTAGCTGGTGCTTAATCGTCTTGATTCTCTTGCT
CCTCTTTGGTTTTTGCTTAGTCTGTGTTCTGCGCTTGGAGTGTGGTTCCTGCTCTCTTGC
TTGTTTCAGGTGGAGTTTCGGTTTGGAGAGTTGGGTTCAGTGATGAGTCTGGCGCCATAT
GTCAGGTCGAGGACCTGTTGACGGTGCGGTGTAGCTGCTTGGGGCAGTGCAGGTGCTTTC
GCTGACGTCGTCTTTGGACTTTCTTCAACTCTAATTCCTTTACTATTCATCGTTTCTGTA
AAGAGCTTTGGTTCTCGGTTGAGTCGTTGTGTCGACTTCGTGTTTCTGAGTGCGCTTTCA
GGTGCCTATATCCCGAGCTTGGTCTCGCGTCTCCTGTGTTGTTTCTTCAGATGGTGCTTT
CAAGATTATGGCTTTCTCCAATTGGTTCTTGTTTGGTGCGGAAGGGTATGTTTCTTTGAG
GTTTTTTCTGCAACGGTGAAGCGTCTCGAGGATACCTGGAGTGCTATTGGATTCTCTCCG
GTGAAAAGGTCTGATTTGAGGTGTGTGGTACTTCGTCCTGCTGTGTGCCGGCGGGTGGAC
CTGTTTCTGTTCTGTGGTTTGGTTGTCAAGCTCTCTTGTGTTGGTGGTCTGTCCTTATTG
GAGGCTCATTCTCGTTTTGCTTGGCTGTCTCCGCGTAAGCCTCCGGTGGTTCTAATGGTC
ATGGTTACTATTTCTTCCGTCCTCTCTTTTGAGCTCTCAGTACTGTGGGATTTAAGTTTC
AAATTTTATACCTTAGTTTGGTTGTTTATGTGTCCCGTGTGTGGGTTTAAGGGTCCCTTC
TTATGGGATTTAGTTTCCCTTCTTATGGGAGTTAGTTTCTGAGGATATATCTTTCTTCCT
TCAGCTTGTGAAATAGATGTTGTATTACACTTTGCTGATCTAATATAATTCAATTTGGG


BQ
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AF RS1GG90TF U 1
AF RS1GG90JQ C 402
BS 1 661 RS1GG90TF
BS 662 662 RS1GG90JQ
BS 663 699 RS1GG90TF
BS 700 700 RS1GG90JQ
BS 701 722 RS1GG90TF
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BS 728 749 RS1GG90TF
BS 750 1259 RS1GG90JQ

RD RS1GG90TF 750 0 0
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GAAAACTTTACCGTCGCCGATCTCTCTCCGTGGTAGGCCGTGCTCGTCACCGCCGCTACG
TGAGGGAGGATCTCCTCGACCTCTTCAGTTTGATCTAAGTTTTATCTGGTATCATCGTTT
TGGGTGAAGGTTTCCATCTCAGTCTAGTGAGTTCTAGTTTGGTTCTGTCTCAAGTAGTCT
CAGAGTCTTTTGTGGTTGATTTGGTGCTTGAATCCCTTTAGTATTTGTCGATTGGGTGAG
TTACTGTAGAAGAGACCTCTGTGGTGGTAGCTGGTGCTTAATCGTCTTGATTCTCTTGCT
CCTCTTTGGTTTTTGCTTAGTCTGTGTTCTGCGCTTGGAGTGTGGTTCCTGCTCTCTTGC
TTGTTTCAGGTGGAGTTTCGGTTTGGAGAGTTGGGTTCAGTGATGAGTCTGGCGCCATAT
GTCAGGTCGAGGACCTGTTGACGGTGCGGTGTAGCTGCTTGGGGCAGTGCAGGTGCTTTC
GCTGACGTCGTCTTTGGACTTTCTTCAACTCTAATTCCTTTACTATTCATCGTTTCTGTA
AAGAGCTTTGGTTCTCGGTTGAGTCGTTGTGTCGACTTCGTGTTTCTGAGTGCGCTTTCA
G*TGCCTATATCCCGAGCTTGGTCTCGCGTCTCCTGTGT*GTTTCTTCAGATGGTGCTTT
CA*GAT*ATGGCTTTCTCCAATTGGTTCT
G

QA 1 749 1 749
DS 

RD RS1GG90JQ 858 0 0
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GATGAGTCTGGCGCCATATGTCAGGTCGAGGACCTGTTGACGGTGCGGTGTAGCTGCTTG
GGGCAGTGCAGGTGCTTTCGCTGACGTCGTCTTTGGACTTTCTTCAACTCTAATTCCTTT
ACTATTCATCGTTTCTGTAAAGAGCTTTGGTTCTCGGTTGAGTCGTTGTGTCGACTTCGT
GTTTCTGAGTGCGCTTTCAGGTGCCTATATCCCGAGCTTGGTCTCGCGTCTCCTGTGTTG
TTTCTTCAGATGGTGCTTTCAAGATTATGGCTTTCTCCAATTGGTTCTTGTTTGGTGCGG
AAGGGTATGTTTCTTTGAGGTTTTTTCTGCAACGGTGAAGCGTCTCGAGGATACCTGGAG
TGCTATTGGATTCTCTCCGGTGAAAAGGTCTGATTTGAGGTGTGTGGTACTTCGTCCTGC
TGTGTGCCGGCGGGTGGACCTGTTTCTGTTCTGTGGTTTGGTTGTCAAGCTCTCTTGTGT
TGGTGGTCTGTCCTTATTGGAGGCTCATTCTCGTTTTGCTTGGCTGTCTCCGCGTAAGCC
TCCGGTGGTTCTAATGGTCATGGTTACTATTTCTTCCGTCCTCTCTTTTGAGCTCTCAGT
ACTGTGGGATTTAAGTTTCAAATTTTATACCTTAGTTTGGTTGTTTATGTGTCCCGTGTG
TGGGTTTAAGGGTCCCTTCTTATGGGATTTAGTTTCCCTTCTTATGGGAGTTAGTTTCTG
AGGATATATCTTTCTTCCTTCAGCTTGTGAAATAGATGTTGTATTACACTTTGCTGATCT
AATATAATTCAATTTGGG

QA 1 858 1 858
DS 



AS 1 2

CO CL4416Contig1 989 2 4 U
GGTCTCACAACTTCACCATTCGTTCGGAGCTAAACGAAAGAAGTGGTCTTCATCGGAGTT
ACGCTCGCAAACTCCAAACATGGCGAGAGGTTTGAAGAAGCATTTGAAGAGGCTCAATGC
CCCTCACCATTGGAGCCTTGACAAACTTGGTGGTGCTTTTGCCCCCAAGCCATCTTCTGG
ACCCCACAAGTCGAGGGAGTGCCTTCCCCTCGTTCTTATCATCAGGAACAGGTTGAAGTA
TGCTCTTACCTACCGTGAAGTCATCTCCATCTTGATGCAAAGGCACATCCAAGTCGATGG
CAAAGTCAGGACTGACAAGACCTACCCTGCTGGTTTCATGGATGTTGTCTCTATCCCCAA
GACTAACGAGAACTTCCGTCTCCTCTATGATACCGAGGGACGTTTCCGTCTCCACTCCCT
CAGGGACGAGGAAGCCAAGTTTAAGCTGTGCAAAGTCCGAACCATCCAGTTAGGACAGAA
GGGCATTCCTTACCTGAACACATACGATGGTCGCACCATCCGTTACCCTGACCCACTCAT
CAAGCCTAATGACACCATCAAGCTCGACCTGGAGGAGAACAAGGTTGTGGACTTCATCAA
GTTTGATGTCGGCAATGTTGTGATGGTGACTGGAGAAAGAAACAGAGGGCGTGTTGGTGT
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ATGGGTTTCTCTTCCTAAGGGTAAAGGTATTAAGTTGACCATCATCGAGGAAGCCAGGAA
GAGGCTCGCTGGCCAACAGGCTGCTTAATTTTGTTGTGTTTTCAGTGCTTTATTGTGTCA
TTTTAGATGACTTTTGTTTCCTTAGACTCACTTTGCATCTTTTGGTTTCGCTACTCGGTT
TTGAGACGTGTTATTTTATATTGAGTTTT


BQ
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AF RS1D674TF U 1
AF RS1D674JQ C 389
BS 1 678 RS1D674TF
BS 679 679 RS1D674JQ
BS 680 723 RS1D674TF
BS 724 989 RS1D674JQ

RD RS1D674TF 723 0 0
GGTCTCACAACTTCACCATTCGTTCGGAGCTAAACGAAAGAAGTGGTCTTCATCGGAGTT
ACGCTCGCAAACTCCAAACATGGCGAGAGGTTTGAAGAAGCATTTGAAGAGGCTCAATGC
CCCTCACCATTGGAGCCTTGACAAACTTGGTGGTGCTTTTGCCCCCAAGCCATCTTCTGG
ACCCCACAAGTCGAGGGAGTGCCTTCCCCTCGTTCTTATCATCAGGAACAGGTTGAAGTA
TGCTCTTACCTACCGTGAAGTCATCTCCATCTTGATGCAAAGGCACATCCAAGTCGATGG
CAAAGTCAGGACTGACAAGACCTACCCTGCTGGTTTCATGGATGTTGTCTCTATCCCCAA
GACTAACGAGAACTTCCGTCTCCTCTATGATACCGAGGGACGTTTCCGTCTCCACTCCCT
CAGGGACGAGGAAGCCAAGTTTAAGCTGTGCAAAGTCCGAACCATCCAGTTAGGACAGAA
GGGCATTCCTTACCTGAACACATACGATGGTCGCACCATCCGTTACCCTGACCCACTCAT
CAAGCCTAATGACACCATCAAGCTCGACCTGGAGGAGAACAAGGTTGTGGACTTCATCAA
GTTTGATGTCGGCAATGTTGTGATGGTGACTGGAGAAAGAAACAGAGGGCGTGTTGGTGT
GATTAAGAACCGTGAGAA*CACAAGGGAAGCTTTGAGACTATCCATATCCAGGACTCTAC
AGG

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1D674JQ 601 0 0
GATACCGAGGGACGTTTCCGTCTCCACTCCCTCAGGGACGAGGAAGCCAAGTTTAAGCTG
TGCAAAGTCCGAACCATCCAGTTAGGACAGAAGGGCATTCCTTACCTGAACACATACGAT
GGTCGCACCATCCGTTACCCTGACCCACTCATCAAGCCTAATGACACCATCAAGCTCGAC
CTGGAGGAGAACAAGGTTGTGGACTTCATCAAGTTTGATGTCGGCAATGTTGTGATGGTG
ACTGGAGAAAGAAACAGAGGGCGTGTTGGTGTGATTAAGAACCGTGAGAAACACAAGGGA
AGCTTTGAGACTATCCATATCCAGGACTCTACAGGACATGAGTTTGCAACTAGGTTGGGA
AACGTCTTCACCCTCGGCAAAGGAACTAAGCCATGGGTTTCTCTTCCTAAGGGTAAAGGT
ATTAAGTTGACCATCATCGAGGAAGCCAGGAAGAGGCTCGCTGGCCAACAGGCTGCTTAA
TTTTGTTGTGTTTTCAGTGCTTTATTGTGTCATTTTAGATGACTTTTGTTTCCTTAGACT
CACTTTGCATCTTTTGGTTTCGCTACTCGGTTTTGAGACGTGTTATTTTATATTGAGTTT
T

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 2

CO CL4417Contig1 818 2 2 U
CTTCTTCCAGGTTTCAATCGAGCTACGTCGGCAGCTTTGCTCGCAGAGTGCGCGAAAGAG
ACGAGTTTAACGAGGTCGCGCAACTGAGAGAGCTATTCCGCAGAAACGACCCTGAAGCGG
TGATCAGAATCTTCGAAAGCAGCCCTTCTATGCATTCCAACCCCTCTGCGCTCACCGAGT
ACATCAAGGGCTTATAACAATGCGAGGAACATCCTCACGGTTTACAACAAGGAGCTGCAT
GCACTTGCTAACGCTTTGCTTCAGAAGGAAACTATGTCTGGGGGAGCAGATTAAGAGAGC
TGCTCGCTGATCTCAACGCTCCTCAGATGAAAAAGCGGCAAGAGGTGGTTGCACAGCAAA
GCCAGCCTGTTCCTCCTCCTTCTCCATCAACTCCTCCTAGCTCTGCTGCTTCATCAGCAG
CCGCAGCGGCTGCTGCTGCGGCTTCTGCTGCCGCCTCGGCTGCTGCAACGGCCGCAAGCA
AAGGTAAAGACATGGCTCCTGTAGGGTCTTAAAATAAAGTAAAGGAGGCTCGTGTATGTG
TATGCTGGGGGTAATTTAATTGGGGAATAAACTCTTTGTTTTGAGAGTATTTTAGAATCA
GTGGAGGGAGGCTTGGCTGGTGAGAGATTAAAAATATTCAGTTTTTTTTTTTTACTAATG
TCTTTATTCCACACTGAACCTCGCTACAGAATGGTCTTTATATTTTCTCTCTCGTTTGTC
TTTTTAATGTATTCGGAAACTTGTGGGAGGCTTCTCAGAAGTTTTGGCTCGTACTGTTTC
AGGTTACAACATAACTATAAAGAACATGCTTTTGTAGG


BQ
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AF RS1FL42TF U 1
AF RS1FL42JQ C 149
BS 1 499 RS1FL42TF
BS 500 818 RS1FL42JQ

RD RS1FL42TF 502 0 0
CTTCTTCCAGGTTTCAATCGAGCTACGTCGGCAGCTTTGCTCGCAGAGTGCGCGAAAGAG
ACGAGTTTAACGAGGTCGCGCAACTGAGAGAGCTATTCCGCAGAAACGACCCTGAAGCGG
TGATCAGAATCTTCGAAAGCAGCCCTTCTATGCATTCCAACCCCTCTGCGCTCACCGAGT
ACATCAAGGGCTTATAACAATGCGAGGAACATCCTCACGGTTTACAACAAGGAGCTGCAT
GCACTTGCTAACGCTTTGCTTCAGAAGGAAACTATGTCTGGGGGAGCAGATTAAGAGAGC
TGCTCGCTGATCTCAACGCTCCTCAGATGAAAAAGCGGCAAGAGGTGGTTGCACAGCAAA
GCCAGCCTGTTCCTCCTCCTTCTCCATCAACTCCTCCTAGCTCTGCTGCTTCATCAGCAG
CCGCAGCGGCTGCTGCTGCGGCTTCTGCTGCCGCCTCGGCTGCTGCAACGGCCGCAAGCA
AAGGTAAAGACATGGCTCC
CTG

QA 1 499 1 499
DS 

RD RS1FL42JQ 670 0 0
TATGCATTCCAACCCCTCTGCGCTCACCGAGTACATCAAGG*CTTATAACAATGCGAGGA
ACATCCTCACGGTTTACAACAAGGAGCTGCATGCACTTGCTAACGCTTTGCTTCAGAAGG
AAACTATGTCTGGGG*AGCAGATTAAG*GAGCTGCTCGCTGATCTCAACGCTCCTCAGAT
GAAAAAGCGGCAAGAGGTGGTTGCACAGCAAAGCCAGCCTGTTCCTCCTCCTTCTCCATC
AACTCCTCCTAGCTTTGCTGCTTCATCAGCAGCCGCAGCGGCTGCTGCTGCGGCTTTTGC
TGCCGCCTCGGCTGCTGCAACGGCCGCAAGCAAAGGTAAAGACATGGCTCCTGTAGGGTC
TTAAAATAAAGTAAAGGAGGCTCGTGTATGTGTATGCTGGGGGTAATTTAATTGGGGAAT
AAACTCTTTGTTTTGAGAGTATTTTAGAATCAGTGGAGGGAGGCTTGGCTGGTGAGAGAT
TAAAAATATTCAGTTTTTTTTTTTTACTAATGTCTTTATTCCACACTGAACCTCGCTACA
GAATGGTCTTTATATTTTCTCTCTCGTTTGTCTTTTTAATGTATTCGGAAACTTGTGGGA
GGCTTCTCAGAAGTTTTGGCTCGTACTGTTTCAGGTTACAACATAACTATAAAGAACATG
CTTTTGTAGG

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

CO CL4418Contig1 1000 2 2 U
GATCGATAGATCGATCTATCGATGACACAGCTGTAGAAGAGGCTCAACGTGCTATCAACG
CAGCTCATGTGGAAGCTACAAGTTTTGAGAATGGTATTGGTCTTGTCAAGTTAATGGGAC
ATTATAGTGGATTCATTGCGATGTATGCAACACTAGCCAGCAGAGACGTGGACTGCTGCT
TGATCCCGGAATCTCCATTTTTTCTTGAAGGCAAAGGCGGTCTTTTCGAGTTTATCGGTA
AACGGCTAAAGGAGAATGGTCACGTGGTGATTGTGATAGCAGAAGGTGCTGGACAAGATC
TGTTGGCTGAAAGCAATGAACAGTCCACAACCCTCAAAGATGCATCTGGGAACAAACTTC
TACAAGACGTTGGCCTATGGATCTCCCAACGGATCAAGGATCATTTTGCCAAGAAGATGA
CCCTAAACCTGAAATACATAGATCCAACCTACATGATAAGGGCTGTTCCGAGCAATGCAT
CAGACAATGTATGCTGCACACTGTTAGCTCAAAGCGCGGTTCATGGAGTGATGGCTGGTT
ACAATGGCTTCACCGTTGGCCTTGTTAATGGCAGACATACTTACATTCCCTTCTATAGGA
TCACTGAGAAACAGAACAAGGTGGTGATCACTGACAGAATGTGGGCAAGGCTTTTGTCTT
CGACAAACCAGCCTAGTTTCATGAAGCACGATGATCACCACGAGCCAAACCATTCTGGTG
GTGAAGCAGGTGCCATGAACTGGTGAAACAACTCTTGTCTGACAATCATTTGTTTGGGAA
AGAAAGTAAGGTTTCTTTATTTTGATAGAAGCTTCTCAAAATGTTTTATAAATCTTTCTT
CAAGCAAAAGAGAAAGAGAGAGATATACATTTCCTCCTTGGAGAAGTTCATACAGTTATA
ATTGTGATAAATCCATGTATTAAACTTTGGAGTGATCTTGCACTTACCAAACTGTAATTT
ACACACATAATAACAAATCTATGAGGAAATGTTTTGGTTC


BQ
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AF RS1DC48TF U 1
AF RS1DC48JQ C 402
BS 1 725 RS1DC48TF
BS 726 1000 RS1DC48JQ

RD RS1DC48TF 725 0 0
GATCGATAGATCGATCTATCGATGACACAGCTGTAGAAGAGGCTCAACGTGCTATCAACG
CAGCTCATGTGGAAGCTACAAGTTTTGAGAATGGTATTGGTCTTGTCAAGTTAATGGGAC
ATTATAGTGGATTCATTGCGATGTATGCAACACTAGCCAGCAGAGACGTGGACTGCTGCT
TGATCCCGGAATCTCCATTTTTTCTTGAAGGCAAAGGCGGTCTTTTCGAGTTTATCGGTA
AACGGCTAAAGGAGAATGGTCACGTGGTGATTGTGATAGCAGAAGGTGCTGGACAAGATC
TGTTGGCTGAAAGCAATGAACAGTCCACAACCCTCAAAGATGCATCTGGGAACAAACTTC
TACAAGACGTTGGCCTATGGATCTCCCAACGGATCAAGGATCATTTTGCCAAGAAGATGA
CCCTAAACCTGAAATACATAGATCCAACCTACATGATAAGGGCTGTTCCGAGCAATGCAT
CAGACAATGTATGCTGCACACTGTTAGCTCAAAGCGCGGTTCATGGAGTGATGGCTGGTT
ACAATGGCTTCACCGTTGGCCTTGTTAATGGCAGACATACTTACATTCCCTTCTATAGGA
TCACTGAGAAACAGAACAAGGTGGTGATCACTGACAGAATGTGGGCAAGGCTTTTGTCTT
CGACAAACCAGCCTAGTTTCATGAAGCACGATGATCACCACGAGCCAAACCATTCTGGTG
GTGAA

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1DC48JQ 599 0 0
CATTTTGCCAAGAAGATGACCCTAAACCTGAAATACATAGATCCAACCTACATGATAAGG
GCTGTTCCGAGCAATGCATCAGACAATGTATGCTGCACACTGTTAGCTCAAAGCGCGGTT
CATGGAGTGATGGCTGGTTACAATGGCTTCACCGTTGGCCTTGTTAATGGCAGACATACT
TACATTCCCTTCTATAGGATCACTGAGAAACAGAACAAGGTGGTGATCACTGACAGAATG
TGGGCAAGGCTTTTGTTTTCGACAAACCAGCCTAGTTTCATGAAGCACGATGATCACCAC
GAGCCAAACCATTCTGGTGGTGAAGCAGGTGCCATGAACTGGTGAAACAACTCTTGTCTG
ACAATCATTTGTTTGGGAAAGAAAGTAAGGTTTCTTTATTTTGATAGAAGCTTCTCAAAA
TGTTTTATAAATCTTTCTTCAAGCAAAAGAGAAAGAGAGAGATATACATTTCCTCCTTGG
AGAAGTTCATACAGTTATAATTGTGATAAATCCATGTATTAAACTTTGGAGTGATCTTGC
ACTTACCAAACTGTAATTTACACACATAATAACAAATCTATGAGGAAATGTTTTGGTTC

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 2

CO CL4419Contig1 1110 2 4 U
GGACGCCGACGATACAACGACGTCGTTCCGTTACCGATTAGTAGTTGTGTGTAGTGTTTC
CTCACTGTCTCGATCGATTGAAATAATTAATCTTCGGCCATGTCGTGGTCGAAGCATGTA
GAGGGACTCGAATCTCTTCGTATTTAGAGAATCTTCATCGAACATCGAGGACTGTGCCTC
TTGTGCCTAGCTCTCGTTATTACACTCATGGAGCTTGTAATGGCAATCAGCATAATCTCC
GAAACAAGAGAGGGCTTTTGGGAAGCTCATCTTCGTTTTTCACTTTGAATTCTCATTCCG
CTGCTGCTGCTGCTAAATCGATGTTGCTTACTAGTGCTCATCGCCACTATTCTTCTACTC
AGACGATAACAGAAACCAAATCGAAGAAGATGCTCTATTACCTCACTGCTGTCGTCTTTG
GCATGGTTGGGCTAACTTACGCCGCTGTGCCGTTGTATAGAACCTTCTGCCAAGCTACTG
GATATGGTGGTACTGTTCAACGCAAAGAGACTGTTGAGGAGAAGATTGCTAGGCATTCAG
AATCTGGCACCGTAACTGAAAGGCTTGTAAATAGGGAGATAGTGGTGCAGTTTAATGCTG
ATGTTGCAGATGGGATGCAGTGGAAGTTCACTCCAACTCAAAGAGAGGTGAGAGTAAAGC
CAGGAGAAAGCGCGCTCGCCTTTTACACTGCTGAAAACAAAAGTTCAGCTCCAATAACTG
GAGTCTCCACTTACAATGTCACTCCCATGAAGGCGGGTGTTTATTTCAACAAGATACAAT
GTTTTTGCTTTGAGGAGCAGCGACTTCTTCCCGGAGAACAGATCGACATGCCGGTGTTCT
TCTACATTGATCCTGAGTTTGAGACTGATTCAAGAATGGACGGAATCAACAACCTGATAT
TGTCTTACACTTTCTTCAAGGTGTCCGAGGAAAATACTACAGATTCGGTCGACAAGAACA
GCTCTGTGCCAGTTCAAGAAAGCAAGTAAAATGTGTCATTTTTTTTAAAGAGAAACTCTC
TCCAATCTTTGTCGAATTTTATAAAGGCATCTTTGTTATGCAATTGTCTCTTAGTTATGT
GCTTTATATCTAAGAAACCTAAAATTATTT


BQ
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AF RS1EU11TF U 1
AF RS1EU11JQ C 415
BS 1 701 RS1EU11TF
BS 702 702 RS1EU11JQ
BS 703 748 RS1EU11TF
BS 749 1110 RS1EU11JQ

RD RS1EU11TF 748 0 0
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CTCACTGTCTCGATCGATTGAAATAATTAATCTTCGGCCATGTCGTGGTCGAAGCATGTA
GAGGGACTCGAATCTCTTCGTATTTAGAGAATCTTCATCGAACATCGAGGACTGTGCCTC
TTGTGCCTAGCTCTCGTTATTACACTCATGGAGCTTGTAATGGCAATCAGCATAATCTCC
GAAACAAGAGAGGGCTTTTGGGAAGCTCATCTTCGTTTTTCACTTTGAATTCTCATTCCG
CTGCTGCTGCTGCTAAATCGATGTTGCTTACTAGTGCTCATCGCCACTATTCTTCTACTC
AGACGATAACAGAAACCAAATCGAAGAAGATGCTCTATTACCTCACTGCTGTCGTCTTTG
GCATGGTTGGGCTAACTTACGCCGCTGTGCCGTTGTATAGAACCTTCTGCCAAGCTACTG
GATATGGTGGTACTGTTCAACGCAAAGAGACTGTTGAGGAGAAGATTGCTAGGCATTCAG
AATCTGGCACCGTAACTGAAAGGCTTGTAAATAGGGAGATAGTGGTGCAGTTTAATGCTG
ATGTTGCAGATGGGATGCAGTGGAAGTTCACTCCAACTCAAAGAGAGGTGAGAGTAAAGC
CAGGAGAAAGCGCGCTCGCCTTTTACACTGCTGAAAACAAA*GTTCAGCTCCAATAACTG
GAGTCTCCACTTACAATGTCACTCCCAT

QA 1 748 1 748
DS 

RD RS1EU11JQ 696 0 0
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CTACTGGATATGGTGGTACTGTTCAACGCAAAGAGACTGTTGAGGAGAAGATTGCTAGGC
ATTCAGAATCTGGCACCGTAACTGAAAGGCTTGTAAATAGGGAGATAGTGGTGCAGTTTA
ATGCTGATGTTGCAGATGGGATGCAGTGGAAGTTCACTCCAACTCAAAGAGAGGTGAGAG
TAAAGCCAGGAGAAAGCGCGCTCGCCTTTTACACTGCTGAAAACAAAAGTTCAGCTCCAA
TAACTGGAGTCTCCACTTACAATGTCACTCCCATGAAGGCGGGTGTTTATTTCAACAAGA
TACAATGTTTTTGCTTTGAGGAGCAGCGACTTCTTCCCGGAGAACAGATCGACATGCCGG
TGTTCTTCTACATTGATCCTGAGTTTGAGACTGATTCAAGAATGGACGGAATCAACAACC
TGATATTGTCTTACACTTTCTTCAAGGTGTCCGAGGAAAATACTACAGATTCGGTCGACA
AGAACAGCTCTGTGCCAGTTCAAGAAAGCAAGTAAAATGTGTCATTTTTTTTAAAGAGAA
ACTCTCTCCAATCTTTGTCGAATTTTATAAAGGCATCTTTGTTATGCAATTGTCTCTTAG
TTATGTGCTTTATATCTAAGAAACCTAAAATTATTT

QA 1 696 1 696
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL4423Contig1 593 2 2 U
GGTTTGGGCCGTCACTTTACTTTTTCTCATACACTCCTGTTCAAGATTCGACGACAATGG
CGGCGTCGACAAACTCTCTCCTCGTCGGAAACCAAACCCAGATCCCTTCCTTCAAACCCA
AACCCATCTTCCTCCACCTCACCAAACCCCCTTCCACCCTCAACCTCACCTCCACAAGAC
CCAAACCCGTCTCCATCAGATGCGCTTCCACCACCACAACCGTCGGATCCGACCCGCGTG
TCACCAACTTCGCCGCGGGCCCCGCCGCACTACCCGAGTTTATCAAGGAAGCTGCTAAGG
AGAAGATGGTGCAGCTCAAGGGGCATAGATCGGTGGGTGGTATGAGGGCTTCTATTTACA
ATGCGATGCCTTTGGCTGGTGTTGAGAAGCTCGTTGCTTTCATGAAAGAGTTCCAGGCTA
TGCATGCTTGATTCCAATCTTCTTCTTTGTTTGAGTGATTATAATAAGCGTTGAATGCTT
ATGATTTGAGTTTTGTTTATGCCAATTGTGTGCGGAACTGTTTCAGTAATAATCTTTTAG
CGTATGCTAGATGTCATGTTTAAGAAATAATAATTTACGCGTGTTTTTATGTT


BQ
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AF RS1AB70TF U 1
AF RS1AB70JQ C 133
BS 1 457 RS1AB70TF
BS 458 593 RS1AB70JQ

RD RS1AB70TF 457 0 0
GGTTTGGGCCGTCACTTTACTTTTTCTCATACACTCCTGTTCAAGATTCGACGACAATGG
CGGCGTCGACAAACTCTCTCCTCGTCGGAAACCAAACCCAGATCCCTTCCTTCAAACCCA
AACCCATCTTCCTCCACCTCACCAAACCCCCTTCCACCCTCAACCTCACCTCCACAAGAC
CCAAACCCGTCTCCATCAGATGCGCTTCCACCACCACAACCGTCGGATCCGACCCGCGTG
TCACCAACTTCGCCGCGGGCCCCGCCGCACTACCCGAGTTTATCAAGGAAGCTGCTAAGG
AGAAGATGGTGCAGCTCAAGGGGCATAGATCGGTGGGTGGTATGAGGGCTTCTATTTACA
ATGCGATGCCTTTGGCTGGTGTTGAGAAGCTCGTTGCTTTCATGAAAGAGTTCCAGGCTA
TGCATGCTTGATTCCAATCTTCTTCTTTGTTTGAGTG

QA 1 457 1 457
DS 

RD RS1AB70JQ 461 0 0
TCCACCTCACCAAACCCCCTTCCACCCTCAACCTCACCTCCACAAGACCCAAACCCGTCT
CCATCAGATGCGCTTCCACCACCACAACCGTCGGATCCGACCCGCGTGTCACCAACTTCG
CCGCGGGCCCCGCCGCACTACCCGAGTTTATCAAGGAAGCTGCTAAGGAGAAGATGGTGC
AGCTCAAGGGGCATAGATCGGTGGGTGGTATGAGGGCTTCTATTTACAATGCGATGCCTT
TGGCTGGTGTTGAGAAGCTCGTTGCTTTCATGAAAGAGTTCCAGGCTATGCATGCTTGAT
TCCAATCTTCTTCTTTGTTTGAGTGATTATAATAAGCGTTGAATGCTTATGATTTGAGTT
TTGTTTATGCCAATTGTGTGCGGAACTGTTTCAGTAATAATCTTTTAGCGTATGCTAGAT
GTCATGTTTAAGAAATAATAATTTACGCGTGTTTTTATGTT

QA 1 461 1 461
DS 



AS 1 2

CO CL4424Contig1 1209 2 8 U
GGAGATCTTCACGGATCTATCACATTCATCTGCAAGCACTTGGAGCATTCCGCTGAAAGG
TTCATACGAAGCGTTGACAAAGTCATTGTCGCTGATCCTGTGACCCGAACGCGCTCGACT
TCCCCAGTACCGGACGAGTTTCAAGATGGAAACGATATAGACATTCTGCTTCACTGCGAC
GGTCTCCTGCTCTGTAGACGCACTGGTTCTCACGTCAAGAGGTTCGAGCCGAAGAAAAAG
AAGGAGGAGGATCCAAAACCAAAACCCCCGCAAATGCAAATAGCGATTTGGAATCCGGTT
CTTAGAAAGGTTAACTGGATCATGCCGTCTCATAGTGAGTCCAGATACAATAACTTCGGG
TTGGGCTACAAGAATCGAGGGGATTACATGATCTTGAGGTTTCCACAGATCATGTTTAAG
TTTGTGGATGGTGAAACCCCGGTTGAGATTTACGAGCTGAAGAATAATTCATGGAGAACT
CTTGAGAAGGTGAAGGTTGATTGGGTGGTGGATAGATCGTGCCAAGGTGTGTCTGTGCTG
GGTAACATGTACTGGCTTGCTGAGAAGAAGCACAAAAGCTACCTTCTAGGTTTTGACTTC
ACCAAGGAAACATTCAAGAATGTATGCTTGCGTCCTCCTTCTACTGGTGGTGAAAGCTAC
TTGAGCTGTTTCCGTGAATCTAGATTGTCTTTGCTACAGCAAGCGGAAGGATCAAAGAAG
ATTGAGGTGTGGGTTACAGACAAGTTGGCTGATGTGCGTCTCTCGTTTACTAAGTATTTC
ACTGTGGCCAGCCCTGCTCTTCCTCTGCTAAAGCCCCATGGATATACGGCTTATCCGGTC
TACTGCTTTGTCAAGCCGAAAACGATCGTTGCATGGTGCGAGGGAGATGAAACACAAGGT
CAGAGGCACTGTACTTACTGCACTCTTTATGAGATTGGTAAGGATGGGCTAAGAGACTCA
ACTGAGACCGAACGTAACTATCCTGAGAAACTCCTACCAGACATTTGTGGCCATGTGTAC
GTTCCAAGTCTGGTATCTCTGTGATGGGTGAGCTTGCTGATAAGATCGAGGAGAGTTTAG
GTTCGTTTTTTAAGGTTTTAGTTTTTGTTCTGGTCTTGTTTTGGTCTCCGAATCAACTAT
ATGATATTTTGTACATATCGACATTGGTTGTCGAAGGATACCTTAATGACAAATATAGGC
AGCTTGTGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FN94TF U 1
AF RS1FN94JQ C 639
BS 1 709 RS1FN94TF
BS 710 710 RS1FN94JQ
BS 711 726 RS1FN94TF
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BS 744 812 RS1FN94TF
BS 813 1209 RS1FN94JQ

RD RS1FN94TF 812 0 0
GGAGATCTTCACGGATCTATCACATTCATCTGCAAGCACTTGGAGCATTCCGCTGAAAGG
TTCATACGAAGCGTTGACAAAGTCATTGTCGCTGATCCTGTGACCCGAACGCGCTCGACT
TCCCCAGTACCGGACGAGTTTCAAGATGGAAACGATATAGACATTCTGCTTCACTGCGAC
GGTCTCCTGCTCTGTAGACGCACTGGTTCTCACGTCAAGAGGTTCGAGCCGAAGAAAAAG
AAGGAGGAGGATCCAAAACCAAAACCCCCGCAAATGCAAATAGCGATTTGGAATCCGGTT
CTTAGAAAGGTTAACTGGATCATGCCGTCTCATAGTGAGTCCAGATACAATAACTTCGGG
TTGGGCTACAAGAATCGAGGGGATTACATGATCTTGAGGTTTCCACAGATCATGTTTAAG
TTTGTGGATGGTGAAACCCCGGTTGAGATTTACGAGCTGAAGAATAATTCATGGAGAACT
CTTGAGAAGGTGAAGGTTGATTGGGTGGTGGATAGATCGTGCCAAGGTGTGTCTGTGCTG
GGTAACATGTACTGGCTTGCTGAGAAGAAGCACAAAAGCTACCTTCTAGGTTTTGACTTC
ACCAAGGAAACATTCAAGAATGTATGCTTGCGTCCTCCTTCTACTGGTGGTGAAAGCTAC
TTGAGCTGTTTCCGTGAATCTAGATTGTCTTTGCTACAGCAAGCGGAAG*ATCAAAGAAG
ATTGAG*TGTGGGTTACAGACA*GTTGGCTGATGTGCGTCTCTCGTTTACTAAGTATTTC
ACTGTGGCCAGCCCTGCTCTTCCTCTGCTAAA

QA 1 812 1 812
DS 

RD RS1FN94JQ 571 0 0
TTCTACTGGTGGTGAAAGCTACTTGAGCTGTTTCCGTGAATCTAGATTGTCTTTGCTACA
GCAAGCGGAAGGATCAAAGAAGATTGAGGTGTGGGTTACAGACAAGTTGGCTGATGTGCG
TCTCTCGTTTACTAAGTATTTCACTGTGGCCAGCCCTGCTCTTCCTTTGCTAAAGCCCCA
TGGATATACGGCTTATCCGGTCTACTGCTTTGTCAAGCCGAAAACGATCGTTGCATGGTG
CGAGGGAGATGAAACACAAGGTCAGAGGCACTGTACTTACTGCACTCTTTATGAGATTGG
TAAGGATGGGCTAAGAGACTCAACTGAGACCGAACGTAACTATCCTGAGAAACTCCTACC
AGACATTTGTGGCCATGTGTACGTTCCAAGTCTGGTATCTCTGTGATGGGTGAGCTTGCT
GATAAGATCGAGGAGAGTTTAGGTTCGTTTTTTAAGGTTTTAGTTTTTGTTCTGGTCTTG
TTTTGGTCTCCGAATCAACTATATGATATTTTGTACATATCGACATTGGTTGTCGAAGGA
TACCTTAATGACAAATATAGGCAGCTTGTGT

QA 1 571 1 571
DS 



AS 1 2

CO CL4425Contig1 833 2 6 U
TCTTCAAGATAAGTTTATTCGCAAGTGGTTGATTTGATTGATTCTTCTGAGCAGCAAAGA
TGAACAGCTGTGGAGTTCAACAAAACGCTTTCGAGGTGATGAGGAGCAGATACGCCGTCG
TTTGCCCTAAACCACGTCGTGTCGGTGGCCTAAACCACCACCACCTTTCTCGATCTCTCC
GTTGGCAAGTCAGTCACCAGATGGAGCTATGTGAATCGAATTCAAGAAGCGATATTTTGG
ATTTCATACTCGCAAAGGGTGGTGGTTATGAACAAGATCCGACGTCGGAGCTATTCTTCA
CAGGGTCACCGCCGAGTAGAGTTTCTAACCCTTTAACCAAAGATTCACTCTTCCGGGACG
AGCTTCTCGTAGTGGCTCCACCTCCTCCGCCGGCTCCACGAGCAACCAAGCTGCCACCAC
CGTCTTCTCCAAGGAACGGTGGCGGTTGCGTTAGGGCGACGACTAACTTCGGGAACAATC
CTGCGGTTCGTGTCGTGGGATTTAATTGCCTTGACATGGACAGACGCAACAGTGTTCCGA
CTCTTGCATAAGAGTCCCAATAACATGCATATATAAAACAGAGAAAGCTAAAAGACCATT
CGAAAGGTTTAGGAGTTGATGATAATGGATTATGTGGGTTTTTTTGTGGAAAATTTGTAA
ATATGTGGAAAAGGGGTAATCAAAAAGATATGTTATATATAAAATTAGGATTTGAAGTCC
AATTTGGGAGTTTTGTAAAAGTAAAAAAAGGGGAGAGAGAAGGGTTTGTGAGTGTTAGTG
GAAGTAAGAGCATCAGTGTTTTTTCCTTATTGTAACAAAAGGGATGAGTTTTG


BQ
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AF RS1EI21TF U 1
AF RS1EI21JQ C 343
BS 1 660 RS1EI21TF
BS 661 661 RS1EI21JQ
BS 662 685 RS1EI21TF
BS 686 686 RS1EI21JQ
BS 687 700 RS1EI21TF
BS 701 833 RS1EI21JQ

RD RS1EI21TF 700 0 0
TCTTCAAGATAAGTTTATTCGCAAGTGGTTGATTTGATTGATTCTTCTGAGCAGCAAAGA
TGAACAGCTGTGGAGTTCAACAAAACGCTTTCGAGGTGATGAGGAGCAGATACGCCGTCG
TTTGCCCTAAACCACGTCGTGTCGGTGGCCTAAACCACCACCACCTTTCTCGATCTCTCC
GTTGGCAAGTCAGTCACCAGATGGAGCTATGTGAATCGAATTCAAGAAGCGATATTTTGG
ATTTCATACTCGCAAAGGGTGGTGGTTATGAACAAGATCCGACGTCGGAGCTATTCTTCA
CAGGGTCACCGCCGAGTAGAGTTTCTAACCCTTTAACCAAAGATTCACTCTTCCGGGACG
AGCTTCTCGTAGTGGCTCCACCTCCTCCGCCGGCTCCACGAGCAACCAAGCTGCCACCAC
CGTCTTCTCCAAGGAACGGTGGCGGTTGCGTTAGGGCGACGACTAACTTCGGGAACAATC
CTGCGGTTCGTGTCGTGGGATTTAATTGCCTTGACATGGACAGACGCAACAGTGTTCCGA
CTCTTGCATAAGAGTCCCAATAACATGCATATATAAAACAGAGAAAGCTAAAAGACCATT
CGAAAGGTTTAGGAGTTGATGATAATGGATTATGTGGGTTTTTTTGTGGAAAATTTGTAA
*TATGTGGAAAAGGGGTAATCAAAA*GATATGTTATATAT

QA 1 700 1 700
DS 

RD RS1EI21JQ 491 0 0
ATTCACTCTTCCGGGACGAGCTTTTTGTAGTGGCTCCACCTCCTCCGCCGGCTCCACGAG
CAACCAAGCTGCCACCACCGTTTTTTCCAAGGAACGGTGGCGGTTGCGTTAGGGCGACGA
CTAACTTCGGGAACAATCCTGCGGTTCGTGTCGTGGGATTTAATTGCCTTGACATGGACA
GACGCAACAGTGTTCCGACTTTTGCATAAGAGTCCCAATAACATGCATATATAAAACAGA
GAAGGCTAAAAGACCATTCGAAAGGTTTAGGAGTTGATGATAATGGATTATGTGGGTTTT
TTTGTGGAAAATTTGTAAATATGTGGAAAAGGGGTAATCAAAAAGATATGTTATATATAA
AATTAGGATTTGAAGTCCAATTTGGGAGTTTTGTAAAAGTAAAAAAAGGGGAGAGAGAAG
GGTTTGTGAGTGTTAGTGGAAGTAAGAGCATCAGTGTTTTTTCCTTATTGTAACAAAAGG
GATGAGTTTTG

QA 1 491 1 491
DS 



AS 1 2

CO CL4426Contig1 1083 2 2 U
GGAAGAGAGGAGAGGATCGATCGTAAAGAGCGAAATCGGAGATGGACGCGATGAGAAAGC
AGCTGGATGTGCTGATGGGAGCGAACCGAAACGGCGACGTGACGGAGGTGAATCGCAAAT
ACTACGACCGCGATGTTTGCCGTCTCTACCTCTCTGGTCTCTGCCCTCACGAGCTCTTCC
AATTGACGAAAATGGATATGGGGCCTTGCCCAAAGGTGCACTCTTTGCAGCTAAGGAAAG
AATATAAAGAAGCAAAGGCGAAAGGTGTTGATAACTACGATAGGGAATTGGAAGACGCGA
TAGACAGGCTTATTGTTGAGTGTGATAGGAAGATTGGTAGAGCCCTTAAGCGTCTTCAGG
AAGAGGATGCAAAAGCTGCCATTGCTATTTCAGTCACTGAAGTTACTCAGTCACCCGAGA
TTCTCGAACTATCAAAACAAATCAAAGAGAAGATGAAGGAAGCAGACCTTCATGATCTTG
AAGGAAAAACGGATATGAAGATTAGGGCTCTTGAGTTAGTTGAAGAGATGAGGACTAAGA
GAGCTGACTTACAGGCTGTGCTGCTGTTGGAGGCCTTTAACAAAGATAGGGCAGCCTTGC
CACAGCCCATCCCTGGTCAGCAGCCAGCTGCAGCATTGCCTCCGCCCGATCCTCGTACGC
AAGAGATGATCAATGAGAAATTAAAGAAAGCTGAAGAGTTCGGCGAACAAGGAATGGTTG
ATGAGGCGCAGAAAGCACTGGAGGAGGCTTAGGCTCTTAAGAAGCTTACTCCTAGACAAG
AACCTGTGGTGGATTCAACCAAATACACTGCTGCTGATGTGCGCATTACGGACCAGAAGC
TGCGTCTATGTGACATATGCGGAGCATTCTTGAGCGTTTATGACAGGTTAAGTTTGGTTA
CACAAAAAAGTTTATTGTTTATGGTTCCTTGGGCATTTAAAGAAAAAGCTAGAAATAGAT
CCTGTGGGTTACAAGTGGCTCATTATTTGACACCGACTGTTGTACCTCCTTTTCACCAGC
AGGCTATTTGGGCCCAGTTTTACGAGGATTACTTTTGCAGCTAATGAATGTGCGTTCTTT
CTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1E407TF U 1
AF RS1E407JQ C 358
BS 1 682 RS1E407TF
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RD RS1E407TF 682 0 0
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AATATAAAGAAGCAAAGGCGAAAGGTGTTGATAACTACGATAGGGAATTGGAAGACGCGA
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GAGCTGACTTACAGGCTGTGCTGCTGTTGGAGGCCTTTAACAAAGATAGGGCAGCCTTGC
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AAGAGATGATCAATGAGAAATT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1E407JQ 726 0 0
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AGATTCTCGAACTATCAAAACAAATCAAAGAGAAGATGAAGGAAGCAGACCTTCATGATC
TTGAAGGAAAAACGGATATGAAGATTAGGGCTCTTGAGTTAGTTGAAGAGATGAGGACTA
AGAGAGCTGACTTACAGGCTGTGCTGCTGTTGGAGGCCTTTAACAAAGATAGGGCAGCCT
TGCCACAGCCCATCCCTGGTCAGCAGCCAGCTGCAGCATTGCCTCCGCCCGATCCTCGTA
CGCAAGAGATGATCAATGAGAAATTAAAGAAAGCTGAAGAGTTCGGCGAACAAGGAATGG
TTGATGAGGCGCAGAAAGCACTGGAGGAGGCTTAGGCTCTTAAGAAGCTTACTCCTAGAC
AAGAACCTGTGGTGGATTCAACCAAATACACTGCTGCTGATGTGCGCATTACGGACCAGA
AGCTGCGTCTATGTGACATATGCGGAGCATTCTTGAGCGTTTATGACAGGTTAAGTTTGG
TTACACAAAAAAGTTTATTGTTTATGGTTCCTTGGGCATTTAAAGAAAAAGCTAGAAATA
GATCCTGTGGGTTACAAGTGGCTCATTATTTGACACCGACTGTTGTACCTCCTTTTCACC
AGCAGGCTATTTGGGCCCAGTTTTACGAGGATTACTTTTGCAGCTAATGAATGTGCGTTC
TTTCTC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4428Contig1 835 2 2 U
GATTATTATTACCCCCGGCTGGAATAGTTAACTGTCCAATCTGAAGAATCGATTCATATC
TTTCGTGAGATTAACCTCCCTATTGTCCTTCTTCTTCTTAAACAGAAGTTTATCGGCTTT
GGTTATCCTCTGTTGGACAAACTCCTGTTGATTGACCATATTATTGTGCCGGTCAATTTC
CGGCAAGTTCCGAAAAGTAGTAGTCACTTGGTTCATACCCTCAACGGAGGGCCACACCCC
AGGGGTAGGATCGTAGGGACTGTAAATGATAGCCCCGGCATTAATCCCACATAAAGTGAA
TATCTCATGCGCTTTTTCGAGCAAGCCCCTCTTCCTTTTTTGTAGGTTGTTTTTCTCGAG
GAGTTGTTGACGATGAAAGCAAGTTTCACCTTCCTTCTCGTCATGGTGTTTGTTGTGTTT
ATTACTTTGTGTAGTGTGTGTTGTGTTTTGAGTTCAGGGATGTGTGTGTCTTATATAGTG
ATGGAGGGCTATGAAATTTTTTATCTTTTTAAGTAGGGAATATATATAGATTTATGAAGT
AAAAAAAACAGAAAGAATAATCACCTACCAATAAAGATGTGATTAATATTTTTATGGACT
ATTGAGTTAAATTATATATATATATACATATGACTGAATAGTCGACAAATATAGTAATCA
CATTTTTATCGGCCGGTAATATTATTGAATGTTTCAATAATTATAGTTCAGTCCTCATTA
TATTTGTCGATAAAAATATTATTGAAAACCAAATCTTAGAAGTTGTCCCAAATATTTGCA
ATGATTTGTTTTAAAGTAACCATATAATTTTTGCAAATACAGTTTATATGACCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1E601TF U 1
AF RS1E601JQ C 132
BS 1 455 RS1E601TF
BS 456 835 RS1E601JQ

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GATTATTATTACCCCCGGCTGGAATAGTTAACTGTCCAATCTGAAGAATCGATTCATATC
TTTCGTGAGATTAACCTCCCTATTGTCCTTCTTCTTCTTAAACAGAAGTTTATCGGCTTT
GGTTATCCTCTGTTGGACAAACTCCTGTTGATTGACCATATTATTGTGCCGGTCAATTTC
CGGCAAGTTCCGAAAAGTAGTAGTCACTTGGTTCATACCCTCAACGGAGGGCCACACCCC
AGGGGTAGGATCGTAGGGACTGTAAATGATAGCCCCGGCATTAATCCCACATAAAGTGAA
TATCTCATGCGCTTTTTCGAGCAAGCCCCTCTTCCTTTTTTGTAGGTTGTTTTTCTCGAG
GAGTTGTTGACGATGAAAGCAAGTTTCACCTTCCTTCTCGTCATGGTGTTTGTTGTGTTT
ATTACTTTGTGTAGTGTGTGTTGTGTTTTGAGTTC

QA 1 455 1 455
DS 

RD RS1E601JQ 704 0 0
GTTGGACAAACTCCTGTTGATTGACCATATTATTGTGCCGGTCAATTTCCGGCAAGTTCC
GAAAAGTAGTAGTCACTTGGTTCATACCCTCAACGGAGGGCCACACCCCAGGGGTAGGAT
CGTAGGGACTGTAAATGATAGCCCCGGCATTAATCCCACATAAAGTGAATATCTCATGCG
CTTTTTCGAGCAAGCCCCTCTTCCTTTTTTGTAGGTTGTTTTTCTCGAGGAGTTGTTGAC
GATGAAAGCAAGTTTCACCTTCCTTCTCGTCATGGTGTTTGTTGTGTTTATTACTTTGTG
TAGTGTGTGTTGTGTTTTGAGTTCAGGGATGTGTGTGTCTTATATAGTGATGGAGGGCTA
TGAAATTTTTTATCTTTTTAAGTAGGGAATATATATAGATTTATGAAGTAAAAAAAACAG
AAAGAATAATCACCTACCAATAAAGATGTGATTAATATTTTTATGGACTATTGAGTTAAA
TTATATATATATATACATATGACTGAATAGTCGACAAATATAGTAATCACATTTTTATCG
GCCGGTAATATTATTGAATGTTTCAATAATTATAGTTCAGTCCTCATTATATTTGTCGAT
AAAAATATTATTGAAAACCAAATCTTAGAAGTTGTCCCAAATATTTGCAATGATTTGTTT
TAAAGTAACCATATAATTTTTGCAAATACAGTTTATATGACCCT

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

CO CL4429Contig1 725 2 4 U
GAGGTTGGATCTGATACACAAGCAAGCGACTGATCATCTCACGCTTGTGAATGCTTATGC
TGCTTACGCTAGGAAGCTCAAGCTCGACGCATCCAAGCAGCTAAACCTGTTCGAAGATCT
GGCGATTAACTTCTCCGATCTGCAGGCCAAACCTGGTATGAAGCTTGATAACGAAATGCT
ATCGAGGAGGATGCGTTTAGGCAGCTCGAGAAAGAAGTTAAAGATAAGGTGAAGACGGCG
AGGATGATGATCGTCGAGTCTAGAGAGTTACGACACGCAGCTCAAAATCCAGAAGCTCAA
GGATACGATCTTCGCTGTTCAAGAACAGTTGGCGAAGGCGAAGAAGAACGGCGCTGTTGC
GAGCTTTATTTCGGCTAAGTCGGTTCCCAAGAGTCTTAACTGTTTGGCTATGAGGCTTGT
TGGGGAGAGGATCAATAACCCTGACAAGTATAAGGACGCTCCGTTTGATTCGGCTGTTGA
GGATCCGAGTCTTTATCACTACGCGATTTTCTCTGACAATGTGATCGCTGTGTCGGTTGT
GGTGAGATCCGTTGTGATGAACGCTGAGGAGCCGTGGAAGCATGTTTTTCACGTGGTGAC
TGATCGGATGAATCTTGCGGCGATGAAGGTTTGGTTTAAGATGCGTCCTTTGGACCGTGG
TGCTCATGTTGAGATCAAATCCGTGGAGGAGTTCAAGTTCTTGAACGCTTCGTATGCGCC
CGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1CL15TF U 1
AF RS1BK14TF U 382
BS 1 438 RS1CL15TF
BS 439 439 RS1BK14TF
BS 440 717 RS1CL15TF
BS 718 725 RS1BK14TF

RD RS1CL15TF 717 0 0
GAGGTTGGATCTGATACACAAGCAAGCGACTGATCATCTCACGCTTGTGAATGCTTATGC
TGCTTACGCTAGGAAGCTCAAGCTCGACGCATCCAAGCAGCTAAACCTGTTCGAAGATCT
GGCGATTAACTTCTCCGATCTGCAGGCCAAACCTGGTATGAAGCTTGATAACGAAATGCT
ATCGAGGAGGATGCGTTTAGGCAGCTCGAGAAAGAAGTTAAAGATAAGGTGAAGACGGCG
AGGATGATGATCGTCGAGTCTAGAGAGTTACGACACGCAGCTCAAAATCCAGAAGCTCAA
GGATACGATCTTCGCTGTTCAAGAACAGTTGGCGAAGGCGAAGAAGAACGGCGCTGTTGC
GAGCTTTATTTCGGCTAAGTCGGTTCCCAAGAGTCTTAACTGTTTGGCTATGAGGCTTGT
TGGGGAGAGGATCAATAATCCTGACAAGTATAAGGACGCTCCGTTTGATTCGGCTGTTGA
GGATCCGAGTCTTTATCACTACGCGATTTTCTCTGACAATGTGATCGCTGTGTCGGTTGT
GGTGAGATCCGTTGTGATGAACGCTGAGGAGCCGTGGAAGCATGTTTTTCACGTGGTGAC
TGATCGGATGAATCTTGCGGCGATGAAGGTTTGGTTTAAGATGCGTCCTTTGGACCGTGG
TGCTCATGTTGAGATCAAATCCGTGGAGGAGTTCAAGTTCTTGAACGCTTCGTATGC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1BK14TF 344 0 0
GGTTCCCAAGAGTCTTAACTGTTTGGCTATGAGGCTTGTTGGGGAGAGGATCAATAACCC
TGACAAGTATAAGGACGCTCCGTTTGATTCGGCTGTTGAGGATCCGAGTCTTTATCACTA
CGCGATTTTCTCTGACAATGTGATTGCTGTGTCGGTTGTGGTGAGATCCGTTGTGATGAA
CGCTGAGGAGCCGTGGAAGCATGTTTTTCACGTGGTGACTGATCGGATGAATCTTGCGGC
GATGAAGGTTTGGTTTAAGATGCGTCCTTTGGACCGTGGTGCTCGTGTTGAGATCAAATC
CGTGGAGGAGTTCAAGTTCTTGAACGCTTCGTATGCGCCCGTCT

QA 1 344 1 344
DS 



AS 1 2

CO CL4430Contig1 391 2 3 U
CGAAGACTAGTATTATATTTAGAGAATCAGTCAACATCATTCCATAAAAGTACAAACTGA
CTCATCCGTCACACATGGCAAAAACATATAAATATTACGTCCACATAAACGAAAACCACT
ACCAGCTAAAAAACAAAAGGCGGCAGCCATTATTACACCATAAACCAAACCTAAAACATC
ATTCGGGTTACTTTAATAATATAAAACTCAAACTCTGATTGTCTCTGCCTCTTTAAAAAG
GTTTCTTTATTCATTTACAAGTGCATGGGTCACACTTGCAGTCGGATCCACACTTGCATG
CATCGTTCTCAGCGCTGCCCTCTCCAAAAGCCTCATACTGGTTCTTCATCGCCGGTGCAA
CGCCAAAGACGAAAGTCTCAGCTGTGGTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AE51TF C 1
AF RS1AE51JQ U 12
BS 1 11 RS1AE51TF
BS 12 364 RS1AE51JQ
BS 365 391 RS1AE51TF

RD RS1AE51TF 391 0 0
CGAAGACTAGTATTATATTTAGAGAATCAGTCAACATCATTCCATAGAAGTACAAACTGA
CTCATCCGTCACACATGGCAGAGACATATAGATATTACGTCCACATAAACGAAAACCACT
ACCAGCTAAAAGACAAAAGGCGGCAGCCATTATTACACCATAAACCAAACCTAGAACATC
ATTCGGGTTACTTTAATAATATAAAACTCAAACTCTGATTGTCTCTGCCTCTTTAAAAAG
GTTTCTTTATTCATTTACAAGTGCATGGGTCACACTTGCAGTCGGATCCACACTTGCATG
CATCGTTCTCAGCGCTGCCCTCTCCAGAAGCCTCATACTGGTTCTTCATCGCCGGTGCAA
CGCCAAAGACGAAAGTCTCAGCTGTGGTCGC

QA 1 391 1 391
DS 

RD RS1AE51JQ 353 0 0
ATTATATTTAGAGAATCAGTCAACATCATTCCATAAAAGTACAAACTGACTCATCCGTCA
CACATGGCAAAAACATATAAATATTACGTCCACATAAACGAAAACCACTACCAGCTAAAA
AACAAAAGGCGGCAGCCATTATTACACCATAAACCAAACCTAAAACATCATTCGGGTTAC
TTTAATAATATAAAACTCAAACTCTGATTGTCTCTGCCTCTTTAAAAAGGTTTCTTTATT
CATTTACAAGTGCATGGGTCACACTTGCAGTCGGATCCACACTTGCATGCATCGTTCTCA
GCGCTGCCCTCTCCAAAAGCCTCATACTGGTTCTTCATCGCCGGTGCAACGCC

QA 1 353 1 353
DS 



AS 1 2

CO CL4431Contig1 1104 2 4 U
GGGACTGATTGCGTCAGCAGACATAGCTTCCAACGTTGTCTCTCTCTGTGGAATCGAATC
TTTAATGGAAGAAAGCTCATCGGAAGAGACGTGCGACATATGGGAAGATTACTTCCGATT
CTGTAAAAGACCTAGAGAGGAGGTGGATACGATAAGCAAGCTACCAGATTCTCTCATCTC
TCAGATACTCTCCCATCTCCCGACCACAAAGGAAGCCGTTCGAACCAGCCTTCTCTCCAA
ACGGTGGAAAACTCTCTACCTTTCGATCCCCGCGTTGACTCTGAACGCTAACGAGTTCCC
AAATCACAACGCCTTCGTTAGTTTCATCGATAGGTTCCTCGATTTCTCTAGAGAACAGAA
CTCGATCCTACACAAGCTGAAGCTAAGTGTTCGAAAGAAGAACGTGGATGATTCTCCTCC
CTGCGTCACGCGGTGAATAGACTCTGTGTCTTCGTCCAAACTTAACCATCTCTACGTCGA
GTGTCTCGTGAACCGTAAGTTTCTAGAAGCGATTCCCCGGAGTCTATACGTATGCTGCGA
CACTTTAGTGTATCTAAGACTCCATCGTGTCTCGTTTGGCGAGTTCGAGTCTGTGTCTTT
ACCTTGTCTCAAGAAAATGGTGTTAGAACACAATGTATACGCAAACGACGCCAGCCTGGA
GCTGTTTATCTCGTCTTGCTCTGTTCTTGAGGATCTGAGCATTGTTAGAATGGCACCTGA
TAAGATCAAGGTTTTACGTGTGTGCTCTCAGTCCTCGACGAGTCTTCATATAGACTATTT
GTTAGGTGAAGGCGATGACTTTGATGATGAGGGTTTCGAGAGAGATGGCTCAGGAGTTTT
CATTGATTCTCCTAAACTCGAGTTCTTGAAGTTCGAAGAAGATCTATCTGATACTAAAAT
AATTACCAATACAGGGTCCTTGGCCAAGGTCAACCTTGTTTTTATTTTCGGTGAGAATGA
TACTGCTGATGTAATCGAGTTACCAAAGCGAGATAAGCGAGATATGATCCGTAACTTCTT
TACTAGCATCTCTCGTGTTACTGATTTGAAGCTCTCTGAGCATATTGTGGAGGTATATAT
ATATATATATAGCTTTGTGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CS89TF U 1
AF RS1E911TF U 367
BS 1 585 RS1CS89TF
BS 586 586 RS1E911TF
BS 587 703 RS1CS89TF
BS 704 1104 RS1E911TF

RD RS1CS89TF 703 0 0
GGGACTGATTGCGTCAGCAGACATAGCTTCCAACGTTGTCTCTCTCTGTGGAATCGAATC
TTTAATGGAAGAAAGCTCATCGGAAGAGACGTGCGACATATGGGAAGATTACTTCCGATT
CTGTAAAAGACCTAGAGAGGAGGTGGATACGATAAGCAAGCTACCAGATTCTCTCATCTC
TCAGATACTCTCCCATCTCCCGACCACAAAGGAAGCCGTTCGAACCAGCCTTCTCTCCAA
ACGGTGGAAAACTCTCTACCTTTCGATCCCCGCGTTGACTCTGAACGCTAACGAGTTCCC
AAATCACAACGCCTTCGTTAGTTTCATCGATAGGTTCCTCGATTTCTCTAGAGAACAGAA
CTCGATCCTACACAAGCTGAAGCTAAGTGTTCGAAAGAAGAACGTGGATGATTCTCCTCC
CTGCGTCACGCGGTGAATAGACTCTGTGTCTTCGTCCAAACTTAACCATCTCTACGTCGA
GTGTCTCGTGAACCGTAAGTTTCTAGAAGCGATTCCCCGGAGTCTATACGTATGCTGCGA
CACTTTAGTGTATCTAAGACTCCATCGTGTCTCGTTTGGCGAGTTTGAGTCTGTGTCTTT
ACCTTGTCTCAAGAAAATGGTGTTAGAACACAATGTATACGCAAACGACGCCAGCCTGGA
GCTGTTTATCTCGTCTTGCTCTGTTCTTGAGGATCTGAGCATT

QA 1 703 1 703
DS 

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G
CTACACAGGCTGAAGCTAAGTGTTCGAAAGAAGAACGTGGATGATTCTCCTCCCTGCGTC
ACGCGGTGGATAGACTCTGTGTCTTCGTCCAAACTTAACCATCTCTACGTCGAGTGTCTC
GTGAACCGTAAGTTTCTAGAAGCGATTCCCCGGAGTCTATACGTATGCTGCGACACTTTA
GTGTATCTAAGACTCCATCGTGTCTCGTTTGGCGAGTTCGAGTCTGTGTCTTTACCTTGT
CTCAAGAAAATGGTGTTAGAACACAATGTATACGCAAACGACGCCAGCCTGGAGCTGTTT
ATCTCGTCTTGCTCTGTTCTTGAGGATCTGAGCATTGTTAGAATGGCACCTGATAAGATC
AAGGTTTTACGTGTGTGCTCTCAGTCCTCGACGAGTCTTCATATAGACTATTTGTTAGGT
GAAGGCGATGACTTTGATGATGAGGGTTTCGAGAGAGATGGCTCAGGAGTTTTCATTGAT
TCTCCTAAACTCGAGTTCTTGAAGTTCGAAGAAGATCTATCTGATACTAAAATAATTACC
AATACAGGGTCCTTGGCCAAGGTCAACCTTGTTTTTATTTTCGGTGAGAATGATACTGCT
GATGTAATCGAGTTACCAAAGCGAGATAAGCGAGATATGATCCGTAACTTCTTTACTAGC
ATCTCTCGTGTTACTGATTTGAAGCTCTCTGAGCATATTGTGGAGGTATATATATATATA
TATAGCTTTGTGAAAAA

QA 2 738 2 738
DS 



AS 1 2

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GATGTTTTCTTCTTCTCCAACCTCCTTCGCTAATCCATTCCTCTCCACGTCTCCCCCTCT
CTCCCCCGTATCTCCTCCGTCTTGCTCCGCCCGTATCTCGCCTCCTCCCGTCTCCGCCTC
TTGCTCATACACCTGCACGGAGGACGCCCCGCGGCTGCACCAGATCCCGCTACGATTGAC
GACAACGACGGCGAACGCTTCTCTCTACGAGATCCTGGAGGTTCCTCTCGGCGCGACTAG
CCAGGATATCAAATCGGCTTACCGGAGACTGGCCAGGATCTGCCATCCAGACGTGGCGGC
GGGAACCGATCGGACGAGTTCTTCTTCTTCTTCTGCGTCGTCGGCCGATGAGTTCATGAA
GATCCACGCGGCTTACTGTACGCTTTCTGATCCCGAGAAACGATCTGTATACGATCGGAG
GATGCTTCGCCGGAGCAGGCCTTTGACCGTCGGTAACTCGGGGATGGGCGGTTACGTTGG
CCGGAACTGGGAAACAGATCAGTGCTGGTAGCGAGTTCACTCGGTGACCGAGTTAACCCG
CGTTAATTTGAATTTAAGAAAAAAGGATGAATCGGATTTGTATAAATTAAATAGGGAAAC
TATAAATCGGGAGCTTGCTTGACGCTGTAATTAATAGTAAGTCATTAAGCTAACACGGAC
GAGGATTTTAGTGTGCTAACATATGCTATACGGCGCCGCTTGGTTCGTGTTACGTAGGAT
CTACGTGTGTTTTTTTACCTTGTGAATCCTATACTAGTCATCAATGAAAACAAAAGAGTG
TCATTTTTCTTG


BQ
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AF RS1DO76TF U 1
AF RS1DO76JQ C 388
BS 1 713 RS1DO76TF
BS 714 852 RS1DO76JQ

RD RS1DO76TF 713 0 0
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GATGTTTTCTTCTTCTCCAACCTCCTTCGCTAATCCATTCCTCTCCACGTCTCCCCCTCT
CTCCCCCGTATCTCCTCCGTCTTGCTCCGCCCGTATCTCGCCTCCTCCCGTCTCCGCCTC
TTGCTCATACACCTGCACGGAGGACGCCCCGCGGCTGCACCAGATCCCGCTACGATTGAC
GACAACGACGGCGAACGCTTCTCTCTACGAGATCCTGGAGGTTCCTCTCGGCGCGACTAG
CCAGGATATCAAATCGGCTTACCGGAGACTGGCCAGGATCTGCCATCCAGACGTGGCGGC
GGGAACCGATCGGACGAGTTCTTCTTCTTCTTCTGCGTCGTCGGCCGATGAGTTCATGAA
GATCCACGCGGCTTACTGTACGCTTTCTGATCCCGAGAAACGATCTGTATACGATCGGAG
GATGCTTCGCCGGAGCAGGCCTTTGACCGTCGGTAACTCGGGGATGGGCGGTTACGTTGG
CCGGAACTGGGAAACAGATCAGTGCTGGTAGCGAGTTCACTCGGTGACCGAGTTAACCCG
CGTTAATTTGAATTTAAGAAAAAAGGATGAATCGGATTTGTATAAATTAAATAGGGAAAC
TATAAATCGGGAGCTTGCTTGACGCTGTAATTAATAGTAAGTCATTAAGCTAA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RS1DO76JQ 465 0 0
TTCTTCTGCGTCGTCGGCCGATGAGTTCATGAAGATCCACGCGGCTTACTGTACGCTTTC
TGATCCCGAGAAACGATCTGTATACGATCGGAGGATGCTTCGCCGGAGCAGGCCTTTGAC
CGTCGGTAACTCGGGGATGGGCGGTTACGTTGGCCGGAACTGGGAAACAGATCAGTGCTG
GTAGCGAGTTCACTCGGTGACCGAGTTAACCCGCGTTAATTTGAATTTAAGAAAAAAGGA
TGAATCGGATTTGTATAAATTAAATAGGGAAACTATAAATCGGGAGCTTGCTTGACGCTG
TAATTAATAGTAAGTCATTAAGCTAACACGGACGAGGATTTTAGTGTGCTAACATATGCT
ATACGGCGCCGCTTGGTTCGTGTTACGTAGGATCTACGTGTGTTTTTTTACCTTGTGAAT
CCTATACTAGTCATCAATGAAAACAAAAGAGTGTCATTTTTCTTG

QA 1 465 1 465
DS 



AS 1 2

CO CL4433Contig1 725 2 2 U
GGTAAACATTTTGACTGGTGAAACAACGGTTCTGCGCACGGATATTATCTATGATTGCGG
GAAAAGTCTCAACCCTGCTGTGGATTTAGGACAGATTGAAGGAGCATTTGTTCAAGGACT
TGGGTTCTTCATGCTTGAAGAGTACCTAATGAACTCAGACGGTCTCATAGTAACAGACAG
CACATGGACTTACAAGATCCCAACGGTCGACACAATCCCAAGACAGTTTAATGTCGAGAT
TCTCAACAGTGGACACCACAAGAACCGTGTTCTTTCATCCAAAGCTTCTGGTGAACCGCC
ATTGCTTTTAGCGTCTTCTGTTCACTGTGCTGTCCGAGCAGCTGTTAAAGAAGCTAAGAA
ACAGACTGTGACATGGAGTGATGATAACCAAGAAGGGGTTGTTGATCTGAGCTTTGAATT
GCCTGTTCCAGCAACAATGCCTGTTGTGAAGGAGCTTTGTGGACTCAATGTTGTTGAGAA
ATACTTGGACTGGAAAATCAAGCAGAGGAAGAACATTTGATAGCTTGTGTGTTTTGTTTC
TGTTGGTGAAGGTAATTGCTCTGTTTATTTGAAGTGCCTGCAACAGTTGTTATGTTTGCA
TAATGATGTTGATGATTTTGTGATAAAAACCAGTTTTTGTAATAAGCTGCAACTTAAAAA
AACCTCTTCAACTTTTGTTGTTGGCATATCTTTATTTATGTTTATATAAAAAAATATTAT
CAGTT


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RS1GJ55TF U 1
AF RS1GJ55JQ C 168
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BS 498 725 RS1GJ55JQ

RD RS1GJ55TF 497 0 0
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GAAAAGTCTCAACCCTGCTGTGGATTTAGGACAGATTGAAGGAGCATTTGTTCAAGGACT
TGGGTTCTTCATGCTTGAAGAGTACCTAATGAACTCAGACGGTCTCATAGTAACAGACAG
CACATGGACTTACAAGATCCCAACGGTCGACACAATCCCAAGACAGTTTAATGTCGAGAT
TCTCAACAGTGGACACCACAAGAACCGTGTTCTTTCATCCAAAGCTTCTGGTGAACCGCC
ATTGCTTTTAGCGTCTTCTGTTCACTGTGCTGTCCGAGCAGCTGTTAAAGAAGCTAAGAA
ACAGACTGTGACATGGAGTGATGATAACCAAGAAGGGGTTGTTGATCTGAGCTTTGAATT
GCCTGTTCCAGCAACAATGCCTGTTGTGAAGGAGCTTTGTGGACTCAATGTTGTTGAGAA
ATACTTGGACTGGAAAA

QA 1 497 1 497
DS 

RD RS1GJ55JQ 558 0 0
TAGTAACAGACAGCACATGGACTTACAAGATCCCAACGGTCGACACAATCCCAAGACAGT
TTAATGTCGAGATTCTCAACAGTGGACACCACAAGAACCGTGTTCTTTCATCCAAAGCTT
CTGGTGAACCGCCATTGCTTTTAGCGTCTTCTGTTCACTGTGCTGTCCGAGCAGCTGTTA
AAGAAGCTAAGAAACAGACTGTGACATGGAGTGATGATAACCAAGAAGGGGTTGTTGATT
TGAGCTTTGAATTGCCTGTTCCAGCAACAATGCCTGTTGTGAAGGAGCTTTGTGGACTCA
ATGTTGTTGAGAAATACTTGGACTGGAAAATCAAGCAGAGGAAGAACATTTGATAGCTTG
TGTGTTTTGTTTCTGTTGGTGAAGGTAATTGCTCTGTTTATTTGAAGTGCCTGCAACAGT
TGTTATGTTTGCATAATGATGTTGATGATTTTGTGATAAAAACCAGTTTTTGTAATAAGC
TGCAACTTAAAAAAACCTCTTCAACTTTTGTTGTTGGCATATCTTTATTTATGTTTATAT
AAAAAAATATTATCAGTT

QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 2

CO CL4434Contig1 1012 2 2 U
GGCAGATCCGTTGACCCAGTTGATAAATAAGTATACTGTTTCTGCTTAAAAGGTACAACG
AGTTGACTCAGTTATCTCCGGTTTCACTCGTCGTTGAATCAGAGAAAGAAAAAAAGAAAA
CTTTTTCTTTTCTCTCACTGTGACAGTCGACTTCCCCACTACATCGATGGCGAGTGAAAA
GCCTATTATTACTACAGAGACCGTTGCTCTCACGGAGAAGAAAATGGACATGTCTTTAGA
TGCCATTATCAAGATGTCAAAGAGCAATACCAATAATAATGTCAATAAAGGCAAGAAACA
GAGAGCATCGAATAAAAAGGAGAGTTTCAATGGTGCTGCCAAAAACAGTACGGTAAAAGC
TCAGCGTTATATGGACTCACGGTCTGATGTTAGACAGGGTGCTCTTGCTAAGAGAAGGTC
AAGTTTCCAAGGAAACCACTTTCCTGTCACAACGAACATTGCTGGTAAAGCCGCTTCTAG
TGCTCCCCTCCGTGGTAGACCTAATAATGCTGGAAGGATGGCTAATACGAATCAATCAAG
GTTCATTACTCCACCAGCTCAGTATGGTTCTGCGCCAAGAGGGTTTGTGGCCAAGCAGCA
GCAGCAACAGCAGAGGGAGAAGCAAGGAAATGGAGGAGGACAGAGGCAAGGGCCTCAAAC
ACTGGACTCACGGTTTGCGTACATGAAGGAAGAAAGGATGAAAATGAAAAGGTTTGCAGA
AAAGGGTGGCAATGTAGTCAACAATGGAGCTGGATTGCAGTACCACCAACAGCAGCAGCA
ACAACGTCCATGGGGAAGAAGAGCCACAATATTCCCCAACTGATTTATGTGATCCGCAGC
GTTCGGATGAATATATATTTGCTATTCATGTAGTTTGGTTTGGATTCAGTGTTTGAACTA
GTGTACAACATTCATTTGTGAATTTCTCTCTCTCTCCTCTTGAAGACTAGCAGAAGAGGA
GATATTGAATCTTGGTTGTACTTGGTGTTTTCATTGGTCAGGGAGGGATTTG


BQ
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AF RS1EP43TF U 1
AF RS1EP43JQ C 281
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BS 612 1012 RS1EP43JQ

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AGTTGACTCAGTTATCTCCGGTTTCACTCGTCGTTGAATCAGAGAAAGAAAAAAAGAAAA
CTTTTTCTTTTCTCTCACTGTGACAGTCGACTTCCCCACTACATCGATGGCGAGTGAAAA
GCCTATTATTACTACAGAGACCGTTGCTCTCACGGAGAAGAAAATGGACATGTCTTTAGA
TGCCATTATCAAGATGTCAAAGAGCAATACCAATAATAATGTCAATAAAGGCAAGAAACA
GAGAGCATCGAATAAAAAGGAGAGTTTCAATGGTGCTGCCAAAAACAGTACGGTAAAAGC
TCAGCGTTATATGGACTCACGGTCTGATGTTAGACAGGGTGCTCTTGCTAAGAGAAGGTC
AAGTTTCCAAGGAAACCACTTTCCTGTCACAACGAACATTGCTGGTAAAGCCGCTTCTAG
TGCTCCCCTCCGTGGTAGACCTAATAATGCTGGAAGGATGGCTAATACGAATCAATCAAG
GTTCATTACTCCACCAGCTCAGTATGGTTCTGCGCCAAGAGGGTTTGTGGCCAAGCAGCA
GCAGCAACAGC

QA 1 611 1 611
DS 

RD RS1EP43JQ 732 0 0
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AAAAACAGTACGGTAAAAGCTCAGCGTTATATGGACTCACGGTCTGATGTTAGACAGGGT
GCTCTTGCTAAGAGAAGGTCAAGTTTCCAAGGAAACCACTTTCCTGTCACAACGAACATT
GCTGGTAAAGCCGCTTCTAGTGCTCCCCTCCGTGGTAGACCTAATAATGCTGGAAGGATG
GCTAATACGAATCAATCAAGGTTCATTACTCCACCAGCTCAGTATGGTTTTGCGCCAAGA
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AAAATGAAAAGGTTTGCAGAAAAGGGTGGCAATGTAGTCAACAATGGAGCTGGATTGCAG
TACCACCAACAGCAGCAGCAACAACGTCCATGGGGAAGAAGAGCCACAATATTCCCCAAC
TGATTTATGTGATCCGCAGCGTTCGGATGAATATATATTTGCTATTCATGTAGTTTGGTT
TGGATTCAGTGTTTGAACTAGTGTACAACATTCATTTGTGAATTTCTCTCTCTCTCCTCT
TGAAGACTAGCAGAAGAGGAGATATTGAATCTTGGTTGTACTTGGTGTTTTCATTGGTCA
GGGAGGGATTTG

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL4435Contig1 880 2 14 U
ATGTGACAACTCATGTGGCGATTGGTATATGATTTCACCAAAAAATTAAATATTGAATAT
GTTATTTAAAAATTTTGAAAGTTCATGTATGTTTTTGCACACCACATAAGTGGGATATGA
TTTTAACATCATCTACGTTAGCAAATTAGATTACGTGACAACTGATGTGGCGATTGGTAT
ATGATTTCACCAAAAAATAAATATTGAACATGTTATTTGAAAATTTTGAAAGTTTATTTA
TGTTTTTGCACTACCACATAAGTGGAGTATGAATTTAACATCATTTACATCGGCAAATTA
GATGACGTGACAACTGATGTGGCGATTGGCATATGATTTCACAAAAAAATTAAATATCAG
ATATGTTATTTGAAAATTCTTGTATGTTTTTTCACTACCACGTAAGTAGAATATGAATTT
AGCCTATCTTCACCTCCCCCCCCCCCCCGACAAGAAAAAAAATAAGTAAGAGAATGCAGT
GCACATTAGTCAGAATCGTGGGTCAAAGTGCAGTACCAACTGAACGTCTTCTTTTTTTTT
TCCTTGAAACATACCGTTTCAACGTCTATTACCTACTAAACGTACTTCAAAGTCCAAATC
TCAAAGAAGGAAAGGTTGGTAACAAAGTTGACCAACCAACAGTTAACACATCGTGGTACA
CTATAAAGATCATTTACCACTGTGTTTAGGAGATAACATTCACCTACTTCAAAGACTCCA
TTCACTGGGTCTCTGACCTCTTTACCTTAGTGTTTCTTAACCATGAATCAACTGACTGTT
TCAGCGGAATACAATGATGCGGGAAACAAGAAGCCTAAGTTTCAAGCAGAACCAACATTG
CCCATCTTTCTCAAGGTAAAATAATCATTTCAAACCAGAC


BQ
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AF RS1C142TF U 1
AF RS1C142JQ C 437
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RD RS1C142TF 789 0 0
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GTTATTTAAAAATTTTGAAAGTTCATGTATGTTTTTGCACACCACATAAGTGGGATATGA
TTTTAACATCATCTACGTTAGCAAATTAGATTACGTGACAACTGATGTGGCGATTGGTAT
ATGATTTCACCAAAAAATAAATATTGAACATGTTATTTGAAAATTTTGAAAGTTTATTTA
TGTTTTTGCACTACCACATAAGTGGAGTATGAATTTAACATCATTTACATCGGCAAATTA
GATGACGTGACAACTGATGTGGCGATTGGCATATGATTTCACAAAAAAATTAAATATCAG
ATATGTTATTTGAAAATTCTTGTATGTTTTTTCACTACCACGTAAGTAGAATATGAATTT
AGCCTATCTTCACCTCCCCCCCCCCCCCGACAAGAAAAAAAATAAGTAAGAGAATGCAGT
GCACATTAGTCAGAATCGTGGGTCAAAGTGCAGTACCAACTGAACGTCTTCTTTTTTTTT
TCCTTGAAACATACCGTTTCAACGTCTATTACCTACTAAACGTACTTCAAAGTCCAAATC
TCAAAGAAGGAAAGGTTGGTAACAAAGTTGACCAACCAACAGTTAACACATCGTGGTACA
CTATAAAGATCATTTACCACTGTGTTTAGGAGATA*CATTCACCTACTTCAAAGACTC*A
TTCACTGGGTCTCTGACCTCTTTAC*TTAGTGTTT*TTAAC*ATGAATCA*CTGACTGTT
TCAGCGGAA

QA 1 789 1 789
DS 

RD RS1C142JQ 444 0 0
CCCCCCCCCCCCGACAAGAAAAAAAATAAGTAAGAGAATGCAGTGCACATTAGTCAGAAT
CGTGGGTCAAAGTGCAGTACCAACTGAACGTCTTCTTTTTTTTTTCCTTGAAACATACCG
TTTCAACGTCTATTACCTACTAAACGTACTTCAAAGTCCAAATCTCAAAGAAGGAAAGGT
TGGTAACAAAGTTGACCAACCAACAGTTAACACATCGTGGTACACTATAAAGATCATTTA
CCACTGTGTTTAGGAGATAACATTCACCTACTTCAAAGACTCCATTCACTGGGTCTCTGA
CCTCTTTACCTTAGTGTTTCTTAACCATGAATCAACTGACTGTTTCAGCGGAATACAATG
ATGCGGGAAACAAGAAGCCTAAGTTTCAAGCAGAACCAACATTGCCCATCTTTCTCAAGG
TAAAATAATCATTTCAAACCAGAC

QA 1 444 1 444
DS 



AS 1 2

CO CL4436Contig1 986 2 8 U
GGGAGAAGAGAAGATGTTGCGAGTTGCAGGGAGGAGGCTTTTGTCTCTAAAGCAGCAGAG
ATCTTCCACTGCCACCTCTTTCGTCCTTTCCAGAGATCACACCATCTCCAAAGAAGGCGA
CGACTCCACCAGATCTGTTCCCTCTGCAGATCTTTCATGTTTCAATTCTTACCACCGGAG
CCTTTTAAGAGGTTTCTCTTCTCAAGTCATTACCCAAGGAAATGAGGTAGGCTTCGCTTC
TGAAGTCCCAGCCACCGTTGAGGCCGTCAAGACGCCTAACTCGAAGATTGTCTATGATGA
CCACAACCACGAGCGTTACCCACCTGGTGACCCTAGCAAGCGTGCCTTCGCCTATTTCGT
CCTGTCCGGTGGGAGGTTTGTCTACGCCTCTGTTCTCCGCCTTCTGGTCCTGAAGCCCAT
TGTTAGCATGTCCGCAAGTAAAGATGTCCTTGCACTTGCGTCCCTCGAGGTCGACCTCGG
GAGCATCGAGCCGGGAACTACTGTCACAGTGAAGTGGCGTGGAAAGCCTGTCTTCATCAG
GCGAAGAACTGAAGACGATATCAAGCTAGCCAATAGCGTGGATCTTGGATCACTGAGGGA
CCCGCAAGAAGACTCGGTGAGGGTCAAGAATCCGGAATGGTAGGTGGTGGTAGGAGTCTG
CACTCACCTGGGGTGCATCCCTTTGCCGAATGCTGGTGATTACGGTGGATGGTTTTGCCC
GTGTCATGGTTCGCATTACGATATCTCTGGAAGGATCAGGAAAGGTCCTGCACCATACAA
CCTGGAAGTACCGACTTACAGCTTCTTGGAAGAGAATAAGTTCTCATTGGTTAATGATGG
AGTAAAAGCACATCAGACAGTGTTTTTGTGTCTTAAAGATCCTCATATGTTTTTGTTTTT
CTTTGATATATACTTTCCGGCTACAAATGTAGCGTGCAAGTTCTCGCCTTCCTTACACCT
GGGTCTTCTCAGCAAGGAAAGTAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FX11TF U 1
AF RS1FX11JQ C 469
BS 1 704 RS1FX11TF
BS 705 705 RS1FX11JQ
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BS 809 986 RS1FX11JQ

RD RS1FX11TF 808 0 0
GGGAGAAGAGAAGATGTTGCGAGTTGCAGGGAGGAGGCTTTTGTCTCTAAAGCAGCAGAG
ATCTTCCACTGCCACCTCTTTCGTCCTTTCCAGAGATCACACCATCTCCAAAGAAGGCGA
CGACTCCACCAGATCTGTTCCCTCTGCAGATCTTTCATGTTTCAATTCTTACCACCGGAG
CCTTTTAAGAGGTTTCTCTTCTCAAGTCATTACCCAAGGAAATGAGGTAGGCTTCGCTTC
TGAAGTCCCAGCCACCGTTGAGGCCGTCAAGACGCCTAACTCGAAGATTGTCTATGATGA
CCACAACCACGAGCGTTACCCACCTGGTGACCCTAGCAAGCGTGCCTTCGCCTATTTCGT
CCTGTCCGGTGGGAGGTTTGTCTACGCCTCTGTTCTCCGCCTTCTGGTCCTGAAGCCCAT
TGTTAGCATGTCCGCAAGTAAAGATGTCCTTGCACTTGCGTCCCTCGAGGTCGACCTCGG
GAGCATCGAGCCGGGAACTACTGTCACAGTGAAGTGGCGTGGAAAGCCTGTCTTCATCAG
GCGAAGAACTGAAGACGATATCAAGCTAGCCAATAGCGTGGATCTTGGATCACTGAGGGA
CCCGCAAGAAGACTCGGTGAGGGTCAAGAATCCGGAATGGTAGGTGGTGGTAGGAGTCTG
CACTCACCTGGGGTGCATCCCTTTGCCGAATGCTGGTGATTACG*TGGATGGTTTTGCCC
GTGTCATGGTTCGCATTACGATATCTCTGGAAGGATCAGGAAAGGTCCTGCAC*ATACAA
CCTGGA*GTACCGACTTACAGCTTCTTG

QA 1 808 1 808
DS 

RD RS1FX11JQ 518 0 0
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TGTCTTCATCAGGCGAAGAACTGAAGACGATATCAAGCTAGCCAATAGCGTGGATCTTGG
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GGTAGGAGTCTGCACTCACCTGGGGTGCATCCCTTTGCCGAATGCTGGTGATTACGGTGG
ATGGTTTTGCCCGTGTCATGGTTCGCATTACGATATCTCTGGAAGGATCAGGAAAGGTCC
TGCACCATACAACCTGGAAGTACCGACTTACAGCTTCTTGGAAGAGAATAAGTTCTCATT
GGTTAATGATGGAGTAAAAGCACATCAGACAGTGTTTTTGTGTCTTAAAGATCCTCATAT
GTTTTTGTTTTTCTTTGATATATACTTTCCGGCTACAAATGTAGCGTGCAAGTTCTCGCC
TTCCTTACACCTGGGTCTTCTCAGCAAGGAAAGTAAAA

QA 1 518 1 518
DS 



AS 1 2

CO CL4437Contig1 1039 2 2 U
GATGCATAGAAGCTGTTGTTACCGGTTCCATGGTGCAATATATTCCATTGTTAGAATTCT
ATGGAGGAGGTCTTCCTTTGATTTCATCTTGGTACGGCAGCTCTGAATGTTTCATTGGGA
TTAATGTCGATCCTCTAAGCAAGCCTTGTGATGTGTCCTATACCATTGTTCCAAGTATGG
CGTACTTCGAGTTCTTAGAGGTCGAGAAGGACCATCAAGAAACTGGTCATAATCTCACAA
AGAACCCTGTGGTCGTTGATCTTGCCGATGTTAAAATTGGACATGATTATGAACTTATTA
TCACAACATTCTCTGGTTTGTATAGGTACCGCTTGGGGGATGTTTTAAGAGTGACTGGTT
TCTACAACAATGCCCCACAATTTTATTTTGTAGGAAGACAAAAAGTTGTTCTGAGCATGG
ACATTGATAAGACGTACGAAGAAGATTTGCACAAGGCCGTGACAAGCGCGACGCACTTGC
TCGAGCCACATGACCTCATGCTCATCGATTTCACTAGCCGTGTGGACTCCTCCACGTTTC
CAGGTCACTACGTGATCTATTGGGAACTCGGGAGGAAACTCAAGGACGCGAAAGTCGAGC
CCCACCGCCATGTCTTGGAAGAATGCTGCTTCACCATTGAGAAGTCTTTCAACTCTGTGT
ACAGAAAGTTACGTAAGAATGATGGTACCATTGGACCCCTTGAGATTAAGGTTGTTAGGC
GTGGCGCTTTTGACGAGCTCATGAATTTGTTCCTGTCTCGAGGCTTTTCTGTGAGTCAGT
ACAAGACCCCGAGGTCGGTGAGTAGTGAAGAAGCTTTTAAGATATTGGAAGAGGCAGTTG
TTTCCGAGTTTTTTAGCACGAAAACTCCGTCGTGGGAGCCACGTGAGATGCACTCTGGCC
GATAAATCCAGTCTCGTAATGTGGACAGTATGAGCCTTCGCTTATAATTACATATGAATA
AGATCGCTATGTAGTATGTACTTTATATCACATAAAAGACACGATTACATAATCGAATAT
ATAAGTCTATTACAATCGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EL91TF U 1
AF RS1EL91JQ C 251
BS 1 579 RS1EL91TF
BS 580 1039 RS1EL91JQ

RD RS1EL91TF 579 0 0
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ATGGAGGAGGTCTTCCTTTGATTTCATCTTGGTACGGCAGCTCTGAATGTTTCATTGGGA
TTAATGTCGATCCTCTAAGCAAGCCTTGTGATGTGTCCTATACCATTGTTCCAAGTATGG
CGTACTTCGAGTTCTTAGAGGTCGAGAAGGACCATCAAGAAACTGGTCATAATCTCACAA
AGAACCCTGTGGTCGTTGATCTTGCCGATGTTAAAATTGGACATGATTATGAACTTATTA
TCACAACATTCTCTGGTTTGTATAGGTACCGCTTGGGGGATGTTTTAAGAGTGACTGGTT
TCTACAACAATGCCCCACAATTTTATTTTGTAGGAAGACAAAAAGTTGTTCTGAGCATGG
ACATTGATAAGACGTACGAAGAAGATTTGCACAAGGCCGTGACAAGCGCGACGCACTTGC
TCGAGCCACATGACCTCATGCTCATCGATTTCACTAGCCGTGTGGACTCCTCCACGTTTC
CAGGTCACTACGTGATCTATTGGGAACTCGGGAGGAAAC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RS1EL91JQ 789 0 0
GGTCGTTGATCTTGCCGATGTTAAAATTGGACATGATTATGAACTTATTATCACAACATT
CTCTGGTTTGTATAGGTACCGCTTGGGGGATGTTTTAAGAGTGACTGGTTTCTACAACAA
TGCCCCACAATTTTATTTTGTAGGAAGACAAAAAGTTGTTCTGAGCATGGACATTGATAA
GACGTACGAAGAAGATTTGCACAAGGCCGTGACAAGCGCGACGCACTTGCTCGAGCCACA
TGACCTCATGTTCATCGATTTCACTAGCCGTGTGGACTCCTCCACGTTTCCAGGTCACTA
CGTGATCTATTGGGAACTCGGGAGGAAACTCAAGGACGCGAAAGTCGAGCCCCACCGCCA
TGTCTTGGAAGAATGCTGCTTCACCATTGAGAAGTCTTTCAACTCTGTGTACAGAAAGTT
ACGTAAGAATGATGGTACCATTGGACCCCTTGAGATTAAGGTTGTTAGGCGTGGCGCTTT
TGACGAGCTCATGAATTTGTTCCTGTCTCGAGGCTTTTCTGTGAGTCAGTACAAGACCCC
GAGGTCGGTGAGTAGTGAAGAAGCTTTTAAGATATTGGAAGAGGCAGTTGTTTCCGAGTT
TTTTAGCACGAAAACTCCGTCGTGGGAGCCACGTGAGATGCACTCTGGCCGATAAATCCA
GTCTCGTAATGTGGACAGTATGAGCCTTCGCTTATAATTACATATGAATAAGATCGCTAT
GTAGTATGTACTTTATATCACATAAAAGACACGATTACATAATCGAATATATAAGTCTAT
TACAATCGC

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 2

CO CL4438Contig1 897 2 4 U
GTGATGACATTATATCATTGGCCTCGTCTTATTTGAATTCACAAATTACTCTTTTGTTGT
GATTCATACTACAAGTTCATATACTGCGAATTTGATACAAGTTTTGTGGTCGCAAAATAG
AGATAAATGGATAAAAGATATACACAACTACTCATCATATCCTCTTCTACCATCCGTCTA
ATTCTTATTAGTCAATTTATCTTTTAATTAAAATTATTAAAAAGTAGTTTTAAAATATGA
TGTGAATGCTAAGAAATCGGAGTTAATCATGCTCTAAGCCTGATCTTTAAGTGATCTAAC
AATTCGTGTAAGACTGTTCAAACTATTTCTACGATTTACAGCCATTACATGGCATACGTA
TGACGATGAATATACTTCACACCCAATTGTCTCAAGTATTTGTTTTTACTCATTTCAAGT
TTTGTATTTGTCTTTTAGGTCACCTAATGTCATCAAGTTCCACAAAAATCACATTTTATT
ATTATTTTTTTGACAAAGAAAATCACATTTTAACTATTAGCAGTGTTTAAACTTGATCTA
AGCTTTATTACGTACTTGTTTTCATACATTGAATGTTATAGAAAAACATGGGTGAATAAT
TAAAACTGTCAATGACAAACATAAACAGAAAAATATCCAAAATTACGTATTAACGTTGAT
AAGAAACACAAAGACATGACCGGATGAGATAGCCCACTTGGTAAGGGTTTTGGGGGCCAA
TTGTCATGCCCCCGGGTTCGACGCCAGGCGGAGGAAACTACTCTTCCGTGTCACCAGTGG
TATTGGGTGTTGGGCCTTGTCCTCAGCCCAGATAATACCCTCCCGGATGAAGTGGACCGT
TGCCTGACCGGACCCTGGGGAATGACCCACGAAGTGGGGAACCCCCAGGATTATCAG


BQ
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AF RS1GZ26TF U 1
AF RS1GZ26JQ C 406
BS 1 632 RS1GZ26TF
BS 633 633 RS1GZ26JQ
BS 634 694 RS1GZ26TF
BS 695 897 RS1GZ26JQ

RD RS1GZ26TF 697 0 0
GTGATGACATTATATCATTGGCCTCGTCTTATTTGAATTCACAAATTACTCTTTTGTTGT
GATTCATACTACAAGTTCATATACTGCGAATTTGATACAAGTTTTGTGGTCGCAAAATAG
AGATAAATGGATAAAAGATATACACAACTACTCATCATATCCTCTTCTACCATCCGTCTA
ATTCTTATTAGTCAATTTATCTTTTAATTAAAATTATTAAAAAGTAGTTTTAAAATATGA
TGTGAATGCTAAGAAATCGGAGTTAATCATGCTCTAAGCCTGATCTTTAAGTGATCTAAC
AATTCGTGTAAGACTGTTCAAACTATTTCTACGATTTACAGCCATTACATGGCATACGTA
TGACGATGAATATACTTCACACCCAATTGTCTCAAGTATTTGTTTTTACTCATTTCAAGT
TTTGTATTTGTCTTTTAGGTCACCTAATGTCATCAAGTTCCACAAAAATCACATTTTATT
ATTATTTTTTTGACAAAGAAAATCACATTTTAACTATTAGCAGTGTTTAAACTTGATCTA
AGCTTTATTACGTACTTGTTTTCATACATTGAATGTTATAGAAAAACATGGGTGAATAAT
TAAAACTGTCAATGACAAACATAAACAGAAAA*TATCCAAAATTACGTATTAACGTTGAT
AAGAAACACAAAGACATGACCGGATGAGATAGCC
ACT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RS1GZ26JQ 492 0 0
TTACTCATTTCAAGTTTTGTATTTGTCTTTTAGGTCACCTAATGTCATCAAGTTCCACAA
AAATCACATTTTATTATTATTTTTTTGACAAAGAAAATCACATTTTAACTATTAGCAGTG
TTTAAACTTGATTTAAGCTTTATTACGTACTTGTTTTCATACATTGAATGTTATAGAAAA
ACATGGGTGAATAATTAAAACTGTCAATGACAAACATAAACAGAAAAATATCCAAAATTA
CGTATTAACGTTGATAAGAAACACAAAGACATGACCGGATGAGATAGCCCACTTGGTAAG
GGTTTTGGGGGCCAATTGTCATGCCCCCGGGTTCGACGCCAGGCGGAGGAAACTACTCTT
CCGTGTCACCAGTGGTATTGGGTGTTGGGCCTTGTCCTCAGCCCAGATAATACCCTCCCG
GATGAAGTGGACCGTTGCCTGACCGGACCCTGGGGAATGACCCACGAAGTGGGGAACCCC
CAGGATTATCAG

QA 1 492 1 492
DS 



AS 1 2

CO CL4439Contig1 1187 2 10 U
GGGATCAACAGGGAGCGTGATGTCATCCTCAGGGAAATGCAAGAGGTGGAAGGGCAAACC
GATGAAGTTGTTCTTGACCATTTACATGCTACTGCGTTCCAATACACACCTCTTGGAAGA
ACTATTCTGGGATCTGCTCAGAATGTCAAGTCTATCACCAGAGATGATCTGCAGAATTAC
ATTAAGACTCACTACACAGCTTCCAGGATGGTGATTGCTGCGGCAGGAGCTGTCAAGCAT
GAGGAAGTTGTTGAGCAAGTGAAGAAGCTATTTACCAAGTTGTCATCTGATCCAACTTCT
ACTACTCAACTGGTTGCCAAAGAACCTGCTAGTTTTACTGGTTCTGAGGTTCGAATGATT
GATGACGACCTGCCCCTTGCACAATTTGCTGTTGCCTTTGAAGGAGCGTCTTGGACAGAT
CCAGATTCTGTTGCTCTTATGGTTATGCAAACCATGTTGGGTTCATGGAGCAAAAATGTT
GGTGGCGGTAAACACATGGGTTCTGCCCTGGTCCAGAGGGTTGCCATTAACGAAATAGCA
GAAAGTATAATGGCATTCAACACCAACTACAAGGATACTGGATTGTTTGGCGTCTACGCA
GTTGCTAAAGCCGATTGCTTGGATGATTTATCATATGCCATTATGCATGAGGTAACCAAG
TTGGCCTTCCGAGTTTCTGACGATGACGTGACACGTGCACGGAATCAGCTCAAATCGTCG
CTTTTGCTTCACATGGATGGAACTAGCCCAATTGCTGAAGATATTGGTCGTCAGCTGCTG
ACATATGGGAGAAGAATCCCAACCGCTGAACTATTTGCTAGGATCGATGCTGTTGATGCC
AGCACCGTTAAACGTGTTGCCAACAAGTATCTCTATGACAAGGACATTGCAATCTCAGCC
ATTGGTCCGATCCAAGATTTGCCAGACTATAACAAGTTCAGACGCAGAACCTACTTTAAC
CGTTACTAAGCCTCTGAAATAACGGTCATAGAACCCCCGCATGTTCGCCCACGGGAGAGA
GAGAGCAGAACCTTGGTGGCGATGGATTCATTTTTTGAGTTTTGTTTTACTGGTATAATA
AATGTACCGCATACTTTTTATCCTTCTATTTGGAATAAAATAAATTTACCGCATATTTGG
AATGATTGTATCCTTTCTTCAGCATTTATTCATATAATTATGGATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DF53TF U 1
AF RS1DF53JQ C 434
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A

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DS 

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AAGATTTGCCAGACTATAACAAGTTCAGACGCAGAACCTACTTTAACCGTTACTAAGCCT
CTGAAATAACGGTCATAGAACCCCCGCATGTTCGCCCACGGGAGAGAGAGAGCAGAACCT
TGGTGGCGATGGATTCATTTTTTGAGTTTTGTTTTACTGGTATAATAAATGTACCGCATA
CTTTTTATCCTTCTATTTGGAATAAAATAAATTTACCGCATATTTGGAATGATTGTATCC
TTTCTTCAGCATTTATTCATATAATTATGGATCT

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

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ATATGCGGGTAGCTTCCATAAAGACGTTCAGATACATTGGGGTGATGGCCGCGGAAAGGT
TCGCGACAGAGATGGAAAGCTTCTTTCTCTCTCGCTCGACAAATCATCTGGTTCGGGTTT
TCAGTCTAATCAGGAGTTTCTCTATGGCAAAGCCGAGGTTCAGATGAAACTTGTCGCCGG
TAACTCTGCTGGAACAGTTACAACATTCTATCTTAAAGCGCCAGGTACTATGTGGGATGA
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TTACACACAAGGGTCTGGAGACAAAGAACAACAATTTCAATTGTGGTTCGACCCAACAAA
GAACTTCCACACTTACTGCATTACATGGAACCCCCAAAGGATTACTTTTACAGTTGATGG
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ACCAATGAGGCTCTACGCCAGCCTTTGGGAAGCAGAGCATTGGGCCACAAGAGGAGGATT
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AGGATGTGTTTGGGCTAATGGAAAATCATCTTGCCCCGCAAACTCCCCATGGTTCACTCA
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AATTTGCAAGTAATAACAAATAATAAATCATGGAAACAAAAGTTTTCGCTACC


BQ
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AF RS1D248TF U 1
AF RS1D248JQ C 366
BS 1 691 RS1D248TF
BS 692 1073 RS1D248JQ

RD RS1D248TF 691 0 0
GGATCAACAAAAACATTCGAGATACAATACTACTCAAGAAATATATAATATGAAGTTTTC
TTGTGGTACAAGATTCGCGTTCTTGGTTCTCTTTCTCATTGCAGCACAATCTGTGGCCGT
ATATGCGGGTAGCTTCCATAAAGACGTTCAGATACATTGGGGTGATGGCCGCGGAAAGGT
TCGCGACAGAGATGGAAAGCTTCTTTCTCTCTCGCTCGACAAATCATCTGGTTCGGGTTT
TCAGTCTAATCAGGAGTTTCTCTATGGCAAAGCCGAGGTTCAGATGAAACTTGTCGCCGG
TAACTCTGCTGGAACAGTTACAACATTCTATCTTAAAGCGCCAGGTACTATGTGGGATGA
GATCGATTTTGAGTTCTTGGGAAACATAAGTGGTCATCCGTATACTCTCCATACGAATAT
TTACACACAAGGGTCTGGAGACAAAGAACAACAATTTCAATTGTGGTTCGACCCAACAAA
GAACTTCCACACTTACTGCATTACATGGAACCCCCAAAGGATTACTTTTACAGTTGATGG
CATTCCTATTAGAGAGTTCAAGAACTCTGAGTCAATTGGTGTTCCATTCCCAAAGAACCA
ACCAATGAGGCTCTACGCCAGCCTTTGGGAAGCAGAGCATTGGGCCACAAGAGGAGGATT
AGAGAAGACAGATTGGTCAAAAGCTCCTTTT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1D248JQ 708 0 0
ATTTTGAGTTCTTGGGAAACATAAGTGGTCATCCGTATACTCTCCATACGAATATTTACA
CACAAGGGTCTGGAGACAAAGAACAACAATTTCAATTGTGGTTCGACCCAACAAAGAACT
TCCACACTTACTGCATTACATGGAACCCCCAAAGGATTACTTTTACAGTTGATGGCATTC
CTATTAGAGAGTTCAAGAACTCTGAGTCAATTGGTGTTCCATTCCCAAAGAACCAACCAA
TGAGGCTCTACGCCAGCCTTTGGGAAGCAGAGCATTGGGCCACAAGAGGAGGATTAGAGA
AGACAGATTGGTCAAAAGCTCCTTTTACTGCTTTCTACAGAAACTACAATGTGGAAGGAT
GTGTTTGGGCTAATGGAAAATCATCTTGCCCCGCAAACTCCCCATGGTTCACTCAGAAAC
TCGATCAGGGAGGTGTGGATAAGATGAAATGGGCACAGAGTAAGTACATGATCTATAACT
ATTGCACCGATACAAAGAGGTTTCCTAAAGGTGTTCCTGCAGTGTGCACTTAAATTATCG
ATTCATTGGTTCGTGAATGAGTTACTTGGCATCATCTTTGTAACTCAAATGAGTTTTATT
TATTGTTTTTCATTCGTTTGTTGCTCAATCATGTGTATGTGGTGTTTTGTGTAAGAATTT
GCAAGTAATAACAAATAATAAATCATGGAAACAAAAGTTTTCGCTACC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

CO CL4441Contig1 772 2 4 U
GCACCCACTTGGTGCACCATTGTTCATGGATACACCAGGATCTAGCTCTCCTCTTAATCA
AACAGAGGTTCCAGCTTTTGATGAGGTTGAGCTTTCAGCAATAGTGGCGTTTGAAGGAAC
TTCCCCGGGGGCTAGTGGGAGTGAGCCTGGCCACAATAAATCCTTGTCCGCAAACACTAA
CCTAGCTGATGTTCTGAGTGTCAACCAGTTGCTAGAATCGGTATCAGAAACTGCCAGGCA
AGTTGCAAGCCTCCCTGTTTCCTCCATCCCTGTACCTTATGACCAAATGACGAACCAGTG
CGAAGCACTTGTGACGGGTAAGCAGCAAAAGATGTCCGTGCTTCAAAGCTTCAAACCTGA
GGCAGCCAAAGCTATAACTCTCTCAGAAGAGGATGAACTCTTTCTTCTCGATGATGAGAC
AGAAGAAGCTGATGAAGATGATCAGAAGGCACTGAATATGGTGGTACAAGTCCAACAACC
TCAAGCAGGCCAGCAGCTCGGATTCTGCTCACTCGAAGTTGAACAAAACTCGTTTCGGTT
ACCTCCTTCAAGCCCTTACGATGAGTTCTTGAAAGCAGCCGGATGTTAAGACGGTATACA
TTCTTTGAAATCTTGCATGTAACTTATATATATAGACACACGGCATGATGTATACATATA
TATTATTACGTGTAATCTTGTGCTTCATCTATCTAATATATTAAAACGTGAGTTAGGACT
CACAGGGAGATGACACATCAGTTTTTTACTGAAATCATATTATTTTTAATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1G645TF U 1
AF RS1G645JQ C 233
BS 1 537 RS1G645TF
BS 538 538 RS1G645JQ
BS 539 571 RS1G645TF
BS 572 772 RS1G645JQ

RD RS1G645TF 571 0 0
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AACAGAGGTTCCAGCTTTTGATGAGGTTGAGCTTTCAGCAATAGTGGCGTTTGAAGGAAC
TTCCCCGGGGGCTAGTGGGAGTGAGCCTGGCCACAATAAATCCTTGTCCGCAAACACTAA
CCTAGCTGATGTTCTGAGTGTCAACCAGTTGCTAGAATCGGTATCAGAAACTGCCAGGCA
AGTTGCAAGCCTCCCTGTTTCCTCCATCCCTGTACCTTATGACCAAATGACGAACCAGTG
CGAAGCACTTGTGACGGGTAAGCAGCAAAAGATGTCCGTGCTTCAAAGCTTCAAACCTGA
GGCAGCCAAAGCTATAACTCTCTCAGAAGAGGATGAACTCTTTCTTCTCGATGATGAGAC
AGAAGAAGCTGATGAAGATGATCAGAAGGCACTGAATATGGTGGTACAAGTCCAACAACC
TCAAGCAGGCCAGCAGCTCGGATTCTGCTCACTCGAAGTTGAACAAAACTCGTTTCG*TT
ACCTCCTTCAAGCCCTTACGATGAGTTCTTG

QA 1 571 1 571
DS 

RD RS1G645JQ 540 0 0
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AACCAGTGCGAAGCACTTGTGACGGGTAAGCAGCAAAAGATGTCCGTGCTTCAAAGCTTC
AAACCTGAGGCAGCCAAAGCTATAACTCTCTCAGAAGAGGATGAACTCTTTCTTCTCGAT
GATGAGACAGAAGAAGCTGATGAAGATGATCAGAAGGCACTGAATATGGTGGTACAAGTC
CAACAACCTCAAGCAGGCCAGCAGCTCGGATTTTGCTCACTCGAAGTTGAACAAAACTCG
TTTCGGTTACCTCCTTCAAGCCCTTACGATGAGTTCTTGAAAGCAGCCGGATGTTAAGAC
GGTATACATTCTTTGAAATCTTGCATGTAACTTATATATATAGACACACGGCATGATGTA
TACATATATATTATTACGTGTAATCTTGTGCTTCATCTATCTAATATATTAAAACGTGAG
TTAGGACTCACAGGGAGATGACACATCAGTTTTTTACTGAAATCATATTATTTTTAATTG

QA 1 540 1 540
DS 



AS 1 2

CO CL4442Contig1 1332 2 2 U
GGATAATTCGCTTCTCTATTCGTTTTGTCCCCACCAAATTTTTTAGATTCTATTAATTTA
TGGTTTTTTCTTCACTTTTTGGTTTTTTAGTTTCAATACTTGAAAACATCGACGTTTGAG
CTTCGAACAGAAAAAACCTGAACCTAAAAAAGAACAAAACGACAAAAGAAAAATAAAGAT
ACAAATCTTTGGTAGCCTTTTTTTTCCTTTGTGCATGGCGTTCCAAATTGGGTCCATAGC
TACGAGTGATTCAATTCGTTTTCCTCTTCTACAAGGAATAAAGATCTTATGATACATTTT
GATCTGCCAATTAAAGAAAACGCTTCAAGTCGTCTTACTAGGCAGGGCAGATGGATGAAA
ATAATGCGGCAAAGTTAACCGGAATCAGGCAGGTCGTAAGGCTTAAGGAGATTTTGCAGA
AATGGCAAACCGTAACGATCGGGCCCAAGTCAGATGTCCCACCATTGGCAGCTGGAAAGC
AAGCGGCGGCAATGATTTCACCGGCGATCAACAAGAGGCTGTTAGCTGTCAAGAACTGTG
ACTCGGATGACGAAAACTGTCAAAGCCCTGAGCCTCCGGTTGATGTTCCCAGAGGGTATC
TTGCGGTTTATGTTGGACCGGAGCTAAGGAGGTTTATCATACCAACAAGCTATCTAGGCC
ACTCTTTGTTCAAGGTGTTGCTCGAAAAGGCAGAGGAAGAGTTCGGGTTTGATCAGAGTG
GCGCCCTCACCATCCCTTGTGAGATCGAGACTTTCAAGTTCTTGGTTAAATGCATGGAGA
ACAATGCTAAAGATGGTTCCAGTAAGCTAAAGATCATTTCTTGCATATAGAGATCATACA
ATGAGCTAGGCACATCCACAGGCCGGCCATGCCAACCCACAACCTATCCCATATCTAACC
CGGTCCAGCTCTTGTGTCATTCAGGCCGACAGGTTTAATCAGGGATGAGTTCAAACCATA
AAAACAGAGTTACATTACATCTCCTAGGTTTAGAATGGGCCGGCCTAGCCTTTAAGACTA
CAATATCATATCTCTTGATCTTATCTAGTTAACCGCATTAATACATACATTTCCAGATAG
CTCGATGAAACCAAGCAAGAGATTGTTTATTTAGGACATTGATGAAATGGAGTAACCAAA
TGCCAACACTAATGGTTTTGTGTAATCTTTTGCAGCTGGAGATGCAGTATCAGCAATGGA
AGAGTAAACACAAAACATTTCTTTTGTTATAATGATTATTGTTATACTTTCTTTTGGTTA
TCATATACTGATGGAAATTGTAGGAATTTAATTACTTTGGGGTGTAATTGTATTTTCCTG
GTTTTCGTTTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DG03TF U 1
AF RS1DG03JQ C 509
BS 1 622 RS1DG03TF
BS 623 1332 RS1DG03JQ

RD RS1DG03TF 622 0 0
GGATAATTCGCTTCTCTATTCGTTTTGTCCCCACCAAATTTTTTAGATTCTATTAATTTA
TGGTTTTTTCTTCACTTTTTGGTTTTTTAGTTTCAATACTTGAAAACATCGACGTTTGAG
CTTCGAACAGAAAAAACCTGAACCTAAAAAAGAACAAAACGACAAAAGAAAAATAAAGAT
ACAAATCTTTGGTAGCCTTTTTTTTCCTTTGTGCATGGCGTTCCAAATTGGGTCCATAGC
TACGAGTGATTCAATTCGTTTTCCTCTTCTACAAGGAATAAAGATCTTATGATACATTTT
GATCTGCCAATTAAAGAAAACGCTTCAAGTCGTCTTACTAGGCAGGGCAGATGGATGAAA
ATAATGCGGCAAAGTTAACCGGAATCAGGCAGGTCGTAAGGCTTAAGGAGATTTTGCAGA
AATGGCAAACCGTAACGATCGGGCCCAAGTCAGATGTCCCACCATTGGCAGCTGGAAAGC
AAGCGGCGGCAATGATTTCACCGGCGATCAACAAGAGGCTGTTAGCTGTCAAGAACTGTG
ACTCGGATGACGAAAACTGTCAAAGCCCTGAGCCTCCGGTTGATGTTCCCAGAGGGTATC
TTGCGGTTTATGTTGGACCGGA

QA 1 622 1 622
DS 

RD RS1DG03JQ 824 0 0
CAACAAGAGGCTGTTAGCTGTCAAGAACTGTGACTCGGATGACGAAAACTGTCAAAGCC*
TGAGC*TCCGGTTGATGTTCCCAGAGGGTATCTTGCGGTTTATGTTGGACCGGAGCTAAG
GAGGTTTATCATACCAACAAGCTATCTAGGCCACTCTTTGTTCAAGGTGTTGCTCGAAAA
GGCAGAGGAAGAGTTCGGGTTTGATCAGAGTGGCGCCCTCACCATCCCTTGTGAGATCGA
GACTTTCAAGTTCTTGGTTAAATGCATGGAGAACAATGCTAAAGATGGTTCCAGTAAGCT
AAAGATCATTTCTTGCATATAGAGATCATACAATGAGCTAGGCACATCCACAGGCCGGCC
ATGCCAACCCACAACCTATCCCATATCTAACCCGGTCCAGCTCTTGTGTCATTCAGGCCG
ACAGGTTTAATCAGGGATGAGTTCAAACCATAAAAACAGAGTTACATTACATCTCCTAGG
TTTAGAATGGGCCGGCCTAGCCTTTAAGACTACAATATCATATCTCTTGATCTTATCTAG
TTAACCGCATTAATACATACATTTCCAGATAGCTCGATGAAACCAAGCAAGAGATTGTTT
ATTTAGGACATTGATGAAATGGAGTAACCAAATGCCAACACTAATGGTTTTGTGTAATCT
TTTGCAGCTGGAGATGCAGTATCAGCAATGGAAGAGTAAACACAAAACATTTCTTTTGTT
ATAATGATTATTGTTATACTTTCTTTTGGTTATCATATACTGATGGAAATTGTAGGAATT
TAATTACTTTGGGGTGTAATTGTATTTTCCTGGTTTTCGTTTCC

QA 1 824 1 824
DS 



AS 1 2

CO CL4443Contig1 784 2 2 U
TTTTTTTTCAAAACTCCCAAACCTAAAGAAAAAAATGGCGCGAATTCTCTTCCGTCTTCT
CGGAGAATCCAACACTCCCTCTCCCGCGGCGGACACCTCCACCGTCTCTTTGAACTCCGA
CCTCGTCGTCATCCTCGCCGCTCTCATCTGCGCCTTGATCTGCGTCCTCGGCCTCATCGC
GGTTTCTCGATGCGTCTGGCTCCGCCGTCTCGCCGCCGGCGCCAGAACCTCCTCCGGATC
TCGAGACGGCTCCGGCCAGTCTCCTCCGCAGCAGGTGGCGGCGGCGAACAAAGGACTGAA
GAAGAAAGTGCTCCAGTCTCTCCCGAAGCTGACTTTCTCGCCGGAATCGCCTTCGTCGGA
GAAGTTCGCCGAGTGCGCCATCTGTCTGGCGGAATTCGCCGCCGGCGACGAGCTCCGCGT
TCTGCCGCAGTGCGGTCACGGGTTCCACTTGTCTTGCATTGACACGTGGCTCGGTTCTCA
CTCCTCTTGCCCTTCTTGCCGTCAGATCTTGGTGGTTGCCAGGTGTCATAAGTGTGGCGG
TTTGCCCGGTAGCTCTAGCTCTAGCTCCGGATCCGAGCCTGAGCCCGAACCTGAAATCGT
GATCCGAATTAAGCAAGGCGAAGATGATCCTAGCTCCTACCTGCCCTGATTCGTTTGGTT
TCCTTCTTCGTGCGTTAGATACCTTTATAATTTAATGCAGATCAGTGGATAGTGTTTTAT
TCTCTTATTAATGTGTACATTTTTATTGTAATTTGTAAATGTTGTATGAAATTGATATTT
CGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1E234TF U 1
AF RS1E234JQ C 277
BS 1 609 RS1E234TF
BS 610 784 RS1E234JQ

RD RS1E234TF 609 0 0
TTTTTTTTCAAAACTCCCAAACCTAAAGAAAAAAATGGCGCGAATTCTCTTCCGTCTTCT
CGGAGAATCCAACACTCCCTCTCCCGCGGCGGACACCTCCACCGTCTCTTTGAACTCCGA
CCTCGTCGTCATCCTCGCCGCTCTCATCTGCGCCTTGATCTGCGTCCTCGGCCTCATCGC
GGTTTCTCGATGCGTCTGGCTCCGCCGTCTCGCCGCCGGCGCCAGAACCTCCTCCGGATC
TCGAGACGGCTCCGGCCAGTCTCCTCCGCAGCAGGTGGCGGCGGCGAACAAAGGACTGAA
GAAGAAAGTGCTCCAGTCTCTCCCGAAGCTGACTTTCTCGCCGGAATCGCCTTCGTCGGA
GAAGTTCGCCGAGTGCGCCATCTGTCTGGCGGAATTCGCCGCCGGCGACGAGCTCCGCGT
TCTGCCGCAGTGCGGTCACGGGTTCCACTTGTCTTGCATTGACACGTGGCTCGGTTCTCA
CTCCTCTTGCCCTTCTTGCCGTCAGATCTTGGTGGTTGCCAGGTGTCATAAGTGTGGCGG
TTTGCCCGGTAGCTCTAGCTCTAGCTCCGGATCCGAGCCTGAGCCCGAACCTGAAATCGT
GATCCGAAT

QA 1 609 1 609
DS 

RD RS1E234JQ 508 0 0
GGCGGCGGCGAACAAAGGACTGAAGAAGAAAGTGCTCCAGTCTCTCCCGAAGCTGACTTT
CTCGCCGGAATCGCCTTCGTCGGAGAAGTTCGCCGAGTGCGCCATCTGTCTGGCGGAATT
CGCCGCCGGCGACGAGCTCCGCGTTCTGCCGCAGTGCGGTCACGGGTTCCACTTGTCTTG
CATTGACACGTGGCTCGGTTCTCACTCCTCTTGCCCTTCTTGCCGTCAGATCTTGGTGGT
TGCCAGGTGTCATAAGTGTGGCGGTTTGCCCGGTAGCTCTAGCTCTAGCTCCGGATCCGA
GCCTGAGCCCGAACCTGAAATCGTGATCCGAATTAAGCAAGGCGAAGATGATCCTAGCTC
CTACCTGCCCTGATTCGTTTGGTTTCCTTCTTCGTGCGTTAGATACCTTTATAATTTAAT
GCAGATCAGTGGATAGTGTTTTATTCTCTTATTAATGTGTACATTTTTATTGTAATTTGT
AAATGTTGTATGAAATTGATATTTCGCG

QA 1 508 1 508
DS 



AS 1 2

CO CL4444Contig1 415 2 4 U
GCTCATCGGGAAGATGATCGAATGGGACCCTTGGGGTGTTCCAGATGACTACGAGTGTGA
AGTAATTGAGAACGATGCACCGATTCCAAGGCACGTTCCGCAGCACCGACCTGGTCCACT
TCCTGAGGATTTCTACAGAACCCTTGAAGGTCTTATTTCAGAGTCCAAAACAAAAATCCC
AGCTGCTGCTGCTGCTACTACCTCCACTGATCCGCAGTTGAAGGAGTAACTTCCAGATTT
TCACATTGTTTGCTTGTGTACTTTGTTGCTTTGTTTGGCTACTGTTCAGAGACAGCGAGC
CTCTGAATAAACTGCTTTAATAATCTTTTGAAAACTAGAACAATGTCACTCGTTTCATAA
ATGTTTTTTATATTTCTTCTCAAAGAACCTATGATAATACAAATGATGTTTCATG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FU51TF U 1
AF RS1FU51JQ C 1
BS 1 20 RS1FU51TF
BS 21 21 RS1FU51JQ
BS 22 337 RS1FU51TF
BS 338 415 RS1FU51JQ

RD RS1FU51TF 337 0 0
GCTCATCGGGAAGATGATCGGATGGGACCCTTGGGGTGTTCCAGATGACTACGAGTGTGA
AGTAATTGAGAACGATGCACCGATTCCAAGGCACGTTCCGCAGCACCGACCTGGTCCACT
TCCTGAGGATTTCTACAGAACCCTTGAAGGTCTTATTTCAGAGTCCAAAACAAAAATCCC
AGCTGCTGCTGCTGCTACTACCTCCACTGATCCGCAGTTGAAGGAGTAACTTCCAGATTT
TCACATTGTTTGCTTGTGTACTTTGTTGCTTTGTTTGGCTACTGTTCAGAGACAGCGAGC
CTCTGAATAAACTGCTTTAATAATCTTTTGAAAACTA

QA 1 337 1 337
DS 

RD RS1FU51JQ 415 0 0
GCTCATCGGGAAGATGATCGAATGGGACCCTTGGGGTGTTCCAGATGACTACGAGTGTGA
AGTAATTGAGAACGATGCACCGATTCCAAGGCACGTTCCGCAGCACCGACCTGGTCCACT
TCCTGAGGATTTCTACAGAACCCTTGAAGGTCTTATTTCAGAGTCCAAAACAAAAATCCC
AGCTGCTGCTGCTGCTACTACCTCCACTGATCCGCAGTTGAAGGAGTAACTTCCAGATTT
TCACATTGTTTGCTTGTGTACTTTGTTGCTTTGTTTGGCTACTGTTCAGAGACAGCGAGC
CTCTGAATAAACTGCTTTAATAATCTTTTGAAAACTAGAACAATGTCACTCGTTTCATAA
ATGTTTTTTATATTTCTTCTCAAAGAACCTATGATAATACAAATGATGTTTCATG

QA 1 415 1 415
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4446Contig1 1108 2 2 U
GGAATTAAAAGATAGTAATAATCTAGGAATCAAAATTGATTAGTCTAAACAGTAAATAAA
AACATTTTAAAACATGTTAAAAAACAAATAACCGTCCTTTCTCTCCCAAGCGACACAGAG
GGCGATAACAAACAACCGTTTCTCTGCAACAATCTCCGGCCGGCGCCGACTCCGGCGTTC
GGTTCGTACTCTTGTTATATTATTATTTTATGTTTCTAAAGCTTTTAGTTTTCAAATAAA
CTCATTTCCGTCGCCTAGTTCTTGAAACAAGCGACGTGATCTATCGTCACACCATCTTTT
CTCTTCCTGCCACCGTCGCGTGATGTCGTCCTCATGGGCAAGCAGTTTACCGTTTCTCCA
TTGGTTCATTGGGCAGTTAGGAGGTCTGGTTCAGATCTTTGACGAGTCACTTTTCTCCCT
ATTAGGTGAGTCTATATTATCTCCATTAATGTTGAGTGCAATCTTCCAACAAACAAAACA
TGGTGGTTTTGTATTGTTGGTGTATTTTCATGGCTTGTTAGACATGGTGGTTTATTCCAT
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CATGGTCATGGAAAGAGGATTGTGTACGTCTTGTTCTCTTGACAATCTGACATGGACAAT
GGTGACTCCATTAATTCAGAGAGATGCGTTTCATTTCTGTCTGTCAACAAGAGGAAATAC
GGCATGTTTATGTGAAAACACGGAGGGGGAGGCGATGGAGTTAAGTGTTTATGATTGTCA
ATTTGAGGGATTTATGATATGGATAAAAACTACAACAAATCATGTTATCTCCTCGAGAGG
GAGTGTATGGAATGGGCAGCGATGTAATAGATGAATCGCACCTACTGATCTGTTAAGTGA
TAAAAACGTTAGATCACAATAAATGGCAGCCGAACACAAAAATAATATGAGCACGAAAAC
AAAAATAAATAAAGTTAGCGAATCAGTCTATGCTGCAAAAGAGTTAGGAAATATCGTGTT
ATTACTTTTCTATTATCATTATCATGTTTTGCTTAAAAATGCATTTGTTGTATATCTGAA
TTCATGTATTCGGTTAAACGTTTTTGAT


BQ
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GGTGACTCCATTAATTCAGAGAGATGCGTTTCATTTCTGTCTGTCA
C

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GGGCAGCGATGTAATAGATGAATCGCACCTACTGATCTGTTAAGTGATAAAAACGTTAGA
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GTTAGCGAATCAGTCTATGCTGCAAAAGAGTTAGGAAATATCGTGTTATTACTTTTCTAT
TATCATTATCATGTTTTGCTTAAAAATGCATTTGTTGTATATCTGAATTCATGTATTCGG
TTAAACGTTTTTGAT

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

CO CL4447Contig1 1257 2 6 U
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ATTGATAGTCTCTGTGAATATGCATTTACAAATAAACTTTGCATCTTTTCTTAGACAGTT
CTTTCTTTTGTATACCAAGTTACTTCCTCATTTCAATCTTATAACAGTTTTCTAGCC


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AF RS1EY13TF U 1
AF RS1EY13JQ C 417
BS 1 735 RS1EY13TF
BS 736 736 RS1EY13JQ
BS 737 754 RS1EY13TF
BS 755 755 RS1EY13JQ
BS 756 767 RS1EY13TF
BS 768 1257 RS1EY13JQ

RD RS1EY13TF 767 0 0
GAGAGAGGTCTCCTCCGTTGTCTCCAGCGTCGGTGATTTGGCTGACAACGATTGGTCCAA
AGACGTCGCCGTTTTGCGTCTCACCAGCCTTGTTTCTAGGTTGCAAGGTCTCAAACGAAA
GCTGGAAGAAGGGAGCAATGTGGAGAATTTGCAGGCTCAGAGGTGTCGTGCTCGTATTGA
TCATTTGGATTCAGCAGACGTGGAGAATATTACTGAGTGGAACAATACAAAGTTGAAACG
GATTCTTGTGGACTACATGCTGCGGATGTCTTATTTCGATACTGCTTCTAAGCTTTCAGA
AAGCAGCAACATTTTGGACCTTGTCGACATTGACATATTTCGAGAAGCTAAGAAGGTGAT
TGACGCCCTTAAACGTAGAGAGGTAGCTTCTGCACTGGCATGGTGTGCTGATAATAAAAC
ACGGCTGAAGAAGTCAAAGAGCAAACTTGAGTTCCAACTAAGGCTGCAAGAATTCATCGA
GTTGGTACGAGCTGACAGCTACAAACAAGCAATCCTTTATGCTCGAAAGCATCTGACACC
ATGGGGAGCAACCCATATGAACGAATTGCAGCACGTTCTGGCCACTCTGGCTTTCAAAAG
TACTACGGAATGCGCAAAATATAAGGCTTTGTTTGAACTACAGCAGTGGGATGTTTTAGT
GCATCAGTTTAAACAAGAATTTTGCAAGTTATATGGCATGACAATGGAGCCCTTATTGAA
CATCTACTTACAAGC*GGCTTGACTGCACTGAAA*CTCCATATAGTT

QA 1 767 1 767
DS 

RD RS1EY13JQ 841 0 0
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TCGAGTTG*TACGAGCTGACAGCTACAAACAAGCAATCCTTTATGCTCGAAAGCATCTGA
CACCATGGGGAGCAACCCATATGAACGAATTGCAGCACGTTCTGGCCACTCTGGCTTTCA
AAAGTACTACGGAATGCGCAAAATATAAGGCTTTGTTTGAACTACAGCAGTGGGATGTTT
TAGTGCATCAGTTTAAACAAGAATTTTGCAAGTTATATGGCATGACAATGGAGCCCTTAT
TGAACATCTACTTACAAGCAGGCTTGACTGCACTGAAAACTCCATATAGTTTTGAAGAAG
GTTGTACTAAGGAGGACCCGCTCTCGCAAGAGAGCTTCCGGAAGCTAGCTTTGCCTTTAC
CGTACTCCAAGCAGGAGCACTCAAAGCTTGTTTGCTATATTTCGAAGGAGCTAATGGACA
CAGAGAACCCACCACAGGTGTTGCCCAATGGCTACGTCTACAGCACCAAGGCCCTCAAGG
AAATGGCGGACAGGAACAAAGGTGAAATAAAATGTCCGAGGACAGGGTTCGTCTGCAACC
ATACGGACTTAGTCAAGGCATATATCATGAACCCTGTTGCTCACTATCCATCACTTTGGT
TGGCATTATGAATTGATGACGACCAAGGTGAGGTCAGTGCATTCAGACCCAACTTCCTTT
CTTCATTGATAGTCTCTGTGAATATGCATTTACAAATAAACTTTGCATCTTTTCTTAGAC
AGTTCTTTCTTTTGTATACCAAGTTACTTCCTCATTTCAATCTTATAACAGTTTTCTAGC
C

QA 1 841 1 841
DS 



AS 1 2

CO CL4448Contig1 1220 2 2 U
GGAGACCATCACTCATCACACGAGTAAGTACTCAAAATCATACAGCTCCTCTGCTTCTGT
CTCCAATGGAATCAGAACCCCTAACCGACACGACCGTACCGAACCAAGTCGAGGCCAAAA
CAGAGTCATCAGAATTCGAGAAGAATCAAGAACGGTACCAAGCACTAATCTCCACGTTCA
CACACGAGAAAGGCTGGAGACCAAAAGAGCCCTTCATCGAGTACGGTGGTCACTGGTGGA
TACAACCTCTCCTCGAAGGCTGCCTTCACGCACAAGAGTTCTTCCAAGCGCGACCCAACG
ACGTCTTCGTCTGCAGCTACCCGAAGACAGGCACCACTTGGCTCAAAGCCTTGACTTTCG
TCATAGCCAATAGATCCCGCCTCGACGATACCTCGAACCCTCTCCTCAGACGTAACCCTC
ACGAGTTCGTTCCTTACATCGAGATCGACTTCCCTTTCTTCCCTCAAGTCGATGTCCTAA
AAGACAAAGGGAACACTCTGTTTTCAACTCACATCCCTTACGAGTCGTTACCAGACTCGG
TTGTGAAGTCACGTTGTAAGTTGGTTTATATCTGGAGAGATCCAAAGGACACTTTCTTCT
CCTTGTGGACTTTCTTACACAAAGAGAGGTCAGAGCTAGGTCCTGTAAACAACCTCGAGG
AGTCTTTTGATATGTTCTGCCGAGGTTTGTCTGGTTACGGTCCTTATCTTGATCATGTCT
TGGGGTACTGGAAAGCTTACCACGAGAATCCGGATAAGATTCTGTTTCTGAAGTACGAGT
TTATGAGAGGTGATCCTTTGCTGTATGTGAAGAAGCTAGCTGAGTTTATGGGGTATGGGT
TCACGGAAGAGGAAGAGGAGAAGGGTGTTGCTGAGAAAGTGGTGGATCTTTGCAGCTTCG
AGACGTTGAAGAATCTTGAAGCTAACAAAGGAGAGAAAGAGAGGGAAGACCGTGCTGCTG
TTTATGCGAATAGCGCTTATTTTAGGAAAGGTAAGGTTGGAGATTGGTCTAATTATCTGA
CTCCAGAGATGGCTGCTCGTATTGATGGGATCATGGCAGAGAAGTTTAAGGATACAGGTT
TGCTTGAACATGGTCAATGACCGGTTCTTGATCTTTATATACTTATTTGCGGCAGAAGTT
TGCTCCTTTTGTCAGTTTGATTATCTTATGTAATAACAAGTTTATATATTGGAACAAAAT
AATAATAATAATAATTCTTG


BQ
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AF RS1DO51TF U 1
AF RS1DO51JQ C 484
BS 1 635 RS1DO51TF
BS 636 1220 RS1DO51JQ

RD RS1DO51TF 635 0 0
GGAGACCATCACTCATCACACGAGTAAGTACTCAAAATCATACAGCTCCTCTGCTTCTGT
CTCCAATGGAATCAGAACCCCTAACCGACACGACCGTACCGAACCAAGTCGAGGCCAAAA
CAGAGTCATCAGAATTCGAGAAGAATCAAGAACGGTACCAAGCACTAATCTCCACGTTCA
CACACGAGAAAGGCTGGAGACCAAAAGAGCCCTTCATCGAGTACGGTGGTCACTGGTGGA
TACAACCTCTCCTCGAAGGCTGCCTTCACGCACAAGAGTTCTTCCAAGCGCGACCCAACG
ACGTCTTCGTCTGCAGCTACCCGAAGACAGGCACCACTTGGCTCAAAGCCTTGACTTTCG
TCATAGCCAATAGATCCCGCCTCGACGATACCTCGAACCCTCTCCTCAGACGTAACCCTC
ACGAGTTCGTTCCTTACATCGAGATCGACTTCCCTTTCTTCCCTCAAGTCGATGTCCTAA
AAGACAAAGGGAACACTCTGTTTTCAACTCACATCCCTTACGAGTCGTTACCAGACTCGG
TTGTGAAGTCACGTTGTAAGTTGGTTTATATCTGGAGAGATCCAAAGGACACTTTCTTCT
CCTTGTGGACTTTCTTACACAAAGAGAGGTCAGAG

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1DO51JQ 737 0 0
ACAAAGGGAACACTCTGTTTTCAACTCACATCCCTTACGAGTCGTTACCAGACTCGGTTG
TGAAGTCACGTTGTAAGTTGGTTTATATCTGGAGAGATCCAAAGGACACTTTCTTCTCCT
TGTGGACTTTCTTACACAAAGAGAGGTCAGAGCTAGGTCCTGTAAACAACCTCGAGGAGT
CTTTTGATATGTTCTGCCGAGGTTTGTCTGGTTACGGTCCTTATCTTGATCATGTCTTGG
GGTACTGGAAAGCTTACCACGAGAATCCGGATAAGATTCTGTTTCTGAAGTACGAGTTTA
TGAGAGGTGATCCTTTGCTGTATGTGAAGAAGCTAGCTGAGTTTATGGGGTATGGGTTCA
CGGAAGAGGAAGAGGAGAAGGGTGTTGCTGAGAAAGTGGTGGATCTTTGCAGCTTCGAGA
CGTTGAAGAATCTTGAAGCTAACAAAGGAGAGAAAGAGAGGGAAGACCGTGCTGCTGTTT
ATGCGAATAGCGCTTATTTTAGGAAAGGTAAGGTTGGAGATTGGTCTAATTATCTGACTC
CAGAGATGGCTGCTCGTATTGATGGGATCATGGCAGAGAAGTTTAAGGATACAGGTTTGC
TTGAACATGGTCAATGACCGGTTCTTGATCTTTATATACTTATTTGCGGCAGAAGTTTGC
TCCTTTTGTCAGTTTGATTATCTTATGTAATAACAAGTTTATATATTGGAACAAAATAAT
AATAATAATAATTCTTG

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

CO CL4449Contig1 923 2 2 U
GTAATCAGAGAACGGTGCTAAATAGAAATATAATACTTTTCTTTTTGAGAAACAGAAATA
TAATACTTGAACCAATTCTCTTGATATATATGGTCGGCTAAATTGTGCAGGCAGGTTATC
TCGAGTGGCTGAAGAGAGCGAGAGAAGAGAAAGCGCAAGTGTTTGCTATAAGAATTGATT
GTGCGGATCCAAGAAGCGTAAGAGAAGCCTTTGAAGGAGTGTTGTCCTTAGGGTTTGTTG
AGGTTTTAGTGTACAATGCTTATCACTCTTCTTCTTACACAAGTCACCATCCCACTTCAT
TCACCCACATTCCTTTCCAATCTTTTCATACTTCTATTTCTGTCTCCGTCTTCGCTGCAT
TCTTGTGCGCCCAACAGGTATACCTTTGTCTAAATTAAATACTTCAAATTACTATATGTA
TTTTATGGCGATTTTGTTATGATAATGTGTTTCGACGTATAATTTATCCACTTATGGAAA
AAACTTGTTAGTATTATTGTAGTAATAGACTTGCAATATTTTGGTTAAAATGAATTAGAT
CATTATGTCGTAACTATGAATTTATATTATATATATAGACTATGTAATGATCCGCACCTC
GTGGGAAATGAGATTATTGATTTTATTATTTTTAAGATAATAAGATATTAGGTCTGTTTA
ATCTGGATATCGTTTCAATTTTAGGTTAGTTTGTTTGGTTTTTAATCTATTAAAATATAA
CAATCATTTTAAATCAATTTTTATTCTGTTTATTCAGTTAAAATGCTTGAGATTTTTAAT
AATTTTCAATGATAACCAAAAATTATTATTATTTATTTGGTTTCATGTTATATGAATTTT
AGACTGTCCTAATGTCAAACCAGTGATTTCATATTATAATTTCTAAATGCATGGAAAATC
AAATCAAATTTAGATAATAATTG


BQ
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AF RS1EI01TF U 1
AF RS1EI01JQ C 346
BS 1 682 RS1EI01TF
BS 683 923 RS1EI01JQ

RD RS1EI01TF 682 0 0
GTAATCAGAGAACGGTGCTAAATAGAAATATAATACTTTTCTTTTTGAGAAACAGAAATA
TAATACTTGAACCAATTCTCTTGATATATATGGTCGGCTAAATTGTGCAGGCAGGTTATC
TCGAGTGGCTGAAGAGAGCGAGAGAAGAGAAAGCGCAAGTGTTTGCTATAAGAATTGATT
GTGCGGATCCAAGAAGCGTAAGAGAAGCCTTTGAAGGAGTGTTGTCCTTAGGGTTTGTTG
AGGTTTTAGTGTACAATGCTTATCACTCTTCTTCTTACACAAGTCACCATCCCACTTCAT
TCACCCACATTCCTTTCCAATCTTTTCATACTTCTATTTCTGTCTCCGTCTTCGCTGCAT
TCTTGTGCGCCCAACAGGTATACCTTTGTCTAAATTAAATACTTCAAATTACTATATGTA
TTTTATGGCGATTTTGTTATGATAATGTGTTTCGACGTATAATTTATCCACTTATGGAAA
AAACTTGTTAGTATTATTGTAGTAATAGACTTGCAATATTTTGGTTAAAATGAATTAGAT
CATTATGTCGTAACTATGAATTTATATTATATATATAGACTATGTAATGATCCGCACCTC
GTGGGAAATGAGATTATTGATTTTATTATTTTTAAGATAATAAGATATTAGGTCTGTTTA
ATCTGGATATCGTTTCAATTTT

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1EI01JQ 578 0 0
CCGTCTTCGCTGCATTCTTGTGCGCCCAACAGGTATACCTTTGTTTAAATTAAATACTTC
AAATTACTATATGTATTTTATGGCGATTTTGTTATGATAATGTGTTTCGACGTATAATTT
ATCCACTTATGGAAAAAACTTGTTAGTATTATTGTAGTAATAGACTTGCAATATTTTGGT
TAAAATGAATTAGATCATTATGTCGTAACTATGAATTTATATTATATATATAGACTATGT
AATGATCCGCACCTCGTGGGAAATGAGATTATTGATTTTATTATTTTTAAGATAATAAGA
TATTAGGTCTGTTTAATCTGGATATCGTTTCAATTTTAGGTTAGTTTGTTTGGTTTTTAA
TCTATTAAAATATAACAATCATTTTAAATCAATTTTTATTCTGTTTATTCAGTTAAAATG
CTTGAGATTTTTAATAATTTTCAATGATAACCAAAAATTATTATTATTTATTTGGTTTCA
TGTTATATGAATTTTAGACTGTCCTAATGTCAAACCAGTGATTTCATATTATAATTTCTA
AATGCATGGAAAATCAAATCAAATTTAGATAATAATTG

QA 1 578 1 578
DS 



AS 1 2

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GTGACCAACTGGGAGTAGAAACCAAACAAAACAGAAATAGAAAGAAACGTCTCTGTTCAA
ACATGGGAGATTGAAGATTAATTGCATCCCTTTTGATTTCCACCGTTCTTCTTACACCAA
ACTCGTTTCTGTTATTAATCCCTCTCTTTTGTGAGTAGCATTAAACTCTCAT


BQ
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AF RS1FN89JQ C 1
AF RS1FN89TF U 1
BS 1 232 RS1FN89TF

RD RS1FN89JQ 232 0 0
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GTGACCAACTGGGAGTAGAAACCAAACAAAACAGAAATAGAAAGAAACGTCTCTGTTCAA
ACATGGGAGATTGAAGATTAATTGCATCCCTTTTGATTTCCACCGTTCTTCTTACACCAA
ACTCGTTTCTGTTATTAATCCCTCTCTTTTGTGAGTAGCATTAAACTCTCAT

QA 1 232 1 232
DS 

RD RS1FN89TF 232 0 0
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GTGACCAACTGGGAGTAGAAACCAAACAAAACAGAAATAGAAAGAAACGTCTCTGTTCAA
ACATGGGAGATTGAAGATTAATTGCATCCCTTTTGATTTCCACCGTTCTTCTTACACCAA
ACTCGTTTCTGTTATTAATCCCTCTCTTTTGTGAGTAGCATTAAACTCTCAT

QA 1 232 1 232
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4452Contig1 1024 2 2 U
GCATCCAGCTCAATTCCTCAGGAGGGAGGAGGATCGTATGTGTAACCTCAGGCGGACTAC
GGTTCCCTTGGAGCAGCGATGCGTAAGATACATAGATAACTTCAGCTCAGGAAATCGAGG
TGCTGCTTCTACTGAGAACTTTGTCAAGGCTGGATATGCTGTCATATTTCTCTTTAGGAG
GGGAACTTGCCAGCCATATTCCCGATCTCTTCCAGATGATCCATTCCTTGAATGTTTCCA
GTTTCCAGATAACACCAACATTCGAGTTCATGCATCACATGTGGAAGCTGTGAAAATGGC
TGTTATGGACCAGCAAGCTGCAGTAGCTGAAGCTCGCTTACTAAAGCTCCCATTCACAAC
CATCTATGAGTATCTTCAGATGTTGCAGTTGATTGCAACGGCACTGAAGGACGTCGGTCC
ATGTTCAATGTTTTATCTTGCTGCGGCTGTGTCTGACTTTTATGTTCCGTGGAAGAGCAT
GGTTGAACATAAAATAGAATCAGGATCTGGTCCTCTGGACATAAGACTAGCTCAAGTCCC
TAAAATGCTTTCAATCTTGAGAACAAATTGGGCTCCAATGGCTTTCTGCATATCATTCAA
GCTAGAGACAGACTCAAAGATTTTGATAGACAAGGCTACAAAGGCTCTACAAAAGTACAA
AGTGCATGCGGTCGTAGCCAATGAGCTATCAACGCGCAAGGAAGAGGTTGTGGTTGTTTC
AAGCAGCGGTAACGTTGTGGTTAGGTGCAACAGCGAGAAGCCTGAATCTATTGTAGAGGA
TAATTTTATTCGTCTCATTGTAGATCGGCATTCGACATATATCAAAGAATTTAGCAGTTG
AAAATGTTTCTCAAATTAAATGCTTTTATGTCAAGAATAGGACAGCTGCAATGAAATGTC
AATGCATACATTCTTGAATGTATATCAGTCCAACCCGACTACATGAGTTCATCTTGGTGT
ATCGATGTTCTTTAGAACAATTCTTGTTGCCTCTACTTAAGTCGTTGCTCTTTCAGTTCC
TTTC


BQ
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10 10 10 10 

AF RS1ET29TF U 1
AF RS1ET29JQ C 446
BS 1 597 RS1ET29TF
BS 598 1024 RS1ET29JQ

RD RS1ET29TF 597 0 0
GCATCCAGCTCAATTCCTCAGGAGGGAGGAGGATCGTATGTGTAACCTCAGGCGGACTAC
GGTTCCCTTGGAGCAGCGATGCGTAAGATACATAGATAACTTCAGCTCAGGAAATCGAGG
TGCTGCTTCTACTGAGAACTTTGTCAAGGCTGGATATGCTGTCATATTTCTCTTTAGGAG
GGGAACTTGCCAGCCATATTCCCGATCTCTTCCAGATGATCCATTCCTTGAATGTTTCCA
GTTTCCAGATAACACCAACATTCGAGTTCATGCATCACATGTGGAAGCTGTGAAAATGGC
TGTTATGGACCAGCAAGCTGCAGTAGCTGAAGCTCGCTTACTAAAGCTCCCATTCACAAC
CATCTATGAGTATCTTCAGATGTTGCAGTTGATTGCAACGGCACTGAAGGACGTCGGTCC
ATGTTCAATGTTTTATCTTGCTGCGGCTGTGTCTGACTTTTATGTTCCGTGGAAGAGCAT
GGTTGAACATAAAATAGAATCAGGATCTGGTCCTCTGGACATAAGACTAGCTCAAGTCCC
TAAAATGCTTTCAATCTTGAGAACAAATTGGGCTCCAATGGCTTTCTGCATATCATT

QA 1 597 1 597
DS 

RD RS1ET29JQ 579 0 0
GCTGTGTCTGACTTTTATGTTCCGTGGAAGAGCATGGTTGAACATAAAATAGAATCAGGA
TCTGGTCCTCTGGACATAAGACTAGCTCAAGTCCCTAAAATGCTTTCAATCTTGAGAACA
AATTGGGCTCCAATGGCTTTCTGCATATCATTCAAGCTAGAGACAGACTCAAAGATTTTG
ATAGACAAGGCTACAAAGGCTCTACAAAAGTACAAAGTGCATGCGGTCGTAGCCAATGAG
CTATCAACGCGCAAGGAAGAGGTTGTGGTTGTTTCAAGCAGCGGTAACGTTGTGGTTAGG
TGCAACAGCGAGAAGCCTGAATCTATTGTAGAGGATAATTTTATTCGTCTCATTGTAGAT
CGGCATTCGACATATATCAAAGAATTTAGCAGTTGAAAATGTTTCTCAAATTAAATGCTT
TTATGTCAAGAATAGGACAGCTGCAATGAAATGTCAATGCATACATTCTTGAATGTATAT
CAGTCCAACCCGACTACATGAGTTCATCTTGGTGTATCGATGTTCTTTAGAACAATTCTT
GTTGCCTCTACTTAAGTCGTTGCTCTTTCAGTTCCTTTC

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

CO CL4453Contig1 1038 2 2 U
GGACCATCAACAAGTCTCTCAGCTTTGTAGTATACACTTCAAGCACCTCCATTTGAATAG
TATCACTCGTAAATATCTACGAAAATGACAACTAATCCATCCATTTTCCTAACCATATTA
CCTATCTTGCTCCTCCTGAACCCCACCAACGCTGGGATCCCTGGTGTCTACACCGGCAGC
TCTTGGCAAACCGCTCACGCCACTTTTTACGGTGGGGATGACGCTTCAGGAACCATGGGT
GGTGCATGCGGTTACGGTAACTTATACAGTCAAGGATATGGTACGAACACGGCGGCTCTC
AGCACGGCGCTTTTCAACAGTGGATTAACTTGTGGTGCTTGCTTTGAAATCAAATGTGTC
AATGATCCTAAGTGGTGTCACTCAGGCAGCCCTTCAGTCTTTGTAACTGCAACAAACTTC
TGTCCTCCGAATTTAGCTCAACCTAGCGACAATGGTGGCTGGTGCAACCCGCCACGTGCT
CACTTCGACCTAGCTATGCCAGTTTTCCTCAAGATCGCTGAGTACCGTGCTGGCATTGTC
CCAATCTCCTACCGCAGGGTGGCATGTAGGAAGAGTGGAGGGATGAGATTCACGATAAAC
GGTCACCGTTACTTCAACTTGGTGCTGATAACGAACGTGGCTGGAGCAGGAGACATCGTG
AGGACGAGCATGAAAGGATCAAAGACTGGTTGGATGGGTTTGACTAGGAACTGGGGACAG
AACTGGCAGTCTAATGCTGTTCTCGTTGGTCAGTCACTCTCCTTCCGTGTCACAACCAGT
GACCGTAGAACCTCGACTTCATGGAACATCGTACCTTCTAACTGGGAGTTCGGACAAACC
TTTGTCGGAAAAAACTTCAGGGTCTAAAGTGAAAAAAGCTCCTTTATCAAGCGTGAGATC
TATGACTTTGTATTTTCTGTTTTTTTTTTTTCTTCATTAATGTGATCCGAAGTGGCTGTT
AAGTAAACAGCCCGCAGCTCTTATCCTGCCTGTAATGTCAAATTTCATTAAAACTATAAT
GTATCATTCACTTATATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FO12TF U 1
AF RS1FO12JQ C 311
BS 1 645 RS1FO12TF
BS 646 1038 RS1FO12JQ

RD RS1FO12TF 645 0 0
GGACCATCAACAAGTCTCTCAGCTTTGTAGTATACACTTCAAGCACCTCCATTTGAATAG
TATCACTCGTAAATATCTACGAAAATGACAACTAATCCATCCATTTTCCTAACCATATTA
CCTATCTTGCTCCTCCTGAACCCCACCAACGCTGGGATCCCTGGTGTCTACACCGGCAGC
TCTTGGCAAACCGCTCACGCCACTTTTTACGGTGGGGATGACGCTTCAGGAACCATGGGT
GGTGCATGCGGTTACGGTAACTTATACAGTCAAGGATATGGTACGAACACGGCGGCTCTC
AGCACGGCGCTTTTCAACAGTGGATTAACTTGTGGTGCTTGCTTTGAAATCAAATGTGTC
AATGATCCTAAGTGGTGTCACTCAGGCAGCCCTTCAGTCTTTGTAACTGCAACAAACTTC
TGTCCTCCGAATTTAGCTCAACCTAGCGACAATGGTGGCTGGTGCAACCCGCCACGTGCT
CACTTCGACCTAGCTATGCCAGTTTTCCTCAAGATCGCTGAGTACCGTGCTGGCATTGTC
CCAATCTCCTACCGCAGGGTGGCATGTAGGAAGAGTGGAGGGATGAGATTCACGATAAAC
GGTCACCGTTACTTCAACTTGGTGCTGATAACGAACGTGGCTGGA

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1FO12JQ 728 0 0
TTTTCAACAGTGGATTAACTTGTGGTGCTTGCTTTGAAATCAAATGTGTCAATGATCCTA
AGTGGTGTCACTCAGGCAGCCCTTCAGTCTTTGTAACTGCAACAAACTTCTGTCCTCCGA
ATTTAGCTCAACCTAGCGACAATGGTGGCTGGTGCAACCCGCCACGTGCTCACTTCGACC
TAGCTATGCCAGTTTTCCTCAAGATCGCTGAGTACCGTGCTGGCATTGTCCCAATCTCCT
ACCGCAGGGTGGCATGTAGGAAGAGTGGAGGGATGAGATTCACGATAAACGGTCACCGTT
ACTTCAACTTGGTGCTGATAACGAACGTGGCTGGAGCAGGAGACATCGTGAGGACGAGCA
TGAAAGGATCAAAGACTGGTTGGATGGGTTTGACTAGGAACTGGGGACAGAACTGGCAGT
CTAATGCTGTTCTCGTTGGTCAGTCACTCTCCTTCCGTGTCACAACCAGTGACCGTAGAA
CCTCGACTTCATGGAACATCGTACCTTCTAACTGGGAGTTCGGACAAACCTTTGTCGGAA
AAAACTTCAGGGTCTAAAGTGAAAAAAGCTCCTTTATCAAGCGTGAGATCTATGACTTTG
TATTTTCTGTTTTTTTTTTTTCTTCATTAATGTGATCCGAAGTGGCTGTTAAGTAAACAG
CCCGCAGCTCTTATCCTGCCTGTAATGTCAAATTTCATTAAAACTATAATGTATCATTCA
CTTATATA

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL4454Contig1 1093 2 2 U
GAGAGTGTTCGAATCTCAAGAAGGCGTTATTAGCGTTGAGAAAATAGTCGAAGCCACGAG
AGTTTTGATCCAAGGATCATGGACCAAACAGCTCTCAAGTCCTCTGTTTGAAGTTGCTAA
TGAAACTATGGAGAAGCATGTTTTTTCATCTCAAGACAGCAACAACAAGGCTACATTGGT
AGATAAAGAGGTTGGAGATTCAGAATCTTATCCACCAGGGGACACATTTGCTAAGGATGA
TTCAACATCTAAGAGCTCGTTGAAAGAGCTAAAGTTGGAGAAAGAAAACATTGAACTCGA
ATTATCAAGATGCTTGCAGAATCTTGAAAGTACAAAGTTGGAGTTGGAAGAGAAAGAGCA
GGTCATAGCAGAGATGAACTCGCAGAGAGACCTGCAAAGCTTGGCAGAAACTCAGCTCAA
ATGCGTGACCGAGTCATACAAGACGCTGGAACTCCATGCCAAAGATTTAGAAGCTAAAGT
GAAAATATTGGAAGAAGAGACAGAGAGACTTGAAACGGCGTTCTCCACAGAAAGGCGTGG
ACATGAGGAGACTCTAGCTAAATGCAAAGACCTTCAAGAAAATATGCAAAGGAATGAGAC
TTGCAGAGAGTGTTCAGCATCCAAACTCCAACCTAATCAGGAGAAAGACATAGCATCAGC
AACCGAGAAGCTTGCAGCTTGTCAAGAAACGATTCACTTACTCAGCCAACAATTGCAATC
CTTGCAACCTCAGAGCAACCACGTTCCCAAATCTCAATCTCCTGAGAAGAAGCTTCAACA
CTACAAAACCTCAGAAGCAGAAGATGATGTTCCTCATGATGATCATAACATTCAGCCATC
TCATTCTTTTAGACACACGGTGAATCCAACAGTCCATGCGATTATCAAGTCTAGCTCGGT
TTCTTCATCTTCTAGAGAAGATGGTGAGAAGCATACGCGCGGGTTAGGACGTTTCTTTCA
TCCAAATCGAAGAACAGTGGACGTTAAGAAAGCTAGGAGATAAACATACTCATTTATCTG
CTTGTTCGTTTTGATCTTCATCTTCCTTCTTGATATGTGTATATGTTTTATAATGCGTTT
TTGAGTGTGTGAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FU33TF U 1
AF RS1FU33JQ C 303
BS 1 637 RS1FU33TF
BS 638 1093 RS1FU33JQ

RD RS1FU33TF 637 0 0
GAGAGTGTTCGAATCTCAAGAAGGCGTTATTAGCGTTGAGAAAATAGTCGAAGCCACGAG
AGTTTTGATCCAAGGATCATGGACCAAACAGCTCTCAAGTCCTCTGTTTGAAGTTGCTAA
TGAAACTATGGAGAAGCATGTTTTTTCATCTCAAGACAGCAACAACAAGGCTACATTGGT
AGATAAAGAGGTTGGAGATTCAGAATCTTATCCACCAGGGGACACATTTGCTAAGGATGA
TTCAACATCTAAGAGCTCGTTGAAAGAGCTAAAGTTGGAGAAAGAAAACATTGAACTCGA
ATTATCAAGATGCTTGCAGAATCTTGAAAGTACAAAGTTGGAGTTGGAAGAGAAAGAGCA
GGTCATAGCAGAGATGAACTCGCAGAGAGACCTGCAAAGCTTGGCAGAAACTCAGCTCAA
ATGCGTGACCGAGTCATACAAGACGCTGGAACTCCATGCCAAAGATTTAGAAGCTAAAGT
GAAAATATTGGAAGAAGAGACAGAGAGACTTGAAACGGCGTTCTCCACAGAAAGGCGTGG
ACATGAGGAGACTCTAGCTAAATGCAAAGACCTTCAAGAAAATATGCAAAGGAATGAGAC
TTGCAGAGAGTGTTCAGCATCCAAACTCCAACCTAAT

QA 1 637 1 637
DS 

RD RS1FU33JQ 791 0 0
TATCAAGATGCTTGCAGAATCTTGAAAGTACAAAGTTGGAGTTGGAAGAGAAAGAGCAGG
TCATAGCAGAGATGAACTCGCAGAGAGACCTGCAAAGCTTGGCAGAAACTCAGCTCAAAT
GCGTGACCGAGTCATACAAGACGCTGGAACTCCATGCCAAAGATTTAGAAGCTAAAGTGA
AAATATTGGAAGAAGAGACAGAGAGACTTGAAACGGCGTTCTCCACAGAAAGGCGTGGAC
ATGAGGAGACTCTAGCTAAATGCAAAGACCTTCAAGAAAATATGCAAAGGAATGAGACTT
GCAGAGAGTGTTCAGCATCCAAACTCCAACCTAATCAGGAGAAAGACATAGCATCAGCAA
CCGAGAAGCTTGCAGCTTGTCAAGAAACGATTCACTTACTCAGCCAACAATTGCAATCCT
TGCAACCTCAGAGCAACCACGTTCCCAAATCTCAATCTCCTGAGAAGAAGCTTCAACACT
ACAAAACCTCAGAAGCAGAAGATGATGTTCCTCATGATGATCATAACATTCAGCCATCTC
ATTCTTTTAGACACACGGTGAATCCAACAGTCCATGCGATTATCAAGTCTAGCTCGGTTT
CTTCATCTTCTAGAGAAGATGGTGAGAAGCATACGCGCGGGTTAGGACGTTTCTTTCATC
CAAATCGAAGAACAGTGGACGTTAAGAAAGCTAGGAGATAAACATACTCATTTATCTGCT
TGTTCGTTTTGATCTTCATCTTCCTTCTTGATATGTGTATATGTTTTATAATGCGTTTTT
GAGTGTGTGAG

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 2

CO CL4455Contig1 828 2 2 U
GGGCAACTGAAATTTGATAAACAACACATAAGAACTCCATGAACAAGAATAGAAGAAAAA
CAAAGGATAGAAACAGAAATGGGATCAAGGTTTCATGCTTTTATGTTCCCATGGTTTGGT
TTCGGTCACATGACTGCATTTCTGCATCTGGCTAACAAACTAGCTGAAAAAGGGCACAAA
ATCACGTTCTTGCTCCCCAAGAAAGCTCTGAAGCAGCTCGAACCTCTAAATCTGTTCCCA
AAATGCATTGCATTTCACACTCTTACCATCCCTTCCGTGGATGGTCTCCCTGATGGCGCC
GAAACAACCTCGGATATTCCGATCACGTTAGGGAGTTTTCTGGCCTCGGCTATGGATCGC
ACACGCGGTCAGGTCGAAGAAGCGGTTCAGTTAGGTAAACCGGATCTTATTTTCTTTGAT
TTTGCTCACTGGATTCCGGACGTAGCTAGAGAGTATGGAGCCAAGAGTGTGAATTTTGTA
ACGATCTCTGCAGCATGTGTGGCTATCTCATTTGTCCCTGGTCGTAGTCCAGATGACTTG
GCTATACCTCCTCCGGGGTATCCTTCATCCAAGGTGTTGCTTCACGGACAAGAAACAAAC
TTTTTGTCATTTCTATCCTATCCCTTTGGTGATGGAGTAACGTTTTACGAACGTATCATG
ACAGGGCTTGTGAACTGTGATGTCATATCGATAAGGACTTGCCGGGAAATGGAAAGAAAA
TTTTGTGATTTTATTGAAAAGAAATTTCAAAGAAAAGTTCTCTTGACGGGTCCAATGCTT
CCTGAGCCGGACATAGCAAGCCACTCGAAGATCATGGAATCACTGGTT


BQ
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AF RS1CJ71TF U 1
AF RS1CR66TF U 326
BS 1 660 RS1CJ71TF
BS 661 828 RS1CR66TF

RD RS1CJ71TF 660 0 0
GGGCAACTGAAATTTGATAAACAACACATAAGAACTCCATGAACAAGAATAGAAGAAAAA
CAAAGGATAGAAACAGAAATGGGATCAAGGTTTCATGCTTTTATGTTCCCATGGTTTGGT
TTCGGTCACATGACTGCATTTCTGCATCTGGCTAACAAACTAGCTGAAAAAGGGCACAAA
ATCACGTTCTTGCTCCCCAAGAAAGCTCTGAAGCAGCTCGAACCTCTAAATCTGTTCCCA
AAATGCATTGCATTTCACACTCTTACCATCCCTTCCGTGGATGGTCTCCCTGATGGCGCC
GAAACAACCTCGGATATTCCGATCACGTTAGGGAGTTTTCTGGCCTCGGCTATGGATCGC
ACACGCGGTCAGGTCGAAGAAGCGGTTCAGTTAGGTAAACCGGATCTTATTTTCTTTGAT
TTTGCTCACTGGATTCCGGACGTAGCTAGAGAGTATGGAGCCAAGAGTGTGAATTTTGTA
ACGATCTCTGCAGCATGTGTGGCTATCTCATTTGTCCCTGGTCGTAGTCCAGATGACTTG
GCTATACCTCCTCCGGGGTATCCTTCATCCAAGGTGTTGCTTCACGGACAAGAAACAAAC
TTTTTGTCATTTCTATCCTATCCCTTTGGTGATGGAGTAACGTTTTACGAACGTATCATG

QA 1 660 1 660
DS 

RD RS1CR66TF 503 0 0
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TTCAGTTAGGTAAACCGGATCTTATTTTCTTTGATTTTGCTCACTGGATTCCGGACGTAG
CTAGAGAGTATGGAGCCAAGAGTGTGAATTTTGTAACGATCTCTGCAGCATGTGTGGCTA
TCTCATTTGTCCCTGGTCGTAGTCCAGATGACTTGGCTATACCTCCTCCGGGGTATCCTT
CATCCAAGGTGTTGCTTCACGGACAAGAAACAAACTTTTTGTCATTTCTATCCTATCCCT
TTGGTGATGGAGTAACGTTTTACGAACGTATCATGACAGGGCTTGTGAACTGTGATGTCA
TATCGATAAGGACTTGCCGGGAAATGGAAAGAAAATTTTGTGATTTTATTGAAAAGAAAT
TTCAAAGAAAAGTTCTCTTGACGGGTCCAATGCTTCCTGAGCCGGACATAGCAAGCCACT
CGAAGATCATGGAATCACTGGTT

QA 1 503 1 503
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4457Contig1 1232 2 12 U
GGAGACAGAGACCGAGAGAGAGAGAGAGATTTAGACCAAAAATGCAGTACAAGAATCTGG
GGAAATCGGGATTGAAAGTGAGCACGCTCTCGTTCGGAGCGTGGGTGACTTTCGGGAACC
AGCTCGACGTGAAAGAAGCCAAATCGATTCTCCAGTGCTGCCGTGATCACGGGGTCAACT
TCTTCGACAACGCCGAGGTCTACGCCAATGGCCGAGCCGAGGAGATTATGGGCCAGGCGA
TTCGCGAGCTCGGCTGGCGCAGATCCGACGTCGTCGTCTCCACCAAGATCTTCTGGGGTG
GCCCTGGTCCTAACGACAAAGGTTTGTCGAGGAAACATATCGTCGAAGGAACCAAAGCTT
CTCTCAAACGACTCGATATGGACTACGTCGATGTCCTCTATTGCCACAGGCCTGATGCTT
CAACACCTATAGAAGAGACGGTGAGGGCGATGAACTACGTGATTGATAAGGGTTGGGCGT
TTTATTGGGGAACAAGTGAATGGTCGGCTCAACAAATCACTGAGGCATGGGGAGCTTCTG
AGAGATTGGATTTGGTCGGTCCAATCGTGGAACAGCCTGAGTACAACATGTTTGCTAGGC
ACAAAGTTGAATCAGAGTTTCTTCCTCTGTACACCAACCATGGCATAGGTCTGACTACTT
GGAGCCCACTCGCATCTGGTGTGCTCACTGGTAAATACAACAAGGGATCTATTCCCTCTG
ACAGCCGATTTGCATTGGAGAATTACAAAAACCTTGCCAATAGATCACTTGTGGATGACG
TGCTGAAGAAAGTCAGCGGGCTCAAACCGATTGCAGATGAGCTAGGTGTAACCTTGGCTC
AGCTTGCAATCGCTTGGTGTGCTTCAAATCCTAATGTGTCATCCGTTATCACCGGTGCCA
CAAGAGAGTTTCAGATTCAAGAAAACATGAAGGCTGTTGATGTGATCCCGTTGTTGACAC
CGCATGTTCTGGACAAGATCGAGCAAGTTATACAGAGCAAACCTAAACGTCCTGAATCAT
ACCGGTAAAAACCAAAATCCTGAGATCATTTGATGGCTGTGTGATGGTTATTCTTGGAAG
TTGCCACGTGTTGTCTTTGTTTGTTTTCATATGCATTTTTAAGACTCAGAGACAGAGAGA
GTTCTAATGTGTTGTTTTCTAGTTTTGTTGGTTCCACATTTTAAAACGGTTCTATTGTTA
GTGAAAACTTAAAAGTTGGTTCTTGTAGTTGC


BQ
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AF RS1BE18TF U 1
AF RS1BE18JQ C 436
BS 1 694 RS1BE18TF
BS 695 695 RS1BE18JQ
BS 696 730 RS1BE18TF
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BS 751 751 RS1BE18JQ
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BS 761 786 RS1BE18TF
BS 787 1232 RS1BE18JQ

RD RS1BE18TF 799 0 0
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GGAAATCGGGATTGAAAGTGAGCACGCTCTCGTTCGGAGCGTGGGTGACTTTCGGGAACC
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TCTTCGACAACGCCGAGGTCTACGCCAATGGCCGAGCCGAGGAGATTATGGGCCAGGCGA
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GCCCTGGTCCTAACGACAAAGGTTTGTCGAGGAAACATATCGTCGAAGGAACCAAAGCTT
CTCTCAAACGACTCGATATGGACTACGTCGATGTCCTCTATTGCCACAGGCCTGATGCTT
CAACACCTATAGAAGAGACGGTGAGGGCGATGAACTACGTGATTGATAAGGGTTGGGCGT
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AGAGATTGGATTTGGTCGGTCCAATCGTGGAACAGCCTGAGTACAACATGTTTGCTAGGC
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ACAGCCGATT*GCATTGGAGA*TTACAAAA*CCTTGCCA*TAGATCACTTGTGGATGACG
TGCTGA
GAAGTCAGCGGGC

QA 1 786 1 786
DS 

RD RS1BE18JQ 797 0 0
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GTGAATGGTCGGCTCAACAAATCACTGAGGCATGGGGAGCTTCTGAGAGATTGGATTTGG
TCGGTCCAATCGTGGAACAGCCTGAGTACAACATGTTTGCTAGGCACAAAGTTGAATCAG
AGTTTCTTCCTCTGTACACCAACCATGGCATAGGTCTGACTACTTGGAGCCCACTCGCAT
CTGGTGTGCTCACTGGTAAATACAACAAGGGATCTATTCCCTCTGACAGCCGATTTGCAT
TGGAGAATTACAAAAACCTTGCCAATAGATCACTTGTGGATGACGTGCTGAAGAAAGTCA
GCGGGCTCAAACCGATTGCAGATGAGCTAGGTGTAACCTTGGCTCAGCTTGCAATCGCTT
GGTGTGCTTCAAATCCTAATGTGTCATCCGTTATCACCGGTGCCACAAGAGAGTTTCAGA
TTCAAGAAAACATGAAGGCTGTTGATGTGATCCCGTTGTTGACACCGCATGTTCTGGACA
AGATCGAGCAAGTTATACAGAGCAAACCTAAACGTCCTGAATCATACCGGTAAAAACCAA
AATCCTGAGATCATTTGATGGCTGTGTGATGGTTATTCTTGGAAGTTGCCACGTGTTGTC
TTTGTTTGTTTTCATATGCATTTTTAAGACTCAGAGACAGAGAGAGTTCTAATGTGTTGT
TTTCTAGTTTTGTTGGTTCCACATTTTAAAACGGTTCTATTGTTAGTGAAAACTTAAAAG
TTGGTTCTTGTAGTTGC

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 2

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TCCTTTTTGATTTGTATATTGAAATCCTAGGGATTGATTTTCTGGGTTTTTAATCTGCAT
GTTCTGTTTCGTTTAAGGGTTGGTGTCAATTTTGATTAAATATGTTTGTGACTGAGAAGC
TTTACAGTGTAGGGGTTTGTTTACAGCAGATATGTAGCGTTATTAGGTTGGGCCGATAAG
GGTTCGAGGGGTTTTGTCAATTTGTGATTTTTCAAGCTTATTTGTAGTTTTTTGTTTTGT
TTTCTGTATATTATTATCTCACATGTTCTTCTGCAGATGAGTATCCTACGTGGTTCTTCT
TCAGGGACAGCTAACAGGAGCCGTCAAACTTGTCTTCCTCCTGGATTCAACAGACCAGCT
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GAGAG


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RS1A317TF U 261
AF RS1A317TV U 1
BS 1 310 RS1A317TV
BS 311 311 RS1A317TF
BS 312 322 RS1A317TV
BS 323 323 RS1A317TF
BS 324 725 RS1A317TV

RD RS1A317TF 344 0 0
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TTTGTGATTTTTCAAGCTTATTTGTAGTTTTTTGTTTTGTTTTCTGTATATTATTATCTC
ACATGTTCTTCTGCAGATGAGTATCCTACGTGGTTCTTCTTCAGGGACAGCTAACAGGAG
CCGTCAAACTTGTCTTCCTCCTGGATTCAACAGACCAGCTACGTCCGCTTCTCTTCCTCC
TGGAGCAACCAGACCAGCTTCTTCTGCTTCTCGACATCCACTTCCAAGCTTAGCTGCTGT
AATGAGCGCACCAGAGAGACGTAACATGCCTGTTCTCCATCCAC

QA 1 344 1 344
DS 

RD RS1A317TV 725 0 0
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AGTATCCTTTATCTCTTCATTAAGTTCTTCTGTTTGAGGTCAGAGATCTCTTATTTGTTT
TCCTTTTTGATTTGTATATTGAAATCCTAGGGATTGATTTTCTGGGTTTTTAATCTGCAT
GTTCTGTTTCGTTTAAGGGTTGGTGTCAATTTTGATTAAATATGTTTGTGACTGAGAAGC
TTTACAGTGTAGGGGTTTGTTTACAGCAGATATGTAGCGTTATTAGGTTGGGCCGATAAG
GGTTCGAGGG*TTTTGTCAATT*GTGATTTTTCAAGCTTATTTGTAGTTTTTTGTTTTGT
TTTCTGTATATTATTATCTCACATGTTCTTCTGCAGATGAGTATCCTACGTGGTTCTTCT
TCAGGGACAGCTAACAGGAGCCGTCAAACTTGTCTTCCTCCTGGATTCAACAGACCAGCT
ACGTCCGCTTCTCTTCCTCCTGGAGCAACCAGACCAGCTTCTTCTGCTTCTCGACATCCA
CTTCCAAGCTTAGCTGCTGTAATGAGCGCACCAGAGAGACGTAACATGCCTGTTCTCCAT
CCACAAAGGCCCAATGGGACTTTATGGTTCGGGATTGACGATTGCACCCAAAAAGATGTA
GTGTCAACATATCAGTCAAACTTTTGGGGACCTTGGTGGACCTACAATATGGTGCCAGAT
GAGAG

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL4459Contig1 905 2 2 U
GATTGGCAAGAGTTTTCTTCCAAAAGGGTACTGAAACTAGGAAGAATATACTACTGCTAA
AACAACACCAAATGACACCAAGTTTAAGAGGATGATAGATGAATTTAATCTTCGCATTGG
AAAAGAAAGATTTGGTTCAACAGATACCGCCAACATATTTCTTCATCTTTCTTTTCGCTT
CGGTACTTCCACGACACATATTATAGAACAGTTAGGTTGATGTGTTCGTATTGCAAGAAA
CACAATGAAAAATTTCACGAACGAAAAGATGATGGTAGAAATGCTGACACCAAAGAAGTT
GCTTATTCTAACTAGCTCTTCAGGAAGCTGAGAGAAATGGAAATAGCATATATATTATCT
GCCTTATCCGTGTGGACTGTGGAGATTCGGAGGATGAGGACCATACTTCTCAGATAGGTG
CCTAAGCATTGACGCTCACTGCAGGTTTCAACTGAATCGCTTTGGTTTACCCCAAAAAAG
AGTACTACACTGTTCTTCAGTGTATCAAGGAAAGAAATCTACTCCCAGGGAGATGGAAAT
GATATGCCTGGAGTTGGAGCAGTTAAAACTGTGCCCTCCATGGATGGCACCAAGGACGTC
CCTGCTGAGCTTAATAGTGTTGAAGTCCAAGCTGACAGTGCAGACTTTCGTGAGGATGTA
CGCACCGTCAAGAAACCCTGCAATGGTTAGCTTCGCATACATGGGGTGTCCAAGCTCAAT
GGCCATTACTGCTCTTCCTTTTGTTTTGAATTTACTTAGTTTCATTAAACTGTTTAGAAC
TCTGTTCCTCTAAAAATCCTTTTCTATGTTTTTACTTTTTAGGAATTTTTCATTTTGCTT
TGCTTTGTCATTAAGAGCAGGAACTCTATTGAGCTTTATCTAAATTTATAAAACCCCAGT
TATGG


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RS1DB31TF U 1
AF RS1DB31JQ C 390
BS 1 566 RS1DB31TF
BS 567 905 RS1DB31JQ

RD RS1DB31TF 566 0 0
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AACAACACCAAATGACACCAAGTTTAAGAGGATGATAGATGAATTTAATCTTCGCATTGG
AAAAGAAAGATTTGGTTCAACAGATACCGCCAACATATTTCTTCATCTTTCTTTTCGCTT
CGGTACTTCCACGACACATATTATAGAACAGTTAGGTTGATGTGTTCGTATTGCAAGAAA
CACAATGAAAAATTTCACGAACGAAAAGATGATGGTAGAAATGCTGACACCAAAGAAGTT
GCTTATTCTAACTAGCTCTTCAGGAAGCTGAGAGAAATGGAAATAGCATATATATTATCT
GCCTTATCCGTGTGGACTGTGGAGATTCGGAGGATGAGGACCATACTTCTCAGATAGGTG
CCTAAGCATTGACGCTCACTGCAGGTTTCAACTGAATCGCTTTGGTTTACCCCAAAAAAG
AGTACTACACTGTTCTTCAGTGTATCAAGGAAAGAAATCTACTCCCAGGGAGATGGAAAT
GATATGCCTGGAGTTGGAGCAGTTAA

QA 1 566 1 566
DS 

RD RS1DB31JQ 516 0 0
GAGGATGAGGACCATACTTCTCAGATAGGTGCCTAAGCATTGACGCTCACTGCAGGTTTC
AACTGAATCGCTTTGGTTTACCCCAAAAAAGAGTACTACACTGTTCTTCAGTGTATCAAG
GAAAGAAATCTACTCCCAGGGAGATGGAAATGATATGCCTGGAGTTGGAGCAGTTAAAAC
TGTGCCCTCCATGGATGGCACCAAGGACGTCCCTGCTGAGCTTAATAGTGTTGAAGTCCA
AGCTGACAGTGCAGACTTTCGTGAGGATGTACGCACCGTCAAGAAACCCTGCAATGGTTA
GCTTCGCATACATGGGGTGTCCAAGCTCAATGGCCATTACTGCTCTTCCTTTTGTTTTGA
ATTTACTTAGTTTCATTAAACTGTTTAGAACTCTGTTCCTCTAAAAATCCTTTTCTATGT
TTTTACTTTTTAGGAATTTTTCATTTTGCTTTGCTTTGTCATTAAGAGCAGGAACTCTAT
TGAGCTTTATCTAAATTTATAAAACCCCAGTTATGG

QA 1 516 1 516
DS 



AS 1 2

CO CL4460Contig1 1094 2 6 U
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CCGGAACCGAGTATAACGGGACTCAAGAGTGCCATATGGAAACTCAAAGCTCCGAGGAAA
ATCAAGCACTTCTTATGGCAAGCCTTATCAGGATATCTTGCAACAGCATCACAATTAAAA
GATCGGCATTGTGCTCGAGAAAGTACGTGCGTTAGATGTGGTCACGAGAGTGAGTCTATT
AACCACACTCTCTTTGAATGCCCACCAGCGTTACAGTGTTGGGCCCTCTCAGCAATACCA
TCTCCTCCGGGGTCTTTCCCGTGTACGTCTCTATTCTCGAATATAGACTATCTGCTGTTT
CGCGCAAAGAAAAAGGGAGTGAGCACAGAGGCGCTGGCTACATTCCCTTGGATCGCTTGG
TATACCTGGAAAGCGCGTAACGAGAAAATCTTCAATAATAAAGATGTCCTCCCGCTGGAT
ACACTGCAACTTGCAGTTAAAGAAGCAGAAAGTTGGTTGCTAGCTCAAAGATTAGAAGAT
ACACCAGACATGGACGTGGACGACCAACCGAGAACAAGGAGCAGCGAAGTGCAGGCGTCG
GAACCGACAAGATGGAGATGTCAAACAGATGCGTCTTGGACAAGTAAGAGGGACAGAGCC
GGAGTGGGGTTTGTACTCTTACAAACCGGTAACCCTGTCATCTTTGGTGCAAAAGGTACG
ACGCAGGTAACATCTCCCCTCCACGCGGAAGCTGAAGCTTTGCTGTGGGCCATGCAAGAG
ATACTAAAGCTGGGACACAGAGAGGTTCGCTTCGAGTCGGACTGTAAACAATTGATCAAG
CTCCTAAGTAATGATGAAGAATGGCCATCCATGGCAGCTGAGATAGACGAGATTAAAGCT
CTTTCTGTTGATTTCATTGAGTTCTCTACAGCTTATATACCGAGATCGCTGAATGTCCGA
GCAGATGGGCTCGCGAAAGGAGGAAGAACACAAGCTACCAATCTCCCGTACGTTGGGCGC
TCTGCTCCTTGCTGGCTAGCCATTGCTGGCCAAAACAGAGCTCCTTAAGTTTCTATAGTT
TTACTTTCGATGTC


BQ
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AF RS1E468TF U 1
AF RS1E468JQ C 308
BS 1 602 RS1E468TF
BS 603 603 RS1E468JQ
BS 604 638 RS1E468TF
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BS 640 651 RS1E468TF
BS 652 1094 RS1E468JQ

RD RS1E468TF 656 0 0
GTCAAGTCGGGCTACGAAGTGGCTCACGAACTGTACGCAGCAAGCAATCTCCCTGCCATA
CCGGAACCGAGTATAACGGGACTCAAGAGTGCCATATGGAAACTCAAAGCTCCGAGGAAA
ATCAAGCACTTCTTATGGCAAGCCTTATCAGGATATCTTGCAACAGCATCACAATTAAAA
GATCGGCATTGTGCTCGAGAAAGTACGTGCGTTAGATGTGGTCACGAGAGTGAGTCTATT
AACCACACTCTCTTTGAATGCCCACCAGCGTTACAGTGTTGGGCCCTCTCAGCAATACCA
TCTCCTCCGGGGTCTTTCCCGTGTACGTCTCTATTCTCGAATATAGACTATCTGCTGTTT
CGCGCAAAGAAAAAGGGAGTGAGCACAGAGGCGCTGGCTACATTCCCTTGGATCGCTTGG
TATACCTGGAAAGCGCGTAACGAGAAAATCTTCAATAATAAAGATGTCCTCCCGCTGGAT
ACACTGCAACTTGCAGTTAAAGAAGCAGAAAGTTGGTTGCTAGCTCAAAGATTAGAAGAT
ACACCAGACATGGACGTGGACGACCAACCGAGAACAAGGAGCAGCGAAGTGCAGGCGTCG
GA*CCGACAAGATGGAGATGTCAAACAGATGCGTCTTG*ACAAGTAAGAGG
ACAGA

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1E468JQ 787 0 0
CCGGGGTC
TTCCCGTGTACGTCTCTATTCTCGAATATAGACTATCTGCTGTTTCGCGCAAAGAAAAAG
GGAGTGAGCACAGAGGCGCTGGCTACATTCCCTTGGATCGCTTGGTATACCTGGAAAGCG
CGTAACGAGAAAATCTTCAATAATAAAGATGTCCTCCCGCTGGATACACTGCAACTTGCA
GTTAAAGAAGCAGAAAGTTGGTTGCTAGCTCAAAGATTAGAAGATACACCAGACATGGAC
GTGGACGACCAACCGAGAACAAGGAGCAGCGAAGTGCAGGCGTCGGAACCGACAAGATGG
AGATGTCAAACAGATGCGTCTTGGACAAGTAAGAGGGACAGAGCCGGAGTGGGGTTTGTA
CTCTTACAAACCGGTAACCCTGTCATCTTTGGTGCAAAAGGTACGACGCAGGTAACATCT
CCCCTCCACGCGGAAGCTGAAGCTTTGCTGTGGGCCATGCAAGAGATACTAAAGCTGGGA
CACAGAGAGGTTCGCTTCGAGTCGGACTGTAAACAATTGATCAAGCTCCTAAGTAATGAT
GAAGAATGGCCATCCATGGCAGCTGAGATAGACGAGATTAAAGCTCTTTCTGTTGATTTC
ATTGAGTTCTCTACAGCTTATATACCGAGATCGCTGAATGTCCGAGCAGATGGGCTCGCG
AAAGGAGGAAGAACACAAGCTACCAATCTCCCGTACGTTGGGCGCTCTGCTCCTTGCTGG
CTAGCCATTGCTGGCCAAAACAGAGCTCCTTAAGTTTCTATAGTTTTACTTTCGATGTC

QA 9 787 9 787
DS 



AS 1 2

CO CL4461Contig1 827 2 2 U
GCGGATACAAAATTGGAGGCGAACTTGATTTTCCAAAGAATAAATCAAAAGTTAAATGGT
TTTCTCCTCCGGATGTTCACGTCCCTCATGACGGTCACGGTCTAACCAACGGCCCTTTGC
CACGAATCGTTATAGCTGAGGTTCTTCTGGACCAACTTAGCCTTGAATCACAGGGGATAA
TAAGAAAGTATTTGAAACCAGAAGGTGGTAAGCAAGCGGTTCTGTCAAGCACTTTGGGGT
CCTTAATATGGGAGAAGCCTAAATGGACTGACTTCAAGCAACTCGCAAAAGAAAACGAAT
TTGCGGCATGGACGCTTATCCACGGCTACACAATGAATCATCTTGCATTTTCGGTTCATC
GATTCAAACATGAGCTCAGTGACATTAAGTTCATCAAACAGTATCTTGAAGAAAAGGAAT
TCGAACTTAACACTGACGGGGGAGTTATCAAAGTGAGTCAAGATGGTTTACTGTTACAAG
TATCGTCCATCGCGGACAAACTTGCGGTTGAATTTGCTGACGGAGTAACTGAAACAATCC
CGGCTTCTTACATTGAGTTTACTCAACGTCTAGTTTTTCCACAGTTCAAAGATGTGCCGT
TTGATGAGCTTAAAGAGTTCCACAGACGTGAAGGCTTTGAGCTTGATAACGCCAGCAACA
TAATGGAAAGTACCCGTTTCACAGCACCAGTGTAAAACAAGACTTGTCTTGTTCGGCTCA
GTATGCCAAATGTGTGCAAGGATTTGTGTTTTATTTATGTGTGACCTTGATCCATATCGG
TAACAATGCAATAATCGTGGAATGGCAGAAAATACAATTAAGTTAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1FH84TF U 1
AF RS1FH84JQ C 148
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BS 304 827 RS1FH84JQ

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TTTCTCCTCCGGATGTTCACGTCCCTCATGACGGTCACGGTCTAACCAACGGCCCTTTGC
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TAAGAAAGTATTTGAAACCAGAAGGTGGTAAGCAAGCGGTTCTGTCAAGCACTTTGGGGT
CCTTAATATGGGAGAAGCCTAAATGGACTGACTTCAAGCAACTCGCAAAAGAAAACGAAT
TTG

QA 1 303 1 303
DS 

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CTGACTTCAAGCAACTCGCAAAAGAAAACGAATTTGCGGCATGGACGCTTATCCACGGCT
ACACAATGAATCATCTTGCATTTTCGGTTCATCGATTCAAACATGAGCTCAGTGACATTA
AGTTCATCAAACAGTATCTTGAAGAAAAGGAATTCGAACTTAACACTGACGGGGGAGTTA
TCAAAGTGAGTCAAGATGGTTTACTGTTACAAGTATCGTCCATCGCGGACAAACTTGCGG
TTGAATTTGCTGACGGAGTAACTGAAACAATCCCGGCTTCTTACATTGAGTTTACTCAAC
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GTGAAGGCTTTGAGCTTGATAACGCCAGCAACATAATGGAAAGTACCCGTTTCACAGCAC
CAGTGTAAAACAAGACTTGTCTTGTTCGGCTCAGTATGCCAAATGTGTGCAAGGATTTGT
GTTTTATTTATGTGTGACCTTGATCCATATCGGTAACAATGCAATAATCGTGGAATGGCA
GAAAATACAATTAAGTTAGG

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL4462Contig1 1106 2 8 U
GGAGAGCTTGCGGAAAGAAGTGAGAACGAAAGAGAAAGAGAAAGAGAAAGAGATTTTAGG
GCAGTGCGCTCGCGAGCGGTGATGCTATTGTCGCAAGTGAGTGCGTACTGGAAAAACAAT
GCACAAATGACGGCCGTGGCAATGGATAGGATGATGGGGTATAGACTGGTATCGAATCAG
GCGATTGTGAGATGGGTTTTCTCTCCGGAGAATGTTGATCAGTTTCATGTGTCTGATCAG
CCATGGGAGATACTTGGGAATGCACTTAACAAGACTTATAATTGTATCTCTGATTTGAGG
AAAGACATATCAAACATTACGAAGAATGTTTTGGTTGCTGAAAAGCTTCAGCAAACGCAC
GAGCAGAGCTGGAGGCTGCAGAGAGCAAACTTTCCCTGGTGGAGGGTGAGCCAGTCCTTG
GTGAAAATCCAGGGAAGATGAAGCGTTTGAGATCAACGGTGGAGAAGACAGGGGAGGCAG
AGGTGTCTATTCGGGAATCTCTAGAGGCAAAAGAGGCTCTTCTTAACAGAGCGCTCTCTG
AAACTGAGGCTCCACTGCTCCTGCTGTTCCAGAGTTTCTCGGCAGTCCTGAAGGAACGGC
TTCCAGAAGCAACGAAAGCGAGATCGTTGGAGGATCTAAAACCTGAAGATGAAAACTCGT
CTGCTATGGAGGTGGACACAGAAAATGGAAACCCAAAGAAAAAATCTGAGATGGGTGAGA
GAGAACAGTGGTGCTTAACGACACTTGGATATCTTACGGCATTTACAAGACAATATGCGA
ACGAGATATGGCCTCACATGGAGAAGTTGAAGAGGGAGGTGTTCTCTGGAGAGGATGTTC
ATCCTCTCTTCCTCCAAGCCATATTCTCTGCACTCCAAATCCCTTTACAGTAATCTGTCG
CTTTTTCATCAGAAACCTATGTATTTTGTTCTATTCTTATGAGAGTTTTTACAATTCAAG
TTTCATTAGTAAGTTGATGAAATTCCTTTTTTTGGACGACAGTTGATGAAATTCCTAGTA
TGGGAAAAACGAAGAAGAGAGTTAGCTCGTTTCCTAGTGTATGTTGTCGTTTGTTTTCTC
AAACCAGCTATAATTAAACTTTGATT


BQ
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AF RS1BQ71TF U 1
AF RS1AV61TF U 353
BS 1 632 RS1BQ71TF
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GCAGTGCGCTCGCGAGCGGTGATGCTATTGTCGCAAGTGAGTGCGTACTGGAAAAACAAT
GCACAAATGACGGCCGTGGCAATGGATAGGATGATGGGGTATAGACTGGTATCGAATCAG
GCGATTGTGAGATGGGTTTTCTCTCCGGAGAATGTTGATCAGTTTCATGTGTCTGATCAG
CCATGGGAGATACTTGGGAATGCACTTAACAAGACTTATAATTGTATCTCTGATTTGAGG
AAAGACATATCAAACATTACGAAGAATGTTTTGGTTGCTGAAAAGCTTCAGCAAACGCAC
GAGCAGAGCTGGAGGCTGCAGAGAGCAAACTTTCCCTGGTGGAGGGTGAGCCAGTCCTTG
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AGGTGTCTATTCGGGAATCTCTAGAGGCAAAAGAGGCTCTTCTTAACAGAGCGCTCTCTG
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TTCCAGAAGCAACGAAAGCGAGATCGTTGGAG*ATCTAAAACCTGAAGATGAAAACTCGT
CTGCTATGGAGGTGGACACAGAAA*TGGAAACC*AAAGAAAAA

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1AV61TF 754 0 0
G
AACGCACGAGCAGAGCTGGAGGCTGCAGAGAGCAAACTTTCCCTGGTGGAGGGTGAGCCA
GTCCTTGGTGAAAATCCAGGGAAGATGAAGCGTTTGAGATCAACGGTGGAGAAGACAGGG
GAGGCAGAGGTGTCTATTCGGGAATCTCTAGAGGCAAAAGAGGCTCTTCTTAACAGAGCG
CTCTCTGAAACTGAGGCTCTACTGCTCCTGCTGTTCCAGAGTTTCTCGGCAGTCCTGAAG
GAACGGCTTCCAGAAGCAACGAAAGCGAGATCGTTGGAGGATCTAAAACCTGAAGATGAA
AACTCGTCTGCTATGGAGGTGGACACAGAAAATGGAAACCCAAAGAAAAAATCTGAGATG
GGTGAGAGAGAACAGTGGTGCTTAACGACACTTGGATATCTTACGGCATTTACAAGACAA
TATGCGAACGAGATATGGCCTCACATGGAGAAGTTGAAGAGGGAGGTGTTCTCTGGAGAG
GATGTTCATCCTCTCTTCCTCCAAGCCATATTCTCTGCACTCCAAATCCCTTTACAGTAA
TCTGTCGCTTTTTCATCAGAAACCTATGTATTTTGTTCTATTCTTATGAGAGTTTTTACA
ATTCAAGTTTCATTAGTAAGTTGATGAAATTCCTTTTTTTGGACGACAGTTGATGAAATT
CCTAGTATGGGAAAAACGAAGAAGAGAGTTAGCTCGTTTCCTAGTGTATGTTGTCGTTTG
TTTTCTCAAACCAGCTATAATTAAACTTTGATT

QA 2 754 2 754
DS 



AS 1 2

CO CL4463Contig1 853 2 6 U
AGAAAGAGTAATTGTGTACAGTTTTCGCTTCATCAAGCTCAACTGCTAATCATCAGAGAT
GGCAACGAATGGAACGACGACGAAGCCACCACCGATGCCTTCTCCACTGCGTAATTCCAA
GTTTTTGCAGTCAAATATGAGGATCTTGGTGACGGGAGGAGCTGGATTCATTGGTTCGCA
TTTGGTTGATAGATTGATGCAAAACGAAAAGAATGAAGTAATCGTCGCTGATAATTACTT
CACAGGATCAAAAGACAATCTCAAGAAATGGATTGGTCATCCAAGATTTGAGCTCATTCG
TCATGATGTGACAGAACCTCTCATGGTCGAGGTTGATCAAATCTACCATTTAGCATGTCC
TGCATCTCCAATTTTCTACAAATACAACCCTGTTAAGACAATAAAAACAAATGTGATTGG
CACACTTAATATGTTGGGACTAGCTAAGCGAGTTGGAGCAAGAATTTTGCTTACTTCCAC
ATCTGAAGTGTACGGTGATCCTCTTGTTCATCCTCAGACCGAGAGCTACTGGGGAAATGT
AAACCCCATCGATCTGTGTCGCGACAGTAGACTGTTTTGTATGTCTACGGGAAGATGTAG
ACTTAAAATTGCGGTCTACAAGTCAACGCACAGGTAATTTTTAATTTGCCTGTTGTGTAT
GGAGAATGGGTGGTGAAAGGCTCTTTGTGGGAGTTTGTGGTTGATAAATGGAAAAAAAGG
AGAATGTTCTTTGTGCATGATGGTTGTACATATGGTGAACTTCTTGAAATGGCACAAGAA
GATTATGATCTGGACAAGAAAACCGAGAAGGTGGAGCTGACATATTCCTTACCAGACGTA
CTTTTAGAGAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BT15TF U 1
AF RS1BT15JQ C 556
BS 1 607 RS1BT15TF
BS 608 608 RS1BT15JQ
BS 609 679 RS1BT15TF
BS 680 680 RS1BT15JQ
BS 681 716 RS1BT15TF
BS 717 853 RS1BT15JQ

RD RS1BT15TF 716 0 0
AGAAAGAGTAATTGTGTACAGTTTTCGCTTCATCAAGCTCAACTGCTAATCATCAGAGAT
GGCAACGAATGGAACGACGACGAAGCCACCACCGATGCCTTCTCCACTGCGTAATTCCAA
GTTTTTGCAGTCAAATATGAGGATCTTGGTGACGGGAGGAGCTGGATTCATTGGTTCGCA
TTTGGTTGATAGATTGATGCAAAACGAAAAGAATGAAGTAATCGTCGCTGATAATTACTT
CACAGGATCAAAAGACAATCTCAAGAAATGGATTGGTCATCCAAGATTTGAGCTCATTCG
TCATGATGTGACAGAACCTCTCATGGTCGAGGTTGATCAAATCTACCATTTAGCATGTCC
TGCATCTCCAATTTTCTACAAATACAACCCTGTTAAGACAATAAAAACAAATGTGATTGG
CACACTTAATATGTTGGGACTAGCTAAGCGAGTTGGAGCAAGAATTTTGCTTACTTCCAC
ATCTGAAGTGTACGGTGATCCTCTTGTTCATCCTCAGACCGAGAGCTACTGGGGAAATGT
AAACCCCATCGATCTGTGTCGCGACAGTAGACTGTTTTGTATGTCTACGGGAAGATGTAG
ACTTAAA*TTGCGGTCTACAAGTCAACGCACAGGTAATTTTTAATTTGCCTGTTGTGTAT
GGAGAATGGGTGGTGAAAG*CTCTTTGTGGGAGTTTGTGGTTGATAAATGGAAAAA

QA 1 716 1 716
DS 

RD RS1BT15JQ 298 0 0
GTGTCGCGACAGTAGACTGTTTTGTATGTCTACGGGAAGATGTAGACTTAAAATTGCGGT
CTACAAGTCAACGCACAGGTAATTTTTAATTTGCCTGTTGTGTATGGAGAATGGGTGGTG
AAAGGCTCTTTGTGGGAGTTTGTGGTTGATAAATGGAAAAAAAGGAGAATGTTCTTTGTG
CATGATGGTTGTACATATGGTGAACTTCTTGAAATGGCACAAGAAGATTATGATCTGGAC
AAGAAAACCGAGAAGGTGGAGCTGACATATTCCTTACCAGACGTACTTTTAGAGAAAA

QA 1 298 1 298
DS 



AS 1 2

CO CL4464Contig1 768 2 2 U
GACCAAACCAAAAAAGCATTAAATCAGAGACTGCAAAAGCAGCTGACTCAAAGAAAGAAG
AGACAGAAGACGCCAAGCCAGTGAAGCCGAAAATCTTTACATACGAGTGTACAGCTTTTC
TTTCAAATCTCAGTGCCAAGGCGCAAGAGGAGGATATACGTAAGTTCTTTAGTGATGTTG
GTGGTGTTGCTTCCATTCGCATTCTCCATGACAAAGGCACTGGAAAACCAAGGGGACTGG
CATACGTTGACTTTGTAGATGATGAGCATCTTGCAGCAGCTATAGCAAAGAACAGAAAGA
TGTTACTTGGTAAGAAGATCAGTATAGCACGGTCAAATCCAAAGAAGGGTAAAAAGGATT
TCACTCGGCGTGGAAATGAAGGTTCGGGGAATTCAAAGGACACATCCCAGGTTTCTGACA
AAGCGAAAGCACCTCTTGATGCGGAAACAGAGGGTGAAAAGCGAGGAAATGAAGTGGAGT
TGAGGGGTAAGAACACGTTTGCTGTCCCGAGAAATGTTAAAGCACTCGGTTTCACGACAC
CCAAACCCATCGCAGCAGATGAGACGCCAAAATCAAATGACGAGTTCAGGAATATGTTCC
TTAAAAAGTAAGGCTTTGGTCCCTTTTTTTCCCCCTGGATACAACGTTCTTGTTCTACTT
TTCTTAATGCACTCTGAAGCAATCTTATGTTGTAAACTGACAATATCGCATCTGAGACTC
TCTCGTTTGTTAAGATAATTAGATAATACAATATGAAGTTGTTATTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1G748TF U 1
AF RS1G748JQ C 193
BS 1 524 RS1G748TF
BS 525 768 RS1G748JQ

RD RS1G748TF 524 0 0
GACCAAACCAAAAAAGCATTAAATCAGAGACTGCAAAAGCAGCTGACTCAAAGAAAGAAG
AGACAGAAGACGCCAAGCCAGTGAAGCCGAAAATCTTTACATACGAGTGTACAGCTTTTC
TTTCAAATCTCAGTGCCAAGGCGCAAGAGGAGGATATACGTAAGTTCTTTAGTGATGTTG
GTGGTGTTGCTTCCATTCGCATTCTCCATGACAAAGGCACTGGAAAACCAAGGGGACTGG
CATACGTTGACTTTGTAGATGATGAGCATCTTGCAGCAGCTATAGCAAAGAACAGAAAGA
TGTTACTTGGTAAGAAGATCAGTATAGCACGGTCAAATCCAAAGAAGGGTAAAAAGGATT
TCACTCGGCGTGGAAATGAAGGTTCGGGGAATTCAAAGGACACATCCCAGGTTTCTGACA
AAGCGAAAGCACCTCTTGATGCGGAAACAGAGGGTGAAAAGCGAGGAAATGAAGTGGAGT
TGAGGGGTAAGAACACGTTTGCTGTCCCGAGAAATGTTAAAGCA

QA 1 524 1 524
DS 

RD RS1G748JQ 576 0 0
CCATTCGCATTCTCCATGACAAAGGCACTGGAAAACCAAGGGGACTGGCATACGTTGACT
TTGTAGATGATGAGCATCTTGCAGCAGCTATAGCAAAGAACAGAAAGATGTTACTTGGTA
AGAAGATCAGTATAGCACGGTCAAATCCAAAGAAGGGTAAAAAGGATTTCACTCGGCGTG
GAAATGAAGGTTCGGGGAATTCAAAGGACACATCCCAGGTTTCTGACAAAGCGAAAGCAC
CTCTTGATGCGGAAACAGAGGGTGAAAAGCGAGGAAATGAAGTGGAGTTGAGGGGTAAGA
ACACGTTTGCTGTCCCGAGAAATGTTAAAGCACTCGGTTTCACGACACCCAAACCCATCG
CAGCAGATGAGACGCCAAAATCAAATGACGAGTTCAGGAATATGTTCCTTAAAAAGTAAG
GCTTTGGTCCCTTTTTTTCCCCCTGGATACAACGTTCTTGTTCTACTTTTCTTAATGCAC
TCTGAAGCAATCTTATGTTGTAAACTGACAATATCGCATCTGAGACTCTCTCGTTTGTTA
AGATAATTAGATAATACAATATGAAGTTGTTATTGC

QA 1 576 1 576
DS 



AS 1 2

CO CL4465Contig1 831 2 6 U
ACTCTGTCCAAGAGATCTGTAGCTGCACATCCATGGCACGACTTTGAGATCGGTCCTGAA
GCTCCATTGGTCTTCAATGTGGTGGTTGAGATCACAAAGGGAAGCAAAGTGAAGTATGAA
CTTGACAAAAAGACCGGTCTTATCAAGGTTGACCGGATCTTGTACTCATCGGTTGTTTAT
CCTCACAACTATGGATTCATTCCAAGGACATTGTGTGAAGACAACGATCCTCTCGATGTT
CTTGTCCTTATGCAGGAACCAGTGCTTCCAGGATGTTTTCTCCGCGCTAGAGCCATTGGA
TTAATGCCCATGATTGATCAGGGAGAGATGGACGACAAGATCATAGCGGTCTGTGCTGAT
GATCCTGAGTACAGACATTTCACTGACATCAAGCAACTCGCTCCTCACCGTCTCTCAGAG
ATCCGTCGTTTCTTCGAAGACTACAAGAAGAACGAGCACAAGGAGGTGGCTGTAAACGAT
TTCTTGCCATCGGAAAAGGCACATGAAGCAATCCAGTACTCCATGGACCTATACGCTGAG
TACATTCTCCATAGCTTGAGGAGATGAACGTACGCACAAGCTGCATATTTATATTCCCTT
ACGGCGAAAGGGATCATTCTTGGCAGCAGAATATTGTTTTAAATAATTATATTTGAATAT
TACAGTTTTTTCTTGTTATTTTTGTTGTTGTTCTTTCTTGAGATGTTGCAATTTTGTTAT
ATTGTATAGTTTGAAACTGATACAAGGACGAATGTATTTTTCATTCTTTCCTTGTCATGT
TAACTTGGATACTAATGGGCTTTATAAGCTCATATGGCCCAAATAAACTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BV66TF U 1
AF RS1BV66JQ C 236
BS 1 498 RS1BV66TF
BS 499 499 RS1BV66JQ
BS 500 528 RS1BV66TF
BS 529 529 RS1BV66JQ
BS 530 545 RS1BV66TF
BS 546 831 RS1BV66JQ

RD RS1BV66TF 546 0 0
ACTCTGTCCAAGAGATCTGTAGCTGCACATCCATGGCACGACTTTGAGATCGGTCCTGAA
GCTCCATTGGTCTTCAATGTGGTGGTTGAGATCACAAAGGGAAGCAAAGTGAAGTATGAA
CTTGACAAAAAGACCGGTCTTATCAAGGTTGACCGGATCTTGTACTCATCGGTTGTTTAT
CCTCACAACTATGGATTCATTCCAAGGACATTGTGTGAAGACAACGATCCTCTCGATGTT
CTTGTCCTTATGCAGGAACCAGTGCTTCCAGGATGTTTTCTCCGCGCTAGAGCCATTGGA
TTAATGCCCATGATTGATCAGGGAGAGATGGACGACAAGATCATAGCGGTCTGTGCTGAT
GATCCTGAGTACAGACATTTCACTGACATCAAGCAACTCGCTCCTCACCGTCTCTCAGAG
ATCCGTCGTTTCTTCGAAGACTACAAGAAGAACGAGCACAAGGAGGTGGCTGTAAACGAT
TTCTTGCCATCGGAAAAG*CACATGAAGCAATCCAGTACTCCATGGAC*TATACGCTGAG
TACAT
C

QA 1 545 1 545
DS 

RD RS1BV66JQ 596 0 0
ATGTTCTTGTCCTTATGCAGGAACCAGTGCTTCCAGGATGTTTTTTCCGCGCTAGAGCCA
TTGGATTAATGCCCATGATTGATCAGGGAGAGATGGACGACAAGATCATAGCGGTCTGTG
CTGATGATCCTGAGTACAGACATTTCACTGACATCAAGCAACTCGCTCCTCACCGTCTTT
CAGAGATCCGTCGTTTTTTCGAAGACTACAAGAAGAACGAGCACAAGGAGGTGGCTGTAA
ACGATTTCTTGCCATCGGAAAAGGCACATGAAGCAATCCAGTACTCCATGGACCTATACG
CTGAGTACATTCTCCATAGCTTGAGGAGATGAACGTACGCACAAGCTGCATATTTATATT
CCCTTACGGCGAAAGGGATCATTCTTGGCAGCAGAATATTGTTTTAAATAATTATATTTG
AATATTACAGTTTTTTCTTGTTATTTTTGTTGTTGTTCTTTCTTGAGATGTTGCAATTTT
GTTATATTGTATAGTTTGAAACTGATACAAGGACGAATGTATTTTTCATTCTTTCCTTGT
CATGTTAACTTGGATACTAATGGGCTTTATAAGCTCATATGGCCCAAATAAACTGG

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 2

CO CL4466Contig1 1165 2 4 U
GGATCGATCATCCGATCGTCTCAACAATCAATTTTCGCACACAAAAGAGACAGATCTGTG
GTTTGTTTACTTATAATCATCGTACCAAGAAGCTACGAAAGTCGAAAGGTCTCGACCCTA
TCTTCAGTAACCAAGTGAGAAGGAGAGCGAAAATCAAAAGATGAAGGCGGCGCAGAAGCC
GATCCACGCCGTGACGACATGGGTTCGCCGGCAACCACCAAAGGTCAAAGCTTTTCTCGC
CGTTGTATCCGCCATGGCTGCTCTCGTCCTCTTGAGAATGATCGTTCACGACCACGACAA
CCTTTTCGTCGCCGCCGAAGCTGTCCACGCCCTCGGAATCTCCGTCCTCATCTACAAACT
CACCAAGGAGAAGACTTGCGCCGGATTGTCTTTGAAGTCTCAAGAGTTAACAGCTCTGTT
TCTGGCTGTGAGACTTTACTGTAGCTTTGTGATGGAGTTTGATATCCACACGTTGCTTGA
TTCGGCTACTTTGGTGACTACCCTTTGGGTTATCTACATGATCCGTTTCAAGCTCAAAGC
TAGTTACATGGAAGACAAAGACAATTTTGCAATCTACTACGTTGTTGTACCATGTGCTGT
TTTATCAGTTCTGATTCACCCGTCAACACATCACCATATAATCAATAAGATCTCTTGGGC
CTTCTGCGTGTACCTTGAAGCTGTTTCGGTTCTTCCTCAGCTTAGAGTCATGCAAAACAC
TAAGATCGTGGAGCCGTTCACAGCACATTACGTGTTTGCATTGGGGATAGCTAGGTTCTT
GAGCTGTGCGCATTGGGTCCTTCAGGTCTTGGACACTCGAGGGAGGTTACTGACTGCTTT
AGGATATGGGTTTTGGCCTATAATGGTCCTCATCTCTGAAGTCATACAAACCTTCATTCT
CGCTGACTTCTGCTACTACTATGTCAAGAGTTTGATGGGTGGCCAGCTTGTTCTTCGTCT
GCCGTCAGGTGTTGTGTAAAATCTGTTGAAGAAGAGAGAAGAAGACACGGTATGGCTTTT
AAGCTTAGTATGGAGTTTGGCTCTATGTTTCTTTTTTGCAGACCATCGTTTTAGTCTACT
GTAAACTCCTTTTCTCATACGTTTTATGTTTTGTTTCTTGGATGTAAAGGAAAAGGGAGT
TGATTTAGAGACTTTTGACAATACT


BQ
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AF RS1FF36TF U 1
AF RS1FF36JQ C 607
BS 1 716 RS1FF36TF
BS 717 717 RS1FF36JQ
BS 718 765 RS1FF36TF
BS 766 1165 RS1FF36JQ

RD RS1FF36TF 765 0 0
GGATCGATCATCCGATCGTCTCAACAATCAATTTTCGCACACAAAAGAGACAGATCTGTG
GTTTGTTTACTTATAATCATCGTACCAAGAAGCTACGAAAGTCGAAAGGTCTCGACCCTA
TCTTCAGTAACCAAGTGAGAAGGAGAGCGAAAATCAAAAGATGAAGGCGGCGCAGAAGCC
GATCCACGCCGTGACGACATGGGTTCGCCGGCAACCACCAAAGGTCAAAGCTTTTCTCGC
CGTTGTATCCGCCATGGCTGCTCTCGTCCTCTTGAGAATGATCGTTCACGACCACGACAA
CCTTTTCGTCGCCGCCGAAGCTGTCCACGCCCTCGGAATCTCCGTCCTCATCTACAAACT
CACCAAGGAGAAGACTTGCGCCGGATTGTCTTTGAAGTCTCAAGAGTTAACAGCTCTGTT
TCTGGCTGTGAGACTTTACTGTAGCTTTGTGATGGAGTTTGATATCCACACGTTGCTTGA
TTCGGCTACTTTGGTGACTACCCTTTGGGTTATCTACATGATCCGTTTCAAGCTCAAAGC
TAGTTACATGGAAGACAAAGACAATTTTGCAATCTACTACGTTGTTGTACCATGTGCTGT
TTTATCAGTTCTGATTCACCCGTCAACACATCACCATATAATCAATAAGATCTCTTGGGC
CTTCTGCGTGTACCTTGAAGCTGTTTCGGTTCTTCCTCAGCTTAGAGTCATGCAAA*CAC
TAAGATCGTGGAGCCGTTCACAGCACATTACGTGTTTGCATTGGG

QA 1 765 1 765
DS 

RD RS1FF36JQ 559 0 0
AGTTCTGATTCACCCGTCAACACATCACCATATAATCAATAAGATCTCTTGGGCCTTCTG
CGTGTACCTTGAAGCTGTTTCGGTTCTTCCTCAGCTTAGAGTCATGCAAAACACTAAGAT
CGTGGAGCCGTTCACAGCACATTACGTGTTTGCATTGGGGATAGCTAGGTTCTTGAGCTG
TGCGCATTGGGTCCTTCAGGTCTTGGACACTCGAGGGAGGTTACTGACTGCTTTAGGATA
TGGGTTTTGGCCTATAATGGTCCTCATCTCTGAAGTCATACAAACCTTCATTCTCGCTGA
CTTCTGCTACTACTATGTCAAGAGTTTGATGGGTGGCCAGCTTGTTCTTCGTCTGCCGTC
AGGTGTTGTGTAAAATCTGTTGAAGAAGAGAGAAGAAGACACGGTATGGCTTTTAAGCTT
AGTATGGAGTTTGGCTCTATGTTTCTTTTTTGCAGACCATCGTTTTAGTCTACTGTAAAC
TCCTTTTCTCATACGTTTTATGTTTTGTTTCTTGGATGTAAAGGAAAAGGGAGTTGATTT
AGAGACTTTTGACAATACT

QA 1 559 1 559
DS 



AS 1 2

CO CL4467Contig1 1308 2 2 U
GAGAGACTGTTCACAAGTCTCTCGTTTCATATGAACCTAAGGTTCTAGATAGTTTTCAAC
TCAGCTTCGGATCAGATAAAGCTGATGCAGTAGATGTTGTACATTGGATTAAAACTGCGT
TTGCTCTAAATTTGCGTACACTGGTACTCCAATTCCTCATCGAGCCATTCGAGGTCTACG
AATTCGTATTTCCGAGTTGCTTGTGTACTTGTGATACACTAGAGACTTTGGAACTCGGGA
GTCTGATTCGTGTAGATCTCCCTGCACCCGGTTCGATGAAGTCTCTAAAAACGCTACGTC
TTATTCAAACGTTCTACACAAACGATGAATCTATTTGTAACCTTTTATCTAGCTGTCCTA
GACTTGAAGAACTCATTGTGGAACGATCTTACGATTATAATGTGAACTTATTCACAATCA
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CAGTGAATCTATCGTTTCAGTCAGATGTCTTGTCTTGAATGTATCAACTTCGGAGGTAAC
TTCTTATATTTCCACTTTAATTGTTTTTGGTTATCTCATTGTTTGTATATATTTTTAATT
TCGTCTCATGGATAGACTATATATCCTCCTACTGGATGTATCTTCTATCAACTGGTATAT
CTACAGATATATACGCATGAACCAGGCTGGTATGATCTACTTACTTGGATGCTCGAACAT
TCACTTAAACTACAAGTCTTGAAGCTCGTTGGTATATATATGAGTAATCCTGATTATCAT
GTGCTCGGCTGGGAATGGAATAAGCCAAAATGTGTTCCTGAATGTTTGTTGTCACATCTA
GAGACATTTGTGTGGAGAAGATACGATTGGAAAAGAGAAAAGGAAGAAGAAGTGGCTACA
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ATACTTACAGTATAAAGAGTGAACAAAATATTTCTGCTTTTAGTTTAATCGGTTATCGTT
TTGGACTTTTTCAAAAAGTTTTCTCAATTTTATTCCTTTTGCTTTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AK15TF U 1
AF RS1AK15JQ C 498
BS 1 651 RS1AK15TF
BS 652 1308 RS1AK15JQ

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CAGTGAATCTATCGTTTCAGTCAGATGTCTTGTCTTGAATGTATCAACTTC

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DS 

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TAATTGTTTTTGGTTATCTCATTGTTTGTATATATTTTTAATTTCGTCTCATGGATAGAC
TATATATCCTCCTACTGGATGTATCTTCTATCAACTGGTATATCTACAGATATATACGCA
TGAACCAGGCTGGTATGATCTACTTACTTGGATGCTCGAACATTCACTTAAACTACAAGT
CTTGAAGCTCGTTGGTATATATATGAGTAATCCTGATTATCATGTGCTCGGCTGGGAATG
GAATAAGCCAAAATGTGTTCCTGAATGTTTGTTGTCACATCTAGAGACATTTGTGTGGAG
AAGATACGATTGGAAAAGAGAAAAGGAAGAAGAAGTGGCTACATATATCCTAAAGAATGC
ACGAGGGTTGAAGAATGCAACTTTCACTACAGATCCCATTGAACCGGGCCAGCTTGACAA
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ATGCCACCTTGTGTTCAAGTTTGAATAATTTCAAAAGAATTTTATACTTACAGTATAAAG
AGTGAACAAAATATTTCTGCTTTTAGTTTAATCGGTTATCGTTTTGGACTTTTTCAAAAA
GTTTTCTCAATTTTATTCCTTTTGCTTTCAG

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 2

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GGGATGAAAGTGCAACAGAATAATGCCTTGGAAGAGAAGAAACGCATGTCAAATCAACAG
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CGCTCTCAGTCTGCTAACACAAATGTGTTACCTGTCTCTACGATGAATCCATCCTTCACC
GTAGCATCAGCATCAGCAGCAGCAGTAGGAGTAGGAGGAGGCAGCGGTTGGTACCCTGCA
AATAGTCAATCTAATAACGGGTACTTGCCCACAAGAAGTCTGCCTCCTAGTGATCTGAAC
TCGAACCTGATGTACCAGCAACTTCAGTATCAGCAGCAGCAATATCAAGGCCAAGGGAGC
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GCGGATGGGTCAATAGGGAAATATGATTATAACAAAATTGATTGGAGTTTAGACAGAGGC
CTAGCTTGTCCGAGACCAGACCAACAAGAGTATGTGGCTGCTGCATCATCCCCTTATGAA
GCAGAGATGAATGGAAGGACAAGAATGAATGGGAATGGGAATGTGAATGGGATGGGAGTA
GTGCAGGAAGCTGCTTTAGTTGGGAACGGTGGGAGGGAATGGACATCACCGTTTGAGGGT
AAAGATCTGTTTGGTTTGTCTAGACAGTATGTGCCTCCTTCTCTTTGAAGGTGAATGTTT
GCTTCTAGAATAATAATTAAAAAAAAAATGCAAGGGGAGAGAGAGAGTGAGAGAGATAAT
GGATGAATGGTATGAGTTTGTGGTTACTAGTTTTTATCAAAAGTGTTTTCTTGCTTGTTT
GCCC


BQ
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10 10 10 10 

AF RS1BT56TF U 1
AF RS1BT56JQ C 357
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BS 678 678 RS1BT56JQ
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BS 708 726 RS1BT56TF
BS 727 964 RS1BT56JQ

RD RS1BT56TF 729 0 0
GGGATGAAAGTGCAACAGAATAATGCCTTGGAAGAGAAGAAACGCATGTCAAATCAACAG
ACACCATTGCCGCAGCTGCGGCCAACAGAAGATACGCATCATGTGGCGGCTCTAGGGAGA
CTACAGCAGCAAGATATGAGGGAACCAGTTATTGTGATGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAA
CGCTCTCAGTCTGCTAACACAAATGTGTTACCTGTCTCTACGATGAATCCATCCTTCACC
GTAGCATCAGCATCAGCAGCAGCAGTAGGAGTAGGAGGAGGCAGCGGTTGGTACCCTGCA
AATAGTCAATCTAATAACGGGTACTTGCCCACAAGAAGTCTGCCTCCTAGTGATCTGAAC
TCGAACCTGATGTACCAGCAACTTCAGTATCAGCAGCAGCAATATCAAGGCCAAGGGAGC
AACGGACACACAATGGGAGGAGGGGTTTCTGCACCACCACCGCATACTGTGGCTCCAGCT
GCTTCTCTTGGGCTCTTCTCCGGGTATGGATCAGCTTCCTCGTCAGGGATAGACTGGAGC
GCGGATGGGTCAATAGGGAAATATGATTATAACAAAATTGATTGGAGTTTAGACAGAGGC
CTAGCTTGTCCGAGACCAGACCAACAAGAGTATGTGGCTGCTGCATCATCCCCTTATGAA
GCAGAGATGAATGGAAG*ACAAGA*TGAATGGGAATGGGA*TGTGA*TGGGATGGGAGTA
GTGCAG
AGC

QA 1 726 1 726
DS 

RD RS1BT56JQ 608 0 0
GAACTCGAACCTGATGTACCAGCAACTTCAGTATCAGCAGCAGCAATATCAAGGCCAAGG
GAGCAACGGACACACAATGGGAGGAGGGGTTTTTGCACCACCACCGCATACTGTGGCTCC
AGCTGCTTTTCTTGGGTTTTTTTCCGGGTATGGATCAGCTTCCTCGTCAGGGATAGACTG
GAGCGCGGATGGGTCAATAGGGAAATATGATTATAACAAAATTGATTGGAGTTTAGACAG
AGGCCTAGCTTGTCCGAGACCAGACCAACAAGAGTATGTGGCTGCTGCATCATCCCCTTA
TGAAGCAGAGATGAATGGAAGGACAAGAATGAATGGGAATGGGAATGTGAATGGGATGGG
AGTAGTGCAGGAAGCTGCTTTAGTTGGGAACGGTGGGAGGGAATGGACATCACCGTTTGA
GGGTAAAGATCTGTTTGGTTTGTCTAGACAGTATGTGCCTCCTTCTCTTTGAAGGTGAAT
GTTTGCTTCTAGAATAATAATTAAAAAAAAAATGCAAGGGGAGAGAGAGAGTGAGAGAGA
TAATGGATGAATGGTATGAGTTTGTGGTTACTAGTTTTTATCAAAAGTGTTTTCTTGCTT
GTTTGCCC

QA 1 608 1 608
DS 



AS 1 2

CO CL4469Contig1 929 2 6 U
GGGGATGATTTCCATGACAGCCTCGGTCTTTACCAGTATATTTGGACGTTGGGTTTCATC
TCCGACCAAACGTACAGCTTACTGAAACTCAAGTGTGGTTTGGGACCGTTTGTTCACACC
TCCGAAGTGTGTCTTAAGGCTCTGGAGATAATGGACATGGAAATAGGTGACATAGACCAA
TACAGCGTTTTCACCCCAGCCTGTACTGCGAATGCATCCCATTCCCAATCAAAAATGTTG
CTGAAGAAGAAAAGAGCAGTAGGTGGCCGCCGTGTGAGTGAAGAGTACGATCCTTGCACG
ATGAAACACTCCGAAGTGTATTTTAGTCTCCCGGAGGTTCAAGAAGCTCTCCATGTCCCA
CCAGGACTTGCACCATCCAAATGGCATACTTGCAGTGATGTTGTGGGTGATAACTGGAAG
GACTCTCCTTCCTCGGTTCTGAACATTTACCACGAGCTTATAGCTTCAGGGCTACGTATA
TGGGTGTTCAGTGGAGACGCAGATGCTGTTGTACCAGTCACATCAACTCGGTACAGCATA
GACGCTCTAAAAATTCGTCCAGTGAGTCCCTATGGTCCTTGGTACATAGACGGACAGGTG
GGAGGGTGGACTCAGGAGTATGATGGTCTAAACTTTGTGACTATGAGAGGTGCAGGCCAT
GAAGTTCCTTTGCACAGACCGAAGGAGGCTCTTGCGCTCTTCAAGGCCTTTATCTCTGGA
ACTTCATTGCCAACACTAGAGAACAGCATCAGCAGAGAGAAGTCCGAACTCGTTAGTAAC
TCATGATGGGTTGTGTGATGATTCTCAGTCGGAAAGTTGCAGTCGCTGTATGGAACTAGT
AAAGAGAATAAAGTAAGAACTGTAAGCGTTAGGTTCGTGAGTTCGTCTTCTGATTGTTTT
TGTTTTGAAACATGCAATGTTGGATTCTG


BQ
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AF RS1CK86TF U 1
AF RS1CV62TF U 272
BS 1 287 RS1CK86TF
BS 288 288 RS1CV62TF
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BS 457 457 RS1CV62TF
BS 458 611 RS1CK86TF
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RD RS1CK86TF 611 0 0
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TCCGACCAAACGTACAGCTTACTGAAACTCAAGTGTGGTTTGGGACCGTTTGTTCACACC
TCCGAAGTGTGTCTTAAGGCTCTGGAGATAATGGACATGGAAATAGGTGACATAGACCAA
TACAGCGTTTTCACCCCAGCCTGTACTGCGAATGCATCCCATTCCCAATCAAAAATGTTG
CTGAAGAAGAAAAGAGCAGTAGGTGGCCGCCGTGTGAGTGAAGAGTATGATCCTTGCACG
ATGAAACACTCCGAAGTGTATTTTAGTCTCCCGGAGGTTCAAGAAGCTCTCCATGTCCCA
CCAGGACTTGCACCATCCAAATGGCATACTTGCAGTGATGTTGTGGGTGATAACTGGAAG
GACTCTCCTTCCTCGGTTCTGAACATTTACCACGAGTTTATAGCTTCAGGGCTACGTATA
TGGGTGTTCAGTGGAGACGCAGATGCTGTTGTACCAGTCACATCAACTCGGTACAGCATA
GACGCTCTAAAAATTCGTCCAGTGAGTCCCTATGGTCCTTGGTACATAGACGGACAGGTG
GGAGGGTGGAC

QA 1 611 1 611
DS 

RD RS1CV62TF 658 0 0
GG
GTGAGTGAAGAGTACGATCCTTGCACGATGAAACACTCCGAAGTGTATTTTAGTCTCCCG
GAGGTTCAAGAAGCTCTCCATGTCCCACCAGGACTTGCACCATCCAAATGGCATACTTGC
AGTGATGTTGTGGGTGATAACTGGAAGGACTCTCCTTCCTCGGTTCTGAACATTTACCAC
GAGCTTATAGCTTCAGGGCTACGTATATGGGTGTTCAGTGGAGACGCAGATGCTGTTGTA
CCAGTCACATCAACTCGGTACAGCATAGACGCTCTAAAAATTCGTCCAGTGAGTCCCTAT
GGTCCTTGGTACATAGACGGACAGGTGGGAGGGTGGACTCAGGAGTATGATGGTCTAAAC
TTTGTGACTATGAGAGGTGCAGGCCATGAAGTTCCTTTGCACAGACCGAAGGAGGCTCTT
GCGCTCTTCAAGGCCTTTATCTCTGGAACTTCATTGCCAACACTAGAGAACAGCATCAGC
AGAGAGAAGTCCGAACTCGTTAGTAACTCATGATGGGTTGTGTGATGATTCTCAGTCGGA
AAGTTGCAGTCGCTGTATGGAACTAGTAAAGAGAATAAAGTAAGAACTGTAAGCGTTAGG
TTCGTGAGTTCGTCTTCTGATTGTTTTTGTTTTGAAACATGCAATGTTGGATTCTG

QA 3 658 3 658
DS 



AS 1 2

CO CL4470Contig1 631 2 4 U
TTTTTGCATCTAAAGGCGGTGCTGCAAAATACATCGCCGACATTCGAGGCTTCCCTGCCG
TGTTCGCCAATACCCTGTGCCTCACGCTAGTGAACCTCCCATTCGTCAATGCCTATAAGT
ATTAACAAAAGATATGTTAATTTAAGTAGAGGATCTTGGTTTATGATTTTAGTTAGGAAA
CAGTTGCGTGTGATAGATATTAATCTTGTTTTAATAGTGAAAGGCGATCTGACCAAAATT
AATCACCTATAAGAATATAATTAGTGTTGATTAAATGTATTTACCTGAAGGCAGTCACCG
ACCAATACGTAAAAGCATGTAGGGTCAGATGGGACTGGCACCCACAAGCCGTCTTGTGAG
CAAATCTCAAGTCCATCTACGTCGTTGGATCTTAACACCGTCAAGATTTGAGGGTCAGAA
TGCTCGCCGAAGCCTATTTGGCTAACGCCTCTTAGCGCATACGGTGCAGGTGGATAGAGG
TTCAACCGTAGGATTGAGTCGCTACGGACGTTTCTGATAAGCTCGCTCACATCGCTAGAT
TTATGGCCCCACAGATCCTCGGCCGTCAGATCAATTATCTCGCATGCTAGATCTTTAACA
GCGCGTATGTAATCATTCGTGGCCGAACTAC


BQ
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AF RS1GN43TF U 1
AF RS1GN43JQ C 12
BS 1 324 RS1GN43TF
BS 325 325 RS1GN43JQ
BS 326 348 RS1GN43TF
BS 349 631 RS1GN43JQ

RD RS1GN43TF 348 0 0
TTTTTGCATCTAAAGGCGGTGCTGCAAAATACATCGCCGACATTCGAGGCTTCCCTGCCG
TGTTCGCCAATACCCTGTGCCTCACGCTAGTGAACCTCCCATTCGTCAATGCCTATAAGT
ATTAACAAAAGATATGTTAATTTAAGTAGAGGATCTTGGTTTATGATTTTAGTTAGGAAA
CAGTTGCGTGTGATAGATATTAATCTTGTTTTAATAGTGAAAGGCGATCTGACCAAAATT
AATCACCTATAAGAATATAATTAGTGTTGATTAAATGTATTTACCTGAAGGCAGTCACCG
ACCAATACGTAAAAGCATGTAGGG*CAGATGGGACTGGCACCCACAAG

QA 1 348 1 348
DS 

RD RS1GN43JQ 620 0 0
AAAGGCGGTGCTGCAAAATACATCGCCGACATTCGAGGCTTCCCTGCCGTGTTCGCCAAT
ACCCTGTGCCTCACGCTAGTGAACCTCCCATTCGTCAATGCCTATAAGTATTAACAAAAG
ATATGTTAATTTAAGTAGAGGATCTTGGTTTATGATTTTAGTTAGGAAACAGTTGCGTGT
GATAGATATTAATCTTGTTTTAATAGTGAAAGGCGATCTGACCAAAATTAATCACCTATA
AGAATATAATTAGTGTTGATTAAATGTATTTACCTGAAGGCAGTCACCGACCAATACGTA
AAAGCATGTAGGGTCAGATGGGACTGGCACCCACAAGCCGTCTTGTGAGCAAATCTCAAG
TCCATCTACGTCGTTGGATCTTAACACCGTCAAGATTTGAGGGTCAGAATGCTCGCCGAA
GCCTATTTGGCTAACGCCTCTTAGCGCATACGGTGCAGGTGGATAGAGGTTCAACCGTAG
GATTGAGTCGCTACGGACGTTTCTGATAAGCTCGCTCACATCGCTAGATTTATGGCCCCA
CAGATCCTCGGCCGTCAGATCAATTATCTCGCATGCTAGATCTTTAACAGCGCGTATGTA
ATCATTCGTGGCCGAACTAC

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 2

CO CL4471Contig1 1141 2 4 U
GGCACAAAAGCCCTCTTTCAAGATCGGTGATTGCATAGCCAGAGCTGCCAGTCAGATGGC
AGGATCTCCTTCAGTTCTCAAGGGTAGTAACCTTGGTGATGAAACTCTTTCTGTGGAGAG
TTTTGTATCCCAGCTTCACTCTGCAGCAACAGACCCTGTAAAAGAGAACCTTGTGTCTGA
AATGGCCACTGGCTTTTTCTTAGACTTCCGAAACTCATCGGCCTCGCAGCAGTATGTTCC
AGAGAAGGCAAGCAGTAAAAGAGGTAGACCATCCAATTCGAATGCAGGAGGAGGAACTGA
AGCATTTGAGTTTGAGGAAATGGGAGACACGTACTGGACTGACAGGGTGATCCATAACGG
TGGTGAAGAGCAAACGCCAGCTGCTACTGAGAAAGAAAACTATCAAGTTGTGCCGGTTGA
GCTGAAACCTGCTCAGGTCAAAAAGACTCGTCGTCCATACAGAAGAAGACGGTCTCAGAT
CAGTTATCCCCTTCCTTCAGCTTCAGACAAACCAGCGGACTTTGATGAGAATGCACCAGC
TGAGCTTATAATGTACTTTTCTGAAACGGATACAATACCTTCTGAGAAGAGCCTGAGTAA
AATGTTCAGGCATTTTGGACCAATAAGGGATTCACAGACTGAGGTTGATGAGGAGAAAAA
CCGGGCTAGGGTAGTTTTCAGGAAGGGTGGTGATGCGGAGGTTGCTTACAAGAGCGCAGG
AAAGTTCAACATCTTTGGGACGAAGACTGTGAATTATGAGCTCAGCTTTACAATCACTGA
AGCATTCAAAGTTCAGCCTTACGTTGTGTCTTTAGGCGAGGAGGAAGCAGTGGTATCTCT
TCCTTCTTAGATGTAGTTCTGATTCAGGCAGGCAGGCAGGGTTTTCAGGTGAAAAGAATT
GGCAGGCATCAAAAGAAGTAAACGATGAAGTGGAAGGCTTTGCTTGTATCTCTGTTAGAG
AGTGAAATTTAGACTGTGTAATAAGTTTGAGACAATAATATGTATCTTCTAGAGACCAGA
GATGTTGATTTTGTTTTGTAATATGACGAGGCTAGAGAGGTAAATCATTTTTTTTTCATG
TTCTTATTGGTAACAAAACTTTTGAGTTGGTGTTGTTTAATCAAGTGATGTTAGGAGTGT
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1AL75TF U 1
AF RS1AL75JQ C 476
BS 1 719 RS1AL75TF
BS 720 720 RS1AL75JQ
BS 721 812 RS1AL75TF
BS 813 1141 RS1AL75JQ

RD RS1AL75TF 812 0 0
GGCACAAAAGCCCTCTTTCAAGATCGGTGATTGCATAGCCAGAGCTGCCAGTCAGATGGC
AGGATCTCCTTCAGTTCTCAAGGGTAGTAACCTTGGTGATGAAACTCTTTCTGTGGAGAG
TTTTGTATCCCAGCTTCACTCTGCAGCAACAGACCCTGTAAAAGAGAACCTTGTGTCTGA
AATGGCCACTGGCTTTTTCTTAGACTTCCGAAACTCATCGGCCTCGCAGCAGTATGTTCC
AGAGAAGGCAAGCAGTAAAAGAGGTAGACCATCCAATTCGAATGCAGGAGGAGGAACTGA
AGCATTTGAGTTTGAGGAAATGGGAGACACGTACTGGACTGACAGGGTGATCCATAACGG
TGGTGAAGAGCAAACGCCAGCTGCTACTGAGAAAGAAAACTATCAAGTTGTGCCGGTTGA
GCTGAAACCTGCTCAGGTCAAAAAGACTCGTCGTCCATACAGAAGAAGACGGTCTCAGAT
CAGTTATCCCCTTCCTTCAGCTTCAGACAAACCAGCGGACTTTGATGAGAATGCACCAGC
TGAGCTTATAATGTACTTTTCTGAAACGGATACAATACCTTCTGAGAAGAGCCTGAGTAA
AATGTTCAGGCATTTTGGACCAATAAGGGATTCACAGACTGAGGTTGATGAGGAGAAAAA
CCGGGCTAGGGTAGTTTTCAGGAAGGGTGGTGATGCGGAGGTTGCTTACAAGAGCGCAG*
AAAGTTCAACATCTTTGGGACGAAGACTGTGAATTATGAGCTCAGCTTTACAATCACTGA
AGCATTCAAAGTTCAGCCTTACGTTGTGTCTT

QA 1 812 1 812
DS 

RD RS1AL75JQ 666 0 0
CAGATCAGTTATCCCCTTCCTTCAGCTTCAGACAAACCAGCGGACTTTGATGAGAATGCA
CCAGCTGAGCTTATAATGTACTTTTCTGAAACGGATACAATACCTTCTGAGAAGAGCCTG
AGTAAAATGTTCAGGCATTTTGGACCAATAAGGGATTCACAGACTGAGGTTGATGAGGAG
AAAAACCGGGCTAGGGTAGTTTTCAGGAAGGGTGGTGATGCGGAGGTTGCTTACAAGAGC
GCAGGAAAGTTCAACATCTTTGGGACGAAGACTGTGAATTATGAGCTCAGCTTTACAATC
ACTGAAGCATTCAAAGTTCAGCCTTACGTTGTGTCTTTAGGCGAGGAGGAAGCAGTGGTA
TCTCTTCCTTCTTAGATGTAGTTCTGATTCAGGCAGGCAGGCAGGGTTTTCAGGTGAAAA
GAATTGGCAGGCATCAAAAGAAGTAAACGATGAAGTGGAAGGCTTTGCTTGTATCTCTGT
TAGAGAGTGAAATTTAGACTGTGTAATAAGTTTGAGACAATAATATGTATCTTCTAGAGA
CCAGAGATGTTGATTTTGTTTTGTAATATGACGAGGCTAGAGAGGTAAATCATTTTTTTT
TCATGTTCTTATTGGTAACAAAACTTTTGAGTTGGTGTTGTTTAATCAAGTGATGTTAGG
AGTGTC

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

CO CL4472Contig1 1064 2 4 U
GCTTCTGAGGATAAGAGGAAGGCTACGACTTCAGGCAAACTTCTTGATGCTAAGACATTG
AGACGTTTGGCCCAAAATAGAGAAGCTGCTCGCAAAAGCCGTCTTAGGAAAAAGGCTTAC
GTGCAACAGCTAGAATCAAGTAGGATAAAACTTTCCCAGTTGGAGCAAGAACTTCAGCGA
GCTCGATCTCAGGGGATGTTTATGGGTGGCTGTGGTCCACCTGGACCTAACATCACTTCC
GGAGCTGCAATGTTTGACATGGAATATGGGAGGTGGCTAGAGGAAGATAACCGGCACATG
TCGGAGATTCGTACCGGTCTTCAGGCTCATTTATCTGACAATGATTTAAGGTTGATCGTT
GACGGTTACATCGCTCACTTTGATGAGGTGTTACGTTTAAAAGCTGTGGCCGCGAAAGCA
GACGTTTTCCACCTCATCATCGGTACATGGATGTCCCCTGCCGAACGCTGTTTTATCTGG
ATGGCCGGATTCCGTCCATCTGACCTCATCAAGATACTTGTGTCGCAAATGGATCTATTG
ACGGAGCAACAACTGATGGGGATATATAGCCTACAACACTCATCGCAACAAGCGGAGGAG
GCTCTCTCGCAAGGACTCGAACAACTTCAGCAATCTCTCATCGATACTCTAGCTGCCTCT
CCCGTCATGGACGGTATGCAACAAATGGCTGTCGCTCTCGGCAAAATCTCTAATCTCGAA
GGCTTTATCCGCCAGGCTGATAACCTGAGGCAGCAAACTGTTCACCAGCTGCGTCGGATT
TTGACCGTTCGCCAAGCCGCACGTTGTTTCCTAGTCATCGGGGAGTATTACGGAAGGCTC
AGAGCTCTTAGCTCTCTTTGGTTGTCTCGACCACGAGAGACGCTGATAAGTGATGAGACA
TCTTGCCAAACGACGACGGAGTTGCAGATGGTTCAATCATCGCGGAACAACTTCTCCAAT
TTCTGAATCGAAATGGAAACCTTGTATGACTAAATGGGCCAAGTTCCTTTGTCTTAAGCT
CACTCTTCTGCTACTCTGTTTCCTTTATGTTGTACTACTAGCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DK23TF U 1
AF RS1DK23JQ C 369
BS 1 600 RS1DK23TF
BS 601 601 RS1DK23JQ
BS 602 705 RS1DK23TF
BS 706 1064 RS1DK23JQ

RD RS1DK23TF 709 0 0
GCTTCTGAGGATAAGAGGAAGGCTACGACTTCAGGCAAACTTCTTGATGCTAAGACATTG
AGACGTTTGGCCCAAAATAGAGAAGCTGCTCGCAAAAGCCGTCTTAGGAAAAAGGCTTAC
GTGCAACAGCTAGAATCAAGTAGGATAAAACTTTCCCAGTTGGAGCAAGAACTTCAGCGA
GCTCGATCTCAGGGGATGTTTATGGGTGGCTGTGGTCCACCTGGACCTAACATCACTTCC
GGAGCTGCAATGTTTGACATGGAATATGGGAGGTGGCTAGAGGAAGATAACCGGCACATG
TCGGAGATTCGTACCGGTCTTCAGGCTCATTTATCTGACAATGATTTAAGGTTGATCGTT
GACGGTTACATCGCTCACTTTGATGAGGTGTTACGTTTAAAAGCTGTGGCCGCGAAAGCA
GACGTTTTCCACCTCATCATCGGTACATGGATGTCCCCTGCCGAACGCTGTTTTATCTGG
ATGGCCGGATTCCGTCCATCTGACCTCATCAAGATACTTGTGTCGCAAATGGATCTATTG
ACGGAGCAACAACTGATGGGGATATATAGCCTACAACACTCATCGCAACAAGCGGAGGAG
*CTCTCTCGCAAGGACTCGAACAACTTCAGCAATCTCTCATCGATACTCTAGCTGCCTCT
CCCGTCATGGACGGTATGCAACAAATGGCTGTCGCTCTCGGCAAA
TCTC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RS1DK23JQ 696 0 0
CATCGCTCACTTTGATGAGGTGTTACGTTTAAAAGCTGTGGCCGCGAAAGCAGACGTTTT
CCACCTCATCATCGGTACATGGATGTCCCCTGCCGAACGCTGTTTTATCTGGATGGCCGG
ATTCCGTCCATCTGACCTCATCAAGATACTTGTGTCGCAAATGGATCTATTGACGGAGCA
ACAACTGATGGGGATATATAGCCTACAACACTCATCGCAACAAGCGGAGGAGGCTCTCTC
GCAAGGACTCGAACAACTTCAGCAATCTCTCATCGATACTCTAGCTGCCTCTCCCGTCAT
GGACGGTATGCAACAAATGGCTGTCGCTCTCGGCAAAATCTCTAATCTCGAAGGCTTTAT
CCGCCAGGCTGATAACCTGAGGCAGCAAACTGTTCACCAGCTGCGTCGGATTTTGACCGT
TCGCCAAGCCGCACGTTGTTTCCTAGTCATCGGGGAGTATTACGGAAGGCTCAGAGCTCT
TAGCTCTCTTTGGTTGTCTCGACCACGAGAGACGCTGATAAGTGATGAGACATCTTGCCA
AACGACGACGGAGTTGCAGATGGTTCAATCATCGCGGAACAACTTCTCCAATTTCTGAAT
CGAAATGGAAACCTTGTATGACTAAATGGGCCAAGTTCCTTTGTCTTAAGCTCACTCTTC
TGCTACTCTGTTTCCTTTATGTTGTACTACTAGCAA

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL4473Contig1 1005 2 4 U
GGTCTACGTTGTTTAGGTTCATGATCCCTCCATTTATATGGAAACCAATGAAGTTTCTGA
ACATAGGGTATGAGAAAGGTCTAAGAAACGCTATTGACGTCGTGCATGGCTTTGTGAACA
AGATGATACTGGATCGTATCTGCATGCTTAAGGATGATGAGACGTTAGATAATAGATCTG
ATGTCCTTACAAGGATTATTCAGATAGAGAGTCATAAAAAAGTCAACGAGATTGGTCCTT
CAACCATTAGGTTTTTTAGACAGTTTTGCACAAGTTTCATCTTAGCTGGGCGTGACACAA
GTTCTGTTGCGCTTTCATGGTTCTTCTGGGTGATACAAAGACACCCACAAGTTAAAAACA
AAATCATCCACGAGATCAGAGAAATCATGAAACAGAGAGGAGATCCTTCAGACAGTAGTC
CCTTCACGGTCAGAGAACTAAACAACATGGTCTATCTTCAAGCAGCAATTTCAGAAACCT
TAAGACTTTACCCACCAATCCCAATGGAGATGAAACAAGCCATTGGAGATGATGTGTTTC
CAGATGGGACATTTATAAAAAAGGGTTCAAGGGTTTACTTCTCTATCTATGCCATGGGAA
GGATGGAATCAATATGGGGGAAAGACTGTGAAATGTTCAGACCAGAGAGGTGGATCCAAG
GAGGGAAGTTTGTCAGTGACGACCAGTTCAAATATGTTGTGTTCAATGCTGGACCTAGGC
TTTGTATAGGGAAAACATTTGCTTACTTGCAAATGAAGATGATAGCTGCTTCAGTCTTGT
TGAAGTACTCAATCAAGGTTGCTCAAGATCATGTTGTTGTCCCGAGAGTTACGACTAACT
TGTACATGAAGTACGGTCTTAAGGTGACCATCACGCCAAGGTTGCCGGAAGAGAAGAAAC
TAGAGTCATGTTTCATGTAGAAAACATTTTAGATTTTACTTACTCAGTTTTTATGATTAA
TAGTTAATACTAATCCTACAATAAAATCATCTTTTGATTTTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1ES02TF U 1
AF RS1G943TF U 415
BS 1 691 RS1ES02TF
BS 692 692 RS1G943TF
BS 693 756 RS1ES02TF
BS 757 1005 RS1G943TF

RD RS1ES02TF 756 0 0
GGTCTACGTTGTTTAGGTTCATGATCCCTCCATTTATATGGAAACCAATGAAGTTTCTGA
ACATAGGGTATGAGAAAGGTCTAAGAAACGCTATTGACGTCGTGCATGGCTTTGTGAACA
AGATGATACTGGATCGTATCTGCATGCTTAAGGATGATGAGACGTTAGATAATAGATCTG
ATGTCCTTACAAGGATTATTCAGATAGAGAGTCATAAAAAAGTCAACGAGATTGGTCCTT
CAACCATTAGGTTTTTTAGACAGTTTTGCACAAGTTTCATCTTAGCTGGGCGTGACACAA
GTTCTGTTGCGCTTTCATGGTTCTTCTGGGTGATACAAAGACACCCACAAGTTAAAAACA
AAATCATCCACGAGATCAGAGAAATCATGAAACAGAGAGGAGATCCTTCAGACAGTAGTC
CCTTCACGGTCAGAGAACTAAACAACATGGTCTATCTTCAAGCAGCAATTTCAGAAACCT
TAAGACTTTACCCACCAATCCCAATGGAGATGAAACAAGCCATTGGAGATGATGTGTTTC
CAGATGGGACATTTATAAAAAAGGGTTCAAGGGTTTACTTCTCTATCTATGCCATGGGAA
GGATGGAATCAATATGGGGGAAAGACTGTGAAATGTTCAGACCAGAGAGGTGGATCCAAG
GAGGGAAGTTTGTCAGTGACGACCAGTTCAA*TATGTTGTGTTCAATGCTGGACCTAGGC
TTTGTATAGGGAAAACATTTGCTTACTTGCAAATGA

QA 1 756 1 756
DS 

RD RS1G943TF 591 0 0
GTAGTCTCTTCACGGTCAGAGAACTAAACAACATGGTCTATCTTCAAGCAGCAATTTCAG
AAACCTTAAGACTTTACCCACCAATCCCAATGGAGATGAAACAAGCCATTGGAGATGATG
TGTTTCCAGATGGGACATTTATAAAAAAGGGTTCAAGGGTTTACTTCTCTATCTATGCCA
TGGGAAGGATGGAATCAATATGGGGGAAAGACTGTGAAATGTTCAGACCAGAGAGGTGGA
TCCAAGGAGGGAAGTTTGTCAGTGACGACCAGTTCAAATATGTTGTGTTCAATGCTGGAC
CTAGGCTTTGTATAGGGAAAACATTTGCTTACTTGCAAATGAAGATGATAGCTGCTTCAG
TCTTGTTGAAGTACTCAATCAAGGTTGCTCAAGATCATGTTGTTGTCCCGAGAGTTACGA
CTAACTTGTACATGAAGTACGGTCTTAAGGTGACCATCACGCCAAGGTTGCCGGAAGAGA
AGAAACTAGAGTCATGTTTCATGTAGAAAACATTTTAGATTTTACTTACTCAGTTTTTAT
GATTAATAGTTAATACTAATCCTACAATAAAATCATCTTTTGATTTTTTAC

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 2

CO CL4474Contig1 1300 2 2 U
CCCTAGTCGTCGTCGTCGTCGGCTCTGTTACTCCGCCGTCCTCGTGTCGGAAACCCAGGT
TCTTCAGCTAACGACCGATCAAACTTGTGATGGCTTCAGCTTCACCGACGGAAGACGGCG
GCGTAAGTAAATTGGAGAAGTTTCTGTGCGAGCGATTGTTGGATCAGTCGCAGCCGATCT
CAGAGCGGTTTAGAGCTCTCTTCTCTCTTCGCAACTTGAAAGGCCCTGCTCCTCGCAACG
CTCTTATCCTCGCATCCAGAGACTCATCCAACTTGTTGGCACATGAAGCTGCGTTTGCGT
TGGGACAGATGCAAGATGCTGAAGCTGTTCCTGCTCTTGAGTCCGTTCTTAACGACATGT
CCTTGCATCCTATTGTACGCCATGAGGCAGCAGAAGCTCTTGGAGCCATTGGTTTAGCTG
GTAATGCTGAGATATTGAAGAAAAGCTTGATCTTGGATCCTGCTCAGGAGGTTCGGGAGA
CATGTGAGTTAGCTCTCAAAAGGATCGAAGAGTTGAGTAGTGTTGATGCGGAGAAGAACT
AGTCAGACTCGACAGAGAGATCACCTTTCATGTCTGTTGACCCAGCGGCTCCGGCTGCTG
CTTTCTCCTCTGTCCACCAACTGAGGGAGATTCTTATGGATGAAACAAAAGGCATGTATG
AGAGATATGCTGCTCTTTTCGCTCTAAGGAATCATGGTGGAGAGGAGGCTGTTTCTGCTA
TTGTTGATTCTTTGAGTGCTGATAGTGCCCTTTTACGTCATGAGGTTGCTTATGTGTTGG
GGCAATTGCAAAACAAAGCTGCTTTAGATACACTAAGCAAAATACTGAGAGATTTGAATG
AGCACCCAATGGTTAGACGCGAGGCTGCAGAAGCGCTTGGTTTTATTGCAGATGAGCAGA
GCATCGCATTGCTACAGGAATTCTCAAGAGACCCTGAGCCGATTGTTTCGCAAAGCTGTG
AAGTTGCATTGAGCATGCTGGAATTTGAAAATTCCGGCAAATCATTTGAGTTCTTTTTCA
CTCAAGACCCGCTTGTTCATTAAGAATGTGTAAGGATTTTAACCATTCTTCGATCATTTA
CCAACAAAGGAACACAAGCTTTTGGAGCCTTTTGTTGCCTTTTGTTATACAGAGAGATTG
GACTGCTACTTTGCATCTTCATTATGTACGATTGTTATAGTTCTATGTATTGAGTTTAAG
TTTAAGATACCATTGTCTTAATCGGTATGGAAGCTTTCTATTGTTAAAGAAAGGAAATGA
TTTTGCATGTCTTCTAATTTCTACCATTTGGTTGATGTAT


BQ
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CTTTCTCCTCTGTCCACCAACTGAGGGAGATTCTTATGGATGAAA

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TCTTTTCGCTCTAAGGAATCATGGTGGAGAGGAGGCTGTTTCTGCTATTGTTGATTCTTT
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CAAAGCTGCTTTAGATACACTAAGCAAAATACTGAGAGATTTGAATGAGCACCCAATGGT
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ACAGGAATTCTCAAGAGACCCTGAGCCGATTGTTTCGCAAAGCTGTGAAGTTGCATTGAG
CATGCTGGAATTTGAAAATTCCGGCAAATCATTTGAGTTCTTTTTCACTCAAGACCCGCT
TGTTCATTAAGAATGTGTAAGGATTTTAACCATTCTTCGATCATTTACCAACAAAGGAAC
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CATCTTCATTATGTACGATTGTTATAGTTCTATGTATTGAGTTTAAGTTTAAGATACCAT
TGTCTTAATCGGTATGGAAGCTTTCTATTGTTAAAGAAAGGAAATGATTTTGCATGTCTT
CTAATTTCTACCATTTGGTTGATGTAT

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DS 



AS 1 2

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TGGGGCTACTAGTGTAAGATGCTCTTGCTGTCAGACTGTCAACCTTGTCCCAGTACCCCC
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CCCAATGTCCGTTAATGAAAGTGGAAAGTTGGTGAGCAACGTTGTGGTTGGAGTGACAAC
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ATCCCTGCGTCTGGTTTGTGCATATTTTACGTACTGTTAATGAACAATTTTTTTTTTTGT
TAAAGAAAAAGTTGATGAACACAAAAGGTTTTTGGTTCAGTAATCTGGCATTCCTGTTTG
TAAACTCCATTGACCATTTTGTGGCATTGTTAAATGTATGTATTAATATAAATCTGATAC
ACCAATGAAACATC


BQ
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BS 633 974 RS1DC20JQ

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CAATGGAAGGGTGCCTTTAGCAAGTAACCGGCCAAATGGAACAGCATCTCCCGGGACTAT
GCCCTCTACATCCACTCAGTCGACACCACCGT
CTC

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1DC20JQ 674 0 0
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TGGGGCTACTAGTGTAAGATGCTCTTGCTGTCAGACTGTCAACCTTGTCCCAGTACCCCC
ACCGTCTAATCAGGTTGCTCATATCAACTGTGGGAACTGTAGGACGACACTCATGTACCC
TTACGGTGCATCATCTGTTAAATGTGCTATTTGCCAGTTTGTTACTAACGTTAACATGAG
CAATGGAAGGGTGCCTTTAGCAAGTAACCGGCCAAATGGAACAGCATCTCCCGGGACTAT
GCCCTCTACATCCACTCAGTCGACACCACCGTTTCAGACACAAACTGTTGTAGTAGAGAA
CCCAATGTCCGTTAATGAAAGTGGAAAGTTGGTGAGCAACGTTGTGGTTGGAGTGACAAC
AGGCCAAAAATAACTTTTTAAGAATGATTGATTTAAAAGATCAATTCCGATTTCGTCTAT
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TAAAGAAAAAGTTGATGAACACAAAAGGTTTTTGGTTCAGTAATCTGGCATTCCTGTTTG
TAAACTCCATTGACCATTTTGTGGCATTGTTAAATGTATGTATTAATATAAATCTGATAC
ACCAATGAAACATC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

CO CL4476Contig1 1412 2 4 U
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CGAATGATCTTTGATTGAAGTACCTTTTTGTCTTAGATTAGGAAATTCATGAGCTGAAGC
TTAAAGAAGAGTATGTTTGATTGTGGCACAACAAATGGAGTCAAATCTCAAGTAATCAGT
GGCCATCGTGAGAAGTTTATCAGGTTAGAGAGTATGGACTCAAGGTACTCCTCCTCCCAG
AGCTCCGACAACAACACGGGCCTAAACAAATGCACGTTAAACATACAAGGAGGAGGACCC
AAACGTTTCGCTCAGGGAAGCAAAACATCATCAGGATCTTTCAAGAAAGGTTTCAGAAAA
GGCTCAGAGGGTCTCTGGTCCATAGGAAGATCCATAGGACTCGGCGTCTCGCGCGCTGTC
TTTCCCGAAGATCTCAAAGTGTCGGAGAAGAAGATATTCGATCCGCAGGACAAGTTCCTC
CTCCTCTGCAACAAGCTCTTCGTTGCTTCCTGCATTTTAGCTGTCTCCGTGGACCCGCTC
TTCTTGTACCTTCCGTTTATAAACGACAAAGCCAAGTGCATCGGTATAGACAGGAAGCTG
GCGATCGTAGCGACGACGTTGAGGACGGTCATAGATTCTTTTTACCTCTTTCACATGGCT
TTGAGTTTAGAACAGCGTACGTTGCTCCTTCTTCAAGGGTTTTGGGAGAGGAGAGCTTGT
GATTGATCCTGCACAGATAGCAAAACGGTATCTGCAGCAGTACTTCATAGTTGATTTGCT
TTCTGTGCTTCCTGTTCCACAGATTATAGTTTGGAGGTTTCTATACACTTCTAGGGGTGC
GAATGTTCTGGCGACAAAGCAAGCACTTCGGTACATAGTGCTAGTTCAGTACATTCCGCG
TTTTCTTAGGATGTATCCTTTGAGTTCAGAGCTGAAGAGAACAGCTGGTGTGTTCGCTGA
AACTGCTTGGGCTGGTGCAGCTTACTATTTGCTACTCTACATGCTTGCAAGTCATATCGT
TGGGGCGTTGTGGTACTTGCTTGCGTTAGAACGCAATAACGACTGCTGGATTAAGGCTTG
CCACAGCAGGAAAGACAGCAACTGTACCAGAAACTTTTTGTTTTGCGGTAACCAAAACAT
GGAAGGCTATGCTGCTTGGGACACTGTGAAGTATTCGATTCTTCAGGAAAAGTGCCCTGT
CAATTGTGAGGAGTAAAACTCACACCTAGATTTTAGATCAGGTTTTGTGTTTAGAATAGG
TAAGGGAAAGATTATCGCGGGCTGAATCCCGTAAGAACTTGATGAATGAACTTCGATTTG
TATTAATATGATTGAAATGAGACGGTTACAAAAGATGATCTTTGATGAATACAAAGATCA
CGAAAGAATTACAAGTAAGAATGCTTTTGAGG


BQ
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AF RS1CD72TF U 1
AF RS1CD72JQ C 707
BS 1 744 RS1CD72TF
BS 745 745 RS1CD72JQ
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RD RS1CD72TF 776 0 0
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CGAATGATCTTTGATTGAAGTACCTTTTTGTCTTAGATTAGGAAATTCATGAGCTGAAGC
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GGCCATCGTGAGAAGTTTATCAGGTTAGAGAGTATGGACTCAAGGTACTCCTCCTCCCAG
AGCTCCGACAACAACACGGGCCTAAACAAATGCACGTTAAACATACAAGGAGGAGGACCC
AAACGTTTCGCTCAGGGAAGCAAAACATCATCAGGATCTTTCAAGAAAGGTTTCAGAAAA
GGCTCAGAGGGTCTCTGGTCCATAGGAAGATCCATAGGACTCGGCGTCTCGCGCGCTGTC
TTTCCCGAAGATCTCAAAGTGTCGGAGAAGAAGATATTCGATCCGCAGGACAAGTTCCTC
CTCCTCTGCAACAAGCTCTTCGTTGCTTCCTGCATTTTAGCTGTCTCCGTGGACCCGCTC
TTCTTGTACCTTCCGTTTATAAACGACAAAGCCAAGTGCATCGGTATAGACAGGAAGCTG
GCGATCGTAGCGACGACGTTGAGGACGGTCATAGATTCTTTTTACCTCTTTCACATGGCT
TTGAGTTTAGAACAGCGTACGTTGCTCCTTCTTCAAGGGTTTTGGGAGAGGAGAGCTTGT
GATTGATCCTGCACAGATAGCAAA*CGGTATCTGCAGCAGTACTTCATAGTTGATT

QA 1 776 1 776
DS 

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ATAGTTGATTTGCTTTCTGTGCTTCCTGTTCCACAGATTATAGTTTGGAGGTTTCTATAC
ACTTCTAGGGGTGCGAATGTTCTGGCGACAAAGCAAGCACTTCGGTACATAGTGCTAGTT
CAGTACATTCCGCGTTTTCTTAGGATGTATCCTTTGAGTTCAGAGCTGAAGAGAACAGCT
GGTGTGTTCGCTGAAACTGCTTGGGCTGGTGCAGCTTACTATTTGCTACTCTACATGCTT
GCAAGTCATATCGTTGGGGCGTTGTGGTACTTGCTTGCGTTAGAACGCAATAACGACTGC
TGGATTAAGGCTTGCCACAGCAGGAAAGACAGCAACTGTACCAGAAACTTTTTGTTTTGC
GGTAACCAAAACATGGAAGGCTATGCTGCTTGGGACACTGTGAAGTATTCGATTCTTCAG
GAAAAGTGCCCTGTCAATTGTGAGGAGTAAAACTCACACCTAGATTTTAGATCAGGTTTT
GTGTTTAGAATAGGTAAGGGAAAGATTATCGCGGGCTGAATCCCGTAAGAACTTGATGAA
TGAACTTCGATTTGTATTAATATGATTGAAATGAGACGGTTACAAAAGATGATCTTTGAT
GAATACAAAGATCACGAAAGAATTACAAGTAAGAATGCTTTTGAGG

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL4477Contig1 715 2 1 U
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TTCCGAAGAATCTAAGCTCGACAGAAAGGAGGTTTCGGGAGATGGCATCGAAACGGATTT
TGAAAGAGTTGAAGGATCTCCAGAAGGATCCTCCTACTTCTTGTAGCGCAGGACCTGTAG
CTGAAGACATGTTTCATTGGCAAGCTACCATAATGGGTCCATCCGACAGCCCTTACTCTG
GTGGTGTTTTTCTTGTTACCATTCATTTCCCTCCTGATTATCCCTTTAAACCTCCTAAGG
TGGCTTTTAGGACGAAGGTGTTCCACCCAAACATTAACAGCAATGGGAGCATCTGTCTCG
ACATCTTGAAGGAGCAGTGGAGTCCTGCCCTTACTATCTCCAAGGTGCTGCTATCGATCT
GTTCGCTGTTAACGGATCCAAACCCGGATGATCCCTTGGTTCCGGAGATAGCTCACATGT
ACAAGACAGACAAGACCAAGTACGAGTCCACTGCTCGGACCTGGACCCAAAAGTACGCCA
TGGGCTGACACTGTGTTATTATCTATCTGTCCGTGAGGATGAATTTTAATAATTAAAACT
CTTCTTTATTTCTATGTAATGAAACTCTGTCCGTCTTATAAAAAAATTGTGAAGGACAGA
ATCAGTAAGAAATCATACGATCTCCATTTTCATCACATTCCGATAAAGCTTAACT


BQ
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AF RS1GC13TF U 1
AF RS1GC13JQ C 380
BS 1 715 RS1GC13TF

RD RS1GC13TF 715 0 0
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TTCCGAAGAATCTAAGCTCGACAGAAAGGAGGTTTCGGGAGATGGCATCGAAACGGATTT
TGAAAGAGTTGAAGGATCTCCAGAAGGATCCTCCTACTTCTTGTAGCGCAGGACCTGTAG
CTGAAGACATGTTTCATTGGCAAGCTACCATAATGGGTCCATCCGACAGCCCTTACTCTG
GTGGTGTTTTTCTTGTTACCATTCATTTCCCTCCTGATTATCCCTTTAAACCTCCTAAGG
TGGCTTTTAGGACGAAGGTGTTCCACCCAAACATTAACAGCAATGGGAGCATCTGTCTCG
ACATCTTGAAGGAGCAGTGGAGTCCTGCCCTTACTATCTCCAAGGTGCTGCTATCGATCT
GTTCGCTGTTAACGGATCCAAACCCGGATGATCCCTTGGTTCCGGAGATAGCTCACATGT
ACAAGACAGACAAGACCAAGTACGAGTCCACTGCTCGGACCTGGACCCAAAAGTACGCCA
TGGGCTGACACTGTGTTATTATCTATCTGTCCGTGAGGATGAATTTTAATAATTAAAACT
CTTCTTTATTTCTATGTAATGAAACTCTGTCCGTCTTATAAAAAAATTGTGAAGGACAGA
ATCAGTAAGAAATCATACGATCTCCATTTTCATCACATTCCGATAAAGCTTAACT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1GC13JQ 336 0 0
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AAACCCGGATGATCCCTTGGTTCCGGAGATAGCTCACATGTACAAGACAGACAAGACCAA
GTACGAGTCCACTGTTCGGACCTGGACCCAAAAGTACGCCATGGGCTGACACTGTGTTAT
TATCTATCTGTCCGTGAGGATGAATTTTAATAATTAAAACTCTTCTTTATTTCTATGTAA
TGAAACTCTGTCCGTCTTATAAAAAAATTGTGAAGGACAGAATCAGTAAGAAATCATACG
ATCTCCATTTTCATCACATTCCGATAAAGCTTAACT

QA 1 336 1 336
DS 



AS 1 2

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TCTCAAGTTTTTGGAGCTTCAAAAAGTTCTTCGCAATAGTCTTCGTCGTTTTCGCCATCT
CCGGTGAGTTCGTTGCCGGATATTACAGGCCGAGCCCCTGGAGATACGCTCATGCCACTT
TCTATGGCGACGAGACAGGGAGTGAAACCATGGGTGGTGCATGTGGATACGGAAACCTGT
ATAACAGCGGCTACGGCCTGGCCACGGCGGCGCTAAGCACGACGTTGTTCAAAGACGGTT
ACGGATGCGGCCAATGTTTCCAAATAATGTGTGTGCAGTCAAAACATTGTTACTATGGAA
ACCCATCTACGGTGGTCACAGCCACCAACCTTTGCCCTCCTAATTGGTACCAAGACTCCA
ACAATGGTGGTTGGTGCAATCCTCCTAGAACCCATTTCGATATGGCTAAACCGGCTTTCA
TGAAACTTGCTAACTGGAAAGCTGGTATCATCCCTGTTTCATACCGCAGTGTACCATGCA
AAAGAAGTGGAGGTATGCGGTTTCAGTTCCAAGGCAATTCATACTGGCTTCTTATCTTCG
TCATGAATGTCGGCGGCGCCGGTGACATCAAGAGCATGGCCGTGAAAGGTAGCCGGACGA
ATTGGATAAGCATGAGCCACAACTGGGGAGCCTCTTACCAAGCTTTTTCTTCTCTCTACG
GTCAGTCTCTCTCTTTCCGGGTTACTTCTTACACCACTGGTGAAACTGTCTATGCTTGGA
ACGTTGCTCCGTCTAACTGGAATGCCGGTATTACTTACAAGAGTAGCGCCAATTTCCGCT
GATGAAGATACCCTTGAAAACCCAAACGGTATCTCTTCTTTTATGATTTATCCCTTTTTG
TTTTTGTTCTTGGGATGTTTAGAAGTTTCGGTGGCGCCTTTTGTTGTTATGGCCCGGCTT
TATGTTACACATCTACATGCATGTATGTATGTAATTGTGATATAACTCTTCATAATCAAA
GTCATGATGATGAAGTCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FX51TF U 1
AF RS1FX51JQ C 313
BS 1 648 RS1FX51TF
BS 649 1040 RS1FX51JQ

RD RS1FX51TF 648 0 0
GGAACAAACAAACCCTAAGAAAACCCATCCAAGAGAAAACGAAACTAGAGATGGGTCCGA
TCTCAAGTTTTTGGAGCTTCAAAAAGTTCTTCGCAATAGTCTTCGTCGTTTTCGCCATCT
CCGGTGAGTTCGTTGCCGGATATTACAGGCCGAGCCCCTGGAGATACGCTCATGCCACTT
TCTATGGCGACGAGACAGGGAGTGAAACCATGGGTGGTGCATGTGGATACGGAAACCTGT
ATAACAGCGGCTACGGCCTGGCCACGGCGGCGCTAAGCACGACGTTGTTCAAAGACGGTT
ACGGATGCGGCCAATGTTTCCAAATAATGTGTGTGCAGTCAAAACATTGTTACTATGGAA
ACCCATCTACGGTGGTCACAGCCACCAACCTTTGCCCTCCTAATTGGTACCAAGACTCCA
ACAATGGTGGTTGGTGCAATCCTCCTAGAACCCATTTCGATATGGCTAAACCGGCTTTCA
TGAAACTTGCTAACTGGAAAGCTGGTATCATCCCTGTTTCATACCGCAGTGTACCATGCA
AAAGAAGTGGAGGTATGCGGTTTCAGTTCCAAGGCAATTCATACTGGCTTCTTATCTTCG
TCATGAATGTCGGCGGCGCCGGTGACATCAAGAGCATGGCCGTGAAAG

QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1FX51JQ 728 0 0
CAATG
TTCCAAATAATGTGTGTGCAGTCAAAACATTGTTACTATGGAAACCCATCTACGGTGGTC
ACAGCCACCAACCTTTGCCCTCCTAATTGGTACCAAGACTCCAACAATGGTGGTTGGTGC
AATCCTCCTAGAACCCATTTCGATATGGCTAAACCGGCTTTCATGAAACTTGCTAACTGG
AAAGCTGGTATCATCCCTGTTTCATACCGCAGTGTACCATGCAAAAGAAGTGGAGGTATG
CGGTTTCAGTTCCAAGGCAATTCATACTGGCTTCTTATCTTCGTCATGAATGTCGGCGGC
GCCGGTGACATCAAGAGCATGGCCGTGAAAGGTAGCCGGACGAATTGGATAAGCATGAGC
CACAACTGGGGAGCCTCTTACCAAGCTTTTTCTTCTCTCTACGGTCAGTCTCTCTCTTTC
CGGGTTACTTCTTACACCACTGGTGAAACTGTCTATGCTTGGAACGTTGCTCCGTCTAAC
TGGAATGCCGGTATTACTTACAAGAGTAGCGCCAATTTCCGCTGATGAAGATACCCTTGA
AAACCCAAACGGTATCTCTTCTTTTATGATTTATCCCTTTTTGTTTTTGTTCTTGGGATG
TTTAGAAGTTTCGGTGGCGCCTTTTGTTGTTATGGCCCGGCTTTATGTTACACATCTACA
TGCATGTATGTATGTAATTGTGATATAACTCTTCATAATCAAAGTCATGATGATGAAGTC
AGC

QA 6 728 6 728
DS 



AS 1 2

CO CL4479Contig1 358 2 2 U
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GGTGAGAGTGGGGCGAGACACTGAGAAAGAAGGCAAAGGTTACTTCGAGGATCGTAGGCC
GGCTTCTAACATGGATCCTTATGTCGTCACTTCCATGATCGCCGAAACCACCATTCTCGG
TTAAGTAATCAACCGCATTTTATAATGTTTGGTTTGTCCGGTTTAGTGTTTTTTTTTTAA
ATTTTTTAATTTGCGAATTTTCATTTGCACTACTAATAATTTATTTTCATGCCCTAGTAG
TAGTATTGACGATGCTTTTTTCATTTCGAATAATTAAATAAAAGGATGTTTATGTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BZ69JQ C 1
AF RS1BZ69TF U 37
BS 1 36 RS1BZ69JQ
BS 37 358 RS1BZ69TF

RD RS1BZ69JQ 358 0 0
GAAGCACGAGACGGCAGATATCAACACGTTCTCATGGGGAGTGGCGAACCGTGGAGCTTC
GGTGAGAGTGGGGCGAGACACTGAGAAAGAAGGCAAAGGTTACTTCGAGGATCGTAGGCC
GGCTTCTAACATGGATCCTTATGTCGTCACTTCCATGATCGCCGAAACCACCATTCTCGG
TTAAGTAATCAACCGCATTTTATAATGTTTGGTTTGTCCGGTTTAGTGTTTTTTTTTTAA
ATTTTTTAATTTGCGAATTTTCATTTGCACTACTAATAATTTATTTTCATGCCCTAGTAG
TAGTATTGACGATGCTTTTTTCATTTCGAATAATTAAATAAAAGGATGTTTATGTTGG

QA 1 358 1 358
DS 

RD RS1BZ69TF 322 0 0
GGGAGTGGCGAACCGTGGAGCTTCGGTGAGAGTGGGGCGAGACACTGAGAAAGAAGGCAA
AGGTTACTTCGAGGATCGTAGGCCGGCTTCTAACATGGATCCTTATGTCGTCACTTCCAT
GATCGCCGAAACCACCATTCTCGGTTAAGTAATCAACCGCATTTTATAATGTTTGGTTTG
TCCGGTTTAGTGTTTTTTTTTTAAATTTTTTAATTTGCGAATTTTCATTTGCACTACTAA
TAATTTATTTTCATGCCCTAGTAGTAGTATTGACGATGCTTTTTTCATTTCGAATAATTA
AATAAAAGGATGTTTATGTTGG

QA 1 322 1 322
DS 



AS 1 2

CO CL4480Contig1 1428 2 2 U
GAACCTCAGTGATACATCACACTGAGTACTCCGATGCCTGAACTTTGTCGTCACATCGAG
CTGCTCAAACCTACCACACAGCGCCTCAGTCTGGTTTACATCAACAATCCTAGCTGCTCC
TTGACCAATTGATACCGTTACAAGAAAGTGAGTCGTATTTTGCACGTCTTTTCCTGAATA
CAAATTCATGTCTTCGTCTGGCTGATGACTCAATAACTTATTTATGGCCTTCCATTCTTC
CTTAGTCAATCCTTCCTCCACCGATCCGTCAGCCTCACTATCGACCTCAGGGTCATCTTC
AGCTTGTGTCCGCCTTCATGGAGATAGTAAACACAAATATTAATTTTAGAAAATGGAATC
TGGTTGTGATGTTGCATTCATGGTTACGATAAGAATTGGAAAAGCCAAAAAGCAAGACAA
CCATATTCAGAAGGAAGAAACAGACTCCACTAACCAATTAAACGAGAACCAACCGCCCTT
TTTCAGCTTTCTCTGCTCGGCGGCTTCTTTTGACTTCACAGATTCTACCTTTGCATGTGC
AATCAACCTATTACGCCGATACAACACATGATCAGATATGACGGGAGGGAAAGCACATAG
ACAGCACAGTGCCTTTGAGATCCCAATGAAAACAAAGAGGAAAAAATGGCAAAGCTTGAA
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TCTAGATAAATGCTGTTTCTTATCCTGGTTGGTCAGTAAAATCCTGCACGGGAGATTAAA
ATGAAACGAACACGTACCATAGTCTCTTTTGTTGCAAACTAGCTTGAGCAGCGAAGCGCC
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ATGTTTTGTATCTTGAAACAACTTCGACTAGCTTTATCCAATCGTGATATTGCTCCTGGT
AAGGGAAACGTGGAAGACAACATACAAGTGACTTAAGTGCAGCACCCC


BQ
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AF RS1FO84JQ C 560
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BS 770 1428 RS1FO84JQ

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AGCTTGTGTCCGCCTTCATGGAGATAGTAAACACAAATATTAATTTTAGAAAATGGAATC
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CCATATTCAGAAGGAAGAAACAGACTCCACTAACCAATTAAACGAGAACCAACCGCCCTT
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AATCAACCTATTACGCCGATACAACACATGATCAGATATGACGGGAGGGAAAGCACATAG
ACAGCACAGTGCCTTTGAGATCCCAATGAAAACAAAGAGGAAAAAATGGCAAAGCTTGAA
CTTCAATGAGAAAAGAAGTGGTATAATAAGACTATGTAATCAAATATGTCTATAAACTTT
CAAGCATATTTGGAACTTGACAATAGTTAATAGCCAAATCAATCCAGAG

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DS 

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ATCCCAATGAAAACAAAGAGGAAAAAATGGCAAAGCTTGAACTTCAATGAGAAAAGAAGT
GGTATAATAAGACTATGTAATCAAATATGTCTATAAACTTTCAAGCATATTTGGAACTTG
ACAATAGTTAATAGCCAAATCAATCCAGAGATCAAGTGTCTGCGAGATGGATTCCGGTGG
AATACATCACAAGGTTGAATTTGACCACATGCTTTCCACTCAAAATGTGGGGATATAATT
ATTACCTCCACAAAAGAATCACTTTGGAATCAAGGTCCTTCTCGATTTCTCTCATCTCTG
GGTTATTAGCATTTGATGACTGCTGCAGAAAGTTGGTATACAGCTGAATATAACGCCGAC
GTAACTGGCAAAGGTGGTGAATTCTATCCCAGGAAAATCGATAGCTGAAAGGGGTCAGAA
TATGAATACAGATCAAAATACAACACCATTCCACAGATAAGAGTGCAGTCATACTTTCCC
AGAAGATGATCAACTATGCAAGACTAAAACCAAAAAGATTTTCTAGATAAATGCTGTTTC
TTATCCTGGTTGGTCAGTAAAATCCTGCACGGGAGATTAAAATGAAACGAACACGTACCA
TAGTCTCTTTTGTTGCAAACTAGCTTGAGCAGCGAAGCGCCACCACAAACGTGGAGCCTC
TGAAACAGGAACCATGGGCCTTAAATGAGAAATCTCTATATATGTTTTGTATCTTGAAAC
AACTTCGACTAGCTTTATCCAATCGTGATATTGCTCCTGGTAAGGGAAACGTGGAAGACA
ACATACAAGTGACTTAAGTGCAGCACCCC

QA 1 869 1 869
DS 



AS 1 2

CO CL4481Contig1 698 2 3 U
GGGCCGCAGTCCAGTCCAATCGCCGGCGGCAGAAAATGGGGAAGAAGGACAAGAGAAATC
ACGACGACCCTGAGCTCGAATTGGAGCCCGAGCTAACTGAAAGAATCGACGACGGAGACC
TCAAGAAGAAGACTAAGAAGAAGAAGAGAAGCCATGATGATCCGGAGCAAAAGGTGAGTC
TCGACGGAGACGCGAAGAAGAAGAAGAAAAAGAAGAAGAAAAGCAAGGAGGAGGAGGAGG
AGCAAACGATAATCCAAGAGGAGGAGAAGCCAAATGGTGAAGAAAAGAAAAAGGAAGGAG
GCAGACCAACTGTTACTATAGCCATAGCTGGCTCCATCATCAACAACACTCAATCCCTCG
AGCTCGCCACACGTCTTGCTGGCCAAATAGCTCGTGCTTCCACTATTTTTCGAATCGACG
AGATTGTAGTGTTCGACAATAAGAGCAGCTCAGAGATCAATAACTCTGATAGCAACAACG
AAAGTGGCGCCCCCTTTCTCGTTCGTATCTTGAAGTATCTAGAGACGCCACAGTATTTGA
GGAAGACTCTCTTTCCCAAGCACAATGATCTTAGATTTGTGGGTATGTTGCCACCTCTTG
ATGCTCCTCACCATCTCCGTAAGCACGAGTGGGAACAATTCCGTGAAGGTGTGACGCTAA
GGGAAAAGCCGTCAAACTCTGAGGGTACATTGGTTGAT


BQ
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AF RS1D454TF U 335
AF RS1ES23TF U 1
BS 1 370 RS1ES23TF
BS 371 371 RS1D454TF
BS 372 698 RS1ES23TF

RD RS1D454TF 321 0 0
CATCATCAACAACACTCAATCCCTCGAGCTCGCCACACGTCTTGCTGGCCAAATAGCTCG
TGCTTCCACTATTTTTCGAATCGACGAGATTGTAGTGTTCGACAATAAGAGCAGCTCAGA
GATCAATAACTCTGATAGCAACAACGAAAGTGGCGCCCCCTTTCTCGTTCGTATCTTGAA
GTATCTAGAGACGCCACAGTATTTGAGGAAGACTCTCTTTCCCAAGCACAATGATCTTAG
ATTTGTGGGTATGTTGCCACCTCTTGATGCTCCTCACCATCTCCGTAAGCACGAGTGGGA
ACAATTCCGTGAAGGTGTGAC

QA 1 321 1 321
DS 

RD RS1ES23TF 698 0 0
GGGCCGCAGTCCAGTCCAATCGCCGGCGGCAGAAAATGGGGAAGAAGGACAAGAGAAATC
ACGACGACCCTGAGCTCGAATTGGAGCCCGAGCTAACTGAAAGAATCGACGACGGAGACC
TCAAGAAGAAGACTAAGAAGAAGAAGAGAAGCCATGATGATCCGGAGCAAAAGGTGAGTC
TCGACGGAGACGCGAAGAAGAAGAAGAAAAAGAAGAAGAAAAGCAAGGAGGAGGAGGAGG
AGCAAACGATAATCCAAGAGGAGGAGAAGCCAAATGGTGAAGAAAAGAAAAAGGAAGGAG
GCAGACCAACTGTTACTATAGCCATAGCTGGCTCCATCATCAACAACACTCAATCCCTCG
AGCTCGCCACGCGTCTTGCTGGCCAAATAGCTCGTGCTTCCACTATTTTTCGAATCGACG
AGATTGTAGTGTTCGACAATAAGAGCAGCTCAGAGATCAATAACTCTGATAGCAACAACG
AAAGTGGCGCCCCCTTTCTCGTTCGTATCTTGAAGTATCTAGAGACGCCACAGTATTTGA
GGAAGACTCTCTTTCCCAAGCACAATGATCTTAGATTTGTGGGTATGTTGCCACCTCTTG
ATGCTCCTCACCATCTCCGTAAGCACGAGTGGGAACAATTCCGTGAAGGTGTGACGCTAA
GGGAAAAGCCGTCAAACTCTGAGGGTACATTGGTTGAT

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL4482Contig1 901 2 2 U
GGATTGGTCGTAGAAACTGACCAACAAACTGACTCTCATATTTTCTCTCTCTCAACTTCC
TCAGCTCCCTCGTCGCCGTCATCAGGAAGAGTGAAAAAGATATTTGCTCATTGCTTAGAT
GGAAGAAATGGAGGTGGTATATTTGCCATTGGACGTGTTGTACAACCAAAAGTAAACATG
GCACCATTGGTACCCAATCAACCACACTACAATGTAAATATGACAGCAGTTCAAGTTGGT
CAAGAGTTTCTAGATATCCCAGCTGATTTATTCCAGCCGGGAGATAGAAAAGGGGCAATA
ATCGACAGTGGTACGACCTTGGCCTATCTTCCAGAGATAATCTATGAACCATTGGTGAAG
AAGATAACCTCGCAGGAGCCTGCTCTGAAAGTTCACATAGTTGATAAAGATTACAAATGC
TTTCAGTACTCTGGAAGAGTTGATGAAGGGTTTCCGAATGTCACTTTCCATTTTGAAGAC
TCGGTTTACCTCAGGGTTTATCCTCATGACTATTTGTTCCCTTATGAAGGAATGTGGTGC
ATTGGGTGGCAAAATAGTGGAATGCAATCCAGAGATAGGAGAAACATGACACTTTTGGGA
GATTTGGTCCTTTCAAACAAGCTTGTTCTCTACGATCTAGAAAATCAGCTTATCGGGTGG
ACTGAGTACAACTGCTCATCAAGCATAAAAGTAAAAGATGAAGGAACAGGAACAGTTCAT
CTAGTAGGCTCACATTTTATTTCTTCTGCATTTCCTCTAGATACCTCATTGCTTTTGCTT
TTGTTAGCTTTTCTCATTACTCTTTTCCTCCTTTAGTAGAGACAGCATATAGATTCTCCT
TTGTATATAGATCCAACATATTGCTTGCGCAAATGGTAAAAAGGTGATCTGAATATATAG
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1GE23TF U 1
AF RS1GE23JQ C 252
BS 1 568 RS1GE23TF
BS 569 901 RS1GE23JQ

RD RS1GE23TF 568 0 0
GGATTGGTCGTAGAAACTGACCAACAAACTGACTCTCATATTTTCTCTCTCTCAACTTCC
TCAGCTCCCTCGTCGCCGTCATCAGGAAGAGTGAAAAAGATATTTGCTCATTGCTTAGAT
GGAAGAAATGGAGGTGGTATATTTGCCATTGGACGTGTTGTACAACCAAAAGTAAACATG
GCACCATTGGTACCCAATCAACCACACTACAATGTAAATATGACAGCAGTTCAAGTTGGT
CAAGAGTTTCTAGATATCCCAGCTGATTTATTCCAGCCGGGAGATAGAAAAGGGGCAATA
ATCGACAGTGGTACGACCTTGGCCTATCTTCCAGAGATAATCTATGAACCATTGGTGAAG
AAGATAACCTCGCAGGAGCCTGCTCTGAAAGTTCACATAGTTGATAAAGATTACAAATGC
TTTCAGTACTCTGGAAGAGTTGATGAAGGGTTTCCGAATGTCACTTTCCATTTTGAAGAC
TCGGTTTACCTCAGGGTTTATCCTCATGACTATTTGTTCCCTTATGAAGGAATGTGGTGC
ATTGGGTGGCAAAATAGTGGAATGCAAT

QA 1 568 1 568
DS 

RD RS1GE23JQ 650 0 0
AGATATCCCAGCTGATTTATTCCAGCCGGGAGATAGAAAAGGGGCAATAATCGACAGTGG
TACGACCTTGGCCTATCTTCCAGAGATAATCTATGAACCATTGGTGAAGAAGATAACCTC
GCAGGAGCCTGCTCTGAAAGTTCACATAGTTGATAAAGATTACAAATGCTTTCAGTACTC
TGGAAGAGTTGATGAAGGGTTTCCGAATGTCACTTTCCATTTTGAAGACTCGGTTTACCT
CAGGGTTTATCCTCATGACTATTTGTTCCCTTATGAAGGAATGTGGTGCATTGGGTGGCA
AAATAGTGGAATGCAATCCAGAGATAGGAGAAACATGACACTTTTGGGAGATTTGGTCCT
TTCAAACAAGCTTGTTCTCTACGATCTAGAAAATCAGCTTATCGGGTGGACTGAGTACAA
CTGCTCATCAAGCATAAAAGTAAAAGATGAAGGAACAGGAACAGTTCATCTAGTAGGCTC
ACATTTTATTTCTTCTGCATTTCCTCTAGATACCTCATTGCTTTTGCTTTTGTTAGCTTT
TCTCATTACTCTTTTCCTCCTTTAGTAGAGACAGCATATAGATTCTCCTTTGTATATAGA
TCCAACATATTGCTTGCGCAAATGGTAAAAAGGTGATCTGAATATATAGC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL4483Contig1 975 2 2 U
TTTTTTTTCTATATTTCAACGACACTTTCAAGTTTCAACCAACACTTGTTGGTCTTGTTG
TTGTTCAGTTTTGTTTTCGTTTCTTCTCTTTAGATCTCTTTCTTGAAAGTCTTATCCTTT
GGATTCTGATTCGATATCTTCTGCTTTGTTTTAGATTTTATCACTTTCTTCAGAATCTCA
GTCTTTTCTTCTGATCTGGGTTTTTCTTCTCTCTGTTAACTTTAGCTGTTTGGTTGCAGA
AACTTGTGAGTGTAGATCAGTTGAAACCCTAACAAAGGTTAGAAAAGAGAAACCTTTTCA
TAGGTTTTTTGGGGTTTTGTCTCATTCTGAGAAATGGGTTCACAGGTTGCTTGTCTAGTT
GCTTGAGGCTTTTTTGTTTGGTAGAGAACTGAACTAGAGTTATGAGAAGAGGTAGAGTGA
AAGGCAAGAGGCAGAATGCTACAGCTAGAGAAGATCGTGGAAGCGGTGAAGAAGAAGAAG
AAGAAAAGATTCCAGCTTATAAGAGAAGAGGGAGGCCACAGAAGCCGGTGAAAGATGAAG
CCGAAGGAGAAGAAGAGATCTTGGAGAAGGATGATGATACAAATGGTTCAGTAACAAGTA
AAGAAGATGTGACAGAGAATGGAAGGAAGAGGAAGAAAGCACTAGAGTCTAAAGAGAGCA
ATGTAACCGAAGAGGAGAATGTGTTAGGTACAAAATCAAGCACAGATGATTCAGTGAAGT
CATCTTTGTCGATAGGGTTTAGACAAGTTGGGAGCAGAAGGAAGAACAAACCAAGACGAG
CTGCAGAAGCTGTTGTTGAATGTCATGGGTTTTGAAAAAAAAAAGAGCTTCTTAAAACTC
TTTTGAAACCCGCCCTTTTGGGTTTTTTTATTGTTGACTTGAATCTCTTTTGTTGTTAGG
ACCCCTGAGTTTGATGCGGGTTGCGTTTCTGTTTCATATACATGGAATCGTAATTCGTAA
TTTTGGATTACTCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DR74TF U 1
AF RS1DR74JQ C 305
BS 1 621 RS1DR74TF
BS 622 975 RS1DR74JQ

RD RS1DR74TF 621 0 0
TTTTTTTTCTATATTTCAACGACACTTTCAAGTTTCAACCAACACTTGTTGGTCTTGTTG
TTGTTCAGTTTTGTTTTCGTTTCTTCTCTTTAGATCTCTTTCTTGAAAGTCTTATCCTTT
GGATTCTGATTCGATATCTTCTGCTTTGTTTTAGATTTTATCACTTTCTTCAGAATCTCA
GTCTTTTCTTCTGATCTGGGTTTTTCTTCTCTCTGTTAACTTTAGCTGTTTGGTTGCAGA
AACTTGTGAGTGTAGATCAGTTGAAACCCTAACAAAGGTTAGAAAAGAGAAACCTTTTCA
TAGGTTTTTTGGGGTTTTGTCTCATTCTGAGAAATGGGTTCACAGGTTGCTTGTCTAGTT
GCTTGAGGCTTTTTTGTTTGGTAGAGAACTGAACTAGAGTTATGAGAAGAGGTAGAGTGA
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AAGAAAAGATTCCAGCTTATAAGAGAAGAGGGAGGCCACAGAAGCCGGTGAAAGATGAAG
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AAGAAGATGTGACAGAGAATG

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GAGGCTTTTTTGTTTGGTAGAGAACTGAACTAGAGTTATGAGAAGAGGTAGAGTGAAAGG
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AAAGATTCCAGCTTATAAGAGAAGAGGGAGGCCACAGAAGCCGGTGAAAGATGAAGCCGA
AGGAGAAGAAGAGATCTTGGAGAAGGATGATGATACAAATGGTTCAGTAACAAGTAAAGA
AGATGTGACAGAGAATGGAAGGAAGAGGAAGAAAGCACTAGAGTCTAAAGAGAGCAATGT
AACCGAAGAGGAGAATGTGTTAGGTACAAAATCAAGCACAGATGATTCAGTGAAGTCATC
TTTGTCGATAGGGTTTAGACAAGTTGGGAGCAGAAGGAAGAACAAACCAAGACGAGCTGC
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GAAACCCGCCCTTTTGGGTTTTTTTATTGTTGACTTGAATCTCTTTTGTTGTTAGGACCC
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GGATTACTCGT

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DS 



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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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DS 



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GGTGGAATACTATATTAGTAATTGTAGACACATCGATCATGTCTGGTGGAACTCCGCGTG
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TCGGAGACATGCACTCCAATATGATTTACATCCTCTTACACGATGCACGGATCAAAAGGA
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GCATGTTGTCGTGGAGCGTGAGAAGGTTCGATGAGAAATGGGAACTGTGGAGTATTTCCG
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GGCCTATATGGGGATTTTTGACTCTCCCTCTCCTGTTCACATTGTTCATGGCATGCCTAG
TTGTGTTCCCACATCTGACGATCATCAAACTCAGGCCTCAGAACGAAGAACTTCGCATAG
ATTGAGAGAAGAATGGAGTTAGTAACTGAGAGAGTGATTGGATGGATGGATGGATACCCT
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GAGGGATGTGTGGTTTGGTTTGAGATGTATAGATAGATATATTAGATGAACTCATTGATG
ATGTAATAGAGAGAGTGATCTTTTTTATCG


BQ
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AF RS1G223TF U 1
AF RS1G223JQ C 581
BS 1 649 RS1G223TF
BS 650 1170 RS1G223JQ

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AATTGGGATCGCTTCTTAGGGTTTTAAACAAGCAAACTCGCCCCCAATCTGAGGTTATTC
AATTTCTCTCTTCTTTTTATCTCCTCACATTACCAGCTCTCCCGTTTTCGATCCCTCGTG
AAATTCGATGAGAATTGATCTTCCTTTTTCTCAGATCTCTTGATATCACCATCTTGTGGA
ATTGAAATCCCCTTTTCCCGTTTGGTAATCTCGAATCGCATAGTTAGTTAGTTAGTAGTA
ATGAAAAGATTGAATTTTTATTTTGTTAATATAAAAAGGGGTTTGTGTTGCTACTGAGGA
GGTGGAATACTATATTAGTAATTGTAGACACATCGATCATGTCTGGTGGAACTCCGCGTG
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TCGGAGACATGCACTCCAATATGATTTACATCCTCTTACACGATGCACG

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DS 

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CCTGCTATCCTTTGCTCTGTGGCCTATATGGGGATTTTTGACTCTCCCTCTCCTGTTCAC
ATTGTTCATGGCATGCCTAGTTGTGTTCCCACATCTGACGATCATCAAACTCAGGCCTCA
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GATGGATGGATGGATACCCTTTTATTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTGTTGAGAAGT
GAATAAGTGTGAAAAGGGGAGAGGGATGTGTGGTTTGGTTTGAGATGTATAGATAGATAT
ATTAGATGAACTCATTGATGATGTAATAGAGAGAGTGATCTTTTTTATCG

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 2

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CCTGGAACCAGAAGTTTGAGTTTGAGGAGTTAGCAGGAGAGGAATATCTGAAGGTGAAAT
GCTACAAAGAAGAGATGCTTGGCACCGACAACATCGGTACTGCTACGCTGAGTCTTCACG
GAATCAGTAATAGTGAGATGCATATATGGGTTCCTCTTGCAGAAGTTAGTTCTGGAGAGA
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TGATTGAACTGGTTCTTGTCGAAGCAAGGGATCTCGTGGCCGCGGATCTTAGAGGAACCA
GTGATCCTTACGTCAGGGTTCAGTATGGAGAGAAGAAACAGAGGACAAAGGTTATTTACA
AGACATTGCATCCAAAATGGAACCAGACTATGGAGTTCCCAGATGATGGGAGCTCCTTGG
AGCTACACGTAAAGACCACAACACTCTGCTTCCAACTTCAAGCATCGGCAACTGCGTTGT
GGAATACCAACGGCTAAAGCCAAACGAGACGGCAGACAAGTGGATACCTCTCCAAGGAGT
GACACGTGGAGAGATCCGTGTCAGAGTCACGAGGAGAGTCACGGAGGCTCCAAGAAGAGT
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ATTGGGAGAGCTGGAGAGTTTGGAGGATGAACAAGAAGAGTATTTGGTCCAGCTTCAGAC
AGAGCAAACGCTGCTTATCAACAAGATTAAAGACCTTGGTAAGGAGATACTTAACTCATC
CCCTATTCAAGCCACGTCTCATTCGCCGTCCAGGTCCGGGTCAGGTTCGGGAGGTGGATC
GTATAGCCGGAGATTACCAGCGCCAATGTAGTGTAGTTGGTTTGTGAACAACCTACAAAA
ACAATCTATGATGTATATAGATAGATATGTAGGGCATTGGATATAATGTTCAAAGAGATT
ATGAGCCCCTTTGTTACAGAAGATAGAAACCATCATCCTTAAGTTTCTC


BQ
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GGAATACCAACGGCTAAAGCCAAACGAGACGGCAGACAAGTGGATACCTCTCCAAG*AGT
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G*TGATGATAA
G

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CTCTGCTTCCAACTTCAAGCATCGGCAACTGCGTTGTGGAATACCAACGGCTAAAGCCAA
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TCAACAAAGCGCTCTTGTTGTCTAACCAGATGAAGCAGGTGATGATAAAGTTTCAGAATT
TGATTGACGATGGAGATCTCGAAGGTCTTGGTGAAGCATTGGGAGAGCTGGAGAGTTTGG
AGGATGAACAAGAAGAGTATTTGGTCCAGCTTCAGACAGAGCAAACGCTGCTTATCAACA
AGATTAAAGACCTTGGTAAGGAGATACTTAACTCATCCCCTATTCAAGCCACGTCTCATT
CGCCGTCCAGGTCCGGGTCAGGTTCGGGAGGTGGATCGTATAGCCGGAGATTACCAGCGC
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TAGAAACCATCATCCTTAAGTTTCTC

QA 1 746 1 746
DS 



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AS 0 0

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BQ
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AACGTTTAATTTTGCCAGTGAGATTTTAGTTTCTGTGTC

QA 1 159 1 159
DS 



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AACAGTGCATCAATTACACTGGTCTGAAACTCTTCTACAAGAACAGTGGAGAAATTTTGG
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TCAGATTTAGTGATGGGATCCATCTCGGTTAATCCTGCATCTTAGAAATGGGAGTTGTGT
ATCCGTCTATGATTCACGCAACAACGCCTGGTGTTCAAGTGGTGAAATTCGGTGATGACG
TGGTCAACAATACACTCCACACTCTGAACCTTTCCTTTTGCGTGGAGTTCCATACTTCGT
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TTTTTCGTGTGTTTATGGACGTCTGTATTCATGCTTATTACTATTACAAGCAGGCTATAT
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TATATACGTGTTGTAGTTAACTTACTCATCTTAAAAATGAGTTGTATTTAACTTCATTTA
TGTTTTATGTAAACTTATGTATGTTAT


BQ
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AF RS1H613TF U 1
AF RS1H613JQB C 353
BS 1 669 RS1H613TF
BS 670 987 RS1H613JQB

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TTGAGACGAATCAAGAAAAATAAACTTAGATGCGTGTTTGATTGAAATGTTACATGTTTG
ATATTGACGAGGGAAAAGAAGTAAACGTTGTGGGGAAGTGCCTTCAATTTAAACTTAAAC
AACAGTGCATCAATTACACTGGTCTGAAACTCTTCTACAAGAACAGTGGAGAAATTTTGG
TGCGCAGCACATCGACAGTGTTATACATTGGGGAGAAGAAGGGTCCGTTTCAACATTCAA
GCTTCTTCGCTGGAGGAGCAATGGTGCTGCATGAAGTTTTGTTGTTGAGAATGGTAGTCT
TAAAGGCTGCTTGGCTATGGTCCATGCTAGTTTCAGGAGGGTGCGTGCAGACTTCCACCT
GTCTGTAACTTTGCTACAGGAGACTTCATTGCAGCAGTAGGGAAAATCGCAGAGGCTCTT
TCAGATTTAGTGATGGGATCCATCTCGGTTAATCCTGCATCTTAGAAATGGGAGTTGTGT
ATCCGTCTATGATTCACGCAACAACGCCTGGTGTTCAAGTGGTGAAATTCGGTGATGACG
TGGTCAACAATACACTCCACACTCTGAACCTTTCCTTTTGCGTGGAGTTCCATACTTCGT
AAAGACTAT

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DS 

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TTCCACCTGTCTGTAACTTTGCTACAGGAGACTTCATTGCAGCAGTAGGGAAAATCGCAG
AGGCTCTTTCAGATTTAGTGATGGGATCCATCTCGGTTAATCCTGCATCTTAGAAATGGG
AGTTGTGTATCCGTCTATGATTCACGCAACAACGCCTGGTGTTCAAGTGGTGAAATTCGG
TGATGACGTGGTCAACAATACACTCCACACTCTGAACCTTTCCTTTTGCGTGGAGTTCCA
TACTTCGTAAAGACTATCCCCAAATTCTAATCATAACACCACCTAGCACCGTGTGGATGA
AGACTTACCTCAAAAAGCCTCCGTCAATGATTGAATGGGAATAAAAGATGAGTATGATCA
GTTTGGCTTTTTTCGTGTGTTTATGGACGTCTGTATTCATGCTTATTACTATTACAAGCA
GGCTATATAGTTTCTGAAAAACCTAATATTATCGATCTAAAGCTTGCTTAATGTTAACAA
AGGTTACTTATATACGTGTTGTAGTTAACTTACTCATCTTAAAAATGAGTTGTATTTAAC
TTCATTTATGTTTTATGTAAACTTATGTATGTTAT

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

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AAACCCTTGTCCGTATCACTGGTGGGAGGAAGGTGAAAGCTGACAGGGATGAGTCCTCAC
CTTACGCAGCTATGCTTGCTGCTCAAGATGTTGCTCAGCGTTGCAAGGAACTTGGAATCA
CCGCTATGCACGTGAAGCTCCGTGCCACGGGTGGAAACAAGACCAAGACACCAGGTCCTG
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ATGTTACTCCGATCCCAACGGACAGTACCCGCAGAAAGGGTGGTAGAAGAGGAAGGAGGC
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GAGTTTCGAAGTTGAATGGTTTTTGTTAATTTTGAGCAACATTTTCTGCTATGATTAG


BQ
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AF RS1GJ12JQ C 1
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BS 408 478 RS1E624TF

RD RS1GJ12JQ 429 0 0
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AAACCCTTGTCCGTATCACTGGTGGGAGGAAGGTGAAAGCTGACAGGGATGAGTCCTCAC
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GTGCTCAATCCGCTCTTAGAGCTCTTGCCCGTTCTGGCATGAAGATTGGTCGCATTGAGG
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TTTGAGTTTTCTTTTGGTTCAGTTTGTCAGACCAATGTTTTTTTTTTGAATTTTGTGAAA
GAGTTT
AGA

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DS 

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GT
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TGTTGCTCAGCGTTGCAAGGAACTTGGAATCACCGCTATGCACGTGAAGCTCCGTGCCAC
GGGTGGAAACAAGACCAAGACACCAGGTCCTGGTGCTCAATCCGCTCTTAGAGCTCTTGC
CCGTTCTGGCATGAAGATTGGCCGCATTGAGGATGTTACTCCGATCCCAACGGACAGTAC
CCGCAGAAAGGGTGGTAGAAGAGGAAGGAGGCTCTGAGTTTTCTTTTGGTTCAGTTTGTC
AGACCAATGTTTTTTTTT*GAATTTTGTGAAAGAGTTTCGAAGTTGAATGGTTTTTGTTA
ATTTTGAGCAACATTTTCTGCTATGATTAG

QA 3 392 3 392
DS 



AS 1 2

CO CL4496Contig1 1031 2 2 U
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AGGTTTCATTGACTTCTCACCCGGTTGCCATCCTGCAGGGCAGACTTCATCAGGGTTCTC
CTGGATGTACTGTAACGCCTGGAGGGTTCTCATAGTCTCATCAACGCTTCGGCCAATACC
AAAATTGTTGATGGTGGAATGTTGGATTACTCCTTCCTTGTCGATTATGAAAAGCCCTCT
CAGTGCTATTCCCTGATCATGGATGAGCACTCCAAAAGACTTTGAGATTGATTTAGTTAC
ATCTGAAACAAGGGGATAGTTCAGATCACCAAGCCCTCCAGATTGTCTGTCTGTCTGGAC
CCACGCAAGGTGGGAGAACACACTATCAACAGAGACACCTAACACTTCTGTGTTCAACTT
CTCAAACTCTGCATACCGGTCACTGAAGGCAGTGATCTCTGTTGGGCAGACGAAAGTGAA
GTCCAAAGGGTAGAAAAAGAGAATCACATACTTCTTCCCAATGTACTCAGAGAGCTTAAC
CTTGATGAACTCCTAATCAAACACAGCCTCAGCCTCAAAATCAGGCGCCTTGTTTCCAAC
CAATGGAAGATCATCGGCCTGAGCCTTGACGGCGAAGCTCCGGCGAGAAACGGAGCTGAG
GGAAGAGCGTTGAGCAAAGCTAGAGCGGAGAGAAGCGGATGCGGGGGGAGAGGATAAGGT
TCGAAGGAAAGAGAGGGAGGGAGAAGGAAGGGAAGAAGACTTGGCTGGGAGAGCCCTAGT
TGAGGAGATGAGAGTGGTTGAAGAAGTAACCGACGCCATTGATAAAACACACACTTTTGT
TTTCTCTCTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EA81JQ U 1
AF RS1DX96TF C 425
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BS 596 1031 RS1DX96TF

RD RS1EA81JQ 595 0 0
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AAATGATATATTCATACAAAAGGGACTGTAAAGAAATTGATTTGATACATTTTGCGGAAG
GATATTGTTCAGAGTAAAAGAAAAGAAGAAAAATAAAATCTCTGCCTCAGATTTCACATA
TAGCAAAGGTTGTAGCTTATTCTAAATAGCTGAAAAGTACTCTTTGCTGAGCTTGGGGTC
AGGTTTCATTGACTTCTCACCCGGTTGCCATCCTGCAGGGCAGACTTCATCAGGGTTCTC
CTGGATGTACTGTAACGCCTGGAGGGTTCTCATAGTCTCATCAACGCTTCGGCCAATACC
AAAATTGTTGATGGTGGAATGTTGGATTACTCCTTCCTTGTCGATTATGAAAAGCCCTCT
CAGTGCTATTCCCTGATCATGGATGAGCACTCCAAAAGACTTTGAGATTGATTTAGTTAC
ATCTGAAACAAGGGGATAGTTCAGATCACCAAGCCCTCCAGATTGTCTGTCTGTCTGGAC
CCACGCAAGGTGGGAGAACACACTATCAACAGAGACACCTAACACTTCTGTGTTC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RS1DX96TF 607 0 0
GCTATTCCCTGATCATGGATGAGCACTCCAAATGACTTTGAGATTGATTTAGTTACATCT
GAAATAAGGGGATAGTTCAGATCACCAAGCCCTCCAGATTTTCTGTCTGTCTGGACCCAC
GCAAGGTGGGAGAACACACTATCAACAGAGACACCTAACACTTCTGTGTTCAACTTCTCA
AACTCTGCATACCGGTCACTGAAGGCAGTGATCTCTGTTGGGCAGACGAAAGTGAAGTCC
AAAGGGTAGAAAAAGAGAATCACATACTTCTTCCCAATGTACTCAGAGAGCTTAACCTTG
ATGAACTCCTAATCAAACACAGCCTCAGCCTCAAAATCAGGCGCCTTGTTTCCAACCAAT
GGAAGATCATCGGCCTGAGCCTTGACGGCGAAGCTCCGGCGAGAAACGGAGCTGAGGGAA
GAGCGTTGAGCAAAGCTAGAGCGGAGAGAAGCGGATGCGGGGGGAGAGGATAAGGTTCGA
AGGAAAGAGAGGGAGGGAGAAGGAAGGGAAGAAGACTTGGCTGGGAGAGCCCTAGTTGAG
GAGATGAGAGTGGTTGAAGAAGTAACCGACGCCATTGATAAAACACACACTTTTGTTTTC
TCTCTCC

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 2

CO CL4497Contig1 1241 2 4 U
GGATCATATATTTATTCCAAAAATGACAAACATGCTGACATCGCCGCTCTGGTCATTACT
CGCCGTGACTTTCATCTCAGTCATCTCCATCGTCCGATCATGCTCGCCTTCCGATCAGAC
GGCTCTCAATGCGTTCAAGTCGTCACTGAGCGAACCAAACCTCGGCATCTTCAACACTTG
GTCCGAAAACACAGACTGCTGCAAAGGATGGTACGGTATTAGCTGCGATCCGGACTCGGG
TCGGGTCACCGATATTTCTCTCCGTGGCGAATCAGAAGACGCTATTTTTCAAAAAGCAGG
CCGGTCCGGTTACATGACCGGTTCGATTGACCCGGCGGTTTGCGGATTAACCTCGCTCAC
TTCCTTCGTCCTCGCCGACTGGAAAGGAATCTCCGGCGAGATTCCTCCTTGCATAACCTC
CTTAGCCTCTCTCCGCATCCTCGACCTCGCCGGGAACAGGATCACCGGAGAGATTCCAGC
CGACATCGGCAAACTCACCAAGCTCGGCGTTCTGAACCTCGCCGAGAATCGGATGTCCGG
CGAGATCCCGGCGTCGCTGACGTCGCTCGCGGAGCTGAAGCATCTCGAGCTGACGGAAAA
CGGAATCTCCGGCGAGATCCAGGCGGATTTCGGATCGTTGAAGATGCTGAGCAGGGCGTT
ACTGGGACGTAACGAACTAACCGGTTTGCTTCCTGAGTCGATGTCCGGTATGGACCGGTT
AGCGGATCTGGATCTATCGAGGAACCATATCGAGGGTCCGATACCGGAATGGGTGGGTAA
CATGAAGGTGCTATCTCTTTTGAATCTCGATTGCAACTCGTTAACCGGTCCGATCCCTGG
TTCGATTCTAAGCAATTCCGGTTTCGGTGTTTTGAATCTGAGCCGAAACGCGTTGGAGGG
AACTATACCCGACGTTTTCGGATCCACGACCTATTTCGTGGCGCTTGATTTGTCTTACAA
TAATCTAGCGGGTCGGATCCCTGACTCGCTATCGTCAGCTAAGTTTGCGGGCCATCTCGA
TATCAGCAACAACAAGCTTTGTGGGCCTATTCCAACCGGTTCTCCTTTTGATCACCTTGG
AGCGTCGTCGTTTAGTGACAACCAGTGTTTGTGCGGTGGCCCTCTGATGAAGACATGTTA
ATAAAACAATCGATTATGGTTCCGGTTCTGCTGAACCGGGTGTTTTATCAAGTTCCTTGT
TGCTCTTGTTCCATATTGGTTTAACTGTTTATTTATTACCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D882TF U 1
AF RS1D882JQ C 453
BS 1 743 RS1D882TF
BS 744 744 RS1D882JQ
BS 745 774 RS1D882TF
BS 775 1241 RS1D882JQ

RD RS1D882TF 774 0 0
GGATCATATATTTATTCCAAAAATGACAAACATGCTGACATCGCCGCTCTGGTCATTACT
CGCCGTGACTTTCATCTCAGTCATCTCCATCGTCCGATCATGCTCGCCTTCCGATCAGAC
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GTCCGAAAACACAGACTGCTGCAAAGGATGGTACGGTATTAGCTGCGATCCGGACTCGGG
TCGGGTCACCGATATTTCTCTCCGTGGCGAATCAGAAGACGCTATTTTTCAAAAAGCAGG
CCGGTCCGGTTACATGACCGGTTCGATTGACCCGGCGGTTTGCGGATTAACCTCGCTCAC
TTCCTTCGTCCTCGCCGACTGGAAAGGAATCTCCGGCGAGATTCCTCCTTGCATAACCTC
CTTAGCCTCTCTCCGCATCCTCGACCTCGCCGGGAACAGGATCACCGGAGAGATTCCAGC
CGACATCGGCAAACTCACCAAGCTCGGCGTTCTGAACCTCGCCGAGAATCGGATGTCCGG
CGAGATCCCGGCGTCGCTGACGTCGCTCGCGGAGCTGAAGCATCTCGAGCTGACGGAAAA
CGGAATCTCCGGCGAGATCCAGGCGGATTTCGGATCGTTGAAGATGCTGAGCAGGGCGTT
ACTGGGACGTAACGAACTAACCGGTTTGCTTCCTGAGTCGATGTCCGGTATGGACCGGTT
AGCGGATCTGGATCTATCGAGGA*CCATATCGAGGGTCCGATACCGGAATGGGT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RS1D882JQ 789 0 0
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TGAACCTCGCCGAGAATCGGATGTCCGGCGAGATCCCGGCGTCGCTGACGTCGCTCGCGG
AGCTGAAGCATCTCGAGCTGACGGAAAACGGAATCTCCGGCGAGATCCAGGCGGATTTCG
GATCGTTGAAGATGCTGAGCAGGGCGTTACTGGGACGTAACGAACTAACCGGTTTGCTTC
CTGAGTCGATGTCCGGTATGGACCGGTTAGCGGATCTGGATCTATCGAGGAACCATATCG
AGGGTCCGATACCGGAATGGGTGGGTAACATGAAGGTGCTATCTCTTTTGAATCTCGATT
GCAACTCGTTAACCGGTCCGATCCCTGGTTCGATTCTAAGCAATTCCGGTTTCGGTGTTT
TGAATCTGAGCCGAAACGCGTTGGAGGGAACTATACCCGACGTTTTCGGATCCACGACCT
ATTTCGTGGCGCTTGATTTGTCTTACAATAATCTAGCGGGTCGGATCCCTGACTCGCTAT
CGTCAGCTAAGTTTGCGGGCCATCTCGATATCAGCAACAACAAGCTTTGTGGGCCTATTC
CAACCGGTTCTCCTTTTGATCACCTTGGAGCGTCGTCGTTTAGTGACAACCAGTGTTTGT
GCGGTGGCCCTCTGATGAAGACATGTTAATAAAACAATCGATTATGGTTCCGGTTCTGCT
GAACCGGGTGTTTTATCAAGTTCCTTGTTGCTCTTGTTCCATATTGGTTTAACTGTTTAT
TTATTACCT

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 2

CO CL4498Contig1 718 2 3 U
GACGACGTAGTAGAGAGCGTTCACTGTGATTGAATCGAAGACGGCGGCGGATGACGACGA
CAAAGGAGCTTGCGATGGAAGGGGAGAAGCATTTAGAGGAGACTATCGAAGCGGCTTTTC
AGATCATCTCCGCCATGAACGATGAGCTCTGCAATCCTTCTCTGTGGTCTACATCATCAT
CCACCGCGAGTTCCACCACGACTGGCTCCAACGGATCGGCTCTCGTTTCCGCCGACGCGG
CTGGGATCGATGGAGCAGCGAATCATTCGGAATCTGCTGGTGGTGGTGGAGGCGGAGCAG
GAGGAGGAAGTGGAAACAGCGCTCTGGATGAAGCTAGTCTTCGCTATAAGAACTCCGTGA
CTTCGCTTCGTGCTGTTCTTGCTGCCATCCCCAATTCTCACAAGACAAAAGTATCCGAAA
CTGAAAATGGTTTAGAAACTCCTGAAGACGAAGAAGAAGAAGACGAAATCGAAAAGTTGG
AGGAGCAAGCCTTGAGTCTCAGAAAGGAGATTGCGGAGAAGAATGTTCATGTCAAAGAGC
TTATCGACAAATTTCGACAACTTATAGCAGATATCTCCACATGGCAAAGCCCTTGTTCTC
TTTGAGTTTTTTTTTCTCTTATTTGACAATGGTGTGATCAGTCAAGACAAGGTGCTAAGC
CTTTGTTCTTGAACTCCTCACTTGATGTATTAGTTTTAGGTATTTTGTTCTTTTGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FJ18TF U 1
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CCACCGCGAGTTCCACCACGACTGGCTCCAACGGATCGGCTCTCGTTTCCGCCGACGCGG
CTGGGATCGATGGAGCAGCGAATCATTCGGAATCTGCTGGTGGTGGTGGAGGCGGAGCAG
GAGGAGGAAGTGGAAACAGCGCTCTGGATGAAGCTAGTCTTCGCTATAAGAACTCCGTGA
CTTCGCTTCGTGCTGTTCTTGCTGCCATCCCCAATTCTCACAAGACAAAAGTATCCGAAA
CTGAAAATGGTTTAGAAACTCCTGAAGACGAAGAAGAAGAAGACGAAATCGAAAAGTTGG
AGGAGCAAGCCTTGAGTCTCAGAAAGGAGATTGCGGAGAAGAATGTTCATGTCAAAGAGC
TTATCGACAAATTTCGACAACTTATAGCAGATATCTCCACATGGCAAAGCCCTTGTTCTC
TTTGAGTTTTTTTTTCTCTTATTTGACAATGGTGTGATCAGTCAAGACAAGGTGCTAAGC
CTTTGTTCTTGAACTCCTCACTTGATGTATTAGTTTTAG*TATTTTGTTCTTTTGACT

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GGAGATTGCGGAGAAGAATGTTCATGTCAAAGAGCTTATCGACAAATTTCGACAACTTAT
AGCAGATATCTCCACATGGCAAAGCCCTTGTTCTCTTTGAGTTTTTTTT*CTCTTATTTG
ACAATGGTGTGATCAGTCAAGACAAGGTGCTAAGCCTTTGTTCTTGAACTCCTCACTTGA
TGTATTAGTTTTAGGTATTTTGTTCTTTTGACT

QA 1 333 1 333
DS 



AS 1 2

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GACGAGTCCATGGTGCCTCTAACAATCAACTGCTGGCCTTCGGTTTCTGGAAACGAGACG
TATGTCAGCATAGAGTATGAAGCCTCGTCCATGTTTGATCTAACTAATGTTATCATCTCC
GTACCTCTTCCTGCTTTGAGAGATGCACCAATGGTTAAACAATGTGATGGGGACTGGAGG
TACGACTCAAGGAATTCAGTTTTGGAATGGTCTATACTTTTTATCGACAACTCAAACCGC
AGTGGGTCAATGGAGTTTGTAGTGCCACCAGTTGATTCATCGGTGTTCTTCCCCATCTCT
GTTCAGTTTGCAGCAACCAATACATACAGTGGATCGAAGGTGACGGGAATGATTCCTCTG
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AATTACGAAGTCGTGTGAGAAGGGTCTTAAGACTTGGAGCCTCTTGTTTTTCTTTTTTTT
TTAATTGCTTTTTATACTATCTTTTCTGGGGATTAAATCTTTCATTTTCTAGGCTTTTGC
TAAGTTTCTTATACTTCTAAGACACAAAACTTAACGACTTTGATATACGCCAGCATCTCG
CTTTAACTTTTG


BQ
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AF RS1FD81JQ C 1
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GTACCTCTTCCTGCTTTGAGAGATGCACCAATGGTTAAACAATGTGATGGGGACTGGAGG
TACGACTCAAGGAATTCAGTTTTGGAATGGTCTATACTTTTTATCGACAACTCAAACCGC
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CTTTAACTTTTG

QA 1 672 1 672
DS 

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TGACTCCAAGGTTTGTGCAGAGGACGCAGCTGGTTGCACAGAATTACGAAGTCGTGTGAG
AAGGGTCTTAAGACTTGGAGCCTCTTGTTTTTCTTTTTTTTT*AATTGCTTTTTATACTA
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AGACACAAAACTTAACGACTTTGATATACGCCAGCATCTCGCTTTAACTT

QA 1 350 1 350
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

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GTTAGCGTTGATCGATCACGTGACGTCGATGCCTAGCGTTGTGATACCGATCAAGGAGCT
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TGGTTGTGTCGACGTGGACATGAAGGAGATCGGTGCTGACTTCTACGCTAGCAATCTCCA
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ATGAGGATTTGGGAAGAAGTGAAGTAGCCTATATATATGTATTTTCTAGTCAGGTCATAA
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ATTTGCTCGACATGTCTGTCTTAAAAACGTTAGCAACGTCGGTAATAAAGTAACAACGGT
CACTATTTTCAGTGTTGTTGTTGGTTCGATGTCACTGTCTTAAAAAAAATCTTTAATTTT
GTGTGTACGTTTATAATGATTCTCTAATTAAATCCATTGTTATTC


BQ
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AF RS1D094TF U 1
AF RS1D094JQ C 423
BS 1 647 RS1D094TF
BS 648 648 RS1D094JQ
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BS 701 757 RS1D094TF
BS 758 1245 RS1D094JQ

RD RS1D094TF 762 0 0
GTCCGGCGGGGAGGTGATCGAGGTTCAGCTCCCGTTCCCGGTTAACTCGGCTGAGGAGAT
AATCAACCGGTTTAGAGCCGGTTTGGAGTTGGGTAAGGCCAACGGTACCAGGAGGGTGAG
GTTAGCGTTGATCGATCACGTGACGTCGATGCCTAGCGTTGTGATACCGATCAAGGAGCT
TGCGAAGATATGTAGAGAGGAAGGCGTTGACCAAGTGTTCGTTGACGCGGCTCACGGGAT
TGGTTGTGTCGACGTGGACATGAAGGAGATCGGTGCTGACTTCTACGCTAGCAATCTCCA
CAAGTGGTTCTTCGCGCCGCCTTCTGTCGCTTTCTTGTATTGCAAAAGGTCCGGTGGTGG
TGGTGGTAGTAATCTGCATCACCCGGTTGTGTCTCACGAGTACAGTAACGGTTTAGCTGT
TGAGAGCACGTGGGTCGGGACTAGGGACTATAGTGCGCAGCTGGTCGTGCCATCGATTTT
GGAGTTTGTGAACCGGTTCGAAGGTGGGATTGATGGGATAAAGAAGAGGAATCATGAGTC
TGTGGTTTAGATGGGACAGATGCTGGTTAAGTCTTGGGGGACGCAGCTAGGTTGTCCGCC
TGAGATGTGTGCGGGTATGGTTATGGTTGGGTTGCCTATGTGCTTAG*TGTGTCGAGCGA
GTCGGATGCTGTGAAGCTTAG*AACCTTTTGAGAGAGAG*TTCTGCATTGAGATCCCGAC
CTGCTATAGAGCGCCTGGTGAGGGGGAGACTGATGAT
CGATC

QA 1 757 1 757
DS 

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AGAGCACGTGG*TCGGGACTAGGGACTATAGTGCGCAGCTGGTCGTGCCATCGATTT*GG
AGTTTGTGAACCGGTTCGAAGGTGGGATTGATGGGATAAAGAAGAGGAATCATGAGTCTG
TGGTTTAGATGGGACAGATGCTGGTTAAGTCTTGGGGGACGCAGCTAGGTTGTCCGCCTG
AGATGTGTGCGGGTATGGTTATGGTTGGGTTGCCTATGTGCTTAGGTGTGTCGAGCGAGT
CGGATGCTGTGAAGCTTAGGAACCTTTTGAGAGAGAGGTTCTGCATTGAGATCCCGACCT
GCTATAGAGCGCCTGGTGAGGGGGAGACTGATGATTCGATCACCGGGTATGTTCGCATTT
CGTTTCAAGTTTATAACAAACCTGAGGAGTATCATAGGCTTAAGGACGCAGTAAATGAAC
TTGTGAGAGATGGGTTCAAATGCACGTCTCTATCTGATTGAATAAGGGTAACAAGCTATT
TCGAGGTGGAGTAAATGAATAATGAATGCCTGGTGGAAGTTATGATGGTTTAGGTACCAT
GAGGATTTGGGAAGAAGTGAAGTAGCCTATATATATGTATTTTCTAGTCAGGTCATAAAA
CATCTTCTCAATACAGTAATGATTGTATGAGAAGACTTTGCAAGCATTCTTCTATTTCAT
TTGCTCGACATGTCTGTCTTAAAAACGTTAGCAACGTCGGTAATAAAGTAACAACGGTCA
CTATTTTCAGTGTTGTTGTTGGTTCGATGTCACTGTCTTAAAAAAAATCTTTAATTTTGT
GTGTACGTTTATAATGATTCTCTAATTAAATCCATTGTTATTC

QA 1 823 1 823
DS 



AS 1 2

CO CL4503Contig1 1255 2 4 U
GCGGTTTAGTGGTTTTCTCGGTCTTCCCTCTGACCTCGAACCGGAGGTCCCTCCTCAGGC
TCCTAGCGCCAGTGCAAGTGTTTTTGGAGTATCAGCAAAGTCTATGCAATGCTCTTACGA
CAACAGAGGAAATAGCGTCCCAACGATCCTTCTCAGGATGCAGAAACGTCTTTATACCGA
AGGAGGTCTTAAGGCAGAAGGAATATTCCGAATAAATCCAGACAATAGCAAAGAAGAGCA
TGTCCGAAAGCAGCTGAACCGTGGTGTAATACCACGTGGAATCGATGTTCATTGCTTGGC
AGGTTTAATAAAGGCCTGGTTTAGGGAGCTACCTACAGGAGTTCTTGATGTGTTGACACC
AGAGCAAGTGATGAAATGCAACACAGAACAAGATTGTAACAAGCTCGTGACTCTTCTTCC
TCCGGTTGAATCTGCGCTTCTTGATTGGGCCATCGGTTTAATGGCTGACGTGGTGGAGCA
TGAACAGTTTAACAAAATGAATGCTCGCAATGTAGCTATGGTTTTCGCTCCAAACATGAC
CCAAATGGCAGATCCTTTAACCGCATTGATCCACGCGGTACAAGTGATGAACTTTCTCAA
GACTTTGATCTTAATGAACCTCAAAGAGAGGGAAAACGCAGATGCCAAAACAAGGTGGAT
CGAGAAACAAACCTCAGATCCTTCAGAAGAATGGGAATCACAACACTCTAAGATAGTCCC
TGAGAAACCCAACAATAACCCTAAGTTCTTGAGAGTGGCTACTCTTTGTAGGCTAGAAGC
TGACAATGAAGAAAAGGTTTGGAACATTGAGAAGAGAAACGATCATAAAGATACAACTAA
AAATACTGGAACTGTTCAGAGGCGGTGTAAGCATCCATTGTTCAAGTCAAGCAGATCGAC
AAAGAAACCTCTTGTAAGTAATCAAGATGAAGGAAGAAGAGGACGAGATGCTTGGGGTTC
ACGTCTCTCTTCTTTGCCTTGGTAAATTTTAATTACTACATACCTCCATTTCGTTCCTTT
TCTGCTTTTGAGAGTGTAAAGATGTATTGTGAAGTATTGATTGATTATAGGTGTTAGTTG
TTTGAACTCTTAGTTCATTCATACCGACTCCGCCCGGTGTTTTTGAGCTTGGTTCATCTA
AAACCAGCACAAAACCAATGCCCTGACCAATATGCATGTGATTTATTATTTTTGGTCGGA
TATTTACTTGACAGTTACGTTAATCTTTTCTTAGAGACAATCCTACTCTGTTCCG


BQ
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AF RS1DZ89TF U 1
AF RS1DZ89JQ C 556
BS 1 654 RS1DZ89TF
BS 655 655 RS1DZ89JQ
BS 656 719 RS1DZ89TF
BS 720 1255 RS1DZ89JQ

RD RS1DZ89TF 722 0 0
GCGGTTTAGTGGTTTTCTCGGTCTTCCCTCTGACCTCGAACCGGAGGTCCCTCCTCAGGC
TCCTAGCGCCAGTGCAAGTGTTTTTGGAGTATCAGCAAAGTCTATGCAATGCTCTTACGA
CAACAGAGGAAATAGCGTCCCAACGATCCTTCTCAGGATGCAGAAACGTCTTTATACCGA
AGGAGGTCTTAAGGCAGAAGGAATATTCCGAATAAATCCAGACAATAGCAAAGAAGAGCA
TGTCCGAAAGCAGCTGAACCGTGGTGTAATACCACGTGGAATCGATGTTCATTGCTTGGC
AGGTTTAATAAAGGCCTGGTTTAGGGAGCTACCTACAGGAGTTCTTGATGTGTTGACACC
AGAGCAAGTGATGAAATGCAACACAGAACAAGATTGTAACAAGCTCGTGACTCTTCTTCC
TCCGGTTGAATCTGCGCTTCTTGATTGGGCCATCGGTTTAATGGCTGACGTGGTGGAGCA
TGAACAGTTTAACAAAATGAATGCTCGCAATGTAGCTATGGTTTTCGCTCCAAACATGAC
CCAAATGGCAGATCCTTTAACCGCATTGATCCACGCGGTACAAGTGATGAACTTTCTCAA
GACTTTGATCTTAATGAACCTCAAAGAGAGGGAAAACGCAGATGCCAAAACAAG*TGGAT
CGAGAAACAAACCTCAGATCCTTCAGAAGAATGGGAATCACAACACTCTAAGATAGTCC
TGA

QA 1 719 1 719
DS 

RD RS1DZ89JQ 700 0 0
TTTAACCGCATTGATCCACGCGGTACAAGTGATGAACTTTCTCAAGACTTTGATCTTAAT
GAACCTCAAAGAGAGGGAAAACGCAGATGCCAAAACAAGGTGGATCGAGAAACAAACCTC
AGATCCTTCAGAAGAATGGGAATCACAACACTCTAAGATAGTCCCTGAGAAACCCAACAA
TAACCCTAAGTTCTTGAGAGTGGCTACTCTTTGTAGGCTAGAAGCTGACAATGAAGAAAA
GGTTTGGAACATTGAGAAGAGAAACGATCATAAAGATACAACTAAAAATACTGGAACTGT
TCAGAGGCGGTGTAAGCATCCATTGTTCAAGTCAAGCAGATCGACAAAGAAACCTCTTGT
AAGTAATCAAGATGAAGGAAGAAGAGGACGAGATGCTTGGGGTTCACGTCTCTCTTCTTT
GCCTTGGTAAATTTTAATTACTACATACCTCCATTTCGTTCCTTTTCTGCTTTTGAGAGT
GTAAAGATGTATTGTGAAGTATTGATTGATTATAGGTGTTAGTTGTTTGAACTCTTAGTT
CATTCATACCGACTCCGCCCGGTGTTTTTGAGCTTGGTTCATCTAAAACCAGCACAAAAC
CAATGCCCTGACCAATATGCATGTGATTTATTATTTTTGGTCGGATATTTACTTGACAGT
TACGTTAATCTTTTCTTAGAGACAATCCTACTCTGTTCCG

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

CO CL4504Contig1 737 2 2 U
TTTTTTCAAGGGTCCTTGATCCTGCATCTCCTTCCCCTATCTCTCTCTGTCGATAAAGTT
TTTTTTCTGTCGATTAAGTTTCCAGATTCACAATTTTTCAAGGGTCTAACTCACAAAACT
CATCTTCTCTCTCTCTTGTATCCCCAATTTTTGTAAGTCATGGTCACCATAAACTTCATC
TTCTTTCTCTCCTCTCCCTCCATCGTTCTCTGTCTCCCTCTCAGTGTCCTGCAGTGGCGG
ACACTGAACAGTGATGCCTCCTCTCTGTTCCGTCATGCCTCTCCCCTACTTCGTGACAGA
TCTGCTCCTCTCCCTCGTCCTTCAGTTTCTCTTCTCTGTCGCAATCTCTCTCTCTTTCTT
CCTCTTTGTTTTGATTGCTTTCCACAGTGACTGATTATTTTTTTGGGTTTTTAAGCAGGT
TTCAGAGAAAGACTGGAGAAAATAGTGTAAGCTTGGAGAATCAGAACAAGGTTGGAGAAT
ACATGATAGGAGGCATCGAAGAAGACAGAGCGGCGGCCTCGAAGGCAGAAGGCAGGACAA
CGGCGTCGGATATGGTACTGAAGCGGGGCTGGTTGACGGCGTAGGTTGAAGAAGAACTTG
GTTTGACAGCTGAATTAGGTTTAGCCCTAGTAAATTGGGTTTAATAAACCAATTTGTATT
TGTAACCATGTATCCAAATTTCAATTTGTAAAGAATACCAATTTAGATACCGATTTAATG
ATGAACTAGATTTTGAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DA55TF U 1
AF RS1DY82TF U 94
BS 1 410 RS1DA55TF
BS 411 737 RS1DY82TF

RD RS1DA55TF 422 0 0
TTTTTTCAAGGGTCCTTGATCCTGCATCTCCTTCCCCTATCTCTCTCTGTCGATAAAGTT
TTTTTTCTGTCGATTAAGTTTCCAGATTCACAATTTTTCAAGGGTCTAACTCACAAAACT
CATCTTCTCTCTCTCTTGTATCCCCAATTTTTGTAAGTCATGGTCACCATAAACTTCATC
TTCTTTCTCTCCTCTCCCTCCATCGTTCTCTGTCTCCCTCTCAGTGTCCTGCAGTGGCGG
ACACTGAACAGTGATGCCTCCTCTCTGTTCCGTCATGCCTCTCCCCTACTTCGTGACAGA
TCTGCTCCTCTCCCTCGTCCTTCAGTTTCTCTTCTCTGTCGCAATCTCTCTCTCTTTCTT
CCTCTTTGTTTTGATTGCTTTCCACAGTGACTGATTATTTTTTTGGGTTT
GTAAACAAGTTT

QA 1 410 1 410
DS 

RD RS1DY82TF 644 0 0
TTTTTCAAGGGTCTAACTCACAAAACTCATCTTCTCTCTCTCTTGTATCCCCAATTTTTG
TAAGTCATGGTCACCATAAACTTCATCTTCTTTCTCTCCTCTCCCTCCATCGTTCTCTGT
CTCTCTCTCAGTGTCCTGCAGTGGCGGACACTGAACAGTGATGCCTCCTCTCTGTTCCGT
CATGCCTCTCCCCTACTTCGTGACAGATCTGCTCCTCTCCCTCGTCCTTCAGTTTCTCTT
CTCTGTCGCAATCTCTCTCTCTTTCTTCCTCTTTGTTTTGATTGCTTTCCACAGTGACTG
ATTATTTTTTTGGGTTTTTAAGCAGGTTTCAGAGAAAGACTGGAGAAAATAGTGTAAGCT
TGGAGAATCAGAACAAGGTTGGAGAATACATGATAGGAGGCATCGAAGAAGACAGAGCGG
CGGCCTCGAAGGCAGAAGGCAGGACAACGGCGTCGGATATGGTACTGAAGCGGGGCTGGT
TGACGGCGTAGGTTGAAGAAGAACTTGGTTTGACAGCTGAATTAGGTTTAGCCCTAGTAA
ATTGGGTTTAATAAACCAATTTGTATTTGTAACCATGTATCCAAATTTCAATTTGTAAAG
AATACCAATTTAGATACCGATTTAATGATGAACTAGATTTTGAC

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 2

CO CL4505Contig1 1217 2 4 U
GATAACAATGCTACGAACCAATTTCTACATTTCAAATCGCTCTTACACGGCGAAACAACC
TTCGCTCTTTAGGGCACAGCACCGTGTTTCCTCTGTTCGCATCACCCATTGTACTGGTGA
TGGTGGTGGTGCTACCGCCGTCCCCTCCTCCTCCCGCCTCCGTGATCTCGTTTTCGTCGT
GAACCCTCAAGGAGCAAATGGTAGAACAGCTCAGGAATGGAAGAAGTTGCTTCCTTACCT
TCGATCTCGTCTGGGTAAAGACTGTAATATATGTGAGTCCTTAACATCTGGTCCTTCTCA
TGCCATTGACATTACAAGAGAGGCTATTAGGGATGGTGCAGATGCTGTCATTGCTGTTGG
AGGTGATGGAACATTGCATGAGGTTGTTAATGGTTTCTTTTGGGAGGGGAAACCTGTTGG
TAATCTCAATAGCGAAGCTGGCCATTCGGCTGCACTTGGTCTGATTCCGTTAGGTACTGG
TTCGGATTTTGCTAGGACATTTGGTTGGAACAATGATCCTCGTGAAGCTGTGGAGCGCAT
TGCTAAAGGGATACGATCACGGTTTGATGTCGGTGTTATCGACCAGGAAGGAAGGGATTC
ACATTACTTCATTAACGTTGCTGATGTTCATTTGAGTGCAAAGGCAGGCTTTTACGCTTC
AAAGTGCAAGAAATTTGGAAACTTGTGCTATGTAATCGGTGCTCTTCAAGCTTTTATGGG
ACATCACAATCGAGATATGAGGATTAAGGTCAATGGAGGTGAATGGGAAGTATATCCACA
AGTCACTGCTCTCTGTGTTGGAAATGCTAAGTACTTTGGCGGAGGAATGAAAATCACTCC
CAATGCTGTCCCTGGAAATGGAAACCTTGAGGTTGTGGTTCTTCAAGACTTCAAATGGTT
TGATTTCATACTGAAGCTTCATAAGCTATACAATGGGACGCATCTCTCGGTTAACAATGT
GAGCTCGAGAAGTGTACAAAGTATAGAAGTAGAGGAGATATCAGAGAGTGGAAGCATCTA
TGTTCAGTCAGATGGAGAACATCTTGGGTTTCTACCTAGAAAATTTCAGGTTTTACCCGG
TGCCATCGACATAATCAGCTAATTATCACAACCGCACCTACCAAGATAGTGTAAAAGGAC
TCAATCATACATTCAGCTTCTTTTTGTTTAGACTGTAAAGATTCTTCTTATTTGAAGTTT
GATTCATTGTTTAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BR10TF U 1
AF RS1BR10JQ C 469
BS 1 572 RS1BR10TF
BS 573 573 RS1BR10JQ
BS 574 633 RS1BR10TF
BS 634 1217 RS1BR10JQ

RD RS1BR10TF 633 0 0
GATAACAATGCTACGAACCAATTTCTACATTTCAAATCGCTCTTACACGGCGAAACAACC
TTCGCTCTTTAGGGCACAGCACCGTGTTTCCTCTGTTCGCATCACCCATTGTACTGGTGA
TGGTGGTGGTGCTACCGCCGTCCCCTCCTCCTCCCGCCTCCGTGATCTCGTTTTCGTCGT
GAACCCTCAAGGAGCAAATGGTAGAACAGCTCAGGAATGGAAGAAGTTGCTTCCTTACCT
TCGATCTCGTCTGGGTAAAGACTGTAATATATGTGAGTCCTTAACATCTGGTCCTTCTCA
TGCCATTGACATTACAAGAGAGGCTATTAGGGATGGTGCAGATGCTGTCATTGCTGTTGG
AGGTGATGGAACATTGCATGAGGTTGTTAATGGTTTCTTTTGGGAGGGGAAACCTGTTGG
TAATCTCAATAGCGAAGCTGGCCATTCGGCTGCACTTGGTCTGATTCCGTTAGGTACTGG
TTCGGATTTTGCTAGGACATTTGGTTGGAACAATGATCCTCGTGAAGCTGTGGAGCGCAT
TGCTAAAGGGATACGATCACGGTTTGATGTCG*TGTTATCGACCAGGAAGGAAGGGATTC
ACATTACTTCATTAACGTTGCTGATGTTCATTT

QA 1 633 1 633
DS 

RD RS1BR10JQ 749 0 0
GTTAGGTACTGGTTCGGATTTTGCTAGGACATTTGGTTGGAACAATGATCCTCGTGAAGC
TGTGGAGCGCATTGCTAAAGGGATACGATCACGGTTTGATGTCGGTGTTATCGACCAGGA
AGGAAGGGATTCACATTACTTCATTAACGTTGCTGATGTTCATTTGAGTGCAAAGGCAGG
CTTTTACGCTTCAAAGTGCAAGAAATTTGGAAACTTGTGCTATGTAATCGGTGCTCTTCA
AGCTTTTATGGGACATCACAATCGAGATATGAGGATTAAGGTCAATGGAGGTGAATGGGA
AGTATATCCACAAGTCACTGCTCTCTGTGTTGGAAATGCTAAGTACTTTGGCGGAGGAAT
GAAAATCACTCCCAATGCTGTCCCTGGAAATGGAAACCTTGAGGTTGTGGTTCTTCAAGA
CTTCAAATGGTTTGATTTCATACTGAAGCTTCATAAGCTATACAATGGGACGCATCTCTC
GGTTAACAATGTGAGCTCGAGAAGTGTACAAAGTATAGAAGTAGAGGAGATATCAGAGAG
TGGAAGCATCTATGTTCAGTCAGATGGAGAACATCTTGGGTTTCTACCTAGAAAATTTCA
GGTTTTACCCGGTGCCATCGACATAATCAGCTAATTATCACAACCGCACCTACCAAGATA
GTGTAAAAGGACTCAATCATACATTCAGCTTCTTTTTGTTTAGACTGTAAAGATTCTTCT
TATTTGAAGTTTGATTCATTGTTTAAACC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

CO CL4506Contig1 1196 2 2 U
GGATTCACCAAAGCATCACATACACTCTTACTTCTCTTCTCATTTTCTTTATATTTTTCC
TCTTTACCTTTGTCATTTAGAGATGGCCGACGTTAAGGTTGAACAAGTCATTACTCCAGC
CTCCTCGCCGTGATCAACAAGTTCGCCATCACCTATTTCAACTACCCCGGCCTCCTCACC
GCCCTCCAGTACCTAACCTCCACCGTCGGCGTCTACCTCCTCGGGAAGCTAGGTTTCCTC
CACCACGACGCCTTCACCTGGGACACCGCCAAGAAGTTCCTCCCCGCCGCCCTCGTCTTC
TACCTCGCCATCTTCACCAACACCAACCTCCTCCGCCACGCCAACGTCGACACCTTCATC
GTCTTCCGCTCCCTCACCCCTCTCCTCGTCGCCATCGCCGACACCGTCTTCCGCTCCCAG
CCGCGTCCTTCCAAGCTCACGTTCTTGTCTCTGCTCGTGATCCTCGCTGGCGCGGTTGGT
TACGTGGCGAACGACTCTGCCTTCACCCTCACGGCTTATTCGTGGGCCGTGGCTTATCTC
GTCACCATCACCACCGAGATGGTTTACATCAAGCATATGGTTTCGAGTCTCGAGCTCAAC
ACGTGGGGGTTTGTTCTGTACAACAACCTATTGTCGCTGATGATCGCGCCCATCTTTTGG
TTTCTAACCGGGGAGTACACGGACGTTTTCACGGCCGTTAATGCTAACGGAGGAGGGAGC
TTGTTTGAGCCAGTAGCATTTTTCGCTGTGGCGTTGTCGTGTGTGTTTGGTTTTCTCATC
AGCTTCTTCGGGTTCGCTGCTAGTAAAGCTATCTCTGCTACAGCTTTTACGGTGACTGGT
GTTGTGAACAAGTTCTTGACTGTTGTGATTAATGTTTTGATTTGGGATAAGCATGCGAGT
CCTGTTGGGTTGGTCTGTCTTCTCGTTACGATCTGTGGTGGTATTGGTTATCAGCAGTCC
GTGACCGTGGCTAAGAAACCGGCCAGCGGTCCATCTCAAGTGTCGAACGACAGTGAGAAG
GTTGATGAAGAGTCGGTGGAGTTGATTCCGGGGAAAGTAGATACTAATGTATGAGAAGGT
TTAGCATTTCAATATTTTGAAATCTGAAGAGGTTTCTGGCCTCTTATAGTATCATTTTTG
TGAACCTTTTACTCTCATTCTCATATTCCATTAATACAAATATTCAAATATTCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1C606TF U 1
AF RS1C606JQ C 447
BS 1 759 RS1C606TF
BS 760 1196 RS1C606JQ

RD RS1C606TF 759 0 0
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TCTTTACCTTTGTCATTTAGAGATGGCCGACGTTAAGGTTGAACAAGTCATTACTCCAGC
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CACCACGACGCCTTCACCTGGGACACCGCCAAGAAGTTCCTCCCCGCCGCCCTCGTCTTC
TACCTCGCCATCTTCACCAACACCAACCTCCTCCGCCACGCCAACGTCGACACCTTCATC
GTCTTCCGCTCCCTCACCCCTCTCCTCGTCGCCATCGCCGACACCGTCTTCCGCTCCCAG
CCGCGTCCTTCCAAGCTCACGTTCTTGTCTCTGCTCGTGATCCTCGCTGGCGCGGTTGGT
TACGTGGCGAACGACTCTGCCTTCACCCTCACGGCTTATTCGTGGGCCGTGGCTTATCTC
GTCACCATCACCACCGAGATGGTTTACATCAAGCATATGGTTTCGAGTCTCGAGCTCAAC
ACGTGGGGGTTTGTTCTGTACAACAACCTATTGTCGCTGATGATCGCGCCCATCTTTTGG
TTTCTAACCGGGGAGTACACGGACGTTTTCACGGCCGTTAATGCTAACGGAGGAGGGAGC
TTGTTTGAGCCAGTAGCATTTTTCGCTGTGGCGTTGTCG

QA 1 759 1 759
DS 

RD RS1C606JQ 750 0 0
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CCTCACGGCTTATTCGTGGGCCGTGGCTTATCTCGTCACCATCACCACCGAGATGGTTTA
CATCAAGCATATGGTTTCGAGTCTCGAGCTCAACACGTGGGGGTTTGTTCTGTACAACAA
CCTATTGTCGCTGATGATCGCGCCCATCTTTTGGTTTCTAACCGGGGAGTACACGGACGT
TTTCACGGCCGTTAATGCTAACGGAGGAGGGAGCTTGTTTGAGCCAGTAGCATTTTTCGC
TGTGGCGTTGTCGTGTGTGTTTGGTTTTCTCATCAGCTTCTTCGGGTTCGCTGCTAGTAA
AGCTATCTCTGCTACAGCTTTTACGGTGACTGGTGTTGTGAACAAGTTCTTGACTGTTGT
GATTAATGTTTTGATTTGGGATAAGCATGCGAGTCCTGTTGGGTTGGTCTGTCTTCTCGT
TACGATCTGTGGTGGTATTGGTTATCAGCAGTCCGTGACCGTGGCTAAGAAACCGGCCAG
CGGTCCATCTCAAGTGTCGAACGACAGTGAGAAGGTTGATGAAGAGTCGGTGGAGTTGAT
TCCGGGGAAAGTAGATACTAATGTATGAGAAGGTTTAGCATTTCAATATTTTGAAATCTG
AAGAGGTTTCTGGCCTCTTATAGTATCATTTTTGTGAACCTTTTACTCTCATTCTCATAT
TCCATTAATACAAATATTCAAATATTCTCT

QA 1 750 1 750
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TGGCTTTTCCGGTGGTTGGCTCCATCGTTGCTGCATCATTCTCCGCCTTCTTGGCTCTTC
TCTTGCAGTAAATATATATATATATTGAGGAGGGGCTCTACGAGATAACAAAACTCTTTT
TTGTTATGATAGGTTCTTTAGAATCTATGGAAAATAATTTTGTCAAATAACCCATTTTGA
TGTATAATCTCATTGTATAAGTTATTACACTAATACTTTTATGAGTATATGATAATAATA
AAATAATATTGTCCTATATAAGCGCTTGTTGATCAGATTTTATAAATCTGGTTAGTAACT
TTATTGCTTTGTGATTAATATCTTTATACACAAAATGGCTGCATGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DR44TF U 1
AF RS1CR10TF U 118
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BS 433 530 RS1CR10TF

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CAATGAAGAACATCAACAACTTCTTTGTCGCCCTCTTTGTCTCGGTTGTGTTAGTGAGCT
CAGCCACAGCAGCTACCATGGAGTCTCCAGCACCAGCACCAGGTGCTTCCTCTGCCACCG
TGGCTTTTCCGGTGGTTGGCTCCATCGTTGCTGCATCATTCTCCGCCTTCTTGGCTCTTC
TCTTGCAGTAAATATATATATATATTGAGGAGGGGCTCTACGAGATAACAAAACTCTTTT
TTGTTATGATAGGTTCTTTAGAATCTATGGAAAATAATTTTGTCAAATAACCCATTTTGA
TGTATAATCTCATTGTATAAGTTATTACACTAATACTTTTATGAGTATATGATAATAATA
AAATAATATTGT

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DS 

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CCGTGGCTTTTCCGGTGGTTGGCTCCATCGTTGCTGCATCATTCTCCGCCTTCTTGGCTC
TTCTCTTGCAGTAAATATATATATATATTGAGGAGGGGCTCTACGAGATAACAAAACTCT
TTTTTGTTATGATAGGTTCTTTAGAATCTATGGAAAATAATTTTGTCAAATAACCCATTT
TGATGTATAATCTCATTGTATAAGTTATTACACTAATACTTTTATGAGTATATGATAATA
ATAAAATAATATTGTCCTATATAAGCGCTTGTTGATCAGATTTTATAAATCTGGTTAGTA
ACTTTATTGCTTTGTGATTAATATCTTTATACACAAAATGGCTGCATGAAAAA

QA 1 413 1 413
DS 



AS 1 2

CO CL4509Contig1 1173 2 2 U
GGGTACAAAACGCGAAGGACAAGGACGTGGGTTATCTCCCCTGGATCTAACGATGTCACT
CCACGCATCTTGTTTGATAGATCATCGGAAGATGTGTACTCAGATCCTGGCTCAACCATG
CTGAGGAGAACAGCTGCTGGAACGTACGTAATAGCAAAGATAAAGAAAGAAAATGATGAA
GGCACTTATGTCTTACTGAACGGAAGTGGGGCTACGCCACAAGGGAATGTACCCTTCCTT
GACTTGTTTGACATAAACACAGGCAACAAAGAACGGATATGGGAGAGCGACAAGGAAAAG
TATTTCGAGACTGTTGTGGCCTTGATGTCTGACCAGAAAGAAGGGGATTTGAAAATGGAG
GAGCTGAAAATTTTGACGTCAAAGGAGTCAAAAACTGAGAACACCCAATATTCTCTCCAA
CTTTGGCCTGACAGGAAAGTGCAACAGATTACAAACTTTCCTCATCCTTATCCTCAGTTG
GCTTCGTTACAGAAAGAGATGAAGTCGTCAGGCGTGGAGTGGCTCATCCCAGCAAAATTG
CTGTTGGGGGACACTCGTATGGGGCGTTTATGACTGCAAATCTCCTTGCTCACGCTCCTC
ATCTTTTCTCTTGCGGAATAGCTCGATCTGGCGCTTATAACAGAACACTGACACCCTTTG
GTTTCCAGAACGAGGACCGAACACTCTGGGAAGCTACCAACGTTTATGTCGAGATGAGCC
CATTCATGTCAGCTAATAAAATCAAGAAGCCAATCTTGCTCATCCATGGTGAAGAAGACA
ATAACCCAGGAACTCTAACAATGCAGTCTGACAGATTTTTCAACGCACTAAAAGGCCACG
GCGCTCTTTGCCGCCTTGTGATTCTTCCTCACGAGAGCCATGGGTACTCAGCACGGGAAA
GCATTATGCACGTTTTCTGGGAAACTGACCGCTGGCTTCAAAAATACTGTGTTCCAAACA
CATCAGATGCAGACACAAGTCCAGACCAGTCCAAAGAAGAATCAGATTCCTCAGAGAAAG
TAGCGACTCCCACAGGAGGTGGTAACCCTGAGTTTGAAGATCACTCCAAGATTAGGAGAT
CACTTCTCTGAGGTCTTTGTGTTTGGTATGGCCACCAAAGGCAGATATTCGAATGCACTT
GCAGAAACAATGCAACACGCTATTTTTTTTCAT


BQ
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AF RS1CV49JQ C 440
BS 1 754 RS1CV49TF
BS 755 1173 RS1CV49JQ

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GACTTGTTTGACATAAACACAGGCAACAAAGAACGGATATGGGAGAGCGACAAGGAAAAG
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CTTTGGCCTGACAGGAAAGTGCAACAGATTACAAACTTTCCTCATCCTTATCCTCAGTTG
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GTTTCCAGAACGAGGACCGAACACTCTGGGAAGCTACCAACGTTTATGTCGAGATGAGCC
CATTCATGTCAGCTAATAAAATCAAGAAGCCAAT

QA 1 754 1 754
DS 

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TGAAGTCGTCAGGCGTGGAGTGGCTCATCCCAGCAAAATTGCTGTTGGGGGACACTCGTA
TGGGGCGTTTATGACTGCAAATCTCCTTGCTCACGCTCCTCATCTTTTCTCTTGCGGAAT
AGCTCGATCTGGCGCTTATAACAGAACACTGACACCCTTTGGTTTCCAGAACGAGGACCG
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AATCAAGAAGCCAATCTTGCTCATCCATGGTGAAGAAGACAATAACCCAGGAACTCTAAC
AATGCAGTCTGACAGATTTTTCAACGCACTAAAAGGCCACGGCGCTCTTTGCCGCCTTGT
GATTCTTCCTCACGAGAGCCATGGGTACTCAGCACGGGAAAGCATTATGCACGTTTTCTG
GGAAACTGACCGCTGGCTTCAAAAATACTGTGTTCCAAACACATCAGATGCAGACACAAG
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TGGTAACCCTGAGTTTGAAGATCACTCCAAGATTAGGAGATCACTTCTCTGAGGTCTTTG
TGTTTGGTATGGCCACCAAAGGCAGATATTCGAATGCACTTGCAGAAACAATGCAACACG
CTATTTTTTTTCAT

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL4510Contig1 1236 2 2 U
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TGGCTCGTGTTGGTATTAATAGCTGTCCAAGCGCACGCAACAAAGCAAAGAAAGAATGCT
AAAATCCCTGCATTAATAGTTTTCGGAGATTCAATAATGGATACTGGTAACAACAACAGT
CTCTCTACTCTTCTTAAGTCCAACTTCCCTCCTTACGGCAAAGACTTTCCCGGTGGATTG
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TTGGCTAAGACAATACCAGCATACCTGAGCCCAAATTTGAAGCCTAGAGATCTTTTGAAA
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CATTATGGAAAAAGAAAAGCTCGGTACATTTTGGACCATAGCATTTTTCTCGTGGTTTCT
AGTAGCAATGACCTTGCTCACACTTATATATCCCAATCTTATAAATATAACTCTACATCG
TATGCTACTTTCTTGGCCAAATCAGCAGTTAAATTCGTAAGAGAATTACACAAGCTTGGA
GCTCGAAAAATTGGGGTGTTTAGTGCACTTCCTGTTGGATGTGTACCACTTCAAAGATCA
GTGCGTGGAAGTGTGTTAACAAGAGAATGTGTTAAACCCTTAAACAATATGGCAAAACAA
TTCAACACTAGACTTTCTCCAGCACTGAGATCTTTGAATAGAAAGTTGGATGGTATTATC
CTCTATGTTGATGTTTATGAGACTTTTCTTGACATGATCCAAAAGCCTAAAAAATACGGT
TTCGAGGTAGCTGATAGAGCTTGTTGCGGTACTGGTTTTCTCGAAATTTTTTATATGTGC
AATTCATTTAATCCATTCACATGTTTTAATTCGTCGGCCTATATATTTTGGGATAGCTAC
CATCCAACTGAAAGAGCTTATCAAGTTATGGTTGATAAGTTACTCAGCAAATACTTAAGC
AAACTCTTTTGATGTTAAACATTACTTACTTCTTTGCGTTTCATTGTATTTATCCTTCTT
ATTGTTTTATGTATGTGATTAATTCATTATTGAATGTTCAATGTCTTGTGCACTGGAATA
ATTTGGATATAATCTTAATGTTCCATGTTTGCAACC


BQ
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AF RS1FM65TF U 1
AF RS1FM65JQ C 492
BS 1 650 RS1FM65TF
BS 651 1236 RS1FM65JQ

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TGGCTCGTGTTGGTATTAATAGCTGTCCAAGCGCACGCAACAAAGCAAAGAAAGAATGCT
AAAATCCCTGCATTAATAGTTTTCGGAGATTCAATAATGGATACTGGTAACAACAACAGT
CTCTCTACTCTTCTTAAGTCCAACTTCCCTCCTTACGGCAAAGACTTTCCCGGTGGATTG
GCTACTGGAAGATTTTCTGATGGAAGAGTTCCTACTGATCTAATTGCGGAAAATTTGGGG
TTGGCTAAGACAATACCAGCATACCTGAGCCCAAATTTGAAGCCTAGAGATCTTTTGAAA
GGTGTATCATTTGCATCTGGAGGAACTGGTTATGATCCATTGACAGCTCAAACTATGTCG
GTGGTATCAGTGTAGGATCAACTAATATATTTCAAAGAGTATATATCAACGATCAAAAAA
CATTATGGAAAAAGAAAAGCTCGGTACATTTTGGACCATAGCATTTTTCTCGTGGTTTCT
AGTAGCAATGACCTTGCTCACACTTATATATCCCAATCTTATAAATATAACTCTACATCG
TATGCTACTTTCTTGGCCAAATCAGCAGTTAAATTCGTAAGAGAATTACA

QA 1 650 1 650
DS 

RD RS1FM65JQ 745 0 0
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CCTTGCTCACACTTATATATCCCAATCTTATAAATATAACTCTACATCGTATGCTACTTT
CTTGGCCAAATCAGCAGTTAAATTCGTAAGAGAATTACACAAGCTTGGAGCTCGAAAAAT
TGGGGTGTTTAGTGCACTTCCTGTTGGATGTGTACCACTTCAAAGATCAGTGCGTGGAAG
TGTGTTAACAAGAGAATGTGTTAAACCCTTAAACAATATGGCAAAACAATTCAACACTAG
ACTTTCTCCAGCACTGAGATCTTTGAATAGAAAGTTGGATGGTATTATCCTCTATGTTGA
TGTTTATGAGACTTTTCTTGACATGATCCAAAAGCCTAAAAAATACGGTTTCGAGGTAGC
TGATAGAGCTTGTTGCGGTACTGGTTTTCTCGAAATTTTTTATATGTGCAATTCATTTAA
TCCATTCACATGTTTTAATTCGTCGGCCTATATATTTTGGGATAGCTACCATCCAACTGA
AAGAGCTTATCAAGTTATGGTTGATAAGTTACTCAGCAAATACTTAAGCAAACTCTTTTG
ATGTTAAACATTACTTACTTCTTTGCGTTTCATTGTATTTATCCTTCTTATTGTTTTATG
TATGTGATTAATTCATTATTGAATGTTCAATGTCTTGTGCACTGGAATAATTTGGATATA
ATCTTAATGTTCCATGTTTGCAACC

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 2

CO CL4511Contig1 970 2 4 U
GAATTTTGAAAAATGAATGGTTTCCACATTGAACCAATGGGCAAAGGAAATATAAGTTCC
TTAAGATTATAAAGAAAGTAAAAATCGCCCAAAGCATAAAAATGGTCGAAACTGTACTCC
CAACTGATCTAAACTATGCTAAAAGATCAGTATGATAAAGGCAAAAGGCCTAGGTAACCA
GATAGGTTGACCACAAAATTTTATACACTTTATGGCATGATTGGACTAGCCATCCAGGTC
TTTATATGCAAAGATTGATATAAAAAAAGGCACAAAAGAGTTATCTCATAGAATCTCACG
TTGTGTAACATGTACACAAGGGAAACTCAATAGGCTATAATGTTCCAAGCATCTAAACAG
ATTTATAGCATGTTCATGAGGGGGAGAAATGACACTCCCGTGGCCCATGAACAACACTAA
AAATCCGAGTGACATGGTCTATGACTATGATAGAACTTGGCCGAATTCTTTGTGATACAA
AGATCACTAGCTAATGTTTGGGAACACATGGATTTACATGTAATAAAAATATGCATCAGG
CCATATTAAGTGAGCATAGATATTCCCATCTAAGAATGATAAAGGGTCATGATCCAGACA
TAGACCATCCTAAGAGATTATGTATAGACCACCACAATAATATGTGCCGTTTAGGATGAA
ACCTCATAAGAAGATGAGATAAGATTGGGAATATATGTTGGATATGAGAATGTTTTCTCC
CACGATTTTATAAGAAACTTTGAGCCAAATATGGGTGATCAGATTAAGGCCAGGTTTACG
GATTGCATGATTAAATCCGACTATCCAACATCAGGGGGAGAAAGAAATAAGCTGGTACAA
GTATAAAGAAATGGAATGGTATTAACCATCCTTGTCTTGGCAAGATCCTCGGACCAGAGA
ATATGATTTAAGACGTCCAAAAAAAGATCATACAAAGCTAGCTAAAAGAATGCCAGACAG
ATTAGACCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GI81TF U 1
AF RS1GI81JQ C 249
BS 1 539 RS1GI81TF
BS 540 540 RS1GI81JQ
BS 541 568 RS1GI81TF
BS 569 970 RS1GI81JQ

RD RS1GI81TF 568 0 0
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TTAAGATTATAAAGAAAGTAAAAATCGCCCAAAGCATAAAAATGGTCGAAACTGTACTCC
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GATAGGTTGACCACAAAATTTTATACACTTTATGGCATGATTGGACTAGCCATCCAGGTC
TTTATATGCAAAGATTGATATAAAAAAAGGCACAAAAGAGTTATCTCATAGAATCTCACG
TTGTGTAACATGTACACAAGGGAAACTCAATAGGCTATAATGTTCCAAGCATCTAAACAG
ATTTATAGCATGTTCATGAGGGGGAGAAATGACACTCCCGTGGCCCATGAACAACACTAA
AAATCCGAGTGACATGGTCTATGACTATGATAGAACTTGGCCGAATTCTTTGTGATACAA
AGATCACTAGCTAATGTTTGGGAACACATGGATTTACATGTAATAAAAATATGCATCAG*
CCATATTAAGTGAGCATAGATATTCCCA

QA 1 568 1 568
DS 

RD RS1GI81JQ 722 0 0
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CATGTACACAAGGGAAACTCAATAGGCTATAATGTTCCAAGCATCTAAACAGATTTATAG
CATGTTCATGAGGGGGAGAAATGACACTCCCGTGGCCCATGAACAACACTAAAAATCCGA
GTGACATGGTCTATGACTATGATAGAACTTGGCCGAATTCTTTGTGATACAAAGATCACT
AGCTAATGTTTGGGAACACATGGATTTACATGTAATAAAAATATGCATCAGGCCATATTA
AGTGAGCATAGATATTCCCATCTAAGAATGATAAAGGGTCATGATCCAGACATAGACCAT
CCTAAGAGATTATGTATAGACCACCACAATAATATGTGCCGTTTAGGATGAAACCTCATA
AGAAGATGAGATAAGATTGGGAATATATGTTGGATATGAGAATGTTTTCTCCCACGATTT
TATAAGAAACTTTGAGCCAAATATGGGTGATCAGATTAAGGCCAGGTTTACGGATTGCAT
GATTAAATCCGACTATCCAACATCAGGGGGAGAAAGAAATAAGCTGGTACAAGTATAAAG
AAATGGAATGGTATTAACCATCCTTGTCTTGGCAAGATCCTCGGACCAGAGAATATGATT
TAAGACGTCCAAAAAAAGATCATACAAAGCTAGCTAAAAGAATGCCAGACAGATTAGACC
CG

QA 1 722 1 722
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL4514Contig1 1182 2 6 U
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GTTATCACCAAATCTGAGATCTATCGATCTATGCTGTGTCACCACCACCACCAGATCTGC
AACTCTCATTATGGCGGAGACTCTCAAAGAAGGTTCGATCACGATTCGCGAGGTCTGGAA
CGACAACCTCCTCGAGGAGTTCGCGCTGATCCGCGAGATCGTCGACAAATACAACTACAT
CGCCATGGACACCGAGTTCCCAGGCGTCGTCCTCAAGCCCGTCGAGACCTTCAAACGCAA
CAACGACCTTAACTACCGCACCCTCAAAGAGAACGTCGACCTCCTCAAACTCATCCAGCT
CGGCCTCACCTTCTCCTACGAGCACGGCAACCTCCCCACCTTCGACGACAAGTTCTGCGT
CTGGCAGTTCAACTTCCGCGAGTTCGACGTCGGTGAAGACATCTACGCGACCGAGTCCAT
CGAGCTTCTCCGCCAGTGCGGGATCGATTTCAAGAAGAACGTCGAGAGGGGGATCGACGC
TGTCCGGTTCGGGGAGCTGATGATGTCTTCAGGGATCGTGCTTAACGATTCCATCACGTG
GGTTACGTTCCACGGAGGTTACGATTTCGGGTATCTCGTCAAGCTTCTGACTTGCAAGGA
GCTTCCTCTCGAGCAGTCCTATTTCTTCAGGTTATTGTTTGTGTATTTCCCTACTGTTTA
CGATATCAAGCACTTGATGACGTTCTGCAACGGGCTGTTCGGAGGGTTGAACAGGCTAGC
GGAGCTTATGGGGGTTGAGAGAGTTGGGGTTTGTCATCAGGCTGGGTCCGATAGCTTGCT
CACGTTAGGCTCGTTTAGGAAGCTCAAGGAACGTTATTTCCCTGGGTTTACTGAGAAGTA
CACTGGTGTCTTGTATGGTCTAGGTGTGGAGGATTCTGCTACTACTATTACTAATTAATG
TTCGAGGGAGGGGGAGGTCTGCATTTAGGTTTTTTTTTTAGTCTTTGTGAGTGTGAGACC
AATTAGAGACTTTGTTGTTTGTGTAAATTGGTTTTTCTAGTAAGTGATTGTTGTGTCTTT
TGTAATTTTTCAGGAAAAAAAAACCTCTTTGATCAAATGAGGAGAGGGGTTTGTTGTTAA
TGTTTTAGCTTTGAGTTTCTGAATGTATATCATCATTTCTGC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FO16TF U 1
AF RS1FO16JQ C 447
BS 1 690 RS1FO16TF
BS 691 691 RS1FO16JQ
BS 692 749 RS1FO16TF
BS 750 750 RS1FO16JQ
BS 751 767 RS1FO16TF
BS 768 1182 RS1FO16JQ

RD RS1FO16TF 784 0 0
GGCCCGTTGGTCCGAGAACTCCTCTGCGTATCCTCTAGATCTGTTCGTTTTCGGACATCT
GTTATCACCAAATCTGAGATCTATCGATCTATGCTGTGTCACCACCACCACCAGATCTGC
AACTCTCATTATGGCGGAGACTCTCAAAGAAGGTTCGATCACGATTCGCGAGGTCTGGAA
CGACAACCTCCTCGAGGAGTTCGCGCTGATCCGCGAGATCGTCGACAAATACAACTACAT
CGCCATGGACACCGAGTTCCCAGGCGTCGTCCTCAAGCCCGTCGAGACCTTCAAACGCAA
CAACGACCTTAACTACCGCACCCTCAAAGAGAACGTCGACCTCCTCAAACTCATCCAGCT
CGGCCTCACCTTCTCCTACGAGCACGGCAACCTCCCCACCTTCGACGACAAGTTCTGCGT
CTGGCAGTTCAACTTCCGCGAGTTCGACGTCGGTGAAGACATCTACGCGACCGAGTCCAT
CGAGCTTCTCCGCCAGTGCGGGATCGATTTCAAGAAGAACGTCGAGAGGGGGATCGACGC
TGTCCGGTTCGGGGAGCTGATGATGTCTTCAGGGATCGTGCTTAACGATTCCATCACGTG
GGTTACGTTCCACGGAGGTTACGATTTCGGGTATCTCGTCAAGCTTCTGACTTGCAAGGA
GCTTCCTCTCGAGCAGTCCTATTTCTTCAG*TTATTGTTTGTGTATTTCCCTACTGTTTA
CGATATCAAGCACTTGATGACGTTCTGCA*CGGGCTGTTCGGAGGGT
GACAGCTAGCGGAGCTT

QA 1 767 1 767
DS 

RD RS1FO16JQ 736 0 0
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ATTTCAAGAAGAACGTCGAGAGGGGGATCGACGCTGTCCGGTTCGGGGAGCTGATGATGT
CTTCAGGGATCGTGCTTAACGATTCCATCACGTGGGTTACGTTCCACGGAGGTTACGATT
TCGGGTATCTCGTCAAGCTTCTGACTTGCAAGGAGCTTCCTCTCGAGCAGTCCTATTTCT
TCAGGTTATTGTTTGTGTATTTCCCTACTGTTTACGATATCAAGCACTTGATGACGTTTT
GCAACGGGCTGTTCGGAGGGTTGAACAGGCTAGCGGAGCTTATGGGGGTTGAGAGAGTTG
GGGTTTGTCATCAGGCTGGGTCCGATAGCTTGCTCACGTTAGGCTCGTTTAGGAAGCTCA
AGGAACGTTATTTCCCTGGGTTTACTGAGAAGTACACTGGTGTCTTGTATGGTCTAGGTG
TGGAGGATTCTGCTACTACTATTACTAATTAATGTTCGAGGGAGGGGGAGGTCTGCATTT
AGGTTTTTTTTTTAGTCTTTGTGAGTGTGAGACCAATTAGAGACTTTGTTGTTTGTGTAA
ATTGGTTTTTCTAGTAAGTGATTGTTGTGTCTTTTGTAATTTTTCAGGAAAAAAAAACCT
CTTTGATCAAATGAGGAGAGGGGTTTGTTGTTAATGTTTTAGCTTTGAGTTTCTGAATGT
ATATCATCATTTCTGC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

CO CL4515Contig1 400 2 7 U
GCCTGTCTGAAAATTTATTCACACTCTTATCTAATAATAAAGGTCGTCGTGCACAGTGTT
TTAACAAAAGACAATACTAGTTTTTTTCTAACGTTCTCCTAAAAAAATGCACCAACATTC
ACTTGTTTCTCACACACTGTTCTGAAAAATGACTTGTCCAAATCGAAGGAAGAGCCCTGC
ATCCGAAGCACTCATGGAAGAGCAATTGACGTTGTGAGGAGTCTTGAGATTTGCATACTC
ATCGACGTAGCACGAAAAGGTCAGCGTTGCTGACGTGGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTAC
CGCTGAGGCTGGTGGTTGTTCAGACAACATAAAGCTGCCGAGGACACGAACCACCTGGTG
CATCGTTGGTCGATCAATCGGCTGTCTTTTGGTGCACAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G701JQ U 10
AF RS1GZ92JQ U 1
BS 1 121 RS1GZ92JQ
BS 122 122 RS1G701JQ
BS 123 175 RS1GZ92JQ
BS 176 176 RS1G701JQ
BS 177 200 RS1GZ92JQ
BS 201 201 RS1G701JQ
BS 202 400 RS1GZ92JQ

RD RS1G701JQ 346 0 0
AAAATTTATTCACACTCTTATCTAATAATAAAGGTCGTCGTGCACAGTGTTTTAACAAAA
GACAATACTATTTTTTTTCTAACGTTCTCCTAGAAAAATGCACCAACATTCACTTGTTTC
TCACACACTGTTCTGAGAAATGACTTGTCCAAATCGAAGGAAGAGCCCTGCATCCGAAGC
ACTCATGGAAGAGCAGTTGACGTTGTGAGGAGTCTTGAGATTTGCATACTCATCGACGTA
GCACGAAGAGGTCAGCGTTGCTGACGTGGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTACCGCTGAGGC
TGGTGGTTGTTCAGACAACATAAAGCTGCCGAGGACACGAACCACC

QA 1 346 1 346
DS 

RD RS1GZ92JQ 400 0 0
GCCTGTCTGAAAATTTATTCACACTCTTATCTAATAATAAAGGTCGTCGTGCACAGTGTT
TTAACAAAAGACAATACTAGTTTTTTTCTAACGTTCTCCTAAAAAAATGCACCAACATTC
ATTTGTTTCTCACACACTGTTCTGAAAAATGACTTGTCCAAATCGAAGGAAGAGCTCTGC
ATCCGAAGCACTCATGGAAGGGCAATTGACGTTGTGAGGAGTCTTGAGATTTGCATACTC
ATCGACGTAGCACGAAAAGGTCAGCGTTGCTGACGTGGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTAC
CGCTGAGGCTGGTGGTTGTTCAGACAACATAAAGCTGCCGAGGACACGAACCACCTGGTG
CATCGTTGGTCGATCAATCGGCTGTCTTTTGGTGCACAGC

QA 1 400 1 400
DS 



AS 1 2

CO CL4516Contig1 618 2 3 U
TAAACAATATATTTCTTTCTAAGAGTGAAAAGCTGTTTTAAGCATAATCAAAGCTTTGAA
GAGTTTTACAATGCATACACAATTCCTCCACAGAGCTCCAGTTCTAACCTTCTTCCATTA
TTGGTAAAGGATAAGACTGGAGATGCAAAAAATAGGCGCAAGTCCTAATTGAGGAAAAGA
AAGATGCCACAATTTACAAGAATATCATCAGCTTGCGCTCATACCACCGATGTTAACTGG
CATTTGATTTGATGATACCTGAGGCTTTAGGACGGGGTTTACCATACTTCTCGACGTACC
CCTCTACCAGCTTCACCATTCTAGTTGCAGACGTATTAAGATATTTCTCAACTGACTCGT
TGTTAGTCGGCACCTGATGTAACTGGACAGCAGCACTGACTATCTTTTCAGTAGCTCTTT
TGACTATCATGTTATGCACATCTTTGCTAAAACGGCCTTCACCCCACAAGGGTTTCAACA
TTTCTTTAATGGTTTCCACAACTGCTGTCCTGAACTGTCTCATTACTTTTGTTCCTGCGT
CCGACCTCACTTCCCCATCCATCTCATCTGTTTTCAACATCTTTTGATGTGATGATCCAT
CACTTCTATGCCAAGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BK80JQ U 397
AF RS1BK80TF C 1
BS 1 396 RS1BK80TF
BS 397 541 RS1BK80JQ
BS 542 618 RS1BK80TF

RD RS1BK80JQ 145 0 0
TGACTATCTTTTCAGTAGCTCTTTTGACTATCATGTTATGCACATCTTTGCTAAAACGGC
CTTCACCCCACAAGGGTTTCAACATTTCTTTAATGGTTTCCACAACTGCTGTCCTGAACT
GTCTCATTACTTTTGTTCCTGCGTC

QA 1 145 1 145
DS 

RD RS1BK80TF 618 0 0
TAAACAATATATTTCTTTCTAAGAGTGAAAAGCTGTTTTAAGCATAATCAAAGCTTTGAA
GAGTTTTACAATGCATACACAATTCCTCCACAGAGCTCCAGTTCTAACCTTCTTCCATTA
TTGGTAAAGGATAAGACTGGAGATGCAAAAAATAGGCGCAAGTCCTAATTGAGGAAAAGA
AAGATGCCACAATTTACAAGAATATCATCAGCTTGCGCTCATACCACCGATGTTAACTGG
CATTTGATTTGATGATACCTGAGGCTTTAGGACGGGGTTTACCATACTTCTCGACGTACC
CCTCTACCAGCTTCACCATTCTAGTTGCAGACGTATTAAGATATTTCTCAACTGACTCGT
TGTTAGTCGGCACCTGATGTAACTGGACAGCAGCACTGACTATCTTTTCAGTAGCTCTTT
TGACTATCATGTTATGCACATCTTTGCTAAGACGGCCTTCACGCCACAAGGGTTTCAACA
TTTCTTTAATGGTTTCCACAACTGCTGTCCTGAACTGTCTCATTACTTTTGTTCCTGCGT
CCGACCTCACTTCCCCATCCATCTCATCTGTTTTCAACATCTTTTGATGTGATGATCCAT
CACTTCTATGCCAAGATC

QA 1 618 1 618
DS 



AS 1 2

CO CL4517Contig1 301 2 1 U
ATAAAAGGATGTGGTGTTAGAGTCTTGAATGTGCCTTCTTGATGAACAAGAAGCCAATGC
AAATGAAAAGTGTAGCATCTGCAATAATCCTCCAACTCACTCAGCTCTAATGGGTATCGA
CCCGAATAAATGAAAAGAATATTGAAAGGAAGAGTTGGCAAGACTTCACAAGTACATCAC
CAGAGTTCACCAGACCTCACATGATTTGGTGTATAAACACAAATTTAAATTTTAATTCAA
ATTTGATATAGACGTTGGGCATTGATGCATGTTTTTATTTGAGAAAGGGCTTACTTTGAT
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 

AF RS1A005TF U 1
AF RS1A005TV U 143
BS 1 301 RS1A005TF

RD RS1A005TF 301 0 0
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AAATGAAAAGTGTAGCATCTGCAATAATCCTCCAACTCACTCAGCTCTAATGGGTATCGA
CCCGAATAAATGAAAAGAATATTGAAAGGAAGAGTTGGCAAGACTTCACAAGTACATCAC
CAGAGTTCACCAGACCTCACATGATTTGGTGTATAAACACAAATTTAAATTTTAATTCAA
ATTTGATATAGACGTTGGGCATTGATGCATGTTTTTATTTGAGAAAGGGCTTACTTTGAT
G

QA 1 301 1 301
DS 

RD RS1A005TV 159 0 0
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GATTTGGTGTATAAACACAAATTTAAATTTTAATTCAAATTTGATATAGACGTTGGGCAT
TGATGCATGTTTTTATTTGAGAAAGGGCTTACTTTGATG

QA 1 159 1 159
DS 



AS 1 2

CO CL4518Contig1 709 2 1 U
CCAAAAAAAAAAAGCAGTCAAGAACAAATCGAAATCTCAAGCTCTATGAAACCTCGTCTT
CCTTCGTCTTCTCCCTCTATTTTACCTTCAATGGATGCTTGATTTGCTCTGGTAACTGCG
TTTGGTGTTTACTATGGATCCTGAAAGTATCATGGCTTCTGCTGATGGGACGGACTCTGC
GTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGAAAGAGAGAGAGACTGAAAAAAAAAAAATTCAC
AAGAGAGATTTCTAGGGTTGCCTCGGTACCTTCATAGGACATGGATTCTACTACCGGTAA
TGGAGCTGAACTTGAATCAGCAAATGGGAGTGGTGTTACTGATGCATTGCCGCCTCCTCC
ACCAGTCATACCTCCCAATGTTGAGCCAGTGCGTGTTAAAACCGAAGTTGCTGAGAAGAA
AAACCTGAGAGTACCTATGGCTCGTAATGGGTTTGGATCAAAGGGTCAGAAGATACCGCT
TTTGACTAATCATTTCAAAGTCAACGTCGCTAATCTTCAAGGACATTTCTACCACTACAG
TGTGGCGCTCTTTTATGATGATGGGCGTCCTGTTGAACAAAAAGGTGTTGGAAGAAAGAT
CCTAGACAAAGTCCATGAGACTTACCATTCTGATCTTGATGGCAAGGAGTTTGCCTACGA
TGGAGAAAAGACTTTGTTTACTTTTGGAGCTTTGCCTAGTAACAAGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1EB61TF U 28
AF RS1EB74TF U 1
BS 1 709 RS1EB74TF

RD RS1EB61TF 138 0 0
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TCAATGGATGCTTGATTTGCTCTGGTAACTGCGTTTGGTGTTTACTATGGATCCTGAAAG
TATCATGGCTTCTGCTGA

QA 1 138 1 138
DS 

RD RS1EB74TF 709 0 0
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TTTGGTGTTTACTATGGATCCTGAAAGTATCATGGCTTCTGCTGATGGGACGGACTCTGC
GTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGAAAGAGAGAGAGACTGAAAAAAAAAAAATTCAC
AAGAGAGATTTCTAGGGTTGCCTCGGTACCTTCATAGGACATGGATTCTACTACCGGTAA
TGGAGCTGAACTTGAATCAGCAAATGGGAGTGGTGTTACTGATGCATTGCCGCCTCCTCC
ACCAGTCATACCTCCCAATGTTGAGCCAGTGCGTGTTAAAACCGAAGTTGCTGAGAAGAA
AAACCTGAGAGTACCTATGGCTCGTAATGGGTTTGGATCAAAGGGTCAGAAGATACCGCT
TTTGACTAATCATTTCAAAGTCAACGTCGCTAATCTTCAAGGACATTTCTACCACTACAG
TGTGGCGCTCTTTTATGATGATGGGCGTCCTGTTGAACAAAAAGGTGTTGGAAGAAAGAT
CCTAGACAAAGTCCATGAGACTTACCATTCTGATCTTGATGGCAAGGAGTTTGCCTACGA
TGGAGAAAAGACTTTGTTTACTTTTGGAGCTTTGCCTAGTAACAAGATG

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 2

CO CL4519Contig1 1210 2 2 U
TTTTTCCCAATCTGATCCTGTCGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAATTCCGCCGCC
GAATCGAAAATTTTACCGTCACGTTCGCTCCTTCCCTCGATCTCCGTTACCGTTCAAGAT
CGAATCTTTCGTGGTGGGGTTTCTCGAGTAAGAGAGAGAAAATGAGTTTTCAGGATTTAG
AGGCGGGAAGAGGAGGGAGACCGTTAGCTTCTTCTTCGAGTAGTAACATCAACGGAGGAG
GAGGAGGGAGACAAGACACGACGCGAGCCGTAGCTTCCGGTGTGTTCCAGATCAACACAG
CCGTCTCTAGCTTCCACCGTCTGGTCAACACTCTCGGTACTCCCAAAGACACCCCGGAGC
TCCGAGATAAGCTGCACAAGACAAGACTACATATCGGAGAGTTAGTGAAAGACACGTCTG
TTAAACTTAGAGAAGCTAGTGAAACTGATCATCAAAGAGGCGTAGATCAAAGGAAGAAGA
TTGTGGATGTTAAGCTTGCAAAGGACTTTCAGTCTGTATTGAAAGAGTTTCAAAAGGCGC
AGCGTCTCGCTGCTGAAAGAGAAACTGTCTATGCTCCTCTTTTCACCAATCCTTCTCCTC
CATCTAGTGAGATAGATGTGAGTGGAGATAAGCATTCAGAGCAGCGTGCGCTTCTTGTGG
AATCGAAAAGACGAGAACTTGTACTGCTGGACAATTAGATTGTATTTAATGAAGCTATCA
TCGAGGAACGAGAGCAAGGGATACAAGAGATCCAGCAGCAAATTGGTGAGGTGCACGAGA
TCTTCAAAGACTTGGCTGTCCTGGTACATGATCAAGGCACCATGATCGATGATATTAGTA
CTCACATCGATAACTCCCACGCTGCAACAGCACAAGGAAGATCTCATCTCGCAAAAGCTT
CGAAGACACAAAGATCGAGTTCAACTCTGATGTGCTTGCTCATGGTGATTTTTGGAATCG
TACTCCTGATTGTTATCATAGTGCTGGCGATTTGATTTTCAAGAACTCACTAAACCATGG
AGAAGTGCTTTCACCATCAATCTAGAGATCTTAATGGGTGTATGTGTGTCACTTTGTTAG
ACTGCTGGTCTTTGGTCTCTTGTTTTAGAGTATATGGAGTAGTCGGGTTTGGTTTGAGGG
TGTCAGAGTGTGTTATTGCTTTTGACTCTTGTATTATATTTTGTTAAAGATCCTTTTATC
TGTGTTTTTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H042TF U 1
AF RS1H042JQB C 367
BS 1 528 RS1H042TF
BS 529 1210 RS1H042JQB

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GAATCGAAAATTTTACCGTCACGTTCGCTCCTTCCCTCGATCTCCGTTACCGTTCAAGAT
CGAATCTTTCGTGGTGGGGTTTCTCGAGTAAGAGAGAGAAAATGAGTTTTCAGGATTTAG
AGGCGGGAAGAGGAGGGAGACCGTTAGCTTCTTCTTCGAGTAGTAACATCAACGGAGGAG
GAGGAGGGAGACAAGACACGACGCGAGCCGTAGCTTCCGGTGTGTTCCAGATCAACACAG
CCGTCTCTAGCTTCCACCGTCTGGTCAACACTCTCGGTACTCCCAAAGACACCCCGGAGC
TCCGAGATAAGCTGCACAAGACAAGACTACATATCGGAGAGTTAGTGAAAGACACGTCTG
TTAAACTTAGAGAAGCTAGTGAAACTGATCATCAAAGAGGCGTAGATCAAAGGAAGAAGA
TTGTGGATGTTAAGCTTGCAAAGGACTTTCAGTCTGTATTGAAAGAGT

QA 1 528 1 528
DS 

RD RS1H042JQB 844 0 0
ATAAGCTGCACAAGACAAGACTACATATCGGAGAGT*AGTGAAAGACACGTCTGTTAAAC
TTAGAGAAGCTAGTGAAACTGATCATCAAAGAGGCGTAGATCAAAGGAAGAAGATTGTGG
ATGTTAAGCTTGCAAAGGACTTTCAGTCTGTATTGAAAGAGTTTCAAAAGGCGCAGCGTC
TCGCTGCTGAAAGAGAAACTGTCTATGCTCCTCTTTTCACCAATCCTTCTCCTCCATCTA
GTGAGATAGATGTGAGTGGAGATAAGCATTCAGAGCAGCGTGCGCTTCTTGTGGAATCGA
AAAGACGAGAACTTGTACTGCTGGACAATTAGATTGTATTTAATGAAGCTATCATCGAGG
AACGAGAGCAAGGGATACAAGAGATCCAGCAGCAAATTGGTGAGGTGCACGAGATCTTCA
AAGACTTGGCTGTCCTGGTACATGATCAAGGCACCATGATCGATGATATTAGTACTCACA
TCGATAACTCCCACGCTGCAACAGCACAAGGAAGATCTCATCTCGCAAAAGCTTCGAAGA
CACAAAGATCGAGTTCAACTCTGATGTGCTTGCTCATGGTGATTTTTGGAATCGTACTCC
TGATTGTTATCATAGTGCTGGCGATTTGATTTTCAAGAACTCACTAAACCATGGAGAAGT
GCTTTCACCATCAATCTAGAGATCTTAATGGGTGTATGTGTGTCACTTTGTTAGACTGCT
GGTCTTTGGTCTCTTGTTTTAGAGTATATGGAGTAGTCGGGTTTGGTTTGAGGGTGTCAG
AGTGTGTTATTGCTTTTGACTCTTGTATTATATTTTGTTAAAGATCCTTTTATCTGTGTT
TTTG

QA 1 844 1 844
DS 



AS 1 2

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GGACCCACTACCATCTTCCTCCTCTCCCTCCTTCTTCTTGACCTCTCTTCTTCTTCTTAC
CATATCTCCTCTACTCTCTCCTAACCTAGGAATCCGACCACCTCTGCTTGTCCCCAAAAG
CTCGAAGTTGACTTTGCTCCAACCAATCTTATCGTCATTGTCCCAACCAAACCTCTCACT
AATCTCCAACAACATCGAAACAGAGCTTACATCTCCTCTGTTTTTCTTCTCTTTGATGCT
CTCATCACTTCCATGGAGGACTTTCTCTGCAAACTCCCACTCAATTCTGTCTTTATAAAC
ATCGTCGTCAAGAACTTCGTCTGCAAGCTTTGCCCAGTACTCAGTGTCTCCTGCTCGTAG
ATTCTTGGAGACCCATTTTAGGTAAGAGGAAGGCTAAGAGCCGAGCATTTTGCCCTTGTG
CTTGCCGAAGTCTATGATTGTGTCTCTGGGCGGCTAGGGTTTGGGTTTGGGAGCGTTTTG
GTTATGGGTTTTGGTTGGTTGATAGGGAAGATGCGATTGGTTGAAGAAGATAGTCTTCTT
CTTGGTCTAAAAGATGATGATGAGATTGTGAAGATGGTAGTGAAGGGTAAGGTTTGTGTT
GCAGAGTAGGGATTGTGGAACAAGACCACCGAGAAACTCATTGTTGTCGTGTTGTGTCGT
GTCTCCGATGACCTATTTGATTTGTTTTTTGGGACCCTTGTTTTTTTCTTACTTCAATCT
TGTAAATGCTGTCTTTGGGACAAATAAACAGAGTTCGAAAATCTTTGTATCCATGTATTT
GGTGAAATGAATGTTAATGTTAC


BQ
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AF RS1G856TF U 1
AF RS1G856JQ C 221
BS 1 552 RS1G856TF
BS 553 803 RS1G856JQ

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AATCTCCAACAACATCGAAACAGAGCTTACATCTCCTCTGTTTTTCTTCTCTTTGATGCT
CTCATCACTTCCATGGAGGACTTTCTCTGCAAACTCCCACTCAATTCTGTCTTTATAAAC
ATCGTCGTCAAGAACTTCGTCTGCAAGCTTTGCCCAGTACTCAGTGTCTCCTGCTCGTAG
ATTCTTGGAGACCCATTTTAGGTAAGAGGAAGGCTAAGAGCCGAGCATTTTGCCCTTGTG
CTTGCCGAAGTCTATGATTGTGTCTCTGGGCGGCTAGGGTTTGGGTTTGGGAGCGTTTTG
GTTATGGGTTTTGGTTGGTTGATAGGGAAGATGCGATTGGTTGAAGAAGATAGTCTTCTT
CTTGGTCTAAAA

QA 1 552 1 552
DS 

RD RS1G856JQ 583 0 0
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TCAATTCTGTCTTTATAAACATCGTCGTCAAGAACTTCGTCTGCAAGCTTTGCCCAGTAC
TCAGTGTCTCCTGCTCGTAGATTCTTGGAGACCCATTTTAGGTAAGAGGAAGGCTAAGAG
CCGAGCATTTTGCCCTTGTGCTTGCCGAAGTCTATGATTGTGTCTCTGG*CGGCTAGGGT
TTGGGTTTGG*AGCGTTTTGGTTATGGGTTTTGGTTGGTTGATAGGGAAGATGCGATTGG
TTGAAGAAGATAGTCTTCTTCTTGGTCTAAAAGATGATGATGAGATTGTGAAGATGGTAG
TGAAGGGTAAGGTTTGTGTTGCAGAGTAGGGATTGTGGAACAAGACCACCGAGAAACTCA
TTGTTGTCGTGTTGTGTCGTGTCTCCGATGACCTATTTGATTTGTTTTTTGGGACCCTTG
TTTTTTTCTTACTTCAATCTTGTAAATGCTGTCTTTGGGACAAATAAACAGAGTTCGAAA
ATCTTTGTATCCATGTATTTGGTGAAATGAATGTTAATGTTAC

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 2

CO CL4521Contig1 1149 2 2 U
GGGAGAGAGAAACAGAGATGGATCACGAAGCAGATGCGTACCGTACGGATTTGATGACGA
TCACGAGATTCGTGCTGAATGAGCGATCAAAGTACCCAGAGTCTCGTGGGGATTTCACGA
TTTTGCTCAGCAACATCGTTTTGGGTTGCAAATTCGTCTGCAGTGCCGTCAACAAGGCTG
GTTTGGCCAAGCTTATTGGACTTGCTGGGGAGACAAATATCCAGGGTGAAGAGCAAAAGA
AACTGGATGTGCTCTCTAACGATGTTTTTATCAAAGCTCTGGTTAGCAGTGGCAGAACAT
CTGTTCTTGTCTCGGAAGAAGATGAGGAAGCTACGTTTGTGGAGTCATCCAAGCGTGGAA
AGTACTGTGTTGTTTTTGATCCACTTGATGGATCCTCAAACATTGACTGTGGTGTCTCCA
TTGGAACAATCTTTGGAATTTACACAATGGACCACAGTGATGAGCCAAGTACCGAGGATG
TTCTGAAACCTGGGAATGAAATGGTTGCAGCTGGTTACTGTATGTACGGAAGCTCCTGCA
TGCTTGTGTTGAGCACTGGAACAGGTGTCCACGGATTTACACTGGACCCATCTCTAGGAG
AGTTCATATTAACTCACCCAGACATTAAGATTCCAAATAAGGGAAACATCTACTCAGTGA
ATGAAGGCAATGCTCAGAACTGGGATGGTCCAACCACGAAGTATGTAGAGAGATGCAAGT
ATCCTAAAGACGGTTCTCCCGCAAAATCTCTTAGATATGTCGGAAGTATGGTAGCCGATG
TTCATCGCACGCTGCTTTATGGAGGAATCTTCTTTTACCCTGCTGACAAGAAAAGCCCCA
ATGGGAAATTGCGTGTCCTGTATGAAGTCTTCCCAATGGCGTTCTTGATGGAGCAAGCTG
GAGGTCAGGCCTTCACTGGCAAGAAAAGGGCACTGGACCTTGTCCCGGAGAAGATCCATG
AGCGTTCTCCGATATTTCTTGGTAGCTATGACGATGTAGAGGAGATTAAGGCTCTGTATG
CTGCGGAGGAGAAGAACTAAGCTTTCCATTGTAATATCGTATTTCTATACCTTCTTCTGT
TGAGACAAACCATTTGACTCGACTCGTGTAAACCAAGAAGACTGGTTAAAAATAATATAT
AACTTTTTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FZ81TF U 1
AF RS1FZ81JQ C 332
BS 1 663 RS1FZ81TF
BS 664 1149 RS1FZ81JQ

RD RS1FZ81TF 663 0 0
GGGAGAGAGAAACAGAGATGGATCACGAAGCAGATGCGTACCGTACGGATTTGATGACGA
TCACGAGATTCGTGCTGAATGAGCGATCAAAGTACCCAGAGTCTCGTGGGGATTTCACGA
TTTTGCTCAGCAACATCGTTTTGGGTTGCAAATTCGTCTGCAGTGCCGTCAACAAGGCTG
GTTTGGCCAAGCTTATTGGACTTGCTGGGGAGACAAATATCCAGGGTGAAGAGCAAAAGA
AACTGGATGTGCTCTCTAACGATGTTTTTATCAAAGCTCTGGTTAGCAGTGGCAGAACAT
CTGTTCTTGTCTCGGAAGAAGATGAGGAAGCTACGTTTGTGGAGTCATCCAAGCGTGGAA
AGTACTGTGTTGTTTTTGATCCACTTGATGGATCCTCAAACATTGACTGTGGTGTCTCCA
TTGGAACAATCTTTGGAATTTACACAATGGACCACAGTGATGAGCCAAGTACCGAGGATG
TTCTGAAACCTGGGAATGAAATGGTTGCAGCTGGTTACTGTATGTACGGAAGCTCCTGCA
TGCTTGTGTTGAGCACTGGAACAGGTGTCCACGGATTTACACTGGACCCATCTCTAGGAG
AGTTCATATTAACTCACCCAGACATTAAGATTCCAAATAAGGGAAACATCTACTCAGTGA
ATG

QA 1 663 1 663
DS 

RD RS1FZ81JQ 818 0 0
TACGTTTGTG*AGTCATCCAAGCGTGGAAAGTACTGTGTTGTTTT*GATCCACTTGATGG
ATCCTCAAACATTGACTGTGGTGTCTCCATTGGAACAATCTTTGGAATTTACACAATGGA
CCACAGTGATGAGCCAAGTACCGAGGATGTTCTGAAACCTGGGAATGAAATGGTTGCAGC
TGGTTACTGTATGTACGGAAGCTCCTGCATGCTTGTGTTGAGCACTGGAACAGGTGTCCA
CGGATTTACACTGGACCCATCTCTAGGAGAGTTCATATTAACTCACCCAGACATTAAGAT
TCCAAATAAGGGAAACATCTACTCAGTGAATGAAGGCAATGCTCAGAACTGGGATGGTCC
AACCACGAAGTATGTAGAGAGATGCAAGTATCCTAAAGACGGTTCTCCCGCAAAATCTCT
TAGATATGTCGGAAGTATGGTAGCCGATGTTCATCGCACGCTGCTTTATGGAGGAATCTT
CTTTTACCCTGCTGACAAGAAAAGCCCCAATGGGAAATTGCGTGTCCTGTATGAAGTCTT
CCCAATGGCGTTCTTGATGGAGCAAGCTGGAGGTCAGGCCTTCACTGGCAAGAAAAGGGC
ACTGGACCTTGTCCCGGAGAAGATCCATGAGCGTTCTCCGATATTTCTTGGTAGCTATGA
CGATGTAGAGGAGATTAAGGCTCTGTATGCTGCGGAGGAGAAGAACTAAGCTTTCCATTG
TAATATCGTATTTCTATACCTTCTTCTGTTGAGACAAACCATTTGACTCGACTCGTGTAA
ACCAAGAAGACTGGTTAAAAATAATATATAACTTTTTC

QA 1 818 1 818
DS 



AS 1 2

CO CL4522Contig1 1174 2 8 U
GTGATGAGGTGTGGAGATTGGAGAAGATTGGTAAAGATGGGGCGTTTCATAAGAAACTAA
CCGCTGAAGGAATAGTCAACGTGGAAGACTTTCTTAGAAAATTGGTCAAGGATTCTGCAA
AACTACGAGCTACTCTCGGAAGCATGTCAAACAAGATGTGGGATGTACTAGTGGAGCACG
CAAAGACATGTGTCCTAAGCGGTAAACTTTATATCTACTATGCTGAAGATTCAAGGACTG
CGGGCGTTGTGTTCAATAACATCTATGAGTTAAGTGGCCTTATCACCGGGGATCAATACT
TCTCTGCTGACTCACTCGATGACACCCAAAAGGTATATGTGGATAGTCTGGTGAAGAAAG
CATATGATAATTGGAACCAAGTGGTAGAGTATGAAGGCAAAACTCTTTTGAACTTCAATC
AGCCTGAGATGGTGAATGTTTCTCAGACAGAACATGTAACGGTGCCGGCAAATTACTCTC
CCCTGCCGCCGTCTCCTATACTCGCTAGTCAGTTTCCTAGATTCTCATTTGAAGGGTATA
ATAATCAAACGCAGCCAACAGCTCAGCTCCATAACTCACAAGCACCATTCGATATTGTTT
TGCAGCAAGATCAGTTCATGGGAATACATCAAGCTCAAACCACCACTGGGATGGCTCTTG
GTCCTCCACAGCAATCCACAGGCGGGTACCACCACGACATTAGCTCATCTTCTGTTCATC
AGGCAAATATTGATCCCTTTGAAGACTGGTCACGCCAGCATGAGAACGAGATCCAGCTAA
GAAGTGATGAAATGCTGGAGAGTGAGGAGATGCAGCAGCTGTTCCAGCTCTGTACTAGCA
TGGGAGGGGATGGAGAAGGTGGATATGGTTTCCCGTCGTTTATTCAAAGTACACCGATGG
TGAAGGGATATGAGGAGGAGCGAGTGAGATCAGGAAAAGCGGTTGTTGGGTGGCTGAAGA
TTAAAGCAGCAATGAAATGGGGAATCTTCATAAGGAAGAAAGCTGCTGAGAGAAGAGCTC
AGATTGTTGAGCTTGATTAAAAATATATTTACTAATAGATGATTTATCCAGGTACAGTAT
AGGTAAAACATACCTGATCACTTGGTTTCACATATTTTTCATGTTTGCCTTGGACATGTT
ATAGGTTTTATGACATCAACGTTACAATCTTTCG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1C687TF U 1
AF RS1C687JQ C 437
BS 1 722 RS1C687TF
BS 723 723 RS1C687JQ
BS 724 753 RS1C687TF
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BS 765 773 RS1C687TF
BS 774 1174 RS1C687JQ

RD RS1C687TF 773 0 0
GTGATGAGGTGTGGAGATTGGAGAAGATTGGTAAAGATGGGGCGTTTCATAAGAAACTAA
CCGCTGAAGGAATAGTCAACGTGGAAGACTTTCTTAGAAAATTGGTCAAGGATTCTGCAA
AACTACGAGCTACTCTCGGAAGCATGTCAAACAAGATGTGGGATGTACTAGTGGAGCACG
CAAAGACATGTGTCCTAAGCGGTAAACTTTATATCTACTATGCTGAAGATTCAAGGACTG
CGGGCGTTGTGTTCAATAACATCTATGAGTTAAGTGGCCTTATCACCGGGGATCAATACT
TCTCTGCTGACTCACTCGATGACACCCAAAAGGTATATGTGGATAGTCTGGTGAAGAAAG
CATATGATAATTGGAACCAAGTGGTAGAGTATGAAGGCAAAACTCTTTTGAACTTCAATC
AGCCTGAGATGGTGAATGTTTCTCAGACAGAACATGTAACGGTGCCGGCAAATTACTCTC
CCCTGCCGCCGTCTCCTATACTCGCTAGTCAGTTTCCTAGATTCTCATTTGAAGGGTATA
ATAATCAAACGCAGCCAACAGCTCAGCTCCATAACTCACAAGCACCATTCGATATTGTTT
TGCAGCAAGATCAGTTCATGGGAATACATCAAGCTCAAACCACCACTGGGATGGCTCTTG
GTCCTCCACAGCAATCCACAGGCGGGTACCACCACGACATTAGCTCATCTTCTGTTCATC
AG*CAAATATTGATCCCTTTGAAGACTGGTCAC*CCAGCATGA*AACGAGATC

QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1C687JQ 738 0 0
TGTTTCTCAGACAGAACATGTAACGGTGCCGGCAAATTACTCTCCCCTGCCGCCGTCTCC
TATACTCGCTAGTCAGTTTCCTAGATTCTCATTTGAAGGGTATAATAATCAAACGCAGCC
AACAGCTCAGCTCCATAACTCACAAGCACCATTCGATATTGTTTTGCAGCAAGATCAGTT
CATGGGAATACATCAAGCTCAAACCACCACTGGGATGGCTCTTGGTCCTCCACAGCAATC
CACAGGCGGGTACCACCACGACATTAGCTCATCTTCTGTTCATCAGGCAAATATTGATCC
CTTTGAAGACTGGTCACGCCAGCATGAGAACGAGATCCAGCTAAGAAGTGATGAAATGCT
GGAGAGTGAGGAGATGCAGCAGCTGTTCCAGCTCTGTACTAGCATGGGAGGGGATGGAGA
AGGTGGATATGGTTTCCCGTCGTTTATTCAAAGTACACCGATGGTGAAGGGATATGAGGA
GGAGCGAGTGAGATCAGGAAAAGCGGTTGTTGGGTGGCTGAAGATTAAAGCAGCAATGAA
ATGGGGAATCTTCATAAGGAAGAAAGCTGCTGAGAGAAGAGCTCAGATTGTTGAGCTTGA
TTAAAAATATATTTACTAATAGATGATTTATCCAGGTACAGTATAGGTAAAACATACCTG
ATCACTTGGTTTCACATATTTTTCATGTTTGCCTTGGACATGTTATAGGTTTTATGACAT
CAACGTTACAATCTTTCG

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

CO CL4523Contig1 754 2 13 U
CTGCTTTAAGTTCCAATTTATTGAACTAAAAAGTGTCCAAACTTTTAAAACTGAAACAAA
AAAACATCTCTTAGATTGATTGTAGAATACTAGTAAAGTAATGGGACTGTGAAAAAATTC
ACATAGAAATTCTGAGTTCCTGTACAGTGTCTGTTACGTATACAGATACGAACGTTAAGA
AACTCTTTCACTATATTCTTGTTTTGCAAAAAGCTATGTCACAGAGTTGGAGCAGCAGGG
ATACAAGATTGATACAACATACGAACTCAATGTTTCCTTGTAGTGTTTTCCATGAACTTC
AATAACATTAGCTTTGTTTCAGCCACCAATGTGTATCATTGGCCTATTAACTGTCTTGGC
AATGTCAAGCATTCCAGCGTGTGCTGCTTTCTTCCTCTTCACAGCAGCGCCTATAATTTC
CCTTAACGTTTCGTCATCAGCACCAAACCGGATAGGATCTCTCAAACTAACCTCTGAAGG
ACCGAACAAGCATACTTTGAAGTTCCCATCCGCAAGTAATCTTAACCTATTGCAGCCAGA
ACAGAAATGTTCTGTCATAAATGTGATGAAAGACACAGAACCGCAGTGCCCATCAATGGT
AAAGTTCTTAGCTGTTTCGGTAGGGTGATCTTGGACACGTTTAATACTCGGAAAGCGCTT
TACCACTTTATCCATCATCTCAGCGTAAGACACAAGCTTCTTTACATTCCAAACGTTTCC
ATCAAAGGGCATAAACTCTATGAACCGGACGTTG


BQ
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AF RS1AM24JQ U 228
AF RS1BP81JQ U 1
BS 1 301 RS1BP81JQ
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BS 560 560 RS1AM24JQ
BS 561 754 RS1BP81JQ

RD RS1AM24JQ 346 0 0
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TTCCATGAACTTCAATAACATTAGCTTTGTTTCAGCCACCAATGTGTATCATTGGCCTAT
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DS 

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AACTCTTTCACTATATTCTTGTTTTGCAAAAAGCTATGTCACAGAGTTGGAGCAGCAGGG
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AATGTCAAGCATTCCAGCGTGTGCTGCTTTCTTCCTCTTCACAGCAGCGCCTATAATTTC
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ACAGAAGTGTTCTGTCATAGATGTGATGAAAGACACAGAACCGCAGTGCCCATCAATGGT
AAAGTTCTTAGCTGTTTCGGTAGGGTGATCTTGGACACGTTTAATACTCGGAAAGCGCTT
TACCACTTTATCCATCATCTCAGCGTAAGACACAAGCTTCTTTACATTCCAAACGTTTCC
ATCAAAGGGCATAAACTCTATGAACCGGACGTTG

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

CO CL4524Contig1 1195 2 10 U
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GAACCACCTCCTGATTGTTGTTGTGTGTTAAAACGACGACGGTTTTGAGTTATGGCTGAA
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TTCAAGATGTCTGGTCTCTTCTCTACACCTATTCGCAATCTGGATTCAAGATCGATTGGC
GCCATAGCGGGGCTCGCAATCGCTGTGATTTTCACATGGAGGGCAATAAGAAGACAACCT
GAAAGAAGGAGACCAAAACGCAGGTTGCAATCAGATCATGAAACCTCTACTTCTCCTGCT
CCTGCTCCTCATGAGGATAATGGTGTTGTTGTTGATCAGTTTTTTCAGACTGGAAAACCT
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CTTGGTGTCATTCTTGAGGAATCAAGTCCTGAAGAACTTCAAAAACAAGCAACAGTGAGG
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CACACAACTAGCTAGGTTCATAAAGTTTCAGCTGCACGTTTCTGCAGCGAAACCAGAGCG
AACGGCTCCGAACGTGTTCACCTCACAATCAATAGAAGAGTTCTTTGGATGTGCTTGATA
CCATCACAATCTCAATAATATTCAGCAAAGCAGCGCAGATGCGTAAATGGTCATGTCTGA
CTGAACTTGCAACTTTTAGCATTGTCTCAGAATTTAGAAGTTTGATGTTTATGGAGTAAG
AGAGTAGTGCGTGAGTTCCTATATGGGGAGTATCCAAGTGGGTACTGTAATATATGTATC
AGCAACTTAGCAGAGTATTCAGGGAAGAAACGAAGGACCTTTGTCTTGTCTAAATTGATG
TCTTGACTTCGTCGCATCAGACCGATCTTGTAATGTGAAGTTGTAAACCTTTTTA


BQ
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AF RS1H690TF U 1
AF RS1H690JQB C 477
BS 1 655 RS1H690TF
BS 656 656 RS1H690JQB
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CCTGCTCCTCATGAGGATAATGGTGTTGTTGTTGATCAGTTTTTTCAGACTGGAAAACCT
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CTTGGTGTCATTCTTGAGGAATCAAGTCCTGAAGAACTTCAAAAACAAGCAACAGTGAGG
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DS 

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GGAAAGAGTTCTTGACGATGAAAGCGAAGCCGAAGTTCTACAGGCACTAGAGACTGCAGG
CATTTTCACATCTGG*TGGTTTGGTCAAAGACAAGGTGCTGTTTTGTAGTACGGAGATCG
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TCAGCACACAACTAGCTAGGTTCATAAAGTTTCAGCTGCACGTTTCTGCAGCGAAACCAG
AGCGAACGGCTCCGAACGTGTTCACCTCACAATCAATAGAAGAGTTCTTTGGATGTGCTT
GATACCATCACAATCTCAATAATATTCAGCAAAGCAGCGCAGATGCGTAAATGGTCATGT
CTGACTGAACTTGCAACTTTTAGCATTGTCTCAGAATTTAGAAGTTTGATGTTTATGGAG
TAAGAGAGTAGTGCGTGAGTTCCTATATGGGGAGTATCCAAGTGGGTACTGTAATATATG
TATCAGCAACTTAGCAGAGTATTCAGGGAAGAAACGAAGGACCTTTGTCTTGTCTAAATT
GATGTCTTGACTTCGTCGCATCAGACCGATCTTGTAATGTGAAGTTGTAAACCTTTTTA

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 2

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CCACTTTTCATACCAAAGGAATGGTCTGATGCAGCGAGTTCCGTTTCCTGCAGCAGTTCG
TTGCAACCCGCTGTAGCTTTGGTTTGTGGTCCTAAAGACAGTGGGAAGACTACATTCTCC
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GTTGGTCAACCTGAATTCACTGTACCTGGTTTTCTTCTCACAGTTGTCGATAAATCAATT
CTAGACCAGGATTGGACAGCTCCTTGTTTAAAGACACCGGAGAGATATTACTTCTATGGT
GATGATTCTGCAAAGAGAGATCCAAAGGCTTATCTACAGTTTGTGTACACCTTGTTCGAT
TACTACCAGCTACACTTCTGCAAGTCGAGTGAGAATAAGACTGCGTTACCTCTTGTCATT
AATACCCCTGGCTGGGTTAAAGGTCTTGGCTATCATGTATTGGTGGACGTATTGAGATAT
GTTTCTCCTTCCCATGTTGTGAAAATCAACATCGAAATTCACAAGAAGAACCTACCAGCT
GGTTTGTTCTGGTTAGACGGTTATCATGATGAGAGACCTCATTTGATTGAGATTCAATCT
GCTTACCCAGTCAGCTACTATCGATCCGCAGCGGAAAAGCATGCTCGTCGGTTGATGAGG
GATAGGCGTATAATCGCCTACTTCAAGCAATGCATTAAAGGAAAAGAAGTGGACACGACC
AAAGAGCTATCCCAAGAACTCGCTTTTCTTGTTCCTTACGAGGTTCCAATATCCAGTTTG
ACCATCACTCATCTACATTGTCAGATTCCAAGTTCAGAAGTGTTTTATAGTTTGAATGCT
TCCATTGTTGGTTTGGGGATTAGCTTTGAAGTGTTTGAAGATTTGCCTTTATGCGTTGGT
CTTGGAATCGTGAGGGGAATAGACATAGAGAGAGGGATCTTGTATGTGATCACTCCAGTT
GCAGAAAATGTGGTTGAGAAAGTTGATCTTTTATGGCAAGGCTACATTGAGATACCTACT
AGTCTTTTGGGTGTGAAAGATTACAGGTCTCCTTATCTATCCCCCTATGTCTTAGCTTCC
ACCTAAACTTCATCTTCTTTTTAAGACTTTTCTTTTTGCTCAGTTTTTTTTTTTTTTTTC
TGTTTGCTACTAGTATGTATCATTAATTTATCTTAATACCAAGTTTCAGTTCTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BJ19TF U 1
AF RS1BJ19JQ C 559
BS 1 697 RS1BJ19TF
BS 698 698 RS1BJ19JQ
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GATAG
CGTA

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1BJ19JQ 699 0 0
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TACTTCAAGCAATGCATTAAAGGAAAAGAAGTGGACACGACCAAAGAGCTATCCCAAGAA
CTCGCTTTTCTTGTTCCTTACGAGGTTCCAATATCCAGTTTGACCATCACTCATCTACAT
TGTCAGATTCCAAGTTCAGAAGTGTTTTATAGTTTGAATGCTTCCATTGTTGGTTTGGGG
ATTAGCTTTGAAGTGTTTGAAGATTTGCCTTTATGCGTTGGTCTTGGAATCGTGAGGGGA
ATAGACATAGAGAGAGGGATCTTGTATGTGATCACTCCAGTTGCAGAAAATGTGGTTGAG
AAAGTTGATCTTTTATGGCAAGGCTACATTGAGATACCTACTAGTCTTTTGGGTGTGAAA
GATTACAGGTCTCCTTATCTATCCCCCTATGTCTTAGCTTCCACCTAAACTTCATCTTCT
TTTTAAGACTTTTCTTTTTGCTCAGTTTTTTTTTTTTTTTTCTGTTTGCTACTAGTATGT
ATCATTAATTTATCTTAATACCAAGTTTCAGTTCTTTTT

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 2

CO CL4526Contig1 1221 2 4 U
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GTGCTTCAAGATTCTTAAGGACTCAAACAGATGGATGATACATTCTTGCATCATAACTTT
TGTTTTGCTTAGCGATGGATTCCTCGTCAAAAAAAAAGGGCCCTTGATTCCGAAGAAGGA
AGAGATGATGACAAGAAAAGTGAGCTAGAGTACTTCTTGGAAGCAACGGAACTTAACGCC
TCCAATTTTCCTCCACAAACGACCGAGGTCGAGCTTGTCAATTTCTTTGGTGCTGATTGT
GCCTTGATTCAGAATGAAATCATCGAGAAGCCTGAAGAGAAACCTCAAGAGAAGTCTGAA
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ACGAAGAAGGTGGCAAGAATCTTGTTTAGATCTCGTGAAGATAAAAAAAGGCCTTTAAGA
GAAACGGAGAAAAGATGAAGGGAGTTCCCATTTATCTTACACGCGTTCGTAACACGCGTA
TTTTTCTTTTGGTGGAAGACCTTGACACTAATAATAAAACAGAATCAGAGATTCGTGACC
AACTGACAAATCATTTTAGTGCGTGTGGAAACGTTTACAAGATATACATTCCTAAAAATG
AGACCGGTGGCTGTTTAAGTTTTGCATGCGTCTTTCTGAATCAGAATATATCAAAATTAG
AGGACATGAAGAATTTATCCAAAATAGACGGTCATGAGATCAGTCTCACAGACTACACCT
TCCAGGCGAGGTTCAGGGATATTAAAGCAATGATGAAGGCGGAGGGGTCTGAGGTTCCTG
AGGATTTTGAGGATGAGGGTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATG
ATGATGATGGGTTTGGGAAGTATGTTAAGAATTATGTTAAGAATTATGATGGGAATTTAT
GGGATGATGAGGATGATGAGGAGGGTGAGGGGATTGGGAATGATGTAGGTGAGGAGGATG
ACGAGATGGATTCTGAGGAGGATGACGAGATGGATTCTGAGGAGGATGACTAACTAATTA
TTTTATCGTGTCAATGGTTGCTGTGGGCTAAGGTCATTTGTTAGACCAAAACAATATGCG
TAATCTAATGTTTTATCATCTTTCATATTTGAGCAATATCGTTGTAGAGCAAACTATGCC
AATGGAGATGAGACAGTTTAC


BQ
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AF RS1FP55TF U 1
AF RS1FP55JQ C 477
BS 1 639 RS1FP55TF
BS 640 640 RS1FP55JQ
BS 641 657 RS1FP55TF
BS 658 1221 RS1FP55JQ

RD RS1FP55TF 661 0 0
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GTGCTTCAAGATTCTTAAGGACTCAAACAGATGGATGATACATTCTTGCATCATAACTTT
TGTTTTGCTTAGCGATGGATTCCTCGTCAAAAAAAAAGGGCCCTTGATTCCGAAGAAGGA
AGAGATGATGACAAGAAAAGTGAGCTAGAGTACTTCTTGGAAGCAACGGAACTTAACGCC
TCCAATTTTCCTCCACAAACGACCGAGGTCGAGCTTGTCAATTTCTTTGGTGCTGATTGT
GCCTTGATTCAGAATGAAATCATCGAGAAGCCTGAAGAGAAACCTCAAGAGAAGTCTGAA
GAGAAGAAGCCTGAAGAGAAACCTCAAGAGAAGTCTGAAGAGAAGAAGCCTGAAGAGAAA
ACGAAGAAGGTGGCAAGAATCTTGTTTAGATCTCGTGAAGATAAAAAAAGGCCTTTAAGA
GAAACGGAGAAAAGATGAAGGGAGTTCCCATTTATCTTACACGCGTTCGTAACACGCGTA
TTTTTCTTTTGGTGGAAGACCTTGACACTAATAATAAAACAGAATCAGAGATTCGTGACC
AACTGACAAATCATTTTAGTGCGTGTGGAAACGTTTACA*GATATACATTCCTAAAA
TGAG

QA 1 657 1 657
DS 

RD RS1FP55JQ 745 0 0
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CGTATTTTTCTTTTGGTGGAAGACCTTGACACTAATAATAAAACAGAATCAGAGATTCGT
GACCAACTGACAAATCATTTTAGTGCGTGTGGAAACGTTTACAAGATATACATTCCTAAA
AATGAGACCGGTGGCTGTTTAAGTTTTGCATGCGTCTTTCTGAATCAGAATATATCAAAA
TTAGAGGACATGAAGAATTTATCCAAAATAGACGGTCATGAGATCAGTCTCACAGACTAC
ACCTTCCAGGCGAGGTTCAGGGATATTAAAGCAATGATGAAGGCGGAGGGGTCTGAGGTT
CCTGAGGATTTTGAGGATGAGGGTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGAT
GATGATGATGATGGGTTTGGGAAGTATGTTAAGAATTATGTTAAGAATTATGATGGGAAT
TTATGGGATGATGAGGATGATGAGGAGGGTGAGGGGATTGGGAATGATGTAGGTGAGGAG
GATGACGAGATGGATTCTGAGGAGGATGACGAGATGGATTCTGAGGAGGATGACTAACTA
ATTATTTTATCGTGTCAATGGTTGCTGTGGGCTAAGGTCATTTGTTAGACCAAAACAATA
TGCGTAATCTAATGTTTTATCATCTTTCATATTTGAGCAATATCGTTGTAGAGCAAACTA
TGCCAATGGAGATGAGACAGTTTAC

QA 1 745 1 745
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4528Contig1 985 2 2 U
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CCTCCTCCTCCCTCTTTCACCCGCGCCACGTCATTTCCCAAATCGTTCCCGCTCTGTACC
CGCCCCAACCGCCGGTTCTCTCTCACTTACCGTTTAAACCAAAACTCGAAACAGAGGAGT
GCAGGAATCGTCAGATGCGAGGCGACGGAAGTTTCTCCTCCTTCTTCTTCCTCGTCTGTT
GCTTCCCCGGGAAGAAACTGGGTGCCGGTGGTGCCGTTATCCGCGCTTCCGAAAGGTGAA
CGGAGAGTGATTATACAAGACGACGAGACGATATTGCTGCTTTGGTATAAGAACGATGTC
TTCGCGATTGAGAACCTTTCTCCCGCCGAAGGAGCCTACAGCGAGGGGCTTCTCAACGCT
AAGCTCACTCAGGATGGTTGCATTGTGTACCCTGTCAAATTTGATGAAGAAAACATCTAC
ATCAGCATTAGAGGCAACGGGAAGAACGAGGCTGCTGCTGAAATCGTCTTCAGTGGAAAA
GCTCAGCCTGGGCTCACAGCAACCAATGCCAACGTAGACGAGGTGAGGATGGTGGTGGAC
GAGGGTTCTCAAGGATTTGGTTTCTCAAGGAAGAACGAAGTGATAAATGGCAAAGTAGCA
GTGATAGGATTCTTACTGCTGTTAGATTTTGAGCTATTGACAGGTAAAGGTCTATTGAAG
GGGACAGGGTTCTTGGACTTCCTTTACTCTGCTTCTGATGCTTTCAAGTAGAGATCAATA
TATCTATCTTTGGTCTGGTTTTTGCTTTACCTCCCTTGTGCAATTTGTGGAAGCATTATT
CAGTAAATGGAGAAACAAACAACATACTTTTTAAGTAACAAAATTCACACCATGTCTTAG
TATATGAATCACATTTTATAGAGATGTCTTGCCTTTGCTTTGTTTGTGTGTTTACCTCTT
AATATAAGATATTCTTTGTTCTTTC


BQ
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AF RS1G792TF U 1
AF RS1G792JQ C 302
BS 1 625 RS1G792TF
BS 626 985 RS1G792JQ

RD RS1G792TF 625 0 0
GGACTCTCCTCCATGGCGACCACCGCATCCACCTCTCTCCCACGTAACTACTCCATCCCT
CCTCCTCCTCCCTCTTTCACCCGCGCCACGTCATTTCCCAAATCGTTCCCGCTCTGTACC
CGCCCCAACCGCCGGTTCTCTCTCACTTACCGTTTAAACCAAAACTCGAAACAGAGGAGT
GCAGGAATCGTCAGATGCGAGGCGACGGAAGTTTCTCCTCCTTCTTCTTCCTCGTCTGTT
GCTTCCCCGGGAAGAAACTGGGTGCCGGTGGTGCCGTTATCCGCGCTTCCGAAAGGTGAA
CGGAGAGTGATTATACAAGACGACGAGACGATATTGCTGCTTTGGTATAAGAACGATGTC
TTCGCGATTGAGAACCTTTCTCCCGCCGAAGGAGCCTACAGCGAGGGGCTTCTCAACGCT
AAGCTCACTCAGGATGGTTGCATTGTGTACCCTGTCAAATTTGATGAAGAAAACATCTAC
ATCAGCATTAGAGGCAACGGGAAGAACGAGGCTGCTGCTGAAATCGTCTTCAGTGGAAAA
GCTCAGCCTGGGCTCACAGCAACCAATGCCAACGTAGACGAGGTGAGGATGGTGGTGGAC
GAGGGTTCTCAAGGATTTGGTTTCT

QA 1 625 1 625
DS 

RD RS1G792JQ 684 0 0
GGAGAGTGATTATACAAGACGACGAGACGATATTGCTGCTTTGGTATAAGAACGATGTCT
TCGCGATTGAGAACCTTTCTCCCGCCGAAGGAGCCTACAGCGAGGGGCTTCTCAACGCTA
AGCTCACTCAGGATGGTTGCATTGTGTACCCTGTCAAATTTGATGAAGAAAACATCTACA
TCAGCATTAGAGGCAACGGGAAGAACGAGGCTGCTGCTGAAATCGTCTTCAGTGGAAAAG
CTCAGCCTGGGCTCACAGCAACCAATGCCAACGTAGACGAGGTGAGGATGGTGGTGGACG
AGGGTTCTCAAGGATTTGGTTTCTCAAGGAAGAACGAAGTGATAAATGGCAAAGTAGCAG
TGATAGGATTCTTACTGCTGTTAGATTTTGAGCTATTGACAGGTAAAGGTCTATTGAAGG
GGACAGGGTTCTTGGACTTCCTTTACTCTGCTTCTGATGCTTTCAAGTAGAGATCAATAT
ATCTATCTTTGGTCTGGTTTTTGCTTTACCTCCCTTGTGCAATTTGTGGAAGCATTATTC
AGTAAATGGAGAAACAAACAACATACTTTTTAAGTAACAAAATTCACACCATGTCTTAGT
ATATGAATCACATTTTATAGAGATGTCTTGCCTTTGCTTTGTTTGTGTGTTTACCTCTTA
ATATAAGATATTCTTTGTTCTTTC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL4529Contig1 1227 2 2 U
ATTGTCTTTTCTCTCTCTCTCTGTCTAGGTATCGATTAGGGAATTAGGGTTTCTAATCTC
TCTCTCTCTCAATTGGAATCTTGAACTCGGATTCGTTCTTCATCTCCCTCCCCATCGACA
ACCATGACTGAGGAAATTCAAAACCCTAAAAGATTTTGCATCTTTTCTTGATTGATTTCC
TTCTATGAATCGATTCGAATTTTGATTACAAATCGTGTTTTGATTACAAATCGTTGTCTC
TTATATGCTTGTCTTGTGTTTCCAAATCGAATTTGATCTGAGTTTGTGTTTTCTTGTAGT
ATTGGGTAAGTCAGGGGAAGAAGTGGTGCGAGTTCTGTAAGATATGGACTCAGAACAACG
CGACAAGTATCAGAAACACCACCGTGAATGTGTCGAGAAGAAGCTCACTGATATGCGTGA
GAAGAGCGCTGCTAAAGACAAAGAGCTCAAGAAGAACGAGAAACTCCTTCAACAGATCGA
AGCTAAAGCAACTCGTAGCTATCAGAAAGACATAGCAACTGCTCATGAAGTTGCAAAAAG
CGAACGGTGCACCCGAGGATGGTACACACGAGAATCACCACCAGTGAGCGAAAATGGTTG
CCTCTTTTGAGTCACTCTTCAGATTGGGTTCTTGACGCTGCTTCGGGCTATTATTACAAC
CAGATCAATGGTCTCCACTATGATTCAAAGTCTGGATTCTATTACAGTGACTCGATAGGA
CGCTGGGTAACACAAGACGAGGCTTACGCTGCGGTTAAAACTTCATCAGATAAAGACACT
AAAATGCCTCTCGTTAAAAAGCCCGTGCCTTCTTCGGAAGCTGGACCAAGTACGGCGAAG
CCACCTGGGAGGGTTGTTTCGGCTACTTTAAACCCGAAAAGAAATGTGAAAGGAGCTGCC
TCATCTGTTGAGATTGGCAATAACAACAAGAGAAAGAGAATAGATGAGAAACCCAAGAAA
GTATCTGCAGAAGAGAAAGCTGCGTTGAGGGCGAGAGAAGCTGCTAGGAAACGAGTTGAA
GACAGAGAAAAATCATTGCTTGGCCTTTACAACAGACCTTTTTGATGAGAAACCATTACT
TGATCCTCTGTAACAGAGGACAGCAATGTTATAGTTATTTCGGTTATTCCTTCAAAACGT
TCAATCCTAAACTTCGTGGTATTTCTCGGAAGTTTCATGGTTTTGCGAATAGTTCCTTTT
TTAATAAAATGAACCAAGCACAACTCC


BQ
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ATTGGGTAAGTCAGGGGAAGAAGTGGTGCGAGTTCTGTAAGATATGGACTCAGAACAACG
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CGCTGGGTA
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TTCATCAGATAAAGACACTAAAATGCCTCTCGTTAAAAAGCCCGTGCCTTCTTCGGAAGC
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AGATGAGAAACCCAAGAAAGTATCTGCAGAAGAGAAAGCTGCGTTGAGGGCGAGAGAAGC
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TTTGCGAATAGTTCCTTTTTTAATAAAATGAACCAAGCACAACTCC

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GGGGAAAAAAATTTACTGCCTCTCAAAAACCTAACATGCATCAATCCGCCATCAAAGGTC
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AGGGATACGACACCTCCCTTCGTAGGGCAGATGTCGATGGTGCTTTGAGAGAACACTTCG
CTTCATGTGGAAACATAATACATGTTTATGTTCCCGTTCCCTTAGACGTAGACGTTACCG
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TGTGTGGATGTTTAGCAACTCAAGACTTTC


BQ
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BS 725 990 RS1DA80JQ

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AGGGATACGACACCTCCCTTCGTAGGGCAGATGTCGATGGTGCTTTGAGAGAACACTTCG
CTTCATGTGGAAACATAATACATGTTTATGTTCCCGTTCCCTTAGACGTAGACGTTACCG
GTGTTATTCTCTGCAGATATTCCTTAATTTATGTTAATGAAGAAGATGAAGAAAAGGCAC
TGAAGCTTGGTGGAAGTGACATGGGAGGACGGATTTTACAAATTAACCCTTACCCGTTCC
ACGAAAATCACCTTGATGATTACTTGGCTCCTATGAAAGAAGGCGAATTCTTTCTGCCAC
AACACACGATAATGGTTAAGGATTTTGAGTCTTCCCTTCCTATCGATGTTATCAAGGCGC
AGGTTGAGAAATATTTCTCTGCAAAAGGTTCTTTTGTTTACCAAGACGTAACCGCTTCTG
GTGCTATCAAAACCGTAGCCAGATTTTATGTCCGTGGACAAGAGGGTGTAGAAACGGCGC
TTGAACGTAGTGGACGTTCTGTTGAAGGTTTGTATTTTGTAGTTACTGAG*TTGTTCCAG
TTCCAGCAAAAATACGCCCGACTGGCTACTGTCACCCACATAACTTTATAGAAGATCCAA
ATAT

QA 1 724 1 724
DS 

RD RS1DA80JQ 595 0 0
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CTTCCTATCGATGTTATCAAGGCGCAGGTTGAGAAATATTTCTCTGCAAAAGGTTCTTTT
GTTTACCAAGACGTAACCGCTTCTGGTGCTATCAAAACCGTAGCCAGATTTTATGTCCGT
GGACAAGAGGGTGTAGAAACGGCGCTTGAACGTAGTGGACGTTCTGTTGAAGGTTTGTAT
TTTGTAGTTACTGAGGTTGTTCCAGTTCCAGCAAAAATACGCCCGACTGGCTACTGTCAC
CCACATAACTTTATAGAAGATCCAAATATTACGGAGAAGAGAAGTCAGAAGAAGAAGAAG
AGCAAGACTACAGAGAGAAATCAGTCGAAGAAGAAAGAGAAGAAGAGGAAGACCAGGGTG
GGATATCAGAAGAAGATGAAGAGTGAGAGTAGGGAGTAGAAATCTGTTTCTTATGAGAAG
ACATGCTTTTTATTATATCAACTTGTGTGTAATGCAACCCGTTCTTTTCTTTTTCTTCTG
GATATTGAATGTGTTATGTTGTTTTTGTGTGGATGTTTAGCAACTCAAGACTTTC

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 2

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GGAAAATTCGAAAATCAAAAATCAAAAATCAGATCTTTCCTCTCATCTCTCCCTCCTCCC
TTCTCTCTCTTCTAGAGCGAAGGTCAGTCACGTACTTGAGGAATCTCTGATTCTTCTCCT
GGTGAGAGTCTAGAGGCTCGGAGAATCTTAAAGCTTAGGGCTTTACTGCCCGTATCGAAA
AAAAAAATGGGGAATCACTCGGAGAGTTTCGATATCAAAGATCTAATCTCATACGGAGAC
GATTTGATCAGCTTACTGAACGCAAAGAACGGGTTCGACGTCGTATCGCAAAGCTTCGAG
CACTTAAAGGCTCTCCGTTTTCGTTGCGACGAGGATTTCAATCAGACACAGAGATCTATC
CAAGATTGTAAGAAGAAGCTCGTTGCATGCAAGAAGAAAACAGAGGAAGCTTGTTCAGAT
GTTTCGGGTGGAGATGATGACGTGGAGCGTCTTCAGAAGGAGCTTGACGAGGAGATGGAG
CTAGAGGCCAAGCTCAAAGACGAGCTTAGAGTCGTCGCTGATGAACTCAAAGACCTGAAT
GCACAATTGACGTCTGTTGATGAACAGAGGCAATCTATTAAGAGAAAAGAGCGTGACGAC
TTGAGAGCTGAGAAAAAGCTCTCTATGTATGCTTCTGTCACAAAAGTTATACAGACGTTG
AGGATCCATCCAAGATCTCACGATGTATCCTCTTCTTTCACTATCTCTTTTTTACTTCCT
TTGTTTCCCTGAGTGTTTTGTATCCTTGATCTATATGTTTACTTAGATATGGTTGATCGC
GAGAAGAAGGTTATTGAGAAGTTCCAGTTCGAGACAAATAAGATGACGGCTTATGAGACA
TGCAGCAGTATTTGGAGCATCATTAACAAGCAATAATAGACAGAGACATGGCACGAGTTC
ATTTGTTTGATGCGTTTTAACAGATTTGGTTTTTAGCTTAGCAACCAAAAACCTCTGTAC
CCACCCCATTTAGTGAATAGTTTTTGGTTTCAGCTTAGCAACCAAAACCTCTGTACCACC
ACCCCATTTACGGTTCCTTAGATGTAAACCCCCATCCTGCTTAGTTTTTTTTCGTTGCCC
TTTTTGTAATTTGATTATGAATATTTTTCTCCTGTAACATCATCATCAGTTCGTCATCTA
TGAAAATTTCCCTTGCAAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EV34TF U 1
AF RS1EV34JQ C 595
BS 1 728 RS1EV34TF
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RD RS1EV34TF 764 0 0
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AAAAAAATGGGGAATCACTCGGAGAGTTTCGATATCAAAGATCTAATCTCATACGGAGAC
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CACTTAAAGGCTCTCCGTTTTCGTTGCGACGAGGATTTCAATCAGACACAGAGATCTATC
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GTTTCGGGTGGAGATGATGACGTGGAGCGTCTTCAGAAGGAGCTTGACGAGGAGATGGAG
CTAGAGGCCAAGCTCAAAGACGAGCTTAGAGTCGTCGCTGATGAACTCAAAGACCTGAAT
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AGGATCCATCCAAGATCTCACGATGTATCCTCTTCTTTCACTATCTCTTTTTTACTTCCT
TTGTTTCC*TGAGTGTTTTGTATCCTTGATCTATATGTTTACTT

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1EV34JQ 567 0 0
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ACGTTGAGGATCCATCCAAGATCTCAGGATGTATCCTCTTCTTTCACTATTTCTTTTTTA
CTTCCTTTGTTTCCCTGAGTGTTTTGTATCCTTGATCTATATGTTTACTTAGATATGGTT
GATCGCGAGAAGAAGGTTATTGAGAAGTTCCAGTTCGAGACAAATAAGATGACGGCTTAT
GAGACATGCAGCAGTATTTGGAGCATCATTAACAAGCAATAATAGACAGAGACATGGCAC
GAGTTCATTTGTTTGATGCGTTTTAACAGATTTGGTTTTTAGCTTAGCAACCAAAAACCT
CTGTACCCACCCCATTTAGTGAATAGTTTTTGGTTTCAGCTTAGCAACCAAAACCTCTGT
ACCACCACCCCATTTACGGTTCCTTAGATGTAAACCCCCATCCTGCTTAGTTTTTTTTCG
TTGCCCTTTTTGTAATTTGATTATGAATATTTTTCTCCTGTAACATCATCATCAGTTCGT
CATCTATGAAAATTTCCCTTGCAAGTC

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 2

CO CL4533Contig1 736 2 2 U
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TGGAATCTGCATATCATATTAGCCAGCTTTCACATCCTCTCCTGAAGGCTTCTGGATTTG
GAAGCATTGTCATGATTTCCTCTGTTGGAGGGGTTGTGTCAATGTGCTGTGGATCCATCT
ATAGTCCAGCGAAAGGAGCTTTGAACCAACTAGCCAAAAATTTGGCGTGCGAATGGGCAA
GAGATGGCATAAGAACCAACTCTGTTGCTCCTAATTTTGTCAACAATACTACCATGGTTC
AACCTTTTTTCAAGGACGCTGATTACGAGAAGAGTTTATTAAACAGAACTCCACTTGGTC
GGGCTGGAGAGCCAAAAGAGGTTGCATCACTTGTGGCTTTCCTGTGTCTACCTGCAGCTT
CATATATTACTGGTCAGACCATTTGTGTTGATGGAGGTCTCACTGTCAATGGTTTCTCCT
ATCAGCCAAAGGCTTGAGCTAAGGCTTGAGCGGTGACTTGTGTGTGTTGGTGATGCAGCG
TACAAGTATATTTAAGTTGGTGTCGGGTTTTATTTTAACCTCTGCTTTCTATCAATAATA
AAGACAAAAATAAGAAACTCTAGTTTTCCATTACTATTGCACTCTTTGAGAATTCAATAG
ATTTGTGTTGGTTTGGTTCACAGTTATCTCTGAAATCAATGTTTATCAATATCTTGCATC
TATTATTTGGTGTTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G538TF U 1
AF RS1G538JQ C 324
BS 1 646 RS1G538TF
BS 647 736 RS1G538JQ

RD RS1G538TF 646 0 0
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ATAGTCCAGCGAAAGGAGCTTTGAACCAACTAGCCAAAAATTTGGCGTGCGAATGGGCAA
GAGATGGCATAAGAACCAACTCTGTTGCTCCTAATTTTGTCAACAATACTACCATGGTTC
AACCTTTTTTCAAGGACGCTGATTACGAGAAGAGTTTATTAAACAGAACTCCACTTGGTC
GGGCTGGAGAGCCAAAAGAGGTTGCATCACTTGTGGCTTTCCTGTGTCTACCTGCAGCTT
CATATATTACTGGTCAGACCATTTGTGTTGATGGAGGTCTCACTGTCAATGGTTTCTCCT
ATCAGCCAAAGGCTTGAGCTAAGGCTTGAGCGGTGACTTGTGTGTGTTGGTGATGCAGCG
TACAAGTATATTTAAGTTGGTGTCGGGTTTTATTTTAACCTCTGCTTTCTATCAATAATA
AAGACAAAAATAAGAAACTCTAGTTTTCCATTACTATTGCACTCTT

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DS 

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GCATCACTTGTGGCTTTCCTGTGTCTACCTGCAGCTTCATATATTACTGGTCAGACCATT
TGTGTTGATGGAGGTCTCACTGTCAATGGTTTCTCCTATCAGCCAAAGGCTTGAGCTAAG
GCTTGAGCGGTGACTTGTGTGTGTTGGTGATGCAGCGTACAAGTATATTTAAGTTGGTGT
CGGGTTTTATTTTAACCTCTGCTTTCTATCAATAATAAAGACAAAAATAAGAAACTCTAG
TTTTCCATTACTATTGCACTCTTTGAGAATTCAATAGATTTGTGTTGGTTTGGTTCACAG
TTATCTCTGAAATCAATGTTTATCAATATCTTGCATCTATTATTTGGTGTTCA

QA 1 413 1 413
DS 



AS 1 2

CO CL4534Contig1 1169 2 2 U
GGGCCATTTTCGGTTTTCTAGTAATTGCTTTTCAAAAATGGTCGGGGTAGTTTTCAAGGA
ATTGTTGTGGGTTATTACGGCAATGACGCTTACAATGGTCGAGGAGGCTCGTGCACAGCT
AGTGCCTTGCTATTTCGTTTTCGGGGACTCAGTCTTCGACAACGGTAACAACAACGACTT
GAATACCACCGTCAAAGTTAACTATTCACCTTATGGTATTGATTTTGCTAGAGGTCCTAC
CGGCCGTTTCAGCAACGGCCGTAATATTCCCGACTTTATCGCTGAACTAATGGGATTCAG
TGATTACATTCCACCTTTCGCTGGGGCATCTCCTGAACAAGCTCACACTGGTATAAACTA
TGCTTCTGGTGCTGCCGGAATTCTCGAAGAGACTAGCTACCATATGGGCGATAGAATCAG
TTTTGAGAAACAAATCGAGAATCACCAGAAGATTATAATGGCGGCGAGTGTGCCATCGGA
GAAGCTGGAGAAATGCCTATACACAATTAATATTGGAAGCAATGATTATCTCAACAATTA
TTTCATGCAAGGTGATAAGTACAATAGTAGTCGCACATTCACTTACGATCAATATGCTGA
ATTCCTCATCCAACGTTATCGCTCTTATTTGGAGTTATTGTATGTCCAAGGAGCAAGTAA
GGTGGCGTTGTTTGGGGTCAGTAAACTAGGGTGCACGCCGCGGATGATCGCTTCCCATGG
TGGCGGTCAACGCTGCGCTGCTGAAGTGAACAAGGCTGTTGAACCATTCAACAAGAACCT
CAAAGCTCTGGTCAGTGAATTTAACACAAACTTCAACGATGCTAAGATCACTTACGTTGA
TATCTTCACCAGTCAAACGCCTCTTGCGTATGCTGCCTTAGGGTTCACAGAAACACGAAA
GAGTTGTTGTACGGTCGAATCAGGGGAAGAACTATGTGCGGCGGATAAACCTGTTTGTAA
ATTTCGAAGAACGTACGTGTACTGGGACAAAGTCCACAGCACTGAGGCAGCCAACATGTT
TGTTGCAAATTCTGCGTTTGCTGGAGTCACTGCTTTTCCTTACAGCCTTGCCTTGCTTGC
AATATGATAGGGACAATATACTCAAAAAATGTCATTCGCATTTCTTTTTGGTGAATATAA
TATATATAAAGACCCTTAAAGACGGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1B071TF U 1
AF RS1B071JQ C 380
BS 1 645 RS1B071TF
BS 646 1169 RS1B071JQ

RD RS1B071TF 645 0 0
GGGCCATTTTCGGTTTTCTAGTAATTGCTTTTCAAAAATGGTCGGGGTAGTTTTCAAGGA
ATTGTTGTGGGTTATTACGGCAATGACGCTTACAATGGTCGAGGAGGCTCGTGCACAGCT
AGTGCCTTGCTATTTCGTTTTCGGGGACTCAGTCTTCGACAACGGTAACAACAACGACTT
GAATACCACCGTCAAAGTTAACTATTCACCTTATGGTATTGATTTTGCTAGAGGTCCTAC
CGGCCGTTTCAGCAACGGCCGTAATATTCCCGACTTTATCGCTGAACTAATGGGATTCAG
TGATTACATTCCACCTTTCGCTGGGGCATCTCCTGAACAAGCTCACACTGGTATAAACTA
TGCTTCTGGTGCTGCCGGAATTCTCGAAGAGACTAGCTACCATATGGGCGATAGAATCAG
TTTTGAGAAACAAATCGAGAATCACCAGAAGATTATAATGGCGGCGAGTGTGCCATCGGA
GAAGCTGGAGAAATGCCTATACACAATTAATATTGGAAGCAATGATTATCTCAACAATTA
TTTCATGCAAGGTGATAAGTACAATAGTAGTCGCACATTCACTTACGATCAATATGCTGA
ATTCCTCATCCAACGTTATCGCTCTTATTTGGAGTTATTGTATGT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1B071JQ 790 0 0
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AATCACCAGAAGATTATAATGGCGGCGAGTGTGCCATCGGAGAAGCTGGAGAAATGCCTA
TACACAATTAATATTGGAAGCAATGATTATCTCAACAATTATTTCATGCAAGGTGATAAG
TACAATAGTAGTCGCACATTCACTTACGATCAATATGCTGAATTCCTCATCCAACGTTAT
CGCTCTTATTTGGAGTTATTGTATGTCCAAGGAGCAAGTAAGGTGGCGTTGTTTGGGGTC
AGTAAACTAGGGTGCACGCCGCGGATGATCGCTTCCCATGGTGGCGGTCAACGCTGCGCT
GCTGAAGTGAACAAGGCTGTTGAACCATTCAACAAGAACCTCAAAGCTCTGGTCAGTGAA
TTTAACACAAACTTCAACGATGCTAAGATCACTTACGTTGATATCTTCACCAGTCAAACG
CCTCTTGCGTATGCTGCCTTAGGGTTCACAGAAACACGAAAGAGTTGTTGTACGGTCGAA
TCAGGGGAAGAACTATGTGCGGCGGATAAACCTGTTTGTAAATTTCGAAGAACGTACGTG
TACTGGGACAAAGTCCACAGCACTGAGGCAGCCAACATGTTTGTTGCAAATTCTGCGTTT
GCTGGAGTCACTGCTTTTCCTTACAGCCTTGCCTTGCTTGCAATATGATAGGGACAATAT
ACTCAAAAAATGTCATTCGCATTTCTTTTTGGTGAATATAATATATATAAAGACCCTTAA
AGACGGTTGC

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 2

CO CL4535Contig1 950 2 2 U
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CCATCGAAAATGGGTCGAATAAGTTTAGTGGTTTGTGATCTGGTTCTGTCGTTCATGTGG
ATATGGGCAGGAGTTCTGGTCAACATCTTAGTCCACGGAGTACTCGGGTTTAGTCGGAAA
GATACGACCGGCGATATCGTCCGTTATCTATTCTCCGTCATCCCCATGTTCCTCTTCGCT
TTCCTTCAGAAACTCACCAAAGGTGGACTCTACAACCCTTTGACCGCTTTGGCTTCTGGT
GTCTCCGGTGGCTTCCGCGGTTTCATCTTCTCCGTCCTGGTTCGCATCCCCGTCGAGGTG
ATGGGATCAGTCCTTGCGGTTAAACATATCATTCACGTTTTCCCTGAGATTGGAAAAGGA
CCAAAACTGAACGTAGCAATCCATCACGGCGCTTTAACCGAAGGGATACTAACCTTTTTC
ATAGTAATGCTCTCATTAGGACTTACAAGGAAGATCCCTGGAAGTTTCTTCATGAAGACT
TGGATTGCTAGTATTGCTAAGTTGACTCTTCATGTTCTTGGATTTGATTTAACCGGTGGA
TGCATGAACCCGGCTGCTGTGATGGGATGGGCTTATGCTCGAGGTGAACACATAACAAAG
GAGCATTTACTTGTGTATTGGCTTGGACCTGTCAAGGCTACTTTGCTCGCTGTTTGGTTC
TTCAATGTTGTGTTTAAGCCTCTCACTGAAGAACAACAAGAGAAACCTAAGGCCAAATCT
GAGTGAGTAATGAGGTCACACCTCTAACAACACACACGAAGGGTGATATTGTTGTATCCA
GGGATGATTTCGTTGTAGCAAACTCAGTTGTATCAATCAGTTCAATAAAAATGTGAATTC
TGGCTTTATACAATGTGCAATGCAATTGATAACAGTATTTGGTTTATTGC


BQ
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AF RS1F219TF U 1
AF RS1F219JQ C 328
BS 1 654 RS1F219TF
BS 655 950 RS1F219JQ

RD RS1F219TF 654 0 0
GAGATTCACAATAGCCTATCACAATAAAAAAAAAAGCTTACTTTCCTGAGAAACAGAGTT
CCATCGAAAATGGGTCGAATAAGTTTAGTGGTTTGTGATCTGGTTCTGTCGTTCATGTGG
ATATGGGCAGGAGTTCTGGTCAACATCTTAGTCCACGGAGTACTCGGGTTTAGTCGGAAA
GATACGACCGGCGATATCGTCCGTTATCTATTCTCCGTCATCCCCATGTTCCTCTTCGCT
TTCCTTCAGAAACTCACCAAAGGTGGACTCTACAACCCTTTGACCGCTTTGGCTTCTGGT
GTCTCCGGTGGCTTCCGCGGTTTCATCTTCTCCGTCCTGGTTCGCATCCCCGTCGAGGTG
ATGGGATCAGTCCTTGCGGTTAAACATATCATTCACGTTTTCCCTGAGATTGGAAAAGGA
CCAAAACTGAACGTAGCAATCCATCACGGCGCTTTAACCGAAGGGATACTAACCTTTTTC
ATAGTAATGCTCTCATTAGGACTTACAAGGAAGATCCCTGGAAGTTTCTTCATGAAGACT
TGGATTGCTAGTATTGCTAAGTTGACTCTTCATGTTCTTGGATTTGATTTAACCGGTGGA
TGCATGAACCCGGCTGCTGTGATGGGATGGGCTTATGCTCGAGGTGAACACATA

QA 1 654 1 654
DS 

RD RS1F219JQ 623 0 0
TTCTCCGTCCTGGTTCGCATCCCCGTCGAGGTGATGGGATCAGTCCTTGCGGTTAAACAT
ATCATTCACGTTTTCCCTGAGATTGGAAAAGGACCAAAACTGAACGTAGCAATCCATCAC
GGCGCTTTAACCGAAGGGATACTAACCTTTTTCATAGTAATGCTCTCATTAGGACTTACA
AGGAAGATCCCTGGAAGTTTTTTCATGAAGACTTGGATTGCTAGTATTGCTAAGTTGACT
CTTCATGTTCTTGGATTTGATTTAACCGGTGGATGCATGAACCCGGCTGCTGTGATGGGA
TGGGCTTATGCTCGAGGTGAACACATAACAAAGGAGCATTTACTTGTGTATTGGCTTGGA
CCTGTCAAGGCTACTTTGCTCGCTGTTTGGTTCTTCAATGTTGTGTTTAAGCCTCTCACT
GAAGAACAACAAGAGAAACCTAAGGCCAAATCTGAGTGAGTAATGAGGTCACACCTCTAA
CAACACACACGAAGGGTGATATTGTTGTATCCAGGGATGATTTCGTTGTAGCAAACTCAG
TTGTATCAATCAGTTCAATAAAAATGTGAATTCTGGCTTTATACAATGTGCAATGCAATT
GATAACAGTATTTGGTTTATTGC

QA 1 623 1 623
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4537Contig1 852 2 4 U
GGTTCTGATCCAAGTCTACGAAGGAGAGCGCGCGAGGACGAAAGACAACAACCTTCTCGG
AACCTTTGAGCTTAAAGGCATCCCTCCTGCTCCGCGTGGAGTCCCTCAGATCAATGTTTG
CTTCGACATGGACGCCAATGGGATCTTGAACGTGTCGGCGGAGGATAAAACCGCGGGTGT
GAGGAACCAGATCACGATCACGAACGACAAAGGGAGGTTGAGCAAAGAGGAGATTGAGAA
GATGGTGCAAGATGCTGAGAGGTACAAGGCCGAGGATGAGCAGGTGAAGAAGAGAGTGGA
GGCCAAGAACGCGCTGGAGAACTATGCTTACAATATGAGGAACACTGTCAAGGATGAGAA
ACTGGCGCAGAAGCTGGATCAAGGGGATAAGCAGAAGATCGAGAAGGCGATTGATGAGAC
GATAGAGTGGATTGAAGGAAACCAGCTAGCGGAAGTTGATGAGTTTGAGTATAAGTTGAA
AGAGCTGGAGGGTATTTGCAACCCAATCATCTCCAAGATGTATCACGCTGGTGCCGGTGC
CGGTGCTGGATATCCCGATGGTGGTGTGCCTGCAAACGGTGGCTCAGGTGCTGCTGGAGG
TCCAAAGATAGAAGAGGTTGATTAGAGCGGTGATAAATGCGGAAACAGAGTGGTTATGGA
CCGGTGGAAAGTCTTTCTTTGTATTATGCATGTCTTAAGTATCTAAGAGTGTCTTTTGTT
TTGCTAATGAAACCAATGAGAACTAGCTATATGCTTTACTCAATTGTTTTTGTTTTTGTT
TCATGTAGTAAATTAAGTAATTTCTTCCTCTAATAATCTGAGTTGCAGTGAAAGACCTCC
ATGAAGTTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FG33TF U 1
AF RS1FM54TF U 200
BS 1 265 RS1FG33TF
BS 266 266 RS1FM54TF
BS 267 533 RS1FG33TF
BS 534 852 RS1FM54TF

RD RS1FG33TF 533 0 0
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AACCTTTGAGCTTAAAGGCATCCCTCCTGCTCCGCGTGGAGTCCCTCAGATCAATGTTTG
CTTCGACATGGACGCCAATGGGATCTTGAACGTGTCGGCGGAGGATAAAACCGCGGGTGT
GAGGAACCAGATCACGATCACGAACGACAAAGGGAGGTTGAGCAAAGAGGAGATTGAGAA
GATGGTGCAAGATGCTGAGAGGTACGAGGCCGAGGATGAGCAGGTGAAGAAGAGAGTGGA
GGCCAAGAACGCGCTGGAGAACTATGCTTACAATATGAGGAACACTGTCAAGGATGAGAA
ACTGGCGCAGAAGCTGGATCAAGGGGATAAGCAGAAGATCGAGAAGGCGATTGATGAGAC
GATAGAGTGGATTGAAGGAAACCAGCTAGCGGAAGTTGATGAGTTTGAGTATAAGTTGAA
AGAGCTGGAGGGTATTTGCAACCCAATCATCTCCAAGATGTATCACGCTGGTG

QA 1 533 1 533
DS 

RD RS1FM54TF 653 0 0
G
CGAACGACAAAGGGAGGTTGAGCAAAGAGGAGATTGAGAAGATGGTGCAAGATGCTGAGA
GGTACAAGGCCGAGGATGAGCAGGTGAAGAAGAGAGTGGAGGCCAAGAACGCGCTGGAGA
ACTATGCTTACAATATGAGGAACACTGTCAAGGATGAGAAACTGGCGCAGAAGCTGGATC
AAGGGGATAAGCAGAAGATCGAGAAGGCGATTGATGAGACGATAGAGTGGATTGAAGGAA
ACCAGCTAGCGGAAGTTGGTGAGTTTGAGTATAAGTTGAAAGAGCTGGAGGGTATTTGCA
ACCCAATCATCTCCAAGATGTATCAGGCTGGTGCCGGTGCCGGTGCTGGATATCCCGATG
GTGGTGTGCCTGCAAACGGTGGCTCAGGTGCTGCTGGAGGTCCAAAGATAGAAGAGGTTG
ATTAGAGCGGTGATAAATGCGGAAACAGAGTGGTTATGGACCGGTGGAAAGTCTTTCTTT
GTATTATGCATGTCTTAAGTATCTAAGAGTGTCTTTTGTTTTGCTAATGAAACCAATGAG
AACTAGCTATATGCTTTACTCAATTGTTTTTGTTTTTGTTTCATGTAGTAAATTAAGTAA
TTTCTTCCTCTAATAATCTGAGTTGCAGTGAAAGACCTCCATGAAGTTTGTC

QA 2 653 2 653
DS 



AS 1 2

CO CL4538Contig1 959 2 2 U
GAGGGTTATGTGGGATCAGAAAACTGGGCGTTCAAGGGGATTTGGATTTGTTTCGTTCCG
AAACCAGCAGGATGCCCAGACTGCAATAGATGAGGCAGGCGGGAAATGGCTTGGTACCAG
GCAGATTCGCTGCAACTGGGCAACAAAAGGAGCCACTTCTGGTGAGGACAAGATGAGCTC
TGATTCCAAAAGTGTTGTGGAACTAACAAGTGGTGTCTCCGAGGATGGCAAAGATACAAG
TAACGGTGATGCTCCTGAGAACAATGCTCAGTACACAACTGTTTACGTTGGGAATCTTGG
TCCAGAGGTTTCCCAGGTTGATCTTCACCGCCACTTCTATTCTCTTGGCGCTGGAGTTAT
TGAGGAGGTTCGTGTTCAAAGAGACAAAGGTTTTGGATTTGTACGGTACTCTACTCATGT
AGAAACCGCCCTCGCTATCCAGCTGGGAAACACACATTCCTACCTCGGTGGCAGGCAGAT
GAAGTGTTCTTGGGGAAGCAAGCCAACTCCACCCGGAACAGTGTCAAACCCGCTTCCTCC
ACCAGGTCCTGCACCAATCCCAGGCTTTTCAGCCAGCGACCTCTTGGCTTACGAGAGGCA
ACTAGCGATGAGCAAGATGGCGGGGATGAATCCGATGATGCATCACCCGCAGGGACAACA
CGCTTTCAAGCAAGCTGCGATGGGAGCCACTGGTTCAAACCAGGCCATTTATGACAGTGG
TTTCCAGAACGCGCAGCGGCTCATGTATTACCAGTGAGTTTTTTTCCAGAAGCTCATGTA
TCTCCTTCTTTCCTTTTCTTTTACCTTGTTGTTATAATGTTCTTGTGTACCTGTGGGTTT
TATGGTTTGTTTCATCCCTCCTTGTTTACTACTTTGCTGTGATGTAGGAAGCAACTTTAA
TATGTTTCAACTAGATACTCAGACACTGTTGTTGCTATATAAACAAAAGCTATTAGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1F189TF U 1
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AAACCAGCAGGATGCCCAGACTGCAATAGATGAGGCAGGCGGGAAATGGCTTGGTACCAG
GCAGATTCGCTGCAACTGGGCAACAAAAGGAGCCACTTCTGGTGAGGACAAGATGAGCTC
TGATTCCAAAAGTGTTGTGGAACTAACAAGTGGTGTCTCCGAGGATGGCAAAGATACAAG
TAACGGTGATGCTCCTGAGAACAATGCTCAGTACACAACTGTTTACGTTGGGAATCTTGG
TCCAGAGGTTTCCCAGGTTGATCTTCACCGCCACTTCTATTCTCTTGGCGCTGGAGTTAT
TGAGGAGGTTCGTGTTCAAAGAGACAAAGGTTTTGGATTTGTACGGTACTCTACTCATGT
AGAAACCGCCCTCGCTATCCAGCTGGGAAACACACATTCCTACCTCGGTGGCAGGCAGAT
GAAGTGTTCTTGGGGAAGCAAGCCAACTCCACCCGGAACAGTGTCAAACCCGCTTCCTCC
ACCAG
TCCT

QA 1 545 1 545
DS 

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GTTTACGTTGGGAATCTTGGTCCAGAGGTTTCCCAGGTTGATCTTCACCGCCACTTCTAT
TCTCTTGGCGCTGGAGTTATTGAGGAGGTTCGTGTTCAAAGAGACAAAGGTTTTGGATTT
GTACGGTACTCTACTCATGTAGAAACCGCCCTCGCTATCCAGCTGGGAAACACACATTCC
TACCTCGGTGGCAGGCAGATGAAGTGTTTTTGGGGAAGCAAGCCAACTCCACCCGGAACA
GTGTCAAACCCGCTTCCTCCACCAGGTCCTGCACCAATCCCAGGCTTTTCAGCCAGCGAC
CTCTTGGCTTACGAGAGGCAACTAGCGATGAGCAAGATGGCGGGGATGAATCCGATGATG
CATCACCCGCAGGGACAACACGCTTTCAAGCAAGCTGCGATGGGAGCCACTGGTTCAAAC
CAGGCCATTTATGACAGTGGTTTCCAGAACGCGCAGCGGCTCATGTATTACCAGTGAGTT
TTTTTCCAGAAGCTCATGTATCTCCTTCTTTCCTTTTCTTTTACCTTGTTGTTATAATGT
TCTTGTGTACCTGTGGGTTTTATGGTTTGTTTCATCCCTCCTTGTTTACTACTTTGCTGT
GATGTAGGAAGCAACTTTAATATGTTTCAACTAGATACTCAGACACTGTTGTTGCTATAT
AAACAAAAGCTATTAGTGC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

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TATAATCCTGAAATCATCTCAGAATCTGAATCTTGAAAGAAAGATAGAACGATACTCCAA
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GCTAAACCGATCAGATACGACGATGACAACTCGACTACAAACACTAATATGCAGGAAGCA
ATTGCAGCC


BQ
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AF RS1AE06JQ U 136
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RD RS1AE06JQ 353 0 0
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QA 1 353 1 353
DS 

RD RS1AE06TF 549 0 0
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GTCTTGCAGAGGCAAGTGACCAAGCTAAATTCTGCCAGAAAAAAAGACAACACTCTTGCA
TATAATCCTGAAATCATCTCAGAATCTGAATCTTGAAAGAAAGATAGAACGATACTCCAA
TTTGTTGTATTAGAGCGTACAAAAGCCGTTGCAAAAATTTGAAGCATGAAATTTAGTTCT
CCGAAAAGAAAACTCACCCCATTAACACTACAAAGGAAGATGCACCATAGTTTTGGGTCC
GTGCCTAACCTATGTAACCCTTGGAGACTTCGGGTGGAGGAGACAAATGGAAATCAGCAA
AGTCTTCCCGTCAAAATGGACAACCAATTGAAAGAACCAGTATTGCAGACATAGAATCGG
GCTAAACCGATCAGATACGACGATGACAACTCGACTACAAACACTAATATGCAGGAAGCA
ATTGCAGCC

QA 1 549 1 549
DS 



AS 1 2

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CCGGCAAGAGTCTTCACGATTTACCGGATTGAGCAATCAAATCATGCCAAGTCAGATTCT
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TATGGGGAAAACGTTATTTACTGGATTCAGCAGAGGCAGTGGTAACAGCTTAGAGCTTCT
ATAATGGCTGAGAAAGATGAAGAATCCTTGTGCCTCGAGATGAAACAATGAGAAGTAGCA
TGATAATCTCCTTTTCAACAACCATCATGAGCTCAGGACTCCATTAACACTACGTTTTTT
TCTTTTTTTCTAATTTGTGGAGACAGTCCTGATGTCTCCTGATTTGGTTATGGTTCTGTA
GGTTCAAAGCCTAGAATTTCACCAGTGTCCAATATCTAACAAGGAAGACTATTAGATTCT
TTAAAAATATGATTGGGTAAATGGCTGTAGAATGTTCAAGTAACGCCTACATTATTGAAT
ATGTAACAGGTGCTACGTACTCAAAAGTCCGGACGTGTGGAGAAATATGATTGAGTTTGG
ATTTGAACTGGAGATCCATTCATCCATCGTTTACAAGTGTGGTGGAGTGTAACAGGTACT
ACTAAATGTACAGACATGTGGAGAAACTAGCAAAAGAGATGTGCTGCTTCTGTTGCTGGT
GTCGCTGCCAAACTATGGCAGGTACCAGAGACGCTCCAACAAGATCTGCTCTCTAAAATG
AGTGCACCGCCAAAGAATGATGCTCCTCTTATCACCCCCAACGACCTTGCCGAGGCTGAT
GGGTTTGTCTTTGGCTTCCCAACAAGGTTCAGTATGATGGCTGCTCAGTTCATAGCTTTC
TTAGATGCAACTGGTGGTCTCTGGAGGACTCAACAACTTGCTGGTAAGCCAGCCGGAATA
TTCTACAGCACCAGGGTTTCGAGGTGGTGGTCAAGAAACCACCGCGTACGTTTTTTTTCC
AAACGAAACCTCATCAAAGACACTTCAGGTTCTTACGTTTTTGAGTGTTTACTTGTGTTG
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TTTAGAACTAACTCTATTTTTATAAATCTTATACCAGTTAAGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AU69TF U 1
AF RS1AU69JQ C 438
BS 1 655 RS1AU69TF
BS 656 656 RS1AU69JQ
BS 657 694 RS1AU69TF
BS 695 695 RS1AU69JQ
BS 696 728 RS1AU69TF
BS 729 1183 RS1AU69JQ

RD RS1AU69TF 736 0 0
GGGATTCAACACCACGGGAGAAGGACGGATTGGTTTACAGCATCCTGATGGAGCCCTTTT
CCGGCAAGAGTCTTCACGATTTACCGGATTGAGCAATCAAATCATGCCAAGTCAGATTCT
TAGGGGCAGAAGAGTTAAGCATTTGCCATGTCATGGAAGGAACGAGCTTTTAAACCTAAT
TATGGGGAAAACGTTATTTACTGGATTCAGCAGAGGCAGTGGTAACAGCTTAGAGCTTCT
ATAATGGCTGAGAAAGATGAAGAATCCTTGTGCCTCGAGATGAAACAATGAGAAGTAGCA
TGATAATCTCCTTTTCAACAACCATCATGAGCTCAGGACTCCATTAACACTACGTTTTTT
TCTTTTTTTCTAATTTGTGGAGACAGTCCTGATGTCTCCTGATTTGGTTATGGTTCTGTA
GGTTCAAAGCCTAGAATTTCACCAGTGTCCAATATCTAACAAGGAAGACTATTAGATTCT
TTAAAAATATGATTGGGTAAATGGCTGTAGAATGTTCAAGTAACGCCTACATTATTGAAT
ATGTAACAGGTGCTACGTACTCAAAAGTCCGGACGTGTGGAGAAATATGATTGAGTTTGG
ATTTGAACTGGAGATCCATTCATCCATCGTTTACAAGTGTGGTGGAGTGTAACAG*TACT
ACTAAATGTACAGACATGTGGAGAAACTAGCAAA*GAGATGTGCTGCTTCTGTTGCTGGT
GTCGCTGC
AAACTATG

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1AU69JQ 746 0 0
TTCACCAGTGTCCAATATCTAACAAGGAAGACTATTAGATTCTTTAAAAATATGATTGGG
TAAATGGCTGTAGAATGTTCAAGTAACGCCTACATTATTGAATATGTAACAGGTGCTACG
TACTCAAAAGTCCGGACGTGTGGAGAAATATGATTGAGTTTGGATTTGAACTGGAGATCC
ATTCATCCATCGTTTACAAGTGTGGTGGAGTGTAACAGGTACTACTAAATGTACAGACAT
GTGGAGAAACTAGCAAAAGAGATGTGCTGCTTCTGTTGCTGGTGTCGCTGCCAAACTATG
GCAGGTACCAGAGACGCTCCAACAAGATCTGCTCTCTAAAATGAGTGCACCGCCAAAGAA
TGATGCTCCTCTTATCACCCCCAACGACCTTGCCGAGGCTGATGGGTTTGTCTTTGGCTT
CCCAACAAGGTTCAGTATGATGGCTGCTCAGTTCATAGCTTTCTTAGATGCAACTGGTGG
TCTCTGGAGGACTCAACAACTTGCTGGTAAGCCAGCCGGAATATTCTACAGCACCAGGGT
TTCGAGGTGGTGGTCAAGAAACCACCGCGTACGTTTTTTTTCCAAACGAAACCTCATCAA
AGACACTTCAGGTTCTTACGTTTTTGAGTGTTTACTTGTGTTGTGTCATTAATTTCTAAC
ACGATTTTTTTGTGATCTTTGTAAGTAGGAGTCAAAAACTATCTTTAGAACTAACTCTAT
TTTTATAAATCTTATACCAGTTAAGC

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 2

CO CL4541Contig1 925 2 2 U
GACGAAGAATACCGTCGCCAAGTACAGGAGTCTTGGGGTTTTGATATTGATGTTCATGTT
CGTATCCCTGAACGTGGAATCTATCCACACGAGCTAGGCAAACGTCAACCGCCTTCCGAT
ATCTCTCTTTACGGCCGTTTGGGAGTTCACTGTTTCAACTTTGAGAAGGGGAGAAAATTT
GCAGTTTATGGGCATACCCAAATACAATATGGATTTAATATATGGAACTATTACTATATC
ACTGTGGAGGTAAAGGATCTTTGTGGACGATTCAGCTCACATTCTCCAGAGCTCAGTCAC
AGGATGTTTTCCCATGAACGGCGAGCATTTAAGAGTCTTGACTGAAATCTGCAGACTAAA
ACCCGAGAAACCAGGTGAAGAAGGTGACTTGACTCAAATTAACGAGGAACCTGTAGATGA
GCTTTACAGAGGTCGTATGCCTAACTTTTTGTCCGAAGCAAAACCTGATGACAGGCTGAG
ATTTTACGAGGTTCAGGAGCAAGACATATGTGAAAATGATTGGCTTCGTCTGTATACTGA
TTTCGCACTTTACTGCTACTGGCGGTATAATGAGGAGGCATTCAAGTCTTGCTTGCCTGC
CGAGATCAACAAGATACTTGTGGGAACCTTTGAAACTCATACAGACCCGTCTCTGAAGCT
CAAGTCTAGTAATGCCATCTTCCACATCAACTTCACTGCCAAGAGCTGTGACTACATATC
GGTTGTCAGGAGGACAAAGGATGGGAGAACAGGGCATATAATACTCGAAATTAGTACCTG
GACCAACCCACCAAGCTCCCCGTGAACAGAAACTGTCGCCCAAATTTTTCCTTTTATGAT
GAACTTTGCTTTGTTTTTATTAACAGTTAAATATTTTTTGTAAATCCTGTTTATGTCCTT
TATTTATGGATGTTTTGATTGCTGC


BQ
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AF RS1AJ20TF U 1
AF RS1AJ20JQ C 120
BS 1 286 RS1AJ20TF
BS 287 925 RS1AJ20JQ

RD RS1AJ20TF 286 0 0
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CGTATCCCTGAACGTGGAATCTATCCACACGAGCTAGGCAAACGTCAACCGCCTTCCGAT
ATCTCTCTTTACGGCCGTTTGGGAGTTCACTGTTTCAACTTTGAGAAGGGGAGAAAATTT
GCAGTTTATGGGCATACCCAAATACAATATGGATTTAATATATGGAACTATTACTATATC
ACTGTGGAGGTAAAGGATCTTTGTGGACGATTCAGCTCACATTCTC

QA 1 286 1 286
DS 

RD RS1AJ20JQ 806 0 0
TATCTCTCTTTACGGCCGTTTGGGAGTTCACTGTTTCAACTTTGAGAAGGGGAGAAAATT
*GCAGTTTATGGGCATACCCAAATACAATATGGATTTAATATATGGAACTATTACTATAT
CACTGTGGAGGTAAAGGATCTT*GTGGACGATTCAGCTCACATTCTCCAGAGCTCAGTCA
CAGGATGTTTTCCCATGAACGGCGAGCATTTAAGAGTCTTGACTGAAATCTGCAGACTAA
AACCCGAGAAACCAGGTGAAGAAGGTGACTTGACTCAAATTAACGAGGAACCTGTAGATG
AGCTTTACAGAGGTCGTATGCCTAACTTTTTGTCCGAAGCAAAACCTGATGACAGGCTGA
GATTTTACGAGGTTCAGGAGCAAGACATATGTGAAAATGATTGGCTTCGTCTGTATACTG
ATTTCGCACTTTACTGCTACTGGCGGTATAATGAGGAGGCATTCAAGTCTTGCTTGCCTG
CCGAGATCAACAAGATACTTGTGGGAACCTTTGAAACTCATACAGACCCGTCTCTGAAGC
TCAAGTCTAGTAATGCCATCTTCCACATCAACTTCACTGCCAAGAGCTGTGACTACATAT
CGGTTGTCAGGAGGACAAAGGATGGGAGAACAGGGCATATAATACTCGAAATTAGTACCT
GGACCAACCCACCAAGCTCCCCGTGAACAGAAACTGTCGCCCAAATTTTTCCTTTTATGA
TGAACTTTGCTTTGTTTTTATTAACAGTTAAATATTTTTTGTAAATCCTGTTTATGTCCT
TTATTTATGGATGTTTTGATTGCTGC

QA 1 806 1 806
DS 



AS 1 2

CO CL4542Contig1 869 2 2 U
GTATATCCATGGATCTTGTTGATAGCATTCCAACTTCTCATGACAAATGTTTCACTGCTT
GGTCACCTATGTGGCATCTTGTCTGGATTTGCATATTCTTATGGCCTTTTCAATTTCTTG
ATGCCCGGCTCTTCATTTTTCTCCAACATTGAGTCAGCCTCATGGATGGCTAGCTGTGTA
AGGCGACCCAAATTCATTATGTGCACTGGTGGAAATCCTTCCAGTTACATGCCAACTTAT
TCTGTACAAAACACGACATCCAGTGGTTTCTCTACAGGAAATGCTTGGAGATCCTTGTCC
TCGTGGCTGCCACAGAGGGAAGCATCTAATCAGTCCTCTGAGGATATTAGATTTCCGGGA
AGAGGTAGAACTCTTAGCGGTACTACCCGTGATCCAACCCCTCCAGCGGGAGAAACAAAC
CCAAACCTCCATGCTAGACTCTTGGAAGATAGCACTCCTGACCGCCTTTCTGATGCAACT
GTGACTGGCATGACAGAGCCAATCCCTGCCGCAAGACAGGTGCCAATAGCAAATGCAGCA
GTCCTGCCTCATTCCCAGGGTCGTGTTGCTGCTTCTGAAGAACAAATCCAGAAGCTCGTT
GCCATGGGCTTCGAAAGGACACAAGTGGAGGTTGCACTTGCAGCTGCCGATGACGATCTA
AACGTAGCTGTGGAGATCTTAATGAGCCAACAGGGCTAAACACATACCAAATTGCAAAGT
ATTACACTGGCGTCTACTGTAACGTTCGTCCCTCGTTCCTCGTTTTACTTGCATTTTAGA
AACCTGTATAGCGCTTCTGTTTTAACCAGATAATCAAACCGGTTTTCCGGTTTAGATTCT
ATACAAACGAAAGGCTGGATTGAGTTTCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GR43TF U 1
AF RS1GR43JQ C 342
BS 1 665 RS1GR43TF
BS 666 869 RS1GR43JQ

RD RS1GR43TF 665 0 0
GTATATCCATGGATCTTGTTGATAGCATTCCAACTTCTCATGACAAATGTTTCACTGCTT
GGTCACCTATGTGGCATCTTGTCTGGATTTGCATATTCTTATGGCCTTTTCAATTTCTTG
ATGCCCGGCTCTTCATTTTTCTCCAACATTGAGTCAGCCTCATGGATGGCTAGCTGTGTA
AGGCGACCCAAATTCATTATGTGCACTGGTGGAAATCCTTCCAGTTACATGCCAACTTAT
TCTGTACAAAACACGACATCCAGTGGTTTCTCTACAGGAAATGCTTGGAGATCCTTGTCC
TCGTGGCTGCCACAGAGGGAAGCATCTAATCAGTCCTCTGAGGATATTAGATTTCCGGGA
AGAGGTAGAACTCTTAGCGGTACTACCCGTGATCCAACCCCTCCAGCGGGAGAAACAAAC
CCAAACCTCCATGCTAGACTCTTGGAAGATAGCACTCCTGACCGCCTTTCTGATGCAACT
GTGACTGGCATGACAGAGCCAATCCCTGCCGCAAGACAGGTGCCAATAGCAAATGCAGCA
GTCCTGCCTCATTCCCAGGGTCGTGTTGCTGCTTCTGAAGAACAAATCCAGAAGCTCGTT
GCCATGGGCTTCGAAAGGACACAAGTGGAGGTTGCACTTGCAGCTGCCGATGACGATCTA
AACGT

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1GR43JQ 528 0 0
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TCCAGCGGGAGAAACAAACCCAAACCTCCATGCTAGACTCTTGGAAGATAGCACTCCTGA
CCGCCTTTCTGATGCAACTGTGACTGGCATGACAGAGCCAATCCCTGCCGCAAGACAGGT
GCCAATAGCAAATGCAGCAGTCCTGCCTCATTCCCAGGGTCGTGTTGCTGCTTTTGAAGA
ACAAATCCAGAAGCTCGTTGCCATGGGCTTCGAAAGGACACAAGTGGAGGTTGCACTTGC
AGCTGCCGATGACGATCTAAACGTAGCTGTGGAGATCTTAATGAGCCAACAGGGCTAAAC
ACATACCAAATTGCAAAGTATTACACTGGCGTCTACTGTAACGTTCGTCCCTCGTTCCTC
GTTTTACTTGCATTTTAGAAACCTGTATAGCGCTTCTGTTTTAACCAGATAATCAAACCG
GTTTTCCGGTTTAGATTCTATACAAACGAAAGGCTGGATTGAGTTTCG

QA 1 528 1 528
DS 



AS 1 2

CO CL4543Contig1 1130 2 2 U
GCAGTCTCAACAACACAAGCTCATGCCGATGTTAGCCTCCACCTATGCGTACCATTTTGC
AACAGTGTACCTCGTGGAGAAATATTCAGAGATGAAGAAGACTCAGGAGGAGCAATTGGT
TGCTGATGTCCATGCGCTCTCTGCGGGGCTCAAATCTTATATAACGTCGTACACCGCTAA
GTCACTCTCGGTCTGCAGAGAAGCTTGTGGAGGACATGGTTACGCAGCTGTTAACAGGTT
TGGAAGCTTGAGAATCGATCATGACATTTTCCAAACATTTGAAGGAGACAACACTGTGCT
TCTGCAACAGGTGGCAGCTGATTTGCTTAAGCGATACAAAGAGAAGTTTCAAGGTGGGAC
ATTGACAGCTACGTGGAGTTACTTGAGAGAGTCGATGAACGCTTACTTGTCTCAGCCAAA
TCCTGTTACAGCTCGTTGGGAAAGTGAAGATCATCTAAGAGATCCTAAATTCCAACTAGA
TGCTTTCCGGTATCGAACATCGCGTCTCCTACAAAGTGTTGCAATGAGATTGACGAAACA
CACCAAGACCCTTGGACCATTCGGCGCTTGGAACAGATGCTTGAATCATCTCTTGACACT
TGCGGAGTCTCACATTGAATCAGTCATTCTCGCCAAGTTCATTGAAGCTGTTCGAAAGTG
TCCGGACCGAAGTGCAAGAGCTGGTCTGAAACTAGCATGTGATCTTTACGCATTGGAGTG
AATATGGAAAGATATAGGAACCTACCGTAACGTGGATTATGTGGCGCCTAACAAAGCCAA
GGCGATTCATAAGTTGACCGAGTATTTGAGTTTTCAAGTAAGGAATGTGGCCAAGGAACT
AGTGGACGCTTTCGACCTACCGGATCATGTTACTCGAGCGCCAATTGCTAGGCAGTCTGA
TGCTTATGCACAGTATACTCAAGTTGTTGGATTCTGAAAAAGGTGAAAGGAAGAAAAAAA
GAAATATCAGATTGAAATAATTAAATCTCCTTCGAGTCTTTTTGATACGAAGTGAAAATA
ACAATTTATAGTACGTGTTGTCCCTTTTCTGTTATGTGTTTTGTGTATTCGTTGCTATTT
GTTTTCCACATGGGAATAAATCAAGTAAGAAACATTGAACTTCATTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CM89TF U 1
AF RS1CM89JQ C 345
BS 1 667 RS1CM89TF
BS 668 1130 RS1CM89JQ

RD RS1CM89TF 667 0 0
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AACAGTGTACCTCGTGGAGAAATATTCAGAGATGAAGAAGACTCAGGAGGAGCAATTGGT
TGCTGATGTCCATGCGCTCTCTGCGGGGCTCAAATCTTATATAACGTCGTACACCGCTAA
GTCACTCTCGGTCTGCAGAGAAGCTTGTGGAGGACATGGTTACGCAGCTGTTAACAGGTT
TGGAAGCTTGAGAATCGATCATGACATTTTCCAAACATTTGAAGGAGACAACACTGTGCT
TCTGCAACAGGTGGCAGCTGATTTGCTTAAGCGATACAAAGAGAAGTTTCAAGGTGGGAC
ATTGACAGCTACGTGGAGTTACTTGAGAGAGTCGATGAACGCTTACTTGTCTCAGCCAAA
TCCTGTTACAGCTCGTTGGGAAAGTGAAGATCATCTAAGAGATCCTAAATTCCAACTAGA
TGCTTTCCGGTATCGAACATCGCGTCTCCTACAAAGTGTTGCAATGAGATTGACGAAACA
CACCAAGACCCTTGGACCATTCGGCGCTTGGAACAGATGCTTGAATCATCTCTTGACACT
TGCGGAGTCTCACATTGAATCAGTCATTCTCGCCAAGTTCATTGAAGCTGTTCGAAAGTG
TCCGGAC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RS1CM89JQ 786 0 0
AAG
TTCAAGGTGGGACATTGACAGCTACGTGGAGTTACTTGAGAGAGTCGATGAACGCTTACT
TGTCTCAGCCAAATCCTGTTACAGCTCGTTGGGAAAGTGAAGATCATCTAAGAGATCCTA
AATTCCAACTAGATGCTTTCCGGTATCGAACATCGCGTCTCCTACAAAGTGTTGCAATGA
GATTGACGAAACACACCAAGACCCTTGGACCATTCGGCGCTTGGAACAGATGCTTGAATC
ATCTCTTGACACTTGCGGAGTCTCACATTGAATCAGTCATTCTCGCCAAGTTCATTGAAG
CTGTTCGAAAGTGTCCGGACCGAAGTGCAAGAGCTGGTCTGAAACTAGCATGTGATCTTT
ACGCATTGGAGTGAATATGGAAAGATATAGGAACCTACCGTAACGTGGATTATGTGGCGC
CTAACAAAGCCAAGGCGATTCATAAGTTGACCGAGTATTTGAGTTTTCAAGTAAGGAATG
TGGCCAAGGAACTAGTGGACGCTTTCGACCTACCGGATCATGTTACTCGAGCGCCAATTG
CTAGGCAGTCTGATGCTTATGCACAGTATACTCAAGTTGTTGGATTCTGAAAAAGGTGAA
AGGAAGAAAAAAAGAAATATCAGATTGAAATAATTAAATCTCCTTCGAGTCTTTTTGATA
CGAAGTGAAAATAACAATTTATAGTACGTGTTGTCCCTTTTCTGTTATGTGTTTTGTGTA
TTCGTTGCTATTTGTTTTCCACATGGGAATAAATCAAGTAAGAAACATTGAACTTCATTT
TCC

QA 4 786 4 786
DS 



AS 1 2

CO CL4544Contig1 1133 2 4 U
GGACAACACACAAGTAACCCTTAATTTCTATCGTTTTCAGCTGTAGCAGCCACTAACTCA
AATCATCTCCTCTCTTCTTAGTCTTTTCAATCAAACCACAAGAATCTCGAGTCCAGTAAG
CACGATAGAAAGAAACTCATGGTGACTTCTCTTCTTCTTATTATCTATTTTACCCCTTTA
AAATATTCTATGCAGATTCTTTATATTTGCTACCGTTTGAATTGGTCTTAAAACTCTCCA
GGGACCAATGATGAGAGTAGAAGAAGAAAGTCCATCATGGCTAATACCATTGCTAAGAGC
AAACTACTTTGTCCCATGTTCGATCCACCTGATTCCAACAAAAGTGAATGCAACATGTTC
TGTCTTGACTGCAGTTCTAGTTCCTTTTGCTCTTACTGTTTGAGCAATCATAAAAACCAT
CGTGTTCTTCAGATACGAAGATCATCATACCACAACGTTGTAAGGGTGAACGAGATTCAG
AAGTACATAGACATCTCTTGTGTTCAGACATATATAATTAACAGCGCAAGGATCGTTTTC
TTGAACGAACGTCCTCAGCCAAGAATCGGCAAAGGCGTTACCAATACTTGTGAAATATGT
TGCAGGAGCCTCCTTGATTCTTTCCGTTTCTGCTCTCTCGGTTGCAAACTTGGAGGGATG
AAGAGAGGAAATCAAAGTCTTTCCTTCTCTTTAAAAGGGAAGCATGGGAGAGAATATCAA
GGTGAAGCGGAATCTGATGAGGCGACCACACCAACTAAGATACGCAAGACATGTGCTTTC
AACCGTCTGATGAATGGTCTCTCCATCTCCACCGTTAAATCAGATTACTTTTCAGGAGAT
CAGTGGTCTTCAAGCTCCGGTGATGAAAGTGGTTTTAAGCTTTCTCCGGGGACACCAACT
ATATATAATCACCGGAACTCGAGCAGACGGAAGGGCGTACCACACCGTGCTCCGTTTTGA
ACTTAACCAACACGTAACTAACCATATAGAAAGGTTTCCCGTGGTCATAGGTCACAGTAT
TGTAAATGGTTAGTATTGTTTTTCTTTTAAAGCCGTAGAAATAGATAATATAAAGAAAAT
CATATACATCGCTGTTTCCTTTGTTTATATCGTATAGGAAATATGTTTGTAGT


BQ
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AF RS1B615TF U 1
AF RS1B615JQ C 388
BS 1 698 RS1B615TF
BS 699 699 RS1B615JQ
BS 700 713 RS1B615TF
BS 714 1133 RS1B615JQ

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AATCATCTCCTCTCTTCTTAGTCTTTTCAATCAAACCACAAGAATCTCGAGTCCAGTAAG
CACGATAGAAAGAAACTCATGGTGACTTCTCTTCTTCTTATTATCTATTTTACCCCTTTA
AAATATTCTATGCAGATTCTTTATATTTGCTACCGTTTGAATTGGTCTTAAAACTCTCCA
GGGACCAATGATGAGAGTAGAAGAAGAAAGTCCATCATGGCTAATACCATTGCTAAGAGC
AAACTACTTTGTCCCATGTTCGATCCACCTGATTCCAACAAAAGTGAATGCAACATGTTC
TGTCTTGACTGCAGTTCTAGTTCCTTTTGCTCTTACTGTTTGAGCAATCATAAAAACCAT
CGTGTTCTTCAGATACGAAGATCATCATACCACAACGTTGTAAGGGTGAACGAGATTCAG
AAGTACATAGACATCTCTTGTGTTCAGACATATATAATTAACAGCGCAAGGATCGTTTTC
TTGAACGAACGTCCTCAGCCAAGAATCGGCAAAGGCGTTACCAATACTTGTGAAATATGT
TGCAGGAGCCTCCTTGATTCTTTCCGTTTCTGCTCTCTCGGTTGCAAACTTGGAGGGATG
AAGAGAGGAAATCAAAGTCTTTCCTTCTCTTTAAAAGG*AAGCATGGGAGAGA
T

QA 1 713 1 713
DS 

RD RS1B615JQ 746 0 0
TGCTCTTACTGTTTGAGCAATCATAAAAACCATCGTGTTCTTCAGATACGAAGATCATCA
TACCACAACGTTGTAAGGGTGAACGAGATTCAGAAGTACATAGACATCTCTTGTGTTCAG
ACATATATAATTAACAGCGCAAGGATCGTTTTCTTGAACGAACGTCCTCAGCCAAGAATC
GGCAAAGGCGTTACCAATACTTGTGAAATATGTTGCAGGAGCCTCCTTGATTCTTTCCGT
TTCTGCTCTCTCGGTTGCAAACTTGGAGGGATGAAGAGAGGAAATCAAAGTCTTTCCTTC
TCTTTAAAAGGGAAGCATGGGAGAGAATATCAAGGTGAAGCGGAATCTGATGAGGCGACC
ACACCAACTAAGATACGCAAGACATGTGCTTTCAACCGTCTGATGAATGGTCTCTCCATC
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AGTGGTTTTAAGCTTTCTCCGGGGACACCAACTATATATAATCACCGGAACTCGAGCAGA
CGGAAGGGCGTACCACACCGTGCTCCGTTTTGAACTTAACCAACACGTAACTAACCATAT
AGAAAGGTTTCCCGTGGTCATAGGTCACAGTATTGTAAATGGTTAGTATTGTTTTTCTTT
TAAAGCCGTAGAAATAGATAATATAAAGAAAATCATATACATCGCTGTTTCCTTTGTTTA
TATCGTATAGGAAATATGTTTGTAGT

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 2

CO CL4545Contig1 956 2 2 U
GGGTTCTAAGGGTGTTTGTTCATCTTCCTCATCGATCCGAAGAGATATCGGTTACCAATT
AACCCTCTTCAAGTCCTTCTTAAATCCATACTCTTGAATGCAATCTCAACTCTTGGGAGG
CAGTGGAATCGCTGCTATAAAAAATTATGCTTTTTATGCTTGAGAATCCTGTCCTCATTA
CATAATTACAAACTAGTAATCATATTCAGTATAATGGCTAACGCTCCAATCTTTCTTATC
GATCCGAAGACCGGATGATTCTCCTCCACTGTTCAGGTGAGGTTGCTGCTTGATTCCGAC
CAGCCAGGAACGTTCGACGCGGTGGAGAAATCATGGGAGACGATATGTTGCTGCTTGATT
CCAAGGCGACCATGATGCCTGTGACGGTGTACGTGTGTTTGTTGCTACTAGGAGCAACCA
AAAACTTTAGACCCGTCGATGCCCATGTGTCTATTCGATTCACTGATCAAACAAAATTAA
ATGAGGTAGCAGAGGACAGTAAGTAAATCACAATGGAACAGTTCCACTTTCATAATTGCC
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CTATGCGAGTGTCTTTGATGGCTTTGCTATACAGCTTAATGCAAAGAAATTTGGCAATGG
TACCTCAAAGGTGAAAGCAACCAGCGTATATACAGAGCCACGAGACACAAGGAACAGCAA
ACAATGGGTTATCCAACACTCTAAAGCTTAGCCAGAAACATCCTTTCCAAAGCTACAGTT
GCTAAAATTTGGAGACTCTTGACTCTGTTTTATTTTAAGTTTCGTCGACATACGACTCTG
TCCTATTTTAAAATTTACGTTTTTCCGTTCTGATGAAAGCAACCATATTAGTACTC


BQ
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AF RS1GM84TF U 1
AF RS1GM84JQ C 466
BS 1 623 RS1GM84TF
BS 624 956 RS1GM84JQ

RD RS1GM84TF 623 0 0
GGGTTCTAAGGGTGTTTGTTCATCTTCCTCATCGATCCGAAGAGATATCGGTTACCAATT
AACCCTCTTCAAGTCCTTCTTAAATCCATACTCTTGAATGCAATCTCAACTCTTGGGAGG
CAGTGGAATCGCTGCTATAAAAAATTATGCTTTTTATGCTTGAGAATCCTGTCCTCATTA
CATAATTACAAACTAGTAATCATATTCAGTATAATGGCTAACGCTCCAATCTTTCTTATC
GATCCGAAGACCGGATGATTCTCCTCCACTGTTCAGGTGAGGTTGCTGCTTGATTCCGAC
CAGCCAGGAACGTTCGACGCGGTGGAGAAATCATGGGAGACGATATGTTGCTGCTTGATT
CCAAGGCGACCATGATGCCTGTGACGGTGTACGTGTGTTTGTTGCTACTAGGAGCAACCA
AAAACTTTAGACCCGTCGATGCCCATGTGTCTATTCGATTCACTGATCAAACAAAATTAA
ATGAGGTAGCAGAGGACAGTAAGTAAATCACAATGGAACAGTTCCACTTTCATAATTGCC
ATCAGCTGATGATATTGTCTAACACGAACACCAAGTTGCCAGTTATGCATGTCACTACTG
CTTACAATGAAGAAACACAAAGC

QA 1 623 1 623
DS 

RD RS1GM84JQ 491 0 0
ATCAAACAAAATTAAATGAGGTAGCAGAGGACAGTAAGTAAATCACAATGGAACAGTTCC
ACTTTCATAATTGCCATCAGCTGATGATATTGTCTAACACGAACACCAAGTTGCCAGTTA
TGCATGTCACTACTGCTTACAATGAAGAAACACAAAGCATTCAATGTATTATGGAAAATT
CAGTGATACTACGTTCTATGCGAGTGTCTTTGATGGCTTTGCTATACAGCTTAATGCAAA
GAAATTTGGCAATGGTACCTCAAAGGTGAAAGCAACCAGCGTATATACAGAGCCACGAGA
CACAAGGAACAGCAAACAATGGGTTATCCAACACTCTAAAGCTTAGCCAGAAACATCCTT
TCCAAAGCTACAGTTGCTAAAATTTGGAGACTCTTGACTCTGTTTTATTTTAAGTTTCGT
CGACATACGACTCTGTCCTATTTTAAAATTTACGTTTTTCCGTTCTGATGAAAGCAACCA
TATTAGTACTC

QA 1 491 1 491
DS 



AS 1 2

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AAAAAAGGCTTCCTTCCAACAGATAAAATGATTCGCAGCTTTGCCAGAGAAACAAAACCA
AGAAGGAACCAGTTGCAATTTGGTTTGCAGTAATGTTCAGTATCCACTGCATTTTATATA
AACCCTCGAGAAAGAAAAAAAAAAATACAAGACAGAGACTCAATACGCCAACTTCCTCTC
CCATCATTTTAGTTCCGCAAACAGCTTAGGTCCGACACATTTGTCAACACATTACCAGTA
ATCAAAATACTGCCCAGTACAATGTTTGTGGCCACTCTCATCATCTTGGATCCTCTTCAC
ACACGCCTGATATTCAAGTAGTGGCTTCACACATTTTGGTTTGCAAGATTCCTCGAGGCA
CTTTTTCGGATCAACAACTTCTACATCCGCCATGGTGAAATTGGAAATAAAGGATCGCAA
GCTTCACTGATCGATCGCCAAACGATGAACCCTAATTGTTGTGATTCGATTTTCCCCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AJ75TF C 1
AF RS1AJ75JQ U 219
BS 1 218 RS1AJ75TF
BS 219 540 RS1AJ75JQ

RD RS1AJ75TF 540 0 0
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AACCCTCGAGAAAGAAAAAAAAAAATACAAGACAGAGACTCAATACGCCAACTTCCTCTC
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CTTTTTCGGATCAACAACTTCTACATCCGCCATGGTGAAATTGGAAATAAAGGATCGCAA
GCTTCACTGATCGATCGCCAAACGATGAACCCTAATTGTTGTGATTCGATTTTCCCCCCC

QA 1 540 1 540
DS 

RD RS1AJ75JQ 322 0 0
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ATTTGTCAACACATTACCAGTAATCAAAATACTGCCCAGTACAATGTTTGTGGCCACTCT
CATCATCTTGGATCCTCTTCACACACGCCTGATATTCAAGTAGTGGCTTCACACATTTTG
GTTTGCAAGATTCCTCGAGGCACTTTTTCGGATCAACAACTTCTACATCCGCCATGGTGA
AATTGGAAATAAAGGATCGCAAGCTTCACTGATCGATCGCCAAACGATGAACCCTAATTG
TTGTGATTCGATTTTCCCCCCC

QA 1 322 1 322
DS 



AS 1 2

CO CL4547Contig1 1084 2 2 U
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TTTAAAAAAAGTATCATCTCTTTTTTTTTTTATAACTTGAAAACGGTTGGAACAGGTACA
CCCAGACGCGAAAGCATTCAAGGGAAAGCAAATTGAGATGTATGAAGAACTTAGAATAGT
ATGTGGTGACCATCACCAAGCCCCAGGTCGATATGCCAAGGTGAAAGCTGAAAGCAATCA
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TGAAGACAATAATAGCGATACAGATGGAACTGAATCCTACGCAGGAGGTGGTGGTGGAGG
AGCAGATGAGTATTTGCATGAAGAGCCTCAAGATCTTCCTCTTCCTCCTCCACCTCGAAA
TCCTTTAAAGCAGCCTCTTAAACGACCTAAAAACTCAGATCCTTTCCAAGAAGCCATGTT
AGCAGTTGCTTCAAGCATTCGTCGCCTAGCTGATGCAGTGGAAGGAAGCAAAAGTTCGGT
CAACACAGAGGAACTGCTTGAAGCAGTGATGGAGATTGATGGATTGGAAGAAGCCAAGCA
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TAATACTAGGATGAGGAAGTTGTTTTTGTTTCGACAGTTTTGGTGGTGGAAGTAATAACA
CAATGTGTGGATTTGCTTTGCTTCGCTTCTCTATGAACTAATAGCAGAATTTTATTTCTA
GGTAAATTAAAAGTCTGGAGTTTGTATTTGGTGCTTGTTGTCTATGGTAAAATGATTTAA
TCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RS1D707TF U 1
AF RS1D707JQ C 332
BS 1 653 RS1D707TF
BS 654 1084 RS1D707JQ

RD RS1D707TF 653 0 0
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TGAAGACAATAATAGCGATACAGATGGAACTGAATCCTACGCAGGAGGTGGTGGTGGAGG
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DS 

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GATGCAGTGGAAGGAAGCAAAAGTTCGGTCAACACAGAGGAACTGCTTGAAGCAGTGATG
GAGATTGATGGATTGGAAGAAGCCAAGCAGATGTATGTGTTTGAGTATCTGAATGGTGAT
CCGGTGAAAGCTAGAGCTTTCATGGCTTATAATACTAGGATGAGGAAGTTGTTTTTGTTT
CGACAGTTTTGGTGGTGGAAGTAATAACACAATGTGTGGATTTGCTTTGCTTCGCTTCTC
TATGAACTAATAGCAGAATTTTATTTCTAGGTAAATTAAAAGTCTGGAGTTTGTATTTGG
TGCTTGTTGTCTATGGTAAAATGATTTAATCCC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL4548Contig1 998 2 2 U
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TTCGTTAACCACCCCAACATCGCCAATTTCAAGTGGACCGAAGGTGAAACTCTTGGTTCC
ACTATCTTCTTCGTGTCTGTTGTAGTCTCAGTCTACCTCTCCTCCACGTTAATACTCCGA
TCTGCCATCGGTTCACTCCCCGCGCTAGGTCCCAGAATTCTCAAACCAATCACTGCTCTC
CACAGCCTCATCCTCTGCATTCTTTCTTTAATCATGGCTGTTGGTTGCACACTCTCTATC
ACCACAGATCCGACAGCAAGTTTGTTCAAAGCGGTCTGTTTTCCCGTCGATGTGAAACCT
AGCGGACGGCTTTTCTTCTGGGCACAAGTCTTCTATCTCTCTAAGATACTCGAGTTCGGA
GACACAATCCTCATCATACTCGGAAAGTCAGTCCAACGGTTGTCCTTCCTCCACGTGTAC
CACCACGCGACAGTTGTGGTCATGTGCTTCCTCTGGCTCCGAACCAGACAGTCTATGTTT
CCCATTGCGCTTGTGACGAACTCGACGGTCCATGTAATCATGTACGGTTATTACTTTCTA
TGTGCTTTAGGATCCAGACCGAAGTGGAAGAGGTTGGTGACGGATTGTCAGATTGTGCAG
TTTGTTTTCAGCTTCGGGTTGTCTGGTTGGATGCTCCGAGAGCATTTTTTCGGGTCGGGT
TGCTCCGGGATTTGGGGATGGTGTTTCAACGCTGCCTTTAATGCTTCTCTTTTGGCTCTC
TTCTTCGACTTCCATTCCAAGAACTATGCTAAAAAGAGTAGCAGACAAGGAGACCGCAAA
AGCGATTAGTTTAGTGGTGTCTTGTCTTTCCATTGTTTGAAATTGTTTTATGAATAAGAT
GTGACATAAGTCATGAAATGGATTCGTTTTTCTGATCC


BQ
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AF RS1EE95TF U 1
AF RS1EE95JQ C 345
BS 1 666 RS1EE95TF
BS 667 998 RS1EE95JQ

RD RS1EE95TF 666 0 0
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AAAAGGAGAAGCGACTAGATTCACGCAATGGCATCATTTCACTCTACCCTCACATACTGG
TTCGTTAACCACCCCAACATCGCCAATTTCAAGTGGACCGAAGGTGAAACTCTTGGTTCC
ACTATCTTCTTCGTGTCTGTTGTAGTCTCAGTCTACCTCTCCTCCACGTTAATACTCCGA
TCTGCCATCGGTTCACTCCCCGCGCTAGGTCCCAGAATTCTCAAACCAATCACTGCTCTC
CACAGCCTCATCCTCTGCATTCTTTCTTTAATCATGGCTGTTGGTTGCACACTCTCTATC
ACCACAGATCCGACAGCAAGTTTGTTCAAAGCGGTCTGTTTTCCCGTCGATGTGAAACCT
AGCGGACGGCTTTTCTTCTGGGCACAAGTCTTCTATCTCTCTAAGATACTCGAGTTCGGA
GACACAATCCTCATCATACTCGGAAAGTCAGTCCAACGGTTGTCCTTCCTCCACGTGTAC
CACCACGCGACAGTTGTGGTCATGTGCTTCCTCTGGCTCCGAACCAGACAGTCTATGTTT
CCCATTGCGCTTGTGACGAACTCGACGGTCCATGTAATCATGTACGGTTATTACTTTCTA
TGTGCT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RS1EE95JQ 654 0 0
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CGTCGATGTGAAACCTAGCGGACGGCTTTTCTTCTGGGCACAAGTCTTCTATCTCTCTAA
GATACTCGAGTTCGGAGACACAATCCTCATCATACTCGGAAAGTCAGTCCAACGGTTGTC
CTTCCTCCACGTGTACCACCACGCGACAGTTGTGGTCATGTGCTTCCTCTGGCTCCGAAC
CAGACAGTCTATGTTTCCCATTGCGCTTGTGACGAACTCGACGGTCCATGTAATCATGTA
CGGTTATTACTTTCTATGTGCTTTAGGATCCAGACCGAAGTGGAAGAGGTTGGTGACGGA
TTGTCAGATTGTGCAGTTTGTTTTCAGCTTCGGGTTGTCTGGTTGGATGCTCCGAGAGCA
TTTTTTCGGGTCGGGTTGCTCCGGGATTTGGGGATGGTGTTTCAACGCTGCCTTTAATGC
TTCTCTTTTGGCTCTCTTCTTCGACTTCCATTCCAAGAACTATGCTAAAAAGAGTAGCAG
ACAAGGAGACCGCAAAAGCGATTAGTTTAGTGGTGTCTTGTCTTTCCATTGTTTGAAATT
GTTTTATGAATAAGATGTGACATAAGTCATGAAATGGATTCGTTTTTCTGATCC

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 2

CO CL4549Contig1 322 2 1 U
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CATTGACATGGCTCTCTCAACTCCTCTTTCTCAGATGTCTGTTGCACTTCCTATTGGAAT
TGATGGGTCGAGCCGATCTATGATTAAGGTGCAAAGTGTAAGCTTCACCGATGCTTAATT
TCCTTTCTAAAACACTCATATAATAATCTATGCTCATTTCACTTCCAGTTGCCTGTTTTT
ATCCTCTTTGGATTTCTGTCTGAGACATTTTCTATCGGATTGTCAAATGTCCGATTTATG
GATATATATGTAATTTCTGCAG


BQ
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AF RS1DP54JQ C 1
AF RS1DP54TF U 1
BS 1 322 RS1DP54TF

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CATTGACATGGCTCTCTCAACTCCTCTTTCTCAGATGTCTGTTGCACTTCCTATTGGAAT
TGATGGGTCGAGCCGATCTATGATTAAGGTGCAAAGTGTAAGCTTCACCGATGCTTAATT
TCCTTTCTAAAACACTCATATAATAATCTATGCTCATTTCACTTCCAGTTGCCTGTTTTT
ATCCTCTTTGGATTTCTGTCTGAGACATTTTCTATCGGATTGTCAAATGTCCGATTTATG
GATATATATGTAATTTCTGCAG

QA 1 322 1 322
DS 

RD RS1DP54TF 322 0 0
GGGCTCCTCAATCATTCGTTTTCTCGATTTGCGATCTAATTCATAATCCAAATTCTTATT
CATTGACATGGCTCTCTCAACTCCTCTTTCTCAGATGTCTGTTGCACTTCCTATTGGAAT
TGATGGGTCGAGCCGATCTATGATTAAGGTGCAAAGTGTAAGCTTCACCGATGCTTAATT
TCCTTTCTAAAACACTCATATAATAATCTATGCTCATTTCACTTCCAGTTGCCTGTTTTT
ATCCTCTTTGGATTTCTGTCTGAGACATTTTCTATCGGATTGTCAAATGTCCGATTTATG
GATATATATGTAATTTCTGCAG

QA 1 322 1 322
DS 



AS 1 2

CO CL4550Contig1 1335 2 4 U
GGATCCAACTTCAGTTTCCCCGCCAAGTCTCGATCTTTACCCGCTAAGACAAACCGTACC
TTCTGTTCTCTTTCCTCCAACCGCCGGATACAACCGTCGCGGTATGGCATCTCGGTCTCA
CGGTAATTCTGCTAATTTTAAGTCCCTCGCCGCTCGTCAGACTTCGATCGGTGGTGGTGG
TGATGATGATGATGGATACTGTACTCTCATAGACTTTGCAGGTAATGGAGGAGGAGGAGG
GAGAGAAGGGACGAATGTAGGAGATGATCTTGTGGTGTTGCTTTACCACTTACAACACGC
CTGCAAAAGAATCGCTTCTCTTGTCGCTTCTCCTTTCAACTCTTCACTTGGAAAGCTCTC
GCTTAACTCCTCTACTGGCTCAGACCGAGACGCGCCTAAGCCGCTTGATATTGTCTCAAA
CGATATCATCTTGTCATCTCTCAGAAACTCAGGGAAAGTAGCAGTAATGGCTTCAGAAGA
AGACGATACTCCCACTTGGATTAAAGATGACGGTCCTTACAATCGACTCGTTGAGCTTGA
TCATTTACCTGTTGAAGAGAAAGCCGAGCTCAATTCTCTCCAGAGAGGTAACAGGCTTGT
AGCTTCGGGTTACGTGCTGTACTCTTCAGCCACGATTCTCTGCGTTACTCTTGGCTCTGG
AACACATGCCTTCACGCTTGATCATTCCACAGGCGAGTTCGTTCTCACACATCAAAACAT
TAAGATCCCTACTCGAGGACAAATCTACTCAGTGAATGATGCGAGGTACTTCGACTGGCC
AGAAGGTTTGAGGAAGTACATTGATACTGTAAGACAAGGGAAAGGGCAGAACCCGAAGAA
ATACTCTGCGCGTTACATTTGTTCTCTGGTGGCTGATCTTCACAGGACTTTGTTATACGG
CGAAGTGGCTATGAATCCAAGAGACCATCTCCGTTTAGTCTACGAAGGAAACCCATTGGC
TTTTCTAGTGGAACAAGCTGGTGGCAAAGCCTCTGATGGAAAGAGAGAGATACTTTCGAT
ACAGCCAGTGAAGCTTCACCAGAGATTACCTCTGTTTCTTGGGAGTGTAGAGGATATGAC
TGAGCTTGAGAGCTATGGAGATGTGCAGCAGACTGTGAATCCTGGCTACGAAGTTTGAAC
GAGTCCCTCTCTTTTTTCACGTGTTGGAAAATTTCAAATCCATGAAATGTTTGTGAAGAT
ATAGCGATGGAATATCGCTTGTTTCATTACATGTTCAAACGTAAATCACTCTAGACCTTG
TTCATTGTAACATAAACCAATCAATCTAGATCTTGTTCATTGTATAAACCAATCAATCTA
GATCTTGTTTATTGT


BQ
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TATCGCTTGTTTCATTACATGTTCAAACGTAAATCACTCTAGACCTTGTTCATTGTAACA
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TGT

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DS 



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BQ
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GCTCCATAGTTCAGATAAGCAAGATCAAACTCGGGAA*CTCTATGCTGCTTCCGTCATGT
ATGGCTACTTCCTTAGAAGA*TCGACCAGAGATACCAGCTTGAGAG

QA 1 766 1 766
DS 

RD RS1C427JQ 715 0 0
GAGATGATACAGAGCCACTTGTCTTCCGTTCTTGGAGACGGAACAGCTGTCGGTCCATTA
AGCTCCATAGTTCAGATAAGCAAGATCAAACTCGGGAAACTCTATGCTGCTTCCGTCATG
TATGGCTACTTCCTTAGAAGAATCGACCAGAGATACCAGCTTGAGAGAACCATGAACACA
CTTCCGAAACGGCCTGAGAAAAACAGGGAACGGTACGAAGAACCTTCCCCTCCGTACCCG
TTATGGGATCCGGATTCATTGATCCGGATCCAACCAGAGGAATATGATCCTGATGAGTAT
GCAATACAAAGAAATGAAGATGAGTCATCTTCTTACGGGTTGAGATCATATGTTACCTAC
TTGGACTCGGATACGCTTCAGAGGTACGCCACGATACGGTCAAAAGAAGCCATGTCGCTG
ATAGAGAAGCAGACTCAGGCTCTCTTTGGACGACCAGACATAAGGATACTAGAGGACGGT
AAGCTGGATACGTCTAACGATGAGGTTCTGTCTCTGAGTTTCTCTGGACTTGCGATGTTG
GTTTTGGAAGCTGTGACCTTTGGGTCTTTCTTATGGGATGCGAGAGCTACGTTGAATCTA
AATACCATTTCCTCAAGGCTTGAGCTTAGTCCTCATTTGTATGTTGTTTTCCAAGTTATA
TGTAAAGAAAGAAGACATTTGTATTCTACTTTTGAATGTAAATTGTTAATCTCTC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

CO CL4552Contig1 1134 2 2 U
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CAATGAAACGCATCGTCCCTCTTCTCTATCGCTACATCTCCATCGCGTTATCTCTCTTCA
AGAGCCTCGTCCTCTGTTTATTCGATAATTTCGATTACCCGATCCTCATCAAACTCGCCG
ACGCCTTCCTATCATTATATTTCATAACTCTCTGCGATCTCCGACCAATCACCGTCGATT
TAAACGATGGAGAAACCACCGTCCATTTCTGGGTCTCCGCCCACCGTAGAATCGACCGTC
CTGACCTCGTCATGCTACACGGCTACGGAGGGAACTCGAAATGGCAGTTTATCCATCAGG
TCTCAGATCTCTCCAAATCTTTCAACCTCTTCATCCCCGACCTCGTCTTCTTCGGGGGAT
CTCACTCGAGGAACACCACCGAGCGGACAATAGAGTTTCAAGCGAGGAGCGTCGTGGGAG
GTCTGAAGAGGCTGGGGTGCAACGAGGAGGGCGGTTTGGCGGTTTACTCGACCAGTTACG
GAGGTTTCGTCGCGTACAGGATGGCGAAGATGTGGCCCGAGATGGTGGAGAAAGTGGTGA
TCGTGAGCAGTGGAGTGGGGTTCACGCAACAGCAGAAGATGACGGACGTGAAGAAACACG
GGGGTGACGTGTCGGAGATTCTTGTTCCGAGGAACCCGCGGGATCTGAGGATGTTGGTTA
GGGTTTCCATGAATAGTGGGATCAAGTTCATTGACTGGGTCCCAGACTTTATCCTCTCCC
AATTCATCGCTGTGATGTATGAGACACATCGGAAGGAACTTGTTGAGTTAGCCAAAAATT
TGCTGGAAAGAGAAGAAGATGCCGAGTTTTATGCAATTTCACAGAAAACCTTAATTATTT
GGGGTGATAAGGATGAGGTGTTTCCCTTGGAGCATGCACGTCGTCTACATAGACAATTGC
CAAACTCGAGTTTAGAGATATTGAAGGATATTGGACACGGCGTGAACATTGAAGCACCAA
CTACTCTTAACAACTTAATAACCTCGTTTGTTTTGGATGTTTCCTGACTATTTTTCGTGT
TCTTACAAATGTAGTAAATTTATATCTATCAATTGCAGTGCCGTACTAACCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EG14TF U 1
AF RS1EG14JQ C 412
BS 1 740 RS1EG14TF
BS 741 1134 RS1EG14JQ

RD RS1EG14TF 740 0 0
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CAATGAAACGCATCGTCCCTCTTCTCTATCGCTACATCTCCATCGCGTTATCTCTCTTCA
AGAGCCTCGTCCTCTGTTTATTCGATAATTTCGATTACCCGATCCTCATCAAACTCGCCG
ACGCCTTCCTATCATTATATTTCATAACTCTCTGCGATCTCCGACCAATCACCGTCGATT
TAAACGATGGAGAAACCACCGTCCATTTCTGGGTCTCCGCCCACCGTAGAATCGACCGTC
CTGACCTCGTCATGCTACACGGCTACGGAGGGAACTCGAAATGGCAGTTTATCCATCAGG
TCTCAGATCTCTCCAAATCTTTCAACCTCTTCATCCCCGACCTCGTCTTCTTCGGGGGAT
CTCACTCGAGGAACACCACCGAGCGGACAATAGAGTTTCAAGCGAGGAGCGTCGTGGGAG
GTCTGAAGAGGCTGGGGTGCAACGAGGAGGGCGGTTTGGCGGTTTACTCGACCAGTTACG
GAGGTTTCGTCGCGTACAGGATGGCGAAGATGTGGCCCGAGATGGTGGAGAAAGTGGTGA
TCGTGAGCAGTGGAGTGGGGTTCACGCAACAGCAGAAGATGACGGACGTGAAGAAACACG
GGGGTGACGTGTCGGAGATTCTTGTTCCGAGGAACCCGCGGGATCTGAGGATGTTGGTTA
GGGTTTCCATGAATAGTGGG

QA 1 740 1 740
DS 

RD RS1EG14JQ 723 0 0
TCGGGGGATCTCACTCGAGGAACACCACCGAGCGGACAATAGAGTTTCAAGCGAGGAGCG
TCGTGGGAGGTCTGAAGAGGCTGGGGTGCAACGAGGAGGGCGGTTTGGCGGTTTACTCGA
CCAGTTACGGAGGTTTCGTCGCGTACAGGATGGCGAAGATGTGGCCCGAGATGGTGGAGA
AAGTGGTGATCGTGAGCAGTGGAGTGGGGTTCACGCAACAGCAGAAGATGACGGAGGTGA
AGAAACACGGGGGTGACGTGTCGGAGATTCTTGTTCCGAGGAACCCGCGGGATTTGAGGA
TGTTGGTTAGGGTTTCCATGAATAGTGGGATCAAGTTCATTGACTGGGTCCCAGACTTTA
TCCTCTCCCAATTCATCGCTGTGATGTATGAGACACATCGGAAGGAACTTGTTGAGTTAG
CCAAAAATTTGCTGGAAAGAGAAGAAGATGCCGAGTTTTATGCAATTTCACAGAAAACCT
TAATTATTTGGGGTGATAAGGATGAGGTGTTTCCCTTGGAGCATGCACGTCGTCTACATA
GACAATTGCCAAACTCGAGTTTAGAGATATTGAAGGATATTGGACACGGCGTGAACATTG
AAGCACCAACTACTCTTAACAACTTAATAACCTCGTTTGTTTTGGATGTTTCCTGACTAT
TTTTCGTGTTCTTACAAATGTAGTAAATTTATATCTATCAATTGCAGTGCCGTACTAACC
TTT

QA 1 723 1 723
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TTTTTTTGAGATCGAATAATTGATTATTAAGATAAAACAGATGGGATCACAACTGTGTCC
ATCCTCAGTAAAAAGTTTCTCTTTCTCAACCAATGAAATGGTATGGTTAAAACTTAAAAG
TATATGGGACCCAAAACGCTACACAACCCAACAACCTTAGCTCATCTGTGTTACCAAAAA
TAACAGGACAGGAAATGAAAAACATAAATGCAAAAAAATGAAGCATAATGGAAAACAGTT
CAGCATTTTATTAAAAAGGAATCTATGCCAAAAAAAAAGCAAAATACTCGTAATCAAGGC
TTTCGATGGGACAAGTGTTGGCTCCGACAATTGCGGTCTGCGAAGTTGTGTTCTTTCGGT
TCCTAGCGAGCAGAGGCTGTTGGAATCCGACAGATCCATCATCTAGGATCCCAGATATCT
TCCTCTCGTAGTTACCTCCTTCGACATCTATATCATGGTCTTCGCTCCGATCATCCATCT
CTTATTCCACCAACATGCAATTTCGATCCCTATCAGATGAATTTGGAGAAGGTAGTGTTT
TACTATTGGTGTAAGAGCTCGAGTCTCCTGATCAAGAACCCTCGCGCTCCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FZ89JQ U 8
AF RS1FZ89TF C 1
BS 1 7 RS1FZ89TF
BS 8 344 RS1FZ89JQ
BS 345 593 RS1FZ89TF

RD RS1FZ89JQ 337 0 0
GAGATCGAATAATTGATTATTAAGATAAAACAGATGGGATCACAACTGTGTCCATCCTCA
GTAAAAAGTTTCTCTTTCTCAACCAATGAAATGGTATGGTTAAAACTTAAAAGTATATGG
GACCCAAAACGCTACACAACCCAACAACCTTAGCTCATCTGTGTTACCAAAAATAACAGG
ACAGGAAATGAAAAACATAAATGCAAAAAAATGAAGCATAATGGAAAACAGTTCAGCATT
TTATTAAAAAGGAATCTATGCCAAAAAAAAAGCAAAATACTCGTAATCAAGGCTTTCGAT
GGGACAAGTGTTGGCTCCGACAATTGCGGTCTGCGAA

QA 1 337 1 337
DS 

RD RS1FZ89TF 593 0 0
TTTTTTTGAGATCGAATAATTGATTATTAAGATAAAACAGATGGGATCACAACTGTGTCC
ATCCTCAGTAAAAAGTTTCTCTTTCTCAACCAATGAAATGGTATGGTTAAAACTTAAAAG
TATATGGGACCCAAAACGCTACACAACCCAACAACCTTAGCTCATCTGTGTTACCAAAAA
TAACAGGACAGGAAATGAAAAACATAAATGCAGAGAAATGAAGCATAATGGAAAACAGTT
CAGCATTTTATTAGAAAGGAATCTATGCCAAAAAAAAAGCAGAATACTCGTAATCAAGGC
TTTCGATGGGACAAGTGTTGGCTCCGACAATTGCGGTCTGCGAAGTTGTGTTCTTTCGGT
TCCTAGCGAGCAGAGGCTGTTGGAATCCGACAGATCCATCATCTAGGATCCCAGATATCT
TCCTCTCGTAGTTACCTCCTTCGACATCTATATCATGGTCTTCGCTCCGATCATCCATCT
CTTATTCCACCAACATGCAATTTCGATCCCTATCAGATGAATTTGGAGAAGGTAGTGTTT
TACTATTGGTGTAAGAGCTCGAGTCTCCTGATCAAGAACCCTCGCGCTCCCCT

QA 1 593 1 593
DS 



AS 1 2

CO CL4555Contig1 1310 2 2 U
GGACCCTAATCGAGTTTGAGAGTCGTCGTCTTCGTCCTCCCTGCCTGCGTCCATCGTCAG
AATTTCATCACTCTCTGATGCGTTGCGGTGTAATGTTATGTACTTCAATTGGGGTTTGCC
TCTTACTCTGATTTTGCGGTCCAGCGAGCACACAAGTATAGAGAAACTCTAATCCGTGGT
AAGAACGTGTTCGTGGTCATCGTTCTCTTCGATCAGCGAATGGGGACGATCCAGTTTCTG
TAACGATATGCATTCGTGATTTCTATGTCTTTACACTTTGCAACTCATGGCCCAATCGAC
ATCGAGCTTATGGCCTAAGGAAGCCCCCAAATCCGTTCGGAACTTCGTTCAACTTTGCCT
CGAGGGTTACTTCGACAACACCATCTTCCACTGTGTAATCCCCGGGTTCCTCGATCCCAC
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TAATGGTAACCAGTTCTTTTTCACTTTGGATAAGTGTGATTGGCTTGATAAGAAGCACAC
TATCTTTGGAAAGGTAACGGGTGATTCAATCTTTAATCTTCTAAGACTAGGAGAGGTTGA
CATTGGTAAAGATGATCGTCCCCTGGATCCTGCTCCCAAAATATTATCTGTTGAGGTTTT
GTGGAACCCTTTCGAAGATATTGTTCCTAGAGTGTTAGCAAAGACATCACATGCTCCTGT
TGATGAAGTCAAGGAATCCCCCAAAAAAGCCTGTGAAGAAATTGAATCTACTGTCATTCG
GAGAAGAAGCTGAGGAAGAGGAGAAGGAACTGGCAGCTGTAAAGCAAAAGATTAAGAGCA
GTCATGACGTGTTGAACGATCCTCGAGTATTGAAGCCAGAATCTACAGATAAAGAACGGA
ATGCATCTGACTTGAAGGAGGTGCTATCTGTGCGGGGAGCTCTCGATCTAAGAAGGAAGA
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TGATGGTGGAGACGAGACTAAATTTGATGCAAAGATGAGGAATCAGGTGCTTAGCAGAAG
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TTTATGTGCTTAGGGATGCTTCTAACCAAATTATAATAAAAGTTCAAACC


BQ
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AF RS1BC44JQ C 563
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CGAGGGTTACTTCGACAACACCATCTTCCACTGTGTAATCCCCGGGTTCCTCGATCCCAC
CGGCTCCGGCACAGGTGGAGAGAGTATATACAGAGGTATCTTTGCCGATGAGTTCCACTC
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TAATGGTAACCAGTTCTTTTTCACTTTGGATAAGTGTGATTGGCTTGATAAGAAGCACAC
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CATTGGTAAAGATGATCGTCCCCTGGATCCTGCTCCCAAA
TATATCTGT

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DS 

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GCTATCTGTGCGGGGAGCTCTCGATCTAAGAAGGAAGATGCTCAAAAAGAGAAAAGCTGG
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CTCCAAAACCAACTCAGAAAAAAGTAATTAGTTTGTTCATCTCTCAAAGCTGATATATAG
AACTTATAAATTACATAACAAAAGTTCAAACCAACTCATTTATGTGCTTAGGGATGCTTC
TAACCAAATTATAATAAAAGTTCAAACC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL4556Contig1 806 2 6 U
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AAAGAGGCGCATAGAGATGAGGCCCAAAGCTGCTTCAGGAAAAGCCATAATAGTGCTGTG
CCTCGCTAGCTTTCTTGCAGGCTCACTGTTCATGAGTCGATCTTTGAGTCGCTCTTACGT
GTCTGAAGAAGAGGATCAACATCTCGTAAAGCATTTGTCTAAACGTTTAGAAGTTCAAAA
GGACCGCGATGAACATAAACGCAAATTGATAGAAAGCAAATCCAGAGACATAATAGGAGA
AGTATCAAAAACCCACCAAGCAGTAAAAGCATTGGAGAGAACTATGTCAACGTTGGAGCT
GGAGTTAGCAGCAGGACGTACAAGCCATAGAAACAGTGAGTTCTGGAGCGAAAAGAGCGC
GAAAAACCAGAGTCTACAAAAAGCGTTTGCAGTGATAGGCATCAACACAGCATTCAGCAG
CAAGAAGAGACGAGATTCGGTGAGACAGACATGGATGCCAACAGGAGAAAAGCTGAAGAA
AATCGAGAAAGAGAAAGGGATTGTTGTAAGGTTTGTGATAGGACACAGTGCAACACCAGG
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AAACACATTGAAGATATCACCAGCTCTCTACAAAGACAAGACTCTACTTCTCACAGCAGC
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TCGTACACACTAGCGAGATATCATCA


BQ
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AF RS1EE57TF U 1
AF RS1B420TF U 8
BS 1 103 RS1EE57TF
BS 104 104 RS1B420TF
BS 105 381 RS1EE57TF
BS 382 382 RS1B420TF
BS 383 553 RS1EE57TF
BS 554 806 RS1B420TF

RD RS1EE57TF 553 0 0
GGGTTTCTTAATCTGAAAGCTCTCGTATTCAGTCCCATCATTTCATAGAGAATTAGGACT
AAAGAGGCGCATAGAGATGAGGCCCAAAGCTGCTTCAGGAAAATCCATAATAGTGCTGTG
CCTCGCTAGCTTTCTTGCAGGCTCACTGTTCATGAGTCGATCTTTGAGTCGCTCTTACGT
GTCTGAAGAAGAGGATCAACATCTCGTAAAGCATTTGTCTAAACGTTTAGAAGTTCAAAA
GGACCGCGATGAACATAAACGCAAATTGATAGAAAGCAAATCCAGAGACATAATAGGAGA
AGTATCAAAAACCCACCAAGCAGTAAAAGCATTGGAGAGAACTATGTCAACGTTGGAGCT
GGAGTTAGCAGCAGGACGTACCAGCCATAGAAACAGTGAGTTCTGGAGCGAAAAGAGCGC
GAAAAACCAGAGTCTACAAAAAGCGTTTGCAGTGATAGGCATCAACACAGCATTCAGCAG
CAAGAAGAGACGAGATTCGGTGAGACAGACATGGATGCCAACAGGAGAAAAGCTGAAGAA
AATCGAGAAAGAG

QA 1 553 1 553
DS 

RD RS1B420TF 799 0 0
GG
AATCTGAAAGCTCTCGTATTCAGTCCCATCATTTCATAGAGAATTAGGGCTAAAGAGGCG
CATAGAGATGAGGCCCAAAGCTGCTTCAGGAAAAGCCATAATAGTGCTGTGCCTCGCTAG
CTTTCTTGCAGGCTCACTGTTCATGAGTCGATCTTTGAGTCGCTCTTACGTGTCTGAAGA
AGAGGATCAACATCTCGTAAAGCATTTGTCTAAACGTTTAGAAGTTCAAAAGGACTGCGG
TGAACATAAACGCAAATTGATAGAAAGCAAATCCAGAGACATAATAGGAGAAGTATCAAA
AACCCACCAAGCAGTAAAAGCATTGGAGAGAACTATGTCAACGTTGGAGCTGGAGTTAGC
AGCAGGACGTACAAGCCATAGAAACAGTGAGTTCTGGAGCGAAAAGAGCGCGAAAAACCA
GAGTTTACAAAAAGCGTTTGCAGTGATAGGCATCAACACAGCATTCAGCAGCAAGAAGAG
ACGAGATTCGGTGAGGCAGACATGGATGCCAACAGGAGAAAAGCTGAAGAAAATCGAGAA
AGAGAAAGGGATTGTTGTAAGGTTTGTGATAGGACACAGTGCAACACCAGGAGGAGTATT
AGACAAAGCCATAGATGAAGAAGACTCAGAGTATAAAGATTTCTTGAGACTAAACACATT
GAAGATATCACCAGCTCTCTACAAAGACAAGACTCTACTTCTCACAGCAGCAGCATGTGG
GACGCAGAGTCTACGTGAAGTAGACGACGACGTACATGTCAACTTAGATGCTCGTACACA
CTAGCGAGATATCATCA

QA 3 799 3 799
DS 



AS 1 2

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TTTGCAAGGCTCGGGTTGTGGAAGTCCTGGAACAAAATGGTTGGTCTTTCGTCTCTTGCA
CTGGCTGCAGCAGGAAGCTTGACAAGTCTGGGAGTTCTCTCCATTGCAACTGTTGCGCTA
TCCCAACATCACAGGAGTTATAAATTAGGAATTTGCTATTACCTGATTTGTGAGATTAAA
AACAAATTTTCCTCATTACTGTATTTAATGTCACGCTCTGTTTCAGGTACAGAGTTGAAC
TTTGCCTTGATGATGGGGCTGCTAATGCCACTTTTGTGGTCTTCAACAGGGAGATGGTGA
ACCTGGCTAAGCAGGATGCAGCTGGCCTCACTCTAGATGAGGTTCTGTTTTTTAAAGTAC
ACTACTGATTTAATATTTGACTAAAAGGGTTAGACGTAATATTAAGTATGGTTGATAACT
GATCTTACACCATGACACCAGCATTGCGAACCAAAAACCAAATAAACGTCATGGAATGCA
ACATACGTGGCCTTGCCACCCCGACTATATACAACCAATTCCACTAAATATTATGTGTTG
AAGGTCTTATTTGAATGCACATGTCCCACCGTACATGAGTAGAAAATAAAATTATTAAAC
TACCCAAAAGTTAATCAACGTAGCTCCAACACATGAACACACGAACTCATTATACGGCAC
TCTTATATAAGTTATAAGTTATCTGAATTTCGTAAAAAAAAATTACAAAAAGCAAGCGAG
AGTATAGACATATATATGGTTGAATGATACATTTGAAATTGAACTATAGTAAATTTGTAT
TTACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1GF40TF U 1
AF RS1GF40JQ C 227
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BS 604 604 RS1GF40JQ
BS 605 716 RS1GF40TF
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BS 761 846 RS1GF40JQ

RD RS1GF40TF 760 0 0
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CTGGCTGCAGCAGGAAGCTTGACAAGTCTGGGAGTTCTCTCCATTGCAACTGTTGCGCTA
TCCCAACATCACAGGAGTTATAAATTAGGAATTTGCTATTACCTGATTTGTGAGATTAAA
AACAAATTTTCCTCATTACTGTATTTAATGTCACGCTCTGTTTCAGGTACAGAGTTGAAC
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ACCTGGCTAAGCAGGATGCAGCTGGCCTCACTCTAGATGAGGTTCTGTTTTTTAAAGTAC
ACTACTGATTTAATATTTGACTAAAAGGGTTAGACGTAATATTAAGTATGGTTGATAACT
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ACATACGTGGCCTTGCCACCCCGACTATATACAACCAATTCCACTAAATATTATGTGTTG
AAG*TCTTATTTGAATGCACATGTCCCACCGTACATGAGTAGAAAATAAAATTATTAAAC
TACCCAAAAGTTAATCAACGTAGCTCCAACACATGAACACACGAACTCATTATACG*CAC
TCTTATATAAGTTATAAGTTATCTGA*TTTCGTAAAAAAA

QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1GF40JQ 620 0 0
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GTACAGAGTTGAACTTTGCCTTGATGATGGGGCTGCTAATGCCACTTTTGTGGTCTTCAA
CAGGGAGATGGTGAACCTGGCTAAGCAGGATGCAGCTGGCCTCACTCTAGATGAGGTTCT
GTTTTTTAAAGTACACTACTGATTTAATATTTGACTAAAAGGGTTAGACGTAATATTAAG
TATGGTTGATAACTGATCTTACACCATGACACCAGCATTGCGAACCAAAAACCAAATAAA
CGTCATGGAATGCAACATACGTGGCCTTGCCACCCCGACTATATACAACCAATTCCACTA
AATATTATGTGTTGAAGGTTTTATTTGAATGCACATGTCCCACCGTACATGAGTAGAAAA
TAAAATTATTAAACTACCCAAAAGTTAATCAACGTAGCTCCAACACATGAACACACGAAC
TCATTATACGGCACTCTTATATAAGTTATAAGTTATCTGAATTTCGTAAAAAAAAATTAC
AAAAAGCAAGCGAGAGTATAGACATATATATGGTTGAATGATACATTTGAAATTGAACTA
TAGTAAATTTGTATTTACAC

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 2

CO CL4558Contig1 813 2 2 U
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GCAACTTCCCTTTACTCACAACATACAACAGCAACAAGGTCATGTACCTGATAAGAACAA
CTTGAGCGGCAACGTTCTCTTTCTTCTCTCTGTCCTTGTCTGTGGTATCATCTGCTCACT
CGGGTTACATTTCGTAATCCGTTGCGTGTTCAGACGTCACTCGAGTTTCATGATCTCTGA
TCCCATCTCAAGCCCGTCCACACCAGCAGCAAACAAAGGCATCAAGAAGAAAGCTCTCAA
GATGTTCCCTGTAGTGAAATACTCACGTGAGATGAACCTCTCAGGGCTTGGCGAGGAGTG
TGTTATTTGTTTGTCTGATTTCATAGCTGGAGAACAGATACGGCTGCTTCCTAAGTGCAA
CCACGGGTTCCACGTTCGTTGTATCGACAGGTGGCTTACGCAACATATAACTTGTCCGAA
GTGCAGACACTGTCTGGTTGAGACATGCCAAAAGATCTTAGTCGACTGCGATGAAGATCA
TCAGGTTCCAGCAAGGGAAAGCATAGATGTCAGAATTGTTCCTCTAGAACCTGAAGCAAG
AGTAAACACTTTTAGATAACGCAGCTAGAGAATATGCCAAGAAACAGTTAGGTTTCAAGA
ACTTAATTGGTTCTTCTCTTTTAGATTTGAACAAAGTTTATGTTTCTAGCCATTGGATTC
AAAATCAAATACAACGAAGGTTTTATTTTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ET18TF U 1
AF RS1ET18JQ C 61
BS 1 581 RS1ET18TF
BS 582 813 RS1ET18JQ

RD RS1ET18TF 581 0 0
GGGCACAAGAGAAAAGAAGAACAAAAAGAGAGAGTAAATGTCTCCAGATCACTTACCTTC
TTCATCTCAAGTCTTCCAAGAACATTCCATTGAAAGTTTCATCTCCAGAAAATTGCTTCA
GCAACTTCCCTTTACTCACAACATACAACAGCAACAAGGTCATGTACCTGATAAGAACAA
CTTGAGCGGCAACGTTCTCTTTCTTCTCTCTGTCCTTGTCTGTGGTATCATCTGCTCACT
CGGGTTACATTTCGTAATCCGTTGCGTGTTCAGACGTCACTCGAGTTTCATGATCTCTGA
TCCCATCTCAAGCCCGTCCACACCAGCAGCAAACAAAGGCATCAAGAAGAAAGCTCTCAA
GATGTTCCCTGTAGTGAAATACTCACGTGAGATGAACCTCTCAGGGCTTGGCGAGGAGTG
TGTTATTTGTTTGTCTGATTTCATAGCTGGAGAACAGATACGGCTGCTTCCTAAGTGCAA
CCACGGGTTCCACGTTCGTTGTATCGACAGGTGGCTTACGCAACATATAACTTGTCCGAA
GTGCAGACACTGTCTGGTTGAGACATGCCAAAAGATCTTAG

QA 1 581 1 581
DS 

RD RS1ET18JQ 753 0 0
TTCATCTCAAGTCT*CCAAGAACATTCCATTGAAAGTTTCATCTCCAGAAAATTGCTTCA
GCAACTTCCCTTTACTCACAACATACAACAGCAACAAGGTCATGTACCTGATAAGAACAA
CTTGAGCGGCAACGTTCTCTTTCTTCTCTCTGTCCTTGTCTGTGGTATCATCTGCTCACT
CGGGTTACATTTCGTAATCCGTTGCGTGTTCAGACGTCACTCGAGTTTCATGATCTCTGA
TCCCATCTCAAGCCCGTCCACACCAGCAGCAAACAAAGGCATCAAGAAGAAAGCTCTCAA
GATGTTCCCTGTAGTGAAATACTCACGTGAGATGAACCTCTCAGGGCTTGGCGAGGAGTG
TGTTATTTGTTTGTCTGATTTCATAGCTGGAGAACAGATACGGCTGCTTCCTAAGTGCAA
CCACGGGTTCCACGTTCGTTGTATCGACAGGTGGCTTACGCAACATATAACTTGTCCGAA
GTGCAGACACTGTCTGGTTGAGACATGCCAAAAGATCTTAGTCGACTGCGATGAAGATCA
TCAGGTTCCAGCAAGGGAAAGCATAGATGTCAGAATTGTTCCTCTAGAACCTGAAGCAAG
AGTAAACACTTTTAGATAACGCAGCTAGAGAATATGCCAAGAAACAGTTAGGTTTCAAGA
ACTTAATTGGTTCTTCTCTTTTAGATTTGAACAAAGTTTATGTTTCTAGCCATTGGATTC
AAAATCAAATACAACGAAGGTTTTATTTTTCCC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL4559Contig1 1182 2 4 U
GGAGTGTTATTTGACTTGCTTGGAGATCGTGGTGTGATTGATATGGGTGTTAACAGAAAT
GCAACAGCGGAAGAAGTAGTGTTGAGCCTTAGGAGGAGAAGAAGAAGACATCGTGTGAGT
GTTCTGAATGAAATTGAAGCAGAGATTACATCTATTGCGAATTCTCTTAATCCGGAGAAG
AATGATATTATTCTATGGAAAAGAGAGTCAGGTTATAAAGAAAGCTTCTCAACTCAAGAA
ACTTGGGAGATGATTAGAGTAAAGAAGCCGACTGGAGCTTGGGTAAAAGGTGTTTGGTTT
GCTCATGGTACGCCAAAATTTTCTTTTATTACTTGGCTTTCAGTTCGCAATAGATTATCT
ACGATGGATAGAGTAGCTGTTTGGTGCTTGGGGGTTGATTCTACTTGCGTTCTTTGTAAA
GCAAGTCAGGAATCTAGAGCTCATCTATTCTTTGAATGCTCGTATACTTCTAGTCTCTGG
GAGTACATTGCCAAAGGGATTATGGGAAATTCTTATACAAAGATTTGGTCTGAGGTCCTT
ATCTTTTTGAGTGACTCGACTTGGGAGAAGAAGAGACTGTTTTGTTTTCGCTATGCTTTT
CAGGCAGTGATCTATGGGATTTGGAGAGAAAGAAATAGGATCAGACATGGTGAAAAGATT
CTTCCAATGCAAGTGCTTCAAAGAATGATAGATAAGGGGATAAGGAACAGAATCAGTTTG
ATGAGGTCGAAGAAGGTTAAAGGAATGGAGGAGTTAATGGTCTACTGGTTTAGCGCTAGA
CATTAAGCTTTTTATTTTCGATGTGAGGTCTTTGAGTTGGGTAGTAGAGTGTGTTTTAAA
TGCTGGAGTTGCTGTTTTCTTATCAAGATTGCTATCCCCTTGCTATGAGTTTTCTTACTC
TTTTTCCATCAATAGAGTTTTGTCCCATTTGGGTTTTCTCTATTGATGGTTTTAATGAGG
AGAAACTCATAGCACTCCCAAACTCAACTTGTGTCTCATGGTTAGTTTGAGGGGGATAAA
GGGATTGGAGTTGATGTTTCTTAGAAGTTGTGTTCTTTGGAGTAGAGTTTGTGATTGTTT
TTAATTTGATTTGTTTGTTAGCTTGATTGCTTGTTGCCCAAGTTAAACAGTATGCACTTG
TTGTAGTAAGGCTTTTTTGATGAATAAATTTAACATTCATTC


BQ
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AF RS1EY69TF U 1
AF RS1EY69JQ C 544
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RD RS1EY69TF 695 0 0
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GTTCTGAATGAAATTGAAGCAGAGATTACATCTATTGCGAATTCTCTTAATCCGGAGAAG
AATGATATTATTCTATGGAAAAGAGAGTCAGGTTATAAAGAAAGCTTCTCAACTCAAGAA
ACTTGGGAGATGATTAGAGTAAAGAAGCCGACTGGAGCTTGGGTAAAAGGTGTTTGGTTT
GCTCATGGTACGCCAAAATTTTCTTTTATTACTTGGCTTTCAGTTCGCAATAGATTATCT
ACGATGGATAGAGTAGCTGTTTGGTGCTTGGGGGTTGATTCTACTTGCGTTCTTTGTAAA
GCAAGTCAGGAATCTAGAGCTCATCTATTCTTTGAATGCTCGTATACTTCTAGTCTCTGG
GAGTACATTGCCAAAGGGATTATGGGAAATTCTTATACAAAGATTTGGTCTGAGGTCCTT
ATCTTTTTGAGTGACTCGACTTGGGAGAAGAAGAGACTGTTTTGTTTTCGCTATGCTTTT
CAGGCAGTGATCTATGGGATTTGGAGAGAAAGAAATAGGATCAGACATGGTGAAAAGATT
CTTCCAATGCAAGTGCTTCAAAGA*TGATAGATAA

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1EY69JQ 639 0 0
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GCAGTGATCTATGGGATTTGGAGAGAAAGAAATAGGATCAGACATGGTGAAAAGATTCTT
CCAATGCAAGTGCTTCAAAGAATGATAGATAAGGGGATAAGGAACAGAATCAGTTTGATG
AGGTCGAAGAAGGTTAAAGGAATGGAGGAGTTAATGGTCTACTGGTTTAGCGCTAGACAT
TAAGCTTTTTATTTTCGATGTGAGGTCTTTGAGTTGGGTAGTAGAGTGTGTTTTAAATGC
TGGAGTTGCTGTTTTCTTATCAAGATTGCTATCCCCTTGCTATGAGTTTTCTTACTCTTT
TTCCATCAATAGAGTTTTGTCCCATTTGGGTTTTCTCTATTGATGGTTTTAATGAGGAGA
AACTCATAGCACTCCCAAACTCAACTTGTGTCTCATGGTTAGTTTGAGGGGGATAAAGGG
ATTGGAGTTGATGTTTCTTAGAAGTTGTGTTCTTTGGAGTAGAGTTTGTGATTGTTTTTA
ATTTGATTTGTTTGTTAGCTTGATTGCTTGTTGCCCAAGTTAAACAGTATGCACTTGTTG
TAGTAAGGCTTTTTTGATGAATAAATTTAACATTCATTC

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 2

CO CL4560Contig1 320 2 1 U
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CCGCTGGAGAGACGTACGAGGTTGCTTTGACTGAGCCTGGGACTTACAGCTTCTACTGTG
CCCCGCATCAGGGTGCTGGTATGGTCGGCAAAGTCACCGTTAACTAATAAACTGTGTGTG
TAAATGCGAAAGGGTGTCTCTGATCCATGTAGAGGCTTTTCTTTCAGTTTTTACTTACAT
AGGTGTTTTGTACTACTTATAAAGAGTGTTGGAATCAAATGGACATTGATTTGTTATAAT
GAGAGTGCTGGTTCCCATCC


BQ
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AF RS1EZ02JQ C 1
AF RS1EZ02TF U 1
BS 1 320 RS1EZ02TF

RD RS1EZ02JQ 320 0 0
GGATCCCGAGCGGTGTTGACGCGAGCATGATCTCCATGGACGAGCAGGACCTACTCAACT
CCGCTGGAGAGACGTACGAGGTTGCTTTGACTGAGCCTGGGACTTACAGCTTCTACTGTG
CCCCGCATCAGGGTGCTGGTATGGTCGGCAAAGTCACCGTTAACTAATAAACTGTGTGTG
TAAATGCGAAAGGGTGTCTCTGATCCATGTAGAGGCTTTTCTTTCAGTTTTTACTTACAT
AGGTGTTTTGTACTACTTATAAAGAGTGTTGGAATCAAATGGACATTGATTTGTTATAAT
GAGAGTGCTGGTTCCCATCC

QA 1 320 1 320
DS 

RD RS1EZ02TF 320 0 0
GGATCCCGAGCGGTGTTGACGCGAGCATGATCTCCATGGACGAGCAGGACCTACTCAACT
CCGCTGGAGAGACGTACGAGGTTGCTTTGACTGAGCCTGGGACTTACAGCTTCTACTGTG
CCCCGCATCAGGGTGCTGGTATGGTCGGCAAAGTCACCGTTAACTAATAAACTGTGTGTG
TAAATGCGAAAGGGTGTCTCTGATCCATGTAGAGGCTTTTCTTTCAGTTTTTACTTACAT
AGGTGTTTTGTACTACTTATAAAGAGTGTTGGAATCAAATGGACATTGATTTGTTATAAT
GAGAGTGCTGGTTCCCATCC

QA 1 320 1 320
DS 



AS 1 2

CO CL4561Contig1 516 2 1 U
GGAACATCAAAGATGGAATCAAAAGCTTTCGGTTCTGTTACGTTCTTGATCATCACCCTT
CTTCTCTGTGGAACAATTCGATTAGGGTTTTGCAGAGTGATGCTAGGAGGCGTTCATGAT
CTCGGAGGAAACCAGAACAGTGGAGTGATCGAGAGTCTCGCTCGGTTTGCTATACGAGAA
CATAACAACAAAGAGAACAAGGTTCTTGAGTTCAAGAAGATTGTTAAGGCAAGAGATCAA
GTAGTTGAAGGAAAGATGTACCACTTTACTCTTGAAGCAAACGAAGGTGGCCAGACTAAG
AATTTCGAAGCCAAAGTTTGGGTGAAGCCATGGATGAACTTCAAGCAGTTACATGAGTTT
AAGGAATCCTCCCCTTGAAGTTCACTTGTTCAGAGGAGGTAATCAAAATGTTTCTGTTAT
TTCTCTGAGAATAAATAAGCCTTTGTTGCAGACCAGTGTGTGTTAAGACGAAACCTGAAG
TTAATGTAATCAAGAAACTTGTTTTCTGTTCTCCCG


BQ
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AF RS1GU35JQ C 1
AF RS1GU35TF U 1
BS 1 516 RS1GU35TF

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GTAGTTGAAGGAAAGATGTACCACTTTACTCTTGAAGCAAACGAAGGTGGCCAGACTAAG
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TTCTCTGAGAATAAATAAGCCTTTGTTGCAGACCAGTGTGTGTTAAGACGAAACCTGAAG
TTAATGTAATCAAGAAACTTGTTTTCTGTTCTCCCG

QA 1 516 1 516
DS 

RD RS1GU35TF 516 0 0
GGAACATCAAAGATGGAATCAAAAGCTTTCGGTTCTGTTACGTTCTTGATCATCACCCTT
CTTCTCTGTGGAACAATTCGATTAGGGTTTTGCAGAGTGATGCTAGGAGGCGTTCATGAT
CTCGGAGGAAACCAGAACAGTGGAGTGATCGAGAGTCTCGCTCGGTTTGCTATACGAGAA
CATAACAACAAAGAGAACAAGGTTCTTGAGTTCAAGAAGATTGTTAAGGCAAGAGATCAA
GTAGTTGAAGGAAAGATGTACCACTTTACTCTTGAAGCAAACGAAGGTGGCCAGACTAAG
AATTTCGAAGCCAAAGTTTGGGTGAAGCCATGGATGAACTTCAAGCAGTTACATGAGTTT
AAGGAATCCTCCCCTTGAAGTTCACTTGTTCAGAGGAGGTAATCAAAATGTTTCTGTTAT
TTCTCTGAGAATAAATAAGCCTTTGTTGCAGACCAGTGTGTGTTAAGACGAAACCTGAAG
TTAATGTAATCAAGAAACTTGTTTTCTGTTCTCCCG

QA 1 516 1 516
DS 



AS 1 2

CO CL4562Contig1 1042 2 4 U
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TGTTTGAGTTCCTGCCTCCGTTCATTAAGAAACAGCTACTTCTGCATCCCGAGTCTGATG
ATTCCGCCCAGCTATCCCAGATTGAGACAGAGAAACTCCTAGCTTATCTCGTCGAGACTG
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ATGTTCTTGGGCATATATGTTACCACATCCTTGCAGCTGGTTTGAACGGCTACATGGCAG
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CAATGATGACGGTTAAGCGCTGGTCCCAAAACTCTGGTTCAACCTCAATAGGAAGACCAG
TAATTCATCCAGCTACCGTGGACTTGAAAGGCAAAGCATACGAGCTATTGAGACAAAATG
CGCAGAAGTTCTTGATGGAAGATATGTACAGAAACCCAGGACCACTCCAGTATGATGGTC
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TTTCATTTTTTTCCACCAGCGGTCAACAATTTGCTTAAAAGATTTTTCATTACTACTACA
TCTCCTAAACTTTGTTTTAGTGTTTTTCAGTTCGTTGTCTTTCACTTCGGCTTTTAACGT
CACTGCCTCTCGCTCTCTTCATAGACTGTTTTGATTTTGTCTTGCAACTCTTATTGTTCA
AAGTTGTTTTTAGTAAAACTATAAACAATAATATTTTGGATTTTCTTTTATAGTGTTTTC
TTTTTGAAACACAACTTTTTAT


BQ
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AF RS1FK91TF U 1
AF RS1FK91JQ C 463
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RD RS1FK91TF 614 0 0
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CAG*TGCAGATGCC

QA 1 614 1 614
DS 

RD RS1FK91JQ 580 0 0
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CTGATGTTCTCTCCACAATTTCATTTTTTTCCACCAGCGGTCAACAATTTGCTTAAAAGA
TTTTTCATTACTACTACATCTCCTAAACTTTGTTTTAGTGTTTTTCAGTTCGTTGTCTTT
CACTTCGGCTTTTAACGTCACTGCCTCTCGCTCTCTTCATAGACTGTTTTGATTTTGTCT
TGCAACTCTTATTGTTCAAAGTTGTTTTTAGTAAAACTATAAACAATAATATTTTGGATT
TTCTTTTATAGTGTTTTCTTTTTGAAACACAACTTTTTAT

QA 1 580 1 580
DS 



AS 1 2

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TGATCCGGTGAATGGAGGAGAAATGACTCAGCTTGAGTATCACAACTGTCTAAAACCGCC
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TGCTCTACTTAAGTGGTGAGATTTGGTGTAACCACATGGTGTGTTAATGTATATAGTTTG
TGTGTATAATAATTACGAACGGTTCTTATAATTTCC


BQ
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AF RS1DG13JQ C 1
AF RS1DG13TF U 1
BS 1 516 RS1DG13TF

RD RS1DG13JQ 516 0 0
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TCGAGTGACAAAGGAACCGTCCATGTCTTTGGTCTCAAAGGTAACTCCGGTGCTCAGGTG
AAAGACACACCCCTCGTCCCTGTCATTATTTAAAGGAGTGTTGCCCAAGTATTTCAGCTC
GGAGTGGTCGGTGGCTCAGTTCAGGTTGGTTGAAGGAACTCAATACATAGTCGCCTTTGG
TCATCAGAAGAACACTGTTGTTATTCTTGGCATGGATGGGAGCTTCTACAGATGCCAGTA
TGATCCGGTGAATGGAGGAGAAATGACTCAGCTTGAGTATCACAACTGTCTAAAACCGCC
TTCTGTTTTCTAGATGATGCAAACTATTCTCTTAAGTTCCTTCTATCTCTTTTTTATCTC
TGCTCTACTTAAGTGGTGAGATTTGGTGTAACCACATGGTGTGTTAATGTATATAGTTTG
TGTGTATAATAATTACGAACGGTTCTTATAATTTCC

QA 1 516 1 516
DS 

RD RS1DG13TF 516 0 0
GGAGATAGAGCAGAGATATATAGTCTGGCTTTCTCTTCAAATGCTCAGTGGTTAGCTGTC
TCGAGTGACAAAGGAACCGTCCATGTCTTTGGTCTCAAAGGTAACTCCGGTGCTCAGGTG
AAAGACACACCCCTCGTCCCTGTCATTATTTAAAGGAGTGTTGCCCAAGTATTTCAGCTC
GGAGTGGTCGGTGGCTCAGTTCAGGTTGGTTGAAGGAACTCAATACATAGTCGCCTTTGG
TCATCAGAAGAACACTGTTGTTATTCTTGGCATGGATGGGAGCTTCTACAGATGCCAGTA
TGATCCGGTGAATGGAGGAGAAATGACTCAGCTTGAGTATCACAACTGTCTAAAACCGCC
TTCTGTTTTCTAGATGATGCAAACTATTCTCTTAAGTTCCTTCTATCTCTTTTTTATCTC
TGCTCTACTTAAGTGGTGAGATTTGGTGTAACCACATGGTGTGTTAATGTATATAGTTTG
TGTGTATAATAATTACGAACGGTTCTTATAATTTCC

QA 1 516 1 516
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4565Contig1 734 2 3 U
TTTTGGACAAAGCCATGATAAAGACTCAAAAACAATTAAAGTTAAAACAGATGTAAACCA
CTGGAAAAGAGAGATAGAGAGCACAAAGATCCAAAAGTATCAAACAAACTATTTCGAAGA
TCCAAAAGTGTCAGATAAACTAGTTCAAAGCAGAAACATATATCAAAACAGATAAAGAAG
TAATCTTGCTTAACGCTTCTTCGAGACACCAACAGTCTTTCCTCTGCGCCCAGTTGTCTT
GGTGTGCTGTCCACGGACACGAAGACCCCAGTAGTGTCTCAGCCCACGGTGGTTTCTGAT
TTTCTTGAGACGCTCGAGATCGCCCCTGAGCTTCATGTCAAGGGCATTGGAGACAACTTG
GGAGTACTTCCCGTCCTTGTAGTCCTTCTGCCTGTTCAGGAACCAGTCTGGGATCTTGTA
CTGCTTTGGGTTAGCAACAATCGTCATCAGGTTGTCGATCTCAGCTGCAGACAACTCACC
AGCCCTCTTGTTCATGTCGACATCAGCTTTCTTGCAGACGATGTTAGCCAAACGCCTCCC
AATACCCTTGATTGAGGTAAGGGCGAACATGATCTTCTGCTTTCCATCGACATTTGTGTT
AAGCACACGGAGAATGTGCTGAAACTCCTCATTCGCGACCAGAGACATTTTGATTAGCGG
AGATGAGATGCGTGAGAAGAAGAAGAAGAAGCCGCCTTCAAGCAGTAATGATCTCTGCAA
TGCTCTAAACACCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H550JQB U 4
AF RS1H550TF C 1
BS 1 4 RS1H550TF
BS 5 521 RS1H550JQB
BS 522 734 RS1H550TF

RD RS1H550JQB 518 0 0
G
GGACAAAGCCATGATAAAGACTCAAAAACAATTAAAGTTAAAACAGATGTAAACCACTGG
AAAAGAGAGATAGAGAGCACAAAGATCCAAAAGTATCAAACAAACTATTTCGAAGATCCA
AAAGTGTCAGATAAACTAGTTCAAAGCAGAAACATATATCAAAACAGATAAAGAAGTAAT
CTTGCTTAACGCTTCTTCGAGACACCAACAGTCTTTCCTCTGCGCCCAGTTGTCTTGGTG
TGCTGTCCACGGACACGAAGACCCCAGTAGTGTCTCAGCCCACGGTGGTTTCTGATTTTC
TTGAGACGCTCGAGATCGCCCCTGAGCTTCATGTCAAGGGCATTGGAGACAACTTGGGAG
TACTTCCCGTCCTTGTAGTCCTTCTGCCTGTTCAGGAACCAGTCTGGGATCTTGTACTGC
TTTGGGTTAGCAACAATCGTCATCAGGTTGTCGATCTCAGCTGCAGACAACTCACCAGCC
CTCTTGTTCATGTCGACATCAGCTTTCTTGCAGACGA

QA 2 518 2 518
DS 

RD RS1H550TF 734 0 0
TTTTGGACAAAGCCATGATAAAGACTCAAAAACAATTAAAGTTAAAACAGATGTAAACCA
CTGGAAAAGAGAGATAGAGAGCACAAAGATCCAAAAGTATCAAACAAACTATTTCGAAGA
TCCAAAAGTGTCAGATAAACTAGTTCAAAGCAGAAACATATATCAAAACAGATAAAGAAG
TAATCTTGCTTAACGCTTCTTCGAGACACCAACAGTCTTTCCTCTGCGCCCAGTTGTCTT
GGTGTGCTGTCCACGGACACGAAGACCCCAGTAGTGTCTCAGCCCACGGTGGTTTCTGAT
TTTCTTGAGACGCTCGAGATCGCCCCTGAGCTTCATGTCAAGGGCATTGGAGACAACTTG
GGAGTACTTCCCGTCCTTGTAGTCCTTCTGCCTGTTCAGGAACCAGTCTGGGATCTTGTA
CTGCTTTGGGTTAGCAACAATCGTCATCAGGTTGTCGATCTCAGCTGCAGACAACTCACC
AGCCCTCTTGTTCATGTCGACATCAGCTTTCTTGCAGACGATGTTAGCCAAACGCCTCCC
AATACCCTTGATTGAGGTAAGGGCGAACATGATCTTCTGCTTTCCATCGACATTTGTGTT
AAGCACACGGAGAATGTGCTGAAACTCCTCATTCGCGACCAGAGACATTTTGATTAGCGG
AGATGAGATGCGTGAGAAGAAGAAGAAGAAGCCGCCTTCAAGCAGTAATGATCTCTGCAA
TGCTCTAAACACCC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL4566Contig1 910 2 2 U
GGACTGGTCTCAGAGGTCAGTTCTACGATCATCTTCTGGACCAGACAGCCAGTTTCTATG
GCTGCCGTTCCGCTGCAGAGCCAGTACATGTCCAACTGAACTTGGCAAGTAACTTCATTG
AGGTTGTAAACACCACTTCTAGAGAGCTATCAGATGTGGAGATAGAGGCATCGGTATGGG
ACCTAGACGGTAACTGCCCATACTACAAAGTGTTCAGCAAAGTCTCTGCACCGCCTAAGA
AAGTTGTGCAAATATCTGACTTCACGTACCCGAAGTCAGAGAACGCAAAGCCTGTTTATT
TCCTTCTTCTCAAACTGTACCATGTCACAGACAAAACAGTTATATCCCGGAATTTCTACT
GGCTACATCTGCCCGGTAAAGACTACACGCTCTTGGAGCCATACAGAAACAAGCAAATAC
CTCTCAAGATCACTTGTGATTCAGTTTTGGTCGGTCCAAAATTCGAGCTGGAGATCACTG
TCCACAATACATCTAGAGCTAATGCTCTTCAAGATGGTTTGCTCCACAAGCTGTTTAGTA
GATTTGGTGTTACTGCAGATAGCCACTGCGGTTTGAAAGTGGTGGGATCTGATCCAGGAG
TTGCTTTCTTTCTTCGTTTCTCAGTACACAATCCGGAGTCAGAGAAACAAGACACGAGGA
TTCTCCCTGTACACTACTCGGACAACTACTTCTCACTAGTTCCGGGTGAATCAATGTCTT
TTAAGATCTCATTTGCAGCTCCTACAGGCGTAAAGAAGTCTCCTCGTGTTTTGCTCCGGG
GTTGGAACTATCCTGATGGGTTTACTGTGTTTGGTTAATTAAAGACAAGTTACTTCTCGT
TATTTTTTGTAACATAACTACGTGCAATGCAAACACAAAACCTTTTCAATAAATAAACGA
AACTCTCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DK44TF U 1
AF RS1DK44JQ C 242
BS 1 654 RS1DK44TF
BS 655 910 RS1DK44JQ

RD RS1DK44TF 654 0 0
GGACTGGTCTCAGAGGTCAGTTCTACGATCATCTTCTGGACCAGACAGCCAGTTTCTATG
GCTGCCGTTCCGCTGCAGAGCCAGTACATGTCCAACTGAACTTGGCAAGTAACTTCATTG
AGGTTGTAAACACCACTTCTAGAGAGCTATCAGATGTGGAGATAGAGGCATCGGTATGGG
ACCTAGACGGTAACTGCCCATACTACAAAGTGTTCAGCAAAGTCTCTGCACCGCCTAAGA
AAGTTGTGCAAATATCTGACTTCACGTACCCGAAGTCAGAGAACGCAAAGCCTGTTTATT
TCCTTCTTCTCAAACTGTACCATGTCACAGACAAAACAGTTATATCCCGGAATTTCTACT
GGCTACATCTGCCCGGTAAAGACTACACGCTCTTGGAGCCATACAGAAACAAGCAAATAC
CTCTCAAGATCACTTGTGATTCAGTTTTGGTCGGTCCAAAATTCGAGCTGGAGATCACTG
TCCACAATACATCTAGAGCTAATGCTCTTCAAGATGGTTTGCTCCACAAGCTGTTTAGTA
GATTTGGTGTTACTGCAGATAGCCACTGCGGTTTGAAAGTGGTGGGATCTGATCCAGGAG
TTGCTTTCTTTCTTCGTTTCTCAGTACACAATCCGGAGTCAGAGAAACAAGACA

QA 1 654 1 654
DS 

RD RS1DK44JQ 669 0 0
AGTTGTGCAAATATCTGACTTCACGTACCCGAAGTCAGAGAACGCAAAGCCTGTTTATTT
CCTTCTTCTCAAACTGTACCATGTCACAGACAAAACAGTTATATCCCGGAATTTCTACTG
GCTACATCTGCCCGGTAAAGACTACACGCTCTTGGAGCCATACAGAAACAAGCAAATACC
TCTCAAGATCACTTGTGATTCAGTTTTGGTCGGTCCAAAATTCGAGCTGGAGATCACTGT
CCACAATACATCTAGAGCTAATGCTCTTCAAGATGGTTTGCTCCACAAGCTGTTTAGTAG
ATTTGGTGTTACTGCAGATAGCCACTGCGGTTTGAAAGTGGTGGGATCTGATCCAGGAGT
TGCTTTCTTTCTTCGTTTCTCAGTACACAATCCGGAGTCAGAGAAACAAGACACGAGGAT
TCTCCCTGTACACTACTCGGACAACTACTTCTCACTAGTTCCGGGTGAATCAATGTCTTT
TAAGATCTCATTTGCAGCTCCTACAGGCGTAAAGAAGTCTCCTCGTGTTTTGCTCCGGGG
TTGGAACTATCCTGATGGGTTTACTGTGTTTGGTTAATTAAAGACAAGTTACTTCTCGTT
ATTTTTTGTAACATAACTACGTGCAATGCAAACACAAAACCTTTTCAATAAATAAACGAA
ACTCTCACT

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 2

CO CL4567Contig1 927 2 12 U
GAAAATAGTCTATTGTCTCCTTTAGATGATGTTTCATTTTTGTTCGAAGTTGTTCTAACA
GTTGAGTGGGGAATAAAAAAAACAGGGAGAAAGGAGTGGTAAGTGAAGTAGGAGGGGCAT
CGAAGTTGATGGTGACGCTTGAGAATGGAGAAGTAAAGAGAGTGGAGCTAGGAAAGCAAG
GGGCTAGATTCATTCCTCAGAAGCAAAAGAGGATGAGGACGTGAGGGGGAGGGGAGGCTT
TGTCCACACATTTTGGAACAACGTTTAGCTCGTTCAGATTATGTTTGTAGAAGAAAAAAA
AAACATTTTAAAACGAGATTAGCTCCTTTGACTTGTACTTATCAAGCTAAACGTGACGAC
TAGCTTCTTATTTGCATGTGTGGCAAAATACACAGTGAAAGAAATGGTTTACATGCTGAG
TGATATCAGATTTTTTAAAGATGTACAATGTTAATGATCTGTATAATGGGCCTATATTTA
TGATATTGGGCTTGAATTTGTACAACTAAACTAATGGATAACAAAAGTCAAACCCAACAC
AAGATGTATTTGGTTATTGCCACAGGAACAGTAACAGACATGATAAACAAAAGATGGATG
GACACAGACAGTTTTACATTAGTTTCTGACAGGGGTGACGTAGAACAACGGTAATAAAAT
ATTCGAATTACCGAATCTGAAGTGTCGGTCCAACATAACTACAATATTGCAGTAGCTGCT
AGAACAGGCAGACATCGTATGATTGCTAACAATAAAAGTTAAAAAAACCTAGAGAGGATA
ACACGTGACGACAGCAATCTTCTTATCTCTTCTTCTTGTTGATCAAAAATCTACCAATCT
TACGTTATTTCATTTCTGTTAGATACTCTCTCTCTCTCTCTACTAGTCAATATCCAGACA
AAACTAAAACTAAAACTAAACTGAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FT38TF U 1
AF RS1FT38JQ C 257
BS 1 302 RS1FT38TF
BS 303 303 RS1FT38JQ
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BS 797 927 RS1FT38JQ

RD RS1FT38TF 796 0 0
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AAGATGTATTTGGTTATTGCCACAGGAACAGTAACAGACATGATAAACAAAAGATGGATG
GACACAGACAGTTTTACATTAGTTTCTGACAGGGGTGACGTAGAACAACGGTAATAAAAT
ATTCGAATTACCGAATCTGAAGTGTCGGTCCAACATAACTACAATATTGCAGTAGCTGCT
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*CACGTGACGACAGCA

QA 1 796 1 796
DS 

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AACAACGTTTAGCTCGTTCAGATTATGTTTGTAGAAGAAAAAAAAAACATTTTAAAACGA
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TGTGTGGCAAAATACACAGTGAAAGAAATGGTTTACATGCTGAGTGATATCAGATTTTTT
AAAGATGTACAATGTTAATGATCTGTATAATGGGCCTATATTTATGATATTGGGCTTGAA
TTTGTACAACTAAACTAATGGATAACAAAAGTCAAACCCAACACAAGATGTATTTGGTTA
TTGCCACAGGAACAGTAACAGACATGATAAACAAAAGATGGATGGACACAGACAGTTTTA
CATTAGTTTCTGACAGGGGTGACGTAGAACAACGGTAATAAAATATTCGAATTACCGAAT
CTGAAGTGTCGGTCCAACATAACTACAATATTGCAGTAGCTGCTAGAACAGGCAGACATC
GTATGATTGCTAACAATAAAAGTTAAAAAAACCTAGAGAGGATAACACGTGACGACAGCA
ATCTTCTTATCTCTTCTTCTTGTTGATCAAAAATCTACCAATCTTACGTTATTTCATTTC
TGTTAGATACTCTCTCTCTCTCTCTACTAGTCAATATCCAGACAAAACTAAAACTAAAAC
TAAACTGAGAT

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 2

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CCACAAAAGAGAAGAGTTCGACCCTGAGTATGACATGATGCTGAGCAGCTCTTGGCTGAG
ATGGAGTTCAAAGACAACGATACTCCTGAAGAAAAAGACCTCAAGCTGCGTATCTTGCGT
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CAAGCATCTTCAAGCTATGTCAATGATCTTGACCTGATTGGGTTCACTGAGTCACAACTG
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CATATGCAACAAGTGATGTCACATGAGATATTCAAAGGGAATGTAACGAAGAAGTCGGAT
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TCTCTCTATGTGTGAGCTCTATTTGAGTTATCATATTGCTCCTCTTGTCACAATTGTAGT
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TTTTTTAATCAACTTGATATTGTTCC


BQ
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AF RS1AR22TFB U 1
AF RS1AR22JQ C 263
BS 1 783 RS1AR22TFB
BS 784 986 RS1AR22JQ

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CCACAAAAGAGAAGAGTTCGACCCTGAGTATGACATGATGCTGAGCAGCTCTTGGCTGAG
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ATCTATTCGAAAAGGCTTGATGAGAGGAAACGTAGAAAGGAGTTCATATTAGAAAGAAAC
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GGGTGTCGCTCCACGGCTGAAGCAGAGAGGTACCTGGCGAGGAAGAGGAAGCGAGAGAAC
GAAGAAGGGATGAACAGAGGGAAAGAGAGCGGAGGGGAAATGGGAACTAGACCACCTGTG
CAAGCATCTTCAAGCTATGTCAATGATCTTGACCTGATTGGGTTCACTGAGTCACAACTG
CTGTCTGAATCCGAGAAGCGTCTATGCAGCGAGGCCAAGTTGGTTCCACCGGTTTATCTA
CATATGCAACAAGTGATGTCACATGAGATATTCAAAGGGAATGTAACGAAGAAGTCGGAT
GCATATAGCTTGTTCAAGATTGATCCGACCAAAGTGGACAGAGTTTACGATATGCTTGTG
AAG

QA 1 783 1 783
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AGAAGGACCTGTCTCAGGAAGAGAAAATGCAGTGTCGGCGTTTAGACGTGTTCATGCGTT
TTCATTCAAAAGAGGAGCATGAGGAGCTTCTCCGCAGTGTTGTGAGCGAGTACCGCATGG
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AAGAGAGCGGAGGGGAAATGGGAACTAGACCACCTGTGCAAGCATCTTCAAGCTATGTCA
ATGATCTTGACCTGATTGGGTTCACTGAGTCACAACTGCTGTCTGAATCCGAGAAGCGTT
TATGCAGCGAGGCCAAGTTGGTTCCACCGGTTTATCTACATATGCAACAAGTGATGTCAC
ATGAGATATTCAAAGGGAATGTAACGAAGAAGTCGGATGCATATAGCTTGTTCAAGATTG
ATCCGACCAAAGTGGACAGAGTTTACGATATGCTTGTGAAGAAAGGTATTGCTCAGCTAT
AAGACTCTGTGTGTTGTATCATGTAATCTATCTATCTCTCTCTCTATGTGTGAGCTCTAT
TTGAGTTATCATATTGCTCCTCTTGTCACAATTGTAGTTTATACTCTGTTCTACATGTCA
TTTAGTCATCATCAATGTTCTGTTTATGCAAATAGTCTTTTTTTAATCAACTTGATATTG
TTCC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL4569Contig1 785 2 4 U
TTTTTATTGTTGTGTGTTTCCGCTCCAGATTTGAAATAGAAGGTTGTAAAAAAATGGATC
CAGATGCAGTCAAGTCGACGCTCTCGAATCTGGCGTTCGGAAACGTATTGGCGGCAGCTG
CTAGAGATTATAAAAAGGAAGTTCTTGAAAATGAGAAGGCGCAATCATCAAAGCATGCCA
ATGAGGAGGTTGATCTCGATGAACTTATGGATGATCCAGAGCTTGAAAAATTGCACGCTG
ATAGGATTGCAGCACTCAAGAGAGAAGTTGAGAAGAGGGAAGCGTTCAAAAGACAAGGAC
ATGGCGAATATCGAGAGGTAAGCGAAGGAAATTTCTTGGGGGAAGTTACTAGGAGTCAGA
AAGTGATCTGCCATTTCTACCACAAGGAGTTTTACCGTTGCAAGATTATGGACAAGCATT
TGAAGACTCTTGCGCCTAGACATGTCGACACTAAGTTCATTAAAGTTGACGCAGAGAATG
CTCCTTTCTTTGTCACCAAGCTTGCAGTTAAGACCTTGCCTTGCGTTTTGCTTTTCAGCA
AGGGAATCGCTATAGATAGGTTAGTTGGGTTCCAGGATTTGGGCACCAAGGACGATTTCA
CCACGACTAAACTGGAGAACGTTCTGATTAAGAAAGGAATGCTCAGCAAGAAGAAGAAAG
AGGAAGATGATGAAGATGCCGAGTACCAAGAGAGCATAAGGAGGTCCGTTAGGTCTTCAG
AGAATCTGGACTCCGACTCTGACTGATCAAGCAAGCTGACTTCACAGATATGCCTTGTCT
CTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 

AF RS1CF86TF U 1
AF RS1CF86JQ C 545
BS 1 664 RS1CF86TF
BS 665 665 RS1CF86JQ
BS 666 696 RS1CF86TF
BS 697 785 RS1CF86JQ

RD RS1CF86TF 696 0 0
TTTTTATTGTTGTGTGTTTCCGCTCCAGATTTGAAATAGAAGGTTGTAAAAAAATGGATC
CAGATGCAGTCAAGTCGACGCTCTCGAATCTGGCGTTCGGAAACGTATTGGCGGCAGCTG
CTAGAGATTATAAAAAGGAAGTTCTTGAAAATGAGAAGGCGCAATCATCAAAGCATGCCA
ATGAGGAGGTTGATCTCGATGAACTTATGGATGATCCAGAGCTTGAAAAATTGCACGCTG
ATAGGATTGCAGCACTCAAGAGAGAAGTTGAGAAGAGGGAAGCGTTCAAAAGACAAGGAC
ATGGCGAATATCGAGAGGTAAGCGAAGGAAATTTCTTGGGGGAAGTTACTAGGAGTCAGA
AAGTGATCTGCCATTTCTACCACAAGGAGTTTTACCGTTGCAAGATTATGGACAAGCATT
TGAAGACTCTTGCGCCTAGACATGTCGACACTAAGTTCATTAAAGTTGACGCAGAGAATG
CTCCTTTCTTTGTCACCAAGCTTGCAGTTAAGACCTTGCCTTGCGTTTTGCTTTTCAGCA
AGGGAATCGCTATAGATAGGTTAGTTGGGTTCCAGGATTTGGGCACCAAGGACGATTTCA
CCACGACTAAACTGGAGAACGTTCTGATTAAGAAAGGAATGCTCAGCAAGAAGAAGAAAG
AGGA*GATGATGAAGATGCCGAGTACCAAGAGAGCA

QA 1 696 1 696
DS 

RD RS1CF86JQ 241 0 0
AATCGCTATAGATAGGTTAGTTGGGTTCCAGGATTTGGGCACCAAGGACGATTTCACCAC
GACTAAACTGGAGAACGTTCTGATTAAGAAAGGAATGCTCAGCAAGAAGAAGAAAGAGGA
AGATGATGAAGATGCCGAGTACCAAGAGAGCATAAGGAGGTCCGTTAGGTCTTCAGAGAA
TCTGGACTCCGACTCTGACTGATCAAGCAAGCTGACTTCACAGATATGCCTTGTCTCTGT
T

QA 1 241 1 241
DS 



AS 1 2

CO CL4570Contig1 1013 2 8 U
GGAGATAAGCTACGGTCCTGCAATGTTATCAACATTCTAATCAGCTTATAGATCCATTAA
TAATAAGTCACACTAGGTTAAAATAAACCTACTCTTGCAAAATTTTGGGACCTAGGGTCC
ATCTATCAACTGTTATGAGTAGAAACGCCCATGAAGAGACAGCGGTTGTTATCACAGCAG
GTGAAGTTTGGGTTGCAACAACCTACACAAAACAACAACTTACATGTGAGCCTACTACAT
ACTTTAGATTAGGAATAGAAAATGGCATATTATAAGAAAAGAGTAACATGCATACATTAG
AAACCAGTTCAGGATGAATCATTTGCCATATTATTTGCATAGATCTCTCGGTTTGATCAG
CGTTGGTTCCACCAACAAAGGTTATCACTGCTAAACACTCAAGAATCTGCAATGAAAGTG
GCATGATATCAGCAAATTGCATATAGAAACTTTTAACAGAATAAAATAGATAATAGATTA
TGAAATTATCCATACCGAAGTTATCTTCAAGGCTGCACCACTAGATTTAAGGGCTTGAGA
GAGAGGAGTGACAGATTCTTCTAGAATCTCTTGTGCTTGATCCCCAAGTCCAACAGTCAA
GGCTAGCAACCCTTGAAACGGCATATTAACTGTTAGTGTGTAGCTCAATAAAAATAAAAA
AAGATGATGCATAAGTTTGCTTGTGCCTCGGTGACTAACCAATAACATGTGATGCTAGTG
AGGACTCCTTACTGGACCCTTTCTTGATGCAGTGTAAACACCGATGCAACAAGGTGGCAA
AGCTACAATGTTGAAGAAGATACATTAGATAACAATCAGGTGTCATCAATACAAAACCAT
AATTAGTTATATGTATAAAAGATTTTTTTGAAGAAGGGATAATAGAGTATGAGATGGTTA
CTTCTTTTCCACAAACTCATGCTGCAAGTCGCTCTTGAATGCGTCAACAATGGAGGCCAA
AGCTTGCTCTCTCGTTGAACTCCTTCACATCCACAAAGGAATCCAAATATTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BG68TF U 1
AF RS1BG68JQ C 273
BS 1 661 RS1BG68TF
BS 662 662 RS1BG68JQ
BS 663 738 RS1BG68TF
BS 739 739 RS1BG68JQ
BS 740 773 RS1BG68TF
BS 774 774 RS1BG68JQ
BS 775 789 RS1BG68TF
BS 790 1013 RS1BG68JQ

RD RS1BG68TF 789 0 0
GGAGATAAGCTACGGTCCTGCAATGTTATCAACATTCTAATCAGCTTATAGATCCATTAA
TAATAAGTCACACTAGGTTAAAATAAACCTACTCTTGCAAAATTTTGGGACCTAGGGTCC
ATCTATCAACTGTTATGAGTAGAAACGCCCATGAAGAGACAGCGGTTGTTATCACAGCAG
GTGAAGTTTGGGTTGCAACAACCTACACAAAACAACAACTTACATGTGAGCCTACTACAT
ACTTTAGATTAGGAATAGAAAATGGCATATTATAAGAAAAGAGTAACATGCATACATTAG
AAACCAGTTCAGGATGAATCATTTGCCATATTATTTGCATAGATCTCTCGGTTTGATCAG
CGTTGGTTCCACCAACAAAGGTTATCACTGCTAAACACTCAAGAATCTGCAATGAAAGTG
GCATGATATCAGCAAATTGCATATAGAAACTTTTAACAGAATAAAATAGATAATAGATTA
TGAAATTATCCATACCGAAGTTATCTTCAAGGCTGCACCACTAGATTTAAGGGCTTGAGA
GAGAGGAGTGACAGATTCTTCTAGAATCTCTTGTGCTTGATCCCCAAGTCCAACAGTCAA
GGCTAGCAACCCTTGAAACGGCATATTAACTGTTAGTGTGTAGCTCAATAAAAATAAAAA
A*GATGATGCATAAGTTTGCTTGTGCCTCGGTGACTAACCAATAACATGTGATGCTAGTG
AGGACTCCTTACTGGACC*TTTCTTGATGCAGTGTAAACACCGATGCAACAAG*TGGCAA
AGCTACAAT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RS1BG68JQ 741 0 0
TAAGAAAAGAGTAACATGCATACATTAGAAACCAGTTCAGGATGAATCATTTGCCATATT
ATTTGCATAGATCTCTCGGTTTGATCAGCGTTGGTTCCACCAACAAAGGTTATCACTGCT
AAACACTCAAGAATCTGCAATGAAAGTGGCATGATATCAGCAAATTGCATATAGAAACTT
TTAACAGAATAAAATAGATAATAGATTATGAAATTATCCATACCGAAGTTATCTTCAAGG
CTGCACCACTAGATTTAAGGGCTTGAGAGAGAGGAGTGACAGATTCTTCTAGAATCTCTT
GTGCTTGATCCCCAAGTCCAACAGTCAAGGCTAGCAACCCTTGAAACGGCATATTAACTG
TTAGTGTGTAGCTCAATAAAAATAAAAAAAGATGATGCATAAGTTTGCTTGTGCCTCGGT
GACTAACCAATAACATGTGATGCTAGTGAGGACTCCTTACTGGACCCTTTCTTGATGCAG
TGTAAACACCGATGCAACAAGGTGGCAAAGCTACAATGTTGAAGAAGATACATTAGATAA
CAATCAGGTGTCATCAATACAAAACCATAATTAGTTATATGTATAAAAGATTTTTTTGAA
GAAGGGATAATAGAGTATGAGATGGTTACTTCTTTTCCACAAACTCATGCTGCAAGTCGC
TCTTGAATGCGTCAACAATGGAGGCCAAAGCTTGCTCTCTCGTTGAACTCCTTCACATCC
ACAAAGGAATCCAAATATTTA

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL4571Contig1 146 2 1 U
GGAAGCCGAGGCTTGAGATTCGGTATGATGATGATGATGATGAGCACTCCCTTGTCCCTG
ACCTAGGCTAAGCTATGGATGAAACTATATATAGAATTTGGTTTGTATATGTGATACTAT
ATACACACACATCTCTTGCCCTTGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BA56JQ C 1
AF RS1BA56TF U 1
BS 1 146 RS1BA56TF

RD RS1BA56JQ 146 0 0
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ATACACACACATCTCTTGCCCTTGCC

QA 1 146 1 146
DS 

RD RS1BA56TF 146 0 0
GGAAGCCGAGGCTTGAGATTCGGTATGATGATGATGATGATGAGCACTCCCTTGTCCCTG
ACCTAGGCTAAGCTATGGATGAAACTATATATAGAATTTGGTTTGTATATGTGATACTAT
ATACACACACATCTCTTGCCCTTGCC

QA 1 146 1 146
DS 



AS 1 2

CO CL4572Contig1 848 2 2 U
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CTCTCCTCTTCCTCTTCTTTTCTCTGAAGCTCTTGTTGAGAACACGGAGGCGCAAACTAA
ACCTACCACCGAGTCCAACTCGACCATTTCCGGTTATCGGACATCTCCACCTCCTGAAAC
TGCCGCTACACCGTACGTTTCTCTCTCTCTCCAAATCACTAGGCGGCGCTTCCATTTTCT
CCCTCCGCCTCGGCACACGTCTCGTTTTTGTCGTTTCTTCTCACTCAGTCGCGGAGGAAT
GCTTCACCAAGAACGACGTAGTTTTAGCTAACAGGCCGGAGTTTATCGTCGGAAAATACA
TCGGGTACAACTCAACCACCATGGTTGGTTCGGCTTATGGAGACAGCTGGCGGAACCTCC
GTCGTATTGGCACCATTGAGATATTCTCATCTCACAGACTCAATAGCTTCTTATCCATCC
GTAAAGACGAGATCCGACGGCTGATATTCTCTCTATCAAAAAACTCTCAACAAGTATGTG
CCATTCAATCTTACGCACGGTTTATAAAAAAAAAAAATTTGCATTATATATATAGATATT
TCCGTAAACATGAAAGACACCAAAGCGAACCTGGTCCACTTGGTTGTGGTTATTTTATTT
CCACTTGGGCTCAAGTGTTCGAAACACCTTTGGTACCTCCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTG
TCTATCTATTAGTTTCCTCGGATCTAGCGTGACCTTGACAAATGAAGGTAATAATAATTA
CCTTTTTCTTTCTAAGAACAAAAAAACATGTAAAGATAAAATATAGAAAAATACCCCTAG
CCAACACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G143TF U 1
AF RS1G143JQ C 516
BS 1 661 RS1G143TF
BS 662 848 RS1G143JQ

RD RS1G143TF 661 0 0
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CCCTCCGCCTCGGCACACGTCTCGTTTTTGTCGTTTCTTCTCACTCAGTCGCGGAGGAAT
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TCGGGTACAACTCAACCACCATGGTTGGTTCGGCTTATGGAGACAGCTGGCGGAACCTCC
GTCGTATTGGCACCATTGAGATATTCTCATCTCACAGACTCAATAGCTTCTTATCCATCC
GTAAAGACGAGATCCGACGGCTGATATTCTCTCTATCAAAAAACTCTCAACAAGTATGTG
CCATTCAATCTTACGCACGGTTTATAAAAAAAAAAAATTTGCATTATATATATAGATATT
TCCGTAAACATGAAAGACACCAAAGCGAACCTGGTCCACTTGGTTGTGGTTATTTTATTT
C

QA 1 661 1 661
DS 

RD RS1G143JQ 333 0 0
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AATTTGCATTATATATATAGATATTTCCGTAAACATGAAAGACACCAAAGCGAACCTGGT
CCACTTGGTTGTGGTTATTTTATTTCCACTTGGGCTCAAGTGTTCGAAACACCTTTGGTA
CCTCCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTGTCTATCTATTAGTTTCCTCGGATCTAGCGTGACCT
TGACAAATGAAGGTAATAATAATTACCTTTTTCTTTCTAAGAACAAAAAAACATGTAAAG
ATAAAATATAGAAAAATACCCCTAGCCAACACT

QA 1 333 1 333
DS 



AS 1 2

CO CL4573Contig1 875 2 2 U
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AGTGCACAAAGTCAGAGTGCAATTACTTCTTGCACAGGTCATGTTTCGACCTTCCCGGTG
AAACTCTTCACAAGTCTCACCCTAATCACCCTTTGACCCTGGTCCATTCTCCACCCTACA
ACCAGTCTACGTTCTCGTGTGATGCGTGTGGTGAGCATGGATCTGGCTTCACATACCATT
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ATGGTGTGACATTCATATGTGATGTTTGTGAAGAAGATATACCAGAGAATCTATGGGTGT
ATTATTGCAAAGAATGTGATTATGGGACACATGTACATTCATGCGCCACATATGAAGATA
ACGGTGCAAAGAAAGGAAAAGAAGAAGGAGAAACAAGCTCGGCGGCTTCAGAGATGAAGT
CGGTAATGGATGCTAAGATGGAGATGGCGATGATGCAGCTCCAGTTAGATGCTATTGACA
CAGCAGGTAGTTATGTCGGTTCATGGGAACCAAGGAGGAGATATTATTGGTGAAGTCTTA
TTTTTTAAACTATTATGTGATTATGAGTGTTTAATAATTGCTCTCTTTTGTGAATTTCTG
TTATGAAATCAATCCAAGAAAAATGTCTTAATCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DW69TF U 1
AF RS1DW69JQ C 104
BS 1 623 RS1DW69TF
BS 624 875 RS1DW69JQ

RD RS1DW69TF 623 0 0
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AGTGCACAAAGTCAGAGTGCAATTACTTCTTGCACAGGTCATGTTTCGACCTTCCCGGTG
AAACTCTTCACAAGTCTCACCCTAATCACCCTTTGACCCTGGTCCATTCTCCACCCTACA
ACCAGTCTACGTTCTCGTGTGATGCGTGTGGTGAGCATGGATCTGGCTTCACATACCATT
GCTCTAAGTGCCAATACGATGTTCATGTTGGATGTGCATTTGTCCCTGAGACCGTGGAGC
GTGAAGACCACGAACACCCTCTCACTCTACTTTACAACACGCCCTGCAAAGGTCGGGAGG
ATGGTGTGACATTCATATGTGATGTTTGTGAAGAAGATATACCAGAGAATCTATGGGTGT
ATTATTGCAAAGAATGTGATTATGGGACACATGTACATTCATGCGCCACATATGAAGATA
ACGGTGCAAAGAAAGGAAAAGAA

QA 1 623 1 623
DS 

RD RS1DW69JQ 772 0 0
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AATTGGGCAAGCTTACAAGTGCACAAAGTCAGAGTGCAATTACTTCTTGCACAGGTCATG
TTTCGACCTTCCCGGTGAAACTCTTCACAAGTCTCACCCTAATCACCCTTTGACCCTGGT
CCATTCTCCACCCTACAACCAGTCTACGTTCTCGTGTGATGCGTGTGGTGAGCATGGATC
TGGCTTCACATACCATTGCTCTAAGTGCCAATACGATGTTCATGTTGGATGTGCATTTGT
CCCTGAGACCGTGGAGCGTGAAGACCACGAACACCCTCTCACTTTACTTTACAACACGCC
CTGCAAAGGTCGGGAGGATGGTGTGACATTCATATGTGATGTTTGTGAAGAAGATATACC
AGAGAATCTATGGGTGTATTATTGCAAAGAATGTGATTATGGGACACATGTACATTCATG
CGCCACATATGAAGATAACGGTGCAAAGAAAGGAAAAGAAGAAGGAGAAACAAGCTCGGC
GGCTTCAGAGATGAAGTCGGTAATGGATGCTAAGATGGAGATGGCGATGATGCAGCTCCA
GTTAGATGCTATTGACACAGCAGGTAGTTATGTCGGTTCATGGGAACCAAGGAGGAGATA
TTATTGGTGAAGTCTTATTTTTTAAACTATTATGTGATTATGAGTGTTTAATAATTGCTC
TCTTTTGTGAATTTCTGTTATGAAATCAATCCAAGAAAAATGTCTTAATCTT

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

CO CL4574Contig1 1338 2 2 U
GGATTCGCACGCAATTCATCTCCTCCTATCGGACTTCGCTACACACAGCACATCGGGCAA
TCAATCTCAAAGCTTCTCTCTTTTTTTAAAAAAAAATTCCTTCTTCTACCTTCTCCAATT
TCCCGAGAGATTCAATGAAGCAGTAAAGAGAATCAAAAATTGGAAATTTATATATTTTTT
CTTCGGAGCTTAAGACCTGAGTCTGTCTGATCTGTCGGAGAGAAAAGAGAGGACGTGTCT
CGCATCTTTGTCTGACTCTCTCTCTATAATTTTAGCTCATAATATAAAGAATGGGAACGA
GCGAAGAAAAGACGCCTTCCAAACAAGCATCCTCGGCACAGGACATTCCTCCCACGCCGT
ATCCAGACTGGTCAAACTCAATGCAGGCTTACTATGGAGGAGGAGGTACTCCGAATCCTT
TTTTCCCATCTCCTGTTGGATCTCCTAGTCCTCACCCCTATATGTGGGGTGCTCAACACC
ATATGATGCCGCCTTATGGGACCCCGGTTCCGTACCCAGCCATGTATCCTCCAGGCGCAG
TCTATGCTCATCCTGGCATGCCCATGCCTCCTACTTCTGCTCCAACCAACAAGGAGACCG
TGAAAGAGCAAGCCGCTGGAAAGAAGTCGAAAGGGAACTTGAAAAGAAAGGGTGAAGGAG
GTGAGAAGGCGCCTTCTGGTTCAGGGAACGATGGTGTATCTCAAAGTGATGAAAGTGTCA
CAGCGGGTTCATCTGATGAAAATGGTGAGAATGTTAACCACCAGGAGCAAGGTTCAGTTA
GGAAGCCGAGCTTTGGACAAATGCTTGCGGATGCAAGTTCTCAGAGTAATACTACTGGTG
AGATAGTGCCCATGAAGCCACTGGCCCCTGGGACTAATCTGAATATGGGAATGGACTTAT
GGTCTTCCCAGGCTGGCGTAGCTGTGAAGGATGAAAGAGAGCTCAAGAGGCAGAAAAGAA
AACAGTCTAACCGTGAATCCGCCAGGCGGTCCAGACTGCGGAAGCAGGCGGAATGCGAAC
AGCTTCAACAGAGAGTAGAGAGTTTGACGAGTGAGAATCAAAGCCTGAGAGATGAATTAC
AGAGACTCTCCAGCGAATGTGAGAAGCTCAAGACTGAGAACAGCTTATCCAGGAAGAGTT
GGTAAGAGTGCATGGACCAGAGGCGGTAGCTGCTAATCTAGAACAGAGTGATACTGGATC
TAAAGACGGTGAAGGAACAAACTAACACACTTAGGAAAAACATGGAACGATTCTCCATTA
CGTTATTGTGATTTTCCAAAACTTATTTGTAAACCAGTCTAAAAGTTATTTGAGATTTAC
GTGTGACCATGACCGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C458TF U 1
AF RS1C458JQ C 591
BS 1 644 RS1C458TF
BS 645 1338 RS1C458JQ

RD RS1C458TF 646 0 0
GGATTCGCACGCAATTCATCTCCTCCTATCGGACTTCGCTACACACAGCACATCGGGCAA
TCAATCTCAAAGCTTCTCTCTTTTTTTAAAAAAAAATTCCTTCTTCTACCTTCTCCAATT
TCCCGAGAGATTCAATGAAGCAGTAAAGAGAATCAAAAATTGGAAATTTATATATTTTTT
CTTCGGAGCTTAAGACCTGAGTCTGTCTGATCTGTCGGAGAGAAAAGAGAGGACGTGTCT
CGCATCTTTGTCTGACTCTCTCTCTATAATTTTAGCTCATAATATAAAGAATGGGAACGA
GCGAAGAAAAGACGCCTTCCAAACAAGCATCCTCGGCACAGGACATTCCTCCCACGCCGT
ATCCAGACTGGTCAAACTCAATGCAGGCTTACTATGGAGGAGGAGGTACTCCGAATCCTT
TTTTCCCATCTCCTGTTGGATCTCCTAGTCCTCACCCCTATATGTGGGGTGCTCAACACC
ATATGATGCCGCCTTATGGGACCCCGGTTCCGTACCCAGCCATGTATCCTCCAGGCGCAG
TCTATGCTCATCCTGGCATGCCCATGCCTCCTACTTCTGCTCCAACCAACAAGGAGACCG
TGAAAGAGCAAGCCGCTGGAAAGAAGTCGAAAGGGAACTTGAAA
GA

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1C458JQ 748 0 0
AAGGAGACCGTGAAAGAGCAAGCCGCTGGAAAGAAGTCGAAAGGGAACTTGAAAAGAAAG
GGTGAAGGAGGTGAGAAGGCGCCTTCTGGTTCAGGGAACGATGGTGTATCTCAAAGTGAT
GAAAGTGTCACAGCGGGTTCATCTGATGAAAATGGTGAGAATGTTAACCACCAGGAGCAA
GGTTCAGTTAGGAAGCCGAGCTTTGGACAAATGCTTGCGGATGCAAGTTCTCAGAGTAAT
ACTACTGGTGAGATAGTGCCCATGAAGCCACTGGCCCCTGGGACTAATCTGAATATGGGA
ATGGACTTATGGTCTTCCCAGGCTGGCGTAGCTGTGAAGGATGAAAGAGAGCTCAAGAGG
CAGAAAAGAAAACAGTCTAACCGTGAATCCGCCAGGCGGTCCAGACTGCGGAAGCAGGCG
GAATGCGAACAGCTTCAACAGAGAGTAGAGAGTTTGACGAGTGAGAATCAAAGCCTGAGA
GATGAATTACAGAGACTCTCCAGCGAATGTGAGAAGCTCAAGACTGAGAACAGCTTATCC
AGGAAGAGTTGGTAAGAGTGCATGGACCAGAGGCGGTAGCTGCTAATCTAGAACAGAGTG
ATACTGGATCTAAAGACGGTGAAGGAACAAACTAACACACTTAGGAAAAACATGGAACGA
TTCTCCATTACGTTATTGTGATTTTCCAAAACTTATTTGTAAACCAGTCTAAAAGTTATT
TGAGATTTACGTGTGACCATGACCGACC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL4575Contig1 537 2 2 U
GGAAGTTGATGAGAATCCAAGCGTTACGTTGCAATGTGGTTTACTGTCAGAATGGAGCTA
GGTTAAACGTGATCCCTGTTCTTGCCTCACGATCTCAAGCCCTTAGGTATCTACTAGTGC
GATGGGGGATTGATTTATCGAACATGGTGGTGTTCGTGGGAGATTCAGGTGACACGGATT
ACGAAGGCTTGCTTGGAGGGGTTCACAAAACTGTGATACTTAAAGGCATAGCGAGTGATT
TGCGTGAGCTACACGGGAACAGAAGCTACCCTATGGAAGACGTGACGCCACTCGACAGTC
CTAATATAACAGAAGCTGAAGAATGTGGGCGTGATGCTATTAAGGCCGCACTTGAGAAGC
TTGGGATCAATCTACCCAAGGCTTGAGGCTGTGTTTTCTCCTCTATATATTAAAAGAGTT
TTTGTACCAATATGCTACGATGGTTGAATTAATAATATGAACTACACTATAACAATAAAA
GATTGTATAATTGAACGAAATGTAAAATTTTGTGTTTGATTTTCGTGGTGTACTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GQ35JQ C 1
AF RS1GQ35TF U 23
BS 1 22 RS1GQ35JQ
BS 23 537 RS1GQ35TF

RD RS1GQ35JQ 537 0 0
GGAAGTTGATGAGAATCCAAGCGTTACGTTGCAATGTGGTTTACTGTCAGAATGGAGCTA
GGTTAAACGTGATCCCTGTTCTTGCCTCACGATCTCAAGCCCTTAGGTATCTACTAGTGC
GATGGGGGATTGATTTATCGAACATGGTGGTGTTCGTGGGAGATTCAGGTGACACGGATT
ACGAAGGCTTGCTTGGAGGGGTTCACAAAACTGTGATACTTAAAGGCATAGCGAGTGATT
TGCGTGAGCTACACGGGAACAGAAGCTACCCTATGGAAGACGTGACGCCACTCGACAGTC
CTAATATAACAGAAGCTGAAGAATGTGGGCGTGATGCTATTAAGGCCGCACTTGAGAAGC
TTGGGATCAATCTACCCAAGGCTTGAGGCTGTGTTTTCTCCTCTATATATTAAAAGAGTT
TTTGTACCAATATGCTACGATGGTTGAATTAATAATATGAACTACACTATAACAATAAAA
GATTGTATAATTGAACGAAATGTAAAATTTTGTGTTTGATTTTCGTGGTGTACTTTT

QA 1 537 1 537
DS 

RD RS1GQ35TF 515 0 0
GTTACGTTGCAATGTGGTTTACTGTCAGAATGGAGCTAGGTTAAACGTGATCCCTGTTCT
TGCCTCACGATCTCAAGCCCTTAGGTATCTACTAGTGCGATGGGGGATTGATTTATCGAA
CATGGTGGTGTTCGTGGGAGATTCAGGTGACACGGATTACGAAGGCTTGCTTGGAGGGGT
TCACAAAACTGTGATACTTAAAGGCATAGCGAGTGATTTGCGTGAGCTACACGGGAACAG
AAGCTACCCTATGGAAGACGTGACGCCACTCGACAGTCCTAATATAACAGAAGCTGAAGA
ATGTGGGCGTGATGCTATTAAGGCCGCACTTGAGAAGCTTGGGATCAATCTACCCAAGGC
TTGAGGCTGTGTTTTCTCCTCTATATATTAAAAGAGTTTTTGTACCAATATGCTACGATG
GTTGAATTAATAATATGAACTACACTATAACAATAAAAGATTGTATAATTGAACGAAATG
TAAAATTTTGTGTTTGATTTTCGTGGTGTACTTTT

QA 1 515 1 515
DS 



AS 1 2

CO CL4576Contig1 807 2 6 U
GGAAAACAATTCTTCTCTACTCTCTCTCTCTCTCTCTCGGCTTGGTAAATACGATCAAGA
AGAGGAAAACGACGACGGCGGCGGGGAGGCCAAGTGGTACCGATGGATCTGATTTCTCGT
ACCGGATGGTCGTTGACTCTCGTTACGCGAAGGTCACTAAAGGGAGATCTCGTCTCCGTC
TCTTGATCCTTGTTCAGGCAACGATATATGTAATTGGACTGTCGTGCGCATTCATGACAA
GTAGTACTAAAAATGAGGAGAGGAACACACTTGGAATTGCATCTGCTGCTGTTGGCTTAC
TCTTTTCATTCATTGCTGATTTTGCTTGCAAACGAAGCAGAGTAAACCTTTTGAGGCTCT
ACACGGCTGCCCCCACCCTTGTCATGCTTCTTTCTGTGTTTTCTGCTGTTAGGAGCAGAT
TAACAATGGAGGAACGGAATAGCTCTGGAACAACCGCCAAGCTTGAGCTTTTAGGCTTCA
TTTCTGCTCAATTAGGAGCGGTGCTGCAGATATTAGCTATCATCGTTACGGGTCAACTGG
TCAATAATGTGTCTCCACCTACTAAGACAGAATAGAGAAGACAAGAGAGTTTGGGTATTG
TCATCTGTGATTTTCCTACATGAGGAAGACATTTAGAATTTTTACTTCAGTATTTTATTT
AGTTACTCGAAAGAGACGTTTTTGATAGATCAATGCACCATAGGAATGTTACGACGGGAG
GCGGACCTGAAACTTTTAAAAAAGAAAAGTAAAATGGCAACTTTTTTGCGGAAGAAAAAA
GAAATGATATGCTCTAGTGAAGAATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1B571TF U 1
AF RS1B571JQ C 173
BS 1 692 RS1B571TF
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DS 

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GAGCAGATTAACAATGGAGGAACGGAATAGCTTTGGAACAACCGCCAAGCTTGAGCTTTT
AGGCTTCATTTTTGCTCAATTAGGAGCGGTGCTGCAGATATTAGCTATCATCGTTACGGG
TCAACTGGTCAATAATGTGTCTCCCCCTACTAAGACAGAATAGAGAAGACAAGAGAGTTT
GGGTATTGTCATCTGTGATTTTCCTACATGAGGAAGACATTTAGAATTTTTACTTCAGTA
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QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

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ACCCATTGTTTTGGTCGGTTCCTTGGAGGGGAACTTCTTGGCTAGCTTTCTGTTGGGTTG
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GATGCTTACGTCAGGGCAGCCGGTTAAATGCAGGAACGCTGTTCATGCGTTAAGAGAGAT
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T


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10 

AF RS1BJ77TF U 1
AF RS1BJ77JQ C 558
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CGCTGCTGGTGCTACGACCTCGTTGTTTCTCTACCATTTGGATTACGCACGGACACGTTT
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TTCGATACTTGGAATCACTCTTTACCGAGGCATGTATTTCGGGATGTACGATACCATCAA
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GATGCTTACGTCAGGGCAGCCGGTTAAATGCAGGAACGCTGTTCATGCGTTAAGAGAGAT
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AGTTGCTGGAGCTGGAGTTCTTGCAGGGTATGATCAGCTTCACCGGATTGCTTATAAGCA
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AAGGGTGGTCAGTAAAAACCAAGAAGTTGTGCTTACATTACAATGTGTTGTGTTGATTAA
CA

QA 1 722 1 722
DS 

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TGAACCAAATCCGACAATGGAAAACTTTCAGGTCAAGAAAGAAAAGGGGGGTCAGTAAAA
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TAATGGGTTTAAAAAAGATGAAGATAGGGAAAAATTGTTGATAAAATTTTTGTCAGATAC
ATTGTTGTTTCAGTAATTTATGAAAAGGAAAAGCCTTTTTGCTT

QA 1 284 1 284
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CCAGCGGATCGAGAAGGGAAAGAGAACAACTTTACAGGCAAGACATGAATCTAGGTTTCG
TAATTGGAGTTCTCGGCGTCCTGATTCTTTCCCACGCCGCCTATTCAACAATCCAATATA
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TCATGATATTCAATCACCGTGGCCGCCTCTTCCCACCGGAGATCACCATGAAGTTTTGAT
TTTCTTTTTCTTTTTGTTTTATTGCACTTCTTAGTCAAACACTCATATGTCCACTGTAAC
GAGATGTTGTCTCCATTGATATTCTAAGTAACTAC


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AF RS1FM03JQ C 1
AF RS1FM03TF U 1
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RD RS1FM03JQ 515 0 0
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QA 1 515 1 515
DS 

RD RS1FM03TF 515 0 0
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CCAGCGGATCGAGAAGGGAAAGAGAACAACTTTACAGGCAAGACATGAATCTAGGTTTCG
TAATTGGAGTTCTCGGCGTCCTGATTCTTTCCCACGCCGCCTATTCAACAATCCAATATA
GAGGATTGTTGAAGATCACGGAGGAAGAGTTCACCGGACCTCCGTTGAATGTTGTTGTGG
AGTTGATCGTGGGACTAGCTCTCTGTATGTGGGCTGCTTTGACTTTCCCTGGCAAGTTTC
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TCATGATATTCAATCACCGTGGCCGCCTCTTCCCACCGGAGATCACCATGAAGTTTTGAT
TTTCTTTTTCTTTTTGTTTTATTGCACTTCTTAGTCAAACACTCATATGTCCACTGTAAC
GAGATGTTGTCTCCATTGATATTCTAAGTAACTAC

QA 1 515 1 515
DS 



AS 1 2

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TACTCTTTTAGCACTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EJ27TF U 1
AF RS1EJ27JQ C 244
BS 1 717 RS1EJ27TF
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RD RS1EJ27TF 776 0 0
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QA 1 776 1 776
DS 

RD RS1EJ27JQ 616 0 0
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TAACGAACATAAACTCTGTTCTTTTTGTAATTTCGTACAAAATGTTGATTGTTATTTTAC
TCTTTTAGCACTTTAC

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 2

CO CL4581Contig1 521 2 2 U
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TCGTCGTTTCTCTTGCGCGCAACACGGACCCTGATCCTCCTTGGAGGACCTCTGATTCCT
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BQ
10 10 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BA22TF C 1
AF RS1BA22JQ U 2
BS 1 2 RS1BA22TF
BS 3 521 RS1BA22JQ

RD RS1BA22TF 521 0 0
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AAGATTTTTGAACGAAAACAACAAGAAATTTTTAAAAACCCCACAAAACTTGTCTAAATG
ACAGGACTAGTCCCTTCTCAATCCTCCTCATCGATGACCTTAGTGCCAAGTCCACTGAGT
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TCGTCGTTTCTCTTGCGCGCAACACGGACCCTGATCCTCCTTGGAGGACCTCTGATTCCT
TTGCTCCATATCTGCTTGTTCAACTTCACGTCTACCCTAACGTCCTTTGTCCCCATGGCT
TTCTCTGCAAACTTCCTGATCTCCTTGATGGCCTTTGGTGCCTTCTTCTTAAAGGTGCTG
TTACAATTTGACAAAGTCAAGCAAAGGAGCAATTAAATCTCACAACAGACCTAATCTTTA
CATAGTGGCTATGTTCTGTTATTAATAAAAAAGTATACACT

QA 1 521 1 521
DS 

RD RS1BA22JQ 520 0 0
C
CCGAAAAAAACGAGTCTTTCCAATAAACTGCATCAGTCACACTACAAAGAAAATACTGAA
GATTTTTGAACGAAAACAACAAGAAATTTTTAAAAACCCCACAAAACTTGTCTAAATGAC
AGGACTAGTCCCTTCTCAATCCTCCTCATCGATGACCTTAGTGCCAAGTCCACTGAGTCC
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GTCGTTTCTCTTGCGCGCAACACGGACCCTGATCCTCCTTGGAGGACCTCTGATTCCTTT
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QA 2 520 2 520
DS 



AS 1 2

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GGCGGAGCTACGCGGCTGCGTCAACGACGTTCGTCGTATGTACAAATGTCTCGTCGAACG
GTACGGATTCTCCGAAGAGGACATCACGGTGCTGATCGACACCGATGACTCTTATACCAA
ACCCACCGGCAAGAACATCCGCAAGGCGCTCTCGGATCTCGTCGGATCGGCTGATTCTGG
GGATGTTCTCGTCGTTCATTACGGCGGACACGGGACGAGGTTGCCGGCTGAGACAGGGGA
GGATGATGACACTGGTTATGATGAATGTATTGTTCCTTGCGACATGAGTCTGATTACTGA
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AGACTCTTGTCACAGTGGTGGCTTGATCGATGAAGCCAAGGAGCAGATTGGTGAGAGCCA
TAAGAAAGACGATGAGGAGGAAGAGGAAGAAGAGTCTTCTTCCAGGTTCGGGTTCAGGAA
GTTCTTGCGCAGCAAGGTGGAAAGCGCCATTAGACGAACAAGAAGAGGGAGATGAGGCGG
ATGAGATCGAGACTAAAGAGATAGAGCTGGAAGACGGAGAAATGATCCTCGCCAAAGACA
AGTCTCTGCCTCTGCAGACACTTATCGACATCCTCAAGCAGCAGACAGGGAACGATGATA
TTGAAGTTGGGAAAATCAGGCCGAGTCTTTTCGATGCCTTTGGTGATGACTCGAGTCCCA
AAGTGAAGAAGTTCATGAAAGTGATCTTAGGTAAGCTTAAAGCAGGAGAAGGAGAAGGTG
GGCTGATGGGAATGCTAGGGAAGCTAGCTTCAGGGTTTCTCGAAGGGAACTTAACGATGA
TGACTATGTGAAACCCGCTATGCAGACGGAAGTTGGTAGGAAAGAAGAGGTTTACGCTGG
TGGGTCTAGAGGTTCGGTTCCGCTTCCGGACAGTGGGATATTGATCAGCGGTTGTCAGAC
TGATCAGACCTCTGCTGATGCGACGCCGCCGGGGAAACCGAGTGAAGCTTATGGAGCGAT
GAGTAACTCGATACAGAAGATATTGGAGGAGACGGACGGGGAGATATCGAACAGGGAGAT
GGTGACGAGGGCAAGGAAGGCGTTGAAGAAGCAAGGGTTTACTCAGCAGCCAGGTTTGTA
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TTTATTTGTAACGACCGTTGATGATGATTCTGGTCGGGAAATAAGCCTCTGTTTGAGGGC
ATTTGTGTAAGTTAAAATTGTGTGTTGTGTTTTGTGATACAATGGTTTCATCTTGTTTTT
ATTGAGGACTATGTTTTGTTTTAAGT


BQ
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AF RS1GQ44TF U 1
AF RS1GQ44JQ C 660
BS 1 696 RS1GQ44TF
BS 697 697 RS1GQ44JQ
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RD RS1GQ44TF 765 0 0
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TTTTCTTCCATCAATGGCGAAAAAGGCGGTGCTGATCGGGATCAACTACCCAGGAACCAA
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GTACGGATTCTCCGAAGAGGACATCACGGTGCTGATCGACACCGATGACTCTTATACCAA
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GGATGTTCTCGTCGTTCATTACGGCGGACACGGGACGAGGTTGCCGGCTGAGACAGGGGA
GGATGATGACACTGGTTATGATGAATGTATTGTTCCTTGCGACATGAGTCTGATTACTGA
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AGACTCTTGTCACAGTGGTGGCTTGATCGATGAAGCCAAGGAGCAGATTGGTGAGAGCCA
TAAGAAAGACGATGAGGAGGAAGAGGAAGAAGAGTCTTCTTCCAGGTTCGGGTTCAGGAA
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AGTCTCTGC*TCTGCAGACACTTATCGACATCCTCAAGCAGCAGA

QA 1 765 1 765
DS 

RD RS1GQ44JQ 807 0 0
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AAAGTGAAGAAGTTCATGAAAGTGATCTTAGGTAAGCTTAAAGCAGGAGAAGGAGAAGGT
GGGCTGATGGGAATGCTAGGGAAGCTAGCTTCAGGGTTTCTCGAAGGGAACTTAACGATG
ATGACTATGTGAAACCCGCTATGCAGACGGAAGTTGGTAGGAAAGAAGAGGTTTACGCTG
GTGGGTCTAGAGGTTCGGTTCCGCTTCCGGACAGTGGGATATTGATCAGCGGTTGTCAGA
CTGATCAGACCTCTGCTGATGCGACGCCGCCGGGGAAACCGAGTGAAGCTTATGGAGCGA
TGAGTAACTCGATACAGAAGATATTGGAGGAGACGGACGGGGAGATATCGAACAGGGAGA
TGGTGACGAGGGCAAGGAAGGCGTTGAAGAAGCAAGGGTTTACTCAGCAGCCAGGTTTGT
ATTGCCATGATGGTTATGCAAATGCTCCTTTTATCTGTTGAGAAAAACTATTTGATGCTT
TTTTATTTGTAACGACCGTTGATGATGATTCTGGTCGGGAAATAAGCCTCTGTTTGAGGG
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TATTGAGGACTATGTTTTGTTTTAAGT

QA 1 807 1 807
DS 



AS 1 2

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GGAGGAGTGGTTGGATGCAATACTTGTCCCCGCGGGTCTCGCCGTGATGGTCGCATACCA
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TGAATCTCGACGACAATGGGTCTTCTCTATGATGACCGAGCCGCTGAAGAACGGTACTTT
AGCAGTACAGACAATAAGGAACAACATAATGGCATCAACTCTTTTAGCCACGACAGCAAT
CACTCTCTGTTCCATCATCGGCGTCTTCGTAAACAACAACACCTCTGCTTCCAAATCCAC
AGCCTCCTCGTCTATCATATACGGAAACAAAAGCCCTCTCCTTTCGACCATCAAGAACTT
CGCGATCCTCGTCTGTTTCCTCATGGCCTTTCTCTGCAACGTCCAGTCCATCAGGTACTA
CGCTCATGTGGGTTTCCTCATCACGGTTCCCGTCTCTAGAGGGAAGAGAGAGCATTGTGA
GTACGTGTCTAGAAACCTGAACCGAGCTAGCTACTTCTGGTCTCTCGGACTTCGAGCTTT
CTACTTCTCCTTCCCGCTCTTCCTGTGGAACTTCGGTCCCATCCCTATGTTTGTGTGTTG
CTGTTTGATGTCGTCGATTCTTTATTTCTTGGATACCACCACTAGCTTCACTAGGCATCT
CCATAGCGAGTCTTTCCGAGAGATTGCTGAGTCTATGGACGATGAAATCGAATCGGCCGT
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AAAACGCAAATAAACTGTCCAAATAACATGTTACATAGATTGTAGACTAAGTAATCTCTT
GCACATTGTAGTCATTATTAGTTAACTCATTGCCTTTGATATATTACG


BQ
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AF RS1E728TF U 1
AF RS1E728JQ C 153
BS 1 658 RS1E728TF
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BS 687 1008 RS1E728JQ

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GGAGGAGTGGTTGGATGCAATACTTGTCCCCGCGGGTCTCGCCGTGATGGTCGCATACCA
CGTCTGGCTCGGCTACGCTATAATCCACCGTCCCAAGCTCACTGTTATCTCCCTCAACGC
TGAATCTCGACGACAATGGGTCTTCTCTATGATGACCGAGCCGCTGAAGAACGGTACTTT
AGCAGTACAGACAATAAGGAACAACATAATGGCATCAACTCTTTTAGCCACGACAGCAAT
CACTCTCTGTTCCATCATCGGCGTCTTCGTAAACAACAACACCTCTGCTTCCAAATCCAC
AGCCTCCTCGTCTATCATATACGGAAACAAAAGCCCTCTCCTTTCGACCATCAAGAACTT
CGCGATCCTCGTCTGTTTCCTCATGGCCTTTCTCTGCAACGTCCAGTCCATCAGGTACTA
CGCTCATGTGGGTTTCCTCATCACGGTTCCCGTCTCTAGAGGGAAGAGAGAGCATTGTGA
GTACGTGTCTAGAAACCTGAACCGAGCTAGCTACTTCTGGTCTCTCGGACTTCGAGCTTT
CTACTTCTCCTTCCCGCTCTTCCTGTGGAACTTCGGTCCCATCCCTATGTTTGTGTGT*G
CTGTTTGATGTCGTCGATTCTTTATT
CTG

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TGACCGAGCCGCTGAAGAACGGTACTTTAGCAGTACAGACAATAAGGAACAACATAATGG
CATCAACTCTTTTAGCCACGACAGCAATCACTCTCTGTTCCATCATCGGCGTCTTCGTAA
ACAACAACACCTCTGCTTCCAAATCCACAGCCTCCTCGTCTATCATATACGGAAACAAAA
GCCCTCTCCTTTCGACCATCAAGAACTTCGCGATCCTCGTCTGTTTCCTCATGGCCTTTC
TCTGCAACGTCCAGTCCATCAGGTACTACGCTCATGTGGGTTTCCTCATCACGGTTCCCG
TCTCTAGAGGGAAGAGAGAGCATTGTGAGTACGTGTCTAGAAACCTGAACCGAGCTAGCT
ACTTCTGGTCTCTCGGACTTCGAGCTTTCTACTTCTCCTTCCCGCTCTTCCTGTGGAACT
TCGGTCCCATCCCTATGTTTGTGTGTTGCTGTTTGATGTCGTCGATTCTTTATTTCTTGG
ATACCACCACTAGCTTCACTAGGCATCTCCATAGCGAGTCTTTCCGAGAGATTGCTGAGT
CTATGGACGATGAAATCGAATCGGCCGTTCATTCTCTGTAGAATCTTCTCTGTTTTCTTG
TGTGGATGAAGAGTTGTAGTATTAGCGGAGTTTGTTTGTAATGTGATGAAACAACCTTGG
CTGTGTCCGAGAGCGCAAACGCTTATGTAAAACGCAAATAAACTGTCCAAATAACATGTT
ACATAGATTGTAGACTAAGTAATCTCTTGCACATTGTAGTCATTATTAGTTAACTCATTG
CCTTTGATATATTACG

QA 1 856 1 856
DS 



AS 1 2

CO CL4584Contig1 1222 2 2 U
GGGAGAGAGACAGAGAGAGAGAAGAGAGGGAGACGAGTAACGGTGTCGTCTTCCTCGTCG
CTGCCTACGATTATTTCCTCGCTCTTCTAAGGGAGGGAGGGGCATTAGAAAGAAAGATAT
GGAAGAAGGGTATGAGAGTCGTCGAGGGAGTAGATGGGAAGATTCGGACACTGACATCTT
GGTCAGGATCTTCCAGAAGTTTAGCATCTTTGAATTGACTTCGGGTTTAGCTCACGTATG
CAGTGGATGGAGAGCTGCTTGCTGCGATCCCATCCTCTGGAAGACTCTTGATCTCTCTCA
CATGAGATCTAGTTTCATCAAGATCCCCTTAGAGCCTTACGTCTACGTGGAGCGTCGCTC
CGATGAGGCCCTCACCCGGATCCTCAAACTCTCCATGAATCTTAGTGGTGGCAACACCAG
AGCCTTGGTTTTCCATTTCAACTTGTTCTTGAGTGATGATCAGCTTACTTACACCGCTGA
AAGGTGTCCAGGGTTGAGACGGGTGGTGCTTCCAGCTTGGAACAGAATTAAAAAGACTGG
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AAACCCGCCTTACCTCTTAACAGAGATCGCCAAGAACTGCAAGAACTTCAAAGAGCTCAA
GATCATGGGTCCATTCGAGATCTTCTTCGCGAACACGCTCATTACTTACCTCCCTAACCT
CAAAACACTCAGCCTTAGATGCTCTGCGATCAAGCGAGAAGCACTGATTAAGATCCTTGA
CGGGTTACCTGATCTTGAAGTGCTCAACATATCTCACTCTTACCTGGTGGAGTACAGTGT
GTGGCAACCGCAGCAGAAAGCGATTGTTAGGGAGCTTGATAAGACGATACTTGAGAAAGC
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GACTGAGAATGACGAAGGGATTGTAAGATGGTATAAGTATGAAGAAGGAGAGTGGAAAGT
TGATGAAGTGAGCTCTCTTCATCTTTGATGGTATCTTGACTTACTTCCAATCTTTCACTG
TTTGTGTGTTTCTCTTTTTGTTTGTTGTTTTTTGAACGTTTTTTGTGTGTATATAAATGT
AGGCAATGCCAAAAAGTTTGTATTCAGTGATCGCCAACCTTGACGTAAGTAGGGAAATAA
ATAAAAACAAACAATTTCTAGT


BQ
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AF RS1C554TF U 1
AF RS1C554JQ C 522
BS 1 669 RS1C554TF
BS 670 1222 RS1C554JQ

RD RS1C554TF 669 0 0
GGGAGAGAGACAGAGAGAGAGAAGAGAGGGAGACGAGTAACGGTGTCGTCTTCCTCGTCG
CTGCCTACGATTATTTCCTCGCTCTTCTAAGGGAGGGAGGGGCATTAGAAAGAAAGATAT
GGAAGAAGGGTATGAGAGTCGTCGAGGGAGTAGATGGGAAGATTCGGACACTGACATCTT
GGTCAGGATCTTCCAGAAGTTTAGCATCTTTGAATTGACTTCGGGTTTAGCTCACGTATG
CAGTGGATGGAGAGCTGCTTGCTGCGATCCCATCCTCTGGAAGACTCTTGATCTCTCTCA
CATGAGATCTAGTTTCATCAAGATCCCCTTAGAGCCTTACGTCTACGTGGAGCGTCGCTC
CGATGAGGCCCTCACCCGGATCCTCAAACTCTCCATGAATCTTAGTGGTGGCAACACCAG
AGCCTTGGTTTTCCATTTCAACTTGTTCTTGAGTGATGATCAGCTTACTTACACCGCTGA
AAGGTGTCCAGGGTTGAGACGGGTGGTGCTTCCAGCTTGGAACAGAATTAAAAAGACTGG
GATATGTAAAGCCATAAGGATCTGGAAAGATCTGGAGTCACTAACAATGCCTAGCATCGC
AAACCCGCCTTACCTCTTAACAGAGATCGCCAAGAACTGCAAGAACTTCAAAGAGCTCAA
GATCATGGG

QA 1 669 1 669
DS 

RD RS1C554JQ 701 0 0
ACAGAATTAAAAAGACTGGGATATGTAAAGCCATAAGGATCTGGAAAGATCTGGAGTCAC
TAACAATGCCTAGCATCGCAAACCCGCCTTACCTCTTAACAGAGATCGCCAAGAACTGCA
AGAACTTCAAAGAGCTCAAGATCATGGGTCCATTCGAGATCTTCTTCGCGAACACGCTCA
TTACTTACCTCCCTAACCTCAAAACACTCAGCCTTAGATGCTCTGCGATCAAGCGAGAAG
CACTGATTAAGATCCTTGACGGGTTACCTGATCTTGAAGTGCTCAACATATCTCACTCTT
ACCTGGTGGAGTACAGTGTGTGGCAACCGCAGCAGAAAGCGATTGTTAGGGAGCTTGATA
AGACGATACTTGAGAAAGCTTCGAGGCTGAAGAGGTTCTTGACTTGTATGGAGCATCAGA
CTTGTGTGATGTGTCAGAGGACTGAGAATGACGAAGGGATTGTAAGATGGTATAAGTATG
AAGAAGGAGAGTGGAAAGTTGATGAAGTGAGCTCTCTTCATCTTTGATGGTATCTTGACT
TACTTCCAATCTTTCACTGTTTGTGTGTTTCTCTTTTTGTTTGTTGTTTTTTGAACGTTT
TTTGTGTGTATATAAATGTAGGCAATGCCAAAAAGTTTGTATTCAGTGATCGCCAACCTT
GACGTAAGTAGGGAAATAAATAAAAACAAACAATTTCTAGT

QA 1 701 1 701
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4586Contig1 516 2 1 U
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AATCAGGAATTTAGATCGTGATTACTTCGTTAACATCGCCAAGTTTGCGGTCGATGAGCA
TAACAAGCATTCAAAAAATAAATTGGTGTTCATTAGAATCCTCGAAGGAAGGGAACGAAT
GGATACGGGACAGAGAGACTATTTTAAAATTGGGGTCAGGAATAGTGAGGATTGGTCAGA
GATATATGAGGCATCAGTGTTTGACAAGGAACATAAGAATGCTCCGATCCTTGAGTTTTT
CAGGAAGATAAGGTAATTTGGATTTGTTAAAATTCAATCTCCCTCAGAAATTATATAATA
TAAGATTTCTGGTAAGTTGAGATTTTTTACATTATACTGTTGTTTGTAAATATGTATTTT
GTTTGAAATAAAAGAAATAAGACTATCAAAGTATAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1F782JQ C 1
AF RS1F782TF U 1
BS 1 516 RS1F782TF

RD RS1F782JQ 516 0 0
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GGATACGGGACAGAGAGACTATTTTAAAATTGGGGTCAGGAATAGTGAGGATTGGTCAGA
GATATATGAGGCATCAGTGTTTGACAAGGAACATAAGAATGCTCCGATCCTTGAGTTTTT
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TAAGATTTCTGGTAAGTTGAGATTTTTTACATTATACTGTTGTTTGTAAATATGTATTTT
GTTTGAAATAAAAGAAATAAGACTATCAAAGTATAT

QA 1 516 1 516
DS 

RD RS1F782TF 516 0 0
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AATCAGGAATTTAGATCGTGATTACTTCGTTAACATCGCCAAGTTTGCGGTCGATGAGCA
TAACAAGCATTCAAAAAATAAATTGGTGTTCATTAGAATCCTCGAAGGAAGGGAACGAAT
GGATACGGGACAGAGAGACTATTTTAAAATTGGGGTCAGGAATAGTGAGGATTGGTCAGA
GATATATGAGGCATCAGTGTTTGACAAGGAACATAAGAATGCTCCGATCCTTGAGTTTTT
CAGGAAGATAAGGTAATTTGGATTTGTTAAAATTCAATCTCCCTCAGAAATTATATAATA
TAAGATTTCTGGTAAGTTGAGATTTTTTACATTATACTGTTGTTTGTAAATATGTATTTT
GTTTGAAATAAAAGAAATAAGACTATCAAAGTATAT

QA 1 516 1 516
DS 



AS 1 2

CO CL4587Contig1 1070 2 2 U
GGAAAAGGTCTCATATATATAAACCCCATGGAGCACTTCTGTGTCTCAATATTCTTTGTT
TTTCGTTAGCTCTCTCTCTTTCTCTTTGTTCCATACTCTCTGTTTGTGGCAAAGGCGTAA
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AACCAACAACACGACCAGAAGCAAATGATATCGTTTAGTCCTCAACAGCCGCAACAGCAG
TATATGTTCAAGTACTGGAGCGACACGTTGAATCTAAGTCCAAGAGGAAGGAGAATGATG
ATGATGAACCAAGAAAGTATTGTTCAGCCGTACAGCGCAACCAAGCTTTACAGAGGAGTG
AGACAACGTCAATGGGGGAAGTGGGTCGCAGAGATACGCAAGCCGAAGAGCAGATCACGT
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TTTAAATTGAGGGGTCATAATGCAACACTTAATTTTCCGGAGCGTTTTGTGAATAAGGAA
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ACACAGCCAAACGAGGCTAACTTGGAGAGCAAGGAAGTATCGCTGAGTAGTGATGGTGGG
TTAGAGGGAGGGATGGCTGAAGCGTGGTTCAATGCGGTTACATCGGGATGGGATCCTGAG
AGTCCTCTTTGGGATGATTTGGATAGTTCTCAGTTTTTACACAGCTCATCTTCTTGTCCC
ATGAAGCCCTTCTTTTGAAAAGGGGCATAACAATTTAGGTTATAGTTTAGGGTATTGCTC
ACTATCATTTGGATGGAGACAGTTTTTGTGATCTCCCATTCCATACATCAGTATCATTGT
TCATCATTTATATGTACGTGTGTGTGCTATTGATTTTCCTACATATATAGATGTCTCTTT
TGTTCCTTGACCTTTTTTTTTGTTTTTGTTTCCTGGCCTTGAACAAGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GA90TF U 1
AF RS1GA90JQ C 393
BS 1 532 RS1GA90TF
BS 533 1070 RS1GA90JQ

RD RS1GA90TF 532 0 0
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TTTCGTTAGCTCTCTCTCTTTCTCTTTGTTCCATACTCTCTGTTTGTGGCAAAGGCGTAA
ATCACTAGTGAAACAGAGAGATGGACTTTGACGAGGAGCTTAATCTCTGTACCACCAAAG
GTAAAAATATAGACACTTCTTCTGGAGAAGCATCTTCAACAACTAGGATATGTCCCGGTT
AACCAACAACACGACCAGAAGCAAATGATATCGTTTAGTCCTCAACAGCCGCAACAGCAG
TATATGTTCAAGTACTGGAGCGACACGTTGAATCTAAGTCCAAGAGGAAGGAGAATGATG
ATGATGAACCAAGAAAGTATTGTTCAGCCGTACAGCGCAACCAAGCTTTACAGAGGAGTG
AGACAACGTCAATGGGGGAAGTGGGTCGCAGAGATACGCAAGCCGAAGAGCAGATCACGT
CTCTGGCTTGGTACTTTTGATACAGCCGAAGAAGCTGCCATGGCCTATGACC

QA 1 532 1 532
DS 

RD RS1GA90JQ 678 0 0
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GATACGCAAGCCGAAGAGCAGATCACGTCTCTGGCTTGGTACTTTTGATACAGCCGAAGA
AGCTGCCATGGCCTATGACCGTCAAGCTTTTAAATTGAGGGGTCATAATGCAACACTTAA
TTTTCCGGAGCGTTTTGTGAATAAGGAAGTTGAGCTTCAAGATTCAACTTGTGAGTCAAG
TTCGTTGGATCAGAAACAAGCCGAAACGACACAGCCAAACGAGGCTAACTTGGAGAGCAA
GGAAGTATCGCTGAGTAGTGATGGTGGGTTAGAGGGAGGGATGGCTGAAGCGTGGTTCAA
TGCGGTTACATCGGGATGGGATCCTGAGAGTCCTCTTTGGGATGATTTGGATAGTTCTCA
GTTTTTACACAGCTCATCTTCTTGTCCCATGAAGCCCTTCTTTTGAAAAGGGGCATAACA
ATTTAGGTTATAGTTTAGGGTATTGCTCACTATCATTTGGATGGAGACAGTTTTTGTGAT
CTCCCATTCCATACATCAGTATCATTGTTCATCATTTATATGTACGTGTGTGTGCTATTG
ATTTTCCTACATATATAGATGTCTCTTTTGTTCCTTGACCTTTTTTTTTGTTTTTGTTTC
CTGGCCTTGAACAAGTTT

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 2

CO CL4588Contig1 566 2 4 U
GGAAATAAAAAAAAATGAATAATCTCACTATTTGTATATTAGTAATTGTTATGTGTTTAA
GTTCGAAAACAATTTCCGGGTGCAACCGGGTGGAGTTCAAAAACGAACTTACGCCTCCTC
GTAATTTCCAACTCAACTGCACATCGAACAGAAAGGAAACAATAAATCTTCAAGATATAA
AACCCAATGGTATATACGCGATTGATCCGGTTAAGGAGACAGGACGTAAAAGAATAGTAT
GGCGTTGTTATTTAAGGGATGGCCCTCACTTTATTTATATAACGAGAGCATACAGAGGAG
CCGCCAGAGCTCGATGCAGACAGATACGCGCATATATGGCTAAATCTGATGCCACTTACT
TAGTGAGAAATAATAAACCGACCGACCAAAAATTTGTTTAGATGTTGGCACGTTCCTAAA
TAAGTCCTTTTTTCAAAATCGGGGTTATAATATAAAAAGAGAATAGTAAAGTATTGTATC
AATCTTCTAGAAAAGAATAATAAAGTATGAGTTTATTTGATATATGTATTGTATCCATCT
TTCAAATTATATCGCATTGCTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1BQ19TF U 1
AF RS1EQ63TF U 17
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GTTCGAAAACAATTTCCGGGTGCAACCGGGTGGAGTTCAAAAACGAACTTACGCCTCCTC
GTAATTTCCAACTCAACTGCACATCGAACAGAAAGGAAACAGTAAATCTTCAAGATATAA
AACCCAATGGTATATACGCGATTGATCCGGTTAAGGAGACAGGACGTAAAAGAATAGTAT
GGCGTTGTTATTTAAGGGATGGCCCTCACTTTATTTATATAACGAGAGCATACAGAGGAG
CCGCCAGAGCTCGATGCAGACAGATACGCGCATATATGGCTAAATCTGATGCCACTTACT
TAGTGAGAAATAATAAACCGACCGACCAAAAATTTGTTTAGATGTTGGCACGTTCCTAAA
TAAGTCCTTTTTTCAAAATCGGGGTTATAATATAAAAAGAGAATAGTAAAGTATTGTATC
AATCTTCTAGAAAAGAATAATAAAGTATGAGTTTATTTGATATATGTATTGTATCCATCT
TTCAAATT

QA 1 548 1 548
DS 

RD RS1EQ63TF 550 0 0
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CGGGTGCAACCGGGTGGAGTTCAAAAACGAACTTACGCCTCCTCGTAATTTCCAACTCAA
CTGCACATCGAACAGAAAGGAAACAATAAATCTTCAAGATATAAAACCCAATGGTATATA
CGCGATTGATCCGGTTAAGGAGACAGGACGTAAAAGAATAGTATGGCGTTGTTATTTAAG
GGATGGCCCTCACTTTATTTATATAGCGAGAGCATACAGAGGAGCCGCCAGAGCTCGATG
CAGACAGATACGCGCATATATGGTTAAATCTGATGCCACTTACTTAGTGAGAAATAATAA
ACCGACCGACCAAAAATTTGTTTGGATGTTGGCACGTTCCTAAATAAGTCCTTTTTTCAA
AATCGGGGTTATAATATAAAAAGAGAATAGTAAAGTATTGTATCAATCTTCTAGAAAAGA
ATAATAAAGTATGAGTTTATTTGATATATGTATTGTATCCATCTTTCAAATTATATCGCA
TTGCTTTTCC

QA 1 550 1 550
DS 



AS 1 2

CO CL4589Contig1 722 2 1 U
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GATACTGATGGAGTTGGTGGTGTGCCGAATCGCTTTCTTGGAATAACACCTGCTTATCTA
TCATATGTCCAGCTCCAAATTCTATGTCCATGGATATGGCTGACTACCAAATGTTTCTTG
CT


BQ
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AF RS1B843TF U 1
AF RS1B111TF U 1
BS 1 722 RS1B111TF

RD RS1B843TF 520 0 0
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CCAATGGTGAAGGCACTGCAAGGCGCGGCTCAGAATCTACCGGCGGATGTGAACCACCTG
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GTAGCTAACCATGGAGGTACTCGGGATGTTCAGGGTCTTTACCCTCAACTTGGCTTGAAG
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AAACTGAGGCTACCTCTTATTTCAGATGATGGTGAAATCCACGAGGAAGCGATCGAAAAG
TGGAGCATGCTATCAAGAAGCTCTCTTGATAGTGCAACCA

QA 1 520 1 520
DS 

RD RS1B111TF 722 0 0
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CCAATGGTGAAGGCACTGCAAGGCGCGGCTCAGAATCTACCGGCGGATGTGAACCACCTG
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AAACTGAGGCTACCTCTTATTTCAGATGATGGTGAAATCCACGAGGAAGAGATCGAAAAG
TGGAGCATGCTATCAAGAAGCTCTCTTGATAGTGCAACCACGAGTTTTACAATCAGCTCT
GCTTCCAACTCGGTCAACTATGCGAATAGCTCTGCGAACAGCGTCGCTTTCGGTGCTGCT
GATACTGATGGAGTTGGTGGTGTGCCGAATCGCTTTCTTGGAATAACACCTGCTTATCTA
TCATATGTCCAGCTCCAAATTCTATGTCCATGGATATGGCTGACTACCAAATGTTTCTTG
CT

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

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TAAGAGACAAGTAGAAGAGAGACTACCAAAGATAACAGCAGACATGTCTAAAACAATAAA
AGGGGCATTTGACTTCTTTGGAATCAACCACTACACGACGTTATACGCGAGGAACGACAG
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CCCATGGGGAATCAGGAAACTAGCAATGTATCTCAAAGACGTCTACGGAAACCCACCTGT
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ATTACAAGATGACAAGAGGATTAGCTTCCACAGAGATTACCTCTCAAACTTATCAGCCGC
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GGAGTGGAACTCTGGTTACACGGTTCGGTTCGGGATATACTATGTGGATTATAAGAACAA
CTTCACAAAGGTTCCGAAAGCCTCTGCTCGATGGTTTCGAACGTTGCTTGATTCTGAACG
TTCTGATAAGCTTCTGCGGGAGAAATGAGATGTCGAATTTATACGTACTGTTGTTCATAC
GAAAAAAAAAAAAGCTCATTTTTTTTTACAGGATTTGTTAACAATTGTGATACGATTCAA
GCAGAAATATAGCGGAATCAAAATTAATTGATTAAAAAAATTAAAATCCTATTTTTATTT
TGAATTTAAAGCAAAATGTGTTGAATTTATACAAGTGAATGATGGTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BO95TF U 1
AF RS1BO95JQ C 135
BS 1 682 RS1BO95TF
BS 683 887 RS1BO95JQ

RD RS1BO95TF 682 0 0
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TAAGAGACAAGTAGAAGAGAGACTACCAAAGATAACAGCAGACATGTCTAAAACAATAAA
AGGGGCATTTGACTTCTTTGGAATCAACCACTACACGACGTTATACGCGAGGAACGACAG
AACAAGGATAAGAAAACTGATTCTACAAGATGCTTCTTCTGATGCAGCCGTTATCACAAG
CTCTTTTCGAGGAGGAGTGCCTATAGGAGAAAAGGCAGGATCAAGCTGGCTACACATAGT
CCCATGGGGAATCAGGAAACTAGCAATGTATCTCAAAGACGTCTACGGAAACCCACCTGT
ATTCATCACAGAAAACGGAATGGATGAGAAGAACAACCCATTCATAGACATGGAGAAAGC
ATTACAAGATGACAAGAGGATTAGCTTCCACAGAGATTACCTCTCAAACTTATCAGCCGC
CATTAGGAAGGATGGTTGTGATGTGAGAGGATACTTCGTGTGGTCATTGCTAGACAACTG
GGAGTGGAACTCTGGTTACACGGTTCGGTTCGGGATATACTATGTGGATTATAAGAACAA
CTTCACAAAGGTTCCGAAAGCCTCTGCTCGATGGTTTCGAACGTTGCTTGATTCTGAACG
TTCTGATAAGCTTCTGCGGGAG

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1BO95JQ 753 0 0
TCTTTGGAATCAACCACTACACGACGTTATACGCGAGGAACGACAGAACAAGGATAAGAA
AACTGATTCTACAAGATGCTTCTTCTGATGCAGCCGTTATCACAAGCTCTTTTCGAGGAG
GAGTGCCTATAGGAGAAAAGGCAGGATCAAGCTGGCTACACATAGTCCCATGGGGAATCA
GGAAACTAGCAATGTATTTCAAAGACGTTTACGGAAACCCACCTGTATTCATCACAGAAA
ACGGAATGGATGAGAAGAACAACCCATTCATAGACATGGAGAAAGCATTACAAGATGACA
AGAGGATTAGCTTCCACAGAGATTACCTTTCAAACTTATCAGCCGCCATTAGGAAGGATG
GTTGTGATGTGAGAGGATACTTCGTGTGGTCATTGCTAGACAACTGGGAGTGGAACTCTG
GTTACACGGTTCGGTTCGGGATATACTATGTGGATTATAAGAACAACTTCACAAGGGTTC
CGAAAGCCTTTGCTCGATGGTTTCGAACGTTGCTTGATTTTGAACGTTTTGATAAGCTTT
TGCGGGAGAAATGAGATGTCGAATTTATACGTACTGTTGTTCATACGAAAAAAAAAAAAG
CTCATTTTTTTTTACAGGATTTGTTAACAATTGTGATACGATTCAAGCAGAAATATAGCG
GAATCAAAATTAATTGATTAAAAAAATTAAAATCCTATTTTTATTTTGAATTTAAAGCAA
AATGTGTTGAATTTATACAAGTGAATGATGGTG

QA 1 753 1 753
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL4593Contig1 944 2 2 U
GGTGCAAACACTAAGCTCAATACGGCACTTAAACGTGGTGAAACTCTATTGTAGCATCAC
TAGCGATGATGACTCGAGCTTGCTGGTGTACGAGTACTTGCCTAAGGGGAGCTTATGGGA
CATGCTTCACTCGTGTGAGAAGTCGAATCTCGGTTGGGAAACGAGGTATGATATTGCTCT
TGGTGCAGCGAAAGGGCTGGAGTATTTGCATCATGGATACGAGAGACCGGTGATTCACCG
TGATGTTAAGTCAAGTAACATATTGCTAGATGAGTCATTCAAGCCTAGGATTGCTGACTT
CGGTCTTGCCAAGATTCTTCAGGCTAAGAATGGTGGTCTAGACTCAACTCATGTCGTTGC
GGGGACATACGGTTACATAGCTCCAGAGTATGGATACTCGTCGAAAGTGAATGAGAAATG
CGATGTGTATAGCTTTGGAGTTGTGTTAATGGAGCTAGTCACGGGGAAGAAACCGATAGA
GGCGGAGTTTGGAGAGAGCAAAGACATAGTGAATTGGGTTAGTAACAATCTGAATAGCAA
AGAGAGTGTTATGGAAGTTGTGGACAAGAGCATAGGAGAAATGTATAGAGAAGACGCGGT
CAAGATGCTGAGGGTGGCAATCCTCTGCACCGCAAGGCAACCTGGACGAAGGCCTACGAT
GAGGAGTGTGGTTCAGATGATCGAGGAGGCGGAACCTTGTAGATTGATGGGCATTGTGAT
TAGTAAAGAGGTGATGTGAAGATCAGAGAAATAAGTTGATGAAGGACCAAGTCTTTCTCA
CTCTTTTGGGTCAGTATGAAACTTGGAGAAAGAGGGCTAATGTGGATCATCTGAATTTGA
TACCTTAGGTAATGGAGAATGCGTTTCTAGTCCTCGTTATGAAACCTTAGGTAATGTAAT
GATATCTGCTGTAAACTGTTTCTTGTAATGATAGAATTTCTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FW11TF U 1
AF RS1FW11JQ C 129
BS 1 647 RS1FW11TF
BS 648 944 RS1FW11JQ

RD RS1FW11TF 647 0 0
GGTGCAAACACTAAGCTCAATACGGCACTTAAACGTGGTGAAACTCTATTGTAGCATCAC
TAGCGATGATGACTCGAGCTTGCTGGTGTACGAGTACTTGCCTAAGGGGAGCTTATGGGA
CATGCTTCACTCGTGTGAGAAGTCGAATCTCGGTTGGGAAACGAGGTATGATATTGCTCT
TGGTGCAGCGAAAGGGCTGGAGTATTTGCATCATGGATACGAGAGACCGGTGATTCACCG
TGATGTTAAGTCAAGTAACATATTGCTAGATGAGTCATTCAAGCCTAGGATTGCTGACTT
CGGTCTTGCCAAGATTCTTCAGGCTAAGAATGGTGGTCTAGACTCAACTCATGTCGTTGC
GGGGACATACGGTTACATAGCTCCAGAGTATGGATACTCGTCGAAAGTGAATGAGAAATG
CGATGTGTATAGCTTTGGAGTTGTGTTAATGGAGCTAGTCACGGGGAAGAAACCGATAGA
GGCGGAGTTTGGAGAGAGCAAAGACATAGTGAATTGGGTTAGTAACAATCTGAATAGCAA
AGAGAGTGTTATGGAAGTTGTGGACAAGAGCATAGGAGAAATGTATAGAGAAGACGCGGT
CAAGATGCTGAGGGTGGCAATCCTCTGCACCGCAAGGCAACCTGGAC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RS1FW11JQ 816 0 0
ACTCGTGTGAGAAGTCGAATCTCGGTTGGGAAACGAGGTATGATATTGCTCTTGGTGCAG
CGAAAGGGCTGGAGTATTTGCATCATGGATACGAGAGACCGGTGATTCACCGTGATGTTA
AGTCAAGTAACATATTGCTAGATGAGTCATTCAAGCCTAGGATTGCTGACTTCGGTCTTG
CCAAGATTCTTCAGGCTAAGAATGGTGGTCTAGACTCAACTCATGTCGTTGCGGGGACAT
ACGGTTACATAGCTCCAGAGTATGGATACTCGTCGAAAGTGAATGAGAAATGCGATGTGT
ATAGCTTTGGAGTTGTGTTAATGGAGCTAGTCACGGGGAAGAAACCGATAGAGGCGGAGT
TTGGAGAGAGCAAAGACATAGTGAATTGGGTTAGTAACAATCTGAATAGCAAAGAGAGTG
TTATGGAAGTTGTGGACAAGAGCATAGGAGAAATGTATAGAGAAGACGCGGTCAAGATGC
TGAGGGTGGCAATCCTCTGCACCGCAAGGCAACCTGGACGAAGGCCTACGATGAGGAGTG
TGGTTCAGATGATCGAGGAGGCGGAACCTTGTAGATTGATGGGCATTGTGATTAGTAAAG
AGGTGATGTGAAGATCAGAGAAATAAGTTGATGAAGGACCAAGTCTTTCTCACTCTTTTG
GGTCAGTATGAAACTTGGAGAAAGAGGGCTAATGTGGATCATCTGAATTTGATACCTTAG
GTAATGGAGAATGCGTTTCTAGTCCTCGTTATGAAACCTTAGGTAATGTAATGATATCTG
CTGTAAACTGTTTCTTGTAATGATAGAATTTCTGTT

QA 1 816 1 816
DS 



AS 1 2

CO CL4594Contig1 575 2 1 U
GGGCCAAAAGAACAAGATCACGATCACAAACGACAAGGGTCGCTTGTCTAAGGACGAGAT
CGAGAAGATGGTTCAAGAAGCTGAGAAGTACAAGTCTGAGGATGAGGAGCACAAGAAGAA
GGTGGAAGCCAAGAATGCTCTTGAGAACTACGCTTACAACATGAGAAACACCATCCGCGA
TGACAAGATCGGTGAGAAGCTTGCTGCTGCAGACAAGAAGAAGATTGAGGATTCGGTTGA
GGAGGCGATCAACTGGCTTGATGGTAACCAGACGGCTGAAGCAGACGAGTTTGAAGACAA
GATGAAAGAGTTGGAGAGTGTGTGCAACCCCATCATTGCTAAGATGTATCAAGGAGCTGG
TGGTGAAGCAGGTGGTCCTGCTGATGATGAAGCTCCTCCTGCTGCTGGAGGTGCCGGCCC
CAAGATTGAAGAAGTCGACTAAACTGGTTCTTTTAGAACTGTTTTCCCTTATCAATTTTT
ATTGTTGTTTGGTTTAGTGTTTTGCTCTTTATTTTACGTTATGTACTCTTTTTCTTCTGT
GGACCTTAATGCGAATTTAGTCGTGGTTTCGAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1GO74TF U 1
AF RS1GO74JQ C 172
BS 1 575 RS1GO74TF

RD RS1GO74TF 575 0 0
GGGCCAAAAGAACAAGATCACGATCACAAACGACAAGGGTCGCTTGTCTAAGGACGAGAT
CGAGAAGATGGTTCAAGAAGCTGAGAAGTACAAGTCTGAGGATGAGGAGCACAAGAAGAA
GGTGGAAGCCAAGAATGCTCTTGAGAACTACGCTTACAACATGAGAAACACCATCCGCGA
TGACAAGATCGGTGAGAAGCTTGCTGCTGCAGACAAGAAGAAGATTGAGGATTCGGTTGA
GGAGGCGATCAACTGGCTTGATGGTAACCAGACGGCTGAAGCAGACGAGTTTGAAGACAA
GATGAAAGAGTTGGAGAGTGTGTGCAACCCCATCATTGCTAAGATGTATCAAGGAGCTGG
TGGTGAAGCAGGTGGTCCTGCTGATGATGAAGCTCCTCCTGCTGCTGGAGGTGCCGGCCC
CAAGATTGAAGAAGTCGACTAAACTGGTTCTTTTAGAACTGTTTTCCCTTATCAATTTTT
ATTGTTGTTTGGTTTAGTGTTTTGCTCTTTATTTTACGTTATGTACTCTTTTTCTTCTGT
GGACCTTAATGCGAATTTAGTCGTGGTTTCGAACT

QA 1 575 1 575
DS 

RD RS1GO74JQ 404 0 0
CATCCGCGATGACAAGATCGGTGAGAAGCTTGCTGCTGCAGACAAGAAGAAGATTGAGGA
TTCGGTTGAGGAGGCGATCAACTGGCTTGATGGTAACCAGACGGCTGAAGCAGACGAGTT
TGAAGACAAGATGAAAGAGTTGGAGAGTGTGTGCAACCCCATCATTGCTAAGATGTATCA
AGGAGCTGGTGGTGAAGCAGGTGGTCCTGCTGATGATGAAGCTCCTCCTGCTGCTGGAGG
TGCCGGCCCCAAGATTGAAGAAGTCGACTAAACTGGTTCTTTTAGAACTGTTTTCCCTTA
TCAATTTTTATTGTTGTTTGGTTTAGTGTTTTGCTCTTTATTTTACGTTATGTACTCTTT
TTCTTCTGTGGACCTTAATGCGAATTTAGTCGTGGTTTCGAACT

QA 1 404 1 404
DS 



AS 1 2

CO CL4595Contig1 1062 2 4 U
GGGTCCTCTTCCAATTTGTATAACCTTGAGCACCTTCCCGAGACTTTCACCTCTTTCTGC
TCTCATGGATTCTTCGAATCTCGGTTCTTCCAGCAAACCGGCATTCTCTTCCTTCTCCCA
ATCCAGCAGAAGCGGCGGTATAGGAAGAGGAAACGAGAGAGATAATGATCGTCGGAGACC
TCAGGGTCGTGGCGACGGCAGAGGAGGAGGAGGAGGCAAAGATAAAATCGATGCACTTGG
AAGACTCTTGACGAGAATCTTGCGACATATGGCTACTGAGCTGAGACTGAACATGAGAGG
CGATGGTTTTGTTAAAGTCGAAGACTTGCTTCAGCTGAATCTGAAAACATCCGCAAACAT
TCAGTTGAAGTCTCATACCATTGATGAGATCAGAGAGGCAGTGAGAAGGGATAATAAACA
ACGTTTTAGCGTCGTTGAAGAGAATGGAGAGCTCTTTATTCGCGCTAACCAAGGCCACTC
TATCACGACGGTTGAATCTGAAAAGTTACTTAAACCAATACTGTCACCGGAAGAAGCTCC
AGTGTGTGTGCATGGAACTTATAGGAAGAATTTGGAATCCATCTTGGCATCGGGGTTAAA
GCGTATGGATAGACTCCATGTTCACTTTTCTTGTGGCTTACCTACAGATGGTGAAGTGAT
AAGTGGCATGAGAAGGAATGTTAATGTCTTGATCTTCCTTGACATCAAGAAAGCTCTTGA
AGATGGGATTGCATTCTACATTTCAGACAACAAGGTGATTTTGACTGAAGGTGTTGATGG
TGTAGTGCCTGTTGAGTATTTCCAAAAGATCGAGTCTTGGCCTAGTCGGCAACCAATTCC
TTTTTGATTTTTTATTATGGACGACAACAGTGACTTATGAGATGTACAATTATCACCACT
TAATCTCGTTTTTGCAATTGTTTTCTTTTTTTATAAATCGATCATGTTTTTATCTCTTCT
TTTAACCTGTCTCATCTGTTTGATACATCAACATTTGATCAATCATTGCGAGTGCAACCC
ATGTATGCAGAAACTTTGTAACTAATGAATATTCTATCTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FK86TF U 1
AF RS1FK86JQ C 219
BS 1 677 RS1FK86TF
BS 678 678 RS1FK86JQ
BS 679 749 RS1FK86TF
BS 750 1062 RS1FK86JQ

RD RS1FK86TF 749 0 0
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TCTCATGGATTCTTCGAATCTCGGTTCTTCCAGCAAACCGGCATTCTCTTCCTTCTCCCA
ATCCAGCAGAAGCGGCGGTATAGGAAGAGGAAACGAGAGAGATAATGATCGTCGGAGACC
TCAGGGTCGTGGCGACGGCAGAGGAGGAGGAGGAGGCAAAGATAAAATCGATGCACTTGG
AAGACTCTTGACGAGAATCTTGCGACATATGGCTACTGAGCTGAGACTGAACATGAGAGG
CGATGGTTTTGTTAAAGTCGAAGACTTGCTTCAGCTGAATCTGAAAACATCCGCAAACAT
TCAGTTGAAGTCTCATACCATTGATGAGATCAGAGAGGCAGTGAGAAGGGATAATAAACA
ACGTTTTAGCGTCGTTGAAGAGAATGGAGAGCTCTTTATTCGCGCTAACCAAGGCCACTC
TATCACGACGGTTGAATCTGAAAAGTTACTTAAACCAATACTGTCACCGGAAGAAGCTCC
AGTGTGTGTGCATGGAACTTATAGGAAGAATTTGGAATCCATCTTGGCATCGGGGTTAAA
GCGTATGGATAGACTCCATGTTCACTTTTCTTGTGGCTTACCTACAGATGGTGAAGTGAT
AAGTGGCATGAGAAGGA*TGTTAATGTCTTGATCTTCCTTGACATCAAGAAAGCTCTTGA
AGATGGGATTGCATTCTACATTTCAGACA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RS1FK86JQ 844 0 0
AAAGAT
AAATCGATGCACTTGGAAGACTCTTGACGAGAATCTTGCGACATATGGCTACTGAGCTGA
GACTGAACATGAGAGGCGATGGTTTTGTTAAAGTCGAAGACTTGCTTCAGCTGAATCTGA
AAACATCCGCAAACATTCAGTTGAAGTCTCATACCATTGATGAGATCAGAGAGGCAGTGA
GAAGGGATAATAAACAACGTTTTAGCGTCGTTGAAGAGAATGGAGAGCTCTTTATTCGCG
CTAACCAAGGCCACTCTATCACGACGGTTGAATCTGAAAAGTTACTTAAACCAATACTGT
CACCGGAAGAAGCTCCAGTGTGTGTGCATGGAACTTATAGGAAGAATTTGGAATCCATCT
TGGCATCGGGGTTAAAGCGTATGGATAGACTCCATGTTCACTTTTCTTGTGGCTTACCTA
CAGATGGTGAAGTGATAAGTGGCATGAGAAGGAATGTTAATGTCTTGATCTTCCTTGACA
TCAAGAAAGCTCTTGAAGATGGGATTGCATTTTACATTTCAGACAACAAGGTGATTTTGA
CTGAAGGTGTTGATGGTGTAGTGCCTGTTGAGTATTTCCAAAAGATCGAGTCTTGGCCTA
GTCGGCAACCAATTCCTTTTTGATTTTTTATTATGGACGACAACAGTGACTTATGAGATG
TACAATTATCACCACTTAATCTCGTTTTTGCAATTGTTTTCTTTTTTTATAAATCGATCA
TGTTTTTATCTCTTCTTTTAACCTGTCTCATCTGTTTGATACATCAACATTTGATCAATC
ATTGCGAGTGCAACCCATGTATGCAGAAACTTTGTAACTAATGAATATTCTATCTGTG

QA 7 844 7 844
DS 



AS 1 2

CO CL4596Contig1 531 2 1 U
GGGACGGCAAACCGGAGTAAAAAAAAACACAAAGCCAATGTCGAAATCCGGCGGAAACCA
ACCCGTAGATCGATACCTAAGACGCCAAGTTCTCGGAGAAGGAACATACGGTGTCGTTTA
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CCACCCCCACATCGTCGAGCTCATCGACGCGTTCCCACACGACGGGAGCTTGCATCTCGT
GTTCGAGTATATGCAGACGGATTTGGAAGCTGTGATTCGTGACCGTAACATCTTCCTTTC
TCCTGGTGATATCAAGTCTTATATGTTGATGACCTTCAAAGGTTTAGCTTACTGTCACAA
GAAGTGGGTTCTGCACAGGGATATGAAGCCTAATAATCTACTGATTGGAGAGAATGGTCT
GTTGAAGTTGGCTGATTTTGGCTTGGCGAGAGTCTTTGGGAGTCCCAATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RS1CT71TF U 1
AF RS1CU86TF U 7
BS 1 531 RS1CT71TF

RD RS1CT71TF 531 0 0
GGGACGGCAAACCGGAGTAAAAAAAAACACAAAGCCAATGTCGAAATCCGGCGGAAACCA
ACCCGTAGATCGATACCTAAGACGCCAAGTTCTCGGAGAAGGAACATACGGTGTCGTTTA
CAAAGCCACCGACACCAAGACTGGTAAGACAGTAGCAGTGAAGAAGATTAGGTTAGGAAA
CCAGAAAGAAGGAGTCAATTTCACGGCCCTCAGGGAGATCAAGCTCTTAAAAGAGCTGAA
CCACCCCCACATCGTCGAGCTCATCGACGCGTTCCCACACGACGGGAGCTTGCATCTCGT
GTTCGAGTATATGCAGACGGATTTGGAAGCTGTGATTCGTGACCGTAACATCTTCCTTTC
TCCTGGTGATATCAAGTCTTATATGTTGATGACCTTCAAAGGTTTAGCTTACTGTCACAA
GAAGTGGGTTCTGCACAGGGATATGAAGCCTAATAATCTACTGATTGGAGAGAATGGTCT
GTTGAAGTTGGCTGATTTTGGCTTGGCGAGAGTCTTTGGGAGTCCCAATCG

QA 1 531 1 531
DS 

RD RS1CU86TF 521 0 0
GG
AAACCGGAGTAAAAAAAAACACAAAGCCAATGTCGAAATCCGGCGGAAACCAACCCGTAG
ATCGATACCTAAGACGCCAAGTTCTCGGAGAAGGAACATACGGTGTCGTTTACAAAGCCA
CCGACACCAAGACTGGTAAGACAGTAGCAGTGAAGAAGATTAGGTTAGGAAACCAGAAAG
AAGGAGTCAATTTCACGGCCCTCAGGGAGATCAAGCTCTTAAAAGAGCTGAACCACCCCC
ACATCGTCGAGCTCATCGACGCGTTCCCACACGACGGGAGCTTGCATCTCGTGTTCGAGT
ATATGCAGACGGATTTGGAAGCTGTGATTCGTGACCGTAACATCTTCCTTTCTCCTGGTG
ATATCAAGTCTTATATGTTGATGACCTTCAAAGGTTTAGCTTACTGTCACAAGAAGTGGG
TTCTGCACAGGGATATGAAGCCTAATAATCTACTGATTGGAGAGAATGGTCTGTTGAAGT
TGGCTGATTTTGGCTTGGCGAGAGTCTTTGGGAGTCCCA

QA 3 521 3 521
DS 



AS 1 2

CO CL4597Contig1 776 2 10 U
GTCAGAAACTCAAGCTCAGTCCAAGAAAACTTAGGAAAAGTCAAAACAAGACACCAACTA
ATGTCAAAACGATAAAGAAACTCAGCAAAGAATCTTACTGAGTATCATCACTGTGTAAAG
ATTTGAAGCAAAAACTAATGTATTTCAGATCAAAGTTAAACTCCCTTTTGTTTATTCAAT
CTTCATCTGATCCTGACTCTTCAGAACTCGATTCCTTCTTGTTTACTTTCTTCTTTGATC
CTCTCTTCTTATCTTCCTCGTCCTCACTGTACTCACTTTCATAATCCTCCTCTTCAATCT
CATCTTCTTCTTCCTCCTCATCCTCCATACCCTCTCCTGCAGCCTCACCATCCACATCAC
GGGTTCTTTTCAAAACCTCCACTTTCAGTGACGTCTTTTGGTCACAACCAATCCAAGCAT
CGCTTAGGCAGAGGCAAGTCAAATTATAAGTACCTTCCCGAGGTGCCAAGACTCTCCCCA
TCACCAATCTTGATCCAATTTTAACCTTCTCAACAGCTTCTTCAACTGCATTGTTCTTAG
CCTCAACGCTTGCTCCTGAACTCTCCATCGTCTCACTAATAGCAATCGAAGCAGTGCTTA
TAGCTTCAGCTTCATCCATGAAACTAACCTTCTGAAAGAACCAGACATTGTTTGAATCCG
CTAGAAGAACCCAAAAGTTCTCCTCCTTGTGGAAAGGGAAGCAAGGCGAGTGAGGAACAG
CGCCTACAAGTCCATTGGGACGTTTCAGAGTGATCCAAGCTTGAACTGTCGTCACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1FY41JQ U 1
AF RS1BV44JQ U 39
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TCATAATCCTCCTCTTCAATCTCATCTTCTTCTTCCTCCTCATCCTCCATACCCTCTCCT
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TGGTCACAACCAATCCAAGCATCGCTTAGGCAGAGGCAAGTCAAATTATAAGTACCTTCC
CGAGGTGCCAAGACTCTCCCCATCACCAATCTTGATCCAATTTTAACCTTCTCAACAGCT
TCTTCAACTGCATTGTTCTTTGCCTCAACGCTTGCTCCTGAACTCTCCATCGTCTCACTA
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AACCAGACATTGTTTGAATCCGCTAGAAGAACCCAAAAGTTCTCCTCCTTGTGGAAAGGG
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GCTTGAACTGTCGTCACG

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BQ
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AF RS1FG22TF U 1
BS 1 519 RS1FG22TF

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DS 

RD RS1FG22TF 519 0 0
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AGTAAAACCTTTTCAATGCAATTGTACGGAACAGATCTCCAGACTTAGGGGTACGACAGG
AATAACGATTCAACGTTGTCATTGTAAATATCATTGCAAATGATATAAAGAAAAAATTAG
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AAAAGAATAATTACTAAAATGCCAATACTGAATTTTTGG

QA 1 519 1 519
DS 



AS 1 2

CO CL4599Contig1 699 2 1 U
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BQ
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AF RS1EO43TF U 15
AF RS1AX53TF U 1
BS 1 699 RS1AX53TF

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GG
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QA 3 147 3 147
DS 

RD RS1AX53TF 699 0 0
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TGTCAGGTCACAACAAGCTTATTTATATAATTCAAGTTGGAATCAGAAACAAGTGCATCC
TTCTTCATTTACACAGGTAGATTGAGATAAAGATGGTGATGCGAACAGTGGATCTACGAT
CAGACACCGTGACTAGACCTACCGACGCGATGCGTGAAGCAATGGGAAGCGCAGAGGTTG
ACGATGACGTCCTCGGGTACGACCCAACGGCTCGACGTCTTGAAGAGGAGATGGCCAAAA
TGATGGGGAAAGAAGCGGCTCTGTTCGTGCCATCTGGTACAATGGGGAACCTCATATGCG
TTATGGTTCACTGCGACGTGAGAGGCAGCGAGGTGATTCTTGGCGACAACTGTCACATCC
ATGTTTACGAGAATGGAGGTATATCAACAATAGGAGGCGTGCATCCCAAGACAATCAAGA
ATGAAGAAGACGGTACAATGACTTGGGGGCTATAGAATCAGCCATTAGAGACCCTAAAGG
AAGCACGTTTTATCCATCAACGAGATTGATTTGCTTGGAGAACACACACGCCAACTCTGG
GTGGGAGATGCTTGAGCGTGGATTACACAGATAGAGTTGGAGAGATTGCCAAGAGACATG
GATTAAAGCTTCATATCGATGGAGCCCGCCTGTTTAATG

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 2

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AGAAATTTATGTTGTCTTTTGATGTAAAATAGTTTTCTTCGATCAATAGATCGAGTTTGT
TGTTTCCCTTGGGGATTATATATTTCGCTTGGCGAATCTTTTGTGGTGTTTTTTCATTCT
CAAATCGAATCTTTTGCTTGTGCTTAATGTTTCTTCTCGTTTGAAGAAAAGTTCAGAATC
CTTGAGGTTTGGATTTTCACTGGTTATGCTCAATCTTTGATTTAAGAGAGTTAATCTTCA
CTTAACCAATTAGATTTCAGATTAGATGAGTACAAGTTTCTCTGAAGATCGAAGATTAAG
AAGATTGGATTGTACGATGGATTTTGTAGAACGGGAAAAGCAGAGTTGGGGCCTATTCAA
GGCGTCTCAACAAATTCCTTGCTCTCTAGATCCGACGGCGAATTCTGGATTCAAAATCTG
GTGATTATTCAAGCTTTCACAGTTGATTCCGGCAACAAACCGCAAAAGAAGCATAAAGGA
GTACAAGATTTAGGAGTCGTTGAATCTCGCGGTGGTTAATCTGAAGAAGCTTCACCGGTG
GTAGCAGTTTCACTGGCGGTGGAATGGAGATGACAAACTCATAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1GN36TF U 25
AF RS1E839TF U 1
BS 1 173 RS1E839TF
BS 174 174 RS1GN36TF
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RD RS1GN36TF 525 0 0
G
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AAAATAGTTTTCTTCGATCAATAGATCGAGTTTGTTGTTTCCCTTGGGGATTATATATTT
CGCTTGGCGAATCTTTTGTGGTGTTTTTTCATTCTCAAATCGAATCTTTTGCTTGTGCTT
AATGTTTCTTCTCGTTTGAAGAAAAGTTCAGAATCCTTGAGGTTTGGATTTTCACTGGTT
ATGCTCAATCTTTGATTTAAGAGAGTTAATCTTCACTTAACCAATTAGATTTCAGATTAG
ATGAGTACAAGTTTCTCTGAAGATCGAAGATTAAGAAGATTGGATTGTACGATGGATTTT
GTAGAACGGGAAAAGCAGAGTTGGGGCCTATTCAAGGCGTCTCAACAAATTCCTTGCTCT
CTAGATCCGACGGCGAATTCTGGATTCAAAATCTGGTGATTATTCAAGCTTTCACAGTTG
ATTCCGGCAACAAACCGCAAAAGAAGCATAAAGGAGTACAAGAT

QA 2 525 2 525
DS 

RD RS1E839TF 646 0 0
GGGGAGAGAGAGAATTCTCTCTTCTTCCCCTTTTCACTCATACAAATCTTGAGAAGGGGA
AGAAATTTATGTTGTCTTTTGATGTAAAATAGTTTTCTTCGATCAATAGATCGAGTTTGT
TGTTTCCCTTGGGGATTATATATTTCGCTTGGCGAATCTTTTGTGGTGTTTTT*CATTCT
CAAATCGAATCTTTTGCTTGTGCTTAATGTTTCTTCTCGTTTGAAGAAAAGTTCAGAATC
CTTGAGGTTTGGATTTTCACTGGTTATGCTCAATCTTTGATTTAAGAGAGTTAATCTTCA
CTTAACCAATTAGATTTCAGATTAGATGAGTACAAGTTTCTCTGAAGATCGAAGATTAAG
AAGATTGGATTGTACGATGGATTTTGTAGAACGGGAAAAGCAGAGTTGGGGCCTATTCAA
GGCGTCTCAACAAATTCCTTGCTCTCTAGATCCGACGGCGAATTCTGGATTCAAAATCTG
GTGATTATTCAAGCTTTCACAGTTGATTCCGGCAACAAACCGCAAAAGAAGCATAAAGGA
GTACAAGATTTAGGAGTCGTTGAATCTCGCGGTGGTTAATCTGAAGAAGCTTCACCGGTG
GTAGCAGTTTCACTGGCGGTGGAATGGAGATGACAAACTCATAAAT

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 2

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ACATTGTACTCCCAGATTTTGGCCCGTACAAACTTGATTTTACTGCAAGTGGACGGCATA
TGCTAGCTGGTGGCCGCAAAGGACACCTTGCTCTTGTAGACATGATGAATATGAACCTAA
TTAAAGAGATCCAGGTAAGGGAAACAGTACGTGATGTTGCATTCCTCCACAATGACCAAT
TCTTTGCAGCTGCCCAGAAGAAGTATGCTTATATTTATGGGAGAGATGGAACTGAGCTCC
ATTGTTTGAAGGAACGTGGTCCAGTGGCTAGACTCAGGTTCCTAAAGAACCACTTCCTGC
TTGCATCAGTGAACAAAATCGGACAGCTGCATTACCAAGACGTGACCTACGGTGACATGG
TAGCTAGTATCCGAACAGGCAAAGGCAGAACAGATGTAATGGAAGTGAATCCTTACAACG
GTGTTGTCGCCTTGGGACATTCCGGTGGAACCGTCACAATGTGGAAACCAACTAGCCAAG
TACCTCTAGTCCAGATGCAGTGCCACCCTGGACCAGTCCCCTCTGTCGCCTTCCATCCAA
ACGGTCATCTCATGGCTACATCGGGCAAAGAGCGCAAAGTCAAGCTCTGGGATCTGCGTA
AATTCGAGGAGGTCCAAACCATTCACGGCTTCCACGCCAAGACGCTGAGTTTCAGCCAGA
AAGGTTTGCTAGCAGCTGGAACCGGATCGTTTGTTCAGGTTTTAGGAGATTCGAGCGGTG
TATACAGCAGATACATGAGCCACTCGATGGTGAAAGGCTACCAGATCGAGAAGGTTATGT
TCAGACCGTACGAGGATGTTCTCGGGATTGGCCACTCGATGGGTTGGTCTAGCGTCCTCA
TACCAGGGTCTGGAGAACCGAACTTCGATTCTTGGGTGGCTAACCCGTTTGAAACGTCGA
AACAGAGACGTGAGAAAGAAGTGCACCTGCTTCTTGATAAGCTCCCGCCTGAGACGATCA
TGCTTGATCCTTTTAAGATAGGTGCCATGAGACCTTCGAGGAGGAAGGAGAAGCCAACGA
GAGGAGAGATGGAAGCTGAGAAAGAGGTGGCGATAGAAGCAGCGAAGGGGGTTGAGATGA
AGAAGAAGACTAAAGGAAGGAACAAACCGAGTAAGAGGACTAAGGAGAAGAAGGAGATGG
TGGAGAGTGTAAAGAGGACATTCCCGGAGCTAGAGCATAGCGCTGCAGGTAAGAAGAGAA
GATTAGGCGAAGATGCTGCTGCGGCAGAGCTTCCCGCATGTCTGAAAAGGTTTGTCAGAT
AAAACTGAAAGTGACGTCTGAAGATTAGTACTGTTCTAATATTGCTTTTTTTTGTTTTTT
TTCTCTCCTAATAATGTTTTCTATTAGGAGAAACTTTACATTATACGATTTAGCAATAAA
AAAAAATTCCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AZ19TF U 1
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BS 693 1451 RS1AZ19JQ

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TCTTTGCAGCTGCCCAGAAGAAGTATGCTTATATTTATGGGAGAGATGGAACTGAGCTCC
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TTGCATCAGTGAACAAAATCGGACAGCTGCATTACCAAGACGTGACCTACGGTGACATGG
TAGCTAGTATCCGAACAGGCAAAGGCAGAACAGATGTAATGGAAGTGAATCCTTACAACG
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TACCTCTAGTCCAGATGCAGTGCCACCCTGGACCAGTCCCCTCTGTCGCCTTCCATCCAA
ACGGTCATCTCATGGCTACATCGGGCAAAGAGCGCAAAGTCAAGCTCTGGGATCTGCGTA
AATTCGAGGAGGTCCAAACCATTCACGGCTTC
AC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RS1AZ19JQ 878 0 0
CCAGT
CCCTCTGTCGC*TTCCATCCAAACGGTCATCTCATG*CTACATCGGGCAAAGAGCGCAAA
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TACCAGATCGAGAAGGTTATGTTCAGACCGTACGAGGATGTTCTCGGGATTGGCCACTCG
ATGGGTTGGTCTAGCGTCCTCATACCAGGGTCTGGAGAACCGAACTTCGATTCTTGGGTG
GCTAACCCGTTTGAAACGTCGAAACAGAGACGTGAGAAAGAAGTGCACCTGCTTCTTGAT
AAGCTCCCGCCTGAGACGATCATGCTTGATCCTTTTAAGATAGGTGCCATGAGACCTTCG
AGGAGGAAGGAGAAGCCAACGAGAGGAGAGATGGAAGCTGAGAAAGAGGTGGCGATAGAA
GCAGCGAAGGGGGTTGAGATGAAGAAGAAGACTAAAGGAAGGAACAAACCGAGTAAGAGG
ACTAAGGAGAAGAAGGAGATGGTGGAGAGTGTAAAGAGGACATTCCCGGAGCTAGAGCAT
AGCGCTGCAGGTAAGAAGAGAAGATTAGGCGAAGATGCTGCTGCGGCAGAGCTTCCCGCA
TGTCTGAAAAGGTTTGTCAGATAAAACTGAAAGTGACGTCTGAAGATTAGTACTGTTCTA
ATATTGCTTTTTTTTGTTTTTTTTCTCTCCTAATAATGTTTTCTATTAGGAGAAACTTTA
CATTATACGATTTAGCAATAAAAAAAAATTCCC

QA 6 878 6 878
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

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TTCAATCTCTGGACGAGATGCCGCCGAACGGAGATCTAGACCGTCAGATCGAACATCTGA
TGGAGTGCAAACCTTTATCGGAGGAGGACGTGAGGACGCTCTGCGATCAAGCTAAAGCGA
TCCTCGTCGAGGAATGGAACGTCCAGCCCGTGAAATGCCCCGTCACCGTCTGCGGCGATA
TCCACGGCCAGTTCTATGACCTCATCGAGCTCTTTCGAATCGGTGGTAACGCCCCCGATA
CCAACTACCTCTTCATGGGAGACTATGTAGACCGTGGTTACTACTCAGCGGAAACGGTTT
CTCTATTGGTGGCGTTGAAAGTTCGGTACAGGGATCGGATTACAATCCTGAGAGGGAACC
ACGAGAGTAGGCAGATCACCCAAGTATATGGTTTTTATGACGAGTGTTTGAGGAAGTACG
GGAATGCAAATGTCTGGAAGTTTTTCACAGACCTTTTCGATTATCTTCCTCTTACTGCCC
TTATCGAGAGTCAGGTTTTCTGTTTGCATGGAGGGCTATCACCTTCTCTGGATACACTTG
ATAATATCCGATGCTTGGATCGCATTCAGGAGGTTCCACACGAAGGACCAATGTGTGATT
TGCTATGGTCTGATCCCGATGACCGATGTGGGTGGGGAATATCTCCTCGAGGTGCTGGCT
ATACATTTGGACAGGATATCGCAACTCAGTTTAATCATAACAATGGACTCAGTCTCATAT
CAAGAGCCCATCAGCTTGTCATGGAAGGTTTTAACTGGGCTCAGGATAAGAACGTGGTGA
CGGTGTTTAGTGCACCAAACTATTGCTACCGGTGTGGAGCCATGGCAGCGATACTAGAGA
TAGGAGAGAACATGGAGCAGAACTTCCTTCAGTTTGATCCAGCTCCTCGACAAGTCGAAC
CAGATACTACCCGTAAGACCCCTGATTATTTTTGTGATTTTTATTTGTATTTTCTTTTTC
TAAGTGGAGTTCCGAGTTTCCCTCAAAAAAGAAAGAAGAAAACATCATTTTGTTGTTGTT
GATGTGATTTATGAGAACAAGAGTTTGTAGGAGAAGCGTCTATATATAGAATAGTGTCTT
CTCATTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CC76TF U 1
AF RS1CC76JQ C 412
BS 1 698 RS1CC76TF
BS 699 699 RS1CC76JQ
BS 700 711 RS1CC76TF
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BS 783 1149 RS1CC76JQ

RD RS1CC76TF 791 0 0
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TCCTCGTCGAGGAATGGAACGTCCAGCCCGTGAAATGCCCCGTCACCGTCTGCGGCGATA
TCCACGGCCAGTTCTATGACCTCATCGAGCTCTTTCGAATCGGTGGTAACGCCCCCGATA
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CTCTATTGGTGGCGTTGAAAGTTCGGTACAGGGATCGGATTACAATCCTGAGAGGGAACC
ACGAGAGTAGGCAGATCACCCAAGTATATGGTTTTTATGACGAGTGTTTGAGGAAGTACG
GGAATGCAAATGTCTGGAAGTTTTTCACAGACCTTTTCGATTATCTTCCTCTTACTGCCC
TTATCGAGAGTCAGGTTTTCTGTTTGCATGGAGGGCTATCACCTTCTCTGGATACACTTG
ATAATATCCGATGCTTGGATCGCATTCAGGAGGTTCCACACGAAGGACCAATGTGTGATT
TGCTATGGTCTGATCCCGATGACCGATGTGGGTGGGGA*TATCTCCTCGAG*TGCTGGCT
ATACATTTGGACAGGATATCGCA*CTCAGTTTA*TCATAACAATGGACTCAGTCTCATAT
CA
GAGCCATCA

QA 1 782 1 782
DS 

RD RS1CC76JQ 738 0 0
GAGGGAACCACGAGAGTAGGCAGATCACCCAAGTATATGGTTTTTATGACGAGTGTTTGA
GGAAGTACGGGAATGCAAATGTCTGGAAGTTTTTCACAGACCTTTTCGATTATCTTCCTC
TTACTGCCCTTATCGAGAGTCAGGTTTTCTGTTTGCATGGAGGGCTATCACCTTCTCTGG
ATACACTTGATAATATCCGATGCTTGGATCGCATTCAGGAGGTTCCACACGAAGGACCAA
TGTGTGATTTGCTATGGTCTGATCCCGATGACCGATGTGGGTGGGGAATATCTCCTCGAG
GTGCTGGCTATACATTTGGACAGGATATCGCAACTCAGTTTAATCATAACAATGGACTCA
GTCTCATATCAAGAGCCCATCAGCTTGTCATGGAAGGTTTTAACTGGGCTCAGGATAAGA
ACGTGGTGACGGTGTTTAGTGCACCAAACTATTGCTACCGGTGTGGAGCCATGGCAGCGA
TACTAGAGATAGGAGAGAACATGGAGCAGAACTTCCTTCAGTTTGATCCAGCTCCTCGAC
AAGTCGAACCAGATACTACCCGTAAGACCCCTGATTATTTTTGTGATTTTTATTTGTATT
TTCTTTTTCTAAGTGGAGTTCCGAGTTTCCCTCAAAAAAGAAAGAAGAAAACATCATTTT
GTTGTTGTTGATGTGATTTATGAGAACAAGAGTTTGTAGGAGAAGCGTCTATATATAGAA
TAGTGTCTTCTCATTGAC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

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AAAGAAGACAGCTGGTTTCCTGGGTATGCATGGACGATCGCAAATTGTGCAACGTGTGAA
ACCCAGCTGGGTTGGCTTTTCACAGCAACAAGCAAGAAGTTGAAGCCATCGTCTTTCTGG
GCAGTTGGTAGCTCACAGGTCGCAGATGACATGCGCTGAGAAAATAGCATTACAACAGGT
CTCACTCACGGATCAGTTCCCGCCGAATTACCCATATAAAATAAAAGGGGTTTCTTTCTA
CCTTAAACTTCTCCAACTGGCGTCTTTAGTATCCTTTATGCGTGTGTGAAATATCACAAA
ATAGTTTGTGAAAGCAGAAGCAGACTAGATATAGAGAGAGACTCTGAAGTAGTAACAACA
GCTTGAGGGGTTGATGTCTTTTTTCATCAATACATTATATATACACATGAAAACAAGATG
TGTCTGTGAAGAAAACCTACTTAGGCTATGAGTATAATGATATTGTTCGGAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CY85JQ C 1
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DS 

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TCTTTCTACCTTAAACTTCTCCAACTGGCGTCTTTAGTATCCTTTATGCGTGTGTGAAAT
ATCACAAAATAGTTTGTGAAAGCAGAAGCAGACTAGATATAGAGAGAGACTCTGAAGTAG
TAACAACAGCTTGAGGGGTTGATGTCTTTTTTCATCAATACATTATATATACACATGAAA
ACAAGATGTGTCTGTGAAGAAAACCTACTTAGGCTATGAGTATAATGATATTGTTCGGAA
TG

QA 1 302 1 302
DS 



AS 1 2

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CGTAAAACCCTAGCGTCTCTGTTTTTCAATCTCGCGTTCAAGGGGGCTGACGGCTTCTTT
TTCTGTTGGTTCCCTTCCTCCTCCGGTTCTGTGTTCGTTTTAGCCTCATACACCGACCCT
AGCAACAGTCGTTACCCCTCTTTGTCTTGGTGCTCTGGATCTCTTCCGCGTAAGACCTAA
CCGGAAGCTGTGGGTTCGTGCCTCTCTTCCCTGGAGCACAGACGAGGGCGTGACAGGTTG
TGAATCTCGGTGGCCTTGTTTTCTCTGTCTCTTGCGGCTGTCGGCGTCAGATCTGGGTCA
GATCTCTGCTCCAAGATGGGTGGTTAGCTAGGGAGCGTCGCTGCCTCTCCTCTCACCTCC
GTCTTGCCTCCCGGTGGCTCAAGGGTCGTGTAGATTTCAGGGTTCTCTAGGACCTTTCCT
CAGAAATTCAATTTCTGTGAGCGGCGGAGCAGAGGTACTCCGTTGAGAGCTCCTTCTTCT
TGTCTCGAGCTTCAGCTGCTTTGGTAAACCTTATTTGCAGCTTGTACTCTCCCTGTTGTG
TCTCTGTTGGTTGAGTGCTTAGGGTTCTCCTAATGTGCTTGCTGCTAGTCACGATGTCAG
AGATTTGTTGTTGCTGGTTCCACCTGTTGTTGAGGGGTCTATGGCTCCTCCTGTTCTCAA
TCCTTTGCCGAGTACCGAGATGTTCCTTTGGATAGCTCGATGTCTTCACTTATCTTTCGG
GTCGCGTGGCCGGATTAGAGAGTATTATTCCGCCTGCGCTTGACCTTGGTTCTCATGCGC
TTCATTGTAGGTTTTGACATCGTTGGCTGTCCAGATGTGAATCTCTCGAGTGGTTTCTTG
GTGTTTGGTTCAACGAAGTCTTCCTCAGCTTGCACCGGTTTGGTTTTGCCGTGCCTTCCG
TGTCGCAGCTTGAGAGTACCTTCGGGTTAGTTTTCGGCAATCCGACTCCTACTAACCTTC
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CTGTTGTTTGAAGCAGTATTTTAGTTTTATGTTTGTTCACTTGTGAACATGATTAGAACT
TCCCTTTGGTTCTATGGGTTTTTTTAACTTTTTTGCGACC


BQ
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BS 620 1180 RS1BC69JQ

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TTCTGTTGGTTCCCTTCCTCCTCCGGTTCTGTGTTCGTTTTAGCCTCATACACCGACCCT
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TGAATCTCGGTGGCCTTGTTTTCTCTGTCTCTTGCGGCTGTCGGCGTCAGATCTGGGTCA
GATCTCTGCTCCAAGATGGGTGGTTAGCTAGGGAGCGTCGCTGCCTCTCCTCTCACCTCC
GTCTTGCCTCCCGGTGGCTCAAGGGTCGTGTAGATTTCAGGGTTCTCTAGGACCTTTCCT
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TCTCTGTTGGTTGAGTGCT

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DS 

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TGGTGTTTGGTTCAACGAAGTCTTCCTCAGCTTGCACCGGTTTGGTTTTGCCGTGCCTTC
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TCTCCTCCTCGTCATTCCCTTGGCCAGCCTGGGTACTTCGAAGAGTGTGTGCAAGGAAAA
AGCTGTTGTTTGAAGCAGTATTTTAGTTTTATGTTTGTTCACTTGTGAACATGATTAGAA
CTTCCCTTTGGTTCTATGGGTTTTTTTAACTTTTTTGCGACC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 2

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AGGAATTGCTGCTTTGAAACAAAACTTCTTCAACAAGGGTCTTAACACCAAAGATCTTGT
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GTCAAGAAGTTTGACTCTCACTACTTTAACATTGTTGCTCAGAAGAAGGGTTTGTTCACT
TCTGACTCAACACTTCTTGATGACCCTGACACCAAAAGTTACATTGACACACAAGTTGCT
ACGGCTGGATCTTCTTTCAACAAAGATTTCTCCGAGTCAATGGTTAAACTCGGGTCTGTT
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TCATCAAGTTAATATAAGAGCTCTCTCTTTGGCTGGTTGATTCAGTAACTCTTTTTGTAT
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TGTTTTGGAATCTCATGTTTGGTTGAATATTCATCTCGTTTTAT


BQ
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BQ
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ATTTTATTTTATGATTTAGTTGAAATTTTTTTTTGTAACATTTTTCAAGTAAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F689TF U 1
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BS 725 893 RS1F689JQ

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GCTTTTTCGCCAAGAATTCCAACACTTTGACAAAAGAAAAAGATGGGTGAATAACAAGGG
GTGAATTGGAGATAGCAACAAAAGATTATGGTGTAAGAGATGAAGATAGCATCAAACACA
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GATGAGAAGGGCAAGCACAGATCCACAAATACAAAATTTTGCGGTCAATTAATCATAGTG
TTCTTGTGTTCACCAAAAATAAAGGTTCAGGGAAGAAGAGCTAAACCTGAGTAAACCGAG
ATAAGAGTAGTTGATCTTTAAAGTTGAAACTTAGTACGTTGCAAGAGTCCACTAGTAATT
TTATTGACAAGCTTATGATAAAAACGAGTAATCTATTTTGGTTAGAAGTGCTTAGTATGG
TTAAAAACATTAGAAGGTATTTTCTAATATATTCAAAATTTGAAATATTCATACAAGTCC
ACATTGTGTAATATAAAATACCGGTACATATAGTCATGGGCATTTTAACCTGGACCCGAA
GACCCGACCCGGAACCGACCCGGAAATATCTGAATCGGAACTGATCCAAAAGTTTATAAG
TATATGTTGGGACCAAAAATTTTCTAACCGAATAGCCC*GGACCCGAAATGAACCGATGC
GAAT

QA 1 724 1 724
DS 

RD RS1F689JQ 705 0 0
GAAAGTATGCCAATAATGATAGAAGCATAGATTTTGAGGAATTTCACTCAATGATGAGAA
GGGCAAGCACAGATCCACAAATACAAAATTTTGCGGTCAATTAATCATAGTGTTCTTGTG
TTCACCAAAAATAAAGGTTCAGGGAAGAAGAGCTAAACCTGAGTAAACCGAGATAAGAGT
AGTTGATCTTTAAAGTTGAAACTTAGTACGTTGCAAGAGTCCACTAGTAATTTTATTGAC
AAGCTTATGATAAAAACGAGTAATCTATTTTGGTTAGAAGTGCTTAGTATGGTTAAAAAC
ATTAGAAGGTATTTTTTAATATATTCAAAATTTGAAATATTCATACAAGTCCACATTGTG
TAATATAAAATACCGGTACATATAGTCATGGGCATTTTAACCTGGACCCGAAGACCCGAC
CCGGAACCGACCCGGAAATATTTGAATCGGAACTGATCCAAAAGTTTATAAGTATATGTT
GGGACCAAAAATTTTTTAACCGAATAGCCCCGGACCCGAAATGAACCGATGCGAATAGAC
TCGGGCCCGAAAAGAACCGACCCGAATAGACCCGACCCGACAAGAACCGATTCATACACG
ACTTAAAAACATTAATATCCAAAACTATATTTTGTTATGTTCTATTTTCTATATTTTATT
TTATGATTTAGTTGAAATTTTTTTTTGTAACATTTTTCAAGTAAT

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL4610Contig1 948 2 6 U
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CGATCTCGCCAACAACCTACTCAAAGCAAACCCTAATTCTTACGCTGTCGTGGTCAGCAC
GGAAAACATAACCCTAAACTGGTACTTCGGCAACGACCGGTCAATGCTCCTCTGCAACTG
CATCTTCCGAATGGGCGGTGCAGCGATTCTCCTCTCTAACCGCCGGCAAGACCGGTCAAA
GTCAAAGTACGAGTTAGTCAACGTCGTACGGACACATAAAGGATCAGACGACAAGAACTA
TAATTGCGTATACCAGAAGGAAGACGAGAGAGGAACGATCGGTGTCTCTTTAGCTCGGGA
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TCTTCCTTTGTCGGAACAGCTAATGTTCTTGGTTTCACTGGTCAAAAGGAAGTTGTTAAA
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TCGACTGAGGAGTTGACGGGTAACGCATGGGCTGGTTCGATTGCGGATTATCCGGTTAAG
ATTGTGCAATGATTGGTTGTACCGGATGTGTGGAGTGTAGTCATTGTTTTGTAATTGTGT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1H778TF U 1
AF RS1H778JQB C 196
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ATTGCGTTTGG

QA 1 731 1 731
DS 

RD RS1H778JQB 753 0 0
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AATGACTTTGCACCGGTTTGGTAACACTTCGAGTAGTTCGCTTTGGTATGAGATGGCTTA
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TTTTTTTTTTTTGTAAGTTGTCGATTGGATATT

QA 1 753 1 753
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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ATGAACAAAATGAAGACGGTAGACCCGCTGGTGTATGCTAAAGTAGTAGAAGAAGTCAAA
AAAAAAAAAATAGAAGCCGAAAAAGAATCTGAACTAAAAGAATTGGAGTATTAAATGTTT
GGACTATCTCCAATGATAATAATCAATATATAGCCATCCAACTCACTAAAAATAATAGAC
CAATCAGAATACAATTTAGTTAAGGGATAATTTGTCAATTTGAAAAGAAAATTAAGTGCA
GAACATTGATTTTGACATAATTCAATCCATAATAATTATGTTAAGTTTTATCCAGTACTA
TTTTTCAAGATGCCAGT


BQ
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AF RS1FV16TF U 14
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G
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ACATAATTCAATCCATAATAATTATGTT

QA 2 569 2 569
DS 

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GGTATTGCCGTCAAAGTCACCAAGGCTTTGCTCCAAGATTTTAGAGAACATGTAATCACG
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AAAAAA***ATAGAAGCCGAAAAAGAATTTGAACTAAAAGAATTGGAGTATTAAATGTTT
GGACTATTTCCAATGATAATAATCAATATATAGCCATCCAACTCACTAAAAATAATAGAC
CAATCAGAATACAATTTAGTTAAGGGATAATTTGTCAATTTGAAAAGAAAATTAAGTGCA
GAACATTGATTTTGACATAATTCAATCCATAATAATTATGTTAAGTTTTATCCAGTACTA
TTTTTCAAGATGCCAGT

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 2

CO CL4613Contig1 1463 2 6 U
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CCATTGCAAGCCAGCTTGTTAATGTGTGGTTGGAACTTTACCGGAAAGAAAAAGCTAGGG
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ATGCCAAAATGGACGAATCTGATTTCAAGAAAAAGTTTCCAGGCAACGTCTTAGGAAGAC
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CTGCCTCCTGTCTTGACCCTGACAGTTCAAGGGTTCAGGTCGATAACTGTTCACAGCGTA
GCCATTCGAATGAACTTGGGTCTCATTCAAAGTTCAGAGAATGTTCTAGAGAAAGTGGGG
CTGCGGAAACCAGTGTTTTTACCGGGGCATGGGTTGATACTGGCGGTAGTAGCGATGGTG
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TTTTCAATCGTGCCTTGCATATGAAGGATGAAGAAGGTTCGATTGCATGTTCGACGGGTC
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ATTTTGTTGCATCATTGCTTATGACCCCTTATAAAGCGAAGAAAATTGATAGAGATGTAT
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AAGCCATGGCTGTTCCCCAATTCCTTGACTCAAAGCGGAAAAACAAGATTCGTGACTTTG
TGGACAAACAAGTTGACAAGTACATTGCGATGGCTAAAGTTGCAAAACCTTGATGGCCAT
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AGATTTAGTGTTAACCCCCATTAGTCAGATTTTTTGCTTCAGGTACCTGAATACATTTCT
TGAAATTCACATATCGTTTCCAG


BQ
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AF RS1FA87TF U 1
AF RS1FA87JQ C 636
BS 1 728 RS1FA87TF
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RD RS1FA87TF 796 0 0
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GTACTTCATTGCAGCTTCCTAAGATTCCCTCGTTTCATAAATTTGCGAGGCGAGAACAGT
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AAGATTGTATGTCAGAGATAGACTCTAGGAACTGCAAAGTTCGGGACTGGTATGATTTCC
CTGCCTCCTGTCTTGACCCTGACAGTTCAAGGGTTCAGGTCGATAACTGTTCACAGCGTA
GCCATTCGAATGAACTTGGGTCTCATTCAAAGTTCAGAGAATGTTCTAGAGAAAGTGGGG
CTGCGGAAACCAGTGTTTTTACCGGGGCATGGGTTGATACTGGCGGTAGTAGCGATGGTG
TCAAGGAT*ACA*TGCTATAGATAGATGGCAATTTCAAGCTACTGCTGCTGATCCTGAAT
TTT
CATCGTGCCTTGC

QA 1 783 1 783
DS 

RD RS1FA87JQ 828 0 0
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ATGCAGCAAACAACAGACGCGGAGAAAGCCATGGCTGTTCCCCAATTCCTTGACTCAAAG
CGGAAAAACAAGATTCGTGACTTTGTGGACAAACAAGTTGACAAGTACATTGCGATGGCT
AAAGTTGCAAAACCTTGATGGCCATTGTGATCGATAGTAATGGCCAATAGTACTTGAGTT
GGTGGTATTTGCTAAAGGATGGCAAAGCCCCTTCGCATAAAACGACATATCATTGCTCAT
TTATCAAGAAGCTTTTTTCAAAGAAGCAGATGATCTCAGATGATAAATGTTTTTCAACTC
ATGCTGATTGTTTTTAGTTTTGTATAGATTTAGTGTTAACCCCCATTAGTCAGATTTTTT
GCTTCAGGTACCTGAATACATTTCTTGAAATTCACATATCGTTTCCAG

QA 1 828 1 828
DS 



AS 1 2

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GTTTCTTTGGGAGACCAAAAATGGGTGGATCTTCATCTTCATCACCAACATCTTCTTCTC
CGGCAAAGAGAGGGAAGAACAAGAATGGTTCTGACAAGCCAAAACAGCCGCAGAGAGGTC
TTGGCGTGGCACAGTTGGAGAAGATAAGATTACACAGCGAACTTAACTGCAACAGCTTCA
ATGCTTACCCTTCTTATCATCCCTCAACTTTCAGTCAGGAGGATGTGAGAATTCAAGGAG
AATATCCATCTATACCATATTCATCATCGTCGGCTCATTATGGAATTCATCCAAACATGA
TGATGAATGCAAGTATTGATCAATACGAGAGAACAACCATAAGATACATAGATGCTCAGC
CTCACATAGCACCAAGTTAGAACCCGAACTACGGTATCTTGGAGAGCCAACATTTTCTGG
AACCAAACATAACCAGACCCTTCTTACATGAGGATCAGAGACATAACTCGTTGGGATCGG
GCAATGAGAACTTCCAAACAATTGACGCAACTGAGCCAGATTTGGAGTTGAGATTGTCAC
TTTGAGTAATGAATTCATATTATTTTTAAGAGGCCATGGATTTGTTAAACTCAAAAAAAT
TAGAAAAGCAAAAAAAAAGTATAATTTAGGTCATCATTTGATTTGTGGGTATCATATTTT
GATACCATCAAGATGTTTATCTTTTCGACAAAGTATGCTTGTAAATCTACATGATGATTT
TCATATATATTAAAGTAGGTATAAAGCC


BQ
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AF RS1DY71TF U 1
AF RS1DY71JQ C 211
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TAGAAA*GCAAAAAAAA

QA 1 737 1 737
DS 

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ACGGTATCTTGGAGAGCCAACATTTTCTGGAACCAAACATAACCAGACCCTTCTTACATG
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CTGAGCCAGATTTGGAGTTGAGATTGTCACTTTGAGTAATGAATTCATATTATTTTTAAG
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AAGTATGCTTGTAAATCTACATGATGATTTTCATATATATTAAAGTAGGTATAAAGCC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1GX38TF U 1
AF RS1GX38JQ C 188
BS 1 681 RS1GX38TF
BS 682 682 RS1GX38JQ
BS 683 710 RS1GX38TF

RD RS1GX38TF 710 0 0
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TCAAGCAACTGAAGAAGGAGCACGCAACGTTGAGAAAGAAGCTTGAACAATATTTCCAGT
TGGCAAGACAGGCGGGGCCTAAGGAGATAGCACGTAGGCCCAAGTAATACAGGGACATAT
CAATGAGGAATCGTCAGCGAATTTTGTAGTAGAAAATGCTATAAATACATATATAGTTCC
TCAATGTATGTAATAAAGAAGATCTTGGATTTTTAATATTATGCATGTTAATAAACGGTC
CAAATTTCTCTCATGTTTTTT*CCTTATATGGCTAATATTCTCCTTAGAT

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DS 

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TATGTTTAGGGAATACTGCAGAGCTGGAAATGCTGAAGGATGCTTGAGGACTTTCAAGCA
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ACAGGCGGGGCCTAAGGAGATAGCACGTAGGCCCAAGTAATACAGGGACATATCAATGAG
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ATGTAATAAAGAAGATCTTGGATTTTTAATATTATGCATGTTAATAAACGGTCCAAATTT
CTCTCATGTTTTTTTCCTTATATGGCTAATATTCTCCTTAGAT

QA 1 523 1 523
DS 



AS 1 2

CO CL4616Contig1 1009 2 2 U
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AAAAACAATTAACATTTTTTAAAACAAACAAATAATATGAATATGCCATAACACGTGGTT
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CGTTTTCTCGGTGGCTGGTCGGTTTTAGTTTCCGTCGTGGCACCTGTTCCAACAAAGGTG
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GAGCTCAAGGGAGTCATGGTGAATCGCCGGTCGTTTATCCGGTGGTGGCTTGAAGTGGCT
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TGTTCTCATGGGCCGTGCTTTGTAGGCTTTAGTGTTTGTAGTTTTTGGGCTATGCCTTTT
TGTCTGTAATTTGGTGGGCTTGTCCCTTAATCTGATAAAATCTTGACGG


BQ
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AF RS1AB76TF U 1
AF RS1AB76JQ C 201
BS 1 723 RS1AB76TF
BS 724 1009 RS1AB76JQ

RD RS1AB76TF 723 0 0
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ACCACTTCCAGTCACCGGTTAGTTTTTCAACACAAACAAATAACATTTTTTGTCAAGAAA
AAAAACAATTAACATTTTTTAAAACAAACAAATAATATGAATATGCCATAACACGTGGTT
TTTTGACAAATAGAGTTTTAAGAGAGAGAAAAGAGAGAGAGAAAGGAGAGAGAAAGTACA
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CGTTTTCTCGGTGGCTGGTCGGTTTTAGTTTCCGTCGTGGCACCTGTTCCAACAAAGGTG
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TTATCTTTATTGTTCTGTGGTTGTGTGTTTTATGTTTGTAGTCTCTGGCGTGGGTGATGG
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TCG

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DS 

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AAAGAGAGAGAGAAAGGAGAGAGAAAGTACATCGCAGTGGTTCTTCTGGCCGACGGCGGT
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TTCCGTCGTGGCACCTGTTCCAACAAAGGTGGACGGTCGGTTTAAGCTTTCCGCGTCGCA
ATATCCCTTAGTCGACGGCGGCCTTGTGTTTTTATCTTTATTGTTCTGTGGTTGTGTGTT
TTATGTTTGTAGTCTCTGGCGTGGGTGATGGATTTGTAGTCGGAGGAGTACCGAAGCTCT
CCGATGGTAAGTGGTGATGTTTCACGCAAAGTTTTTTCTTGGTGCTTGCGACAAATGGTG
GTGGTTGAGATCTCGCACAAGCGATTGAATCTCGCCGGTTAGGAAAACACCTGATTTGAA
GATGTTTACGGTGAAGATGGTGTGAGATGTTGAGCTCAAGGGAGTCATGGTGAATCGCCG
GTCGTTTATCCGGTGGTGGCTTGAAGTGGCTGTGCGTGCGGCGGCTGTGCTCGCGGTGGC
AGAGATCCAAGGATTCTAGGGTTTCTTTAGGTGTTCTCATGGGCCGTGCTTTGTAGGCTT
TAGTGTTTGTAGTTTTTGGGCTATGCCTTTTTGTCTGTAATTTGGTGGGCTTGTCCCTTA
ATCTGATAAAATCTTGACGG

QA 10 809 10 809
DS 



AS 1 2

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CTTAGCCAAGTTAGCCGAGCAAGCTGAACGTTACGAGGAGATGGTTGAGTTCATGGAGAA
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TCCGATTAGATTGGGACTTGCTCTCAACTTCTCTGTCTTCTACTATGAGATTCTCAACTC
ACCTGATCGCGCTTGCGTCTCGCCAAACAGGCTTGATGAAGCAATCTCTGAGCTGGACAC
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GACCCTCTGGACTTCTGACCTTAATGATGAGGTGGGTGGTGATGAGATCAAGGAGGCGTC
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CGAGCAAGACATTTCTAAGTATGTATGGTCTGGATTTGGCTTTAGTTTCTGAAAACATTA
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CTGTGAACTCTGTTCTTTTTTTAATGGGGGTTTTAAGCTGTTGAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AG64TF U 1
AF RS1AG64JQ C 211
BS 1 724 RS1AG64TF
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RD RS1AG64TF 732 0 0
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GAAGATTGAGACCGAGCTTGGGAAGATCTGTGATGGGATTCTGAACCTTTTGGATTCTCA
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TTACCATAGGTACCTTGCTGAGTTTAAGACTGGTGCTGAGAGGAAGGATGCTGCTGAGAG
TACTCTCTTGGCTTACAAATCAGCTCAGGATATTGCACTTGCTGATTTACCTCCTACTCA
TCCGATTAGATTGGGACTTGCTCTCAACTTCTCTGTCTTCTACTATGAGATTCTCAACTC
ACCTGATCGCGCTTGCGTCTCGCCAAACAGGCTTGATGAAGCAATCTCTGAGCTGGACAC
ATTATGAGAAGA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1AG64JQ 857 0 0
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AGCTTCCTGGAGGATCATTTCTTCCATTGAACAGAAGGAAGAAAGCAGAGGGAACGAGGA
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TGGTGCTGAGAGGAAGGATGCTGCTGAGAGTACTCTCTTGGCTTACAAATCAGCTCAGGA
TATTGCACTTGCTGATTTACCTCCTACTCATCCGATTAGATTGGGACTTGCTCTCAACTT
CTCTGTCTTCTACTATGAGATTCTCAACTCACCTGATCGCGCTTGCGTCTCGCCAAACAG
GCTTGATGAAGCAATCTCTGAGCTGGACACATTAGGAGAAGAATCATACAAGGACAGCAC
GCTCATAATGCAACTTCTCCGTGACAATCTGACCCTCTGGACTTCTGACCTTAATGATGA
GGTGGGTGGTGATGAGATCAAGGAGGCGTCAAAAGACGAGCCTGAAGAAGGAAAACAAGC
GTAGACGTTGAAGTGACCTCAGTAAGGGAGCGAGCAAGACATTTCTAAGTATGTATGGTC
TGGATTTGGCTTTAGTTTCTGAAAACATTATGATTTGAGGTTTGTAAAAGCAGAGAGAAG
GTCATGATTTGGTTTTCTTCTTTGGAAACTCTGTGAACTCTGTTCTTTTTTTAATGGGGG
TTTTAAGCTGTTGAGTC

QA 1 857 1 857
DS 



AS 1 2

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GGGAGGAAAACACCAAAAGACATCGAGTTCTGTCGGAATCTCCCCAAATCCGTCACTCCA
GCAGCAGACCATCGAGATCCTCCTCTCCAAAGCAATGGGAACCAGAGAACAAGAGGTCAT
CAGAGACAAAGAAGCGATGAGAAGATGGTCAAGAAGCATGAGATCCCTAGGGAAGACCAT
CGGCTTGGTCCCCACGATGGGTTTCCTCCACGACGGCCACTTGTCCCTCGTCCGTGAATC
CCTCACACTCTCCGACGTCACCTTCGTCTCAATCTACGTCAACCCAGGCCAGTTCTCTCC
CACCGAGGATCTCTCCACTTACCCTTCTGATTTCTCCGGCGATCTCTCCAAGCTCGCCGC
CGTTTCCTCCTCCGGTTCCGATGTAATCGTCGTGTTCAACCCGACAAACCTCTACGACTA
CAACGACGGAAGGAGGAAGACAAGCGGCCACAGCGGAGGAGGGAGGAAGGTGGTGAGTTG
TGTGGAGGAAGGTGGGATAGGGCACGAGACGTGGGTTAGAGTGGAGTGATTGGAGAAAGG
TTTGTGTGGGAAGAGCAGCCTGTCTTCTTCAGAGGTGTGGCCACTATTGTTACTAAGCTT
TTCAATATCGTTGAGCCTGACGTTGCTATGTTTGGTAAAAAGGATTATCAGCAGTGGCGT
CTTATCAAGAGAATGGTTCGGGATCTTGATTTTGGGATTGAGATAGTAGGATCGGATATA
GCTAGAGAAAAGGATGGACTTGCTATGAGTTCTAGGAATGTTCATCTTTCAGGTGAAGAA
AGGCAAAGGGCGTTATCTATAAGTAAGTCACTGGCCATGGCTAAAGCTTTTGCCGCACAA
GGGAAAAACGGTTGTAAAGAGCTTAAGGATATGATCGTTTCAGAGATTGTTGGAGCTGCA
GGAAGAATCGATTATGTCGAGATTGTTGATCAAGAAACTCTTGAAGGAGTGGAAGAGATA
AAGAGTGGAGTAGTTATTTGTGTTGCTGCCTGGTTTGGAACGGTTAGGCTCATAGACAAC
ATTGAGATTAATGTCGCTGTCTAGTTCCCACTTTACGCATCAAGTTTCCATCTTTGGCTC
GTAGACAAAACAAAAAACCTTGAGAAGCTTCTAAGCTTTGATTGGTAATTATGCATCTGA
AGCCTTTGGAAAGAGAGAAGAACGATGAGAATCAACGTGTTTATTATTAGCTTTTACAAT
ATTTTGTCTGAAAGAGAAAAGATTGAAAACACAGAATCACATTTGCACACTCTTGAAAAC
CTTAGTGTGTTTGATCTTTGATGCAAGTAAGAAGAATAAATATTACTCCCTTATAACAGA
GATTTATCTAATGCATATACGATGTTCAGGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BT09TF U 1
AF RS1BT09JQ C 582
BS 1 727 RS1BT09TF
BS 728 1352 RS1BT09JQ

RD RS1BT09TF 727 0 0
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GCAGCAGACCATCGAGATCCTCCTCTCCAAAGCAATGGGAACCAGAGAACAAGAGGTCAT
CAGAGACAAAGAAGCGATGAGAAGATGGTCAAGAAGCATGAGATCCCTAGGGAAGACCAT
CGGCTTGGTCCCCACGATGGGTTTCCTCCACGACGGCCACTTGTCCCTCGTCCGTGAATC
CCTCACACTCTCCGACGTCACCTTCGTCTCAATCTACGTCAACCCAGGCCAGTTCTCTCC
CACCGAGGATCTCTCCACTTACCCTTCTGATTTCTCCGGCGATCTCTCCAAGCTCGCCGC
CGTTTCCTCCTCCGGTTCCGATGTAATCGTCGTGTTCAACCCGACAAACCTCTACGACTA
CAACGACGGAAGGAGGAAGACAAGCGGCCACAGCGGAGGAGGGAGGAAGGTGGTGAGTTG
TGTGGAGGAAGGTGGGATAGGGCACGAGACGTGGGTTAGAGTGGAGTGATTGGAGAAAGG
TTTGTGTGGGAAGAGCAGCCTGTCTTCTTCAGAGGTGTGGCCACTATTGTTACTAAGCTT
TTCAATATCGTTGAGCCTGACGTTGCTATGTTTGGTAAAAAGGATTATCAGCAGTGGCGT
CTTATCAAGAGAATGGTTCGGGATCTTGATTTTGGGATTGAGATAGTAGGATCGGATATA
GCTAGAG

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1BT09JQ 771 0 0
CACTATTGTTACTAAGCTTTTCAATATCGTTGAGCCTGACGTTGCTATGTTTGGTAAAAA
GGATTATCAGCAGTGGCGTCTTATCAAGAGAATGGTTCGGGATCTTGATTTTGGGATTGA
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TCATCTTTCAGGTGAAGAAAGGCAAAGGGCGTTATCTATAAGTAAGTCACTGGCCATGGC
TAAAGCTTTTGCCGCACAAGGGAAAAACGGTTGTAAAGAGCTTAAGGATATGATCGTTTC
AGAGATTGTTGGAGCTGCAGGAAGAATCGATTATGTCGAGATTGTTGATCAAGAAACTCT
TGAAGGAGTGGAAGAGATAAAGAGTGGAGTAGTTATTTGTGTTGCTGCCTGGTTTGGAAC
GGTTAGGCTCATAGACAACATTGAGATTAATGTCGCTGTCTAGTTCCCACTTTACGCATC
AAGTTTCCATCTTTGGCTCGTAGACAAAACAAAAAACCTTGAGAAGCTTCTAAGCTTTGA
TTGGTAATTATGCATCTGAAGCCTTTGGAAAGAGAGAAGAACGATGAGAATCAACGTGTT
TATTATTAGCTTTTACAATATTTTGTCTGAAAGAGAAAAGATTGAAAACACAGAATCACA
TTTGCACACTCTTGAAAACCTTAGTGTGTTTGATCTTTGATGCAAGTAAGAAGAATAAAT
ATTACTCCCTTATAACAGAGATTTATCTAATGCATATACGATGTTCAGGGT

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 2

CO CL4619Contig1 1155 2 2 U
GGACGTATTTTCTCTCTCCTTTGTTCCCCTTTTCTCCCCCTCTGCGTTTCAACTTCAACT
TTCAGATCCGGAGTCTTTTTTCCTTCTTCTCAGCACTCTCGTTTTCTATTTGCAGCTGAG
GTGTTTTCTCTCTCCCTCTCCGCCTTGTCCATGGCTTTGTTCTCAGAAGCTCCGGATCTG
GCATGGTCTTCTCGGTGGTAGAGTCTGGATGCCGAGATGGTGCGGTTACTTCCGATGCTG
TCGGCATTTAGGTTTTCGTGAAGTGTACCCTTAAGCTCCTTACAAGGATTGTGGCAGATG
GAGGAGACCGATTTGCTCATCAGCCAAGGTTCAGTGGTGTCGTCTTCGATCTTCCTCTTC
CTCGACGGTGAGGTGTGTGTGGTACTAAGGGACCGTCTCTTCTTGGTGTCTTGAAAGACC
CTCTCTGTCTACCAGCACTGAGAGATTTAGAGGCTTTCATTATATCAAATGTGTGCTTAG
TCCGGTCTGCTGGTGTGTGTCAGAGGATGTGATGGTGGCGCGTAGAGTGTTGCAGTGATA
CGGTGTCGGGGACACCGTCTATGTCTTCTCGAGGTGGCGCTACCGTCTATGGTCTTATCG
AGGTGGCGCTGCGACTTTCCTCTACTCTTATCACCCTCTTCCAGGCTTTTGTTTCAGTCT
CCCAGTGAAGGTACATCAACTTGGTCTCTTGGGTTTTAACGCTCATGTGGCTATATTGTT
TTGAACTGATCCGTACCACCGGTTCTTTTCTTGACATCTCAAGCTTACCTTGCTTCAGTT
CTCGAAGTAGGGTACTGGAAAGGATTGTGGAGACTTCCAATGGTCTGGGGAGTTCATCCG
TTCTTGGTTTTCAAGTCAGTCTGTGGCTATATCCTAGTACCATGAATTCGATTATTTTGC
TTATGGTAATGTCGCATCCCTATAGCTATAGGCAGGTCTTGGAGCTTCGAACTGTATCCT
ATCTGGTTGATTTTAATACAATTCTATTTAAAAAAAAAAGAGAAAAAAAATCTTACCACG
TTATTTCACAAAAATGACTTTGATGTAAAAATATTTAAAAAAACGATTTAGCTAATATTT
ATGTTTCTGTAATAAAAACTCCCACTGGATTTAGATTGGGTATCTCAAAACCTTGAATGA
TATACACTTTGCGCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ET54TF U 1
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BS 1 649 RS1ET54TF
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GTGTTTTCTCTCTCCCTCTCCGCCTTGTCCATGGCTTTGTTCTCAGAAGCTCCGGATCTG
GCATGGTCTTCTCGGTGGTAGAGTCTGGATGCCGAGATGGTGCGGTTACTTCCGATGCTG
TCGGCATTTAGGTTTTCGTGAAGTGTACCCTTAAGCTCCTTACAAGGATTGTGGCAGATG
GAGGAGACCGATTTGCTCATCAGCCAAGGTTCAGTGGTGTCGTCTTCGATCTTCCTCTTC
CTCGACGGTGAGGTGTGTGTGGTACTAAGGGACCGTCTCTTCTTGGTGTCTTGAAAGACC
CTCTCTGTCTACCAGCACTGAGAGATTTAGAGGCTTTCATTATATCAAATGTGTGCTTAG
TCCGGTCTGCTGGTGTGTGTCAGAGGATGTGATGGTGGCGCGTAGAGTGTTGCAGTGATA
CGGTGTCGGGGACACCGTCTATGTCTTCTCGAGGTGGCGCTACCGTCTATGGTCTTATCG
AGGTGGCGCTGCGACTTTCCTCTACTCTTATCACCCTCTTCCAGGCTTT

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DS 

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AGTCTCCCAGTGAAGGTACATCAACTTGGTCTCTTGGGTTTTAACGCTCATGTGGCTATA
TTGTTTTGAACTGATCCGTACCACCGGTTCTTTTCTTGACATCTCAAGCTTACCTTGCTT
CAGTTCTCGAAGTAGGGTACTGGAAAGGATTGTGGAGACTTCCAATGGTCTGGGGAGTTC
ATCCGTTCTTGGTTTTCAAGTCAGTCTGTGGCTATATCCTAGTACCATGAATTCGATTAT
TTTGCTTATGGTAATGTCGCATCCCTATAGCTATAGGCAGGTCTTGGAGCTTCGAACTGT
ATCCTATCTGGTTGATTTTAATACAATTCTATTTAAAAAAAAAAGAGAAAAAAAATCTTA
CCACGTTATTTCACAAAAATGACTTTGATGTAAAAATATTTAAAAAAACGATTTAGCTAA
TATTTATGTTTCTGTAATAAAAACTCCCACTGGATTTAGATTGGGTATCTCAAAACCTTG
AATGATATACACTTTGCGCT

QA 1 560 1 560
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TGAATATTTTGTAATATTTTTCTTGTGTAGAATTATCATGTATAAGCATTTTGCTTGTCC
CTTCATGTATAACATTGGGACGGTACAGATCATTACAACATAAAAACTTTGTGTATGTGA
TTCATATATATGGTTTACAATACCTTGTGATATTCATAA


BQ
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AF RS1DC92TF U 8
AF RS1CI53TF U 1
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GG
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AACAACCGATGACGATGCGCCTCCGACTCCCGGAGATGATGATGTGGCAGTCGCCGGACC
TATCGGAAGCGAAACTTCTTACGCAAACTATCCGCCGCCTCAGCAAACTTCAGGAAGTGG
CCTCACCGCTATGATTGGAACCGTTTCTATTGCTGCTACGATGGTTGGATCGCTATTATT
TTTCTGAGGCGTGATTGGTATATGTAATCTAAGAAATTAATATGTTTTTAATGAATATTT
TGTAATATTTTTCTTGTGTAGAATTATCATGTATAAGCATTTTGCTTG
CC

QA 3 530 3 530
DS 

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GGGACTATTAACTAACATAATGGTGCGCCTTCACGTAGCTCTCCTTCTTCTCTTCATCGC
CGTTTCCACCGTCATCGTATCAGCTACTGATAAACCGTCGGTGACCACCTCTGGACCTCC
AACCGCAACAGCTCCGACCAGTGGAGATATCGAGGTAGCACAGGCTCCAGCAGACGACAA
CGCCGTCGGAACAACCGATGACGATGCGCCTCCGACTCCCGGAGATGATGATGTGGCAGT
CGCCGGACCTATCGGAAGCGAAACTTCTTACGCAAACTATCCGCCGCCTCAGCAAACTTC
AGGAAGTGGCCTCACCGCTATGATTGGAACCGTT*CTATTGCTGCTACGATGGTTGGATC
GCTATTATTTTTCTGAGGCGTGATTGGTATATGTAATCTAAGAAATTAATATGTTTTTAA
TGAATATTTTGTAATATTTTTCTTGTGTAGAATTATCATGTATAAGCATTTTGCTTGTCC
CTTCATGTATAACATTGGGACGGTACAGATCATTACAACATAAAAACTTTGTGTATGTGA
TTCATATATATGGTTTACAATACCTTGTGATATTCATAA

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 2

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TCCTTCGAAACCATGGTCGTGAATGGTTGGACAGGCGCCTTCTGGGACATGGATGACTTC
CCACTCCCTCCTGGTCTCGATGTAGATCAGTTTGTTGAGAATGTCGAGTTAGCTCTATGG
GATAAGGGTGTTCGTGGTGGTGACGTGGTGTTCTATGCTTATGGTAGTTCGGATTCCTTT
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ACAAGGTTTTATCGTTTGTTACATGGCATGATTCACTGGCTTCGCTACCGTGAACAGTAT
GGAGGGATAAAAACTTTGTTGGTTATCGCAAAGAGTACCCCAGGGGAAGATACCAAAGTC
ATGATCAGATTTTTTGACAGACTTCTTTTGAGAGATCATAATGTTTTCACAGTAGTTCCT
GACGGATGCTCACCAGAAAACTGTGATTATCCTGAGCCAATTGCAGCTTGGCATTGGTCT
TCCTTGTGTTCTGGAGGTAGTTCCATCGACCTGTATAGTAGTGATGATGACGATGATTCC
GGAAGCAGCTCACCAGAAACTGATCGTGCAAGTGAAACTGATGCTGCTGGTTCCGCTACT
CAAAACGTCGTCCAAAAGGAAACGGCTGATGCTGACGCTCAGAACTAGTTGGCAGATAAT
AATACTTTCAAGAAATGATTTGCTTCCCGAGGCTCCTAATGCTTTGATCATATACCGTCA
ATGTGGAACAATTCTTGCATTATCAATATGTGAGCAATTTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E273TF U 1
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GGAGGGATAAAAACTTTGTTGGTTATCGCAAAGAGTACCCCAGGGGAAGATACCAAAGTC
ATGATCAGATTTTTTGACAGACTTCTTTTGAGAGATCATAATGTTTTCACAGTAGTTCCT
GACGGATGCTCACCAGAAAACTGTGATTATCCTGAGCCAATTGCAGCTTGGCATTGGTCT
TCCTTGTGTTCTGGAGGTAGTTCCATCGACCTGTATAGTAGTGATGATGACGATGATTCC
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CAA

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DS 

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GACGTGGTGTTCTATGCTTATGGTAGTTCGGATTCCTTTGATTGTGGTCGATACATAGCT
TCCGAGTCCTTCACCCCAGAAAAAGTTGTCCATAAACCTACAAGGTTTTATCGTTTGTTA
CATGGCATGATTCACTGGCTTCGCTACCGTGAACAGTATGGAGGGATAAAAACTTTGTTG
GTTATCGCAAAGAGTACCCCAGGGGAAGATACCAAAGTCATGATCAGATTTTTTGACAGA
CTTCTTTTGAGAGATCATAATGTTTTCACAGTAGTTCCTGACGGATGCTCACCAGAAAAC
TGTGATTATCCTGAGCCAATTGCAGCTTGGCATTGGTTTTCCTTGTGTTCTGGAGGTAGT
TCCATCGACCTGTATAGTAGTGATGATGACGATGATTCCGGAAGCAGCTCACCAGAAACT
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ACGGCTGATGCTGACGCTCAGAACTAGTTGGCAGATAATAATACTTTCAAGAAATGATTT
GCTTCCCGAGGCTCCTAATGCTTTGATCATATACCGTCAATGTGGAACAATTCTTGCATT
ATCAATATGTGAGCAATTTTTATT

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1EZ77TF U 1
AF RS1EZ77JQ C 86
BS 1 599 RS1EZ77TF

RD RS1EZ77TF 599 0 0
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DS 

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CTTGTTGTTGTAAATGTCGTGGCTTTGAGAACTGGTATCTAACTAAAATAATTGCCATGA
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ATGATTTTAAGATAAATCTTTATTCTGTATTGAC

QA 1 514 1 514
DS 



AS 1 2

CO CL4624Contig1 972 2 2 U
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GTTAAATGTTAGCTAATTATTATTTTAAATAATTTTTCATGATTTATAAAAGGTAACAAA
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TAGTAAACTTTCTCCTCTCTGCTTTCGCTCTGTCTCTAGCACTTCCTACATTCTTTGTCT
GCGTGTGAATCAACTCTTCTTGATTTCCAGAACCACTCACACAAGACCAAGGTGCATTAT
TCTCACATTTAACTTGATCTCGAATCATCTGTTTATTTTTCTGTTGTTGTGGGTTTCTCC
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TCTCTTTTCCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CL09TF U 1
AF RS1CL09JQ C 189
BS 1 707 RS1CL09TF
BS 708 972 RS1CL09JQ

RD RS1CL09TF 707 0 0
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GTGAATTCATCATGGTGGTCGAATTGTTGAAAAAATCATGATGAAGTTAATGGAGTAAGG
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TTTGTAGAAGTCTCAAACATAGTAATATCCTAGCCTCCTAGGCAGCAAGAACAAATAGTT
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GTTAAATGTTAGCTAATTATTATTTTAAATAATTTTTCATGATTTATAAAAGGTAACAAA
CAGCAAAGCACAGAAAAGCAAATTTGATATCTCTTTCATAAAAGAAGATAAAAAGATTAA
TTCTTTGGTGAAATTAAACCATTTGTTTCTCTCTTCTCTCTCTCTCCTGTGTGTTTTCCA
TAGTAAACTTTCTCCTCTCTGCTTTCGCTCTGTCTCTAGCACTTCCTACATTCTTTGTCT
GCGTGTGAATCAACTCTTCTTGATTTCCAGAACCACTCACACAAGAC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1CL09JQ 784 0 0
AACTATAACATGTCTAGATAACAAAATAGTTAGCGAATTCATTAAGATTCGAGTTATGTC
AGTCATGCTGGTCAGCCATGATAGATACTAAATATTCTTTTCTTTTTGTATATTTGTAGA
AGTCTCAAACATAGTAATATCCTAGCCTCCTAGGCAGCAAGAACAAATAGTTTTACAGAT
GTTCTGATGATTAATAGTATGCAATTCCTTAGTTTAATAGCGATTATAAAATGTTAAATG
TTAGCTAATTATTATTTTAAATAATTTTTCATGATTTATAAAAGGTAACAAACAGCAAAG
CACAGAAAAGCAAATTTGATATCTCTTTCATAAAAGAAGATAAAAAGATTAATTCTTTGG
TGAAATTAAACCATTTGTTTCTCTCTTCTCTCTCTCTCCTGTGTGTTTTCCATAGTAAAC
TTTCTCCTCTCTGCTTTCGCTCTGTCTCTAGCACTTCCTACATTCTTTGTCTGCGTGTGA
ATCAACTCTTCTTGATTTCCAGAACCACTCACACAAGACCAAGGTGCATTATTCTCACAT
TTAACTTGATCTCGAATCATCTGTTTATTTTTCTGTTGTTGTGGGTTTCTCCTTTTTACC
ATGTTTTATTTATAATTTGTCTCTCTGTCTTGTCCGTTCGTGTGATTTGCTCAGACATCT
AGTTGTTATTTTCTTCTTTCTCCATCACTCGACACTAGTTTGGTGGTTTCCAGGAAATGT
CAGAAGAAAGTAAATATTTCACTTTGCCTACATTGGATTCCTTAAAAGTGACTCTCTTTT
CCCG

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 2

CO CL4625Contig1 770 2 2 U
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CTAAGGTTGATTTCTCTAGCTTTGTGAGCACACGTGTTAAAACAAAGCTCTCTGCAAGGA
ACACCGGAGGAGGAGACTACGAGCTATCATCGCCAAGCCCAGCTGAGCAAGAGGTACTAG
AGAGCTTTCTCTTGAACGCCATCAACTGAGTCTCTTCGACCGTTTAAACCTCGCCTGGAA
GATCATCTTCCCTTCCCGCGCGGCGTCGAGGAGAAGCTCCAACGCGAGGATCGCCAAGCA
GCGGCTCAAGATGATCTTGTTTTCGGACAGGTGCGCGGTCAGCGACGAAGCCAAAAGGAA
AATCGTCAACAACATCGTTCACGCGCTGTCGGATTTCGTGGAGATCGAGTCGGAGGAGAA
GGTTCAGCTGAATGTCGCCACGGACGGTGACCAGGGGACCATTTACTCGGTCACGGTGCC
TGTTAGGAGGGTGAAAGCAGAGTACCAAGAAGTCGACGAGGTTGGATCTATATCCGATGG
GGATTACAAAGATACCCTTGATGGTTCTGTGGATGTCAGGTTCGACTTTTATGTTCCGGA
GTAATAAGTGGGGGCACGGTCTTATTAGAGTTGGATTCTTGAACAGTGTCTTGTTTGTCT
GTTTTCTTGAAATTTTAGTCTGTAAGGGAACAAAGAAAGTTTCTTACAACTCCTATTGTG
TATATATATATGCAACTTATCTCTTCAAAGTTTTAACTATGTTCTTGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FF87TF U 1
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BS 210 770 RS1FF87JQ

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QA 1 209 1 209
DS 

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CTCAAGATGATCTTGTTTTCGGACAGGTGCGCGGTCAGCGACGAAGCCAAAAGGAAAATC
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CAGCTGAATGTCGCCACGGACGGTGACCAGGGGACCATTTACTCGGTCACGGTGCCTGTT
AGGAGGGTGAAAGCAGAGTACCAAGAAGTCGACGAGGTTGGATCTATATCCGATGGGGAT
TACAAAGATACCCTTGATGGTTCTGTGGATGTCAGGTTCGACTTTTATGTTCCGGAGTAA
TAAGTGGGGGCACGGTCTTATTAGAGTTGGATTCTTGAACAGTGTCTTGTTTGTCTGTTT
TCTTGAAATTTTAGTCTGTAAGGGAACAAAGAAAGTTTCTTACAACTCCTATTGTGTATA
TATATATGCAACTTATCTCTTCAAAGTTTTAACTATGTTCTTGGCT

QA 1 706 1 706
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4627Contig1 1132 2 18 U
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CGATTCAAAGATGAACGACTTAATGACCAAATCATTCACAAGCTACGTCGACCTTAAAAA
ATCAGCGATGAAGGATGATCTCGAATCAGGACCAGATCCCGATCTCGAGATGGCGAACAA
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GTCTCTCTCACCGAGACGCTCACTCGGATCTCGCAGTACAACGACGAGAGCAGATCCGCG
CACAAGGCGGACTCCGTGAAGTCTCTCCGCAACAAGATCTCCAACGAGATCGTCTCCGGC
CTAAGAAAAGCGAAATCGATCAAGGCCACGCTCGAGGAGATGGACCGAGCGAACCGGGAG
ATTAAACGGTTATCCGGAACTCCGGTTTACAGGAGCAGAGTGGCGGTTACAAACGGTTTG
AGGAAGAAGCTGAGAGAATCGATGATGGAGTTCCAGGCGCTGAGGCAGAGGATGATGAGC
GAGTACAAAGAGACAGTTGAGAGACGGTACTTCACCGTCACTGGTGAGAGACCAGACGAA
ACTACGATCGAGAAGATTATAACCGACGGAGGTGAAGAGTTTCTCGCACGTGCGGTTCAG
GAGCACGGGAGAGGGAAGGTCTTGGAGACTGTGGTTGAGATTCAAGACAGGTATGATGCG
GCGAAGGAGATAGAGAAGAGCTTGTTAGAGCTACACCAAGTGTTTCTAGACATGGCTGTG
ATGGTCGAGGCGCAAGGCGAGCAGATGGATGAGATTGAGCATCACGTGATGAACCGAGCC
ATTACGTGAAGGATGGTGCTAAGGAGTTGAATACCGCAAAGAAGCATCAGAGAAGCAGTA
GGAAATGGATGTGCATCGGTATCATTGTCCTGCTCATCATCATTCTCATCGTCATCATCC
CCATCATCACCAGTTTCACCTCTTCTTGATGAGAGACATTTGTGTTTACTTATTACCCAC
TAAAGGATGTCTTAATCCTTGTGTTTTTGTTGTGTAATAATCCAATGAATGTGTTTTTAC
AGAGATGTATTTTTGTCTTATAACAACAATCTACCTGAACTTTCTGATTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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ATTAAACGGTTATCCGGAACTCCGGTTTACAGGAGCAGAGTGGCGGTTACAAACGGTTTG
AGGAAGAAGCTGAGAGAATCGATGATGGAGTTCCAGGCGCTGAGGCAGAGGATGATGAGC
GAGTACAAAGAGACAGTTGAGAGACGGTACTTCACCGTCACTGGTGAGAGACCAGACGAA
ACTACGATCGAGAAGATTATAACCGACGGAGGTGAAGAGTTTCTCGCACGTGCGGTTCAG
*AGCACGGGAGAGGGAAG*TCTTGGAGACTGTGGTTGAGATTCAAGACAG*TATGATGCG
GCGAAG*AGATAGAGA*GAGCTTGT*AGAGCTACACCAAGTGTTTCTAGACATGGCTGTG
ATGGTCGAGGCGCAAG*CGAGCAGATGGATGAGAT*GAGCATCACGTGAT

QA 1 830 1 830
DS 

RD RS1FA27JQ 865 0 0
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CGCAACAAGATCTCCAACGAGATCGTCTCCGGC*TAAGAAAAGCGAAATCGATCAAGGCC
ACGCTCGAGGAGATGGACCGAGCGAACCGGGAGATTAAACGGTTATCCGGAACTCCGGTT
TACAGGAGCAGAGTGGCGGTTACAAACGGTTTGAGGAAGAAGCTGAGAGAATCGATGATG
GAGTTCCAGGCGCTGAGGCAGAGGATGATGAGCGAGTACAAAGAGACAGTTGAGAGACGG
TACTTCACCGTCACTGGTGAGAGACCAGACGAAACTACGATCGAGAAGATTATAACCGAC
GGAGGTGAAGAGTTTCTCGCACGTGCGGTTCAGGAGCACGGGAGAGGGAAGGTCTTGGAG
ACTGTGGTTGAGATTCAAGACAGGTATGATGCGGCGAAGGAGATAGAGAAGAGCTTGTTA
GAGCTACACCAAGTGTTTCTAGACATGGCTGTGATGGTCGAGGCGCAAGGCGAGCAGATG
GATGAGATTGAGCATCACGTGATGAACCGAGCCATTACGTGAAGGATGGTGCTAAGGAGT
TGAATACCGCAAAGAAGCATCAGAGAAGCAGTAGGAAATGGATGTGCATCGGTATCATTG
TCCTGCTCATCATCATTCTCATCGTCATCATCCCCATCATCACCAGTTTCACCTCTTCTT
GATGAGAGACATTTGTGTTTACTTATTACCCACTAAAGGATGTCTTAATCCTTGTGTTTT
TGTTGTGTAATAATCCAATGAATGTGTTTTTACAGAGATGTATTTTTGTCTTATAACAAC
AATCTACCTGAACTTTCTGATTGGT

QA 1 865 1 865
DS 



AS 1 2

CO CL4628Contig1 912 2 2 U
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TACTCCGACTTTAATCCTGCTGTCTTAAATGGTGATTGCGAACTCTCCAGATGCATCGTT
CAGTCGTCAAATCGGGTGTTTCTCGGTTGTGGAGGCTAGGAATATCAAGCGTGGTGGAGA
GTTTATGTGGGTCGATATGCTCCTGTTGGATGTCAGTGATTGTTAAAGCTGAAATCATGG
CGGTACAGATGTCGGAGAAGAAGTATTGATCCCTATGATTCAGCTAAGGTGACAAGAGAC
AGAGCATTGAGATAATGGTCGATAGAGAAAACTGGAGAAAACATAAACATAGACTTTGAT
TCTGGATAATCTAGAGATCCTGAGACAAAGGCATGGTTAGAGCAACACAAACATTTGGTG
TGATCACCTCCACCACCAATCGCACAAACATACCAAACGATTGGCCTCGGAAATTAAGTT
ACATGGGTTTTTTTTGTGTTGCTCTTTGTTCTCTCATTCACAATTTCTGGTGAGCTACTA
TTCTACTTTCACTTCTGGAAAGCATGAAGTTCTCAATTTTTAAGGTCATATTTCCCCATC
CGAGATTTTGTGAGGACTGATGGTGCAACAACATTGTAGAAGTTTGCTGGAGGGATTTAC
AAAGACTCAGATGGGAAGTTTGGAGGTCAAAAAAAGAGAGATAACACCAGCTGGGGCAAC
AAGAGAGTAGAAACAGAGGTGAACCAAGTTTTGTTGATTATGGAAGAAAGAAAATACTCT
GACGTTTTTAATACGTCGATGCATAGTAATGCTTTTGTTTTGTCAATCTGCATAGTAATT
GAGTAGGAAAGAATGGAAAACTTCCAAATACGGTATTTGCTTTTGAGTTATTTTATACAT
TTGCATTTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BG72TF U 1
AF RS1BG72JQ C 385
BS 1 691 RS1BG72TF
BS 692 912 RS1BG72JQ

RD RS1BG72TF 691 0 0
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TACTCCGACTTTAATCCTGCTGTCTTAAATGGTGATTGCGAACTCTCCAGATGCATCGTT
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GTTTATGTGGGTCGATATGCTCCTGTTGGATGTCAGTGATTGTTAAAGCTGAAATCATGG
CGGTACAGATGTCGGAGAAGAAGTATTGATCCCTATGATTCAGCTAAGGTGACAAGAGAC
AGAGCATTGAGATAATGGTCGATAGAGAAAACTGGAGAAAACATAAACATAGACTTTGAT
TCTGGATAATCTAGAGATCCTGAGACAAAGGCATGGTTAGAGCAACACAAACATTTGGTG
TGATCACCTCCACCACCAATCGCACAAACATACCAAACGATTGGCCTCGGAAATTAAGTT
ACATGGGTTTTTTTTGTGTTGCTCTTTGTTCTCTCATTCACAATTTCTGGTGAGCTACTA
TTCTACTTTCACTTCTGGAAAGCATGAAGTTCTCAATTTTTAAGGTCATATTTCCCCATC
CGAGATTTTGTGAGGACTGATGGTGCAACAACATTGTAGAAGTTTGCTGGAGGGATTTAC
AAAGACTCAGATGGGAAGTTTGGAGGTCAAA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1BG72JQ 528 0 0
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TTTGTTCTCTCATTCACAATTTCTGGTGAGCTATTATTCTACTTTCACTTCTGGAAAGCA
TGAAGTTCTCAATTTTTAAGGTCATATTTCCCCATCCGAGATTTTGTGAGGACTGATGGT
GCAACAACATTGTAGAAGTTTGCTGGAGGGATTTACAAAGACTCAGATGGGAAGTTTGGA
GGTCAAAAAAAGAGAGATAACACCAGCTGGGGCAACAAGAGAGTAGAAACAGAGGTGAAC
CAAGTTTTGTTGATTATGGAAGAAAGAAAATACTCTGACGTTTTTAATACGTCGATGCAT
AGTAATGCTTTTGTTTTGTCAATCTGCATAGTAATTGAGTAGGAAAGAATGGAAAACTTC
CAAATACGGTATTTGCTTTTGAGTTATTTTATACATTTGCATTTAAGC

QA 1 528 1 528
DS 



AS 1 2

CO CL4629Contig1 518 2 1 U
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TTTCTTGCGGTGTACGTAGGAGAGAGCCAGAAAAAGGGATATTTGGTACCAGTCTCATAC
TTGAGCCAGCCTTCTTTTCAAGCTCTTCTAAGAAAATCTGAAGAAGAGTTTGGATATGAT
CATCCAATGGGCGGCTTAACGATTCCTTGTCCTGAAGATACATTCATCAACGTGACGTCT
CAGCTTCAATGATGATGATTATACACCATTTTGTTATAGTTAGAGATAGACTTGTTCCCT
GTAAGTAGTGGAGATTTTTTTCCTCTGTCTTGTTGAAAGAGTTATTCTGTAACGTTTTGA
AAGTGAATGCCATAGACACGATCATGATTCATGTTACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CF46JQ C 1
AF RS1CF46TF U 1
BS 1 518 RS1CF46TF

RD RS1CF46JQ 518 0 0
GGATCAACCAAAAACAAACAATCCAATAACTTTAATCTTTCATACATCTTCAAAAGCTTA
GAAGAATTCAACCTTTCAGTAAAAGAAAAACAAATGGCTTTGATGAGAAGTATATTGGGT
GCAAAGAAGATTCTTGGAACCTCAACAAGCAAATGGGCAACCTCGGCTGCACCAAAAGGA
TTTCTTGCGGTGTACGTAGGAGAGAGCCAGAAAAAGGGATATTTGGTACCAGTCTCATAC
TTGAGCCAGCCTTCTTTTCAAGCTCTTCTAAGAAAATCTGAAGAAGAGTTTGGATATGAT
CATCCAATGGGCGGCTTAACGATTCCTTGTCCTGAAGATACATTCATCAACGTGACGTCT
CAGCTTCAATGATGATGATTATACACCATTTTGTTATAGTTAGAGATAGACTTGTTCCCT
GTAAGTAGTGGAGATTTTTTTCCTCTGTCTTGTTGAAAGAGTTATTCTGTAACGTTTTGA
AAGTGAATGCCATAGACACGATCATGATTCATGTTACT

QA 1 518 1 518
DS 

RD RS1CF46TF 518 0 0
GGATCAACCAAAAACAAACAATCCAATAACTTTAATCTTTCATACATCTTCAAAAGCTTA
GAAGAATTCAACCTTTCAGTAAAAGAAAAACAAATGGCTTTGATGAGAAGTATATTGGGT
GCAAAGAAGATTCTTGGAACCTCAACAAGCAAATGGGCAACCTCGGCTGCACCAAAAGGA
TTTCTTGCGGTGTACGTAGGAGAGAGCCAGAAAAAGGGATATTTGGTACCAGTCTCATAC
TTGAGCCAGCCTTCTTTTCAAGCTCTTCTAAGAAAATCTGAAGAAGAGTTTGGATATGAT
CATCCAATGGGCGGCTTAACGATTCCTTGTCCTGAAGATACATTCATCAACGTGACGTCT
CAGCTTCAATGATGATGATTATACACCATTTTGTTATAGTTAGAGATAGACTTGTTCCCT
GTAAGTAGTGGAGATTTTTTTCCTCTGTCTTGTTGAAAGAGTTATTCTGTAACGTTTTGA
AAGTGAATGCCATAGACACGATCATGATTCATGTTACT

QA 1 518 1 518
DS 



AS 1 2

CO CL4630Contig1 1316 2 2 U
GGACCTTAAACCAGAGGTACTTTATATACTCCATGATGGCGTTCTTTATTTGTTTTCTTG
TAAATCATTTGGTTTTAGGTGTCCCATCATAGAATGAGTTCCACTAACTTATGCAGAGTG
ATGGTTCTGTTTCTTTTCCTCTCACAGAACTTTCTGTTAGTACAAAGGATGAGACTTCTC
CTCTAAAAGCAATAGACTTTGGTCTCTCTGATTATGTCAAGCCAGATGAGAGGTTGAATG
ACATAGTAGGAAGTGCTTACTACGTCGCCCCTGAAGTCTTACACCGTACATACGGAACAG
AAGCTGACATGTGGAGTATTGGAGTGATTGCTTACATCCTTCTTTGTGGGAGTAGACCCT
TTTGGGCCCGTACTGAATCAGGAATCTTTAGAGCTGTACTTAAGTCAGTACCTAACTTTG
AAGAAGCTCCTTGGCCTTCACTATCACCTGAAGCTGTAGATTTTGTGAAGAGATTGCTTA
ACAAAGATTACCGTAAAAGACTAACTGCTGCACAGGCTTTGTGTCATCCGTGGCTGGTTG
GCTCGCATGAACTCAAGATACCTTGTGATATGATCATATACAAGCTTGTTAAAGTGTACA
TAATGTCTACTTCATTGAGAAAATCAGCTTTAGTTACTCTTGCCAAGACATTAACTGTAC
CACAGTTAGCTTATCTGAGGGAGCAATTTACATTGTTGGGGCCAAGTAAAAATGGATATA
TCTCCATGCACAACTACAAAACAGCAATACTAGAGAGCTCAACAGATGCTATGAAGGATT
CAAGAGTCTTAGATTTTGTTCACATGATAAGTTGTCTTCAGTACAAGAAACTAGACTTTG
AAGAGTTCTGTGCATCAGCATTAAGTGTTTATCAGATGGAAGCAATGGAAACATGGGAGC
AACACGCACGGCGTGCTTACGAGTTGTTTGAGAAAGATGGGAATAGACCTATCATGATTG
AGGAACTTGCATCGGAACTCGGACTCGGACCATCAGTCCCGGTGCATGTTGTGCTACAGG
ATTGGATAAGACATTCGGATGGAAAGCTTAGTTTCTTGGGTTTTGTCAGACTACTACATG
GTGTGTCTTCTCGTACATTACATAAAGCTTAGGAGCAATGACATTGTTTGAGTGTAGATT
TTGGTTTCTTTTTTTCCTTTTTCTTTTTTTACCGTTTCTTGATAGTTTTGAGTCAAATAT
TCGATGATTATGTCAGTGTATGTATGTGTAATGTGTGTTGTGTGGGGAAGGAATGGTTTC
AGATGAAGAGGAATGTACAGAATGAGACTTATTCCATATCTCTAAGACTCTTAACT


BQ
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AF RS1DV39TF U 1
AF RS1DV39JQ C 556
BS 1 707 RS1DV39TF
BS 708 1316 RS1DV39JQ

RD RS1DV39TF 707 0 0
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TAAATCATTTGGTTTTAGGTGTCCCATCATAGAATGAGTTCCACTAACTTATGCAGAGTG
ATGGTTCTGTTTCTTTTCCTCTCACAGAACTTTCTGTTAGTACAAAGGATGAGACTTCTC
CTCTAAAAGCAATAGACTTTGGTCTCTCTGATTATGTCAAGCCAGATGAGAGGTTGAATG
ACATAGTAGGAAGTGCTTACTACGTCGCCCCTGAAGTCTTACACCGTACATACGGAACAG
AAGCTGACATGTGGAGTATTGGAGTGATTGCTTACATCCTTCTTTGTGGGAGTAGACCCT
TTTGGGCCCGTACTGAATCAGGAATCTTTAGAGCTGTACTTAAGTCAGTACCTAACTTTG
AAGAAGCTCCTTGGCCTTCACTATCACCTGAAGCTGTAGATTTTGTGAAGAGATTGCTTA
ACAAAGATTACCGTAAAAGACTAACTGCTGCACAGGCTTTGTGTCATCCGTGGCTGGTTG
GCTCGCATGAACTCAAGATACCTTGTGATATGATCATATACAAGCTTGTTAAAGTGTACA
TAATGTCTACTTCATTGAGAAAATCAGCTTTAGTTACTCTTGCCAAGACATTAACTGTAC
CACAGTTAGCTTATCTGAGGGAGCAATTTACATTGTTGGGGCCAAGT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1DV39JQ 761 0 0
AAGATA
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AGCAATTTACATTGTTGGGGCCAAGTAAAAATGGATATATCTCCATGCACAACTACAAAA
CAGCAATACTAGAGAGCTCAACAGATGCTATGAAGGATTCAAGAGTCTTAGATTTTGTTC
ACATGATAAGTTGTCTTCAGTACAAGAAACTAGACTTTGAAGAGTTCTGTGCATCAGCAT
TAAGTGTTTATCAGATGGAAGCAATGGAAACATGGGAGCAACACGCACGGCGTGCTTACG
AGTTGTTTGAGAAAGATGGGAATAGACCTATCATGATTGAGGAACTTGCATCGGAACTCG
GACTCGGACCATCAGTCCCGGTGCATGTTGTGCTACAGGATTGGATAAGACATTCGGATG
GAAAGCTTAGTTTCTTGGGTTTTGTCAGACTACTACATGGTGTGTCTTCTCGTACATTAC
ATAAAGCTTAGGAGCAATGACATTGTTTGAGTGTAGATTTTGGTTTCTTTTTTTCCTTTT
TCTTTTTTTACCGTTTCTTGATAGTTTTGAGTCAAATATTCGATGATTATGTCAGTGTAT
GTATGTGTAATGTGTGTTGTGTGGGGAAGGAATGGTTTCAGATGAAGAGGAATGTACAGA
ATGAGACTTATTCCATATCTCTAAGACTCTTAACT

QA 7 761 7 761
DS 



AS 1 2

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TTGCGTAGCTTTCTTATTTCACACCAAGATCTCTTTGTTCCTGTAGCACTACCGGGTGAG
TCTGTGGGCTTCTCTTTCTTATGGTCTTCCCTTTGGACAGATCTACTATTTCACCGGTAT
GTACCACCATCATCGACTCTCTGCTCGACGACCACTCTCCCTACGGGGAAGAACTACTCA
AACTTATTATGGCGTGACGGCAAAAGCCCCAATAACCTTGCTTTAGATCTTGCCGTAACT
GAGTTCCTTTGTGGCTCTGCTCACACCGACGATTGCTCCCTCTATATCAGTTTGTTAGAC
CACAGCGACCAAAGGCTCGGCTTTGGTTCCATCAAATATCCACAGCTTCATCACGGTAAT
GCTGGAGTTGGAAGTCCTTGCCTGGAATCAACGCTCGTTCCCTCGGAATTTGGTCTCAAA
CCCATCTCTCTGTCCGCTGGTGTGAAGAAACTGCTTCCTCCTCTATTGGGACTTCTTTTA
GTGTCCTCACAAGACATTTGAAGTGTCTCTGTAAACAGCTATTGTCATGAGTTTACAATG
TACATCTGTCGTCTAAAGCTAACTTCTTTAATCTCAAGACATGGCTTAGGGAAGCTTCAA
AGATTAAGCCTCATAGACTTATCCTTTTTGGAAAAGTTTATATCAACTTCCTCCCACCGA
GGCTGGGAGAGATCGCTTTCACCATTCTCCTCCTTCATGGATAGATACTTACCATCACAT
CCCTCCTATACGGAGTCTTCAACGAACTCAACCAATCAGTTTGAGCTCTATAACCAGTTC
GAGTTGCTCACACCGTTTGTGATGCTACAAATTTCGTCCAACAATCACATTGGTCTCTAC
AAGATATTTCATGAGGCTTGGCAATTGAAGTTATGTGATTTATATCTATCTTAAGTATTT
TAATCTCTTGTTTAGCCACCAAGTTGGCAGTTTGTAATGATAATAGAGCTGTAAAAGCTC
TTAACTATTGTAGGGTTCCTCAAATTTAAGT


BQ
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AF RS1C463TF U 1
AF RS1C463JQ C 396
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TCTGTGGGCTTCTCTTTCTTATGGTCTTCCCTTTGGACAGATCTACTATTTCACCGGTAT
GTACCACCATCATCGACTCTCTGCTCGACGACCACTCTCCCTACGGGGAAGAACTACTCA
AACTTATTATGGCGTGACGGCAAAAGCCCCAATAACCTTGCTTTAGATCTTGCCGTAACT
GAGTTCCTTTGTGGCTCTGCTCACACCGACGATTGCTCCCTCTATATCAGTTTGTTAGAC
CACAGCGACCAAAGGCTCGGCTTTGGTTCCATCAAATATCCACAGCTTCATCACGGTAAT
GCTGGAGTTGGAAGTCCTTGCCTGGAATCAACGCTCGTTCCCTCGGAATTTGGTCTCAAA
CCCATCTCTCTGTCCGCTGGTGTGAAGAAACTGCTTCCTCCTCTATTGGGACTTCTTTTA
GTGTCCTCACAAGACATTTGAAGTGTCTCTGTAAACAGCTATTGTCATGAGTTTACAATG
TACATCTGTCGTCTAAAGCTAACTTCTTTAATCTCAAGACATGGCTTAGG*AAGCTTCAA
AGATTAAGCCTCATAGACTTATCC

QA 1 744 1 744
DS 

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ATATCCACAGCTTCATCACGGTAATGCTGGAGTTGGAAGTCCTTGCCTGGAATCAACGCT
CGTTCCCTCGGAATTTGGTCTCAAACCCATCTCTCTGTCCGCTGGTGTGAAGAAACTGCT
TCCTCCTCTATTGGGACTTCTTTTAGTGTCCTCACAAGACATTTGAAGTGTCTCTGTAAA
CAGCTATTGTCATGAGTTTACAATGTACATCTGTCGTCTAAAGCTAACTTCTTTAATCTC
AAGACATGGCTTAGGGAAGCTTCAAAGATTAAGCCTCATAGACTTATCCTTTTTGGAAAA
GTTTATATCAACTTCCTCCCACCGAGGCTGGGAGAGATCGCTTTCACCATTCTCCTCCTT
CATGGATAGATACTTACCATCACATCCCTCCTATACGGAGTCTTCAACGAACTCAACCAA
TCAGTTTGAGCTCTATAACCAGTTCGAGTTGCTCACACCGTTTGTGATGCTACAAATTTC
GTCCAACAATCACATTGGTCTCTACAAGATATTTCATGAGGCTTGGCAATTGAAGTTATG
TGATTTATATCTATCTTAAGTATTTTAATCTCTTGTTTAGCCACCAAGTTGGCAGTTTGT
AATGATAATAGAGCTGTAAAAGCTCTTAACTATTGTAGGGTTCCTCAAATTTAAGT

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

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CTCGTTAATGCTTTAAATCTAATTCAACCTATC


BQ
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AF RS1CK49JQ C 1
AF RS1CK49TF U 1
BS 1 513 RS1CK49TF

RD RS1CK49JQ 513 0 0
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CCTCTCGTTGCTTTCTCTTCCTCCCATTACCTCTCTTCTCTCCGGAGCGTCGCATCATCC
TCTCTCTTCCCTCATTCCCCATCCCTCGTTCAGAGAAAATATTCGAACAGAGGTTCTTGT
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QA 1 513 1 513
DS 

RD RS1CK49TF 513 0 0
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CCTCTCGTTGCTTTCTCTTCCTCACATTACCTCTCTTCTCTCCGGAGCGTCGCATCATCC
TCTCTCTTCCCTCATTCCCCATCCCTCGTTCAGAGAAAATATTCGAACAGAGGTTCTTGT
GGCACGGTGGTGTCTCCCACGTGTGCTGCTGCTGCTGCCTCTGATGCAGCTCAACTGAAA
AGCGCTAAAGAAGACATCAAAGTGCTTCTCCGCACAAAGTTTTACCATCCGATTCTCGTA
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GGTGGAGCTAATGGAAGTCTTAGGTTCGAGCCTGAGCTTAAACATGCTGCAAACGCTGGT
CTCGTTAATGCTTTAAATCTAATTCAACCTATC

QA 1 513 1 513
DS 



AS 1 2

CO CL4633Contig1 941 2 2 U
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AGTTGGAGTGTGGAGGTATGGAGGGACTGTGAGGATAGTCTCTTTACATCCAAAAGTCTC
TTCGACGAGTTTGTGTCTTCGTAGCGAAAGCAACACCGATGAGTCTGTGTCTTTGGACGA
ATCCGAGTCTTCTCAGTATGACCAGCTTCTTGATTTTCTTCACCTCTCTAACGAGATTGC
AACTGAGGAATCTGAAACAGCAGTCTCCCTAGCCTTTCTTTTCGATCATTTCGCGCATCA
GCTTCTAAATGCTTACCTCAAGGAGAGTGATGGGATCAACGATCTACCTTTAAATGAAAT
GGTGATCGATACCTTGCTCAACAGGGTAGTCAAGGATTTATCTGCAATACTTGTTTCTCA
AGCGACTAAGCTGGGTTCGTTTCTAAGGAAGATATTGAAATGTGACAACCGAAATCTATC
AAGAACAGAGTTTTTAGAAGCAGTCTTCACATATTTTCGGCACAGAAAATATTTGGTGTC
AAAGGAGTTTTCAAAGTTTTGTAAGTGTGGTGGAAAGCCTGAGATTATCGGATCAAGCGT
CCCAGAGTTTTCTCCTATTCATGCAGAAGCTATTGGTCTTCAACATAAAGAGCTGGAGGT
AATGATTTTTAATTTTCTAGTGATGTAAAGACCAACGGAAATCTCATATCTTTGTTTGCA
TTCATGTTTTTCGGGATGTAATAATTTTTTTAATCCCACTGACTCATGTAGCATGTAAAA
TCAAATTACATGGAAACAAGATGCCAAGTTGAACAAATGCAGTCAGAATGGCATGAAGAA
CTTCAAAGGATAGGTTACATATATATATTTACTCTTTACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CZ12TF U 1
AF RS1CZ12JQ C 489
BS 1 638 RS1CZ12TF
BS 639 941 RS1CZ12JQ

RD RS1CZ12TF 638 0 0
GGAAGATATGCAACTTTTGACATTTGGAGCTTCTGATCTTGAAAAGGGAGGTTCATCGAA
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ATCCGAGTCTTCTCAGTATGACCAGCTTCTTGATTTTCTTCACCTCTCTAACGAGATTGC
AACTGAGGAATCTGAAACAGCAGTCTCCCTAGCCTTTCTTTTCGATCATTTCGCGCATCA
GCTTCTAAATGCTTACCTCAAGGAGAGTGATGGGATCAACGATCTACCTTTAAATGAAAT
GGTGATCGATACCTTGCTCAACAGGGTAGTCAAGGATTTATCTGCAATACTTGTTTCTCA
AGCGACTAAGCTGGGTTCGTTTCTAAGGAAGATATTGAAATGTGACAACCGAAATCTATC
AAGAACAGAGTTTTTAGAAGCAGTCTTCACATATTTTCGGCACAGAAAATATTTGGTGTC
AAAGGAGTTTTCAAAGTTTTGTAAGTGTGGTGGAAAGC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1CZ12JQ 453 0 0
AGCTGGGTTCGTTTCTAAGGAAGATATTGAAATGTGACAACCGAAATCTATCAAGAACAG
AGTTTTTAGAAGCAGTCTTCACATATTTTCGGCACAGAAAATATTTGGTGTCAAAGGAGT
TTTCAAAGTTTTGTAAGTGTGGTGGAAAGCCTGAGATTATCGGATCAAGCGTCCCAGAGT
TTTCTCCTATTCATGCAGAAGCTATTGGTCTTCAACATAAAGAGCTGGAGGTAATGATTT
TTAATTTTCTAGTGATGTAAAGACCAACGGAAATCTCATATCTTTGTTTGCATTCATGTT
TTTCGGGATGTAATAATTTTTTTAATCCCACTGACTCATGTAGCATGTAAAATCAAATTA
CATGGAAACAAGATGCCAAGTTGAACAAATGCAGTCAGAATGGCATGAAGAACTTCAAAG
GATAGGTTACATATATATATTTACTCTTTACCC

QA 1 453 1 453
DS 



AS 1 2

CO CL4634Contig1 335 2 3 U
AAAAGTTGAGATTCTTCTTCAATGGCATGACTTTTAATGGTGGTGCCAAACCACTTACGC
TACTCTCTTAAAGAAACAAAAAAAAAGTTCGTCACTGCTTTAAACTTTTCCGTTGACTTG
TCCGTTAGAACTTCAAATTAATATTTCATTATGAATAAAAAATATGCAAGTATAAATATG
TGTTACTTATTGTCAACTCAGCATACAAACATTGGGTTTTCAGACGGTAATGTCATTTTT
ATCCATAGATTAATCACATGTGTCGATGGATGAATTGAACTGAAGTATATCAACACTTTT
CATGAAGTCAACTCATACTTTTTCATTGAAGTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CQ59JQ U 63
AF RS1CQ59TF C 1
BS 1 62 RS1CQ59TF
BS 63 200 RS1CQ59JQ
BS 201 335 RS1CQ59TF

RD RS1CQ59JQ 138 0 0
CTCTCTTAAAGAAACAAAAAAAAAGTTCGTCACTGCTTTAAACTTTTCCGTTGACTTGTC
CGTTAGAACTTCAAATTAATATTTCATTATGAATAAAAAATATGCAAGTATAAATATGTG
TTACTTATTGTCAACTCA

QA 1 138 1 138
DS 

RD RS1CQ59TF 335 0 0
AAAAGTTGAGATTCTTCTTCAATGGCATGACTTTTAATGGTGGTGCCAAACCACTTACGC
TACTCTCTTAAAGAAACAAAAAAAAAGTTCGTCACTGCTTTAAACTTTTCCGTTGACTTG
TCCGTTAGAACTTCAAATTAATATTTCATTATGAATAAAAAATATGCAAGTATAAATATG
TGTTACTTATTGTCAACTCAGCATACAAACATTGGGTTTTCAGACGGTAATGTCATTTTT
ATCCATAGATTAATCACATGTGTCGATGGATGAATTGAACTGAAGTATATCAACACTTTT
CATGAAGTCAACTCATACTTTTTCATTGAAGTATC

QA 1 335 1 335
DS 



AS 1 2

CO CL4635Contig1 736 2 4 U
GCATTTTCAACTGCAGACGGAGCTCTGGAGGCAGCTCCTGCGATGGGTATAGCTGATGCC
ATACTGGACCTTGTGAGTAGTGGGACAACACTCAAAGAAAATAACTTAAAAGAGATTGAA
GGAGGCGTTGTGCTGGAAAGTCAGGCGGTACTTGTGGCAAGCAGAAGAGCATTGACCGAC
AGAGAAGGAGCGTTAAACACATTGCACGAGATTCTGGAGAGACTGGAGGCCCATCTGAAG
GCAGATGGCCAGTTCACTGTTGTTGCAAACATGAGAGGAAATAGTGCTCAGGAAGTGGCT
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TACTGTAAACAAGATGGAAAAGTATCGATTGACTACTATGCCATTGTGATTTGTGTGCCA
AAGAAGGCCTTATACGAGTCAGTGAAGCAACTCAGAGCGGTTGGAGGCAGTGGGGTATTA
GTTTCACCTCTGACCTACATTTTTGATGAGGAAACTCCAAGATGGGGCCAACTCCTGAGA
AACCTCAAGCTTTAAATGTATCGGTAAGGAAGATGCATACGATGAATAGGTTTTAAGGAG
ACCCTTTGGTTTGAATCTCTGGGTTGGTACTTTTGTGTCAACCTTAGTTCTGTCTTCTTT
CTTTCTCTCGTCGCTGTTGTAATTTTTACTTCACTTTTTCTGTTTGGATCCTACACATTG
TTGTTTTGTCTGTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RS1H729TF U 1
AF RS1H729JQB C 233
BS 1 640 RS1H729TF
BS 641 641 RS1H729JQB
BS 642 733 RS1H729TF
BS 734 736 RS1H729JQB

RD RS1H729TF 733 0 0
GCATTTTCAACTGCAGACGGAGCTCTGGAGGCAGCTCCTGCGATGGGTATAGCTGATGCC
ATACTGGACCTTGTGAGTAGTGGGACAACACTCAAAGAAAATAACTTAAAAGAGATTGAA
GGAGGCGTTGTGCTGGAAAGTCAGGCGGTACTTGTGGCAAGCAGAAGAGCATTGACCGAC
AGAGAAGGAGCGTTAAACACATTGCACGAGATTCTGGAGAGACTGGAGGCCCATCTGAAG
GCAGATGGCCAGTTCACTGTTGTTGCAAACATGAGAGGAAATAGTGCTCAGGAAGTGGCT
GAACGCGTGCTGAGCCAACCATTATTGTCAGGACTGCAGGGACCAACAATAAGCCCAGTT
TACTGTAAACAAGATGGAAAAGTATCGATTGACTACTATGCCATTGTGATTTGTGTGCCA
AAGAAGGCCTTATACGAGTCAGTGAAGCAACTCAGAGCGGTTGGAGGCAGTGGGGTATTA
GTTTCACCTCTGACCTACATTTTTGATGAGGAAACTCCAAGATGGGGCCAACTCCTGAGA
AACCTCAAGCTTTAAATGTATCGGTAAGGAAGATGCATACGATGAATAGGTTTTAAGGAG
ACCCTTTGGTTTGAATCTCTGGGTTGGTACTTTTGTGTCA*CCTTAGTTCTGTCTTCTTT
CTTTCTCTCGTCGCTGTTGTAATTTTTACTTCACTTTTTCTGTTTGGATCCTACACATTG
TTGTTTTGTCTGT

QA 1 733 1 733
DS 

RD RS1H729JQB 504 0 0
ATCTGAAGGCAGATGGCCAGTTCACTGTTGTTGCAAACATGAGAGGAAATAGTGCTCAGG
AAGTGGCTGAACGCGTGCTGAGCCAACCATTATTGTCAGGACTGCAGGGACCAACAATAA
GCCCAGTTTACTGTAAACAAGATGGAAAAGTATCGATTGACTACTATGCCATTGTGATTT
GTGTGCCAAAGAAGGCCTTATACGAGTCAGTGAAGCAACTCAGAGCGGTTGGAGGCAGTG
GGGTATTAGTTTCACCTCTGACCTACATTTTTGATGAGGAAACTCCAAGATGGGGCCAAC
TCCTGAGAAACCTCAAGCTTTAAATGTATCGGTAAGGAAGATGCATACGATGAATAGGTT
TTAAGGAGACCCTTTGGTTTGAATCTCTGGGTTGGTACTTTTGTGTCAACCTTAGTTCTG
TCTTCTTTCTTTCTCTCGTCGCTGTTGTAATTTTTACTTCACTTTTTCTGTTTGGATCCT
ACACATTGTTGTTTTGTCTGTTAG

QA 1 504 1 504
DS 



AS 1 2

CO CL4636Contig1 895 2 2 U
AGGAAGCTAAGATAAAACTAGAAGCCTTGGACAAGAAAGATAGGGAAAGAAGAAGAACGG
CTGAGTTGAAAAACAACCTTGAATCTTATGTTTATGCTACCAAAGAGAAGCTAGAAGCAC
CCGAATTTGAAAAGGTTTCCACCCAAGAAGAGCGCAAGGCGTTCGTTGAGAAGCTTGATG
AGGTTCAAGATTGGCTTTACATGGACGGAGAAGATGCTAATGCCACAGAGTTCCAGGACC
GGCTTGACTCACTAAAAGCCATTGGCAGTCCCATATCTTTGCGGTCAGAGGAGCTTACAG
CACGACCAGTAGCAGTTGAATACGCTCAAAAATACCTAACCGAAGTGAAAGAGATCATAA
AAGAGTGGGAGACGAACAAAACTTGGCTTCCGAAAGAAAAAATCGATGAGGTGTCAAAGG
AAGCAGAGAAAGTAAAAAGCTGGTTGGAGAAGAATGAAACTGAGCAGAAAAAGAGTGCTC
TGTGGAGCAAGCCAGTGTTCACGTCCGATGAAGTGTACGCTAAAGTATTTACCCTGCAAG
ACAAGGTGACGAAGGTTAATAGGATTCCAAAGCCAAAGCCAAAGATAGAGAAAGCAACCA
AGAAGGAGAACACATCGAAGGAGGAGGAGGAACAATCAAAGTCTTCAGACTCCATTAATT
CTTCTGAATCTGCCAAAGAAGAAGAAGGGCTCCACCAGGAGCTTTGATTAACATTATTTT
AATATAGTATTTAATAACAGAGTTTAATTTTGTGTGTGTTTTAAGTGTCAAATAGGAAAA
GGTTAGTAAAGCCAAGCTGGGATAAGCAAATAGGATTTTATTCCTTTTTCATCTTCTTCA
CCTTAGAAAAGAAATATTAATATAAAATTTTGGTCTCTTTATCCATTTGAACTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BP44TF U 1
AF RS1BP44JQ C 120
BS 1 554 RS1BP44TF
BS 555 895 RS1BP44JQ

RD RS1BP44TF 557 0 0
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CTGAGTTGAAAAACAACCTTGAATCTTATGTTTATGCTACCAAAGAGAAGCTAGAAGCAC
CCGAATTTGAAAAGGTTTCCACCCAAGAAGAGCGCAAGGCGTTCGTTGAGAAGCTTGATG
AGGTTCAAGATTGGCTTTACATGGACGGAGAAGATGCTAATGCCACAGAGTTCCAGGACC
GGCTTGACTCACTAAAAGCCATTGGCAGTCCCATATCTTTGCGGTCAGAGGAGCTTACAG
CACGACCAGTAGCAGTTGAATACGCTCAAAAATACCTAACCGAAGTGAAAGAGATCATAA
AAGAGTGGGAGACGAACAAAACTTGGCTTCCGAAAGAAAAAATCGATGAGGTGTCAAAGG
AAGCAGAGAAAGTAAAAAGCTGGTTGGAGAAGAATGAAACTGAGCAGAAAAAGAGTGCTC
TGTGGAGCAAGCCAGTGTTCACGTCCGATGAAGTGTACGCTAAAGTATTTACCCTGCAAG
ACAAGGTGACGAAG
TTA

QA 1 554 1 554
DS 

RD RS1BP44JQ 776 0 0
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GAGGTTCAAGATTGGCTTTACATGGACGGAGAAGATGCTAATGCCACAGAGTTCCAGGAC
CGGCTTGACTCACTAAAAGCCATTGGCAGTCCCATATCTTTGCGGTCAGAGGAGCTTACA
GCACGACCAGTAGCAGTTGAATACGCTCAAAAATACCTAACCGAAGTGAAAGAGATCATA
AAAGAGTGGGAGACGAACAAAACTTGGCTTCCGAAAGAAAAAATCGATGAGGTGTCAAAG
GAAGCAGAGAAAGTAAAAAGCTGGTTGGAGAAGAATGAAACTGAGCAGAAAAAGAGTGCT
CTGTGGAGCAAGCCAGTGTTCACGTCCGATGAAGTGTACGCTAAAGTATTTACCCTGCAA
GACAAGGTGACGAAGGTTAATAGGATTCCAAAGCCAAAGCCAAAGATAGAGAAAGCAACC
AAGAAGGAGAACACATCGAAGGAGGAGGAGGAACAATCAAAGTCTTCAGACTCCATTAAT
TCTTCTGAATCTGCCAAAGAAGAAGAAGGGCTCCACCAGGAGCTTTGATTAACATTATTT
TAATATAGTATTTAATAACAGAGTTTAATTTTGTGTGTGTTTTAAGTGTCAAATAGGAAA
AGGTTAGTAAAGCCAAGCTGGGATAAGCAAATAGGATTTTATTCCTTTTTCATCTTCTTC
ACCTTAGAAAAGAAATATTAATATAAAATTTTGGTCTCTTTATCCATTTGAACTTT

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

CO CL4637Contig1 809 2 2 U
GGATAGCTAAAAGTTCCATATATATAACCCAAACAAGATATCATTGAAGAGAAGCCAGAG
ATCATAATGTCTATAGATTTATCATCTGACCATGTTTGCTATGTCCACTGCAACTTCTGC
ACCACGATTTTAGCGGTAAATGTACCATATGCAAGTTTGTTCACACTTGTGACGGTGAGA
TGTGGCCATTGTACCAATTTGCTCTCTCTAAACATTGGAGTTTCACTTCATCAAACCTCA
CCTACTCCTATTCATCAAGACCCTCAGCATAAGCAACGCATAACCTCTGCGGTGACAAGG
AAAGAATATGGATCATCTTCTAGGAGCTCCAACCATTTTTCAACCACATTGGCAGAAAGT
GTCGATCGAGAGGCCCCTAGGATGCCTCCTATTCGTCCGCCGGAGAAAAGACAACGCGTT
CCTTCGGCCTACAACAGGTTCATCAAAGAGGAAATCCAAAGAATCAAGGCTGGCAATCCA
GAGATCAGCCACCGCGAGGCGTTTAGCACAGCTGCTAAAAATTGGGCACATTTTCCTCAC
ATTCACTTTGGATTAAAGCTGGATGGCAACAAGAAGGGAAAGCAATTAGACCAGACAGTT
GCAGGACAAAAGTCTAATGGATACTACTAAAGCCTTTACATATACATCGATAATGGCTAT
TATATATATGTATGTGTATGCGGATGATGGAAGTGAAGGCAAAGAAGAAGAAGATTATAA
TAACCTTACACACACACATATATACGTGTATGTATGTCCCTTTCTTTTTTCTTGCGTGGG
CTCCATCTATAACTACGTTTCTGTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AG54TF U 1
AF RS1AG54JQ C 291
BS 1 807 RS1AG54TF
BS 808 809 RS1AG54JQ

RD RS1AG54TF 807 0 0
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ATCATAATGTCTATAGATTTATCATCTGACCATGTTTGCTATGTCCACTGCAACTTCTGC
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TGTGGCCATTGTACCAATTTGCTCTCTCTAAACATTGGAGTTTCACTTCATCAAACCTCA
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AAAGAATATGGATCATCTTCTAGGAGCTCCAACCATTTTTCAACCACATTGGCAGAAAGT
GTCGATCGAGAGGCCCCTAGGATGCCTCCTATTCGTCCGCCGGAGAAAAGACAACGCGTT
CCTTCGGCCTACAACAGGTTCATCAAAGAGGAAATCCAAAGAATCAAGGCTGGCAATCCA
GAGATCAGCCACCGCGAGGCGTTTAGCACAGCTGCTAAAAATTGGGCACATTTTCCTCAC
ATTCACTTTGGATTAAAGCTGGATGGCAACAAGAAGGGAAAGCAATTAGACCAGACAGTT
GCAGGACAAAAGTCTAATGGATACTACTAAAGCCTTTACATATACATCGATAATGGCTAT
TATATATATGTATGTGTATGCGGATGATGGAAGTGAAGGCAAAGAAGAAGAAGATTATAA
TAACCTTACACACACACATATATACGTGTATGTATGTCCCTTTCTTTTTTCTTGCGTGGG
CTCCATCTATAACTACGTTTCTGTGTT

QA 1 807 1 807
DS 

RD RS1AG54JQ 519 0 0
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TGGCAATCCAGAGATCAGCCACCGCGAGGCGTTTAGCACAGCTGCTAAAAATTGGGCACA
TTTTCCTCACATTCACTTTGGATTAAAGCTGGATGGCAACAAGAAGGGAAAGCAATTAGA
CCAGACAGTTGCAGGACAAAAGTTTAATGGATACTACTAAAGCCTTTACATATACATCGA
TAATGGCTATTATATATATGTATGTGTATGCGGATGATGGAAGTGAAGGCAAAGAAGAAG
AAGATTATAATAACCTTACACACACACATATATACGTGTATGTATGTCCCTTTCTTTTTT
CTTGCGTGGGCTCCATCTATAACTACGTTTCTGTGTTCC

QA 1 519 1 519
DS 



AS 1 2

CO CL4638Contig1 1288 2 2 U
CTGGTGGTGCTGCAAAGAAAAGTAAGCATGTGTACCACTGTACTGACGAGGAATATCGAT
CGAAATATTCTGGCTGGCCGACGAATATCATCAACATTGAAATTCCTTCCCCTAACGGCC
TTGATGCGTATCCATCAGTTACAGAAGCAGTTAAAGCCAACATGACCAACATGGAATGTG
GTCTCCCCACTCTTTTGTCTTTCACAGCTCGTGAATTAGCAGATGGGACTCTTTTCAAAG
CAATTAAAGAATATGATCCAGATAGCGCGAGGATGTTACACCAGTTAAAGAAGTTGTATC
ATGATGACCCTGTTATGAACCCACTGACTCCTTGGGAGAGACCACCTATAAAAAATGTAT
TTTGCATATATGGTGCTCATTTAAAGACAGAGGTTGGCTATTACTTTGCCCCAAGTGGCA
AACCTTATCCTGATAATTGGATCATTACGGATATTATTTACGAAACTGAAGGTTCCCTCG
TGTCAAGGTCTGGAACTGTGGTTGATGGGAACGCTGGGCCTATAACTGGGGATGAGACGG
TACCCTATCATTCACTCTCTTGGTGCAAGAATTGGCTCGGACCTAAAGTCAGCATAACAA
TGGCTCCCCAGCCAGAACACGATGGAAGTGATGTACAAATCGAACTGAATGTTGAACATG
AGCATGGGTCAGACATCATAGCGAACATGACAAAGGCACCAAGGGTGAAGTACATAACCT
TCTTCGAAGATTCTGAGAGTATTCCAGGAAAGATAACGGCAGTGTGGGAGCTTGATAAAG
CGAATCACAGGAACATCGTTAGATCGCCAGTTCTTATGAGAGAGCTATGGCTTCAGATGT
GGCATGACATTCAGCCTGGCGAAAAGTCCAAATTTGTCACCAAAGCCAAGCGGGGGCCAC
TTAGAGATGCGGATTGCTACTGGGATTACGGGAAAGCATGTTGTGCTTGGCAAGAATACT
GCGAATACAGATACAGTTTTGGGGATGTTCACCTAGGACAAAGTTGTAGATTGAGGAACA
CATCTTTTAATGTACTGCTCCAGTACATATAAGATCATCTCCTCGTTCAGGTTCACAATA
ATTCCTTCCTCTTAATTTTTCGCTCCCAGTAAGGGGAAAAAAAAACGTTGAATTCTTATT
GCTCTCTCTATATCTACAATTTTGCCTTCTCACGCAATGGTATTCTTTTGTGATTTGTAG
CTAGAGTGCAGTTACTTTGAATTTTACGGCTAAACCCGTATTGAAAAGGTATTTTTGTTA
ATTACACTAAGGTAGTAAAACCCGTTTA


BQ
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AF RS1A484TF U 1
AF RS1A484JQ C 549
BS 1 691 RS1A484TF
BS 692 1288 RS1A484JQ

RD RS1A484TF 691 0 0
CTGGTGGTGCTGCAAAGAAAAGTAAGCATGTGTACCACTGTACTGACGAGGAATATCGAT
CGAAATATTCTGGCTGGCCGACGAATATCATCAACATTGAAATTCCTTCCCCTAACGGCC
TTGATGCGTATCCATCAGTTACAGAAGCAGTTAAAGCCAACATGACCAACATGGAATGTG
GTCTCCCCACTCTTTTGTCTTTCACAGCTCGTGAATTAGCAGATGGGACTCTTTTCAAAG
CAATTAAAGAATATGATCCAGATAGCGCGAGGATGTTACACCAGTTAAAGAAGTTGTATC
ATGATGACCCTGTTATGAACCCACTGACTCCTTGGGAGAGACCACCTATAAAAAATGTAT
TTTGCATATATGGTGCTCATTTAAAGACAGAGGTTGGCTATTACTTTGCCCCAAGTGGCA
AACCTTATCCTGATAATTGGATCATTACGGATATTATTTACGAAACTGAAGGTTCCCTCG
TGTCAAGGTCTGGAACTGTGGTTGATGGGAACGCTGGGCCTATAACTGGGGATGAGACGG
TACCCTATCATTCACTCTCTTGGTGCAAGAATTGGCTCGGACCTAAAGTCAGCATAACAA
TGGCTCCCCAGCCAGAACACGATGGAAGTGATGTACAAATCGAACTGAATGTTGAACATG
AGCATGGGTCAGACATCATAGCGAACATGAC

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1A484JQ 740 0 0
CATTCACTCTCTTGGTGCAAGAATTGGCTCGGACCTAAAGTCAGCATAACAATGGCTCCC
CAGCCAGAACACGATGGAAGTGATGTACAAATCGAACTGAATGTTGAACATGAGCATGGG
TCAGACATCATAGCGAACATGACAAAGGCACCAAGGGTGAAGTACATAACCTTCTTCGAA
GATTCTGAGAGTATTCCAGGAAAGATAACGGCAGTGTGGGAGCTTGATAAAGCGAATCAC
AGGAACATCGTTAGATCGCCAGTTCTTATGAGAGAGCTATGGCTTCAGATGTGGCATGAC
ATTCAGCCTGGCGAAAAGTCCAAATTTGTCACCAAAGCCAAGCGGGGGCCACTTAGAGAT
GCGGATTGCTACTGGGATTACGGGAAAGCATGTTGTGCTTGGCAAGAATACTGCGAATAC
AGATACAGTTTTGGGGATGTTCACCTAGGACAAAGTTGTAGATTGAGGAACACATCTTTT
AATGTACTGCTCCAGTACATATAAGATCATCTCCTCGTTCAGGTTCACAATAATTCCTTC
CTCTTAATTTTTCGCTCCCAGTAAGGGGAAAAAAAAACGTTGAATTCTTATTGCTCTCTC
TATATCTACAATTTTGCCTTCTCACGCAATGGTATTCTTTTGTGATTTGTAGCTAGAGTG
CAGTTACTTTGAATTTTACGGCTAAACCCGTATTGAAAAGGTATTTTTGTTAATTACACT
AAGGTAGTAAAACCCGTTTA

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL4639Contig1 677 2 6 U
GGAGCCAGCGTCTCCTCATTTTCATTCCAGAAACTTCTTATCAACCATGGCCCAAAATCA
AAATCTGGTCGACTTAACCGAGAAACTAAGCTTGTCTTCGAGCAAGATAGTGTTAACCAG
CTCCGACGGCGATTCTTTCGAGATCGACGAAGCAGTGGCTCGCAAATCCGAGACCATAGC
TGAAATGCTCGAAGCCGGCTGTGCCGGAGAGATCCCGCTTCAGAACGTCACCGGGGAGAT
CCTCGACAAAGTCATCGACTACTGCAAGAAGCACGCCGAAGAAGCTGGTCCGTTTGAAGA
AGAAGAAGATGAAGACAAAGAGGCGAAGAAGAAATGGGATGCGGAGTTCGTGAAAGTAGA
TCTGGAAACCATGTTCGAGCTCATTCTTGCTGCTAACTATCTCAACATCCCGGGCCTTCT
CGATCTTACATCCCAGGCGGTTGCAGATCACATTAAAGACAAAACACCAGAGGATGTTCG
CGAGATTTTCGGTATCGAGAACGATTTCACACCCGAAGAAGAAGAAGCTGTTCGCAAGGA
GCACGCTTGGGCTTTTGAATGATTTCTAAATTAATAATAATGTTCTTAGATCTGTTTATT
TCGCGAATCTTGATTGACTTGGCCTCTTTAGTTTCCAATGGGTAATGTCTTTCGTCTCTT
TAATTTCAATGTTTGCA


BQ
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AF RS1CT56TF U 1
AF RS1AI26TF U 23
BS 1 36 RS1CT56TF
BS 37 37 RS1AI26TF
BS 38 84 RS1CT56TF
BS 85 85 RS1AI26TF
BS 86 185 RS1CT56TF
BS 186 677 RS1AI26TF

RD RS1CT56TF 185 0 0
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AAATCTGGTCGACTTAACCGAGAAGCTAAGCTTGTCTTCGAGCAAGATAGTGTTAACCAG
CTCCGACGGCGATTCTTTCGAGATCGACGAAGCAGTGGCTCGCAAATCCGAGACCATAGC
TGAAA

QA 1 185 1 185
DS 

RD RS1AI26TF 655 0 0
CATTCCAGAAACTTCTTATCAACCATGGCCCAAAATCAAA*TCTGGTCGACTTAACCGAG
AAACTAAGCTTGTCTTCGAGCAAGATAGTGTTAACCAGCTCCGACGGCGATTCTTTCGAG
ATCGACGAAGCAGTGGCTCGCAAATCCGAGACCATAGCTGAAATGCTCGAAGCCGGCTGT
GCCGGAGAGATCCCGCTTCAGAACGTCACCGGGGAGATCCTCGACAAAGTCATCGACTAC
TGCAAGAAGCACGCCGAAGAAGCTGGTCCGTTTGAAGAAGAAGAAGATGAAGACAAAGAG
GCGAAGAAGAAATGGGATGCGGAGTTCGTGAAAGTAGATCTGGAAACCATGTTCGAGCTC
ATTCTTGCTGCTAACTATCTCAACATCCCGGGCCTTCTCGATCTTACATCCCAGGCGGTT
GCAGATCACATTAAAGACAAAACACCAGAGGATGTTCGCGAGATTTTCGGTATCGAGAAC
GATTTCACACCCGAAGAAGAAGAAGCTGTTCGCAAGGAGCACGCTTGGGCTTTTGAATGA
TTTCTAAATTAATAATAATGTTCTTAGATCTGTTTATTTCGCGAATCTTGATTGACTTGG
CCTCTTTAGTTTCCAATGGGTAATGTCTTTCGTCTCTTTAATTTCAATGTTTGCA

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 2

CO CL4640Contig1 900 2 2 U
GGCTCACTACTTCCATCAAAACGCCGAAACCCAGTTCTTTGTCTCTACTATAGTCCCTAG
CCTACTTTCAGCGACGTTCTCTCTCTGGTTGACACCGGAGGAATTCGTCTTCTTTGGATC
GCACAGGCGGCGCCTTCGATAGGCTTTGCCATATGGCCACGGCAGAAGCAGCTCCAGCTT
CTGCTGGTCCACGATATGCTCCAGAGGATCCCACTCTTCCCAAACCTTGGAAGGGACTTA
TCGATGGAAGTAGCGGCGTTTTGTATTACTGGAATCCTGAAACGAACATTACTCAATACG
AAAGACCTTCTCCACCTTTGCCAGCTGGAGCTCCTCCGAAGCTAGCTCAGATTCCTGTAC
CTTCTGCAGTACAACAAGGCCATCAAGGTCAGATTGAACAAGCAAAACCAGTTGGTCACG
TGGCTCAGCAACATGGTTTACAACAACAGCCTCAGCAATTCCCATCTCAACATGGAAGGC
CCCAAATGATGCAGCAGCAGCATCCGGGCCAGCAGATGCCTCAACAATCAGGTCAACAGT
TTTCCCAACAACAGGGCCAATCTATGGCGTCACAGCCACAAGGGTATCCTTCTCAACAGA
CGTACCAGCAAATGCCACAGCAGCAGCAACCAATGCAGAACCAGCATTCACAGATTTCTC
AACAGGGCCATCAGTATGGACATTCACAACAACAGTACATGGGTTATCGTCCTTACATGC
AACCACAAGGGACTCAAAATTCACATCAGACACCTCAGATGGGTCCCCAGGGTCAGCAGT
TTCCGAGCCAGCAAGAGTACAACTCATTGCCTCCAAAGAGGGAGGGGGAAGAGTTCCATG
GGGGTAAGAAAACTGGGTTTTCTCAACCCCATCTACAAAATTCTGAAGGTTCGCCATCTC


BQ
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AF RS1GJ71TF U 1
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CCCAAATGATGCAGCAGCAGCATCCGGGCCAGCAGA

QA 1 516 1 516
DS 

RD RS1GJ71JQ 534 0 0
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AACAACAGGGCCAATCTATGGCGTCACAGCCACAAGGGTATCCTTCTCAACAGACGTACC
AGCAAATGCCACAGCAGCAGCAACCAATGCAGAACCAGCATTCACAGATTTCTCAACAGG
GCCATCAGTATGGACATTCACAACAACAGTACATGGGTTATCGTCCTTACATGCAACCAC
AAGGGACTCAAAATTCACATCAGACACCTCAGATGGGTCCCCAGGGTCAGCAGTTTCCGA
GCCAGCAAGAGTACAACTCATTGCCTCCAAAGAGGGAGGGGGAAGAGTTCCATGGGGGTA
AGAAAACTGGGTTTTCTCAACCCCATCTACAAAATTCTGAAGGTTCGCCATCTC

QA 1 534 1 534
DS 



AS 1 2

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TCTTGGATTTCATCTCTGGAGTTGTTATTTCTTTGAATTTAAAGAGTATGAGCATGTTTT
TAACTCAGTTCGGTTATTAGTCCTTTTGCTTC


BQ
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AF RS1EB30JQ C 1
AF RS1EB30TF U 1
BS 1 512 RS1EB30TF

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QA 1 512 1 512
DS 

RD RS1EB30TF 512 0 0
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GAGCGTGGTGAAGCCGATTAAGAAGGATGCGAAGAGAGCTGTGCTTAAGAAGAACCCGTT
GAAGAACCTTAATGTGATGCTTAAGTTGAATCCGTACGCTAAGACTGCAAAGAGGATGTC
TTTGTTGGCTGAAGCGCAGAGAGTTAAGTCTAAGAAGGAGAAACTCGAGAAGAAGAGGAA
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TATGATCTCAGACAGTGATTACACAGAGTTTGATAACTTCACCAAGTGGCTTGGAGCCAG
TCAGTAGTTCTATCCGGTTTAGGCAAAGATTTTTGGTTATTACTTTATGTTATTCATTTT
TCTTGGATTTCATCTCTGGAGTTGTTATTTCTTTGAATTTAAAGAGTATGAGCATGTTTT
TAACTCAGTTCGGTTATTAGTCCTTTTGCTTC

QA 1 512 1 512
DS 



AS 1 2

CO CL4642Contig1 591 2 2 U
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TAATGTATAAGTTTGATATTTGTTCTTTAACAGTGATTAAAGGTGAACGAT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DB36TF U 1
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BS 1 532 RS1DB36TF
BS 533 591 RS1DB36JQ

RD RS1DB36TF 532 0 0
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QA 1 532 1 532
DS 

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AGCTTCTTTGATGTTAATTAAACTCACTACTCCAAAAGTATAATGTATAAGTTTGATATT
TGTTCTTTAACAGTGATTAAAGGTGAACGAT

QA 1 571 1 571
DS 



AS 1 2

CO CL4643Contig1 398 2 2 U
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BQ
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15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AW45TF U 1
AF RS1CA71TF U 209
BS 1 367 RS1AW45TF
BS 368 398 RS1CA71TF

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GGAAAAGCAAAAGCATCAAGCATGGGGAGCTTCTAGTCCATGTTGAGATGAAGCATCATG
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ATGTGAAGACTTAAGAGATGAGAAGAGGAGAAGAAGAAACTCGCCAAGTAAAAGAAATGG
TTGGCAAGTTTGAAGAGAGTCACGGGTGAGAATAAGGAGAGAGTGGTTCCCAACCGTTGG
GACCTGT

QA 1 367 1 367
DS 

RD RS1CA71TF 190 0 0
G
GCACAAGGTAGCATAGTTGGATATTCAAATAATGTGAAGACTTAAGAGATGAGAAGAGGA
GAAGAAGAAACTCGCCAAGTAAAAGAAATGGTTGGCGAGTTTGAAGAGAGTCACGGGTGA
GAGTAAGGAGAGAGTGGTTCCCAACCGTTGGGACCTGTCCCTTTCACTCTGCGTTGATAC
CACTGCTTT

QA 2 190 2 190
DS 



AS 1 2

CO CL4644Contig1 668 2 3 U
GTGGAGAGCAGAGCAGGCGGCGATGAAGACGGTGATGGGAAGGGTAACGAGTGAGAGACC
GATCAGTCTCTCAAAGGCGGCAACGCTTCTCTCAAGTTTCGTTTCCTCAGAGACAGAGGC
CTCTCAAGACGTCGCCGCGTACCTCCGACGCGCCTCCGCTGCCTTCACCGAGCTTAAGAG
CTTCCACAGAGAGATTAGATCTACTACCAAGCCTGAATCCGAGGCAAAGGATGAGAAGAA
GAAGAGCAGAGAAGAAGAAGTTGTTGTTGAGGAGGAGAAGGAGAGTGTGAAGTTGGAAGA
GGAGGCAGTGAAGAAAGAGAGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGCAAAGGTGATGATGTTGT
TGTTGTTGAAGAAAAAATGGATGTGAAGTTAGAAGAAGAGCAGAGGAACAATGATGAGAG
CAAGAAGAAAAAGAAGCACAAGAAGAAGAGCAAAGGTGAAGATGTTGTTGAAGAAGAGAA
AAAGAAGAAGAAGAAGAAGCGGAAGAGTGATGGAGAGATTGGTTCTGAGGAGAAGAAGAA
GAGGAAATCAAAGGAGATTGATGCTTGAACTTGCTTTCTTTTGTCATCTTGGAGACCAAT
TTTGTAGGCTTAAGATGTTCCTTATTGACAATTAAGATTTTGATAAAAAAGATTTGATTT
GTGGAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1B418TF U 1
AF RS1B418JQ C 140
BS 1 649 RS1B418TF
BS 650 650 RS1B418JQ
BS 651 668 RS1B418TF

RD RS1B418TF 668 0 0
GTGGAGAGCAGAGCAGGCGGCGATGAAGACGGTGATGGGAAGGGTAACGAGTGAGAGACC
GATCAGTCTCTCAAAGGCGGCAACGCTTCTCTCAAGTTTCGTTTCCTCAGAGACAGAGGC
CTCTCAAGACGTCGCCGCGTACCTCCGACGCGCCTCCGCTGCCTTCACCGAGCTTAAGAG
CTTCCACAGAGAGATTAGATCTACTACCAAGCCTGAATCCGAGGCAAAGGATGAGAAGAA
GAAGAGCAGAGAAGAAGAAGTTGTTGTTGAGGAGGAGAAGGAGAGTGTGAAGTTGGAAGA
GGAGGCAGTGAAGAAAGAGAGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGCAAAGGTGATGATGTTGT
TGTTGTTGAAGAAAAAATGGATGTGAAGTTAGAAGAAGAGCAGAGGAACAATGATGAGAG
CAAGAAGAAAAAGAAGCACAAGAAGAAGAGCAAAGGTGAAGATGTTGTTGAAGAAGAGAA
AAAGAAGAAGAAGAAGAAGCGGAAGAGTGATGGAGAGATTGGTTCTGAGGAGAAGAAGAA
GAGGAAATCAAAGGAGATTGATGCTTGAACTTGCTTTCTTTTGTCATCTTGGAGACCAAT
TTTGTAGGCTTAAGATGTTCCTTATTGACAATTAAGATTTTGATAAAAA*GATTTGATTT
GTGGAACT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1B418JQ 529 0 0
TACCTCCGACGCGCCTCCGCTGCCTTCACCGAGCTTAAGAGCTTCCACAGAGAGATTAGA
TTTACTACCAAGCCTGAATCCGAGGCAAAGGATGAGAAGAAGAAGAGCAGAGAAGAAGAA
GTTGTTGTTGAGGAGGAGAAGGAGAGTGTGAAGTTGGAAGAGGAGGCAGTGAAGAAAGAG
AGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGCAAAGGTGATGATGTTGTTGTTGTTGAAGAAAAAATG
GATGTGAAGTTAGAAGAAGAGCAGAGGAACAATGATGAGAGCAAGAAGAAAAAGAAGCAC
AAGAAGAAGAGCAAAGGTGAAGATGTTGTTGAAGAAGAGAAAAAGAAGAAGAAGAAGAAG
CGGAAGAGTGATGGAGAGATTGGTTTTGAGGAGAAGAAGAAGAGGAAATCAAAGGAGATT
GATGCTTGAACTTGCTTTTTTTTGTCATCTTGGAGACCAATTTTGTAGGCTTAAGATGTT
CCTTATTGACAATTAAGATTTTGATAAAAAAGATTTGATTTGTGGAACT

QA 1 529 1 529
DS 



AS 1 2

CO CL4645Contig1 158 2 1 U
GACTGGAATCTTGCTAGCTGTGACAATCATATATCAGTATTTCGAAACCTTTGAGAAGGA
AAAAGCGAGTGAGCTCGGCTTCTTTGGCTTCTAAATGTATCAGTCTTATGTAAAAGGGTA
AATTTTGATGAGCTAGTGAGGAACACTCGTACGTGTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1A495JQ C 1
AF RS1A495TF U 1
BS 1 158 RS1A495TF

RD RS1A495JQ 158 0 0
GACTGGAATCTTGCTAGCTGTGACAATCATATATCAGTATTTCGAAACCTTTGAGAAGGA
AAAAGCGAGTGAGTTCGGCTTCTTTGGCTTCTAAATGTATCAGTCTTATGTAAAAGGGTA
AATTTTGATGAGCTAGTGAGGAACATTCGTACGTGTCC

QA 1 158 1 158
DS 

RD RS1A495TF 158 0 0
GACTGGAATCTTGCTAGCTGTGACAATCATATATCAGTATTTCGAAACCTTTGAGAAGGA
AAAAGCGAGTGAGCTCGGCTTCTTTGGCTTCTAAATGTATCAGTCTTATGTAAAAGGGTA
AATTTTGATGAGCTAGTGAGGAACACTCGTACGTGTCC

QA 1 158 1 158
DS 



AS 1 2

CO CL4646Contig1 902 2 2 U
GGACTGTACGTCGTATCCGAAACCACCAACTTCGTCTCTCATCTTCCTCCGGCTTAGCGG
CGGTGACGATTGCGCTTCATCTCATGTCTGTAACGGACTGCGTTATGAATCTGTCTTTAA
TCCCTTTGATTAATTCTCACACGATGTTTCTTTGATGCGCTGGTTAGATGTGAGGGGCTG
TGTATAAATAGATATCCTGCGAAAATGAGCAACCAGAAGAACGCCTTGATCTTACCGCAG
ATGTACAGTGTACTCTTTGGTTGTCCAACGTTTGGCTGTCCTTGAGAACTTGAGTCTCAC
TGTTGGGAAGCGAGGTTCTCAGAGAGATTCAGGTGAATCCATCTTCCACCTAGATGAAAT
GAAACTTCTATTTCATTGGGATCATGGATTTTGGTGGACTTCCAAATATTATCTGTAAGA
GTTTCTGCAAATTCTTCAGTCCACTTCAAGTTCCTGAGAACAACAATGATCCTGATGATG
GATAGAACTCCAAGGCCAAATGGAGCACGACTATGACAACAGGCCTGACTCCTGATCTCA
TATTCAGTTCTATTTTCTTTTTAGCTCAGTTCTAGGATCTAAATATGTCGATTGTTTAAT
CAGTAGATCAAACCATTAAAGAGAAAATCGTCTTGCGTGTTGTGTCAAAGTTTACTGGTG
AAGTTGTTGATGCATATTACCTTGAGATGGACAACGATGATGATGAGGTTACCGAAGATG
ATGATGAGGATGCGAAGGGAGGAAGATGAGTAGAGGAGGACGAGGATGACAATGAAAAGG
ATGAGCAAGGAAAGAAGAGCATAAAAAGTCATCACCTGGACGCAAGTCTGGAAGCATACA
ACTTGCGGAAGGTCAACAAGGTGAGAGGCCTTTGGAGAGTAAGCAACAGTGAGTAAAATT
TT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1GE68TF U 1
AF RS1GE68JQ C 558
BS 1 707 RS1GE68TF
BS 708 902 RS1GE68JQ

RD RS1GE68TF 711 0 0
GGACTGTACGTCGTATCCGAAACCACCAACTTCGTCTCTCATCTTCCTCCGGCTTAGCGG
CGGTGACGATTGCGCTTCATCTCATGTCTGTAACGGACTGCGTTATGAATCTGTCTTTAA
TCCCTTTGATTAATTCTCACACGATGTTTCTTTGATGCGCTGGTTAGATGTGAGGGGCTG
TGTATAAATAGATATCCTGCGAAAATGAGCAACCAGAAGAACGCCTTGATCTTACCGCAG
ATGTACAGTGTACTCTTTGGTTGTCCAACGTTTGGCTGTCCTTGAGAACTTGAGTCTCAC
TGTTGGGAAGCGAGGTTCTCAGAGAGATTCAGGTGAATCCATCTTCCACCTAGATGAAAT
GAAACTTCTATTTCATTGGGATCATGGATTTTGGTGGACTTCCAAATATTATCTGTAAGA
GTTTCTGCAAATTCTTCAGTCCACTTCAAGTTCCTGAGAACAACAATGATCCTGATGATG
GATAGAACTCCAAGGCCAAATGGAGCACGACTATGACAACAGGCCTGACTCCTGATCTCA
TATTCAGTTCTATTTTCTTTTTAGCTCAGTTCTAGGATCTAAATATGTCGATTGTTTAAT
CAGTAGATCAAACCATTAAAGAGAAAATCGTCTTGCGTGTTGTGTCAAAGTTTACTGGTG
AAGTTGTTGATGCATATTACCTTGAGATGGACAACGATGATGATGAG
TTAC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1GE68JQ 345 0 0
TTTTTAGCTCAGTTCTAGGATCTAAATATGTCGATTGTTTAATCAGTAGATCAAACCATT
AAAGAGAAAATCGTCTTGCGTGTTGTGTCAAAGTTTACTGGTGAAGTTGTTGATGCATAT
TACCTTGAGATGGACAACGATGATGATGAGGTTACCGAAGATGATGATGAGGATGCGAAG
GGAGGAAGATGAGTAGAGGAGGACGAGGATGACAATGAAAAGGATGAGCAAGGAAAGAAG
AGCATAAAAAGTCATCACCTGGACGCAAGTCTGGAAGCATACAACTTGCGGAAGGTCAAC
AAGGTGAGAGGCCTTTGGAGAGTAAGCAACAGTGAGTAAAATTTT

QA 1 345 1 345
DS 



AS 1 2

CO CL4647Contig1 1428 2 2 U
GAGATGGGAAGCCATCCAAGCCGTTAGAACCAAACACGGCGGTTTGGGTTTGAACCATTT
CAGGCTATTGAAGAGGTTAGGATGTGGGGACATAGGAACGGTTCATCTCGCGGAGTTGAA
CGGGACGAGGTGATACTTCGCCATGAAGGTTATGGACAAAACCGCTTTGGCTAGCAGGAA
GAAGCTTCTCAGAGCTCAGACCGAGAGGGAGATACTGCAGTGTCTTGACCACCCGTTTCT
TCCCACGTTGTATAGTCATTTCGAGACTGAGAAGTTCTCTTGTTTGGTTATGGAGTTTTG
TCCTGGTGGTGACTTGCATACGCTCAGACAGAGACGGCCAGGGAAACGTTTCACCGAGCA
AGCAGCTAAGTTCTATGTAGCGGAGGTGCTTCTTGCAATGGAGTATCTACACATGCTTGG
GATCATTTACCGTGATCTGCAGCCAGAGAACGTTCTTGTGAGAGATGATGGACACGTGAT
GCTTTCGGATTTCGATCTCTCCTTGAGATGTACCGTTAGCCTCTCTATAGTCAGATCATC
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CGGGTACTTGGCTCCGGAGATCATCAAAGGTGAAGGACACGGAAGCGCGGTTGATTGGTG
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AAACAGAGCGACGCTCTTCAATGTGGTTGGTCGGCCTTTGAGGTTCCCTTAGTCTCCGGT
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BQ
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AF RS1G329TF U 1
AF RS1G329JQ C 694
BS 1 748 RS1G329TF
BS 749 1428 RS1G329JQ

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GCTTTCGGATTTCGATCTCTCCTTGAGATGTACCGTTAGCCTCTCTATAGTCAGATCATC
AACCAATCTCGGATCCGAAGGCTTGTCAAAGAGTTCGGTTTCTTGCTCGCAGCAGCCATC
TTGCATACAGTAGCCTTCTTGCATCTCGATGGCTCCCACGTCCTGCTTCGGTCCTCGGTT
CTTCTCTAAATCCAAGAAAGATAAGAAACCGAAAACAGACAACGGTAACCACCAAGTGAC
TCCCTTACCAGAGCTCGTTGCTGAGACA
GCG

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DS 

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GCAGCATCCTTTCTTTGAAGGAGTGAACTGGGCTTTGGTTAGGTGTGCTAGTCCGCCTGA
GATTCCTAAACCGGTTGATCTCGAACCGGTGAATTGTAGTCCTTCTGTAGTACCAGCTGC
TGCATCTACAAGCGTCAGAACTGATCAGAGCAATTATCTCGAGTTTGATTTCTTCTGAAT
GTGTTCTTGCAAGAAACTGTGGACACGATTTGATGATGATGCCTCTTATTGTTTCTTTGC
AAATTCTTCAGAATCTGTTTAGTGTTTTTCTTTTTTTCTTTTCACGTGTTGAACAAGTTA
TGAGATTTGTATCATTCTTGAACAATCTGAGACAGTCTCTGTACCATATTATGAAGTTAA
AATGTTATTAGACAC

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

CO CL4648Contig1 1141 2 10 U
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ATTCTCCTCAGCTTCTTCTCATTTTTCGGTTACCTCTTCTTCTTCAAGAAGACAAATGAC
TTGGGTCCGAGCCCTCCCTCTTTGCCGATCATCGGCCATCTTCGCCATTTTCTCTCAGTT
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ACACACGACTTAAACATTTCGTCACGCAACGCACCTGCCATCGACGAGTCTCTCGTGTTT
GGATCTTCCGGCTTCATCGTATCTCCCTATGGAGATTACGTTAAGTTCATAAAGAAGCTT
CTTGCGACGAAGCTTCTTAGACCGCGGGCAATCGAGAAGTCACGAGGTGTCCGTGCAGAG
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ATTGGTAACGAAACGATGAAGTTCACTAACAACATGATCTGCGGGATGAGCATGGGGGAG
GAGTTGTTCAGAGGAGAACGGTGAGGCAGAGACTGTGAGGGGATTGATTAACAAGTCTTT
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ACTCCTCTCACTGTTTAAGAAAGACATACTTGATGTTTCAAACCGATTTGATGAGTTGTT
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GGATTTGCTGTTGGAAGCTTCTCGAGACGAAAATGCAGAGTATAAAATCACTAGGAACCA
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T


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10 

AF RS1C627TF U 1
AF RS1C627JQ C 413
BS 1 702 RS1C627TF
BS 703 703 RS1C627JQ
BS 704 737 RS1C627TF
BS 738 740 RS1C627JQ
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BS 763 792 RS1C627TF
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BS 794 804 RS1C627TF
BS 805 1141 RS1C627JQ

RD RS1C627TF 804 0 0
GGGCCTCTCACTCAAACAATGGCAGCAATGACCATTGACTTTCAAACCTGCTTCATCTTC
ATTCTCCTCAGCTTCTTCTCATTTTTCGGTTACCTCTTCTTCTTCAAGAAGACAAATGAC
TTGGGTCCGAGCCCTCCCTCTTTGCCGATCATCGGCCATCTTCGCCATTTTCTCTCAGTT
CTACCCCACAAGGCTTTTCAGCAAATCTCGACCAAGTATGGACCTCTCCTACATCTCCGC
ATTTTCAGTTTTCCCATAGTCCTCGTCTCTTCTACCACGATGGCCTACGAGATATTCACG
ACACACGACTTAAACATTTCGTCACGCAACGCACCTGCCATCGACGAGTCTCTCGTGTTT
GGATCTTCCGGCTTCATCGTATCTCCCTATGGAGATTACGTTAAGTTCATAAAGAAGCTT
CTTGCGACGAAGCTTCTTAGACCGCGGGCAATCGAGAAGTCACGAGGTGTCCGTGCAGAG
GAGCTAAAGCAGTTTTATTTAAAACTGCACGACAAGGCGTCGAAGAAAGAGAGCATTGAG
ATTGGTAACGAAACGATGAAGTTCACTAACAACATGATCTGCGGGATGAGCATGGGGGAG
GAGTTGTTCAGAGGAGAACGGTGAGGCAGAGACTGTGAGGGGATTGATTAACAAGTCTTT
CGCCTTATCGAGGAAGATTCTCTTTGTAAACGTATTACGTAG*CCACTGGAGAAGCTTGG
ACTCCTCTCACTGTTTA**GAAGACATACTTGATGTTTCAA*CCGATTTGATGAGTTGTT
GGAGAGGATTAT*CTTGAGCATGA

QA 1 804 1 804
DS 

RD RS1C627JQ 729 0 0
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GTGCAGAGGAGCTAAAGCAGTTTTATTTAAAACTGCACGACAAGGCGTCGAAGAAAGAGA
GCATTGAGATTGGTAACGAAACGATGAAGTTCACTAACAACATGATCTGCGGGATGAGCA
TGGGG*AGGAGTTGTTCAGAGGAGAACGGTGAGGCAGAGACTGTGAGGGGATTGATTAAC
AAGTCTTTCGCCTTATCGAGGAAGATTCTCTTTGTAAACGTATTACGTAGGCCACTGGAG
AAGCTTGGACTCCTCTCACTGTTTAAGAAAGACATACTTGATGTTTCAAACCGATTTGAT
GAGTTGTTGGAGAGGATTATTCTTGAGCATGAAGAGAAACCGGAGGAAGAGCAAGATATG
GACATGATGGATTTGCTGTTGGAAGCTTCTCGAGACGAAAATGCAGAGTATAAAATCACT
AGGAACCAGATCAAGGCATTGTTCGCGGAAATTTTTATGGGAGGCACAGACACCTCGGCA
CACACAACACAGTGGACAATGGCGGAGCTGGTTAACAACCCAAACAGTCTTGAGAAATTA
AGAGATGAAATTGATATGGTTGTAGGGAAATCAAGATTGATCCAAGAAACAGATCTACCA
AACCTCCCTTATTTGCAAGCAGTGGTTAAGGAAGGGCTACGCTTGCCCCCCCCGGCCCCT
TTACTAGTT

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

CO CL4649Contig1 1015 2 2 U
AATCTGGGGAGAAAATATACTTTCTATTGTTTTGGGATGGTTTCAGGGATTAAGTGTCTG
TATGTATGGGCTGAGTAGGCAAAATCACATCATTATCAAAAGTAAAGATAGCTGGTTTTT
GTGATCTGGCTGCGGCTTTTGAAAATTTGTGAATTGGGGATATTACCTCCTCCACCCATA
CCATGTAGACCCTTAATCCTGAATCCAAAGCTCTGAGAGAGAGACAGAGAGAGCACTTTG
TTTGTTTGCAAGTTGACCAACACACATATGCACTCTGATTTGGCAGTCTTGTATTGAAAT
GGAGCTGTGCTTACGAATATCTCATGACCAAAGCGCCAAGAAGCACCTTCGTCAAGAAGC
TACAAACAAAAAACTTATTCTTGGGCACATAGCGACTCTAGAAACTCGACGAACCTAGAC
CTCACATCTGAAGATTTCAGTTATTAGCAGCAAGTACTGCTCCGAGTAGATGTCTTTAAC
TGGTTTGATTATGTTTACGGCAGAGTTTTTTTATTTTCTAACATCTGCAGATGACTCTTC
CTGAAAAAGCCGGCTGCAAAAAGAAAAGACCTATGAAGTCAGGTGCAACCATTAAGACAG
TGGTGAGGATAACCACTATGTCCGGTTAGATTAATTGTTTTTAACTATCGCCATCTTCTT
TTCATCTTCAATATGTTTTAGCTTGTTTTCTGACAAGACACAGAGTTGTTGATTAGGAAG
ATGCCTGGAAAAGTCAAGGCAAGTAAAAGTTTCCAATGGGTCAAGCGTTAATTATCTTCT
GTGTCTCTGTCATCGTTTTCATTGTTTCATCACCGGAAAATAATTCCTTTTAGTCTGGTT
CCTTAGTCTTTCGGTGTAGCAATACATTCCTCTATTATGACTCTCGAGTCTTGGAAACTT
GAGTTACGTTTGGTTTGTGAGTCAGGACAACATAGTTTGCATGTTTTGTTCCTGATTCTC
CAAAAGGTGTATTGACGTTCAAGCATAACGATCAACTTATTATATGAATTAAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DP22TF U 1
AF RS1DP22JQ C 212
BS 1 718 RS1DP22TF
BS 719 1015 RS1DP22JQ

RD RS1DP22TF 724 0 0
AATCTGGGGAGAAAATATACTTTCTATTGTTTTGGGATGGTTTCAGGGATTAAGTGTCTG
TATGTATGGGCTGAGTAGGCAAAATCACATCATTATCAAAAGTAAAGATAGCTGGTTTTT
GTGATCTGGCTGCGGCTTTTGAAAATTTGTGAATTGGGGATATTACCTCCTCCACCCATA
CCATGTAGACCCTTAATCCTGAATCCAAAGCTCTGAGAGAGAGACAGAGAGAGCACTTTG
TTTGTTTGCAAGTTGACCAACACACATATGCACTCTGATTTGGCAGTCTTGTATTGAAAT
GGAGCTGTGCTTACGAATATCTCATGACCAAAGCGCCAAGAAGCACCTTCGTCAAGAAGC
TACAAACAAAAAACTTATTCTTGGGCACATAGCGACTCTAGAAACTCGACGAACCTAGAC
CTCACATCTGAAGATTTCAGTTATTAGCAGCAAGTACTGCTCCGAGTAGATGTCTTTAAC
TGGTTTGATTATGTTTACGGCAGAGTTTTTTTATTTTCTAACATCTGCAGATGACTCTTC
CTGAAAAAGCCGGCTGCAAAAAGAAAAGACCTATGAAGTCAGGTGCAACCATTAAGACAG
TGGTGAGGATAACCACTATGTCCGGTTAGATTAATTGTTTTTAACTATCGCCATCTTCTT
TTCATCTTCAATATGTTTTAGCTTGTTTTCTGACAAGACACAGAGTTGTTGATTAGGA
GATGCC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1DP22JQ 804 0 0
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ACTCTGATTTGGCAGTCTTGTATTGAAATGGAGCTGTGCTTACGAATATCTCATGACCAA
AGCGCCAAGAAGCACCTTCGTCAAGAAGCTACAAACAAAAAACTTATTCTTGGGCACATA
GCGACTCTAGAAACTCGACGAACCTAGACCTCACATCTGAAGATTTCAGTTATTAGCAGC
AAGTACTGCTCCGAGTAGATGTCTTTAACTGGTTTGATTATGTTTACGGCAGAGTTTTTT
TATTTTCTAACATCTGCAGATGACTCTTCCTGAAAAAGCCGGCTGCAAAAAGAAAAGACC
TATGAAGTCAGGTGCAACCATTAAGACAGTGGTGAGGATAACCACTATGTCCGGTTAGAT
TAATTGTTTTTAACTATCGCCATCTTCTTTTCATCTTCAATATGTTTTAGCTTGTTTTCT
GACAAGACACAGAGTTGTTGATTAGGAAGATGCCTGGAAAAGTCAAGGCAAGTAAAAGTT
TCCAATGGGTCAAGCGTTAATTATCTTCTGTGTCTCTGTCATCGTTTTCATTGTTTCATC
ACCGGAAAATAATTCCTTTTAGTCTGGTTCCTTAGTCTTTCGGTGTAGCAATACATTCCT
CTATTATGACTCTCGAGTCTTGGAAACTTGAGTTACGTTTGGTTTGTGAGTCAGGACAAC
ATAGTTTGCATGTTTTGTTCCTGATTCTCCAAAAGGTGTATTGACGTTCAAGCATAACGA
TCAACTTATTATATGAATTAAACT

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 2

CO CL4650Contig1 723 2 3 U
GCAGAAGAGATGCAATTTAACTTAGGATTCGTTTTACAGAGCAAAAGATTATTACATAGA
TGAGTGACTACAAGAAGGCATTAAAACACACACCAAACAGCTTGAAACAACAAATTCACT
CGAGAAGATTCCAATTATCGTCACATTTAGGGTACTTGAGAACATATGGTATTAGCCCTT
TAGTCCGACTCTGGCCTGCAACGTGGAACCGATGCAAGACCTTCAAGTAGGCAGGGCGGT
TTTTGGCATCAACGTCCATCTCATCGAAATTAGGCTCTACTTTGTTGAAGTACGCTGAAG
CTGCTGCATGTCCTTTAACCTTGCCAAGAAAATCCACATAAAGCTCAAGTTGAGAGGGAG
AAAACACCATCTTCTTTTTATCCATCCACCTGACAAGATCCTCCTGATCTACAAAAACGC
CCTTCTTTCCTTCTTCCCTTATGATGAGATCTATTGTCTCAACCGTAAGAGACTTCAGCT
TCTGAAATACCTTCCTCTTCTCCACTTTCTGTTTCTCTGGCTTTATCGGACCAGAGCTCT
CCTTCTCAACCTTGACCGGTGCTGAGCTCTCGACGCCAGATGAAAACGGCGCAGCCACCG
TTGTACAAGCCATCTTCCACATACGACCGTTCGAAGACAGCGGAGCAACGATTTTCTTCC
AGAGCTCAAGAGAAGCCATGGGGGAACTAACTGCGGCAGATATTATGTGCTTCTTGTTTC
CCC


BQ
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10 10 10 

AF RS1FJ42JQ U 14
AF RS1FJ42TF C 1
BS 1 13 RS1FJ42TF
BS 14 530 RS1FJ42JQ
BS 531 723 RS1FJ42TF

RD RS1FJ42JQ 517 0 0
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GAAGGCATTAAAACACACACCAAACAGCTTGAAACAACAAATTCACTCGAGAAGATTCCA
ATTATCGTCACATTTAGGGTACTTGAGAACATATGGTATTAGCCCTTTAGTCCGACTCTG
GCCTGCAACGTGGAACCGATGCAAGACCTTCAAGTAGGCAGGGCGGTTTTTGGCATCAAC
GTCCATCTCATCGAAATTAGGCTCTACTTTGTTGAAGTACGCTGAAGCTGCTGCATGTCC
TTTAACCTTGCCAAGAAAATCCACATAAAGCTCAAGTTGAGAGGGAGAAAACACCATCTT
CTTTTTATCCATCCACCTGACAAGATCCTCCTGATCTACAAAAACGCCCTTCTTTCCTTC
TTCCCTTATGATGAGATCTATTGTCTCAACCGTAAGAGACTTCAGCTTCTGAAATACCTT
CCTCTTCTCCACTTTCTGTTTCTCTGGCTTTATCGGA

QA 1 517 1 517
DS 

RD RS1FJ42TF 723 0 0
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TGAGTGACTACAAGAAGGCATTAAAACACACACCAAACAGCTTGAAACAACAAATTCACT
CGAGAAGATTCCAATTATCGTCACATTTAGGGTACTTGAGAACATATGGTATTAGCCCTT
TAGTCCGACTCTGGCCTGCAACGTGGAACCGATGCAAGACCTTCAAGTAGGCAGGGCGGT
TTTTGGCATCAACGTCCATCTCATCGAAATTAGGCTCTACTTTGTTGAAGTACGCTGAAG
CTGCTGCATGTCCTTTAACCTTGCCAAGAAGATCCACATAAAGCTCAAGTTGAGAGGGAG
AAAACACCATCTTCTTTTTATCCATCCACCTGACAAGATCCTCCTGATCTACAAAAACGC
CCTTCTTTCCTTCTTCCCTTATGATGAGATCTATTGTCTCAACCGTAAGAGACTTCAGCT
TCTGAAATACCTTCCTCTTCTCCACTTTCTGTTTCTCTGGCTTTATCGGACCAGAGCTCT
CCTTCTCAACCTTGACCGGTGCTGAGCTCTCGACGCCAGATGAAAACGGCGCAGCCACCG
TTGTACAAGCCATCTTCCACATACGACCGTTCGAAGACAGCGGAGCAACGATTTTCTTCC
AGAGCTCAAGAGAAGCCATGGGGGAACTAACTGCGGCAGATATTATGTGCTTCTTGTTTC
CCC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1CN90TF U 1
AF RS1CN90JQ C 1
BS 1 508 RS1CN90TF
BS 509 757 RS1CN90JQ

RD RS1CN90TF 508 0 0
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TCCGCCACCTCAGGATATGTCTGAGGACTACCTTAAAGAGCAGCTTGATGCTGCTAACAC
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GACCGAACTTGCTGCTAATAAGACCGAACTTGCGGAACTTGATGAGGAATATAAGGAAAG
GCAACGAGTCCTTGATGCTATGTTTGATAGAATTGTTGAGCAGAACCCGACGATAGCATC
GGCATTGAAGGCTCGACAATCTGCAACAGAGGGGTCTAACGATCAGGAGAAGAAGGAGCG
GGACGTCGAGGCTCTGTTGGAAATAATG

QA 1 508 1 508
DS 

RD RS1CN90JQ 757 0 0
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GCTACAGTCTAAGAGCATGTCCCAAACCCAGATGGAGGAGATCTCCTCTCAGTTTACACC
CCGCAATAACAGAAATATGTACGATTTTGTTTACATCTTGCATGGAGCTCCTCCTCCTTC
TCCGCCACCTCAGGATATGTCTGAGGACTACCTTAAAGAGCAGCTTGATGCTGCTAACAC
CAAACTTGCGGAACTTGATGCTGCTAAGACCAAACTTGCGGAACTTGATGCTGCTAATGA
GACCGAACTTGCTGCTAATAAGACCGAACTTGCGGAACTTGATGAGGAATATAAGGAAAG
GCAACGAGTCCTTGATGCTATGTTTGATAGAATTGTTGAGCAGAACCCGACGATAGCATC
GGCATTGAAGGCTCGACAATCTGCAACAGAGGGGTCTAACGATCAGGAGAAGAAGGAGCG
GGACGTCGAGGCTCTGTTGGAAATAATGACGGACCTGTATCCAGATTTTGCATCAGCGCT
GAGGGTTATGCGTGGTGGGACTGACTTAGAGCGAGGGGAGACGTCTAGGGATCAGGGGGA
GCTCGACCAAACTACTACGTCCACAGCTGTGGCAACAGACCGAGATGGAAACTAGATTTT
ATGATTGTTTTTTTTAATTTGTAAAACTTATATACTGTATGTTACAAATTATTAGGACAG
GGCATTTTGATCGGGGGTTTCGGATAGGATATTTTGG

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

CO CL4652Contig1 1205 2 2 U
GGAAAAAGAGTACGGATGAAAGTGAAACAAAAACCTCATCATAGAGTCTCTTGTTGGCTG
ATTTTTGATCCTTAGATTTTATCAGAATAAATATCTTACCAATCTCAGGACTTGCCCTCA
ATAACTTCTCAATCAACACTACAGCAAAAAAGATTCAAAAATCAGTTTACTTTGGACAAG
AAGAAAACTCTGTTTTTTTTTTGGGTTTGTCTTACCTTTACCAAGCAACCCGGTCGCACC
GGTAAGGAGATAGGTTTTTCCTTTTAAGAAACGAACGATTCCAACTCCATCACTGACACT
AGGTTCTAGCTCAGGCGACACAGCTTTCAACGAGGTTTCACGATAACAACAAGAAGTTTG
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TGTTTTCATTGCCATTTCTGGAAGAAGAAAAAAGTGAAGCTTTTAATTAGTTTCTTCTTT
TTATGGAAGGCTTTTGTGTGAGAGACTGAGAGTATATATAGAAAATTTACAAAGGAGTTG
AATGCGTTCAGGTTTCCAGTAAGGTGTCACAGACCATAAATTTGTTTTATTGGGCAATAT
TGACTCATCGGTAAGGAGTATGTTTTAACGTCCTTCCACCTGCAAAGGGTCATGGACATC
TCTCAAACTGTTTCGCCACTTTAAGAGATAGTTGGGCTGAGAGTTTTGCATGCCAGAAAA
GTCTATTGACTCGTCGGTAAGGACTAAAGGAGTATGGTCTATGTTACTGCAGCACGCAAC
TTGGTCGAAACCTTTTTATTATTTTTACCAATTCCATTCTCTACAATCCTGACATTATAA
TTATAATTAGTTTGTTTACAAAAATTATAATTAGATCAACATCAACAAATAAGTAAACTT
TAATATTTGTTTAATATTTCAAAACCGTAATGTAAAAATCATGAAAAGATGAGAATTTCT
GTCATAATTAATGTATTTTAGAGGAAAAATATACATGAACATGTATATACAAAAGCATAT
ATCAGAATATTTAAATACAAAAGATCGACTAGAATAACTATCACAGATTATTAGGAAGCT
AATTAAGGTGAATCTCTAAACATGTGTGTGTCGGAAAACTTTGGAGTCTCAAGTATAACA
TTCTA


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RS1D687TF U 1
AF RS1D687JQ C 552
BS 1 607 RS1D687TF
BS 608 1205 RS1D687JQ

RD RS1D687TF 607 0 0
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ATTTTTGATCCTTAGATTTTATCAGAATAAATATCTTACCAATCTCAGGACTTGCCCTCA
ATAACTTCTCAATCAACACTACAGCAAAAAAGATTCAAAAATCAGTTTACTTTGGACAAG
AAGAAAACTCTGTTTTTTTTTTGGGTTTGTCTTACCTTTACCAAGCAACCCGGTCGCACC
GGTAAGGAGATAGGTTTTTCCTTTTAAGAAACGAACGATTCCAACTCCATCACTGACACT
AGGTTCTAGCTCAGGCGACACAGCTTTCAACGAGGTTTCACGATAACAACAAGAAGTTTG
GACTCCACGTGTCATCAACCATGGCAAAGGACGAGCCAAGAAGTGGTTCGGTCTGCCGGA
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TGTTTTCATTGCCATTTCTGGAAGAAGAAAAAAGTGAAGCTTTTAATTAGTTTCTTCTTT
TTATGGAAGGCTTTTGTGTGAGAGACTGAGAGTATATATAGAAAATTTACAAAGGAGTTG
AATGCGT

QA 1 607 1 607
DS 

RD RS1D687JQ 654 0 0
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GTTTCCAGTAAGGTGTCACAGACCATAAATTTGTTTTATTGGGCAATATTGACTCATCGG
TAAGGAGTATGTTTTAACGTCCTTCCACCTGCAAAGGGTCATGGACATCTCTCAAACTGT
TTCGCCACTTTAAGAGATAGTTGGGCTGAGAGTTTTGCATGCCAGAAAAGTCTATTGACT
CGTCGGTAAGGACTAAAGGAGTATGGTCTATGTTACTGCAGCACGCAACTTGGTCGAAAC
CTTTTTATTATTTTTACCAATTCCATTCTCTACAATCCTGACATTATAATTATAATTAGT
TTGTTTACAAAAATTATAATTAGATCAACATCAACAAATAAGTAAACTTTAATATTTGTT
TAATATTTCAAAACCGTAATGTAAAAATCATGAAAAGATGAGAATTTCTGTCATAATTAA
TGTATTTTAGAGGAAAAATATACATGAACATGTATATACAAAAGCATATATCAGAATATT
TAAATACAAAAGATCGACTAGAATAACTATCACAGATTATTAGGAAGCTAATTAAGGTGA
ATCTCTAAACATGTGTGTGTCGGAAAACTTTGGAGTCTCAAGTATAACATTCTA

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 2

CO CL4653Contig1 927 2 2 U
GTAACGAGCTTGCTAATGGAGTATACAAGGAGGAGGAGGAGACTAAGGAAACAATGAAGA
AGAGCCAAAAGGCGGATAGAAAGAAAAAGAAGCTGAAAGAGAAGTTGCTAAAGGAAGCTA
CTAAAGCTGACAATCGTGGAGTTTGCTACTTGAGCCGCATCCCACCACACATGGATCACG
TTAGACTTCGCCAGATTCTCTCTCAGTTTGGTGAAATTGATAGGATTTATCTTGCTCCTG
AAGATCCTGAAGCACAAGTTCATCGCAAGAAGGCTGGTGGGTTTCGTGGCCAACTCTTCT
CTGAAGGTTGGGTGGAGTTTGCTAAGAAAACCGTAGCTAAGAGAGTCGCTGATATGCTAA
ATGGAGAACAAATAGGGGGAAAGAAGAAGTCGGCTATATACTATGATATTTGGAACATCA
AATACTTGACCAAGTTCAAATGGGATGATCTCACCGATGAAATCGCATACAAAAGTGCAA
TACGGGAACAGAAACTGAATATGGTTATGTCTGCTACCAAAAGAGAGAAGGACTTTTATT
TATCTAAAGTAGAGAAGTCTCGTGCCATGACCGAGATTGATGAACGAATGAAGAAGAAGC
GAAAGATCCAGGAAGAATCAGGCAGCACCGCTGAACCAGCAGAGGTCTTCCCACCTAGGG
TGGTTCGTCAGTTCAGACAGAAGACATCAATCAAAAATGAGGTGTCTCAGAGCAAACCTG
GTCTCTCCACAGATGTCCTAGCATCGGTTTTCGGCGGTTCTTAAAGATTAAGAAGAGGCA
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TTAGTTTTGCATGTCAACAGAGTGAACCTTCACATACACTTCTCTGGCTTTTTGTTACTA
AGAATATGAATTACAACAAATTTTGAT


BQ
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AF RS1B875TF U 1
AF RS1B875JQ C 120
BS 1 641 RS1B875TF
BS 642 927 RS1B875JQ

RD RS1B875TF 641 0 0
GTAACGAGCTTGCTAATGGAGTATACAAGGAGGAGGAGGAGACTAAGGAAACAATGAAGA
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CTAAAGCTGACAATCGTGGAGTTTGCTACTTGAGCCGCATCCCACCACACATGGATCACG
TTAGACTTCGCCAGATTCTCTCTCAGTTTGGTGAAATTGATAGGATTTATCTTGCTCCTG
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CTGAAGGTTGGGTGGAGTTTGCTAAGAAAACCGTAGCTAAGAGAGTCGCTGATATGCTAA
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AATACTTGACCAAGTTCAAATGGGATGATCTCACCGATGAAATCGCATACAAAAGTGCAA
TACGGGAACAGAAACTGAATATGGTTATGTCTGCTACCAAAAGAGAGAAGGACTTTTATT
TATCTAAAGTAGAGAAGTCTCGTGCCATGACCGAGATTGATGAACGAATGAAGAAGAAGC
GAAAGATCCAGGAAGAATCAGGCAGCACCGCTGAACCAGCA

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1B875JQ 808 0 0
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GTTAGACTTCGCCAGAT*CTCTCTCAGTTTGGTGAAATTGATAGGATTTATCTTGCTCCT
GAAGATCCTGAAGCACAAGTTCATCGCAAGAAGGCTGGTGGGTTTCGTGGCCAACTCTTC
TCTGAAGGTTGGGTGGAGTTTGCTAAGAAAACCGTAGCTAAGAGAGTCGCTGATATGCTA
AATGGAGAACAAATAGGGGGAAAGAAGAAGTCGGCTATATACTATGATATTTGGAACATC
AAATACTTGACCAAGTTCAAATGGGATGATCTCACCGATGAAATCGCATACAAAAGTGCA
ATACGGGAACAGAAACTGAATATGGTTATGTCTGCTACCAAAAGAGAGAAGGACTTTTAT
TTATCTAAAGTAGAGAAGTCTCGTGCCATGACCGAGATTGATGAACGAATGAAGAAGAAG
CGAAAGATCCAGGAAGAATCAGGCAGCACCGCTGAACCAGCAGAGGTCTTCCCACCTAGG
GTGGTTCGTCAGTTCAGACAGAAGACATCAATCAAAAATGAGGTGTCTCAGAGCAAACCT
GGTCTCTCCACAGATGTCCTAGCATCGGTTTTCGGCGGTTCTTAAAGATTAAGAAGAGGC
ATGTGAAGATATTGCAGTTTGATCAAAGGCTTTATAATATATGTATGAATGGCATTTCCC
ATTAGTTTTGCATGTCAACAGAGTGAACCTTCACATACACTTCTCTGGCTTTTTGTTACT
AAGAATATGAATTACAACAAATTTTGAT

QA 1 808 1 808
DS 



AS 1 2

CO CL4654Contig1 998 2 4 U
GGACAAAAACTCAACTCATCATCTTATAATTATTCTCTCCGAAATAAGAAACCAAAACCC
AATTTCGTTACCTCTTCCCTCAATCCATAAGTCAAAAAATCATCAAGCTTTAAGCTCAAA
AAACTCGATCTAGAACTGGTTTGGAGAAGATGGGCTCTGAAGGACCAAAAGCAATTACGA
TTCACGTGACTGGCTTCAAGAGGTTCCTTGGTGTTTCCGAAGACCCTACTGAGAAAATCG
CTACTAATCTGAAATCGTATGTGGAGAAACGAGGGTTGCCTTCTGGGCTAACTCTTGGTA
GCTGCACTGTTCTTGAGTCTGCTGGGGAAGGTGGAAAGGCTCGGCTTTATCAGGTTCTGG
AGTCTAGTGTTGCTGCCTCCTCTGGAGATAACAAGAACACCAATGGAACTGTTGTTTGGC
TTCATCTTGGAGTGAATAGCGGATCGGAAAAATTCGCAATTGAAAGACAAGCAGTGAACG
AAGCTCATTTTCGTTGTCCTGATCAATTAGGCTGGCAACCACAGAGGCTTCCTATAGTTT
TTGAAGATGGAAGCATTTTAAAGGCAAAAGAGACTACATGTCCAACAGAGTCGATATTCA
ATATACTAAAGAACAAAGGCTACGACGTTGTTCAATCAGACGACGCTGGACGGTTTGTGT
GCAACTACCTCTACTATCACTCCCTCACGTTCGCTGAGCAAAAGGGACACAAGTCACTCT
TCCTCCACGTTCCTTTATTCTCCAAAATCGATGAAGATACTCAGATGCAGTTCGTCGTCT
CTCTCTTGGAGGCAATTGCAGCTACTTGCTAGTGTACTATTGCCACAGTGTGTAAGTATA
AATGTATATCCTTCTACGAAGCATTGTGTTCTTTTGTTGGGGAGTGTGGTTGTATTGTAG
CTTGTGATAAAAAAAAGACTTATTGCTTTTGGCTCTGAAACTTTCTGGGTCTTGTAAAGC
ACACGATTAGGAAAGAAAGAGCCTTTTGTGATTGTCCC


BQ
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AF RS1BN73TF U 1
AF RS1BN73JQ C 324
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TTCACGTGACTGGCTTCAAGAGGTTCCTTGGTGTTTCCGAAGACCCTACTGAGAAAATCG
CTACTAATCTGAAATCGTATGTGGAGAAACGAGGGTTGCCTTCTGGGCTAACTCTTGGTA
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AAGCTCATTTTCGTTGTCCTGATCAATTAGGCTGGCAACCACAGAGGCTTCCTATAGTTT
TTGAAGATGGAAGCATTTTAAAGGCAAAAGAGACTACATGTCCAACAGAGTCGATATTCA
ATATACTAAAGAACAAAGGCTACGACGTTGTTCAATCAGACGACGCTGGACGGTTTGTGT
GCAACTACCTCTACTATCACTCCCTCACGTTCGCTGAGCAAAAGGGACACAAGTCACTCT
TCCTCCACGTTCCTTTATTCTCCAAAATCGATGAAGATACTCAGATGCAGTTCGTCGTCT
CTCTCTTGGAG*CAATTGCAGCTACTTGCTAGTGTACTATTGCCACAGTGTGTAAGTATA

QA 1 840 1 840
DS 

RD RS1BN73JQ 675 0 0
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CAATTAGGCTGGCAACCACAGAGGCTTCCTATAGTTTTTGAAGATGGAAGCATTTTAAAG
GCAAAAGAGACTACATGTCCAACAGAGTCGATATTCAATATACTAAAGAACAAAGGCTAC
GACGTTGTTCAATCAGACGACGCTGGACGGTTTGTGTGCAACTACCTCTACTATCACTCC
CTCAGGTTCGCTGAGCAAAAGGGACACAAGTCACTCTTCCTCCACGTTCCTTTATTCTCC
AAAATCGATGAAGATACTCAGATGCAGTTCGTCGTCTCTCTCTTGGAGGCAATTGCAGCT
ACTTGCTAGTGTACTATTGCCACAGTGTGTAAGTATAAATGTATATCCTTCTACGAAGCA
TTGTGTTCTTTTGTTGGGGAGTGTGGTTGTATTGTAGCTTGTGATAAAAAAAAGACTTAT
TGCTTTTGGCTCTGAAACTTTCTGGGTCTTGTAAAGCACACGATTAGGAAAGAAAGAGCC
TTTTGTGATTGTCCC

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

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GCTCTTCTCAACAAGTCCTTTTTACCTAACCGCTCTTCCCTCTCCTCCTCCTCTACCTCT
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GAAACTCAAAGTGTTAAAGTTGAGGAGACACAAGTGTTCGCGTGTCCTGTTTGTTACGAA
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AF RS1CN49JQ C 1
AF RS1CN49TF U 1
BS 1 512 RS1CN49TF

RD RS1CN49JQ 512 0 0
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GCTCTTCTCAACAAGTCCTTTTTACCTAACCGCTCTTCCCTCTCCTCCTCCTCTACCTCT
CATTCTCGTCTTTACCGATTCTCTTCCTCTGTTCGCTCTCGTTTCCCTTCTGCCTCCATA
CGCGCCGTTGCTCTTGAACCAGAACTAAACGAAACTCCAAATTCCGACAAGAAAGACACT
GAAACTCAAAGTGTTAAAGTTGAGGAGACACAAGTGTTCGCGTGTCCTGTTTGTTACGAA
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AGTGTAACAAGACATACTCTAGCAAAGATGAATACTTGGATCTAACCGTCACTGCTGGTT
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TGATCATCTCAACTGTTTTTCTTTCAGTTTAC

QA 1 512 1 512
DS 

RD RS1CN49TF 512 0 0
GGGCTCGTTGACTCCCTTAAAGCTTCTCTAATGGCGATGGCTTCACTAACAACTTCTTCT
GCTCTTCTCAACAAGTCCTTTTTACCTAACCGCTCTTCCCTCTCCTCCTCCTCTACCTCT
CATTCTCGTCTTTACCGATTCTCTTCCTCTGTTCGCTCTCGTTTCCCTTCTGCCTCCATA
CGCGCCGTTGCTCTTGAACCAGAACTAAACGAAACTCCAAATTCCGACAAGAAAGACACT
GAAACTCAAAGTGTTAAAGTTGAGGAGACACAAGTGTTCGCGTGTCCTGTTTGTTACGAA
CCGCTTATGAGGAAAGGACCTTCAGACAAGCAATCTACAGGTCTGGTTTCAAGTGTGGAC
AGTGTAACAAGACATACTCTAGCAAAGATGAATACTTGGATCTAACCGTCACTGCTGGTT
TTGATTCTTTCAATGAAGTCAAACCCATTACAACTGAACTCTTTCGGTATATTTGGTTTT
TGATCATCTCAACTGTTTTTCTTTCAGTTTAC

QA 1 512 1 512
DS 



AS 1 2

CO CL4656Contig1 1130 2 4 U
GGACTATGGATGGAGAAGTCCAGAGCTGGGGACGCAACCAGAACGGTCAACTTGGTCTTG
GTGATACTGAAGATTCTCTAGTGCCTCAGAAGATTCAAGCCTTTGAGGGAATACGAATCA
AAATGGTAGCAGCTGGTGCAGAACACACTGCTGCGGTTACAGAAGATGGTGATCTTTACG
GATGGGGATGGGGACGATATGGAAATTTGGGATTAGGTGACCGCAATGACCGCTTGGTCC
CTGAAAGGGTTACCTCTGCTAGTGGTGAGAAGATGAGCATGGTTGCTTGTGGATGGCGGC
ACACAATAGCAGTGTCTTATTCTGGAGCATTGTATACTTATGGATGGAGCAAATATGGAC
AGTTAGGACATGGGGACTTTGAAGATCACCTTGTTCCTCACAAACTTGAAGCGCTGAGCA
ACAGCGTCATCTCCCAGATTTCTGGAGGTTGGAGACATACAATGGCATTGACTTCTGATG
GGAAACTATATGGATGGGGTTGGAATAAGTTTGGGCAAGTAGGAGTAGTTGATAACTTAG
ATCAGTGTTCTCCTTTGCAAGTTCGGTTTCCAGACGATCAGAAAGTAGTTCAAGTCTCAT
GTGGATGGAGACATACATTGGCTGTGACTGAAAGAAATAATGTGTTTGCTTGGGGAAGAG
GTACAAACGGACAGCTCGGCATTGGAGAGTCACTTGACAGGAACTATCCTAAGATTATAG
AAGCATTGAGCGTTGATGGAGCAAGTGGACAACATATAGAGTCTTCTAATTTTGATCCAT
CTTCAGGGAAAAGCTGGGTGTCACCGGCAGAGAGATATGCAGTTGTTCCTGATGAAAAGA
CAGGACAAACGGATGGTTCTAGCAAAGGCAATGGAAGTGATATGAGTGTCCCCACAGACT
GATCTCAAGCTTGTGTTCGATTTTGAGTTTTTCTTCTTCTTTTCTTTTTAACGATCTCTA
CTGGGTTGTACACCACGTACGTCTGGCCTAGTTTGGGATTTGCTTCTTTTTTCTTGGTCG
TTTTTGTTTAGTTTGTGTTTTGTTACTCAAACTCCAGTCTCTTTATTTTAACCATAATAA
TGTCTTACGAATTATGTGGTTTTTTCTTACCAATATTGCACTTTCTGATC


BQ
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AF RS1FC76TF U 1
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ATCAGTGTTCTCCTTT

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DS 

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AATGGCATTGACTTCTGATGGGAAACTATATGGATGGGGTTGGAATAAGTTTGGGCAAGT
AGGAGTAGTTGATAACTTAGATCAGTGTTCTCCTTTGCAAGTTCGGTTTCCAGACGATCA
GAAAGTAGTTCAAGTCTCATGTGGATGGAGACATACATTGGCTGTGACTGAAAGAAATAA
TGTGTTTGCTTGGGGAAGAGGTACAAACGGACAGCTCGGCATTGGAGAGTCACTTGACAG
GAACTATCCTAAGATTATAGAAGCATTGAGCGTTGATGGAGCAAGTGGACAACATATAGA
GTCTTCTAATTTTGATCCATCTTCAGGGAAAAGCTGGGTGTCACCGGCAGAGAGATATGC
AGTTGTTCCTGATGAAAAGACAGGACAAACGGATGGTTCTAGCAAAGGCAATGGAAGTGA
TATGAGTGTCCCCACAGACTGATCTCAAGCTTGTGTTCGATTTTGAGTTTTTCTTCTTCT
TTTCTTTTTAACGATCTCTACTGGGTTGTACACCACGTACGTCTGGCCTAGTTTGGGATT
TGCTTCTTTTTTCTTGGTCGTTTTTGTTTAGTTTGTGTTTTGTTACTCAAACTCCAGTCT
CTTTATTTTAACCATAATAATGTCTTACGAATTATGTGGTTTTTTCTTACCAATATTGCA
CTTTCTGATC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

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ACTTAAAAAAAGCAAAACGTAAAAAACAGACCTAAACCTAGGCAGTGAGCACGACGGCGC
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AAGGCTTCCGTCACCAACGGTAACGCACTTTATGAACCTTGACGCGCTCATTGCCCAAGC
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AAAAGCAACCTCAGATCTACGTCTGAGGAACAACAACCCCACAATATGAATCAAATTCCT
CCGAGTCTTCTACCATTTACATTCAATTAAACATCTCTCCGGGACAAACAAAAAAACTAA
ACGATGTAAGTGAATGAGGAAACGCTAGAATGAAAG


BQ
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AF RS1GE21TF C 1
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BS 5 512 RS1GE21JQ
BS 513 516 RS1GE21TF

RD RS1GE21TF 516 0 0
GCCATATCATATCAATCAATCAATACCACATTTAACTGAAATGACGATTATAAAATCCAT
TAATATTGATTAAAAGACGTCTCATTCCAAAAAGCAACAAACTCTGAGTCCAACAACGAT
ACTTAAAAAAAGCAAAACGTAAAAAACAGACCTAAACCTAGGCAGTGAGCACGACGGCGC
CACCAGCCTCCTTGATCTTCTTCTCAGCAGTCTTGGAAATGAGCTTAGCCTTCACAACGA
AAGGCTTCCGTCACCAACGGTAACGCACTTTATGAACCTTGACGCGCTCATTGCCCAAGC
CCAAACTTGATGAAGACACAGTACAGAAAACGAAAGAGAAAAAGTAAAAAGAATAAAATA
AAAAGCAACCTCAGATCTACGTCTGAGGAACAACAACCCCACAATATGAATCAAATTCCT
CCGAGTCTTCTACCATTTACATTCAATTAAACATCTCTCCGGGACAAACAAAAAAACTAA
ACGATGTAAGTGAATGAGGAAACGCTAGAATGAAAG

QA 1 516 1 516
DS 

RD RS1GE21JQ 508 0 0
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ATTGATTAAAAGACGTCTCATTCCAAAAAGCAACAAACTCTGAGTCCAACAACGATACTT
AAAAAAAGCAAAACGTAAAAAACAGACCTAAACCTAGGCAGTGAGCACGACGGCGCCACC
AGCCTCCTTGATCTTCTTCTCAGCAGTCTTGGAAATGAGCTTAGCCTTCACAACGAAAGG
CTTCCGTCACCAACGGTAACGCACTTTATGAACCTTGACGCGCTCATTGCCCAAGCCCAA
ACTTGATGAAGACACAGTACAGAAAACGAAAGAGAAAAAGTAAAAAGAATAAAATAAAAA
GCAACCTCAGATCTACGTCTGAGGAACAACAACCCCACAATATGAATCAAATTCCTCCGA
GTCTTCTACCATTTACATTCAATTAAACATCTCTCCGGGACAAACAAAAAAACTAAACGA
TGTAAGTGAATGAGGAAACGCTAGAATG

QA 1 508 1 508
DS 



AS 1 2

CO CL4658Contig1 933 2 2 U
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GTATTGATGATAGTGGTGAACAAGGCAACAAGACTGCTGCTAAGACATGCTGTTCCCTCT
TGTCCAAGTTGGCAGGAAGTGACTCTAACAAGAGTACCATAGTTGAGAAGCGGGGTCTAG
ACAAGTTAATCAAACTCGCACAACGATTCTCGGAGGATCCCCTAGTCATACAAGAGGTCA
TGTCGATAATCTCTATAATCTGTCTGAGATCACCAGACCACGCAGCCAGTGCTATAGAAG
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AGAGAAACGCTTGCAACATGATACGGAACATTGCTGTGAGAAATGCAGAGAACAGAAAAA
TCCTGCTTGCCAATGGAATTGAGAAGCTCATAAGGAATGCTAAGGCGAACAATGAGATAT
GCAGAGCCTCTGCAACTGATGCACTGAGAGACCTTGGCCTTGATAACTACAATAGCTAAA
GCCTATCTTCTCCATTGCTAAATTTCATACAATTTAACGAGGTTTGGTGGTACCCCAATC
GTTTCTGCACTTTCTTTTGTGTCATTCAAGCAAAGAGGAATGATCCATTTCAAAATCAAA
TTGGGTAGAAAGCATTCCAACTTAAAACTTTTGCGTCGATTGTATTGTTGGAACAGCTGA
TCATGTAGTAAAATGGAAACACTTCTTTTTTTGTGCTCTACTTTTCATGTTTTGTTAAAG
TCTCTTCTATCCTGTCACCATCTCTCTCGAAGAGTGTATTCGGAATTATTATGTACGGAG
ATATGTTTTATAAGATTAAAAAAACATTGCGTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1G988TF U 1
AF RS1G988JQ C 181
BS 1 614 RS1G988TF
BS 615 933 RS1G988JQ

RD RS1G988TF 614 0 0
GGGCAGGGATTGGCTCCGATAGCTTGGTATCGGCAAGTATTGCGTTAAAATCAATCGCTG
TAAACGATGAAATATGTAAATCTATTGCTGAAAGTGGTGGAATAGACACACTTCTTCGAT
GTATTGATGATAGTGGTGAACAAGGCAACAAGACTGCTGCTAAGACATGCTGTTCCCTCT
TGTCCAAGTTGGCAGGAAGTGACTCTAACAAGAGTACCATAGTTGAGAAGCGGGGTCTAG
ACAAGTTAATCAAACTCGCACAACGATTCTCGGAGGATCCCCTAGTCATACAAGAGGTCA
TGTCGATAATCTCTATAATCTGTCTGAGATCACCAGACCACGCAGCCAGTGCTATAGAAG
CTGGAGCTGGTGATCTGGCAATCCAAGCTATGAAGAGGTTCCCAGCAGCCGCCCAAATGC
AGAGAAACGCTTGCAACATGATACGGAACATTGCTGTGAGAAATGCAGAGAACAGAAAAA
TCCTGCTTGCCAATGGAATTGAGAAGCTCATAAGGAATGCTAAGGCGAACAATGAGATAT
GCAGAGCCTCTGCAACTGATGCACTGAGAGACCTTGGCCTTGATAACTACAATAGCTAAA
GCCTATCTTCTCCA

QA 1 614 1 614
DS 

RD RS1G988JQ 753 0 0
TGTCCAAGTTGGCAGGAAGTGACTCTAACAAGAGTACCATAGTTGAGAAGCGGGGTCTAG
ACAAGTTAATCAAACTCGCACAACGATTCTCGGAGGATCCCCTAGTCATACAAGAGGTCA
TGTCGATAATCTCTATAATCTGTCTGAGATCACCAGACCACGCAGCCAGTGCTATAGAAG
CTGGAGCTGGTGATCTGGCAATCCAAGCTATGAAGAGGTTCCCAGCAGCCGCCCAAATGC
AGAGAAACGCTTGCAACATGATACGGAACATTGCTGTGAGAAATGCAGAGAACAGAAAAA
TCCTGCTTGCCAATGGAATTGAGAAGCTCATAAGGAATGCTAAGGCGAACAATGAGATAT
GCAGAGCCTCTGCAACTGATGCACTGAGAGACCTTGGCCTTGATAACTACAATAGCTAAG
GCCTATCTTCTCCATTGCTAAATTTCATACAATTTAACGAGGTTTGGTGGTACCCCAATC
GTTTCTGCACTTTCTTTTGTGTCATTCAAGCAAAGAGGAATGATCCATTTCAAAATCAAA
TTGGGTAGAAAGCATTCCAACTTAAAACTTTTGCGTCGATTGTATTGTTGGAACAGCTGA
TCATGTAGTAAAATGGAAACACTTCTTTTTTTGTGCTCTACTTTTCATGTTTTGTTAAAG
TCTCTTCTATCCTGTCACCATCTCTCTCGAAGAGTGTATTCGGAATTATTATGTACGGAG
ATATGTTTTATAAGATTAAAAAAACATTGCGTC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL4659Contig1 481 2 2 U
GGACCTGACCCGTTTTCAGATTCCATTTCCTGCACCTGAGTGTAGACACGATGAGCACGG
AGATGGACGACTCTTCTTCAGATGTGCGGCGGCGCGTGTCATGCACTAAATACTTCGACG
CTCTCTGGTTCTGCTACTCACCATATTACCAAATGCAGCAGTACTACCGGGTTGGGAAAC
TTGATGATTGTACTAAGAAGTTCTCTGCTCTCTTTGATTGTCTTTCATTAAAGACCAAAA
GTGCTTCTGAAGCCCAGAAAATTCTGGAAGAGCAAGAGAAAGCAGATGCAGCAAATCATA
TCTGGATTATGCGGACAGAGGAAGAAGCTTCAAGACATTGGAACGAGACTTTCGGGCATT
TGGATGATCCGAATTATTAGAAGTACAGTTTTTACTTTCCCTACTGGATTCTTGATTGAC
ATTTTTTACTTCCAAGAAACTCGATTTTTGCTAGAGATCTGCAGATTTTTCTGCCGGATA
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 

AF RS1BZ41JQ C 1
AF RS1BZ41TF U 92
BS 1 91 RS1BZ41JQ
BS 92 481 RS1BZ41TF

RD RS1BZ41JQ 481 0 0
GGACCTGACCCGTTTTCAGATTCCATTTCCTGCACCTGAGTGTAGACACGATGAGCACGG
AGATGGACGACTCTTCTTCAGATGTGCGGCGGCGCGTGTCATGCACTAAATACTTCGACG
CTCTCTGGTTCTGCTACTCACCATATTACCAAATGCAGCAGTACTACCGGGTTGGGAAAC
TTGATGATTGTACTAAGAAGTTCTCTGCTCTCTTTGATTGTCTTTCATTAAAGACCAAAA
GTGCTTCTGAAGCCCAGAAAATTCTGGAAGAGCAAGAGAAAGCAGATGCAGCAAATCATA
TCTGGATTATGCGGACAGAGGAAGAAGCTTCAAGACATTGGAACGAGACTTTCGGGCATT
TGGATGATCCGAATTATTAGAAGTACAGTTTTTACTTTCCCTACTGGATTCTTGATTGAC
ATTTTTTACTTCCAAGAAACTCGATTTTTGCTAGAGATCTGCAGATTTTTCTGCCGGATA
G

QA 1 481 1 481
DS 

RD RS1BZ41TF 390 0 0
GCGCGTGTCATGCACTAAATACTTCGACGCTCTCTGGTTCTGCTACTCACCATATTACCA
AATGCAGCAGTACTACCGGGTTGGGAAACTTGATGATTGTACTAAGAAGTTCTCTGCTCT
CTTTGATTGTCTTTCATTAAAGACCAAAAGTGCTTCTGAAGCCCAGAAAATTCTGGAAGA
GCAAGAGAAAGCAGATGCAGCAAATCATATCTGGATTATGCGGACAGAGGAAGAAGCTTC
AAGACATTGGAACGAGACTTTCGGGCATTTGGATGATCCGAATTATTAGAAGTACAGTTT
TTACTTTCCCTACTGGATTCTTGATTGACATTTTTTACTTCCAAGAAACTCGATTTTTGC
TAGAGATCTGCAGATTTTTCTGCCGGATAG

QA 1 390 1 390
DS 



AS 1 2

CO CL4660Contig1 663 2 4 U
GGCGAAAGCACAAGAGGAAGTAGACAGAGTTTTGGCGGGAAGAAACCCTGCTTATGAGGA
TATAAAGGAGTTGAAGTACATCACTCGTTGTATTAACGAGTCTATGCGTCTCTACCCTCA
TCCTCCTGTCTTGATTAGAAGAGCTCAAGTTCCAGACATCCTTCCAGGGAACTACAAGGT
TAATACAGGACAAGACATTATGATCTCCGTCTATAACGTCCATCGTTCATCCGCGGTGTG
GGAGAAAGCTGAAGAGTTTCTGCCTGAACGTTTCGAGTTAGAAGGACCGATTCCTAACGA
AACAAACACAGATTTCAAGTTTATACCATTTAGTGGAGGGCCTAGAAAATGTGTAGGTGA
TCAGTTTGCATTGATGGAAGCCATAGTGGCACTTGCGGTGTTTTTCCAGCGCCTAAACGT
TGAGCTTGTTCCTGATCAGACCATCAGCATGACCACTGGAGCTACCATACACACCACTAA
TGGATTGTATATGAAGGTGAGCCAAAGGTAAGCTAGAAATGTGGAAGATGAAGTTTGAAT
CTGTTTTCATCTGTATTTTATGATTATTGATTTTTGTTGTTACCATCATGATTCATTGTA
GTTACAACTTTTGCTATATGCCTTAACAAGCAAACAATAAGTGATAAAGAGTTGGATTCA
CTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 

AF RS1GW50JQ C 1
AF RS1FK15TF U 504
BS 1 504 RS1GW50JQ
BS 505 548 RS1FK15TF
BS 549 549 RS1GW50JQ
BS 550 663 RS1FK15TF

RD RS1GW50JQ 659 0 0
GGCGAAAGCACAAGAGGAAGTAGACAGAGTTTTGGCGGGAAGAAACCCTGCTTATGAGGA
TATAAAGGAGTTGAAGTACATCACTCGTTGTATTAACGAGTCTATGCGTCTCTACCCTCA
TCCTCCTGTCTTGATTAGAAGAGCTCAAGTTCCAGACATCCTTCCAGGGAACTACAAGGT
TAATACAGGACAAGACATTATGATCTCCGTCTATAACGTCCATCGTTCATCCGCGGTGTG
GGAGAAAGCTGAAGAGTTTCTGCCTGAACGTTTCGAGTTAGAAGGACCGATTCCTAACGA
AACAAACACAGATTTCAAGTTTATACCATTTAGTGGAGGGCCTAGAAAATGTGTAGGTGA
TCAGTTTGCATTGATGGAAGCCATAGTGGCACTTGCGGTGTTTTTCCAGCGCCTAAACGT
TGAGCTTGTTCCTGATCAGACCATCAGCATGACCACTGGAGCTACCATACACACCACTAA
TGGATTGTATATGAAGGTGAGCCAAAGGTAAGCTAGAAATGTGGAAGATGAAGTTTGAAT
CTGTTTTCATCTGTATTTTATGATTATTGATTTTTGTTGTTACCATCATGATTCATTGTA
GTTACAACTTTTGCTATATGCCTTAACAAGCAAACAATAAGTGATAAAGAGTTGGATTC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RS1FK15TF 160 0 0
G
AAGGTAAGCTAGAAATGTGGAAGATGAAGTTTGAATCTGTTTTCGTCTGTATTTTATGAT
TATTGATTTTTGTTGTTACCATCATGATTCATTGTAGTTACAACTTTTGCTATATGCCTT
AACAAGCAAACAATAAGTGATAAAGAGTTGGATTCACTC

QA 2 160 2 160
DS 



AS 1 2

CO CL4661Contig1 632 2 2 U
GGCCATAAGAAGGTGGAATTTTACAGTTTCGGGATCTCAAGATCTGCAAAAAAGGGAGAA
GAAAGATGATCGTTTGCGTCTCCGTCGTCGGCCACCAGAACAATCCGCTTTACATACAGA
GCTTCACCGACGCCGATGACGCCCTCAAGCTCCACCACGTCGTTCATTGCTCCCTCGACG
TCATCGAAGAGCGAGTGAACAATCCCAAAACCACATTGAACAAGGCTTTTCTTGGCCTAC
TCTATCCTACACTGAACTACAAAGTGTATGGTTACCTGACTAATACCAAAGTGAAATTTA
TACTGGTCACAACTGATTTGGATGTAAGAGACACCGATGTCAGAAACTTCTTCAGGAAAT
TCCATGCTGCCTATGTAGATGCAGTCTCAAACCCATTCCATGTCCCTGGCAAGAAGATAA
CCTCTAGAACCTTTGCTCAAACTGTGAGCAACATTGTCGGATCATACGGTTTGAACTGAC
CCCTCGTACTTGCTGCTTTCTGTGTTTACTGTGTGCATTGGCGGAACTACATTTCTTTTT
ATCATTTTTCTTTTCTTGTTTATATCAAACGCTTGGATTGTTGTAAGAAGAATTATTGGG
TTCACATGAATGGATATTTAAGTTTGGTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DY85TF U 1
AF RS1DY85JQ C 88
BS 1 596 RS1DY85TF
BS 597 632 RS1DY85JQ

RD RS1DY85TF 596 0 0
GGCCATAAGAAGGTGGAATTTTACAGTTTCGGGATCTCAAGATCTGCAAAAAAGGGAGAA
GAAAGATGATCGTTTGCGTCTCCGTCGTCGGCCACCAGAACAATCCGCTTTACATACAGA
GCTTCACCGACGCCGATGACGCCCTCAAGCTCCACCACGTCGTTCATTGCTCCCTCGACG
TCATCGAAGAGCGAGTGAACAATCCCAAAACCACATTGAACAAGGCTTTTCTTGGCCTAC
TCTATCCTACACTGAACTACAAAGTGTATGGTTACCTGACTAATACCAAAGTGAAATTTA
TACTGGTCACAACTGATTTGGATGTAAGAGACACCGATGTCAGAAACTTCTTCAGGAAAT
TCCATGCTGCCTATGTAGATGCAGTCTCAAACCCATTCCATGTCCCTGGCAAGAAGATAA
CCTCTAGAACCTTTGCTCAAACTGTGAGCAACATTGTCGGATCATACGGTTTGAACTGAC
CCCTCGTACTTGCTGCTTTCTGTGTTTACTGTGTGCATTGGCGGAACTACATTTCTTTTT
ATCATTTTTCTTTTCTTGTTTATATCAAACGCTTGGATTGTTGTAAGAAGAATTAT

QA 1 596 1 596
DS 

RD RS1DY85JQ 545 0 0
TCGGCCACCAGAACAATCCGCTTTACATACAGAGCTTCACCGACGCCGATGACGCCCTCA
AGCTCCACCACGTCGTTCATTGCTCCCTCGACGTCATCGAAGAGCGAGTGAACAATCCCA
AAACCACATTGAACAAGGCTTTTCTTGGCCTACTCTATCCTACACTGAACTACAAAGTGT
ATGGTTACCTGACTAATACCAAAGTGAAATTTATACTGGTCACAACTGATTTGGATGTAA
GAGACACCGATGTCAGAAACTTCTTCAGGAAATTCCATGCTGCCTATGTAGATGCAGTCT
CAAACCCATTCCATGTCCCTGGCAAGAAGATAACCTCTAGAACCTTTGCTCAAACTGTGA
GCAACATTGTCGGATCATACGGTTTGAACTGACCCCTCGTACTTGCTGCTTTCTGTGTTT
ACTGTGTGCATTGGCGGAACTACATTTCTTTTTATCATTTTTCTTTTCTTGTTTATATCA
AACGCTTGGATTGTTGTAAGAAGAATTATTGGGTTCACATGAATGGATATTTAAGTTTGG
TTTTT

QA 1 545 1 545
DS 



AS 1 2

CO CL4662Contig1 883 2 2 U
GAAAGGTCACAGGGGGCTTTACTCGGTTTATGTTCATCCGCATCCGTCTTTTACAGCCAA
GTTTCCGGCTAGTTCTGTTTTCCACCGGAGGCAGATACCTAGTCAGGTTGCAGAATGGGG
GAGAATGACCATGTGCGATGCAGAGAAGCGTCTACTCGCCAACGCACTGCTAGATATCTC
CAACGAATGGTTTGTTCTCGTCTCGGAGTTATGCATACCACTCTACAACTTCACGACAAT
CTACAGCTACTTAAGCCGATCAAAACACAGCTTCATGGGTGCTTTTGATGACCCTGGACC
GTTCGGCCGCGGCCGCTACAACGAGAACATGGAGCCTGAAGTTCCCATCACCAAATGGCG
GAAAGGGTCTCAGTGGTTTGAGATTAACCGGGAACTCGCAGCTACCATTGTCAAAGACAC
ATTGTATTACCCCAAATTCAAAGAGTTTTGTAGGCCTGCTTGTTATGTGGACGAGCATTA
CTTCCCTACGATGTTGACGATTGAGAAACCAATGGCGCTGGCTAACCGGAGCTTGACGTG
GGTGGATTGGTCTAGAGGCGGCCCCCACCCGGCTACGTTTGGGCGATCGGACATTACGGA
GAAGTTCTTTGAGAAGATCTTTGATGGAAAGAACTGCGCTTATAATGGTCGTAACACTTC
CATGTGTTATCTCTTTGCGAGGAAGTTTGCTCCAAGTGCTTTGGAGCCTTTGCTTCACAT
AGCTCCCAAGATTATGGGATTTTGAGTTAGAGAGGAGTGTCTGAACCTTTTGAAATCATA
TAGAGATAATGAAATGGATGTGATATGGATTCTGTCCAAGAAATTACTGCGATATTGTTT
TATTTTGTTTGTTTTTATACTAGTTTGGAAGAACATGACAGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AE04TF U 1
AF RS1AE04JQ C 30
BS 1 538 RS1AE04TF
BS 539 883 RS1AE04JQ

RD RS1AE04TF 540 0 0
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GAGAATGACCATGTGCGATGCAGAGAAGCGTCTACTCGCCAACGCACTGCTAGATATCTC
CAACGAATGGTTTGTTCTCGTCTCGGAGTTATGCATACCACTCTACAACTTCACGACAAT
CTACAGCTACTTAAGCCGATCAAAACACAGCTTCATGGGTGCTTTTGATGACCCTGGACC
GTTCGGCCGCGGCCGCTACAACGAGAACATGGAGCCTGAAGTTCCCATCACCAAATGGCG
GAAAGGGTCTCAGTGGTTTGAGATTAACCGGGAACTCGCAGCTACCATTGTCAAAGACAC
ATTGTATTACCCCAAATTCAAAGAGTTTTGTAGGCCTGCTTGTTATGTGGACGAGCATTA
CTTCCCTACGATGTTGACGATTGAGAAACCAATGGCGCTGGCTAACCGGAGCTTGACG
GG

QA 1 538 1 538
DS 

RD RS1AE04JQ 854 0 0
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GGCAGATACCTAGTCAGGTTGCAGAATGGGGGAGAATGACCATGTGCGATGCAGAGAAGC
GTCTACTCGCCAACGCACTGCTAGATATCTCCAACGAATGGTTTGTTCTCGTCTCGGAGT
TATGCATACCACTCTACAACTTCACGACAATCTACAGCTACTTAAGCCGATCAAAACACA
GCTTCATGGGTGCTTTTGATGACCCTGGACCGTTCGGCCGCGGCCGCTACAACGAGAACA
TGGAGCCTGAAGTTCCCATCACCAAATGGCGGAAAGGGTCTCAGTGGTTTGAGATTAACC
GGGAACTCGCAGCTACCATTGTCAAAGACACATTGTATTACCCCAAATTCAAAGAGTTTT
GTAGGCCTGCTTGTTATGTGGACGAGCATTACTTCCCTACGATGTTGACGATTGAGAAAC
CAATGGCGCTGGCTAACCGGAGCTTGACGTGGGTGGATTGGTCTAGAGGCGGCCCCCACC
CGGCTACGTTTGGGCGATCGGACATTACGGAGAAGTTCTTTGAGAAGATCTTTGATGGAA
AGAACTGCGCTTATAATGGTCGTAACACTTCCATGTGTTATCTCTTTGCGAGGAAGTTTG
CTCCAAGTGCTTTGGAGCCTTTGCTTCACATAGCTCCCAAGATTATGGGATTTTGAGTTA
GAGAGGAGTGTCTGAACCTTTTGAAATCATATAGAGATAATGAAATGGATGTGATATGGA
TTCTGTCCAAGAAATTACTGCGATATTGTTTTATTTTGTTTGTTTTTATACTAGTTTGGA
AGAACATGACAGAA

QA 1 854 1 854
DS 



AS 1 2

CO CL4663Contig1 845 2 2 U
GATGGGTTCTGAAACTTCTTGCTGAACACGACTTAGATGTTCTGCTGTTTTATGTTAATC
CTTCTCAAAGTTTTAATCTTTTCCCGAGAAAATTCGAATTCTGTTTCTCTCTCTCTCTCA
ACGCCGCCACTGAGTAGGAGGGATTAAAGCTCAAACCTTTATGGTGGATTTGGATTGTAT
TTGACATGAATTAGGAAAGAAAAAGGAAGAATCTATTTTTATTGGATTTTGGGGGATATA
CTACTTTCCATATCTTTGTTGTTTCTGATGGATACGATTCGTGTAGAGGCCAATGGATGT
AGTAATAATAAGGCTCTTGTTATCAGTCTAAAGAGCAGTGGGAATGAGGATCAGGTTTCT
GAGGAAGAAAGTGAGTCACAGTGTTTATTGCCGCCTCCTAATCCTAGGAAAGGAGGGATG
TCTAGAAGTAGTGACAAGATTAAGAGGACTGTCCAGTGGAATGACAACAAAGGTGACAAT
CTCGCTCAGGTTTTGGTTTATGAACCAAGTGAAGTAAGCGATACAGATGACGATGATTCA
GATTCCTGCATCTGCACAATTATGTAGCCCTCCCCAACCAACCCACCATTAAACATTGGA
GTTTAACAATGAGCTCGTCTTTGTTATCTGGCTTCTTTTCAGCAAGACGAACCAACTTAA
GCGACTGGACATCAATCACCAATCAGGCAGCTTCCTGATTTTGTTTTTCAGGACCAGTTC
AAATGAGGGATGTAGTAGACTCATATAAGCTCTTATACCAGGATCGTCACATTTCAGTAT
ATAGATTATAGATTACTGCTGTATTTTTGCGAGTGCTGTTTGATTTGATGACAGGTTTTG
ACAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RS1CT23TF U 1
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BS 683 845 RS1CT23JQ

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CTACTTTCCATATCTTTGTTGTTTCTGATGGATACGATTCGTGTAGAGGCCAATGGATGT
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TCTAGAAGTAGTGACAAGATTAAGAGGACTGTCCAGTGGAATGACAACAAAGGTGACAAT
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GCGACTGGACATCAATCACCAA

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1CT23JQ 671 0 0
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GATATACTACTTTCCATATCTTTGTTGTTTCTGATGGATACGATTCGTGTAGAGGCCAAT
GGATGTAGTAATAATAAGGCTCTTGTTATCAGTCTAAAGAGCAGTGGGAATGAGGATCAG
GTTTCTGAGGAAGAAAGTGAGTCACAGTGTTTATTGCCGCCTCCTAATCCTAGGAAAGGA
GGGATGTCTAGAAGTAGTGACAAGATTAAGAGGACTGTCCAGTGGAATGACAACAAAGGT
GACAATCTCGCTCAGGTTTTGGTTTATGAACCAAGTGAAGTAAGCGATACAGATGACGAT
GATTCAGATTCCTGCATCTGCACAATTATGTAGCCCTCCCCAACCAACCCACCATTAAAC
ATTGGAGTTTAACAATGAGCTCGTCTTTGTTATCTGGCTTCTTTTCAGCAAGACGAACCA
ACTTAAGCGACTGGACATCAATCACCAATCAGGCAGCTTCCTGATTTTGTTTTTCAGGAC
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CAGTATATAGATTATAGATTACTGCTGTATTTTTGCGAGTGCTGTTTGATTTGATGACAG
GTTTTGACAGG

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 2

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TCTTCCTCTTCTACACTCCTTTCTGGCTCACTCTCTCCTTGGGCATCGTTGTTCCTTACA
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ACCGTTACTGGGTTAAGGCAAATCTCTGGATTATTATTTTCAGCTATGTGGGAAACTACT
TTTGGACTCACTATTTCTTCAAAGTTCTTGGAGCCTCCTACACTTTCCCATCCTGGAAAA
TGAATAACGTGCCTCACACAACATTCTTCATGACGCATGCTTGCTTCCCCTTTTACCACG
TCGCCTCCAACATCACTCTCCGAAGGCTACGACATTCCGTTGCTGGTTTACCTGATTCTC
TCAGATGGTCTTTTGAGGCTGCTTGGATTCTTGCGCTCTCTTATTTCATTGCTTACCTCG
AGACTGTTGCTATTGCCAATTTTCCTTACTACGAGTTTGTGGATCGAAGTGCCATGTACA
AAGTTGGATGTTTGTTCTATGCCATCTACTTCTTTGTCAGCTTCCCAATGTTCTTCAGGT
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CTTACCGGAGGGACAAAACTGCCTTCAGTCTGGGTTACCATGGTTCTCCCGTTGAATCCT
GATTCATGGCTCTCCTTCGACCAAGTCATGGACCGATACTGAAACCTAAGAAAGAGTTCC
GTAAACACTTCCGGAAAGAAGTTAATGCGATTTTGGTAATGTTTCTCAGGTTTCTTTTGA
CTCCTTGCCTTTTGTTATATTTTTCTTCAGTTTCTCTTTGTTATATTTTGGTAACGAAAC
CTTGAAGTTATCTTTTTACCGAACAGAATGGAAGTTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTGAAA
TCAATGTACTGGTTCATAGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E142TF U 1
AF RS1E142JQ C 497
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RD RS1E142TF 761 0 0
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GTACTTCAGGGAGGAGCTTGTGGTTGGCAGCGAATCCGAGCAAGAGATGGGGAGAACTCT
TCTTCCTCTTCTACACTCCTTTCTGGCTCACTCTCTCCTTGGGCATCGTTGTTCCTTACA
AGCTTTACGAGACATTCACGGAGCTGGAGTATCTGCTTCTCTCCTTGGTTTCAGCTCTTC
CCGCTTTCTTCATCCCCATGTTACTTGTTGGAAAGGCTGACAGAAGCTTACCCTGGAAGG
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TTTGGACTCACTATTTCTTCAAAGTTCTTGGAGCCTCCTACACTTTCCCATCCTGGAAAA
TGAATAACGTGCCTCACACAACATTCTTCATGACGCATGCTTGCTTCCCCTTTTACCACG
TCGCCTCCAACATCACTCTCCGAAGGCTACGACATTCCGTTGCTGGTTTACCTGATTCTC
TCAGATGGTCTTTTGAGGCTGCTTGGATTCTTGCGCTCTCTTATTTCATTGCTTACCTCG
AGACTGTTGCTATTGCCAATTTTCCTTACTACGAGTTTGTGGATCGAAGTGC*ATGTACA
AAGTTGGATGTTTGTTCTATGCCATCTACTTCTTTGTCAGC

QA 1 761 1 761
DS 

RD RS1E142JQ 724 0 0
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CTATGCCATCTACTTCTTTGTCAGCTTCCCAATGTTCTTCAGGTGGAAGAGGAACCAAGT
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AACTGCCTTCAGTCTGGGTTACCATGGTTCTCCCGTTGAATCCTGATTCATGGCTCTCCT
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TACCGAACAGAATGGAAGTTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTGAAATCAATGTACTGGTTCA
TAGC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL4665Contig1 894 2 2 U
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TGATCGAGTTCGGTGGCCGGTGAGCATCTTTGCCACCGGTCGCCACCCCCTTTTTTGTTT
TTTGTTTTACTCCGACTTAGTTCGGATCTGTTTTCGGCTTGTCCGATTGTATATTCCGGT
CATCAGACTTTTCTTTCCAGTTGTGGATAATAAATTCGCTAGGCGACTTTTGCGGTGTGC
GTGTGTTGTCTAACCTTTCACCGTTTATCACTTCAATCCTGTTGATCTATTGACTGGATA
CCCTGTTTCACCGAATCAACTTAGCCGCTTTTCAACGAGAATCAGTCTTTACCGATTTAG
ATTAGCCATTTTGGTTTAAGGTAAAGCATCTCTGCTTAAAAGATGGTGAGTTCGATGGAT
TTATTAGGTCGTTGAAAGGGATTCAGCAGAGCCGGCGTTTATATCGGTCCGGCAAAGTAT
CTCTGTCTTCAACCCGATCTAAATGTCCTCTGTTTTAAGTACGGCGAGTCATGGGTCCCT
CCGGTTAATTGATCTTGGCTAACGTGAAAGGAAATTGGAGTACAAGATCTAAGCAACCTA
AGAAGTTACAGTGGCTGGCGTTAGGTGTGAGTTGCCGCCCGGTAGTCTCTTCCTCGCGAC
GGAGTCAGTGGTGGTTGAGCAAAGGGCGGTGGTGTTGATACGTGTCTCACTTATGCACCA
GATACTGCCACGTAGCAGACTAGTATCTTCCAACCTGCACGTGTAAAATATTATGTTAAG
TATATTGCAGTTTGTGTTGGGTTTACTGATTTCTTTGTACTCCAGTTTGTGTAATAGCCC
ATTGGGCTCTCGTTTAATGAAACGAATGTTGACAAAAAAAAATATTCCTTGCCG


BQ
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0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1H173TF U 1
AF RS1H173JQB C 145
BS 1 681 RS1H173TF
BS 682 894 RS1H173JQB

RD RS1H173TF 681 0 0
GGAACTAAAGTATTCTCTCTCTCTAGAAGCCCCAACTTCGCTCTAGTTCTTCTCAATCGC
TGATCGAGTTCGGTGGCCGGTGAGCATCTTTGCCACCGGTCGCCACCCCCTTTTTTGTTT
TTTGTTTTACTCCGACTTAGTTCGGATCTGTTTTCGGCTTGTCCGATTGTATATTCCGGT
CATCAGACTTTTCTTTCCAGTTGTGGATAATAAATTCGCTAGGCGACTTTTGCGGTGTGC
GTGTGTTGTCTAACCTTTCACCGTTTATCACTTCAATCCTGTTGATCTATTGACTGGATA
CCCTGTTTCACCGAATCAACTTAGCCGCTTTTCAACGAGAATCAGTCTTTACCGATTTAG
ATTAGCCATTTTGGTTTAAGGTAAAGCATCTCTGCTTAAAAGATGGTGAGTTCGATGGAT
TTATTAGGTCGTTGAAAGGGATTCAGCAGAGCCGGCGTTTATATCGGTCCGGCAAAGTAT
CTCTGTCTTCAACCCGATCTAAATGTCCTCTGTTTTAAGTACGGCGAGTCATGGGTCCCT
CCGGTTAATTGATCTTGGCTAACGTGAAAGGAAATTGGAGTACAAGATCTAAGCAACCTA
AGAAGTTACAGTGGCTGGCGTTAGGTGTGAGTTGCCGCCCGGTAGTCTCTTCCTCGCGAC
GGAGTCAGTGGTGGTTGAGCA

QA 1 681 1 681
DS 

RD RS1H173JQB 750 0 0
GATCTGTTTTCGGCTTGTCCGATTGTATATTCCGGTCATCAGACTTTTCTTTCCAGTTGT
GGATAATAAATTCGCTAGGCGACTTTTGCGGTGTGCGTGTGTTGTCTAACCTTTCACCGT
TTATCACTTCAATCCTGTTGATCTATTGACTGGATACCCTGTTTCACCGAATCAACTTAG
CCGCTTTTCAACGAGAATCAGTCTTTACCGATTTAGATTAGCCATTTTGGTTTAAGGTAA
AGCATCTTTGCTTAAAAGATGGTGAGTTCGATGGATTTATTAGGTCGTTGAAAGGGATTC
AGCAGAGCCGGCGTTTATATCGGTCCGGCAAAGTATTTCTGTTTTCAACCCGATCTAAAT
GTCCTCTGTTTTAAGTACGGCGAGTCATGGGTCCCTCCGGTTAATTGATCTTGGCTAACG
TGAAAGGAAATTGGAGTACAAGATTTAAGCAACCTAAGAAGTTACAGTGGCTGGCGTTAG
GTGTGAGTTGCCGCC*GGTAGTTTTTTCCTCGCGACGGAGTCAGTGGTGGTTGAGCAAAG
GGCGGTGGTGTTGATACGTGTCTCACTTATGCACCAGATACTGCCACGTAGCAGACTAGT
ATCTTCCAACCTGCACGTGTAAAATATTATGTTAAGTATATTGCAGTTTGTGTTGGGTTT
ACTGATTTCTTTGTACTCCAGTTTGTGTAATAGCCCATTGGGCTCTCGTTTAATGAAACG
AATGTTGACAAAAAAAAATATTCCTTGCCG

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL4666Contig1 976 2 2 U
CTCCGACCAAACCCGGCATTACTCCAGACGCCGGAGATTCTGGAATCCGCCGGAGATTTC
TCCACAAAAGGGCATTTTTCTCGCCGGAGATAGTTCCAAGAGGAGGCAATCTGATGGAGA
AACTCAAGGAGATGAGTTTATCAAACAATCGGCTTCGCCTTGACGAGATGCTACCGCCGC
CGACGCCGGAGAAGACGTCTCCGGGAAACTTCCCCGCGGTAACGGTGGAAGACGTGAAGA
AGCTAATGAGAGCAGCGGAAATGGAGATGGTGAAATCGAGGCTGAGAGACATCGGTAAAA
ACTGGGTTCCTTATTCGGAGTTCGTTCGGGTATGCGGAGAAAACAACTCGGATCCTGAAC
ATGGTAACCGGGTCGCGAATATGCTTGACAAAGCCGGAAACGTCATCGTTTTAGGAAACT
TCGTCTGCCTTAAACCGGAAGAGTTGACAAAAGCCGTGGCTGGTCTCATTCCGACACACG
AACCCACTCGCAACGCCGCGACAAGACAAGAGTTCGAACAACTCGAGATGGTAAAATCAG
ACATCGACAAAAGAGCCTACGATCTGGTACGGCGAGAATTACAGGCCGGATTGGGCCTTG
TAATAGCCCAAACGATTGGGTTTTTTAGACTAACGTTTTGGGAGCTGTCGTGGGACGTGA
TGGAGCCCATATGTTTCTTCGTAACTTCGACGTATTTCATGGCTGGTTACGCCTTCTTCC
TCCGTACCGCCAAGGAACCTTCCTTCGAAGGGTTTTACAAGAGCCGTTTCGAGACCAAGC
AGAGACGTTTGATTAAAACGCTTGACTCCGATATCGACAGGTTTACCAAGCTACAGAAGA
TACACCGTCCAGATTTGACTCATTCAGCTGGTCGTTGTTGATCCTAATCCTTTTTTTGTT
CCTTCTAATTCGGATACTAATTAAATGTATAGCGACCTCTAAAATTTTCGTAGATAATAA
ATCAAATATTAGGTGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AJ35TF U 1
AF RS1AJ35JQ C 221
BS 1 728 RS1AJ35TF
BS 729 976 RS1AJ35JQ

RD RS1AJ35TF 728 0 0
CTCCGACCAAACCCGGCATTACTCCAGACGCCGGAGATTCTGGAATCCGCCGGAGATTTC
TCCACAAAAGGGCATTTTTCTCGCCGGAGATAGTTCCAAGAGGAGGCAATCTGATGGAGA
AACTCAAGGAGATGAGTTTATCAAACAATCGGCTTCGCCTTGACGAGATGCTACCGCCGC
CGACGCCGGAGAAGACGTCTCCGGGAAACTTCCCCGCGGTAACGGTGGAAGACGTGAAGA
AGCTAATGAGAGCAGCGGAAATGGAGATGGTGAAATCGAGGCTGAGAGACATCGGTAAAA
ACTGGGTTCCTTATTCGGAGTTCGTTCGGGTATGCGGAGAAAACAACTCGGATCCTGAAC
ATGGTAACCGGGTCGCGAATATGCTTGACAAAGCCGGAAACGTCATCGTTTTAGGAAACT
TCGTCTGCCTTAAACCGGAAGAGTTGACAAAAGCCGTGGCTGGTCTCATTCCGACACACG
AACCCACTCGCAACGCCGCGACAAGACAAGAGTTCGAACAACTCGAGATGGTAAAATCAG
ACATCGACAAAAGAGCCTACGATCTGGTACGGCGAGAATTACAGGCCGGATTGGGCCTTG
TAATAGCCCAAACGATTGGGTTTTTTAGACTAACGTTTTGGGAGCTGTCGTGGGACGTGA
TGGAGCCCATATGTTTCTTCGTAACTTCGACGTATTTCATGGCTGGTTACGCCTTCTTCC
TCCGTACC

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1AJ35JQ 756 0 0
AACGGTGGAAGACGTGAAGAAGCTAATGAGAGCAGCGGAAATGGAGATGGTGAAATCGAG
GCTGAGAGACATCGGTAAAAACTGGGTTCCTTATTCGGAGTTCGTTCGGGTATGCGGAGA
AAACAACTCGGATCCTGAACATGGTAACCGGGTCGCGAATATGCTTGACAAAGCCGGAAA
CGTCATCGTTTTAGGAAACTTCGTCTGCCTTAAACCGGAAGAGTTGACAAAAGCCGTGGC
TGGTCTCATTCCGACACACGAACCCACTCGCAACGCCGCGACAAGACAAGAGTTCGAACA
ACTCGAGATGGTAAAATCAGACATCGACAAAAGAGCCTACGATCTGGTACGGCGAGAATT
ACAGGCCGGATTGGGCCTTGTAATAGCCCAAACGATTGGGTTTTTTAGACTAACGTTTTG
GGAGCTGTCGTGGGACGTGATGGAGCCCATATGTTTCTTCGTAACTTCGACGTATTTCAT
GGCTGGTTACGCCTTCTTCCTCCGTACCGCCAAGGAACCTTCCTTCGAAGGGTTTTACAA
GAGCCGTTTCGAGACCAAGCAGAGACGTTTGATTAAAACGCTTGACTCCGATATCGACAG
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ATCCTAATCCTTTTTTTGTTCCTTCTAATTCGGATACTAATTAAATGTATAGCGACCTCT
AAAATTTTCGTAGATAATAAATCAAATATTAGGTGC

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL4667Contig1 1274 2 2 U
GGGGATCTAGGGTAAGGGTTTCTAAATTGAGGAGGAGGAGGAGGAGAGTTTGAAGCTTGA
ACCATGTCTCGGTTTCTCAACGAACTCTCCTTGATGCACAAGAGGGGCCTTCGTTTGTTC
TCCTCACCGTCTTCGGGTCCTTTTCTGAGGCTTGGCAATACGGTCAAGGAAGAAGAAGAA
GAAGATGACATTCTCTTGTTCGATGCTGCCAAGGAAGAGTTACTCACTGTCCCTGACAAA
CCACATCCTCATGAGCTCGCTGACACGACTGTCGTTACATCTTCTCTTGGATGGGGTTTT
TTCTCTGCCTTTTCCGACCACCGTTCCTTGTACATCTCCGACCACTTGAACCCACTGTCT
TCCACAACATCATCATCCAAGGTCATTCCTCTGCCTCCCCTCACTGCTCTCTCCTCTTGC
CAAACTGACGTCTTCTGCAATGTCGCTATGTCTTCATCCTCTCCTAGTGATGATGACCCG
GACTTGGTCGTTGCTCTCAAGTTCTTGGGCAGACAGCTCTGTCTCTGTAGACCAAACCGT
GATTTGCGTTGGACTAACATCGCCACTCCTTTCCCCTTCTTGGAAAGATCCAACCTCATC
TTCTCCAACAGAGACCGCAAGTTCTACTTGCCTCTTCCTGGCAGCACCTACTTGTGCTCC
TGGGATCTCCACTTCACCCCTAGCTTCCGTAAGTTTATGTATACCAACCGTCCCAAGCTC
TCACAGTCCCAGCACCAGTTTCTGGATTCTTGTTCCAGGGCTGATCACTGGGTTGAGTCT
CCCTCCGGGGAGCGTTTCCTCGTCAAATGCTACACTCTGGACGACAGAGACCCTGTGTTC
ATGGTGTTTAGAGAGGAAGACATGATCAACATGTGTTACACTGAGGACATTGGTGATTTG
TGCATCTTCATTTCGGAGTCTGACCCTTTCTGCGTCCAAGCTAGCTCGTGCCCTGGTCTA
CTCCCCAACTCCATCTATCTTGTAGAACCTGTCTTTGGTGTTTACCATCTCCCCACCAGA
AGCCTTCGTCATTTTGAAGAGAAACTGGATAAGACTGAGACCAGAAGCCTTGGTCATTTT
GAAGAGAGACTGGATAAGACTGAGGTTAATCTCCACCTTCCTCACTGGCTTCCTCCTCTT
CCTACTATCTAGCTTTCATCTTCTAGTCGTAGCTAAGATATAACTCTTTTGTACCTGCTC
TCTGTCTCTGTTTGCCTTGTGTGTTAAAACTTCCTCCTGTGTAGTGGTAATATGCATATT
TTGTTAGTACCCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BF75TF U 1
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BS 680 1274 RS1BF75JQ

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ACCATGTCTCGGTTTCTCAACGAACTCTCCTTGATGCACAAGAGGGGCCTTCGTTTGTTC
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GAAGATGACATTCTCTTGTTCGATGCTGCCAAGGAAGAGTTACTCACTGTCCCTGACAAA
CCACATCCTCATGAGCTCGCTGACACGACTGTCGTTACATCTTCTCTTGGATGGGGTTTT
TTCTCTGCCTTTTCCGACCACCGTTCCTTGTACATCTCCGACCACTTGAACCCACTGTCT
TCCACAACATCATCATCCAAGGTCATTCCTCTGCCTCCCCTCACTGCTCTCTCCTCTTGC
CAAACTGACGTCTTCTGCAATGTCGCTATGTCTTCATCCTCTCCTAGTGATGATGACCCG
GACTTGGTCGTTGCTCTCAAGTTCTTGGGCAGACAGCTCTGTCTCTGTAGACCAAACCGT
GATTTGCGTTGGACTAACATCGCCACTCCTTTCCCCTTCTTGGAAAGATCCAACCTCATC
TTCTCCAACAGAGACCGCAAGTTCTACTTGCCTCTTCCTGGCAGCACCTACTTGTGCTCC
TGGGATCTCCACTTCACCC
T

QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1BF75JQ 695 0 0
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GGCAGCACCTACTTGTGCTCCTGGGATCTCCACTTCACCCCTAGCTTCCGTAAGTTTATG
TATACCAACCGTCCCAAGCTCTCACAGTCCCAGCACCAGTTTCTGGATTCTTGTTCCAGG
GCTGATCACTGGGTTGAGTCTCCCTCCGGGGAGCGTTTCCTCGTCAAATGCTACACTCTG
GACGACAGAGACCCTGTGTTCATGGTGTTTAGAGAGGAAGACATGATCAACATGTGTTAC
ACTGAGGACATTGGTGATTTGTGCATCTTCATTTCGGAGTCTGACCCTTTCTGCGTCCAA
GCTAGCTCGTGCCCTGGTCTACTCCCCAACTCCATCTATCTTGTAGAACCTGTCTTTGGT
GTTTACCATCTCCCCACCAGAAGCCTTCGTCATTTTGAAGAGAAACTGGATAAGACTGAG
ACCAGAAGCCTTGGTCATTTTGAAGAGAGACTGGATAAGACTGAGGTTAATCTCCACCTT
CCTCACTGGCTTCCTCCTCTTCCTACTATCTAGCTTTCATCTTCTAGTCGTAGCTAAGAT
ATAACTCTTTTGTACCTGCTCTCTGTCTCTGTTTGCCTTGTGTGTTAAAACTTCCTCCTG
TGTAGTGGTAATATGCATATTTTGTTAGTACCCTT

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

CO CL4668Contig1 589 2 2 U
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CTTGTCCTCCCTCGCCATCCTCGGTCTTCTCTTTCGTCAACTCAACGTCTCGGTACCTGT
GGATCCATTAGAGTGGCAAATATCACAAGATACAGCCTGTAACATCGTTGCACGCTTAGC
TAATACTGTTGGTGCAGCTGAATCCGTTTTGCGTGTTGCAGCAACGGGCCACGACAAGAG
GCTATTTCTTAAGGTTGTGATCTCTCTTTACTTCTTGGCAGCCCTGGGACGAATCATATC
GGGACTATGTTTGTTCTGTCTCTACATGGCTTGTCTGAACTCTCAATCTACTGGAAACTC
CGTACTGAGACGAACTAACCGAGAGACTTCAGAATGAGAAGAAGCACCTTCAGAGTTTTG
AAGATTTGACTCACAAATCACAATCACTATCACAATCTGTCTAAAATTGTTTTCTTCTTA
ATCTTCTTTCCAACCGAATTAACATGTTGATATAGCTTTCGGTAGTTACATTTATTATAA
CCTTTGTAGTTTCTAAATTTTTCAAAAAAACTTTGGTAATGTGGCTTCG


BQ
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AF RS1BZ12JQ C 1
AF RS1BZ12TF U 74
BS 1 73 RS1BZ12JQ
BS 74 589 RS1BZ12TF

RD RS1BZ12JQ 589 0 0
GGACTGCGCTAATCGAAACGCGACTCTTCTCTCCCTCTTCTCCGATGTCCTCATCGTTCT
CTTGTCCTCCCTCGCCATCCTCGGTCTTCTCTTTCGTCAACTCAACGTCTCGGTACCTGT
GGATCCATTAGAGTGGCAAATATCACAAGATACAGCCTGTAACATCGTTGCACGCTTAGC
TAATACTGTTGGTGCAGCTGAATCCGTTTTGCGTGTTGCCGCAACGGGCCACGACAAGAG
GCTATTTCTTAAGGTTGTGATCTCTCTTTACTTCTTGGCAGCCCTGGGACGAATCATATC
GGGACTATGTTTGTTCTGTCTCTACATGGCTTGTCTGAACTCTCAATCTACTGGAAACTC
CGTACTGAGACGAACTAACCGAGAGACTTCAGAATGAGAAGAAGCACCTTCAGAGTTTTG
AAGATTTGACTCACAAATCACAATCACTATCACAATCTGTCTAAAATTGTTTTCTTCTTA
ATCTTCTTTCCAACCGAATTAACATGTTGATATAGCTTTCGGTAGTTACATTTATTATAA
CCTTTGTAGTTTCTAAATTTTTCAAAAAAACTTTGGTAATGTGGCTTCG

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1BZ12TF 516 0 0
GCCATCCTCGGTCTTCTCTTTCGTCAACTCAACGTCTCGGTACCTGTGGATCCATTAGAG
TGGCAAATATCACAAGATACAGCCTGTAACATCGTTGCACGCTTAGCTAATACTGTTGGT
GCAGCTGAATCCGTTTTGCGTGTTGCAGCAACGGGCCACGACAAGAGGCTATTTCTTAAG
GTTGTGATCTCTCTTTACTTCTTGGCAGCCCTGGGACGAATCATATCGGGACTATGTTTG
TTCTGTCTCTACATGGCTTGTCTGAACTCTCAATCTACTGGAAACTCCGTACTGAGACGA
ACTAACCGAGAGACTTCAGAATGAGAAGAAGCACCTTCAGAGTTTTGAAGATTTGACTCA
CAAATCACAATCACTATCACAATCTGTCTAAAATTGTTTTCTTCTTAATCTTCTTTCCAA
CCGAATTAACATGTTGATATAGCTTTCGGTAGTTACATTTATTATAACCTTTGTAGTTTC
TAAATTTTTCAAAAAAACTTTGGTAATGTGGCTTCG

QA 1 516 1 516
DS 



AS 1 2

CO CL4669Contig1 514 2 1 U
GGACACCACAAAAACATAAAAAGAAAAAGAAATAGTTGACGAAATGAAGACAATAGTCTT
GCTCCTCCTGCTTCATGCCGTTTCAACATCAGGGAACAAGATGTATAGTTGGCAAAATCT
CACTGGCGTCCATGAAGATGAAGGGATTTGGGATTCTCTTGCGCCGAATAAGGACCCTTA
CATAACCCATGTAGCCCTTCAACCTGGGAAGACATGTGGTACATGTACTGGAACTGCTAA
TGGTATAAAATTTAACGATTGTTCATTATACCATAGATGCAAACGCATGGTAATGTAACT
CCAGTTTCCTCTATGCTCCAAATGGTTACGCTATGCGGGACACAGAAGAGGAGCATACCC
AAAGTCGACTATGCATATTTACAACTTTCTTTCGTTCTGTCTCCGTACGCTCTATGAGTA
CCAGTCGATATATATGTACTGTGCATCTATTAGAAAACCCATGTATCCTCTACTGTGTCC
CTTCAGGATTTTTATATGTGAAACAAGTTTCATT


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QA 1 514 1 514
DS 



AS 1 2

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BQ
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QA 1 518 1 518
DS 



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QA 1 515 1 515
DS 



AS 1 2

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BQ
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C

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BQ
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QA 1 555 1 555
DS 



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BQ
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AF RS1D434JQ U 47
AF RS1D434TF C 1
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BS 565 718 RS1D434TF

RD RS1D434JQ 518 0 0
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TCAAATGCCACACATACATGGGAGTGAAGTCACGATCATCTAACTTCAAAAATGGATTAC
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ACTTCGTGGTGGATTTCATAGCCATGGATGTAGTTTATGCAGAGGATGTTTTTTGATCTA
GGATGGATTTAGGTTTAGAGAGATAGATCTTTCTATAG

QA 1 518 1 518
DS 

RD RS1D434TF 718 0 0
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TGCCAAGCTTCTATGATGACTTTGAGCTGGGATTCTCCCGTGAACTGTTAGCCACTAAGC
TTCTCAAGATTATGCGTCTGCAATTGCTCCAGATGCATCATAGCCTTTTGCCTTGGGATG
CTCTCCACGACCTCTGAGGAGCCAGGTGACTCAACTAAGAAATTACCAACCTTCTCTTTG
GCACCGTCAACAACAGACCACATATGTTTCTCCTCTAGCTTCAGTTTTTCTTCTTTCAAA
GCTTTTTTCTCCTCTGTGGTCATTTGTTTCTTCTTCTCTTTCTCCCTCAAATGCCACACA
TACATGGGAGTGAAGTCACGATCATCTAACTTCAAAAATGGATTACCCGGAACCGAAGCC
GTGATCAGATCGTCCTTGTGATATGTCGCTGAAATACATAGCTGAGACTTCGTGGTGGAT
TTCATAGCCATGGATGTAGTTTATGCAGAGGATGTTTTTTGATCTAGGATGGATTTAGGT
TTAGAGAGATAGATCTTTCTATAGGAGGAGAATCAAAGGGAGATGGAGCAAAACCTTTAA
GAATTGCTTTAACATCGACAGTGAATGAGAAGGTAACGGAAAAAAATAGAGAATGGAGAA
GATGAAGTGGAAGAGTAGGGGGAGAGTCGCCAGAAGGCGAAGACGCAGGTTTGTCTCC

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

CO CL4676Contig1 729 2 2 U
GGATTTTCTTCTCTTTCGCTTTTACTCTGTTCACTCAGAGCATAAACCCTAAAAAGACAG
GAACCAGAAACTAAAAAACACGAACACGATGTTGTTAGGGAAGAGACAGAGACAAGAGAT
AAAGAGAACCACGAGTCTGTCGGAGATAAAATTCGACTTGAACTTACCTAGTGAACCAGA
AGAGCCGTCCGATCATCATCAGGTTCAGATGTTGAGTCCGAGGAAAAGTAAGCTCGTGGC
CATTGATGAACATCGCCAGGTTAATCATGGCTTGTTAGATCAACGTCTCTTAGCGATGGT
AGGTACACCGAGGAGACACTCAGAAGATTACTCCACTCACGTCGGAGATTTTCTGAGGTC
TTGCTCTCTCTGTAAACGTCATCTTGTTCCCGGCCGAGACATCTATATGTATAGAGGAGA
TAGGGCGTTTTGTAGTTTAGAGTGCAGGCAACAGCAGATTACGGTGGACGAGAGGAAAGA
GAAGGGCTTGGTTAGGTCTACCGTCGCCACCGGATCCGGCAAAGGAGAGAGAGTTTCCGC
CGCCGTGTAGGTCACCTCGACAAATATATATTTATATCCGTATGATTGTATATGGTTATT
ATTATTATGTCTAAAAGGATTGGGCATTATTGGCCATGATTAACCTTGTCAATCATCTTA
AGCTTTGCTCTAAAACTTAATTTAAGAGTTAAGACTAGACTATGGTGCTTTGCATATTAT
AAAAAAAAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BH70TF U 1
AF RS1BH70JQ C 1
BS 1 514 RS1BH70TF
BS 515 729 RS1BH70JQ

RD RS1BH70TF 514 0 0
GGATTTTCTTCTCTTTCGCTTTTACTCTGTTCACTCAGAGCATAAACCCTAAAAAGACAG
GAACCAGAAACTAAAAAACACGAACACGATGTTGTTAGGGAAGAGACAGAGACAAGAGAT
AAAGAGAACCACGAGTCTGTCGGAGATAAAATTCGACTTGAACTTACCTAGTGAACCAGA
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GAAGGGCTTGGTTAGGTCTACCGTCGCCACCGGA

QA 1 514 1 514
DS 

RD RS1BH70JQ 729 0 0
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GAACCAGAAACTAAAAAACACGAACACGATGTTGTTAGGGAAGAGACAGAGACAAGAGAT
AAAGAGAACCACGAGTCTGTCGGAGATAAAATTCGACTTGAACTTACCTAGTGAACCAGA
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CATTGATGAACATCGCCAGGTTAATCATGGCTTGTTAGATCAACGTCTCTTAGCGATGGT
AGGTACACCGAGGAGACACTCAGAAGATTACTCCACTCACGTCGGAGATTTTCTGAGGTC
TTGCTCTCTCTGTAAACGTCATCTTGTTCCCGGCCGAGACATCTATATGTATAGAGGAGA
TAGGGCGTTTTGTAGTTTAGAGTGCAGGCAACAGCAGATTACGGTGGACGAGAGGAAAGA
GAAGGGCTTGGTTAGGTCTACCGTCGCCACCGGATCCGGCAAAGGAGAGAGAGTTTCCGC
CGCCGTGTAGGTCACCTCGACAAATATATATTTATATCCGTATGATTGTATATGGTTATT
ATTATTATGTCTAAAAGGATTGGGCATTATTGGCCATGATTAACCTTGTCAATCATCTTA
AGCTTTGCTCTAAAACTTAATTTAAGAGTTAAGACTAGACTATGGTGCTTTGCATATTAT
AAAAAAAAA

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

CO CL4677Contig1 1098 2 2 U
GGCACGTCGTCGTTCATTCTAAAACCCCCTCTCAAGCAAAGTTCTTCAATCTTCTTCGCT
TCGCTGTAAACCATGTCATTCGAAGATGATTTTGTGGAAGATGATGAAATGAACATGATT
GATGAAGACGCAGCATCTGACTCCGAAGCAGAGTCTTTGTCAGATTCTGATTCAGAAAAC
GAGATCACTGAGAAGCTAGCTGAGCCGACAAAGACTGCTGTCCCAACAGAGATGGTTTGC
TTGACAAACTTCAAGACATTAGTTGGCCAGAAGATGTTGACTGGACTCACAAGCTCACCG
TCGAGATCGAGCAAGGACAAGCCGTGGATGTAAACGACGACCTCGCTAGAGAGATGGCGT
TCTACACTCAAGCCCTCGAAGGGACGAGGCAGGCTTTCGAGAAGCTCCAGGAGATGGGAC
TGCCTTTCCTCAGGCCGGCTGATTACTACGCGGAGTTGGTGAAATCAGATACGCACATGG
AGAAAGTGAAGTCTAAGCTTCTGTACGAGAAGAAACAGATGGAGGAGGCTGAAGAGAGGA
GGAAAGCTAGGGACAACAAGAAGATGGCTAAGGAAGTACAGTCTCAGAAGATGAAGGAGA
GGGCTAAGCAGAAGAAGGATGAGATTGAGTCTGTCAAGAAGTGGAGGAAACAGGGGCAGC
AGAGTGGGTTTAGTGAGAAAGGAGCTGGAGAGCTTGATCTTGGGTTTGGAAACGGAAAGA
GTTTCCAGAGAGGAGGTGGTAAGAAGAGACCAGGTGTGTCTCCAGGTGATCGATCGGGAG
GTAAAGGGAAGACCGCTTCGAGGATGAACAATAAGAAGAGGGAGTTTAGGGATTCTAAGT
TTGGTCATGGTGGAAGGAAAGGGTTGAGCAAGCAGAACACTGCAGAGACGACGAATGATT
TCAAAGGTGGGTTTCGTGATGGCAAAGCTGGTGGAAACAAGAGACAGAAGAGATAAACAA
AGTTTGGTTATTTAAACCCATCTATAGTTTCAACACTATAAACTATTATGTCATGCTGGA
TTATGTTTTTGAGAGAATGTTTCTTTAGTTACAATGTTGTAGTAATGATTCTTGGATTAA
AAAAGGTCGATGTGTTTC


BQ
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AF RS1D881TF U 1
AF RS1D881JQ C 430
BS 1 568 RS1D881TF
BS 569 1098 RS1D881JQ

RD RS1D881TF 568 0 0
GGCACGTCGTCGTTCATTCTAAAACCCCCTCTCAAGCAAAGTTCTTCAATCTTCTTCGCT
TCGCTGTAAACCATGTCATTCGAAGATGATTTTGTGGAAGATGATGAAATGAACATGATT
GATGAAGACGCAGCATCTGACTCCGAAGCAGAGTCTTTGTCAGATTCTGATTCAGAAAAC
GAGATCACTGAGAAGCTAGCTGAGCCGACAAAGACTGCTGTCCCAACAGAGATGGTTTGC
TTGACAAACTTCAAGACATTAGTTGGCCAGAAGATGTTGACTGGACTCACAAGCTCACCG
TCGAGATCGAGCAAGGACAAGCCGTGGATGTAAACGACGACCTCGCTAGAGAGATGGCGT
TCTACACTCAAGCCCTCGAAGGGACGAGGCAGGCTTTCGAGAAGCTCCAGGAGATGGGAC
TGCCTTTCCTCAGGCCGGCTGATTACTACGCGGAGTTGGTGAAATCAGATACGCACATGG
AGAAAGTGAAGTCTAAGCTTCTGTACGAGAAGAAACAGATGGAGGAGGCTGAAGAGAGGA
GGAAAGCTAGGGACAACAAGAAGATGGC

QA 1 568 1 568
DS 

RD RS1D881JQ 669 0 0
TCAGGCCGGCTGATTACTACGCGGAGTTGGTGAAATCAGATACGCACATGGAGAAAGTGA
AGTCTAAGCTTCTGTACGAGAAGAAACAGATGGAGGAGGCTGAAGAGAGGAGGAAAGCTA
GGGACAACAAGAAGATGGCTAAGGAAGTACAGTCTCAGAAGATGAAGGAGAGGGCTAAGC
AGAAGAAGGATGAGATTGAGTCTGTCAAGAAGTGGAGGAAACAGGGGCAGCAGAGTGGGT
TTAGTGAGAAAGGAGCTGGAGAGCTTGATCTTGGGTTTGGAAACGGAAAGAGTTTCCAGA
GAGGAGGTGGTAAGAAGAGACCAGGTGTGTCTCCAGGTGATCGATCGGGAGGTAAAGGGA
AGACCGCTTCGAGGATGAACAATAAGAAGAGGGAGTTTAGGGATTCTAAGTTTGGTCATG
GTGGAAGGAAAGGGTTGAGCAAGCAGAACACTGCAGAGACGACGAATGATTTCAAAGGTG
GGTTTCGTGATGGCAAAGCTGGTGGAAACAAGAGACAGAAGAGATAAACAAAGTTTGGTT
ATTTAAACCCATCTATAGTTTCAACACTATAAACTATTATGTCATGCTGGATTATGTTTT
TGAGAGAATGTTTCTTTAGTTACAATGTTGTAGTAATGATTCTTGGATTAAAAAAGGTCG
ATGTGTTTC

QA 1 669 1 669
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

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GCTTTCCTCCCAATTCTCGTCCCGATCCTTCTCAGGTTAAAGCAGCGTACCGGAAGAAAG
TATGGGAATCACACCCTGACCTGTTCCCTGATGATCAGAAGCTCCGTGCCGAGTCTAAGT
TCAAATCTATATCCGAAGCTTACTCTTGCCTTGAGTTTGGTGATGTTAAAGGCCAACACT
ATTCCAGATCAGGTGTGTATTCAAGGGTGGTCAGGACGGGAGTCCCGCGGACATATGCAT
ATGCCAAAAGAGGTAATGCGTGGTTGATCGGTGCACCTTTCCTTTTGATCGTCCTTGGAA
CCATCGGTCTTGGTGGAATCAAAGCTAACAGGGCATACAATATGCAAAAACAGACGTTCC
CCTCTCATAATCCCTCCCTTCCTTGATTCAGAGTGTCCCTCTCTTTGAATCTGAGTGAGA
GCTGCCAACAGTGAGATATATTTACTTCTTGTTAAATTCGAAAGGGATGTAAGGTTAGAG
TAACTCTTTTAAGATTTGAAGTCCTAGGAATGTGGGGAACTAGGGATTATCTGCTTGGTG
ATTCCTCTACTTGTTGTAATTTGAATAGCAATACATACACAAGGACTCGGCTTCTGTACT
TTGTATTTGTATTATTATACTTGATTCAGTGAAAGATGGTGTGAGTGAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1G846TF U 1
AF RS1G846JQ C 426
BS 1 435 RS1G846TF
BS 436 436 RS1G846JQ
BS 437 573 RS1G846TF
BS 574 710 RS1G846JQ

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GCTTTCCTCCCAATTCTCGTCCCGATCCTTCTCAGGTTAAAGCAGCGTACCGGAAGAAAG
TATGGGAATCACACCCTGACCTGTTCCCTGATGATCAGAAGCTCCGTGCCGAGTCTAAGT
TCAAATCTATATCCGAAGCTTACTCTTGCCTTGAGTTTGGTGATGTTAAAGGCCAACACT
ATTCCAGATCAGGTGTGTATTCAAGGGTGGTCAGGACGGGAGTCCCGCGGACATATGCAT
ATGCCAAAAGAGGTAATGCGTGGTTGATCGGTGCACCTTTCCTTTTGATCGTCCTTGGAA
CCATCGGTCTTGGTGGAATCAAAGCTAACAGGGCATACAATATGCAAAAACAGACGTTCC
CCTCTCATAATCCCTTCCTTCCTTGATTCAGAGTGTCCCTCTCTTTGAATCTGAGTGAGA
GCTGCCAACAGTGAGATATATTTACTTCTTGTTAAATTCGAAAGGGATGTAAGGTTAGAG
TAACTCTTTTAAGATTTGAAGTCCTAGGAATGT

QA 1 573 1 573
DS 

RD RS1G846JQ 285 0 0
CATAATCCCTCCCTTCCTTGATTCAGAGTGTCCCTCTCTTTGAATTTGAGTGAGAGCTGC
CAACAGTGAGATATATTTACTTCTTGTTAAATTCGAAAGGGATGTAAGGTTAGAGTAACT
CTTTTAAGATTTGAAGTCCTAGGAATGTGGGGAACTAGGGATTATCTGCTTGGTGATTCC
TCTACTTGTTGTAATTTGAATAGCAATACATACACAAGGACTCGGCTTCTGTACTTTGTA
TTTGTATTATTATACTTGATTCAGTGAAAGATGGTGTGAGTGAGG

QA 1 285 1 285
DS 



AS 1 2

CO CL4681Contig1 515 2 1 U
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TTTTGAACAAGTCTCCACATCTACAGACTCTTGTCATCAAGGGTCCACTGCACGCTGATA
ATGTTGAACGTGAGTATGGGTTTTCACCTGTGAGAGTACTCAAGATAACTGAGTATGGAG
GAGAGGTTGGAGAGTTTGAGCAAATGAAGCTTTTCTTTGAGAAACTGACATGTCTTGAGC
TTGTCAAAGTTTGTGCTTATGCAATAACCGACAAGGAAAAGTCTAGGATCACCAGTGATC
TACTAATGCTTCCTAGATCGTCCATGTGCAAGGTCCAGATCAAGTTTTGTGAGGAAGCAA
GACCCAAATTGAATACTAGGAGCAGGCTATTAAGTTAATGAATGAAGTTATGTAAACTAT
GATAAGTCTGGTTTTTGTGCACAATTGCTCTGTTTTCTATTGTGTGGACGTGAATGAGAA
GACAAATACTCAGTATATGTCAACAATGTACTCAT


BQ
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AF RS1E870JQ C 1
AF RS1E870TF U 1
BS 1 515 RS1E870TF

RD RS1E870JQ 515 0 0
GCTCTCGCTTAATTGTTACAGTTGATTACCCAAGCTACAATTGGGAGTTTCTGCCACTTC
TTTTGAACAAGTCTCCACATCTACAGACTCTTGTCATCAAGGGTCCACTGCACGCTGATA
ATGTTGAACGTGAGTATGGGTTTTCACCTGTGAGAGTACTCAAGATAACTGAGTATGGAG
GAGAGGTTGGAGAGTTTGAGCAAATGAAGCTTTTCTTTGAGAAACTGACATGTCTTGAGC
TTGTCAAAGTTTGTGCTTATGCAATAACCGACAAGGAAAAGTCTAGGATCACCAGTGATC
TACTAATGCTTCCTAGATCGTCCATGTGCAAGGTCCAGATCAAGTTTTGTGAGGAAGCAA
GACCCAAATTGAATACTAGGAGCAGGCTATTAAGTTAATGAATGAAGTTATGTAAACTAT
GATAAGTCTGGTTTTTGTGCACAATTGCTCTGTTTTCTATTGTGTGGACGTGAATGAGAA
GACAAATACTCAGTATATGTCAACAATGTACTCAT

QA 1 515 1 515
DS 

RD RS1E870TF 515 0 0
GCTCTCGCTTAATTGTTACAGTTGATTACCCAAGCTACAATTGGGAGTTTCTGCCACTTC
TTTTGAACAAGTCTCCACATCTACAGACTCTTGTCATCAAGGGTCCACTGCACGCTGATA
ATGTTGAACGTGAGTATGGGTTTTCACCTGTGAGAGTACTCAAGATAACTGAGTATGGAG
GAGAGGTTGGAGAGTTTGAGCAAATGAAGCTTTTCTTTGAGAAACTGACATGTCTTGAGC
TTGTCAAAGTTTGTGCTTATGCAATAACCGACAAGGAAAAGTCTAGGATCACCAGTGATC
TACTAATGCTTCCTAGATCGTCCATGTGCAAGGTCCAGATCAAGTTTTGTGAGGAAGCAA
GACCCAAATTGAATACTAGGAGCAGGCTATTAAGTTAATGAATGAAGTTATGTAAACTAT
GATAAGTCTGGTTTTTGTGCACAATTGCTCTGTTTTCTATTGTGTGGACGTGAATGAGAA
GACAAATACTCAGTATATGTCAACAATGTACTCAT

QA 1 515 1 515
DS 



AS 1 2

CO CL4682Contig1 1028 2 2 U
GAAGCTTTACGATTGGTCCTTTTCAAAGTTCACACGGAGAAGCAGCACGTGTCAAAGTAA
GAGTTCAGCTAAATCTCCACGGGGTTGTCACCATCGATTCAGCTTTTCTAATAGAGGATC
CTAAGGAGAATACGACTTCTGAAGAGACAGTATCCGAAAATAACCATCAATCTCCTGCGA
CAAAGGATGGTTCTACTGGTAACGATCAGAAGGCAATCAAAAGAATGAAAATTTCAGTTG
TTGAGAACGTCTCTGGTGCATTGACAAAGAATGTTATCGGAAGCCAAACAGAGAGAAAAC
TCTTTGGTGGAGCAAGATCTGAAGATGGAGTCGACAAAGGATAAGAAAAATGCTCTTGAA
TCCTTTGTTTATGAGATGCGTGATAAGATGTTAAATACATATAGAAGCACTGCAACTGAG
TCAGAACGGGAATGCATCGCTAGAAATCTTCAAGAAACAGAGGAATGGCTATACGAAGAT
GGTGATGATGAATCTGAAAATGCTTACATCGAGAAGTTGAATGACATCAAAAAGCTCATT
GATCCTATTGAAAATCGGTTTAAAGATGGAGAAGAGAGAGTACAAGCATCAAAAGATCTT
GCGAAAACTATAGCAGATAATAGAATGGCTGCAGAGTCTCTTCCTCCTCCAAGAAAGAAC
GCGGTTCTTGATGAATGTAAGAAAGTCGAGAGGTGGCTCCAGGAGAGAACCACGGAACAA
GTATCACATAGCCATCCGGAGCTGCAATCTGGTGAAATCAGGAGAAAGGCCGATGCTCTT
AACGCGACGTGCAAGTACATTGGGAAGTCAAACTCTCCCCCCACGAAATCGGAACACAAT
GGATCCCACGGACGTCGAAACTCGGATGATATGGAGCTTGATTGATTTTTCACTTTTTGT
TCTTTGATATTAATTTTGTTGAACAAAAGAATAAGACGAAAGTCTCATTATTACTTCTCA
CATAAACAATTATGTTCATTTTTGTCAAACGGTTTGAAAACGATTATTCTCGAAGTTGAT
TTTTTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G912TF U 1
AF RS1G912JQ C 381
BS 1 519 RS1G912TF
BS 520 1028 RS1G912JQ

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GAGTTCAGCTAAATCTCCACGGGGTTGTCACCATCGATTCAGCTTTTCTAATAGAGGATC
CTAAGGAGAATACGACTTCTGAAGAGACAGTATCCGAAAATAACCATCAATCTCCTGCGA
CAAAGGATGGTTCTACTGGTAACGATCAGAAGGCAATCAAAAGAATGAAAATTTCAGTTG
TTGAGAACGTCTCTGGTGCATTGACAAAGAATGTTATCGGAAGCCAAACAGAGAGAAAAC
TCTTTGGTGGAGCAAGATCTGAAGATGGAGTCGACAAAGGATAAGAAAAATGCTCTTGAA
TCCTTTGTTTATGAGATGCGTGATAAGATGTTAAATACATATAGAAGCACTGCAACTGAG
TCAGAACGGGAATGCATCGCTAGAAATCTTCAAGAAACAGAGGAATGGCTATACGAAGAT
GGTGATGATGAATCTGAAAATGCTTACATCGAGAAGTTG

QA 1 519 1 519
DS 

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TAGAAATCTTCAAGAAACAGAGGAATGGCTATACGAAGATGGTGATGATGAATCTGAAAA
TGCTTACATCGAGAAGTTGAATGACATCAAAAAGCTCATTGATCCTATTGAAAATCGGTT
TAAAGATGGAGAAGAGAGAGTACAAGCATCAAAAGATCTTGCGAAAACTATAGCAGATAA
TAGAATGGCTGCAGAGTCTCTTCCTCCTCCAAGAAAGAACGCGGTTCTTGATGAATGTAA
GAAAGTCGAGAGGTGGCTCCAGGAGAGAACCACGGAACAAGTATCACATAGCCATCCGGA
GCTGCAATCTGGTGAAATCAGGAGAAAGGCCGATGCTCTTAACGCGACGTGCAAGTACAT
TGGGAAGTCAAACTCTCCCCCCACGAAATCGGAACACAATGGATCCCACGGACGTCGAAA
CTCGGATGATATGGAGCTTGATTGATTTTTCACTTTTTGTTCTTTGATATTAATTTTGTT
GAACAAAAGAATAAGACGAAAGTCTCATTATTACTTCTCACATAAACAATTATGTTCATT
TTTGTCAAACGGTTTGAAAACGATTATTCTCGAAGTTGATTTTTTCAG

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 2

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AAAATAGTAAATAAAATGGAAGAAATGATTGACAAATTCAATTCAAATTTCACTGAAAGA
TCGATTGATCCCTGAAAATTTTATATAAAAGTGACTTAAACAAACAACATTTAAATAAAA
ACATTTTTCGGTTCTGCAAATTTAGTTTCTGCTTGGTTCCTGAATCATTTGCACTGCCTG
TTGAAAGCAAGACAACGTGTAATGCACATCATTTGTTGTTATCTGGTGGTGTATAACCAT
TCTGATCCGGGACGAGTTTTCTGGGATGAAGAGAATGCCATACTCAGTTAGACTCTTGCG
CAGTTTCTCAGCAGTAAGTCTTGATCCATCCTCCATATCCATGAAAATCATGTTGGTCTC
CGCGGCTGTAACGTTCACTCTAATCCCTTTCATCTGATTCAACCCTTCAGCTAACAACTT
TGTCTTCTTGTGGTCAAACTGTAACTTTGGGAGGTTCTCTTGAAGTGCGACCAAAGCAGC
TGCACACAGAACACCTATTTGCCTCATTCCTCCTCCTAATGTTTTCCTTAACGTTTTTGC
ATTTTCCATGAAACTCTGTGAACCAACGACTACAGATCCTATAGGAGCTCCAAGACCTTT
AGAGAGACACACCGAAACAGAGTCAGCAGCCTGTACAAGCCTATGGACTGGAACTC


BQ
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AF RS1EO43JQ U 92
AF RS1AX53JQ U 1
BS 1 116 RS1AX53JQ
BS 117 117 RS1EO43JQ
BS 118 198 RS1AX53JQ
BS 199 199 RS1EO43JQ
BS 200 328 RS1AX53JQ
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BS 330 585 RS1AX53JQ
BS 586 587 RS1EO43JQ
BS 588 716 RS1AX53JQ

RD RS1EO43JQ 553 0 0
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TGACTTAAACAAACAACATTTAAATAAAAACATTTTTCGGTTCTGCAAATTTAGTTTCTG
CTTGGTTCCTGAATCATTTGCACTGCCTGTTGAAAGCAAGACAATGTGTAATGCACATCA
TTTGTTGTTATCTGGTGGTGTATAACCATTCTGATCCGGGACGAGTTTTCTGGGATGACG
AGAATGCCATACTCAGTTAGACTCTTGCGCAGTTTCTCAGCAGTAAGTCTTGATCCATCC
TCCATATCCATGAAAATCATGTTGGTCTCCGCGGCTGTAACGTTCACTCTAATCCCTTTC
ATCTGATTCAACCCTTCAGCTAACAACTTTGTCTTCTTGTGGTCAAACTGTAACTTTGGG
AGGTTCTCTTGAAGTGCGACCAAAGCAGCTGCACACAGAACACCTATTTGCC*CATTCCT
CCTCCTAATGTTTTCCTTAACGTTTTTGCCTTTTCCATGAAACTCTGTGAACCAACGACT
ACAGATCCTATAG

QA 1 553 1 553
DS 

RD RS1AX53JQ 716 0 0
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AAAATAGTAAATAAAATGGAAGAAATGATTGACAAATTCAATTCAAATTTCACTGAGAGA
TCGATTGATCCCTGAAAATTTTATATAAAAGTGACTTAAACAAACAACATTTAAATAAAA
ACATTTTTCGGTTCTGCAGATTTAGTTTCTGCTTGGTTCCTGAATCATTTGCACTGCCTG
TTGAAAGCAAGACAACGTGTAATGCACATCATTTGTTGTTATCTGGTGGTGTATAACCAT
TCTGATCCGGGACGAGTTTTCTGGGATGGAGAGAATGCCATACTCAGTTAGACTCTTGCG
CAGTTTCTCAGCAGTAAGTCTTGATCCATCCTCCATATCCATGAAAATCATGTTGGTCTC
CGCGGCTGTAACGTTCACTCTAATCCCTTTCATCTGATTCAACCCTTCAGCTAACAACTT
TGTCTTCTTGTGGTCAAACTGTAACTTTGGGAGGTTCTCTTGAAGTGCGACCAAAGCAGC
TGCACACAGAACACCTATTTGCCTCATTCCTCCTCCTAATGTTTT**TTAACGTTTTTGC
ATTTTCCATGAAACTCTGTGAACCAACGACTACAGATCCTATAGGAGCTCCAAGACCTTT
AGAGAGACACACCGAAACAGAGTCAGCAGCCTGTACAAGCCTATGGACTGGAACTC

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

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GGAATCAATCCTTCTCTTATTCACAACCCGAAACTCTTCCATGGATAGTTGTCTCTCTAA
ACACGCGGCGCTCCCCTTACCCCCGTCCCGTTCGAGGAGACTGAGCGGCGATAGAAGCTT
ATTGGTTCTTCCTGCGATGCGCAAGGTCCAGTATCGATCTTTAGTCATGGTTGCCGCTGC
GGGTAACAACCAGTCCGAGCCTGGAAGCAGCTTTAACGCGCCGCTTAAACCTCGAACGTC
GCAGGGAAAGTTTCTGAGAGGTCTGTTGATAAACAAGCGTCACCTCTTTCACTACGCCGC
TGCTGATGAGCTCAGGTTGCTGGCAGAGAACCGTGAAGCTGCTTTGGCTCGTATGTCTCT
CAGCTTTGGTTCCGACGAAGCTTCTCTCCACAGAAGAATAGCTCAGCACAAGGAACGTTA
CTGCAAAACAGCAGTCCAAGAAATAATATACATGCTAATAGTCTATAAATACTCTGAGAT
AAGGGTCCCTCTGGCTCCAAAGCTCTCTAGATGCATCCACAATGGAAGACTCGAGATATG
GCCTAAGAAAGACCGGGAGCTAGAGTCAATCCACAGCTGCGATGCCCTTGAACTCATCAA
AGAACACGTAGACGCGGTCACCGGATTACGTGTCAATTCACGCGTGACTGAAAAAACACA
GATACAGAAGCTTCATCTCAGAAAGGTATACGTTGCCTCGATCTTGTGTGGTTACTTCTT
GAAATCCGCTTCCCTCAGACACCGAGTTGTATGTAGATAATACATATAAGCTCAATGAGA
ATGCAGAAGCGCAAGAAAATAGAAGTATATGAACCAGTTCGGTTAAAAGAAAAGCTTCAT
GATCCTTTGGTTGGTGTTATATGCAGGGAAGAAGTTTTTGCAGAATCTTTCAGGCGATGC
TTTTAGTGTGTATACTGTATAGACGAATAAGAATGTGGCGGTTAAGGAAACAAGGGCTGC
AAATGGTTGTTTATAGAAAGAATATACCTCATGAATATAAGAAACTTATATTTATGGAAT
GAAAACATTGGATATTTGGATGATGAATAGTATATGTTGAACTTATTAATGGAATAATGA
CTTACATT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EC14TF U 1
AF RS1EC14JQ C 275
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BS 656 656 RS1EC14JQ
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RD RS1EC14TF 804 0 0
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ATGCAGA
GCGCAGAAATAGAAGTA

QA 1 787 1 787
DS 

RD RS1EC14JQ 814 0 0
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CTAATAGTCTATAAATACTCTGAGATAAGGGTCCCTCTGGCTCCAAAGCTCTCTAGATGC
ATCCACAATGGAAGACTCGAGATATGGCCTAAGAAAGACCGGGAGCTAGAGTCAATCCAC
AGCTGCGATGCCCTTGAACTCATCAAAGAACACGTAGACGCGGTCACCGGATTACGTGTC
AATTCACGCGTGACTGAAAAAACACAGATACAGAAGCTTCATCTCAGGAAGGTATACGTT
GCCTCGATCTTGTGTGGTTACTTCTTGAAATCCGCTTCCCTCAGACACCGAGTTGTATGT
AGATAATACATATAAGCTCAATGAGAATGCAGAAGCGCAAGAAAATAGAAGTATATGAAC
CAGTTCGGTTAAAAGAAAAGCTTCATGATCCTTTGGTTGGTGTTATATGCAGGGAAGAAG
TTTTTGCAGAATCTTTCAGGCGATGCTTTTAGTGTGTATACTGTATAGACGAATAAGAAT
GTGGCGGTTAAGGAAACAAGGGCTGCAAATGGTTGTTTATAGAAAGAATATACCTCATGA
ATATAAGAAACTTATATTTATGGAATGAAAACATTGGATATTTGGATGATGAATAGTATA
TGTTGAACTTATTAATGGAATAATGACTTACATT

QA 1 814 1 814
DS 



AS 1 2

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ACGTATTGGATTGGATTGGATTGGATTGGATTGGATCGGATATTGGTGCTGAGAGATGCT
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AAATTTGGTCCAGTTTTGATTCCTATCAGTTATATTAATTCATTCTATATCTTTTGAACA
GAAAACCGAAACTAAATATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1EI28TF U 1
AF RS1EI28JQ C 91
BS 1 621 RS1EI28TF

RD RS1EI28TF 621 0 0
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ACGTATTGGATTGGATTGGATTGGATTGGATTGGATCGGATATTGGTGCTGAGAGATGCT
TCTCCTTCTCTCTGGAGGAGACTTGAAGATCAGCAATTATTGGTACCGGCGACACCAGTT
TTGAGGTTGGCTGAATAGACGGTTGGACCGGCTGCAGACGGTAAAATGAATAGGTACACG
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GAAAACCGAAACTAAATATGG

QA 1 621 1 621
DS 

RD RS1EI28JQ 531 0 0
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TTGGATCGGATATTGGTGCTGAGAGATGCTTTTCCTTCTTTTTGGAGGAGACTTGAAGAT
CAGCAATTATTGGTACCGGCGACACCAGTTTTGAGGTTGGCTGAATAGACGGTTGGACCG
GCTGCAGACGGTAAAATGAATAGGTACACGTTTAGCCCATGGCACATTTATTTCGGACCG
AAAAACCGAACTGAACTTAACCTAAAAACAAAATTTGGTCCAGTTTTGATTCCTATCAGT
TATATTAATTCATTCTATATCTTTTGAACAGAAAACCGAAACTAAATATGG

QA 1 531 1 531
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4687Contig1 582 2 2 U
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CAAAGATATGGGTTTTGAAGGTTCAATGAAGTTTTTCAAAAG


BQ
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AF RS1EE77TF U 1
AF RS1G042TF U 1
BS 1 518 RS1EE77TF
BS 519 582 RS1G042TF

RD RS1EE77TF 518 0 0
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GATCTGGGAAAGTAAAGACAAAGGGGGAAAGATGAAGCAGGCGAGATTTCTGGATTGGTA
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GACCGGTTTCTACGACAAGGTTACTGTACTAGAAGCTGAGAAACGAGCCTATGAAAATTC
CCCTGAAGCTCAAGCCATGCGAGAAGCTCTTAATCCCTGGAGAAACAAGGACGCTGCAGC
TACAAAAACTCCTTAGAAAGGTTCAGTCATGAAGTTACTTTTACTCACTCTCAAACTTTG
CAAATGCTGCTTCAGCCTCTGCTATTTTGAGATATTAAGTTTTTCATTTGCTAAATGTAG
CAGCTTTGAACACATTTACATGTTATGAATGAAGAAGA

QA 1 518 1 518
DS 

RD RS1G042TF 582 0 0
GGAACCACAGTGAGGAATTAAAACCCCTCCGACCAGAAACTGTGGATAATTCTATAGTTA
AATCCTCGAAAATCATACATCGGAAAATATATTTGAATCCGTGAGTCTTCTTCTGCTGAA
GATCTGGGAAAGTAAAGACAAAGGGGGAAAGATGAAGCAGGCGAGATTTCTGGATTGGTA
TGTGAAGATTGCAATTGGATCTGCTATCATCGGCGGAGGAATGGAGTTCTTCATGATCAA
GACCGGTTTCTACGACAAGGTTACTGTACTAGAAGCTGAGAAACGAGCCTATGAAAATTC
CCCTGAAGCTCAAGCCATGTGAGAAGCTCTTAATCCCTGGAGAAACAAGGACGCTGCAGC
TACAAAAACTCCTTAGAAAGGTTCAGTCATGAAGTTACTTTTACTCACTCTCAAACTTTG
CAAATGCTGCTTCAGCCTCTGCTATTTTGAGATATTAAGTTTTTCATTTGCTAAATGTAG
CAGCTTTGAACACATTTACATGTTATGAATGAAGAAGATAAAAGATGCTGAAATAAAAAA
CAAAGATATGGGTTTTGAAGGTTCAATGAAGTTTTTCAAAAG

QA 1 582 1 582
DS 



AS 1 2

CO CL4688Contig1 633 2 2 U
GGAACTGGACAGTTAAGGTTTGCGATTTTGGACTGTCAAGATTCAAGGCAAACACTTTCA
TACCATCAAAATCTGTTGCAGGAACACCTGAGTGGATGGCTCCAGAGTTTCTTAGAGGGG
AGCCGACAAATGAAAAATCAGATGTTTACAGTTTTGGAGTTGTCCTATGGGAGTTGATTA
CTCTGCAGCAGCCTTGGAATGGGCTCAGTCCTGCTCAGGTGGTTGGAGCTGTAGCATTCC
AGAACAGGAGGCTTGTAATCCCTCCCAATACATCTCCTGTTTTGGTGTCTCTAATGGAAG
CTTGCTGGGCAGATGAGCCGGCTCAGCGGCCAGCATTTGGTGGCATTGTGGACACACTGA
AGAAGCTACTAAAGTCTCCAGTGCAGCTGATCCAAATGGGTGGAGACAAAGGGGTAAATT
CAACTTAATCACTTCCCATTCTATAGCTTAAATATGTTAAAACTTTTAAGGTACTAACAT
AAACAATTAGGTGCGAGATGCGTTGATTAGCTCCTGAATTTGATTTTAAGATAGAAAAAA
AATCAATGAGACAAGGCCTTGCCTGGGAGAATGGAAGGCTACTTAATTTGTTTTTTTTGG
CTTGTATAGTTTTAAGTACTTTTGACTTTGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D812TF U 1
AF RS1D812JQ C 30
BS 1 542 RS1D812TF
BS 543 633 RS1D812JQ

RD RS1D812TF 542 0 0
GGAACTGGACAGTTAAGGTTTGCGATTTTGGACTGTCAAGATTCAAGGCAAACACTTTCA
TACCATCAAAATCTGTTGCAGGAACACCTGAGTGGATGGCTCCAGAGTTTCTTAGAGGGG
AGCCGACAAATGAAAAATCAGATGTTTACAGTTTTGGAGTTGTCCTATGGGAGTTGATTA
CTCTGCAGCAGCCTTGGAATGGGCTCAGTCCTGCTCAGGTGGTTGGAGCTGTAGCATTCC
AGAACAGGAGGCTTGTAATCCCTCCCAATACATCTCCTGTTTTGGTGTCTCTAATGGAAG
CTTGCTGGGCAGATGAGCCGGCTCAGCGGCCAGCATTTGGTGGCATTGTGGACACACTGA
AGAAGCTACTAAAGTCTCCAGTGCAGCTGATCCAAATGGGTGGAGACAAAGGGGTAAATT
CAACTTAATCACTTCCCATTCTATAGCTTAAATATGTTAAAACTTTTAAGGTACTAACAT
AAACAATTAGGTGCGAGATGCGTTGATTAGCTCCTGAATTTGATTTTAAGATAGAAAAAA
AA

QA 1 542 1 542
DS 

RD RS1D812JQ 604 0 0
GGACTGTCAAGATTCAAGGCAAACACTTTCATACCATCAAAATCTGTTGCAGGAACACCT
GAGTGGATGGCTCCAGAGTTTCTTAGAGGGGAGCCGACAAATGAAAAATCAGATGTTTAC
AGTTTTGGAGTTGTCCTATGGGAGTTGATTACTCTGCAGCAGCCTTGGAATGGGCTCAGT
CCTGCTCAGGTGGTTGGAGCTGTAGCATTCCAGAACAGGAGGCTTGTAATCCCTCCCAAT
ACATCTCCTGTTTTGGTGTCTCTAATGGAAGCTTGCTGGGCAGATGAGCCGGCTCAGCGG
CCAGCATTTGGTGGCATTGTGGACACACTGAAGAAGCTACTAAAGTCTCCAGTGCAGCTG
ATCCAAATGGGTGGAGACAAAGGGGTAAATTCAACTTAATCACTTCCCATTCTATAGCTT
AAATATGTTAAAACTTTTAAGGTACTAACATAAACAATTAGGTGCGAGATGCGTTGATTA
GCTCCTGAATTTGATTTTAAGATAGAAAAAAAATCAATGAGACAAGGCCTTGCCTGGGAG
AATGGAAGGCTACTTAATTTGTTTTTTTTGGCTTGTATAGTTTTAAGTACTTTTGACTTT
GAGC

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 2

CO CL4689Contig1 1037 2 8 U
TCCGTCACGGTTACTTCACTCTCCCTCTCTCTGTCTCAAACTCGCTCATCTTTATCGATT
CCCCAGGTTTTTGATTTGATGGGAACTCCAGAGTCATCTCGCGAGCCATGCCCGGACCGT
ATCCTCGACGACATCGGCGGGGCCTTCGGCATGGGAGCTGTGGGAGGAGGAGCCTTTCAT
TTCATTAAAGGGACGTACAACTCCCCCAAAAGAAGTCGCTTTATGGGAGGAAGACAAGGG
GTGACGATGCACGCGCCTCGCTTGGGAGGCAGTTTCGCTGTCTGGGGAGGTTTATTCTCG
ACGTTTGATTGCTCCATGGTGTACCTTAGGCAGAAGGAGGATCCTTGGAACTCCATCTTC
GCGGGTGCTGCGACCGGAGGGTTTCTGGCTATGCGTCAGGGGCCTAGCGCGGCTGTGAGG
TCTGCGCTTTTCGGTGGGGTTTTGCTTGCTTTGATCGAAGGAGCGGGGATTGCCTTGAAT
AAGATGTTGGCTCAGCCTCAGCATATGCAGATGGAGGAAGGGATGATGATGCCTGGAGGA
ATGCCTGGGATGCAGCAGATGGGGCAGCAGATGCCTAATCAAGGGCAGGTGATGCAAGAG
AGTACTGATTCATCACCATCACCAACGTCATGGTTAGGAGGTTTGTTTGGTAAGAAGAAT
GATGAGGCGCAGGGGCAGACGAGTAGTGGAAGTGAAACAAAGGTGTTGGAGAGTTTTGAT
GCGCCTCCAGTGCCATCATTTGAGTACAAGTGAGCTTGATAGATGGATGGATCCTATCTT
GTTGCCTACTGGTGGCTCTTCAGAGCAGTCTGTTATGTTTTGTGGTGGTAGTCGATCTAT
CATCATTTGTTTCTTCTGCAGAATTATATAACTTGTTCTTGGAAGAACGAGTCTACTCTT
CCTTGGCTTAAAGTTTTTATGTTTTAATCTTCTTTTGTGCTTATTGTGAAATCATTCCAC
AACTATTTATTTGAATAATGTACTAGTATTTTAGAGTGGGAATGTTTGAGCAATGAAAAT
GGATTCATTTGGATCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AU47TF U 1
AF RS1AU47JQ C 187
BS 1 210 RS1AU47TF
BS 211 211 RS1AU47JQ
BS 212 674 RS1AU47TF
BS 675 675 RS1AU47JQ
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BS 704 716 RS1AU47TF
BS 717 1037 RS1AU47JQ

RD RS1AU47TF 720 0 0
TCCGTCACGGTTACTTCACTCTCCCTCTCTCTGTCTCAAACTCGCTCATCTTTATCGATT
CCCCAGGTTTTTGATTTGATGGGAACTCCAGAGTCATCTCGCGAGCCATGCCCGGACCGT
ATCCTCGACGACATCGGCGGGGCCTTCGGCATGGGAGCTGTGGGAGGAGGAGCCTTTCAT
TTCATTAAAGGGACGTACAACTCCCCCAAAGGAAGTCGCTTTATGGGAGGAAGACAAGGG
GTGACGATGCACGCGCCTCGCTTGGGAGGCAGTTTCGCTGTCTGGGGAGGTTTATTCTCG
ACGTTTGATTGCTCCATGGTGTACCTTAGGCAGAAGGAGGATCCTTGGAACTCCATCTTC
GCGGGTGCTGCGACCGGAGGGTTTCTGGCTATGCGTCAGGGGCCTAGCGCGGCTGTGAGG
TCTGCGCTTTTCGGTGGGGTTTTGCTTGCTTTGATCGAAGGAGCGGGGATTGCCTTGAAT
AAGATGTTGGCTCAGCCTCAGCATATGCAGATGGAGGAAGGGATGATGATGCCTGGAGGA
ATGCCTGGGATGCAGCAGATGGGGCAGCAGATGCCTAATCAAGGGCAGGTGATGCAAGAG
AGTACTGATTCATCACCATCACCAACGTCATGGTTAGGAGGTTTGTTTGGTAAGAAGAAT
GATGAGGCGCAGGG*CAGACGAGTAGTGGAAGTGAAACAAAG*TGTTGGAGAGTTT
GATG

QA 1 716 1 716
DS 

RD RS1AU47JQ 851 0 0
AAAGGGACGTACAACTCCCCCAAAAGAAGTCGCTTTATGGGAGGAAGACAAGGGGTGACG
ATGCACGCGCCTCGCTTGG*AGGCAGTTTCGCTGTCTGGGGAGGTTTATTCTCGACGTTT
GATTGCTCCATGGTGTACCTTAGGCAGAAGGAGGATCCTTGGAACTCCATCTTCGCGGGT
GCTGCGACCGGAGGGTTTCTGGCTATGCGTCAGGGGCCTAGCGCGGCTGTGAGGTCTGCG
CTTTTCGGTGGGGTTTTGCTTGCTTTGATCGAAGGAGCGGGGATTGCCTTGAATAAGATG
TTGGCTCAGCCTCAGCATATGCAGATGGAGGAAGGGATGATGATGCCTGGAGGAATGCCT
GGGATGCAGCAGATGGGGCAGCAGATGCCTAATCAAGGGCAGGTGATGCAAGAGAGTACT
GATTCATCACCATCACCAACGTCATGGTTAGGAGGTTTGTTTGGTAAGAAGAATGATGAG
GCGCAGGGGCAGACGAGTAGTGGAAGTGAAACAAAGGTGTTGGAGAGTTTTGATGCGCCT
CCAGTGCCATCATTTGAGTACAAGTGAGCTTGATAGATGGATGGATCCTATCTTGTTGCC
TACTGGTGGCTCTTCAGAGCAGTCTGTTATGTTTTGTGGTGGTAGTCGATCTATCATCAT
TTGTTTCTTCTGCAGAATTATATAACTTGTTCTTGGAAGAACGAGTCTACTCTTCCTTGG
CTTAAAGTTTTTATGTTTTAATCTTCTTTTGTGCTTATTGTGAAATCATTCCACAACTAT
TTATTTGAATAATGTACTAGTATTTTAGAGTGGGAATGTTTGAGCAATGAAAATGGATTC
ATTTGGATCAG

QA 1 851 1 851
DS 



AS 1 2

CO CL4690Contig1 721 2 2 U
GACGTTTGTGGTGAAGAACTTCTCACTTGGTGCCAAAAACGCTCTTCTGTAAACCCCGGT
ACATCCTTTGTTGACTCTATGTGCTCACAACTCTCAATGTTTTTGATTTAAAAACTCGAA
ACATGAAGTATACCTTTGACAACACTTCATATTATATGCTTTGAAATTTTCAGATGGGAC
TAGGATAAGGATGCCATCAGAGGAATTGTATAGCAAAAGAGATGTCTGTTGCGTGAAAAA
CGTGGAGGCGTTTTCACTCGGTGTAGCAGATCTTGAAGACGTCGTGGCCTTGATCCCGAC
TCTCGAGATTCGTAAGGAGACATAGAGTGCAAGGAGCCACAAGGTACGAATCTCCATATT
TGAGGCTATGAGCGGCTAGGCTTGGAGATATAGAAGGAGATGGCTTCGGAGATCGTACTG
TTCAGTCAATTTTTTATTTTTTTTTCTTTTCAGTCAATTAGATTCTAATATTCGATGGAT
ATTGATGATATAAGCTTGGTGGTTGTCATACACTATATTGTACGATGTATTTGTCGCTTT
AATAAGATCATTGTTTTCACCTAAGTTTAGATTGAATAACATCTCAACCCTAGCTACCTT
TTTAATTTCTCTTCCTTCAAAGAATACGTGAGTTTATAGGTGCAGCTTGAAAGATAGGGA
ATTAGCAGAAATGATGTTATTAAAACTTGGGTGGCTCACAGATCCTTTTTAACTTTATTA
C


BQ
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10 

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TTTTTCTTTTCAGTCAATTAGATTCTAATATTCGATGGATATTGATGATATAAGCTTGGT
GGTTGTCATACACTATATTGTACGATGTATTTGTCGCTTTAATAAGATCATTGTTTTCAC
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TAAAACTTGGGTGGCTCACAGATCCTTTTTAACTTTATTAC

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AS 0 0

AS 1 2

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AAATCCAATCATACAACAACAACAGCACCCATCCATCGAGGGTCCCACCCTTCCTTTTCC
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CTCACCAGTCTTGTGGTGTTCTCCGACATCCTCTAATCGGAACTCGAACAGTCATCAGAT
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BQ
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AGTCTTCCACTTACACCTATCTCCTCGCCGACGTCTCCCATCCTGATAAACCTGCTCTGT
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QA 1 743 1 743
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QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1FV27TF U 1
AF RS1FV27JQ C 191
BS 1 709 RS1FV27TF
BS 710 1012 RS1FV27JQ

RD RS1FV27TF 718 0 0
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GCTTCTTACAGCGTTCTTGTTGATAACAAAGAGAGGGAGTTTGGTAGTATGTACACAGAC
TGGGATATCCTTCCTCCCAGGAAGATTAAGGTTAAAAACGCAAAGAAGCCAGTGGACTGG
GATGATAGAGAATATATTGATGATCCTAATGATGTCAAACCTGAGGGTTATGATTCAATC
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GGTCCCTGGGAAGCCCCTAAGATCCCAAATCCAGCGTACAAAGGTCCTTGGAAAGCAAAG
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GCAAGAACCATGGTTGATGACTATTTTGATCAGCACAGGGAGTCTGAGAAGGAGTTATTT
GCGGAAGCTGAGAAAGAAAGAAAAGCTAGAGAAGATGAGGAATCTCGGA
GGCAGAGAA

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1FV27JQ 822 0 0
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AAGCCCCTAAGATCCCAAATCCAGCGTACAAAGGTCCTTGGAAAGCAAAGAAAATGAAGA
ACCCAAACTACAAGGGAAAATGGAAGAACCCATGGATAGATAATCCAGAGTTTGAAGATG
ATCCAGATCTTTATGTTCTGAAGCCTATAAAATATATAGGCATTGAAGTATGGCATGTGA
AGGCTGGCTCAATATTTGACAATATCTTGATCACTGATGACCCTCAATATGCAAGAACCA
TGGTTGATGACTATTTTGATCAGCACAGGGAGTCTGAGAAGGAGTTATTTGCGGAAGCTG
AGAAAGAAAGAAAAGCTAGAGAAGATGAGGAATCTCGGAAGGCAAGAGAAGAAGGGGAAC
GTAGAAGGAAGGAGAGAGACCACCGGTATGGAGACAGGAGGAGGCGTTACAAACGGCCCA
ATCCACGTGATTACATGGATGATTACCATGACGAGCTATAAGGCGCTGTGGTGGGCGTTA
CTAAGTGACAAACAAATTGGGAACTATTTGGTTGTCTTGTGTGATTGTGATTTGTAACCT
TTCTTGAGGCTGAAATGTAACCCTTAGTATTTATATTCATGTAACTTATTTTGGCATGAA
CACTGTTACCTGTTTTTCGGAAATTCAGAAACTTCCAAGAGT

QA 1 822 1 822
DS 



AS 1 2

CO CL4694Contig1 918 2 2 U
GGCCCAAAAAAATGGCTCTTGTTCAATCCATAGCTCTTGCTAACTTCAACGTCCGGTTAT
CGCCGGTTCTATCCACACTCCACGCTCCGTCGTCTCTCTTTCTCCGGAGGGAAACTCGTC
CTTTAACCTCACCGTTGTCATCCTCCTCCTCCACCGCCGCCGGGAGCTTGTCCTTCTCGC
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GTCTCATGAGAGACTCACTGTAGGCTGAATGTTTTTTTATTTTCGTGTCTTTATTTTGTT
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GATGAGTACGAGTTTGCACGCGACATGCAGGTTCGGGGCTTACCTACATTGTTATTCATC
AGTCCTGACCCAATCAAAGATGCAATCAAAACAGAAGGGCTAATTCCAATACAGATGATG
CGAGATATCATCGACAACGACATGTGAAGGTCTTCTTGTCCTGAAGAAACACACTTTCTT
GCTTTAGGATTTGAATAGTTGTTATTTGGCTTTTTGAGGATAATGCGGTGAGAAGAATGT
CATCTAGTTTCATAAGAAAAAATGTAAACGAGATGAATGTAATCTTAGAATTTATATATA
TGCAGTGTTAGTTTCGGT


BQ
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AF RS1G142TF U 1
AF RS1G142JQ C 181
BS 1 692 RS1G142TF
BS 693 918 RS1G142JQ

RD RS1G142TF 692 0 0
GGCCCAAAAAAATGGCTCTTGTTCAATCCATAGCTCTTGCTAACTTCAACGTCCGGTTAT
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CTTTAACCTCACCGTTGTCATCCTCCTCCTCCACCGCCGCCGGGAGCTTGTCCTTCTCGC
AGCTGACGCATCAGCGGAAGTCTCCTCTCTGCCCTCCGCCTCGCGGCAAGTTTGTTAGAG
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CTCGAAATGCTTGCAGTAGAGTATGAGAGCAATGCAATGATTGTGAAAGTTGATACAGAT
GATGAGTACGAGTTTGCACGCGACATGCAGGTTCGGGGCTTACCTACATTGTTATTCATC
AGTCCTGACCCAATCAAAGATGCAATCAAAAC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RS1G142JQ 738 0 0
AGCTGACGCATCAGCGGAAGTCTCCTCTCTGCCCTCCGCCTCGCGGCAAGTTTGTTAGAG
AAGATTATCTTGTGGTACGGCTCTCAGTCTCCGTATTGTTGTATAAGAACAATGCGTAGC
AGCACTAGACTGCTAAGTGCTCAGAATTTGAGATTGGTTAATTTGAGAATCTGTAGCGGT
GTCTCATGAGAGACTCACTGTAGGCTGAATGTTTTTTTATTTTCGTGTCTTTATTTTGTT
TGACAGAGGAAATTGTCAGCTGAAGAACTTCAGGAGCTGGTGAAAGGAGAGAGGAAGGTG
CCGCTCATTGTTGATTTTTATGCCACATGGTGTGGACCTTGTATCTTGATGGCCCAGGAA
CTCGAAATGCTTGCAGTAGAGTATGAGAGCAATGCAATGATTGTGAAAGTTGATACAGAT
GATGAGTACGAGTTTGCACGCGACATGCAGGTTCGGGGCTTACCTACATTGTTATTCATC
AGTCCTGACCCAATCAAAGATGCAATCAAAACAGAAGGGCTAATTCCAATACAGATGATG
CGAGATATCATCGACAACGACATGTGAAGGTCTTCTTGTCCTGAAGAAACACACTTTCTT
GCTTTAGGATTTGAATAGTTGTTATTTGGCTTTTTGAGGATAATGCGGTGAGAAGAATGT
CATCTAGTTTCATAAGAAAAAATGTAAACGAGATGAATGTAATCTTAGAATTTATATATA
TGCAGTGTTAGTTTCGGT

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

CO CL4695Contig1 1263 2 6 U
AGGGACAAACGCATCATCATGGCGTCTTATCTCCGAGTCTCTCTTTCCTTCGTATTCTCG
GCTCTGCTAATCTCACCGGCTGTCTCGCAGTCATGTTCGTCACAGACATTTACCGGCGAC
AAATCATACCCTCACTGTCTAGCCCTCCCTAACCTCAAAAACCGGTGTTGCCACCGTGAC
GACGCTTAACATCATCTCATACAGCTCCCTTGTCCCGGGGAAGCTATCCTTCGATGTATG
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TCCGGCGGATTTAGCTGCGAGTGGGAAGGTTAATCAGGTTTGGCAGGTTGGACCAGGAGT
GTCACCTAACGGGAGGATACAGCCACACGATTTCAAGCCTCCGAATATTAACGCCGTTGG
ATCGCTCGATTTGAGCGGCGCCACTACAGGGGTATCTGCCTCCGGCGGTGCTGGAAACTC
AAGGATTCGTAAGAGAAACATCCATGGGATATTGAATGCGGTGAGTTGGGGAATTTTGTT
TCCGATTGGAGCAATGATAGCAAGATACATGAGAATATTTGAATCCGCAGATCCTGCTTG
GTTTTACCTCCACGTGTCATGTCAGTTCTCTGCTTACGTCATCGGTGTTGCCGGATGGGC
AACCGGACTCAAGCTCGGCTCCGAGTCTAAGGGAATTACATTCAACAGTCATCGCAACAT
CGGCATTGCTCTCTTCGCTATGGCCACGCTTCAGATGTTTGCGATGCTGTTGCGGCCAAG
GAAAGACCACAAATTGAGATTCTTTTGGAATATTTACCACCATGGAGTTGGATACTCTAT
CCTTATCCTTGGAATCATCAATGTTTTCAAAGGTCTTAGCATCTTGAACCCAGAGCATAC
TTACAAGACCGCTTATATCGCTGTTATTGCGACTTTGGGAGGCATTACTTTGTTCTTGGA
AGCTGTAACTTGGGTCATTGTCCTCAAGAGGAAATCTGATAATTCCAACAACCCTCCCAA
GCCCTGAGTAATTCAAAAAATCGCTATTTTTATTTCTTAAGTTACAAATACGTTGTTTTT
CTCCCAACTTTTTTATTCAACTCAAGATGTTGCTTGTGTTTGATGATGATGACTTTTGGT
GTTTATGTATAGTAGGAGAAAAACCTGATGTATTAGTGTTTTTTCTTTGTAGCTTTGTCT
TTTTTTTCCTCTGTTTATGTGACAGTTATTCAAAAGTTTTATTCTATATGATTATTTTTT
ACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 

AF RS1AR04TFB U 1
AF RS1AR04JQ C 677
BS 1 692 RS1AR04TFB
BS 693 693 RS1AR04JQ
BS 694 780 RS1AR04TFB
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BS 782 846 RS1AR04TFB
BS 847 1263 RS1AR04JQ

RD RS1AR04TFB 846 0 0
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*AAAGACCACAAATTGAGATTCTTTTGGAATATTTACCACCATGGAGTTGGATACTCTAT
CCTTAT

QA 1 846 1 846
DS 

RD RS1AR04JQ 587 0 0
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GCTATGGCCACGCTTCAGATGTTTGCGATGCTGTTGCGGCCAAGGAAGGACCACAAATTG
AGATTCTTTTGGAATATTTACCACCATGGAGTTGGATACTCTATCCTTATCCTTGGAATC
ATCAATGTTTTCAAAGGTCTTAGCATCTTGAACCCAGAGCATACTTACAAGACCGCTTAT
ATCGCTGTTATTGCGACTTTGGGAGGCATTACTTTGTTCTTGGAAGCTGTAACTTGGGTC
ATTGTCCTCAAGAGGAAATCTGATAATTCCAACAACCCTCCCAAGCCCTGAGTAATTCAA
AAAATCGCTATTTTTATTTCTTAAGTTACAAATACGTTGTTTTTCTCCCAACTTTTTTAT
TCAACTCAAGATGTTGCTTGTGTTTGATGATGATGACTTTTGGTGTTTATGTATAGTAGG
AGAAAAACCTGATGTATTAGTGTTTTTTCTTTGTAGCTTTGTCTTTTTTTTCCTCTGTTT
ATGTGACAGTTATTCAAAAGTTTTATTCTATATGATTATTTTTTACC

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 2

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TGTTTGAATCATGGATCTTGTTTTTGGATACC


BQ
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AF RS1CK44JQ C 1
AF RS1CK44TF U 1
BS 1 512 RS1CK44TF

RD RS1CK44JQ 512 0 0
GGCTTCTCCGTCTTCCTCTCAGTAGCAGCAGCAGCAGTCTTGCGAAAATGGTGAAGGGAC
GCCAAGGAGAACGTGTCAGACTCTACGTCAGAGGAACCATCTTGGGATACAAAAGGTCGA
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AGGTGACATGGTACAAGGGAAAGAGGATGGCTTACATCTACAAGGCCAAGACCAAGAAGA
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TTGTCCGTGCCAAGTTCACTTCCAACTTGCCTCCTAAGTCCATGGGAATGAGGGTGAGAG
TTTTCATGTATCCGAGTAACATTTGAAGCAAAGTATTACAGCATAAACTTTGATTTAGCT
GTTGTTTTTGCCCACTAGTTCTTCGTTTTGTATTTGATACTGAAAGCATTTTCGTTTCTT
TGTTTGAATCATGGATCTTGTTTTTGGATACC

QA 1 512 1 512
DS 

RD RS1CK44TF 512 0 0
GGCTTCTCCGTCTTCCTCTCAGTAGCAGCAGCAGCAGTCTTGCGAAAATGGTGAAGGGAC
GCCAAGGAGAACGTGTCAGACTCTACGTCAGAGGAACCATCTTGGGATACAAAAGGTCGA
AGTCAAACCAGTACCCAAACACATCCCTGATCCAGATCGAAGGAGTCAACACTACAGAGG
AGGTGACATGGTACAAGGGAAAGAGGATGGCTTACATCTACAAGGCCAAGACCAAGAAGA
ACGGTAGCCACTACCGCTGCATCTGGGGAAAGGTTACTAGGCCTCACGGTAACAGCGGTG
TTGTCCGTGCCAAGTTCACTTCCAACTTGCCTCCTAAGTCCATGGGAATGAGGGTGAGAG
TTTTCATGTATCCGAGTAACATTTGAAGCAAAGTATTACAGCATAAACTTTGATTTAGCT
GTTGTTTTTGCCCACTAGTTCTTCGTTTTGTATTTGATACTGAAAGCATTTTCGTTTCTT
TGTTTGAATCATGGATCTTGTTTTTGGATACC

QA 1 512 1 512
DS 



AS 1 2

CO CL4697Contig1 1173 2 2 U
GGAAGAGAGCGACAAAAAGAAAAAAAAATCAAAATTTAGAGAGAGCTAAAAAAAATATCA
AATTTCTTTATTTCAACCTAAGAAGTTTCAATAGTTTCAAACTTTCAACCATCTTTCCTT
TGAAGATCCATATGGCAGCCGTAGATATGTTTAGTAGCAGCACTGATCATTCTGATCCTT
TCAAAGAAGAGCTCATGAAAGTACTTAGACCTTTTACCAACGCTGTTTCTTCTATTCCTC
AGGTTCCAGACACAATCTTCGGTTTCAATCAAACCACACCTCTCGGTCTAAACCAGCTCA
CACCTTACCAAATCCACCAGATACAAAACCAGCTTAACCAGAGACGCAACACCAATATCT
CAAATCTCTCTCCAAAGCTAGTACCAATGAAGAACATAGCCACTCAGAAACTCTACAGAG
GAGTCGGACAAAGGCACTGGGGGAAATGGGTTGCTGAGATCCGTTTACCCAAGAACCGGA
CCCGGCTCTGGCTTGGAACTTTCGACACAGCTGAAGAAGCAGCCATGGCTTATGATCAAG
CTGCTTACCAGCTTCGTGGCGAATTAGCAAGGCTTAATTTCCCACACATCAAACACGAGT
ACGGATACGGAGGCGGTGATAGAATCTTTAAGCCTCTTCATCCTTCTGTTGAAGCAAAGC
TCGAAGCGATTTGTCAGAGCTTGAGAAAGACAGAGGATTATGATCTCCCCTGTTCCGAAA
CAGAGCTTTTCCCGCCAAAAGCAGAGTATCAAGAAAGTGAATTTGGGTTTTTGAGAGCTG
ATGAGAATTCATTTTCCGACGAGTCTCTGGTTGGATCTTCTTCGCCGGAGTCGGGTATTA
CCACTACGTTCTTAGATTTCTCGGATTCAGGGTGTGATGAGATTGGGAGTTTCGTGCTGG
AGAAGTTTCCTTCTGTGGAGATTGATTGGGATGCGATTAGCAAGTTGTCCGAATCTTAAG
TGTCATATTAGTTTAGCTAATCTCTGCAACTTAATTTTTCAACAGTTGTGGGAGAATCAG
CTAGGCTTTGTTTCTGTTGAAATCTTCCTCCATGTGTTCGGTCTGGCTGGTTTATGTTTT
TATTTCTTCTCACAAACCTTGTCTTTTGACCAACCAGAGAAGTCTCCATGTATTTATACC
ATCTTTAAGTTTCTAATGAATGTAAATTATACT


BQ
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AF RS1F878TF U 1
AF RS1F878JQ C 564
BS 1 701 RS1F878TF
BS 702 1313 RS1F878JQ

RD RS1F878TF 702 0 0
GGGGCTCCTTATTAGCGAAGCCAATTGAGAGCTTTTTAACCTTCAGAAGAAGACACGCAG
ACGAAACAAAAAGAGAAAAAAAAATGCAAACTCAACTGTATTTGATAACGGTTGTCGTAT
TAGCATCATTTCTCGTACATCCTCGAGTTTGTTCTCCAACCTGTAGTTTCCCGGCGATCT
TCAACTTCGGCGACTCTAATTCCGACACAGGAGGTCTCTCCGCCGCCTTCGGACAAGCTC
CTTACCCTAATGGAGAAACCTTCTTCCACACCCCTTCTGGTCGTTTCTCAGATGGTCGAC
TCATCGTTGACTTCATAGCGGAGGAGTTAAGGTTGCCATACCTAAACGCTTTCCTAGACT
CCATCGGTTCAAACTTCAGCCGTGGTGCCAACTTCGCCACCGCTGGATCCACCGTCCGTC
CACCAAACACCACCATTTCTCAGAGCGGTGCGAGTCCAGTCTCTCTCGACGTTCAGTTGG
TTCAGTTCTCCGATTTCCTCACTTGTTCACAACTCATTCGCACTCGAGGTGGCGTGTTTG
AGCATTTACTTCCGAGGAAAGAGTATTTCTCTCAAGCATTGTACACATTCGACATTGGTC
AGAACGATCTCACTACTGGATTGGAACTCAACTTGACAACAGATCAAATCAAGTCTTACA
TTCCAGATGTTCTCGATCAGTTGTCCAATGCCATTCGTAAG
T

QA 1 701 1 701
DS 

RD RS1F878JQ 750 0 0
TATTTCTCTCAAGCATTGTACACATTCGACATTGGTCAGAACGATCTCACTACTGGATTG
GAACTCAACTTGACAACAGATCAAATCAAGTCTTACATTCCAGATGTTCTCGATCAGTTG
TCCAATGCCATTCGTAAGGTGTATAAGAATGGAGGAAGAAGATTTTGGATACATAACACT
GCCCCAATTGGCTGTTTACCTTATGTCTTGGACCGGTGGCCTGTACCGGCTTCTCAGATC
GATAAGCACGGTTGTGCAGTTCCGCGTAATGAGATTGCTAGGTATTATAACTCTGAGCTC
GAAAGAAGAGTGGTTGGGTTAAGAAAAGAGCTGTCTAAAGCTGCATTCACTTACGTTGAT
GTTTACTCTATCAAGCTTACTCTCATCACTCAAGCCGAGAAACTTGGTTTTAAAAGTCCT
TTGGTTGCTTGTTGTGGACATGGTGGGAAGTATAATTTCGACAAACTCATCAAATGTGGA
GTTAAATATACGGTGAATGGGAAAGAGACCGTGCTTGCAAAGTCTTGTGACGACGTGTCG
TTGAGAGTTAACTGGGACGGCGTGCATTTCACTGAAGCGGCAAACCGTCGGATCTTTCAG
CAGATAAACGGCGGAGCGTTTTCGGATCCTCCTCTTCCTCTTAGGTTTGCCTGCACCAGA
TCAGTCATGTGACCGGAGTGCCCTTTAAATATGGGGATTAATAAAGCTTTTTGAACTATT
TATATATTATATGCTGTTTAATAAAAAAGA

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL4699Contig1 1240 2 10 U
GGATCCCTAAACTTGGCTTAATACTCAAACAAAGAAGAGAAACAACAATGGCGCTCAAGA
ACTTACTTGTCCTTGTGGTTCTTCTTGGCGTCGTTGGATTTTCCGTTGCACATCCATATG
GGAACCCACTTAAGAAACAAAATGGACACAGGAACCCACGGGCCACGGGTGATCTTGACC
TTGACTACTACCGCTCCAAGTGTCCACAATTGGAAACCATTGTCCGTCGTGTCACATTTC
AATACGTCTCTCGCAGGCCAACTCTTGCCGCTGCGCTTCTAAGGATGCATTTTCACGACT
GCTTTGTCAGAGGATGTGATGGTTCCATTCTTCTGAAATCTCCACTCAAAGATGCGGAAA
GAGATGCTTTCCCTAACTTGTCAGTGAGAGGCTACGAGGTGATCGATGCTGCCAAGTCAG
CTCTCGATAGGACTTGGGGTTGTCGTGGTCTTGTCTCTTGCGCTGATATTATTGCCTTGG
TCGCTAGAGACGCTGTTTCAGTGATCGGAGGACCATGGTGGCCTGTTCCATTGGGGAGGA
GAGACGGACGCATCTCGAAGAGCTCCGAGGTTAATTTACCATCTCCATTCTCGGACGTAA
AGACACTGAAGAAGAACTTCCTTGACAAGGGTCTTAACACTAAAGACCTAGTCGTCCTCT
CAGGAGCTCACACCATTGGTGTATCTTCTTGCGGTCTCATCAACAACCGTATCCATAACT
TCACGGGCAGAGGCGACTTTGACCCAGCGATGAACCCTAGCTACGTTAGGGCATTGAAGA
AAAGGTGCAAGCCAACTGATGTCAAGACCCCTGTGGATATGGACCCAGGCAGTGCCAAGA
AATTTGACTCTCACTACTTCAACATTGTGGCTCAGAAGAAGGGTTTGTTCACATTTGATG
CAACACTTCTCGATGACCTTGACACCAACCTCTACATTCAGGCGCAGGTCTTGACTGGTG
GGGCTTCCTTCAACAGAGTTTTCTTTGAATCAATGGTCAAACTTGGTTTCGTCGAGATCC
TTACCGGGAAGCAAGGTGAGGTCAGGAGGAGGTGCGCTTTTGTTAACTAACTTTGGACTG
ATGATTGAAGTTCTAAAACGTTTTCTGCTTATTATGTTCTTTTATTCATGTCCTTTTTCC
ACGGAAGTTCTTTGTGTTTGAATTTCAAAAATGTGTAATAATGTATTTCTTCCTTTCTCG
AATGTTATCTGCTGAGTATTGTTTGAATTGAATGAAAATG


BQ
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AF RS1E926TF U 1
AF RS1E926JQ C 580
BS 1 663 RS1E926TF
BS 664 664 RS1E926JQ
BS 665 713 RS1E926TF
BS 714 714 RS1E926JQ
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BS 734 753 RS1E926TF
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BS 755 766 RS1E926TF
BS 767 1240 RS1E926JQ

RD RS1E926TF 772 0 0
GGATCCCTAAACTTGGCTTAATACTCAAACAAAGAAGAGAAACAACAATGGCGCTCAAGA
ACTTACTTGTCCTTGTGGTTCTTCTTGGCGTCGTTGGATTTTCCGTTGCACATCCATATG
GGAACCCACTTAAGAAACAAAATGGACACAGGAACCCACGGGCCACGGGTGATCTTGACC
TTGACTACTACCGCTCCAAGTGTCCACAATTGGAAACCATTGTCCGTCGTGTCACATTTC
AATACGTCTCTCGCAGGCCAACTCTTGCCGCTGCGCTTCTAAGGATGCATTTTCACGACT
GCTTTGTCAGAGGATGTGATGGTTCCATTCTTCTGAAATCTCCACTCAAAGATGCGGAAA
GAGATGCTTTCCCTAACTTGTCAGTGAGAGGCTACGAGGTGATCGATGCTGCCAAGTCAG
CTCTCGATAGGACTTGGGGTTGTCGTGGTCTTGTCTCTTGCGCTGATATTATTGCCTTGG
TCGCTAGAGACGCTGTTTCAGTGATCGGAGGACCATGGTGGCCTGTTCCATTGGGGAGGA
GAGACGGACGCATCTCGAAGAGCTCCGAGGTTAATTTACCATCTCCATTCTCGGACGTAA
AGACACTGAAGAAGAACTTCCTTGACAAGGGTCTTAACACTAAAGACCTAGTCGTCCTCT
CAG*AGCTCACACCATTGGTGTATCTTCTTGCGGTCTCATCAACAACCGTATC*ATAACT
TCACGGGCAGAG*CGACTTTGACCCAGCGATGA*CCCTAGCTACGT
AGGCAT

QA 1 766 1 766
DS 

RD RS1E926JQ 661 0 0
CATCTCCATTCTCGGACGTAAAGACACTGAAGAAGAACTTCCTTGACAAGGGTCTTAACA
CTAAAGACCTAGTCGTCCTCTCAGGAGCTCACACCATTGGTGTATCTTCTTGCGGTCTCA
TCAACAACCGTATCCATAACTTCACGGGCAGAGGCGACTTTGACCCAGCGATGAACCCTA
GCTACGTTAGGGCATTGAAGAAAAGGTGCAAGCCAACTGATGTCAAGACCCCTGTGGATA
TGGACCCAGGCAGTGCCAAGAAATTTGACTCTCACTACTTCAACATTGTGGCTCAGAAGA
AGGGTTTGTTCACATTTGATGCAACACTTCTCGATGACCTTGACACCAACCTCTACATTC
AGGCGCAGGTCTTGACTGGTGGGGCTTCCTTCAACAGAGTTTTCTTTGAATCAATGGTCA
AACTTGGTTTCGTCGAGATCCTTACCGGGAAGCAAGGTGAGGTCAGGAGGAGGTGCGCTT
TTGTTAACTAACTTTGGACTGATGATTGAAGTTCTAAAACGTTTTCTGCTTATTATGTTC
TTTTATTCATGTCCTTTTTCCACGGAAGTTCTTTGTGTTTGAATTTCAAAAATGTGTAAT
AATGTATTTCTTCCTTTCTCGAATGTTATCTGCTGAGTATTGTTTGAATTGAATGAAAAT
G

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 2

CO CL4700Contig1 677 2 2 U
GTGGTCATCCACCTTGCGTAGGTGTATGTCGGTTCAGTTCTATTCCCTCTCTCTCTCTCA
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACACTCTTCTTCACTCTCCTCCTGCTTTTTTCAAAAAA
AAAAAAACTGATCTTTCTGTTTCCCGAAGAGACGCGATCAGTCTCAAACCCTAGCGGTTC
TGATCATAGGAAGTGGAGAAATGCTAGATCACTGCGCGAAGGATTCGGAGAGAAGAAGAG
GTGGTGAGGATGTGATCGAACAGAACAAGGCTTGTTGTAACGACAAGAAGACTTGCGCCG
ATTGTGGTACAAGCAAAACTCCTCTCTGGCGATCTGAAAAGAAACCCTAAATTTGGCGAA
TCGATGAAACAGAGGATGATGGATTTGGGGATGACGAAGCGATCATCATCGACGGTGGAG
AAACAGCTACGGAAGCTAGGGGAGGAAGAGCAAGCGGCGGTGCTTCTCATGGCTCTCTCT
TATGGATCAGTGTACGCTTAGGTGGTTCTGAGAGCAGTTATGATTGATGATAACTAACAA
ACGAATCTTGTAATCTTTCATCTCTTTCTTCTTTTTGTCTGAGATTGTTTGGCTTTCTGT
TCTTTCAAATTCTAGTGTGATCTGGAAATTTTTTTAAAAAAAGTTTTGGAGTTTGTAATA
AGAAGCCGAATGAAGGG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A551TF U 1
AF RS1A551JQ C 114
BS 1 635 RS1A551TF
BS 636 677 RS1A551JQ

RD RS1A551TF 635 0 0
GTGGTCATCCACCTTGCGTAGGTGTATGTCGGTTCAGTTCTATTCCCTCTCTCTCTCTCA
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACACTCTTCTTCACTCTCCTCCTGCTTTTTTCAAAAAA
AAAAAAACTGATCTTTCTGTTTCCCGAAGAGACGCGATCAGTCTCAAACCCTAGCGGTTC
TGATCATAGGAAGTGGAGAAATGCTAGATCACTGCGCGAAGGATTCGGAGAGAAGAAGAG
GTGGTGAGGATGTGATCGAACAGAACAAGGCTTGTTGTAACGACAAGAAGACTTGCGCCG
ATTGTGGTACAAGCAAAACTCCTCTCTGGCGATCTGAAAAGAAACCCTAAATTTGGCGAA
TCGATGAAACAGAGGATGATGGATTTGGGGATGACGAAGCGATCATCATCGACGGTGGAG
AAACAGCTACGGAAGCTAGGGGAGGAAGAGCAAGCGGCGGTGCTTCTCATGGCTCTCTCT
TATGGATCAGTGTACGCTTAGGTGGTTCTGAGAGCAGTTATGATTGATGATAACTAACAA
ACGAATCTTGTAATCTTTCATCTCTTTCTTCTTTTTGTCTGAGATTGTTTGGCTTTCTGT
TCTTTCAAATTCTAGTGTGATCTGGAAATTTTTTT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1A551JQ 564 0 0
CAAAAAAAAAAAAACTGATCTTTCTGTTTCCCGAAGAGACGCGATCAGTCTCAAACCCTA
GCGGTTCTGATCATAGGAAGTGGAGAAATGCTAGATCACTGCGCGAAGGATTCGGAGAGA
AGAAGAGGTGGTGAGGATGTGATCGAACAGAACAAGGCTTGTTGTAACGACAAGAAGACT
TGCGCCGATTGTGGTACAAGCAAAACTCCTCTCTGGCGATTTGAAAAGAAACCCTAAATT
TGGCGAATCGATGAAACAGAGGATGATGGATTTGGGGATGACGAAGCGATCATCATCGAC
GGTGGAGAAACAGCTACGGAAGCTAGGGGAGGAAGAGCAAGCGGCGGTGCTTCTCATGGC
TCTCTCTTATGGATCAGTGTACGCTTAGGTGGTTTTGAGAGCAGTTATGATTGATGATAA
CTAACAAACGAATCTTGTAATCTTTCATCTCTTTCTTCTTTTTGTCTGAGATTGTTTGGC
TTTCTGTTCTTTCAAATTCTAGTGTGATCTGGAAATTTTTTTAAAAAAAGTTTTGGAGTT
TGTAATAAGAAGCCGAATGAAGGG

QA 1 564 1 564
DS 



AS 1 2

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CACCAGTGCGAGTTAATGGCCAACGGTAATCTACCGAGAAGAATCATAAAGGAAACTCAA
CGTCTGCTCAGTGAACCGTCTCCGGGTATAAGTGCATCGCCATCTGAGGATAACATGAGG
TACTTCAACGTTATGGTTCTTGGTCCTTCACAATCCCCTTATGAAGGAGGGGTTTTTAAG
TTGGAGCTCTTTTTGCCTGAAGAATACCCCATGTCAGCTCCCAAGGTTAGGTTTCTCACC
AAGATATACCATCCTAACATTGATAAGCTTGGAAGAATCTGTCTTGATATTCTGAAAGAC
AAATGGAGCCCTGCTCTCCAAATACAAACAGTTCTCCTAAGTATCCAAGCCCTTCTAAGT
GCACCAAACCCTGATGATCCATTGTCTGAGAACATTGCTAAGCATTGGAAAACTAATGAG
GCCGAAGCTGTGGAGACAGCTAAGGAATGGACCCGTCTTTACGCAAGCGGGGCATGATGG
ATTGGAGAGTGAAAAGAAGATCTCATTCATCCAAAATAACATCAAAGCTATAAAAGGCTT
ATATTTTACTGGCTGTCCTCCCCTCATAATGGTAAAAATGTGTGTTTCGGCACATGGAGT
TGTAATCTCTCTCAAAATATTGTATCATTATCAGTAGGGTTAAGACTCGTTTAACTATAG
TTGAAACTTTTCCAAGCTTGGTTGAATCAAACTATCTTCTCTACTTTATAAGGCTATTGT
ATTGTAGTACATAAGTTTGGTCGGAAAAAGAATAACAAGAAGAGCTTGAC


BQ
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AF RS1G926TF U 1
AF RS1G926JQ C 313
BS 1 625 RS1G926TF
BS 626 830 RS1G926JQ

RD RS1G926TF 625 0 0
GGGTTCTCGATCATCTCTCTCTCTCAAAAGAAAAAAACCCGAACTCTGATCGATCCAACT
CACCAGTGCGAGTTAATGGCCAACGGTAATCTACCGAGAAGAATCATAAAGGAAACTCAA
CGTCTGCTCAGTGAACCGTCTCCGGGTATAAGTGCATCGCCATCTGAGGATAACATGAGG
TACTTCAACGTTATGGTTCTTGGTCCTTCACAATCCCCTTATGAAGGAGGGGTTTTTAAG
TTGGAGCTCTTTTTGCCTGAAGAATACCCCATGTCAGCTCCCAAGGTTAGGTTTCTCACC
AAGATATACCATCCTAACATTGATAAGCTTGGAAGAATCTGTCTTGATATTCTGAAAGAC
AAATGGAGCCCTGCTCTCCAAATACAAACAGTTCTCCTAAGTATCCAAGCCCTTCTAAGT
GCACCAAACCCTGATGATCCATTGTCTGAGAACATTGCTAAGCATTGGAAAACTAATGAG
GCCGAAGCTGTGGAGACAGCTAAGGAATGGACCCGTCTTTACGCAAGCGGGGCATGATGG
ATTGGAGAGTGAAAAGAAGATCTCATTCATCCAAAATAACATCAAAGCTATAAAAGGCTT
ATATTTTACTGGCTGTCCTCCCCTC

QA 1 625 1 625
DS 

RD RS1G926JQ 518 0 0
CCTAACATTGATAAGCTTGGAAGAATCTGTCTTGATATTCTGAAAGACAAATGGAGCCCT
GCTCTCCAAATACAAACAGTTCTCCTAAGTATCCAAGCCCTTCTAAGTGCACCAAACCCT
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GAGACAGCTAAGGAATGGACCCGTCTTTACGCAAGCGGGGCATGATGGATTGGAGAGTGA
AAAGAAGATCTCATTCATCCAAAATAACATCAAAGCTATAAAAGGCTTATATTTTACTGG
CTGTCCTCCCCTCATAATGGTAAAAATGTGTGTTTCGGCACATGGAGTTGTAATCTCTCT
CAAAATATTGTATCATTATCAGTAGGGTTAAGACTCGTTTAACTATAGTTGAAACTTTTC
CAAGCTTGGTTGAATCAAACTATCTTCTCTACTTTATAAGGCTATTGTATTGTAGTACAT
AAGTTTGGTCGGAAAAAGAATAACAAGAAGAGCTTGAC

QA 1 518 1 518
DS 



AS 1 2

CO CL4702Contig1 754 2 6 U
GTGCTCTGGCCTTGCCTTTCAGTCCATAGCTCTGTTTCGTGGTTCGCTCTCACCGGAAGT
GCACTTTCAAGGTGGTGAGCGGTCGAGTTTTGTTCTTCGTTTGTGGTAGTCTCGTCTGTC
GCCGGACGACTTCAGTTTGCAGTTGAAAAACTATCCTCTTGTTCTAAGAGGTGGAGTGCG
TGGACGGTGGTAGCACTTCGTGAGTCTCCGGAGTTCTATTTCCTGTATGTGGTGGCGCAC
TTGGAGTCCATCCATCCCGATATTGGGGTTTGATCTTTGCAAACTTCGATAGGATGTTCC
TTTTTTCTTATTGCAGGTACTCGTACCACGTCTCACAGCAGCTACAGCTCAACCGAACTT
TATCTAGTGTTGGGGAACACACTTCGGTGCTTGGTCTGTCGGGTTTCAAGTATGATACTA
GTAGGCTATTGTTCTTCCGGCTTTGCGCTTACTTGTCGGTGAAGATTACGAGCCTGAGGA
GTTCGTCAAAAACCAGCTACTCCGATGATGGCATGCGATGCACCGGTAACCTAGGAAACT
AGGTTAACGCCACCTTCAAATGGTTACCATCAAAGGTTGAGAACGGCTATTGATAGTCTG
AGAACTTCGAGGCTAGCTAGCGGAATGCGCCGGTGTGGGGTGGTTGAGCGAAGCTAAGTA
TGTTTCGATGTTTCTTATGACCATTTTGTTCGAATCACGTTTGTAATCGACATTTGAATT
CCCGTATTTCGGGTTGATTAATATAAGTACTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FA77TF U 1
AF RS1FA77JQ C 122
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TGGACGGTGGTAGCACTTCGTGAGTCTCCGGAGTTCTATTTCCTGTATGTGGTGGCGCAC
TTGGAGTCCATCCATCCCGATATTGGGGTTTGATCTTTGCAAACTTCGATAGGATGTTCC
TTTTTTCTTATTGCAGGTACTCGTACCACGTCTCACAGCAGCTACAGCTCAACCGAACTT
TATCTAGTGTTGGGGAACACACTTCGGTGCTTGGTCTGTCGGGTTTCAAGTATGATACTC
GTAGGCTATTGTTCTTCCGGCTTTGCGCTTACTTGTCGGTGAAGATTACGAGCGTGAGGA
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DS 

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GGACGGTGGTAGCACTTCGTGAGTCTCCGGAGTTCTATTTCCTGTATGTGGTGGCGCACT
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TTTTTCTTATTGCAGGTACTCGTACCACGTCTCACAGCAGCTACAGCTCAACCGAACTTT
ATCTAGTGTTGGGGAACACACTTCGGTGCTTGGTCTGTCGGGTTTCAGGTATGATACTAG
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TTCGTCAAAAACCAGCTACTCCGATGATGGCATGCGATGCACCGGTAACCTAGGAAACTA
GGTTAACGCCACCTTCAAATGGTTACCATCAAAGGTTGAGAACGGCTATTGATAGTTTGA
GAACTTCGGGGCTAGCTAGCGGAATGCGCCGGTGTGGGGTGGTTGAGCGAAGCTAAGTAT
GTTTCGATGTTTCTTATGACCATTTTGTTCGAATCACGTTTGTAATCGACATTTGAATTC
CCGTATTTCGGGTTGATTAATATAAGTACTGTT

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 2

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TATCTCATCGTATCACATTCTGTTCTGTGATATTTGAGAATCAACGTCAATACCTCGGTG
TAGGTCCGGGATAATCCTTTATTCCATAGTCCTGGGGCTATTTACAACTAGCCAATTCAG
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TATGCTACTAATACTTGTACTTGCTCTGCTATTCTGCCCAAGCCTGGCTGAGGAAGAGTT
ACGGGGCTTCGAAAAATATGCTGATTCGGACGTTAAAAATACTATATAC


BQ
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AF RS1GJ75TF U 1
AF RS1GJ75JQ C 1
BS 1 513 RS1GJ75TF
BS 514 649 RS1GJ75JQ

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GTTAACTGATTGGTCGTAGGTTCGAATCCTACTTGGGGAGATTTGATTCATTCCGAATTC
AAGAATTCAGAATGTAAGAGTAGGTAACCCGTTCCCTGTGTCTTTGTTTCTATTGCATTC
TATCTCATCGTATCACATTCTGTTCTGTGATATTTGAGAATCAACGTCAATACCTCGGTG
TAGGTCCGGGATAATCCTTTATTCCATAGTCCTGGGGCTATTTACAACTAGCCAATTCAG
AATTTGCAGGTGTACTAACAAGTGCATCAAAGCTGCAGTCACCGATTCTCCTGAGAGTTC
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QA 1 513 1 513
DS 

RD RS1GJ75JQ 649 0 0
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TCCGGGGGTTACGAAGGAAACTTCGAGTTCATATTGGTCATGGGTTGAGAACGGGAATTG
AACTCTATGAGATCTAATCTCCCGTTGTTCCTCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCGGTCGGCT
GTTAACTGATTGGTCGTAGGTTCGAATCCTACTTGGGGAGATTTGATTCATTCCGAATTC
AAGAATTCAGAATGTAAGAGTAGGTAACCCGTTCCCTGTGTCTTTGTTTCTATTGCATTC
TATCTCATCGTATCACATTCTGTTCTGTGATATTTGAGAATCAACGTCAATACCTCGGTG
TAGGTCCGGGATAATCCTTTATTCCATAGTCCTGGGGCTATTTACAACTAGCCAATTCAG
AATTTGCAGGTGTACTAACAAGTGCATCAAAGCTGCAGTCACCGATTCTCCTGAGAGTTC
ACAATTACCTCGCGCAAACATATTAATTTAATGACTTAATGATGAGGAACGCATTTTTTC
TATGCTACTAATACTTGTACTTGCTCTGCTATTCTGCCCAAGCCTGGCTGAGGAAGAGTT
ACGGGGCTTCGAAAAATATGCTGATTCGGACGTTAAAAATACTATATAC

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 2

CO CL4704Contig1 1120 2 2 U
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CGAATGGGATTGATCCGATGTCGGTTTACTCGGCCGGTTCGGAGATTAACCAGTTGCAGT
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GATCCGCAATGCCTCTAAGTTATCCATCTGGTTGTAACTAAGACTTGATTCGTTTGGTGT
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ATTGCGGTGGTTTCTGGTGTTTAGATTTGTCATAGGAGTACTTGTCATGGGTTGGTTAGC
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GGACCGTCCCACGACTTTTTTACTGCCAAGGAGCTTTTCCGACCCGTTTTTCCTGATCCT
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GTATTTATGAAGTTAACCCTTTTTCTTTTCCCATATTTACACATTGTTCCCCTCCTAGTA
ATCAGTAATCACGATCCTGTTTTTGGGTTTGACAAAACGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H261TF U 1
AF RS1H261JQB C 436
BS 1 584 RS1H261TF
BS 585 1120 RS1H261JQB

RD RS1H261TF 584 0 0
GGGAGCGGCACCAGGGGAGTGTTAACGCGATCGGGTGGGCTCCGCAGAGCTGTAAGCATA
TATGTTCTGGGGGTGATGACGCGCAGGCGCTTATTTGGGAGTTGCCGACGGTTGCTGGAC
CGAATGGGATTGATCCGATGTCGGTTTACTCGGCCGGTTCGGAGATTAACCAGTTGCAGT
GGTCTTCTTCGTTGCCTGATTGGATTGGGATTGCTTTCGCTAACAAAATGCAGCTCCTTA
GAGTTTGAGATGGAGATGGAAAGTGATCAGAATCGGAGATAGCAATAGACCCCCGTGTAA
CCAGTAAGATGCGTAAGCTTTAGTAGGGTTTGGTTGGTGCATGCACATTCTGGTTTCTTT
GATCCGCAATGCCTCTAAGTTATCCATCTGGTTGTAACTAAGACTTGATTCGTTTGGTGT
ACCAAATGCTCTACTATTTTATCTCTGTTTGTGTATAAACCCAACCAGGATAATAATATT
ATTGCGGTGGTTTCTGGTGTTTAGATTTGTCATAGGAGTACTTGTCATGGGTTGGTTAGC
ATCTAAACAAAAGCAATTGTGTAAGATAAGTTTACAGGTTCCAA

QA 1 584 1 584
DS 

RD RS1H261JQB 685 0 0
ATTTTATCTCTGTTTGTGTATAAACCCAACCAGGATAATAATATTATTGCGGTGGTTTCT
GGTGTTTAGATTTGTCATAGGAGTACTTGTCATGGGTTGGTTAGCATCTAAACAAAAGCA
ATTGTGTAAGATAAGTTTACAGGTTCCAACTTTAGACACATGAAAATTAACTTCAAATGA
AAACCAAAAGTTCCAAACCTCGAGGTTAGCTTGACGGAAGCGAGAGGACCGTCCCACGAC
TTTTTTACTGCCAAGGAGCTTTTCCGACCCGTTTTTCCTGATCCTGGTCTTACCCGCATC
CGATCATTATAGGAGTTACCACAGAGGAAACCTGAACGGAGTGTCTTTGAATCAATCCAG
CTCCCCACCATTGAGACCACCGTGGCAGGAGATGAGCACGGTGGCAAAGATAACGAGAGG
CTGCAGTGTTGAAACTTGGTTTGAGAAAACCCTAAGAGTGTCGCTATTTTGGTTTGAGAG
AGAGATTAACAGATTCTTTTGTTTTTCGAGTGAAGACTGTCGGAAAAGTTTTTTTTTCGA
TAAGGTGAAAAATGGGATAAGGACGCTGACATATGCAAACGAATTGTATTTATGAAGTTA
ACCCTTTTTCTTTTCCCATATTTACACATTGTTCCCCTCCTAGTAATCAGTAATCACGAT
CCTGTTTTTGGGTTTGACAAAACGC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL4705Contig1 763 2 5 U
AGAAGTTAGGAACCCAACTTAGTACGTATCTTCTTGGAAACGAAGGCAACGACATGGAAA
CAGACATCGAGATTGAGAGCGATGAAGAGAAAAATGGTCGGAATCTGAGAAGTGCTTCTG
ATTTACAAAATGAGCTGCAGAATACTTCTTCAGTGTCCAGGAAAAGGCATTATGTGGAAC
AGTATACTACCAAAGAATCTGTTCAAGATGCCTTGATAGGAAGACATGAAGAAGATAAGG
TGGAGAATGGGAGGAGTCCTTCTCGTTGGAATAGGATTCCTTCGATATCATTTTCTGAAG
AGGAAAGTAGAGCGCGGAACGAGGAAGACACGATGAACAAGTCCTCATCGAAGGAAGACA
CTAGGAAAAGAAGAAGGCTCTCTTCTGGCACCTCATCTAGCAATAAGGTAATGTCGTCAA
CAAGCATGGCAGCTCGGGTATCTGATGAAGTGGCAGAGTTTGATGAAGAAAATACTCGAG
AAGCCAATGGCTCTCCTCTCATATCTCTTCCTCCACCCCCACCTTTCAGAAATGCTCATT
TTCATGGAGACGAGGAGACAAAAGTCGATGTGATTGAACGGAGGAAAGCCGATGATGTTG
ATTCCGTCTGATCTTAATCTGAATTCATAACCTCTTAGACAGAAAGTTCTGTTCTTTAAG
TAATATATGCTAGGGAAGCTTTTGCATTTTGTTCTGTGCAGTACTTAAAACAAAGACTAG
AATGGGTACATGATGATCTTTAAATATATTTAATCTCCAGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1F035JQ C 1
AF RS1DL87TF U 236
BS 1 238 RS1F035JQ
BS 239 334 RS1DL87TF
BS 335 335 RS1F035JQ
BS 336 759 RS1DL87TF
BS 760 763 RS1F035JQ

RD RS1F035JQ 763 0 0
AGAAGTTAGGAACCCAACTTAGTACGTATCTTCTTGGAAACGAAGGCAACGACATGGAAA
CAGACATCGAGATTGAGAGCGATGAAGAGAAAAATGGTCGGAATCTGAGAAGTGCTTCTG
ATTTACAAAATGAGCTGCAGAATACTTCTTCAGTGTCCAGGAAAAGGCATTATGTGGAAC
AGTATACTACCAAAGAATCTGTTCAAGATGCCTTGATAGGAAGACATGAAGAAGATAAGG
TGGAGAATGGGAGGAGTCCTTCTCGTTGGAATAGGATTCCTTCGATATCATTTTCTGAAG
AGGAAAGTAGAGCGCGGAACGAGGAAGACACGATGAACAAGTCCTCATCGAAGGAAGACA
CTAGGAAAAGAAGAAGGCTCTCTTCTGGCACCTCATCTAGCAATAAGGTAATGTCGTCAA
CAAGCATGGCAGCTCGGGTATCTGATGAAGTGGCAGAGTTTGATGAAGAAAATACTCGAG
AAGCCAATGGCTCTCCTCTCATATCTCTTCCTCCACCCCCACCTTTCAGAAATGCTCATT
TTCATGGAGACGAGGAGACAAAAGTCGATGTGGTTGAACGGAGGAAAGCCGATGATGTTG
ATTCCGTCTGATCTTAATCTGAATTCATAACCTCTTAGACAGAAAGTTCTGTTCTTTAAG
TAATATATGCTAGGGAAGCTTTTGCATTTTGTTCTGTGCAGTACTTAAAACAAAGACTAG
AATGGGTACATGATGATCTTTAAATATATTTAATCTCCAGGAC

QA 1 763 1 763
DS 

RD RS1DL87TF 524 0 0
GGG
GGTGGAGAATGGGAGGAGTCCTTCTCGTTGGAATAGGATTCCTTCGATATCATTTTCTGA
AGAGGAAAGTAGAGCGCGGAACGAGGAAGACACGATTAACAAGTCCTCATCGAAGGAAGA
CACTAGGAAAAGAAGAAGGCTCTCTTCTGGCACCTCATCTAGCAATAAGGTAATGTCGTC
AACAAGCATGGCAGCTCGGGTATCTGATGAAGTGGCAGAGTTTGATGAAGAAAATACTCG
AGAAGCCAATGGCTCTCCTCTCATATCTCTTCCTCCACCCCCACCTTTCAGAAATGCTCA
TTTTCATGGAGACGAGGAGACAAAAGTCGATGTGATTGAACGGAGGAAAGCCGATGATGT
TGATTCCGTCTGATCTTAATCTGAATTCATAACCTCTTAGACAGAAAGTTCTGTTCTTTA
AGTAATATATGCTAGGGAAGCTTTTGCATTTTGTTCTGTGCAGTACTTAAAACAAAGACT
AGAATGGGTACATGATGATCTTTAAATATATTTAATCTCCA

QA 4 524 4 524
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4707Contig1 1024 2 2 U
GGAAAGACGAAGCATCAAAGGGAGTATTGTCGTCGGCGGCTGATTCCGATGATCGATCCC
ACCCTGATTCGTAGCTCTAGCTCTGGCCCAGCTTCTACTTCATCTGTCTCTTCCTCAGGT
GTCTGTAGAGGCCTCCGCGACAATACCGAGACGGGAAACATTTGAGCCGGCGGCACTGCT
ACAGGTACGGTTGGGGATATGGTTATGGTCTTACGTTAGAGAAGAGATCTTCTCATGGAA
GGAAGTGGAATGGAAAGCATATCTAAGGGATTCTCAGAGGAGAGTTTAAGCAGTGGAAAA
TTACTCTTGGAACGTGTGATCCATCACCTATGATGGCTAATCAGTTTTATGTAAGTCGTA
TGACCTTAGTGGAATTGAAATCTATGTTTATTGAATCCCAGACTTGTTAGTTCCATTGAT
AGTATTTTACTTCCAAAGTGTAGCCTTTTATACTTCCATTGTGTTACTCTTTGAGGATCT
TGCAACAGAGGATCATATCTTCCAATTATACCATCGAAAGCTTAAGGCCAGGCTCAAGTC
TTTTCCAAAGCGTTGCAGGTAAGATTAAATTTGGTCATTTTCACCATCATGCATATATCA
CATTCATATTTTACTATTGAAATGAATCTCTTCTGGCATAGTAATATATCAGAATGATAA
TCAGTGTATTGTGTTATCAATCTTTGGCCTAGAAAACATGAATCTCTAAACAGATTGCAG
AAGAGAAGTTGCAGATATTGATTTAAAGTTCCGGAGTTTGGTAGCAATTGGCTTGTTGGT
TAGTTCTCAAATCACTAAGTTCTTCCGTTCAAGAACAATATGTATATATGCTTGTTGGTT
ACAGATTTTTTTCCAATACAAATGCTTGAAGGCCTCGTGAAGAATATAGCAAATTAGCAA
TAGGCTTTTAGGTGGAAGTTGGTGCTGATATCGATTTTGTGATTTGCCAACTTTAGAAGG
ACACTTGTGACACCGCCAATATTAGGATTGTTTTGAATGTAAATTTTATTCAATTTTATT
ACCC


BQ
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10 10 10 10 

AF RS1DF36TF U 1
AF RS1DF36JQ C 498
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BS 674 1024 RS1DF36JQ

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ACAGGTACGGTTGGGGATATGGTTATGGTCTTACGTTAGAGAAGAGATCTTCTCATGGAA
GGAAGTGGAATGGAAAGCATATCTAAGGGATTCTCAGAGGAGAGTTTAAGCAGTGGAAAA
TTACTCTTGGAACGTGTGATCCATCACCTATGATGGCTAATCAGTTTTATGTAAGTCGTA
TGACCTTAGTGGAATTGAAATCTATGTTTATTGAATCCCAGACTTGTTAGTTCCATTGAT
AGTATTTTACTTCCAAAGTGTAGCCTTTTATACTTCCATTGTGTTACTCTTTGAGGATCT
TGCAACAGAGGATCATATCTTCCAATTATACCATCGAAAGCTTAAGGCCAGGCTCAAGTC
TTTTCCAAAGCGTTGCAGGTAAGATTAAATTTGGTCATTTTCACCATCATGCATATATCA
CATTCATATTTTACTATTGAAATGAATCTCTTCTGGCATAGTAATATATCAGAATGATAA
TCAGTGTATTGTG

QA 1 673 1 673
DS 

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GGTAAGATTAAATTTGGTCATTTTCACCATCATGCATATATCACATTCATATTTTACTAT
TGAAATGAATCTCTTCTGGCATAGTAATATATCAGAATGATAATCAGTGTATTGTGTTAT
CAATCTTTGGCCTAGAAAACATGAATCTCTAAACAGATTGCAGAAGAGAAGTTGCAGATA
TTGATTTAAAGTTCCGGAGTTTGGTAGCAATTGGCTTGTTGGTTAGTTCTCAAATCACTA
AGTTCTTCCGTTCAAGAACAATATGTATATATGCTTGTTGGTTACAGATTTTTTTCCAAT
ACAAATGCTTGAAGGCCTCGTGAAGAATATAGCAAATTAGCAATAGGCTTTTAGGTGGAA
GTTGGTGCTGATATCGATTTTGTGATTTGCCAACTTTAGAAGGACACTTGTGACACCGCC
AATATTAGGATTGTTTTGAATGTAAATTTTATTCAATTTTATTACCC

QA 1 527 1 527
DS 



AS 1 2

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AAACATTTTTTAGTATTTGTTATGGTCTAAAAAAGTCATAACTATGATGCATTTATAATT
GTGCAATGAGATTTCTTGTGCAATTGTGGCTTTTGTTTCACTCTATTGTGCATCGAGATC
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CT


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AF RS1GH87JQ C 1
AF RS1GH87TF U 1
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CTAATGGAACAAGCACGCAGTGACGAATCCAGATGAAGTAGCTGACGAAGTTATCGCCTT
GGCTGAAATGTAAGAACGAACGTCATTTGATTTCTATATATTTCTAGTTTTTTTTTGCTT
AAACATTTTTTAGTATTTGTTATGGTCTAAAAAAGTCATAACTATGATGCATTTATAATT
GTGCAATGAGATTTCTTGTGCAATTGTGGCTTTTGTTTCACTCTATTGTGCATCGAGATC
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CT

QA 1 482 1 482
DS 

RD RS1GH87TF 482 0 0
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GGCTGAAATGTAAGAACGAACGTCATTTGATTTCTATATATTTCTAGTTTTTTTTTGCTT
AAACATTTTTTAGTATTTGTTATGGTCTAAAAAAGTCATAACTATGATGCATTTATAATT
GTGCAATGAGATTTCTTGTGCAATTGTGGCTTTTGTTTCACTCTATTGTGCATCGAGATC
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CT

QA 1 482 1 482
DS 



AS 1 2

CO CL4709Contig1 1314 2 2 U
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ATACTTGAACACTAGTGTGCTATTCAAAAAAATGTTTCGCCGCAAGACTACTTCGCAAGC
TGAGCAAGAGAGTAACGAGGCAGCTCTCAGAGAGGCAAAGATCAAAGAGCTTAAGACTCT
CATTGGCGAGCTCTCAGGAAGGAGTTCGCTCTACTGTTCAGATCCGTGTCTTAAGAGATA
TCTCGAAGCTAGGAACTGGAATGTAGGCAAAGCCAAGAAGATGCTTGAAGAGACGCTGAA
ATGGAGATCCACCTTTAAACCCGAGGAGATCCGATGGGATGAGGCTTCAGGTGAAGGTGA
GACTGGTAAAGTCTACAAAGCTGGATTCCATGACGGGAGTGGGAGAACGGTTCTTATACT
CAGACCCGGTTTGCAGAACACCAAGTCGTTGGAGAACCAGATGAAACATTTGGTGTATCT
CATTGAGAATGCTATCATGAATCTCCCGGAGGATCAAGAACAGATGTCTTGGCTCATTGA
TTTTACGGACTGGTCGCTGAGCACCAGTGTGCCTATCAAATCAGCAAGAGAAACCATCAA
CATACTGCAGAATCACTACCCTGAGAGACTCGCTGTCGCTTTCCTCTATAACCCTCCAAG
GCTCTTTGAGGCATTCTGGAAGATAGTGAAGTACTTCATTGATGCAAAGACATTCACCAA
GGTGAAGTTTGTTTACCCAAAGAACTCTGAGAGCGTGGAGCTTATGAGCTCGTTTTTCGA
CGAGGAGAACCTCCCAACGGAGTTTGGAGGGAAAGCTTTGTTGCAGTATAACCATGAAGA
GTTCTCTAAGCAAATGAGCCAAGACGATGCTAAAACTGCAGGCTTTTGGGGACTGGTCCG
TCATAGTAACAACAACAACAATCACCAGCAGCAGCAGTCGAGCAGCGGATTTTCTGGAGC
AGAGATTGCTCCTGAGCCAATCCAAACCAACCCTTAAACTGTGGCTTTGAAGGCTATGTA
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AGAGGAGAGTCTTAGAGAGAGGTTGTAAGATTTAGATATAGCGTTTGATTAAATAAAACG
GATTTGTGTTTGTTATAAGCAGGTCTTGTAGGTGAATCCAAAAATACTTTACTC


BQ
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AF RS1FP96TF U 1
AF RS1FP96JQ C 574
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BS 662 1314 RS1FP96JQ

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ATACTTGAACACTAGTGTGCTATTCAAAAAAATGTTTCGCCGCAAGACTACTTCGCAAGC
TGAGCAAGAGAGTAACGAGGCAGCTCTCAGAGAGGCAAAGATCAAAGAGCTTAAGACTCT
CATTGGCGAGCTCTCAGGAAGGAGTTCGCTCTACTGTTCAGATCCGTGTCTTAAGAGATA
TCTCGAAGCTAGGAACTGGAATGTAGGCAAAGCCAAGAAGATGCTTGAAGAGACGCTGAA
ATGGAGATCCACCTTTAAACCCGAGGAGATCCGATGGGATGAGGCTTCAGGTGAAGGTGA
GACTGGTAAAGTCTACAAAGCTGGATTCCATGACGGGAGTGGGAGAACGGTTCTTATACT
CAGACCCGGTTTGCAGAACACCAAGTCGTTGGAGAACCAGATGAAACATTTGGTGTATCT
CATTGAGAATGCTATCATGAATCTCCCGGAGGATCAAGAACAGATGTCTTGGCTCATTGA
T

QA 1 661 1 661
DS 

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TGTCGCTTTCCTCTATAACCCTCCAAGGCTCTTTGAGGCATTCTGGAAGATAGTGAAGTA
CTTCATTGATGCAAAGACATTCACCAAGGTGAAGTTTGTTTACCCAAAGAACTCTGAGAG
CGTGGAGCTTATGAGCTCGTTTTTCGACGAGGAGAACCTCCCAACGGAGTTTGGAGGGAA
AGCTTTGTTGCAGTATAACCATGAAGAGTTCTCTAAGCAAATGAGCCAAGACGATGCTAA
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GCAGTCGAGCAGCGGATTTTCTGGAGCAGAGATTGCTCCTGAGCCAATCCAAACCAACCC
TTAAACTGTGGCTTTGAAGGCTATGTATTGTTGTTGTAACCAAAACCCTTTACAAATGGG
GGGACTAATATTAGCTCTTGATTGCTAAGAGGAGAGTCTTAGAGAGAGGTTGTAAGATTT
AGATATAGCGTTTGATTAAATAAAACGGATTTGTGTTTGTTATAAGCAGGTCTTGTAGGT
GAATCCAAAAATACTTTACTC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

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AAGTCAGGATATGAACGTTTATGCTGCTTGCAATGCATTCAGCCAAGAGACCACAACTAT
GGAACAACATGTGTATGTCGTGTTCCAAAACACTTGCGTGAAGAGAAGGTGGTTGAATGC
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TCTGACAAACCCTCACTCTTGTTAATTCTGGATTATGTACACCCTAAAACCCTGTCCAAA
TTTCATTTGCAAAACCTCTATCACTTGTCGAAATCAGAAAAGACGTTCCCGGTTTGGTC


BQ
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AF RS1BD56TF U 1
AF RS1BD56JQ C 117
BS 1 599 RS1BD56TF

RD RS1BD56TF 599 0 0
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CTTTATGAGTTCTGCTTGGATCAGAACTATGCTGATCGTAACCTCATTGCCAAGTGGAAA
AAGTCAGGATATGAACGTTTATGCTGCTTGCAATGCATTCAGCCAAGAGACCACAACTAT
GGAACAACATGTGTATGTCGTGTTCCAAAACACTTGCGTGAAGAGAAGGTGGTTGAATGC
GTTCATTGCGGTTGTCAAGGATGCGCTAGCGGCGATTAACCAATCTATCTCTCTTTTTCC
TCTGACAAACCCTCACTCTTGTTAATTCTGGATTATGTACACCCTAAAACCCTGTCCAAA
TTTCATTTGCAAAACCTCTATCACTTGTCGAAATCAGAAAAGACGTTCCCGGTTTGGTC

QA 1 599 1 599
DS 

RD RS1BD56JQ 483 0 0
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GAAAAAGTCAGGATATGAACGTTTATGCTGCTTGCAATGCATTCAGCCAAGAGACCACAA
CTATGGAACAACATGTGTATGTCGTGTTCCAAAACACTTGCGTGAAGAGAAGGTGGTTGA
ATGCGTTCATTGCGGTTGTCAAGGATGCGCTAGCGGCGATTAACCAATCTATCTCTCTTT
TTCCTCTGACAAACCCTCACTCTTGTTAATTCTGGATTATGTACACCCTAAAACCCTGTC
CAAATTTCATTTGCAAAACCTCTATCACTTGTCGAAATCAGAAAAGACGTTCCCGGTTTG
GTC

QA 1 483 1 483
DS 



AS 1 2

CO CL4711Contig1 850 2 2 U
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GTCATAATTATGATGTTCATCACCCTCTTGTTCAAGCTTGGGATCTGCCAATGTGTAGTT
AAAAGCTTATGCAAAATGTGTTGTGCCGCTTGTGCAATGTACTGGTTCGCCATCGGAGAG
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CTCCGTGACATAGAAGCCGCGAGTTACGATTACCCAAGCGATAACGAGCCAAGTTCACCA
GACAGCACTAGGCCGAAGCAGAGAAGAAGAAAAAGAAGAAGAAGAATACGAGGAAGCACA
CACAACCATAACGGTGGCAGCAGCAGCCGTCGCCTAGTAAGACTAAAGAGTAGACAAATG
TCTATACGAGTTGGAGGCAAATCAAGAAGAGTGAGAAGTGGTAGAAAGATGAAATCCAGT
AGAGTGAGAATTAAGAAGATCGTCAAAGACAAAGATGTGGTCGATTAAAATGTGTATACT
ATTGTCACTAAACTCAAAACATGAACATCTCATTTTTATTCAGATGAAATGAACACACAA
AACCGTTAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BB43TF U 1
AF RS1BB43JQ C 253
BS 1 544 RS1BB43TF
BS 545 850 RS1BB43JQ

RD RS1BB43TF 544 0 0
GGACTCGCTTCTTTACGTTTTGATAAACATGATTGCTGTGAAAATCATCGATCAATTAAG
AGAGTGATTAGTTGGTTAATTGTCCAAAGATCCCCATCGACTTTGTATTAAATAAAAATG
GGCAACACTATAGGAACCGATATCGGTGGTTTTATTGGCAACGTATTCACAGCACCCCTC
AAAGCCACACTTGGAAGATCCTGTCTAAATGTATGCTCGGGGCCATGGGATCTTTCGTGT
TTCATAGAACACTTCTGTCTTCCTGATATTGCCAAGCTCGTCCTTATCTCAGGCCTCTGT
GTCATAATTATGATGTTCATCACCCTCTTGTTCAAGCTTGGGATCTGCCAATGTGTAGTT
AAAAGCTTATGCAAAATGTGTTGTGCCGCTTGTGCAATGTACTGGTTCGCCATCGGAGAG
ATGATTCGTTGCTTGTGGCACAGTTTGACGAACACTAAACGTGTATACCGCAGAAAACGT
CTCCGTGACATAGAAGCCGCGAGTTACGATTACCCAAGCGATAACGAGCCAAGTTCACCA
GACA

QA 1 544 1 544
DS 

RD RS1BB43JQ 598 0 0
TTCTGTCTTCCTGATATTGCCAAGCTCGTCCTTATCTCAGGCCTCTGTGTCATAATTATG
ATGTTCATCACCCTCTTGTTCAAGCTTGGGATCTGCCAATGTGTAGTTAAAAGCTTATGC
AAAATGTGTTGTGCCGCTTGTGCAATGTACTGGTTCGCCATCGGAGAGATGATTCGTTGC
TTGTGGCACAGTTTGACGAACACTAAACGTGTATACCGCAGAAAACGTTTCCGTGACATA
GAAGCCGCGAGTTACGATTACCCAAGCGATAACGAGCCAAGTTCACCAGACAGCACTAGG
CCGAAGCAGAGAAGAAGAAAAAGAAGAAGAAGAATACGAGGAAGCACACACAACCATAAC
GGTGGCAGCAGCAGCCGTCGCCTAGTAAGACTAAAGAGTAGACAAATGTCTATACGAGTT
GGAGGCAAATCAAGAAGAGTGAGAAGTGGTAGAAAGATGAAATCCAGTAGAGTGAGAATT
AAGAAGATCGTCAAAGACAAAGATGTGGTCGATTAAAATGTGTATACTATTGTCACTAAA
CTCAAAACATGAACATCTCATTTTTATTCAGATGAAATGAACACACAAAACCGTTAAG

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 2

CO CL4712Contig1 499 2 3 U
AGAGAATTTGGCAGCAGATCCAGAGGTAACCGGTTCGAAGCCAGTTGGCCCTCCATTTTT
TTTTGATTCCTGTAAATCTCAAGTGTAGTATATTACACTTTTTTGGTAATTATCAAAAAC
AATTTCAAAACTTATAATTAAAAAAACTATATATGGAGAAAGGGAAGATAAATCCCGAAG
ACTTTTTGCATATCCATCATTCACAAGTCTCCAAGATTCAAATAATCCAGCAACTGTTTT
CATCATCCAGCTCTGGTTCTCCTGACCATATTTGCTTCACTTGTTCCCACACCAAGGATC
CTCCTCCCTTTGAAGTGAATTCAACAATGGTTGTGCAGCATTTACGCTCATCCTCGCATT
GCTCCCACTTATCAAACTTCACTATACATCTCCCAGGAATGTTGTCTATTACCAGAACCT
GATCCACCCAAACCCAAAACTTCTTCCTACTTTTGTCTCCATGATACTTCCTCAGCTCAT
CAAAGATGTCCCTCAAAAA


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EZ49JQ U 1
AF RS1G743JQ U 1
BS 1 191 RS1EZ49JQ
BS 192 193 RS1G743JQ
BS 194 499 RS1EZ49JQ

RD RS1EZ49JQ 499 0 0
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TTTTGATTCCTGTAAATCTCAAGTGTAGTATATTACACTTTTTTGGTAATTATCAAAAAC
AATTTCAAAACTTATAATTAAAAAAACTATATATGGAGAAAGGGAAGATAAATCCCGAAG
ACTTTTTGCAT**CCATCATTCACAAGTCTCCAAGATTCAAATAATCCAGCAACTGTTTT
CATCATCCAGCTCTGGTTCTCCTGACCATATTTGCTTCACTTGTTCCCACACCAAGGATC
CTCCTCCCTTTGAAGTGAATTCAACAATGGTTGTGCAGCATTTACGCTCATCCTCGCATT
GCTCCCACTTATCAAACTTCACTATACATCTCCCAGGAATGTTGTCTATTACCAGAACCT
GATCCACCCAAACCCAAAACTTCTTCCTACTTTTGTCTCCATGATACTTCCTCAGCTCAT
CAAAGATGTCCCTCAAAAA

QA 1 499 1 499
DS 

RD RS1G743JQ 492 0 0
G
GAGAATTTGGCAGCAGATCCAGAGGTAACCGGTTCGAAGCCAGTTGGCCCTCCATTTTTT
TTTGATTCCTGTAAATCTCAAGTGTAGTATATTACACTTTTTTGGTAATTATCAAAAACA
ATTTCAAAACTTATAATTAAAAAAACTATATATGGAGAAAGGGAAGATAAATCCCGAAGA
CTTTTTGCATATCCATCATTCACAAGTCTCCAAGATTCAAATAATCCAGCAACTGTTTTC
ATCATCCAGCTCTGGTTCTCCTGACCATATTTGCTTCACTTGTTCCCACACCAAGGATCC
TCCTCCCTTTGAAGTGAATTCAACAATGGTTGTGCAGCATTTACGCTCATCCTCGCATTG
CTCCCACTTATCAAACTTCACTATACATCTCCCAGGAATGTTGTCTATTACCAGAACCTG
ATCCACCCAAACCCAAAACTTCTTCCTACTTTTGTCTCCATGATACTTCCTCAGCTCATC
AAAGATGTCCC

QA 2 492 2 492
DS 



AS 1 2

CO CL4713Contig1 768 2 2 U
GGTCTGTGGAAGAGGCTAGTTACTATAGAGAGACGGCCTTTGCGTTGAGACTGGCGAAAG
AGGTTATAAAGATGCAGCAGGGTTGGAGAGCCAATGCCATTGCGCATATGAATAGAACTG
ATGGGTTTTCGAAAACGTTGGCGAATTCGTGTACTGATTGGCCTTTGCTTCTGCTCGAGT
TGTTGTCACAAGCTGCAGAGATTGGTTTCTTTCAGCCTAAGCTAGTCTTAAACAACATTG
AAATATTGAAGAATGCTATTCAGACTGATGATTCAACTGTCTCAGCGTCAGTGTACCATG
ACAATCTTGTATGGAGAATAATAGCTTTGGGTGCGAATGAGCGCTGTCTACCTGTCCTGT
TCGTGACTTCCGATAGCTACTACTCATATCAAGCCTTTGTTGGCTTCGGGTTTCCAGACA
TTTTCATCTCTCGTGAGACATTTGGATGGACTCCTCAAGAAGCCAAATTACACATGGTTC
CTGATTACTTCAGTGCTTCGGAGTGGACTATCATTGCTGATGTTCTTGGAGCCAATTCTC
GGCATCTATTTGAGCTTTATGCGCTTAAGCAAAGTAATCATTACCAAAGTTTGATGGGGA
ACAAAGCAGGTACATTTGAAGATATTGTGGATGCATACTTGGCATATTTACAAGTTGCTG
TGGTTAATCCTGCAATGGAAAAAGCTTTGCTGCGGCTTCACGGTATGCCGCTGATGTACG
CAAGGAAGTATTCCAGATGAGAATTACGCTTTGGTGCTGCATGGAGCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GG31TF U 1
AF RS1EF69TF U 66
BS 1 547 RS1GG31TF
BS 548 768 RS1EF69TF

RD RS1GG31TF 547 0 0
GGTCTGTGGAAGAGGCTAGTTACTATAGAGAGACGGCCTTTGCGTTGAGACTGGCGAAAG
AGGTTATAAAGATGCAGCAGGGTTGGAGAGCCAATGCCATTGCGCATATGAATAGAACTG
ATGGGTTTTCGAAAACGTTGGCGAATTCGTGTACTGATTGGCCTTTGCTTCTGCTCGAGT
TGTTGTCACAAGCTGCAGAGATTGGTTTCTTTCAGCCTAAGCTAGTCTTAAACAACATTG
AAATATTGAAGAATGCTATTCAGACTGATGATTCAACTGTCTCAGCGTCAGTGTACCATG
ACAATCTTGTATGGAGAATAATAGCTTTGGGTGCGAATGAGCGCTGTCTACCTGTCCTGT
TCGTGACTTCCGATAGCTACTACTCATATCAAGCCTTTGTTGGCTTCGGGTTTCCAGACA
TTTTCATCTCTCGTGAGACATTTGGATGGACTCCTCAAGAAGCCAAATTACACATGGTTC
CTGATTACTTCAGTGCTTCGGAGTGGACTATCATTGCTGATGTTCTTGGAGCCAATTCTC
GGCATCT

QA 1 547 1 547
DS 

RD RS1EF69TF 703 0 0
ATAAAGATGCAGCAGGGTTGGAGAGCCAATGCCATTGCGCATATGAATAGAACTGATGGG
TTTTCGAAAACGTTGGCGAATTCGTGTACTGATTGGCCTTTGCTTCTGCTCGAGTTGTTG
TCACAAGCTGCAGAGATTGGTTTCTTTCAGCCTAAGCTAGTCTTAAACAACATTGAAATA
TTGAAGAATGCTATTCAGACTGATGATTCAACTGTCTCAGCGTCAGTGTACCATGACAAT
CTTGTATGGAGAATAATAGCTTTGGGTGCGAATGAGCGCTGTCTACCTGTCCTGTTCGTG
ACTTCCGATAGCTACTACTCATATCAAGCCTTTGTTGGCTTCGGGTTTCCAGACATTTTC
ATCTCTCGTGAGACATTTGGATGGACTCCTCAAGAAGCCAAATTACACATGGTTCCTGAT
TACTTCAGTGCTTCGGAGTGGACTATCATTGCTGATGTTCTTGGAGCCAATTCTCGGCAT
CTATTTGAGCTTTATGCGCTTAAGCAAAGTAATCATTACCAAAGTTTGATGGGGAACAAA
GCAGGTACATTTGAAGATATTGTGGATGCATACTTGGCATATTTACAAGTTGCTGTGGTT
AATCCTGCAATGGAAAAAGCTTTGCTGCGGCTTCACGGTATGCCGCTGATGTACGCAAGG
AAGTATTCCAGATGAGAATTACGCTTTGGTGCTGCATGGAGCA

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 2

CO CL4714Contig1 669 2 2 U
GACACTCCTCTCTCTCTCTCTCTTCAGATCAATAGCTGCTGCGGAGGAGGAGAAGCAAGC
ACCGGCGGAGATAAATGGCAGGGTACAGAGTGGAAGACGACTACGATTACCTCTTCAAAG
TCGTCCTCATAGGCGATTCGGGTGTAGGCAAATCGAATCTGCTCTCCAGATTCACCAAAA
ACGAGTTCAATCTCGAGTCTAAATCCACCATTGGCGTCGAGTTCGCAACTCGGACCTTGA
AAGTCGATGAAAAGGTCGTCAAGGCTCAGATTTGGGATACTGCTGGTCAAGAAAGGTACC
GTGCCATCACTAGTGCATACTACCGTGGAGCCGTTGGCGCACTCCTAGTATATGATACTA
CCCGCCGTGCGACTTTCGAGAACGTTGACCGGTGGTTGAAGGAGCTCAAGAACCACACAG
ACCCTAACATCGTGGTGATGCTCGTCGGTAACAAGTCTGATCTGCGCCATTTGCTAGCTG
TTCCCACGGAAGATGGGAAATCATATGCCGAGCAGGAATCGCTTTGCTTCATGGAAACAT
CTGCCCTTGAATCCACCAACGTCGAGAACGCCTTTGCAGAGGTTTTGACGCAGATTTACC
GTATAACTAGCAAGAAGCAAATGGAAGCTGGTGAGGATGGGAACGGATCTGTTCCGAAAG
GTGAGAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GZ33TF U 1
AF RS1GZ33JQ C 510
BS 1 570 RS1GZ33TF
BS 571 669 RS1GZ33JQ

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ACCGGCGGAGATAAATGGCAGGGTACAGAGTGGAAGACGACTACGATTACCTCTTCAAAG
TCGTCCTCATAGGCGATTCGGGTGTAGGCAAATCGAATCTGCTCTCCAGATTCACCAAAA
ACGAGTTCAATCTCGAGTCTAAATCCACCATTGGCGTCGAGTTCGCAACTCGGACCTTGA
AAGTCGATGAAAAGGTCGTCAAGGCTCAGATTTGGGATACTGCTGGTCAAGAAAGGTACC
GTGCCATCACTAGTGCATACTACCGTGGAGCCGTTGGCGCACTCCTAGTATATGATACTA
CCCGCCGTGCGACTTTCGAGAACGTTGACCGGTGGTTGAAGGAGCTCAAGAACCACACAG
ACCCTAACATCGTGGTGATGCTCGTCGGTAACAAGTCTGATCTGCGCCATTTGCTAGCTG
TTCCCACGGAAGATGGGAAATCATATGCCGAGCAGGAATCGCTTTGCTTCATGGAAACAT
CTGCCCTTGAATCCACCAACGTCGAGAACG

QA 1 570 1 570
DS 

RD RS1GZ33JQ 160 0 0
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GCCTTTGCAGAGGTTTTGACGCAGATTTACCGTATAACTAGCAAGAAGCAAATGGAAGCT
GGTGAGGATGGGAACGGATCTGTTCCGAAAGGTGAGAAGA

QA 1 160 1 160
DS 



AS 1 2

CO CL4715Contig1 1022 2 2 U
GCAGCGGCCTGCGATGTCTGCGGTTGTGAAAATGATGAAAGGGAGTTTGGAGATTCCTAC
ACCGACGCAACCGCCGTTTTTGAATCCGGGGAGTGTATTAGAGATGAGAAAGATGATGTC
TCCGACGACTGATCAGTCTCAGTCTTCAGGTTGGAGGAGTGACAACATATCTGAGAGTTT
CTTCGAACCTAGATGAGCTTTTAAGATCGGTTTATATCAGAAAATATCTTTGTGATGGAC
TCTGAATCTGTGTAATATGTGTACAAAGAACTGAGATGCTGATTAATCGTGTGACTAATT
AAGGGTAACGTCTGAGGCACGAAACTGTGTATGTATAAGTACCTAGGAAGTGGACACGGT
TAGAGCTCACTTGGTGGAGGGCAGACTCCAGTTTAGTCTTGGTTTAGGTTTGTTTATAAT
CACTAGTTTTGTTTGCGTTTTCATATTTGCAAAAATCATTTTTATTAAAATAGTTTAAAT
ATACAAAGAACAGTTAATAGAAAACTCCACGCCAAAGAAAAGTTCAAGGAGCCGCGACCG
TGAGGACGACTACTAAACATGTTAAATTATATTATTTTTTTCTGGTGAAGAATAAATACG
TGATAAGATTATATGCATTTTGGTCTGCCCAACATAATTTGTTTGTTACTTATTATAGAT
AGAAGCTGTCACTATTCTGAGTTTTGTAACTCCACTACATAATTTTCAGCATTGATTATC
CAACCACTTCCCATGTCCTTTTGTATTTTTATTGACTACAAAGTTTTGACAATGGCAAGA
GACCTTGTAATTGTTTTTTTTTCCTTTTAATTTCTAGAACTTTATTGGTAACATACCAAA
CCATTTCTTTAGTCCAACGTCCTCTACCGTTAGTTTATCCATTGACATTTTTAAAATCTT
ATTTTCTGGAATGTCTTCATACAAACACTAAAGGACATGTGAAGCTATCTTATTCTCTTA
AGAAAAGTATTCAGAAAACTTGGAATTTATAGGCCGGTGGTCCCTATACATTTAGATCTC
CT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RS1EJ88TF U 1
AF RS1EJ88JQ C 252
BS 1 737 RS1EJ88TF
BS 738 1022 RS1EJ88JQ

RD RS1EJ88TF 737 0 0
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ACCGACGCAACCGCCGTTTTTGAATCCGGGGAGTGTATTAGAGATGAGAAAGATGATGTC
TCCGACGACTGATCAGTCTCAGTCTTCAGGTTGGAGGAGTGACAACATATCTGAGAGTTT
CTTCGAACCTAGATGAGCTTTTAAGATCGGTTTATATCAGAAAATATCTTTGTGATGGAC
TCTGAATCTGTGTAATATGTGTACAAAGAACTGAGATGCTGATTAATCGTGTGACTAATT
AAGGGTAACGTCTGAGGCACGAAACTGTGTATGTATAAGTACCTAGGAAGTGGACACGGT
TAGAGCTCACTTGGTGGAGGGCAGACTCCAGTTTAGTCTTGGTTTAGGTTTGTTTATAAT
CACTAGTTTTGTTTGCGTTTTCATATTTGCAAAAATCATTTTTATTAAAATAGTTTAAAT
ATACAAAGAACAGTTAATAGAAAACTCCACGCCAAAGAAAAGTTCAAGGAGCCGCGACCG
TGAGGACGACTACTAAACATGTTAAATTATATTATTTTTTTCTGGTGAAGAATAAATACG
TGATAAGATTATATGCATTTTGGTCTGCCCAACATAATTTGTTTGTTACTTATTATAGAT
AGAAGCTGTCACTATTCTGAGTTTTGTAACTCCACTACATAATTTTCAGCATTGATTATC
CAACCACTTCCCATGTC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RS1EJ88JQ 771 0 0
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CTGAGGCACGAAACTGTGTATGTATAAGTACCTAGGAAGTGGACACGGTTAGAGCTCACT
TGGTGGAGGGCAGACTCCAGTTTAGTCTTGGTTTAGGTTTGTTTATAATCACTAGTTTTG
TTTGCGTTTTCATATTTGCAAAAATCATTTTTATTAAAATAGTTTAAATATACAAAGAAC
AGTTAATAGAAAACTCCACGCCAAAGAAAAGTTCAAGGAGCCGCGACCGTGAGGACGACT
ACTAAACATGTTAAATTATATTATTTTTTTCTGGTGAAGAATAAATACGTGATAAGATTA
TATGCATTTTGGTCTGCCCAACATAATTTGTTTGTTACTTATTATAGATAGAAGCTGTCA
CTATTTTGAGTTTTGTAACTCCACTACATAATTTTCAGCATTGATTATCCAACCACTTCC
CATGTCCTTTTGTATTTTTATTGACTACAAAGTTTTGACAATGGCAAGAGACCTTGTAAT
TGTTTTTTTTTCCTTTTAATTTCTAGAACTTTATTGGTAACATACCAAACCATTTCTTTA
GTCCAACGTCCTCTACCGTTAGTTTATCCATTGACATTTTTAAAATCTTATTTTCTGGAA
TGTCTTCATACAAACACTAAAGGACATGTGAAGCTATCTTATTCTCTTAAGAAAAGTATT
CAGAAAACTTGGAATTTATAGGCCGGTGGTCCCTATACATTTAGATCTCCT

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 2

CO CL4716Contig1 1141 2 2 U
GAGGTTCCAAGAACTTCATGAAGAATCTTTGCCACAAATACAATATCCCTACTGCTAAGT
ATAAGACATTTTCTGATGCGTCTGCTGCTAAAGAATACATCAAAGAGCAAGGTGTACCGA
TCGTGATCAAAGCAGACGGCTTAGCAGCAGGAAAAGGAGTCACTGTCGCCATGGAGCTAG
ATGAGGCCTACGACGCTGTTGACTCGATGCTGGTGGAAGGCGTGTTTGGTTCCGCAGGAT
GTCAGGTGATCGTGGAGGAGTTTCTCGAGGGAGAAGAAGCTTCATTTTTCGCGCTTGTGG
ATGGAGAGAACGCCATTCCTCTGGAATCTGCTCAGGACCACAAGAGGGTTGGTGATGGAG
ATACGGGTCCTAACACTGGAGGAATGGGAGCTTATTCTCCTGCACCGGTTCTGACTAAGG
AGCTAAAGGATGTGGTGATGGAGACTATAATTCATCCTACCGTTAAAGGAATGGCTGAAG
AAGGTTGTAAGTTTGTTGGTGTTCTGTTTGCTGGTCTGATGATCGAGAAGAAGTCCGGTT
TACCTAAACTGATTGAGTTCAATGTCCGGTTTGGAGATCCAGAATGTCAGGTACTGATGA
TGCGTCTAGAGTCTGACCTCGCAAAGGTTTTGCTAGCTGCTTGTAAAGGCGAGCTAAGCG
GCGTGTCGCTTGACTGGTCAAAAGATTCAGCGATGGTGGTTGTAATGGCAAGCAAAGGTT
ACCCCGGTGCTTACGAGAAAGGAACGATCATCAGAAACCTTGAAGAAGCTGAAACCGTTG
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CGAGTGGAGGACGTGTTCTTGGGGTCACGGCGATGGGTAAAGACTTGGAAGAGGCGCGTG
AAAGAGCCTACTTGGCGGTACAAGAGATCAAATGGCCTGGTGGTTTCTTTAGGAGTGATA
TTGGTTGGAGAGCGCTTCGTCAGAAACAAGTAGCTACAAAAGAGTGAGTGAAGAGAAAAG
AACTTTGTTGTGAACCAGAACATTAAAGACTCACTTTATTCTGTTATGAGATTATTCAAA
ATAGCTTTCTTTTCATTGAATTTTAAATTTTATTCAAAGTTTTAAAGAATGTTTAGTTCC
G


BQ
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10 

AF RS1GT54TF U 1
AF RS1GT54JQ C 412
BS 1 586 RS1GT54TF
BS 587 1141 RS1GT54JQ

RD RS1GT54TF 586 0 0
GAGGTTCCAAGAACTTCATGAAGAATCTTTGCCACAAATACAATATCCCTACTGCTAAGT
ATAAGACATTTTCTGATGCGTCTGCTGCTAAAGAATACATCAAAGAGCAAGGTGTACCGA
TCGTGATCAAAGCAGACGGCTTAGCAGCAGGAAAAGGAGTCACTGTCGCCATGGAGCTAG
ATGAGGCCTACGACGCTGTTGACTCGATGCTGGTGGAAGGCGTGTTTGGTTCCGCAGGAT
GTCAGGTGATCGTGGAGGAGTTTCTCGAGGGAGAAGAAGCTTCATTTTTCGCGCTTGTGG
ATGGAGAGAACGCCATTCCTCTGGAATCTGCTCAGGACCACAAGAGGGTTGGTGATGGAG
ATACGGGTCCTAACACTGGAGGAATGGGAGCTTATTCTCCTGCACCGGTTCTGACTAAGG
AGCTAAAGGATGTGGTGATGGAGACTATAATTCATCCTACCGTTAAAGGAATGGCTGAAG
AAGGTTGTAAGTTTGTTGGTGTTCTGTTTGCTGGTCTGATGATCGAGAAGAAGTCCGGTT
TACCTAAACTGATTGAGTTCAATGTCCGGTTTGGAGATCCAGAATG

QA 1 586 1 586
DS 

RD RS1GT54JQ 730 0 0
TGACTAAGGAGCTAAAGGATGTGGTGATGGAGACTATAATTCATCCTACCGTTAAAGGAA
TGGCTGAAGAAGGTTGTAAGTTTGTTGGTGTTCTGTTTGCTGGTCTGATGATCGAGAAGA
AGTCCGGTTTACCTAAACTGATTGAGTTCAATGTCCGGTTTGGAGATCCAGAATGTCAGG
TACTGATGATGCGTCTAGAGTCTGACCTCGCAAAGGTTTTGCTAGCTGCTTGTAAAGGCG
AGCTAAGCGGCGTGTCGCTTGACTGGTCAAAAGATTCAGCGATGGTGGTTGTAATGGCAA
GCAAAGGTTACCCCGGTGCTTACGAGAAAGGAACGATCATCAGAAACCTTGAAGAAGCTG
AAACCGTTGCTCCAGGAGTGAAGGTTTTCCACGCAGGAACGGATGTTGATGCAGAAGGGA
ATGTTGTTGCGAGTGGAGGACGTGTTCTTGGGGTCACGGCGATGGGTAAAGACTTGGAAG
AGGCGCGTGAAAGAGCCTACTTGGCGGTACAAGAGATCAAATGGCCTGGTGGTTTCTTTA
GGAGTGATATTGGTTGGAGAGCGCTTCGTCAGAAACAAGTAGCTACAAAAGAGTGAGTGA
AGAGAAAAGAACTTTGTTGTGAACCAGAACATTAAAGACTCACTTTATTCTGTTATGAGA
TTATTCAAAATAGCTTTCTTTTCATTGAATTTTAAATTTTATTCAAAGTTTTAAAGAATG
TTTAGTTCCG

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL4717Contig1 657 2 2 U
CTTCAGCAAAGTACCTTCTCATTGCAGCGTTTCTCGCTTCAAGAAACCCAGCAACGCTGG
ATGCCTCCATGTTTGACTCCACAGGGGGCATGGATAATCGTAAAAGAAAGCGCAAGGCCT
CTGAGAAGTCGATGGAGAAGAAGGAAATGGCAGAGCAGGAAGCAGTGATGAAAGGTCCTG
GAAGCTTTCCACTGGAGAGACTGTTGGCGATATTCCAGTGCATTGCCTCTGTAGGAGATT
CTTCATTTGGCGATGATGCTGAAGAAGAAGGAGAAGAAGAAGCTACTGGTTATGACAAGT
AGAGTAACAATATGATGTCTGATATTCTGCTTCAAGTTGAGTCTTTGTGATGCAAACTTC
ATGATCAAAAGCGGAAGCTGCCCATTAGGAGGATCTATTAGGTACCGTTCCATGGTGTCT
GAAGATCTGTCTCTGAGGGTTGCGAGAAGCCTCAACTTTCCACTGTCCAAGTACTTATAC
AGAAGATAGTATGTTGGAGGAGGAAACTAAAATAGATATGGTATATATTCCTGTAGAAGA
GGCCATGCATCTCTAAGCCTAAACCCGGTGTAGGCAAGATCCTCTTGATTTTCGGTATGG
GAATTCATTTTGTAACACAAACTTTTTAAGAATTAATTAAGAATGTGGTCCAAACCG


BQ
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AF RS1G294TF U 1
AF RS1G294JQ C 435
BS 1 613 RS1G294TF
BS 614 657 RS1G294JQ

RD RS1G294TF 613 0 0
CTTCAGCAAAGTACCTTCTCATTGCAGCGTTTCTCGCTTCAAGAAACCCAGCAACGCTGG
ATGCCTCCATGTTTGACTCCACAGGGGGCATGGATAATCGTAAAAGAAAGCGCAAGGCCT
CTGAGAAGTCGATGGAGAAGAAGGAAATGGCAGAGCAGGAAGCAGTGATGAAAGGTCCTG
GAAGCTTTCCACTGGAGAGACTGTTGGCGATATTCCAGTGCATTGCCTCTGTAGGAGATT
CTTCATTTGGCGATGATGCTGAAGAAGAAGGAGAAGAAGAAGCTACTGGTTATGACAAGT
AGAGTAACAATATGATGTCTGATATTCTGCTTCAAGTTGAGTCTTTGTGATGCAAACTTC
ATGATCAAAAGCGGAAGCTGCCCATTAGGAGGATCTATTAGGTACCGTTCCATGGTGTCT
GAAGATCTGTCTCTGAGGGTTGCGAGAAGCCTCAACTTTCCACTGTCCAAGTACTTATAC
AGAAGATAGTATGTTGGAGGAGGAAACTAAAATAGATATGGTATATATTCCTGTAGAAGA
GGCCATGCATCTCTAAGCCTAAACCCGGTGTAGGCAAGATCCTCTTGATTTTCGGTATGG
GAATTCATTTTGT

QA 1 613 1 613
DS 

RD RS1G294JQ 223 0 0
GAGGGTTGCGAGAAGCCTCAACTTTCCACTGTCCAAGTACTTATACAGAAGATAGTATGT
TGGAGGAGGAAACTAAAATAGATATGGTATATATTCCTGTAGAAGAGGCCATGCATCTTT
AAGCCTAAACCCGGTGTAGGCAAGATCCTCTTGATTTTCGGTATGGGAATTCATTTTGTA
ACACAAACTTTTTAAGAATTAATTAAGAATGTGGTCCAAACCG

QA 1 223 1 223
DS 



AS 1 2

CO CL4718Contig1 1327 2 4 U
TTCACCACTTCCCACTTCCATTTTTTTTGAAATAATAGAGAGGTAATATTCCTCCAAATC
TCTCTCTCTCTCCCAGGATGGTTGTTGCTATGGACCAACGCACCAATGGGAAAGGAAATG
AAGAAGGGTTTGATCCGAGCGTACAACCGCCGTTTAAGATCGGGGACATAAGAGCTGCGA
TTCCTAAGCATTGTTGGGTGAAAAGTCCTTTGAGATCTATGAGCTACGTCGCCAGAGACA
TTTGCGCCGTCGCGGCTTTGGCCACTGCTGCCGTGTATTTTAATAGCTGGTTCCTCTGGC
CTCTCTATTGGGTCGCTCAAGGAACCCTTTTCTGGGCCATCTTTGTCCTCGGCCACGACT
GTGGACATGGGAGTTTCTCAGACATTCCTCTGCTGAATAGTGTGGTTGGCCATATCCTTC
ATTCCTTCATCCTCGTTCCTTACCATGGTTGGAGAATAAGCCATCGGACACACCACCAGA
ACCATGGCCATGTTGAAAACGACGAGTCTTGGGTTCCGTTACCAGAAAAGTTATACAAGA
ATTTACCCCACAGTACTCGCATGCTCAGATACACTGTCCCTCTCCCCATGCTCGCTTACC
CTATCTATCTGTGGTACAGAAGTCCTGGGAAAGAAGGGTCACATTTTAACCCATACAGTG
GTTTATTTGCTCCAAGCGAAAGAAAGCTTATTGCAACTTCAACTACTTGCTGGTCCATAA
TGTTGGCTGTTCTTATCTATCTTTCCTTCCTCGTTGGTCCAGTCACAGTTCTCAAAGTAT
ACGGTGTTCCTTACATCATCTTCGTGATGTGGTTGGACGCTGTCACTTACTTGCATCACC
ATGGTCATGATGAGAAGCTGCCTTGGTACAGAGGCAAGGAATGGAGTTACCTACGTGGAG
GATTAACAACTATTGATAGAGATTACGGAATTTTCAACAACATTCATCACGACATTGGAA
CTCACGTGATCCATCATCTTTTCCCACAAATCCCTCACTATCACTTGGTCGATGCTACAA
AAGCAGCTAAACATGTGTTGGGAAGATATTACAGAGAACCAAAGACGTCAGGAGCAATAC
CGATCCACTTGGTGGAGAGTTTGGTAGCAAGTATTAAGAAAGATCATTACGTCAGTGACA
CTGGTAACATTGTCTTCTATGAGACTGATCCAGATCTCTACGTTTATGCTTCTGTCAAAT
CGAAAATCAAATAACCTTTCTTCCCCCCCTTTTTGTTAAGCTCTATTAATAATAAACCAG
TCTTTTTAAAAACTTATTTATTGTCGTTTTTAAGTTTAAAATGTAGTCGTGGAATTATTT
TTTATTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CG13TF U 1
AF RS1CG13JQ C 635
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BS 731 1327 RS1CG13JQ

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TTCCTAAGCATTGTTGGGTGAAAAGTCCTTTGAGATCTATGAGCTACGTCGCCAGAGACA
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GTGGACATGGGAGTTTCTCAGACATTCCTCTGCTGAATAGTGTGGTTGGCCATATCCTTC
ATTCCTTCATCCTCGTTCCTTACCATGGTTGGAGAATAAGCCATCGGACACACCACCAGA
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ATTTACCCCACAGTACTCGCATGCTCAGATACACTGTCCCTCTCCCCATGCTCGCTTACC
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TGTTGGCTGT

QA 1 730 1 730
DS 

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AACTTCAACTACTTGCTGGTCCATAATGTTGGCTGTTCTTATCTATCTTTCCTTCCTCGT
TGGTCCAGTCACAGTTCTCAAAGTATACGGTGTTCCTTACATCATCTTCGTGATGTGGTT
GGACGCTGTCACTTACTTGCATCACCATGGTCATGATGAGAAGCTGCCTTGGTACAGAGG
CAAGGAATGGAGTTACCTACGTGGAGGATTAACAACTATTGATAGAGATTACGGAATTTT
CAACAACATTCATCACGACATTGGAACTCACGTGATCCATCATCTTTTCCCACAAATCCC
TCACTATCACTTGGTCGATGCTACAAAAGCAGCTAAACATGTGTTGGGAAGATATTACAG
AGAACCAAAGACGTCAGGAGCAATACCGATCCACTTGGTGGAGAGTTTGGTAGCAAGTAT
TAAGAAAGATCATTACGTCAGTGACACTGGTAACATTGTCTTCTATGAGACTGATCCAGA
TCTCTACGTTTATGCTTCTGTCAAATCGAAAATCAAATAACCTTTCTTCCCCCCCTTTTT
GTTAAGCTCTATTAATAATAAACCAGTCTTTTTAAAAACTTATTTATTGTCGTTTTTAAG
TTTAAAATGTAGTCGTGGAATTATTTTTTATTG

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

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TTTTAGCATATTTTCTCAAAGAGAAGATCTATAGAAAATTTCGTGTGATCTTTCTAGATT
AACTGAACATGTCGCTAGACGGACTAGGAGGGATGGCTTTTGCGGAGGCTTACACGGCGA
GGAAGTTTCACAGAGAAAACATGAAGACTTTGACGTCAAGCACAGCCACAACCGTCGGTG
GTGGAACCGAAGACAACGGTGGACGATATAGCCGGTGGTTTTTCGGTAAGCGGAGCACCA
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AGAACTAATCTAAGGAATAAAAAAACTTTATATATCTTTCGTGTTTTACTTTATTTCTGC
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AGT


BQ
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AF RS1FW41JQ C 1
AF RS1FW41TF U 1
BS 1 483 RS1FW41TF

RD RS1FW41JQ 483 0 0
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TTTTAGCATATTTTCTCAAAGAGAAGATCTATAGAAAATTTCGTGTGATCTTTCTAGATT
AACTGAACATGTCGCTAGACGGACTAGGAGGGATGGCTTTTGCGGAGGCTTACACGGCGA
GGAAGTTTCACAGAGAAAACATGAAGACTTTGACGTCAAGCACAGCCACAACCGTCGGTG
GTGGAACCGAAGACAACGGTGGACGATATAGCCGGTGGTTTTTCGGTAAGCGGAGCACCA
AGAAAAACTCGGCTAAAGTTTGTGATCTAATAACTATAGAATAAGTCGATGGTCACATCC
AGAACTAATCTAAGGAATAAAAAAACTTTATATATCTTTCGTGTTTTACTTTATTTCTGC
TTTATATTTGATGATGTGTATTGTGATTTTCTTTATGAAATTTTAGGTGAGATTGTGTAA
AGT

QA 1 483 1 483
DS 

RD RS1FW41TF 483 0 0
GGACCAAACAACACTCATCTTTCACCAAAGTATTTAACTTTTTATCTTCTCTTTTTCGTA
TTTTAGCATATTTTCTCAAAGAGAAGATCTATAGAAAATTTCGTGTGATCTTTCTAGATT
AACTGAACATGTCGCTAGACGGACTAGGAGGGATGGCTTTTGCGGAGGCTTACACGGCGA
GGAAGTTTCACAGAGAAAACATGAAGACTTTGACGTCAAGCACAGCCACAACCGTCGGTG
GTGGAACCGAAGACAACGGTGGACGATATAGCCGGTGGTTTTTCGGTAAGCGGAGCACCA
AGAAAAACTCGGCTAAAGTTTGTGATCTAATAACTATAGAATAAGTCGATGGTCACATCC
AGAACTAATCTAAGGAATAAAAAAACTTTATATATCTTTCGTGTTTTACTTTATTTCTGC
TTTATATTTGATGATGTGTATTGTGATTTTCTTTATGAAATTTTAGGTGAGATTGTGTAA
AGT

QA 1 483 1 483
DS 



AS 1 2

CO CL4720Contig1 1353 2 6 U
GGACGAAGATGATTCTGAGGTGAATGATGATGGAGAATTGAGTTTTGAATATAGAGTGAA
TGACAAGGACCAAAATGCAGATTCTTCACCTAGTGTCTCACAGTTGGGTCAATCAGATAT
CACATTTCCACTAGTTGCAGGAGTAAAAACTGGGCAGGAAAATGAGGAAGCAAACTATGG
GAGATCTCGTTCTTATAGGAGAGATGTTAGGATAGAGAGCCAGTCAGCACCCCTGTTTGC
TGAGAACCGGACAACTCCTCCTTCGGAGAAGCTTTTACGGATGCGATCATCTTAACACGA
AAATTCAGCACTTATGCATTGCCAACACCTGTGGAATCAGCTAAAATTCCCTCATCTGTT
ACAAGTCTAGGTAACAACAAGAGCATGGCTTCATCTAATCCTGCAAAGCCAATAGCAAAA
AACATTTGGTATTCACCCCCACTGGAAACTCGTGGACCTGCAAAGGTTTCTTCCAGACCA
ATGACTTGCTTGAAAGAACAAGTTCTGAGAGAGAGTAACAAGAATACATCTTCTCGGTTG
CCTCGGCCTTCGACAGATGGACTCTTGTACTCTCGTATCGGATCACTCAAGAGGCGATCC
TTTTCTGGTCCAATTACAAGCAAACCGTTGCCTAACAAGCCTCTCTCTTCAACGCCTCGT
TTATACTCGGGTCCAATCCCAAGGAGTCCAGTCTCCAAGTTACTGAAAATGTCAACATCG
TCTCCAACTGCTTCCCCTACATTTGTCTCAACCCCGAAAATAAGCGAGCTCCATGAGCTT
CCTAGACCACCACCACCACCACCAAGCAGCTTTGCTAAGTCTTCGAGGGCATTTGGATAT
TCAGCACCTCTGGTTTCAAAGAGCCAATTGCTTAGTAAACCTATTATTTCAACTCCACCA
TCTCCTCTCCCAATACCACCCGCAATCACTCGTAGCTTCTCTATACCTACTGGCAACCTT
AGAGGAACAGAGTTAGATATGTTTAAGATGAGTTTGGGTGCTAATAAGTTAAGCACTGCC
TCCCCTCCTTTAACCCCGATGTCATTGGTCCATCCACCTCCATCTGCTATTACCGAGCAC
GCAGAGCACCCAACCATGTCCAAACAAGAGAGGAGGACTTGAAGGTGTAAGTTGTTTGTA
GCTCTGCCTAAAAGCTTGTAGGAGGAGGAAGACATTCCCTCTAGTTGCAGATATGTAAAT
ATCTCTCCTGTTTTGTTCTGACAATGCTGAAGAAAAAAAGAAAGAGAGCCGAACAGTGAC
AAGGAATTGCCAAGTAATTTTGACTTTTTTTAATAATCATTCAGTGGTTTATAACAACAT
TACGATTATTTATTGAAGTCATTTATAACATCG


BQ
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AF RS1E864TF U 1
AF RS1E864JQ C 564
BS 1 675 RS1E864TF
BS 676 676 RS1E864JQ
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BS 710 754 RS1E864TF
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RD RS1E864TF 756 0 0
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AACATTTGGTATTCACCCCCACTGGAAACTCGTGGACCTGCAAAGGTTTCTTCCAGACCA
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TCTCCAACTGCTTCCCCTACATTTGTCTCAACCC
GA

QA 1 754 1 754
DS 

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TC
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CGTTGCCTAACAAGCCTCTCTCTTCAACGCCTCGTTTATACTCGGGTCCAATCCCAAGGA
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TCTCAACCCCGAAAATAAGCGAGCTCCATGAGCTTCCTAGACCACCACCACCACCACCAA
GCAGCTTTGCTAAGTCTTCGAGGGCATTTGGATATTCAGCACCTCTGGTTTCAAAGAGCC
AATTGCTTAGTAAACCTATTATTTCAACTCCACCATCTCCTCTCCCAATACCACCCGCAA
TCACTCGTAGCTTCTCTATACCTACTGGCAACCTTAGAGGAACAGAGTTAGATATGTTTA
AGATGAGTTTGGGTGCTAATAAGTTAAGCACTGCCTCCCCTCCTTTAACCCCGATGTCAT
TGGTCCATCCACCTCCATCTGCTATTACCGAGCACGCAGAGCACCCAACCATGTCCAAAC
AAGAGAGGAGGACTTGAAGGTGTAAGTTGTTTGTAGCTCTGCCTAAAAGCTTGTAGGAGG
AGGAAGACATTCCCTCTAGTTGCAGATATGTAAATATCTCTCCTGTTTTGTTCTGACAAT
GCTGAAGAAAAAAAGAAAGAGAGCCGAACAGTGACAAGGAATTGCCAAGTAATTTTGACT
TTTTTTAATAATCATTCAGTGGTTTATAACAACATTACGATTATTTATTGAAGTCATTTA
TAACATCG

QA 3 790 3 790
DS 



AS 1 2

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TTT


BQ
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AF RS1CE30JQ C 1
AF RS1CE30TF U 1
BS 1 483 RS1CE30TF

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TCCTAAACAGCAAGATAGGGTGGATAGCATCGGGCGTCTTCCCGCTCCGAAGAAACCAAT
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TTAGGTTTTTAACGTTTGATGTTTTGGGTTTAAGTTGTTTGTGTTGTTTCTTGTTCATGT
TCTTACAAGAAAAAAATTGAAAATGGCAGATTTTTATTGGACAAAATAAGGCCATTCTCG
TTT

QA 1 483 1 483
DS 

RD RS1CE30TF 483 0 0
GGGAGCCATAGGGAAGCAAATAGAAGACGGAGTGAGACTAATGGGTCGTGGTGCTGATGG
GATCAAATGGCCACTTCATTTTGAGGTCTCGAGAGTGGCGGTTAGGGCCAAAGAAGTGGT
GGAAGCAGCAGGAGGATCGGTGAGGAGAGTGTATTACAACAAATTGGGCTTGAGGGCGTT
GCTTAAACCGGAATGGTTTGAGAAGAAAGGAAGGCTATTGCCAAAAGCAGCGAGACCACC
TCCTAAACAGCAAGATAGGGTGGATAGCATCGGGCGTCTTCCCGCTCCGAAGAAACCAAT
CCCGTTTTTTTCAGCTGAGGAAAACAAAGTTGAGTCTCCTGTTGAATCGTGATGTTTGAG
TTAGGTTTTTAACGTTTGATGTTTTGGGTTTAAGTTGTTTGTGTTGTTTCTTGTTCATGT
TCTTACAAGAAAAAAATTGAAAATGGCAGATTTTTATTGGACAAAATAAGGCCATTCTCG
TTT

QA 1 483 1 483
DS 



AS 1 2

CO CL4722Contig1 1202 2 2 U
GTCTTCTTTGATCATCATTTATGGTTCATTGTGGCCATACCTTTGCGTCCTCCCCTTCGC
CCGAGACAGCGAAACTCTTCTTTGACCATCGTACATTCCCCTCCTTGTCTATGGCAGCGA
TAGCAGCCTTCAGGCAGGTCTATATGAAGAGAGAAAGTAGCATTAAGAATAGACTGGTTC
ATGTGACTTGGATTCACCCAGCTCTCTGGTGTCTTGATGGCTGAACACCCTGAATTATCT
TGCAACTCGGAGTAATACAAGCTGCTTCCTCCTCCTTTGCAATTCGCAAAAGTGAAACCA
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AGAGAGAAGTTTGACACGTCACTGCAGGATCCTGTTTCCAAGCTTCTGTTAAGCCTTGGG
TCGGTGACGGTTATGGTGCTGGCTTGGGAGACGCTTGTCACTTTGTACCATTCCCCTTTT
TCCTCAAGCTGTATCTCTGTGATCTGGTAATCAGTGCACTGCAGCTTGAACAGACCGCAT
CGAGACGGCATGGATGTGTTGTAGAAAGGGAAGCTGAAGTCGAGGCTTCCACATGAGAAT
GTTTCAGCACAGCCTGTCCGGTTCTTGCTCTGGGCTTCTGCCATGAGAAAGATTAGGAAG
AAGAAGACCAACACGGAGATAGTCTTCATTGATGGTGTGATTACAGACTTGTGATTCTTG
ATAATCTAGATCTACAAAAATATCAAGACTTTTTATTATGTGGAAGACATTCTTATGGAA
CTATGGCTTACGTCATCAAGGCATATATACTTGGGGTATAGTAAAGCTTATGTTAGCTAG
AATCACACTTGTACGTGTAAAGACTGGAACCAAAGTTGATCCTTTTTTATTATAGATGAT
TTTTAAGACTTTAAGTTAATTATAGATGATGTGACAAAAAAAAGTTAATTATAGATGATA
AATTTTCAAATTCACTGACTATGAATCTAGGTAGTTCAAATGAACGTAGATTCCATAATA
TGTGCAAATATTTTAAATTCAGAGACTAATCTATATACTGACTTGCATACCATTGGAATA
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TACTCGGTTATGATTGATCGGAAGTCAATTTGTGATACTAAATGTGGAGAGAGGGTCTTT
TC


BQ
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10 10 

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TCGGTGACGGTTATGGTGCTGGCTTGGGAGACGCTTGTCACTTTGTACCATTCCCCTTTT
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CGAGACGGCATGGATGTGTTGTAGAAAGGGAAGCTGAAGTCGAGGCTTCCACATGAGAAT
GTTTCAGCACAGCCTGTCCGGTTCTTGCTCTGGGCTTCTGCCATGAGAAAGA

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DS 

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GCATCGAGACGGCATGGATGTGTTGTAGAAAGGGAAGCTGAAGTCGAGGCTTCCACATGA
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CTTGATAATCTAGATCTACAAAAATATCAAGACTTTTTATTATGTGGAAGACATTCTTAT
GGAACTATGGCTTACGTCATCAAGGCATATATACTTGGGGTATAGTAAAGCTTATGTTAG
CTAGAATCACACTTGTACGTGTAAAGACTGGAACCAAAGTTGATCCTTTTTTATTATAGA
TGATTTTTAAGACTTTAAGTTAATTATAGATGATGTGACAAAAAAAAGTTAATTATAGAT
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AATATGTGCAAATATTTTAAATTCAGAGACTAATCTATATACTGACTTGCATACCATTGG
AATAAAAGGAGTGATAAATAGAAGAAATTGTAAATGCAATAGTATGTGATTTTGACGCAC
CCACTACTCGGTTATGATTGATCGGAAGTCAATTTGTGATACTAAATGTGGAGAGAGGGT
CTTTTC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL4723Contig1 1261 2 4 U
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GCCCTGTGTCTGACCGAGGTTTTCTAGAAATTTTAAGCTGCATGTTTGGACGTCGCTATC
TTATTCACCGGAGAACCCTTAATTTCTGTTTTTCCTCACCCCACATACAAATACAATTTA
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ATTTTTTGTTCATCGGATTCGTGGAAAGAGATTGTTTATTTTGGTGGTACTGCTCATCAA
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TACATCATATAATCTATTTTTTCTAGTTCCATATAGGATCATGTTTCGAATTTTCGAACC
GATCATCACCATTTGTAGATTAAAAAAAATACTTATATATCAATCCTATAGGAAACCTTA
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TAAAAAAAATTAACACAAAATGATCGAAACAAAAAACTACAAGTCCAAATTTTTCCAAAA
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TTCATATTGCTAAACTTATGTGGATATATGATATATACGAAAATAAACCTGGATCTTGCT
TTGAAGAGCTTTCACATACTCCACAGCTTCTTCTAACATGTCTGCAGTGTTGGTTTGCTG
C


BQ
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10 

AF RS1EW88TF U 1
AF RS1EW88JQ C 549
BS 1 713 RS1EW88TF
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RD RS1EW88TF 728 0 0
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TTATTCACCGGAGAACCCTTAATTTCTGTTTTTCCTCACCCCACATACAAATACAATTTA
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TTAATGAGAAATAATACAGAGAAAATTTAGATCTTTTATGGTAATCAGAATAAATGTTGA
ATTTTTTGTTCATCGGATTCGTGGAAAGAGATTGTTTATTTTGGTGGTACTGCTCATCAA
TTTCTGGCACTGTTCATTGATTTAGGGTACTACTACTCTTTGTGGCATTACTGTTCATTG
GTGGACACAGAGATTTTTGATAAGATTAGATTCACAGAAAGCAGTCTTAGGGT*AGTAAA
GAGGATGA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1EW88JQ 713 0 0
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ACTGTTCATTGATTTAGGGTACTACTACTCTTTGTGGCATTACTGTTCATTGGTGGACAC
AGAGATTTTTGATAAGATTAGATTCACAGAAAGCAGTCTTAGGGTTAGTAAAGAGGATGA
TAAGAACACCAAACCAATTTTACTTCCCCCACTTATATGAAGGACATGCGTACATATTCA
TTTTTTTTGAACTTTTCTCCTTATTGTACAAAACTTTTACAGCTTAGATTCATACATCAT
ATAATCTATTTTTTCTAGTTCCATATAGGATCATGTTTCGAATTTTCGAACCGATCATCA
CCATTTGTAGATTAAAAAAAATACTTATATATCAATCCTATAGGAAACCTTATTGTTCTT
CCTTAGGTTTGCAAATGCACCTCCTCTGCTGCTCTGTCAACTCCTGAATCCATAAAAAAA
ATTAACACAAAATGATCGAAACAAAAAACTACAAGTCCAAATTTTTCCAAAAAATTGCTA
CTACTAATCATTGTTCTCTCCGGTAGCTTTTTCTTGAAACATTTCCCTCGTTTTCATATT
GCTAAACTTATGTGGATATATGATATATACGAAAATAAACCTGGATCTTGCTTTGAAGAG
CTTTCACATACTCCACAGCTTCTTCTAACATGTCTGCAGTGTTGGTTTGCTGC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

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GCTCTCCTCGACGGAGACGGACATCAACCTCGGCGGCTCTCCTCCAATCGAAAGGAATCC
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CTTGTGTCACAGATCACTGCAAGCGTGTGAAGGAGTGGAGTGAAAGAGTTGAAGTCTTGT
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TTGTAATGTTGGAGTCTTGTGTCGCACGGTCTTGTAATCCTGTAGTCTTGTAATGTTAAG
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BQ
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AF RS1H552TF U 1
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GCTCTCCTCGACGGAGACGGACATCAACCTCGGCGGCTCTCCTCCAATCGAAAGGAATCC
TATGGATCACAATGCTCTTGATTTGTGCTCTGTGCCTGAAGCTTCAATGATGAAGACAAT
AAACCAAGTTCATCGAACAATGCAATACAGGTGTAAGCGTGAAGGAGTGGAGTGAAAGAG
TTGAAGTCTTGTGTCACAGATCACTGCAAGCGTGAAGGAGTGGAGTGAAAGAGTTGAAGT
CTTGTGTCACAGATCACTGCAAGCGTGTGAAGGAGTGGAGTGAAAGAGTTGAAGTCTTGT
GGTCTTGTCGTGGAGCAGAGCCTTGTAGTCTTGTGGTCTTGTGGTCTGAGTCTTGTAGTC
TTGTAATGTTGGAGTCTTGTGTCGCACGGTCTTGTAATCCTGTAGTCTTGTAATGTTAAG
AATCCTAAATTAAGATACTAGCATTGGAGCATTAAAAAGATGGTGTCTTTT

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DS 

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GGAGTGAAAGAGTTGAAGTCTTGTGTCACAGATCACTGCAAGCGTGAAGGAGTGGAGTGA
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TGTAATGTTAAGAATCCTAAATTAAGATACTAGCATTGGAGCATTAAAAAGATGGTGTCT
TTT

QA 1 483 1 483
DS 



AS 1 2

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AATCACCTTTTCAGATCCT


BQ
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AF RS1GK14TF U 1
AF RS1GK14JQ C 14
BS 1 499 RS1GK14TF

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TATTTCGCTAGCTGGCTGGGGCACGCTTTTCTACAGTGGATACAAGCTCTTCACCGGTGG
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AATCACCTTTTCAGATCCT

QA 1 499 1 499
DS 

RD RS1GK14JQ 486 0 0
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GATCCT

QA 1 486 1 486
DS 



AS 1 2

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TATGCTAAATTCCACAGTTAGGCGCAGGACCCATCTCGTTCAATCTTTCTCTGTTGTCTT
CCTTTACTGGCTTTACTACGTCTCATAGTTTCTGAAACTCTCCAACTTTAATCTTCCATA
TATACTTTATACTCGTATAACTATATCCAAACCTAGTTTTCTAAAATATATATATTTTCT
TTTGTTTCTTCATCGTATATCTATCATCGATATTGTTCCTGTTCAGTCTTGAAATTTACC
CTAAAAAAACATTTTTAAAAATATTAGTATCTCTCTTCTCTTTGGAGGCTTGTTTGTTTG
TTTACTGCATGGAATCGTCGTCGGTAACAACTTCGTCGGCGATTCAAACCTCTTCCGGGT
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CGAGGAGATCAAGGATGAAGAAACAGAAGCTCCTGGACGATCTAACGGCTCAGGTAAACC
AGCTCAAGAAAGAGAACAGCGAGATCGTGACAAGTGTCAGCATCACCACGCAGCACTACT
TGGCTGTTGAAGCAGAGAACTCTGTTCTCAGAGCTCAGCTCGATGAACTCAGCCACCGGC
TCCAATCTCTCAACGACATCATCGGTTTCCTCGACAACACCAACGGGGTTTGTCCGAACC
CTCTGACCGGTCCAGAGTCTGATGACTTCCTCGTGAATCAGATGAATATGAACATGTTTC
ATATGATGAACCAGCCTCTCATGGCATCTTCTGATGCTTTGCTGTATTAGAAATGTGGAC
CCAAAAAAACCTCGAAATTATCTAATGGGGCCGTTTCTTTGTCAGATTTTAAGTTATGTC
CAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATG


BQ
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AF RS1BW57TF U 1
AF RS1C768TF U 248
BS 1 468 RS1BW57TF
BS 469 469 RS1C768TF
BS 470 676 RS1BW57TF
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RD RS1BW57TF 757 0 0
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TTCTTTGTCTTTGAGACACATGTCTCCGATTATACTCAGTGAGATCTTCCTCTCTGGGTT
TATGCTAAATTCCACAGTTAGGCGCAGGACCCATCTCGTTCAATCTTTCTCTGTTGTCTT
CCTTTACTGGCTTTACTACGTCTCATAGTTTCTGAAACTCTCCAACTTTAATCTTCCATA
TATACTTTATACTCGTATAACTATATCCAAACCTAGTTTTCTAAAATATATATATTTTCT
TTTGTTTCTTCATCGTATATCTATCATCGATATTGTTCCTGTTCAGTCTTGAAATTTACC
CTAAAAAAACATTTTTAAAAATATTAGTATCTCTCTTCTCTTTGGAGGCTTGTTTGTTTG
TTTACTGCATGGAATCGTCGTCGGTAACAACTTCGTCGGCGATTCAAATCTCTTCCGGGT
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TC*AATCTCTCAACGACATCATCGGTTTC
TCGACACA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RS1C768TF 767 0 0
G
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TTCATCGTATATCTATCATCGATATTGTTCCTGTTCAGTCTTGAAATTTACCCTAAAAAA
ACATTTTTAAAAATATTAGTATCTCTCTTCTCTTTGGAGGCTTGTTTGTTTGTTTACTGC
ATGGAATCGTCGTCGGTAACAACTTCGTCGGCGATTCAAACCTCTTCCGGGTCAGAGGAG
AATCTCATGGAGCAGAGGAAACGTAAGAGGATGCTCTCAAACCGTGAGTCAGCGAGGAGA
TCAAGGATGAAGAAACAGAAGCTCCTGGACGATCTAACGGCTCAGGTAAACCAGCTCAAG
AAAGAGAACAGCGAGATCGTGACAAGTGTCAGCATCACCACGCAGCACTACTTGGCTGTT
GAAGCAGAGAACTCTGTTCTCAGAGCTCAGCTCGATGAACTCAGCCACCGGCTCCAATCT
CTCAACGACATCATCGGTTTCCTCGACAACACCAACGGGGTTTGTCCGAACCCTCTGACC
GGTCCAGAGTCTGATGACTTCCTCGTGAATCAGATGAATATGAACATGTTTCATATGATG
AACCAGCCTCTCATGGCATCTTCTGATGCTTTGCTGTATTAGAAATGTGGACCCAAAAAA
ACCTCGAAATTATCTAATGGGGCCGTTTCTTTGTCAGATTTTAAGTTATGTCCAGAGAGA
GAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATG

QA 2 767 2 767
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1AZ32TF U 1
AF RS1AZ32JQ C 1
BS 1 33 RS1AZ32TF
BS 34 34 RS1AZ32JQ
BS 35 487 RS1AZ32TF
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RD RS1AZ32TF 487 0 0
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CACCTCT

QA 1 487 1 487
DS 

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GAGGGAGATCTGATGGAAGAGTTCAAGAGCTTTTTGATTACGATCCAAGTTACCCCTAAG
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ATGATGTGATTATAATATTTATAATAAAAGCGAGTATCATACTTTTTTTTG

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

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GCTTGTGGGCTATCTTTTCCGGGGACTGTCTCGTTGTCCGCTGGACTTTGTATTTCCGGG
ATGGTATTCACCGGACAAAACTGTAGTTCCGATCTAATATAATCTTATTTTCAGTGTGAA
AAGAAAAACTACACTAAATTAAACTCAAATCTAAAAGAAAAACAATGTTTTTTATTGAAT
ACTATTTCGAATTCTTTTACTATGTGTGCTATTTTGTAATAAAAATGTATGTATAAGGTA
TATCTCTTTGTTCTGTATCCAAGTCTTTATTATATTGATAAAAAAGTCTTTATTATGTAT
GCCTAATTTTTTATTAGTCTCGATTAGCGAGCACTAGCCCTTTACCTAAGACATGTTAAG
CAGCATGCTTTATGCCTATTAAGCCACTAACCTGAGTAGCTTGAGGTAGATTCTCTGGCT
AGTTTAGAAGATAAAATAAGAAATGAAAAAGTCCGAGTATCTTAACCGCCCTTCCATAGT
TATTTTCTTGTTTTTTCACAACATGCGCCGCACGTTGTCTCTCCAGCCCTACAAAAACTG
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AAGAACAGAGACAAGGGAAAGCGAAACGACTAGTTCTTGATCTGTACTCCTCTTTTGCTT
TCTTCTCTTCCATTTTGTGGTT


BQ
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AF RS1G022TF U 1
AF RS1G022JQ C 291
BS 1 749 RS1G022TF
BS 750 750 RS1G022JQ
BS 751 774 RS1G022TF
BS 775 775 RS1G022JQ
BS 776 785 RS1G022TF
BS 786 1042 RS1G022JQ

RD RS1G022TF 791 0 0
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TGAAGCAGTGTTCTCTACTTGCATGTGCTATTCACTATAGGAGGATTCGCAAATCGAAGA
ATTGGCCATGATTGCTCTAATCGATTTGTCTTTGTTCAAAGAAGGCTCCCTGCTGTTTAT
GTCTCTTGCATGTTTGTTTCTTGAGATTCTGGAATTAAATTTGATCTGTTTTTAAGGTTT
AGTCTAGTTTTGAATGTTTATTTCATATGTATGTTTGTTTCTTATTTCATGTTATCTCCC
GCTTGTGGGCTATCTTTTCCGGGGACTGTCTCGTTGTCCGCTGGACTTTGTATTTCCGGG
ATGGTATTCACCGGACAAAACTGTAGTTCCGATCTAATATAATCTTATTTTCAGTGTGAA
AAGAAAAACTACACTAAATTAAACTCAAATCTAAAAGAAAAACAATGTTTTTTATTGAAT
ACTATTTCGAATTCTTTTACTATGTGTGCTATTTTGTAATAAAAATGTATGTATAAGGTA
TATCTCTTTGTTCTGTATCCAAGTCTTTATTATATTGATAAAAAAGTCTTTATTATGTAT
GCCTAATTTTTTATTAGTCTCGATTAGCGAGCACTAGCCCTTTACCTAAGACATGTTAAG
CAGCATGCTTTATGCCTATTAAGCCACTAACCTGAGTAGCTTGAGGTAGATTCTCTGGCT
AGTTTAGAAGATAAAATAAGAAATGAAAA*GTCCGAGTATCTTAACCGCCCTTC*ATAGT
TATTT
CTGTTT

QA 1 785 1 785
DS 

RD RS1G022JQ 752 0 0
GTTATCTCCCGCTTGTGGGCTATCTTTTCCGGGGACTGTCTCGTTGTCCGCTGGACTTTG
TATTTCCGGGATGGTATTCACCGGACAAAACTGTAGTTCCGATCTAATATAATCTTATTT
TCAGTGTGAAAAGAAAAACTACACTAAATTAAACTCAAATCTAAAAGAAAAACAATGTTT
TTTATTGAATACTATTTCGAATTCTTTTACTATGTGTGCTATTTTGTAATAAAAATGTAT
GTATAAGGTATATCTCTTTGTTCTGTATCCAAGTCTTTATTATATTGATAAAAAAGTCTT
TATTATGTATGCCTAATTTTTTATTAGTCTCGATTAGCGAGCACTAGCCCTTTACCTAAG
ACATGTTAAGCAGCATGCTTTATGCCTATTAAGCCACTAACCTGAGTAGCTTGAGGTAGA
TTCTCTGGCTAGTTTAGAAGATAAAATAAGAAATGAAAAAGTCCGAGTATTTTAACCGCC
CTTCCATAGTTATTTTCTTGTTTTTTCACAACATGCGCCGCACGTTGTCTCTCCAGCCCT
ACAAAAACTGCATCAACGTTTCTTTGTTTCATTCATTTGCACCAACTCAAAAAACATAAA
AACAAATGTTTAAATAGCTGGAAAAATACATGTAGAACACAAAGTATTTTTTGCTTCTTT
TGTTATGTTAAAGAACAGAGACAAGGGAAAGCGAAACGACTAGTTCTTGATCTGTACTCC
TCTTTTGCTTTCTTCTCTTCCATTTTGTGGTT

QA 1 752 1 752
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGGTTAAGCAAAGAATTTGAAGCTGCACGGGCATCCCAAAGTCAGGAACTATGCTTAGAT
GGGGAAGAGTGGAATGATGGCTTGTTGGCTACACTAAGGGAACGGGTGCATATGGAGGCT
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GCTTACAGAGTGGGAAATAAGGTGATCTATTGCTTAGAGGGAGCAAGAATTGGAATACAG
TATGAAACATCTTTCGCAGGAGAAACTTACGAGATCTACCACTGTGTACTTGAGAGCAAG
TCGTTCTTGGAGAAGATGAATGTACTGGAGCACACAATTCCGTTCTTTTTGCCACTACGT
GACTTGGAAAATGATCATCTTTCTTCGAATGCTAAGAAATTCATCGACAGTGTTGGGGAT
CTCCTGCACGCATATGTGGACGGGAGGGAACAGGTCCGGCTTATCAAAGAGCTCTATGGA
AATCAGATCAGGGAGCTTTATCACAGTCTTCCTTACCACATGGTTGAATTTGCGATAGAT
GATTGTGACTGCAAAGTGGTGGTGAGCCTGAGATATGGGAATCTTATGTGTGAACTTCCG
ACAAAAGTGAGAGTTCTAGCATGGCCAATGCACCAGCTGAAGAGACAATGTACAAGCCCT
AGGTTAAGTAAACTTGCCAGTCAAGCAATCCCTGTGCGTTTATCTTTTGCCGAGGATGCC
TTACGGATCCAGTCACTACCTGAAGCATACGCAGAGATTATAGTAAACATGCCACAAGAA
ATTGAGCAAATATTTCTGTAGAAGAGTTGGGAGCTAAGACTCTGAAGCTTTCTCCAAGTC
TTATACTCTTATATATATCTCGCTACTTTCTTGTATGCTATTTGATGTTGATCCTTCATC
TAACAATGTTAAAATTGTGCCACATAATGAATTTTGTTTAGCTTTTCGTCC


BQ
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AF RS1G569TF U 1
AF RS1G569JQ C 464
BS 1 640 RS1G569TF
BS 641 951 RS1G569JQ

RD RS1G569TF 642 0 0
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GGGGAAGAGTGGAATGATGGCTTGTTGGCTACACTAAGGGAACGGGTGCATATGGAGGCT
GACAGAAAGGACAGCGGTAATGCAGGTCTTGCACCAGTTTCTCACCCTGAAGAACGAGTT
GCTTACAGAGTGGGAAATAAGGTGATCTATTGCTTAGAGGGAGCAAGAATTGGAATACAG
TATGAAACATCTTTCGCAGGAGAAACTTACGAGATCTACCACTGTGTACTTGAGAGCAAG
TCGTTCTTGGAGAAGATGAATGTACTGGAGCACACAATTCCGTTCTTTTTGCCACTACGT
GACTTGGAAAATGATCATCTTTCTTCGAATGCTAAGAAATTCATCGACAGTGTTGGGGAT
CTCCTGCACGCATATGTGGACGGGAGGGAACAGGTCCGGCTTATCAAAGAGCTCTATGGA
AATCAGATCAGGGAGCTTTATCACAGTCTTCCTTACCACATGGTTGAATTTGCGATAGAT
GATTGTGACTGCAAAGTGGTGGTGAGCCTGAGATATGGGAATCTTATGTGTGAACTTCCG
ACAAAAGTGAGAGTTCTAGCATGGCCAATGCACCAGCTGA
GA

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1G569JQ 488 0 0
TCAAAGAGCTCTATGGAAATCAGATCAGGGAGCTTTATCACAGTCTTCCTTACCACATGG
TTGAATTTGCGATAGATGATTGTGACTGCAAAGTGGTGGTGAGCCTGAGATATGGGAATC
TTATGTGTGAACTTCCGACAAAAGTGAGAGTTCTAGCATGGCCAATGCACCAGCTGAAGA
GACAATGTACAAGCCCTAGGTTAAGTAAACTTGCCAGTCAAGCAATCCCTGTGCGTTTAT
CTTTTGCCGAGGATGCCTTACGGATCCAGTCACTACCTGAAGCATACGCAGAGATTATAG
TAAACATGCCACAAGAAATTGAGCAAATATTTCTGTAGAAGAGTTGGGAGCTAAGACTCT
GAAGCTTTCTCCAAGTCTTATACTCTTATATATATCTCGCTACTTTCTTGTATGCTATTT
GATGTTGATCCTTCATCTAACAATGTTAAAATTGTGCCACATAATGAATTTTGTTTAGCT
TTTCGTCC

QA 1 488 1 488
DS 



AS 1 2

CO CL4731Contig1 883 2 6 U
TAAAAGCTAACATAACTGAGAACTTCACCCGTCAGAGTAAGTTTACATATGGGCTTGTGA
TGGAGGAGATAACAACTCGAGATGAAAGCAGTCACATCTCTGCAAATGGTCAGAGACTAC
TACCTAGTGGAGGAATCATTGCTGATGGACCTCCAACAACTCTCAGTGGTACCGGTATTG
ACCGGATGGCCTTTCTACAAGCCAACATCACCCGTGATAATACCAAGTTTGTCAACGGGG
CTGTTGTTGGAGAGAGGAACGTGTTTCAGGTGGATCAAGACTTGGGTATTGGAAGCACAT
TCCCTTTCTTCAACCACCACCAATTGACTCTAACAAGATTCATTCAGCTGCAGCAAGTGG
AAGAAGGCGCTGGGAAGCCACCTCCACCGGTTCTAGTCCTCCATGGACATTACGGTGGCT
GCGTTGGCGACCTTCCTAGCTACGACGCTTTCGTCCTGGGTGGTCCATACTCTGTCCGTG
GCTACAACATGGGTGAGCTCGGTGCAGCCAGGAACATTCTCGAGCTGGGTGCTGAGATTA
GAGTACCTGTGAAGAACACGCATGTGTATGCATTTGCTGAGCATGGGAACGATCTGGGAA
GCTCCAAGGATGTGAAGGGGAACCCAACAGCAGTCTATAGGAGAGTGGGGCAAGGTTCTT
CATACGGTGTAGGTGAAGCTTGGTTTGGTAAGAGCCGAGTATGCTGTAGATCACAACAAC
GGAACTGGAGCTCTATTCTTCCGGTTTGGTGAGAGGTATTAATGTAATGAGAGAGGTAAC
CTTCGGCTTGACATTATTTTCTTCAAGGGTTTGTTCAAGGCCCTCTGTATTTTTTTTTCT
TCCTTTTTTCTTTCCTTTTATGGATTTTAAAATCTTTTTTAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AG44TF U 1
AF RS1AG44JQ C 128
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TACCTAGTGGAGGAATCATTGCTGATGGACCTCCAACAACTCTCAGTGGTACCGGTATTG
ACCGGATGGCCTTTCTACAAGCCAACATCACCCGTGATAATACCAAGTTTGTCAACGGGG
CTGTTGTTGGAGAGAGGAACGTGTTTCAGGTGGATCAAGACTTGGGTATTGGAAGCACAT
TCCCTTTCTTCAACCACCACCAATTGACTCTAACAAGATTCATTCAGCTGCAGCAAGTGG
AAGAAGGCGCTGGGAAGCCACCTCCACCGGTTCTAGTCCTCCATGGACATTACGGTGGCT
GCGTTGGCGACCTTCCTAGCTACGACGCTTTCGTCCTGGGTGGTCCATACTCTGTCCGTG
GCTACAACATGGGTGAGCTCGGTGCAGCCAGGAACATTCTCGAGCTGGGTGCTGAGATTA
GAGTACCTGTGA**GACACGCATGTGTATGCATTTGCTGAGCATGGGAACGATCTGG*AA
GCTCCAAGGATGTGAA

QA 1 616 1 616
DS 

RD RS1AG44JQ 756 0 0
TGGAGGAATCATTGCTGATGGAC*TCCAACAACTCTCAGTGGTACCGGTATTGACCGGAT
GGCCTTTCTACAAGCCAACATCACCCGTGATAATACCAAGTTTGTCAACGGGGCTGTTGT
TGGAGAGAGGAACGTGTTTCAGGTGGATCAAGACTTGGGTATTGGAAGCACATTCCCTTT
CTTCAACCACCACCAATTGACTCTAACAAGATTCATTCAGCTGCAGCAAGTGGAAGAAGG
CGCTGGGAAGCCACCTCCACCGGTTCTAGTCCTCCATGGACATTACGGTGGCTGCGTTGG
CGACCTTCCTAGCTACGACGCTTTCGTCCTGGGTGGTCCATACTCTGTCCGTGGCTACAA
CATGGGTGAGCTCGGTGCAGCCAGGAACATTCTCGAGCTGGGTGCTGAGATTAGAGTACC
TGTGAAGAACACGCATGTGTATGCATTTGCTGAGCATGGGAACGATCTGGGAAGCTCCAA
GGATGTGAAGGGGAACCCAACAGCAGTCTATAGGAGAGTGGGGCAAGGTTCTTCATACGG
TGTAGGTGAAGCTTGGTTTGGTAAGAGCCGAGTATGCTGTAGATCACAACAACGGAACTG
GAGCTCTATTCTTCCGGTTTGGTGAGAGGTATTAATGTAATGAGAGAGGTAACCTTCGGC
TTGACATTATTTTCTTCAAGGGTTTGTTCAAGGCCCTCTGTATTTTTTTTTCTTCCTTTT
TTCTTTCCTTTTATGGATTTTAAAATCTTTTTTAAT

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

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GTGTATGCAATAGTAAATTTATAGTATAATATGAATACATTTCGTCATCATAAGACATAA
AGACCGGATCATTACTAGTCATTACCCAAAGAAATAGGTTTTGTCTGATAACAATACACA
AGTAACATCAATCTTATTATTACCAAATGGGTTTCTTATGTCTCCAGTAATTTTCTTTCT
TTATTCGCCACATCTTAAAAACTAACAGTGAGCCAAATCAGAGCTTCGACGTCACGGAGG
GATTAGGAGGTCTTGCCTCTCTTAACAAGGCCTCTTGCGTTAACGATACAACCAGCTCTC
CTTTTCTGTTGAACATTTCACCAGTGACAAAACCCCTGGTCACGTGCGCAGTTGGACTAA
CAATCACAAAAAGCAACCAGTCATCAGCTCTAAGAGGTCGGTGAAACCACATCGCATGGT
CCAGGCTAAGTGCAGCAGATCTCAGGCCCTTTCTTCGGTGAGGGTTCAAACTGATGCTTG
CAAATATCAAATCCGAAGCAAATGCCACAACACATCGATGCAAAGCTTGGTCATCAGAAA
GCTTTCCCTTTGCTCTAAGCCAATACCTCAATCTTGGTGGAGACTTTGTCTGGTTTGTAG
AATTACTGGGCTCACAAAACCGAATCTCTC


BQ
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AF RS1DM23JQ U 7
AF RS1DM23TF C 1
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RD RS1DM23JQ 485 0 0
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GATCATTACTAGTCATTACCCAAAGAAATAGGTTTTGTCTGATAACAATACACAAGTAAC
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GCCACATCTTAAAAACTAACAGTGAGCCAAATCAGAGCTTCGACGTCACGGAGGGATTAG
GAGGTCTTGCCTCTCTTAACAAGGCCTCTTGCGTTAACGATACAACCAGCTCTCCTTTTC
TGTTGAACATTTCACCAGTGACAAAACCCCTGGTCACGTGCGCAGTTGGACTAACAATCA
CAAAAAGCAACCAGTCATCAGCTCTAAGAGGTCGGTGAAACCACATCGCATGGTCCAGGC
TAAGTGCAGCAGATCTCAGGCCCTTTCTTCGGTGAGGGTTCAAACTGATGCTTGCAAATA
TCAAA

QA 1 485 1 485
DS 

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AGTAACATCAATCTTATTATTACCAAATGGGTTTCTTATGTCTCCAGTAATTTTCTTTCT
TTATTCGCCACATCTTAAAAACTAACAGTGAGCCAAATCAGAGCTTCGACGTCACGGAGG
GATTAGGAGGTCTTGCCTCTCTTAACAAGGCCTCTTGCGTTAACGATACAACCAGCTCTC
CTTTTCTGTTGAACATTTCACCAGTGACAAAACCCCTGGTCACGTGCGCAGTTGGACTAA
CAATCACAAAAAGCAACCAGTCATCAGCTCTAAGAGGTCGGTGAAACCACATCGCATGGT
CCAGGCTAAGTGCAGCAGATCTCAGGCCCTTTCTTCGGTGAGGGTTCAAACTGATGCTTG
CAAATATCAAATCCGAAGCAAATGCCACAACACATCGATGCAAAGCTTGGTCATCAGAAA
GCTTTCCCTTTGCTCTAAGCCAATACCTCAATCTTGGTGGAGACTTTGTCTGGTTTGTAG
AATTACTGGGCTCACAAAACCGAATCTCTC

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 2

CO CL4733Contig1 862 2 2 U
TTTTTAATATCCCAGATTAAATAGATTCATGAATTGTTAACTCCCCACCAAAATAAATCT
GATACAGATGCAGAAGAAAAAATTGGAAGAAAGGTAACATTGGAATAACAAAAACATCTA
ATCTACCATTATGGTTAGGCAGATAAAAGCCTGGACAGTGGACATTGAGAAAGAAAAAAA
AACGATTATATAGAAAAACAAATGAAGAAAAATCAAAACTAGTTGCTTCTTTATATTCCA
ATGCTCAACGAAGCAGACCGCAATGCCAAAGAAGAAGATTTTGAGCTCAATGTGATCATT
GAACATGTGATCTAGCGGCACTATTAATTAAGCATGTATTGTTGTGACATGGAATGAAGG
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ATCCAATCAACATAACCAGTCGAACCGCCCATCTGGTCCTCGATGAGGTTTCTAAGGAGA
AGGAAGCCTTCTCGGGGTTGTTCTCCTTGCCTCACTAGCAAACACATGGGACGATATGAT
GGATCATTCTCCCTCACTTTCTTTATCAACCTCATTAGCTTCTTCGACATCCCATTCTCT
TGTTCTTCCAGTGTAACCCTTGAGAGCTCTGCTGCAAAGTCATCCCCAAGAAGATTTTTA
GCAATGTCAGGTGAAAGCATCCGGCCAGACCACAAAACCAATCGAAGACCATCGTCATAA
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TTTAGGTCATCATGGTCTACTGATGGCTTTAAGAGCCACTCGTCAACACGGTATAAACTG
GGATATACAGCTTCATAGCTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G275TF C 1
AF RS1AS89JQ U 70
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BS 70 862 RS1AS89JQ

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GGATCATTCTCCCTC

QA 1 555 1 555
DS 

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ATAGAAAAACAAATGAAGAAAAATCAAAACTAGTTGCTTCTTTATATTCCAATGCTCAAC
GAAGCAGACCGCAATGCCAAAGAAGAAGATTTTGAGCTCAATGTGATCATTGAACATGTG
ATCTAGCGGCACTATTAATTAAGCATGTATTGTTGTGACATGGAATGAAGGTTTCTTACC
AAATGTAAACTATATTAAGCATTTTGTTGGACTTGGCGGTGAAGTTGGAGCATCCAATCA
ACATAACCAGTCGAACCGCCCATCTGGTCCTCGATGAGGTTTCTAAGGAGAAGGAAGCCT
TCTCGGGGTTGTTCTCCTTGCCTCACTAGCAAACACATGGGACGATATGATGGATCATTC
TCCCTCACTTTCTTTATCAACCTCATTAGCTTCTTCGACATCCCATTCTCTTGTTCTTCC
AGTGTAACCCTTGAGAGCTCTGCTGCAAAGTCATCCCCAAGAAGATTTTTAGCAATGTCA
GGTGAAAGCATCCGGCCAGACCACAAAACCAATCGAAGACCATCGTCATAAATGTAAAGG
CCTCTAGAGTCCAAACTCTCTGCAGCTAGAGGCAATCTCCTTAATACGTCCTTTAGGTCA
TCATGGTCTACTGATGGCTTTAAGAGCCACTCGTCAACACGGTATAAACTGGGATATACA
GCTTCATAGCTTT

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

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TTTTGATACTTTGGTGCAAACCCTTTAAGCTCCGTTTCATCATTTTGCAGTGCTTGATCG
GTTTTGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ET65TF U 1
AF RS1ET65JQ C 120
BS 1 605 RS1ET65TF
BS 606 909 RS1ET65JQ

RD RS1ET65TF 605 0 0
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GAGAT

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DS 

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TGAGATTCGTGAGGAAGGTGGTGAAACGTTTGTCAGTCTCTTGGATTTGAAGCGCCCATT
TAAGGAGATGAAGGATCTTGATATGGAACAGGTCGTTGCAGACATCGTGGAGAAGCTTAA
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CCTCGGGATTATCAAATAGACTTCTTGAATATGATCAACTTGCAGGATTCTTTAGGATTT
GTTTTGATACTTTGGTGCAAACCCTTTAAGCTCCGTTTCATCATTTTGCAGTGCTTGATC
GGTTTTGTGC

QA 1 790 1 790
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DU73TF C 1
AF RS1DU73JQ U 43
BS 1 42 RS1DU73TF
BS 43 524 RS1DU73JQ

RD RS1DU73TF 524 0 0
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TACCGGGATTCAGACAAGAGTACAACTCAAGTCGAAGTTAACCCAAATTTGAAATATTTT
GCGAGATGTTTATAAAAGAACCGTAAAAGTCTACATTATTTCCCCAAGAGACAAACCAAA
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GCAGCTTGAGCAGCCTTCTTTGCTGCTTTCTCTTGCAATGCTTTTCCATCTCTTTCACGG
CGTTGCTCCGGCGTCAATCCGTCGTCAGCAGACTTTCCTTTTCCTCCAGCACGAGCCGCG
GCTCTTTCACGGTCACGCTCTCTCTGACTTCCACGAGTCATGGTGAATTGAGGATGAATC
CGCGTAAGAAGGAAGCGATCCGGTCAATGCAGAAGAAACGCAGCGAAGGGATTTGGATTT
TATAATGAGGGGATTCGATTCTATTCTCTTTTAAATCAAGTCCC

QA 1 524 1 524
DS 

RD RS1DU73JQ 482 0 0
TTTTCAACAGAGACAGCATACCGGGATTCAGACAAGAGTACAACTCAAGTCGAAGTTAAC
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CCCAAGAGACAAACCAAATGAGATCACTTCTTAGCAGTTCCCTTGCCTCCTGCTCCTCCA
CCAGAACCTGCAGCAGCTGCAGCTTGAGCAGCCTTCTTTGCTGCTTTCTCTTGCAATGCT
TTTCCATCTCTTTCACGGCGTTGCTCCGGCGTCAATCCGTCGTCAGCAGACTTTCCTTTT
CCTCCAGCACGAGCCGCGGCTCTTTCACGGTCACGCTCTCTCTGACTTCCACGAGTCATG
GTGAATTGAGGATGAATCCGCGTAAGAAGGAAGCGATCCGGTCAATGCAGAAGAAACGCA
GCGAAGGGATTTGGATTTTATAATGAGGGGATTCGATTCTATTCTCTTTTAAATCAAGTC
CC

QA 1 482 1 482
DS 



AS 1 2

CO CL4737Contig1 1059 2 4 U
GGGGGACCGCCAGGAACCGGAAAGACCACTACTGCACTTGCTATCGCACACCAACTATTT
GGCCCTGAATTGTACAAGTCTAGGGTGTTGGAGCTGAATGCTAGTGACGACAGAGGGATT
AATGTTGTTCGCACAAAGATCAAGGATTTTGCTGCTGTTGCTGTTGGCTCCAACTACCGT
CAAGGCGGTTACCCTTGCCCATCGTTTAAGATCATCATCCTAGATGAGGCTGATTCTATG
ACGGAAGATGCTCAGAACGCCTTGAGGCGCACAATGGAAACTTACTCCAAAGTCACCAGA
TTCTTTTTCATATGTAACTATATCAGCAGGATCATAGAGCCCCTAGCTTCAAGATGTGCA
AAGTTCAGGTTCAAACCACTTTCTGAAGAAGTCATGAGTAACCGTATATTGCATATATGT
AATGAAGAGGGTCTCAACCTTGGTGGAGAGGGTCTTTCAACTTTGAGCTCCATCTCACAA
GGTGATCTTCGTAGAGCCATCACGTATCTGCAGAGTGGCGCTCGATTGTTTGGATCAACA
ATAACTTCTAGAGATTTACTCGATGTGTCTGGGGTAGTTCCTCTGGAGGTAGTAGAGAGA
TTTTTTACAGCATGCAAAAGTGGTGATTTCGATATTGCAAACAAAGAAGTGGACAACATA
GTCGCAGAAAGATATCCTGCATCTCAAATCACCAATCAGTTATTTGATATAGTCGTTGAG
GCTGGTGATGACATAACAGACAATCAAAAGGCTAAGATCTGCAAATGTCTAGCTGAAACA
GATAAGCGACTTGTAGATGGTGCGGATGAGTATCTGCAGCTTCTGGACGTAGCAAGCAAT
ACAATTCGTGCACTCTCAGAAATGGCTCAAGACTTCTGAAGCAAATGACCGCCAAATTCA
AAGCTCTGCATCTTGATTTTCATTTCTGTTCTGCTAGTGTTGAGTTTGCAACGTATCTCT
ACCTTATGAATTGTCACAATGGCACTTGTCGAGCTATTATTATTAAATGTGACAAAAAGA
AATGGTTTTTATAATGTTTGATCATATGACCAAGTAGAG


BQ
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AF RS1BE52TF U 1
AF RS1BE52JQ C 203
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BS 693 693 RS1BE52JQ
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BS 717 1059 RS1BE52JQ

RD RS1BE52TF 716 0 0
GGGGGACCGCCAGGAACCGGAAAGACCACTACTGCACTTGCTATCGCACACCAACTATTT
GGCCCTGAATTGTACAAGTCTAGGGTGTTGGAGCTGAATGCTAGTGACGACAGAGGGATT
AATGTTGTTCGCACAAAGATCAAGGATTTTGCTGCTGTTGCTGTTGGCTCCAACTACCGT
CAAGGCGGTTACCCTTGCCCATCGTTTAAGATCATCATCCTAGATGAGGCTGATTCTATG
ACGGAAGATGCTCAGAACGCCTTGAGGCGCACAATGGAAACTTACTCCAAAGTCACCAGA
TTCTTTTTCATATGTAACTATATCAGCAGGATCATAGAGCCCCTAGCTTCAAGATGTGCA
AAGTTCAGGTTCAAACCACTTTCTGAAGAAGTCATGAGTAACCGTATATTGCATATATGT
AATGAAGAGGGTCTCAACCTTGGTGGAGAGGGTCTTTCAACTTTGAGCTCCATCTCACAA
GGTGATCTTCGTAGAGCCATCACGTATCTGCAGAGTGGCGCTCGATTGTTTGGATCAACA
ATAACTTCTAGAGATTTACTCGATGTGTCTGGGGTAGTTCCTCTGGAGGTAGTAGAGAGA
TTTTTTACAGCATGCAAAAGTGGTGATTTCGATATTGCAAACAAAGAAGTGGACAACATA
GTCGCAGAAAGATATCCTGCATCTCAAATCAC*AATCAGTTATTTGATATAGTCGT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RS1BE52JQ 857 0 0
ATCGTT
AGATCATCATC*TAGATGAGGCTGAT*CTATGACGGAAGATGCTCAGAACGCCTTGAGGC
GCACAATGGAAACTTACTCCAAAGTCACCAGATT*TTTTTCATATGTAACTATATCAGCA
GGATCATAGAGCCCCTAGCTTCAAGATGTGCAAAGTTCAGGTTCAAACCACTTTCTGAAG
AAGTCATGAGTAACCGTATATTGCATATATGTAATGAAGAGGGTCTCAACCTTGGTGGAG
AGGGTCTTTCAACTTTGAGCTCCATCTCACAAGGTGATCTTCGTAGAGCCATCACGTATC
TGCAGAGTGGCGCTCGATTGTTTGGATCAACAATAACTTCTAGAGATTTACTCGATGTGT
CTGGGGTAGTTCCTCTGGAGGTAGTAGAGAGATTTTTTACAGCATGCAAAAGTGGTGATT
TCGATATTGCAAACAAGGAAGTGGACAACATAGTCGCAGAAGGATATCCTGCATCTCAAA
TCACCAATCAGTTATTTGATATAGTCGTTGAGGCTGGTGATGACATAACAGACAATCAAA
AGGCTAAGATCTGCAAATGTCTAGCTGAAACAGATAAGCGACTTGTAGATGGTGCGGATG
AGTATCTGCAGCTTCTGGACGTAGCAAGCAATACAATTCGTGCACTCTCAGAAATGGCTC
AAGACTTCTGAAGCAAATGACCGCCAAATTCAAAGCTCTGCATCTTGATTTTCATTTCTG
TTCTGCTAGTGTTGAGTTTGCAACGTATCTCTACCTTATGAATTGTCACAATGGCACTTG
TCGAGCTATTATTATTAAATGTGACAAAAAGAAATGGTTTTTATAATGTTTGATCATATG
ACCAAGTAGAG

QA 7 857 7 857
DS 



AS 1 2

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ACTTCAAATCCAAGGTACTTAATTCAAATGGAGTAGTGTTGGTAGAGTTCTTTGCACCAT
GGTGTGGTCATTGCAAAGCTCTCACACCAACATGGGAGAAAGTGGCTACTGTTCTGAAAG
GTGTTGCTACTGTGGCAGCTCCTGATGCAGACGCTCACCAGTCTGCTGCTCAGGATTATG
GTATTCAAGGCTTCCCAACGATCAAGGTCTTTGTTCCTGGAAAGCCTCCTGTTGATTACC
AAGGAGCTAGAGATGCTAAATCCATTGCTAATTTTGCTTACAAGCAGATCAAAGCTCTTC
TGAGTGACCGTTTGGAAGTAAAAAGCAAGCCAACTGGAGGATCTAATGAAAAGAAATCTG
AGCCTAGTGCATCTGCGGAACTAAACTCTGCCAATTTTGATGAGTTGGTCATCAAAAGCA
ATGACCTCTGGATCGTTGAGTTCTTCGCACCTTGGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCCC
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BQ
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AF RS1A276TF U 352
AF RS1A276TV U 1
BS 1 585 RS1A276TV

RD RS1A276TF 176 0 0
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AGAAATCTGAGCCTAGTGCATCTGCGGAACTAAACTCTGCCAATTTTGATGAGTTGGTCA
TCAAAAGCAATGACCTCTGGATCGTTGAGTTCTTCGCACCTTGGTGTGGACACTGC

QA 1 176 1 176
DS 

RD RS1A276TV 585 0 0
TCAATCTCACCAACGCTCTTTACGGATCCTCGTCACCTGTGGTTCAGCTCACTGCTTCTA
ACTTCAAATCCAAGGTACTTAATTCAAATGGAGTAGTGTTGGTAGAGTTCTTTGCACCAT
GGTGTGGTCATTGCAAAGCTCTCACACCAACATGGGAGAAAGTGGCTACTGTTCTGAAAG
GTGTTGCTACTGTGGCAGCTCCTGATGCAGACGCTCACCAGTCTGCTGCTCAGGATTATG
GTATTCAAGGCTTCCCAACGATCAAGGTCTTTGTTCCTGGAAAGCCTCCTGTTGATTACC
AAGGAGCTAGAGATGCTAAATCCATTGCTAATTTTGCTTACAAGCAGATCAAAGCTCTTC
TGAGTGACCGTTTGGAAGTAAAAAGCAAGCCAACTGGAGGATCTAATGAAAAGAAATCTG
AGCCTAGTGCATCTGCGGAACTAAACTCTGCCAATTTTGATGAGTTGGTCATCAAAAGCA
ATGACCTCTGGATCGTTGAGTTCTTCGCACCTTGGTGTGGACACTGCAAAAAGCTTGCCC
CAGAGCGGAAAAGGGCTGCAAAGAACTTGAAGGGGAAAGTGAAAT

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 2

CO CL4739Contig1 482 2 1 U
GGAAACATAGCTTAAGTAGGTCACCTCGTTGTCGCTGTCCTTGAGCAGAAGATCAGAGAG
AAGGGAACGAGAAACAGAGAGCAATCCGCGCTTTCTTACACGATGAAAGATGATTACGAG
GTTGATGAGAAGAAACAAGCTGCTGCTGATGTATTGTTTAGTTATTCCAAGTTTGCTATG
ACCTGCATCGGTAACCAGACTCGTCCTCCCGACATGAGGTTGCATCTCATGAAGGAGATC
TCGGGACTGCCAACGTCTCTGAAGAGAAGAGAAGCTTCAAGAGCTGCAACCTCTCCTGAT
CCACTCGGCGAATCCTCCAGCTCTGGTACCGCCAGGCTTGATAAAGTTGATAGTTTCAGA
GCTCTTTGATTTTCTTTTCTTTTTTTCTTTTAATAGTTCCAGGCTTGGTTTTGATAGTGT
TATTACTCTAATGTAATTCCCATTGTGTGACTCTGAGAAATAAAATCTTATGCTTCTACT
TC


BQ
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CC


BQ
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20 20 

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CC

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CC

QA 1 482 1 482
DS 



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CGC


BQ
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10 10 10 

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BQ
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20 20 20 20 

AF RS1C532TF C 1
AF RS1C532JQ U 7
BS 1 6 RS1C532TF
BS 7 484 RS1C532JQ

RD RS1C532TF 484 0 0
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AACAAATCCATCCTAGCAACAACGTCGAGGTCAACAGTGACCTCATCCAGTAACAGTACC
TTGAATGGAAGTAAAAGACCCATGCATATTTGCACACGACGCCTCTGCCCATCAGAAACC
CTGTGCATACGCCACTGAAGGTTGATATCAAGAAGATCAATCAGTTTCTCTCTTCTCTCA
GGAC

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DS 

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AACTCTTATTCTTACTGATGATCTCTCAAAAGATGTTGAGATTTCATCGGTAATACGCCA
TTTGTCTAGATGACATAAAAGGAGAGGAAGCAACAGGTTTCTTCTTAGTCTTCTTCTCCA
CTTTGGTTTCAGACCGAATCTGCTCTCTGTTCACATTCTTCTTTGAAGAATTCCAACAAA
TCCATCCTAGCAACAACGTCGAGGTCAACAGTGACCTCATCCAGTAACAGTACCTTGAAT
GGAAGTAAAAGACCCATGCATATTTGCACACGACGCCTCTGCCCATCAGAAACCCTGTGC
ATACGCCACTGAAGGTTGATATCAAGAAGATCAATCAGTTTCTCTCTTCTCTCAGGAC

QA 1 478 1 478
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1H596TF U 1
AF RS1H164TF U 1
BS 1 232 RS1H164TF
BS 233 233 RS1H596TF
BS 234 703 RS1H164TF

RD RS1H596TF 489 0 0
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TATAAAGTCTCAGCTTCAAACACAGTGAAGGGTCTAAGAAGTCGTCCACCATCTTCTTAC
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TCTCGTCCTTTCTCAGCCGCTGGCTATAACTGGACACTTGTTGTGTATCCGAACGGGAAC
AAGAATGAC

QA 1 489 1 489
DS 

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TCTTCTATTGTTCTCTTGTCTTGTCTCTTCATCACGTCTGCCTCTTCAAGTTCCTTCATA
CGGCAAGTCACTGATGACTTCATCACAAACTTGCAACATGGTGATGGAGATGGACCAGAA
CCAATCCGAGGAGAAGCGCACTACTTGCGTAAACATGTTCAAGATGGAGATGTACCAGAC
CCAATTCAAGGAGAAGCCCATTACTTACATAACCATGATCAAGAGATCTCATCACGTGAC
TATAAAGTCTCAGCTTCAAACACAGTGAAGGGTCTAAGAAGTCGTCCACCATCTTCTTAC
TCTCTAAAGATGGAGTCGTTCAACACGCTACTCAAGTCAAAATACTCGGAGAGATATGTA
TCTCGTCCTTTCTCAGCCGCTGGCTATAACTGGACACTTGTTGTGTATCCGAACGGGAAC
AAGAATGACAAAGGTGCAGGGTACCTCTCGCTTTACGCAGCCATAGAAAACTCCACTCTG
CTCCACATGAAGAGGTTTACGTTGATCTCAGGTTTTACGTCTTCAACAAGAAACAGAATA
AGTATTTTACCATCCAAGATACCGATGTATGGAGATTTAATATCTTCAAAACGATGTGGG
GGTTCTCTCAGTTCTCCCTGGTTATACATTTAAAAGTCCGTAT

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 2

CO CL4746Contig1 1382 2 8 U
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CTATATTTTAGTATATCAATCATCGCTGTGAATTCTTATTTTGAATATCACTTCCACAAT
TCCCGCCCGTCATCGAACTCATATAATACAATATATATATACTAGACCCTAGGAACCACT
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TCGGGACTGCATCGTCATGCAGTACACGGTCTCCAGGGTGCTACCCCATCATCGTGTCTT
CATTACCTTGTTCCATTCGCAGGACCAAGTCACGGTAATGCGGGGACTTTAGGGATAGTG
AATAGTAATAAGACTTCACATGATTTTACTTCCATGATTATTCCAAAATTAATCCTTAGT
TAATCCATAATTAATCATAATTAATTCTTAATTAATCCCAGATTAATCCTTAATTAATCT
CATATTAATCTTTAATTAATCCAAGATTAGTTCTTAATTAATCATGATTACTCCTTAATT
AATCCAAGATTAATTCTCAATTAAACCAAGATAAATTCTTAAATAAGATTAGTACTTGAG
AAAAAAATACTAATATTAGGATTAACCTCAGTTTAATATTTTGATCATATCTTTGAGTTT
AAGTGTTTACACTAAGTAAACACCACAAGGTTCATAAAGATTTAGAGACTTTGCTTCATA
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TCCCCAGAAGAGAATCAACTCTGCACTCAGAAGTGGAAGCACTGCGATGGGCGATGGAGA
ATATGCTTCAGCATTCAACACGCCAGAACTTCGGAACAGACTGCAAAGATTTGATTGCAA
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TGATCATATGCTTCCCGGATTTCAAGATCTCTTATGTTCCAAGAGCGCCTAATCAGATTT
CAGACTTTTTAGCTAAAACAGCTAGATCCTTCCATAGGGAGTTAAATTTTGTTGGTTGTT
CTGTTCCGGTCTGGTTACCCAGACCACCTCAAGTTTGAGTAATAGAATAGCCGTTTGCCG
TC


BQ
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10 10 

AF RS1B920TF U 1
AF RS1B920JQ C 585
BS 1 687 RS1B920TF
BS 688 688 RS1B920JQ
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CTATATTTTAGTATATCAATCATCGCTGTGAATTCTTATTTTGAATATCACTTCCACAAT
TCCCGCCCGTCATCGAACTCATATAATACAATATATATATACTAGACCCTAGGAACCACT
AAGGCTAACCGAGCCTAGTAAGTTAGCATTACCGTCATCCTCGAATGTCCTTATGAACAT
TCGGGACTGCATCGTCATGCAGTACACGGTCTCCAGGGTGCTACCCCATCATCGTGTCTT
CATTACCTTGTTCCATTCGCAGGACCAAGTCACGGTAATGCGGGGACTTTAGGGATAGTG
AATAGTAATAAGACTTCACATGATTTTACTTCCATGATTATTCCAAAATTAATCCTTAGT
TAATCCATAATTAATCATAATTAATTCTTAATTAATCCCAGATTAATCCTTAATTAATCT
CATATTAATCTTTAATTAATCCAAGATTAGTTCTTAATTAATCATGATTACTCCTTAATT
AATCCAAGATTAATTCTCAATTAAACCAAGATAAATTCTTAAATAAGATTAGTACTTGAG
AAAAAAATACTAATATTAGGATTAACCTCAGTTTAATATTTTGATCATATCTTTGAGTTT
AAGTGTTTACACTAAGTAAACACCACA*GGTTCATAAAGATTTAGAGACTTTGCTTCATA
ACTAGAATATTTCAATTTGGTACATCTGGGAAGCTCGAA*TGACAAACTCT

QA 1 771 1 771
DS 

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TCATATCTTTGAGTTTAAGTGTTTACACTAAGTAAACACCACAAGGTTCATAAAGATTTA
GAGACTTTGCTTCATAACTAGAATATTTCAATTTGGTACATCTGGAAGGCTCGAAATGAC
AAACTCTTTAAGGGAATAGACAGAGATCTTCTGGAACTAGTTCGATATGCTGAAAGTTAG
TGTCAAGCTTGGTTTAATGCCAATGAGATGATACCGCCGGTAGTACAAGAGAGTAATGCA
GTGGAACCCCAAGTCATAAGCTTGGGAAATATTTGCTTACTGGATGGATCATGGACAGCG
CTTGCTCAATTTAGTGGGCGTGGATGGGTCTAGTTGGACAGTGGTGGAAAGACGCAACTC
ATGGGATCACACAACTTCCCCAGAAGAGAATCAACTCTGCACTCAGAAGTGGAAGCACTG
CGATGGGCGATGGAGAATATGCTTCAGCATTCAACACGCCAGAACTTCGGAACAGACTGC
AAAGATTTGATTGCAATGATCAAGGAACCTCATGCTTGGCCAAGCTTTGCTACGAAATTG
GAGATGATAGAGACACTGATCATATGCTTCCCGGATTTCAAGATCTCTTATGTTCCAAGA
GCGCCTAATCAGATTTCAGACTTTTTAGCTAAAACAGCTAGATCCTTCCATAGGGAGTTA
AATTTTGTTGGTTGTTCTGTTCCGGTCTGGTTACCCAGACCACCTCAAGTTTGAGTAATA
GAATAGCCGTTTGCCGTC

QA 1 798 1 798
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AGTCATAAAACTAGTAGTTTATATAGATAATAGTCTGCTGTTACACAAATGCTTAAAACT
CCACACACTGAAGTACAAAGTTGTTTGCATAACTTAGGAGCTAAAGATAGTCAAAAGGGC
AGAGACGAAGCACACATATCTAAAGAAAGTTAACATGAGATATGGAAAAGAAACGACTTT
AATACTTTTATTCTCATACCTCTCCTCTCATCATTGACTACTAAACTCACTCCATCCTTT
GGCGTTTATTTTTCAGCTTTGTGAACATCTGCTCAACATCTTCCGACGTTATCGCCCTTG
AAGTACCAACAGACTCCAGCAAACTCCGTAACCCTTCTTTGAAGTTATTGACGCGGTGAC
AGAACTCAACTTTAGTTACATGGTCGAGATTTTTCATAACGATCAAGTGCTTCGCCTTCC
TGTTTCTCCAGTTTCTCTGTTCTTTTCTCCTTTGCCTTATTCTCGTATTCAGCAATCGTG
TCCTCCGCATCAAGTAAGTAGCTAACCTTTCTCTCGCTGTACATCTCAAGGCACGTCTCG
CATTTGCACAGCATGTTCCTCCAGTTTTTGGCTAAAAACAGCGGTTTCTTCTCAAACTCA
ATACACGAGGTTAGACCTGTTGCAATAGCACAACCAGCCGCAGGAAAGGGTTCAGGTTCG
GCGAGCTTCTCAGTGCATCCTCTCAAAACAGGTTTTTCAGCTTCAGTACTGTTCTCAGGC
TTG


BQ
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10 10 10 

AF RS1E046TF C 1
AF RS1BW64JQ U 57
BS 1 58 RS1E046TF
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RD RS1E046TF 562 0 0
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AATACTTTTATTCTCATACCTCTCCTCTCATCATTGACTACTAAACTCACTCCATCCTTT
GGCGTTTATTTTTCAGCTTTGTGAACATCTGCTCAACATCTTCCGACGTTATCGCCCTTG
AAGTACCAACAGACTCCAGCAAACTCCGTAACCCTTCTTTGAAGTTATTGACGCGGTGAC
AGAACTCAACTTTAGTTACATGGTCGAGATTTTTTTTAACGATCAAGTGCTTCGCCTTCC
TGTTTCTCCAGTTTCTCTGTTCTTTTCTCCTTTGCCTTATTCTCGTATTCAGCAATCGTG
TCCTCCGCATCAAGTAAGTA
CC

QA 1 560 1 560
DS 

RD RS1BW64JQ 727 0 0
CT
GCAGTCATAAAACTAGTAGTTTATATAGATAATAGTCTGCTGTTACACAAATGCTTAAAA
CTCCACACACTGAAGTACAAAGTTGTTTGCATAACTTAGGAGCTAAAGATAGTCAAA*GG
GCAGAGACGAAGCACACATATCTAAAGAAAGTTAACATGAGATATGGAAAAGAAACGACT
TTAATACTTTTATTCTCATACCTCTCCTCTCATCATTGACTACTAAACTCACTCCATCCT
TTGGCGTTTATTTTTCAGCTTTGTGAACATCTGCTCAACATCTTCCGACGTTATCGCCCT
TGAAGTACCAACAGACTCCAGCAAACTCCGTAACCCTTCTTTGAAGTTATTGACGCGGTG
ACAGAACTCAACTTTAGTTACATGGTCGAGATTTTTCA*AACGATCAAGTGCTTCGCCTT
CCTGTTTCTCCAGTTTCTCTGTTCTTTTCTCCTTTGCCTTATTCTCGTATTCAGCAATCG
TGTCCTCCGCATCAAGTAAGTAGCTAACCTTTCTCTCGCTGTACATCTCAAGGCACGTCT
CGCATTTGCACAGCATGTTCCTCCAGTTTTTGGCTAAAAACAGCGGTTTCTTCTCAAACT
CAATACACGAGGTTAGACCTGTTGCAATAGCACAACCAGCCGCAGGAAAGGGTTCAGGTT
CGGCGAGCTTCTCAGTGCATCCTCTCAAAACAGGTTTTTCAGCTTCAGTACTGTTCTCAG
GCTTG

QA 3 727 3 727
DS 



AS 1 2

CO CL4749Contig1 855 2 2 U
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ATCTCTTCTGGGTTTAATAACAGCTCTTACCGGCTTTGCTGCTGAAGCTACCAAAACCAA
GATAAATGAGGTCACTGTTACCACCTCTGGTTCATTATGCTCTTATGAAAGAAGCACTGC
TTTCACTCTCGGCTTGAATTCAGCTGTCTTTCTAATTATGGCTCAGATCATCGCAAGCGT
TGGAAGCGGTTGTTTCTGTTGTAGAAAAGGTCCTTCTCCTTCAAGATCCAAGTGGATCAT
CTCCTTAGTCTGCTTCATCGTTTCTTGGTTCACTTTTGCTATAGCTCTCCTCCTGCTGCT
ATCTGGAGCTGTACTCAACAATAACCACACCCTGGAGGCAACGTCTCCCGATCCCTACTC
CTGCTACAGTGTTAGGACGGGCGTTTTCTCTACCGCTTCTGTGCTTTCTATTATTACTAT
TGCGCTTGGGATTGTCTACTATCTATGTTTGAATTCGAGTAACCAAAACGTTGGTGGCAC
AAGGACGGTGGCTAACCAAGGAGGAGGGATAGCAATGGGACAGCCTCAGTTTCCAGAGAG
AGTAGAAGATCCTGTCTTTGTACATGACGATACTCACATGAGAAGACAGCTCACTTAAAA
AAAATACAGAACAGGGCTTGCTTGGTAAACAAGTTAGGTTTAGGAAGATATATTTAGATA
AAAAGAAGGCTTTGTCTGATTTTTACCTACATTTTTGTATCTTTCTGATTTTTTTTCTTG
TATGTGAGGGTATAAGATCATCTCCAACTCATCTATATATTTTTCTTTGTAATATAAAAT
TATTTCATTCCACTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E765TF U 1
AF RS1E765JQ C 149
BS 1 285 RS1E765TF
BS 286 855 RS1E765JQ

RD RS1E765TF 285 0 0
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ATCTCTTCTGGGTTTAATAACAGCTCTTACCGGCTTTGCTGCTGAAGCTACCAAAACCAA
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TTTCACTCTCGGCTTGAATTCAGCTGTCTTTCTAATTATGGCTCAGATCATCGCAAGCGT
TGGAAGCGGTTGTTTCTGTTGTAGAAAAGGTCCTTCTCCTTCAAG

QA 1 285 1 285
DS 

RD RS1E765JQ 707 0 0
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TTTCTAATTATGGCTCAGATCATCGCAAGCGTTGGAAGCGGTTGTTTCTGTTGTAGAAAA
GGTCCTTCTCCTTCAAGATCCAAGTGGATCATCTCCTTAGTCTGCTTCATCGTTTCTTGG
TTCACTTTTGCTATAGCTCTCCTCCTGCTGCTATCTGGAGCTGTACTCAACAATAACCAC
ACCCTGGAGGCAACGTCTCCCGATCCCTACTCCTGCTACAGTGTTAGGACGGGCGTTTTC
TCTACCGCTTCTGTGCTTTCTATTATTACTATTGCGCTTGGGATTGTCTACTATCTATGT
TTGAATTCGAGTAACCAAAACGTTGGTGGCACAAGGACGGTGGCTAACCAAGGAGGAGGG
ATAGCAATGGGACAGCCTCAGTTTCCAGAGAGAGTAGAAGATCCTGTCTTTGTACATGAC
GATACTCACATGAGAAGACAGCTCACTTAAAAAAAATACAGAACAGGGCTTGCTTGGTAA
ACAAGTTAGGTTTAGGAAGATATATTTAGATAAAAAGAAGGCTTTGTCTGATTTTTACCT
ACATTTTTGTATCTTTCTGATTTTTTTTCTTGTATGTGAGGGTATAAGATCATCTCCAAC
TCATCTATATATTTTTCTTTGTAATATAAAATTATTTCATTCCACTT

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 2

CO CL4750Contig1 904 2 6 U
GGAAAAGGCGTGAAAGGAGCTCAGCCAGGTCCTGTCCTGTCGTGTTATCAACGGGTGAAA
ATTGCAGTTGGAGCCGCAAGAGGGCTTGAGTATTTGCATGAAAAAGCAAATCCTCGCATC
ATCCACCGTGACATCAAATCAAGCAATGTCCTGCTCTTCGAAGATGATGTTGCCAAGATT
GCTGACTTTGATCTCTCTAATCAAGCTCCTGATATGGCTGCTCGCCTTCATTCAACCCGT
GTTCTTGGAACTTCCGGTTACCATGCCCCTGAATATGCGATGACCGGTCAGTTAAATGCC
AAAAGTGATGTGTACAGCTTCGGGGTTGTCTTGCTCGAACTCCTTACAGGTCGAAAACCT
GTTGATCATAGATTGCCTAGAGGCCAGCAAAGTCTAGTCACATGGGCAACACCTAAATTG
AGCGAAGACAAGGTCAAACAGTGCGTCGATGCAAGACTTGGTGGCGATTACCCTCCAAAA
GCTGTTGCTAAGCTAGCGGCGGTTGCAGCGTTGTGCGCGCAGTATGAAGCAGATTTTAGA
CCGAATATGAGTATTGTTGTGAAAGCTCTGCAACCTTTGTTGAACGCTCGAGCCGCAGCT
CCAGGGGATGGATTACATTAGCCAACACCACTTTCCCCTCCGTCTACCACACAATATTTG
ATTTCCATATACAGTAATCAAAACTTAACGTGCATAGAAAATTCCTTTTTATTTTTTTAT
TTTATTACAAAATTAAATCCGCACGGTTATTTGGATTCTTGCATTCCTACTAAACTGCTA
TCTCTATACAATTTCTGACTGTCTAATATTGTTATTTCCATTGAAATTGTGGTTAAAAAC
CAGAATCATAGTGTGATACTTTTGGTTATTTTTTCTGTTATGAACTTATGAATTTGTGTA
AAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RS1G210TF U 1
AF RS1F192JQ C 157
BS 1 207 RS1G210TF
BS 208 208 RS1F192JQ
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RD RS1G210TF 661 0 0
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ATCCACCGTGACATCAAATCAAGCAATGTCCTGCTCTTCGAAGATGATGTTGCCAAGATT
GCTGACTTTGATCTCTCTAATCAAGCTTCTGATATGGCTGCTCGCCTTCATTCAACCCGT
GTTCTTGGAACTTCCGGTTACCATGCCCCTGAATATGCGATGACCGGTCAGTTAAATGCC
AAAAGTGATGTGTACAGCTTCGGGGTTGTCTTGCTCGAACTCCTTACAGGTCGAAAACCT
GTTGATCATAGATTGCCTAGAGGCCAGCAAAGTCTAGTCACATGGGCAACACCTAAATTG
AGCGAAGACAAGGTCAAACAGTGCGTCGATGCAAGACTTGGTGGCGATTACCCTCCAAAA
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CCGAATATGAGTATTGTTGTGAAAGCTCTGCAACCTTTGTTGAACGCTCGAGCCGCAGCT
CCAGGGGATGGATTACATTAGCCAACACCACTTTCCCCTCCGTCTACCACACAATATTTG
A

QA 1 661 1 661
DS 

RD RS1F192JQ 748 0 0
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GCTGCTCGCCTTCATTCAACCCGTGTTCTTGGAACTTTCGGTTACCATGCCCCTGAATAT
GCGATGACCGGTCAGTTAAATGCCAAAAGTGATGTGTACAGCTTCGGGGTTGTCTTGCTC
GAACTCCTTACAGGTCGAAAACCTGTTGATCATAGATTGCCTAGAGGCCAGCAAAGTCTA
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CTTGGTGGCGATTACCCTCCAAAAGCTGTTGCTAAGCTAGCGGCGGTTGCAGCGTTGTGC
GCGCAGTATGAAGCAGATTTTAGACCGAATATGAGTATTGTTGTGAAAGCTTTGCAACCT
TTGTTGAACGCTCGAGCCGCAGCTCCAGGGGATGGATTACATTAGCCAACACCACTTTCC
CCTCCGTTTACCACACAATATTTGATTTCCATATACAGTAATCAAAACTTAACGTGCATA
GAAAATTCCTTTTTATTTTTTTATTTTATTACAAAATTAAATCCGCACGGTTATTTGGAT
TCTTGCATTCCTACTAAACTGCTATCTCTATACAATTTCTGACTGTCTAATATTGTTATT
TCCATTGAAATTGTGGTTAAAAACCAGAATCATAGTGTGATACTTTTGGTTATTTTTTCT
GTTATGAACTTATGAATTTGTGTAAAGG

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL4751Contig1 1081 2 6 U
GGATATACAAAAACGCTAGTCGTCGTCGGCTCTGTAACTCCCGTCGTCGACCCAATACGC
CGTTGAAGCTAATTTAAGTGATGGAACCTAACGGGTCAGCTTCATCGACTGAAAACGGCG
TCGTAAATGACGTGGAGAAGTTTCTCTGCGAGCGATTGGTGGACCAGTCGCAGCCCATCT
CGGAGCGGTTCAGAGCTCTCTTCTCTCTTCGCAACTTGAAAGGCCCTGGACCTCGCAACG
CTCTAATCCCCGCGTCCAGAGACGAATCAAACTTGTTGGCGCATAAAGCTGCGTTTGCGT
TGGGACAGATGCAAAATGCTGAGATTTTGAAGAAGAGCTTGGTGTTGGATCCAGCTCAGG
AGGTTAGGGAAACGTGTGAGCTAGCTCTCAAAAGGATTGAAGAGTTGAGTAATGTTGGTG
CGGAGAAGGAGTTAGACACGACTGAGAAATCACCTTTCATGTCTGTTGACCCTGCGGCTC
CAGCTGCTGCTTTCTCTTCTGTAGACCAACTGAGGCAAATTCTTCTGGATGAAACAAAAG
GCATGTATGAGAGATATGCTGCTCTCTTTGCTCTAAGGAATCATGGTGGAGAGGAAGCTG
TCTCTGCCATAGTTGATTCTTTGAGTGCTAATAGTGCCCTTCTACGTCACGAGGTAGCTT
ATGTCTTGGGGCAACTGCAAAACAAAGCTGCATTAGCTACTCTAAGCAAAATACTTAGAG
ATGTGAACGAGCATCCCATGGTCAGACATGAGGCTGCAGAAGCACTTGGTTCTATTGCAG
ATGAGCAGAGCATCGCATTGCTACAAGAGTTTTTAAGGGACCCTGAACCGATTGTTTCTC
AAAGCTGTGAAGTTGCATTGAGCATGTTGGAATTTGAAAATTTTGGCAAATCATTCGAGT
TCTTTTTCACTCAAGACCCACTTGTTCACTAAGAACGGTCAAGGATCATAACCATTCTTC
TATCATTTACCAACCAAGGAACACAAACTTTTTTTTTAAAGCTGAATGTTCACTAAGAAT
GCTCAAGGATCATAACCATTCTTCTATCACTTACCAACGAAGGAATACAAACTTTTTTTT
G


BQ
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10 

AF RS1FF01TF U 1
AF RS1FF01JQ C 606
BS 1 710 RS1FF01TF
BS 711 711 RS1FF01JQ
BS 712 752 RS1FF01TF
BS 753 753 RS1FF01JQ
BS 754 794 RS1FF01TF
BS 795 1081 RS1FF01JQ

RD RS1FF01TF 794 0 0
GGATATACAAAAACGCTAGTCGTCGTCGGCTCTGTAACTCCCGTCGTCGACCCAATACGC
CGTTGAAGCTAATTTAAGTGATGGAACCTAACGGGTCAGCTTCATCGACTGAAAACGGCG
TCGTAAATGACGTGGAGAAGTTTCTCTGCGAGCGATTGGTGGACCAGTCGCAGCCCATCT
CGGAGCGGTTCAGAGCTCTCTTCTCTCTTCGCAACTTGAAAGGCCCTGGACCTCGCAACG
CTCTAATCCCCGCGTCCAGAGACGAATCAAACTTGTTGGCGCATAAAGCTGCGTTTGCGT
TGGGACAGATGCAAAATGCTGAGATTTTGAAGAAGAGCTTGGTGTTGGATCCAGCTCAGG
AGGTTAGGGAAACGTGTGAGCTAGCTCTCAAAAGGATTGAAGAGTTGAGTAATGTTGGTG
CGGAGAAGGAGTTAGACACGACTGAGAAATCACCTTTCATGTCTGTTGACCCTGCGGCTC
CAGCTGCTGCTTTCTCTTCTGTAGACCAACTGAGGCAAATTCTTCTGGATGAAACAAAAG
GCATGTATGAGAGATATGCTGCTCTCTTTGCTCTAAGGAATCATGGTGGAGAGGAAGCTG
TCTCTGCCATAGTTGATTCTTTGAGTGCTAATAGTGCCCTTCTACGTCACGAGGTAGCTT
ATGTCTTGGGGCAACTGCAAAACAAAGCTGCATTAGCTACTCTAAGCAAA*TACTTAGAG
ATGTGAACGAGCATCCCATGGTCAGACATGAG*CTGCAGAAGCACTTGGTTCTATTGCAG
ATGAGCAGAGCATC

QA 1 794 1 794
DS 

RD RS1FF01JQ 476 0 0
GCCATAGTTGATTCTTTGAGTGCTAATAGTGCCCTTTTACGTCACGAGGTAGCTTATGTC
TTGGGGCAACTGCAAAACAAAGCTGCATTAGCTACTCTAAGCAAAATACTTAGAGATGTG
AACGAGCATCCCATGGTCAGACATGAGGCTGCAGAAGCACTTGGTTTTATTGCAGATGAG
CAGAGCATCGCATTGCTACAAGAGTTTTTAAGGGACCCTGAACCGATTGTTTCTCAAAGC
TGTGAAGTTGCATTGAGCATGTTGGAATTTGAAAATTTTGGCAAATCATTCGAGTTCTTT
TTCACTCAAGACCCACTTGTTCACTAAGAACGGTCAAGGATCATAACCATTCTTCTATCA
TTTACCAACCAAGGAACACAAACTTTTTTTTTAAAGCTGAATGTTCACTAAGAATGCTCA
AGGATCATAACCATTCTTCTATCACTTACCAACGAAGGAATACAAACTTTTTTTTG

QA 1 476 1 476
DS 



AS 1 2

CO CL4752Contig1 1009 2 2 U
GCTCCTCCGCTATAGCTTCCGGCGTCTCTGCCTTCGCCGTCAATGGAGTCTCCGAGAAAG
ATTGGAACTTGGTCAAAGAGATGGGTGCGAAATACCCTTCTGTTGTTCCCTGCTTTGGTA
TCCATCCATGGTATGTAGCAGAGAGGAGTCCTCAGTGGTTTGAGACGTTGAAGAGCTTGT
TTGAGACCACTCCTAGTGCTGCTGTTGGAGAAATTGGTTTGGACAAAGGGTCAAAGGGAA
GGGAGATTGATTTCTCAGACCAGGTTGGAGTGTTTCGTCAACAGCTCGAACTCGCAAAGG
AATTGAATAAACCTGCGTCGATCCACTGTGTCCGTGCATTCGGTGATCTACTTGAGATAA
CAAAATCTGTGGGGCCTTTTCCTGCTGGAGTCATCCTTCACTCCTACTTGGGCTCTGCTG
AGATGGTTCCTGAGTTTGCAAAGCTCGGTGCTACTTCTCCTTCTCTGGCTTTCTCATGTC
CATGAGTGAGAAGAAAGCCAAGAAGATGTTGAAAGCTGTTCCTTCTGATAGGATCTTATT
AGAGACTGATTCACCCGATGCGTTACCAAAGTCGGAGTCAGGGACTCTCTACTTTGTAGA
AGGAGATCCTTCTCTGCCGGAAGAAAGAAACTCATCTCGGGATCTTGAGTCTAATGCTTC
CAGTGGTGGCGGCTCGTTGAAGTTGCCGAAGGAAACACTTAATCACCCTGCTAATATTCA
CACCGTACTTGAGTATGTAGCAAAGTTGTTGGACGTGAAGAACGAAGAACTCGCGGAACT
AAGCTATAACAATGCTGTTCGGTTATTCTCTTACTCAGGTTCGAAGCTGCTTCTCGAGAG
AGGTGTCGCTGATGTCTCCCTTCACAGTCAAAACCATTCAACAACACATGTACCATGAGT
TCTTAAGTCATTGTAGTTGTGTTTGTCGCTACTCTGTTACAAGTCTTTGAAGTTTGAATA
GTGTTGTAGACTCACACTTCTCTTCGTATAAGACCATTTATAACTATGT


BQ
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AF RS1BD35TF U 1
AF RS1BD35JQ C 316
BS 1 687 RS1BD35TF
BS 688 1009 RS1BD35JQ

RD RS1BD35TF 687 0 0
GCTCCTCCGCTATAGCTTCCGGCGTCTCTGCCTTCGCCGTCAATGGAGTCTCCGAGAAAG
ATTGGAACTTGGTCAAAGAGATGGGTGCGAAATACCCTTCTGTTGTTCCCTGCTTTGGTA
TCCATCCATGGTATGTAGCAGAGAGGAGTCCTCAGTGGTTTGAGACGTTGAAGAGCTTGT
TTGAGACCACTCCTAGTGCTGCTGTTGGAGAAATTGGTTTGGACAAAGGGTCAAAGGGAA
GGGAGATTGATTTCTCAGACCAGGTTGGAGTGTTTCGTCAACAGCTCGAACTCGCAAAGG
AATTGAATAAACCTGCGTCGATCCACTGTGTCCGTGCATTCGGTGATCTACTTGAGATAA
CAAAATCTGTGGGGCCTTTTCCTGCTGGAGTCATCCTTCACTCCTACTTGGGCTCTGCTG
AGATGGTTCCTGAGTTTGCAAAGCTCGGTGCTACTTCTCCTTCTCTGGCTTTCTCATGTC
CATGAGTGAGAAGAAAGCCAAGAAGATGTTGAAAGCTGTTCCTTCTGATAGGATCTTATT
AGAGACTGATTCACCCGATGCGTTACCAAAGTCGGAGTCAGGGACTCTCTACTTTGTAGA
AGGAGATCCTTCTCTGCCGGAAGAAAGAAACTCATCTCGGGATCTTGAGTCTAATGCTTC
CAGTGGTGGCGGCTCGTTGAAGTTGCC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1BD35JQ 694 0 0
CGTCGATCCACTGTGTCCGTGCATTCGGTGATCTACTTGAGATAACAAAATCTGTGGGGC
CTTTTCCTGCTGGAGTCATCCTTCACTCCTACTTGGGCTCTGCTGAGATGGTTCCTGAGT
TTGCAAAGCTCGGTGCTACTTCTCCTTCTCTGGCTTTCTCATGTCCATGAGTGAGAAGAA
AGCCAAGAAGATGTTGAAAGCTGTTCCTTTTGATAGGATCTTATTAGAGACTGATTCACC
CGATGCGTTACCAAAGTCGGAGTCAGGGACTCTTTACTTTGTAGAAGGAGATCCTTTTCT
GCCGGAAGAAGGAAACTCATCTCGGGATCTTGAGTCTAATGCTTCCAGTGGTGGCGGCTC
GTTGAAGTTGCCGAAGGAAACACTTAATCACCCTGCTAATATTCACACCGTACTTGAGTA
TGTAGCAAAGTTGTTGGACGTGAAGAACGAAGAACTCGCGGAACTAAGCTATAACAATGC
TGTTCGGTTATTCTCTTACTCAGGTTCGAAGCTGCTTCTCGAGAGAGGTGTCGCTGATGT
CTCCCTTCACAGTCAAAACCATTCAACAACACATGTACCATGAGTTCTTAAGTCATTGTA
GTTGTGTTTGTCGCTACTCTGTTACAAGTCTTTGAAGTTTGAATAGTGTTGTAGACTCAC
ACTTCTCTTCGTATAAGACCATTTATAACTATGT

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL4753Contig1 505 2 3 U
GGTCTCGGGGAAGTTGTGATTTTGCCGGCACAGCCACAGTCTCAGCCTCTGATCCCAGCT
ACACTTCTTGTGCTTTTCCTGCAAGTGCCAGTGGAAGTGGGACAATGACACCAGTGACGA
CAACACCATCGACAAGAGTCCCTACGACAACTAATACAAGACCCTACACAGTCACACCCC
CAACAGGAGGAGGTTTGGGGATTCCAGCCGGTGGTTTCAATCCAGACTACACAGATCCAT
CCTATTCCTTTGGACTCAAACTCCAAAACCCAACTTTATTTTTTATCTGGATTCTTCATG
CTCTTCTACTTGTTGATCTAGTAGTGAACAACAACTAAGTTGGACTGTTGCGGATCATGT
GAATGTGCCAATGTGGGTCTCTCTCTCTCACTAATGGAATCTTTTGTGAGATAGACTTGT
TTTGTTCAATCCTTGTCTGTTATTTTCCCTAGCTGTTATCCACTTCGCTTTCAGAAAAAA
AAAAGAAGAATTGTACATTTTGAGC


BQ
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CAACAGGAGGAGGTTTGGGGATTCCAGCCGGTGGTTTCAATCCAGACTACACAGATCCAT
CCTATTCCTTTGGACTCAAACTCCAAAACCCAACTTTATTTTTTATCTGGATTCTTCATG
CTCTTCTACTTGTTGATCTAGTAGTGAACAACAACTAAGTTGGACTGTTGCGGATCATGT
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AAAAGAAGAATTGTACATTTTGAGC

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DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CS50JQ U 118
AF RS1CS50TF C 1
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QA 1 319 1 319
DS 

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QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1D324TF U 1
AF RS1D324JQ C 254
BS 1 739 RS1D324TF
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TATACAAGCGTGCTTATCC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1D324JQ 690 0 0
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ATACGGTCCAATATCTTTCCCATCCCTTCCTGCGGTAGTTCTGAAAATTTCTGAAGGGTC
CGATGCTCCTGCTGTTGCTGCCCTTGGTTCCTTGAAAAGCATTGAACCCAACAAAATAAT
CTTGAAGAAGATAATATTGACTGGGTATCCTCAGAGAGTATCAAAAATGAAAGCATCAGT
AAGATATATGTTCCATAACCCGGAAGACGTGAGATGGTTTAAGCCTGTAGAAGTGTGGAC
AAAATGTGGGCGTCGTGGTCGCGTGAAGGAGCCAGTGGGCACACATGGTGCAATGAAATG
CATATTCAATGGAGTGGTGCAGCAACATGACGTTGTGTGCATGAACTTATACAAGCGTGC
TTATCCCAAATGGCCTGAGCGTATGTACCCCCAGCTTCTGTAATTTTATTTAATAGGATG
AAGCTCTGATGATGTTGTTCAAGTTTCCTCTTTTTTTTTTTTTTGTTCAAGATGTTCAAT
TTGCTATGAATTCAAATTCTTACTTTTGATAACTTATGGACCTGGTTTTGTGAAGTCCTC
AGTTTTGTCATGCATGTGATAATATAATAT

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

CO CL4756Contig1 1162 2 6 U
GGAATCTGGCGTTTGTCTCGGTGGCTGCGGCTGTTCTGGTGATGAGCAGGAATGAGCATC
CGATCATGCCGCTTAGGGTTTGGCTGTTTGGGTATGCGTTGCAGTGCGTGTTGCATATGG
TTTGTGTGTGTTTTGAGTATAGGAGGAGGAACCGGATGAGGACTAATAGGAGGACTACGT
CGTTGCGTTCTTCTTCTTCTTCTTCATCTTCTTCCTCGATGGAGGAAGATGCTTTGGTTT
CAAGGAGGAACTCAGATGAGCAGCTGGAGAGTGAAGGCAGCAGCAGTGTTGCGAAGCATC
TTGAATCTGCCAACACAATGTTCTCATTTATTTGGTGGATCATTGGGTTCTACTGGGTAT
CTGCTGGTGGCCAAGAGTTAGCGGAAGAATCCCCGCGTATTTACTGGTTGTCTATCGTCT
TCCAGGGTTTCGATGTGTTCTTTGTTGTCTTTTGTTTTGCGTTGGCCTGCGTTATTGGAA
TTGCTGTTTGCTGCTGCCTTCCATGCATCATCGCAGTTTTGTACGCTGTTGCCGATCAGG
AAGGGGCGTCAAAAGAAGACATTGAGCAGCTCACCAAATTCAAGTTTCGAAAACTTGGCT
GTGTCAACAAACACGCTGGTGATGAAGCCCAAGAGGGGATAATGACCGAGTGTGGTACAG
ATTCACCCCTTGAACATACCATTCTGCAGGAAGATGCAGAATGTTGCATCTGTCTCTCTG
CATATGAAGATGGAACCGAACTAAGGGAACTTCCTTGTGGCCATCATTTCCACTGCTCAT
GCGTAGACAAATGGCTGTACATAAACGCCACTTGCCCACTCTGCAAATACAACATCCTCA
AGAGCAGCAACTTGGACCGTGAGGAAGTCTAGAAGAAACAGATTTGCATATTCATGACCC
CACACAAACATTTGATCAGGAAACTTGGGGGGTCCAGAGGTAAAAAAAAAACGACTGGTG
TTTTTGGATATAATGCATTGTTTGTGATAATGATATCTATACAAATGATTTTACTTTTGT
CTGTTTTATTTTGATTTTTTTTTGGAATCAGGTCTGTACATGTATATATCTATGTTCTTT
CACTTGCAACCACTCTTTTGTATCACCTCTCTGTATCATGGATCTTTCATCATTTGGAGA
TTGGTCATTGAAGCTTTTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DQ30TF U 1
AF RS1DQ30JQ C 499
BS 1 689 RS1DQ30TF
BS 690 691 RS1DQ30JQ
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RD RS1DQ30TF 735 0 0
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CGATCATGCCGCTTAGGGTTTGGCTGTTTGGGTATGCGTTGCAGTGCGTGTTGCATATGG
TTTGTGTGTGTTTTGAGTATAGGAGGAGGAACCGGATGAGGACTAATAGGAGGACTACGT
CGTTGCGTTCTTCTTCTTCTTCTTCATCTTCTTCCTCGATGGAGGAAGATGCTTTGGTTT
CAAGGAGGAACTCAGATGAGCAGCTGGAGAGTGAAGGCAGCAGCAGTGTTGCGAAGCATC
TTGAATCTGCCAACACAATGTTCTCATTTATTTGGTGGATCATTGGGTTCTACTGGGTAT
CTGCTGGTGGCCAAGAGTTAGCGGAAGAATCCCCGCGTATTTACTGGTTGTCTATCGTCT
TCCAGGGTTTCGATGTGTTCTTTGTTGTCTTTTGTTTTGCGTTGGCCTGCGTTATTGGAA
TTGCTGTTTGCTGCTGCCTTCCATGCATCATCGCAGTTTTGTACGCTGTTGCCGATCAGG
AAGGGGCGTCAAAAGAAGACATTGAGCAGCTCACCAAATTCAAGTTTCGAAAACTTGGCT
GTGTCAACAAACACGCTGGTGATGAAGCCCAAGAGGGGATAATGACCGAGTGTGGTACAG
ATTCACCCCTTGAACATACCATTCTGCAG**AGATGCAGA*TGTTGCATCTGTCTCTCTG
CATATGA
GATGGAAC

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1DQ30JQ 664 0 0
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ACATTGAGCAGCTCACCAAATTCAAGTTTCGAAAACTTGGCTGTGTCAACAAACACGCTG
GTGATGAAGCCCAAGAGGGGATAATGACCGAGTGTGGTACAGATTCACCCCTTGAACATA
CCATTCTGCAGGAGGATGCAGAATGTTGCATCTGTCTCTCTGCATATGAAGATGGAACCG
AACTAAGGGAACTTCCTTGTGGCCATCATTTCCACTGCTCATGCGTAGACAAATGGCTGT
ACATAAACGCCACTTGCCCACTCTGCAAATACAACATCCTCAAGAGCAGCAACTTGGACC
GTGAGGAAGTCTAGAAGAAACAGATTTGCATATTCATGACCCCACACAAACATTTGATCA
GGAAACTTGGGGGGTCCAGAGGTAAAAAAAAAACGACTGGTGTTTTTGGATATAATGCAT
TGTTTGTGATAATGATATCTATACAAATGATTTTACTTTTGTCTGTTTTATTTTGATTTT
TTTTTGGAATCAGGTCTGTACATGTATATATCTATGTTCTTTCACTTGCAACCACTCTTT
TGTATCACCTCTCTGTATCATGGATCTTTCATCATTTGGAGATTGGTCATTGAAGCTTTT
GACC

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

CO CL4757Contig1 1099 2 2 U
GGGCACTCACACACCACATTTTCCTTCTCCTCTCTTTGTTTCATCAATCACTCGCCCTTC
CTTCAAATTTCCATTAATTGTGGTGACTTTTTATTTTCAAGTTGGTTCCAAACGTTTCGC
TGACATGCTCTATTTCATATGCGTCTACAATTGTTGATGTTCTATAAAAAATTAACAAAG
ATGTTAAATAAATGAGTTAATATTATTTATTAATACTGACTACATAATAGGAAATGCTAC
TACGTGCCATATAGACCAAGCTACAAAGTTATAATCAAATGATATTATATTTAACCTACA
TGACAAGAATTAGATCACAAACTGTAGTTCTTTATATAGAGATCTACGAACTTATAGATT
CGTAGATATGAATTTACATAGAGTTTGTGATCGATATACGAATCACTATAAATATAAGTT
TGTGATCGATAGACGAATCAACAGGAGGGAGTCAACCCTCCTATTGCTAAACTCTTTTAT
GAAATGCTGTTGTTGTTTGATCAAAAAAAAAAAAGAATTTACATAAAAATCTATTATGCA
TTGTTGTTAATAAGATGATCAATTTATATTTTTTTACAAAATCAAATTTTTTTCTTCTTG
CTTTGGATAAATTTTCATTATTCATTTCTATAGTTTTGCAACAATTAAAATCAAAAACAA
AAAAAAATTAAGAGACCTGATTTTTAACTGGAAGTTTGGGACTAAAGTGAACCTTTCTTC
ATGTTTTATGAGATTTTGGGTAAATGCAGGAATAACCAAAAGGTGAAGGACTACAATTTC
AAAAAGGCGAAATTTAACCATTGTTGCTCTACAGCTTTTGGATGGATGGTGACTGCCGTA
GATATTGCGAGGTAGTAGGAGCCGCACGGAGACAAAACAACTGATTGTCACAAGGAAGAA
GAGTGTTGATGTGAAACTTCCGAGGTGTTGAAGAAGCTTGAGGAAAATCAAAAACGGTGT
CGTTGCTAAGATTTTCTTGCTTTTAATTTATATGTTAGTCTTTAGATATAGGTATGTGTT
GTTTCTCGGATCTGAAACAGTGCAGCTTGGGTTGTGATATTACGTGTATACACACATCAA
TTAACTTAATGTGCACACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FI62TF U 1
AF RS1FI62JQ C 490
BS 1 657 RS1FI62TF
BS 658 1099 RS1FI62JQ

RD RS1FI62TF 657 0 0
GGGCACTCACACACCACATTTTCCTTCTCCTCTCTTTGTTTCATCAATCACTCGCCCTTC
CTTCAAATTTCCATTAATTGTGGTGACTTTTTATTTTCAAGTTGGTTCCAAACGTTTCGC
TGACATGCTCTATTTCATATGCGTCTACAATTGTTGATGTTCTATAAAAAATTAACAAAG
ATGTTAAATAAATGAGTTAATATTATTTATTAATACTGACTACATAATAGGAAATGCTAC
TACGTGCCATATAGACCAAGCTACAAAGTTATAATCAAATGATATTATATTTAACCTACA
TGACAAGAATTAGATCACAAACTGTAGTTCTTTATATAGAGATCTACGAACTTATAGATT
CGTAGATATGAATTTACATAGAGTTTGTGATCGATATACGAATCACTATAAATATAAGTT
TGTGATCGATAGACGAATCAACAGGAGGGAGTCAACCCTCCTATTGCTAAACTCTTTTAT
GAAATGCTGTTGTTGTTTGATCAAAAAAAAAAAAGAATTTACATAAAAATCTATTATGCA
TTGTTGTTAATAAGATGATCAATTTATATTTTTTTACAAAATCAAATTTTTTTCTTCTTG
CTTTGGATAAATTTTCATTATTCATTTCTATAGTTTTGCAACAATTAAAATCAAAAA

QA 1 657 1 657
DS 

RD RS1FI62JQ 610 0 0
TTGTTGTTTGATCAAAAAAAAAAAAGAATTTACATAAAAATCTATTATGCATTGTTGTTA
ATAAGATGATCAATTTATATTTTTTTACAAAATCAAATTTTTTTCTTCTTGCTTTGGATA
AATTTTCATTATTCATTTCTATAGTTTTGCAACAATTAAAATCAAAAACAAAAAAAAATT
AAGAGACCTGATTTTTAACTGGAAGTTTGGGACTAAAGTGAACCTTTCTTCATGTTTTAT
GAGATTTTGGGTAAATGCAGGAATAACCAAAAGGTGAAGGACTACAATTTCAAAAAGGCG
AAATTTAACCATTGTTGCTCTACAGCTTTTGGATGGATGGTGACTGCCGTAGATATTGCG
AGGTAGTAGGAGCCGCACGGAGACAAAACAACTGATTGTCACAAGGAAGAAGAGTGTTGA
TGTGAAACTTCCGAGGTGTTGAAGAAGCTTGAGGAAAATCAAAAACGGTGTCGTTGCTAA
GATTTTCTTGCTTTTAATTTATATGTTAGTCTTTAGATATAGGTATGTGTTGTTTCTCGG
ATCTGAAACAGTGCAGCTTGGGTTGTGATATTACGTGTATACACACATCAATTAACTTAA
TGTGCACACT

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 2

CO CL4758Contig1 1136 2 2 U
GGACGTTGAAATTACAACGGCTAAAAGCTGGAAAATTGGGAGGGAAATCGGAGACGCCGT
GGTCAAGGCGTCTAGTAACCCTAACCGGAGATGGTACGGACCTCACATGGCCGCATCGGT
TCGTGCAATCTCTGAACGCATACCGCTAGTTGATTTCGTACTAGAGATCAGAGACGCTCG
TATTCCCTTGTCTTCTGAGTATGAGTTGTTGAGAAAGTTTTCACTTTTTCCGTCAAAACG
GATCGTTGTGCTGAACAAGATGGAGCTTGCCGATCCTTTGGAATTGAAGAAGTGGATGGC
TTACTTTCAAGGGAGAAACTATCTGTCCTATGCAGTAAACTCACATAACAAAGAGTGTGT
CAAGAATTTTCTCAACTTCTTGCAGAGTCAAGTTAGGGAATTGCACAAGTCTGGCCATTC
TGGTCATACCACAACTATGATGCTTCTTGGGATTCCTAACGTTGGAAAATCCGCTCTCTC
CAATTCTCTTCATCAAATTGGGAGGATTAGTGCTGCAGAGAAAGGGAAGCTAAAGCATAC
AACAGTTAGTTCACAGCCTGGAGATACTAAAGACATTATGAGCTTGAAGATCGGTAGCCA
TCCTAACGTCTATGTTCTAGACACGCCTGGAGTTTTTCCTCCTAAGCTGCTTGATGCTGA
GATCTGCTCGAAGTTGGCATTAACAGGAGCTATTCCGGATGATATAGTTGGGGAGAAAGA
ACTAGCACGGTTTTGTCTGACTCTACTAAACTCGAGCCATGAATACAAGAAATGGGCAAA
ACTGTGCAGATCTCAGGATGTTACAGAAAGTTTATCCAATGAAAACTCCACGTCTAGTGC
CCAACGAAAGAGGCAGTACCCAACAGATCATACACAGGATTTTATTGTTTACGATGTACA
GAGCTGGTTCTGGTCATGTGTTTCAAAGTTTGGTGGACGAACAGAGAATGGAATCAATTG
AACAGAGTGGACAACATGTTCAGTTTGTATGGAGTCATCATTAAGATGCCTTAAATGTTT
ACATATGTTTCATCAAGGTTGTATCTTTATCATCTTTGTATGTGTTCTTGTGCTTTAAAA
ATATTGGTTTTCTTCTTCTATTTGTTCTTATTGAATCTCTCAAACTCTGAGACCGG


BQ
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AF RS1G454TF U 1
AF RS1G454JQ C 396
BS 1 563 RS1G454TF
BS 564 1136 RS1G454JQ

RD RS1G454TF 563 0 0
GGACGTTGAAATTACAACGGCTAAAAGCTGGAAAATTGGGAGGGAAATCGGAGACGCCGT
GGTCAAGGCGTCTAGTAACCCTAACCGGAGATGGTACGGACCTCACATGGCCGCATCGGT
TCGTGCAATCTCTGAACGCATACCGCTAGTTGATTTCGTACTAGAGATCAGAGACGCTCG
TATTCCCTTGTCTTCTGAGTATGAGTTGTTGAGAAAGTTTTCACTTTTTCCGTCAAAACG
GATCGTTGTGCTGAACAAGATGGAGCTTGCCGATCCTTTGGAATTGAAGAAGTGGATGGC
TTACTTTCAAGGGAGAAACTATCTGTCCTATGCAGTAAACTCACATAACAAAGAGTGTGT
CAAGAATTTTCTCAACTTCTTGCAGAGTCAAGTTAGGGAATTGCACAAGTCTGGCCATTC
TGGTCATACCACAACTATGATGCTTCTTGGGATTCCTAACGTTGGAAAATCCGCTCTCTC
CAATTCTCTTCATCAAATTGGGAGGATTAGTGCTGCAGAGAAAGGGAAGCTAAAGCATAC
AACAGTTAGTTCACAGCCTGGAG

QA 1 563 1 563
DS 

RD RS1G454JQ 741 0 0
GGGAATTGCACAAGTCTGGCCATTCTGGTCATACCACAACTATGATGCTTCTTGGGATTC
CTAACGTTGGAAAATCCGCTCTCTCCAATTCTCTTCATCAAATTGGGAGGATTAGTGCTG
CAGAGAAAGGGAAGCTAAAGCATACAACAGTTAGTTCACAGCCTGGAGATACTAAAGACA
TTATGAGCTTGAAGATCGGTAGCCATCCTAACGTCTATGTTCTAGACACGCCTGGAGTTT
TTCCTCCTAAGCTGCTTGATGCTGAGATCTGCTCGAAGTTGGCATTAACAGGAGCTATTC
CGGATGATATAGTTGGGGAGAAAGAACTAGCACGGTTTTGTCTGACTCTACTAAACTCGA
GCCATGAATACAAGAAATGGGCAAAACTGTGCAGATCTCAGGATGTTACAGAAAGTTTAT
CCAATGAAAACTCCACGTCTAGTGCCCAACGAAAGAGGCAGTACCCAACAGATCATACAC
AGGATTTTATTGTTTACGATGTACAGAGCTGGTTCTGGTCATGTGTTTCAAAGTTTGGTG
GACGAACAGAGAATGGAATCAATTGAACAGAGTGGACAACATGTTCAGTTTGTATGGAGT
CATCATTAAGATGCCTTAAATGTTTACATATGTTTCATCAAGGTTGTATCTTTATCATCT
TTGTATGTGTTCTTGTGCTTTAAAAATATTGGTTTTCTTCTTCTATTTGTTCTTATTGAA
TCTCTCAAACTCTGAGACCGG

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL4759Contig1 1257 2 8 U
GGGAGAACAAAGAGAGAGAGAGATTCAACTTCCACATAGAACCATGGGAGCAGAAAACGA
AGCCGAGCAACAAGAGAACTTGACAGCAATGAAACTACCGGTACTACCGATTAAACCTAA
CAATCACAGCCACTCTATGTCATCACCCATTCACAGTTCCATAGCAGCGTCTGTCCCCTT
TAGCTGGGAAGAAGAGCCCGGCAAGCCCAAGCAACACTCTTCTTCTTCTTCTTCATCCTC
TTCCTCGGCATTAACTTCTTATTCGTCATCTTCTCCTCAAACCCACAAGTCCTTGGAGTT
ACCACCAAGGCTACACTCACTTGAAAAGGATGGAGGATCACTTACCAAACTGAACTCACC
CATCACTGTCTTTGATGGACCTTACAGCATGACGAGATCAAGAAGGTTGGATTCACCTTC
CTTTAGGTTGCTTATGAAAGGTAGTGGTGACTGTTGTGGGTCTTTCAGGAGTGACATGTA
TGGTGATTTAGATGATGTTGATGAGGAGACCAAGCAGCAGAACATGAGTAGTGGTGGATC
TCTGGCTCTTGTGAAGAAGAGAAGGGGGCTAGGGTTTTTTGGGTTTAGCAGGAGAAGAGC
TTTGAAAAGAAAAACAGAGTTTGGTAGAGGTAGTTATGTGTTTCCATCTTCAGTGGACAG
AGAGAGTGTATGTGGAAGAAAAGAGGAGGAAGAAGGAGAAGACAAAAGCTTTGGCTATGG
AGATGGTGATGGTATTACTTGCAGCCAAAGCAGCAGGTTTTGTGAAGTGAATATTGCAAA
CATTAGCAGAACAGGGAGCTTCTTTACTCTGCCTACACCACCTTCCTTTTCAAAGTCTCA
CTTCTGGAAGAATGTGTATGCAGGACTAGAGCAAGTGGTTCCATGGAAAAACAAGAAGTC
TACAGGTTAAGGTTCTGTTCTATCAAAGATTTTGAAAGATCAAACGTCAAACCCTTTTGA
GTTTCGCAAGTCTCCTCCAACCCTTTGGTTTATGATACTAGTTTTTTCAAAATTTTCAAG
AAAATGACATTACCATTAAAAGAGTGTGAAGCCCAGCTTTTTTCACGCTTGTCGTTGTTG
TTGTGTTTGTGATGGTTTAAATGTTTTTGGAATTTTTGTAAAGAGAAAACAGAGAAGTTT
ACGATGTATCATGATTATGGGTCCAAGGGATATATATATTCACATCATGTTTGTGCTTAT
TTGGACCAGAAAACAAGGAGATTTTCTTTTATATGTAACCCAAGTGATTATATCATA


BQ
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AF RS1CV11TF U 1
AF RS1CV11JQ C 444
BS 1 591 RS1CV11TF
BS 592 592 RS1CV11JQ
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AGCCGAGCAACAAGAGAACTTGACAGCAATGAAACTACCGGTACTACCGATTAAACCTAA
CAATCACAGCCACTCTATGTCATCACCCATTCACAGTTCCATAGCAGCGTCTGTCCCCTT
TAGCTGGGAAGAAGAGCCCGGCAAGCCCAAGCAACACTCTTCTTCTTCTTCTTCATCCTC
TTCCTCGGCATTAACTTCTTATTCGTCATCTTCTCCTCAAACCCACAAGTCCTTGGAGTT
ACCACCAAGGCTACACTCACTTGAAAAGGATGGAGGATCACTTACCAAACTGAACTCACC
CATCACTGTCTTTGATGGACCTTACAGCATGACGAGATCAAGAAGGTTGGATTCACCTTC
CTTTAGGTTGCTTATGAAAGGTAGTGGTGACTGTTGTGGGTCTTTCAGGAGTGACATGTA
TGGTGATTTAGATGATGTTGATGAGGAGACCAAGCAGCAGAACATGAGTAGTGGTGGATC
TCTGGCTCTTGTGAAGAAGAGAAGGGGGCTAGGGTTTTTTGGGTTTAGCAG*AGAAGAGC
TTTGAAAAGAAAAACAGAGTTTGGTAGAG*TAGTTATGTGTTTC*ATCTTCAGTGGACAG
AGAGAGTGTATGTGGAAGAAAAGAG

QA 1 685 1 685
DS 

RD RS1CV11JQ 814 0 0
GTGGTGACTGTTGTGGGTCTTTCAGGAGTGACATGTATGGTGATTTAGATGATGTTGATG
AGGAGACCAAGCAGCAGAACATGAGTAGTGGTGGATCTCTGGCTCTTGTGAAGAAGAGAA
GGGGGCTAGGGTTTTTTGGGTTTAGCAGGAGAAGAGCTTTGAAAAGAAAAACAGAGTTTG
GTAGAGGTAGTTATGTGTTTCCATCTTCAGTGGACAGAGAGAGTGTATGTGGAAGAAAAG
AGGAGGAAGAAGGAGAAGACAAAAGCTTTGGCTATGGAGATGGTGATGGTATTACTTGCA
GCCAAAGCAGCAGGTTTTGTGAAGTGAATATTGCAAACATTAGCAGAACAGGGAGCTTCT
TTACTCTGCCTACACCACCTTCCTTTTCAAAGTCTCACTTCTGGAAGAATGTGTATGCAG
GACTAGAGCAAGTGGTTCCATGGAAAAACAAGAAGTCTACAGGTTAAGGTTCTGTTCTAT
CAAAGATTTTGAAAGATCAAACGTCAAACCCTTTTGAGTTTCGCAAGTCTCCTCCAACCC
TTTGGTTTATGATACTAGTTTTTTCAAAATTTTCAAGAAAATGACATTACCATTAAAAGA
GTGTGAAGCCCAGCTTTTTTCACGCTTGTCGTTGTTGTTGTGTTTGTGATGGTTTAAATG
TTTTTGGAATTTTTGTAAAGAGAAAACAGAGAAGTTTACGATGTATCATGATTATGGGTC
CAAGGGATATATATATTCACATCATGTTTGTGCTTATTTGGACCAGAAAACAAGGAGATT
TTCTTTTATATGTAACCCAAGTGATTATATCATA

QA 1 814 1 814
DS 



AS 1 2

CO CL4760Contig1 1183 2 2 U
GGAGTTTCGCAATTCAGATTCTAAAAAATCAACTCGATTGAGGCTTTCTGATCTAATCTA
AAAAAGATCAAAAGATGGCAGAATCAGAAGAGAGCGGAGTGTTATTCCCAATTTTCATTC
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CCAAGAAACAAAGGAGCATTCATTGTCAGTGTCTTGACTGTGACCGTTCAGGGAAGTACA
AGAGATCCGTCTCTCAAAAAGTCTCTAGCTTTACTTCATGTAGCAACTTGACGGTTGTGC
TTCTCTGGTTTGTAGTGGTCTTCTTGATTTCTTACACTAAGAACATCAGCCGTGAGAGGC
AACTCTTTGAACCATTCGGTATACTTGGTTTGGAACCTGGTGCTTCAGATTCACAAATCA
AGAAAGCATATAGAAAACTCTCTATTCAATACCATCCTGATAAAAATCCAGATCCAGAGG
CCAACAAATACTTTGTGGAGTCAATAGCTAAAGCTTACCAAGCTTTGACTGATCCGTTAT
CTCGTGAAAACTTTGAGAAGTACGGTCATCCTGATGGCAGACAGGGTTATAAACTGGGAA
TTGCTCTACCTCAGTTTATCCTAGACCTAAATGGAGAATCTGGTGGGCTATTGTTGCTGT
TTACAGTTGGTTTCTGTATTCTATTGCCGCTAGTGGTCGCCTCCATCTATCTCTGGAGAT
CTTCAAAGTACACTGGGAACTACGTCAAGCTCCAAACTCGTCAAGCGTATTACGAGTTAA
TGAAACCCTCTTTGACTACAAGCAAGGTTATGGAAATTTTCATCAAAGCAGCTGAGTACA
CAGAGATTCCAGTTCGTAAAACTGATGATGATACTCTGAAGAAACTCTTTACGTCTGTCA
AAAGCGAGCTGAGTCTGGACCCTAAGAAGATGAGGCAAGATGAAGCTAAGTTTTGGAAAC
AGGATCCTGCAATTAGCAAGGCTGAGCTTTTGATACAGAAACAGTTAACTCGTGAATCAG
CAGTTTTGTCTCCAACTCTGCAAAGTGATTTCAGGCGTGTACTAGAGTTTGCACCTCGTC
TCCTTGAAGATTTAATAAAGATGGCGGTTATACCCCACAATGAGAAAGGTCATGGATGGT
TAAGTCCTGCACTTGGAGTCATTGAGCTATCTCAATGCATTGT


BQ
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AF RS1BV44TF U 1
AF RS1FY41TF U 584
BS 1 755 RS1BV44TF
BS 756 1183 RS1FY41TF

RD RS1BV44TF 771 0 0
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AAAAAGATCAAAAGATGGCAGAATCAGAAGAGAGCGGAGTGTTATTCCCAATTTTCATTC
TGACAATCATCGCAATTCCATTGGTGCCTTACACATTCGTGAAGCTAAGCCGCGCTTTTT
CCAAGAAACAAAGGAGCATTCATTGTCAGTGTCTTGACTGTGACCGTTCAGGGAAGTACA
AGAGATCCGTCTCTCAAAAAGTCTCTAGCTTTACTTCATGTAGCAACTTGACGGTTGTGC
TTCTCTGGTTTGTAGTGGTCTTCTTGATTTCTTACACTAAGAACATCAGCCGTGAGAGGC
AACTCTTTGAACCATTCGGTATACTTGGTTTGGAACCTGGTGCTTCAGATTCACAAATCA
AGAAAGCATATAGAAAACTCTCTATTCAATACCATCCTGATAAAAATCCAGATCCAGAGG
CCAACAAATACTTTGTGGAGTCAATAGCTAAAGCTTACCAAGCTTTGACTGATCCGTTAT
CTCGTGAAAACTTTGAGAAGTACGGTCATCCTGATGGCAGACAGGGTTATAAACTGGGAA
TTGCTCTACCTCAGTTTATCCTAGACCTAAATGGAGAATCTGGTGGGCTATTGTTGCTGT
TTACAGTTGGTTTCTGTATTCTATTGCCGCTAGTGGTCGCCTCCATCTATCTCTGGAGAT
CTTCAAAGTACACTGGGAACTACGTCAAGCTCCAA
CTCGTCAGCGTATATG

QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1FY41TF 600 0 0
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TGGGCTATTGTTGCTGTTTACAGTTGGTTTCTGTATTCTATTGCCGCTAGTGGTCGCCTC
CATCTATCTCTGGAGATCTTCAAAGTACACTGGGAACTACGTCAAGCTCCAAACTCGTCA
AGCGTATTACGAGTTAATGAAACCCTCTTTGACTACAAGCAAGGTTATGGAAATTTTCAT
CAAAGCAGCTGAGTACACAGAGATTCCAGTTCGTAAAACTGATGATGATACTCTGAAGAA
ACTCTTTACGTCTGTCAAAAGCGAGCTGAGTCTGGACCCTAAGAAGATGAGGCAAGATGA
AGCTAAGTTTTGGAAACAGGATCCTGCAATTAGCAAGGCTGAGCTTTTGATACAGAAACA
GTTAACTCGTGAATCAGCAGTTTTGTCTCCAACTCTGCAAAGTGATTTCAGGCGTGTACT
AGAGTTTGCACCTCGTCTCCTTGAAGATTTAATAAAGATGGCGGTTATACCCCACAATGA
GAAAGGTCATGGATGGTTAAGTCCTGCACTTGGAGTCATTGAGCTATCTCAATGCATTGT

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 2

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TTAGTTTCACAGTCTTCTCTTGAGCTGCGTCTCGACGCTTATGGTCACTCCCTCTCTATT
CTCCAGTCTCCGTGTTCACTGAACACGCCTGGAGTAACGGGGTCAGTGATGTGGGACAGT
GGAGTGGTGTTAGGGAAGTTCTTGGAGCACTCTGTTGATTCCAAGCTTCTTTCTCTTGAA
GCCAAGAAGATCGTTGAGCTGGGTTCTGGTTGTGGCTTAGTTGGTTGTGTCGCAGCGCTT
TTGGGAGGGAATGTTGTACTCACTGATCCCCCGGATAGACTGAGGCTACTTAAGAAGAAC
GTCGATACCAATCTGCAACGTGGTGGTAACACAAGGGGATCTGCTGTTGTGCAGGAACTT
GTTTGGGGAGATGACCCTGATCCAGATTTGATTGAACCGTTCCCTGATTACGTATTGGGC
TCAGATGTTATCTACAGCGAAGAAGCTGTTCACCATTTGATCCAAACGCTTGTGCAACTC
TGCGGCGATCAAACTACAATCTTCCTATCAGGAGAACTACGGAATGATGCTGTTCTTGAG
TACTTCTTAGAATTTGCGCTGAAACATTTTGCGATAGGGCGTGTGGAGCAAACACAGTGG
CATCCGGATTATCGCAGCCGTAGAGTAGTGCTTTACGTTCTTGAGAAGAAGTCGAAGAGA
TGCCTCGCTGATGTTTCTTCGCTTAATCAATCTTGTTAGCCCATTGAGGTTTGTTTTGTT
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ATGGCTGTTTACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AG32TF U 69
AF RS1AG32JQ C 1
BS 1 68 RS1AG32JQ
BS 69 571 RS1AG32TF
BS 572 854 RS1AG32JQ

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GAATGTTGTACTCACTGATCCCCCGGATAGACTGAGGCTACTTAAGAAGAACGTCGATAC
CAATCTGCAACGTGGTGGTAACACAAGGGGATCTGCTGTTGTGCAGGAACTTGTTTGGGG
AGATGACCCTGATCCAGATTTGATTGAACCGTTCCCTGATTACGTATTGGGCTCAGATGT
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TCAAACTACAATCTTCCTATCAG
AGAACTA

QA 1 503 1 503
DS 

RD RS1AG32JQ 854 0 0
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GGAGTGGTGTTAGGGAAGTTCTTGGAGCACTCTGTTGATTCCAAGCTTCTTTCTCTTGAA
GCCAAGAAGATCGTTGAGCTGGGTTCTGGTTGTGGCTTAGTTGGTTGTGTCGCAGCGCTT
TTGGGAGGGAATGTTGTACTCACTGATCCCCCGGATAGACTGAGGCTACTTAAGAAGAAC
GTCGATACCAATTTGCAACGTGGTGGTAACACAAGGGGATTTGCTGTTGTGCAGGAACTT
GTTTGGGGAGATGACCCTGATCCAGATTTGATTGAACCGTTCCCTGATTACGTATTGGGC
TCAGATGTTATTTACAGCGAAGAAGCTGTTCACCATTTGATCCAAACGCTTGTGCAACTT
TGCGGCGATCAAACTACAATTTTCCTATCAGGAGAACTACGGAATGATGCTGTTCTTGAG
TACTTCTTAGAATTTGCGCTGAAACATTTTGCGATAGGGCGTGTGGAGCAAACACAGTGG
CATCCGGATTATCGCAGCCGTAGAGTAGTGCTTTACGTTCTTGAGAAGAAGTCGAAGAGA
TGCCTCGCTGATGTTTCTTCGCTTAATCAATCTTGTTAGCCCATTGAGGTTTGTTTTGTT
TTGTTTACACTACAGTGTATGATGACGTACCACTTAACGTGTTGAGATATTATAAACGAT
ATGGCTGTTTACTT

QA 1 854 1 854
DS 



AS 1 2

CO CL4762Contig1 970 2 2 U
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GCCATGGCCTTTCAGATTATAGCTTCTTCTTCTTCACTAACGATTGCACAATCTCACCTT
CTCTCCTTCCCTCCTCTACGATCTTCCTATAAAGCTTCGAGCTTTAACCTCTCCTCATGG
GTCTCTCTCTCGGGCTCGTCTCGTTTCTCTCCCTACATTGGTTTAAAGCATATGGGCATC
TCCATCTCCCCGAAATCTTCAAACCCAGAGAAGGAGAGAAGATTTAAAAATGGTTTGGTG
ATTCGTGCGTCTTTGTTTGGCGTTGGAGCACCCGAGGCTTTGGTTATTGGTGTTGTCGCT
TTGTTAGTCTTTGATCCTAAAGGCCTTGCAGAGGTAGCTAGAACTCTTGGGACAACACTG
CGTACATTTCAGCCCACCATTAGAGAGCTACAGGATGTTTCAAGAGATTTCAAAAGCACC
CTTGAGCGTGAAATTGGCCTCGATGAAATCTCAACACCAGATGTCTACAACCAGAGCAGA
ATGAACAGTGCTCGCCCTCCTCCAACATTAGTTAGTAGCAGTGAAGATTCTGTGACTACA
AGTGAGCCCAATGATGCTCAATCACCAAAAGCTTACACAACTGAAGATTACCTCAAGATC
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ACTCAAGAACCGCTGCAACCACCAGAGCCTGAAGTTACATTGAGAGAGACCATGTCTGCA
TCTCCTTCAAGGCAAGATTGAAAGGCACCAAAAATTTGACTCATGTGTATTTATGTTCTA
TTCGTTTCCTAGTTAATGTTTATAAATGGGGGTTGTTAGTTAATTATCGTCCTATCTTGA
ATGATTGACTAAAGATGGTTAATAGGGAAAAAGACCTTAATATTACAAATTTATATGATT
TTAGAACATT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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BS 788 970 RS1A882JQ

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TCTCCTT

QA 1 787 1 787
DS 

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GTGAGCCCAATGATGCTCAATCACCAAAAGCTTACACAACTGAAGATTACCTCAAGATCA
CTGAAGAGCAGCTCAAAGCTTCGTCTCCTGGTAAAAGCCAAGCAGAGGATCAAACTCGGA
CTCAAGAACCGCTGCAACCACCAGAGCCTGAAGTTACATTGAGAGAGACCATGTCTGCAT
CTCCTTCAAGGCAAGATTGAAAGGCACCAAAAATTTGACTCATGTGTATTTATGTTCTAT
TCGTTTCCTAGTTAATGTTTATAAATGGGGGTTGTTAGTTAATTATCGTCCTATCTTGAA
TGATTGACTAAAGATGGTTAATAGGGAAAAAGACCTTAATATTACAAATTTATATGATTT
TAGAACATT

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 2

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TTGGC


BQ
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AF RS1G531JQ C 1
AF RS1G531TF U 1
BS 1 485 RS1G531TF

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TTGGC

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AAAAAATCATCGGTGGTGGCCTCCGGGAGGTCATGAAAACGCCGGTAAACCAGAATGGCA
CTAGAAGATTCGGACGGTGGTTTGTTGGAAAGCCAACGAAAAGTTCTGCTAAGGTTTCGG
ATCCCGCGACGATTGAGTGATAAAGAAGAAGAAACATGTTCTCTTGTTTTCCTTTCTTCA
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GTTTGTAAACGTTGTAAAATATGAACATATGAGCAACACTATGATTATGGAATGGAACTT
TTGGC

QA 1 485 1 485
DS 



AS 1 2

CO CL4764Contig1 1059 2 2 U
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ACCCCTGGAAGAGATGGAAGTGTTGGTTTAAGCGTGATAAGCCGGTTAGCAGAAGAATTC
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BQ
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AF RS1EM95TF U 1
AF RS1EM95JQ C 464
BS 1 637 RS1EM95TF
BS 638 1059 RS1EM95JQ

RD RS1EM95TF 637 0 0
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CTGGTTAGAAGATGCGGTGGAGGCCCCAAGGGAAATGAGTCAGGGGAGGTGCAAGTGCAG
GCATCAGTACTATCCGAACTTCAGCGCAGGCTTCTGAGAACCGAAGCTGCTCTTCGTGAG
AAAGAAGAGGAGAACGAGATTCTCAGACAGAGACTCCAGCAGTACGACAACAGGTGGTCT
GAATATGAAACAAAGATGAAATCCATGGAAGAGATTTGGCAAAAGCAAATGAGATCATTG
CAGTCCAGTCTTTCCATTGCAAAGAGAAGCCTAGATGTCGAGGGTTCACCCAGATACTCG
GATGCATCTGTGAACGCTAGCTACTGCGCAAGTGATTTCTCTGGAAGCTATGATTTCAGA
ACCCCTGGAAGAGATGGAAGTGTTGGTTTAAGCGTGATAAGCCGGTTAGCAGAAGAATTC
GGACAGAGAGCTCAGGTGTTTGGAGACGACACAAAGTTCTTGATGGAAGTGAAATCTGGT
AAGGTGGAAGCGAACTTGAGTCCTGAAAGGGAGCTAA

QA 1 637 1 637
DS 

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GGTTAGCAGAAGAATTCGGACAGAGAGCTCAGGTGTTTGGAGACGACACAAAGTTCTTGA
TGGAAGTGAAATCTGGTAAGGTGGAAGCGAACTTGAGTCCTGAAAGGGAGCTAAGGAGGC
TGAAACAGATGTTTGAGACTTGGAAGAAGGACTATGGAGGGAGACTAAGGGAAACGAAAA
CGATACTTAGCAGACTTGGGAGTGAAGAAACTGGTGGTTCACCTTCAGTGGAGAGGGTGA
AGTCCAAGTGGTGGGGGAGGTTAAGGAGTACCAGGTTTTAATGGTATGTTCCTTTTCTTG
AGACTCACGTCTCTTTGTTTTTTATCTTTACACGTTTGATGTTTGTCTGAGGTTTTGGTT
TTGTTGCTGAGAGAGGTGAGAAGGCTCATGGGACTATTAATGAGTCCAAATCTACTGGCA
AGTTCAGTAAATATTTTTTTATACATTAAACCTGTATTGATATCCATTTGTCCCAAGACT
ATGTGGACTGACCAGTGTTGTGGAAACATATAAAGCATCAATAAAAATATGTTTGC

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 2

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TCAAAAGAGTTTTCAGTGTCTTCTTATATTAAAAATCGAGAGTGGATGGATCGACACATT
GATCCAGTTGATAATAATGTTTCAAGAGAGTTTAGTGAAAGTGTTGAAGTTTTTGTCGCA
TTTGACTCGAATCAAAATTCTTTCATAGAGCGGAAAACCATGTTATGTCCTTGTGCAAGA
TGTTAAAACCGAAAGCAACCTGATGCAAGAGCCGTATGTCGCCATCTTTACTGAGTCGGC
TTCAAAAGTAATTATTATGTATAGTAAAGCCATGGAGAAAGCTACTATGACACTGGAGAA
TCATCGACGGGAGGTCAATTTATGGGAGATGAAGCAAGGTATGCGGAATACGGGCCATAT
GGAGATTACATTTCAGGAGGATACTTTGGGTCACCAGAAAATGTGATGAAAGAACCCAAT
GAAGAGCAATATGAAGAAATATTTTTTGAAGCTTTTAAAACCTCTAATCAACCACTATAT
TATGGATATTCTGAAGGTATTTTTCAACTATATTTGGCATCTCATTTAATGAAAATAAAA
ATTGATTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BN38JQ C 1
AF RS1BN38TF U 126
BS 1 125 RS1BN38JQ
BS 126 609 RS1BN38TF

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GGAAGAACCATAATAACTTAAACGAGAGTGAAAATATCAAACAATTTTTCCCAAAAAGAA
TCAAAAGAGTTTTCAGTGTCTTCTTATATTAAAAATCGAGAGTGGATGGATCGACACATT
GATCCAGTTGATAATAATGTTTCAAGAGAGTTTAGTGAAAGTGTTGAAGTTTTTGTCGCA
TTTGACTCGAATCAAAATTCTTTCATAGAGCGGAAAACCATGTTATGTCCTTGTGCAAGA
TGTTAAAACCGAAAGCAACCTGATGCAAGAGCCGTATGTCGCCATCTTTACTGAGTCGGC
TTCAAAAGTAATTATTATGTATAGTAAAGCCATGGAGAAAGCTACTATGACACTGGAGAA
TCATCGACGGGAGGTCAATTTATGGGAGATGAAGCAAGGTATGCGGAATACGGGCCATAT
GGAGATTACATTTCAGGAGGATACTTTGGGTCACCAGAAAATGTGATGAAAGAACCCAAT
GAAGAGCAATATGAAGAAATATTTTTTGAAGCTTTTAAAACCTCTAATCAACCACTATAT
TATGGATATTCTGAAGGTATTTTTCAACTATATTTGGCATCTCATTTAATGAAAATAAAA
ATTGATTAT

QA 1 609 1 609
DS 

RD RS1BN38TF 484 0 0
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AAACCGAAAGCAACCTGATGCAAGAGCCGTATGTCGCCATCTTTACTGAGTCGGCTTCAA
AAGTAATTATTATGTATAGTAAAGCCATGGAGAAAGCTACTATGACACTGGAGAATCATC
GACGGGAGGTCAATTTATGGGAGATGAAGCAAGGTATGCGGAATACGGGCCATATGGAGA
TTACATTTCAGGAGGATACTTTGGGTCACCAGAAAATGTGATGAAAGAACCCAATGAAGA
GCAATATGAAGAAATATTTTTTGAAGCTTTTAAAACCTCTAATCAACCACTATATTATGG
ATATTCTGAAGGTATTTTTCAACTATATTTGGCATCTCATTTAATGAAAATAAAAATTGA
TTAT

QA 1 484 1 484
DS 



AS 1 2

CO CL4766Contig1 1257 2 2 U
GTATGAAAATGCCAAGCAGCAGACAAATAATGCATTTGATACCTCACAGACAAGCATGCA
GAATCTTGCTTCATTAACAAATGTGATGCAAGGGTATTCAGACGCTACTCCAAACACTCT
ATTGGGACAAACAGCACAAAGTGCGAGGGAGCTTGAGCTTCAGTACTCGACTTTCCCAGG
AGGACAGTCTATGCCATCAAGAAGCAACGATTACTCACTAAATGACCAAAGCATTTCTAT
GCCAGAGGCGCTAAGAGATGGTGGTGGTATTCAAACAACGCAGCCAAGCCAGCAGCAGAA
CTTACCCGGTGCCAATGTTGCTACTGGACCAGCTCTTCCTCAAGGACCTCAACAGCTTCC
AATGCACCCTTATTCTCAGCACACTGTGCCTCTAACTCACTTTGCCAACATGATCAGTTA
CCCTTTGATGCCTCAGGGCTACCCATACATGCCCTCGGCTTTCCAGCAAGCATTTTCTGG
TAATAGCCCATACCACCAGTCACCTGCCGCTTTGCTTCCTCAGTACAAAAACAACATTTC
CCCCAGTAGTTTGCCTCAGTCCGCCCCCATCTCCTCCCCATATGGATTCGGGAATTCGAG
CAATGTTGGAGCCGGAAACTTCTCTCTTAACCAACAACAACAACAACAGGCAGCTCCTAC
CGGTGCAACACTTAGTTATGAAGACGCTCTTAGTCTACAATACAAACAGAACAGCCATCT
TTTGTCACTTCAGCAACAACACCAACAACAACAACAGCAGAATGAAAACTCGGCTGTGTG
GCTTCATGGACCTGGTTCTCAAACAATGTCGAGTGTCCAGAGCAATGCGTACTACAACCT
TCAAGCACAACAGCAAGCTCAGCAATTCCGACAAGCTCAGCAACAGGCGCAACAGCAGTA
TGGATCGCTCGGTTACCCAAACTACTATCAGTCACAAACCGGAATGTCAATAGAGCACCA
ACAGCGAAACCCAAGGGAAGGTTGCTCGCAAGGCCAGCCCTCAAAGCAAACACCGCAGCA
GCACCTATGGCAAAACTCTTACTAGGTGGCGGTTTCAGTCCACCGCTCAGGCCTCATGGT
TGTGTACTATAAAGCTGATAACCGGTTATACAGGTTATCGGTTTATTTGAGTTTGTTGGG
TAGGTAGGCTGAAGAGGGAAAAAGGACGGATCTTCAGAGTGTCTGTGTGAGTGTATTTAT
CTTCTTCTGTTAACTTAGGGAACAAGCAAACTCTAATCTTTATCAATGCAACTAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CS51TF U 1
AF RS1CS51JQ C 540
BS 1 713 RS1CS51TF
BS 714 1257 RS1CS51JQ

RD RS1CS51TF 713 0 0
GTATGAAAATGCCAAGCAGCAGACAAATAATGCATTTGATACCTCACAGACAAGCATGCA
GAATCTTGCTTCATTAACAAATGTGATGCAAGGGTATTCAGACGCTACTCCAAACACTCT
ATTGGGACAAACAGCACAAAGTGCGAGGGAGCTTGAGCTTCAGTACTCGACTTTCCCAGG
AGGACAGTCTATGCCATCAAGAAGCAACGATTACTCACTAAATGACCAAAGCATTTCTAT
GCCAGAGGCGCTAAGAGATGGTGGTGGTATTCAAACAACGCAGCCAAGCCAGCAGCAGAA
CTTACCCGGTGCCAATGTTGCTACTGGACCAGCTCTTCCTCAAGGACCTCAACAGCTTCC
AATGCACCCTTATTCTCAGCACACTGTGCCTCTAACTCACTTTGCCAACATGATCAGTTA
CCCTTTGATGCCTCAGGGCTACCCATACATGCCCTCGGCTTTCCAGCAAGCATTTTCTGG
TAATAGCCCATACCACCAGTCACCTGCCGCTTTGCTTCCTCAGTACAAAAACAACATTTC
CCCCAGTAGTTTGCCTCAGTCCGCCCCCATCTCCTCCCCATATGGATTCGGGAATTCGAG
CAATGTTGGAGCCGGAAACTTCTCTCTTAACCAACAACAACAACAACAGGCAGCTCCTAC
CGGTGCAACACTTAGTTATGAAGACGCTCTTAGTCTACAATACAAACAGAACA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RS1CS51JQ 718 0 0
CCCCCAGTAGTTTGCCTCAGTCCGCCCCCATCTCCTCCCCATATGGATTCGGGAATTCGA
GCAATGTTGGAGCCGGAAACTTCTCTCTTAACCAACAACAACAACAACAGGCAGCTCCTA
CCGGTGCAACACTTAGTTATGAAGACGCTCTTAGTCTACAATACAAACAGAACAGCCATC
TTTTGTCACTTCAGCAACAACACCAACAACAACAACAGCAGAATGAAAACTCGGCTGTGT
GGCTTCATGGACCTGGTTCTCAAACAATGTCGAGTGTCCAGAGCAATGCGTACTACAACC
TTCAAGCACAACAGCAAGCTCAGCAATTCCGACAAGCTCAGCAACAGGCGCAACAGCAGT
ATGGATCGCTCGGTTACCCAAACTACTATCAGTCACAAACCGGAATGTCAATAGAGCACC
AACAGCGAAACCCAAGGGAAGGTTGCTCGCAAGGCCAGCCCTCAAAGCAAACACCGCAGC
AGCACCTATGGCAAAACTCTTACTAGGTGGCGGTTTCAGTCCACCGCTCAGGCCTCATGG
TTGTGTACTATAAAGCTGATAACCGGTTATACAGGTTATCGGTTTATTTGAGTTTGTTGG
GTAGGTAGGCTGAAGAGGGAAAAAGGACGGATCTTCAGAGTGTCTGTGTGAGTGTATTTA
TCTTCTTCTGTTAACTTAGGGAACAAGCAAACTCTAATCTTTATCAATGCAACTAAAA

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

CO CL4767Contig1 808 2 4 U
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TTCTAAATTACGAGATCGTCGGAGGCCAATTATGGTGGCCGGACAAATCAAAGCCCATGA
AAGTCAATAACGTGGAAGCATTCGGAATATCAGTTGAAACAATTTTAAAGTCCATGGCTA
CACACCCGAACTACACCGGTTTAACCATCGTGAGAACATGGTCGCCTGATCACTACGAGG
GTGGGGCTTGGAACACAGGAGGTTCATGCACCGGGAAAGAAGAACCCATCCTCCCAGGGA
AGCTAGTGGAAAACGGGTTCACGGAGATAATGCACGAGAAGCAAGCAACGGGGTTTAACA
GAGCTTTGGAGGGAGTGGCGGACAGCTCGAAACTTAAGTTAAAGCTTATGGATATTACAG
AGGCTTTCGGATATCGACATGATGGTCATCCTGGTCCGTACAGGAGTCCTGACCCAAAGA
AGATCACTAAAAGGGGACCGGATGGACGACCTCCACCTCAAGACTGCTTGCACTGGTGCA
TGCCGGGACCGGTTGATACATGGAACGAAATGGTTTTGGAGCTCATAAGGAGAGACGTGG
AAGGCAGTAAAAGGAATAGCTGATGAGTTACATATACTATTAATATGATTATTGATCGAT
ATGATAAACCAAAGATAAACTCTCACTTGTAGAGTTTTTGTCAACCACGGTGAGGTAGAA
TTAGGATTGTTTTGATCGTATTTCTTCCATGTTCGCTTGTGTCTTTGAGATTTAAAGCTA
TTTTCCTCTATTTGATTTTACTTTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DL96TF U 1
AF RS1DL96JQ C 111
BS 1 589 RS1DL96TF
BS 590 590 RS1DL96JQ
BS 591 599 RS1DL96TF
BS 600 808 RS1DL96JQ

RD RS1DL96TF 599 0 0
GGAAGTTCGACGTGGTTGTCCTGTCATCAGGTCACTGGTTTGCAAAGCAATCTGTCTACG
TTCTAAATTACGAGATCGTCGGAGGCCAATTATGGTGGCCGGACAAATCAAAGCCCATGA
AAGTCAATAACGTGGAAGCATTCGGAATATCAGTTGAAACAATTTTAAAGTCCATGGCTA
CACACCCGAACTACACCGGTTTAACCATCGTGAGAACATGGTCGCCTGATCACTACGAGG
GTGGGGCTTGGAACACAGGAGGTTCATGCACCGGGAAAGAAGAACCCATCCTCCCAGGGA
AGCTAGTGGAAAACGGGTTCACGGAGATAATGCACGAGAAGCAAGCAACGGGGTTTAACA
GAGCTTTGGAGGGAGTGGCGGACAGCTCGAAACTTAAGTTAAAGCTTATGGATATTACAG
AGGCTTTCGGATATCGACATGATGGTCATCCTGGTCCGTACAGGAGTCCTGACCCAAAGA
AGATCACTAAAAGGGGACCGGATGGACGACCTCCACCTCAAGACTGCTTGCACTGGTGCA
TGCCGGGACCGGTTGATACATGGAACGAAATGGTTTTGGAGCTCATAAG*AGAGACGTG

QA 1 599 1 599
DS 

RD RS1DL96JQ 698 0 0
AAGCCCATGAAAGTCAATAACGTGGAAGCATTCGGAATATCAGTTGAAACAATTTTAAAG
TCCATGGCTACACACCCGAACTACACCGGTTTAACCATCGTGAGAACATGGTCGCCTGAT
CACTACGAGGGTGGGGCTTGGAACACAGGAGGTTCATGCACCGGGAAAGAAGAACCCATC
CTCCCAGGGAAGCTAGTGGAAAACGGGTTCACGGAGATAATGCACGAGAAGCAAGCAACG
GGGTTTAACAGAGCTTTGGAGGGAGTGGCGGACAGCTCGAAACTTAAGTTAAAGCTTATG
GATATTACAGAGGCTTTCGGATATCGACATGATGGTCATCCTGGTCCGTACAGGAGTCCT
GACCCAAAGAAGATCACTAAAAGGGGACCGGATGGACGACCTCCACCTCAAGACTGCTTG
CACTGGTGCATGCCGGGACCGGTTGATACATGGAACGAAATGGTTTTGGAGCTCATAAGG
AGAGACGTGGAAGGCAGTAAAAGGAATAGCTGATGAGTTACATATACTATTAATATGATT
ATTGATCGATATGATAAACCAAAGATAAACTCTCACTTGTAGAGTTTTTGTCAACCACGG
TGAGGTAGAATTAGGATTGTTTTGATCGTATTTCTTCCATGTTCGCTTGTGTCTTTGAGA
TTTAAAGCTATTTTCCTCTATTTGATTTTACTTTTGAC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL4768Contig1 821 2 2 U
GCCTCAGAGACAATCTGGAGATTTACACAAGTGATTACACAGTTCAAGTTCTTGTCGGAT
ATTGTCTGGTGTATGTTTTTATGCAGACGTTCATGATTCCCGGAACTGTGTTCATGTCAT
TGCTTGCCGGTGCTCTCTTTGGAGTTATCAAAGGGATGGCTCTCGTTGTCTCCACCGCGA
CAGCTGGTGCTTCCTCTTGCTTCTTCCTCTCTAAGCTCATCGGTAGACCTTTGATCTTCT
CCCTTTGGCCCGACAAGCTCGTCTTCTTCCAAGATCAGGTCGCCAGGAGGAAAGACGGGT
TGCTGAACTATATGCTCTTCTTGAGACTAACACCGACGTTGCCTAACACGTTCATTAATG
TTGCTTCTCCTATTGTTGATGTTCCTTACCATATCTTCTTCCTCGCTACATTCATCGGTC
TGATTCCTGCTGCTTATGTCACTGTCCGGGCTGGGATCGCTCTTGGAGAGCTGAAATCAT
TGGGAGATCTCTATGACTTCAACTCTATGGCGACTCTGTTTCTCATTGGTGTGCTCTCTG
TGACTCCAACTCTAATTAGCAAGAAAAAGGTGTAAGAAGAAGAAGAGACAAAGCCTTCTC
ATGGATACAGTGATGATGACGATGAAGATGATGATGAGAACATTGCAAAAGCCTCATTTG
TGTATATATTTTAGAATGTTTAGTACCAATTTCAAATCCCACATGTTCTCTACATGCTTT
TAAACTTAAAAAAATGTACTGGAATACATCTCAAACGGGTTGCACTTTCATGGGCCTTTG
AACAACGTGTTTATAGGCCTGGTTTATAATCTAAGTTATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GZ03TF U 1
AF RS1GZ03JQ C 82
BS 1 565 RS1GZ03TF
BS 566 821 RS1GZ03JQ

RD RS1GZ03TF 565 0 0
GCCTCAGAGACAATCTGGAGATTTACACAAGTGATTACACAGTTCAAGTTCTTGTCGGAT
ATTGTCTGGTGTATGTTTTTATGCAGACGTTCATGATTCCCGGAACTGTGTTCATGTCAT
TGCTTGCCGGTGCTCTCTTTGGAGTTATCAAAGGGATGGCTCTCGTTGTCTCCACCGCGA
CAGCTGGTGCTTCCTCTTGCTTCTTCCTCTCTAAGCTCATCGGTAGACCTTTGATCTTCT
CCCTTTGGCCCGACAAGCTCGTCTTCTTCCAAGATCAGGTCGCCAGGAGGAAAGACGGGT
TGCTGAACTATATGCTCTTCTTGAGACTAACACCGACGTTGCCTAACACGTTCATTAATG
TTGCTTCTCCTATTGTTGATGTTCCTTACCATATCTTCTTCCTCGCTACATTCATCGGTC
TGATTCCTGCTGCTTATGTCACTGTCCGGGCTGGGATCGCTCTTGGAGAGCTGAAATCAT
TGGGAGATCTCTATGACTTCAACTCTATGGCGACTCTGTTTCTCATTGGTGTGCTCTCTG
TGACTCCAACTCTAATTAGCAAGAA

QA 1 565 1 565
DS 

RD RS1GZ03JQ 740 0 0
TGCAGACGTTCATGATTCCCGGAACTGTGTTCATGTCATTGCTTGCCGGTGCTCTCTTTG
GAGTTATCAAAGGGATGGCTCTCGTTGTCTCCACCGCGACAGCTGGTGCTTCCTCTTGCT
TCTTCCTCTCTAAGCTCATCGGTAGACCTTTGATCTTCTCCCTTTGGCCCGACAAGCTCG
TCTTCTTCCAAGATCAGGTCGCCAGGAGGAAAGACGGGTTGCTGAACTATATGCTCTTCT
TGAGACTAACACCGACGTTGCCTAACACGTTCATTAATGTTGCTTCTCCTATTGTTGATG
TTCCTTACCATATCTTCTTCCTCGCTACATTCATCGGTCTGATTCCTGCTGCTTATGTCA
CTGTCCGGGCTGGGATCGCTCTTGGAGAGCTGAAATCATTGGGAGATCTCTATGACTTCA
ACTCTATGGCGACTCTGTTTCTCATTGGTGTGCTCTCTGTGACTCCAACTCTAATTAGCA
AGAAAAAGGTGTAAGAAGAAGAAGAGACAAAGCCTTCTCATGGATACAGTGATGATGACG
ATGAAGATGATGATGAGAACATTGCAAAAGCCTCATTTGTGTATATATTTTAGAATGTTT
AGTACCAATTTCAAATCCCACATGTTCTCTACATGCTTTTAAACTTAAAAAAATGTACTG
GAATACATCTCAAACGGGTTGCACTTTCATGGGCCTTTGAACAACGTGTTTATAGGCCTG
GTTTATAATCTAAGTTATCT

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL4769Contig1 778 2 6 U
GGACACAGATGGCGGCGAGCGCGTGTCTCCGACTGCCGGCGGCGATGTCTGTCCGGCGAG
AGGAAGGAGTTCCGAATTCAAAATCTTCGCAGGAAAAACCGAGACTTTATCTCAACAAAC
CTTCATGGATAGTCACAACTCAGTGTGGCGCTAAGACGAGGAGAAAGGAGAAGGGTCGAT
GCGTAATCTGCCATGAAACTGGAAGAGTGGACTGTTTCAATTGTAGCGGAAAAGGTAACG
AACTCTGTTTCTCAACGTTTAGTGTCTCATCATCTTATGATGTTTGCTTGCATGTTTGTG
ATGTATATGATTCAAAGGGAGGACTAATTTCGTGGATATGGAGATGCTTCCAAGAGGAGA
GTGGCCCAAATGGTGCAGGAGCTGTGGAGGGAGTGGGTTATGTGAATGCTCTCGCTGTCT
TGGCACTGGAGAGTACAGATATATTATGGGTTTCCGGTTCTTAAACAAAGAGGATGACGT
CGATCCACAGTTATGATATGCTATAACTCTGGTGGTGCTGTTTCCTTACCAGTTGTTTTG
TATGTTTTCAATGATGAATAGTGAAAACTTTAGTATGTTAGATATGATTGCTCAGGTTTT
TCTCTTCAACCTTAATGCTCATCATGTTGCATACGAAGAGAAATCAACACATCCTGTGTC
CTTTGAGCCCACAAGTCCTTTTGGAAGATGATGTAAACACTTTTGGATCTTGATTTGTTC
CTTTTGGAAGATGATGTAAACGCTTGTGAATCTTGATTTGCAAAATGGTTGGATCTGC


BQ
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ATGTGAATGCTCTCGCTGTCTTGGCACTGGAGAGTACAGATATATTATGGGTTTCCGGTT
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GTTTCCTTACCAGTTGTTTTGTATGTTTTCAATGATGAATAGTGAAAACTTTAGTATGTT
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GCAAAATGGTTGGATCTGC

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AF RS1BG07TF U 1
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AAAAGGTTATATTGTCTTTTTGAGATAAAAGATGGTCTGATGATGACGATGATGATTATA
CTTTGATTAGCTTATAAACATGTTTTTTTTTCTTTTTCTTTTGGGGTTTAGTGATTTTCA
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TTAC

QA 1 484 1 484
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AS 0 0

AS 1 2

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CAAAAAATATTTTAAGAAAGCATTTGATTTTTAGTTTAATCTTGTAAATGCATGTATTTG
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GTACTATATTTACTCGATTCGTTTTGCATTTGGATTGAATAATTGTATTTTCCATCCTGG
CTAGCTGTTGAAACAAGAATACTTTTCCAAGTTTAGAATAGTTATGCTCACATACACAAC
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GAGGAGGAATCTCGTGATGAACCATTTCAAGAGAGGATAGAGTAGTCTAAGGAGAGAGAG
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BQ
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AF RS1DF79JQ C 566
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BS 703 1288 RS1DF79JQ

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TGAGAAGGGACAACAACGGCGGCACCGGAGCTAATATTTATGATAGCTCCTCGACGGCGG
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ATGATTTTGGTCCATGTGAGTTGGTCAACCTCGTGGAAGAACATGGCTCGTGGGTAAGTT
ATCCCAACGTTGTTTATCAGAATTCCAACTTCAAGGTCTTTGATCCCCTCCTCGATAGCT
TCATATCCTCTTTCTGCACATTTCTCCAATTTATCACTATTCATATAAGTATAACACCCT
TCATTTATATATTACATCTGCCCCCATCTCTAGTTTTGCATGCATATAAGTATCATTTTT
GTAGACTGAAAATAGCTTAGACGTTTTACCCCCTAAAATGATAAATATACAAAAAACTAA
CAAAAAATATTTTAAGAAAGCATTTGATTTTTAGTTTAATCTTGTAAATGCATGTATTTG
TTATAAGTCGCTTTATACTATAACAAATTGAAGTGTATATTGCAACTCTGGAGTAACTGT
GTACTATATTTACTCGATTCGTTTTGCATTTGGATTGAATAATTGTATTTTCCATCCTGG
CTAGCTGTTGAAACAAGAATACTTTTCCAAGTTTAGAATAGT

QA 1 702 1 702
DS 

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GCATTTGGATTGAATAATTGTATTTTCCATCCTGGCTAGCTGTTGAAACAAGAATACTTT
TCCAAGTTTAGAATAGTTATGCTCACATACACAACATAGACGGCTAGTTCCATAGGATTG
ACCAGAAGCAGTGAAGTGAAGACTGCATTGAAAAATAAGAAAGTGCATTTAGTATTACCA
GAGGAGAAGTCAAAGGGAATGATCTTGATCTTGTTTTGTGGAAACTCTTGTCGGAAATCA
TCGGAAACAGAAGCGAGCTTAGAAGGGTTTCTACTGACTAGGATGAGGTTAAGGCCGTGT
TTTGCCAGCTCGTGAGCAAAGGCTCGTCCGATCCCATCTGTGGCTTCAGTGACCAAAGCC
CACGAGCCATAACGCTTGACCCGCCCGGGGTCAGTGAGGAGGAATCTCGTGATGAACCAT
TTCAAGAGAGGATAGAGTAGTCTAAGGAGAGAGAGAAAACCTATGAAGCTTACGACATGG
AGATGCCATGTTGTTTGCATGTTCTTCTTTCTGTTTCTTTTCTATTTTCTTTATGTTCTT
GTTTGCTGATTTTGTGTGGTCATGAGATTTGGGCATGGAGCTAACTCACTCTCTTTATGT
GGGAAAATTATAATTATGAAAGACTAGAGAGATATTTATTTATTATATTATTTCCTCAAT
CTT

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

CO CL4774Contig1 1491 2 2 U
GAACCGGAGCTTCTTCGAGAAGCGGAGGTCAGTCTGGTCCTCTCCCTAACGCAACTGGCC
GTATGTCCGGCTCTTTGGCTTCTGCCGCCGGGTCGAGTTCCATGAAGAAAACAAACTCTG
GCCCTTTGTCTAAGCACGGGGAGCCTCTGAAGAAGACATCTGGTCCTCAGTCCGGTGGTG
TGACACGTCAGAACTCTGGCTCTATCCCTATGCTCCCAACCACAGGCCTCATAACATCTG
GTCCGATCACTTCCGGTCCTTTGAACTCGTCTGGGGGTCCTAGGAAGATCTCTGGTCCTC
TAGACTATTCCGGCTCGATGAAGACGCATCATCATAAGCCCTCCTCCGTTGTCCATAACC
AGGCGGTAACTACGCTTGGTCCTGAAGATGACTTCTCCTGCATGAAGAGCTTCCCCAAGC
CTGTGCTCTGGCTGGTTATACTTATATTTGTGATGGGGTTCCTCTCTGGAGGCTTCATTC
TCGGAGCGGTTCACAATGCGGTTCTCCTCGTCGTCGTGGCGGCCTTGTTCGCTGCTGTTG
CTGCGCTCTTCTTCTGGAATCTTTCTTGTGAGAGACGCGGCGTCACAGATTTCGTCGGTG
GTTATCCTGATGCTGATCTTAGAACTGCCAAAAACGGTCAATACGTTAAAGTCACTGGGG
TGGTGACATGTGGTAACGTGCCGCTTGAGTCATCGTTCCATAGAGTTCCCAGATGTGTTT
ACACGTCCACTTGTCTATACGAGTACCGTGGATGGGGTTCAAAGCCAGCCAATGCTTCAC
ACCATCGCTTCACATGGGGACTAAGATCAGCAGAGAGGCATGTGGTAGACTTCTACATCT
CTGATTTCCAGTCTGGTCTGAGAGCATTGGTGAAAACCGGAAACGGTGCAAAGGTAACAC
CTATCGTGGATGACTCTGTTGTCATCGATTTCAAGCCAGGAAGCGAGCAAGCGTCTCCAG
ATTTCGTAAGGTGGTTGGGTCAGAAGAATCTATCCAATGGCGAGCGAGTTATGCGGCTTA
AAGAAGGGTATATCAAAGAAGGAAGCACAGTAAGTGTGATTGGAGTGGTGCAGAGAAACG
AAAGCGTGTTGATGATAGTCCCAACGACAGAGCCGTTAGCAGCTGGTTGGCAATGGAGCA
AGTGCACGTTCCGTGCAAGTCTTGAAGGCATTGTGCTGAGATGTGAAGACTCATCAAACG
TAGACGCAATCCCAGTCTAAGTGCAGTTTGTTAGTAGTAAGTCTTCCTTCTTGTTCTTTC
TTCCACGGTTGGTAGACTAAAAATCATCATCACTTCGGCTTCATAAAATATTTTGCATGA
AATTTGAAATGTGTTCTTGGTTTTGGTGGCTTCTCTCTACTGATGATGATTCCTTTGGTT
GGTGGTTTTATGGTAGTGTTTGTTTCTGCTAATTAGTTTCTTATTTTTTTTAATAAGGAG
TCATTACATTAGTTTCGGACTTAATTTGTGTTACGGTTTGTAATTGTAAAG


BQ
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AF RS1G325TF U 1
AF RS1G325JQ C 636
BS 1 812 RS1G325TF
BS 813 1491 RS1G325JQ

RD RS1G325TF 812 0 0
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GTATGTCCGGCTCTTTGGCTTCTGCCGCCGGGTCGAGTTCCATGAAGAAAACAAACTCTG
GCCCTTTGTCTAAGCACGGGGAGCCTCTGAAGAAGACATCTGGTCCTCAGTCCGGTGGTG
TGACACGTCAGAACTCTGGCTCTATCCCTATGCTCCCAACCACAGGCCTCATAACATCTG
GTCCGATCACTTCCGGTCCTTTGAACTCGTCTGGGGGTCCTAGGAAGATCTCTGGTCCTC
TAGACTATTCCGGCTCGATGAAGACGCATCATCATAAGCCCTCCTCCGTTGTCCATAACC
AGGCGGTAACTACGCTTGGTCCTGAAGATGACTTCTCCTGCATGAAGAGCTTCCCCAAGC
CTGTGCTCTGGCTGGTTATACTTATATTTGTGATGGGGTTCCTCTCTGGAGGCTTCATTC
TCGGAGCGGTTCACAATGCGGTTCTCCTCGTCGTCGTGGCGGCCTTGTTCGCTGCTGTTG
CTGCGCTCTTCTTCTGGAATCTTTCTTGTGAGAGACGCGGCGTCACAGATTTCGTCGGTG
GTTATCCTGATGCTGATCTTAGAACTGCCAAAAACGGTCAATACGTTAAAGTCACTGGGG
TGGTGACATGTGGTAACGTGCCGCTTGAGTCATCGTTCCATAGAGTTCCCAGATGTGTTT
ACACGTCCACTTGTCTATACGAGTACCGTGGATGGGGTTCAAAGCCAGCCAATGCTTCAC
ACCATCGCTTCACATGGGGACTAAGATCAGCA

QA 1 812 1 812
DS 

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TTCCATAGAGTTCCCAGATGTGTTTACACGTCCACTTGTCTATACGAGTACCGTGGATGG
GGTTCAAAGCCAGCCAATGCTTCACACCATCGCTTCACATGGGGACTAAGATCAGCAGAG
AGGCATGTGGTAGACTTCTACATCTCTGATTTCCAGTCTGGTCTGAGAGCATTGGTGAAA
ACCGGAAACGGTGCAAAGGTAACACCTATCGTGGATGACTCTGTTGTCATCGATTTCAAG
CCAGGAAGCGAGCAAGCGTCTCCAGATTTCGTAAGGTGGTTGGGTCAGAAGAATCTATCC
AATGGCGAGCGAGTTATGCGGCTTAAAGAAGGGTATATCAAAGAAGGAAGCACAGTAAGT
GTGATTGGAGTGGTGCAGAGAAACGAAAGCGTGTTGATGATAGTCCCAACGACAGAGCCG
TTAGCAGCTGGTTGGCAATGGAGCAAGTGCACGTTCCGTGCAAGTCTTGAAGGCATTGTG
CTGAGATGTGAAGACTCATCAAACGTAGACGCAATCCCAGTCTAAGTGCAGTTTGTTAGT
AGTAAGTCTTCCTTCTTGTTCTTTCTTCCACGGTTGGTAGACTAAAAATCATCATCACTT
CGGCTTCATAAAATATTTTGCATGAAATTTGAAATGTGTTCTTGGTTTTGGTGGCTTCTC
TCTACTGATGATGATTCCTTTGGTTGGTGGTTTTATGGTAGTGTTTGTTTCTGCTAATTA
GTTTCTTATTTTTTTTAATAAGGAGTCATTACATTAGTTTCGGACTTAATTTGTGTTACG
GTTTGTAATTGTAAAG

QA 1 856 1 856
DS 



AS 1 2

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TCACCGTATGCAGTTAGAGGTGTAGTAAATAATCAAGCACCAGGAAGTGGCATTACTCTT
TCTAGGCCAATGTTACCTCCTCCGGTACCAAACCCTCATCCATTGCCTCCTTTGAGTCAG
CTTCCTCCACTTGGAAGTATGATGCAGAACAGTCCCTTCCCTATGGAAGAGCCTCTAACA
GTAGAGAGCTTTCTAAATTCACTTGGACTTGGAAAATACTTCCTTGCCTTTAAGAGAGAG
GAAGTGGACATGACGACGATAAAGCAGATGAAAGAAAGTGATCTAAAAGATCTCATCATA
CCAATGGGTCCAAGGAAGAAGATTCTTCAGGCCATAGCGTGTCTTCCAAAACGGTAGCAG
CGGTGAGAAACCGGTTTGGCCTCTTGCTGATTCTTACTCTTGTGATCATAATTGGCCTTT
TGCGGATCAAAACTAAGAAGAAACTCTTCTCTTTGGATGATTGTAGTCAGAATGTTATTC
TCCGGATCTTCTCTGTGATGCAATTTATCTATTTTTCTTTTAGACAAGTTGTCGACCGAA
TCAGCTTAGTCGTGTCAGGGTTCTGTGTCTATTTTGAAACGTGACATGCATTTTGGTGAA
TTGTAACTTATTTCTCCAATAGCATATTTCAATCCTAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DB76TF U 1
AF RS1DB76JQ C 124
BS 1 608 RS1DB76TF
BS 609 699 RS1DB76JQ

RD RS1DB76TF 608 0 0
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TCTAGGCCAATGTTACCTCCTCCGGTACCAAACCCTCATCCATTGCCTCCTTTGAGTCAG
CTTCCTCCACTTGGAAGTATGATGCAGAACAGTCCCTTCCCTATGGAAGAGCCTCTAACA
GTAGAGAGCTTTCTAAATTCACTTGGACTTGGAAAATACTTCCTTGCCTTTAAGAGAGAG
GAAGTGGACATGACGACGATAAAGCAGATGAAAGAAAGTGATCTAAAAGATCTCATCATA
CCAATGGGTCCAAGGAAGAAGATTCTTCAGGCCATAGCGTGTCTTCCAAAACGGTAGCAG
CGGTGAGAAACCGGTTTGGCCTCTTGCTGATTCTTACTCTTGTGATCATAATTGGCCTTT
TGCGGATCAAAACTAAGAAGAAACTCTTCTCTTTGGATGATTGTAGTCAGAATGTTATTC
TCCGGATCTTCTCTGTGATGCAATTTATCTATTTTTCTTTTAGACAAGTTGTCGACCGAA
TCAGCTTA

QA 1 608 1 608
DS 

RD RS1DB76JQ 576 0 0
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CCTCCACTTGGAAGTATGATGCAGAACAGTCCCTTCCCTATGGAAGAGCCTCTAACAGTA
GAGAGCTTTCTAAATTCACTTGGACTTGGAAAATACTTCCTTGCCTTTAAGAGAGAGGAA
GTGGACATGACGACGATAAAGCAGATGAAAGAAAGTGATCTAAAAGATCTCATCATACCA
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TGAGAAACCGGTTTGGCCTCTTGCTGATTCTTACTCTTGTGATCATAATTGGCCTTTTGC
GGATCAAAACTAAGAAGAAACTCTTCTCTTTGGATGATTGTAGTCAGAATGTTATTCTCC
GGATCTTCTCTGTGATGCAATTTATCTATTTTTCTTTTAGACAAGTTGTCGACCGAATCA
GCTTAGTCGTGTCAGGGTTCTGTGTCTATTTTGAAACGTGACATGCATTTTGGTGAATTG
TAACTTATTTCTCCAATAGCATATTTCAATCCTAGG

QA 1 576 1 576
DS 



AS 1 2

CO CL4776Contig1 1073 2 8 U
AAAAAAGACAGAGAGAAAAACACATTCTCCTTATATTAACTTCTCAACTTCCTTGCATGA
ATCTAAACTGAGAACACAACTGGTCTCTTCTTCTCATAGAGTTCTAAAGCAGCAAAAAGC
TTTAAACACTTGTGTTTCTTCTGTGTTAAGTGTGTTTTTTGCTTGTTCGGTTCTTCTCCT
CACCAATGGATACTTTCAATTCTCAGAAAACTAAATCAAGAAAGATAAAGAGGCTTGCGA
AGAAGTCTCGTGCTCAGATAATCTTGGATCTGTTTTACCGGGCGATCGAGATAGCTCTTG
TCCTGGTTACGGCAGCTAAGCTTTGCTATCAGCTCGTCATCACGTTGCATGACTCTGGTG
TCGCCGAGGCTATTTTAGCAAACCGTAATCTCGCGTTTGTTGTAGCAAACGCCATAGTCA
TCGCTCTAATCGCGAAATCTGGCCTTCTCTTGAATCAAAAAGTTGTCCCGAAGTGCGAAA
GCAACGACCTTTACGAGGAGTTTGTTCACGAGAGGAGCGACGAGGTGAGAAACAGAGGAA
AACAGAGCGAAGCAGAGAGCAAGGCTACACAGAGCATAATAGAAGCCAGAGCAAAACAGA
GTGAAGCAGAGAAAGAGACACAGAGCATAACTGAGAAGAGAGAGACACAGAGCAAGCCAG
AGAAGTCTACAAAACATAGTACTTCAGTGCAGAGAGAGAAGCAAATTAAAGTCCAAGCTG
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AGACGGATGCTTCTTTTGAAAGATTTGATTCTGACGATGAACTCCGGTTCAAGATCGAGT
CTTTCATTGCAAGGCAGAGGAGGAATCAAAATGATATGATTAGCTTGGTTTAACTTAGAT
AAAACAAAAAATATATTAAAATAACAAAAAAAATTAGTTTTTGCAAATACCATTCACGTA
TATGATAATGTGAGTGTTTGTTATAAAAGGGTGAAAATATTTTAAATCCTTGG


BQ
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AF RS1GM41TF U 1
AF RS1GM41JQ C 240
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CGAAAA*GATGGAGAAACAGAG

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DS 

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GTCCTGGTTACGGCAGCTAAGCTTTGCTATCAGCTCGTCATCACGTTGCATGACTCTGGT
GTCGCCGAGGCTATTTTAGCAAACCGTAATCTCGCGTTTGTTGTAGCAAACGCCATAGTC
ATCGCTCTAATCGCGAAATCTGGCCTTCTCTTGAATCAAAAAGTTGTCCCGAAGTGCGAA
AGCAACGACCTTTACGAGGAGTTTGTTCACGAGAGGAGCGACGAGGTGAGAAACAGAGGA
AAACAGAGCGAAGCAGAGAGCAAGGCTACACAGAGCATAATAGAAGCCAGAGCAAAACAG
AGTGAAGCAGAGAAAGAGACACAGAGCATAACTGAGAAGAGAGAGACACAGAGCAAGCCA
GAGAAGTTTACAAAACATAGTACTTCAGTGCAGAGAGAGAAGCAAATTAAAGTCCAAGCT
GCGAAAAAGATGGAGAAACAGAGTTTGGCTGAGAAGAGACAAAGTCAGAGTTACCAACGA
AGCAGGTCAGAGAATCTGGAGGGTTTGGAGAAGAGTTCAAGTGGAAGATTAAGGAGATCA
GAGACGGATGCTTCTTTTGAAAGATTTGATTCTGACGATGAACTCCGGTTCAAGATCGAG
TCTTTCATTGCAAGGCAGAGGAGGAATCAAAATGATATGATTAGCTTGGTTTAACTTAGA
TAAAACAAAAAATATATTAAAATAACAAAAAAAATTAGTTTTTGCAAATACCATTCACGT
ATATGATAATGTGAGTGTTTGTTATAAAAGGGTGAAAATATTTTAAATCCTTGG

QA 1 834 1 834
DS 



AS 1 2

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TCTGTCGCTAAGATTCAGATCGCTAGCTGGCCGTGCATCTAATTCGCTGCCGTTTTTGAT
CATCTTCCCACAGTTAAGATCTCAACAAGTTAAAACAACAATGAACAGAACCGCACGAAT
CGATATCCCCTCATCGTCGTCTTCTCCAGCTCCAGCTTCAGCAGCAGATGGTGAGCTCAA
CGAAGACGACATCTTCTCAATAGACATATCTCACGCGCCTAAACACTCTCCATCCTCTTC
TCCCGCTCAACACCCACCTGCCCGCCAGCTTCAACGAACCAAAAGCGGTTTGAAGAACGT
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CACGTCTTCTTCGTCTTCGTCTCGAATCATCCCTTCGGCTCCTAAACCTCCTCAAGAGAG
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GGCCCAGTCTTCGTTGCTGTCTTGTTCTGTGCTTGAAGGAGCAGGAAGAACACTTAAAGG
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AGAAAAAACGTTTCAGTGTATTATGTTCATATATGTTGTCTACTTTAGACGATGTGTTGT
TACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

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AF RS1DM70JQ C 496
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BS 668 965 RS1DM70JQ

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TCTGTCGCTAAGATTCAGATCGCTAGCTGGCCGTGCATCTAATTCGCTGCCGTTTTTGAT
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GTTAGCGATGAGAAGTCGTCATAAGAAGGAGTTCAAGCTTACTGATGTGGTGGTGGATGA
GGAGGAA

QA 1 667 1 667
DS 

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TCGTCATAAGAAGGAGTTCAAGCTTACTGATGTGGTGGTGGATGAGGAGGAAGAAGAGGA
TGAAGGTGAAAGGTTTCCCCCACACGAGATTGTAGCTCGGTCTTTGGCCCAGTCTTCGTT
GCTGTCTTGTTCTGTGCTTGAAGGAGCAGGAAGAACACTTAAAGGGAGAGATCTCAGACA
GGTGAGGAACGCTGTTTTCAGAAAAACCGGTTTCATAGATTGAGTTTTGCTGCTTCTTTT
TTTTCATTCAAAAGAAACACATTCTTTAATTTGTTATTTGGCCTCAGAAAAAACGTTTCA
GTGTATTATGTTCATATATGTTGTCTACTTTAGACGATGTGTTGTTACTT

QA 1 470 1 470
DS 



AS 1 2

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CCTTATGATCCAAAGGATGGACCAAAGGACGGAGAAATAAATGGTGGGTTCCGTGGATAC
CGTGCAAGTGGTGGTCGCGGAGGTCACGTTGGTGGATTTGCCAATGGTAAGACGGGTGAT
GTGGAACGCACAAAGAGGGTCTATGACCGCCGTAGCGGAACAGGTCGTAGTAATGACCTG
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GCTGACACCACTGATGAAAAGAAAGAGGCTCCTGCGGATGAGCAGAGGAGAAAGGACCTG
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TGCAAGCCACAAAGGTTGAGGAGAGGAAAGTTGACACCAAAGTGTTTGAGTTTATGCAAC
AGCTTTTTAACAAAAAGACGAATAATGAGGAAATTTTCATCAAGCTGGGATCCGACAAGG
ACAAACGCAAAGATGGTGCTGAGAAAGAAGAGAAGGCCAAAAAGTTTTTGAGCATTAACG
AGTTTTTGAAGCCGGGTGATGGAGAGAGATACAATCCAAGAGGTGGATACCGTGGAAGAG
GAGGTCGCAGTGGTGGTCGTGGACAGAGAGATGGTGGAGGTCGTGACGGTCGTGGACAGA
GAGATGGAGGAAACCAAAGGCATGGAGGAGCACCTGCTCCGGCTATTGGAGACAGTGCTC
AGTTCCCGTCGTTGGGCAAGTAAAGACCCCCTGTTGGTCCTTGAGCCTTTATCAATCTTT
ACAACTTTATTTAGTTTGATTTTTGTTTTTAGTTCTATCAATTTTTGTTACACTTTTTTT
ACAAAACGAGTTTGGAGACTTTTATGTTATG


BQ
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AF RS1AD07TF U 1
AF RS1AD07JQ C 515
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BS 684 1291 RS1AD07JQ

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AAGCTAGTCAGTGTGTCGTATTTTGATTCTGCGTGATTACCCCCACTGGAGATGACGACT
TTGAACCCGTTCGATCTCTTAGGAGTTGACGCTGAGGATCCAAGCCAGATTGTTGTGGCT
TTACCGAAGAAGGTCGAGAAAGCAGCTCCTCTGCCGCCTGCTAAGAACACTAAGTTGCAA
ACCAAACAGGCTCCTCCTTCTCAAGCTGTGAGGGAGTCAAGGAATGCTCCTTCAGGAGGT
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CCTTATGATCCAAAGGATGGACCAAAGGACGGAGAAATAAATGGTGGGTTCCGTGGATAC
CGTGCAAGTGGTGGTCGCGGAGGTCACGTTGGTGGATTTGCCAATGGTAAGACGGGTGAT
GTGGAACGCACAAAGAGGGTCTATGACCGCCGTAGCGGAACAGGTCGTAGTAATGACCTG
AAACGTGAGGGTGGTGGGCGTGGAAACTGGGGTACCCCTGAAGATGATATTCCACCACCA
ACCGAGGAACCAACAATAGAGGTTGAGAAGAGCCCTGTTGCTGAGAAGGAAGGCGGTGAG
GCTGACACCACTGATGAAAAGAA

QA 1 683 1 683
DS 

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CTGTTGCTGAGAAGGAAGGCGGTGAGGCTGACACCACTGATGAAAAGAAAGAGGCTCCTG
CGGATGAGCAGAGGAGAAAGGACCTGAAGACAAGGAGATGACACTGGAAGAGTATGAGAA
AATTTTGGAGGAAAAGAAAAAAGCTTTGCAAGCCACAAAGGTTGAGGAGAGGAAAGTTGA
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TTTCATCAAGCTGGGATCCGACAAGGACAAACGCAAAGATGGTGCTGAGAAAGAAGAGAA
GGCCAAAAAGTTTTTGAGCATTAACGAGTTTTTGAAGCCGGGTGATGGAGAGAGATACAA
TCCAAGAGGTGGATACCGTGGAAGAGGAGGTCGCAGTGGTGGTCGTGGACAGAGAGATGG
TGGAGGTCGTGACGGTCGTGGACAGAGAGATGGAGGAAACCAAAGGCATGGAGGAGCACC
TGCTCCGGCTATTGGAGACAGTGCTCAGTTCCCGTCGTTGGGCAAGTAAAGACCCCCTGT
TGGTCCTTGAGCCTTTATCAATCTTTACAACTTTATTTAGTTTGATTTTTGTTTTTAGTT
CTATCAATTTTTGTTACACTTTTTTTACAAAACGAGTTTGGAGACTTTTATGTTATG

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 2

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TCGTGATCGTTAACTCCAAGCCCCCACCCACCTAGGTGTAAATCGGTTCTTAGTTTCAAT
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GGTGAATCTTGTAATTTTTCATTTCTAGGGTTAGCTTTTTAAAAAAAAATGTTTTTCTCC
GGCGATCCTTCGACTCGGAAGCGAGTTGATTTAGGTGGCCGGAGCAGTAAGGAGAGAGAC
GCTAAGAAGCTTCTTGAGCAGACCAGGACGGGGCGTAATCGCCGTTTGCTTCACAAGCAG
CAGAATGCCGCCGCCCTCAAAATTCAGAAATTCTTTAGAGGTAGAAGATCAGTGGCCATT
GAGCGTTCCAAGGTCAGGCGTGACTTCTGTGAAACCTTTGGTGATAATTGCCAGAATGTC
GACAGGCGTTGCTTTGAGCCAGGTTCAAGTTTCCTCCGTCAGTTACTGTTTTTCTTCAAG
GCACATAACTCTGGGGATTTTGTGATTCTTGTGGAGACGTGTCGCCTACTGAAAAGTTTT
TTTCAGAGCAATGGTATTTCCAATATTTATGCATGTTCCTTTTGTTGATATTTTTGGTCA
GTTCATTCGTGGGTTTAACTTTTTA


BQ
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AF RS1AQ10TFB U 1
AF RS1AQ10JQ C 412
BS 1 601 RS1AQ10TFB
BS 602 685 RS1AQ10JQ

RD RS1AQ10TFB 605 0 0
GGGACTTCCCGAAAATATTTTCTCTGCTTGAGATTTCTCTTTCCACGCAATCATTAATTT
TCGTGATCGTTAACTCCAAGCCCCCACCCACCTAGGTGTAAATCGGTTCTTAGTTTCAAT
CGAAGCGGATAGGCCAACAGTAGCTGAGATTTTTGTTTTTTAGGTTATTGGAGGAGGAGG
GGTGAATCTTGTAATTTTTCATTTCTAGGGTTAGCTTTTTAAAAAAAAATGTTTTTCTCC
GGCGATCCTTCGACTCGGAAGCGAGTTGATTTAGGTGGCCGGAGCAGTAAGGAGAGAGAC
GCTAAGAAGCTTCTTGAGCAGACCAGGACGGGGCGTAATCGCCGTTTGCTTCACAAGCAG
CAGAATGCCGCCGCCCTCAAAATTCAGAAATTCTTTAGAGGTAGAAGATCAGTGGCCATT
GAGCGTTCCAAGGTCAGGCGTGACTTCTGTGAAACCTTTGGTGATAATTGCCAGAATGTC
GACAGGCGTTGCTTTGAGCCAGGTTCAAGTTTCCTCCGTCAGTTACTGTTTTTCTTCAAG
GCACATAACTCTGGGGATTTTGTGATTCTTGTGGAGACGTGTCGCCTACTGAAAAGTTTT
T
CTCA

QA 1 601 1 601
DS 

RD RS1AQ10JQ 274 0 0
GTGGCCATTGAGCGTTCCAAGGTCAGGCGTGACTTTTGTGAAACCTTTGGTGATAATTGC
CAGAATGTCGACAGGCGTTGCTTTGAGCCAGGTTCAAGTTTCCTCCGTCAGTTACTGTTT
TTTTTCAAGGCACATAACTTTGGGGATTTTGTGATTTTTGTGGAGACGTGTCGCCTACTG
AAAAGTTTTTTTCAGAGCAATGGTATTTCCAATATTTATGCATGTTCCTTTTGTTGATAT
TTTTGGTCAGTTCATTCGTGGGTTTAACTTTTTA

QA 1 274 1 274
DS 



AS 1 2

CO CL4780Contig1 1180 2 6 U
GATTATATTGTTAGATATATATTCATAATAAAGAAAAATATCAAAATATCTTGTGTTAAT
TATTTATTTTTAAGTAAACTGGTTAAAATAAACTTGTCATTATTATTTTTAATGAGAATC
TAAAATCAAACAAACTTCAAAAGTACAAATTGTAAACCATATATTACACAAAATTATTTC
CATATAATATTTCCTTATAATAGAATATATACTATACAAACTATCAACAGTTAAAATGCT
TAAATATTCATTGTAAAATATTTGAAATATGTTGAGAAAAAAGAATATTTGAAATATAAT
TAGAAAATTAAAGTAATTTAAAATTTAAAATTTAAAATTAATGATATATCATACTAATAA
ACAATTTAATTTAATTACAGTGTTCTCCGTTAGAAAAGGAAAAGCTCTACCACTGTTTAC
GTTGCTTTATTTCTGTGAGAATGTCTGAGAGTTTTTTTCACGAACTTGTCAAGGCTTTTC
TCCTTGATTTCAGTTCTTTATCTGAGCCTCCTCATCAAAAGTCTAGCTATAGTTTCATCA
ACCTGACTGTTGGATCATACCAATCTGCATAAACACAAATGCGCTTTTGCTGTATGCATA
AACGCCTCTTCTGGTGATCTTTTTCGCATAAAAAAACCCCAGGAAACAAAACTTAGAAAC
CTGTATCGATCTTTAAATTGAGCTACATCCGGGAACCTTAGAAATCTGCTTATCCCTCAT
CCACTGCCTCAGGCTCTCAGCTTCGACAAACCGACCTGCAGCTGTATATAGACCAGCCAA
CGTCACATAATATCCAGCTTTCCCCGGCTTAAGTTGAATCAGCTTCCTCGCCACTCTTTC
CCCTACTTGTACATTCCCATACACCTTGCACCCACTCAACACCGCACCCATAACAGCCTC
ATCAGCTTCCACGGGCATTTCTTCCATAAACTTCTCTGCTTCCTCCAAAAGACCCGCTCT
AGCCATACAATCCGCCATACTAGCATAGTGTTTCAACTCGGGAACTATCTTATACTCCTG
CATCTGTCTGAAATACAGCCAAGACTTATCCACAAGACCACCATGTGCACATGCTGACAA
AACACCAAGAAAAGTAACAGCGTTAGGCTCGATCCCTTCCTCGAGCATCTCCTCAAACAG
TTTTACCGACATGACAACGTCCCAGTCCAACCCATAACCC


BQ
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AF RS1DM44TF U 1
AF RS1DM44JQ C 509
BS 1 635 RS1DM44TF
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BS 678 691 RS1DM44TF
BS 692 1180 RS1DM44JQ

RD RS1DM44TF 691 0 0
GATTATATTGTTAGATATATATTCATAATAAAGAAAAATATCAAAATATCTTGTGTTAAT
TATTTATTTTTAAGTAAACTGGTTAAAATAAACTTGTCATTATTATTTTTAATGAGAATC
TAAAATCAAACAAACTTCAAAAGTACAAATTGTAAACCATATATTACACAAAATTATTTC
CATATAATATTTCCTTATAATAGAATATATACTATACAAACTATCAACAGTTAAAATGCT
TAAATATTCATTGTAAAATATTTGAAATATGTTGAGAAAAAAGAATATTTGAAATATAAT
TAGAAAATTAAAGTAATTTAAAATTTAAAATTTAAAATTAATGATATATCATACTAATAA
ACAATTTAATTTAATTACAGTGTTCTCCGTTAGAAAAGGAAAAGCTCTACCACTGTTTAC
GTTGCTTTATTTCTGTGAGAATGTCTGAGAGTTTTTTTCACGAACTTGTCAAGGCTTTTC
TCCTTGATTTCAGTTCTTTATCTGAGCCTCCTCATCAAAAGTCTAGCTATAGTTTCATCA
ACCTGACTGTTGGATCATACCAATCTGCATAAACACAAATGCGCTTTTGCTGTATGCATA
AACGCCTCTTCTGGTGATCTTTTTCGCATAAAAAA*CCCCAGGAAACAAAACTTAGAAAC
CTGTATCGATCTTTAA*TTGAGCTACATCCG

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1DM44JQ 672 0 0
TCCTCATCAAAAGTCTAGCTATAGTTTCATCAACCTGACTGTTGGATCATACCAATCTGC
ATAAACACAAATGCGCTTTTGCTGTATGCATAAACGCCTCTTCTGGTGATCTTTTTCGCA
TAAAAAAACCCCAGGAAACAAAACTTAGAAACCTGTATCGATCTTTAAATTGAGCTACAT
CCGGGAACCTTAGAAATCTGCTTATCCCTCATCCACTGCCTCAGGCTCTCAGCTTCGACA
AACCGACCTGCAGCTGTATATAGACCAGCCAACGTCACATAATATCCAGCTTTCCCCGGC
TTAAGTTGAATCAGCTTCCTCGCCACTCTTTCCCCTACTTGTACATTCCCATACACCTTG
CACCCACTCAACACCGCACCCATAACAGCCTCATCAGCTTCCACGGGCATTTCTTCCATA
AACTTCTCTGCTTCCTCCAAAAGACCCGCTCTAGCCATACAATCCGCCATACTAGCATAG
TGTTTCAACTCGGGAACTATCTTATACTCCTGCATCTGTCTGAAATACAGCCAAGACTTA
TCCACAAGACCACCATGTGCACATGCTGACAAAACACCAAGAAAAGTAACAGCGTTAGGC
TCGATCCCTTCCTCGAGCATCTCCTCAAACAGTTTTACCGACATGACAACGTCCCAGTCC
AACCCATAACCC

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

CO CL4781Contig1 988 2 2 U
TTTTTGCCACAAACTCCATGCATAGTAACCTTCAACAAAAGCTCACCATCCATATGTTTC
TTCGGCGCTTTTGGTCTGTCAACCCATAAGATCTCCACCTTTTTAATATCTCGGTAGCCT
GCAAGAACACAACTAGTTAATAATAATAACAGAACAAGAACTGTCCTTGTTATTAAGATT
ACCTTTGACGGGAGAGTCTAGAAGAAAAGGGATCAAGACAAGTCGAATCGCCTCAAGTTC
CAAAGAATCCTGCGTGGAGGCTTCAACAACAGTAACTGTGATGCATAGTCTATCACCATC
CATTGACTTATCATCCCAAGAGCAGTGGTTCCTAATCAACAACACATAAATGTAAAACAG
GTTAGTATCATCTTTAGATGCAATGATGCTAAAATGGTAAAACCTTTTGAGGATGTATCT
TACGTGCTTTGGATTTCTAAATCAATTACATCAAGCTTCAGTTCTTTCTTCCTGTTCGCA
TACTGTTTGTTTAATGAAGAGACAACAGATTCAAGGTCTAGTTGTTTCTGCTTCAGTACT
TTCTGTAGATTTGCAAAAGAGGTAACACACATTAGAATAGAATGTTTTTCCATATATTAT
AGACATGTAGGTGGGTTTGTATCTGTATGAGTTTTGTACCTTGGAGATGTGAAAATGGCA
AACCCACGAGCTCATAGGCATCTTTGTGTTAGTCCTCGGAGAGAATCTATTAACCAAATA
TTATAAAAAATTTAGTAGAAGCCATTGAAAGAAAGAGTTTTAGAAAAACGTTACTAACAT
TATCATGGATGTTGAAACAATCTTTGAGAAACACAGTTTCTCCAAGTGGTTCTTGATGTC
CAATGCCCCGTATTCAAACCCATGCTTCTTCTTAGAAAGTGTTTCAGACAAGTACAAAGA
CATTGTCTGTTCTTTTAGACCTTTCTTGGACCCACACTCTAACACATTCTGCAGAAGAAG
AAGAACACAAAGTGTGAATATGATTTAT


BQ
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AF RS1G885TF U 1
AF RS1G885JQ C 284
BS 1 607 RS1G885TF
BS 608 988 RS1G885JQ

RD RS1G885TF 607 0 0
TTTTTGCCACAAACTCCATGCATAGTAACCTTCAACAAAAGCTCACCATCCATATGTTTC
TTCGGCGCTTTTGGTCTGTCAACCCATAAGATCTCCACCTTTTTAATATCTCGGTAGCCT
GCAAGAACACAACTAGTTAATAATAATAACAGAACAAGAACTGTCCTTGTTATTAAGATT
ACCTTTGACGGGAGAGTCTAGAAGAAAAGGGATCAAGACAAGTCGAATCGCCTCAAGTTC
CAAAGAATCCTGCGTGGAGGCTTCAACAACAGTAACTGTGATGCATAGTCTATCACCATC
CATTGACTTATCATCCCAAGAGCAGTGGTTCCTAATCAACAACACATAAATGTAAAACAG
GTTAGTATCATCTTTAGATGCAATGATGCTAAAATGGTAAAACCTTTTGAGGATGTATCT
TACGTGCTTTGGATTTCTAAATCAATTACATCAAGCTTCAGTTCTTTCTTCCTGTTCGCA
TACTGTTTGTTTAATGAAGAGACAACAGATTCAAGGTCTAGTTGTTTCTGCTTCAGTACT
TTCTGTAGATTTGCAAAAGAGGTAACACACATTAGAATAGAATGTTTTTCCATATATTAT
AGACATG

QA 1 607 1 607
DS 

RD RS1G885JQ 705 0 0
CATAGTCTATCACCATCCATTGACTTATCATCCCAAGAGCAGTGGTTCCTAATCAACAAC
ACATAAATGTAAAACAGGTTAGTATCATCTTTAGATGCAATGATGCTAAAATGGTAAAAC
CTTTTGAGGATGTATCTTACGTGCTTTGGATTTCTAAATCAATTACATCAAGCTTCAGTT
CTTTCTTCCTGTTCGCATACTGTTTGTTTAATGAAGAGACAACAGATTCAAGGTCTAGTT
GTTTCTGCTTCAGTACTTTCTGTAGATTTGCAAAAGAGGTAACACACATTAGAATAGAAT
GTTTTTCCATATATTATAGACATGTAGGTGGGTTTGTATCTGTATGAGTTTTGTACCTTG
GAGATGTGAAAATGGCAAACCCACGAGCTCATAGGCATCTTTGTGTTAGTCCTCGGAGAG
AATCTATTAACCAAATATTATAAAAAATTTAGTAGAAGCCATTGAAAGAAAGAGTTTTAG
AAAAACGTTACTAACATTATCATGGATGTTGAAACAATCTTTGAGAAACACAGTTTCTCC
AAGTGGTTCTTGATGTCCAATGCCCCGTATTCAAACCCATGCTTCTTCTTAGAAAGTGTT
TCAGACAAGTACAAAGACATTGTCTGTTCTTTTAGACCTTTCTTGGACCCACACTCTAAC
ACATTCTGCAGAAGAAGAAGAACACAAAGTGTGAATATGATTTAT

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL4782Contig1 1006 2 2 U
GGAACAGAAAAAGGTTGAAACTGTGAAAGTTTGGTGGGAAGGAAAAGCTTCTCATATTAT
TGCTTAATTACCCTTCCCGGAGGAGATCGGAGATAAATGGCTGCCAATTTCTGGGAATCT
TCTCAATGCAAACGGCTTCTGGAACAAGAAGAAGTGGATGCAGTTCACCCACTCGACAAA
GAACGTGGAATTACAGTTGAGGATTTCAAGCTCATCAAGTTCCATATGTCTAATCATATA
ACGAAATTGGCTCAGCACATTAAAGTCCGACAAAGGGTTGTGGCTACTGCAATTACGTAT
ATGATACGAGTTTATACCAAGAAGAGCATGGTGGAGTTTGATCCCCGTCTTGTTGCCATT
ACATGCTTGTACCTGGCTTCCAAAGCTGAAGAGAGCATTGTCCAGGCCAGGAATCTTGTT
TTTTACATCAAAAGATTGTATCCGGATGAGTACAAGTATGAACTAAAAGATCTATTAGGA
ATGGAGATGAAGGTCTTAGAAGCACTCAACTATTCGCTGGTTGTGTTTCACCCTTACCGC
TCTCTATCTGAGTTTTTGCAAGATGCTGCATTGAACGATGTAAATATGAACCAGATGACA
TGGGGAATTGTCAACGATACATATAAGATGGACCTGATTCTTGTACACCCGCCGTATCGC
ATAGTGCTAGCGTGCATATACATAGCAAGTGTCCACAGAGAGAAAGATATCACTGCATGG
TTACAAGATCTTAACGAGGACATGAACTTGGTGAAGAACATTGCCATGGAGATTTTGGAC
TTCTACGAGAACTACAGAAGTATCACCGATGAAAAAGTGAGTTCTGCGTTCAACAAACTG
ACTATGAAGCCGTAGCAGCTGGGGATTCGCCTCCATCTCCATGATTTATCTGATGCTCTC
ATCTTACAGCTAGACTTTCTTCAGTTGCCCATGTTAGTTTTGTGGCAGACATGTATGTAA
CATTGTTGAATCTACCAAACATAAATCTTAAAGTGATAACTTCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GF66TF U 1
AF RS1GF66JQ C 350
BS 1 732 RS1GF66TF
BS 733 1006 RS1GF66JQ

RD RS1GF66TF 732 0 0
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TGCTTAATTACCCTTCCCGGAGGAGATCGGAGATAAATGGCTGCCAATTTCTGGGAATCT
TCTCAATGCAAACGGCTTCTGGAACAAGAAGAAGTGGATGCAGTTCACCCACTCGACAAA
GAACGTGGAATTACAGTTGAGGATTTCAAGCTCATCAAGTTCCATATGTCTAATCATATA
ACGAAATTGGCTCAGCACATTAAAGTCCGACAAAGGGTTGTGGCTACTGCAATTACGTAT
ATGATACGAGTTTATACCAAGAAGAGCATGGTGGAGTTTGATCCCCGTCTTGTTGCCATT
ACATGCTTGTACCTGGCTTCCAAAGCTGAAGAGAGCATTGTCCAGGCCAGGAATCTTGTT
TTTTACATCAAAAGATTGTATCCGGATGAGTACAAGTATGAACTAAAAGATCTATTAGGA
ATGGAGATGAAGGTCTTAGAAGCACTCAACTATTCGCTGGTTGTGTTTCACCCTTACCGC
TCTCTATCTGAGTTTTTGCAAGATGCTGCATTGAACGATGTAAATATGAACCAGATGACA
TGGGGAATTGTCAACGATACATATAAGATGGACCTGATTCTTGTACACCCGCCGTATCGC
ATAGTGCTAGCGTGCATATACATAGCAAGTGTCCACAGAGAGAAAGATATCACTGCATGG
TTACAAGATCTT

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1GF66JQ 657 0 0
TTGTTGCCATTACATGCTTGTACCTGGCTTCCAAAGCTGAAGAGAGCATTGTCCAGGCCA
GGAATCTTGTTTTTTACATCAAAAGATTGTATCCGGATGAGTACAAGTATGAACTAAAAG
ATCTATTAGGAATGGAGATGAAGGTCTTAGAAGCACTCAACTATTCGCTGGTTGTGTTTC
ACCCTTACCGCTCTCTATCTGAGTTTTTGCAAGATGCTGCATTGAACGATGTAAATATGA
ACCAGATGACATGGGGAATTGTCAACGATACATATAAGATGGACCTGATTCTTGTACACC
CGCCGTATCGCATAGTGCTAGCGTGCATATACATAGCAAGTGTCCACAGAGAGAAAGATA
TCACTGCATGGTTACAAGATCTTAACGAGGACATGAACTTGGTGAAGAACATTGCCATGG
AGATTTTGGACTTCTACGAGAACTACAGAAGTATCACCGATGAAAAAGTGAGTTCTGCGT
TCAACAAACTGACTATGAAGCCGTAGCAGCTGGGGATTCGCCTCCATCTCCATGATTTAT
CTGATGCTCTCATCTTACAGCTAGACTTTCTTCAGTTGCCCATGTTAGTTTTGTGGCAGA
CATGTATGTAACATTGTTGAATCTACCAAACATAAATCTTAAAGTGATAACTTCATC

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 2

CO CL4783Contig1 718 2 7 U
GGATTATTGTTATCGTCTCAAATACGCTTTGCTTTGTTCATATACTACTTTTTAACCTTT
CTAGAGAGTTTCTACAGAGATGGCAGGTCGGGGAAAACAACTTGGATCTGGCGCGGCGAA
GAAGGCCACTTCTCGTAGTAGCAAGGCCGGGCTCCAATTCCCTGTTGGTCGTATCGCTCG
ATTCCTCAAGGCCGGAAAGTACGCTGAGCGTGTTGGAGCTGGAGCTCCGGTTTATCTCGC
CGCCGTTCTTGAATACCTCGCCGCCGAGGTGCTTGAGCTCGCTGGGAACGCGGCCAGAGA
TAACAAAAAGACAAGGATTGTGCCTCGTCACATTCAGCTTGCTGTGAGGAACGACGAGGA
GCTAAGTAAGCTACTTGGAGATGTGACGATTGCTAATGGAGGAGTGATGCCTAACATCCA
CAATCTCCTTCTCCCAAACAAGAAGGCTGGTTCCTCTAAGCCTGCCGATGAAGATTAGGA
GAATCCAAGTGACAAAGCTGATGTCAGAGCGAACACGCAGAAGATGTTTTTTTTCAGTTT
CTTTCTTTAATTTCTCTTCTGCAGCAGTGTGAATGTAGGAGTAGCTGGAAATGATATTAC
TGTCGTGTGAATATATGAAGAACACTTTTCTGCTTTAGGTTTTACTGTAATACTCCACTT
TGTTAACTTATTGCAATGGTTTGATGCTTATCTTTTTATACACCAAAGTTACAACCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1H264TF U 1
AF RS1H264JQB C 228
BS 1 628 RS1H264TF
BS 629 629 RS1H264JQB
BS 630 638 RS1H264TF
BS 639 639 RS1H264JQB
BS 640 665 RS1H264TF
BS 666 666 RS1H264JQB
BS 667 718 RS1H264TF

RD RS1H264TF 718 0 0
GGATTATTGTTATCGTCTCAAATACGCTTTGCTTTGTTCATATACTACTTTTTAACCTTT
CTAGAGAGTTTCTACAGAGATGGCAGGTCGGGGAAAACAACTTGGATCTGGCGCGGCGAA
GAAGGCCACTTCTCGTAGTAGCAAGGCCGGGCTCCAATTCCCTGTTGGTCGTATCGCTCG
ATTCCTCAAGGCCGGAAAGTACGCTGAGCGTGTTGGAGCTGGAGCTCCGGTTTATCTCGC
CGCCGTTCTTGAATACCTCGCCGCCGAGGTGCTTGAGCTCGCTGGGAACGCGGCCAGAGA
TAACAAAAAGACAAGGATTGTGCCTCGTCACATTCAGCTTGCTGTGAGGAACGACGAGGA
GCTAAGTAAGCTACTTGGAGATGTGACGATTGCTAATGGAGGAGTGATGCCTAACATCCA
CAATCTCCTTCTCCCAAACAAGAAGGCTGGTTCCTCTAAGCCTGCCGATGAAGATTAGGA
GAATCCAAGTGACAAAGCTGATGTCAGAGCGAACACGCAGAAGATGTTTTTTTTCAGTTT
CTTTCTTTAATTTCTCTTCTGCAGCAGTGTGAATGTAGGAGTAGCTGGAAATGATATTAC
TGTCGTGTGAATATATGAAGAACACTTT*CTGCTTTAG*TTTTACTGTAATACTCCACTT
TGTTA*CTTATTGCAATGGTTTGATGCTTATCTTTTTATACACCAAAGTTACAACCCC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1H264JQB 491 0 0
CGGTTTATCTCGCCGCCGTTCTTGAATACCTCGCCGCCGAGGTGCTTGAGCTCGCTGGGA
ACGCGGCCAGAGATAACAAAAAGACAAGGATTGTGCCTCGTCACATTCAGCTTGCTGTGA
GGAACGACGAGGAGCTAAGTAAGCTACTTGGAGATGTGACGATTGCTAATGGAGGAGTGA
TGCCTAACATCCACAATCTCCTTCTCCCAAACAAGAAGGCTGGTTCCTCTAAGCCTGCCG
ATGAAGATTAGGAGAATCCAAGTGACAAAGCTGATGTCAGAGCGAACACGCAGAAGATGT
TTTTTTTCAGTTTCTTTCTTTAATTTCTCTTCTGCAGCAGTGTGAATGTAGGAGTAGCTG
GAAATGATATTACTGTCGTGTGAATATATGAAGAACACTTTTCTGCTTTAGGTTTTACTG
TAATACTCCACTTTGTTAACTTATTGCAATGGTTTGATGCTTATCTTTTTATACACCAAA
GTTACAACCCC

QA 1 491 1 491
DS 



AS 1 2

CO CL4784Contig1 983 2 2 U
GGAAGAAGGCTTAGTCTCACAAAGAGGACTAATCGCCTTGGCTCAGGGCTGCCAATAGCT
AGAATACATGGCTGTCTACGTCTCAGACATAACCAACGAGTCACTCGAAAGCATAGGGAC
ATACCTGAAAAACCTCTGTGACTTCCGCCTCGTTTTACTCGACAGGGAAGAGAGAATCAC
GGACCTGCCGCTGGACAACGGAGTCCGTTCCCTCTTGATAGGATGCAAGAAACTCAGACG
GTTTGCGTTTTATCTCAGACAAGGGGGGTTAACGGACGTGGGGTTAAGCTATATAGGACA
GTACAGCCCCAACGTGAGGTGGATGCTTCTTGGTTACGTCGGTGAAACAGACGAGGGGCT
AATGGAGTTCTCGAGAGGCTGTCCGAGTCTACAGAAGCTAGAGATGAGAGGGTGTTGTTT
CAGCGAACGAGCAATCGCTGCAGCGGTTATGAGGTTGCCTTCGTTGAGATACTTGTGGGT
ACAAGGGTATAGAGCATCGGTTAGGGGACAAGATTTGAGGTTGATGTCTAGACCGTACTG
GAACATAGAGCTGATACCGTCTAGAAGAGTACCGGAAGTGAATCAGCTTGGAGAGGTAAG
AGAGATGGAGCATCCGGCTCATATATTGGCTTACTACTCTTTGGCTGGTCAAAGAACAGA
TTGTCCACCAACTGTTAGAGTCCTAAAGGAGACATGATGATGATGATGATGATGATGATG
ATGATGATGCTGATCCAAAGCAGGTTTGTATATAAAAAAAGATTTGGTTATTATATCATT
TTCAGTCTCTTGAGTTTTGGGGGTTACATGAACTGTGTGATGTGATGATGTTTTCTTTTT
TTTTGTTCACTTTCTGTTGGTATGGGTCAGTGGTTTTGAGAGATTTTATATAGTATCCTT
GTTTGTAATAGAGCATATTTTATTGTTCTTTTTTTTCCACATTTTATTGTTATCTTTTTT
GAATAAAACCCCTCTTTTGAGAG


BQ
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AF RS1CQ81JQ C 255
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BS 736 983 RS1CQ81JQ

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AGAATACATGGCTGTCTACGTCTCAGACATAACCAACGAGTCACTCGAAAGCATAGGGAC
ATACCTGAAAAACCTCTGTGACTTCCGCCTCGTTTTACTCGACAGGGAAGAGAGAATCAC
GGACCTGCCGCTGGACAACGGAGTCCGTTCCCTCTTGATAGGATGCAAGAAACTCAGACG
GTTTGCGTTTTATCTCAGACAAGGGGGGTTAACGGACGTGGGGTTAAGCTATATAGGACA
GTACAGCCCCAACGTGAGGTGGATGCTTCTTGGTTACGTCGGTGAAACAGACGAGGGGCT
AATGGAGTTCTCGAGAGGCTGTCCGAGTCTACAGAAGCTAGAGATGAGAGGGTGTTGTTT
CAGCGAACGAGCAATCGCTGCAGCGGTTATGAGGTTGCCTTCGTTGAGATACTTGTGGGT
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GAACATAGAGCTGATACCGTCTAGAAGAGTACCGGAAGTGAATCAGCTTGGAGAGGTAAG
AGAGATGGAGCATCCGGCTCATATATTGGCTTACTACTCTTTGGCTGGTCAAAGAACAGA
TTGTCCACCAACTGTTAGAGTCCTAAAGGAGACATGATGATGATGATGATGATGATGATG
ATGATGATGCTGATC

QA 1 735 1 735
DS 

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CGGCTCATATATTGGCTTACTACTCTTTGGCTGGTCAAAGAACAGATTGTCCACCAACTG
TTAGAGTCCTAAAGGAGACATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGCTGAT
CCAAAGCAGGTTTGTATATAAAAAAAGATTTGGTTATTATATCATTTTCAGTCTCTTGAG
TTTTGGGGGTTACATGAACTGTGTGATGTGATGATGTTTTCTTTTTTTTTGTTCACTTTC
TGTTGGTATGGGTCAGTGGTTTTGAGAGATTTTATATAGTATCCTTGTTTGTAATAGAGC
ATATTTTATTGTTCTTTTTTTTCCACATTTTATTGTTATCTTTTTTGAATAAAACCCCTC
TTTTGAGAG

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

CO CL4785Contig1 1080 2 2 U
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ATTTGGTTCCTCCTTGATTATTCCGAAACGCCGTCGTTTCTCCGATCAAATCTAGTTCCT
TTCTCTCTAAGCCCAGAAGACACCATTGTACCCAGAAAACTCCGAGATCGTAGATTTAAA
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TGAAATCTCCGATGGATAGTTCGAGTGACAACGAGGGTGATTACGACGGAATGAATGAAG
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TGGGCGGTGGCAAAGCTGCTGACTTGCTTTTGTGGAGGAAGAGACATCATTCGTTGGGAG
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CTGGTTTTAGGAGCAGACATGTGAATTCGTTACCAGAGCTTGTTCTATCTGAGGAAATGG
TGAATAGTGCCGCAGCTTCTTTGCGTATCAAACTTAATCACTTGCTTGTGATGGCTCATG
ATGTCACAGTTGGCAACGATTTTAGGCTCTTCCTCAAGGTGGTGATTTGTCTGTGGCTTC
TTTCTGCCATTGGTTGCTATATTTCTTTCTGCACTCTTGTTTATATCGGGACCATCCTAC
CTGTAACAATACCAGCTTTGTACAGCAAATATCAAAGCAAAGTAGACAAGTGTTGCGGTT
TGATTCACAGGCAGTTGACTCATCACTACAAGTTAGTTGACGAAAATGTTATAAGCAGAC
TCTCATGGAGCTTTTCTAAAGATAAAGATTCATGAGCTTAGGTTTGGTGATTTTTGAAAA
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AF RS1D332TF U 1
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BS 1 679 RS1D332TF
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GGGACTAGAGGCGGAGAATTTCGAGAATGTTGGAATTGGATGCATGTAAAACCCAATTCG
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TTCTCTCTAAGCCCAGAAGACACCATTGTACCCAGAAAACTCCGAGATCGTAGATTTAAA
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GAGGATCCACATCGGAGGATTATCGATTGTTGGGTCGGCAAGTTACGGTTCATCAGTTCA
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TTATCGTCTTATCAACCGTAGCTTGGCTTATATTCGAGTTTTCTGGATTGCCTTTCTTAT
CTGTTTCTTCAGATGTCTTACTGATCGTTGTTATAATATCATTCGTCCTTGCCCGGGCTT
CTGGTTTTAGGAGCAGACATGTGAATTCGTTACCAGAGCTTGTTCTATCTGAGGAAATGG
TGAATAGTGCCGCAGCTTCTTTGCGTATCAAACTTAATCACTTGCTTGTGATGGCTCATG
ATGTCACAGTTGGCAACGA

QA 1 679 1 679
DS 

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AGACGAGAGATTCCTCA*TCAGTCAAGAT*GGCAT*CGGAAAGTCGGATAATTTGGGGTA
TTGAAATCTCCGATGGATAGT*CGAGTGACAACGAGGGTGAT*ACGACGGAATGAATGAA
GGAGGATCCACATCGGAGGATTATCGATTGTTGGGTCGGCAAGTTACGGTTCATCAGTTC
ATGGGCGGTGGCAAAGCTGCTGACTTGCTTTTGTGGAGGAAGAGACATCATTCGTTGGGA
GTTATCGTCTTATCAACCGTAGCTTGGCTTATATTCGAGTTTTCTGGATTGCCTTTCTTA
TCTGTTTCTTCAGATGTCTTACTGATCGTTGTTATAATATCATTCGTCCTTGCCCGGGCT
TCTGGTTTTAGGAGCAGACATGTGAATTCGTTACCAGAGCTTGTTCTATCTGAGGAAATG
GTGAATAGTGCCGCAGCTTCTTTGCGTATCAAACTTAATCACTTGCTTGTGATGGCTCAT
GATGTCACAGTTGGCAACGATTTTAGGCTCTTCCTCAAGGTGGTGATTTGTCTGTGGCTT
CTTTCTGCCATTGGTTGCTATATTTCTTTCTGCACTCTTGTTTATATCGGGACCATCCTA
CCTGTAACAATACCAGCTTTGTACAGCAAATATCAAAGCAAAGTAGACAAGTGTTGCGGT
TTGATTCACAGGCAGTTGACTCATCACTACAAGTTAGTTGACGAAAATGTTATAAGCAGA
CTCTCATGGAGCTTTTCTAAAGATAAAGATTCATGAGCTTAGGTTTGGTGATTTTTGAAA
ATGCTTTTACTCTGTCTTTCTTCACTAGTTGAGTTTTCTTCTTATTTTACCATGTGTAGT
ATGTAACTAAACGACTGATATAATTGATGAATATATAAGATGGTTTCAATTGTTCAAGTC
G

QA 1 901 1 901
DS 



AS 1 2

CO CL4786Contig1 477 2 1 U
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CAAGTGGGATGCTTATCTCGATCTTCTCCAGCTTGACTACACTGAAGGGGACGCACTTGA
TGCACTCAACCTATTTAGATACTGCTGCAGGCGTATGCTAATGACGCATGTTGATCTGAT
TGAGAAGCTTCTCAACTACACTCTGGAGAAATCAGACAACATTTAGAAGAGCATGAAATC
TGCTGAAATTGTATTCCTTCTTAGCATATCTATGGGAACTCTGTGTTTTGGTGTAAAAAC
TTGAATCGATACGGGTTTTGGAAGACGCTAGTGAATTTGTCATATGTATGTCAGTGACTC
TCTGTGTGATTCAGTGTTATAATTTTATGAGCTGAAAGAATTGTTTTCCTTTTGAGT


BQ
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AF RS1C869JQ C 1
AF RS1C869TF U 1
BS 1 477 RS1C869TF

RD RS1C869JQ 477 0 0
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TGCACTCAACCTATTTAGATACTGCTGCAGGCGTATGCTAATGACGCATGTTGATCTGAT
TGAGAAGCTTCTCAACTACACTCTGGAGAAATCAGACAACATTTAGAAGAGCATGAAATC
TGCTGAAATTGTATTCCTTCTTAGCATATCTATGGGAACTCTGTGTTTTGGTGTAAAAAC
TTGAATCGATACGGGTTTTGGAAGACGCTAGTGAATTTGTCATATGTATGTCAGTGACTC
TCTGTGTGATTCAGTGTTATAATTTTATGAGCTGAAAGAATTGTTTTCCTTTTGAGT

QA 1 477 1 477
DS 

RD RS1C869TF 477 0 0
GGAATCGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGCAGACCCAAGTCAACAGTTTCGCAGTTC
TTTGCTCGAGAAGATGATTATCCCTGTACGATGCTTTACATGCGGAAAGGTGATTGGAAA
CAAGTGGGATGCTTATCTCGATCTTCTCCAGCTTGACTACACTGAAGGGGACGCACTTGA
TGCACTCAACCTATTTAGATACTGCTGCAGGCGTATGCTAATGACGCATGTTGATCTGAT
TGAGAAGCTTCTCAACTACACTCTGGAGAAATCAGACAACATTTAGAAGAGCATGAAATC
TGCTGAAATTGTATTCCTTCTTAGCATATCTATGGGAACTCTGTGTTTTGGTGTAAAAAC
TTGAATCGATACGGGTTTTGGAAGACGCTAGTGAATTTGTCATATGTATGTCAGTGACTC
TCTGTGTGATTCAGTGTTATAATTTTATGAGCTGAAAGAATTGTTTTCCTTTTGAGT

QA 1 477 1 477
DS 



AS 1 2

CO CL4787Contig1 1021 2 2 U
GGGAAACCAAGTAAACCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCAGAACGACGTGTTCGA
TTCGAAGATCATTGTGATCTTAATCAGTGATTGAATTAGGGTTTAACCATGGAAGACGAA
TCAGGAAACGAAGGAGACGGATACACAATGAGCGATTCACCGCTTGCTCGATGGAGAATC
GAATTCTCGAAATCTTTCCAGAGTCACCTCGACAAATCGGCTCCACACCTCGTTCGAAGA
TGGCTAGTGACGCTAATCGCCGCGGTGATCTACATCTACAGAGTTTACTACGCTTACGGA
TTCTTCGTCGTCTCGTATGGTCTTGCGACGTACATCTTAAACCTCTTGATCGGTTTCCTC
TCCCCCAAAGTCGATCCAGAGCTCGAAGCCTTGGATCATGCTTCTGCTTCTTCTGAGACT
AGTAAAGATTCTGATGAGTTCAAGCCTTTTGTTCGTCGTCTCCCTGAGTTCAAGTTCTGG
TATGCAGCTACTAAGGCTTTTGTTGTAGCGTTTGTGATGACCTTCTTCTCGTTTTTGGAT
GTGCCTGTGTTCTGGCCAATCTTGCTTTGCTACTGGTTGTTTCTGTATTTTCTCACTATG
AAACGACAGATCGTGCACATGATCAAGTACAGATATGTTCCTTTCGATTTTGGAAAAAAG
AGGTATGGTGGAAATGATAAGCCTAGTAGCAGCAATTCACCTCAAGGAGATGAAAATACG
GCTCAAACGTGAAGCTTATACCAGACCATGGCTTGGTGCGTTTGGATCAATATACGCCAA
ATTACTGATCCGGATCGCTTTACTGACGCAGTAGAAGTGGATAAATACGTCATTTTACTC
AAATACTATAGATTTTAGAGTTTACTTGCTTTGATTACATAATGAACTTTGTCACCAAAT
CTGTAAAACTGCTCCTGGTGTGTCTCTCTCCATGAGTTCAGTGTGTAAATGTTAACTCAG
ATCAGAACTAAATGTAACTTCTCTTTTTATTGAATGAATCAGAACCATATACAAGTTGCA
G


BQ
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10 

AF RS1H534TF U 1
AF RS1H534JQB C 532
BS 1 715 RS1H534TF
BS 716 1021 RS1H534JQB

RD RS1H534TF 715 0 0
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TTCGAAGATCATTGTGATCTTAATCAGTGATTGAATTAGGGTTTAACCATGGAAGACGAA
TCAGGAAACGAAGGAGACGGATACACAATGAGCGATTCACCGCTTGCTCGATGGAGAATC
GAATTCTCGAAATCTTTCCAGAGTCACCTCGACAAATCGGCTCCACACCTCGTTCGAAGA
TGGCTAGTGACGCTAATCGCCGCGGTGATCTACATCTACAGAGTTTACTACGCTTACGGA
TTCTTCGTCGTCTCGTATGGTCTTGCGACGTACATCTTAAACCTCTTGATCGGTTTCCTC
TCCCCCAAAGTCGATCCAGAGCTCGAAGCCTTGGATCATGCTTCTGCTTCTTCTGAGACT
AGTAAAGATTCTGATGAGTTCAAGCCTTTTGTTCGTCGTCTCCCTGAGTTCAAGTTCTGG
TATGCAGCTACTAAGGCTTTTGTTGTAGCGTTTGTGATGACCTTCTTCTCGTTTTTGGAT
GTGCCTGTGTTCTGGCCAATCTTGCTTTGCTACTGGTTGTTTCTGTATTTTCTCACTATG
AAACGACAGATCGTGCACATGATCAAGTACAGATATGTTCCTTTCGATTTTGGAAAAAAG
AGGTATGGTGGAAATGATAAGCCTAGTAGCAGCAATTCACCTCAAGGAGATGAAA

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1H534JQB 490 0 0
TTTTTGGATGTGCCTGTGTTCTGGCCAATCTTGCTTTGCTACTGGTTGTTTCTGTATTTT
CTCACTATGAAACGACAGATCGTGCACATGATCAAGTACAGATATGTTCCTTTCGATTTT
GGAAAAAAGAGGTATGGTGGAAATGATAAGCCTAGTAGCAGCAATTCACCTCAAGGAGAT
GAAAATACGGCTCAAACGTGAAGCTTATACCAGACCATGGCTTGGTGCGTTTGGATCAAT
ATACGCCAAATTACTGATCCGGATCGCTTTACTGACGCAGTAGAAGTGGATAAATACGTC
ATTTTACTCAAATACTATAGATTTTAGAGTTTACTTGCTTTGATTACATAATGAACTTTG
TCACCAAATCTGTAAAACTGCTCCTGGTGTGTCTCTCTCCATGAGTTCAGTGTGTAAATG
TTAACTCAGATCAGAACTAAATGTAACTTCTCTTTTTATTGAATGAATCAGAACCATATA
CAAGTTGCAG

QA 1 490 1 490
DS 



AS 1 2

CO CL4788Contig1 835 2 2 U
GGGTTCCAACACAAACTCTCTCTCTAAAACCTCCAACTTCTCACTAAAAAGCGTCTAATT
GAAGTTTGCTTCGGGGGCCGGCGGTTCCCCACCGTCGGTCACCACCCCTTTTGTTTGTAA
CATATTAGTATTTTCTTTGCCTTTTGTTTTTTGATGTTTATACTTCCGTTTAGCGGATAT
GTTCTTTCGTTGCAGATCAAACTTCGCTAGGCGATGGTTTAGTTTTCAAGTTCCAACCTT
TCGCATGCGTAACTCTAATCCCGTCAACTCTTGATCATATATGATGTTTCTCCTAATCAG
CTTTTCCACTGTTTAATGGAGAATCAGTCTTTGCTGACTTAGATCTAGCCATGTTTGGCT
TAAGGCAAAGCTTCTCTAATAAAAAAGGGTAAAGTTTGTTTGGATTTCTTAGGTCTTTTG
AAGAAGATTCAGCAGAGATGGCGTTTCTAACGGTCCGTCAAAGAATCTCTATTTCAACTG
ACTTAAATTTCCTCAGGATTAAACATTGGTGAAACATGACTTTCTGGTTAATGAGTTTCG
GTTTAAAGCGAGAGGTTTCGTTGGGAGTACAAGTCTTGGCAAATCAAGGTGTTGTGGCGG
CTCCTGATGAAGAACCATACCGGCGGCACTGTTTTTCCGGTGACAAAGTCGAAGGCGGTT
ACGTCAAGAGCTCAAGAGCGGTGGAGAAGATTGGTGTCCTCGTTAACATCAAGTTCCTGC
CACGTAGCAGCATCTCAAAAATTACCCTACACGTGTTATAAGCTGTGTCATCCTTTTGTT
TATTTGTGTTGGGCCTTAATGCCAATATTGTACTTTTCTTTAGTCCAAGAGGCTT


BQ
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AF RS1G219TF U 1
AF RS1FD53JQ C 159
BS 1 634 RS1G219TF
BS 635 835 RS1FD53JQ

RD RS1G219TF 634 0 0
GGGTTCCAACACAAACTCTCTCTCTAAAACCTCCAACTTCTCACTAAAAAGCGTCTAATT
GAAGTTTGCTTCGGGGGCCGGCGGTTCCCCACCGTCGGTCACCACCCCTTTTGTTTGTAA
CATATTAGTATTTTCTTTGCCTTTTGTTTTTTGATGTTTATACTTCCGTTTAGCGGATAT
GTTCTTTCGTTGCAGATCAAACTTCGCTAGGCGATGGTTTAGTTTTCAAGTTCCAACCTT
TCGCATGCGTAACTCTAATCCCGTCAACTCTTGATCATATATGATGTTTCTCCTAATCAG
CTTTTCCACTGTTTAATGGAGAATCAGTCTTTGCTGACTTAGATCTAGCCATGTTTGGCT
TAAGGCAAAGCTTCTCTAATAAAAAAGGGTAAAGTTTGTTTGGATTTCTTAGGTCTTTTG
AAGAAGATTCAGCAGAGATGGCGTTTCTAACGGTCCGTCAAAGAATCTCTATTTCAACTG
ACTTAAATTTCCTCAGGATTAAACATTGGTGAAACATGACTTTCTGGTTAATGAGTTTCG
GTTTAAAGCGAGAGGTTTCGTTGGGAGTACAAGTCTTGGCAAATCAAGGTGTTGTGGCGG
CTCCTGATGAAGAACCATACCGGCGGCACTGTTT

QA 1 634 1 634
DS 

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TATACTTCCGTTTAGCGGATATGTTCTTTCGTTGCAGATCAAACTTCGCTAGGCGATGGT
TTAGTTTTCAAGTTCCAACCTTTCGCATGCGTAACTCTAATCCCGTCAACTCTTGATCAT
ATATGATGTTTCTCCTAATCAGCTTTTCCACTGTTTAATGGAGAATCAGTCTTTGCTGAC
TTAGATCTAGCCATGTTTGGCTTAAGGCAAAGCTTCTCTAATAAAAAAGGGTAAAGTTTG
TTTGGATTTCTTAGGTCTTTTGAAGAAGATTCAGCAGAGATGGCGTTTCTAACGGTCCGT
CAAAGAATCTCTATTTCAACTGACTTAAATTTCCTCAGGATTAAACATTGGTGAAACATG
ACTTTCTGGTTAATGAGTTTCGGTTTAAAGCGAGAGGTTTCGTTGGGAGTACAAGTCTTG
GCAAATCAAGGTGTTGTGGCGGCTCCTGATGAAGAACCATACCGGCGGCACTGTTTTTCC
GGTGACAAAGTCGAAGGCGGTTACGTCAAGAGCTCAAGAGCGGTGGAGAAGATTGGTGTC
CTCGTTAACATCAAGTTCCTGCCACGTAGCAGCATCTCAAAAATTACCCTACACGTGTTA
TAAGCTGTGTCATCCTTTTGTTTATTTGTGTTGGGCCTTAATGCCAATATTGTACTTTTC
TTTAGTCCAAGAGGCTT

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 2

CO CL4789Contig1 1287 2 4 U
GGGCATGAATGTTAACCTAATCTCGTCACACCCGAAGCAGAGCAACACCACACAGGATGG
CAGATTCAATCAAGGAGAGGTACACAGTCGGATATGCCCTCGCAGCGAAGAAGCAGCACA
GCTTCATCCAGCCCTCGCTGATCGAACACTCGAGGCGACGAGGCATTGATCTGATCAAGC
TCTATCCGGCGAAGCCGTTAACGGAGCAAGGGAGACTCGATTGCGTAATCCACAAGCTAT
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TCGTCGACTCCCCCGAGGCGATCGAGAGGCTGCACAACAGGGTGTCGATGCTCGAGGTGA
TCACTCAGCTGACCTTCTCCGTCTCCGAGGGGGAGCGTTTCGGAGTTCCCAAGCAGGTCG
TCGTGATGGACGAGAGCGTTCTGAGCGGCGGAGGAGCTGCTTTGGGAGAGGAGCTGGAGT
TTCCGGTGATCGCTAAGCCCTTGGACGCGGACGGGAGCGCGAGGTCTCACAAGATGTTCT
TGATCTACGATCAAGAAGGGATGAAGATACTTAAAGCACCGATCGTGCTGCAGGAGTTTG
TGAACCACGGAGGCGTTATCTTCAAGTCTATGTGGTGGGAGACTACGTGAAGTGCGTAAA
GAGAAGATCTTTGCCTGATATTTCCGAGGAGAAGATCGGGACGGCGAGAGGGTCGCTTCC
GTTCTCGCAGATATCGAACTTGACTGCTAACTGTGCTCAGGAGGAGAAGAACAGGGAGGA
GTATGGAGAGGATAGGAGCTTGGAGAAAGTGGAGATGCCTCCGACGAGTTTCTTGGAGGA
GCTGGCGAAGGCGATGAGGGAATCGATGGGGCTTAATCTGTTTAACTTTGACGTGATTAG
GGATGCGAGGGATGCTAGTAGGTACCTTGTGATTGATATTAACTACTTCCCTGGGTATGC
TAAGATGCCGTCTTACGAGCCTGTGTTGACGGAGTTCTTCTGGGACATGGTCACAAAGAA
GAAGAGCCATGTCTGAGAATAATAATCTCGAGAAACATATCTTAGAGAGGATTACTACAC
ATTGCAATTGCCGTTGCAGACATCTCGAGGCTGTCCTATGGTGGTGACTTAGCTTGCTCT
GCTAATTTTTCATTTGGATTCTTGAACTTTTGTGCTTTTTTATTAAAAAAAAATTGTTGT
TATTATTTCTTAGTTGTTTCGTCTGTCTTTTACTTCCAAGTTTTGCAAAGGTTATGCAAT
GCATAACTGTTGCCTACTCTTGAAAAA


BQ
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AF RS1FS66TF U 1
AF RS1FS66JQ C 623
BS 1 692 RS1FS66TF
BS 693 693 RS1FS66JQ
BS 694 706 RS1FS66TF
BS 707 1287 RS1FS66JQ

RD RS1FS66TF 706 0 0
GGGCATGAATGTTAACCTAATCTCGTCACACCCGAAGCAGAGCAACACCACACAGGATGG
CAGATTCAATCAAGGAGAGGTACACAGTCGGATATGCCCTCGCAGCGAAGAAGCAGCACA
GCTTCATCCAGCCCTCGCTGATCGAACACTCGAGGCGACGAGGCATTGATCTGATCAAGC
TCTATCCGGCGAAGCCGTTAACGGAGCAAGGGAGACTCGATTGCGTAATCCACAAGCTAT
ACGACGCCGTTTGGAAGGAGAACCTCGTCGCGTTTCGCGAGAAGTTCCCCTTCGTTCCCG
TCGTCGACTCCCCCGAGGCGATCGAGAGGCTGCACAACAGGGTGTCGATGCTCGAGGTGA
TCACTCAGCTGACCTTCTCCGTCTCCGAGGGGGAGCGTTTCGGAGTTCCCAAGCAGGTCG
TCGTGATGGACGAGAGCGTTCTGAGCGGCGGAGGAGCTGCTTTGGGAGAGGAGCTGGAGT
TTCCGGTGATCGCTAAGCCCTTGGACGCGGACGGGAGCGCGAGGTCTCACAAGATGTTCT
TGATCTACGATCAAGAAGGGATGAAGATACTTAAAGCACCGATCGTGCTGCAGGAGTTTG
TGAACCACGGAGGCGTTATCTTCAAGTCTATGTGGTGGGAGACTACGTGAAGTGCGTAAA
GAGAAGATCTTTGCCTGATATTTCCGAGGAGA*GATCGGGACGGCG

QA 1 706 1 706
DS 

RD RS1FS66JQ 665 0 0
AAG
GTCTATGTGGTGGGAGACTACGTGAAGTGCGTAAAGAGAAGATCTTTGCCTGATATTTCC
GAGGAGAAGATCGGGACGGCGAGAGGGTCGCTTCCGTTCTCGCAGATATCGAACTTGACT
GCTAACTGTGCTCAGGAGGAGAAGAACAGGGAGGAGTATGGAGAGGATAGGAGCTTGGAG
AAAGTGGAGATGCCTCCGACGAGTTTCTTGGAGGAGCTGGCGAAGGCGATGAGGGAATCG
ATGGGGCTTAATCTGTTTAACTTTGACGTGATTAGGGATGCGAGGGATGCTAGTAGGTAC
CTTGTGATTGATATTAACTACTTCCCTGGGTATGCTAAGATGCCGTCTTACGAGCCTGTG
TTGACGGAGTTCTTCTGGGACATGGTCACAAAGAAGAAGAGCCATGTCTGAGAATAATAA
TCTCGAGAAACATATCTTAGAGAGGATTACTACACATTGCAATTGCCGTTGCAGACATCT
CGAGGCTGTCCTATGGTGGTGACTTAGCTTGCTCTGCTAATTTTTCATTTGGATTCTTGA
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AA

QA 4 665 4 665
DS 



AS 1 2

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AACACTGTTGATAATAAGAACAAAGGGAAGGCTATTCAATTGGGAGACGAAGATGAGGGG
TCTGCTAGCGATTGTTATGAAACAACCAACAACAACGACGAATCGTATCCTGGTTCCTCT
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CAAGCTTTCAAGTTTTCTTCTTCCTCCGGTCAACTTGAGCCTCAGACTCCTGATACCGTG
ATGGGGGAGGCTCCTGTTGTTCTAGCTACAGCTCCTTCTGGTTTAGGGCTTCCGGTGCCA
AACAACCCGTCCTGGTACAAAGGGCATAAGATGTACCCTCATGCTCGGCCTAGAGTGGAG
GAGGTTATTGCAGGTCAGAGCTCTTCCAGAGTTAAGAGGAACATGGAGGATTATCTTGGC
AAGTATTTGTTTTTCAAAAAGTTTGACATTGTTGAAGATTTGGGGGACCATGAATACGCT
GCTCAGGAAGGCAAACCCTCGGACACTAACGTTGCAGAGAGCAGTAACAGACCACCCAGT
TGAGAGCTTCATTGCTTCCTTTTCTTATTTGATCATTTTCTTATTTTAAGTAGCTTAAGC
TCTTCTTAGGCGAGATTTCTTCAATGTTAACAGATCACAGAGGAGTTAGTTGATCCTTTT
CTTATTATATATCATGGATCCTCTTTCTTTCTTATAAATGACATGACTTTATTGAGAGGG
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RS1DP74TF U 1
AF RS1DP74JQ C 555
BS 1 696 RS1DP74TF
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CAAGCTTTCAAGTTTTCTTCTTCCTCCGGTCA*CTTGAGCCT

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1DP74JQ 707 0 0
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TGGATCCTCTTTCTTTCTTATAAATGACATGACTTTATTGAGAGGGT

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 2

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TATTGTACCGAGAAGTTCCTTCAGAAATCCGGTTTAAACCACATTACAATCCGGTTATGC
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CGTGCATGGACAACTCAAGAAGTAATAACATTATGTGAGAGACTTGCTGGGCAAGATGCG
AATGTCACAACGGTTCCAGTTTCTGTATTGAGAGTCACACGTCAGTTAACAAGGTTTTTT
CAGTGGACAAACGATGTTGCAGATAGATTGGCCTTCACAGAGGTCCTCTCGAGTGACACG
GTCTTCTCTGTTCCGATGACTGAGACTAATAGTCTACTAGGTGTGGATCAAAAGGATTTG
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AATAAGATTCAACGCTATTAAAAACTGCATTTGCGTCCATAATGTGTCACTGAGCTTTAT
CGGTTTGTTTCTTATTCAACAATGGGTTATTGTACTTTTTGTAATTAAAGAGAATTATTG
TAATATAAATGTAGCTTACCATACATATTCTTTGTTGCCTTGAGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1H571TF U 1
AF RS1H571JQB C 287
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AATAAGATTCAACGCTATTAAAAACTGCATTTGCGTCCATAATGTGTCACTGAGCTTTAT
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AAAGAGAATTATTGTAATATAAATGTAGCTTACCATACATATTCTTTGTTGCCTTGAGGT

QA 1 540 1 540
DS 



AS 1 2

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C


BQ
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10 

AF RS1F706TF U 1
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QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

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ATCGACTTCTTTGGCTTCTTCTTGTTTTCCTTCTTCTTCTCTTCGTCGGTTTGCTTCTTC
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BQ
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AF RS1H705JQB U 7
AF RS1H705TF C 1
BS 1 6 RS1H705TF
BS 7 483 RS1H705JQB
BS 484 650 RS1H705TF

RD RS1H705JQB 477 0 0
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AGCACAACTACCTCGGACTACTTATAATATAAAGATCAACATTAATACAAAGTTTATAAA
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AAGGCCTTAGATAGCTTCACAAGGTTAGGCCTCGCAATTCCCAAATGCATTTTCCCAGTT
GAGAACTTCAGTGCCTGCAAGCAACACAGTTGCTGCTGATCAATCCCATCGTCATCGTCT
TCCTCTTCCACTACTACTTCCTTCTTCTTCTCTATGCTCTTCGACTTCATCATCATCGAC
TTCTTTGGCTTCTTCTTGTTTTCCTTCTTCTTCTCTTCGTCGGTTTGCTTCTTCTCTGTT
TCGGTCTCGTAAGTCTCCCAAAGCTGATCCATCCCTTGTCCTACGTCAGCGTTGTGT

QA 1 477 1 477
DS 

RD RS1H705TF 650 0 0
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TACAAAAGCACAACTACCTCGGACTACTTATAATATAAAGATCAACATTAATACAAAGTT
TATAAATTCTTCCTTCATGCTTTCTTGGGATGCTTGTTGGCATTGTAAAACCTTCCAAAT
CCTTTGAAGGCCTTAGATAGCTTCACAAGGTTAGGCCTCGCAATTCCCAAATGCATTTTC
CCAGTTGAGAACTTCAGTGCCTGCAAGCAACACAGTTGCTGCTGATCAATCCCATCGTCA
TCGTCTTCCTCTTCCACTACTACTTCCTTCTTCTTCTCTATGCTCTTCGACTTCATCATC
ATCGACTTCTTTGGCTTCTTCTTGTTTTCCTTCTTCTTCTCTTCGTCGGTTTGCTTCTTC
TCTGTTTCGGTCTCGTAAGTCTCCCAAAGCTGATCCATCCCTTGTCCTACGTCAGCGTTG
TGTCGTTCCTCGAACAGCTTGCATGCCAATGTTCTCCTCCACTCTTTCTCTTTCCTCATT
GACCCAAAGCTCCTTAGAGAAACATCTTCTTCTTGAACATGTAAGGTGAGATGTCAATGG
CGACAAAGAAGCTTAGCCAAGTGTTTTTTTTTGGTTCTTTTTCTTTGCCC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL4794Contig1 1148 2 2 U
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TCTCACTTGTACTCCAATGATGGTATCTCTTGTTTCCAGAAAAATCAGAGCCTCAAACTC
TCCGGACCACTTATTTCCATCAAGACAAAACGACCCTCGAGGGTACAAGTAATATCCGCT
GTTCAGTTCCGACCTTGCATTGACATCCACAAGGGGAAAGTGAAACAAATAGTTGGATCC
ACTTTAAGCGACTTAAAAGAAGACGGTTCGGCTCTCGTGACGAACTTCGAATCAGACAAA
TCCGCGGAAGAGTATGCAAACATGTACAAAGAAGATGGGCTCACAGGTGGTCATGTGATT
ATGCTCGGGGCAGACCCTTTAAGCCAATCTGCAGCTATTGGAGCTTTACATGCTTATCCC
GGCGGTTTGCAGGTTGGAGGTGGGATCAGTTCGGAGAATTGTTTGAGTTATATAGAGGAG
GGAGCAAGTCATGTTATTGTCACTTCGTATGTGTTTAACAATGGGAAGCTTGATCTTGAG
AGACTGAAAGATCTTGTGAAGATTGTTGGGAAAGAAAGATTGATATTGGACCTTAGCTGC
AGAAAGAAAGATGACGGAAGATACGCGATTGCTACTGATAGGTGGCAGAAGTTCAGCGAC
GTCTTGCTTGATGAGAAATCGTTGGAGTTTCTTGGAGGTTTTGCAGATGAGTTTCTGGTG
CATGGTGTTGATGTTGAAGGAAAGAAGCTAGGGATTGATGAAGAGCTTGTTGCATTGCTT
GGCAACTATTCTCCGATTCCAGTAACTTATGCGGGAGGCGTGACAGTGATGGGTGATGTG
GAGAGGATCAAAGAAGCAGGGAAGGGACGTGTGGATGTAACAGTGGGAAGTGCCTTGGAC
ATTTTTGGTGGTAATCTGCCTTACAAAGATGTTGTTGCTTGGCATCACCAGCAACAAGAA
CCCTCTTCAGCACTCCATTGAAAACCTCATTTTCTGTCTTTTGCTTTGTTTTATTTGTCC
AATATTTAATAATTTTCAACTTAATATTCGTGAAAGAGTCAAAAAAAACAATAGATGTTG
AATTTTTTTTCATGGATTGCTACATTGCTAATTTGACTTTCTTCTTTCGAATAACATTGA
AATTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E965TF U 1
AF RS1E965JQ C 426
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BS 614 1148 RS1E965JQ

RD RS1E965TF 613 0 0
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TCTCACTTGTACTCCAATGATGGTATCTCTTGTTTCCAGAAAAATCAGAGCCTCAAACTC
TCCGGACCACTTATTTCCATCAAGACAAAACGACCCTCGAGGGTACAAGTAATATCCGCT
GTTCAGTTCCGACCTTGCATTGACATCCACAAGGGGAAAGTGAAACAAATAGTTGGATCC
ACTTTAAGCGACTTAAAAGAAGACGGTTCGGCTCTCGTGACGAACTTCGAATCAGACAAA
TCCGCGGAAGAGTATGCAAACATGTACAAAGAAGATGGGCTCACAGGTGGTCATGTGATT
ATGCTCGGGGCAGACCCTTTAAGCCAATCTGCAGCTATTGGAGCTTTACATGCTTATCCC
GGCGGTTTGCAGGTTGGAGGTGGGATCAGTTCGGAGAATTGTTTGAGTTATATAGAGGAG
GGAGCAAGTCATGTTATTGTCACTTCGTATGTGTTTAACAATGGGAAGCTTGATCTTGAG
AGACTGAAAGATCTTGTGAAGATTGTTGGGAAAGAAAGATTGATATTGGACCTTAGCTGC
AGAAAGAAAGATG

QA 1 613 1 613
DS 

RD RS1E965JQ 723 0 0
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AAGTCATGTTATTGTCACTTCGTATGTGTTTAACAATGGGAAGCTTGATCTTGAGAGACT
GAAAGATCTTGTGAAGATTGTTGGGAAAGAAAGATTGATATTGGACCTTAGCTGCAGAAA
GAAGGATGACGGAAGATACGCGATTGCTACTGATAGGTGGCAGAAGTTCAGCGACGTCTT
GCTTGATGAGAAATCGTTGGAGTTTCTTGGAGGTTTTGCAGATGAGTTTCTGGTGCATGG
TGTTGATGTTGAAGGAAAGAAGCTAGGGATTGATGAAGAGCTTGTTGCATTGCTTGGCAA
CTATTCTCCGATTCCAGTAACTTATGCGGGAGGCGTGACAGTGATGGGTGATGTGGAGAG
GATCAAAGAAGCAGGGAAGGGACGTGTGGATGTAACAGTGGGAAGTGCCTTGGACATTTT
TGGTGGTAATCTGCCTTACAAAGATGTTGTTGCTTGGCATCACCAGCAACAAGAACCCTC
TTCAGCACTCCATTGAAAACCTCATTTTCTGTCTTTTGCTTTGTTTTATTTGTCCAATAT
TTAATAATTTTCAACTTAATATTCGTGAAAGAGTCAAAAAAAACAATAGATGTTGAATTT
TTTTTCATGGATTGCTACATTGCTAATTTGACTTTCTTCTTTCGAATAACATTGAAATTT
TAC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

CO CL4795Contig1 546 2 2 U
ATATTACAACCACCAATATATATCACACATTTACGTTTATACATTGTTTCCAAATCGCAT
GCATTGTTACACACCTATGCATCGATCGTCTTACTACAGATTGCATGACTTTTATTTAAT
CGCGACCGAGCTTAAGTACCAAGACACTCCACATACTTAATAATTATACATCACCATCAT
GCACCCGTCGCATTTAAGTTCTAAATTAAACTCACATAAAATTCACATGCACCAACTCCG
TAAATTATGCATGTTGAGTAGATATTGTAACTATCAGACTTTTAATCCAAAGCAAGCATC
GAGAGCTTCTCCGATTGTCAGATAGACTTTTCCACCGATTTTGTTGATGAACTTTGCTTG
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ATCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RS1AB57TF C 1
AF RS1AB57JQ U 69
BS 1 68 RS1AB57TF
BS 69 546 RS1AB57JQ

RD RS1AB57TF 546 0 0
ATATTACAACCACCAATATATATCACACATTTACGTTTATACATTGTTTCCAAATCGCAT
GCATTGTTACACACCTATGCATCGATCGTCTTACTACAGATTGCATGACTTTTATTTAAT
CGCGACCGAGCTTAAGTACCAAGACACTCCACATACTTAATAATTATACATCACCATCAT
GCACCCGTCGCATTTAAGTTCTAAATTAAACTCACATAAAATTCACATGCACCAACTCCG
TAAATTATGCATGTTGAGTAGATATTGTAACTATCAGACTTTTAATCCAAAGCAAGCATC
GAGAGCTTCTCCGATTGTCAGATAGACTTTTCCACCGATTTTGTTGATGAACTTTGCTTG
ATTCAGCTTGTGGAGCACTGTCCATTTAGGGTTAACGATCACCAGCTCAACACCATTTTG
GATTAGGTTGTTTTGGAGCTCCACCAAGGCAGTAATTCCGGATGTATCCACGTTTATTAA
ATTTGACATATCAAGGACGACAAAGAGGATGTTTTTCTTAGCGTTGGTCTTTGTGTTTCC
ATCATC

QA 1 546 1 546
DS 

RD RS1AB57JQ 478 0 0
ACACACCTATGCATCGATCGTCTTACTACAGATTGCATGACTTTTATTTAATCGCGACCG
AGCTTAAGTACCAAGACACTCCACATACTTAATAATTATACATCACCATCATGCACCCGT
CGCATTTAAGTTCTAAATTAAACTCACATAAAATTCACATGCACCAACTCCGTAAATTAT
GCATGTTGAGTAGATATTGTAACTATCAGACTTTTAATCCAAAGCAAGCATCGAGAGCTT
CTCCGATTGTCAGATAGACTTTTCCACCGATTTTGTTGATGAACTTTGCTTGATTCAGCT
TGTGGAGCACTGTCCATTTAGGGTTAACGATCACCAGCTCAACACCATTTTGGATTAGGT
TGTTTTGGAGCTCCACCAAGGCAGTAATTCCGGATGTATCCACGTTTATTAAATTTGACA
TATCAAGGACGACAAAGAGGATGTTTTTCTTAGCGTTGGTCTTTGTGTTTCCATCATC

QA 1 478 1 478
DS 



AS 1 2

CO CL4796Contig1 1092 2 2 U
GGGACCGATCTCATTCAAAGAACACGCTCCTTCATCTTCCTCGGCTGAATCTCTTCTTGT
CTCGGTTTTACAGTTGGATTCGCATATCAGATTGAATTTTTACTCGATAACTAGCAGCAA
TTATGGATGACTGGGAGGATGAGCAGCTTGCACCACTTCCAGCTAAAGTCGAGCTTAAAA
GTAATTGGGATGACGAGGATGTAGATGAGAATGATATTAAGGACTCTTGGGAGGATGATG
ATGATGATGACGACGAACCTGCTCCGGTAAAGCCTGCTACTGAGAAGGCTCCTCCTAAGA
AAGCAGCAGCAGCCAAAGCTGTTGAAAAGAAGGGCAAAGCAGCCGATGTTCCCAAAGAAG
CACCAAAGGAAGAAGAACCTTTGGATCCTATCTCTGAGAAACTTCGCTTGCAGAGGCTTG
TTGAAGAAGCTGACTACAAGGCAACTGCTGAACTCTTTGGAACGAAGGGTGACGAGACAA
AACTTGATGTGTTCATCCCCAGGGCTGTTGAGGTTAGTGAGGAAAGTGCGTGGTGAGGCT
TTGAGGTTTCGTGGGGCTGAGTATGAGTTCGTGTCGCGTTTGGCTTTGCTGATTAAGAGA
GTGGATGGACTTGGAGATGATACGAAGATTGCTGCGAAGATGATTCATGATGTTCTTGAT
AAGTATTAGTATTACATGGGAGGTACAGGGTTGGATTCTTCGGGTTTCATCCAGAGCCTA
ATCGGTACTCATCACTCTGCTTAAACCAATTCTTGGATTTAGGGTTAATGCACTTTTCTG
TAATTGGTTTTAGTGAGAAGTCTATAATGTGGGATACGTTTTGAGTCTGTCCATTAATGA
AATTGAAGCTGGAAAAGTATGCAAGCGTGTGCGTCAAGGTCTCTTGTTTCCAGAAGATGG
AAATTTAGAACTTCATGAAATGAATTTGATATATTTTCAAAAGCTTCGCTTTGTTTTATG
GTTTTTTTTTAATCTTGTCTTAACCTCAACGGGTTCTGTTCTGTATGATGAATTGAAGAA
GATATTGTAGTTCACCAAGTACATGAAAGGTGAAGAACAAACCAAATGATTGAATCAATG
ATTTTTGGTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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BS 644 1092 RS1BV83JQ

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GTGGATGGACTTGGAGATGATACGAAGATTGCTGCGAAGATGA

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DS 

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AGGAAAGTGCGTGGTGAGGCTTTGAGGTTTCGTGGGGCTGAGTATGAGTTCGTGTCGCGT
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ATGATTCATGATGTTCTTGATAAGTATTAGTATTACATGGGAGGTACAGGGTTGGATTCT
TCGGGTTTCATCCAGAGCCTAATCGGTACTCATCACTCTGCTTAAACCAATTCTTGGATT
TAGGGTTAATGCACTTTTCTGTAATTGGTTTTAGTGAGAAGTCTATAATGTGGGATACGT
TTTGAGTCTGTCCATTAATGAAATTGAAGCTGGAAAAGTATGCAAGCGTGTGCGTCAAGG
TCTCTTGTTTCCAGAAGATGGAAATTTAGAACTTCATGAAATGAATTTGATATATTTTCA
AAAGCTTCGCTTTGTTTTATGGTTTTTTTTTAATCTTGTCTTAACCTCAACGGGTTCTGT
TCTGTATGATGAATTGAAGAAGATATTGTAGTTCACCAAGTACATGAAAGGTGAAGAACA
AACCAAATGATTGAATCAATGATTTTTGGTGGC

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 2

CO CL4797Contig1 1393 2 4 U
GAGCGGCAGAGTCTCTGACGCCGTGATAGAGTCACCTGACAGGCACACGCTTCTCCCGTT
GCCGGAACCGGTTATCATTCCCGGTTCGAGATTCAGAGAGGTCTATTACTGGGATTCTTA
CTGGGTCATCAAAGGACTTTTGACGAGTAAAATGTTCACTACGGCACAAGGTTTAGTGAC
GAACCTGATGTCACTCGTGGAGACTTATGGTTACGTTCTGAACGGCGCTAGAGCTTATTA
CACTAACCGAAGCCAACCACCTCTACTGAGCTCAATGGTTTATGAGATTTATAAAGTCAC
CAAAGATGAGGAACTTGTGATGAAAGCTATCCCTGTGCTTCTCAAAGAATACGAGTTCTG
GAACTCAGGAAAACATAAGGTGGTTATTCGAGACACTAGTGGCAATGATCACATTTTAAG
CCGTTACTACGCCATGTGGAACATGCCCAGACCTGAATCCTCTGTTTTCGATCAAGAATC
AGCTTCGGGGTTTTCCAGTACGTTGGAGAAACAAAGGTTCCATCGAGATATAGCTACGGC
TGCTGAATCAGGATGCGACTTCAGCACGCGATGGATGAGACATCCTCCTAATTTCACAAC
GATGGCTACAACATCAGTTGTTCCTGTTGATCTAAATGTCTTTCTTCTCAAGATGGAACT
CGATATAGCGTTTATGATGGAGATTGCTGGCGACAAAAACGGTTCAGAGCGTTTTGTGAA
AGCGTCAGAAGCAAGAAAGAAAGCGTTTGAGATCGTGTTTTGGAACGAAAAAGCAGGGCA
GTGGCTAGATTACTGGCTTTCCTCTAATGGTGACGAGCCTGAGACATGGAAAGCTGAGAA
CCAAAACAACAACGTGTTTGCATCTAACTTCGCCCCTATTTGGATTAGTTCCGTCCATTC
TGATGAAAATTTTGTCAAGAAAGTTGTGAAGGCTCTTGAAAACTCAGGACTCATCGCTCC
CGCTGGAATCCTAACCTCTTTGACAAACTCGGGACAACAATGGGACGCTCCTAATGGATG
GGCACCGCAACAAGAGATGATTGTCACAGGACTCGCGAGATCTGATCTAAAGGAAGCTAA
AGTGATGGCAGAGGAGATTGCAAGGAGGTGGATAAGAAGCAGCTATCGTGCATACAAGAC
AAGTGGGACTATTCATGAGAAGCTCGATGTTTCAGAGATTGGTGAATATGGTGGTGGAGG
AGAATATAAGCCACAGACGGGATTTGGATGGTCAAATGGAGTTATATTAACATTCTTGGA
GGAGTTTGGATGGCCCTCTGACCTGAGCATTATTGAACCGTAGATTTCCTACTTTTGTAT
TAAACATTAAATAAAGGAGTTACTTCAAAGTTTGTAATTTTATCAAAAACTTTATAATAG
TGGAAATTTAATC


BQ
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CACTAACCGAAGCCAACCACCTCTACTGAGCTCAATGGTTTATGAGATTTATAAAGTCAC
CAAAGATGAGGAACTTGTGATGAAAGCTATCCCTGTGCTTCTCAAAGAATACGAGTTCTG
GAACTCAGGAAAACATAAGGTGGTTATTCGAGACACTAGTGGCAATGATCACATTTTAAG
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GATGGCTACAACATCAGTTGTTCCTGTTGATCTAAATGTCTTTCTTCTCAAGATGGAACT
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AGCGTCAGAAGCAAGAA

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AACTCGATATAGCGTTTATGATGGAGATTGCTGGCGACAAAAACGGTTCAGAGCGTTTTG
TGAAAGCGTCAGAAGCAAGAAAGAAAGCGTTTGAGATCGTGTTTTGGAACGAAAAAGCAG
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AGAACCAAAACAACAACGTGTTTGCATCTAACTTCGCCCCTATTTGGATTAGTTCCGTCC
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CTCCCGCTGGAATCCTAACCTCTTTGACAAACTCGGGACAACAATGGGACGCTCCTAATG
GATGGGCACCGCAACAAGAGATGATTGTCACAGGACTCGCGAGATCTGATCTAAAGGAAG
CTAAAGTGATGGCAGAGGAGATTGCAAGGAGGTGGATAAGAAGCAGCTATCGTGCATACA
AGACAAGTGGGACTATTCATGAGAAGCTCGATGTTTCAGAGATTGGTGAATATGGTGGTG
GAGGAGAATATAAGCCACAGACGGGATTTGGATGGTCAAATGGAGTTATATTAACATTCT
TGGAGGAGTTTGGATGGCCCTCTGACCTGAGCATTATTGAACCGTAGATTTCCTACTTTT
GTATTAAACATTAAATAAAGGAGTTACTTCAAAGTTTGTAATTTTATCAAAAACTTTATA
ATAGTGGAAATTTAATC

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DS 



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BQ
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AF RS1G637JQ U 50
AF RS1G637TF C 1
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BS 527 624 RS1G637TF

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QA 1 477 1 477
DS 

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CTTCCAATAATACAAGACGAGACGACGATCACAGGAGGAACAAGAGTACTTGCGTTTGAC
CTTGAAACAGAGTGGTAAGAAACAGAACAACCACTTCGTCTCAGTATCTACCGCCGCCAC
TTTTCCGCCGCAGTATGGACACACACCCGGTGCTTGTTGTCGACCAAGCTCTGTCTTCTC
CTCGTGATACACAAACTCAAAACACATTTTTGGGTATTTGTTTTTCTTACTCGGAGATCC
CTTTTTGTGTCGATATATTTCTTCTGGACTTGTCTCTGCGTCTGGAAGTGTGAAGAACAA
GAAATGAGAAAATATTACCACAAAAGGGAAAAATATTATAAAGTGTGATGATGTTTTCTT
TTGTTCACAAGGACTTTGCTGTCC

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

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GAAAAGTTGAGGCCAGTACCATGTTCTTCTCAGTTCTTCATTGAACTTTCATGTCTCTTT
TTATTTAGTGTTAGATGGATTTCTAAGTAATCAGTAGTGCGTGCCTTATTACAATCTAAA
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GACGATCAAATCGGACTGAACGGAAAGACTTTAGCCGACGGAGAAACAAAGATTAGTTTA
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CCTTTATTATTCACTTCAAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DK87TF U 1
AF RS1DK87JQ C 516
BS 1 626 RS1DK87TF
BS 627 627 RS1DK87JQ
BS 628 667 RS1DK87TF
BS 668 1220 RS1DK87JQ

RD RS1DK87TF 668 0 0
GGGTCGTGAAGATAAACTGAAACGAATCGTCGTCTTCAACACCTTCATTAACCATTGATT
TACACTTCTCACACGATCTATTACTGATTGCATACTTCCATCATCAGAATCTTCGACTAT
AAAAAGATTATTATTCAGAGCTTTTGTTTGTGAGAGATGATAGTGGGAGACTGGGAATGG
ATTTTTTTTTATTAGATTCAGAATAATTGTGTTAGGTACTTCACCCTCCTATAATCCTCG
ATGGCAGACTCAGAATAATCTTGAGAGCAAGTATTCATGGTTCGGTGATAACTACCGCTC
CGTCGATGAGGTTGCTTCTGCTCTTTCACATGCTGGTTTGGAGTTCATCGAGTGGGCTGA
AAGTAACAGTGTTCGTTTTCTGGGGATTTTCTACGGGTTGCAGCTGGTTGTGCAGAAGCT
CGGGGGTGTTGTGGTGGAAGGGGAGCGTAAGGAGTATGGGAAGATGTAGATTGAGGTGAA
GGGTGATGAGAGTGAGATTTTTAGTGAGGGGAGGGTTGGTGAGAAGCAGGTTGTTTGGAT
GAGTCATGGGGATGAGGCTGTTGAGCTTCCTGATGGGTTTGAGGTTGTGGCGAGGAGTTC
TCACGGAGATGTTTTTGCTTTGGAGA*CAGGGAGAGGAGGATTTATGGTTTGCAGTATCA
TCCTGAG
T

QA 1 667 1 667
DS 

RD RS1DK87JQ 705 0 0
GTT
GTGAGAAGCAGGTTGTTTGGATGAGTCATGGGGATGAGGCTGTTGAGCTTC*TGATGGGT
TTGAGGTTGTGGCGAGGAGTTCTCAGGGAGATGTTTTTGCTTTGGAGAACAGGGAGAGGA
GGATTTATGGTTTGCAGTATCATCCTGAGGTTGCTTCTGCTCTTTCAATTTCAGTGATAC
ACTCTGTAATAGGTTTGAAGAAGTTCTCATGTGTTAAAAGAGATATTGCAGATCCGACAA
AAAGGGCATGACGTATGTGGAAGAAAAGTTGAGGCCAGTACCATGTTCTTCTCAGTTCTT
CATTGAACTTTCATGTCTCTTTTTATTTAGTGTTAGATGGATTTCTAAGTAATCAGTAGT
GCGTGCCTTATTACAATCTAAATTTGATGTGCTGTGTCAAATGTCTAGCTTACAATGTTT
ATTTTATAATCTTGGCAGGTTTGACGATCAAATCGGACTGAACGGAAAGACTTTAGCCGA
CGGAGAAACAAAGATTAGTTTACAATTGTAATAGCTCCCACGTGCATCACGTGGTCTGTA
GAAGTTAAAATTTCTGGCTTAGGATATTAACAGGATTTTATCCCTGGACGAAATTCATGT
AGGGTGTCATCGCAAAATGGTTACGAAACTGCACGAGCCCATTTTTCAGTTTTTCTCCTT
ATTTTTACAATGTTTAATATTTCCTTTATTATTCACTTCAAA

QA 4 705 4 705
DS 



AS 1 2

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CCGGACTCCGGTTCTTTACGGTTTACGGTCCTTGGGGAAGACCGGATATGGCTTACTTCT
TCTTCACCAAAGCCATACTCCACGGGAAGTCGATAGATATTTACCGAACGCAAGACAATC
AAGAAGTGGCGCGTGACTTCACCTACATAGACGATATAGTTAAAGGATGTGTCGGTGCGT
TGGACACGGCGGAGAAAAGCACGGGAAGCGGCGGGAAGAAGCGAGGGCCGGCTCAGTTAC
GTGTTTACAATCTCGGGAACACTTCTCCGGTTCCTGTCGGGAGATTGGTGTCGATCTTGG
AAGGGTTGTTAGGGAGTAAAGCGAGGAAGCATCTGATCAAAATGCCTAGGAACGGTGACG
TGCCTTACACGCATGCGAATGTGAGCTTGGCGTATAAAGACTTTGGGTATAAACCAACAA
CGGATCTCGCGGCGGGGTTGAGGAAGTTTGTTAAGTGGTACGTTAGTTATTACGGGATAC
AGCCGAGGGTGAAAAGGGAAAACTCTCACGCCGATGATTCCGCTTAAATAATGCCACCCT
GCTTTTCATCAACATCACATGCTTGTTTTTATTTCTTTACAACCCAAAAAAGATAATTAT
TTACAGGGACATATTTCAGTATTTTTCTGTTTTTAGTTTTAAAAATGCCAAAAGATCATT
AATGGTGGTCCTTTTTTAAGGGGGATCGAAGTGGGAATTAAATTGTTACAGCTGTATGTT
ATAATAGAAAGATATTTGTGAGTGTAATTGGAAATATATGTGGGTTTGTTATGTAATAAA
TGATGGGATAATGATCTTGCTGGAATGTGCTTATAATCG


BQ
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AF RS1G759TF U 1
AF RS1G759JQ C 315
BS 1 498 RS1G759TF
BS 499 879 RS1G759JQ

RD RS1G759TF 498 0 0
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CCGGACTCCGGTTCTTTACGGTTTACGGTCCTTGGGGAAGACCGGATATGGCTTACTTCT
TCTTCACCAAAGCCATACTCCACGGGAAGTCGATAGATATTTACCGAACGCAAGACAATC
AAGAAGTGGCGCGTGACTTCACCTACATAGACGATATAGTTAAAGGATGTGTCGGTGCGT
TGGACACGGCGGAGAAAAGCACGGGAAGCGGCGGGAAGAAGCGAGGGCCGGCTCAGTTAC
GTGTTTACAATCTCGGGAACACTTCTCCGGTTCCTGTCGGGAGATTGGTGTCGATCTTGG
AAGGGTTGTTAGGGAGTAAAGCGAGGAAGCATCTGATCAAAATGCCTAGGAACGGTGACG
TGCCTTACACGCATGCGAATGTGAGCTTGGCGTATAAAGACTTTGGGTATAAACCAACAA
CGGATCTCGCGGCGGGGT

QA 1 498 1 498
DS 

RD RS1G759JQ 565 0 0
GGGAACACTTCTCCGGTTCCTGTCGGGAGATTGGTGTCGATCTTGGAAGGGTTGTTAGGG
AGTAAAGCGAGGAAGCATCTGATCAAAATGCCTAGGAACGGTGACGTGCCTTACACGCAT
GCGAATGTGAGCTTGGCGTATAAAGACTTTGGGTATAAACCAACAACGGATCTCGCGGCG
GGGTTGAGGAAGTTTGTTAAGTGGTACGTTAGTTATTACGGGATACAGCCGAGGGTGAAA
AGGGAAAACTCTCACGCCGATGATTCCGCTTAAATAATGCCACCCTGCTTTTCATCAACA
TCACATGCTTGTTTTTATTTCTTTACAACCCAAAAAAGATAATTATTTACAGGGACATAT
TTCAGTATTTTTCTGTTTTTAGTTTTAAAAATGCCAAAAGATCATTAATGGTGGTCCTTT
TTTAAGGGGGATCGAAGTGGGAATTAAATTGTTACAGCTGTATGTTATAATAGAAAGATA
TTTGTGAGTGTAATTGGAAATATATGTGGGTTTGTTATGTAATAAATGATGGGATAATGA
TCTTGCTGGAATGTGCTTATAATCG

QA 1 565 1 565
DS 



AS 1 2

CO CL4801Contig1 720 2 3 U
ACCAAACTGGTAGACAATTTTAATAGGGGGACGACGAAACACAGAACACATAAAAAGACA
CATAAACTTAAAGAGAGTCGCTGCGACCCGACCATAGTAAAACCCGACAAGAGCTTCTCT
CTCACTCAGCACTTGACTTCCTTCAAACCATGTGCAAAGTACAAAAATGTTGGGTTAGTT
GCACCCTCCTTGTAGTAAGCAAAGACAATAGTGCTGTCATCGTGCATGCCCTCCCCAACA
AAAAATTGGAAGTCCTTGAGCTTGGGGAGCAAAAACTTGGTAGCTCCCTCAATACCCTTC
TTGAACTCTTCTTGCTGCTCCGGGGTGAGCTTGGGAGTCAAAAGCTTGATGTACTTCTTG
ATATAGGCAATGAAGCCCTTCTTGTCGTAAGTAGGCTGCTCCTGAAGTCTAAAGGTGTCG
ACAATGTCAACAACCTTTTCAACAGAGTCGTCAACACCCTCGTCCTCACCACCTTCTTCA
GCAGATGGGTTGGCACCGATGTTAACCTCTACGCATCCCTTGGTAGTCCACTTTCCTTCA
ACTTCCCAGAGAATACCATTCTCAATCTCCTTGTATGGGAAAGAGTCAGAGAGAAGCTCA
TCACCGGTGAGAAGATCGGTGTACACCAACATGGTCGCTTTATTTGTTTTTTGTTTTTTT
TTAAATCGCTCACGAATCTATCTAGAGATTGCGGGAGAGAGACGCAGCGACGTGAGGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1C994JQ U 207
AF RS1C994TF C 1
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BS 212 399 RS1C994JQ
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AAAAA
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AAAACTTGGTAGCTCCCTCAATACCCTTCTTGAACTCTTCTTGCTGCTCCGGGGTGAGCT
TGGGAGTCAAAAGCTTGATGTACTTCTTGATATAGGCAATGAAGCCCTTCTTGTCGTAAG
TAGGCTGC

QA 6 193 6 193
DS 

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CATAAACTTAAAGAGAGTCGCTGCGACCCGACCATAGTAAAACCCGACAAGAGCTTCTCT
CTCACTCAGCACTTGACTTCCTTCAAACCATGTGCAAAGTACAAAAATGTTGGGTTAGTT
GCACCCTCCTTGTAGTAAGCAAAGACAATAGTGCTGTCATCGTGCATGCCCTCCCCAACA
AAGAATTGGAAGTCCTTGAGCTTGGGGAGCAAAAACTTGGTAGCTCCCTCAATACCCTTC
TTGAACTCTTCTTGCTGCTCCGGGGTGAGCTTGGGAGTCAAAAGCTTGATGTACTTCTTG
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ACAATGTCAACAACCTTTTCAACAGAGTCGTCAACACCCTCGTCCTCACCACCTTCTTCA
GCAGATGGGTTGGCACCGATGTTAACCTCTACGCATCCCTTGGTAGTCCACTTTCCTTCA
ACTTCCCAGAGAATACCATTCTCAATCTCCTTGTATGGGAAAGAGTCAGAGAGAAGCTCA
TCACCGGTGAGAAGATCGGTGTACACCAACATGGTCGCTTTATTTGTTTTTTGTTTTTTT
TTAAATCGCTCACGAATCTATCTAGAGATTGCGGGAGAGAGACGCAGCGACGTGAGGGCC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

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CGTCCGCGACTACGACGCCGTTTCGAAGGCGATCGAAGAATCCGGTCCGATCGATGTGTT
GGTGGTGAACCAAGGCGTGTTTACGGCGAGGGAGCTCGAGAAGCGTAGCGTGGAGGATGT
CAAGTTCACGATCGATGTTAATCTGGTCGGGAGCTTTAATGTGATTAAAGCTGCTTTGCC
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AGCCGGTCAGGTAGCTATTAATTAGTGTATCCCGGTTTAAGTTGGTTAATTTAGATTGTA
CCAATGGTTGGTTAGTTTCCTTTAGCTAAACCGTTGGACATGTTGATTGCTTTGTTGTGT
AGGTGGGTGTCTACGGCTATGCTGCGTATTCGGCGAACAAGTTTGGGCTACAAGGTTTAG
CACAATCGCTGCAGCAAGAAGTTATTGCTGATGACATTCATGTCACTCTTGTTTTCCCTC
CTGACACTGATACACCAGGGTTTGAGGAAGGTAAAGACTAAAGACTATACTCTGAAGCTT
TTGTTTAGTTATTCATTGTGGATGCATAGAGTATAATAGCACATGACAGTAGGTAGGAAT
AGGATTAGGCAGCTAATGAGTTTGCTTATACTAAAGCAGATAAGGCAGTTAAATGCATAG
AAAAAAAGTTGGAGACAGAGTACATAACGCTGTTCTATATGGTTGTTATAATGAGATCAA
AGCTGCACCGTTATGTTTCTGGCCTGAATATTTGCATCTAATTTGCTTCTTTGCTACGAA
ATTACCTGCTAGGAGAAACGCTAAATACTTAGTATATTGACTACGAAAGTGTTTAGAGTT
GTGTTCTTTAAGTAGTTTCAAATTGGTTGCACTAGTTGTAAAAATGTTTTTGTTTGAATA
AATTTTACATTCATCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BJ17TF U 1
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CCAATGGTTGGTTAGTTTCCTTTAGCTAAACCGTTGGACATGTTGATTGCTTTGTTGTGT
AGGTGGGTGTCTACGGCTATGCTGCGTATTCGGCGAACAAGTTTGGGCTACAAGGTTTAG
CACAATCGCTGCAGCAAGAAGTTATTGCTGATGACATTCATGTCACTCTTGTTTTCCCTC
CTGACACTGATACACCAGGGTTTGAGGAAGGTAAAGACTAAAGACTATACTCTGAAGCTT
TTGTTTAGTTATTCATTGTGGATGCATAGAGTATAATAGCACATGACAGTAGGTAGGAAT
AGGATTAGGCAGCTAATGAGTTTGCTTATACTAAAGCAGATAAG*CAGTTAAATGCATAG
AAAA

QA 1 724 1 724
DS 

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ACACTGATACACCAGGGTTTGAGGAAGGTAAAGACTAAAGACTATACTCTGAAGCTTTTG
TTTAGTTATTCATTGTGGATGCATAGAGTATAATAGCACATGACAGTAGGTAGGAATAGG
ATTAGGCAGCTAATGAGTTTGCTTATACTAAAGCAGATAAGGCAGTTAAATGCATAGAAA
AAAAGTTGGAGACAGAGTACATAACGCTGTTCTATATGGTTGTTATAATGAGATCAAAGC
TGCACCGTTATGTTTCTGGCCTGAATATTTGCATCTAATTTGCTTCTTTGCTACGAAATT
ACCTGCTAGGAGAAACGCTAAATACTTAGTATATTGACTACGAAAGTGTTTAGAGTTGTG
TTCTTTAAGTAGTTTCAAATTGGTTGCACTAGTTGTAAAAATGTTTTTGTTTGAATAAAT
TTTACATTCATCC

QA 1 733 1 733
DS 



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AGATCATTGATGCTTTGCTCCAGCTCATTGATTCTGCCTCCCATGTCATCGATCTTTGTG
ATGATGGAGTCGGACATTGTCTGAAACCTGCTTTGCATCTGCTGCAGGAGATTTTGGACA
AAAGCAGTCATATCAGCAGTGCTCTGCTTAGTATCCTCAGAATCATGCCCATCCATTTTT
AGGGTTGCTCGGATGACGGAGAATTATGGAGAAGCGATGAGACGACGGAGATGTGAGAGC
GATGTACCGAGAAAATCC


BQ
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AF RS1DB93TF C 1
AF RS1DB93JQ U 19
BS 1 18 RS1DB93TF
BS 19 498 RS1DB93JQ

RD RS1DB93TF 498 0 0
GGTACCACCACGTCATGAATCTATTGAATGAACTCAACAAGATATTCATGTCTTTCGAAA
CAGAAAATTTTAAAAAGTCATAGTACTGCGCTTAATAAATTTCAGTGTTTGCGAGACAAG
CAGAAAAGATAATGGACCATAGTTTTTTTTTCAAGTGGGAATTAACTAGCCGGTGTTTTG
GGTTCATCGCCTGATTTGGAGGCAGGAGGTGGAGTGCCTTCAACTCCCATCTCGGCTCTT
AGATCATTGATGCTTTGCTCCAGCTCATTGATTCTGCCTCCCATGTCATCGATCTTTGTG
ATGATGGAGTCGGACATTGTCTGAAACCTGCTTTGCATCTGCTGCAGGAGATTTTGGACA
AAAGCAGTCATATCAGCAGTGCTCTGCTTAGTATCCTCAGAATCATGCCCATCCATTTTT
AGGGTTGCTCGGATGACGGAGAATTATGGAGAAGCGATGAGACGACGGAGATGTGAGAGC
GATGTACCGAGAAAATCC

QA 1 498 1 498
DS 

RD RS1DB93JQ 480 0 0
ATCTATTGAATGAACTCAACAAGATATTCATGTCTTTCGAAACAGAAAATTTTAAAAAGT
CATAGTACTGCGCTTAATAAATTTCAGTGTTTGCGAGACAAGCAGAAAAGATAATGGACC
ATAGTTTTTTTTTCAAGTGGGAATTAACTAGCCGGGGTTTTGGGTTCATCGCCTGATTTG
GAGGCAGGAGGTGGAGTGCCTTCAACTCCCATCTCGGCTCTTAGATCATTGATGCTTTGC
TCCAGCTCATTGATTCTGCCTCCCATGTCATCGATCTTTGTGATGATGGAGTCGGACATT
GTCTGAAACCTGCTTTGCATCTGCTGCAGGAGATTTTGGACAAAAGCAGTCATATCAGCA
GTGCTCTGCTTAGTATCCTCAGAATCATGCCCATCCATTTTTAGGGTTGCTCGGATGACG
GAGAATTATGGAGAAGCGATGAGACGACGGAGATGTGAGAGCGATGTACCGAGAAAATCC

QA 1 480 1 480
DS 



AS 1 2

CO CL4804Contig1 480 2 1 U
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AGGCGATTAGATTCAAGGTCCCTGGGCTAATGAAGATAAGGTACATAGGGCAAACGACCA
TGGGGAGCGCAGCAATTTTTGGGCTTTTCCTAGGTGCCGGCAGTTTGATACACTGTGGAA
AATAAGCTTTTAAGTTTGTGCCCTGTTGAAAGATTTGTTTCTTTTCTGAAAGACATTGAT
CTTTTTTTTTTAATTCAATAAGTTTTTTTTGTGGTGAATCATCATCTCTTGGGTTTTGAT
GTTTTGTTTCTTTTACATGATGTAACAATCTCGTTAATGAAAAGATCATGTTTACAAGCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GW49JQ C 1
AF RS1GW49TF U 1
BS 1 480 RS1GW49TF

RD RS1GW49JQ 480 0 0
GGATGATGCGAAAGGCAAAATCGATTGTCCAAAAAAAAAAGGAAAAAAACATAAAAGCGG
AGGCGAGGGAAGCAACCACCGCAAAGATGGCGAAAGATAGTTGTTTAACCATAATCGTTG
CCGGAGCTGCCATCGGCGGCGCAGTTGGCGGCGCTGTAGGTGCTGTCTATGGAACTTACG
AGGCGATTAGATTCAAGGTCCCTGGGCTAATGAAGATAAGGTACATAGGGCAAACGACCA
TGGGGAGCGCAGCAATTTTTGGGCTTTTCCTAGGTGCCGGCAGTTTGATACACTGTGGAA
AATAAGCTTTTAAGTTTGTGCCCTGTTGAAAGATTTGTTTCTTTTTTGAAAGACATTGAT
CTTTTTTTTTTAATTCAATAAGTTTTTTTTGTGGTGAATCATCATCTCTTGGGTTTTGAT
GTTTTGTTTCTTTTACATGATGTAACAATCTCGTTAATGAAAAGATCATGTTTACAAGCT

QA 1 480 1 480
DS 

RD RS1GW49TF 480 0 0
GGATGATGCGAAAGGCAAAATCGATTGTCCAAAAAAAAAAGGAAAAAAACATAAAAGCGG
AGGCGAGGGAAGCAACCACCGCAAAGATGGCGAAAGATAGTTGTTTAACCATAATCGTTG
CCGGAGCTGCCATCGGCGGCGCAGTTGGCGGCGCTGTAGGTGCTGTCTATGGAACTTACG
AGGCGATTAGATTCAAGGTCCCTGGGCTAATGAAGATAAGGTACATAGGGCAAACGACCA
TGGGGAGCGCAGCAATTTTTGGGCTTTTCCTAGGTGCCGGCAGTTTGATACACTGTGGAA
AATAAGCTTTTAAGTTTGTGCCCTGTTGAAAGATTTGTTTCTTTTCTGAAAGACATTGAT
CTTTTTTTTTTAATTCAATAAGTTTTTTTTGTGGTGAATCATCATCTCTTGGGTTTTGAT
GTTTTGTTTCTTTTACATGATGTAACAATCTCGTTAATGAAAAGATCATGTTTACAAGCT

QA 1 480 1 480
DS 



AS 1 2

CO CL4805Contig1 935 2 2 U
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ACATTCCTCATGGAATATTCCGGCGACCACCGATTCGACGTGATCATCGTCGGAGCAGGA
GTTATGGGAAGCTCCGCAGCGTACCAGCTAGCGAAAAGAGGACACAAGACTCTCCTCCTC
GAGCAATTCGACTTCCTCCACCACCGTGGCTCATCCCACGGCGAGTCACGCACCATACGT
GCCACTTACCCGGAGGATTACTACTACACCATGGTGTCCGAGTCAGCTCAGCTATGGGCC
CAGGCCCAGTCCGAGATCGGATACAAAGTCCATTTCCCAACTCATCACTTCGACATGGGC
CCTAAGGACCGGCAGAGCCTCCTCTCTGTTGTCGCCACGTGTCGTAAACACGGCTTGGCT
CACAGGGTCATGGACTCCAAGACCGTGTCTGAATATTTCTCCGGCAGGATCAATATCCCG
GAGAACTGGATCGGAGTCTCGACAGACCTTGGAGGAGTTATCAAACCGACCAAAGCCGTG
TCTATGTTCCAGACGCTAGCGCTAAAGAACGGCGACTCAGCTTTGTATGTATTCAATGAC
GCCAGATGAGGACTTTGTGATTGACTTTCTTGGTGGGGAGTTTGGGAAAGATGTGGTGGT
CGGCGGCGGGTTTTCCGGTCATGGGTTTAAGATGGCGCCTGCTGTTGGGAGGATATTAGC
GGAGCTGGCGACGGAGGGAGAGGCTGGAGGAGGAGTTGAGATGAAGCAGTTTAGTCTGAG
GAGGTTTGAGGAGAATCCTAAAGGGAATGCTAAAGAGTATCCTGACCAGGTGATACTTGG
TAGTAACCTTTGAATAAAATTAGTATTACATTTGGTTGTATAAGTGTCAACTGTTGAATA
ATTTTTTTTAAAAAAAATTGTTGAAGAAGAACAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AE01TF U 1
AF RS1AE01JQ C 171
BS 1 658 RS1AE01TF
BS 659 935 RS1AE01JQ

RD RS1AE01TF 658 0 0
GGATCCGACCTTCAATCAACCCTCTCTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTGTTTCTCTCACTA
ACATTCCTCATGGAATATTCCGGCGACCACCGATTCGACGTGATCATCGTCGGAGCAGGA
GTTATGGGAAGCTCCGCAGCGTACCAGCTAGCGAAAAGAGGACACAAGACTCTCCTCCTC
GAGCAATTCGACTTCCTCCACCACCGTGGCTCATCCCACGGCGAGTCACGCACCATACGT
GCCACTTACCCGGAGGATTACTACTACACCATGGTGTCCGAGTCAGCTCAGCTATGGGCC
CAGGCCCAGTCCGAGATCGGATACAAAGTCCATTTCCCAACTCATCACTTCGACATGGGC
CCTAAGGACCGGCAGAGCCTCCTCTCTGTTGTCGCCACGTGTCGTAAACACGGCTTGGCT
CACAGGGTCATGGACTCCAAGACCGTGTCTGAATATTTCTCCGGCAGGATCAATATCCCG
GAGAACTGGATCGGAGTCTCGACAGACCTTGGAGGAGTTATCAAACCGACCAAAGCCGTG
TCTATGTTCCAGACGCTAGCGCTAAAGAACGGCGACTCAGCTTTGTATGTATTCAATGAC
GCCAGATGAGGACTTTGTGATTGACTTTCTTGGTGGGGAGTTTGGGAAAGATGTGGTG

QA 1 658 1 658
DS 

RD RS1AE01JQ 765 0 0
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CACCATACGTGCCACTTACCCGGAGGATTACTACTACACCATGGTGTCCGAGTCAGCTCA
GCTATGGGCCCAGGCCCAGTCCGAGATCGGATACAAAGTCCATTTCCCAACTCATCACTT
CGACATGGGCCCTAAGGACCGGCAGAGCCTCCTCTCTGTTGTCGCCACGTGTCGTAAACA
CGGCTTGGCTCACAGGGTCATGGACTCCAAGACCGTGTTTGAATATTTTTCCGGCAGGAT
CAATATCCCGGAGAACTGGATCGGAGTCTCGACAGACCTTGGAGGAGTTATCAAACCGAC
CAAAGCCGTGTTTATGTTCCAGACGCTAGCGCTAAAGAACGGCGACTCAGCTTTGTATGT
ATTCAATGACGCCAGATGAGGACTTTGTGATTGACTTTCTTGGTGGGGAGTTTGGGAAAG
ATGTGGTGGTCGGCGGCGGGTTTTCCGGTCATGGGTTTAAGATGGCGCCTGCTGTTGGGA
GGATATTAGCGGAGCTGGCGACGGAGGGAGAGGCTGGAGGAGGAGTTGAGATGAAGCAGT
TTAGTCTGAGGAGGTTTGAGGAGAATCCTAAAGGGAATGCTAAAGAGTATCCTGACCAGG
TGATACTTGGTAGTAACCTTTGAATAAAATTAGTATTACATTTGGTTGTATAAGTGTCAA
CTGTTGAATAATTTTTTTTAAAAAAAATTGTTGAAGAAGAACAGT

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL4806Contig1 782 2 2 U
GGAAATGGCTAATGGGCTACGAAGCCCAACGCTAAACCCTGACTGTGTTCTTCCTCCTCT
GCGCCGCTTTCTCACTCTTCGTTACTTCCTTGTCGGATCTTCCTCCCCTGGTTTCGTCTT
CGATAAGCAATGGCTGGAAAAGCTGCGGAAGCCGTGGCAAAGACCGTGACGGCGATTCAG
CAACCGTGGAGGGCGAAGCTCGATAAGTACAGAACCGAGCTAACAAAAGGAGTGTGGGGT
TACTGGGAGATGGGAGCATGGAAGCCTTTAGGGATAAGCGCACGCAGGAGGGCGATGCTG
AGGAAAGAAGTGTTGACCGCTGGGGAGGATTGGCCTTACGATCCAGAGAGGAAAGCGATG
AGGACGAAGAGGAAAGGGCACAAGTGCGATAGAATCTCAGCTGAGAAAAGAGAGAACACT
GCGAAGCTTATGCTGAAGATGCCTCAGATGCTGCTTGATTACAAGAAGAGAAGGTGGGAG
AAGAAGATGAAGGAAGAGGAGAAAGCTAAAGAAGACAAGTGATGTTGTGTCTTCCTTTAG
TCTCTTTGGATGCGAAACAAAAAGTCTGATTGACTAGTAATAATCCTGTCTTTGAAACAA
ACATCTGGGATTTTTGATGTTCCATAGATGGTGGAATGCTTTTGCGTTATGTGTGTTTCT
TTGCTGTTTTGTTGTCCTGTTTTGAACTGAAACCAAACGTTGTTGAGGGTTAGGATTGCA
TTTGTTGGATACAAGCTCAGACTAATCTTGACTGTAAAAATTGGTTTATGAACTAATACA
TC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RS1CC30TF U 1
AF RS1H526TF U 348
BS 1 533 RS1CC30TF
BS 534 782 RS1H526TF

RD RS1CC30TF 533 0 0
GGAAATGGCTAATGGGCTACGAAGCCCAACGCTAAACCCTGACTGTGTTCTTCCTCCTCT
GCGCCGCTTTCTCACTCTTCGTTACTTCCTTGTCGGATCTTCCTCCCCTGGTTTCGTCTT
CGATAAGCAATGGCTGGAAAAGCTGCGGAAGCCGTGGCAAAGACCGTGACGGCGATTCAG
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TACTGGGAGATGGGAGCATGGAAGCCTTTAGGGATAAGCGCACGCAGGAGGGCGATGCTG
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AGGACGAAGAGGAAAGGGCACAAGTGCGATAGAATCTCAGCTGAGAAAAGAGAGAACACT
GCGAAGCTTATGCTGAAGATGCCTCAGATGCTGCTTGATTACAAGAAGAGAAGGTGGGAG
AAGAAGATGAAGGAAGAGGAGAAAGCTAAAGAAGACAAGTGATGTTGTGTCTT

QA 1 533 1 533
DS 

RD RS1H526TF 435 0 0
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AAGAGAGAACACTGCGAAGCTTATGCTGAAGATGCCTCAGATGCTGCTTGATTACAAGAA
GAGAAGGTGGGAGAAGAAGATGAAGGAAGAGGAGAAAGCTAAAGAAGACAAGTGATGTTG
TGTCTTCCTTTAGTCTCTTTGGATGCGAAACAAAAAGTCTGATTGACTAGTAATAATCCT
GTCTTTGAAACAAACATCTGGGATTTTTGATGTTCCATAGATGGTGGAATGCTTTTGCGT
TATGTGTGTTTCTTTGCTGTTTTGTTGTCCTGTTTTGAACTGAAACCAAACGTTGTTGAG
GGTTAGGATTGCATTTGTTGGATACAAGCTCAGACTAATCTTGACTGTAAAAATTGGTTT
ATGAACTAATACATC

QA 1 435 1 435
DS 



AS 1 2

CO CL4807Contig1 518 2 4 U
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CCTTCAAGCTAACGGTTCGGAATCGTCAGGCTAAGGTCACGGTGGTTCCATCGGCTGCGG
CGCTTGTGATCAAGGCGTTGAAGGAGCCGGAGAGGGACCGGAAGAAGGTGAAGAACATCA
AGCACAATGGTAACATTTCGTTTGATGATGTAATTGAGATCGCTAAGATCATGAGGCCTA
GATCTATTGCTAAGGAGTTGAGTGGGACTGTGAGGGAGATTCTTGGAACCTGTGTCTCTG
TTGGGTGCACTGTTGATGGGAAGGACCCCAAGGATCTTCAGCAGGAGATCCAAGAGGGCG
AGATTGATATTCCTGAGAAATAAGGAAAACGAGAAAGATAGATGTTGTCTTTTTTATTTT
TCACTTAGAAATGACTCAGTTTTGGATTTGTTGTTGCGTTTTCTTTTCTCTGTTTCAAGA
ACACTAATGAGTTTATCAATCGCAATGTTTTGAATTTC


BQ
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AF RS1ES21TF U 1
AF RS1ES21JQ C 13
BS 1 379 RS1ES21TF
BS 380 380 RS1ES21JQ
BS 381 515 RS1ES21TF
BS 516 518 RS1ES21JQ

RD RS1ES21TF 518 0 0
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CCTTCAAGCTAACGGTTCGGAATCGTCAGGCTAAGGTCACGGTGGTTCCATCGGCTGCGG
CGCTTGTGATCAAGGCGTTGAAGGAGCCGGAGAGGGACCGGAAGAAGGTGAAGAACATCA
AGCACAATGGTAACATTTCGTTTGATGATGTAATTGAGATCGCTAAGATCATGAGGCCTA
GATCTATTGCTAAGGAGTTGAGTGGGACTGTGAGGGAGATTCTTGGAACCTGTGTCTCTG
TTGGGTGCACTGTTGATGGGAAGGACCCCAAGGATCTTCAGCAGGAGATCCAAGAGGGCG
AGATTGATATTCCTGAGAACTAAGGAAAACGAGAAAGATAGATGTTGTCTTTTTTATTTT
TCACTTAGAAATGACTCAGTTTTGGATTTGTTGTTGCGTTTTCTTTTCTCTGTTTCAAGA
ACACTAATGAGTTTATCAATCGCAATGTTTTGAAT
CTC

QA 1 515 1 515
DS 

RD RS1ES21JQ 506 0 0
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CGGTTCGGAATCGTCAGGCTAAGGTCACGGTGGTTCCATCGGCTGCGGCGCTTGTGATCA
AGGCGTTGAAGGAGCCGGAGAGGGACCGGAAGAAGGTGAAGAACATCAAGCACAATGGTA
ACATTTCGTTTGATGATGTAATTGAGATCGCTAAGATCATGAGGCCTAGATTTATTGCTA
AGGAGTTGAGTGGGACTGTGAGGGAGATTCTTGGAACCTGTGTTTTTGTTGGGTGCACTG
TTGATGGGAAGGACCCCAAGGATCTTCAGCAGGAGATCCAAGAGGGCGAGATTGATATTC
CTGAGAAATAAGGAAAACGAGAAAGATAGATGTTGTTTTTTTTATTTTTCACTTAGAAAT
GACTCAGTTTTGGATTTGTTGTTGCGTTTTTTTTTTTCTGTTTCAAGAACACTAATGAGT
TTATCAATCGCAATGTTTTGAATTTC

QA 1 506 1 506
DS 



AS 1 2

CO CL4808Contig1 555 2 3 U
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CTTGGTACTAAATGTTTAATACCAGCAATCAGCAACCTCGTTACTGGCCGGTTCTTCTGG
CACCTGGAGCTTCTCAGGGGGACCAAAAGTCCTCGGCTGCTGTTGGAAATCACCCTTCCC
TGGTTTCCCAATGTCTATATAAATCATCCTCCCATTGTACATCCGACGGTCCATGGTCTC
AATGGCTAAAAAAGCATCGTCCTGAGACATGTATTGAATGAAGGCATAACCTTTTGATCT
CTTCATTGACTCATCTTTGACAAGCTTAACTTCAGCTATCTCGCCGAAAGCTGAAAACTC
CTTTTGCAGAAAGTCTTCACTTGTAGAAAACGGTAAGTTTCTGACCATGATTTTGCTGGC
GAGAGGGTAATTAGACAGCGAAGCTTGAATCTTAGGAAGTCTAGGTTTTGCGTAGCTTGA
TAGAGAAGTTGATGAAGCCACAAAGGAAGGGAAAGCGAGCGTCGCCGACCACATGGTTTC
TCACGGCTGTCGGCC


BQ
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AF RS1FX79JQ U 52
AF RS1FX79TF C 1
BS 1 51 RS1FX79TF
BS 52 253 RS1FX79JQ
BS 254 555 RS1FX79TF

RD RS1FX79JQ 202 0 0
TTTCGTTAACTTGGTACTAAATGTTTAATACCAGCAATCAGCAACCTCGTTACTGGCCGG
TTCTTCTGGCACCTGGAGCTTCTCAGGGGGACCAAAAGTCCTCGGCTGCTGTTGGAAATC
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CATGGTCTCAATGGCTAAAAAA

QA 1 202 1 202
DS 

RD RS1FX79TF 555 0 0
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CTTGGTACTAAATGTTTAATACCAGCAATCAGCAACCTCGTTACTGGCCGGTTCTTCTGG
CACCTGGAGCTTCTCAGGGGGACCAGAAGTCCTCGGCTGCTGTTGGAAATCACGCTTCCC
TGGTTTCGCAATGTCTATATAAATCATCCTCCCATTGTACATCCGACGGTCCATGGTCTC
AATGGCTAGAAAAGCATCGTCCTGAGACATGTATTGAATGAAGGCATAACCTTTTGATCT
CTTCATTGACTCATCTTTGACAAGCTTAACTTCAGCTATCTCGCCGAAAGCTGAAAACTC
CTTTTGCAGAAAGTCTTCACTTGTAGAAAACGGTAAGTTTCTGACCATGATTTTGCTGGC
GAGAGGGTAATTAGACAGCGAAGCTTGAATCTTAGGAAGTCTAGGTTTTGCGTAGCTTGA
TAGAGAAGTTGATGAAGCCACAAAGGAAGGGAAAGCGAGCGTCGCCGACCACATGGTTTC
TCACGGCTGTCGGCC

QA 1 555 1 555
DS 



AS 1 2

CO CL4809Contig1 1037 2 2 U
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CAACAACGTCAACGAGACCGATTCAACTATGTCTCAGAGAAAAAACTTGAATGAGACCTC
GGGGTTTACACAGCTGGCATCTCCGAGGGTTCAGGATCTTTCCGATCATTCAAAAGGGTC
GAAATCGACAAATGATCAACGTGAACAAAGCAAACCATCCCAAGCAAAGGACGGTCGTAG
TAAAACAAACTCAAGTAGGAGTTGCACGAAGGTTCACAAGCAAGGGATTGTACTTGGCCG
GTCAGTGGATCTGTCAAAGTTCCAGAACTACGAGGAGTTAATAGCTGAGTTGGATATGCT
GTTTGAGTTCAATGGAGAGTTGATGGCTCCTAAGAAGGATTGGCTGGTAGTTTACACAGA
TGATGAGGATGATATGATGCTCGTTGGAGACGATCCATGGCAGGAGTTTTGTTGCATGGT
TCGCAAGATCTTCATATACACGAAAGAGGTAGTCATGAAGATGAACCCGGGAACTTTAAG
CTGTAGGAGTGAGGAAGAAGCAGTTGTTGGGGAAGGATCAGATGCAAAGGGCGCCAAGTC
TGCATCGAATCCTTCATTATCCAGCGAACTCTTGAACCAAAAGAACCAACTACAAGCCGA
GGGAGATGTAGAAACCCAAATCAGGAGGAGAGGTTGATGGTGGAGCCTGGAGAAAAAAGA
GAGTTGCAATTTTTGGAGTATTTTGTTACCGTTTAGAATTATTAGCAACACCACCCTATT
AATATCGAGTAATAATAAAGTGAACAAAAGGTGGTTATATGGGTATTAATATAAGTAGAA
TATGAAAGGCTCTTTCATAAGTAGTAGAAATGATGGTTGGAGACTTGGAGTTGTTAGATG
GAGGTTGGTCTCGGTTCTTTTTTATTTAAGTAGCTCTTTAATCTCTTGCAGAGATCTCTT
TAAAGTCTTTTATTGTTTTTATAGTGATCGGCAGTGTACATAAGGTTTTTAAAAAAAAAT
TAAACAGTATTCTATCC


BQ
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AF RS1D614TF U 1
AF RS1D614JQ C 220
BS 1 680 RS1D614TF
BS 681 1037 RS1D614JQ

RD RS1D614TF 680 0 0
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QA 1 680 1 680
DS 

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TATTAGCAACACCACCCTATTAATATCGAGTAATAATAAAGTGAACAAAAGGTGGTTATA
TGGGTATTAATATAAGTAGAATATGAAAGGCTCTTTCATAAGTAGTAGAAATGATGGTTG
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AATCTCTTGCAGAGATCTCTTTAAAGTCTTTTATTGTTTTTATAGTGATCGGCAGTGTAC
ATAAGGTTTTTAAAAAAAAATTAAACAGTATTCTATCC

QA 1 818 1 818
DS 



AS 1 2

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TTAAATGCAAAACCAAGGTTTATCATCCCAATATCGATTTGGAAGGAAACGTCTGCCTCA
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BQ
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AF RS1AA56TF U 1
AF RS1C204TF U 58
BS 1 245 RS1AA56TF
BS 246 720 RS1C204TF

RD RS1AA56TF 245 0 0
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AGAACGAGAATCCGGTGGGAGAGATCAGAGGGAGAATCGTCGGCGATCTTGAGCTCTCTA
AAAAAACAGAAGCAATGATTGGGTTGTTTAAAGTAAAGGAAAAGCAAAGAGAACAAGCTC
AGAATGCTAGCAGAGGCGGAGGAGCTTCTGTCAAGAAGCAATCTGCTGGTGAACTTCGTC
TTCAC

QA 1 245 1 245
DS 

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GG
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AAAAAAACAGAAGCAATGATTGGGTTGTTTAAAGTAAAGGAAAAGCAAAGAGAACAAGCT
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CTTCACAAAGATATATCAGAGTTAAATCTTCCAAGCTCGTGTACGATATCATTTCCTAAT
GGCAAAGATGATTTGATGAACTTTGAAGTCTCCATTAAACCTGATGATGGTTACTACCAC
AATGGTACATTTGTTTTCACGTTCCAAGTGTCTCCTGTGTATCCTCATGAAGTTCCTAAA
GTTAAATGCAAAACCAAGGTTTATCATCCCAATATCGATTTGGAAGGAAACGTCTGCCTC
AACATCTTGCGTGAAGACTGGAAACCTGTTCTTAACATTAACACTGTTATCTATGGACTC
TTCCATCTTTTCACGGAACCCAACTCCGAAGATCCGTTGAACCATGACGCAGCACAAGTT
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GTTGGCCAGACCTTTTTCCCGCGCTGCATCTAACAAAAGCTCTGGTTCGTTCTTCTTAAA
G

QA 3 663 3 663
DS 



AS 1 2

CO CL4811Contig1 792 2 5 U
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AAACTTCCCCCATGTAAACTTATGCGTGACCCCAGCGATGAGAGCATCCGATTTGAAAAC
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GACGTTATTGTTCTCTGCTAAAAAAACATCCACAGATGTTTTCAATGACACTGCCATAAA
TTGATGTACCGTAAACAGCAAGTCTTCTCTCTCCTTGCTCTCTCCTCCATGCACTTCCCA
TTTGTTCTTCAACGTCATTCCCTTTTGGCGCATTGTGAGGATTGTGAAACCAGTTGGATC
AGTCATAACCCTTTTACGGTTTATTCCCCAAGCTTGTCCATCAATTTGTAGGAGGAGGTT
TCCGCTTGGATCAAACACTTGGTAATTATCTTTTGAGAAACTCTGAACTTTCCTCTTAAC
CATCAGATCCATTGGGTATGGATTACAGAATTGCTCGCCCACTACGCTTATTGTAGGATC
TCCCACTTGCCATTCTGTTTTCTTATTCTTTGGCATTGATTCTGTTTTGAATAAACTCAA
AAAGAAGAAGTTTGCAAAAGATTATGAAAGCCTCTTGCTTTAGAGGTCTTGATATCTCCT
CTCCTTATCCCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AN65JQ U 261
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BS 266 478 RS1AN65JQ
BS 479 792 RS1AN65TF

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AAAAAACATCCACAGATGTTTTCAATGACACTGCCATAAATTGATGTACCGTAAACAGCA
AGTCTTCTCTCTCCTTGCTCTCTCCTCCATGCACTTCCCATTTGTTCTTCAACGTCATTC
CCTTTTGGCGCATTGTGAGGATTGTGAAACCAGTTGGA

QA 1 218 1 218
DS 

RD RS1AN65TF 792 0 0
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TAGTAAGATGACATATATCATCAATTCTCATTGTCATCAACCATAACAAGCAAAGCAATG
ATAAAAGCATAATCCACCTCTGGATTCACTCTCACCCTAAAATTACATTTCCCTTTGCAG
AAACTTCCCCCATGTAAACTTATGCGTGACCCCAGCGATGAGAGCATCCGATTTGAAAAC
TTTGAATGAGATATTCGAGTATCCACCTGAAGCATGAAAATCACAAGTCGTACTTTTCTT
GACGTTATTGTTCTCTGCTAAGAAAACATCCACAGATGTTTTCAATGACACTGCCATAGA
TTGATGTACCGTAAACAGCAAGTCTTCTCTCTCCTTGCTCTCTCCTCCATGCACTTCCCA
TTTGTTCTTCAACGTCATTCCCTTTTGGCGCATTGTGAGGATTGTGAAACCAGTTGGATC
AGTCATAACCCTTTTACGGTTTATTCCCCAAGCTTGTCCATCAATTTGTAGGAGGAGGTT
TCCGCTTGGATCAAACACTTGGTAATTATCTTTTGAGAAACTCTGAACTTTCCTCTTAAC
CATCAGATCCATTGGGTATGGATTACAGAATTGCTCGCCCACTACGCTTATTGTAGGATC
TCCCACTTGCCATTCTGTTTTCTTATTCTTTGGCATTGATTCTGTTTTGAATAAACTCAA
AAAGAAGAAGTTTGCAAAAGATTATGAAAGCCTCTTGCTTTAGAGGTCTTGATATCTCCT
CTCCTTATCCCT

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 2

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TCACGTGAGTTCTTAGGTCCTCTAAGAAGAACAGTGTTATGTCCCAAAGGAGCTCTGAAA
GCAAGCTGGTCAAAGGTCAGGCATTCACCACCAGCTTTCTCAATCCGAGCTCTGGCTCTC
TCTGTGAACCTCAAGGCAGTAACTTTGATAGCTGGGATCTCATGTATTCTCAAATCATCG
GTGATGGTTCCAACCAAGACAGCAATCTTATCTTCCTTGCCGGTCATGAACTCCACGAGC
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GCGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1C856JQ U 57
AF RS1C856TF C 1
BS 1 56 RS1C856TF
BS 57 540 RS1C856JQ
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RD RS1C856JQ 484 0 0
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CACTGCATTGAACTTGCTCTGTGTTCTCCTTACCAGAAACCGGTAAAGCTTGACGGTAAG
CTTG

QA 1 484 1 484
DS 

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TTGAATCCACGGCTCTTCCTCTTTCCTCTGGCCTTCTCGAACTTCCTTCCCTTGGACCGA
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TCACGTGAGTTCTTAGGTCCTCTAAGAAGAACAGTGTTATGTCCCAAAGGAGCTCTGAGA
GCAAGCTGGTCAAAGGTCAGGCATTCACCACCAGCTTTCTCAATCCGAGCTCTGGCTCTC
TCTGTGAACCTCAAGGCAGTAACTTTGATAGCTGGGATCTCATGTATTCTCAAATCATCG
GTGATGGTTCCAACCAAGACAGCAATCTTATCTTCCTTGCCGGTCATGAACTCGACGAGC
CTGGATAGAGAAAGGGGAGCTTTGTTGACTTTGCTCATGAAAAGCCTCTTCAGGATCACT
GCATTGAACTTGCTCTGTGTTCTCCTTACCAGAAACCGGTAAAGCTTGACGGTAAGCTTG
AGGTAGACATCGTCAGACTTTGGAGCTGTCCTTTTGGTCTTCTTGCTCTTACCTCCTGCG
ATCAAATCAATTCCCATTGTAGCGTCCGGGGATGTAGTGATGCCGCCGCCGTCGAAGCTT
GCGCCC

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

CO CL4813Contig1 540 2 2 U
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AAATCCACCAAGTACTTTGAGTTATGTTTTGGTCTTCTTCGAGACGAATGAGGTTTAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DF17JQ C 1
AF RS1B169TF U 368
BS 1 367 RS1DF17JQ
BS 368 540 RS1B169TF

RD RS1DF17JQ 503 0 0
CTCTCTGGTGTTCTCGCCGGCTCTCTTGTTTCCGGTGTCCAGATTGCTATTTCTGCGTCT
AACACTGGTGGTGCCTGGGACAACGCCAAGAAATACATCGAGGCTGGTGTATCAGAGCAC
GCAAAGAGTCTTGGACCAAAGGGTTCAGAGCCACACAAGGCAGCTGTGATTGGAGACACT
ATTGGAGACCCGTTGAAGGATACTTCAGGACCTTCGTTGAACATCCTGATCAAGCTCATG
GCTGTTGAGTCTTTCGTCTTTGCTCCCTTCTTTGCCACTCACGGTGGCATCCTTTTCAAG
TACCTCTGAACTCAACCCTGAGTGAAGAAGAAAGATGATGATGAAGATGGTTACAATGCC
TCTTTTTACCATTCTTGTTTTCATTTTGCGTAGGTGGTTTTAAAACATTTAGTTTGGACT
CATTCCAAAGAACCAAACCAAAAGATGTTTCTCTCTCTTTTTGTGCTGTCTAGATTTTAG
AAATCCACCAAGTACTTTGAGTT

QA 1 503 1 503
DS 

RD RS1B169TF 173 0 0
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AAGAACCAAACCAAAAGATGTTTCTCTCTCTTTTTGTGCTGTCTAGATTTTAGAAATCCA
CCAAGTACTTTGAGTTATGTTTTGGTCTTCTTCGAGACGAATGAGGTTTAAGT

QA 1 173 1 173
DS 



AS 1 2

CO CL4814Contig1 1170 2 2 U
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TCCACGTGGAGAGCTGTCTCGGTGACACCACCACCACCAACGTAGACGAAGCTACATCCG
ATGAGAAGGTTAACAATGACGAGATGGAGAAGCTTGTGGTTGTGTATCTCTCTGGGAAAC
CGACGGAGAGTTCGGTTGATGTTTTGCTTAGGTTGTTTAAGAACATAGCGAAAGAGCCTG
AGAACGGTAAGTTTAGGAGGGTTAGGATGAGTATCGGTGATGTTGCGGGAGGCGTTGAGC
TTCTCGAGCTTGTTGGGTTTGAATTGAAAGAGGAAAATGACGAGATTTGGGCGGTTATGT
ATGTTCCTGGAGGAGACCGAACTCAATTGATCAACGAAGTTGTCGGAATGTTGGAAAAAA
GAAAGATCGAAATTAATAGAAACGATGAGGTTCAAGTGGAGCCAGTGGCTCCGAAGAAGA
TCGATAGAGAGATTCGTGTCTTCTTCTCGGTTGCTGAGAACGTAGCGTCGAGAATAGAGG
TGCCTGATTCTTTCTATAGCCTCTCTGCGGATGAGATCAAAAGAGAAGCGGATTTGAGGA
GGAAAAAGATTGCGGAATCGCAGCTTTTGATCCCGAGATCTTACAAGGAGAAACAAGCGA
AAGCAGCTAGAAAGAGATACAAAAGGAGTATGATAAGAGTTCAGTTTCCTGATGGAGTTG
TGCTTCAAGGTGTGTTTGCTCCTTGGGAACCAACCCTTGCTCTCTATGAGTTTGTGAGTT
CTGCTTTGAAAGAGCCAAGTTTGCAGTTCGAGCTTTTGGATCCTGTCTTGGTTAAACGGC
GTGTGATTCCGCATACTCCAGCTCCGGGACAGAAGCCAAGAACCTTGGAGGATGAAGAGC
TTGTTCCCTCAGCGCTAATTAAGTTTAGACCGATTGAGACTGACTCTCTCGTCTACACTG
GTCTATGCAATGAACTCCTGGAGATCAGTGAACCACTCACATGATCATTTCGAGTTCCAC
AGAAGATTTGGCTTCAAACGGTTTTAAGTTTCTCTATTTTATGTTGTGGTTGGTTGATTG
TTCTCTGTTTGTGATTCGAACATATTATAGGGTTTTAAGGAAAAAGAATTGTGTAATCTG
CACAATAATTAGAATCAAAGTTTGAAGATT


BQ
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AF RS1EB06TF U 1
AF RS1EB06JQ C 549
BS 1 607 RS1EB06TF
BS 608 1170 RS1EB06JQ

RD RS1EB06TF 607 0 0
GCAACATGTTCGAGTGTCCGATCTGCGGCAACCCTTTCAAAACAGAGGAGGAAGTCTCCG
TCCACGTGGAGAGCTGTCTCGGTGACACCACCACCACCAACGTAGACGAAGCTACATCCG
ATGAGAAGGTTAACAATGACGAGATGGAGAAGCTTGTGGTTGTGTATCTCTCTGGGAAAC
CGACGGAGAGTTCGGTTGATGTTTTGCTTAGGTTGTTTAAGAACATAGCGAAAGAGCCTG
AGAACGGTAAGTTTAGGAGGGTTAGGATGAGTATCGGTGATGTTGCGGGAGGCGTTGAGC
TTCTCGAGCTTGTTGGGTTTGAATTGAAAGAGGAAAATGACGAGATTTGGGCGGTTATGT
ATGTTCCTGGAGGAGACCGAACTCAATTGATCAACGAAGTTGTCGGAATGTTGGAAAAAA
GAAAGATCGAAATTAATAGAAACGATGAGGTTCAAGTGGAGCCAGTGGCTCCGAAGAAGA
TCGATAGAGAGATTCGTGTCTTCTTCTCGGTTGCTGAGAACGTAGCGTCGAGAATAGAGG
TGCCTGATTCTTTCTATAGCCTCTCTGCGGATGAGATCAAAAGAGAAGCGGATTTGAGGA
GGAAAAA

QA 1 607 1 607
DS 

RD RS1EB06JQ 622 0 0
TCTTTCTATAGCCTCTCTGCGGATGAGATCAAAAGAGAAGCGGATTTGAGGAGGAAAAAG
ATTGCGGAATCGCAGCTTTTGATCCCGAGATCTTACAAGGAGAAACAAGCGAAAGCAGCT
AGAAAGAGATACAAAAGGAGTATGATAAGAGTTCAGTTTCCTGATGGAGTTGTGCTTCAA
GGTGTGTTTGCTCCTTGGGAACCAACCCTTGCTCTCTATGAGTTTGTGAGTTCTGCTTTG
AAAGAGCCAAGTTTGCAGTTCGAGCTTTTGGATCCTGTCTTGGTTAAACGGCGTGTGATT
CCGCATACTCCAGCTCCGGGACAGAAGCCAAGAACCTTGGAGGATGAAGAGCTTGTTCCC
TCAGCGCTAATTAAGTTTAGACCGATTGAGACTGACTCTCTCGTCTACACTGGTCTATGC
AATGAACTCCTGGAGATCAGTGAACCACTCACATGATCATTTCGAGTTCCACAGAAGATT
TGGCTTCAAACGGTTTTAAGTTTCTCTATTTTATGTTGTGGTTGGTTGATTGTTCTCTGT
TTGTGATTCGAACATATTATAGGGTTTTAAGGAAAAAGAATTGTGTAATCTGCACAATAA
TTAGAATCAAAGTTTGAAGATT

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 2

CO CL4815Contig1 1302 2 2 U
GGGTTTTCACCACCAAAGAACACAATCTCCGGCGATCGGAAGAGAGAGAGAGATGAGCAG
CACGGCAGGGAAGATGGTGACATCGAGATCGGAGCTGGAATTGGATCACCCAAACATCGA
AGATTACCTTCCTTCAGGTTCCTCCATCAACGAGCCTCGTGGCAAGCTCAGCCTGCGTGA
TTTGATAGACATTTCTCCAACCCTCACTGAAGCTGCTGGTGCCATTGTCGATGACTCATT
CACTCGGTGTTTCAAGTCGAATCCTCCAGAGCCTTGGAACTGGAACATCTACTTGTTTCC
TTTATGGTGCTGTGGTGTTTTTGTTAGATACTGTATCCTCTTTCCCTTGAGGTGCATGAC
TTTGGCTTTTGGGTGGTTTATTTTCCTTTCAACCTTTATCCCTGTACATTCTCTCCTCAA
AGGTCAGGATAGGTTGAGGAAAAAGATTGAGAGAGTCTTGGTGGAAATGATATGCAGCTT
CTTTGTGGCCTCATGGACAGGAGTTGTTAGATACCACGGCCCACGCCCTAGCATCCGTCC
TAAGCAGGTCTATGTTGCCAACCATACTTCGATGATTGATTTCATCGTCTTGGAGCAGAT
GACGGCTTTTGCTGTTATAATGCAGAAGCATCCTGGTTGGGTTGGGCTTCTGCAAAGCAC
AATACTAGAGAGCGTGGGATGTATCTGGTTCAATCGTTCCGAGGCAAAGGATCGTGAAAT
TGTCGCAAGAAAGTTAAGGAACCATGTTCAAGGAAGTGACAATAACCCTCTTCTCATATT
TCCCGAGGGGACTTGTGTGAATAATAATTACACTGTGATGTTTAAGAAGGGTTCTTTTGA
ATTGGACTGCACTGTTTGTCCAATCGCCATTAAATACAATAAGATCTTTGTCGACGCCTT
CTGGAACAGCAGAAAACAATCATTTACTATGCACTTACTGCAACTCATGACATCGTGGGC
TGTTGTGTGTGAAGTGTGGTACTTGGAACCCCAAACAATAAGGCCTGATGAAACAGCTAT
TGAGTTTGCAGAGAGGGTCAGAGACATGATATCTCATAGGGCAGGTCTCAAAAAGGTTCC
TTGGGATGGATACTTGAAGTATTCGAGGCCAAGTTCCAAGCATAGTGAACGCAAGCAACA
GAGTTTTGCAGAGTCGATCCTGGCTAGATTGGAAGAAAAGTGAATGCAAAGATCTTATCA
TGTTCTTTTCTTGTTCCTTGTGTTTTATTTTTCTGTTTGTCAAAACAAACTCATAAATCA
TGTGCTTTTAGCTCCCTGTTTTACAATACATTACATCTTGTG


BQ
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AF RS1C024TF U 1
AF RS1C024JQ C 572
BS 1 632 RS1C024TF
BS 633 1302 RS1C024JQ

RD RS1C024TF 632 0 0
GGGTTTTCACCACCAAAGAACACAATCTCCGGCGATCGGAAGAGAGAGAGAGATGAGCAG
CACGGCAGGGAAGATGGTGACATCGAGATCGGAGCTGGAATTGGATCACCCAAACATCGA
AGATTACCTTCCTTCAGGTTCCTCCATCAACGAGCCTCGTGGCAAGCTCAGCCTGCGTGA
TTTGATAGACATTTCTCCAACCCTCACTGAAGCTGCTGGTGCCATTGTCGATGACTCATT
CACTCGGTGTTTCAAGTCGAATCCTCCAGAGCCTTGGAACTGGAACATCTACTTGTTTCC
TTTATGGTGCTGTGGTGTTTTTGTTAGATACTGTATCCTCTTTCCCTTGAGGTGCATGAC
TTTGGCTTTTGGGTGGTTTATTTTCCTTTCAACCTTTATCCCTGTACATTCTCTCCTCAA
AGGTCAGGATAGGTTGAGGAAAAAGATTGAGAGAGTCTTGGTGGAAATGATATGCAGCTT
CTTTGTGGCCTCATGGACAGGAGTTGTTAGATACCACGGCCCACGCCCTAGCATCCGTCC
TAAGCAGGTCTATGTTGCCAACCATACTTCGATGATTGATTTCATCGTCTTGGAGCAGAT
GACGGCTTTTGCTGTTATAATGCAGAAGCATC

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1C024JQ 731 0 0
ATGATTGATTTCATCGTCTTGGAGCAGATGACGGCTTTTGCTGTTATAATGCAGAAGCAT
CCTGGTTGGGTTGGGCTTCTGCAAAGCACAATACTAGAGAGCGTGGGATGTATCTGGTTC
AATCGTTCCGAGGCAAAGGATCGTGAAATTGTCGCAAGAAAGTTAAGGAACCATGTTCAA
GGAAGTGACAATAACCCTCTTCTCATATTTCCCGAGGGGACTTGTGTGAATAATAATTAC
ACTGTGATGTTTAAGAAGGGTTCTTTTGAATTGGACTGCACTGTTTGTCCAATCGCCATT
AAATACAATAAGATCTTTGTCGACGCCTTCTGGAACAGCAGAAAACAATCATTTACTATG
CACTTACTGCAACTCATGACATCGTGGGCTGTTGTGTGTGAAGTGTGGTACTTGGAACCC
CAAACAATAAGGCCTGATGAAACAGCTATTGAGTTTGCAGAGAGGGTCAGAGACATGATA
TCTCATAGGGCAGGTCTCAAAAAGGTTCCTTGGGATGGATACTTGAAGTATTCGAGGCCA
AGTTCCAAGCATAGTGAACGCAAGCAACAGAGTTTTGCAGAGTCGATCCTGGCTAGATTG
GAAGAAAAGTGAATGCAAAGATCTTATCATGTTCTTTTCTTGTTCCTTGTGTTTTATTTT
TCTGTTTGTCAAAACAAACTCATAAATCATGTGCTTTTAGCTCCCTGTTTTACAATACAT
TACATCTTGTG

QA 1 731 1 731
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GTTACAACGACGATCGAACGGTGACGAAAGAATCCTCCGGCGCGAAATCGGCGCCGATGA
CTCGCGATCTCCTCGGAAGCAGAGGAGGAGGAGGAGGTGATCGGTCACTAGAGCTCGACC
TCGATCTTCAAGTCCCCGCCGGATGGGAGAAACGTCTCGATCTCAAGTCAGGGAAGGTTT
ACCTTCAACGATGCAACTCAACGAGCTCGTCGACGATAACAAACGCAGATCTATCATCAT
CCAATCAAACAGTACCAACGACTACGACGACGACGTTTCAGGATTTGAATTTCCCTCCGA
ATCCAACAAATCCTCATCACGCCAAGCCTCTGCTCAACCTCTTCGACGACACCTCCCCGG
AGCTGAAGCTTCGTCCCTCCCATCCTCTCTCTCTATCGCCGAACCGTAATTTCCAGAGCG
TATGCACGCTGGACAAGGTGAAATCGGCTCTGGAGAGAGCCGAGAGAGATCCGGTTACGT
TCAGGAAACGGCAATCGCCGGACGATCATCTTCATCGTCGGACGGAGGCTGCGTCGCCGG
TGGCGGCTGGGTGTCCTGGATGTTTGAGCTACGTTCTGGTGATGAAGAACAACCCGAGGT
GTCCCAGATGCGATACAGTTGTTTCGTTGCCTACGGATTCTTCTTCTTCTTCCATGATGA
AGAAGAAGGTTAAGATTGATCTCAACATATCAATTTGAAACTTATGGGGCTTAACTGAAA
CATCTTTTATTCTTTGGGGGGTCTTGGTGATATGTTGTAAATGATAGATAAAAATTTGAA
AAGAAAGACCCAAAAAAATTGATGCGATGGATTTTTGAAGGTGCTACAACTATTCTGTAA
ATGCGTTATGTTGAACAATTGGAAAAAATAATAATTACTG


BQ
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AF RS1H472TF U 1
AF RS1H472JQB C 244
BS 1 719 RS1H472TF
BS 720 940 RS1H472JQB

RD RS1H472TF 719 0 0
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GTTACAACGACGATCGAACGGTGACGAAAGAATCCTCCGGCGCGAAATCGGCGCCGATGA
CTCGCGATCTCCTCGGAAGCAGAGGAGGAGGAGGAGGTGATCGGTCACTAGAGCTCGACC
TCGATCTTCAAGTCCCCGCCGGATGGGAGAAACGTCTCGATCTCAAGTCAGGGAAGGTTT
ACCTTCAACGATGCAACTCAACGAGCTCGTCGACGATAACAAACGCAGATCTATCATCAT
CCAATCAAACAGTACCAACGACTACGACGACGACGTTTCAGGATTTGAATTTCCCTCCGA
ATCCAACAAATCCTCATCACGCCAAGCCTCTGCTCAACCTCTTCGACGACACCTCCCCGG
AGCTGAAGCTTCGTCCCTCCCATCCTCTCTCTCTATCGCCGAACCGTAATTTCCAGAGCG
TATGCACGCTGGACAAGGTGAAATCGGCTCTGGAGAGAGCCGAGAGAGATCCGGTTACGT
TCAGGAAACGGCAATCGCCGGACGATCATCTTCATCGTCGGACGGAGGCTGCGTCGCCGG
TGGCGGCTGGGTGTCCTGGATGTTTGAGCTACGTTCTGGTGATGAAGAACAACCCGAGGT
GTCCCAGATGCGATACAGTTGTTTCGTTGCCTACGGATTCTTCTTCTTCTTCCATGATG

QA 1 719 1 719
DS 

RD RS1H472JQB 697 0 0
TTCAACGATGCAACTCAACGAGCTCGTCGACGATAACAAACGCAGATCTATCATCATCCA
ATCAAACAGTACCAACGACTACGACGACGACGTTTCAGGATTTGAATTTCCCTCCGAATC
CAACAAATCCTCATCACGCCAAGCCTCTGCTCAACCTCTTCGACGACACCTCCCCGGAGC
TGAAGCTTCGTCCCTCCCATCCTCTCTCTCTATCGCCGAACCGTAATTTCCAGAGCGTAT
GCACGCTGGACAAGGTGAAATCGGCTCTGGAGAGAGCCGAGAGAGATCCGGTTACGTTCA
GGAAACGGCAATCGCCGGACGATCATCTTCATCGTCGGACGGAGGCTGCGTCGCCGGTGG
CGGCTGGGTGTCCTGGATGTTTGAGCTACGTTCTGGTGATGAAGAACAACCCGAGGTGTC
CCAGATGCGATACAGTTGTTTCGTTGCCTACGGATTCTTCTTCTTCTTCCATGATGAAGA
AGAAGGTTAAGATTGATCTCAACATATCAATTTGAAACTTATGGGGCTTAACTGAAACAT
CTTTTATTCTTTGGGGGGTCTTGGTGATATGTTGTAAATGATAGATAAAAATTTGAAAAG
AAAGACCCAAAAAAATTGATGCGATGGATTTTTGAAGGTGCTACAACTATTCTGTAAATG
CGTTATGTTGAACAATTGGAAAAAATAATAATTACTG

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 2

CO CL4818Contig1 756 2 2 U
TCAAACCAATCAATCAAAATGTTGCGCATTATCTTCCTCTTATCTCTCCTTTTTGCTCTA
TCCAATGCCTCTGTTCAAGACTTCTGTGTGGCCAACCTGAAACGTGCTGAAACCCCTGCA
GGTTACCCATGCATTCGTCCCATTCACGTCAAAGCCAAGGACTTTGTCTTTTCCGGTTTA
GGCACTCCTGGGAACACTACAAACATCATCAGCGCTGCCGTCACGCCCGGTTTCGCCGCT
CAGTTCCCGGGTCTGAATGGTCTAGGCCTCTCTACAGCTAGACTTGACCTAGCTCCTAAA
GGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTCTGAGGTTCTTTTTGTCCTTGACGGC
TACATTACCGCTGGGTTTGTCTCCTCTGCGAACGCTGTCTACGTGCAGACGCTAAAACCA
GGACAGGTCATGGTTTTCCCACAAGGCCTGCTTCACTTCCAGATCAATGCGGGGAAATCA
GCTGCAGCAGCCTTTGTCACTTTCAGCAGTGCTAGTCCAGGTCTCCAGATTCTAGATTTC
GCGCTTTTTGCTAACAGTCTTCCTACTGAACTCGTCTCTGGTACTACTTTCCTTGACCCT
GCTATAGTCAAGAAGCTAAAGGGTGTTCTAGGGGGAACTGGCTAAAAGATACTTGGTGCT
TTCATTGACACTTTTCTCTTTGATGGGTTCTTGTCTTCTATGTTTTGTAGTCCTTGTAAT
ACCTGTCTACATTATTACATTGTATGTGAGTTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FZ43TF U 1
AF RS1FZ43JQ C 257
BS 1 441 RS1FZ43TF
BS 442 756 RS1FZ43JQ

RD RS1FZ43TF 441 0 0
TCAAACCAATCAATCAAAATGTTGCGCATTATCTTCCTCTTATCTCTCCTTTTTGCTCTA
TCCAATGCCTCTGTTCAAGACTTCTGTGTGGCCAACCTGAAACGTGCTGAAACCCCTGCA
GGTTACCCATGCATTCGTCCCATTCACGTCAAAGCCAAGGACTTTGTCTTTTCCGGTTTA
GGCACTCCTGGGAACACTACAAACATCATCAGCGCTGCCGTCACGCCCGGTTTCGCCGCT
CAGTTCCCGGGTCTGAATGGTCTAGGCCTCTCTACAGCTAGACTTGACCTAGCTCCTAAA
GGTGTGATCCCAATGCACACTCACCCTGGTGCCTCTGAGGTTCTTTTTGTCCTTGACGGC
TACATTACCGCTGGGTTTGTCTCCTCTGCGAACGCTGTCTACGTGCAGACGCTAAAACCA
GGACAGGTCATGGTTTTCCCA

QA 1 441 1 441
DS 

RD RS1FZ43JQ 500 0 0
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ACACTCACCCTGGTGCCTCTGAGGTTCTTTTTGTCCTTGACGGCTACATTACCGCTGGGT
TTGTCTCCTCTGCGAACGCTGTCTACGTGCAGACGCTAAAACCAGGACAGGTCATGGTTT
TCCCACAAGGCCTGCTTCACTTCCAGATCAATGCGGGGAAATCAGCTGCAGCAGCCTTTG
TCACTTTCAGCAGTGCTAGTCCAGGTCTCCAGATTCTAGATTTCGCGCTTTTTGCTAACA
GTCTTCCTACTGAACTCGTCTCTGGTACTACTTTCCTTGACCCTGCTATAGTCAAGAAGC
TAAAGGGTGTTCTAGGGGGAACTGGCTAAAAGATACTTGGTGCTTTCATTGACACTTTTC
TCTTTGATGGGTTCTTGTCTTCTATGTTTTGTAGTCCTTGTAATACCTGTCTACATTATT
ACATTGTATGTGAGTTTCTC

QA 1 500 1 500
DS 



AS 1 2

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GGGATGTGGGCGAGTCCTTTCAGCCGCCGTGTTGAGATAGCACTCACCCTCAAAGGCGTA
CCATACGAGTTCTCTGAGCAAGATATCGCCAACAATAGCCCCCTGCTACTCCAATCAAAC
CCGGTTCACAAGAAGATTCCGGTTCTTCTCCATAACGGTAAACCAATCTCAGAATCGCTC
GTGATCCTTGAGTACATCGATGATACATGGCAGAACGATCCCATCCTGCCTCAAGATCCG
TACGACAGAGCTACGGCTCGGTTTTGGGGAAGGTTCGTCGATGAACAGATCTATGTAACG
GCTATGAAAGTGGTGGGGAAGGTTGGAGAAGAAAAAGACGCGGCGGTGGAAGCCACGAGA
GATTTGTTGAGGTTGTTGGAGAAAGAGCTTGTCGGGAAAGATTTTCTCGGTGGGGAAAGG
TTAGGGTTCGTGGACATCGTTGCAACTTTGGTGGCGTTTTGGCTGATGAGAACGGAAGAG
GTCGTTGGAGTCAAGGTTGTTCCTGTGGAGATGTTCCCAGAGATTCACAGATGGGTTAAG
AATCTTTTGGACGTTGATGTCATCAAGAAATGTATCCCTCCTGAAGATGAACATCTCAAC
TACATAAGAGCTCGCATGGATCGCCTCAAACTCAAATCTGTTTGATAACCAATTATATAT
ATAAGTTCAATAAATTAAATCAAAGAAACTATTTGTTTTTAGTTTTTTTTTTTTGTAACT
GAGAAAACTATTTTTTCTTAGTTTGTTTCTTGTTATGTGTTGAAATAACATTGTCAGTTC
TTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RS1GZ79TF U 1
AF RS1GZ79JQ C 241
BS 1 689 RS1GZ79TF
BS 690 690 RS1GZ79JQ
BS 691 707 RS1GZ79TF
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BS 709 713 RS1GZ79TF
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RD RS1GZ79TF 738 0 0
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GCTATGAAAGTGGTGGGGAAGGTTGGAGAAGAAAAAGACGCGGCGGTGGAAGCCACGAGA
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TTAGGGTTCGTGGACATCGTTGCAACTTTGGTGGCGTTTTGGCTGATGAGAACGGAAGAG
GTCGTTGGAGTCAAGGTTGTTCCTGTGGAGATGTTCCCAGAGATTCACAGATGGGTTAAG
AATCTTTTGGACGTTGATGTCATCAAGAAATGTATCCCTCCTGAAGATGAACATCTCAAC
TACATAAGAGCTCGCATGGATCGCCTCAA*CTCAAATCTGTTTGATA*CCAAT*ATATAT
ATAAGTTCA
TAAATTAAT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RS1GZ79JQ 605 0 0
GTGATCCTTGAGTACATCGATGATACATGGCAGAACGATCCCATCCTGCCTCAAGATCCG
TACGACAGAGCTACGGCTCGGTTTTGGGGAAGGTTCGTCGATGAACAGATCTATGTAACG
GCTATGAAAGTGGTGGGGAAGGTTGGAGAAGAAAAAGACGCGGCGGTGGAAGCCACGAGA
GATTTGTTGAGGTTGTTGGAGAAAGAGCTTGTCGGGAAAGATTTTCTCGGTGGGGAAAGG
TTAGGGTTCGTGGACATCGTTGCAACTTTGGTGGCGTTTTGGCTGATGAGAACGGAAGAG
GTCGTTGGAGTCAAGGTTGTTCCTGTGGAGATGTTCCCAGAGATTCACAGATGGGTTAAG
AATCTTTTGGACGTTGATGTCATCAAGAAATGTATCCCTCCTGAAGATGAACATTTCAAC
TACATAAGAGCTCGCATGGATCGCCTCAAACTCAAATCTGTTTGATAACCAATTATATAT
ATAAGTTCAATAAATTAAATCAAAGAAACTATTTGTTTTTAGTTTTTTTTTTTTGTAACT
GAGAAAACTATTTTTTCTTAGTTTGTTTCTTGTTATGTGTTGAAATAACATTGTCAGTTC
TTGTT

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 2

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GGGCTCTCCCTTCCTCCATCCTCTTCCCGGTTTCTCCTTCTTCCTCCTCCATCATCGCTC
CGATCCTTTTCGGTTCCAATATCGCCGAGAAAGTTTCGACCTTTCTCCGGTACCACCGCA
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GACGAATGCATTCTTGTTGACGAAACTGATCGCGTTGTAGGGCACGACAGCAAATATAAT
TGTCATCTGATGGAAAATATTGAAGCTAAGAATTTGCTTCACAGGGCCTTCAGTGTATTT
TTATTCAACTCGAACTATGAGCTGCTTCTCCAGCAAAGGTCGAAAGCAAAGGTGACCTTC
CCACTAGTGTGGACAAACACTTGTTGCAGCCATCCTCTTTACCGTGAATCAGAGCTTATC
GAGGAAAATGCACTCGGTGTGAGGAATGCTGCACAGAGAAAGCTTCTTGACGAGCTCGGT
ATCGTAGCTGAAGATGTACCAGTGGATGAGTTCACTCCCTTGGGGCGTATGCTTTACAAG
GCTCCTTCTGATGGCAAATGGGGAGAGCACGAACTGGACTACTTGCTGTTCATTGTGAGG
GATGTTAAGGGGGAACCAAACCCTGACGAAGTAGCGGAGATAAAGTATGTGAGCAGGGAA
AGACTGAAGGAGCTGGTGAAGAAAGCAGATGCAGGGGAGGAAGGTTTGAAGTTGTCACCA
TGGTTCAGACTGGTGGTGGACAATTTTTTGATGAAGTGGTGGGATCATGTTGGGAAAGGA
ACTCTTGATGAAGCTGTTGACATGAAAACTATCCACAAATTTTGAAACCACTTTTTTCCT
CAAGTTTTTGTGA


BQ
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AF RS1H325TF U 1
AF RS1H325JQB C 467
BS 1 610 RS1H325TF
BS 611 611 RS1H325JQB
BS 612 666 RS1H325TF
BS 667 853 RS1H325JQB

RD RS1H325TF 666 0 0
GGGCTCTCCCTTCCTCCATCCTCTTCCCGGTTTCTCCTTCTTCCTCCTCCATCATCGCTC
CGATCCTTTTCGGTTCCAATATCGCCGAGAAAGTTTCGACCTTTCTCCGGTACCACCGCA
ATGGCAACAGATGCTAAAGATGCTGGAATGGATGCTGTCCAGAGACGCCTCATGTTTGAG
GACGAATGCATTCTTGTTGACGAAACTGATCGCGTTGTAGGGCACGACAGCAAATATAAT
TGTCATCTGATGGAAAATATTGAAGCTAAGAATTTGCTTCACAGGGCCTTCAGTGTATTT
TTATTCAACTCGAACTATGAGCTGCTTCTCCAGCAAAGGTCGAAAGCAAAGGTGACCTTC
CCACTAGTGTGGACAAACACTTGTTGCAGCCATCCTCTTTACCGTGAATCAGAGCTTATC
GAGGAAAATGCACTCGGTGTGAGGAATGCTGCACAGAGAAAGCTTCTTGACGAGCTCGGT
ATCGTAGCTGAAGATGTACCAGTGGATGAGTTCACTCCCTTGGGGCGTATGCTTTACAAG
GCTCCTTCTGATGGCAAATGGGGAGAGCACGAACTGGACTACTTGCTGTTCATTGTGAGG
GATGTTAAGGTGGAACCAAACCCTGACGAAGTAGCGGAGATAAAGTATGTGAGCAGGGAA
AGACTG

QA 1 666 1 666
DS 

RD RS1H325JQB 387 0 0
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GTATGCTTTACAAGGCTCCTTTTGATGGCAAATGGGGGGAGCACGAACTGGACTACTTGC
TGTTCATTGTGAGGGATGTTAAGGGGGAACCAAACCCTGACGAAGTAGCGGAGATAAAGT
ATGTGAGCAGGGAAGGACTGAAGGAGCTGGTGAAGAAAGCAGATGCAGGGGAGGAAGGTT
TGAAGTTGTCACCATGGTTCAGACTGGTGGTGGACAATTTTTTGATGAAGTGGTGGGATC
ATGTTGGGAAAGGAACTCTTGATGAAGCTGTTGACATGAAAACTATCCACAAATTTTGAA
ACCACTTTTTTCCTCAAGTTTTTGTGA

QA 1 387 1 387
DS 



AS 1 2

CO CL4821Contig1 1353 2 2 U
GGGGACGAAGATTATTTTGCTACGGCTGGTGTTTCAAAGAAAATCAAGATATTTGAGTTC
AATTCCCTATTTAACGAAGCTGTGGACATCCATTATCCAGCCGTGGAAATGTCAAATAGA
TCAAAGCTTAGCGGCGTTTGCTGGAACAACTATATCAGGAACTACTTAGCATCCTCTGAT
TATGATGGTATCATCAAGTTATGGGATGTGACAACAGGACAGGCCATTTCACATTTCATA
GAGCACGAGAAGCGGGCCTGGTCTGTTGATTTCTCTGAAGCGTGTCCGACAAAATTAGCC
AGTGGAAGCGATGATTGTTCTGTGAAGCTGTGGAACATCAATGAGAGGAATTGCTTAGGA
ACGATCAGGAACATTGCAAACGTCTGTTGTGTGCAATTTTCTCCACAGTCGTCTCATCTG
CTAGCCTTTGGATCATCAGATTTCAGAACATACTGCTACGATACACGGAACTTGAGAACT
CCTTGGTGCATACTGTCAGGACACAACAAAGCAGTTAGCTACGCCAAATTCTTGGATAGT
GAAACCCTTGTCACAGCGTCAACTGATAACACGTTAAAGCTCTGGGATCTTAAGAAAACT
ACTCACGGTGGCCTCTCCACAAATGCTTGCAGCTTAACTTTTGTTGGCCATACGAACGAG
AAGAACTTTGTTGGGTTGTCTACTGCCGATGGATATATAGCTTGTGGCTCAGAGACAAAT
GAGGTTTATGCATATCACCGCTCTCTTCCAATGCCCATTACCGCGTACAAGTTTGGTTCG
ATTGATCCTATAACAGGAAATGAGATTGAGGAAGACAACAACCTATTTGTTTCAAGCGTT
TGCTGGAGAAAAAGATCAAATATGGTTGTTTCAGCTAGCTCAAATGGGTCTATCAAAGTT
CTACAGCTGGTTTGAAATCATTACATTCAGAAGAAGCCTATGTATATTTTCTTTTCACCT
GGAGATTCCCCTTGGCTTTAGGGTAAAAACAAAGAACCATCAACCCAGGACACAGACGAA
ACAATCATACTACCGAGGTTGTGGAGAAGGTTGAGATGATGAACAAAGCTTTCAACACAG
AAGAGATATGCTCAGTAACTCAGTCTTATGTACAGTGTTGGTTAGTAGCTGCGGTTTGGG
TAGTAATACAGGTGGTGAGGATACGTAGTAAGAGGTAAGACCTTTTTCTTGGTGGTGTTT
TAAGTTTTTATTTATTTATTTATTTGCCCCTCCTGTAGTTATGATACCAGATCTTACGTT
TGTTATCTAAAGTTGCCTTCCTATAGAGTACTAGACCACCATACTCTTTTGTTTTTGATG
TGTATATACATAGATGATATGAGCTTTTATCCT


BQ
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AF RS1FB67TF U 1
AF RS1FB67JQ C 589
BS 1 645 RS1FB67TF
BS 646 1353 RS1FB67JQ

RD RS1FB67TF 645 0 0
GGGGACGAAGATTATTTTGCTACGGCTGGTGTTTCAAAGAAAATCAAGATATTTGAGTTC
AATTCCCTATTTAACGAAGCTGTGGACATCCATTATCCAGCCGTGGAAATGTCAAATAGA
TCAAAGCTTAGCGGCGTTTGCTGGAACAACTATATCAGGAACTACTTAGCATCCTCTGAT
TATGATGGTATCATCAAGTTATGGGATGTGACAACAGGACAGGCCATTTCACATTTCATA
GAGCACGAGAAGCGGGCCTGGTCTGTTGATTTCTCTGAAGCGTGTCCGACAAAATTAGCC
AGTGGAAGCGATGATTGTTCTGTGAAGCTGTGGAACATCAATGAGAGGAATTGCTTAGGA
ACGATCAGGAACATTGCAAACGTCTGTTGTGTGCAATTTTCTCCACAGTCGTCTCATCTG
CTAGCCTTTGGATCATCAGATTTCAGAACATACTGCTACGATACACGGAACTTGAGAACT
CCTTGGTGCATACTGTCAGGACACAACAAAGCAGTTAGCTACGCCAAATTCTTGGATAGT
GAAACCCTTGTCACAGCGTCAACTGATAACACGTTAAAGCTCTGGGATCTTAAGAAAACT
ACTCACGGTGGCCTCTCCACAAATGCTTGCAGCTTAACTTTTGTT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1FB67JQ 765 0 0
CTTAAGAAAACTACTCACGGTGGCCTCTCCACAAATGCTTGCAGCTTAACTTTTGTTGGC
CATACGAACGAGAAGAACTTTGTTGGGTTGTCTACTGCCGATGGATATATAGCTTGTGGC
TCAGAGACAAATGAGGTTTATGCATATCACCGCTCTCTTCCAATGCCCATTACCGCGTAC
AAGTTTGGTTCGATTGATCCTATAACAGGAAATGAGATTGAGGAAGACAACAACCTATTT
GTTTCAAGCGTTTGCTGGAGAAAAAGATCAAATATGGTTGTTTCAGCTAGCTCAAATGGG
TCTATCAAAGTTCTACAGCTGGTTTGAAATCATTACATTCAGAAGAAGCCTATGTATATT
TTCTTTTCACCTGGAGATTCCCCTTGGCTTTAGGGTAAAAACAAAGAACCATCAACCCAG
GACACAGACGAAACAATCATACTACCGAGGTTGTGGAGAAGGTTGAGATGATGAACAAAG
CTTTCAACACAGAAGAGATATGCTCAGTAACTCAGTCTTATGTACAGTGTTGGTTAGTAG
CTGCGGTTTGGGTAGTAATACAGGTGGTGAGGATACGTAGTAAGAGGTAAGACCTTTTTC
TTGGTGGTGTTTTAAGTTTTTATTTATTTATTTATTTGCCCCTCCTGTAGTTATGATACC
AGATCTTACGTTTGTTATCTAAAGTTGCCTTCCTATAGAGTACTAGACCACCATACTCTT
TTGTTTTTGATGTGTATATACATAGATGATATGAGCTTTTATCCT

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL4822Contig1 1188 2 4 U
GTCTGGTAACAATGTGAAAGCGAAGAAGAAGCTAACCAGAGACTGGAAGGAATCAAATGA
GGGGAGAATGCGAGAGAAAATGGAGGGGGAGGAGGAGGGAGGGACGGCGTCGAGGGAATC
GAGGGATCTGTAGAGGACGAAGATGGAGATGGAAATGGCGGCGAGGAATATAACGGCTCG
GCGTACGGGGCGCGAGCACGGCGTCATGGTGACGGAAGCTACGGAGGAGGAAGAATGGTT
AACGTCGTGAGGCGAGATGGTGAGGTTCGTCGTCGACTTGAGACTCGAGGTGACACGGTG
CGATAGATGATTCATCTACACCACCGACCATCGTCGGCACCGACGCGAAATCAAAAGGTT
AATTTCGAGACTTTATTTGTTTTTTTAACGGTTAAACTTTTGTTTTTACTATTTCACCAA
GAGAAATTACTGGAAGGTTGTCGATAAATAACCGTATAAATTACTTTCTCTTCCTTTTTT
AATTTCGTCGAGTGATTTTAATCTTCCAAACATGAAAATGAAATCAGCATATGTACTGTG
CTTTATTATTGGGTTTATTATCATTTTATACTTTTTTGGCAGTAATTATTTTATGCTTTT
TAAGGTTTCACTTTCAGTTTGATATTAACGTTTAGATAAATTTTTTTTTGTGTTTCAGAA
AAAAAAAAGAGTTTCAAAAAAAAAAAGATAAATTTTATTTTCAAGATTTCGTCCATGTGA
TAAACCAACAATCCTAGGAGTTTAACAACAAAATTATCTGAATCTTTTCACTGAGGCTAA
GCTAAGGAGGCAAATATTTATTTACTGAGTTTAGCTGCTCAGGAGAGAGATTGAAAGAGA
AAGGTTGAGATCAATCTTTGGTGAAGAACCAAGGCAATCTTTGAAGACCAATGGTGCAGA
ACAAGTGGAGACTGCTTCGCTCGTTTCACTCACTGATGATCCGTTGCTTCTCCATTGATG
ATGATGATGATTCAACGACAGAGACAACGACAAATCTTCCGCTTCTTGTTCTTGCCAAGT
CTTTTCTTCCTTCTCTGTTTTCTGTTGAGACAGAAAAAAACGAAATCAGTTGCTAAACCG
GACAATAACCAGATTTTGGTATCACAATTTCAATAAAACCGGTTGATAGTTATAAACCAA
ACCGCAATCCCCTAAATAAGTGAGAATATGAAGATCTGAGTTCTTTTG


BQ
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AACGTCGTGAGGCGAGATGGTGAGGTTCGTCGTCGACTTGAGACTCGAGGTGACACGGTG
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GAGAAATTACTGGAAGGTTGTCGATAAATAACCGTATAAATTACTTTCTCTTCCTTTTTT
AATTTCGTCGAGTGATTTTAATCTTCCAAACATGAAAATGAAATCAGCATATGTACTGTG
CTTTATTATTGGGTTTATTATCATTTTATACTTTTTTGGCAGTAATTATTTTATGCTTTT
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AAAAAAA

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DS 

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TTTTAAGGTTTCACTTTCAGTTTGATATTAACGTTTAGATAAATTTTTTTTTGTGTTTCA
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TGATAAACCAACAATCCTAGGAGTTTAACAACAAAATTATCTGAATCTTTTCACTGAGGC
TAAGCTAAGGAGGCAAATATTTATTTACTGAGTTTAGCTGCTCAGGAGAGAGATTGAAAG
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AGAACAAGTGGAGACTGCTTCGCTCGTTTCACTCACTGATGATCCGTTGCTTCTCCATTG
ATGATGATGATGATTCAACGACAGAGACAACGACAAATCTTCCGCTTCTTGTTCTTGCCA
AGTCTTTTCTTCCTTCTCTGTTTTCTGTTGAGACAGAAAAAAACGAAATCAGTTGCTAAA
CCGGACAATAACCAGATTTTGGTATCACAATTTCAATAAAACCGGTTGATAGTTATAAAC
CAAACCGCAATCCCCTAAATAAGTGAGAATATGAAGATCTGAGTTCTTTTG

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 2

CO CL4823Contig1 1053 2 6 U
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ATATCTTTCTTCTGCAAATGTGCAGTGGAGTGGATGAGAACGCAGTTGAATCGTGCGCAG
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GCTTCCGCATCATTCCCCTAGATTCCAAATCGGAGGGATTGAGTCCTAACCGAACACTAG
ACCTAGCATCGGCTCTAGACATAGGGAGCAGAACAGCCGGGGACTCATGCGGAAACAGAG
GAAACACAAAGTCAGTGATGACAATAGCGTTTCAGCTAGCTTTTGAGATGCACATGCAAG
AGAATGTAGCTTCAATGGCTAGACAATACGTGAGAAGTGTGATCGCCTCAGTACAACGGG
TCGCGCTTGCTCTCTCTCCTTCTTCTCATCAGCTAAGCGGAGGCCTGCGTCCACCACCCG
CATCACCTGAAGCTCACACACTCGCTCGTTGGATTTCTCATTCGTACAGATGTTACCTTG
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TATTTAGTCATATAGTCCTGAAAAATTCAAATC


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AF RS1H669TF U 1
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BS 1 729 RS1H669TF
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GCGTTGAACTACTTAAACCTAATGGAACTGATCTTCTCAAGTCTCTTTGGCACCATTCTG
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DS 

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TTTGAGATGCACATGCAAGAGAATGTAGCTTCAATGGCTAGACAATACGTGAGAAGTGTG
ATCGCCTCAGTACAACGGGTCGCGCTTGCTCTCTCTCCTTCTTCTCATCAGCTAAGCGGA
GGCCTGCGTCCACCACCCGCATCACCTGAAGCTCACACACTCGCTCGTTGGATTTCTCAT
TCGTACAGATGTTACCTTGGCGTTGAACTACTTAAACCTAATGGAACTGATCTTCTCAAG
TCTCTTTGGCACCATTCTGACGCCCTCATGTGTTGTTCACTCAAGGCCTTACCGCCGGTA
TTCACATTTGCGAACCAGGCTGGCTTAGACATGCTGGAGACGACGTTGGTGGCACTTCAA
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TTATCTCTTAGTTAATTTGTATTTAGTCATATAGTCCTGAAAAATTCAAATC

QA 1 772 1 772
DS 



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CCAACACTTGTTATTGTTAGTTGTTGTTTCTTTGTTCCCTTAAGATCTCAAAGTCTTATC
CTTTGGGTTTTGATTAGATATCTTCTGTTTGGTTTCATCACTTTCTTTCTGATCTGGGTT
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AGAGTAACCCTTTATAGGTTTTATTGGGGTTTTGTCTCATTCTGAGAAATGGGTTCACAG
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TATGTTGACTGTTCTGGATAAGTTTAAAGAGATTTAGAGACTGTTCATGCAACTATTAAG
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TCAATGTCTAGTTACTCAAGTGTTGCTTTGACATATTACCTTAGCCTCCTTCAAAACAAT
TGTTTTTGTATGTGTTTGAATTTTAATCCGGTTTCATTGTGTTGTTGTCTCTTTTTCAGA
GCTAGGATACTACAGAAACAACCTTTTCACTTGGAGGGTTCTTGTCTAGTTGCTTTTAGG
CTTTTTGGTTTGGTAGAGAAATTGAATTAGTAGTAATGAGAAGAGGTAAAGGGAAGAGAA
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GGAGAAGAGGGAGGCCACAAAAGCCGGTTAAAGATGAAACCGAAGGAGAAAGAGAAGAGA
TTGCGGAGAAGGATGATGATAATACAAACGGTTCAGTAACAAGTAAAGAAGATGTGACAG
AGAATGGGAGGAAGGGGGAGAAAGCGGTAGAAGAGTCTAAAGAGAGCAATGTAACAGAAG
AAGAGAATGTGTTAGGATCGAAATCAAGCGCTGATGATTTAGTGAAGCCATCGTTGTCTA
TGGGGTTTAGACATGTTGGGAGTAGGAGGAAGAACAAACCAAGACGAGCTGCGGAAGTTG
TTGTTGAATGTAATGGTGTTTGAAGAAAGAGATTCTTGGAGACTGCCTTTTTTTTATTTG
TTCTTTGTTGACTTGAATATTACTTTTTGTTGTTAGGACTTTTGATGCAGTTGCGTTTTA
GTTTTCATATATGGAATCAGATTTTATC


BQ
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AF RS1C508TF U 1
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TGTTTTTGTATGTGTTTGAATTTTAATCCGGTTTCATTGTGTTGTTGTCTCTTTTTCAGA
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CTTT

QA 1 719 1 719
DS 

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TCAATGTCTAGTTACTCAAGTGTTGCTTTGACATATTACCTTAGCCTCCTTCAAAACAAT
TGTTTTTGTATGTGTTTGAATTTTAATCCGGTTTCATTGTGTTGTTGTCTCTTTTTCAGA
GCTAGGATACTACAGAAACAACCTTTTCACTTGGAGGGTTCTTGTCTAGTTGCTTTTAGG
CTTTTTGGTTTGGTAGAGAAATTGAATTAGTAGTAATGAGAAGAGGTAAAGGGAAGAGAA
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AGAATGGGAGGAAGGGGGAGAAAGCGGTAGAAGAGTCTAAAGAGAGCAATGTAACAGAAG
AAGAGAATGTGTTAGGATCGAAATCAAGCGCTGATGATTTAGTGAAGCCATCGTTGTCTA
TGGGGTTTAGACATGTTGGGAGTAGGAGGAAGAACAAACCAAGACGAGCTGCGGAAGTTG
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GTTTTCATATATGGAATCAGATTTTATC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

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AGAGTGTAGAGAAGAACAGATTGAATCTGATGAAGCCAAGGAGAGAAGCTGGAAACTTTC
TGCTAGATCTCTCCGTAAAAAATCTTCTGAAGCTGCAAAAGATTCAGCCGCCGGAAAAAC
CGTTCGGACAGGAACTCTCGTGGTCGCCTAGTATAATATTTTTATTACATAAGAAAACCA
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TTTT


BQ
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20 20 20 20 

AF RS1DY52JQ C 1
AF RS1DY52TF U 1
BS 1 484 RS1DY52TF

RD RS1DY52JQ 484 0 0
GGCTCCTCCTCCTCTTTCCTTCATCTTCCTCCTCTCTGAGCTAAATCTTGAATTTGCTTC
AGCAGTCCACTCTATTCCTCAATTCCAAAGCTTTTTCGATTAGCAAATGGCTTCGTATTA
CTCTGCGTTTTTCGGCAGTGAAGAGCCACACTTTTTGGAATCATGCTCTCTTTGCAGTAA
ACACCTTGGTCTTAACTCCGACATCTTCATGTACAGAGGAGACACAGCGTTTTGTAGCAT
AGAGTGTAGAGAAGAACAGATTGAATCTGATGAAGCCAAGGAGAGAAGCTGGAAACTTTC
TGCTAGATCTCTCCGTAAAAAATCTTCTGAAGCTGCAAAAGATTCAGCCGCCGGAAAAAC
CGTTCGGACAGGAACTCTCGTGGTCGCCTAGTATAATATTTTTATTACATAAGAAAACCA
AAGCATGTAGCTTTTGTGTATACCCATTTTGTCTAAAGCTATATATATATATCACCCTTC
TTTT

QA 1 484 1 484
DS 

RD RS1DY52TF 484 0 0
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AGCAGTCCACTCTATTCCTCAATTCCAAAGCTTTTTCGATTAGCAAATGGCTTCGTATTA
CTCTGCGTTTTTCGGCAGTGAAGAGCCACACTTTTTGGAATCATGCTCTCTTTGCAGTAA
ACACCTTGGTCTTAACTCCGACATCTTCATGTACAGAGGAGACACAGCGTTTTGTAGCAT
AGAGTGTAGAGAAGAACAGATTGAATCTGATGAAGCCAAGGAGAGAAGCTGGAAACTTTC
TGCTAGATCTCTCCGTAAAAAATCTTCTGAAGCTGCAAAAGATTCAGCCGCCGGAAAAAC
CGTTCGGACAGGAACTCTCGTGGTCGCCTAGTATAATATTTTTATTACATAAGAAAACCA
AAGCATGTAGCTTTTGTGTATACCCATTTTGTCTAAAGCTATATATATATATCACCCTTC
TTTT

QA 1 484 1 484
DS 



AS 1 2

CO CL4826Contig1 899 2 2 U
GCAATCTAAAACAATGAAAACTCCATATTCTTTATTCAAACATTTCCTTTTCTCTATTTT
GGGCATGCCATTTCTCATGATACATAGTGTTTCATCATTGAACCTTACCAATGAGTATCT
CAATCACAAATGCCTCCTTGATCAAGGGAAATATAACTCTGGAAGTGAGTACGAGGATAA
CCTCAACCGTCTCTTTCGTTCAATTAGTAGTGATGCTTCTGGTGTGATCGGTTTCGCATA
CTTAAGTATTGGATCGACTCCCAATTTTCTTACTATCACTCTCCAGTGTCGTGGTGACTC
TATTGGGTCTAAATGCCATACATGTACTGACACCGCAATCTCGGAGTTTCGTAAAAGATG
TCCGAAGAACAAAGGAGGAATCATATGGTACGACCAATGTTTTCTCTTTGTTACTACAAT
CAAAGAAGAAGATCTAATTAAAACTAATTACGAGAATATTTTTTCTATGTACAACTCAAA
TAACGTGAGAGGGGATAGAATTTTTTTTGCCAAGAGGGTGAGAGATTTTTTATATGAGCT
CACACTTAAAGTGGAGAAAACAATTGAGGGCGATCACATCTTATTATACGCGGCAGGAGA
AAAGAAGCTTGGAAAAAATAAACTGTACGCAATGGTGCAGTGTATAGAACAAACATTAGA
TTGTAAGAGTTGTCTGGAATGGAGTATCAAAAAGCTTTTCAAAAACAGTGACATTAAACA
AGGAGCAAGAGTTTTGGGTACGAATTGTGGTGTAAGATATGAGCTATACCCTTTTTTGGG
GAGAAGCAATTTCACAGTGGTGTGAATACATCCTTTTCATAATTTCCAATTATGAGTTTT
GTTTATTTTTTTATTTAGCTGAAATGTTACATTCATATATCAATAAAAATAGTGTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FP49TF U 1
AF RS1FP49JQ C 194
BS 1 673 RS1FP49TF
BS 674 899 RS1FP49JQ

RD RS1FP49TF 673 0 0
GCAATCTAAAACAATGAAAACTCCATATTCTTTATTCAAACATTTCCTTTTCTCTATTTT
GGGCATGCCATTTCTCATGATACATAGTGTTTCATCATTGAACCTTACCAATGAGTATCT
CAATCACAAATGCCTCCTTGATCAAGGGAAATATAACTCTGGAAGTGAGTACGAGGATAA
CCTCAACCGTCTCTTTCGTTCAATTAGTAGTGATGCTTCTGGTGTGATCGGTTTCGCATA
CTTAAGTATTGGATCGACTCCCAATTTTCTTACTATCACTCTCCAGTGTCGTGGTGACTC
TATTGGGTCTAAATGCCATACATGTACTGACACCGCAATCTCGGAGTTTCGTAAAAGATG
TCCGAAGAACAAAGGAGGAATCATATGGTACGACCAATGTTTTCTCTTTGTTACTACAAT
CAAAGAAGAAGATCTAATTAAAACTAATTACGAGAATATTTTTTCTATGTACAACTCAAA
TAACGTGAGAGGGGATAGAATTTTTTTTGCCAAGAGGGTGAGAGATTTTTTATATGAGCT
CACACTTAAAGTGGAGAAAACAATTGAGGGCGATCACATCTTATTATACGCGGCAGGAGA
AAAGAAGCTTGGAAAAAATAAACTGTACGCAATGGTGCAGTGTATAGAACAAACATTAGA
TTGTAAGAGTTGT

QA 1 673 1 673
DS 

RD RS1FP49JQ 706 0 0
TTTCGTTCAATTAGTAGTGATGCTTCTGGTGTGATCGGTTTCGCATACTTAAGTATTGGA
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TGCCATACATGTACTGACACCGCAATCTCGGAGTTTCGTAAAAGATGTCCGAAGAACAAA
GGAGGAATCATATGGTACGACCAATGTTTTCTCTTTGTTACTACAATCAAAGAAGAAGAT
CTAATTAAAACTAATTACGAGAATATTTTTTCTATGTACAACTCAAATAACGTGAGAGGG
GATAGAATTTTTTTTGCCAAGAGGGTGAGAGATTTTTTATATGAGCTCACACTTAAAGTG
GAGAAAACAATTGAGGGCGATCACATCTTATTATACGCGGCAGGAGAAAAGAAGCTTGGA
AAAAATAAACTGTACGCAATGGTGCAGTGTATAGAACAAACATTAGATTGTAAGAGTTGT
CTGGAATGGAGTATCAAAAAGCTTTTCAAAAACAGTGACATTAAACAAGGAGCAAGAGTT
TTGGGTACGAATTGTGGTGTAAGATATGAGCTATACCCTTTTTTGGGGAGAAGCAATTTC
ACAGTGGTGTGAATACATCCTTTTCATAATTTCCAATTATGAGTTTTGTTTATTTTTTTA
TTTAGCTGAAATGTTACATTCATATATCAATAAAAATAGTGTTTAC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL4827Contig1 532 2 2 U
CTTCTTCTTCTTTTCTTCGCTATTAATAAGATGTTTCCATCAAAGCCAGAAGAAGTTGTT
ACTGTTGATGTGAGCCAAGCCAAGACTCTCCTCCAGTCCGACCATCAATATCTTGATGTT
AGGACCGAGGAAGAGTTCAGGAGAGGCCATTGTCTGGCACCTAAGATCCTCAACGTCCCC
TACATGCTCAACACACCTCAAGGGAGAGTGAAGAATCCAAATTTTTTGGATCAAGTATCT
TCTCTTCTCAGCCCAACTGATGATATCCTTGTGGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTC
AATGCCACAAGTGAGCTTGTCGCTGCAGGTTACAAGAAAGTGAGAAACATAGGAGGTGGG
TACTTGGCTTGGGTGGATCAGAACTTTCCCATCAACAAGGAGCAGCAGCAATCTGCAAAC
TAATCATCCTCTTTTATTAAAAATAAAAGTATAATGCAATGAAAGTATAATGCAATGTAA
TAATGTATCGCCTATTTGTCGTGTATTTTAGTAAAATATAATTTCGTTGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BK33TF U 1
AF RS1BK33JQ C 18
BS 1 505 RS1BK33TF
BS 506 532 RS1BK33JQ

RD RS1BK33TF 505 0 0
CTTCTTCTTCTTTTCTTCGCTATTAATAAGATGTTTCCATCAAAGCCAGAAGAAGTTGTT
ACTGTTGATGTGAGCCAAGCCAAGACTCTCCTCCAGTCCGACCATCAATATCTTGATGTT
AGGACCGAGGAAGAGTTCAGGAGAGGCCATTGTCTGGCACCTAAGATCCTCAACGTCCCC
TACATGCTCAACACACCTCAAGGGAGAGTGAAGAATCCAAATTTTTTGGATCAAGTATCT
TCTCTTCTCAGCCCAACTGATGATATCCTTGTGGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTC
AATGCCACAAGTGAGCTTGTCGCTGCAGGTTACAAGAAAGTGAGAAACATAGGAGGTGGG
TACTTGGCTTGGGTGGATCAGAACTTTCCCATCAACAAGGAGCAGCAGCAATCTGCAAAC
TAATCATCCTCTTTTATTAAAAATAAAAGTATAATGCAATGAAAGTATAATGCAATGTAA
TAATGTATCGCCTATTTGTCGTGTA

QA 1 505 1 505
DS 

RD RS1BK33JQ 515 0 0
CGCTATTAATAAGATGTTTCCATCAAAGCCAGAAGAAGTTGTTACTGTTGATGTGAGCCA
AGCCAAGACTTTCCTCCAGTCCGACCATCAATATCTTGATGTTAGGACCGAGGAAGAGTT
CAGGAGAGGCCATTGTCTGGCACCTAAGATCCTCAACGTCCCCTACATGCTCAACACACC
TCAAGGGAGAGTGAAGAATCCAAATTTTTTGGATCAAGTATCTTCTCTTTTCAGCCCAAC
TGATGATATCCTTGTGGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTCAATGCCACAAGTGAGCT
TGTCGCTGCAGGTTACAAGAAAGTGAGAAACATAGGAGGTGGGTACTTGGCTTGGGTGGA
TCAGAACTTTCCCATCAACAAGGAGCAGCAGCAATCTGCAAACTAATCATCCTCTTTTAT
TAAAAATAAAAGTATAATGCAATGAAAGTATAATGCAATGTAATAATGTATCGCCTATTT
GTCGTGTATTTTAGTAAAATATAATTTCGTTGTTG

QA 1 515 1 515
DS 



AS 1 2

CO CL4828Contig1 504 2 2 U
GAGCCTCAGATATTTCCGGCTTTTTATTTCGCATATTCGTTGTAAGTTATTACATTGTTA
CTTGTGCCACTTTCACATTTATTATTACACAAACCATGACACACTTGGCCACTTACACAT
TTATTATCACACAAACCATGACGCGTGCATGACTCATATCCCACCGCTTAGAATCTGATC
ATAAGGGCTGTCGTTGCAGTAGTCGCATAAGCATTTAACACCACCAGCACCGGCATCTCC
CCAAATGCATCTTCCACCTTTAGCCCCCTTGTTCTCACGGCATCTTGTATAACAAATCGT
CGGAAAAATCCGAGGCGCACAGAAGCCAAAACCCACATCACCACCGTATTCTTTCAGGCA
CTCGCTATCCTGGGCTATTATCTCCGGCACTTCAAAAATCACCGAAACGAGGATGAAAAT
GAGGGTGAAAGAAAAAACTGATTTTGTTGCCATGGCCATTTTATCTCTATGTCTGCTCTT
TACTCTCTGTTGAATTTGGAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1FX09TF C 1
AF RS1FX09JQ U 21
BS 1 20 RS1FX09TF
BS 21 504 RS1FX09JQ

RD RS1FX09TF 504 0 0
GAGCCTCAGATATTTCCGGCTTTTTATTTCGCATATTCGTTGTAAGTTATTACATTGTTA
CTTGTGCCACTTTCACATTTATTATTACACAAACCATGACACACTTGGCCACTTACACAT
TTATTATCACACAAACCATGACGCGTGCATGACTCATATCCCACCGCTTAGAATCTGATC
ATAAGGGCTGTCGTTGCAGTAGTCGCATAAGCATTTAACACCACCAGCACCGGCATCTCC
CCAAATGCATCTTCCACCTTTAGCCCCCTTGTTCTCACGGCATCTTGTATAACAAATCGT
CGGAAAAATCCGAGGCGCACAGAAGCCAAAACCCACATCACCACCGTATTCTTTCAGGCA
CTCGCTATCCTGGGCTATTATCTCCGGCACTTCAAAAATCACCGAAACGAGGATGAAAAT
GAGGGTGAAAGAAGAAACTGATTTTGTTGCCATGGCCATTTTATCTCTATGTCTGCTCTT
TACTCTCTGTTGAATTTGGAGTCC

QA 1 504 1 504
DS 

RD RS1FX09JQ 484 0 0
TTTTTATTTCGCATATTCGTTGTAAGTTATTACATTGTTACTTGTGCCACTTTCACATTT
ATTATTACACAAACCATGACACACTTGGCCACTTACACATTTATTATCACACAAACCATG
ACGCGTGCATGACTCATATCCCACCGCTTAGAATCTGATCATAAGGGCTGTCGTTGCAGT
AGTCGCATAAGCATTTAACACCACCAGCACCGGCATCTCCCCAAATGCATCTTCCACCTT
TAGCCCCCTTGTTCTCACGGCATCTTGTATAACAAATCGTCGGAAAAATCCGAGGCGCAC
AGAAGCCAAAACCCACATCACCACCGTATTCTTTCAGGCACTCGCTATCCTGGGCTATTA
TCTCCGGCACTTCAAAAATCACCGAAACGAGGATGAAAATGAGGGTGAAAGAAAAAACTG
ATTTTGTTGCCATGGCCATTTTATCTCTATGTCTGCTCTTTACTCTCTGTTGAATTTGGA
GTCC

QA 1 484 1 484
DS 



AS 1 2

CO CL4829Contig1 1163 2 2 U
TGCTGATGCAGAGAAAGGAAAAGATGAAGATGGTGGGGAGAAGGCAGCTGAAGCAGTGGA
GCTTAAAGAACCAACCTCTGTGAAAGAGGGTGTTGAAGAAGTTAAGCTTGAAACTGTTGA
TGCTGAGAAAGCAGAAGAGAAGGGAACCGTTGAAAGTGTAGCTGAAGAAGACAAGAAGGA
TAAGGAGGAGACAAAGTGGTTGATGTTTCTGAATCAACAGATGAAGGCAAACAAGTTGAT
GTTCAACCTGTGAGAGAAGTACCTGAAGAGACTGTAGAAGACAAGATCAAAGACGTTGAT
GTTCTTGAAGTCAAGGCAAAGCCAGATGATTCTGAAAAAGTTGAGACTCAGCCTGAGAAA
GCAAATGAATTGGCAACAGATGTTGAAGTGGCGAAAACAGAGGAAACAACAGAAGAAGCA
GCGAAGGTTGAGCTTGAGGGAAAGCTGGAGGATACCATTGTTGTTGAGACCAAAGAGACT
TCTGAATCTGCCCCCCAAAAGGAGACAGAAGGAGACGCCTCTTCTCCTGCTGATCTCACT
GAGAAAGCCATTACCGAGGAGAAGCATGTAGTGGAAGAACCATCAAAGGATGAAACAGAG
AACGTAACTGAAGCAAAAGGCATCGTCATCAAAGCACCAGCTACAGAAGAAGAAAACATC
AAGAAGGAGATGAAACACCTGCTGCAGATGTCAAGAGCGAAGAGACTCTGAAAGAAACTG
AAGGAAACAAACAAGAGGTTGTAGAAACAGCACCTGTTGTTAAAGAGATAGAAGAGCCAG
AAGTCACAGCCAAAGAAGTTGTTGTTAAGCCAAAGAATACAAACAGCATCATGTCAAAGG
TGAAGAAGTCTCTTGTTAAGGCAAAGAAAGCAATCATTGGGAAATCTCCAAGCTCCAAGA
CTATCACAACTGAAGAAGCCAAAGAAGAGATCATCAAAGCCAAGTGATTAAAGAAAAAGA
GTCATGAATTACTTAAAAGTCTTTTCAGGTATTTTAAATTTCTTTTGTTGGTTTTGTTTC
TTTGTGTTGGGGGGAGAAAAAAAAGACAGAACATTCTTTTTATTTTGTGCTTGATGGCTT
TGTGTTGGTTATAACTTTTATGTCTGTAAAACCTGCAAAGATTTGGCTTTGTGTTATGGA
TGTGTGTTTGAGAAATTTCTTTC


BQ
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AF RS1E313TF U 1
AF RS1E313JQ C 399
BS 1 578 RS1E313TF
BS 579 1163 RS1E313JQ

RD RS1E313TF 578 0 0
TGCTGATGCAGAGAAAGGAAAAGATGAAGATGGTGGGGAGAAGGCAGCTGAAGCAGTGGA
GCTTAAAGAACCAACCTCTGTGAAAGAGGGTGTTGAAGAAGTTAAGCTTGAAACTGTTGA
TGCTGAGAAAGCAGAAGAGAAGGGAACCGTTGAAAGTGTAGCTGAAGAAGACAAGAAGGA
TAAGGAGGAGACAAAGTGGTTGATGTTTCTGAATCAACAGATGAAGGCAAACAAGTTGAT
GTTCAACCTGTGAGAGAAGTACCTGAAGAGACTGTAGAAGACAAGATCAAAGACGTTGAT
GTTCTTGAAGTCAAGGCAAAGCCAGATGATTCTGAAAAAGTTGAGACTCAGCCTGAGAAA
GCAAATGAATTGGCAACAGATGTTGAAGTGGCGAAAACAGAGGAAACAACAGAAGAAGCA
GCGAAGGTTGAGCTTGAGGGAAAGCTGGAGGATACCATTGTTGTTGAGACCAAAGAGACT
TCTGAATCTGCCCCCCAAAAGGAGACAGAAGGAGACGCCTCTTCTCCTGCTGATCTCACT
GAGAAAGCCATTACCGAGGAGAAGCATGTAGTGGAAGA

QA 1 578 1 578
DS 

RD RS1E313JQ 765 0 0
AGAGGAAACAACAGAAGAAGCAGCGAAGGTTGAGCTTGAGGGAAAGCTGGAGGATACCAT
TGTTGTTGAGACCAAAGAGACTTCTGAATCTGCCCCCCAAAAGGAGACAGAAGGAGACGC
CTCTTCTCCTGCTGATCTCACTGAGAAAGCCATTACCGAGGAGAAGCATGTAGTGGAAGA
ACCATCAAAGGATGAAACAGAGAACGTAACTGAAGCAAAAGGCATCGTCATCAAAGCACC
AGCTACAGAAGAAGAAAACATCAAGAAGGAGATGAAACACCTGCTGCAGATGTCAAGAGC
GAAGAGACTCTGAAAGAAACTGAAGGAAACAAACAAGAGGTTGTAGAAACAGCACCTGTT
GTTAAAGAGATAGAAGAGCCAGAAGTCACAGCCAAAGAAGTTGTTGTTAAGCCAAAGAAT
ACAAACAGCATCATGTCAAAGGTGAAGAAGTCTCTTGTTAAGGCAAAGAAAGCAATCATT
GGGAAATCTCCAAGCTCCAAGACTATCACAACTGAAGAAGCCAAAGAAGAGATCATCAAA
GCCAAGTGATTAAAGAAAAAGAGTCATGAATTACTTAAAAGTCTTTTCAGGTATTTTAAA
TTTCTTTTGTTGGTTTTGTTTCTTTGTGTTGGGGGGAGAAAAAAAAGACAGAACATTCTT
TTTATTTTGTGCTTGATGGCTTTGTGTTGGTTATAACTTTTATGTCTGTAAAACCTGCAA
AGATTTGGCTTTGTGTTATGGATGTGTGTTTGAGAAATTTCTTTC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL4830Contig1 873 2 2 U
ATTCAAAATTTATCTCCTCAGCTTCTACTAGGAAGCACACTCGTGAGACATGGCCGCCGC
AGTTTCCACCGTTGGTGCCATCAACAGAGCTCCGTTGAGCTTGAACGGGTCAGGAGCAGG
AGCTGCTTCAGTCCCAGCAACGACCTTCTTGGGAAAGAAAGTTGTAACCGCGTCGAGATT
CGCACAGAGCAACATGATTGATGGGCTTTACATTGCCCCTGCTTTCATGGACAAGCTTGT
TGTTCACATCACCAAGAACTTCTTGACTTTGCCTAACATCAAGGTTCCACTTATTTTGGG
TATTTGGGGAGGCAAAGGTCAAGGTAAATCCTTCCAGTGTGAGCTTGTCATGGCCAAGAT
GGGCATCAACCCAATCATGATGAGTGCTGGAGAGCTTGAGAGCGGGAACGCAGGAGAGCC
AGCCAAGCTTATCCGTCAAAGGTACCGTGAGGCAGCAGACCTGATCAAGAAAGGAAAGAT
GTGTTGTCTCTTCATCAACGATCTCGACGCTGGTGCTGGTCGTATGGGTGGTATCACTCA
GTACACTGACCAATACCTTAACGAGGCTGCCTTGGGAGACGCAAACGCCGACGCTATTGG
ACGTGGAACTTTCTTCGATTCCACATGAGGGAAAAGTGCACACTAAAGTGAAGTTGCATG
TTCCTGAAGGGTGTTAATGATCCTGCGGTCAAGAACTTTGATCCAACGGCTAGAAGTGAC
TGATGGAACTTGTGTCTACAACTTTTGAGCTTTCTCCTACTTATAATTAAATCTCCTGTT
TTTTTTTCTTTGTAATTGTGAATTGGTGGCTCTTGTCATCTTTGTTTTTATGATTATGTG
CAAACGTTCATATATTACAGTTGCCCTTTTACC


BQ
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AF RS1GV04TF U 1
AF RS1GV04JQ C 488
BS 1 664 RS1GV04TF
BS 665 873 RS1GV04JQ

RD RS1GV04TF 664 0 0
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TGTTCACATCACCAAGAACTTCTTGACTTTGCCTAACATCAAGGTTCCACTTATTTTGGG
TATTTGGGGAGGCAAAGGTCAAGGTAAATCCTTCCAGTGTGAGCTTGTCATGGCCAAGAT
GGGCATCAACCCAATCATGATGAGTGCTGGAGAGCTTGAGAGCGGGAACGCAGGAGAGCC
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ACGTGGAACTTTCTTCGATTCCACATGAGGGAAAAGTGCACACTAAAGTGAAGTTGCATG
TTCC

QA 1 664 1 664
DS 

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GACCAATACCTTAACGAGGCTGCCTTGGGAGACGCAAACGCCGACGCTATTGGACGTGGA
ACTTTCTTCGATTCCACATGAGGGAAAAGTGCACACTAAAGTGAAGTTGCATGTTCCTGA
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CTTTGTAATTGTGAATTGGTGGCTCTTGTCATCTTTGTTTTTATGATTATGTGCAAACGT
TCATATATTACAGTTGCCCTTTTACC

QA 1 386 1 386
DS 



AS 1 2

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GGAGGTCAGCCGGCGGCTAAGAGGGCCAAGAGTGAAGCACCGTCGCCGTCACCAGCTTCC
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TTCGGAAAGACTGATGCAGCCTCAGTGCTCTCTGAAGCCATTGAATACATTAAGTTCTTG
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AACAGAGTGATCATCACAAAGAGCTAGAAGTTTCAGAAGAACCAGATCTTAGAAGTCGAG
GGTTATGCTTAGTGCCAGTTTCAAGCATATTTCCAGTGACGCACGACACTACAGTAGATT
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TATATATTTTTAGATTTATAACTAATTTTTAAAATAATGTGC


BQ
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AF RS1EB86TF U 1
AF RS1EB86JQ C 288
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TCGCCGAACTTTTTTCCGGCGTTACAGCCGCCGCAGATTCACGCGCCGACGAGTTTTGAT
GAACAAAAGAATATAACGAAGGTTCCTAATTCGAGGAGCAATGAAGCAAAGAGAGATGGA
GGAGGTCAGCCGGCGGCTAAGAGGGCCAAGAGTGAAGCACCGTCGCCGTCACCAGCTTCC
AAGGCTAGGAAAGAGAAAATGGGCGACAGAATCGCTGCGCTGCAACAATTGGTTTCACCT
TTCGGAAAGACTGATGCAGCCTCAGTGCTCTCTGAAGCCATTGAATACATTAAGTTCTTG
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AACAGAGTGATCATCACAAAGAGCTAGAAGTTTCAGAAGAACCAGATCTTAGAAGTCGAG
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TCTGGACTCCTACGTTTGGTGGGACTTTTAGATAGATTGGTATACAGATGAAAAAGT*AT
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DS 

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ATTGGTTTCACCTTTCGGAAAGACTGATGCAGCCTCAGTGCTCTCTGAAGCCATTGAATA
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TCTTTACAGCATCAACAGAGTGATCATCACAAAGAGCTAGAAGTTTCAGAAGAACCAGAT
CTTAGAAGTCGAGGGTTATGCTTAGTGCCAGTTTCAAGCATATTTCCAGTGACGCACGAC
ACTACAGTAGATTTCTGGACTCCTACGTTTGGTGGGACTTTTAGATAGATTGGTATACAG
ATGAAAAAGTTATGTTTAGATTTCGGTTGACGTATAATTTAACCTACATATACGTTGATT
TGCTGATAAGAAAATCACCCCATTTTAGTCGAAGTGAGAAGATTAATGAACAACTGAAAC
GTGTTTGTCCATTTATATATTTTTAGATTTATAACTAATTTTTAAAATAATGTGC

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 2

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TTTTTCTTGAATTGGTTGATTGATCGATTCGAATCTTGCTTATCGTGATTTGATTCTCTA
GGGTTTCGTTGATTGGGTTGATTTCTCTTTTCTCTTTGTTATCAATTTGATTTTTTCTTG
TATACGATTCAATTATCTCATTGAGAAGAATACGATGGCGGCAGGGGGAGGAGTTGATGT
CTCTAGAAGTTCTCTTTCCGTCAAAAAAGACCACGACTTTTACAGGAACGGTGCTCGTGG
AGATGGTGAGAGGCGTCCTCAAACTAAACCACCGCTTAACGAGCAAGGTCTCAGGAGGTT
TGATGGGCGTAACCGGTCACGGTTGGTTTCTGAGAAAGGGGAGGGAGGAGGGTCAGAGAC
CCGCTGAGAAGAGGAGGAAGTTTTCACCTATCTTGTGGGACGACGTTGAAGATAAAGTTT
CTAAAGCTCCTACTTCTAGGGAGAAG


BQ
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AF RS1AD40TF U 100
AF RS1B512TF U 1
BS 1 686 RS1B512TF

RD RS1AD40TF 482 0 0
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TTATCGTGATTTGATTCTCTAGGGTTTCGTTGATTGGGTTGATTTCTCTTTTCTCTTTGT
TATCAATTTGATTTTTTCTTGTATACGATTCAATTATCTCATTGAGAAGAATACGATGGC
GGCAGGGGGAGGAGTTGATGTCTCTAGAAGTTCTCTTTCCGTCAAAAAAGACCACGACTT
TTACAGGAACGGTGCTCGTGGAGATGGTGAGAGGCGTCCTCAAACTAAACCACCGCTTAA
CGAGCAAGGTCTCAGGAGGTTTGATGGGCGTAACCGGTCACGGTTGGTTTCTGAGAAAGG
G
A

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DS 

RD RS1B512TF 686 0 0
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GTTGCTTCTGGCGATCGCATCGGCTCCGTAGATCGATCTCCTTCCATCTCAATCCTCCTC
CGTTCTCTTCTTACCTTCCCTCCGGTAAGACCTTCCGGAACTTGTTTGAATCGGAGGAGA
TCAAGGGAAACCAAAAAAACCTATCGCATCCCTGGAAAATTGAATTTCTAGGGTTTCTAA
TTTTTCTTGAATTGGTTGATTGATCGATTCGAATCTTGCTTATCGTGATTTGATTCTCTA
GGGTTTCGTTGATTGGGTTGATTTCTCTTTTCTCTTTGTTATCAATTTGATTTTTTCTTG
TATACGATTCAATTATCTCATTGAGAAGAATACGATGGCGGCAGGGGGAGGAGTTGATGT
CTCTAGAAGTTCTCTTTCCGTCAAAAAAGACCACGACTTTTACAGGAACGGTGCTCGTGG
AGATGGTGAGAGGCGTCCTCAAACTAAACCACCGCTTAACGAGCAAGGTCTCAGGAGGTT
TGATGGGCGTAACCGGTCACGGTTGGTTTCTGAGAAAGGGGAGGGAGGAGGGTCAGAGAC
CCGCTGAGAAGAGGAGGAAGTTTTCACCTATCTTGTGGGACGACGTTGAAGATAAAGTTT
CTAAAGCTCCTACTTCTAGGGAGAAG

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 2

CO CL4833Contig1 1074 2 8 U
GGGCCTGGGAAGGGGATTGGTAAGAACGCTAAAGATGATGTTGAGATTAAGGAGTATAAA
AGGTGGACTGCTAAGGAAGGGTTAGGTTTCGATCTCGATAGGTCTAAGGTTGTTGTTGAT
ACGAAGAAGGCTAAACTGAAACTTGATGTTAGTGGTGGAGAGCTGTTTTTCGTTGGGAAA
GAAGTGAGGATTGTCGGTGGTAGAGATGTGGGGTTAAAGGGTGAGATTGTGGAGAAGAAG
GGTGATGATTCGTTTGTTGTGAAGCTCTCTGGGAGTGGAGATGAAGTGAGAGTTGGTGTG
AGTGATGTAGCAGATTTGGGTTCACAGGAAGAAGAAAGGTGTCTCAAGAAGTTGAAAGAT
AAGAAGGCGAGTAAAAGAAGCAGAGGAACAGAGAGAGTGAGTAGAAATGAAGTTAGAGTC
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CATATAAAGGTGAGAATAGTAAGCAAGAAATTGAAAGATGGGAGGTTGTATCTTAAGAAA
GGGAGAGTTGTTGATGTTGTTGGACCGACGACATGTGATATCACGATGGATGAGACGCAA
GAGTTGGTTCAAGGGGTTGATCAGGAGCTGCTGGAGACGGCACTGCCGAGGCGAGGAGGA
CCAGTTTTGATCCTATCGGGGAAACATAAGGGCGTCTATGGGAATCTGGTCGAGAAAGAT
TTGGATAGAGAAACTGGTGTGGTTCGTGATTTAGACAACCACAAGATGCTTGATGTTAGA
CTTGAACAAGTTGCTGAGTACATGGGCGATATGGATGATGTTGAGTACTGAAACTATCAA
TACTAAAGCTGCTTACTTTCAGATTTACGAGGAACCTCGGTGCAAGTATGAGTTTCTTGA
GTTTGCAGACAAAATTGACATTGGCTTCGGTGTCTGTCTTCGAGTAATTGCACTCACTTG
TACCATTTGTAAGAGCACTTTTTAGGAGTACGTACATGGTATTGCACCATTTTATTCACT
ACATCTATAAACTTTGTGGTCTGAACTAAAAGAGCTAATCAATGAACTTTACAC


BQ
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AF RS1AZ04TF U 1
AF RS1AZ04JQ C 259
BS 1 683 RS1AZ04TF
BS 684 684 RS1AZ04JQ
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AGGTGGACTGCTAAGGAAGGGTTAGGTTTCGATCTCGATAGGTCTAAGGTTGTTGTTGAT
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GAAGTGAGGATTGTCGGTGGTAGAGATGTGGGGTTAAAGGGTGAGATTGTGGAGAAGAAG
GGTGATGATTCGTTTGTTGTGAAGCTCTCTGGGAGTGGAGATGAAGTGAGAGTTGGTGTG
AGTGATGTAGCAGATTTGGGTTCACAGGAAGAAGAAAGGTGTCTCAAGAAGTTGAAAGAT
AAGAAGGCGAGTAAAAGAAGCAGAGGAACAGAGAGAGTGAGTAGAAATGAAGTTAGAGTC
AGTGAGAAGGATGATAGAGGAGGTGAGAGGAGAGTGAAGAAGCCCTCATGGCTCAGGAGT
CATATAAAGGTGAGAATAGTAAGCAAGAAATTGAAAGATGGGAGGTTGTATCTTAAGAAA
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CCAGTTTTGATCCTATCGGGGAA*CATAAGG*CGTCTATGGGAATCTGGTCGAGAA*GAT
TTGGATAGAGA

QA 1 731 1 731
DS 

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GGTTCACAGGAAGAAGAAAGGTGTCTCAAGAAGTTGAAAGATAAGAAGGCGAGTAAAAGA
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GGAGGTGAGAGGAGAGTGAAGAAGCCCTCATGGCTCAGGAGTCATATAAAGGTGAGAATA
GTAAGCAAGAAATTGAAAGATGGGAGGTTGTATCTTAAGAAAGGGAGAGTTGTTGATGTT
GTTGGACCGACGACATGTGATATCACGATGGATGAGACGCAAGAGTTGGTTCAAGGGGTT
GATCAGGAGCTGCTGGAGACGGCACTGCCGAGGCGAGGAGGACCAGTTTTGATCCTATCG
GGGAAACATAAGGGCGTCTATGGGAATCTGGTCGAGAAAGATTTGGATAGAGAAACTGGT
GTGGTTCGTGATTTAGACAACCACAAGATGCTTGATGTTAGACTTGAACAAGTTGCTGAG
TACATGGGCGATATGGATGATGTTGAGTACTGAAACTATCAATACTAAAGCTGCTTACTT
TCAGATTTACGAGGAACCTCGGTGCAAGTATGAGTTTCTTGAGTTTGCAGACAAAATTGA
CATTGGCTTCGGTGTCTGTCTTCGAGTAATTGCACTCACTTGTACCATTTGTAAGAGCAC
TTTTTAGGAGTACGTACATGGTATTGCACCATTTTATTCACTACATCTATAAACTTTGTG
GTCTGAACTAAAAGAGCTAATCAATGAACTTTACAC

QA 1 816 1 816
DS 



AS 1 2

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AAAATAATGCCGATTAGTGAGAAAATTCCGACTTGGGCCGTTGTTCCGGCTACTTTTGCC
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AATGTATTGTCGATGGCTAAGACCATACCACTTCCCGTCGATGGACCAGAGAGCATCGAG
TGGGATCCGCAAGGAGGGGGTCCTTATGCTGCTGTTGTGGACGGCCGTATTCTCAAGTGG
CGTGGAGATGGTCTCGGTTGGGTTGAGTTCGCATACACATCTCCTCACAGAGGAAACTGT
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GGCTTGGCTGAGTTGGTAGTGGACCAGGTT


BQ
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CB92TF U 1
AF RS1EU57TF U 1
BS 1 55 RS1CB92TF
BS 56 56 RS1EU57TF
BS 57 215 RS1CB92TF
BS 216 216 RS1EU57TF
BS 217 481 RS1CB92TF
BS 482 482 RS1EU57TF
BS 483 510 RS1CB92TF

RD RS1CB92TF 510 0 0
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AAAATAATGCCGATTAGTGAGAAAATTCCGACTTGGGCCGTTGTTCCGGCTACTTTTGCC
GTCTTTTCCGTAATTTCGTATCAGATCCTAATCGCGCCGGACAATTTGAACGGCACCAAA
AATGTATTGTCGATGGCTAAGACCATACCACTTCCTGTCGATGGACCAGAGAGCATCGAG
TGGGATCCGCAAGGAGGGGGTCCTTATGCTGCTGTTGTGGACGGCCGTATTCTCAAGTGG
CGTGGAGATGGTCTCGGTTGGGTTGAGTTCGCATACACATCTCCTCACAGAGGAAACTGT
TCACGGCATGAAGTAGTACCTACATGTGGAAGGCCACTTGGACTTAGTTTCGAGAAGAAA
ACAGGAGACTTGTACATCTGTGATGGTTACTTTGGGGTCATGAAAGTGGGGCCAGAAAGA
G*CTTGGCTGAGTTGGTAGTGGACCAGGTT

QA 1 510 1 510
DS 

RD RS1EU57TF 494 0 0
GGAAGCTAACAACAGCTAGTGTTACACACGTCTCTTCAACCAACATATTTGCCTCCGGTG
AAAATAATGCCGATTAGTGAGAAAATTCCGACTTGGGCCGTTGTTCCGGCTACTTTTGCC
GTCTTTTCCGTAATTTCGTATCAGATCCTAATCGCGCCGGACAATTTGAACGGCACCAAA
AATGTATTGTCGATGGCTAAGACCATACCACTTCCCGTCGATGGACCAGAGAGCATCGAG
TGGGATCCGCAAGGAGGGGGTCCTTATGCTGCTGTTGTGGACGGCCGTATTCTCAAGTGG
CGTGGAGATGGTCTCGGTTGGGTTGAGTTCGCATACACATCTCCTCACAGAGGAAACTGT
TCACGGCATGAAGTAGTACCTACATGTGGAAGGCCACTTGGACTTAGTTTCGAGAAGAAA
ACAGGAGACTTGTACATCTGTGATGGTTACTTTGGGGTCATGAAAGTGGGGCCAGAAAGA
GGCTTGGCTGAGTT

QA 1 494 1 494
DS 



AS 1 2

CO CL4835Contig1 1019 2 2 U
GGACATCTCTCCCCAGACATACAACTCAACTCTCTATTTCTCTCTTTAGCTTTAAGCTCC
CAAAAGAAAAGATAAGAGCTTTAGGTTTTTTTTTACCTTCTCTACATGGACTTGACTGGA
CTTAAATGGCTGCAACAACAACAACGAATGGTTTCACCTGAGTTTCTTCAGATACTTGCC
TCAGATGGGAGAGAAGAGCTCAGAAGGGTTGAGAGTTATTTGGGAAACAATATTTATGAT
ACTATTGATGGCTGCATCTCCAGGACAAGTAGCTTCCAAATGGAACCAGTGAAGAACAAT
GAAGAAAACAGAGCCGTTGCCTTGCTGAACAAGAGAAAATCTGAGGGTAAGACAGAAACA
AGAGAGAAGAAGAAGAAGAAAATCAAAGCAGAGGATGAAACAGAGTCAAGCATAAAAGGA
GAATCAAACATGAGCAACACAGAGACATCCTCAGACATTCAGAAACAAGATTACATCCAT
GTGAGAGCTAGAAGAGGTGAAGCCACTGACAGACATAGCTTAGCAGAAAGGGCAAGGAGA
GAAAAGATAAGCAAGAAGATGCAATGTCTTCAAGACATTGTTCCTGGATGCAACAAAGTT
ACTGGTAAAGCCGGTATGCTTGATGAGATCATCAACTACGTCCAGTCTCTGCAACAACAA
GTCGAGTTCTTGTCCATGAAACTCTCTGTCTTAAACCCACAGCTTGAGTTTCATATCAAT
GAATTATCCATGATGGCGGATCTAAGGTCTTTTCCATTACACCAGCAAGGATCTCTTGAT
TACTCAGTCATAAACTCAAACCAAACCACATCTCTCGTCGCTAAAAATGATACATCTTCA
AGCTGGGATATTCACTCACAGTGTCCTTACAACAACTTGCGAACCGATCCTGTTTCAAAT
TTCTTCAGCCTCAAGTAAAGAAGTTAGGGACAAGGGTCATTGAAAAGTCTGCAAGTTTTA
TTTCTCTCATCATTCTCCTTGTTATTAGAAATATGAACCAGAAAGACAGAGGAAACCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GH81TF U 1
AF RS1GH81JQ C 343
BS 1 520 RS1GH81TF
BS 521 1019 RS1GH81JQ

RD RS1GH81TF 520 0 0
GGACATCTCTCCCCAGACATACAACTCAACTCTCTATTTCTCTCTTTAGCTTTAAGCTCC
CAAAAGAAAAGATAAGAGCTTTAGGTTTTTTTTTACCTTCTCTACATGGACTTGACTGGA
CTTAAATGGCTGCAACAACAACAACGAATGGTTTCACCTGAGTTTCTTCAGATACTTGCC
TCAGATGGGAGAGAAGAGCTCAGAAGGGTTGAGAGTTATTTGGGAAACAATATTTATGAT
ACTATTGATGGCTGCATCTCCAGGACAAGTAGCTTCCAAATGGAACCAGTGAAGAACAAT
GAAGAAAACAGAGCCGTTGCCTTGCTGAACAAGAGAAAATCTGAGGGTAAGACAGAAACA
AGAGAGAAGAAGAAGAAGAAAATCAAAGCAGAGGATGAAACAGAGTCAAGCATAAAAGGA
GAATCAAACATGAGCAACACAGAGACATCCTCAGACATTCAGAAACAAGATTACATCCAT
GTGAGAGCTAGAAGAGGTGAAGCCACTGACAGACATAGCT

QA 1 520 1 520
DS 

RD RS1GH81JQ 677 0 0
GAGGGTAAGACAGAAACAAGAGAGAAGAAGAAGAAGAAAATCAAAGCAGAGGATGAAACA
GAGTCAAGCATAAAAGGAGAATCAAACATGAGCAACACAGAGACATCCTCAGACATTCAG
AAACAAGATTACATCCATGTGAGAGCTAGAAGAGGTGAAGCCACTGACAGACATAGCTTA
GCAGAAAGGGCAAGGAGAGAAAAGATAAGCAAGAAGATGCAATGTCTTCAAGACATTGTT
CCTGGATGCAACAAAGTTACTGGTAAAGCCGGTATGCTTGATGAGATCATCAACTACGTC
CAGTCTCTGCAACAACAAGTCGAGTTCTTGTCCATGAAACTCTCTGTCTTAAACCCACAG
CTTGAGTTTCATATCAATGAATTATCCATGATGGCGGATCTAAGGTCTTTTCCATTACAC
CAGCAAGGATCTCTTGATTACTCAGTCATAAACTCAAACCAAACCACATCTCTCGTCGCT
AAAAATGATACATCTTCAAGCTGGGATATTCACTCACAGTGTCCTTACAACAACTTGCGA
ACCGATCCTGTTTCAAATTTCTTCAGCCTCAAGTAAAGAAGTTAGGGACAAGGGTCATTG
AAAAGTCTGCAAGTTTTATTTCTCTCATCATTCTCCTTGTTATTAGAAATATGAACCAGA
AAGACAGAGGAAACCAT

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 2

CO CL4836Contig1 1159 2 6 U
GATATCCGGGTCAGGTAACACCGGTGGACTTGATCTTGATCTGAGGCTTGCGTCTCATCA
GTCTTCCAAATCGAATATTAGACCTATAAGCGTTACGTGAAATATATATAACTCGTTAAG
TAATGGGTGTAATTAGAATAACTAAAATGCTTACATATATCAACCATCGATGCTATCTAA
TTTGATTCTGATCCATCTTAGTTTTGGTAAATATTTCTGTATCATTGTGAGATTTTTGCC
TTGCGTCCACATTTATTTCTATACGCAAAGCCACAATGGAGCTTTAACATTGTGGCTTGC
CACAAGATAAGAAACTTGGGTTACAATTAAGTTATAGCTTTTTCAAAAAACAGTTTGCAC
TTGTTGTAAAAATTTAGTTTTTTTGAATAAATTTAACATATATTCAAAAAAAAAAATTCC
ATACGCAAATGATAAAGTTAATAACCAGAGATTTTTGACTTGCGTGCCCAAACGCGGTTC
AGCAAACCTTTTCTTTTTCTTTTGTCAACTTAACCAAATAAAGTAGAGTTGTAACAATGC
ATACAGTAATCCTTATTTTTCGAGCTATATCTTCTTACATAGAATAATTTCGAATCCACT
TTAATACAAAACCAGGAGTACTTTTCAGAATCGAAATAGTTTAGTTGTTGGGGGAAAACA
ATACACATTTTAAACATTTTTATAATTTGGAATCCACTTTTTTATTCAGAAAAAAACATT
TCTATATTCAAGTGCAAGCTGTGTTAATATTGACACTACTATTGGAAAAGGAAACAAAGT
GATTGGAGGACTAAATATGGCTTCTTATGTCATCAATAGATATGAAAAAGCCATTTTTTC
TTTTCTTGGTTGAGATTTTGGATATTAGGATATCCCACTTGAACCAAGAACATATTACGA
CTATATTAATGCAACCACTAGCTTAGAGCGTTTTCTTTTGTCTTAACGTTTAGCAGGTTT
GAAATAGTTATGGTCGCGAATTCAGAGCATCAACAATTTGATTCATAAGTTTTTCAGTAA
AAATGTATATTTAAGTTTTATCGGTTCTAATTACATTTTCCTGTTTTGATAGAACTATCT
GAATAAAAAGCTCCTTAATATACTAAATTACTGTCTTTGTCATTTCGTGTGCGGATAACC
TTAAGTAAAATGTTGTGCT


BQ
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AF RS1EA28TF U 1
AF RS1EA28JQ C 584
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TTGCGTCCACATTTATTTCTATACGCAAAGCCACAATGGAGCTTTAACATTGTGGCTTGC
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AGCAAACCTTTTCTTTTTCTTTTGTCAACTTAACCAAATAAAGTAGAGTTGTAACAATGC
ATACAGTAATCCTTATTTTTCGAGCTATATCTTCTTACATAGAATAATTTCGAATCCACT
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TCTATATTCAAGTGCAAGCTGTGTTA*TATTGACACTACTATTGGAAAAG

QA 1 770 1 770
DS 

RD RS1EA28JQ 576 0 0
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GAAAAAGCCATTTTTTCTTTTCTTGGTTGAGATTTTGGATATTAGGATATCCCACTTGAA
CCAAGAACATATTACGACTATATTAATGCAACCACTAGCTTAGAGCGTTTTCTTTTGTCT
TAACGTTTAGCAGGTTTGAAATAGTTATGGTCGCGAATTCAGAGCATCAACAATTTGATT
CATAAGTTTTTCAGTAAAAATGTATATTTAAGTTTTATCGGTTCTAATTACATTTTCCTG
TTTTGATAGAACTATCTGAATAAAAAGCTCCTTAATATACTAAATTACTGTCTTTGTCAT
TTCGTGTGCGGATAACCTTAAGTAAAATGTTGTGCT

QA 1 576 1 576
DS 



AS 1 2

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AATCATATATGTATCTTTGCTGTTGTT


BQ
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AF RS1GZ05TF U 1
AF RS1GZ05JQ C 146
BS 1 626 RS1GZ05TF
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RD RS1GZ05TF 626 0 0
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CCAGATGCGATCTTGTGTCTGTTACTACCTATGAAAGTGGAAGCGGCTGCACTATTGTTT
GAGTCATGTATTTCTTGCATTAGTCACCGCTACTTTTACCATATTATATAGTCTTCATGT
CAAATCCTGCAACCTACATGTTAGCCAGGATTACTTTCTTATATTAGTATGCTTTGTTTT
AATCATATATGTATCTTTGCTGTTGT

QA 1 626 1 626
DS 

RD RS1GZ05JQ 482 0 0
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TCCTTACCCAGCTTCTTACCCACCTCCTTACTGCGCCAGATGCGATCTTGTGTCTGTTAC
TACCTATGAAAGTGGAAGCGGCTGCACTATTGTTTGAGTCATGTATTTCTTGCATTAGTC
ACCGCTACTTTTACCATATTATATAGTCTTCATGTCAAATCCTGCAACCTACATGTTAGC
CAGGATTACTTTCTTATATTAGTATGCTTTGTTTTAATCATATATGTATCTTTGCTGTTG
TT

QA 1 482 1 482
DS 



AS 1 2

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ATGATCATCATCTTCTTTTAGTGATGTTC


BQ
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AF RS1F874JQ C 1
AF RS1F874TF U 1
BS 1 509 RS1F874TF

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GAAGAAGATGGAGATGAGAAACATGAAGCTCTTTTTAGAGAATCAAAGCATTATACGAGA
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TTTGCTTCATCCATAACTCTCCCCTGTTTCATCCTCCTCCTTCCTCTAGTGATCTTCATG
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CTCCGGACCCAAAGTTGGAGCCTAGATTCATCTATGTACTAAATATTAATATATATATCC
ATGATCATCATCTTCTTTTAGTGATGTTC

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DS 

RD RS1F874TF 509 0 0
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CCCGGACACACGCACACCCACGATGACATCAGCTTCGTGCCACAACAAACGTAAACTTAA
GACACAAACCCATCTCCGTGTCCTTAATCTCACCAGGAGGAGAAGAATACTGTGGGCAGA
GAAGAAGATGGAGATGAGAAACATGAAGCTCTTTCTAGAGAATCAAAGCATTATACGAGA
GAACGAGGCTTTAAAGAAGAAAGCACTTCTTCTCCACCAAGAAAATAATGCTCTCTTCTC
TCTGCTTCATCCATAACTCTCCCCTGTTTCATCCTCCTCCTTCCTCTAGTGATCTTCATG
AAGCATGTTTCTTTAGTACGTTTGTTTTCGCCTTCCCTACTAAAATAAAGAAACCTCAGG
CTCCGGACCCAAAGTTGGAGCCTAGATTCATCTATGTACTAAATATTAATATATATATCC
ATGATCATCATCTTCTTTTAGTGATGTTC

QA 1 509 1 509
DS 



AS 1 2

CO CL4839Contig1 1270 2 2 U
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TTAGGAGGAACTTCTTTCCATGGCTGGTTCAAGAACAACTCAACACCCCCTAAGCTTCTC
GACATCAGAGCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCGGTTAATAATAATAGTAAGAGCAGATGG
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CTTGGAGGAGCAGTTCCTCCCGTTACTACCAGGATAGTAGATGCAGAAAGCACCACCACA
AAGATACAACAACAGCCTTTTGGGAACCTTCAGCAACGTCTTGCCGAAAACAAAGATCTG
TCTAGTCTCCTCACTGTTATCGTCTCTGATCTCGAGACGACCGGCTTGCATAGGGTGAAG
GAGAGGATTATCGAGATCGCTGCTCAGGATCTAGCTGGTGGTGAGAACAGTACGTTCCAG
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ATGGTTTGTAGACCTGAGGTTCCAAGAATGGAGGAGATGATACCGATATTTCTGAGGTAT
GTTCAGAGTAGACAGAAGAAGCCTGGAGGGTATGTGATGATTGTTGCACATAACGGCAAA
ACGTTTGATTTTCAGTTCTTGATCAACGAGTTTAACCGCTGCTCTTACGAGATTCCTCCT
AACTGGCTCTTCTTTGACTCCCTCCCACTTGCCAGAGAGAGCATGAAGTCTGTAGACGCA
ACAGTGAAGCCAAAAGCGTCATTATCAGCTCTAGGGGATTACTATAACCTTGTAAGGGAT
GGTGAAGCTCACAGAGCATTGTCAGATGTATTACTTTTATCTCAGGTGTTTCAGAGACTA
ACCATTGATCTCAAGCTCTCGCTATCTGATCTTGTCCTCCGCTCTCACACCACGTCCGAC
CTTATTGCTGCCATGGCAAAGAACAAGAAGGCATGAAAGATTTTTAGAAACATTGGTCTC
TTATTAGCAGGGTTTCTTTTCTCATTATTGATCTCTGATTCTATTGTTTCTCTATATAGT
GTATGTAACTCCGGAAAAAATCTCAAGTCATGTAACCTATTGTTTAATTTATCTTGGGAT
AAATTAAGCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BR63TF U 1
AF RS1BR63JQ C 470
BS 1 649 RS1BR63TF
BS 650 1270 RS1BR63JQ

RD RS1BR63TF 649 0 0
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ATGCAAGTTTTCGTTACACAAGAACGAGATCGGAAGAGTGATTATTGATCTTTTAACTTA
GAGAGGAGAGGAAGAATGTGTGTCTCAATCTCGCAAGTATCGAGATTCAGAATCAACCTA
TTAGGAGGAACTTCTTTCCATGGCTGGTTCAAGAACAACTCAACACCCCCTAAGCTTCTC
GACATCAGAGCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCGGTTAATAATAATAGTAAGAGCAGATGG
GTCAGGAGAAACGTGAGTACAACCACACAAGGAAGCAGGAGCAACACCAAGAGCAGTATC
CTTGGAGGAGCAGTTCCTCCCGTTACTACCAGGATAGTAGATGCAGAAAGCACCACCACA
AAGATACAACAACAGCCTTTTGGGAACCTTCAGCAACGTCTTGCCGAAAACAAAGATCTG
TCTAGTCTCCTCACTGTTATCGTCTCTGATCTCGAGACGACCGGCTTGCATAGGGTGAAG
GAGAGGATTATCGAGATCGCTGCTCAGGATCTAGCTGGTGGTGAGAACAGTACGTTCCAG
ACTCTGGTCAACCCTGGTGTTCCTATATTGAATACTAGCATCCATGGGA

QA 1 649 1 649
DS 

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ACAAAGATCTGTCTAGTCTCCTCACTGTTATCGTCTCTGATCTCGAGACGACCGGCTTGC
ATAGGGTGAAGGAGAGGATTATCGAGATCGCTGCTCAGGATCTAGCTGGTGGTGAGAACA
GTACGTTCCAGACTCTGGTCAACCCTGGTGTTCCTATATTGAATACTAGCATCCATGGGA
TCAGGAACGATATGGTTTGTAGACCTGAGGTTCCAAGAATGGAGGAGATGATACCGATAT
TTCTGAGGTATGTTCAGAGTAGACAGAAGAAGCCTGGAGGGTATGTGATGATTGTTGCAC
ATAACGGCAAAACGTTTGATTTTCAGTTCTTGATCAACGAGTTTAACCGCTGCTCTTACG
AGATTCCTCCTAACTGGCTCTTCTTTGACTCCCTCCCACTTGCCAGAGAGAGCATGAAGT
CTGTAGACGCAACAGTGAAGCCAAAAGCGTCATTATCAGCTCTAGGGGATTACTATAACC
TTGTAAGGGATGGTGAAGCTCACAGAGCATTGTCAGATGTATTACTTTTATCTCAGGTGT
TTCAGAGACTAACCATTGATCTCAAGCTCTCGCTATCTGATCTTGTCCTCCGCTCTCACA
CCACGTCCGACCTTATTGCTGCCATGGCAAAGAACAAGAAGGCATGAAAGATTTTTAGAA
ACATTGGTCTCTTATTAGCAGGGTTTCTTTTCTCATTATTGATCTCTGATTCTATTGTTT
CTCTATATAGTGTATGTAACTCCGGAAAAAATCTCAAGTCATGTAACCTATTGTTTAATT
TATCTTGGGATAAATTAAGCG

QA 1 801 1 801
DS 



AS 1 2

CO CL4840Contig1 812 2 4 U
GGATCGTTGATTCCGAAGTAAACACAGACTCGAAAGTAGTAGAGATGGAAGTCGAAGCTG
CGGAGAAACGCGAGAGAGAGAAGACGGAGGAGGAAACAGAGGGCGGAGGCGAGTCGAAGA
AGCAGAAGGTGGGAGATGAAGAGAAGTCTAACGGGTCGGATCCGGTTAAACTGGGTCCGA
AGGAGTTTGTTACTTCCGTGGCTATGTTCGATTACTTCACCAAGTTTATGCACTTTTGGC
CAACTGATCTCGATGTCAATAAGTATGAGCATACGGTGTTACTAGATCTGATCAAGAAGG
GACATTCTGAGCCTGACGCGAAGATTGGGGGAGGGATCAAACCCTTCCAAGTGAGAACCC
ACCCGATGTGGAAAAGCAGGTGCTTCTTTCTTGTTAGGGAAGACGACTCTGCCGACGATT
TCAGCTACAGGAAGTGTGTAGATCACATCCTCCCGTTGCCTGAAAACATGAAGACTCCTG
GTCATAACGGCAATGGACATGGTTGTGGTGGAAGAAGAGGCGGGCGTGGTGGTGGTGGTA
GAGGTGGGAGATTCAGAAGATGATTTTGCTTTCTGTTTCTTTCTTGCTGGCCTTGCCGAT
TGAAATTTTGGAATTTTTCATGTCGGTTGCTAAAAACTTATTTAAGTTTTGAGGAATGCT
ACTATTGTTTTGTCGGAGAGGAATCATCAGTTTATAATAATACTGCTTGAAAGAAGCAGT
AGCAGCTTGTCTCTATGTTCATAACAACCTCAGAGGTTTAGTATGTTAAGACAATTATGT
TTAAAATGCACATGTTAGACACAATGTTTTGC


BQ
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AF RS1B664TF U 1
AF RS1B664JQ C 338
BS 1 341 RS1B664TF
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BS 524 812 RS1B664JQ

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GGATCGTTGATTCCGAAGTAAACACAGACTCGAAAGTAGTAGAGATGGAAGTCGAAGCTG
CGGAGAAACGCGAGAGAGAGAAGACGGAGGAGGAAACAGAGGGCGGAGGCGAGTCGAAGA
AGCAGAAGGTGGGAGATGAAGAGAAGTCTAACGGGTCGGATCCGGTTAAACTGGGTCCGA
AGGAGTTTGTTACTTCCGTGGCTATGTTCGATTACTTCACCAAGTTTATGCACTTTTGGC
CAACTGATCTCGATGTCAATAAGTATGAGCATACGGTGTTACTAGATCTGATCAAGAAGG
GACATTCTGAGCCTGACGCGAAGATTGGGGGAGGGATCAAAGCCTTCCAAGTGAGAACCC
ACCCGATGTGGAAAAGCAGGTGCTTCTTTCTTGTTAGGGAAGACGACTCTGCCGACGATT
TCAGCTACAGGAAGTGTGTAGATCACATCCTCCCGTTGCCTGAAAACATGAAGACTCCTG
GTCATAACGGCAATGGACATGGTTGTGGTGGAAGAAGAGGCGG

QA 1 523 1 523
DS 

RD RS1B664JQ 475 0 0
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GGAAGACGACTCTGCCGACGATTTCAGCTACAGGAAGTGTGTAGATCACATCCTCCCGTT
GCCTGAAAACATGAAGACTCCTGGTCATAACGGCAATGGACATGGTTGTGGTGGAAGAAG
AGGCGGGCGTGGTGGTGGTGGTAGAGGTGGGAGATTCAGAAGATGATTTTGCTTTCTGTT
TCTTTCTTGCTGGCCTTGCCGATTGAAATTTTGGAATTTTTCATGTCGGTTGCTAAAAAC
TTATTTAAGTTTTGAGGAATGCTACTATTGTTTTGTCGGAGAGGAATCATCAGTTTATAA
TAATACTGCTTGAAAGAAGCAGTAGCAGCTTGTCTCTATGTTCATAACAACCTCAGAGGT
TTAGTATGTTAAGACAATTATGTTTAAAATGCACATGTTAGACACAATGTTTTGC

QA 1 475 1 475
DS 



AS 1 2

CO CL4841Contig1 1321 2 4 U
GGAACTTCATTGGTAGGTACATCTCTGAAAACTATAATTTCAATCCAAACCCAGAAGACC
ACTGATCACTTCATCCATGGAGATCATCTCAAACACCATAAAGTTTCTTCCTTTATCAAT
CATTACTATTCTGTTCTTCATCTTCTTCCTCTGTTTTTTTCTCGCCATGGCTAGTGATGA
AGATGACATAAAATGCCTACGAGGAAATCAGACTTCTCTTTCCGACTATTAGAGATTTCT
CAAATCATGAAATTTCACAAACACAACTCTCGGGTTCCTATGAAAATTTGCCGGCCCGTC
TTGTTGGAGATTAGAGCCTTGTTTATGTCCTTCCACCATGAGATCTATGGATGTAAGAAT
TCAAGAACAACAAAGAGTGATGATAATAATTGGAGAGCAAATATAACAGCAACCATGAGG
ACAAATGCTATGCATATGGGATTTTGATGCTATGCATATGGAATCAGCATCTTTGTGGAT
TTACTCGAATATGGTTCTCTTCTTCAAATGGTGTTGTGTTGTTTACGCCGTTTAGGTAAA
AATTCGATTTTGAGTCTGGAGAAGGAAGAAAATGTGGTAGTGTTGAATTAAAATATTTAC
TTTTATATTTGGATCTAAGAGCATTTGTTTCGTAACTTCTTCTGCAAATTTAGTTTAGGT
ACTTATTATGATTTTGAAAGTTGATGTTGTTGTTAATCATGTTCTATCTTGAACTTGAGC
ACAAGTTGTTATTTAGGTTACTAGTGGATACAATCAATCAAGGTTTTCGTGATGCCAGTG
GCAAATTCAACAAGCTGACAGTGGGATCCAGAATACTAACAACTCTACGAAAAAAACTTG
GATCTAAAAATACACGCTGTCAGTATGAAAATAGGATGAAAATCTTGAAGGGTAGGTACC
AAGGCTTTGCAGATTTTTTTCATTGTAGTTCTGGTTTTGGGTGGGTCTTTGAAACGAAAC
AAATTCACAGCAGACGATGAAGTATGGAATGTCTATTTACAGTGATCATATGTTCAGAAT
TATTTTCGTAAAGAATGTCGTTCAGACATGTTTCCTGAAGAAATTGTTGTCGCTAATGGT
ACTCAAGAAGTATGTGAAGATGAGAACATGTATGGTGTTGTTGAGAATTCAAGAACAACA
AAGAGTGATACTAATAATTGGAGAGCAAATATAACAGCAACCATGAGGACAGATGCTATG
CATATGGGATCTTGATGCAACAACAATCTATTTTGTTTTTAGAAGTTCTCTTTTCCGTTA
TGTTTTAAATTTATATTTCATGTTTTTTTGAATTTGATTTTTTGATAAACAATTTTGATC
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RS1F483TF U 1
AF RS1F483JQ C 546
BS 1 658 RS1F483TF
BS 659 659 RS1F483JQ
BS 660 732 RS1F483TF
BS 733 1321 RS1F483JQ

RD RS1F483TF 732 0 0
GGAACTTCATTGGTAGGTACATCTCTGAAAACTATAATTTCAATCCAAACCCAGAAGACC
ACTGATCACTTCATCCATGGAGATCATCTCAAACACCATAAAGTTTCTTCCTTTATCAAT
CATTACTATTCTGTTCTTCATCTTCTTCCTCTGTTTTTTTCTCGCCATGGCTAGTGATGA
AGATGACATAAAATGCCTACGAGGAAATCAGACTTCTCTTTCCGACTATTAGAGATTTCT
CAAATCATGAAATTTCACAAACACAACTCTCGGGTTCCTATGAAAATTTGCCGGCCCGTC
TTGTTGGAGATTAGAGCCTTGTTTATGTCCTTCCACCATGAGATCTATGGATGTAAGAAT
TCAAGAACAACAAAGAGTGATGATAATAATTGGAGAGCAAATATAACAGCAACCATGAGG
ACAAATGCTATGCATATGGGATTTTGATGCTATGCATATGGAATCAGCATCTTTGTGGAT
TTACTCGAATATGGTTCTCTTCTTCAAATGGTGTTGTGTTGTTTACGCCGTTTAGGTAAA
AATTCGATTTTGAGTCTGGAGAAGGAAGAAAATGTGGTAGTGTTGAATTAAAATATTTAC
TTTTATATTTGGATCTAAGAGCATTTGTTTCGTAACTTCTTCTGCAAATTTAGTTTAG*T
ACTTATTATGATTTTGAAAGTTGATGTTGTTGTTAATCATGTTCTATCTTGAACTTGAGC
ACAAGTTGTTAT

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1F483JQ 776 0 0
GATTTTGAGTCTGGAGAAGGAAGAAAATGTGGTAGTGTTGAATTAAAATATTTACTTTTA
TATTTGGATCTAAGAGCATTTGTTTCGTAACTTCTTCTGCAAATTTAGTTTAGGTACTTA
TTATGATTTTGAAAGTTGATGTTGTTGTTAATCATGTTCTATCTTGAACTTGAGCACAAG
TTGTTATTTAGGTTACTAGTGGATACAATCAATCAAGGTTTTCGTGATGCCAGTGGCAAA
TTCAACAAGCTGACAGTGGGATCCAGAATACTAACAACTCTACGAAAAAAACTTGGATCT
AAAAATACACGCTGTCAGTATGAAAATAGGATGAAAATCTTGAAGGGTAGGTACCAAGGC
TTTGCAGATTTTTTTCATTGTAGTTCTGGTTTTGGGTGGGTCTTTGAAACGAAACAAATT
CACAGCAGACGATGAAGTATGGAATGTCTATTTACAGTGATCATATGTTCAGAATTATTT
TCGTAAAGAATGTCGTTCAGACATGTTTCCTGAAGAAATTGTTGTCGCTAATGGTACTCA
AGAAGTATGTGAAGATGAGAACATGTATGGTGTTGTTGAGAATTCAAGAACAACAAAGAG
TGATACTAATAATTGGAGAGCAAATATAACAGCAACCATGAGGACAGATGCTATGCATAT
GGGATCTTGATGCAACAACAATCTATTTTGTTTTTAGAAGTTCTCTTTTCCGTTATGTTT
TAAATTTATATTTCATGTTTTTTTGAATTTGATTTTTTGATAAACAATTTTGATCG

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

CO CL4842Contig1 136 2 1 U
GATAATCGTTTTGTTTGTTTCGCGCAAATGTAGACAGTAATGTGCTTATTTTGAGTCATT
TTATCTTTCCTTTGCTAGACACTTGTACCCTCTTGTTTCGATGGTTAAAGCATCATAATC
AATTTTCTAAATCAAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FT09JQ C 1
AF RS1FT09TF U 1
BS 1 136 RS1FT09TF

RD RS1FT09JQ 136 0 0
GATAATCGTTTTGTTTGTTTCGCGCAAATGTAGACAGTAATGTGCTTATTTTGAGTCATT
TTATCTTTCCTTTGCTAGACACTTGTACCCTCTTGTTTCGATGGTTAAAGCATCATAATC
AATTTTCTAAATCAAT

QA 1 136 1 136
DS 

RD RS1FT09TF 136 0 0
GATAATCGTTTTGTTTGTTTCGCGCAAATGTAGACAGTAATGTGCTTATTTTGAGTCATT
TTATCTTTCCTTTGCTAGACACTTGTACCCTCTTGTTTCGATGGTTAAAGCATCATAATC
AATTTTCTAAATCAAT

QA 1 136 1 136
DS 



AS 1 2

CO CL4843Contig1 1010 2 4 U
GAGGAAGAGGACCTCTTGTGAGGGCATCGTTGCAGGCAGCTGAAGAAACCAATCGCAAGT
TGAAAGTTTATGCTGTCGAGAAGAATCCTAATGCAGTTGTAACGCTCCATAACTTGGTTA
AGCTGGAAGGCTGGGAAGGCATCGTTACGATAATATCATGCGACATGCGTTTTTGGAATG
CTTCTGAGAAAGCTGATATATGGTTAGCGAACTGCTCGGTTCTTTTGGAGACAATGAACT
CTCTCCTGAGTGTCTTGATGGAGCCCAAAGGTTTCTGAAGTCAGATGGAATTTCAATACC
ATCCTCGTATACAAGTTTCATACAACCTGTAACAGCTTCGAAGCTTTACAATGACGTTAA
GGCTCATAAAGACCTTGCGCACTTTGAAACTCCTTATGTCGTAAAACTGCACAGTGTAGC
TAGACTTGCTCCTTCCCAATCTGTCTTCACCTTTACTCATCCAAATTTCTCAACAAAAGC
CAACAACCAACGCTACAAAAAGCTTAGTTTCAATCTACCAAGCGACGCTGGATCAGCCTT
GGTGCATGGATTCGCTGGCTATTTTGATTCCGTCCTGTATAAAGATGTACATCTCGGGAT
CGAACCTACAACAGCAACACCAAACATGTTCAGCTGGTTCCCGATCTTTTTCCCACTGAG
GAAGCCTGTAGAAGTTCACCCAGGTTCTCCACTAGAAGTACACTTTTGGAGGTGTTGTGG
TTCCTCGAAAGTTTGGTATGAATGGTCTGTGTCTTCACCTACTCCAACTCCGATGCACAA
CACCAATGGCCGTTCCTACTGGGTCGGCCTTTAGGATCAGAGGGTAACTGAGAAGAGTCA
TGGGACTGATGATGAAGTTATGTGCTTTCGCTGTGCTGTATTTTTATGTCGAGCAAAAGA
CAAAAGTTTATAAGTGAACCAAATCTGTTTTGACCTTATGAATGTTTTTACTTCATCAGT
AATAGCTTTACCTCTGCACTTTTAATACAGAGCTGTTTACCCACGTATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AO81TFB U 1
AF RS1AO81JQ C 462
BS 1 814 RS1AO81TFB
BS 815 815 RS1AO81JQ
BS 816 845 RS1AO81TFB
BS 846 1010 RS1AO81JQ

RD RS1AO81TFB 845 0 0
GAGGAAGAGGACCTCTTGTGAGGGCATCGTTGCAGGCAGCTGAAGAAACCAATCGCAAGT
TGAAAGTTTATGCTGTCGAGAAGAATCCTAATGCAGTTGTAACGCTCCATAACTTGGTTA
AGCTGGAAGGCTGGGAAGGCATCGTTACGATAATATCATGCGACATGCGTTTTTGGAATG
CTTCTGAGAAAGCTGATATATGGTTAGCGAACTGCTCGGTTCTTTTGGAGACAATGAACT
CTCTCCTGAGTGTCTTGATGGAGCCCAAAGGTTTCTGAAGTCAGATGGAATTTCAATACC
ATCCTCGTATACAAGTTTCATACAACCTGTAACAGCTTCGAAGCTTTACAATGACGTTAA
GGCTCATAAAGACCTTGCGCACTTTGAAACTCCTTATGTCGTAAAACTGCACAGTGTAGC
TAGACTTGCTCCTTCCCAATCTGTCTTCACCTTTACTCATCCAAATTTCTCAACAAAAGC
CAACAACCAACGCTACAAAAAGCTTAGTTTCAATCTACCAAGCGACGCTGGATCAGCCTT
GGTGCATGGATTCGCTGGCTATTTTGATTCCGTCCTGTATAAAGATGTACATCTCGGGAT
CGAACCTACAACAGCAACACCAAACATGTTCAGCTGGTTCCCGATCTTTTTCCCACTGAG
GAAGCCTGTAGAAGTTCACCCAGGTTCTCCACTAGAAGTACACTTTTGGAGGTGTTGTGG
TTCCTCGAAAGTTTGGTATGAATGGTCTGTGTCTTCACCTACTCCAACTCCGATGCACAA
CACCAATGGCCGTTCCTACTGGGTCGGCCTTTAG*ATCAGAGGGTAACTGAGAAGAGTCA
TGGGA

QA 1 845 1 845
DS 

RD RS1AO81JQ 549 0 0
CAAATTTCTCAACAAAAGCCAACAACCAACGCTACAAAAAGCTTAGTTTCAATCTACCAA
GCGACGCTGGATCAGCCTTGGTGCATGGATTCGCTGGCTATTTTGATTCCGTCCTGTATA
AAGATGTACATCTCGGGATCGAACCTACAACAGCAACACCAAACATGTTCAGCTGGTTCC
CGATCTTTTTCCCACTGAGGAAGCCTGTAGAAGTTCACCCAGGTTCTCCACTAGAAGTAC
ACTTTTGGAGGTGTTGTGGTTCCTCGAAGGTTTGGTATGAATGGTCTGTGTCTTCACCTA
CTCCAACTCCGATGCACAACACCAATGGCCGTTCCTACTGGGTCGGCCTTTAGGATCAGA
GGGTAACTGAGAAGAGTCATGGGACTGATGATGAAGTTATGTGCTTTCGCTGTGCTGTAT
TTTTATGTCGAGCAAAAGACAAAAGTTTATAAGTGAACCAAATCTGTTTTGACCTTATGA
ATGTTTTTACTTCATCAGTAATAGCTTTACCTCTGCACTTTTAATACAGAGCTGTTTACC
CACGTATGT

QA 1 549 1 549
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4845Contig1 928 2 2 U
GGGAATCGGTCGGAGAGAGAAAAAAAGAGAGATGGGAGGGAAAGGTAAGAAGAGGAGAGA
GAAAAACTATTTGGCAGCTCACGGCGGACCGGCGAGACTCCCGCCGCCGCCTGATCGTTC
CAAGCAAGATGCACTTCCTTCCAAGCTCCGTGTTCTCATGAACTACACCTCTCCGCCTCC
TCCTCAAGATTCTACTAAACAACAAGTTGTTGTAGAGAAGAAAGAAAAAATTCTAAAGCT
GGAGTAGTAGTTGGTGCTGCCAAGAATGTCAAGTCTGGGGGTGAAGCAAAGTCGGAAACA
AAGGCGGTTGGAGAAGGAAAATCTGAGGGATACACAACCTCTTCTGATCATGAGAATGAT
GGAGACGATATAAAGTTGAACAACAAGGGGGGAGATGAAAAGAAGAAGAAAAAGAGAAAG
AGGAGTGAGATCAAGGACCTTCGTTTCGAACAGGAACTTGCAGAGTTGGATGGTCGGTCC
AAAAGGAAAGAACGCAAGAAGAAGTATTGGGAGGCAAAGAAGCAAAAGAAGAATAAAGGA
AAAACAGAAGATACACTCAGAGAAAACTTCCCCAAGCATGAGCAGATCAGATTTGGTGAT
GTCGTTCAAGCTCCACCGAAGCTTGCTGTTGTTCCAAAGGCACGAAAGACTCCTATGAGT
GCTTCCAAGGAGAGATTGAGATTAGAGGCCATTGAAGCTTACAGATCTCGCAATGGATGG
ACCTCAAGACCAGGTGTTCAGATTCCTACCGTCACCATGCAATGAGATTTTTGTTGGGTC
ATGAACTCAGTTTTGTGTACTAGCTAGCTGGCTGTTAAACTAGTTTGTGATTCTAACGTT
GTGATAGTTTGAATTATCCAGACATCTCTTCCAAAATGTAAAAGTGGATTATTTATTTCA
GTACCAATGAAATCTTTTTTGGTGTTTG


BQ
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AF RS1GV48TF U 1
AF RS1GV48JQ C 450
BS 1 632 RS1GV48TF
BS 633 928 RS1GV48JQ

RD RS1GV48TF 632 0 0
GGGAATCGGTCGGAGAGAGAAAAAAAGAGAGATGGGAGGGAAAGGTAAGAAGAGGAGAGA
GAAAAACTATTTGGCAGCTCACGGCGGACCGGCGAGACTCCCGCCGCCGCCTGATCGTTC
CAAGCAAGATGCACTTCCTTCCAAGCTCCGTGTTCTCATGAACTACACCTCTCCGCCTCC
TCCTCAAGATTCTACTAAACAACAAGTTGTTGTAGAGAAGAAAGAAAAAATTCTAAAGCT
GGAGTAGTAGTTGGTGCTGCCAAGAATGTCAAGTCTGGGGGTGAAGCAAAGTCGGAAACA
AAGGCGGTTGGAGAAGGAAAATCTGAGGGATACACAACCTCTTCTGATCATGAGAATGAT
GGAGACGATATAAAGTTGAACAACAAGGGGGGAGATGAAAAGAAGAAGAAAAAGAGAAAG
AGGAGTGAGATCAAGGACCTTCGTTTCGAACAGGAACTTGCAGAGTTGGATGGTCGGTCC
AAAAGGAAAGAACGCAAGAAGAAGTATTGGGAGGCAAAGAAGCAAAAGAAGAATAAAGGA
AAAACAGAAGATACACTCAGAGAAAACTTCCCCAAGCATGAGCAGATCAGATTTGGTGAT
GTCGTTCAAGCTCCACCGAAGCTTGCTGTTGT

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1GV48JQ 479 0 0
ACAGGAACTTGCAGAGTTGGATGGTCGGTCCAAAAGGAAAGAACGCAAGAAGAAGTATTG
GGAGGCAAAGAAGCAAAAGAAGAATAAAGGAAAAACAGAAGATACACTCAGAGAAAACTT
CCCCAAGCATGAGCAGATCAGATTTGGTGATGTCGTTCAAGCTCCACCGAAGCTTGCTGT
TGTTCCAAAGGCACGAAAGACTCCTATGAGTGCTTCCAAGGAGAGATTGAGATTAGAGGC
CATTGAAGCTTACAGATCTCGCAATGGATGGACCTCAAGACCAGGTGTTCAGATTCCTAC
CGTCACCATGCAATGAGATTTTTGTTGGGTCATGAACTCAGTTTTGTGTACTAGCTAGCT
GGCTGTTAAACTAGTTTGTGATTCTAACGTTGTGATAGTTTGAATTATCCAGACATCTCT
TCCAAAATGTAAAAGTGGATTATTTATTTCAGTACCAATGAAATCTTTTTTGGTGTTTG

QA 1 479 1 479
DS 



AS 1 2

CO CL4846Contig1 1050 2 2 U
GGAGACCATTCACGGCCAATCCTCGCTCTCTCTCACTCCATCGTCGAAGCCAGTGTTCCG
ACTCCGAGTAGCGTAAACCCCAGCGACTGCATCAATGGTCTAGATTCAACTGGATCATCT
CGTGGTTTTATCAGAGGGAGGTGACACTTTGTTGAGAGGGTGAATATTTTGTAAGAAGAC
AAAATCAACATCAAATGGATTTAGACTTCGATGATGAACCTGCTGCACCTGCAGCTAGGG
CTGGTGCAAGGTTTAAGCCGAAAGGGAGACCACAACCCAAGAAGAAGCAAGTCTCTGTCT
CAACCTCACAACAGACAACAACACTCTCTTCTGATGCTGCCAAGGAGACACTCTCCACAC
AAAGTAAAGATGCATCATCATCATCAACTTATCCCAGCAATGTATCAACTTCTGAGACTA
TTGTTATCCCTGATGGTGGAACCATTAGCCAATCCACCATGGGAACTATATCTAAAGAAA
ACTTAGATGAATTCTCAGGAGTTTCTGTTCTTCGTGCTTGTACTAAGGTAAATTCGGAGG
GAAAAAGATGCGAGGATGGCACAGAGGCGGCGGCACCTGCATGTCCTGATGACCCTAGAA
GACAAGATTCTGCAACGTTTGGAGATTTTGTTACTCATGAAACGGATGAAGTTATTAATG
CTGAAACTCAAAGGATGCAAACAGGGGAAGAAGGAGAAGAATGTCATTGGAACATGGAAA
CTCTTGATATTGTACAAGAGGAAGGCATCACCAGTACTTATGAGCAACATACTGGAAAGT
TCCAACCAAAGCCTAGATTGCTCGACACTGTGATTGAAGAAGAACCAGAGTCTCATTACT
CTGTTGATGATACAATGGATGCTGCTAATCAGTCTGAGTTTATGGTCAATGAGGAATCAA
GAAACACCGATCCTACATGTCATGGAGATCATCAAGAAGAAGAACATAATATTCCTGAAG
TCCCAAGAGAAACGGCTCCTGGCGTATTGGAACAAGAACATCATGTTGTCTCACCTAGTA
ATAACGATTCTGTTATGGGAGAAGGAGAAC


BQ
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AF RS1AO37TFB U 1
AF RS1AO37JQ C 286
BS 1 763 RS1AO37TFB
BS 764 1050 RS1AO37JQ

RD RS1AO37TFB 763 0 0
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ACTCCGAGTAGCGTAAACCCCAGCGACTGCATCAATGGTCTAGATTCAACTGGATCATCT
CGTGGTTTTATCAGAGGGAGGTGACACTTTGTTGAGAGGGTGAATATTTTGTAAGAAGAC
AAAATCAACATCAAATGGATTTAGACTTCGATGATGAACCTGCTGCACCTGCAGCTAGGG
CTGGTGCAAGGTTTAAGCCGAAAGGGAGACCACAACCCAAGAAGAAGCAAGTCTCTGTCT
CAACCTCACAACAGACAACAACACTCTCTTCTGATGCTGCCAAGGAGACACTCTCCACAC
AAAGTAAAGATGCATCATCATCATCAACTTATCCCAGCAATGTATCAACTTCTGAGACTA
TTGTTATCCCTGATGGTGGAACCATTAGCCAATCCACCATGGGAACTATATCTAAAGAAA
ACTTAGATGAATTCTCAGGAGTTTCTGTTCTTCGTGCTTGTACTAAGGTAAATTCGGAGG
GAAAAAGATGCGAGGATGGCACAGAGGCGGCGGCACCTGCATGTCCTGATGACCCTAGAA
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CTGAAACTCAAAGGATGCAAACAGGGGAAGAAGGAGAAGAATGTCATTGGAACATGGAAA
CTCTTGATATTGTACAAGAGGAAGGCATCACCAGTACTTATGA

QA 1 763 1 763
DS 

RD RS1AO37JQ 765 0 0
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AGACACTCTCCACACAAAGTAAAGATGCATCATCATCATCAACTTATCCCAGCAATGTAT
CAACTTCTGAGACTATTGTTATCCCTGATGGTGGAACCATTAGCCAATCCACCATGGGAA
CTATATCTAAAGAAAACTTAGATGAATTCTCAGGAGTTTCTGTTCTTCGTGCTTGTACTA
AGGTAAATTCGGAGGGAAAAAGATGCGAGGATGGCACAGAGGCGGCGGCACCTGCATGTC
CTGATGACCCTAGAAGACAAGATTCTGCAACGTTTGGAGATTTTGTTACTCATGAAACGG
ATGAAGTTATTAATGCTGAAACTCAAAGGATGCAAACAGGGGAAGAAGGAGAAGAATGTC
ATTGGAACATGGAAACTCTTGATATTGTACAAGAGGAAGGCATCACCAGTACTTATGAGC
AACATACTGGAAAGTTCCAACCAAAGCCTAGATTGCTCGACACTGTGATTGAAGAAGAAC
CAGAGTCTCATTACTCTGTTGATGATACAATGGATGCTGCTAATCAGTCTGAGTTTATGG
TCAATGAGGAATCAAGAAACACCGATCCTACATGTCATGGAGATCATCAAGAAGAAGAAC
ATAATATTCCTGAAGTCCCAAGAGAAACGGCTCCTGGCGTATTGGAACAAGAACATCATG
TTGTCTCACCTAGTAATAACGATTCTGTTATGGGAGAAGGAGAAC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL4847Contig1 1018 2 2 U
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GTGTCCTCTGAAATTTACTTAGTTTTTTTGTCTTTTTTTTTTGTGCGGGAGATGGTTCAT
TGAATCTAGATGGTAGAATATTCATAGGAATTGGCTTCATATAGAGGGGTTCTCTAGGTT
CCTCAGGTATACATCTGAGGTCGATTAATTCCTTTTGTGTGTGTGTGTATTTGTATCGGC
AATGAGCGCATCAAGGTTCATAAAGTGTGTCACCGTTGGAGATGGAGCTGTTGGCAAAAC
ATGTTTGCTCATTTCTTACACCAGCAACACCTTTCCCACGGACTATGTCCCCACTGTTTT
CGATAACTTTAGTGCCAATGTGGTTGTTAATGGAGCCACGGTCAATCTTGGATTGTGGGA
TACTGCAGGGCAGGAGGACTATAACAGATTAAGACCATTGAGTTACCGTGGTGCTGATGT
TTTCATTCTAGCCTTCTCTCTCATTAGTAAGGCTAGTTATGAGAATGTCTCCAAGAAGTG
GATCCCTGAGTTGCAGCATTATGCTCCTGGTGTCCCCATCGTCCTTGTTGGTACCAAACT
AGATTTTCGGGATGACAAGCAGTTTTTCGTAGACCATCCTGGTGCTGTCCCTATTACCAC
AGCTCAGGGGGAGGAACTGAAGAAGCTAATTGAAGCGCCTGCTTACATTGAATGCAGTTC
AAAATCACAAGAGAACGTGAAGGGAGTTTTCGATGCAGCGATCAGAGTGGTCCTTCAACC
TCCAAAGCAGAAGAAAAAGAAGAGCAAGGCGCAAAAAGCTTGCTCCATTTTGTAATAGCT
TTCATGGGAGAGAGAGGCTAAGAAGCTCTTTGATGACAGAGGTCTCTCGTTACATTAAGT
ATTTGCTTTTTTTTTTGTTTTCTTCACTCTTTTCTTCGTTATTGCTGTCTCTTATAAAAA
TCGAATTATGGGTTTAATTCAACTTACTCATGGTTGAGACATCTATAAATTTTGGACT


BQ
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AF RS1GI78TF U 1
AF RS1GI78JQ C 339
BS 1 521 RS1GI78TF
BS 522 1018 RS1GI78JQ

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GTGTCCTCTGAAATTTACTTAGTTTTTTTGTCTTTTTTTTTTGTGCGGGAGATGGTTCAT
TGAATCTAGATGGTAGAATATTCATAGGAATTGGCTTCATATAGAGGGGTTCTCTAGGTT
CCTCAGGTATACATCTGAGGTCGATTAATTCCTTTTGTGTGTGTGTGTATTTGTATCGGC
AATGAGCGCATCAAGGTTCATAAAGTGTGTCACCGTTGGAGATGGAGCTGTTGGCAAAAC
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TACTGCAGGGCAGGAGGACTATAACAGATTAAGACCATTGAGTTACCGTGGTGCTGATGT
TTTCATTCTAGCCTTCTCTCTCATTAGTAAGGCTAGTTATG

QA 1 521 1 521
DS 

RD RS1GI78JQ 680 0 0
CGGACTATGTCCCCACTGTTTTCGATAACTTTAGTGCCAATGTGGTTGTTAATGGAGCCA
CGGTCAATCTTGGATTGTGGGATACTGCAGGGCAGGAGGACTATAACAGATTAAGACCAT
TGAGTTACCGTGGTGCTGATGTTTTCATTCTAGCCTTCTCTCTCATTAGTAAGGCTAGTT
ATGAGAATGTCTCCAAGAAGTGGATCCCTGAGTTGCAGCATTATGCTCCTGGTGTCCCCA
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CTGCTTACATTGAATGCAGTTCAAAATCACAAGAGAACGTGAAGGGAGTTTTCGATGCAG
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GAGGTCTCTCGTTACATTAAGTATTTGCTTTTTTTTTTGTTTTCTTCACTCTTTTCTTCG
TTATTGCTGTCTCTTATAAAAATCGAATTATGGGTTTAATTCAACTTACTCATGGTTGAG
ACATCTATAAATTTTGGACT

QA 1 680 1 680
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4849Contig1 483 2 2 U
GGAGGGTTTGTGACTCTTCGCTTATCGCCGCTAAGCTCTGTCGCCTCCGTGAAACCGTCG
TTTCTTCAGGTTTGTTCCTCAATGGATTCTCAGATTAAGCACGCCGTGGTGGTGAAAGTG
ATGGGCCGTACTGGGTCCAGGGGTCAGGTGACTCAGGTTCGAGTCAAGTTCACAGACTCT
GATCGTTACATTATGAGAAACGTCAAGGGGCCAGTGAGAGAAGGCTACATCCTCACCTTG
CTCGAGTCTGAGAGAGAAGCCAGGAGACTTCGTTGATTGGCCTTTTTCTTACCGCAAGTT
GGGAAACGAGAAAACAGAACAATGTCTACTTATTTCTCTTTTTTTGGTTTCTCTGACCGG
TTTAGTTTGGTTTGTTGCTTTAAGACAGTTGCTGGATTGATATGGTTATTTGGTATTCAA
AGCCTCTTCTTTATCTGTTTGTTTCAAACGTTTCTCTGGTTGTGTTCTTAACTTGTTTAA
CCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 

AF RS1D003TF U 1
AF RS1D003JQ C 1
BS 1 480 RS1D003TF
BS 481 483 RS1D003JQ

RD RS1D003TF 483 0 0
GGAGGGTTTGTGACTCTTCGCTTATCGCCGCTAAGCTCTGTCGCCTCCGTGAAACCGTCG
TTTCTTCAGGTTTGTTCCTCAATGGATTCTCAGATTAAGCACGCCGTGGTGGTGAAAGTG
ATGGGCCGTACTGGGTCCAGGGGTCAGGTGACTCAGGTTCGAGTCAAGTTCACAGACTCT
GATCGTTACATTATGAGAAACGTCAAGGGGCCAGTGAGAGAAGGCTACATCCTCACCTTG
CTCGAGTCTGAGAGAGAAGCCAGGAGACTTCGTTGATTGGCCTTTTTCTTACCGCAAGTT
GGGAAACGAGAAAACAGAACAATGTCTACTTATTTCTCTTTTTTTGGTTTCTCTGACCGG
TTTAGTTTGGTTTGTTGCTTTAAGACAGTTGCTGGATTGATATGGTTATTTGGTATTCAA
AGCCTCTTCTTTATCTGTTTGTTTCAAACGTTTCTCTGGTTGTGTTCTTAACTTGTTTAA
GCC

QA 1 480 1 480
DS 

RD RS1D003JQ 483 0 0
GGAGGGTTTGTGACTCTTCGCTTATCGCCGCTAAGCTCTGTCGCCTCCGTGAAACCGTCG
TTTCTTCAGGTTTGTTCCTCAATGGATTCTCAGATTAAGCACGCCGTGGTGGTGAAAGTG
ATGGGCCGTACTGGGTCCAGGGGTCAGGTGACTCAGGTTCGAGTCAAGTTCACAGACTCT
GATCGTTACATTATGAGAAACGTCAAGGGGCCAGTGAGAGAAGGCTACATCCTCACCTTG
CTCGAGTCTGAGAGAGAAGCCAGGAGACTTCGTTGATTGGCCTTTTTCTTACCGCAAGTT
GGGAAACGAGAAAACAGAACAATGTCTACTTATTTCTCTTTTTTTGGTTTCTCTGACCGG
TTTAGTTTGGTTTGTTGCTTTAAGACAGTTGCTGGATTGATATGGTTATTTGGTATTCAA
AGCCTCTTCTTTATCTGTTTGTTTCAAACGTTTCTCTGGTTGTGTTCTTAACTTGTTTAA
CCC

QA 1 483 1 483
DS 



AS 1 2

CO CL4850Contig1 509 2 2 U
CCTCAACAACTTGTCTGTCATTACAATATAATAACAAGAGTGGGTGTAAGAATCACAAAA
AAATCCAGAAAATTGATGATAACATATGACAAAAGCTTTGGGAGTTTCGTGGGAAACTTA
GGACCAAACAAAACAACACACGTGTTGTTGTAAAGAAGAATCAAAATGTACAGAGAGAGA
GAGAGAGAGAGAGAGAGTTTATCATTTGCGGATGGAAAGAAGCTCGAAGCTTCTGAGTGC
CTCGTCACGTGCAGTCCTCGAAGCAAACACTCTGTTACGGTTGAAGGCAGATGCAGTCTT
TGACTCGTATCCGGTCACACCAGCTGCAGCTGGCGCTTGTGTTCTCTGAAAGACTGATGG
TCTGCCAACTCCTCCTCCGCTTGAGGCCACACGGCTCGAGCCGCGGCTCTCTCCTTGTTC
CCCTGATGAGCTCGGTCTACTTCCAGAGGCTACTGCTCTCCTTGAAGCACTTCCGTATCT
TGAAGTGTTTCTTCCTTTCTCAAATACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CU13TF C 1
AF RS1CU13JQ U 14
BS 1 13 RS1CU13TF
BS 14 509 RS1CU13JQ

RD RS1CU13TF 509 0 0
CCTCAACAACTTGTCTGTCATTACAATATAATAACAAGAGTGTGTGTAAGAATCACAAAA
AAATCCAGAGAATTGATGATAACATATGACAAAAGCTTTGGGAGTTTCGTGGGAAACTTA
GGACCAAACAAAACAACACACGTGTTGTTGTAAAGAAGAATCAAAATGTACAGAGAGAGA
GAGAGAGAGAGAGAGAGTTTATCATTTGCGGATGGAAAGAAGCTCGAAGCTTCTGAGTGC
CTCGTCACGTGCAGTCCTCGAAGCAGACACTCTGTTACGGTTGAAGGCAGATGCAGTCTT
TGACTCGTATCCGGTCACACCAGCTGCAGCTGGCGCTTGTGTTCTCTGAAAGACTGATGG
TCTGCCAACTCCTCCTCCGCTTGAGGCCACACGGCTCGAGCCGCGGCTCTCTCCTTGTTC
CCCTGATGAGCTCGGTCTACTTCCAGAGGCTACTGCTCTCCTTGAAGCACTTCCGTATCT
TGAAGTGTTTCTTCCTTTCTCAGATACCC

QA 1 509 1 509
DS 

RD RS1CU13JQ 496 0 0
TCTGTCATTACAATATAATAACAAGAGTGGGTGTAAGAATCACAAAAAAATCCAGAAAAT
TGATGATAACATATGACAAAAGCTTTGGGAGTTTCGTGGGAAACTTAGGACCAAACAAAA
CAACACACGTGTTGTTGTAAAGAAGAATCAAAATGTACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG
AGAGTTTATCATTTGCGGATGGAAAGAAGCTCGAAGCTTCTGAGTGCCTCGTCACGTGCA
GTCCTCGAAGCAAACACTCTGTTACGGTTGAAGGCAGATGCAGTCTTTGACTCGTATCCG
GTCACACCAGCTGCAGCTGGCGCTTGTGTTCTCTGAAAGACTGATGGTCTGCCAACTCCT
CCTCCGCTTGAGGCCACACGGCTCGAGCCGCGGCTCTCTCCTTGTTCCCCTGATGAGCTC
GGTCTACTTCCAGAGGCTACTGCTCTCCTTGAAGCACTTCCGTATCTTGAAGTGTTTCTT
CCTTTCTCAAATACCC

QA 1 496 1 496
DS 



AS 1 2

CO CL4851Contig1 990 2 2 U
GGGATGTGGAAGAAGAAAAAGAGATGAAGCGCGGTGGAATCAGACGGAAGCGATTGTTCG
GGAGGACGGTTCTCTTGACGTCAGTTGTTTTCTTGATCGGTTTCGGTTTGCTTCTGTTAA
CGCTCCGCTCCGTGGATGATCGTAACTCCTTCATCGATGACGACGACGACAACGACGCCG
TTTCGGACGAGGACAGCGCGAGATGGATCAACTCTTCTTCCTCCTCCGTGGTGGAAGCCA
AGGTACGGCGGTAGGCTCTGCGCGACGGTGGAGGAGATGGGGAGCGAGTTCGATGGTGGT
GGTGGTGGTGGTTTCGTGGATCAGAGCCTCAGAGTTCGTGATATCATCCGTCGCCATTTT
CACCTCAACGGTGAGAGAGAATATTATATTATTCGATTCTTGATTTTCTTGATTAGCAAG
ATCTTGAGTTGGGATAGAGCTCAGAGTTTTCTTGGATTTGTTTTTTTCAGGGGCTGGAGC
AGTGCGTGAGCTAGCTCCGGAGGAGTTTTGTAGACGTGGTTACGTTCTTGGGAAGACGGC
AGAGGCTGGATTCGGGAACGAGATGTACAAGATCTTGACTTCGGGGGCGTTGAGCATAAT
GTTGAACAGATCCTTGATCATTGGCCAGACCAGGCATATACTGGTTCTTTCCTCAATCCT
TTTTTTCTGCCTTTTTTGAGAAACTGTTTTGCAACTCTCTGAATATTAGTGTTTTTTTAG
ATTTGTGTTATCTGTCTGTTTGTTTATACCTTTCTGTGTGTGTGTGTGTGTTTCCTCAGG
GGCAAATATCCGTTTGGTGATTACATTGCTTACTCTAATGCTACATTTACATTAGCTGAA
GTGAAGCATCTGTGGCGACAAAAAGGCTGCGTGAAGAAGTATGGAAGGCGGCTTGTCATG
AGGTTGGATGATTTTGAGAAGCCGGCTAAGAGTAATGTCTTATGTGGCAACTGGAAGAAG
TGGGAGGAAGCTATTATATGGTTTGTGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GR60TF U 1
AF RS1GR60JQ C 487
BS 1 620 RS1GR60TF
BS 621 990 RS1GR60JQ

RD RS1GR60TF 620 0 0
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GGAGGACGGTTCTCTTGACGTCAGTTGTTTTCTTGATCGGTTTCGGTTTGCTTCTGTTAA
CGCTCCGCTCCGTGGATGATCGTAACTCCTTCATCGATGACGACGACGACAACGACGCCG
TTTCGGACGAGGACAGCGCGAGATGGATCAACTCTTCTTCCTCCTCCGTGGTGGAAGCCA
AGGTACGGCGGTAGGCTCTGCGCGACGGTGGAGGAGATGGGGAGCGAGTTCGATGGTGGT
GGTGGTGGTGGTTTCGTGGATCAGAGCCTCAGAGTTCGTGATATCATCCGTCGCCATTTT
CACCTCAACGGTGAGAGAGAATATTATATTATTCGATTCTTGATTTTCTTGATTAGCAAG
ATCTTGAGTTGGGATAGAGCTCAGAGTTTTCTTGGATTTGTTTTTTTCAGGGGCTGGAGC
AGTGCGTGAGCTAGCTCCGGAGGAGTTTTGTAGACGTGGTTACGTTCTTGGGAAGACGGC
AGAGGCTGGATTCGGGAACGAGATGTACAAGATCTTGACTTCGGGGGCGTTGAGCATAAT
GTTGAACAGATCCTTGATCA

QA 1 620 1 620
DS 

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TGGATTCGGGAACGAGATGTACAAGATCTTGACTTCGGGGGCGTTGAGCATAATGTTGAA
CAGATCCTTGATCATTGGCCAGACCAGGCATATACTGGTTCTTTCCTCAATCCTTTTTTT
CTGCCTTTTTTGAGAAACTGTTTTGCAACTCTCTGAATATTAGTGTTTTTTTAGATTTGT
GTTATCTGTCTGTTTGTTTATACCTTTCTGTGTGTGTGTGTGTGTTTCCTCAGGGGCAAA
TATCCGTTTGGTGATTACATTGCTTACTCTAATGCTACATTTACATTAGCTGAAGTGAAG
CATCTGTGGCGACAAAAAGGCTGCGTGAAGAAGTATGGAAGGCGGCTTGTCATGAGGTTG
GATGATTTTGAGAAGCCGGCTAAGAGTAATGTCTTATGTGGCAACTGGAAGAAGTGGGAG
GAAGCTATTATATGGTTTGTGAGC

QA 1 504 1 504
DS 



AS 1 2

CO CL4852Contig1 902 2 2 U
GGGGGGGAGATCGCTCAAAGCCCTAACTAAACTCTGAATCTTCCTCGAAGCAACCGCAAG
TCTTTGTAGGTCTCTAGGGCGATTGATTGATTCATATATCTATGGCGGACGTTGAGAATC
AACAAGACTCTTCGTTTCCAGTGAAGAGGAAATCGGATCTCTGTTGCCAAGACCAGGATA
ATGTGGCGAACAAGGCTCACAAGCTTAATCCTTCGTCGAGTTCTGAGTCCAAAGACGGAC
AAGTTAATGGAAACGGCGTCGAGAATCTGAATTCCTCAACTGATGAAAAACTAGGGACAG
AATCATCGCTTGGGAAGGAAGCTGAAGATAAGCAAGAAGTGGAAGAGGAAGAGGAGGAGG
ATTTGATTGAAGCTGAGATTGACAGGAAAGGTAAAGGCATAGCGAGAGAGGACAAAGGAA
AAGGAAAACTGATCGAAGTTGATGAAAGTGACGACAGCGATGATGATGAAGACGACGAAG
ATGGTGATGAGTACGACGAAAGTGATTTGTCTGACGATCCATTGGCGGAGGTGGATTTGG
ATAACATCCTTCCCTCGAGGACTAGGAGACGATCGATCCAGCCTGGAGTCTTCATCTCCA
ATGACTGTATCGGAAACCACGAGGATGATGATGATGATGATGATAGCAGTGACGATAGTG
ATGCTTAAGGTTAGTGCTAAGAAATCAAGATGTAGTTCCTTTGATTCTAAACTATGTTCA
ATGATTGTTGGTTATAATCTAAATGTTTCCAACGCTTGGACCAAAAGTTAGCTACTATAC
CTATCATGTTATTGCAATTTCAACTCATTTTGCGTCTTGGTTGTGGTCTGTGTGAGCTTA
AATTTCGTTTCTTTGTATGCTTGTGACTTTTATACTACATTAGAGAAAAATATTACCGAA
TC


BQ
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10 10 

AF RS1B236TF U 1
AF RS1B236JQ C 174
BS 1 527 RS1B236TF
BS 528 902 RS1B236JQ

RD RS1B236TF 527 0 0
GGGGGGGAGATCGCTCAAAGCCCTAACTAAACTCTGAATCTTCCTCGAAGCAACCGCAAG
TCTTTGTAGGTCTCTAGGGCGATTGATTGATTCATATATCTATGGCGGACGTTGAGAATC
AACAAGACTCTTCGTTTCCAGTGAAGAGGAAATCGGATCTCTGTTGCCAAGACCAGGATA
ATGTGGCGAACAAGGCTCACAAGCTTAATCCTTCGTCGAGTTCTGAGTCCAAAGACGGAC
AAGTTAATGGAAACGGCGTCGAGAATCTGAATTCCTCAACTGATGAAAAACTAGGGACAG
AATCATCGCTTGGGAAGGAAGCTGAAGATAAGCAAGAAGTGGAAGAGGAAGAGGAGGAGG
ATTTGATTGAAGCTGAGATTGACAGGAAAGGTAAAGGCATAGCGAGAGAGGACAAAGGAA
AAGGAAAACTGATCGAAGTTGATGAAAGTGACGACAGCGATGATGATGAAGACGACGAAG
ATGGTGATGAGTACGACGAAAGTGATTTGTCTGACGATCCATTGGCG

QA 1 527 1 527
DS 

RD RS1B236JQ 729 0 0
CAGGATAATGTGGCGAACAAGGCTCACAAGCTTAATCCTTCGTCGAGTTCTGAGTCCAAA
GACGGACAAGTTAATGGAAACGGCGTCGAGAATCTGAATTCCTCAACTGATGAAAAACTA
GGGACAGAATCATCGCTTGGGAAGGAAGCTGAAGATAAGCAAGAAGTGGAAGAGGAAGAG
GAGGAGGATTTGATTGAAGCTGAGATTGACAGGAAAGGTAAAGGCATAGCGAGAGAGGAC
AAAGGAAAAGGAAAACTGATCGAAGTTGATGAAAGTGACGACAGCGATGATGATGAAGAC
GACGAAGATGGTGATGAGTACGACGAAAGTGATTTGTCTGACGATCCATTGGCGGAGGTG
GATTTGGATAACATCCTTCCCTCGAGGACTAGGAGACGATCGATCCAGCCTGGAGTCTTC
ATCTCCAATGACTGTATCGGAAACCACGAGGATGATGATGATGATGATGATAGCAGTGAC
GATAGTGATGCTTAAGGTTAGTGCTAAGAAATCAAGATGTAGTTCCTTTGATTCTAAACT
ATGTTCAATGATTGTTGGTTATAATCTAAATGTTTCCAACGCTTGGACCAAAAGTTAGCT
ACTATACCTATCATGTTATTGCAATTTCAACTCATTTTGCGTCTTGGTTGTGGTCTGTGT
GAGCTTAAATTTCGTTTCTTTGTATGCTTGTGACTTTTATACTACATTAGAGAAAAATAT
TACCGAATC

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

CO CL4853Contig1 1060 2 2 U
GTCGAGACTGGCACCTAGTAAATAAGAAGAGAGGAAGTTGAGGAGCTGTAGTTATGATGA
TTCAGCGATTATCAAGCTTGGTCCAGCTGAGAGATTTCTTAAGGAATTGCTTCATGTGCC
GTTCGTGTTCAAACGGGTTGATGCTTTGCTCTGTGTAGCTAACTTCAACTCCGAGATTGA
ATACCTCAGACGATCTTTCAGTGTTGTGCAGGCTGCTTGTGAAGAACTAAGGAAAAATAA
AATGTTCTCTAGACTTCTTGAAGCTATACTCAAGACAGGAAACAAGATGAGTGTTGGAAC
AAACTCTCATGCTTTTAAATTTGACACCTCCTCAAGCTCGCTGAGGTCAAGGGGCTAGAT
GGAAGAAGCACTGTCTTGCATTTCGTTGTCCAGGAGATGATAAAATCAGAAAGCTCTGTG
GAAGTTCTGGACCGCATCAGAAACCTGAGCTCAGAGATGGACACGGTGAAAAAATCGGCT
GACGTTGAGTATGGTGTTCTAACAAGCGGTGTTTTGAAGCTTTGTCAGGGAATCAAGAAC
ATCAAGGAGCTTCTGATGCTGAGCGAAGAGAGTGGATGTAGTGGAGAGCAGTGGCTGAAG
TTCGAGGCTAAGTTGGCTCGGTTCTTGGAAACTGCTGCAGGGGAGATTCTGACGATCAAA
GCACAAGAGAGCTCAACGCTGTCTGCAATGGAAGAGGTCACAGAGCTGTTCCATGGAGGT
TCTGTCAAAGAAGAAGTTCACACACTGAGAGTTTTCATGGCTGTGAGAGACTTCCTGTCT
ACTCTAGACGAAGTATGTAACGAAATGGGAGATAGATTCTCATCTTAAGATTTTTAAAAT
GTAGTTGAAGTAGATGATCAACGAACTAGTTTATTAGGAAGTAGCCTTCAGTTTTCTGTT
ATCTCTAAAATGAGATACCTCTAAACTAATAAGGGTATCTTGCAATCTGTTGTAACCTGC
ACTGTTTTAGCTTCAAGTAGGCATTAGATGGATGGATTTTAAGACATTTCTTGTACTTTC
TCAGCTTGAAGTAAGCATTTAGATGTATGGATTTTAAGAC


BQ
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AATGTTCTCTAGACTTCTTGAAGCTATACTCAAGACAGGAAACAAGATGAGTGTTGGAAC
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TTCGAGGCTAAGTTGGCTCGGTTCTTGGAAACTGCTGCAGGGGA

QA 1 644 1 644
DS 

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GTGAGAGACTTCCTGTCTACTCTAGACGAAGTATGTAACGAAATGGGAGATAGATTCTCA
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GACATTTCTTGTACTTTCTCAGCTTGAAGTAAGCATTTAGATGTATGGATTTTAAGAC

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 2

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TCAGAGACGACGACGCAATTCTAGGATTTTTCTTCGTTCAAAGATCTGATTTTTTCTCGG
TCGGAGAAGGAGATAAAAAAGCACCGATCCATGGCCGATTGATCTAAGTTAATCTCCGGA
GTTTCGGAGTGTTTTTTTTTAGAAATCTGAAAAAGATGGCAGTCTCTTTCCCTCGTCTTC
CGAGGTGGTTGTGTGGTGGTGGTGGTAACACTAAGAAAGAGTCAAAGGGATCTCCTCCTT
CACTGAAGAAGACTATTAAGACTGAGTCTTCTTCTTCTACGGTGAAGAAGATTAAGAGAG
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CTGAACCAGATGATCCAGAGTGGTCCATTGGTTGGGTTGAGCCTCATGGACCAGGGTTTA
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TCTAGACTTCTCTCATGTTGTTTTTCAGTATCATAATTAAGAATCAAATAATTAAAAAAA
AACAAGGAAAAAAAAGGGGGCAAGGTGGATAGCTTTTAGAGACTTTTTTGTTTCAACGAG
TGACAACAAGTCATCCTCAAGAATTTACTAATGGACAAAGATGATAGGGTGATGGAGACT
TGGCAACATAACATGAATGAAGAATTGGTAATGCTATGAATATGATATATATTATATGAT
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CACTTTTGCGGTCGAGATTATTTGTTTTTGACCAACAACAAAAAAAAAAAACAATCCTTC
TTTTTTTCCTTTGTTCTTTTGTGGTTAGTGATGTGTAATGATAGTAGTGTACATGTACAT
AAGTTCGGTTTCTCTCTTGAATCACATGTCACGTGCTTACTTTCGAC


BQ
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AF RS1F033TF U 1
AF RS1F033JQ C 640
BS 1 719 RS1F033TF
BS 720 1127 RS1F033JQ

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TCGGAGAAGGAGATAAAAAAGCACCGATCCATGGCCGATTGATCTAAGTTAATCTCCGGA
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CGAGGTGGTTGTGTGGTGGTGGTGGTAACACTAAGAAAGAGTCAAAGGGATCTCCTCCTT
CACTGAAGAAGACTATTAAGACTGAGTCTTCTTCTTCTACGGTGAAGAAGATTAAGAGAG
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CTGAACCAGATGATCCAGAGTGGTCCATTGGTTGGGTTGAGCCTCATGGACCAGGGTTTA
AAAGTGAGGATGATTCTGGTGGTGGTGGGTTTGTTGTTCTTGTTCCTTGTTACAAGAAAG
TTATGGATGGTTCAGGGAATCAGATTCTGAATGGCTTCTTCCCTCCTGCTCCTGATGGGA
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TCTAGACTTCTCTCATGTTGTTTTTCAGTATCATAATTAAGAATCAAATAATTAAAAAA

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DS 

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AGACTTTTTTGTTTCAACGAGTGACAACAAGTCATCCTCAAGAATTTACTAATGGACAAA
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GAAAGCGTTTTCGGCTTTTTTCACTTTTGCGGTCGAGATTATTTGTTTTTGACCAACAAC
AAAAAAAAAAAACAATCCTTCTTTTTTTCCTTTGTTCTTTTGTGGTTAGTGATGTGTAAT
GATAGTAGTGTACATGTACATAAGTTCGGTTTCTCTCTTGAATCACATGTCACGTGCTTA
CTTTCGAC

QA 1 488 1 488
DS 



AS 1 2

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TCCAGACTCCTCTCCTCCTCCTCCTCAGCCACCGCCATCTCCGTCGCCAAACCGTTACTC
TCCCCAACCTTCACGGCGCCTTTATCTTTCACGCGCTCTCTCGCTCCTAACCTCTCCCTC
AAATCCAACACCCGCCGCAGCATCACCCTCTTCGCCACAAGATCCTTCTCAACAACCATC
ACCTCCGCCATCTCCGTCGGAGACAAACTCCCAGACTCCACTCTCTCCTACCTCGACCCC
GCCACCAACGACGTCAAAACAGTCACCGTCTCCTCCCTAACCGCCGGGAAGAAAACCATC
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AACGACGCGTTCGTGATGGAGGCGTGGAGGAAGGACCTCGGGATCAACGACGAGGTGATG
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AGAAGGAGGCGCTTTTACGAACAGTAGTGCTGAGGATATGCTTAAGGCTCTTTGATCCCG
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FV03TF U 1
AF RS1FV03JQ C 182
BS 1 646 RS1FV03TF
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BS 664 955 RS1FV03JQ

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AGA

QA 1 663 1 663
DS 

RD RS1FV03JQ 774 0 0
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TCTCCAAAGCGGGAGAGCTCAGATCCAAAGGCGTCGACGCCATCGCGTGCGTCTCCGTGA
ACGACGCGTTCGTGATGGAGGCGTGGAGGAAGGACCTCGGGATCAACGACGAGGTGATGC
TGTTATCCGATGGTAACGGAGAGTTCACGGGGAAGCTTGGCGTGGAGTTGGATTTGAGGG
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GAAGGAGGCGCTTTTACGAACAGTAGTGCTGAGGATATGCTTAAGGCTCTTTGATCCCGT
TTCTTTTTCTCTGTTTGTGTTTTGTTTTGCTGTCTTCTCTTTTGTTGGAGGCTTGGAGCT
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TCGGAAGCGTTTAGACTTTAGGCCGTATCTTTGTTTCTAGTTATTGCTACTTTGGGTTAG
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QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

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TTATCCCAGAGGGATGAGTACAGCTTTCCGGCAAACGGTCTCCGTGTGGCATTATCAAGG
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AAC


BQ
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20 20 20 

AF RS1FW52JQ C 1
AF RS1FW52TF U 1
BS 1 483 RS1FW52TF

RD RS1FW52JQ 483 0 0
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AAATGTTGGGGAGCCATCTTGTTGACTTTCGACAACTGTGGCATGTGGAATATTCGGTTT
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TTATCCCAGAGGGATGAGTACAGCTTTCCGGCAAACGGTCTCCGTGTGGCATTATCAAGG
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GTGTTATGAGATGTCTGTATATAAGAATGTAAAAATTATTTTATATTTTCAAATTAAATA
AAC

QA 1 483 1 483
DS 

RD RS1FW52TF 483 0 0
GATCTTGATGGATACTCTTTCTTTGCTGTCGCGGTTGAGCCAGGGAAGTGGACGCCTGCG
AAGAGGAAGAACTATAATCTGTTAGACGCAGTATACCGACACACAATCCAAGTTTATCCA
AAATGTTGGGGAGCCATCTTGTTGACTTTCGACAACTGTGGCATGTGGAATATTCGGTCT
GAGATTCTCGAGAAACGTTACTTAGGTCAACAGCTTTATGTTAATGTTGGCCCGCCGGAA
TTATCCCAGAGGGATGAGTACAGCTTTCCGGCAAACGGTCTCCGTGTGGCATTATCAAGG
GCTTGCCTGATCCTCAGCCTCCCAGGGACTCGCTTTGATTTGGTTCGGTGTGGTTCGGTT
CAGACGTTTCTTACATTCTTATATACGTATGTCCTTAAAATTTTGGTTACGATGGTGAAA
GTGTTATGAGATGTCTGTATATAAGAATGTAAAAATTATTTTATATTTTCAAATTAAATA
AAC

QA 1 483 1 483
DS 



AS 1 2

CO CL4857Contig1 649 2 1 U
GGGAAGAAAGTCTCGTCTGCCAAAGCGCATTGGAACGCCTTTGTAAGACCAAAGAGCTTG
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AGAATGATGAGGAAGCAGAATCATTACTGAGGGAACACACACTTCCGATAATGGGACCAG
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CATTTGCAATGCCGGCCGAGGATTTCCCTCCGGCATCGATCCCGGCAGGTTTCTCCGGTT
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ACTCCACTTCCAATGTGAAAAAGCCAACAACGTAAGTAGACCCCATTGCGGATTCAATAT
TATCAAATCAATTTCCTTGTTGGACCACAAATTGTGGGATTGTTTTTTTTCTCATTCTTT
CTAATTGGGTAAGAACTAAAAATGTTCATTGTTTCGTTTGTCAGAATCGTCCGTTAATTG
TTTTTTTTTGGTTTAGCAATATAGTAAATGAAATTCCCAAGCTTTTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GP69TF U 1
AF RS1GP69JQ C 171
BS 1 649 RS1GP69TF

RD RS1GP69TF 649 0 0
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AGAGACTTCAAGAGGTTTGTTCGTGTTTGACACTTGAGACAATGGAGAAGATGATACGTC
CATTTGCAATGCCGGCCGAGGATTTCCCTCCGGCATCGATCCCGGCAGGTTTCTCCGGTT
ACTTTTCGAAAAGCGCCGCCGTGCTCGAGCGTCTTGTAAAACTCTGGCCCTTCAACAAGA
ACTCCACTTCCAATGTGAAAAAGCCAACAACGTAAGTAGACCCCATTGCGGATTCAATAT
TATCAAATCAATTTCCTTGTTGGACCACAAATTGTGGGATTGTTTTTTTTCTCATTCTTT
CTAATTGGGTAAGAACTAAAAATGTTCATTGTTTCGTTTGTCAGAATCGTCCGTTAATTG
TTTTTTTTTGGTTTAGCAATATAGTAAATGAAATTCCCAAGCTTTTAGC

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1GP69JQ 479 0 0
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ATGATACGTCCATTTGCAATGCCGGCCGAGGATTTCCCTCCGGCATCGATCCCGGCAGGT
TTCTCCGGTTACTTTTCGAAAAGCGCCGCCGTGCTCGAGCGTCTTGTAAAACTCTGGCCC
TTCAACAAGAACTCCACTTCCAATGTGAAAAAGCCAACAACGTAAGTAGACCCCATTGCG
GATTCAATATTATCAAATCAATTTCCTTGTTGGACCACAAATTGTGGGATTGTTTTTTTT
CTCATTCTTTCTAATTGGGTAAGAACTAAAAATGTTCATTGTTTCGTTTGTCAGAATCGT
CCGTTAATTGTTTTTTTTTGGTTTAGCAATATAGTAAATGAAATTCCCAAGCTTTTAGC

QA 1 479 1 479
DS 



AS 1 2

CO CL4858Contig1 663 2 4 U
TTTTTACCGTCTCTGATCGGAAAAATCGCCGGAGATACCACCGGTCTCCAGGAGAGGCTG
AGGACCGAGGTGAGGAAGGTCTGCGGGTCCGGTTCGGTTCTGAATTTCAGGACGGTTAAC
GAGATGGAGCTGGTTAAGTCCGTGGTTTACGAAACGCTGCGTTTAAACCCGCCGGTTCCG
TTGCAGTACGCGCGCGCGAGGGATGATTTCAAGATAAGCTCGCACGACGCGGTTTACGAG
GTCAAGAAAGGAGAGCTTCTCTGCGGTTACCAGCCGCTGGTGATGAGAGACGCTAGCATC
TTTGACGACCCGGAGGAGTTTAAACCGGATCGGTTTGTAGGTGAGACCGGGTCCAAGTTG
CTTAATTATCTGTTCTGGTCTAATGGTCCACAAACCGGTACGCCGAGCGCGTCGAACAAA
CAGTGTGCAGCCAAAGAGATGGTTACTATCACGGCTGCCTTGATCATCGCCAATTTATTT
CTCCGGTACGATAAAATAACCGGCGACGCCGGGAGTATCAAGACCGTTGTTAAAGCTACA
TGAGGAAGACTCATCACTTCCTCCACGGTCTCATATCATATGTTTATGTTTGGAGTGTCG
AATAAGATTTAAACTAAAATAATGCGAACTGTAACAGAAATTGCCAGAGGTATTTTCTGT
TAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 

AF RS1CX35TF U 1
AF RS1CX35JQ C 156
BS 1 639 RS1CX35TF
BS 640 640 RS1CX35JQ
BS 641 654 RS1CX35TF
BS 655 663 RS1CX35JQ

RD RS1CX35TF 654 0 0
TTTTTACCGTCTCTGATCGGAAAAATCGCCGGAGATACCACCGGTCTCCAGGAGAGGCTG
AGGACCGAGGTGAGGAAGGTCTGCGGGTCCGGTTCGGTTCTGAATTTCAGGACGGTTAAC
GAGATGGAGCTGGTTAAGTCCGTGGTTTACGAAACGCTGCGTTTAAACCCGCCGGTTCCG
TTGCAGTACGCGCGCGCGAGGGATGATTTCAAGATAAGCTCGCACGACGCGGTTTACGAG
GTCAAGAAAGGAGAGCTTCTCTGCGGTTACCAGCCGCTGGTGATGAGAGACGCTAGCATC
TTTGACGACCCGGAGGAGTTTAAACCGGATCGGTTTGTAGGTGAGACCGGGTCCAAGTTG
CTTAATTATCTGTTCTGGTCTAATGGTCCACAAACCGGTACGCCGAGCGCGTCGAACAAA
CAGTGTGCAGCCAAAGAGATGGTTACTATCACGGCTGCCTTGATCATCGCCAATTTATTT
CTCCGGTACGATAAAATAACCGGCGACGCCGGGAGTATCAAGACCGTTGTTAAAGCTACA
TGAGGAAGACTCATCACTTCCTCCACGGTCTCATATCATATGTTTATGTTTGGAGTGTCG
AATAAGATTTAAACTAAAATAATGCGAACTGTAACAGAA*TTGCCAGAGGTATT

QA 1 654 1 654
DS 

RD RS1CX35JQ 508 0 0
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AAGCTCGCACGACGCGGTTTACGAGGTCAAGAAAGGAGAGCTTCTCTGCGGTTACCAGCC
GCTGGTGATGAGAGACGCTAGCATCTTTGACGACCCGGAGGAGTTTAAACCGGATCGGTT
TGTAGGTGAGACCGGGTCCAAGTTGCTTAATTATCTGTTCTGGTCTAATGGTCCACAAAC
CGGTACGCCGAGCGCGTCGAACAAACAGTGTGCAGCCAAAGAGATGGTTACTATCACGGC
TGCCTTGATCATCGCCAATTTATTTCTCCGGTACGATAAAATAACCGGCGACGCCGGGAG
TATCAAGACCGTTGTTAAAGCTACATGAGGAAGACTCATCACTTCCTCCACGGTCTCATA
TCATATGTTTATGTTTGGAGTGTCGAATAAGATTTAAACTAAAATAATGCGAACTGTAAC
AGAAATTGCCAGAGGTATTTTCTGTTAA

QA 1 508 1 508
DS 



AS 1 2

CO CL4859Contig1 897 2 2 U
TTTTTAGACAAGAACAAGGATGTGATTGTGACGCTTATCATCGAGGACTACGTGAAATCT
CCCAATGGTTTAGGCAGAGTGTTTGATGCATCCGGCTTGAGAAATTTCTGGTTTCCGGTA
ACAAGTATGCCTAAGAACGGAGAAGATTGGCCTACCATCGATGAAATGGTAACTAAGAAC
CAACGGTTGCTGGTTTTTACGTCAAATCCTCAAAAGGAAGCTACTGAAGGAATCGCATTT
TTATGGAAATACATGGTAGAGAATCAACATGGAGATGGAGGCATGAGGCCTGGAGTATGT
ACCAATAGACCAGAGTCAGCTGGTATGGGAGATACATCGAGATCACTAGTTCTTGTAAAC
TATTTTCCGGACACTGCGAATTTGATGGGATCTTGTAAACAGAACTCTGCTCCTCTTCTT
GACACCATCATGAAATGTCAAGAAGCCTCGGGACAACGCTGGCCTAACTTCATTGCAGTT
GATTTCTACAAGAAAAGCGATGGTGGAGGAGCTCCAAAAGCAGTAGATGTTGCAAACGGC
CGTTCACTTTGCGGCTGTGACGACATAGCCGCTTGTAAGGAGAACATGCCGTATGGGACG
TGTGAGAAACGTGAAGAAGAGCCGAGCAAACTTGATTCGAAACTCATGATGATTGCTAAA
CCTACAGCCGATGCTACCAAACCGACCCAACTTGGGCTTTCTGTGTTTGTTGTAACCTTT
GTCTCACTTCTCTCATTTTTTTGACATTGATGGTTACGTTTTATACTAATTAATATATGT
TCCGGTTTCGGTTCGCAAAGAATCAAACCCGATTAAAATCGGTACCAAGCCAAAACTTAT
TTTACTTGTAATGATACACACATATTGTATTTATTCAGCAAATCACATTTGCAGTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D176TF U 1
AF RS1D176JQ C 411
BS 1 575 RS1D176TF
BS 576 897 RS1D176JQ

RD RS1D176TF 575 0 0
TTTTTAGACAAGAACAAGGATGTGATTGTGACGCTTATCATCGAGGACTACGTGAAATCT
CCCAATGGTTTAGGCAGAGTGTTTGATGCATCCGGCTTGAGAAATTTCTGGTTTCCGGTA
ACAAGTATGCCTAAGAACGGAGAAGATTGGCCTACCATCGATGAAATGGTAACTAAGAAC
CAACGGTTGCTGGTTTTTACGTCAAATCCTCAAAAGGAAGCTACTGAAGGAATCGCATTT
TTATGGAAATACATGGTAGAGAATCAACATGGAGATGGAGGCATGAGGCCTGGAGTATGT
ACCAATAGACCAGAGTCAGCTGGTATGGGAGATACATCGAGATCACTAGTTCTTGTAAAC
TATTTTCCGGACACTGCGAATTTGATGGGATCTTGTAAACAGAACTCTGCTCCTCTTCTT
GACACCATCATGAAATGTCAAGAAGCCTCGGGACAACGCTGGCCTAACTTCATTGCAGTT
GATTTCTACAAGAAAAGCGATGGTGGAGGAGCTCCAAAAGCAGTAGATGTTGCAAACGGC
CGTTCACTTTGCGGCTGTGACGACATAGCCGCTTG

QA 1 575 1 575
DS 

RD RS1D176JQ 487 0 0
TCCTCTTCTTGACACCATCATGAAATGTCAAGAAGCCTCGGGACAACGCTGGCCTAACTT
CATTGCAGTTGATTTTTACAAGAAAAGCGATGGTGGAGGAGCTCCAAAAGCAGTAGATGT
TGCAAACGGCCGTTCACTTTGCGGCTGTGACGACATAGCCGCTTGTAAGGAGAACATGCC
GTATGGGACGTGTGAGAAACGTGAAGAAGAGCCGAGCAAACTTGATTCGAAACTCATGAT
GATTGCTAAACCTACAGCCGATGCTACCAAACCGACCCAACTTGGGCTTTCTGTGTTTGT
TGTAACCTTTGTCTCACTTCTCTCATTTTTTTGACATTGATGGTTACGTTTTATACTAAT
TAATATATGTTCCGGTTTCGGTTCGCAAAGAATCAAACCCGATTAAAATCGGTACCAAGC
CAAAACTTATTTTACTTGTAATGATACACACATATTGTATTTATTCAGCAAATCACATTT
GCAGTAT

QA 1 487 1 487
DS 



AS 1 2

CO CL4860Contig1 739 2 2 U
GGACAACCTTCGGACCAAAGAATCATACCCCTCTCTTTAAGCCATTCAAACTAGTAAAAG
ATGGGGATACTGAAGAAGAAAAAATACGACCGAAAGCCGTCGTTTAAGAGTGTTTTAACC
TCAATATTAGCTACACAAGCCGCAATATTCCTCTTGTTGCTCGCCGGTGTATCCCTTGCT
GGCACAGCCGCCGCATTTATCGCTACCATGCCACTATTCGTAGTATTCAGTCCGATTCTC
ATACCAGCTGGTATTACCACTGGTTTACTGACTACAGGTTTAGCAGCTTCCGGTGGCGCC
GGTGCGACGGCTGTCACCATCGTCCTGTGGCTCTACAAGCAAGCAACGGGCAAGGAAGCG
CCACCTGCCTTTTCAAAAATTTTGAAAAAAGTAGTACCTGGAGAAGGTGCTGCAGCTGCA
CCAGCAGCCGCACCAGCAGCGGCACCAGCAGCAGCACCAGCAGCAGCACCAGCAGCCGTG
CCAGCAGCTAAGCCAGCAGCGGCACCAGCAGCTAAGCCAGCGCCCGCTCCAGCACCCGCT
CCAACACCCGCTCCAGCACCTAAGCCATGAGCCAGCAGCCGCACCGAGTATATGAAAATA
AGTGGTGGGTACATAAAAAAGAATAATTATAATTTTACGTGGAGATGAAATTTTTTTCAA
GTAATATTCTACTAATGGATGTCGTGGTACAAAATAATAACTAATGTAAGCATTCTGTTG
TATAGCACTTTACGAAAAA


BQ
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AF RS1G883TF U 1
AF RS1DA70TF U 562
BS 1 620 RS1G883TF
BS 621 739 RS1DA70TF

RD RS1G883TF 620 0 0
GGACAACCTTCGGACCAAAGAATCATACCCCTCTCTTTAAGCCATTCAAACTAGTAAAAG
ATGGGGATACTGAAGAAGAAAAAATACGACCGAAAGCCGTCGTTTAAGAGTGTTTTAACC
TCAATATTAGCTACACAAGCCGCAATATTCCTCTTGTTGCTCGCCGGTGTATCCCTTGCT
GGCACAGCCGCCGCATTTATCGCTACCATGCCACTATTCGTAGTATTCAGTCCGATTCTC
ATACCAGCTGGTATTACCACTGGTTTACTGACTACAGGTTTAGCAGCTTCCGGTGGCGCC
GGTGCGACGGCTGTCACCATCGTCCTGTGGCTCTACAAGCAAGCAACGGGCAAGGAAGCG
CCACCTGCCTTTTCAAAAATTTTGAAAAAAGTAGTACCTGGAGAAGGTGCTGCAGCTGCA
CCAGCAGCCGCACCAGCAGCGGCACCAGCAGCAGCACCAGCAGCAGCACCAGCAGCCGTG
CCAGCAGCTAAGCCAGCAGCGGCACCAGCAGCTAAGCCAGCGCCCGCTCCAGCACCCGCT
CCAACACCCGCTCCAGCACCTAAGCCATGAGCCAGCAGCCGCACCGAGTATATGAAAATA
AGTGGTGGGTACATAAAAAA

QA 1 620 1 620
DS 

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G
AGCCATGAGCCAGCAGCCGCACCGAGTATATGAAAATAAGTGGTGGGTACATAAAAAAGA
ATAATTATAATTTTACGTGGAGATGAAATTTTTTTCAAGTAATATTCTACTAATGGATGT
CGTGGTACAAAATAATAACTAATGTAAGCATTCTGTTGTATAGCACTTTACGAAAAA

QA 2 178 2 178
DS 



AS 1 2

CO CL4861Contig1 1209 2 2 U
AGGGGCTAATTAACCGTTTCTAACCCTAATCCCCTCTTCCCCTCTTCCCCTCTGCGCCGA
ATCAACCTAATCTTTTAGTTTCTTCTTCACGCCGGCGTTCTTCGATCTCACCGGCTGTCT
GCGTCGATATTTCCTCCGGTCTGCGTCTCTCTCAGTCTCCCTATCTCTCTCGAAAATCTT
ACCCGAAAACATGTCTTATGCGGATTTTCGAGCCAGTTCTCTCCCATCTTCTTCATCTCA
TGGGTTTGGTTCCCCGGTTACCCAAAGAACAAGTGTCCCTCCTCCACAGCCAGCTCCCAC
ATCAAACATCGAGGATAGGTTACTGAACGAGCTGCTGGTGGCACCAGGACGGGAGTGTCT
TCCTAAGCTGAGCCCATATAGAGAACCAGATACTAGCTGGTTTAGGGAAAGAAACCGCAA
TTTAATTTGCAAGTCCATTTTGAAATGCTTTCACACTCTGCTTGAAGTGCCTTATCCAAC
TTATGCACATGTTCCATTAGAAATTCAGAAGATGTGGCTCCGTTCATTTGCGCAAGAATG
GAATTGGGACCCTGCTATCACCAGTCAGGTGCGGTCAGCCTTTGATTTGCAGGCTAGAAA
ACAATACAAGAGCCACATGACTGAGTGGAAGAAAAACTGGAGGCTGAAGAAGGGTAAACC
CTTAGGTTTGAATCTTGGTGTGTGGGAGGGGTTGCAAGTTTATTGGCAGCTCGATGCTAC
TGCATCTATTGCAGCTACCAATAGTAGTAATAGAAGAAGCCAGCGTGGTGGAAAAGGTCA
AGCAATACATAATGGCGGTGCTAAGACAATAGAGTCCCGTGAAGAGATCAACCAAATGGT
TCTTGAGCATGTTCCTGTAAAGAAAGGTCGTCGTTATGGTTTCGGTCGTATCTCGGAGGG
GATCTCAACCTCGTCATTTCAGTCCTCTTTTGTCCAAGATATGGAGCGAATGAAGGCAGA
ACTTGTTAAAGAGCAGGCATTCCGAAAAGCTTTGGAGGAACAGCTTCGTAACGTCACCAA
TTTCATTTCCAATCTTTACCCATTTCAGTTTTTTGCAACAAAAGCCAAACCGACTTTGGG
ACTCAAAGCCCCGACGACCATGTTTCTCAGTAAAATTTAGTATTTTATCTGTCTAAATTA
AGGATGTTTAAATTAAAAATTTTCATATGTAAATTAAGGATGTTTATTAAATTAAGGATT
TTCAAATGC


BQ
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AF RS1FA95TF U 1
AF RS1FA95JQ C 476
BS 1 636 RS1FA95TF
BS 637 1209 RS1FA95JQ

RD RS1FA95TF 636 0 0
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ATCAACCTAATCTTTTAGTTTCTTCTTCACGCCGGCGTTCTTCGATCTCACCGGCTGTCT
GCGTCGATATTTCCTCCGGTCTGCGTCTCTCTCAGTCTCCCTATCTCTCTCGAAAATCTT
ACCCGAAAACATGTCTTATGCGGATTTTCGAGCCAGTTCTCTCCCATCTTCTTCATCTCA
TGGGTTTGGTTCCCCGGTTACCCAAAGAACAAGTGTCCCTCCTCCACAGCCAGCTCCCAC
ATCAAACATCGAGGATAGGTTACTGAACGAGCTGCTGGTGGCACCAGGACGGGAGTGTCT
TCCTAAGCTGAGCCCATATAGAGAACCAGATACTAGCTGGTTTAGGGAAAGAAACCGCAA
TTTAATTTGCAAGTCCATTTTGAAATGCTTTCACACTCTGCTTGAAGTGCCTTATCCAAC
TTATGCACATGTTCCATTAGAAATTCAGAAGATGTGGCTCCGTTCATTTGCGCAAGAATG
GAATTGGGACCCTGCTATCACCAGTCAGGTGCGGTCAGCCTTTGATTTGCAGGCTAGAAA
ACAATACAAGAGCCACATGACTGAGTGGAAGAAAAA

QA 1 636 1 636
DS 

RD RS1FA95JQ 734 0 0
CCAACTTATGCACATGTTCCATTAGAAATTCAGAAGATGTGGCTCCGTTCATTTGCGCAA
GAATGGAATTGGGACCCTGCTATCACCAGTCAGGTGCGGTCAGCCTTTGATTTGCAGGCT
AGAAAACAATACAAGAGCCACATGACTGAGTGGAAGAAAAACTGGAGGCTGAAGAAGGGT
AAACCCTTAGGTTTGAATCTTGGTGTGTGGGAGGGGTTGCAAGTTTATTGGCAGCTCGAT
GCTACTGCATCTATTGCAGCTACCAATAGTAGTAATAGAAGAAGCCAGCGTGGTGGAAAA
GGTCAAGCAATACATAATGGCGGTGCTAAGACAATAGAGTCCCGTGAAGAGATCAACCAA
ATGGTTCTTGAGCATGTTCCTGTAAAGAAAGGTCGTCGTTATGGTTTCGGTCGTATCTCG
GAGGGGATCTCAACCTCGTCATTTCAGTCCTCTTTTGTCCAAGATATGGAGCGAATGAAG
GCAGAACTTGTTAAAGAGCAGGCATTCCGAAAAGCTTTGGAGGAACAGCTTCGTAACGTC
ACCAATTTCATTTCCAATCTTTACCCATTTCAGTTTTTTGCAACAAAAGCCAAACCGACT
TTGGGACTCAAAGCCCCGACGACCATGTTTCTCAGTAAAATTTAGTATTTTATCTGTCTA
AATTAAGGATGTTTAAATTAAAAATTTTCATATGTAAATTAAGGATGTTTATTAAATTAA
GGATTTTCAAATGC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL4862Contig1 710 2 2 U
GGGACCCGAGTGTATTCAACAGATACCGTTAAAGGCCTCGCAGAACAGCTTGATCTCCAA
GTTTTTCTCAGCAAAGCAGCCAAAAACAGAAGAAAAGGACAAGGAAACCAGATCCAGTGA
TGCAACCATCCCAGCTGGTCCGAAACAGGAACCTTTACTTGAAGAAGGGGTCGTAGTCTC
GGATAGCAATGATGAAATTAAACAAGTGGATGAGGAGGAGAATGAAGCCCAGAATCTGTG
TTTTCAAAAGATTGTGAAGGCGGAAGGAGATAGCTCAGGAGCCATTGCATCTGATCCTGA
ATCTGTAAAGAAGGAAGTCAAGGAGGGTACATGTGGAGAAGGTGAATCCGTAGAGACTGG
TGGGTTAGAGTTTAGCGGGGAGTCTTCAGTAAAGAGTGGGACAAAGCGAGGTTATGAGTT
ATTTTCAGGTCAAGAAAATCCAAATCCATGGAAACAGTCTGTTGTGAGGAGGTTGGAAGA
TGTTGTTGAAAAAAGCTCTGGGAAGAAGCAAGGAAAAGGAAAGTCTAAATCTAAGGAGAC
GCAGCAGTCTACATTACATTTCTTTTTCGATGGGAAATAGTTTGTTTGTGTACATAAAAT
CATCTATGAGGACGTGTTTGAGAGCTAGCTAGTTTGGTTGTAGATCATAAATGGATATTA
TGTATCGTCGATGCTTTTGTTTATGTGTTGTTGTTGCTCAATCTTAAAGC


BQ
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AF RS1C134TF U 1
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BS 1 494 RS1C134TF
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QA 1 494 1 494
DS 

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QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

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GAGACTATCAATCTCCCAGCGCCCACGTTCAATGTTTCACAACTGATCCAAAGCTTTGCG
GCAAGAGGCTTATCGGTGAAAGACATGGTTACACTCTCAGGCGGCCACACGATAGGATTC
TCTCATTGCTCATCTTTCGAGGCCCGTCTTCAAAACTTCAGCAAATTCCATGACGTTGAT
CCTTCCATGAACTTTGCTTTTGCACAAAGTTTGAAAAGAAATGCCCTAGATCTAGCAACC
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TTAACTCTCGCTTTGTTAATTAGAGCAAAGCCCTACAGAAGAGAAGTTGCTAATGAGGGT
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AAATGTAACGACCGATACTAAACCATATTATATAAGTTCCCTATGAGTTGCAGCGTTTGC
TTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1ER85TF U 1
AF RS1ER85JQ C 494
BS 1 694 RS1ER85TF
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RD RS1ER85TF 780 0 0
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CCCACAAACCTTAAAATGGCATTCTCGAAGAGACTCATTTTCTCGATGATCTTTACAGTT
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CCCGTTGCAGAAAAAATCATACTCGAAACTGTTAAGAACGCTACTTTGTATGATCCTAAA
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TCGATTCTACTAGATTCGTCTAAGTCAACCCAAGCTGAGAAGGATGGTCCTCCAAACATT
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CGTACTGTCTCTTGTGCCGATGTAATCGCCATAGCAGCCAGAGATGTTGTCACCCTGTCT
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CCTTCCATGAACTTTGCTTTTGCACAAAGTTTGAAA*GAAATGCCCTAGATCTAGCA
CCG

QA 1 777 1 777
DS 

RD RS1ER85JQ 711 0 0
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AGGGACAATGTTGGACTCCACGGCCACGGTTTTTGATAATGATTATTACAAGCAGATCTT
GTCAGGGAAAGGAGTGTTTGGGTCTGATCAGGCGCTTTTAGGTGATTCCCGTACCAAGTG
GATTGTTGAGACGTTTGCTCGAGACCAAATGGCCTTTTTCAGGGAGTTTGTAACTTCCAT
GGTGAAACTTGGAAACTTTGGAGTCAAGGAGACAGGACAAGTCAGAATTAACTCTCGCTT
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AAATTTGTTTTCATTTATATTTGATATTCTAATAATGTAAACTTGGCAAATGTAACGACC
GATACTAAACCATATTATATAAGTTCCCTATGAGTTGCAGCGTTTGCTTAC

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

CO CL4864Contig1 1104 2 4 U
AATCTTTCGTTACTCTCAAAGAATCTGAAGCATCAAAGGTCAAAGCTCTAAGTAAATATG
GAGATGGGTTTCCAGGAAAATCAGCAAAACCAAGAACTTACAAATCTCATGGAGATTGGA
TCTGGGCATTACGGGTGCTCACATTACAGGAGACGATGTAAGATTAGAGCACCTTGTTGT
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CAGCTTCTTAGACATGATCTCCCTCGACATGATGTTTCAAAGGTCATTTGCTCGCTTTGT
GAGACAGAACAAGACGTCCAGCAGAACTGCATCAGTTGTGGCGTATGTATGGGGAAGTAC
TTTTGCTCAAAATGCAAGTTCTTTGACGATGATCTTTCCAAGAAGCAATATCACTGCGAT
GAATGTGGGATTTGCAGGACCGGAGTAGAAGAAAACTTCTTCCATTGCAAAAGATGTCGG
TGTTGCTACTCTAAAGTCATGGAGGACAAGCATCGATGTGTAGAAGGCGCAATGCATCAC
AATTGCCCTGTTTGTTTTGAGTATCTGTTTGATTCCACAAGAGATATCACGGTGTTGAGA
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TGCCCTGTATGCTCTAAATCCATATGTGACATGTCCAACATGTGGAAGAAACTTGATGAA
GAGGTTGCTGCATACCCAATGCCAAAAGTGTACGAAGACAAGATGGTGTGGATACTTTGC
AATGACTGTGGTTCAAACTTGAATGTTCGGTTTCATTTGATCGCGCATAAGTGCACTAGC
TGCGGTTCCTACAACACTAGACAGACGCAGAGAGGACCTGATACTACTCACTCTTGCTCT
TCAGGAGTTCCTCAGGTTGTTGGTTCAACCGGTTAATTAAGACCTGAACCGGAGCTGGTT
CGGTGTTTGAATCTCCCAAGGGAAATTATTTATGTACCTTCTTAACTATATCAGTACATA
TTCAAATGCCTATGACGACTGTGTTATAACCACTTCGACTCGCGGGTCTAGATGATCTAT
AATAAAACGTAAAAATAGATTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EO66TF U 1
AF RS1EO66JQ C 288
BS 1 746 RS1EO66TF
BS 747 747 RS1EO66JQ
BS 748 785 RS1EO66TF
BS 786 1104 RS1EO66JQ

RD RS1EO66TF 785 0 0
AATCTTTCGTTACTCTCAAAGAATCTGAAGCATCAAAGGTCAAAGCTCTAAGTAAATATG
GAGATGGGTTTCCAGGAAAATCAGCAAAACCAAGAACTTACAAATCTCATGGAGATTGGA
TCTGGGCATTACGGGTGCTCACATTACAGGAGACGATGTAAGATTAGAGCACCTTGTTGT
GATGAAGTTTTCGATTGTAGACACTGCCACAACGAAGCTAAGGACTCTCTTCAAACTGAA
CAGCTTCTTAGACATGATCTCCCTCGACATGATGTTTCAAAGGTCATTTGCTCGCTTTGT
GAGACAGAACAAGACGTCCAGCAGAACTGCATCAGTTGTGGCGTATGTATGGGGAAGTAC
TTTTGCTCAAAATGCAAGTTCTTTGACGATGATCTTTCCAAGAAGCAATATCACTGCGAT
GAATGTGGGATTTGCAGGACCGGAGTAGAAGAAAACTTCTTCCATTGCAAAAGATGTCGG
TGTTGCTACTCTAAAGTCATGGAGGACAAGCATCGATGTGTAGAAGGCGCAATGCATCAC
AATTGCCCTGTTTGTTTTGAGTATCTGTTTGATTCCACAAGAGATATCACGGTGTTGAGA
TGTGGTCACACAATGCATTTACAATGCATCAAAGATATGGGGCTGCATAACCGATACACA
TGCCCTGTATGCTCTAAATCCATATGTGACATGTCCAACATGTGGAAGAAACTTGATGAA
GAGGTTGCTGCATACCCAATGCCAAA*GTGTACGAAGACAAGATGGTGTGGATACTTTGC
AATGA

QA 1 785 1 785
DS 

RD RS1EO66JQ 817 0 0
TTGCTCGCTTTGTGAGACAGAACAAGACGTCCAGCAGAACTGCATCAGTTGTGGCGTATG
TATGGGGAAGTACTTTTGCTCAAAATGCAAGTTCTTTGACGATGATCTTTCCAAGAAGCA
ATATCACTGCGATGAATGTGGGATTTGCAGGACCGGAGTAGAAGAAAACTTCTTCCATTG
CAAAAGATGTCGGTGTTGCTACTCTAAAGTCATGGAGGACAAGCATCGATGTGTAGAAGG
CGCAATGCATCACAATTGCCCTGTTTGTTTTGAGTATCTGTTTGATTCCACAAGAGATAT
CACGGTGTTGAGATGTGGTCACACAATGCATTTACAATGCATCAAAGATATGGGGCTGCA
TAACCGATACACATGCCCTGTATGCTCTAAATCCATATGTGACATGTCCAACATGTGGAA
GAAACTTGATGAAGAGGTTGCTGCATACCCAATGCCAAAAGTGTACGAAGACAAGATGGT
GTGGATACTTTGCAATGACTGTGGTTCAAACTTGAATGTTCGGTTTCATTTGATCGCGCA
TAAGTGCACTAGCTGCGGTTCCTACAACACTAGACAGACGCAGAGAGGACCTGATACTAC
TCACTCTTGCTCTTCAGGAGTTCCTCAGGTTGTTGGTTCAACCGGTTAATTAAGACCTGA
ACCGGAGCTGGTTCGGTGTTTGAATCTCCCAAGGGAAATTATTTATGTACCTTCTTAACT
ATATCAGTACATATTCAAATGCCTATGACGACTGTGTTATAACCACTTCGACTCGCGGGT
CTAGATGATCTATAATAAAACGTAAAAATAGATTTTG

QA 1 817 1 817
DS 



AS 1 2

CO CL4865Contig1 511 2 2 U
GCACAGGCTTTGGGTGGCTCTTTCCCGCGACGAGATCGAGGAAGACGTGTTCAGCATGAG
CGGGAACAGGCCATCTCGTCGACCGCGAAAGAGGGCCAAGACTTTGCAGAAACATCTCGA
TGTTATCTTCCCTGGGTTGTGTCTTGTTGGGATGAATGCTGATTGCTTCAGAGTTACCAC
TTCTCCCTCTAAGCGATGATCGGCCCATAAACATGTCGACAAAAAGGGTAGATAGCTGGT
GACATGGTCTAGAATCCACAACACACAACAGTAAAAGATAGGAAGACGAAATATCTCAAG
AGACATTTGTCTTGTCTCATATCAAACTTAGTTGGAACAAAGTTATATATAAGTAAATAT
GGGTAAGTTCCATAAACTATTTATAAAGAGAGAGGGTGGTTGGTTCGATTTTGAGTTATC
CATAATGAAATACAGAAAATCGGTTAGTGTGATGATGCTTTGTGTAGTTAAACTAAATCT
CATGGTGGAGTAAATTTTACATTTCTTTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1B708JQ C 1
AF RS1B708TF U 14
BS 1 13 RS1B708JQ
BS 14 511 RS1B708TF

RD RS1B708JQ 511 0 0
GCACAGGCTTTGGGTGGCTCTTTCCCGCGACGAGATCGAGGAAGACGTGTTCAGCATGAG
CGGGAACAGGCCATCTCGTCGACCGCGAAAGAGGGCCAAGACTTTGCAGAAACATCTCGA
TGTTATCTTCCCTGGGTTGTGTCTTGTTGGGATGAATGCTGATTGCTTCAGAGTTACCAC
TTCTCCCTTTAAGCGATGATCGGCCCATAAACATGTCGACAAAAAGGGTAGATAGCTGGT
GACATGGTCTAGAATCCACAACACACAACAGTAAAAGATAGGAAGACGAAATATCTCAAG
AGACATTTGTCTTGTCTCATATCAAACTTAGTTGGAACAAAGTTATATATAAGTAAATAT
GGGTAAGTTCCATAAACTATTTATAAAGAGAGAGGGTGGTTGGTTCGATTTTGAGTTATC
CATAATGAAATACAGAAAATCGGTTAGTGTGATGATGCTTTGTGTAGTTAAACTAAATCT
CATGGTGGAGTAAATTTTACATTTCTTTGTG

QA 1 511 1 511
DS 

RD RS1B708TF 498 0 0
GTGGCTCTTTCCCGCGACGAGATCGAGGAAGACGTGTTCAGCATGAGCGGGAACAGGCCA
TCTCGTCGACCGCGAAAGAGGGCCAAGACTTTGCAGAAACATCTCGATGTTATCTTCCCT
GGGTTGTGTCTTGTTGGGATGAATGCTGATTGCTTCAGAGTTACCACTTCTCCCTCTAAG
CGATGATCGGCCCATAAACATGTCGACAAAAAGGGTAGATAGCTGGTGACATGGTCTAGA
ATCCACAACACACAACAGTAAAAGATAGGAAGACGAAATATCTCAAGAGACATTTGTCTT
GTCTCATATCAAACTTAGTTGGAACAAAGTTATATATAAGTAAATATGGGTAAGTTCCAT
AAACTATTTATAAAGAGAGAGGGTGGTTGGTTCGATTTTGAGTTATCCATAATGAAATAC
AGAAAATCGGTTAGTGTGATGATGCTTTGTGTAGTTAAACTAAATCTCATGGTGGAGTAA
ATTTTACATTTCTTTGTG

QA 1 498 1 498
DS 



AS 1 2

CO CL4866Contig1 1202 2 2 U
GCTTGAGAGCAAGTATGGATCACCGAAAATTTAATGATGGTGTCACTGTCGCTAGGGAGG
TCGAGTTGGAGGACCCGGTTGAGAACATTGGTGCAAAGCTTGTCAGACAAGCAGCTGCAA
AGACCAATGACTTGGCTGGTGACGGTACAACAACATCTGTTGTTCTTGCACAGGGCTTTA
TTGCTGAGGGTGTCAAGGTGGTGGCTGCAGGTGCAAACCCTGTATTGATCACTAGAGGCA
TTGAGAAGACAGCAAAGGCTTTGGTTCACGAGCTGAAGCTAATGTCTAAGGAGGTGGAAG
ACAGTGAACTTGCGGATGTGGCGGCTGTTAGTGCCGGCAACAACCCTGAAGTTGGAAACA
TGATTGCTGAAGCAATGAGCAAAGTGGGCAGGAAAGGTGTGGTGACACTTGAGGAGGGTA
AAAGTGCTGAGAACCACCTTTACGTGGTGGAAGGCATGCAGTTTGACCGTGGTTATATCT
CACCGTACTTCGTGACAGACACTGAGAAAATGTCTGTCGAGTACGATAACTGCAAGCTGC
TTCTTGTTGACAAGAAGGTTACCAATGCAAGGGATCTTGTTGGTGTTCTAGAGGATGCTA
TTAGAGGCGGTTATCCGATTCTAATAATAGCAGAAGATATTGAACAGGAAGCTTTAGCTA
CTCTTGTTGTTAACAAGCTTAGAGGCACTTTGAAAATAGCAGCTCTTAAAGCTCCTGGAT
TTGGAGAGCGGAAGAGCCAGTACCTTGACGATATTGCCATTCTAACTGGAGCTACTGTGA
TAAGAGAGGAAGTTGGTCTTTCTGTTGACAAAGCTGGGAAAGAGGTTTTAGGAAACGCCT
TTAAGGTTGTCCTCACCAAGGAGATGACGACCATTGTGGGTGATGGTAGCACACAGGAAG
CAGTGAACAAGCGTGTCATCGACCCCACAAAGGTTGTGAGATGTTGTTTAGAACATGCAG
CTTCCGTTGCAAAGACGTTCTTGATGTCCGACTGTGTGGTTGTGGAGGTCAAGGAGCCAG
AGCCAGTTCCTGCTGGCAATCCAATGGACAATTCAGGATATGGATACTGAGATAGAGCAG
CCTGATTTGCCTTTGAAGAGGAGATATGAATGAACATTCCGAAATGAGAGTTAGCTCACT
GGGATACCGATTACTTTAGCTTGTAAACAAAATTTATGTGCTAAGTGTAATGATTTTTTT
TG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RS1AQ06TFB U 1
AF RS1AQ06JQ C 619
BS 1 779 RS1AQ06TFB
BS 780 1202 RS1AQ06JQ

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AGACCAATGACTTGGCTGGTGACGGTACAACAACATCTGTTGTTCTTGCACAGGGCTTTA
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TTGAGAAGACAGCAAAGGCTTTGGTTCACGAGCTGAAGCTAATGTCTAAGGAGGTGGAAG
ACAGTGAACTTGCGGATGTGGCGGCTGTTAGTGCCGGCAACAACCCTGAAGTTGGAAACA
TGATTGCTGAAGCAATGAGCAAAGTGGGCAGGAAAGGTGTGGTGACACTTGAGGAGGGTA
AAAGTGCTGAGAACCACCTTTACGTGGTGGAAGGCATGCAGTTTGACCGTGGTTATATCT
CACCGTACTTCGTGACAGACACTGAGAAAATGTCTGTCGAGTACGATAACTGCAAGCTGC
TTCTTGTTGACAAGAAGGTTACCAATGCAAGGGATCTTGTTGGTGTTCTAGAGGATGCTA
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CTCTTGTTGTTAACAAGCTTAGAGGCACTTTGAAAATAGCAGCTCTTAAAGCTCCTGGAT
TTGGAGAGCGGAAGAGCCAGTACCTTGACGATATTGCCATTCTAACTGGAGCTACTGTG

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DS 

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TTAGAGGCACTTTGAAAATAGCAGCTCTTAAAGCTCCTGGATTTGGAGAGCGGAAGAGCC
AGTACCTTGACGATATTGCCATTCTAACTGGAGCTACTGTGATAAGAGAGGAAGTTGGTC
TTTCTGTTGACAAAGCTGGGAAAGAGGTTTTAGGAAACGCCTTTAAGGTTGTCCTCACCA
AGGAGATGACGACCATTGTGGGTGATGGTAGCACACAGGAAGCAGTGAACAAGCGTGTCA
TCGACCCCACAAAGGTTGTGAGATGTTGTTTAGAACATGCAGCTTCCGTTGCAAAGACGT
TCTTGATGTCCGACTGTGTGGTTGTGGAGGTCAAGGAGCCAGAGCCAGTTCCTGCTGGCA
ATCCAATGGACAATTCAGGATATGGATACTGAGATAGAGCAGCCTGATTTGCCTTTGAAG
AGGAGATATGAATGAACATTCCGAAATGAGAGTTAGCTCACTGGGATACCGATTACTTTA
GCTTGTAAACAAAATTTATGTGCTAAGTGTAATGATTTTTTTTG

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 2

CO CL4867Contig1 1115 2 6 U
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AGAGCTTTTTTCCTTTTTGCCTCTAATACACATCAATGGCGATTCCTGTGATTGATTTCT
CCAAGATCAATGGTGAAGAAAGGGAGAAGACACTCTCTGAGATCGCTAAAGCTTGTGAAG
AATGGGGTTTCTTTCAGCTGGTGAACCATGGGATACCATTGGAGCTTCTGAACAAGGTGA
AGAAGCTTGCCTCAGACTGCTACAAAACAGAGAGAGAAGAAGCGTTCAAGACCTCAACTC
CCGTGAAGCTTCTCAACGAGATGCTTGAGAAGAACTCAGGAGAGAAGCTCGAGAACGTTG
ACTGGGAAGATGTGTTCACTCTCTTAGACCAGAACCAGAACGAATGGCCATCAAACACCT
CTGGCCTCAAAGAGACGATGGTAGAATACAGAGAAGAAGTGAGGAAGCTAGCGAGCAAGA
TGATGGAAGTGATGGACGAGAACTTGGGTTTGACCAAAGATTACATAAAGAAAGCATTTA
ACGAAGGGATGGAAGATGGGGAAGAGACGGCTTTCTTTGGAACCAAAGTCAGCCATTACC
CACCTTGTCCTCATCCAGAGCTTGTCAGTGGGCTTAGGGCTCATACTGATGCGGGAGGTG
TGGTTTTGCTGTTCCAAGACGATGAGTACGATGGTCTTCAGGTGTTGAAAGATGGAGAGT
GGATCGATGTTCAGCCGTTGCCTAATGCTATTGTTATCAACACTGGTGATCAGATTGAAG
TTTTTAGCAATGGAAGGTACAAGAGTGCATGGCACAGGGTGTTGGCAAGGGAGGAAGGAA
ACAGGAGGTCCATAGCTTCCTTTTACAATCCGTCGTACAAGGCGGCCATCGGGCCAGCGG
CGGTGGCGGCGGAAGGGATTGAGGAAGGAAGTGAGAAGAAGTATCCAAAGTTTGTGTTTG
GAGACTATATGGATGTCTATGCAAACCAGAAGTTCATGCCTAAGGAGCCTCGTTTTCTTG
CTGTAAAGACTCTTTAAGTGTCAATTTTATCACTGTTTTATTCAATGTCCTGAACCATGA
TGTATTTTCACTTTAAGTTATTAAATGCCAAATTT


BQ
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AF RS1BJ14TF U 1
AF RS1BJ14JQ C 412
BS 1 701 RS1BJ14TF
BS 702 702 RS1BJ14JQ
BS 703 709 RS1BJ14TF
BS 710 710 RS1BJ14JQ
BS 711 755 RS1BJ14TF
BS 756 1115 RS1BJ14JQ

RD RS1BJ14TF 755 0 0
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CCAAGATCAATGGTGAAGAAAGGGAGAAGACACTCTCTGAGATCGCTAAAGCTTGTGAAG
AATGGGGTTTCTTTCAGCTGGTGAACCATGGGATACCATTGGAGCTTCTGAACAAGGTGA
AGAAGCTTGCCTCAGACTGCTACAAAACAGAGAGAGAAGAAGCGTTCAAGACCTCAACTC
CCGTGAAGCTTCTCAACGAGATGCTTGAGAAGAACTCAGGAGAGAAGCTCGAGAACGTTG
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CTGGCCTCAAAGAGACGATGGTAGAATACAGAGAAGAAGTGAGGAAGCTAGCGAGCAAGA
TGATGGAAGTGATGGACGAGAACTTGGGTTTGACCAAAGATTACATAAAGAAAGCATTTA
ACGAAGGGATGGAAGATGGGGAAGAGACGGCTTTCTTTGGAACCAAAGTCAGCCATTACC
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TGGTTTTGCTGTTCCAAGACGATGAGTACGATGGTCTTCAG*TGTTGAA*GATGGAGAGT
GGATCGATGTTCAGCCGTTGCCTAATGCTATTGTT

QA 1 755 1 755
DS 

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AAGCATTTAACGAAGGGATGGAAGATGGGGAAGAGACGGCTTTCTTTGGAACCAAAGTCA
GCCATTACCCACCTTGTCCTCATCCAGAGCTTGTCAGTGGGCTTAGGGCTCATACTGATG
CGGGAGGTGTGGTTTTGCTGTTCCAAGACGATGAGTACGATGGTCTTCAGGTGTTGAAAG
ATGGAGAGTGGATCGATGTTCAGCCGTTGCCTAATGCTATTGTTATCAACACTGGTGATC
AGATTGAAGTTTTTAGCAATGGAAGGTACAAGAGTGCATGGCACAGGGTGTTGGCAAGGG
AGGAAGGAAACAGGAGGTCCATAGCTTCCTTTTACAATCCGTCGTACAAGGCGGCCATCG
GGCCAGCGGCGGTGGCGGCGGAAGGGATTGAGGAAGGAAGTGAGAAGAAGTATCCAAAGT
TTGTGTTTGGAGACTATATGGATGTCTATGCAAACCAGAAGTTCATGCCTAAGGAGCCTC
GTTTTCTTGCTGTAAAGACTCTTTAAGTGTCAATTTTATCACTGTTTTATTCAATGTCCT
GAACCATGATGTATTTTCACTTTAAGTTATTAAATGCCAAATTT

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

CO CL4868Contig1 1227 2 2 U
GGGAAAAAAAAATCAGATCTTTCCTTCTTCTTTTGTATTCCCTTAGCCACAAAGTTCGAA
CCTTTTTAGAAGAAAGGCTATGGATCGAAGAGAAGCAATGGGTTCTTATTACATCCAAAG
AGGCATGCCTGGTTCTGCTCCTCCTCCTCCTCAGACTCAACATCCCTTTCAAGGGTTTCA
CCATTTCTCCAATCCCAACTCTCCTTTCTTGTCTAACCAGAACAACCCAGGAAGCGGCGG
CGGCGGCGGCGGCTCCACTGGGTTCGTGTCTCCTCCTCCTCCTCCTACTTCCGGTGAGAC
CTCTGGGAAGAGGAAGAGAGGACGGCCTAGGAAATACGGACAAGACGGTTCTGTTTCTTT
AGCATTGTCTCCTTCCATGTCCCCCCCAAACTCTAACAAACGTGGTCGTGGTAGACCTCC
TGGCTCCGGCAAGAAGCAAAGACTTGCTTCCATTGGTGACTTGATGCCTTCATCGTCAGG
GATGAGCTTCACGCCGCACGTAATCGTAGTCTCCGTTGGTGAAGACATTGCATCAAAGGT
ACTGTCTTTCTCTCAGCAAGGTCCAAGAGCCATTTGTGTCTTATCAGCTATTGGTGCAGT
TTCTACTGCAACGCTTATTCAACCAGCACCATCCCATGGAGCTATAACCTACGAGGGTCG
TTTCGAGCTTGTTTCTCTATCACTTTCTTATCTGAACGCAAATGACAATGACTACTCAAA
CCGCACTGGAAACCTAGCGGTCTCACTCGCTAGCCCTGATGGTCGTGTCATTGGTGGTGG
AATTGGAGGGCCTTTAATTGCAGCAAGTCATGTTCAGGTTATCGTTGGGAGCTTCCTTTG
GGCGGTTCCCAAACTGAAGGTTAAGAGACGAGAAGAAGCTTCTGAAGATGTTCAAGAGAC
CGATGCTTTGGAGAACAACGACAACACAGCAGCACCAACGTCGCCTTCTGTTCCTCAGAA
CCTTGTTCAGACTCCTGTAGGCATGTGGTCAACCGGTTCAAGATCGATGGATATGCATCA
CGCTCATATGGACATTGATTTAATGCGCGGATGATGATTCATGTGTGTAGTACATAACCA
TTGAAACCTAGGAGAAGAAGAAGAAGACAAAGACTTTAAAGCTAACACCTCTCTGAGAGT
ATTATTGTCTTTTGGTTTTATGTCTAGGAAACAAAAAGACTTGTAGTGATTTTTCAGAAC
TCATGTGTTTTCATTTATTATTCTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1C824TF U 1
AF RS1C824JQ C 491
BS 1 651 RS1C824TF
BS 652 1227 RS1C824JQ

RD RS1C824TF 651 0 0
GGGAAAAAAAAATCAGATCTTTCCTTCTTCTTTTGTATTCCCTTAGCCACAAAGTTCGAA
CCTTTTTAGAAGAAAGGCTATGGATCGAAGAGAAGCAATGGGTTCTTATTACATCCAAAG
AGGCATGCCTGGTTCTGCTCCTCCTCCTCCTCAGACTCAACATCCCTTTCAAGGGTTTCA
CCATTTCTCCAATCCCAACTCTCCTTTCTTGTCTAACCAGAACAACCCAGGAAGCGGCGG
CGGCGGCGGCGGCTCCACTGGGTTCGTGTCTCCTCCTCCTCCTCCTACTTCCGGTGAGAC
CTCTGGGAAGAGGAAGAGAGGACGGCCTAGGAAATACGGACAAGACGGTTCTGTTTCTTT
AGCATTGTCTCCTTCCATGTCCCCCCCAAACTCTAACAAACGTGGTCGTGGTAGACCTCC
TGGCTCCGGCAAGAAGCAAAGACTTGCTTCCATTGGTGACTTGATGCCTTCATCGTCAGG
GATGAGCTTCACGCCGCACGTAATCGTAGTCTCCGTTGGTGAAGACATTGCATCAAAGGT
ACTGTCTTTCTCTCAGCAAGGTCCAAGAGCCATTTGTGTCTTATCAGCTATTGGTGCAGT
TTCTACTGCAACGCTTATTCAACCAGCACCATCCCATGGAGCTATAACCTA

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1C824JQ 737 0 0
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TCTCAGCAAGGTCCAAGAGCCATTTGTGTCTTATCAGCTATTGGTGCAGTTTCTACTGCA
ACGCTTATTCAACCAGCACCATCCCATGGAGCTATAACCTACGAGGGTCGTTTCGAGCTT
GTTTCTCTATCACTTTCTTATCTGAACGCAAATGACAATGACTACTCAAACCGCACTGGA
AACCTAGCGGTCTCACTCGCTAGCCCTGATGGTCGTGTCATTGGTGGTGGAATTGGAGGG
CCTTTAATTGCAGCAAGTCATGTTCAGGTTATCGTTGGGAGCTTCCTTTGGGCGGTTCCC
AAACTGAAGGTTAAGAGACGAGAAGAAGCTTCTGAAGATGTTCAAGAGACCGATGCTTTG
GAGAACAACGACAACACAGCAGCACCAACGTCGCCTTCTGTTCCTCAGAACCTTGTTCAG
ACTCCTGTAGGCATGTGGTCAACCGGTTCAAGATCGATGGATATGCATCACGCTCATATG
GACATTGATTTAATGCGCGGATGATGATTCATGTGTGTAGTACATAACCATTGAAACCTA
GGAGAAGAAGAAGAAGACAAAGACTTTAAAGCTAACACCTCTCTGAGAGTATTATTGTCT
TTTGGTTTTATGTCTAGGAAACAAAAAGACTTGTAGTGATTTTTCAGAACTCATGTGTTT
TCATTTATTATTCTACC

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

CO CL4869Contig1 912 2 2 U
GGAGCGTTAAACAATCTCGTCTTCTCTCTCTCTCTCCCTCAAGAAAACTCATCAAGACAC
TGCCTCTTCTGATTTAGGTTTCGATTAAACTGTTAATCGCGAGATCTTTCCGGTGAAACC
TATGGCGAACATGAACACTCTTCAACAGATGGTCTTTCCTGACGAGAACGCTCCGATTCA
TCGCAAAAGGGCCGTTACTGGTGCTTCTGTGAAAAGTACCAAACGAACTGTTCTTGGTCA
GAAGAAACTTGGAGGAGCTCGTAAGGCTCTGAATGATATTACAAACAAGTCTGGTGTTCA
ACCCAAAGCTTCTTCTAAGAACAAGCAGATCGCTTCTGCTGCAACTGCAACTGCTGTGAA
GGGAGAAATCAACATAGCTGGAGAGATGTACTTGCATGATCACAGCAAGTGCATCAAAGA
GCAGCAAAATCTCTGGGATGATCACTTCTCTGCTGATATTCTACTCCACCATGATCGTTC
CAGCATCAAGGGAAAGAATCTCAAGCATGAGACAGAAGTGATGGATGCTAAGAACAACCT
GACTTGTGACGAACCAGAAGAGATTCCATCTCCCAAGCTGACCGATTGGCTTAAGAGCTC
GACTCCATGGCGCTCCCCAGTCCGTCATGGCTCTATGATGATGATGCCTTCCACTCCTCT
GGCTTGGCGATTTGATTCAGATGAATTCACTCTCAAGGAAGACTATGACGACCTCTTCTG
AATGTCTGTTTCTTAATAATGTCTTTGAAAGCTTTTCATCCTTCAGATGAAGTCGTAGTA
CTAGCAGTTATGTTTCATCAATGCCTCTTCAGTTCCTCATGTACTTAACAACTCTGTGTC
CATCACTCTGTAACTGATTTGGAATCTTTTTCTAGCGTATGAGCATTATGAGCATTTTCA
TTTTACAGTTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FB96TF U 1
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BS 671 912 RS1FB96JQ

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GACTTGTGACGAACCAGAAGAGATTCCATCTCCCAAGCTGACCGATTGGCTTAAGAGCTC
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DS 

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GTTCAACCCAAAGCTTCTTCTAAGAACAAGCAGATCGCTTCTGCTGCAACTGCAACTGCT
GTGAAGGGAGAAATCAACATAGCTGGAGAGATGTACTTGCATGATCACAGCAAGTGCATC
AAAGAGCAGCAAAATCTCTGGGATGATCACTTCTCTGCTGATATTCTACTCCACCATGAT
CGTTCCAGCATCAAGGGAAAGAATCTCAAGCATGAGACAGAAGTGATGGATGCTAAGAAC
AACCTGACTTGTGACGAACCAGAAGAGATTCCATCTCCCAAGCTGACCGATTGGCTTAAG
AGCTCGACTCCATGGCGCTCCCCAGTCCGTCATGGCTCTATGATGATGATGCCTTCCACT
CCTCTGGCTTGGCGATTTGATTCAGATGAATTCACTCTCAAGGAAGACTATGACGACCTC
TTCTGAATGTCTGTTTCTTAATAATGTCTTTGAAAGCTTTTCATCCTTCAGATGAAGTCG
TAGTACTAGCAGTTATGTTTCATCAATGCCTCTTCAGTTCCTCATGTACTTAACAACTCT
GTGTCCATCACTCTGTAACTGATTTGGAATCTTTTTCTAGCGTATGAGCATTATGAGCAT
TTTCATTTTACAGTTCC

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1DC87TF U 81
AF RS1H156TF U 1
BS 1 88 RS1H156TF
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G
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TCTTAAGTACTCTCACACATTTGTCTTTTGTTTTATCTAATGTCTTCATTTATATCATCT
GTTTTACTGGAAAACACACTAATATTACGAATTGTATTAC

QA 2 521 2 521
DS 

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TCTTGATTCATGTTGCATGAAGCATGATGCTTGTGTTCAATCCAGAAATAATGATTACCT
AAGCCAAGAGTGTAGTCAGAAGTTCATAAACTGCATGGACAATTTCAGCAATACGAAGCA
ACCGACGTTTACAGGTAACACATGCGATCCCGATGAAGTCATTGATGTCATCTCCATTGT
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TGGTTAATCGCTTCTCTTGTTTCTTAAGTACTCTCACACATTTGTCTTTTGTTTTATCTA
ATGTCTTCATTTATATCATCCGTTTTACTGGAAAACACACTAA*ATTACGAATTGTATTA
CTATATAGCTTTATGTGTCTCGGATTCTAAAGGGCCGCACTAAAGCCATGTTAGAGAACT
AGTGTATATGTACTTGAT

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 2

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GCGTCAACCTACCTCCTTCTTCCTCTTCCGATCATAGATCTCCCGCTTTTGCTGGAGGAG
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AAGATGATTTCACAGCCTTCGTTGGGAGAAAACCTCCAAGACGACCAAAGAAGAGACCAA
GAACTGTTCAGAAGCAATTGAATACTGTTTTTCCCGGACTGTGGCTAGCAGAAGAGGTAA
CAGCATGCTCTTACGACCCCCCTGAGGTTGCCGAAACATGATTTAAGGGTGTGATTCTTC
ATTTTTAAGGTCCAAAAGACATTCTTCTTGTTTGTATCAACTTTGTTTTCTACTCTTCCC
CTTGTTTAAAGGAAGCACAAATGTAGCCAATGTGCCCCATTATTAGTGAACGAATGTTGT
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1B061TF U 1
AF RS1B061JQ C 130
BS 1 628 RS1B061TF
BS 629 836 RS1B061JQ

RD RS1B061TF 630 0 0
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CCCAAACTCCCAGTTTCTTCAATCAATCAATGGAGTTCCCTCCACCGCAGGAGAGATCAA
AGCGCCTCCATAACTTCACCTTACCTTATCTCCGATGGGGTCACCAGAGATTCCTCAAGT
GCGTCAACCTACCTCCTTCTTCCTCTTCCGATCATAGATCTCCCGCTTTTGCTGGAGGAG
GAGGAGAGTTTGATCTCATCGCGTGCGATGGGAAACCACCACCACCAAAGGTCTCAGCTT
TGGGCGATGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCTCGGCCGTGGAATCTGAGGACGAGGAGGG
CTGCTTGTAACGAGCCTGGAGATGAGGAGGAGGAGGAGCCCACGAGGATCACTGCCGTCA
AGAGAGATTCATCGTCGCAGAAATTGAAATTCTCTGTTTCTTTGTTGAGACAAGAGATCG
AAGATGATTTCACAGCCTTCGTTGGGAGAAAACCTCCAAGACGACCAAAGAAGAGACCAA
GAACTGTTCAGAAGCAATTGAATACTGTTTTTCCCGGACTGTGGCTAGCAGAAGAGGTAA
CAGCATGCTCTTACGACCCCCCTGAGGT
GC

QA 1 628 1 628
DS 

RD RS1B061JQ 707 0 0
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TACCTCCTTCTTCCTCTTCCGATCATAGATCTCCCGCTTTTGCTGGAGGAGGAGGAGAGT
TTGATCTCATCGCGTGCGATGGGAAACCACCACCACCAAAGGTCTCAGCTTTGGGCGATG
CAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCTCGGCCGTGGAATCTGAGGACGAGGAGGGCTGCTTGTA
ACGAGCCTGGAGATGAGGAGGAGGAGGAGCCCACGAGGATCACTGCCGTCAAGAGAGATT
CATCGTCGCAGAAATTGAAATTCTCTGTTTCTTTGTTGAGACAAGAGATCGAAGATGATT
TCACAGCCTTCGTTGGGAGAAAACCTCCAAGACGACCAAAGAAGAGACCAAGAACTGTTC
AGAAGCAATTGAATACTGTTTTTCCCGGACTGTGGCTAGCAGAAGAGGTAACAGCATGCT
CTTACGACCCCCCTGAGGTTGCCGAAACATGATTTAAGGGTGTGATTCTTCATTTTTAAG
GTCCAAAAGACATTCTTCTTGTTTGTATCAACTTTGTTTTCTACTCTTCCCCTTGTTTAA
AGGAAGCACAAATGTAGCCAATGTGCCCCATTATTAGTGAACGAATGTTGTTTTTTCATT
ACCAAAGCTAATTGTAATCTCCAGCATGTCTCGATAGTGCAACTTTC

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 2

CO CL4872Contig1 877 2 8 U
TTTTTTTTTCCAGCAAATGGAGGGGCAGTTCAAGTCACTCATTGTTCTCTCACACTACCT
TGAGGTATGTATGCAAAACATCAATCTTGGTTTGAGACTTGAGATCCTGATTTGAGTATT
TGGAATACTTGTTTTGGTTTTGTAGACTGGGAGGTTCCAGCAGTTTTGGGATGAAGCTGC
CAAGAACCGTCACATTCTCGAGACTGTTCCAGGTATATATCAATTTTCTGGAACTAGATT
AGTTACTTAAAGAATGTATCAGTTGTCTAGTACATAAGTAGGGTCCTTATGGTACTGTGT
CTATTCATTTTATGATTTGTGTGTAGATGTCTTACATGCAAGAGATTGAATGCAGGTTTT
GAACAAGCTATCCAAGCGTATGCAACTCACCTTCTTAGTTTAAGCTACCAAAAGCTTCCA
AGATCTGTGCTTGCTGAGGTATGATGTTAAATTGAATTTATGAAATCTTGACACATAATA
GATAGCTAAAGTCATCAACCTGTAGAACTTTGGATCTAAAGTCTCTCACTTTGTATAATT
TTACATGCCCTTTGCTCATTAGTTATATGATTATTTGTCACAGGCTGTTAACATGGATGG
TGCATCCCTAGACAAGTTCATTGAGCACCAGCTGAAGAACAGTGGATGGATTGTTGAGAA
AGAAAATGGAAGTATCGTCTTACCACAGAACGAGTTTAATCATCCTGAGCTTAAGAAAAA
CACAAGCGAGAATGTTCCCTTGGAGCACATCGCCCGCATCTTCCCCATCCTTGGTTAAAC
CCATTTTTTATGAGAACTCTGCAAATTTTCATTTGTCTGTTTTTCTTGTAATGCAACATT
TTGAAACGCTTTAATGTGATTTTTTTCGTCCTCTTGC


BQ
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AF RS1EV75TF U 1
AF RS1EV75JQ C 265
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AGTTACTTAAAGAATGTATCAGTTGTCTAGTACATAAGTAGGGTCCTTATGGTACTGTGT
CTATTCATTTTATGATTTGTGTGTAGATGTCTTACATGCAAGAGATTGAATGCAGGTTTT
GAACAAGCTATCCAAGCGTATGCAACTCACCTTCTTAGTTTAAGCTACCAAAAGCTTCCA
AGATCTGTGCTTGCTGAGGTATGATGTTAAATTGAATTTATGAAATCTTGACACATAATA
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TTACATGCCCTTTGCTCATTAGTTATATGATTATTTGTCACAGGCTGTTAACATGGATGG
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AGAAAATGGAAGTATCGTCTTAC*ACAGAACGAGTTTAATCATCCTGAGCTTAAGAAAA*
CACAAGCGAGA*TGTTCCCTTGGAGCACATCGCCCGCATCTTCCCCATCCTTGGTT

QA 1 776 1 776
DS 

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GAACTTTGGATTTAAAGTCTCTCACTTTGTATAATTTTACATGCCCTTTGCTCATTAGTT
ATATGATTATTTGTCACAGGCTGTTAACATGGATGGTGCATCCCTAGACAAGTTCATTGA
GCACCAGCTGAAGAACAGTGGATGGATTGTTGAGAAAGAAAATGGAAGTATCGTCTTACC
ACAGAACGAGTTTAATCATCCTGAGCTTAAGAAAAACACAAGCGAGAATGTTCCCTTGGA
GCACATCGCCCGCATCTTCCCCATCCTTGGTTAAACCCATTTTTTATGAGAACTCTGCAA
ATTTTCATTTGTCTGTTTTTCTTGTAATGCAACATTTTGAAACGCTTTAATGTGATTTTT
TTCGTCCTCTTGC

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 2

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GAGATAACAAAGAGTATCTCCCGATAGAGGGGTTGGCTGCATTCAACAAGGCCACTGCTG
AGTTACTGTTTGGTGCTGGTCATCCTGTTATCAAGGAACAAAAGGTGGCAACAATTCAGG
GTCTTTCAGGAACAGGTTCACTCCGATTAGCAGCGGCTCTTATCGAGCGTTATTTTCCTG
GAGCTAAAGTTCTGATATCTGCACCAACATGGGGTAATCACAAGAATATCTTCAACGATG
CCAAAGTTCCCTGGTCTGAGTACAGATACTATGATCCCAAAACAATTGGGTTTGGATTTT
GATGGGGATGATAGCAGATATTAAGGAAGCTCCAGAAAGATCATTCATATTGCTACACGG
TTGTGCTCACAACCCAACTGGAATTGACCCAACACCAGAACAGTGGGTGAAAATTGCTGA
CGTCATTCAAGAAAAG


BQ
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AF RS1EZ32TF U 1
AF RS1AM20TF U 93
BS 1 96 RS1EZ32TF
BS 97 97 RS1AM20TF
BS 98 288 RS1EZ32TF
BS 289 289 RS1AM20TF
BS 290 534 RS1EZ32TF
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BS 550 550 RS1AM20TF
BS 551 585 RS1EZ32TF
BS 586 736 RS1AM20TF

RD RS1EZ32TF 585 0 0
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ACCCATTCCTGAAAGCAAAGTCATTTAGCAGGGTGATCATGTCGGTTGCAGTCAAGCCTT
CTCGATTTGAGGGTATTACCATGGCTCCACCAGACCCTATTCTTGGAGTCAGCGAAGCTT
TCAAAGCTGACACTAACGAGCTTAAGCTAAATCTCGGTGTTGGTGCGTACCGAACTGAGG
AACTCCAGCCTTATGTCCTTAATGTTGTTAAAAAGGCGGAGAACCTGATGTTGGAGAGAG
GAGATAACAAAGAGTATCTCCCGATAGAGGGGTTGGCTGCATTCAACAAGGCCACTGCTG
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CCAAAGTTCTCTGGTCTGAGTACAGATACTATGATCCCAAAACAA

QA 1 585 1 585
DS 

RD RS1AM20TF 644 0 0
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GACCCTATTCTTGGAGTCAGCGAAGCTTTCAAAGCTGACACTAACGAGCTTAAGCTAAAT
CTCGGTGTTGGTGCGTACCGAACTGAGGAACTCCAGCCTTATGTCCTTAATGTTGTTAAA
AAGGCGGAGAACCTGAGGTTGGAGAGAGGAGATAACAAAGAGTATCTCCCGATAGAGGGG
TTGGCTGCATTCAACAAGGCCACTGCTGAGTTACTGTTTGGTGCTGGTCATCCTGTTATC
AAGGAACAAAAGGTGGCAACAATTCAGGGTCTTTCAGGAACAGGTTCACTCCGATTAGCA
GCGGCTCTTATCGAGCGTTATTTTCCTGGAGCTAAAGTTCTGATATCTGCACCAACATGG
GGTAATCACAAGAATATCTTCAACGATGCCAAAGTTCCCTGGTCTGAGTACAGATACTAT
GATCCCAAAACAATTGGGTTTGGATTTTGATGGGGATGATAGCAGATATTAAGGAAGCTC
CAGAAAGATCATTCATATTGCTACACGGTTGTGCTCACAACCCAACTGGAATTGACCCAA
CACCAGAACAGTGGGTGAAAATTGCTGACGTCATTCAAGAAAAG

QA 1 644 1 644
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL4876Contig1 1247 2 6 U
GATCTGGAAATCTAAATCATAATCTTCGTTCTGAGGGATTTAGGGCTTTGTTCTATGTTG
GGTAGGTACAACTGCATATGATCTCTATCCTCTGTCTGCAAAGTATGAAAGGTTGTGGAT
GCCTTTATTCCTGGAGATCGATTTTCAGGAGAAACAATGGTCTGTGTGTCTTTGTAATTG
AGCCAGTTCCTGCTTCTCTTATTTGATGTGTGTTGTTTTTTCGTTTTAGGACAGGTGATA
CGCTTTTTGCATTTGTCCGCTTTAAGTATAAAGACGAAGCTCACAAATCAGTGGGAACGC
TTTGATGCTAGGTCTAATATCAATTTATGCACTTGGTGATTGGATTTGACATGAAAGCAT
TTGTTATTGTTTTAGGAAGAGTTTTATTAGGTTTTTGTTTAAGTTTCTAATTTTTGATTT
TTATACTTAAAACCATTTTTATATTCTCAGTGTGTATGTTTTATCTCTTAGAACTTACTG
TCTTCTGTGTTTGTTGAGTTTTCTGTTTTGTTCGTCTTGGAGTTTCCGTTGTATTTTGAT
TTTTCTTTTCCTGAAGGTTTAGCTACGAAATTATGTTTACAGACGACGAGATCTGCGACA
TTGATATATTTGTCATTTCAGTTAGGATATTATCACAAAAAAAAAAAAATCTCTAAGCAT
GTGATTATGTTAACCTCCAATGATCTCCGATTGCATGAATCAAACAGTGTTAGTCTTAAC
CTGAAACATACCTTTTTAAATCATACCTTAAACATGCTTGCTTTTATGATTTTAGATCTG
GGGTTTGTTCTGACATAACAGGCTGCATGAATGGTAGTATAACTGGCCGCACAACTACCT
GCACAGCGAGTGTTCGTAGATGTTGCAAAAGCTATCTCAGAATTCGAACTTGTGACAGTC
AGTGCAAGCCCGCTCAGTGGCAAAATGCAAGGAAACAACTTCCATATGATATCAGAGTTG
TTGAGATGAGTATGAATGATTCTTAGCTCCGCGACTATGGACCAACTGTAAGTTCTGTCC
CTTCTCCATAATATCTATATGTTCAGAACTTACATCTGCTCTGAACGATTCTTAGTTCCA
TAATCTGTAAGTTCTTTTTTGAGAAGAGTATGAATGGTTGGTTTTTGCTCTTTTTACAGA
TTTTTGTGTGAAAAGACCATTTTTACTACTCTGGATCATTCCTTACATCAAAAAGCTAAC
CAATAGAAAATGAATAAAATACGACTGAGTTACATTGTTACGGTGCC


BQ
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AF RS1B448TF U 1
AF RS1B448JQ C 594
BS 1 648 RS1B448TF
BS 649 649 RS1B448JQ
BS 650 751 RS1B448TF
BS 752 752 RS1B448JQ
BS 753 764 RS1B448TF
BS 765 1247 RS1B448JQ

RD RS1B448TF 764 0 0
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GGTAGGTACAACTGCATATGATCTCTATCCTCTGTCTGCAAAGTATGAAAGGTTGTGGAT
GCCTTTATTCCTGGAGATCGATTTTCAGGAGAAACAATGGTCTGTGTGTCTTTGTAATTG
AGCCAGTTCCTGCTTCTCTTATTTGATGTGTGTTGTTTTTTCGTTTTAGGACAGGTGATA
CGCTTTTTGCATTTGTCCGCTTTAAGTATAAAGACGAAGCTCACAAATCAGTGGGAACGC
TTTGATGCTAGGTCTAATATCAATTTATGCACTTGGTGATTGGATTTGACATGAAAGCAT
TTGTTATTGTTTTAGGAAGAGTTTTATTAGGTTTTTGTTTAAGTTTCTAATTTTTGATTT
TTATACTTAAAACCATTTTTATATTCTCAGTGTGTATGTTTTATCTCTTAGAACTTACTG
TCTTCTGTGTTTGTTGAGTTTTCTGTTTTGTTCGTCTTGGAGTTTCCGTTGTATTTTGAT
TTTTCTTTTCCTGAAGGTTTAGCTACGAAATTATGTTTACAGACGACGAGATCTGCGACA
TTGATATATTTGTCATTTCAGTTAGGATATTATCACAAAAAAAAAAAA*TCTCTAAGCAT
GTGATTATGTTAACCTCCAATGATCTCCGATTGCATGAATCAAACAGTGTTAGTCTTAAC
CTGAAACATACCTTTTTAAATCATACCTTAA*CATGCTTGCTTT

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1B448JQ 654 0 0
TGCGACATTGATATATTTGTCATTTCAGTTAGGATATTATCACAAAAAAAAAAAAATCTC
TAAGCATGTGATTATGTTAACCTCCAATGATCTCCGATTGCATGAATCAAACAGTGTTAG
TCTTAACCTGAAACATACCTTTTTAAATCATACCTTAAACATGCTTGCTTTTATGATTTT
AGATCTGGGGTTTGTTCTGACATAACAGGCTGCATGAATGGTAGTATAACTGGCCGCACA
ACTACCTGCACAGCGAGTGTTCGTAGATGTTGCAAAAGCTATCTCAGAATTCGAACTTGT
GACAGTCAGTGCAAGCCCGCTCAGTGGCAAAATGCAAGGAAACAACTTCCATATGATATC
AGAGTTGTTGAGATGAGTATGAATGATTCTTAGCTCCGCGACTATGGACCAACTGTAAGT
TCTGTCCCTTCTCCATAATATCTATATGTTCAGAACTTACATCTGCTCTGAACGATTCTT
AGTTCCATAATCTGTAAGTTCTTTTTTGAGAAGAGTATGAATGGTTGGTTTTTGCTCTTT
TTACAGATTTTTGTGTGAAAAGACCATTTTTACTACTCTGGATCATTCCTTACATCAAAA
AGCTAACCAATAGAAAATGAATAAAATACGACTGAGTTACATTGTTACGGTGCC

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 2

CO CL4877Contig1 1179 2 2 U
GAGAGACTGAGTGTTTGCTTATTGTATGAAATGAGCAAGGGGAAGAGCTCTTTCTGGTAC
CCTTACTTGTTTCATTTGCCTCGGGACTATGATCTCTTGTCCACTTTCCGTGATTTCGAG
AAGCAAGCTTTACAAGTTGAAGATGCTGTTTGGGCTGCAGAGAAAGCTATATCCAAGTCT
CTGTCTGAGTGGAAAGAAGCTGTTACGTTGATGAAGGAGTTAGATCTCAAGCCCAAGTTT
CAGAGTCTTCATGCATGGAACTGGGCTTCTGCTACTATATCTTCGCGGACGCTGCATGTT
CCATGGGACAGTGCAGGGTGCTTGTGTCCCGTGGGGGACTTGTTTAACTATGATGCTCCT
GGAGATGATCATTTGAATACCTCTGCGAATTCAACTACTAATGCAGAGGAAGCAGGACAT
GTTGTTGAGACTCTGTCTGAAAGGCTCACAGATGGTGGATTCGATGGAGACGCCAATGCT
TATTGTCTTTATGCAAGAAGGAATTATCAGCTTGGAGAACAGGTTCTTCTATGTTACGGG
ACTTACACGAATCTGGAGCTTCTTGAGCACTATGGGTTTACCTTAGAAGAGAACTCAAAT
GACAAGGTCTTTATCCCTCTAGAAACCACCCTTTATGCTCTAGCTTCTTCATGGCCTAAA
GATTCTTTATACATTCATCAAGACGGCAAGCCGTTTTTTGCGCTTGTATCCACGCTGAGA
CTGTGGCTGATCCCGCAGAGCCAGCGTGACAAGTCGGTTATGCGCCTCGTTTACGCTGGA
TTTCAGATATCTGTGAAGAATGAGGTTCTGGTCATGAAGTGGGTGGCAGAGAAATGCCGA
AGTGTTTTAAGGGATCTGCCAACATCTCTCGTAGAGGATAGAGTGATTTTTCGGGACATT
GACAAGCTCCAAGACCCTGAGTTGCGTCCGGAGCAGAGAGAAGCAGAAGCTTTTTGCAGT
GAAGTACGTTGTTTTCTAGATGTGAAGAACCATTTGGTAAATGGGGGATTTTGTGGGAAA
ATGAATAGGAGAGTGAGTAAATGGAGATTGACAGTGCAGTGGAGGCTAAGGTACAAGAGA
ACTCTTGCAGATTGCATCTCTTATTGTAATGAGAAACTTAATCATTTAATATAGAATTTG
GAGATTTGTAACATCATTTTTATATGGAAAAATAATGCT


BQ
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AF RS1H389TF U 1
AF RS1ER88JQ C 558
BS 1 678 RS1H389TF
BS 679 1179 RS1ER88JQ

RD RS1H389TF 678 0 0
GAGAGACTGAGTGTTTGCTTATTGTATGAAATGAGCAAGGGGAAGAGCTCTTTCTGGTAC
CCTTACTTGTTTCATTTGCCTCGGGACTATGATCTCTTGTCCACTTTCCGTGATTTCGAG
AAGCAAGCTTTACAAGTTGAAGATGCTGTTTGGGCTGCAGAGAAAGCTATATCCAAGTCT
CTGTCTGAGTGGAAAGAAGCTGTTACGTTGATGAAGGAGTTAGATCTCAAGCCCAAGTTT
CAGAGTCTTCATGCATGGAACTGGGCTTCTGCTACTATATCTTCGCGGACGCTGCATGTT
CCATGGGACAGTGCAGGGTGCTTGTGTCCCGTGGGGGACTTGTTTAACTATGATGCTCCT
GGAGATGATCATTTGAATACCTCTGCGAATTCAACTACTAATGCAGAGGAAGCAGGACAT
GTTGTTGAGACTCTGTCTGAAAGGCTCACAGATGGTGGATTCGATGGAGACGCCAATGCT
TATTGTCTTTATGCAAGAAGGAATTATCAGCTTGGAGAACAGGTTCTTCTATGTTACGGG
ACTTACACGAATCTGGAGCTTCTTGAGCACTATGGGTTTACCTTAGAAGAGAACTCAAAT
GACAAGGTCTTTATCCCTCTAGAAACCACCCTTTATGCTCTAGCTTCTTCATGGCCTAAA
GATTCTTTATACATTCAT

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1ER88JQ 622 0 0
GCTTCTTGAGCACTATGGGTTTACCTTAGAAGAGAACTCAAATGACAAGGTCTTTATCCC
TCTAGAAACCACCCTTTATGCTCTAGCTTCTTCATGGCCTAAAGATTCTTTATACATTCA
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GAGCCAGCGTGACAAGTCGGTTATGCGCCTCGTTTACGCTGGATTTCAGATATCTGTGAA
GAATGAGGTTCTGGTCATGAAGTGGGTGGCAGAGAAATGCCGAAGTGTTTTAAGGGATCT
GCCAACATCTCTCGTAGAGGATAGAGTGATTTTTCGGGACATTGACAAGCTCCAAGACCC
TGAGTTGCGTCCGGAGCAGAGAGAAGCAGAAGCTTTTTGCAGTGAAGTACGTTGTTTTCT
AGATGTGAAGAACCATTTGGTAAATGGGGGATTTTGTGGGAAAATGAATAGGAGAGTGAG
TAAATGGAGATTGACAGTGCAGTGGAGGCTAAGGTACAAGAGAACTCTTGCAGATTGCAT
CTCTTATTGTAATGAGAAACTTAATCATTTAATATAGAATTTGGAGATTTGTAACATCAT
TTTTATATGGAAAAATAATGCT

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 2

CO CL4878Contig1 804 2 3 U
TTTTTTTTTCTTGTGAAATGCCAATATAAAACACCAAAGATAACTTGACAGAAGGTAACA
AAAACCAATACAGTCTAACCATCTTCCCTTATAAGGCAAACAAACTGCTACTACAGAAAG
TGTCATCATTGGTCCATTAAAACAACAACTCTAAAGCTCATGAAGAGAAACAAAACCTGG
AACGTCCTCTTGCACTCATCAATCAACCGTCTAAACTGCTCAACGAGTTGATGCACCATC
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TTCGCAATATTGAGATCCTGAAACAATCCATCTTTAAAATACTCTCTAGTCAGAATCGCT
TCGTAGAAGACATAGGACTCGGCCAAGTAGCCAGCATCGCTCGTACGCATGTAATGCCCG
TAGTAAAGCTGCGCGATTCGAGAAGCGATCTCTCCAATCTCCCATCTCTTGAGTCCAGAT
TCCACGAGCTTCTGGCGATTCTCTTGCTGAAACTTCCATAGCTGTGTGTACACTTTGAAC
ACCTTGAAGAAATAGTTTTCATACCTGCTGCGTTCGTAGAAAGGCAAGTCTCTGATCTTG
GAGAATTTTTTGTCGGCTTTGTTGACGAGAGACCAGTAAACTTCACTCAGCGGGATATTG
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TGACTCTACGGAGAGGAGGAGGACTGGTTCGCTATTCCTATGTGCGATCGAGTTGTTGTT
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BQ
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AF RS1EP73JQ U 13
AF RS1EP73TF C 1
BS 1 12 RS1EP73TF
BS 13 473 RS1EP73JQ
BS 474 804 RS1EP73TF

RD RS1EP73JQ 461 0 0
GTGAAATGCCAATATAAAACACCAAAGATAACTTGACAGAAGGTAACAAAAACCAATACA
GTCTAACCATCTTCCCTTATAAGGCAAACAAACTGCTACTACAGAAAGTGTCATCATTGG
TCCATTAAAACAACAACTCTAAAGCTCATGAAGAGAAACAAAACCTGGAACGTCCTCTTG
CACTCATCAATCAACCGTCTAAACTGCTCAACGAGTTGATGCACCATCTCTCTACGGCCT
AACACCAAACAAACCATAAGAAACCTAGCAAGAAACCGAAGCTGCTTGTTCGCAATATTG
AGATCCTGAAACAATCCATCTTTAAAATACTCTCTAGTCAGAATCGCTTCGTAGAAGACA
TAGGACTCGGCCAAGTAGCCAGCATCGCTCGTACGCATGTAATGCCCGTAGTAAAGCTGC
GCGATTCGAGAAGCGATCTCTCCAATCTCCCATCTCTTGAG

QA 1 461 1 461
DS 

RD RS1EP73TF 804 0 0
TTTTTTTTTCTTGTGAAATGCCAATATAAA*CACCAAAGATAACT*GACAGAAGGTAACA
AAA*CCAATACAGTCTAACCATCT*CCCTTATAAGGCAAACAAACTGCTACTACAGAAAG
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AACGTCCTCTTGCACTCATCAATCAACCGTCTAAACTGCTCAACGAGTTGATGCACCATC
TCTCTACGGCCTAACACCAAACAAACCATAAGAAACCTAGCAAGAAACCGAAGCTGCTTG
TTCGCAATATTGAGATCCTGAAACAATCCATCTTTAAAATACTCTCTAGTCAGAATCGCT
TCGTAGAAGACATAGGACTCGGCCAAGTAGCCAGCATCGCTCGTACGCATGTAATGCCCG
TAGTAAAGCTGCGCGATTCGAGAAGCGATCTCTCCAATCTCCCATCTCTTGAGTCCAGAT
TCCACGAGCTTCTGGCGATTCTCTTGCTGAAACTTCCATAGCTGTGTGTACACTTTGAAC
ACCTTGAAGAAATAGTTTTCATACCTGCTGCGTTCGTAGAAAGGCAAGTCTCTGATCTTG
GAGAATTTTTTGTCGGCTTTGTTGACGAGAGACCAGTAAACTTCACTCAGCGGGATATTG
TTTCCGCTGATTAGCTGTGACATTTTCTGAGAAGCTTGAAGGTCACGCACGGCGAAGCGG
TGACTCTACGGAGAGGAGGAGGACTGGTTCGCTATTCCTATGTGCGATCGAGTTGTTGTT
TGTCGTCGTCTTCTAGATCGGCCC

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 2

CO CL4879Contig1 266 2 1 U
GGGCTGCACAGTTGCGGCCACACAACAAACCCTTTTATGAAATCTATCAATCTATTATAG
TTCTTGAAGACAACTTCCAAGCTTCTTCCTTTCTATTTTTTGCACTTAAATAAAGCTTTA
ATAAGCTATTTATATTTCAATAAATCTCTGTTTTACATTCGTTCTCATGGTATCAGAGCT
TCAGTCGGTTTTCATGGGATTACCTTATCATTTTCTAGCTTCCGCACGTTCTGTACAAGC
CGTCTCAAGTTTCCACCAAACTCTCC


BQ
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AF RS1D603JQ C 1
AF RS1D603TF U 1
BS 1 266 RS1D603TF

RD RS1D603JQ 266 0 0
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TTCTTGAAGACAACTTCCAAGCTTCTTCCTTTCTATTTTTTGCACTTAAATAAAGCTTTA
ATAAGCTATTTATATTTCAATAAATCTCTGTTTTACATTCGTTCTCATGGTATCAGAGCT
TCAGTCGGTTTTCATGGGATTACCTTATCATTTTCTAGCTTCCGCACGTTCTGTACAAGC
CGTCTCAAGTTTCCACCAAACTCTCC

QA 1 266 1 266
DS 

RD RS1D603TF 266 0 0
GGGCTGCACAGTTGCGGCCACACAACAAACCCTTTTATGAAATCTATCAATCTATTATAG
TTCTTGAAGACAACTTCCAAGCTTCTTCCTTTCTATTTTTTGCACTTAAATAAAGCTTTA
ATAAGCTATTTATATTTCAATAAATCTCTGTTTTACATTCGTTCTCATGGTATCAGAGCT
TCAGTCGGTTTTCATGGGATTACCTTATCATTTTCTAGCTTCCGCACGTTCTGTACAAGC
CGTCTCAAGTTTCCACCAAACTCTCC

QA 1 266 1 266
DS 



AS 1 2

CO CL4880Contig1 492 2 1 U
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AAACCGTTATTGGTGATTGTAATAAGAGAAACCTAGACTGAAGTAGAGAATCCAAGCAGT
GAAGGCTTTCTCATCATTTTCAACGTATTTTAAAAATTTCTATTGCAATAAATTTGAAAC
ATGTGTGTGTTGATCAACTGATCAGTAGTGATATAAATGTTTGTAAGTTTACGCCTTTGT
TTCTTTCTGGTTTTTTTCATGTGCAAGTTTACTTTGTCCAATTAATAAAAAGATCAAAAA
TAATAAGTTTGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1D180JQ C 1
AF RS1D180TF U 1
BS 1 492 RS1D180TF

RD RS1D180JQ 492 0 0
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CCCCCAGTTTACCATTCTCCACCACCACCCAAGAAGTACGTATATAAATCACCTCCTCCT
CCAGTCCACCACTACTCTCCCCCACACCATCCTTACCTCTACACATCTCCTCCTCCTCCA
TACCACTATTAGAAAACTCTTTCACGGAGAGAACAAGATGTACACAAGTAGACAAGATGG
AAACCGTTATTGGTGATTGTAATAAGAGAAACCTAGACTGAAGTAGAGAATCCAAGCAGT
GAAGGCTTTCTCATCATTTTCAACGTATTTTAAAAATTTCTATTGCAATAAATTTGAAAC
ATGTGTGTGTTGATCAACTGATCAGTAGTGATATAAATGTTTGTAAGTTTACGCCTTTGT
TTCTTTCTGGTTTTTTTCATGTGCAAGTTTACTTTGTCCAATTAATAAAAAGATCAAAAA
TAATAAGTTTGT

QA 1 492 1 492
DS 

RD RS1D180TF 492 0 0
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CCCCCAGTTTACCATTCTCCACCACCACCCAAGAAGTACGTATATAAATCACCTCCTCCT
CCAGTCCACCACTACTCTCCCCCACACCATCCTTACCTCTACACATCTCCTCCTCCTCCA
TACCACTATTAGAAAACTCTTTCACGGAGAGAACAAGATGTACACAAGTAGACAAGATGG
AAACCGTTATTGGTGATTGTAATAAGAGAAACCTAGACTGAAGTAGAGAATCCAAGCAGT
GAAGGCTTTCTCATCATTTTCAACGTATTTTAAAAATTTCTATTGCAATAAATTTGAAAC
ATGTGTGTGTTGATCAACTGATCAGTAGTGATATAAATGTTTGTAAGTTTACGCCTTTGT
TTCTTTCTGGTTTTTTTCATGTGCAAGTTTACTTTGTCCAATTAATAAAAAGATCAAAAA
TAATAAGTTTGT

QA 1 492 1 492
DS 



AS 1 2

CO CL4881Contig1 1063 2 2 U
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GAGACCTCAACTCTACTCTGCTGCTGATTACTGTGAGAAGTCTTATCTCCATAGCGAACA
GAAGCAAATGGTGTTGGACAATTTGAAGGACTACACTGTTAAGGCTCTGGTGAATGCTGT
TGATCACCTGGGTACTGTTGCTTCCAAGCTTACTCATCTCTTTGATCAGCAGAGCTCTGA
CATATCAACTATGGAGCTGAGGGCTTCTTGTGTTAGCCAGCAACTGCTTACTTGCCGGAC
TTATATAGACAAAGAAGGTCTTAGACAGCAGCAGCTTTTAGCAGTTATCCCACTTCATCA
CAAACACTACATTCTACCTAATTCTGCCAACAAGCGGGTGCACTTTAGTCCTCTCAGAAG
ATCTGAATCAAGACAGAATCATCACCAAGCTATATCCCGTCTTCAACCTTCAGATGCCCC
TGCTTCGAAATCACTTTCCTGGCATTTAGGCTCAGAGACTAAGTCGACCCCGAAAGGAAC
AACAGCCACTGTTGCACCAAGCTCCAAAGATTCAAAAGCTTTTGCAAAGACAACTGGAGT
GTTCCATCTTTTAGGTGATGAAGAAAACGTAAAGCCTTTGGTCGGAGGTTCTCAAGTCTC
AGGTGTTCCTGCAACATCCACTATCACAAGGCAGGCACAGAAGGATACGGAAGTCCCCAA
ACTTACGACGGCTCACAACCCACGAAGAGAGATCATTCAAGCACCCGTAAGGACCAAGAG
TGTTCTATTTGCATTTTTCGTCAAACAGAAAACTCCAAAGCTCAAAGCTGGTTACGTCTA
GTGAAAACAACTCCCTACACTGACACTGAGAATGAAATTTCAATATCATCCCATCACCTT
TCTTTTATTTTTACAACACGTTCTCTTTCCATGTATAAATTTTCTTAGTTCAAACATATC
AATGTACTAAGTCGTACAAACATGTTCCGTGATTAACAAAACTGTGTAGATCAAGAATAA
TGTTGTTTTAAGCAAAGCTTTGAAGTGCAAAGACGCTACAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AV36TF U 1
AF RS1AV36JQ C 412
BS 1 583 RS1AV36TF
BS 584 1063 RS1AV36JQ

RD RS1AV36TF 583 0 0
GGAGGTTTCCATGGAACGCAGCAAGAGCTTCGTCAAGGCCTTGCAGGAGCTCAAGAACTT
GAGACCTCAACTCTACTCTGCTGCTGATTACTGTGAGAAGTCTTATCTCCATAGCGAACA
GAAGCAAATGGTGTTGGACAATTTGAAGGACTACACTGTTAAGGCTCTGGTGAATGCTGT
TGATCACCTGGGTACTGTTGCTTCCAAGCTTACTCATCTCTTTGATCAGCAGAGCTCTGA
CATATCAACTATGGAGCTGAGGGCTTCTTGTGTTAGCCAGCAACTGCTTACTTGCCGGAC
TTATATAGACAAAGAAGGTCTTAGACAGCAGCAGCTTTTAGCAGTTATCCCACTTCATCA
CAAACACTACATTCTACCTAATTCTGCCAACAAGCGGGTGCACTTTAGTCCTCTCAGAAG
ATCTGAATCAAGACAGAATCATCACCAAGCTATATCCCGTCTTCAACCTTCAGATGCCCC
TGCTTCGAAATCACTTTCCTGGCATTTAGGCTCAGAGACTAAGTCGACCCCGAAAGGAAC
AACAGCCACTGTTGCACCAAGCTCCAAAGATTCAAAAGCTTTT

QA 1 583 1 583
DS 

RD RS1AV36JQ 652 0 0
TCTCAGAAGAT*TGAATCAAGACAGAATCATCACCAAGCTATATCCCGTCTTCAACCTTC
AGATGCCCCTGCTTTGAAATCACTTTCCTGGCATTTAGGCTCAGAGACTAAGTCGACCCC
GAAAGGAACAACAGCCACTGTTGCACCAAGCTCCAAAGATTCAAAAGCTTTTGCAAAGAC
AACTGGAGTGTTCCATCTTTTAGGTGATGAAGAAAACGTAAAGCCTTTGGTCGGAGGTTC
TCAAGTCTCAGGTGTTCCTGCAACATCCACTATCACAAGGCAGGCACAGAAGGATACGGA
AGTCCCCAAACTTACGACGGCTCACAACCCACGAAGAGAGATCATTCAAGCACCCGTAAG
GACCAAGAGTGTTCTATTTGCATTTTTCGTCAAACAGAAAACTCCAAAGCTCAAAGCTGG
TTACGTCTAGTGAAAACAACTCCCTACACTGACACTGAGAATGAAATTTCAATATCATCC
CATCACCTTTCTTTTATTTTTACAACACGTTCTCTTTCCATGTATAAATTTTCTTAGTTC
AAACATATCAATGTACTAAGTCGTACAAACATGTTCCGTGATTAACAAAACTGTGTAGAT
CAAGAATAATGTTGTTTTAAGCAAAGCTTTGAAGTGCAAAGACGCTACAAAG

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 2

CO CL4882Contig1 856 2 2 U
GTGGAACACTCACTTACAGCAACCTCTTATGAAGTTGACAGAGCATACATCGCCTTTTAA
GCATGGAACTGAAAGGCAGGTCTGCAATCTGGCGTGGAACAAGAATGTTTACGAGATAGA
GAACGGGTACTCTCAAAACCAAATCATGCCTTGGAACTGGAAGTACCCATCCATGGCAAA
TATTGTTAGATGCATCTGATGGTTATAGACTATGAGAATTATGGAATACCTAATGCTGAG
TACCATTCAATTGTTAGGAGGCGGTAGAGAAGTCGATTCCATTCTCAAGGTGGTGCTCTG
CTTTGAGGAAAACGATATTTTTCATGTCTGTGGCAGACTAATTCCCACATCTGACGGTCT
GAGCTTGATTTCATCAATCTCGAACTCATTTTCTGCGACTTGGATCAGGGAAATTTAGAA
ATTTAAATTACCTGAGATGTCAAGGAAAGAATGCGTCATTGAAGTGGTGAAGATGTGAGC
AGTGCTTGCTTCTCATATACTCAACTTCAGTAGTAAATTATTGTGATTCTCTTTATAACG
ACCGATTATTGGTTTGAAACCATATATTTTTGAATCCTCAGAGGTTCATTTTAGAGCAAG
ATATAGAGTGAGGTTCATGTGCAGCATTTACAAGGTACACGATGAAGCCAAATAAAATGT
CTTTATTCGCCGGAAATCTGATGGGTCAAAATGGGAGCACCAATTTAAATGTTGTTCTAA
AGATGGTGTAAAGAAATTCTGTCTAAAGCTTCCCATAAACCATGTTTTATTCTTGGATAT
GATCTTGCAACTTTGAATGTAATAATTTATTATTTTGTTTGACTTAATAATTATTAAGTT
GTCAACTTCTTTTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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BS 609 856 RS1DI07JQ

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ATATAGAG

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DS 

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ATATGATCTTGCAACTTTGAATGTAATAATTTATTATTTTGTTTGACTTAATAATTATTA
AGTTGTCAACTTCTTTTATG

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DS 



AS 1 2

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CAAG


BQ
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10 10 10 10 

AF RS1AS26TF U 1
AF RS1AS26JQ C 564
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CCTCGATCGTTTTACTTTGGTCATACCGTATTGTCTGGACACGATCAAATGGGATGTTAT
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TTTTATGCCTTGTAGCAGCAGCACTGTTGATTCATTACTAGACAAGGCTTTGTCTGAGTG
GAACAACCAGGACTCGACACTCCTACTTGTTCTCATTCAAGGATTGAGGGATCAATATGT
GGCCTACCAACGAAAGCGAGTGGGTCAAGTTGATGATGATCGTGTCAAGTTTGAAATTAG
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GCTTT*CCCTGTTGAGGATGTTAA
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DS 

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AACTTCCTCCATGGATGGATGGGATGTGCTTAGCTGAATATCTTCCCCATCTCGAAGAAA
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AGGCATTGACTTTTTTTCTTGGAAGACCTCTTGAAGCGGATCCTACCTTTTGCCGTAAGG
CATCTTTCCTTGCTGCCTCGGGACCATTTCCATTCGTGGTTCACTTCTTCTTTCCAACTC
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GCGAGCCGGTAAAATTAAACCTCCTCACCGACTACCCATGGAGTCCTAGGTGGGAAGTGG
GGCGCATGGCTGAACGATTGTGTGACTTCCTAACCGATGAAGCTGTCAACTTCAAAAAAT
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GAATGTTATGTTATATTTCTCCTGTTATGTCAAGTTTAGTGGAATCCTTTTTGTACTTTC
ATGAAAATATTGAATGACAACTGAAACCGTTTCTTCTCAAG

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

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CCACATCCTGCAGGGACGAATCTTTCTTTGTTCAAGAGAGATATCGATGAGCTCATAGAC
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AATTTCTCTTATATATATGAAGCCTTTCCTAACACCAACTTAGCCTTTTTCATTCAGTCA
CTATATGCTCATACCATTGGTCACATGGTTAGTATTGATTATTTTTCAAGGAGACTTGGA
GGTCTTTACTGTCTTTATTGCCTTCACGAGATCCAGCCTTTCAAACCCAAGTTCCGGGTC
TATATCTCACTTCAGGAGCTTGAGAAACTTAGGGATCTTATAATTGAGGCAAAGGACAAA
GGTGTAGAGATGGCTAATGCTGTGGCGAAACAAATGCTTGACAGAAACATGTTTGTATTT
GGAGCTGTAGACTTTGATGAAGCGTCTACAACTGAGAAGCTTCACCAATCAACAGAGCTA
CAGAATGCACTTGTGCGGTGTGCTTATAGAAAATTAACGTCTGAAACCGAGATTGAGAAG
TTTATTCATTTGGATATTGGTAATGAAGTTGATCTGAGTTCCCTGCGTAAAATGTCTATG
GAATATGCAGAGGCCAAGAAGCGTACAGTGAAAAGTGCAGGAGAAATAGTGGAGATTGAG
GGCATAAAGCACATAGCTGAAGAGAAAGAACTGATGTCAGAGAGAGTGGAGAAACTGAAA
GAGGAATGGGATTCGCAAAAAGTTTCATTTTATGAGAAAACCAAGCTTGATGGTCTTCAT
ACGACACAGAAACTTCTGAAAGATGTTGAAAACGGTGAAGATGATGGGTTTGATGAGCTT
GATCGCCTACTTTGTGAGAGCTGACTTAGGGACATCTCTAACCCAACTCCATTTTTTACT
CAAAAATAGATAAAAAGTGAATATAGAGTAACATATGCTCCAATCCAACTCCATATCTCA
CTCCATTTTGAAGTTTACTCCATAAATAGAGTAATCTATTTTTTGTTTGTTCATGATTCC
ATTATAGAGTGAAAAATAGAGTAGGGTTTGAGCAATTTTACTCCATATTCACTTTTACTC
CATTTTGGAGAAAAAAATAGAGTTTTACATTGGAGATGTTCTTTAGCCACTGGAACTACC
TTTTATGGATGCCCGCTATTGAAAAGCTCTCTATAGACCTGGTATCTACAGGTGAGTTTG
CTTGAACCAGACTTTGTATCAAGTGCTTATTGAAAAGCTCTCTATTGCCGCTTTTTATGG
TCTCTTGTTTCTGGGGCTATTTCGTTTTGCCGCCAGTTTGTATATGGTATTGATATTTGA
CATATGATATTTGACA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AM21TF U 1
AF RS1AM21JQ C 594
BS 1 756 RS1AM21TF
BS 757 1456 RS1AM21JQ

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AATTTCTCTTATATATATGAAGCCTTTCCTAACACCAACTTAGCCTTTTTCATTCAGTCA
CTATATGCTCATACCATTGGTCACATGGTTAGTATTGATTATTTTTCAAGGAGACTTGGA
GGTCTTTACTGTCTTTATTGCCTTCACGAGATCCAGCCTTTCAAACCCAAGTTCCGGGTC
TATATCTCACTTCAGGAGCTTGAGAAACTTAGGGATCTTATAATTGAGGCAAAGGACAAA
GGTGTAGAGATGGCTAATGCTGTGGCGAAACAAATGCTTGACAGAAACATGTTTGTATTT
GGAGCTGTAGACTTTGATGAAGCGTCTACAACTGAGAAGCTTCACCAATCAACAGAGCTA
CAGAATGCACTTGTGCGGTGTGCTTATAGAAAATTAACGTCTGAAACCGAGATTGAGAAG
TTTATTCATTTGGATATTGGTAATGAAGTTGATCTGAGTTCCCTGCGTAAAATGTCTATG
GAATATGCAGAGGCCAAGAAGCGTACAGTGAAAAGT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RS1AM21JQ 863 0 0
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TGAGAAGTTTATTCATTTGGATATTGGTAATGAAGTTGATCTGAGTTCCCTGCGTAAAAT
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TCTTCATACGACACAGAAACTTCTGAAAGATGTTGAAAACGGTGAAGATGATGGGTTTGA
TGAGCTTGATCGCCTACTTTGTGAGAGCTGACTTAGGGACATCTCTAACCCAACTCCATT
TTTTACTCAAAAATAGATAAAAAGTGAATATAGAGTAACATATGCTCCAATCCAACTCCA
TATCTCACTCCATTTTGAAGTTTACTCCATAAATAGAGTAATCTATTTTTTGTTTGTTCA
TGATTCCATTATAGAGTGAAAAATAGAGTAGGGTTTGAGCAATTTTACTCCATATTCACT
TTTACTCCATTTTGGAGAAAAAAATAGAGTTTTACATTGGAGATGTTCTTTAGCCACTGG
AACTACCTTTTATGGATGCCCGCTATTGAAAAGCTCTCTATAGACCTGGTATCTACAGGT
GAGTTTGCTTGAACCAGACTTTGTATCAAGTGCTTATTGAAAAGCTCTCTATTGCCGCTT
TTTATGGTCTCTTGTTTCTGGGGCTATTTCGTTTTGCCGCCAGTTTGTATATGGTATTGA
TATTTGACATATGATATTTGACA

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DS 



AS 1 2

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CGTTGCATCTGCCGGAAGCTTCTACGAGAGCTTTGATATCACTTGGGGAGATGGTCGTGC
CGACATATACGAGAGTGGACAGCTTCTCACTTGTACTCTTGACAAGGTCTCCGGCTCAGG
GTTTCAGTCCAAGAGGGAGTACTTGTACGTTAAGATCGACATGAAGCTCAAGCTCGTCGC
TGGAAACTCAGCTGGAACCGTAACCGCCTACTACCTTTCGTCTAAAGGTGCGACATGGGA
TGAGATTGACTTTGAGTTCTTGGGAAATCTCACAGGACAGCCTTACACTTGTGGATGGGA
TCCCAATTCGGGTGTTCAAGAACAACGAGAAAAATGGAGTGGCATACCCTACGTCCCAAC
CCATGAAGATATACTCAAGCCTTTGGGAAGCTGATGACTGGGCCACGCAGGGCGGTCGCG
TGAAGACAGACTGGAGCAACGCACCAAAAAGAATTCATGATCTACAACTATTGTACCGAT
TACAAGAGGTTCCCTCAGGGTTTTGCCAAGGAGTGTTACCTTTGAAAACTTTGGTTGATC
CTCCTACATTGAGAATTTTCGAGCATTTTCCTCAATAATTTTTATTTTATTTCCCTTTCG
TGTTATTTCATTCTTGTGATGTTACTTTGATTTATTCTCTTTTATTCAAGTGTTTCTGAG
ATGCGATAATACATGCACGCATATATAATGTTACC


BQ
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AF RS1CH35TF U 1
AF RS1CH35JQ C 123
BS 1 614 RS1CH35TF
BS 615 815 RS1CH35JQ

RD RS1CH35TF 614 0 0
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GGTTCCCGCGACAAAAAAGCCTCTGTTGTTGTCTTTCCTCGGCTTTGGCTTCTTTGTTCT
CGTTGCATCTGCCGGAAGCTTCTACGAGAGCTTTGATATCACTTGGGGAGATGGTCGTGC
CGACATATACGAGAGTGGACAGCTTCTCACTTGTACTCTTGACAAGGTCTCCGGCTCAGG
GTTTCAGTCCAAGAGGGAGTACTTGTACGTTAAGATCGACATGAAGCTCAAGCTCGTCGC
TGGAAACTCAGCTGGAACCGTAACCGCCTACTACCTTTCGTCTAAAGGTGCGACATGGGA
TGAGATTGACTTTGAGTTCTTGGGAAATCTCACAGGACAGCCTTACACTTGTGGATGGGA
TCCCAATTCGGGTGTTCAAGAACAACGAGAAAAATGGAGTGGCATACCCTACGTCCCAAC
CCATGAAGATATACTCAAGCCTTTGGGAAGCTGATGACTGGGCCACGCAGGGCGGTCGCG
TGAAGACAGACTGGAGCAACGCACCAAAAAGAATTCATGATCTACAACTATTGTACCGAT
TACAAGAGGTTCCC

QA 1 614 1 614
DS 

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TTGCATCTGCCGGAAGCTTCTACGAGAGCTTTGATATCACTTGGGGAGATGGTCGTGCCG
ACATATACGAGAGTGGACAGCTTCTCACTTGTACTCTTGACAAGGTCTCCGGCTCAGGGT
TTCAGTCCAAGAGGGAGTACTTGTACGTTAAGATCGACATGAAGCTCAAGCTCGTCGCTG
GAAACTCAGCTGGAACCGTAACCGCCTACTACCTTTCGTCTAAAGGTGCGACATGGGATG
AGATTGACTTTGAGTTCTTGGGAAATCTCACAGGACAGCCTTACACTTGTGGATGGGATC
CCAATTCGGGTGTTCAAGAACAACGAGAAAAATGGAGTGGCATACCCTACGTCCCAACCC
ATGAAGATATACTCAAGCCTTTGGGAAGCTGATGACTGGGCCACGCAGGGCGGTCGCGTG
AAGACAGACTGGAGCAACGCACCAAAAAGAATTCATGATCTACAACTATTGTACCGATTA
CAAGAGGTTCCCTCAGGGTTTTGCCAAGGAGTGTTACCTTTGAAAACTTTGGTTGATCCT
CCTACATTGAGAATTTTCGAGCATTTTCCTCAATAATTTTTATTTTATTTCCCTTTCGTG
TTATTTCATTCTTGTGATGTTACTTTGATTTATTCTCTTTTATTCAAGTGTTTCTGAGAT
GCGATAATACATGCACGCATATATAATGTTACC

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

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TATTCAAACATTTTATTTTCTCTATTTTGGGCATGCCGTTTCTCATGATACATAGTGTTT
CATCATTGAACCTTACCAATGAGTATCTCAATCACAAATGCCTCCTTGATCAAGGGAAAT
ATAACTCTGGAAGTGAGTACGAGGATAACCTCAACCGTCTCTTTCGTTCAGTTAGTAGTG
ATGCTTATGGTGTGATTGGTTTCGTACACACAAGTATTGGATCGACTCCCAATTTTATTT
CTATCACTCTCCAGTGTCGTGGTGACTCTATTGGGTCTAAATGCCATACATGTACTGACA
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ACCAATGTTTTCTCTTTGTTACTACAATCAAAGAAAAAGATCTAATCAAAACTAACTACG
AGAATATTTTTTCTATGTACAACTCAAATAACGTGAGAGGGGATGGAATCTTGTTTGCCA
AGAGGGTGATGGATTTTTTATCTGAGCTCACACTTAAAGTCGAGAAAACAATCAAGGGCA
TTCACATCTTATTATATGCGGAAAGGGAAAAGAAGTTTGGGAAAAATAAATTGTATGCAA
TGGTGCAGTGTATACAACTAACATTAGATTGTAAGAGTTGTCTGCAATGGAGTATCAAAA
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TAAGATATGAGTTATACCCTTTTCTTAGGAGAAGCAATTTCACGGTGGTGTGAATACATC
CTTTTCATAATTTCTAATTATGAGTTTTGTTTACTTTTTTTATTTAGCTGAAATGTTACA
TTCATATATCAATAAAAATAGTGTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1G269TF U 1
AF RS1G269JQ C 215
BS 1 645 RS1G269TF
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TATTCAAACATTTTATTTTCTCTATTTTGGGCATGCCGTTTCTCATGATACATAGTGTTT
CATCATTGAACCTTACCAATGAGTATCTCAATCACAAATGCCTCCTTGATCAAGGGAAAT
ATAACTCTGGAAGTGAGTACGAGGATAACCTCAACCGTCTCTTTCGTTCAGTTAGTAGTG
ATGCTTATGGTGTGATTGGTTTCGTACACACAAGTATTGGATCGACTCCCAATTTTATTT
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ACCAATGTTTTCTCTTTGTTACTACAATCAAAGAAAAAGATCTAATCAAAACTAACTACG
AGAATATTTTTTCTATGTACAACTCAAATAACGTGAGAGGGGATGGAATCTTGTTTGCCA
AGAGGGTGATGGATTTTTTATCTGAGCTCACACTTAAAGTCGAGAAAACAATCAAGGGCA
TTCACATCTTATTATATGCGGAAAGGGAAAAGAAGTTTGGGAAAA*TAAATTGTATGCAA
TGGTGCAGTGTATACAACTAACATTAGATTGTAAGAGTTGTCTGCAATGGAGTATC

QA 1 716 1 716
DS 

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TATTGGATCGACTCCCAATTTTATTTCTATCACTCTCCAGTGTCGTGGTGACTCTATTGG
GTCTAAATGCCATACATGTACTGACACCGCAATCTCGGAGTTTCGTAAGAGATGTCCGAA
GAACAAAGGAGGAATCATATGGTACGACCAATGTTTTCTCTTTGTTACTACAATCAAAGA
AAAAGATCTAATCAAAACTAACTACGAGAATATTTTTTCTATGTACAACTCAAATAACGT
GAGAGGGGATGGAATCTTGTTTGCCAAGAGGGTGATGGATTTTTTATCTGAGCTCACACT
TAAAGTCGAGAAAACAATCAAGGGCATTCACATCTTATTATATGCGGAAGGGGAAAAGAA
GTTTGGGAAAAATAAATTGTATGCAATGGTGCAGTGTATACAACTAACATTAGATTGTAA
GAGTTGTCTGCAATGGAGTATCAAAAAACTTTTCAATAACAGTAACGTTAAACAAGGAGC
AAGAGTTTTGGGTACGAATTGTGAAGTAAGATATGAGTTATACCCTTTTCTTAGGAGAAG
CAATTTCACGGTGGTGTGAATACATCCTTTTCATAATTTCTAATTATGAGTTTTGTTTAC
TTTTTTTATTTAGCTGAAATGTTACATTCATATATCAATAAAAATAGTGTTTAC

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

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GGGCCGATCTATCAGAACTCTACAGTGTGTCGCAGAACGAGAGAGAGAGATAGAGACAAT
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AGTCTCTTATGAGATCACTAAGATCAATCTCTACAAGGATGGTAGGCATGGCAAAGCGTG
GGGTATCGTTCACAAAGATGGGCTGCGAGCTGCGGAAGCTCCTAAGAAGATAAGCGGAGT
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CTCTGCAACCGCCGCCGAAGTTCAACCTGCCTGATGGTCTGTTTGCTTCCATTGTTTGTG
GGGGTACTTCTCAGGATATATCTGTTTGCAGTTTGTTTACCTTTTGGAAGATACAACTCT
TTTGTTACTTGATGAGTCACTTTTGAATTTGGTGGTAGCTTTGTAGGAAAATATTGGCTT
TTCGGTCCATCTTTTAAAGACTTGTACGCTTCTTGACATGGATTGTGATTGGCTTTTTGT
GTCAACTTGTGTTGTAGGTGATCTTCTGGTGTTAAAACATCTAATAAAATACATCATTTA
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RS1DY64TF U 1
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GGGGTACTTCTCAGGATATATCTGTTTGCAGTTTGTTTACCTTTTGGAAGATACAACTCT
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TT

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DS 

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TGGCTTTTTGTGTCAACTTGTGTTGTAGGTGATCTTCTGGTGTTAAAACATCTAATAAAA
TACATCATTTACC

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 2

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AAATCTATTTATTTTAAAAGGAAACAGATGAAATAAGATGTATATATGTATATGGTTTCA
TATGTTTTTGTATTTGCATAATAATCAATTTCTTCGGCTG


BQ
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AF RS1CW01TF U 1
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QA 1 162 1 162
DS 

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TATGTTTTTGTATTTGCATAATAATCAATTTCTTCGGCTG

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

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ATCTGTTCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DD32JQ C 1
AF RS1DD32TF U 1
BS 1 549 RS1DD32TF

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QA 1 549 1 549
DS 

RD RS1DD32TF 549 0 0
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TTTTTCATGTAATGGCTTGATGTTGAATGAACCTAGTTCCATTCTCTTTATCAAAGGATT
ATCTGTTCC

QA 1 549 1 549
DS 



AS 1 2

CO CL4890Contig1 638 2 13 U
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AAGCATACAATAGAATCCAGAACCAATTATTGTCTCAAATAGATACCAAACACACAACTC
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AATACATTCAAACACAAACAGAAGACACTTCAGATTAACACACACCATTCATCTTCTTCC
TCTCCTTCACAAACTTCCTCCATCCAACAATGACTTCCATCAGAATGTCCCTTTCCACCT
TCTTCCCTTTCACATTTCCGAAATCCTCCGCTCCCATCTTCTTGGATATCTTGGAAGGCA
AGGTGTCAAGCTCGTGAAGCACCTTCACAATATCAGCCACAAGTCTCTCCGCAAGTGTTC
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TGGTGTAAGCCGGGACAATCCAGCCAAAACGGCGTAGCATCTCTGAGATCTCGAACTCGT
TGTGGAAACTGTGGTCCTTGAGAGAGAAGGCTACCAGTGGCACTCCTACCTCCTTTGAGA
CTATGTTGAAACGCTCTGTTTTCTCGATCCCTTCTCTC


BQ
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15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FM96JQ U 14
AF RS1G286JQ U 1
BS 1 64 RS1G286JQ
BS 65 65 RS1FM96JQ
BS 66 78 RS1G286JQ
BS 79 79 RS1FM96JQ
BS 80 108 RS1G286JQ
BS 109 109 RS1FM96JQ
BS 110 207 RS1G286JQ
BS 208 208 RS1FM96JQ
BS 209 301 RS1G286JQ
BS 302 302 RS1FM96JQ
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BS 384 638 RS1G286JQ

RD RS1FM96JQ 555 0 0
CG
TTTCAAGACTATTTTACAAATAATCAAAGGCTCAAGATGAGTTTCAAGCATACAATAGAA
TCCAGAATCAATTATTGTCTCAAATAGATACCAAACACACAACTCTTTCATCAAACTCCA
AGTTCTCACACACTCACATACCTCTTCTTTTATTAGACGACATTTAATACATTCGAACAC
AAACCGAAGACACTTCAGATTAACACACACCGTTCATCTTCTTCCTCTCCTTCACAAACT
TCCTCCATCCAACAATGACTTCCATCAGAATGTCCCTTTCCACCTTCTTCCCTTTCACAT
TTCCGAAATCCTCTGCTCCCATCTTCTTGGATATCTTGGATGGCAAGGTGTCAAGCTCGT
GAAGCACCTTCACGATATCAGCCACAAGTCTCTCCGCAAGTGTTCTTGAGAAATCTTCCC
TTATGACAACACGGAGAACCGTGATGTGTTGCGCATCCGCAGGCATGGTGTAAGCCGGGA
CAATCCAGCCAAAGCGGCGTAGCATCTCTGAGATCTCGAACTCGTTGTGGAAACTGTGGT
CCTTGAGAGAGAA

QA 3 555 3 555
DS 

RD RS1G286JQ 638 0 0
CTCAAGGAAATAGCATTTCAAGACTATTTTACAAATAATCAAAGGCTCAAGATGAGTTTC
AAGCGTACAATAGAATCCGGAACCAATTATTGTCTCAAATAGATACCAGACACACAACTC
TTTCATCAAACTCCAAGTTCTCACACACACACATACCTCTTCTTTTATTAGACGACATTT
AATACATTCAAACACAAACAGAAGACAGTTCAGATTAACACACACCATTCATCTTCTTCC
TCTCCTTCACAAACTTCCTCCATCCAACAATGACTTCCATCAGAATGTCCCTTTCCACCT
TTTTCCCTTTCACATTTCCGAAATCCTCCGCTCCCATCTTCTTGGATATCTTGGAAGGCA
AGGTGTCAAGCTCGTGAAGCACTTTCACAATATCAGCCACAAGTCTCTCCGCAAGTGTTC
TTGAGAAATCTTCCCTTATGACAACACGGAGAACCGTGATGTGTTGCGCATCCGCAGGCA
TGGTGTAAGCCGGGACAATCCAGCCAAAACGGCGTAGCATCTCTGAGATCTCGAACTCGT
TGTGGAAACTGTGGTCCTTGAGAGAGAAGGCTACCAGTGGCACTCCTACCTCCTTTGAGA
CTATGTTGAAACGCTCTGTTTTCTCGATCCCTTCTCTC

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

CO CL4891Contig1 714 2 4 U
GGATGAGTAGCCGTTCAAGTCCGTTCGGACAGCAAGTGAGGACGCTGCCTCAGCAACAGC
AAGTGAGGACGCTGTCTCAACACCAGCAAGGGAGGACACTTCCTCAACAACAACAGCAAG
GGATGATGGTGAAAAGATGCAGCGAGTCAAAACGCTGGCGTTTCAGCAAGAGGAATGCTA
CTGATTCAGACTCTGAGTCCGATGCACCAATGTCTGATGATGATGATTCCGGTGATAGTT
TACCCCCGCCTCCTCTGTCCAAGAGGCTGAAGACGGAGGAGAAGAAGATGATTAGCAAGA
AGGAGGAAGCAAGTGGAGGGAGCTAAGCCGCGCGATCATGAGATTCGGTGAAGCTTACGA
GCAAACAGAGAACGCGAAACTGCAGCAAGTGGTTGAGATGGAGAAAGAGAGGATGAAGTT
CTTGAAGGAGCTGGAACTGCAGAGAATGCAGTTCTTTGTGAAGACTCAATTGGAGATATC
AGAGATTAAGCAGGCACGGAGGAGAATGGGTAACACTAGTAGTGATGATCACCACAAGAG
CAAAAACAACATGAATGCGATTGTCAGCAACGATGATGTCGGTAACTAGAGAGTTATAGT
TTGATTCAGGTCGTAATCTACATATATTTTAGATTTGAGTTTGATATTGTCGAGAAAGAA
ACTTATTTAGGCTTTTATCATGAGTGTATTATTAATAGTTTGCCAAACCTTTGT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FT31TF U 1
AF RS1DA37TF U 487
BS 1 496 RS1FT31TF
BS 497 497 RS1DA37TF
BS 498 652 RS1FT31TF
BS 653 714 RS1DA37TF

RD RS1FT31TF 652 0 0
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AAGTGAGGACGCTGTCTCAACACCAGCAAGGGAGGACACTTCCTCAACAACAACAGCAAG
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TACCCCCGCCTCCTCTGTCCAAGAGGCTGAAGACGGAGGAGAAGAAGATGATTAGCAAGA
AGGAGGAAGCAAGTGGAGGGAGCTAAGCCGCGCGATCATGAGATTCGGTGAAGCTTACGA
GCAAACAGAGAACGCGAAACTGCAGCAAGTGGTTGAGATGGAGAAAGAGAGGATGAAGTT
CTTGAAGGAGCTGGAACTGCAGAGAATGCAGTTCTTTGTGAAGACTCAATTGGAGATATC
AGAGATTAAGCAGGCAGGGAGGAGAATGGGTAACACTAGTAGTGATGATCACCACAAGAG
CAAAAACAACATGAATGCGATTGTCAGCAACGATGATGTCGGTAACTAGAGAGTTATAGT
TTGATTCAGGTCGTAATCTACATATATTTTAGATTTGAGTTTGATATTGTCG

QA 1 652 1 652
DS 

RD RS1DA37TF 228 0 0
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CAACATGAATGCGATTGTCAGCAACGATGATGTCGGTAACTAGAGAGTTATAGTTTGATT
CAGGTCGTAATCTACATATATTTTAGATTTGAGTTTGATATTGTCGAGAAAGAAACTTAT
TTAGGCTTTTATCATGAGTGTATTATTAATAGTTTGCCAAACCTTTGT

QA 1 228 1 228
DS 



AS 1 2

CO CL4892Contig1 1126 2 2 U
GGAAAAAAAAAAAACAGAAGACGTGTGAAAAAGAAAAACAGAACACATCCGGCGATGTCA
GGTCCGAGCCGAAAGAACATGGAAAGAATTAAAGGTCCATGGAGTCCAGAAGAAGATAAT
CTCTTGCAGAGTCTGGTGCAGAAACACGGTCCGAGAAACTGGTCCTTGATCAGCAAATCT
ATCCCCGGGCGCTCGGGTAAATCCTGCCGTCTCCGCTGGTGTAACCAGCTATCTCCGGAG
GTCGAGCACCGTGCCTTTACGGCGGAGGAAGACGAGACGATTATTCGGGCACACGCTCGG
TTCGGTAACAAGTGGGCGACCATCTCTCGTCTCCTCAATGGAAGAACCGACAACGCTATC
AAGAACCATTGGAACTCGACGCTCAAGCGTAAATGCAGCGCTTTTACATCTGATGGACAG
AGCTGTGACTTCGGTGGTAACGGAGGGTATGACGGTAACTTAGGAGAGGAGCAACCGTTG
AAACGTACGGCGAGTGGTGGTGGTGTGTCTACCGGGTTATATATGAGCCCCGGAAGTCCA
TCTGGATCTGACGTCAGCGAGCAATCCAGTGGTGCTCCACACGTGTTCAAACCGACGGCT
AGATCTGGTGCTGTAACGGAGGTGACGGCGTCAACGTCCGGTGAAGATCCGCCTACTTAT
CTAAGTTTGTCTCTCCCTTGGAATAACCGTTGCGAGACGGAGACGGTTAGAGTCAACGAG
CCAACTCAAGTAAACGAGAACACGGTTATTGACGTTGGTTACACGGCGGAGCTGTTCCCG
ATTAGAAAGGAAGAGGTGGAAGAAGAGAAAGGGATATCAGGATTCGGTGGTGAGTTCATG
ACGGTGGTGCAGGATATGATTAGGACGGAGGTGAGGAGTTACATGGCGGATTTACAGCGA
GGGAACGTTGCTGGTGGTGGTTCTAGCGGAGGAAGTGGTGGTGGTGGTGGTTCGTGTATG
CCGCAAAGTGTGAACAGCCGCCGTGTCGGGTTTAGGGAGTTTATAGTGAAGCAAATCGGT
ATTGGGAAGAGCGAGTAGTGATTTTAAGTGAGAGAAGAAAGCAAAAGAGTCTTAAAAACT
TTTCACTCTGTTTCTCGTGAAAATAAAAGTTTCAGGCTTTTCATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1A617TF U 1
AF RS1A617JQ C 288
BS 1 783 RS1A617TF
BS 784 1126 RS1A617JQ

RD RS1A617TF 783 0 0
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ATCCCCGGGCGCTCGGGTAAATCCTGCCGTCTCCGCTGGTGTAACCAGCTATCTCCGGAG
GTCGAGCACCGTGCCTTTACGGCGGAGGAAGACGAGACGATTATTCGGGCACACGCTCGG
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AGCTGTGACTTCGGTGGTAACGGAGGGTATGACGGTAACTTAGGAGAGGAGCAACCGTTG
AAACGTACGGCGAGTGGTGGTGGTGTGTCTACCGGGTTATATATGAGCCCCGGAAGTCCA
TCTGGATCTGACGTCAGCGAGCAATCCAGTGGTGCTCCACACGTGTTCAAACCGACGGCT
AGATCTGGTGCTGTAACGGAGGTGACGGCGTCAACGTCCGGTGAAGATCCGCCTACTTAT
CTAAGTTTGTCTCTCCCTTGGAATAACCGTTGCGAGACGGAGACGGTTAGAGTCAACGAG
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ATT

QA 1 783 1 783
DS 

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CGACAACGCTATCAAGAACCATTGGAACTCGACGCTCAAGCGTAAATGCAGCGCTTTTAC
ATCTGATGGACAGAGCTGTGACTTCGGTGGTAACGGAGGGTATGACGGTAACTTAGGAGA
GGAGCAACCGTTGAAACGTACGGCGAGTGGTGGTGGTGTGTCTACCGGGTTATATATGAG
CCCCGGAAGTCCATCTGGATCTGACGTCAGCGAGCAATCCAGTGGTGCTCCACACGTGTT
CAAACCGACGGCTAGATCTGGTGCTGTAACGGAGGTGACGGCGTCAACGTCCGGTGAAGA
TCCGCCTACTTATTTAAGTTTGTCTCTCCCTTGGAATAACCGTTGCGAGACGGAGACGGT
TAGAGTCAACGAGCCAACTCAAGTAAACGAGAACACGGTTATTGACGTTGGTTACACGGC
GGAGCTGTTCCCGATTAGAAAGGAAGAGGTGGAAGAAGAGAAAGGGATATCAGGATTCGG
TGGTGAGTTCATGACGGTGGTGCAGGATATGATTAGGACGGAGGTGAGGAGTTACATGGC
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AGTCTTAAAAACTTTTCACTCTGTTTCTCGTGAAAATAAAAGTTTCAGGCTTTTCATGG

QA 1 839 1 839
DS 



AS 1 2

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AAAAACATGTCGGGCTTG


BQ
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AF RS1B381TF U 1
AF RS1B381JQ C 9
BS 1 506 RS1B381TF
BS 507 678 RS1B381JQ

RD RS1B381TF 506 0 0
GGGCCTTCTTCTCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAAACCCAAATTCAAGTTCAATCC
TGTTTACGGACATTAACCTTTATCGCAGCGAACTCTCAAAAGACCACCACATGGCCAACT
TCGATGGGCCAGGGTTCGCGATGGTTGATGGCTACTGGATCCAGACCAAAGCCATAGACG
TCGAATCATCAACCGACAACCTCAAGGATCTCTACCGCTTCTTCGCTTCCAAGTTCGTCA
CGTTCGTCGGCGTTCAGATCCAAGAAGACCTTGTCTTGCTCAAGGAGAATCACGGGATCG
TGATTAGGAGCTCCTTGGAGATTGGGAAGCTTGCTGCTAAAGCGAGAGGGACTCCGATCG
TTGAGTTCCTTGGGACGAGGGAGTTGGCTCATAAGATACTTTGGTATGATATGAGCAGGC
TCGATTCGATTCAGTCCAAGTGGGATGAAGCTGGGGGGGAATGATCGTCTTGAAGCTGCT
GCTATTGAAGGTTGGCTTATTTATAG

QA 1 506 1 506
DS 

RD RS1B381JQ 670 0 0
TTCTCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAAACCCAAATTCAAGTTCAATCCTGTTTACG
GACATTAACCTTTATCGCAGCGAACTCTCAAAAGACCACCACATGGCCAACTTCGATGGG
CCAGGGTTCGCGATGGTTGATGGCTACTGGATCCAGACCAAAGCCATAGACGTCGAATCA
TCAACCGACAACCTCAAGGATCTCTACCGCTTCTTCGCTTCCAAGTTCGTCACGTTCGTC
GGCGTTCAGATCCAAGAAGACCTTGTCTTGCTCAAGGAGAATCACGGGATCGTGATTAGG
AGCTCCTTGGAGATTGGGAAGCTTGCTGCTAAAGCGAGAGGGACTCCGATCGTTGAGTTC
CTTGGGACGAGGGAGTTGGCTCATAAGATACTTTGGTATGATATGAGCAGGCTCGATTCG
ATTCAGTCCAAGTGGGATGAAGCTGGGGGG*AATGATCGTCTTGAAGCTGCTGCTATTGA
AGGTTGGCTTATTTATAGTGTTTACGATCAGTTGCAGCAGTGATGTGTTGTTCTTGATCA
TATGGATTTTGTGAGATTGCTTGCGCTTGATATTGATTGCAGTTTGTGCATTTTGATCTC
TTTGTTGGTTGTTATTGAGTGAACAAAATAATAATGTACTGAATAAAGAAAAAAAAACAT
GTCGGGCTTG

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

CO CL4894Contig1 1238 2 2 U
GTGTACTCCCTCCATTTCTAATCGTCAGTAGTTTTACTTAAAAACACAAATATTTAGAAA
GTTCTTAATTTTTTTTTAAACAATATTATTTAATTAATTAATTTAACCAATTGTAAAAAA
ATCTAAAATTATTTTAATGGTCACCCAATATCCAATAAATGAAAAAGATGCATTGAAATA
TATAAACTACTTGTATTATGAAACAAATTTCTTTTGTTAAAACTACTTACAGCTAACTGT
ATAGTGAACCCATTAAACTATTCACAAATGCCATATATTAAAAACTCGATTCAAACGGCA
AGATATTGAGATTTCACATACTCATACATGATGCACCCATAATCTACAGCTAACTACCAT
GCATATTTCTGGAATCTGAAACCCAAATCTCTATCTACCACACTCGATCGATGATAGTTT
ATCGACACGTCAAATTCTTTTGAATTAATTACAAGTTATTTGTCCTCTTCTTATTCCCCC
CCCCCCCCTCCCCCCTCTTTCAGATTCTCTATCCGTGCAGTTTCTAGTGGTATATATATA
TAGCAACTATAGAAGAGACCAAATATATTTCAGAACACAAGCTCGAGTCATATATTGAAA
GCAATATACTTGTACCGATATACAAGTTTATATAGGGTAAATAGATAATTCCATATATAC
ATAACAAAAATTTACAAGAAAAAACTAGTTTGTGTCTTTGTTTTACGTTCGTGGGTTCAC
ATACACAGTTGATGGGAAGAACTGTGATCACCAAAGCACCAAAGCTTTTCTTAAGGTCAA
CGCCACAACTTTCTCATCATTCTTCTTTTATTTTCACATATCAAATTCTATTAGCCACGC
ATACATCACAAAGGCTGAAAACAACCCCCAAATAAATCATCTTGTTAATTGCTTAATCAG
TAAACTATAAATTTTTCATATTTTGTGTTCAAAACCTTCTTATCGTCATAACTTTTACAA
AAAAAAATTTGTAAACTAAGCTTTTTTGAAATTAATATAGTTATGGCCCATAGTAGACAC
GGACAAAATACTCGAAACCCGATATTAAAACCGAACCTGAATCCGTATCCGATTCGAGCT
GTTATAAAATAAATGTTTATACAAATACTTTTCAAGATCTAGCTTTTATAAAAAATTTAA
CTAGTAGCTAGGGTGGGTGTTCGAGGAAAAGCTACATAGGTAGTAATTAAAATGTGTGAT
CAATATGTGAAGTATAGACAACTTTGAGGTCATTTGTG


BQ
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AF RS1D033TF U 1
AF RS1D033JQ C 503
BS 1 664 RS1D033TF
BS 665 1238 RS1D033JQ

RD RS1D033TF 664 0 0
GTGTACTCCCTCCATTTCTAATCGTCAGTAGTTTTACTTAAAAACACAAATATTTAGAAA
GTTCTTAATTTTTTTTTAAACAATATTATTTAATTAATTAATTTAACCAATTGTAAAAAA
ATCTAAAATTATTTTAATGGTCACCCAATATCCAATAAATGAAAAAGATGCATTGAAATA
TATAAACTACTTGTATTATGAAACAAATTTCTTTTGTTAAAACTACTTACAGCTAACTGT
ATAGTGAACCCATTAAACTATTCACAAATGCCATATATTAAAAACTCGATTCAAACGGCA
AGATATTGAGATTTCACATACTCATACATGATGCACCCATAATCTACAGCTAACTACCAT
GCATATTTCTGGAATCTGAAACCCAAATCTCTATCTACCACACTCGATCGATGATAGTTT
ATCGACACGTCAAATTCTTTTGAATTAATTACAAGTTATTTGTCCTCTTCTTATTCCCCC
CCCCCCCCTCCCCCCTCTTTCAGATTCTCTATCCGTGCAGTTTCTAGTGGTATATATATA
TAGCAACTATAGAAGAGACCAAATATATTTCAGAACACAAGCTCGAGTCATATATTGAAA
GCAATATACTTGTACCGATATACAAGTTTATATAGGGTAAATAGATAATTCCATATATAC
ATAA

QA 1 664 1 664
DS 

RD RS1D033JQ 736 0 0
GATTCTCTATCCGTGCAGTTTCTAGTGGTATATATATATAGCAACTATAGAAGAGACCAA
ATATATTTCAGAACACAAGCTCGAGTCATATATTGAAAGCAATATACTTGTACCGATATA
CAAGTTTATATAGGGTAAATAGATAATTCCATATATACATAACAAAAATTTACAAGAAAA
AACTAGTTTGTGTCTTTGTTTTACGTTCGTGGGTTCACATACACAGTTGATGGGAAGAAC
TGTGATCACCAAAGCACCAAAGCTTTTCTTAAGGTCAACGCCACAACTTTCTCATCATTC
TTCTTTTATTTTCACATATCAAATTCTATTAGCCACGCATACATCACAAAGGCTGAAAAC
AACCCCCAAATAAATCATCTTGTTAATTGCTTAATCAGTAAACTATAAATTTTTCATATT
TTGTGTTCAAAACCTTCTTATCGTCATAACTTTTACAAAAAAAAATTTGTAAACTAAGCT
TTTTTGAAATTAATATAGTTATGGCCCATAGTAGACACGGACAAAATACTCGAAACCCGA
TATTAAAACCGAACCTGAATCCGTATCCGATTCGAGCTGTTATAAAATAAATGTTTATAC
AAATACTTTTCAAGATCTAGCTTTTATAAAAAATTTAACTAGTAGCTAGGGTGGGTGTTC
GAGGAAAAGCTACATAGGTAGTAATTAAAATGTGTGATCAATATGTGAAGTATAGACAAC
TTTGAGGTCATTTGTG

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

CO CL4895Contig1 790 2 12 U
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ACACGCTTCACTATCATCAGCAGAGGTTGCTTCAGCTACAAGCGATGATCAAGAACATGA
GGAAAATGGCAACGAACCATTTGTAGTCAGCGAACCCCTTTTGCCAAACGATCAAACCCT
TAAACGCCAGAAATCTTCTTTCTCCGACTTACTAGACGCTACAGATTTCACGTTCTTGAC
AAACTTTCTAAACGAGACTCCGGACAATCGTACTGAAACAGACCTTTCTTTCATGTTTGG
AGATTTCTCAAACCCTGACATCTACGGGAACCGTTACTTGGATCACAAGTTACCGAAGCT
GAGCTCTCCAACTTCAGAGACCAGAGTTATCGGAAACAAAAGAGAACGATTGGACTATTC
TGAAGAAATGATCAACACTTCGAAGAAGATGATCAACAACTTTAGTTACAATAATAGCAT
GGATCATTTGGATCATAGTATGGTTCAACAATCTAGTTTTCTGAATCAGGAATTCTTGAT
GAGTCCTCCTCACCTTCACTATCAAGGCTAGAGATGTTCAAAACCCAATTATGCGAATTA
GGGCCCATTTGATGATTGAAAAGTAGGAGTCGTTACTATTATATAAAATTACAAAAGTAT
TGTGGGGAGGGGGGAAATATATAAAATAGTGGTAGTCGATATTTGATCGTATCAATACAA
CCATATTTTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H650TF U 1
AF RS1H650JQB C 265
BS 1 686 RS1H650TF
BS 687 687 RS1H650JQB
BS 688 707 RS1H650TF
BS 708 708 RS1H650JQB
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BS 775 790 RS1H650JQB

RD RS1H650TF 790 0 0
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GGAAAATGGCAACGAACCATTTGTAGTCAGCGAACCCCTTTTGCCAAACGATCAAACCCT
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AGATTTCTCAAACCCTGACATCTACGGGAACCGTTACTTGGATCACAAGTTACCGAAGCT
GAGCTCTCCAACTTCAGAGACCAGAGTTATCGGAAACAAAAGAGAACGATTGGACTATTC
TGAAGAAATGATCAACACTTCGAAGAAGATGATCAACAACTTTAGTTACAATAATAGCAT
GGATCATTTGGATCATAGTATGGTTCAACAATCTAGTTTTCTGAATCAGGAATTCTTGAT
GAGTCCTCCTCACCTTCACTATCAAGGCTAGAGATGTTCAAAACCCAATTATGCGAATTA
GGGCCCATTTGATGATTGAAAAGTAG*AGTCGTTACTATTATATAAA*TTACAAA*GTAT
TGTGGGGAGGGGG*AAATATATAAA*TAGTGGTAGTCGATATTTGATCGTATCA
TACAACATATTTTGAA

QA 1 774 1 774
DS 

RD RS1H650JQB 526 0 0
CGACTTACTAGACGCTACAGATTTCACGTTCTTGACAAACTTTCTAAACGAGACTCCGGA
CAATCGTACTGAAACAGACCTTTCTTTCATGTTTGGAGATTTCTCAAACCCTGACATCTA
CGGGAACCGTTACTTGGATCACAAGTTACCGAAGCTGAGCTCTCCAACTTCAGAGACCAG
AGTTATCGGAAACAAAAGAGAACGATTGGACTATTCTGAAGAAATGATCAACACTTCGAA
GAAGATGATCAACAACTTTAGTTACAATAATAGCATGGATCATTTGGATCATAGTATGGT
TCAACAATCTAGTTTTTTGAATCAGGAATTCTTGATGAGTCCTCCTCACCTTCACTATCA
AGGCTAGAGATGTTCAAAACCCAATTATGCGAATTAGGGCCCATTTGATGATTGAAAAGT
AGGAGTCGTTACTATTATATAAAATTACAAAAGTATTGTGGGGAGGGGGGAAATATATAA
AATAGTGGTAGTCGATATTTGATCGTATCAATACAACCATATTTTG

QA 1 526 1 526
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL4899Contig1 1379 2 2 U
GGATACTAGTTATACCTCATTTCCCTCTCTTCTCAACTCATCTCTATCCATCTCTACAAT
GGCGTCGTCCCACTGCACGATGAGAGGTGCTGTTGGAGTACCCCTCCTCCGATTCTCCAC
CAATGGAGTCGTCTCTTCCACCAGATCCATTCTCAACTCCGGAAGAAGAAACCATCATCG
TCTTCTCACCATCCCCAGCTCTCTCTCCTCTCTCTCCTCAATCTCCACTCACACCACTTC
CAACTTCACCCGCGGGCAGAACAGCATCAAGCCTCAGCAAGTCAGAAAGATTTGGATATC
TTCTCCTCTTTGTATGGGTCGTCGCTCTTCCAAAATCGCTGGCCGAAAGGGGGCTCAAGA
TTCAAAGAAGGCGAAGCTTTACTGTAGGATTGGCAAGGAGGTTGTATCTGCTGTCAGGAA
AGGGGGTCCAAACCCAGTGTCCAATACAGTTCTAGCTACCATTCTTGAGAAAGCAAAAGA
CCTAGATGTACCCAAGGACATTGTGGAGCGTAATATTAAAAGGGCTTCTGAGAAGGGCCA
AGAAGATTTTATCGAGAAGATCTATGAGGTATATGGATATGGTGGAGTTAGTATGGTAGT
CGAGGTCTTAACAGACAAAATTAATCGATCAGTTGCAGCTGTTAGATCTGTTGTTAAGGA
TTATGGAGGCAAAATGGCTGATTCAGGATCTGTCATGTTCAAGTTTAGACGAGTTAGGGT
CGTCAACATAAAGGTCACCGAGGCTGACAAAGACCAGCTCTTTATTATTGCTCTAGATGC
TGGAGCTGAGGATGTTATTGATCCCCCAAGTTATGAAGATGATACTGATGAAGATAGGGA
AGAAAGGTACTACAAAATTGTAACTTCTAACGAGAACTACTCAACAGTGTTGGCGAAGCT
ACGCGATGAAGGAGTGAACTTTGAGCCTGACAATGGCTCTGAACTTCTCCCTCTGACTAC
AGTTGAGGTGGATGATGAGGCCATGGAACTGAACAAAGAGCTTATGCAGAAACTACTTGA
ACTTGATGATGTTGATGCTGTTTATATCGACCAAAAATGAACAAATACATTACAGGAAGT
TTTACTGGGGGTCAATCTCGGAAATGGTTTTTGGTTCAAGGCTGCATATATTGTGAAGAA
GGAATTATGATGGTTCTGGAACACACTTACGATTCACTTCTAGTTTCCAGTTTGAAGCTA
TAAGATCACTATTGTTACCTTATAATTCTTAATAAATTGTTTCTTAACCGAAGACTGTTT
AAACAGTTTCTTTTTTTTAATCATCATCACTTCAATATTTGTTGGGGTTTATTTTTGTAT
GTATAAGTTAAGCTTATGTATGCAATCCGAACTGTAAACGTAATGCAAACTGTTCAGGC


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AF RS1AV76JQ C 506
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ATAT

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DS 

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ATGAACAAATACATTACAGGAAGTTTTACTGGGGGTCAATCTCGGAAATGGTTTTTGGTT
CAAGGCTGCATATATTGTGAAGAAGGAATTATGATGGTTCTGGAACACACTTACGATTCA
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AACGTAATGCAAACTGTTCAGGC

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DS 



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ATTGGCTGGCAAGCATTTGCAAACTCCATCAAACCAGAAGACTCTAACCGTCTTAACAAT
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ATTTGTTCTTCCTCTTAAATGTTATCTTTAGTTTAC


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AF RS1DX95TF U 1
AF RS1DX95JQ C 405
BS 1 727 RS1DX95TF
BS 728 1056 RS1DX95JQ

RD RS1DX95TF 727 0 0
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TGGTTTCGTCGGAAAAGGGCATTGCTTCGCCGTGAAAGTGAAACCGATGGAGGAGAGGGT
GAAGCTAACGGTGAAGTCTCGGTATAGCGACTCATCTTCGCCACCTTACTCTCCTCCGCA
AAACGGGGAAGGAGGATCTTCGCCGCGGTTTTATGTGGGTCATTCTATTTACAAAGGGAA
AGCTGCTCTTACTATTGAGCCTCGTGCCCCCGAGTTTGTGTCTTTACAATCTGGTGCGTT
CAAGCTTTCTAAGGAAGGGTTCTTGCTCCTCCAGTTTGCTCCTGCAGCTGGTGTTCGTCA
GTACGACTGGAGCAGGAAACAGGTGTTCTCCTTGTCGGTTACAGAGATTGGTAATTTAGT
TAGCCTTGGGCCGAGGGAATCATGTGAATTCTTTCATGATCCTAACAAGGGAAAAGGTAG
TGATGAAGGTAAAGTGAGGAAAGTGCCGAAAGTTGAACCCCTTCCAGATGGTTCTGGCCG
CTTCTTTAACCTGAGTGTTCAAAACAAGCTTTTGAATGTAGATGAGAGTGTATACATACC
TATCACTAAAGCAGAGTTTGCTGTTCTTATCTCTGCTTCAACTTCATATTGCCCCACCTT
ATTGGCT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1DX95JQ 652 0 0
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ACAAGGGAAAAGGTAGTGATGAAGGTAAAGTGAGGAAAGTGCCGAAAGTTGAACCCCTTC
CAGATGGTTCTGGCCGCTTCTTTAACCTGAGTGTTCAAAACAAGCTTTTGAATGTAGATG
AGAGTGTATACATACCTATCACTAAAGCAGAGTTTGCTGTTTTTATTTCTGCTTCAACTT
CATATTGCCCCCCCTTATTGGCTGGCAAGCATTTGCAAACTCCATCAAACCAGAAGACTC
TAACCGTCTTAACAATGCGTCACCTAAGTATGGAGGAGACTACGAATGGAGTAGATGATT
GAGAATCACAAACAACCTTGCAAACTCGGTTCTTGTGTCCATCCCATCTTTTTTGTTATT
GCAGTCAACGAGTAGCAGTAGAGACTGAAGCAGTGTTTTAGACCAAATGGGATGTGTTGT
TGTGTAGGAAAAAAAAACATTTTGTAGTGAAGACTGGAGAGCAAACGGTTGGAATTTTGG
GTAATAACAAGAATCAATTTGTTCTTCCTCTTAAATGTTATCTTTAGTTTAC

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 2

CO CL4901Contig1 501 2 1 U
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CGCAAAATGAAGCTTTCTTTGCGTTTGATCTCAGCTGTTCTCCTCATGATTATGATATTC
GTCGCTTCAGGGATGGGTCCAGTCACCGTGGAGGCACGCACGTGTTAGTCGAAGAGCCAT
AAGTTCAGGGGTCCTTGTGTGAGCAGGCACAATTGCGCAAATGTGTGCCACAACGAAGGT
TTTCATGGAGGTAAATGCCGTGGGTTCTGTCGTCGTTGCTACTGTACCAGACATTGCTGA
TCCATCCATCTCAATCGATTCTCATAAATCTTCAATCCATCGTCTCGTCTCTTCTCGTGT
TTGTTTCTTTCTGTCTAATATTTCGTACAGTGCCATGTTGCACTGTGTATGTGTGTGTGT
TTAATGTGTTCTCGAATAAGTCTTTGGTTTGTGTGTTTTTCGTTTTATTGTAATGTTAAA
TTCTAATGTTTATTTTAAAGC


BQ
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AF RS1C522JQ C 1
AF RS1C522TF U 1
BS 1 501 RS1C522TF

RD RS1C522JQ 501 0 0
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CGCAAAATGAAGCTTTCTTTGCGTTTGATTTCAGCTGTTCTCCTCATGATTATGATATTC
GTCGCTTCAGGGATGGGTCCAGTCACCGTGGAGGCACGCACGTGTTAGTCGAAGAGCCAT
AAGTTCAGGGGTCCTTGTGTGAGCAGGCACAATTGCGCAAATGTGTGCCACAACGAAGGT
TTTCATGGAGGTAAATGCCGTGGGTTCTGTCGTCGTTGCTACTGTACCAGACATTGCTGA
TCCATCCATCTCAATCGATTCTCATAAATCTTCAATCCATCGTCTCGTCTCTTCTCGTGT
TTGTTTCTTTCTGTCTAATATTTCGTACAGTGCCATGTTGCACTGTGTATGTGTGTGTGT
TTAATGTGTTCTCGAATAAGTCTTTGGTTTGTGTGTTTTTCGTTTTATTGTAATGTTAAA
TTCTAATGTTTATTTTAAAGC

QA 1 501 1 501
DS 

RD RS1C522TF 501 0 0
GACACACTTAACAATTGTTTCCTTCCAACTCTCGCTCTCTCTTAAACTTTCTTCCTCTCT
CGCAAAATGAAGCTTTCTTTGCGTTTGATCTCAGCTGTTCTCCTCATGATTATGATATTC
GTCGCTTCAGGGATGGGTCCAGTCACCGTGGAGGCACGCACGTGTTAGTCGAAGAGCCAT
AAGTTCAGGGGTCCTTGTGTGAGCAGGCACAATTGCGCAAATGTGTGCCACAACGAAGGT
TTTCATGGAGGTAAATGCCGTGGGTTCTGTCGTCGTTGCTACTGTACCAGACATTGCTGA
TCCATCCATCTCAATCGATTCTCATAAATCTTCAATCCATCGTCTCGTCTCTTCTCGTGT
TTGTTTCTTTCTGTCTAATATTTCGTACAGTGCCATGTTGCACTGTGTATGTGTGTGTGT
TTAATGTGTTCTCGAATAAGTCTTTGGTTTGTGTGTTTTTCGTTTTATTGTAATGTTAAA
TTCTAATGTTTATTTTAAAGC

QA 1 501 1 501
DS 



AS 1 2

CO CL4902Contig1 876 2 2 U
GGACACATTGCATCGCCGACTCCAAGACTTCGCCGAATATGACCGTCGAATCAACCACCG
CCGCGCACGGCAACACCGTCGCACCCAACGGAGACGCTTCCAACGGTAACATTATCCCTT
CCTCCAAGAAATCACGCGAGAGCGACCGTCGCCGCCGCAGGCGGAATCAGAAGAAGAACA
ACAAAGCCGCATCCCGTGCCGATGTAGAGGAGGCGGACGTTTCTGGCGCTTCCGATTCGA
AGGAGAACGCAGATCCGCAGCCACAGGTTGAGATTGAGTATGTTCCAGTGCAGCCTGAGT
TCGAAGATGGTTTTAGCGATGAGTTCAAGCAAATCTTTGAGAAGTTCAGTTTCAAGGAGA
CTGTTGCCTCTGAGGACGATGCTAATAAGGATGAATCTGAGGAGAATAAAGATGTGAAAA
AGAAGGTTAATTCGGATTCAGAGGGAGACGAGGATGATCAGGGCAATGAACAAAAAGAGA
AGGGGATCTCTAATAAGCAAAAGAAGCTTGAACGCAGGATGAATATTGCTGAGCTGAAGC
AGGTGTCCGCTAGGCCTGATGTTGTTGAGGTCTGGGACGCTACTTCAGCAGACCCAAAGT
TGTTGGTGTTTTTGAAGTCGTATCGCAATACAGTTCCTGTTCCAAGACACTGGTCACAGA
AGAGAAAGTATTTGCAGGGAAAGCGTGGTATAGAGAAGGCGCCATTCCATCTTCCTGATT
TCATTGCTGCAACCGGAATTCAGAAAATTAGACAGGCTTACATTGAGAAAGAAGACGGTA
AAAAGTTGAAGCAGAAGCAAAGGGAGCGAATGCAACCAAAGATGGGAAAGATGGACATTG
ACTACCAGGTGCTCCATGATGCATTCTTCAAATACC


BQ
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AF RS1H516TF U 1
AF RS1H516JQB C 236
BS 1 674 RS1H516TF
BS 675 876 RS1H516JQB

RD RS1H516TF 674 0 0
GGACACATTGCATCGCCGACTCCAAGACTTCGCCGAATATGACCGTCGAATCAACCACCG
CCGCGCACGGCAACACCGTCGCACCCAACGGAGACGCTTCCAACGGTAACATTATCCCTT
CCTCCAAGAAATCACGCGAGAGCGACCGTCGCCGCCGCAGGCGGAATCAGAAGAAGAACA
ACAAAGCCGCATCCCGTGCCGATGTAGAGGAGGCGGACGTTTCTGGCGCTTCCGATTCGA
AGGAGAACGCAGATCCGCAGCCACAGGTTGAGATTGAGTATGTTCCAGTGCAGCCTGAGT
TCGAAGATGGTTTTAGCGATGAGTTCAAGCAAATCTTTGAGAAGTTCAGTTTCAAGGAGA
CTGTTGCCTCTGAGGACGATGCTAATAAGGATGAATCTGAGGAGAATAAAGATGTGAAAA
AGAAGGTTAATTCGGATTCAGAGGGAGACGAGGATGATCAGGGCAATGAACAAAAAGAGA
AGGGGATCTCTAATAAGCAAAAGAAGCTTGAACGCAGGATGAATATTGCTGAGCTGAAGC
AGGTGTCCGCTAGGCCTGATGTTGTTGAGGTCTGGGACGCTACTTCAGCAGACCCAAAGT
TGTTGGTGTTTTTGAAGTCGTATCGCAATACAGTTCCTGTTCCAAGACACTGGTCACAGA
AGAGAAAGTATTTG

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1H516JQB 641 0 0
TTCGAAGGAGAACGCAGATCCGCAGCCACAGGTTGAGATTGAGTATGTTCCAGTGCAGCC
TGAGTTCGAAGATGGTTTTAGCGATGAGTTCAAGCAAATCTTTGAGAAGTTCAGTTTCAA
GGAGACTGTTGCCTCTGAGGACGATGCTAATAAGGATGAATCTGAGGAGAATAAAGATGT
GAAAAAGAAGGTTAATTCGGATTCAGAGGGAGACGAGGATGATCAGGGCAATGAACAAAA
AGAGAAGGGGATCTTTAATAAGCAAAAGAAGCTTGAACGCAGGATGAATATTGCTGAGCT
GAAGCAGGTGTCCGCTAGGCCTGATGTTGTTGAGGTCTGGGACGCTACTTCAGCAGACCC
AAAGTTGTTGGTGTTTTTGAAGTCGTATCGCAATACAGTTCCTGTTCCAAGACACTGGTC
ACAGAAGAGAAAGTATTTGCAGGGAAAGCGTGGTATAGAGAAGGCGCCATTCCATCTTCC
TGATTTCATTGCTGCAACCGGAATTCAGAAAATTAGACAGGCTTACATTGAGAAAGAAGA
CGGTAAAAAGTTGAAGCAGAAGCAAAGGGAGCGAATGCAACCAAAGATGGGAAAGATGGA
CATTGACTACCAGGTGCTCCATGATGCATTCTTCAAATACC

QA 1 641 1 641
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4904Contig1 680 2 1 U
GGAATTGACAAGTACACATGATAGCCTTCTCAAGTACCGTGATATCTGCCTAGATCAAGG
AGTTAACGAGCAAGACGTGGAGATATTCTGTGATGTGGCAAATAACGTTGAGGAGGGGAT
TGTGAACCTTGTCTATGAAAACAGTATCAAGAAGCTTATTATTGGAGCAGCTGCTGATTC
CCGCTACTCCCAGGGCATGGTTAATATCACATCTAGAAAAGCCAAGTATGTGACTCGCCA
CGCGCCTCATTCCTGTAAAATATGGCTTGTTTGTAGTGGGAACCTCATCCAAACGAGGGA
GGGACGGTTTGATCTCGCGGGTTCATCGCACTCCTCCTCTCAATCCTTAGCCAACGAGCC
TCCCCCATATTTCATCTGTCCCATTTCAAAGGAGATTATGCAGAATCCCCATGTTGCAGC
AGATGGTTACACTTACGAAGCAGATAAGTTCAAAATCTGGCTCAGTCATGGAGGTGAAAA
ATCGCCGATGACAAACTTGAGGCTTGAGAATAACAAGCTCACGCCAAATCGTGTTCTTCG
TTCAGCTATTAAGGAGTGGTTGCAACAGCACCCTCTTTGATTTGCCTTAAAGATAGATAT
TATGTTTGATTGTGTTGTGTGATTCAGTAAAGATATATGGTGAATGAAACGTGAAAAATT
CTAATGAAAAAAGTTCTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EK17TF U 1
AF RS1EK17JQ C 168
BS 1 680 RS1EK17TF

RD RS1EK17TF 680 0 0
GGAATTGACAAGTACACATGATAGCCTTCTCAAGTACCGTGATATCTGCCTAGATCAAGG
AGTTAACGAGCAAGACGTGGAGATATTCTGTGATGTGGCAAATAACGTTGAGGAGGGGAT
TGTGAACCTTGTCTATGAAAACAGTATCAAGAAGCTTATTATTGGAGCAGCTGCTGATTC
CCGCTACTCCCAGGGCATGGTTAATATCACATCTAGAAAAGCCAAGTATGTGACTCGCCA
CGCGCCTCATTCCTGTAAAATATGGCTTGTTTGTAGTGGGAACCTCATCCAAACGAGGGA
GGGACGGTTTGATCTCGCGGGTTCATCGCACTCCTCCTCTCAATCCTTAGCCAACGAGCC
TCCCCCATATTTCATCTGTCCCATTTCAAAGGAGATTATGCAGAATCCCCATGTTGCAGC
AGATGGTTACACTTACGAAGCAGATAAGTTCAAAATCTGGCTCAGTCATGGAGGTGAAAA
ATCGCCGATGACAAACTTGAGGCTTGAGAATAACAAGCTCACGCCAAATCGTGTTCTTCG
TTCAGCTATTAAGGAGTGGTTGCAACAGCACCCTCTTTGATTTGCCTTAAAGATAGATAT
TATGTTTGATTGTGTTGTGTGATTCAGTAAAGATATATGGTGAATGAAACGTGAAAAATT
CTAATGAAAAAAGTTCTCTC

QA 1 680 1 680
DS 

RD RS1EK17JQ 513 0 0
CAGCTGCTGATTCCCGCTACTCCCAGGGCATGGTTAATATCACATCTAGAAAAGCCAAGT
ATGTGACTCGCCACGCGCCTCATTCCTGTAAAATATGGCTTGTTTGTAGTGGGAACCTCA
TCCAAACGAGGGAGGGACGGTTTGATCTCGCGGGTTCATCGCACTCCTCCTCTCAATCCT
TAGCCAACGAGCCTCCCCCATATTTCATTTGTCCCATTTCAAAGGAGATTATGCAGAATC
CCCATGTTGCAGCAGATGGTTACACTTACGAAGCAGATAAGTTCAAAATTTGGCTCAGTC
ATGGAGGTGAAAAATCGCCGATGACAAACTTGAGGCTTGAGAATAACAAGCTCACGCCAA
ATCGTGTTTTTCGTTCAGCTATTAAGGAGTGGTTGCAACAGCACCCTCTTTGATTTGCCT
TAAAGATAGATATTATGTTTGATTGTGTTGTGTGATTCAGTAAAGATATATGGTGAATGA
AACGTGAAAAATTTTAATGAAAAAAGTTCTCTC

QA 1 513 1 513
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4906Contig1 848 2 3 U
GAAGAGAACGAGGAGGGTCAAGAGAAGAGTGGTACTGAAGAGAATGAAGCTGAAGAGAAG
AAAGACAATGTCAATACAGAAGAGAATGAAGCTGAAGAGAAGAAGGACAATGGTGGTACA
GAAGAGAACGAGGAGAATAGAGAGAAGAGTGAAGCTGAAGAGAAGAAAGAGGATGGTGGT
GGAGAAGAGAAAGAGGAGAAAATAGAGGAAGTGACTGATGAGAATGAAGGGAAGAAGAAG
AAGGAGAGTGAGGAAGCGAGAGAGAATAATTACAAGGGAGATGATGCTTCTAGTGAGGTG
GTTCATGAGGCCGATGAGAAGGTGCAAGCGGAGGAAGACAAGACCGGAGAATCTGAAGAC
ACTGTTATCAAGAGTGTTTTGCCGACTGATAATGAGGGGAGCAGCAGTGACGAGAAGAAC
ACTGGTAATGGTGATTCGGATTCCTCTAGTGAGATAAAATCTGAGGGTGAATCCATGGAG
AAGAATGAGATGGTGGAGAAGGAAGGGTTCAATGATTCTAACGGTGACTTGCCTGAGTCT
AACCACTCACCGTCTAATGCAACAGAGACTACAGAAGGATCTTCTGGGAATGATGGGTCA
GAGTCTACTGTAAAGACAGATGAGAAAGAGAAGGCAGAGTCTTCTGAAAACTCATCTCAA
GAAGAAAGTAAAGGTGGAGACACTGAGACAAAGGAGAAAGAAGAGTCTTCTTCTCAAGAG
AAATCTAAAATGGAGACACTGAGGCAAAGGAGAAGAGAGAGTCTTCATCTCAGAGAAGTA
AAGATGGAGAAACTGAACAAGGAGAAGAAGAGTCTTCATCTCAGAGAGTCTAAGAGAAGA
AACAGAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DB69TF U 385
AF RS1G370TF U 1
BS 1 410 RS1G370TF
BS 411 411 RS1DB69TF
BS 412 848 RS1G370TF

RD RS1DB69TF 321 0 0
G
CTGATAATGAGGGGAGCAGCAGTGACGAGAAGAACACTGGTAATGGTGATTCGGATTCCT
CTAGTGAGATAAAATCTGAGGGTGAATCCATGGAGAAGAATGAGATGGTGGAGAAGGAAG
GGTTCAATGATTCTAACGGTGACTTGCCTGAGTCTAACCACTCACCGTCTAATGCAACAG
AGACTACAGAAGGATCTTCTGGGAATGATGGGTCAGAGTCTACTGTAAAGACAGATGAGA
AAGAGAAGGCAGAGTCTTCTGAAAACTCATCTCAAGAAGAAAGTAAAGGTGGAGACACTG
AGACAAAGGATAAAGAAGAG

QA 2 321 2 321
DS 

RD RS1G370TF 848 0 0
GAAGAGAACGAGGAGGGTCAAGAGAAGAGTGGTACTGAAGAGAATGAAGCTGAAGAGAAG
AAAGACAATGTCAATACAGAAGAGAATGAAGCTGAAGAGAAGAAGGACAATGGTGGTACA
GAAGAGAACGAGGAGAATAGAGAGAAGAGTGAAGCTGAAGAGAAGAAAGAGGATGGTGGT
GGAGAAGAGAAAGAGGAGAAAATAGAGGAAGTGACTGATGAGAATGAAGGGAAGAAGAAG
AAGGAGAGTGAGGAAGCGAGAGAGAATAATTACAAGGGAGATGATGCTTCTAGTGAGGTG
GTTCATGAGGCCGATGAGAAGGTGCAAGCGGAGGAAGACAAGACCGGAGAATCTGAAGAC
ACTGTTATCAAGAGTGTTTTGCCGACTGATAATGAGGGGAGCAGCAGTGATGAGAAGAAC
ACTGGTAATGGTGATTCGGATTCCTCTAGTGAGATAAAATCTGAGGGTGAATCCATGGAG
AAGAATGAGATGGTGGAGAAGGAAGGGTTCAATGATTCTAACGGTGACTTGCCTGAGTCT
AACCACTCACCGTCTAATGCAACAGAGACTACAGAAGGATCTTCTGGGAATGATGGGTCA
GAGTCTACTGTAAAGACAGATGAGAAAGAGAAGGCAGAGTCTTCTGAAAACTCATCTCAA
GAAGAAAGTAAAGGTGGAGACACTGAGACAAAGGAGAAAGAAGAGTCTTCTTCTCAAGAG
AAATCTAAAATGGAGACACTGAGGCAAAGGAGAAGAGAGAGTCTTCATCTCAGAGAAGTA
AAGATGGAGAAACTGAACAAGGAGAAGAAGAGTCTTCATCTCAGAGAGTCTAAGAGAAGA
AACAGAGA

QA 1 848 1 848
DS 



AS 1 2

CO CL4907Contig1 1405 2 2 U
GATACGATAATGGAGTGACATACATGTTTGTACAGCATGTAACGTTTACCTCATGATAGC
TTCTAGGCAGAACTGTAATGCTGCCAGTCTTCTCTTCTTCTTGCATCGCGTTGTCGATGT
CTTCAAGCATTACTTTGAGGCGTTGGAGGAAGAATCATTGAGGGATAACTTTGTGGTTGT
GTATGAGTTACTTGATGAGATGATGGACTTTGGTTACCCTCAGTATACCGAAGCAAGAAT
CCTTAGTGAGTTCATCAAGACTGATGCTTATAGGATGGAAGTTACACAGAGACCTCCAAT
GGCTGTCACTAATGCTGTTTCTTGGAGGAGTGAGGGGTTACAGTTTAAGAAAAACGAAGT
TTTCTTGGACGTGGTTGAGAGTGTAAATATCCTCGTCAACAGTAATGGGCAAATTGTGAG
GTCTGATGTCGTTGGAGCATTGAAGATGCGAACATATTTGAGTGGAATGCCAGAGTGTAA
GCTAGGTCTGAATGATAGAGTACTGTTGGAAGCACAGGGGAGAGCAACAAAAGGAAAAGC
TATTGACTTGGAGGACATCAAATTTCATCAGTGTGTTCGATTGGCTCGTTTTGAGAACGA
TAGGACGATATCCTTCATACCACCTGATGGGGCTTTTGATTTGATGACATATAGACTCAG
TACCCAGGTAAAGCCTCTTATATGGGTCGAAGCTCAGATAGAGAGGCATTCCAGGAGTCG
TGTTGAGATGCTTGTAAAAGCTAGAAGCCAGTTCAAGGAAAGAAGCACTGCAACGAATGT
TGAGATCGAGTTGCCTGTACCGACCGATGCATCCAACCCCACCGTAAGAACATCTTTCGG
GTCTGCCGCATATGCTCCTGAAAAAGATGCATTGGTTTGGAAAATCAAATCTTTCCCTGG
GAACAAGGAGTATATGTTGAGAGCAGAGTTCCATCTCCCAAGTATAACCGCAGAGGAAGC
CACGCCTGAGCGAAAAGCTCCCATCCGAGTCAAATTCGAGATCCCATATTTCACTGTTTC
AGGAATACAGGTTCGGTACCTGAAGGTGATAGAGAAGAGTGGGTACCAAGCTCTTCCATG
GGTGAGATATATAACTATGGCTGGTGAGTACGAACTCAGACTCATGTAACATGAGATCTG
TGTTGTTGTTTCTTTTGTTTTTATTTAAAGTCATTTGTCAACGAAAGAAAGCAGACGAAG
ATGGAAGAAAAGGAAAAAAAAACTTTTAGCTGATAAAGATTTACGGTGAAGGTTGTTTTA
GCAGCCTATATATCTTGTGTATTGTTTTGTGTTTCTCTTTATGTTTTCTGTAAGCTTTTA
CTGACACTTTTAATCTTTGTCAAAAATTGTTAAACAACGAGCATTCTTTTGTATGGTCAC
TTTGTCTAGTTTTTTCCTGTGGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1A611TF U 1
AF RS1A611JQ C 591
BS 1 755 RS1A611TF
BS 756 1405 RS1A611JQ

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GATACGATAATGGAGTGACATACATGTTTGTACAGCATGTAACGTTTACCTCATGATAGC
TTCTAGGCAGAACTGTAATGCTGCCAGTCTTCTCTTCTTCTTGCATCGCGTTGTCGATGT
CTTCAAGCATTACTTTGAGGCGTTGGAGGAAGAATCATTGAGGGATAACTTTGTGGTTGT
GTATGAGTTACTTGATGAGATGATGGACTTTGGTTACCCTCAGTATACCGAAGCAAGAAT
CCTTAGTGAGTTCATCAAGACTGATGCTTATAGGATGGAAGTTACACAGAGACCTCCAAT
GGCTGTCACTAATGCTGTTTCTTGGAGGAGTGAGGGGTTACAGTTTAAGAAAAACGAAGT
TTTCTTGGACGTGGTTGAGAGTGTAAATATCCTCGTCAACAGTAATGGGCAAATTGTGAG
GTCTGATGTCGTTGGAGCATTGAAGATGCGAACATATTTGAGTGGAATGCCAGAGTGTAA
GCTAGGTCTGAATGATAGAGTACTGTTGGAAGCACAGGGGAGAGCAACAAAAGGAAAAGC
TATTGACTTGGAGGACATCAAATTTCATCAGTGTGTTCGATTGGCTCGTTTTGAGAACGA
TAGGACGATATCCTTCATACCACCTGATGGGGCTTTTGATTTGATGACATATAGACTCAG
TACCCAGGTAAAGCCTCTTATATGGGTCGAAGCTCAGATAGAGAGGCATTCCAGGAGTCG
TGTTGAGATGCTTGTAAAAGCTAGAAGCCAGTTCA

QA 1 755 1 755
DS 

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ATAGACTCAGTACCCAGGTAAAGCCTCTTATATGGGTCGAAGCTCAGATAGAGAGGCATT
CCAGGAGTCGTGTTGAGATGCTTGTAAAAGCTAGAAGCCAGTTCAAGGAAAGAAGCACTG
CAACGAATGTTGAGATCGAGTTGCCTGTACCGACCGATGCATCCAACCCCACCGTAAGAA
CATCTTTCGGGTCTGCCGCATATGCTCCTGAAAAAGATGCATTGGTTTGGAAAATCAAAT
CTTTCCCTGGGAACAAGGAGTATATGTTGAGAGCAGAGTTCCATCTCCCAAGTATAACCG
CAGAGGAAGCCACGCCTGAGCGAAAAGCTCCCATCCGAGTCAAATTCGAGATCCCATATT
TCACTGTTTCAGGAATACAGGTTCGGTACCTGAAGGTGATAGAGAAGAGTGGGTACCAAG
CTCTTCCATGGGTGAGATATATAACTATGGCTGGTGAGTACGAACTCAGACTCATGTAAC
ATGAGATCTGTGTTGTTGTTTCTTTTGTTTTTATTTAAAGTCATTTGTCAACGAAAGAAA
GCAGACGAAGATGGAAGAAAAGGAAAAAAAAACTTTTAGCTGATAAAGATTTACGGTGAA
GGTTGTTTTAGCAGCCTATATATCTTGTGTATTGTTTTGTGTTTCTCTTTATGTTTTCTG
TAAGCTTTTACTGACACTTTTAATCTTTGTCAAAAATTGTTAAACAACGAGCATTCTTTT
GTATGGTCACTTTGTCTAGTTTTTTCCTGTGGGCC

QA 1 815 1 815
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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ACCATAGACGAGAGGTTCGCAGCTCTGGATCTAAACAACGACGGCGTTTTATCTCGATCC
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GTGACACCTCAGGAGGAGCTGACGAGTCTTTACGACTCGATCTTCGATAAGTTCGACACG
GATCAGAGCGGTTCCGTGGATCTGGAGGAGTTCAGATCGGAGATGAAGAAGATCGTGCTA
GCGATCGCCGACGGGCTCGGATCGTGTCCGATTACGATGGCTTTGGATGACAATGATGAT
AATTTGCTGAAGAAGGCGGCGGATCTGGAAGCTTCGAAGCTCGAGAAGAAGGCTTCTTGA
TGAACGATGATTTAAATGGTTCTTTTTAAAGTGTTCTTCGTCTTCGTTGTTGCTTATGTA
GTGTTTGTTTGTGATGTAAGCAATATGAATAATAATAAAGGCCTTTCGATTTGTG


BQ
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AF RS1BX51TF U 1
AF RS1BX51JQ C 192
BS 1 535 RS1BX51TF

RD RS1BX51TF 535 0 0
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GAGCTACGAAAGACGTTCGAATCGATGAGGCTTTTGGAATCGCACTTCGGCGTCGACGTG
GTGACACCTCAGGAGGAGCTGACGAGTCTTTACGACTCGATCTTCGATAAGTTCGACACG
GATCAGAGCGGTTCCGTGGATCTGGAGGAGTTCAGATCGGAGATGAAGAAGATCGTGCTA
GCGATCGCCGACGGGCTCGGATCGTGTCCGATTACGATGGCTTTGGATGACAATGATGAT
AATTTGCTGAAGAAGGCGGCGGATCTGGAAGCTTCGAAGCTCGAGAAGAAGGCTTCTTGA
TGAACGATGATTTAAATGGTTCTTTTTAAAGTGTTCTTCGTCTTCGTTGTTGCTTATGTA
GTGTTTGTTTGTGATGTAAGCAATATGAATAATAATAAAGGCCTTTCGATTTGTG

QA 1 535 1 535
DS 

RD RS1BX51JQ 344 0 0
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TTCCGTGGATTTGGAGGAGTTCAGATCGGAGATGAAGAAGATCGTGCTAGCGATCGCCGA
CGGGCTCGGATCGTGTCCGATTACGATGGCTTTGGATGACAATGATGATAATTTGCTGAA
GAAGGGGGGGGATTTGGAAGCTTCGAAGCTCGAGAAGAAGGCTTCTTGATGAACGATGAT
TTAAATGGTTTTTTTTAAAGTGTTTTTTGTCTTCGTTGTTGCTTATGTAGTGTTTGTTTG
TGATGTAAGCAATATGAATAATAATAAAGGCCTTTCGATTTGTG

QA 1 344 1 344
DS 



AS 1 2

CO CL4910Contig1 999 2 2 U
GCATTGGCGCAATCCCATGAATTGGCACAATCTTGCATCACCTCACAAAGGAATCCAAGC
AGTGGTATCAACGCAGAGTGTGAACGTGATCATCGTTTGTGGCCCTAGCCGTGCGAAAAT
CGCAAAGCCTCAATGTCAATAGAAGAAAAGCCAGAAACATTTTTTATTAACTGTTTCTCT
ACATACTCAAGAAATGTATATTTTTGTCTAACCCTTTCTAAAGTCCCACAAATCCTTCTT
TGAGAACAATTTGAAGGATGAAACATAGATATAGAACATTAACGTTCAACACAAGTTACT
CCCAGTGAAAGTATATACTAAAATGTATATTATGGGACCGTTCGTTTCACCATTTGTTTA
TCTCCATTCAAATGATCCATTTGTGTGGTCCATACACATGATTCATTCAGATTTTATTAG
ATGTTTGTTTATGCATTCAAGTGATTCATCTAGATAAATCATTTAAATGGATTTTACGTT
TGTTTGTCCATTTAAATAACTCATCTAGATGAATCATCTAAGTAAATTAATTACCCTTGT
TTTGACTTAACCATGTATTTGATATTAATTTCAACTATATTAATTTTAATTATTTAATCT
ATTATATTTACAACATAATTATTTTAAAGTTAGTATTTTGACGGGAAACCATGATTTGCG
GTTTTGGTGGAAAACACGTTTTTAGAGTTTTGGCGAGAAAACACATTTTTGTGGTTTTGG
CGGAAAACTGAGTTTTTGTTGCTTTGGCGGAAAATGCGTTTTATGGTTTTTGCGGAAAAT
CACGTTTTTGTTGTTTTGGCGGAAAATCACGTATTTCCAGTTTTGGTAAAAAATGCGTTT
TTGCGGTTTTGACGAGAAACTATGTTTTTGCGGCTTGGCGGAATACCGCGTTTTGAAAGA
AACCGTGTTTTTGTTTTTTTTTTTTGCGATTTTGGCAAGAAATCAAGTTTTGCGATTTTG
GCAGCAAATCGTGTTTTTGTGGGTTTAGCAGAAAATCGC


BQ
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AF RS1AQ17TFB U 1
AF RS1AQ17JQ C 503
BS 1 827 RS1AQ17TFB
BS 828 999 RS1AQ17JQ

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ATGTTTGTTTATGCATTCAAGTGATTCATCTAGATAAATCATTTAAATGGATTTTACGTT
TGTTTGTCCATTTAAATAACTCATCTAGATGAATCATCTAAGTAAATTAATTACCCTTGT
TTTGACTTAACCATGTATTTGATATTAATTTCAACTATATTAATTTTAATTATTTAATCT
ATTATATTTACAACATAATTATTTTAAAGTTAGTATTTTGACGGGAAACCATGATTTGCG
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TTTGCGATTTTGGCAAGAAATCAAGTTTTGCGATTTTGGCAGCAAATCGTGTTTTTGTGG
GTTTAGCAGAAAATCGC

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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1CQ28TF U 57
AF RS1G603TF U 1
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BS 377 566 RS1G603TF

RD RS1CQ28TF 334 0 0
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QA 1 566 1 566
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1DV50JQ C 1
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GTAAGCGAATTCGTTTGTTTATTCTTCCCAGATCTTTAACAGTTTTTGTTAATGTGAAAT
TTATTTAGCACG

QA 1 312 1 312
DS 



AS 1 2

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CGGAAACCTTTTCCAGTACATCCATGAAGAGTCTGATGATTACACTATGATATGGGGAAT
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AACTGTTGTTTCAGGTACAGTCGGGTATATGGATCCAGAGTATTATAGGTCCAGCCAGTA
TACAGAAAAGAGTGATGTTTACAGTTTTGGGGTCGTCCTAGCGGAACTTATCACTGGAGA
TAAGCCCGTCATAACAATACAAAACACTCGGGAAACAAAAAGCTTGGCGGATCATTTCAG
ACTCGCTGTGAAAGAGAGGAGGTTGTCTGATATTATGGATGCTCGAATAAAAGAGGATTG
CAAACTGGAACAAGTAAAGGCAGTGGCAAATCTGGCGGTGAAGTGCTTGAGCTCGAAAGG
AAACAAACGTCCAACTATGAGAGAAGTTTCTACCGAGTTAGAGAGAATTTCCGCGTCTCC
AGAGGATTCACATGTGCACGTTATGATTGATGAAGATGAAGAAGACGAGGAAGAAGAGGC
TAGGAATATGGTAAACAGAGGCGAGTCTTTGAGTGTTGCTCTGACTGCTCCAGCCTTTGG
TATTGTGCCTTCGCCTTCTTCTCCAAATGCTGAACCATTGTCTCCTCGTCCCACATGGTG
AGTCTACAGATTTTAGAGTAATGGTGAATAAATGTGATGATCATCATCTTTAAGACGTTT
GGTAATAAATTTGCAAGGGTGAGCTTCAATTCATGATTTAAATGATTTGGTTTTGTATTA
ATGTGTGTTTTAGATTATATATTTTTGTATTTATGTGTGTTAAAATACTATTCATGTTCT
TAGTATTTATGTTTTGTGTTTGAGATAATTATTTGTAATTTATGTTGACATTTGGTTTTT
ATATATTTGGTTTCTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DF18TF U 1
AF RS1DF18JQ C 394
BS 1 705 RS1DF18TF
BS 706 1099 RS1DF18JQ

RD RS1DF18TF 705 0 0
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CGGAAACCTTTTCCAGTACATCCATGAAGAGTCTGATGATTACACTATGATATGGGGAAT
GCGTCTACGCATTGCTGTGGACGTGGCAGGAGCTCTTTCTTATCTTCATTCTTCTGCAAG
TTCTCCAGTCTATCACAGAGATATCAAGTCCACAAACATATTACTGGACGAGAGGCACCG
AGCCAAGGTGGCTGATTTCGGAACATCGAGGTCAATAACAATAGATCAAACTCATTGGAC
AACTGTTGTTTCAGGTACAGTCGGGTATATGGATCCAGAGTATTATAGGTCCAGCCAGTA
TACAGAAAAGAGTGATGTTTACAGTTTTGGGGTCGTCCTAGCGGAACTTATCACTGGAGA
TAAGCCCGTCATAACAATACAAAACACTCGGGAAACAAAAAGCTTGGCGGATCATTTCAG
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AAACAAACGTCCAACTATGAGAGAAGTTTCTACCGAGTTAGAGAGAATTTCCGCGTCTCC
AGAGGATTCACATGTGCACGTTATGATTGATGAAGATGAAGAAGA

QA 1 705 1 705
DS 

RD RS1DF18JQ 706 0 0
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TATGGATGCTCGAATAAAAGAGGATTGCAAACTGGAACAAGTAAAGGCAGTGGCAAATCT
GGCGGTGAAGTGCTTGAGCTCGAAAGGAAACAAACGTCCAACTATGAGAGAAGTTTCTAC
CGAGTTAGAGAGAATTTCCGCGTCTCCAGAGGATTCACATGTGCACGTTATGATTGATGA
AGATGAAGAAGACGAGGAAGAAGAGGCTAGGAATATGGTAAACAGAGGCGAGTCTTTGAG
TGTTGCTCTGACTGCTCCAGCCTTTGGTATTGTGCCTTCGCCTTCTTCTCCAAATGCTGA
ACCATTGTCTCCTCGTCCCACATGGTGAGTCTACAGATTTTAGAGTAATGGTGAATAAAT
GTGATGATCATCATCTTTAAGACGTTTGGTAATAAATTTGCAAGGGTGAGCTTCAATTCA
TGATTTAAATGATTTGGTTTTGTATTAATGTGTGTTTTAGATTATATATTTTTGTATTTA
TGTGTGTTAAAATACTATTCATGTTCTTAGTATTTATGTTTTGTGTTTGAGATAATTATT
TGTAATTTATGTTGACATTTGGTTTTTATATATTTGGTTTCTTTAT

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL4914Contig1 505 2 2 U
GTACGGCTCATAATCATTAATTCACTGACACTCGAAGATTTCAGCACTAAACCTTTCAAG
AAGTTTGTTTATAGTTATACAAACTTGTCTTAAAGATGGACATCATTACATCATTACATT
ACACCAATAAAAAGCTAAAGCAACCAGATCAAGAGGACGAAAAGGTGTCGATGATGGTGG
TGTGAAGCGGGTCACTAAGGTGAGTCGCCCAGTTGTTGAGCGGTCCTTTACCCGTTGCAG
CCGCCTGAACCGCAAATCCCAAGAAGGCAACCATGGCTAAACGAGCGTGTTTGATCTCAG
CCAACTGAAGCTGAGCCTTCTTGGGAGCGGCTGCTTTCTTGGTCCCGAATCCAAACCGGG
CTGTGAACCGGCATGAACCGGAGTTGATGTCGGAAACCACCCGAGTACCCATGATAGAAG
AAGCAGCAGCGGCTGTTGAAGTGGCGGCCATCACGAGAGCTGTTTGTATGTTTTGTCACA
CGTTTGTTGAGTTGTGATGTTCTCC


BQ
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AF RS1FM35TF C 1
AF RS1FM35JQ U 5
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BS 5 505 RS1FM35JQ

RD RS1FM35TF 505 0 0
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AAGTTTGTTTATAGTTATACAAACTTGTCTTAAAGATGGACATCATTACATCATTACATT
ACACCAATAAAAAGCTAAAGCAACCAGATCAAGAGGACGAGAAGGTGTCGATGATGGTGG
TGTGAAGCGGGTCACTAAGGTGAGTCGCCCAGTTGTTGAGCGGTCCTTTACCCGTTGCAG
CCGCCTGAACCGCAAATCCCAAGAAGGCAACCATGGCTAAACGAGCGTGTTTGATCTCAG
CCAACTGAAGCTGAGCCTTCTTGGGAGCGGCTGCTTTCTTGGTCCCGAATCCAAACCGGG
CTGTGAACCGGCATGAACCGGAGTTGATGTCGGAAACCACCCGAGTACCCATGATAGAAG
AAGCAGCAGCGGCTGTTGAAGTGGCGGCCATCACGAGAGCTGTTTGTATGTTTTGTCACA
CGTTTGTTGAGTTGTGATGTTCTCC

QA 1 505 1 505
DS 

RD RS1FM35JQ 501 0 0
GGCTCATAATCATTAATTCACTGACACTCGAAGATTTCAGCACTAAACCTTTCAAGAAGT
TTGTTTATAGTTATACAAACTTGTCTTAAAGATGGACATCATTACATCATTACATTACAC
CAATAAAAAGCTAAAGCAACCAGATCAAGAGGACGAAAAGGTGTCGATGATGGTGGTGTG
AAGCGGGTCACTAAGGTGAGTCGCCCAGTTGTTGAGCGGTCCTTTACCCGTTGCAGCCGC
CTGAACCGCAAATCCCAAGAAGGCAACCATGGCTAAACGAGCGTGTTTGATCTCAGCCAA
CTGAAGCTGAGCCTTCTTGGGAGCGGCTGCTTTCTTGGTCCCGAATCCAAACCGGGCTGT
GAACCGGCATGAACCGGAGTTGATGTCGGAAACCACCCGAGTACCCATGATAGAAGAAGC
AGCAGCGGCTGTTGAAGTGGCGGCCATCACGAGAGCTGTTTGTATGTTTTGTCACACGTT
TGTTGAGTTGTGATGTTCTCC

QA 1 501 1 501
DS 



AS 1 2

CO CL4915Contig1 451 2 1 U
GGAGCGAGATACTTCCGACCTAAACCCTAGTCTCTCTCCGTCTCCGTCTTCTCCGATTCT
GCAAGTATGAGTCGATCAGGCCAGCCTCCGGATCTCAAGAAGTACATGGACAAGAAGCTC
CAAATTAAGCTTAATGCGAACAGAATGGTAGTTGGAACTCTCCGTGGGTTTGACCAGTTC
ATGAACCTTGTTGTCGATAACACTGTTGAGGTCAATGGTGATGACAAAACTGACATTGGC
ATGGTGGTGATAAGAGGAAACAGCATTGTCACTGTTGAAGCTCTTGAGCCAGTTGGAAGA
TCTTAGTCTACTTTGCACCACTGGTGTCTGTATTTTGACTTTTGAGTTTGCTCTCTGTAT
TGGAACTTATTTAGTAAAAGACGATTATCAGCATGAATCATGAGGATCTTGTAGAAGTTT
TCTATGATTAATTATTCCTCTCTTTGTACTG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DZ94TF U 1
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G
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DS 



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ACC


BQ
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20 20 20 

AF RS1G330JQ C 1
AF RS1G330TF U 1
BS 1 543 RS1G330TF

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ACC

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ACCAGATGGAAAAGGAAAAGGGACCGGATTTGGGTTTGGTTCTGGTTCTGGTTCTGGTTC
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ACC

QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1E759TF U 1
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BS 568 1057 RS1E759JQ

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QA 1 567 1 567
DS 

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AAGCCAGGATGCGATTGCTGCTGCTAGAGAACGGTTTTTGGCTCGGAAGAAGGCAAAGAT
TGAAGAATAGTTGTGCAAATTTCACTCGCTCCCAATGTTGTTACTTTTGTGTCCAAACTT
TCTCTTTGTAATACTAATATATCGGATCACTTTCTGTTTTAAAGACATTTTCAGT

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 2

CO CL4918Contig1 1279 2 2 U
GGACTCCAAAGAACATTCTTAAAGTTGCTAAAAGAGAGAGACGTCAATGGCTGAAAAGCA
GAGGATCTGTGTTACTGGTTCAGGAGGATATATTGCTTCATGGCTCGTCAAGTCTCTTCT
CTCCCATGGCTACACTGTGCATGGAACCGTTCGAGATCCTTGTGATCGAAAGAACGACCA
TTTGAAGAAACTGAATAATGCTTCAAAGAATCTGAAACTTTTCGAAGCAGATTTGTTTGA
CTATGAAGGTCTTTCTTCAGCTATTTCTGGTTGTTATGGTGTTTTTCATATTGCTGGTCC
GGTGCCTTTTGAAGATGTTCCTCTCACAGAGGAACAACTGATTAAACCAGCTCTCACTGG
CACCAAAAACGTTCTAGAAGCATGTACAGAAGCTAAAGTGAAGAAAGTTGTGGTTGTATC
ATCACTTGCGGCGGTTGTTTACAACCCAAAGTGGCCAAGAAATGTTGATGTGGACGAGAG
CTGCTGGTCAGACACTCAATACCTTTACTCACGTGAGGGTTATTGGTCGTATTACTTTCT
TGCCAAAACATTAATGGAACGTGAAGCTATAGAGTGGAGCAGGACAAGCTTAGCTGATGT
TGTTACGGTCTGTCCCTCGGTCGTGATAGGCCCTAGGCTTCAGTCCACGCTTAACTCTAG
TAGCTTGGGACTTCTAAACTTTATAAAAGGAGGTGTGATATCCTTATTGAGTGACCAACT
CTATCTTGTGGATGTGCGTGATGTTGCTGATGCTCTTTTGTTGGTGTATGAAAATCAAGA
AGCAAAAGGAAGATACATATGCAGTTTTTATTCACTTCACAACAACGATCTTATGAAGAA
GCTGATGAATATGTATCCTAAACGCAACTTCCCTAAAAGTTTCAGTGAGAGAAAGGAGAA
GCAAGTGAATGAGAATGTACTTCGAATAAGTTCAGAGAAGTTGGAGAAACTTGGGTGGAA
GTTTAGGTCACTAGAAGAAACCATTGATGACTCTGTTGTGAGCTTTGAGGCTACTGGTGA
TCTTCCAAAGCAGTAATAACTCATAGTGAAAGGAAGGGAGGCTTCTTCCTCTTCCTTTTT
TTCTGCATTTGTTAAGTTACTTGAGCCTTGGTAAAAAAAAAGATATGTTACTCTTGAAAT
AAAACGACTTCATGAAAATGGTCTTAATTTTCACATTTTCAAACCCACTATTCAGTAATT
CCTCCTTTTAAAATTAAATGTTGTTATTAAACAAAATTCTTTACAAAATTAATGTTCTGA
TTTTAATGCAGTTATTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BI46TF U 1
AF RS1BI46JQ C 620
BS 1 735 RS1BI46TF
BS 736 1279 RS1BI46JQ

RD RS1BI46TF 735 0 0
GGACTCCAAAGAACATTCTTAAAGTTGCTAAAAGAGAGAGACGTCAATGGCTGAAAAGCA
GAGGATCTGTGTTACTGGTTCAGGAGGATATATTGCTTCATGGCTCGTCAAGTCTCTTCT
CTCCCATGGCTACACTGTGCATGGAACCGTTCGAGATCCTTGTGATCGAAAGAACGACCA
TTTGAAGAAACTGAATAATGCTTCAAAGAATCTGAAACTTTTCGAAGCAGATTTGTTTGA
CTATGAAGGTCTTTCTTCAGCTATTTCTGGTTGTTATGGTGTTTTTCATATTGCTGGTCC
GGTGCCTTTTGAAGATGTTCCTCTCACAGAGGAACAACTGATTAAACCAGCTCTCACTGG
CACCAAAAACGTTCTAGAAGCATGTACAGAAGCTAAAGTGAAGAAAGTTGTGGTTGTATC
ATCACTTGCGGCGGTTGTTTACAACCCAAAGTGGCCAAGAAATGTTGATGTGGACGAGAG
CTGCTGGTCAGACACTCAATACCTTTACTCACGTGAGGGTTATTGGTCGTATTACTTTCT
TGCCAAAACATTAATGGAACGTGAAGCTATAGAGTGGAGCAGGACAAGCTTAGCTGATGT
TGTTACGGTCTGTCCCTCGGTCGTGATAGGCCCTAGGCTTCAGTCCACGCTTAACTCTAG
TAGCTTGGGACTTCTAAACTTTATAAAAGGAGGTGTGATATCCTTATTGAGTGACCAACT
CTATCTTGTGGATGT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RS1BI46JQ 660 0 0
GTCGTGATAGGCCCTAGGCTTCAGTCCACGCTTAACTCTAGTAGCTTGGGACTTCTAAAC
TTTATAAAAGGAGGTGTGATATCCTTATTGAGTGACCAACTCTATCTTGTGGATGTGCGT
GATGTTGCTGATGCTCTTTTGTTGGTGTATGAAAATCAAGAAGCAAAAGGAAGATACATA
TGCAGTTTTTATTCACTTCACAACAACGATCTTATGAAGAAGCTGATGAATATGTATCCT
AAACGCAACTTCCCTAAAAGTTTCAGTGAGAGAAAGGAGAAGCAAGTGAATGAGAATGTA
CTTCGAATAAGTTCAGAGAAGTTGGAGAAACTTGGGTGGAAGTTTAGGTCACTAGAAGAA
ACCATTGATGACTCTGTTGTGAGCTTTGAGGCTACTGGTGATCTTCCAAAGCAGTAATAA
CTCATAGTGAAAGGAAGGGAGGCTTCTTCCTCTTCCTTTTTTTCTGCATTTGTTAAGTTA
CTTGAGCCTTGGTAAAAAAAAAGATATGTTACTCTTGAAATAAAACGACTTCATGAAAAT
GGTCTTAATTTTCACATTTTCAAACCCACTATTCAGTAATTCCTCCTTTTAAAATTAAAT
GTTGTTATTAAACAAAATTCTTTACAAAATTAATGTTCTGATTTTAATGCAGTTATTTAC

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL4919Contig1 495 2 1 U
GGGGTTTATTATTGAGCACACTGGCTTTAGGGTTTTTCTTCAGCTCGGTTCTTGTAACCA
TCGTTGAGAAAGTCACCGATAAAGCTCATCCGTGGATCGCTGATGATCTCAACAAAGGCC
GTCTATACAATTTCTATTGGCTTGTGGCCGTAATTGTTGCCTTGAACTTCCTTGTTTTCC
TCGTTTTCTCCAAGTGGTACGTCTACAAGGAGAAGCGACTTGCTGACCTTGGGATTGAGT
TGGAAGATGAGCCAGACATTCCAATGGGTCATTGATCTAATGAAGATGAATAATGTGTCT
ATGTTGATATGTTTGAATTTGATTATGAATTTTGTGTTATATTTTATTTTATGATGTTTT
TTTTTCACAGTTACCTTTTGTTTCTAAGTACAAATAATGGACCGACCGATAAGGGACAAA
AGTTAAGGTTTTCCGATTTGGTTCTGTATAAAAGCAGAAAGTGTAAAATTTATAAGATTT
AACGCAGTTAACGTC


BQ
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AF RS1DZ78JQ C 1
AF RS1DZ78TF U 1
BS 1 495 RS1DZ78TF

RD RS1DZ78JQ 495 0 0
GGGGTTTATTATTGAGCACACTGGCTTTAGGGTTTTTCTTCAGCTCGGTTCTTGTAACCA
TCGTTGAGAAAGTCACCGATAAAGCTCATCCGTGGATCGCTGATGATCTCAACAAAGGCC
GTCTATACAATTTCTATTGGCTTGTGGCCGTAATTGTTGCCTTGAACTTCCTTGTTTTCC
TCGTTTTCTCCAAGTGGTACGTCTACAAGGAGAAGCGACTTGCTGACCTTGGGATTGAGT
TGGAAGATGAGCCAGACATTCCAATGGGTCATTGATCTAATGAAGATGAATAATGTGTCT
ATGTTGATATGTTTGAATTTGATTATGAATTTTGTGTTATATTTTATTTTATGATGTTTT
TTTTTCACAGTTACCTTTTGTTTCTAAGTACAAATAATGGACCGACCGATAAGGGACAAA
AGTTAAGGTTTTCCGATTTGGTTCTGTATAAAAGCAGAAAGTGTAAAATTTATAAGATTT
AACGCAGTTAACGTC

QA 1 495 1 495
DS 

RD RS1DZ78TF 495 0 0
GGGGTTTATTATTGAGCACACTGGCTTTAGGGTTTTTCTTCAGCTCGGTTCTTGTAACCA
TCGTTGAGAAAGTCACCGATAAAGCTCATCCGTGGATCGCTGATGATCTCAACAAAGGCC
GTCTATACAATTTCTATTGGCTTGTGGCCGTAATTGTTGCCTTGAACTTCCTTGTTTTCC
TCGTTTTCTCCAAGTGGTACGTCTACAAGGAGAAGCGACTTGCTGACCTTGGGATTGAGT
TGGAAGATGAGCCAGACATTCCAATGGGTCATTGATCTAATGAAGATGAATAATGTGTCT
ATGTTGATATGTTTGAATTTGATTATGAATTTTGTGTTATATTTTATTTTATGATGTTTT
TTTTTCACAGTTACCTTTTGTTTCTAAGTACAAATAATGGACCGACCGATAAGGGACAAA
AGTTAAGGTTTTCCGATTTGGTTCTGTATAAAAGCAGAAAGTGTAAAATTTATAAGATTT
AACGCAGTTAACGTC

QA 1 495 1 495
DS 



AS 1 2

CO CL4920Contig1 935 2 4 U
GGAACGCCGTCTCTCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCGCTCGCGCCTCCGTCACGGTT
ACTTCACTCTCCTCGAGCCGTGGGAGGAGGAGCCTTTCATTTCATCAAAGGGACGTACAA
CTCCCCCAAAGGAAGTCGCTTTATGGGAGGAAGACAAGGGGTGACGATGCACGCGCCTCG
CTTGGGGTAGTTTCGCTGTCTGGGGAGGGCTCTTCTCGACGTTTGATTGCTCCATGGTGT
ACCTTAGGCAAAAGGAGGATCCTTGGAACTCGATCTTCGCGGGTGCTGCGACCGGAGGGT
TTCTGGCTATGCGTCAGGGGCCTAGCGCGGCTGTGAGGTCTGCACTTTTCGGTGGGGTTT
TGCTCGCTTTGATCGAAGGAGCCGGGATTGCGTTGAATAAGATGTTGGATCAGCCTCAGC
ATATGCAGATGGAGGAGGGGATTATGATGCCTGGAGGAATGCCTGGGATGCAGCAGATGG
GGCAGGTGCCTGGAATGGGGCAGCAGATGCCTAATCAAGGGCAGGTGATGCAAGAGAGTA
CTGATTCATCACCATCATCATCGTCATGGTTGGGAGGTCTGTTTGGTAAGAAGAATGATG
AGGCGCAGGGGCAGACGAGTAGTGGAAGTGAAACAAAGGTGTTGGAGAGTTTTGATGCGC
CTCCAGTGCCATCATTTGAGTACAAGTGAGCTTGATAGATGGATGGATCCTATCTTGTTG
CCTACTGGTGGCTCTTCAGAGCAGTCTGTTATGTTTTGTGGTGGTAGTCGATCTATCATC
ATTTGTTTCTTCTGCAGAATTATATAACTTGTTCTTGGAAGAACGAGTCTACTCTTCCTT
GGCTTAAAGTTTTATGTTTTAATGTTCTCTTGTGCTTATTGTGAAATCATTCCACAACTA
TTTATTTGAATAATGTACTAGTATTTTGGAGTGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BF13TF U 1
AF RS1BF13JQ C 136
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RD RS1BF13TF 635 0 0
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CTCCCCCAAAGGAAGTCGCTTTATGGGAGGAAGACAAGGGGTGACGATGCACGCGCCTCG
CTTGGGGTAGTTTCGCTGTCTGGGGAGGGCTCTTCTCGACGTTTGATTGCTCCATGGTGT
ACCTTAGGCAAAAGGAGGATCCTTGGAACTCGATCTTCGCGGGTGCTGCGACCGGAGGGT
TTCTGGCTATGCGTCAGGGGCCTAGCGCGGCTGTGAGGTCTGCACTTTTCGGTGGGGTTT
TGCTCGCTTTGATCGAAGGAGCCGGGATTGCGTTGAATAAGATGTTGGATCAGCCTCAGC
ATATGCAGATGGAGGAGGGGATTATGATGCCTGGAGGAATGCCTGGGATGCAGCAGATGG
GGCAGGTGCCTGGAATGGGGCAGCAGATGCCTAATCAAGGGCAGGTGATGCAAGAGAGTA
CTGATTCATCACCATCATCATCGTCATGGTTGGGAGGTCTGTTTGGTAAGAAGAATGATG
AGGCGCAGGG*CAGACGAGTAGTGGAAGTGAAACA

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1BF13JQ 800 0 0
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CTGTCTGGGGAGGGCTCTTCTCGACGTTTGATTGCTCCATGGTGTACCTTAGGCAAAAGG
AGGATCCTTGGAACTCGATCTTCGCGGGTGCTGCGACCGGAGGGTTTCTGGCTATGCGTC
AGGGGCCTAGCGCGGCTGTGAGGTCTGCACTTTTCGGTGGGGTTTTGCTCGCTTTGATCG
AAGGAGCCGGGATTGCGTTGAATAAGATGTTGGATCAGCCTCAGCATATGCAGATGGAGG
AGGGGATTATGATGCCTGGAGGAATGCCTGGGATGCAGCAGATGGGGCAGGTGCCTGGAA
TGGGGCAGCAGATGCCTAATCAAGGGCAGGTGATGCAAGAGAGTACTGATTCATCACCAT
CATCATCGTCATGGTTGGGAGGTCTGTTTGGTAAGAAGAATGATGAGGCGCAGGGGCAGA
CGAGTAGTGGAAGTGAAACAAAGGTGTTGGAGAGTTTTGATGCGCCTCCAGTGCCATCAT
TTGAGTACAAGTGAGCTTGATAGATGGATGGATCCTATCTTGTTGCCTACTGGTGGCTCT
TCAGAGCAGTCTGTTATGTTTTGTGGTGGTAGTCGATCTATCATCATTTGTTTCTTCTGC
AGAATTATATAACTTGTTCTTGGAAGAACGAGTCTACTCTTCCTTGGCTTAAAGTTTTAT
GTTTTAATGTTCTCTTGTGCTTATTGTGAAATCATTCCACAACTATTTATTTGAATAATG
TACTAGTATTTTGGAGTGGG

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 2

CO CL4921Contig1 752 2 2 U
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TGCGGCTGAGGCGATTCCCGGTACACCGAGAATCCGGGATGTGAGAATCGTATCCGGATC
GGAGGTAACCGGATTATGTGGTCGCGGGTCTTCTCGGGTTCCATTCAAACTCAAAGACAA
TTACGACGGTGTGGGAGACTTTGACCTCAAGAAAATGGAGGAAAATGCAGCAAAGCTTGA
GAAGGATCTGATTATGAAAGAGTTAGAAACTCTAGATTTTCTAGAAGCTCTTGGATCAAC
GAAAAAGATTGTTAAAGACTTGAAGCTGGAGCTGCAACAGCGACAACCCGTGAAATGCAT
GGAAAGCCCTGAACACCTTCGTTCACAAATTAAAGAGATGAACCATGGTGAACGTTGCCA
CCGTAGTCTCTTGAAGTCTCCAGATATGGTCTTCACGGAACTAAAGCAAGCCAGTATGAA
TCTTGGTAAAACAATGGACGATCTTTCTATGATCCGATCCTACGTTGAATCTTCGAATTG
AAGACGGTGGAACATAAAGATTTTATTGGAGTGGCGCCTCTAGCTGAGGAGCTTAACAGT
TTGAGGTCAAAGCATGATGATGAAGAGAGATTCATTACCAAGAATGTATACGTGAACCCG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1G115TF U 1
AF RS1G115JQ C 174
BS 1 668 RS1G115TF
BS 669 752 RS1G115JQ

RD RS1G115TF 668 0 0
GGAAACCATTTGGTTGTTCTTGAGGCGGTGAATGGCGGAGAGGAGGCTTCAGAAGAATTC
TGCGGCTGAGGCGATTCCCGGTACACCGAGAATCCGGGATGTGAGAATCGTATCCGGATC
GGAGGTAACCGGATTATGTGGTCGCGGGTCTTCTCGGGTTCCATTCAAACTCAAAGACAA
TTACGACGGTGTGGGAGACTTTGACCTCAAGAAAATGGAGGAAAATGCAGCAAAGCTTGA
GAAGGATCTGATTATGAAAGAGTTAGAAACTCTAGATTTTCTAGAAGCTCTTGGATCAAC
GAAAAAGATTGTTAAAGACTTGAAGCTGGAGCTGCAACAGCGACAACCCGTGAAATGCAT
GGAAAGCCCTGAACACCTTCGTTCACAAATTAAAGAGATGAACCATGGTGAACGTTGCCA
CCGTAGTCTCTTGAAGTCTCCAGATATGGTCTTCACGGAACTAAAGCAAGCCAGTATGAA
TCTTGGTAAAACAATGGACGATCTTTCTATGATCCGATCCTACGTTGAATCTTCGAATTG
AAGACGGTGGAACATAAAGATTTTATTGGAGTGGCGCCTCTAGCTGAGGAGCTTAACAGT
TTGAGGTCAAAGCATGATGATGAAGAGAGATTCATTACCAAGAATGTATACGTGAACCCG
CAATGCGA

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1G115JQ 579 0 0
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AGCTTGAGAAGGATCTGATTATGAAAGAGTTAGAAACTCTAGATTTTCTAGAAGCTCTTG
GATCAACGAAAAAGATTGTTAAAGACTTGAAGCTGGAGCTGCAACAGCGACAACCCGTGA
AATGCATGGAAAGCCCTGAACACCTTCGTTCACAAATTAAAGAGATGAACCATGGTGAAC
GTTGCCACCGTAGTCTCTTGAAGTCTCCAGATATGGTCTTCACGGAACTAAAGCAAGCCA
GTATGAATCTTGGTAAAACAATGGACGATCTTTCTATGATCCGATCCTACGTTGAATCTT
CGAATTGAAGACGGTGGAACATAAAGATTTTATTGGAGTGGCGCCTCTAGCTGAGGAGCT
TAACAGTTTGAGGTCAAAGCATGATGATGAAGAGAGATTCATTACCAAGAATGTATACGT
GAACCCGCAATGCGAACAGGTTAAGATGGTTGTTGAAACCAATGATAACAAACAGAGCAG
TGCGTGTCTGAAAACCGCAAAAATGAGATTGGTTGCCGC

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

CO CL4922Contig1 310 2 11 U
GGAGCAACCAATCACATCAATCTGATTGATATGAAGTAACAATAAATCGGGTAATGTAAA
CAACACATATGAACGATACACTGGAACGTTTCTGTAACCAAATAAAACCGATTCAATCGG
GGACAACAAATCAAAAAATTTTTTTTTTTAAAAAGGAAAAAACTCAATCAATGAAACCAG
TTCTTCTGAAAACAGCATTCCTCACCTGCCGAAGATCCCTCCCTTTAAGAGTTCTTCCAG
CTCCTTCAAGCACAGAGCAAGACAGCAAAGAAGACTGAGCCAAAGACCTCGCTACAATCT
CGTGAGGGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DS72JQ U 13
AF RS1G090JQ U 1
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BS 50 50 RS1DS72JQ
BS 51 58 RS1G090JQ
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BS 60 135 RS1G090JQ
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BS 137 153 RS1G090JQ
BS 154 154 RS1DS72JQ
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BS 158 158 RS1DS72JQ
BS 159 310 RS1G090JQ

RD RS1DS72JQ 188 0 0
CC
CATCAATCTGATTGATATGAAGTAACAATAAATCGGGTAATGTAAACAACACATATGAAC
GATACACTGGAACGTTTCTGTAACCAAATAAAACCGATTCAATCGGGGACAACAAATCAA
AAAATTTTTTTTTTTAAAAAGGAAAAAACTCAATCAATGAAACCAGTTCTTCTGAAAACA
GC
TTTC

QA 3 184 3 184
DS 

RD RS1G090JQ 310 0 0
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CAACACATATGAACGATACACTGGAACGTTTCTGTAACCAAATAAAACCGATTCAATCGG
GGACAACAAATCAAAGAATTTTTTTTTTTAAAA*GGAGAAAACTCAATCAATGAAACCAG
TTCTTCTGAAAACAGCATTCCTCACCTGCCGAAGATCCCTCCCTTTAAGAGTTCTTCCAG
CTCCTTCAAGCACAGAGCAAGACAGCAAAGAAGACTGAGCCAAAGACCTCGCTACAATCT
CGTGAGGGGG

QA 1 310 1 310
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4924Contig1 627 2 5 U
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TTGACTGTGGAAAGCAGCAAGCCTCGACCTTAGAACCTCAGCATTATCATCTTTGCGTTG
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GTGGTAACTCCTGCCACTCGATGGGTGGATCCATCTCCCGGTTATTCTTTCCTCCAGGAC
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CTCATCTAGCTTCTCTGCCTGAGCAACAGTCCTGGGAAACCCATCAAGGATGAAACCTTT
CTGGCATTTTGGCTTGTTCATGGCTTCATCAATTATACCAACAACCAACTCATCAGTGAC
AAGCGCTCCCTTGTCCATAACTTCTTTGGCCTTGAGACCAAGAGGGGTCTTAGAAGCAAC
AGCAGCTCTCAACATGTCGCCGGTGGATAAATGACACAAGCAATACTCATCCTTCACTAT
TGGAGATTGTGTACCTTTCCCTGACCCTGGAGGTCCAATGAAGATGAGGCGTTTGTCAGG
CTTTTGTGCACATTTGAGGCGGCGGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A581JQ U 51
AF RS1A581TF C 1
BS 1 50 RS1A581TF
BS 51 491 RS1A581JQ
BS 492 492 RS1A581TF
BS 493 554 RS1A581JQ
BS 555 627 RS1A581TF

RD RS1A581JQ 504 0 0
CCGGTTCAGTTTGACTGTGGAAAGCAGCAAGCCTCGACCTTAGAACCTCAGCATTATCAT
CTTTGCGTTGGATCAGAGGCTCTCCGGTGATATCATCAACTCCAGGGGTCTTGGGAGGTG
CGAACTTGGTGTGGTAACTCCTGCCACTCGATGGGTGGATCCATCTCCCGGTTATTCTTT
CCTCCAGGACTGAGTCATCGATGGCAAAGTTGAAAACTTTGTCGATTCCAGTTCCACGCT
TCTTAAGCATCTCATCTAGCTTCTCTGCCTGAGCAACAGTCCTGGGAAACCCATCAAGGA
TGAAACCTTTCTGGCATTTTGGCTTGTTCATGGCTTCATCAATTATACCAACAACCAACT
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TAGAAGCAACAGCAGCTCTCACCATGTCGCCGGTGGATAAATGACACAAGCAATACTCAT
CCTTCACTATTGGAGATTGTGTAC

QA 1 504 1 504
DS 

RD RS1A581TF 627 0 0
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TTGACTGTGGAAAGCAGCAAGCCTCGACCTTAGAACCTCAGCATTATCATCTTTGCGTTG
GATCAGAGGCTCTCCGGTGATATCATCAACTCCAGGGGTCTTGGGAGGTGCGAACTTGGT
GTGGTAACTCCTGCCACTCGATGGGTGGATCCATCTCCCGGTTATTCTTTCCTCCAGGAC
TGAGTCATCGATGGCAAAGTTGAGAACTTTGTCGATTCCAGTTCCACGCTTCTTAAGCAT
CTCATCTAGCTTCTCTGCCTGAGCAACAGTCCTGGGAAACCCATCAAGGATGAAACCTTT
CTGGCATTTTGGCTTGTTCATGGCTTCATCAATTATACCAACAACCAACTCATCAGTGAC
AAGCGCTCCCTTGTCCATAACTTCTTTGGCCTTGAGACCAAGAGGGGTCTTAGAAGCAAC
AGCAGCTCTCAACATGTCGCCGGTGGATAAATGACACAAGCAATACTCATCCTTCACTAT
TGGAGATTGTGTACCTTTCCCTGACCCTGGAGGTCCAATGAAGATGAGGCGTTTGTCAGG
CTTTTGTGCACATTTGAGGCGGCGGAG

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL4925Contig1 864 2 4 U
GTCGTTTACTGGAACGTTGGATAAATGCAAGGCGTGTGACAAAACCGTCTACGTCATGGA
TTTGTTGACGTTGGAGGGTAACACTTATCACAAATCATGTTTCCGATGCAGTCACTGCAA
TGGCACTCTCCAGATGAGTACTTACTCGTCCATGGATGGAGTTCTTTACTGCAAGACTCA
CTTCGAACAGCTTTTCAAAGAATCTGGCAATTTCAGCAAGAACTTTCAGACTGGAAAGAC
AGAGAAGTCGAATGAACAAATGAATCGAGCTCCAAGCAAGTTATCTTCATTCTTCAGTGG
AACACAAGACAAGTGTGCGAGTTGTCACAAAACCGTTTACCCACTTGAGAAAGTAAACAT
GGAAGGTGAATGTTACCACAAGACTTGCTTCAAGTGCGCACACAGTGGTTGTCCTTTGAC
TCACTCTTCTTACGCTTCTCTCAACGGTGTCCTCTACTGTAAAGTCCGTTTCAACCAGCT
CTTTCTCGAGAAAGGAAGTTACAACCACGTCCATCAAGCCGCTGCTAACCACCGCCGAAC
CGCCTCTTCTGGTGCCTCTACTCCGCCTTCTGAAGATCAGAAACCCGAAGAAAACGCTGC
AATTCCGGAAGGAGATGCAGGAGAAGAAGAAGCAGTCCCTGAAGCTGCTGCAGGAGAAGA
GCCTGAGCCTGTGGTTGAGTCTTGAATGTTGTGGAGGAAGAATCTGATCAGTTGTCAAAT
TTGAAGTTTATATACACTTTTATGTTTATAATGAAAATATTTGTATACAATTTGTTGCTA
TTTCTTTTTGTAAATCTTTTGTAAATTTAAAAGCTTTTTTTGGGAGAGAATCTGTTGTAA
GCAAATATTATAATTTATTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AL91TF U 1
AF RS1AL91JQ C 198
BS 1 653 RS1AL91TF
BS 654 654 RS1AL91JQ
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BS 699 864 RS1AL91JQ

RD RS1AL91TF 698 0 0
GTCGTTTACTGGAACGTTGGATAAATGCAAGGCGTGTGACAAAACCGTCTACGTCATGGA
TTTGTTGACGTTGGAGGGTAACACTTATCACAAATCATGTTTCCGATGCAGTCACTGCAA
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CTTCGAACAGCTTTTCAAAGAATCTGGCAATTTCAGCAAGAACTTTCAGACTGGAAAGAC
AGAGAAGTCGAATGAACAAATGAATCGAGCTCCAAGCAAGTTATCTTCATTCTTCAGTGG
AACACAAGACAAGTGTGCGAGTTGTCACAAAACCGTTTACCCACTTGAGAAAGTAAACAT
GGAAGGTGAATGTTACCACAAGACTTGCTTCAAGTGCGCACACAGTGGTTGTCCTTTGAC
TCACTCTTCTTACGCTTCTCTCAACGGTGTCCTCTACTGTAAAGTCCGTTTCAACCAGCT
CTTTCTCGAGAAAGGAAGTTACAACCACGTCCATCAAGCCGCTGCTAACCACCGCCGAAC
CGCCTCTTCTGGTGCCTCTACTCCGCCTTCTGAAGATCAGAAACCCGAAGAAAACGCTGC
AATTCCGGAAGGAGATGCAGGAGAAGAAGAAGCAGTCCCTGAAGCTGCTGCAG*AGAAGA
GCCTGAGCCTGTGGTTGAGTCTTGAATGTTGTGGAGGA

QA 1 698 1 698
DS 

RD RS1AL91JQ 667 0 0
AAGAATCTGGCAATTTCAGCAAGAACTTTCAGACTGGAAAGACAGAGAAGTCGAATGAAC
AAATGAATCGAGCTCCAAGCAAGTTATCTTCATTCTTCAGTGGAACACAAGACAAGTGTG
CGAGTTGTCACAAAACCGTTTACCCACTTGAGAAAGTAAACATGGAAGGTGAATGTTACC
ACAAGACTTGCTTCAAGTGCGCACACAGTGGTTGTCCTTTGACTCACTCTTCTTACGCTT
CTCTCAACGGTGTCCTCTACTGTAAAGTCCGTTTCAACCAGCTCTTTCTCGAGAAAGGAA
GTTACAACCACGTCCATCAAGCCGCTGCTAACCACCGCCGAACCGCCTCTTCTGGTGCCT
CTACTCCGCCTTCTGAAGATCAGAAACCCGAAGAAAACGCTGCAATTCCGGAAGGAGATG
CAGGAGAAGAAGAAGCAGTCCCTGAAGCTGCTGCAGGAGAAGAGCCTGAGCCTGTGGTTG
AGTCTTGAATGTTGTGGAGGAAGAATCTGATCAGTTGTCAAATTTGAAGTTTATATACAC
TTTTATGTTTATAATGAAAATATTTGTATACAATTTGTTGCTATTTCTTTTTGTAAATCT
TTTGTAAATTTAAAAGCTTTTTTTGGGAGAGAATCTGTTGTAAGCAAATATTATAATTTA
TTTTATT

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 2

CO CL4926Contig1 878 2 2 U
GGACTTTACCTTATTCTCTCTCAATTCTCCTCTTCGTAGCCGTCGAATCTGAAATGATCA
CCGGAATGTTCCGAAGATCTTCCCTGCCGTCAAGGCAGACTCTCTCCGCCGCACTGAGCT
CTTTTGATTCGGCTCTTTCCCGAAATTTCACCACCGGAGCCTCCGCGAATCTTAATCCGA
TTGGAAACGGATCTAATCTCTCCTCCGCATCGTTTCAAGGCTACGCCACTGAGCGTGAAA
CTAGCGTCGCAGATTCAATCAAAATCACTCCAGAGAATGTCAAACCATTGAGCAAGAAGA
AGAAAGAAGGAGAAGAAAGCACATCGAAGATCAAAGGAACGAGGATCTGCATTGCTATCC
GTTCCTTCGACAACCCGGAGAAGGAAGCCTGGTGTCTCCCTCCCCACAGTCGCTACGCCG
CGATGCCCGACACGAGGACCTAGTACACGGTCCTGCGTTCCCCTCACGTCGACAAGAAGT
CGAGGGAGCAGTTCGAGATGAGGTTCAAGAAACGGTTTCTTGTCATCAAGGCTCAGAGCC
ATGAGCTTAACAAGAAGCTGTTTTGGTTGAAGCGTTACCGTATCCTCGGTGCTCAGTACG
AGCTTCAGTTCCATTGCAAGACCAGGTTGGACATGTCTCCCGTGTTAGCCAGCATCAAAG
GCTCCACCGTCGGTGGTCAGTGAGATAATGCTTGAAGAGATCGTTTTTGAGAAGTTGGGG
TTTTGATCCGATCCTGTAATAATGTCTGAATCTTACGTCGGATTCAGTAAAGAATTCAGC
TTATACATCACAATTCTTAGCTTTTGTTCTTGTTTTTTTTTTCAGTTACTGATGTTTCAA
AGACATGGTTTTTAGGCTGAATTTTAGTGTCACGGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E108TF U 1
AF RS1E108JQ C 162
BS 1 658 RS1E108TF
BS 659 878 RS1E108JQ

RD RS1E108TF 658 0 0
GGACTTTACCTTATTCTCTCTCAATTCTCCTCTTCGTAGCCGTCGAATCTGAAATGATCA
CCGGAATGTTCCGAAGATCTTCCCTGCCGTCAAGGCAGACTCTCTCCGCCGCACTGAGCT
CTTTTGATTCGGCTCTTTCCCGAAATTTCACCACCGGAGCCTCCGCGAATCTTAATCCGA
TTGGAAACGGATCTAATCTCTCCTCCGCATCGTTTCAAGGCTACGCCACTGAGCGTGAAA
CTAGCGTCGCAGATTCAATCAAAATCACTCCAGAGAATGTCAAACCATTGAGCAAGAAGA
AGAAAGAAGGAGAAGAAAGCACATCGAAGATCAAAGGAACGAGGATCTGCATTGCTATCC
GTTCCTTCGACAACCCGGAGAAGGAAGCCTGGTGTCTCCCTCCCCACAGTCGCTACGCCG
CGATGCCCGACACGAGGACCTAGTACACGGTCCTGCGTTCCCCTCACGTCGACAAGAAGT
CGAGGGAGCAGTTCGAGATGAGGTTCAAGAAACGGTTTCTTGTCATCAAGGCTCAGAGCC
ATGAGCTTAACAAGAAGCTGTTTTGGTTGAAGCGTTACCGTATCCTCGGTGCTCAGTACG
AGCTTCAGTTCCATTGCAAGACCAGGTTGGACATGTCTCCCGTGTTAGCCAGCATCAA

QA 1 658 1 658
DS 

RD RS1E108JQ 717 0 0
TCCGCGAATCTTAATCCGATTGGAAACGGATCTAATCTCTCCTCCGCATCGTTTCAAGGC
TACGCCACTGAGCGTGAAACTAGCGTCGCAGATTCAATCAAAATCACTCCAGAGAATGTC
AAACCATTGAGCAAGAAGAAGAAAGAAGGAGAAGAAAGCACATCGAAGATCAAAGGAACG
AGGATCTGCATTGCTATCCGTTCCTTCGACAACCCGGAGAAGGAAGCCTGGTGTCTCCCT
CCCCACAGTCGCTACGCCGCGATGCCCGACACGAGGACCTAGTACACGGTCCTGCGTTCC
CCTCACGTCGACAAGAAGTCGAGGGAGCAGTTCGAGATGAGGTTCAAGAAACGGTTTCTT
GTCATCAAGGCTCAGAGCCATGAGCTTAACAAGAAGCTGTTTTGGTTGAAGCGTTACCGT
ATCCTCGGTGCTCAGTACGAGCTTCAGTTCCATTGCAAGACCAGGTTGGACATGTCTCCC
GTGTTAGCCAGCATCAAAGGCTCCACCGTCGGTGGTCAGTGAGATAATGCTTGAAGAGAT
CGTTTTTGAGAAGTTGGGGTTTTGATCCGATCCTGTAATAATGTCTGAATCTTACGTCGG
ATTCAGTAAAGAATTCAGCTTATACATCACAATTCTTAGCTTTTGTTCTTGTTTTTTTTT
TCAGTTACTGATGTTTCAAAGACATGGTTTTTAGGCTGAATTTTAGTGTCACGGTGC

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 2

CO CL4927Contig1 1020 2 4 U
GGACAGTCTCTTCTTCTCTTAAGGTTAAATTGTCAGAAGGCGGCAATGCGTAGCCTTAGG
CTGGCTCGAAACCATTCGAAGTCAGTGCATGAGAGACTTGTCTATGAAGTATGTGATCCA
GCTACTTGAAGAAGCGCTTCGTTGTCCATCAGATGGTCTTCGTAAGGGACAATGTGTTGT
GTGTTTGCAGGCTTTGAACAACTTGGGAAGTGTGTATGTTGACTGTGATAAGCTGGATCT
CGCAGCTGATTGCTACACTAACGCGCTAAACATCAAGCACACAAGAGCTCACCAAGGCTT
AGCTCGTGTGTACCATATGAAAAACCAAACTAAAGCTGCCTACGATGAGATGACAAAGCT
GATAGAGAAAGCTCGGAACAATGCATCTGCCTTTGAGAAACGGTCAGAGTATTGTGAACG
GGAGATGGCACAGAGCGACCTGGGGATGGCCACACTGCTAGATCCCCTTAGAACTTACCC
TTACAGATACAGATCCGCAGTTCTAATGGATGACCATAAAGAAACGGAAGCCATTGAGGA
GCTGTCGAAAGCCTTAGCCTTTAAACCTGACCTCCAGCTGTTACATCTACGGGCAGCATT
CTATGATTCAATGGGTGTATCTGCAGATGCTATCAGAGACTGTGAAGCAGCTCTGAGTCT
TGATCCAAACCACAAAGATACCATCGACCTCTATAACAAAGCACGTGAACCACAACCATA
GACAAACCCATCTGCAATCTTATTTATCTCCTACAATACGGCGGGTGAGAGAGCTGCTTC
CCTCTGAAACCTGAGATGCACTTGTATGCTTCACGCCAATGGGAAAACTAAAGCTTGGTT
CCTTTGTAATCAAGAAGTTTTGATACAAGGGGGAACAAACCAAAGGAGCAGCGACTTAGA
TTGTAAATATAAACTTCATACTTTGTGGTTTTGTGATTGATTCTGGTTTGATGATTGGAT
CAGATTAATATATATATATAGTGCAGAGTGTTTTCCGGAGAAAGGGAAAAATGAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1C371TF U 1
AF RS1C371JQ C 253
BS 1 727 RS1C371TF
BS 728 728 RS1C371JQ
BS 729 750 RS1C371TF
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RD RS1C371TF 757 0 0
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CTGGCTCGAAACCATTCGAAGTCAGTGCATGAGAGACTTGTCTATGAAGTATGTGATCCA
GCTACTTGAAGAAGCGCTTCGTTGTCCATCAGATGGTCTTCGTAAGGGACAATGTGTTGT
GTGTTTGCAGGCTTTGAACAACTTGGGAAGTGTGTATGTTGACTGTGATAAGCTGGATCT
CGCAGCTGATTGCTACACTAACGCGCTAAACATCAAGCACACAAGAGCTCACCAAGGCTT
AGCTCGTGTGTACCATATGAAAAACCAAACTAAAGCTGCCTACGATGAGATGACAAAGCT
GATAGAGAAAGCTCGGAACAATGCATCTGCCTTTGAGAAACGGTCAGAGTATTGTGAACG
GGAGATGGCACAGAGCGACCTGGGGATGGCCACACTGCTAGATCCCCTTAGAACTTACCC
TTACAGATACAGATCCGCAGTTCTAATGGATGACCATAAAGAAACGGAAGCCATTGAGGA
GCTGTCGAAAGCCTTAGCCTTTAAACCTGACCTCCAGCTGTTACATCTACGGGCAGCATT
CTATGATTCAATGGGTGTATCTGCAGATGCTATCAGAGACTGTGAAGCAGCTCTGAGTCT
TGATCCAAACCACAAAGATACCATCGACCTCTATAACAAAGCACGTGAACCACAACCATA
GACAAACTCATCTGCAATCTTATTTATCTC
TACAATA

QA 1 750 1 750
DS 

RD RS1C371JQ 768 0 0
CTACACTAACGCGCTAAACATCAAGCACACAAGAGCTCACCAAGGCTTAGCTCGTGTGTA
CCATATGAAAAACCAAACTAAAGCTGCCTACGATGAGATGACAAAGCTGATAGAGAAAGC
TCGGAACAATGCATCTGCCTTTGAGAAACGGTCAGAGTATTGTGAACGGGAGATGGCACA
GAGCGACCTGGGGATGGCCACACTGCTAGATCCCCTTAGAACTTACCCTTACAGATACAG
ATCCGCAGTTCTAATGGATGACCATAAAGAAACGGAAGCCATTGAGGAGCTGTCGAAAGC
CTTAGCCTTTAAACCTGACCTCCAGCTGTTACATCTACGGGCAGCATTCTATGATTCAAT
GGGTGTATCTGCAGATGCTATCAGAGACTGTGAAGCAGCTCTGAGTCTTGATCCAAACCA
CAAAGATACCATCGACCTCTATAACAAAGCACGTGAACCACAACCATAGACAAACCCATC
TGCAATCTTATTTATCTCCTACAATACGGCGGGTGAGAGAGCTGCTTCCCTCTGAAACCT
GAGATGCACTTGTATGCTTCACGCCAATGGGAAAACTAAAGCTTGGTTCCTTTGTAATCA
AGAAGTTTTGATACAAGGGGGAACAAACCAAAGGAGCAGCGACTTAGATTGTAAATATAA
ACTTCATACTTTGTGGTTTTGTGATTGATTCTGGTTTGATGATTGGATCAGATTAATATA
TATATATAGTGCAGAGTGTTTTCCGGAGAAAGGGAAAAATGAAAAAAA

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL4928Contig1 671 2 3 U
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GACAGCTTCTCTTTCCTCTTAGCGTCGGTCCAACGATGGCGGCGAACCGGTGCGTTAGGA
GGCTCGACATCTTCCACTTGCTGGCTCAAATCCTCAAAATCTAGTTGGTTTCAAAAAGCA
CGAGTCTTTTTGGGTGTGGTATATGAAAAATGTAACTCTTTTGCTACCAAACTAGCTTCT
CTGATTGATTTAAATACAATATTTAAACTATTCAGATCATCATGATCCACGCCACAAACC
ACTCTAATCAAAAGTTCTTGAGGCAAAGATTCAAGGCGAGATCTCTCAGCAGACAACGAA
ACATTAGCAGTTCTGCTTCTTTGTCTCTTCACCGGCGTTGTCGATTCAGTTGCCGGAATC
TCTCTGCTTGAAAACAAAACCCTTTTCCTCCCTAACCCTCTCGTGAACGTAGTAACTGAA
CCTAATCCTAAATCTAACTCCTCTTCCTCTGACTTCACTAACTTTGTTAACGCCATTGTT
GTTCTTCCTCCACTAAGAAAGTTCTTGACAAACAGAGTCTCCGAGAACCACTCCACCACT
TTAACGACTCTGCAGAACCAAAATTCACCGATCAAATGTAGATAGTGAATCATCAGAACG
CAAATGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F437JQ U 58
AF RS1F437TF C 1
BS 1 61 RS1F437TF
BS 62 534 RS1F437JQ
BS 535 671 RS1F437TF

RD RS1F437JQ 477 0 0
TTAA
ACAGCTTCTCTTTCCTCTTAGCGTCGGTCCAACGATGGCGGCGAACCGGTGCGTTAGGAG
GCTCGACATCTTCCACTTGCTGGCTCAAATCCTCAAAATCTAGTTGGTTTCAAAAAGCAC
GAGTCTTTTTGGGTGTGGTATATGAAAAATGTAACTCTTTTGCTACCAAACTAGCTTCTC
TGATTGATTTAAATACAATATTTAAACTATTCAGATCATCATGATCCACGCCACAAACCA
CTCTAATCAAAAGTTCTTGAGGCAAAGATTCAAGGCGAGATCTCTCAGCAGACAACGAAA
CATTAGCAGTTCTGCTTCTTTGTCTCTTCACCGGCGTTGTCGATTCAGTTGCCGGAATCT
CTCTGCTTGAAAACAAAACCCTTTTCCTCCCTAACCCTCTCGTGAACGTAGTAACTGAAC
CTAATCCTAAATCTAACTCCTCTTCCTCTGACTTCACTAACTTTGTTAACGCC

QA 5 477 5 477
DS 

RD RS1F437TF 671 0 0
ATCCCACCCATATACATATCTCATCATCATTTTCAAGTAAACAATGCCACAGAGACATTA
GACAGCTTCTCTTTCCTCTTAGCGTCGGTCCAACGATGGCGGCGAACCGGTGCGTTAGGA
GGCTCGACATCTTCCACTTGCTGGCTCAAATCCTCAAAATCTAGTTGGTTTCGAAAAGCA
CGAGTCTTTTTGGGTGTGGTATATGAAAAATGTAACTCTTTTGCTACCAAACTAGCTTCT
CTGATTGATTTAGATACAATATTTAGACTATTCAGATCATCATGATCCACGCCACAAACC
ACTCTAATCAAAAGTTCTTGAGGCAGAGATTCAAGGCGAGATCTCTCAGCAGACAACGAA
ACATTAGCAGTTCTGCTTCTTTGTCTCTTCACCGGCGTTGTCGATTCAGTTGCCGGAATC
TCTCTGCTTGAAAACAAAACCCTTTTCCTCCCTAACCCTCTCGTGAACGTAGTAACTGAA
CCTAATCCTAAATCTAACTCCTCTTCCTCTGACTTCACTAACTTTGTTAACGCCATTGTT
GTTCTTCCTCCACTAAGAAAGTTCTTGACAAACAGAGTCTCCGAGAACCACTCCACCACT
TTAACGACTCTGCAGAACCAAAATTCACCGATCAAATGTAGATAGTGAATCATCAGAACG
CAAATGAAAAA

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 2

CO CL4929Contig1 800 2 3 U
AGATATGCTCCAAGGTTCCGTTACTAAAGGATGACCGTTGAGGAGTTCTAGGTTAACTCT
ATCAGATGATAAGGTACTTTGTAGAGCTTATGAGAGCTATTATGTTGGCTAGTTTTTATT
GTATCTCAAACAACATATATATTGGATCCTTGCAGTGTTATATTGAGCGAAAAACAGGAA
ACCGGTTCCGTTCCCTTGTTTCCGTTGAGAGATACTTGAAAGATCCCGGGAAGCTTGCAG
ATAAGCAGCCTATGCGTATAGATTACCACCGTGGCCGTTCCAGAGATTTCAGATTACCTA
ATGGATGGATCGTTGAGGGGAAACCGCGGAGTAGTTCCAGTCAAATTGATAAGGTACACA
CATCTGTGGGGTTTGGTATTCTTTGGTTTGAGTATTATGGTCCAACCGTTTGTACTGTTT
TTTTGTTCGCAGACTTACATTTGAGCCAGGAACGGGGAATAAATTTTCGTTCTCTGGCTG
CTGTTGAGAGATACTTAAACGGTGCAAATGACTCGGTTAATTCCATGGTGCCTTCCGGGC
GGCTTTCGGTAAGTTTCTAAATCTTTTACACTACTATACTATACAGGTTTGATGGTGTTT
TCTTCCAAATTTTGGCTAACTCGGACCGGGTTTCAGGCAGTTGTTATTGACGAAAAGCCA
CCGGAGAAAGTTAAATGGGTACTGAACGGTCCAGGTGGAAACATGTTTAGTGCGCATGTG
AGCGGCTCGGTCGTGCCTAGCTCTGTCAAACAGACATGGGCTGAGGCCTTTGTCTCACTG
ATCCAAGACCGCTTTTAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BU51JQ U 387
AF RS1BU51TF C 1
BS 1 386 RS1BU51TF
BS 387 532 RS1BU51JQ
BS 533 800 RS1BU51TF

RD RS1BU51JQ 146 0 0
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CAGGAACGGGGAATAAATTTTCGTTCTCTGGCTGCTGTTGAGAGATACTTAAACGGTGCA
AATGACTCGGTTAATTCCATGGTGCC

QA 1 146 1 146
DS 

RD RS1BU51TF 800 0 0
AGATATGCTCCAAGGTTCCGTTACTAAAGGATGACCGTTGAGGAGTTCTAGGTTAACTCT
ATCAGATGATAAGGTACTTTGTAGAGCTTATGAGAGCTATTATGTTGGCTAGTTTTTATT
GTATCTCAAACAACATATATATTGGATCCTTGCAGTGTTATATTGAGCGAAAAACAGGAA
ACCGGTTCCGTTCCCTTGTTTCCGTTGAGAGATACTTGAAAGATCCCGGGAAGCTTGCAG
ATAAGCAGCCTATGCGTATAGATTACCACCGTGGCCGTTCCAGAGATTTCAGATTACCTA
ATGGATGGATCGTTGAGGGGAAACCGCGGAGTAGTTCCAGTCAAATTGATAAGGTACACA
CATCTGTGGGGTTTGGTATTCTTTGGTTTGAGTATTATGGTCCAACCGTTTGTACTGTTT
TTTTGTTCGCAGACTTACATT*GAGCCAGGAACGGGGAATAAATTT*CGTTCTCTGGCTG
CTGTTGAGAGATACTTAAACGGTGCAAATGACTCGGTTAATTCCATGGTGCCTTCCGGGC
GGCTTTCGGTAAGTTTCTAAATCTTTTACACTACTATACTATACAGGTTTGATGGTGTTT
TCTTCCAAATTTTGGCTAACTCGGACCGGGTTTCAGGCAGTTGTTATTGACGAAAAGCCA
CCGGAGAAAGTTAAATGGGTACTGAACGGTCCAGGTGGAAACATGTTTAGTGCGCATGTG
AGCGGCTCGGTCGTGCCTAGCTCTGTCAAACAGACATGGGCTGAGGCCTTTGTCTCACTG
ATCCAAGACCGCTTTTAACC

QA 1 800 1 800
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4931Contig1 759 2 2 U
TTTTTCTTTCTGATAGCTGCATACCTCTGTATAGTTTCAGCTACACGTATAACTACATCA
TGTCAACACCAACTAGTTTCGTTGATAGCTTTGCAGATACAAAAGATAAGCGTTATAATC
CTAGAATGGATCCGGTAATTCATGTTCATAACTGGAGAAAAGGATCACAGCGGGTCGTTC
TGAATAGAAAACACGCAGAAATTGTGGTGAACGATACCATCGTCTTGCCTATGTTTCAGC
AGCATTGCAGGCGGAAATCACTACCAGAGTTTTGGCGAGATCGTCCTGTACCAGCTGAAG
GTTGGAAGGAACACAACTGTATACCTGATGAGCACTACGTTCAGACATTGCTAGCTCAAA
AGGGTGTAGATAGCGAACTCACACGACGGTCATTATCACACTCAGCTTGGGACCTTACTT
CCTCTAAAAGTAATGAACGTCGTGGATGGCATCCTATGACTTACAAGTTCTCCGATGCTA
CTCCTCACCTTATACAGTCTATTAAGGGTATCGACAATATCAACTATGAGACGGAATACA
GGAGAGAATGGTGTACAAGTAAAGGGAAACCGGCACCGTGTTTCCTCTTTGCCCGGAAGT
TCACTCGTCCCGCCGCTCTCCGCCTCCTCCGTGAGTCTATCTTGTTGAAGGACAAAGAGC
AAGACAGTTAAAGTAGTAGATCCTTAACCATTCAAAATCATATATTATACATAGGTATGT
AAGATTACAAAGAGTTATTACGTTTGTGCTTGTAATGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1C093TF U 1
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BS 1 619 RS1C093TF
BS 620 759 RS1C093JQ

RD RS1C093TF 619 0 0
TTTTTCTTTCTGATAGCTGCATACCTCTGTATAGTTTCAGCTACACGTATAACTACATCA
TGTCAACACCAACTAGTTTCGTTGATAGCTTTGCAGATACAAAAGATAAGCGTTATAATC
CTAGAATGGATCCGGTAATTCATGTTCATAACTGGAGAAAAGGATCACAGCGGGTCGTTC
TGAATAGAAAACACGCAGAAATTGTGGTGAACGATACCATCGTCTTGCCTATGTTTCAGC
AGCATTGCAGGCGGAAATCACTACCAGAGTTTTGGCGAGATCGTCCTGTACCAGCTGAAG
GTTGGAAGGAACACAACTGTATACCTGATGAGCACTACGTTCAGACATTGCTAGCTCAAA
AGGGTGTAGATAGCGAACTCACACGACGGTCATTATCACACTCAGCTTGGGACCTTACTT
CCTCTAAAAGTAATGAACGTCGTGGATGGCATCCTATGACTTACAAGTTCTCCGATGCTA
CTCCTCACCTTATACAGTCTATTAAGGGTATCGACAATATCAACTATGAGACGGAATACA
GGAGAGAATGGTGTACAAGTAAAGGGAAACCGGCACCGTGTTTCCTCTTTGCCCGGAAGT
TCACTCGTCCCGCCGCTCT

QA 1 619 1 619
DS 

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AATGGATCCGGTAATTCATGTTCATAACTGGAGAAAAGGATCACAGCGGGTCGTTCTGAA
TAGAAAACACGCAGAAATTGTGGTGAACGATACCATCGTCTTGCCTATGTTTCAGCAGCA
TTGCAGGCGGAAATCACTACCAGAGTTTTGGCGAGATCGTCCTGTACCAGCTGAAGGTTG
GAAGGAACACAACTGTATACCTGATGAGCACTACGTTCAGACATTGCTAGCTCAAAAGGG
TGTAGATAGCGAACTCACACGACGGTCATTATCACACTCAGCTTGGGACCTTACTTCCTC
TAAAAGTAATGAACGTCGTGGATGGCATCCTATGACTTACAAGTTTTCCGATGCTACTCC
TCACCTTATACAGTCTATTAAGGGTATCGACAATATCAACTATGAGACGGAATACAGGAG
AGAATGGTGTACAAGTAAAGGGAAACCGGCACCGTGTTTCCTCTTTGCCCGGAAGTTCAC
TCGTCCCGCCGCTCTCCGCCTCCTCCGTGAGTCTATCTTGTTGAAGGACAAAGAGCAAGA
CAGTTAAAGTAGTAGATCCTTAACCATTCAAAATCATATATTATACATAGGTATGTAAGA
TTACAAAGAGTTATTACGTTTGTGCTTGTAATGTG

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

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TCTGAGAAGCTCCTTAGAACTCACCGATCATGAAACTTAGGCGAATCCTCGGTTCCGTTT
CGAGTCTCGCTACAGAGAAGCTCTCTTCGTCTTCGTATTCTTCCCGTTGCCCGTCGAGAC
AGATCTTCACGGCGCGGTCGGCATCATCTTCTTCGCAACGAAATGCCGAAACCGTTGGAT
TCGATCATGGATTTGGATAGAGCCAAAACCAAATCGCCGGAGGAGCTCACCTCGATCTGG
GACGATTATCACTTGGGACGAGGGCATATTGGAATCACTATGAAAGCTCAGCTTTATCGT
TTGTTGGAGCAACGAGCAGCTGAGTGCCGATACTTTGTCATTCCGTTGTGGAGAGGAAAT
GGTTACATTACAATGTTTGCTCAAGTTGAAGCGCCACACATGATTTTCACTGGTCTCGAA
GACTACAAAGCGAGAGGAACTGAAGCGGCTCCTTACTTGACAAGCAAATTTTACACTGAG
CTTTCAGAGACGAAAGACTTGGTGTTTATCCGAGGCGATGTTGTGTTCACAAGCAAGCTC
ACAGACGAGGAGGGGAAATGGCTGATGGAGACGGCTCAGTCGTTTTACTTGAACGACAAT
CGGTACAAACTGCTCGAGCGGTTCAACAAACATACTCATGAGTTTGAGTTCAAGGATGTG
TTACAAGCTCTGGATATGCCTGTCCTCTGATTTGGTTAAAAATCAGGACTAAAACTTCTC
TGTTTTTCTTTCTTTATGAGATATCATTGTATTAGAATTGCTTGTGGGAATATTAAATTT
CCAGAGATTTTGCTCTC


BQ
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AF RS1D035TF U 1
AF RS1D035JQ C 176
BS 1 658 RS1D035TF
BS 659 659 RS1D035JQ
BS 660 676 RS1D035TF
BS 677 857 RS1D035JQ

RD RS1D035TF 676 0 0
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TCTGAGAAGCTCCTTAGAACTCACCGATCATGAAACTTAGGCGAATCCTCGGTTCCGTTT
CGAGTCTCGCTACAGAGAAGCTCTCTTCGTCTTCGTATTCTTCCCGTTGCCCGTCGAGAC
AGATCTTCACGGCGCGGTCGGCATCATCTTCTTCGCAACGAAATGCCGAAACCGTTGGAT
TCGATCATGGATTTGGATAGAGCCAAAACCAAATCGCCGGAGGAGCTCACCTCGATCTGG
GACGATTATCACTTGGGACGAGGGCATATTGGAATCACTATGAAAGCTCAGCTTTATCGT
TTGTTGGAGCAACGAGCAGCTGAGTGCCGATACTTTGTCATTCCGTTGTGGAGAGGAAAT
GGTTACATTACAATGTTTGCTCAAGTTGAAGCGCCACACATGATTTTCACTGGTCTCGAA
GACTACAAAGCGAGAGGAACTGAAGCGGCTCCTTACTTGACAAGCAAATTTTACACTGAG
CTTTCAGAGACGAAAGACTTGGTGTTTATCCGAGGCGATGTTGTGTTCACAAGCAAGCTC
ACAGACGAGGAGGGGAAATGGCTGATGGAGACGGCTCAGTCGTTTTACTTGAACGACA*T
CGGTACAAACTGCTCG

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1D035JQ 682 0 0
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TGGATTCGATCATGGATTTGGATAGAGCCAAAACCAAATCGCCGGAGGAGCTCACCTCGA
TCTGGGACGATTATCACTTGGGACGAGGGCATATTGGAATCACTATGAAAGCTCAGCTTT
ATCGTTTGTTGGAGCAACGAGCAGCTGAGTGCCGATACTTTGTCATTCCGTTGTGGAGAG
GAAATGGTTACATTACAATGTTTGCTCAAGTTGAAGCGCCACACATGATTTTCACTGGTC
TCGAAGACTACAAAGCGAGAGGAACTGAAGCGGCTCCTTACTTGACAAGCAAATTTTACA
CTGAGCTTTCAGAGACGAAAGACTTGGTGTTTATCCGAGGCGATGTTGTGTTCACAAGCA
AGCTCACAGACGAGGAGGGGAAATGGCTGATGGAGACGGCTCAGTCGTTTTACTTGAACG
ACAATCGGTACAAACTGCTCGAGCGGTTCAACAAACATACTCATGAGTTTGAGTTCAAGG
ATGTGTTACAAGCTCTGGATATGCCTGTCCTCTGATTTGGTTAAAAATCAGGACTAAAAC
TTCTCTGTTTTTCTTTCTTTATGAGATATCATTGTATTAGAATTGCTTGTGGGAATATTA
AATTTCCAGAGATTTTGCTCTC

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 2

CO CL4933Contig1 1251 2 2 U
GGCGCTTCGAGTTAGCGAAGCGCTGTAGTAGCGCCGAAGCCCTATGTGCTATAATGCTGA
GCCAAGGACTCCGCCTTATCTATAGAAGCAGTCAACTGAGTTCTGAACGAATTAGATCCT
TGGTAATGGCTCAATCTATAGATAGAAAGCCTTATGATGGGAAACCATCACGTTAGGTTT
GGAGAGAGATGGGACCGGTTATATAATAGAGGGAGCAGATGCAAGCTTTTTTCTTTCAAT
AGCCGGCCAAATGACTACAGGATCATCGGTCTACTCTACCTCAATTCACCATTTCGAACT
TTATACAGAAGGTTTTTCCGTACCAGCTTCTTCTACCTATACCGCAGTTGAAGCACCTAA
AGGAGAATTTGGTGTCTTTCTGGTCAGTAATGGAAGCAATCGTCCCTACCGTTGTAAAAT
AAGAGCACCCGGCTTTGCCCATTCACAAGGACTCGATTTTATGTCCAAACATCACATGCC
AGCAGATGTGGTCACCATCATAGGTACTCAAGATATTGTGTTTGGAGAGGTGGATAGATA
GGGCGACTAGTTGCCAGGACCTTAGCTTTATTGCGAGCCCAGAAGTCTCTCTTTTTTTTC
GGCCTTCAGGAACAGCCTTTAAGTAAAATCCAACCTAATATCATTCATATCCTTCTACAT
AGAAGAAAGACACTCTAAGATCCTTTTTCAAACCTGCTCCCATTTAGAGTCAAGAGATAG
ATAAATAGACACGTCCCATTGCCACTTGATGGGGGGGGCGTTCGTTGTATGTTGAAGCAG
AGATGAATAGGGTGACTGTGAAGAGAAGAATCAAAAGGATCGAACTACCTACTCATTATT
TGGAGGTTAATCATAGAACACCAAAAGCTGTGGTATTTTATGGACCTAACATAGGTCATA
TCCCTCACGACATAAGATTAAAAGATCCAAACCTTTTTCTTTGGAGCAGAAACGGACGTG
GCCAAAACATATAAAGATCGGCGTAGTCACTCGTAGTAGGAGTCAAGATATTGCGTATAA
ATATATATAAAGAGAGAGTCTCTTGAGCGGCCGAGAATCTTCTGTCAAAAGGACCATTGG
AGAACTTGGCTACTCACTTGGCTGATCCATGGCACAAAAACATTGGCGATATTGTTATCC
CTCTGAACTAGTGGCTTGTAAAAAAAATAGTAATGTGTCCTATGATGAGCTTCATGTGTA
TCAAAACTCTCTGTAATGAAAATACAGATTGTGAAACCTATGATGTTTTGT


BQ
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AF RS1AV95TF U 1
AF RS1AV95JQ C 442
BS 1 605 RS1AV95TF
BS 606 1251 RS1AV95JQ

RD RS1AV95TF 605 0 0
GGCGCTTCGAGTTAGCGAAGCGCTGTAGTAGCGCCGAAGCCCTATGTGCTATAATGCTGA
GCCAAGGACTCCGCCTTATCTATAGAAGCAGTCAACTGAGTTCTGAACGAATTAGATCCT
TGGTAATGGCTCAATCTATAGATAGAAAGCCTTATGATGGGAAACCATCACGTTAGGTTT
GGAGAGAGATGGGACCGGTTATATAATAGAGGGAGCAGATGCAAGCTTTTTTCTTTCAAT
AGCCGGCCAAATGACTACAGGATCATCGGTCTACTCTACCTCAATTCACCATTTCGAACT
TTATACAGAAGGTTTTTCCGTACCAGCTTCTTCTACCTATACCGCAGTTGAAGCACCTAA
AGGAGAATTTGGTGTCTTTCTGGTCAGTAATGGAAGCAATCGTCCCTACCGTTGTAAAAT
AAGAGCACCCGGCTTTGCCCATTCACAAGGACTCGATTTTATGTCCAAACATCACATGCC
AGCAGATGTGGTCACCATCATAGGTACTCAAGATATTGTGTTTGGAGAGGTGGATAGATA
GGGCGACTAGTTGCCAGGACCTTAGCTTTATTGCGAGCCCAGAAGTCTCTCTTTTTTTTC
GGCCT

QA 1 605 1 605
DS 

RD RS1AV95JQ 810 0 0
A
TCACAAGGACTCGATTTTATGTCCAAACATCACATGCCAGCAGATGTGGTCACCATCATA
GGTACTCAAGATATTGTGTTTGGAGAGGTGGATAGATAGGGCGACTAGTTGCCAGGACCT
TAGCTTTATTGCGAGCCCAGAAGTCTCTCTTTTTTTTCGGCCTTCAGGAACAGCCTTTAA
GTAAAATCCAACCTAATATCATTCATATCCTTCTACATAGAAGAAAGACACTCTAAGATC
CTTTTTCAAACCTGCTCCCATTTAGAGTCAAGAGATAGATAAATAGACACGTCCCATTGC
CACTTGATGGGGGGGGCGTTCGTTGTATGTTGAAGCAGAGATGAATAGGGTGACTGTGAA
GAGAAGAATCAAAAGGATCGAACTACCTACTCATTATTTGGAGGTTAATCATAGAACACC
AAAAGCTGTGGTATTTTATGGACCTAACATAGGTCATATCCCTCACGACATAAGATTAAA
AGATCCAAACCTTTTTCTTTGGAGCAGAAACGGACGTGGCCAAAACATATAAAGATCGGC
GTAGTCACTCGTAGTAGGAGTCAAGATATTGCGTATAAATATATATAAAGAGAGAGTCTC
TTGAGCGGCCGAGAATCTTCTGTCAAAAGGACCATTGGAGAACTTGGCTACTCACTTGGC
TGATCCATGGCACAAAAACATTGGCGATATTGTTATCCCTCTGAACTAGTGGCTTGTAAA
AAAAATAGTAATGTGTCCTATGATGAGCTTCATGTGTATCAAAACTCTCTGTAATGAAAA
TACAGATTGTGAAACCTATGATGTTTTGT

QA 2 810 2 810
DS 



AS 1 2

CO CL4934Contig1 834 2 4 U
GGGAAGCAATAGCACCATCTCTCTCTCTTGAATAAGCTCCTCTGCTCTGTTTTCTTTTCT
TTCTATCTTCTCTCTATCTATCTCTTTTACTCAGTGGACTTCTGAAACAAAACAAAAAAA
ATGGCATCTTCTTCTTCTAGATCCCAATCTGAGTTCTGTCCTCTCTCGCCGTGTCCTTCT
ATCGGTAACTTCGTCGAACGGATTAAAGACGCATGTCGTTTCCTCGTATCCGCTGTTCTT
GGCACAATTCTCTCGGCGATCTTGACCTTCTTCTTCGCTCTAGTGGGAACATTGCTTGGA
GCGGTCACAGGAGCTTTGATAGGCCAAGAAACAGAGAGTGGTTTCATCCGAGGAGCTGCT
GTCGGAGCCATCTCAGGAGCTGTTTTCTCCATCGAAGTCTTTGAGTCATCTCTTGTTCTC
TGGAAATCTAATGAGTCACGCTTCGGTTGCCTCCTCTACTTGATTGATGTCATTGTTAGT
CTTATAAGTGGTAGACCTGTACGGGAACGCATAGGTCCAGCAATGCTAAGTGCAGTTCAA
AGTCAGATGGGAGCTGTGGATGCAACCTTCGATGACCTCTCGAGTATCTTTGACACCGGT
GGCTCAAAAGGATTAACAAAAGATATGGTTGATCAAATACCCAAAATCAAAATCACAGGC
AGAAACAACTTAGATGCTTCCGGCAACAAAGACTCTTGTTCTGTTTGTTTTCAGGATTTT
CAGCTTGGTGAAACGGTAAGAAGCTTGCCGCAATGTCATCACATGTTTCACTTCCCTTGC
ATAGACAATTGGCTCCTCAGACACGGATCTTGTCCTATGTGTAGACGTGATCTT


BQ
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AF RS1GR88TF U 1
AF RS1E810JQ C 458
BS 1 470 RS1GR88TF
BS 471 471 RS1E810JQ
BS 472 640 RS1GR88TF
BS 641 834 RS1E810JQ

RD RS1GR88TF 640 0 0
GGGAAGCAATAGCACCATCTCTCTCTCTTGAATAAGCTCCTCTGCTCTGTTTTCTTTTCT
TTCTATCTTCTCTCTATCTATCTCTTTTACTCAGTGGACTTCTGAAACAAAACAAAAAAA
ATGGCATCTTCTTCTTCTAGATCCCAATCTGAGTTCTGTCCTCTCTCGCCGTGTCCTTCT
ATCGGTAACTTCGTCGAACGGATTAAAGACGCATGTCGTTTCCTCGTATCCGCTGTTCTT
GGCACAATTCTCTCGGCGATCTTGACCTTCTTCTTCGCTCTAGTGGGAACATTGCTTGGA
GCGGTCACAGGAGCTTTGATAGGCCAAGAAACAGAGAGTGGTTTCATCCGAGGAGCTGCT
GTCGGAGCCATCTCAGGAGCTGTTTTCTCCATCGAAGTCTTTGAGTCATCTCTTGTTCTC
TGGAAATCTAATGAGTCACGCTTCGGTTGCCTCCTCTACTTGATTGATGTTATTGTTAGT
CTTATAAGTGGTAGACCTGTACGGGAACGCATAGGTCCAGCAATGCTAAGTGCAGTTCAA
AGTCAGATGGGAGCTGTGGATGCAACCTTCGATGACCTCTCGAGTATCTTTGACACCGGT
GGCTCAAAAGGATTAACAAAAGATATGGTTGATCAAATAC

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1E810JQ 377 0 0
ACTTGATTGATGTCATTGTTAGTCTTATAAGTGGTAGACTTGTACGGGAACGCATAGGTC
CAGCAATGCTAAGTGCAGTTCAAAGTCAGATGGGAGCTGTGGATGCAACCTTCGATGACC
TCTCGAGTGTTTTTGACACCGGTGGCTCAAAAGGATTAACAAAAGATATGGTTGATCAAA
TACCCAAAATCAAAATCACAGGCAGAAACAACTTAGATGCTTCCGGCAACAAAGACTCTT
GTTCTGTTTGTTTTCAGGATTTTCAGCTTGGTGAAACGGTAAGAAGCTTGCCGCAATGTC
ATCACATGTTTCACTTCCCTTGCATAGACAATTGGCTCCTCAGACACGGATCTTGTCCTA
TGTGTAGACGTGATCTT

QA 1 377 1 377
DS 



AS 1 2

CO CL4935Contig1 812 2 4 U
GGGTGACGCTTCAGGACATTAGGGATCAGGCTAAGTACGATGGGTACTACTATAACCAGT
TCTTGATCGTTAACGATTGTTTGCATCGGTATCGCCACGCTGCGGATTGGACATTCTTCT
TTGATGTCGATGAGTACATCTATTTGCCTGATGGGAACACGCTTGAGTCTGTTCTCAAAG
AGTTCTCGGGGTACACTCAGTTCACGATTGAGCAGAACCCGATGTCTAGTGTTCTTTGCT
TAAACGACTCGACTCAAGATTATCCCAGGCAATGGGGATTTGAGAAGATGTTATTCAGGG
AATCAAGAACAAACGTAAGACGCGACAGGAAATACGCGATCCAAGCCAAGAACGCGTTTG
CGACAGGAGTTCACATGTCTGAAAACGTAGTAGGCAAAACGCTACACAAGACGGAGACGA
AGATCCGTTATTACCATTACCACAACACTATAACGTTTCACGAGGAGCTTTGCAGAGAGA
TGTTGCCTGTTTCGGCCAAGGACAGCGTGACATTGTACAATAAGCTTCCGTATGTGTATG
ACGACAAGATGAAGAAGCTAGTTAACAGGGTTAAAGAGTTTGAGGAGAAGAAACTTGGGA
CGGAGACTGTGAAGAATTTCTCATGACCAGAGTTGACTTAATCCCCTCTTGTAAGCGTTT
TGTCGATATAAGGTATAGTCGTTTCCGTTGTATCATCATTTTTCGTTTCTGGTTTGTCCT
CTGTTACTATTCCATTAATAACTTTTTATATAATTTTAGTATTTTTTGTTTAAACCCTTA
TGAATGTCAAATGACAAAGAATATAACTTAGC


BQ
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AF RS1FZ06TF U 1
AF RS1FZ06JQ C 388
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DS 

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TTGTATCATCATTTTTCGTTTCTGGTTTGTCCTCTGTTACTATTCCATTAATAACTTTTT
ATATAATTTTAGTATTTTTTGTTTAAACCCTTATGAATGTCAAATGACAAAGAATATAAC
TTAGC

QA 1 425 1 425
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CGATAGTACCCATCCTTCGCAGCCATCTCTTTCCTCACTGCCTGACGATATCGTTTTGAG
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AAGATCCCTTGTCCGCTCGCCTGAGCTCAACGCCTTACGATCCATCCTCCCCAGGAGCTC
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CCCAACTCCCTTCCCTCCTCATCCTAATTACTGTTCTTCAGCCGTCGTTTCAGTGGACTC
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ATCCAAGTTGAAGTTTTCGATCCAAAATCAGAGACTTGGGAGCTTGCTGGGGCGGAGATC
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TATCACGTGTGTGTGGTGGAGGATGTTCTCTTTGCTTTTTTTTACCGGGATTGGGTTGAT
GTGGTTTGATACAAAGCTCAATGTGTGGAGGAAATTGATTGGTCGTGATGGGAAGGAACT
GTTTATCTCACGTGTGAGGGCCATGTCGAAATATGACGGAAGGCTTGTTGTTTTTACCTA
CATTATCTCAGCTGACGTCTTGAGGAAATCAAATGCAGTTGATATGAAGAAGAAGGTTCA
GTGTATGTTGGTTTCACTGGATAGAGCTGGAGAAAAGATCTGTGGTACGATCGATTGGTC
TTGTATTGTGGCTACAGTCCCAGTTTGGTTTAATTCTCAGCATTGTTTAGCTGTTTCCGA
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TATCGTGAAACACAATAAAGAAATGAACATGTTTTGAAGGTTTTTTTTGGAATTAAAGGC
ATATGTTTGTTAT


BQ
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AF RS1DY42TF U 1
AF RS1DY42JQ C 499
BS 1 626 RS1DY42TF
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CGATAGTACCCATCCTTCGCAGCCATCTCTTTCCTCACTGCCTGACGATATCGTTTTGAG
ATGCTTGGTCTTTATCCCAAGGATCTATCACCTAAACATCTCATGGGTCTCAAAACACCT
AAGATCCCTTGTCCGCTCGCCTGAGCTCAACGCCTTACGATCCATCCTCCCCAGGAGCTC
CTCCCTCCATGTATGTTTTCAAGAAATCCACGGCAATGGCGATGACGAAGAAGACCATTC
AACCTTCCACTGGTTTCCTCTGACTAGTACAGAGGAGGAGGAGTATGGGTTTTTTCTGAA
CCCAACTCCCTTCCCTCCTCATCCTAATTACTGTTCTTCAGCCGTCGTTTCAGTGGACTC
AAAGATCTTCTTCATTGGCAGATCTAGAGAACATTCGACGGATCTATGGGTCCTTGATAC
ACGATCTGGAAACATCACTCAGGGACCAAGCATGAGTGTGCCTCGAGTACATCTCCAAGC
AGTTGTGGGAGTAATCGACGGGATATATACATACTCGGAGGCGGAAAGTATGATGAAGAG
ATCCAAGTTGAAGTTTTCGATCCAAA*TCAGAGACTTGGGAGCTTGCTGGGGCGGAGATC
GTTCGTA*GATGCCACGGA

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DS 

RD RS1DY42JQ 835 0 0
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GATCCAAAATCAGAGACTTGGGAGCTTGCTGGGGCGGAGATCGTTCGTAAGATGCCACGG
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CAATGTGTGGAGGAAATTGATTGGTCGTGATGGGAAGGAACTGTTTATCTCACGTGTGAG
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GGATAGAGCTGGAGAAAAGATCTGTGGTACGATCGATTGGTCTTGTATTGTGGCTACAGT
CCCAGTTTGGTTTAATTCTCAGCATTGTTTAGCTGTTTCCGAGTGATTGGTTAGAGTATG
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QA 1 835 1 835
DS 



AS 1 2

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ACGTTGGCGTCACTGACGGTCGTATTCTCAAATGGCGCGGTGAAGAGCTAGGCTGGGTCG
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GTGGGAGGCCATTGGGACTTAGCTTCCATAAGAAAACAGGAGATCTGTATATTTGTGATG
GTTACTTTGGGGTCATGAGGTCGGACCAAAGGGAGGCTTGGCCGAGGTAGTTGTTGATGA
AGCCGAAGGACGCAAAGTCATGTTTGCGAACCAAATGGATATAGACGAAGAGGAAGAGGT
CTTCTACTTCAATGATAGTAGCGATAAATACCACTTCGAGCAAGTGTTCTACGTGTATAT
GTCCGGGGAGAAGACGGGAAGAGTAATTAGATACGATATGAAGAAGAAAGAGGCCACAGT
TATAATGGACAAACTTCATCTACCTAATGGTTTAGCTCTAAGCAAGGACGGATCGTTTGT
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CGGAACCAACGAGGTTTTCGCCAAGGTCCCGGGTCCTGCGGACAATATCAGGCGCACTCC
TACCGGAGATTTTTGGGTTGCATTGCATTCTAAAGACAGTTTGTTCACTCGTGTGTTTCT
GACTCACTCTTTGGTTGGGAAGTTTTTCATCAAAATGCTGAAGATGGAGACTGCGGTTCA
TCTCGTTAATGGAGGGAAACCTCATGGAATTGTCATGAAACTCTCTGGAGGGACAGGAGA
GGTTCTTGAGATACTTGAGGACAGTGAAGGGAAGACGATGAAGTATGTTAGTGAAGCTTA
TGAGACAAAAGATGGCAAGTTATGGTTTGGGTCTGTGTTTTGGCCGGCAGTTTGGGTGCT
TGATAAATCTGTTTACGGTCTCAAATGAGTTAGCGATTGCTAACAAAAATGTAATAATTT
GGTGTTATGGTCTTCTTTTTAGGAGACGTGCATCTTCTTTTGTATTTTCTTGTTGTTGTG
TGAGTGGACTTTGATTCTGAAGAAATTTGGTTCAGTTGAGTAATCTAATGGAGTTTTGTG
GGATTTTATAAATGATTAAAACGAAAACGAGTTGCTATATTTGATTTGATTTTACTTGAT
TTAATTATATACTAGATTTTGATC


BQ
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AF RS1C188TF U 1
AF RS1C188JQ C 578
BS 1 654 RS1C188TF
BS 655 655 RS1C188JQ
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BS 736 758 RS1C188TF
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RD RS1C188TF 758 0 0
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TGAAGCAGGTTGCAGTCGCTCCGGTCGTCGTAGCCATCCTTTGCTATTTCTTCTGGTCAT
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ACGTTGGCGTCACTGACGGTCGTATTCTCAAATGGCGCGGTGAAGAGCTAGGCTGGGTCG
AGTTCGCCTACTTTTCTCCTCTCAGAGATAATTGTTCGAGGCATAAAGTAGTTCCAAGTT
GTGGGAGGCCATTGGGACTTAGCTTCCATAAGAAAACAGGAGATCTGTATATTTGTGATG
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AGCCGAAGGACGCAAAGTCATGTTTGCGAACCAAATGGATATAGACGAAGAGGAAGAGGT
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GTCCGGGGAGAAGACGGGAAGAGTAATTAGATACGATATGAAGAAGAAAGAGGC*ACAGT
TATAATGGACAAACTTCATCTACCTAATGGTTTAGCTCTAAGCAAGGACGGATCGTTTGT
ACTCACCTGTGAAG*TGGTACAAATATTATCCATAGAA

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1C188JQ 827 0 0
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ATGAAGAAGAAAGAGGCCACAGTTATAATGGACAAACTTCATCTACCTAATGGTTTAGCT
CTAAGCAAGGACGGATCGTTTGTACTCACCTGTGAAGGTGGTACAAATATTATCCATAGA
ATATGGGTCAAGGGTCCCAAAGCCGGAACCAACGAGGTTTTCGCCAAGGTCCCGGGTCCT
GCGGACAATATCAGGCGCACTCCTACCGGAGATTTTTGGGTTGCATTGCATTCTAAAGAC
AGTTTGTTCACTCGTGTGTTTCTGACTCACTCTTTGGTTGGGAAGTTTTTCATCAAAATG
CTGAAGATGGAGACTGCGGTTCATCTCGTTAATGGAGGGAAACCTCATGGAATTGTCATG
AAACTCTCTGGAGGGACAGGAGAGGTTCTTGAGATACTTGAGGACAGTGAAGGGAAGACG
ATGAAGTATGTTAGTGAAGCTTATGAGACAAAAGATGGCAAGTTATGGTTTGGGTCTGTG
TTTTGGCCGGCAGTTTGGGTGCTTGATAAATCTGTTTACGGTCTCAAATGAGTTAGCGAT
TGCTAACAAAAATGTAATAATTTGGTGTTATGGTCTTCTTTTTAGGAGACGTGCATCTTC
TTTTGTATTTTCTTGTTGTTGTGTGAGTGGACTTTGATTCTGAAGAAATTTGGTTCAGTT
GAGTAATCTAATGGAGTTTTGTGGGATTTTATAAATGATTAAAACGAAAACGAGTTGCTA
TATTTGATTTGATTTTACTTGATTTAATTATATACTAGATTTTGATC

QA 1 827 1 827
DS 



AS 1 2

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CAGAAGCCTCAAACTTTTCTTCTCGATTTTTTGCGATTGTCTAAGTCTCTGAATTCCATT
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CGCCTCGGCAGATCCGCCCAGTCTGGTGTCGGTCGACTCATACGATTCTGGGATTCCAGG
AACATTAACAAGAATGGAGAGTTTATGGGCATCACCATCATTTTCCTCCTCGATGAACTG
GACTCCATGATCCACGGTTTTATCCCCGCTAACCGGGCCAGCCAAGCCGGTTCTATTGTG
AGATTGGACCGTTTTGAAGTTGCACGGGTCGCCCACATTTACAAGATCACAGAGCATCAG
TTCGCGATCCGTTTCATCCCTTCAACACGTGTTGTTGAGGTCCAGGTGGACTCTCCTGTG
ATCAAGTCCGACAAATTCATGGTTCGGCGTTTTGACCACCTTCAAGTGCTTGCGAACACC
AACCTAGAGCTTCCAGGTAATGAATCCCAGCCTGTAATGGTGGTCATTACGGTTAATCCA
AAAATATTTGGAGGACATCTCTATGCGATCAAAGATTACATAAACTGTCTTACCAGCAAT
TTTCTATGTGTTACACATACTTACTCGCTCCCTGCACCTTGGGAGGTGGAGCAGCAAAGA
GTTGATACCATGGAAGGGATTAAAAAGGAGTTTGTGTCAATAGGATATTTCCACACGTTC
ATCTCCAACTCCACTGAGCAGATCCAGGTTCGTGTTGGACTTGCTGTTGATGACAGAAAG
GACAGTGCCACTTTTGTGATCTTCGACAGAGAGACGACAAAACTCATCACTCCAAATCAC
CGTATGTTCACCGTTTCAGCAATCAGTAAGACCTCTTATTTGTCACTCAGGCAAAGAGTG
ACAGCAGCAACCCACCTCCAGTCGTGGATATGGAATGACAAGCAACAGAATCTGCCAGCA
ACATGGGTGATGCACCAAAGACTTCACTGGGAGTTGTTGAAGCAAGTCTGCCAGGTCATG
CAGCCAACAAGAACAAACGCAAACGTCCCTGTGAGTGATTCTCGCAACCCATCTAACCGT
CTATTGCACTTAGCTTTTGTTTCATTTTTTTTTTGGTATGAATAGCTTCTGTTTCATTTC
AATTGTCTACTTTGTTTTCTCTACTTCGAACTTTATTGTCTCTTTGATATGTTGC


BQ
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AF RS1DK95TF U 1
AF RS1DK95JQ C 585
BS 1 700 RS1DK95TF
BS 701 1255 RS1DK95JQ

RD RS1DK95TF 700 0 0
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CAGAAGCCTCAAACTTTTCTTCTCGATTTTTTGCGATTGTCTAAGTCTCTGAATTCCATT
AGGAAGATGACTTCACCAGCTGCTCCAGCCGCCGTTCCCTACTCCACCTTCAACTCTCTC
CGCCTCGGCAGATCCGCCCAGTCTGGTGTCGGTCGACTCATACGATTCTGGGATTCCAGG
AACATTAACAAGAATGGAGAGTTTATGGGCATCACCATCATTTTCCTCCTCGATGAACTG
GACTCCATGATCCACGGTTTTATCCCCGCTAACCGGGCCAGCCAAGCCGGTTCTATTGTG
AGATTGGACCGTTTTGAAGTTGCACGGGTCGCCCACATTTACAAGATCACAGAGCATCAG
TTCGCGATCCGTTTCATCCCTTCAACACGTGTTGTTGAGGTCCAGGTGGACTCTCCTGTG
ATCAAGTCCGACAAATTCATGGTTCGGCGTTTTGACCACCTTCAAGTGCTTGCGAACACC
AACCTAGAGCTTCCAGGTAATGAATCCCAGCCTGTAATGGTGGTCATTACGGTTAATCCA
AAAATATTTGGAGGACATCTCTATGCGATCAAAGATTACATAAACTGTCTTACCAGCAAT
TTTCTATGTGTTACACATACTTACTCGCTCCCTGCACCTT

QA 1 700 1 700
DS 

RD RS1DK95JQ 671 0 0
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CTGTCTTACCAGCAATTTTCTATGTGTTACACATACTTACTCGCTCCCTGCACCTTGGGA
GGTGGAGCAGCAAAGAGTTGATACCATGGAAGGGATTAAAAAGGAGTTTGTGTCAATAGG
ATATTTCCACACGTTCATCTCCAACTCCACTGAGCAGATCCAGGTTCGTGTTGGACTTGC
TGTTGATGACAGAAAGGACAGTGCCACTTTTGTGATCTTCGACAGAGAGACGACAAAACT
CATCACTCCAAATCACCGTATGTTCACCGTTTCAGCAATCAGTAAGACCTCTTATTTGTC
ACTCAGGCAAAGAGTGACAGCAGCAACCCACCTCCAGTCGTGGATATGGAATGACAAGCA
ACAGAATCTGCCAGCAACATGGGTGATGCACCAAAGACTTCACTGGGAGTTGTTGAAGCA
AGTCTGCCAGGTCATGCAGCCAACAAGAACAAACGCAAACGTCCCTGTGAGTGATTCTCG
CAACCCATCTAACCGTCTATTGCACTTAGCTTTTGTTTCATTTTTTTTTTGGTATGAATA
GCTTCTGTTTCATTTCAATTGTCTACTTTGTTTTCTCTACTTCGAACTTTATTGTCTCTT
TGATATGTTGC

QA 1 671 1 671
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CAGTTGACGGAAAGCTTGGTTGATGTTGTGTGTGAAGATAAGAAGAATTGTCTCAGGTAC
CATGCAAAGTTAGTGAAATTGCACAAGTTGAATTCGGAAGGAAAGGACAATGTTACCACA
CTGGAATACCATACCTTTCATGACAACCTTATTAAACATTTGAAGAAGGGAGTTCTAGCT
GTTGGCTTGACCATTTATCCAAGTTATTCAAAACTGAAGAATAAGGAAATATACTATCCC
ACTAAGGCTGAATGGAATGGAAAGACTGAAAGTTATGCACATGTAATGGTGTGTACTGGG
CACAACTATGATGCAAAGAAGAATCTGTTCTATGAATTTCAAGAATCTGCTGGGGTTAAA
GTTTGTGATCGTGGTTATGTGAAGATCTATGCTGATTTGGTTTATCAATTTGTTGAGATG
GTGGTTTAGATGATGGACGACTGAGGATGTGTTTCTACTGCTAACAGAGGTCGTCGGTGT
TATGTGGTTGTTTCCTTTTTCTTTTTGGAACTTCCTAGTCCTTGAACTTTAAACTTCTCT
TTATTTCTCTTTTCTAATCTGTCTATCCTTCCCTGAGTATTAAAACCAAATTACTTATCT
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TAGTTGAT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FI66JQ C 1
AF RS1CT65TF U 286
BS 1 285 RS1FI66JQ
BS 286 430 RS1CT65TF
BS 431 431 RS1FI66JQ
BS 432 728 RS1CT65TF

RD RS1FI66JQ 728 0 0
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CAGTTGACGGAAAGCTTGGTTGATGTTGTGTGTGAAGATAAGAAGAATTGTCTCAGGTAC
CATGCAAAGTTAGTGAAATTGCACAAGTTGAATTCGGAAGGAAAGGACAATGTTACCACA
CTGGAATACCATACCTTTCATGACAACCTTATTAAACATTTGAAGAAGGGAGTTCTAGCT
GTTGGCTTGACCATTTATCCAAGTTATTCAAAACTGAAGAATAAGGAAATATACTATCCC
ACTAAGGCTGAATGGAATGGAAAGACTGAAAGTTATGCACATGTAATGGTGTGTACTGGG
CACAACTATGATGCAAAGAAGAATCTGTTCTATGAATTTCAAGAATCTGCTGGGGTTAAA
GTTTGTGATCGTGGTTATGTGAAGATTTATGCTGATTTGGTTTATCAATTTGTTGAGATG
GTGGTTTAGATGATGGACGACTGAGGATGTGTTTTTACTGCTAACAGAGGTCGTCTGTGT
TATGTGGTTGTTTCCTTTTTCTTTTTGGAACTTCCTAGTCCTTGAACTTTAAACTTCTCT
TTATTTCTCTTTTCTAATCTGTCTATCCTTCCCTGAGTATTAAAACCAAATTACTTATCT
ATGCAAACGTTTTGCCTTTTCTTTTTGTTCAAAACCTATGATATAACAACCTAATAGCTG
TAGTTGAT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1CT65TF 443 0 0
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ATGGTGTGTACTGGGCACAACTATGATGCAAAGAAGAATCTGTTCTATGAATTTCAAGAA
TCTGCTGGGGTTAAAGTTTGTGATCTTGGTTATGTGAAGATCTATGCTGATTTGGTTTAT
CAATTTGTTGAGATGGTGGTTTAGATGATGGACGACTGAGGATGTGTTTCTACTGCTAAC
AGAGGTCGTCGGTGTTATGTGGTTGTTTCCTTTTTCTTTTTGGAACTTCCTAGTCCTTGA
ACTTTAAACTTCTCTTTATTTCTCTTTTCTAATCTGTCTATCCTTCCCTGAGTATTAAAA
CCAAATTACTTATCTATGCAAACGTTTTGCCTTTTCTTTTTGTTCAAAACCTATGATATA
ACAACCTAATAGCTGTAGTTGAT

QA 1 443 1 443
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4943Contig1 991 2 2 U
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ACGGTGACGTGGTTTCCAAGGTTCTCGATAGGTTGGAGTTCGAGGAAGTGAACAGGGAAG
TGTTCGAGGAGTGCGAGAGACTTGTTGTGCAGTGTCTGAAGGATGCTAAAGTGGACGTTG
ATGATATAGACGATGTGATAATGGTCGGAGGGTGTTCTTACATACCTAAAGTGAGAGCTA
TCGTCTCTGACGTGTGCAGGAAGGAAGAGATTTACAAGGAAGTGAATCCGTTGGAAGCTG
CGGTCAGAGGAGCTGCTTTGGAAGGTGCTGTGACGTCGGGGATACACGATCCGTTCGGGA
GCTTAGACCTCTTGACTATACAAGCCACGGCTCTCGCGGTTGGAGTCAGAGCCAGCGGAG
ACAGGTTCGTGCCCGTGATACCACGCAACACGATGGTTCCTGCGCGTAGGGACCTCTTCT
TCACTACGGTTCATGATGATCAGAAGGAAGCTTTGATCGTTGTGTACGAAGGGGAAGGAG
AGAGTGTTGGAGAGAATCATCTTCTTGGCTATTTCAAGATCGTTGGGATCCCGCCGGCGC
GTAAAGGAGTTCCTGAGATTAATGTTTGTATGGACATTGATGCTTCGAATGCTTTGAGGG
TTTTTGCGGCGGTGTTGATGCCGGGGTCGAAGAGCCCTGTGGTTCCTGTGATTGAAGTGA
GGATGCCGACGGTTGATGATGGACATGGTTGGTGTGCTCAAGCTTTGAATGCCAAGTTTG
GAGCCGCTCTTGATTTGGTTACTCTCCAGAGGAAGTGATGTGAGTTTGAATTAAGAGATG
TTTTTTATGTGATCGTTTAGCAAAAAGAGTGTGTTAGTGTGTGTGTGTTTTGAGTCTTTT
GTGTTGAAACTTGGTCACAATGTCTAAGTGTAATGAAGTAATAATGTTATACAGATTGTG
TAATATAATAGTAATAAACGGAGTGTTGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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BS 716 991 RS1A653JQ

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ACGGTGACGTGGTTTCCAAGGTTCTCGATAGGTTGGAGTTCGAGGAAGTGAACAGGGAAG
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CGGTCAGAGGAGCTGCTTTGGAAGGTGCTGTGACGTCGGGGATACACGATCCGTTCGGGA
GCTTAGACCTCTTGACTATACAAGCCACGGCTCTCGCGGTTGGAGTCAGAGCCAGCGGAG
ACAGGTTCGTGCCCGTGATACCACGCAACACGATGGTTCCTGCGCGTAGGGACCTCTTCT
TCACTACGGTTCATGATGATCAGAAGGAAGCTTTGATCGTTGTGTACGAAGGGGAAGGAG
AGAGTGTTGGAGAGAATCATCTTCTTGGCTATTTCAAGATCGTTGGGATCCCGCCGGCGC
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TTTTTGCGGCGGTGTTGATGCCGGGGTCGAAGAGCCCTGTGGTTCCTGTGATTGA

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DS 

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TAAAGTGAGAGCTATCGTCTCTGACGTGTGCAGGAAGGAAGAGATTTACAAGGAAGTGAA
TCCGTTGGAAGCTGCGGTCAGAGGAGCTGCTTTGGAAGGTGCTGTGACGTCGGGGATACA
CGATCCGTTCGGGAGCTTAGACCTCTTGACTATACAAGCCACGGCTCTCGCGGTTGGAGT
CAGAGCCAGCGGAGACAGGTTCGTGCCCGTGATACCACGCAACACGATGGTTCCTGCGCG
TAGGGACCTCTTCTTCACTACGGTTCATGATGATCAGAAGGAAGCTTTGATCGTTGTGTA
CGAAGGGGAAGGAGAGAGTGTTGGAGAGAATCATCTTCTTGGCTATTTCAAGATCGTTGG
GATCCCGCCGGCGCGTAAAGGAGTTCCTGAGATTAATGTTTGTATGGACATTGATGCTTC
GAATGCTTTGAGGGTTTTTGCGGCGGTGTTGATGCCGGGGTCGAAGAGCCCTGTGGTTCC
TGTGATTGAAGTGAGGATGCCGACGGTTGATGATGGACATGGTTGGTGTGCTCAAGCTTT
GAATGCCAAGTTTGGAGCCGCTCTTGATTTGGTTACTCTCCAGAGGAAGTGATGTGAGTT
TGAATTAAGAGATGTTTTTTATGTGATCGTTTAGCAAAAAGAGTGTGTTAGTGTGTGTGT
GTTTTGAGTCTTTTGTGTTGAAACTTGGTCACAATGTCTAAGTGTAATGAAGTAATAATG
TTATACAGATTGTGTAATATAATAGTAATAAACGGAGTGTTGGAC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

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GGAATTTCCAAATCAAATTAAAAAAAAAAAAAGACTCCTTCGTTCATCAGCCATGCTCAG
ATCCACCTTTGCTTCCTTAATCGTCGACGTCAATTTGCGGCGCACGTTACGTCTCTCTTA
CCCTGCGGCGCATCTTAGCCGTTCCTCACGCTTCACAGCCACTTCCCCTTGCTCCTCCTC
CCGTAAAGCTCCAACCTTTGTGATACCCACCACCTTCTCTTCCTCTTATTCCTCTTCGTC
GGAGAAACACCCACCACCATCGCCGCCCCTTACCCGATCAGCAGCCCTCGTGGGACAAGA
CGACGCACCCATCAGCCACGAGAACTCTTCTTCCAAAGTTCTTACATTGCCCACCGTCCT
AACCCTTGGTCGCGTCGCTGCCGTTCCCCTTCTCGTCTCCAGTACGCTTTTCTCATTTAA
GTTCTAAAGTTGTTGTCTTTCTTTGAGATTGTGTGTTTTAACATGTTGAAAGTCTTCACC
TTTTGCTTCTCTTTAGTTCTAAGCTCTTTTTTGGGATTGTGTTTTTTTTTTGTTCATGTT
AAAGTGTTCACCTTATTGTTGTTGTTATTGCTTGTAAGCCTTCTACGTTGATGGATGGTG
GGGAACAACTGCGACCACAAGCATCTTCGTTGCAGCTGCTGTTACAGACTGGCTTGACGG
CTATCTTGCACGCAAGATGAAGTTAGGTTCTGCGTTTGGAGCGTTTTTAGATCCGGTTGC
AGATAAGCTTATGGTCGCAGCTACATTGATCTTACTCTGTACAAAGCCTATCGACGTTGC
TTTGTTAGGACCTGTTCCGTGGTTACTAACAGTACCGTCTATTGCAATCATTGGTAGAGA
GATTACCATGTTTGCGGTTAGAGAATGGGCTGCATCTCAAAATGGAAAGCTATTAGAGGC
TGTCGCGGTAAACAACTTGGGCAAGTGGAAAACCGCCACGCAGATGACAGCACTAACCAT
ACTTCTCGCGAGCCGGGACAGCAGTGTCGGATGGCTCGCAGCGTCTGGCGCTGGATTGCT
TTATGTGTCTGCAGGACTATCGGTTTGGTCTTTAGCCGTTTATATGAGGAAGATTTGGAA
AGTACTGCTGAAGTAGGTGGTAGTTTTTTTATCTATATCAGATTTGTTTTGCTTTTAACA
TCCATTTTGGATATGGAGAGTGTCTCGGTCATCGCCTGTACAGGGAGCACAAAACTATGT
AGATGGTTTTGCTTTGTTCTGCTCTGTTTCTTTATTTGTTGTCCTAACACAATTTAAAGG
ATAGGAATGGTCTGGCTTAAAAGCCTAATCATGGTGTGTATGAAAGGAACAATCATAACA
GAAAATAAAGATAATACATACC


BQ
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AF RS1EX55TF U 1
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ATCCACCTTTGCTTCCTTAATCGTCGACGTCAATTTGCGGCGCACGTTACGTCTCTCTTA
CCCTGCGGCGCATCTTAGCCGTTCCTCACGCTTCACAGCCACTTCCCCTTGCTCCTCCTC
CCGTAAAGCTCCAACCTTTGTGATACCCACCACCTTCTCTTCCTCTTATTCCTCTTCGTC
GGAGAAACACCCACCACCATCGCCGCCCCTTACCCGATCAGCAGCCCTCGTGGGACAAGA
CGACGCACCCATCAGCCACGAGAACTCTTCTTCCAAAGTTCTTACATTGCCCACCGTCCT
AACCCTTGGTCGCGTCGCTGCCGTTCCCCTTCTCGTCTCCAGTACGCTTTTCTCATTTAA
GTTCTAAAGTTGTTGTCTTTCTTTGAGATTGTGTGTTTTAACATGTTGAAAGTCTTCACC
TTTTGCTTCTCTTTAGTTCTAAGCTCTTTTTTGGGATTGTGTTTTTTTTTTGTTCATGTT
AAAGTGTTCACCTTATTGTTGTTGTTATTGCTTGTAAGCCTTCTACGTTGATGGATGGTG
GGGAACAACTGCGACCACAAGCATCTTCGTTGCAGCTGCTGTTACAGACTGGCTTGACGG
CTATCTTGCACGCAAGATGAAGTTAGGTTCTGCGTTTGGAGCGTTTT
AGAT

QA 1 707 1 707
DS 

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TGACGGCTATCTTGCACGCAAGATGAAGTTAGGTTCTGCGTTTGGAGCGTTTTTAGATCC
GGTTGCAGATAAGCTTATGGTCGCAGCTACATTGATCTTACTCTGTACAAAGCCTATCGA
CGTTGCTTTGTTAGGACCTGTTCCGTGGTTACTAACAGTACCGTCTATTGCAATCATTGG
TAGAGAGATTACCATGTTTGCGGTTAGAGAATGGGCTGCATCTCAAAATGGAAAGCTATT
AGAGGCTGTCGCGGTAAACAACTTGGGCAAGTGGAAAACCGCCACGCAGATGACAGCACT
AACCATACTTCTCGCGAGCCGGGACAGCAGTGTCGGATGGCTCGCAGCGTCTGGCGCTGG
ATTGCTTTATGTGTCTGCAGGACTATCGGTTTGGTCTTTAGCCGTTTATATGAGGAAGAT
TTGGAAAGTACTGCTGAAGTAGGTGGTAGTTTTTTTATCTATATCAGATTTGTTTTGCTT
TTAACATCCATTTTGGATATGGAGAGTGTCTCGGTCATCGCCTGTACAGGGAGCACAAAA
CTATGTAGATGGTTTTGCTTTGTTCTGCTCTGTTTCTTTATTTGTTGTCCTAACACAATT
TAAAGGATAGGAATGGTCTGGCTTAAAAGCCTAATCATGGTGTGTATGAAAGGAACAATC
ATAACAGAAAATAAAGATAATACATACC

QA 1 808 1 808
DS 



AS 1 2

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CTAAATAATGTCTCGCTTGATATAATTTTTAGCAGCTGTGAATTATTTATTAATTAGGAT
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GCTTTGAAAGAATCTGGTGTCTCTAGAGCCTTCTGAATGTAGGTATCGTCCCACCCAAAC
CACCCTTGGAGTTTGTGTAAATAATTAGTTGCAGCTCCTTAACACAATCCGTAACGGAGG
GCCTCTCGCTGCTCTCTATACGGATGCAACGTGATGCCAAATCAGCAAACATGGCTATAG
CTTCCATGCTGTATGAGTTCCGAGACAGCTCTGGATCTATAACCTTGCGCAGTTTCTTTC
TATCATTTAGTATACTCCTGACCTGTAGCACCAGGTTCTGTTCGTTTGGGCCCTGAGTTA
AGTCAACTGCTCTGCGTCCGGTTAGTAGTTCTAGCAGCACGACTCCAAATGCATAAATGT
CGCTTTGTAGAGTAAGTTTGCCTGTCGATGTGTATTCAGGGTCGAAGTAGCCGAA


BQ
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AF RS1GK28TF C 1
AF RS1GK28JQ U 221
BS 1 220 RS1GK28TF
BS 221 595 RS1GK28JQ

RD RS1GK28TF 389 0 0
AATAAAACACAATAAACACCCCGATTTACATGGTGACTTTATAGTATATAGTATATACAT
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TGTTTTCTTTTTATCAGCAACCTCTCATTGTTGGAAAAAAATGACGTAGTCCATATTACT
GCTTTGAAAGAATCTGGTGTCTCTAGAGCCTTCTGAATGTAGGTATCGTCCCACCCAAAC
CACCCTTGGAGTTTGTGTAGATAATTAGTTGCAGCTCCTTAACACAATCCGTAACGGAGG
GCCTCTCGCTGCTCTCTATACGGATGCAACGTGATGCCAAATCAGCAAACATGGCTATAG
CTTCCATGCTGTATGAGTTCCGAGACAGC

QA 1 389 1 389
DS 

RD RS1GK28JQ 375 0 0
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AACCTTGCGCAGTTTCTTTCTATCATTTAGTATACTCCTGACCTGTAGCACCAGGTTCTG
TTCGTTTGGGCCCTGAGTTAAGTCAACTGCTCTGCGTCCGGTTAGTAGTTCTAGCAGCAC
GACTCCAAATGCATAAATGTCGCTTTGTAGAGTAAGTTTGCCTGTCGATGTGTATTCAGG
GTCGAAGTAGCCGAA

QA 1 375 1 375
DS 



AS 1 2

CO CL4946Contig1 974 2 2 U
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GTTATGGAGGTGGTTTGAAATGGCTTGAGAGGTTGTCTTACATTAACTCTGTGGTTTACC
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GCAAATTCATTGTTCCGGAGATAAGCAACTATGCGAGTATCCTCTTCATGGCACTCTTCT
CGTCCATTGCAGTAACTGGTGTTCTCGAGATGCAATGGGGCAAAGTTGGGATCGATGACT
GGTGGAGAAATGAACAGTTTTGGGTCATTGGAGGTGTCTCTGCTCATCTCTTTGCTCTCT
TCCAAGGTCTTCTCAAGGTTCTCGCTGGTGTGGACACTAACTTCACGGTCACGTCAAAGG
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CTCCCACGACTCTTCTCATCATAAACGTCATTGGAATCGTGGTGGGAATCTCTGATGCTA
TAAGCAATGGTTATGACTCATGGGGACCGCTTTTTGGAAGGTTGTTCTTTGCACTTTGGG
TGGTTATTCATCTTTACCCTTTCCTTAAAGGTTTGCTAGGGAAACAAGATAGAATGCCGA
CCATTATTGTCGTCTGGTCTATTCTCCTGGCTTCTATTCTTACTCTTCTTTGGGTAAGGG
TTAACCCGTTTGTGGCTAAAGGTGGTCCTATTCTCGAGATATGTGGTTTGGACTGCTTGT
GATTTGATCCAAGGTTGGTTCCCACAGAGCAAGAGAGGTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG
ATTATCTACCCTCTTAAAGACTCCTTTCATTGTGTTCATTAAACGTTGATACAAGAAAAA
AAAGATTTAATTTTGTTTACGTGAATGTTATTTTTGCAAGAATGTGTTGTAGATATAGAA
GAAGTTTGTTGTCC


BQ
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AF RS1AN84TF U 1
AF RS1AN84JQ C 220
BS 1 708 RS1AN84TF
BS 709 974 RS1AN84JQ

RD RS1AN84TF 708 0 0
GTAGATGGGCTCTTGGGTCTGTTGAGATTTTCTTGAGTAGGCATTTTCCTATTTGGTATG
GTTATGGAGGTGGTTTGAAATGGCTTGAGAGGTTGTCTTACATTAACTCTGTGGTTTACC
CATGGACCTCTCTCCCACTCATTGTCTACTGTTCTCTCCCAGCCATTTGTCTTCTCACAG
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CGTCCATTGCAGTAACTGGTGTTCTCGAGATGCAATGGGGCAAAGTTGGGATCGATGACT
GGTGGAGAAATGAACAGTTTTGGGTCATTGGAGGTGTCTCTGCTCATCTCTTTGCTCTCT
TCCAAGGTCTTCTCAAGGTTCTCGCTGGTGTGGACACTAACTTCACGGTCACGTCAAAGG
CAGCTGATGATGGAGAGTTCTCAGACCTTTATCTATTCAAATGGACTTCACTTCTCATCC
CTCCCACGACTCTTCTCATCATAAACGTCATTGGAATCGTGGTGGGAATCTCTGATGCTA
TAAGCAATGGTTATGACTCATGGGGACCGCTTTTTGGAAGGTTGTTCTTTGCACTTTGGG
TGGTTATTCATCTTTACCCTTTCCTTAAAGGTTTGCTAGGGAAACAAGATAGAATGCCGA
CCATTATTGTCGTCTGGTCTATTCTCCTGGCTTCTATTCTTACTCTTC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1AN84JQ 755 0 0
TCCTCTTCATGGCACTCTTCTCGTCCATTGCAGTAACTGGTGTTCTCGAGATGCAATGGG
GCAAAGTTGGGATCGATGACTGGTGGAGAAATGAACAGTTTTGGGTCATTGGAGGTGTCT
CTGCTCATCTCTTTGCTCTCTTCCAAGGTCTTCTCAAGGTTCTCGCTGGTGTGGACACTA
ACTTCACGGTCACGTCAAAGGCAGCTGATGATGGAGAGTTCTCAGACCTTTATCTATTCA
AATGGACTTCACTTCTCATCCCTCCCACGACTCTTCTCATCATAAACGTCATTGGAATCG
TGGTGGGAATCTCTGATGCTATAAGCAATGGTTATGACTCATGGGGACCGCTTTTTGGAA
GGTTGTTCTTTGCACTTTGGGTGGTTATTCATCTTTACCCTTTCCTTAAAGGTTTGCTAG
GGAAACAAGATAGAATGCCGACCATTATTGTCGTCTGGTCTATTCTCCTGGCTTCTATTC
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GAATGTGTTGTAGATATAGAAGAAGTTTGTTGTCC

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DS 



AS 1 2

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TTCCACACGCAATCTTACGTCTTGACCTAGCGGGTCGTACCTAACCGACTACCTTATGAA
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TCCAGGAATCCATGAAACCACATATAATTCTATCATGAAATGTGATGTGGATATTAGGAA
AGATTTGTATGGGAACATTGTGCTAAGTGGTGGAACCACAATGTTTGGTGGGATTGGTGA
TAGAATGAGCAAAGAGATTACGGCCTTGGCTCCTAGTAGTATGAAGATTAAGGTCGTGGC
TCCACCAGAAAGGAAGTACAGTGTTTGGATCGGTGGTTCTATATTGGCTTCACTCAGTAC
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TTGTCAAAAAAAAAACTTAAAACATTTCGATCTTTTCTACCAATTGCAATTTTTGTTTAG
TTACATTTTTATGCAAATTGTTCTTTGTAATTTTGTTTCGAAGCAACTTAACCAATGTCA
GTAAAATTCTTTAATAATTATGTATACCATATCAATAGTGTTCC


BQ
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DS 

RD RS1BY58JQ 755 0 0
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GTTCCGGTGTCCAGAAGTTCTGTTTCAGCCATCACTGATTGGAATGGAAAATCCAGGAAT
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TTTCTAATCAAACAACTCATGCGAATGATATCCGAAGTGAAAGAAAAAACGTTGTCAAAA
AAAAAACTTAAAACATTTCGATCTTTTCTACCAATTGCAATTTTTGTTTAGTTACATTTT
TATGCAAATTGTTCTTTGTAATTTTGTTTCGAAGCAACTTAACCAATGTCAGTAAAATTC
TTTAATAATTATGTATACCATATCAATAGTGTTCC

QA 1 755 1 755
DS 



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TGAGGGCTCGAACGAAGTTCAAGATCATGTTAAATTGACCGAGAATTCCACTGTCAACAA
TGGCTCCTCTCTTTTTGTTTCTCCTTTGTTTTCTCGTGAGCCGCAACCATTACAAAAAGT
GATCAAATGGATGCAAAACATGAAAGAAATTGAAGAGGAACAGAAGAAGAGAATAATCTT
CTTGAGTAGCTTTATTTCGGGATTCAAAGAAGAGCTTCATACTGATATTCTTCTAAAACC
TGGCGATGATGGACCTCCTGTTCCTGCACATAGAGCTTTGTTGGCTTCAAAATCCGAGAT
CTTCAAGAATATTTTAGATTCAGACGAATGCAAAACCGCTCCAGAATACGCCATAACACT
CCAAGAACTAAACTTAGAGGAACTTCAAGCTCTCTTGGAGTTTCTATACACCGGCACACT
GGCTTCAGACAAGTTGAAGAAGCATGTATATGCCTTGTTTGTTGCAGCCGATAAGTACAT
GATTCATTACTTGCAAGAGTTCTGCGAGCAGCATATGCTTAGTTCCTTGGAAATATCTAG
CGTTCTTGATGTTCTTGATGTCTCGGATCTTGGTTCGAGCAAGACCTTGAAGGAAGCTGC
TCTAGGGTTCGTGGTGCAAAACATGGACGACATTGTTTTGTCAGACAAATACGAAGAATT
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AAACAAGAGACGTGATTAACTTAGTGAGATATAAAAACACTGTAAGAAAGTTTTGTATGT
TTTATTGTTTATAGCTGTTCGTAATCCTCCATATAGCAAATTCTATGACTTT


BQ
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AF RS1DA32TF U 1
AF RS1DA32JQ C 314
BS 1 687 RS1DA32TF
BS 688 952 RS1DA32JQ

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CACGATATGCGGATCATGCTACGACGGAGCTCGAACCATTATGTCGTTGCTCAAGAAGCT
TGAGGGCTCGAACGAAGTTCAAGATCATGTTAAATTGACCGAGAATTCCACTGTCAACAA
TGGCTCCTCTCTTTTTGTTTCTCCTTTGTTTTCTCGTGAGCCGCAACCATTACAAAAAGT
GATCAAATGGATGCAAAACATGAAAGAAATTGAAGAGGAACAGAAGAAGAGAATAATCTT
CTTGAGTAGCTTTATTTCGGGATTCAAAGAAGAGCTTCATACTGATATTCTTCTAAAACC
TGGCGATGATGGACCTCCTGTTCCTGCACATAGAGCTTTGTTGGCTTCAAAATCCGAGAT
CTTCAAGAATATTTTAGATTCAGACGAATGCAAAACCGCTCCAGAATACGCCATAACACT
CCAAGAACTAAACTTAGAGGAACTTCAAGCTCTCTTGGAGTTTCTATACACCGGCACACT
GGCTTCAGACAAGTTGAAGAAGCATGTATATGCCTTGTTTGTTGCAGCCGATAAGTACAT
GATTCATTACTTGCAAGAGTTCTGCGAGCAGCATATGCTTAGTTCCTTGGAAATATCTAG
CGTTCTTGATGTTCTTGATGTCTCGGA

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DS 

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CCTCCTGTTCCTGCACATAGAGCTTTGTTGGCTTCAAAATCCGAGATCTTCAAGAATATT
TTAGATTCAGACGAATGCAAAACCGCTCCAGAATACGCCATAACACTCCAAGAACTAAAC
TTAGAGGAACTTCAAGCTCTCTTGGAGTTTCTATACACCGGCACACTGGCTTCAGACAAG
TTGAAGAAGCATGTATATGCCTTGTTTGTTGCAGCCGATAAGTACATGATTCATTACTTG
CAAGAGTTCTGCGAGCAGCATATGCTTAGTTCCTTGGAAATATCTAGCGTTCTTGATGTT
CTTGATGTCTCGGATCTTGGTTCGAGCAAGACCTTGAAGGAAGCTGCTCTAGGGTTCGTG
GTGCAAAACATGGACGACATTGTTTTGTCAGACAAATACGAAGAATTTTCTCGGAAAAAC
CAGCATTTATGCGTTCAAATTACTAGGGCGTTCTTGACGGAAACGAGAAACAAGAGACGT
GATTAACTTAGTGAGATATAAAAACACTGTAAGAAAGTTTTGTATGTTTTATTGTTTATA
GCTGTTCGTAATCCTCCATATAGCAAATTCTATGACTTT

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 2

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GGAATTCATTACAATTACAAAACAGCGAAAAGACACAGAGGGAGAGAGATCTCAAGTCTG
ATCCACAACAATGGCGTCTCTCAAAGTCCCGGCCAACGTTCCTCTTCCCCAAGAAGACGC
CGAGCAACTCCACAAGGCTTTTGCAGGATGGGGTACCAACGAGAAGCTGATCATATCAAT
TCTAGCCCACAGGAACTCTGCACAGCGCAGCTTAATCCGCAGCGCTTACGCCGCTACTTA
CAATGAGGATCTTCTCAAGGCCTTAGACAAAGAGCTTTCTAGTGACTTTGAGAGAGTTGT
CATGTTGTGGACTCTTGATCCAGCGGAGAGAGATGCTTTTCTTGCTAAAGAATCAACCAA
AATGTTCACCAAGAACAATTGGGTTCTTGTTGAAATCGCTTGCACTAGGTCTCCTCTTGA
TCTTTTCAAGGTCAAGCAAGCTTACCAAGCACGTTACAAGAAATCACTCGAGGAAGATGT
TGCGCAACACACATCTGGTGACCTTCGTAAGCTATTGCTTCCTCTTGTTAGCACTTTTAG
GTACGAAGGAGATGAGGTGAACATGAGGCTTGCAAGATCTGAAGCCAAGTTACTTCACGA
GAAGGTCTCAGAGAAAGCCTTCAGCGATGATGACTTCATCAGAATCTTGACAACAAGGAG
CAAAGCACAGCTCGGTGCAACTCTTAACCAATACAACAATGAGTATGGAAACGCCATTAA
CAAGAACTTGAAGGAAGATTCGGATGACGAATACCTTAAACTACTAAGAGCTGTAGTCAC
GTGTTTGACATATCCTGAGAAGCATTTTGAGAAGGTTTTGCGTCTAGCAATTAACAGAAT
GGGGACTGACGAGTGGGCACTAACCCGAGTCGTGAGTACACGAACTGAAGTTGACATGGA
ACGTATTAAAGAGGAGTATCAGCGAAGGAACAGCATTCCTTTGCACGATGCCGTCGCTAA
AGACACTTCTGGTGATTATGAGGACATGCTTGTTGCTCTTCTTGGACATGGAGATGTTTA
AAACTGGTTCAGTCCCCATGCTTTCTTTCTTTTTACTGGTTTGTTTTGAATAAAAGAGTT
GTGTAAACTGGTTTCTGCTACTATCTATCTATCTATGTATTTGAGTCTGTTTAAATACAA
TCTAAAGCACAAGTTAAAGCGAAATCTCTGT


BQ
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AF RS1ER48TF U 1
AF RS1ER48JQ C 566
BS 1 731 RS1ER48TF
BS 732 1171 RS1ER48JQ

RD RS1ER48TF 731 0 0
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ATCCACAACAATGGCGTCTCTCAAAGTCCCGGCCAACGTTCCTCTTCCCCAAGAAGACGC
CGAGCAACTCCACAAGGCTTTTGCAGGATGGGGTACCAACGAGAAGCTGATCATATCAAT
TCTAGCCCACAGGAACTCTGCACAGCGCAGCTTAATCCGCAGCGCTTACGCCGCTACTTA
CAATGAGGATCTTCTCAAGGCCTTAGACAAAGAGCTTTCTAGTGACTTTGAGAGAGTTGT
CATGTTGTGGACTCTTGATCCAGCGGAGAGAGATGCTTTTCTTGCTAAAGAATCAACCAA
AATGTTCACCAAGAACAATTGGGTTCTTGTTGAAATCGCTTGCACTAGGTCTCCTCTTGA
TCTTTTCAAGGTCAAGCAAGCTTACCAAGCACGTTACAAGAAATCACTCGAGGAAGATGT
TGCGCAACACACATCTGGTGACCTTCGTAAGCTATTGCTTCCTCTTGTTAGCACTTTTAG
GTACGAAGGAGATGAGGTGAACATGAGGCTTGCAAGATCTGAAGCCAAGTTACTTCACGA
GAAGGTCTCAGAGAAAGCCTTCAGCGATGATGACTTCATCAGAATCTTGACAACAAGGAG
CAAAGCACAGCTCGGTGCAACTCTTAACCAATACAACAATGAGTATGGAAACGCCATTAA
CAAGAACTTGA

QA 1 731 1 731
DS 

RD RS1ER48JQ 606 0 0
AGGCTTGCAAGATCTGAAGCCAAGTTACTTCACGAGAAGGTCTCAGAGAAAGCCTTCAGC
GATGATGACTTCATCAGAATCTTGACAACAAGGAGCAAAGCACAGCTCGGTGCAACTCTT
AACCAATACAACAATGAGTATGGAAACGCCATTAACAAGAACTTGAAGGAAGATTCGGAT
GACGAATACCTTAAACTACTAAGAGCTGTAGTCACGTGTTTGACATATCCTGAGAAGCAT
TTTGAGAAGGTTTTGCGTCTAGCAATTAACAGAATGGGGACTGACGAGTGGGCACTAACC
CGAGTCGTGAGTACACGAACTGAAGTTGACATGGAACGTATTAAAGAGGAGTATCAGCGA
AGGAACAGCATTCCTTTGCACGATGCCGTCGCTAAAGACACTTCTGGTGATTATGAGGAC
ATGCTTGTTGCTCTTCTTGGACATGGAGATGTTTAAAACTGGTTCAGTCCCCATGCTTTC
TTTCTTTTTACTGGTTTGTTTTGAATAAAAGAGTTGTGTAAACTGGTTTCTGCTACTATC
TATCTATCTATGTATTTGAGTCTGTTTAAATACAATCTAAAGCACAAGTTAAAGCGAAAT
CTCTGT

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 2

CO CL4950Contig1 502 2 1 U
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AAGAAAGACTCCATTCAAGATTAATTACGACAACATTTTTTTTTATGCACAACCCAAATA
ACGTGAAAGGGGATGCAAAACTGTTCGCCAAGAGGGTGAGGGATTTTATCTATGAGCTAA
CACTTAAAGTCATGAAAATCACCAATAACGGTGAACTCGATTTTTACGCGGCGGGAGAAA
AGAAGCTCGGAAAAAATAAATTATATGCAATGGTGCAATGCAATCCACTAACAAGAGATT
GTGAAAAATGTTTGGCATGGAGTATCATAAATCTTTTAAAAAACAACGACACTAAACAAG
GTGGACGAGTTTTGGGTACGAATTGTAATGTAAGATATGAGCTATACCCTTTTCTTAGAA
GTTAAAGCATTTTTAAGTTATGTTTATTTTTTCTTTTTGTTGCTAAAATGCAATACATAT
ATCAATAAAAGGAGTGTTTACC


BQ
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AF RS1F030TF U 1
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BS 1 502 RS1F030TF

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AAGAAAGACTCCATTCAAGATTAATTACGACAACATTTTTTTTTATGCACAACCCAAATA
ACGTGAAAGGGGATGCAAAACTGTTCGCCAAGAGGGTGAGGGATTTTATCTATGAGCTAA
CACTTAAAGTCATGAAAATCACCAATAACGGTGAACTCGATTTTTACGCGGCGGGAGAAA
AGAAGCTCGGAAAAAATAAATTATATGCAATGGTGCAATGCAATCCACTAACAAGAGATT
GTGAAAAATGTTTGGCATGGAGTATCATAAATCTTTTAAAAAACAACGACACTAAACAAG
GTGGACGAGTTTTGGGTACGAATTGTAATGTAAGATATGAGCTATACCCTTTTCTTAGAA
GTTAAAGCATTTTTAAGTTATGTTTATTTTTTCTTTTTGTTGCTAAAATGCAATACATAT
ATCAATAAAAGGAGTGTTTACC

QA 1 502 1 502
DS 

RD RS1F030JQ 171 0 0
TT
TTTTAAAAAACAACGACACTAAACAAGGTGGACGAGTTTTGGGTACGAATTGTAATGTAA
GATATGAGCTATACCCTTTTTTTAGAAGTTAAAGCATTTTTAAGTTATGTTTATTTTTTC
TTTTTGTTGCTAAAATGCAATACATATATCAATAAAAGGAGTGTTTACC

QA 3 171 3 171
DS 



AS 1 2

CO CL4951Contig1 1377 2 8 U
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TGCTTTTGATTATTTGACCAAATCTGTGCAAATATATAAAGCACCCTGGTTTATTCAAGA
TAAACCTAGATTCAAGTACCGTGGTCTGCTGATAGATACATCAAGACATTATCTACCAAT
TGATGTTATCAAGCAGATCATTGAGTCTATGTCCTTTGCTAAACTTAACGTCCTGCATTG
GCACATTGTAGATGAGCAGTCCTTTCCTCTTGAAACGCCTACGTATCCTAATCTGTGGAA
AGGAGCTTATTCGAGATGGGAACGTTATACCGTTGAGGATGCCTCTGAGATTGTTAGGTT
TGCCAAAATGAGAGGTATTAACGTCATGGCTGAACTAGATGTACCTGGCCATGCTGAATC
ATGGGGAACTGGTTATCCTGATCTTTGGCCGTCTCCTTCTTGCCGAGAGCCCCTTGACGT
CACTAAAAACTTTACATTCGATGTGATCTCTGGCATTTTGACAGATATGAGAAAGATATT
CCCATTTGAGTTTTTCCACTTGGGCGGTGATGAAGTAAATACAGATTGCTGGAAGAACAC
AACTCATGTCAAGGAATGGCTTCAGGGTCGCAACTTCACTTCTAAGGATGCATATAAGTA
CTTTGTACTCAGAGCTCAACAGATAGCAATATCTAAAAACTGGACACCTGTCAACTGGGA
AGAAACATTCATTTCATTTGGAAAATATCTTGATCCACGGACCGTGGTGCAAAACTGGCT
AGTATCTGATATATGTCAAAAGGCAGTAGCAAAAGGATTCAGATGTATTTTCAGTAACCA
AGGATATTGGTACCTCGACCATCTAGATGTCCCCTGGGACCAGGTTTACAATACCGAGCC
TCCGAATGGAATCCATGACCCTTCTCAGCAAAAGCTTGTGATTGGTGGAGAAGTTTGCAT
GTGGGGTGAAACAGCTGATACATCCGTTGTGCTTCAGACAATTTAGCCTAGAGCTGCAGC
AGCTGCAGAACGGATGTGGAGCACTAGAGAGGCTGTGTCAAAGGGAAACATAACGTTAAC
CGCATTGCCTCGTTTACACTACTTCAGATGTTTACTGAATAACCGTGGGGTTCCAGCAGC
TCCAGTTGATAACTGGTATGCACGAAGACCACCCTCTGGACCTGGCTCTTGCTATGCTCA
GTGATTCCAAATAATATCATCTCATTTTAATTTGTATTATATGTAACTTCTCTTGTCTGA
AAACTTGTTTATGCATTTGTTTTCTTCAATTGTTTTCTTCTTGATAACTCAAATCAAAGT
TGTGTTTGTTTTTTCTTGCAACAATAATCAGTCATGAGACATCTGAGCTTTTTGACG


BQ
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AF RS1DK48TF U 1
AF RS1DK48JQ C 593
BS 1 646 RS1DK48TF
BS 647 647 RS1DK48JQ
BS 648 698 RS1DK48TF
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BS 773 1377 RS1DK48JQ

RD RS1DK48TF 772 0 0
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TGCTTTTGATTATTTGACCAAATCTGTGCAAATATATAAAGCACCCTGGTTTATTCAAGA
TAAACCTAGATTCAAGTACCGTGGTCTGCTGATAGATACATCAAGACATTATCTACCAAT
TGATGTTATCAAGCAGATCATTGAGTCTATGTCCTTTGCTAAACTTAACGTCCTGCATTG
GCACATTGTAGATGAGCAGTCCTTTCCTCTTGAAACGCCTACGTATCCTAATCTGTGGAA
AGGAGCTTATTCGAGATGGGAACGTTATACCGTTGAGGATGCCTCTGAGATTGTTAGGTT
TGCCAAAATGAGAGGTATTAACGTCATGGCTGAACTAGATGTACCTGGCCATGCTGAATC
ATGGGGAACTGGTTATCCTGATCTTTGGCCGTCTCCTTCTTGCCGAGAGCCCCTTGACGT
CACTAAAAACTTTACATTCGATGTGATCTCTGGCATTTTGACAGATATGAGAAAGATATT
CCCATTTGAGTTTTTCCACTTGGGCGGTGATGAAGTAAATACAGATTGCTGGAAGAACAC
AACTCATGTCAAGGAATGGCTTCAGGGTCGCAACTTCACTTCTAAG*ATGCATATAAGTA
CTTTGTACTCAGAGCTCAACAGATAGCAATATCTAAAA*CTGGACACCTGTCAACTGGGA
AGAA*CATTCATTTCATTTGGAAAATATCTTGATCCACGGACCGTGGTGCAA

QA 1 772 1 772
DS 

RD RS1DK48JQ 785 0 0
AAGAACACAACTCATGTCAAGGAATGGCTTCAGGGTCGCAACTTCACTTCTAAGGATGCA
TATAAGTACTTTGTACTCAGAGCTCAACAGATAGCAATATCTAAAAACTGGACACCTGTC
AACTGGGAAGAAACATTCATTTCATTTGGAAAATATCTTGATCCACGGACCGTGGTGCAA
AACTGGCTAGTATCTGATATATGTCAAAAGGCAGTAGCAAAAGGATTCAGATGTATTTTC
AGTAACCAAGGATATTGGTACCTCGACCATCTAGATGTCCCCTGGGACCAGGTTTACAAT
ACCGAGCCTCCGAATGGAATCCATGACCCTTCTCAGCAAAAGCTTGTGATTGGTGGAGAA
GTTTGCATGTGGGGTGAAACAGCTGATACATCCGTTGTGCTTCAGACAATTTAGCCTAGA
GCTGCAGCAGCTGCAGAACGGATGTGGAGCACTAGAGAGGCTGTGTCAAAGGGAAACATA
ACGTTAACCGCATTGCCTCGTTTACACTACTTCAGATGTTTACTGAATAACCGTGGGGTT
CCAGCAGCTCCAGTTGATAACTGGTATGCACGAAGACCACCCTCTGGACCTGGCTCTTGC
TATGCTCAGTGATTCCAAATAATATCATCTCATTTTAATTTGTATTATATGTAACTTCTC
TTGTCTGAAAACTTGTTTATGCATTTGTTTTCTTCAATTGTTTTCTTCTTGATAACTCAA
ATCAAAGTTGTGTTTGTTTTTTCTTGCAACAATAATCAGTCATGAGACATCTGAGCTTTT
TGACG

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

CO CL4952Contig1 1055 2 6 U
TCACGACGTGGCTCCATTGTTTCGTTGCCTGGAGGAGGGGAAGGAACCGGTGAGGCAGAG
TTTGTGCAAGCGTCTGCTTTGGTTGGCCAACCGGCTCTTTACTCCAAAGACCTTCTCAGA
GAACATACGATCGGTCCTGCCATGGTTCATCCGTCAGCAACAGCTAAAGGGTCACTTTGG
CATGATCTTCAGGATCCTGGAGTCAAACGTGCTCTGTTCGTAGGAGTTGGTCTTCAGATA
CTTCAGCAGTTCTCAGGGATCAATGGAGTCCTTTATTACACACCTCAAATCCTAGAGCAG
GCAGGTGTTGGGATTCTGTTATCAAACTTGGGGATTAGTTCTTCCTCGTCATCTCTACTT
ATAAGTGCATTGACAACCTTTGTGATGTTACCTGCAATAGCTGTTGCAATGAGGCTCATG
GATCTCTCTGGTCGAAGGACGTTGCTGCTCACTACGATTCCAATCTTAATAGCATCTCTA
ATAGTCTTAGTAATCTCGAATCTAGTCCACATGAACAGCGTTGTACACGCGGTCTTATCA
ACAGTAAGCGTTGTTCTCTACTTCTGCTTCTTCGTGATGGGTTTCGGTCCTACTCCAAAC
ATCCTATGCTCGGAGATCTTCCCAACTCGAGTACGTGGGATTTGCATTGCTATATGTGCG
CTCACGTTCTGGATATGTGACATTATCGTCACTTACAGTCTCCCTGTGCTGCTTAAATCC
ATTGGGCTTGCTGGTGTGTTGGGAATGTATGCAGTCGTCTGTTGCATCTCGTGGGGATTT
GTGTACCTTAAAGTCCCTGAAACTAAAGGTATGCCGCTTGAAGTCATTACTGAGTTCTTC
TCTATTGGAGCTAGACAAGCTGAAGCTGACAAAACCAACTGAGAAAACTAAAAGACAGGA
AGGAGTTTCAAGTTTGTAATGTTACCATGTTGGTGTGGATTTGTTGTTGTCTTTCTACTT
TGTGCAGTAATAATCATCTCTCTGTGTTTCTTCTCCCTCTTGTGGGGAGAAAAAAAGATT
CAGACTTTCAATTACAAATCTCTTTATTATCATTC


BQ
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AF RS1FU13TF U 1
AF RS1FU13JQ C 289
BS 1 716 RS1FU13TF
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ACAGTAAGCGTTGTTCTCTACTTCTGCTTCTTCGTGATGGGTTTCGGTCCTACTCCAAAC
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CTCACGTTCTGGATATGTGACATTATCGTCACTTACAGTCTCCCTGTGCTGCTTAA*TCC
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GTGTACCTTAA
GTCC

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DS 

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AAT
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ACTCCAAACATCCTATGCTCGGAGATCTTCCCAACTCGAGTACGTGGGATTTGCATTGCT
ATATGTGCGCTCACGTTCTGGATATGTGACATTATCGTCACTTACAGTCTCCCTGTGCTG
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TGGGGATTTGTGTACCTTAAAGTCCCTGAAACTAAAGGTATGCCGCTTGAAGTCATTACT
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AAAAAGATTCAGACTTTCAATTACAAATCTCTTTATTATCATTC

QA 4 767 4 767
DS 



AS 1 2

CO CL4953Contig1 953 2 2 U
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AAGAGACTACTTAAGATTAAAATCAAAGTTTGAGAGTTTGGAATAAATCTTTTAGATACT
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BQ
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AF RS1DZ86TF U 1
AF RS1DZ86JQ C 219
BS 1 705 RS1DZ86TF
BS 706 953 RS1DZ86JQ

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GACAACACCTTGTGGTTTGGTTTTGTGGCTGAGGACGAAGGGGAGTTCCTGATCATATGA
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AAGTCTCTCAGATTTCCATTGGAGATGGTGTCACGCTCTGCAGAC

QA 1 705 1 705
DS 

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GGTTGGAGGAATCATTGCGTTTGACAACACCTTGTGGTTTGGTTTTGTGGCTGAGGACGA
AGGGGAGTTCCTGATCATATGAGGGAATATAGAGAGGCTCTTATAGAGTTCAATAAGAAA
TTGGCTTTGGATACTCGTGTCGAAGTCTCTCAGATTTCCATTGGAGATGGTGTCACGCTC
TGCAGACGCCTTATTTGATCAAAAGAGACTACTTAAGATTAAAATCAAAGTTTGAGAGTT
TGGAATAAATCTTTTAGATACTTCAATAATCACTTCTTGTCATTTTATCACTGATTTGCA
TTTAATGGTGTGTTTGATATATGATCAATCCACATCTTCTTCGCATACTCATCTGTTGCA
CAATGATCACAACTGGCTGGATGTGTATCATCTTCTATCGATATGTTAGTTTATGAACTA
CTTTAAAAGTTGTAC

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

CO CL4954Contig1 702 2 3 U
GGGGAGATGGTCGATTGAGAGAGAGACTGATTTCTAGGGTTTGCTGATTGATTCTCTTCG
TGTTCTGGATATTCCTTTGTGCAAAAAAAAAGAGGATTGATTCCTCGTCTGCTTTCGGTC
CTCTCAACAAGCGATCTAGGAACAGACAGTGGATGATCTACAAGGCTTCAAGGCTTTGTT
TCATTTTCTTTTGTCCAGAACAGAGGGGGTGGTCGTGAATCCCACATGTACCTCTCTATC
TCTCCCTTTATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGAAATCTGATATTTTTTTTCTTGGTAAA
GGTGGTGGTCGTGACAGAGCTTGTGTTCATGACCATAGAAGGCGTTCGTGAGCAGTGGAG
GCGTTTCTGAGAAAATGTAGTGGTCATGAGCAGAGGAGGCAGCGGCGGTCGTTAGAAGAG
GAGGTAAGGCGAAGTCTCGGTAGTGATGGACATGGCGGCTATGCGACCATGAAAGGAGGA
AAGAGTAGCAGCTTATTCATAGATAGAAGTTGTGCGGCGGAGGCAGATCGGGGGAGGCGG
TGGTGCAAAGGAGTTAGGGTTTTTTTAGATTTTGTTTTTAAACCCGGTTTGTATGTAAAA
ACCGGTTTAATTTGTTAACCAAAAATATTTGTAACCTGTGGTTTAATTTATAAACAGAAA
TCAGTTGTATACCGAATTTTAATATAAACCGGTTTCATTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DV28TF U 1
AF RS1DV28JQ C 284
BS 1 653 RS1DV28TF
BS 654 654 RS1DV28JQ
BS 655 702 RS1DV28TF

RD RS1DV28TF 702 0 0
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TGTTCTGGATATTCCTTTGTGCAAAAAAAAAGAGGATTGATTCCTCGTCTGCTTTCGGTC
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TCATTTTCTTTTGTCCAGAACAGAGGGGGTGGTCGTGAATCCCACATGTACCTCTCTATC
TCTCCCTTTATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGAAATCTGATATTTTTTTTCTTGGTAAA
GGTGGTGGTCGTGACAGAGCTTGTGTTCATGACCATAGAAGGCGTTCGTGAGCAGTGGAG
GCGTTTCTGAGAAAATGTAGTGGTCATGAGCAGAGGAGGCAGCGGCGGTCGTTAGAAGAG
GAGGTAAGGCGAAGTCTCGGTAGTGATGGACATGGCGGCTATGCGACCATGAAAGGAGGA
AAGAGTAGCAGCTTATTCATAGATAGAAGTTGTGCGGCGGAGGCAGATCGGGGGAGGCGG
TGGTGCAAAGGAGTTAGGGTTTTTTTAGATTTTGTTTTTAAACCCGGTTTGTATGTAAAA
ACCGGTTTAATTTGTTAACCAAAAATATTTGTAACCTGTGGTTTAATTTATAA*CAGAAA
TCAGTTGTATACCGAATTTTAATATAAACCGGTTTCATTTAT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RS1DV28JQ 419 0 0
TTTTTTTTCTTGGTAAAGGTGGTGGTCGTGACAGAGCTTGTGTTCATGACCATAGAAGGC
GTTCGTGAGCAGTGGAGGCGTTTTTGAGAAAATGTAGTGGTCATGAGCAGAGGAGGCAGC
GGCGGTCGTTAGAAGAGGAGGTAAGGCGAAGTCTCGGTAGTGATGGACATGGCGGCTATG
CGACCATGAAAGGAGGAAAGAGTAGCAGCTTATTCATAGATAGAAGTTGTGCGGCGGAGG
CAGATCGGGGGAGGCGGTGGTGCAAAGGAGTTAGGGTTTTTTTAGATTTTGTTTTTAAAC
CCGGTTTGTATGTAAAAACCGGTTTAATTTGTTAACCAAAAATATTTGTAACCTGTGGTT
TAATTTATAAACAGAAATCAGTTGTATACCGAATTTTAATATAAACCGGTTTCATTTAT

QA 1 419 1 419
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL4956Contig1 1048 2 4 U
GGAAGAATCCAGCCCCTTATTGATAATTTAGGGTTCATCAAAATCTACGATCTCTGCCAT
CAGAGAGGCTGAGGTCGGCGTGACGATTCCGTTCGTTGGGGTTTAGATCACGTCCTTCCA
CCTTCGTTCCATCGATCGAAACGAGACAGTTTCCAGATCGCATTAAACATGTTCCTAACT
ACCATAGCCACGAACTATGTGTGTGAATCTTCTTAGAGGCGGTATTTCTAAGATTATAAA
AAGAATTCAAAGCTAGATACAACGTGTTAGGCTGTTCCAGGATGCAAATAGGTCTTGAAT
TGATTCATCTCGGCGGCGGCAGTTTCGGCAACTAACGATGCTAACTCTCGAGAACGTCGG
TGGTTTCACGTCGTTGCTTGAGCCTCCACTTGCCGTCATTGTATTTTCAAGTACTGGCCC
TTACGGAATTTTTTTTGATATCTCCACCGCCGCTTCACCATTACGGAACATTGACTAGCC
CAAAACAATCGGTCTCGCAAGAGAATAGAACTCAACAAAAAGGCTAAAAGCTTAACGAAG
ACGAAGAACAAAGCTCGGAAGAGAACGAGAAGCTTTCATATGTTCATGTTAGAGTTCGCT
GTGGTGAAGCAACAGATAGCCATAGCAGAACGAATTATAGGCAAGAAGGGAGAAAATTAA
TACACGGATGAAGCTGCTATAGGAACTGGTTCCAGGCTGTGATAAGTTGCCTTCAAAAGT
GATGAAGCAGACAATACAGAAGAAAAACAATGATATCTTCTATGATTCCGAAAGTGACCA
TGTTTTTTGTTTTTCTTATTTTTTTACTTTTGAGCCTCTGTTTCTATATTTGATAGAAAA
TTCATTTATGAGATTCAGTGAGTTTAGAGACATTGATGACTCTGAGTGACACTTCTGGAT
TGTTTGGAAGGTCTCAACTTCTCGGATGGGGCTAATTTGTAATTCTCTTTTTTTTTTGTT
TTGTTTTTATGCTACAACTAACGTGTAATTCTCAATCTCTCAAACCTTCATATGCTTTTT
ATCAAGGAAACCCCAGAAACTAGAAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AH47TF U 1
AF RS1AH47JQ C 308
BS 1 746 RS1AH47TF
BS 747 747 RS1AH47JQ
BS 748 799 RS1AH47TF
BS 800 1048 RS1AH47JQ

RD RS1AH47TF 799 0 0
GGAAGAATCCAGCCCCTTATTGATAATTTAGGGTTCATCAAAATCTACGATCTCTGCCAT
CAGAGAGGCTGAGGTCGGCGTGACGATTCCGTTCGTTGGGGTTTAGATCACGTCCTTCCA
CCTTCGTTCCATCGATCGAAACGAGACAGTTTCCAGATCGCATTAAACATGTTCCTAACT
ACCATAGCCACGAACTATGTGTGTGAATCTTCTTAGAGGCGGTATTTCTAAGATTATAAA
AAGAATTCAAAGCTAGATACAACGTGTTAGGCTGTTCCAGGATGCAAATAGGTCTTGAAT
TGATTCATCTCGGCGGCGGCAGTTTCGGCAACTAACGATGCTAACTCTCGAGAACGTCGG
TGGTTTCACGTCGTTGCTTGAGCCTCCACTTGCCGTCATTGTATTTTCAAGTACTGGCCC
TTACGGAATTTTTTTTGATATCTCCACCGCCGCTTCACCATTACGGAACATTGACTAGCC
CAAAACAATCGGTCTCGCAAGAGAATAGAACTCAACAAAAAGGCTAAAAGCTTAACGAAG
ACGAAGAACAAAGCTCGGAAGAGAACGAGAAGCTTTCATATGTTCATGTTAGAGTTCGCT
GTGGTGAAGCAACAGATAGCCATAGCAGAACGAATTATAGGCAAGAAGGGAGAAAATTAA
TACACGGATGAAGCTGCTATAGGAACTGGTTCCAGGCTGTGATAAGTTGCCTTCAAAAGT
GATGAAGCAGACAATACAGAAGAAAA*CAATGATATCTTCTATGATTCCGAAAGTGACCA
TGTTTTTTGTTTTTCTTAT

QA 1 799 1 799
DS 

RD RS1AH47JQ 741 0 0
TCTCGGCGGCGGCAGTTTCGGCAACTAACGATGCTAACTCTCGAGAACGTCGGTGGTTTC
ACGTCGTTGCTTGAGCCTCCACTTGCCGTCATTGTATTTTCAAGTACTGGCCCTTACGGA
ATTTTTTTTGATATCTCCACCGCCGCTTCACCATTACGGAACATTGACTAGCCCAAAACA
ATCGGTCTCGCAAGAGAATAGAACTCAACAAAAAGGCTAAAAGCTTAACGAAGACGAAGA
ACAAAGCTCGGAAGAGAACGAGAAGCTTTCATATGTTCATGTTAGAGTTCGCTGTGGTGA
AGCAACAGATAGCCATAGCAGAACGAATTATAGGCAAGAAGGGAGAAAATTAATACACGG
ATGAAGCTGCTATAGGAACTGGTTCCAGGCTGTGATAAGTTGCCTTCAAAAGTGATGAAG
CAGACAATACAGAAGAAAAACAATGATATCTTCTATGATTCCGAAAGTGACCATGTTTTT
TGTTTTTCTTATTTTTTTACTTTTGAGCCTCTGTTTCTATATTTGATAGAAAATTCATTT
ATGAGATTCAGTGAGTTTAGAGACATTGATGACTCTGAGTGACACTTCTGGATTGTTTGG
AAGGTCTCAACTTCTCGGATGGGGCTAATTTGTAATTCTCTTTTTTTTTTGTTTTGTTTT
TATGCTACAACTAACGTGTAATTCTCAATCTCTCAAACCTTCATATGCTTTTTATCAAGG
AAACCCCAGAAACTAGAAAAT

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL4957Contig1 680 2 1 U
GGCTCAGAGATTTTATCCAAAAATAGTTTTGTTTAATTCTCTGGAAGGAAAAAAATAAAA
AAGAAAACCATTTCTTCAGCTCTTGTTCTTCTTTGGCTGAGAGGCAATGGCGGAGGAGCA
AAAGACGATCAAAGTTGACGTAGATTCTCCTGCGGTTGTAGCTCCGGCGAAGGAACCTAC
TCCTGCTCCGGTGGAAGTTTCAAAAGACGTGGCGGAGGAGAAAGTTCATACTCCACTTCC
CGACGAGTCCAAAGCTCTTACCGTTGTTGAAACATAATAGTCACCAAACGTTAAAGAGAG
CAAAAAAAACTCCATATAACCATGAGTGTCTTTGATTAAAAAATGAGACAGCAAGTTGAC
GGAAGACGAGAGACAGAAAGAGAGATACCCAATTGCTTATAGACGGTGTCCATGTCATCC
ATGGAATGAGAGGACCGAACAGAGAAGAGAAGAACTCGAGATGATGATCAAGATGAGGCA
TCATCGCAAGATGTCTTCCGCCAGGTGAACATATAGCCGCTATTCCCAACGGTGAGCCAT
TGAGATTAAAAGGGTATGCTTCAGTCACGCTCCCATCATCGTCACAGTATCTCAACGGAG
CCAAATCTGAGTGAAGCATATGGTCCAAGACTCCTTCGTCCGAGAAATAAGCCCGTCCTT
CTCCAAGAGCCGCCCAAACT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AW85TF U 107
AF RS1AW86TF U 1
BS 1 680 RS1AW86TF

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GCGAAGGAACCTACTCCTGCTCCGGTGGAAGTTTCAAAAGACGTGGCGGAGGAGAAAGTT
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ATCAAGATGAGGCATCATCGCAAGATGTCTTCCGCCAGGTGAACATATAGCCGCTATTCC
CAACGGTGAGCCATTGAGATTAAAAGGGTATGCTTCAGTCACGCTCCCATCATCGTCACA
GTATCTCAACG

QA 1 491 1 491
DS 

RD RS1AW86TF 680 0 0
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AAGAAAACCATTTCTTCAGCTCTTGTTCTTCTTTGGCTGAGAGGCAATGGCGGAGGAGCA
AAAGACGATCAAAGTTGACGTAGATTCTCCTGCGGTTGTAGCTCCGGCGAAGGAACCTAC
TCCTGCTCCGGTGGAAGTTTCAAAAGACGTGGCGGAGGAGAAAGTTCATACTCCACTTCC
CGACGAGTCCAAAGCTCTTACCGTTGTTGAAACATAATAGTCACCAAACGTTAAAGAGAG
CAAAAAAAACTCCATATAACCATGAGTGTCTTTGATTAAAAAATGAGACAGCAAGTTGAC
GGAAGACGAGAGACAGAAAGAGAGATACCCAATTGCTTATAGACGGTGTCCATGTCATCC
ATGGAATGAGAGGACCGAACAGAGAAGAGAAGAACTCGAGATGATGATCAAGATGAGGCA
TCATCGCAAGATGTCTTCCGCCAGGTGAACATATAGCCGCTATTCCCAACGGTGAGCCAT
TGAGATTAAAAGGGTATGCTTCAGTCACGCTCCCATCATCGTCACAGTATCTCAACGGAG
CCAAATCTGAGTGAAGCATATGGTCCAAGACTCCTTCGTCCGAGAAATAAGCCCGTCCTT
CTCCAAGAGCCGCCCAAACT

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DS 



AS 1 2

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ATATTCGTGAAAACCTTGACCGGAAAAACCATAACCCTAGAAGTTGAGAGCAGCGATACC
ATCGACAATGTCAAATCCAAAATCCAGGATAAAGAGGGGATACCACCAGATCAACAGAGG
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AACGTGTTGAGGAGAAAGAAGGCATCCCTCCTGTCCAACAAAGGCTCATCTACGCTGGAA
AACAGCTAGCTGATGACAAAACGGCAAAAGACTACAACATCGAGGGAGGCTCTGTTCTTC
ATCTGGTCCTTGCTTTTAGAGGTGGTGGTTTTGGTTTTTTTTGAGAAGTTAGCTCTTTTT
TCTCTCCTGAGTTTTATCTTTTCTATGACTTGCAATTTGGATTTACTATGGGGTTTGGAT
CAGTTTACCAATAATCTCTCCAATATCGGATCAAAAATAATATTTATTTGGATTTGGTTA
CTTTTGATG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ES77TF U 1
AF RS1ES77JQ C 1
BS 1 494 RS1ES77TF
BS 495 669 RS1ES77JQ

RD RS1ES77TF 494 0 0
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ATCTGGTCCTTGCT

QA 1 494 1 494
DS 

RD RS1ES77JQ 669 0 0
GGAGAGGCAGAGACAAATAGAGAGAGAGAAATCAAAGAAATCTTTCGAGGAAGGATGCAG
ATATTCGTGAAAACCTTGACCGGAAAAACCATAACCCTAGAAGTTGAGAGCAGCGATACC
ATCGACAATGTCAAATCCAAAATCCAGGATAAAGAGGGGATACCACCAGATCAACAGAGG
CTAATCTTTGCTGGGAAACAACTAGAGGATGGCCGAACGCTCGCTGACTACAACATCCAG
AGTCCACTCTTCACTTGGTCTTGAGGCTTAGGGGTGGCACCATGATCAAGGTCAAGACTC
TCACAGGCAAAGAGATCGAAATTGATATCGAACCTACCGGCACTATCGATCGCATCAAAG
AACGTGTTGAGGAGAAAGAAGGCATCCCTCCTGTCCAACAAAGGCTCATTTACGCTGGAA
AACAGCTAGCTGATGACAAAACGGCAAAAGACTACAACATCGAGGGAGGCTCTGTTTTTC
ATCTGGTCCTTGCTTTTAGAGGTGGTGGTTTTGGTTTTTTTTGAGAAGTTAGCTCTTTTT
TCTCTCCTGAGTTTTATCTTTTCTATGACTTGCAATTTGGATTTACTATGGGGTTTGGAT
CAGTTTACCAATAATCTCTCCAATATCGGATCAAAAATAATATTTATTTGGATTTGGTTA
CTTTTGATG

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 2

CO CL4959Contig1 1114 2 10 U
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CTTGACACTGGATCAGACAACAAATATTGCATATGGTGAGGCTTCTGTTATGTCAAGAAG
ACCACGCAGGACTTCCTCAGCTCGAGTAAGGCCTATGTTACTCAGTCAGACATCTCATGA
GTGTCTTGTAACATCAACACGTTCAGATAGGACTTCTCCAGCCCGTGTAATGCCATCAAA
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TAGCTCATCTCAAATGCTGGCTACACCCACTGAGATTGATCAGGTGGTTGATATGGCTCA
GGATGAGGCACATGTATCACAAACTGATAGTGATATCACTGAGAATCTAATGCGAACTCA
TGATGAGTTCTTAAGTATTCAATCTAGATTGACAAAATTACAAATTGTTAGGCATTTTTG
GGAACGTAGCGATGTTAAAGGCGCAATAGGGGCTTTGAGAAAGCTGACAGATCAGTCTGT
TCAAGCAGATGTGATCAGTATTTTAACAGACAAGATAGAGATTCTCACATTGGATATGTT
CTCTCAGTTGGTCCCTGTCCTCACAAGCTTATTGGGTAGCAGGACAGAGAGGCCTGTGAA
TGTCTCCTTGGACATGCTCTTGAAGCTTGTAGCAGTGTTCGGTACAGTTATGCGCTCAAC
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AGGCGGTCTAATATCAAGAAAGGCTCAGGAACTAAACCTTGTTCTTCAACAGACATAGCC
ACATGCAAAACAAACCATGCTCATGGAGCTGCTCCGCAAGTTCTTGTAACTGTAATTTGC
AAAGAAACGTCTTGTGTCTCTCACGGAACTTTATAGTATCTGCGGATTCGTAGAGAAAGG
AAATATTTAACCTCTAGAAGAAATACTTGGAAACTAATTTGGTATATGGTTGTAAATCAA
ATCATATATTTGGCATGAGTAGCTTCAATTCTGG


BQ
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AF RS1DS42TF U 1
AF RS1DS42JQ C 298
BS 1 642 RS1DS42TF
BS 643 643 RS1DS42JQ
BS 644 718 RS1DS42TF
BS 719 719 RS1DS42JQ
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BS 786 806 RS1DS42TF
BS 807 1114 RS1DS42JQ

RD RS1DS42TF 814 0 0
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CTTGACACTGGATCAGACAACAAATATTGCATATGGTGAGGCTTCTGTTATGTCAAGAAG
ACCACGCAGGACTTCCTCAGCTCGAGTAAGGCCTATGTTACTCAGTCAGACATCTCATGA
GTGTCTTGTAACATCAACACGTTCAGATAGGACTTCTCCAGCCCGTGTAATGCCATCAAA
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GGATGAGGCACATGTATCACAAACTGATAGTGATATCACTGAGAATCTAATGCGAACTCA
TGATGAGTTCTTAAGTATTCAATCTAGATTGACAAAATTACAAATTGTTAGGCATTTTTG
GGAACGTAGCGATGTTAAAGGCGCAATAGGGGCTTTGAGAAAGCTGACAGATCAGTCTGT
TCAAGCAGATGTGATCAGTATTTTAACAGACAAGATAGAGATTCTCACATTGGATATGTT
CTCTCAGTTGGTCCCTGTCCTCACAAGCTTATTGGGTAGCAG*ACAGAGAGGCCTGTGAA
TGTCTCCTTGGACATGCTCTTGAAGCTTGTAGCAGTGTTCGGTACAGTTATGCGCTCA*C
TATCTCAGCTCCACGGATAGTTGGCGTTGATCTTCATGCGGATGAAAGGATACAA*TCTG
CCA**GTTGTTCTGCGGGACTGCACA
GATTCAAA

QA 1 806 1 806
DS 

RD RS1DS42JQ 817 0 0
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TCAGGATGAGGCACATGTATCACAAACTGATAGTGATATCACTGAGAATCTAATGCGAAC
TCATGATGAGTTCTTAAGTATTCAATCTAGATTGACAAAATTACAAATTGTTAGGCATTT
TTGGGAACGTAGCGATGTTAAAGGCGCAATAGGGGCTTTGAGAAAGCTGACAGATCAGTC
TGTTCAAGCAGATGTGATCAGTATTTTAACAGACAAGATAGAGATTCTCACATTGGATAT
GTTCTCTCAGTTGGTCCCTGTCCTCACAAGCTTATTGGGTAGCAGGACAGAGAGGCCTGT
GAATGTCTCCTTGGACATGCTCTTGAAGCTTGTAGCAGTGTTCGGTACAGTTATGCGCTC
AACTATCTCAGCTCCACGGATAGTTGGCGTTGATCTTCATGCGGATGAAAGGATACAAAT
CTGCCAAGTTTGTTCTGCGGGACTGCACAAGATTCAAAGGATTCTTCCAATTCTCGCTAG
AAGAGGCGGTCTAATATCAAGAAAGGCTCAGGAACTAAACCTTGTTCTTCAACAGACATA
GCCACATGCAAAACAAACCATGCTCATGGAGCTGCTCCGCAAGTTCTTGTAACTGTAATT
TGCAAAGAAACGTCTTGTGTCTCTCACGGAACTTTATAGTATCTGCGGATTCGTAGAGAA
AGGAAATATTTAACCTCTAGAAGAAATACTTGGAAACTAATTTGGTATATGGTTGTAAAT
CAAATCATATATTTGGCATGAGTAGCTTCAATTCTGG

QA 1 817 1 817
DS 



AS 1 2

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ATTACTAAAGCCTCTGTACGGATTTTGGTTGGGGGAAGAAAGGTAAAAATCTACAAGCTA
GCAGTAGCCTCTTCAAGGCTCTGAACTCCTTCCCCTTCTTCTTCTTCATCTGCTGCAGAG
ATTAGAGATGCGGACTGAATCTTTCCGGCATGATCAAGTCTCATGAAAATCACTCCCCGT
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CTCACTAAAACCACTTGTTCATCGCTTTCTCCATCCTCAGCTAGGGAGTAACCAACCACG
AAGACAGCGGCTAAACGATCATCCTCGGCGAATTTGGATCAACCAGGTATGATGTCCATG
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AGTGTTCGAACACCATCACATGTACTCAGGACAACCATTCCGTTTTGGGACGCCATGGCC
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ATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 

AF RS1DW28JQ U 182
AF RS1DW28TF C 1
BS 1 185 RS1DW28TF
BS 186 679 RS1DW28JQ
BS 680 723 RS1DW28TF

RD RS1DW28JQ 498 0 0
TTAA
AGATGCGGACTGAATCTTTCCGGCATGATCAAGTCTCATGAAAATCACTCCCCGTGCACG
GCGTGACTGGATGGAGATGTCCCTGACTTTGATCCTGTTCACTGTTCCGCTTTGGCTCAC
TAAAACCACTTGTTCATCGCTTTCTCCATCCTCAGCTAGGGAGTAACCAACCACGAAGAC
AGCGGCTAAACGATCATCCTCGGCGAATTTGGATCAACCAGGTATGATGTCCATGCTCGC
CATCTTATCCGCATTCTTGAGTCTCATGGCAGTCACTCCCTTTGTGTTTCTGCTCAGTGT
TCGAACACCATCACATGTACTCAGGACAACCATTCCGTTTTGGGACGCCATGGCCACAAG
ATCATCGCTTGAGCAACAACGAACCCATTTCAACTCATCACCAGAATTCAATTGAATTGC
TATGATTCCAGTTGATCGTATCCCTGAGAATAGCTTCAAAGGTACTTTCTTGATGCAGCC
ATTCACAGTAAGCA

QA 5 498 5 498
DS 

RD RS1DW28TF 723 0 0
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ATTACTAAAGCCTCTGTACGGATTTTGGTTGGGGGAAGAAAGGTAAAAATCTACAAGCTA
GCAGTAGCCTCTTCAAGGCTCTGAACTCCTTCCCCTTCTTCTTCTTCATCTGCTGCAGAG
ATTAGAGATGCGGACTGAATCTTTCCGGCATGATCAAGTCTCATGAGAATCACTCCCCGT
GCACGGCGTGACTGGATGGAGATGTCCCTGACTTTGATCCTGTTCACTGTTCCGCTTTGG
CTCACTAGAACCACTTGTTCATCGCTTTCTCCATCCTCAGCTAGGGAGTAACCAACCACG
AAGACAGCGGCTAAACGATCATCCTCGGCGAATTTGGATCAACCAGGTATGATGTCCATG
CTCGCCATCTTATCCGCATTCTTGAGTCTCATGGCAGTCACTCCCTTTGTGTTTCTGCTC
AGTGTTCGAACACCATCACATGTACTCAGGACAACCATTCCGTTTTGGGACGCCATGGCC
ACAAGATCATCGCTTGAGCAACAACGAACCCATTTCAACTCATCACCAGAATTCAATTGA
ATTGCTATGATTCCAGTTGATCGTATCCCTGAGAATAGCTTCAAAGGTACTTTCTTGATG
CAGCCATTCACAGTAAGCATCAGGAGATACTGGTCTTCTGAAAACTCGCTAACAGGAACG
ATC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

CO CL4961Contig1 509 2 2 U
GGGTCTTACACTGATCTATTTCCGCTGCTTATATCAAACGTCTAACGTCTTATCATCATG
GGTTTGAAGGAGGACTTCGAAGAGCATGCTGAGAAAGTCAAGAAGCTCACAACGAGCCCC
CGAACGAGGACTTGCTCATCCTCTACGGACTCTACAAGCAAGCCACTGTCGGACCAGTCA
CCACCAGTCGTCCTGGAATGTTCAGCATGAAGGAAAGAGTCAAGTGGGATGCTTGGAAGG
CTGTTGAAGGTAAATCGACTGACGAAGCTATGAGTGACTACATCACTAAGGTGAAGCAAC
TCCTTGAAGCAGAGGCTGCCTCGGCTTCAACTTGATGAATATCTCTACATAAATGATTCG
TCCTCTGTCTGCAGTAGTTCTATATCTAAGCTTTAAATAACTTTAGCATAAGACTTGTTT
CTTCTTACTTTTTGTGTTCCTATCGTTTATGAATCTGTTATTTTACTTTGTGAACTTGAT
CTCGATTTGAAATGTCATATGGTTTGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CR77JQ C 1
AF RS1CR77TF U 18
BS 1 17 RS1CR77JQ
BS 18 509 RS1CR77TF

RD RS1CR77JQ 509 0 0
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GGTTTGAAGGAGGACTTCGAAGAGCATGCTGAGAAAGTCAAGAAGCTCACAACGAGCCCC
CGAACGAGGACTTGCTCATCCTTTACGGACTCTACAAGCAAGCCACTGTCGGACCAGTCA
CCACCAGTCGTCCTGGAATGTTCAGCATGAAGGAAAGAGTCAAGTGGGATGCTTGGAAGG
CTGTTGAAGGTAAATCGACTGACGAAGCTATGAGTGACTACATCACTAAGGTGAAGCAAC
TCCTTGAAGCAGAGGCTGCCTCGGCTTCAACTTGATGAATATCTCTACATAAATGATTCG
TCCTCTGTCTGCAGTAGTTCTATATTTAAGCTTTAAATAACTTTAGCATAAGACTTGTTT
CTTCTTACTTTTTGTGTTCCTATCGTTTATGAATCTGTTATTTTACTTTGTGAACTTGAT
CTCGATTTGAAATGTCATATGGTTTGGAC

QA 1 509 1 509
DS 

RD RS1CR77TF 492 0 0
ATTTCCGCTGCTTATATCAAACGTCTAACGTCTTATCATCATGGGTTTGAAGGAGGACTT
CGAAGAGCATGCTGAGAAAGTCAAGAAGCTCACAACGAGCCCCCGAACGAGGACTTGCTC
ATCCTCTACGGACTCTACAAGCAAGCCACTGTCGGACCAGTCACCACCAGTCGTCCTGGA
ATGTTCAGCATGAAGGAAAGAGTCAAGTGGGATGCTTGGAAGGCTGTTGAAGGTAAATCG
ACTGACGAAGCTATGAGTGACTACATCACTAAGGTGAAGCAACTCCTTGAAGCAGAGGCT
GCCTCGGCTTCAACTTGATGAATATCTCTACATAAATGATTCGTCCTCTGTCTGCAGTAG
TTCTATATCTAAGCTTTAAATAACTTTAGCATAAGACTTGTTTCTTCTTACTTTTTGTGT
TCCTATCGTTTATGAATCTGTTATTTTACTTTGTGAACTTGATCTCGATTTGAAATGTCA
TATGGTTTGGAC

QA 1 492 1 492
DS 



AS 1 2

CO CL4962Contig1 693 2 3 U
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CAAGAAAAAAAACACTCTCATGGCTACTAAATTCATCATCCTCGCTCAAGTCCACCGCTC
CAAAATCTCAATTACAACCCTAAAACCTCGTAAATGCAACAAAAACAAGCCCCGACCATC
CAAATCCATAACCGATAGCATGTTCAACAATGCTTGTCCTGGCAAAACGCTTACTGAAAT
TTATCATAATAACCTTAAGAACTTATCCCCTCTAGCTAATTCAGTATTGTTTACGTAAGA
TCAGCCAGTTAAAGAAGAGCAGATGAGTCAACAAGAACATGCGAAGCTGTGCAACCTCAA
CCGCAAAGACGGTAAGTCGGTAATCACAACAGAATATGGAGATTTGAGACGTGAAGTTGC
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GTTTTACAATGAGTTTTCTTGTGATGCTTGTGTTGGGAGTAGCACTATGGTTGTAGTCGA
TCCATATTTTTCTGTTCCGGTTTTACCTTTCAATAGTTAACTAATATCATCATGTCTACG
GGGTGGAAAAAGTTGTATTAAAATTAGTAACTTCGTTGTGTTGTAATGTGTTGAAAAGTC
TTGATATGTGTAATGAAAAACGTCAGTTTATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BW03TF U 29
AF RS1BW03JQ C 1
BS 1 28 RS1BW03JQ
BS 29 519 RS1BW03TF
BS 520 693 RS1BW03JQ

RD RS1BW03TF 491 0 0
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AAATTCATCATCCTCGCTCAAGTCCACCGCTCCAAAATCTCAATTACAACCCTAAAACCT
CGTAAATGCAACAAAAACAAGCCCCGACCATCCAAATCCATAACCGATAGCATGTTCAAC
AATGCTTGTCCTGGCAAAACGCTTACTGAAATTTATCATAATAACCTTAAGAACTTATCC
CCTCTAGCTAATTCAGTATTGTTTACGTAAGATCAGCCAGTTAAAGAAGAGCAGATGAGT
CAACAAGAACATGCGAAGCTGTGCAACCTCAACCGCAAAGACGGTAAGTCGGTAATCACA
ACAGAATATGGAGATTTGAGACGTGAAGTTGCTCAATTAAGCTTGTTTTGGTACATGAAA
TGTTCCAGCTATATATTAAGGAAGGCAAGAGCGTTTTACAATGAGTTTTCTTGTGATGCT
TGTGTTGGGAG

QA 1 491 1 491
DS 

RD RS1BW03JQ 693 0 0
GGAATTCAACACCAATCACTTCATACCATTGGCAAGCACACTCAACAGCCTCATACTTAT
CAAGAAAAAAAACACTCTCATGGCTACTAAATTCATCATCCTCGCTCAAGTCCACCGCTC
CAAAATTTCAATTACAACCCTAAAACCTCGTAAATGCAACAAAAACAAGCCCCGACCATC
CAAATCCATAACCGATAGCATGTTCAACAATGCTTGTCCTGGCAAAACGCTTACTGAAAT
TTATCATAATAACCTTAAGAACTTATCCCCTCTAGCTAATTCAGTATTGTTTACGTAAGA
TCAGCCAGTTAAAGAAGAGCAGATGAGTCAACAAGAACATGCGAAGCTGTGCAACCTCAA
CCGCAAAGACGGTAAGTCGGTAATCACAACAGAATATGGAGATTTGAGACGTGAAGTTGC
TCAATTAAGCTTGTTTTGGTACATGAAATGTTCCAGCTATATATTAAGGAAGGCAAGAGC
GTTTTACAATGAGTTTTCTTGTGATGCTTGTGTTGGGAGTAGCACTATGGTTGTAGTCGA
TCCATATTTTTCTGTTCCGGTTTTACCTTTCAATAGTTAACTAATATCATCATGTCTACG
GGGTGGAAAAAGTTGTATTAAAATTAGTAACTTCGTTGTGTTGTAATGTGTTGAAAAGTC
TTGATATGTGTAATGAAAAACGTCAGTTTATGG

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

CO CL4963Contig1 648 2 5 U
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TGTGGAAGATCTATGGGATGAGCAGAAACCACAGCCCAGCCCTAACGAGAAGCTCAACGC
ATGTTTCGAGAGCATCCCTGTCTCTGCTTTCCCTCTCTCCTCTGATTCACAAGACATCGA
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GAGCGCTCCTGTTGTAGATGTTGACGCTCCTGAAGACGCCAGCTGGATTGACCGCTACAT
CGGTATTGTGGAGTTTCCAGGCATTGTTGTCTGGCTTTTGCATCAGTTGGACCCAACATC
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TCCTGGATAACGGAGATTCAGCTGTAACTTCTGGAAACTTCTTTGAGGTCCTTACTTCTT
CAGAGCTATACAAGAACACCAAAGTTCGAGATATCTCTGGAACATTCAGATGGGCACCTT
TCCTTGCTCTGCAGAAAGAGAACTCCTTTTTAACCATGCTGTTACTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1C193TF U 50
AF RS1CZ36TF U 1
BS 1 155 RS1CZ36TF
BS 156 156 RS1C193TF
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BS 433 433 RS1C193TF
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RD RS1C193TF 512 0 0
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CTAGGGATGCGTGTGGAAGATCTATGGGATGAGCAGAAACCACAGCCCAGCCCTAACGAG
AGGCTCAACGCATGTTTCGAGAGCATCCCTGTCTCTGCTTTCCCTCTCTCCTCTGATTCA
CAAGACATCGAGTTGAGATCATTCACAAGCTTGGCTGAAGCTGTTGAGACACTGTCGAAA
CTCAAGGTGTTGAGCGCTCCTGTTGTAGATGTTGACGCTCCTGAAGACGCCAGCTGGATT
GACCGCTACATCGGTATTGTGGAGTTTCCAGGCATTGTTGTCTGGCTTTTGCATCAGTTG
GACCCAACATCTCCAAGGAGCCCCTGCTGTTGCAGGTTCAAATGGAGTTTCTCATGACTT
CACCGCCGATATCCTGGATAACGGAGATTCAGCTGTAACTTCTGGAAACTTCTTTGAGGT
CCTTACTTCTTCAGAGCTATACAAGAACACCA

QA 1 512 1 512
DS 

RD RS1CZ36TF 648 0 0
GGGAGATAAAAAGACTGTGTGGGAAAAGATGGCGAGTGTGCCGGAGATAAAGATAGTGAG
GAGCGAGAGCTTAGGGCATCGAAGTGAGGTGTCGAGCCCGGAAGCTAAGCTAGGGATGCG
TGTGGAAGATCTATGGGATGAGCAGAAACCACAGCTCAGCCCTAACGAGAAGCTCAACGC
ATGTTTCGAGAGCATCCCTGTCTCTGCTTTCCCTCTCTCCTCTGATTCACAAGACATCGA
GTTGAGATCAGACACAAGCCTGGCTGAAGCTGTTGAGACACTGTCGAAACTCAAGGTGTT
GAGCGCTCCTGTTGTAGATGTTGACGCTCCTGAAGACGCCAGCTGGATTGACCGCTACAT
CGGTATTGTGGAGTTTCCAGGCATTGTTGTCTGGCTTTTGCATCAGTTGGACCCAACATC
TCCAAGGAGCCC*TGCTGTTGCAGGTTCAAATGGAGTTTCTCATGACTTCACCGCCGATA
TCCTGGATAACGGAGATTCAGCTGTAACTTCTGGAAACTTCTTTGAGGTCCTTACTTCTT
CAGAGCTATACAAGAACACCAAAGTTCGAGATATCTCTGGAACATTCAGATGGGCACCTT
TCCTTGCTCTGCAGAAAGAGAACTCCTTTTTAACCATGCTGTTACTTC

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 2

CO CL4964Contig1 959 2 2 U
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GAGGAGAAGGTTAGGGAAGTAGATGAGGTTAAGAGAGAGATGAAGGGGCTTTCGGTGGAG
AAGATGGAGGTGGAGATGGTTAACCGTGACCAGAAGGAAATGATGGTGAAGTTGGAGAGA
AAGGTGGAGAGTTTGACAAGGGAAGAGAAGGGTTTACGTGATCAGGTTGTAGGGTTGGAG
AAGAGTCTTGACGAGGTTAGGGAGGAAGCAAAAGCAAAGGAGGAGAGGATCATTGCGCTG
GCGAAAGAGAAATCTATCAAGGTTTCTGAGCTTGAGGGTTTACTGGTGGAGAATGTTTCG
ATCAAGAAACAGATGGAGATGGCTCTGGTGCAAGCTTCTGAGAAGGAGAAACTGGCGGAC
CAAATTGCGCGCGAGAAGGTTGATCTTTTGGAGCATATTAGTAAGCAGGAAGCTAAGTTT
GATGAGATGAGTAAACTAGCGGATGAGCAAAAGCGTGTTGTGGTGCAACTGCGGAATGAT
TATAATGATCAGATCAAGACTAGTGAGAAGTTTAGCTGCAATGTTAGCCAACTTAAGGAT
GCTCTGGACTTGGCTAAGGTCGATAGAAACAACGCCGGGAAGGCTCTTGACGAGGAGAAG
AAGAGTGGGTTGGCTCTTAAGGAAAAGGTTGCAGAGCTAGAGAAAACGATTCAAGCGTCT
GGTAAAGAGCTTGAGAAGATCAAGGCTGAGCGAGGGAGATTGATTAAAGAGAAGAAGGAA
CTGGAGAACCGTTCTGAGTCGTTGAGAAAGGAAAAGGGTATCCTCCAAAAGGATCTCGTG
GAGCTCAAAAAAGATATGGGTGTGTTAAAAACTGAGCTAGAATCTTCTGGAACAAATGCC
AAACTTGGTCTAACAATGCTAAAGACTGTGTCCTCTCTAGTATGTGGACAAGACAACAA


BQ
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AF RS1A937TF U 1
AF RS1A937JQ C 128
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BS 615 959 RS1A937JQ

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GAGGAGAAGGTTAGGGAAGTAGATGAGGTTAAGAGAGAGATGAAGGGGCTTTCGGTGGAG
AAGATGGAGGTGGAGATGGTTAACCGTGACCAGAAGGAAATGATGGTGAAGTTGGAGAGA
AAGGTGGAGAGTTTGACAAGGGAAGAGAAGGGTTTACGTGATCAGGTTGTAGGGTTGGAG
AAGAGTCTTGACGAGGTTAGGGAGGAAGCAAAAGCAAAGGAGGAGAGGATCATTGCGCTG
GCGAAAGAGAAATCTATCAAGGTTTCTGAGCTTGAGGGTTTACTGGTGGAGAATGTTTCG
ATCAAGAAACAGATGGAGATGGCTCTGGTGCAAGCTTCTGAGAAGGAGAAACTGGCGGAC
CAAATTGCGCGCGAGAAGGTTGATCTTTTGGAGCATATTAGTAAGCAGGAAGCTAAGTTT
GATGAGATGAGTAAACTAGCGGATGAGCAAAAGCGTGTTGTGGTGCAACTGCGGAATGAT
TATAATGATCAGATCAAGACTAGTGAGAAGTTTAGCTGCAATGTTAGCCAACTTAAGGAT
GCTCTGGACTTGGC

QA 1 614 1 614
DS 

RD RS1A937JQ 832 0 0
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AGAGTTTGACAAGGGAAGAGAAGGGTTTACGTGATCAGGTTGTAGGGTTGGAGAAGAGTC
TTGACGAGGTTAGGGAGGAAGCAAAAGCAAAGGAGGAGAGGATCATTGCGCTGGCGAAAG
AGAAATCTATCAAGGTTTCTGAGCTTGAGGGTTTACTGGTGGAGAATGTTTCGATCAAGA
AACAGATGGAGATGGCTCTGGTGCAAGCTTCTGAGAAGGAGAAACTGGCGGACCAAATTG
CGCGCGAGAAGGTTGATCTTTTGGAGCATATTAGTAAGCAGGAAGCTAAGTTTGATGAGA
TGAGTAAACTAGCGGATGAGCAAAAGCGTGTTGTGGTGCAACTGCGGAATGATTATAATG
ATCAGATCAAGACTAGTGAGAAGTTTAGCTGCAATGTTAGCCAACTTAAGGATGCTCTGG
ACTTGGCTAAGGTCGATAGAAACAACGCCGGGAAGGCTCTTGACGAGGAGAAGAAGAGTG
GGTTGGCTCTTAAGGAAAAGGTTGCAGAGCTAGAGAAAACGATTCAAGCGTCTGGTAAAG
AGCTTGAGAAGATCAAGGCTGAGCGAGGGAGATTGATTAAAGAGAAGAAGGAACTGGAGA
ACCGTTCTGAGTCGTTGAGAAAGGAAAAGGGTATCCTCCAAAAGGATCTCGTGGAGCTCA
AAAAAGATATGGGTGTGTTAAAAACTGAGCTAGAATCTTCTGGAACAAATGCCAAACTTG
GTCTAACAATGCTAAAGACTGTGTCCTCTCTAGTATGTGGACAAGACAACAA

QA 1 832 1 832
DS 



AS 1 2

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CTTGTCCATTTCACTCTACCTACCGGAGACACCCACATCACCGAGAGAAAATCCTTAGAA
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CCTGAACCAGAAGATTGCCCTCCTCCACCACCTCCTCCTCCATAACCTCCTCCACCACCT
CCTCCTACAATCCCTCCTCCACCACATTTCCCAAAATCACCACAACCTCCACCTCCCAAA
CCACCGCATTCACGGCATAGAGGACGTAAATCGCCGCCTAAGCTGCCGGGGCAGCCACCG
TTGCCGCTACTTGGCTTTGAGAGCCCACTACTAGAGAAAGTGTACCCAGTCCTCAAAGCT
TTTCAGAAACTAGTGACAGACGATCCAAAGCATATTCTTAAAACTTGGAATGGCACCGAC
ATTTGCAACAAGTACAAATATCTCGGACTTGAATGCGCAATATTCCCGAATACATCTAAT
AAGGCACTCGCGAGCATTCAGTTTAACGGTTATAACTTTGGTGGCGATAAACTCGTGTTA
CATGACTTCCTCGACAAGCTAGACACAGTCACGATCTTTCACGCAAACTCCAACAACTTC


BQ
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AF RS1E045TF U 1
AF RS1E311TF U 1
BS 1 136 RS1E045TF
BS 137 660 RS1E311TF

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ATCATCATTGGAGGCG

QA 1 136 1 136
DS 

RD RS1E311TF 660 0 0
GGACCTCATCATTTCTTCAAACCAATGGCTTCACTTCTCCTTCTCCTCCTTTCACTCTCA
CTTGTCCATTTCACTCTACCTACCGGAGACACCCACATCACCGAGAGAAAATCCTTAGAA
ATCATCATTGGAGGCGGTGGCAATCCACCGCCGTCGCCTTCACCGGAACCGGAACCTGAA
CCTGAACCAGAAGATTGCCCTCCTCCACCACCTCCTCCTCCATAACCTCCTCCACCACCT
CCTCCTACAATCCCTCCTCCACCACATTTCCCAAAATCACCACAACCTCCACCTCCCAAA
CCACCGCATTCACGGCATAGAGGACGTAAATCGCCGCCTAAGCTGCCGGGGCAGCCACCG
TTGCCGCTACTTGGCTTTGAGAGCCCACTACTAGAGAAAGTGTACCCAGTCCTCAAAGCT
TTTCAGAAACTAGTGACAGACGATCCAAAGCATATTCTTAAAACTTGGAATGGCACCGAC
ATTTGCAACAAGTACAAATATCTCGGACTTGAATGCGCAATATTCCCGAATACATCTAAT
AAGGCACTCGCGAGCATTCAGTTTAACGGTTATAACTTTGGTGGCGATAAACTCGTGTTA
CATGACTTCCTCGACAAGCTAGACACAGTCACGATCTTTCACGCAAACTCCAACAACTTC

QA 1 660 1 660
DS 



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CO CL4966Contig1 497 2 4 U
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GACTACAACATCAAACGATAATGACAACAAAAGCAAAACCAATTTACAAAGACAGAATGA
CAAATCCCATTTTATCACTCTTCTCTCTATCTGAATGTTCACTTAACTTCTCGGCCAATC
ACGTAACGCCGTGTCACAACCAAATCCAAACCCACGTCAGCGTGAGTCACCAAGACCCTA
GCAAGACCAATGTGATGACGCTGAAAAGTAAGAAGTGGACCACATGGTACGGGTGCTGAA
TTAAAGTTGATGAGCCGTTAGAGAATTCGGAAGAGTCAACAGCTAAAGGCATGCCGTCAC
CGCCGAAAGCACATGACCGTGGCTCGCCGTTTTGGTTGAGCATGACGGCTCGGAGGACTG
AAGTGACAGTGGGGAAGTAAGCCGTACGGTTCTTAGCGAGAAGCCAAGTGAGACCCATGA
GAACACAGTCTTTGTTC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1F659TF C 1
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RD RS1F659TF 497 0 0
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GAACACAGTCTTTGTTC

QA 1 497 1 497
DS 

RD RS1F659JQ 496 0 0
G
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CTACCACATCAAACGATAATGACAACAAAAGCAAAACCAATTTACAAAGACAGAATGACA
AATCCCATTTTATCACTCTTCTCTCTATCTGAATGTTCACTTAACTTCTCGGCCAATCAC
GTAACGCCGTGTCACAACCAAATCCAAACCCACGTCAGCGTGAGTCACCAAGACCCTAGC
AAGACCAATGTGATGACGCTGAAAAGTAAGAAGTGGACCACATGGTACGGGTGCTGAATT
AAAGTTGATGAGCCGTTAGAGAATTCGGAAGAGTCAACAGCTAAAGGCATGCCGTCACCG
CCGAAAGCACATGACCGTGGCTCGCCGTTTTGGTTGAGCATGACGGCTCGGAGGACTGAA
GTGACAGTGGGGAAGTAAGCCGTACGGTTCTTAGCGAGAAGCCAAGTGAGACCCATGAGA
ACACAGTCTTTGTTC

QA 2 496 2 496
DS 



AS 1 2

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GGCAAGTGGGACTGAGGCATTTGCTTATTGTTCCCAAGATTCAAGCCTCAGGAATGTCTC
CTGTGGTAGGGATCTTAACCAGGCAAGATCTAAGGGCATACAACATTCTACAAGCTTTTC
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TACCTGTGTTTGTAAAATTTGTCTTTGCAGCCATGTTGTTTCCTTCCCATTCTTGAAGTC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1H062TF U 1
AF RS1H062JQB C 158
BS 1 648 RS1H062TF
BS 649 650 RS1H062JQB

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TACCTGTGTTTGTAAAATTTGTCTTTGCAGCCATGTTGTTTCCTTCCCATTCTTGAAGTC
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QA 1 648 1 648
DS 

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QA 1 493 1 493
DS 



AS 1 2

CO CL4968Contig1 982 2 2 U
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AGATCAAACTGGTGTGTCCTTTTTTTGTCTTGTACTTGTAATGATACACGTTAATATAGT
ATCGATCGGAGGATTGTCGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GS65TF U 1
AF RS1GS65JQ C 221
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BS 691 982 RS1GS65JQ

RD RS1GS65TF 690 0 0
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AAACAGTAGTGACGACAAAGAGCGTGAAATACATGCCGTTTTGGTTGTCGTTTTTCCTCT
TCTTAAACGGCGCGATCTGGGCAGTGTATGCTTCACTCCAACACGACGTTTTTCTACTTG
TGCCAAATGGAGTGGGGTTTGTGTTTGGGACAATACAACTCATACTTTATGGAATTTACA
GAAACGCCAAACCGGCCGTTTAAGCTCAAG

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1GS65JQ 762 0 0
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GCTTTTTCTCATTTATGTCCCTCGACATCTCAAGTTAAATACAATCGTAGTGGTTGCGTT
GTTGAACGTCTTTTTCCCAGTAGTAGCGATTGCTGCCACGAGAAGTGAGTTTCAAGATGA
GAAAATGCGTTCTCAATCGATGGGGTTCATCTGTGCTGGCCTCAACATTGTAATGTATGG
TTCTCCTCTTTCTGCTATGAAAACAGTAGTGACGACAAAGAGCGTGAAATACATGCCGTT
TTGGTTGTCGTTTTTCCTCTTCTTAAACGGCGCGATCTGGGCAGTGTATGCTTCACTCCA
ACACGACGTTTTTCTACTTGTGCCAAATGGAGTGGGGTTTGTGTTTGGGACAATACAACT
CATACTTTATGGAATTTACAGAAACGCCAAACCGGCCGTTTAAGCTCAAGTAAGATTGCT
GCAGATGAAGAGGAAGGCCTCACAGCACGTGCCCCTCTCCTTTCTTAAACCTATTTTATA
AAAAATTATAAGATACTTTCTTTTAGTTTTTTGGGGAGTGTTTGTGTTGATTTTCTTTTA
TAAATAAAATCTTTTTATCATTTCTTTGCCATTATTGTGGTGTACGATTTTTTGTGTCCC
TTGTTTTTTTGAAGCAAATTAGATCAAACTGGTGTGTCCTTTTTTTGTCTTGTACTTGTA
ATGATACACGTTAATATAGTATCGATCGGAGGATTGTCGGCC

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL4969Contig1 589 2 1 U
GGTCAAGCTCTGAGTAACGAGAACTCTGCGTCGACTAGTAGTAATACTCCTCCTCCTTCC
ACGAATTCGCCGCGGGATTCTGATGATACTTCGTCGTCTCCGATGGGGTCTCTCCTTGCA
GAAGCTGCAGCATTTGGGGAAGGTGACAATGAGAATGAGTCGCTTGAAGTCAAGGCACAA
AAAGCACTCGATTGTCCTTGCATTGCAGATCTGCGTAATGGATCCTGCGGGTCTCAGTTC
ACCGAGGCTTTCCGTTGCTTTCTCATAAGCACTGCTGAAGAAAAGGGATCAGACTGTGTT
CATCCATTCGTTGCATTGCAAAGCTGTATCAAAGCCAACCCAAACGCATTCTCTATCCAC
AGCAATGGAAAGCCTATTTTTTCTCCCTTCCTTCTCCTACGAACAACAAACTGAAGAAGT
AAAAGAAGCCATTGTGTAAACACGTTTGGTTCTTAGTTTACATTCTCTCGTGTATTGATC
CAAAACGAATCGCTTATTCGGAAGCTTAACCGTTTGGTTTAATTCAAATAGCCGACCGGT
TTGGATTGAGACTTTAATTAGAAGTTTAATAAAATGCTTTAGTTTTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BN05TF U 1
AF RS1BN05JQ C 99
BS 1 589 RS1BN05TF

RD RS1BN05TF 589 0 0
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ACGAATTCGCCGCGGGATTCTGATGATACTTCGTCGTCTCCGATGGGGTCTCTCCTTGCA
GAAGCTGCAGCATTTGGGGAAGGTGACAATGAGAATGAGTCGCTTGAAGTCAAGGCACAA
AAAGCACTCGATTGTCCTTGCATTGCAGATCTGCGTAATGGATCCTGCGGGTCTCAGTTC
ACCGAGGCTTTCCGTTGCTTTCTCATAAGCACTGCTGAAGAAAAGGGATCAGACTGTGTT
CATCCATTCGTTGCATTGCAAAGCTGTATCAAAGCCAACCCAAACGCATTCTCTATCCAC
AGCAATGGAAAGCCTATTTTTTCTCCCTTCCTTCTCCTACGAACAACAAACTGAAGAAGT
AAAAGAAGCCATTGTGTAAACACGTTTGGTTCTTAGTTTACATTCTCTCGTGTATTGATC
CAAAACGAATCGCTTATTCGGAAGCTTAACCGTTTGGTTTAATTCAAATAGCCGACCGGT
TTGGATTGAGACTTTAATTAGAAGTTTAATAAAATGCTTTAGTTTTCGC

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1BN05JQ 491 0 0
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GTCGCTTGAAGTCAAGGCACAAAAAGCACTCGATTGTCCTTGCATTGCAGATCTGCGTAA
TGGATCCTGCGGGTCTCAGTTCACCGAGGCTTTCCGTTGCTTTTTCATAAGCACTGCTGA
AGAAAAGGGATCAGACTGTGTTCATCCATTCGTTGCATTGCAAAGCTGTATCAAAGCCAA
CCCAAACGCATTCTCTATCCACAGCAATGGAAAGCCTATTTTTTCTCCCTTCCTTCTCCT
ACGAACAACAAACTGAAGAAGTAAAAGAAGCCATTGTGTAAACACGTTTGGTTCTTAGTT
TACATTCTCTCGTGTATTGATCCAAAACGAATCGCTTATTCGGAAGCTTAACCGTTTGGT
TTAATTCAAATAGCCGACCGGTTTGGATTGAGACTTTAATTAGAAGTTTAATAAAATGCT
TTAGTTTTCGC

QA 1 491 1 491
DS 



AS 1 2

CO CL4970Contig1 1206 2 6 U
GGGCTCTCACTATTAACACTTCTCTCTCTCTCTCTATCTCTTTTGTGGACAGTCTTTCTT
CTCTCGAGCTTGGAATTTCAAAGATCCTTGTAACATGGAGTACTCGATCAAGGATGATGT
GACTCAACTGATAGGTAACACTCCAATGGTGTACCTGAACAACATTGTAGATGGTTGTGT
TGCACGTATCGCGGCTAAGCTCGAGATGATGCAGCCTTGCTCTAGTGTCAAGGACAGAAT
TGCTTATGGTATGATTAAAGATGCAGAAGACAAGGGTTTGATTACTCCCGGAAAGAGCAT
ATTGATTGAGCCAACATCGGGTAACACCGGGATTGGTATAGCAATGGTTGGGGCAGCTAG
AGGTTACAAAGTTGTGATTACACTGCCTGCATCAGTCAGCATTGAGAGAAGAATCATTCT
TCTAGCATTAGGTGCAGAGGTTCACCTCACAGATCCTAAAAAAGGCGTTATGGGAGTAAT
TGTCAAAGCTGAAGAGTTATTAAGCAAGACTCCAGATGGTCACATACTAGAGCAATTCAG
AAACCCTTCAAACCCACAATCTCATTACGAGGCCACTGGTCCAGAGATATGGAGAGACTC
TGCAGAGAAAGTAGATATATTGGTTGTTGGTGTTGGGGACTGGTAGAACGATCTCTGGAG
CAGGAAGTTCCTCAAGGAGAAGAATCAAGCCGTTAAGGTTTATGGAGTGGAACCTGCAGA
GAGTGCAGTACTCAGTGGAGGGCAACCTGGTCCACATGGGATCCAAGGTATAGGAGCTGG
ACTCATCCCAGACAATTTGGATTTCAGCGTTCTTGATGAAGTCATTCAAGTGACAAGTGT
GGAAGCTATTGAAACAGCCAAACTTCTTGCCCTGAAAGAAGGATTACTGGTTGGAATATC
ATCCGGAGCTGCTGCAGCCGCTGCGATAAAGGTTGCAAAACGACCAGAAAACGCAGGGAA
GCTCATAGTTGTGGTTTTCCCGAGTGGCGGGGAACGGTACTTGTCGACTCCGATGTTCGA
CTCGATCAGAAGTGAAGCGGAGAATTTGGCAATTGAATGAGAGAGACTTATCCACTGCTA
CTACTACGTAACTCGGTTCGGTTATGTAATAAAGTACCAAGATACCGGTTTTGTCATTTT
TGAGTTTTGACATACATTGAAAGTGTTGTTTGACTTGAAATGACATGACGTAATATTGTT
TTCAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1A591TF U 1
AF RS1A591JQ C 657
BS 1 697 RS1A591TF
BS 698 698 RS1A591JQ
BS 699 767 RS1A591TF
BS 768 768 RS1A591JQ
BS 769 835 RS1A591TF
BS 836 1206 RS1A591JQ

RD RS1A591TF 841 0 0
GGGCTCTCACTATTAACACTTCTCTCTCTCTCTCTATCTCTTTTGTGGACAGTCTTTCTT
CTCTCGAGCTTGGAATTTCAAAGATCCTTGTAACATGGAGTACTCGATCAAGGATGATGT
GACTCAACTGATAGGTAACACTCCAATGGTGTACCTGAACAACATTGTAGATGGTTGTGT
TGCACGTATCGCGGCTAAGCTCGAGATGATGCAGCCTTGCTCTAGTGTCAAGGACAGAAT
TGCTTATGGTATGATTAAAGATGCAGAAGACAAGGGTTTGATTACTCCCGGAAAGAGCAT
ATTGATTGAGCCAACATCGGGTAACACCGGGATTGGTATAGCAATGGTTGGGGCAGCTAG
AGGTTACAAAGTTGTGATTACACTGCCTGCATCAGTCAGCATTGAGAGAAGAATCATTCT
TCTAGCATTAGGTGCAGAGGTTCACCTCACAGATCCTAAAAAAGGCGTTATGGGAGTAAT
TGTCAAAGCTGAAGAGTTATTAAGCAAGACTCCAGATGGTCACATACTAGAGCAATTCAG
AAACCCTTCAAACCCACAATCTCATTACGAGGCCACTGGTCCAGAGATATGGAGAGACTC
TGCAGAGAAAGTAGATATATTGGTTGTTGGTGTTGGGGACTGGTAGAACGATCTCTGGAG
CAGGAAGTTCCTCAAGGAGAAGAATCAAGCCGTTAAG*TTTATGGAGTGGAACCTGCAGA
GAGTGCAGTACTCAGTGGAGGGCAACCTGGTCCACATGGGATCCAAG*TATAGGAGCTGG
ACTCATCCCAGACAATTTGGATTTCAGCGTTCTTGATGAAGTCATTCAAGTGACA
GTGTGG

QA 1 835 1 835
DS 

RD RS1A591JQ 550 0 0
GAGCAG
GGAAGTTCCTCAAGGAGAAGAATCAAGCCGTTAAGGTTTATGGAGTGGAACCTGCAGAGA
GTGCAGTACTCAGTGGAGGGCAACCTGGTCCACATGGGATCCAAGGTATAGGAGCTGGAC
TCATCCCAGACAATTTGGATTTCAGCGTTCTTGATGAAGTCATTCAAGTGACAAGTGTGG
AAGCTATTGAAACAGCCAAACTTCTTGCCCTGAAAGAAGGATTACTGGTTGGAATATCAT
CCGGAGCTGCTGCAGCCGCTGCGATAAAGGTTGCAAAACGACCAGAAAACGCAGGGAAGC
TCATAGTTGTGGTTTTCCCGAGTGGCGGGGAACGGTACTTGTCGACTCCGATGTTCGACT
CGATCAGAAGTGAAGCGGAGAATTTGGCAATTGAATGAGAGAGACTTATCCACTGCTACT
ACTACGTAACTCGGTTCGGTTATGTAATAAAGTACCAAGATACCGGTTTTGTCATTTTTG
AGTTTTGACATACATTGAAAGTGTTGTTTGACTTGAAATGACATGACGTAATATTGTTTT
CAAC

QA 7 550 7 550
DS 



AS 1 2

CO CL4971Contig1 513 2 3 U
GGGTATCATCCAAGTTTAAAGAAACAAACAAGTGTAAGAAAAAGGAAAGAAAGCAAAAGC
TGCAGAAATGGCAAAGACCCTCAATTCCATCTGCTTCACCACTCTTTTGCTCGTTGTCTT
GTTAATTTCCACCGAAATCCCGAAGAGCGAGGCGACTTGTAAGAAGTATTTAGGCGAAGC
CCCAGTATATCCATGCAAGGAAAAAGCTTGTAAGGATGTGTGTAAGGAACATTACTACCA
CTCGTGTAAAGGAGAGTGTGAGAAGCATGGCTACGAAGAGCATTGCCACTGCTACGGAAA
ATACTGAAAATTACAAAGATAAGTCTATCGTATAAAATAAAAACAATAAGACCTTATATA
TCTATAATGTAAGTGTGGTATGTTCGATTTAATAAAGGTATGTATGTTTAAGCTGTTTGC
TTTAAATTGAAGATGTTGATCACCTTCTAAATTTATAATATATAAAATCATGTTGTATGC
TGTTTTATTAATAATAAACTATACTTTTGTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1BR92TF U 1
AF RS1BF58TF U 18
BS 1 350 RS1BR92TF
BS 351 351 RS1BF58TF
BS 352 513 RS1BR92TF

RD RS1BR92TF 513 0 0
GGGTATCATCCAAGTTTAAAGAAACAAACAAGTGTAAGAAAAAGGAAAGAAAGCAAAAGC
TGCAGAAATGGCAAAGACCCTCAATTCCATCTGCTTCACCACTCTTTTGCTCGTTGTCTT
GTTAATTTCCACCGAAATCCCGAAGAGCGAGGCGACTTGTAAGAAGTATTTAGGCGAAGC
CCCAGTATATCCATGCAAGGAAAAAGCTTGTAAGGATGTGTGTAAGGAACATTACTACCA
CTCGTGTAAAGGAGAGTGTGAGAAGCATGGCTACGAAGAGCATTGCCACTGCTACGGAAA
ATACTGAAAATTACAAAGATAAGTCTATCGTATAAAATAAAAACAATAAGGCCTTATATA
TCTATAATGTAAGTGTGGTATGTTCGATTTAATAAAGGTATGTATGTTTAAGCTGTTTGC
TTTAAATTGAAGATGTTGATCACCTTCTAAATTTATAATATATAAAATCATGTTGTATGC
TGTTTTATTAATAATAAACTATACTTTTGTGTT

QA 1 513 1 513
DS 

RD RS1BF58TF 493 0 0
AAAGAAACAAACAAGTGTAAGAAAAAGGAAAGAAAGCAAAAGCTGCAGAAATGGCAAAGA
CCCTCAATTCCATCTGCTTCACCACTCTTTTGCTCGTTGTCTTGTTAATTTCCACCGAAA
TCCCGAAGAGCGAGGCGACTTGTAAGAAGTATTTAGGCGAAGCCCCAGTATATCCATGCA
AGGAAAAAGCTTGTAAGGATGTGTGTAAGGAACATTACTACCACTCGTGTAAAGGAGAGT
GTGAGAAGCATGGCTACGAAGAGCATTGCCACTGCTACGGAAAATACTGAAAATTACAAA
GATAAGTCTATCGTATAAAATAAAAACAATAAGACCTTATATATCTATAATGTAAGTGTG
GTATGTTCGATTTAATAAAGGTATGTATGTTTAAGCTGTTTGCTTTAAATTGAAGATGTT
GATCACCTTCTAAATTTATAATATATAAAATCATGTTGTATGCTGTTTTATTAATAATAA
ACTATACTTTTGT

QA 1 493 1 493
DS 



AS 1 2

CO CL4972Contig1 932 2 8 U
GTGTTCTACGACAGCGAGTCCGTTGTGAACCTTTTAGCTGGCTGTGTTAGTCTTGAAGAT
TTGTGTGTCACTCGACGTGGTTTTGATGATGTGGAGACTTTCACTATTGCCGTGCCATCT
TTACATGAGCTAACCATAGAAAATAGCCACTATGATAGTTCTGGCTACGTGATAAATTCT
CCTTCTTTGAAAAAATTGACGATTAGAGTGATTGACAAGACTCTCAGGTCTGAATTAATG
ATGATTAATGCACCTGAGCTGGTAGAGGCGAAAATTTGGACCGATGATGGATTTGTGCTG
CGAGAATCACTCACTTCAGTCAAACGCCTTTCCTTGAGTTCATTACACATGGAGGTTCCT
GCTGGTTGCATCTTCAATCAGCTGGAATATTTGCAGCTGATTACAGGTTATCTACTGTCT
TGGATTCCATTAATGGTCATGCTTGATAACTCTCCTAATTTACAAGTTCTAGAGATCTTC
AGTGAACACTATGCTGAACTAACATGGAAGCAACCAAAACATGTACCGCAATGTTTGCAC
CATCTTAAGATATTAGATTGGTACGTAATGGGATTAACATACGGGGAAGAGGTGGCCAAA
TACATCCTATCCAATTCAAGGCGTTTGGAAAATGTTGTTTTGCGCATGGACTGCCGCAAC
TTCGAAGAGGATTTTCCTGAGGAAGAAAGACTTAAGGTGTGTCATTTCATGGAAAAATGG
TGTCCAGATGGTTGTAAGTTTGAGCTTATAGTGGCTCCGATTGACGACTGTTGCTTTAGG
CCGTCTTATTATGGTTCCTAATTTGAGTCGCAGCTGGTTCGGATCTTGTGTAGTTGACTG
ACTAGTTGTACTCATGGCTACTATGTCCTAGACTAAACATTGCTCTTTGCATTTGCTACT
TTTTACTATAACCAGAACACTCGGAGGACCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F555TF U 1
AF RS1F555JQ C 250
BS 1 681 RS1F555TF
BS 682 682 RS1F555JQ
BS 683 696 RS1F555TF
BS 697 697 RS1F555JQ
BS 698 716 RS1F555TF
BS 717 717 RS1F555JQ
BS 718 753 RS1F555TF
BS 754 932 RS1F555JQ

RD RS1F555TF 753 0 0
GTGTTCTACGACAGCGAGTCCGTTGTGAACCTTTTAGCTGGCTGTGTTAGTCTTGAAGAT
TTGTGTGTCACTCGACGTGGTTTTGATGATGTGGAGACTTTCACTATTGCCGTGCCATCT
TTACATGAGCTAACCATAGAAAATAGCCACTATGATAGTTCTGGCTACGTGATAAATTCT
CCTTCTTTGAAAAAATTGACGATTAGAGTGATTGACAAGACTCTCAGGTCTGAATTAATG
ATGATTAATGCACCTGAGCTGGTAGAGGCGAAAATTTGGACCGATGATGGATTTGTGCTG
CGAGAATCACTCACTTCAGTCAAACGCCTTTCCTTGAGTTCATTACACATGGAGGTTCCT
GCTGGTTGCATCTTCAATCAGCTGGAATATTTGCAGCTGATTACAGGTTATCTACTGTCT
TGGATTCCATTAATGGTCATGCTTGATAACTCTCCTAATTTACAAGTTCTAGAGATCTTC
AGTGAACACTATGCTGAACTAACATGGAAGCAACCAAAACATGTACCGCAATGTTTGCAC
CATCTTAAGATATTAGATTGGTACGTAATGGGATTAACATACGGGGAAGAGGTGGCCAAA
TACATCCTATCCAATTCAAGGCGTTTGGAAAATGTTGTTTTGCGCATGGACTGCCGCAAC
TTCGAAGAGGATTTTCCTGAG*AAGAAAGACTTAAG*TGTGTCATTTCATGGAAAA*TGG
TGTCCAGATGGTTGTAAGTTTGAGCTTATAGTG

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1F555JQ 683 0 0
GCACCTGAGCTGGTAGAGGCGAAAATTTGGACCGATGATGGATTTGTGCTGCGAGAATCA
CTCACTTCAGTCAAACGCCTTTCCTTGAGTTCATTACACATGGAGGTTCCTGCTGGTTGC
ATCTTCAATCAGCTGGAATATTTGCAGCTGATTACAGGTTATCTACTGTCTTGGATTCCA
TTAATGGTCATGCTTGATAACTCTCCTAATTTACAAGTTCTAGAGATCTTCAGTGAACAC
TATGCTGAACTAACATGGAAGCAACCAAAACATGTACCGCAATGTTTGCACCATCTTAAG
ATATTAGATTGGTACGTAATGGGATTAACATACGGGGAAGAGGTGGCCAAATACATCCTA
TCCAATTCAAGGCGTTTGGAAAATGTTGTTTTGCGCATGGACTGCCGCAACTTCGAAGAG
GATTTTCCTGAGGAAGAAAGACTTAAGGTGTGTCATTTCATGGAAAAATGGTGTCCAGAT
GGTTGTAAGTTTGAGCTTATAGTGGCTCCGATTGACGACTGTTGCTTTAGGCCGTCTTAT
TATGGTTCCTAATTTGAGTCGCAGCTGGTTCGGATCTTGTGTAGTTGACTGACTAGTTGT
ACTCATGGCTACTATGTCCTAGACTAAACATTGCTCTTTGCATTTGCTACTTTTTACTAT
AACCAGAACACTCGGAGGACCCC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

CO CL4973Contig1 1018 2 4 U
TGTCTAGAGAAGAGTATACTAAAGGACGGTTTCTTTCCAGCACAGACAATCTTAAATTTC
TAGACAAAGCAGCGATTGTCGAAACTCGAGGGAGCGGGAATATGGCCGAGAAGGAGAGTC
CATGGAAACTCTCAACGGTAACAAAAGTAGAAGAACTGAAACTACTCATCAACATGATTC
CGATCTGGTTCTTTACATTAGCTTTCGGCATATGCGCTACTCAAGGCACAACACTCTTCA
TCAAACAAGCCATTATCATAGACCGACATATCGGTCACAACTTCGTAGTTCCTCCATCTT
CCATGTTTGCTCTTGTAGCTCTCCCCATGATCATCTTCTTAACAGTCTATGAGAAACTCC
TTGTGCCTCTTTTGAGATGCGTCACGGGAAATGAAAGAGGTATTAGCATTCTGCAAAGAA
TCGGAACCGGTATGGTTTTCTCCTTGATCACCATGGCCATTGCTGCTCTAGTTGAGAGAA
AAAGATTGGATTATGCTAAGCAACATCGCATGGCCATGAGTGTTATATGGTTAGTTCCTC
AGTTCATAGTTATAGGCATAGCTGATGCTTTGACTCTTGTGGGTCTTCAAGAGTATTTCT
ACGACCAAGTCCCTGATTCAATGAGAAGTCTAGGCATAGCCTTTTACCTTAGTGTGATTG
GAGCAGCTAGTTTTGTCAACAATTTCTTGATAATGGTTACTGATCATTTAAGTGAGGAAA
TCTCTGGAAAGAACTTGTTTGGGAAAGATCTTAATAGCAGTCGCTTGGACCGTTTTTACT
GGACGCTAGCCGCTTTGACCGCTGCAAGTATATGCTTCTTTGTGATTGTAGCCAAAAGGT
ATACTTATAAGAGTGTGCAATCAAGTCTGGCTATTGCTGACGGTGGCGATGACGTCAAGG
CAGCCTCGGTGCAAAATACGTCAAAGTATACTTAAACATGCATCACTATAGATTTGGTTA
TGCTTTTTTTTTTTTTTGTAACAATAGATTTGGTTATGTTATCACCATTTTCATGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1D042TF U 1
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GGAC

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QA 1 751 1 751
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BQ
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AF RS1E554JQ C 1
AF RS1E554TF U 1
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QA 1 457 1 457
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1FW47JQ C 1
AF RS1FW47TF U 1
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TTTATCTATT

QA 1 490 1 490
DS 



AS 1 2

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GTGGTCATGAATACACACTGAGTAACTCCAAGTTTGCATTGTCTATAGAGCCAAACAACG
AAGTACTTCAGTCTTATGTTGCTCATGTTGCAGAGCTCCGTAAAAAGAAATTACCTACGA
TTCCAACAACACTGAAGATGGAGAAAGCTTGTAACCCATTCCTCCGCAGTTCGAATACAG
ATATTCGACGAGCTTTAGGTATTTCAGAGACTGCAGATGAAGCAGAAGCTTTGGCTATTA
TCCGAGAAGCAAAGGATAATTTCAAAGCTTAGGCTTTTTCTCCCGAGGGGCAATTCTTTG
GTTTGCATCTGTTTCCTCCGACAAAAACAAAAAGACAGAAAGAGAGAGAGAGAGACAGAG
AGACAGAGAGAGATATGTTTACTTTTGATGTAAAACATCTAATGTTGGTACTCATTAACA
CTGCAATTAGGTTTTGGTTGATGATTTTTCAACAAAAAAATATTTACCTTTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AT32TF U 1
AF RS1AT32JQ C 209
BS 1 678 RS1AT32TF
BS 679 679 RS1AT32JQ
BS 680 703 RS1AT32TF
BS 704 955 RS1AT32JQ

RD RS1AT32TF 703 0 0
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TCCAAAGCTTCTTCTGCTATCTCCTTCTTTCGATGTTCCAGGAAGCTAACAAGTGAGCCA
TGTGTGAGGCAGCTTCACATCCGAAAGGGTCTCGTCTGCAGAGTCATGAAGCTTGTCTCT
TCACCTCTTAGGACTCTCCGCGGTGCTGGCAAATCTATTCGAGTCTCCAGTTTCTGCAGT
GTCTCCTCCAATCCCTCCTCTTTGCAGATTGAAATGGTAAACTCTTTGAAGGTACCCCTA
AGCAGATGCTTGCTTCTCTCAAAAAGATCATATCTTTACCAGATGACACAAGCATATACT
GTGGTCATGAATACACACTGAGTAACTCCAAGTTTGCATTGTCTATAGAGCCAAACAACG
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ATATTCGACGAGCTTTAG*TATTTCAGAGACTGCAGATGAAGC

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DS 

RD RS1AT32JQ 747 0 0
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GTCTCGTCTGCAGAGTCATGAAGCTTGTCTCTTCACCTCTTAGGACTCTCCGCGGTGCTG
GCAAATCTATTCGAGTCTCCAGTTTCTGCAGTGTCTCCTCCAATCCCTCCTCTTTGCAGA
TTGAAATGGTAAACTCTTTGAAGGTACCCCTAAGCAGATGCTTGCTTCTCTCAAAAAGAT
CATATCTTTACCAGATGACACAAGCATATACTGTGGTCATGAATACACACTGAGTAACTC
CAAGTTTGCATTGTCTATAGAGCCAAACAACGAAGTACTTCAGTCTTATGTTGCTCATGT
TGCAGAGCTCCGTAAAAAGAAATTACCTACGATTCCAACAACACTGAAGATGGAGAAAGC
TTGTAACCCATTCCTCCGCAGTTCGAATACAGATATTCGACGAGCTTTAGGTATTTCAGA
GACTGCAGATGAAGCAGAAGCTTTGGCTATTATCCGAGAAGCAAAGGATAATTTCAAAGC
TTAGGCTTTTTCTCCCGAGGGGCAATTCTTTGGTTTGCATCTGTTTCCTCCGACAAAAAC
AAAAAGACAGAAAGAGAGAGAGAGAGACAGAGAGACAGAGAGAGATATGTTTACTTTTGA
TGTAAAACATCTAATGTTGGTACTCATTAACACTGCAATTAGGTTTTGGTTGATGATTTT
TCAACAAAAAAATATTTACCTTTTTAC

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

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TGACGTTGAAACCGGTGGGTTTCACGGTGGAGAAGATGTCGGCCAGAGGTTTACCGTCGC
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GTTATGGTGTTTACAAGTTTGTTGACAAGTATGGAGCTAACGTTGATGGATACAGTCCTA
TCTACAACGAGGAGGAGTGGTCAGCGAGTGGTGATGTGTACAAGGGAGGAGTCACCGGAT
TGGCTATTTGGGCAGTGACGCTTGCCGGAATTCTCGCCGGAGGAGCTCTTCTTGTGTACA
ACACAAGCGCTTTGGCTCAGTAAATCTTTTAAAAGACATGTTTCTCTCTATGTTTTGTGT
TCTCTGTTTCTCTCTTCTCTGTAATGCTCAGAACATACTTTTGAAATTTATAAAAGAACT
CTAGTGTTTGTACG


BQ
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AF RS1BR62TF U 1
AF RS1GJ39TF U 1
BS 1 494 RS1BR62TF

RD RS1BR62TF 494 0 0
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TCGCAAGAGCTTCTCCTTATTCCTTCAAAATCGTCGCGAGCGGTGTCAAGAAGATCAAGG
GTTATGGTGTTTACAAGTTTGTTGACAAGTATGGAGCTAACGTTGATGGATACAGTCCTA
TCTACAACGAGGAGGAGTGGTCAGCGAGTGGTGATGTGTACAAGGGAGGAGTCACCGGAT
TGGCTATTTGGGCAGTGACGCTTGCCGGAATTCTCGCCGGAGGAGCTCTTCTTGTGTACA
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TCTCTGTTTCTCTCTTCTCTGTAATGCTCAGAACATACTTTTGAAATTTATAAAAGAACT
CTAGTGTTTGTACG

QA 1 494 1 494
DS 

RD RS1GJ39TF 490 0 0
GGAGGAGAAGAGGAGAGAGAGAGAGAGAAGAAATGGCTGCTTCAGTGATGCTTTCATCGG
TGACGTTGAAACCGGTGGGTTTCACGGTGGAGAAGATGTCGGCCAGAGGTTTACCGTCGC
TCGCAAGAGCTTCTCCTTATTCCTTCAAAATCGTCGCGAGCGGTGTCAAGAAGATCAAGG
GTTATGGTGTTTACAAGTTTGTTGACAAGTATGGAGCTAACGTTGATGGATACAGTCCTA
TCTACAACGAGGAGGAGTGGTCAGCGAGTGGTGATGTGTACAAGGGAGGAGTCACCGGAT
TGGCTATTTGGGCAGTGACGCTTGCCGGAATTCTCGCCGGAGGAGCTCTTCTTGTGTACA
ACACAAGCGCTTTGGCTCAGTAAATCTTTTAAAAGACATGTTTCTCTCTATGTTTTGTGT
TCTCTGTTTCTCTCTTCTCTGTAATGCTCAGAACATACTTTTGAAATTTATAAAAGAACT
CTAGTGTTTG

QA 1 490 1 490
DS 



AS 1 2

CO CL4978Contig1 1065 2 2 U
GGGTCGCCGTGTGGAAACAATCTCATTCTCTTCTTCGCCTCCATGAATCTCCTCAAAACC
ATTCATCACCCGTCCACTCTCACTCAATTTTACCGTTTTGCTACAACACACTCCTTCGCT
TCCTCGTCATCCTCCCTGCTCTCACTCTCTCCACAAAGACCCACAATCTCTCTCGTTTCC
ACCTCCAACCGAAGTTCCTTCGCACTCTCGAGCATCTCCAGCACCAGAGCTTCGTTTTCA
GGTAACCAAGAGGATGGGAAGAGAGAAGAGGGAGATGAATTGGTTTACAAGAAGACGCTG
AGACTGGTGGAGTGCGCCATGTTCGCTGCTGTCACCGGCCTCGTTTACTTCCTCAGCAAC
TCTCTCGCCATCGAGAACTACTTTGGGTGTTTCTTCGCATTGCCAATAGTGATCTCTTCG
ATAAGATGGAACATCGCAGGCGGCAGGAAGACAATGGTTGCTACTGTCATGCTCTTGTTC
ATATTATCAGGTCCGGTCAAAGCTTTAACTTACTTTCTTATGCATGGTCTTCTGGGGCTT
GCAATTGGTCCATTGTGGAGGATGAAGGCAAGCTGGCGTCTCTCCATTTTCTTGTGCACA
ATGGTCCGAGCATTGGGTCTCATAGGATATGTTCTGACATCATCCTTCCTAATAAGAGAA
AACATTCTTGCTGTGATCACAATCAACATCCACGCCTCTCTTTCCTATGTTTTCACTGCC
ATGGGCCTGAACCTAATGCCTTCCATGAGCCTCATCTATATGATATTCGGAACAGTGCTA
TTGCTAAACAGTGGATTCTTTGTGCTGTTGCTGCATATCCTCTACTCAATCTTCCTCGCA
AGACTTGGGATGAAATTTTCGTTGAGGTTACCTGCCTGGTTAGACAAAGCAATATGATGG
TATTCACAGGATCCACACAGAAACAGAAAGCAGAGTTGGTGGTAGATTTTGTGTAGAGCA
TCTTTGGTGGAGCATATTTTTGTAAAACTTGTAGTGCTCACGAGCAAATCCAAACCCCAA
ACAAAAATTTGTTTATAATCTGATCAGTACTCTAATTTTCATATC


BQ
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AF RS1FJ12TF U 1
AF RS1FJ12JQ C 435
BS 1 684 RS1FJ12TF
BS 685 1065 RS1FJ12JQ

RD RS1FJ12TF 684 0 0
GGGTCGCCGTGTGGAAACAATCTCATTCTCTTCTTCGCCTCCATGAATCTCCTCAAAACC
ATTCATCACCCGTCCACTCTCACTCAATTTTACCGTTTTGCTACAACACACTCCTTCGCT
TCCTCGTCATCCTCCCTGCTCTCACTCTCTCCACAAAGACCCACAATCTCTCTCGTTTCC
ACCTCCAACCGAAGTTCCTTCGCACTCTCGAGCATCTCCAGCACCAGAGCTTCGTTTTCA
GGTAACCAAGAGGATGGGAAGAGAGAAGAGGGAGATGAATTGGTTTACAAGAAGACGCTG
AGACTGGTGGAGTGCGCCATGTTCGCTGCTGTCACCGGCCTCGTTTACTTCCTCAGCAAC
TCTCTCGCCATCGAGAACTACTTTGGGTGTTTCTTCGCATTGCCAATAGTGATCTCTTCG
ATAAGATGGAACATCGCAGGCGGCAGGAAGACAATGGTTGCTACTGTCATGCTCTTGTTC
ATATTATCAGGTCCGGTCAAAGCTTTAACTTACTTTCTTATGCATGGTCTTCTGGGGCTT
GCAATTGGTCCATTGTGGAGGATGAAGGCAAGCTGGCGTCTCTCCATTTTCTTGTGCACA
ATGGTCCGAGCATTGGGTCTCATAGGATATGTTCTGACATCATCCTTCCTAATAAGAGAA
AACATTCTTGCTGTGATCACAATC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1FJ12JQ 631 0 0
CGCAGGCGGCAGGAAGACAATGGTTGCTACTGTCATGCTCTTGTTCATATTATCAGGTCC
GGTCAAAGCTTTAACTTACTTTCTTATGCATGGTCTTCTGGGGCTTGCAATTGGTCCATT
GTGGAGGATGAAGGCAAGCTGGCGTCTCTCCATTTTCTTGTGCACAATGGTCCGAGCATT
GGGTCTCATAGGATATGTTCTGACATCATCCTTCCTAATAAGAGAAAACATTCTTGCTGT
GATCACAATCAACATCCACGCCTCTCTTTCCTATGTTTTCACTGCCATGGGCCTGAACCT
AATGCCTTCCATGAGCCTCATCTATATGATATTCGGAACAGTGCTATTGCTAAACAGTGG
ATTCTTTGTGCTGTTGCTGCATATCCTCTACTCAATCTTCCTCGCAAGACTTGGGATGAA
ATTTTCGTTGAGGTTACCTGCCTGGTTAGACAAAGCAATATGATGGTATTCACAGGATCC
ACACAGAAACAGAAAGCAGAGTTGGTGGTAGATTTTGTGTAGAGCATCTTTGGTGGAGCA
TATTTTTGTAAAACTTGTAGTGCTCACGAGCAAATCCAAACCCCAAACAAAAATTTGTTT
ATAATCTGATCAGTACTCTAATTTTCATATC

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 2

CO CL4979Contig1 1053 2 4 U
GAAGGAGAAGCGTTCTGCATATGCCCCTGAGACAGGAGTCAGATATGATGGGGTTTACAG
GATCGAGAAGTGCTGGAGAAAAGTTGGAATACAGGGTTCTTTCAAGGTCTGTCGTTACCT
ATTTGTTAGGTGTGACAATGAGCCTGCTCCATGGACCAGTGATGAGCATGGGGATCGTCC
AAGACCTTTGCCTAACATTCCAGAGCTTAAGATGGCAACAGAGCTCTTTGAGAGAACGGA
AAGTCCATCATGGAATTTTGATGAAGGTGAGGGTTGTTGGAAGTGGATGAAGCCTCCCCC
TGCTAGTTTAAAGGCAGTTAATGTTCTGGATCCTGGGGAGAGGAAGAGTATGAAGAGGGC
TATAAAGGCGGCACATTCAAATACCGTGAGAGAAAAACTTCTGAAAGAATTCAGCTGCAT
GATCTGCCGGCAGGTAATGACTCTTCCTGTGACAACCCCTTGTGCTCATAACTTCTGCAA
GGCTTGTTTAGAAGATAAGTTTGCTGGGCAAACTCTGGTGAGGGAAGGAAGCAGAGGTGG
GCGGACACTTCGTGCACAGAAGAACATCATGAACTGTCCATGTTGCCCCAACGACATCTC
TGACTTTCTCCAGAACCCTCAGGTCAATAGAGAAGTAATGGACGTGATAGAGAAGCTTAA
GAACAAGGAAGAGGAAAAGGCAGAGTCTGAAGAAGTTGAAGAGGCAAGTGTTGATGAAAA
GGAAGAAAAGGCTGAGTCAGAGTCCGAGGGAAACTGCGAGGGTGCCGACCTTGAAGAAGC
CGAACAACCAAGGAAGAGAGCCAAACTGGACACTACTGACACAGTAGTTCCTGCGACTAA
GGTGGAATTTGACATGAAGTAGTGAGAGGGGCCTTTCCAATGGCTCTTTTTTTTGGATCG
AACCATCAGGTAAAAATAGAGATGTCTCTTTTTATCTTGGAACCAATGACAAAACTCTGG
TGCCTGATTGGCTGATTTGGTAAGAAACAGTTGCGGAAGTTGTGTAATATGAATGATTGG
TAAGTGACTTCGAAATATATAACTGTTGAGCTG


BQ
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AF RS1DN09TF U 1
AF RS1DN09JQ C 493
BS 1 620 RS1DN09TF
BS 621 621 RS1DN09JQ
BS 622 662 RS1DN09TF
BS 663 1053 RS1DN09JQ

RD RS1DN09TF 662 0 0
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GATCGAGAAGTGCTGGAGAAAAGTTGGAATACAGGGTTCTTTCAAGGTCTGTCGTTACCT
ATTTGTTAGGTGTGACAATGAGCCTGCTCCATGGACCAGTGATGAGCATGGGGATCGTCC
AAGACCTTTGCCTAACATTCCAGAGCTTAAGATGGCAACAGAGCTCTTTGAGAGAACGGA
AAGTCCATCATGGAATTTTGATGAAGGTGAGGGTTGTTGGAAGTGGATGAAGCCTCCCCC
TGCTAGTTTAAAGGCAGTTAATGTTCTGGATCCTGGGGAGAGGAAGAGTATGAAGAGGGC
TATAAAGGCGGCACATTCAAATACCGTGAGAGAAAAACTTCTGAAAGAATTCAGCTGCAT
GATCTGCCGGCAGGTAATGACTCTTCCTGTGACAACCCCTTGTGCTCATAACTTCTGCAA
GGCTTGTTTAGAAGATAAGTTTGCTGGGCAAACTCTGGTGAGGGAAGGAAGCAGAGGTGG
GCGGACACTTCGTGCACAGAAGAACATCATGAACTGTCCATGTTGCCCCAACGACATCTC
TGACTTTCTCCAGAACCCTC*GGTCAATAGAGAAGTAATGGACGTGATAGAGAAGCTTAA
GA

QA 1 662 1 662
DS 

RD RS1DN09JQ 561 0 0
AGATAAGTTTGCTGGGCAAACTCTGGTGAGGGAAGGAAGCAGAGGTGGGCGGACACTTCG
TGCACAGAAGAACATCATGAACTGTCCATGTTGCCCCAACGACATCTCTGACTTTCTCCA
GAACCCTCAGGTCAATAGAGAAGTAATGGACGTGATAGAGAAGCTTAAGAACAAGGAAGA
GGAAAAGGCAGAGTCTGAAGAAGTTGAAGAGGCAAGTGTTGATGAAAAGGAAGAAAAGGC
TGAGTCAGAGTCCGAGGGAAACTGCGAGGGTGCCGACCTTGAAGAAGCCGAACAACCAAG
GAAGAGAGCCAAACTGGACACTACTGACACAGTAGTTCCTGCGACTAAGGTGGAATTTGA
CATGAAGTAGTGAGAGGGGCCTTTCCAATGGCTCTTTTTTTTGGATCGAACCATCAGGTA
AAAATAGAGATGTCTCTTTTTATCTTGGAACCAATGACAAAACTCTGGTGCCTGATTGGC
TGATTTGGTAAGAAACAGTTGCGGAAGTTGTGTAATATGAATGATTGGTAAGTGACTTCG
AAATATATAACTGTTGAGCTG

QA 1 561 1 561
DS 



AS 1 2

CO CL4980Contig1 996 2 4 U
GACTCACGAGCTGCTGGCCGCTGTTGTTTGTTTCTGCTTCCATCTCTCTCTTTCGCTGCT
TCTCGAATCATCTTCTTCGTCGTTCAAGTGAAAGATGGCTGATGGTGAGGACATTCAACC
CCTTGTCTGTGACAATGGAACTGGAATGGTGAAGGCTGGTTTTGCTGGTGACGATGCCCC
CAGGGCTGTGTTCCCAAGTATCGTTGGTCGTCCAAGGCACACTGGTGTCATGGTTGGAAT
GGGTCAGAAAGATGCTTACGTTGGTGACGAAGCTCAGTCCAAAAGAGGTTACATGTTCAC
CACTACCGCCGAGCGAGAAATCGTCCGTGACATCAAAGAGAAACTTGCTTATGTCGCTCT
CGACTTCGGGCAAGAGCTCGAGACAGCTAAGAGCAGTTCTTCGGTGGAGAAGAACTACGA
GCTACCTGATGGACAAGTCATCACCATTGGAGCTGAGAGATTCCGTTGCCCTGAAGTACT
CTTCCAGCCATCGCTGATCGGAATGGAAGCTCCTGGAATCCATGAAACGACTTACAACTC
CATCATGAAGTGTGACGTGGATATCAGGAAGGATCTGTATGGAAACATCGTCCTCAGTGG
TGGTTCAACCATGTTCGCATGAAGATCAAAGTGGTCGCACCGCCCGAGAGGAAATACAGT
GTCTGGATTGGAGGATCTATCCTTGCATCCCTCAGCACTTTCCAACAGATGTGGATCTCG
AAGGGAGAGTACGATGAGTCCGGTCCGTCGATTGTCCACAGGAAATGCTTTTAAGTGGTT
GAGTGTTGTTTACAAATCTATTTCCCGAAGTTGAGATGGGAAGTGAAACTATCTGTTGTT
ATGTGGTTGTTGTGTTTTCTCGGGTCTTATTAAAAAAACCTCTCTTGAGTCTCTGTGTAC
TTTAGTTTTACCTCTGTTTATTATTCTCTCTTTAGGATGCTTGTGATGATGCTGGTTTTT
TTGTCCTTATTAAGCAAAAAAAGAATATCATATTCT


BQ
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CACTACCGCCGAGCGAGAAATCGTCCGTGACATCAAAGAGAAACTTGCTTATGTCGCTCT
CGACTTCGGGCAAGAGCTCGAGACAGCTAAGAGCAGTTCTTCGGTGGAGAAGAACTACGA
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TCTGTTTATTATTCTCTCTTTAGGATGCTTGTGATGATGCTGGTTTTTTTGTCCTTATTA
AGCAAAAAAAGAATATCATATTCT

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

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ACTCTAATTGTGTATGTTAATTTCTTTAATTAATACTAAAATTTGAATATTCCCC


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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CM04TF U 1
AF RS1CM04JQ C 538
BS 1 693 RS1CM04TF
BS 694 694 RS1CM04JQ
BS 695 706 RS1CM04TF
BS 707 1315 RS1CM04JQ

RD RS1CM04TF 706 0 0
GGACTTCTCCGGCGATCAAAAATCTCGACGAGAGACCAAGAACAAGAAGAAGAGGATGGC
GACATCTTTCTCTAAAATCCTAACCAGATCGAAACCTCAAAGCCACATCTACTCCAACTC
CCATTCCCTCCAGAGACACTTCTCCGCCGTCGCCGACTCTTCCTTCTCTACCTCCGCCGC
CCTTGGAAGCCAAACGAGTCCTCCCTCTCCGACGCAAGACAATAACAAAAGAGGAGGGTC
GAAGTGGACACAACTGCTCTTGTTCTTGCCTGGAGCGATTACCTTCGGTCTCGGTTCCTG
GCAAATCGTCAGAAGGGAGGAAAAGATCAAAACACTGGAGTACCAACAACAACGGTTGAA
AATGGAACCGATGAAGCTAAACGCAGACCATCCTCCTGATAAGAATCTTGATGCCTTGGA
ATTTAGACGGGTTAGTTGCAAGGGCGTTTTTGACGAGGATAAGTCTATATTTTTGGGTCC
ACGGTCTAGGTCCATATCTGGAGTCACTGAAAATGGATACTATGTCATCACACCTCTATT
GCCGATCCCTGGTGACCTGGGTAGCATGCAGTCGCCTATTCTTGTGAATCGCGGATGGGT
TCCTCGTAGTTGGAGAGACAAGTTACAAGAATCTACAGAGTCAGTCTCCCTTGCAAATGA
CTCAACAATAGCTAAACCACTCCCCACTGAGCA*CATTCATGGTGG

QA 1 706 1 706
DS 

RD RS1CM04JQ 778 0 0
ATTGCCGATCCCTGGTGACCTGGGTAGCATGCAGTCGCCTATTCTTGTGAATCGCGGATG
GGTTCCTCGTAGTTGGAGAGACAAGTTACAAGAATCTACAGAGTCAGTCTCCCTTGCAAA
TGACTCAACAATAGCTAAACCACTCCCCACTGAGCAACATTCATGGTGGAAATTTTGGTC
TAAGACGCCAGTGATTCCCAAGGAGCAAGTATCCACGGCTGTTAAGCCAGTAGAAGTTGT
TGGTGTGATCAGGGGAGGGGAGAACCCGAGCATATCTGTCCCGGCCAATGATCCAAGCAC
GGGGCAGTGGTTCTACGTAGACGTACCTGCAATGGCTCGTGCCATGGGTCTTCCTGAAGA
CACAATTTACGTAGAGGACGTTCATGAGGACATAGATCGGAGTAGACCGTATCCTGTCCC
GAAAGACATCAACACTTTGATCCGGAGTAAAGTCATGCCACAGGACCATCTCAACTACTG
CATAACATGGTACTCTCTTTCGGCGGCTGTCACTTTCATGGCTTACAAGAGGCTCAAGCC
AAAGTCTGCTCTCAGATAAGCTTTCGTTGATCAAATCAAGCCTCATTCTTTTTTTTTGTT
ACACCGAAAGAAAAACCATCAGCAAACGTTTATGTGAAATCTTTGTATTATTACTACTAA
TAAAAAGTTCATTGTGGTTTACTAGTGTTTATTCAATTAGAGTTTGTCTTGGAAGACCAA
CGAACTCTAATTGTGTATGTTAATTTCTTTAATTAATACTAAAATTTGAATATTCCCC

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 2

CO CL4982Contig1 542 2 1 U
GTGAAGGTGAAGAACGTTGTTACTGGTGATGTGTCGGATTTGAAAGTGTCTGGGTTGTTC
TTTGCGATTGGTCATGAGCCGGCGACGAAGTTCTTGGATGGGCAGCTTGAGCTTGATGAG
GATGGGTATGTGGTGACTAAACCTGGTACCACTAAGACGAGCGTGGTTGGTGTGTTCGCT
GCTGGAGATGTGCAAGACAAGAAGTATAGGCAGGCCATCACAGCTGCAGGAACTGGGTGT
ATGGCGGCCTTGGATGCAGAGCATTACTTACAGGAGATTGGATCTCAGGAGGGTAAGAGT
GATTAGAGAAGATGTAGGAGAAGGACCCAATTATAAGAAAAGCTATTTCACCAATAAATG
GTCTTTAAAACAATCTGAGGGATTCTGAGTAGAGTTTTATTATGTGCGTTTGCAGTTGGA
GTTGAGTCTGGATTGTGTGCCAAGTTGTAACTCTTTAGTAGTCACAGCTTGGACCAAAAT
TGCTCTTGATTTATCCCTCAGGTGAGGGCTTTTTAGTTAATTTGATTATGTTTTATTCCA
GC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 

AF RS1EQ91TF U 1
AF RS1EQ91JQ C 52
BS 1 542 RS1EQ91TF

RD RS1EQ91TF 542 0 0
GTGAAGGTGAAGAACGTTGTTACTGGTGATGTGTCGGATTTGAAAGTGTCTGGGTTGTTC
TTTGCGATTGGTCATGAGCCGGCGACGAAGTTCTTGGATGGGCAGCTTGAGCTTGATGAG
GATGGGTATGTGGTGACTAAACCTGGTACCACTAAGACGAGCGTGGTTGGTGTGTTCGCT
GCTGGAGATGTGCAAGACAAGAAGTATAGGCAGGCCATCACAGCTGCAGGAACTGGGTGT
ATGGCGGCCTTGGATGCAGAGCATTACTTACAGGAGATTGGATCTCAGGAGGGTAAGAGT
GATTAGAGAAGATGTAGGAGAAGGACCCAATTATAAGAAAAGCTATTTCACCAATAAATG
GTCTTTAAAACAATCTGAGGGATTCTGAGTAGAGTTTTATTATGTGCGTTTGCAGTTGGA
GTTGAGTCTGGATTGTGTGCCAAGTTGTAACTCTTTAGTAGTCACAGCTTGGACCAAAAT
TGCTCTTGATTTATCCCTCAGGTGAGGGCTTTTTAGTTAATTTGATTATGTTTTATTCCA
GC

QA 1 542 1 542
DS 

RD RS1EQ91JQ 491 0 0
GGGTTGTTCTTTGCGATTGGTCATGAGCCGGCGACGAAGTTCTTGGATGGGCAGCTTGAG
CTTGATGAGGATGGGTATGTGGTGACTAAACCTGGTACCACTAAGACGAGCGTGGTTGGT
GTGTTCGCTGCTGGAGATGTGCAAGACAAGAAGTATAGGCAGGCCATCACAGCTGCAGGA
ACTGGGTGTATGGCGGCCTTGGATGCAGAGCATTACTTACAGGAGATTGGATCTCAGGAG
GGTAAGAGTGATTAGAGAAGATGTAGGAGAAGGACCCAATTATAAGAAAAGCTATTTCAC
CAATAAATGGTCTTTAAAACAATCTGAGGGATTCTGAGTAGAGTTTTATTATGTGCGTTT
GCAGTTGGAGTTGAGTCTGGATTGTGTGCCAAGTTGTAACTCTTTAGTAGTCACAGCTTG
GACCAAAATTGCTCTTGATTTATCCCTCAGGTGAGGGCTTTTTAGTTAATTTGATTATGT
TTTATTCCAGC

QA 1 491 1 491
DS 



AS 1 2

CO CL4983Contig1 164 2 1 U
TTTTTGGGTACTAATGGAGTTATATGATGACGAAAAACTTGTTGGACTTTGATCCATTTG
ACCTAATTACTGCTTGTTTACTATTATTATTTTGAAGTATGAGATGGAGTGGACAAGAGG
GTTGTTCTTGTCTGGTGAATCTTTGAAAGTGTTTTGTTCTTTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DM30JQ C 1
AF RS1DM30TF U 1
BS 1 164 RS1DM30TF

RD RS1DM30JQ 164 0 0
TTTTTGGGTACTAATGGAGTTATATGATGACGAAAAACTTGTTGGACTTTGATCCATTTG
ACCTAATTACTGCTTGTTTACTATTATTATTTTGAAGTATGAGATGGAGTGGACAAGAGG
GTTGTTCTTGTCTGGTGAATCTTTGAAAGTGTTTTGTTCTTTTG

QA 1 164 1 164
DS 

RD RS1DM30TF 164 0 0
TTTTTGGGTACTAATGGAGTTATATGATGACGAAAAACTTGTTGGACTTTGATCCATTTG
ACCTAATTACTGCTTGTTTACTATTATTATTTTGAAGTATGAGATGGAGTGGACAAGAGG
GTTGTTCTTGTCTGGTGAATCTTTGAAAGTGTTTTGTTCTTTTG

QA 1 164 1 164
DS 



AS 1 2

CO CL4984Contig1 532 2 2 U
GATTCCGATATGGAGCTCACGGCGCGGAGTTCGGATCAAAACTGCACCGGGGAGAGGCGG
GTACGTACGCGATATAACGTTCAGAAACGTCACGTTCGATGAGCTGAGAGTTGGGGTTGT
GATAAAAACTGACTACAACGAGCATCCGGACGGTGGATTCGACCCTCGATCGTTCCCGGT
GCTCGAGAACATTATCTACACGGGGATATACGGTCAGGGAGTGCGCGTGCCGGTGCGTAT
CCAAGGAAGCAAAGAGATTCCGGTTAGAAACGTAACGTTCAGGGACATGTCGGTGGGGGT
AACTTACAAGAAGAAGCATGTATTCCAGTGTTCTTACGTGCAAGGGCGTGTGATAGGGAC
CGTCTTCCCTGCTCCGTGTGAGAATCTTGATCGGTATGACGAGCAGGAACAGCTGGTGAA
GCAGTCTGATTCCCACAATGTAACAGATATAGATTACGAGATATGAGTCTGACCAAGAAC
ATGTTAAAAAATATTGTTAAACAAATATTTAGCAAAAACTAATACTGTTAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FW84JQ C 1
AF RS1FW84TF U 1
BS 1 491 RS1FW84TF
BS 492 532 RS1FW84JQ

RD RS1FW84JQ 532 0 0
GATTCCGATATGGAGCTCACGGCGCGGAGTTCGGATCAAAACTGCACCGGGGAGAGGCGG
GTACGTACGCGATATAACGTTCAGAAACGTCACGTTCGATGAGCTGAGAGTTGGGGTTGT
GATAAAAACTGACTACAACGAGCATCCGGACGGTGGATTCGACCCTCGATCGTTCCCGGT
GCTCGAGAACATTATCTACACGGGGATATACGGTCAGGGAGTGCGCGTGCCGGTGCGTAT
CCAAGGAAGCAAAGAGATTCCGGTTAGAAACGTAACGTTCAGGGACATGTCGGTGGGGGT
AACTTACAAGAAGAAGCATGTATTCCAGTGTTCTTACGTGCAAGGGCGTGTGATAGGGAC
CGTCTTCCCTGCTCCGTGTGAGAATCTTGATCGGTATGACGAGCAGGAACAGCTGGTGAA
GCAGTCTGATTCCCACAATGTAACAGATATAGATTACGAGATATGAGTCTGACCAAGAAC
ATGTTAAAAAATATTGTTAAACAAATATTTAGCAAAAACTAATACTGTTAGC

QA 1 532 1 532
DS 

RD RS1FW84TF 491 0 0
GATTCCGATATGGAGCTCACGGCGCGGAGTTCGGATCAAAACTGCACCGGGGAGAGGCGG
GTACGTACGCGATATAACGTTCAGAAACGTCACGTTCGATGAGCTGAGAGTTGGGGTTGT
GATAAAAACTGACTACAACGAGCATCCGGACGGTGGATTCGACCCTCGATCGTTCCCGGT
GCTCGAGAACATTATCTACACGGGGATATACGGTCAGGGAGTGCGCGTGCCGGTGCGTAT
CCAAGGAAGCAAAGAGATTCCGGTTAGAAACGTAACGTTCAGGGACATGTCGGTGGGGGT
AACTTACAAGAAGAAGCATGTATTCCAGTGTTCTTACGTGCAAGGGCGTGTGATAGGGAC
CGTCTTCCCTGCTCCGTGTGAGAATCTTGATCGGTATGACGAGCAGGAACAGCTGGTGAA
GCAGTCTGATTCCCACAATGTAACAGATATAGATTACGAGATATGAGTCTGACCAAGAAC
ATGTTAAAAAA

QA 1 491 1 491
DS 



AS 1 2

CO CL4985Contig1 960 2 4 U
GGAACGGAGCAGGAAAAATCTCCATCTCTCTCAAGTCTCAAAAGTCAACAAACTCGAAAA
GTAAGAATACACACTGAACTTTCCATTATATCCCCTCCTCATCTGTGGCTTATCCGAATA
CATCTCTCTGAATTCTTGATTATGAATCACTCGGGATCCTCTCTCATGGTTTCTTCCATT
TCTTCCTCGCCTCCGACTTGGAGATACCACGTCTTCACCAGCTTCCATGGACCAGACGTT
CGTAAAACGTTTCTCAGTCACTTACGCAAACAGTTTGCCTTCAATGGGATTTCGATGTTT
GACGATCGAGTAATCGACAGAGGCCAAACCATTGCCCCTGAACTCACACAAGCAATCAGG
GAATCGAGGATCTCGATCGTGGTGCTGTCCAAGAACTATGCTTCTTCCAGCTGGTGTTTG
GATGAGCTGCTGGAGATTCTGAAGTGCAAGGAAGAAACTGGGCAGATAGTGATGACGGTC
TTCTACGGAGTAGATCCATCTCATGTGCGGAAACAGACAGAAGATTTTGGGAAAGTTTTC
AATGAAACTTGTGCTGGTAATACGGAGGTGAAGAGACAAAAATGGAGCCAGGCTTTGACC
GATGTGGGAAACATAGCCGGCGAGCACTTCCTAGACTGGTTTGTGTCTAATCGTACATTT
CTTATCTGTTTCTTTTTCATCTATTAATAGTGTTATACAGGGGTGGGGATAAAACCTAAA
TCAAACCAAACTAAACTAACCTAACTGAATCCAAACGGATCCAAACCAAAATGAAGTATA
CGGGGGTGATTGGTTGGGCTTAAGTGCTGACTTTAGCTTTATTTTCTATCTACAGCCTTT
AAATTAAAATTCATGTTTTATCTTGTTTTTTTCCCCTTGAAATTCCATTCATAATATTGA
TTAAGCTTTTACATACACCTAATGTACAACCACATGACCTATACGTTGATCTAGACAACC


BQ
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AF RS1BF02TF U 1
AF RS1BF02JQ C 198
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GTAAGAATACACACTGAACTTTCCATTATATCCCCTCCTCATCTGTGGCTTATCCGAATA
CATCTCTCTGAATTCTTGATTATGAATCACTCGGGATCCTCTCTCATGGTTTCTTCCATT
TCTTCCTCGCCTCCGACTTGGAGATACCACGTCTTCACCAGCTTCCATGGACCAGACGTT
CGTAAAACGTTTCTCAGTCACTTACGCAAACAGTTTGCCTTCAATGGGATTTCGATGTTT
GACGATCGAGTAATCGACAGAGGCCAAACCATTGCCCCTGAACTCACACAAGCAATCAGG
GAATCGAGGATCTCGATCGTGGTGCTGTCCAAGAACTATGCTTCTTCCAGCTGGTGTTTG
GATGAGCTGCTGGAGATTCTGAAGTGCAAGGAAGAAACTGGGCAGATAGTGATGACGGTC
TTCTACGGAGTAGATCCATCTCATGTGCGGAAACAGACAGAAGATTTTGGGAAAGTTTTC
AATGAAACTTGTGCTGGTAATACGGAGGTGAAGAGACAAAAATGGAGCCAGGCTTTGACC
GATGTGGGAAACATAGCCGGCGAGCACTTCCTAGACTGGTTTGTGTCTAATCGTACATTT
CTTATCTGTTTCTTTT*CATCTATTAATAGTGT
AT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RS1BF02JQ 763 0 0
TTGGAGATACCACGTCTTCACCAGCTTCCATGGACCAGACGTTCGTAAAACGTTTCTCAG
TCACTTACGCAAACAGTTTGCCTTCAATGGGATTTCGATGTTTGACGATCGAGTAATCGA
CAGAGGCCAAACCATTGCCCCTGAACTCACACAAGCAATCAGGGAATCGAGGATCTCGAT
CGTGGTGCTGTCCAAGAACTATGCTTCTTCCAGCTGGTGTTTGGATGAGCTGCTGGAGAT
TCTGAAGTGCAAGGAAGAAACTGGGCAGATAGTGATGACGGTCTTCTACGGAGTAGATCC
ATCTCATGTGCGGAAACAGACAGAAGATTTTGGGAAAGTTTTCAATGAAACTTGTGCTGG
TAATACGGAGGTGAAGAGACAAAAATGGAGCCAGGCTTTGACCGATGTGGGAAACATAGC
CGGCGAGCACTTCCTAGACTGGTTTGTGTCTAATCGTACATTTCTTATCTGTTTCTTTTT
CATCTATTAATAGTGTTATACAGGGGTGGGGATAAAACCTAAATCAAACCAAACTAAACT
AACCTAACTGAATCCAAACGGATCCAAACCAAAATGAAGTATACGGGGGTGATTGGTTGG
GCTTAAGTGCTGACTTTAGCTTTATTTTCTATCTACAGCCTTTAAATTAAAATTCATGTT
TTATCTTGTTTTTTTCCCCTTGAAATTCCATTCATAATATTGATTAAGCTTTTACATACA
CCTAATGTACAACCACATGACCTATACGTTGATCTAGACAACC

QA 1 763 1 763
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GTTAGTGGTGAACTACAAAGGAAGAGCATACACTCAAAGAGTTGAGCCAAAGCTTGCTCT
TGTCGAATCTGAGCTGCCTAAGGAAGCCTTCTTGGAAGATTGGGAGCCAACAAAAGACTC
ATTTTTGGTGGTAAAAGCTCCAGGTATGAGTCCGTTAAAGATTAGTCTTCCAAGGAGTTA
GGCTGTGTAGCCGCTGCAAGGTGCCACTTGTGAATCAAAAACCGGAGTTCCAGATGTAGC
AGAACCAACTGAAACTCTGATGAAATTCAGATCAGACAAAGTCTTAGTGCCAGACAAGAA
GCCACGTGGAAAGGTTTTCTTTGGTAAGGAGATGGTTTGGAACTGGAACATAAGCAACAG
TGAAGGCAAAGGCAATAAGACAATCAAAGTTGGTGATACCATCTCTGTTGTAAGGAAGAT
GCCTTCTAGAGCTGAAGCAGCTGTTTAACTCTCAACATATTTGCTTTCTTTTCTTCTTCT
GTGTGTTATCTTCTTGTGATCTCTAAACTAAAGTTAAGATATATGATTGCTTGCTTGCTT
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GTGTGATCATGTTTTTCTGTTCC


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AF RS1AL21TF U 1
AF RS1AL21JQ C 131
BS 1 195 RS1AL21TF
BS 196 683 RS1AL21JQ

RD RS1AL21TF 197 0 0
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GTTAGTGGTGAACTACAAAGGAAGAGCATACACTCAAAGAGTTGAGCCAAAGCTTGCTCT
TGTCGAATCTGAGCTGCCTAAGGAAGCCTTCTTGGAAGATTGGGAGCCAACAAAAGACTC
ATTTTTGGTGGTAAA
GC

QA 1 195 1 195
DS 

RD RS1AL21JQ 553 0 0
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CCGCTGCAAGGTGCCACTTGTGAATCAAAAACCGGAGTTCCAGATGTAGCAGAACCAACT
GAAACTCTGATGAAATTCAGATCAGACAAAGTCTTAGTGCCAGACAAGAAGCCACGTGGA
AAGGTTTTCTTTGGTAAGGAGATGGTTTGGAACTGGAACATAAGCAACAGTGAAGGCAAA
GGCAATAAGACAATCAAAGTTGGTGATACCATCTCTGTTGTAAGGAAGATGCCTTCTAGA
GCTGAAGCAGCTGTTTAACTCTCAACATATTTGCTTTCTTTTCTTCTTCTGTGTGTTATC
TTCTTGTGATCTCTAAACTAAAGTTAAGATATATGATTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTCAT
CTAAATCAAACAGACTTCACTTGTTCTGAGAGATACATATCTTGTTGAATGTGTGATCAT
GTTTTTCTGTTCC

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 2

CO CL4988Contig1 976 2 12 U
GGTTAACAGGCAGCTGATCTACAATTTCCCCAAGGAGCTCTTCGCAGACGCTGGTGTACT
TGCTATTGAGCATGCTGACTTCGAAGGAATAGAGCGTCTTGGTCTGGTCACAGGCGGTGA
AATAGCTTCGACCTTTGACAACCCAGAATCTGTTAAGCTTGGACATTGCAAGCTCATCGA
AGAGATCATGATCGGTGAAGACAAGCTGATCCATTTCTCCGGTGTTGAGATGGGCCAGGC
TTGTTCAATTGTCCTAAGGGGTGCTAGTCACCATGTTCTAGACGAGGCTGAAAGATCACT
CCACGATGCCTTATGTGTTCTCTCCCAAACAGTGAATGACAGTAGAGTCTTGCTCGGAGG
TGGATGGCCAGAGATGGTGATGGCAAAGGAAGTAGATGAGCTTGCGAGGAAAACAGCTGG
CAAAAAAATCTCACGCCATCGAAGCTTTCTCACGGGCTCTAGTGGCTATACCGACAACAA
TCGCAGACAATGCTGGTTTGGACAGTGCAGAATTGGTGGCTCAGCTTCGTGCAGAGCACC
ACACTGAAGGGTGTAACGCTGGGATCGACGTCATCTCCGGAGCTGTAGGAGATATGGAGG
AAAGAGGAATCTATGAAGCATTCAAAGTGAAGCAAGCGGTTCTGCTTTCAGCGACAGAAG
CAGCTGAGATGATACTGCGAGTGGATGAGATCATTACATGTGCTCCTAGGAGGAGAGAAG
ACAGGATGTGAAAACACATCACGTGCACATGGTGGGGAGAGAGATTTCATCATTAGACCA
CCACACCCTCCTCCCCAGTGGCCATGTCTAGCACATTGGATTGTGTTTTCGATTTGGATC
AGAAAACAGCTTTAAATGTTTTAATGTTTTGCTTCTTAAACTTTGTTTGTTTTCCTAAAT
CTGAATATTGTTTTGATTTTTTTTTTTGAGGTGTTTTGACAAAATGTGTTCCTAAGAGTT
AAACTTGTCGTCTAGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FS13TF U 1
AF RS1DF33JQ C 251
BS 1 427 RS1FS13TF
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BS 792 976 RS1DF33JQ

RD RS1FS13TF 795 0 0
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TGCTATTGAGCATGCTGACTTCGAAGGAATAGAGCGTCTTGGTCTGGTCACAGGCGGTGA
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CAAAAAA*TCTCACGCCATCGAAGCTTTCTCACGGGCTCTAGTGGCTATACTGACAACAA
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ACACTGAAGGGTGTAACGCTGGGATCGACGTCATCTCCGGAGCTGTAGGAGATATGGAGG
AAAGAGGAATCTATGAAGCATTCAAAGTGAAGCAAGCGGTTCTGCTTTCAGCGACAGAAG
CAGCTGAGATGATACTGCGAGTGGATGAGATCATTACATGTGCTCCTAGGAG*AGAGAAG
ACAGGATGTGAAA*CACATCACGTGCACATGGTGGGGAGAGAGATTTCATCATTAGACCA
C*ACACCCTCC
CCCC

QA 1 791 1 791
DS 

RD RS1DF33JQ 726 0 0
GTCT
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GTGTTCTCTCCCAAACAGTGAATGACAGTAGAGTCTTGCTCGGAGGTGGATGGCCAGAGA
TGGTGATGGCAAAGGAAGTAGATGAGCTTGCGAGGAAAACAGCTGGCAAAAAAATCTCAC
GCCATCGAAGCTTTCTCACGGGCTTTAGTGGCTATACCGACAACAATCGCAGACAATGCT
GGTTTGGACAGTGCAGAATTGGTGGCTCAGCTTCGTGCAGAGCACCACACTGAAGGGTGT
AACGCTGGGATCGACGTCATTTCCGGAGCTGTAGGAGATATGGAGGAAAGAGGAATCTAT
GAAGCATTCAAAGTGAAGCAAGCGGTTTTGCTTTCAGCGACAGAAGCAGCTGAGATGATA
CTGCGAGTGGATGAGATCATTACATGTGCTCCTAGGAGGAGAGAAGACAGGATGTGAAAA
CACATCACGTGCACATGGTGGG*AGAGAGATTTCATGATTAGACCACCACACCCTCCTCC
CCAGTGGCCATGTCTAGCACATTGGATTGTGTTTTCGATTTGGATCAGAAAACAGCTTTA
AATGTTTTAATGTTTTGCTTCTTAAACTTTGTTTGTTTTCCTAAATCTGAATATTGTTTT
GATTTTTTTTTTTGAGGTGTTTTGACAAAATGTGTTCCTAAGAGTTAAACTTGTCGTCTA
GT

QA 5 726 5 726
DS 



AS 1 2

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GTTATCCTGCAGCAACATCTCTCTGAAACCGTCTCTCTCTAAGTCTCTTTATTCTCGTTC
TCTCTGTTGTCTCATTCGCTGCTCACAGGAAGGGAAAGGAGCGGTCAGTCCGTTGGTTTG
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CTTTGTTGATCCTGCTCTTGCTTTTAAGTCAATCCTAAGGCAAGCCAATTTCAAGGGTGC
CAAGTTGTTAGGTGCTAGCTTCTTTGATGCAGACCTAACAGGTGCTGATTTATCCGAAAC
TGATCTCCGAGGTGCAGATTTCTCCTTGGCTAACGTAACAAAGGTGAATTTAACTAACGC
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GTTTTTTTTTTTGTTAGTGATGTTGTTGCAGAGTGAGTGTGTCAGAGTGAGTGTGTATAT
AAATATGCTTACTATTCTCAAGTCCGTTAGACATTCAGAGATCATGTATGCTACAGAACA
ATATAAAAACCCCCAAACATGATGGTGGAACAGAAAGAAAAAAAAACCAGCTGTGTTTTC
TCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RS1DN36TF U 1
AF RS1DN36JQ C 150
BS 1 656 RS1DN36TF
BS 657 844 RS1DN36JQ

RD RS1DN36TF 656 0 0
GGACTGAAACATTTGATCTCGTGGAGAAGACGAACAAATGGCAATTCTCAGTAACGTCTC
GTTATCCTGCAGCAACATCTCTCTGAAACCGTCTCTCTCTAAGTCTCTTTATTCTCGTTC
TCTCTGTTGTCTCATTCGCTGCTCACAGGAAGGGAAAGGAGCGGTCAGTCCGTTGGTTTG
GTCATTAGGAGAAGAGGTTTCAAAGAGAAGTTTACTTGCACTTGTCTCTGCTTCTCTCTT
CTTTGTTGATCCTGCTCTTGCTTTTAAGTCAATCCTAAGGCAAGCCAATTTCAAGGGTGC
CAAGTTGTTAGGTGCTAGCTTCTTTGATGCAGACCTAACAGGTGCTGATTTATCCGAAAC
TGATCTCCGAGGTGCAGATTTCTCCTTGGCTAACGTAACAAAGGTGAATTTAACTAACGC
TAACTTGGAAGGAGCAACTGCTACCGGAAACACATCATTCAAGGGTTCAAACATTACAGG
CGCTGATTTCACTGATGTTCCTCTAAGAGATGATCAACGAGAATACCTTTGCAAAATAGC
TGATGGGGTTAATGCCACCACTGGGAATGCCACACGGGACACATTGCTCTGCAACTGAAC
TTGTCAAGTGTAAACCTTTGTATCGTTGGGGAGTCTTCTTCTTCTGAGTTTTTGTA

QA 1 656 1 656
DS 

RD RS1DN36JQ 695 0 0
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GTTTACTTGCACTTGTCTCTGCTTCTCTCTTCTTTGTTGATCCTGCTCTTGCTTTTAAGT
CAATCCTAAGGCAAGCCAATTTCAAGGGTGCCAAGTTGTTAGGTGCTAGCTTCTTTGATG
CAGACCTAACAGGTGCTGATTTATCCGAAACTGATCTCCGAGGTGCAGATTTCTCCTTGG
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ACACATCATTCAAGGGTTCAAACATTACAGGCGCTGATTTCACTGATGTTCCTTTAAGAG
ATGATCAACGAGAATACCTTTGCAAAATAGCTGATGGGGTTAATGCCACCACTGGGAATG
CCACACGGGACACATTGCTCTGCAACTGAACTTGTCAAGTGTAAACCTTTGTATCGTTGG
GGAGTTTTCTTTTTTTGAGTTTTTGTAAAAGGTTTTTTTTTTTGTTAGTGATGTTGTTGC
AGAGTGAGTGTGTCAGAGTGAGTGTGTATATAAATATGCTTACTATTCTCAAGTCCGTTA
GACATTCAGAGATCATGTATGCTACAGAACAATATAAAAACCCCCAAACATGATGGTGGA
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QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

CO CL4990Contig1 893 2 9 U
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CGAACTTTCACTTCCTGCGGATCTAACCGACGTCAAAGCATATGTTGTCACGGTCCCGTA
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TCGTCGGTTTACTTCCGGTTAGCTGATAATTACTCTTTTTATTTCACCGGTTATTGGATT
CACAGCATACGACGCGACAAACACGAATGATCTCAAAAGATTGAATCTTTCTATCGATGG
GGACAATCCAATAACGATCAAATTCGATCCTTACGTTCCACGTCATCAAAGAAGAGAAAT
CAGATGCGTCGCATTGGGAGATAACGAGTCGTTGTTTTTCAGCGATACGTCAATGAATTA
CAGTTGTGCCACTACTAATTCTCATGGCAATTACGCGCTTGTTGTGGCTCTAAACCAAAA
ACACAACACGAGATCGAAACTAGATTTGGCTCGGAGAAAGTGGTGGTGGATTGCTTTAAC
CATCATAGGAATCTCGGTTTTGCTTTTTGTTGTGATCGTTGGTGTGGTGAAGTTAGTGAG
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TTGGATTGGTCAAAGTAGAATGCCGGCGGCAACGATGGTGAGAACTCAGCCGTGTTTGGA
ATATCATGAAGATTTTCCTTCTTCAAATATACCTTGAATTTTTGTAGTTTCTTGTCGGAA
AATTAATTACCTTTGGCTTGGCTCTGTACAGTGAGTTAACATTCAAAGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
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AF RS1AH55TF U 13
AF RS1AH55JQ C 1
BS 1 12 RS1AH55JQ
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RD RS1AH55TF 523 0 0
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TCCTGCGGATCTAACCGACGTCAAAGCATATGTTGTCACGGTCCCGTAACAGCATGTTCT
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TACGCTAAGAGGATAGCTTTCGTCTACGATACTCTCGGTGATCACTCTTCGTCGGTTTAC
TTCCGGTTAGCTGATAATTACTCTTTTTATTTCACCGGTTATTGGATTCACAGCATACGA
CGCGACAAACACGAATGATCTCAAAAGATTGAATCTTTCTATCGATGGGGACAATCCAAT
AACGATCAAATTCGATCCTTACGTTCCACGTCATCAAAGAAGAGAAATCAGATGCGTCGC
ATTGGGAGATAACGAGTCGTTGTTTTTCAGCGATACGTCA*TGAATTACAGT*GTGCCAC
TACTAATTCTCATGGCA**TACGCGCTTGTTGTGGCTCTAA
CC

QA 1 521 1 521
DS 

RD RS1AH55JQ 893 0 0
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CGAACTTTCACTTC*TGCGGATCTAACCGACGTCAAAGCATATGTTGTCACGGTCC*GTA
ACAGCATGTTCTGGAGAAAAGGAGCAAATTTTAGTGGAGTCTACGTTCCGCCC*ATGGTC
AAAACGATGCCGTACGCTAAGAGGATAGCTTTCGTCTACGATACTCTCGGTGATCACTCT
TCGTCGGTTTACTTCCGGTTAGCTGATAATTACTCTTTT*ATTTCACCGGTTATTGGATT
CACAGCATACGACGCGACAAACACGAATGATCTCAAAAGATTGAATCTTTCTATCGATGG
GGACAATCCAATAACGATCAAATTCGATCCTTACGTTCCACGTCATCAAAGAAGAGAAAT
CAGATGCGTCGCATTGGGAGATAACGAGTCGTTGTTTTTCAGCGATACGTCAATGAATTA
CAGTTGTGCCACTACTAATTCTCATGGCCATTACGCGCTTGTTGTGGCTCTAAACCAAAA
ACACAACACGAGATCGAAACTAGATTTGGCTCGGAGAAAGTGGTGGTGGATTGCTTTAAC
CATCATAGGAATCTCGGTTTTGCTTTTTGTTGTGATCGTTGGTGTGGTGAAGTTAGTGAG
GAAGAAGAGGTTCAGAGAGATGGAAAGAGAGTCTGAGAAGAGTGAGATGGTCGGAAACAT
TTGGATTGGTCAAAGTAGAATGCCGGCGGCAACGATGGTGAGAACTCAGCCGTGTTTGGA
ATATCATGAAGATTTTCCTTCTTCAAATATACCTTGAATTTTTGTAGTTTCTTGTCGGAA
AATTAATTACCTTTGGCTTGGCTCTGTACAGTGAGTTAACATTCAAAGTTTCC

QA 1 893 1 893
DS 



AS 1 2

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ACTCTCCAGGAAGCACAAGCCTCACCGCGGTCTGAATCTCCCTCGAAGTGATGGTGGGCT
TCTTGTTGTACCTCGCGAGCTTCGACGCCTCGCCGGCGAGCTTCTCGAAAATGTCGTTGA
TGAAACTGTTCATGATCCCCATGGCCTTGCTGGAGATTCCGATGTCCGGGTGAACCTGCT
TCAGGACCTTGAAGATGTAGATCTTGTACGTTTCGACGCTCTTCTTCGAACGCTTCTTCT
TCTTGTCGCCGCCTGCGCCTGCATCCTTGGGGAGCTTCTTCCCGGCCTTCGGTTTCTTCT
CCGCCGGAACTTTCTCGGCGGCTTTCGATTTCTCCTCAGCCGGTTTCTTCTCCGCGAGCT
TCTTCTCTGCCTTGGGCGCCATTGATGAGGAAGTTGCAAATCTG


BQ
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AF RS1AF70TF C 1
AF RS1AF70JQ U 25
BS 1 24 RS1AF70TF
BS 25 584 RS1AF70JQ

RD RS1AF70TF 193 0 0
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CTTAGGAGCTGGTAAACTTCGTGACAGCCTTAGTACCCTCGGAGACGGCGTGTTTCGCCA
ACTCTCCAGGAAG

QA 1 193 1 193
DS 

RD RS1AF70JQ 560 0 0
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ACGAGAAAACAAGAAAGGAGCCCTAAAACTCGTAAACTTAGGAGCTGGTAAACTTCGTGA
CAGCCTTAGTACCCTCGGAGACGGCGTGTTTCGCCAACTCTCCAGGAAGCACAAGCCTCA
CCGCGGTCTGAATCTCCCTCGAAGTGATGGTGGGCTTCTTGTTGTACCTCGCGAGCTTCG
ACGCCTCGCCGGCGAGCTTCTCGAAAATGTCGTTGATGAAACTGTTCATGATCCCCATGG
CCTTGCTGGAGATTCCGATGTCCGGGTGAACCTGCTTCAGGACCTTGAAGATGTAGATCT
TGTACGTTTCGACGCTCTTCTTCGAACGCTTCTTCTTCTTGTCGCCGCCTGCGCCTGCAT
CCTTGGGGAGCTTCTTCCCGGCCTTCGGTTTCTTCTCCGCCGGAACTTTCTCGGCGGCTT
TCGATTTCTCCTCAGCCGGTTTCTTCTCCGCGAGCTTCTTCTCTGCCTTGGGCGCCATTG
ATGAGGAAGTTGCAAATCTG

QA 1 560 1 560
DS 



AS 1 2

CO CL4992Contig1 1012 2 2 U
GGATTACACGAGTGTAATAAACTAGGATTGTCGATGTCTTTTTTTAGTTAGTTCCTCCGT
CTTCTGATCTCTTTCGTTGCACCGACTCTCGTTCAATCTTTAGATCCGATCCACAAAACG
ATGTCGATGTCTCATAATGTATCGTTTTTGTTCTTGGCTATATTATTTTTCTCCGTCCTG
CTTCAATCTTCCACAAGCGCAATTGTTAATCCTTCCAAAGTGAAGCAGGTTTCATCCAAA
CCCAGGGCGTTTGTGTATGAAGGGTTCCTCACGGAATTGGAATGTGATCATATGGTTTCG
CTTGCAAAAGCGAGCCTTAAGAGATCAGCTGTAGCTGATAATGATAGTGGAGAGAGCAAG
CTCAGCGAAGTTCGAACCAGCTCTGGCACCTTTATCCCCAAAGCAAAGGATCCCATTGTT
GCTGGTATAGAAGACAAGATCTCCACTTGGACATTTCTTCCTAAAGAGAATGGGGAAGAC
ATTCAGGTACTGAGATACGAGTACGGTCAAAAATACGATGCTCACTTTGACTACTTCCAC
GACAAAGTGAATATTGTACGTGGTGGACACCGCATAGCAACAGTTCTCATGTATCTATCT
AATGTCACAAGAGGTGGAGAAACCGTCTTCCCCCATGCCGAGATACCTTCTCGCCGAGTA
CTATCTGAGAACCAAGAAGACCTATCTGATTGTGCCAAGAAAGGAATTGCCGTGAAACCA
AGGAAAGGGGATGCTTTGTTGTTCTTCAACCTCCACCCTGACGCAATCCCTGACCCGTTT
CTTCACGGTGGATGTCCTGTGATCGAAGGAGAGAAATGGTCAGCGACCAAGTGGATCCAT
GTGGACTCATTTGATAAGATTGTGGCGCCTGGTGGAAACTGTACTGATATGAACGAGAGC
TGTGAGAGATGGGCAGTGCTTGGGGAATGCACAAAGAACCCAGAGTATATGGTTGGTTCT
GCTGAGCTTCCTGGCTATTGCAGGCGTAGCTGTAAGGCTTGCTAGACTATAC


BQ
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AF RS1F210TF U 1
AF RS1F210JQ C 427
BS 1 787 RS1F210TF
BS 788 1012 RS1F210JQ

RD RS1F210TF 787 0 0
GGATTACACGAGTGTAATAAACTAGGATTGTCGATGTCTTTTTTTAGTTAGTTCCTCCGT
CTTCTGATCTCTTTCGTTGCACCGACTCTCGTTCAATCTTTAGATCCGATCCACAAAACG
ATGTCGATGTCTCATAATGTATCGTTTTTGTTCTTGGCTATATTATTTTTCTCCGTCCTG
CTTCAATCTTCCACAAGCGCAATTGTTAATCCTTCCAAAGTGAAGCAGGTTTCATCCAAA
CCCAGGGCGTTTGTGTATGAAGGGTTCCTCACGGAATTGGAATGTGATCATATGGTTTCG
CTTGCAAAAGCGAGCCTTAAGAGATCAGCTGTAGCTGATAATGATAGTGGAGAGAGCAAG
CTCAGCGAAGTTCGAACCAGCTCTGGCACCTTTATCCCCAAAGCAAAGGATCCCATTGTT
GCTGGTATAGAAGACAAGATCTCCACTTGGACATTTCTTCCTAAAGAGAATGGGGAAGAC
ATTCAGGTACTGAGATACGAGTACGGTCAAAAATACGATGCTCACTTTGACTACTTCCAC
GACAAAGTGAATATTGTACGTGGTGGACACCGCATAGCAACAGTTCTCATGTATCTATCT
AATGTCACAAGAGGTGGAGAAACCGTCTTCCCCCATGCCGAGATACCTTCTCGCCGAGTA
CTATCTGAGAACCAAGAAGACCTATCTGATTGTGCCAAGAAAGGAATTGCCGTGAAACCA
AGGAAAGGGGATGCTTTGTTGTTCTTCAACCTCCACCCTGACGCAATCCCTGACCCGTTT
CTTCACG

QA 1 787 1 787
DS 

RD RS1F210JQ 586 0 0
ATAGAAGACAAGATCTCCACTTGGACATTTCTTCCTAAAGAGAATGGGGAAGACATTCAG
GTACTGAGATACGAGTACGGTCAAAAATACGATGCTCACTTTGACTACTTCCACGACAAA
GTGAATATTGTACGTGGTGGACACCGCATAGCAACAGTTCTCATGTATCTATCTAATGTC
ACAAGAGGTGGAGAAACCGTCTTCCCCCATGCCGAGATACCTTCTCGCCGAGTACTATTT
GAGAACCAAGAAGACCTATCTGATTGTGCCAAGAAAGGAATTGCCGTGAAACCAAGGAAA
GGGGATGCTTTGTTGTTTTTCAACCTCCACCCTGACGCAATCCCTGACCCGTTTTTTCAC
GGTGGATGTCCTGTGATCGAAGGAGAGAAATGGTCAGCGACCAAGTGGATCCATGTGGAC
TCATTTGATAAGATTGTGGCGCCTGGTGGAAACTGTACTGATATGAACGAGAGCTGTGAG
AGATGGGCAGTGCTTGGGGAATGCACAAAGAACCCAGAGTATATGGTTGGTTCTGCTGAG
CTTCCTGGCTATTGCAGGCGTAGCTGTAAGGCTTGCTAGACTATAC

QA 1 586 1 586
DS 



AS 1 2

CO CL4993Contig1 826 2 2 U
TGCTAAGATCACTAGCTCCCAGATAACAAAGACTACCACATCAACCCTGTAACAAAGCAA
ACGAGAGACGAATAGCATCAAGTACCACAGTAAGATTGTGCATAGTAACATCTTAACTAT
CAAGCTAACAAAGAATCTATAAATCACAAACTAACACAAGCACAAAGGTCTAAGCTCATG
TAATGCACTAGTATCCGATCTTAGACTAAATGTTTCAGAGGAAGAGCCAAATCACAGCTA
AACGAAGGTTAGATCGCAAATCGTGAATTGATAAAGTAGTTATCTGACCTTGAGGACGAG
AAATTGGAGGGGGAAGAGAAGAAGGATACGGAGGCCCAGTCATGCTTTGACCTAATCTGA
TATTTTTTGAGCTGTTCCGCTAGATTTGATCTCGTTATCATCACTTCCTCCGAAAATCGT
CACCACCCGTCGGAGAACACACGGAGATGCCGAGAAATCCACAGCGACGCGACGATGTTC
GATTCGTTAGGTTTCGGCGATTCGTTGGCGTGGACTCTTTTCTCTCTCTCCCTCCCGACG
TCAATGTCAATAAACATCGGGTCGGGTTATAGATAGATCCGACTCTGTCAGGCCCATATA
ATTTTTTATGCCCGTTAGAGTTGTAATCGCTAAGGCCTCACTTCGTGGCCCATAGCAGTA
AGCTGGTTATGGATATAATATGAAAGCTTTTTATATCATTAGTAGAAGAATTAGGCAATG
CACTGATTGATTCTCGTGTCCCACCAAGTAATAAAGTGAGTGATAAACATCGTTGAATAT
TCATGAGTTGACAGCAATTATCAGGTCCAGACAGGCGGTGAAAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AH31TF U 1
AF RS1AH31JQ C 142
BS 1 196 RS1AH31TF
BS 197 826 RS1AH31JQ

RD RS1AH31TF 213 0 0
TGCTAAGATCACTAGCTCCCAGATAACAAAGACTACCACATCAACCCTGTAACAAAGCAA
ACGAGAGACGAATAGCATCAAGTACCACAGTAAGATTGTGCATAGTAACATCTTAACTAT
CAAGCTAACAAAGAATCTATAAATCACAAACTAACACAAGCACAAAGGTCTAAGCTCATG
TAATGCACTAGTATCC
CGATTCTTAGACTAAAT

QA 1 196 1 196
DS 

RD RS1AH31JQ 685 0 0
AATCACAAACTAACACAAGCACAAAGGTTTAAGCTCATGTAATGCACTAGTATCCGATCT
TAGACTAAATGTTTCAGAGGAAGAGCCAAATCACAGCTAAACGAAGGTTAGATCGCAAAT
CGTGAATTGATAAAGTAGTTATCTGACCTTGAGGACGAGAAATTGGAGGGGGAAGAGAAG
AAGGATACGGAGGCCCAGTCATGCTTTGACCTAATCTGATATTTTTTGAGCTGTTCCGCT
AGATTTGATCTCGTTATCATCACTTCCTCCGAAAATCGTCACCACCCGTCGGAGAACACA
CGGAGATGCCGAGAAATCCACAGCGACGCGACGATGTTCGATTCGTTAGGTTTCGGCGAT
TCGTTGGCGTGGACTCTTTTCTCTCTCTCCCTCCCGACGTCAATGTCAATAAACATCGGG
TCGGGTTATAGATAGATCCGACTCTGTCAGGCCCATATAATTTTTTATGCCCGTTAGAGT
TGTAATCGCTAAGGCCTCACTTCGTGGCCCATAGCAGTAAGCTGGTTATGGATATAATAT
GAAAGCTTTTTATATCATTAGTAGAAGAATTAGGCAATGCACTGATTGATTCTCGTGTCC
CACCAAGTAATAAAGTGAGTGATAAACATCGTTGAATATTCATGAGTTGACAGCAATTAT
CAGGTCCAGACAGGCGGTGAAAAGC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL4994Contig1 1195 2 4 U
GGACACCTTCGGCGTATAGAACCCGATAAGCCGCTTTTGTACAGCTCCGCCGCATCCCCG
AAGCCAACACCAATGGCGTCTCTTCTCCAACCTTCATCTCGACTTCTTCTCCAGAGTCAA
ACTCAACAAAATGTTCGTCAACCATCGCTTCTCCCTCGCTCCTCCCCTAAAACACCGTTC
CTCGTCTCCTTACCCTCACTCCGTCCCTCGAGACCGAACCTCCACCTCTCCACTTCCGCG
TCGAAGAAACCATCGGAGATTTCCACGTCGGAGAACAAAAAAGAGGAAGAAGTAGAAGAG
GAAGTAGAGGAGGACATGATGTGGATTCAGGAGAAGGCGCTTGACCTAGTCGAGTTCACC
GGTTCGGTGACTCAAGCGATTCCAGGTCCCCGAGTCGGAAGCAGCAAGCTGCCGTGGATG
CTCGCCGTCCCTCTGGCTTACGCCGGCGTCACGTTCGTAACCGCCTTCGTTAAAACCGTT
AAGAAGTTCTCTTCTCCTAAAGCACAACGCAAGAAACTGGTGAATCAGAATGCTATGCTT
TGTAGATCTATAGACGAGCTGTTACAGAAAGAAGGGACAGTGAATAGCTCTGAGCTTAAG
GAAATTGAAGAAAAGACAGGGTTTAACATGATGGAGATGTTGAGGAAGTACATTCGCTAT
GCGTTGAATGAGAAGCCGTTTAACCCTGATCTCGTTGCGAGTCTCATTCATCTCAGAAGA
GCTTCTGGTTTGGATGATTCTCAGATTCCTGAGATTTTGAATGAAATCTCTCGTCGTATC
GTTAAAGAAAAAGGTCCTGTTGTGATGAATATGCAAGGCTTTACAGAAAAGGGGTTCAAG
AGAAAACTAGCCGTGCAGGCGCTTTTTGGAAAAATTTACTATCTTTCCGAGCTTCCTGAC
TTCTGCTCAAAAGACAACTCGTTGATGGTCAAGGAAATATTCGGAGTTACAGACGAAGAC
GCAGAGAAGCTGCGGATACACGCCCTTGCTGAAGCTGGAGACATAGACTCACTTGAGAAA
ATGGTGGAATTCGAGAAAGCGGCGGATACTTCGTCGGATATAGACGATACAAATGAAGAA
GACGACACCACCACCACCACCCCTTAAGGATTATCTGTTTAAAAACAACTTCAATACTAG
AGATTTTTCCAAGGTTTTTTTCTTCTGCTATTTGAGTTAATCACAGGTTGTTCAT


BQ
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AF RS1BL01TF U 1
AF RS1BL01JQ C 472
BS 1 765 RS1BL01TF
BS 766 766 RS1BL01JQ
BS 767 792 RS1BL01TF
BS 793 1195 RS1BL01JQ

RD RS1BL01TF 792 0 0
GGACACCTTCGGCGTATAGAACCCGATAAGCCGCTTTTGTACAGCTCCGCCGCATCCCCG
AAGCCAACACCAATGGCGTCTCTTCTCCAACCTTCATCTCGACTTCTTCTCCAGAGTCAA
ACTCAACAAAATGTTCGTCAACCATCGCTTCTCCCTCGCTCCTCCCCTAAAACACCGTTC
CTCGTCTCCTTACCCTCACTCCGTCCCTCGAGACCGAACCTCCACCTCTCCACTTCCGCG
TCGAAGAAACCATCGGAGATTTCCACGTCGGAGAACAAAAAAGAGGAAGAAGTAGAAGAG
GAAGTAGAGGAGGACATGATGTGGATTCAGGAGAAGGCGCTTGACCTAGTCGAGTTCACC
GGTTCGGTGACTCAAGCGATTCCAGGTCCCCGAGTCGGAAGCAGCAAGCTGCCGTGGATG
CTCGCCGTCCCTCTGGCTTACGCCGGCGTCACGTTCGTAACCGCCTTCGTTAAAACCGTT
AAGAAGTTCTCTTCTCCTAAAGCACAACGCAAGAAACTGGTGAATCAGAATGCTATGCTT
TGTAGATCTATAGACGAGCTGTTACAGAAAGAAGGGACAGTGAATAGCTCTGAGCTTAAG
GAAATTGAAGAAAAGACAGGGTTTAACATGATGGAGATGTTGAGGAAGTACATTCGCTAT
GCGTTGAATGAGAAGCCGTTTAACCCTGATCTCGTTGCGAGTCTCATTCATCTCAGAAGA
GCTTCTGGTTTGGATGATTCTCAGATTCCTGAGATTTTGAATGAA*TCTCTCGTCGTATC
GTTAAAGAAAAA

QA 1 792 1 792
DS 

RD RS1BL01JQ 724 0 0
AAAACCGTTAAGAAGTTCTCTTCTCCTAAAGCACAACGCAAGAAACTGGTGAATCAGAAT
GCTATGCTTTGTAGATCTATAGACGAGCTGTTACAGAAAGAAGGGACAGTGAATAGCTCT
GAGCTTAAGGAAATTGAAGAAAAGACAGGGTTTAACATGATGGAGATGTTGAGGAAGTAC
ATTCGCTATGCGTTGAATGAGAAGCCGTTTAACCCTGATCTCGTTGCGAGTCTCATTCAT
CTCAGAAGAGCTTCTGGTTTGGATGATTCTCAGATTCCTGAGATTTTGAATGAAATCTCT
CGTCGTATCGTTAAAGAAAAAGGTCCTGTTGTGATGAATATGCAAGGCTTTACAGAAAAG
GGGTTCAAGAGAAAACTAGCCGTGCAGGCGCTTTTTGGAAAAATTTACTATCTTTCCGAG
CTTCCTGACTTCTGCTCAAAAGACAACTCGTTGATGGTCAAGGAAATATTCGGAGTTACA
GACGAAGACGCAGAGAAGCTGCGGATACACGCCCTTGCTGAAGCTGGAGACATAGACTCA
CTTGAGAAAATGGTGGAATTCGAGAAAGCGGCGGATACTTCGTCGGATATAGACGATACA
AATGAAGAAGACGACACCACCACCACCACCCCTTAAGGATTATCTGTTTAAAAACAACTT
CAATACTAGAGATTTTTCCAAGGTTTTTTTCTTCTGCTATTTGAGTTAATCACAGGTTGT
TCAT

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL4995Contig1 954 2 4 U
GGGATGCGTCACGGTGACCGCATTGACCAAGTCGACCCACTCTGGCTCGACACCGCTGCG
AGACCTTGGGACCCTCCGCTCGTTCACGACGGTATGGTTCGCGCGTTTCGAACTGGTCAA
CGGATTCGATCTCAGATACCATTTCCCATCCACAGGGTCTTCGTCTCTCCCTTCATCCGC
TGCGTCCAGACTGCTTCAGAAGTGGTCAACGCTCTCACTGCCATCGATCTTGACCCTAAC
GCTACGTCGTCTAAAGACGTCCTCTCCATCGACAAATCCAAGCTCAAGGTTTCTATTGAG
TTCGGATTAAGCGAGATGCTTAACACAATATCTATTAAGCCTGAGATTGCCCCTAGAGAT
AGAAAATTCGAGTTCTTGATTTCTGATCTTGAAGCTATGTTTCCTGAGGGAATGGTGGAT
CATAATGCGGTTCCTGCTTATAAAGAGATGCCACGATGGGGAGAGACCGTACAAGGATGC
ACTGTTCGATTTCTTAATGTTGTTAACACACTTGCTAATAGGTATCCTTCAGAGAACTTG
CTCTTAGTCACTCACGGGGAAGGAGTAAGGACTACATTTGCAACCTATAAAGAGGTTGAT
GTATACGACATTGAGTACTGTGCTTGTGCTGAACTGAGAAGGCAGATCTCGAGTCAAGGC
GGGTCTACAAAAGCTGGACACTTTGAGGTCATAACAAGTCTTGGTCAATCTGGAATCAAG
TATCATTAACCACCACAGCAGAGCAATGATCATGTCCTTGGACAAACTCAGGTTTAGTCA
AATGTCTTCGAAAGATCATCATGCCATTGGGGAACCAAACCGGATTCTGGATATCTAGAA
TTTTCCGGTTAACCTGCCTTGCACTTCATTACAGAAGGAAATATATAACGAGAACAACAT
TGTAGTCAATCCAAGAAAATTAATAAAAGATATTTTAACTGCCCTTCAAAGCAG


BQ
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AF RS1EQ86TF U 1
AF RS1EQ86JQ C 199
BS 1 671 RS1EQ86TF
BS 672 672 RS1EQ86JQ
BS 673 684 RS1EQ86TF
BS 685 954 RS1EQ86JQ

RD RS1EQ86TF 684 0 0
GGGATGCGTCACGGTGACCGCATTGACCAAGTCGACCCACTCTGGCTCGACACCGCTGCG
AGACCTTGGGACCCTCCGCTCGTTCACGACGGTATGGTTCGCGCGTTTCGAACTGGTCAA
CGGATTCGATCTCAGATACCATTTCCCATCCACAGGGTCTTCGTCTCTCCCTTCATCCGC
TGCGTCCAGACTGCTTCAGAAGTGGTCAACGCTCTCACTGCCATCGATCTTGACCCTAAC
GCTACGTCGTCTAAAGACGTCCTCTCCATCGACAAATCCAAGCTCAAGGTTTCTATTGAG
TTCGGATTAAGCGAGATGCTTAACACAATATCTATTAAGCCTGAGATTGCCCCTAGAGAT
AGAAAATTCGAGTTCTTGATTTCTGATCTTGAAGCTATGTTTCCTGAGGGAATGGTGGAT
CATAATGCGGTTCCTGCTTATAAAGAGATGCCACGATGGGGAGAGACCGTACAAGGATGC
ACTGTTCGATTTCTTAATGTTGTTAACACACTTGCTAATAGGTATCCTTCAGAGAACTTG
CTCTTAGTCACTCACGGGGAAGGAGTAAGGACTACATTTGCAACCTATAAAGAGGTTGAT
GTATACGACATTGAGTACTGTGCTTGTGCTGAACTGAGAAGGCAGATCTCGAGTCAAGGC
GGGTCTACAAA*GCTGGACACTTT

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1EQ86JQ 756 0 0
GAAGTGGTCAACGCTCTCACTGCCATCGATCTTGACCCTAACGCTACGTCGTCTAAAGAC
GTCCTCTCCATCGACAAATCCAAGCTCAAGGTTTCTATTGAGTTCGGATTAAGCGAGATG
CTTAACACAATATCTATTAAGCCTGAGATTGCCCCTAGAGATAGAAAATTCGAGTTCTTG
ATTTCTGATCTTGAAGCTATGTTTCCTGAGGGAATGGTGGATCATAATGCGGTTCCTGCT
TATAAAGAGATGCCACGATGGGGAGAGACCGTACAAGGATGCACTGTTCGATTTCTTAAT
GTTGTTAACACACTTGCTAATAGGTATCCTTCAGAGAACTTGCTTTTAGTCACTCACGGG
GAAGGAGTAAGGACTACATTTGCAACCTATAAAGAGGTTGATGTATACGACATTGAGTAC
TGTGCTTGTGCTGAACTGAGAAGGCAGATCTCGAGTCAAGGCGGGTCTACAAAAGCTGGA
CACTTTGAGGTCATAACAAGTCTTGGTCAATCTGGAATCAAGTATCATTAACCACCACAG
CAGAGCAATGATCATGTCCTTGGACAAACTCAGGTTTAGTCAAATGTCTTCGAAAGATCA
TCATGCCATTGGGGAACCAAACCGGATTCTGGATATCTAGAATTTTCCGGTTAACCTGCC
TTGCACTTCATTACAGAAGGAAATATATAACGAGAACAACATTGTAGTCAATCCAAGAAA
ATTAATAAAAGATATTTTAACTGCCCTTCAAAGCAG

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL4996Contig1 933 2 2 U
TTTTTTTTAAATATCATTTCCTTTGTGATTTTTATTTATATATATTATAAATGGGAATTG
AGATGAATCCTGATGAGAATTTTGTTATATATGAGAGATTATTGTAATGGTGAGATGATA
TGTTTGCCAAAAGCCAACTGATATTTGAAATTGTACTAATCTCTAAGGTTTTATTGGTTT
CGTTGCTCATATTTGACTTAAAATCATTTTTGTTGAGTTTATTCTCCATAATCATTTTTG
TTGATCATATGTATGATTCTTAATCTGGGTTCTGTGTTTTAATGGAACTGGGTTATGAAG
ACACTGAGGCTTTTGTCTTTTCTGATGTTGGTGAGGTTGGAAGAGGGGAGGTTAAGGTGG
AGAGTGGTGAGGAGGAGGAAGAGGAGAGTCAGAGTGATGATTCTGAGATTGTTTTACTCT
TGACTCTCTTCTGATGAAGACGTCTCCACTTATTTCAGCGACTTTGGAACTGTGGAAGAT
GTGAGGATCCCATATCAGCAGCAGAGGATGTATGGGTTTGCTACTTTTGCCAATGCTGAA
ACTGTGAGAACCATATTGGCTCGTGGGAACCCTCATTTCATCTGTGACTCACGTGTGCTT
GTTAAACCTTACAAGGAGAAAGGAAATATCCTTCAAAACAGGAGGCAACAAAAGCAACTT
CAAGAGCTGATGGAGAGAGGGAACTATTCTACTTTTTCAAGTTCTGGAATGGATCTATAT
GAATGTCACTTAGGTTAGTTTTTGTTAGAGTTAAGAAACGTGTTTTGTTGTTTGTTTCTT
ACCGAGATCGTAACTCTTCATGTGTCTTGTTGATACCAGGACCAAGTTTAGATACTCTTT
TCTTGTTTCTCAGTTTCAGTAACTTCATTTGAGATTGTTACTACAATTTCCTTTTTTTTC
CTAAGAATTCCTAAATGAAATACATCATTGGAC


BQ
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AF RS1CI74TF U 1
AF RS1CI74JQ C 149
BS 1 637 RS1CI74TF
BS 638 933 RS1CI74JQ

RD RS1CI74TF 637 0 0
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AGATGAATCCTGATGAGAATTTTGTTATATATGAGAGATTATTGTAATGGTGAGATGATA
TGTTTGCCAAAAGCCAACTGATATTTGAAATTGTACTAATCTCTAAGGTTTTATTGGTTT
CGTTGCTCATATTTGACTTAAAATCATTTTTGTTGAGTTTATTCTCCATAATCATTTTTG
TTGATCATATGTATGATTCTTAATCTGGGTTCTGTGTTTTAATGGAACTGGGTTATGAAG
ACACTGAGGCTTTTGTCTTTTCTGATGTTGGTGAGGTTGGAAGAGGGGAGGTTAAGGTGG
AGAGTGGTGAGGAGGAGGAAGAGGAGAGTCAGAGTGATGATTCTGAGATTGTTTTACTCT
TGACTCTCTTCTGATGAAGACGTCTCCACTTATTTCAGCGACTTTGGAACTGTGGAAGAT
GTGAGGATCCCATATCAGCAGCAGAGGATGTATGGGTTTGCTACTTTTGCCAATGCTGAA
ACTGTGAGAACCATATTGGCTCGTGGGAACCCTCATTTCATCTGTGACTCACGTGTGCTT
GTTAAACCTTACAAGGAGAAAGGAAATATCCTTCAAA

QA 1 637 1 637
DS 

RD RS1CI74JQ 785 0 0
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TTTGTTGAGTTTATTCTCCATAATCATTTTTGTTGATCATATGTATGATTCTTAATCTGG
GTTCTGTGTTTTAATGGAACTGGGTTATGAAGACACTGAGGCTTTTGTCTTTTCTGATGT
TGGTGAGGTTGGAAGAGGGGAGGTTAAGGTGGAGAGTGGTGAGGAGGAGGAAGAGGAGAG
TCAGAGTGATGATTCTGAGATTGTTTTACTCTTGACTCTCTTCTGATGAAGACGTCTCCA
CTTATTTCAGCGACTTTGGAACTGTGGAAGATGTGAGGATCCCATATCAGCAGCAGAGGA
TGTATGGGTTTGCTACTTTTGCCAATGCTGAAACTGTGAGAACCATATTGGCTCGTGGGA
ACCCTCATTTCATCTGTGACTCACGTGTGCTTGTTAAACCTTACAAGGAGAAAGGAAATA
TCCTTCAAAACAGGAGGCAACAAAAGCAACTTCAAGAGCTGATGGAGAGAGGGAACTATT
CTACTTTTTCAAGTTCTGGAATGGATCTATATGAATGTCACTTAGGTTAGTTTTTGTTAG
AGTTAAGAAACGTGTTTTGTTGTTTGTTTCTTACCGAGATCGTAACTCTTCATGTGTCTT
GTTGATACCAGGACCAAGTTTAGATACTCTTTTCTTGTTTCTCAGTTTCAGTAACTTCAT
TTGAGATTGTTACTACAATTTCCTTTTTTTTCCTAAGAATTCCTAAATGAAATACATCAT
TGGAC

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

CO CL4997Contig1 823 2 2 U
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ATGTTTTACTTCCTTCTTGCCCTAACAGCTGTTTTGGCTGCCACCGCAAACGCCGGACCA
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TTTATCGGACAGGAGCGTTCAGATCTCAGGAGGGGCATTCCCGTGAAATTTTCAAACTGG
AGGTCTAGAGTTGGGTTCGTCCCCGAATCAGAGAACCTCAACATCGAGATGGATGTCGAA
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BQ
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AF RS1FG77TF U 1
AF RS1FG77JQ C 405
BS 1 569 RS1FG77TF
BS 570 823 RS1FG77JQ

RD RS1FG77TF 569 0 0
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ATGTTTTACTTCCTTCTTGCCCTAACAGCTGTTTTGGCTGCCACCGCAAACGCCGGACCA
GTTCTCGACGTGAATGGTGATATCATATTCGGCGGCAGTTACTACGCTATCTCCGTCATC
AGTGGCGCTGGAGGTGGCGGCCTAACTCTCACCCCCCGTAATGGCAACCAGTGTCCCCTC
TTTATCGGACAGGAGCGTTCAGATCTCAGGAGGGGCATTCCCGTGAAATTTTCAAACTGG
AGGTCTAGAGTTGGGTTCGTCCCCGAATCAGAGAACCTCAACATCGAGATGGATGTCGAA
CCTACGTTCTGCGCTGAGTCAACTTATTGGTGGGTCACTCCAGCCCCCAGTCCCTGGAGA
TCGTTGGTCATAGCGGTTGGTCCTAAGCCAGAAGCTGGAGGAGAAGATTCGTCGAGGAGT
CTCTTCCAGATCAAGAAAACTAGTGAAAACCCTAACGCTTACAAGTTTGCATATTGTAGG
GACGGTAACGATTGCACCGATGTCGGTAG

QA 1 569 1 569
DS 

RD RS1FG77JQ 419 0 0
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AGATTCGTCGAGGAGTCTCTTCCAGATCAAGAAAACTAGTGAAAACCCTAACGCTTACAA
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CGTTCGGGGTTTGGTTATAGGCTCTACCCCACCATTCGCTAGCCCATTCGAGGTTATGTT
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AAGACCACTTAATGAAGAGGATAAGAGTTATAACTTACGTCTAATAATAAAACTCTTTCC
CTTTATGCTGTTTTCTTTGTTCGTCGATCATCATCATCGTATCTGGAATAAAAACAATT

QA 1 419 1 419
DS 



AS 1 2

CO CL4998Contig1 1130 2 2 U
ACTAGTCTTCTGCGTCTTTCGTGATCTCATTGCTCTCTCCATTCTCGCTCCTCTTGCTTA
TATCCGTGACAAGAAGACAAGACCTCCTTTGAACCGACGCTTTCTCTTAGCTTTCTTCTT
CCTCGGCTTAACTGGGATATTTGGGAACCAGCTTTTGTTCCTCGTCGGTCTCAATTACAC
CAATCCCACTTATGCTGCAGCCATTCAGCCCTCTATTCCTGTTTTTACTTTCATCTTGGC
TCTCGTTATGGGAACAGAGAGATTGAATTTATTCAAACTAGAAGGTCAAGCTAAGGTAGG
AGGTACGCTGGCCTGTGTCTCTGGGGCCGTGTTGATGGTTTTGTTTCGTGGACCGGCTTT
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CTTGATTGGGAACTGCACTTGCATGGCTGCTTTTCTTGCTATTCAGGCTCCAGTGTTGAA
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GGTGACATCTGCTTTTTTCATGACCAATGAGTCAACCAACTGGAGTCTCACAAGATCCGA
GTTCTTTGCAGTTGTCTACGCAGGAGTAATCGCATCTGCCCTTAACTATGGTCTCTTGAC
GTGGTCAAATAAGATTTTGGGTCCTTCCTTGGTTGCTCTTTATAACCCTCTTCAACCTGC
AGCCTCGGCCTTCTTGTCCAGAATCTTCCTAGGAAGCCCTATCTACTTGGGGAGCATTTT
AGGCGGGTGTGCAATCATCGCAGGTCTTTGCAGTGTCACTTGGGCGTCTTACAAGGAAAA
GAAAGCAGCAACAGCAGCAGCAGGTACCATCCCGATCACCTCAAAGGAAGTTGAACCTTT
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GTCACCAAAATCTGCTGACTGAACCAACTTTCAGGCTTCTTGAAATCGGGCCTGTGATGT
TTTCTTAATCCTCTTTTGCGGCAGTAGTGACTATTATACTTTTCAAACAG


BQ
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AF RS1BC85TF U 1
AF RS1BC85JQ C 417
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BS 476 1130 RS1BC85JQ

RD RS1BC85TF 475 0 0
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TATCCGTGACAAGAAGACAAGACCTCCTTTGAACCGACGCTTTCTCTTAGCTTTCTTCTT
CCTCGGCTTAACTGGGATATTTGGGAACCAGCTTTTGTTCCTCGTCGGTCTCAATTACAC
CAATCCCACTTATGCTGCAGCCATTCAGCCCTCTATTCCTGTTTTTACTTTCATCTTGGC
TCTCGTTATGGGAACAGAGAGATTGAATTTATTCAAACTAGAAGGTCAAGCTAAGGTAGG
AGGTACGCTGGCCTGTGTCTCTGGGGCCGTGTTGATGGTTTTGTTTCGTGGACCGGCTTT
GTTTGGGGAAACAGAGCCTGACTTCTTGGGTCATGGTGAAATAAGACACCCTGAAGCATC
TGGACACTTGGGGTCTAGCTTTCTCAATGGACTTGGGAGATGGAATCTGGGAGTT

QA 1 475 1 475
DS 

RD RS1BC85JQ 714 0 0
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TGTGCTTGATTGGGAACTGCACTTGCATGGCTGCTTTTCTTGCTATTCAGGCTCCAGTGT
TGAAGAAGTATCCGGCAAATCTTTCAGTTACAGCGTACTCGTATTTCTTTGGGACCATGT
TCATGGTGACATCTGCTTTTTTCATGACCAATGAGTCAACCAACTGGAGTCTCACAAGAT
CCGAGTTCTTTGCAGTTGTCTACGCAGGAGTAATCGCATCTGCCCTTAACTATGGTCTCT
TGACGTGGTCAAATAAGATTTTGGGTCCTTCCTTGGTTGCTCTTTATAACCCTCTTCAAC
CTGCAGCCTCGGCCTTCTTGTCCAGAATCTTCCTAGGAAGCCCTATCTACTTGGGGAGCA
TTTTAGGCGGGTGTGCAATCATCGCAGGTCTTTGCAGTGTCACTTGGGCGTCTTACAAGG
AAAAGAAAGCAGCAACAGCAGCAGCAGGTACCATCCCGATCACCTCAAAGGAAGTTGAAC
CTTTGATCTACAAAGACCATAAGAACAAACCAATGGGACATCTATTCACAAACATTCCCA
TCTCGTCACCAAAATCTGCTGACTGAACCAACTTTCAGGCTTCTTGAAATCGGGCCTGTG
ATGTTTTCTTAATCCTCTTTTGCGGCAGTAGTGACTATTATACTTTTCAAACAG

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL4999Contig1 585 2 3 U
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AAAAGAATCTTTTCTGTAATGGAAATCTTAAAAAAATTTCACGAAGCCAGGAAGCGGAAA
GAGCACATATGATATATATAAACAAATAAACTCATAACACACATAATTAACAAACACAAG
TACATAAATATAGTTTAAAATCAGGAATATTGAATAATATATTACCAGGAAGCTGCCATG
GCTCACAAATATGCAAGTCAATCTCCACAAGATCACTAGCACCCTTCAAGGCTTCATCAA
CGTCATCATCCTCAACATCACCGTGGTCAGATTTGGCCCTAATCTTGTTGCAAAGATAAT
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TATCTTTCAACCCCATTATGTGAATAAATAAGTAACTTAATATGT


BQ
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AF RS1BU30JQ U 175
AF RS1BU30TF C 1
BS 1 174 RS1BU30TF
BS 175 339 RS1BU30JQ
BS 340 585 RS1BU30TF

RD RS1BU30JQ 165 0 0
ATAAAAAAAAGAATCTTTTCTGTAATGGAAATCTTAAAAAAATTTCACGAAGCCAGGAAG
CGGAAAGAGCACATATGATATATATAAACAAATAAACTCATAACACACATAATTAACAAA
CACAAGTACATAAATATAGTTTAAAATCAGGAATATTGAATAATA

QA 1 165 1 165
DS 

RD RS1BU30TF 585 0 0
GGTCAATCTACAAATCCGGAATTTATGTGAACATATCCTCCGTTTCTGTGTGTTTATTGA
ACATGTAGGTAGGATCTGACTAATACACAAGATTAAAACATCATTAAATTATTTAGACAA
ACGATGCAAAGAACAAAACCCGATTTTACGAATCTGTTATCTCTTTTATGTTCAATAAAA
AAAAGAATCTTTTCTGTAATGGAAATCTTAAAAAAATTTCACGAAGCCAGGAAGCGGAAA
GAGCACATATGATATATATAAACAAATAAACTCATAACACACATAATTAACAAACACAAG
TACATAAATATAGTTTAAAATCAGGAATATTGAATAATATATTACCAGGAAGCTGCCATG
GCTCACAAATATGCAAGTCAATCTCCACAAGATCACTAGCACCCTTCAAGGCTTCATCAA
CGTCATCATCCTCAACATCACCGTGGTCAGATTTGGCCCTAATCTTGTTGCAAAGATAAT
GACAAACTAACTCTTCATCGCTTGGATGAAACCGAAACCCCGGTGGCAATTTGGACCCAA
TATCTTTCAACCCCATTATGTGAATAAATAAGTAACTTAATATGT

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 2

CO CL5000Contig1 445 2 1 U
GACTTTCGAATTGGTAGGGATCGGTCTATTGATTTGGGAGCTGGAGAGCTCTTCCCATCC
CGTTCAGTTCTCCTTTTGCTTCACATTGGATCAGTCTCGTCAAGACTGGTTCGATACGAA
GCAAACGAGAATTGAACGGAACAAAGCACATCTTCTTCTGGTGTAATCTTCCATTCACAA
GCTATGAAGTTAACAATACACCTCTATTCTCCACCGCTGATGTTTGGATTGGCCATGGGA
GAGTAGGGACTAGGGATGCTCTTGAATTTATCTCCAGGGGTAGTTTTAATTATGTTTATT
TGGTTTGTTCATGATTTCTCTCAGTTCTGAAACTTATCAAGGCTTTGTTGTTATGTATTG
TTTAGCTAACTCTGTGAGATCTATGGCTTGTAATTAATTTATGCTACTCACCATTCCTAT
TATTCTGATGATGCAGCCAATTTAT


BQ
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AF RS1GA89JQ C 1
AF RS1GA89TF U 1
BS 1 445 RS1GA89TF

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DS 

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GCAAACGAGAATTGAACGGAACAAAGCACATCTTCTTCTGGTGTAATCTTCCATTCACAA
GCTATGAAGTTAACAATACACCTCTATTCTCCACCGCTGATGTTTGGATTGGCCATGGGA
GAGTAGGGACTAGGGATGCTCTTGAATTTATCTCCAGGGGTAGTTTTAATTATGTTTATT
TGGTTTGTTCATGATTTCTCTCAGTTCTGAAACTTATCAAGGCTTTGTTGTTATGTATTG
TTTAGCTAACTCTGTGAGATCTATGGCTTGTAATTAATTTATGCTACTCACCATTCCTAT
TATTCTGATGATGCAGCCAATTTAT

QA 1 445 1 445
DS 



AS 1 2

CO CL5001Contig1 1106 2 2 U
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GGCGATTAGGGTTTCACCACCCTTTCGCCGCCGTTGATTTCGCCTCACGCGTATCAACGA
GAAGCTTCTTCCTCTTCCCTTCCTTCCTCTCCTTCCATGGCGCCGCTTGTAGCAGGTCCA
GCTTTCCTTCCACGCCCTCCCTCAGACCCACCAGATTCGAGTTTGAAGGTTGTTCTCCCG
TTAAATCCTCCAGATCCGCCGGTTCCTCCTGACCCTCCGCCTGATACATTATTTTTCATG
GGTTTCCTTCAGTTGTACGATCTATGGGTCGCAGTTGCTTTTCCCCATAAGTTCTCAGAT
CCAGATATATGTTCGATGATTTCATATGAACTAGTTTCGTTGGATCCGAGCTTTTATGTG
TTAGTTCCGACTGTTTCGGTTGCATTTCGTTATGCTGCCTCTGTTGGCACTTTTGTGGTC
TATGAGTGGTCCTTTACTGCAGTATGCAGGTGTTGTCCATTTACTGCAGTATGCAGGCTT
ACTTCCACCTTTGCTCTAATGGCTTTTGCAATGATAAGGCATTCTCTCCTCTTGTGGCAG
CTTGGAGTGAAAGTTCTTAAATTATGTATCCTTCCAACAAATCTGGTTTGTTTGGGCAGT
AATTGCCTTTATTTCTCCTTTAAGGAGTGTTTTGTCCTCCCACATCTATCACTTGTTATT
AGTGAAATTGTTATAGGGAGCATTGTTTTGAAGATGGTTCTGTATGAAGCAGAAGCGAAG
GTGTTTATCGTCTCTCGTTTAGATGGTGTCAACTGTCTGACCTCTTTGACCATGGAGGTT
TTCATCCCTCCCCTTTATTGTTTCGAACAGGAATGTCAAGTTGAAGAAGTCTTCTTGTTT
GACTGTCCACTTTCGGAGACAACGGTGGTTGAACTTGTGATATCACCTTTATCTTTAAGC
TTTTATTTGAGTACTTGTTTAAGCTTTCTCAATTGCTTGTCCAGTGTATTGGTCTATGAT
TTGGTTTGTTTGGTTCCTTGTAGCCTTATTGTATCCTCCATTGATGGAGTTAAACTCTTT
TAAGTTTCAATGAAAGTTGTTTGACC


BQ
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AF RS1GJ68TF U 1
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BS 532 1106 RS1GJ68JQ

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GGCGATTAGGGTTTCACCACCCTTTCGCCGCCGTTGATTTCGCCTCACGCGTATCAACGA
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TTAAATCCTCCAGATCCGCCGGTTCCTCCTGACCCTCCGCCTGATACATTATTTTTCATG
GGTTTCCTTCAGTTGTACGATCTATGGGTCGCAGTTGCTTTTCCCCATAAGTTCTCAGAT
CCAGATATATGTTCGATGATTTCATATGAACTAGTTTCGTTGGATCCGAGCTTTTATGTG
TTAGTTCCGACTGTTTCGGTTGCATTTCGTTATGCTGCCTCTGTTGGCACTTTTGTGGTC
TATGAGTGGTCCTTTACTGCAGTATGCAGGTGTTGTCCATTTACTGCAGTA

QA 1 531 1 531
DS 

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TAAGGCATTCTCTCCTCTTGTGGCAGCTTGGAGTGAAAGTTCTTAAATTATGTATCCTTC
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TGGTTCTGTATGAAGCAGAAGCGAAGGTGTTTATCGTCTCTCGTTTAGATGGTGTCAACT
GTCTGACCTCTTTGACCATGGAGGTTTTCATCCCTCCCCTTTATTGTTTCGAACAGGAAT
GTCAAGTTGAAGAAGTCTTCTTGTTTGACTGTCCACTTTCGGAGACAACGGTGGTTGAAC
TTGTGATATCACCTTTATCTTTAAGCTTTTATTTGAGTACTTGTTTAAGCTTTCTCAATT
GCTTGTCCAGTGTATTGGTCTATGATTTGGTTTGTTTGGTTCCTTGTAGCCTTATTGTAT
CCTCCATTGATGGAGTTAAACTCTTTTAAGTTTCAATGAAAGTTGTTTGACC

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 2

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TCACCTATATACATTTTACAACGTTCTGATTGAGGCTCCTCTACTCCAGTGTTTGAAGAC
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TATTTTCTTTTATGGTGTCCATCATAATGACCTTGGCGGGAGAAGATTGACTCGTGATAT
CCTCACTGCTATGTCGATGGTCAGCGAACTATTTATTCGTTGTAGTTTTTGGGAGGAAAT
CATTCCATACATCTTTCCTCGAAGCTTCAGTTTTGTTCCTTGTCAAGATTGACGAGTCAA
TATATTTACCTTGATCTGGAAATGTTACTAAATCTACTTCAGAGCTGCCCAAAACTAGAA
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CTTTTATGCATCGCTCTACTCGACTTGTTTTTGTCTGTTTGATTTTTGTTTTTGCAGATA
GGGGATGCCTCCTTGGTTTATAGAGAAAATAGAGAAGCAAAAGCGATGTCTTCGACAGTG
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GAAAGAGAAATGAAACTAGTAAAGTATTTCCTGGAGAATTCAACAATCCTGGAGAAACTG
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CTTGCTATGCAAAGATGCTCGAGCACTTGCCAAGTTCTTGTTCTTTAATTGGTAGTTGAA
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TGGGTTTTTAGGCAAAATATTTTTAGTGGTTTAATTCTTTATATAGTGTATAGGACGGAA
TCATATTATCTACTATTTTATTTCAGGAGAT


BQ
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AF RS1BX63TF U 1
AF RS1BX63JQ C 216
BS 1 709 RS1BX63TF
BS 710 991 RS1BX63JQ

RD RS1BX63TF 709 0 0
TCGGTACTCTGTTAAAGTTGCAAAGGGTTTACAAGTGCGCTCTCGGACGCTAAAGAGAAT
TCACCTATATACATTTTACAACGTTCTGATTGAGGCTCCTCTACTCCAGTGTTTGAAGAC
TGATGTTAACTTGAGAAATCAATTTGAGATCATCCATTCGGGTTTCTTAGACAAAGTAGA
TATTTTCTTTTATGGTGTCCATCATAATGACCTTGGCGGGAGAAGATTGACTCGTGATAT
CCTCACTGCTATGTCGATGGTCAGCGAACTATTTATTCGTTGTAGTTTTTGGGAGGAAAT
CATTCCATACATCTTTCCTCGAAGCTTCAGTTTTGTTCCTTGTCAAGATTGACGAGTCAA
TATATTTACCTTGATCTGGAAATGTTACTAAATCTACTTCAGAGCTGCCCAAAACTAGAA
TCTCTCAACTTGTTGGTGAATAGCTTTACACCCTTTTATGACGCAATTAGTTTGTCAAAG
CTTTTATGCATCGCTCTACTCGACTTGTTTTTGTCTGTTTGATTTTTGTTTTTGCAGATA
GGGGATGCCTCCTTGGTTTATAGAGAAAATAGAGAAGCAAAAGCGATGTCTTCGACAGTG
CCTCCATGTTTGGTGTCATCCCTCAAGTTTATGGAATTGAAAAGTCGAATCTTCGTATAT
GAAAGAGAAATGAAACTAGTAAAGTATTTCCTGGAGAATTCAACAATCC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1BX63JQ 776 0 0
GCGGGAGAAGATTGACTCGTGATATCCTCACTGCTATGTCGATGGTCAGCGATCTATTTA
TTCGTTGTAGTTTTTGGGAGGAAATCATTCCATACATCTTTCCTCGAAGCTTCAGTTTTG
TTCCTTGTCAAGATTGACGAGTCAATATATTTACCTTGATCTGGAAATGTTACTAAATCT
ACTTCAGAGCTGCCCAAAACTAGAATCTCTCAACTTGTTGGTGAATAGCTTTACACCCTT
TTATGACGCAATTAGTTTGTCAAAGCTTTTATGCATCGCTCTACTCGACTTGTTTTTGTC
TGTTTGATTTTTGTTTTTGCAGATAGGGGATGCCTCCTTGGTTTATAGAGAAAATAGAGA
AGCAAAAGCGATGTCTTCGACAGTGCCTCCATGTTTGGTGTCATCCCTCAAGTTTATGGA
ATTGAAAAGTCGAATCTTCGTATATGAAAGAGAAATGAAACTAGTAAAGTATTTCCTGGA
GAATTCAACAATCCTGGAGAAACTGACAATAAGTCTTCGTGATGACAATAGCATTAAGGC
AAAGCATGTCATCCTCGGTGAAATCCTTGCTATGCAAAGATGCTCGAGCACTTGCCAAGT
TCTTGTTCTTTAATTGGTAGTTGAACAGTTGGGTTTTGTAGTTGAGGCTATTTTTGTAGT
TGTTAAATTGATTAATTTAATCAGTTGGGTTTTTAGGCAAAATATTTTTAGTGGTTTAAT
TCTTTATATAGTGTATAGGACGGAATCATATTATCTACTATTTTATTTCAGGAGAT

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

CO CL5003Contig1 963 2 4 U
AGGATGAGAAAGAGACGAAACATCTGGAAGCTCTCGAAGGTGCATCCACGCGCCTCCATC
TGTTCGAGATGGATCTACTAACTATGACACTGTTTCCGCCGCCGTCAACGGCTGCGCCGG
CGTTTTCCACCTCGCATCTCCCTGTATCGTCGACGAAGTCCAAGATCCTCAGAAGCAACT
ACTTGATCCAGCGGTTAAGGGGACATTAAATGTACTAACGGCGGCGAAAGAAGCCGGGGT
GAAGAGAGTTGTGGTGACGTCTTCCATATCGGCGATTACCCCAAGCCCCAACTGGCCTGC
TGATAAGATCAAGAACGAGGAGTGTTGGGCTGATCAAGACTTCTGCAAGCAAAATGGATT
GTGGTATCCACTTTCTAAGACGCTTGCTGAGAAGGCAGCTTGGGAGTTTGCAGAGGAGAA
GGGATTGGATGTGGGTTGTGGGTGAATCCAGGAACCGTCATGGGTCCCGTCATCCCTCCA
TCGATCAACGCTAGCATGCTCATGCTTCTACGCCTCCTTCAGGGGTGTACAGAGACGTAC
GAGAACTTCTTCATGGGTTCGGTGCATTTCAAGGATGTGGCATTAGCTCATATTCTTGTC
TACGAGAACCCATCTGCGAAAGGAAGACACTTGTGCGTTGAGGCTATCTCTCACTACGGT
GATTTTGTTGCCAAAGTAGCTGAACTCTATCCTAATTACAATGTCCCCAAGTTGCCGAGA
GAGACTCAACCGGGTTTACTCCGAGCTAAGAACGCAGCGAAGAAGCTGATGGAATTGGGG
TTAGAGTTCAGTTCCATGGAGGATATCATCAAGGACGGTGTGGAGAGTCTTAAAAGCAAA
GGATTTATCTCTTAAAACTCATTTGCGTTATTTAGCAGTGAGCTAATTATGGTGGCAGCA
GAATCATGTCATTGTTATATGATACTTCGCAATTTGAATAAATAAGCTACCCCTTGCTGT
ACT


BQ
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10 10 10 

AF RS1BW50TF U 1
AF RS1BW50JQ C 148
BS 1 642 RS1BW50TF
BS 643 643 RS1BW50JQ
BS 644 655 RS1BW50TF
BS 656 963 RS1BW50JQ

RD RS1BW50TF 655 0 0
AGGATGAGAAAGAGACGAAACATCTGGAAGCTCTCGAAGGTGCATCCACGCGCCTCCATC
TGTTCGAGATGGATCTACTAACTATGACACTGTTTCCGCCGCCGTCAACGGCTGCGCCGG
CGTTTTCCACCTCGCATCTCCCTGTATCGTCGACGAAGTCCAAGATCCTCAGAAGCAACT
ACTTGATCCAGCGGTTAAGGGGACATTAAATGTACTAACGGCGGCGAAAGAAGCCGGGGT
GAAGAGAGTTGTGGTGACGTCTTCCATATCGGCGATTACCCCAAGCCCCAACTGGCCTGC
TGATAAGATCAAGAACGAGGAGTGTTGGGCTGATCAAGACTTCTGCAAGCAAAATGGATT
GTGGTATCCACTTTCTAAGACGCTTGCTGAGAAGGCAGCTTGGGAGTTTGCAGAGGAGAA
GGGATTGGATGTGGGTTGTGGGTGAATCCAGGAACCGTCATGGGTCCCGTCATCCCTCCA
TCGATCAACGCTAGCATGCTCATGCTTCTACGCCTCCTTCAGGGGTGTACAGAGACGTAC
GAGAACTTCTTCATGGGTTCGGTGCATTTCAAGGATGTGGCATTAGCTCATATTCTTGTC
TACGAGAACCCATCTGCGAAAGGAAGACACTTGTGCGTTGAG*CTATCTCTCACT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1BW50JQ 816 0 0
CGTCGACGAAGTCCAAGATCCTCAGAAGCAACTACTTGATCCAGCGGTTAAGGGGACATT
AAATGTACTAACGGCGGCGAAAGAAGCCGGGGTGAAGAGAGTTGTGGTGACGTCTTCCAT
ATCGGCGATTACCCCAAGCCCCAACTGGCCTGCTGATAAGATCAAGAACGAGGAGTGTTG
GGCTGATCAAGACTTCTGCAAGCAAAATGGATTGTGGTATCCACTTTCTAAGACGCTTGC
TGAGAAGGCAGCTTGGGAGTTTGCAGAGGAGAAGGGATTGGATGTGG*TTGTGG*TGAAT
CCAGGAACCGTCATGGGTCCCGTCATCCCTCCATCGATCAACGCTAGCATGCTCATGCTT
TTACGCCTCCTTCAGGGGTGTACAGAGACGTACGAGAACTTCTTCATGGGTTCGGTGCAT
TTCAAGGATGTGGCATTAGCTCATATTCTTGTCTACGAGAACCCATCTGCGAAAGGAAGA
CACTTGTGCGTTGAGGCTATCTCTCACTACGGTGATTTTGTTGCCAAAGTAGCTGAACTC
TATCCTAATTACAATGTCCCCAAGTTGCCGAGAGAGACTCAACCGGGTTTACTCCGAGCT
AAGAACGCAGCGAAGAAGCTGATGGAATTGGGGTTAGAGTTCAGTTCCATGGAGGATATC
ATCAAGGACGGTGTGGAGAGTCTTAAAAGCAAAGGATTTATCTCTTAAAACTCATTTGCG
TTATTTAGCAGTGAGCTAATTATGGTGGCAGCAGAATCATGTCATTGTTATATGATACTT
CGCAATTTGAATAAATAAGCTACCCCTTGCTGTACT

QA 1 816 1 816
DS 



AS 1 2

CO CL5004Contig1 655 2 1 U
AAAAGTTCTTGGAGATATAATTAAAAAAAAAGGCTTTTAGATACAAATTCAAATTCATAG
TGAAAATGGAAAATCTTTTATAAATCCCATATTATTAGGTCAACCTGAACCGAAATCACC
AAAACAGATTCAAAATCGTTGATACAATAACCTAACACCAATTACTTACTGACAAAGCTT
GGATTTTCCTACGTTAGGGTTTATTCTTATTACCAGAACTCATCTATAGGAGTGATCACG
AACTGAACTCGTGTATGAAGTTGTTTAGATCGGTAAAAGAAGACCCTCCTTCTTCCACAG
CTGCCTTAGCCATCTCTGCCAATTTCTTTATCCGTATCTTCCTTTCCTCTGCCTCTCCCC
AAGCCAACACCTCTCTCACAGCCTTCTCAAGTTTCTCTCTGCTAACGATTTCATCTCCCA
TATTTCTCACATGTTTTGTGGCTCCAACGCTCACACCTGTTCCCAGCACTTGTGTAACCA
ATTTCTCGTTGTAGAATTGCTCCGCTCAGATAGGCCATGTCACCATCGGTAGCCCTGCAG
TCACTCCTTCAAGAAGCGAGTTCCAGCCGCAATGTGTCACAAACCCACCGGTTGCTTGGT
GCTCAAGTATCAACACCTGTGGAGCCCATCCTCTTACTATCATCCCTCTCCCTTT


BQ
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AF RS1H796JQB U 1
AF RS1GC01JQ U 1
BS 1 655 RS1GC01JQ

RD RS1H796JQB 489 0 0
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ATTTCTCGT

QA 1 489 1 489
DS 

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AAAAGTTCTTGGAGATATAATTAAAAAAAAAGGCTTTTAGATACAAATTCAAATTCATAG
TGAAAATGGAAAATCTTTTATAAATCCCATATTATTAGGTCAACCTGAACCGAAATCACC
AAAACAGATTCAAAATCGTTGATACAATAACCTAACACCAATTACTTACTGACAAAGCTT
GGATTTTCCTACGTTAGGGTTTATTCTTATTACCAGAACTCATCTATAGGAGTGATCACG
AACTGAACTCGTGTATGAAGTTGTTTAGATCGGTAAAAGAAGACCCTCCTTCTTCCACAG
CTGCCTTAGCCATCTCTGCCAATTTCTTTATCCGTATCTTCCTTTCCTCTGCCTCTCCCC
AAGCCAACACCTCTCTCACAGCCTTCTCAAGTTTCTCTCTGCTAACGATTTCATCTCCCA
TATTTCTCACATGTTTTGTGGCTCCAACGCTCACACCTGTTCCCAGCACTTGTGTAACCA
ATTTCTCGTTGTAGAATTGCTCCGCTCAGATAGGCCATGTCACCATCGGTAGCCCTGCAG
TCACTCCTTCAAGAAGCGAGTTCCAGCCGCAATGTGTCACAAACCCACCGGTTGCTTGGT
GCTCAAGTATCAACACCTGTGGAGCCCATCCTCTTACTATCATCCCTCTCCCTTT

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 2

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CTTTGGTTCAGTCACTTGGCTCTCTTTGCAAAGCTTGTAAACCCGAGGTGGATGTGGAGG
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ACTTCTGGCTTTTG


BQ
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AF RS1B068TF U 1
AF RS1B068JQ C 646
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BS 678 709 RS1B068TF
BS 710 794 RS1B068JQ

RD RS1B068TF 709 0 0
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CCAGTAGACCAGAGGA*CTCGTGAATCGATGTATCAACGGTGCAGATTG

QA 1 709 1 709
DS 

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ATTGTTTGACGATTGGTGTGAGGAAACAGAGCAACGGTGTTAGTGGCTACTTGATTAACA
CACGATGGCAGAAGAACTTCTGGCTTTTG

QA 1 149 1 149
DS 



AS 1 2

CO CL5006Contig1 1078 2 2 U
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CATCGTAGAAACATTGTGGAGGAGGCGAAGAGAATGGGGAAAGGAGGGGAAGAGCAGAGT
AACGGTTCCGAATCGTTAAAGCCTGATACATTCCTCGCTTGGGCCAAAGACGTTAGAGAA
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CGTCATCAGATCTACGGTTTGAACGAGTTAGAGAAGCCTGAAGGGACGTCGCTTTTCAAG
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TCCTTCGTGCTGGCCTTTGTCGATGGAGATGAAGGAGGTGAGATGGGGATCACTGCCTTT
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ATACTGATAGATGAAGTTCTCAAGTTTGTAGGAAGGTTGACTAGTGGATACCGCTACACA
CGTCGCACTCCCTCTGTGAAGCAAAAGGAGGAGTAAGAAGATTTGTAAACGTAAAGCATC
ATATTATTTATTTAAAGACTCTAGTTTTAGCTTTAATATTATTCACTTTGTTGCTTTAAC
TTAATGTCAGTGTCGTTGGTTATTTTAAAATTTTCCAAACGATTCCATTTGGATTGAT


BQ
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AF RS1B535TF U 1
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BS 1 610 RS1B535TF
BS 611 1078 RS1B535JQ

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CGTCATCAGATCTACGGTTTGAACGAGTTAGAGAAGCCTGAAGGGACGTCGCTTTTCAAG
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TCCTTCGTGCTGGCCTTTGTCGATGGAGATGAAGGAGGTGAGATGGGGATCACTGCCTTT
GTTGAGCCGCTTGTGATCTTCTTGATCTTGATTGTGAATGCGATCGTTGGGATCTGGCAG
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GTGACGCGGGACGGGGTTAAAGTTTCTAGCTTGCCTGCTAAGGAGCTTGTTCCCGGGGAT
GTTGTGGAGC

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DS 

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CTAGCTTGCCTGCTAAGGAGCTTGTTCCCGGGGATGTTGTGGAGCTCAGGGTGGGTGATA
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TTTAGCTTTAATATTATTCACTTTGTTGCTTTAACTTAATGTCAGTGTCGTTGGTTATTT
TAAAATTTTCCAAACGATTCCATTTGGATTGAT

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1E846TF U 1
AF RS1E846JQ C 223
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TATGGAGTTTGAGGTTGGTGCTGATGTTGAAGTCAATGCAGATGGAGGTAAGGCTCATAA
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TTGTGCTTTGATGAATCTGCTCGTGATTTTTCTGATTCTTTAACTGATTAATGGTTTTGA
TTTT
A

QA 1 724 1 724
DS 

RD RS1E846JQ 604 0 0
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CCTAATCCAAACAAAGACCAAGGTATTTATTACGACGACGTCCACCTCTCTTTCTCCACC
AACAGCTCCTCTCTCGTTAACTACACAGTGCCAAGATTCTACCAAGGACACAAGAAGAAG
GCCAAGAAGTGGGGTCAGGCTGTGTCTTTGAACAACCAGACGGTTTTACGAGCGGTTTTG
CCTAATGGGTCGGCATTTTTTAGGATGGATCTGAAGACGCGGGTGAGGTTCAAGATTGTT
TTCTGGAAGACTAAGAGGTATGGAGTT*GAGGTTGGTGCTGATGTTGAAGTCAATGCAGA
TGGAGGTAAGGCTCATAAGAAAGGGATTAATATGAAGAAATCTGATTCTTCTACTAGGTT
AAGAAGCTGTTTTCTTATTTGTGCTTTGATGAATCTGCTCGTGATTTTTCTGATTCTTTA
ACTGATTAATGGTTTTGATTTTTATTTGCTTTTCATGAGTTTTGTTGACTCTTTTCATGA
GTTTTTTGTGTGTTTTAGTTCCATTTTTCTTCTTTCTTCTTATTCGTAGTTTCTAAATTC
GACC

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 2

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CAGAATCAACAGGGTTCGATCGATGAGAAGAGCATCGGATTTGGGTTTCCTAGTTTTGCT
TTCAGTGGATCCATGGGGCTAATGGCTGTGCCCAAGAAGAAGGTTTCTAAACACAAGAGA
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GGGCGAGTCAAGCTCCCACATTTCTTCTGTTGCAGCGGTGAGCGGGTAAACCCCAGTGAG
CAAGGCCACTAGAACTGATGACCAAGATCTCCTATTTGATTACTCCCTGTTGGATATCCA
TAGGGGTACATCTTGGGTTTCTTAGTCAGTGATACTATAGACTTAGTTGATTCTGTTTTT
TTGTCAAATTATCTGGGTTTCAGCTGCAAGATCAATATCCTCCTGCTTCCTTTTTCTTGA
CAAGTTATGTTGTTGACATTGCTTGTTGCAAAGTTTAGGCCAGCTCATTATATATGTGCT
CTTAGACTTAAAATCAACAGCTACATCTACTTTAAATAAAGAGAAATATCTTCCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D474TF U 1
AF RS1D474JQ C 154
BS 1 635 RS1D474TF
BS 636 715 RS1D474JQ

RD RS1D474TF 635 0 0
GTGAGAGAAGAAACTGCTGCATCAATGGCGTTGAGACTGACATCGCTGAAACGCGCCGCG
GCTGAGTTATGCCGCATCTTGGAAGTCCGAAGCTTCAGCCACGTCGCGGGTATGCCTCCG
CCTTTTAACAGCGTCATCGATCGACCCATCGCTATGCCGCCGCTAATTGCACCTGAGAAT
CAGAATCAACAGGGTTCGATCGATGAGAAGAGCATCGGATTTGGGTTTCCTAGTTTTGCT
TTCAGTGGATCCATGGGGCTAATGGCTGTGCCCAAGAAGAAGGTTTCTAAACACAAGAGA
GGGATAAATGGGCCAAAGGCTCTTAAGCCTGTTCCTGTCATCATCCGTTGCAGGAGTTGC
GGGCGAGTCAAGCTCCCACATTTCTTCTGTTGCAGCGGTGAGCGGGTAAACCCCAGTGAG
CAAGGCCACTAGAACTGATGACCAAGATCTCCTATTTGATTACTCCCTGTTGGATATCCA
TAGGGGTACATCTTGGGTTTCTTAGTCAGTGATACTATAGACTTAGTTGATTCTGTTTTT
TTGTCAAATTATCTGGGTTTCAGCTGCAAGATCAATATCCTCCTGCTTCCTTTTTCTTGA
CAAGTTATGTTGTTGACATTGCTTGTTGCAAAGTT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1D474JQ 562 0 0
ATGCCGCCGCTAATTGCACCTGAGAATCAGAATCAACAGGGTTCGATCGATGAGAAGAGC
ATCGGATTTGGGTTTCCTAGTTTTGCTTTCAGTGGATCCATGGGGCTAATGGCTGTGCCC
AAGAAGAAGGTTTCTAAACACAAGAGAGGGATAAATGGGCCAAAGGCTCTTAAGCCTGTT
CCTGTCATCATCCGTTGCAGGAGTTGCGGGCGAGTCAAGCTCCCACATTTCTTCTGTTGC
AGCGGTGAGCGGGTAAACCCCAGTGAGCAAGGCCACTAGAACTGATGACCAAGATCTCCT
ATTTGATTACTCCCTGTTGGATATCCATAGGGGTACATCTTGGGTTTCTTAGTCAGTGAT
ACTATAGACTTAGTTGATTCTGTTTTTTTGTCAAATTATCTGGGTTTCAGCTGCAAGATC
AATATCCTCCTGCTTCCTTTTTCTTGACAAGTTATGTTGTTGACATTGCTTGTTGCAAAG
TTTAGGCCAGCTCATTATATATGTGCTCTTAGACTTAAAATCAACAGCTACATCTACTTT
AAATAAAGAGAAATATCTTCCC

QA 1 562 1 562
DS 



AS 1 2

CO CL5009Contig1 188 2 3 U
CCAAAAAAGCGTCATTTGCATAGTTGTAAATGATCTTTGGCAATAAAATCCGTGTCCCCT
TTTCAAATTCAACACTTGTTTGTATGAAACTGTCTCTTGCTTGCCTAAGTTCTTGGAGTA
TTCCTTCCGCTGTATAAACTCCAACCATTGGATCGGTTAATTTTCCAGTTGAAAGGGCAA
AATGAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D724JQ U 34
AF RS1BA88JQ U 1
BS 1 56 RS1BA88JQ
BS 57 57 RS1D724JQ
BS 58 188 RS1BA88JQ

RD RS1D724JQ 105 0 0
TT
TTTGGCAATAAAATCCGTGTCCCCTTTTCAAATTCAACACTTGTTTGTATGAAACTGTCT
CTTGCTTGCCTAATTTCTTGGAGTATTCCTTCCGCTGTA
AAAA

QA 3 101 3 101
DS 

RD RS1BA88JQ 188 0 0
CCAAAAAAGCGTCATTTGCATAGTTGTAAATGATCTTTGGCAATAAAATCCGTGTCTCCT
TTTCAAATTCAACACTTGTTTGTATGAAACTGTCTCTTGCTTGCCTAAGTTCTTGGAGTA
TTCCTTCCGCTGTATAAACTCCAACCATTGGATCGGTTAATTTTCCAGTTGAAAGGGCAA
AATGAAAA

QA 1 188 1 188
DS 



AS 1 2

CO CL5010Contig1 384 2 1 U
AATTTCTTACAAATTCAAAGAGCTTGAAAATGAGTACAGCCACTTTCGTAGAGATCCTTC
TGGCTATCCTCTTGCCTCCTCTCGGCGTCTTTCTCAAATTTGGCTTAAAGGTTGAGTTTT
GGATATGTTTGATCTTGACGCTGTTTGGTTATCTTCCCGGGATCCTTTACGCTCTTTATA
TCATCACCAAGGACTGATTTTCATCTCATTTGTTTTTCCTCTCGGTCTCCTTGAGGAACA
GCTGTTTCGTCGTCGTGATCTCCCATTTGGGACTGCTTCGTAATTTGTTTTATATGCTCT
GAGTAATTAATATCATTGTTGTATTTGTATTATTATTTACTTTATGCTAAATATATATGA
AGAAGAATTCGTTGGTTTATGTGA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1GL94JQ C 1
AF RS1GL94TF U 1
BS 1 384 RS1GL94TF

RD RS1GL94JQ 384 0 0
AATTTCTTACAAATTCAAAGAGCTTGAAAATGAGTACAGCCACTTTCGTAGAGATCCTTC
TGGCTATCCTCTTGCCTCCTCTCGGCGTCTTTCTCAAATTTGGCTTAAAGGTTGAGTTTT
GGATATGTTTGATCTTGACGCTGTTTGGTTATCTTCCCGGGATCCTTTACGCTCTTTATA
TCATCACCAAGGACTGATTTTCATCTCATTTGTTTTTCCTCTCGGTCTCCTTGAGGAACA
GCTGTTTCGTCGTCGTGATCTCCCATTTGGGACTGCTTCGTAATTTGTTTTATATGCTCT
GAGTAATTAATATCATTGTTGTATTTGTATTATTATTTACTTTATGCTAAATATATATGA
AGAAGAATTCGTTGGTTTATGTGA

QA 1 384 1 384
DS 

RD RS1GL94TF 384 0 0
AATTTCTTACAAATTCAAAGAGCTTGAAAATGAGTACAGCCACTTTCGTAGAGATCCTTC
TGGCTATCCTCTTGCCTCCTCTCGGCGTCTTTCTCAAATTTGGCTTAAAGGTTGAGTTTT
GGATATGTTTGATCTTGACGCTGTTTGGTTATCTTCCCGGGATCCTTTACGCTCTTTATA
TCATCACCAAGGACTGATTTTCATCTCATTTGTTTTTCCTCTCGGTCTCCTTGAGGAACA
GCTGTTTCGTCGTCGTGATCTCCCATTTGGGACTGCTTCGTAATTTGTTTTATATGCTCT
GAGTAATTAATATCATTGTTGTATTTGTATTATTATTTACTTTATGCTAAATATATATGA
AGAAGAATTCGTTGGTTTATGTGA

QA 1 384 1 384
DS 



AS 1 2

CO CL5011Contig1 819 2 2 U
TTTTTTTTAGTCAGTGCAATAAACAGTTTCCTAAACAGTTATTTTATTATAATAAGAGTA
CTATAAAAATGTTGATAAAAATAAAGAAATAATGAAGATGTGTTCGTGTTCGTGTAGCGG
AGATAACGTAGTTGGTTTCTAGAGAGAGACAGAAGCTCTAAAAAAGGGTTTGAAACGAAG
AAGACGAGGAGATTAAAACACCAAGAAAGAAAGAAACTTTAACCAAAACAAATGTCGTTC
CGCAGCATAGTTCGTGACGTGAGAGACAGTATAGGAAGCCTATCAAGGCGTAGATTCGAC
TTTAAGCTAAGCAGCCTACACAAAGAAGGAGGCAAATCTCGTGGCTCGGTTCAAGACTGT
CACGAGGAACTACAACAAGAACAGGCTCTGGTACTTGTTCAAGAAACCCTTTGGGCGAAT
CTTCCTCCTGAGCTGTTGCATGATGTGATCAAAAGGCTGGAAGAGATATGTGCAAAGAGG
TTGTTCAAAGGCCTGAGCTCTCCGGCAAAATCACGTTCCCTGTTTCCCTCAAACAGCCTG
GACCAAGAGATGCAACAATGCAATGCTTTATCAAAAGGGATAAGTCTAACCTCACTTACC
ATCTATACCTTTGTCTCAGTCCTGCTCTGTTGGTTGAGAATGGAAAGTTTCTTCTTTCGG
CGAAACGCACAAGAAGAAGCACTTACACCGAGTACGTGATCTCCATGCACGCAGAGACCA
TTTCGAGATCAAACAACACCTACATTGGCAAGATAGTCTAACTTTCTTGGCACAAAGTTC
ATCATATACGACACACAGCCTCCATACACAACCCTCTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1G322JQ C 1
AF RS1AX52TF U 104
BS 1 107 RS1G322JQ
BS 108 819 RS1AX52TF

RD RS1G322JQ 202 0 0
TTTTTTTTAGTCAGTGCAATAAACAGTTTCCTAAACAGTTATTTTATTATAATAAGAGTA
CTATAAAAATGTTGATAAAAATAAAGAAATAATGAAGATGTGTTCGTGTTCGTGTAGCGG
AGATAACGTAGTTGGTTTCTAGAGAGCGACAGAAGCTCTAAAAAAGGGTTTGAAACGAAG
AAGACGAGGAGATTAAAACACC

QA 1 202 1 202
DS 

RD RS1AX52TF 716 0 0
GGGA
GTTCGTGTAGCGGAGATAACGTAGTTGGTTTCTAGAGAGAGACAGAAGCTCTAAAAAAGG
GTTTGAAACGAAGAAGACGAGGAGATTAAAACACCAAGAAAGAAAGAAACTTTAACCAAA
ACAAATGTCGTTCCGCAGCATAGTTCGTGACGTGAGAGACAGTATAGGAAGCCTATCAAG
GCGTAGATTCGACTTTAAGCTAAGCAGCCTACACAAAGAAGGAGGCAAATCTCGTGGCTC
GGTTCAAGACTGTCACGAGGAACTACAACAAGAACAGGCTCTGGTACTTGTTCAAGAAAC
CCTTTGGGCGAATCTTCCTCCTGAGCTGTTGCATGATGTGATCAAAAGGCTGGAAGAGAT
ATGTGCAAAGAGGTTGTTCAAAGGCCTGAGCTCTCCGGCAAAATCACGTTCCCTGTTTCC
CTCAAACAGCCTGGACCAAGAGATGCAACAATGCAATGCTTTATCAAAAGGGATAAGTCT
AACCTCACTTACCATCTATACCTTTGTCTCAGTCCTGCTCTGTTGGTTGAGAATGGAAAG
TTTCTTCTTTCGGCGAAACGCACAAGAAGAAGCACTTACACCGAGTACGTGATCTCCATG
CACGCAGAGACCATTTCGAGATCAAACAACACCTACATTGGCAAGATAGTCTAACTTTCT
TGGCACAAAGTTCATCATATACGACACACAGCCTCCATACACAACCCTCTCA

QA 5 716 5 716
DS 



AS 1 2

CO CL5012Contig1 1168 2 2 U
GGCAACCAACTATGCGCAATGCTGCTCAAGCGGTTCACGATACCTTGCCAACACCTTCAG
TTTCAGCTTCTACTAAGAAGCACAAACCAAACCAGCCAGTTCCTTCTCAACCATTCGCTT
CACCTCCTTTCCACCCTCAAGCTGATCCCACTGACCAATTTGCTTCATGGAAGGCTAAAC
GAGGATCTGTTCCCAATGCCAAGGGCAAAAAGCATAAACCAGGTTTCCCTGGTGGTTCGT
CTTCTGCAAAACCTATCTCATACCATCCTTCAGATCAACAACCTCCACGAGGACAAGGCA
TGAACAGATTACCATCTGGTCCCACCAGTTCAAGTGAACCCACAAACGGACCCGAACCTG
AGTCCTTTGTAGGAAGAAAAGTTAGAACAAGGTGGCCAGAAGACAATACATTTTACGAGG
CTGTCATCACCAAGTACAATCCCGTTGAGGGTCGCCATGCTTTGGTTTATGACATTGGAA
CACCTAGCGAGACATGGGAATGGGTCAATCTCTCAGAGATATCTCCTGGGGATATTGAGT
GGATAGGAGAGGGTCCTGCGGTTGGTAATCAGTATGGTTATAACGGACAAGGTCTTAATA
GAACCACAGGACCGAACAGTGTTCCTCAACGAGGAAGCGGTGTGGTAAAGACCACGGTTA
AAAAAGATTTCAGAACATCGCAGAATGGAACTGGGAAAAGGAAACATATGGATATACGAA
TCCGTCAGACCAGTGTCCTAATCAGAGAGGTGGAGAGAGTTCTTGGCTCACACAATCCAG
ATCCTCAAGAAATTGAAAGGGCTAAGAGAATGTTGGAGGAGCAAGAACAAGCGCTTGTGG
GTGCAATCGCAAAGCTTGGAGATATATCCGATGGAGAAAACGAAGGTGGCTTTCGTCGCT
AAACTTGTGTGTTTTGATAGAATCAAGCAGTTTTGCCATGGTTTCCATTAAAGAAGAGAG
CATTTGTTGAGATCAAAAGGTCAGAGTCTCAACTTCTTTGATGTGTTACCCTTTTTGGTT
GTATCTGACTGTAATTTTTGCTGACAGTTAGAGATTAGATCTTTACCTTAATGTTGGTTT
TGTTGGATATATTAGAACACGAATCAGACAATAAAGATTCGTGTTCCTTTATCAGACTCA
AATGGTGGAAGTGAGTAAAATATAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BP85TF U 1
AF RS1BP85JQ C 379
BS 1 660 RS1BP85TF
BS 661 1168 RS1BP85JQ

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TTTCAGCTTCTACTAAGAAGCACAAACCAAACCAGCCAGTTCCTTCTCAACCATTCGCTT
CACCTCCTTTCCACCCTCAAGCTGATCCCACTGACCAATTTGCTTCATGGAAGGCTAAAC
GAGGATCTGTTCCCAATGCCAAGGGCAAAAAGCATAAACCAGGTTTCCCTGGTGGTTCGT
CTTCTGCAAAACCTATCTCATACCATCCTTCAGATCAACAACCTCCACGAGGACAAGGCA
TGAACAGATTACCATCTGGTCCCACCAGTTCAAGTGAACCCACAAACGGACCCGAACCTG
AGTCCTTTGTAGGAAGAAAAGTTAGAACAAGGTGGCCAGAAGACAATACATTTTACGAGG
CTGTCATCACCAAGTACAATCCCGTTGAGGGTCGCCATGCTTTGGTTTATGACATTGGAA
CACCTAGCGAGACATGGGAATGGGTCAATCTCTCAGAGATATCTCCTGGGGATATTGAGT
GGATAGGAGAGGGTCCTGCGGTTGGTAATCAGTATGGTTATAACGGACAAGGTCTTAATA
GAACCACAGGACCGAACAGTGTTCCTCAACGAGGAAGCGGTGTGGTAAAGACCACGGTTA

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DS 

RD RS1BP85JQ 790 0 0
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ATCCCGTTGAGGGTCGCCATGCTTTGGTTTATGACATTGGAACACCTAGCGAGACATGGG
AATGGGTCAATCTCTCAGAGATATCTCCTGGGGATATTGAGTGGATAGGAGAGGGTCCTG
CGGTTGGTAATCAGTATGGTTATAACGGACAAGGTCTTAATAGAACCACAGGACCGAACA
GTGTTCCTCAACGAGGAAGCGGTGTGGTAAAGACCACGGTTAAAAAAGATTTCAGAACAT
CGCAGAATGGAACTGGGAAAAGGAAACATATGGATATACGAATCCGTCAGACCAGTGTCC
TAATCAGAGAGGTGGAGAGAGTTCTTGGCTCACACAATCCAGATCCTCAAGAAATTGAAA
GGGCTAAGAGAATGTTGGAGGAGCAAGAACAAGCGCTTGTGGGTGCAATCGCAAAGCTTG
GAGATATATCCGATGGAGAAAACGAAGGTGGCTTTCGTCGCTAAACTTGTGTGTTTTGAT
AGAATCAAGCAGTTTTGCCATGGTTTCCATTAAAGAAGAGAGCATTTGTTGAGATCAAAA
GGTCAGAGTCTCAACTTCTTTGATGTGTTACCCTTTTTGGTTGTATCTGACTGTAATTTT
TGCTGACAGTTAGAGATTAGATCTTTACCTTAATGTTGGTTTTGTTGGATATATTAGAAC
ACGAATCAGACAATAAAGATTCGTGTTCCTTTATCAGACTCAAATGGTGGAAGTGAGTAA
AATATAGACC

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 2

CO CL5013Contig1 926 2 2 U
CAATAATGGATGAGGCTACTAGGACAACTTCGCTCAAGAATAACCCTGCAGCGCTCTTAG
CAATGTGTTGGTACTGGGCTTCTGATGGCGTTGGTTCCAAGGATATGGTTATCCTTCCTT
ACAAGGATAGCTTATTGCTATTTAGCCGGTATCTGCAGCAGTTGGTCATGGAATCACTAG
GAAAGGAGTTTGATCTTGACGGTAACACTGTTAATCAAGGGCTAACTGTATATGGAAACA
AAGGGAGCACAGATCAGCATGCCTACATTCAACAACTGAGGGAGGGTGTGCACAACTTCT
TTGCAACCTTCATAGAAGTGCTACGTGACAGACCTCCGGGTCATGACTGGGAGCTTGAGC
CAGGTGTCACTTGTGGTGACTACCTCTTTGGGATGCTTCAGGGAACTAGATCTGCTTTAT
ATGCAAACGGTAGAGAGTCCATTAGTGTTACCATCGAGGAAGTGACACCAAGATCTGTTG
GGGCTATCATAGCTCTTTATGAAAGAGCGGTCGGGTTGTATGCCTCACTTGTCAATATTA
ATGCTTACCACCAACCTGGTGTGGAAGCCGGGAAGAAGGCGGCAGCTGAAGTTCTGGCGC
TGCAAAAGCGTGTATTGTCAGTTCTTAATGAAGCCAGTTGTAAAGATCCGGTAGAGCCAT
TGACACTGGACGAGATAGCTGATCGTTGCCATGCTCCTGAAGAGATTGAGATGATATACA
AGATCATAGCTCACATGTCTGCAAACGACAGAGTTTTGATAGCTGAAGGTAGCTGCGGAT
CGCCAAGGAGTGTTAAAGTGTACCTGGGAGAGTGCAGTGTGGATGACATGTTCGCATAAT
AAAACTTTCCTCAAACGCACAAATGAGTCTCAATCTCTGTTCTGTTGTTTTTCCTTATTT
ATTTCTGCCAAACGTCTATGATTTTG


BQ
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AF RS1G015TF U 1
AF RS1G015JQ C 279
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CAATAATGGATGAGGCTACTAGGACAACTTCGCTCAAGAATAACCCTGCAGCGCTCTTAG
CAATGTGTTGGTACTGGGCTTCTGATGGCGTTGGTTCCAAGGATATGGTTATCCTTCCTT
ACAAGGATAGCTTATTGCTATTTAGCCGGTATCTGCAGCAGTTGGTCATGGAATCACTAG
GAAAGGAGTTTGATCTTGACGGTAACACTGTTAATCAAGGGCTAACTGTATATGGAAACA
AAGGGAGCACAGATCAGCATGCCTACATTCAACAACTGAGGGAGGGTGTGCACAACTTCT
TTGCAACCTTCATAGAAGTGCTACGTGACAGACCTCCGGGTCATGACTGGGAGCTTGAGC
CAGGTGTCACTTGTGGTGACTACCTCTTTGGGATGCTTCAGGGAACTAGATCTGCTTTAT
ATGCAAACGGTAGAGAGTCCATTAGTGTTACCATCGAGGAAGTGACACCAAGATCTGTTG
GGGCTATCATAGCTCTTTATGAAAGAGCGGTCGGGTTGTATGCCTCACTTGTCAATATTA
ATGCTTACCACCAACCTGGTGTGGAAGCCGGGAAGAAGGCGGCAGCTGAAGTTCTGGCGC
TGCAAAAGCGTGTATTGTCAGTTCTTAATGAAGCCAGTTGTAAAGATCCGGTAGAGCCAT
TG

QA 1 662 1 662
DS 

RD RS1G015JQ 648 0 0
AGGGAGGGTGTGCACAACTTCTTTGCAACCTTCATAGAAGTGCTACGTGACAGACCTCCG
GGTCATGACTGGGAGCTTGAGCCAGGTGTCACTTGTGGTGACTACCTCTTTGGGATGCTT
CAGGGAACTAGATCTGCTTTATATGCAAACGGTAGAGAGTCCATTAGTGTTACCATCGAG
GAAGTGACACCAAGATCTGTTGGGGCTATCATAGCTCTTTATGAAAGAGCGGTCGGGTTG
TATGCCTCACTTGTCAATATTAATGCTTACCACCAACCTGGTGTGGAAGCCGGGAAGAAG
GCGGCAGCTGAAGTTCTGGCGCTGCAAAAGCGTGTATTGTCAGTTCTTAATGAAGCCAGT
TGTAAAGATCCGGTAGAGCCATTGACACTGGACGAGATAGCTGATCGTTGCCATGCTCCT
GAAGAGATTGAGATGATATACAAGATCATAGCTCACATGTCTGCAAACGACAGAGTTTTG
ATAGCTGAAGGTAGCTGCGGATCGCCAAGGAGTGTTAAAGTGTACCTGGGAGAGTGCAGT
GTGGATGACATGTTCGCATAATAAAACTTTCCTCAAACGCACAAATGAGTCTCAATCTCT
GTTCTGTTGTTTTTCCTTATTTATTTCTGCCAAACGTCTATGATTTTG

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 2

CO CL5014Contig1 392 2 1 U
GGGAGAAACAGATCTTGAAAGCCAAACTTCTCTCTTTTTTCTTATTCTCAATCTCAACTT
ATCTCCTCCGACCATCTCCTGCCTTGCTTAATCTCCATTTATCTTCATGCCTATCCCTGC
TCAGCCTCCATCCAAGCCTGCCGTCGTTAGCATCAGTCGCCATTGTCGTGGAGGTGGAGA
CCAAGACGATCTCATGACTCTGTGTTTCATCCTCTTTCTTCATCTTTTGTGAAGAAATCT
GAGAAGGAAAAGAGATGAAGCGGGAAGGAGAATAATACGGTGAATCCGTATGATAGATCA
ATGTTCAGTAAACAAAGATCTATAAACTCATTTGTAAAAGATTGATGAAAGAGAACAATC
CTTACGTATGAATTTCCAATAGATTTTTCCCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EK78JQ C 1
AF RS1EK78TF U 1
BS 1 392 RS1EK78TF

RD RS1EK78JQ 392 0 0
GGGAGAAACAGATCTTGAAAGCCAAACTTCTCTCTTTTTTTTTATTCTCAATCTCAACTT
ATCTCCTCCGACCATCTCCTGCCTTGCTTAATCTCCATTTATCTTCATGCCTATCCCTGC
TCAGCCTCCATCCAAGCCTGCCGTCGTTAGCATCAGTCGCCATTGTCGTGGAGGTGGAGA
CCAAGACGATCTCATGACTCTGTGTTTCATCCTCTTTCTTCATCTTTTGTGAAGAAATTT
GAGAAGGAAAAGAGATGAAGCGGGAAGGAGAATAATACGGTGAATCCGTATGATAGATCA
ATGTTCAGTAAACAAAGATCTATAAACTCATTTGTAAAAGATTGATGAAAGAGAACAATC
CTTACGTATGAATTTCCAATAGATTTTTCCCG

QA 1 392 1 392
DS 

RD RS1EK78TF 392 0 0
GGGAGAAACAGATCTTGAAAGCCAAACTTCTCTCTTTTTTCTTATTCTCAATCTCAACTT
ATCTCCTCCGACCATCTCCTGCCTTGCTTAATCTCCATTTATCTTCATGCCTATCCCTGC
TCAGCCTCCATCCAAGCCTGCCGTCGTTAGCATCAGTCGCCATTGTCGTGGAGGTGGAGA
CCAAGACGATCTCATGACTCTGTGTTTCATCCTCTTTCTTCATCTTTTGTGAAGAAATCT
GAGAAGGAAAAGAGATGAAGCGGGAAGGAGAATAATACGGTGAATCCGTATGATAGATCA
ATGTTCAGTAAACAAAGATCTATAAACTCATTTGTAAAAGATTGATGAAAGAGAACAATC
CTTACGTATGAATTTCCAATAGATTTTTCCCG

QA 1 392 1 392
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL5017Contig1 384 2 1 U
GTTTAGGGCAAAGATGGAGCACTATGTGTACAGTGGAGAAAAGAAGCACGCTTTGGCAGG
GATCGGGATATTCACCGTCATCTTCGGCATCCCTTGGTATCTTATGAATCGAGGATCAAA
CAACCATCGGTCTCACCAAGATTACATGGAAAAGGCTGATAAAGCTAGAAAAGCTCGTCT
CTCTTCATCTCCATCTCCATCCTCTGACAAGTAGTCCTGTTTCAGACTCTAGTCAGATAC
ATGCCGTGACTCAGCGTTTTCCATGTCCATACAAAACATAACTCAGCAATGTGTCTGAGC
CAGTGTGGTTTATTTAGTTCAGTTACGTATCATCATTTCACTGTACTCCAGTTTCTATAT
TGAATAAAATAAAAAGTTTTTCTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FP48JQ C 1
AF RS1FP48TF U 1
BS 1 384 RS1FP48TF

RD RS1FP48JQ 384 0 0
GTTTAGGGCAAAGATGGAGCACTATGTGTACAGTGGAGAAAAGAAGCACGCTTTGGCAGG
GATCGGGATATTCACCGTCATCTTCGGCATCCCTTGGTATCTTATGAATCGAGGATCAAA
CAACCATCGGTCTCACCAAGATTACATGGAAAAGGCTGATAAAGCTAGAAAAGCTCGTCT
CTCTTCATCTCCATCTCCATCCTCTGACAAGTAGTCCTGTTTCAGACTCTAGTCAGATAC
ATGCCGTGACTCAGCGTTTTCCATGTCCATACAAAACATAACTCAGCAATGTGTCTGAGC
CAGTGTGGTTTATTTAGTTCAGTTACGTATCATCATTTCACTGTACTCCAGTTTCTATAT
TGAATAAAATAAAAAGTTTTTCTC

QA 1 384 1 384
DS 

RD RS1FP48TF 384 0 0
GTTTAGGGCAAAGATGGAGCACTATGTGTACAGTGGAGAAAAGAAGCACGCTTTGGCAGG
GATCGGGATATTCACCGTCATCTTCGGCATCCCTTGGTATCTTATGAATCGAGGATCAAA
CAACCATCGGTCTCACCAAGATTACATGGAAAAGGCTGATAAAGCTAGAAAAGCTCGTCT
CTCTTCATCTCCATCTCCATCCTCTGACAAGTAGTCCTGTTTCAGACTCTAGTCAGATAC
ATGCCGTGACTCAGCGTTTTCCATGTCCATACAAAACATAACTCAGCAATGTGTCTGAGC
CAGTGTGGTTTATTTAGTTCAGTTACGTATCATCATTTCACTGTACTCCAGTTTCTATAT
TGAATAAAATAAAAAGTTTTTCTC

QA 1 384 1 384
DS 



AS 1 2

CO CL5018Contig1 911 2 2 U
GGGTGCTCAGAGAGAGAAATGGCAGCTTCAACACTAACACTTCCCTGCTTCAAACTCTAC
GATCAACCAACCCTCCTCCTTCGCTGCAACAAATCATCTAACCAAACACTTCTTAGATTC
AACTTGTCGCCTCCAAAGCCTCCCTTGATCTCCTCACGTGACAACAATAGTTCTCAGCGA
TTCAGAGCCCTGCCTGAGACCATTGCCGTCAAACAGGACGACACGACTGCTGATGACGAC
AATCCTCCTGCGACCATCAACACTAAGCTCTACTTTGGGAACCTGCCGTACAATGTTGAC
AGTGCAACACTCGCTCAGATCATCCAAGACTTCGCTAACCCCGAGCTCGTCGAGGTTCTT
TACAACAGAGACACAGGACAGAGTCGTGGGTTCGCCTTTGTGACAATGAGCAACGTCGAA
GACTGCAACGTCATCATCGAGAACCTCGATGGAACTGAGTATCTTGGTAGGACTTTGAAG
GTGAACTTTGCAGACAAACCAAAACCAAACAAAGAACCTCTGTATCCAGAAACAGAGTAC
AAGCTGTTTGTTGGTAACTTGTCGTGGACAGTCACTTCGGAGTCGTTAGCTGGAGCGTTT
CGGGAGTGCGGAGAAGTGGTTGGTGCTAGAGTTGTGTACGATGGAGACACCGGGAAGTCA
AGAGGTTATGGCTTTGTATGTTACTCCTCCCAAGCTGAAATGGAAACCGCTCTTGAATCG
CTGGATGGGCTTGAGCTGGAGGGTCGGGCCATTCGAGTAAACCTGGCTCAGGGGAAGAAA
TACTGATACCTTGAAATAACATTTTGAGATTTTCATCGTTAGAGATTATGTTTCAATTTG
AACTAAAAAAAAATCAATATATTTTGTATGGTTTAAGGTTTGGTAGTAACTAATATAATC
AGCACCAATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DP45TF U 1
AF RS1DP45JQ C 253
BS 1 636 RS1DP45TF
BS 637 911 RS1DP45JQ

RD RS1DP45TF 636 0 0
GGGTGCTCAGAGAGAGAAATGGCAGCTTCAACACTAACACTTCCCTGCTTCAAACTCTAC
GATCAACCAACCCTCCTCCTTCGCTGCAACAAATCATCTAACCAAACACTTCTTAGATTC
AACTTGTCGCCTCCAAAGCCTCCCTTGATCTCCTCACGTGACAACAATAGTTCTCAGCGA
TTCAGAGCCCTGCCTGAGACCATTGCCGTCAAACAGGACGACACGACTGCTGATGACGAC
AATCCTCCTGCGACCATCAACACTAAGCTCTACTTTGGGAACCTGCCGTACAATGTTGAC
AGTGCAACACTCGCTCAGATCATCCAAGACTTCGCTAACCCCGAGCTCGTCGAGGTTCTT
TACAACAGAGACACAGGACAGAGTCGTGGGTTCGCCTTTGTGACAATGAGCAACGTCGAA
GACTGCAACGTCATCATCGAGAACCTCGATGGAACTGAGTATCTTGGTAGGACTTTGAAG
GTGAACTTTGCAGACAAACCAAAACCAAACAAAGAACCTCTGTATCCAGAAACAGAGTAC
AAGCTGTTTGTTGGTAACTTGTCGTGGACAGTCACTTCGGAGTCGTTAGCTGGAGCGTTT
CGGGAGTGCGGAGAAGTGGTTGGTGCTAGAGTTGTG

QA 1 636 1 636
DS 

RD RS1DP45JQ 659 0 0
ACCATCAACACTAAGCTCTACTTTGGGAACCTGCCGTACAATGTTGACAGTGCAACACTC
GCTCAGATCATCCAAGACTTCGCTAACCCCGAGCTCGTCGAGGTTCTTTACAACAGAGAC
ACAGGACAGAGTCGTGGGTTCGCCTTTGTGACAATGAGCAACGTCGAAGACTGCAACGTC
ATCATCGAGAACCTCGATGGAACTGAGTATCTTGGTAGGACTTTGAAGGTGAACTTTGCA
GACAAACCAAAACCAAACAAAGAACCTCTGTATCCAGAAACAGAGTACAAGCTGTTTGTT
GGTAACTTGTCGTGGACAGTCACTTCGGAGTCGTTAGCTGGAGCGTTTCGGGAGTGCGGA
GAAGTGGTTGGTGCTAGAGTTGTGTACGATGGAGACACCGGGAAGTCAAGAGGTTATGGC
TTTGTATGTTACTCCTCCCAAGCTGAAATGGAAACCGCTCTTGAATCGCTGGATGGGCTT
GAGCTGGAGGGTCGGGCCATTCGAGTAAACCTGGCTCAGGGGAAGAAATACTGATACCTT
GAAATAACATTTTGAGATTTTCATCGTTAGAGATTATGTTTCAATTTGAACTAAAAAAAA
ATCAATATATTTTGTATGGTTTAAGGTTTGGTAGTAACTAATATAATCAGCACCAATCT

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

CO CL5019Contig1 384 2 1 U
GACGTGAGTTTTAACTAGGATGGCGATTGGTTAGTTTTCACGGCGAATCTCTGTGGGATC
ACGGCGGAGCCGGTGGCGATGCCGAATCAGTTTCAGCCGTATGGAGATTTGTATGTTGTG
AAGTTGGATGGGACGGGGCTGAGGAGGCTGACGTGGAATGGGTATGAAGATGGAACGCCC
ACGTGGCATACTGTGGATGATTTGGATCTGAGTGGGTTGAGTTTGAACGGTCAAGATGGA
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TCTTTCCCAAAT

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AF RS1D379TF U 1
AF RS1D379JQ C 381
BS 1 660 RS1D379TF
BS 661 1238 RS1D379JQ

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CAAACAAAAATAACCATGGAAGAAAATCAACAAGAAGCTTCATCAATGCCACTAGTTCCT
ATAGACAGTTTCTCTTACAGTTGGGTAGTCAACTGTTCTTCTTTGGAAGCTTCTATTGAT
GATCATCATCAAACCTACGAAGATTCTTCTTCTTCCTTCATAGAGATGGACCCAAGATTG
CCTCCTTCTAGAAGATTCTTCATCAACAAAGCCCACGAAAGTAGCTTCAAGTTTGATAAC
TTTGTCTCTTTCTCCGACGAAGATAACTCTTTAGTTCACGCGGACGAGCTTTTCCGTGAC
GGCTACGTCATGCCTTATCTATCAAAAGCCGCGTCAGCAGCTACGGAAGAAGAATATGAG
CAGTTGGATGCGAAATCGGAGAAAAAGATGGAGACACGTGACATTAAGAGCAAGTCCCCT
TCTTCTTGTAGAAAGTTGAGAAGAGTTTCGAAATGGGTTTTGTTGTTTTTGACGCCATTG
TGTAAAAGATTAAGGAGATGTAGAACCGCTGGATCATCCGGAGGGATCAGTACCGACTCT
AGGACCCGTCTAACGACGTTGTCTAGAAGCAGAGTTTATTCAGATGAAATGACTTCGTCG

QA 1 660 1 660
DS 

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GAAAAAGATGGAGACACGTGACATTAAGAGCAAGTCCCTTTCTTCTTGTAGAAAGTTGAG
AAGAGTTTCGAAATGGGTTTTGTTGTTTTTGACGCCATTGTGTAAAAGATTAAGGAGATG
TAGAACCGCTGGATCATCCGGAGGGATCAGTACCGACTCTAGGACCCGTCTAACGACGTT
GTCTAGAAGCAGAGTTTATTCAGATGAAATGACTTCGTCGCCAAGAATAAGTGTTGCAGA
TGATTATTATTGGAGAAGATCTTGTGACTCAGAGAGCTCCATTTAGGAAGCCGTTCTTCA
TTGCAAGAAATCTTTCGAGAAATGAGACTTAAGAATCCATGTAAAAGGAGCAGGTAGAGT
AGAGATGGAGAATATTAAGCTTAAGAAGAATAAGCAAATTGCATTACACGTTACACATGG
AGTGGCGAAGAGAGAGACAGAGCAACTTGTGTTGTGTCTTTTGTTGTTTCTCTCTCTTGA
ATTAAAAAGACTGATGTGATGATTCCATGTGAATGTCTCACTGATGTGAATCAAGAATTT
ATCTTCTTTTTTACATGAGTAGGCACATATATAGAGCAGCTAGCAGAATCAAGAAAATGT
TTTCAGATTTTCTTGGCTGTTATAGTTCCTTTTCTATAATTCAATCCTATATGTATCTTA
TATGTGCCTACCCATGTTTTACTTTCTGGTCCAATTGTGTTTTGAATATTCTTACTTTTT
GTGAAAAAATTGTCTTTTATTGTTTTGTAGATCATATGTGTATGTCATCATATATATGAT
TGAACTCCTTTTCTTATC

QA 1 858 1 858
DS 



AS 1 2

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CGTGGATTCGCCGGCAGCCACCGAAGGTTAAGGCGTTTCTTTGCGTGGTTACGGCAATGA
CGATCCTCGTCTTCCTCAGGGTCATTGTACACGAGCACGACAACCTTTTCATCGCGTCCG
AGGCTGTCCATGCCGTTGGGATCTCCGTTCTTATCTATAAACTCACGAAGGAGAAGACAT
GCGCTGGGATATCTCTCAAGTCGCAGGAGCTAACGGCTTTGTTTCTGGCTGTGCGGTTGT
ATTGTAGCTTTGTAATGGAGTTTGATCTTCACGCGTTACTTGATTCTGCTACTTTGGCCA
CCACCCTTTGGGTCATTTATATGATCCGTTTCAACCTTAGACCCACGTATATGGAAGACA
AAGACAACTTTCCCATCTACTACGTTGTAGCCCCATGCGCTGTTGTATCTTTGCTCATTC
ATCCATCAACACGCCACCACATCATAAACAGGCTCTTTTGGGCCTTCTGTGTTTATCTTG
AAGCTGTTTCAGTTCTTCCTCAATTAAGAGTCATGCAGAACACTAAGATCGTGGAACCAT
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ACTATGTTCAGAGTTTAATGGGTGGACAGCTCGTTTTTCGTCTTCCTTCTGGTGTGGTAT
AAGAAGCTTTATAAAAGGATTGCTTGAGCTTGTTTTAAACTTTTAATTTTACTAGAGACT
TTGAG


BQ
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AF RS1DE74TF U 1
AF RS1DE74JQ C 332
BS 1 607 RS1DE74TF
BS 608 965 RS1DE74JQ

RD RS1DE74TF 607 0 0
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CAATAGAGAGAAAGATCTAAAAGATGAAGGCGGAGAAGAGTCCGATTCAGACCGTGACGT
CGTGGATTCGCCGGCAGCCACCGAAGGTTAAGGCGTTTCTTTGCGTGGTTACGGCAATGA
CGATCCTCGTCTTCCTCAGGGTCATTGTACACGAGCACGACAACCTTTTCATCGCGTCCG
AGGCTGTCCATGCCGTTGGGATCTCCGTTCTTATCTATAAACTCACGAAGGAGAAGACAT
GCGCTGGGATATCTCTCAAGTCGCAGGAGCTAACGGCTTTGTTTCTGGCTGTGCGGTTGT
ATTGTAGCTTTGTAATGGAGTTTGATCTTCACGCGTTACTTGATTCTGCTACTTTGGCCA
CCACCCTTTGGGTCATTTATATGATCCGTTTCAACCTTAGACCCACGTATATGGAAGACA
AAGACAACTTTCCCATCTACTACGTTGTAGCCCCATGCGCTGTTGTATCTTTGCTCATTC
ATCCATCAACACGCCACCACATCATAAACAGGCTCTTTTGGGCCTTCTGTGTTTATCTTG
AAGCTGT

QA 1 607 1 607
DS 

RD RS1DE74JQ 634 0 0
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CGCGTTACTTGATTCTGCTACTTTGGCCACCACCCTTTGGGTCATTTATATGATCCGTTT
CAACCTTAGACCCACGTATATGGAAGACAAAGACAACTTTCCCATCTACTACGTTGTAGC
CCCATGCGCTGTTGTATCTTTGCTCATTCATCCATCAACACGCCACCACATCATAAACAG
GCTCTTTTGGGCCTTCTGTGTTTATCTTGAAGCTGTTTCAGTTCTTCCTCAATTAAGAGT
CATGCAGAACACTAAGATCGTGGAACCATTCACAGCACATTACGTATTTGCTTTGGGAAT
CGCTAGGTTCTTGAGTTGTGCACACTGGATCCTTCAGGTGTTGGATACGAGAGGGAGGTT
GCTGACTGCATTAGGGTATGGACTATGGCCTTTAATGGTCCTCCTCTCTGAAATTATCCA
AACTTTCATCCTTGCAGATTTTTGCTATTACTATGTTCAGAGTTTAATGGGTGGACAGCT
CGTTTTTCGTCTTCCTTCTGGTGTGGTATAAGAAGCTTTATAAAAGGATTGCTTGAGCTT
GTTTTAAACTTTTAATTTTACTAGAGACTTTGAG

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 2

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GAAAGGGAGTTAGAAATCCAGACAAAGATCGTCAGATTGTGGAACACGAGTTGCAGGAAA
GTGGGTATAGTCCAGAATCCGAGAAAGCGACGAACAAACATGTCGAAGAAGAGGAAGAGG
AAGATGAAGAGGAAGAATCTGTGGAGAAGATCTTCGAAAGCAGAGAAGTACCTTCGTGGA
AGAAGCAGCTGACTCTGAGGGCTTTCGTGGTGAGCTTTATGCTAAGCATCTTGTTTAGCT
TCATCGTCATGAAGCTTAACCTCACGACGGGAATCATACCATCGCTCAACGTCTCTGCTG
GTCCTCTGGGTTTCTTCTTCGTCAAGACATGGACCAAGGTGCTTTATAAGTCTGGTTACT
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CCGGCATTGCCTTCAGCGGAGGGTTTGGGACATACCTCTTTGGGATGAGTGAACGGATTG
CTAAACAATCAGGAGATGCTTCCCGTGGCTTCAAGGACCCTTCTCTGGGTTGGATTATTG
GTTTCCTCTTTGTCGTCAGCTTTCTTGGTCTCTTCTCTGTTGTTCCCCTGCGAAAGATAA
TGGTAATAGACTTCAAACTAACATACCCAAGCGGTACAGCAACTGCTCATCTCATCAACA
GTTTTCATACCCCTCAAGGAGCCAAGCTAGCCAAGAAACAAGTGAGGATGTTGGGGAGAT
TCTTCTCCTTAAGCTTCTTGTGGAGTTTCTTCCAATGGCTCTTCCCCGGAGGTGACAACT
GCGGCTTCTCCAACTTCCCAACCTTCGGACTCAAAGCTTACCAATACAAGTAAGCTCTCA
CTCAACAAAACAGTTCCACTTATTACTCTC


BQ
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AF RS1BY14TF U 1
AF RS1BY14JQ C 375
BS 1 760 RS1BY14TF
BS 761 930 RS1BY14JQ

RD RS1BY14TF 760 0 0
GGAGAACTAAGAAACAGAGAAAACGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATAGGATGA
GAAAGGGAGTTAGAAATCCAGACAAAGATCGTCAGATTGTGGAACACGAGTTGCAGGAAA
GTGGGTATAGTCCAGAATCCGAGAAAGCGACGAACAAACATGTCGAAGAAGAGGAAGAGG
AAGATGAAGAGGAAGAATCTGTGGAGAAGATCTTCGAAAGCAGAGAAGTACCTTCGTGGA
AGAAGCAGCTGACTCTGAGGGCTTTCGTGGTGAGCTTTATGCTAAGCATCTTGTTTAGCT
TCATCGTCATGAAGCTTAACCTCACGACGGGAATCATACCATCGCTCAACGTCTCTGCTG
GTCCTCTGGGTTTCTTCTTCGTCAAGACATGGACCAAGGTGCTTTATAAGTCTGGTTACT
TGAAACAGCCCTTTACTCGCCAGGAGAATACTGTTATTCAGACCTGCGTTGTTGCTTCTT
CCGGCATTGCCTTCAGCGGAGGGTTTGGGACATACCTCTTTGGGATGAGTGAACGGATTG
CTAAACAATCAGGAGATGCTTCCCGTGGCTTCAAGGACCCTTCTCTGGGTTGGATTATTG
GTTTCCTCTTTGTCGTCAGCTTTCTTGGTCTCTTCTCTGTTGTTCCCCTGCGAAAGATAA
TGGTAATAGACTTCAAACTAACATACCCAAGCGGTACAGCAACTGCTCATCTCATCAACA
GTTTTCATACCCCTCAAGGAGCCAAGCTAGCCAAGAAACA

QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1BY14JQ 556 0 0
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ACTCGCCAGGAGAATACTGTTATTCAGACCTGCGTTGTTGCTTCTTCCGGCATTGCCTTC
AGCGGAGGGTTTGGGACATACCTCTTTGGGATGAGTGAACGGATTGCTAAACAATCAGGA
GATGCTTCCCGTGGCTTCAAGGACCCTTCTCTGGGTTGGATTATTGGTTTCCTCTTTGTC
GTCAGCTTTCTTGGTCTCTTCTCTGTTGTTCCCCTGCGAAAGATAATGGTAATAGACTTC
AAACTAACATACCCAAGCGGTACAGCAACTGCTCATCTCATCAACAGTTTTCATACCCCT
CAAGGAGCCAAGCTAGCCAAGAAACAAGTGAGGATGTTGGGGAGATTCTTCTCCTTAAGC
TTCTTGTGGAGTTTCTTCCAATGGCTCTTCCCCGGAGGTGACAACTGCGGCTTCTCCAAC
TTCCCAACCTTCGGACTCAAAGCTTACCAATACAAGTAAGCTCTCACTCAACAAAACAGT
TCCACTTATTACTCTC

QA 1 556 1 556
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CAAGTTATGGTCGCCCTGAAGGCCGATACACGGATGGCTGCTTCTCTCATTCGTCTTCAT
TTCCATGACTGTTTCGTTAATGGGTGCGATGCGTCTGTATTGTTGGATGGAGACGACAGC
GAGAAATTAGCGTTACCAAATCTGAACTCTGCCAGAGGATTTGAATTAATTGATACTATC
AAAGCCGCTGTGGAATACGCATGTCCTGGTGTTGTTTCTTGCGCTGATATACTCTCTCTA
GCCGCTCGCGACTCCGTTGTCTTAAGCGGAGGACCTCAATGGAGGGTGGCATTAGGGCGA
AAAGATGGACTTGTGGCAAATCAGAGCAGTGCAAATAATCTGCCATCTCCTTTTGAACCC
TTAGACGCTATTATTGCCAAGTTTGTAGCTGTTGGCCTTAATGTCGCCGACGTCGTAGCT
TTATCAGGAGCTCACACCTTTGGGCAAGCAAAGTGTGATGTATTCAGCAACCGGCTGTTC
AACTTTAAAGGCGCAGGATCTCCGGACACAACACTTGAGACAACACTCTTGTCTGATCTG
CGAACGGTTTGTCCCGCCGGAGGAAGTGGAAACCAAACAGCTCCCCTAGACAGTAACTCT
ACCAACGCCTTCGACAACAATTATTTCAAGAACCTCCTCGAAGGAAAAGGTCTTTTGAGT
TCGGATCAGATTCTTTTCTCGAGTGATTTGGCCGTGAACACAACAAAGAGACTTGTGGAG
GCTTATAGTCGGAGCCAGTACTTGTTTTTCAAGGACTTCACTTGTTCGATGATCAAAATG
GGTGGTATTGCGAATCTTGTTAATGGATCTAATGGCGAGGTTAGGAAAAACTGTCGGGTT
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ATCCTCGTGTGTATCTAAATTGTCACGTGTGCAATAGTAAGAAGTTACCGGGGTCTGTTT
TTCGAAATGTCAATGAAAGCAAAACAAGTATATTTTACC


BQ
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AF RS1AY35TF U 1
AF RS1AY35JQ C 343
BS 1 619 RS1AY35TF
BS 620 1059 RS1AY35JQ

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GAGCTAAACCCTAACATTTACGCTAAATCATGCCCGTATCTTGTACCAATTGTCCGCAGA
CAAGTTATGGTCGCCCTGAAGGCCGATACACGGATGGCTGCTTCTCTCATTCGTCTTCAT
TTCCATGACTGTTTCGTTAATGGGTGCGATGCGTCTGTATTGTTGGATGGAGACGACAGC
GAGAAATTAGCGTTACCAAATCTGAACTCTGCCAGAGGATTTGAATTAATTGATACTATC
AAAGCCGCTGTGGAATACGCATGTCCTGGTGTTGTTTCTTGCGCTGATATACTCTCTCTA
GCCGCTCGCGACTCCGTTGTCTTAAGCGGAGGACCTCAATGGAGGGTGGCATTAGGGCGA
AAAGATGGACTTGTGGCAAATCAGAGCAGTGCAAATAATCTGCCATCTCCTTTTGAACCC
TTAGACGCTATTATTGCCAAGTTTGTAGCTGTTGGCCTTAATGTCGCCGACGTCGTAGCT
TTATCAGGAGCTCACACCTTTGGGCAAGCAAAGTGTGATGTATTCAGCAACCGGCTGTTC
AACTTTAAAGGCGCAGGATCTCCGGACACAACACTTGAGACAACACTCTTGTCTGATCTG
CGAACGGTTTGTCCCGCCG

QA 1 619 1 619
DS 

RD RS1AY35JQ 717 0 0
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CCATCTCCTTTTGAACCCTTAGACGCTATTATTGCCAAGTTTGTAGCTGTTGGCCTTAAT
GTCGCCGACGTCGTAGCTTTATCAGGAGCTCACACCTTTGGGCAAGCAAAGTGTGATGTA
TTCAGCAACCGGCTGTTCAACTTTAAAGGCGCAGGATCTCCGGACACAACACTTGAGACA
ACACTCTTGTCTGATCTGCGAACGGTTTGTCCCGCCGGAGGAAGTGGAAACCAAACAGCT
CCCCTAGACAGTAACTCTACCAACGCCTTCGACAACAATTATTTCAAGAACCTCCTCGAA
GGAAAAGGTCTTTTGAGTTCGGATCAGATTCTTTTCTCGAGTGATTTGGCCGTGAACACA
ACAAAGAGACTTGTGGAGGCTTATAGTCGGAGCCAGTACTTGTTTTTCAAGGACTTCACT
TGTTCGATGATCAAAATGGGTGGTATTGCGAATCTTGTTAATGGATCTAATGGCGAGGTT
AGGAAAAACTGTCGGGTTATCAATAACTATTAGGTCTGTGTTTTTTTTTTATATTTGCAA
TGTTTGGGTTTTGATCAAATCCTCGTGTGTATCTAAATTGTCACGTGTGCAATAGTAAGA
AGTTACCGGGGTCTGTTTTTCGAAATGTCAATGAAAGCAAAACAAGTATATTTTACC

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 2

CO CL5026Contig1 718 2 2 U
GGACACCTGACTTGAATTCATCATTAAATATATGAGATGCCCACTTCTTTTCCTTGTCTT
TAGTTAATCTGCAGCTAAGGAAGACGGACGAGAAGAGAAACCCTAACATGGCACAAGCTG
AACAAACCAAGAATGATTCTCCATTACATCAGTATGAAAATTTTGTTGAGATAGAGAACG
AGAAGACTCTTGCGTTGATAAATGCATGGGAAGAGAACGAGAAGGCCAAAGCTCAAACCA
AAGCGTACAAAGAACTTTGCTCCATTGAAGCATGGGAAAACAACGTGAAGACATCTCTAG
AGTTAGACTTGAAGAAAATGGAGGAAAATTTAGAAGTGGAGAAAGATGAATATTCAAAAA
TATTCAAGAAAAAATACCAGAAATTGAAAAAATTGCAGAAGCGAAAAGAGAAAAAATTGA
GAAACAAAAAGAGCAAAAATCTATCAACCTGAAAAAAATGAGTGAGAAGTTAAGTGCAAC
TCCAAACGCTTATCCACCCAAAACCAAAACCTGTGGATGTCTCTAGAACATGTCTTATGA
ATCAATTACCGGCCCGTTAAATCATCTATTAGACTTTGCTCGTGGCTAAAGGGGATATAT
ATATTCAACGAATAAAGGGAAATCTATGTACGACGCTTTCAAGTATCGATGTATTGTTCA
TGTGTATATAATATGGTTTTACCTATGGCAATTGCTATTGAATCTATGATTATGAATC


BQ
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AF RS1H457TF U 1
AF RS1H457JQB C 289
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BS 673 718 RS1H457JQB

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ATATTCAACGAATAAAGGGAAATCTATGTACGACGCTTTCAAGTATCGATGTATTGTTCA
TGTGTATATAAT

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DS 

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AGAAAAAATTGAGAAACAAAAAGAGCAAAAATCTATCAACCTGAAAAAAATGAGTGAGAA
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CATGTCTTATGAATCAATTACCGGCCCGTTAAATCATCTATTAGACTTTGCTCGTGGCTA
AAGGGGATATATATATTCAACGAATAAAGGGAAATCTATGTACGACGCTTTCAAGTATCG
ATGTATTGTTCATGTGTATATAATATGGTTTTACCTATGGCAATTGCTATTGAATCTATG
ATTATGAATC

QA 1 430 1 430
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

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GAGCTTCCCTGGATGTGGCAGCTATTCGATTGGTTGATGTTCCGGAGAAGGCTCGCAAAC
TCCTAAACCTATTGGAGCAGTCTAAAGACCCAAGGTTCCATGCATTGCCTTTGGCATCTC
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AAGTCAGGCAAAGACTGGGGGAAGTATCTCGCCTACCAATCTGGTCTTCAGTGGAGGAAC
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TTGTTTGTAAGATACGTCGTATCAGTTTCGATTAGTCTCTAAACTCTCAAAAACGTGCTT
TGGTGCCATTGTCATATTTTTTTTACACATTGCGAAAGTTTTGATGCTCTATATAAGACA
AGAGTATTGATGTTCC


BQ
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AF RS1BD48JQ C 585
BS 1 637 RS1BD48TF
BS 638 1156 RS1BD48JQ

RD RS1BD48TF 637 0 0
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AAATACTCACTGTAGCGGATTGCCTTACGAGCAGGTCTTCTGTGTTTGAAGCTTCTTTGA
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GAGCTTCCCTGGATGTGGCAGCTATTCGATTGGTTGATGTTCCGGAGAAGGCTCGCAAAC
TCCTAAACCTATTGGAGCAGTCTAAAGACCCAAGGTTCCATGCATTGCCTTTGGCATCTC
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AAGTCAGGCAAAGACTGGGGGAAGTATCTCGCCTACCAATCTGGTCTTCAGTGGAGGAAC
AGACCGCTTTTGCTCTACCAAACTTCAGCTCATACCC

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DS 

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TGGATGTTCAAGGTAGCAGAAGGCGCCACGGCTCTGTACATGGAGCAACTGAGAGGAATC
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GTGCTTGCGGCCCTGTCCATGCCGATTCCGCCTGTGCTTGCAACTTTCCAGACGTGTTTG
GCTACACCAAGAGATGAGCTCAAAGATGTAATGAAATCAGAAGCTGGTAGTGAACTTGAT
TTCCCTACTGCCAATCTTGTTTGTAAGATACGTCGTATCAGTTTCGATTAGTCTCTAAAC
TCTCAAAAACGTGCTTTGGTGCCATTGTCATATTTTTTTTACACATTGCGAAAGTTTTGA
TGCTCTATATAAGACAAGAGTATTGATGTTCC

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 2

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AAAGGAGTATATGGCTAAAAAGGCTCAGAAGAAGGCATTACGTGCAGCAAAGAAGCTCAA
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CGAATTCTCCGTCAAAGCTGAGAAGAGAAGGATACTCTGAGGAGAGCAGAGGAAGCGGCG
CAAGAAGTTGAGACCAGCAAGAAGGCATTGGAGGAAGCTGTGGAGAGAACCGACACTGCA
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AGATCATCAGTGGACAACACTGCCAAGTTCAAGACAACAACAACAACGAGAACAAAGAGT
CTGATGGATGTAAACGGTCTGCATCTGACGTATGATTTTGTTCTTGGTCCATCGTCATCT
TCAGTTCCTGTCTTGAAGCCAACGATGTCGATAGGGGAAATACTCAGCGAGAAGCTACTT
GTTGCGGAGGATTCAGACGTGATGAATGTTGCTAGCCAGAGGAGGAAGATGTCGCTTGGT
CAGATGCTGGCAAAGAATAGCAATGGTGATGGAGCTTCGAGCAAGAAGTGTGAAGGGAAG
GAGAATGGGAAAAGATCAGCGACGACTCTAAAGAGAAAGAATCTCGGGTTTGCTAAGATC
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GTTTTCTTTTACACTTGGCTTGTGTTCTGTAAATTTACATTTCTTTTGTGCCTGGACCTT
AATGGGCTTTTTATTGGGCTTTTATGGACTTTTATGGGCATTTAAATAGCTTTT


BQ
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1F307TF U 1
AF RS1F307JQ C 253
BS 1 638 RS1F307TF
BS 639 954 RS1F307JQ

RD RS1F307TF 638 0 0
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AAAGGAGTATATGGCTAAAAAGGCTCAGAAGAAGGCATTACGTGCAGCAAAGAAGCTCAA
GACTCACTCCGTCTCTGGCTACTCCAACGATTCAAACCCATTCGGGGATTCCAACCTCAC
CGAGACCTTTGTGTGGCGCAAGAAAATTGAGAAAGATGTTCACCATGGAGTGCCCTTGGA
CGAATTCTCCGTCAAAGCTGAGAAGAGAAGGATACTCTGAGGAGAGCAGAGGAAGCGGCG
CAAGAAGTTGAGACCAGCAAGAAGGCATTGGAGGAAGCTGTGGAGAGAACCGACACTGCA
AGACTCGAATCAGAAGAGGCGCTACGAAACTGGAAGTCAGAGAATGGACAGAGGAGGAGA
AGATCATCAGTGGACAACACTGCCAAGTTCAAGACAACAACAACAACGAGAACAAAGAGT
CTGATGGATGTAAACGGTCTGCATCTGACGTATGATTTTGTTCTTGGTCCATCGTCATCT
TCAGTTCCTGTCTTGAAGCCAACGATGTCGATAGGGGAAATACTCAGCGAGAAGCTACTT
GTTGCGGAGGATTCAGACGTGATGAATGTTGCTAGCCA

QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1F307JQ 702 0 0
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ACCAGCAAGAAGGCATTGGAGGAAGCTGTGGAGAGAACCGACACTGCAAGACTCGAATCA
GAAGAGGCGCTACGAAACTGGAAGTCAGAGAATGGACAGAGGAGGAGAAGATCATCAGTG
GACAACACTGCCAAGTTCAAGACAACAACAACAACGAGAACAAAGAGTTTGATGGATGTA
AACGGTCTGCATCTGACGTATGATTTTGTTCTTGGTCCATCGTCATCTTCAGTTCCTGTC
TTGAAGCCAACGATGTCGATAGGGGAAATACTCAGCGAGAAGCTACTTGTTGCGGAGGAT
TCAGACGTGATGAATGTTGCTAGCCAGAGGAGGAAGATGTCGCTTGGTCAGATGCTGGCA
AAGAATAGCAATGGTGATGGAGCTTCGAGCAAGAAGTGTGAAGGGAAGGAGAATGGGAAA
AGATCAGCGACGACTCTAAAGAGAAAGAATCTCGGGTTTGCTAAGATCGTTTTGTTGTTA
AACAAGAGAAGAAGAACAAGAAGATTGGTTTGAACTTGAGGTGATAGTGTTTTCTTTTAC
ACTTGGCTTGTGTTCTGTAAATTTACATTTCTTTTGTGCCTGGACCTTAATGGGCTTTTT
ATTGGGCTTTTATGGACTTTTATGGGCATTTAAATAGCTTTT

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 2

CO CL5031Contig1 773 2 2 U
GCTCCAAAACTTGGTAGCAAAGAGATTATGTCGGAAGACTATCAGAACCGCGCTTCAAGT
CTACTTTGTGTTGCTAGCATATCAGGCTGTTGCCAGGTGACTGTGCCACTTGGGCAGCAT
GAGAAGTGCCCTGTTTCAGTATCCTTGATTGCAAGACATGGTGGCGATCGTTTCTTGCTG
GACACAGTGCAGAAAATGTATGCCTCTTTGCAAGAGAACTCCAGTCTCATCGTTAATCCT
AAATCATCCACAAATACTATTAGCCAAGAAGAGTCAGCTGAGATTGCAAAAGAGAAGGGA
AACCAAGCATTCAAAGAGAAACAATGGCAGAAAGCAATTGGGCTGTACTCAGAAGCTATA
AAGTTAAATGACAAGAATGGTACCTATTACAGTAACAGAGCTGCTGCATACCTTGAACTT
GCAAGCTTTCGTCAAGCTGAAGCTGATTGTACCAAGGCTCTTACCCTAGATAAGAAGAAC
ATCAAGGCATATCTACGAAGAGGAACTGCAAGAGAAATGTTAGGCAGTTTCAAGGAAGCT
ATAGATGATTTTTGTTATGCGTTAGTTCTGGAGCCAAACAACAAGGGAGCGGCTCTGTTT
GCAGATAGACTAAGGAAGGTGTTCCTCCAGTGACCAGCTTTTTTGTAGTTAGTAAATCTT
TTGATGTTCCAGATTGTTGTCACCATTGTTTTGAGTTTATTAGAATCTGTCAAGAGACTT
TGTTAAATGATATTCAGGGCATTTGAATTCGAGAAATAGAAAAAGTTTAAGTT


BQ
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AF RS1GH34TF U 1
AF RS1GH34JQ C 230
BS 1 519 RS1GH34TF
BS 520 773 RS1GH34JQ

RD RS1GH34TF 519 0 0
GCTCCAAAACTTGGTAGCAAAGAGATTATGTCGGAAGACTATCAGAACCGCGCTTCAAGT
CTACTTTGTGTTGCTAGCATATCAGGCTGTTGCCAGGTGACTGTGCCACTTGGGCAGCAT
GAGAAGTGCCCTGTTTCAGTATCCTTGATTGCAAGACATGGTGGCGATCGTTTCTTGCTG
GACACAGTGCAGAAAATGTATGCCTCTTTGCAAGAGAACTCCAGTCTCATCGTTAATCCT
AAATCATCCACAAATACTATTAGCCAAGAAGAGTCAGCTGAGATTGCAAAAGAGAAGGGA
AACCAAGCATTCAAAGAGAAACAATGGCAGAAAGCAATTGGGCTGTACTCAGAAGCTATA
AAGTTAAATGACAAGAATGGTACCTATTACAGTAACAGAGCTGCTGCATACCTTGAACTT
GCAAGCTTTCGTCAAGCTGAAGCTGATTGTACCAAGGCTCTTACCCTAGATAAGAAGAAC
ATCAAGGCATATCTACGAAGAGGAACTGCAAGAGAAATG

QA 1 519 1 519
DS 

RD RS1GH34JQ 544 0 0
TCGTTAATCCTAAATCATCCACAAATACTATTAGCCAAGAAGAGTCAGCTGAGATTGCAA
AAGAGAAGGGAAACCAAGCATTCAAAGAGAAACAATGGCAGAAAGCAATTGGGCTGTACT
CAGAAGCTATAAAGTTAAATGACAAGAATGGTACCTATTACAGTAACAGAGCTGCTGCAT
ACCTTGAACTTGCAAGCTTTTGTCAAGCTGAAGCTGATTGTACCAAGGCTTTTACCCTAG
ATAAGAAGAACATCAAGGCATATTTACGAAGAGGAACTGCAAGAGAAATGTTAGGCAGTT
TCAAGGAAGCTATAGATGATTTTTGTTATGCGTTAGTTCTGGAGCCAAACAACAAGGGAG
CGGCTCTGTTTGCAGATAGACTAAGGAAGGTGTTCCTCCAGTGACCAGCTTTTTTGTAGT
TAGTAAATCTTTTGATGTTCCAGATTGTTGTCACCATTGTTTTGAGTTTATTAGAATCTG
TCAAGAGACTTTGTTAAATGATATTCAGGGCATTTGAATTCGAGAAATAGAAAAAGTTTA
AGTT

QA 1 544 1 544
DS 



AS 1 2

CO CL5032Contig1 377 2 1 U
GGAGCAAAATTAGGAGATGAGATCATGGAATACTAAAGCCTTGAGACGCACTTGAGCCTC
ATCAATAAATTCACCGGCAGTCTCGCCAGGATCTGCATCAGCACATCCCCCAGGGAGTTC
CGGAGTGACAATGGCGACGGGTTTTGAATCGGGCTTGGAAAGGGCTCTTCTATTCCTTGA
TGTTTTCATCTTCTTTTTCCCCAAACCTTTCACCGCAGCTATTCGAAAAGACAATCCCAC
CATAGCTTGTAGATAGATCTGTTTCTCAACTCTATCGGCTCTGTTTTCTTTTTCTTGTGA
GTCAACCCTAGGGAAGTATGCAATTGGTCACCTGAATGATAATTGTACTATTTCCATTTC
TATGGATTTTTTTTTGC


BQ
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CATAGCTTGTAGATAGATCTGTTTCTCAACTCTATCGGCTCTGTTTTCTTTTTCTTGTGA
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TATGGATTTTTTTTTGC

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DS 



AS 1 2

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TCAACTCCACTCTTCGTCAAAGTGGTTTCAGTCCATTTTCACTCGATGTTCAGTTCGTGC
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CGATGCTGCCTGAAGCCGACAGTTTCTCTCGGCCTTGTACACTTTCGACATCGGACAAAA
CGATCTCACTGCTGGTTACTTCGCTAATAAAACGGTGGAACAAATTGGAACCGTAGATGT
TCCTGAGATCATCAGCCAGTTCAAGAATGCTGTCACGTATATTTACGCACAAGGAGGGAG
ATACTTTTGGATTCACAACACAGGACCTATCGGTTGTTTAGCGTATGTGATTGAATGGTT
TCCGCTTAAAGCATCAGACTTTGATTCACATGGATGTGTCTCTCCCTTGAACCATTTGGC
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TTATTAGACTTCTGAGTTTTGGCTCTTATTG


BQ
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AF RS1G717TF U 1
AF RS1G717JQ C 578
BS 1 628 RS1G717TF
BS 629 1291 RS1G717JQ

RD RS1G717TF 628 0 0
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TTGGTTCAAACTTCAGCCACGGCGCTAACTTTGCTACGGCCGGATCTCCCATCAGAGCTC
TCAACTCCACTCTTCGTCAAAGTGGTTTCAGTCCATTTTCACTCGATGTTCAGTTCGTGC
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CGATGCTGCCTGAAGCCGACAGTTTCTCTCGGCCTTGTACACTTTCGACATCGGACAAAA
CGATCTCACTGCTGGTTACTTCGCTAAT

QA 1 628 1 628
DS 

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CATGAGTTGTTTCTTCACGCACAGGGTCACGGGTTCAAGAGGTCGTTGGTTTCATGTTGT
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AAAGGCAAAGAGGTTTACATTGGAAAGCCGTGCGATGAGCCTGACAAGGCTGTGATATGG
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TTGAGCATGGCCTGTCACAGGCAGTGACAAAACCAAGAAGAAGAGAGAAGCTTTGCTTCT
TGGAATGAGTTTGTTTTTATAGCTTATTAGACTTCTGAGTTTTGGCTCTTATTG

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

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CTGTGTTGTTTCTTTGGTCTAATGCCACCGTGTTCATCAACAAGTCGCCGCCAAAGATAC
CTGAAGTTCATATCCCTGAGGAGCCTATCCTTCAGCTCGCATCTGGGCTCAGAATCGAGA
TCAACCGTGGACTCTCCTCTCTTCGTGAGATTGCTTCTGGCAGGGATCTCAAGAAATTCC
TCTGTGCTATAGTCGGCTTGTGGGTTCTATCCATCATGGGCGGCTGGTTCAATTTCTTGA
CATTGGCATACATAGCTCTTGTGCTGCTCTTCACGGTTCCTCTTGTTTACGACAAGTACG
AAGACAAGGTCGACCCATTAGGTGAGAAAGCAATGATCGAGATCAAGAAGCAGTATGCAG
TGTTGGACGAGAAGGTGTTGAGCAAGATCCCCATGGGCCCGTTGAAGAACAAGAAGAAAG
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CCTCGTTTTGTTTGTTTTTTCGTTTATGCCATTGTTGGTGAACGTGGAAGGGATACAATT
AGTGTTGGGTTCTTTTTCTCTTTAAACCTACTATATAACCATTTGAATCTTCG


BQ
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AF RS1D008TF U 1
AF RS1D008JQ C 248
BS 1 630 RS1D008TF
BS 631 1013 RS1D008JQ

RD RS1D008TF 630 0 0
GGGAGCCAGCTGTGGAGATCGTGGAGAGGGAATCGTTGATGGATAAGATAACGGAGAAGA
TCCACCACGGTGGCGATTCCTCTTCGTCGTCTTCATCGTCTGATGACGAGGACGATAAGA
AGAAGAAGAAGAAGCCGGAGTCTCCGTCTTCTGTGAAATCAAAAGTCTACCGCTTGTTCG
GAAGGGAGAAGCCTGTTCATAAGGTTCTCGGCGGTGGAAAGCCGGCGGATATATTCATGT
GGAAGGATAAGAAGATGTCAGGTGGTGTGCTTGGTGGTGCTACAGCCGCGTGGGTTCTGT
TTGAGTTGATGGAGTACCATCTTCTCACTTTGCTTTGCCACGTGATGATTGTTGTGCTTG
CTGTGTTGTTTCTTTGGTCTAATGCCACCGTGTTCATCAACAAGTCGCCGCCAAAGATAC
CTGAAGTTCATATCCCTGAGGAGCCTATCCTTCAGCTCGCATCTGGGCTCAGAATCGAGA
TCAACCGTGGACTCTCCTCTCTTCGTGAGATTGCTTCTGGCAGGGATCTCAAGAAATTCC
TCTGTGCTATAGTCGGCTTGTGGGTTCTATCCATCATGGGCGGCTGGTTCAATTTCTTGA
CATTGGCATACATAGCTCTTGTGCTGCTCT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RS1D008JQ 766 0 0
TAAGAAGATGTCAGGTGGTGTGCTTGGTGGTGCTACAGCCGCGTGGGTTCTGTTTGAGTT
GATGGAGTACCATCTTCTCACTTTGCTTTGCCACGTGATGATTGTTGTGCTTGCTGTGTT
GTTTCTTTGGTCTAATGCCACCGTGTTCATCAACAAGTCGCCGCCAAAGATACCTGAAGT
TCATATCCCTGAGGAGCCTATCCTTCAGCTCGCATCTGGGCTCAGAATCGAGATCAACCG
TGGACTCTCCTCTCTTCGTGAGATTGCTTCTGGCAGGGATCTCAAGAAATTCCTCTGTGC
TATAGTCGGCTTGTGGGTTCTATCCATCATGGGCGGCTGGTTCAATTTCTTGACATTGGC
ATACATAGCTCTTGTGCTGCTCTTCACGGTTCCTCTTGTTTACGACAAGTACGAAGACAA
GGTCGACCCATTAGGTGAGAAAGCAATGATCGAGATCAAGAAGCAGTATGCAGTGTTGGA
CGAGAAGGTGTTGAGCAAGATCCCCATGGGCCCGTTGAAGAACAAGAAGAAAGATTAGGG
TTTACAAAATGGTGATCGTGTTCGTCAGATAGCAAGAAAAAAGGGTGTTGTGAAATGGTG
TTGAAGCTTTATGTTAGATCGTTTAATATGTTATGTGAATGAACGTGGATTTTCCTCGTT
TTGTTTGTTTTTTCGTTTATGCCATTGTTGGTGAACGTGGAAGGGATACAATTAGTGTTG
GGTTCTTTTTCTCTTTAAACCTACTATATAACCATTTGAATCTTCG

QA 1 766 1 766
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5036Contig1 978 2 6 U
GGGGGACGATTCGAGCACATAGCCGAGCCTGGATGCCACTTCTTCAACCCTCTCGCCGGT
CAGTGGCTCGCCGGCGTCCTCTCCACCAGGATCAACTCTCTCGACGTCAAAATCGAGACC
AAAACCAAGGATAATGTGTTTGTGCAGCTGATATGCTCGATTCAGTATCGCGTGGTGAAA
GCAAACGCTGACGATGCTTTTTACGAGCTTCAGAACCCTCGAGAGCAGATCCAGGCTTAC
GTTTTTGATGTGGTTAGAGCTTTGGTTCCAATGATGACGCTCGACGCTCTTTTTGAACAA
AAGGGAGAAGTCGCCAAGTCTGTTCTTGAAGAACTCGAGAAGGTGATGGGTGCTTATGGA
TACAGCATTGAACACATTCTCATGGTTGACATTATTCCTGATCCTTCTGTTCGCAAGGCC
ATGAATGAAATCAATGCAGCACAAAGGCTCCAGCTCGCGAGTGTTTACAAAGGAGAAGCA
GAGAAGATTCTCCAAGTGAAGAGAGCGGAAGCAGAGGCGGAAGCCAAGTACCTGGGCGGT
GTGGGTGTCGCTAGACAGAGGCAAGCGATCACAGACGGACTGAGGGAGAACATAATGAAC
TTCTCTAGCAAAGTAGAAGGCACTTCGTCCAAAGATATCATGGACTTGATCATGATCACG
CAGTACTTTGACACCATGAGAGACCTCGGAAGCTCATCTAAGAACACAACCGTGTTTCTT
CCTCACGGTCCGGGGCACTTGAGGGATATCAGCGACCAGATTCGTAACGGTTTGATGGAG
GCGTCCAGTGCTCGTGTCGGCGACGAGGTTTAAAGTGAGATTCACTTGGGGTTGTGAATC
TATTTATATTCGTGGGTTTTGCTTTCTTTGATTATGGTTTAAATTACAGTTTAGCACTTG
GGTATGTGTGAATTTATTTGGATGTTGCTTCCTTTTATGTTTATGGTTTTAATTTATTAA
TGATATAAATAATAACCC


BQ
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AF RS1C501TF U 1
AF RS1C501JQ C 375
BS 1 744 RS1C501TF
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BS 770 978 RS1C501JQ

RD RS1C501TF 769 0 0
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CAGTGGCTCGCCGGCGTCCTCTCCACCAGGATCAACTCTCTCGACGTCAAAATCGAGACC
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GTTTTTGATGTGGTTAGAGCTTTGGTTCCAATGATGACGCTCGACGCTCTTTTTGAACAA
AAGGGAGAAGTCGCCAAGTCTGTTCTTGAAGAACTCGAGAAGGTGATGGGTGCTTATGGA
TACAGCATTGAACACATTCTCATGGTTGACATTATTCCTGATCCTTCTGTTCGCAAGGCC
ATGAATGAAATCAATGCAGCACAAAGGCTCCAGCTCGCGAGTGTTTACAAAGGAGAAGCA
GAGAAGATTCTCCAAGTGAAGAGAGCGGAAGCAGAGGCGGAAGCCAAGTACCTGGGCGGT
GTGGGTGTCGCTAGACAGAGGCAAGCGATCACAGACGGACTGAGGGAGAACATAATGAAC
TTCTCTAGCAAAGTAGAAGGCACTTCGTCCAAAGATATCATGGACTTGATCATGATCACG
CAGTACTTTGACACCATGAGAGACCTCGGAAGCTCATCTAAGAACACAACCGTGTTTCTT
CCTCACGGTCCGGGGCACTTGAGG*ATATCAGCGAC*AGATTCGTAACG

QA 1 769 1 769
DS 

RD RS1C501JQ 604 0 0
CATTCTCATGGTTGACATTATTCCTGATCCTTCTGTTCGCAAGGCCATGAATGAAATCAA
TGCAGCACAAAGGCTCCAGCTCGCGAGTGTTTACAAAGGAGAAGCAGAGAAGATTCTCCA
AGTGAAGAGAGCGGAAGCAGAGGCGGAAGCCAAGTACCTGGGCGGTGTGGGTGTCGCTAG
ACAGAGGCAAGCGATCACAGACGGACTGAGGGAGAACATAATGAACTTCTCTAGCAAAGT
AGAAGGCACTTCGTCCAAAGATATCATGGACTTGATCATGATCACGCAGTACTTTGACAC
CATGAGAGACCTCGGAAGCTCATCTAAGAACACAACCGTGTTTTTTCCTCACGGTCCGGG
GCACTTGAGGGATATCAGCGACCAGATTCGTAACGGTTTGATGGAGGCGTCCAGTGCTCG
TGTCGGCGACGAGGTTTAAAGTGAGATTCACTTGGGGTTGTGAATCTATTTATATTCGTG
GGTTTTGCTTTCTTTGATTATGGTTTAAATTACAGTTTAGCACTTGGGTATGTGTGAATT
TATTTGGATGTTGCTTCCTTTTATGTTTATGGTTTTAATTTATTAATGATATAAATAATA
ACCC

QA 1 604 1 604
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5038Contig1 1152 2 8 U
GGGACGACGATATTTATTGGTTTCCTTTATCTTATATATTTTTTTGGTAGGCTAAGTTTT
TAAAAGGAAACTAAAGTGTTGCCTCCATGTTTTGAAATGACTAATTTAGTTAGTTAAAAC
AATTCAAATAGTCTACAATCATGTTGCCTGTAAATATGATTAGAAAAGAGGTTAAAAGTG
ACAAATTTAAGAGAAACACCGAGAGACTGAACACCATCATTATATATATATACTTTGTCA
TCACAACATAATGGGCTAAAATATGATTGCATATCGATAAAATTGTATTTATTAATTACA
ATGTCGAATCATTTATTAGATTCACAAGTTATATTATACTCCACATTTGTGTTCAAAAAA
AATATTATACTCCACATTTTTGTTGGAGAAGGAATACCATGAAACAAGTGGTGCGAGTGT
GTAAGACTTTTGTCATTTTGTTTTGGAACATATACAAAAGACACACAAGTGGTGAGTGAG
TGGTAATAATAATAATAATTTGTAAATTGTACATGTAAATAAAGATAACAGGAGAGACAG
TGGGAGAAGTGAAGGCAGTAGCAGACATGCACCAAAGGAAAGCTGAGATGGCTAAGCACT
CTGATGCTTTTATTGCTTTACCTGGTGGATATGGGACACTTGAAGAGCTTCTTGAAGTAA
TCACTTGGGCACAGCTTGGAATCCATGATAAACCAGTAATCAATTTGCATCCATTTCAAT
TTACATTATATATAAATAATTAAAAATAACTATTTTGAATGTATTATTGTTTAATTTATA
TATGAATGTGAAGGTGGGATTACTGAATGTGGAAGGATACTACGATTCTTTGTTATCATT
CATAGACAAAGCAGTGGAAGAAGGTTTCATTGCACCAACTGCTCGTCATATCATTGTCTC
TGCTTCTTCTGCTAAAGACCTTGTCAAGAAACTCGAGGAATATGTACCAAGGCATGAGAA
GGTAGCCTCAGAGAAAAGCTGGGAGATGGAGCAAATAGGGCAGAGTCCCACTTGTGAAAT
CTCAAGATGAAAAGGATAAAGCCCAACTGAATTTTTTTCTAAATTGGGTTCCTTGTTGCT
TGTAAAACACAAATTGACTTTATTTGTGTAGTTTATTCTGTTGTTTAATGTACTTTTAGC
ATTTTATTTCGG


BQ
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TTC


BQ
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AGATGATGTTCAATTTCTCGGTGGGAGAGTATTTTGAGAGAGAAGGATATAATGGTTCAG
AGTTTGTGCCTACTTATGAAGATAAAGATGGTGACTGGATGCTCATTGGGGATGTTCCAT
GGGAGATGTTTGTATGCACTTGCAAGAGACTGAGGATCATGAAAGGATCAGAGGCCAAAG
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AAGAGAGCAGAGTTTCTTTTGGTCAAGA

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DS 

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ATGTTCAATTTCTCGGTGGGAGAGTATTTTGAGAGAGAAGGATATAATGGTTCAGAGTTT
GTGCCTACTTATGAAGATAAAGATGGTGACTGGATGCTCATTGGGGATGTTCCATGGGAG
ATGTTTGTATGCACTTGCAAGAGACTGAGGATCATGAAAGGATCAGAGGCCAAAGGTTTA
GGATGTGATGTATGAGACAAAGATTCATGAAGCCTAAAAGAGGCACAAGAACCTAAAGAG
AGCAGAGTTTCTTTTGGTCAAGAAAAAATCTGGTTGTGCTCGGGTTGTCGGGGAAGACCT
ATGTTCAGGATACCTCATCGGTGAATTTGAATGTAGAGATGCTTAATGGTATTAAGCACA
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GTTATTCTTATGTTTGTAGCATTCTGTTTTGTGTTCTCATTGATCAAAAGAGATTTTC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

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AATGTTGAAGGGAGAGGCAGAGCCTAAGCAGAAGAAAGGTTGGTCAGAGTCGCTGCTAGA
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TGCACCTCTTAATCTGAAAAGCAAGTCAGTTGCACGGTTTTGCTTCTTTTCCAAGTTGAA
GTCAAGCAACCACGGTCCAGACAGAGCACCGGTCTATCTCAATGTTTATGACTTGACTCC
TATTAACGGATATATCTATTGGGCAGGCCTCGGTATATTTCACTCTGGTGTAGAAGTTCA
TGGAGTAGAATATGCTTTTGGTGCACATGATTACGCAAGCAGTGGTGTTTTCGAGGTTGA
ACCAAGGCAATGCCCGGGCTTCAAATTCAAGAAGTCGATATTCATTGGAACCACGAATTT
AAACCCAGCACAAGTGAGAGAGTTCATGGAAGAGACGGCTTGCAATTACTACGGGAATAT
GTATCACCTGATTGCTAAGAACTGCAACCATTTCTGCCACGACGTTTGCTACAAACTAAC
CGGCAAAAAGATCCCGAAATGGGTGAACCGGCTTGCGCAAATAGGTTCTGTGTGTAGCTG
CATACTCCCCGAGTCACTCAAGATCACAGGGGTTAGTCGTGATGATCAAGACGGGCGAAG
AATCACAGAGGAAGAAAGCGAAACGAGATGTCTCACAACAAGCTCGTTCAGCTGTTTGTC
TTCTATCTCCATGAGACAAAAACAGCTTTCAACATCGTCTTTACTGATACAATCACCTCT
CAGAGGATGCCTACCTCCATGGCAACTCAAACGATCAAAATCCGACACCAGTTCCTTGAA
AGGAAGGTAGACAAAAACATCCGACATTTCTCCCCTTCTCCGTCTTTGTAATAGAGTTAG
ATTTAACAAACCCATTTGTCTTTCTTTCCGTTTGTATTTTGCTTTCGAAATTTGAAAACC
CATTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DV76TF U 1
AF RS1DV76JQ C 475
BS 1 668 RS1DV76TF
BS 669 669 RS1DV76JQ
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BS 753 768 RS1DV76TF
BS 769 1087 RS1DV76JQ

RD RS1DV76TF 773 0 0
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TGGAGTAGAATATGCTTTTGGTGCACATGATTACGCAAGCAGTGGTGTTTTCGAGGTTGA
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CATACTCCCCGAGTCACTCA*GATCACAGGG*TTAGTCGTGATGATCA
GACGG

QA 1 768 1 768
DS 

RD RS1DV76JQ 613 0 0
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TAGCTGCATACTCCCCGAGTCACTCAAGATCACAGGGGTTAGTCGTGATGATCAAGACGG
GCGAAGAATCACAGAGGAAGAAAGCGAAACGAGATGTCTCACAACAAGCTCGTTCAGCTG
TTTGTCTTCTATCTCCATGAGACAAAAACAGCTTTCAACATCGTCTTTACTGATACAATC
ACCTCTCAGAGGATGCCTACCTCCATGGCAACTCAAACGATCAAAATCCGACACCAGTTC
CTTGAAAGGAAGGTAGACAAAAACATCCGACATTTCTCCCCTTCTCCGTCTTTGTAATAG
AGTTAGATTTAACAAACCCATTTGTCTTTCTTTCCGTTTGTATTTTGCTTTCGAAATTTG
AAAACCCATTTCT

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 2

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TGTTTTGGGAACAAATCTGATTATGGAAAAGGAAGACAGATGCCTGTTCACTATGGCTCT
AACAAGCTTAACTATTTCACCGTCTCAGCCACAATCGCTACGCAGTTACCAAACGCCGTT
GGTGCTGCTTATTCCTTAAAGATGGACGGGAAGGAAGCGTGTGCGGTCACCTTCTTTGGC
GATGGTGGCTCAAGTGAGGGGGACTTCCATGCTGCTTTGAACTTTGCAGCGGTTATGGAA
GCACCTGTTTTGTTTATATGCAGGAACAATGGATGGGCGATCAGTACTCCCACCTCAGAT
CAGTTCCGAAGTGATGGTGTGGTGGTGAAAGGCCGTGCTTATGGGATTAGGAGCATACGT
GTGGATGGGAACGATGCGCTTGCTATGTACAGTGCGGTGCATGAAGGTCGCGAGATGGCG
ATTAGAGAACATAGGCCAATCTTGATCGTGGCCTTAACGTATCGTGTAGGACACCACTCA
ACGTCAGATGAATCCACTAGGTACCGCTCTGCAGATGAGATAGAGTGGTGGATCAAAGCA
AGAAACCCTCTGTCTAGGTTTAGGACTTGGGTTGAGAGTAATGGCTGGTGGAGTGATGAA
GCTGAATCTGATCTGAGAAGCAGAATCAAGAAAGAGATGTTAGAAGCTATCCGGGTTGCA
GAGAAGACTGAGAAACCTAATCTGAATCACATGTTCTCAGATGTGTATGATGTTCCTCCT
TTGAACCTCAGGGAGCAGGAACTTCTGGTGAGGAAGTGTGTCAAAAGTCACCCACAAGAT
TACCCATCAGATGTACCTCTTTAGGTGGACACATATATGAAATACTCCCATGTAATAAAG
TGTAAAAGATTATCTACACTGTGAATCATAATCTTTTCATTGAAAACTGGATCATCATTA
ACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RS1GP31TF U 1
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GGTGCTGCTTATTCCTTAAAGATGGACGGGAAGGAAGCGTGTGCGGTCACCTTCTTTGGC
GATGGTGGCTCAAGTGAGGGGGACTTCCATGCTGCTTTGAACTTTGCAGCGGTTATGGAA
GCACCTGTTTTGTTTATATGCAGGAACAATGGATGGGCGATCAGTACTCCCACCTCAGAT
CAGTTCCGAAGTGATGGTGTGGTGGTGAAAGGCCGTGCTTATGGGATTAGGAGCATACGT
GTGGATGGGAACGATGCGCTTGCTATGTACAGTGCGGTGCATGAAGGTCGCGAGATGGCG
ATTAGAGAACATAGGCCAATCTTGATCGTGGCCTTAACGTATCGTGTAGGACACCACTCA
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AGAGCT

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DS 

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GATGGTGTGGTGGTGAAAGGCCGTGCTTATGGGATTAGGAGCATACGTGTGGATGGGAAC
GATGCGCTTGCTATGTACAGTGCGGTGCATGAAGGTCGCGAGATGGCGATTAGAGAACAT
AGGCCAATCTTGATCGTGGCCTTAACGTATCGTGTAGGACACCACTCAACGTCAGATGAA
TCCACTAGGTACCGCTCTGCAGATGAGATAGAGTGGTGGATCAAAGCAAGAAACCCTCTG
TCTAGGTTTAGGACTTGGGTTGAGAGTAATGGCTGGTGGAGTGATGAAGCTGAATCTGAT
CTGAGAAGCAGAATCAAGAAAGAGATGTTAGAAGCTATCCGGGTTGCAGAGAAGACTGAG
AAACCTAATCTGAATCACATGTTCTCAGATGTGTATGATGTTCCTCCTTTGAACCTCAGG
GAGCAGGAACTTCTGGTGAGGAAGTGTGTCAAAAGTCACCCACAAGATTACCCATCAGAT
GTACCTCTTTAGGTGGACACATATATGAAATACTCCCATGTAATAAAGTGTAAAAGATTA
TCTACACTGTGAATCATAATCTTTTCATTGAAAACTGGATCATCATTAACTC

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 2

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GAGCCTGGAACCACTTGGTTTGGTCGGGACAAGGGTAAACTGACTCGGATGATCACTAAG
ATCTTTAAAAACAAGTTTAATGGTCCATACTACAGCTGGACTGTTGTGCCTCGGGGAAGA
CAAGAAAGATGAAAACTCACACATGGCGTCCTACACTAACCGGTTTAGTTCAGAAGAAGT
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ATAAAGCCAAAGAAAAAAGTTTGACGGCTTAAGCTGCTCGGATGTCTGACCGTAACGGTC
TTGGTCCTCACAAGCACAACTCTGGGCAGAAGTCTTTCAAACAAATCGAGCAAGAATTGG
TAACTTCATTTTCTTTGAACAAGTTAAAAAAAAATTATGTCTTAATAGCCTTTACTTTGT
TTACCATTTCAGGTAGAGGAATTGGGCAGACCGGTGACTCTTAGTGAAGTCTTCATTAAG
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TATCGGCGGAACAAACAGTCAAAGTTGGATGACCTTGAGGCTGAAAACGAAGACCCTTCA
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TCTACTTTCACAGACAAAAGAGGAAAACATTATGGGATTGGAAGCCTCAAGAGTACTCTC
GTCAATGGAAAGCGGAAGTACAGTGCACCCTCTTTAATCCTGGACCTGCAAACACAGCTT
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ATTGAGGAGCAGGCTGCCCAAAATGCAAACAATCTCCGCATAATCGAGGAGCAGGCTGCT
CATAGCGCAGAGCAGGGAGCACAGCTCAAGGAGTTATCTATAGTGAACAAGTTTTTGACT
GCAACAAATCCTCAGTATGTTGAATTCGTTGCAGCTAACAAGTCTGGTGATTAAGTTCTC
TCTTTCTTTGAATCTAAGTTCTTTCTTTTGTGTACTTTCAAACTTATGATCAGGTGTTAA
TACACCCTGTTAAACTCCTAAATAAAAGGAGTTCTTTTGTATCAAACTTAAGCTTGTTAA
AATTTTCAGTTTTTTATC


BQ
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AF RS1D638TF U 1
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BS 1 639 RS1D638TF
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ATCTTTAAAAACAAGTTTAATGGTCCATACTACAGCTGGACTGTTGTGCCTCGGGGAAGA
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TTGAGAAGATCGGTCAGCTCCGTCTCAAAGGCATTGTTAGCACTCGTAGGACTACTCGAA
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ATAAAGCCAAAGAAAAAAGTTTGACGGCTTAAGCTGCTCGGATGTCTGACCGTAACGGTC
TTGGTCCTCACAAGCACAACTCTGGGCAGAAGTCTTTCAAACAAATCGAGCAAGAATTGG
TAACTTCATTTTCTTTGAACAAGTTAAAAAAAAATTATGTCTTAATAGCCTTTACTTTGT
TTACCATTTCAGGTAGAGGAATTGGGCAGACCGGTGACTCTTAGTGAAGTCTTCATTAAG
ACTCATACAAAAAAGGATGGTACCTTTGTGGATATGAAAGCACAGGAGGTGGTTGAGGTG
TATCGGCGGAACAAACAGTCAAAGTTGGATGACCTTGAG*CTGAAAACGAAGACCCTTCA
GAGTCTAGTTCACAAGCTCCTGAGCTCTCTATAGATGAG*ACAATGAGATATTCCTCCTG
TCTACTTTCACAGACAAAA

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1D638JQ 892 0 0
GGCTT
AGCTGCTCGGATGTCTGACCGTAACGGTCTTG*TCCTCACAAGCACAACTCTGGGCAGAA
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AA*TTATGTCTTAATAGCCTTTACTTTGTTTACCATTTCAGGTAGAGGAATTGGGCAGAC
CGGTGACTCTTAGTGAAGTCTTCATTAAGACTCATACAAAAAAGGATGGTACCTTTGTGG
ATATGAAAGCACAGGAGGTGGTTGAGGTGTATCGGCGGAACAAACAGTCAAGGTTGGATG
ACCTTGAGGCTGAAAACGAAGACCCTTCAGAGTCTAGTTCACAAGCTCCTGAGCTCTCTA
TAGATGAGGACAATGAGATATTCCTCCTGTCTACTTTCACAGACAAAAGAGGAAAACATT
ATGGGATTGGAAGCCTCAAGAGTACTCTCGTCAATGGAAAGCGGAAGTACAGTGCACCCT
CTTTAATCCTGGACCTGCAAACACAGCTTGATGAAGCTCACCGCAAGATCGAGGAGCAGG
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ATCTCCGCATAATCGAGGAGCAGGCTGCTCATAGCGCAGAGCAGGGAGCACAGCTCAAGG
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CAGCTAACAAGTCTGGTGATTAAGTTCTCTCTTTCTTTGAATCTAAGTTCTTTCTTTTGT
GTACTTTCAAACTTATGATCAGGTGTTAATACACCCTGTTAAACTCCTAAATAAAAGGAG
TTCTTTTGTATCAAACTTAAGCTTGTTAAAATTTTCAGTTTTTTATC

QA 6 892 6 892
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GTCCTCGTGGAGACGGTCCGGTATGAAGCTTGTACCTGATCCATCAAATCCAAGTCATTT
CCGGTTTATGTTTGCTGAGATGGTAAATAACCGGCCGGTTCTGTTTACGTATCATTCTAA
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CAATAATGTTTTCTTAAGCTTATCAAACCGACCTCACGAGAGTATTGTGATGAGCGTGGA
CGATGTTGATGGGTCGATGACAAACCGGGTTCCAGTGATTTTGAGGCCAAGGATGAACCA
AGAGGCGATAAGAGGATGCCCTATCAAGTGTTGGATTCAGCAGGAACGATCTAGAGAGTC
AGTTGTTACATATACATGGAGATGAATACAAAGTGGTTATTAGGTTAGACACAATAGAGT
TATCAAAGATGAAGCGGATGAAGAGTCTAGAGGTTTGGGAGATAAGCTCAAATGGTGAGA
AGTGGGAGTTAGTGTCAAGAGCTCCTAGCGAAGTGATCAGCAACAAGCCTTGTGGTGTGA
TGATGGGATGCTTAGAGAGGAGACTAGGGGTGATTAGAGTGGCTTTGATGACGAACCGTG
AGGGTTTATGGAATATTATATGGATGGATTATGATAAGGAGAAGGATAAGTGGGAATGGG
TCCCATTGCCACATTGTAGATTCTTGCAAGGCTCAAATATGGCCGGTATTAGCTTTTCTT
CTGGTCTCACTTTTTCTTTGTAACACACTTCAAAAGTTTAATATATATGTCGGTATCAAT
CACCCGACCATACGCTTTTTTATTATATGATTGTTGGAATTCAATGAATTTCACGAGCTG
GGAC


BQ
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10 10 10 10 

AF RS1GN41TF U 1
AF RS1GN41JQ C 370
BS 1 643 RS1GN41TF
BS 644 644 RS1GN41JQ
BS 645 703 RS1GN41TF
BS 704 704 RS1GN41JQ
BS 705 741 RS1GN41TF
BS 742 742 RS1GN41JQ
BS 743 752 RS1GN41TF
BS 753 753 RS1GN41JQ
BS 754 764 RS1GN41TF
BS 765 1144 RS1GN41JQ

RD RS1GN41TF 777 0 0
GATCAGACAACTCAACCATGGATCACAGAGAGACACATGGATCTTTGTCTATACAAGGCG
TTGGCGTCGCGACAACGGTGTGCTTCACGGATTTTCCAACCGTTCTGTACGGTGGTTCAA
GATTCCGGTGGCTGAAATTTTGACCGGTGAGTTTTTTCCCGGTGAAGATTTATATTTACT
AACGGCTAGCGGTAATTTTCTTCTCTTTGCTTCTAATACTCATAGTGGAATCATAGCCGT
TGATCTCGTGGACAAGAGTGTTAGAAGAATCAGCTCATGTCCTTTAGGTCCACGTGGCAC
GTCCTCGTGGAGACGGTCCGGTATGAAGCTTGTACCTGATCCATCAAATCCAAGTCATTT
CCGGTTTATGTTTGCTGAGATGGTAAATAACCGGCCGGTTCTGTTTACGTATCATTCTAA
CACAACCACGTGGACTACTAAAGAAGCAGAGGAAGTAAATAACTGGGGTCATAAGAAAAA
CAATAATGTTTTCTTAAGCTTATCAAACCGACCTCACGAGAGTATTGTGATGAGCGTGGA
CGATGTTGATGGGTCGATGACAAACCGGGTTCCAGTGATTTTGAGGCCAAGGATGAACCA
AGAGGCGATAAGAGGATGCCCTATCAAGTGTTGGATTCAGCAG*AACGATCTAGAGAGTC
AGTTGTTACATATACATGGAGATGAATACAAAGTGGTTATTAG*TTAGACACAATAGAGT
TATCAAAGATGAAGCGGATGA*GAGTCTAGAG*TTTGGGAGATA
GCTCAATGGTGAG

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1GN41JQ 775 0 0
GTTTGCTGAGATGGTAAATAACCGGCCGGTTCTGTTTACGTATCATTCTAACACAACCAC
GTGGACTACTAAAGAAGCAGAGGAAGTAAATAACTGGGGTCATAAGAAAAACAATAATGT
TTTCTTAAGCTTATCAAACCGACCTCACGAGAGTATTGTGATGAGCGTGGACGATGTTGA
TGGGTCGATGACAAACCGGGTTCCAGTGATTTTGAGGCCAAGGATGAACCAAGAGGCGAT
AAGAGGATGCCCTATCAAGTGTTGGATTCAGCAGGAACGATCTAGAGAGTCAGTTGTTAC
ATATACATGGAGATGAATACAAAGTGGTTATTAGGTTAGACACAATAGAGTTATCAAAGA
TGAAGCGGATGAAGAGTCTAGAGGTTTGGGAGATAAGCTCAAATGGTGAGAAGTGGGAGT
TAGTGTCAAGAGCTCCTAGCGAAGTGATCAGCAACAAGCCTTGTGGTGTGATGATGGGAT
GCTTAGAGAGGAGACTAGGGGTGATTAGAGTGGCTTTGATGACGAACCGTGAGGGTTTAT
GGAATATTATATGGATGGATTATGATAAGGAGAAGGATAAGTGGGAATGGGTCCCATTGC
CACATTGTAGATTCTTGCAAGGCTCAAATATGGCCGGTATTAGCTTTTCTTCTGGTCTCA
CTTTTTCTTTGTAACACACTTCAAAAGTTTAATATATATGTCGGTATCAATCACCCGACC
ATACGCTTTTTTATTATATGATTGTTGGAATTCAATGAATTTCACGAGCTGGGAC

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

CO CL5046Contig1 817 2 8 U
AGGGATGGATGGGAAAAGCAAGCTAGCAAACAGATACAAATTCCCAGCGGCCATTCGCCA
AATCCACTTGCTCATACACGCGTTCAGTTCCATCAGGATCAGACACATGTTCTTGTTGTC
CATGCCAGCCAGTTAGCTATATATGAGGCTCCTAAATTAGAGAGCATGAAGCAGTGGATC
CCGAAGGAATCAAGTGGGTCAGTGACAGATGCTGTATACTCGTGTGATAGCCAGTCAATC
TACGCTGCCTTTGACGATGGAAGTGTGAGTATCTTGACGGCAACAACGTTGCAACTCAAG
TGCCGCATTGGTCCCAGTTCATATTTGCCTTCAAATCCGAGCTCGAGGGTATATCCAGCC
ACCATAGCAGCCCATCCCTCTGAACCAAATCAATTTGCAGTTGGACTTACTGATGGTGGG
GTTCACGTGATCGAACCACCAGGACCAGAAGGTAAGTGGGGGACGTCTCCACCGCCAGAA
AACGGTGCAGGACCAAGCGTCTCCTCAGCACCTGGATCAGATCAACAGCCGAGGTGAGGT
CTGATTCAGCAAGCTCCGCACCACCATGATGCAGCCTCCTAAGTTATTATTTATAGACTT
TGAGAGGAGAGCTCTGCGATTTGTAGGGTTATATATTGGCTTTACTCATTCATAGTAGGT
GAAAGGTGAAGCAGTAGTGTCTTCCATTAAGTCTAGTGCTTTTTATTTTTAAAATGGTTT
CTTTTGAGATCATTCTTATCATCAGATAGTTTCTTTCCAACAATATGTTTTTAGATTTGG
TTTGTAGATACCAGTTTGATAGCAATTCAAAATGCTG


BQ
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AF RS1F279TF U 1
AF RS1H676TF U 39
BS 1 47 RS1F279TF
BS 48 48 RS1H676TF
BS 49 50 RS1F279TF
BS 51 51 RS1H676TF
BS 52 228 RS1F279TF
BS 229 229 RS1H676TF
BS 230 329 RS1F279TF
BS 330 817 RS1H676TF

RD RS1F279TF 329 0 0
AGGGATGGATGGGAAAAGCAAGCTAGCAAACAGATACAAATTCCCAGTGGGCATTCGCCA
AATCCACTTGCTCATACACGCGTTCAGTTCCATCAGGATCAGACACATGTTCTTGTTGTC
CATGCCAGCCAGTTAGCTATATATGAGGCTCCTAAATTAGAGAGCATGAAGCAGTGGATC
CCGAAGGAATCAAGTGGGTCAGTGACAGATGCTGTATACTCGTGTGATGGCCAGTCAATC
TACGCTGCCTTTGACGATGGAAGTGTGAGTATCTTGACGGCAACAACGTTGCAACTCAAG
TGCCGCATTGGTCCCAGTTCATATTTGCC

QA 1 329 1 329
DS 

RD RS1H676TF 779 0 0
G
ATTCCCAGCGGCCATTCGCCAAATCCACTTGCTCATACACGCGTTCAGTTCCATCAGGAT
CAGACACATGTTCTTGTTGTCCATGCCAGCCAGTTAGCTATATATGAGGCTCCTAAATTA
GAGAGCATGAAGCAGTGGATCCCGAAGGAATCAAGTGGGTCAGTGACAGATGCTGTATAC
TCGTGTGATAGCCAGTCAATCTACGCTGCCTTTGACGATGGAAGTGTGAGTATCTTGACG
GCAACAACGTTGCAACTCAAGTGCCGCATTGGTCCCAGTTCATATTTGCCTTCAAATCCG
AGCTCGAGGGTATATCCAGCCACCATAGCAGCCCATCCCTCTGAACCAAATCAATTTGCA
GTTGGACTTACTGATGGTGGGGTTCACGTGATCGAACCACCAGGACCAGAAGGTAAGTGG
GGGACGTCTCCACCGCCAGAAAACGGTGCAGGACCAAGCGTCTCCTCAGCACCTGGATCA
GATCAACAGCCGAGGTGAGGTCTGATTCAGCAAGCTCCGCACCACCATGATGCAGCCTCC
TAAGTTATTATTTATAGACTTTGAGAGGAGAGCTCTGCGATTTGTAGGGTTATATATTGG
CTTTACTCATTCATAGTAGGTGAAAGGTGAAGCAGTAGTGTCTTCCATTAAGTCTAGTGC
TTTTTATTTTTAAAATGGTTTCTTTTGAGATCATTCTTATCATCAGATAGTTTCTTTCCA
ACAATATGTTTTTAGATTTGGTTTGTAGATACCAGTTTGATAGCAATTCAAAATGCTG

QA 2 779 2 779
DS 



AS 1 2

CO CL5047Contig1 898 2 2 U
GTGGGAAGTTAAAAGACTTAAAAGACATTAGTCTCACACAGAAGTTTCACTACAGTATCA
TCAAACAATTTAGCACCAATGAGAAATAATGGTTCGTACCTTATAGCTCTGAAAGAAAAG
GAAATATTAAAGGAACTCCGGCAATGACTAGAATTATAAGAACAGTTAGCTAGTTCTTGT
GGTGAACAGAAAAAAAAAGTTAGCTAGATCTTGTTGTTATTGGAGTTTGTCTTAAATCAA
GACCATCCCACTTGGATCGATTTTAAATATATCACTTGGATCAAGACCATCCCACTCCAG
AAAAAAAAGTTATCTAGATCTTCCATAATTTTCTTAAATCACACATCACTTTCATCTTTG
ATTTAGGAGATGTTAATGAGAATTATATTTATAATGATTATTAGAATTTTAAAGTTTAGT
ATTATTGGTTTATAGATTTTTACATTCTTATTAAAATCTAGTATTACTGGTTTGATGATT
TCTATACAAAATTATTTGTTACTCAAAAAATTTAAATTTTAATGGTTCTTCAAATCTATT
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ATTGGTTAACCAAACAAATCCATCTTTAAATTTTCTTTATTATCACACTATTTTATCAAA
CAATAATTCATTTGATCAAGATTTTCATTAAAAGTAATTGTAATTTAGATATTTTTAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AA
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QA 1 563 1 563
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AS 1 2

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TT


BQ
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10 10 

AF RS1F671TF U 1
AF RS1F671JQ C 380
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TATCGATAATTTGCAAGATGAGATGATGGATCTGATGGATGTGAGTTCTGAGATTCAAGA
AACGCTTGGTAGGAGCTATAGTGTTCCTGATGGTCTCGACGAAGATGATCTCATGGGAGA
GCTGGAGGCTCTTGAAGCTGATATGGGAGACGAGACAGAAGCAGATGGAGTGCCTTCTTA
TCTCCAACCCGATAAGCATAGTGATTACGATGATGAACTTAACTTGCCTTCAGTACCCAT
AGGACAGACTGGAGCTCCACCTGGTCGAGTTCAG*CTGAGGATGAGTTTGGGTTGCCGGC
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CGGGGATAAAAGTTTCTGGCGATTTTCTTTTGTGGAGTGGAGCTACTAAGCTCTTTTTTA
GGCTTAGGCTTCTGATCACTTTGTTCATAACATTTTCAACTTTTCTTTTGGCTCTGTAAT
GAATTTTACAATAATTGTGTGTTTTATGGATGGCTCTTTTCTT

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 2

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AATAAAATTAAAAGAAGTAGTAGAAAGAGGCGAGGAGGAGATACAAGGAAGAGGAGATAC
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ATTTAAGACCTGGTGAAGGAGACGCTATAGCACAGTATGTGCAGCAAGGGAAACGTATCC
CACGTAGAGGAGAAGTTGGTCTTAACGCTGATGAGATTCAGAGGTTTGAGGATCTTGGGT
ACGTCATGAGTGGGAGTAGGCATCAAAGGATGAATGCCATTCGTATAAGAAAGGAGAACC
AGGTTTATAGCGCTGAAGACAAACGGGCGCTGGCTATGTTTAACTATGAGGAGAAGGCCA
AGCGTGAGGCTAAGGTTATGTCTGATCTTTCCAGGCTTGTGCAGCGCCATATGGGACAAG
AGTTGGGTCCCAATCATGACCCTTTTGGTTCTGGAAAGACTGATGGACCTGATGACTGAA
TTGGGACATACAGAAGCTGCTGCTCCGCTCTGCTTTTGATGCTTCATCCTACTTCTTTCT
CTCTCATCTATCTTTGGTTATGCTGTTTTGTCTAAAACTTGTCACACATACAGAAGCTGT
TGCTCCCCTCTCATTTTATTTGCACTGTTTTATATATTGATATAATTTAGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DU74TF U 1
AF RS1DU74JQ C 399
BS 1 592 RS1DU74TF
BS 593 593 RS1DU74JQ
BS 594 679 RS1DU74TF
BS 680 1072 RS1DU74JQ

RD RS1DU74TF 684 0 0
GGGAGCCCTAGCTTATCATATCACAAGATGTCGCCTCCGCCTCGGAGCTGGATCACGGAG
AATCAAGGGCAGGCGAATCAAGGTCGGCGTAGAGGATGGGATTCGTCATCGGAATCGGAT
GAGAAAGATAGGAGACGGAAGAAAAGCACAAGTATTAGGAAGAAGAAGAAGACAAGATAC
ACTGATTCTAATGAGAGCAGCGATGAATATGAGATTAGTGGTGATGATGAACAACACAAC
AAGTCAAAGATCAAGAGGCGGAATAAGCATGGATTTGATGAGGAAGATAGCAGAAGTAAG
AATAAAATTAAAAGAAGTAGTAGAAAGAGGCGAGGAGGAGATACAAGGAAGAGGAGATAC
ACCGATTCTGATGATGTTCTCTCAAGGCAAAACTTGAAGAAAAGGTCAAGGAACCTCAGC
TTGATCAAGAGGAATCGAACAAGAAAGCTTTAGCTCCTGAAGATGAAAAAGAAGCTGCTG
TGGTGGGTCCAATGCCTTTACCTAAAGCTGGAGGACACATCAGAAACTACCACGGTCGTG
ATTTAAGACCTGGTGAAGGAGACGCTATAGCACAGTATGTGCAGCAAGGGAA*CGTATCC
CACGTAGAGGAGAAGTTGGTCTTAACGCTGATGAGATTCAGAGGTTTGAGGATCTTGGGT
ACGTCATGAGTGGGAGTAG
CATCA

QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1DU74JQ 674 0 0
GAAAAGGTCAAGGAACCTCAGCTTGATCAAGAGGAATCGAACAAGAAAGCTTTAGCTCCT
GAAGATGAAAAAGAAGCTGCTGTGGTGGGTCCAATGCCTTTACCTAAAGCTGGAGGACAC
ATCAGAAACTACCACGGTCGTGATTTAAGACCTGGTGAAGGAGACGCTATAGCACAGTAT
GTGCAGCAAGGGAAACGTATCCCACGTAGAGGAGAAGTTGGTCTTAACGCTGATGAGATT
CAGAGGTTTGAGGATCTTGGGTACGTCATGAGTGGGAGTAGGCATCAAAGGATGAATGCC
ATTCGTATAAGAAAGGAGAACCAGGTTTATAGCGCTGAAGACAAACGGGCGCTGGCTATG
TTTAACTATGAGGAGAAGGCCAAGCGTGAGGCTAAGGTTATGTCTGATCTTTCCAGGCTT
GTGCAGCGCCATATGGGACAAGAGTTGGGTCCCAATCATGACCCTTTTGGTTCTGGAAAG
ACTGATGGACCTGATGACTGAATTGGGACATACAGAAGCTGCTGCTCCGCTCTGCTTTTG
ATGCTTCATCCTACTTCTTTCTCTCTCATCTATCTTTGGTTATGCTGTTTTGTCTAAAAC
TTGTCACACATACAGAAGCTGTTGCTCCCCTCTCATTTTATTTGCACTGTTTTATATATT
GATATAATTTAGCG

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

CO CL5050Contig1 1264 2 2 U
GGTCCAAACTCCAGGCTGGTTACCTCTTCCCGGAGATTGCAAGAAGAAGGTCTGCACATT
TGCTGAAGTACCCAGATGCGCAAATTATCAGTCTTGGGATAGGTGACACAACTGAGCCAA
TTCCAGAAGTGATCACTTCTGCAATGGCAAAGAAAGCTCATGAGTTGTCCACAGTAGAGG
GATATAGTGGTTATGGTGCTGAACAAGGTGCAAAGCCACTGAGAGCTGCTCTTGCCAAAA
CATACTACAGTGGCCTTGGCATAGGTGATGACATCTTCGTTTCTGATGGTGCCAAATGTG
ATATCTCACGTCTCCAGGTTATGCTTGGTTCCAATGTTACAGTTGCTGTTCAAGATCCTT
CATATCCGGCTTATGTGGACTCCATTGTTATTATGGGTCAGACCGGACAATTTAACACAG
ATATGCAGAAGTATGGGAACATTGAGTACATGAGATGCACTCCAGAGAACGGCTTCTTCC
CAGACTTATCAACTGTTGGCAGGACGGACATCATTTTCTTCTGTTCCCCAAACAACCCTA
CGGGTGCTGCTGCCACGAGGGATCAACTGACTCAGTTAGTACAGTTTGCAAAGAAGAACG
GATCAATCATAGTGTATGATTCCGCATATGCAATGTATATGTCTGATGATAACCCACGCT
CCATTTTCGAAATCCCTGGAGCAGAAGAGGTCGCTATGGAGACAGCTTCCTTCAGTAAAT
ACGCAGGTTTCACCGGAGTTAGACTTGGTTGGACAGTCATCCCGAAGAAGCTGCTCTATT
CAGACGGCTTCCCTGTTGCAAAAGACTTCAATCGAATTGTCTGCACTTGTTTCAACGGTG
CCTCCAATCTCTCTCAAGCTGGTGCTCTTGCTTGCCTTACACCAGAAGGACTTGAGGCAA
TGCTAGGTGGTTGGGTTCTACAAAGAAAACACAAACATAATCATAGACACATTCACTTCT
CTCGGATATGATGTGTATGGAGGAAAGAATGCGCCTTACGTTTGGGTTCATTTCCCGAAG
CAAAGCTCATGGGATGTGTTTGCTGAGATTCTGGAGAAGACTCACGTGGTTACAACTCCA
GGGAGCGGGTTTGGACCTGGAGGTGAAGGGTTTGTTCGTGTTAGCGCCTTTGGTCACAGA
GAGAACATCTTGGAGGCATGTCGGAGATTCAAGCAGCTTTACAAATGAAAAAGATTCTTG
TAATCACTCAGCATCCTCTTTAATGACTTGGGACTAGGATTAAAATAATATCGTCTCTTT
TGTT


BQ
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10 10 10 10 

AF RS1DW65TF U 1
AF RS1DW65JQ C 586
BS 1 676 RS1DW65TF
BS 677 1264 RS1DW65JQ

RD RS1DW65TF 676 0 0
GGTCCAAACTCCAGGCTGGTTACCTCTTCCCGGAGATTGCAAGAAGAAGGTCTGCACATT
TGCTGAAGTACCCAGATGCGCAAATTATCAGTCTTGGGATAGGTGACACAACTGAGCCAA
TTCCAGAAGTGATCACTTCTGCAATGGCAAAGAAAGCTCATGAGTTGTCCACAGTAGAGG
GATATAGTGGTTATGGTGCTGAACAAGGTGCAAAGCCACTGAGAGCTGCTCTTGCCAAAA
CATACTACAGTGGCCTTGGCATAGGTGATGACATCTTCGTTTCTGATGGTGCCAAATGTG
ATATCTCACGTCTCCAGGTTATGCTTGGTTCCAATGTTACAGTTGCTGTTCAAGATCCTT
CATATCCGGCTTATGTGGACTCCATTGTTATTATGGGTCAGACCGGACAATTTAACACAG
ATATGCAGAAGTATGGGAACATTGAGTACATGAGATGCACTCCAGAGAACGGCTTCTTCC
CAGACTTATCAACTGTTGGCAGGACGGACATCATTTTCTTCTGTTCCCCAAACAACCCTA
CGGGTGCTGCTGCCACGAGGGATCAACTGACTCAGTTAGTACAGTTTGCAAAGAAGAACG
GATCAATCATAGTGTATGATTCCGCATATGCAATGTATATGTCTGATGATAACCCACGCT
CCATTTTCGAAATCCC

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1DW65JQ 679 0 0
TTGCAAAGAAGAACGGATCAATCATAGTGTATGATTCCGCATATGCAATGTATATGTCTG
ATGATAACCCACGCTCCATTTTCGAAATCCCTGGAGCAGAAGAGGTCGCTATGGAGACAG
CTTCCTTCAGTAAATACGCAGGTTTCACCGGAGTTAGACTTGGTTGGACAGTCATCCCGA
AGAAGCTGCTCTATTCAGACGGCTTCCCTGTTGCAAAAGACTTCAATCGAATTGTCTGCA
CTTGTTTCAACGGTGCCTCCAATCTCTCTCAAGCTGGTGCTCTTGCTTGCCTTACACCAG
AAGGACTTGAGGCAATGCTAGGTGGTTGGGTTCTACAAAGAAAACACAAACATAATCATA
GACACATTCACTTCTCTCGGATATGATGTGTATGGAGGAAAGAATGCGCCTTACGTTTGG
GTTCATTTCCCGAAGCAAAGCTCATGGGATGTGTTTGCTGAGATTCTGGAGAAGACTCAC
GTGGTTACAACTCCAGGGAGCGGGTTTGGACCTGGAGGTGAAGGGTTTGTTCGTGTTAGC
GCCTTTGGTCACAGAGAGAACATCTTGGAGGCATGTCGGAGATTCAAGCAGCTTTACAAA
TGAAAAAGATTCTTGTAATCACTCAGCATCCTCTTTAATGACTTGGGACTAGGATTAAAA
TAATATCGTCTCTTTTGTT

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

CO CL5051Contig1 581 2 8 U
CCAGCAGTTTCATATATAGCAATTTCAAACCAAAACACAAACCATAAAATTCTGAGTTAT
GACAAACCATAATATGTTTCTGATTTCAGACAGTTTCTCAAACGATAAGACCTGAGAAAA
AAACAGAGCAACAAGAACTCAGTTCTCCGAACTGGAAGATGTGTCTCCACCAGAAGAAGA
AGACTCGCTGTTAAGCCTCTTCATCTCCTCGTACGCCCACTCCAGCCCGTGGCAGTAATG
CACCGGCGGATTGAACCTGGTATCACTTATATCATCAGGCAAGAAAGCTCCATTCTCCAC
CAAAAACTTCACGGCTTCTCCCTTCCTCTCTTTAGCCGCGGCGTGGAGAGGAGTCCACCC
GCAGGAGCCCCATGTCCTCCCATCAATGTTAGCCCCACGCTCGAGGAGCAAATCCATGAC
TTCAATGTGACCTCCCTCAGCAGCAAGGGGAAGCGGAAACACTCCTTTCGATTTAGGTCC
CCACGCTAGAGCGTTAACATCAAACCCTTGGTCGAGCAGCTGCTTGACGGATTTCAAATC
GCCTTTTCGAGCTTTGATGTGGAGCGGAGTCCAGCCTCTGT


BQ
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AF RS1G211JQ U 1
AF RS1CC11JQ U 168
BS 1 379 RS1G211JQ
BS 380 380 RS1CC11JQ
BS 381 448 RS1G211JQ
BS 449 449 RS1CC11JQ
BS 450 457 RS1G211JQ
BS 458 458 RS1CC11JQ
BS 459 474 RS1G211JQ
BS 475 581 RS1CC11JQ

RD RS1G211JQ 474 0 0
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GACAAACCATAATATGTTTCTGATTTCAGACAGTTTCTCAAACGATAAGACCTGAGAAAA
AAACAGAGCAACAAGAACTCAGTTCTCCGAACTGGAAGATGTGTCTCCACCAGAAGAAGA
AGACTCGCTGTTAAGCCTCTTCATCTCCTCGTACGCCCACTCCAGCCCGTGGCAGTAATG
CACCGGCGGATTGAACCTGGTATCACTTATATCATCAGGCAAGAAAGCTCCATTCTCCAC
CAAAAACTTCACGGCTTCTCCCTTCCTCTCTTTAGCCGCGGCGTGGAGAGGAGTCCACCC
GCAGGAGCCCCATGTCCTCGCATCAATGTTAGCCCCACGCTCGAGGAGCAAATCCATGAC
TTCAATGTGACCTCCCTCAGCAGCAAGGTGAAGCGGAGACACTCCTTTCGATTT

QA 1 474 1 474
DS 

RD RS1CC11JQ 414 0 0
CCCCAAAAAAAAAAA
ACTCGCTGTTAAGCCTCTTCATCTCCTCGTACGCCCACTCCAGCCCGTGGCAGTAATGCA
CCGGCGGATTGAACCTGGTATCACTTATATCATCAGGCAAGAAAGCTCCATTCTCCACCA
AAAACTTCACGGCTTCTCTCTTCCTCTCTTTAGCCGCGGCGTGGAGAGGAGTCCACCCGC
AGGAGCCCCATGTCCTCCCATCAATGTTAGCCCCACGCTCGAGGAGCAAATCCATGACTT
CAATGTGACCTCCCTCAGCAGCAAGGGGAAGCGGAAACACTCCTTTCGATTTAGGTCCCC
ACGCTAGAGCGTTAACATCAAACCCTTGGTCGAGCAGCTGCTTGACGGATTTCAAATCGC
CTTTTCGAGCTTTGATGTGGAGCGGAGTCCAGCCTCTGT

QA 16 414 16 414
DS 



AS 1 2

CO CL5052Contig1 1114 2 8 U
GGATTCTCCTGTAATTCCTTTCCACCAGGAGAAAACTAAGGAACCGATAACTCGCAAACC
CATCAAAACAAAACAAAAAAATGCCATCAGGCAAACCTTCTTCTTCTGTCTTCTCATTAC
ATCTCAAACCAACACCATTAAAACCTTCAAGCAGCACCAGCAACAACAACAACACCACAA
ACCAAGCATGCGCGGCTTGCAAATACCAACGTAGAAAATGTGCTCCTGATTGTCTTCTCG
CTCCTTACTTTCCTCACGACCGTCACCGACAATTCCTCAACGCGCATAAGCTCTTTGGTG
TAAGCAACATCACCAAGATCATCAAAGACCTTAGCCCTCCTGATAAAGACGCCGCTATGT
ATACAATCATGTTTCAATCCGATGCACGTGCCAATGATCCCATCGATGGATGCTATAGCA
TCATTAGAAAGCTTCAGTACCAGATCGAATACTCAAAAAACGAGTTGGAGATGGTTGTTC
AGCAATTGGCTGTGTTCCGTAATCATCATCAAGAACCGCATATTCAGATTCAAGAACCTG
AGGATCTCTCTAGTTTTTCGAGTTCTTGTGATCTAAACAACAACAACAACTCGATTCCTT
ACAGCTACCCTCTTCACCATGTCCAAGAACCAATTCAGCAGCAACAAGAACAACAACAAT
ATTGTTCCTCTGGAAACTTTAACGGGTTACAAGAAGACATGTGGTGTCTTCAACTTCAAG
ATTCATCAACGACGGTGAATATGAAAGGTGGCTTCATTGATGAATGTGAGGACATTAAGC
CTGTGGAAGAGGTTTCTAGTGAAACACACGAGTTCGAGCATCATCATGATGGTTTGGTTG
AAGAACCATACATCATTTCTCCTTAGCTTTTCCTTTTTCTTTTGGTCTGTTGGACTTTTA
TTATTTTCTTGATTTTAGAATCATTTTTCTAGGGCTAACAAAATCTCCTTTCGCTGATCG
ATCTTAATAGTTATTTTTTAACCAAATTTATTTTCTTCTGGATTTTTTTTTTGTATTTCA
TTTGGTAAAATTTGTATTAGATGTGAAAGAAACATGGAATCTTCAAGATAAATGTTAAAC
AAGAATTTGATGGAATAAAACACATTTTAATGGC


BQ
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AF RS1BB26TF U 1
AF RS1BB26JQ C 351
BS 1 691 RS1BB26TF
BS 692 694 RS1BB26JQ
BS 695 722 RS1BB26TF
BS 723 723 RS1BB26JQ
BS 724 734 RS1BB26TF
BS 735 735 RS1BB26JQ
BS 736 747 RS1BB26TF
BS 748 1114 RS1BB26JQ

RD RS1BB26TF 766 0 0
GGATTCTCCTGTAATTCCTTTCCACCAGGAGAAAACTAAGGAACCGATAACTCGCAAACC
CATCAAAACAAAACAAAAAAATGCCATCAGGCAAACCTTCTTCTTCTGTCTTCTCATTAC
ATCTCAAACCAACACCATTAAAACCTTCAAGCAGCACCAGCAACAACAACAACACCACAA
ACCAAGCATGCGCGGCTTGCAAATACCAACGTAGAAAATGTGCTCCTGATTGTCTTCTCG
CTCCTTACTTTCCTCACGACCGTCACCGACAATTCCTCAACGCGCATAAGCTCTTTGGTG
TAAGCAACATCACCAAGATCATCAAAGACCTTAGCCCTCCTGATAAAGACGCCGCTATGT
ATACAATCATGTTTCAATCCGATGCACGTGCCAATGATCCCATCGATGGATGCTATAGCA
TCATTAGAAAGCTTCAGTACCAGATCGAATACTCAAAAAACGAGTTGGAGATGGTTGTTC
AGCAATTGGCTGTGTTCCGTAATCATCATCAAGAACCGCATATTCAGATTCAAGAACCTG
AGGATCTCTCTAGTTTTTCGAGTTCTTGTGATCTAAACAACAACAACAACTCGATTCCTT
ACAGCTACCCTCTTCACCATGTCCAAGAACCAATTCAGCAGCAACAAGAACAACAACAAT
ATTGTTCCTCTGGAAACTTTAACGGGTTACA**GAGACATGTGGTGTCTTCAACTTCAAG
AT*CATCAACGACG*TGAATATGAAAG
TGGCTCATTGATGATGTGA

QA 1 747 1 747
DS 

RD RS1BB26JQ 764 0 0
GCCGCTATGTATACAATCATGTTTCAATCCGATGCACGTGCCAATGATCCCATCGATGGA
TGCTATAGCATCATTAGAAAGCTTCAGTACCAGATCGAATACTCAAAAAACGAGTTGGAG
ATGGTTGTTCAGCAATTGGCTGTGTTCCGTAATCATCATCAAGAACCGCATATTCAGATT
CAAGAACCTGAGGATCTCTCTAGTTTTTCGAGTTCTTGTGATCTAAACAACAACAACAAC
TCGATTCCTTACAGCTACCCTCTTCACCATGTCCAAGAACCAATTCAGCAGCAACAAGAA
CAACAACAATATTGTTCCTCTGGAAACTTTAACGGGTTACAAGAAGACATGTGGTGTCTT
CAACTTCAAGATTCATCAACGACGGTGAATATGAAAGGTGGCTTCATTGATGAATGTGAG
GACATTAAGCCTGTGGAAGAGGTTTCTAGTGAAACACACGAGTTCGAGCATCATCATGAT
GGTTTGGTTGAAGAACCATACATCATTTCTCCTTAGCTTTTCCTTTTTCTTTTGGTCTGT
TGGACTTTTATTATTTTCTTGATTTTAGAATCATTTTTCTAGGGCTAACAAAATCTCCTT
TCGCTGATCGATCTTAATAGTTATTTTTTAACCAAATTTATTTTCTTCTGGATTTTTTTT
TTGTATTTCATTTGGTAAAATTTGTATTAGATGTGAAAGAAACATGGAATCTTCAAGATA
AATGTTAAACAAGAATTTGATGGAATAAAACACATTTTAATGGC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL5053Contig1 274 2 1 U
GGACTCGAGAAAGAAAGTAAAAATGGCAACGACCCAGCTCAAATCAGATGCGATCATGGA
TATGATGAAGCAGCATCTCTCCACCGACGCCGGTAAAGAGCTCACAGAGAAGATCGGCCT
CGTTTATCAGATCAACGTCGCTCCCAAGAAATTGGGGTTTGAAGAGGTTACCTACATCGT
TGATCTGAAGAAAGGAGAAGTCACCAAAGGTTATCTCTCTCTTTCTTTGATTACGCTAAT
TGGATATTCGAATAAGATAATGGTTTCGTAATTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1FK63JQ C 1
AF RS1FK63TF U 1
BS 1 274 RS1FK63TF

RD RS1FK63JQ 274 0 0
GGACTCGAGAAAGAAAGTAAAAATGGCAACGACCCAGCTCAAATCAGATGCGATCATGGA
TATGATGAAGCAGCATCTCTCCACCGACGCCGGTAAAGAGCTCACAGAGAAGATCGGCCT
CGTTTATCAGATCAACGTCGCTCCCAAGAAATTGGGGTTTGAAGAGGTTACCTACATCGT
TGATCTGAAGAAAGGAGAAGTCACCAAAGGTTATCTCTCTCTTTCTTTGATTACGCTAAT
TGGATATTCGAATAAGATAATGGTTTCGTAATTG

QA 1 274 1 274
DS 

RD RS1FK63TF 274 0 0
GGACTCGAGAAAGAAAGTAAAAATGGCAACGACCCAGCTCAAATCAGATGCGATCATGGA
TATGATGAAGCAGCATCTCTCCACCGACGCCGGTAAAGAGCTCACAGAGAAGATCGGCCT
CGTTTATCAGATCAACGTCGCTCCCAAGAAATTGGGGTTTGAAGAGGTTACCTACATCGT
TGATCTGAAGAAAGGAGAAGTCACCAAAGGTTATCTCTCTCTTTCTTTGATTACGCTAAT
TGGATATTCGAATAAGATAATGGTTTCGTAATTG

QA 1 274 1 274
DS 



AS 1 2

CO CL5054Contig1 793 2 2 U
GCGCCAACACCAACACCAACCCCACCTGTTGTAACGCCACCAACACCAACACCACCAACC
CCAACTCCACCGGTGGTAACGCCACCGACACCAACCCCTCCTGTCGTAACACCACCAACA
CCAACACCACCGGTCGTCACGCCACCGACACCAACCCCTCCTGTCGTAACACCACCAACA
CCAACACCACCGGTCGTCACGCCACCGACACCAACCCCTCCTGTCGTAACACCACCAACA
CCAACACCACCGGTAGTAACGCCACCGACGCCAACCCCTCCTGTCGTAACACCACCAACA
CCAACTCCACCTAAACCAGAAACTTGCCCAATCGACACATTGAGGCTAGGCGCTTGTGTG
GACGTTCTTGGAGGTTTGATTCACATCGGGCTTGGTGGAAGTGACGCCAAGAAAGAGTGT
TGTCCGGTTTTGGGAGGTTTAGTTGACTTAGACGCAGCCGTTTGTCTATGTACCACCATT
AAAGCCAAACTTCTCAACCTCGACCTTATTATCCCCATTGCTCTTGAGCTTCTTATCGAC
TGTGGAAAGAATCCACCACCTGGCTTCAAATGTCCCTCTTGATGAATGAAGTGTCTCTCT
ATCGTGTGTTTTTTTCTTTCTTTCTTTCAAGAATTTGTTGTTTGATAATCTCTTTGGGCA
ATGGGAGGTTAGTTTTTGTGTGTGGGACCTTTAATCACTTGTTTTAATAATGTACAATAA
ATGGGTATGTTTCGGTTTTGTTGATTTAATTTTAAGAAGAAAAAACTGTAAAACGGTATA
ATTATCTTTGGAC


BQ
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AF RS1DQ72TF U 1
AF RS1DQ72JQ C 235
BS 1 629 RS1DQ72TF
BS 630 793 RS1DQ72JQ

RD RS1DQ72TF 629 0 0
GCGCCAACACCAACACCAACCCCACCTGTTGTAACGCCACCAACACCAACACCACCAACC
CCAACTCCACCGGTGGTAACGCCACCGACACCAACCCCTCCTGTCGTAACACCACCAACA
CCAACACCACCGGTCGTCACGCCACCGACACCAACCCCTCCTGTCGTAACACCACCAACA
CCAACACCACCGGTCGTCACGCCACCGACACCAACCCCTCCTGTCGTAACACCACCAACA
CCAACACCACCGGTAGTAACGCCACCGACGCCAACCCCTCCTGTCGTAACACCACCAACA
CCAACTCCACCTAAACCAGAAACTTGCCCAATCGACACATTGAGGCTAGGCGCTTGTGTG
GACGTTCTTGGAGGTTTGATTCACATCGGGCTTGGTGGAAGTGACGCCAAGAAAGAGTGT
TGTCCGGTTTTGGGAGGTTTAGTTGACTTAGACGCAGCCGTTTGTCTATGTACCACCATT
AAAGCCAAACTTCTCAACCTCGACCTTATTATCCCCATTGCTCTTGAGCTTCTTATCGAC
TGTGGAAAGAATCCACCACCTGGCTTCAAATGTCCCTCTTGATGAATGAAGTGTCTCTCT
ATCGTGTGTTTTTTTCTTTCTTTCTTTCA

QA 1 629 1 629
DS 

RD RS1DQ72JQ 559 0 0
CCAACACCAACACCACCGGTAGTAACGCCACCGACGCCAACCCCTCCTGTCGTAACACCA
CCAACACCAACTCCACCTAAACCAGAAACTTGCCCAATCGACACATTGAGGCTAGGCGCT
TGTGTGGACGTTCTTGGAGGTTTGATTCACATCGGGCTTGGTGGAAGTGACGCCAAGAAA
GAGTGTTGTCCGGTTTTGGGAGGTTTAGTTGACTTAGACGCAGCCGTTTGTTTATGTACC
ACCATTAAAGCCAAACTTTTCAACCTCGACCTTATTATCCCCATTGCTCTTGAGCTTCTT
ATCGACTGTGGAAAGAATCCACCACCTGGCTTCAAATGTCCCTCTTGATGAATGAAGTGT
CTCTCTATCGTGTGTTTTTTTCTTTCTTTCTTTCAAGAATTTGTTGTTTGATAATCTCTT
TGGGCAATGGGAGGTTAGTTTTTGTGTGTGGGACCTTTAATCACTTGTTTTAATAATGTA
CAATAAATGGGTATGTTTCGGTTTTGTTGATTTAATTTTAAGAAGAAAAAACTGTAAAAC
GGTATAATTATCTTTGGAC

QA 1 559 1 559
DS 



AS 1 2

CO CL5055Contig1 873 2 6 U
GGATAGTTCAGGACAATCCCAAGTTCAAGAAAAAACAGAATTTCATTAATCAAACAAAAA
TGTGTGCACTAGTCCCTCCAGTGTTCCCAAACTTTGGGTGGCCGTCGACAGGAGAGTACG
AGAGTTACTACCTGGCCGGAGAGAACCTCGACGACTTTACGTTTCTTGATTTTCCAGCAC
AAGAGACATATGGAGTGGAACATCATCAGGAGATTCAGGAATTGTTAGGGGTCTCTGTTG
CGTCCGAGGGCAATGGGGTCGTGACCAAGAAGCTTAATCACAATGCTAGTGAGCGTGACC
GTCGCAAGAAGATCAACTCTTTGTTCTCGTCTCTCCGTTCATGTCTTCCCGCTTCTGATC
AGTCGAAGAAGTTAAGTATTCCTCAGACGGTTTCTCGGAGCTTGAAGTACATACCGGAGC
TACAAGGAGAAGTGAAGAAGTTAATAAAAAAGAAGGAAGAACTCTTGGTGTGAGTATCGA
GTCAAAGAGACATTGAACATTACGTTGAGCCGCAACCAAAGGCCGTTACACGTTACGTCG
CGACCATTTCTGCGACTAGGCTTGGAGACAACGAAGTGATGGTCCAAATCTCATCGTCCA
AGATTCATAACTTTTCAATATCTAATGTGTTAAGTGGGTTAGAAGAAGATGGGTTTGTTC
TTGTGGATGTTTCATCTTCAAGGTCTCATGGAGAAAGGCTCTTCTACACTTTGCATCTTC
AAATGGGAAATATAGATAATCACAATCTGACGTGCGAAGAGCTAAACCAGAGAATGTTGT
ACTTGTATGAGGAATGTGGAAACTCGTTTAGATGATAATCTGTTCCTGTTTCTTTTAGTT
ATGTCATCCTTTCTCAACATCTAATGTTCACGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1H772TF U 1
AF RS1H772JQB C 342
BS 1 682 RS1H772TF
BS 683 683 RS1H772JQB
BS 684 697 RS1H772TF
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BS 699 737 RS1H772TF
BS 738 873 RS1H772JQB

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TGTGTGCACTAGTCCCTCCAGTGTTCCCAAACTTTGGGTGGCCGTCGACAGGAGAGTACG
AGAGTTACTACCTGGCCGGAGAGAACCTCGACGACTTTACGTTTCTTGATTTTCCAGCAC
AAGAGACATATGGAGTGGAACATCATCAGGAGATTCAGGAATTGTTAGGGGTCTCTGTTG
CGTCCGAGGGCAATGGGGTCGTGACCAAGAAGCTTAATCACAATGCTAGTGAGCGTGACC
GTCGCAAGAAGATCAACTCTTTGTTCTCGTCTCTCCGTTCATGTCTTCCCGCTTCTGATC
AGTCGAAGAAGTTAAGTATTCCTCAGACGGTTTCTCGGAGCTTGAAGTACATACCGGAGC
TACAAGGAGAAGTGAAGAAGTTAATAAAAAAGAAGGAAGAACTCTTGGTGTGAGTATCGA
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CGACCATTTCTGCGACTAGGCTTGGAGACAACGAAGTGATGGTCCAAATCTCATCGTCCA
AGATTCATAACTTTTCAATATCTAATGTGTTAAGTGGGTTAGAAGAAGATGGGTTTGTTC
TTGTGGATGTTTCATCTTCAAG*TCTCATGGAGAAAG*CTCTTCTACACTTTGCATCTTC
AAATGGGAAATATAGAT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RS1H772JQB 532 0 0
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TTGAAGTACATACCGGAGCTACAAGGAGAAGTGAAGAAGTTAATAAAAAAGAAGGAAGAA
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GCCGTTACACGTTACGTCGCGACCATTTCTGCGACTAGGCTTGGAGACAACGAAGTGATG
GTCCAAATCTCATCGTCCAAGATTCATAACTTTTCAATATCTAATGTGTTAAGTGGGTTA
GAAGAAGATGGGTTTGTTCTTGTGGATGTTTCATCTTCAAGGTCTCATGGAGAAAGGCTC
TTCTACACTTTGCATCTTCAAATGGGAAATATAGATAATCACAATCTGACGTGCGAAGAG
CTAAACCAGAGAATGTTGTACTTGTATGAGGAATGTGGAAACTCGTTTAGATGATAATCT
GTTCCTGTTTCTTTTAGTTATGTCATCCTTTCTCAACATCTAATGTTCACGT

QA 1 532 1 532
DS 



AS 1 2

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CTGAAGTTCCATAACGTGCAGAAAGCTATTAGGTTCACGGGTAAGTACGGTGAGCATCCT
GATGAAAACTTTGATCCCAAGGCACTTCCGGCTATAGAGAAGATCACGTTTGAGAATGTT
AGCGGTGAAGAAATCGGTGTTGCGGGTCTTCTTGAAGGTATTGAAGGAGACAAGTTTAAG
AACATATGTTTCCTTAATGTTACTCTTACGGTGAAGAAGAACTCGAAGAAGTCTCCATGG
AAATGCCCACATGTTAGAGGCTATTCACAGTGGGTTTCGCCGGAGATTACTTGTGATTCT
TTTGAAGAGAGTATCTTCCCGGAGCATAGCTCTGATTGTTTTGGGTTGTCAGAGAATAAT
CTGGAGAAATCAAGTGGTTTAAGTAGATCACCATGGTTGCTTTCTTGGTAAGTTACTGAT
GTTTGACCTAAGGGGAACACACAGTTTGCTTGAGTGTGAAGAAACCTCTTCAAATTTTCC
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TTTTTGTTGTAAATTTGTGTGCAGTGAGGAGAATAATCAGAGTGACTTGAGAGCTTTTTT
GTTGTTGTTTTTTTTTGTATGGATTTTTAATGCTTTGGTGAGCAGAACAAGTGTAATATC
TTCAC


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RS1CL33TF U 155
AF RS1CJ05JQ C 1
BS 1 154 RS1CJ05JQ
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RD RS1CL33TF 399 0 0
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AGAAGAACTCGAAGAAGTCTCCATGGAAATGCCCACATGTTAGAGGCTATTCACAGTGGG
TTTCGCCGGAGATTACTTGTGATTCTTTTGAAGAGAGTATCTTCCCGGAGCATAGCTCTG
ATTGTTTTGGGTTGTCAGAGAATAATCTGGAGAAATCAAGTGGTTTAAGTAGGTCACCAT
GGTTGCTTTCTTGGTAAGTTACTGATGTTTGACCTAAGGGGAACACACAGTTTGCTTGAG
TGTGAAGAAACCTCTTCAAATTTTCCTTCCAATTTTTTT

QA 1 399 1 399
DS 

RD RS1CJ05JQ 725 0 0
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CTGAAGTTCCATAACGTGCAGAAAGCTATTAGGTTCACGGGTAAGTACGGTGAGCATCCT
GATGAAAACTTTGATCCCAAGGCACTTCCGGCTATAGAGAAGATCACGTTTGAGAATGTT
AGCGGTGAAGAAATCGGTGTTGCGGGTCTTCTTGAAGGTATTGAAGGAGACAAGTTTAAG
AACATATGTTTCCTTAATGTTACTCTTACGGTGAAGAAGAACTCGAAGAAGTCTCCATGG
AAATGCTCACATGTTAGAGGCTATTCACAGTGGGTTTCGCCGGAGATTACTTGTGATTCT
TTTGAAGAGAGTATCTTCCCGGAGCATAGCTCTGATTGTTTTGGGTTGTCAGAGAATAAT
CTGGAGAAATCAAGTGGTTTAAGTAGATCACCATGGTTGCTTTCTTGGTAAGTTACTGAT
GTTTGACCTAAGGGGAACACACAGTTTGCTTGAGTGTGAAGAAACCTCTTCAAATTTTCC
TTCCAATTTTTTTTCTCTGAGGTTTTTGTTTTTCAAAAGTGATGTTTTCTTCTTTTTTCC
TTTTTGTTGTAAATTTGTGTGCAGTGAGGAGAATAATCAGAGTGACTTGAGAGCTTTTTT
GTTGTTGTTTTTTTTTGTATGGATTTTTAATGCTTTGGTGAGCAGAACAAGTGTAATATC
TTCAC

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL5057Contig1 1137 2 8 U
GGGTCATCGTCTGAGCTTACCAAAACTCCGGTCAAATGGCGATGATGACTGCTACACTCT
TCCATGCACTTGTTCCTTCCAACAGTTACAAAACAGGAGCTGTGTCCTCTTCGTTAGTCT
CAGTTCCGTCTTCTTCGTCGTCTCTCCGATTCCGCTCGCTTGTCTCGGATTCAACGTCGG
TTTATGCTCGGAGGAAGTTAACCGGGGATCTCAGAAGAGTATCCTTAACTGTCTCCGCCG
CCGCAGCAACTGAGCCTCTCACCGTTCTGGTCACCGGTGCCGGTGGAAGAACAGGGCAAA
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CGAAAGAGAGCAAGGAGAAGATCGGTGGAGAGGAGGAAGTGTTCGTCGGAGATATTCGAG
ACCTTGAAGCCATTGCTCCCGCTGTTCAAGGGATTGATGCTTTGGTCATTCTTACGAGCG
CTGTACCGAAGATGAAACCTGGTTTTGATCCTAGCAAAGGAGAGAGACCTGAGTCCTACT
TTGAAGAAGGAGCTTATCCTGAACAGGTTGATTGGATTGGTCAGAAGAATCAGATAGATG
CCGCTAAGGCAGCTGGAGTTAAGCAGATTGTTTTGGTCGGGTCGATGGGAGGAACAAACA
TAAACAACCCCTTGAATAGCATTGGCAATGCCAACATTCTGGTTTGGAAGAGGAAAGCTG
AGCAGTACTTGGCTGACTCCGGTATTCCATACACCATCGTCAGGGCGGGTGGTTTGCAGG
ACAAGGAAGGTGGCATCCGGGAACTAATTGTGGGGAAAGATGACGAGATTCTTGAGACAG
AGACGAGAACAATAGCAAGGGCTGATGTTGCAGAAGTCTGCGTTCGGGCGTTGCAGCTCG
AGGAGTCAAAGTTTAAAGCACTTGATCTGGCCTCAAAGCCTGAGGGAACTGTTTGAACCG
AAATCGGTGCTTCGTAGGGGTAGACTGATTTCGATGGTGGGATTAGGAGAGGTCTTCATA
ATGAGCTTGAACTGGATAGATGGAGAGTAAAAGATGTGTAATATGTTATAGCTGGACCCG
GTGAAGGGTTGCCTACGTACCCCGAAAGGGGATCAAGCCAATCGTAGTTCTACAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EU93TF U 1
AF RS1EU93JQ C 449
BS 1 608 RS1EU93TF
BS 609 609 RS1EU93JQ
BS 610 708 RS1EU93TF
BS 709 709 RS1EU93JQ
BS 710 715 RS1EU93TF
BS 716 716 RS1EU93JQ
BS 717 737 RS1EU93TF
BS 738 1137 RS1EU93JQ

RD RS1EU93TF 737 0 0
GGGTCATCGTCTGAGCTTACCAAAACTCCGGTCAAATGGCGATGATGACTGCTACACTCT
TCCATGCACTTGTTCCTTCCAACAGTTACAAAACAGGAGCTGTGTCCTCTTCGTTAGTCT
CAGTTCCGTCTTCTTCGTCGTCTCTCCGATTCCGCTCGCTTGTCTCGGATTCAACGTCGG
TTTATGCTCGGAGGAAGTTAACCGGGGATCTCAGAAGAGTATCCTTAACTGTCTCCGCCG
CCGCAGCAACTGAGCCTCTCACCGTTCTGGTCACCGGTGCCGGTGGAAGAACAGGGCAAA
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CGAAAGAGAGCAAGGAGAAGATCGGTGGAGAGGAGGAAGTGTTCGTCGGAGATATTCGAG
ACCTTGAAGCCATTGCTCCCGCTGTTCAAGGGATTGATGCTTTGGTCATTCTTACGAGCG
CTGTACCGAAGATGAAACCTGGTTTTGATCCTAGCAAAGGAGAGAGACCTGAGTCCTACT
TTGAAGAAGGAGCTTATCCTGAACAGGTTGATTGGATTGGTCAGAAGAATCAGATAGATG
CCGCTAAG*CAGCTGGAGTTAAGCAGATTGTTTTGGTCGGGTCGATGGGAGGAACAAACA
TAAACAACCCCTTGAATAGCATTGGCAATGCCAACATTCTGGTTTGGA*GAGGAA*GCTG
AGCAGTACTTGGCTGAC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RS1EU93JQ 689 0 0
AGGGATTGATGCTTTGGTCATTCTTACGAGCGCTGTACCGAAGATGAAACCTGGTTTTGA
TCCTAGCAAAGGAGAGAGACCTGAGTCCTACTTTGAAGAAGGAGCTTATCCTGAACAGGT
TGATTGGATTGGTCAGAAGAATCAGATAGATGCCGCTAAGGCAGCTGGAGTTAAGCAGAT
TGTTTTGGTCGGGTCGATGGGAGGAACAAACATAAACAACCCCTTGAATAGCATTGGCAA
TGCCAACATTCTGGTTTGGAAGAGGAAAGCTGAGCAGTACTTGGCTGACTCCGGTATTCC
ATACACCATCGTCAGGGCGGGTGGTTTGCAGGACAAGGAAGGTGGCATCCGGGAACTAAT
TGTGGGGAAAGATGACGAGATTCTTGAGACAGAGACGAGAACAATAGCAAGGGCTGATGT
TGCAGAAGTCTGCGTTCGGGCGTTGCAGCTCGAGGAGTCAAAGTTTAAAGCACTTGATCT
GGCCTCAAAGCCTGAGGGAACTGTTTGAACCGAAATCGGTGCTTCGTAGGGGTAGACTGA
TTTCGATGGTGGGATTAGGAGAGGTCTTCATAATGAGCTTGAACTGGATAGATGGAGAGT
AAAAGATGTGTAATATGTTATAGCTGGACCCGGTGAAGGGTTGCCTACGTACCCCGAAAG
GGGATCAAGCCAATCGTAGTTCTACAACG

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 2

CO CL5058Contig1 880 2 2 U
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GCGCGGCGGAGAAGTACTCTGAAGCATTGTCTTTGTGTCCGATGAGGTCGAAGAAGGAGA
GAGTGGTGCTGTACAGCAACCGAGCGCAGTGTCATCTCCTGCTTCAGCAGCCTCTGGTTG
CTATAAGCGACGCCACGCGCGCGCTCTCCTTGCACAACCCTGTGAACAGACACGCAAAGA
GTCTTTGGAGGAGAGCTCAGGCTTATGATATGTTGGGGTTAGCTAAAGAGAGTCTGTTGG
ATGCGATTCTGTTTACTAACGAGTGTTCTCAGTCGAATGATCCGGATCTGTCCATGAGAC
AGAACAAGGTTCCTGACTACGCGGAGAGGCTGGTGAAGAAGCAGATGAGGGCGGCTTGGT
TGTTTAAAGAAGCGGCGTTGAAGCAGGGAGGTGTGCATAGGAAAGGGGAAGAGAGGGGAG
AAGTGTATGGGAATGAGAGCGATGATTCGCAGTGGGAGACTGCTAGTGAGAGCGATATTG
GAGATGATGGAAGGGATCATATGGGTCTTGATGATGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGTTG
AAGGCCATGGAGAGAAGTGGAAGAACCGTGATAAATCTAGTGAAAAAACTGAGAAAACTT
CTGCTAAAGGTATGAGGCATGGATACAGCATTAAGCTGGCAGAGGAGGAAATGTGAAGAA
GACCTGAAACAATGGGTTACAACAAGGTCCTTGAAAGAAGTTGAGAAGAAAAAAAAATTG
TTTTGTTTTTCCAGTGATTTTATTTATTTTTGCTCTGGTGTGTATGTAAGAATTATTCAA
GAGAAATGTGAGTTTCAATTTGTATAAATTACATTCTCTC


BQ
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AF RS1DY94TF U 1
AF RS1DY94JQ C 213
BS 1 599 RS1DY94TF
BS 600 880 RS1DY94JQ

RD RS1DY94TF 599 0 0
GAGCGGCTCTAGTGGTGAAACTCGAAGGAAACTCTCTGTTTTCTTCAGGAGACATCGCAG
GCGCGGCGGAGAAGTACTCTGAAGCATTGTCTTTGTGTCCGATGAGGTCGAAGAAGGAGA
GAGTGGTGCTGTACAGCAACCGAGCGCAGTGTCATCTCCTGCTTCAGCAGCCTCTGGTTG
CTATAAGCGACGCCACGCGCGCGCTCTCCTTGCACAACCCTGTGAACAGACACGCAAAGA
GTCTTTGGAGGAGAGCTCAGGCTTATGATATGTTGGGGTTAGCTAAAGAGAGTCTGTTGG
ATGCGATTCTGTTTACTAACGAGTGTTCTCAGTCGAATGATCCGGATCTGTCCATGAGAC
AGAACAAGGTTCCTGACTACGCGGAGAGGCTGGTGAAGAAGCAGATGAGGGCGGCTTGGT
TGTTTAAAGAAGCGGCGTTGAAGCAGGGAGGTGTGCATAGGAAAGGGGAAGAGAGGGGAG
AAGTGTATGGGAATGAGAGCGATGATTCGCAGTGGGAGACTGCTAGTGAGAGCGATATTG
GAGATGATGGAAGGGATCATATGGGTCTTGATGATGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGTT

QA 1 599 1 599
DS 

RD RS1DY94JQ 668 0 0
CACAACCCTGTGAACAGACACGCAAAGAGTCTTTGGAGGAGAGCTCAGGCTTATGATATG
TTGGGGTTAGCTAAAGAGAGTCTGTTGGATGCGATTCTGTTTACTAACGAGTGTTCTCAG
TCGAATGATCCGGATCTGTCCATGAGACAGAACAAGGTTCCTGACTACGCGGAGAGGCTG
GTGAAGAAGCAGATGAGGGCGGCTTGGTTGTTTAAAGAAGCGGCGTTGAAGCAGGGAGGT
GTGCATAGGAAAGGGGAAGAGAGGGGAGAAGTGTATGGGAATGAGAGCGATGATTCGCAG
TGGGAGACTGCTAGTGAGAGCGATATTGGAGATGATGGAAGGGATCATATGGGTCTTGAT
GATGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGTTGAAGGCCATGGAGAGAAGTGGAAGAACCGTGAT
AAATCTAGTGAAAAAACTGAGAAAACTTCTGCTAAAGGTATGAGGCATGGATACAGCATT
AAGCTGGCAGAGGAGGAAATGTGAAGAAGACCTGAAACAATGGGTTACAACAAGGTCCTT
GAAAGAAGTTGAGAAGAAAAAAAAATTGTTTTGTTTTTCCAGTGATTTTATTTATTTTTG
CTCTGGTGTGTATGTAAGAATTATTCAAGAGAAATGTGAGTTTCAATTTGTATAAATTAC
ATTCTCTC

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL5059Contig1 1071 2 2 U
GGACGAAACACGGGTAATGGCTTCTTTCAAACCACTAACAGTGATCTGCATAGGAGACAT
CCATGGACACATTTCGAAACTCGAAAAACTCTGGCTTAATCTACAAACCGCCCTCGGCCC
ATCAGAGTTCACCACAGCTCTTGTCATCTTCCTAGGCGACTACTGCGATCGTGGACCGCA
TACCCGACAAGTCATTGACTTCTTGATCGCTCTGCCGGAGAAACACCCCGACCAGACACA
CGTCTTTCTCGCCGGGAACCACGACTTCGCCTTCGCGGGGTTTCTAGGTTTGTTGCCACG
TCCTTCGGATGGATCTGAGCTGAAGGATACGTGGAGTGAGTTCGAGAAGAGCGAGGAGAG
AGAAGGATGGTATAAAGGCCAAAGCTTCGAGGATATGCATGTCCAGAGTAGAAGATGGGC
TGGCAAAACTAGGGAGCGATTCGCTACGTACACCGTCGGGGTTGTTGAGTATATCGGATC
TATTTACGATGCTGGGTCGACTTTTCAATCGTATGGCGTCCCTCATGGATCTTCTGATTT
GATGGAGGCAGTACCAGAGAGTCACAAGAAGTTCTTGACCAATATGGTTTGGGTTCACGA
AGAGGAAGATGTTTGTATAGAAACAGAGGAAGGGCTCAAGCAATGCAAGTTGATTGCGGT
ACATGCTGGGTTAGATAAATGGAAGAGTGTTAACGAACAGCTAGAGCTTCTGAGAGCTAA
AGACACGAGCTTCTCGAGGGTACAACCTCTAAGTGGACGGAAAGACGTTTGGAACATGCC
ACAGGAACTTGATGATAAACAACCGACTATTGTAGTCAGCGGTCACCACGGGAAACTACA
CATCGATGGCTTGAGACTGATCATCGATGAAAGCGGTGGATACGATTATAATCATCTGGC
TGCAATCATTCTTCCTTCTAAGAAGATCATCCGCGACACCGATATCTTCTCCAACCAACG
TTAATTTTCAACAGCTGCTCCAACTTCAAATGTTGTTTCAAATTATCTCATCGTACTTTT
GTCTCATCGAATATTCCATCTTTCTATCTTTAATTAAAAGTCTTTCCATCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1C118TF U 1
AF RS1C118JQ C 308
BS 1 428 RS1C118TF
BS 429 1071 RS1C118JQ

RD RS1C118TF 428 0 0
GGACGAAACACGGGTAATGGCTTCTTTCAAACCACTAACAGTGATCTGCATAGGAGACAT
CCATGGACACATTTCGAAACTCGAAAAACTCTGGCTTAATCTACAAACCGCCCTCGGCCC
ATCAGAGTTCACCACAGCTCTTGTCATCTTCCTAGGCGACTACTGCGATCGTGGACCGCA
TACCCGACAAGTCATTGACTTCTTGATCGCTCTGCCGGAGAAACACCCCGACCAGACACA
CGTCTTTCTCGCCGGGAACCACGACTTCGCCTTCGCGGGGTTTCTAGGTTTGTTGCCACG
TCCTTCGGATGGATCTGAGCTGAAGGATACGTGGAGTGAGTTCGAGAAGAGCGAGGAGAG
AGAAGGATGGTATAAAGGCCAAAGCTTCGAGGATATGCATGTCCAGAGTAGAAGATGGGC
TGGCAAAA

QA 1 428 1 428
DS 

RD RS1C118JQ 764 0 0
GATGGATCTGAGCTGAAGGATACGTGGAGTGAGTTCGAGAAGAGCGAGGAGAGAGAAGGA
TGGTATAAAGGCCAAGGCTTCGAGGATATGCATGTCCAGAGTAGAAGATGGGCTGGCAAA
ACTAGGGAGCGATTCGCTACGTACACCGTCGGGGTTGTTGAGTATATCGGATCTATTTAC
GATGCTGGGTCGACTTTTCAATCGTATGGCGTCCCTCATGGATCTTCTGATTTGATGGAG
GCAGTACCAGAGAGTCACAAGAAGTTCTTGACCAATATGGTTTGGGTTCACGAAGAGGAA
GATGTTTGTATAGAAACAGAGGAAGGGCTCAAGCAATGCAAGTTGATTGCGGTACATGCT
GGGTTAGATAAATGGAAGAGTGTTAACGAACAGCTAGAGCTTCTGAGAGCTAAAGACACG
AGCTTCTCGAGGGTACAACCTCTAAGTGGACGGAAAGACGTTTGGAACATGCCACAGGAA
CTTGATGATAAACAACCGACTATTGTAGTCAGCGGTCACCACGGGAAACTACACATCGAT
GGCTTGAGACTGATCATCGATGAAAGCGGTGGATACGATTATAATCATCTGGCTGCAATC
ATTCTTCCTTCTAAGAAGATCATCCGCGACACCGATATCTTCTCCAACCAACGTTAATTT
TCAACAGCTGCTCCAACTTCAAATGTTGTTTCAAATTATCTCATCGTACTTTTGTCTCAT
CGAATATTCCATCTTTCTATCTTTAATTAAAAGTCTTTCCATCT

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL5060Contig1 503 2 3 U
CAGCCTTGGCCTTACTTAGCCGAAGCTCTTACCAAGTTTCAGGACCCAGCAGAGGCTGAT
AAGCTGTTGAAAATCCAGAGGGAGTTGGATGAGACCAAGATTATCCTTCATAAGACCATT
GATAGCGTTCTAGCCCGTGGTGAGAAGCTGGACAGCCTAGTCGAGAAAAGCTCTGATTTG
AGCATGGCATCCCAGATGTTCTACAAGCAAGCAAAGAAAACGAATTCATGTTGCACTATC
CTGTGAGCTGCAACTCTCTCTGGATGTCTTGGGGTATATATAGTCAACCAAACTTTTGCT
GGGGGCAGAGGCGAGACTACAGTTTATCATCATTTTATATCTATATATTTGAATCTCTTC
TCTCGTTTGCATGCACTTTGAAACTCATGTCGTGTGGCGTGTTATACTCTCTACCAAGAT
TATATGATTGCTTTTGTTTATGTTTTTTAATGGTAAAAACATCATCACATTCTTTTCTCC
TTTTGTTGGGTACTTGATACTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1C630TF U 44
AF RS1E293JQ C 1
BS 1 44 RS1E293JQ
BS 45 447 RS1C630TF
BS 448 503 RS1E293JQ

RD RS1C630TF 410 0 0
G
CCCAGCAGAGGCTGATAAGCTGTTGAAAATCCAGAGGGAGTTGGATGAGACCAAGATTAT
CCTTCATAAGACCATTGATAGCGTTCTAGCCCGTGGTGAGAAGCTGGACAGCCTAGTCGA
GAAAAGCTCTGATTTGAGCATGGCATCCCAGATGTTCTACAAGCAAGCAAAGAAAACGAA
TTCATGTTGCACTATCCTGTGAGCTGCAACTCTCTCTGGATGTCTTGGGGTATATATAGT
CAACCAAACTTTTGCTGGGGGCAGAGGCGAGACTACAGTTTATCATCATTTTATATCTAT
ATATTTGAATCTCTTCTCTCGTTTGCATGCACTTTGAAACTCATGTCGTGTGGCGTGTTA
TACTCTCTACCAAGATTATATGATTGCTTTTGTTTATGTTTTT
CATGGT

QA 2 404 2 404
DS 

RD RS1E293JQ 503 0 0
CAGCCTTGGCCTTACTTAGCCGAAGCTCTTACCAAGTTTCAGGACCCAGCAGAGGCTGAT
AAGCTGTTGAAAATCCAGAGGGAGTTGGATGAGACCAAGATTATCCTTCATAAGACCATT
GATAGCGTTTTAGCCCGTGGTGAGAAGCTGGACAGCCTAGTCGAGAAAAGCTTTGATTTG
AGCATGGCATCCCAGATGTTTTACAAGCAAGCAAAGAAAACGAATTCATGTTGCACTATC
CTGTGAGCTGCAACTCTCTCTGGATGTCTTGGGGTATATATAGTCAACCAAACTTTTGCT
GGGGGCAGAGGCGAGACTACAGTTTATCATCATTTTATATCTATATATTTGAATCTCTTC
TCTCGTTTGCATGCACTTTGGAACTCATGTCGTGTGGCGTGTTATACTCTCTACCAAGAT
TATATGATTGCTTTTGTTTATGTTTTTTAATGGTAAAAACATCATCACATTCTTTTCTCC
TTTTGTTGGGTACTTGATACTTC

QA 1 503 1 503
DS 



AS 1 2

CO CL5061Contig1 413 2 2 U
GGGGAACCTACCGTCGTCGCCTCCAGCAGAGAAACCAGAAGAGTATCCGCAATCGACGAT
GGGGAAGGTGCACGGTTCATTGGCTCGTGCGGGTAAAGTGAGAGGTCAGACACCGAAAGT
GGCTAAGCAGGACAAGAAGAAGAAGCCCCGTGGCCGTGCTCACAAGCGTTTGCAACACAA
CCGCCGTTTCGTCACCGCCGTTGTTGGCTTTGGCAAGAAGAGAGGACCAAACTCATCAGA
GAAGTAGACATGGAACTGTTTCACCTTTTTATTGCGGTTTTCTGATTATTTTAATGGCTC
GTTTGTCTATCAACAAAGCCAATGGATGTTGTTGAGCCAATGTTTCTAATCAGTTTCATT
TGTGTTACATCTGTTTCTACTCTGATTATGTACCATATGCTCTTCGATTGGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AG89JQ C 1
AF RS1AG89TF U 27
BS 1 26 RS1AG89JQ
BS 27 413 RS1AG89TF

RD RS1AG89JQ 413 0 0
GGGGAACCTACCGTCGTCGCCTCCAGCAGAGAAACCAGAAGAGTATCCGCAATCGACGAT
GGGGAAGGTGCACGGTTCATTGGCTCGTGCGGGTAAAGTGAGAGGTCAGACACCGAAAGT
GGCTAAGCAGGACAAGAAGAAGAAGCCCCGTGGCCGTGCTCACAAGCGTTTGCAACACAA
CCGCCGTTTCGTCACCGCCGTTGTTGGCTTTGGCAAGAAGAGAGGACCAAACTCATCAGA
GAAGTAGACATGGAACTGTTTCACCTTTTTATTGCGGTTTTCTGATTATTTTAATGGCTC
GTTTGTCTATCAACAAAGCCAATGGATGTTGTTGAGCCAATGTTTCTAATCAGTTTCATT
TGTGTTACATCTGTTTCTACTCTGATTATGTACCATATGCTCTTCGATTGGTG

QA 1 413 1 413
DS 

RD RS1AG89TF 387 0 0
CAGAGAAACCAGAAGAGTATCCGCAATCGACGATGGGGAAGGTGCACGGTTCATTGGCTC
GTGCGGGTAAAGTGAGAGGTCAGACACCGAAAGTGGCTAAGCAGGACAAGAAGAAGAAGC
CCCGTGGCCGTGCTCACAAGCGTTTGCAACACAACCGCCGTTTCGTCACCGCCGTTGTTG
GCTTTGGCAAGAAGAGAGGACCAAACTCATCAGAGAAGTAGACATGGAACTGTTTCACCT
TTTTATTGCGGTTTTCTGATTATTTTAATGGCTCGTTTGTCTATCAACAAAGCCAATGGA
TGTTGTTGAGCCAATGTTTCTAATCAGTTTCATTTGTGTTACATCTGTTTCTACTCTGAT
TATGTACCATATGCTCTTCGATTGGTG

QA 1 387 1 387
DS 



AS 1 2

CO CL5062Contig1 1038 2 2 U
GGCCACATGTCATATATAGACTGCAGATTCACAAATATAGGTTAATAATTCTTTTTTACT
GCCTATTTATTTATAATTGTGGACTTATCATGTACCATCTTTTGTGGTTACAGCTCTCTA
CAAAAACTGTATTAATGAATAATATTTTAATACAAAACCATTCTGGAGGACTCGTGTCTG
GAAATTATGTGCAAGCTGCGAAGAGAAAAGGTAAAGAGCATCTATCGTATCATCTCCCAA
AAGCGACAAGCAAAAGTGAGACTGAGCCTACTCGTTACTCACACACTCTGCGTTGATACC
ACTGCTTACGGCCGGGGACATGCTCTTCTTACAAAACGCCTCTAAGCATGCTGATAAGGT
GAAACAAACCGGAGAGTCTAAGGTTATGAAAGAGGAAGGAGGAGGAGCGACATGGGCTTT
CGAAGTAGGGTCAAAGTCTCTTATGTGTCCCATTGTAGTAGAAGATATTAACCCTCCTCG
CATCTTCCAAGTTGAGATGTTATGCGAACAACGAGGATTCTTTCTAGAGATCGCTGATTG
GATCAGAAGTTTAGGACTGACCATCTTGAAGGGTGTCATTGAAACTCGTGTAGACAAGAT
TTGGGCTCGGTTCACTGTTGAGGCGAGTCGAGATGTGGCAAGGATGGAGATATTCATGCA
ACTAGTGAAGATTTTGGAGCAGACGATGAAATGTGGAGGAAACTCTAAGGCTATTTTGGA
TGGGATCAAAGCTACAATGTCCATTACCAACACCACCTTACCGGTTACTACTGGTGGCTG
TTCAATGTAAGTGACCGGCTTGGTTAAAAGCTAGATTCATATTGGGGTTACGAGCGGACC
GGTCCAGGAGGCTCGCTATGACTAACTAAAAAAAGTCAGTCTGAAAATCGGTTTGGCTGT
TCAATGTACATTTGCTTCTTCTTTTTTTATTGATCTTTTGGGATTTTTGCGAATTTTATT
TTCTATATCGAATCTCATTTGTGTGGATTTTTTCTTTGTTACTTTTAAGCCTATGGAGAC
TGATATAATGAATTAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EH12TF U 1
AF RS1EH12JQ C 308
BS 1 696 RS1EH12TF
BS 697 1038 RS1EH12JQ

RD RS1EH12TF 696 0 0
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GCCTATTTATTTATAATTGTGGACTTATCATGTACCATCTTTTGTGGTTACAGCTCTCTA
CAAAAACTGTATTAATGAATAATATTTTAATACAAAACCATTCTGGAGGACTCGTGTCTG
GAAATTATGTGCAAGCTGCGAAGAGAAAAGGTAAAGAGCATCTATCGTATCATCTCCCAA
AAGCGACAAGCAAAAGTGAGACTGAGCCTACTCGTTACTCACACACTCTGCGTTGATACC
ACTGCTTACGGCCGGGGACATGCTCTTCTTACAAAACGCCTCTAAGCATGCTGATAAGGT
GAAACAAACCGGAGAGTCTAAGGTTATGAAAGAGGAAGGAGGAGGAGCGACATGGGCTTT
CGAAGTAGGGTCAAAGTCTCTTATGTGTCCCATTGTAGTAGAAGATATTAACCCTCCTCG
CATCTTCCAAGTTGAGATGTTATGCGAACAACGAGGATTCTTTCTAGAGATCGCTGATTG
GATCAGAAGTTTAGGACTGACCATCTTGAAGGGTGTCATTGAAACTCGTGTAGACAAGAT
TTGGGCTCGGTTCACTGTTGAGGCGAGTCGAGATGTGGCAAGGATGGAGATATTCATGCA
ACTAGTGAAGATTTTGGAGCAGACGATGAAATGTGG

QA 1 696 1 696
DS 

RD RS1EH12JQ 731 0 0
ACGGCCGGGGACATGCTCTTCTTACAAAACGCCTCTAAGCATGCTGATAAGGTGAAACAA
ACCGGAGAGTCTAAGGTTATGAAAGAGGAAGGAGGAGGAGCGACATGGGCTTTCGAAGTA
GGGTCAAAGTCTCTTATGTGTCCCATTGTAGTAGAAGATATTAACCCTCCTCGCATCTTC
CAAGTTGAGATGTTATGCGAACAACGAGGATTCTTTCTAGAGATCGCTGATTGGATCAGA
AGTTTAGGACTGACCATCTTGAAGGGTGTCATTGAAACTCGTGTAGACAAGATTTGGGCT
CGGTTCACTGTTGAGGCGAGTCGAGATGTGGCAAGGATGGAGATATTCATGCAACTAGTG
AAGATTTTGGAGCAGACGATGAAATGTGGAGGAAACTCTAAGGCTATTTTGGATGGGATC
AAAGCTACAATGTCCATTACCAACACCACCTTACCGGTTACTACTGGTGGCTGTTCAATG
TAAGTGACCGGCTTGGTTAAAAGCTAGATTCATATTGGGGTTACGAGCGGACCGGTCCAG
GAGGCTCGCTATGACTAACTAAAAAAAGTCAGTCTGAAAATCGGTTTGGCTGTTCAATGT
ACATTTGCTTCTTCTTTTTTTATTGATCTTTTGGGATTTTTGCGAATTTTATTTTCTATA
TCGAATCTCATTTGTGTGGATTTTTTCTTTGTTACTTTTAAGCCTATGGAGACTGATATA
ATGAATTAATC

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

CO CL5063Contig1 1306 2 2 U
GCACATCTTTGAGTGGCGATCTTCATTTCATTTAAGCCGTAGGTTTTGATTTCTTGTGAG
AAAAGCTAGAGTGAGATTCTCAGCCTGTATCATTTGGTATCAGAGCTAAAAGCTCCTATC
ATTTTTTCTGTTTTTCATTCTACTTTCCAAAAAAAAACCAGAAAAATCGTTTTCCTCTCT
CTTTCTTTTCTGTTTTGTTTTTTTTTTCTCTAAGTTTCTTTCATACAAAAATTATAAAGA
GAAGTTATGGAAAAACAGTCTAGCAACAGCAACATGGCCGACCATCCTTGGAGTCTTTTA
AAGCAAGAAGATTATTATTTTGCAGGAAGATCAGGCCCAGATGAGTACTTTGAATGGGAG
CACAAGATGAATGAGTTCTTCATTTCTTGCCGCTGTCCAGATTTCGAGAAGGTATACATT
GCTGCTGATCAACTCATCGACCTAACTCAACTCTGGTGGAGACAATCTACTACAAATGGA
GGCCGTCGCTGGAATTCTCGAGAATATACTTGGGGTGAGATGAAAAATATGATGAGGAAG
CAATACATCCCACACGATCAATATCAAGAAATCCGGAGGTAATTTCGCACGCTTTGCCAA
GATGATAAGACGGTCATGGAGTACCACAAGCAATTCAACCATCTTCGCATTCGGCTCAAT
CCAGGAGTAAGGAATGAGGATATCATGGACCAGTTTGCTTATGGGCTAAAAAATGAGATC
CGTTTCCACATACAAGGACACTCATGCAATTGTTTGGAGGAGTTGGGCCAACAGGCGGCC
CAAATTGAGCATGAAAACAAAGAGCCCGAACCGCTTGATCCATCTGAAGAAGTCCAGCAA
AATCCGAGGTACATCCCTATATCACATGAGCAAGTTTTGAGGACAAAACTTTTACAAGGG
GGAGGTAATGATGCGGCCATGAAATCCACAGCTCCTAAAGTAGACAAAACTTTCCATGTT
TGGACTCGAATGAACCTAGACACCATCAAGCATGTGGTTTGTTTGACTCAGCTGGCTGTT
CCCAAACAAAGGCCACCACTTAAGCCTCCTCCTTATCAGCTAATAAATATGTGGATCAAT
GGTATTAAAGGCGTGGTCATCATCTTCTTAATAAGCAAATCTCAATCCCTTGAGATCAGC
CCTTTTGACCAGCATTTTGATTGTCTTTTAATTATGATTTTTCCTAGAAATCCGCCTTTC
ATTTATGTCTTTGATTTTGTCCAAGAGCTATATATAAAGCTCCTCTCCATTCATTGTAAA
AGCAGACTTGAGTATTGAATAAAAAGTGAGATTTTCTCTTGAGAGT


BQ
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AF RS1H350TF U 1
AF RS1H350JQB C 642
BS 1 734 RS1H350TF
BS 735 1306 RS1H350JQB

RD RS1H350TF 750 0 0
GCACATCTTTGAGTGGCGATCTTCATTTCATTTAAGCCGTAGGTTTTGATTTCTTGTGAG
AAAAGCTAGAGTGAGATTCTCAGCCTGTATCATTTGGTATCAGAGCTAAAAGCTCCTATC
ATTTTTTCTGTTTTTCATTCTACTTTCCAAAAAAAAACCAGAAAAATCGTTTTCCTCTCT
CTTTCTTTTCTGTTTTGTTTTTTTTTTCTCTAAGTTTCTTTCATACAAAAATTATAAAGA
GAAGTTATGGAAAAACAGTCTAGCAACAGCAACATGGCCGACCATCCTTGGAGTCTTTTA
AAGCAAGAAGATTATTATTTTGCAGGAAGATCAGGCCCAGATGAGTACTTTGAATGGGAG
CACAAGATGAATGAGTTCTTCATTTCTTGCCGCTGTCCAGATTTCGAGAAGGTATACATT
GCTGCTGATCAACTCATCGACCTAACTCAACTCTGGTGGAGACAATCTACTACAAATGGA
GGCCGTCGCTGGAATTCTCGAGAATATACTTGGGGTGAGATGAAAAATATGATGAGGAAG
CAATACATCCCACACGATCAATATCAAGAAATCCGGAGGTAATTTCGCACGCTTTGCCAA
GATGATAAGACGGTCATGGAGTACCACAAGCAATTCAACCATCTTCGCATTCGGCTCAAT
CCAGGAGTAAGGAATGAGGATATCATGGACCAGTTTGCTTATGGGCTAAAAAATGAGATC
CGTTTCCACATACA
GACACTCATGCATGTT

QA 1 734 1 734
DS 

RD RS1H350JQB 665 0 0
TCTTCGCATTCGGCTCAATCCAGGAGTAAGGAATGAGGATATCATGGACCAGTTTGCTTA
TGGGCTAAAAAATGAGATCCGTTTCCACATACAAGGACACTCATGCAATTGTTTGGAGGA
GTTGGGCCAACAGGCGGCCCAAATTGAGCATGAAAACAAAGAGCCCGAACCGCTTGATCC
ATCTGAAGAAGTCCAGCAAAATCCGAGGTACATCCCTATATCACATGAGCAAGTTTTGAG
GACAAAACTTTTACAAGGGGGAGGTAATGATGCGGCCATGAAATCCACAGCTCCTAAAGT
AGACAAAACTTTCCATGTTTGGACTCGAATGAACCTAGACACCATCAAGCATGTGGTTTG
TTTGACTCAGCTGGCTGTTCCCAAACAAAGGCCACCACTTAAGCCTCCTCCTTATCAGCT
AATAAATATGTGGATCAATGGTATTAAAGGCGTGGTCATCATCTTCTTAATAAGCAAATC
TCAATCCCTTGAGATCAGCCCTTTTGACCAGCATTTTGATTGTCTTTTAATTATGATTTT
TCCTAGAAATCCGCCTTTCATTTATGTCTTTGATTTTGTCCAAGAGCTATATATAAAGCT
CCTCTCCATTCATTGTAAAAGCAGACTTGAGTATTGAATAAAAAGTGAGATTTTCTCTTG
AGAGT

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

CO CL5064Contig1 509 2 13 U
GGACTTTCTACAATAAACACTTTCATCTCTTTTCTCTCTTCCCAGTGTTCCTTTACAATG
TGGGGCGTCACCGTCGTGTCTCTCGTCCTTCTTCTCATTGCCACAGCTAATTCCGCCGTT
GTCCCCTTCCGTGATGGGATATTACCGAACGGCGACTTCGAGCTAGGACCAAAGCCATCC
GACTTGAAAGGAACCGAAATAATAAACAAGATGGCAATCCCGAACTGGGAAGTCACGGGG
TTCGTCGAGTACATAAGCTCAGGACACAAACAAGGAGACATGCTTCTCGTCGTCCCCGCC
GGAAAATTCGCAGTGAGGCTCGGAAACGAAGCGTCGATCAAACAAAGAATCAAAGTGGTG
AAAGGAATGTATTACTCGCTCACTTTCAGCGCCGCGAGGACGTGCGCTCAAGACGAAAGG
CTCAACATCTCGGTAGCGCCTGACTCTGGCGTCATCCCCGTGCAGACCGTGTACAGCAGC
AGTGGGTGGGATCTATACGCTTGGGCGTT


BQ
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AF RS1D633TF U 8
AF RS1GN29TF U 1
BS 1 23 RS1GN29TF
BS 24 24 RS1D633TF
BS 25 43 RS1GN29TF
BS 44 44 RS1D633TF
BS 45 164 RS1GN29TF
BS 165 165 RS1D633TF
BS 166 215 RS1GN29TF
BS 216 216 RS1D633TF
BS 217 296 RS1GN29TF
BS 297 297 RS1D633TF
BS 298 311 RS1GN29TF
BS 312 312 RS1D633TF
BS 313 509 RS1GN29TF

RD RS1D633TF 426 0 0
CTACAATAAACACTTTC*TCTCTTTTCTCTCTTCCCAGTGTTCCTTTACAATGTGGGGCG
TCACCGTCGTGTCTCTCGTCCTTCTTCTCATTGCCACAGCTAATTCCGCCGTTGTCCCCT
TCCGTGATGGTATTTTACCGAACGGCGACTTCGAGCTAGGACCAAAGCCATCCGACTTGA
AAGGAACCGAAATAATAAACAAGATGGCAATCCCGAACTGGGAAGTCACGGGGTTCGTCG
AGTACATAAGCTCAGGACACAAACAAGGAGACATGCTTCTCGTCGTCCCCGCCGGAAAAT
TCGCAGTGAGGCTCGGAAACGAAGCGTCGATCAAACAAAGAATCAAAGTGGTGAAAGGAA
TGTATTACTCGCTCACTTTCAGCGCCGCGAGGACGTGCGCTCAAGACGAAAGGCTCAACA
TCTCGG

QA 1 426 1 426
DS 

RD RS1GN29TF 509 0 0
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TGGGGCGTCACCGTCGTGTCTCTCGTCCTTCTTCTCATTGCCACAGCTAATTCCGCCGTT
GTCCCCTTCCGTGATGGGATATTACCGAACGGCGACTTCGAGCTCGGACCAAAGCCATCC
GACTTGAAAGGAACCGAAATAATAAACAAGATGGCCATCCCGAACTGGGAAGTCACGGGG
TTCGTCGAGTACATAAGCTCAGGACACAAACAAGGAGACATGCTTCTCGTCGTCCCGGCC
GGAAAATTCGCGGTGAGGCTCGGAAACGAAGCGTCGATCAAACAAAGAATCAAAGTGGTG
AAAGGAATGTATTACTCGCTCACTTTCAGCGCCGCGAGGACGTGCGCTCAAGACGAAAGG
CTCAACATCTCGGTAGCGCCTGACTCTGGCGTCATCCCCGTGCAGACCGTGTACAGCAGC
AGTGGGTGGGATCTATACGCTTGGGCGTT

QA 1 509 1 509
DS 



AS 1 2

CO CL5065Contig1 1297 2 2 U
GAGTCAATTTTACAAAGACTCGACAAAAGACTTCATCGAAGTGGAGACTCGAGTCCCAAT
TCAAGTATGGGCAATTCAGAAGAACAACGGATTGCTTTTAGAGGAAAGTCACACCGATGG
GATTGTTCCAACCAGTACCATCCAGACAGAAATATACTGGAAAGGGATGGATGGAGATTC
AGAATGGACTAGAGCAAACGATGCATATGATAATGGCGAGGATGGGTATGACAGTTCACG
CGACGAGATCTCCCCTGTTTCATCCTATCCCAACAAAGGAAATCTAAACATAGCTTTTGG
TAGTTCAGTGTCCTTGAATTCTGGACCAAGATTATCTATGAATGCCACGTCATATATTGA
AGGTGTTGGATCATCTCCAAAAGAAATGGTCTCTCAGTTATCAGCTGCTGTGGTGTCTTA
CGACTCTGGACCCGATGGCTTATCTCCTGGTAAATCATCAAATTCCGGGATTCCAAGCCA
ACAGCCCAAGCAGACAAATGGCCCAGGAGCATCAAACTCACCTGAAGCTGGAGCTGGAGA
ACCAATTCCATCAGAAAGATTCACACGAGGAAGATCTTACAACATCAGAATGGATGACCA
AGTTCTTCTTAGATTTTCCCCAAAGAATGCAGACTCTACTTATTACTTCAGCGATAACAT
TGGTGGAACACTTACTTTCTTCCATGAAGGAGCTAGAAGATGTCTTGAGGTCTCGGTTAC
ACTAGAAACTTCAGAGACAATAAACAGGAAATTTGTTCATCCGTCGAGGAGAAGTTCTCC
AACGCATACTAAGGTTCAAAGCGATCACCATGAAGTGGTGGCAGACCTTATTCAGACCAG
CTTTCTTTTCTCGATTCCCACGGATGGTCCAATGTCGTTTACTACACCCCGTGTTTCTGT
GCAATGGATTCTTCGGTTTGAGTTCCTAATCACCCCAAAGGATGTGGACTTGAGCAGGTA
TGAACATCCGTTGTTAGTCCCGGAAAAAGAAAGAAGCGAATGGGTTCTTCCGATAACGGT
ACATGCACCACCACCCCGAACATCATCATCACCTGCTCAAAACCGAGGCGATAAGCTATT
TGGTTTGGAGCCTTCTTGGACTCGCAGCTAAACCACCTCCTGCAATATAATTTTCTTTTA
TTTCTCTTTTGGAATATTTACCACAACTTTTTTTTTCATTTATATTTGTAATTCTAGTTT
ATAAATAAAAAACCATCATCTTCTGGTTTGAGAGCGAAGTTATGAACACAACTGCATAAA
TTACAAGATTTCTTTAATTTCAGGCAGAATCTGAATT


BQ
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AF RS1DV90TF U 1
AF RS1DV90JQ C 533
BS 1 617 RS1DV90TF
BS 618 1297 RS1DV90JQ

RD RS1DV90TF 617 0 0
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TCAAGTATGGGCAATTCAGAAGAACAACGGATTGCTTTTAGAGGAAAGTCACACCGATGG
GATTGTTCCAACCAGTACCATCCAGACAGAAATATACTGGAAAGGGATGGATGGAGATTC
AGAATGGACTAGAGCAAACGATGCATATGATAATGGCGAGGATGGGTATGACAGTTCACG
CGACGAGATCTCCCCTGTTTCATCCTATCCCAACAAAGGAAATCTAAACATAGCTTTTGG
TAGTTCAGTGTCCTTGAATTCTGGACCAAGATTATCTATGAATGCCACGTCATATATTGA
AGGTGTTGGATCATCTCCAAAAGAAATGGTCTCTCAGTTATCAGCTGCTGTGGTGTCTTA
CGACTCTGGACCCGATGGCTTATCTCCTGGTAAATCATCAAATTCCGGGATTCCAAGCCA
ACAGCCCAAGCAGACAAATGGCCCAGGAGCATCAAACTCACCTGAAGCTGGAGCTGGAGA
ACCAATTCCATCAGAAAGATTCACACGAGGAAGATCTTACAACATCAGAATGGATGACCA
AGTTCTTCTTAGATTTT

QA 1 617 1 617
DS 

RD RS1DV90JQ 765 0 0
GCTGGAGAACCAATTCCATCAGAAAGATTCACACGAGGAAGATCTTACAACATCAGAATG
GATGACCAAGTTCTTCTTAGATTTTCCCCAAAGAATGCAGACTCTACTTATTACTTCAGC
GATAACATTGGTGGAACACTTACTTTCTTCCATGAAGGAGCTAGAAGATGTCTTGAGGTC
TCGGTTACACTAGAAACTTCAGAGACAATAAACAGGAAATTTGTTCATCCGTCGAGGAGA
AGTTCTCCAACGCATACTAAGGTTCAAAGCGATCACCATGAAGTGGTGGCAGACCTTATT
CAGACCAGCTTTCTTTTCTCGATTCCCACGGATGGTCCAATGTCGTTTACTACACCCCGT
GTTTCTGTGCAATGGATTCTTCGGTTTGAGTTCCTAATCACCCCAAAGGATGTGGACTTG
AGCAGGTATGAACATCCGTTGTTAGTCCCGGAAAAAGAAAGAAGCGAATGGGTTCTTCCG
ATAACGGTACATGCACCACCACCCCGAACATCATCATCACCTGCTCAAAACCGAGGCGAT
AAGCTATTTGGTTTGGAGCCTTCTTGGACTCGCAGCTAAACCACCTCCTGCAATATAATT
TTCTTTTATTTCTCTTTTGGAATATTTACCACAACTTTTTTTTTCATTTATATTTGTAAT
TCTAGTTTATAAATAAAAAACCATCATCTTCTGGTTTGAGAGCGAAGTTATGAACACAAC
TGCATAAATTACAAGATTTCTTTAATTTCAGGCAGAATCTGAATT

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

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GGCTTGTAGGCGTTTCTAAGATTCTCTACACCTCTCAAAGTCATGGCCTCGTCTGCGGAT
CTTAGCAAGAAGCAGTTTAAGAAGTCTATGACCAAGAAATCACACTCATGGTGGTGGGAC
AGTCACAATTGTCCCAAGAACTCGAAGTGGCTTGCAGAAAATCTAGAGAAGATGGATGAC
CGTGTGAAGCACATGTTAAAGTTGATTGAAGAAGACGCAGACTCTTTTGCCAAGAAAGCT
CAGATGTATTACCAGAAGCGTCCCGAGTTAATCCACCTTGTGGAGGAGTTTTACCGCATG
TATCGCGCTTTGGCTGAGCGTTATGATCAAGCTAGTGGTGAACTTCAGAAAATGCATCTC
TCTGGGACACAGTCACAGGGCTCTCTTGAGAAATCATCTCCTACTTCCCAAGAGAAATCG
AGTCACCCTCATAAGGAAGATGAAGAAGACTCATCATCTCTGTCTGATTCTGATTCTGAT
TCTGACTCTAAGTCGGTTCCTGATGATGAAGATGGCGACGAGGCATTGATCCGTAGGATG
GCTGATCTAGAACTTGAGCTTCAAGAAACTAAAGAGAAACTCCAGCTACAGCAAGAACGT
CTTAATGGTGACAACAACACCGATCTCCTTCAGAAAATTACTGTATATGAAAGAGAGCTT
AAAGAAGCTAATATAAAGATTCGAATGCAAGAAGAAGAGATCGCTAATCTGAAGATTGAG
CTTAATCGTTGCATTTCCTCTGAAGCAAAAACTCGTGTTGAGAAAGAGGGTCTTGATTTG
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TGGGTTGTTGCCAAATTGACTCCATTGGAATTCATCATGGAAGTGTATGCGCCAAATGCT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EB77TF U 1
AF RS1EB77JQ C 281
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CGTGTGAAGCACATGTTAAAGTTGATTGAAGAAGACGCAGACTCTTTTGCCAAGAAAGCT
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TATCGCGCTTTGGCTGAGCGTTATGATCAAGCTAGTGGTGAACTTCAGAAAATGCATCTC
TCTGGGACACAGTCACAGGGCTCTCTTGAGAAATCATCTCCTACTTCCCAAGAGAAATCG
AGTCACCCTCATAAGGAAGATGAAGAAGACTCATCATCTCTGTCTGATTCTGATTCTGAT
TCTGACTCTAAGTCGGTTCCTGATGATGAAGATGGCGACGAGGCATTGATCCGTAGGATG
GCTGATCTAGAACTTGAGCTTCAAGAAACTAAAGAGAAACTCCAGCTACAGCAAGAACGT
CTTAATGGTGACAACAACACCGATCTCCTTCAGAAAATTACTGTATATGAAAGAGAGCTT
AAAGAAGCTAATATAAAGATTCGA*TGCA*GAAGAAGAGATCGCTAATCTGAAGATTGAG
CTTAATCGTT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RS1EB77JQ 736 0 0
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AACTTCAGAAAATGCATCTCTCTGGGACACAGTCACAGGGCTCTCTTGAGAAATCATCTC
CTACTTCCCAAGAGAAATCGAGTCACCCTCATAAGGAAGATGAAGAAGACTCATCATCTC
TGTCTGATTCTGATTCTGATTCTGACTCTAAGTCGGTTCCTGATGATGAAGATGGCGACG
AGGCATTGATCCGTAGGATGGCTGATCTAGAACTTGAGCTTCAAGAAACTAAAGAGAAAC
TCCAGCTACAGCAAGAACGTCTTAATGGTGACAACAACACCGATCTCCTTCAGAAAATTA
CTGTATATGAAGGAGAGCTTAAAGAAGCTAATATAAAGATTCGAATGCAAGAAGAAGAGA
TCGCTAATCTGAAGATTGAGCTTAATCGTTGCATTTCCTCTGAAGCAAAAACTCGTGTTG
AGAAAGAGGGTCTTGATTTGGTTAAAGAGGAAACTAAAGATGCAGGTGCCACTCTTTTCT
GCTCAACCACGTCTGGTGGTATTGTGTCTCTTTCTATTATTATCATTTTGTATTGTTTTA
CTTTTTTGAAGTCAATACGGTGGGTTGTTGCCAAATTGACTCCATTGGAATTCATCATGG
AAGTGTATGCGCCAAATGCTTGAGCCTGAACTGTGCTTCGTGTTTATTTTAACGTCCACT
GTTACTTCATTTTAGC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

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GGATACAAAGAAGAAATCCAATAAACTCTTCTAACTTTCTACGTCAAATTCATTACTCTT
TTTGTTAGGAAAAGTATAAATTTGAAATAAGAAAATGGCAACTAACAAAATCTCCTTCTT
CTTGGTTCTTTGCATCTGTGTTTTGTTATCCTCAGGATTTGGAAAAGCAGCACTAAATCC
AACGGGAAAAAAATGTCCGGATCCAAATGGTGTAGACAAAAAAGCTGCATGTTATAGCTA
CTGCAAAACACAGGGTTTTATGGGTGGTTCTTGTCAAGGACATAAAGGTAATTACATGTG
TAAGTGTTATGAAGGTAAATGAATATTTGCGAATTTTGTTACTTTCAAATACTCGTTGGT
TTGGTTTTATGAGGAATAATAAACGCAAATAAATACTTTAGTTGATGTATTTGTTTTATT
CTACTTTTCAATATTTAAGATATTTTTCACGCAAAAA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AD06TF U 5
AF RS1GK24TF U 1
BS 1 457 RS1GK24TF

RD RS1AD06TF 404 0 0
GG
AAAGAAGAAATCCAATAAACTCTTCTAACTTTCTACGTCAAATTCATT*CTCTTTTTGTT
AGGAAAAGTATAAATTTGAAATAAGAAAATGGCAACTAACAAAATCTCCTTCTTCTTGGT
TCTTTGCATCTGTGTTTTGTTATCCTCAGGATTTGGAAAAGCAGCACTAAATCCAACGGG
GAAAAAATGTCCGGATCCAAATGGTGTAGACAAAAAAGCTGCATGTTATAGCTACTGCAA
AACACAGGGTTTTATGGGTGGTTCTTGTCAAGGACATAAAGGTAATTACATGTGTAAGTG
TTATGAAGGTAAATGAATATTTGCGAATTTTGTTACTTTCAAATACTCGT*GGTTTGGTT
TTATGAGGAATAATAAACGCAAATAAATACTTTAGTTGATGT

QA 3 404 3 404
DS 

RD RS1GK24TF 457 0 0
GGATACAAAGAAGAAATCCAATAAACTCTTCTAACTTTCTACGTCAAATTCATTACTCTT
TTTGTTAGGAAAAGTATAAATTTGAAATAAGAAAATGGCAACTAACAAAATCTCCTTCTT
CTTGGTTCTTTGCATCTGTGTTTTGTTATCCTCAGGATTTGGAAAAGCAGCACTAAATCC
AACGGGAAAAAAATGTCCGGATCCAAATGGTGTAGACAAAAAAGCTGCATGTTATAGCTA
CTGCAAAACACAGGGTTTTATGGGTGGTTCTTGTCAAGGACATAAAGGTAATTACATGTG
TAAGTGTTATGAAGGTAAATGAATATTTGCGAATTTTGTTACTTTCAAATACTCGTTGGT
TTGGTTTTATGAGGAATAATAAACGCAAATAAATACTTTAGTTGATGTATTTGTTTTATT
CTACTTTTCAATATTTAAGATATTTTTCACGCAAAAA

QA 1 457 1 457
DS 



AS 1 2

CO CL5068Contig1 733 2 1 U
GGGTCGGAACACTAGTCAGAAGCAGCATCGTTAAGAACAAAGCTTGAGAAAGTTACCAGT
TTGGTTTCGGGAGAGAATCTGACTGGAAAAAGCTGGCGGCTTTAAACTCAACAACTGTTT
TTCTCTGCACGGTATCGAGAAGTCTCGTGGTTTCGCAACTGTTTTGAATAAGAGAGCATT
CAGCTCACAGTTACGCTCTGCCTGTTCAGCTCCCTACGTTGGTCGAGTTATGGCTTCTTC
TACTGGAGGTGGACCAAAATCTGGTTACGCGACATCATCCATATCTACCAATGAACCTGT
TGTTTCTGTTGATTGGCTCCACTCCAGTCTTAAAGAGGCTGATATAAAAGTTTTGGATGC
CTCATGGTACATGCCATTTGAGCAAAGAAATCCAATCCAAGAGTATCAAGTTGCTCATAT
TCCAGGTGCTCTCTTCTTTGATTTGGATGGAATATCAGATAGAAGAACTAATTTACCACA
CATGCTGCCATCTGAGGAAGCTTTTGCTGCTGCTTGTTCTGCTCTTGGAATCGAGAACAA
AGATGGAGTGGTTGTGTATGATGGAAAGGGCATCTTTAGTGCCTCTCGTGTTTGGTGGAT
GTTTAGAGTCTTTGGACATGAAAATGTTTGGGTACTTGATGGAGGCTTACCGAGATGGCG
TGCTTCATGCTATGACGTTGAATCTAGTGCTTCTAGTGATGTCATTTTGAAAGCAATGCA
GCAAGTGAGGTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FC10TF U 142
AF RS1EM34TF U 1
BS 1 733 RS1EM34TF

RD RS1FC10TF 278 0 0
GTCTCGTGGTTTCGCAACTGTTTTGAATAAGAGAGCATTCAGCTCACAGTTACGCTCTGC
CTGTTCAGCTCTCTACGTTGGTCGAGTTATGGCTTCTTCTACTGGAGGTGGACCAAAATC
TGGTTACGCGACATCATCCATATCTACCAATGAACCTGTTGTTTCTGTTGATTGGCTCCA
CTCCAGTCTTAAAGAGGCTGATATAAAAGTTTTGGATGCCTCATGGTACATGCCATTTGA
GCAAAGAAATCCAATCCAAGAGTATCAAGTTGCTCATA

QA 1 278 1 278
DS 

RD RS1EM34TF 733 0 0
GGGTCGGAACACTAGTCAGAAGCAGCATCGTTAAGAACAAAGCTTGAGAAAGTTACCAGT
TTGGTTTCGGGAGAGAATCTGACTGGAAAAAGCTGGCGGCTTTAAACTCAACAACTGTTT
TTCTCTGCACGGTATCGAGAAGTCTCGTGGTTTCGCAACTGTTTTGAATAAGAGAGCATT
CAGCTCACAGTTACGCTCTGCCTGTTCAGCTCCCTACGTTGGTCGAGTTATGGCTTCTTC
TACTGGAGGTGGACCAAAATCTGGTTACGCGACATCATCCATATCTACCAATGAACCTGT
TGTTTCTGTTGATTGGCTCCACTCCAGTCTTAAAGAGGCTGATATAAAAGTTTTGGATGC
CTCATGGTACATGCCATTTGAGCAAAGAAATCCAATCCAAGAGTATCAAGTTGCTCATAT
TCCAGGTGCTCTCTTCTTTGATTTGGATGGAATATCAGATAGAAGAACTAATTTACCACA
CATGCTGCCATCTGAGGAAGCTTTTGCTGCTGCTTGTTCTGCTCTTGGAATCGAGAACAA
AGATGGAGTGGTTGTGTATGATGGAAAGGGCATCTTTAGTGCCTCTCGTGTTTGGTGGAT
GTTTAGAGTCTTTGGACATGAAAATGTTTGGGTACTTGATGGAGGCTTACCGAGATGGCG
TGCTTCATGCTATGACGTTGAATCTAGTGCTTCTAGTGATGTCATTTTGAAAGCAATGCA
GCAAGTGAGGTGT

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 2

CO CL5069Contig1 872 2 2 U
GGCCTCTTCTTCCTCTTCAAGTCCGCCGTTGCAACTCAGTAATAAAGGCTCGAGCTTTAG
AAGACAATGGCTGCTCCTTTCCCAACCTTAACTCTGATTCTGGATTGAAGAAGCTCGACG
AGCATCTCCTCACTCGCAGTTACATCACTGGGTACCAGGCTTCAAAGGATGACATCACTG
TCTTTACAGCTCTTGCAAAGCCTCCAACTTCACAGTGTGTCAACGCATATCGTTGGTACA
GCCACATCGATGCCCTTTTGAGGATCTCTGGTGTCTCTGCTGAAGGAAGCGGTGTCATTG
TTGAGGGATCAGCCCCCGTCTCAGAGGAGGCTGTTGCTACTCCACCAGCAGCTGATTCTA
AGGATGCGGCTGATGAGGAAGATGATGATGATGTTGATCTTTTCGGTGAGGAGACCGAAG
AGGAGAAGAAAGCTGCTGAAGAGAGAGCTGCTTCCGTGAAGGCATCTACTAAGAAGGAGG
AATCTGGAAAGTCATCAGTCTTGATTGATATCAAGCCATGGGATGATGAGACTGACATGA
AGAAGCTAGAGGAAGCTGTGAGATCCGTCCAGATGGAAGGATTATTCTGGGGAGCGTCAA
AGCTTGTACCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAGTTGCAGATCATGTGCACCATTGTTGACG
ACCTCGTCTCTGTGGACACCATGATTGAAGAGACGCTCACCGTCGAGCCAATCAATGAGT
TTGTCCAGAGCTGTGACATTGTTGCCTTCAACAAAATCTGAGGATGGAGAAAAGAGCTCA
AGGATGTCCTTTGTGTGTTTTTATTTTTTGAGTTTCCTGTGTTTTCTACTGTTGTTTTGA
TTCTGATATTTGAATAATTTTGATGCTTATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D557TF U 1
AF RS1D557JQ C 188
BS 1 576 RS1D557TF
BS 577 872 RS1D557JQ

RD RS1D557TF 576 0 0
GGCCTCTTCTTCCTCTTCAAGTCCGCCGTTGCAACTCAGTAATAAAGGCTCGAGCTTTAG
AAGACAATGGCTGCTCCTTTCCCAACCTTAACTCTGATTCTGGATTGAAGAAGCTCGACG
AGCATCTCCTCACTCGCAGTTACATCACTGGGTACCAGGCTTCAAAGGATGACATCACTG
TCTTTACAGCTCTTGCAAAGCCTCCAACTTCACAGTGTGTCAACGCATATCGTTGGTACA
GCCACATCGATGCCCTTTTGAGGATCTCTGGTGTCTCTGCTGAAGGAAGCGGTGTCATTG
TTGAGGGATCAGCCCCCGTCTCAGAGGAGGCTGTTGCTACTCCACCAGCAGCTGATTCTA
AGGATGCGGCTGATGAGGAAGATGATGATGATGTTGATCTTTTCGGTGAGGAGACCGAAG
AGGAGAAGAAAGCTGCTGAAGAGAGAGCTGCTTCCGTGAAGGCATCTACTAAGAAGGAGG
AATCTGGAAAGTCATCAGTCTTGATTGATATCAAGCCATGGGATGATGAGACTGACATGA
AGAAGCTAGAGGAAGCTGTGAGATCCGTCCAGATGG

QA 1 576 1 576
DS 

RD RS1D557JQ 685 0 0
AGCTCTTGCAAAGCCTCCAACTTCACAGTGTGTCAACGCATATCGTTGGTACAGCCACAT
CGATGCCCTTTTGAGGATCTCTGGTGTCTCTGCTGAAGGAAGCGGTGTCATTGTTGAGGG
ATCAGCCCCCGTCTCAGAGGAGGCTGTTGCTACTCCACCAGCAGCTGATTCTAAGGATGC
GGCTGATGAGGAAGATGATGATGATGTTGATCTTTTCGGTGAGGAGACCGAAGAGGAGAA
GAAAGCTGCTGAAGAGAGAGCTGCTTCCGTGAAGGCATCTACTAAGAAGGAGGAATCTGG
AAAGTCATCAGTCTTGATTGATATCAAGCCATGGGATGATGAGACTGACATGAAGAAGCT
AGAGGAAGCTGTGAGATCCGTCCAGATGGAAGGATTATTCTGGGGAGCGTCAAAGCTTGT
ACCGGTTGGTTACGGTATCAAGAAGTTGCAGATCATGTGCACCATTGTTGACGACCTCGT
CTCTGTGGACACCATGATTGAAGAGACGCTCACCGTCGAGCCAATCAATGAGTTTGTCCA
GAGCTGTGACATTGTTGCCTTCAACAAAATCTGAGGATGGAGAAAAGAGCTCAAGGATGT
CCTTTGTGTGTTTTTATTTTTTGAGTTTCCTGTGTTTTCTACTGTTGTTTTGATTCTGAT
ATTTGAATAATTTTGATGCTTATTC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5071Contig1 1294 2 12 U
GTGGTTTGGAGTGGAGAGTGAATACAACTGTATGGTGATCGACCTTCTTGGTCCTAGTCT
GGAGGAATTTTTCAACTATTGCAGTCGATCTTTCTCTCTCAAAACAGTTCTCATGCTCGC
TGATCAGATGTTAAACAGAGTGGAGTATATGCATGTAAGAGGGTTTCTCCATCGTGATAT
TAAGCCAGATAACTTTCTGATGGGTCTTGGCCGCAAAGCAAACCAGGTCTACATCATTGA
CTATGGACTGGCGAAGAAGTATAGAGACCTTCAAACACATAAGCATATTCCTTACAGAGA
AAACAAGAATCTTACAGGAACAGCTCGATATGCAAGTGTTAACACCCATCTTGGAATTGA
GCAAAGTAGGAGGGATGATCTGGAATCTCTGGGTTATATGCTTATGTACTTTCTCCGAGG
AAGCCTTCCATGGCAAGGCCTTCGTGCAGGAACCAAAAAACAAAAGTATGACAAGATCAG
TGAAAAGAAAAGACTTATACCAGTGGATGTCCTCTGTAGAAACTTTCCACCTGAGTTCAC
ATCCTATTTCCTCTACGTCCGTTCATTGCGGTTTGAAGACAAACCAGACTATTCATACTT
AAAGAAGCTTTTCAGAGACCTATTCATCCGACAAGGTTATCAGTTTGACTATGTATTCGA
TTGGACAATACTGAGGTATCAGCACGGCTCCAGTTCCACTTCCTATGCTACACCAAGACC
AAGCCTAAGACCAGCTCTGAATATTCCAATACCATCTGCCGAGAAACCAGAAAAGCCTTC
AACTGGCCTTCAAGCTGAGCGGTTTAGCAGACCAAGAACTTCAGAGAACGTTCTTACATC
TAGAGACACGCTTAACAAGGAGAGACCAATCACTATATCCAGGAACCATAGTTTTTCAAG
AAAAGCAGTTGCTGGATCTAGTGTTCGAGTCACTTCCTCAGCTGATTTCGCAGAGAACGG
GTCGAGCAGAGTCGTCCTAAACACTGGCCGTCCTTCTACAACTCAGAGGACACAGTTCCC
TCCTTCGTCATCCTCTTTGCTACAAAGGCTGCACCATCAAGACTTCCTCCTGACGTTACC
CTCGAGTTCCTCACTATTGGAAACGGCAAGAGGAAGTGAGTCTCCATATTATCGGTCAAG
AAACAAACAAACAAACATTGCCTGGTTTTAATTGTGTTCAGTGTTGTAGTTACTATCACC
AATTTATCCTCGTGGTTATTACACTGATAAAAAGTATGTACATAAATATGCATGAACATG
TTTTATAAGCTGAATAAACAACCAATTTATAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GK80TF U 1
AF RS1GK80JQ C 546
BS 1 740 RS1GK80TF
BS 741 741 RS1GK80JQ
BS 742 773 RS1GK80TF
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BS 805 805 RS1GK80JQ
BS 806 814 RS1GK80TF
BS 815 1294 RS1GK80JQ

RD RS1GK80TF 818 0 0
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GGAGGAATTTTTCAACTATTGCAGTCGATCTTTCTCTCTCAAAACAGTTCTCATGCTCGC
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TAAGCCAGATAACTTTCTGATGGGTCTTGGCCGCAAAGCAAACCAGGTCTACATCATTGA
CTATGGACTGGCGAAGAAGTATAGAGACCTTCAAACACATAAGCATATTCCTTACAGAGA
AAACAAGAATCTTACAGGAACAGCTCGATATGCAAGTGTTAACACCCATCTTGGAATTGA
GCAAAGTAGGAGGGATGATCTGGAATCTCTGGGTTATATGCTTATGTACTTTCTCCGAGG
AAGCCTTCCATGGCAAGGCCTTCGTGCAGGAACCAAAAAACAAAAGTATGACAAGATCAG
TGAAAAGAAAAGACTTATACCAGTGGATGTCCTCTGTAGAAACTTTCCACCTGAGTTCAC
ATCCTATTTCCTCTACGTCCGTTCATTGCGGTTTGAAGACAAACCAGACTATTCATACTT
AAAGAAGCTTTTCAGAGACCTATTCATCCGACAAGGTTATCAGTTTGACTATGTATTCGA
TTGGACAATACTGAGGTATCAGCACGGCTCCAGTTCCACTTCCTATGCTACACCAAGACC
AAGCCTAAGACCAGCTCTGA*TATTCCAATACCATCTGCCGAGAAACCAGAAA*GCCTTC
A*CTGGCCT*CAAGCTGAGCGGTT*AGCAGACCA
GACT

QA 1 814 1 814
DS 

RD RS1GK80JQ 749 0 0
ATTTCCTCTACGTCCGTTCATTGCGGTTTGAAGACAAACCAGACTATTCATACTTAAAGA
AGCTTTTCAGAGACCTATTCATCCGACAAGGTTATCAGTTTGACTATGTATTCGATTGGA
CAATACTGAGGTATCAGCACGGCTCCAGTTCCACTTCCTATGCTACACCAAGACCAAGCC
TAAGACCAGCTCTGAATATTCCAATACCATCTGCCGAGAAACCAGAAAAGCCTTCAACTG
GCCTTCAAGCTGAGCGGTTTAGCAGACCAAGAACTTCAGAGAACGTTCTTACATCTAGAG
ACACGCTTAACAAGGAGAGACCAATCACTATATCCAGGAACCATAGTTTTTCAAGAAAAG
CAGTTGCTGGATCTAGTGTTCGAGTCACTTCCTCAGCTGATTTCGCAGAGAACGGGTCGA
GCAGAGTCGTCCTAAACACTGGCCGTCCTTCTACAACTCAGAGGACACAGTTCCCTCCTT
CGTCATCCTCTTTGCTACAAAGGCTGCACCATCAAGACTTCCTCCTGACGTTACCCTCGA
GTTCCTCACTATTGGAAACGGCAAGAGGAAGTGAGTCTCCATATTATCGGTCAAGAAACA
AACAAACAAACATTGCCTGGTTTTAATTGTGTTCAGTGTTGTAGTTACTATCACCAATTT
ATCCTCGTGGTTATTACACTGATAAAAAGTATGTACATAAATATGCATGAACATGTTTTA
TAAGCTGAATAAACAACCAATTTATAGCC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

CO CL5072Contig1 1181 2 4 U
GATTCATCATCTCTCTGCGCCTCCCTCTCTCTCTCAAACTCTCAGCTCACACAGACGACA
CTCATCATGGGGAAGAAGAAGTTCATCGACAAGAAAAAGGCGGCGACTTTCGAGCTCTGC
CCTCGCGACACCTCAGACCCATTATACAGCGACGCTCCCGGAGGCGATAAGATCTTCCTA
CGAGTCGATCAGAACCCTGTGAACATCAACGGTTTCACCGAAGACAACTCACAGTTCGAT
GACGCCCCTGAAGAAGGAGGAGAAGAAGATTTGGCTTACGGCTACTCCAGCTTCGCGGGT
TCGAGCAGCAGCAACAACAACAACCCTTTGCCTGCTCACGTGAGGAAGGAGATTCTCGAG
CTGGGTTACCCTGACGATGGGTATAACTACTTGGACCATTTGAGAGAGATCAAGAACACT
GGCGGCGGTTCTAACTTCTACTCTAACCCTAAGTTCGAAGGCGAGCATCTTCCTCGTGAC
GACGTCAAGGCTTATGATGCGTCTCGTGTGAAGGTCTCTGGCGTGGTGGTGGAAGGTGGT
GGAGATGATGATAAGTTGATGTATAGCGTGGCGTCCAAGACTGTTAATGTGAAGGTGAAG
AAGGCTATTGATCCTGAAGTGGCGGCTTTGCTTGAGGATAGCGATGGGTCTGAGTTTGGT
TCTGATGTTGAGGATTTGGAGGAGGATTTTGTCGTTCAAGCTCAAGAGGGAGAGGGTGGT
TCTGAGGTGGTGGAGTTTGCTGATGAGAGACCTGTTGTGGTTGAGAGCAAGCCGAGAGTT
ATGCGTCAGATTGATGAGATGTTTGATCAGCTTGAGGTTAATGAGTATGGAAGTGAGAGT
GAGGACAATGATGGTTACCAAGAGGAAGAAGAAGAAGAGTTCAATGCTCAGAGCGTTGGT
AATAATCTTATTTACGAGAAGCCGAAAGGTTACGAGCTTGATGATGAGAAGTATATGAAC
CCTGCGGATCTGTTGAAGAACAGTGACAATGTGAAAGACAAAGAGGAGCTTGATCGCATC
ATCCGCAGTCTGTGCAGTACGGTGAGGATTTGGTTAACGGCAACGAAGATGAGTTTGTGG
AGGTGGTTGAAGAGAGCAGCGACGAGAGCGAGAAGTGGGATTGCGAACCATGGTCACTAC
ATACTCGAATCTCGATAACCACCCTGGTAGAATCTGTGATC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1FG70TF U 1
AF RS1EO07TF U 372
BS 1 636 RS1FG70TF
BS 637 637 RS1EO07TF
BS 638 770 RS1FG70TF
BS 771 1181 RS1EO07TF

RD RS1FG70TF 770 0 0
GATTCATCATCTCTCTGCGCCTCCCTCTCTCTCTCAAACTCTCAGCTCACACAGACGACA
CTCATCATGGGGAAGAAGAAGTTCATCGACAAGAAAAAGGCGGCGACTTTCGAGCTCTGC
CCTCGCGACACCTCAGACCCATTATACAGCGACGCTCCCGGAGGCGATAAGATCTTCCTA
CGAGTCGATCAGAACCCTGTGAACATCAACGGTTTCACCGAAGACAACTCACAGTTCGAT
GACGCCCCTGAAGAAGGAGGAGAAGAAGATTTGGCTTACGGCTACTCCAGCTTCGCGGGT
TCGAGCAGCAGCAACAACAACAACCCTTTGCCTGCTCACGTGAGGAAGGAGATTCTCGAG
CTGGGTTACCCTGACGATGGGTATAACTACTTGGACCATTTGAGAGAGATCAAGAACACT
GGCGGCGGTTCTAACTTCTACTCTAACCCTAAGTTCGAAGGCGAGCATCTTCCTCGTGAC
GACGTCAAGGCTTATGATGCGTCTCGTGTGAAGGTCTCTGGCGTGGTGGTGGAAGGTGGT
GGAGATGATGATAAGTTGATGTATAGCGTGGCGTCCAAGACTGTTAATGTGAAGGTGAAG
AAGGCTATTGATCCTGAAGTGGCGGCTTTGCTTGAG*ATAGCGATGGGTCTGAGTTTGGT
TCTGATGTTGAGGATTTGGAGGAGGATTTTGTCGTTCAAGCTCAAGAGGGAGAGGGTGGT
TCTGAGGTGGTGGAGTTTGCTGATGAGAGACCTGTTGTGGTTGAGAGCAA

QA 1 770 1 770
DS 

RD RS1EO07TF 810 0 0
G
GACGATGGGTATAACTACTTGGACCATTTGAGAGAGATCAAGAACACTGGCGGCGGTTCT
AACTTCTACTCTAACCCTAAGTTCGAAGGCGAGCATCTTCCTCGTGACGACGTCAAGGCT
TATGATGCGTCTCGTGTGAAGGTCTCTGGCGTGGTGGTGGAAGGTGGTGGAGATGATGAT
AAGTTGATGTATAGCGTGGCGTCCAAGACTGTTAATGTGAAGGTGAAGAAGGCTATTGTT
CCTGAAGTGGCGGCTTTGCTTGAGGATAGCGATGGGTCTGAGTTTGGTTCTGATGTTGAG
GATTTGGAGGAGGATTTTGTCGTTCAAGCTCAAGAGGGAGAGGGTGGTTCTGAGGTGGTG
GAGTTTGCTGATGAGAGACCTGTTGTGGTTGAGAGCAAGCCGAGAGTTATGCGTCAGATT
GATGAGATGTTTGATCAGCTTGAGGTTAATGAGTATGGAAGTGAGAGTGAGGACAATGAT
GGTTACCAAGAGGAAGAAGAAGAAGAGTTCAATGCTCAGAGCGTTGGTAATAATCTTATT
TACGAGAAGCCGAAAGGTTACGAGCTTGATGATGAGAAGTATATGAACCCTGCGGATCTG
TTGAAGAACAGTGACAATGTGAAAGACAAAGAGGAGCTTGATCGCATCATCCGCAGTCTG
TGCAGTACGGTGAGGATTTGGTTAACGGCAACGAAGATGAGTTTGTGGAGGTGGTTGAAG
AGAGCAGCGACGAGAGCGAGAAGTGGGATTGCGAACCATGGTCACTACATACTCGAATCT
CGATAACCACCCTGGTAGAATCTGTGATC

QA 2 810 2 810
DS 



AS 1 2

CO CL5073Contig1 527 2 2 U
GCGGTGAGGTGCAAGATCCTGTTGCTAGAGAGATGTTGGCTACTCTGACTAGGCTGAAGG
AGGGGAAAGAAGCACAACTTCAGCAGTCTCAATTGGGTGGCAACGATGGGTCCACAGCTT
CCAACGTACTGTCCCGTGAAGAGATCAACCAAATGGTTCTTGAGCATGTTCCTGTAAAGA
AAGGTCGTCGTTATGGTCTCGGTCGTATCTCGGAGGGGATCTCAACCTCGTCATCTCAGT
CCTCTTTTGTCCAAGATATGGAGCGAATGAAGGCAGAACTTGTTAAAGAGCAGGCATTCC
GAAAAGCTTTGGAGGAACAGCTTCGTAACGTCACCAATTTCATCTCCAATCTTTACCCAT
CTCAGTTTTCTGCAACACAAAGCCAAACCGACTCTGCGACTCAAAGCCCCGACGACCATG
TTTCTCAGTAAAATTTAGTATTTTATCTGTCTAAATTAAGGATGTTTAAATTAAAAATTT
TCATATGTAAATTAAGGATGTTTATTAAATTAAGGATTTTCAAATGC


BQ
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AF RS1B333TF U 1
AF RS1B333JQ C 1
BS 1 276 RS1B333TF
BS 277 527 RS1B333JQ

RD RS1B333TF 276 0 0
GCGGTGAGGTGCAAGATCCTGTTGCTAGAGAGATGTTGGCTACTCTGACTAGGCTGAAGG
AGGGGAAAGAAGCACAACTTCAGCAGTCTCAATTGGGTGGCAACGATGGGTCCACAGCTT
CCAACGTACTGTCCCGTGAAGAGATCAACCAAATGGTTCTTGAGCATGTTCCTGTAAAGA
AAGGTCGTCGTTATGGTCTCGGTCGTATCTCGGAGGGGATCTCAACCTCGTCATCTCAGT
CCTCTTTTGTCCAAGATATGGAGCGAATGAAGGCAG

QA 1 276 1 276
DS 

RD RS1B333JQ 527 0 0
GCGGTGAGGTGCAAGATCCTGTTGCTAGAGAGATGTTGGCTACTCTGACTAGGCTGAAGG
AGGGGAAAGAAGCACAACTTCAGCAGTCTCAATTGGGTGGCAACGATGGGTCCACAGCTT
CCAACGTACTGTCCCGTGAAGAGATCAACCAAATGGTTCTTGAGCATGTTCCTGTAAAGA
AAGGTCGTCGTTATGGTCTCGGTCGTATCTCGGAGGGGATCTCAACCTCGTCATCTCAGT
CCTCTTTTGTCCAAGATATGGAGCGAATGAAGGCAGAACTTGTTAAAGAGCAGGCATTCC
GAAAAGCTTTGGAGGAACAGCTTCGTAACGTCACCAATTTCATCTCCAATCTTTACCCAT
CTCAGTTTTCTGCAACACAAAGCCAAACCGACTCTGCGACTCAAAGCCCCGACGACCATG
TTTCTCAGTAAAATTTAGTATTTTATCTGTCTAAATTAAGGATGTTTAAATTAAAAATTT
TCATATGTAAATTAAGGATGTTTATTAAATTAAGGATTTTCAAATGC

QA 1 527 1 527
DS 



AS 1 2

CO CL5074Contig1 280 2 1 U
GTATCAGAATTTCGGAAGCCCATATGCCTCTGCAGTTCCTTCGAACTCACCACCTTCTTT
CTCTTCTGGAGGAAACCCGTTTGGGTAAGAATGGCAAGAACATTAGCTCGAAATCTGTAA
TGCTTTTGAGGGATGATTGATTGGGCTCTTGGAAGTTTGGGTTCTAAAATGTGTGCAACC
ATTTGTTAAAAAGAGTGGACGAAAAGTGTGAGGCATGAAAGTGAAGAAGAATTTGGGGTT
TGTGTGGCTGTTAAATCATTTATTATAAGCATCATTTTGT


BQ
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AF RS1AU79JQ C 1
AF RS1AU79TF U 1
BS 1 280 RS1AU79TF

RD RS1AU79JQ 280 0 0
GTATCAGAATTTCGGAAGCCCATATGCCTCTGCAGTTCCTTCGAACTCACCACCTTCTTT
CTCTTCTGGAGGAAACCCGTTTGGGTAAGAATGGCAAGAACATTAGCTCGAAATCTGTAA
TGCTTTTGAGGGATGATTGATTGGGCTCTTGGAAGTTTGGGTTTTAAAATGTGTGCAACC
ATTTGTTAAAAAGAGTGGACGAAAAGTGTGAGGCATGAAAGTGAAGAAGAATTTGGGGTT
TGTGTGGCTGTTAAATCATTTATTATAAGCATCATTTTGT

QA 1 280 1 280
DS 

RD RS1AU79TF 280 0 0
GTATCAGAATTTCGGAAGCCCATATGCCTCTGCAGTTCCTTCGAACTCACCACCTTCTTT
CTCTTCTGGAGGAAACCCGTTTGGGTAAGAATGGCAAGAACATTAGCTCGAAATCTGTAA
TGCTTTTGAGGGATGATTGATTGGGCTCTTGGAAGTTTGGGTTCTAAAATGTGTGCAACC
ATTTGTTAAAAAGAGTGGACGAAAAGTGTGAGGCATGAAAGTGAAGAAGAATTTGGGGTT
TGTGTGGCTGTTAAATCATTTATTATAAGCATCATTTTGT

QA 1 280 1 280
DS 



AS 1 2

CO CL5075Contig1 1128 2 10 U
GGGGAGACACTCTCGCCCAGCGCCGCGTTCTCTCTCTTCTCTCCGGTAAACCTTCGTCGA
TTTTCACCAATTCCGATCATCCGACTCATTGTTTTACATCCCAAACTCTCGCTGTCCTGG
TTCCATGGATAATAAAGGCCCAGTGCAGAAGACAGTTGTGCTCGAGCCGTTTATCAAGTC
GGTGAGGCTTTTAGCAAGGGCGTTCTATGATGATTATACTACCAAAAGCGATAATCAGCA
GAAAACTGCTAGAAGTGACAATAGAGGGATTGCCGTTGTGGTACTGGATGAGCTTACCAG
GAAGCAATGGGTGAGAGAAGAGGACTTGGCTAAGGAGTTGAAGTTGCACGCTAAGCAACT
TAGAAAAATTATACGACACTTTGAAGAACAAAACTTGATCATGCGTGACCACAGGAAAGA
GACTGCAAAAGGTGCAAAGATGTATAGTGTTGCAGTAGCTGCTACAACTGGTGGCCGAGC
AGAGGACAAGGTTAAGTTCCATACCCACTCGTATTGCTGCCTCAATTATCCACAGATATA
TGATGTTGTTCGTTATAAACTGCACCGGATGAAAAAGAAGCTAAAAGACGAACTAGAAGA
TAAGAATACTGTTCAAGAGTATGGCTGTCCTAACTGCCAGAGGAAATATAATGCACTGGA
TGCCTTGAGACTAATTTCTATGGAAGACGATGCTTTTCATTGTGAAAATTGCAATGGTGA
ATTGGTTGTGGAATGTAACAAGCTAACTTCAGAAGAAGTAGCAGATGGAGATGATAATGC
AAGGAGACGGCGGCGAGAAAAACTAAGAGATATGCTTCAGAAGATGGAGGTTCAGATAAA
ACCTCTGATGGATCAAATAAACAGAGTAAAAGACCTGCCAGTTCCCGACTTTGGATCTCT
TATCGCATGGGAGGCTCGTGCAGCTATTGCTGCTCGTGAAAATGGCGAGCTTAACCCTAA
TGATCCTTTGAGGTCACAGGGTGGGTATGGTTCAACACCAATGCCATTTCTCGGAGAGAC
AAAGGTTGAGGTTAACCTTGGTGAAGGAAAAGAGGATGTCAAAGCTAACGGTGGAGATTC
TAGTCTGAAAGTGTTGCCTCCATGGATGATCAAGCAAGGATGAATCTG


BQ
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AF RS1GY20TF U 1
AF RS1BS46TF U 448
BS 1 531 RS1GY20TF
BS 532 532 RS1BS46TF
BS 533 582 RS1GY20TF
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BS 584 670 RS1GY20TF
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BS 708 708 RS1BS46TF
BS 709 745 RS1GY20TF
BS 746 1128 RS1BS46TF

RD RS1GY20TF 748 0 0
GGGGAGACACTCTCGCCCAGCGCCGCGTTCTCTCTCTTCTCTCCGGTAAACCTTCGTCGA
TTTTCACCAATTCCGATCATCCGACTCATTGTTTTACATCCCAAACTCTCGCTGTCCTGG
TTCCATGGATAATAAAGGCCCAGTGCAGAAGACAGTTGTGCTCGAGCCGTTTATCAAGTC
GGTGAGGCTTTTAGCAAGGGCGTTCTATGATGATTATACTACCAAAAGCGATAATCAGCA
GAAAACTGCTAGAAGTGACAATAGAGGGATTGCCGTTGTGGTACTGGATGAGCTTACCAG
GAAGCAATGGGTGAGAGAAGAGGACTTGGCTAAGGAGTTGAAGTTGCACGCTAAGCAACT
TAGAAAAATTATACGACACTTTGAAGAACAAAACTTGATCATGCGTGACCACAGGAAAGA
GACTGCAAAAGGTGCAAAGATGTATAGTGTTGCAGTAGCTGCTACAACTGGTGGCCGAGC
AGAGGACAAGGTTAAGTTCCATACCCACTCGTATTGCTGCCTCAATTATCCCCAGATATA
TGATGTTGTTCGTTATAAACTGCACCGGATGAAAAAGAAGCTCAAAGACGAACTAGAAGA
TAAGAATACTGTTCAAGAGTATGGCTGTCCTAACTGCCAGAGGAAATATAATGCACTGGA
TGCCTTGAGATTAATTTCTATGGAAGACGATGCTTTTCATTGTGAAA*TTGCAATGGTGA
ATTGGTTGTGGAATGTAACAAGCTA
CTT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1BS46TF 681 0 0
G
GTTGCAGTAGCTGCTACAACTGGTGGCCGAGCAGAGGACAAGGTTAAGTTCCATACCCAC
TCGTATTGCTGCCTCAATTATCCACAGATATATGATGTTGTTCGTTATAAACTGCACCGG
ATGAAAAAGAAGCTAAAAGATGAACTAGAAGATAAGAATACTGTTCAAGAGTATGGCTGT
CCTAACTGCCAGAGGAAATATAATGCACTGGATGCCTTGAGACTAATTTCTATGGAAGAC
GATGCTTTTCATTGTGAAAATTGCAATGGTGAATTGGTTGTGGAATGTAACAAGCTAACT
TCAGAAGAAGTAGCAGATGGAGATGATAATGCAAGGAGACGGCGGCGAGAAAAACTAAGA
GATATGCTTCAGAAGATGGAGGTTCAGATAAAACCTCTGATGGATCAAATAAACAGAGTA
AAAGACCTGCCAGTTCCCGACTTTGGATCTCTTATCGCATGGGAGGCTCGTGCAGCTATT
GCTGCTCGTGAAAATGGCGAGCTTAACCCTAATGATCCTTTGAGGTCACAGGGTGGGTAT
GGTTCAACACCAATGCCATTTCTCGGAGAGACAAAGGTTGAGGTTAACCTTGGTGAAGGA
AAAGAGGATGTCAAAGCTAACGGTGGAGATTCTAGTCTGAAAGTGTTGCCTCCATGGATG
ATCAAGCAAGGATGAATCTG

QA 2 681 2 681
DS 



AS 1 2

CO CL5076Contig1 950 2 2 U
GGGACCGGCGAAGTTCCAAAGAGATCTTATGCATCCATTGTGATGGTTATGAAAGAGAAT
GCTGCACCGATGTCTGCTTCGAGAACTCCAACTAAGGTAGTGGAACCAAAGAGACGAGAA
GATCAAGCCACTCATGTCCCTCTACCAACACCGTTGTCTGAGAAATCAGATTCAAGAGCA
AATGTAGCTGTAAATGGGAACGATCAAGACAATGAAAGAGCTCCAGGTCCATCCATCTAT
CTAAAGGGCTTGCCCCTTGATGCAACACCAGCCTTGCTCGAGAATGAGTTCCAGAAGTTT
GGACTTATTAGGACCAACGGAATTCAAGTAAGAAGCCATAAGGGATTCTGTTTTGGCTTT
GTTGAGTTTGAATCCGCGAGTTCCATGCGAAGCGCAATCGAGGCATCACCTATCATACTC
GGTGGGCAGAACGTAGTTGTCGAGGAAAAACGATCGACGGCAAGAGGGAATCATAGAGGA
CGCTCAGCGTTTGGTGTAGGCGCAGGCTACAGAAACGAAGGTGGAAGGGGTCGTGGGAGC
TTTGGAGGTGGAAGAGGCCGGAACGAATTCAACGGATATGGTAACAACAGGGGAAACAAT
AGAGGAGGATATGCAAACAGAGCAAATGGCGACGGTGGTGGGTTTCCGAGACGTGTAAGA
CGTGGTGCTGGTGGCGGAATAGATGCAAACGGAGCTACAAAACCTGTCGATACTCCTCTC
GTGTCTCTCACTGCGTAACGTTTCAACCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAGAGGCTCGAATT
GTTTTAGAGAGTATAGGCTTAGAGCTGTGACTAAAAAATAGCTATTATTCTCTTTTTCTC
TGCATCCCCCATTTTGTTAATTGGAGTTACAAATTCTATGAGGCAGATAAAGTTTCGGCA
AGCTCTTGTTCGTCTAGCAACGTTTAAAACTCGATTCACAAAATTCAGAC


BQ
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AF RS1EP02TF U 1
AF RS1EP02JQ C 395
BS 1 511 RS1EP02TF
BS 512 950 RS1EP02JQ

RD RS1EP02TF 511 0 0
GGGACCGGCGAAGTTCCAAAGAGATCTTATGCATCCATTGTGATGGTTATGAAAGAGAAT
GCTGCACCGATGTCTGCTTCGAGAACTCCAACTAAGGTAGTGGAACCAAAGAGACGAGAA
GATCAAGCCACTCATGTCCCTCTACCAACACCGTTGTCTGAGAAATCAGATTCAAGAGCA
AATGTAGCTGTAAATGGGAACGATCAAGACAATGAAAGAGCTCCAGGTCCATCCATCTAT
CTAAAGGGCTTGCCCCTTGATGCAACACCAGCCTTGCTCGAGAATGAGTTCCAGAAGTTT
GGACTTATTAGGACCAACGGAATTCAAGTAAGAAGCCATAAGGGATTCTGTTTTGGCTTT
GTTGAGTTTGAATCCGCGAGTTCCATGCGAAGCGCAATCGAGGCATCACCTATCATACTC
GGTGGGCAGAACGTAGTTGTCGAGGAAAAACGATCGACGGCAAGAGGGAATCATAGAGGA
CGCTCAGCGTTTGGTGTAGGCGCAGGCTACA

QA 1 511 1 511
DS 

RD RS1EP02JQ 556 0 0
CAATCGAGGCATCACCTATCATACTCGGTGGGCAGAACGTAGTTGTCGAGGAAAAACGAT
CGACGGCAAGAGGGAATCATAGAGGACGCTCAGCGTTTGGTGTAGGCGCAGGCTACAGAA
ACGAAGGTGGAAGGGGTCGTGGGAGCTTTGGAGGTGGAAGAGGCCGGAACGAATTCAACG
GATATGGTAACAACAGGGGAAACAATAGAGGAGGATATGCAAACAGAGCAAATGGCGACG
GTGGTGGGTTTCCGAGACGTGTAAGACGTGGTGCTGGTGGCGGAATAGATGCAAACGGAG
CTACAAAACCTGTCGATACTCCTCTCGTGTCTCTCACTGCGTAACGTTTCAACCCCCCCC
CAAAAAAAAAAAAAGAGGCTCGAATTGTTTTAGAGAGTATAGGCTTAGAGCTGTGACTAA
AAAATAGCTATTATTCTCTTTTTCTCTGCATCCCCCATTTTGTTAATTGGAGTTACAAAT
TCTATGAGGCAGATAAAGTTTCGGCAAGCTCTTGTTCGTCTAGCAACGTTTAAAACTCGA
TTCACAAAATTCAGAC

QA 1 556 1 556
DS 



AS 1 2

CO CL5077Contig1 905 2 8 U
GCACGTCGACTCGATCAGGAACATGCTGAACTTTGTCTTGGGTCATCCCGAGATCCCCGC
TATGCCGAGGAGGTTCGACATGAAGTTCTCGAACCTGAAGAACTCGTCGGAGACGGTGAG
GATCACGAGTATCTTCAACGGTCATTGGAACGAGACGCAGAACTACCAAGGCCTCGACTC
GCTCAGAGACCAAGACTTTAGAGAGCTGCTCAAGAAGTACTTCTCCGAGGAAGACCGTGT
TCCGGACGCTATGTTCGTGAACTCTGGTCTGCACGATGGGATTCACTGGCATAGTATCAG
AGCCTTTGAGAAAGGTGCTGAGACGGCGGCTGCGTTCTGGAGAGACGTTTTCGACGGGGT
CAAAGCCAGGGGACTGAAGCCGCCTGAAGTGATTTTCAGGAACACGATCGCGACGGGTGG
TTACGCTAGGTTGCTAGCGTTTAATCCGAGCAAAATGGAGGCGTTCAACGGTGTGTTTCT
TGAGAAGATGAGGGATGCGGGGTTGGTCACGAGCGTGGTTGATAACTTTGATATGACGTA
TCCGTGGCATTATGATAATCGGTGTAACGATGGAGTTCATTACGGGAGAACTCCGGCGAA
AATGCGGTGGAGGGACGGTGAGATTGGGCATCAGTACTTTGTGGATGTGATGCTTATTCA
CGTGTTGCTGAATGCATTGTGTGTGAGCTAGTAGTGGTGATCAAAGTTTGGTTTTAGGAG
TCACGGATTCTTTATTTATGTGTAAACTTTTTCATATAATTTTTTGAGTATAGATCATAT
ATTTATTTGGAATAACTCAACTGAAGCTTGAGTTTCTATCGTGTAATGTATAAATGGCGA
GAGAGATTGGAACAACAAATGTTTGGCAAATCATTTTTCTGATTTTATTAGTGGAACAAG
TCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RS1CZ80TF U 1
AF RS1CZ80JQ C 393
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BS 718 718 RS1CZ80JQ
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BS 761 791 RS1CZ80TF
BS 792 905 RS1CZ80JQ

RD RS1CZ80TF 807 0 0
GCACGTCGACTCGATCAGGAACATGCTGAACTTTGTCTTGGGTCATCCCGAGATCCCCGC
TATGCCGAGGAGGTTCGACATGAAGTTCTCGAACCTGAAGAACTCGTCGGAGACGGTGAG
GATCACGAGTATCTTCAACGGTCATTGGAACGAGACGCAGAACTACCAAGGCCTCGACTC
GCTCAGAGACCAAGACTTTAGAGAGCTGCTCAAGAAGTACTTCTCCGAGGAAGACCGTGT
TCCGGACGCTATGTTCGTGAACTCTGGTCTGCACGATGGGATTCACTGGCATAGTATCAG
AGCCTTTGAGAAAGGTGCTGAGACGGCGGCTGCGTTCTGGAGAGACGTTTTCGACGGGGT
CAAAGCCAGGGGACTGAAGCCGCCTGAAGTGATTTTCAGGAACACGATCGCGACGGGTGG
TTACGCTAGGTTGCTAGCGTTTAATCCGAGCAAAATGGAGGCGTTCAACGGTGTGTTTCT
TGAGAAGATGAGGGATGCGGGGTTGGTCACGAGCGTGGTTGATAACTTTGATATGACGTA
TCCGTGGCATTATGATAATCGGTGTAACGATGGAGTTCATTACGGGAGAACTCCGGCGAA
AATGCGGTGGAGGGACGGTGAGATTGGGCATCAGTACTTTGTGGATGTGATGCTTATTCA
CGTGTTGCTGAATGCATTGTGTGTGAGCTAGTAGTGGTGATCAAAGTTTGGTTTTAG*AG
TCACGGATTCTTTATTTATGTGTAA*CTTTTTCATATA**TTTTTGAGTATAGATCATAT
ATTTATTTGGA
TACTCACTGAAGCTTG

QA 1 791 1 791
DS 

RD RS1CZ80JQ 513 0 0
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AAATGGAGGCGTTCAACGGTGTGTTTCTTGAGAAGATGAGGGATGCGGGGTTGGTCACGA
GCGTGGTTGATAACTTTGATATGACGTATCCGTGGCATTATGATAATCGGTGTAACGATG
GAGTTCATTACGGGAGAACTCCGGCGAAAATGCGGTGGAGGGACGGTGAGATTGGGCATC
AGTACTTTGTGGATGTGATGCTTATTCACGTGTTGCTGAATGCATTGTGTGTGAGCTAGT
AGTGGTGATCAAAGTTTGGTTTTAGGAGTCACGGATTCTTTATTTATGTGTAAACTTTTT
CATATTATTTTTTGAGTATAGATCATATATTTATTTGGAATAACTCAACTGAAGCTTGAG
TTTCTATCGTGTAATGTATAAATGGCGAGAGAGATTGGAACAACAAATGTTTGGCAAATC
ATTTTTCTGATTTTATTAGTGGAACAAGTCTTC

QA 1 513 1 513
DS 



AS 1 2

CO CL5078Contig1 589 2 2 U
GGAAACTTTCACATGAAGAAGCTCTGAAGGAGAAAGAAAACCTTCAAAATTCGAAGAAGA
TGGGTCTTCTCTGTTTCAATTCTCTCACTCCTCTCTCTTCTTCATCTCCTCCAAGGCTTC
AACTTTCGTCTTTCGCTTCACCAGTTTTCAGCCTTAAACCCAACAAGAACAGAGTCTTTC
TCAGTGCTTACAGTTTGAGCAATAGCCATGGAAGATCACCAATTGTGAAGGCAGCTGCTT
CTGGCGTGTACGGAGCTGAGCCCGAGAGCAACGAGGAAGCACCTAAGACTGTTGCTGTTG
CTGCTGCTGTCTCAGTGGATAAACTACCATTGGAATCAAAAGAAGCTAAAGAGAAGCTTC
TGCTAGAACAGAGGATGAAGATGAAGCTGGCCAAGAAGATTAGGCTACGGAGGAAACGTC
TGGTTCGTAAGCGTAAGTTGAGGAAGAAGGGTCGTTGGCCACCTTCCAAGATGAAGAAGC
TCAAGAATGTTTGATGATCATCACTCTTTGCTCTCTTCTATTATTCAACTCTTTTTTTTT
TGTAATGTTGTTTTGTATAAGCTGGATTAAATCTCAAGCTGAGTTCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1E389TF U 1
AF RS1E389JQ C 131
BS 1 548 RS1E389TF
BS 549 589 RS1E389JQ

RD RS1E389TF 548 0 0
GGAAACTTTCACATGAAGAAGCTCTGAAGGAGAAAGAAAACCTTCAAAATTCGAAGAAGA
TGGGTCTTCTCTGTTTCAATTCTCTCACTCCTCTCTCTTCTTCATCTCCTCCAAGGCTTC
AACTTTCGTCTTTCGCTTCACCAGTTTTCAGCCTTAAACCCAACAAGAACAGAGTCTTTC
TCAGTGCTTACAGTTTGAGCAATAGCCATGGAAGATCACCAATTGTGAAGGCAGCTGCTT
CTGGCGTGTACGGAGCTGAGCCCGAGAGCAACGAGGAAGCACCTAAGACTGTTGCTGTTG
CTGCTGCTGTCTCAGTGGATAAACTACCATTGGAATCAAAAGAAGCTAAAGAGAAGCTTC
TGCTAGAACAGAGGATGAAGATGAAGCTGGCCAAGAAGATTAGGCTACGGAGGAAACGTC
TGGTTCGTAAGCGTAAGTTGAGGAAGAAGGGTCGTTGGCCACCTTCCAAGATGAAGAAGC
TCAAGAATGTTTGATGATCATCACTCTTTGCTCTCTTCTATTATTCAACTCTTTTTTTTT
TGTAATGT

QA 1 548 1 548
DS 

RD RS1E389JQ 459 0 0
TTTCGCTTCACCAGTTTTCAGCCTTAAACCCAACAAGAACAGAGTCTTTTTCAGTGCTTA
CAGTTTGAGCAATAGCCATGGAAGATCACCAATTGTGAAGGCAGCTGCTTTTGGCGTGTA
CGGAGCTGAGCCCGAGAGCAACGAGGAAGCACCTAAGACTGTTGCTGTTGCTGCTGCTGT
CTCAGTGGATAAACTACCATTGGAATCAAAAGAAGCTAAAGAGAAGCTTTTGCTAGAACA
GAGGATGAAGATGAAGCTGGCCAAGAAGATTAGGCTACGGAGGAAACGTTTGGTTCGTAA
GCGTAAGTTGAGGAAGAAGGGTCGTTGGCCCCCTTCCAAGATGAAGAAGCTCAAGAATGT
TTGATGATCATCACTCTTTGCTTTTTTTTATTATTCAACTCTTTTTTTTTTGTAATGTTG
TTTTGTATAAGCTGGATTAAATCTCAAGCTGAGTTCTTT

QA 1 459 1 459
DS 



AS 1 2

CO CL5079Contig1 410 2 2 U
GGATGCACATTGGTACATCAGAATCAATTAGCAAAACATAATAAGTAAGAGGATGGATGT
CAGAAATCGCAAGAACGATGAAGTAAGTGTGTTTCAGATGCCTCTTCACTACCCGAGATA
CTCTAAAGAAGATTACCAAGGCATGCCAGAATGGAAACTCGACAGGGTTTTAGCAGATTA
TGGTTTGTCTACTTATGGAGACTTGGCTCACAAGCGAGAGTTTTCTATTGGAACTTTCCT
TTGGATTTCAACTCACAATTCAAAGCTTTATCAAGACAAGTCATCAACTACAAACTGAAG
GAAGAAACAAAATCATCTATTTCATAATGTTTTGAAAAGCACTAAGGTTATGCTAGGCTA
CGATAAATGATGTTGAGTAATAAAGACACATGTAAATCAGGAGTTTTTTA


BQ
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AF RS1CX19JQ C 1
AF RS1CX19TF U 1
BS 1 406 RS1CX19TF
BS 407 410 RS1CX19JQ

RD RS1CX19JQ 410 0 0
GGATGCACATTGGTACATCAGAATCAATTAGCAAAACATAATAAGTAAGAGGATGGATGT
CAGAAATCGCAAGAACGATGAAGTAAGTGTGTTTCAGATGCCTTTTCACTACCCGAGATA
CTTTAAAGAAGATTACCAAGGCATGCCAGAATGGAAACTCGACAGGGTTTTAGCAGATTA
TGGTTTGTCTACTTATGGAGACTTGGCTCCCAAGCGAGAGTTTTTTATTGGAACTTTCCT
TTGGATTTCAACTCACAATTCAAAGCTTTATCAAGACAAGTCATCAACTACAAACTGAAG
GAAGAAACAAAATCATTTATTTCATAATGTTTTGAAAAGCACTAAGGTTATGCTAGGCTA
CGATAAATGATGTTGAGTAATAAAGACACATGTAAATCAGGAGTTTTTTA

QA 1 410 1 410
DS 

RD RS1CX19TF 410 0 0
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CAGAAATCGCAAGAACGATGAAGTAAGTGTGTTTCAGATGCCTCTTCACTACCCGAGATA
CTCTAAAGAAGATTACCAAGGCATGCCAGAATGGAAACTCGACAGGGTTTTAGCAGATTA
TGGTTTGTCTACTTATGGAGACTTGGCTCACAAGCGAGAGTTTTCTATTGGAACTTTCCT
TTGGATTTCAACTCACAATTCAAAGCTTTATCAAGACAAGTCATCAACTACAAACTGAAG
GAAGAAACAAAATCATCTATTTCATAATGTTTTGAAAAGCACTAAGGTTATGCTAGGCTA
CGATAAATGATGTTGAGTAATAAAGACACATGTAAATCAGGAGTTT
CTTA

QA 1 406 1 406
DS 



AS 1 2

CO CL5080Contig1 943 2 16 U
GGTATATACATTGACCAGGTGAATCTGATCTTGCTTTCAAATGGAGAAGAAAAGCCAGAA
GAATAGTACACATGATTCCTTTTTGACACATCACCCTGTTCTCTGTATCCTTGCTTTGTC
TGCAATATTCATAGCGATAGACCCCTTTCACATGAGTCCTATTGGCGGACGTGAGTTCAA
GCCTGTGAAGCATGAGGTCGCTCCATACAAGCAAGTCATGGAGAACTGGCCAAGAGACAA
CCTTAGTCAACTAGGTCAGCATGGGAAGCCGGAGTTTGTGGACCAAGTCTTTGGTCCAGA
GTCATTAGAGTTTGATGGTTTAGGCCGTGGTCCGTACACAGGGTTGGCTGATGGAAGGGT
GGTCAGATGGATGGGTGAAGCAAACGGATGGGAGACATTCTCCGTTGTAACATCAAAATG
GTCAGAAGAGGCTTGCGCAAGAGGGGTGGATTCAACAACAAACAAGCAGTGGAAGCATGA
GAAGCTGTGTGGGAGACCTCTTGGTCTGAGGTTTGATAAAGAGACAGGGAACTTGTACAT
TGCAGACGCTTACTATGGTCTACTAGTGGTTGGTCCTGAAGGAGGGATTGCCACACCTTT
AGCTACCCATGTGGAAAGAAAGCCTATACTCTTTGCCAACGATCTTGACATCCATAGAAA
TGGCTCAATCTTCTTCACTGACACAAGCACAAGATATGACAGAGCGAATCATTTCTTCAT
ATTGCTTGAAGGAGAATCAACTGGGAGGCTTCTAAGATATGACCCACCTACCAAAACAAC
ACACGTTGTGCTTGATGGTTTGGCTTTTCCCAATGGCATTCAGCTCTCTAGAGACCAATC
TTTCCTTCTCTTCACAGAAACAACCAATTGCAGATTGGTGAAATATTGGGCTGGAGGGTT
CAAGAAAGGGTGAGGGTGGAGGTTGTGGCGGATCTACCAGGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 0 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CW54TF U 1
AF RS1CR65TF U 285
BS 1 339 RS1CW54TF
BS 340 340 RS1CR65TF
BS 341 345 RS1CW54TF
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BS 385 426 RS1CW54TF
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BS 686 726 RS1CW54TF
BS 727 943 RS1CR65TF

RD RS1CW54TF 726 0 0
GGTATATACATTGACCAGGTGAATCTGATCTTGCTTTCAAATGGAGAAGAAAAGCCAGAA
GAATAGTACACATGATTCCTTTTTGACACATCACCCTGTTCTCTGTATCCTTGCTTTGTC
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GCCTGTGAAGCATGAGGTCGCTCCATACAAGCAAGTCATGGAGAACTGGCCAAGAGACAA
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GTCATTAGAGTTTGATGGTTTAGGCCGTGGTCCGTACACGGGGTTTGCTGATGGAAGGGT
GGTTAGATGGATGGGTGAAGCAACCGGATGGGAGACATTCTCCGTTGTAACATCAAAATG
GTCAGAGGAGGCTTGCGCAAGAGGTGTGGATTCAACAACAAACAAGCAGTGGAAGCATGA
GAAGCTGTGTGGGAGACCTCTTGGTCTGAGGTTTGATAAAGAGACAGGGAACTTGTACAT
TGCAGACGCTTACTATGGTCTACTAGTGGTTGGTCCTGAAGGAGGGATTGCCACACCTTT
AGCTACCCATGTGGAAAGAAAGCCTATACTCTTTGCCAACGATCTTGACATCCATAGAAA
TGGCTCAATCTTCTTCACTGACACGAGCACAAGATATGACAGAGCGAATCATTTCTTCAT
ATTGCT

QA 1 726 1 726
DS 

RD RS1CR65TF 659 0 0
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TGGCTGATGGAAGGGTGGTCAGATGGATGGGTGAAGCAAACGGATGGGAGACATTCTCCG
TTGTAACATCAAAATGGTCAGAAGAGTCTTGTGCAAGAGGGGTGGATTCAACAACAAACA
AGCAGTGGAAGCATGAGAAGCTGTGTGGGAGACCTCTTGGTCTGAGGTTTGATAAAGAGA
CAGGGAACTTGTACATTGCGGCGGCTTACTATGGTCTACTAGTGGTTGGTCCTGAAGGAG
GGATTGCCACACCTTTAGCTACCCATGTGGAAGGAAAGCCTATACTCTTTGCCAACGATC
TTGACATCCATAGAAATGGCTCAATCTTCTTCACTGACACAAGCACAAGATATGACAGAG
CGAATCTTTTCTTCATATTGCTTGAAGGAGAATCAACTGGGAGGCTTCTAAGATATGACC
CACCTACCAAAACAACACACGTTGTGCTTGATGGTTTGGCTTTTCCCAATGGCATTCAGC
TCTCTAGAGACCAATCTTTCCTTCTCTTCACAGAAACAACCAATTGCAGATTGGTGAAAT
ATTGGGCTGGAGGGTTCAAGAAAGGGTGAGGGTGGAGGTTGTGGCGGATCTACCAGGAT

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

CO CL5081Contig1 950 2 2 U
GCCTGAGGAGCTCCTCAGGAAGATACTGTTGCTCGACGCCGAGCTCGTGATGCTGCTTCG
GAGCGTGCGCGGCTTCGCAATCAGAATACTGCTTCGCTCTTTGTTGATGACGACGGTGTT
GATGACCCCGAGGAGAGATATGAGAATGATGGGAACCGCACGGAAGATGGTATCCAGATT
GAAGCTTTTAGTCTGGACAGAGAGAAAGAGGAAGGATACTTTGATGGTGATGGGAACTAT
GTTGAGTATGTTAGAGAGAAGGAAGACAAGGATGCATGGCTTGACAGTATTGAAATGAAT
CCGATGTATATTGGACGATCTGCTGCTAACGATACTGAGAAGGAAGAAGATGGTGGGGAC
GAGAAACCAGCGGATGAACTTTCTCGAGAAGATGTTGCAGTCCTAAAGAGGCGTATTGCT
AGCGTCCTTGAACCAGGGGAGACGGTCCTGCGTGCTTTAAGGAGGTTGAAAGGGAACTCT
AATAATCGCAAAGAGAAGATGGATTCTGAGACAAAGGTCATCTTTGACCAGCTTACTGAG
GATGCCAACAAGCTCATCCAGAATGGAGATTACAATGTTTATAATGAGGATCAAGAAGTT
TTTCAGCGTAAAGTTGATGGATATGAGAGACTGGCTCAAGAAAGAGCAAAAGATTGTGAC
ATGTTTGGCGATGACGAAGAAGATACAGCTGGAGCCGTGCAACAAGGGGTCACAAATGAT
GGATCTGATTATGTCTTCGACGAGTCTTCAGGGTACTACTACAGCAGCAGCCTTGGTTAC
TACTATGATCCGAACACTGGACTTTACTGCTATGCAGCAACCGGCAAATGGTACAAGTAC
AACGCAGAGACGAAGGAATATGAAGAGGTGGTTGCTGAAGTTGCTCCGGTGGAAGTTTAA
TATCGTTAGTTTGTACTTTTGATATATGTTTCTTTTTTTAGTTTGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BI76TF U 1
AF RS1BI76JQ C 305
BS 1 580 RS1BI76TF
BS 581 950 RS1BI76JQ

RD RS1BI76TF 580 0 0
GCCTGAGGAGCTCCTCAGGAAGATACTGTTGCTCGACGCCGAGCTCGTGATGCTGCTTCG
GAGCGTGCGCGGCTTCGCAATCAGAATACTGCTTCGCTCTTTGTTGATGACGACGGTGTT
GATGACCCCGAGGAGAGATATGAGAATGATGGGAACCGCACGGAAGATGGTATCCAGATT
GAAGCTTTTAGTCTGGACAGAGAGAAAGAGGAAGGATACTTTGATGGTGATGGGAACTAT
GTTGAGTATGTTAGAGAGAAGGAAGACAAGGATGCATGGCTTGACAGTATTGAAATGAAT
CCGATGTATATTGGACGATCTGCTGCTAACGATACTGAGAAGGAAGAAGATGGTGGGGAC
GAGAAACCAGCGGATGAACTTTCTCGAGAAGATGTTGCAGTCCTAAAGAGGCGTATTGCT
AGCGTCCTTGAACCAGGGGAGACGGTCCTGCGTGCTTTAAGGAGGTTGAAAGGGAACTCT
AATAATCGCAAAGAGAAGATGGATTCTGAGACAAAGGTCATCTTTGACCAGCTTACTGAG
GATGCCAACAAGCTCATCCAGAATGGAGATTACAATGTTT

QA 1 580 1 580
DS 

RD RS1BI76JQ 646 0 0
TGTATATTGGACGATCTGCTGCTAACGATACTGAGAAGGAAGAAGATGGTGGGGACGAGA
AACCAGCGGATGAACTTTCTCGAGAAGATGTTGCAGTCCTAAAGAGGCGTATTGCTAGCG
TCCTTGAACCAGGGGAGACGGTCCTGCGTGCTTTAAGGAGGTTGAAAGGGAACTCTAATA
ATCGCAAAGAGAAGATGGATTCTGAGACAAAGGTCATCTTTGACCAGCTTACTGAGGATG
CCAACAAGCTCATCCAGAATGGAGATTACAATGTTTATAATGAGGATCAAGAAGTTTTTC
AGCGTAAAGTTGATGGATATGAGAGACTGGCTCAAGAAAGAGCAAAAGATTGTGACATGT
TTGGCGATGACGAAGAAGATACAGCTGGAGCCGTGCAACAAGGGGTCACAAATGATGGAT
CTGATTATGTCTTCGACGAGTCTTCAGGGTACTACTACAGCAGCAGCCTTGGTTACTACT
ATGATCCGAACACTGGACTTTACTGCTATGCAGCAACCGGCAAATGGTACAAGTACAACG
CAGAGACGAAGGAATATGAAGAGGTGGTTGCTGAAGTTGCTCCGGTGGAAGTTTAATATC
GTTAGTTTGTACTTTTGATATATGTTTCTTTTTTTAGTTTGAAAAA

QA 1 646 1 646
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5083Contig1 386 2 1 U
GACTCCGAACAAGTTCGACAATATGTATTACCAGAATATCCCCAAGGGTCTCGAGTTGCT
TGAGTCGGATCACGGGCTGTACTCCGACCCGAGGACCCGGCCTTTTGTTGATCTTTACGC
TAGAGATCAAGATCGGTTCTTTAAAGACTTCGCTAAAGCTATGCAAAAGTTGAGTCTTTA
CGGTGTTCAGACTGGTCGGCGGGGTGAGATCCGGCGAAGATGCGATGCCATTAACTGAGT
TTTTATTTATTTTAATGTTATTTTCGGATTATATTTTGGGGAAGAATGTGAGATTTGAGA
GTGTTAATCTTCTTGAGTAATTGCTCATATGTTTTTATATAATGTAAAACACTTATAATC
TATATGGATGATCGTTTTAATTTGCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1GI83JQ C 1
AF RS1GI83TF U 1
BS 1 386 RS1GI83TF

RD RS1GI83JQ 386 0 0
GACTCCGAACAAGTTCGACAATATGTATTACCAGAATATCCCCAAGGGTCTCGAGTTGCT
TGAGTCGGATCACGGGCTGTACTCCGACCCGAGGACCCGGCCTTTTGTTGATCTTTACGC
TAGAGATCAAGATCGGTTCTTTAAAGACTTCGCTAAAGCTATGCAAAAGTTGAGTCTTTA
CGGTGTTCAGACTGGTCGGCGGGGTGAGATCCGGCGAAGATGCGATGCCATTAACTGAGT
TTTTATTTATTTTAATGTTATTTTCGGATTATATTTTGGGGAAGAATGTGAGATTTGAGA
GTGTTAATCTTCTTGAGTAATTGCTCATATGTTTTTATATAATGTAAAACACTTATAATC
TATATGGATGATCGTTTTAATTTGCG

QA 1 386 1 386
DS 

RD RS1GI83TF 386 0 0
GACTCCGAACAAGTTCGACAATATGTATTACCAGAATATCCCCAAGGGTCTCGAGTTGCT
TGAGTCGGATCACGGGCTGTACTCCGACCCGAGGACCCGGCCTTTTGTTGATCTTTACGC
TAGAGATCAAGATCGGTTCTTTAAAGACTTCGCTAAAGCTATGCAAAAGTTGAGTCTTTA
CGGTGTTCAGACTGGTCGGCGGGGTGAGATCCGGCGAAGATGCGATGCCATTAACTGAGT
TTTTATTTATTTTAATGTTATTTTCGGATTATATTTTGGGGAAGAATGTGAGATTTGAGA
GTGTTAATCTTCTTGAGTAATTGCTCATATGTTTTTATATAATGTAAAACACTTATAATC
TATATGGATGATCGTTTTAATTTGCG

QA 1 386 1 386
DS 



AS 1 2

CO CL5084Contig1 438 2 1 U
GGGAGAAAGAGAGAAAAAAAAAGCAAAGAAAAAGAGGAATGATGAAGAAGCAAATGACAA
TAGCGGCGGCTCTTCTGATTCTGATGGCTTTATCCTCCAATTTGGATATGGTTGCTGAGG
CTCAGTTAGGCCCTGGAGACTGCTACGACGGTTGCTCCACCGCTTGCGTCCAGCGCGACT
CGAGAAAGACGGCCCGATGCGATCGCAAGTGCTCCATTCGGTGTGGCCCAGATGCTAAAA
ATGCAAGAGAGACTGGTGCTTGAACTTTTATATTTACTAAGACCCATTTTAGATTTAATT
ATGTTGTAATCTTCGTTTAATAATTTTATCTATGCAAAACAAATTATGTATTGTTTATGT
TGCTGTTAGCTACTAGTACCATAATGATAATGTAATAAACTTTGAAATCTAATGAAAACG
GGACCAGCCGGTCTATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CK96TF U 57
AF RS1FK26TF U 1
BS 1 438 RS1FK26TF

RD RS1CK96TF 281 0 0
GG
AATAGCGGCGGCTCTTCTGATTCTGATGGCTTTATCTTCCAATTTGGATATGGTTGCTGA
GGCTCAGTTAGGCCCTGGAGACTGCTACGACGGTTGCTCCACCGCTTGCGTCCAGCGCGA
CTCGAGAAAGACGGCCCGATGCGATCGCAAGTGCTCCATTCGGTGTGGCCCAGATGCTAA
AAATGCAAGAGAGACTGGTGCTTGAACTTTTATATTTACTAAGACCCATTTTAGATTTAA
TTATGTTGTAATCTTCGTTTAATAATTTTATCTATGCAA

QA 3 281 3 281
DS 

RD RS1FK26TF 438 0 0
GGGAGAAAGAGAGAAAAAAAAAGCAAAGAAAAAGAGGAATGATGAAGAAGCAAATGACAA
TAGCGGCGGCTCTTCTGATTCTGATGGCTTTATCCTCCAATTTGGATATGGTTGCTGAGG
CTCAGTTAGGCCCTGGAGACTGCTACGACGGTTGCTCCACCGCTTGCGTCCAGCGCGACT
CGAGAAAGACGGCCCGATGCGATCGCAAGTGCTCCATTCGGTGTGGCCCAGATGCTAAAA
ATGCAAGAGAGACTGGTGCTTGAACTTTTATATTTACTAAGACCCATTTTAGATTTAATT
ATGTTGTAATCTTCGTTTAATAATTTTATCTATGCAAAACAAATTATGTATTGTTTATGT
TGCTGTTAGCTACTAGTACCATAATGATAATGTAATAAACTTTGAAATCTAATGAAAACG
GGACCAGCCGGTCTATGT

QA 1 438 1 438
DS 



AS 1 2

CO CL5085Contig1 275 2 1 U
GGACAAATCGTCTCTCTCTCTTCTCTATATATATTTCTCTCTCTCTCTCTGTCATCTGTT
TCTCTAATGGCGATGATGGTGGAGAATAACTACGGTTACGGTGGTGGAGGCACCGGAGAA
AGGATACAGTTGATGGTGGAAGGTCAAGGCAAGGCGGTTCCTGCTCCGTTTCTCACGAAA
ACATACCAGCTTGTTGACGATCCCGCGACGGATCATGTTGTTTCTTGGGGAGATGATGAC
ACTACTTTCATCGTTTGGCGTCCACCCGAGTTTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1F321JQ C 1
AF RS1F321TF U 1
BS 1 275 RS1F321TF

RD RS1F321JQ 275 0 0
GGACAAATCGTCTCTCTCTCTTCTCTATATATATTTCTCTCTCTCTCTCTGTCATCTGTT
TCTCTAATGGCGATGATGGTGGAGAATAACTACGGTTACGGTGGTGGAGGCACCGGAGAA
AGGATACAGTTGATGGTGGAAGGTCAAGGCAAGGCGGTTCCTGCTCCGTTTCTCACGAAA
ACATACCAGCTTGTTGACGATCCCGCGACGGATCATGTTGTTTCTTGGGGAGATGATGAC
ACTACTTTCATCGTTTGGCGTCCACCCGAGTTTGC

QA 1 275 1 275
DS 

RD RS1F321TF 275 0 0
GGACAAATCGTCTCTCTCTCTTCTCTATATATATTTCTCTCTCTCTCTCTGTCATCTGTT
TCTCTAATGGCGATGATGGTGGAGAATAACTACGGTTACGGTGGTGGAGGCACCGGAGAA
AGGATACAGTTGATGGTGGAAGGTCAAGGCAAGGCGGTTCCTGCTCCGTTTCTCACGAAA
ACATACCAGCTTGTTGACGATCCCGCGACGGATCATGTTGTTTCTTGGGGAGATGATGAC
ACTACTTTCATCGTTTGGCGTCCACCCGAGTTTGC

QA 1 275 1 275
DS 



AS 1 2

CO CL5086Contig1 387 2 1 U
GGTGAGAAAGCTGATTACAAGGGTACATTTAATGGGACGATTCATATTGTTGCTGGAGGT
GCAGGAGCTGGTCTTGCTGAGTTCTCTGATCTCCAACCGAACTGGAGTCTGGTCAGAGAC
TACGACTATGGATTCCTAAAACTTACAGCGGTTGATTACTCTAATCTTCTGTTCGAGTAC
AAGAAGAGCAGTGACGGAAGAGTCCATGATTCGTTCAAGATATCAAGAGATTATAGAGAC
GTCTTGGCTTGTGCTGTTGATAGTTGCCCTGCAACTACACTTGCTTCTTAAAGAAAAGAA
GAGAGAATCTTGCAACTTGCATGAACAACTCGTTGGTTACACATCAATTATAGTTACTGG
CAAATGCTAATAAAGCAAGAGTCATTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CB29JQ C 1
AF RS1CB29TF U 1
BS 1 387 RS1CB29TF

RD RS1CB29JQ 387 0 0
GGTGAGAAAGCTGATTACAAGGGTACATTTAATGGGACGATTCATATTGTTGCTGGAGGT
GCAGGAGCTGGTCTTGCTGAGTTCTCTGATCTCCAACCGAACTGGAGTCTGGTCAGAGAC
TACGACTATGGATTCCTAAAACTTACAGCGGTTGATTACTCTAATCTTCTGTTCGAGTAC
AAGAAGAGCAGTGACGGAAGAGTCCATGATTCGTTCAAGATATCAAGAGATTATAGAGAC
GTCTTGGCTTGTGCTGTTGATAGTTGCCCTGCAACTACACTTGCTTCTTAAAGAAAAGAA
GAGAGAATCTTGCAACTTGCATGAACAACTCGTTGGTTACACATCAATTATAGTTACTGG
CAAATGCTAATAAAGCAAGAGTCATTT

QA 1 387 1 387
DS 

RD RS1CB29TF 387 0 0
GGTGAGAAAGCTGATTACAAGGGTACATTTAATGGGACGATTCATATTGTTGCTGGAGGT
GCAGGAGCTGGTCTTGCTGAGTTCTCTGATCTCCAACCGAACTGGAGTCTGGTCAGAGAC
TACGACTATGGATTCCTAAAACTTACAGCGGTTGATTACTCTAATCTTCTGTTCGAGTAC
AAGAAGAGCAGTGACGGAAGAGTCCATGATTCGTTCAAGATATCAAGAGATTATAGAGAC
GTCTTGGCTTGTGCTGTTGATAGTTGCCCTGCAACTACACTTGCTTCTTAAAGAAAAGAA
GAGAGAATCTTGCAACTTGCATGAACAACTCGTTGGTTACACATCAATTATAGTTACTGG
CAAATGCTAATAAAGCAAGAGTCATTT

QA 1 387 1 387
DS 



AS 1 2

CO CL5087Contig1 1215 2 2 U
GGGCACTGATCACAACATCGTATTCAATTATTATATCAAAAAACGTTCCAGGCTTTTTCC
CCCTTCAGAGTTCAGACTCGGAATTTCTTCTCCATTGAAGCTGGATTCTAAGGTCAGTTC
ATTCTTCTTTTTTTTTTCAGTCTTCTTTCTCAATCTATCTGATATATCATTTCTGAGATT
TCAGATCCTTCTCTCAAGTGTTTCTGGGTTGGTATATATTTACTAAGAGTTCTTTAAGAT
TTAATTATAATTACTTGAAAATTTGAATCGTCTGCTTACCAATCATCGAGTCACCGCAAA
CTCTTTTGACTCCTTTCCATCTTTTAGTTTATTATTTTCTTAAGTTCCTTCTATTCATTT
GTTATCAAAACAATTCGAATCAATTATAATCCGTAAAATTCAATAGACGTTTGCTTTAGT
ATTTAATTACCATAGACTCATGTAAGTAACTGCTTAGTTATGACCATGTGACGTTGAAAA
ACATTAATTTCGCTCACTAATTTGTACATGTTAAGGGGTCAACCTCATTGCATTTGAAGT
TAATTGTTTTTGTTACTCTATAGAATCCTTTTTCACACGCAAGTCTTGTCTCTGTAAATC
ACTTTCTTGTTCTGGTAATTGTAGAGACATTAGCCTTTCCTTCTTCTTGATGTTGTCAGC
AAAAGTAAAAGTTTTTTTTTTCTTAAAAGAAAAATTCTTCTTCAATGGGTTAATTACACT
TAACTCCCTATTTCATAGAACCTAAAATCCAGAAGAAAAAAGTTTATTCCTTTTTTACAT
CACATGCAAACCTCTCTGTCTGTCTCTCTTTCTCTTTATCTATTATCACTTGCTAGTTCT
GACAATATTGCAGAGGTTTTTAGCTCTCTGTTTTTTTTGCTGTTGTTGTTGTCAACACTC
TGTTTTGTTTAATGTTTTAGATTTAACAGCAAAAGCTGAAAGCTTTGGATAGTGAAGCAG
CTTCAAAAAGAAAATAAAAAACAAAATGGGCTTCAAAGTTTGCATCTTTCTCCTCTTGGG
GTGCCTACTTCTAGCTTCAAAGACAACAATGGCACGAGACATGAAACGTGCATCGATCGT
GATCCAAGGAGCTAGTCGAATCGCTGAGACCGACGAGAACTTTGTCTGTGCGACATTGGA
CTGGTGGCCACATGACAAGTGCAACTATGACAATTGTCCTTGGGGTTACTCTTCAGTTAT
CAACATGGTAATAGC


BQ
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BQ
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TGGTAGCGTTAAGTTCGAGGTATGTGACAAAGACGAGCTTGTTTTGTCTGGAACGCTGGA
GATGTCTGGTAGTAATGGTTTCACAGGGGAGTCTGCTAAGCATAGCGTGAAGCGGTGGGG
AATGAACTGTGAAACTGAGATCACTGCAGGGTCTGGTTTCTTGAAGGAGAAATACATTGG
TTGTTCTGAGTTATCATCTCCGTTGCCAAGTATTGAAGTGTACGTCACTGGTTGCTTCTC
TGGAACACCCATCATTCTAACCAAGACGCTGCAGCTTGGTTTCAGAAAGAAGCACAGTAG
GACGAGTGCGTTAGATTCGATTCCAGAGTATGAAAGCGGTGAATCACAGAAAGGCAGCTC
TTCTGAGCTTGATTTTCAGGTGACAGAATACGGAAGTTATAAACAAGACTATGGAGGAGA
ATACGGAGACATGTATTTGGGAAGAGAGTACGGAGATGGTGAAGATGGGGAAATGTCGT

QA 1 599 1 599
DS 

RD RS1C145JQ 767 0 0
CTGCTAAGCATAGCGTGAAGCGGTGGGGAATGAACTGTGAAACTGAGATCACTGCAGGGT
CTGGTTTCTTGAAGGAGAAATACATTGGTTGTTCTGAGTTATCATCTCCGTTGCCAAGTA
TTGAAGTGTACGTCACTGGTTGCTTCTCTGGAACACCCATCATTCTAACCAAGACGCTGC
AGCTTGGTTTCAGAAAGAAGCACAGTAGGACGAGTGCGTTAGATTCGATTCCAGAGTATG
AAAGCGGTGAATCACAGAAAGGCAGCTCTTCTGAGCTTGATTTTCAGGTGACAGAATACG
GAAGTTATAAACAAGACTATGGAGGAGAATACGGAGACATGTATTTGGGAAGAGAGTACG
GAGATGGTGAAGATGGGGAAATGTCGTGGTTCAATGCGGGTGTGAGGGTTGGTGTGGGAA
TTGGTCTTGGTGTATGTGTAGGTCTGGGCATTGGGGTTGGCCTGCTTGTGCGTACCTATC
AATCAACCACCAGAAACTTCAGAAGAAGGATTATCTAATCTTCACTCAAATCACCACCAT
TAAGCTTATTCACCTTCTCTTTAACTCCCACTCCATTGCAGATCTCTTTTTTGACTGATA
GTCTAATTAAAATACCTAATCATGCTGTGTAGCATCATAATCTTTCTTCTTCGTACGTGT
GTTTTTTATATCTTTGTTGCCTTCAAAATTTTGAAAGGAATCATTGCCTTTATGTTCTTG
TTGTTTGTTGAGATTCAGACTGAAAGAAACAAAGTTTGTTATTGGGC

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL5089Contig1 1191 2 2 U
GTTAGACGAGAGGAAGAGAGAGTGAGATGGTTTGCTGCTGTCTGGTCGTCGAGAAGCATC
CCTCGACAGAGTTTCCATGCTTGGTTGGTTGTACTTAACAGGATCCCCACTAGAGATAGG
TTGATTAGTTGGGGGCTCCAAGTCCCTCCCTTATGCCTCCTCTGTAACATAAAGGATGAA
TCAAGGGACCATTTATACTGGGAGTGTGATTATGCTTGCGACCTTTGGAGGATCGTTGCG
GGAAGATGTCGATTCATACCTGATCGCGATTGGGAGGACTCGCTGGAACAGATGGTCTCC
TTGCCACCGCCGGCTGCTACACGATCTCTGATCCTTCTTGGTTGGCAAGCCACAATGTGC
TGGATTTGGAATGAGCGAAACGCGAGATTGCATGCGAACCAGTTCAGGTCGATCGATGCA
CTCTTCTCTATAATAGATCATCAGGTGAGGAACAAGTTACAGAGCTTCAGAGAGACAAAC
CCCAGGAGGTCTTCGGAGATGATGCAACAATGGGTTAGATGATCATTCTCAATTGATGGT
GGAGTTGCAAAAGCTTAATCGCTCTGGTTGGATTGAGCGAAACTACTGGAGTATCGGAGA
AGATGTTTAGGCACTGTGGGCCACAATTGTATTGGGCTTGGTCGGAAATTACTAGGGCTT
GGGTTATTATGATATGAGTTTATTGGGCTATGGGGCTCTTTCACTAGTGCATTAGTCATT
TGTAAAACTTTTTTTTCTTTCCGCAATTTATATTAAGAAGCCTGTTACAAAAAAAAAAAA
CAATACGTAGAAAAGAATTAACATTCGTGAACAAAACAAAAGCTGCAAACCCAGTACTTA
TGAAACGAATATATTATATGCTCATGTGTACATGACAATTATAGGCGAAAACAAATTTCA
AAAAAAAACTATAGGCCTCCATTATAAGTTAAAATTCGTCAGATCTTTAAGAAATCGACA
CATGAACGATTAACTATTAACTAGATAACAAACATGACTCACTGTAACAGAAAAAGGAGC
CCTGCCATAAATAAAACCACTTTAATGTATTCAACTAGTATGTATTTGGAAGATACTGAA
CCTGATCAACGAAGTGCGCTCTATATTCTCATAGTAGCAACAAAACAAAAGATGTTGAAC
ATTAAATCAAAAATGAAACACATATATAGGTGAAAGAGCTAGAAGAAAGGT


BQ
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AF RS1BD64TF U 1
AF RS1BD64JQ C 561
BS 1 651 RS1BD64TF
BS 652 1191 RS1BD64JQ

RD RS1BD64TF 651 0 0
GTTAGACGAGAGGAAGAGAGAGTGAGATGGTTTGCTGCTGTCTGGTCGTCGAGAAGCATC
CCTCGACAGAGTTTCCATGCTTGGTTGGTTGTACTTAACAGGATCCCCACTAGAGATAGG
TTGATTAGTTGGGGGCTCCAAGTCCCTCCCTTATGCCTCCTCTGTAACATAAAGGATGAA
TCAAGGGACCATTTATACTGGGAGTGTGATTATGCTTGCGACCTTTGGAGGATCGTTGCG
GGAAGATGTCGATTCATACCTGATCGCGATTGGGAGGACTCGCTGGAACAGATGGTCTCC
TTGCCACCGCCGGCTGCTACACGATCTCTGATCCTTCTTGGTTGGCAAGCCACAATGTGC
TGGATTTGGAATGAGCGAAACGCGAGATTGCATGCGAACCAGTTCAGGTCGATCGATGCA
CTCTTCTCTATAATAGATCATCAGGTGAGGAACAAGTTACAGAGCTTCAGAGAGACAAAC
CCCAGGAGGTCTTCGGAGATGATGCAACAATGGGTTAGATGATCATTCTCAATTGATGGT
GGAGTTGCAAAAGCTTAATCGCTCTGGTTGGATTGAGCGAAACTACTGGAGTATCGGAGA
AGATGTTTAGGCACTGTGGGCCACAATTGTATTGGGCTTGGTCGGAAATTA

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1BD64JQ 631 0 0
GCTCTGGTTGGATTGAGCGAAACTACTGGAGTATCGGAGAAGATGTTTAGGCACTGTGGG
CCACAATTGTATTGGGCTTGGTCGGAAATTACTAGGGCTTGGGTTATTATGATATGAGTT
TATTGGGCTATGGGGCTCTTTCACTAGTGCATTAGTCATTTGTAAAACTTTTTTTTCTTT
CCGCAATTTATATTAAGAAGCCTGTTACAAAAAAAAAAAACAATACGTAGAAAAGAATTA
ACATTCGTGAACAAAACAAAAGCTGCAAACCCAGTACTTATGAAACGAATATATTATATG
CTCATGTGTACATGACAATTATAGGCGAAAACAAATTTCAAAAAAAAACTATAGGCCTCC
ATTATAAGTTAAAATTCGTCAGATCTTTAAGAAATCGACACATGAACGATTAACTATTAA
CTAGATAACAAACATGACTCACTGTAACAGAAAAAGGAGCCCTGCCATAAATAAAACCAC
TTTAATGTATTCAACTAGTATGTATTTGGAAGATACTGAACCTGATCAACGAAGTGCGCT
CTATATTCTCATAGTAGCAACAAAACAAAAGATGTTGAACATTAAATCAAAAATGAAACA
CATATATAGGTGAAAGAGCTAGAAGAAAGGT

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 2

CO CL5090Contig1 1178 2 2 U
GGGCCTCCGTCCGACTTCGATGGCGGGTTTCAGTTCTCTAATTTGTACAACGCCTCTGAA
ACGCGCAGTTGCTAGAGCAACCGGAAACCTAACGGCGCCGTTAGTTACTGTTTCTTCCGC
GCGAAACCTCTTCACCGGAGGATGTAATGGTGAGCAAGGAATGTTTCCTCATTTCAGTGG
AGTAAGTAATCATATTCTTACAAGTCCATTTCATCATATTCTTCTTGGGGTCAATCAAAC
AAACAAGCCCGTTTTTCTAAGGGTCCAATCGATGAGCTATCAGTTTGTGGCTGATTCCCA
TGCATCTCATACACCTTCTCTGGAAACCGAGGATGAGCAAGATGCTGAGGAGGAAAAAGG
TGAAACCACTAGGAAGCATCAAACTGGGGAGAACATACCCAAGAAGGATAAAATTAAGTT
TCTTGTGAATACTCTTCTTGATATTGAAGATAACAAAGAGGCTGTCTACGGAGCTCTGGA
TGCTTGGGTTGCTTGGGAACGCAATTTCCCTATTGCTTCCCTCAAAAGAGTAATAGCTAT
TCTTGAAAAGGAACATCAATGGCATCGAATGGTTCAGGTAATAAAGTGGATTCTAAGTAA
GGGACAAGGTAACGCGATGGGGACATATGGACAGTTGATACGGGGGTTGGATATGGATCG
TAGAGTAGAAGAGGCGCATGCAATCTGGCGTAAGAAAATGGGGAATGATCTGCACTCCGT
GCCTTGGCAATTATGCTTACAAATGATTCGCATATATTTCCGGAACAACATGTTACAAGA
ACTTGTGAAGCTGTTTAAGGATCTAGAGAGTTATGGACGTAAGCCTACGGATAAAAAGAT
TGTGCAGTCAGTGGCGGACGCTTACGAGCTTTTAGGAATGCTCGAGGAGAAAGAAAGAGT
ATTGACTAAATATAGCAATCTGTTTCTCGGTACAGCATCGGATGATAAATCAAGAAGATC
TTCAAGGAAGAAGAAGAAACCAGGAGTGATGAATACTGAAGCAACCACAGAGGACGCAGC
AGAAGATGCGTTACAAATAGGGATCGAAGAAAATGTGGAGAATCACCAAGAATCAGAAGC
TACCACTGAGAAATGATCCAAACATGGAGCAAAAGTTGTGTACGCACTAGTATACTATAG
TAATATTGTATCGACTGAACTAGAACATATTTTTGCCT


BQ
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BS 1 726 RS1BL02TF
BS 727 1178 RS1BL02JQ

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ACGCGCAGTTGCTAGAGCAACCGGAAACCTAACGGCGCCGTTAGTTACTGTTTCTTCCGC
GCGAAACCTCTTCACCGGAGGATGTAATGGTGAGCAAGGAATGTTTCCTCATTTCAGTGG
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AAACAAGCCCGTTTTTCTAAGGGTCCAATCGATGAGCTATCAGTTTGTGGCTGATTCCCA
TGCATCTCATACACCTTCTCTGGAAACCGAGGATGAGCAAGATGCTGAGGAGGAAAAAGG
TGAAACCACTAGGAAGCATCAAACTGGGGAGAACATACCCAAGAAGGATAAAATTAAGTT
TCTTGTGAATACTCTTCTTGATATTGAAGATAACAAAGAGGCTGTCTACGGAGCTCTGGA
TGCTTGGGTTGCTTGGGAACGCAATTTCCCTATTGCTTCCCTCAAAAGAGTAATAGCTAT
TCTTGAAAAGGAACATCAATGGCATCGAATGGTTCAGGTAATAAAGTGGATTCTAAGTAA
GGGACAAGGTAACGCGATGGGGACATATGGACAGTTGATACGGGGGTTGGATATGGATCG
TAGAGTAGAAGAGGCGCATGCAATCTGGCGTAAGAAAATGGGGAATGATCTGCACTCCGT
GCCTTG

QA 1 726 1 726
DS 

RD RS1BL02JQ 728 0 0
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TATTGCTTCCCTCAAAAGAGTAATAGCTATTCTTGAAAAGGAACATCAATGGCATCGAAT
GGTTCAGGTAATAAAGTGGATTCTAAGTAAGGGACAAGGTAACGCGATGGGGACATATGG
ACAGTTGATACGGGGGTTGGATATGGATCGTAGAGTAGAAGAGGCGCATGCAATCTGGCG
TAAGAAAATGGGGAATGATCTGCACTCCGTGCCTTGGCAATTATGCTTACAAATGATTCG
CATATATTTCCGGAACAACATGTTACAAGAACTTGTGAAGCTGTTTAAGGATCTAGAGAG
TTATGGACGTAAGCCTACGGATAAAAAGATTGTGCAGTCAGTGGCGGACGCTTACGAGCT
TTTAGGAATGCTCGAGGAGAAAGAAAGAGTATTGACTAAATATAGCAATCTGTTTCTCGG
TACAGCATCGGATGATAAATCAAGAAGATCTTCAAGGAAGAAGAAGAAACCAGGAGTGAT
GAATACTGAAGCAACCACAGAGGACGCAGCAGAAGATGCGTTACAAATAGGGATCGAAGA
AAATGTGGAGAATCACCAAGAATCAGAAGCTACCACTGAGAAATGATCCAAACATGGAGC
AAAAGTTGTGTACGCACTAGTATACTATAGTAATATTGTATCGACTGAACTAGAACATAT
TTTTGCCT

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

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TCCCACCAATGCGGCTCGTGTACAGCTTCCTGATGGTAGATACTTAGCTTACCAAGAGCT
TGGTGTTCCAGCAGAAAGAGCGAGATACTCTTTACTTACTCCTCATTCTTTTCTCTCCTC
TCGACTTGCAGGCATACCTGGACTGAAGAAGTCACTGCTTGTGGAGTATGGTGTCCGTTT
AGTTTCGTATGATCTTCCAGGTTTTGGAGAGAGTGATCCTCACCGAGGTCGAAACCTTAG
CTCATCTGCCTCGGATTTGATTAACCTTGCGGCTGCCATCGGAATTGATGAGAAGTTCTG
GTTACTCGGTTACTCTACTGGTAGTATGCATACCTGGGCTGCTATGAAATACTTCCCTGA
CAAAATTGCAGGAGCTGCAATGGTGGCTCCGGTGATCAATCCTTATGAGCCAAGCATGGC
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TTTAGCTCGCCGGTTTCCAGCTCTTCTCCCTTTCTTCTACCGTAGATCTTTTCTCTCTGG
TAAACTTGATCATCTCGATCAGTGGATGTCACTATCAGTAGGAGAAAAGGATAAGCTTCT
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AGGAATCACAAAGCCATTTGTAGAAGAATCAGTGCTTCAAGTATCGAGTTGGGGCTTTAC
TCTTTCCGAGTTCCGCACACAGAAGAAATGCACAACTAATGGTGTCCTCTCTTGGCTCAT
GTCAATGTACAGTGAAGCTGAATGTGAACTAGTCGGGTTTCGAAAACCCATTCACATATG
GTAGGGAATGGAAGATCGGGTTGCTCCACCATCTATGAGTGACTACATTGGCAGGATGAT
TCCGGAAGCTACTGTACATAAGATTCCAAATGAAGGTCACTTCTCGTTCTTCTATTTCTG
TGATGAGTGCCACAGACAGATATTTTATGCTTTGTTTGGAGAACCAAAGGGACAGCTCGA
GAGAGTAAGAGAAACAAAGGAGACTCTAGTCGAAACAGAGACAGATAAGGACAGTACTAA
TGCTGCTACCACAACCACCAAAGAGTAAAGAAAAGTAAAGAGGTGGATAACTATAGAAAA
ATGATAGCTACATATTTTTTTTTTGGTTTCGGATTCTATAGGGGTTTTTACACCAAAACA
GAATTTTTATTTTGGATCACATTTTACATTCTAAAAGTAGTGGTGAATGAGAATCTGTCG
ATGGTTTTCTTATTCTGATATTACAGTTCAATTTCTTATTGCACCTCTGCTAATAGTCAT
ACATTAACT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EP85TF U 1
AF RS1EP85JQ C 601
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TCGACTTGCAGGCATACCTGGACTGAAGAAGTCACTGCTTGTGGAGTATGGTGTCCGTTT
AGTTTCGTATGATCTTCCAGGTTTTGGAGAGAGTGATCCTCACCGAGGTCGAAACCTTAG
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CAAAATTGCAGGAGCTGCAATGGTGGCTCCGGTGATCAATCCTTATGAGCCAAGCATGGC
CAAGGAAGAGATGGTGAAAACATGGGAGCAATGGTTAACAAAGAGGAAATTCATGTACTT
TTTAGCTCGCCGGTTTCCAGCTCTTCTCCCTTTCTTCTACCGTAGATCTTTTCTCTCTGG
TAAACTTGATCATCTCGATCAGTGGATGTCACTATCAGTAGGAGAAAAGGATAAGCTTCT
ACTCAAAGACCCAACTTTCCAAGAATTT
ATC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RS1EP85JQ 789 0 0
TAAACTTGATCATCTCGATCAGTGGATGTCACTATCAGTAGGAGAAAAGGATAAGCTTCT
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AGGAATCACAAAGCCATTTGTAGAAGAATCAGTGCTTCAAGTATCGAGTTGGGGCTTTAC
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ATGGTTTTCTTATTCTGATATTACAGTTCAATTTCTTATTGCACCTCTGCTAATAGTCAT
ACATTAACT

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 2

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TCCTCCTCAGGCTTCCGTCTCTACGAGCGCCGTAACTCGATGAAGAATCTCAAAATCAAC
CCGCTAAACCCGGTTTTCAACCCGGTTTTCTCGCCCCGGAAACCCGAGATCCTCTCTCCA
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TTTAATCGATCCGGGGTCATCGAGTCAAAGCCCCGACGATGCTGAGGAGAAAGCGATGAA
AGAGAAAGGCTTTTATTTACATCCGTCTCCGGCGACAACTCCGATGGATTCAGAGCCTCG
TCTTCTTCCTCTGTTTCCCGGTTACTTCTCCTCGAGTCTCAGGTTCTTCCACAGATTCTA
GTTCTTGAATGAAACCAAACTCTAATTTTTTTTTAAATATCATTTCCTTTGTGATTTTTA
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GATTATTGTAATGCTGAGATGATATGTTTGCCAAAAGCCAACTGATATTTGAAATTGTAC
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AATAGTAACAATCTGTTGCCC


BQ
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AF RS1AC79TF U 1
AF RS1AC79JQ C 523
BS 1 762 RS1AC79TF
BS 763 763 RS1AC79JQ
BS 764 811 RS1AC79TF
BS 812 1341 RS1AC79JQ

RD RS1AC79TF 811 0 0
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TCCTCCTCAGGCTTCCGTCTCTACGAGCGCCGTAACTCGATGAAGAATCTCAAAATCAAC
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TCTTCTTCCTCTGTTTCCCGGTTACTTCTCCTCGAGTCTCAG*TTCTTCCACAGATTCTA
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QA 1 811 1 811
DS 

RD RS1AC79JQ 819 0 0
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GTTCTTCCACAGATTCTAGTTCTTGAATGAAACCAAACTCTAATTTTTTTTTAAATATCA
TTTCCTTTGTGATTTTTATTTATATATTATAAATGGGAATTTGAGATGAATCCTGATGAG
AATTTGTTATATATGAGAGATTATTGTAATGCTGAGATGATATGTTTGCCAAAAGCCAAC
TGATATTTGAAATTGTACTAATCTCTAAGGTGTTTATTGGTTTCGTTGCTCATATTTGAC
TTAAAATCATTTTTGTTGAGTTTATTCTCCATAACAACAACTTTACAGTTTCTGAAAAAT
ACTAACAATTAAGAGATATGAATGAGTAGAATATGAAAACTGGACTAGTTGTGGAATTTG
TTTCTGATCAAAATATTCTAGTGAAATTTTATTATCTTTTACTGTCAATTATGAAGTTTT
ACTGTCAGAAAATTGTATTTTTAGGATACACAACTTGTTGCATTCTCCCAAATCTTTTAG
TACAAATTAACATGAGATTAGTCTCTGATAGAGAAACAAATTTGTCCAACTTTCTTTTGC
TAAAGGATCTGGTGATGAAATAGTAACAATCTGTTGCCC

QA 1 819 1 819
DS 



AS 1 2

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TGTTCACATGATCGTCTCTATCAACTGCAAAGACAATACCGATCTCGTAACAAACCAAGC
TGCTCTGTTCGTGTTCGGAGATTCTCTGTTCGATGCTGGAAACAACAACTACATCGATAC
TTTCTCTAGATTCAAGTCTAATATCTGGCCGTACGGTCAAACAACATTCAAATCGCCCAC
TGGAAGAATCTCCGATGGACGTTTGATCCCTGATTTTATCGCTGAGTATGCATGGTTACC
GTTAATCCCGCCAAATCTACAACCAAGTAACGGTAATAATCAATTTACTTTTGGGGTAAA
TTTTGCTTCAGGTGGTGCCGGAGCTTTGGTTGAAACCTTCCCTGGAATGGTGATAAGTTT
GGGAGCACAATTAAATAATTTCAAGAACGTTGCAAATAGTTTGCGGTCTGAGTTAGGAGA
CTCAGAGGCCAAAAGGATTATCTCAAGAGCTGTTTATATATTTCATATTGGAGGCAACGA
CTATGTTTACCCCATTTTATTTGCAAATTCTTCCACTTTCCAATCCAGTTCCAAGGAGAA
ATTCAGCGATTTTGTTTTCGGTAACATAACCGCTGTAATCGAGGAAGTGTATAAAGTTGG
AGGAAGAAAGTTTGGATTCTTGAATATAGGAGCATATGATTGTGCACCAGCCTCGTTGAT
CATAGACCAAACAAATATAGGATCTTGTTTCAAGCCAATCACTGATCTGATCAATCTGCA
CAATAAGAAGCTACCTAATGTGTTAAAGCTTCTCGAGCGTGACCTGTCTGGATTCAAATA
CGCCCTTCACGATTACCACACTTCTCTATCCGAAAGAATCAACAACCCTTTGAAATACGG
GTTTAAAGAAGGGAAGAAGGCATGTTGTGGTACTGGACCGTTGAGGGGGATAAATACTTG
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GTAGAGTACATCCATGTATAGATAAGTATGAAATAAGAGACGGGGTCTTTATCTC


BQ
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AF RS1EX33TF U 1
AF RS1EX33JQ C 448
BS 1 689 RS1EX33TF
BS 690 690 RS1EX33JQ
BS 691 727 RS1EX33TF
BS 728 1195 RS1EX33JQ

RD RS1EX33TF 733 0 0
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TGTTCACATGATCGTCTCTATCAACTGCAAAGACAATACCGATCTCGTAACAAACCAAGC
TGCTCTGTTCGTGTTCGGAGATTCTCTGTTCGATGCTGGAAACAACAACTACATCGATAC
TTTCTCTAGATTCAAGTCTAATATCTGGCCGTACGGTCAAACAACATTCAAATCGCCCAC
TGGAAGAATCTCCGATGGACGTTTGATCCCTGATTTTATCGCTGAGTATGCATGGTTACC
GTTAATCCCGCCAAATCTACAACCAAGTAACGGTAATAATCAATTTACTTTTGGGGTAAA
TTTTGCTTCAGGTGGTGCCGGAGCTTTGGTTGAAACCTTCCCTGGAATGGTGATAAGTTT
GGGAGCACAATTAAATAATTTCAAGAACGTTGCAAATAGTTTGCGGTCTGAGTTAGGAGA
CTCAGAGGCCAAAAGGATTATCTCAAGAGCTGTTTATATATTTCATATTGGAGGCAACGA
CTATGTTTACCCCATTTTATTTGCAAATTCTTCCACTTTCCAATCCAGTTCCAAGGAGAA
ATTCAGCGATTTTGTTTTCGGTAACATAACCGCTGTAATCGAGGAAGTGTATAAAGTTGG
AGGAAGAAAGTTTGGATTCTTGAATATAG*AGCATATGATTGTGCACCAGCCTCGTTGAT
CATAGAC
AAAAAA

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1EX33JQ 748 0 0
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AGCTGTTTATATATTTCATATTGGAGGCAACGACTATGTTTACCCCATTTTATTTGCAAA
TTCTTCCACTTTCCAATCCAGTTCCAAGGAGAAATTCAGCGATTTTGTTTTCGGTAACAT
AACCGCTGTAATCGAGGAAGTGTATAAAGTTGGAGGAAGAAAGTTTGGATTCTTGAATAT
AGGAGCATATGATTGTGCACCAGCCTCGTTGATCATAGACCAAACAAATATAGGATCTTG
TTTCAAGCCAATCACTGATCTGATCAATCTGCACAATAAGAAGCTACCTAATGTGTTAAA
GCTTCTCGAGCGTGACCTGTCTGGATTCAAATACGCCCTTCACGATTACCACACTTCTCT
ATCCGAAAGAATCAACAACCCTTTGAAATACGGGTTTAAAGAAGGGAAGAAGGCATGTTG
TGGTACTGGACCGTTGAGGGGGATAAATACTTGTGGAGGCAGAGTTTTGGGACAATCACA
AGGTTATGAATTATGCGAGAACGTTAGGGATTACTTATTTTTCGACTCATTTCATTTGAC
GGAGAAGGCTCATCGACAGATTGCAGAGCTTACTTGGAGTGGACCGTCTAATGTTACTGG
ACCTTATAATCTCAAAACATTGTTTGAGTTGAAGTAGAGTACATCCATGTATAGATAAGT
ATGAAATAAGAGACGGGGTCTTTATCTC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CAATGATTTACATGGACATCTACTCTATCTTCAGTAAAATACTAGAAAGCCCTGCGCACT
ATGGATTTGAGGAGGTAAAGAAACCGTGCTGCAAAATCGGATTAACGGGAGGAGGTGTAT
TCTGCAAAAAGAAGACATCAAAAATATGTCCCAATACATCGTCTTATTTGTTTTGGGATG
GTGCCCACCCTACTGAGAGAGCTTATGAAACATTAAACAAAAAACTTGTTAAAAAAATAC
CTCCGTTATATCTGATTAATAACTGTCTTTATTACATTATTAATCTCACCAAAAGGACAA
CTTTTGCAACGTATTAATAATGTAGGCATGAGCGGTTTCTGCGACTAATAATCCAAACAC
CATTTGAGAATTGAGATAGTCATGTAAGCCTTTTGTTTTTTTATCAAACGATTTCCTAAG
CGAGCCAGTCATTTTTACCTAAGATTTACACTAGATTATATAAAAAATATATACACTAGA
TTTTTATAGGAGTTATTTGTGTAATAGCCATATTTAAAAGATAAATTAGGTACGTAACAT
TGATTTTGACATAATTAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BO79TF U 1
AF RS1GQ75TF U 101
BS 1 296 RS1BO79TF
BS 297 297 RS1GQ75TF
BS 298 461 RS1BO79TF
BS 462 462 RS1GQ75TF
BS 463 486 RS1BO79TF
BS 487 620 RS1GQ75TF

RD RS1BO79TF 486 0 0
TTTTTAATTCCAAGCTCGCTATAATTTTGGGTCAGTTGTCGGAAACCCTACGAAATTCGA
CAATGATTTACATGGACATCTACTCTATCTTCAGTAAAATACTAGAAAGCCCTGCGCACT
ATGGATTTGAGGAGGTAAAGAAACCGTGCTGCAAAATCGGATTAACGGGAGGAGGTGTAT
TCTGCAAAAAGAAGACATCAAAAATATGTCCCAATACATCGTCTTATTTGTTTTGGGATG
GTGCCCACCCTACTGAGAGAGCTTATGAAACATTAAACAAAAAACTTGTTAAAAAA*TAC
CTCCGTTATATCTGATTAATAACTGTCTTTATTACATTATTAATCTCACCAAAAGGACAA
CTTTTGCAACGTATTAATAATGTAGGCATGAGCGGTTTCTGCGACTAATAATCCAAACAC
CATTTGAGAATTGAGATAGTCATGTAAGCCTTTTGTTTTTT*ATCAAACGATTTCCTAAG
CGAGCC

QA 1 486 1 486
DS 

RD RS1GQ75TF 520 0 0
G
CTAGAAAGCCCTGCGCACTATGGATTTGAGGAGGTAAAGAAACCGTGCTGCAAAATCGGA
TTAACGGGAGGAGGTGTATTCTGCAAAAAGAAGACATCAAAAATATGTCCCAATACATCG
TCTTATTTGTTTTGGGATGGTGCCCACCCTACTGAGAGAGCTTATGAAACATTAAACAAA
AAACTTGTTAAAAAAATACCTCCGTTATATCTGATTAATAACTGTCTTTATTACATTATT
AATCTCACCAAAAGGACAACTTTTGCAACGTATTAATAATGTAGGCATGAGCGGTTTCTG
CGACTAATAATCCAAACACCATTTGAGAATTGAGATAGTCATGTAAGCCTTTTGTTTTTT
TATCAAACGATTTCCTAAGCGAGCCAGTCATTTTTACCTAAGATTTACACTAGATTATAT
AAAAAATATATACACTAGATTTTTATAGGAGTTATTTGTGTAATAGCCATATTTAAAAGA
TAAATTAGGTACGTAACATTGATTTTGACATAATTAAAT

QA 2 520 2 520
DS 



AS 1 2

CO CL5096Contig1 1158 2 2 U
GGGCATCTCGAGAGCCCGTGGCGATTAAGGTTTCGAGATTGCTCTTTCATCTTCTTCTTC
ATCTTCTTCTTCATGATACAAAATAATACCAGTTACAGAATAATCAACTAACAACCCTCC
ATTACCCCATCACCCCGATCTCTAATCAATGTGAGTCCCGATCTTCGAAGATGGTGGAGA
TTCGAATATAGAAAAGTGTCAGAAGAAAGAACAAGCGCTCTTCGACGGTGTGTTTTCAGT
AGTAATCGCTGAGCTCATATCTATAAAAGTATTATAAGTGACCCTTCACAAGGAAAAGCC
TGTGTCATGGCTACCACACTTCCATAATCGTATAGTGATGTTTCTGGGACGTTGAGTATG
TTTGACTCACATGCTGTATCATTCCATAGCCACCTGGACGGATAGCATAAATCCCAAATA
GTAGGAGGCGTCTGTTCCTGAATGCCACATCTAGGAGACAACTTTATTTCGACAAGGAGA
CTAATGCAGAGGAAAACTATTTTTACAAGCTGGTCTCTTAAGACACTGGGAACACATCAT
CAGCTTCACTGCTGAGGGGCTATTCCAAGGTTGAGCCTGTGACCATAGGCTGAACTAAAC
GAGTTATTCCTCACTCCCAGCCCCAGGTTGTACAATGATCTTTAGTATGATTGTATTTTG
AATTTTAAAAACTCTGTATGTGATTCTGTTAATGGAAAATGTAGAGGTTGAATTTGTTTG
CACCAAGAAGGTCATTGGATTTAATATGGACAAAGGCTGGTGCTATGTCTCTTGCTTCAT
ATGTACAATGAAGCTTCAGTGGACGGTTTCATTTTTTACTTGGCAACCTGCAGTAACACC
AATGCAGTTGGTGTCCTTTGGCAACCACCACAATCAAGAGCACCATAAGAGAAATCTTAC
GCCAAATTGCGGACAATTCACCGGTACTTGGAAACCAACAGCTTTTCAGCTTACTACGAA
ACAAGATGTTGGACTCTTTTAAATTACCCTCCTACATGATACACCACCAACAACTTTTAA
AGCTCAGGCACACAAGTTTTGGCTTTTCTGTTTTACAAGGAAAGAATCATGAGTGAAAGG
TTTTTTTTTTTTGGTTTGCAGTTTGTAATTATTGTAAGAAAGAAGGACATTTGATAATAT
TGGCATCGTTTCGCCGCT


BQ
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AF RS1F750TF U 1
AF RS1F750JQ C 363
BS 1 661 RS1F750TF
BS 662 1158 RS1F750JQ

RD RS1F750TF 665 0 0
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ATCTTCTTCTTCATGATACAAAATAATACCAGTTACAGAATAATCAACTAACAACCCTCC
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AGTAATCGCTGAGCTCATATCTATAAAAGTATTATAAGTGACCCTTCACAAGGAAAAGCC
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TTTGACTCACATGCTGTATCATTCCATAGCCACCTGGACGGATAGCATAAATCCCAAATA
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CAGCTTCACTGCTGAGGGGCTATTCCAAGGTTGAGCCTGTGACCATAGGCTGAACTAAAC
GAGTTATTCCTCACTCCCAGCCCCAGGTTGTACAATGATCTTTAGTATGATTGTATTTTG
A
TTTT

QA 1 661 1 661
DS 

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AGGAGGCGTCTGTTCCTGAATGCCACATCTAGGAGACAACTTTATTTCGACAAGGAGACT
AATGCAGAGGAAAACTATTTTTACAAGCTGGTCTCTTAAGACACTGGGAACACATCATCA
GCTTCACTGCTGAGGGGCTATTCCAAGGTTGAGCCTGTGACCATAGGCTGAACTAAACGA
GTTATTCCTCACTCCCAGCCCCAGGTTGTACAATGATCTTTAGTATGATTGTATTTTGAA
TTTTAAAAACTCTGTATGTGATTCTGTTAATGGAAAATGTAGAGGTTGAATTTGTTTGCA
CCAAGAAGGTCATTGGATTTAATATGGACAAAGGCTGGTGCTATGTCTCTTGCTTCATAT
GTACAATGAAGCTTCAGTGGACGGTTTCATTTTTTACTTGGCAACCTGCAGTAACACCAA
TGCAGTTGGTGTCCTTTGGCAACCACCACAATCAAGAGCACCATAAGAGAAATCTTACGC
CAAATTGCGGACAATTCACCGGTACTTGGAAACCAACAGCTTTTCAGCTTACTACGAAAC
AAGATGTTGGACTCTTTTAAATTACCCTCCTACATGATACACCACCAACAACTTTTAAAG
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TTTTTTTTTTGGTTTGCAGTTTGTAATTATTGTAAGAAAGAAGGACATTTGATAATATTG
GCATCGTTTCGCCGCT

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 2

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TGATACAGTAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GH22TF U 1
AF RS1EF14TF U 336
BS 1 383 RS1GH22TF
BS 384 384 RS1EF14TF
BS 385 717 RS1GH22TF
BS 718 731 RS1EF14TF

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TCGTACAAGTCCTTTTGCTATTACTGGTTTCTCACACATAAGTGTTGGAGAAACGGCAAC
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ATGCATTGACACAGCAATTGCAGGGTTTCGTAAGAGATGTCCAAGTAACAAAGGAGGAAT
AATATGGTACGATCAATGTCTTCTCTATATTAATACGATCAAAGAAAAAGTTCCAATCAA
GATTAATTACAAGAATATTATTTCTATGCACAGTCCAATAACAGTGGAGGCACGCACATG
TGAGTCACAGAGCCATAGGTTCATGGGTCCATGTGTGAGCGAAAACAACTGTGCAAACGT
GTGCCACAACGAAGGTTTTGGCGGAGGCAAATGCCGTGGACTTCGTCGTCGGTGCTTCTG
CACCAGAAATTGCTGATTCATTGAATCTTATAACTCATCAAAATCATCGATCAATCGTCT
TGTGTTTGCTTCTTTCTACATCTTCCGTACAGTACCATGTCGTATCGTACGCGTGTGCAT
CTCTAGTGTGTTCTCGAATAAGTCTTTGGTTTGTGTGTTATGAGCTTTTATGTAATATTA
TTTCTAATGAATGAATGATAACTGCAGACTTGATAATATAAACATTATGAAATTAAA
TGTGATA

QA 1 717 1 717
DS 

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G
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GAGCGAAAACAACTGTGCAAACGTGTGCCACAACGAAGGTTTTGGCGGAGGCAAATGCCG
TGGACTTCGTCGTCGGTGCTTCTGCACCAGAAATTGCTGATTCATTGAATCTTATAACTC
ATCGAAATCATCGATCAATCGTCTTGTGTTTGCTTCTTTCTACATCTTCCGTACAGTACC
ATGTCGTATCGTACGCGTGTGCATCTCTAGTGTGTTCTCGAATAAGTCTTTGGTTTGTGT
GTTATGAGCTTTTATGTAATATTATTTCTAATGAATGAATGATAACTGCAGACTTGATAA
TATAAACATTATGAAATTAAAATGTGATACAGTAT

QA 2 396 2 396
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TGTATACCTCACCGGTGGTTTTAAAAAACCTCGCGAATTAACTTGGGTTACTGGCGTGGT
TCTGGGTGTATTGACCGCATCTTTTGGTGTAACAGGTTATTCTTTACCTTGGGATCAAAT
TGGCTATTGGGCAGTCAAAATTGTAACAGGTGTACCTGACGCTATTCCGGTAATAGGATC
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AGGCTACATTGACACACAAGTTGCTACCGCTGGATCTTCATTTAACAAAGATTTCTCCGA
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AGTATTGTCCCATTAATGTTTTTTTCCTTTCTCCAAGTCTGTTTTTTCAGACAGTCCTTT
GTATGATGTTTTGGAGTCTCATGTTTCTTTAATTATCATCTCCTTTATAAGATGC


BQ
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AF RS1BL58TF U 1
AF RS1BL58JQ C 213
BS 1 598 RS1BL58TF
BS 599 895 RS1BL58JQ

RD RS1BL58TF 598 0 0
TTTTTTAGTACAAGTAGCTACGGGATTTGCTATGACTTTTTATTGCCGTCCAACTGTTAC
TGAGGCTTTTGCTTCCGTTCAATATATAATGACTGAAGCTGACTTTGGTTGGTTAATCCG
ATCAGTTCATCGATGGTCGGCAAGTATGATGGTCCTAATGATGATCCTGCACGTATTTCG
TGTATACCTCACCGGTGGTTTTAAAAAACCTCGCGAATTAACTTGGGTTACTGGCGTGGT
TCTGGGTGTATTGACCGCATCTTTTGGTGTAACAGGTTATTCTTTACCTTGGGATCAAAT
TGGCTATTGGGCAGTCAAAATTGTAACAGGTGTACCTGACGCTATTCCGGTAATAGGATC
GCCTCTTGTAGAATTATTACGCGGAAGTGCTAGTGTTGGACAATCCACTTTGACCCATCC
ATGAACCCTAGCTACGTTAGGGCATTGAAGAAAAGGTGCAAGCCAACTGATTTCACGACA
TCAGTGGAGATGGACCCAGGAAGTGTCAAGAAGTTTGACTCTCACTACTTCAACATTGTG
GCTCAGAAGAAAGGGTTTGTTTACATCTGACTCAACACTTCTCGAAGACCCTGAGACC

QA 1 598 1 598
DS 

RD RS1BL58JQ 683 0 0
GCGAATTAACTTGGGTTACTGGCGTGGTTCTGGGTGTATTGACCGCATCTTTTGGTGTAA
CAGGTTATTCTTTACCTTGGGATCAAATTGGCTATTGGGCAGTCAAAATTGTAACAGGTG
TACCTGACGCTATTCCGGTAATAGGATCGCCTCTTGTAGAATTATTACGCGGAAGTGCTA
GTGTTGGACAATCCACTTTGACCCATCCATGAACCCTAGCTACGTTAGGGCATTGAAGAA
AAGGTGCAAGCCAACTGATTTCAGGACATCAGTGGAGATGGACCCAGGAAGTGTCAAGAA
GTTTGACTCTCACTACTTCAACATTGTGGCTCAGAAGAA*GGGTTTGTTTACATCTGACT
CAACACTTCTCGAAGACCCTGAGACCAAAGGCTACATTGACACACAAGTTGCTACCGCTG
GATCTTCATTTAACAAAGATTTCTCCGAGTCGATGGTTAAACTCGGTTCTGTAGAAGTTC
TCACCGGGAACAAGGGCGAGATCAGGAGGAAATGTGCCTTCGTAAACTGAGTTCCATAAA
AGTTCTCTCTCTTTTTGATTGTTGATTCAGTATTGTCCCATTAATGTTTTTTTCCTTTCT
CCAAGTCTGTTTTTTCAGACAGTCCTTTGTATGATGTTTTGGAGTCTCATGTTTCTTTAA
TTATCATCTCCTTTATAAGATGC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

CO CL5100Contig1 1053 2 2 U
GCACAGGTGGGTAGGTAGAGAATACCTAGGGGCGCGAGACAACTCTCTCTAAGGAACTCG
GCAAAATAGCCCCGTAACTTCGGGAGAAGGGGTGCCTCCCTCGACCGCCGCCGCCGCTGA
GGATGACGATCCTAGCCGTCCCTCTATCGTTCTCATCAACAACTTCAACCTACTCTACCA
CAATAATGACTACAAAAACCACAACCACCACCCCGCCGTTGACTTACCTTCCTCATCCAC
CGCCACCACCACCACCTTCTCCTCTTCCGCCACGTCATCATACGAATCCGAGAGTCACGA
CATTTCTCCTGAATTGTCCGCCGCTTTCGCTTCCCGTCGCTTCTTCTTCTCTTCTCCTGG
CCGATCAAATGCAATAACCGACTCACCGGAAACACGGTCAAGAGAACTCTCTGATAATAG
CGACACTGCCGCTATCAACACAACAAAGAAAAAGAGCTACGACACTACCGTGAATACCAC
GAGGCTTCTAACCGGAGGTTCCGCCGTGAAACAACACGTATACTCACCGGATCCGTTAAC
TGACTTCCGACAATCAATGCATGAGATGATTGATGCCGCCATTGTCGCCGGCGATCTTAG
CCATCCCGACGACGGTTATGATTACTTGAACGAGCTGCTTCTCAGTTATTTAGCGTTGAA
TCCAACCGACATGCACAAGTTCATCATAAGGGCTTTCTCCGACACCATGGTCTCACTCTT
GTCGGAAGAACGTCGGATGTGATGACGCAGCGGCCGCCTAGATTAAAAAAAATGATCGTG
TAATAAACGACCCACGTGATTTTATTAATTAAGTCGATGGACCTAACATTTTTTTTACAT
TATCGTCTTCAAGGAAGAGAAACCATCTCAGAAAACTACTGACAGATTTATCTTTATTTC
CTTTTTTTGTATTTTGTATGTTTTTGTTAAATAAACCTCAGTTTCGTAACAGAGGTAAAT
TAATGTTTTTGCATGCATTTACGACCGAATGCCAAGTGTAATTATTATGTAACGATATTT
GATTTTCAAGAATTATTGAGGTGGCGGGTGCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EJ42TF U 1
AF RS1EJ42JQ C 339
BS 1 725 RS1EJ42TF
BS 726 1053 RS1EJ42JQ

RD RS1EJ42TF 725 0 0
GCACAGGTGGGTAGGTAGAGAATACCTAGGGGCGCGAGACAACTCTCTCTAAGGAACTCG
GCAAAATAGCCCCGTAACTTCGGGAGAAGGGGTGCCTCCCTCGACCGCCGCCGCCGCTGA
GGATGACGATCCTAGCCGTCCCTCTATCGTTCTCATCAACAACTTCAACCTACTCTACCA
CAATAATGACTACAAAAACCACAACCACCACCCCGCCGTTGACTTACCTTCCTCATCCAC
CGCCACCACCACCACCTTCTCCTCTTCCGCCACGTCATCATACGAATCCGAGAGTCACGA
CATTTCTCCTGAATTGTCCGCCGCTTTCGCTTCCCGTCGCTTCTTCTTCTCTTCTCCTGG
CCGATCAAATGCAATAACCGACTCACCGGAAACACGGTCAAGAGAACTCTCTGATAATAG
CGACACTGCCGCTATCAACACAACAAAGAAAAAGAGCTACGACACTACCGTGAATACCAC
GAGGCTTCTAACCGGAGGTTCCGCCGTGAAACAACACGTATACTCACCGGATCCGTTAAC
TGACTTCCGACAATCAATGCATGAGATGATTGATGCCGCCATTGTCGCCGGCGATCTTAG
CCATCCCGACGACGGTTATGATTACTTGAACGAGCTGCTTCTCAGTTATTTAGCGTTGAA
TCCAACCGACATGCACAAGTTCATCATAAGGGCTTTCTCCGACACCATGGTCTCACTCTT
GTCGG

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1EJ42JQ 715 0 0
GCTTCTTCTTCTCTTCTCCTGGCCGATCAAATGCAATAACCGACTCACCGGAAACACGGT
CAAGAGAACTCTCTGATAATAGCGACACTGCCGCTATCAACACAACAAAGAAAAAGAGCT
ACGACACTACCGTGAATACCACGAGGCTTCTAACCGGAGGTTCCGCCGTGAAACAACACG
TATACTCACCGGATCCGTTAACTGACTTCCGACAATCAATGCATGAGATGATTGATGCCG
CCATTGTCGCCGGCGATTTTAGCCATCCCGACGACGGTTATGATTACTTGAACGAGCTGC
TTTTCAGTTATTTAGCGTTGAATCCAACCGACATGCACAAGTTCATCATAAGGGCTTTTT
CCGACACCATGGTCTCACTCTTGTCGGAAGAACGTCGGATGTGATGACGCAGCGGCCGCC
TAGATTAAAAAAAATGATCGTGTAATAAACGACCCACGTGATTTTATTAATTAAGTCGAT
GGACCTAACATTTTTTTTACATTATCGTCTTCAAGGAAGAGAAACCATCTCAGAAAACTA
CTGACAGATTTATCTTTATTTCCTTTTTTTGTATTTTGTATGTTTTTGTTAAATAAACCT
CAGTTTCGTAACAGAGGTAAATTAATGTTTTTGCATGCATTTACGACCGAATGCCAAGTG
TAATTATTATGTAACGATATTTGATTTTCAAGAATTATTGAGGTGGCGGGTGCAT

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

CO CL5101Contig1 1111 2 2 U
GGGAAACATCTTCTCTCCGTCTCGTCCCGTCCCGTCCCGTCCCGTCTCAGTCACCGACTA
AAACCCTAAACAATGCCGCAGGGAGATTATATAGAATTGCACCAGAAGAGGCATGGACGT
CGCCTCGATTACGAAGAGCGCAAGCGCAAGAAGGAGGCGCGTGCTTTTCACAAGCGCTCC
AAACAGGCTCAGAATTCAATAGGAATAAAGGGTAAGATGATTGCCAAGAAAAACTATGCT
GAGAAAGCTCAAATGAAGAAGACATTAAAAATGCACGAGGAGAGTTCATCAAGGCGTAAA
GCTGATGAGGATGTTCAGGAAGGAGCTGTTCCTGCTTATCTTCTTGATCGTGAGAACACC
ACTCGCTCCAAGGTTCTTAGCAACACCATTAAGCAAAAGAGGAAAGAGAAAGCTGGGAAA
TGGGAGGTCCCTCTTCCCAAGGTCCGTCCCGTGGCTGAAGATGAAATGTTCAGAGTGATC
CGATCTGGGAAGAGGAAAACAAAACAGTGGAAGAGGATGGTTACGAAAGCTACGTTTGTT
GGACCTGGTTTCACAAGGAAGCCACCAAAGTACGAGCGTTTCATCCGCCCTTCTGGACTG
CGTTTCACCAAAGCCCACGTTACTCACCCTGAGCTGAGATGCACTTTCTGTCTTGAGATT
ATTGGAATCAAGAAGAATCCCAACGGTCCAATGTATACTTCACTTGGTGTCATGACTAGA
GGAACTATCATTGAGGTCAATGTGAGTGAGCTTGGTCTTGTTACACCAGCTGGAAAAGTC
GTCTGGGGGAAATACGCTCAAGTGACGAACAATCCAGAGAATGATGGATGTATTAACGCA
GTTTTGCTTGTTTAATCAAAATCTCCAGCAATGTTAGAGAGATCTGAACAGAGTCTTGAA
GAAGGCAATAATCTTGGTGGTTACTTTCTATTTAGTTTTCTGAAAACAGTTTTTTCTAAT
GTTTATCTCAAGTTTGTCTTCTCATCACATTAACCAGCTCTTACAGCTTTCCGAGGACCC
ACAAAATGTTAGATCTGTTACGTGCATGTAATGCAAGAAACATATATGTGTACAAGTAAA
GGTTTTACTTAATAGAAATACAAGTTACATC


BQ
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AF RS1DZ63TF U 1
AF RS1DZ63JQ C 341
BS 1 719 RS1DZ63TF
BS 720 1111 RS1DZ63JQ

RD RS1DZ63TF 719 0 0
GGGAAACATCTTCTCTCCGTCTCGTCCCGTCCCGTCCCGTCCCGTCTCAGTCACCGACTA
AAACCCTAAACAATGCCGCAGGGAGATTATATAGAATTGCACCAGAAGAGGCATGGACGT
CGCCTCGATTACGAAGAGCGCAAGCGCAAGAAGGAGGCGCGTGCTTTTCACAAGCGCTCC
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ACTCGCTCCAAGGTTCTTAGCAACACCATTAAGCAAAAGAGGAAAGAGAAAGCTGGGAAA
TGGGAGGTCCCTCTTCCCAAGGTCCGTCCCGTGGCTGAAGATGAAATGTTCAGAGTGATC
CGATCTGGGAAGAGGAAAACAAAACAGTGGAAGAGGATGGTTACGAAAGCTACGTTTGTT
GGACCTGGTTTCACAAGGAAGCCACCAAAGTACGAGCGTTTCATCCGCCCTTCTGGACTG
CGTTTCACCAAAGCCCACGTTACTCACCCTGAGCTGAGATGCACTTTCTGTCTTGAGATT
ATTGGAATCAAGAAGAATCCCAACGGTCCAATGTATACTTCACTTGGTGTCATGACTAG

QA 1 719 1 719
DS 

RD RS1DZ63JQ 771 0 0
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GGAAAGAGAAAGCTGGGAAATGGGAGGTCCCTCTTCCCAAGGTCCGTCCCGTGGCTGAAG
ATGAAATGTTCAGAGTGATCCGATCTGGGAAGAGGAAAACAAAACAGTGGAAGAGGATGG
TTACGAAAGCTACGTTTGTTGGACCTGGTTTCACAAGGAAGCCACCAAAGTACGAGCGTT
TCATCCGCCCTTCTGGACTGCGTTTCACCAAGGCCCACGTTACTCACCCTGAGCTGAGAT
GCACTTTCTGTCTTGAGATTATTGGAATCAAGAAGAATCCCAACGGTCCAATGTATACTT
CACTTGGTGTCATGACTAGAGGAACTATCATTGAGGTCAATGTGAGTGAGCTTGGTCTTG
TTACACCAGCTGGAAAAGTCGTCTGGGGGAAATACGCTCAAGTGACGAACAATCCAGAGA
ATGATGGATGTATTAACGCAGTTTTGCTTGTTTAATCAAAATCTCCAGCAATGTTAGAGA
GATCTGAACAGAGTCTTGAAGAAGGCAATAATCTTGGTGGTTACTTTCTATTTAGTTTTC
TGAAAACAGTTTTTTCTAATGTTTATCTCAAGTTTGTCTTCTCATCACATTAACCAGCTC
TTACAGCTTTCCGAGGACCCACAAAATGTTAGATCTGTTACGTGCATGTAATGCAAGAAA
CATATATGTGTACAAGTAAAGGTTTTACTTAATAGAAATACAAGTTACATC

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 2

CO CL5102Contig1 728 2 3 U
GGATCCGGACATTGAGATGGCAATCCTTGCTCCGGCGAGTTTCGGGCGGTTAACCGTTCC
GTCTCGTGCGCAAGTTAGGGTAAGAATCTCTGCTTCTGCTAACCCACGCACTTCAGTTGA
CTGGGTCAAGGAAACTTCAAGCTTTTTCGAACAAGACAAGAGACCGATCATGTTGTTCGA
CGGTGTTTGCAATCTCTGTAATGGTGGTGTGAAGTTTGTCCGAGACCATGATCATAACAG
GAGCATAAGGTTTGAAGCATTACAGAGTGAAGCAGGAAAGAAACTGTTGATGCGGTCAGG
ACGTGCTCCTGATGATATATCAAGTGTCGTACTTGTCGAGAAAGATGGGTCTTACATAAA
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CTTTTTGCAGTTTGCGCCTCTGTTTGTGAGGGACTTTCTGTATGAAAATGTTGCAAACAA
CCGTTATGCAATGTTTGGTCGGTCTGATTCATGTGAGATCTAAGAAGACATCATTGACTG
GTGATCTTATTTTGTCAAAAAAAACTAGATATGTCAAAAAAAATATTTCCTACAGTTTAA
TATATGCTTTTGTATATAGATGTATAGTTACAACAGCCTTTGAACGACCCATAAGTATGT
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TTCCAGTT


BQ
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AF RS1CK61TF U 143
AF RS1CK61JQ C 1
BS 1 142 RS1CK61JQ
BS 143 517 RS1CK61TF
BS 518 728 RS1CK61JQ

RD RS1CK61TF 375 0 0
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GGTGGTGTGAAGTTTGTCCGAGACCATGATCATAACAGGAGCATAAGGTTTGAAGCATTA
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AGTGTCGTACTTGTCGAGAAAGATGGGTCTTACATAAAATCAGAAGCGGTTTTGAAGATT
ATGAAATACATTGACTTGCCATTTCCACGGCTTGCATTCTTTTTGCAGTTTGCGCCTCTG
TTTGTGAGGGACTTTCTGTATGAAAATGTTGCAAACAACCGTTATGCAATGTTTGGTCGG
TCTGATTCATGTGAG

QA 1 375 1 375
DS 

RD RS1CK61JQ 728 0 0
GGATCCGGACATTGAGATGGCAATCCTTGCTCCGGCGAGTTTCGGGCGGTTAACCGTTCC
GTCTCGTGCGCAAGTTAGGGTAAGAATCTCTGCTTCTGCTAACCCACGCACTTCAGTTGA
CTGGGTCAAGGAAACTTCAAGCTTTTTCGAACAAGACAAGAGACCGATCATGTTGTTCGA
CGGTGTTTGCAATCTCTGTAATGGTGGTGTGAAGTTTGTCCGAGACCATGATCATAACAG
GAGCATAAGGTTTGAAGCATTACAGAGTGAAGCAGGAAAGAAACTGTTGATGCGGTCAGG
ACGTGCTCCTGATGATATATCAAGTGTCGTACTTGTCGAGAAAGATGGGTCTTACATAAA
ATCAGAAGCGGTTTTGAAGATTATGAAATACATTGACTTGCCATTTCCACGGCTTGCATT
CTTTTTGCAGTTTGCGCCTCTGTTTGTGAGGGACTTTCTGTATGAAAATGTTGCAAACAA
CCGTTATGCAATGTTTGGTCGGTCTGATTCATGTGAGATCTAAGAAGACATCATTGACTG
GTGATCTTATTTTGTCAAAAAAAACTAGATATGTCAAAAAAAATATTTCCTACAGTTTAA
TATATGCTTTTGTATATAGATGTATAGTTACAACAGCCTTTGAACGACCCATAAGTATGT
ACTCTCGAAAATGTATGACGTCTTGGATGATGATATTTGTATCAAATGTGGAAATTAGCA
TTCCAGTT

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL5103Contig1 1184 2 6 U
GGAGATTCCCATGAACGGGTCAAGCTAAGATAAACATCTTTTTTTGCAACTACCAACGAG
TTGTTTCCGAACATAACTCACTTACGGATCCACTCTTCTCTCTCTCTCTCTCGTTCTTGC
AAGATTGATATGTTAGATCCTTCAGCTGAAACCTACAGTCACCACTTGAGTTTCCCAACT
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CCGAGGAGTCCTCTTCACCGGCCGGAACGCTACTCTAGCCTTTCTCCGGATTCAAAGGCT
CAGGCTATCGCTCGTGGACAACGGGAGCTTATGGAGATGGTCAGTAAGATGCCAGAGTCG
TGTTACGAGCTTTCCTTGAGGGATCTTGTCGAAGCGAGGGGAAACGAAGAGAATAACGAT
AGGAAGATCTTCGATGAGTTGACTCAGAGAACAGGTAAGGTTGTGAGGAAGACGAAGAGC
GGTAAACGGGCTGATCCGAGTGTAAACAACGGTGGGTTTCTTCTCAAAATGATGTTTCCG
TTTAGCTTTGGATCTAAGAAAGATACGGCGAAAAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAGAAAG
GAGAAGGATTCTGTTAAAGATTCTCACGTTTCGCCGAGACCTTCGATCTCTGATGAGTCT
TTGAAAACAGAGGATAGAGAGTGGTGGAATAGATTGCCTGAGTCGAGGGGTAGCGAGAGC
ACAAAGAGGAGCGGTAGCAGCAATAGCAACAGGAGCCTAAGCAGCATAAGGGATAAAAAG
AGTAGCTGCTTGTTGTCTTTCCTCTGGTTTGTACGTTCACGAGACTGAAAGCGAGTTTTA
ACTCAATGTATGGTGGTGACCCCTTCTTGTCTAAATAAAAACCTTCCAAGAACAGAGGAG
ATGAGACCAGAGAGAATAAAACCTTTGAATGTGCCACGGAGATGACAAAACAATACTCCT
ACATTTTTTGCTTTGTTTTTTATGTAAGCCTGTGTATTGTTTCGGATACGGTTTTATTTG
TGTAATTAGAGTCTAATGTGCACTGATTAGTCTCTCAATTATGGAATTTTGAATCCTTCT
TCATGTACAGTATGTGTAAGTGTAGCTTAGCTTTTTCTCTCCACTTGATTATCCTTCCTT
TATGCATTAAAAGCCTAAAACTAATAATACTCCCATCTTTGCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1H494TF U 1
AF RS1H494JQB C 377
BS 1 666 RS1H494TF
BS 667 667 RS1H494JQB
BS 668 752 RS1H494TF
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BS 754 771 RS1H494TF
BS 772 1184 RS1H494JQB

RD RS1H494TF 778 0 0
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TTGTTTCCGAACATAACTCACTTACGGATCCACTCTTCTCTCTCTCTCTCTCGTTCTTGC
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GTTCCCAATGATCACTCAGATTCCGGCGTCTGTTCTCCTACTCTGTGGAGTACAAGTCCA
CCGAGGAGTCCTCTTCACCGGCCGGAACGCTACTCTAGCCTTTCTCCGGATTCAAAGGCT
CAGGCTATCGCTCGTGGACAACGGGAGCTTATGGAGATGGTCAGTAAGATGCCAGAGTCG
TGTTACGAGCTTTCCTTGAGGGATCTTGTCGAAGCGAGGGGAAACGAAGAGAATAACGAT
AGGAAGATCTTCGATGAGTTGACTCAGAGAACAGGTAAGGTTGTGAGGAAGACGAAGAGC
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TTTAGCTTTGGATCTAAGAAAGATACGGCGAAAAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAGAAAG
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TTGAAA*CAGAGGATAGAGAGTGGTGGAATAGATTGCCTGAGTCGAGGGGTAGCGAGAGC
ACAAAGAGGAGCGGTAGCAGCAATAGCAACAG*AGCCTAAGCAGCATAAGG
ATAAAAA

QA 1 771 1 771
DS 

RD RS1H494JQB 808 0 0
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AGT*GACTCAGAGAACAGGTAAGGTTGTGAGGAAGACGAAGAGCGGTAAACGGGCTGATC
CGAGTGTAAACAACGGTGGGTTTCTTCTCAAAATGATGTTTCCGTTTAGCTTTGGATCTA
AGAAAGATACGGCGAAAAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAGAAAGGAGAAGGATTCTGTTA
AAGATTCTCAGGTTTCGCCGAGACCTTCGATCTCTGATGAGTCTTTGAAAACAGAGGATA
GAGAGTGGTGGAATAGATTGCCTGAGTCGAGGGGTAGCGAGAGCACAAAGAGGAGCGGTA
GCAGCAATAGCAACAGGAGCCTAAGCAGCATAAGGGATAAAAAGAGTAGCTGCTTGTTGT
CTTTCCTCTGGTTTGTACGTTCACGAGACTGAAAGCGAGTTTTAACTCAATGTATGGTGG
TGACCCCTTCTTGTCTAAATAAAAACCTTCCAAGAACAGAGGAGATGAGACCAGAGAGAA
TAAAACCTTTGAATGTGCCACGGAGATGACAAAACAATACTCCTACATTTTTTGCTTTGT
TTTTTATGTAAGCCTGTGTATTGTTTCGGATACGGTTTTATTTGTGTAATTAGAGTCTAA
TGTGCACTGATTAGTCTCTCAATTATGGAATTTTGAATCCTTCTTCATGTACAGTATGTG
TAAGTGTAGCTTAGCTTTTTCTCTCCACTTGATTATCCTTCCTTTATGCATTAAAAGCCT
AAAACTAATAATACTCCCATCTTTGCCT

QA 1 808 1 808
DS 



AS 1 2

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AATCAAGGAAGAAGGATTCTCCGGTTACTACTACTACTACTACTACTACTACTCAAGCTG
CTGAGTGTCAAGAGAGTAGTGATGTGAATCAGAGTAGTACCCCGGGGCTACCAAGCTATA
TGCAAGCGACTAAATCCGCAAAAGCAAAGCTGAGACTACAACAAGGCTCTTCTTCTCCTA
AGCAACAAGGGGCTGAGAAAGCCACTAGACGTTACTCACTGCCATCTTCAGGTAATAACG
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GGAAGAGATGATATTCATCTGGTATTCAAAGAGGTCTCTAATGTTTCCCACTCTACAGAT
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BQ
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AF RS1D673TF U 1
AF RS1D673JQ C 233
BS 1 623 RS1D673TF
BS 624 658 RS1D673JQ

RD RS1D673TF 623 0 0
GGGATGTGAAAGAAGAGAGAACTCCCAAACAAAAGAACTCAGCTGGGAAGGAGAATAAAA
AATCAAGGAAGAAGGATTCTCCGGTTACTACTACTACTACTACTACTACTACTCAAGCTG
CTGAGTGTCAAGAGAGTAGTGATGTGAATCAGAGTAGTACCCCGGGGCTACCAAGCTATA
TGCAAGCGACTAAATCCGCAAAAGCAAAGCTGAGACTACAACAAGGCTCTTCTTCTCCTA
AGCAACAAGGGGCTGAGAAAGCCACTAGACGTTACTCACTGCCATCTTCAGGTAATAACG
CAAGAGTCACTTCTGATTCTCCTAAGACAACAAGAGTCTCAAACTCTGGTGGCAAAACCG
GGAAGAAGACCGAGAAACCTTCGGCCCGAGAAGGCAATGGGAAGACAGCTCAGGTAGAGT
GGAAGAGATGATATTCATCTGGTATTCAAAGAGGTCTCTAATGTTTCCCACTCTACAGAT
ATGTCACCATCTATCTATATAGTTAGAGTATGTAATTTCTGTTTGTGTTTGTGTTGAGAA
TGTACATCATCGGTTTTGTTTTTTGTGTGTGAGTGGCAAGTTTATTTTCTGTTTTCATGC
TACATTCCTTCTGTTATTACCTT

QA 1 623 1 623
DS 

RD RS1D673JQ 426 0 0
TTT
TCCTAAGCAACAAGGGGCTGAGAAAGCCACTAGACGTTACTCACTGCCATCTTCAGGTAA
TAACGCAAGAGTCACTTTTGATTCTCCTAAGACAACAAGAGTCTCAAACTCTGGTGGCAA
AACCGGGAAGAAGACCGAGAAACCTTCGGCCCGAGAAGGCAATGGGAAGACAGCTCAGGT
AGAGTGGAAGAGATGATATTCATTTGGTATTCAAAGAGGTCTTTAATGTTTCCCACTCTA
CAGATATGTCACCATCTATCTATATAGTTAGAGTATGTAATTTCTGTTTGTGTTTGTGTT
GAGAATGTACATCATCGGTTTTGTTTTTTGTGTGTGAGTGGCAAGTTTATTTTCTGTTTT
CATGCTACATTCCTTCTGTTATTACCTTGAAAAATCAACTTTGGTTATGATATTATGTAT
TCG

QA 4 426 4 426
DS 



AS 1 2

CO CL5105Contig1 757 2 4 U
GGACAGTATCTTTACAAGTTGCGCAAATCTGATTCGCCAAAAAAACAAACCCTAGTCCGC
CGCTTGTCTCGCTCGATCAATTCTCTGGAGTAATGTCATCCCAATCCGCAGAGCCTTCGG
GCAAAAAGAAGAAGCGTAAGGCAAGGACTAAACATGAAGATGAAGATGAAGATGATGAGA
AGAAGCGGAAGTTGAATCCAAGTTATTCTCCTACTATGTGGAAATCAAGCAGTTCTGAGT
CGGAGTATGAGGGCCTCTATCTTGAAAACCAACTCGGTGTTTCAAAACTACCTGGAAATG
CTACCGAGGAAGATGTGTTAGAGTTCTTCAATAGAACACCTGTCAAAGTAAAATTAATTG
ATGTGTTCAACAAGAAAAATGTGATTGTTGACCATCAAGCTGATGTCTTTTTTGCTTCTC
GTTCTGCAACAAAAGAGGGTCTGAAATTAAATGGTAGAATGATGGGGAAAACAAGTACTT
TACGTTGCACGGCGTGGGAACAGTCGAGAGATCATATGTGTTAGTGGTTTCAACAACGAA
GTCAACATAGATGTTATCAAAGGGGAGATTCGTCGGAAATTCCGTCGACGTGGAAAAATA
CTAAATATATTTCTTCCAGTCGAAGATAGCACTGGTTTAAGTCTTGGGTTTGGGTATATA
TTCATTGATCTCAAAGAGAAGAAGTACAAGGATTTGATTGGTCACACCGAAATTACTGGA
CGAAAAGTGAAATCAGAAGTGCTACACCTAAACTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1G348TF U 1
AF RS1EF51TF U 312
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QA 1 446 1 446
DS 



AS 1 2

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AGATGCATTTAGGGTCGAAAATGAGGCATGTGCAGATAGACAGATAAATATTTAATTGGT
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ATGCCTGGCTTCGACCTGTCCTCGATTTTTGTCTATTCATTTTGCTCTTATTTTGTTTAT
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GAACATCCATTTGTGT


BQ
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AF RS1CJ60TF U 1
AF RS1CJ60JQ C 477
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ATGCGGTATCTCTTGCTCAGAGCGAAGAGGAGCCTGTGGCAGCGGCCCGCAAGTTAACGG
ACACAGCCTTCACTCGTGGCAGCGCGGACAACATCACGTGCATTGTTGTTAAGTTCCATC
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QA 1 767 1 767
DS 

RD RS1CJ60JQ 740 0 0
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GAGGATGCGGTATCCCTTGCTCAGAGCGAAGAGGAGCCTGTGGCAGCGGCCCGCAAGTTA
ACGGACACAGCCTTCACTCGTGGCAGCGCGGACAACATCACGTGCATTGTTGTTAAGTTC
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AAAAAGATGCATTTAGGGTCGAAAATGAGGCATGTGCAGATAGACAGATAAATATTTAAT
TGGTTTAGTAGTTGTGTGCTTTGTGGCTACCTGTAACGTTTGAGGATTTGTGTTGCATAT
GCACATGCCTGGCTTCGACCTGTCCTCGATTTTTGTCTATTCATTTTGCTCTTATTTTGT
TTATTGGTGCTTCTGGCAGCAAAAAACACACCAGTTGTTATGTTTCTTCCACTTCTTTAT
ATCTGAACATCCATTTGTGT

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL5107Contig1 1065 2 6 U
GGAAATCTGCCGGTCCATTCTCTCCGAAGCTCTTCTTCAGTCGTGACTGTGACTACTCAC
TTAAGATGCTTCAGATTGCTTTGTATTTGTCATGTGGTGCTACAGCATGTTACCTATGGG
GCCGCAGAATTAAAGGGAAAGCTGACTCTTTTAACAGTATTACCCGTGTGTCCGACATCA
AATGTCTAGATGATATGATGAAAGAGAAAGCCACGAATCTCCTTGTAGCTGTGTCCGGAA
AAGTTGCTTCTGCAACGCCCTTTAACTGCAAACATGATGATAATGATTCTTCTTCCGGTG
ATGTTTTTGAGGCTAAGTTCGAAATGGGGTATGAGACCAAGTTGGGCGATGATGGTGGTC
TGATAAACACGTGTCATAATTTTCTGGTTCAGATCAAGGATACTCCTTGGTATCTTGAAG
ACGGTACTGGTACGGTGAAAGTAGTGAGAGCTGAACTTGCTGATGGATATATTGATATTC
TGAAACCGCAAATTGATATGACGTCAATGAGTGAAATCTTTCAGAGGTTTGAAAACCCCC
AAGAAGGCTCTAAGGTGATCTGTCGTGGTGCTCTCGATACTGGTACCTTCTTAACCATTG
TTGGCGAGGTTGATAGAGACGAATCTGGTACTCTCACGATTCAAAAGCCCAAGGAACAGT
CTTTTAGGGTCTTCAGTGGAGAGGGCTCGTTTGAGAAAATGGTTGCCAACTTGAAGTCAA
ATTCAGAGTTTTATTTTTTTTACGCCAAGATCTTTGGAACTATTGCTGTGGCTATAGCCG
TCGTGAAGGGTGTGGGTTTCGTAAGAAGGGTTCGACGTGAGAGATCTGATTCAGACAACG
AAGAAAACCCATGAGGGAGGAGAATAAGACAACAGTAGTTTATGGGGATGCAAGTGAATG
AATTCCCCATCCTCTAGCAAGTGAAGTCCTTTACGCTCCTTTTGAGATAGAGAGTGAGAT
TTCCACGGCTTGTATTGATGTTCGTTTGCTCATCCATCCAGGAATCATGCACTTCATTTT
ATTAACGAGAAGTTTGAACTAATGATTAAAATTCTTAAGATCTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D570TF U 1
AF RS1D570JQ C 389
BS 1 653 RS1D570TF
BS 654 654 RS1D570JQ
BS 655 668 RS1D570TF
BS 669 669 RS1D570JQ
BS 670 679 RS1D570TF
BS 680 1065 RS1D570JQ

RD RS1D570TF 679 0 0
GGAAATCTGCCGGTCCATTCTCTCCGAAGCTCTTCTTCAGTCGTGACTGTGACTACTCAC
TTAAGATGCTTCAGATTGCTTTGTATTTGTCATGTGGTGCTACAGCATGTTACCTATGGG
GCCGCAGAATTAAAGGGAAAGCTGACTCTTTTAACAGTATTACCCGTGTGTCCGACATCA
AATGTCTAGATGATATGATGAAAGAGAAAGCCACGAATCTCCTTGTAGCTGTGTCCGGAA
AAGTTGCTTCTGCAACGCCCTTTAACTGCAAACATGATGATAATGATTCTTCTTCCGGTG
ATGTTTTTGAGGCTAAGTTCGAAATGGGGTATGAGACCAAGTTGGGCGATGATGGTGGTC
TGATAAACACGTGTCATAATTTTCTGGTTCAGATCAAGGATACTCCTTGGTATCTTGAAG
ACGGTACTGGTACGGTGAAAGTAGTGAGAGCTGAACTTGCTGATGGATATATTGATATTC
TGAAACCGCAAATTGATATGACGTCAATGAGTGAAATCTTTCAGAGGTTTGAAAACCCCC
AAGAAGGCTCTAAGGTGATCTGTCGTGGTGCTCTCGATACTGGTACCTTCTTAACCATTG
TTGGCGAGGTTGATAGAGACGAATCTGGTACTCTCACGATTCAAAAGCCCAAG*AACAGT
CTTTTAGG*TCTTCAGTGG

QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1D570JQ 677 0 0
TCAGATCAAGGATACTCCTTGGTATCTTGAAGACGGTACTGGTACGGTGAAAGTAGTGAG
AGCTGAACTTGCTGATGGATATATTGATATTCTGAAACCGCAAATTGATATGACGTCAAT
GAGTGAAATCTTTCAGAGGTTTGAAAACCCCCAAGAAGGCTCTAAGGTGATCTGTCGTGG
TGCTCTCGATACTGGTACCTTCTTAACCATTGTTGGCGAGGTTGATAGAGACGAATCTGG
TACTCTCACGATTCAAAAGCCCAAGGAACAGTCTTTTAGGGTCTTCAGTGGAGAGGGCTC
GTTTGAGAAAATGGTTGCCAACTTGAAGTCAAATTCAGAGTTTTATTTTTTTTACGCCAA
GATCTTTGGAACTATTGCTGTGGCTATAGCCGTCGTGAAGGGTGTGGGTTTCGTAAGAAG
GGTTCGACGTGAGAGATCTGATTCAGACAACGAAGAAAACCCATGAGGGAGGAGAATAAG
ACAACAGTAGTTTATGGGGATGCAAGTGAATGAATTCCCCATCCTCTAGCAAGTGAAGTC
CTTTACGCTCCTTTTGAGATAGAGAGTGAGATTTCCACGGCTTGTATTGATGTTCGTTTG
CTCATCCATCCAGGAATCATGCACTTCATTTTATTAACGAGAAGTTTGAACTAATGATTA
AAATTCTTAAGATCTAT

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 2

CO CL5108Contig1 1254 2 10 U
GGACCATCATCTCTCCAAGTAGCAAAACCTAACTCTTTCTTTAACAAGAGCGCAAGCTCT
TTCTTTATCTTCTCCTCTACCCTCATAGAAATTTTAGAACACCCCTTCTTAGCACTTCAC
ACAGAAATGGCCATTACTAAAATAGCAATTCTCTTTACCACATTTGTGCTTTTCAGCCTC
GCCGACGCAAAAATCCCCGGCGTCTACTCCGGCGGCGCGTGGCAAACCGCACACGCCACT
TTCTATGGGGGCAGCGACGCCTCCGGCACTATGGGAGGAGCTTGTGGTTACGGTAACCTT
TACAGCCAAGGTTACGGAACTAACACGGCTGCCTTGAGCACGGCTCTGTTTAACAGTGGT
ATGAGTTGTGGAGCCTGCTTTGAGCTAAAATGTGCCAACGACCCACAATGGTGCCATTCA
GGTAGCCCATCGATACTCATTACCGCAACCAATTTCTGCCCACCAAACTTTGCTCAGGCC
AGTGATAACGGAGGATGGTGCAACCCGCCAAGAGCCCACTTTGATCTAGCCATGCCTGTC
TTCCTCAAGATCGCTCAATATCGTGCCGGCATTGTCCCAGTTTCATACCGCAGGGTGCCT
TGTAGAAAGAGAGGAGGGATAAGGTTCACAATCAACGGTCACCGTTACTTCAACTTGGTT
CTGATCACTAACGTGGCGGGAGCAGGAGACATCGTGAGGACGAGCGTGAAAGGTTCACGA
ACTGGTTGGATGAGTTTGAGCAGAAACTGGGGTCAGAACTGGCAATCTAACGCTGTCTTG
GTTGGTCAGTCACTTTCTTTCCGCGTCACAGGCAGTGATCGTAGAACCTCGACTTCATGG
AACATAGTTCCTTCTAACTGGCAGTTTGGTCAAACCTATGTCGGTAAGAATTTCAGGGTC
TAACCGATTTTCAAGAAACTCTATCTTTAAGTGGTCGAGACAAAAGAAAACTCTCCGCTA
ATTTCGCTTCTTTTTTGCAAAATTCTATACTAAGGAGAGAAAATCAAGGGGGGATTGGTA
TCTATGACTTTTGTTTTTGTGTGTGTTTTTAATTAGTTTTTTTTGGGGGTTGGTGTTTTA
ATTGTGGGGGAAAGTGAATGAGTGTAGTTGAAGTGGCTGTGAGAAAAAGTCGTAACAGCC
CGCAGCTACTAAAGTATTTACAATGGTTGTGTTTTTTTTTTACAATGGTTGGGTTGTAAG
TTACAACTTGTAACGTTTAATCTCGTGTAATGTAATACATATGGTTGTGATACT


BQ
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AF RS1EY88TF U 1
AF RS1EY88JQ C 508
BS 1 594 RS1EY88TF
BS 595 595 RS1EY88JQ
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BS 771 807 RS1EY88TF
BS 808 1254 RS1EY88JQ

RD RS1EY88TF 807 0 0
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TTCTTTATCTTCTCCTCTACCCTCATAGAAATTTTAGAACACCCCTTCTTAGCACTTCAC
ACAGAAATGGCCATTACTAAAATAGCAATTCTCTTTACCACATTTGTGCTTTTCAGCCTC
GCCGACGCAAAAATCCCCGGCGTCTACTCCGGCGGCGCGTGGCAAACCGCACACGCCACT
TTCTATGGGGGCAGCGACGCCTCCGGCACTATGGGAGGAGCTTGTGGTTACGGTAACCTT
TACAGCCAAGGTTACGGAACTAACACGGCTGCCTTGAGCACGGCTCTGTTTAACAGTGGT
ATGAGTTGTGGAGCCTGCTTTGAGCTAAAATGTGCCAACGACCCACAATGGTGCCATTCA
GGTAGCCCATCGATACTCATTACCGCAACCAATTTCTGCCCACCAAACTTTGCTCAGGCC
AGTGATAACGGAGGATGGTGCAACCCGCCAAGAGCCCACTTTGATCTAGCCATGCCTGTC
TTCCTCAAGATCGCTCAATATCGTGCCGGCATTGTCCCAGTTTCATACCGCAGG*TGCCT
TGTAGAAAGAGAGGAGGGATAAGGTTCACAATCAACGGTCACCGTTACTTCAACTTGGTT
CTGATCACTAACGTGGCGGGAGCAGGAGACATCGTGAGGACGAGCGTGAAAG*TTCACGA
ACTGGTTGGATGAGTTTGAGCAGAAACTGGGGTCAGAACTGGCA*TCTA*CGCTGTCTTG
GTTGGTCAGTCACTTTCTTTCCGCGTC

QA 1 807 1 807
DS 

RD RS1EY88JQ 747 0 0
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GGCATTGTCCCAGTTTCATACCGCAGGGTGCCTTGTAGAAAGAGAGGAGGGATAAGGTTC
ACAATCAACGGTCACCGTTACTTCAACTTGGTTCTGATCACTAACGTGGCGGGAGCAGGA
GACATCGTGAGGACGAGCGTGAAAGGTTCACGAACTGGTTGGATGAGTTTGAGCAGAAAC
TGGGGTCAGAACTGGCAATCTAACGCTGTCTTGGTTGGTCAGTCACTTTCTTTCCGCGTC
ACAGGCAGTGATCGTAGAACCTCGACTTCATGGAACATAGTTCCTTCTAACTGGCAGTTT
GGTCAAACCTATGTCGGTAAGAATTTCAGGGTCTAACCGATTTTCAAGAAACTCTATCTT
TAAGTGGTCGAGACAAAAGAAAACTCTCCGCTAATTTCGCTTCTTTTTTGCAAAATTCTA
TACTAAGGAGAGAAAATCAAGGGGGGATTGGTATCTATGACTTTTGTTTTTGTGTGTGTT
TTTAATTAGTTTTTTTTGGGGGTTGGTGTTTTAATTGTGGGGGAAAGTGAATGAGTGTAG
TTGAAGTGGCTGTGAGAAAAAGTCGTAACAGCCCGCAGCTACTAAAGTATTTACAATGGT
TGTGTTTTTTTTTTACAATGGTTGGGTTGTAAGTTACAACTTGTAACGTTTAATCTCGTG
TAATGTAATACATATGGTTGTGATACT

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

CO CL5109Contig1 944 2 2 U
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AAAAGAAGAGAGATTAGCAATGATGGGCAGTGTCGAGCTGAATCTGAGGGAGACTGAGTT
GTGTCTTGGTCTTCCCGGCGGGGATACGGCGGCCCCAGTGACTGGAACCAAGAGAGGCTT
CTCGGAGACGGTTGATCTGAAGCTGAATCTGAACAATGAACCTGAAAGCAAGGGAGGATC
TAAGCCTCATGACATCGTGGCTTCTGTTTCCAAGGAAAAGAGTTCATGTCCCAAAGATCC
AGCCAAGCCTCCAGCCAAGGCACAAGTTGTGGGCGTTTGTGAAGGTTTCAATGGACGGAG
CACCGTACTTAAGGAAAGTCGACTTGAAGATGTATAAGAGCTACGACGAACTCTCTAATG
CTTTGTCTAACATGTTCAGCTCTTTTACCATGGGGAAAAATGGAGGAGAAGAAGGAATGA
TAGACTTCATGAATGAGAGGAAAGTAATGGATATAGTGAATGGTTGGGACTATGTTCCCT
CTTACGAAGACAAAGACGGTGATTGGATGCTCGTCGGCGACGTCCCTTGGCCAATGTTCG
TTGATACATGCAAGCGTTTACGTCTCATGAAAGGATCTGACGCCATTGGTCTTGCTCCGA
GAGCAATGGAGAAATGCAAGAGTAGAGCTTGAAGTTAAAAGATTAAGAGGTAATGATCGT
ATATTTGATTAACACATTGATGAGTGTTAATTGTGGGCTTTACTATGAAAGTATTTGTTT
CATATCTACTATTTTTCTTTTAATTGTCTGTTTTGATCTGCATCATATGTTGGTGTGTAG
ATACGATTTATATGCTATAATTATATGTAATGAACTTAAGTTAAATATGTGAGACGTTTG
TAATAATACATATGTAATAATTTTGAACATCTTTTGTGTTTCTC


BQ
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AF RS1AU55TF U 1
AF RS1AU55JQ C 252
BS 1 629 RS1AU55TF
BS 630 944 RS1AU55JQ

RD RS1AU55TF 629 0 0
ATAAAAACCATTTCCCCATCTTCCTCATCACCTTCCCGAGAAGAAGAAGAAGATTATTGA
AAAAGAAGAGAGATTAGCAATGATGGGCAGTGTCGAGCTGAATCTGAGGGAGACTGAGTT
GTGTCTTGGTCTTCCCGGCGGGGATACGGCGGCCCCAGTGACTGGAACCAAGAGAGGCTT
CTCGGAGACGGTTGATCTGAAGCTGAATCTGAACAATGAACCTGAAAGCAAGGGAGGATC
TAAGCCTCATGACATCGTGGCTTCTGTTTCCAAGGAAAAGAGTTCATGTCCCAAAGATCC
AGCCAAGCCTCCAGCCAAGGCACAAGTTGTGGGCGTTTGTGAAGGTTTCAATGGACGGAG
CACCGTACTTAAGGAAAGTCGACTTGAAGATGTATAAGAGCTACGACGAACTCTCTAATG
CTTTGTCTAACATGTTCAGCTCTTTTACCATGGGGAAAAATGGAGGAGAAGAAGGAATGA
TAGACTTCATGAATGAGAGGAAAGTAATGGATATAGTGAATGGTTGGGACTATGTTCCCT
CTTACGAAGACAAAGACGGTGATTGGATGCTCGTCGGCGACGTCCCTTGGCCAATGTTCG
TTGATACATGCAAGCGTTTACGTCTCATG

QA 1 629 1 629
DS 

RD RS1AU55JQ 693 0 0
ACATCGTGGCTTCTGTTTCCAAGGAAAAGAGTTCATGTCCCAAAGATCCAGCCAAGCCTC
CAGCCAAGGCACAAGTTGTGGGCGTTTGTGAAGGTTTCAATGGACGGAGCACCGTACTTA
AGGAAAGTCGACTTGAAGATGTATAAGAGCTACGACGAACTCTCTAATGCTTTGTCTAAC
ATGTTCAGCTCTTTTACCATGGGGAAAAATGGAGGAGAAGAAGGAATGATAGACTTCATG
AATGAGAGGAAAGTAATGGATATAGTGAATGGTTGGGACTATGTTCCCTCTTACGAAGAC
AAAGACGGTGATTGGATGCTCGTCGGCGACGTCCCTTGGCCAATGTTCGTTGATACATGC
AAGCGTTTACGTCTCATGAAAGGATCTGACGCCATTGGTCTTGCTCCGAGAGCAATGGAG
AAATGCAAGAGTAGAGCTTGAAGTTAAAAGATTAAGAGGTAATGATCGTATATTTGATTA
ACACATTGATGAGTGTTAATTGTGGGCTTTACTATGAAAGTATTTGTTTCATATCTACTA
TTTTTCTTTTAATTGTCTGTTTTGATCTGCATCATATGTTGGTGTGTAGATACGATTTAT
ATGCTATAATTATATGTAATGAACTTAAGTTAAATATGTGAGACGTTTGTAATAATACAT
ATGTAATAATTTTGAACATCTTTTGTGTTTCTC

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

CO CL5110Contig1 638 2 3 U
TGGGCTGTACCAAAATTGCCTCTAACACATCCTCCTCCTTTCCTCCCTGAGGAAGAAGGC
GACGATGGAGGTTGGCCCAGCGAAGGAGCCGTGATCGGGGAAGAAGAGACCAGTTTGATC
TCATCTCTGAAACGAGAATCCTGCGTTAATGGGTTAGCGACTCTGCTCGGCGGGGACCCA
CATAAAAACGGGGACGGCGAGTCTAACACCTGCGTATGACGAACTTGTTCCGAACCATAA
CCATCCTTGGTGAGGATGATATCTAAGATATCCTTCTCTGCCTTGGATTCAACTTGCTGG
CTAAAGTAACATCGCAGAGAGCGAGAGGGATGGTCGTAGTTACGGAGACCAATACGACGT
GGTTTTGGGCAAACTACAACACTCTGTTCTCCTCCTCCTCCCGCAGAGAGCGCGTTCGGC
TGAATCGCCCACCGATGATTCATCGTTTTCTTCTTCCGATCAAACGAAAAAAACTTAAGG
TTTAACTGTACAGAGAGAGCCTATGGGAGGGAGGGGATAAGAGCTAGAACATGGAAGAGA
AAGAAATTAATAAAAGGGTAGAGAGAAAGGGATGATGAGAGGCGTGAGAGAGTGTGTGGG
GAAGTGTTAGGCGAGCGAGACAAGGGAAGACGGGTCCC


BQ
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AF RS1CV53JQ U 125
AF RS1CV53TF C 1
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BS 125 234 RS1CV53JQ
BS 235 638 RS1CV53TF

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QA 1 110 1 110
DS 

RD RS1CV53TF 638 0 0
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GACGATGGAGGTTGGCCCAGCGAAGGAGCCGTGATCGGGGAAGAAGAGACCAGTTTGATC
TCATCTCTGAAACGAGAATCCTGCGTTAATGGGTTAGCGACTCTGCTCGGCGGGGACCCA
CATAAAAACGGGGACGGCGAGTCTAACACCTGCGTATGACGAACTTGTTCCGAACCATAA
CCATCCTTGGTGAGGATGATATCTAAGATATCCTTCTCTGCCTTGGATTCAACTTGCTGG
CTAAAGTAACATCGCAGAGAGCGAGAGGGATGGTCGTAGTTACGGAGACCAATACGACGT
GGTTTTGGGCAAACTACAACACTCTGTTCTCCTCCTCCTCCCGCAGAGAGCGCGTTCGGC
TGAATCGCCCACCGATGATTCATCGTTTTCTTCTTCCGATCAAACGAAAAAAACTTAAGG
TTTAACTGTACAGAGAGAGCCTATGGGAGGGAGGGGATAAGAGCTAGAACATGGAAGAGA
AAGAAATTAATAAAAGGGTAGAGAGAAAGGGATGATGAGAGGCGTGAGAGAGTGTGTGGG
GAAGTGTTAGGCGAGCGAGACAAGGGAAGACGGGTCCC

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

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GGGTGTCAAACACTGCTCAATCCGATGTGAATGCTGTTACTTGGGGAGTTTTCCCGGCTA
AGGAGATCATTCAACCAACCATTGTGGATCCGGCTAGCTTCAAAGTCTGGAAAGATGAAG
CGTTTGAGACTTGGTCAAGAAGCTGGGCTAACTTGTACCCTGAATCTGACCCTTCAAGAA
ACTTGCTCGAAGAGGTCAAGAACAGTTACTATTTGGTGAGTTTGGTTGAGAATGATTACA
TCAACGGTAACATATTCACAGTCTTTACTGATCTTTGAGAAGAACATATGTTGTCCCACG
GCTTTCATGATTTGGCTTTTGTAATGTCTCTTAAAATATTGGGAATATAGCTTTATATAC
ATCATGTTGTCATCATTATCATGTTGATTTGCCAATAAAGTTTGTATTGTTAAAGAAAGC
ATCTTTCTCCCTACCTATGTGACACAAAAGTTGCCTGAAACAAAGTTTTCATTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GU19TF U 1
AF RS1G408TF U 106
BS 1 410 RS1GU19TF
BS 411 411 RS1G408TF
BS 412 535 RS1GU19TF

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CGTTTGAGACTTGGTCAAGAAGCTGGGCTAACTTGTACCCTGAATCTGACCCTTCAAGAA
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TCAACGGTAACATATTCACAGTCTTTACTGATCTTTGAGAAGAACATATGTTGTCCCACG
GCTTTCATGATTTGGCTTTTGTAATGTCTCTTAAAATATTGGGAATATAGTTTTATATAC
ATCATGTTGTCATCATTATCATGTTGATTTGCCAATAAAGTTTGTATTGTTAAAGAAAGC
ATCTTTCTCCCTACCTATGTGACACAAAAGTTGCCTGAAACAAAGTTTTCATTAG

QA 1 535 1 535
DS 

RD RS1G408TF 381 0 0
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TCTGGAAAGATGAAGCGTTTGAGACTTGGTCAAGAAGCTGGGCTAACTTGTACCCTGAAT
CTGACCCTTCAAGAAACTTGCTCGAAGAGGTCAAGAACAGTTACTATTTGGTGAGTTTGG
TTGAGAATGATTACATCAACGGTAACATATTCACAGTCTTTACTGATCTTTGAGAAGAAC
ATATGTTGTCCCACGGCTTTCATGATTTGGCTTTTGTAATGTCTCTTAAAATATTGGGAA
TATAGCTTTATATACATCATGTTGTCATCATTATCATGTTGATTTGCCAATAAAGTTTGT
ATTGTTAAAGAAAGCATCTTT

QA 1 381 1 381
DS 



AS 1 2

CO CL5112Contig1 1179 2 2 U
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CGGCGAAAAGTCTCATCTCATCTCACCGCCACTCGAATCTCTGTCCTGAAGTCCACCGCC
ATTTCACTAGCGATGGGAGACGAGAAGCCGACGGTTGTGATGGCCAATCGAGAAAGAGAC
CTGGAGCTTCTGATGCCCGTCGCTGATTCCAAAGATAAAGATGAAGGTTCTAGTTCGAAG
CCTTCTTCATCTTCTTCTTCGCAGCATCAAGCTAGCCACGAGACTTTAAGCTTGTTCATT
AGGGGTTGGGCCTCTAAGAAGTTCATGACTGGCTGTGTTATCCTCCTTCCCATTGCCATT
ACATTCTACATAACATGGTGGTTTATTCACTTTGTTGATGGTTTCTTCTCTCCCATTTAT
GTTCAACTTGGAATCAACATTTTTGGTTTCGGTTTCTTGACTTCAATCGCGTTCATCTTC
TTGGTCGGAGTGTTCATGTCTTCATGGTTGGGGGCTTCGGTTCTGAACTTGGGAGAGTGG
TTTATCAAGCGGATGCCATTTGTTCGTCACATCTACAACGCCTCCAAGCAAATCAGCACT
GCCATTTCTCCTGATCAAAATACACAAGCTTTCAAGGAAGTTGCAATCATCAGGCATCCG
CGTGTAGGCGAATACGCATTTGGGTTTATTACATCAACTGTTGTTCTTCAGAATTACCCA
ACAGAGGAGGAACTTTGCTGTGTTTATGTTCCAACGAACCACCTTCACATCGGAGATATA
CTACTTGTCAACAGTAATGACGTTATCAGGCCAAACCTCTCGGTCCGTGAAGGCATAGAG
ATTGTTGTTTCGGGTGGAATGTCAATGCCGCAAATTCTATCTACACTAGATAAACCAGCA
GCCTCCATCGACAGAGCTACAAGCGTATAGAGAAACTCATGCAGAAGAAGAAGAAGAAGA
AGACGCTTTCTAGTTTTGTTTGGGATCTGATCTGAGGATTGTGGTTTTTGAATGTTTGAT
GATGAGTGTTCGTCTCTTCAGCGTTGTTGTAACATTCCTCCCATTTGTTATTTGTGTGTT
TACAAAAAAGGTGTATAATGTAAGCTTAGTTCTATATCCCTCCTTAGATATGAGAATCTT
TTTATTTCAATTGAAAAAGCATTGAGAGTTATATTATAC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AF87TF U 1
AF RS1AF87JQ C 491
BS 1 573 RS1AF87TF
BS 574 1179 RS1AF87JQ

RD RS1AF87TF 573 0 0
GGAGAGTCCGCTTGGGGAAGGTAGTAAGTAGCTCAACAGAAGAAGAAGAAGAGTCGTCGT
CGGCGAAAAGTCTCATCTCATCTCACCGCCACTCGAATCTCTGTCCTGAAGTCCACCGCC
ATTTCACTAGCGATGGGAGACGAGAAGCCGACGGTTGTGATGGCCAATCGAGAAAGAGAC
CTGGAGCTTCTGATGCCCGTCGCTGATTCCAAAGATAAAGATGAAGGTTCTAGTTCGAAG
CCTTCTTCATCTTCTTCTTCGCAGCATCAAGCTAGCCACGAGACTTTAAGCTTGTTCATT
AGGGGTTGGGCCTCTAAGAAGTTCATGACTGGCTGTGTTATCCTCCTTCCCATTGCCATT
ACATTCTACATAACATGGTGGTTTATTCACTTTGTTGATGGTTTCTTCTCTCCCATTTAT
GTTCAACTTGGAATCAACATTTTTGGTTTCGGTTTCTTGACTTCAATCGCGTTCATCTTC
TTGGTCGGAGTGTTCATGTCTTCATGGTTGGGGGCTTCGGTTCTGAACTTGGGAGAGTGG
TTTATCAAGCGGATGCCATTTGTTCGTCACATC

QA 1 573 1 573
DS 

RD RS1AF87JQ 689 0 0
TGTTCATGTCTTCATGGTTGGGGGCTTCGGTTCTGAACTTGGGAGAGTGGTTTATCAAGC
GGATGCCATTTGTTCGTCACATCTACAACGCCTCCAAGCAAATCAGCACTGCCATTTCTC
CTGATCAAAATACACAAGCTTTCAAGGAAGTTGCAATCATCAGGCATCCGCGTGTAGGCG
AATACGCATTTGGGTTTATTACATCAACTGTTGTTCTTCAGAATTACCCAACAGAGGAGG
AACTTTGCTGTGTTTATGTTCCAACGAACCACCTTCACATCGGAGATATACTACTTGTCA
ACAGTAATGACGTTATCAGGCCAAACCTCTCGGTCCGTGAAGGCATAGAGATTGTTGTTT
CGGGTGGAATGTCAATGCCGCAAATTCTATCTACACTAGATAAACCAGCAGCCTCCATCG
ACAGAGCTACAAGCGTATAGAGAAACTCATGCAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGACGCTTTC
TAGTTTTGTTTGGGATCTGATCTGAGGATTGTGGTTTTTGAATGTTTGATGATGAGTGTT
CGTCTCTTCAGCGTTGTTGTAACATTCCTCCCATTTGTTATTTGTGTGTTTACAAAAAAG
GTGTATAATGTAAGCTTAGTTCTATATCCCTCCTTAGATATGAGAATCTTTTTATTTCAA
TTGAAAAAGCATTGAGAGTTATATTATAC

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 2

CO CL5113Contig1 282 2 1 U
GGGATCAACTATCTCTCTCTTATAGATACATAACAAGAGAGATAAAGATGCCTGATTGGG
GACCAGTTTTTGTGGCGGTGGCGCTCTTCGTGTTGCTAACTCCGGGAGTACTGATTCAGA
TTCCGGGGAAAAACTGAGTGGTTGAGTTTGGAACATTTCAGACAAGTGGTCTTTCGGTTA
TAGTCCATGCGCTCATCTACTTCACTCTTGTTTGTATTCTCTTGCTCGCTATTCAAATTC
ACATGTACATCGCCTAATCTAATAAAATAAATAAATCTCTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A510TF U 1
AF RS1A511TF U 1
BS 1 282 RS1A510TF

RD RS1A510TF 282 0 0
GGGATCAACTATCTCTCTCTTATAGATACATAACAAGAGAGATAAAGATGCCTGATTGGG
GACCAGTTTTTGTGGCGGTGGCGCTCTTCGTGTTGCTAACTCCGGGAGTACTGATTCAGA
TTCCGGGGAAAAACTGAGTGGTTGAGTTTGGAACATTTCAGACAAGTGGTCTTTCGGTTA
TAGTCCATGCGCTCATCTACTTCACTCTTGTTTGTATTCTCTTGCTCGCTATTCAAATTC
ACATGTACATCGCCTAATCTAATAAAATAAATAAATCTCTCC

QA 1 282 1 282
DS 

RD RS1A511TF 282 0 0
GGGATCAACTATCTCTCTCTTATAGATACATAACAAGAGAGATAAAGATGCCTGATTGGG
GACCAGTTTTTGTGGCGGTGGCGCTCTTCGTGTTGCTAACTCCGGGAGTACTGATTCAGA
TTCCGGGGAAAAACTGAGTGGTTGAGTTTGGAACATTTCAGACAAGTGGTCTTTCGGTTA
TAGTCCATGCGCTCATCTACTTCACTCTTGTTTGTATTCTCTTGCTCGCTATTCAAATTC
ACATGTACATCGCCTAATCTAATAAAATAAATAAATCTCTCC

QA 1 282 1 282
DS 



AS 1 2

CO CL5114Contig1 801 2 4 U
GGAACGAGGAGGACGATGATGAGTCAAACGGTGCATCAACTTCACTCTTATTTACGTTCG
AGGGCAGGAGGGGCATGTCTAGTCTTGTCACCGTCGTCTCCCAGGCCGTCTCCACGACTC
GTATGCATTGCCGTAAGTGATCGTAGCAACGTTCTGATGTCTATGGTCCTAGTTTACCAA
CTATGGTCAATCCAGAAAGCCGCATTCTTGAAATGGATCCTGAGAAGAAGACTATCATCC
CAACAGAATACTTGGGGGTGAAGCTAGTGTCATTTGGATTTGCAGGGCAAGGACGTGCCA
TAATGAGAGGTCCAATGGTGTCTGGTGTCATAAATCAACTCCTTACAACAACTGAATGGG
GAGAGCTGGATTATCTTGTTATCGACATGCCTCCTGGAACCGGTGACATTCAACTAACCC
TTTGCCAGGTTGCGCCGTTAACAGCAGCGGTAATTGTGACCACACCTCAAAAATTGGCAT
TTATAGATGTTACCAAAGTGTGGACGAATGGACTGGTGAACAAAAGATTCAGTTCGGAGA
TGTGGCAGAAGATATCGAGCCTGAGGAAATACGACCAATGGGAAACTATGCCGTCTCGAT
AACCTGGCCGGACGGGTTTAGCCAGATTGCTCCGTATGACCAGCTGGAATCAATTGAACG
GTTAGTAGAGGTTCCTCCATTGTCGGCAGTTGAAGTATAATTCTTAAAACCATAGCGTTT
CCTTCTCGAAGATAAAATTTGTATTTGTCTATATTATTAAAACATGATACCTTTTTTGAG
GTTTCCTTATCAAATCTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G435TF U 1
AF RS1G435JQ C 227
BS 1 565 RS1G435TF
BS 566 566 RS1G435JQ
BS 567 608 RS1G435TF
BS 609 801 RS1G435JQ

RD RS1G435TF 608 0 0
GGAACGAGGAGGACGATGATGAGTCAAACGGTGCATCAACTTCACTCTTATTTACGTTCG
AGGGCAGGAGGGGCATGTCTAGTCTTGTCACCGTCGTCTCCCAGGCCGTCTCCACGACTC
GTATGCATTGCCGTAAGTGATCGTAGCAACGTTCTGATGTCTATGGTCCTAGTTTACCAA
CTATGGTCAATCCAGAAAGCCGCATTCTTGAAATGGATCCTGAGAAGAAGACTATCATCC
CAACAGAATACTTGGGGGTGAAGCTAGTGTCATTTGGATTTGCAGGGCAAGGACGTGCCA
TAATGAGAGGTCCAATGGTGTCTGGTGTCATAAATCAACTCCTTACAACAACTGAATGGG
GAGAGCTGGATTATCTTGTTATCGACATGCCTCCTGGAACCGGTGACATTCAACTAACCC
TTTGCCAGGTTGCGCCGTTAACAGCAGCGGTAATTGTGACCACACCTCAAAAATTGGCAT
TTATAGATGTTACCAAAGTGTGGACGAATGGACTGGTGAACAAAAGATTCAGTTCGGAGA
TGTGGCAGAAGATATCGAGCCTGAG*AAATACGACCAATGGGAAACTATGCCGTCTCGAT
AACCTGGC

QA 1 608 1 608
DS 

RD RS1G435JQ 575 0 0
GAAGACTATCATCCCAACAGAATACTTGGGGGTGAAGCTAGTGTCATTTGGATTTGCAGG
GCAAGGACGTGCCATAATGAGAGGTCCAATGGTGTCTGGTGTCATAAATCAACTCCTTAC
AACAACTGAATGGGGAGAGCTGGATTATCTTGTTATCGACATGCCTCCTGGAACCGGTGA
CATTCAACTAACCCTTTGCCAGGTTGCGCCGTTAACAGCAGCGGTAATTGTGACCACACC
TCAAAAATTGGCATTTATAGATGTTACCAAAGTGTGGACGAATGGACTGGTGAACAAAAG
ATTCAGTTCGGAGATGTGGCAGAAGATATCGAGCCTGAGGAAATACGACCAATGGGAAAC
TATGCCGTCTCGATAACCTGGCCGGACGGGTTTAGCCAGATTGCTCCGTATGACCAGCTG
GAATCAATTGAACGGTTAGTAGAGGTTCCTCCATTGTCGGCAGTTGAAGTATAATTCTTA
AAACCATAGCGTTTCCTTCTCGAAGATAAAATTTGTATTTGTCTATATTATTAAAACATG
ATACCTTTTTTGAGGTTTCCTTATCAAATCTTTCC

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 2

CO CL5115Contig1 1250 2 2 U
GGTCTTCGAACGGTTCTTAATTTTCTCGACGAGATCTCTCTCTCTCCACCTTCCACCACC
GTGCGGAGAGGGATGTCGAAAGCTCGTGTTTACACCGACGTCAACGTGATCCGACCCAAG
GAGTATTGGGATTACGAGTCTCTCAACGTTCAGTGGGGGGAGCAAGATGATTACGAGGTT
GTCAGGAAGGTGGGGAGAGGCAAATACAGTGAGGTGTTTGAGGGGATTAACGTGAACAAC
AACGAGAAGTGCGTTATCAAGATTCTCAAGCCTGTCAAGAAGAAGAAGATTAGAAGAGAG
ATTAAGATACTTCAGAATCTCTGTGGAGGGCCAAATATTGTCAAGCTGTTTGATGTTGTG
AGAGACCAACACTCAAAAACACCAAGCTTGATATTTGAGTATGTTAACAGCACTGACTTC
AAGGTTCTGTATCCGACTTTGACTGATTACGACATCCGTTACTACATCTATGAGCTGTTG
AAGGCGTTGGACTACTGCCACTCGCAAGGTATAATGCACAGAGATGTCAAGCCACACAAT
GTCATGATTGACCATGAGCTCCACAAACTTCGCTTAATTGATTGGGGTCTCGCTGAGTTT
TATCATCCTGGAAAAGAGTATAACGTCCGTGTAGCCTCAAGGTACTTCAAGGGACCGGAA
CTTCTAGTGGATTTACAGGACTATGACTATTCCTTGGACATGTGGAGCCTCGGTTGCATG
TTTGCTGGGATGATATTCCGCAAGGAACCTTTCTTTTATGGCCATGACAACCAAGATCAG
CTCGTCAAAATTGCAAAGGTCCTTGGAACCGATGAACTGAATGCATATCTGAATAAGTAT
CAGTTAGAACTTGATGCCCAACTAGAGGCACTTGTTGGGAGACATAGCAGGAAGCCTTGG
TTTAAGTTCATCAATGCTGACAATCGCCATTTGGTCTCACCTGAGGCGATTGATTACCTC
GACAAGCTACTGCGGTATGATCATCAAGACAGGTTAACTGCAAAAGAAGCAATGGCTCAC
CCTTATTTCGCGCAAGTCAGGGCAGCAGAAAGCAGCAGAACGAGAACTCAGTAGAGATGT
TCTCTGAGTATGTCAAAGTGACGTGATGTTATGGTTATTGTTTTCTTTAAAGAAGTGATG
TCACTGCCTAATCCTAAAAGTTTATCAGATATTCTCGAGACTGCTTTCATGTATTTTCAA
ACTTGTAGAACTATATTGGGTTTAAAACCTCTATCAAGTCGAATTTAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AQ20TFB U 1
AF RS1AQ20JQ C 405
BS 1 789 RS1AQ20TFB
BS 790 1250 RS1AQ20JQ

RD RS1AQ20TFB 793 0 0
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GTGCGGAGAGGGATGTCGAAAGCTCGTGTTTACACCGACGTCAACGTGATCCGACCCAAG
GAGTATTGGGATTACGAGTCTCTCAACGTTCAGTGGGGGGAGCAAGATGATTACGAGGTT
GTCAGGAAGGTGGGGAGAGGCAAATACAGTGAGGTGTTTGAGGGGATTAACGTGAACAAC
AACGAGAAGTGCGTTATCAAGATTCTCAAGCCTGTCAAGAAGAAGAAGATTAGAAGAGAG
ATTAAGATACTTCAGAATCTCTGTGGAGGGCCAAATATTGTCAAGCTGTTTGATGTTGTG
AGAGACCAACACTCAAAAACACCAAGCTTGATATTTGAGTATGTTAACAGCACTGACTTC
AAGGTTCTGTATCCGACTTTGACTGATTACGACATCCGTTACTACATCTATGAGCTGTTG
AAGGCGTTGGACTACTGCCACTCGCAAGGTATAATGCACAGAGATGTCAAGCCACACAAT
GTCATGATTGACCATGAGCTCCACAAACTTCGCTTAATTGATTGGGGTCTCGCTGAGTTT
TATCATCCTGGAAAAGAGTATAACGTCCGTGTAGCCTCAAGGTACTTCAAGGGACCGGAA
CTTCTAGTGGATTTACAGGACTATGACTATTCCTTGGACATGTGGAGCCTCGGTTGCATG
TTTGCTGGGATGATATTCCGCAAGGAACCTTTCTTTTATGGCCATGACAACCAAGATCAG
CTCGTCAAA
TTGC

QA 1 789 1 789
DS 

RD RS1AQ20JQ 846 0 0
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CATCTATGAGCTGTTGAAGGCGTTGGACTACTGCCACTCGCAAGGTATAATGCACAGAGA
TGTCAAGCCACACAATGTCATGATTGACCATGAGCTCCACAAACTTCGCTTAATTGATTG
GGGTCTCGCTGAGTTTTATCATCCTGGAAAAGAGTATAACGTCCGTGTAGCCTCAAGGTA
CTTCAAGGGACCGGAACTTTTAGTGGATTTACAGGACTATGACTATTCCTTGGACATGTG
GAGCCTCGGTTGCATGTTTGCTGGGATGATATTCCGCAAGGAACCTTTTTTTTATGGCCA
TGACAACCAAGATCAGCTCGTCAAAATTGCAAAGGTCCTTGGAACCGATGAACTGAATGC
ATATCTGAATAAGTATCAGTTAGAACTTGATGCCCAACTAGAGGCACTTGTTGGGAGACA
TAGCAGGAAGCCTTGGTTTAAGTTCATCAATGCTGACAATCGCCATTTGGTCTCACCTGA
GGCGATTGATTACCTCGACAAGCTACTGCGGTATGATCATCAAGACAGGTTAACTGCAAA
AGAAGCAATGGCTCACCCTTATTTCGCGCAAGTCAGGGCAGCAGAAAGCAGCAGAACGAG
AACTCAGTAGAGATGTTCTCTGAGTATGTCAAAGTGACGTGATGTTATGGTTATTGTTTT
CTTTAAAGAAGTGATGTCACTGCCTAATCCTAAAAGTTTATCAGATATTCTCGAGACTGC
TTTCATGTATTTTCAAACTTGTAGAACTATATTGGGTTTAAAACCTCTATCAAGTCGAAT
TTAAAA

QA 1 846 1 846
DS 



AS 1 2

CO CL5116Contig1 876 2 2 U
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TGAAGAGGTCATCTCTCTGATAAAGCCAATCGCATCGGTGAAGAAACTGTCGACGAATCT
GATCCTCTCTGCAGACTTGCCGGCTTATGCTATAGGTGATGAGAAACGTCTGATGCAAAC
TATTCTCAACATCATGGGAAGTGCTGTAAAATTCACCAAGGAAGGCCACGTCTCCATAAT
AGCTTCTATCATGAAACCTGAGTCCTTGAGAGAATTACCATCTCCAGACTTCTATCCAGT
TCCAAGTGACAACCACTTCTACCTATGCGTGCAGGTGAAGGACACAGGGTGTGGAATTCA
CACGCAAGACATTCCTTTTCTCTTCACCAAATTTGTGCAGCCTCGGACTGGAGCTCAGAG
GAACCATTCTGGTGCAGGACTCGGTCTAGCTCTCTGCAAACGGTTCGTTGGGCTAATGGG
AGGATGCATATGGATAGAAAGCGAAGGGATAGAGAAAGGGTGCACGGCTTCGTTCATAAT
AAGGCTGGGTATCTGCAACGGTCCGAGCAGTAGCAGCGGTTCAATGGCGCTACGTCTTGC
AGCTAAATCACAAACAAGACCGTGGAACTGGTGATAACACATTACGATGGATATGGTGAC
TTCCATTCAGGACAGCTTTTTTGGGGTAACTATCACACAGCAGAAAGAGAAAGGAGAATA
TGTATTATTATTATATACATGGCCGGAAGGGTTGAACTGATCTTTAACTTGTTTGATTTT
TGTTGGATGTAATTTGTAAATAAAAACACATACATATATGTATGTATGCCGGGAGGTGTA
TCTCTGTCTTTTGACCAGCGTTTGTTTAAGTTTTAT


BQ
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AF RS1AI41TF U 1
AF RS1AI41JQ C 294
BS 1 666 RS1AI41TF
BS 667 876 RS1AI41JQ

RD RS1AI41TF 666 0 0
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TGAAGAGGTCATCTCTCTGATAAAGCCAATCGCATCGGTGAAGAAACTGTCGACGAATCT
GATCCTCTCTGCAGACTTGCCGGCTTATGCTATAGGTGATGAGAAACGTCTGATGCAAAC
TATTCTCAACATCATGGGAAGTGCTGTAAAATTCACCAAGGAAGGCCACGTCTCCATAAT
AGCTTCTATCATGAAACCTGAGTCCTTGAGAGAATTACCATCTCCAGACTTCTATCCAGT
TCCAAGTGACAACCACTTCTACCTATGCGTGCAGGTGAAGGACACAGGGTGTGGAATTCA
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GAACCATTCTGGTGCAGGACTCGGTCTAGCTCTCTGCAAACGGTTCGTTGGGCTAATGGG
AGGATGCATATGGATAGAAAGCGAAGGGATAGAGAAAGGGTGCACGGCTTCGTTCATAAT
AAGGCTGGGTATCTGCAACGGTCCGAGCAGTAGCAGCGGTTCAATGGCGCTACGTCTTGC
AGCTAAATCACAAACAAGACCGTGGAACTGGTGATAACACATTACGATGGATATGGTGAC
TTCCAT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RS1AI41JQ 583 0 0
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GAATTCACACGCAAGACATTCCTTTTCTCTTCACCAAATTTGTGCAGCCTCGGACTGGAG
CTCAGAGGAACCATTCTGGTGCAGGACTCGGTCTAGCTCTCTGCAAACGGTTCGTTGGGC
TAATGGGAGGATGCATATGGATAGAAAGCGAAGGGATAGAGAAAGGGTGCACGGCTTCGT
TCATAATAAGGCTGGGTATCTGCAACGGTCCGAGCAGTAGCAGCGGTTCAATGGCGCTAC
GTCTTGCAGCTAAATCACAAACAAGACCGTGGAACTGGTGATAACACATTACGATGGATA
TGGTGACTTCCATTCAGGACAGCTTTTTTGGGGTAACTATCACACAGCAGAAAGAGAAAG
GAGAATATGTATTATTATTATATACATGGCCGGAAGGGTTGAACTGATCTTTAACTTGTT
TGATTTTTGTTGGATGTAATTTGTAAATAAAAACACATACATATATGTATGTATGCCGGG
AGGTGTATCTCTGTCTTTTGACCAGCGTTTGTTTAAGTTTTAT

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 2

CO CL5117Contig1 1231 2 2 U
GCGGTATCGCTGAGAATCTTACTTGGGAAGTGTTCAGAGAGACTCTCATCGAACAAGCCG
AGCAAGGTGTGGACTACTTCACTATCCACGCTGGTGTTCTTCTGCGTTACATTCCTTTAA
CCGCTAAGCGTATGACTGGTATCGTTTCTCGTGGAGGATCAATCCATGCTAAGTGGTGCT
TAGCTTACCACAAGGAGAACTTTGCTTACGAGCACTGGGATGATATTCTAGACATATGTA
ACCAGTATGACGTGGCTCTTTCCATTGGGGATGGTCTGAGACCTGGCTCCATCTATGATG
CTAATGACACTGCTCAGTTTGCTGAGCTTCTTACTCAAGGTGAACTAACTCGCCGAGCAT
GGGCGAAAGATGTGCAGGTGATGAACGAAGGGCCAGGGCACGTGCCGATGAACAAGATCC
CGGAGAATATGCAGAAGCAGCTTGAATGGTGTAAAGAGGCGCCGTTCTACACGCTTGGTC
CTTTGACTACCGATATAGCTCCTGGGTATGATCACATCACCTCTGCCATTGGAGCTGCCA
ATATCGGAGCCTTGGGGACAGCTCTTCTCTGCTACGTAACACCAAAAGAGCATCTCGGTT
TACCGAACAGAGACGATGTGAAGGCTGGGGTTATAGCTTACAAGATAGCCGCACACGCGG
CTGATCTAGCCAAGCAGCATCCGCATGCACAGGCGTGGGACGATGCGCTGAGCAAGGCCC
GGTTTGAGTTTAGGTGGATGGATCAGTTTGCCCTGTCGTTGGACCCTATGACCGCGATGT
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TCAATGTTGCAAAGAAAACAATCAGCGGAGTGCAGCACGGTGAAGTTGGTGGTGAAATCT
ACTTGCCAGAGAGCTATGTCAAGGCTGCTAAGAAGTAAAAAGGGAAAGGGTGGAAACAAG
ATCTCGCTTACAGGTGCCTGTTGGACTATACCTGAATAAGGCACAAAATGTTGGTAAGCT
TTAGTAGTCTCTCTGTTTTTTAAACTTTAGAACTATCTATCGTGTTATGTTTCTCCTGTT
TGTTTCATTGAGTCAGTGTCAGTAATAAAAA


BQ
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AF RS1B579TF U 1
AF RS1BX01TF U 617
BS 1 716 RS1B579TF
BS 717 1231 RS1BX01TF

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AGCAAGGTGTGGACTACTTCACTATCCACGCTGGTGTTCTTCTGCGTTACATTCCTTTAA
CCGCTAAGCGTATGACTGGTATCGTTTCTCGTGGAGGATCAATCCATGCTAAGTGGTGCT
TAGCTTACCACAAGGAGAACTTTGCTTACGAGCACTGGGATGATATTCTAGACATATGTA
ACCAGTATGACGTGGCTCTTTCCATTGGGGATGGTCTGAGACCTGGCTCCATCTATGATG
CTAATGACACTGCTCAGTTTGCTGAGCTTCTTACTCAAGGTGAACTAACTCGCCGAGCAT
GGGCGAAAGATGTGCAGGTGATGAACGAAGGGCCAGGGCACGTGCCGATGAACAAGATCC
CGGAGAATATGCAGAAGCAGCTTGAATGGTGTAAAGAGGCGCCGTTCTACACGCTTGGTC
CTTTGACTACCGATATAGCTCCTGGGTATGATCACATCACCTCTGCCATTGGAGCTGCCA
ATATCGGAGCCTTGGGGACAGCTCTTCTCTGCTACGTAACACCAAAAGAGCATCTCGGTT
TACCGAACAGAGACGATGTGAAGGCTGGGGTTATAGCTTACAAGATAGCCGCACACGCGG
CTGATCTAGCCAAGCAGCATCCGCATGCACAGGCGTGGGACGATGCGCTGAGCAAG
CC

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DS 

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G
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CATCCGCATGCACAGGCGTGGGACGATGCGCTGAGCAAGGCCCGGTTTGAGTTTAGGTGG
ATGGATCAGTTTGCCCTGTCGTTGGACCCTATGACCGCGATGTCTTTCCATGATGAGACT
CTTCCGGCTGATGGAGCCAAGGTTGCGCACTTCTGCTCCATGTGTGGACCAAAGTTCTGC
TCCATGAAGATAACTGAAGACATCAGGAAGTATGCGGAGGAGAATGGTTATGGCACTGCC
GAGGAAGCGCTCAGAAAAGGGATGGAAGCTATGAGTCAAGAGTTCAATGTTGCAAAGAAA
ACAATCAGCGGAGTGCAGCACGGTGAAGTTGGTGGTGAAATCTACTTGCCAGAGAGCTAT
GTCAAGGCTGCTAAGAAGTAAAAAGGGAAAGGGTGGAAACAAGATCTCGCTTACAGGTGC
CTGTTGGACTATACCTGAATAAGGCACAAAATGTTGGTAAGCTTTAGTAGTCTCTCTGTT
TTTTAAACTTTAGAACTATCTATCGTGTTATGTTTCTCCTGTTTGTTTCATTGAGTCAGT
GTCAGTAATAAAAA

QA 2 615 2 615
DS 



AS 1 2

CO CL5118Contig1 896 2 6 U
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TCCTTCGTCGTTTCGTCCAACGCTTTCTTAGCTTCGAGATTGAAGACTAGACTCAATGAG
GGGAAGGAGCTACACACCGTCACCACCGAGGGGTTATGGTAGGAGGGGCAGGAGCCCTAG
CCCCCGTGGTGGTGGCCGTTACGGTGGCGGTCGTGACAGGGATCTCCCAACCAGTCTTTT
GGTTCGCAATCTTCGTCATGATTGCAGGCAAGAAGACCTTAGGAGGCCATTGAGCAGTTT
GGTCCTGTCAAGGACATCTACCTACCAAGGGATTATTATACCGGAGATCCAAGGGGGTTT
GGTTTCATTCAATATGTGGATCCTGCTGATGCTGCTGAGGCAAAACATCACATGGAAGGC
TATCTTCTTCTTGGTCGTGAGCTGACTGTTGTATTTGCAGAAGAGAACAGGAAGAAGCCA
ACTGAAATGAGAACAAGGGATCGAGGTGGCAGGAGCAATAGATTCAATGACAGAAGACGT
TCTCCTCCTCGCTACTCTCGTTCTCCACCCCCTCGGCGTGGCGGTAGAACACGATCACGT
AGCCGTGACTATAACTCTCCTCCCCCTAAAAGACATCAATCTAGGTCTGTCTCACCACAG
GAGAGACGATACTAGAAGGAGAGGTCATACTCTCGTTCACCACCACGTAATGGCTCAAGG
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AGAAGCGTGAGCCCCAGAAGAAACAGGAGCTACACTCCTGAACAAGCCAGGAGCCCTGTC
CCGAGGCAGAGCAGGAGCCCAAGTCCTCGTGGGGAACGAAATGGATACCGTTTTCC


BQ
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AF RS1BU45TF U 1
AF RS1BU45JQ C 388
BS 1 630 RS1BU45TF
BS 631 631 RS1BU45JQ
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TCCTTCGTCGTTTCGTCCAACGCTTTCTTAGCTTCGAGATTGAAGACTAGACTCAATGAG
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CCCCCGTGGTGGTGGCCGTTACGGTGGCGGTCGTGACAGGGATCTCCCAACCAGTCTTTT
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GGTTTCATTCAATATGTGGATCCTGCTGATGCTGCTGAGGCAAAACATCACATGGAAGGC
TATCTTCTTCTTGGTCGTGAGCTGACTGTTGTATTTGCAGAAGAGAACAGGAAGAAGCCA
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TCTCCTCCTCGCTACTCTCGTTCTCCACCCCCTCGGCGTGGCGGTAGAACACGATCACGT
AGCCGTGACTATAACTCTCCTCCCCCTAAA*GACATCAATCTAG*TCTGTCTCAC
ACAGAGAGACGATAC

QA 1 655 1 655
DS 

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GATGCTGCTGAGGCAAAACATCACATGGAAGGCTATCTTCTTCTTGGTCGTGAGCTGACT
GTTGTATTTGCAGAAGAGAACAGGAAGAAGCCAACTGAAATGAGAACAAGGGATCGAGGT
GGCAGGAGCAATAGATTCAATGACAGAAGACGTTTTCCTCCTCGCTACTCTCGTTCTCCA
CCCCCTCGGCGTGGCGGTAGAACACGATCACGTAGCCGTGACTATAACTCTCCTCCCCCT
AAAAGACATCAATCTAGGTCTGTCTCACCACAGGAGAGACGATACTAGAAGGAGAGGTCA
TACTCTCGTTCACCACCACGTAATGGCTCAAGGGCTCGCAGTGGAAGTCGTGAGAAGGTG
CAGAAAATCTACAGCAGGAGCCGGAGCCCAAGAAGAAGCGTGAGCCCCAGAAGAAACAGG
AGCTACACTCCTGAACAAGCCAGGAGCCCTGTCCCGAGGCAGAGCAGGAGCCCAAGTCCT
CGTGGGGAACGAAATGGATACCGTTTTCC

QA 1 509 1 509
DS 



AS 1 2

CO CL5119Contig1 980 2 6 U
GCTACTCCCTCTTCATCTATAAAACGAAAGCTATCGAATTTGTTACCAATCTGCGTGGCT
CTAGTAGTCATCGCCGAGATCTGCTTCCTTGGTCGTCTCGACAAAGTCTCTTTAGTCAAC
ACGTTGACCGATTTCTTCACCCAGTCTCCGCCGGGTAGATCCGACCAGAAGAACATCGAA
TTGATGTCGGAGAGCTGCGAGGAGTGGCTGACGAGACAAGACTCAGTGACTTACTCTAGA
GACTTCAATAAAGATCCAATCTTTATCTCCAGTGGTCAAAAGGACTTTCAATCATGTTCC
ATAGATTGTACATTTGGAGATAGCTCAGGTAGAGCAGCACCAGACGCTGCGTTTGGACTA
GGTAACCAACCTGGAAGTCTTTCTATTCTCCGTTCCATGGAATCAGCTCAGTACTATCCT
GAAAACGATATCTCACACGCACGACGGAGTGGTTACGATATTGTGATGACCACTAGTCTT
TCATCAGATGTCCCTGTTGGGTATTTTTCATGGGCTGAGTATGATATTATGGCTCCGGTC
CAGCCCAAGACCGAGAAGGCTATCGCTGCTGCTTTTATTTCTAACTGTGGTGCTCCGAAT
TTTCGACTGAAAGCACTTGAAGGTCTGATGAAGAGTAGGATCAAGATTGATTCTTATGGT
GGTTGTCATCGGAACCGTGATGGAGAAGTTGACAAGGTTGAAGCTCTTAAGCGTTACAAG
TTTAGTTTGGCTTTTGAGAACACTAACGAGGAGGATTATGTCACTGAGAAGTTCTTCCAG
TCTCTTGTTGCTGGATCTGTCCCTGTGGTTGTTGGTGCTCCTAACATAGAAGAATTTGCG
CCTGCTTCAGACTCATTCCTTCACATTAAGAGTATGGAAGATGTGGAGCCAGTTGCAAAG
AGAATGAAGTATCTCACAGCTAACCCTGCTGCTTATAATCAAACACTAAGATGGAAGTAT
GAGGGTCCTTCGGATTCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GU73TF U 357
BS 1 638 RS1D774TF
BS 639 639 RS1GU73TF
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BS 698 739 RS1D774TF
BS 740 980 RS1GU73TF

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CTAGTAGTCATCGCCGAGATCTGCTTCCTTGGTCGTCTCGACAAAGTCTCTTTAGTCAAC
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TTGATGTCGGAGAGCTGCGAGGAGTGGCTGACGAGACAAGACTCAGTGACTTACTCTAGA
GACTTCAATAAAGATCCAATCTTTATCTCCAGTGGTCAAAAGGACTTTCAATCATGTTCC
ATAGATTGTACATTTGGAGATAGCTCAGGTAGAGCAGCACCAGACGCTGCGTTTGGACTA
GGTAACCAACCTGGAAGTCTTTCTATTCTCCGTTCCATGGAATCAGCTCAGTACTATCCT
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TCATCAGATGTCCCTGTTGGGTATTTTTCATGGGCTGAGTATGATATTATGGCTCCGGTC
CAGCCCAAGACCGAGAAGGCTATCGCTGCTGCTTTTATTTCTAACTGTGGTGCTCCGAAT
TTTCGACTGAAAGCACTTGAAGGTCTGATGAAGAGTAG*ATCAAGATTGATTCTTATGGT
GGTTGTCATCGGAACCGTGATGGAGAAGTTGACAAG*TTGAAGCTCTTAAGCGTTACAAG
TTTAGTTTGGCTTTTGAGA

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1GU73TF 624 0 0
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TCCTGAAAACGATATCTCACACGCACGACGGAGTGGTTACGATATTGTGATGACCACTAG
TCTTTCATCAGATGTCCCTGTTGGGTATTTTTCATGGGCTGAGTATGATATTATGGCTCC
GGTCCAGCCCAAGACCGAGAAGGCTATCGCTGCTGCTTTTATTTCTAACTGTGGTGCTCC
GAATTTTCGACTGAAAGCACTTGAAGGTCTGATGAAGAGTAGGATCAAGATTGATTCTTA
TGGTGGTTGTCATCGGAACCGTGATGGAGAAGTTGACAAGGTTGAAGCTCTTAAGCGTTA
CAAGTTTAGTTTGGCTTTTGAGAACACTAACGAGGAGGATTATGTCACTGAGAAGTTCTT
CCAGTCTCTTGTTGCTGGATCTGTCCCTGTGGTTGTTGGTGCTCCTAACATAGAAGAATT
TGCGCCTGCTTCAGACTCATTCCTTCACATTAAGAGTATGGAAGATGTGGAGCCAGTTGC
AAAGAGAATGAAGTATCTCACAGCTAACCCTGCTGCTTATAATCAAACACTAAGATGGAA
GTATGAGGGTCCTTCGGATTCTTT

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

CO CL5120Contig1 1131 2 6 U
GGTCCCAAGGTCGTACTATCGGACTCTATCACTAGTCTCCAAGAGCTTTCGATCTATGGT
GGTTGCACCTGAGCTTTACAAGGTTAGGTCACTCTTGGGCCTCACGGAGACTTGTCTATA
TGTGTGCTTGAGGTTCGGGTTGACTTGTTATAAGTGGTACACCCTCTCCAAGACTAGTAC
TAGTAGTAGTGGCTATGTTTTGGGTAGAGTCTCAATGCGCGATGTTGATGATGCTTCTCC
TCGTGTGGTGGGTTTGTTATATTCAGATCTTGTGGCTGTTGGTTCTGAAATCTACAACGT
TGGCGTAGCAGATAAAGGAACCATGCCCACCTCTGGGGTCTCAATTCTTGATTGCAAGAC
TCACAGGTGGCGTAAGGCTCCACGCATGCCAGTGGAGCTAACTGAACTTTCTACCACATT
CCTTGATCAAAAGATATATGTACTTGGACGCTTCCATCAAGATGGTTCCTGGAAGAGCTA
CTTCGAGGTATTCAACACAAATACTCAAACTTGGCATCTCCCTTGCTGTGGTGGATGTGA
TACCCCCAGAATCACTTTTATTGTTGACGGCAAGCTCCACGTGGTGACTTTCTTTGATGG
CGTGTTTGCTTTCAATTCAAAGCAATGTAGATGGGACCTGGTTGATGAACAATATCCAAG
CACGGGCACTATGTTTTTAGATTCTTACTGCGAGGTTGATAATATTCTCTACTCTGTTTC
TGACCACGGAGCTCTGAGATGGTATGACTCCGACAAGACTAGGTGGAGAGATTTGAAGGG
TTTGGTTGGGCTACTACCTAAGTTGCCTAGTCCTCTTGCTGGTTATGGTTCTTATGTTAA
ACTGACGGGTTTTGGTGGTGGAAAGATTATGGTTTTCTGGAATGCCAATTTCAGTTGTCA
CTTGACTCGAAGGGAGACCATATGTTGTGCGGAGATATCGCTTGAAAGACGCGATGGAGA
CTGTTGGGGCAAACTTGAGTGGCCTGATAGTGTGCTTTCAGTCCCTGTGGGAACTGAGTT
CGTTAAAGTTCTTGCTGTAACGCTTTGAATTAATGAATGTTGTGTCTTTCTTTAACTTTT
ATTTTTTTGTTTTGTAATAATGGCTTTTTCAATTTCTCTGATGATTAAGTT


BQ
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20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AB32TF U 1
AF RS1AB32JQ C 449
BS 1 761 RS1AB32TF
BS 762 762 RS1AB32JQ
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BS 810 810 RS1AB32JQ
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RD RS1AB32TF 843 0 0
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GGTTGCACCTGAGCTTTACAAGGTTAGGTCACTCTTGGGCCTCACGGAGACTTGTCTATA
TGTGTGCTTGAGGTTCGGGTTGACTTGTTATAAGTGGTACACCCTCTCCAAGACTAGTAC
TAGTAGTAGTGGCTATGTTTTGGGTAGAGTCTCAATGCGCGATGTTGATGATGCTTCTCC
TCGTGTGGTGGGTTTGTTATATTCAGATCTTGTGGCTGTTGGTTCTGAAATCTACAACGT
TGGCGTAGCAGATAAAGGAACCATGCCCACCTCTGGGGTCTCAATTCTTGATTGCAAGAC
TCACAGGTGGCGTAAGGCTCCACGCATGCCAGTGGAGCTAACTGAACTTTCTACCACATT
CCTTGATCAAAAGATATATGTACTTGGACGCTTCCATCAAGATGGTTCCTGGAAGAGCTA
CTTCGAGGTATTCAACACAAATACTCAAACTTGGCATCTCCCTTGCTGTGGTGGATGTGA
TACCCCCAGAATCACTTTTATTGTTGACGGCAAGCTCCACGTGGTGACTTTCTTTGATGG
CGTGTTTGCTTTCAATTCAAAGCAATGTAGATGGGACCTGGTTGATGAACAATATCCAAG
CACGGGCACTATGTTTTTAGATTCTTACTGCGAGGTTGATAATATTCTCTACTCTGTTTC
TGACCACGGAGCTCTGAGATGGTATGACTCCGACAAGACTATGTGGAGAGATTTGAAGGG
TTTGGTTGGGCTACTACCTAAGTTGCCTA*TCCTCTTGCTGGTTATGGTTCTTATGTTAA
ACT

QA 1 843 1 843
DS 

RD RS1AB32JQ 683 0 0
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ACTTGGCATCTCCCTTGCTGTGGTGGATGTGATACCCCCAGAATCACTTTTATTGTTGAC
GGCAAGCTCCACGTGGTGACTTTCTTTGATGGCGTGTTTGCTTTCAATTCAAAGCAATGT
AGATGGGACCTGGTTGATGAACAATATCCAAGCACGGGCACTATGTTTTTAGATTCTTAC
TGCGAGGTTGATAATATTCTTTACTCTGTTTCTGACCACGGAGTTCTGAGATGGTATGAT
TCCGACAAGACTAGGTGGAGAGATTTGAAGGGTTTGGTTGGGCTACTACCTAAGTTGCCT
AGTCCTCTTGCTGGTTATGGTTCTTATGTTAAACTGACGGGTTTTGGTGGTGGAAAGATT
ATGGTTTTCTGGAATGCCAATTTCAGTTGTCACTTGACTCGAAGGGAGACCATATGTTGT
GCGGAGATATCGCTTGAAAGACGCGATGGAGACTGTTGGGGCAAACTTGAGTGGCCTGAT
AGTGTGCTTTCAGTCCCTGTGGGAACTGAGTTCGTTAAAGTTCTTGCTGTAACGCTTTGA
ATTAATGAATGTTGTGTCTTTCTTTAACTTTTATTTTTTTGTTTTGTAATAATGGCTTTT
TCAATTTCTCTGATGATTAAGTT

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

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GATAATATATTAGGTAGCTTGCGATACAAGTCAAACATATACATACATATTGAAAAAGAA
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GATGTGACCAATAGAACCCCAAGCAAGAACATCCACGATGTTGAATCCAACTGGATCGTT
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ACCGTTCTGCTCCGGCACCTGTTTCGCCACGTTCTCTCTCTGGAAGTTGAAGAAGACGAA
CCGGCCTAGGAAGAGGGAGAGACCGGTGCTGAGGCTTATGACCACGGATGGGCTGAGCTC
GGCTTTCACGACGGCGGAGGAGGAAGATCTTCTCCCGGAAGTGGTGGATAGCTTGGGTAA
GGCGGAGGAGGAACCACCGAGGCGGAGAGGACGGAGGCCGTGGAAGGAGATGGAGTTTGG
GTTTTGGTGGGAGAATGCGGCGGTGGTTGCGGGTGTGAGCAAAGCAGATGCGCTTGTAGC
CATGTTATCTTCTTCTTCTTCTTCTCTGGAGCC


BQ
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AF RS1D506JQ U 2
AF RS1D506TF C 1
BS 1 2 RS1D506TF
BS 3 239 RS1D506JQ
BS 240 240 RS1D506TF
BS 241 288 RS1D506JQ
BS 289 633 RS1D506TF

RD RS1D506JQ 293 0 0
C
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TAATATATTAGGTAGCTTGCGATACAAGTCAAACATATACATACATATTGAAAAAGAATC
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TGTGACCAATAGAACCCCAAGCAAGAACATCCACGATGTTGAATCCAACTGGATCGT*CG
ACTTCAAGAGGCTAACGTACTCCTTGGCACGATCATCTCCGGCTTC
AAGTGG

QA 2 287 2 287
DS 

RD RS1D506TF 633 0 0
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GATAATATATTAGGTAGCTTGCGATACAAGTCAAACATATACATACATATTGAAAAAGAA
TCAGCCAAAGAAGCTAGGATCATAGCCATTGCTAGAGGTGGCCAGGACGTAGTAAGCAAC
GATGTGACCAATAGAACCCCAAGCAAGAACATCCACGATGTTGAATCCAACTGGATCGTT
CGACTTCAAGAGGCTAACGTACTCCTTGGCACGATCATCTCCGGCTTCGAAGTGGGTTTT
ACCGTTCTGCTCCGGCACCTGTTTCGCCACGTTCTCTCTCTGGAAGTTGAAGAAGACGAA
CCGGCCTAGGAAGAGGGAGAGACCGGTGCTGAGGCTTATGACCACGGATGGGCTGAGCTC
GGCTTTCACGACGGCGGAGGAGGAAGATCTTCTCCCGGAAGTGGTGGATAGCTTGGGTAA
GGCGGAGGAGGAACCACCGAGGCGGAGAGGACGGAGGCCGTGGAAGGAGATGGAGTTTGG
GTTTTGGTGGGAGAATGCGGCGGTGGTTGCGGGTGTGAGCAAAGCAGATGCGCTTGTAGC
CATGTTATCTTCTTCTTCTTCTTCTCTGGAGCC

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 2

CO CL5122Contig1 1093 2 2 U
GGGCTGACTTCACCGGAGAAGACAACAACAATGCATTGCGGATGTGCTTTCGCTACACCA
GCTCTGTCCCCACGTTTTCCATTCGAAATCAAAACCTCACTTCCGAAGCTCCGAGCTTCA
TCAGCCCGAACCCATATCCAGATTAACCATCCCGATGATCTCACGGACAAATCTCCGGCG
ACGAGGGTTACGTTACCGTCTCACGTGGATTCCATCACCGGCACTTCAAACCCTTTTGTC
AAACACTGCTCGAAGCTCCGCCAAATCGCCTCTTACCGCCACGCTCACGGCTCTGTTCTC
GTCGTCGGAGCTATCCCAATCAGGGAAGTATGTATGTTCCAAACGAACAAGCAAGGAGTC
ACCACCACTGAGATTGACTGTCTTCTTCTCCACGAGGAAGCTCAGATTCCACTAGGGTTA
GAGAGTCTAAGTATGCGCATTGTTCGAGTTAGTTCTTTAGTGATGAAGAAACTCTCCGGA
GTGCAGTCTACTGAATCTGTTGAAGCCGTTGCCTTGATGAGAATCCCTAGCAGCTTCATC
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TCTGCTCACCGAGTTCTTGTTCTTGACAACATACAGGACCCTGGGAATCTTGGCACGTTA
ATCAGATCAGCTATGGCTTTTAATTGGGATGGAGCATTTCCGCTTCCGGGTTGTTGTGAT
CCATTCAACGACAAAGCTCTGCGAGCAAGCCGAGGTGCTTCCTTTCAACTCCCATTAGTT
TCTGGTAACTGGAACCACCTTCAGCTTCTACAACGTGACTTTCAGATGAAGCTATTGGCT
GGCCATCCAGCAAGTACTACTACTACTCAGAAACCAGTCTCCAAACTTTCCTTAGAGTTT
GCTCAATCTTTAGCAGACAAGCCTTTATGCTTGATCTTAGGTAGTGAAGGGCACGGTTTG
TCTGAGCAATCACGACAAGCGTGTGAGCTTGTGAGCATTCCCATGGAAGGTGAGTTTGAA
TCTCTTAATGTATCGGTTGCTGGTGGCATTTTCTTATTCATGCCTCAATAAATATATAAA
AAGTTGACCACCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E692TF U 1
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TCAGCCCGAACCCATATCCAGATTAACCATCCCGATGATCTCACGGACAAATCTCCGGCG
ACGAGGGTTACGTTACCGTCTCACGTGGATTCCATCACCGGCACTTCAAACCCTTTTGTC
AAACACTGCTCGAAGCTCCGCCAAATCGCCTCTTACCGCCACGCTCACGGCTCTGTTCTC
GTCGTCGGAGCTATCCCAATCAGGGAAGTATGTATGTTCCAAACGAACAAGCAAGGAGTC
ACCACCACTGAGATTGACTGTCTTCTTCTCCACGAGGAAGCTCAGATTCCACTAGGGTTA
GAGAGTCTAAGTATGCGCATTGTTCGAGTTAGTTCTTTAGTGATGAAGAAACTCTCCGGA
GTGCAGTCTACTGAATCTGTTGAAGCCGTTGCCTTGATGAGAATCCCTAGCAGCTTCATC
GATCTTGAAGATGATGATGAAGACATGATCATAACAAGAGATTGTGACAAGTGGTTCCCT
TCTGCTCACCGAGTTCTTGTTCTTGACAACATACAGGACCCTGGGAATCTTGGCACGTTA
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DS 

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GTTAGTTCTTTAGTGATGAAGAAACTCTCCGGAGTGCAGTCTACTGAATCTGTTGAAGCC
GTTGCCTTGATGAGAATCCCTAGCAGCTTCATCGATCTTGAAGATGATGATGAAGACATG
ATCATAACAAGAGATTGTGACAAGTGGTTCCCTTCTGCTCACCGAGTTCTTGTTCTTGAC
AACATACAGGACCCTGGGAATCTTGGCACGTTAATCAGATCAGCTATGGCTTTTAATTGG
GATGGAGCATTTCCGCTTCCGGGTTGTTGTGATCCATTCAACGACAAAGCTCTGCGAGCA
AGCCGAGGTGCTTCCTTTCAACTCCCATTAGTTTCTGGTAACTGGAACCACCTTCAGCTT
CTACAACGTGACTTTCAGATGAAGCTATTGGCTGGCCATCCAGCAAGTACTACTACTACT
CAGAAACCAGTCTCCAAACTTTCCTTAGAGTTTGCTCAATCTTTAGCAGACAAGCCTTTA
TGCTTGATCTTAGGTAGTGAAGGGCACGGTTTGTCTGAGCAATCACGACAAGCGTGTGAG
CTTGTGAGCATTCCCATGGAAGGTGAGTTTGAATCTCTTAATGTATCGGTTGCTGGTGGC
ATTTTCTTATTCATGCCTCAATAAATATATAAAAAGTTGACCACCC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

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AATGAATTTAGCAGTAAGTTTGAAATCGAACAAGGGAGTGCCATGTGGAGTTTAGTATCA
GACCACTGTATAATCTGTCCAATTGGTTCATCATCCTAGTCAATTGTTTCAGTCACACTG
TTAATAAACTTGCTGTAATGTAAACAAAAGATTCAATAGGGCTCCTTCCAACACTAAAAA
AATCGATGTTACC


BQ
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AF RS1F440JQ C 1
AF RS1F440TF U 1
BS 1 373 RS1F440TF

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QA 1 373 1 373
DS 

RD RS1F440TF 373 0 0
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CCGGTGAATTGGATTGAGATAGAGAAGTTCTTCAAGGTGCCAAAGACGGTAAAAGAGTCG
AAATGGGTCAAGGTCAAGCTTCTTCAGATGCAGAGGAGAAGCTATGGGTTGCATCTTTGG
AATGAATTTAGCAGTAAGTTTGAAATCGAACAAGGGAGTGCCATGTGGAGTTTAGTATCA
GACCACTGTATAATCTGTCCAATTGGTTCATCATCCTAGTCAATTGTTTCAGTCACACTG
TTAATAAACTTGCTGTAATGTAAACAAAAGATTCAATAGGGCTCCTTCCAACACTAAAAA
AATCGATGTTACC

QA 1 373 1 373
DS 



AS 1 2

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TGTTTTTTTTTGTGTGTGTGTCTGAATATAGATAAACGTCACATATATCCATATATTTGA
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AAGATCAACCGACAAGTAACGTTTGCGAAGCGTAGGAACGGATTGTTGAAGAAAGCTTAC
GAATTGTCTGTTCTTTGCGATGCTGAGGTGGCTCTCATCATCTTCTCCAACCGTGGCAAG
CTCTATGAGTTTTGCAGCTCCTCTAACATGATCAAGACACTGGAACGGTACCAGAAATGC
AGTTATGGTTCTATTGAAGTCAACAACAAACCTGCCAAAGAACTTGAGAATAGCTACAGA
GAGTATCTGAAGCTTAAGGGTAGGTATGAGAGCCTTCAGCGCCAACAAAGGAATCTTCTT
GGGGATGATTTAGGACCTCTCAACTCAAAGGAACTAGAGCAGCTTGAGCGTCAACTAGAT
GGCTCTCTCAAGCAAGTTCGCTCCATCAAGACACAGTACATGCTTGACCAGCTCTCTGAT
CTTCAAAGCAAAGAGCAAATGTTGCTTGAAACCAATAGAGCTTTGGCAATGAAGCTGGAT
GATATGATTGGTGTGAGAAGCCATCATATGGGAGGAGGAGGAGGATGGGAAGGCAATGAA
CAGAATGTTTCGTACGAGCATCATCAAGCTCAGAGTCAAGGACTATTCCAGCCTCTTGAA
TGCAATCCTACTCTGCAGATGGGGTACAACAATCCAGTAGGTTCGGAGCAGATAACTGCA
ACAACACAAGCGCAGGCGCAGCCAGGGAACGGTTACATCCCAGGCTGGATGCTCTTAGTG
TCCACATTCTGAGAGTCAGTCAATGTGATCAAAACTCACCAACAAAAGCTCCGTTTTAAA
TAATATAAATAGTAGTATAGAACACAAGACTTGGATTTATTTATATAATTAAGTGGCTAT
GTATATTGTCCTAAGAATCT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1E278TF U 1
AF RS1GH82TF U 492
BS 1 587 RS1E278TF
BS 588 1160 RS1GH82TF

RD RS1E278TF 587 0 0
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TCCTTACAGTTTCTTGTTCTTGAAATTAGGGTTAATTTCTTTTTTTCTTCCTTTAATTTA
AATCACTTCCCCGGACCTTAAAGATCAGATCTTTCCTCAGAAAAAGAGATACCCAACTCG
TGTTTTTTTTTGTGTGTGTGTCTGAATATAGATAAACGTCACATATATCCATATATTTGA
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GAGTATCTGAAGCTTAAGGGTAGGTATGAGAGCCTTCAGCGCCAACA

QA 1 587 1 587
DS 

RD RS1GH82TF 669 0 0
G
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GAGCAAATGTTGCTTGAAACCAATAGAGCTTTGGCAATGAAGCTGGATGATATGATTGGT
GTGAGAAGCCATCATATGGGAGGAGGAGGAGGATGGGAAGGCAATGAACAGAATGTTTCG
TACGAGCATCATCAAGCTCAGAGTCAAGGACTATTCCAGCCTCTTGAATGCAATCCTACT
CTGCAGATGGGGTACAACAATCCAGTAGGTTCGGAGCAGATAACTGCAACAACACAAGCG
CAGGCGCAGCCAGGGAACGGTTACATCCCAGGCTGGATGCTCTTAGTGTCCACATTCTGA
GAGTCAGTCAATGTGATCAAAACTCACCAACAAAAGCTCCGTTTTAAATAATATAAATAG
TAGTATAGAACACAAGACTTGGATTTATTTATATAATTAAGTGGCTATGTATATTGTCCT
AAGAATCT

QA 2 669 2 669
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GTTCTTGATCGGTAAAAGCATAATGATATCTCCGGCGCTGGAGAAAGGGACAGTGTCCGT
CGATGCTTATTTCCCCGCCGGGAACTGGTTCGATATGTTTAACTATTCCTTTACCGTCGG
TGGAGATTCCGGCAAGCACGTCAGGCTTGATACTCCCGCCGATCACGTCAATGTTCATGT
TCGAGAAGGTAGCATTGTGGCTATGCAAGGAGAAGCTATGACAACTAGAGAAGCCAGAAC
GAAACCGTTTGAGCTTCTAGTTGTAGCCAGCAGGCTTGAGAACATCTCGGGCCAACTGTT
TCTCGATGATGGCG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1GF05JQ C 1
AF RS1GF05TF U 1
BS 1 374 RS1GF05TF

RD RS1GF05JQ 374 0 0
GGCGCGACCGCTCTTCTTCTCCTTCCCTAGAGACATTAACACCTATGAGATCAGTTCGCA
GTTCTTGATCGGTAAAAGCATAATGATATCTCCGGCGCTGGAGAAAGGGACAGTGTCCGT
CGATGCTTATTTCCCCGCCGGGAACTGGTTCGATATGTTTAACTATTCCTTTACCGTCGG
TGGAGATTCCGGCAAGCACGTCAGGCTTGATACTCCCGCCGATCACGTCAATGTTCATGT
TCGAGAAGGTAGCATTGTGGCTATGCAAGGAGAAGCTATGACAACTAGAGAAGCCAGAAC
GAAACCGTTTGAGCTTCTAGTTGTAGCCAGCAGGCTTGAGAACATCTCGGGCCAACTGTT
TCTCGATGATGGCG

QA 1 374 1 374
DS 

RD RS1GF05TF 374 0 0
GGCGCGACCGCTCTTCTTCTCCTTCCCTAGAGACATTAACACCTATGAGATCAGTTCGCA
GTTCTTGATCGGTAAAAGCATAATGATATCTCCGGCGCTGGAGAAAGGGACAGTGTCCGT
CGATGCTTATTTCCCCGCCGGGAACTGGTTCGATATGTTTAACTATTCCTTTACCGTCGG
TGGAGATTCCGGCAAGCACGTCAGGCTTGATACTCCCGCCGATCACGTCAATGTTCATGT
TCGAGAAGGTAGCATTGTGGCTATGCAAGGAGAAGCTATGACAACTAGAGAAGCCAGAAC
GAAACCGTTTGAGCTTCTAGTTGTAGCCAGCAGGCTTGAGAACATCTCGGGCCAACTGTT
TCTCGATGATGGCG

QA 1 374 1 374
DS 



AS 1 2

CO CL5127Contig1 373 2 2 U
GCGTTGGTTACACGCGAGTTATTGCCGGAGGCGGCGTTGATGACGTTGAAGAAATCAAGC
AGTGGGAGGTTGGCTTGTCTGGATCTGAGTTTGGGGATGGTGGAGAATTTGAATCTCAAG
TTGGAGCTTGGAAGACCTGTTTGTTGATTTGTTTTTCTTTTTCTTTACCCCTTTTTGTTT
TTTTCTGGATATATTAATTAGTTTCCATCATTCTTTGATTTGTTTCCTTGATATTTTAGA
TTTATACATATACATCTGCAGATTTAGGAAACTTTCATAGGCCGGGTGTAATATTTTCTT
TCCTTTCATGGTGAAAATATTCTTTACTTGCTTGAGATTTGTTATATATATATCTTTCAG
TTTAAACTTAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AM17JQ C 1
AF RS1AM17TF U 92
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BS 92 373 RS1AM17TF

RD RS1AM17JQ 373 0 0
GCGTTGGTTACACGCGAGTTATTGCCGGAGGCGGCGTTGATGACGTTGAAGAAATCAAGC
AGTGGGAGGTTGGCTTGTCTGGATCTGAGTTTGGGGATGGTGGAGAATTTGAATCTCAAG
TTGGAGCTTGGAAGACCTGTTTGTTGATTTGTTTTTCTTTTTCTTTACCCCTTTTTGTTT
TTTTCTGGATATATTAATTAGTTTCCATCATTCTTTGATTTGTTTCCTTGATATTTTAGA
TTTATACATATACATCTGCAGATTTAGGAAACTTTCATAGGCCGGGTGTAATATTTTCTT
TCCTTTCATGGTGAAAATATTCTTTACTTGCTTGAGATTTGTTATATATATATCTTTCAG
TTTAAACTTAAAC

QA 1 373 1 373
DS 

RD RS1AM17TF 282 0 0
TGGGGATGGTGGAGAATTTGAATCTCAAGTTGGAGCTTGGAAGACCTGTTTGTTGATTTG
TTTTTCTTTTTCTTTACCCCTTTTTGTTTTTTTCTGGATATATTAATTAGTTTCCATCAT
TCTTTGATTTGTTTCCTTGATATTTTAGATTTATACATATACATCTGCAGATTTAGGAAA
CTTTCATAGGCCGGGTGTAATATTTTCTTTCCTTTCATGGTGAAAATATTCTTTACTTGC
TTGAGATTTGTTATATATATATCTTTCAGTTTAAACTTAAAC

QA 1 282 1 282
DS 



AS 1 2

CO CL5128Contig1 647 2 3 U
GGATGGCCAAAATGGAATCAATCAGCTTCTCTCTGGCCATCACCACATCTTATTCTTCCT
GAACCTATCTTCTTCTCATTTCTGCATTCCTTCTTCTTCTTTTAGTTATATTTTTTTTCC
CTTCTTCTCTTAATCAATTCGATCGATCAAGTGAAAATGGCTCAATCCTGCGTTAAAGTC
GCTCGAACCAACAATCTCAAGAACCTAGTGAACCGTCGTGTTTTGATTCTCCGTCGATTC
ACGCGCATTCTCCTGAACAGAATCGTCCCTTGCACTCCCGGCAAATCACAGAGTTATCTC
CTGTTGTCACGCGCCGCCACTCCCTCTCCCAGTGTCTCTCGTTCTCTCCCTCCTCCTCCG
GTCGTTGACGGTGAGGTCGCACGCCGCACATCGGTACACGACCTCGATAGCAGCAACCGG
AGATCTGACTCTGATCTTGTTTCTCTGAAAATCAGCCTCTTAGGAGATCCCGACACCGGA
AAGACTTGCTTCCTGGCCAAGTATGTTGGTGGAGAGAAACAAGTTGAGATGAGAGAGTTG
GAGAAAGGGATCCATTGTACTGACAAGACGTTATCCATGGGAGGAGCTCGCATTTCCTAC
AGTATCTGCGAGTTACAAGGGGCTGAGAAATCACGTGATCTAATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GJ82TF U 1
AF RS1AW92TF U 237
BS 1 454 RS1GJ82TF
BS 455 455 RS1AW92TF
BS 456 647 RS1GJ82TF

RD RS1GJ82TF 647 0 0
GGATGGCCAAAATGGAATCAATCAGCTTCTCTCTGGCCATCACCACATCTTATTCTTCCT
GAACCTATCTTCTTCTCATTTCTGCATTCCTTCTTCTTCTTTTAGTTATATTTTTTTTCC
CTTCTTCTCTTAATCAATTCGATCGATCAAGTGAAAATGGCTCAATCCTGCGTTAAAGTC
GCTCGAACCAACAATCTCAAGAACCTAGTGAACCGTCGTGTTTTGATTCTCCGTCGATTC
ACGCGCATTCTCCTGAACAGAATCGTCCCTTGCACTCCCGGCAAATCACAGAGTTATCTC
CTGTTGTCACGCGCCGCCACTCCCTCTCCCAGTGTCTCTCGTTCTCTCCCTCCTCCTCCG
GTCGTTGACGGTGAGGTCGCACGCCGCACATCGGTACACGACCTCGATAGCAGCAACCGG
AGATCTGACTCTGATCTTGTTTCTCTGAAAATCATCCTCTTAGGAGATCCCGACACCGGA
AAGACTTGCTTCCTGGCCAAGTATGTTGGTGGAGAGAAACAAGTTGAGATGAGAGAGTTG
GAGAAAGGGATCCATTGTACTGACAAGACGTTATCCATGGGAGGAGCTCGCATTTCCTAC
AGTATCTGCGAGTTACAAGGGGCTGAGAAATCACGTGATCTAATCCC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RS1AW92TF 379 0 0
ATTCACGCGCATTCTCCTGAACAGAATCGTCCCTTGCACTCCCGGCAAATCACAGAGTTA
TCTCCTGTTGTCACGCGCCGCCACTCCCTCTCCCAGTGTCTCTCGTTCTCTCCCTCCTCC
TCCGGTCGTTGACGGTGAGGTCGCACGCCGCACATCGGTACACGACCTCGATAGCAGCAA
CCGGAGATCTGACTCTGATCTTGTTTCTCTGAAAATCAGCCTCTTAGGAGATCCCGACAC
CGGAAAGACTTGCTTCCTGGCCAAGTATGTTGGTGGAGAGAAACAAGTTGAGATGAGAGA
GTTGGAGAAAGGGATCCATTGTACTGACAAGACGTTATCCATGGGAGGAGCTCGCATTTC
CTACAGTATCTGCGAGTTA

QA 1 379 1 379
DS 



AS 1 2

CO CL5129Contig1 1201 2 4 U
GATATCAAACAAAATCAAACCCAATAAACTGAGAAGGATATAAAAGGCAAGATAATGAAG
TCGGCCGTGATCTCAGTCTTCGTCCTCGTGATTCTCGTGGCCTGGCAAGTATCGGCTGGC
AAAGACTTACCGGAGGAGGGAGGATACGGAGGCGACGAGGAAGAGGACACAAAGTCATGG
TTTCCTTTGGACAATCAATTATCGTTGAGTTATTATGATAAGATTTGTCCAAATTTTGAG
AAAATCGTTGATAGCAAAGTTAGGGAATGGACAAAGACTGATCCGTCCCTTGGTCCAGCC
CTCCTACGCCTTCTCTTCCACGATTGCGGCGTCACGGGATGTGATGCATCTATTCTTCTA
GACCACAAAGGATCGGAGAGAAGATCTCCAGCAAGCAAAACCCTAAGAGGCTTCGAGCTA
ATCGACGATATCAAGTCTGAGCTCGAGAAAGCCTGCCCCAGTCTAGTCTCATGTGCCGAC
ATCCTAACCGCAGCTAGCCGCAGCGCCACCTACCAACTAGGTGGTCCTTACTGGCCCAAC
GCCTACGGACGTCGTGACTCCAAAGACTCTTACGCTAGAGACGCCGAGAAAGTCCCCTCA
GGCCGCCGTGACATCACCGCCCTTCTCGAGACGTTTCAGTCTTACGGACTCAACATTCTC
GATCTTGTCGTCCTTTCCGGAGCCCACACCATCGGAAAAGCCTACTGTGGAACCATCCAG
TCGAGGCTCTACAACTTCAACGCCACCCATGGAACTGATCCGTCCATTGACACCAAATAC
GCAGATTTCTTGCGCCGCAAGTGTCGTTGGGCCTCGGAGACGGTTTACCTAGACGCCACG
ACTCCGGTGGTATTCGATAATCAGTACTACATTAATCTTCAGAAGAATATGGGAGTTTTG
ACGACTGATGCGGAGCTTGTGAAGGACCCGAGGACTGCTCCGCTTGTAAAAGCTTTCGCG
GAGCAGCCGCCTCAGATGTTCAGACATCAGTTTGCTGTGTCGATGGCTAAGCTGGTCAAT
GTCGGTGTCATCACTGGTGAAGATCGTATTGGAGAGATCCGGAGGGTTTGCAGCAAATCT
AACTCTAAACGTTACTGATTTTTTCTTTTCCAAAAAAATCGGTGCTGAGTTTATAAAAGA
ATCTTGCTTGACAAATAATTTCTTGTTTTGTTTCAATTTTAATTTTGTGATACGTTGTCT
G


BQ
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10 

AF RS1AQ51TFB U 1
AF RS1AQ51JQ C 455
BS 1 822 RS1AQ51TFB
BS 823 823 RS1AQ51JQ
BS 824 834 RS1AQ51TFB
BS 835 1201 RS1AQ51JQ

RD RS1AQ51TFB 834 0 0
GATATCAAACAAAATCAAACCCAATAAACTGAGAAGGATATAAAAGGCAAGATAATGAAG
TCGGCCGTGATCTCAGTCTTCGTCCTCGTGATTCTCGTGGCCTGGCAAGTATCGGCTGGC
AAAGACTTACCGGAGGAGGGAGGATACGGAGGCGACGAGGAAGAGGACACAAAGTCATGG
TTTCCTTTGGACAATCAATTATCGTTGAGTTATTATGATAAGATTTGTCCAAATTTTGAG
AAAATCGTTGATAGCAAAGTTAGGGAATGGACAAAGACTGATCCGTCCCTTGGTCCAGCC
CTCCTACGCCTTCTCTTCCACGATTGCGGCGTCACGGGATGTGATGCATCTATTCTTCTA
GACCACAAAGGATCGGAGAGAAGATCTCCAGCAAGCAAAACCCTAAGAGGCTTCGAGCTA
ATCGACGATATCAAGTCTGAGCTCGAGAAAGCCTGCCCCAGTCTAGTCTCATGTGCCGAC
ATCCTAACCGCAGCTAGCCGCAGCGCCACCTACCAACTAGGTGGTCCTTACTGGCCCAAC
GCCTACGGACGTCGTGACTCCAAAGACTCTTACGCTAGAGACGCCGAGAAAGTCCCCTCA
GGCCGCCGTGACATCACCGCCCTTCTCGAGACGTTTCAGTCTTACGGACTCAACATTCTC
GATCTTGTCGTCCTTTCCGGAGCCCACACCATCGGAAAAGCCTACTGTGGAACCATCCAG
TCGAGGCTCTACAACTTCAACGCCACCCATGGAACTGATCCGTCCATTGACACCAAATAC
GCAGATTTCTTGCGCCGCAAGTGTCGTTGGGCCTCGGAGACG*TTTACCTAGAC

QA 1 834 1 834
DS 

RD RS1AQ51JQ 747 0 0
GCCCCAGTCTAGTCTCATGTGCCGACATCCTAACCGCAGCTAGCCGCAGCGCCACCTACC
AACTAGGTGGTCCTTACTGGCCCAACGCCTACGGACGTCGTGACTCCAAAGACTCTTACG
CTAGAGACGCCGAGAAAGTCCCCTCAGGCCGCCGTGACATCACCGCCCTTCTCGAGACGT
TTCAGTCTTACGGACTCAACATTCTCGATCTTGTCGTCCTTTCCGGAGCCCACACCATCG
GAAAAGCCTACTGTGGAACCATCCAGTCGAGGCTCTACAACTTCAACGCCACCCATGGAA
CTGATCCGTCCATTGACACCAAATACGCAGATTTCTTGCGCCGCAAGTGTCGTTGGGCCT
CGGAGACGGTTTACCTAGACGCCACGACTCCGGTGGTATTCGATAATCAGTACTACATTA
ATCTTCAGAAGAATATGGGAGTTTTGACGACTGATGCGGAGCTTGTGAAGGACCCGAGGA
CTGCTCCGCTTGTAAAAGCTTTCGCGGAGCAGCCGCCTCAGATGTTCAGACATCAGTTTG
CTGTGTCGATGGCTAAGCTGGTCAATGTCGGTGTCATCACTGGTGAAGATCGTATTGGAG
AGATCCGGAGGGTTTGCAGCAAATCTAACTCTAAACGTTACTGATTTTTTCTTTTCCAAA
AAAATCGGTGCTGAGTTTATAAAAGAATCTTGCTTGACAAATAATTTCTTGTTTTGTTTC
AATTTTAATTTTGTGATACGTTGTCTG

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

CO CL5130Contig1 629 2 3 U
ATATAAAAGATCTTGATATAGAAAATAAATGTTGCATAAATGTTCAGTAAGAAAAAACAG
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AAGACAAAGTGCAGCTTCAAGACCAGCCAAACCTTTGACAAGTGAGCAACACTCCTGGCT
CGGTGGTGTACCGATGACCTCATGAACTAAACCTAACCAGCTCCCACACACTCCAAACTT
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GGCATGACAAAACAAGAATGTTAAGTTGAGGACTAGCAACAAGACGAGAAGCAATGGAAA
AGCTTTTGAAATAGCCATTGGTTTGTTTGAGTTTCAAGCTATAGCTACGGGATATCGAAG
AAGAAGAAGAAGAAGATAGACCTTTTAATTTGCTTTCTCTGGTGGGGAGTTTATCATCCT
GCATGTGGCTGCAATCATTTGTGTTATCC


BQ
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AF RS1BS33JQ U 148
AF RS1BS33TF C 1
BS 1 150 RS1BS33TF
BS 151 537 RS1BS33JQ
BS 538 629 RS1BS33TF

RD RS1BS33JQ 390 0 0
AAA
AGTCTTGCCACAAGAGTTGAAAAGCAAAGTGAGAGCAACAGGAAGTTTAACCGGAGCGAC
TCCGAGTAGGCTGGTTTTAAGGGCAGTGCAAAGACAAAGTGCAGCTTCAAGACCAGCCAA
ACCTTTGACAAGTGAGCAACACTCCTGGCTCGGTGGTGTACCGATGACCTCATGAACTAA
ACCTAACCAGCTCCCACACACTCCAAACTTGACCGTGTCTCTTGGACATTTCATGGATGA
TTGTTTTGTGGGAGGAGGGCATTGCTTAACGGCATGACAAAACAAGAATGTTAAGTTGAG
GACTAGCAACAAGACGAGAAGCAATGGAAAAGCTTTTGAAATAGCCATTGGTTTGTTTGA
GTTTCAAGCTATAGCTACGGGATATCG

QA 4 390 4 390
DS 

RD RS1BS33TF 629 0 0
ATATAAAAGATCTTGATATAGAAAATAAATGTTGCATAAATGTTCAGTAAGAAAAAACAG
GAATATGAAATACAATAAAAGAAAAAAAAGAAACAATTCTTTTACAAGATAACAATTGGT
TCAAGATCAACAGACGAATCCCTGAGGAAGAGTCTTGCCACAAGAGTTGAGAAGCAAAGT
GAGAGCAACAGGAAGTTTAACCGGAGCGACTCCGAGTAGGCTGGTTTTAAGGGCAGTGCA
AAGACAAAGTGCAGCTTCAAGACCAGCCAAACCTTTGACAAGTGAGCAACACTCCTGGCT
CGGTGGTGTACCGATGACCTCATGAACTAGACCTAACCAGCTCCCACACACTCCAAACTT
GACCGTGTCTCTTGGACATTTCATGGATGATTGTTTTGTGGGAGGAGGGCATTGCTTAAC
GGCATGACAAAACAAGAATGTTAAGTTGAGGACTAGCAACAAGACGAGAAGCAATGGAAA
AGCTTTTGAGATAGCCATTGGTTTGTTTGAGTTTCAAGCTATAGCTACGGGATATCGAAG
AAGAAGAAGAAGAAGATAGACCTTTTAATTTGCTTTCTCTGGTGGGGAGTTTATCATCCT
GCATGTGGCTGCAATCATTTGTGTTATCC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 2

CO CL5131Contig1 282 2 1 U
GCTCATCATTGGTTTCATCCTAAAACTCGCCTTAGCTTCTCCCACATAACAGCTATCAGC
AGCTTCTCCGCATCATCTACCATTTCAGCTTACGAGGGATAGCTGTTAACTCTCTATTGA
TCTTGTTCTACTTTGTCCATTAAAATTTGCTTCTTTGTCAATTATATTGGATGTACATCA
TTGACCCAATAGAACCTTTCATTATTATGTTTACTTCTCCACTACATTTAAGTGGAAATG
ACTTATTCTCTTTATACGCATTGTGCAGGAAAACTGTTTCAT


BQ
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AF RS1GX08JQ C 1
AF RS1GX08TF U 1
BS 1 282 RS1GX08TF

RD RS1GX08JQ 282 0 0
GCTCATCATTGGTTTCATCCTAAAACTCGCCTTAGCTTCTCCCACATAACAGCTATCAGC
AGCTTCTCCGCATCATCTACCATTTCAGCTTACGAGGGATAGCTGTTAACTCTCTATTGA
TCTTGTTCTACTTTGTCCATTAAAATTTGCTTCTTTGTCAATTATATTGGATGTACATCA
TTGACCCAATAGAACCTTTCATTATTATGTTTACTTCTCCACTACATTTAAGTGGAAATG
ACTTATTCTCTTTATACGCATTGTGCAGGAAAACTGTTTCAT

QA 1 282 1 282
DS 

RD RS1GX08TF 282 0 0
GCTCATCATTGGTTTCATCCTAAAACTCGCCTTAGCTTCTCCCACATAACAGCTATCAGC
AGCTTCTCCGCATCATCTACCATTTCAGCTTACGAGGGATAGCTGTTAACTCTCTATTGA
TCTTGTTCTACTTTGTCCATTAAAATTTGCTTCTTTGTCAATTATATTGGATGTACATCA
TTGACCCAATAGAACCTTTCATTATTATGTTTACTTCTCCACTACATTTAAGTGGAAATG
ACTTATTCTCTTTATACGCATTGTGCAGGAAAACTGTTTCAT

QA 1 282 1 282
DS 



AS 1 2

CO CL5132Contig1 581 2 2 U
AAGTGGAAACCAAATTTGATGTTAAAATAGAGAAGTATTACATATCTTCATGATCTTAGA
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ATAGAGAGTTATAACATCTCTTTATTACACAAAGGAAGTTCCAATAGCTTTCAGATGGCT
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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CTAGTTTAACCCATACTCACTCGAAGACAAGAACGGCTTCTGTGAACCTCAGGAAGTGAC
TGCCACCACTTTCTGAATGTTGAGCCCTCCAGAAAAATATGCTCATCATCTACTTCCTTA
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QA 1 581 1 581
DS 

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QA 1 378 1 378
DS 



AS 1 2

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TTAGTTATTTGTGGGCAGTAGTTTTTTCTGAAATCTTTTTCCGGATAGACTTTCAGTCTG
ATTCTGATGGGTTTCTCCTTAAACTGCTGCTGGTGGTGACTGATCTTCTCGATCGTCGTT
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BQ
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AF RS1FZ35TF U 1
AF RS1FZ35JQ C 280
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BS 658 934 RS1FZ35JQ

RD RS1FZ35TF 657 0 0
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TTAGTTATTTGTGGGCAGTAGTTTTTTCTGAAATCTTTTTCCGGATAGACTTTCAGTCTG
ATTCTGATGGGTTTCTCCTTAAACTGCTGCTGGTGGTGACTGATCTTCTCGATCGTCGTT
GTGGCTTGTCCATTTACCCCACCTCCCACTTTCTCTACTAATCGGTTGTCAGATTTTGCA
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GCTCTCATCTGTGGCTTCTTCTTGGCGTTCCTTGTCACTTCTAGTCGACGTCGCCTTCGG
CCATGATTGCCGTTATTGAAGCTCTCTGCTCTGTAATCAGTATGTGCTATTCACCAT

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DS 

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AATCGGTTGTCAGATTTTGCATGCAAGTTACATCTTCATCTCGGTGATTCTCGGGCTGGT
TTCTAGCTTCGTCTTGGCCTTGTTGTTCCTTTGGATCTGTTCTGGGTTCGATCCTTTTCT
AGTTTCATTCTTGTGACTAGATCTGTCCGGATTTGGATCGACTCGCTCCTTGTCTTCAAC
CCTGAGATTGGTCGATATCTCGCTCTCATCTGTGGCTTCTTCTTGGCGTTCCTTGTCACT
TCTAGTCGACGTCGCCTTCGGCCATGATTGCCGTTATTGAAGCTCTTTGCTCTGTAATCA
GTATGTGCTATTCACCATAGGAGGAGTCAGTCATCTTAAATTGGGTGACTTTCTATCAAA
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TTTGTATTGGTCCTATTTCGCTTGTTTGTTTTAGGTGTAGCTGTAGTACGTTTCCTTTGT
TAAGGCTTTATCTCTGGGAAAACTTTTGTTTTTCGCCAGCAACGTTTCCGGAGTCATTTC
TTTGTACTGCCGGCTTGGTTTCTCAAATATGTATTCCTCCCTTGTTTTTCCTGTG

QA 1 655 1 655
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CGAGGACCCAACACCAAAGATTTCAGCTTTCAGGATGCTGATCTCCTCAAACCAGACATT
CTTGCTCCTGGCTCTCTTATCTGGTCTGCTTGGTCTCAGAATGGAACAGACGAGGCTAAC
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ACTCTGAAACAGAGACGATGACGCTCGTCAAAGCAACTCCCTTCGATTACGGTAGCGGCC
ACGTCAATCCAAGCGCCGCTCTTGACCCTGGCCTCGTCTTCGACGCGGGTTACGAGGACT
ACTTAGGTTTCTTGTGCACCACGTCAGGCATCAACGCTCGCGAGATAAGGAACTTCACCA
ACACTCCTTGCAACTACAGAATGAGACACCCTTCGAACTTCAACTCGCCGTCTATAGCCG
TCTCTCATCTGGTGAGAACGCAGACGGTGACCAGGAGAGTGACGAATGTTGCGGAGGAGG
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CGGTGACCGGAGCTTATAGCTTTGGAGAGGTTACGTTGAAAGGAAGCCGCGGGCATAAAG
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TATTATTATTGTTATTTTTGTAATACGCAGTAATAATAATTAAAATATTAGTTTTGTCTG
AGTAAAAAAAAGGAATAATAATACAGTTTGTATAATTAGTAATATTTGTTTGCTTTATAA
GAACCTTGAGGAGATAATAGTAATATAATTATATGAT


BQ
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AF RS1GS58TF U 1
AF RS1GS58JQ C 459
BS 1 626 RS1GS58TF
BS 627 627 RS1GS58JQ
BS 628 753 RS1GS58TF
BS 754 1057 RS1GS58JQ

RD RS1GS58TF 753 0 0
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CGAGGACCCAACACCAAAGATTTCAGCTTTCAGGATGCTGATCTCCTCAAACCAGACATT
CTTGCTCCTGGCTCTCTTATCTGGTCTGCTTGGTCTCAGAATGGAACAGACGAGGCTAAC
TACGTCGGTGAAGGATTTGCACTGATCTCTGGCACAAGCATGGCTGCACCGCACATCGCC
GGTATAGCTGCACTGGTGAAACAGAAGCATCCTCAGTGGAGTCCAGCCGCCATCAAATCA
GCTCTGATGACGACTTCAACGGTCACGGACCGAGCAGGGAGGCCTCTCCAAGCCAGCAGT
ACTCTGAAACAGAGACGATGACGCTCGTCAAAGCAACTCCCTTCGATTACGGTAGCGGCC
ACGTCAATCCAAGCGCCGCTCTTGACCCTGGCCTCGTCTTCGACGCGGGTTACGAGGACT
ACTTAGGTTTCTTGTGCACCACGTCAGGCATCAACGCTCGCGAGATAAGGAACTTCACCA
ACACTCCTTGCAACTACAGAATGAGACACCCTTCGAACTTCAACTCGCCGTCTATAGCCG
TCTCTCATCTGGTGAGAACGCAGACG*TGACCAGGAGAGTGACGAATGTTGCGGAGGAGG
AAGAGACGTACACGATCACATCGAGGATGGAGCCGTCTATTGCTATTGAAGTGAGTCCTC
CTGCGATGACGCTTAGAGCGGGAGCTTCTAGAG

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1GS58JQ 599 0 0
TTCGACGCGGGTTACGAGGACTACTTAGGTTTCTTGTGCACCACGTCAGGCATCAACGCT
CGCGAGATAAGGAACTTCACCAACACTCCTTGCAACTACAGAATGAGACACCCTTCGAAC
TTCAACTCGCCGTCTATAGCCGTCTTTCATTTGGTGAGAACGCAGACGGTGACCAGGAGA
GTGACGAATGTTGCGGAGGAGGAAGAGACGTACACGATCACATCGAGGATGGAGCCGTCT
ATTGCTATTGAAGTGAGTCCTCCTGCGATGACGCTTAGAGCGGGAGCTTCTAGAGAGTTC
TCGGTGACTCTGACGGTGAGATCGGTGACCGGAGCTTATAGCTTTGGAGAGGTTACGTTG
AAAGGAAGCCGCGGGCATAAAGTGAGTCTCCCGGTGGTTGCCTTGGGATACAAGCGATGA
AGAAATGAATGTGAGGTTGTAATATTATTATTGTTATTTTTGTAATACGCAGTAATAATA
ATTAAAATATTAGTTTTGTCTGAGTAAAAAAAAGGAATAATAATACAGTTTGTATAATTA
GTAATATTTGTTTGCTTTATAAGAACCTTGAGGAGATAATAGTAATATAATTATATGAT

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 2

CO CL5136Contig1 1043 2 4 U
GGATGTCTCTCACTCTCTATCCAAACAATTAAAAAAAAAAAGGTCCATAAAGAAGAAAAA
AAAAGACAAGTTCCGGAAAACAACGCAGCATCGCCGTCGTCGTACCAAGAATCTTTAAAT
TTTTTTTTGGTATCTCAACCTTTGATTCTTCGAATTTATTCGGTTTTCGAATCGAGAAAG
AAATGGATTCTGATTCATGGAGTGATCGTCTCGCATCCGCTTCACGAAGATACCAGCTCG
ATTTCTTGTCTCGATCTGATAACTTCTTGGGGTTTGAGGAGGTAGAGGGAGAAGATGAGT
TCAGGGAAGAGTATGCTTGCCCCTTCTGCTCAGACTACTTTGATATCGTCTCTCTCTGCT
GCCACATAGACGAAGATCATCCCCACGGAAACAATCAATGGGGTATGTCCCGTTTGTGCG
GTGAAAGTGAGCTCTGATATGGTTGCTCATATAACTCTTCAACATGCAAATATGTTCAAG
GTGACAACTCGGAAAAGAAAATCAAGAAGAGGCGGGGTTCAATCCATGCTATCAATCTTG
AGGAGAGAGTTTCCTGATGGAAACTTCCAGAGCTTGTTTGAAGGATCTTCACGTGTTGTT
GTACCTTCTTCTTCCTCCAGTATAGCTGCTGACCCTTTGTTGTCTTCCTTCATTTCTCCG
ATGGCGGATGGACTTTTCATTTCAGAGACGAGTTCTGCCAAAAAGACATCAAACCAGAGT
TTGCCTGAACGGAGTGTTGAGAAGAAGTCGCTTTCAGCAGAGGATCACAGAGAAAAGTTG
AAACAGAGCGAGTTCGTTCAAGGGGTTTTTTGCTCAATGATTCTTGATGATGATTTATAA
AGGAGAGAAAAAAATAACTTTGTCTACAAGTATTATTAGATCATTCAACTGTTGGAACAA
ATTTAATGGAGTTGTTGTTTGTTTTCAACAAGTGATATGGTGGGATAACCAAGAATAATG
TTAGAGAAGCTTTGTATTGAAGAGTCAAAAGAGATACATGAATAATGAGTATTATTTATC
TTATTGAACACATTCTTTTCTTT


BQ
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AF RS1CE69TF U 1
AF RS1CE69JQ C 310
BS 1 383 RS1CE69TF
BS 384 384 RS1CE69JQ
BS 385 700 RS1CE69TF
BS 701 1043 RS1CE69JQ

RD RS1CE69TF 700 0 0
GGATGTCTCTCACTCTCTATCCAAACAATTAAAAAAAAAAAGGTCCATAAAGAAGAAAAA
AAAAGACAAGTTCCGGAAAACAACGCAGCATCGCCGTCGTCGTACCAAGAATCTTTAAAT
TTTTTTTTGGTATCTCAACCTTTGATTCTTCGAATTTATTCGGTTTTCGAATCGAGAAAG
AAATGGATTCTGATTCATGGAGTGATCGTCTCGCATCCGCTTCACGAAGATACCAGCTCG
ATTTCTTGTCTCGATCTGATAACTTCTTGGGGTTTGAGGAGGTAGAGGGAGAAGATGAGT
TCAGGGAAGAGTATGCTTGCCCCTTCTGCTCAGACTACTTTGATATCGTCTCTCTCTGCT
GCCACATAGACGAAGATCATCCC*ACGGAAACAATCAATGGGGTATGTCCCGTTTGTGCG
GTGAAAGTGAGCTCTGATATGGTTGCTCATATAACTCTTCAACATGCAAATATGTTCAAG
GTGACAACTCGGAAAAGAAAATCAAGAAGAGGCGGGGTTCAATCCATGCTATCAATCTTG
AGGAGAGAGTTTCCTGATGGAAACTTCCAGAGCTTGTTTGAAGGATCTTCACGTGTTGTT
GTACCTTCTTCTTCCTCCAGTATAGCTGCTGACCCTTTGTTGTCTTCCTTCATTTCTCCG
ATGGCGGATGGACTTTTCATTTCAGAGACGAGTTCTGCCA

QA 1 700 1 700
DS 

RD RS1CE69JQ 734 0 0
AGTATGCTTGCCCCTTCTGCTCAGACTACTTTGATATCGTCTCTCTCTGCTGCCACATAG
ACGAAGATCATCCCCACGGAAACAATCAATGGGGTATGTCCCGTTTGTGCGGTGAAAGTG
AGCTCTGATATGGTTGCTCATATAACTCTTCAACATGCAAATATGTTCAAGGTGACAACT
CGGAAAAGAAAATCAAGAAGAGGCGGGGTTCAATCCATGCTATCAATCTTGAGGAGAGAG
TTTCCTGATGGAAACTTCCAGAGCTTGTTTGAAGGATCTTCACGTGTTGTTGTACCTTTT
TCTTCCTCCAGTATAGCTGCTGACCCTTTGTTGTCTTCCTTCATTTTTCCGATGGCGGAT
GGACTTTTCATTTCAGAGACGAGTTTTGCCAAAAAGACATCAAACCAGAGTTTGCCTGAA
CGGAGTGTTGAGAAGAAGTCGCTTTCAGCAGAGGATCACAGAGAAAAGTTGAAACAGAGC
GAGTTCGTTCAAGGGGTTTTTTGCTCAATGATTCTTGATGATGATTTATAAAGGAGAGAA
AAAAATAACTTTGTCTACAAGTATTATTAGATCATTCAACTGTTGGAACAAATTTAATGG
AGTTGTTGTTTGTTTTCAACAAGTGATATGGTGGGATAACCAAGAATAATGTTAGAGAAG
CTTTGTATTGAAGAGTCAAAAGAGATACATGAATAATGAGTATTATTTATCTTATTGAAC
ACATTCTTTTCTTT

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL5137Contig1 842 2 2 U
GGACTGTCGTTTCGTCCAAAGTTTTCACCGACGAACCGAACTGTTTATCTCCTTTCCCTT
TAGGATTCAATCTCTCTCAGGTAAATTTTTCTTCTTCCAGTGTTATTAATTGGCTTCAAA
TTTTGCTACAATTGATATCGAATTTTCACTTTTTTTTTTCTGGGTTCCACGAAATTCAAC
TCCTTTACGATTTGATTTTACATGATTTTCAATTGTAAGATTAACGATTTCTTCTTGTTT
CTATATGTCTTTAAACTGTTTTATCATTCTTCCGTTGTCTTCTCTGAGCATTTTCATGGC
AGACTAATGGAAGAGCATACGAGTCACTCTTCTTTCGATGAACATTGTTTCTTCTGCGGG
AAAAAGGGAGGTTCAGGGGAATGGGACAGTATGGTCAAGATTGCTAAAGCGATGATTACA
ACTGGAGAGGTCCTATCTGCGAGCGAATACATCATCTGCAAATGAATCCAACTCAAAAAC
GATGATGATGTTTAAGGTTGCTGTGAGTCCAGAGAAAGCATACGCCGGAGCTGCCATTTC
ATTTATCTTTGGGATACTTTCATGGCAAATCAGTCAGGGAATCCAAAGCATACCAGAGAG
CTCATTGCAGTATGCTAATGACAATGCATTGCTTCTCGCAAAGTCTCTAAGAGGGTCCCT
TCTAGCTACGTTTTATGCGTCAGCCGTCTTGTCAGGCTTCACAACAGCGGGGCTTCTCCT
TCTCGCTAAGCAGCTTTCATCGGAGAAAGACTCATCATAATCCTTCCGGGGAAGATCTCT
AATGTTTGTATCTACTACAACCTTTAATTATGTCTATTATACTGTGGAATTGGGTTGAGT
TG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RS1D588TF U 1
AF RS1D588JQ C 331
BS 1 636 RS1D588TF
BS 637 842 RS1D588JQ

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TAGGATTCAATCTCTCTCAGGTAAATTTTTCTTCTTCCAGTGTTATTAATTGGCTTCAAA
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TCCTTTACGATTTGATTTTACATGATTTTCAATTGTAAGATTAACGATTTCTTCTTGTTT
CTATATGTCTTTAAACTGTTTTATCATTCTTCCGTTGTCTTCTCTGAGCATTTTCATGGC
AGACTAATGGAAGAGCATACGAGTCACTCTTCTTTCGATGAACATTGTTTCTTCTGCGGG
AAAAAGGGAGGTTCAGGGGAATGGGACAGTATGGTCAAGATTGCTAAAGCGATGATTACA
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ATGGTCAAGATTGCTAAAGCGATGATTACAACTGGAGAGGTCCTATCTGCGAGCGAATAC
ATCATCTGCAAATGAATCCAACTCAAAAACGATGATGATGTTTAAGGTTGCTGTGAGTCC
AGAGAAAGCATACGCCGGAGCTGCCATTTCATTTATCTTTGGGATACTTTCATGGCAAAT
CAGTCAGGGAATCCAAAGCATACCAGAGAGCTCATTGCAGTATGCTAATGACAATGCATT
GCTTCTCGCAAAGTCTCTAAGAGGGTCCCTTCTAGCTACGTTTTATGCGTCAGCCGTCTT
GTCAGGCTTCACAACAGCGGGGCTTCTCCTTCTCGCTAAGCAGCTTTCATCGGAGAAAGA
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TGTCTATTATACTGTGGAATTGGGTTGAGTTG

QA 1 512 1 512
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5139Contig1 1159 2 2 U
GGATCTCAAAACCAATCAAATGGCTTCTCTGGACCACATTCTCTGTCTTCTTCCTCTTCT
CCTCATCTCTTCCTTACACGTTCTGCTTGCTTCAGCCACACCACACAAACTAAAAAACGC
CATTACCATCCGAGACGTCAACCGCAGAGTACCTTACATCGGTCTCGTGACGGTCTTTGA
GACTGAAGAAAATGCTTTCCTGGGAAGTGTAGATTTCAGACCGGATCCTGCTCATCCCTT
CTTGGATCTCTCTGGAAGACGTTTTCGGATAGGGAAGATTCATGGAAAGAAGGTTGTGTA
TGTCAGATGTGGGATAGGAATGGTGAACGCCGCAGCAGCAACGCAACAAATGATAGACGT
GTTTAAAGTGAAAGGGATTGTGCATTTTGGGATTGCAGGAAATATAAACAACTCAATGTC
CATAGGAGACGTGAGCATTCCTAAGCAAATCACCAATGCTGGCTTGTGGGATTGGCTGAA
TCCAGACAAAGCAGAGGGAGGTGACTATGCAGCATACTTAGATTTTGGGAAGTATACTGT
TCCACAAGGGGATGGCAGCGACAGTGTGTTAGGGAGCATTGGATACAGCTACGAGGAACT
ATACTCAGTCAGTATTGGTCATAAGAATTCACCTAAGAAAGTGTTTTGGATCAATACAAC
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TGCAACCTTGTGTCTTCCAGAGAAACCAAAACTGGTTGTTGGATTAAAGGCAGCCACCGC
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AATTGTAATAAGGGGACTATCAGATTTAGCTGGAGCACAAACAGGAGACAATGCTGTTCG
TAAGTTTGGATCTTTGGCTGCCACTAATACTGCTAGAGCTGTTCTAGAGTTCATCAAGAA
GCTGCCACCAAACTACAACCTTAGTTCCTAAGTATTTATCATAATGAGTGATTTAATCTG
CAATTTTCTTTCTATAAAATAAGTGTTCACTATTCAGCTTTTCTTAAGTCGAACACTCTT
AATCTCAGCATTGCAAAAA


BQ
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AF RS1BL62TF U 1
AF RS1BL62JQ C 378
BS 1 763 RS1BL62TF
BS 764 1159 RS1BL62JQ

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CCTCATCTCTTCCTTACACGTTCTGCTTGCTTCAGCCACACCACACAAACTAAAAAACGC
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GACTGAAGAAAATGCTTTCCTGGGAAGTGTAGATTTCAGACCGGATCCTGCTCATCCCTT
CTTGGATCTCTCTGGAAGACGTTTTCGGATAGGGAAGATTCATGGAAAGAAGGTTGTGTA
TGTCAGATGTGGGATAGGAATGGTGAACGCCGCAGCAGCAACGCAACAAATGATAGACGT
GTTTAAAGTGAAAGGGATTGTGCATTTTGGGATTGCAGGAAATATAAACAACTCAATGTC
CATAGGAGACGTGAGCATTCCTAAGCAAATCACCAATGCTGGCTTGTGGGATTGGCTGAA
TCCAGACAAAGCAGAGGGAGGTGACTATGCAGCATACTTAGATTTTGGGAAGTATACTGT
TCCACAAGGGGATGGCAGCGACAGTGTGTTAGGGAGCATTGGATACAGCTACGAGGAACT
ATACTCAGTCAGTATTGGTCATAAGAATTCACCTAAGAAAGTGTTTTGGATCAATACAAC
TCAAGAGTGGCTTCAACTTGCAGCTGGTCTAGAGAAGATGGAGCTGTTGCAGTGTGTGAA
TGCAACCTTGTGTCTTCCAGAGAAACCAAAACTGGTTGTTGGA

QA 1 763 1 763
DS 

RD RS1BL62JQ 782 0 0
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TTCCTAAGCAAATCACCAATGCTGGCTTGTGGGATTGGCTGAATCCAGACAAAGCAGAGG
GAGGTGACTATGCAGCATACTTAGATTTTGGGAAGTATACTGTTCCACAAGGGGATGGCA
GCGACAGTGTGTTAGGGAGCATTGGATACAGCTACGAGGAACTATACTCAGTCAGTATTG
GTCATAAGAATTCACCTAAGAAAGTGTTTTGGATCAATACAACTCAAGAGTGGCTTCAAC
TTGCAGCTGGTCTAGAGAAGATGGAGCTGTTGCAGTGTGTGAATGCAACCTTGTGTCTTC
CAGAGAAACCAAAACTGGTTGTTGGATTAAAGGCAGCCACCGCTAATACATTCGTGGATA
ATGCAGCTTACAGAGATTTCTTATACGATACTTTTGGTGTTTCCTCCTCAGATATGGAGA
GTTCTGCAGTGGCTATGACATGCGTATCAAATGGGTATCCTGTAATTGTAATAAGGGGAC
TATCAGATTTAGCTGGAGCACAAACAGGAGACAATGCTGTTCGTAAGTTTGGATCTTTGG
CTGCCACTAATACTGCTAGAGCTGTTCTAGAGTTCATCAAGAAGCTGCCACCAAACTACA
ACCTTAGTTCCTAAGTATTTATCATAATGAGTGATTTAATCTGCAATTTTCTTTCTATAA
AATAAGTGTTCACTATTCAGCTTTTCTTAAGTCGAACACTCTTAATCTCAGCATTGCAAA
AA

QA 1 782 1 782
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5141Contig1 1140 2 4 U
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AAGATAAAAGGAGTCTTGTATTTTATGATTCAAGAACAAGAAGCGCAGAAACCACAAAGG
TTTTGTTGCCACTGAGGGTCACAATCTTATTCGTTCTTTGATCAGATGGGGTCTAGCCTC
TACCCTGACTGGACAGAGCTGACTCGGGAATGTCTCATCGACATCTTCTCACGTCTGAGC
ATGGGGAAACGATGGGACGGACCGATGCTTGTCTCCAAGAAGTGGATGGACGTATGCCAA
GACACGTCTCTCAACGCTGTCTTGGAACTCGAAGCTGAGTTTCTGTCCTCCACCGATACA
ACCTACTGGTGGAGTCCTGAGTTCGAGGAAAAAGTTGACTCAACCATCAGGTTTGCTGTG
GATCAGAGCCAGGGCGAACTCAAGGAGCTCCGAGTCAGGCATTGCACGAACCAGTCTCTC
TCCTACGTCGCCGAGAGGTGTCCTAATCTTGAGGTACTTTGGGTTAAGTATAGCCCAAAG
GTTAATATTGAGTCCATGAGGAATATAGCACTAAACTGCCCCCAAGCTTAAAGAGCTTGA
CGTAAGCTGCTCTTATGAAATAACTTGTGAGTGCATGGAACTGGTTGGTACAAACTGCAA
GAATCTTCAGGTCCTGAAACGGAACCTGATGCCGCCATCCGAGGTGGCAAGGTTAAAGCG
TTATGCCTATGTGCAGAAGCAGTATCTATCTTTTGAAACGTTAGGAAACGTTGATGCGTA
TACGATTGGGAGACACATGCGTCAGCTGAAGCACTTGGAACTTCGAAACTCCACATTGAC
TGATAAAGCTTTTGCTCATCTTTGTAAACGGTGTTCGAATCTTGAGTACTTGGAATTGGT
CGGGAGTAGCTACTTGACTAGCGTTGGTGTTGCTAATGGTACCTCGAGCTTGAAGAATCT
GAAGGAGATCAAGAAACCAGATTTTGCAGCCACCCTGTTCAACTAGTTGAACGCATGTAG
TTTTGTGTTGGTGATACCTTTTTGTTTTCTATTATTATTGTTTTTTCATATATTCTCTTT
TCTTAAAAATAATCATATCACTTAGTTATCACATAATCTCGTGTATTGGATATTCTTAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AJ81TF U 1
AF RS1AJ81JQ C 391
BS 1 670 RS1AJ81TF
BS 671 671 RS1AJ81JQ
BS 672 757 RS1AJ81TF
BS 758 1140 RS1AJ81JQ

RD RS1AJ81TF 759 0 0
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AAGATAAAAGGAGTCTTGTATTTTATGATTCAAGAACAAGAAGCGCAGAAACCACAAAGG
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TACCCTGACTGGACAGAGCTGACTCGGGAATGTCTCATCGACATCTTCTCACGTCTGAGC
ATGGGGAAACGATGGGACGGACCGATGCTTGTCTCCAAGAAGTGGATGGACGTATGCCAA
GACACGTCTCTCAACGCTGTCTTGGAACTCGAAGCTGAGTTTCTGTCCTCCACCGATACA
ACCTACTGGTGGAGTCCTGAGTTCGAGGAAAAAGTTGACTCAACCATCAGGTTTGCTGTG
GATCAGAGCCAGGGCGAACTCAAGGAGCTCCGAGTCAGGCATTGCACGAACCAGTCTCTC
TCCTACGTCGCCGAGAGGTGTCCTAATCTTGAGGTACTTTGGGTTAAGTATAGCCCAAAG
GTTAATATTGAGTCCATGAGGAATATAGCACTAAACTGCCCCCAAGCTTAAAGAGCTTGA
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GAATCTTCAG*TCCTGAAACGGAACCTGATGCCGCCATCCGAGGTGGCAAGGTTAAAGCG
TTATGCCTATGTGCAGAAGCAGTATCTATCTTTTGAA
CG

QA 1 757 1 757
DS 

RD RS1AJ81JQ 750 0 0
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CGAGTCAGGCATTGCACGAACCAGTCTCTCTCCTACGTCGCCGAGAGGTGTCCTAATCTT
GAGGTACTTTGGGTTAAGTATAGCCCAAAGGTTAATATTGAGTCCATGAGGAATATAGCA
CTAAACTGCCCC*AAGCTTAAAGAGCTTGACGTAAGCTGCTCTTATGAAATAACTTGTGA
GTGCATGGAACTGGTTGGTACAAACTGCAAGAATCTTCAGGTCCTGAAACGGAACCTGAT
GCCGCCATCCGAGGTGGCAAGGTTAAAGCGTTATGCCTATGTGCAGAAGCAGTATCTATC
TTTTGAAACGTTAGGAAACGTTGATGCGTATACGATTGGGAGACACATGCGTCAGCTGAA
GCACTTGGAACTTCGAAACTCCACATTGACTGATAAAGCTTTTGCTCATCTTTGTAAACG
GTGTTCGAATCTTGAGTACTTGGAATTGGTCGGGAGTAGCTACTTGACTAGCGTTGGTGT
TGCTAATGGTACCTCGAGCTTGAAGAATCTGAAGGAGATCAAGAAACCAGATTTTGCAGC
CACCCTGTTCAACTAGTTGAACGCATGTAGTTTTGTGTTGGTGATACCTTTTTGTTTTCT
ATTATTATTGTTTTTTCATATATTCTCTTTTCTTAAAAATAATCATATCACTTAGTTATC
ACATAATCTCGTGTATTGGATATTCTTAGT

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL5142Contig1 1102 2 2 U
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GGATAGATAGTAATGGGGGATCATCTGGCGAGAGCGGAGGAATTCGAGAAGAAGGCTGAG
AAGAAGCTCAACGGATGGGGAATCTTCGGATCCAAGTACGAGGATGCTGCTGATCTCCTC
GAGAAATCTGCTAATTCTTATAAGCTCGCCAAATCATGGGATCTAGCTGGAAAGGCTTAT
CTTAAACTTGCTGATTGTCACTTAAAGTCCGATAGCAAACATGATGCTGCTAACGCTTAC
GCCGAAGCTGCTAAATGCTACAAGAAAGTTGACACTAATGGAGCTGCGTCTTGTCTAGAG
CGAGCAGTGGATATATTCTGCGAGATAGGAAGGCTCAACATGGCTGCCAGATACTACAAG
GAATTTGCTGAGTATTATGAAGCTGACCAGAAGATCGGCCAGGCTATTTTTTACTTTGAA
AAGGCAGCTGAGTTCTTTCAAAACGAAGAAGTGACCACCTCTGCAAACCAGTGCACAGTT
GGAGCAATATGACAAGGCAATCAAGATTTATGAAGAGATAGCATGCCAATCACTCAACAA
TAACTTGCTTAAGTATGGAGTTAAAGGCCATCTTCTCAATGCTGGCATGTGCCACCTTTG
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TTTTACAGGAACAAGAGAATGCAAATTCTTATCTGACCTTGCTTCTGCAATCGATGAAGA
AGACATAGCAAAGTTCACAGATGTTGTCAAGGAGTTTGATAGCATGACTCCTCTGGATTC
ATGGAAGACGACTATGTTGTTGAGGGTGAAAGAGAAGCTGAAGGCAAAGGAGCTTGAGGA
AGATGATCTTACCTAAGCATATCTCTCTCTATCTAACCCAAGCTTTCCCTTATTAATTAC
TGCTGGTTCGTATCATCACTAGTGTTAGTGTTACTTCTTCATTCATGTTTGGTTTTATTG
TGTGAGGTTATCAGCTTCTAAGGTTGCCTGTGAGGTTTGATAAAATTGGTTTGTTTGATA
TCAAAAGACTACATTTGCTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1B163TF U 1
AF RS1B163JQ C 300
BS 1 688 RS1B163TF
BS 689 1102 RS1B163JQ

RD RS1B163TF 688 0 0
GGCACGATCGATTGGTTTGCAGCGAAAGAAAACCCGTCGAAGCAAAAATCCTGTGGAAAG
GGATAGATAGTAATGGGGGATCATCTGGCGAGAGCGGAGGAATTCGAGAAGAAGGCTGAG
AAGAAGCTCAACGGATGGGGAATCTTCGGATCCAAGTACGAGGATGCTGCTGATCTCCTC
GAGAAATCTGCTAATTCTTATAAGCTCGCCAAATCATGGGATCTAGCTGGAAAGGCTTAT
CTTAAACTTGCTGATTGTCACTTAAAGTCCGATAGCAAACATGATGCTGCTAACGCTTAC
GCCGAAGCTGCTAAATGCTACAAGAAAGTTGACACTAATGGAGCTGCGTCTTGTCTAGAG
CGAGCAGTGGATATATTCTGCGAGATAGGAAGGCTCAACATGGCTGCCAGATACTACAAG
GAATTTGCTGAGTATTATGAAGCTGACCAGAAGATCGGCCAGGCTATTTTTTACTTTGAA
AAGGCAGCTGAGTTCTTTCAAAACGAAGAAGTGACCACCTCTGCAAACCAGTGCACAGTT
GGAGCAATATGACAAGGCAATCAAGATTTATGAAGAGATAGCATGCCAATCACTCAACAA
TAACTTGCTTAAGTATGGAGTTAAAGGCCATCTTCTCAATGCTGGCATGTGCCACCTTTG
CAAAGCTGATGTTGTTTCCATCACCAAT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RS1B163JQ 803 0 0
ACG
CGAAGCTGCTAAATGCTACAAGAAAGTTGACACTAATGGAGCTGCGTCT*GTCTAGAGCG
AGCAGTGGATATATTCTGCGAGATAGGAAGGCTCAACATGGCTGCCAGATACTACAAGGA
ATTTGCTGAGTATTATGAAGCTGACCAGAAGATCGGCCAGGCTATTTTTTACTTTGAAAA
GGCAGCTGAGTTCTTTCAAAACGAAGAAGTGACCACCTCTGCAAACCAGTGCACAGTTGG
AGCAATATGACAAGGCAATCAAGATTTATGAAGAGATAGCATGCCAATCACTCAACAATA
ACTTGCTTAAGTATGGAGTTAAAGGCCATCTTCTCAATGCTGGCATGTGCCACCTTTGCA
AAGCTGATGTTGTTTCCATCACCAATGCGCTGGAGAAATATCAGGATCTTGATCCAACTT
TTACAGGAACAAGAGAATGCAAATTCTTATCTGACCTTGCTTCTGCAATCGATGAAGAAG
ACATAGCAAAGTTCACAGATGTTGTCAAGGAGTTTGATAGCATGACTCCTCTGGATTCAT
GGAAGACGACTATGTTGTTGAGGGTGAAAGAGAAGCTGAAGGCAAAGGAGCTTGAGGAAG
ATGATCTTACCTAAGCATATCTCTCTCTATCTAACCCAAGCTTTCCCTTATTAATTACTG
CTGGTTCGTATCATCACTAGTGTTAGTGTTACTTCTTCATTCATGTTTGGTTTTATTGTG
TGAGGTTATCAGCTTCTAAGGTTGCCTGTGAGGTTTGATAAAATTGGTTTGTTTGATATC
AAAAGACTACATTTGCTGTC

QA 4 803 4 803
DS 



AS 1 2

CO CL5143Contig1 906 2 2 U
GGACTCCACCGGCGTCACTATTTACTTTCTCCCACCTCCCTCCAATCGCCTCACATAAGG
TCAATCATCCTTCCGATCTCAAATTCTCTCTCTTGCCTGTAAATGGTTCTACCAAGTGGT
GTCCCTTACCGGAACACCATCAATCTCGATCTTACCTCTGCCTGCCCGTTACGGACTACA
TACTTAGCGTCATCGGGTGCCTCCATGGACCCATGCTCCGATCCGTAGACCTACCACGCT
CATTCGGACCTTAGACCTCTCCTACTTCCCGATCACAAGCAAGTGTTTGGATGATTTTCT
CAAACTTCAACACCTTGAATAACTTCTTCTACAAGGGTGCTTCGGAGTCGATGTTGACAC
TCTTAAATCACTCACACATCATTGCAACTCCTAAAAAATACATATTTTAATCTCCATCTT
ATCAGTAGTAGACTTTTGAGATTTTACTTTTTTAAAAAACATGTTTTCTTCTCTGTAGAA
CCTTGATGCATTGAGCTGCCAGAATTTAACTCAGAGAGGTTTAACCTCACTCTTAAGCGG
GGCCGAATGTCTCGAGCACCTTGATCTAACACACTCTTCTTCTGTGATCTCATTTGATTT
CGCAAATAGCTTAAACAAGGTTTCAGCATTACAGTCGATCAGGTTGGATGGTTGTTCGGT
ATATTGTGATAGGTTGAAGGCGATAGGCACTCTGTGCATTTCCCTCAGAGAGGTTAGCCT
AAGCAAATGTGTCACCGTAACTGATCAAGGTCAGCAACAGAAAATAAAGGTAAAGTTTCC
GGTTTGCCTTTGAATTTCATGTCGTAAATGATTATATAGATCAGATTTCGGCCTGATATT
TTTTTGGTTTGTAGTTAATAGTCATTCTGGTGTTGAATATAATTTTGGTCTGTAAAAGTT
AATAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1GT86TF U 1
AF RS1GT86JQ C 113
BS 1 492 RS1GT86TF
BS 493 906 RS1GT86JQ

RD RS1GT86TF 492 0 0
GGACTCCACCGGCGTCACTATTTACTTTCTCCCACCTCCCTCCAATCGCCTCACATAAGG
TCAATCATCCTTCCGATCTCAAATTCTCTCTCTTGCCTGTAAATGGTTCTACCAAGTGGT
GTCCCTTACCGGAACACCATCAATCTCGATCTTACCTCTGCCTGCCCGTTACGGACTACA
TACTTAGCGTCATCGGGTGCCTCCATGGACCCATGCTCCGATCCGTAGACCTACCACGCT
CATTCGGACCTTAGACCTCTCCTACTTCCCGATCACAAGCAAGTGTTTGGATGATTTTCT
CAAACTTCAACACCTTGAATAACTTCTTCTACAAGGGTGCTTCGGAGTCGATGTTGACAC
TCTTAAATCACTCACACATCATTGCAACTCCTAAAAAATACATATTTTAATCTCCATCTT
ATCAGTAGTAGACTTTTGAGATTTTACTTTTTTAAAAAACATGTTTTCTTCTCTGTAGAA
CCTTGATGCATT

QA 1 492 1 492
DS 

RD RS1GT86JQ 794 0 0
CAAGTGGTGTCCCTTACCGGAACACCATCAATCTCGATCTTACCTCTGCCTGCCCGTTAC
GGACTACATACTTAGCGTCATCGGGTGCCTCCATGGACCCATGCTCCGATCCGTAGACCT
ACCACGCTCATTCGGACCTTAGACCTCTCCTACTTCCCGATCACAAGCAAGTGTTTGGAT
GATTTTCTCAAACTTCAACACCTTGAATAACTTCTTCTACAAGGGTGCTTCGGAGTCGAT
GTTGACACTCTTAAATCACTCACACATCATTGCAACTCCTAAAAAATACATATTTTAATC
TCCATCTTATCAGTAGTAGACTTTTGAGATTTTACTTTTTTAAAAAACATGTTTTCTTCT
CTGTAGAACCTTGATGCATTGAGCTGCCAGAATTTAACTCAGAGAGGTTTAACCTCACTC
TTAAGCGGGGCCGAATGTCTCGAGCACCTTGATCTAACACACTCTTCTTCTGTGATCTCA
TTTGATTTCGCAAATAGCTTAAACAAGGTTTCAGCATTACAGTCGATCAGGTTGGATGGT
TGTTCGGTATATTGTGATAGGTTGAAGGCGATAGGCACTCTGTGCATTTCCCTCAGAGAG
GTTAGCCTAAGCAAATGTGTCACCGTAACTGATCAAGGTCAGCAACAGAAAATAAAGGTA
AAGTTTCCGGTTTGCCTTTGAATTTCATGTCGTAAATGATTATATAGATCAGATTTCGGC
CTGATATTTTTTTGGTTTGTAGTTAATAGTCATTCTGGTGTTGAATATAATTTTGGTCTG
TAAAAGTTAATAGC

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

CO CL5144Contig1 1005 2 2 U
CTCTTCAGTTTAGCGTTCTTCAAGGAAGCAAACAAACAAATATTATAAAAAATGGATTCT
CACATCAAAATTATTGTTATAGTAGTCATCGCCAGTGTTTTGGTTGGGGGAGGGTCCTCA
TAGTATGTTGTTGCATGAATAAGAAGCAGAAACTTCGACTGCCTGAGCCGCAGGTTCAAC
GAGGGATGATAGTCAGTGATCCTACACATCAGCCAAGGGGAATTCATGTGGACAATGGTA
AGATTTGTTAAGAAATGAGAAACTTAGCTCAAATTGGACTAAGTCTTCATAATATACTTG
TTTTTAATTATTCTTTAAGCTATTTTTTTGTAATAATTTACAAAAACATATTATTTCCTC
ATATTAGCAAAATGAGGGGAGTTTGTAGCTTGTTACAAAAAATAATAATTCTTTACTATA
ACTTGTTAGATAAAATGAGGTTTTCTTGCTAAAAAGGTTTTCTAAAAATGGGTTCAAACC
TTGTGGTAGACCGAACAACACTAGATTACCAAAGAGTTTTTTGTTTCTTTTGGCTAATAA
GGTGTAGAACAATTAACTGTCGGTTCTCCTAAAGATCGCTCGGGGAGTAGAAGCGACACC
ATTGTGAAGCCTGTTAGTCCGCACGCCGTAAAAGATAGCTTGCGCAAGGCACCTAAAAGT
TTGGGAGAGCTTCAGAGTAAGAGAGATGATGGAGGTTTTGCTGTTATGACAGTCGTTGCT
TCTACTTCAGCAATATTTTCTGGCGATTTTGGCGGTGGTGGTGGTGGTGATGGCGGTTGC
AGTAATGGTGGCTGTGGTGGTGGTGGCGGCTGTGGTTGTGGGGGCTGAATAGCTGATAAA
AGTTGATTTTAAGTATGTCGTAATGATGTTTCTTCATAGTTTTCGTTTAGATTCAGTGTT
TTAGTTTAACTCTGTGGTTATCCAGTGGATTTAGTAACATTCATCTTTTGTTAACTCTAT
GGTTGCAGATTTCACCTAGACCGATTTTTAGAACTTTGATAATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EY44TF U 1
AF RS1EY44JQ C 349
BS 1 628 RS1EY44TF
BS 629 1005 RS1EY44JQ

RD RS1EY44TF 628 0 0
CTCTTCAGTTTAGCGTTCTTCAAGGAAGCAAACAAACAAATATTATAAAAAATGGATTCT
CACATCAAAATTATTGTTATAGTAGTCATCGCCAGTGTTTTGGTTGGGGGAGGGTCCTCA
TAGTATGTTGTTGCATGAATAAGAAGCAGAAACTTCGACTGCCTGAGCCGCAGGTTCAAC
GAGGGATGATAGTCAGTGATCCTACACATCAGCCAAGGGGAATTCATGTGGACAATGGTA
AGATTTGTTAAGAAATGAGAAACTTAGCTCAAATTGGACTAAGTCTTCATAATATACTTG
TTTTTAATTATTCTTTAAGCTATTTTTTTGTAATAATTTACAAAAACATATTATTTCCTC
ATATTAGCAAAATGAGGGGAGTTTGTAGCTTGTTACAAAAAATAATAATTCTTTACTATA
ACTTGTTAGATAAAATGAGGTTTTCTTGCTAAAAAGGTTTTCTAAAAATGGGTTCAAACC
TTGTGGTAGACCGAACAACACTAGATTACCAAAGAGTTTTTTGTTTCTTTTGGCTAATAA
GGTGTAGAACAATTAACTGTCGGTTCTCCTAAAGATCGCTCGGGGAGTAGAAGCGACACC
ATTGTGAAGCCTGTTAGTCCGCACGCCG

QA 1 628 1 628
DS 

RD RS1EY44JQ 657 0 0
TATTATTTCCTCATATTAGCAAAATGAGGGGAGTTTGTAGCTTGTTACAAAAAATAATAA
TTCTTTACTATAACTTGTTAGATAAAATGAGGTTTTCTTGCTAAAAAGGTTTTCTAAAAA
TGGGTTCAAACCTTGTGGTAGACCGAACAACACTAGATTACCAAAGAGTTTTTTGTTTCT
TTTGGCTAATAAGGTGTAGAACAATTAACTGTCGGTTCTCCTAAAGATCGCTCGGGGAGT
AGAAGCGACACCATTGTGAAGCCTGTTAGTCCGCACGCCGTAAAAGATAGCTTGCGCAAG
GCACCTAAAAGTTTGGGAGAGCTTCAGAGTAAGAGAGATGATGGAGGTTTTGCTGTTATG
ACAGTCGTTGCTTCTACTTCAGCAATATTTTCTGGCGATTTTGGCGGTGGTGGTGGTGGT
GATGGCGGTTGCAGTAATGGTGGCTGTGGTGGTGGTGGCGGCTGTGGTTGTGGGGGCTGA
ATAGCTGATAAAAGTTGATTTTAAGTATGTCGTAATGATGTTTCTTCATAGTTTTCGTTT
AGATTCAGTGTTTTAGTTTAACTCTGTGGTTATCCAGTGGATTTAGTAACATTCATCTTT
TGTTAACTCTATGGTTGCAGATTTCACCTAGACCGATTTTTAGAACTTTGATAATAG

QA 1 657 1 657
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGAACAACTATTACTTTTGTGTTTAATTTACTTTTTGGTTCTCCAGGCAAAAAGAAAAAA
AAAAAACTTTTTGGTTCTTTGGACATAACATTGGGAGCAAAACAGATCATATTCTTGTGA
AATAAAAACAGACGGAGCAGCGAAGTCAGAAAGAATGGAGAAAGTGATGAACCTGATAAA
GCCGAAGCCTGATCCGAAGCAACTCTTGCGTGATTGGCAACGCAAGCTTCTTCAAGAGTG
CCGTAACATCGAACGCCAAATCCGAGATATACAAAAAGAAGAGAAACAGTTCAGGAGGCT
ATTAAAGAAGCTGCTAAGCGTAACGATATGGTCTCAGCAAAGGCGCTTGCTAAGGAGATT
GTGGGTGCGAGAAGAACAGTCAACCGTTTATATGAAAACAAGGCACAGATGAATTCCATA
TCAATGCACCTCGGAGAAAGTGTTGCTGTTGCTCGAACAGTTGGACATCTGTCCAAGAGC
GCAGAGGTTATGAAGCTTGTCAATAATCTCATGAAGGCACCACAAATGGCTGCTACTATG
CAGGAGTTCAGCAAAGAGATGACTAAGGCTGGAGTTATTGAGGAGTTTGTGAACGAGGCC
ATTGACAACGCACTAGATTCAGAGGATATGGAAGAAGAGATCGACGAAGAGGTCGATAAA
GTATTGACTGCTATTGCTGGAGAAACCGCTGCTGAGCTTCCAGAAGCTGTCAGGAAGGAA
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GGTGTTGATGATGAGGAAGAACTGGAGGAGATTCGAGCTCGGCTCGCTAAAGTTAGATCC
TAACTTGATTCAGTTGACTCTTTTTATATACGATTTTTATTGATTCGAAAGGTGATGAGA
ACATAAGGCGATTGATGTGTATTGTATAATATATAATTGAATTACAGTATACATTGTAAT
CATAAGCTGTCTTTTGGTAACAAATTTTTCTTTTTTTTCC


BQ
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AF RS1FX95TF U 1
AF RS1FX95JQ C 335
BS 1 713 RS1FX95TF
BS 714 1000 RS1FX95JQ

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AAAAAACTTTTTGGTTCTTTGGACATAACATTGGGAGCAAAACAGATCATATTCTTGTGA
AATAAAAACAGACGGAGCAGCGAAGTCAGAAAGAATGGAGAAAGTGATGAACCTGATAAA
GCCGAAGCCTGATCCGAAGCAACTCTTGCGTGATTGGCAACGCAAGCTTCTTCAAGAGTG
CCGTAACATCGAACGCCAAATCCGAGATATACAAAAAGAAGAGAAACAGTTCAGGAGGCT
ATTAAAGAAGCTGCTAAGCGTAACGATATGGTCTCAGCAAAGGCGCTTGCTAAGGAGATT
GTGGGTGCGAGAAGAACAGTCAACCGTTTATATGAAAACAAGGCACAGATGAATTCCATA
TCAATGCACCTCGGAGAAAGTGTTGCTGTTGCTCGAACAGTTGGACATCTGTCCAAGAGC
GCAGAGGTTATGAAGCTTGTCAATAATCTCATGAAGGCACCACAAATGGCTGCTACTATG
CAGGAGTTCAGCAAAGAGATGACTAAGGCTGGAGTTATTGAGGAGTTTGTGAACGAGGCC
ATTGACAACGCACTAGATTCAGAGGATATGGAAGAAGAGATCGACGAAGAGGTCGATAAA
GTATTGACTGCTATTGCTGGAGAAACCGCTGCTGAGCTTCCAGAAGCTGTCAG
AAGGA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RS1FX95JQ 666 0 0
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AAAACAAGGCACAGATGAATTCCATATCAATGCACCTCGGAGAAAGTGTTGCTGTTGCTC
GAACAGTTGGACATCTGTCCAAGAGCGCAGAGGTTATGAAGCTTGTCAATAATCTCATGA
AGGCACCACAAATGGCTGCTACTATGCAGGAGTTCAGCAAAGAGATGACTAAGGCTGGAG
TTATTGAGGAGTTTGTGAACGAGGCCATTGACAACGCACTAGATTCAGAGGATATGGAAG
AAGAGATCGACGAAGAGGTCGATAAAGTATTGACTGCTATTGCTGGAGAAACCGCTGCTG
AGCTTCCAGAAGCTGTCAGGAAGGAAAGGATAAAGGTGCCTGCACAGAAGACCAGCACTT
CCCGCGAGGAAGAGGCAATTGCAGAAGGTGTTGATGATGAGGAAGAACTGGAGGAGATTC
GAGCTCGGCTCGCTAAAGTTAGATCCTAACTTGATTCAGTTGACTCTTTTTATATACGAT
TTTTATTGATTCGAAAGGTGATGAGAACATAAGGCGATTGATGTGTATTGTATAATATAT
AATTGAATTACAGTATACATTGTAATCATAAGCTGTCTTTTGGTAACAAATTTTTCTTTT
TTTTCC

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

CO CL5147Contig1 551 2 2 U
GGACTCCAAAAATCTCATCTACTCCTCTACCTGATACTAAACGCAGTGCCTTTCCCATTT
TCCCAGTTTCGTTTTCGTGCCTTTGTTTCTGTCGGATCTTCTACGGTATCAGATCGGTGG
ATTCACTCTTGATTTGGACTTTGCGGGTAAGCCTTCTTGCGTGTTTGGGTCTCGGTTTCG
TGTTTTACGGGAACAATAGCACTGCTGTGTCAATCTTGACTGGAAGATGGGTTCCCAAAC
CAAAGACTGTGATGCTGTTGCTAAGAAAGAAAAGATTGAGGCAAGTCTTAAATAATTAAT
TCCCAATTCATTTAGTAGAGTACTATTCCCTCAAAAAACGTATGTCTGGTTGAATATATT
TTTGTTTGTAGGGTGCGGAACTTGAGCGTCGAAAATCTTTAGAACGTATTACTGGAATTA
GGGGCTAACATTATCTATCTAAGATTCAAGTGATTTCTACTATCATCTCGGTTTTGTATG
TACTTTGCATCTAAACGTAACTATGTAGTTTGCATCTAAGACAAATAATATGAAAACTGA
TGCAGGGAACC


BQ
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AF RS1BN81JQ C 1
AF RS1BN81TF U 172
BS 1 171 RS1BN81JQ
BS 172 551 RS1BN81TF

RD RS1BN81JQ 551 0 0
GGACTCCAAAAATCTCATCTACTCCTCTACCTGATACTAAACGCAGTGCCTTTCCCATTT
TCCCAGTTTCGTTTTCGTGCCTTTGTTTCTGTCGGATCTTCTACGGTATCAGATCGGTGG
ATTCACTCTTGATTTGGACTTTGCGGGTAAGCCTTCTTGCGTGTTTGGGTCTCGGTTTCG
TGTTTTACGGGAACAATAGCACTGCTGTGTCAATCTTGACTGGAAGATGGGTTCCCAAAC
CAAAGACTGTGATGCTGTTGCTAAGAAAGAAAAGATTGAGGCAAGTCTTAAATAATTAAT
TCCCAATTCATTTAGTAGAGTACTATTCCCTCAAAAAACGTATGTCTGGTTGAATATATT
TTTGTTTGTAGGGTGCGGAACTTGAGCGTCGAAAATCTTTAGAACGTATTACTGGAATTA
GGGGCTAACATTATCTATCTAAGATTCAAGTGATTTCTACTATCATCTCGGTTTTGTATG
TACTTTGCATCTAAACGTAACTATGTAGTTTGCATCTAAGACAAATAATATGAAAACTGA
TGCAGGGAACC

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DS 

RD RS1BN81TF 380 0 0
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TTCCCAAACCAAAGACTGTGATGCTGTTGCTAAGAAAGAAAAGATTGAGGCAAGTCTTAA
ATAATTAATTCCCAATTCATTTAGTAGAGTACTATTCCCTCAAAAAACGTATGTCTGGTT
GAATATATTTTTGTTTGTAGGGTGCGGAACTTGAGCGTCGAAAATCTTTAGAACGTATTA
CTGGAATTAGGGGCTAACATTATCTATCTAAGATTCAAGTGATTTCTACTATCATCTCGG
TTTTGTATGTACTTTGCATCTAAACGTAACTATGTAGTTTGCATCTAAGACAAATAATAT
GAAAACTGATGCAGGGAACC

QA 1 380 1 380
DS 



AS 1 2

CO CL5148Contig1 1300 2 2 U
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TCAATCGCCTTTTTTCTACTCCTATCCACCACCATCGCCGTTTTGTTAACACATCATCCC
TCTTCTACGTTAAACGCCTTTCTTCAATCCAAGCATCCCCTCCCATGTCCAAAATTGAAT
CGGATCCCTCTTCGATTCATAGCAGAGTCATGATGCTTATCAAATTATACAACCTAGACG
CGGCCGCAGAGCAAGCACGTTTGGCCATCTTTTCCACAGGTAATCCTTTATTGACCGCCG
AGACCTGCGTGGCTATCATCGACGCTATGCGCAGTGACAGACGGTATAGTGACGCATACG
ATTTGTTCCATTACTACGCTGATAAAGCTAAATCGGATCTGATAACCAACCTCTGCTCCA
CTCCAATCATCATTGCCTTATGTGATGAAGGCAAACTCGACGAGGCTCTTGAATTATACA
CACACTTTTTGTTGCGCAATCGTCCGAGTTATCGTGCCCAACTAGCCCTGGCTCAAGGGT
TGGTCGACGCGGGTAGGATTGATGAAGCTATAGATAAGTTCTACTGCGTGGATAGGTCCG
TTTATGGCATTTTCATCCGTGGGTTTTTGGATTTGGGGAATCTTGAAAGGGCTAACCAGC
TTTTTCAAGAGCTCAAGTTGAGTGACGACTCGGACACTGTGGCGCACGCAAGTGCGATGT
TTATGGAGCATTGGTTTAAGCAAGAGATGGATGAGGAAGCTATGGAGTGTTACTTTTCGT
CCAAGGAAGAGTTCAGCGAGATCTATGCGACTGCTGCAAATGTCTTTTTGAAAGTGTTGC
TAAGGTACGGTAAGAAAAAAGAAGCTTGGTTATTGTTCAGTCAGATGCTGGAGCAAAGCA
AGTGCCCGAGAAAGTTTGATTCTGAGTCGTGTAATATTATGTGGATGAGTGTTTCAAGCT
TGGGAAGATTAGCGAGGCAGTTGAGATATTTCACAAGTCTGTTGGCACAGTTAGTCATCC
ACAGTTGGCTTACAGGAACCTGATCACCAGGTTTTGCGAGCAAGATCTCTTGTCCGAAGC
AGAGCAATTTTTCGCTGAAATGTGCTCTAAAAAGTTTTTTCTCCCTGATGTTCCAACATA
TCGAACGATGATGGATGCATATGTGAAGAAGGGTAGAGTCAGTGATGCTGTAAAAACTGT
GAACCAAACTTTGGATGCCTCTTTAAACTATATTGCTAAGAAAGTCATAGTAGTGTAACA
TTTCTTTGTCTTAGCAGTTGTTCCGTTTCTTAATGAATAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FF24TF U 1
AF RS1FF24JQ C 661
BS 1 756 RS1FF24TF
BS 757 1300 RS1FF24JQ

RD RS1FF24TF 756 0 0
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TCAATCGCCTTTTTTCTACTCCTATCCACCACCATCGCCGTTTTGTTAACACATCATCCC
TCTTCTACGTTAAACGCCTTTCTTCAATCCAAGCATCCCCTCCCATGTCCAAAATTGAAT
CGGATCCCTCTTCGATTCATAGCAGAGTCATGATGCTTATCAAATTATACAACCTAGACG
CGGCCGCAGAGCAAGCACGTTTGGCCATCTTTTCCACAGGTAATCCTTTATTGACCGCCG
AGACCTGCGTGGCTATCATCGACGCTATGCGCAGTGACAGACGGTATAGTGACGCATACG
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CTCCAATCATCATTGCCTTATGTGATGAAGGCAAACTCGACGAGGCTCTTGAATTATACA
CACACTTTTTGTTGCGCAATCGTCCGAGTTATCGTGCCCAACTAGCCCTGGCTCAAGGGT
TGGTCGACGCGGGTAGGATTGATGAAGCTATAGATAAGTTCTACTGCGTGGATAGGTCCG
TTTATGGCATTTTCATCCGTGGGTTTTTGGATTTGGGGAATCTTGAAAGGGCTAACCAGC
TTTTTCAAGAGCTCAAGTTGAGTGACGACTCGGACACTGTGGCGCACGCAAGTGCGATGT
TTATGGAGCATTGGTTTAAGCAAGAGATGGATGAGG

QA 1 756 1 756
DS 

RD RS1FF24JQ 640 0 0
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TTATGGAGCATTGGTTTAAGCAAGAGATGGATGAGGAAGCTATGGAGTGTTACTTTTCGT
CCAAGGAAGAGTTCAGCGAGATCTATGCGACTGCTGCAAATGTCTTTTTGAAAGTGTTGC
TAAGGTACGGTAAGAAAAAAGAAGCTTGGTTATTGTTCAGTCAGATGCTGGAGCAAAGCA
AGTGCCCGAGAAAGTTTGATTCTGAGTCGTGTAATATTATGTGGATGAGTGTTTCAAGCT
TGGGAAGATTAGCGAGGCAGTTGAGATATTTCACAAGTCTGTTGGCACAGTTAGTCATCC
ACAGTTGGCTTACAGGAACCTGATCACCAGGTTTTGCGAGCAAGATCTCTTGTCCGAAGC
AGAGCAATTTTTCGCTGAAATGTGCTCTAAAAAGTTTTTTCTCCCTGATGTTCCAACATA
TCGAACGATGATGGATGCATATGTGAAGAAGGGTAGAGTCAGTGATGCTGTAAAAACTGT
GAACCAAACTTTGGATGCCTCTTTAAACTATATTGCTAAGAAAGTCATAGTAGTGTAACA
TTTCTTTGTCTTAGCAGTTGTTCCGTTTCTTAATGAATAA

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

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ACCGTGACTCAAAACCGAGACGGATCGACCAAAAACGCTCGATGGACCGTCGAACCGGTA
CGAGATTCGTACCACGTGATCCGTCTCAAAAGCTGTTACGGTAAATACCTAACCGCTTCC
AACGAGCGGTTCTTGCTAGGAGCCACGGGGAAGAAAGTGATTCAGCTGAAACCGAGTCGG
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AGACACGGTAACTATCTACGAGGTAACGGTGGTCTCCCGCCGTGGAGAAACTCCGTCACG
CACGATAATCCTCATATGTCGGCTACTCAGGACTCCATCTCGTGGGGAGGTTGATATCGT
TGAGCTCTTGATTAATCCTCAAGTCACGGCGGAGACTGAGTTCACTCCGTCGCCGAAGAC
GCCGCCTCCTCCGCCGCGTAGGAGGCCATCGAGGACTCCGTCTTCTCTTTCAGAGAGATC
CGAAGAAGATTCGGTTGTGTCTCCACCGAAATCGGATGGGAGGACGATATACTACCACAT
CGCCGACGATGAAGGACACGTGGAAGATGAATCAGGCGTTGGATACGCTTTCACATTTAA
AGGAAACAGCGTGGCGGAGCTGACTCAGACTCTGCGAGAAGAAACGTGCATGAGGATGCT
GTGGTGTGCACTCGCAGTCCCTTAAACGGCAAGGTGTTTCCTCTTCGTTTGCAACTTCCT
CCAAACAATGGAACATTGCATGTCATTTTAGTAGCTTCCGGTGCTAGTCTCTAGACTAGT
GATTTGTCTTCTTGTGTGGTAAGTGTTTGGTGAAGCAAATATGATATGAATTGAACCTTA
CAGAAAGTCTATAAGATAATAAGAGTTGGTAGTTGGTACAAGATTCGTGGTGACGGAGAT
AAAAGGCGTCGCATTGGAGCCTTATTTAGTCTTTGAATACGAGTTGATGTGTAAAAATAC
AGTAGAGTTTTGATAATAGAAAAAAGAAATGCTTACAACATTTATTTTTTTGGGATATAG
ACCAAGTTGTTCGTTTTTGTTGTTGATGTAAATAAACGATTTCTTTTTGTAAACGAGCAT
TTTGATTTATTTTGTATGAGCATGTTACGAGT


BQ
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AF RS1BT71TF U 1
AF RS1BT71JQ C 480
BS 1 552 RS1BT71TF
BS 553 553 RS1BT71JQ
BS 554 580 RS1BT71TF
BS 581 1292 RS1BT71JQ

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AAGACGAGTAACTTCAACCCAGACGAAACAGTATCAGCGATGGAGTTTTTCAATAACGCT
AAAACCGTTCGAATGCGTAACAGCCACAACAAGTATCTTTCCGCAGACGACGACGAAGAA
ACCGTGACTCAAAACCGAGACGGATCGACCAAAAACGCTCGATGGACCGTCGAACCGGTA
CGAGATTCGTACCACGTGATCCGTCTCAAAAGCTGTTACGGTAAATACCTAACCGCTTCC
AACGAGCGGTTCTTGCTAGGAGCCACGGGGAAGAAAGTGATTCAGCTGAAACCGAGTCGG
CTCGACTCGGCGGTCGAGTGGGAACCGGTGAGAGAAGGATCCAAGATCAAGCTCAGGACG
AGACACGGTAACTATCTACGAGGTAACGGTGGTCTCCCGCCGTGGAGAAACTCCGTCACG
CACGATAATCCTCATATGTCGGCTACTCAGGACTCCATCTCGTGGGGAGGTTGATATCGT
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CGCCGCCTCCTCCGCCGCGTAGGAGGCCATCGAGGACTCCGTCTTCTCTTTCAGAGAGAT
CCGAAGAAGATTCGGTTGTGTCTCCACCGAAATCGGATGGGAGGACGATATACTACCACA
TCGCCGACGATGAAGGACACGTGGAAGATGAATCAGGCGTTGGATACGCTTTCACATTTA
AAGGAAACAGCGTGGCGGAGCTGACTCAGACTCTGCGAGAAGAAACGTGCATGAGGATGC
TGTGGTGTGCACTCGCAGTCCCTTAAACGGCAAGGTGTTTCCTCTTCGTTTGCAACTTCC
TCCAAACAATGGAACATTGCATGTCATTTTAGTAGCTTCCGGTGCTAGTCTCTAGACTAG
TGATTTGTCTTCTTGTGTGGTAAGTGTTTGGTGAAGCAAATATGATATGAATTGAACCTT
ACAGAAAGTCTATAAGATAATAAGAGTTGGTAGTTGGTACAAGATTCGTGGTGACGGAGA
TAAAAGGCGTCGCATTGGAGCCTTATTTAGTCTTTGAATACGAGTTGATGTGTAAAAATA
CAGTAGAGTTTTGATAATAGAAAAAAGAAATGCTTACAACATTTATTTTTTTGGGATATA
GACCAAGTTGTTCGTTTTTGTTGTTGATGTAAATAAACGATTTCTTTTTGTAAACGAGCA
TTTTGATTTATTTTGTATGAGCATGTTACGAGT

QA 1 813 1 813
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5151Contig1 919 2 2 U
GGATCGGAGACTCAGATCTGCAATCTAAGTTCTTGAGGGATCCAATTTGAAGGGAGAAGA
AGAAGAAGAAGCATGGACACTTTTACGGCGGAGGATCTGTCGACGATCGGCGGAATCGCC
ACCGTGTCGCTCCTTCACTCGTTTATTCCGACTCACTGGCTACCTTTCTCAATCGTTGGA
CGCGCGCAGAAATGGACGCTTTCCAGAACTCTCTTCGTCACTGCATTTGGAGCAGTCCTG
CATGTTATCTCCACTTCTCTTCTCGGTATAACAGCGATCACTATGGCGAATACCATCGCC
GGTGAAGAGACTGTTCACAAGCTTGCTTCTCTTTTGCTTGTGATTCTCGGTGGAAGCTAT
GTCGTATTGTTTTTGGCTGGTAAAGGTGGTCACACTCATTCTCATAACAAACCCATGGAG
AAAATGGCTGCTGCTGGGCTTGTTCTCGTTCCTGCGTTATCTCCATGTGCTACAACTCTC
CCTGTTTTCCTCGCTGTTGGAAATTCTAAGCCCATGATGGTTCTCGCCATCATAGTTCTG
CTGATAAGCACCATATTGGTGATGACATCTCTGGTGGCTCTATCGTTCTATGGTGCAAGT
CAGCTGAAGTTTCACTGGGTGGAGCGATACGACAAGCTACTGGTTGGTTCGGTTCTGTGT
TTGGTAGGTATCTTAACCCTTTTCTTCCATGATCATGACCACCATGGCCACGAAGCACAT
CAACTCCCCAGGAAAATCATTACTCTTTAGAGACGGCTTTCAAATCTCTGTTTTGTCCGT
CATGTCTGTTTGTTGTAGAGCGGCTTAAGGTCTTCCCGGTTGTATGTCTATAACTAGTTG
TAACGCTCTCTGTTTGCGCGTGAAAAAAACATATTGCAGCCTTAATTTCATTCAATAGAA
CACCATTGTGAATGTGATC


BQ
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AF RS1FK52TF U 1
AF RS1FK52JQ C 262
BS 1 642 RS1FK52TF
BS 643 919 RS1FK52JQ

RD RS1FK52TF 642 0 0
GGATCGGAGACTCAGATCTGCAATCTAAGTTCTTGAGGGATCCAATTTGAAGGGAGAAGA
AGAAGAAGAAGCATGGACACTTTTACGGCGGAGGATCTGTCGACGATCGGCGGAATCGCC
ACCGTGTCGCTCCTTCACTCGTTTATTCCGACTCACTGGCTACCTTTCTCAATCGTTGGA
CGCGCGCAGAAATGGACGCTTTCCAGAACTCTCTTCGTCACTGCATTTGGAGCAGTCCTG
CATGTTATCTCCACTTCTCTTCTCGGTATAACAGCGATCACTATGGCGAATACCATCGCC
GGTGAAGAGACTGTTCACAAGCTTGCTTCTCTTTTGCTTGTGATTCTCGGTGGAAGCTAT
GTCGTATTGTTTTTGGCTGGTAAAGGTGGTCACACTCATTCTCATAACAAACCCATGGAG
AAAATGGCTGCTGCTGGGCTTGTTCTCGTTCCTGCGTTATCTCCATGTGCTACAACTCTC
CCTGTTTTCCTCGCTGTTGGAAATTCTAAGCCCATGATGGTTCTCGCCATCATAGTTCTG
CTGATAAGCACCATATTGGTGATGACATCTCTGGTGGCTCTATCGTTCTATGGTGCAAGT
CAGCTGAAGTTTCACTGGGTGGAGCGATACGACAAGCTACTG

QA 1 642 1 642
DS 

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CTTGCTTCTCTTTTGCTTGTGATTCTCGGTGGAAGCTATGTCGTATTGTTTTTGGCTGGT
AAAGGTGGTCACACTCATTCTCATAACAAACCCATGGAGAAAATGGCTGCTGCTGGGCTT
GTTCTCGTTCCTGCGTTATCTCCATGTGCTACAACTCTCCCTGTTTTCCTCGCTGTTGGA
AATTCTAAGCCCATGATGGTTCTCGCCATCATAGTTCTGCTGATAAGCACCATATTGGTG
ATGACATCTCTGGTGGCTCTATCGTTCTATGGTGCAAGTCAGCTGAAGTTTCACTGGGTG
GAGCGATACGACAAGCTACTGGTTGGTTCGGTTCTGTGTTTGGTAGGTATCTTAACCCTT
TTCTTCCATGATCATGACCACCATGGCCACGAAGCACATCAACTCCCCAGGAAAATCATT
ACTCTTTAGAGACGGCTTTCAAATCTCTGTTTTGTCCGTCATGTCTGTTTGTTGTAGAGC
GGCTTAAGGTCTTCCCGGTTGTATGTCTATAACTAGTTGTAACGCTCTCTGTTTGCGCGT
GAAAAAAACATATTGCAGCCTTAATTTCATTCAATAGAACACCATTGTGAATGTGATC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

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TTTACATGGACCCACTTTTCATTCCATTTGTGGGAATTTGATGATCTATAAACCGTCCCT
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AAACTTTCCGGCCTCATATAAGAATGGAAAACTTGAGCATTTTCTGCATTGGTGGATGAA
GAATCGCAAACATAATAATTTTTGGTTAACCATGTTCAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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BS 1 279 RS1CK36TF

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TTTACATGGACCCACTTTTCATTCCATTTGTGGGAATTTGATGATCTATAAACCGTCCCT
AACGAACGATCGGCTCATGTTTGAGCATGATGAATCACTTCATGCCGACCTCTTGCTAAT
AAACTTTCCGGCCTCATATAAGAATGGAAAACTTGAGCATTTTCTGCATTGGTGGATGAA
GAATCGCAAACATAATAATTTTTGGTTAACCATGTTCAC

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DS 

RD RS1CK36TF 279 0 0
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TTTACATGGACCCACTTTTCATTCCATTTGTGGGAATTTGATGATCTATAAACCGTCCCT
AACGAACGATCGGCTCATGTTTGAGCATGATGAATCACTTCATGCCGACCTCTTGCTAAT
AAACTTTCCGGCCTCATATAAGAATGGAAAACTTGAGCATTTTCTGCATTGGTGGATGAA
GAATCGCAAACATAATAATTTTTGGTTAACCATGTTCAC

QA 1 279 1 279
DS 



AS 1 2

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GAAGAAGAAGAAGGCCAATCATGTCTAGGCAAGTCGCAGCAAGGCTTCTGGGATCTCTGT
CTCGCCGTTGCTCAAGCACCAGCAACAGCAGCAGCTCTGAATTGTTTCCGACTCTCAGCT
CATTGACTCAATCTCGCTCATTCGCGTCTGATCCTCCGCCTCCAGCTGCCGTATTCGTTG
ACAAAAACACCAGAGTCATGTGTCAAGGCATCACCGGAAAGAACGGAACTTTCCACACCG
AGCAAGCCATTGAGTACGGCACCAAAATGGTGGCAGGAGTGACACCAAAGAAGGGTGGAA
CAGATCACTTAGGTCTCCCTGTGTTCAACTCTGTTGCTGAAGCCAAGGCTGAGACCAAAG
CCAATGCCTCTGTCATTTATGTTCCCGCGCCTTTCGCTGCTGCTGCTATTATGGAGGGTA
TTCAAGCTGAGTTGGATCTTATCGTCTGCATTACTGAAGGAATCCCTCAACACGACATGG
TACGTGTAAAGCATGCACTCAACAGTCAATCAAAAACTAGGCTGATTGGTCCAAACTGCC
CTGGGATTATCGAGCCTGGTGAATGCAAGATTGGTATTATGCCGGGGTACATCCACAAGC
CTGGCAAGATTGGGATCGTCTCTCGTTCTGGAACCCTGACATATGAAGCTGTTTTCCAAA
CAACAGCAGTTGGTCTAGGCCAATCTACTTGTGTAGGAATTGGTGGAGATCCTTTTAATG
GGACCAACTTTGTCGACTGCTTGGAGAAATTCTTTGTTGATCCTCAAACAGAAGGTATCG
TTCTCATTGGAGAAATCGGAGGCACTGCAGAAGAAGATGCTGCAGTTTTGATAAAAGAAA
GTGGTACTGATAAGCCTGTTGTTGCTTTCATTGCTGGACTCACTGCACCACCAGGTCGTC
GAATGGGTCATGCAGGAGCCATTGTTTCCGGTGGGAAAGGTACAGCTCAGGACAAGATTA
AGAGCCTAAATGATGCAGGAGTGAAGGTTGTTGAATCTCCAGCTAAGATAGGAGCGGCCA
TGTATGATCTCTTCAAAGAAAGAGGTCTTTTGAAGCAGTGAAGTGAATTTCACTAGCTCA
CCTTTTTTTTCCATCTTGAAACCTTGGAGAAGTAAACAAAAAAAAGAAACCTAAGCCCTC
GCCATTGATGGGTTGCACACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CO32TF U 1
AF RS1CO32JQ C 432
BS 1 738 RS1CO32TF
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BS 740 822 RS1CO32TF
BS 823 1221 RS1CO32JQ

RD RS1CO32TF 822 0 0
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CATTGACTCAATCTCGCTCATTCGCGTCTGATCCTCCGCCTCCAGCTGCCGTATTCGTTG
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AGCAAGCCATTGAGTACGGCACCAAAATGGTGGCAGGAGTGACACCAAAGAAGGGTGGAA
CAGATCACTTAGGTCTCCCTGTGTTCAACTCTGTTGCTGAAGCCAAGGCTGAGACCAAAG
CCAATGCCTCTGTCATTTATGTTCCCGCGCCTTTCGCTGCTGCTGCTATTATGGAGGGTA
TTCAAGCTGAGTTGGATCTTATCGTCTGCATTACTGAAGGAATCCCTCAACACGACATGG
TACGTGTAAAGCATGCACTCAACAGTCAATCAAAAACTAGGCTGATTGGTCCAAACTGCC
CTGGGATTATCGAGCCTGGTGAATGCAAGATTGGTATTATGCCGGGGTACATCCACAAGC
CTGGCAAGATTGGGATCGTCTCTCGTTCTGGAACCCTGACATATGAAGCTGTTTTCCAAA
CAACAGCAGTTGGTCTAG*CCAATCTACTTGTGTAGGAATTGGTGGAGATCCTTTTAATG
GGACCAACTTTGTCGACTGCTTGGAGAAATTCTTTGTTGATC

QA 1 822 1 822
DS 

RD RS1CO32JQ 790 0 0
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TTGGATCTTATCGTCTGCATTACTGAAGGAATCCCTCAACACGACATGGTACGTGTAAAG
CATGCACTCAACAGTCAATCAAAAACTAGGCTGATTGGTCCAAACTGCCCTGGGATTATC
GAGCCTGGTGAATGCAAGATTGGTATTATGCCGGGGTACATCCACAAGCCTGGCAAGATT
GGGATCGTCTCTCGTTCTGGAACCCTGACATATGAAGCTGTTTTCCAAACAACAGCAGTT
GGTCTAGGCCAATCTACTTGTGTAGGAATTGGTGGAGATCCTTTTAATGGGACCAACTTT
GTCGACTGCTTGGAGAAATTCTTTGTTGATCCTCAAACAGAAGGTATCGTTCTCATTGGA
GAAATCGGAGGCACTGCAGAAGAAGATGCTGCAGTTTTGATAAAAGAAAGTGGTACTGAT
AAGCCTGTTGTTGCTTTCATTGCTGGACTCACTGCACCACCAGGTCGTCGAATGGGTCAT
GCAGGAGCCATTGTTTCCGGTGGGAAAGGTACAGCTCAGGACAAGATTAAGAGCCTAAAT
GATGCAGGAGTGAAGGTTGTTGAATCTCCAGCTAAGATAGGAGCGGCCATGTATGATCTC
TTCAAAGAAAGAGGTCTTTTGAAGCAGTGAAGTGAATTTCACTAGCTCACCTTTTTTTTC
CATCTTGAAACCTTGGAGAAGTAAACAAAAAAAAGAAACCTAAGCCCTCGCCATTGATGG
GTTGCACACC

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 2

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TCTTTTTGCCTTTTGTTCTTTCTGTTAAGTTTTGACTGGTAACTAATTTGCAAAAAAAAA
GGAATTACAAAACTCGAATGATAAAGTTACTGCAAAATCCAATCAAAGCCATTAACTGTA
TATACTACCCACAACTGAAGACAGACCCTGACAGGTATTATCCCTCAGGACCCATCACTC
TCCTAATTTTTCCAGGAGGTGACAGCACGGCAGGGCTGTTTCCGTGTCGGTTGTTTTGCT
CAAAGGCTTTTGGTTCAAGGGCGTCTCCTTTCGAAGCTGGAATCTGAAGCTTCCCTGGCT
CAGTTGGTGATGGAGAAGACGAGAAATACCTGTGGTCCAAAGCTTGCTGTATGGTGATCC
TTTGTCGCGGGTCGTAAATGAACATTTTGGATAGAAGATCCAAAGCGTCATCGCTTGCCA
TAGGGAAAATGGTACGTAGTGGTGGAGCTGGTGTGTAGGAGAACTCCATGTACTCTGGGA
GGTAGATCATGTCGGACCATTGGGATTGTGTTGGAGTTCCAAAAGCTTGAAAGATCTTTC
CCAGTTGATCTATCTCAGTTGAACCTGGTAGAAAGGGTCGGCGAAGTAATAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1CT71JQ U 79
AF RS1CU86JQ U 1
BS 1 112 RS1CU86JQ
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BS 114 140 RS1CU86JQ
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RD RS1CT71JQ 299 0 0
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TGATAAAGTTACTGCAAAATCCAATCAAAGCCATTAACTGTATATACTACCCACAACTGA
AGACAGACCCTGACAGGTATTATCCCTCAGGACCCATCACTCTCCTAATTTTTCCAGGAG
GTGACAGCACGGCAGGGCTGTTTCCGTGTCGGTTGTTTTGCTCAAAGGCTTTTGGTTCAA
GGGCGTCTCCTTTCGAAGCTGGAATCTGAAGCTTCCCTGGCTCAGTTGGTGATGGA
AAA

QA 1 296 1 296
DS 

RD RS1CU86JQ 653 0 0
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TCTTTTTGCCTTTTGTTCTTTCTGTTAAGTTTTGACTGGTAACTAATTTGCAGAAAAAAA
GGAATTACAAAACTCGAATGCTAGAGTTACTGCAAAATCCAATCAAAGCCATTAACTGTA
TATACTACCCACAACTGAAGACAGACCCTGACAGGTATTATCCCTCAGGACCCATCACTC
TCCTAATTTTTCCAGGAGGTGACAGCACGGCAGGGCTGTTTCCGTGTCGGTTGTTTTGCT
CAGAGGCTTTTGGTTCAAGGGCGTCTCCTTTCGAAGCTGGAATCTGAAGCTTCCCTGGCT
CAGTTGGTGATGGAGAAGACGAGAAATACCTGTGGTCCAAAGCTTGCTGTATGGTGATCC
TTTGTCGCGGGTCGTAAATGAACATTTTGGATAGAAGATCCAAAGCGTCATCGCTTGCCA
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GGTAGATCATGTCGGACCATTGGGATTGTGTTGGAGTTCCAAAAGCTTGAAAGATCTTTC
CCAGTTGATCTATCTCAGTTGAACCTGGTAGAAAGGGTCGGCGAAGTAATAGC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 2

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CATCCAAGAAAGAGGGGAAAAAGATGATAGAGGTGGTGCTGAACGATCGACTGGGGAAGA
AAGTAAGGGTGAAGTGTAACGAAGACGACACGATCGGTGATCTGAAGAAGCTGGTGGCGG
CGCAGACGGGAACGCGAGCGGAGAAGATTCGGATTCAGAAGTGGTACAACATCTACAAGG
ATCACATCACTCTCAAGGACTACGAGATCCACGACGGCATGGGTCTCGAGCTCTACTACA
ACTAGGCGAACCGGAGGGGTGCTAAGCAAGTGTGTGCTGAAGGAATGTTGTTGATTTGCG
CACCTCCATAAACAACAATAAATATGTCTGTAAAATTGGGTAATTGGTTTCTGATTATGT
ATTGCTTTGGTAAAACTAAAATCAAATGTGTTGTAATAAGCTACTCTTCCGACTTTTGTC
TACGGTAAAGTCTCTCGGTGTTGTGCTCGATTGCTATAATTCTAAATGTTGCCCATAACT
TTCTGG


BQ
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15 15 15 15 15 10 

AF RS1A362TF U 1
AF RS1A362TV U 165
BS 1 545 RS1A362TF
BS 546 546 RS1A362TV

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CATCCAAGAAAGAGGGGAAAAAGATGATAGAGGTGGTGCTGAACGATCGACTGGGGAAGA
AAGTAAGGGTGAAGTGTAACGAAGACGACACGATCGGTGATCTGAAGAAGCTGGTGGCGG
CGCAGACGGGAACGCGAGCGGAGAAGATTCGGATTCAGAAGTGGTACAACATCTACAAGG
ATCACATCACTCTCAAGGACTACGAGATCCACGACGGCATGGGTCTCGAGCTCTACTACA
ACTAGGCGAACCGGAGGGGTGCTAAGCAAGTGTGTGCTGAAGGAATGTTGTTGATTTGCG
CACCTCCATAAACAACAATAAATATGTCTGTAAAATTGGGTAATTGGTTTCTGATTATGT
ATTGCTTTGGTAAAACTAAAATCAAATGTGTTGTAATAAGCTACTCTTCCGACTTTTGTC
TACGGTAAAGTCTCTCGGTGTTGTGCTCGATTGCTATAATTCTAAATGTTGCCCATAACT
TTCTG

QA 1 545 1 545
DS 

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TACAACATCTACAAGGATCACATCACTCTCAAGGACTACGAGATCCACGACGGCATGGGT
CTCGAGCTCTACTACAACTAGGCGAACCGGAGGGGTGCTAAGCAAGTGTGTGCTGAAGGA
ATGTTGTTGATTTGCGCACCTCCATAAACAACAATAAATATGTCTGTAAAATTGGGTAAT
TGGTTTCTGATTATGTATTGCTTTGGTAAAACTAAAATCAAATGTGTTGTAATAAGCTAC
TCTTCCGACTTTTGTCTACGGTAAAGTCTCTCGGTGTTGTGCTCGATTGCTATAATTCTA
AATGTTGCCCATAACTTTCTGG

QA 1 382 1 382
DS 



AS 1 2

CO CL5156Contig1 1250 2 2 U
GGCCCCTCCCCTCTCTGCGTCGAGATCTCTCTCTCTTTCTCAAACTCTCGTCAACAAACA
AAGTGACCACCTTCTCAGCTTCGATCTCTTCTTAATCAAACTAATGGATCTCGCGGCGGA
GGAGCTTCAATTTCTCAGCATCGGAGGCATACTCCGTGAATCCACCACGATCCCCAAATT
CTCCCCGAGAACATTCTACCTCATAACCCTAACCCTAATCTTCCCTCTCTCCTTCGCCAT
CCTCGCTCATTCCCTCTTCACTCAACCCATCCTCAACCAGCTCGACGCTTCTCCTCCCTC
CGCCGACCAGTCTCAGACCAACCACCAATGGACTCTCCTCTTCGTCTACCGGTTCATCTA
CATCATCTTCCTCTTCGCCTTCTCCCTCCTCTCCACCGCCGCCGTCGTCTTCACTGTCGC
CTCCCTCTACACAAGCAAACCCGTTTCCTTCTCCTCCACCATGTCGGCCATCCCTCTCGT
CCTCAAACGCCTCTTCATCACTTTCCTCTGGGTCTCTCTCTGTATGCTCGTCTACAACTC
CGTCTTCTTGATGTCCCTCGTCATCCTCATCGTCGCCATCGATCTCCAGAGCGTGATCCT
CGCTGTCTTCTCCATGGTTGTCATCTTTATCCTGTTTCTTGGCGTTCACGTTTACATGAC
TGCTTGGTGGCATTTAGCTAGCGTTGTCTCTGTTCTTGAACCTGTCTACGGGATCGCCGC
CATGAGGAAGAGCTACGATTTGCTTAAAGGGAGACGCACATGGCGTGTTCCATGGTGTTT
ATGTATCTCGCTCTTTGCGGGTTCATCGCCGGTGTTTTCGGAGGCGTGGTGGTTCGTGGA
GGTGATGAGTTCGGGTTGTTTGCGAGGATTGTTGTTGGAGGGTTCTTGGTTGGTGTCTTA
GTCGTTGTGAATCTTGTTGGGTTGCTTGTGCAGAGTGTCTTTTACTATGTCTGCAAGAGC
TTTCACCATCAGGCGATTGATAAATCCGCCTTGCACGATCATCTTGGTGGGTATCTTGGT
GACTATGTGCCTTTAAAGAGCAGTGTTCAGATGGAGAATTTTGACATTTGATATAATCAA
ATGAAAGGATAAAAATTGTAATGTTTGTAATGCTTTATAGTCTTTGTTGTTATAGCTTTT
ATCTGAATTAATCTGGGGGACTAGACTGATATTGCAGATGTGTGTATGTTCCCTGTAATC
TTTGTAGTGTGTTTTGTTCCAAATTGGAAGGTTAATGAAATAAAAGTTGC


BQ
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AF RS1FU84TF U 1
AF RS1FU84JQ C 545
BS 1 722 RS1FU84TF
BS 723 1250 RS1FU84JQ

RD RS1FU84TF 722 0 0
GGCCCCTCCCCTCTCTGCGTCGAGATCTCTCTCTCTTTCTCAAACTCTCGTCAACAAACA
AAGTGACCACCTTCTCAGCTTCGATCTCTTCTTAATCAAACTAATGGATCTCGCGGCGGA
GGAGCTTCAATTTCTCAGCATCGGAGGCATACTCCGTGAATCCACCACGATCCCCAAATT
CTCCCCGAGAACATTCTACCTCATAACCCTAACCCTAATCTTCCCTCTCTCCTTCGCCAT
CCTCGCTCATTCCCTCTTCACTCAACCCATCCTCAACCAGCTCGACGCTTCTCCTCCCTC
CGCCGACCAGTCTCAGACCAACCACCAATGGACTCTCCTCTTCGTCTACCGGTTCATCTA
CATCATCTTCCTCTTCGCCTTCTCCCTCCTCTCCACCGCCGCCGTCGTCTTCACTGTCGC
CTCCCTCTACACAAGCAAACCCGTTTCCTTCTCCTCCACCATGTCGGCCATCCCTCTCGT
CCTCAAACGCCTCTTCATCACTTTCCTCTGGGTCTCTCTCTGTATGCTCGTCTACAACTC
CGTCTTCTTGATGTCCCTCGTCATCCTCATCGTCGCCATCGATCTCCAGAGCGTGATCCT
CGCTGTCTTCTCCATGGTTGTCATCTTTATCCTGTTTCTTGGCGTTCACGTTTACATGAC
TGCTTGGTGGCATTTAGCTAGCGTTGTCTCTGTTCTTGAACCTGTCTACGGGATCGCCGC
CA

QA 1 722 1 722
DS 

RD RS1FU84JQ 706 0 0
TTCTTGATGTCCCTCGTCATCCTCATCGTCGCCATCGATCTCCAGAGCGTGATCCTCGCT
GTCTTCTCCATGGTTGTCATCTTTATCCTGTTTCTTGGCGTTCACGTTTACATGACTGCT
TGGTGGCATTTAGCTAGCGTTGTCTCTGTTCTTGAACCTGTCTACGGGATCGCCGCCATG
AGGAAGAGCTACGATTTGCTTAAAGGGAGACGCACATGGCGTGTTCCATGGTGTTTATGT
ATCTCGCTCTTTGCGGGTTCATCGCCGGTGTTTTCGGAGGCGTGGTGGTTCGTGGAGGTG
ATGAGTTCGGGTTGTTTGCGAGGATTGTTGTTGGAGGGTTCTTGGTTGGTGTCTTAGTCG
TTGTGAATCTTGTTGGGTTGCTTGTGCAGAGTGTCTTTTACTATGTCTGCAAGAGCTTTC
ACCATCAGGCGATTGATAAATCCGCCTTGCACGATCATCTTGGTGGGTATCTTGGTGACT
ATGTGCCTTTAAAGAGCAGTGTTCAGATGGAGAATTTTGACATTTGATATAATCAAATGA
AAGGATAAAAATTGTAATGTTTGTAATGCTTTATAGTCTTTGTTGTTATAGCTTTTATCT
GAATTAATCTGGGGGACTAGACTGATATTGCAGATGTGTGTATGTTCCCTGTAATCTTTG
TAGTGTGTTTTGTTCCAAATTGGAAGGTTAATGAAATAAAAGTTGC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL5157Contig1 996 2 2 U
GGATCTCTAGCCGGCCCACTCCCGAGGAACCGAACAATATTTACGCATTTATTGAAAACT
CCGATGAACCAATTCCTATTTTATTTCTTTGACGTAATCAAATCGTCTAAACTGTTACCA
AACCCTAAACCTAGATTTTAGCGAGAGAAAGTCTCCGATCCAGCGATCCTCTCATCGTGG
TGGGAACCATGGGCGAAGAAGGCGAGTTTTCCCTTAATATGACAATGACAATGGTGATGT
GGAACATGGATGACTACCCAATCCCTGATGCTGCTGGTATCGAAGATGATCTTGGTTTTA
TTCGTACTAATATCAAACAAGTTGTTCATCGAATGGGCTTTCGTGGATATATGGAAGTCG
ATGTGTATTGTAAGCGAATCAACAGCGACGTAAAAGAAAAGTTGAGCAAGGCCGGAATCA
TTTACTTACCCTCATGTACAAGAACTTACCTGTTTTCTGGTGTTAACAAAGCGGCTCCTA
TGGATATGACTTCTATTTTGATTGATTCCGCACTAACTAATACTGAATCATGTGTTCCAC
TTTGTTTCGTGGTAATCGCAAAGGCAAACCGGAAGGGGAGTTAGATAGGGTTCTCAAGTG
TTTGGAATCTAGGGGTCACGGTATTCTCCTAATTGATCCGACTGCTATCACAGGATCTTT
CTTTAGTGTGGAATCTCTACTTGCTTGTGCACGTGTTTTACGTCCTCCTCCTCCTCCTCG
TACCGATCTCTCCTCTCGTCTTCTTCCCCATGATTATTTCTCCCAAGGCCAAGAAGATGT
TGAAGAAGAAGATGCCTACAATATTGTAGATTTCCTCGGTAAGACCATCCCAAATTGTTG
TTCTGTTTGTTTATGATTTTTTTTTTAATCTGTCATATTGAAATAAATAATAATTAAAAC
TATTGTGCATTGCTCAGAGCCTATAAGAGCAACATTATTGCTAGGACTTAAATGTTGGTC
CTTAGGTTTTTTTAATAATATTTTGGTGTTAAGGAC


BQ
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AF RS1DW95TF U 1
AF RS1DW95JQ C 269
BS 1 649 RS1DW95TF
BS 650 996 RS1DW95JQ

RD RS1DW95TF 649 0 0
GGATCTCTAGCCGGCCCACTCCCGAGGAACCGAACAATATTTACGCATTTATTGAAAACT
CCGATGAACCAATTCCTATTTTATTTCTTTGACGTAATCAAATCGTCTAAACTGTTACCA
AACCCTAAACCTAGATTTTAGCGAGAGAAAGTCTCCGATCCAGCGATCCTCTCATCGTGG
TGGGAACCATGGGCGAAGAAGGCGAGTTTTCCCTTAATATGACAATGACAATGGTGATGT
GGAACATGGATGACTACCCAATCCCTGATGCTGCTGGTATCGAAGATGATCTTGGTTTTA
TTCGTACTAATATCAAACAAGTTGTTCATCGAATGGGCTTTCGTGGATATATGGAAGTCG
ATGTGTATTGTAAGCGAATCAACAGCGACGTAAAAGAAAAGTTGAGCAAGGCCGGAATCA
TTTACTTACCCTCATGTACAAGAACTTACCTGTTTTCTGGTGTTAACAAAGCGGCTCCTA
TGGATATGACTTCTATTTTGATTGATTCCGCACTAACTAATACTGAATCATGTGTTCCAC
TTTGTTTCGTGGTAATCGCAAAGGCAAACCGGAAGGGGAGTTAGATAGGGTTCTCAAGTG
TTTGGAATCTAGGGGTCACGGTATTCTCCTAATTGATCCGACTGCTATC

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1DW95JQ 728 0 0
TGCTGCTGGTATCGAAGATGATCTTGGTTTTATTCGTACTAATATCAAACAAGTTGTTCA
TCGAATGGGCTTTCGTGGATATATGGAAGTCGATGTGTATTGTAAGCGAATCAACAGCGA
CGTAAAAGAAAAGTTGAGCAAGGCCGGAATCATTTACTTACCCTCATGTACAAGAACTTA
CCTGTTTTCTGGTGTTAACAAAGCGGCTCCTATGGATATGACTTCTATTTTGATTGATTC
CGCACTAACTAATACTGAATCATGTGTTCCACTTTGTTTCGTGGTAATCGCAAAGGCAAA
CCGGAAGGGGAGTTAGATAGGGTTCTCAAGTGTTTGGAATCTAGGGGTCACGGTATTCTC
CTAATTGATCCGACTGCTATCACAGGATCTTTCTTTAGTGTGGAATCTCTACTTGCTTGT
GCACGTGTTTTACGTCCTCCTCCTCCTCCTCGTACCGATCTCTCCTCTCGTCTTCTTCCC
CATGATTATTTCTCCCAAGGCCAAGAAGATGTTGAAGAAGAAGATGCCTACAATATTGTA
GATTTCCTCGGTAAGACCATCCCAAATTGTTGTTCTGTTTGTTTATGATTTTTTTTTTAA
TCTGTCATATTGAAATAAATAATAATTAAAACTATTGTGCATTGCTCAGAGCCTATAAGA
GCAACATTATTGCTAGGACTTAAATGTTGGTCCTTAGGTTTTTTTAATAATATTTTGGTG
TTAAGGAC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL5158Contig1 823 2 2 U
GGACCGCCGTCCGTCTCCCTAAACTCAAATCGTCTTTCGCATTTCCATCGCTTCACTAAT
CTGTATCATCCCTCTCCCACTGGTATAACGGAAAATGCGAGGGATATCGAGTCGATCACT
TTATTATTTGACACGATCTCTGTTATCACGCGCCCGTCACGGGATCACAGTGGAGACATC
ATCAGGTGGATGCACACCTGCGCTTGGTTCTCTGTGGTCTGCTCTTCAGAGCCGTGGCGT
TAAAGTTAACGCCATTCAGTTAAGGCCAGGGAACGTTATTGAACGAACAGGACGTACTTT
CCGGGTTGTAGAATCAGAGCATAAACAACAAGGCAGAGGAGGAGCCTCCATACAGGTAGA
GCTTCGCGATGTTGACAACGGGAGCAAACTTAACCTGCGGTTTGGAGCTGAGGAGTCCGT
TGAGAAGGTTTTTGTTCAGGAGAAATCTTTCACATGTTTATATACAGAAGGAGATACTGC
ATTTCTGATTGAGCCCGATACGTTTGAGCAAGTTGAGGTGCCCTTGGACATATTTGGCAA
AGCTGCTGTATATTTGAAAGAGGAAATGAGAGTACAGTTGCAGCTGTATGATGGAAGAGC
TTTATCTGCATCTGTCCCTAAGCATGTCACATGCACAATCCAAGAAACACAACTTCCCAT
GAAAGGCTTGACCTCAGCTCCTCGTTACAAGAGAGCTCTCCTGGATAATGGCTCTACTAT
TCAAGTACCATCTTATCTGGAGGCAGGGGAAAAGATTGTGATAAACACCGAGGATGATTC
TTTTGTCAAGAGGGACAACAAATGAAATAATCAAATGCTGCCT


BQ
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AF RS1AP93TFB U 1
AF RS1AP93JQ C 449
BS 1 739 RS1AP93TFB
BS 740 823 RS1AP93JQ

RD RS1AP93TFB 739 0 0
GGACCGCCGTCCGTCTCCCTAAACTCAAATCGTCTTTCGCATTTCCATCGCTTCACTAAT
CTGTATCATCCCTCTCCCACTGGTATAACGGAAAATGCGAGGGATATCGAGTCGATCACT
TTATTATTTGACACGATCTCTGTTATCACGCGCCCGTCACGGGATCACAGTGGAGACATC
ATCAGGTGGATGCACACCTGCGCTTGGTTCTCTGTGGTCTGCTCTTCAGAGCCGTGGCGT
TAAAGTTAACGCCATTCAGTTAAGGCCAGGGAACGTTATTGAACGAACAGGACGTACTTT
CCGGGTTGTAGAATCAGAGCATAAACAACAAGGCAGAGGAGGAGCCTCCATACAGGTAGA
GCTTCGCGATGTTGACAACGGGAGCAAACTTAACCTGCGGTTTGGAGCTGAGGAGTCCGT
TGAGAAGGTTTTTGTTCAGGAGAAATCTTTCACATGTTTATATACAGAAGGAGATACTGC
ATTTCTGATTGAGCCCGATACGTTTGAGCAAGTTGAGGTGCCCTTGGACATATTTGGCAA
AGCTGCTGTATATTTGAAAGAGGAAATGAGAGTACAGTTGCAGCTGTATGATGGAAGAGC
TTTATCTGCATCTGTCCCTAAGCATGTCACATGCACAATCCAAGAAACACAACTTCCCAT
GAAAGGCTTGACCTCAGCTCCTCGTTACAAGAGAGCTCTCCTGGATAATGGCTCTACTAT
TCAAGTACCATCTTATCTG

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1AP93JQ 375 0 0
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CAAGTTGAGGTGCCCTTGGACATATTTGGCAAAGCTGCTGTATATTTGAAAGAGGAAATG
AGAGTACAGTTGCAGCTGTATGATGGAAGAGCTTTATCTGCATCTGTCCTTAAGCATGTC
ACATGCACAATCCAAGAAACACAACTTCCCATGAAAGGCTTGACCTCAGCTCCTCGTTAC
AAGAGAGCTTTCCTGGATAATGGCTCTACTATTCAAGTACCATTTTATCTGGAGGCAGGG
GAAAAGATTGTGATAAACACCGAGGATGATTCTTTTGTCAAGAGGGACAACAAATGAAAT
AATCAAATGCTGCCT

QA 1 375 1 375
DS 



AS 1 2

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GGCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCCGGAGAAAGAAAAAGTAAAAGAAGGCTCTTTCTGATC
TCCTCTTTAACTTGGATCGTTTCGTGAATCTGTTTCTCCTTAGATCCAAACCATTTCAAT
CTCATAAAAATATCGATTTCGCGTTTCTGGTCTGTCACAATCAGAAGCCAGAAAAAAGGG
GATGGCGGCGGTGAATGGGTACCAAGGAAATACTCCGGCGGAGACAACGCCGGCAGCCAC
CGGATCGAAGCATCCTGCTCCTCCGACTAAGACCGTCGATAGCCAATCCGTTCTTAAAAG
GTTGCAATCTGAACTAATGGGTTTAATGATGGGAGGTGATCCGGGGATATCGGCTTTCCC
AGAGGAAGACAACATATTCTGCTGGAAAGGAACAATCACAGGAAGCAAAGATACTGTGTT
TGAAGGAACTGAGTACAGACTCTCACTCGCTTTCTCCAACGATTATCCTTTCAAACCTCC
CAAGATCAAGTTTGAGACTTGCTGCTTCCATCCTAATGTGGATCTCTATGGCAATATTTG
CTTGGACATTCTTCAGGATAAATGGTCATCTGCCTATGATGTGAGGACGATATTACTCTC
GATTCAAAGCCTTCTTGGAGAACCGAACATCAGCTCACCATTGAACAACCAAGCAGCTCA
GCTTTGGAGCAACCAAGAAGAGTATAGGAAGATGGTAGAGAAGCTCTACAAACCGTTAAA
CGCATGATTCTGAAAAGCCTCTTGTCACTGCATTCAAATGATCATGTTACTTTTTTATTA
AACTTTGTAATATCAATTCGTGCCAGTCTTAGCAATCAAAACTAGTAATATCTTCCATGC
AACC


BQ
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10 10 10 10 

AF RS1GH75TF U 1
AF RS1GH75JQ C 151
BS 1 529 RS1GH75TF
BS 530 844 RS1GH75JQ

RD RS1GH75TF 529 0 0
GGCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCCGGAGAAAGAAAAAGTAAAAGAAGGCTCTTTCTGATC
TCCTCTTTAACTTGGATCGTTTCGTGAATCTGTTTCTCCTTAGATCCAAACCATTTCAAT
CTCATAAAAATATCGATTTCGCGTTTCTGGTCTGTCACAATCAGAAGCCAGAAAAAAGGG
GATGGCGGCGGTGAATGGGTACCAAGGAAATACTCCGGCGGAGACAACGCCGGCAGCCAC
CGGATCGAAGCATCCTGCTCCTCCGACTAAGACCGTCGATAGCCAATCCGTTCTTAAAAG
GTTGCAATCTGAACTAATGGGTTTAATGATGGGAGGTGATCCGGGGATATCGGCTTTCCC
AGAGGAAGACAACATATTCTGCTGGAAAGGAACAATCACAGGAAGCAAAGATACTGTGTT
TGAAGGAACTGAGTACAGACTCTCACTCGCTTTCTCCAACGATTATCCTTTCAAACCTCC
CAAGATCAAGTTTGAGACTTGCTGCTTCCATCCTAATGTGGATCTCTAT

QA 1 529 1 529
DS 

RD RS1GH75JQ 694 0 0
TCTGTCACAATCAGAAGCCAGAAAAAAGGGGATGGCGGCGGTGAATGGGTACCAAGGAAA
TACTCCGGCGGAGACAACGCCGGCAGCCACCGGATCGAAGCATCCTGCTCCTCCGACTAA
GACCGTCGATAGCCAATCCGTTCTTAAAAGGTTGCAATCTGAACTAATGGGTTTAATGAT
GGGAGGTGATCCGGGGATATCGGCTTTCCCAGAGGAAGACAACATATTCTGCTGGAAAGG
AACAATCACAGGAAGCAAAGATACTGTGTTTGAAGGAACTGAGTACAGACTCTCACTCGC
TTTCTCCAACGATTATCCTTTCAAACCTCCCAAGATCAAGTTTGAGACTTGCTGCTTCCA
TCCTAATGTGGATCTCTATGGCAATATTTGCTTGGACATTCTTCAGGATAAATGGTCATC
TGCCTATGATGTGAGGACGATATTACTCTCGATTCAAAGCCTTCTTGGAGAACCGAACAT
CAGCTCACCATTGAACAACCAAGCAGCTCAGCTTTGGAGCAACCAAGAAGAGTATAGGAA
GATGGTAGAGAAGCTCTACAAACCGTTAAACGCATGATTCTGAAAAGCCTCTTGTCACTG
CATTCAAATGATCATGTTACTTTTTTATTAAACTTTGTAATATCAATTCGTGCCAGTCTT
AGCAATCAAAACTAGTAATATCTTCCATGCAACC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL5160Contig1 1391 2 2 U
GGCACAAGGCACAAGACACAAGGCACAAGCAAAGAAGAAGAAGAAAGAATACACAAATCC
CTGAAACCTTGCTCAGTTGCCAAATTGATTTGCATTCATCTTCTCCTTCACACGCCCAAT
CTCTCTACTTCTCCGGTCACTGGATCGGGGAATCCACTCGATTAGGCTCTCTTTCCGTTC
TCTGGATTGTGTTCCGATGACGTGTCCGGAAGACGAAAAGGCACTTCTTTTGCCGCGGAT
GAAAGTCGAAGGCGATGAAGACGCCGACGTCGAGAAAGGGGCTTATGTGAAACTGGGTGA
GGGTCAAGAAGAATCATCAGGGCAGGAGGAGGAGAAGAAAGAAGAAGAAGTAAAGGAGGA
GGCTGCTACGTCGCCGTTTTGGTTCTGGTTCAAGCTTGCTCTTTTATTCTCTTTTCTTGC
TGCCTTGGCCTTCGTTGCTTACCGATGGGTCGGTCCTTTAATCATGGACAAGGAGCTTAT
CCCGATTATAAAATGGGAGATAAGGACTTTCACACATCCCGTGTGCGGTCTTCTTGTCTT
TGCATCCGTGGCTGTATTCCCCACTATACTTCTTCCCTCTACTCCCTCCACGTGGATTGC
TGGGATGACTTTTGGTTACGGCTACGGCTTTCTACTTATTATCTCTGCTGCATCTCTTGG
TGTCTCCCTTCCTTACTTCATTGGACACCTCTTCCGCCACAATATTCAAAGATGGTTGGA
AAGGTATCCTGATCAAGCAGTGGTATTAAGAGCTGCGGGTGAAGGGAACTGGTTTCACCA
GTTTCGAGCAGTCACTTTAATCCGGATTTCTCCATTCCCTTACATTCTTTATAACTACTG
CTCTGTAGCAACTCGTGTTAAGTACGGTCCTTACATCACTGGATCTCTCTTAGGCATGGT
GCCCGAGATCTTTGTTGCTATCTATACCGGGAATCTTGTAAAGACATTAGCAGAAGCATC
TTCTGCAGATAAACACGGCCTCTCGGTTACGCAGATCATTCTCAACATTTTGGGCTTTCT
AGGAACTGTGGCTACAACGGTTCTCATCACAAAGTATGCGAAAAGACAGCTGGAGACCAT
GAAGAAAGAGGAAGAAGCATTGCTGCAATAAAACCCCTCCGAGTTGCTTCTATCTCTCGT
CTCACTCCTTACACAGTTCACGTTTGCTCCAAGATGTGTAAGAGCACTGGTTATTTTGTT
TCCTTGGTTCTTCTCATCTCTTTAATTAACACAGCCTTCAAAAAAAGAAGAAGAAACATA
TGGTGGTTAACTAGTAGTATGAACAGAGGGAGAATCTAACACCATTCTTGATTCTTGGGT
GTAAGTAAGTATTGTGTACTTGTGTGGCTTTGGTGACATGAATTAAAAAAAATTGTTATT
TGCAAACGACG


BQ
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CTCTCTACTTCTCCGGTCACTGGATCGGGGAATCCACTCGATTAGGCTCTCTTTCCGTTC
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TGCCTTGGCCTTCGTTGCTTACCGATGGGTCGGTCCTTTAATCATGGACAAGGAGCTTAT
CCCGATTATAAAATGGGAGATAAGGACTTTCACACATCCCGTGTGCGGTCTTCTTGTCTT
TGCATCCGTGGCTGTATTCCCCACTATACTTCTTCCCTCTACTCCCTCCACGTGGATTGC
TGGGATGACTTTTGGTTACGGCTACGGCTTTCTACTTATTATCTCTGCTGCATCTCTTGG
TGTCTCCCTTCCTTACTTCATTGGACACCTCTTCCGCCACAATATTCAAAGATGGTTGGA
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CCTTACATTCTTTATAACTACTGCTCTGTAGCAACTCGTGTTAAGTACGGTCCTTACATC
ACTGGATCTCTCTTAGGCATGGTGCCCGAGATCTTTGTTGCTATCTATACCGGGAATCTT
GTAAAGACATTAGCAGAAGCATCTTCTGCAGATAAACACGGCCTCTCGGTTACGCAGATC
ATTCTCAACATTTTGGGCTTTCTAGGAACTGTGGCTACAACGGTTCTCATCACAAAGTAT
GCGAAAAGACAGCTGGAGACCATGAAGAAAGAGGAAGAAGCATTGCTGCAATAAAACCCC
TCCGAGTTGCTTCTATCTCTCGTCTCACTCCTTACACAGTTCACGTTTGCTCCAAGATGT
GTAAGAGCACTGGTTATTTTGTTTCCTTGGTTCTTCTCATCTCTTTAATTAACACAGCCT
TCAAAAAAAGAAGAAGAAACATATGGTGGTTAACTAGTAGTATGAACAGAGGGAGAATCT
AACACCATTCTTGATTCTTGGGTGTAAGTAAGTATTGTGTACTTGTGTGGCTTTGGTGAC
ATGAATTAAAAAAAATTGTTATTTGCAAACGACG

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TTCAGTTGCGTCAAAACGAGCTGCTGACTCTTCCTCACCAAGGAGCTTCTCCTCCTCGTT
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AAGATGTCGTCACGATGAAGGTGAATGTTCAGGGTTTAGGGTATGTAAAAGTGAATATGG
ATGGGTTGGCATAGGCAGAAAAGTGGACATTAGAGCTCATTCTTCTTATGAAAACTTGGC
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AAGGGTTCGGATCATGGGAACCTCTGAAGCTAATGGACTTGCTCCAAGACATCAAGAACA
GAAGGAGAGACAAAGACAATGAAACAGCCCTTCTTTTAACTTCCCTTGCAAAGTTACTCA
ATCGAAAAGTATACCGGTGAATCCGATAAAAGCTGAAGCTTAAGATTTTATAGTAATCGT
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CTTCTCAGAGATAGAATGTTCTTTCTTTCTTATATTGTACATAGTTGAATATGGTTTGAT
TTTTCTTGTGTGCTTATTGTTTTTTTCTAAAAGAAC


BQ
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BS 602 602 RS1AY81JQ
BS 603 627 RS1AY81TF
BS 628 1056 RS1AY81JQ

RD RS1AY81TF 627 0 0
GAAAAGACTCTCTCTCTCTCTCTTTGATATCTTTGTCGACATGCGTGGGTCGGAAATGGA
GAGGGGGAAGAGTAATCTTCTTCTTCCGGCTGAGAGTGAGCTGGAGCTGGGATTAGGGCT
CAGCATCGGCGGTGGCGCGTGGAAAGAGCGTGGGAGAATTCTAACGGCTAAGGATTTTCC
TTCAGTTGCGTCAAAACGAGCTGCTGACTCTTCCTCACCAAGGAGCTTCTCCTCCTCGTT
CAAGCAGTCAGATAGTGGGATGGCCACCAATTGGGTCACACAGGATGAACAAGGTGAACA
ACCACCAAGCTATGAAGGCGGGGACCAAAGCTGAAGAAGAAGAAAAGAATGATGAGCCTA
AAGATGTCGTCACGATGAAGGTGAATGTTCAGGGTTTAGGGTATGTAAAAGTGAATATGG
ATGGGTTGGCATAGGCAGAAAAGTGGACATTAGAGCTCATTCTTCTTATGAAAACTTGGC
TCAGACGCTTGAGGAAATGTTCTTCGGAATGACAGGTTCTACTACTTGTAGGGAAAAGGT
GAAGAAACCTTTGAGACTTTTAGATGGATCAGCAGAGTTTGTACTCACTTATGA*GATGA
G*AAAGAGACTGGATGCTTGTTGGAGA

QA 1 627 1 627
DS 

RD RS1AY81JQ 830 0 0
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GAACAAGGTGAACAACCACCAAGCTATGAAGGCGGG*ACCAAAGCTGAAGAAGAAGAAAA
GAATGATGAGCCTAAAGATGTCGTCACGATGAAGGTGAATGTTCAGGGTTTAGGGTATGT
AAAAGTGAATATGGATGGGTTGGCATAGGCAGAAAAGTGGACATTAGAGCTCATTCTTCT
TATGAAAACTTGGCTCAGACGCTTGAGGAAATGTTCTTCGGAATGACAGGTTCTACTACT
TGTAGGGAAAAGGTGAAGAAACCTTTGAGACTTTTAGATGGATCAGCAGAGTTTGTACTC
ACTTATGAAGATGAGGAAGGAGACTGGATGCTTGTTGGAGATGTTCCATGGAGAATGTTT
GTCACTTCAGTGAAAAGGGTTCGGATCATGGGAACCTCTGAAGCTAATGGACTTGCTCCA
AGACATCAAGAACAGAAGGAGAGACAAAGACAATGAAACAGCCCTTCTTTTAACTTCCCT
TGCAAAGTTACTCAATCGAAAAGTATACCGGTGAATCCGATAAAAGCTGAAGCTTAAGAT
TTTATAGTAATCGTGGTTTTTATTACAGGTTTGGAATATGATTTTTTTTTCATTGTGTCA
TTCAATTAGTAGTTTCCTTGGTTTTTTTTTCATCTTCCAGTTGTTTATTCTTTCTCAGTG
TATCAGTTGTCTCTCTTCTCAGAGATAGAATGTTCTTTCTTTCTTATATTGTACATAGTT
GAATATGGTTTGATTTTTCTTGTGTGCTTATTGTTTTTTTCTAAAAGAAC

QA 1 830 1 830
DS 



AS 1 2

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GCTCTAGTTCTCTGGCTTAATGGAGGTCCAGGTTGTTCTTCTGTGGGATATGGAGCAACA
CAAGAAATTGGTCCCTTTCTCGTGGACGCCAATGAAAATGGACTTAAATTTAATCCATAC
GCATGGAATAAAGAGGCCAACATGCTGTTTTTAGAATCTCCCGTCGGTGTTGGCTTTTCG
TATTCAAACACAACTAGCGATTATCAAAAACTTGACGATGACTTTACAGCAAGAGACGCA
TTCACTTTTCTTTGCAACTGGTTCGAGAAATTCCCAGAACACAAAGGAAATACGTTCTAC
ATCGCAGGCGAAAGCTACGCAGGAAAATACGTACCAGAGCTAGCAGAGGTCGTGTACGAT
AACAATAACAAGAACAATGGTTCATCGCTTCGCATCAACCTTAAGGGTATTTTGCTTGGG
AATCCTGAGACATCAGATGCAGAAGATTGGAGAGGTTGGGTGGATTACGCATGGAGCCAT
GCGGTTATATCTGATGAGACGCATAGAATCATAACCAGGACTTGCAATTTCAGCAGCGAC
AATACTTGGAGCGACGATGAGTGCTCCGAAGCCGTAGACGAAGTTCAAAAGCAGTACGAC
GAGATCGATATCTATAGCCTTTATACATCGGTTTGTGTAGGAGATTCTGCCCGATCCTCT
TACTTGGATTCTGCACAATTCAAGACAAATTATCACACCAGCTCCAAGAGGAGGGTTCCA
CCAAGGCGCTTGGGTGGATATGACCCATGCTTAGACGATTACGCTAGAACATTCTACAAT
AGAGCAGATGTTCAGAAGTCTCTTCATGCGAGTGATGGAGTTAATCTCAAGGACTGGAGG
ATTTGCAACATGGAGATCTTTCATAACTGGACTTATACAAAGCCCTCGGTTTTGCCTATA
TACGAGAAACTGATCGCCGGGGGATTAAGAATATGGGTTTACAGTGGTGACACAGACGGA
AGAGTTCCGGTACTCGCGACAAGGTATAGCTTAAGCGCACTCGAATTACCAATCAAGACA
GTTTGGAGGCCTTGGTACCATGAGAAACAGGTAAGTGGATGGCTCCAAGAATACGAAGGT
CTAACGTTTGCTACGTTCAGAGGAGCTGGACATGCTGTGCCTTCCTTCAAACCAAGCAGC
TCTCTTGCCTTTTTCTCGGCCTTTCTCACCGGAATTCCTCCGCCGCAGTCACGGTAGAGA
AGCAATTATTAGTCGTCTTTATGTCTTGAGAATGTTTGAAAGATTTTGGGTTTTGTTACG
TTAACTTGTCAGACACGGTATAAGGAGGGAAAATGATTGTAAACATGTAAAAGATAAACT
GAACGTGACTATGTTGCTTTC


BQ
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AF RS1DM68TF U 1
AF RS1DM68JQ C 577
BS 1 688 RS1DM68TF
BS 689 1341 RS1DM68JQ

RD RS1DM68TF 693 0 0
GCTCTAGTTCTCTGGCTTAATGGAGGTCCAGGTTGTTCTTCTGTGGGATATGGAGCAACA
CAAGAAATTGGTCCCTTTCTCGTGGACGCCAATGAAAATGGACTTAAATTTAATCCATAC
GCATGGAATAAAGAGGCCAACATGCTGTTTTTAGAATCTCCCGTCGGTGTTGGCTTTTCG
TATTCAAACACAACTAGCGATTATCAAAAACTTGACGATGACTTTACAGCAAGAGACGCA
TTCACTTTTCTTTGCAACTGGTTCGAGAAATTCCCAGAACACAAAGGAAATACGTTCTAC
ATCGCAGGCGAAAGCTACGCAGGAAAATACGTACCAGAGCTAGCAGAGGTCGTGTACGAT
AACAATAACAAGAACAATGGTTCATCGCTTCGCATCAACCTTAAGGGTATTTTGCTTGGG
AATCCTGAGACATCAGATGCAGAAGATTGGAGAGGTTGGGTGGATTACGCATGGAGCCAT
GCGGTTATATCTGATGAGACGCATAGAATCATAACCAGGACTTGCAATTTCAGCAGCGAC
AATACTTGGAGCGACGATGAGTGCTCCGAAGCCGTAGACGAAGTTCAAAAGCAGTACGAC
GAGATCGATATCTATAGCCTTTATACATCGGTTTGTGTAGGAGATTCTGCCCGATCCTCT
TACTTGGATTCTGCACAATTCAAGACAA
TTATC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RS1DM68JQ 765 0 0
GACGAAGTTCAAAAGCAGTACGACGAGATCGATATCTATAGCCTTTATACATCGGTTTGT
GTAGGAGATTCTGCCCGATCCTCTTACTTGGATTCTGCACAATTCAAGACAAATTATCAC
ACCAGCTCCAAGAGGAGGGTTCCACCAAGGCGCTTGGGTGGATATGACCCATGCTTAGAC
GATTACGCTAGAACATTCTACAATAGAGCAGATGTTCAGAAGTCTCTTCATGCGAGTGAT
GGAGTTAATCTCAAGGACTGGAGGATTTGCAACATGGAGATCTTTCATAACTGGACTTAT
ACAAAGCCCTCGGTTTTGCCTATATACGAGAAACTGATCGCCGGGGGATTAAGAATATGG
GTTTACAGTGGTGACACAGACGGAAGAGTTCCGGTACTCGCGACAAGGTATAGCTTAAGC
GCACTCGAATTACCAATCAAGACAGTTTGGAGGCCTTGGTACCATGAGAAACAGGTAAGT
GGATGGCTCCAAGAATACGAAGGTCTAACGTTTGCTACGTTCAGAGGAGCTGGACATGCT
GTGCCTTCCTTCAAACCAAGCAGCTCTCTTGCCTTTTTCTCGGCCTTTCTCACCGGAATT
CCTCCGCCGCAGTCACGGTAGAGAAGCAATTATTAGTCGTCTTTATGTCTTGAGAATGTT
TGAAAGATTTTGGGTTTTGTTACGTTAACTTGTCAGACACGGTATAAGGAGGGAAAATGA
TTGTAAACATGTAAAAGATAAACTGAACGTGACTATGTTGCTTTC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL5163Contig1 1145 2 2 U
GTGAACCTGAACTTTACTGATAACGGGAAGCAGAAGCTTGGGTTTGAAGGAGTCGGTAAC
AACAGATCATTGGACACTTACTCTAGTGAAAGCAGCATACCAGCGATGCACCTACTGAGC
CGCATGGATCCGCGTCTGAGGTCTAACGTTCCCGTTGATCAGAGCCGGAACGCTAGCTTT
ACGAAGCCACCGGTTCACCAGTCTCAACCAGGGGACTGTAACAAAACAGCCTACTCCACG
AAGCAGTGGCCGTTTGATCTTTACAGCAAAAGAGTAGTAACTCCTGAGACTTCTCGTGGA
AATTTAGCCATCGTTCCACCAGTTGGCACGTCCCCAATATCGTTTCAAAGTGAAAAGAGT
CCTGCAGAAAACGCTGACTTCAGATTCCAAGCTTCATGGAACCATCACCAGGAGAAAAAC
TCCATTGCCCCGTACAACAACAGTTCTCATCACAAGCCGGTCTTCACAAGCAGCAGCAGC
GATCCTGGGAAGTTCCAGCTTCTCGGAGCATCAGATTCTATGAAGCTACCTCTCAAATAT
CACATGAAAGATAACGCCAAGAAACACAAGTCCAAAAACCACAACAACGCCGCCGTCTCT
GCCTGTCCTCCAACGACCATTTGTGGAAGTTTTGTGTGCAGTGTCAGTAGAAACCCAGCT
GATTTCACCATTCTTGATGCACCTGGGAACGTTTATATGATTAAGGGTGAAGATTTTAAG
GTCAGCAAACAGCTGAGCTTCAGGAAGAAACAAAACTTGTGTAAGCAGGATGCATTGATG
CTAAACAAGGTTTCTTTTGCTCCTACTGATGCAGAGAATGCCTGAAATATTTTATTTGGG
AGTTTGTTTTTTTGTCAGTGTGAAGCAGGTGAAGTAACAGGAGAGACATGCATTGTAGAT
ACAGAGGGATACGCACCCATTCCTCTTTGCTTTTTTTTTATCAGAGAAGATTATTATCTC
CTCTTGTTTCTTTCTTGACAACTTAAAAAAGAATTTTTTGTATGTTTGATGTCTCATCAA
GTCGAGAGGTGTAATATGCTAGGAACAGAACTAAGGGAAAACATGTACCACGGTACAATT
GGGAAGAAGTATAACTTGTCTTTGAACTGAGTGCCTGTAGTGTCAATGAAATGGTTTTTG
AGGTG


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RS1ER05TF U 1
AF RS1ER05JQ C 327
BS 1 706 RS1ER05TF
BS 707 1145 RS1ER05JQ

RD RS1ER05TF 714 0 0
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CGCATGGATCCGCGTCTGAGGTCTAACGTTCCCGTTGATCAGAGCCGGAACGCTAGCTTT
ACGAAGCCACCGGTTCACCAGTCTCAACCAGGGGACTGTAACAAAACAGCCTACTCCACG
AAGCAGTGGCCGTTTGATCTTTACAGCAAAAGAGTAGTAACTCCTGAGACTTCTCGTGGA
AATTTAGCCATCGTTCCACCAGTTGGCACGTCCCCAATATCGTTTCAAAGTGAAAAGAGT
CCTGCAGAAAACGCTGACTTCAGATTCCAAGCTTCATGGAACCATCACCAGGAGAAAAAC
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CACATGAAAGATAACGCCAAGAAACACAAGTCCAAAAACCACAACAACGCCGCCGTCTCT
GCCTGTCCTCCAACGACCATTTGTGGAAGTTTTGTGTGCAGTGTCAGTAGAAACCCAGCT
GATTTCACCATTCTTGATGCACCTGGGAACGTTTATATGATTAAGG
TGAAGATC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RS1ER05JQ 819 0 0
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CCAAGCTTCATGGAACCATCACCAGGAGAAAAACTCCATTGCCCCGTACAACAACAGTTC
TCATCACAAGCCGGTCTTCACAAGCAGCAGCAGCGATCCTGGGAAGTTCCAGCTTCTCGG
AGCATCAGATTCTATGAAGCTACCTCTCAAATATCACATGAAAGATAACGCCAAGAAACA
CAAGTCCAAAAACCACAACAACGCCGCCGTCTTTGCCTGTCCTCCAACGACCATTTGTGG
AAGTTTTGTGTGCAGTGTCAGTAGAAACCCAGCTGATTTCACCATTCTTGATGCACCTGG
GAACGTTTATATGATTAAGGGTGAAGATTTTAAGGTCAGCAAACAGCTGAGCTTCAGGAA
GAAACAAAACTTGTGTAAGCAGGATGCATTGATGCTAAACAAGGTTTCTTTTGCTCCTAC
TGATGCAGAGAATGCCTGAAATATTTTATTTGGGAGTTTGTTTTTTTGTCAGTGTGAAGC
AGGTGAAGTAACAGGAGAGACATGCATTGTAGATACAGAGGGATACGCACCCATTCCTCT
TTGCTTTTTTTTTATCAGAGAAGATTATTATCTCCTCTTGTTTCTTTCTTGACAACTTAA
AAAAGAATTTTTTGTATGTTTGATGTCTCATCAAGTCGAGAGGTGTAATATGCTAGGAAC
AGAACTAAGGGAAAACATGTACCACGGTACAATTGGGAAGAAGTATAACTTGTCTTTGAA
CTGAGTGCCTGTAGTGTCAATGAAATGGTTTTTGAGGTG

QA 1 819 1 819
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CAATGGATTCTCCTCCTCTTCCTCCGACGAAGCTTGATTATCATGTAGACATGTTTAAAC
TTCAATCACAAGCCACGTTCCTCTCCTTATTCAAGGTTCTCCATTACGGAGTTTTCGAGG
GTTGTTCGAATCCTGAAGATATTGAGAAGGGGAAACAAGTTCAGTTGCTTGTTGATGAAT
CAAGGCGCAAACTCAACTCCAGGTTGCACTCAGCTGGACACTTGCTAGATTTGTGTATGC
AGAAGATTGGGTTAGGACATTTGGAGCCTGGGAAAGGCTACCATTTCCCTGACGGTCCTT
TTGTGGAATACAAAGGAGGCGTTCCACAGGCTGAACTACAGGTGAAGCAGAAAGAGTTGG
AGGCAGAGGCTAATGAACTGATATCCAAAGGAGGAAAGGTTTATGCTGCTATATTACCCT
ATGGAGGGGCATCCGTGCTCTGCGGTGGCAGTCTTCCTGATTATATTCCCAGGGGTAGCA
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GCTCAACAGCCACGAATTAGTATTTTGTGGGTATTTATTTTTTATCAAAACTACTAAGCG
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ACTCAGCCTCTTAATTCGCATTACAATATTGACTCTTGGTTTGTATAATCATACCAAACA
TTTGGTAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GP46TF U 1
AF RS1GP46JQ C 364
BS 1 707 RS1GP46TF
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GTTGTTCGAATCCTGAAGATATTGAGAAGGGGAAACAAGTTCAGTTGCTTGTTGATGAAT
CAAGGCGCAAACTCAACTCCAGGTTGCACTCAGCTGGACACTTGCTAGATTTGTGTATGC
AGAAGATTGGGTTAGGACATTTGGAGCCTGGGAAAGGCTACCATTTCCCTGACGGTCCTT
TTGTGGAATACAAAGGAGGCGTTCCACAGGCTGAACTACAGGTGAAGCAGAAAGAGTTGG
AGGCAGAGGCTAATGAACTGATATCCAAAGGAGGAAAGGTTTATGCTGCTATATTACCCT
ATGGAGGGGCATCCGTGCTCTGCGGTGGCAGTCTTCCTGATTATATTCCCAGGGGTAGCA
CTCCCCGAGTCTTAAGATTAGGTGAAAACCCTGGGTGTCCGTGTGGTGGAACCCATGTCT
CCGATATATCTGATATCATAAGCATGAAGATCACACAGATGAGAACAAAGAAAGGAATGA
CAAAAGTTTTCTACACCATTGCATCTTAATTCCAGTATACAAAAAAA*GTCAAGGGAAGG
A*TTGAAGTGATGACGACTGTTTCA*TCAGTTGGCT

QA 1 756 1 756
DS 

RD RS1GP46JQ 605 0 0
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CAGAGGCTAATGAACTGATATCCAAAGGAGGAAAGGTTTATGCTGCTATATTACCCTATG
GAGGGGCATCCGTGCTCTGCGGTGGCAGTCTTCCTGATTATATTCCCAGGGGTAGCACTC
CCCGAGTCTTAAGATTAGGTGAAAACCCTGGGTGTCCGTGTGGTGGAACCCATGTCTCCG
ATATATCTGATATCATAAGCATGAAGATCACACAGATGAGAACAAAGAAAGGAATGACAA
AAGTTTTCTACACCATTGCATCTTAATTCCAGTATACAAAAAAAAGTCAAGGGAAGGAAT
TGAAGTGATGACGACTGTTTCAATCAGTTGGCTTCAACAGCAAGCAGCCTCTCCTGTGCT
CAACAGCCACGAATTAGTATTTTGTGGGTATTTATTTTTTATCAAAACTACTAAGCGACT
CTCCCTATCATTGATAAGTCGTATTAACGATATGATATTGATGTGATATGATCTTCCACT
CAGCCTCTTAATTCGCATTACAATATTGACTCTTGGTTTGTATAATCATACCAAACATTT
GGTAC

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 2

CO CL5166Contig1 1254 2 2 U
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CCTAGAAATATTGACTATCATACTGGAGTCTTTGCTAGCAAAATCACTCCAGCGAAGGAT
GGGAAACCAGTTATGATTGAGCTTATTGATGCCAAAACCAAAGAACCTAAGGATACCTTG
GAGGTAGATGCTGCTCTTATTGCAACTGGAAGAGCTCTATTCACCAACGGTCTTGGCTTG
GAAAACGTCAATGTTGTGACGCAAAGAGGTTTCATTCCGGTTGATGAGCGAATGCGTGTG
ATCGATGGAAATGGGAAACTGGTTCCGAACTTGTACTGCATCGGTGATGCCAATGGTAAA
CTCATGCTTGCACATGCAGCCAGTGCCCAAGGAATATCTGTGGTTGAGCAAGTCACAGGT
AGAGATCATGTGCTTAATCATCTAAGCATCCCAGCTGCTTGCTTTACTCATCCTGAAATT
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BQ
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TC

QA 4 785 4 785
DS 



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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FN15TF U 1
AF RS1FN15JQ C 259
BS 1 613 RS1FN15TF
BS 614 614 RS1FN15JQ
BS 615 639 RS1FN15TF
BS 640 1062 RS1FN15JQ

RD RS1FN15TF 645 0 0
GATCACAACTATGTCTTGTGGTTGAAGTGGTAATCGTAGCTTTATGTTAACATTTTGCTT
TTTTTTTTCAGGTTTGGACATAAATCACAACTAGACAAGACAAGAAGAATGGCTGATGAC
AAATGGACCGATGAAGAAGTTAGGTATTTCTTTGCTCTTTATGCTGATGAGAAAAAGAAA
GGGAACAGACCAAGGAGTGGCATAAATCTAGCTGGAAGAGAGTTCATCATAAATAAGTTT
GAAGAGAAATTTGCTAAGAGATGGATATGGGACAGGTTTAAGAACAAGGTTGATATTAGT
AGAAAAGCATATATCAAGTTCAAGAAGCTTACCCACAACAGAACCGGACTTGTATATGAT
GCTTTGGGAAGGTTGGCGATGTCGGAAGGTTGGTGGGATCAACGCATTGCGGAATGGCAA
GGTGCAAGAAAGTATAAGATCAAAGTGCCTCCAAACATGGATGTATTTGAAGCAGAGTTT
GGTGCTGTTACTGTAACTGGAGCAGAGGGATGGTGTGCTCAACAAGGAGAAGCTAGCTTA
GATTCTAGAGTAGATGCAGAGAAGAATGATGGGTCTGATTCAGTTGACACTGATATGCCA
GCACCAAGAGAAG*AACCAGTAGGGCTGGATCTTCAAAA
GAAAGC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RS1FN15JQ 804 0 0
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TTCAAGAAGCTTACCCACAACAGAACCGGACTTGTATATGATGCTTTGGGAAGGTTGGCG
ATGTCGGAAGGTTGGTGGGATCAACGCATTGCGGAATGGCAAGGTGCAAGAAAGTATAAG
ATCAAAGTGCCTCCAAACATGGATGTATTTGAAGCAGAGTTTGGTGCTGTTACTGTAACT
GGAGCAGAGGGATGGTGTGCTCAACAAGGAGAAGCTAGCTTAGATTCTAGAGTAGATGCA
GAGAAGAATGATGGGTCTGATTCAGTTGACACTGATATGCCAGCACCAAGAGAAGGAACC
AGTAGGGCTGGATCTTCAAAAAGAAAGCGTAAGGAATGTGATCAAGAGCCTTATGTTGTA
CGGAATGCAATTCTGGCTGAAAAAAATAAGATAGCTAAGGAGATTGTAGAGATAATGGCA
GAGGATCGTGTGTTGTTGCAGGAGGATCGCAAATTCCGTATAGACTCAGTGTTGGAGATA
CTTAATAAGCTGCCTGGAGTGATAATGTGGTCACCATTTCACATTGGTGCACTTAACCAT
CTCAAAGCTGTTGAAGGAAACAGAATGGCTTTTATGTCTTTCTCTAGTGATGATGATAAA
ATTAGCTATCTTGAGAATATGATTGGAGTTAAGATGTATGAAGGATTGTAGTGTCTGTTT
TAGTATCACTCTTTTTAGTAAGACTGTTTTAATATGACTCGGATTGTAGTGTTTCTTTTA
AGCCAATGACTTTTGTTTCATTCC

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 2

CO CL5168Contig1 734 2 2 U
GAAGGTCTGTGTGTGGAAAAAAACAATGGCGATAATTTTGCAAGTCCCTCCTCCGTCTTC
CCTGTGGAACACCAGAAACCCCCCAATTCTTCTACTCTTCAGTTCGATCTAATTCGGAGA
AGTTCAGATGCAGAGCCGTCCGAGAGAAAGCCGAAGAGATGGAGAAGAAGAACACTCCTC
CTTCTTCTTCTTCGGCTGAGGAAGTCACCAAGAAATATGGACTCGAAGTTGGTCTATGGA
AGATATTGAGCTCCAAGGATGAAGAGGAAGAAGTTGACGGAGAGAATAAGAAGAAGAAAT
CAAAAACAGACGAAGCAAAAGAGTTACTCGCTAAGTACGGTGGTGCTTATCTTGCTACCT
CCATTACCCTTTCCCTCCTTTCCTTCTCACTCTGCTACGCTCTCGTCACTTCCGGTGTTG
ATGTTCCAGCTCTTCTCCTAAAGGTTGGGATTTCGACGAATGAGACAGGAGAGAAAGTAG
GAGCCTTTGCTTTGGCTTACGCAGAGCATAAAGCTGCTTCTCCAAGAAGGTTTCCTCCTA
CGGTGGCTTTGACTCCTATTGTAGCTAATTGGATTGGGAATAAAGTGGACAAGGAGAAGG
GTGATGACTAGTCAGTATTTTCCTTTAGTTTACTCAATCGTACTAAATTGTATAATCACT
ATACTCACTCTTTCTAGGTTCTATGTACAAAACATTTAAGCTTCTTTAATCTGTGAGAAT
GACGTCGAGTTAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DO66TF U 1
AF RS1DO66JQ C 394
BS 1 674 RS1DO66TF
BS 675 734 RS1DO66JQ

RD RS1DO66TF 674 0 0
GAAGGTCTGTGTGTGGAAAAAAACAATGGCGATAATTTTGCAAGTCCCTCCTCCGTCTTC
CCTGTGGAACACCAGAAACCCCCCAATTCTTCTACTCTTCAGTTCGATCTAATTCGGAGA
AGTTCAGATGCAGAGCCGTCCGAGAGAAAGCCGAAGAGATGGAGAAGAAGAACACTCCTC
CTTCTTCTTCTTCGGCTGAGGAAGTCACCAAGAAATATGGACTCGAAGTTGGTCTATGGA
AGATATTGAGCTCCAAGGATGAAGAGGAAGAAGTTGACGGAGAGAATAAGAAGAAGAAAT
CAAAAACAGACGAAGCAAAAGAGTTACTCGCTAAGTACGGTGGTGCTTATCTTGCTACCT
CCATTACCCTTTCCCTCCTTTCCTTCTCACTCTGCTACGCTCTCGTCACTTCCGGTGTTG
ATGTTCCAGCTCTTCTCCTAAAGGTTGGGATTTCGACGAATGAGACAGGAGAGAAAGTAG
GAGCCTTTGCTTTGGCTTACGCAGAGCATAAAGCTGCTTCTCCAAGAAGGTTTCCTCCTA
CGGTGGCTTTGACTCCTATTGTAGCTAATTGGATTGGGAATAAAGTGGACAAGGAGAAGG
GTGATGACTAGTCAGTATTTTCCTTTAGTTTACTCAATCGTACTAAATTGTATAATCACT
ATACTCACTCTTTC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1DO66JQ 341 0 0
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CGACGAATGAGACAGGAGAGAAAGTAGGAGCCTTTGCTTTGGCTTACGCAGAGCATAAAG
CTGCTTCTCCAAGAAGGTTTCCTCCTACGGTGGCTTTGACTCCTATTGTAGCTAATTGGA
TTGGGAATAAAGTGGACAAGGAGAAGGGTGATGACTAGTCAGTATTTTCCTTTAGTTTAC
TCAATCGTACTAAATTGTATAATCACTATACTCACTCTTTCTAGGTTCTATGTACAAAAC
ATTTAAGCTTCTTTAATCTGTGAGAATGACGTCGAGTTAGG

QA 1 341 1 341
DS 



AS 1 2

CO CL5169Contig1 583 2 2 U
GGTGTTCTGGCTGTTCTACAAGGCCTTCGACGATCTAGGCATCCCGAACAGCGAGTACCC
CGCCCCGTTCGCCACGGTGTACCGAAGCATGGCTAAGCTGGGAGTCGAAGGCGTTGCTTC
TTTGCCAAGAGAGTGTTTAGTTCTATGCTACGGCTTCTTCAGCGTGGCGATTCTCGTGAA
CATAGTGAAGGACAGTTTGCCGAGTAAGTTCGGGAGGTTCGTGCCGCTGCCGATGGCGAT
GGCGATACCGTTTTTCTTGGGGCCGTACTTTGCGAATCGACATGTGCGTGGGGAGTTTGA
TACTTTTTGTCTGGGAGAGAGTGGATGCGGGGAAGGCTGAGGCTTTTGGGACTGCGGTGG
CGTCTGGTTTGATATGTGGAGATGGGATTTGGTCTTTTCCGAGCTCGGTGTTGGCGATAG
CTGGTGTGAATCCTCCTGTTTGTATGAAGTTTCTCTCTGCTGCGACTAATTCGAGAGTTG
ATAGCTTCTTGAATAGATCTTAATATGTTATGAATAAAGTGTATTTGTACAGATCATTAG
ATATGCACACAATACATGCTTTATAAATGGTTGTTTTCAAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1H356TF U 1
AF RS1H356JQB C 1
BS 1 286 RS1H356TF
BS 287 583 RS1H356JQB

RD RS1H356TF 293 0 0
GGTGTTCTGGCTGTTCTACAAGGCCTTCGACGATCTAGGCATCCCGAACAGCGAGTACCC
CGCCCCGTTCGCCACGGTGTACCGAAGCATGGCTAAGCTGGGAGTCGAAGGCGTTGCTTC
TTTGCCAAGAGAGTGTTTAGTTCTATGCTACGGCTTCTTCAGCGTGGCGATTCTCGTGAA
CATAGTGAAGGACAGTTTGCCGAGTAAGTTCGGGAGGTTCGTGCCGCTGCCGATGGCGAT
GGCGATACCGTTTTTCTTGGGGCCGTACTTTGCGAATCGACATGTG
GCGGGGG

QA 1 286 1 286
DS 

RD RS1H356JQB 583 0 0
GGTGTTCTGGCTGTTCTACAAGGCCTTCGACGATCTAGGCATCCCGAACAGCGAGTACCC
CGCCCCGTTCGCCACGGTGTACCGAAGCATGGCTAAGCTGGGAGTCGAAGGCGTTGCTTC
TTTGCCAAGAGAGTGTTTAGTTCTATGCTACGGCTTCTTCAGCGTGGCGATTCTCGTGAA
CATAGTGAAGGACAGTTTGCCGAGTAAGTTCGGGAGGTTCGTGCCGCTGCCGATGGCGAT
GGCGATACCGTTTTTCTTGGGGCCGTACTTTGCGA*TCGACATGTGCGTGGGGAGTTTGA
TACTTTTTGTCTGGGAGAGAGTGGATGCGGGGAAGGCTGAGGCTTTTGGGACTGCGGTGG
CGTCTGGTTTGATATGTGGAGATGGGATTTGGTCTTTTCCGAGCTCGGTGTTGGCGATAG
CTGGTGTGAATCCTCCTGTTTGTATGAAGTTTCTCTCTGCTGCGACTAATTCGAGAGTTG
ATAGCTTCTTGAATAGATCTTAATATGTTATGAATAAAGTGTATTTGTACAGATCATTAG
ATATGCACACAATACATGCTTTATAAATGGTTGTTTTCAAACC

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 2

CO CL5170Contig1 839 2 6 U
GGGAACTGTTGAGCCCTTTGGTTTCATCGAGAGACCCCTAAAACCCGATCTAGGTGAAGA
ATGGCGTCTTCTTCTTCTTCCTTCTCCCTCACCTCTCCGGCTGCTTCCGTCTATGGAGGA
GCCACTCGAAACTCGTCGCAGTTACCTCTCCCAACCACTCGCTCTCGTCTCCCTCGCAGA
GTTTCGTTCCGTCTCTCCTCCGCCAAGCCTAAGCTTCGCTTTCTCTCCAAGCCTACTCGC
AGTAGCCACCCTGTGGTGAAAGCCCTTTCTAACCAGGTTGGTGGAGGTGCATCATCAAAT
GCTTCAGCTCCTGCAGGACCCTCAGCTGAAGGAAAGGATACAAACTCATCAAAAGACTCT
TCTTCACCTGATTTAGCTACAGAGGAGTCTATCTCTGAGTTCCTGACCCAAGTCACAACT
CTTGTCAAGCTTGTGGATTCTAGAGACATTGTCGAGTTGCAGTTGAAACAGCTCGACTGT
GAGCTTGTCATCCGGAAAAAGGAAGCCTTACCTCAACCACAAGCCCCTGCGCCTTATGTT
ATGATGCAGCAACCAAACCAACCATCTTATGTGCAAGCAACGGCTCCTCCTCCTTCTGCA
CCTGCTGCCTCACCTCCACCTTCTTCTACTCCAGCCTCTTTGCCCGCACCATCTCCACCT
AGTCCAGCGAAATCATCGCTTCCAACTGTTAAAAGTCCCATGGCAGCACATTCTACCGCA
GTCCGGGACCTGGTGAACCACCTTTTATCAGTTGGAGACAAGTGCAGAAGGGCAAGTTCT
ATGCATCGTCGAGCATGAAGTAGTGATGAATAGAGTCTGATCAACCGGAACGTAGTGGA


BQ
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AF RS1G150TF U 1
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DS 



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GCTCTGCTCCATCTTCATCACCACCTCCTCCTTCTGCTCCGACCACTGCACCTAGTGTTA
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AGATGCGTGATCTTGTGGACCGCAACCCTGAGCTTGGTCATGTTCTTAATGACCCTAGCA
TCCTTAGGCAGACTATGGAAGCTGCGAGGAACCCGGAGCTGATGCGTGAGATGATGCGGA
ATACTGATAGGGCTATGAGTAATATTGAGTCTATGCCTGAAGGGTTTAATCATCTTAGGC
GTATGTATGAAAATGTCCAGGAGCCGCTCATGAATGCGACTACTATGTCCGGGAACGCGG
GAAACAATGCGGCTTCTAATCCTTTTGCTGCTCTTCTTGGAAACCAGGGGGTTACTACAC
AAGGTGGCGGTGCTTCTAATAATTCTACGACGACTCCGAGTGCTGAAACGGGGACTGGAA
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ATGCCCCAGGAAGGACAAATTCTGGTGGGGATACGAGAAGCCCTGGACTTGGTGGTCTTG
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CTCTCTGTTGATACTGCTCCGGAGAAACTGATAGCCTACCGGTGTATATCCTAAGATTTG
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CGTTTTGAGTTTTGGACC


BQ
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AF RS1EQ54TF U 1
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GCTCTGCTCCATCTTCATCACCACCTCCTCCTTCTGCTCCGACCACTGCACCTAGTGTTA
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GG

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DS 

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CAT
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GCCCCAGGAAGGACAAATTCTGGTGGGGATACGAGAAGCCCTGGACTTGGTGGTCTTGGT
GGCCTTGGTGGTCTTGGTGGCCTTGGTGGCCTTAAGAGGATGATAATGGGAAGTGTAAGC
AACCATGTCGTGAACAACGTGGCATGCCCTGTCACCGTCGTGAAGGCTCACCACTAAGCT
CTCTGTTGATACTGCTCCGGAGAAACTGATAGCCTACCGGTGTATATCCTAAGATTTGTG
TGTCGTTGTTGTCTTAATATGGATTTATAACTCTCGTGTCACTTGTATGTTGTTTATTCT
TGTGCATCTTTGTCTTTTCACTGGGTAAAAATATTTCTACCTTCTAATAATAATTACTCG
TTTTGAGTTTTGGACC

QA 4 739 4 739
DS 



AS 1 2

CO CL5172Contig1 989 2 2 U
GTGTGACGGGCAAAAAATGTCGGGGAAGACTGTTAATAATATGGTGCAGGATAATGTGAG
CAAGCCTCGCTTCTGCAAGTCTTTGTCTTTGGGAGAAACTTGGACTTCTAAATCCATGAG
GATTATTCCGGAAGAGTTTGTGAGAAGCGCGCCTGGAGCTTTTGAACACAGAGTGGTGTT
CAGTGTTCGTTGGGGAAATTCCTGGCAACTCTGGCTCCAGCGAGACAAGAACGGTCTGTT
TATGGAAGAAGAAGATTGGGATGAGTTCGTGACTGATAACTTCTTAGCTCCAAATGATGT
CTTGCTCTTCACACACGTCGACACCATGTTCATTGAAGTGCGAATCTATAAACATGACTC
GCACCACTTGAAAGAGATCACCTCAGCACCTCTCCAAGCTCCAGTGTTTACCCCCGTGCC
CCAGAACTCTCCATTGGAAACTCCTGCCCCTGCCCCTGCATCTGCAAGTGGAGCGAGACA
GGTCGATGAACTCGTCAGAAATCCTGAGCAGTGGCTCGTAAATCCGAGTAACCCTTTCTT
TGTGAAGACGCTGGGTAAAAAGAATGATGCTCTGTATGTGAGCCATCTGGTGACGGCGAA
GTATGGTTTGCAGTTTGGTCCCCATGATTCCCCCATGTTTTACCTTCTTCCCAACGAAAA
AATCGAGGCAGCCACTAAGATCTACGGAGGTTGCCCTTGTTTCAGTGGCTTGGCTGCTGT
ATGTCGCAAGTACAAGCTGAAGCAAGGAGACACTGTCGTTTTCGAACTCGAACGCTCGAG
AGGAGTGGTTACCGCCGTTAGACTGCATTTCCCCAACGAGTAAAGCAGATTTGAGTCCTC
TCCACTCTCCTAAGTTAGCCTAGTGGTTAATTACTCTTGTGGTAAGTTTCTCATAATATG
CTATGTTGAAGCTAAAACTTCTTATTTCTCTTTTGCAACATGGAGAATTACTATTGGATA
AGTTTTATCTTAATGGTGTATTTGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BV79TF U 1
AF RS1BV79JQ C 381
BS 1 661 RS1BV79TF
BS 662 989 RS1BV79JQ

RD RS1BV79TF 661 0 0
GTGTGACGGGCAAAAAATGTCGGGGAAGACTGTTAATAATATGGTGCAGGATAATGTGAG
CAAGCCTCGCTTCTGCAAGTCTTTGTCTTTGGGAGAAACTTGGACTTCTAAATCCATGAG
GATTATTCCGGAAGAGTTTGTGAGAAGCGCGCCTGGAGCTTTTGAACACAGAGTGGTGTT
CAGTGTTCGTTGGGGAAATTCCTGGCAACTCTGGCTCCAGCGAGACAAGAACGGTCTGTT
TATGGAAGAAGAAGATTGGGATGAGTTCGTGACTGATAACTTCTTAGCTCCAAATGATGT
CTTGCTCTTCACACACGTCGACACCATGTTCATTGAAGTGCGAATCTATAAACATGACTC
GCACCACTTGAAAGAGATCACCTCAGCACCTCTCCAAGCTCCAGTGTTTACCCCCGTGCC
CCAGAACTCTCCATTGGAAACTCCTGCCCCTGCCCCTGCATCTGCAAGTGGAGCGAGACA
GGTCGATGAACTCGTCAGAAATCCTGAGCAGTGGCTCGTAAATCCGAGTAACCCTTTCTT
TGTGAAGACGCTGGGTAAAAAGAATGATGCTCTGTATGTGAGCCATCTGGTGACGGCGAA
GTATGGTTTGCAGTTTGGTCCCCATGATTCCCCCATGTTTTACCTTCTTCCCAACGAAAA
A

QA 1 661 1 661
DS 

RD RS1BV79JQ 609 0 0
CCTCAGCACCTCTCCAAGCTCCAGTGTTTACCCCCGTGCCCCAGAACTCTCCATTGGAAA
CTCCTGCCCCTGCCCCTGCATCTGCAAGTGGAGCGAGACAGGTCGATGAACTCGTCAGAA
ATCCTGAGCAGTGGCTCGTAAATCCGAGTAACCCTTTCTTTGTGAAGACGCTGGGTAAAA
AGAATGATGCTCTGTATGTGAGCCATCTGGTGACGGCGAAGTATGGTTTGCAGTTTGGTC
CCCATGATTCCCCCATGTTTTACCTTCTTCCCAACGAAAAAATCGAGGCAGCCACTAAGA
TCTACGGAGGTTGCCCTTGTTTCAGTGGCTTGGCTGCTGTATGTCGCAAGTACAAGCTGA
AGCAAGGAGACACTGTCGTTTTCGAACTCGAACGCTCGAGAGGAGTGGTTACCGCCGTTA
GACTGCATTTCCCCAACGAGTAAAGCAGATTTGAGTCCTCTCCACTCTCCTAAGTTAGCC
TAGTGGTTAATTACTCTTGTGGTAAGTTTCTCATAATATGCTATGTTGAAGCTAAAACTT
CTTATTTCTCTTTTGCAACATGGAGAATTACTATTGGATAAGTTTTATCTTAATGGTGTA
TTTGAAAAA

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 2

CO CL5173Contig1 628 2 3 U
CTCACCAATAGAGAGACTATACTTTAGAGTACGAACTTTCTACAGAAAAACTGAAAAGGC
AGTGATAAAATCATCTCAATGTCAACAACACAAATTTCATAGCATTATTCAACTATCTCC
CTCGTCTCTTAGCGTTCGATATTCTTCAATATCCAACAAGTCTTCTTCCTCACTTCTTTT
ACCGGCTTGCTCTTTCCAATATGACACTAACTTTTTCAATCGCACCATTTCTTTGGATGA
AATATGTTTGCTGGGATCATTCACGATCGTTCTCACTCTTGATGCATATAGAAGAGAATT
GTATGTCTCGTCCAAATTTGATTCGGCTGGAGACACATTAACAAACATTAACGTCTTCGC
ATTTCCACCCAATGAATCGCTCATCAACATTGTTAACTTGTGATTCCGGTAGGGAATATG
CTGGCTGCCCGAAGATAAAGCACCAATGACATCACCTAATGCAGAAAGTGATTTGTTGAT
ACTTTGAGCTTCTTTGAGTTGGCAACCAGCAGAGCCCGACTTTTTAACTCTCTCAGAACC
AGCAAGATCCACGAAGCTCAACTTGCCCCTCGCAGCGGACTGGGTTTGAAGATCGATACT
TTCAATAACAACCGAAAGGATTAGGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1A569JQ U 217
AF RS1A569TF C 1
BS 1 216 RS1A569TF
BS 217 497 RS1A569JQ
BS 498 628 RS1A569TF

RD RS1A569JQ 281 0 0
CAATCGCACCATTTCTTTGGATGAAATATGTTTGCTGGGATCATTCACGATCGTTCTCAC
TCTTGATGCATATAGAAGAGAATTGTATGTCTCGTCCAAATTTGATTCGGCTGGAGACAC
ATTAACAAACATTAACGTCTTCGCATTTCCACCCAATGAATCGCTCATCAACATTGTTAA
CTTGTGATTCCGGTAGGGAATATGCTGGCTGCCCGAAGATAAAGCACCAATGACATCACC
TAATGCAGAAAGTGATTTGTTGATACTTTGAGCTTCTTTGA

QA 1 281 1 281
DS 

RD RS1A569TF 628 0 0
CTCACCAATAGAGAGACTATACTTTAGAGTACGAACTTTCTACAGAAAAACTGAAAAGGC
AGTGATAAAATCATCTCAATGTCAACAACACAAATTTCATAGCATTATTCAACTATCTCC
CTCGTCTCTTAGCGTTCGATATTCTTCAATATCCAACAAGTCTTCTTCCTCACTTCTTTT
ACCGGCTTGCTCTTTCCAATATGACACTAACTTTTTCAATCGCACCATTTCTTTGGATGA
AATATGTTTGCTGGGATCATTCACGATCGTTCTCACTCTTGATGCATATAGAAGAGAATT
GTATGTCTCGTCCAAATTTGATTCGGCTGGAGACACATTAACAAACATTAACGTCTTCGC
ATTTCCACCCAATGAATCGCTCATCAACATTGTTAACTTGTGATTCCGGTAGGGAATATG
CTGGCTGCCCGAAGATAAAGCACCAATGACATCACCTAATGCAGAAAGTGATTTGTTGAT
ACTTTGAGCTTCTTTGAGTTGGCAACCAGCAGAGCCCGACTTTTTAACTCTCTCAGAACC
AGCAAGATCCACGAAGCTCAACTTGCCCCTCGCAGCGGACTGGGTTTGAAGATCGATACT
TTCAATAACAACCGAAAGGATTAGGTGC

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 2

CO CL5174Contig1 583 2 2 U
ACGCCACAGGGATCCGTTGACCCTCTCACAGGGAAAGATCCAGCGAAGGCGTTAACAGCT
GTAGCGTCTGGATTCTTCGATAACGTGAAGAAAAACAAGCAGAGCTTCTTCCAGTTCTTC
TCGATGACTGGGATTTTGCTTCTGAGCTTCCGATCGGTAAGTCAGAAGTATCGAATCCAC
GATCTGGAGGAAGACACGGCTGTTCTCAAGAAGGAGAGTGATAGTTTGACGGAGCGTATG
AGTAAAATCAAGAGCGATCTTCTGCATCAAGCGTCGATTGACTCTACCGGTGTATTTGCT
TCTCGACTCCGTCTGCTTTTCGGTGATGATAAAAAGTAGACGGGAGATTGGTTGGTTTTT
AAGTCAAACGAGGTTATATTAGTTTTCTACAGATGTACCTGTCTGTAATGTCTCTTTCTT
TATCTGGAATCTTTTTTTTTCTTCGCTAGATTGTAAGGTTTTGGCGAATGAAAAGGGTTT
TAAGTTGATGTGATTCTGACAAAATGGTGGAACGTTTTGGATTATCGAAACGCTGGTTTA
TGTTCATGTTTTTGAAAGAGTAAGAATTGTAGGTTCATTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BY55JQ C 1
AF RS1BY55TF U 303
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BS 303 583 RS1BY55TF

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TATCTGGAATCTTTTTTTTTCTTCGCTAGATTGTAAGGTTTTGGCGAATGAAAAGGGTTT
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TGTTCATGTTTTTGAAAGAGTAAGAATTGTAGGTTCATTTGAC

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DS 

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TTCATGTTTTTGAAAGAGTAAGAATTGTAGGTTCATTTGAC

QA 1 281 1 281
DS 



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GATGGCTGGTGTAAAGCGAAAATTAAGTCCAGAGTCAGATCCTCACGCTCTTCACAAAGT
ACTGGATGAGGTCTCATGCCCTGTTTGCATGGATCACCCTCACAATGCTGTTCTCCTCCT
CTGCACCTCTCACGACAAAGGTTGCAGGTCTTACATCTGTGACACCAGTTACCGTCACTC
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TCCCAATCCCGACCCAAACTCTGCCTCAAGGCCAAACATCAACCAAGTCGCTGTTAGGGA
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AGGATTCAAGGTGGTAGAAGAAGTGAGAAGCTATCTCGACATGAAGAGCCGAAGCTGCTC
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ATTATATATTATACATTGAAAACATAGTTTGCTTTTGC


BQ
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AF RS1G189TF U 1
AF RS1G189JQ C 654
BS 1 716 RS1G189TF
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GATGGCTGGTGTAAAGCGAAAATTAAGTCCAGAGTCAGATCCTCACGCTCTTCACAAAGT
ACTGGATGAGGTCTCATGCCCTGTTTGCATGGATCACCCTCACAATGCTGTTCTCCTCCT
CTGCACCTCTCACGACAAAGGTTGCAGGTCTTACATCTGTGACACCAGTTACCGTCACTC
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TCCCAATCCCGACCCAAACTCTGCCTCAAGGCCAAACATCAACCAAGTCGCTGTTAGGGA
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AGGATTCAAGGTGGTAGAAGAAGTGAGAAGCTATCTCGACATGAAGAGCCGAAGCTGCTC
ACGAGAGTCTTGCTCATTCACGGGTAACTACCAGGATCTGCGCCGACATGCAAGAAGGAT
ACACCCAACGTCTCGTCCTTCGGACACTGATCCAACGAGAGAGAGAGCTTGGAGACGCCT
CGAGAACCAGAGGGAGTATGGAGATATAGTCAGTGCAATACGCTCTGCCATGCCCG*TGC
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CGGAGA

QA 1 749 1 749
DS 

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TGTTGTTTCAGATGATTGGGTCTCTTGAAAATAACGGAGGGTCTAGTGGTAGTGGTGGTG
GCAGTGGTGGTGGATCAAGATCTCACAGGTCGAGGGCTTGGAGGAACACTCATCGCCGTT
CTTCTTCAGATAGGCGTTATCTTTGGGGAGAGAATCTATTGGGTCTACAAGATGAAGACA
ATGATGATGATGATGATGGTGAAGGGTTGCGTTTACAGAACGAAACAGGTGATGGTTCGA
ATCATGTTCCTAGAAGAAGACGAAGGTTTGGTCGTCCGAGATCAAGCGGAAACCATCCGC
GTTAAAAAGCCACTTGTCTCGGTGCTATCTCTCGGGTCAGAACCAGACCGATGCAAAGGG
AAAGGTTTTGCTGAAATCCCCCGAGAGCCGTAGGATTTGTTTGGTGTTTTTAATGTAAAT
GTCATTTTCTGAGCTTCCTCGAGTCGCTCATTGTACGCTGAAGTATGGTTTTATGCAATG
TCTTTTCATTATATATTATACATTGAAAACATAGTTTGCTTTTGC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL5176Contig1 565 2 4 U
GGGAACAGAGGAATCTAAAAACTCCGTTTCAGGACAGTTATGGACGAATCGTATCGGAAT
CTAACGGATTTGATCCGGAGAACCTCTCTTTCAGAGACATTCGTCGACATCTTGCTATGC
GCAGTTCCGATTTGGCTCGCCGTCATGATCGGGCTTCTGATCGGATGGTCCTGGCGTCCT
AGGTGGACCGGATTGGTTTACCTAGGGTTCCGTTCCAAGCTCCGGTTTCTCTGGACCGCT
CCTCCCGGGTTCGGCGCTCGCCGCGTCTGGCTTGCCTTCACCGCTCTCTCCGCCTTCTCC
GTCTGCCGCACCTTATGGTCAAGGCTCGGTTCAAGTTCCAAGAAATCCACCGGAGAGATT
CCTCCCAGTGAGGCAGTTATACGAGTTAGTGATGTAAACCGAGAAATAAAGAAGGATGTT
GTGACGGAGAAGGATCTTGAGCATCTGTTGCATCTGCTTGAAGCTGGGAATGCAGATATG
GAATGGCAATCTATGATGGATAAATCTACTCCTAACATGAGCTACCAGGCCTGGCGTCAT
GAGCCTCAGACAGGTCCTGTTGTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GW37TF U 1
AF RS1GZ21TF U 1
BS 1 222 RS1GW37TF
BS 223 223 RS1GZ21TF
BS 224 383 RS1GW37TF
BS 384 565 RS1GZ21TF

RD RS1GW37TF 383 0 0
GGGAACAGAGGAATCTAAAAACTCCGTTTCAGGACAGTTATGGACGAATCGTATCGGAAT
CTAACGGATTTGATCCGGAGAACCTCTCTTTCAGAGACATTCGTCGACATCTTGCTATGC
GCAGTTCCGATTTGGCTCGCCGTCATGATCGGGCTTCTGATCGGATGGTCCTGGCGTCCT
AGGTGGACCGGATTGGTTTACCTAGGGTTCCGTTCCAAGCTCTGGTTTCTCTGGACCGCT
CCTCCCGGGTTCGGCGCTCGCCGCGTCTGGCTTGCCTTCACCGCTCTCTCCGCCTTCTCC
GTCTGCCGCACCTTATGGTCAAGGCTCGGTTCAAGTTCCAAGAAATCCACCGGAGAGATT
CCTCCCAGTGAGGCAGTTATACG

QA 1 383 1 383
DS 

RD RS1GZ21TF 565 0 0
GGGAACAGAGGAATCTAAAAACTCCGTTTCAGGACAGTTATGGACGAATCGTATCGGAAT
CTAACGGATTTGATCCGGAGAACCTCTCTTTCAGAGACATTCGTCGACATCTTGCTATGC
GCAGTTCCGATTTGGCTCGCCGTCATGATCGGGCTTCTGATCGGATGGTCCTGGCGTCCT
AGGTGGACCGGATTGGTTTACCTAGGGTTCCGTTCCAAGCTCCGGTTTCTCTGGACCGCT
CCTCCCGGGTTCGGCGCTCGCCGCGTCTGGCTTGCCTTCACCGCTCTCTCCGCCTTCTCC
GTCTGCCGCACCTTATGGTCAAGGCTCGGTTCAAGTTCCAAGAAATCCACCGGAGAGATT
CCTCCCAGTGAGGCAGTTATACGAGTTAGTGATGTAAACCGAGAAATAAAGAAGGATGTT
GTGACGGAGAAGGATCTTGAGCATCTGTTGCATCTGCTTGAAGCTGGGAATGCAGATATG
GAATGGCAATCTATGATGGATAAATCTACTCCTAACATGAGCTACCAGGCCTGGCGTCAT
GAGCCTCAGACAGGTCCTGTTGTTT

QA 1 565 1 565
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5178Contig1 539 2 3 U
ATTAAAGGTCTCTTGAAATAAACATATCAAAGTGTTGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAACAC
ATCAAAGCCACGAGACCACCCTTCGGTTAAAGTCCCACGATTAAAGAATCAATCTCCCCA
CCCCGATTGCTACATCAGGTTTATTCGACCAGTCCAAGCACTCATAAAAATATCAAACAC
TAAAGCCTACCCATATGATGTAGTAATTACAAAGTCATGAACCCTTTCCCTCACGTGCGC
ATCTTCAGGTTCCCTTAGGAGCGCGTTCGCATCATGTCACGACCTTATGATGAACAGGTG
CCTGGACTCCAGTGGAAACAGCAAACGTAGTGGTCGGGGTTGTGGTCTTTGACAACCCCA
TATTGGAAAAAAATCCAAGACCCGACACTTCGAAATCGGATCTCTCGAACCGGCCTGAAT
CACCCGGTAAACGAACGTAGTAAGAAAAAAAAAGCGACAAATCGTCCCCATAACGGATTT
GCATGACGGCTCTGTAAACAAACGGGATTAGACCCTCCATCTGTGTTATTGCTATATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DC03TF C 1
AF RS1DC03JQ U 76
BS 1 75 RS1DC03TF
BS 76 506 RS1DC03JQ
BS 507 539 RS1DC03TF

RD RS1DC03TF 539 0 0
ATTAAAGGTCTCTTGAAATAAACATATCAAAGTGTTGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAACAC
ATCAAAGCCACGAGACCACCCTTCGGTTAAAGTCCCACGATTAGAGAATCAATCTCCCCA
CCCCGATTGCTACATCAGGTTTATTCGACCAGTCCAAGCACTCATAAGAATATCAGACAC
TAAAGCCTAGCCATATGATGTAGTAATTACAAAGTCATGAACCCTTTCCCTCACGTGCGC
ATCTTCAGGTTCCCTTAGGAGCGCGTTCGCATCATGTCACGACCTTATGATGAACAGGTG
CCTGGACTCCAGTGGAAACAGCAAACGTAGTGGTCGTGGTTGTGGTCTTTGACGACGCCA
TATTGGAAGAAGATCCAAGACCCGACACTTCGAAATCGGATCTCTCGAACCGGCCTGAAT
CACCCGGTAAACGAACGTAGTAAGAAGAAGAAAGCGACGAATCGTCGCCATAACGGATTT
GCATGACGGCTCTGTAAACAAACGGGATTAGACCCTCCATCTGTGTTATTGCTATATCC

QA 1 539 1 539
DS 

RD RS1DC03JQ 431 0 0
CCACCCTTCGGTTAAAGTCCCACGATTAAAGAATCAATCTCCCCACCCCGATTGCTACAT
CAGGTTTATTCGACCAGTCCAAGCACTCATAAAAATATCAAACACTAAAGCCTACCCATA
TGATGTAGTAATTACAAAGTCATGAACCCTTTCCCTCACGTGCGCATCTTCAGGTTCCCT
TAGGAGCGCGTTCGCATCATGTCACGACCTTATGATGAACAGGTGCCTGGACTCCAGTGG
AAACAGCAAACGTAGTGGTCGGGGTTGTGGTCTTTGACAACCCCATATTGGAAAAAAATC
CAAGACCCGACACTTCGAAATCGGATCTCTCGAACCGGCCTGAATCACCCGGTAAACGAA
CGTAGTAAGAAAAAAAAAGCGACAAATCGTCCCCATAACGGATTTGCATGACGGCTCTGT
AAACAAACGGG

QA 1 431 1 431
DS 



AS 1 2

CO CL5179Contig1 404 2 1 U
GGGAGATGCTTGTCAGGAAAGAAAAACAAGTTATAGTATTCTGCAAGTACGTAGAACATT
GTTTAACCATGAGATCTGCTACTTGGTTTATAGGTTTCTGTGTTCTTATCTTTCTCCTAA
TGTGTGATGGTAAAGGACCTAAAGAAGATGCGGTGTGTCCAAGAATAGAAGATATCGAAG
GAAACTGCGAAGATGATGGACCGAAAGTGTGTGAGAAGCATATGACAAAAGTTTATAACG
AAAAATATTTTAACTGCACATGTGATAATATGTTCATGTTACATAAGATCAAGCGTTTTT
GCGAATGTAACATAAAATGTAAAGACCAGACCTAGGACTGTAGAAGCCTATATGAAGCAT
GTGCTTTAGGGCTGGAAAACATTATATATTTTTATGGACCAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1GU17TF U 1
AF RS1FI83TF U 1
BS 1 404 RS1FI83TF

RD RS1GU17TF 281 0 0
GGGAGATGCTTGTCAGGAAAGAAAAACAAGTTATAGTATTCTGCAAGTACGTAGAACATT
GTTTAACCATGAGATCTGCTACTTGGTTTATAGGTTTCTGTGTTCTTATCTTTCTCCTAA
TGTGTGATGGTAAAGGACCTAAAGAAGATGCGGTGTGTCCAAGAATAGAAGATATCGAAG
GAAACTGCGAAGATGATGGACCGAAAGTGTGTGAGAAGCATATGACAAAAGTTTATAACG
AAAAATATTTTAACTGCACATGTGATAATATGTTCATGTTA

QA 1 281 1 281
DS 

RD RS1FI83TF 404 0 0
GGGAGATGCTTGTCAGGAAAGAAAAACAAGTTATAGTATTCTGCAAGTACGTAGAACATT
GTTTAACCATGAGATCTGCTACTTGGTTTATAGGTTTCTGTGTTCTTATCTTTCTCCTAA
TGTGTGATGGTAAAGGACCTAAAGAAGATGCGGTGTGTCCAAGAATAGAAGATATCGAAG
GAAACTGCGAAGATGATGGACCGAAAGTGTGTGAGAAGCATATGACAAAAGTTTATAACG
AAAAATATTTTAACTGCACATGTGATAATATGTTCATGTTACATAAGATCAAGCGTTTTT
GCGAATGTAACATAAAATGTAAAGACCAGACCTAGGACTGTAGAAGCCTATATGAAGCAT
GTGCTTTAGGGCTGGAAAACATTATATATTTTTATGGACCAAAA

QA 1 404 1 404
DS 



AS 1 2

CO CL5180Contig1 1074 2 2 U
TACAACTTCATTTGAATTCTTTTCATGACTTACTTGAGTTTGAGTTCCCTCTTTCAGAAG
AATACCAGACAGTTAATGTCTCTGTAAGACTTGATGCATTCGAATCTGAGGAAGAAGGAA
ATCATCAAGAAAAATTCGAGCTCATCTCTTTTTGCTCGAAACCACGTAAGCGTAGACAAA
GAGGTCATAGAGTTAACCCCAGCCTACTAAATGTTACCTTTTTACCCATGGATTCGCCCT
GTTTACCCAATGGCACAGATAATGGAACCCCTCTGCTGAGTAATGGAAACCATAGTTTAG
GATACCCCGTGGCAACAGATGTTGCTGGACAATTCGGGATGAACAATTCACCAGCCATAG
CTCAGTGTTCGATGAACTCGAATGCCAAAGCTGTGTTAGCAAGCGAAGCTGTGGCCCATG
CTGCTAAGACAAGAAAGTTATCTGCCGAGCGATCAGAGGCTAGAAGCAACCTACTTCTCC
AGAAACGCCAGTTCTATCATTCTCACAGAGTTCAGCCAATGTCACTTGAGCAAGTAATGT
CTGATCGAGATAGCGAAGATGAAGTGGATGATGACGTTGCAGATCTGGAAGATCGCCAGA
TGCTTGATGATTTTGTGGATGTGAATAAGAACGAAAAGAGATTCATGCATCTTTGGAACT
CTTTTGTAAGAAAACAAAGGGTTGTGGCGGATGGTCATATACCATGGGCATGTGAAGCAT
TTTCAAAGTTTCACAAGGAAGAGTTGCTCCATTCTTCACCACTCTTCTGGTGCTGGAGAT
TATTTATGATAAAACTATGGAACATTGGACTTGTAGACTCGGCCACCATCAACAACTGCA
ATATCATCCTCGAGAATTGCGATAGTAACTCGGACAAGAACAACAAGAAGAGTGTGGATG
TTGGTATTGACATTAACAGTAACGCCATGGATGTTGACGAGGATGTCAATAACAGCAAAG
CCAAGTAATAGGCTGAATTAGAGAACCCCCTCTGGCTGCAACATTCATCTGTTTTATTAG
TTTGCAAACTGATTTCATTTTTTCTTTTTTTTTGGGTATCAACTGACTCCAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GD10TF U 1
AF RS1GD10JQ C 412
BS 1 675 RS1GD10TF
BS 676 1074 RS1GD10JQ

RD RS1GD10TF 675 0 0
TACAACTTCATTTGAATTCTTTTCATGACTTACTTGAGTTTGAGTTCCCTCTTTCAGAAG
AATACCAGACAGTTAATGTCTCTGTAAGACTTGATGCATTCGAATCTGAGGAAGAAGGAA
ATCATCAAGAAAAATTCGAGCTCATCTCTTTTTGCTCGAAACCACGTAAGCGTAGACAAA
GAGGTCATAGAGTTAACCCCAGCCTACTAAATGTTACCTTTTTACCCATGGATTCGCCCT
GTTTACCCAATGGCACAGATAATGGAACCCCTCTGCTGAGTAATGGAAACCATAGTTTAG
GATACCCCGTGGCAACAGATGTTGCTGGACAATTCGGGATGAACAATTCACCAGCCATAG
CTCAGTGTTCGATGAACTCGAATGCCAAAGCTGTGTTAGCAAGCGAAGCTGTGGCCCATG
CTGCTAAGACAAGAAAGTTATCTGCCGAGCGATCAGAGGCTAGAAGCAACCTACTTCTCC
AGAAACGCCAGTTCTATCATTCTCACAGAGTTCAGCCAATGTCACTTGAGCAAGTAATGT
CTGATCGAGATAGCGAAGATGAAGTGGATGATGACGTTGCAGATCTGGAAGATCGCCAGA
TGCTTGATGATTTTGTGGATGTGAATAAGAACGAAAAGAGATTCATGCATCTTTGGAACT
CTTTTGTAAGAAAAC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1GD10JQ 663 0 0
TGGCCCATGCTGCTAAGACAAGAAAGTTATCTGCCGAGCGATCAGAGGCTAGAAGCAACC
TACTTCTCCAGAAACGCCAGTTCTATCATTCTCACAGAGTTCAGCCAATGTCACTTGAGC
AAGTAATGTCTGATCGAGATAGCGAAGATGAAGTGGATGATGACGTTGCAGATCTGGAAG
ATCGCCAGATGCTTGATGATTTTGTGGATGTGAATAAGAACGAAAAGAGATTCATGCATC
TTTGGAACTCTTTTGTAAGAAAACAAAGGGTTGTGGCGGATGGTCATATACCATGGGCAT
GTGAAGCATTTTCAAAGTTTCACAAGGAAGAGTTGCTCCATTCTTCACCACTCTTCTGGT
GCTGGAGATTATTTATGATAAAACTATGGAACATTGGACTTGTAGACTCGGCCACCATCA
ACAACTGCAATATCATCCTCGAGAATTGCGATAGTAACTCGGACAAGAACAACAAGAAGA
GTGTGGATGTTGGTATTGACATTAACAGTAACGCCATGGATGTTGACGAGGATGTCAATA
ACAGCAAAGCCAAGTAATAGGCTGAATTAGAGAACCCCCTCTGGCTGCAACATTCATCTG
TTTTATTAGTTTGCAAACTGATTTCATTTTTTCTTTTTTTTTGGGTATCAACTGACTCCA
ATC

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

CO CL5181Contig1 1034 2 2 U
GGAGACAACTATTGTCCGCTTCTTATCTCTGAAAAAGAAAAAAACATGACACAGAGAGTC
TGAAGATCAAAGCAAAAGCCTTTCGTAGTCGTAATCGAAACGCCAAATCATTACCGTTCA
ACTGAAAATCCAACAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTC
ATTACAATGGAGAACGGTGCTGGATTTACAGGAGACAATATGAAAAAGAAAAAGCCTGTT
GGTGATGGTTTTGTCGGCGGGTTTTTCCCTGTCTCTACCACCAAGATCGCGTGGAAATCA
AGGAAAAGATCAGCATCTGCGAACTCAGACAAAGCGCTGGAGGCTGCTGCTATGGAGGTC
ACACCAGAGAAGGATGAGTCAACAACAACAACAAAAATGGAAACTACAACTCCACCTGTT
CTGTCCGAGAAAAGAAGAGCTCTGTTTGAGCCACTTGAACCTATTACTACAAACTTGAAC
GGAAAGCGACCAATGGACGCTGATTCGCTCTTGCCGCCCCCAGATTTCGAGTCTGCAAAC
TACCCGAAAGGTTGGTTGATCGGTAAGAAGAGGAAGCTGGTCAATGTTGATGTGGTTGAG
AGCATGCGAAGAATCGCTGTCCAAGAAATGAACAGAAAGGACCGAGAGATAGATGGGTTA
AACGAGCAGCTAGAAGAGGACTCGCGTTGCTTAGAGCATCTGCAGCTTCAGCTGCTACAA
GAGAGAAGCAAGAGAACAGAGATTGAAAGAGAGAACGCAATGTTGAAAGAGCAAGTCGAT
ATGCTTGTCAACATGATACACCAAGATGAAGAAGAAGAAGTAGCAGAAGAACCATAGCTC
TAGCATGGTGTCCTATTTAAAGTACGTCTACAATATTAAATAGCTCTGTTCTGTTTGTTC
ATTCATTTGTCCATAAAACGTAAGGAAAGGAAGAAGCTTTACTACCAATCTATTTATCTG
GTTTAAGCTACTGTTGTTTCCTCCTGTTAGAACAAATCAACATTATATATATATTTTAAG
TCAAGTTCTTTACG


BQ
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AF RS1EM45TF U 1
AF RS1EM45JQ C 320
BS 1 719 RS1EM45TF
BS 720 1034 RS1EM45JQ

RD RS1EM45TF 730 0 0
GGAGACAACTATTGTCCGCTTCTTATCTCTGAAAAAGAAAAAAACATGACACAGAGAGTC
TGAAGATCAAAGCAAAAGCCTTTCGTAGTCGTAATCGAAACGCCAAATCATTACCGTTCA
ACTGAAAATCCAACAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTC
ATTACAATGGAGAACGGTGCTGGATTTACAGGAGACAATATGAAAAAGAAAAAGCCTGTT
GGTGATGGTTTTGTCGGCGGGTTTTTCCCTGTCTCTACCACCAAGATCGCGTGGAAATCA
AGGAAAAGATCAGCATCTGCGAACTCAGACAAAGCGCTGGAGGCTGCTGCTATGGAGGTC
ACACCAGAGAAGGATGAGTCAACAACAACAACAAAAATGGAAACTACAACTCCACCTGTT
CTGTCCGAGAAAAGAAGAGCTCTGTTTGAGCCACTTGAACCTATTACTACAAACTTGAAC
GGAAAGCGACCAATGGACGCTGATTCGCTCTTGCCGCCCCCAGATTTCGAGTCTGCAAAC
TACCCGAAAGGTTGGTTGATCGGTAAGAAGAGGAAGCTGGTCAATGTTGATGTGGTTGAG
AGCATGCGAAGAATCGCTGTCCAAGAAATGAACAGAAAGGACCGAGAGATAGATGGGTTA
AACGAGCAGCTAGAAGAGGACTCGCGTTGCTTAGAGCATCTGCAGCTTCAGCTGCTACA
GAGAGAGCAGA

QA 1 719 1 719
DS 

RD RS1EM45JQ 715 0 0
CGAACTCAGACAAAGCGCTGGAGGCTGCTGCTATGGAGGTCACACCAGAGAAGGATGAGT
CAACAACAACAACAAAAATGGAAACTACAACTCCACCTGTTCTGTCCGAGAAAAGAAGAG
CTCTGTTTGAGCCACTTGAACCTATTACTACAAACTTGAACGGAAAGCGACCAATGGACG
CTGATTCGCTCTTGCCGCCCCCAGATTTCGAGTCTGCAAACTACCCGAAAGGTTGGTTGA
TCGGTAAGAAGAGGAAGCTGGTCAATGTTGATGTGGTTGAGAGCATGCGAAGAATCGCTG
TCCAAGAAATGAACAGAAAGGACCGAGAGATAGATGGGTTAAACGAGCAGCTAGAAGAGG
ACTCGCGTTGCTTAGAGCATTTGCAGCTTCAGCTGCTACAAGAGAGAAGCAAGAGAACAG
AGATTGAAAGAGAGAACGCAATGTTGAAAGAGCAAGTCGATATGCTTGTCAACATGATAC
ACCAAGATGAAGAAGAAGAAGTAGCAGAAGAACCATAGCTCTAGCATGGTGTCCTATTTA
AAGTACGTCTACAATATTAAATAGCTCTGTTCTGTTTGTTCATTCATTTGTCCATAAAAC
GTAAGGAAAGGAAGAAGCTTTACTACCAATCTATTTATCTGGTTTAAGCTACTGTTGTTT
CCTCCTGTTAGAACAAATCAACATTATATATATATTTTAAGTCAAGTTCTTTACG

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

CO CL5182Contig1 1072 2 4 U
GGGTGGCAATTAGAATTTTGGTGTGGCAAAGAGAATAATATTTTTGAAGGTGTGGCAATG
GAGAATACTATCCCTCTATCTCTCCCAAATCCCTAAAACAGGAAGCACATCGTAAAGCGG
CGGCTTAGGGTTATTTGCCTCTTCACCATGGACGCGTACGACATCCTGAGATCCGAGAGG
TTAGAGTTCGAGAGTGAGGCTGCTGAGAAAGCCTTTGCCGACAGGATCAGTGGCAAGCCC
CGAGCTTTGATTTCTGTGACGGGATACAACCCTAATCTGCCTGAGGATGATATCAAGAAG
GAACTGATTGAACTCTTCAGTTCATGTGGTGACGTTACAAGGGTTATTGTTCCCAAAGAC
CCTGATCATAGCCCTAATCTCGACAGACGTGCTTTAGTTATTCTTTTCGGAGATGGGGCA
GAAGAGAAGGCCTTGCAACTTAATGGAACTGACGTTGGAGGATGGAATGCTCTTGTTAAG
GTTGAATCGGATGAAGAAGATGAGGAGGCAGCACGCTATAGATCCTCTCTGATTAACGAA
CTAATGAATGACCCAAAATTTTGGTATGGCGTTTCGGTTAGGGGATATGACACTTCCCTC
CCTGTAGACCAAGTCGAGAGGGCTTTGAAGGAACATTTCTCTGATTGTGGGGAGATAACT
CATGTTTTTGTCGATACTCTCGACAAGCTGACTAATGTCTATTTTTCCCTACAAGAAGGA
GAAGCTAGGGCGCTGGCTCGTGATGGAATTAGAATGGGAGAATTCGAATTAGATATTTCT
GGCGTACCTTCAGTCCTAAGTAACCGTCCCAATCCCTTTGGCAACGGTGAAATTGAAATT
GGTTTGGGCTATACTGTCCCAGCTCATATGATTGAGTTTGCCAACAAGGACGACGACGAG
ATCGAGAACAAGGTCATTGCTTTCAAGAAGCAGAGGAGGCTTATCTAGAAATTTCTCTTT
CTCTCAAGAAGCTCTATCTTTGGTGTTTAATAATAATAAATCGTGTGAATGATAATACAA
TGCAACCTTGGGGCTTTCTTACTTACGTTTAATCTCAAAGCTCACATTATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GQ54TF U 1
AF RS1GQ54JQ C 437
BS 1 685 RS1GQ54TF
BS 686 686 RS1GQ54JQ
BS 687 705 RS1GQ54TF
BS 706 1072 RS1GQ54JQ

RD RS1GQ54TF 708 0 0
GGGTGGCAATTAGAATTTTGGTGTGGCAAAGAGAATAATATTTTTGAAGGTGTGGCAATG
GAGAATACTATCCCTCTATCTCTCCCAAATCCCTAAAACAGGAAGCACATCGTAAAGCGG
CGGCTTAGGGTTATTTGCCTCTTCACCATGGACGCGTACGACATCCTGAGATCCGAGAGG
TTAGAGTTCGAGAGTGAGGCTGCTGAGAAAGCCTTTGCCGACAGGATCAGTGGCAAGCCC
CGAGCTTTGATTTCTGTGACGGGATACAACCCTAATCTGCCTGAGGATGATATCAAGAAG
GAACTGATTGAACTCTTCAGTTCATGTGGTGACGTTACAAGGGTTATTGTTCCCAAAGAC
CCTGATCATAGCCCTAATCTCGACAGACGTGCTTTAGTTATTCTTTTCGGAGATGGGGCA
GAAGAGAAGGCCTTGCAACTTAATGGAACTGACGTTGGAGGATGGAATGCTCTTGTTAAG
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CCTGTAGACCAAGTCGAGAGGGCTTTGAAGGAACATTTCTCTGATTGTGGGGAGATAACT
CATGTTTTTGTCGATACTCTCGACA*GCTGACTAATGTCTATTTT
CCC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RS1GQ54JQ 636 0 0
AACTTAATGGAACTGACGTTGGAGGATGGAATGCTCTTGTTAAGGTTGAATCGGATGAAG
AAGATGAGGAGGCAGCACGCTATAGATCCTCTCTGATTAACGAACTAATGAATGACCCAA
AATTTTGGTATGGCGTTTCGGTTAGGGGATATGACACTTCCCTCCCTGTAGACCAAGTCG
AGAGGGCTTTGAAGGAACATTTCTCTGATTGTGGGGAGATAACTCATGTTTTTGTCGATA
CTCTCGACAAGCTGACTAATGTCTATTTTTCCCTACAAGAAGGAGAAGCTAGGGCGCTGG
CTCGTGATGGAATTAGAATGGGAGAATTCGAATTAGATATTTCTGGCGTACCTTCAGTCC
TAAGTAACCGTCCCAATCCCTTTGGCAACGGTGAAATTGAAATTGGTTTGGGCTATACTG
TCCCAGCTCATATGATTGAGTTTGCCAACAAGGACGACGACGAGATCGAGAACAAGGTCA
TTGCTTTCAAGAAGCAGAGGAGGCTTATCTAGAAATTTCTCTTTCTCTCAAGAAGCTCTA
TCTTTGGTGTTTAATAATAATAAATCGTGTGAATGATAATACAATGCAACCTTGGGGCTT
TCTTACTTACGTTTAATCTCAAAGCTCACATTATGC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

CO CL5183Contig1 987 2 2 U
GGGATTCAAACCCTAATCACAATCACAATGGTGCCCTCCTTGAAAGCCGTCGTTTTCGCG
AGGCAGATGGCGAAGAAGATTCGCGTCACGACGCCGTTTACTCGCTTTCTCTCAACCGGG
GACGACAAAAAGCAGCAGAACCCACCAGAGCCTTTACCCAACAGACCATTGCGAGGGGAG
AGATCTCCTTCCAACTCCGCTAAGCCTTCTCAAACCCCTAAACTCGAAAACACACTATCC
GACCATGGCTTCCTCGAGCAGTTCAAGCTTGGTGTATCCCATCAGGAAGAGGAGCAAAAG
CCCCAGGAGGAGGAAACAAGCCAGCCATTACCGGATCCTCAAGACTCGGACGAGATCTTC
AAGGCGATGAAGGAAGGAGGTCTGATTCCCAACGCTGTGGCCATGCTTGATGGGCTTTGC
AAAGATGGGCTTGTACAGGAAGCGATGAAGCTGTTCGGGACGATGCGTGACAAGGGTACA
ATCCCTGAGGTGGTTATCTACACTGCTGTTGTGGAGGGCTTTTGCAAGGCTCGTAAAATC
ATGACGCGAAGAGGATTTTCAGGAAGATGCAGACCGTTGGGATCTCTCCGAATGCGTTTA
GCTATGGTGTCCTGGTTCAGGGGTTGTACGCTTGCAACATGCTTGACGATGCTGTTGATT
TCTGCGTTGAGATGCTCGAGTCTGGTCACTCTCCCAACATCCCCACTTTCGTTGGATTGG
TTGATGCCTTGTGCAGAGAAAAGGGCGTCGAACAGGCTCGGTCCGCTATTGACACGTTCA
GCCAGAAAGGATTTGCGGTTAATTTAAAGACCGTCAAGGAGTTTATGGAGAAGACGGCGC
CGTTTCCGTCTCTGGCTTGGGAAGCCGTTTTCAAGAAGAAATCAATCGAGAAACCTTTTT
GATTGTTGCAGTCTCCATAAGTTTGTACGTGACTTGTAGTAGCAACCCCGGGACAAAAAG
TATAATAAAGACCTGAGGTTTCAGATT


BQ
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AF RS1ES49TF U 1
AF RS1ES49JQ C 279
BS 1 680 RS1ES49TF
BS 681 987 RS1ES49JQ

RD RS1ES49TF 680 0 0
GGGATTCAAACCCTAATCACAATCACAATGGTGCCCTCCTTGAAAGCCGTCGTTTTCGCG
AGGCAGATGGCGAAGAAGATTCGCGTCACGACGCCGTTTACTCGCTTTCTCTCAACCGGG
GACGACAAAAAGCAGCAGAACCCACCAGAGCCTTTACCCAACAGACCATTGCGAGGGGAG
AGATCTCCTTCCAACTCCGCTAAGCCTTCTCAAACCCCTAAACTCGAAAACACACTATCC
GACCATGGCTTCCTCGAGCAGTTCAAGCTTGGTGTATCCCATCAGGAAGAGGAGCAAAAG
CCCCAGGAGGAGGAAACAAGCCAGCCATTACCGGATCCTCAAGACTCGGACGAGATCTTC
AAGGCGATGAAGGAAGGAGGTCTGATTCCCAACGCTGTGGCCATGCTTGATGGGCTTTGC
AAAGATGGGCTTGTACAGGAAGCGATGAAGCTGTTCGGGACGATGCGTGACAAGGGTACA
ATCCCTGAGGTGGTTATCTACACTGCTGTTGTGGAGGGCTTTTGCAAGGCTCGTAAAATC
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QA 1 680 1 680
DS 

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GGCCATGCTTGATGGGCTTTGCAAAGATGGGCTTGTACAGGAAGCGATGAAGCTGTTCGG
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CTTTTGCAAGGCTCGTAAAATCATGACGCGAAGAGGATTTTCAGGAAGATGCAGACCGTT
GGGATCTCTCCGAATGCGTTTAGCTATGGTGTCCTGGTTCAGGGGTTGTACGCTTGCAAC
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GTAGCAACCCCGGGACAAAAAGTATAATAAAGACCTGAGGTTTCAGATT

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 2

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GTGAACACCGGGAAGGGTAAGGGAACCCACGTGAGCGTTAGCGGCGGAAAAGGTCACGGC
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GGGGGCGTTATAGTGCACACGCGCCACAAGGGCAAGCCGGTCTACGTGGGCGTGAAACCA
GGACCAAACCCTTTTGTGTATAACTATGCAGCAAGCGAGACTCAGCTCCACGACGATCCC
AAAGCGGCTCTCTTCTTCTTGGAGAAAGACATGGTTCCCGGAAAAGCTATGAACCTCACG
TTTAATGCGGAGGACGGTTACGACGGCAAAACTGCGTTCTTGCCACGTGGAGAGGCGGAA
ATGGTGCCGTTCGGGTCTGAGAAGTTCTCGGAGATCTTGAACACGTTCTCGGTGAAACCT
GGTTCGGAAGAAGCTGAGATGATGAAGAAAACGATTGAGGAGTGTGAAGCGAAAAGAGTC
GGTGGAGAGGAGAAGTATTGTGCTACGTCTTTGGAGTCTATGGTTGATTTTAGCGTTTCT
AAACTTGGCAAAGATCACTTCCGTGCTGTCTCCACTGAGGTGGCTGAGAAGAATGCACCG
ATGCAAAAGTACAGAATCGCAGCTGGTGGGGTAAAGAAGTTATCAGACGACAAGTCAGTG
GTGTGCCACAAACAGAAGTACCCATTCGCGGTTTTCTACTGCCACAAAGCGATGATGACG
AGCGTTTACGCGGTTCCACTCGAAGGGGAGAACGGGTTGCGGGCTAAAGCGGTTGCGGTA
TGCCACAAGAACACCTCAGCGTGGAACCCAAACCACTTGGCTTTTAAAGTCCTTAAGGTG
AAGCCTGGGAGTGTTCCGGTCTGCCACTTCCTCCCTGAGACCCATGTTGTTTGGTTCAGC
TACTAGATATGGCTTTCTATGTTATGTAATAATTTATAAGAAGATCTATACTCTGGGATG
TTTTGTATTTATACATATAGTAATGTGTGATTTTCCATATAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CT37TF U 1
AF RS1CT37JQ C 585
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BS 708 1304 RS1CT37JQ

RD RS1CT37TF 707 0 0
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GGACCAAACCCTTTTGTGTATAACTATGCAGCAAGCGAGACTCAGCTCCACGACGATCCC
AAAGCGGCTCTCTTCTTCTTGGAGAAAGACATGGTTCCCGGAAAAGCTATGAACCTCACG
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QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1CT37JQ 720 0 0
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TGATTTTAGCGTTTCTAAACTTGGCAAAGATCACTTCCGTGCTGTCTCCACTGAGGTGGC
TGAGAAGAATGCACCGATGCAAAAGTACAGAATCGCAGCTGGTGGGGTAAAGAAGTTATC
AGACGACAAGTCAGTGGTGTGCCACAAACAGAAGTACCCATTCGCGGTTTTCTACTGCCA
CAAAGCGATGATGACGAGCGTTTACGCGGTTCCACTCGAAGGGGAGAACGGGTTGCGGGC
TAAAGCGGTTGCGGTATGCCACAAGAACACCTCAGCGTGGAACCCAAACCACTTGGCTTT
TAAAGTCCTTAAGGTGAAGCCTGGGAGTGTTCCGGTCTGCCACTTCCTCCCTGAGACCCA
TGTTGTTTGGTTCAGCTACTAGATATGGCTTTCTATGTTATGTAATAATTTATAAGAAGA
TCTATACTCTGGGATGTTTTGTATTTATACATATAGTAATGTGTGATTTTCCATATAATC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

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CTTCACCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AQ66TFB C 1
AF RS1AQ66JQ U 85
BS 1 84 RS1AQ66TFB
BS 85 369 RS1AQ66JQ

RD RS1AQ66TFB 369 0 0
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ATAATAAGTCAACAAGATCCAGAGTTTGTCAATACAAGCATAAAAAAAAACCTGCAACTG
GTAGTTGAGGTTTCCTTTTTTGAAAAGAAAAAACAGAAAAGAGAAAAAAACGAATGACTA
AACTGGTTGGGAAGAGGGTACACACTTACTCTCAGTACTCCTCCTCCTGTTGGTAATCTC
CTTCCTCCTCATCCTCGTACTCACCTTCTTCATCTGCAGTTGCGTCTTGGTATTGCTGGT
ACTCTGAGACAAGATCGTTCATGTTGCTCTCTGCTACTGTGAACTCCGTCTCGTCCATTC
CTTCACCTC

QA 1 369 1 369
DS 

RD RS1AQ66JQ 285 0 0
TTTGTCAATACAAGCATAAAAAAAAACCTGCAACTGGTAGTTGAGGTTTCCTTTTTTGAA
AAGAAAAAACAGAAAAAAAAAAAAAACGAATGACTAAACTGGTTGGGAAAAGGGTACACA
CTTACTCTCAGTACTCCTCCTCCTGTTGGTAATCTCCTTCCTCCTCATCCTCGTACTCAC
CTTCTTCATCTGCAGTTGCGTCTTGGTATTGCTGGTACTCTGAAACAAAATCGTTCATGT
TGCTCTCTGCTACTGTGAACTCCGTCTCGTCCATTCCTTCACCTC

QA 1 285 1 285
DS 



AS 1 2

CO CL5186Contig1 1006 2 2 U
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CTTCATAATAGCTTCAAGGCCGTTTCATCTCCAGCATCGGTCAAGTGACCATCTCTTGCC
TTCTCTTGGCTTAAATCTCAACCTCAAGCGCAGGCTCTCTCTATCCATCACCTCATTTAC
CACCAAGATTCTGTCTCCTCCTCCTTTCTCGGACAAGGAAAAGAGAAGTAATGCCCTGCC
GCGTGGGGCAGGAGAAGGAGTTAAAGATGATGCGAGGAGTAAGCTGCTTCAAGTAGTCTT
GGTCTCTCCCCAGATTCCTGGAAACACAGGTTGCACTGCAAGAACATGTGCAGCTTCAGC
TGTTGGTCTGCATTTAGTCGGGCCATTAGGTTTTCAAGTGGATGACGCCAAAGTAAAGCG
AGCTGGTTTGGATTATTGGCCCTATGTGGTTGTCAAAGCACACAGCTCATGGGCTGAGTT
TCAAGAATATTTCAGGCAACAGGAGGGAGAGAAACGGATGATAGCTTTCACAAAAAGAGG
AACAAAAACACATTCAGACTCCTCTTACAGAAGAGGCGATTACCTCTTGTTCGGGTCAGA
GACAAGTGGTCTACCTCCTGAAGCACTGTCAGACTGCAAAGACGAGAAATACGGAGGGGG
GACCATACGTATACCGATGGTGGAGACGTATGTGAGATGTTTGAATCTGTCGGTGAGTGT
AGGGGTTGCTGTGTATGAAGCGTCCAGACAGCTTAACTATGAGCAGATTGATTGTGCACC
TGAAGGGATTCTGTGAACGGTGAAGAACCATTGTTTGCAGATGATATTTTTGCTTGATAC
ATTGCAACAAAAATAGAAGAGAGACAACAAAGGCATGATAGTCATAAGCCATAGGTGGAT
GGAAACTTCACTTTTTAGCCAATTTTTTAGCTGATTATCCTTTTTATCTATCAAAACCTA
AGTGTGGGGATGACAGCTTTTCAGTTTCGAATTTTAGAACTAGTAC


BQ
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AF RS1H010TF U 1
AF RS1H010JQB C 381
BS 1 645 RS1H010TF
BS 646 1006 RS1H010JQB

RD RS1H010TF 645 0 0
GGAAGGAAGGAAGTAGGTTGGCTCGGGAAGAATGGGGAGTTGCGGCCGGAGCAGTCTGAA
CTTCATAATAGCTTCAAGGCCGTTTCATCTCCAGCATCGGTCAAGTGACCATCTCTTGCC
TTCTCTTGGCTTAAATCTCAACCTCAAGCGCAGGCTCTCTCTATCCATCACCTCATTTAC
CACCAAGATTCTGTCTCCTCCTCCTTTCTCGGACAAGGAAAAGAGAAGTAATGCCCTGCC
GCGTGGGGCAGGAGAAGGAGTTAAAGATGATGCGAGGAGTAAGCTGCTTCAAGTAGTCTT
GGTCTCTCCCCAGATTCCTGGAAACACAGGTTGCACTGCAAGAACATGTGCAGCTTCAGC
TGTTGGTCTGCATTTAGTCGGGCCATTAGGTTTTCAAGTGGATGACGCCAAAGTAAAGCG
AGCTGGTTTGGATTATTGGCCCTATGTGGTTGTCAAAGCACACAGCTCATGGGCTGAGTT
TCAAGAATATTTCAGGCAACAGGAGGGAGAGAAACGGATGATAGCTTTCACAAAAAGAGG
AACAAAAACACATTCAGACTCCTCTTACAGAAGAGGCGATTACCTCTTGTTCGGGTCAGA
GACAAGTGGTCTACCTCCTGAAGCACTGTCAGACTGCAAAGACGA

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1H010JQB 626 0 0
GGCCATTAGGTTTTCAAGTGGATGACGCCAAAGTAAAGCGAGCTGGTTTGGATTATTGGC
CCTATGTGGTTGTCAAAGCACACAGCTCATGGGCTGAGTTTCAAGAATATTTCAGGCAAC
AGGAGGGAGAGAAACGGATGATAGCTTTCACAAAAAGAGGAACAAAAACACATTCAGACT
CCTCTTACAGAAGAGGCGATTACCTCTTGTTCGGGTCAGAGACAAGTGGTCTACCTCCTG
AAGCACTGTCAGACTGCAAAGACGAGAAATACGGAGGGGGGACCATACGTATACCGATGG
TGGAGACGTATGTGAGATGTTTGAATCTGTCGGTGAGTGTAGGGGTTGCTGTGTATGAAG
CGTCCAGACAGCTTAACTATGAGCAGATTGATTGTGCACCTGAAGGGATTCTGTGAACGG
TGAAGAACCATTGTTTGCAGATGATATTTTTGCTTGATACATTGCAACAAAAATAGAAGA
GAGACAACAAAGGCATGATAGTCATAAGCCATAGGTGGATGGAAACTTCACTTTTTAGCC
AATTTTTTAGCTGATTATCCTTTTTATCTATCAAAACCTAAGTGTGGGGATGACAGCTTT
TCAGTTTCGAATTTTAGAACTAGTAC

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 2

CO CL5187Contig1 1217 2 2 U
GGGAAACTGCAGCAAAAAAACCCTAAACCCCCACCCACTAGATTTGCGAGTAAGAGGAAA
AATGAATGGTGTTTCTCGTCATCTTCGAGCTTCTCCACTTCCTTCGTTAATCCGAAGCTA
TGGTGGAATCAAGTCGGTCTGTCGATTTTCGTCTCAATCAGATGGCTTCTCTGGTGGGAG
AGAGCAAGGACCAGTTCCTGGAAACTCCGAGAACAAGTCAGGCTCACCGGATCCTAATCC
TTCACCCTCCAAAACCTTCAGTGAAATAAAAGCAGGTTTACTAAACTCCTCCGGAGGAGG
AAAGGGCACCTCATCCACCTTCAGTAGTTTCAGTGAACTGAGATCAGGCCTTTTAAACCG
AGCAGGAGACGGTGGCTACCCATCTCCTAATGCTCCTCCCACCTTCAAAAACCCCTTTAG
ATCACGCTTACCAAACACCTTACCTTCTCAGTCCGGTGAAGAAGGCTTACCAAGCACTGG
AGGAAGCGCACCACCCAGCTACCAAGGCTTCACTCAGTCTAACCTTTTCAAGGACAACTT
CCGGACCGGTGGGATTTCCAAAGACCTGGACTTTGTCAGGGGAGTGATCGAGGAGGACGA
AAGACGTAGAGCCGCCACAGGGGGGCTCTTCTCTCACTTCCATCGCCCTAATCTGGAGAC
CAACGCCGACGTCATTCACATCAAGCTGCTGAGGAACAACACGTTCGTCACGGTTACTGA
TTCCAAAGGGAACGTCAAGTGCAAGGCTACGTCGGGTAGTGTGCCTGACCTGAAGGGTGG
GAGGAAGATGACGAGTTACACGGCTGATGCTACCGCTGAGAACATTGGGAGGAGGGTTAA
GGCTATGGGTTTGAAATCTGTGGTGGTGAAGGTGAATGGGTTTACGCATTTCAAGAAGAA
GAGAAACGCCATTGTGGCGTTTAGGATCGGTTACTCCAATTCCAGGAATGATCAGAATCC
TATTGTCTACATCGAGGACACTACTAGGAAAGCTCATAATGGTTGCAGATCGCCAAGGAA
ACGTCGGGTGTGAGAAAAAAAAGGGGGAAACGTGTTTGCAGATTTGCTTTTGTTGTTCTT
CTATGGTCACACTACAGAAACCATTTCTTTTTGCTAATCTTCTCTTTGTTTGGTTATTAC
TTTTAAATCCTGATGAAAATCGGGTCTGAATCAAATCGACTGCTTAATAAACCGGAAATT
GAAAAACCGGATCACTC


BQ
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AF RS1GU11TF U 1
AF RS1GU11JQ C 530
BS 1 651 RS1GU11TF
BS 652 1217 RS1GU11JQ

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AATGAATGGTGTTTCTCGTCATCTTCGAGCTTCTCCACTTCCTTCGTTAATCCGAAGCTA
TGGTGGAATCAAGTCGGTCTGTCGATTTTCGTCTCAATCAGATGGCTTCTCTGGTGGGAG
AGAGCAAGGACCAGTTCCTGGAAACTCCGAGAACAAGTCAGGCTCACCGGATCCTAATCC
TTCACCCTCCAAAACCTTCAGTGAAATAAAAGCAGGTTTACTAAACTCCTCCGGAGGAGG
AAAGGGCACCTCATCCACCTTCAGTAGTTTCAGTGAACTGAGATCAGGCCTTTTAAACCG
AGCAGGAGACGGTGGCTACCCATCTCCTAATGCTCCTCCCACCTTCAAAAACCCCTTTAG
ATCACGCTTACCAAACACCTTACCTTCTCAGTCCGGTGAAGAAGGCTTACCAAGCACTGG
AGGAAGCGCACCACCCAGCTACCAAGGCTTCACTCAGTCTAACCTTTTCAAGGACAACTT
CCGGACCGGTGGGATTTCCAAAGACCTGGACTTTGTCAGGGGAGTGATCGAGGAGGACGA
AAGACGTAGAGCCGCCACAGGGGGGCTCTTCTCTCACTTCCATCGCCCTAA

QA 1 651 1 651
DS 

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AATCTGGAGACCAACGCCGACGTCATTCACATCAAGCTGCTGAGGAACAACACGTTCGTC
ACGGTTACTGATTCCAAAGGGAACGTCAAGTGCAAGGCTACGTCGGGTAGTGTGCCTGAC
CTGAAGGGTGGGAGGAAGATGACGAGTTACACGGCTGATGCTACCGCTGAGAACATTGGG
AGGAGGGTTAAGGCTATGGGTTTGAAATCTGTGGTGGTGAAGGTGAATGGGTTTACGCAT
TTCAAGAAGAAGAGAAACGCCATTGTGGCGTTTAGGATCGGTTACTCCAATTCCAGGAAT
GATCAGAATCCTATTGTCTACATCGAGGACACTACTAGGAAAGCTCATAATGGTTGCAGA
TCGCCAAGGAAACGTCGGGTGTGAGAAAAAAAAGGGGGAAACGTGTTTGCAGATTTGCTT
TTGTTGTTCTTCTATGGTCACACTACAGAAACCATTTCTTTTTGCTAATCTTCTCTTTGT
TTGGTTATTACTTTTAAATCCTGATGAAAATCGGGTCTGAATCAAATCGACTGCTTAATA
AACCGGAAATTGAAAAACCGGATCACTC

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

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AAAATTTGTTGTCTTGTGTTTGCACTTTTTAGATTTAAGCGTTTCTTTGTACTCTTAGAT
CAACTATAATTTTATTCTGTATCAA


BQ
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AF RS1BT14JQ C 1
AF RS1BT14TF U 1
BS 1 265 RS1BT14TF

RD RS1BT14JQ 265 0 0
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AGCACCATGTTTTTGACTTCTTACAGGATCTCTGGTAGAAATCTTTTTCTCGGTAGTTTG
AAAATTTGTTGTCTTGTGTTTGCACTTTTTAGATTTAAGCGTTTCTTTGTACTCTTAGAT
CAACTATAATTTTATTCTGTATCAA

QA 1 265 1 265
DS 

RD RS1BT14TF 265 0 0
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CAACAAGTATATGAACTACGATTCTTCCCCAACAAGTAGATGAATCTAAATAGCATCTAA
AGCACCATGTTTTTGACTTCTTACAGGATCTCTGGTAGAAATCTTTTTCTCGGTAGTTTG
AAAATTTGTTGTCTTGTGTTTGCACTTTTTAGATTTAAGCGTTTCTTTGTACTCTTAGAT
CAACTATAATTTTATTCTGTATCAA

QA 1 265 1 265
DS 



AS 1 2

CO CL5189Contig1 1145 2 2 U
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TTTCTTATCACACAAAAAAAGAAGAAGAAGAGGGAAGCAATGGCTTCGGCTCTGAAACTC
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ACGCCTGCATGTTGTGGAGGAATGAGAAATTTGAATGGTTTAGCTCAAACCACACTAGAC
CGTCAACAAGCATGCAAATGCGTACAGTCCATTATAAGTTCCATCCCTGGTCTCAACCCA
AATCTAGCTGCTGGTCTTCCTGGACGGTGCGGTGTTAGCTTTCCCTATCCTATCTCCGCG
AGCAATAACTGCGACAGGTAAGCAAGCCTTTTGTTCTCTTTTTGTTAAGTCCAAGTTCAC
ATTAATTCTTTTTATTTTCTTTCTTACATGATTAACTAGGGTAAAACCCGCCCTACGGGC
GGGTAAGCAAATGAAAAACTGATTAAAACATATTAATTGGTAAAATATAACTAAAACAAA
ATAACATTATTGTGAATATATTGTTAATAATTTTTTGTTTTATTATAAAATATTGTAATG
CAAATGTCAATATCTTGTTGAAAATAATTTGTTTAGTAATATTATGATTCAAATGTCAAA
AATGTTATATTTTTTTATCAATCCTTTGAATTTTATAGTTTATCTTATACTATTAATTTA
GGTTCTTACAAATTTTTAGCCATTTATGAGACTGTAAATATTTATCACACTTATGCAATA
TATTTTATTGTGTCATACGATTTATGGGTTTTACCCAATATATTTTATTTTACGTTATAA
TCACTTGATAGTAAATTTTAATATACTTTATAATTTAATCTTCAGCTATTTGATATATAT
CTTGGTTGTTGATCATCATATTAAAAAAAAAGATCATCATATTTGTCAAGATATGTCAAC
TACCGCTTGGTTGTATATATTTAGACGCCGTAGTCTGATTTGTCATCTTTTCATGTTTTT
GGCTGTAAGCTTGTAAACATTAAATCATCAAATTGATGTACTGAAAGAGCTAACTCATTC
ATTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1BK13TF U 1
AF RS1BK13JQ C 381
BS 1 777 RS1BK13TF
BS 778 1145 RS1BK13JQ

RD RS1BK13TF 777 0 0
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TTTCTTATCACACAAAAAAAGAAGAAGAAGAGGGAAGCAATGGCTTCGGCTCTGAAACTC
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AACGCAGTGGCAAGTTGCATAGCTCCTTGTGTCCCCTACCTAAGACAAGGCGGGGTCGTG
ACGCCTGCATGTTGTGGAGGAATGAGAAATTTGAATGGTTTAGCTCAAACCACACTAGAC
CGTCAACAAGCATGCAAATGCGTACAGTCCATTATAAGTTCCATCCCTGGTCTCAACCCA
AATCTAGCTGCTGGTCTTCCTGGACGGTGCGGTGTTAGCTTTCCCTATCCTATCTCCGCG
AGCAATAACTGCGACAGGTAAGCAAGCCTTTTGTTCTCTTTTTGTTAAGTCCAAGTTCAC
ATTAATTCTTTTTATTTTCTTTCTTACATGATTAACTAGGGTAAAACCCGCCCTACGGGC
GGGTAAGCAAATGAAAAACTGATTAAAACATATTAATTGGTAAAATATAACTAAAACAAA
ATAACATTATTGTGAATATATTGTTAATAATTTTTTGTTTTATTATAAAATATTGTAATG
CAAATGTCAATATCTTGTTGAAAATAATTTGTTTAGTAATATTATGATTCAAATGTCAAA
AATGTTATATTTTTTTATCAATCCTTTGAATTTTATAGTTTATCTTATACTATTAAT

QA 1 777 1 777
DS 

RD RS1BK13JQ 765 0 0
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AGCAAGCCTTTTGTTCTCTTTTTGTTAAGTCCAAGTTCACATTAATTCTTTTTATTTTCT
TTCTTACATGATTAACTAGGGTAAAACCCGCCCTACGGGCGGGTAAGCAAATGAAAAACT
GATTAAAACATATTAATTGGTAAAATATAACTAAAACAAAATAACATTATTGTGAATATA
TTGTTAATAATTTTTTGTTTTATTATAAAATATTGTAATGCAAATGTCAATATCTTGTTG
AAAATAATTTGTTTAGTAATATTATGATTCAAATGTCAAAAATGTTATATTTTTTTATCA
ATCCTTTGAATTTTATAGTTTATCTTATACTATTAATTTAGGTTCTTACAAATTTTTAGC
CATTTATGAGACTGTAAATATTTATCACACTTATGCAATATATTTTATTGTGTCATACGA
TTTATGGGTTTTACCCAATATATTTTATTTTACGTTATAATCACTTGATAGTAAATTTTA
ATATACTTTATAATTTAATCTTCAGCTATTTGATATATATCTTGGTTGTTGATCATCATA
TTAAAAAAAAAGATCATCATATTTGTCAAGATATGTCAACTACCGCTTGGTTGTATATAT
TTAGACGCCGTAGTCTGATTTGTCATCTTTTCATGTTTTTGGCTGTAAGCTTGTAAACAT
TAAATCATCAAATTGATGTACTGAAAGAGCTAACTCATTCATTGC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

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CCCCAGGGGCAGCAAAAGCAGCTTGTGAACGGGAACCAATAGCGAATGCTTGATATTCAA
AGTAGTTTCCGCTGGGGCAGTTGTAGTAAAAATGGGCTCCTGACTCGTCCAGTCCACCAA
CCAGTAAACCCACACCATAAGGTCGTTTCCATGACCGTTGGGTACATACCTGAGCCTTAT
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TGATGGATTCAGATCTCGTGTAACGAGACAGAACACGGCCGTCGGCGGTGAGACCAGCGA
TAGCGACACCGATGTGGTCATCGACTTTGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H240JQB U 138
AF RS1H240TF C 1
BS 1 137 RS1H240TF
BS 138 425 RS1H240JQB
BS 426 570 RS1H240TF

RD RS1H240JQB 288 0 0
CATTCATAACCCAACACCTTGTTATTTGTAAATCAAACTCTAACACTCTCACTTGCTCAC
ATTTCCATTGGTGCAATATCTTGATCACCTGCACCACCTTGTTCCCCAGGGGCAGCAAAA
GCAGCTTGTGAACGGGAACCAATAGCGAATGCTTGATATTCAAAGTAGTTTCCGCTGGGG
CAGTTGTAGTAAAAATGGGCTCCTGACTCGTCCAGTCCACCAACCAGTAAACCCACACCA
TAAGGTCGTTTCCATGACCGTTGGGTACATACCTGAGCCTTATCAGCA

QA 1 288 1 288
DS 

RD RS1H240TF 570 0 0
AAATAAAACTACAATTTTTTAGTAACCACAAAAAGAAAAGGAAAGATTTCACGCGAGTAA
AAAGCCAAAGTACTTGGGACATAGACTGACTTTTAAACTCAGAATGGAACTTCGACACCA
GAGAGCTAAAGACGACACATTCATAACCCAACACCTTGTTATTTGTAGATCAAACTCTAA
CACTCTCACTTGCTCACATTTCCATTGGTGCAATATCTTGATCACCTGCACCACCTTGTT
CCGCAGGTGCAGCAGAAGCAGCTTGTGAACGGGAACCAATAGCGAATGCTTGATATTCAA
AGTAGTTTCCGCTGGGGCAGTTGTAGTAGAGATGGGCTCCTGACTCGTCCAGTCCACCAA
CCAGTAAACCCACACCATAAGGTCGTTTCCATGACCGTTGGGTACATACCTGAGCCTTAT
CAGCAAGACGAACGACGAGACGGCCAACGGGGAGAGGAGACTCGTAGGTGAAAGAGTGAT
TGATGGATTCAGATCTCGTGTAACGAGACAGAACACGGCCGTCGGCGGTGAGACCAGCGA
TAGCGACACCGATGTGGTCATCGACTTTGC

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 2

CO CL5191Contig1 691 2 2 U
TGCCAAACAGTTGTGTCCATTTCCAATACCAACAACGCTCATTTAAGATTCATGCAACAA
CAAGAAAAGAAAAACAGCATACGACTGAAACACTCAGGGTTTTCAAGTTAACAACACAAG
AAACAGGCATGAGCCAAAAATAAAGGCAACCAAACTTCAGGTCCATGCTCCCAGTAGCTC
AACTGGTTTCATCTCTAAATAGGCTTGATCTTGAAGTGCAGCGAGATGAGCGAAAAAACA
AGGCATTTCAAGTCCTGAACAAGATAGTAAAAGATGCGAAGACCTTCAGGATCATCACTG
CTCTGGACATCAACGAGAGAACCAATCTTAGATGTAGCGAAAGAGATATGCTCATTTCCC
ATCACGATCTCAAGCTCTTGCCTTCCAACTCGGTCAGGTTCCGGCCACTTAAAATCATCT
TCTTTCATTATCTCGCTCTCGGAGACGACACGCTTGCACTCGTTGAGAACGGCGGGGGTG
AGAAACACCTCCTTACGGATCATCGTATCGTTCTTGTAGTTCGAGTTGTTTGCGTAACGG
AGCTTACCGTCAGGTCTAAACTCGAACTCCAGGAACTCGTGTCCAAATTTCCCCTTGTGT
CCCACATAGTACCTCAGGTAGAACTCGTTTTCTTCTTCCGCCGCCATCCCTTCCTTCCTT
CCTTCTCCGTCTCTCCCGATTTCTCTTCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DL91TF C 1
AF RS1DL91JQ U 87
BS 1 86 RS1DL91TF
BS 87 691 RS1DL91JQ

RD RS1DL91TF 489 0 0
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CAAGAAAAGAAAAACAGCATACGACTGAAACACTCAGGGTTTTCAAGTTAACAACACAAG
AAACAGGCATGAGCCAAAAATAAAGGCAACCAAACTTCAGGTCCATGCTCCCAGTAGCTC
AACTGGTTTCATCTCTAAATAGGCTTGATCTTGAAGTGCAGCGAGATGAGCGAAAAAACA
AGGCATTTCAAGTCCTGAACAAGATAGTAAAAGATGCGAAGACCTTCAGGATCATCACTG
CTCTGGACATCAACGAGAGAACCAATCTTAGATGTAGCGAAAGAGATATGCTCATTTCCC
ATCACGATCTCAAGCTCTTGCCTTCCAACTCGGTCAGGTTCCGGCCACTTAAAATCATCT
TCTTTCATTATCTCGCTCTCGGAGACGACACGCTTGCATTCGTTGAGAACGGCGGGGGTG
AGAAACACC

QA 1 489 1 489
DS 

RD RS1DL91JQ 605 0 0
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CAACCAAACTTCAGGTCCATGCTCCCAGTAGCTCAACTGGTTTCATCTCTAAATAGGCTT
GATCTTGAAGTGCAGCGAGATGAGCGAAAAAACAAGGCATTTCAAGTCCTGAACAAGATA
GTAAAAGATGCGAAGACCTTCAGGATCATCACTGCTCTGGACATCAACGAGAGAACCAAT
CTTAGATGTAGCGAAAGAGATATGCTCATTTCCCATCACGATCTCAAGCTCTTGCCTTCC
AACTCGGTCAGGTTCCGGCCACTTAAAATCATCTTCTTTCATTATCTCGCTCTCGGAGAC
GACACGCTTGCACTCGTTGAGAACGGCGGGGGTGAGAAACACCTCCTTACGGATCATCGT
ATCGTTCTTGTAGTTCGAGTTGTTTGCGTAACGGAGCTTACCGTCAGGTCTAAACTCGAA
CTCCAGGAACTCGTGTCCAAATTTCCCCTTGTGTCCCACATAGTACCTCAGGTAGAACTC
GTTTTCTTCTTCCGCCGCCATCCCTTCCTTCCTTCCTTCTCCGTCTCTCCCGATTTCTCT
TCTCT

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 2

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AAATACATCATATACATTGTATGGTCAAAACTTTTCTTGTGGGTTTATAGCTCGCTGCAA
TAAGCAATGTCATTTGATTTAAGT


BQ
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AF RS1C531JQ C 1
AF RS1C531TF U 1
BS 1 264 RS1C531TF

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AAAGCTAACTTGTAAAATAGGGAGGGGTATAAAATAATGTAACTAGAAAGCAATAAACAC
AAATACATCATATACATTGTATGGTCAAAACTTTTCTTGTGGGTTTATAGCTCGCTGCAA
TAAGCAATGTCATTTGATTTAAGT

QA 1 264 1 264
DS 

RD RS1C531TF 264 0 0
TTTTTTTTAGATGGACAGGAATGGACCGGCGAAGGTGAGGAGGCTGTTCGGCTCAATCCC
GTGGTGTTTACAGACAACATGAAAAGTGGGATATTAATGGCAGCATTGTCACCTAACGAC
AAAGCTAACTTGTAAAATAGGGAGGGGTATAAAATAATGTAACTAGAAAGCAATAAACAC
AAATACATCATATACATTGTATGGTCAAAACTTTTCTTGTGGGTTTATAGCTCGCTGCAA
TAAGCAATGTCATTTGATTTAAGT

QA 1 264 1 264
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5194Contig1 820 2 4 U
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CGGCGTTTCACAGAGAGAAGGAGGAAGAAGAATGGATTCGAGACCCAGTGGACCAGCGAT
GTTGACGGCGGAGGAGCAAGCCGTTTTAAACGAAGGAATCGGTTTGATACTTTCACGGTG
GACTGCCATGCGAGCCGCCGTAGATAACGGCTGGGGCGGCCGAGATTCTCATCTGAAAGC
CGAACGCACCGTTTCCAATGTTCTTAATTACTTCATCCATTTGAAAGATCCAACGATGGG
TTTTGATGGGTTAGCTGATATTCTAGAGAATGGTCTTCATGAGCTTAACACTGTGGCTGA
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GGGTACAGACATGATGGTGGATGCATCTGAGCAATCCTCAAACAGGTTACCAGAAGCCAT
GCCGGTTGATGAACCAAAAGCTGATGATGGCTGGACGGTAGTTCCAAGTAGAAAAAACAA
GGGCAAGAGGAACTAAACGGTTTTAGGTTCCAATGGTGTTGTGTAATATCTCAACAGTTT
TGGTTTGTTTTGTTTTATTACTTAAATAAATACTATTTTGATTGTTACTCTTTTTTAACT
TTTTAAACAACATCAGAAGGTTGTGTTACTGTTTTTATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1F263TF U 1
AF RS1F263JQ C 236
BS 1 637 RS1F263TF
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BS 639 656 RS1F263TF
BS 657 820 RS1F263JQ

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GACTGCCATGCGAGCCGCCGTAGATAACGGCTGGGGCGGCCGAGATTCTCATCTGAAAGC
CGAACGCACCGTTTCCAATGTTCTTAATTACTTCATCCATTTGAAAGATCCAACGATGGG
TTTTGATGGGTTAGCTGATATTCTAGAGAATGGTCTTCATGAGCTTAACACTGTGGCTGA
TGATGGAAGCCTTGAGGAGGTGACAGAGACGTTGCTAGATTTGTATTACGAATGCCTTGA
AGGAAACTACCAAAGGGTTGAGACACTGAGGGTAACTAGTTCTCAGACTAGTGCAAGAGT
TGTCAAGGTTCCAAACGGTAACGATGAGGATGATGAGGAAAGCGATGATGAAGATGAGGA
GGGTACAGACATGATGGTGGATGCATCTGAGCAATCCTCAAACAGGTTACCAGAAGCCAT
GCCGGTTGATGAACCAAAAGCTGATGATGGCTGGACG*TAGTTCCAAGTAGAAAAA

QA 1 656 1 656
DS 

RD RS1F263JQ 585 0 0
AAAGCCGAACGCACCGTTTCCAATGTTCTTAATTACTTCATCCATTTGAAAGATCCAACG
ATGGGTTTTGATGGGTTAGCTGATATTTTAGAGAATGGTTTTCATGAGCTTAACACTGTG
GCTGATGATGGAAGCCTTGAGGAGGTGACAGAGACGTTGCTAGATTTGTATTACGAATGC
CTTGAAGGAAACTACCAAAGGGTTGAGACACTGAGGGTAACTAGTTTTCAGACTAGTGCA
AGAGTTGTCAAGGTTCCAAACGGTAACGATGAGGATGATGAGGAAAGCGATGATGAAGAT
GAGGAGGGTACAGACATGATGGTGGATGCATTTGAGCAATCCTCAAACAGGTTACCAGAA
GCCATGCCGGTTGATGAACCAAAAGCTGATGATGGCTGGACGGTAGTTCCAAGTAGAAAA
AACAAGGGCAAGAGGAACTAAACGGTTTTAGGTTCCAATGGTGTTGTGTAATATCTCAAC
AGTTTTGGTTTGTTTTGTTTTATTACTTAAATAAATACTATTTTGATTGTTACTCTTTTT
TAACTTTTTAAACAACATCAGAAGGTTGTGTTACTGTTTTTATAC

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 2

CO CL5195Contig1 1030 2 2 U
GGATATCAAAGTTTCTCTCTCATTTCTTCATCACTTCACTGCCCTGTTTTTTTCCTTATT
TTGAATAGTTCTCGAAACTTTTCTCCTAAAACTCTTTGCATAAATCATAAACAAAACCGA
ATAAGAGACCGTCAAAATTATTATCCTATCCGTGTAAAACAATGGTTGCATCAGCTTCGG
AGAGTAGGTCAGTGGAGGAATATTACAGCCGCCAAGCGGAGAGAGTGACTCAAGTACCCA
ACTCAGCTTCTGACTTAATGACTGATGAGAGCAAGGCAGAGCAAAACGAGAACTCAAAGA
AGACAAAACGTGTTAAAGACTCCGGTAAGCACCCGGTATATCGCGGTGTAAGGATGAGGA
GCTGGGGCAAATGGGTGTCGGAGATTCGTGAGCCGAGGAAGAAGTCTCGTATTTGGCTCG
GAACTTTCCCCACGCCGGAAATGGCGGCGCGTGCCCACGACGTTGCAGCTTTGAGCATTA
AAGGGACCTCAGCTATACTAAACTTCCCTGAACTAGCTGACTCATTCCCTCGACCTGTCT
CGCTAAACCCTCGAGACATTCAGACAGCAGCTCTCAAAGCAGCACACATGGAACCAACAA
CGTCGTTCACGTCTTCTACTTCTTCACTTGAGTCTCTAGTGATGGTGATGGACCTCTCGA
AAACTGAGTCGGAGGAGCTTGACGAGATCGTGGAGCTGCCAAGTCTAGGGTCGAATTGCG
ACGTACACTCGGCTAGCTTTGGGAAGGAGTTCGTGTTTTCTGACTCAGTGGACTACTGTT
TATATCCTCCGCCGTGGGGGCAGTGGTCGGAAGATAGCTACGGAATTAACCCTAATTTCA
ATAACGGCTTGTCATGGGATCTCTAACGACGTTTTAAATCAGTTTGATTTTTTGTATCAT
TATTATAAGTATCGTAGTGTTTAATACCGTGCTTATGAACACTTTGTGTTAGCTAAGAAA
GGGTTTGTTTTTCTTTGGTGCGTGTGTGAGCTCCGTAATGAATTCGTGTATAAAACTCGG
TTTGTGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DV13TF U 1
AF RS1DV13JQ C 316
BS 1 704 RS1DV13TF
BS 705 1030 RS1DV13JQ

RD RS1DV13TF 704 0 0
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TTGAATAGTTCTCGAAACTTTTCTCCTAAAACTCTTTGCATAAATCATAAACAAAACCGA
ATAAGAGACCGTCAAAATTATTATCCTATCCGTGTAAAACAATGGTTGCATCAGCTTCGG
AGAGTAGGTCAGTGGAGGAATATTACAGCCGCCAAGCGGAGAGAGTGACTCAAGTACCCA
ACTCAGCTTCTGACTTAATGACTGATGAGAGCAAGGCAGAGCAAAACGAGAACTCAAAGA
AGACAAAACGTGTTAAAGACTCCGGTAAGCACCCGGTATATCGCGGTGTAAGGATGAGGA
GCTGGGGCAAATGGGTGTCGGAGATTCGTGAGCCGAGGAAGAAGTCTCGTATTTGGCTCG
GAACTTTCCCCACGCCGGAAATGGCGGCGCGTGCCCACGACGTTGCAGCTTTGAGCATTA
AAGGGACCTCAGCTATACTAAACTTCCCTGAACTAGCTGACTCATTCCCTCGACCTGTCT
CGCTAAACCCTCGAGACATTCAGACAGCAGCTCTCAAAGCAGCACACATGGAACCAACAA
CGTCGTTCACGTCTTCTACTTCTTCACTTGAGTCTCTAGTGATGGTGATGGACCTCTCGA
AAACTGAGTCGGAGGAGCTTGACGAGATCGTGGAGCTGCCAAGT

QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1DV13JQ 715 0 0
AAGACTCCGGTAAGCACCCGGTATATCGCGGTGTAAGGATGAGGAGCTGGGGCAAATGGG
TGTCGGAGATTCGTGAGCCGAGGAAGAAGTCTCGTATTTGGCTCGGAACTTTCCCCACGC
CGGAAATGGCGGCGCGTGCCCACGACGTTGCAGCTTTGAGCATTAAAGGGACCTCAGCTA
TACTAAACTTCCCTGAACTAGCTGACTCATTCCCTCGACCTGTCTCGCTAAACCCTCGAG
ACATTCAGACAGCAGCTCTCAAAGCAGCACACATGGAACCAACAACGTCGTTCACGTCTT
TTACTTCTTCACTTGAGTCTCTAGTGATGGTGATGGACCTCTCGAAAACTGAGTCGGAGG
AGCTTGACGAGATCGTGGAGCTGCCAAGTCTAGGGTCGAATTGCGACGTACACTCGGCTA
GCTTTGGGAAGGAGTTCGTGTTTTCTGACTCAGTGGACTACTGTTTATATCCTCCGCCGT
GGGGGCAGTGGTCGGAAGATAGCTACGGAATTAACCCTAATTTCAATAACGGCTTGTCAT
GGGATCTCTAACGACGTTTTAAATCAGTTTGATTTTTTGTATCATTATTATAAGTATCGT
AGTGTTTAATACCGTGCTTATGAACACTTTGTGTTAGCTAAGAAAGGGTTTGTTTTTCTT
TGGTGCGTGTGTGAGCTCCGTAATGAATTCGTGTATAAAACTCGGTTTGTGTTTT

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

CO CL5196Contig1 428 2 1 U
GTGTGGAAGAGTCTCTGAAACGGTACTGCCAGAGGATTGGAAGACACGATTTCTGGGGAG
GGGAATCTGAGCTGCTTGTTCTTTCCAAGCTATGTAAACAGCCAATCATCGTCTACATAC
CAGAGCATGAGCATAGGAGAGGAGGAGGGTATGGGTCGGGGTTTATTCCGATTGCAGAGT
ATGGAGCTGAGTTTAGAGGAGGCTGGGGAAAAGGGAACAAGACCAAGAATGTTGTTAGGC
TTCTTTACAGTGGTAGAAACCATTATGATCTGCTTCGCTAGACCTGAGATGATTGAAGTT
TTCTACTTCCTGTTGGAATCCATGATTCCAAATTTGTTTAAAAACTTTCAATGCAAAAAA
CATGAACATGTACCAGTTCTCCCTTCTCTGCTATAGGTGGATATTTCAATTGAATTTGGA
TTCGGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1B364TF U 1
AF RS1B364JQ C 18
BS 1 428 RS1B364TF

RD RS1B364TF 428 0 0
GTGTGGAAGAGTCTCTGAAACGGTACTGCCAGAGGATTGGAAGACACGATTTCTGGGGAG
GGGAATCTGAGCTGCTTGTTCTTTCCAAGCTATGTAAACAGCCAATCATCGTCTACATAC
CAGAGCATGAGCATAGGAGAGGAGGAGGGTATGGGTCGGGGTTTATTCCGATTGCAGAGT
ATGGAGCTGAGTTTAGAGGAGGCTGGGGAAAAGGGAACAAGACCAAGAATGTTGTTAGGC
TTCTTTACAGTGGTAGAAACCATTATGATCTGCTTCGCTAGACCTGAGATGATTGAAGTT
TTCTACTTCCTGTTGGAATCCATGATTCCAAATTTGTTTAAAAACTTTCAATGCAAAAAA
CATGAACATGTACCAGTTCTCCCTTCTCTGCTATAGGTGGATATTTCAATTGAATTTGGA
TTCGGTTC

QA 1 428 1 428
DS 

RD RS1B364JQ 411 0 0
AAACGGTACTGCCAGAGGATTGGAAGACACGATTTCTGGGGAGGGGAATTTGAGCTGCTT
GTTCTTTCCAAGCTATGTAAACAGCCAATCATCGTCTACATACCAGAGCATGAGCATAGG
AGAGGAGGAGGGTATGGGTCGGGGTTTATTCCGATTGCAGAGTATGGAGCTGAGTTTAGA
GGAGGCTGGGGAAAAGGGAACAAGACCAAGAATGTTGTTAGGCTTCTTTACAGTGGTAGA
AACCATTATGATTTGCTTCGCTAGACCTGAGATGATTGAAGTTTTCTACTTCCTGTTGGA
ATCCATGATTCCAAATTTGTTTAAAAACTTTCAATGCAAAAAACATGAACATGTACCAGT
TCTCCCTTTTCTGCTATAGGTGGATATTTCAATTGAATTTGGATTCGGTTC

QA 1 411 1 411
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5198Contig1 399 2 1 U
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ATACCCTGGAGGTGCATTTGACCCTCTTGGATACTCCAAAGACCCCAAGAAGTTTGAGGA
GTTGAAAGTTAAGGAGATCAAGAACGGGAGGCTTGCGTTGTTGGCCTTTGTAGGCTTCTG
TGTGCAGCAATCGGCTTACCCAGGGACAGGACCATTGGAGAACTTGGCTACTCACTTGGC
GGATCCATGGCACAAAAACATTGGCGATATTGTTATCCCTCTGAACTAGTGACTTGTAAA
AAAAATGGTAGTAATGTGTCCTATGAGCTGCATGTGTATCAAAACTCTCTGTAATGAAAA
GACAGATTGTGAAACCTATGATGTTTTGTCTTGGTGAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1EI03JQ C 1
AF RS1EI03TF U 1
BS 1 399 RS1EI03TF

RD RS1EI03JQ 399 0 0
GGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGGAGAAAGACCCTGAGAAAAAGAA
ATACCCTGGAGGTGCATTTGACCCTCTTGGATACTCCAAAGACCCCAAGAAGTTTGAGGA
GTTGAAAGTTAAGGAGATCAAGAACGGGAGGCTTGCGTTGTTGGCCTTTGTAGGCTTCTG
TGTGCAGCAATCGGCTTACCCAGGGACAGGACCATTGGAGAACTTGGCTACTCACTTGGC
GGATCCATGGCACAAAAACATTGGCGATATTGTTATCCCTCTGAACTAGTGACTTGTAAA
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GACAGATTGTGAAACCTATGATGTTTTGTCTTGGTGAGC

QA 1 399 1 399
DS 

RD RS1EI03TF 399 0 0
GGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGGAGAAAGACCCTGAGAAAAAGAA
ATACCCTGGAGGTGCATTTGACCCTCTTGGATACTCCAAAGACCCCAAGAAGTTTGAGGA
GTTGAAAGTTAAGGAGATCAAGAACGGGAGGCTTGCGTTGTTGGCCTTTGTAGGCTTCTG
TGTGCAGCAATCGGCTTACCCAGGGACAGGACCATTGGAGAACTTGGCTACTCACTTGGC
GGATCCATGGCACAAAAACATTGGCGATATTGTTATCCCTCTGAACTAGTGACTTGTAAA
AAAAATGGTAGTAATGTGTCCTATGAGCTGCATGTGTATCAAAACTCTCTGTAATGAAAA
GACAGATTGTGAAACCTATGATGTTTTGTCTTGGTGAGC

QA 1 399 1 399
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5200Contig1 1008 2 4 U
AGCTTTTCTAAGATAAACCAATTGAAGAAGAAACCACGTTTTCCCCGAATCTCAGCTTTC
TCGTTTTGTTGTGTGAAAGATTATGACAGGAGGAGGAGCCATGTCTCTTTTATCGAAACT
ACGGTGTATCACGGTAGATGTTACCGGTACACTCATAGCTTACAAAGGAGAGCTTGGTGA
TTACTATTGTATGGCTGCTAAAGCCATTGGCTTGCCTTGTCCTGATTACAAACGAGTCCA
TGAAGGTTTCAAACTTGCTTATACTGACATGGCTCGAAAGTATCCCTGTTTCGGTTTCTC
CGCCAAAATACCAAACGTTGTCTGGTGGAAAACCGTTGTCAGAGATTCATTTGTCAAGGC
AGGATATGAGTATGATGAGGAGACGTTTGAGAAAGTGTTTAGACGAATCTATTCGACGTT
TGGTTCTGCTGCACCTTACTCTGTCTTTCAAGATTCTCAACCCTTCTTGAGATGGGCGCC
AGAAAGTTCTTATTGTTGGACTTGTTAGCAACGCTGAGTATCGATATCAAGAAGTTATTT
TACCTGCCTTGGGTTTGAACAAGGGTGAGTGGGATTTTGGTGTGTTCTCTGGTGTTGAAG
GGGTGGAGAAACCAGATCCGAGGATTTACAAGCTGGCGTTAGAGAGAGCTGGGAACATTG
CTCCTGAAGAGGCTTTGCATATTGGAGATAGTATGCGTAAAGATTATGTTCCGGCAAAGA
GTATTGGGATGCATGCTTTGTTGCTTGATAGGTTTAAGACTGAAGCTGCTAAAGACTGGA
GGGATGCTGGAGCTATTGTGCTTCCTGATTTGGTTTCTGTTCAACAGCTTTTGGAGTCTG
ATAAGTTGAAATGTTGAAAAGAAAGAGACCAGTATGGATTTGATGTATTGTAGTATTGCA
CATTCTGTGCCCTTTCTTCCTATTCTCTTAGTTCTTATGAGTAGAAAGAGTTTTTATAAC
AAGGTGAACTAGGTGATTTTTCCGTGCTCATGCACGGGTATAAATATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D542TF U 1
AF RS1D542JQ C 434
BS 1 671 RS1D542TF
BS 672 672 RS1D542JQ
BS 673 710 RS1D542TF
BS 711 1008 RS1D542JQ

RD RS1D542TF 710 0 0
AGCTTTTCTAAGATAAACCAATTGAAGAAGAAACCACGTTTTCCCCGAATCTCAGCTTTC
TCGTTTTGTTGTGTGAAAGATTATGACAGGAGGAGGAGCCATGTCTCTTTTATCGAAACT
ACGGTGTATCACGGTAGATGTTACCGGTACACTCATAGCTTACAAAGGAGAGCTTGGTGA
TTACTATTGTATGGCTGCTAAAGCCATTGGCTTGCCTTGTCCTGATTACAAACGAGTCCA
TGAAGGTTTCAAACTTGCTTATACTGACATGGCTCGAAAGTATCCCTGTTTCGGTTTCTC
CGCCAAAATACCAAACGTTGTCTGGTGGAAAACCGTTGTCAGAGATTCATTTGTCAAGGC
AGGATATGAGTATGATGAGGAGACGTTTGAGAAAGTGTTTAGACGAATCTATTCGACGTT
TGGTTCTGCTGCACCTTACTCTGTCTTTCAAGATTCTCAACCCTTCTTGAGATGGGCGCC
AGAAAGTTCTTATTGTTGGACTTGTTAGCAACGCTGAGTATCGATATCAAGAAGTTATTT
TACCTGCCTTGGGTTTGAACAAGGGTGAGTGGGATTTTGGTGTGTTCTCTGGTGTTGAAG
GGGTGGAGAAACCAGATCCGAGGATTTACAAGCTGGCGTTAGAGAGAGCTGGGAACATTG
CTCCTGAAGAG*CTTTGCATATTGGAGATAGTATGCGTAAAGATTATGTT

QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1D542JQ 575 0 0
CCTTACTCTGTCTTTCAAGATTCTCAACCCTTCTTGAGATGGGCGCCAGAAAGTTTTTAT
TGTTGGACTTGTTAGCAACGCTGAGTATCGATATCAAGAAGTTATTTTACCTGCCTTGGG
TTTGAACAAGGGTGAGTGGGATTTTGGTGTGTTTTCTGGTGTTGAAGGGGTGGAGAAACC
AGATCCGAGGATTTACAAGCTGGCGTTAGAGAGAGCTGGGAACATTGCTCCTGAAGAGGC
TTTGCATATTGGAGATAGTATGCGTAAAGATTATGTTCCGGCAAAGAGTATTGGGATGCA
TGCTTTGTTGCTTGATAGGTTTAAGACTGAAGCTGCTAAAGACTGGAGGGATGCTGGAGC
TATTGTGCTTCCTGATTTGGTTTCTGTTCAACAGCTTTTGGAGTCTGATAAGTTGAAATG
TTGAAAAGAAAGAGACCAGTATGGATTTGATGTATTGTAGTATTGCACATTCTGTGCCCT
TTCTTCCTATTCTCTTAGTTCTTATGAGTAGAAAGAGTTTTTATAACAAGGTGAACTAGG
TGATTTTTCCGTGCTCATGCACGGGTATAAATATT

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 2

CO CL5201Contig1 459 2 2 U
GAGAGAGAAAAAAAACGAAGAAAAAGCACAGAGCGAGGACACAAAGAATCATAGAAAGCA
TAAGATGAAGAGAATTCCTCGTATCAAATTTCCTAAGAGACACTCTTCTTCTTCCTCCTC
TGCTATTTCCTCAGGTACTGGACCGAGGTCGGGATCTGTTGCCGGCGGCGAGAAAAATGT
GACGGCGAGTTCAGATGTCCCGGCGGCTCCGAAGAACACTGCTGATGGAGGAAAAGCATC
TTTGCAGCCGAAACGCACACCTGTCTCCGACAAGGAAATCGAGTCTATAATGTTGGGAGG
TTGCATCTGACATTTGAAGATCTGATCTTGGAGCTCCTGTCTTTTTCTGCTGGTGAAGTT
CATTATGCTTTGTTCTTTTTAATGTAAAGAAAGAACTAATAATGTAAGAGGGATAGTTTT
ATATGAATGATGCTCTCCGTTGTCCGAAAAGAGAGTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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BQ
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BQ
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QA 1 401 1 401
DS 

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ATGATCATCTTACAATAATATCATCTTTATGTCTCTTTCTTGTTTTATCCAAATCTTTTT
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TTAAAATATGTAATAAAAATAAATAAATATAGTTTTTAATT

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DS 



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TTTTGTATAAGTAACTAAATCCTTTTATCGTTGGGGTTTTGTATTTTCATTGGCAATAAA
ATTATAAATGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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ATTATAAATGT

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QA 1 400 1 400
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TAAAAAATTGTTTAATTTTCTGGGTTCCTATTTAATTCTCAGAACAGTTTTG

QA 1 592 1 592
DS 



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AAATTTTTGTAGGCTCCATCATCAAGAACTTTGATCACATTTAATAAAAAATATTTTTAA
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BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1F816TF U 1
AF RS1F816JQ C 415
BS 1 677 RS1F816TF
BS 678 678 RS1F816JQ
BS 679 743 RS1F816TF
BS 744 744 RS1F816JQ
BS 745 818 RS1F816TF
BS 819 1086 RS1F816JQ

RD RS1F816TF 824 0 0
TTTTTGATGATTAAATCCATCAAATAACATGTATTAAGTCTGAAAATCAATCATATTAAA
ACCAAATACATCAATCGGATACATCTACATTCTCGTCATCACTAGAAACATCATCATCTT
CGTTAAACTTGTCTTCAACGGCTTTGTCTGTGGCATCGTCGGTAAGATCTTCGTACTCAT
GATTATGCGGATCAATGAGAAGAATGTCATCAATTTCTTGTTCAGGTTCCTTGACTTCAT
TTATCTATTCTTCTTGTAATGGTGGTTCTTCTCCACTAATGATTCGTCCTCGAGGTGTAA
CTTTGATCACGGATAACCAAAGCCACGTAAAAAAACGTGCTTCATAATTTTGTCGTTAAA
GCCACATAAACATTTTCCTCGTAAAGTAGACGCGAAACTTACGTCGAGTTTACGAGGATA
CTAGCTTTCCTCGTTAAAACCACGCAAACTTATGTTTCCTTTACGAAAAAAACATTTCCT
CGTTAATTTACGACGCTATAACATTTATTTTATGTTTCTTCGTAAATTTCTCGTAATTGC
AACGTAAAATTACGAAGTTCCTTTTTCTTCGAAGTTTTTTCGCTAAAATGCTATTTTCTT
GTAGTGGTGGTTGATAGTTTCGTTTTCAGCTCCGCAGCGAGGACAGTTGCTTTCAGTAAT
GGTTGTGATCAGATTAG*TGGTGAGACTGATAACATCGAGAAGACACTAACTGTTTCTCT
TTTGGATCCAACAACGTCTAAAA*GAGCATCACAGCATCTGATCCATTAGCTTCAATCAC
TTGGGTTGATGTATGTATGGCTCTGCTCCAGTCTCTTT
CACTTC

QA 1 818 1 818
DS 

RD RS1F816JQ 672 0 0
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TTTCCTCGTTAATTTACGACGCTATAACATTTATTTTATGTTTCTTCGTAAATTTCTCGT
AATTGCAACGTAAAATTACGAAGTTCCTTTTTCTTCGAAGTTTTTTCGCTAAAATGCTAT
TTTCTTGTAGTGGTGGTTGATAGTTTCGTTTTCAGCTCCGCAGCGAGGACAGTTGCTTTC
AGTAATGGTTGTGATCAGATTAGGTGGTGAGACTGATAACATCGAGAAGACACTAACTGT
TTCTCTTTTGGATCCAACAACGTCTAAAAAGAGCATCACAGCATCTGATCCATTAGCTTC
AATCACTTGGGTTGATGTATGTATGGCTCTGCTCCAGTCTCTTTTCACTTCAGTTGATTC
TTGATTAAATTTTTGTAGGCTCCATCATCAAGAACTTTGATCACATTTAATAAAAAATAT
TTTTAAAAAATCATTAATTAAGAAATTCTCATTGGACCATTTAAAATGAGAGTTTCTTAA
CTAAAGTTCTTAGATTATTTTTATTAATTAAAAATTCATTAAGAAATCCATTAGGGGCGA
TAGGGATAATCATGCTCTAAATAAGATATAAATGAAACGATCACAACATTTTCCTTTAAA
ATCTCCATACGC

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

CO CL5210Contig1 743 2 3 U
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GGGAACAAAGAAGGGATAGAATGCGATTCAGACGACTCATCATGGACTTCAGGACATGAT
TTTGGCAGACCGAACATAAAAGCTGTCAACAACCTTCCCCACGTTTGCAATGGTGTCAAG
AGTAGCCGAATAAATAGCATCCGCCTTCGGATCCTCGAATATGATGAGACACCCAGCTCC
CTGATCCAACGTACCTGCGAACTTCTTGTCAAGAATCATCTGAAAGTGATCTGGAAATCA
GTCGTTCCGGGTATCTTGGCCACGGCGTCGATGATCCTTCTGACGATTTTCGCGGTCTTG
GCCTTGGGGATCAGGGAGAAGAAAGGTCGAAGCTTGGTTAGCAGCGTCCGGAGATCCTCG
CCTCTCTTCTCTTCGGTGAGGCGATCGCAGAGGTTGGTGATGGCTTGCTCCTTGATGCGT
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GTTGTCTGTTTATACAAAACTCAAAATCTCCTTGTGAATCGGCAGATTCGTCGTTTCTGG
GTAAAAGCCTTGGACGACGGTCC


BQ
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AF RS1EK83JQ U 157
AF RS1EK83TF C 1
BS 1 156 RS1EK83TF
BS 157 440 RS1EK83JQ
BS 441 743 RS1EK83TF

RD RS1EK83JQ 288 0 0
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CCCCACGTTTGCAATGGTGTCAAGAGTAGCCGAATAAATAGCATCCGCCTTCGGATCCTC
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CATCTGAAAGTGATCTGGAAATCAGTCGTTCCGGGTATCTTGGCCACGGCGTCGATGATC
CTTCTGACGATTTTCGCGGTCTTGGCCTTGGGGATCAGGGAGAA
AAAA

QA 1 284 1 284
DS 

RD RS1EK83TF 743 0 0
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AATCCATACCGTTTACTTTCAGTTTCTCCGATTCCAAACGATAACTAAAAACCAAAAAAA
GGGAACAAAGAAGGGATAGAATGCGATTCAGACGACTCATCATGGACTTCAGGACATGAT
TTTGGCAGACCGAACATAAAAGCTGTCAACAACCTTCCCCACGTTTGCAATGGTGTCAAG
AGTAGCCGAGTAGATAGCATCCGCCTTCGGATCCTCGAATATGATGAGACACCCAGCTCC
CTGATCCAACGTACCTGCGAACTTCTTGTCAAGAATCATCTGAGAGTGATCTGGAGATCA
GTCGTTCCGGGTATCTTGGCCACGGCGTCGATGATCCTTCTGACGATTTTCGCGGTCTTG
GCCTTGGGGATCAGGGAGAAGAAAGGTCGAAGCTTGGTTAGCAGCGTCCGGAGATCCTCG
CCTCTCTTCTCTTCGGTGAGGCGATCGCAGAGGTTGGTGATGGCTTGCTCCTTGATGCGT
AGAGCCTCCGGAGATGAAGAAGGGTCTTCCAAGACTTGGTACAGTATCTGAATAGCCTCA
GAGCTGTTGGCTTCTTGAGCCAGGGAGATCGTCTCGGTTGTAGCGGGATACGAAACCATT
GTTGTCTGTTTATACAAAACTCAAAATCTCCTTGTGAATCGGCAGATTCGTCGTTTCTGG
GTAAAAGCCTTGGACGACGGTCC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5212Contig1 1003 2 2 U
GGGTCTTCTTCTTACAAAAACTTTTGTCTGCAGTTAGCCGTGAGCGCAGAGGAAAAATTG
CTTTTTTCTTCCCTTTTTATCAGATGATAGGAGGAAGGGAACAACACATCAGAAGATTCC
AATTCCGCAGAAATCAATCTCAGATTCGCCTCTTTTCTCTCTCTGCTCCGTCGTCTTCTA
GGGTTTCCTGATGCATGAGTTCTCTACTGTTGATGGTTTTGCGGAGATAAACGAGAGCTT
AGCCGAGATGATTAAGTACATTGCTAACGAACCCTCTGTGGGGCTTTACTACATCCAGCA
GCACGTCCGCAACGCAGCACCCAACGTCCTCAACCTCAACGCCCAAGTCTTGGACAAGTC
CCGTGAAACTGCTCTCCATACCGAAGACTCGGAAGAGTCTATCGCCATGGTGAAATCGAC
GAAAGAGTGTGGTTCTCCTATAGCTGATGGGATGATAGGAGACATCAAGAGCTCCTTAGC
GTTAATGTCCTCGAAACAACCGAGGAGAGGGCTCATCCTCAACGCCGGGAGCTCCTGGAG
CAGCAGATCCAACAGCAGTATAGCAACACCAACAACAACAGTGCGTGGTTCTGAATATAG
TCAGGACACTAGCGAAAGCGGCAGCTATTTCACATCGGTGTTCAAGTCGGCTAAGGAGAA
GGCAAGCAATATCAAATGGCCACAGCTTGACTTCAAAGAACAGAAGGTGGAGACTATCCC
CAACGTGGAAAGCAATGAGTCAGAAGAAGAAAAAGAAGAAGAAGAAGTTTTAAGCAAAGG
TGAACAACATATGGTGGAGAAGACAAAGTTTGAGGAGTTTAAGGCTGGTAAAGAAGCGAG
TCTTAAGGCATGGCTTGGAGATATGGATGAAGATGCAGATGTTAGTGGACGTGCTACTGA
GAGGATTTAAGTGTTTTGTATAATGGTGCTGATGGAGACACGGAAGAAGCAGAGCTCATG
TGTAATTTTCATAATTAAGTTAAATAGAACATGTTATACTACC


BQ
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AGA

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DS 

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GAAGATGCAGATGTTAGTGGACGTGCTACTGAGAGGATTTAAGTGTTTTGTATAATGGTG
CTGATGGAGACACGGAAGAAGCAGAGCTCATGTGTAATTTTCATAATTAAGTTAAATAGA
ACATGTTATACTACC

QA 1 615 1 615
DS 



AS 1 2

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GTACTACTGGGCAACACCAGTGGCATGGACGTTGTACGGGATAATCACATCTCAAGTAGG
AGACAAAGATGCGACGGTGCAGATCGCTGGTGTTGGAGACACGAGCCTCAGAACGTTGCT
GAAAGATGGGTTCGGGTTCGAACATGACTTCTTGCCAGTTGTAGCTGCTGTCCACATCGG
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AAGGTGATGATGGAGAGGAGAATAAGAATAATAACATTTGTAGCATAGTGTGTTTTGGAC
GTTGTTGAAATTCTTGTAAATTTTCTTATTTTATCATATTGGTTTTATTTGGTCAGTC


BQ
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AGCAATAGCCATTGAGAGAACTGTGTTCTACCGTGAGAAAGCAGCTGGAATGTACTCAGC
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TGTGGCCTTGACACCAAACTATCAAATAGCTGG

QA 1 693 1 693
DS 

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TACCCTATGCAATCTCTCAGGTGGCGGTGGAAATCATGTACAACACGATACAAACAGCAG
TCTACACGTTAATCCTTTACTCGATGATTGGATATGACTGGACCGTGGCCAGGTTCTTGT
GGTTCTACTACTATATGTTGACAAGCTTTATTTACTTCACTCTATACGGTATGATGCTTG
TGGCCTTGACACCAAACTATCAAATAGCTGGGATTTACATGTCCTTCTTCCTCAGTTTCT
GGAATTTTTTTTCCGGTTTCCTCATCCCAAGACCGCAAATACCGATATGGTGGAGATGGT
ACTACTGGGCAACACCAGTGGCATGGACGTTGTACGGGATAATCACATCTCAAGTAGGAG
ACAAAGATGCGACGGTGCAGATCGCTGGTGTTGGAGACACGAGCCTCAGAACGTTGCTGA
AAGATGGGTTCGGGTTCGAACATGACTTCTTGCCAGTTGTAGCTGCTGTCCACATCGGAT
GGATACTGCTGTTTGTCTTTGTCTTTGCTTATGGAATCAAGTTCCTCAACTTTCAAAGAA
GGTGATGATGGAGAGGAGAATAAGAATAATAACATTTGTAGCATAGTGTGTTTTGGACGT
TGTTGAAATTCTTGTAAATTTTCTTATTTTATCATATTGGTTTTATTTGGTCAGTC

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

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ATTAAGAAGATCGTTTTTTCAGTTTTAACATTTGTCTCTTTCTTTTTTTCTCGTTCGATC
TTTCATCGGCTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGCTTTGAGTTTGAGTTCGCG
TGGCTTTGTGAGAGCATCAACATGACTTTTCAACTTTGTCTTTTTTTATTTACAAAATTA
AATTGTTTTTAAAGCGCGTGTCCCCTTGTTTTGGCCCATAATAAATTCTAATAAATTTAG
GAAAGAAAAAGGACATAAAAATAATATTCAACGATAACAGTGAATAAGATCAACAATTTT
CGCTGTAAAAAAAATAATGCGATTAATTTAGATTTGGG


BQ
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AF RS1GY62JQ C 1
AF RS1GY62TF U 1
BS 1 398 RS1GY62TF

RD RS1GY62JQ 398 0 0
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ATTAAGAAGATCGTTTTTTCAGTTTTAACATTTGTCTCTTTCTTTTTTTCTCGTTCGATC
TTTCATCGGCTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGCTTTGAGTTTGAGTTCGCG
TGGCTTTGTGAGAGCATCAACATGACTTTTCAACTTTGTCTTTTTTTATTTACAAAATTA
AATTGTTTTTAAAGCGCGTGTCCCCTTGTTTTGGCCCATAATAAATTCTAATAAATTTAG
GAAAGAAAAAGGACATAAAAATAATATTCAACGATAACAGTGAATAAGATCAACAATTTT
CGCTGTAAAAAAAATAATGCGATTAATTTAGATTTGGG

QA 1 398 1 398
DS 

RD RS1GY62TF 398 0 0
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ATTAAGAAGATCGTTTTTTCAGTTTTAACATTTGTCTCTTTCTTTTTTTCTCGTTCGATC
TTTCATCGGCTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGCTTTGAGTTTGAGTTCGCG
TGGCTTTGTGAGAGCATCAACATGACTTTTCAACTTTGTCTTTTTTTATTTACAAAATTA
AATTGTTTTTAAAGCGCGTGTCCCCTTGTTTTGGCCCATAATAAATTCTAATAAATTTAG
GAAAGAAAAAGGACATAAAAATAATATTCAACGATAACAGTGAATAAGATCAACAATTTT
CGCTGTAAAAAAAATAATGCGATTAATTTAGATTTGGG

QA 1 398 1 398
DS 



AS 1 2

CO CL5215Contig1 1156 2 10 U
GGAATTCAGAGGAAATCTTAGCTGTACAGTACTTCTGTCTCTCCCTTTCTTCATCAAAAG
ACGAGAGATTAAAAAAAAAAAGGACAAAACTTTTAAAGGAATCTCCTCCCCTCAGTTCGA
GAAACCACGAAAGGGTTTTACTTTGATTCAGTTCTTGTTCTCGAAAGTCTTCTCTGCTTT
TGTTGTCTTTTTGGACAATACTTTGGTCTTTGGTCTGAAGCAATGCAGTTATATCATCAT
CCATACTCGTTAGACAGCCAGAGAGTGAGACTAGCTTTGGAAGAGAAGGGCATTGATTAC
ACATCATACCATGTGAATCCCATCACAGGCAAGCACATGGACTCTTCCTTCTTCAGGATG
AATCCCAGCGCCAAACTTCCCGTTTTCAGGAACGGTTCTCACATCATTTTGGACACTATT
GAGATCATAGAATACTTGGAGAGAATAGCTGAGGTGTCTTCTGGTGTAGAGGATGCTACT
TTCGGTAGAGAAGTACTTGAATGGATGCGGAAGATCAGAGAATGGGACTCCAAGCTTTTC
ACACTTGCTCACATCCCTGATAATCGCCGCCTCTACGTTTCCAAGTTCTTGAGGATGGTT
ATGATTGCGCGGATGGCCGAGTCTCCGGACTTGGCCAGTGCTTACCATAGGAAGCTAAGG
GAAGCTTACGAGACAGAGGACAAACTAAAAGACCCTGAAGCCTTGAGGAGAAGCAAAGAC
CATTTGCTCAGGCTTCTTGATGAGGTTGAGAGCAGGCTAGAGGGGACGAGTTATGTGGCA
GGGAATGAGTTTAGCATGGCTGATGTGATGCTAGTGCCTGTGCTGGCTCGGTTGTCGCTG
CTGGATTTGGAAGAGGAGTGTATAAGTAGCAGGAAGAATCTTGCTGAGTATTGGGTGGTT
GTGAGGAGTAGACCAAGCTACAAGAAGGTTATTGGAAGGTACTTTAGTGGCTGGAGAAAA
TATGCAACACTTTTGAAGACTTGGATGTTTGTTAGAGTCAGAAGCTTGCTCAGAAAATAT
TGAAGATTTGGTCTCTTTTGTTTTTGTATTTCCCACTTTGAATGTTCATTTTACATCCCC
TATATATTAAAGGAGAAGCATTTTTAAGGCTTTCCTTAAACGATTTTGGTGAGAATGCAT
GAGAAGGCTCTATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EN13TF U 1
AF RS1EN13JQ C 516
BS 1 731 RS1EN13TF
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BS 778 1156 RS1EN13JQ

RD RS1EN13TF 777 0 0
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ACGAGAGATTAAAAAAAAAAAGGACAAAACTTTTAAAGGAATCTCCTCCCCTCAGTTCGA
GAAACCACGAAAGGGTTTTACTTTGATTCAGTTCTTGTTCTCGAAAGTCTTCTCTGCTTT
TGTTGTCTTTTTGGACAATACTTTGGTCTTTGGTCTGAAGCAATGCAGTTATATCATCAT
CCATACTCGTTAGACAGCCAGAGAGTGAGACTAGCTTTGGAAGAGAAGGGCATTGATTAC
ACATCATACCATGTGAATCCCATCACAGGCAAGCACATGGACTCTTCCTTCTTCAGGATG
AATCCCAGCGCCAAACTTCCCGTTTTCAGGAACGGTTCTCACATCATTTTGGACACTATT
GAGATCATAGAATACTTGGAGAGAATAGCTGAGGTGTCTTCTGGTGTAGAGGATGCTACT
TTCGGTAGAGAAGTACTTGAATGGATGCGGAAGATCAGAGAATGGGACTCCAAGCTTTTC
ACACTTGCTCACATCCCTGATAATCGCCGCCTCTACGTTTCCAAGTTCTTGAGGATGGTT
ATGATTGCGCGGATGGCCGAGTCTCCGGACTTGGCCAGTGCTTACCATAGGAAGCTAAGG
GAAGCTTACGAGACAGAGGACAAACTAAAAGACCCTGAAGCCTTGAGGAGAAGCAAAGAC
CATTTGCTCAG*CTTCTTGATGAGGT*GAGAGCAG*CTAGAGGG*ACGAGTTATGTG

QA 1 777 1 777
DS 

RD RS1EN13JQ 641 0 0
CAGAGAATGGGACTCCAAGCTTTTCACACTTGCTCACATCCCTGATAATCGCCGCCTCTA
CGTTTCCAAGTTCTTGAGGATGGTTATGATTGCGCGGATGGCCGAGTCTCCGGACTTGGC
CAGTGCTTACCATAGGAAGCTAAGGGAAGCTTACGAGACAGAGGACAAACTAAAAGACCC
TGAAGCCTTGAGGAGAAGCAAAGACCATTTGCTCAGGCTTCTTGATGAGGTTGAGAGCAG
GCTAGAGGGGACGAGTTATGTGGCAGGGAATGAGTTTAGCATGGCTGATGTGATGCTAGT
GCCTGTGCTGGCTCGGTTGTCGCTGCTGGATTTGGAAGAGGAGTGTATAAGTAGCAGGAA
GAATCTTGCTGAGTATTGGGTGGTTGTGAGGAGTAGACCAAGCTACAAGAAGGTTATTGG
AAGGTACTTTAGTGGCTGGAGAAAATATGCAACACTTTTGAAGACTTGGATGTTTGTTAG
AGTCAGAAGCTTGCTCAGAAAATATTGAAGATTTGGTCTCTTTTGTTTTTGTATTTCCCA
CTTTGAATGTTCATTTTACATCCCCTATATATTAAAGGAGAAGCATTTTTAAGGCTTTCC
TTAAACGATTTTGGTGAGAATGCATGAGAAGGCTCTATTTC

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

CO CL5216Contig1 775 2 2 U
CAAAGGCTGTGGTACCTGCAGTAGACGTTATGTTTCAAGCTCTCAGTGATTTTGGATCAA
AGATTATTCCACCCAAAAGGATTTTAAAGATGCTTCCGGAACTTTTCGACCACCAAGATC
AGAACGTCCGTGCATCTGCCAAAGGGGTAACTCTGGAGCTATGCCGTTGGATTGGAAAAG
ACCCTGTAAAATCTATTTTGTTTGAGAAAATGAGAGATACAATGAAAAAAGAGCTGGAGG
CTGAGCTTTGCCAATGTCTCGGTGGGTGCCAAGCCTGCTCGAAAGATAAGGTCTGAGCAA
GACAAAGAGCCAGAAGCAGAAGCTAGTTTTGATGTGGTGGGTGATAGGCCCAGTGAAGAA
CCTGTTGCTGATGCGCCTCAGGAAATAGATGAGTATGATTTTATGGATCCTGTGGATATT
TTGACTCCTTTGGAAAAGTTTGGGTTCTGGGAAGGAGTGAAAGCTACAAAGTGGTCAGAA
CGTAAGGAGGGGGTTGCAGAGCTAACAAAGCTTGCTTCAACAAAAAAGATAGCTCCTGGT
GATTTTTCAGAAATTTGTCGGACCTTAAAGAAGGTAGTTAACTTCCACGATAAGAAGTCC
AGGCGGCATTGATTATTATTTATATGTTATAATCCTTTGTATGTATTAGCTCCCTTGCAG
TAGTTTCTAACTGTTGCAGATGCATCCGGCAAACATATGTGCTTATTGATTAACCTGTAG
TTTGAAGTTCATGCGCTTTATTTAAACCCTCAAATAGGGAAAATGTTTTTTGATT


BQ
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AF RS1EW28TF U 1
AF RS1EW28JQ C 195
BS 1 321 RS1EW28TF
BS 322 775 RS1EW28JQ

RD RS1EW28TF 321 0 0
CAAAGGCTGTGGTACCTGCAGTAGACGTTATGTTTCAAGCTCTCAGTGATTTTGGATCAA
AGATTATTCCACCCAAAAGGATTTTAAAGATGCTTCCGGAACTTTTCGACCACCAAGATC
AGAACGTCCGTGCATCTGCCAAAGGGGTAACTCTGGAGCTATGCCGTTGGATTGGAAAAG
ACCCTGTAAAATCTATTTTGTTTGAGAAAATGAGAGATACAATGAAAAAAGAGCTGGAGG
CTGAGCTTTGCCAATGTCTCGGTGGGTGCCAAGCCTGCTCGAAAGATAAGGTCTGAGCAA
GACAAAGAGCCAGAAGCAGAA

QA 1 321 1 321
DS 

RD RS1EW28JQ 581 0 0
ATTTTGTTTGAGAAAATGAGAGATACAATGAAAAAAGAGCTGGAGGCTGAGCTT*GCCAA
TGTCTCGGTGGGTGCCAAGCCTGCTCGAAAGATAAGGTTTGAGCAAGACAAAGAGCCAGA
AGCAGAAGCTAGTTTTGATGTGGTGGGTGATAGGCCCAGTGAAGAACCTGTTGCTGATGC
GCCTCAGGAAATAGATGAGTATGATTTTATGGATCCTGTGGATATTTTGACTCCTTTGGA
AAAGTTTGGGTTCTGGGAAGGAGTGAAAGCTACAAAGTGGTCAGAACGTAAGGAGGGGGT
TGCAGAGCTAACAAAGCTTGCTTCAACAAAAAAGATAGCTCCTGGTGATTTTTCAGAAAT
TTGTCGGACCTTAAAGAAGGTAGTTAACTTCCACGATAAGAAGTCCAGGCGGCATTGATT
ATTATTTATATGTTATAATCCTTTGTATGTATTAGCTCCCTTGCAGTAGTTTCTAACTGT
TGCAGATGCATCCGGCAAACATATGTGCTTATTGATTAACCTGTAGTTTGAAGTTCATGC
GCTTTATTTAAACCCTCAAATAGGGAAAATGTTTTTTGATT

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

CO CL5217Contig1 1148 2 2 U
GCTGGGCAAAGCAGGAAGGCTTGCCTTGCTTGGAAACAGTGTCTGTTAATTGCACGTCTT
TGAGCAAAACAACAGATATATTCTCCAAGATACTTGGTGAAGACAAGACAGGGAAGAAAG
CTATTGGCTCCTCTTCACCTCTAGAGCAACTTCAGATTATGTTTTCTCAAAAGCAACAAT
CACCCAGCTCAAAGATGATGCTAGTTATTGCAGATGAGATGGACTACTTGATCACAAAAG
ATCGTGGTGTCCTTCACGAGCTTTTTATGCTCACAACTTTGCCATTTTCAAGATGTATAC
TTATAGGTGTAGCAAACGCAATAGACCTCGCAGATCGTTTCCTTCCAAAATTGAAGTCTC
TTAATTGCAAACCTTTGGTTGTCACTTTCCCTGCCTATTCTATGCAACAGATCCTAAGGA
TACTTCAGGAGAGGCTTGTGGAACTTCCATATGTTGCATTTCAACCAAAAGCCTTGGAGC
TTTGTGCCAGAAAAGTATCAGCTGCATCAGGAGACATGAGAAAGGCTCTATCTGTCTGCA
GGAGTGCTTTAGAAATCTTAGAAACAGAAGTTAAAGGATCAACAGATAACGAGCCACAAA
CTCCAGTTACAGAGGATCAAGTGGTCAAGATGGATCATATGCTAGCAGTGGCCAAAACCT
TCAAATCTCCAGTTGTTGACACCATTCAGGCCCTTCCTCAACACCAGCAAATCATAGTTT
GTTCTGCTGCAAAGGCCTTTAGAGGAAGCAAAAAGGACAGAACCATAGCAGAGTTAAATA
AGTTATACTTGGAAATCTGTAAATCGTCGATGATCACTCCAGCTGGAATAACAGAGTTCA
CCAACATGTGTACGGTGCTAAACGACCAGGGGATTGTAAAACTAAGTCAGGCTCGGAACG
ATAAGTTAAAGAGAGTGAGCCTAAGAGTAGATGAAGCAGACATTACATTTGCTCTTAAGG
AAATTCGATTCTTCCGCAACTGTCTTCTGTGATGAAGTTTTTGAAGATGGGTTTCTTCAT
TTTTTTTTACAGAGTACAAGAGAGTAAAAAACTCAGTACTCTCATAGACTGTATTCTTCT
GTTATGTAAATGAACAAAAACAAAATGTATTTAATACATTTTACTATTAAGAGCAAAGTT
TAAAGACC


BQ
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AF RS1GA80TF U 1
AF RS1GA80JQ C 527
BS 1 644 RS1GA80TF
BS 645 1148 RS1GA80JQ

RD RS1GA80TF 644 0 0
GCTGGGCAAAGCAGGAAGGCTTGCCTTGCTTGGAAACAGTGTCTGTTAATTGCACGTCTT
TGAGCAAAACAACAGATATATTCTCCAAGATACTTGGTGAAGACAAGACAGGGAAGAAAG
CTATTGGCTCCTCTTCACCTCTAGAGCAACTTCAGATTATGTTTTCTCAAAAGCAACAAT
CACCCAGCTCAAAGATGATGCTAGTTATTGCAGATGAGATGGACTACTTGATCACAAAAG
ATCGTGGTGTCCTTCACGAGCTTTTTATGCTCACAACTTTGCCATTTTCAAGATGTATAC
TTATAGGTGTAGCAAACGCAATAGACCTCGCAGATCGTTTCCTTCCAAAATTGAAGTCTC
TTAATTGCAAACCTTTGGTTGTCACTTTCCCTGCCTATTCTATGCAACAGATCCTAAGGA
TACTTCAGGAGAGGCTTGTGGAACTTCCATATGTTGCATTTCAACCAAAAGCCTTGGAGC
TTTGTGCCAGAAAAGTATCAGCTGCATCAGGAGACATGAGAAAGGCTCTATCTGTCTGCA
GGAGTGCTTTAGAAATCTTAGAAACAGAAGTTAAAGGATCAACAGATAACGAGCCACAAA
CTCCAGTTACAGAGGATCAAGTGGTCAAGATGGATCATATGCTA

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1GA80JQ 622 0 0
TCTATCTGTCTGCAGGAGTGCTTTAGAAATCTTAGAAACAGAAGTTAAAGGATCAACAGA
TAACGAGCCACAAACTCCAGTTACAGAGGATCAAGTGGTCAAGATGGATCATATGCTAGC
AGTGGCCAAAACCTTCAAATCTCCAGTTGTTGACACCATTCAGGCCCTTCCTCAACACCA
GCAAATCATAGTTTGTTCTGCTGCAAAGGCCTTTAGAGGAAGCAAAAAGGACAGAACCAT
AGCAGAGTTAAATAAGTTATACTTGGAAATCTGTAAATCGTCGATGATCACTCCAGCTGG
AATAACAGAGTTCACCAACATGTGTACGGTGCTAAACGACCAGGGGATTGTAAAACTAAG
TCAGGCTCGGAACGATAAGTTAAAGAGAGTGAGCCTAAGAGTAGATGAAGCAGACATTAC
ATTTGCTCTTAAGGAAATTCGATTCTTCCGCAACTGTCTTCTGTGATGAAGTTTTTGAAG
ATGGGTTTCTTCATTTTTTTTTACAGAGTACAAGAGAGTAAAAAACTCAGTACTCTCATA
GACTGTATTCTTCTGTTATGTAAATGAACAAAAACAAAATGTATTTAATACATTTTACTA
TTAAGAGCAAAGTTTAAAGACC

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 2

CO CL5218Contig1 900 2 2 U
GTGGCGTTTTCTGGCTGCTCACATGGTTGCAACCCCGAGGAAGAAGAAGAACTAACAAGA
ATGAGATATGCTTATCCATGGTGGAAGGAGAAAGTCATAGACTCTGAGGTGAAGAGGAAA
GAAGGCCTTTGCCCATTAACTCCTGAGGAAACTGCTCTCACGCTGACCGCGTTGGGTATT
GACCGTAATGTTCAAATATACATAGCTGCTGGAGAAATCTACGGTGGTGAAAGGCGGATG
AGGGCTTTAACAGACGCTTTTCCAAATGTGGTCCGGAAAGAAACCATACTGGAATCCTCT
GATCTGGATTTTTGCCGGAACCATTCATCTCAAATGGCTGCACTTGATTACCTAGTGGCT
GTTGAGAGCGACATATTTGTTCCAACCTATGATGGGAACATGGCGAGAGTGGTTGAAGGT
CACCGCAGGTTCTTGGGGTTTAAGAAGACAATTCAGCTGAATAGGAAGTTTCTAGTTAAG
CTGATAGATGAATATACCCAAGGATTGTTGACTTGGGATGTGTTCTCATCCATGGTGAAG
GCGTTCCACTCTACTCGAATGGGAAGTCCGAAGAGACGGTTAGCGATTCCAAATAAACCG
AAGGAGGAAGACTACTTCTACTCCAACCCGCAAGAATGTCTGCAGCTGTTAGATGAACCA
CTGAGAGCAATTTGATGGAGGTGACTTCACACCATTACAGTCTTAACGATGGAGTTACCG
TGAGTTTTTTATTTATTTATTACGGGTTTGAGTTACTTAGAGTTCTTGGTGAATAGATTT
ATGTATGAGCTTCCATGGATGGAGAGAGAGAAAATGATGTTGATTGGAGCTTACATTGTA
AAGTTTGGCATCCATGGCCTTGCCAGTTTTGTTAGCTAAATAAAAAGTGCCATTTTATGT


BQ
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AF RS1EL67TF U 1
AF RS1EL67JQ C 309
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BS 579 900 RS1EL67JQ

RD RS1EL67TF 583 0 0
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ATGAGATATGCTTATCCATGGTGGAAGGAGAAAGTCATAGACTCTGAGGTGAAGAGGAAA
GAAGGCCTTTGCCCATTAACTCCTGAGGAAACTGCTCTCACGCTGACCGCGTTGGGTATT
GACCGTAATGTTCAAATATACATAGCTGCTGGAGAAATCTACGGTGGTGAAAGGCGGATG
AGGGCTTTAACAGACGCTTTTCCAAATGTGGTCCGGAAAGAAACCATACTGGAATCCTCT
GATCTGGATTTTTGCCGGAACCATTCATCTCAAATGGCTGCACTTGATTACCTAGTGGCT
GTTGAGAGCGACATATTTGTTCCAACCTATGATGGGAACATGGCGAGAGTGGTTGAAGGT
CACCGCAGGTTCTTGGGGTTTAAGAAGACAATTCAGCTGAATAGGAAGTTTCTAGTTAAG
CTGATAGATGAATATACCCAAGGATTGTTGACTTGGGATGTGTTCTCATCCATGGTGAAG
GCGTTCCACTCTACTCGAATGGGAAGTCCGAAGAGACG
TTAGC

QA 1 578 1 578
DS 

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CGACATATTTGTTCCAACCTATGATGGGAACATGGCGAGAGTGGTTGAAGGTCACCGCAG
GTTCTTGGGGTTTAAGAAGACAATTCAGCTGAATAGGAAGTTTCTAGTTAAGCTGATAGA
TGAATATACCCAAGGATTGTTGACTTGGGATGTGTTTTCATCCATGGTGAAGGCGTTCCA
CTCTACTCGAATGGGAAGTCCGAAGAGACGGTTAGCGATTCCAAATAAACCGAAGGAGGA
AGACTACTTCTACTCCAACCCGCAAGAATGTCTGCAGCTGTTAGATGAACCACTGAGAGC
AATTTGATGGAGGTGACTTCACACCATTACAGTCTTAACGATGGAGTTACCGTGAGTTTT
TTATTTATTTATTACGGGTTTGAGTTACTTAGAGTTCTTGGTGAATAGATTTATGTATGA
GCTTCCATGGATGGAGAGAGAGAAAATGATGTTGATTGGAGCTTACATTGTAAAGTTTGG
CATCCATGGCCTTGCCAGTTTTGTTAGCTAAATAAAAAGTGCCATTTTATGT

QA 1 592 1 592
DS 



AS 1 2

CO CL5219Contig1 267 2 1 U
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AGGAGGAGATGTGAAACGGTTATATCATTTGACTTTGGTTTCGATTGGCTTACAGAAGCA
GATGCTGGTGTTTGTTGAGATTTCAGATTTTATTTCCTCAGTTTTCAGAGCTTCTCTTTA
CTCAGACTGGTTCCATTGGTTCCTGTAATAAAATCGACCCTGTATAGTTTTCTTGTGGTT
TATGAGAAAGTTATTAGATATTTTCAC


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AF RS1AI07JQ C 1
AF RS1AI07TF U 1
BS 1 267 RS1AI07TF

RD RS1AI07JQ 267 0 0
GAACCAGAAGGGAGCCGGGACGAGCCGAGCTCATCAAGCTAGATGGTCCCTAAAAGAACC
AGGAGGAGATGTGAAACGGTTATATCATTTGACTTTGGTTTCGATTGGCTTACAGAAGCA
GATGCTGGTGTTTGTTGAGATTTCAGATTTTATTTCCTCAGTTTTCAGAGCTTCTCTTTA
CTCAGACTGGTTCCATTGGTTCCTGTAATAAAATCGACCCTGTATAGTTTTCTTGTGGTT
TATGAGAAAGTTATTAGATATTTTCAC

QA 1 267 1 267
DS 

RD RS1AI07TF 267 0 0
GAACCAGAAGGGAGCCGGGACGAGCCGAGCTCATCAAGCTAGATGGTCCCTAAAAGAACC
AGGAGGAGATGTGAAACGGTTATATCATTTGACTTTGGTTTCGATTGGCTTACAGAAGCA
GATGCTGGTGTTTGTTGAGATTTCAGATTTTATTTCCTCAGTTTTCAGAGCTTCTCTTTA
CTCAGACTGGTTCCATTGGTTCCTGTAATAAAATCGACCCTGTATAGTTTTCTTGTGGTT
TATGAGAAAGTTATTAGATATTTTCAC

QA 1 267 1 267
DS 



AS 1 2

CO CL5220Contig1 1163 2 4 U
GGAGAGCCACTTGGATCGCCGCTTTACTTCCTATGGTGATTGCTTCGATACCCAGTTCAA
AGCCGACATCTTTTCATCAACTCGTTCTGGGTTTCGCAGGAAGAGGCAAGATCCTTCATC
CCTCGTCTCAGAAGTGGACAGTTCCTCAAAAATGCTTTGCTCATTTCTATGTTTTGGGAG
CGGCGTGGACCACTCTTCTGCTAGCAACCACTTGGATGTATGCTTGCAAAACAGCACCTT
TATCCTCAGAGGAGTTCCACCTTTCCGACATTGCAAGCCACTTAACCGGCGGTTCCCATG
TTTTCTCCTTTCATAAATCTCATTTGAATCCTGTGGAGCACCGTTTCAAAGTGTGGCGAG
CAGTGTTCCTACTTGTTCTGATGGAAATCCAAGTTCTGAGACGCCTTATTGAGTCATTCT
ATGTCTTCAAGTATAGCCCTTCTGCTCGGCTTCACATTCTTGGTTACCTCGTCGGATTGT
TTTTCTATACAGTAGCGCCTTTATCACTCTGCGTCAATGTAGCTCCAGAGGTAGCTAGAT
TTGCCGGATATCAAGTTGCTGAGTTCATTGCCAAAGGAAAAAGCCACACCCCAGCGGCCC
CTGAGTTTGACATATTATCATCTTTAAGCCCTTTGATGAAGCTTGGATGGTGCCAGTTGA
TTGGTGGCATCATTTTTCTCTGGGGATGGTTACATCAACGCCGCTGTCATGCAATTCTTG
GATCGCTTCGGGAAAATCCTAGCCAAGCGAAAGAGTACACAATCCCACATGGAGATTGGT
TTGAAATCGTCTCCAGTCCACATTATTTGGCAGAAATTGTGTTATATACTGGTTTGCTGA
TTGCTAGTGGAGGAGCAGATATAACAATCTGGTTACTCCTTGGTTTCGTGGTTGGGAATT
TGACATTAGCGGCTGGAGAAACACACCGGTGGTATTTCCGGAAGTTTGAGAACTATCCGG
CTAACCGAAATGCCATTTTCCCTTTTATTTACTAACCAAGCTTGTATTCTGTATTTGAAT
AGAACACAACTTAACCAAGCTTGTATTCTGTATTTGAATAATCATGTTTATATTGTCGCT
ATGTTCTCATCTTTATGTTTATATTGTCGCTTGTTTCTTGGAATTTACCGATTTTATTGT
TATATTCTCAGTTAAATGAATTT


BQ
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AF RS1FJ09TF U 1
AF RS1FJ09JQ C 522
BS 1 735 RS1FJ09TF
BS 736 736 RS1FJ09JQ
BS 737 746 RS1FJ09TF
BS 747 1163 RS1FJ09JQ

RD RS1FJ09TF 746 0 0
GGAGAGCCACTTGGATCGCCGCTTTACTTCCTATGGTGATTGCTTCGATACCCAGTTCAA
AGCCGACATCTTTTCATCAACTCGTTCTGGGTTTCGCAGGAAGAGGCAAGATCCTTCATC
CCTCGTCTCAGAAGTGGACAGTTCCTCAAAAATGCTTTGCTCATTTCTATGTTTTGGGAG
CGGCGTGGACCACTCTTCTGCTAGCAACCACTTGGATGTATGCTTGCAAAACAGCACCTT
TATCCTCAGAGGAGTTCCACCTTTCCGACATTGCAAGCCACTTAACCGGCGGTTCCCATG
TTTTCTCCTTTCATAAATCTCATTTGAATCCTGTGGAGCACCGTTTCAAAGTGTGGCGAG
CAGTGTTCCTACTTGTTCTGATGGAAATCCAAGTTCTGAGACGCCTTATTGAGTCATTCT
ATGTCTTCAAGTATAGCCCTTCTGCTCGGCTTCACATTCTTGGTTACCTCGTCGGATTGT
TTTTCTATACAGTAGCGCCTTTATCACTCTGCGTCAATGTAGCTCCAGAGGTAGCTAGAT
TTGCCGGATATCAAGTTGCTGAGTTCATTGCCAAAGGAAAAAGCCACACCCCAGCGGCCC
CTGAGTTTGACATATTATCATCTTTAAGCCCTTTGATGAAGCTTGGATGGTGCCAGTTGA
TTGGTGGCATCATTTTTCTCTGGGGATGGTTACATCAACGCCGCTGTCATGCAATTCTTG
GATCGCTTCGGGAAA*TCCTAGCCAA

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1FJ09JQ 642 0 0
GCTCCAGAGGTAGCTAGATTTGCCGGATATCAAGTTGCTGAGTTCATTGCCAAAGGAAAA
AGCCACACCCCAGCGGCCCCTGAGTTTGACATATTATCATCTTTAAGCCCTTTGATGAAG
CTTGGATGGTGCCAGTTGATTGGTGGCATCATTTTTCTCTGGGGATGGTTACATCAACGC
CGCTGTCATGCAATTCTTGGATCGCTTCGGGAAAATCCTAGCCAAGCGAAAGAGTACACA
ATCCCACATGGAGATTGGTTTGAAATCGTCTCCAGTCCACATTATTTGGCAGAAATTGTG
TTATATACTGGTTTGCTGATTGCTAGTGGAGGAGCAGATATAACAATCTGGTTACTCCTT
GGTTTCGTGGTTGGGAATTTGACATTAGCGGCTGGAGAAACACACCGGTGGTATTTCCGG
AAGTTTGAGAACTATCCGGCTAACCGAAATGCCATTTTCCCTTTTATTTACTAACCAAGC
TTGTATTCTGTATTTGAATAGAACACAACTTAACCAAGCTTGTATTCTGTATTTGAATAA
TCATGTTTATATTGTCGCTATGTTCTCATCTTTATGTTTATATTGTCGCTTGTTTCTTGG
AATTTACCGATTTTATTGTTATATTCTCAGTTAAATGAATTT

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 2

CO CL5221Contig1 933 2 6 U
GGGTCTTCTGGTGGATCTGTGGGGGAAATCTGGTAACGTGGAGAAGGCGTGGCGATGGTA
TCAGGCGATGCTTCGTGCTGGTCTGCTACCTAACGTTCCTACGTTCAATTCACTTCTCAG
CACCTTCCTTAGGGTTAACAAGATAAGCGAAGCTTCTGAGTTGTTACAGAACATGCTGGC
GCCTGGTCTACGCCCTTCTTTGCAGACGTACACGTTGCTGTTGAGCTGTTGCACGGACGG
TAGGTCGAAACTTGACGTGGGTTTCTGCGGTCAGCTGATGGCTAGCATTGGTCATCCGGC
GCACATGTTTCTCCTCGAGATGCCGTCCGCTGGTCCTGACGGCGAAAACGTGAGGAGCCA
TGTGAAGAGGTTCTTGGATATCATGCACAGCGAGGACAGGGAGAGCAAGAGGGGGCTTGT
GGACGCGGTGGTTGACTTTCTGCACAAGTCAGGGCTGAAAGAAGAGGCGGGATCGGTCTG
GGAAGTCGCGGCGCAGAAGAACGTTTTCCCCGACGCGTTGAGGGAGAAGAGCAGCAGTTA
CTGGCTCATCAATCTCCATGTGATGTCGGAGGGAACCGCGGTGACGGCTCTGTCTAGGAC
GCTCGCTTGGTTCCGTAAGCAGATGTTGGTCTCGGGACGTGGCCCTGCTCGGATAGATAT
AGTAACTGGTTGGGGAAGGCGTAGCAGAGTCACTGGTACGTCGATGGTGAGACAAGCGGT
TGAGGAGCTGCTCAACGTGTTCGGTTCACCGTTTTTCACGGAGAGTGGGAACTCGGGTTG
TTTCGTTGGATGTGGTGAGTCTCTCAACAGGTGGTTGCTTCAGTCTTATGTTGAGAGGAT
GCATTTGTTGTGAGGTTGTTTGTAAGTCATATATAAGTTAAGGGTGTTAGGATTATATTT
GAAACTGCTCTCTTTAGTCTTTTGTCCTCTGCT


BQ
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AF RS1B442TF U 1
AF RS1B442JQ C 340
BS 1 676 RS1B442TF
BS 677 677 RS1B442JQ
BS 678 724 RS1B442TF
BS 725 725 RS1B442JQ
BS 726 740 RS1B442TF
BS 741 933 RS1B442JQ

RD RS1B442TF 753 0 0
GGGTCTTCTGGTGGATCTGTGGGGGAAATCTGGTAACGTGGAGAAGGCGTGGCGATGGTA
TCAGGCGATGCTTCGTGCTGGTCTGCTACCTAACGTTCCTACGTTCAATTCACTTCTCAG
CACCTTCCTTAGGGTTAACAAGATAAGCGAAGCTTCTGAGTTGTTACAGAACATGCTGGC
GCCTGGTCTACGCCCTTCTTTGCAGACGTACACGTTGCTGTTGAGCTGTTGCACGGACGG
TAGGTCGAAACTTGACGTGGGTTTCTGCGGTCAGCTGATGGCTAGCATTGGTCATCCGGC
GCACATGTTTCTCCTCGAGATGCCGTCCGCTGGTCCTGACGGCGAAAACGTGAGGAGCCA
TGTGAAGAGGTTCTTGGATATCATGCACAGCGAGGACAGGGAGAGCAAGAGGGGGCTTGT
GGACGCGGTGGTTGACTTTCTGCACAAGTCAGGGCTGAAAGAAGAGGCGGGATCGGTCTG
GGAAGTCGCGGCGCAGAAGAACGTTTTCCCCGACGCGTTGAGGGAGAAGAGCAGCAGTTA
CTGGCTCATCAATCTCCATGTGATGTCGGAGGGAACCGCGGTGACGGCTCTGTCTAGGAC
GCTCGCTTGGTTCCGTAAGCAGATGTTGGTCTCGGGACGTGGCCCTGCTCGGATAGATAT
AGTAACTGGTTGGGGA*GGCGTAGCAGAGTCACTGGTACGTCGATGGTGAGACAAGCGGT
TGAG*AGCTGCTCAACGTGT
CGGTCACCGTTTT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RS1B442JQ 594 0 0
CGGCGAAAACGTGAGGAGCCATGTGAAGAGGTTCTTGGATATCATGCACAGCGAGGACAG
GGAGAGCAAGAGGGGGCTTGTGGACGCGGTGGTTGACTTTCTGCACAAGTCAGGGCTGAA
AGAAGAGGCGGGATCGGTCTGGGAAGTCGCGGCGCAGAAGAACGTTTTCCCCGACGCGTT
GAGGGAGAAGAGCAGCAGTTACTGGCTCATCAATCTCCATGTGATGTCGGAGGGAACCGC
GGTGACGGCTCTGTCTAGGACGCTCGCTTGGTTCCGTAAGCAGATGTTGGTCTCGGGACG
TGGCCCTGCTCGGATAGATATAGTAACTGGTTGGGGAAGGCGTAGCAGAGTCACTGGTAC
GTCGATGGTGAGACAAGCGGTTGAGGAGCTGCTCAACGTGTTCGGTTCACCGTTTTTCAC
GGAGAGTGGGAACTCGGGTTGTTTCGTTGGATGTGGTGAGTCTCTCAACAGGTGGTTGCT
TCAGTCTTATGTTGAGAGGATGCATTTGTTGTGAGGTTGTTTGTAAGTCATATATAAGTT
AAGGGTGTTAGGATTATATTTGAAACTGCTCTCTTTAGTCTTTTGTCCTCTGCT

QA 1 594 1 594
DS 



AS 1 2

CO CL5222Contig1 1125 2 2 U
GGACCAAGGACCATACAACACAACACCATTTGCAAACAACTTCTGCTTTCTCTCACTGAG
TTTTTGAAATGAGAGGGATGAAGAGTCTAACTATTTGGGCTCTCTTTGCTGCTTTACTCT
CACAGCAGCTGTTTGCTTCCGTTACTTCCATAAGGTTCGAAGATGAGAAGACATACTACT
CTCCTCCCTCTGGACACGACGGTTACACTCCCACTCCTAACTGTGGAAGTCCACCTTACG
ACCCAACTCCTTCAACTCCATCTCACACTCCAACTCCTTCGACTCCATCTCACACTCCAA
CCCCACACACACCAACTCACCACACGCCTCCTTGTAACTGTGGGACTCCACCTCACGACC
CTTCCACACCTTCTCACCCTTCTACACCATCACATCCTTCGACGCCTTCACACCCTTCAA
CGCCTCCTTCGGGTGGATATTACTCTCCACCAAGTACTCCAGTCGTTGTGACTCCACCAA
CACCCATTGTTGTAGGAAGCCCACCAACTCCTATTATTGACCCTGGCACTCCTGGAACTC
CTTTCGTTCCTGCTCCTTTTCCACCAATCACTGGAACATGCGATTACTGGAGAAACCACC
CTACACTCATATGGGGTCTTCTTGGCTGGTGGGGAACCGTTGGTGGAGCGTTTGGTACAG
TCAGTACTTCCAGTAGCATTCCAGGCTTTGATCCTCACATGAACCTTTTTCAGGCACTTT
CCAATACCCGCACCGATGCTATTGGATCTTTCTACCGTGAAGGCACAGCGTCTTGGTTAA
ACTCCATGGTCAGCAACAAGTTCCCTTTCACAACCTCTCAAGTCAGAGACCACTTTGTGG
CAGGACTTTCCTCAACCAAGGCAGCAACAAAGCAAGCTCATACCTTCAAGCTTGCTAATG
AAGGTCGTTTAAAGCCTAGAAACTAGAAACAAGAGAGTTTTTCATTTATCACAGTCGTTT
GTTGGTTTGCATTAAAACAATCTTGATTAATTATCCTATGCAGTGTGTGTGCTCATTAGA
GTTTTAGAGTGTCCTATAGCTTCTAGTAATATTTATGATGGATACTCCTTTTATATTTGT
TGTTTTAAAATTTTCTTGATCTTAATAATAGTAGTACTATTTAGC


BQ
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CACAGCAGCTGTTTGCTTCCGTTACTTCCATAAGGTTCGAAGATGAGAAGACATACTACT
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ACCCAACTCCTTCAACTCCATCTCACACTCCAACTCCTTCGACTCCATCTCACACTCCAA
CCCCACACACACCAACTCACCACACGCCTCCTTGTAACTGTGGGACTCCACCTCACGACC
CTTCCACACCTTCTCACCCTTCTACACCATCACATCCTTCGACGCCTTCACACCCTTCAA
CGCCTCCTTCGGGTGGATATTACTCTCCACCAAGTACTCCAGTCGTTGTGACTCCACCAA
CACCCATTGTTGTAGGAAGCCCACCAACTCCTATTATTGACCCTGGCACTCCTGGAACTC
CTTTCGTTCCTGCTCCTTTTCCACCAATCACTGGAACATGCGATTACTGGAGAAACCACC
CTACACTCATATGGGGTCTTCTTGGCTGGTGGGGAACCGTTGGTGGAGCGTTTGGTACAG
TCAGTACTTCCAGTAGCATTCCAGGCTTTGATC
TCACAT

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GTAGGAAGCCCACCAACTCCTATTATTGACCCTGGCACTCCTGGAACTCCTTTCGTTCCT
GCTCCTTTTCCACCAATCACTGGAACATGCGATTACTGGAGAAACCACCCTACACTCATA
TGGGGTCTTCTTGGCTGGTGGGGAACCGTTGGTGGAGCGTTTGGTACAGTCAGTACTTCC
AGTAGCATTCCAGGCTTTGATCCTCACATGAACCTTTTTCAGGCACTTTCCAATACCCGC
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AGCAACAAGTTCCCTTTCACAACCTCTCAAGTCAGAGACCACTTTGTGGCAGGACTTTCC
TCAACCAAGGCAGCAACAAAGCAAGCTCATACCTTCAAGCTTGCTAATGAAGGTCGTTTA
AAGCCTAGAAACTAGAAACAAGAGAGTTTTTCATTTATCACAGTCGTTTGTTGGTTTGCA
TTAAAACAATCTTGATTAATTATCCTATGCAGTGTGTGTGCTCATTAGAGTTTTAGAGTG
TCCTATAGCTTCTAGTAATATTTATGATGGATACTCCTTTTATATTTGTTGTTTTAAAAT
TTTCTTGATCTTAATAATAGTAGTACTATTTAGC

QA 1 694 1 694
DS 



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ATCAAAGAAGCAAATAATGGAGTCGATGAAGATGATGGTTGTTTTCATGGTCGTTGCAGT
GGCTTTCTCAGCCGTAGGACAAGCGGCGGCTGCCACCGTGGAAGCTCCAGCTCCAAGCCC
AACCTCTGATGCTGCCATGTTCGTACCGGCATTGTTTGCATCTGTTGTTGCTTTGGCATC
AGGTCTTCTCTTTTGAGTCAAAACAAACATTTCGTTTTTCTCCATTTGTTTTATTGTTTC
GTTCATGAGTTTGTGTGTGATCTGATTCTATTTTGTATAGAGCGTTGTATTATTCTTAAT
GTAACCATCCGTTTCTATATTATATCATCATTCATCAGACTGTTTACG


BQ
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AF RS1GO57JQ C 1
AF RS1GO57TF U 1
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DS 

RD RS1GO57TF 408 0 0
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ATCAAAGAAGCAAATAATGGAGTCGATGAAGATGATGGTTGTTTTCATGGTCGTTGCAGT
GGCTTTCTCAGCCGTAGGACAAGCGGCGGCTGCCACCGTGGAAGCTCCAGCTCCAAGCCC
AACCTCTGATGCTGCCATGTTCGTACCGGCATTGTTTGCATCTGTTGTTGCTTTGGCATC
AGGTCTTCTCTTTTGAGTCAAAACAAACATTTCGTTTTTCTCCATTTGTTTTATTGTTTC
GTTCATGAGTTTGTGTGTGATCTGATTCTATTTTGTATAGAGCGTTGTATTATTCTTAAT
GTAACCATCCGTTTCTATATTATATCATCATTCATCAGACTGTTTACG

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DS 



AS 1 2

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CTGGTGTCGGGAAGATGAGGAACAGGCGTTACATTTGTAGGAAAGGTCCTCTTGTTGTTT
ACGGTACCGAATGGTCTAAGATTGTGAAGGCGTTTAGGAACCTTCCCGGGGTGGAGCTTT
GCCACGTGGAGAGGCTTAACTTGCTGAAGCTTGCACCCGGTGGTCACCTAGGGAGGTTTG
TGGTTTGGACCAAGTCTGCTTTCGAGAAGCTTGAGGGGATCTACGGGTCGTTTGAGAAGC
CCTCGGAGAAGAAGAAGGGGTACGTGCTTCCTAGGGCGAAGATGGTGAACGCTGATTTGG
CGAGGATTATTAACTCTGACGAGGTGCAGAGTGTGGTGAAGCCGATTAAGAAGGATGCCA
AGAGGGCTGTGATGAAGGAGAATTTGAATGTGATGCTGAAGTTGAATCCGTATGCGAAGA
CCGCGAAGAGGATGTCTCTCTTGGCGGAAGAGCAGAGGGTTAAGGCTAAGAAGGAGAAGC
TCACCAAGAAGAGGAAGACTGTCACCAAGGAGGAGGCATTGGCGATCAAGGCAGCAGGGA
AGTCGTGGTACCAGACTATGATCTCCGACAGTGACCACACCGAGTTTGACAACTTTACCA
AATGGCTGGGTGCTAGCCAGTAATAATAATATTATCTGCTTGAAACACTCTTTCATGTTT
AGGGAATGTTTT


BQ
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AF RS1C716TF U 1
AF RS1C716JQ C 416
BS 1 675 RS1C716TF
BS 676 852 RS1C716JQ

RD RS1C716TF 681 0 0
GCGCCGTTCCCGCGCTCGTTATGGCGCGTGGTCACAAGATCGAGAACGTCCCCGAGATGC
CTCTTGTTGTCAGTGACTCTGCCGAGGGCGTGGAGAAGACGTCGGCTGCTATCAAGGTTT
TGAAGCAGATTGGGGCTTATGACGATGCCGAGAAGGCCAAGGATAGTATTGGGATTAGGT
CTGGTGTCGGGAAGATGAGGAACAGGCGTTACATTTGTAGGAAAGGTCCTCTTGTTGTTT
ACGGTACCGAATGGTCTAAGATTGTGAAGGCGTTTAGGAACCTTCCCGGGGTGGAGCTTT
GCCACGTGGAGAGGCTTAACTTGCTGAAGCTTGCACCCGGTGGTCACCTAGGGAGGTTTG
TGGTTTGGACCAAGTCTGCTTTCGAGAAGCTTGAGGGGATCTACGGGTCGTTTGAGAAGC
CCTCGGAGAAGAAGAAGGGGTACGTGCTTCCTAGGGCGAAGATGGTGAACGCTGATTTGG
CGAGGATTATTAACTCTGACGAGGTGCAGAGTGTGGTGAAGCCGATTAAGAAGGATGCCA
AGAGGGCTGTGATGAAGGAGAATTTGAATGTGATGCTGAAGTTGAATCCGTATGCGAAGA
CCGCGAAGAGGATGTCTCTCTTGGCGGAAGAGCAGAGGGTTAAGGCTAAGAAGGAGAAGC
TCACCAAGAAGAGGA
GACTGT

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1C716JQ 437 0 0
GAAGCCCTCGGAGAAGAAGAAGGGGTACGTGCTTCCTAGGGCGAAGATGGTGAACGCTGA
TTTGGCGAGGATTATTAACTCTGACGAGGTGCAGAGTGTGGTGAAGCCGATTAAGAAGGA
TGCCAAGAGGGCTGTGATGAAGGAGAATTTGAATGTGATGCTGAAGTTGAATCCGTATGC
GAAGACCGCGAAGAGGATGTCTCTCTTGGCGGAAGAGCAGAGGGTTAAGGCTAAGAAGGA
GAAGCTCACCAAGAAGAGGAAGACTGTCACCAAGGAGGAGGCATTGGCGATCAAGGCAGC
AGGGAAGTCGTGGTACCAGACTATGATCTCCGACAGTGACCACACCGAGTTTGACAACTT
TACCAAATGGCTGGGTGCTAGCCAGTAATAATAATATTATCTGCTTGAAACACTCTTTCA
TGTTTAGGGAATGTTTT

QA 1 437 1 437
DS 



AS 1 2

CO CL5225Contig1 936 2 4 U
GTAAACAAACGCAAACGCGTACTTGTATTCATACCCCTGGATATCCACCCATGGTGCCAA
CTGATCTTCCTCAGTCGACCATGTTATCTGCTCTAGACAGAGCAAGCATTGCATATTTTG
ATGTAAGATTACACGAAACCGCATTGGTGATTGCAAACGAGGCAAGTCAGAAGAAGATAC
CTATATTAGTTGATGCAGAGAAGAAAAGAGATGGATTAGATGATCTCTTGCAACTCGCCG
ATTACGTTGTCTGCACGGCAAAATTCCCTCAGGCATGGACAGAAGCGTCTTCAATTCCAT
GTGCGCTTGTGTCCATGATGTTGAGATTGCCGAAGCTGAAGTTTGTGATCGTAACCTTAG
GTGAAGAAGGATGCTTAATGATCCAGAGAGATTCAACAGAAACATCAGAATCCAAAGAGA
CAGACATTGAGAGTTTGGTGGAGTCGCTGAAGCAAACATCAGACTCGACCGCAACATTTC
CAACTTGCGTTTCATCCGAGACAGCTAAGCTAAAGGCCAACGGGATAGGAACTCTGAGCG
GAAGACTGTTTCTCGGAACAGCAGAGAAAATTCCTCCAGAAGAGCTTGTTGACACCACCG
GTGCAGGCGACGCATTCATAGGAGCAGCTCTTTATGCCTTATGCGCCGGCATGCCCCCAG
AGAAGATGCTACCGTTCGCTACTCAAGTGGCTGCTTGCAACTGCCGGGCTTTGGGAGCTC
GTACTGGTCTTCCTCACCGTAATGATCCCCGACTTAAACCCTTTTTGGTTTGACAACTTC
AATGTTCTATGTTCCTTTTATCTTTTTCCAAGTCACTTACCCCATTGCCCACTTTCCCAT
ATTTAAAACTTAATACGTATTAAATCAACAAAGACTTGGTGTCAAATACTAATATCCATG
TCAGGTTTGACTTTGCTTTGTTGTAAAACGAAACGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EA70TF U 1
AF RS1EA70JQ C 333
BS 1 699 RS1EA70TF
BS 700 700 RS1EA70JQ
BS 701 741 RS1EA70TF
BS 742 936 RS1EA70JQ

RD RS1EA70TF 748 0 0
GTAAACAAACGCAAACGCGTACTTGTATTCATACCCCTGGATATCCACCCATGGTGCCAA
CTGATCTTCCTCAGTCGACCATGTTATCTGCTCTAGACAGAGCAAGCATTGCATATTTTG
ATGTAAGATTACACGAAACCGCATTGGTGATTGCAAACGAGGCAAGTCAGAAGAAGATAC
CTATATTAGTTGATGCAGAGAAGAAAAGAGATGGATTAGATGATCTCTTGCAACTCGCCG
ATTACGTTGTCTGCACGGCAAAATTCCCTCAGGCATGGACAGAAGCGTCTTCAATTCCAT
GTGCGCTTGTGTCCATGATGTTGAGATTGCCGAAGCTGAAGTTTGTGATCGTAACCTTAG
GTGAAGAAGGATGCTTAATGATCCAGAGAGATTCAACAGAAACATCAGAATCCAAAGAGA
CAGACATTGAGAGTTTGGTGGAGTCGCTGAAGCAAACATCAGACTCGACCGCAACATTTC
CAACTTGCGTTTCATCCGAGACAGCTAAGCTAAAGGCCAACGGGATAGGAACTCTGAGCG
GAAGACTGTTTCTCGGAACAGCAGAGAAAATTCCTCCAGAAGAGCTTGTTGACACCACCG
GTGCAGGCGACGCATTCATAGGAGCAGCTCTTTATGCCTTATGCGCCGGCATGCCCCCAG
AGAAGATGCTACCGTTCGCTACTCAAGTGGCTGCTTGCA*CTGCCGGGCTTTGGGAGCTC
GTACTGGTCTTCCTCACCGTA
TGATCCC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1EA70JQ 604 0 0
AAGCTGAAGTTTGTGATCGTAACCTTAGGTGAAGAAGGATGCTTAATGATCCAGAGAGAT
TCAACAGAAACATCAGAATCCAAAGAGACAGACATTGAGAGTTTGGTGGAGTCGCTGAAG
CAAACATCAGACTCGACCGCAACATTTCCAACTTGCGTTTCATCCGAGACAGCTAAGCTA
AAGGCCAACGGGATAGGAACTTTGAGCGGAAGACTGTTTCTCGGAACAGCAGAGAAAATT
CCTCCAGAAGAGCTTGTTGACACCACCGGTGCAGGCGACGCATTCATAGGAGCAGCTCTT
TATGCCTTATGCGCCGGCATGCCCCCAGAGAAGATGCTACCGTTCGCTACTCAAGTGGCT
GCTTGCAACTGCCGGGCTTTGGGAGCTCGTACTGGTCTTCCTCACCGTAATGATCCCCGA
CTTAAACCCTTTTTGGTTTGACAACTTCAATGTTCTATGTTCCTTTTATCTTTTTCCAAG
TCACTTACCCCATTGCCCACTTTCCCATATTTAAAACTTAATACGTATTAAATCAACAAA
GACTTGGTGTCAAATACTAATATCCATGTCAGGTTTGACTTTGCTTTGTTGTAAAACGAA
ACGT

QA 1 604 1 604
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5227Contig1 738 2 7 U
GGGGAACCCCACTGTCTGAAAAGAAAAGAAAAAAAAACATAAAAAGGGAGATTTAACCAC
ATCTCCCATTTTTATTCTTCATCATCGCTTTGATCGTCACACTAAGATTTCACTTGCGTT
TCTTCTGTGGAAGATCAGATCTTGGACAATCTCCAGTTCAAAGCGAGGAGGAGAAGTAGG
AAGTAAAGGCAAAAGGGGGTTGAAGGATGTCGCCATTCACAGGAACTCAACAGAAGTGCA
AGGCTTGCGAGAAGACAGTGTACCCTGTGGAGCTTCTCTCAGCTGATGATGTTAGCTACC
ACAAGTCCTGCTTCAAATGCTCTCACTGCAAATCCAGGCTTCAGTTGAGTAGATATTCAT
CGATGGAAGGTGTGTTGTACTGTAAGCCTCATTATGAGCAGCTATTCAAGGAGTCTGGTA
GCTTCACCAAGAACTTTCAGTCACCTGCAAAACCAGCTGAGAAATCAAGTCCTGAGCTGA
CAAGGACTCCTAACAGAGTTGCTGGTATGTTCTCTGGTACACAAGAAAAATGTGCCACTT
GCAGTAAAACTGTGTATCCTATCGAGAAGGTAACAGTGGAGAGCCAGACATATCACAAGT
CCTGCTTCAAATGCTCACATGGAGGCTGCCCAATTTCGCCTTCAAACTACGCAGCTCTTG
AAGGAATCTTGTACTGCAAGCACCATTTCGCTCAGCTTTTCAAGGAGAAGGTAGCTACAA
CCACTTGATCAATCCGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C536TF U 82
AF RS1C682TF U 1
BS 1 116 RS1C682TF
BS 117 117 RS1C536TF
BS 118 212 RS1C682TF
BS 213 213 RS1C536TF
BS 214 288 RS1C682TF
BS 289 289 RS1C536TF
BS 290 738 RS1C682TF

RD RS1C536TF 297 0 0
GG
ATCGCTTTGATCGTCACACTAAGATTTCACTTGCGTTTCTTCTGTGGAAGATCAGATCTT
GGACAATCTCCAGTTCAAAGCGAGGAGGAGAAGTAGGAAGTAAAGGCAAAAGGGGGTTGA
AGGATGTCGCCATTCACAGGAACTCAACAGAAGTGCATG*CTTGCGAGAGGACAGTGTAC
CCTGTGGAGTTTCTCTCATCTGATGATGTTAGCTACCACAAGTCCTGCTTCAAATGCTCT
CACTGCAAATCCAGGCTTCAGTTGAGTAGATATTCATCGATGGAAGGTGTGTTGT

QA 3 297 3 297
DS 

RD RS1C682TF 738 0 0
GGGGAACCCCACTGTCTGAAAAGAAAAGAAAAAAAAACATAAAAAGGGAGATTTAACCAC
ATCTCCCATTTTTATTCTTCATCATCGCTTTGATCGTCACACTAAGATTTCACTTGTGTT
TCTTCTGTGGAAGATCAGATCTTGGACAATCTCCAGTTCAAAGCGAGGAGGAGAAGTAGG
AAGTAAAGGCAAAAGGGGGTTGAAGGATGTCGTCATTCACAGGAACTCAACAGAAGTGCA
AGGCTTGCGAGAAGACAGTGTACCCTGTGGAGCTTCTCTCAGCTGATGGTGTTAGCTACC
ACAAGTCCTGCTTCAAATGCTCTCACTGCAAATCCAGGCTTCAGTTGAGTAGATATTCAT
CGATGGAAGGTGTGTTGTACTGTAAGCCTCATTATGAGCAGCTATTCAAGGAGTCTGGTA
GCTTCACCAAGAACTTTCAGTCACCTGCAAAACCAGCTGAGAAATCAAGTCCTGAGCTGA
CAAGGACTCCTAACAGAGTTGCTGGTATGTTCTCTGGTACACAAGAAAAATGTGCCACTT
GCAGTAAAACTGTGTATCCTATCGAGAAGGTAACAGTGGAGAGCCAGACATATCACAAGT
CCTGCTTCAAATGCTCACATGGAGGCTGCCCAATTTCGCCTTCAAACTACGCAGCTCTTG
AAGGAATCTTGTACTGCAAGCACCATTTCGCTCAGCTTTTCAAGGAGAAGGTAGCTACAA
CCACTTGATCAATCCGCT

QA 1 738 1 738
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5229Contig1 924 2 2 U
AACAAAAGATGAGCAACATTATCATCCTATTTGTGACATTTCTTGCTCTTTCTTCTTCAT
CTCGAGCAGCAGATGTGACAGAGACTGCGTTCCATTACAAAAAAGGAGAACTAGCCGATC
CATCGAAATGGAGCATGATCAAGAAAGAACGGGAAATTTGTGGGACTGGGAAGAGGCAAT
CACCAATAGATCTTTCTCCAGAAATAGCTCGCCTAGTTCACAATTCTACAAAGCTTATTC
AGACATATTACAAACCAGTAGAAGCTACTCTTAAGAACCGTGGACACGACATCATGGTGT
CATGGGATGACGACGCAGGGAAGATTGTGATAAATAATACTGACTATCAATTGGTTCAAA
GCCATTGGCACGCACCTTCAGAGCATTTACTCAATGGAGAAAGGTTTGCCATGGAACTTC
ACATGGTTCATAAAAGTGAAGAAGGACACTTAGCAGTTATAGGAGTTCTCTTCCGAAAAG
GAGAGCCGAATGCTTTCATTTCAAGGATAATGGAAAAGATCAATTCGATCGCAAACATCC
AATATGGAGAGGCCACCATAGGAAGGCTACATCCAAAAGACTTCGGATGGGATCTTACAA
AATTCTACGAATATAGGGGATCTCTCACTACTCCTCCTTGCACGGAAGATGTCATCTGGA
CCATCATTAACAAGGTGGGGACTGTTTCACATGAGCAAATTAAAGTATTAGTCGATGCTC
GCCGCGGTGGTTACGAGGATAACGCAAGACCCGCTCAACCGCTGAATGACCGTGTGGTTT
ATCTAAACGAACAGCATACCAGATCAACTCCAAGCTCCCAAGGACAAATTGATATAAATT
AATTTTGAAGATGTTTGTGGATTGGCTGCTCCTCCATTACTAATTATATTTTACAACATG
AATTTACAAATTTATATATTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DA77TF U 1
AF RS1DA77JQ C 268
BS 1 670 RS1DA77TF
BS 671 924 RS1DA77JQ

RD RS1DA77TF 670 0 0
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CTCGAGCAGCAGATGTGACAGAGACTGCGTTCCATTACAAAAAAGGAGAACTAGCCGATC
CATCGAAATGGAGCATGATCAAGAAAGAACGGGAAATTTGTGGGACTGGGAAGAGGCAAT
CACCAATAGATCTTTCTCCAGAAATAGCTCGCCTAGTTCACAATTCTACAAAGCTTATTC
AGACATATTACAAACCAGTAGAAGCTACTCTTAAGAACCGTGGACACGACATCATGGTGT
CATGGGATGACGACGCAGGGAAGATTGTGATAAATAATACTGACTATCAATTGGTTCAAA
GCCATTGGCACGCACCTTCAGAGCATTTACTCAATGGAGAAAGGTTTGCCATGGAACTTC
ACATGGTTCATAAAAGTGAAGAAGGACACTTAGCAGTTATAGGAGTTCTCTTCCGAAAAG
GAGAGCCGAATGCTTTCATTTCAAGGATAATGGAAAAGATCAATTCGATCGCAAACATCC
AATATGGAGAGGCCACCATAGGAAGGCTACATCCAAAAGACTTCGGATGGGATCTTACAA
AATTCTACGAATATAGGGGATCTCTCACTACTCCTCCTTGCACGGAAGATGTCATCTGGA
CCATCATTAA

QA 1 670 1 670
DS 

RD RS1DA77JQ 657 0 0
CTCTTAAGAACCGTGGACACGACATCATGGTGTCATGGGATGACGACGCAGGGAAGATTG
TGATAAATAATACTGACTATCAATTGGTTCAAAGCCATTGGCACGCACCTTCAGAGCATT
TACTCAATGGAGAAAGGTTTGCCATGGAACTTCACATGGTTCATAAAAGTGAAGAAGGAC
ACTTAGCAGTTATAGGAGTTCTCTTCCGAAAAGGAGAGCCGAATGCTTTCATTTCAAGGA
TAATGGAAAAGATCAATTCGATCGCAAACATCCAATATGGAGAGGCCACCATAGGAAGGC
TACATCCAAAAGACTTCGGATGGGATCTTACAAAATTCTACGAATATAGGGGATCTCTCA
CTACTCCTCCTTGCACGGAAGATGTCATCTGGACCATCATTAACAAGGTGGGGACTGTTT
CACATGAGCAAATTAAAGTATTAGTCGATGCTCGCCGCGGTGGTTACGAGGATAACGCAA
GACCCGCTCAACCGCTGAATGACCGTGTGGTTTATCTAAACGAACAGCATACCAGATCAA
CTCCAAGCTCCCAAGGACAAATTGATATAAATTAATTTTGAAGATGTTTGTGGATTGGCT
GCTCCTCCATTACTAATTATATTTTACAACATGAATTTACAAATTTATATATTTTCC

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 2

CO CL5230Contig1 1006 2 4 U
GGAAACGGAAATAGAGATCTCATTTTCTCTCTCTCTTTAATCACTGTTCATCTTCCTCCC
TTTTGCTCTTAGAAAACCAGATCTAGGGTTCCTTAGCTCGCCGACTTCGGTGGCTTCTAT
AGCACCGGAGTCGGGTTCCTCTTTGTGTATATTCGGCTTTTTGTTTTGCTCTGTTTTCAT
CTTGGTTTTGTTGGATTAAGTTACGGCCTCTCCGAAGTATCCTTTGGCTTCGGTGTTCCG
GCTTTTCTCCACTTGACAAACGATGATGGCCTATGGCTCTTTGAAACTAACTGGGCTTAG
AAATGGTGGTTTGTAGTGGTTTGATTGTGCTTTTATTTTTCAGATCTGGCGGCCCTGCTT
GTGTTTGGGGCTTTGGCGTGATGACCGATCTAGCTCTGTCCTCCTTGTTTCCTGATTGTG
TTGGTTGTGGGTGTGAATCCGGCGATTCTGGTTCCCTTGCTCGTGGAAGTTTCGACCTAA
AACGGATATGCTAACCCGAGGAGAGCTTTCTTAGTCTCCTCCCCTTTGCCGTTGGTGTCT
TCCCATACATGCTTTCTGACCTTGGCTTCTTCTTGCTACTGTTGCCGGTGCGAGCTTGTG
TTTATCAGAGTTTCCGATGTGTTCAGTGGCCCCCCAAAGTCTGCTTTATTATTTGGAAGG
TTCTTCCAGAGATTGTTGGTCACCGGAACTATCATTGCGGCCTCGCTGGGAAGGTATCTC
TGGGACGAGGGTTAAGCAAATGTTCTGGTCCTATTCCATGTTCTTAATCTCTGTTTGTTT
CATTCCTTTGTTGTTCTTTGGTCATTTGCCTTTTTTAAAGTCTTGGTTCAGTTTTTTAGA
TTGTATTTGAAGCCTAGGTTTGTGCAGCTCTGTTGTTTTCCTCTGTTCTATTTCTTAAGT
CTCCCAATGTTGGGCTGTAGTCTCAGGAGATATAGATGTTATCTTCCTGCTTAGTATCCT
GGTTGTATGGTTTCAGGCTGAAGTTTCTAATCAAGTATTGTTCAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1C338TF U 1
AF RS1C338JQ C 243
BS 1 634 RS1C338TF
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BS 656 1006 RS1C338JQ

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GGAAACGGAAATAGAGATCTCATTTTCTCTCTCTCTTTAATCACTGTTCATCTTCCTCCC
TTTTGCTCTTAGAAAACCAGATCTAGGGTTCCTTAGCTCGCCGACTTCGGTGGCTTCTAT
AGCACCGGAGTCGGGTTCCTCTTTGTGTATATTCGGCTTTTTGTTTTGCTCTGTTTTCAT
CTTGGTTTTGTTGGATTAAGTTACGGCCTCTCCGAAGTATCCTTTGGCTTCGGTGTTCCG
GCTTTTCTCCACTTGACAAACGATGATGGCCTATGGCTCTTTGAAACTAACTGGGCTTAG
AAATGGTGGTTTGTAGTGGTTTGATTGTGCTTTTATTTTTCAGATCTGGCGGCCCTGCTT
GTGTTTGGGGCTTTGGCGTGATGACCGATCTAGCTCTGTCCTCCTTGTTTCCTGATTGTG
TTGGTTGTGGGTGTGAATCCGGCGATTCTGGTTCCCTTGCTCGTGGAAGTTTCGACCTAA
AACGGATATGCTAACCCGAGGAGAGCTTTCTTAGTCTCCTCCCCTTTGCCGTTGGTGTCT
TCCCATACATGCTTTCTGACCTTGGCTTCTTCTTGCTACTGTTGCCGGTGCGAGCTTGTG
TTTATCAGAGTTTCCGATGTGTTCAGTGGCCCCC*AAAGTCTGCTTTATTATTTG

QA 1 655 1 655
DS 

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TTTTCTCCACTTGACAAACGATGATGGC*TATGGCTCTTTGAAACTAACTGGGCTTAGAA
ATGGTGGTTTGTAGTGGTTTGATTGTGCTTTTATTTTTCAGATCTGGCGGCCCTGCTTGT
GTTTGGGGCTTTGGCGTGATGACCGATCTAGCTCTGTCCTCCTTGTTTCCTGATTGTGTT
GGTTGTGGGTGTGAATCCGGCGATTCTGGTTCCCTTGCTCGTGGAAGTTTCGACCTAAAA
CGGATATGCTAACCCGAGGAGAGCTTTCTTAGTCTCCTCCCCTTTGCCGTTGGTGTCTTC
CCATACATGCTTTCTGACCTTGGCTTCTTCTTGCTACTGTTGCCGGTGCGAGCTTGTGTT
TATCAGAGTTTCCGATGTGTTCAGTGGCCCCCCAAAGTCTGCTTTATTATTTGGAAGGTT
CTTCCAGAGATTGTTGGTCACCGGAACTATCATTGCGGCCTCGCTGGGAAGGTATCTCTG
GGACGAGGGTTAAGCAAATGTTCTGGTCCTATTCCATGTTCTTAATCTCTGTTTGTTTCA
TTCCTTTGTTGTTCTTTGGTCATTTGCCTTTTTTAAAGTCTTGGTTCAGTTTTTTAGATT
GTATTTGAAGCCTAGGTTTGTGCAGCTCTGTTGTTTTCCTCTGTTCTATTTCTTAAGTCT
CCCAATGTTGGGCTGTAGTCTCAGGAGATATAGATGTTATCTTCCTGCTTAGTATCCTGG
TTGTATGGTTTCAGGCTGAAGTTTCTAATCAAGTATTGTTCAGT

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL5231Contig1 912 2 2 U
GGGGAATAATACAAATCATGTTGGTATGCCTGGTGGTTACGGACCATCACATGGTTCCTT
CCCAACAGGATATAATCCCACTTCCGCTGCTTCAGCTGGGAATTCAACTTCCAATGAGGA
TCTCAGCACATTGCAGTTGAAGGAAAACAACGGCTACAGCACAACAGGGCAACAGAGTGA
AGCATCGTTACCTGTATGGATTGCTGGACCAGGACGAGATGTGCCGAGCCCTTTCTACGG
TTTACAGCACCATGGTCAACACGTGACTTACGCTCCAGCACAAGCCGGTCACGTGGCATT
CCGGGTATGTATCATCCGGGACAAGCAGCAGTGACAGCAGCAGGAGTTCACCATCCGCTC
TTGCAACAGTCTCAGGGTGTTACTGGAGCTGATATGGTTACACCTGGGCCTAACGTCTTC
CAACAGCCTCAGCAAACACCGATGAATTGGCCAAGTAATTACTGAAACAGGAAGGAAAGG
GGGATTGAACCAGAGTATCAGGAAGATATGTTGCGGGTTTTTCGTTGACTGGCGTGTGTG
TGTATGCCATCTAACAAATTACCGAAGAAATCAAACTGAAGTTGAGCATGAAGGGATTGA
CACAGGATGATCATAAAAGGATAGGGGAAGAAGGTATTGCTTATTGAATCTAGTGTTTTT
TTTGGTGTTTCTATATCTTTTCATTTTTGGGCTTTTCTTCGTTATTTTAGCTCTTCTGAG
CTTAAAGCCAATAGAACTTTTGCTACCTGAGTCTGTATCTGAAGACTCTTCCTTCTTTTG
TCAGCCTATTGTGAGAACATGTTCAATATGCAGTTAACCTGAATTTTTTTATTTGATATT
CAAATTACAAGAAAATATATAGAATGTAATAGTCTTCCTGAATATTCAAATATTATTAAA
GTGTTTTCTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D594TF U 1
AF RS1D594JQ C 239
BS 1 641 RS1D594TF
BS 642 912 RS1D594JQ

RD RS1D594TF 653 0 0
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CCCAACAGGATATAATCCCACTTCCGCTGCTTCAGCTGGGAATTCAACTTCCAATGAGGA
TCTCAGCACATTGCAGTTGAAGGAAAACAACGGCTACAGCACAACAGGGCAACAGAGTGA
AGCATCGTTACCTGTATGGATTGCTGGACCAGGACGAGATGTGCCGAGCCCTTTCTACGG
TTTACAGCACCATGGTCAACACGTGACTTACGCTCCAGCACAAGCCGGTCACGTGGCATT
CCGGGTATGTATCATCCGGGACAAGCAGCAGTGACAGCAGCAGGAGTTCACCATCCGCTC
TTGCAACAGTCTCAGGGTGTTACTGGAGCTGATATGGTTACACCTGGGCCTAACGTCTTC
CAACAGCCTCAGCAAACACCGATGAATTGGCCAAGTAATTACTGAAACAGGAAGGAAAGG
GGGATTGAACCAGAGTATCAGGAAGATATGTTGCGGGTTTTTCGTTGACTGGCGTGTGTG
TGTATGCCATCTAACAAATTACCGAAGAAATCAAACTGAAGTTGAGCATGAAGGGATTGA
CACAGGATGATCATAAAAGGATAGGGGAAGAAGGTATTGCT
ATGATCTAGTGT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1D594JQ 674 0 0
GGTTTACAGCACCATGGTCAACACGTGACTTACGCTCCAGCACAAGCCGGTCACGTGGCA
TTCCGGGTATGTATCATCCGGGACAAGCAGCAGTGACAGCAGCAGGAGTTCACCATCCGC
TCTTGCAACAGTCTCAGGGTGTTACTGGAGCTGATATGGTTACACCTGGGCCTAACGTCT
TCCAACAGCCTCAGCAAACACCGATGAATTGGCCAAGTAATTACTGAAACAGGAAGGAAA
GGGGGATTGAACCAGAGTATCAGGAAGATATGTTGCGGGTTTTTCGTTGACTGGCGTGTG
TGTGTATGCCATCTAACAAATTACCGAAGAAATCAAACTGAAGTTGAGCATGAAGGGATT
GACACAGGATGATCATAAAAGGATAGGGGAAGAAGGTATTGCTTATTGAATCTAGTGTTT
TTTTTGGTGTTTCTATATCTTTTCATTTTTGGGCTTTTCTTCGTTATTTTAGCTCTTCTG
AGCTTAAAGCCAATAGAACTTTTGCTACCTGAGTCTGTATCTGAAGACTCTTCCTTCTTT
TGTCAGCCTATTGTGAGAACATGTTCAATATGCAGTTAACCTGAATTTTTTTATTTGATA
TTCAAATTACAAGAAAATATATAGAATGTAATAGTCTTCCTGAATATTCAAATATTATTA
AAGTGTTTTCTTGG

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

CO CL5232Contig1 616 2 7 U
CTAACTACAAATAATACCGTTGTACATTTACCAGTCCAATGAACATTTACTAAACCGTTA
CCGGTTAAGTATGGTCTCCACCATAACATCATTCCATGAATCAATCGGACCGGGTAAGCA
CCAATGCAAACAATCATTCTGAACACTGCTCTTATCTTTCACTCCAGCAAAAGGATTCGG
ATGCCTGTACGGTCCCGGATGCCCGTCTGGTCGGAAAAAAAACATCCCAGTCGTGTCCAA
CAGTCTAAAGTTGGTGGAACCTTCTCCAAAATTCCGAAACACGTCAAGCTCAACGTCACG
CATGACATCATCAACGGTTTTCAACTCCGCCTCGTCTTCTTTAAAGGGCATCGTCCTGTT
CCAATACCCACCAGTGTTCCACTCTCCGTTCTCGAAATGGTCAGGTGTCGTGGTCCGGAA
CAGAACCAGGGGTTTGTGCCTCGAGTCGCGGACGAAGCTCCGGAGTAGCTTCAGGGTTTT
GCGGTAGGAGTAATCGTATCCGAAGTCTGTTAGGTTGTTTCTGCCTTGGCAGTAATGGCA
GCCTGTGACTGTGTTGTTTTCGTGGAATATCGTTGCTTTGAGGAACCATTTGCCACCGGA
GATGACGACGTAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A248TR U 121
AF RS1FJ96TF C 1
BS 1 120 RS1FJ96TF
BS 121 326 RS1A248TR
BS 327 327 RS1FJ96TF
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BS 410 414 RS1A248TR
BS 415 616 RS1FJ96TF

RD RS1A248TR 297 0 0
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ATGCCTGTACGGTCCCGGATGCCCGTCTGGTCGGAAAAAAAACATCCCAGTCGTGTCCAA
CAGTCTAAAGTTGGTGGAACCTTCTCCAAAATTCCGAAACACGTCAAGCTCAACGTCACG
CATGACATCATCAACGGTTTTCAACTTCGCCTCGTCTTCTTTAAAGGGCATCGTCCTGTT
CCAATACCCACCAGTGTTCCACTCTCCGTTCTCGAAATGGTCAGGTGTTGTGGT
TCG

QA 1 294 1 294
DS 

RD RS1FJ96TF 616 0 0
CTAACTACAAATAATACCGTTGTACATTTACCAGTCCAATGAACATTTACTAAACCGTTA
CCGGTTAAGTATGGTCTCCACCATAACATCATTCCATGAATCAATCGGACCGGGTAAGCA
CCAATGCAGACAATCATTCTGAACACTGCTCTTATCTTTCACTCCAGCAAAAGGATTCGG
ATGCCTGTACGGTCCCGGATGCCCGTCTGGTCGGAGAAGAGACATCCCCGTCGTGTCCAA
CAGTCTAAAGTTGGTGGAACCTTCTCCAAAATTCCGAAACACGTCAAGCTCAACGTCACG
CATGACATCATCAACGGTTTTCAACTCCGCCTCGTCTTCTTTAAAGGGCATCGTCCTGTT
GCAATACCCACCAGTGTTCCACTCTCCGTTCTCGAAATGGTCAGGTGTCGTGGTCCGGAA
CAGAACCAGGGGTTTGTGCCTCGAGTCGCGGACGAAGCTCCGGAGTAGCTTCAGGGTTTT
GCGGTAGGAGTAATCGTATCCGAAGTCTGTTAGGTTGTTTCTGCCTTGGCAGTAATGGCA
GCCTGTGACTGTGTTGTTTTCGTGGAATATCGTTGCTTTGAGGAACCATTTGCCACCGGA
GATGACGACGTAATCC

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 2

CO CL5233Contig1 1282 2 2 U
GGATAGTCCACACTTTCCTCTCACGGAAGAGAGAAGACATAGTTTCTTCAATCGGCGCCA
GATCCTCCGAGAGTGGCAGATATGATGGAATCGGGGGCTGGTCTCTTGGCGATGGAAGAG
AGGATCCTACCGGGAAGCTTCTTCCAGTTTCCTCTTCCTGGATTCAGTGCTTCTCCCAAT
CGGTTATCTCCTTGTCCTCCTCCCCCTCCTCCCACTGGTCGTGAGAGGTACTTGGCTGAA
TTGCTGCAAGAGAGGCAAAAGTTGGGTCCTTTCTCACAACTTATGCCACATTGCTTCAGA
CTACTTAATCAAGAAATTCGGAGGGTCTCAAGTTTATCCGACCTTGATAGATATGAGCCT
GGCAGTCCATTTAGATCGCCTGCTCTTCTGCCCCCGACTAATGGAAAGCTTGATTTTGAT
GGATGGTCAATGATGCAAGCAGAGGAGAATTTTCATCACCAGAGAGCTTCCCCATTTCGT
GCTCCAGTAGGCTGGGGACTCCATTCTCCTCCTCCACCCATTGTGAAAAGAGTGATTAGG
CTTGATGTGCCTGTCGATCAATTTCCAACCTTCAATTTCGTTGGGCGGATTCTCGGCCCG
CGTGGGAACTCTCTAAAAAGAGTCGAGCTGGCAACACAGTGTAGGGTGTTTATTAGAGGA
CGAGGATCCGTCAAGGATACTCTCAAGGAGGAGAAACTCAAAGGTAAGCCAGGTTACGAG
CATCCCAGTGAGCCACTACATTTACTGATCGAAGCCGAGCTTCCCGAGGACATAATCAAC
TCTCGATTGGAGCATGCAGTTCATTTCCTTGAGTCGCTCCTAAAGCCAATGGACGAATCA
GTGGACCACTACAAGAGGGAACAGCTGAAGGAGTTAGCTGCTCTGAATGGTACGCTAAGG
GAAGAGAGTCCAAGTCCGAGCTTGAGCCCTTGTCTGAGTCCGAGCATGTCCCCTTTCAAC
ACCAAGCGTGCCAAGACTGGACAATAAAGATTTTTACACGAGAGATGATTTCCTTTTTTT
TCTGTGATTCGGACAGAGAAACCATGGCATGGTCGTGTGGACTTGGGGCAAATGCTCTCT
CTCTATGCATCATTGCCTATCTATCGGCGGGGTGATAACGTTCTAACGTTTTTGATGAGA
CACTTCAATTAATTTGTTTTGGTCATTAAGTTTATTCTTTATATTTTTGAAAGTTTTGTT
GGCTAGCAGTGATTACCATTGACTGGGTAATAATAATCTTAATAATGGCGTTTATGAAAT
GTAATCTCGTTCTGATTCATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1C363TF U 1
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CTACTTAATCAAGAAATTCGGAGGGTCTCAAGTTTATCCGACCTTGATAGATATGAGCCT
GGCAGTCCATTTAGATCGCCTGCTCTTCTGCCCCCGACTAATGGAAAGCTTGATTTTGAT
GGATGGTCAATGATGCAAGCAGAGGAGAATTTTCATCACCAGAGAGCTTCCCCATTTCGT
GCTCCAGTAGGCTGGGGACTCCATTCTCCTCCTCCACCCATTGTGAAAAGAGTGATTAGG
CTTGATGTGCCTGTCGATCAATTTCCAACCTTCAATTTCGTTGGGCGGATTCTCGGCCCG
CGTGGGAACTCTCTAAAAAGAGTCGAGCTGGCAACACAGTGTAGGGTGTTTATTAGAGGA
CGAGGATCCGTCAAGGATACTCTCAAGGAGGAGAAACTC

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CCTGTCGATCAATTTCCAACCTTCAATTTCGTTGGGCGGATTCTCGGCCCGCGTGGGAAC
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GTCAAGGATACTCTCAAGGAGGAGAAACTCAAAGGTAAGCCAGGTTACGAGCATCCCAGT
GAGCCACTACATTTACTGATCGAAGCCGAGCTTCCCGAGGACATAATCAACTCTCGATTG
GAGCATGCAGTTCATTTCCTTGAGTCGCTCCTAAAGCCAATGGACGAATCAGTGGACCAC
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CCAAGTCCGAGCTTGAGCCCTTGTCTGAGTCCGAGCATGTCCCCTTTCAACACCAAGCGT
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CGGACAGAGAAACCATGGCATGGTCGTGTGGACTTGGGGCAAATGCTCTCTCTCTATGCA
TCATTGCCTATCTATCGGCGGGGTGATAACGTTCTAACGTTTTTGATGAGACACTTCAAT
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GGGAATGTGTCTGAATACAATTCTGTTTTCTAGTTCG


BQ
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BS 1 277 RS1FO07TF

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GGGAATGTGTCTGAATACAATTCTGTTTTCTAGTTCG

QA 1 277 1 277
DS 



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CGTGTTGGGAGGTCTTCCAATACATGACTTGCTCGGAGAATAAAGCGTCCTTCTTCGGAG
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TAGTTTTGTCGGACAAACGAACCAGACTAATAACCAAGTGAGGAGAAGGTCAAGATTTCT
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AATTAGG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FR61TF U 1
AF RS1FR61JQ C 142
BS 1 293 RS1FR61TF
BS 294 294 RS1FR61JQ
BS 295 459 RS1FR61TF
BS 460 460 RS1FR61JQ
BS 461 554 RS1FR61TF
BS 555 907 RS1FR61JQ

RD RS1FR61TF 554 0 0
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GAGGTCGTAAGAGGAACAACAACAACAGAGTTGCTGAGCGAGTTTCTCGTAGGACTCAAA
AGAGGCAAAAGAAGTCAGAAGCTTCCGATACTGACTCCATCGCCACTGGGAGTCGTTCAG
CAAGCGATGCAAAACATAAAGAAAATGAAGATGCCACGTCCTCTTCTCAGAAGCATGTGA
AATCTGGGAGCTCTAAGAATTCAAGAAAGAACGACACTCCTGTAGAAGACTCCGAGAATT
CTGTGGAGAGTGACGATCCTGCTTCTCAGTTAAATGCGGTTGCATCTGAACCGTGTAGCG
ATGGGAGTTTAAGGAAAGAAGAGTTTATGGGTGAAAATGTATGTCCAGGAGGAGTATCTG
AAGATGAGTCGTGGAGACCACTTGAGAAAAGCCTTTTCCGAAAAGGTGTTGAGATTTTTG
GAATGAATAGGTGAGTAACATATGCCAGGTTTCTAAATGTGTAGGAGGATATAGTCATTA
TTAATTATCTGTTT

QA 1 554 1 554
DS 

RD RS1FR61JQ 766 0 0
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AAAATGAAGATGCCACGTCCTCTTCTCAGAAGCATGTGAAATCTGGGAGCTCTAAGAATT
CAAGAAAGAACGACACTCCTGTAGAAGACTCCAAGAATTCTGTGGAGAGTGACGATCCTG
CTTCTCAGTTAAATGCGGTTGCATCTGAACCGTGTAGCGATGGGAGTTTAAGGAAAGAAG
AGTTTATGGGTGAAAATGTATGTCCAGGAGGAGTATCTGAAGATGAGTCGTGGAGACCAC
TTGAGAAAAGCCTTTTCCAAAAAGGTGTTGAGATTTTTGGAATGAATAGGTGAGTAACAT
ATGCCAGGTTTCTAAATGTGTAGGAGGATATAGTCATTATTAATTATCTGTTTCTTTGTA
GCTGCATGATTGCTAGGAACCTTCTGTGTGGTCTCAAGTCGTGTTGGGAGGTCTTCCAAT
ACATGACTTGCTCGGAGAATAAAGCGTCCTTCTTCGGAGGTGATGCGTTGAATCCCGACG
GCTCTTCCAAGTTTGATATCAATGGAAATATGGTATAGTGCTATTGTTGTACATATGTTC
CTATTATAATGCATTTAGTTCTCGTCAGAACTAATACTTTAGTTTTGTCGGACAAACGAA
CCAGACTAATAACCAAGTGAGGAGAAGGTCAAGATTTCTACGTAGAAGAGGCAAAGTGCG
GCGGTTGAAGTGTACGTGGAAGTCTGCAGCATATCATTCAATTAGG

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

CO CL5236Contig1 1049 2 2 U
GGACGTTCAAAACTCCAAAACCTTTTGGAGCAAATCGCGATCCTTTCAATCGAAATTGAT
AATCAAGAAAGCCATTCAAATGTCAGCGACGACGACGAACACGACGGGACCGGACTCGGC
GCCGTCTCCGCCTTCTTCTCGCGTCGGCAGAGCCAATTCCGACGGAATCATCTGCTTCTT
CCTCGCAGCAGTACGTTTCGTTAGCTCAACTGGAGGATACAGGAAACACTAGTGGTCTCA
GTAATTCTGCAAAGCATCTTGAATCAGCCAACACAATGTTCTCGTTCATCTGGTGGGTAA
TCGGATTCTACTGGGTATCTGCGGGAGGCCAAACACTCTCTAGTGACGCTCCTCAGCTCT
ATTGGTTGTGTATCATATTTCTTGGTTTCGATGTTTTCTTTGTTGTATTCTGTGTTGCAC
TGGCTTGTGTTGTGGGACTTGCTGTTTGCTGCTGTCTTCCATGTATAATTGCAATCTTAT
ATGCTGTTGCCGACGAGGAGGGAGCATCGAAGAAGGACATAGATCAAATGCCGAAATTCA
GATTTAGAAAGATAGGCAACGGTGAAAAGCTCCAAGGCGAAACTACCGACCGAGGAATAA
TGACAGAATGTGGAACAGATTCACCTATCGAACGCTCACTTTCTTCAGAAGACTCGGAAT
GTTGCATATGTTTGTGCGGATATGAAGACGGAGTTGAACTAAGAGAACTACCTTGTAACC
ATCACTTTCATTGCACTTGCATCGACAAATGGCTTCACATAAACTCTCGTTGCCCGCTTT
GCAAGTTCAACATCTTGAAGAATGAAAACGAAGTCTAGTGATCTTTCGTGGGGATCGGAT
CACCTGAACAAAATCTCCGACCAGAAGTTTTCAGGTAAATGTAAAAGCTCTGGGGTGTGT
TTTAAGTGTTGTGCATTTAGGATTGTAGATCAATGTATTGTGTGTGTCACATTGACGAGT
GAGAAACATGTGAATTCAACCTTGGACCTGTTTTTTTTTATCTTGGCGTGTCCACGTGGA
AACATAAACTTGTGTTTCTGGTTTTATTC


BQ
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AF RS1EU73TF U 1
AF RS1EU73JQ C 457
BS 1 717 RS1EU73TF
BS 718 1049 RS1EU73JQ

RD RS1EU73TF 719 0 0
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AATCAAGAAAGCCATTCAAATGTCAGCGACGACGACGAACACGACGGGACCGGACTCGGC
GCCGTCTCCGCCTTCTTCTCGCGTCGGCAGAGCCAATTCCGACGGAATCATCTGCTTCTT
CCTCGCAGCAGTACGTTTCGTTAGCTCAACTGGAGGATACAGGAAACACTAGTGGTCTCA
GTAATTCTGCAAAGCATCTTGAATCAGCCAACACAATGTTCTCGTTCATCTGGTGGGTAA
TCGGATTCTACTGGGTATCTGCGGGAGGCCAAACACTCTCTAGTGACGCTCCTCAGCTCT
ATTGGTTGTGTATCATATTTCTTGGTTTCGATGTTTTCTTTGTTGTATTCTGTGTTGCAC
TGGCTTGTGTTGTGGGACTTGCTGTTTGCTGCTGTCTTCCATGTATAATTGCAATCTTAT
ATGCTGTTGCCGACGAGGAGGGAGCATCGAAGAAGGACATAGATCAAATGCCGAAATTCA
GATTTAGAAAGATAGGCAACGGTGAAAAGCTCCAAGGCGAAACTACCGACCGAGGAATAA
TGACAGAATGTGGAACAGATTCACCTATCGAACGCTCACTTTCTTCAGAAGACTCGGAAT
GTTGCATATGTTTGTGCGGATATGAAGACGGAGTTGAACTAAGAGAACTACCTTGTA
CC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1EU73JQ 593 0 0
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ACATAGATCAAATGCCGAAATTCAGATTTAGAAAGATAGGCAACGGTGAAAAGCTCCAAG
GCGAAACTACCGACCGAGGAATAATGACAGAATGTGGAACAGATTCACCTATCGAACGCT
CACTTTCTTCAGAAGACTCGGAATGTTGCATATGTTTGTGCGGATATGAAGACGGAGTTG
AACTAAGAGAACTACCTTGTAACCATCACTTTCATTGCACTTGCATCGACAAATGGCTTC
ACATAAACTCTCGTTGCCCGCTTTGCAAGTTCAACATCTTGAAGAATGAAAACGAAGTCT
AGTGATCTTTCGTGGGGATCGGATCACCTGAACAAAATCTCCGACCAGAAGTTTTCAGGT
AAATGTAAAAGCTCTGGGGTGTGTTTTAAGTGTTGTGCATTTAGGATTGTAGATCAATGT
ATTGTGTGTGTCACATTGACGAGTGAGAAACATGTGAATTCAACCTTGGACCTGTTTTTT
TTTATCTTGGCGTGTCCACGTGGAAACATAAACTTGTGTTTCTGGTTTTATTC

QA 1 593 1 593
DS 



AS 1 2

CO CL5237Contig1 434 2 1 U
GGAATCTCTTCAGTTTGCACTCAAAACCTCCTAACTTTACAGATTCAGACCTACCAAATG
GCACCATCATCTGCGATGTTCATGCTCTCCTCCTATCCTCAAATTCAGCAGTTACCAACA
ACACACAATAGTACTCTGCAGCCACAACAACAGGAACCGTCTCTGCCGGTGGTTAAATGT
CACCTTCCGGCAAGAAGCTCATCAGAAAGTTCTGAAAGTTCTCGTTCCAAGTTTATTTTC
TGGCTGTTTGGTGATCCTGCTACCTACGACAAGAGGTTCCAACGAGCTGTTGAACTTAGT
TGCTCCTGATGGAGGTTCTTCCTACTTTCTTCTTTTGTGTGTGTTGTAAATGAACATATG
TAATTTCTTCCTCATAATCTCATCATGTTCTGTAATATACAATAATGAAATCGTTTGAAG
ATGTTTGATACACC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RS1F407TF U 1
AF RS1BR07TF U 17
BS 1 434 RS1F407TF

RD RS1F407TF 434 0 0
GGAATCTCTTCAGTTTGCACTCAAAACCTCCTAACTTTACAGATTCAGACCTACCAAATG
GCACCATCATCTGCGATGTTCATGCTCTCCTCCTATCCTCAAATTCAGCAGTTACCAACA
ACACACAATAGTACTCTGCAGCCACAACAACAGGAACCGTCTCTGCCGGTGGTTAAATGT
CACCTTCCGGCAAGAAGCTCATCAGAAAGTTCTGAAAGTTCTCGTTCCAAGTTTATTTTC
TGGCTGTTTGGTGATCCTGCTACCTACGACAAGAGGTTCCAACGAGCTGTTGAACTTAGT
TGCTCCTGATGGAGGTTCTTCCTACTTTCTTCTTTTGTGTGTGTTGTAAATGAACATATG
TAATTTCTTCCTCATAATCTCATCATGTTCTGTAATATACAATAATGAAATCGTTTGAAG
ATGTTTGATACACC

QA 1 434 1 434
DS 

RD RS1BR07TF 413 0 0
GG
ACTCAAAACCTCCTAACTTTACAGATTCAGACCTACCAAATGGCACCATCATCTGCGATG
TTCATGCTCTCCTCCTATCCTCAAATTCAGCAGTTACCAACAACACACAATAGTACTCTG
CAGCCACAACAACAGGAACCGTCTCTGCCGGTGGTTAAATGTCACCTTCCGGCAAGAAGC
TCATCAGAAAGTTCTGAAAGTTCTCGTTCCAAGTTTATTTTCTGGCTGTTTGGTGATCCT
GCTACCTACGACAAGAGGTTCCAACGAGCTGTTGAACTTAGTTGCTCCTGATGGAGGTTC
TTCCTACTTTCTTCTTTTGTGTGTGTTGTAAATGAACATATGTAATTTCTTCCTCATAAT
CTCATCATGTTCTGTAATATACAATAAT*AAATCGTTTGAAGATGTTTGAT

QA 3 413 3 413
DS 



AS 1 2

CO CL5238Contig1 912 2 2 U
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GCGTTGCGAAAGCTGCGAAGAGACCTGTGGTTCTTGTCTTGATATGTGGCGGTCCTGTCG
ATGTCTCGTTTGCTAAGGATAACGACAATATCGGTAGCATTGTTAGGGCTGGTTATCCTG
GTGAAGCTGGAGGTGTTGCTCTTGCTGAGATCTTGTTCGGTGATCACAATCCTGGCGGGA
GATTACCTGTGACATGGTATCCACAGAGCTTTGTGAATGTGAAGATGACAGACACGGGGA
TGAGATCATCATCATCTGGATATCCAGGAAGGACTTACAGATTCTACAAAGGACCTAAAG
TGTTTGAGTTTGGTCACGGCTTAAGCTACACAACTTACTCTTACCAGTTCAAGACTCTTC
CTCAAAACACTCTCTACTTGAACCAATCCAAACCTCAAACCAACTCAGACTCTCTTCGAT
ACGCTCTGGTCTCAGAAATGGGAAAAGAAAGCTGCGAAACAGCCAAGACTAAGGTGAGCG
TTGTGGTCGAGAACCAAGGAGAGGTGGCTGGGAAACATCCGGTGCTGGTGTTTGCGAGGC
ACGAAAGAGGAGGAGGAGAAGATGGGACGCGAGCTGAGAAACAGCTTGTCGGGTTTAAGA
GCGTTGTGTTGAGAAACGGAGAGAGAGGTGAAGTTGAGTTTGAGGTTGGTGTTTGTGAGC
ATTTGGGCAGAGCTAATGAAGTTGGTGTTATGGTTGTTGAAGAAGGAAAGTACTTTTTAA
CCGTTGGAAACTCAGAGCTCCCTCTTACAGTTAATGTCTAAATCTTTAAAAAAAAAAAAC
ATAATGTAAGAAAAAAACTTCCTTTTGGATTGGCTTTTGAGTGGATTGGAAATAAGGAAA
CGTGATTTGTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FH12TF U 1
AF RS1FH12JQ C 479
BS 1 648 RS1FH12TF
BS 649 912 RS1FH12JQ

RD RS1FH12TF 648 0 0
GGGAAGACTTTGACCGTGTCGACCTTAGTTTACCAGGGAAGCAACGAGAGCTGATAATAA
GCGTTGCGAAAGCTGCGAAGAGACCTGTGGTTCTTGTCTTGATATGTGGCGGTCCTGTCG
ATGTCTCGTTTGCTAAGGATAACGACAATATCGGTAGCATTGTTAGGGCTGGTTATCCTG
GTGAAGCTGGAGGTGTTGCTCTTGCTGAGATCTTGTTCGGTGATCACAATCCTGGCGGGA
GATTACCTGTGACATGGTATCCACAGAGCTTTGTGAATGTGAAGATGACAGACACGGGGA
TGAGATCATCATCATCTGGATATCCAGGAAGGACTTACAGATTCTACAAAGGACCTAAAG
TGTTTGAGTTTGGTCACGGCTTAAGCTACACAACTTACTCTTACCAGTTCAAGACTCTTC
CTCAAAACACTCTCTACTTGAACCAATCCAAACCTCAAACCAACTCAGACTCTCTTCGAT
ACGCTCTGGTCTCAGAAATGGGAAAAGAAAGCTGCGAAACAGCCAAGACTAAGGTGAGCG
TTGTGGTCGAGAACCAAGGAGAGGTGGCTGGGAAACATCCGGTGCTGGTGTTTGCGAGGC
ACGAAAGAGGAGGAGGAGAAGATGGGACGCGAGCTGAGAAACAGCTTG

QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1FH12JQ 434 0 0
ATACGCTCTGGTTTCAGAAATGGGAAAAGAAAGCTGCGAAACAGCCAAGACTAAGGTGAG
CGTTGTGGTCGAGAACCAAGGAGAGGTGGCTGGGAAACATCCGGTGCTGGTGTTTGCGAG
GCACGAAAGAGGAGGAGGAGAAGATGGGACGCGAGCTGAGAAACAGCTTGTCGGGTTTAA
GAGCGTTGTGTTGAGAAACGGAGAGAGAGGTGAAGTTGAGTTTGAGGTTGGTGTTTGTGA
GCATTTGGGCAGAGCTAATGAAGTTGGTGTTATGGTTGTTGAAGAAGGAAAGTACTTTTT
AACCGTTGGAAACTCAGAGCTCCCTCTTACAGTTAATGTCTAAATCTTTAAAAAAAAAAA
ACATAATGTAAGAAAAAAACTTCCTTTTGGATTGGCTTTTGAGTGGATTGGAAATAAGGA
AACGTGATTTGTGT

QA 1 434 1 434
DS 



AS 1 2

CO CL5239Contig1 434 2 2 U
GGATATTTTCTTTCTTTCTGTAATCCCGTAGAGTTTGAGAAGATCAATCTGCTCTCCACT
TTTTTTATTCTTGCCGTTCTCTCTAAGCATGTAGAACTTGACAAACTAATTGACTTATGG
CTGTAGGGAACTTTGGCATTCTGAGTCACCACCAATGTTGCACCAGGTTTGATTTTGGCT
TACTGATTGCATTGTTGACACAAGACTTTGGACTTAGTTGGAAAGTCGTGGAAGTTCATG
GAGAAAGACAGAGCAGTGTTCATGGAGATGTGAATAATGATTAGTTTTATAATATTGTTT
AGCAATTTTTGTTTATTTATGCCTTGTGAGTTTGTACGATGAATGAATTGTGTTATTTCT
TTTTTACGTGCACTGATTTTCCTAATTAATTAATTAATTGTTTTGTATGTATTAATATAC
ATTTTTCAGAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1FI21JQ C 1
AF RS1FI21TF U 18
BS 1 17 RS1FI21JQ
BS 18 434 RS1FI21TF

RD RS1FI21JQ 434 0 0
GGATATTTTCTTTCTTTCTGTAATCCCGTAGAGTTTGAGAAGATCAATTTGCTTTCCACT
TTTTTTATTCTTGCCGTTCTCTCTAAGCATGTAGAACTTGACAAACTAATTGACTTATGG
CTGTAGGGAACTTTGGCATTTTGAGTCACCACCAATGTTGCACCAGGTTTGATTTTGGCT
TACTGATTGCATTGTTGACACAAGACTTTGGACTTAGTTGGAAAGTCGTGGAAGTTCATG
GAGAAAGACAGAGCAGTGTTCATGGAGATGTGAATAATGATTAGTTTTATAATATTGTTT
AGCAATTTTTGTTTATTTATGCCTTGTGAGTTTGTACGATGAATGAATTGTGTTATTTCT
TTTTTACGTGCACTGATTTTCCTAATTAATTAATTAATTGTTTTGTATGTATTAATATAC
ATTTTTCAGAAGCC

QA 1 434 1 434
DS 

RD RS1FI21TF 417 0 0
CTGTAATCCCGTAGAGTTTGAGAAGATCAATCTGCTCTCCACTTTTTTTATTCTTGCCGT
TCTCTCTAAGCATGTAGAACTTGACAAACTAATTGACTTATGGCTGTAGGGAACTTTGGC
ATTCTGAGTCACCACCAATGTTGCACCAGGTTTGATTTTGGCTTACTGATTGCATTGTTG
ACACAAGACTTTGGACTTAGTTGGAAAGTCGTGGAAGTTCATGGAGAAAGACAGAGCAGT
GTTCATGGAGATGTGAATAATGATTAGTTTTATAATATTGTTTAGCAATTTTTGTTTATT
TATGCCTTGTGAGTTTGTACGATGAATGAATTGTGTTATTTCTTTTTTACGTGCACTGAT
TTTCCTAATTAATTAATTAATTGTTTTGTATGTATTAATATACATTTTTCAGAAGCC

QA 1 417 1 417
DS 



AS 1 2

CO CL5240Contig1 1018 2 2 U
GTTTGTTTTGGTGCCAACCTCCACCGCAACAATCGCTAGCTTCAACCTCCGGAGTCGCCG
TAAGGAATCCTCCGTGGCATATTTTTTGAGGTCTACAAAGTGTTTTTGCCTTTCTTAACG
AACTAGGAAATGGTTAAAAGTCATGGAGAGTTTTGATTTACTAGAGATATCATGACGCAG
TGCATAGACGGATTCAAGCATGTATGCAACTCTCTGTTTCGGTGTTTTGATATCGAGATA
TATAAACAGTCTGGAGGCCTTGGAGATCCTGAACTACTTGCCAGAGAGACAGTTTTTAGC
GTGAGTGAAATAGAGGCTCTCTATGAGCTGTTTAAGAAAATCAGCAGTGCTGTCATTGAT
GATGGGCTAATAAACAAGGAAGAGTTTCAACTAGCCTTGTTCAAGACCAATAAAAAAGAG
AGCTTGTTTGCAGACCGGGTGTTTGATTTGTTTGACACAAAGCATAATGGAATATTGGGG
TTTGAGGAGTTTGCCCGTGCTCTCTCCGTCTTTCATCCAAATGCTCCTATAGACGACAAG
ATTGATTTTTGTTTCAGCTATATGATCTTAAGCAGCAAGGTTTCATCGAGAGGCAGGAGG
TGAAGCAAATGGTGGTGGCTACTCTTGCTGAGTCAGGCATGAACCTGTCAGACGAAGTCA
TAGAGAGTATAATCGACAAGACATTTGAAGAAGCTGACACAAAGCATGACGGGAGGATCG
ATAAGGAAGAGTGGAGGATCCTTGTTTTTAGGCATCCTTCGCTTTTGAAGAACATGACAC
TTCAGTATCTCAAGGATATCACGACTACGTTTCCGAGCTTTGTGTTTCATTTTCAGGTGG
AAGATACCTGAGAAGAGCATAGCAGATCAAACAGTTTGGCAAGTGTGTTTGTTTTCAGTC
ATGTATCATGTTTATTTGTTTTTTTTTAAATCTCTTTGAACTCCAGTTTCCAAGATTTTG
TTGTTTTTTCTGTGAAAATGGAAAAGAAAAAAAACGAAAACAAAGTTGTATTTTTAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1B830TF U 1
AF RS1B830JQ C 298
BS 1 710 RS1B830TF
BS 711 1018 RS1B830JQ

RD RS1B830TF 710 0 0
GTTTGTTTTGGTGCCAACCTCCACCGCAACAATCGCTAGCTTCAACCTCCGGAGTCGCCG
TAAGGAATCCTCCGTGGCATATTTTTTGAGGTCTACAAAGTGTTTTTGCCTTTCTTAACG
AACTAGGAAATGGTTAAAAGTCATGGAGAGTTTTGATTTACTAGAGATATCATGACGCAG
TGCATAGACGGATTCAAGCATGTATGCAACTCTCTGTTTCGGTGTTTTGATATCGAGATA
TATAAACAGTCTGGAGGCCTTGGAGATCCTGAACTACTTGCCAGAGAGACAGTTTTTAGC
GTGAGTGAAATAGAGGCTCTCTATGAGCTGTTTAAGAAAATCAGCAGTGCTGTCATTGAT
GATGGGCTAATAAACAAGGAAGAGTTTCAACTAGCCTTGTTCAAGACCAATAAAAAAGAG
AGCTTGTTTGCAGACCGGGTGTTTGATTTGTTTGACACAAAGCATAATGGAATATTGGGG
TTTGAGGAGTTTGCCCGTGCTCTCTCCGTCTTTCATCCAAATGCTCCTATAGACGACAAG
ATTGATTTTTGTTTCAGCTATATGATCTTAAGCAGCAAGGTTTCATCGAGAGGCAGGAGG
TGAAGCAAATGGTGGTGGCTACTCTTGCTGAGTCAGGCATGAACCTGTCAGACGAAGTCA
TAGAGAGTATAATCGACAAGACATTTGAAGAAGCTGACACAAAGCATGAC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1B830JQ 721 0 0
AGCGTGAGTGAAATAGAGGCTCTCTATGAGCTGTTTAAGAAAATCAGCAGTGCTGTCATT
GATGATGGGCTAATAAACAAGGAAGAGTTTCAACTAGCCTTGTTCAAGACCAATAAAAAA
GAGAGCTTGTTTGCAGACCGGGTGTTTGATTTGTTTGACACAAAGCATAATGGAATATTG
GGGTTTGAGGAGTTTGCCCGTGCTCTTTCCGTCTTTCATCCAAATGCTCCTATAGACGAC
AAGATTGATTTTTGTTTCAGCTATATGATTTTAAGCAGCAAGGTTTCATCGAGAGGCAGG
AGGTGAAGCAAATGGTGGTGGCTACTCTTGCTGAGTCAGGCATGAACCTGTCAGACGAAG
TCATAGAGAGTATAATCGACAAGACATTTGAAGAAGCTGACACAAAGCATGACGGGAGGA
TCGATAAGGAAGAGTGGAGGATCCTTGTTTTTAGGCATCCTTCGCTTTTGAAGAACATGA
CACTTCAGTATCTCAAGGATATCACGACTACGTTTCCGAGCTTTGTGTTTCATTTTCAGG
TGGAAGATACCTGAGAAGAGCATAGCAGATCAAACAGTTTGGCAAGTGTGTTTGTTTTCA
GTCATGTATCATGTTTATTTGTTTTTTTTTAAATCTCTTTGAACTCCAGTTTCCAAGATT
TTGTTGTTTTTTCTGTGAAAATGGAAAAGAAAAAAAACGAAAACAAAGTTGTATTTTTAA
G

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL5241Contig1 887 2 2 U
GGATGGTCGGGAAAATTCAGATTCTCTTGTTAAGCCGCACGCTCCCAACACCGTCCACAC
CTTCTTCCTATCCTTCCTCCGACCTTTATTTAACAATAAACTATTTTTTAAGTACTGTTT
AATCAGTTTATGCTTTTTATATCAACAAAACGAGGAGCTACTATTATAAGAGAAAGAAGA
GAGAGAGAAAGAAGAACAAGAGCCTCCGATCGTCTTCCTCCGCTCCGGCCGACGTTGGTG
GGTTTCTTCCGCCACGGCGTCGGTTGGACCCTCTGATCTGTTTTCTTTTTTTTTTCTTTT
CGGCTTGGTTTGTACAGTTTTGGTTTCGGAGTTGCACCTCCATGGTTGTCGTCCGCTTTT
GGCTCCGGGAGGCGGTGGCTTATCCAGCATCGTTGATCGCCGGGCTTTTGACTCCAGTAC
CCGCGCTAGTCTCTCCGATGAGATCTCGATATGGTATCGTTTGAAGCTATCCGACTATAA
CGTTGAAGAAGCAAGAGAAGGGTATGGTGGTTGTCCGTAGCCTCGGATGAGATCTCGGGA
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GGGCTTCGGCGACGAAGAAAAGTGCGGAGGTTCAAGCTCCGGCGAGAATTCCCGGCGAAG
GACGTGTCGCAGTGGTCTCGGTTTGTGTCCGTATTGTGTGACGCGTGTTCTGTCGGTGTA
GGAATTGCAACACGTGGACGTCTACGTGATCGGTTTAGACGCGTGAGGGTGAAAAGTGTG
TGGGCTGGGTTTCAGGCTCATTGGTTTTAACTTGCCCTTTATGTTGGGCCTTTGTATCTG
TACTTTCGTTGTTATCTGGGCTTTAGTCTCATAATAAATTAGACGAC


BQ
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AF RS1DT83TF U 1
AF RS1DT83JQ C 302
BS 1 562 RS1DT83TF
BS 563 887 RS1DT83JQ

RD RS1DT83TF 562 0 0
GGATGGTCGGGAAAATTCAGATTCTCTTGTTAAGCCGCACGCTCCCAACACCGTCCACAC
CTTCTTCCTATCCTTCCTCCGACCTTTATTTAACAATAAACTATTTTTTAAGTACTGTTT
AATCAGTTTATGCTTTTTATATCAACAAAACGAGGAGCTACTATTATAAGAGAAAGAAGA
GAGAGAGAAAGAAGAACAAGAGCCTCCGATCGTCTTCCTCCGCTCCGGCCGACGTTGGTG
GGTTTCTTCCGCCACGGCGTCGGTTGGACCCTCTGATCTGTTTTCTTTTTTTTTTCTTTT
CGGCTTGGTTTGTACAGTTTTGGTTTCGGAGTTGCACCTCCATGGTTGTCGTCCGCTTTT
GGCTCCGGGAGGCGGTGGCTTATCCAGCATCGTTGATCGCCGGGCTTTTGACTCCAGTAC
CCGCGCTAGTCTCTCCGATGAGATCTCGATATGGTATCGTTTGAAGCTATCCGACTATAA
CGTTGAAGAAGCAAGAGAAGGGTATGGTGGTTGTCCGTAGCCTCGGATGAGATCTCGGGA
CAGTTTCGGTGAAGCTCTCCGA

QA 1 562 1 562
DS 

RD RS1DT83JQ 586 0 0
GGCTTGGTTTGTACAGTTTTGGTTTCGGAGTTGCACCTCCATGGTTGTCGTCCGCTTTTG
GCTCCGGGAGGCGGTGGCTTATCCAGCATCGTTGATCGCCGGGCTTTTGACTCCAGTACC
CGCGCTAGTCTCTCCGATGAGATCTCGATATGGTATCGTTTGAAGCTATCCGACTATAAC
GTTGAAGAAGCAAGAGAAGGGTATGGTGGTTGTCCGTAGCCTCGGATGAGATCTCGGGAC
AGTTTCGGTGAAGCTCTCCGATTAGAAAAGGGCTTCAGCGACGATCTCCGATTAGAAAAG
GGCTTCGGCGACGAAGAAAAGTGCGGAGGTTCAAGCTCCGGCGAGAATTCCCGGCGAAGG
ACGTGTCGCAGTGGTCTCGGTTTGTGTCCGTATTGTGTGACGCGTGTTCTGTCGGTGTAG
GAATTGCAACACGTGGACGTCTACGTGATCGGTTTAGACGCGTGAGGGTGAAAAGTGTGT
GGGCTGGGTTTCAGGCTCATTGGTTTTAACTTGCCCTTTATGTTGGGCCTTTGTATCTGT
ACTTTCGTTGTTATCTGGGCTTTAGTCTCATAATAAATTAGACGAC

QA 1 586 1 586
DS 



AS 1 2

CO CL5242Contig1 1549 2 2 U
GTAAGGCCGAGATCAAATAAATGTGCCTCCAAGTCGTTTACCGTGAATGAACCCTCATTT
CTAATAATTTCTTTCACCTCTTCTTCGTTCGGATCATAAAGCGGTACTTTGAACGAATTC
ACCTTTGATGCACTCACAAGACCCTGTACAAAAGATCATGATAACAATTAAAAAGTAATT
AAATATCAACAAAATCTAATGATTTTATTACCTCGAATACTAGGTCACAGAGAGAATCAG
ATAACAATGACAACCAATGACAACAGTCCCTATATTGCGGGTCATCAAGAGTCTTTCTGC
CGAGTAATGTGAGAACCATGCGTCCATTAGATACCATCTCTTCCGACCGCATCCTTAGGA
ATGTCATAAAATCTTTTTGGAACTGATTCAAGTAAGCCTTGTATTCACTTAGAGGACTTG
AACTTGTTATGTACAGACTCATCTTGTTCTTCTCCAGTCCGTCCGGAACCTTATAAGACC
AAAATTGCATTGTTATAATTTTCGTACTTATGAATAATTTTGAGTCTATAAGTAGAAAAT
TAGAACTAAGTACTTATATTACCTCAGAGAGGTAATGAAGACTGTAATTTGAATGAACAA
AATGGAGACTCTTGCGAGGAAAGAGCCTTGAGTAAAAGGAACCAGGTACCGCAGAGATAA
AGCATGGTATTTTGCTTGTGAGCTTATTGTTGAAGAAGTTAGGAACTTGAACGTCGTGTT
GAAATCGTTATTAGCGAGATCATTTAGACAACAATCTATCTCTGGCGGGTTTTGGTTCCA
TTTTTGACACAATACATTGATTGTGTTAACAATTTCAGACATCACCAAGAATGTGTTTTG
TCCCGAAGAACAGCCCAAATCGGCTAGTTTAATGCATTTAGGAAAGTCCAAGTTTGTGAT
CATTTCTTTAGTGTTTTTAATCAGGATGGGCTTGGTCATTAATAAAACTCTTCTCTGCAG
AAAGCCAAGAACGCAAATTACTTAGCAAATATGTGTGTTTTTAATAAAACTTTTGAGGGA
ATATGGGTTGAAAACCCAACTAATCCCACTAAGTGGGACAATAACGACCATTAATCTGTC
CCCGAATTTTCTAGTGAGGACTAGTAGCAACTTAATTCATAGAAGGATTCGAACCTATAA
CTTTATGCCATTTAGCAAATATGTTGAACTCTAAATAGTTTGAGTACAGAATATAATATA
TAAATTATACATTAGTTTGTGTATGCATGTCCCACAAAAAGAAAAATAAATATATAGAAG
ATGAAAGAACCTGAAGAAGAGAGTTGGTGGAGTAGCTATTGTGTCCATCTCCTCCACGCA
TACTTAAAATACTCACAAAAGGGTATTGACTACTCTCTTCACCGCCATTATTCATTTCAT
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AF RS1AQ73JQ C 789
BS 1 871 RS1AQ73TFB
BS 872 1549 RS1AQ73JQ

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QA 1 871 1 871
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ACCTGAAGAAGAGAGTTGGTGGAGTAGCTATTGTGTCCATCTCCTCCACGCATACTTAAA
ATACTCACAAAAGGGTATTGACTACTCTCTTCACCGCCATTATTCATTTCATGTTCACTC
TTGCCATCACACCTGCATCGATCGAATGCATAGACAAATAGATAGTTAAGTGCATACATC
TATAGTTAGCATATACAATCATGTGACATGAATATGAATACGTGGGAAGAACCTTGAGGA
AGAATTCGTATGGTTGAATCTTGAATTCATTTCGCGAACTA

QA 1 761 1 761
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AS 1 2

CO CL5243Contig1 1024 2 4 U
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10 10 10 10 

AF RS1GH54TF U 1
AF RS1GH54JQ C 232
BS 1 619 RS1GH54TF
BS 620 620 RS1GH54JQ
BS 621 641 RS1GH54TF
BS 642 1024 RS1GH54JQ

RD RS1GH54TF 641 0 0
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CTGAGAGCTTCCGCGGAGATTCTAGGTAAAGGCACGTTCGGGACGACGTACAAAGCGGTT
CTCGAGGACGCGACTTCCGTAGCCGTGAAACGTCTCAAGGACGTCGCGGCTGGGAAACGC
GATTTCGAGCAGCAGATGGAGATCGTCGGAGGGATTAAGCACGAGAACGTCGTGGAGCTT
AAGGCTTACTATTACTCCAAGGACGAGAAGCTTATGGTTTATGACTATCTCAGCGATGGG
AGTGTTGCTTCTTTGCTTCACGGTAACCGAGGGGAGAACCGGGTTCCGTTGGATTGGAAA
ACGAGGATGAAGATCGCGATTGGCGCAGCGAAAGGGATCGCTAGAATCCACAGAGAGAAC
AATGGAAAGCTCGTACATGGCAACGTCAAGTCTTCGAATATATTCTTGAACGCAGAGCGT
AACGGCTGCGTGTCTGATCTTGGTTTGACAGCTGTGATGAGCGCCTTGGCCCCACCTATC
TCTAGGCAAGCTGGTTACCGTGCGCCCGAAGTAACAGACACAAGGAAGTCTTCTCAGTTA
TCAGATGTTTACAGCTTCG*CGTCGTTTTGCTCGAACTGCT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1GH54JQ 793 0 0
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AGCGATGGGAGTGTTGCTTCTTTGCTTCACGGTAACCGAGGGGAGAACCGGGTTCCGTTG
GATTGGAAAACGAGGATGAAGATCGCGATTGGCGCAGCGAAAGGGATCGCTAGAATCCAC
AGAGAGAACAATGGAAAGCTCGTACATGGCAACGTCAAGTCTTCGAATATATTCTTGAAC
GCAGAGCGTAACGGCTGCGTGTCTGATCTTGGTTTGACAGCTGTGATGAGCGCCTTGGCC
CCACCTATCTCTAGGCAAGCTGGTTACCGTGCGCCCGAAGTAACAGACACAAGGAAGTCT
TCTCAGTTATCAGATGTTTACAGCTTCGGCGTCGTTTTGCTCGAACTGCTCACGGGAAAA
TCGCCGATTCACACTACCGCAGGAGATGAGATTATACATTTGGTTCGGTGGGTACATTCT
GTTGTGAGAGAGGAATGGACTGCGGAGGTGTTCGACGTGGAGCTTCTGAGGTATACAAAC
ATAGAGGAAGAGATGGTTGAGATGTTGCAGATTGCTCTGTCGTGTGTTGTCAAAGCACCC
GACCAGAGACCGAAGATGTCTGATTTGGTTAGGCTTATGGAGGGTGTCGGAAACCGACGA
GCCAGTCTTGAGACTAAACCAGAGAAGAAAGCCTCCGAGACTTCCACGCCGAGTGAAACT
TGATGGACTTACAGAAAATTAAGAAACTGTTGATTTATAGTTAATATATGAAGTTTGTAT
AATCTCTTCTGCC

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

CO CL5244Contig1 1026 2 14 U
GCAAGTCTTGCCCATATGTAGCCGTCTCTTAAACCAAGAGATTTTCCGGGTTAGTGGAAT
GATGTCAAACCAAGGGTTTACTGATTTTGATCGGCTGAGGCATCGAAGCCCTAGTCCAAT
GGCTTCACCAAATCACATGTCTAATGTTCCTGGTGCTGGATATGGTGGTGGTTGGAATGG
TCTTCCACCAGAGAGAATGGTTGGTCCTCATGGAATGGCAATGGAGTGGCAAGGTGCACC
TGCTAGCCCAAGCGCATACACAGTCAAGCGTATCTTGCGTTTAGATCTTCCAGTTGATAC
ATTTCCTAATTTCAATTTTGTTGGAAGACTTCTGGGGCCTAGAGGGAGCTCGTTGAAGCG
TGTGGAAGCAACTACGGGTTGCCGTGTGTTTATTAGAGGGAAAGGATCAATTAAGGACCC
TGACAAAGAAGAGAAACTGAAAGGGAAGCCTGGCTATGAGCATCTCAACGAGCAGCTCCA
TATCCTCATTGAGGCTGATCTTCCTGCTGATATTGTCGATATAAAGCTGCGACATGCCCA
AGAGATCATCGAGGAGTTAGTAAAACCTGTGGATGAGTCACAGGACTACATCAAGAGGCA
GCAACTACGAGAGCTCGCGTTGCTGAACTCGAACCTGAGAGAAAACAGTCCAGGTCCAAG
CGGTGGTAGTGTCTCTCCATTCAATTCAAACGCAATGAAACGTCCAAAAACAGGACGCTA
AGCAAAAGAGACCATGAGGTACCAAGCATATGTGTATATGTGTATAACCACTAGCCTAAT
GCTGTTTTGTTTATGTTACGTCTCTCTACTCTTGGTTCTTCTGCTTTTACCTCTCTGATG
ATCCACACAGTGATTCTCAAAGCACAAAGCACAAAGCACCAAGACGAGAAGTACTAATAA
TGAAAGTAGCTGTGATGCATTTGTAACCATTAAAGATTAGATTTGTTCTGGATTTATTTA
TTCATGTGTTGTGACTTGTGAGTTTGTAGTATGGACATCTAATTACATTATATTCGTGTT
TTTGAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1C439TF U 1
AF RS1C439JQ C 343
BS 1 709 RS1C439TF
BS 710 710 RS1C439JQ
BS 711 713 RS1C439TF
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BS 744 770 RS1C439TF
BS 771 1026 RS1C439JQ

RD RS1C439TF 770 0 0
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GATGTCAAACCAAGGGTTTACTGATTTTGATCGGCTGAGGCATCGAAGCCCTAGTCCAAT
GGCTTCACCAAATCACATGTCTAATGTTCCTGGTGCTGGATATGGTGGTGGTTGGAATGG
TCTTCCACCAGAGAGAATGGTTGGTCCTCATGGAATGGCAATGGAGTGGCAAGGTGCACC
TGCTAGCCCAAGCGCATACACAGTCAAGCGTATCTTGCGTTTAGATCTTCCAGTTGATAC
ATTTCCTAATTTCAATTTTGTTGGAAGACTTCTGGGGCCTAGAGGGAGCTCGTTGAAGCG
TGTGGAAGCAACTACGGGTTGCCGTGTGTTTATTAGAGGGAAAGGATCAATTAAGGACCC
TGACAAAGAAGAGAAACTGAAAGGGAAGCCTGGCTATGAGCATCTCAACGAGCAGCTCCA
TATCCTCATTGAGGCTGATCTTCCTGCTGATATTGTCGATATAAAGCTGCGACATGCCCA
AGAGATCATCGAGGAGTTAGTAAAACCTGTGGATGAGTCACAGGACTACATCAAGAGGCA
GCAACTACGAGAGCTCGCGTTGCTGAACTCGAACCTGAGAGAAAACAGTCCAGGTCCAAG
CGGTGGTAGTGTCTCTCCATTCAATTCAAACGCAATGAAACGTCCAAAA*CAG*ACGCTA
AGCAAA*GAGAC*ATGAG*TAC*AAGCATATGTGTATATGTGTATAACCA

QA 1 770 1 770
DS 

RD RS1C439JQ 684 0 0
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AGGATCAATTAAGGACCCTGACAAAGAAGAGAAACTGAAAGGGAAGCCTGGCTATGAGCA
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AAAGCTGCGACATGCCCAAGAGATCATCGAGGAGTTAGTAAAACCTGTGGATGAGTCACA
GGACTACATCAAGAGGCAGCAACTACGAGAGCTCGCGTTGCTGAACTCGAACCTGAGAGA
AAACAGTCCAGGTCCAAGCGGTGGTAGTGTCTCTCCATTCAATTCAAACGCAATGAAACG
TCCAAAAACAGGACGCTAAGCAAAAGAGACCATGAGGTACCAAGCATATGTGTATATGTG
TATAACCACTAGCCTAATGCTGTTTTGTTTATGTTACGTCTCTCTACTCTTGGTTCTTCT
GCTTTTACCTCTCTGATGATCCACACAGTGATTCTCAAAGCACAAAGCACAAAGCACCAA
GACGAGAAGTACTAATAATGAAAGTAGCTGTGATGCATTTGTAACCATTAAAGATTAGAT
TTGTTCTGGATTTATTTATTCATGTGTTGTGACTTGTGAGTTTGTAGTATGGACATCTAA
TTACATTATATTCGTGTTTTTGAG

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL5245Contig1 1049 2 2 U
GGCTGCTTTCGAAAAAGAAGAAAAAAAATAAATTTGGATTTTGGAATTTTCCGGTGGAGT
GAAAAGCTTCGTGCTTGGTGCGTCGATTTTAGGGTTTGTTTTCTATAGTTAAAGTGTGAT
TGTACTCTGCGGCATATAACTTGATGAGGTGGTGGACTTTGTATAGCATATTGATTTCCT
GCGTGGGGACCTGACCAAGCTAAGAATCTTGTGGGGGGGCTTCTGATTGGCTCCAACTTC
AGGAAATTTTCAACACGTGTCTCGAGTTGCAACGTAGATAAATGGAGGAAGATGGAGAAA
TGGGGATGTTTTTCAAGAATCCAGTTGATATGGTTGAGTCTCGCGGTGTAATGTTCTCTT
GCTTTGTCGCTGCTCTTGTTGGTATTCTCACCATTGCCTACACTGCTTTTCAATGGAGAA
GGAATATCAATTTAAGCTGGACGAAAGCCATAGCCAGGTCAAAGAAAAATCCGAAGGCGC
GGCATAAGACTCCTGTTGCTCCACATAGCTGGGAGCTACACTCTATATCTCGTGGCAAGA
ACTTGAACTGCTGTGTATGCTTGAAGTCGATATCACCGTCGCAGAAAATTGTAGCTTCCG
AAACTTTTGTCCACGGGTGTACCATCTGTGGAGCAGCAGCCCATTTTAGTTGTTCTTCTA
GTGCACCCAAAGATTGCAAATGCGTCTCCATGGTTGGGTATGAGCATGTGGTGCACCAGT
GGGCTGTGCGGTGGACAGAAGGTGCTGATCAGACTGATGACTCTTCGTTTTGTAGCTACT
GTGACGAGTCATGTAGTAGCTCCTTTCTTGGGGGTTCTCCTATTTGGTGCTGCTTGTGGT
GTCAACGTCTTGTCCATGTTGACTGTCACAGTAATATGTCAAATGAAACGGGGGACATCT
GTGATCTAGGACCTCTTAGAAGGTTAATTCTGTGCCCTCTTTATGTTAAGGAATTGACTC
GGAATCCCTCTGGAGGATTTTTGAGCACAATCACGCATGGTGCAAATGAACTTGCATCTA
CCGTCCGTGCCAGTATCAGGAGTCAGAGC


BQ
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AF RS1G657TF U 1
AF RS1G657JQ C 402
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TGGGGATGTTTTTCAAGAATCCAGTTGATATGGTTGAGTCTCGCGGTGTAATGTTCTCTT
GCTTTGTCGCTGCTCTTGTTGGTATTCTCACCATTGCCTACACTGCTTTTCAATGGAGAA
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GGCATAAGACTCCTGTTGCTCCACATAGCTGGGAGCTACACTCTATATCTCGTGGCAAGA
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AAACTTTTGTCCACGGGTGTACCATCTGTGGAGCAGCAGCCCATTTTAGTTGTTCTTCTA
GTGCACCCAAAGATTGCAAATG

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DS 

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AAGAAAAATCCGAAGGCGCGGCATAAGACTCCTGTTGCTCCACATAGCTGGGAGCTACAC
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TCTTCGTTTTGTAGCTACTGTGACGAGTCATGTAGTAGCTCCTTTCTTGGGGGTTCTCCT
ATTTGGTGCTGCTTGTGGTGTCAACGTCTTGTCCATGTTGACTGTCACAGTAATATGTCA
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TATGTTAAGGAATTGACTCGGAATCCCTCTGGAGGATTTTTGAGCACAATCACGCATGGT
GCAAATGAACTTGCATCTACCGTCCGTGCCAGTATCAGGAGTCAGAGC

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1A022TF U 1
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CTATATTAGTTTTATAATGTTCTCAGTTACATCTAAATTTATATATGCATGTGCATGCAT
ATGATTATGTATGCATGAGAGTGCAAACTTGTAATATTTAATCGGTATTGAAATTTTAAT
AATGAAAGCGTAGCTTTAAATCTT

QA 1 264 1 264
DS 



AS 1 2

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TTTTTTTTTTTTTTACAATTCCATTGTTTCAAACTCTATTAATAAAAAATTCATGCC


BQ
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AF RS1CF27TF U 1
AF RS1CF27JQ C 295
BS 1 657 RS1CF27TF
BS 658 658 RS1CF27JQ
BS 659 691 RS1CF27TF
BS 692 692 RS1CF27JQ
BS 693 704 RS1CF27TF
BS 705 957 RS1CF27JQ

RD RS1CF27TF 715 0 0
GGAACCCAAACGCCGCTGAATCGATCAAAAGATGTACGACTCTCCTCTTCGTGCGGTGAC
CTCTGCGCTTCTGCTCATGACCTGAAACGCTCTGATTTATGTTTTCCTCTTTAATCCCAT
TAATTCACTCCCCCACGATGTGCCTTCAAAGCATTCTTCGATCTGAAAAGCGGTGTGGTT
ACGGTATAAATACATGTGAGATTCATCCTTTCGAACTCATCTTCTCTTCGTATCCCATAA
AAAAAATACATTCGATTCAAATTGATCAAGCTTTCTCTTCTCCCTGACCGTCTTCTTCCT
GTTGTTGTTCGATGGCTTTTACTATTCGTTTCACAGACAAAACTGTTTGTTGACCTGACT
GAACCGTCTGTACCGATCCCAAAGGAGTGCTTCCGTTTCTGTAATTACCAGCAACTTATG
GGGTTAGCCAATACGAGAATTGATTTAACAGATATGACTCAGAGTACACAACGCATGATG
ATCACCCTGAGCCTTGAAAGACCTGTTTAGTAGGGGTCATGAACCAAAGGGTGGTGGTTG
CCACAGACATCAACCCTAAGTTAGTCGGCGGTCGACCCTTCCTCAATGCAACCTCCGATG
GCCTTAAGGGCACTGCCGTGGAGGATGGTGGCTTTGTTTCTTATGGTGATGCAGCAG*TG
GGAGTGGTGAGCCAGTTTATCCAAGTAAGAC*TCTGTTGATGGA
GTCCACAGCGA

QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1CF27JQ 663 0 0
CTTCCTGTTGTTGTTCGATGGCTTTTACTATTCGTTTCACAGACAAAACTGTTTGTTGAC
CTGACTGAACCGTCTGTACCGATCCCAAAGGAGTGCTTCCGTTTCTGTAATTACCAGCAA
CTTATGGGGTTAGCCAATACGAGAATTGATTTAACAGATATGACTCAGAGTACACAACGC
ATGATGATCACCCTGAGCCTTGAAAGACCTGTTTAGTAGGGGTCATGAACCAAAGGGTGG
TGGTTGCCACAGACATCAACCCTAAGTTAGTCGGCGGTCGACCCTTCCTCAATGCAACCT
CCGATGGCCTTAAGGGCACTGCCGTGGAGGATGGTGGCTTTGTTTCTTATGGTGATGCAG
CAGGTGGGAGTGGTGAGCCAGTTTATCCAAGTAAGACCTCTGTTGATGGAAGGTCCAACA
GCGAGGAAGGAACAGGCATGCAAGTGGGTAGCTTTAGAAAGAAGCCACGCACTGAGTAAT
TCCTGAAATACAAGGGAAACTTAAGTTACAAGTGCTGCTGGCATGTCCGTAGCATCAGTT
TTTAAATAAATTTTTTAAACACTACGAAGTTTACTTCAAATATTTTGGATATTTGGTTTT
GTTAGTTTTTTTTTTTTTTTACAATTCCATTGTTTCAAACTCTATTAATAAAAAATTCAT
GCC

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

CO CL5248Contig1 1078 2 2 U
GACATCTTAAAGACATACTAAAGGAAATAAATAAATGGTTTAGCTATGATGTTCTTAAAA
CAGCAACATCAGGTTTCTCTTCAGAGAATCTAATTAAAAAAGGAGGATGTAACGAAGTCT
ACAAAGGGGTTCTTGAAGATGGGAAAGCAGTGGCGGTGAAGATCTTGAAATCATCTGGAA
AAGAAGAAGCAGTGAAGGATTTTGTTCAAGAAGTGAGCATAATCTCTTCTTTGAATCACC
AAAACATCTCTCCTTTAATCGGTGTCTGCGTCCAATATGATGACCTTATCTCTGTTTACA
ATCTCGCATCCAGAGGAAGTTTGGAGGAGACCCTTCAGGGTAAGCATGTATTGACATGGG
AAGCGAGATTCAAGATAGCAATTGGGTTAGGGGAAGCTCTTGATTATCTTCATAACCAAT
GTTCTAATCCTGTCATCCACAGAGATGTCAAATCTTCTAATGTTCTTCTCTCAGATGAGT
TAGAACCTCAGCTGTCGGATTTCGGACTCTCGATGTGGGGATCAAAGTCTTGTTTATACA
CAATACAAAGAGACGTGGTGGGCACGTTTGGATACCTAGCTCCTGAATACTTCATGTACG
GAAAGGTCAGCAACAAAGTTGATGTTTATGCCTTTGGAGTAGTTTTGCTTGAACTCATAT
CAGGAAGAACTACTATTTCTTCTGATAGCCCAAGAGGACAGGAGAGTTTGGTCATGTGGG
CAAAACCGGTTATAGAAAAAGGTGCTGCAAAAGAGCTCTTGGATACGAACATTTCAGGGA
ATTTCGATGATGCTCAGTTTCAGAAAATGGTTCTTGCTGCTAAATATTGTCTTACAAGAG
CAGCTACTCATCGTCCCAATATCAGAGAGATACTCAAGCTGCTAAAAGGAGAAGATGAAG
TAGAGAAATGGGTGAAGAAAGTAGAAGAAGATGATGACTGTTTCGACGACGAGGTTTACC
CAAATTCAAACAAAGAACTACACTTGAGCCTTGCAATGCTCGACATTGAGGATAATGACT
CTATTTCAGTTGGCAGCTTGGAGAGAAGTAACAATAGCCTATTTTCTTCTTCTCCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CZ71TF U 1
AF RS1CH95TF U 377
BS 1 645 RS1CZ71TF
BS 646 1078 RS1CH95TF

RD RS1CZ71TF 645 0 0
GACATCTTAAAGACATACTAAAGGAAATAAATAAATGGTTTAGCTATGATGTTCTTAAAA
CAGCAACATCAGGTTTCTCTTCAGAGAATCTAATTAAAAAAGGAGGATGTAACGAAGTCT
ACAAAGGGGTTCTTGAAGATGGGAAAGCAGTGGCGGTGAAGATCTTGAAATCATCTGGAA
AAGAAGAAGCAGTGAAGGATTTTGTTCAAGAAGTGAGCATAATCTCTTCTTTGAATCACC
AAAACATCTCTCCTTTAATCGGTGTCTGCGTCCAATATGATGACCTTATCTCTGTTTACA
ATCTCGCATCCAGAGGAAGTTTGGAGGAGACCCTTCAGGGTAAGCATGTATTGACATGGG
AAGCGAGATTCAAGATAGCAATTGGGTTAGGGGAAGCTCTTGATTATCTTCATAACCAAT
GTTCTAATCCTGTCATCCACAGAGATGTCAAATCTTCTAATGTTCTTCTCTCAGATGAGT
TAGAACCTCAGCTGTCGGATTTCGGACTCTCGATGTGGGGATCAAAGTCTTGTTTATACA
CAATACAAAGAGACGTGGTGGGCACGTTTGGATACCTAGCTCCTGAATACTTCATGTACG
GAAAGGTCAGCAACAAAGTTGATGTTTATGCCTTTGGAGTAGTTT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1CH95TF 702 0 0
G
GCAATTGGGTTAGGGGAAGCTCTTGATTATCTTCATAACCAATGTTCTAATCCTGTCATC
CACAGAGATGTCAAATCTTCTAATGTTCTTCTCTCAGATGAGTTAGAACCTCAGCTGTCG
GATTTCGGACTCTTGATGTGGGGATCAAAGTCTTGTTTATACACAATACAAAGAGACGTG
GTGGGCACGTTTGGATACCTAGCTCCTGAATACTTCATGTACGGAAAGGTCAGCAACAAA
GTTGATGTTTATGCCTTTGGAGTAGTTTTGCTTGAACTCATATCAGGAAGAACTACTATT
TCTTCTGATAGCCCAAGAGGACAGGAGAGTTTGGTCATGTGGGCAAAACCGGTTATAGAA
AAAGGTGCTGCAAAAGAGCTCTTGGATACGAACATTTCAGGGAATTTCGATGATGCTCAG
TTTCAGAAAATGGTTCTTGCTGCTAAATATTGTCTTACAAGAGCAGCTACTCATCGTCCC
AATATCAGAGAGATACTCAAGCTGCTAAAAGGAGAAGATGAAGTAGAGAAATGGGTGAAG
AAAGTAGAAGAAGATGATGACTGTTTCGACGACGAGGTTTACCCAAATTCAAACAAAGAA
CTACACTTGAGCCTTGCAATGCTCGACATTGAGGATAATGACTCTATTTCAGTTGGCAGC
TTGGAGAGAAGTAACAATAGCCTATTTTCTTCTTCTCCATC

QA 2 702 2 702
DS 



AS 1 2

CO CL5249Contig1 793 2 1 U
GGATCGTCTTAGATCCAGACTCAAGAAGAGACTAACTCAGAAACCCTTTTGAGAGCAGGC
CAAGCTAATGTCTTCGTCTCTGCTTCCCAGCCTCTCTTCCAAGCCCTCTCTCCGCAAACT
TGCCCTGAGATGCCAAACACTTCGAACGTTCTCCTCCTCCTCCACCACCACCAACCCTTA
CTTGTTGTATCGTGTCACCTGTTGTGGTAAAGAAGGTGATGAAGAATCCCCAGGAGTAAT
GACACAGCTCCACATGTTTGACCCGGCCAAAGAAGAACATATCATCGTCGGTGATATGCC
ATTTCCCAAAGAGTAGGTTGGGTCTTCGCTGGTGGGAAGTTCCAATGGATGGGGAGTTTT
TCTATGGGGCAAACGTTCCATACTAATCAGTGACTTCTGCAACCCCTTGAGCTTTAAATC
CAAACCCAAGTTCATCCCTCTGCTTCCTAGGCCTGATATAATTAGTTGTCAAGCTGACTT
GGTAAGTGGCGTGGCAATGTCCTCTTCTCCTCAAGAGGAAGAAGACTACCTTGTGGCTGT
CAAGTTTACGGGACGTCCGGTGAGTATATATAAGCCGAGTGACACTAAGGCGGTCCATCT
CATTTTGCCTCATAATGTATTCGATCATTTTGAACCATCCAAGTTGATGTATTCCAAGAG
AGATCAAAGGTCTACATGCCAAGTTCTGGTGGCCACCACTTGTGGTCTTGGGATGGTCTT
GAATCCACGAAGCCTGAGTTCATGAGTTCGCTTTCACACCTTCCTCAGTTTTCTCATCCG
AGTGCAGCTTTGG


BQ
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AF RS1BB71TF U 393
AF RS1FN87TF U 1
BS 1 793 RS1FN87TF

RD RS1BB71TF 255 0 0
ACTTCTGCAACCCCTTGAGCTTTAAATCCAAACCCAAGTTCATCCCTCTGCTTCCTAGGC
CTGATATAATTAGTTGTCAAGCTGACTTGGTAAGTGGCGTGGCAATGTCCTCTTCTCCTC
AAGAGGAAGAAGACTACCTTGTGGCTGTCAAGTTTACGGGACGTCCGGTGAGTATATATA
AGCCGAGTGACACTAAGGCGGTCCATCTCATTTTGCCTCATAATGTATTCGATCATTTTG
AACCATCCAAGTTGA

QA 1 255 1 255
DS 

RD RS1FN87TF 793 0 0
GGATCGTCTTAGATCCAGACTCAAGAAGAGACTAACTCAGAAACCCTTTTGAGAGCAGGC
CAAGCTAATGTCTTCGTCTCTGCTTCCCAGCCTCTCTTCCAAGCCCTCTCTCCGCAAACT
TGCCCTGAGATGCCAAACACTTCGAACGTTCTCCTCCTCCTCCACCACCACCAACCCTTA
CTTGTTGTATCGTGTCACCTGTTGTGGTAAAGAAGGTGATGAAGAATCCCCAGGAGTAAT
GACACAGCTCCACATGTTTGACCCGGCCAAAGAAGAACATATCATCGTCGGTGATATGCC
ATTTCCCAAAGAGTAGGTTGGGTCTTCGCTGGTGGGAAGTTCCAATGGATGGGGAGTTTT
TCTATGGGGCAAACGTTCCATACTAATCAGTGACTTCTGCAACCCCTTGAGCTTTAAATC
CAAACCCAAGTTCATCCCTCTGCTTCCTAGGCCTGATATAATTAGTTGTCAAGCTGACTT
GGTAAGTGGCGTGGCAATGTCCTCTTCTCCTCAAGAGGAAGAAGACTACCTTGTGGCTGT
CAAGTTTACGGGACGTCCGGTGAGTATATATAAGCCGAGTGACACTAAGGCGGTCCATCT
CATTTTGCCTCATAATGTATTCGATCATTTTGAACCATCCAAGTTGATGTATTCCAAGAG
AGATCAAAGGTCTACATGCCAAGTTCTGGTGGCCACCACTTGTGGTCTTGGGATGGTCTT
GAATCCACGAAGCCTGAGTTCATGAGTTCGCTTTCACACCTTCCTCAGTTTTCTCATCCG
AGTGCAGCTTTGG

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

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GCATGGGTCTGAAGGAGAATGGAGTTCTATGTGTGTACCCTCAGGAAAAATAATATCAAA
AACATGTTGTTCATCTCAAAAGAGAAGAAGAATGAGCACCAACGAGTTCAGAGTCTGTGA
GTGCAACTATTAATCTTGTGTCTTTTAGAGAAGATCAACAACAACACAATCTCTATAGAG
AAACCAATTTGTATCAAAGAATACTTATCAGCTGAAGAATCATATTGCCTCGCCAGAAGC
AACAACAAAAAGAATAGGCTAGGTTGAGCCACGTCAGATTCCAGCGTGGAAACTGATGCC
TTCTTTGATTGACACGTCAGATCTCTTAATTGATGCCTTCTCTTACTAGGCTCGCGTGTT
GGGCTTCGTCATATAATTGGTGCGATGTTTACGGCCCTAATAAGGAATAGATCTTTGGTC
TTCGGTTTCGTCGATGCGGCTGTCTAGCTGTGGCGATGGCGTTTGAGATTCGTACCGGAG
GCGTCGTGTAACTCCGACTTTAACCCTTCTGTCTTTAATGGTGATTACGAACTCTCCAGT
CGTCGAATCGGAGATGGCTAATAGAGTAGAAGCATCAACATGTATCTGGAGGAGAAGAGC
TCATTCAAGGCATTTGACTTCACTGTATAGATCCACTGGTGCAAGACCCTCTTGGGAGGA
TGATAGTGGAAGAGATAATGAATCGGAAAGTAACACTTTTGATTGGTCAGATAAGAGAAG
CAGTTCGCAGCTGAAGAGCTCTCAAGAGAGAGAGAGAGCATAATCCCTAAAGGGATTGAA
ACGGTGAGATGAGCCTCGAACCAGAAAATATGGGGATGAGGGAGTGGCTGAAAGAGAATG
TTAAGGAGGAGGAATATGTGGTTATGAAAGCAGAGGTTGACGTGTTGGAGGTGATGATGA
GGAGAAGGAACATGGAGACAGACGTGAGAGGATATGTATATGCGTTTTTTTCTTTACATT
ATCTTCTTTTTTGTTGTCCGAATTGTTTTAATCATCTTATGCTCATTCTCTTTTGTTGTG
GTGTTGCAGTTTCGGGGTTCTAATAAGCTTAATTAATTATGTTAAGTAATTCCCC


BQ
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AF RS1F881TF U 1
AF RS1F881JQ C 341
BS 1 604 RS1F881TF
BS 605 1075 RS1F881JQ

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GCATGGGTCTGAAGGAGAATGGAGTTCTATGTGTGTACCCTCAGGAAAAATAATATCAAA
AACATGTTGTTCATCTCAAAAGAGAAGAAGAATGAGCACCAACGAGTTCAGAGTCTGTGA
GTGCAACTATTAATCTTGTGTCTTTTAGAGAAGATCAACAACAACACAATCTCTATAGAG
AAACCAATTTGTATCAAAGAATACTTATCAGCTGAAGAATCATATTGCCTCGCCAGAAGC
AACAACAAAAAGAATAGGCTAGGTTGAGCCACGTCAGATTCCAGCGTGGAAACTGATGCC
TTCTTTGATTGACACGTCAGATCTCTTAATTGATGCCTTCTCTTACTAGGCTCGCGTGTT
GGGCTTCGTCATATAATTGGTGCGATGTTTACGGCCCTAATAAGGAATAGATCTTTGGTC
TTCGGTTTCGTCGATGCGGCTGTCTAGCTGTGGCGATGGCGTTTGAGATTCGTACCGGAG
GCGTCGTGTAACTCCGACTTTAACCCTTCTGTCTTTAATGGTGATTACGAACTCTCCAGT
CGTCGAATCGGAGATGGCTAATAGAGTAGAAGCATCAACATGTATCTGGAGGAGAAGAGC
TCAT

QA 1 604 1 604
DS 

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TCTTACTAGGCTCGCGTGTTGGGCTTCGTCATATAATTGGTGCGATGTTTACGGCCCTAA
TAAGGAATAGATCTTTGGTCTTCGGTTTCGTCGATGCGGCTGTCTAGCTGTGGCGATGGC
GTTTGAGATTCGTACCGGAGGCGTCGTGTAACTCCGACTTTAACCCTTCTGTCTTTAATG
GTGATTACGAACTCTCCAGTCGTCGAATCGGAGATGGCTAATAGAGTAGAAGCATCAACA
TGTATCTGGAGGAGAAGAGCTCATTCAAGGCATTTGACTTCACTGTATAGATCCACTGGT
GCAAGACCCTCTTGGGAGGATGATAGTGGAAGAGATAATGAATCGGAAAGTAACACTTTT
GATTGGTCAGATAAGAGAAGCAGTTCGCAGCTGAAGAGCTCTCAAGAGAGAGAGAGAGCA
TAATCCCTAAAGGGATTGAAACGGTGAGATGAGCCTCGAACCAGAAAATATGGGGATGAG
GGAGTGGCTGAAAGAGAATGTTAAGGAGGAGGAATATGTGGTTATGAAAGCAGAGGTTGA
CGTGTTGGAGGTGATGATGAGGAGAAGGAACATGGAGACAGACGTGAGAGGATATGTATA
TGCGTTTTTTTCTTTACATTATCTTCTTTTTTGTTGTCCGAATTGTTTTAATCATCTTAT
GCTCATTCTCTTTTGTTGTGGTGTTGCAGTTTCGGGGTTCTAATAAGCTTAATTAATTAT
GTTAAGTAATTCCCC

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

CO CL5251Contig1 1145 2 4 U
GCTCAGCATCTCGATCATCTTTTCGTCGACTCCGATCACGCCGTTGATTAGAGACCGATC
GTAAGATGGAGTTAGATTCTCCGGTAGAGACGAAGAGATTCCGTTGTTCTCGAGTTGTAT
GCAGATGTGTGCCCAAGCTTTGACGAAAGTGCTTGACGTTTTCCCGTCTAAAACGGCATG
GTGTGTTACGACCCCGATGGAGAATCCATGGTTCGGGAACAACGTGATTTGAAGGGATAG
AACTGTGGCTGAGTCATCGGAGACCGGTAACTCGGGGAGTAAGTTGTATAACTCGGAAAC
CGGACGTTGTCCATAACCGGATAGGAGAGAAAAATCAGCTCCCGTCTCGGCTATCGTTAC
TGAAACGGCGTCGTTTTGAGAGACGACGATGCTGGGCTTGGGCTCGTTTTGGGCCCATGT
TATGCGGCCGGCGAGAGGGAGATAGTTGCGGAGGACGAGGGACAAGGAGAGCTTGAGTTT
AGGGAGGATGAAGGAGTTGAAATGCTCATGCGTCGACTCGGTGTGTCTGTAGAAGAAGAC
TCGCTTCACTGGGCTGAACAGTAGCCACGGCAGATCGAAGAACGTCAAGGGAATCTTGAG
CGAGTGGGGGACCGAGTCTGAGGCGGTGGCAGGGGTGACTCGGGCAACCTCGATGATGTG
TGTAGTCATTGGTGACGACGAGTATGTAGGATGTTTCAATAATAAACCAATACTAGTAAC
TATATATAACAGAACTGCAGAACAGTCTGAGATCTATTCTACTTTAACGACCAAAACAAC
TTCTTTCTGGGAGGAGGATGACTCGGGGAATCTCATCTATAAGTAGCGTCATTGGTGACG
CTGGTCGGATCGCAAATATTTAGAAGTTCCATTGAGAAAATAGTAAAACACCAGTGACTC
TAGAATCTTTTGATCTATGTACATATACGACCAAATTACCCATATGTCACGTGTTATGAA
ATAACTGACATCTCAAAGGTTCACATGGTGGTATTCAACTCACATGGTGGTGTTCAAAGG
TTCTAAAAAAACATTTTAAATATTTAATTTTAAAATTAGTTAATCAATTATAAAAAGACT
GTAAAACTTAATTAGTTGAATAGTTTTTAATAAAGTTAAAATCAATTCTAAAATCTCAAA
ACTTC


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RS1D489TF U 1
AF RS1D489JQ C 596
BS 1 622 RS1D489TF
BS 623 623 RS1D489JQ
BS 624 684 RS1D489TF
BS 685 1145 RS1D489JQ

RD RS1D489TF 684 0 0
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GTAAGATGGAGTTAGATTCTCCGGTAGAGACGAAGAGATTCCGTTGTTCTCGAGTTGTAT
GCAGATGTGTGCCCAAGCTTTGACGAAAGTGCTTGACGTTTTCCCGTCTAAAACGGCATG
GTGTGTTACGACCCCGATGGAGAATCCATGGTTCGGGAACAACGTGATTTGAAGGGATAG
AACTGTGGCTGAGTCATCGGAGACCGGTAACTCGGGGAGTAAGTTGTATAACTCGGAAAC
CGGACGTTGTCCATAACCGGATAGGAGAGAAAAATCAGCTCCCGTCTCGGCTATCGTTAC
TGAAACGGCGTCGTTTTGAGAGACGACGATGCTGGGCTTGGGCTCGTTTTGGGCCCATGT
TATGCGGCCGGCGAGAGGGAGATAGTTGCGGAGGACGAGGGACAAGGAGAGCTTGAGTTT
AGGGAGGATGAAGGAGTTGAAATGCTCATGCGTCGACTCGGTGTGTCTGTAGAAGAAGAC
TCGCTTCACTGGGCTGAACAGTAGCCACGGCAGATCGAAGAACGTCAAGGGAATCTTGAG
CGAGTGGGGGACCGAGTCTGAG*CGGTGGCAGGGGTGACTCGGGCAACCTCGATGATGTG
TGTAGTCATTGGTGACGACGAGTA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1D489JQ 550 0 0
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ATGTGTGTAGTCATTGGTGACGACGAGTATGTAGGATGTTTCAATAATAAACCAATACTA
GTAACTATATATAACAGAACTGCAGAACAGTCTGAGATCTATTCTACTTTAACGACCAAA
ACAACTTCTTTCTGGGAGGAGGATGACTCGGGGAATCTCATCTATAAGTAGCGTCATTGG
TGACGCTGGTCGGATCGCAAATATTTAGAAGTTCCATTGAGAAAATAGTAAAACACCAGT
GACTCTAGAATCTTTTGATCTATGTACATATACGACCAAATTACCCATATGTCACGTGTT
ATGAAATAACTGACATCTCAAAGGTTCACATGGTGGTATTCAACTCACATGGTGGTGTTC
AAAGGTTCTAAAAAAACATTTTAAATATTTAATTTTAAAATTAGTTAATCAATTATAAAA
AGACTGTAAAACTTAATTAGTTGAATAGTTTTTAATAAAGTTAAAATCAATTCTAAAATC
TCAAAACTTC

QA 1 550 1 550
DS 



AS 1 2

CO CL5252Contig1 881 2 2 U
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GCCAATATATATTGGTTTTGGAAGCATGCCTCTTGATGATCCCAAAAGGACAATGGACAT
TATACTGGAAACATTGAGAGATACAGAACAAAGAGGGATAGTTGATCGAGGTTGGGGTGG
CCTTGGAAACCTTGCAGATGTTCCTGAAAATGTATTCCTCTTAGAGGACTGTCCTCACGA
TTGGTTGTTTCCTCAATGTTCAGCTGTGATTCATCATGGCGGTGCTGGAACCACAGCGAC
TGGACTGAAAGCTGGGTAAAACGTTATACTCATCACCAAAGTGTCCTGTGGTGAAACTAT
AGCAGTTTTCTTTACTACATGAAATTTAACACTACCTATTGCTTTTGAATGTTTCTTTTA
TGCCTGCAGTGTCCAACAACAATTGTACCGTTCTTTGGGGATCAGTTCTTCTGGGGTGAC
AGGGTCTGTGAGAAGGGACTTGGGCCTGCGCCAATACCGATAGCTCAGCTCAATGTTGAG
AACCTCTGTAGTGCCATAAGATTTATGCTTCAACCAGAGGTGAAATCACGAGTGATGGAA
CTAGCGAAAGTACTGGAGAATGAGGATGGTGTAGCTGCAGCAGTTGATGCATTCCATAAG
CATTTGCCACCGGAGCTACCACTTCCCGAGTCCGCACCTGAGAAAAAGGATGAAGATGAT
CAACCAGACCTGTTACAGCGGTTTTTCATCCAGATTGGCAGAAAGTGTTGCCTTCCATGT
GGGGGCGTGTGATATCAAATGTTTTTAGATGCTTTTTTAGTTGCGTAATCTTGTATCTGC
AACTTCAATTCATTTCGTTCAATGGTCAGGAATATTATTAC


BQ
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AF RS1F548TF U 1
AF RS1F548JQ C 299
BS 1 702 RS1F548TF
BS 703 881 RS1F548JQ

RD RS1F548TF 702 0 0
GCTTGGATCAAAGTACAAACCTCGGGAAGAGTTTATCCACTGGATAGAAAGAGGATCACC
GCCAATATATATTGGTTTTGGAAGCATGCCTCTTGATGATCCCAAAAGGACAATGGACAT
TATACTGGAAACATTGAGAGATACAGAACAAAGAGGGATAGTTGATCGAGGTTGGGGTGG
CCTTGGAAACCTTGCAGATGTTCCTGAAAATGTATTCCTCTTAGAGGACTGTCCTCACGA
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TGCCTGCAGTGTCCAACAACAATTGTACCGTTCTTTGGGGATCAGTTCTTCTGGGGTGAC
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CTAGCGAAAGTACTGGAGAATGAGGATGGTGTAGCTGCAGCAGTTGATGCATTCCATAAG
CATTTGCCACCGGAGCTACCACTTCCCGAGTCCGCACCTGAG

QA 1 702 1 702
DS 

RD RS1F548JQ 583 0 0
ACTGGACTGAAAGCTGGGTAAAACGTTATACTCATCACCAAAGTGTCCTGTGGTGAAACT
ATAGCAGTTTTCTTTACTACATGAAATTTAACACTACCTATTGCTTTTGAATGTTTCTTT
TATGCCTGCAGTGTCCAACAACAATTGTACCGTTCTTTGGGGATCAGTTTTTCTGGGGTG
ACAGGGTCTGTGAGAAGGGACTTGGGCCTGCGCCAATACCGATAGCTCAGCTCAATGTTG
AGAACCTCTGTAGTGCCATAAGATTTATGCTTCAACCAGAGGTGAAATCACGAGTGATGG
AACTAGCGAAAGTACTGGAGAATGAGGATGGTGTAGCTGCAGCAGTTGATGCATTCCATA
AGCATTTGCCACCGGAGCTACCACTTCCCGAGTCCGCACCTGAGAAAAAGGATGAAGATG
ATCAACCAGACCTGTTACAGCGGTTTTTCATCCAGATTGGCAGAAAGTGTTGCCTTCCAT
GTGGGGGCGTGTGATATCAAATGTTTTTAGATGCTTTTTTAGTTGCGTAATCTTGTATCT
GCAACTTCAATTCATTTCGTTCAATGGTCAGGAATATTATTAC

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 2

CO CL5253Contig1 1209 2 2 U
GGAGAAGATCGAAGACTCATTCTCCGTAAGTTTCCTTCTTTCTCTCCTCTCCCTTCGATC
GCCTAATTAAGGAGAATTCTTAAGCTGAGTTGTAAAAAATGGCATGTAGAGGTTGTTTAG
AGTGTTTGCTAAAGCTACTAAATTTTATTCTGGCGGTTGCTGGACTCGGCATGATTGGTT
ATGGTATCTACTTGTTTGTCGAGTTCAAGAGAGCATCCGACAACTCTCTTCACTTCAGTG
CCGACGACCACCAGAGTTACGTCTCTTTTGGGAGGCCCATGCTTATGTCTCTTGCTCTCT
CTTCCAATGTCTTTGACAATTTCCCCAAAGCTTGGTTCATCTACTTGTTCATTGGTATCG
GCGTGGCTCTGTTTGTTATCTCATGCTGTGGCTGTGTTGGTACTTGTTCAAGGAACGTCT
GCTGCTTATCTTGTTACTCTCTGCTTCTCATCTTGTTGATCTTGGCGGAGCTTGGAGCTG
CTGCGTTTATATTCTTCGACAACAGCTGGAGAGATGAAATTCCTTCTGACAGGACTGGGA
ACTTCGATACCATCTATAATTTTCTCAGAGAAAACTGGAACATCGTAAGATGGGTAGCTC
TAGGAGCCGTTGTTTTCGAGGCTTTGCTTTTCTTGCTTGCCCTTATTGTTAGGGCAGCTA
ATACACCAGCGGAGTATGACAGTGATGATGAGTTTATTACTCCTCCAAGGCAACAGATCA
GGCAGCCATTCATCAACCGCCAGCCCGCCCCTGTCACCGGTGTCCCAGTTGCTCCTACTT
TGGACCAACGCCCGAGCCGCAGTGACCCTTGGAGTGCACGTATGAGGGAGAAGTATGGTC
TTGACACATCTGAGTTCACATACAATCCCTCAGAGTCGCACCGGTTCCATCAAATGCCGG
CGCAACCAAATGAAGAAAAGGGTCGATGCACCATCATGTAAGTCCATGCTAAAAAAGAGG
GAGTTCAGTCAGTTGTTCTCTTTTCCTGTTATCTTGTCTTCGTGTGTAACAATCAAGAGA
GTCAGTGAAACTAGAGGGTTGTTTCTAGGTTGATGATGATGACCACTCTTAGCATTGCAT
TGGAGATCTCTCTAATCAACTTAGTCACGTTTTATGAAAACTCTTCTTTTCGTTGTGTCT
TTGTAGTCGTATTGGTTGTTTGATTCGGTCCTATAAATTCTTATTATATATAAAATTCAT
CTGTTTTGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A865TF U 1
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BS 1 827 RS1A865TF
BS 828 1209 RS1A865JQ

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AGTGTTTGCTAAAGCTACTAAATTTTATTCTGGCGGTTGCTGGACTCGGCATGATTGGTT
ATGGTATCTACTTGTTTGTCGAGTTCAAGAGAGCATCCGACAACTCTCTTCACTTCAGTG
CCGACGACCACCAGAGTTACGTCTCTTTTGGGAGGCCCATGCTTATGTCTCTTGCTCTCT
CTTCCAATGTCTTTGACAATTTCCCCAAAGCTTGGTTCATCTACTTGTTCATTGGTATCG
GCGTGGCTCTGTTTGTTATCTCATGCTGTGGCTGTGTTGGTACTTGTTCAAGGAACGTCT
GCTGCTTATCTTGTTACTCTCTGCTTCTCATCTTGTTGATCTTGGCGGAGCTTGGAGCTG
CTGCGTTTATATTCTTCGACAACAGCTGGAGAGATGAAATTCCTTCTGACAGGACTGGGA
ACTTCGATACCATCTATAATTTTCTCAGAGAAAACTGGAACATCGTAAGATGGGTAGCTC
TAGGAGCCGTTGTTTTCGAGGCTTTGCTTTTCTTGCTTGCCCTTATTGTTAGGGCAGCTA
ATACACCAGCGGAGTATGACAGTGATGATGAGTTTATTACTCCTCCAAGGCAACAGATCA
GGCAGCCATTCATCAACCGCCAGCCCGCCCCTGTCACCGGTGTCCCAGTTGCTCCTACTT
TGGACCAACGCCCGAGCCGCAGTGACCCTTGGAGTGCACGTATGAGG
AGA

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DS 

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TTGCTTTTCTTGCTTGCCCTTATTGTTAGGGCAGCTAATACACCAGCGGAGTATGACAGT
GATGATGAGTTTATTACTCCTCCAAGGCAACAGATCAGGCAGCCATTCATCAACCGCCAG
CCCGCCCCTGTCACCGGTGTCCCAGTTGCTCCTACTTTGGACCAACGCCCGAGCCGCAGT
GACCCTTGGAGTGCACGTATGAGGGAGAAGTATGGTCTTGACACATCTGAGTTCACATAC
AATCCCTCAGAGTCGCACCGGTTCCATCAAATGCCGGCGCAACCAAATGAAGAAAAGGGT
CGATGCACCATCATGTAAGTCCATGCTAAAAAAGAGGGAGTTCAGTCAGTTGTTCTCTTT
TCCTGTTATCTTGTCTTCGTGTGTAACAATCAAGAGAGTCAGTGAAACTAGAGGGTTGTT
TCTAGGTTGATGATGATGACCACTCTTAGCATTGCATTGGAGATCTCTCTAATCAACTTA
GTCACGTTTTATGAAAACTCTTCTTTTCGTTGTGTCTTTGTAGTCGTATTGGTTGTTTGA
TTCGGTCCTATAAATTCTTATTATATATAAAATTCATCTGTTTTGT

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 2

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TAAGAGAAGCAATGGTAGGTTCTAACTGTGGATGTGGTTCCGCTTGCAAATGTGGTGACT
CTTGCAGCTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCGGCTGCGGGTCAAACT
GTAGCTGTGGGGACAGCTGCAGCTGTTGAAGAAATCGTGATCTAACTCACATATATGCAG
GAAATACTGGGGGAATATGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTTTGAATAAAGATT
TGCGCGTTATGTTGCCTAATACCTCTCTTAATCTTTGACTTTTCCTGCTTTATATCTTTA
TATGTGTGGTTGTGTAATGTTTTCGTTTGTAACCT


BQ
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AF RS1BZ79JQ C 1
AF RS1BZ79TF U 1
BS 1 395 RS1BZ79TF

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GAAATACTGGGGGAATATGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTTTGAATAAAGATT
TGCGCGTTATGTTGCCTAATACCTCTCTTAATCTTTGACTTTTCCTGCTTTATATCTTTA
TATGTGTGGTTGTGTAATGTTTTCGTTTGTAACCT

QA 1 395 1 395
DS 

RD RS1BZ79TF 395 0 0
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TAAGAGAAGCAATGGTAGGTTCTAACTGTGGATGTGGTTCCGCTTGCAAATGTGGTGACT
CTTGCAGCTGCGAGAAGAACTACAACACGGAGTGCGACAACTGCGGCTGCGGGTCAAACT
GTAGCTGTGGGGACAGCTGCAGCTGTTGAAGAAATCGTGATCTAACTCACATATATGCAG
GAAATACTGGGGGAATATGTGTTTGATGTTAAGAGATATGTGTGTGTTTGAATAAAGATT
TGCGCGTTATGTTGCCTAATACCTCTCTTAATCTTTGACTTTTCCTGCTTTATATCTTTA
TATGTGTGGTTGTGTAATGTTTTCGTTTGTAACCT

QA 1 395 1 395
DS 



AS 1 2

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CTACTGAGGACCAGTTCGATACAGTTGATCTGTCTGATAATGAGATAGTTAAGCTCGAAA
ACTTCCCACTCCTCAATCGCTTAGGGACTTTGATCATAAACAACAATCGGATCACCAGGA
TTAATCCTAATATTGGAGAGTTCCTACCGAAGCTGCACACTCTGGTTCTTACAAACAACA
GGCTTGTGAATTTGGTTGAAATTGATCCCCTTGCCTCCATTCCAAAGCTGCAGTACCTTA
GTTTGTTGGATAATAATATCACCAAAAAGCCAAATTATCGCCTTTATGTGATTCACAAGC
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CGGCTTTGTTTTCATCCAAGGAAGCGGAAGAGGAGGTTAAGAAGGTATCTCAGCAGGAGG
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AGGAGCAAATTTTAGCAATCAAGGCTGCAATTATCAACTCCCAGACGATAGAAGAAATTG
CAAGACTCGAACAGGCTTTGAAGTTTGGCCAGGTTCCTGCAGGCCTGATAGTTCCTGATC
CTGCATCTGGTGTTAATGACAGTTCTGGTCCTATGGAGGAATAGAAAATGTGGCAGTTGC
TCCTTCAGACCGTAGTAGCTGCTGCTTGAATTGCTCACAGCAGTTATGTCTGACAAGCTT
TATTGCTTCATGGTCATGTAAGACATCCTTAGGAAAATTGTAAACTACTTGTGCTCAAGA
GCATCTGTTATTGAACCCTTGAAAAGAGTGGCAAAGAGGATTTTGTAATGTTTAGTCTGC
AATCACAGAAAGAGATGGTGCACAGTGCACACAGAATTTGCC


BQ
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AF RS1BY30TF U 1
AF RS1BY30JQ C 350
BS 1 756 RS1BY30TF
BS 757 1062 RS1BY30JQ

RD RS1BY30TF 756 0 0
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GAACAATGGTGAAGCTCACGGCTGATTTGATCTGGAATAGCCCTCACTTCTTCAATGCCG
TTAAGGAGCGAGAATTGGAGCTACGAGGTAACAAGATTCCTGTAATCGAGAACTTGGGTG
CTACTGAGGACCAGTTCGATACAGTTGATCTGTCTGATAATGAGATAGTTAAGCTCGAAA
ACTTCCCACTCCTCAATCGCTTAGGGACTTTGATCATAAACAACAATCGGATCACCAGGA
TTAATCCTAATATTGGAGAGTTCCTACCGAAGCTGCACACTCTGGTTCTTACAAACAACA
GGCTTGTGAATTTGGTTGAAATTGATCCCCTTGCCTCCATTCCAAAGCTGCAGTACCTTA
GTTTGTTGGATAATAATATCACCAAAAAGCCAAATTATCGCCTTTATGTGATTCACAAGC
TGAAATCACTTCGAGTATTGGACTTTATAAAAGTCAAAGCCAAGGAGAGAGCTGAAGCTG
CGGCTTTGTTTTCATCCAAGGAAGCGGAAGAGGAGGTTAAGAAGGTATCTCAGCAGGAGG
TTCAAAAAGTGGTGGATACTACAGAAGAACCAGAGACTCCAAAAGTGGTGGCCCCAACCC
AGGAGCAAATTTTAGCAATCAAGGCTGCAATTATCAACTCCCAGACGATAGAAGAAATTG
CAAGACTCGAACAGGCTTTGAAGTTTGGCCAGGTTC

QA 1 756 1 756
DS 

RD RS1BY30JQ 713 0 0
TACAAACAACAGGCTTGTGAATTTGGTTGAAATTGATCCCCTTGCCTCCATTCCAAAGCT
GCAGTACCTTAGTTTGTTGGATAATAATATCACCAAAAAGCCAAATTATCGCCTTTATGT
GATTCACAAGCTGAAATCACTTCGAGTATTGGACTTTATAAAAGTCAAAGCCAAGGAGAG
AGCTGAAGCTGCGGCTTTGTTTTCATCCAAGGAAGCGGAAGAGGAGGTTAAGAAGGTATT
TCAGCAGGAGGTTCAAAAAGTGGTGGATACTACAGAAGAACCAGAGACTCCAAAAGTGGT
GGCCCCAACCCAGGAGCAAATTTTAGCAATCAAGGCTGCAATTATCAACTCCCAGACGAT
AGAAGAAATTGCAAGACTCGAACAGGCTTTGAAGTTTGGCCAGGTTCCTGCAGGCCTGAT
AGTTCCTGATCCTGCATCTGGTGTTAATGACAGTTCTGGTCCTATGGAGGAATAGAAAAT
GTGGCAGTTGCTCCTTCAGACCGTAGTAGCTGCTGCTTGAATTGCTCACAGCAGTTATGT
CTGACAAGCTTTATTGCTTCATGGTCATGTAAGACATCCTTAGGAAAATTGTAAACTACT
TGTGCTCAAGAGCATCTGTTATTGAACCCTTGAAAAGAGTGGCAAAGAGGATTTTGTAAT
GTTTAGTCTGCAATCACAGAAAGAGATGGTGCACAGTGCACACAGAATTTGCC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

CO CL5256Contig1 956 2 2 U
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TCAAATGAGTCTCGGGTTATAGGATACTGGGAAAATATTCAACCGGAGAATGTGAAGACA
CCTGCGGAAGTATATGCTGCTCTTAAAGATGAAAACTACAACATATCTTACCGGAGAATA
CCATTAACCAGAGAAAGAGATGCATTAGCTACTGATTTAGATGCGATCCAGTATTGTAAA
GACGATTCCGCTGGGGGTTACTTGTTTGTATCGCACACCGGTTTTGGAGGAGCTTCTTAC
GCAATGGCCATTACCTGTCTCGTGCTTCAACCTGGTCAGAAGCTTACAGCTACACCAAAC
ACCGATTCTTCTGCCTTAGGGGAAGATGATTCACCTTCACGCGCTTGTGATGAAGAAACG
TTGAGTATGGGAGATTACCGTGACATACTGAGTCTCATAAGAGTTCTTTCTCATGGTCCT
CAAAGCAAAGCAGACGTAGATGGAATAATCCAACAGTGTGCTGGTGCAGGACATTTGAAG
GAAGACATTTGTTACTACACCAAAGAACTCAACAAGCTTCCTAATACAAAAGATGAAGAC
CGTTCATACATCATGGACATGGGTGTTAAAGCCTTAAAGCGCTACTTTTATCTGATAACA
TTCAGATCATACCTCTACTGCACGTCACCGAAAGAAACGAAATTCTTGGATTGGATGAGG
TCACGGCCGGAACTTGGACATTTCTGTCATAACCTCAGGATAGATAAGTGATAAGTGTCC
GGTTTATTACATATAAATGTAGGCAAGTTATGTTGTTTGGTGTTACAGCTTTTAGTATAT
ATATAAGTTGTACAGCTCTGAGCTTTCTCTCCTGTGTTTGGTCTGTAGAGAGAGATATCT
CGTCTCTAAAGTTTGTTTAAGACACTCCGACTGATACAGCATGTTACTCTGATCAA


BQ
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AF RS1CY02TF U 1
AF RS1CY02JQ C 450
BS 1 719 RS1CY02TF
BS 720 956 RS1CY02JQ

RD RS1CY02TF 724 0 0
GGGGAGGTTAGAGAAACTGGAGGTCGAATGCTATTACACCGTGAAGAGTATAGCCCAGCA
TCAAATGAGTCTCGGGTTATAGGATACTGGGAAAATATTCAACCGGAGAATGTGAAGACA
CCTGCGGAAGTATATGCTGCTCTTAAAGATGAAAACTACAACATATCTTACCGGAGAATA
CCATTAACCAGAGAAAGAGATGCATTAGCTACTGATTTAGATGCGATCCAGTATTGTAAA
GACGATTCCGCTGGGGGTTACTTGTTTGTATCGCACACCGGTTTTGGAGGAGCTTCTTAC
GCAATGGCCATTACCTGTCTCGTGCTTCAACCTGGTCAGAAGCTTACAGCTACACCAAAC
ACCGATTCTTCTGCCTTAGGGGAAGATGATTCACCTTCACGCGCTTGTGATGAAGAAACG
TTGAGTATGGGAGATTACCGTGACATACTGAGTCTCATAAGAGTTCTTTCTCATGGTCCT
CAAAGCAAAGCAGACGTAGATGGAATAATCCAACAGTGTGCTGGTGCAGGACATTTGAAG
GAAGACATTTGTTACTACACCAAAGAACTCAACAAGCTTCCTAATACAAAAGATGAAGAC
CGTTCATACATCATGGACATGGGTGTTAAAGCCTTAAAGCGCTACTTTTATCTGATAACA
TTCAGATCATACCTCTACTGCACGTCACCGAAAGAAACGAAATTCTTGGATTGGATGAG
TCACG

QA 1 719 1 719
DS 

RD RS1CY02JQ 507 0 0
GAGTCTCATAAGAGTTCTTTCTCATGGTCCTCAAAGCAAAGCAGACGTAGATGGAATAAT
CCAACAGTGTGCTGGTGCAGGACATTTGAAGGAAGACATTTGTTACTACACCAAAGAACT
CAACAAGCTTCCTAATACAAAAGATGAAGACCGTTCATACATCATGGACATGGGTGTTAA
AGCCTTAAGGCGCTACTTTTATCTGATAACATTCAGATCATACCTTTACTGCACGTCACC
GAAAGAAACGAAATTCTTGGATTGGATGAGGTCACGGCCGGAACTTGGACATTTCTGTCA
TAACCTCAGGATAGATAAGTGATAAGTGTCCGGTTTATTACATATAAATGTAGGCAAGTT
ATGTTGTTTGGTGTTACAGCTTTTAGTATATATATAAGTTGTACAGCTCTGAGCTTTCTC
TCCTGTGTTTGGTCTGTAGAGAGAGATATCTCGTCTCTAAAGTTTGTTTAAGACACTCCG
ACTGATACAGCATGTTACTCTGATCAA

QA 1 507 1 507
DS 



AS 1 2

CO CL5257Contig1 600 2 3 U
ATGAAGTTCTTGTTGGATATGTTCTAAACACCACTCTACTTAACCGAAGGAGGCCAAGAT
AGTCTCCGGTCAAGTTGAACATTCTCATCTTCTTCTGTTTCATTTTGATCATGGATTTGC
CTCCTTGTTGTCTGAACAGCCAAGTCGTCAAAGCTTGAATCTGTTCTCCCTTGAGGTGGA
GTCACACAATCCGAGTCTCTATGTGGCGTTTCGTTACTTCCTGGTGTTGTTGGTAAAGAA
AATGCAAAGCTACCAACTCTAAGGTCTTGAAAAGTTGCGAATGATTCTCTCATCGCGGTC
ATGGCCTAAAAGAATCTCGTGCATGACGCTAGTGCCACCGGTATTGGACGCAGCATTTCC
CCCCAGACAGAAGGAGGTTCTTTAAAGTTTTGGCTCCACTGAAAATCAGACACTGATGCT
GTTAAGGCGCCATAATCACTGGCGGCTTTCATTAACAACTCTGAAAATTGTTTCTGATAT
TCTGCTTCAACTGGAATACAATCCAGTGAATAAGGTTGTTGGAGACGAGCAATGATGCGA
TCCTTGTTTTGTATAACATCTTTCAAGATTTGAGTAGTCCTTGAAAGAGTCTCGATTTTC


BQ
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0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EH72JQ U 62
AF RS1EH72TF C 1
BS 1 65 RS1EH72TF
BS 66 348 RS1EH72JQ
BS 349 600 RS1EH72TF

RD RS1EH72JQ 287 0 0
GTCC
CCGGTCAAGTTGAACATTCTCATCTTCTTCTGTTTCATTTTGATCATGGATTTGCCTCCT
TGTTGTCTGAACAGCCAAGTCGTCAAAGCTTGAATCTGTTCTCCCTTGAGGTGGAGTCAC
ACAATCCGAGTCTCTATGTGGCGTTTCGTTACTTCCTGGTGTTGTTGGTAAAGAAAATGC
AAAGCTACCAACTCTAAGGTCTTGAAAAGTTGCGAATGATTCTCTCATCGCGGTCATGGC
CTAAAAGAATCTCGTGCATGACGCTAGTGCCACCGGTATTGGA

QA 5 287 5 287
DS 

RD RS1EH72TF 600 0 0
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AGTCTCCGGTCAAGTTGAACATTCTCATCTTCTTCTGTTTCATTTTGATCATGGATTTGC
CTCCTTGTTGTCTGAACAGCCAAGTCGTCGAAGCTTGAATCTGTTCTCCCTTGAGGTGGA
GTCACACAATCCGAGTCTCTATGTGGCGTTTCGTTACTTCCTGGTGTTGTTGGTAAAGAA
GATGCAGAGCTACCAACTCTAAGGTCTTGAAGAGTTGCGAATGATTCTCTCATCGCGGTC
ATGGCCTAGAAGAATCTCGTGCATGACGCTAGTGCCACCGGTATTGGACGCAGCATTTCC
CCCCAGACAGAAGGAGGTTCTTTAAAGTTTTGGCTCCACTGAAAATCAGACACTGATGCT
GTTAAGGCGCCATAATCACTGGCGGCTTTCATTAACAACTCTGAAAATTGTTTCTGATAT
TCTGCTTCAACTGGAATACAATCCAGTGAATAAGGTTGTTGGAGACGAGCAATGATGCGA
TCCTTGTTTTGTATAACATCTTTCAAGATTTGAGTAGTCCTTGAAAGAGTCTCGATTTTC

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 2

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AATGGAGAGCGTGATGAAGATAATAAAGCCAAAGCCTGATCCGAAGCAAATCTTGCGTGA
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GAAAGAAGAGAGAAATGTACAGAAAGCTATTAAAGAAGCTGCAAAGCGAAATGATATGGT
CTCAGCCAAGGCGCTTGCCAAGGAGATTGTGAGTTCGAGAAGAACAGTGAACCGTCTATA
CGAAAACAAAGCGCAGATGAATTCCATTTCAATGCACCTCGGTGAAAGTGTTGCTGTTGC
TCGAACAGTTGGGCATCTGTCCAAGAGCGCAGAGGTTATGAAGCTAGTCAATAACCTCAT
GAAAGCCCCCCAAATGGCTGCAACTATGCAGGAGTTCAGCAAAGAGATGACTAAGGCTGG
AGTGATTGAGGAGTTTGTGAATGATGCCATTGACAATGCACTGGATTCTGAGGATATGGA
AGATGAGATCGACGATGAGGTTGATCAAGTATTGACAGCTATTGCTGGAGAAACCGCTGC
TGAGCTCCCAGAAGCTGTCAGGAAGGAAAGGATAAAGGTACCTGCGCACAAGGCTAGCAC
TTCCCGCGAGGAAGAAGCAATTGCAGAAGGTGATGATGACGATGAGGAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FN80TF U 1
AF RS1FN80JQ C 379
BS 1 648 RS1FN80TF
BS 649 711 RS1FN80JQ

RD RS1FN80TF 648 0 0
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AATGGAGAGCGTGATGAAGATAATAAAGCCAAAGCCTGATCCGAAGCAAATCTTGCGTGA
CTGGCAACGTAAGCTTCGTCAGGAGTGCCGTAACATCGAACGCCAAATCCGAGATATACA
GAAAGAAGAGAGAAATGTACAGAAAGCTATTAAAGAAGCTGCAAAGCGAAATGATATGGT
CTCAGCCAAGGCGCTTGCCAAGGAGATTGTGAGTTCGAGAAGAACAGTGAACCGTCTATA
CGAAAACAAAGCGCAGATGAATTCCATTTCAATGCACCTCGGTGAAAGTGTTGCTGTTGC
TCGAACAGTTGGGCATCTGTCCAAGAGCGCAGAGGTTATGAAGCTAGTCAATAACCTCAT
GAAAGCCCCCCAAATGGCTGCAACTATGCAGGAGTTCAGCAAAGAGATGACTAAGGCTGG
AGTGATTGAGGAGTTTGTGAATGATGCCATTGACAATGCACTGGATTCTGAGGATATGGA
AGATGAGATCGACGATGAGGTTGATCAAGTATTGACAGCTATTGCTGGAGAAACCGCTGC
TGAGCTCCCAGAAGCTGTCAGGAAGGAAAGGATAAAGGTACCTGCGCA

QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1FN80JQ 333 0 0
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TGCAACTATGCAGGAGTTCAGCAAAGAGATGACTAAGGCTGGAGTGATTGAGGAGTTTGT
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GGTTGATCAAGTATTGACAGCTATTGCTGGAGAAACCGCTGCTGAGCTCCCAGAAGCTGT
CAGGAAGGAAAGGATAAAGGTACCTGCGCACAAGGCTAGCACTTCCCGCGAGGAAGAAGC
AATTGCAGAAGGTGATGATGACGATGAGGAAGA

QA 1 333 1 333
DS 



AS 1 2

CO CL5259Contig1 604 2 2 U
GGAGAATCCTCGTAGCCTATCCCTTCTTCTCCTTCGTCCTCCTGTTCTTCCGTTTCGGCG
TCGTTTCGTCTCCATCGTTCATCGTGGTCCTCTGCTTTGGATTCGATCATCTCCTCCTCT
ATCCTCCATGTCATCTCAGGCTGAATCTGGGGCTCCTCAACAATCCGATTGTTCAAAAAC
GGTGAGGATGGTGATAAAGGGAAGAGTACAGGGAGTTTGCTACAGGAACTGGACCGTTGA
GAATGCGGAGCAGCTCGGGATTAAAGGATGGGTGAGGAACCGCAGGGACGGTTCAGTGGA
AGCGGTCTTCTCTGGACCAACTGAAGCTGTGGAAGAAATGCAGCAGAGGTGCCGCCGTGG
TCCTCCTGCAGCCATGGTTACTGGATTGGAGGCTTTCCCATCCACTGAAGAACCAGAAAC
AGGTTTCGAATACAGATCAACTGTCTGATTCGAGGGTTCCTTGAATGTTGCAGTGGTTAC
TTATGGATATAATAAAGTTGTAACAAGGCTTAGATTGACACACGTATTTTGATCAATTTG
CTCTGGCCTGGGTCGTGTTTTAAAAAACTTGATAGCAACTCAATAAAAGAGATTCATTAC
CGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RS1FU83TF U 1
AF RS1FU83JQ C 149
BS 1 567 RS1FU83TF
BS 568 604 RS1FU83JQ

RD RS1FU83TF 567 0 0
GGAGAATCCTCGTAGCCTATCCCTTCTTCTCCTTCGTCCTCCTGTTCTTCCGTTTCGGCG
TCGTTTCGTCTCCATCGTTCATCGTGGTCCTCTGCTTTGGATTCGATCATCTCCTCCTCT
ATCCTCCATGTCATCTCAGGCTGAATCTGGGGCTCCTCAACAATCCGATTGTTCAAAAAC
GGTGAGGATGGTGATAAAGGGAAGAGTACAGGGAGTTTGCTACAGGAACTGGACCGTTGA
GAATGCGGAGCAGCTCGGGATTAAAGGATGGGTGAGGAACCGCAGGGACGGTTCAGTGGA
AGCGGTCTTCTCTGGACCAACTGAAGCTGTGGAAGAAATGCAGCAGAGGTGCCGCCGTGG
TCCTCCTGCAGCCATGGTTACTGGATTGGAGGCTTTCCCATCCACTGAAGAACCAGAAAC
AGGTTTCGAATACAGATCAACTGTCTGATTCGAGGGTTCCTTGAATGTTGCAGTGGTTAC
TTATGGATATAATAAAGTTGTAACAAGGCTTAGATTGACACACGTATTTTGATCAATTTG
CTCTGGCCTGGGTCGTGTTTTAAAAAA

QA 1 567 1 567
DS 

RD RS1FU83JQ 456 0 0
GGGGCTCCTCAACAATCCGATTGTTCAAAAACGGTGAGGATGGTGATAAAGGGAAGAGTA
CAGGGAGTTTGCTACAGGAACTGGACCGTTGAGAATGCGGAGCAGCTCGGGATTAAAGGA
TGGGTGAGGAACCGCAGGGACGGTTCAGTGGAAGCGGTTTTTTTTGGACCAACTGAAGCT
GTGGAAGAAATGCAGCAGAGGTGCCGCCGTGGTCCTCCTGCAGCCATGGTTACTGGATTG
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TTCGAGGGTTCCTTGAATGTTGCAGTGGTTACTTATGGATATAATAAAGTTGTAACAAGG
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DS 



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TTTCAGTATTTTGTTTAACCATGTTAGGAGTCTTCATTAACAGCAATAATGAAGATGATT
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TGAAGCCTTACCTTATGGATCTTGGCAGCACCAACAAGACTTACATCAACAAAGACCCTA
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GCCGAGAGTACGTACTGTTGCACGAGGGTTTTGCGGAGTGAATTAAATCAGAGTCAAGCA
GCAAGGAGATCGCTTTTCTCAGGGGGTTTAAAGAGAGGATAGTTGAGCAGCTTCGTTTCT
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TTACCATTTTAGCATTTGCTTACCGACCCCCAATGTTAAATTTGAAAGAGATTTTAATTT
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TGCGATCGATCTTTACTTG


BQ
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AF RS1EA13JQ C 561
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GAAGAGAAGGAGACAAGGAGGAGAAGACGAGGAGGAACGTGACGGATTTGGAAGTTGGGG
ATAAGAGACGACGCGGCGGCTCAGGGAGAGAGGAGACTGAAGAAAGGAGAATAGCGGAGG
ATGAGAGACAAACTAATAGAGGAAGACGTGAGAGGTCTGCTTCACCGTCAGATAGGAATA
GTCGCAAGATTAGGCGTTCACCAGACAGACCTTCTGCATCAAGGCATGATGAGGGATCTA
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CAATTGCTAGAATGAAAGCAGCTGAAGAAGCTTTGGCAAAGAAGAA

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DS 

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GCTAGAAAACCCAACAAAAGATGGAGACTTTATGTTTTCAAGGATAGTGGACCACTGGAT
GAGCCACTCCAGCTCCATCGCCAAAGCTGCTACCTCTTTGGACGTGAGAGAAGAGTCGCT
GACATTCCTACTGATCACCCTTCTTGCAGCAAGCAGCATGCTGTTATCCAGTACCGGGAA
GTGACAGTGGAGAAACCAGATGGCATGGTGGAGAAGCAAGTGAAGCCTTACCTTATGGAT
CTTGGCAGCACCAACAAGACTTACATCAACAAAGACCCTATTGAATCAGAACGCTACTAT
GAGCTGCGCGAGAAAGATACCATCAAGTTTGGTAACAGCAGCCGAGAGTACGTACTGTTG
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AGGGGGTTTAAAGAGAGGATAGTTGAGCAGCTTCGTTTCTACTTTCCTCAGATAGCGTAT
CTACTGTGTTGGTTACACAGTCTCGACATTTTGTTAATACTTACCATTTTAGCATTTGCT
TACCGACCCCCAATGTTAAATTTGAAAGAGATTTTAATTTCTAGCTTTTCTGTTTTGTAA
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DS 



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CCAACAAGAGAAATGCTTGAACCGCTGTTACGTACTGCTGCAGCTATTGGGCTTAGCTTA
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TGCTGATAATTTGAACTATCGGCACAGGAATGCCCAGATGGCAAGTCGAGCTTCAGTAGA
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F109TF U 1
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CTTA
CAGC

QA 1 724 1 724
DS 

RD RS1F109JQ 768 0 0
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CGAAGATATGCTGATGTCTTCGTGCACAGATTACTTGCCGCGTCATTAGGAATATACAAG
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TATCATCATATCATTATTTATTATTGGATGCCAGTTTTGTTGAGAAGT

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

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ATCTTACTCGACCAGGTTTCTGATTGCTCGTCATATGGGATTAGTAAGAGAGACATTCTG
AAGATAGAAGATGATCACAGTCTTGAGGTAAAGCCACAACACCCTCAAAAAGGTAAATCC
ATGTCTGAAGAGTCACTGGTCGTGGACAAACTAGAGGTCTCCGGCAGGTTCACGGATCCA
AACAAAGAAGTAAACAAGAGGAAAGTTCTCGAGAGACTTGATTCAGATTTACAAAAGCTC
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AATGAAAAGTGAGTTTGAGTTTAATATATGAATGACGAACACCTTTCTTAATATATGTTT
TGCGTTTGGAAGATTTTA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AJ37TF U 1
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QA 1 710 1 710
DS 

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TATC
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TTTGGAAGATTTTA

QA 5 858 5 858
DS 



AS 1 2

CO CL5263Contig1 1105 2 6 U
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AAAATCAGACTCCGGTTGAGAAGCCTCTTGTTTCGGCTAGGATCGGCCAACGGAAACTGG
TCAAGACCACCACGGCAGAACGAAAATCTTTGAAAGCGTTGAGAGTGGCGAAGCCGAAGC
GGCACGAGACTCTTGAGAGTACGTGGAAGATGATAACGGAAGGGAAGCCGTTGACTAGCT
ATTACCGGAGACCAGACACGTTCGGACTTGGCGTAGAAGATTCTTCCAACAAGACAAAAC
AATCCGGTTTGAAGAAAGCCGAGACGTTTAGCGATCGGACCAAGTATTACCTCTCACCGG
CCGTGTCCCGGAGTCGAAACGAGCTGAATATAAGAGCAGAAGCGTTTATAAAAAAGTGCA
ACGACGAAAGGTTCGAGTCGATGAGACAGGACACAGAAATGACTCGTCGTGGTCTTTCGT
TTTAGTTTTAGTTATGGTTTTTTTGCTTTTGTTTTGTCTATTTTAGTTTCGATTGCATTT
TCTTTCTAGAAGCTATTAAGTAATAAGAAAAGGAAATGACAAATGTGGGAAGTCATGGAT
AAACAAAGCACCCCTTATTGGCCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1EH02TF U 1
AF RS1EH02JQ C 350
BS 1 703 RS1EH02TF
BS 704 704 RS1EH02JQ
BS 705 732 RS1EH02TF
BS 733 733 RS1EH02JQ
BS 734 761 RS1EH02TF
BS 762 1105 RS1EH02JQ

RD RS1EH02TF 778 0 0
GGGACAACAACTACTAAACACCATTTCCATAAATCCGAAGAGAGAAAGAGAAAGAGAGAA
GGACAAGATCGGGAAAAATGGCGTCATGGATTAAACCGGTGCTAATCTCTACAGGAGTCG
TAGCTGTAGCTATGCAACTAAAAATCATTGTCCCTGTTGTGGCACTAGATTTCTCTCGAG
CTCCCATCCTTTTCGGTTCCTTTCTCTCATGGCTGAAACCACCATACCTCTACGTCATCA
CCAACGTCATCATCGCCATGATCGGGTTCTCATCCATATATCACCGGATCATCACAAACC
CCGAGGTCAAAGACCACGGGGGCTCATACGGCGGCGACCATAAGTTTCAGAACGAGCAGA
ACGTCCACCGAGCTCAACCGCAGCGATCTGAAGATTTCAGTTTTATCGCCGCAGCTCCGC
CGTCAAAGACCATCGTTAAGGAGAAGGGGAGAGAAGAGGTGGTTACGGAGAAGCTAGCAG
AAGCGGCGGCAAAGTTAGAGGAGGAGAAGAAGTGTTTAGTGGTGGTGGTGGCCAAACCGG
AAAATCAGACTCCGGTTGAGAAGCCTCTTGTTTCGGCTAGGATCGGCCAACGGAAACTGG
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GGCACGAGACTCTTGAGAGTACGTGGAAGATGATAACGGAAGG*AAGCCGTTGACTAGCT
ATTACCGGAGAC*AGACACGTTCGGACTTGGCGTAGAAGAT
CTTCAACAGACAAACAT

QA 1 761 1 761
DS 

RD RS1EH02JQ 756 0 0
GAACGAGCAGAACGTCCACCGAGCTCAACCGCAGCGATCTGAAGATTTCAGTTTTATCGC
CGCAGCTCCGCCGTCAAAGACCATCGTTAAGGAGAAGGGGAGAGAAGAGGTGGTTACGGA
GAAGCTAGCAGAAGCGGCGGCAAAGTTAGAGGAGGAGAAGAAGTGTTTAGTGGTGGTGGT
GGCCAAACCGGAAAATCAGACTCCGGTTGAGAAGCCTCTTGTTTCGGCTAGGATCGGCCA
ACGGAAACTGGTCAAGACCACCACGGCAGAACGAAAATTTTTGAAAGCGTTGAGAGTGGC
GAAGCCGAAGCGGCACGAGACTCTTGAGAGTACGTGGAAGATGATAACGGAAGGGAAGCC
GTTGACTAGCTATTACCGGAGACCAGACACGTTCGGACTTGGCGTAGAAGATTCTTCCAA
CAAGACAAAACAATCCGGTTTGAAGAAAGCCGAGACGTTTAGCGATCGGACCAAGTATTA
CCTCTCACCGGCCGTGTCCCGGAGTCGAAACGAGCTGAATATAAGAGCAGAAGCGTTTAT
AAAAAAGTGCAACGACGAAAGGTTCGAGTCGATGAGACAGGACACAGAAATGACTCGTCG
TGGTCTTTCGTTTTAGTTTTAGTTATGGTTTTTTTGCTTTTGTTTTGTCTATTTTAGTTT
CGATTGCATTTTCTTTCTAGAAGCTATTAAGTAATAAGAAAAGGAAATGACAAATGTGGG
AAGTCATGGATAAACAAAGCACCCCTTATTGGCCTT

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL5264Contig1 943 2 4 U
TTCTCTGCTTCGACGTTGCTTGGATTGACTGAAACCCAATTGCTACAGTGTTGCAACTGG
AGATTTCCGCCTCGCCGCTACTAGGATTCTCTCGTCACTGCCAACACCTCACTGAAATTA
GGGTTCATAACCTTTGGTCCTTGTTGATTCTTCTGGCTCTGTTTCTCCAAATCGAGTCTA
TCAAAGTCAGGAGGAGGAGGTTTGCTTTAAAGGCTAGAGCATGAGGATGATTCTGATTTT
CGTATAGAATGTCGAGTTGGTTTGATAAGTGACGAGGAATTTGACTGTTAAAGCAGCTGT
CTTGGACTACAAAGCAGAGAGGCAATTACTAGCAGCGGTCTTCTATTACTAGACCGCATT
GAAACTCTATCTTAGTTGAGGAATTTGACTGTTAAAGCAGCTGTCTTGGATTAGGCCACC
CATCTAGTTTTCATGTTTTGTTATTGCCTCTCTGCTTTTGTTTCTTCATAAGCTGATCTC
TCTCTTGATCAGGCCATTGAGACTAAGTTGCAAGAGTGTTTGAAGAAGGGTGTTTATGGT
GACATATACAATTACTCGGAGCTTGACTGGAACAAGGTTCTTGGTGAAGAAAACCAGTGG
CAGAGGGTGTTGAGGAAGAAGAGGAAAAGATTGTTTTGTTGCTGAATGCTTGTTGTCGAG
TCTACAGAACTTTGGGAGACCACGAGATATAGATATTGTGGTTTATATCTTGCAAAGGGC
TCGTAATGGTGATTTGCCTTGAGACATGAGTAGCGATGGCAGCAAGATCTTTCTCATCAG
GGTGCTGTAACGTTAATGGAACCTAATGAAGATTATGTTTAGATTAGTTTTAGATTTTTC
TTTTAATTTATTTTGGTGTAAACCTTTTGGTTTACTTTGATAAACCGATTATAATTTTGT
AAACAAATTTGAAACCCCATAAAGAAAATCTAATATTATTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BK96TF U 1
AF RS1BK96JQ C 165
BS 1 529 RS1BK96TF
BS 530 530 RS1BK96JQ
BS 531 571 RS1BK96TF
BS 572 943 RS1BK96JQ

RD RS1BK96TF 571 0 0
TTCTCTGCTTCGACGTTGCTTGGATTGACTGAAACCCAATTGCTACAGTGTTGCAACTGG
AGATTTCCGCCTCGCCGCTACTAGGATTCTCTCGTCACTGCCAACACCTCACTGAAATTA
GGGTTCATAACCTTTGGTCCTTGTTGATTCTTCTGGCTCTGTTTCTCCAAATCGAGTCTA
TCAAAGTCAGGAGGAGGAGGTTTGCTTTAAAGGCTAGAGCATGAGGATGATTCTGATTTT
CGTATAGAATGTCGAGTTGGTTTGATAAGTGACGAGGAATTTGACTGTTAAAGCAGCTGT
CTTGGACTACAAAGCAGAGAGGCAATTACTAGCAGCGGTCTTCTATTACTAGACCGCATT
GAAACTCTATCTTAGTTGAGGAATTTGACTGTTAAAGCAGCTGTCTTGGATTAGGCCACC
CATCTAGTTTTCATGTTTTGTTATTGCCTCTCTGCTTTTGTTTCTTCATAAGCTGATCTC
TCTCTTGATCAGGCCATTGAGACTAAGTTGCAAGAGTGTTTGAAGAAGG*TGTTTATGGT
GACATATACAATTACTCGGAGCTTGACTGGA

QA 1 571 1 571
DS 

RD RS1BK96JQ 779 0 0
CTCCAAATCGAGTCTATCAAAGTCAGGAGGAGGAGGTTTGCTTTAAAGGCTAGAGCATGA
GGATGATTCTGATTTTCGTATAGAATGTCGAGTTGGTTTGATAAGTGACGAGGAATTTGA
CTGTTAAAGCAGCTGTCTTGGACTACAAAGCAGAGAGGCAATTACTAGCAGCGGTCTTCT
ATTACTAGACCGCATTGAAACTCTATCTTAGTTGAGGAATTTGACTGTTAAAGCAGCTGT
CTTGGATTAGGCCACCCATCTAGTTTTCATGTTTTGTTATTGCCTCTCTGCTTTTGTTTC
TTCATAAGCTGATCTCTCTCTTGATCAGGCCATTGAGACTAAGTTGCAAGAGTGTTTGAA
GAAGGGTGTTTATGGTGACATATACAATTACTCGGAGCTTGACTGGAACAAGGTTCTTGG
TGAAGAAAACCAGTGGCAGAGGGTGTTGAGGAAGAAGAGGAAAAGATTGTTTTGTTGCTG
AATGCTTGTTGTCGAGTCTACAGAACTTTGGGAGACCACGAGATATAGATATTGTGGTTT
ATATCTTGCAAAGGGCTCGTAATGGTGATTTGCCTTGAGACATGAGTAGCGATGGCAGCA
AGATCTTTCTCATCAGGGTGCTGTAACGTTAATGGAACCTAATGAAGATTATGTTTAGAT
TAGTTTTAGATTTTTCTTTTAATTTATTTTGGTGTAAACCTTTTGGTTTACTTTGATAAA
CCGATTATAATTTTGTAAACAAATTTGAAACCCCATAAAGAAAATCTAATATTATTATG

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

CO CL5265Contig1 655 2 4 U
AACCATAACACTTATATAATCGAGAATCAAATCATAACACTTATATTAAGAACACATGGT
TTCATATAACACGAAAGGACTCTGCACCGTAGTCTAACGAAACATTAAAAGACCTAACCT
AAACCTACGGCTACACATTCATAAGCTGAAAACACCACAAACACAGAGAAACTGAATCTA
CTCGTCATCACCGGAAGGTTTGGAAGCACCACCCGCCTTCTTGGGAAGAAGAAGGTTGTG
AATGTTTGGCATCACACCTCCGTTAGCAATCGTCACATCTCCAAGCAACTTGCTAAGCTC
CTCGTCGTTCCTCACCGCCAGCTGGATGTGACGCGGCACGATTCTCGTCTTCTTGTTGTC
CCTCGCCGCGTTCCCAGCCAATTCGAGAACCTCTGCGGCTAGGTATTCGAGAACGGCGGC
TAGGTAGACCGGAGCTCCGGCACCGACACGTTCGGCGTATTTGCCGTTTTTCAAGAACCG
GGCGATACGACCCACGGGGAACTGGAGACCGGCTTTGCTGCTCCGAGACGTCGCCTTCTT
CGCGACTCCAGATCCGAGAGTTTTTCCACGACCAGCCATTTGTGATTTCGGAAAGAGAGG
CGACGACGACGACTCGGTGAAAGCGAAAAGAGGGAAGCGTACGAAAGTGTATGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CB79JQ U 1
AF RS1B368TF C 204
BS 1 360 RS1CB79JQ
BS 361 361 RS1B368TF
BS 362 603 RS1CB79JQ
BS 604 655 RS1B368TF

RD RS1CB79JQ 603 0 0
AACCATAACACTTATATAATCGAGAATCAAATCATAACACTTATATTAAGAACACATGGT
TTCATATAACACGAAAGGACTCTGCACCGTAGTCTAACGAAACATTAAAAGACCTAACCT
AAACCTACGGCTACACATTCATAAGCTGAAAACACCACAAACACAGAGAAACTGAATCTA
CTCGTCATCACCGGAAGGTTTGGAAGCACCACCCGCCTTCTTGGGAAGAAGAAGGTTGTG
AATGTTTGGCATCACACCTCCGTTAGCAATCGTCACATCTCCAAGCAACTTGCTAAGCTC
CTCGTCGTTCCTCACCGCCAGCTGGATGTGACGCGGCACGATTCTCGTCTTCTTGTTGTC
TCTCGCCGCGTTCCCAGCCAATTCGAGAACCTCTGCGGCTAGGTATTCGAGAACGGCGGC
TAGGTAGACCGGAGCTCCGGCACCGACACGTTCGGCGTATTTGCCGTTTTTCAAGAACCG
GGCGATACGACCCACGGGGAACTGGAGACCGGCTTTGCTGCTCCGAGACGTCGCCTTCTT
CGCGACTCCAGATCCGAGAGTTTTTCCACGACCAGCCATTTGTGATTTCGGAAAGAGAGG
CGA

QA 1 603 1 603
DS 

RD RS1B368TF 452 0 0
AAGCACCACCCGCCTTCTTGGGAAGAAGAAGGTTGTGAATGTTTGGCATCACACCTCCGT
TAGCAATCGTCACATCTCCAAGCAACTTGCTAAGCTCCTCGTCGTTCCTCACCGCCAGCT
GGATGTGACGCGGCACGATTCTCGTCTTCTTGTTGTCCCTCGCCGCGTTCCCAGCCAATT
CGAGAACCTCTGCGGCTAGGTATTCGAGAACGGCGGCTAGGTAGACCGGAGCTCCGGCAC
CGACACGTTCGGCGTATTTGCCGTTTTTCAAGAACCGGGCGATACGACCCACGGGGAACT
GGAGACCGGCTTTGCTGCTCCGAGACGTCGCCTTCTTCGCGACTCCAGATCCGAGAGTTT
TTCCACGACCAGCCATTTGTGATTTCGGAAAGAGAGGCGACGACGACGACTCGGTGAAAG
CGAAAAGAGGGAAGCGTACGAAAGTGTATGTC

QA 1 452 1 452
DS 



AS 1 2

CO CL5266Contig1 1022 2 8 U
GGACTCACACTTACAAACATACACAAAGATCAATAGGGTTAAACTAGGAGTGAAGATGGC
AACTAAGCAAGAAGCTTTAGCCATCGAACTCATAAGCCAACGCCTTCTCACAGATGTTGC
TTCCATGGAAACCAAAGTTTCCAATATTACCTTTCACGACGCTGACTCATCTCTTGTTGC
AAGCCAAGATCACGACCCAAGCCCAAGAACCACCACTAAACCAAACTCTACTCTTAACCG
TCGTAAACCGCCCTTACCGAACATATCCGTTCCAAGAACGGTCTCTTGTACGATAAAGAA
GGCAGAGGAAGAGGAGGAGACAAGGCACTACCGAGGAGTGAGGAGGAGGCCATGGGGAAA
ATATGCGGCGGAGATTAGGGATCCGAATAAAAAGGGGTCTAGGCTTTGGCTTGGGACTTA
CGGCACCGCCGTGGAAGCTGCAAGAGCTTACGACCAAGCGGCGTTTGAGTTGCGTGGGAG
AAAAGCAATCTTGAATTTCCCTCTAGAAGTGAGGGCTACGTCCGACAGCTGTTTCGTTGG
GTTAGGGAAACGAAAGCGGCTTAAGAGTTTCCCCGCGGTGGATGAGGAAGAGGAGGAGAA
GGCAGTACCGGTTAGGGTTAAAGATGAGGAAAAAGAGAGAGAGACCACGGTGGCTGAGGT
TGAAGCGGTGCCTTTGACGCCGTCAAGTTGGATGGGGGTTTGGGATGTGGGAGGAGCAGG
AGATGGGATCTTTAGTGTTCCTCCGTTAACTCCGACGTCTCCCAACTCCGTTGTCTCCGT
TACTTGAACTTTTGAATTGTCAACGGTTGGTGACGTTTCCACCTGCTTCACTCTCTTAAT
TTATTTATTAATTAATAGTAGCATAGCGGTAGTGTACAAACATCAAATTAATTAGTATTT
TAGTACCAATCATTTTATTCGTTAATTTATAGGAAAATTATGGATGTTCAAAATTTGGAT
GATAATTTGTATTTGTTGATGTTCATGTAAATTCGTTGATTGTATAAAAATTCTTGTTCA
TT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1CL06TF U 1
AF RS1CL06JQ C 306
BS 1 658 RS1CL06TF
BS 659 659 RS1CL06JQ
BS 660 685 RS1CL06TF
BS 686 686 RS1CL06JQ
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BS 699 711 RS1CL06TF
BS 712 1022 RS1CL06JQ

RD RS1CL06TF 711 0 0
GGACTCACACTTACAAACATACACAAAGATCAATAGGGTTAAACTAGGAGTGAAGATGGC
AACTAAGCAAGAAGCTTTAGCCATCGAACTCATAAGCCAACGCCTTCTCACAGATGTTGC
TTCCATGGAAACCAAAGTTTCCAATATTACCTTTCACGACGCTGACTCATCTCTTGTTGC
AAGCCAAGATCACGACCCAAGCCCAAGAACCACCACTAAACCAAACTCTACTCTTAACCG
TCGTAAACCGCCCTTACCGAACATATCCGTTCCAAGAACGGTCTCTTGTACGATAAAGAA
GGCAGAGGAAGAGGAGGAGACAAGGCACTACCGAGGAGTGAGGAGGAGGCCATGGGGAAA
ATATGCGGCGGAGATTAGGGATCCGAATAAAAAGGGGTCTAGGCTTTGGCTTGGGACTTA
CGGCACCGCCGTGGAAGCTGCAAGAGCTTACGACCAAGCGGCGTTTGAGTTGCGTGGGAG
AAAAGCAATCTTGAATTTCCCTCTAGAAGTGAGGGCTACGTCCGACAGCTGTTTCGTTGG
GTTAGGGAAACGAAAGCGGCTTAAGAGTTTCCCCGCGGTGGATGAGGAAGAGGAGGAGAA
GGCAGTACCGGTTAGGGTTAAAGATGAGGAAAAAGAGAGAGAGACCACGGTGGCTGAG*T
TGAAGCGGTGCCTTTGACGCCGTCA*GTTGGATGGGG*TTTGGGATGTGGG

QA 1 711 1 711
DS 

RD RS1CL06JQ 717 0 0
AGGAAGAGGAGGAGACAAGGCACTACCGAGGAGTGAGGAGGAGGCCATGGGGAAAATATG
CGGCGGAGATTAGGGATCCGAATAAAAAGGGGTCTAGGCTTTGGCTTGGGACTTACGGCA
CCGCCGTGGAAGCTGCAAGAGCTTACGACCAAGCGGCGTTTGAGTTGCGTGGGAGAAAAG
CAATCTTGAATTTCCCTCTAGAAGTGAGGGCTACGTCCGACAGCTGTTTCGTTGGGTTAG
GGAAACGAAAGCGGCTTAAGAGTTTCCCCGCGGTGGATGAGGAAGAGGAGGAGAAGGCAG
TACCGGTTAGGGTTAAAGATGAGGAAAAAGAGAGAGAGACCACGGTGGCTGAGGTTGAAG
CGGTGCCTTTGACGCCGTCAAGTTGGATGGGGGTTTGGGATGTGGGAGGAGCAGGAGATG
GGATCTTTAGTGTTCCTCCGTTAACTCCGACGTCTCCCAACTCCGTTGTCTCCGTTACTT
GAACTTTTGAATTGTCAACGGTTGGTGACGTTTCCACCTGCTTCACTCTCTTAATTTATT
TATTAATTAATAGTAGCATAGCGGTAGTGTACAAACATCAAATTAATTAGTATTTTAGTA
CCAATCATTTTATTCGTTAATTTATAGGAAAATTATGGATGTTCAAAATTTGGATGATAA
TTTGTATTTGTTGATGTTCATGTAAATTCGTTGATTGTATAAAAATTCTTGTTCATT

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 2

CO CL5267Contig1 1365 2 4 U
GGAGTTCAATTTCACCCAGTCACCTCCATGTAATGTAAAAAGAAGCGACTTCGTCTCTCT
CTTAAAGCCTCAGCCGTCAAGTTTCAGATCTCCGTCGACCGGCGCGTGGTGGCTCCAATA
GCGCCACCGCCGGTCTCCTTTTCTTCCGTTCTCTGTCTACTGTAAGTCTTGTTGGTAGTT
TCGTGTCTCTTCACCTCGGCTCTCTCAACGCTTTTGTTAGAAGGTTCGATCTGGTTTGGG
GGAAAAATCTGTCTTCTCGGTGGATTCTCGATACTCGAACTAGGTTGGAGGTTCCGCAGG
TTGAGGTCTTGCTAGGTTCTGTGCGGTGGTTACGGGATTGAGGTTAGGGTTCCGACGCCG
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TGAGTTTGGTGAAGCTAGTTCTTTAGGTTGGTTGTGTTGAGGTCTCTTGTATGGGGATCT
TTGTTTCGGGATCAAGTTTTGGTGTTTCTATATGGTTAGCTTGGATTGCTTCTCTGGGTT
CGAATCTGTTTTCTGGTGCGCGGTGGCAAGTTATAGCCGGCTCTGATGTGGGTGTTTAAT
TCTTCCATCGAACCTGGTCAAGCGACATTCAAGCGTCTCATTGGTGATTCATCAAGCTTG
TATCTCATCCTTGGTTTCTCGGAGTTGAAGGTGTGTTAGAGGGTCGTAGTGTGCTGGAGT
GTGTTTGGTTTGGTGACTTAGTAGGATGGAGCTCTTGCTCGGGCCATCGGTTGGAAATTA
TCTGTTGTGGTCTTTGAGCGGTCTGTCTCTTCTTTCATCATTGGTTCTGATCTTATAATT
TCAGTCTATGAAGCATCGAAGCGGGGAAGTTATGCAGTTCTTTGGTTTGCAACCGACGGG
TTTCTCCGGATTTCTTGGTAAGGAGCTGTGGAGCTTATGCTCAATTGCGACGGTCTTGGA
GTAGTCGATCGCCAAAAGCGTATGTTTCTCATCGTTTGGCTGCTCGAGTTGATGGCTTGT
TCTATGGTGGCTTCTCTGGTTGAAGAAGTGGTAAGTGTGTTGGTTACTGGTTTGGTTTCT
AAAGGACTGGTTCTAAGAGATAACAGCTCAACTCTAATAAGATAGGCCGGCTTCGCTTTC
CTTCTCAATTCTGCTTCCGGCTTCGATATGCTTTCTTGTTCTTGAAGTTTATGCTTAACC
TCCAGTATGTTTTAGACTCTTTTTCTCTCTTTCATTCTCTTAAGTTTGTGAAATCAGTTT
TAGTTTCATCATTTGTCTCCGGGTGTATCCTGTTTCACGCCGGCTTGTGGTTCCGGAAAG
GTGTTATACCTTTGCCGGCTTTGTGTAAGTACTGGTGTTAATCCC


BQ
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AF RS1DO91TF U 1
AF RS1DO91JQ C 648
BS 1 690 RS1DO91TF
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GGAAAAATCTGTCTTCTCGGTGGATTCTCGATACTCGAACTAGGTTGGAGGTTCCGCAGG
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CGAATCTGTTTTCTGGTGCGCGGTGGCAAGTTATAGCCGGCTCTGATGTGGGTGTTTAAT
TCTTCCATCGAACCTGGTCAAGCGACATTCAAGCGTCTCATTGGTGATTCATCAAGCTTG
TATCTCATCCTTGGTTTCTCGGAGTTGAAG*TGTGTTAGAGGGTCGTAGTGTGCTGGAGT
GTGTTTGGTTTGGTGA

QA 1 736 1 736
DS 

RD RS1DO91JQ 718 0 0
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AGTGTGCTGGAGTGTGTTTGGTTTGGTGACTTAGTAGGATGGAGCTCTTGCTCGGGCCAT
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TGATCTTATAATTTCAGTCTATGAAGCATCGAAGCGGGGAAGTTATGCAGTTCTTTGGTT
TGCAACCGACGGGTTTCTCCGGATTTCTTGGTAAGGAGCTGTGGAGCTTATGCTCAATTG
CGACGGTCTTGGAGTAGTCGATCGCCAAAAGCGTATGTTTCTCATCGTTTGGCTGCTCGA
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TGGTTTGGTTTCTAAAGGACTGGTTCTAAGAGATAACAGCTCAACTCTAATAAGATAGGC
CGGCTTCGCTTTCCTTCTCAATTCTGCTTCCGGCTTCGATATGCTTTCTTGTTCTTGAAG
TTTATGCTTAACCTCCAGTATGTTTTAGACTCTTTTTCTCTCTTTCATTCTCTTAAGTTT
GTGAAATCAGTTTTAGTTTCATCATTTGTCTCCGGGTGTATCCTGTTTCACGCCGGCTTG
TGGTTCCGGAAAGGTGTTATACCTTTGCCGGCTTTGTGTAAGTACTGGTGTTAATCCC

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

CO CL5268Contig1 1155 2 10 U
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AGAGAGATAACAATGTCCGGCTCCGATAATCCACAGGCTCCTCACTCGTCGAAAGACGCT
ACTGATGTTGGTTGGTACATTCTTGGTGGAAACCAGGAGAGCCTGGGTCCATATACCTTC
TTGGAGCTGTGTGATCATTTCAAGAATGGTTACCTACAGGAAACTACACTAGTCTGGGCT
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GGAGCTGAAGTTGACCAATCAGCTGGAGGTGCATCTGGGTTAGTGAATGGATATAATGCT
ACAACGAATCAAGAGAAGCAAGCTTCTACTGAGGATGAGTTTGAGAAATGGCAGAAAGAG
ATTCAAGAAGCAGAGGCGGAGGCTGAAAGGTTGAAAAATGGCGCTGTTGGAGATGATCAG
GACAGACCTTCTTCACCACCCGAGGGGGAAGATGAGTTCACAGATGATGATGGAACTAGA
TATAAATGGGACAAAGCTCTTAGAGCATGGGCTCCTCAGAACGAGCCACAGGGTAGCGCT
GATCCTTATGGACTTGAAGAGATGACCTTTGCTGAGGAAGACGAAGTAATTCCAACTATA
AACATCCTTGATACTTCTGTTGATAAGGAGGATGCCTCTAAGGATGATGTGGCTAGTAAG
AAAGAAGAAGATGGCTCTGATCAGACCGCGGAAATAAACAATAATGGAAAGAGGAAGCTG
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AAAGTAAACCCACATATCTATGTCACTGGGTTGCCCAAAGATGTCACGATCGAGGAAGTG
GTTGAAGTTTTTTCTAAATGCGGCATTATTAAGGAGGATGACAGTGGCAAGCCTCGCATA
AAGCTTTACAGTGACAAGGCGACAGGAGAATTAAAAGGCGATGCTCTTATCACGTATATG
AAGGAGCCCTCAGTGGATCTTGCAATTCAAATCTTAGACGGGGCTCCTTTACGTCCAGCT
GACAAGCTCCTCATGTCAGTTTCTCGAGCTAAGTTCGAGCAGAAAGGGGAGAGATTTATA
ACAAAGCAAACCGAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BP94TF U 1
AF RS1BP94JQ C 387
BS 1 592 RS1BP94TF
BS 593 593 RS1BP94JQ
BS 594 636 RS1BP94TF
BS 637 637 RS1BP94JQ
BS 638 654 RS1BP94TF
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BS 663 676 RS1BP94TF
BS 677 1155 RS1BP94JQ

RD RS1BP94TF 676 0 0
GGCTCTCAAAAAAGCGACACTCCCTTTTAAGTCGGTTTTGTTTTATGAAGGTTTAGCGAG
AGAGAGATAACAATGTCCGGCTCCGATAATCCACAGGCTCCTCACTCGTCGAAAGACGCT
ACTGATGTTGGTTGGTACATTCTTGGTGGAAACCAGGAGAGCCTGGGTCCATATACCTTC
TTGGAGCTGTGTGATCATTTCAAGAATGGTTACCTACAGGAAACTACACTAGTCTGGGCT
GAAGGAAGAAGCGAATGGCAGCCACTTTCTGCTATCACTGAGTTGATGTCAAGGATTTCT
GGAGCTGAAGTTGACCAATCAGCTGGAGGTGCATCTGGGTTAGTGAATGGATATAATGCT
ACAACGAATCAAGAGAAGCAAGCTTCTACTGAGGATGAGTTTGAGAAATGGCAGAAAGAG
ATTCAAGAAGCAGAGGCGGAGGCTGAAAGGTTGAAAAATGGCGCTGTTGGAGATGATCAG
GACAGACCTTCTTCACCACCCGAGGGGGAAGATGAGTTCACAGATGATGATGGAACTAGA
TATAAATGGGACAAAGCTCTTAGAGCATGGGCTCCTCAGAACGAGCCACAGG*TAGCGCT
GATCCTTATGGACTTGAAGAGATGACCTTTGCTGAG*AAGACGAAGTAATTCCA*CTATA
A*CATCCTTGATACTT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1BP94JQ 769 0 0
TACTGAGGATGAGTTTGAGAAATGGCAGAAAGAGATTCAAGAAGCAGAGGCGGAGGCTGA
AAGGTTGAAAAATGGCGCTGTTGGAGATGATCAGGACAGACCTTCTTCACCACCCGAGGG
GGAAGATGAGTTCACAGATGATGATGGAACTAGATATAAATGGGACAAAGCTCTTAGAGC
ATGGGCTCCTCAGAACGAGCCACAGGGTAGCGCTGATCCTTATGGACTTGAAGAGATGAC
CTTTGCTGAGGAAGACGAAGTAATTCCAACTATAAACATCCTTGATACTTCTGTTGATAA
GGAGGATGCCTCTAAGGATGATGTGGCTAGTAAGAAAGAAGAAGATGGCTCTGATCAGAC
CGCGGAAATAAACAATAATGGAAAGAGGAAGCTGCCAGAAGAAGAAACTGAAAAGAAGGA
AGCAAACAAGCCTCCAGAAGCGTGGTTTGAGCTGAAAGTAAACCCACATATCTATGTCAC
TGGGTTGCCCAAAGATGTCACGATCGAGGAAGTGGTTGAAGTTTTTTCTAAATGCGGCAT
TATTAAGGAGGATGACAGTGGCAAGCCTCGCATAAAGCTTTACAGTGACAAGGCGACAGG
AGAATTAAAAGGCGATGCTCTTATCACGTATATGAAGGAGCCCTCAGTGGATCTTGCAAT
TCAAATCTTAGACGGGGCTCCTTTACGTCCAGCTGACAAGCTCCTCATGTCAGTTTCTCG
AGCTAAGTTCGAGCAGAAAGGGGAGAGATTTATAACAAAGCAAACCGAT

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

CO CL5269Contig1 910 2 2 U
GGCTCGAGCCGGCGCCAAAAGTGGGAGCCGATGGGGCGCGAGCGAAGAATCTCGATGAAA
TCAATCAACGGCCCAGATTCAACGACAGTCTTATTAACGGCCAGAGATTGATCCTCGTTA
TCCGGTTGGTCGTGTCCAACAGTCTCCTCCTTTCTCGGTAAGCTCGCCGAGCTCTGCACG
TCACTCGTTTCTTTCGCCTCGACGAACTCGGGCGAGTCGTTTCCCTCTCTTACTACTGAG
TCACCTCTCTCCGAGTCCTTCGCCCCGCTCTCGCAGCTTCCTCTACCCGAATCCTCCCTA
ACCGGTTTCTCCTCGGTCCCATCTCCCCCGATCCGGTTCGGCTCTTCTTTCACTGATTCA
TCGATTTCCCGGTTCGGTTCGGTAACCGGAACGTCGTGGTTTTCCCCGGTTTCCGCGGGT
TTAACCAGATCTGAAGATCCGGTCACCTTCTCCGCCTCCTCCTTCTCTCTCTCATCCTCC
AATCTCTTCACCTTCAACTGCAGAGACGAAATGGATACATCGTAACGTTCGACTTCGCGG
CGGAGCTCATCGACGCGGAGCTTTCTCAGCTCCTCGAGCCACCAAGAGATCTCGGAGACG
GTTTCTCCCTCGTCGGGGGAGAATCGTCGCTTGAGATCGTTGTATTTGCGGCGACAGTCG
GAGGCGGTGAGGGTGCGAGAAGAAGAGTTTTGTTTGTGGATTTCGGCGGCGACGGAGTCC
CACGAGTCGACGCCGTGACGGCGAACGGCGCAGGCGAGGAGGAGCTCCTCCCATGTGCTC
CATGTTTGGTTGTTTTCTTCGTTTTCCGGTTTTGCCATTGAATAGGTTTTGGTTATTGTC
ACTTTTGTCCCAAATGATCTCTCCTCGGCTGCTGCAAATCGTTGGCTTCCACTAAGAAGA
AACCTTTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A855TF U 1
AF RS1A855JQ C 252
BS 1 647 RS1A855TF
BS 648 910 RS1A855JQ

RD RS1A855TF 647 0 0
GGCTCGAGCCGGCGCCAAAAGTGGGAGCCGATGGGGCGCGAGCGAAGAATCTCGATGAAA
TCAATCAACGGCCCAGATTCAACGACAGTCTTATTAACGGCCAGAGATTGATCCTCGTTA
TCCGGTTGGTCGTGTCCAACAGTCTCCTCCTTTCTCGGTAAGCTCGCCGAGCTCTGCACG
TCACTCGTTTCTTTCGCCTCGACGAACTCGGGCGAGTCGTTTCCCTCTCTTACTACTGAG
TCACCTCTCTCCGAGTCCTTCGCCCCGCTCTCGCAGCTTCCTCTACCCGAATCCTCCCTA
ACCGGTTTCTCCTCGGTCCCATCTCCCCCGATCCGGTTCGGCTCTTCTTTCACTGATTCA
TCGATTTCCCGGTTCGGTTCGGTAACCGGAACGTCGTGGTTTTCCCCGGTTTCCGCGGGT
TTAACCAGATCTGAAGATCCGGTCACCTTCTCCGCCTCCTCCTTCTCTCTCTCATCCTCC
AATCTCTTCACCTTCAACTGCAGAGACGAAATGGATACATCGTAACGTTCGACTTCGCGG
CGGAGCTCATCGACGCGGAGCTTTCTCAGCTCCTCGAGCCACCAAGAGATCTCGGAGACG
GTTTCTCCCTCGTCGGGGGAGAATCGTCGCTTGAGATCGTTGTATTT

QA 1 647 1 647
DS 

RD RS1A855JQ 659 0 0
CGAGTCCTTCGCCCCGCTCTCGCAGCTTCCTCTACCCGAATCCTCCCTAACCGGTTTCTC
CTCGGTCCCATCTCCCCCGATCCGGTTCGGCTCTTCTTTCACTGATTCATCGATTTCCCG
GTTCGGTTCGGTAACCGGAACGTCGTGGTTTTCCCCGGTTTCCGCGGGTTTAACCAGATC
TGAAGATCCGGTCACCTTCTCCGCCTCCTCCTTCTCTCTCTCATCCTCCAATCTCTTCAC
CTTCAACTGCAGAGACGAAATGGATACATCGTAACGTTCGACTTCGCGGCGGAGCTCATC
GACGCGGAGCTTTTTCAGCTCCTCGAGCCACCAAGAGATCTCGGAGACGGTTTCTCCCTC
GTCGGGGGAGAATCGTCGCTTGAGATCGTTGTATTTGCGGCGACAGTCGGAGGCGGTGAG
GGTGCGAGAAGAAGAGTTTTGTTTGTGGATTTCGGCGGCGACGGAGTCCCACGAGTCGAC
GCCGTGACGGCGAACGGCGCAGGCGAGGAGGAGCTCCTCCCATGTGCTCCATGTTTGGTT
GTTTTCTTCGTTTTCCGGTTTTGCCATTGAATAGGTTTTGGTTATTGTCACTTTTGTCCC
AAATGATCTCTCCTCGGCTGCTGCAAATCGTTGGCTTCCACTAAGAAGAAACCTTTGTG

QA 1 659 1 659
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5271Contig1 1106 2 4 U
GTATCGAAGAAGAAGCTGAAAATGTAAAGCTAGCAAATCGAATTCTCGTGAAAAGCTATC
TATCTATGGCTTCCGTTGCTTCTAAGCTCTATTCAGACGATGTCAGTCTTCTAGTGTTGT
TGCTTGATACGAACCCCTTATTCTGGAGCAATATGTCGACTACATTCTCTCAGTTCCTCT
CTCATGTGCTTGCTTTTCTAAACGCGGTTTTGGGATTGAATCAACTGAACCAAGTTGTTG
TGATAGCTACTGGATACAGCTCATGTGATTACATCTGTGATTCGTCTTTGGCATCGAATG
TGATGAGCTCAGAGAGCGGTAGTAGAACTGGAATGCCTGCGCTGTTTGGTTCTTTGCTTG
AGAAGCTGGAAGATTTTATTGCCAGAGATGAGGAGCTCATCAAGGAGGGGCAGGAGCATG
ATGATGATGATAATAGAATAGCTTCTTCTCTCTTGTCAGGATCACTCTCCATGGCTCTTT
GCTACATACAGAGGGTTTTCCGTTCTGGACATCTTCATCCCCAGCCTCGGATTTTATGCT
TGCAAGGCTCTCCAGATGGCCCGGAGCAATATGTAGCTGTTATGAACTCTATCTTCTCAG
CACAACGCCTAATGGTTCCCATTGATTCCTGTTACATAGGTACACAGAACTCGGCATTTC
TGCAGCACGCATCTTACATAACCGGCGGTGTACATCATGCACCTAAACAGTTGGATGGGC
TGTTTCAGTTTCTAACGACAATCTTTGCCACTGATTTGCACACCCGCAGCTTTGTGCAGC
TCCCTAAACCCGTAGGCGTTGATTTTCGAGCATCGTGCTTTGCCACAAGAAGACTATCGA
TATGGGGTATGTTTGTTCGGTATGTCTGTCCATTTTCTGTGAGCATCACAAGAAATGTTC
AACCTGCGGTTCTGTTTTTGGTCAGTCAAAGCTTGATGGTGCTTCAACTGTGAATGATAA
GAAGAGAAAAGCTCCTGATTCTTAAAAACATCTTTTACGCTGGAGCCACTGCAAACTTTG
CTTAGTATTCTAGCATTGTAGTCTTTTGATTTACAAGAATCTATGAACGAACACCAAGTT
AAAAATCATCAATTACAGTTTTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TGCAAGGCTCTCCAGATGGCCCGGAGCAATATGTAGCTGTTATGAACTCTATCTTCTCAG
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TCTTT

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TGAACTCTATCTTCTCAGCACAACGCCTAATGGTTCCCATTGATTCCTGTTACATAGGTA
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CTAAACAGTTGGATGGGCTGTTTCAGTTTCTAACGACAATCTTTGCCACTGATTTGCACA
CCCGCAGCTTTGTGCAGCTCCCTAAACCCGTAGGCGTTGATTTTCGAGCATCGTGCTTTG
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TTCAACTGTGAATGATAAGAAGAGAAAAGCTCCTGATTCTTAAAAACATCTTTTACGCTG
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ATGAACGAACACCAAGTTAAAAATCATCAATTACAGTTTTGACC

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DS 



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AGAGGATGAATGGGGAGAGACGCAGTTCTCCAGGGACAGATCAAACCGATACGAGGGAGC
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AGTCTCTGGTCTTCTTTGTTCAGTTGACAGCGAAGTTCCCGTTGGTTGTTATATTTCTGC
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CTCTCTTGCTGGCGTTGCCGTCGTTTCTCATCCTCTACTTTGCTTATCCTTGTCTCGACT
GGCTCGTCAGGGAGATTGTCACTTGAAAGTGGTGTTTCTCTATTTATTCGACGACTCTTC
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CCTTCTGATTGCTTGAGGTTTGTCTCAATAAGATTTGATGTCTAT


BQ
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BS 688 1185 RS1BD34JQ

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ATCAGAATCGTATATGCATTTTTGGAGTCATGAAGGTCGGAGGAGGAGTTGGCTATTACT
AGAATCTGTTATCCACCACCCCTGAAGATACTAGAAAAATGTGGAATCTAGCCTCGAGTT
ACCTCACCGGACCTAGAAACGAACCAAGAAGGCCACCACAAATCCATCCTCATGTAGACT
GCTGTTCTGACGACGACGATGCTTCATCTCTAGGCAGCAAAGAAGAAGGTCTCGAGTGTC
CCATCTGCTGGGAATCATTCAACATCGTCGAAAACGTTCCTTACGTCCTTTGGTGCGGCC
ACACCATGTGCAAAAACTGCATCCTCGGACTTCAGTGGGCTATCGTCAAACTACCTACTC
ACCCTGTTCAGCTCCCTCTCTTCATCTCCTGCCCCTGGTGCAACCTCCTCTCCTTCCGTC
TCGTCTTCAGAGGAGCTCTTAGGTCCCCTCGCAAGAACTACTTTGTGCTTTGGATGGTCG
AGAGGATGAATGGGGAGAGACGCAGTTCTCCAGGGACAGATCAAACCGATACGAGGGAGC
AGCAGCAGCCTCCGTGTCTCCTCCACCATCGCCGTGGCGCTCAACCTGAGCAGCCATCAG
*TGATGGTAATGATGGTCATCGAGTTC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1BD34JQ 756 0 0
AGCTCCCTCTCTTCATCTC*TGCCCCTGGTGCAACCTCCTCTCCTTCCGTCTCGTCTTCA
GAGGAGCTCTTAGGTCCCCTCGCAAGAACTACTTTGTGCTTTGGATGGTCGAGAGGATGA
ATGGGGAGAGACGCAGTTCTCCAGGGACAGATCAAACCGATACGAGGGAGCAGCAGCAGC
CTCCGTGTCTCCTCCACCATCGCCGTGGCGCTCAACCTGAGCAGCCATCAGGTGATGGTA
ATGATGGTCATCGAGTTCGAAGGGACAACAACATACAAACTTCGCTGAGGAAGTCTCTGG
TCTTCTTTGTTCAGTTGACAGCGAAGTTCCCGTTGGTTGTTATATTTCTGCTGATTATAC
TCTATGCGATACCGACCAGTGCAGCCATATTGGCAATGTACATTCTAGTCACTCTCTTGC
TGGCGTTGCCGTCGTTTCTCATCCTCTACTTTGCTTATCCTTGTCTCGACTGGCTCGTCA
GGGAGATTGTCACTTGAAAGTGGTGTTTCTCTATTTATTCGACGACTCTTCTTCCTCTAT
GTAAGTATGATGATTTGGTAATTACCAGTCTTCCTTATCTATATATGTAGATGTAGTTTC
TTTTGGTTTGCATTGTTGCTCTATGGGAGTTTGGAGAAAGGACATGTCCATGTGTTGTAA
GGGCTGTTCTTTGTAGGAGTTCAATAGTATTTGTAATATTTTGAGGATCTGCCTTCTGAT
TGCTTGAGGTTTGTCTCAATAAGATTTGATGTCTAT

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL5273Contig1 1098 2 4 U
CTCCACTCTGCAACTAAATCTCTCCAAAGTCGAAGAGGCTTGTTCAGGAGCAGTTCACTG
TCAGCTAATGGACTCGGTACACCCTGGAGCTGTGCCAATGCACAAGGTTAATTTCGATGC
TAAGAGTGAGTACGAGATGATTCAGAACTACAAGGTTCTTCAGGACGTGTTTAACAAACT
AAAGATCACTAAGCACATAGAAGTGAGCAAGCTCGTTAAGGGTAGACTATTGGATAACTT
GGAGTTTCATGCAATGGATGAAGAAGTACTGTGATTCTGTCAATGGTTCCCAGCTTCACA
ATTACCACGCAATGGAGAGAAGAGAAGCCTGTAAAGGAGGAAAAGAAGCAACCAAGAGAG
CTGCAGCTACTCAACAATCAGCCAAGAGTTCTTCTTCAGTTGGACCTAGACCTTCATCTT
CAAATGGAACCCGTAAACATGAAGCACCATCCTCTGGGAATCAGCACTCTTCAAAAGCAC
CTTCTTCTAAACAATCTAAACCAGTGACTGCTGCTTATGATGAAAAGATCACAGAACTGA
AACTGTACATAGACAGTTTGGAAAAAGAGAGAGACTTCTACTTCTCTAAACTGCGTGATG
TAGAGATTCTCTGTCAGAACCCTGACACAGATAACTTACCTCTTGTTGGTTCCATTAAAA
GGATACTCTACGCAGCAGATGGAGAAGACGTTGGAGGAGGAGGAGCAGAAGCAACAGAGA
CACAGACCTTAAGCCCTATTGCTGAATCATCTTCAGAAGAGAGAAGGAGCAGTGGATTAG
AGTCGCAGAAGAGGAAACTCATAGTGAATCACGACGTGGATGCTGCAGCGGTTACAACTC
TCTCTCCAAGGCAACGCCTCTCTGATTCTACTGATGTCAAATGCAGTGGATCCTCTCCTC
TTTTAACTTGCTGAATCAAAAAAAAAAATATAAAAACGAAGAAAGTTACTTACTTGTGTC
TCTCTCCAAGAAATTGTTCTTATGTTTGAAAAAAATCCCATCTCTACTATATTATAAACC
CAAAATATCATACATGTGATGATGTTTTATAATATGTTTTGGCTACTGTTAAAAAATAAC
TGCTGCGTTTTAGCTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BW93TF U 1
AF RS1BW93JQ C 375
BS 1 633 RS1BW93TF
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BS 635 651 RS1BW93TF
BS 652 1098 RS1BW93JQ

RD RS1BW93TF 651 0 0
CTCCACTCTGCAACTAAATCTCTCCAAAGTCGAAGAGGCTTGTTCAGGAGCAGTTCACTG
TCAGCTAATGGACTCGGTACACCCTGGAGCTGTGCCAATGCACAAGGTTAATTTCGATGC
TAAGAGTGAGTACGAGATGATTCAGAACTACAAGGTTCTTCAGGACGTGTTTAACAAACT
AAAGATCACTAAGCACATAGAAGTGAGCAAGCTCGTTAAGGGTAGACTATTGGATAACTT
GGAGTTTCATGCAATGGATGAAGAAGTACTGTGATTCTGTCAATGGTTCCCAGCTTCACA
ATTACCACGCAATGGAGAGAAGAGAAGCCTGTAAAGGAGGAAAAGAAGCAACCAAGAGAG
CTGCAGCTACTCAACAATCAGCCAAGAGTTCTTCTTCAGTTGGACCTAGACCTTCATCTT
CAAATGGAACCCGTAAACATGAAGCACCATCCTCTGGGAATCAGCACTCTTCAAAAGCAC
CTTCTTCTAAACAATCTAAACCAGTGACTGCTGCTTATGATGAAAAGATCACAGAACTGA
AACTGTACATAGACAGTTTGGAAAAAGAGAGAGACTTCTACTTCTCTAAACTGCGTGATG
TAGAGATTCTCTGTCAGAACCCTGACACAGATA*CTTACCTCTTGTTGGTT

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1BW93JQ 724 0 0
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AAACATGAAGCACCATCCTCTGGGAATCAGCACTCTTCAAAAGCACCTTCTTCTAAACAA
TCTAAACCAGTGACTGCTGCTTATGATGAAAAGATCACAGAACTGAAACTGTACATAGAC
AGTTTGGAAAAAGAGAGAGACTTCTACTTCTCTAAACTGCGTGATGTAGAGATTCTCTGT
CAGAACCCTGACACAGATAACTTACCTCTTGTTGGTTCCATTAAAAGGATACTCTACGCA
GCAGATGGAGAAGACGTTGGAGGAGGAGGAGCAGAAGCAACAGAGACACAGACCTTAAGC
CCTATTGCTGAATCATCTTCAGAAGAGAGAAGGAGCAGTGGATTAGAGTCGCAGAAGAGG
AAACTCATAGTGAATCACGACGTGGATGCTGCAGCGGTTACAACTCTCTCTCCAAGGCAA
CGCCTCTCTGATTCTACTGATGTCAAATGCAGTGGATCCTCTCCTCTTTTAACTTGCTGA
ATCAAAAAAAAAAATATAAAAACGAAGAAAGTTACTTACTTGTGTCTCTCTCCAAGAAAT
TGTTCTTATGTTTGAAAAAAATCCCATCTCTACTATATTATAAACCCAAAATATCATACA
TGTGATGATGTTTTATAATATGTTTTGGCTACTGTTAAAAAATAACTGCTGCGTTTTAGC
TGAT

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL5274Contig1 1028 2 2 U
GGATCGTCGATTATACGTTGCTATCGATCTCTCTCTCTCTTTATCTTCGCGATGGATTGA
GGAGGAGGGAGGCGACAAAAAAAAAGAAGATGATGTTTTGCAGAAACGTCTTCGTGAAAC
GGAAGAAGAAGAATCCAGGATCGGTGCCTGTTTATCTCAATGTTTACGATCTCACCCCAA
TGAATGTCTACGGTTACTGGCTCGGAATCGGCATTTATCACTCTGGTCTCCAAGTTCATG
GGGTTGAGTATGGATACGGGGCGCACGAGCATTCAAGCACAGGGATTTTCAAAGTGGAGC
CAAAGAAGTGTCCTGGTTTCACATTCAGGAAATCGATCCTGGTGGGTGAGACGGAGATGA
AGCCCAAAGAAGTTGGAAGCGTTATGGAGGAGCTAGCAGATGAGTATCAGGGGAGTAAAT
ACCACCTCATCACAAGGAACTGTAATCATTTCTGCAACGATGTTTGTTTAAAACTTACTC
AAAAGTCAATCCCTAACTGGGTCAACCGTCTTGCTCGCTTAGGTTTCATGTGCAACTGTG
TGTTACCGGCTAGCTTGAACGAGATGAAAGTGAAGCAGGTAGGTAAAGACGGGAAGCTCT
TGGAAGTAGGATCAAGTAAAAAGAATAAAAAGAAGAAGAATAAAAAGAAGGCGGGAAGCA
GATCGGGTCCTTTAGCTTCTTCATCTGATTCAAGGGTAGCTAATAATAATAATAATAAGC
CTTCACATGCCAGATCAATATCAACCGGTAATCCTCCTTGTTCTGCTTCTTTTTGTCCTT
TGAAGTAACATAGATATCGAGTTCCCTTCTCATGGTTGCATCTGGAGCTCAAGATTAGAA
AGCGTAAGCGTGTGAAGACATGATTCTTTGTCATTGTTCGAAAAGCTAACTATATGTATT
TGTATATGAACTGAGGGTCCTTGTATTTTATTCACAAGTGTTAACAACCCTTTTGGGTTG
GTTTTCATTGTTATAGGAGAATCATCAAAATCTGCCAAAAGAATGTGTGAATTCGACTTT
CATCTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CI35TF U 1
AF RS1CI35JQ C 225
BS 1 617 RS1CI35TF
BS 618 1028 RS1CI35JQ

RD RS1CI35TF 617 0 0
GGATCGTCGATTATACGTTGCTATCGATCTCTCTCTCTCTTTATCTTCGCGATGGATTGA
GGAGGAGGGAGGCGACAAAAAAAAAGAAGATGATGTTTTGCAGAAACGTCTTCGTGAAAC
GGAAGAAGAAGAATCCAGGATCGGTGCCTGTTTATCTCAATGTTTACGATCTCACCCCAA
TGAATGTCTACGGTTACTGGCTCGGAATCGGCATTTATCACTCTGGTCTCCAAGTTCATG
GGGTTGAGTATGGATACGGGGCGCACGAGCATTCAAGCACAGGGATTTTCAAAGTGGAGC
CAAAGAAGTGTCCTGGTTTCACATTCAGGAAATCGATCCTGGTGGGTGAGACGGAGATGA
AGCCCAAAGAAGTTGGAAGCGTTATGGAGGAGCTAGCAGATGAGTATCAGGGGAGTAAAT
ACCACCTCATCACAAGGAACTGTAATCATTTCTGCAACGATGTTTGTTTAAAACTTACTC
AAAAGTCAATCCCTAACTGGGTCAACCGTCTTGCTCGCTTAGGTTTCATGTGCAACTGTG
TGTTACCGGCTAGCTTGAACGAGATGAAAGTGAAGCAGGTAGGTAAAGACGGGAAGCTCT
TGGAAGTAGGATCAAGT

QA 1 617 1 617
DS 

RD RS1CI35JQ 804 0 0
T
GTCTCCAAGTTCATGGGGTTGAGTATGGATACGGGGCGCACGAGCATTCAAGCACAGGGA
TTTTCAAAGTGGAGCCAAAGAAGTGTCCTGGTTTCACATTCAGGAAATCGATCCTGGTGG
GTGAGACGGAGATGAAGCCCAAAGAAGTTGGAAGCGTTATGGAGGAGCTAGCAGATGAGT
ATCAGGGGAGTAAATACCACCTCATCACAAGGAACTGTAATCATTTCTGCAACGATGTTT
GTTTAAAACTTACTCAAAAGTCAATCCCTAACTGGGTCAACCGTCTTGCTCGCTTAGGTT
TCATGTGCAACTGTGTGTTACCGGCTAGCTTGAACGAGATGAAAGTGAAGCAGGTAGGTA
AAGACGGGAAGCTCTTGGAAGTAGGATCAAGTAAAAAGAATAAAAAGAAGAAGAATAAAA
AGAAGGCGGGAAGCAGATCGGGTCCTTTAGCTTCTTCATCTGATTCAAGGGTAGCTAATA
ATAATAATAATAAGCCTTCACATGCCAGATCAATATCAACCGGTAATCCTCCTTGTTCTG
CTTCTTTTTGTCCTTTGAAGTAACATAGATATCGAGTTCCCTTCTCATGGTTGCATCTGG
AGCTCAAGATTAGAAAGCGTAAGCGTGTGAAGACATGATTCTTTGTCATTGTTCGAAAAG
CTAACTATATGTATTTGTATATGAACTGAGGGTCCTTGTATTTTATTCACAAGTGTTAAC
AACCCTTTTGGGTTGGTTTTCATTGTTATAGGAGAATCATCAAAATCTGCCAAAAGAATG
TGTGAATTCGACTTTCATCTTAC

QA 2 804 2 804
DS 



AS 1 2

CO CL5275Contig1 739 2 1 U
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CAATTTTATTTCTCTAATAATCTTCAGCCGCCAAAGAGAAACCCAACAGCTTGTTCTTCG
TTTCCTTCAAACAATCTCAGAGCTTGTACCACTGCTTCTCTCGAGAAGCCTAACTCCACA
AGCTTCGCAATCTTCGCTCCAAATTCAGGTCCAGTTTGTTTGGTGTTTTGGTTTATGGGA
CAATTTTATTTCTCTAATAATCTTCAGCCGCCAAAGAGAAACCCAGCAGCTTGTTCTTCG
TTTCCTTCGAACAATCTCAGAGCTTGTACCACTGCTTCTCTCGAGAAGCCTAACTCCACA
AGCTTCGCAATCTTCGCTTCAAATTCAGGTCCCTCTGATCTTGAAGGTTGATTCGCTGGG
CTCGCAACTGTGTTACTACTCTTCTCTGTAAACCCTGAAGGAACCGCTGCTCCAGAGCTA
GATGCTTGATTCGGAACACCACCTTCATCAAGGAATCGAGAAGGGAGGTCTTTCTCTTGC
AAAAAGGGAACCGAGACCTCTCCTCCTCCAACAGTCAGGACGTTATCCTTCAAATCAATA
GTGCACTGATGCTTACGCAGCATATCGAGGCCAAAAAGGAACTCCATGTTAGGTGAGTCC
AGCACTATGAATGAACACGGGTAAAAGTTTTTTCCAATCTTGATTGGAGCGACATGAATG
CGGCCTACTATCTCTGTTT


BQ
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AF RS1A234TR U 149
AF RS1A234JQ U 1
BS 1 739 RS1A234JQ

RD RS1A234TR 392 0 0
CCACTGCTTCTCTCGAGAAGCCTAACTCCACAAGCTTCGCAATCTTCGCTCCAAATTCAG
GTCCAGTTTGTTTGGTGTTTTGGTTTATGGGACAATTTTATTTCTCTAATAATCTTCAGC
CGCCAAAGAGAAACCCAGCAGCTTGTTCTTCGTTTCCTTCGAACAATCTCAGAGCTTGTA
CCACTGCTTCTCTCGAGAAGCCTAACTCCACAAGCTTCGCAATCTTCGCTTCAAATTCAG
GTCCCTCTGATCTTGAAGGTTGATTCGCTGGGCTCGCAACTGTGTTACTACTCTTCTCTG
TAAACCCTGAAGGAACCGCTGCTCCAGAGCTAGATGCTTGATTCGGAACACCACCTTCAT
CAAGGAATCGAGAAGGGAGGTCTTTCTCTTGC

QA 1 392 1 392
DS 

RD RS1A234JQ 739 0 0
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CAATTTTATTTCTCTAATAATCTTCAGCCGCCAAAGAGAAACCCAACAGCTTGTTCTTCG
TTTCCTTCAAACAATCTCAGAGCTTGTACCACTGCTTCTCTCGAGAAGCCTAACTCCACA
AGCTTCGCAATCTTCGCTCCAAATTCAGGTCCAGTTTGTTTGGTGTTTTGGTTTATGGGA
CAATTTTATTTCTCTAATAATCTTCAGCCGCCAAAGAGAAACCCAGCAGCTTGTTCTTCG
TTTCCTTCGAACAATCTCAGAGCTTGTACCACTGCTTCTCTCGAGAAGCCTAACTCCACA
AGCTTCGCAATCTTCGCTTCAAATTCAGGTCCCTCTGATCTTGAAGGTTGATTCGCTGGG
CTCGCAACTGTGTTACTACTCTTCTCTGTAAACCCTGAAGGAACCGCTGCTCCAGAGCTA
GATGCTTGATTCGGAACACCACCTTCATCAAGGAATCGAGAAGGGAGGTCTTTCTCTTGC
AAAAAGGGAACCGAGACCTCTCCTCCTCCAACAGTCAGGACGTTATCCTTCAAATCAATA
GTGCACTGATGCTTACGCAGCATATCGAGGCCAAAAAGGAACTCCATGTTAGGTGAGTCC
AGCACTATGAATGAACACGGGTAAAAGTTTTTTCCAATCTTGATTGGAGCGACATGAATG
CGGCCTACTATCTCTGTTT

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

CO CL5276Contig1 1082 2 2 U
GAAGGGAAAGAAAAAGAAGGCCGTTAAGAAAAAAGGAGATCTCTACCGGACTTACGGAAC
AAGAGTTATTCCAGTGTTTATTCTCTCATTAGCCGATGTGGACCCAAAGCTCATGATGGA
AGATGAGAGCCTCGTGTGGGCAAGCAGTGATGTGGTCATTGTACTTCAGCATATAAATGA
GAAAATACCTTTGAGTTATGTTTCTGAAACAGAGAGACAGCACGCCATTCCGTCACAAGT
ACAACGGCATATACTTGCTGGAATAGCTTCAGCTTTAGGCGGTGTAAGTGCACCATATGA
AAAGACCTCTCACGCGCATGAAAGACCTGTCACCAATTGGCTTTGGGCAGCCGGTTGTCA
CCCGTTTGGACCGTTCTCAAACGTCTCTCAAATGAGTCAAATGCTTCAAGATGTAGCACT
GAGGAATACTATCTATGCGCGGGTTGATTCTGCTCTACACAAAATCCGCGAAACATCAGA
GGCAGTACAAAACTTTGCATCTGAATACCTCAAAACTCCACTAGGAGAGCCAGTGAAAGA
CAAAAAGAACAAAACAAAAACGGAGCTATGGGTGGAGAAGTTCTACAAAAAGACAACCAC
ATTGCCTGAGCCTTTCCCGCACGAGCTAGTCGAAAGATTAGAGAAATATCTAGACAGTGT
AGAGGAGCAACTAGTGGATCTCTCTTCTTTGCTATACGACCACAAACTATACGATGCACA
TCTCAACAGCTCAGAGATTCTTCAGACCACCATGTTTACACAGCAGTACGTAGAACATGT
ACTGGAAACAGAAAGGGAGAACATGAGATGCTGTAAGATAGAGTACAAATACACAGTTGG
AGTCAAATCTTATCAGACATTGGTGTACGGAGGGATACTTATTGCAGGTTTTCTTGTCTA
CTTCCTTGTCATCTTCTTCTCTTCTCCTCCTGCTCGTTGATTCTTGTTTTGAGGGTCATA
GATTTTGTAACGTTTCCGTTTACTGTTGAATCCATGTGACTAGATTTTTTTTTTTTGGCT
AGAAGTTTGTTGACATATGATTCTAGTAAAATTATAAATTACCAATTAAAGAAAGTTGTG
CG


BQ
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10 10 

AF RS1CY96TF U 1
AF RS1CY96JQ C 453
BS 1 723 RS1CY96TF
BS 724 1082 RS1CY96JQ

RD RS1CY96TF 723 0 0
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AAGAGTTATTCCAGTGTTTATTCTCTCATTAGCCGATGTGGACCCAAAGCTCATGATGGA
AGATGAGAGCCTCGTGTGGGCAAGCAGTGATGTGGTCATTGTACTTCAGCATATAAATGA
GAAAATACCTTTGAGTTATGTTTCTGAAACAGAGAGACAGCACGCCATTCCGTCACAAGT
ACAACGGCATATACTTGCTGGAATAGCTTCAGCTTTAGGCGGTGTAAGTGCACCATATGA
AAAGACCTCTCACGCGCATGAAAGACCTGTCACCAATTGGCTTTGGGCAGCCGGTTGTCA
CCCGTTTGGACCGTTCTCAAACGTCTCTCAAATGAGTCAAATGCTTCAAGATGTAGCACT
GAGGAATACTATCTATGCGCGGGTTGATTCTGCTCTACACAAAATCCGCGAAACATCAGA
GGCAGTACAAAACTTTGCATCTGAATACCTCAAAACTCCACTAGGAGAGCCAGTGAAAGA
CAAAAAGAACAAAACAAAAACGGAGCTATGGGTGGAGAAGTTCTACAAAAAGACAACCAC
ATTGCCTGAGCCTTTCCCGCACGAGCTAGTCGAAAGATTAGAGAAATATCTAGACAGTGT
AGAGGAGCAACTAGTGGATCTCTCTTCTTTGCTATACGACCACAAACTATACGATGCACA
TCT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1CY96JQ 630 0 0
CTCTACACAAAATCCGCGAAACATCAGAGGCAGTACAAAACTTTGCATCTGAATACCTCA
AAACTCCACTAGGAGAGCCAGTGAAAGACAAAAAGAACAAAACAAAAACGGAGCTATGGG
TGGAGAAGTTCTACAAAAAGACAACCACATTGCCTGAGCCTTTCCCGCACGAGCTAGTCG
AAAGATTAGAGAAATATCTAGACAGTGTAGAGGAGCAACTAGTGGATCTCTCTTCTTTGC
TATACGACCACAAACTATACGATGCACATCTCAACAGCTCAGAGATTCTTCAGACCACCA
TGTTTACACAGCAGTACGTAGAACATGTACTGGAAACAGAAAGGGAGAACATGAGATGCT
GTAAGATAGAGTACAAATACACAGTTGGAGTCAAATCTTATCAGACATTGGTGTACGGAG
GGATACTTATTGCAGGTTTTCTTGTCTACTTCCTTGTCATCTTCTTCTCTTCTCCTCCTG
CTCGTTGATTCTTGTTTTGAGGGTCATAGATTTTGTAACGTTTCCGTTTACTGTTGAATC
CATGTGACTAGATTTTTTTTTTTTGGCTAGAAGTTTGTTGACATATGATTCTAGTAAAAT
TATAAATTACCAATTAAAGAAAGTTGTGCG

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 2

CO CL5277Contig1 1001 2 6 U
GGACAAACACATTCTTAATATAGGCAAGGATGGCAGAAACTACGCAGAGGAAGAGGGAGG
TGTTTGCGACCAAGAATGAATTCTCGGTAGCAATGGCTAAGTACACTTCTCATCTCTCGG
CAAAGTTCTGCAAGGAGAAAGGAATTTTCACCGTTGTTCTCTCCGGCGGTGGCCTAATCG
ATTGGCTCTGCAAGTTGTTGGAATCACCATACAAAGACTCAGTCGAATGGTCAAAGTGGC
ACGTCTTTTGGGTGGACGAGAGGGTTTGTTCACATGAAGATCGAGACAGCAACTACAAAC
TCGCCATGGATGGTTTTATCTCCAAGGTTGGGATTCCTAAAGAGAACATCTACGCAATCG
ACAAACAATGTGCCGCTGATGGTGACGCGGAGCGTTGTGCGACTCTCTACGAGGAGTGCT
TGAGGAACCTGGTGAAGGAAAAGATACTCCCACTAAGTCCAAATGGCCAATATCCTCAGT
TCGATCTCCAGCTTCAAGGGATGGGTCCTGATGGCCACATGGCGTCTCTCTTCCCGAAAC
GTCCTCAGATCAATGAGACGGACAAGTGGGTCACTCACATTACCGACTCCCCAAAACCGC
CACCAAGGAGAATCACAATGACTTTACCCGTCATCAACTCGTCTTTGTACAATCTTATGG
CCGTTTGCGACGACAACACAGACCAATGTGCACGTTCCATCGCTGGAATCTTTAAGAACA
ACAATCTTGACTTACCTGCTGCTCATCTTACTGCCCAAGTCGAAACTATGTGGTACCTTG
ACAAAGCAGCTGCTTCATTGCTTTAGAGAGCCAAACACATTAATAAATGCATGGTGTTCT
TGATATGAGTAATAAGGGGACGTTTGTTTCACCATTTGTCATTTCCATTCAGATGATTCA
TTTATATGATCTATCTAGATGATTCATTCAGATTTTTGTACATGTTTGTTTGTTCATCCA
AATATCTCATCTAGATGGATCATCTAAATGAATTATATGTC


BQ
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AF RS1CW86TF U 1
AF RS1CW86JQ C 386
BS 1 675 RS1CW86TF
BS 676 676 RS1CW86JQ
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BS 721 792 RS1CW86TF
BS 793 1001 RS1CW86JQ

RD RS1CW86TF 792 0 0
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TGTTTGCGACCAAGAATGAATTCTCGGTAGCAATGGCTAAGTACACTTCTCATCTCTCGG
CAAAGTTCTGCAAGGAGAAAGGAATTTTCACCGTTGTTCTCTCCGGCGGTGGCCTAATCG
ATTGGCTCTGCAAGTTGTTGGAATCACCATACAAAGACTCAGTCGAATGGTCAAAGTGGC
ACGTCTTTTGGGTGGACGAGAGGGTTTGTTCACATGAAGATCGAGACAGCAACTACAAAC
TCGCCATGGATGGTTTTATCTCCAAGGTTGGGATTCCTAAAGAGAACATCTACGCAATCG
ACAAACAATGTGCCGCTGATGGTGACGCGGAGCGTTGTGCGACTCTCTACGAGGAGTGCT
TGAGGAACCTGGTGAAGGAAAAGATACTCCCACTAAGTCCAAATGGCCAATATCCTCAGT
TCGATCTCCAGCTTCAAGGGATGGGTCCTGATGGCCACATGGCGTCTCTCTTCCCGAAAC
GTCCTCAGATCAATGAGACGGACAAGTGGGTCACTCACATTACCGACTCCCCAAAACCGC
CACCAAGGAGAATCACAATGACTTTACCCGTCATCAACTCGTCTTTGTACAATCTTATGG
CCGTTTGCGACGACA*CACAGACCAATGTGCACGTTCCATCGCTGGAATCTTTAAGAC**
ACAATCTTGACTTACCTGCTGCTCATCTTACTGCCCAAGTCGAAACTATGTGGTACCTTG
ACAAAGCAGCTG

QA 1 792 1 792
DS 

RD RS1CW86JQ 616 0 0
CGCGGAGCGTTGTGCGACTCTCTACGAGGAGTGCTTGAGGAACCTGGTGAAGGAAAAGAT
ACTCCCACTAAGTCCAAATGGCCAATATCCTCAGTTCGATCTCCAGCTTCAAGGGATGGG
TCCTGATGGCCACATGGCGTCTCTCTTCCCGAAACGTCCTCAGATCAATGAGACGGACAA
GTGGGTCACTCACATTACCGACTCCCCAAAACCGCCACCAAGGAGAATCACAATGACTTT
ACCCGTCATCAACTCGTCTTTGTACAATCTTATGGCCGTTTGCGACGACAACACAGACCA
ATGTGCACGTTCCATCGCTGGAATCTTTAAGAACAACAATCTTGACTTACCTGCTGCTCA
TCTTACTGCCCAAGTCGAAACTATGTGGTACCTTGACAAAGCAGCTGCTTCATTGCTTTA
GAGAGCCAAACACATTAATAAATGCATGGTGTTCTTGATATGAGTAATAAGGGGACGTTT
GTTTCACCATTTGTCATTTCCATTCAGATGATTCATTTATATGATCTATCTAGATGATTC
ATTCAGATTTTTGTACATGTTTGTTTGTTCATCCAAATATCTCATCTAGATGGATCATCT
AAATGAATTATATGTC

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 2

CO CL5278Contig1 1282 2 4 U
GCATAATATTGGAGAGTGATAATTTGTCTTCGTTATTTCCAAATGCTGCCTTCGGTATTG
GAGGATTTGAGTTAGATGCACGCCATCTATTTGCATTGCTAACCACTCTTGCTGTTCTCC
CCACCGTCTGGCTCAGAGATCTAAGTGTACTGAGTTACATCTCAGCTGGAGGGGTGATTG
CATCGGTGCTAGTGGTTTTGTGTTTGTTTTGGATTGGGTTGGTAGAGGATGTTGGAATCC
ACAGCAAAGGAACTACATTAAACTTGTCAACTTTACCTGTAGCTATAGGGCTCTACGGTT
ACTGCTACTCAGGACATGCTGTTTTCCCCAATATTTATACTTCTATGGCTAAACCAACTC
AATACCCAGCTGTTCTCTTGACATGCTTTGGTATTTGTACTCTGATGTATGCCGGTGTGG
CTGTTATGGGTTATACAATGTTTGGAGAAGCAACAGAATCACAGTTTACTCTCAACTTGC
CTCAAGATTTGGTTGCAACTAAGATTGCTGTGTGGACTACGGTGGTGAATCCATTTACCA
AATATCCTTTCCAATAAAAATACTTATAAATAGTTTTATTTTTACTGTTTAACTTGCATA
AATTTATCTCTGTGTGTCCCCTTAACAAAAGAAAGCACATATGCTTTGACCATATCTCCA
GTAGCACTGAGTCTTGAGGAACTGATACCAGAAAGACATAACAAGTCACATTGGTACGCC
ATTGCCATTAGAACTGCATTGGTCTTCTCTACTCTGCTTGTCGGTCTTTCCATTCCCTTC
TTTGGTCTTGTCATGTCATTGATTGGATCCTTGTTGACAATGCTCGTCGTAAGCTATATC
TTTTCCTTGTCTACAATAACCTGACACTACTTTATGTATATGTAAGTTCATACTTTGTTT
TGTGCAGACGCTAATACTTCCCCCAGCTTGTTTCTTGAGCATCGTACAGGGAAAAGTTAC
CCGGACACAGATGCTGCTGTGTGTCTTAATCATCATAGTAGGAGGCATATCTTCTGTTAT
TGGATCATATTCAGCTCTCTCCAAGATCATTCAGAAACTGAGCAGCTGAACATAAAATCT
CTTTTCTTCTTATACAAATCTTTTACCCGTTTTGTCTTCTTGGGAACCCCTTTTTTTTCT
TTTTTTTCATATAGCAAACTCATTCTTGCACACACAGCTTTTGTATTTTTCTGAGGGATG
ATGATGATCTGCTCTTCTGCTTGTTTAGACTGGTTTGAAACAAATACGTTAACGATGTAT
TTGAGTAATAAAGATTCTGCTT


BQ
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BQ
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CTCGTTGCCTGCCTGCCTTACTCTGTGTTCTCTCTTTTGTTCGTGCGAATTATTTTGCTT
CATGGATGTTGCGGCGGTGGCGAGATGTGCCGGAAGGTGCTATGTTTCTCCGGCGGCGTT
CCGAGAGTCGCGGAATCTGAGGTTATCGTTGTCTGATCTCCGGAGCTTGGAGCCTGCCGG
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AGACAAGTCGATTTCTGCCCGGCAAAGTGAAACGCAGCAAATCAACGGAAACATCGTCTG
GCATGCTTGTCCCATCACTAAACCCGACAGACAAGAACTGATTAATCAAAAGGGTTGTGT
CATTTGGATTACTGGCTTAAGTGGTTCGGGGAAAAGTAGTCTGGCGTGTGCTGTTAGCCG
AGCTCTGTACAACCGTGGAAAGCTCTCGTATATACTCGATGGTGACAACGTTCGACATGG
TTTAAACAGCGATCTTGGTTTCAAAGCAGAAGATCGAGTCGAAAACATCCGAAGAGTTGG
TGAAGTCGCCAAATTGTTTGCGGATTCTGGAATCATCTGTATTGCTAGTCTCATCTCTCC
TTACCGAAAGGAACGAGCT

QA 1 739 1 739
DS 

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G
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AAACGCAGCAAATCAACGGAAACATCGTCTGGCATGCTTGTCCCATCACTAAACCCGACA
GACAAGAACTGATTAATCAAAAGGGTTGTGTCATTTGGATTACTGGCTTAAGTGGTTCGG
GGAAAAGTAGTCTGGCGTGTGCTGTTAGCCGAGCTCTGTACAACCGTGGAAAGCTCTCGT
ATATACTCGATGGTGACAACGTTCGACATGGTTTAAACAGCGATCTTGGTTTCAAAGCAG
AAGATCGAGCCGAAAACATCCGAAGAGTTGGTGAAGTCGCCAAATTGTTTGCGGATTCTG
GAATCATCTGTATCGCTAGTCTCATCTCTCCTTACCGAAAGGAACGAGCTGCTTGTCGTG
CATTGCTACCGCAAGGAGATTTCATCGAGGTGTTCATGGATGTGCCACTCCATGTCTGTG
AAGCTAGAGACCCAAAGGGCTTATACAAGCGTGCACGCGCTGGGGAAATCAAAGGTTTCA
CAGGAATAGATGACCCTTATGAACCACCTTCGGATTGTGAGATTGTGATACAAAACAAGA
GAGACGAGAATCCATCTTCATCTCTTTCAGAAATGGCAGAGATTGTTGTGTCCTACTTAC
ACCAAAATGGATACCTCAAGCCGTCGTAGAGAATCATCACTCCACATAA

QA 2 710 2 710
DS 



AS 1 2

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AGACAAGTTTCACGTTTGAGATAGATAACTTCTCGGAGAAGGAAGGGTTGATACGTTCAC
CAAATTTCTTTAGTGGAGGCTGCGAATGGTTTGTTGATCTTTGTCCCAAAGGATACGGTA
TTGAAGATCACTTGTCTACGTTCCTCTGTGTTGCAAACCCTGAATCATTGCTACTTGGAT
GGATAAGAAGAGCTATTCTTTCATTAGTGCTATCAAACGAATCCGGCAAAAGACTGTACG
GAACATTTAGAAATGGACCACCGTGCAAGACTTTCTGCGCTCAGTTTCCAGCATGGGGTT
GGGCAAATGCCATACCTCTTGAAAAGCTTCACGAAAATGGGTTTATGGAGAAGAATAAAC
TGATAGTCCAACTCAAAGTACAAGTACTTGAAGTTGTTGATGAAGCAGAAGTTACTGGTA
AGGAGACATTAGATGTCAACGGTTTCCAAGTTCTTTATTGTGAGGTTGGTCAAGTGACTA
ATATTTTCGCAAAGCATCCGGACATTGCCTTGAATTTCATACCTAAGAGCCAATTGGTGA
AAACAACATACATGCATCTCCTCATGGGTCTCATCGAGAAACTGAACAAGCCTCCACGTA
GCTTCACCAAGAACGAATTGAGCGACACTCGCATGGAATTGGCAGATCTAACAAAAGCAG
GGTTCAAGCTAGACTGGTTGAAGGAAAAGCTTGATGAGATTTCCTTGGAGTTGAAGAAAT
CAAATGATGATGGTTCCGTGAGTTCTTATAGTTCTCGAGCCCAACAAATGGAGGAAAAGC
TCCAAGAACTCGAGAAACAAGTCAAGAATCTCAACCTTGAACTGGACACAGAAAAGGTCA
AGTCTGCCGCTGAAGTTTTGTTGTTGGAACAGACGGTGTCGGATCTCAGAGATGAGCTGA
GCATGATAAAACCAAGATCAACTCCTAAAGACGTACTTGAGGGAGTTGTTCTCTCTTGGG
AAGTATTGGATTACCCGGATCTCAGTAATGAAGAAGTAGAATAAGTAATGACATTTTGTT
ACTGTTTTCCTGTTTTCTTTTATAAATTCTAAATTTCTTAGTTATGTTCTTCTATAGAAA
A


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1CS10TF U 1
AF RS1CS10JQ C 318
BS 1 710 RS1CS10TF
BS 711 1141 RS1CS10JQ

RD RS1CS10TF 710 0 0
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AGACAAGTTTCACGTTTGAGATAGATAACTTCTCGGAGAAGGAAGGGTTGATACGTTCAC
CAAATTTCTTTAGTGGAGGCTGCGAATGGTTTGTTGATCTTTGTCCCAAAGGATACGGTA
TTGAAGATCACTTGTCTACGTTCCTCTGTGTTGCAAACCCTGAATCATTGCTACTTGGAT
GGATAAGAAGAGCTATTCTTTCATTAGTGCTATCAAACGAATCCGGCAAAAGACTGTACG
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GGGCAAATGCCATACCTCTTGAAAAGCTTCACGAAAATGGGTTTATGGAGAAGAATAAAC
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AGGAGACATTAGATGTCAACGGTTTCCAAGTTCTTTATTGTGAGGTTGGTCAAGTGACTA
ATATTTTCGCAAAGCATCCGGACATTGCCTTGAATTTCATACCTAAGAGCCAATTGGTGA
AAACAACATACATGCATCTCCTCATGGGTCTCATCGAGAAACTGAACAAGCCTCCACGTA
GCTTCACCAAGAACGAATTGAGCGACACTCGCATGGAATTGGCAGATCTA

QA 1 710 1 710
DS 

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GTACAAGTACTTGAAGTTGTTGATGAAGCAGAAGTTACTGGTAAGGAGACATTAGATGTC
AACGGTTTCCAAGTTCTTTATTGTGAGGTTGGTCAAGTGACTAATATTTTCGCAAAGCAT
CCGGACATTGCCTTGAATTTCATACCTAAGAGCCAATTGGTGAAAACAACATACATGCAT
CTCCTCATGGGTCTCATCGAGAAACTGAACAAGCCTCCACGTAGCTTCACCAAGAACGAA
TTGAGCGACACTCGCATGGAATTGGCAGATCTAACAAAAGCAGGGTTCAAGCTAGACTGG
TTGAAGGAAAAGCTTGATGAGATTTCCTTGGAGTTGAAGAAATCAAATGATGATGGTTCC
GTGAGTTCTTATAGTTCTCGAGCCCAACAAATGGAGGAAAAGCTCCAAGAACTCGAGAAA
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TTTTATAAATTCTAAATTTCTTAGTTATGTTCTTCTATAGAAAA

QA 1 824 1 824
DS 



AS 1 2

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CGAAGAGGCTGTGGACACTATCACCGCAGACGGCGATAACCACCGCCATAGCGAGAAGAA
GCTACAGTGTAATACCGATGGTCATCGAGACTTCATCGCGAGGCGAGAGAGCTTACGACA
TCTTCTCGCGACTGCTCAAGGAGCGTATCATCTGCATCAACGGCCCCATAAACGACGACA
CGTCCCACGTCGTCGTGGCTCAGCTTCTCTACCTCGAGTCCGAGAATCCTTCGAAGCCGA
TTCACATGTACCTCAATTCACCAGGCGGACACGTCACCGCCGGTCTTGCGATTTACGATA
CTATGCAGTACATTCGATCTCCGATAAGCACGATTTGTTTAGGTCAAGCTGCGTCCATGG
CTTCTCTTCTGTTGGCAGCAGGTGCCAAAGGACAGAGACGGTCACTTCCCAATGCGAGCG
TCATGATTCATCAACCTTCGGGAGGATACAGCGGACAAGCCAAGGATATGACTATCCACA
CGAAGCAGATTGTTCGTGTTTGGGATGCTTTGAACCAGCTGTACGTGAAACACACGGGGC
AACCCATCGATGTGGTTGAGAAGAACATGGATAGGGATCATTTCATGACTCCTGAAGAGG
CTAAAGCGCTTGGTATAATCGATGAAGTGATTGATGAGAGACCGATGGAGTTGGTCAAGG
ATGCTGTTGGAGATGAAAAGCAAAGATAAAAGTTAAGAGAAGCTGGTAATCAAAGTAATA
AACTTTTTTTACTCTCTCTTTTTTTTTTTTCTCATTTTGCTCTTGTTAGAGAGCTATTTT
CCCTTGATGATGATATTGATAACCTCTCGCAAACCATTTTTTTTTCCTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1E335TF U 1
AF RS1E335JQ C 252
BS 1 655 RS1E335TF
BS 656 890 RS1E335JQ

RD RS1E335TF 655 0 0
GGTCTTTCTTTCAGGCGTAACCCTAGAAAATTGGAGCCATGAGGGGTCTGATCTCCGGCG
CGAAGAGGCTGTGGACACTATCACCGCAGACGGCGATAACCACCGCCATAGCGAGAAGAA
GCTACAGTGTAATACCGATGGTCATCGAGACTTCATCGCGAGGCGAGAGAGCTTACGACA
TCTTCTCGCGACTGCTCAAGGAGCGTATCATCTGCATCAACGGCCCCATAAACGACGACA
CGTCCCACGTCGTCGTGGCTCAGCTTCTCTACCTCGAGTCCGAGAATCCTTCGAAGCCGA
TTCACATGTACCTCAATTCACCAGGCGGACACGTCACCGCCGGTCTTGCGATTTACGATA
CTATGCAGTACATTCGATCTCCGATAAGCACGATTTGTTTAGGTCAAGCTGCGTCCATGG
CTTCTCTTCTGTTGGCAGCAGGTGCCAAAGGACAGAGACGGTCACTTCCCAATGCGAGCG
TCATGATTCATCAACCTTCGGGAGGATACAGCGGACAAGCCAAGGATATGACTATCCACA
CGAAGCAGATTGTTCGTGTTTGGGATGCTTTGAACCAGCTGTACGTGAAACACACGGGGC
AACCCATCGATGTGGTTGAGAAGAACATGGATAGGGATCATTTCATGACTCCTGA

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1E335JQ 639 0 0
GTCGTGGCTCAGCTTCTCTACCTCGAGTCCGAGAATCCTTCGAAGCCGATTCACATGTAC
CTCAATTCACCAGGCGGACACGTCACCGCCGGTCTTGCGATTTACGATACTATGCAGTAC
ATTCGATCTCCGATAAGCACGATTTGTTTAGGTCAAGCTGCGTCCATGGCTTTTTTTTTG
TTGGCAGCAGGTGCCAAAGGACAGAGACGGTCACTTCCCAATGCGAGCGTCATGATTCAT
CAACCTTCGGGAGGATACAGCGGACAAGCCAAGGATATGACTATCCACACGAAGCAGATT
GTTCGTGTTTGGGATGCTTTGAACCAGCTGTACGTGAAACACACGGGGCAACCCATCGAT
GTGGTTGAGAAGAACATGGATAGGGATCATTTCATGACTCCTGAAGAGGCTAAAGCGCTT
GGTATAATCGATGAAGTGATTGATGAGAGACCGATGGAGTTGGTCAAGGATGCTGTTGGA
GATGAAAAGCAAAGATAAAAGTTAAGAGAAGCTGGTAATCAAAGTAATAAACTTTTTTTA
CTCTCTCTTTTTTTTTTTTCTCATTTTGCTCTTGTTAGAGAGCTATTTTCCCTTGATGAT
GATATTGATAACCTCTCGCAAACCATTTTTTTTTCCTCG

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 2

CO CL5283Contig1 826 2 6 U
GCGGAAACAGCAGGAGGGACAAAGCACTTGCGTCATTACAAAGTGTTGACAGCATGAGCG
TAAGAAACTGGCTGGACAGACCCCCACGTTTGAATAGATTCCTGATACCACTGGAGGCGG
AGAGACCGATGGCTAATGATTTACTCCTGGAACTTTATCTGCAACCTGGTTCACCTTTAG
CTTCTGGATTCCGTTTGGATGCTTTTAACGCCATAAAGCCTCGTGTTACCCACTCGCCTT
CTTCAGATGTAGTTGACATTTGGGACCCCACGAGTATCATAATGGAAGATAGGCACGTCT
CTCCAGCCGTCTTGTATATACAAGTATCTGTTCTTCAGGAACAGTACAAGATGGTGACCA
TAGCGGAATACAGGTTGCCTGAGGCGAGAGTTGGAACACCGATGTATTTCGACTTCCCCA
AGCAAGTTCAAGCACGTAGAGTATCCTTTAAGCTGCTTGGAGATGTTGCAGCTTTTGTCG
ATGATCCTGCAGAGACTGATGATTTGAATGGCAAGGCTTCTCCTTTTGCTGCAGGGCTGT
CTTTAGCAAACAGGATCAAGCTGTATTACTATGCTGATCCCTATGAAGTAGGGAAATGGG
CTAGCCTTTCTGCTGTCTGATTTTTACTCTTTTCACTGGATGTAACTTGGATCGATCTAT
ACACTTCGGGATCTTAGATTTTGTTTTGTTTTTATCCCATTTCCACTAAAAACAGGTTTG
TTGTGTTTGTATGGTTTTTTTGTTTCAAAGTATTACTTACATTGTTATTGTATTTTCCCC
AAAAGGATATTGAAAAAAATGTTATACTGGAGTGGTTTTGATGTCC


BQ
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AF RS1EH81TF U 1
AF RS1EH81JQ C 331
BS 1 692 RS1EH81TF
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BS 736 826 RS1EH81JQ

RD RS1EH81TF 735 0 0
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CTTCTGGATTCCGTTTGGATGCTTTTAACGCCATAAAGCCTCGTGTTACCCACTCGCCTT
CTTCAGATGTAGTTGACATTTGGGACCCCACGAGTATCATAATGGAAGATAGGCACGTCT
CTCCAGCCGTCTTGTATATACAAGTATCTGTTCTTCAGGAACAGTACAAGATGGTGACCA
TAGCGGAATACAGGTTGCCTGAGGCGAGAGTTGGAACACCGATGTATTTCGACTTCCCCA
AGCAAGTTCAAGCACGTAGAGTATCCTTTAAGCTGCTTGGAGATGTTGCAGCTTTTGTCG
ATGATCCTGCAGAGACTGATGATTTGAATGGCAAGGCTTCTCCTTTTGCTGCAGGGCTGT
CTTTAGCAAACAGGATCAAGCTGTATTACTATGCTGATCCCTATGAAGTAGGGAAATGGG
CTAGCCTTTCTGCTGTCTGATTTTTACTCTTTTCACTGGATGTAACTTGGATCGATCTAT
ACACTTCGGGATCTTAGATTTTGTTTTGTTTT*ATCCCATTTCCACTAAAA*CAGGTTTG
TTGTGTTTGTATGGT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RS1EH81JQ 496 0 0
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TTGGAACACCGATGTATTTCGACTTCCCCAAGCAAGTTCAAGCACGTAGAGTATCCTTTA
AGCTGCTTGGAGATGTTGCAGCTTTTGTCGATGATCCTGCAGAGACTGATGATTTGAATG
GCAAGGCTTCTCCTTTTGCTGCAGGGCTGTCTTTAGCAAACAGGATCAAGCTGTATTACT
ATGCTGATCCCTATGAAGTAGGGAAATGGGCTAGCCTTTTTGCTGTCTGATTTTTACTCT
TTTCACTGGATGTAACTTGGATCGATCTATACACTTCGGGATCTTAGATTTTGTTTTGTT
TTTATCCCATTTCCACTAAAAACAGGTTTGTTGTGTTTGTATGGTTTTTTTGTTTCAAAG
TATTACTTACATTGTTATTGTATTTTCCCCAAAAGGATATTGAAAAAAATGTTATACTGG
AGTGGTTTTGATGTCC

QA 1 496 1 496
DS 



AS 1 2

CO CL5284Contig1 1118 2 4 U
TTTTTCTCTCTCTCCGTCTCCGACGATGGCTACCGGTGACCAGAGCAAGAAGAGAAAGCA
GCGTTATCTCCCTCAGAATAGACCAGCTAAGAAGAAGGGAGCATACCCTTTGAAGCCAGG
TGTGCAAGGTTTCTTCATCTCGTGCGATGGCGGACGCGAATACCAAGCTTCTCAGGAAGC
TATTAACGTCATTGATTCCTTTTTTGAGGAGCTAATACATGGGACTGGCTTGAAAATGAA
TTCTTCTGGGGTGCTCGAGAACCCAATTAACAAAAAGGTTACGTTTTCCTATAGCGAGGA
TGAGGATGAAGAGGAAGAGGAAGATTATGATGACAAGGAAGAGGAAAACAAAGAGGAGGC
TGGTGGGGATAAGGAAGAAGTGAAAGAAGGCGGTATTGATCAAGTGGTTGAGACTGAGAA
AGAATTAGCAAGCCAAGAAGGTTCATGTGATGTCAAACAGTTAGCAGAAACTGAGACTGA
AAAGGAAGAAGAGAAACAAAAGAATATTGTTGAAGAACCTCCAAAAAAGAAGCCATGTGT
GGAAGAAGCATCAGCAAAAGTAAACGGAAATGCAGAGAAGTCCATTGATAAGCTTATTGA
TGCTGAACTAAAAGAGCTTGGTGACAAGAGCAAGAGACGGTTTATGAAGTTAGATCCTGG
TTGCAACGGTATTGTCTTCATCCAAATGAAAAGGAGAGATGGTGATCCAAGTCCCAAAGA
CATTGTACAGCATGCAATGACTTCTGCTGCTGCAACAAAAAAACATATGTCAAGGTTCAT
CCTAAGAATTTTACCAATTGAAGTGGCGTGTTACCCTTCAGAGGAAGAGATTTCAAGAGC
TATCAAACCTCTTGTAGAACAGTATTTTCCCGTTGAGACTGATAACCCCCGGAAATTTGC
TGTGTTGTATGGAGCACGTGCAAACACCGGCCTTGATAGGATGAAAATAATAAACACGGT
TGCTAAATCTGTTCCTGCCCCTCACAAAGTTGATTTGAACAACCCGGAGATGTCTATCGT
GGTTGAAATTGTTAAGACAGTGTGCTTAATTGGGGTGGTGGAGAAGTACAAGGAGCTGGC
AAAGTACAATCTCAGGCAGCTCACGTCAACCAAGTGAT


BQ
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AF RS1CB30TF U 1
AF RS1CB30JQ C 489
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BS 570 570 RS1CB30JQ
BS 571 635 RS1CB30TF
BS 636 1118 RS1CB30JQ

RD RS1CB30TF 635 0 0
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TATTAACGTCATTGATTCCTTTTTTGAGGAGCTAATACATGGGACTGGCTTGAAAATGAA
TTCTTCTGGGGTGCTCGAGAACCCAATTAACAAAAAGGTTACGTTTTCCTATAGCGAGGA
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TGGTGGGGATAAGGAAGAAGTGAAAGAAGGCGGTATTGATCAAGTGGTTGAGACTGAGAA
AGAATTAGCAAGCCAAGAAGGTTCATGTGATGTCAAACAGTTAGCAGAAACTGAGACTGA
AAAGGAAGAAGAGAAACAAAAGAATATTGTTGAAGAACCTCCAAAAAAGAAGCCATGTGT
GGAAGAAGCATCAGCAAAAGTAAACGGAA*TGCAGAGAAGTCCATTGATAAGCTTATTGA
TGCTGAACTAAAAGAGCTTGGTGACAAGAGCAAGA

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DS 

RD RS1CB30JQ 630 0 0
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TAAAAGAGCTTGGTGACAAGAGCAAGAGACGGTTTATGAAGTTAGATCCTGGTTGCAACG
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AGCATGCAATGACTTCTGCTGCTGCAACAAAAAAACATATGTCAAGGTTCATCCTAAGAA
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CTCTTGTAGAACAGTATTTTCCCGTTGAGACTGATAACCCCCGGAAATTTGCTGTGTTGT
ATGGAGCACGTGCAAACACCGGCCTTGATAGGATGAAAATAATAAACACGGTTGCTAAAT
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TTGTTAAGACAGTGTGCTTAATTGGGGTGGTGGAGAAGTACAAGGAGCTGGCAAAGTACA
ATCTCAGGCAGCTCACGTCAACCAAGTGAT

QA 1 630 1 630
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CAGTGCCGAAAGATCAAAGTGGATTGTGATGCGATTTGTAAACCCAAACGCCGTCTTTAA
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TAATATTCTAATTAAGTAATAAATAGCAAATCCTGCTATACAGGAACAACTAGTGTTGTC
TGCTAAAAGACATATATTTCTTCGAATTGTTCG


BQ
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AF RS1H084JQB C 1
AF RS1H084TF U 1
BS 1 393 RS1H084TF

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TGTATTGTCCTGGTTTTACTTGGTAGTTTTCACGAAGATGTTAATTTAAAAGTTGATGCG
CGGGGACCATATTGCTATAGAGAAACTAATACTAGATGGTGTTGTACTGCACAACCAAAA
CAGTGCCGAAAGATCAAAGTGGATTGTGATGCGATTTGTAAACCCAAACGCCGTCTTTAA
TTTTCCAGAAGAAATGTTCTATACTTATATATTTCAAATAATTCCGTACTTCTATTATTC
TAATATTCTAATTAAGTAATAAATAGCAAATCCTGCTATACAGGAACAACTAGTGTTGTC
TGCTAAAAGACATATATTTCTTCGAATTGTTCG

QA 1 393 1 393
DS 

RD RS1H084TF 393 0 0
GAACAAAACATTTATTTGCAAAGAAGAAATACAATGTCAACATCCAGATTTACTTTATTT
TGTATTGTCCTGGTTTTACTTGGTAGTTTTCACGAAGATGTTAATTTAAAAGTTGATGCG
CGGGGACCATATTGCTATAGAGAAACTAATACTAGATGGTGTTGTACTGCACAACCAAAA
CAGTGCCGAAAGATCAAAGTGGATTGTGATGCGATTTGTAAACCCAAACGCCGTCTTTAA
TTTTCCAGAAGAAATGTTCTATACTTATATATTTCAAATAATTCCGTACTTCTATTATTC
TAATATTCTAATTAAGTAATAAATAGCAAATCCTGCTATACAGGAACAACTAGTGTTGTC
TGCTAAAAGACATATATTTCTTCGAATTGTTCG

QA 1 393 1 393
DS 



AS 1 2

CO CL5287Contig1 887 2 2 U
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TAACCCTCACAGCAACTGCAACCGCTGCACCCAAAGCCAAACGCAGGAACTACCTTTTCA
CACCGCATGCAAAAGCAGTCGCGGGAGTATGCACCGTCGTCATAACAAACACAAGTCTAT
GCTGCAAAACCCTTAAACACGTTCCTACAAATGACCCCATCGAATTGATCCGAGCGTTAG
CGGCTGCGACTGAATCTTCCGTGAAAAGAAGTGTAACTTTCCTCTCCGAGATCAAACCAA
AACACAAATCGAACGCAACCGCAGCTGCAGCGATCTACAGCTGCCAGAAAAACCTGAACT
ACGCGTTGGAAGATTTCGCCGAGTTTTGGAACGCTACGGGGAAAGATGTAACGACGTTGG
CTCATAACTATTTCACGTGTAAGAAGACGTTGATGTCGATCATGGGGTATCACTGGACTT
GTTTGGATGATATTGATGATAAGAATCTGTTGAAAGAAGTGGAGACTGGGATCAGTGTTG
GGAAGAATCTAAGCAGTAATACGTTTGATGTCTTCAATGGTTTGAAAACTATTTTTAAGA
CGTTTTGTATTAAGGTGAAGCTTAACGAGGAAGACACTTCGCCCCAACCCCCACCATTGT
CGAATTATTACTTCTGATTAAATGATCTGGATGTAATAATTGATTAATATCATCATATAA
TGCCTAAAGCGTCGTGTATGGTGTATATGTTCTAGGTTTTATACATGTACGGACGGATAT
TCGAGATGATTGGAAAGGATATATATTAATGAAATGTGATCTTTATT


BQ
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AF RS1E158TF U 1
AF RS1E158JQ C 256
BS 1 647 RS1E158TF
BS 648 887 RS1E158JQ

RD RS1E158TF 653 0 0
GGATCGGAAGCTCTCTCTCCTTCCTCCTGATCCGTTCCTTTCCGATCCTTTTTTTTGTCT
CCGTCCATATAGGAGAACACACGATCATGATCACTCCAATCAAACTAGCCTTTCTCCTCT
TAACCCTCACAGCAACTGCAACCGCTGCACCCAAAGCCAAACGCAGGAACTACCTTTTCA
CACCGCATGCAAAAGCAGTCGCGGGAGTATGCACCGTCGTCATAACAAACACAAGTCTAT
GCTGCAAAACCCTTAAACACGTTCCTACAAATGACCCCATCGAATTGATCCGAGCGTTAG
CGGCTGCGACTGAATCTTCCGTGAAAAGAAGTGTAACTTTCCTCTCCGAGATCAAACCAA
AACACAAATCGAACGCAACCGCAGCTGCAGCGATCTACAGCTGCCAGAAAAACCTGAACT
ACGCGTTGGAAGATTTCGCCGAGTTTTGGAACGCTACGGGGAAAGATGTAACGACGTTGG
CTCATAACTATTTCACGTGTAAGAAGACGTTGATGTCGATCATGGGGTATCACTGGACTT
GTTTGGATGATATTGATGATAAGAATCTGTTGAAAGAAGTGGAGACTGGGATCAGTGTTG
GGAAGAATCTAAGCAGTAATACGTTTGATGTCTTCAATGGTTTGAAA
CTATTT

QA 1 647 1 647
DS 

RD RS1E158JQ 632 0 0
AACACGTTCCTACAAATGACCCCATCGAATTGATCCGAGCGTTAGCGGCTGCGACTGAAT
CTTCCGTGAAAAGAAGTGTAACTTTCCTCTCCGAGATCAAACCAAAACACAAATCGAACG
CAACCGCAGCTGCAGCGATCTACAGCTGCCAGAAAAACCTGAACTACGCGTTGGAAGATT
TCGCCGAGTTTTGGAACGCTACGGGGAAAGATGTAACGACGTTGGCTCATAACTATTTCA
CGTGTAAGAAGACGTTGATGTCGATCATGGGGTATCACTGGACTTGTTTGGATGATATTG
ATGATAAGAATCTGTTGAAGGAAGTGGAGACTGGGATCAGTGTTGGGAAGAATCTAAGCA
GTAATACGTTTGATGTCTTCAATGGTTTGAAAACTATTTTTAAGACGTTTTGTATTAAGG
TGAAGCTTAACGAGGAAGACACTTCGCCCCAACCCCCACCATTGTCGAATTATTACTTCT
GATTAAATGATCTGGATGTAATAATTGATTAATATCATCATATAATGCCTAAAGCGTCGT
GTATGGTGTATATGTTCTAGGTTTTATACATGTACGGACGGATATTCGAGATGATTGGAA
AGGATATATATTAATGAAATGTGATCTTTATT

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 2

CO CL5288Contig1 950 2 4 U
GCACAGTCATATATTCTCTTCACATTAGACAAACTTATCTACAAGCTCATCAAGCATATC
CAAGTAGTAGCAGCTGATGAGATGGACAACAAACTACAACAGTTGTATTCATATGAGAAA
TCAAGAAAGCCTGAAAAGTATATGAATGAGGTTTATTATTAAAACGCTCGTGTTCTTCTT
CCTGATGAAGATGTATACCGCATTGAATGTAAACTTTCAGCACCAACAACATTATCTATT
CAGCTTCTGGACTATGGACATGATAAGCCTGATGTGACATCCATTTCCATGGACCCAAAT
TTTTCAGCTTACCTCCAAAACAAGTTCCTTTCCTGCCAAGCTAATGTGAAAGAGAACCCT
CGAATATATCTAAAACGGAATAAGCGTAAAAATGGTGATGACGATGAACTCTCTACCACG
GATCGAGTTAAGATCAATAATGGTTTGGAGTGTAAGATAACATGCAGTTCTTCAAAGGTC
TCGTATGTATTTGACACAGAGGATGTATTGCATCGTGTGAAGAGGAGGAAGGTTTTGAAC
CAAAGCAGTGGTTCTTTAATTAGGGAAAAGAGGATACAAAGATACCAAAAACTTCTCACC
AACCAATGACAGTTTCTCACTTGCACTCTCAGGCAAAAAAAAAAGAAGAAGCTCGTGAGT
AGAGCAACTTGGTACGCTTTTAAAGACATAAAGTTGCCATTCCTTTTGCTTGTTATACGT
CAGGACTGAGATTCTGTCAGAAGAGAAGAATGGCTCTCTCTCTCTCTCTCACTTCTGCTT
GCTGTTACCTCTGCTCCTCGTTGAAAATAAAAAGGGGAAGGAGGGGGAGATGAGAAGGAT
TAAGCTTTCCACAAATTGGTGTATATAAAGCTTTTGTATGTTGTAACATTAACATAAAGT
CCCTCTTTTTGTTTGGTACCTATTCTTTTCAACATTAGTCACTTGAATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CD25TF U 1
AF RS1CD25JQ C 300
BS 1 643 RS1CD25TF
BS 644 644 RS1CD25JQ
BS 645 698 RS1CD25TF
BS 699 950 RS1CD25JQ

RD RS1CD25TF 698 0 0
GCACAGTCATATATTCTCTTCACATTAGACAAACTTATCTACAAGCTCATCAAGCATATC
CAAGTAGTAGCAGCTGATGAGATGGACAACAAACTACAACAGTTGTATTCATATGAGAAA
TCAAGAAAGCCTGAAAAGTATATGAATGAGGTTTATTATTAAAACGCTCGTGTTCTTCTT
CCTGATGAAGATGTATACCGCATTGAATGTAAACTTTCAGCACCAACAACATTATCTATT
CAGCTTCTGGACTATGGACATGATAAGCCTGATGTGACATCCATTTCCATGGACCCAAAT
TTTTCAGCTTACCTCCAAAACAAGTTCCTTTCCTGCCAAGCTAATGTGAAAGAGAACCCT
CGAATATATCTAAAACGGAATAAGCGTAAAAATGGTGATGACGATGAACTCTCTACCACG
GATCGAGTTAAGATCAATAATGGTTTGGAGTGTAAGATAACATGCAGTTCTTCAAAGGTC
TCGTATGTATTTGACACAGAGGATGTATTGCATCGTGTGAAGAGGAGGAAGGTTTTGAAC
CAAAGCAGTGGTTCTTTAATTAGGGAAAAGAGGATACAAAGATACCAAAAACTTCTCACC
AACCAATGACAGTTTCTCACTTGCACTCTCAGGCAAAAAAAAA*GAAGAAGCTCGTGAGT
AGAGCAACTTGGTACGCTTTTAAAGACATAAAGTTGCC

QA 1 698 1 698
DS 

RD RS1CD25JQ 651 0 0
TTTTTCAGCTTACCTCCAAAACAAGTTCCTTTCCTGCCAAGCTAATGTGAAAGAGAACCC
TCGAATATATCTAAAACGGAATAAGCGTAAAAATGGTGATGACGATGAACTCTCTACCAC
GGATCGAGTTAAGATCAATAATGGTTTGGAGTGTAAGATAACATGCAGTTCTTCAAAGGT
CTCGTATGTATTTGACACAGAGGATGTATTGCATCGTGTGAAGAGGAGGAAGGTTTTGAA
CCAAAGCAGTGGTTCTTTAATTAGGGAAAAGAGGATACAAAGATACCAAAAACTTCTCAC
CAACCAATGACAGTTTCTCACTTGCACTCTCAGGCAAAAAAAAAAGAAGAAGCTCGTGAG
TAGAGCAACTTGGTACGCTTTTAAAGACATAAGGTTGCCATTCCTTTTGCTTGTTATACG
TCAGGACTGAGATTCTGTCAGAAGAGAAGAATGGCTCTCTCTCTCTCTCTCACTTCTGCT
TGCTGTTACCTCTGCTCCTCGTTGAAAATAAAAAGGGGAAGGAGGGGGAGATGAGAAGGA
TTAAGCTTTCCACAAATTGGTGTATATAAAGCTTTTGTATGTTGTAACATTAACATAAAG
TCCCTCTTTTTGTTTGGTACCTATTCTTTTCAACATTAGTCACTTGAATGC

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 2

CO CL5289Contig1 695 2 2 U
GATCACTCATGTTTCGTACAAAAACCTTATAACTTTACAAAAAGCCAAGAACACAATGCT
GAATTCCTCACAAGCATCCTTTGCTCTTATCTTTCTCTGCTGCATTTCCTTTTTCTTGTC
TACACTCGCTTTGTCCTCGCCTGTTTCCAACCCTGAGCTCGTAGTTGAGGAAGTCCACAG
GAAAATAAACGAGTCCATATCACGAAGGAGCTTAGGATACTTCTCGTGTGAGACCGGTAA
TCCAATCGACGATTGTTGGCGACGCGACAAAGACTGGGAGAAAAACCGGAAACGGTTAGC
TGATTGTGGAATCGGTTTTGGAAAAAACGCAATTGGTGGTCGCGATGGTGAAATTTACGT
GGTCACCGATCCAGGAAATGATGACCCAGTAAACCCTAAACCGGGAACACTAAGATACGC
AGTAATTCAAGATGCACCGCTCTGGATTATATTCAACCGAGACATGACGATCCAACTAAA
AGAAGAACTCATAATGAACTCTTTCAAAACTCTAGACGGACGAGGAGCATCAGTACACAT
CTCCGGTGGGCCGTGTATAACCATACAATATGTGACAAACATCATCATCCATGGTTTACA
CATACATGACTGTAAGCAAGTGGGAACACTTACGTTCGAGATTCTCCAGAGCACTACGGG
TGGCGGACGATATCGGACGGTGACGTGTTTCGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CN96TF U 1
AF RS1GR93TF U 7
BS 1 285 RS1CN96TF
BS 286 695 RS1GR93TF

RD RS1CN96TF 285 0 0
GATCACTCATGTTTCGTACAAAAACCTTATAACTTTACAAAAAGCCAAGAACACAATGCT
GAATTCCTCACAAGCATCCTTTGCTCTTATCTTTCTCTGCTGCATTTCCTTTTTCTTGTC
TACACTCGCTTTGTCCTCGCCTGTTTCCAACCCTGAGCTCGTAGTTGAGGAAGTCCACAG
GAAAATAAACGAGTCCATATCACGAAGGAGCTTAGGATACTTCTCGTGTGAGACCGGTAA
TCCAATCGACGATTGTTGGCGACGCGACAAAGACTGGGAGAAAAA

QA 1 285 1 285
DS 

RD RS1GR93TF 689 0 0
GG
ATGTTTCGTACAAAAACCTTATAACTTTACAAAAAGCCAAGAACACAATGCTGAATTCCT
CACAAGCATCCTTTGCTCTTATCTTTCTCTGCTGCATTTCCTTTTTCTTGTCTACACTCG
CTTTGTCCTCGCCTGTTTCCAACCCTGAGCTCGTAGTTGAGGAAGTCCACAGGAAAATAA
ACGAGTCCATATCACGAAGGAGCTTAGGATACTTCTCGTGTGAGACCGGTAATCCAATCG
ACGATTGTTGGCGATGCGACAAAGACTGGGAGAAAAACCGGAAACGGTTAGCTGATTGTG
GAATCGGTTTTGGAAAAAACGCAATTGGTGGTCGCGATGGTGAAATTTACGTGGTCACCG
ATCCAGGAAATGATGACCCAGTAAACCCTAAACCGGGAACACTAAGATACGCAGTAATTC
AAGATGCACCGCTCTGGATTATATTCAACCGAGACATGACGATCCAACTAAAAGAAGAAC
TCATAATGAACTCTTTCAAAACTCTAGACGGACGAGGAGCATCAGTACACATCTCCGGTG
GGCCGTGTATAACCATACAATATGTGACAAACATCATCATCCATGGTTTACACATACATG
ACTGTAAGCAAGTGGGAACACTTACGTTCGAGATTCTCCAGAGCACTACGGGTGGCGGAC
GATATCGGACGGTGACGTGTTTCGATC

QA 3 689 3 689
DS 



AS 1 2

CO CL5290Contig1 1313 2 2 U
GGATAAATCTTGTGAAAAGAGAAGGATAAAAATATGGTGAACAAAACCTCTGTCGAATTC
GATTCTTATATCGAACGAAAGGCTTTCGATGAGACGCAAGAAGGAGTAAAAGGACTTGTC
GACGCTAAAATCACCGAAGTCCCACGCATCTTCCACGTCCCAAAAGATACCTTGATCAAC
GAGAAACCCTCTGTTTCAGACCTAGGGATCCCTATCATCGACTTTGCAAGCGTCCACGTG
GACACAGCCTCACGTGAAACCGTCGTGGAGAAGGTAAAACACGCGGCGGAGAAGTGGGGA
TTCTTCCAGGTGATCAATCATGGTATTCTTTGAACGTTCTTAAAGAGATTGAAGATGGAG
TTCGTAGGTTTCATGAGGAAGATCCTGAGGTCAAGAAACGATACTTCTCGCGCGATTTCA
GCGCTAACAAATTTGTCTACAATAGTAACTTCGATCTATACAGTGCTTCTCCTTCTGTTA
ATTGGAGAGATGCTTTCTCTTGTTACATGGCTCCAGATCCTCCACCTCCTGAGGATCTCC
CAGTGGCTTGCAGGGATGCTATGATCGAATACACAAAGCATGTGATGAGTTTAGGTGATT
TGCTATTGAGCTTCTTTCAGAAGCACTAGGTTTGAAATCTGAAACCTTGAAGAACATGGA
TTGCTTGAAGAGTTTGCTTATGATATGCAATTATTACCCACCTTGTCCACAACCTGACTT
AACTATGGGGATAAGTCAGCACTCTGACAACTCTTTCCTCACGATTCTTCTTCAAGACAA
CATCGGCGGTCTTCAGATTCTTCATCAAGATTCTTGGGTCGATGTCTCTCCTATCCCCGG
AGCTCTTGTCATCAACATGGGAGATTTCTTGCAGTTGATAACGAACGATAAATTTGTGAG
TGCCAACCATAGAGTGCCCGCGAACAGAAAAGGGCCAAGGGTTTCAATAGCGAGCTTTTT
CAGCTCAAGTGCACTCCCTAATGCGACAGTTTATGGACCCATGAAAGAGCTTGTGTTTGA
GGAAAACCCTCCAAAATACAGAGACATAACCATAAAAGAATACACCGAAGGATATTTTGT
GAAAGGTCTAGATGGAACATCCCATCTGTCGAATATTAGGATATGAATTAAGCGCATGAT
CAGCTACTCTGTTCTTGGCTATGCAGTAGCTAACCTAATGTATCAAAAATAAGAAAGCAT
AGCCTATGTGTGTGTGTGTGTATTAGTGTATGTGTTGAGCTACTCTGTTTGGATCTTTCT
AATTTAGCCAGACGTACCAGACCATAAGAGTACCCTTATTGGTAGAACTCTCC


BQ
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AF RS1AO83TFB U 1
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BS 1 852 RS1AO83TFB
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GACACAGCCTCACGTGAAACCGTCGTGGAGAAGGTAAAACACGCGGCGGAGAAGTGGGGA
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GCGCTAACAAATTTGTCTACAATAGTAACTTCGATCTATACAGTGCTTCTCCTTCTGTTA
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CAGTGGCTTGCAGGGATGCTATGATCGAATACACAAAGCATGTGATGAGTTTAGGTGATT
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TTGCTTGAAGAGTTTGCTTATGATATGCAATTATTACCCACCTTGTCCACAACCTGACTT
AACTATGGGGATAAGTCAGCACTCTGACAACTCTTTCCTCACGATTCTTCTTCAAGACAA
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AGCTCTTGTCAT

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DS 

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CGATGTCTCTCCTATCCCCGGAGCTCTTGTCATCAACATGGGAGATTTCTTGCAGTTGAT
AACGAACGATAAATTTGTGAGTGCCAACCATAGAGTGCCCGCGAACAGAAAAGGGCCAAG
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CATGAAAGAGCTTGTGTTTGAGGAAAACCCTCCAAAATACAGAGACATAACCATAAAAGA
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GATATGAATTAAGCGCATGATCAGCTACTCTGTTCTTGGCTATGCAGTAGCTAACCTAAT
GTATCAAAAATAAGAAAGCATAGCCTATGTGTGTGTGTGTGTATTAGTGTATGTGTTGAG
CTACTCTGTTTGGATCTTTCTAATTTAGCCAGACGTACCAGACCATAAGAGTACCCTTAT
TGGTAGAACTCTCC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

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CAAAGAGAAGCACCCTGGAAATAAAAGATCTCAAGTTTCCAAAAGAGTTGTCTATGGAGA
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AF RS1FR87JQ C 1
AF RS1FR87TF U 1
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ATAAATCAATACAACTAAAACATGATCCCCTACT

QA 1 394 1 394
DS 

RD RS1FR87TF 394 0 0
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AAATGGAGTATATGAATCCACACTTCATAGAGTGATCAACAACTCTCCTCGGTACCGTGT
ATGCGTCGGATTCTTCTACGAGATCAACTTTGACGAGATGGCTGAACCATTGGATATCTT
CAAAGAGAAGCACCCTGGAAATAAAAGATCTCAAGTTTCCAAAAGAGTTGTCTATGGAGA
GCATCTCGTTAACAAACTCCAGGCCACCTTCACAAATTCAATGGAAAACATTTAATTTGA
TTGGTTGGATTTCAATTGCAATGTTTTATCTGGATTTCTAGTTCTAATAAGAAACACATA
ATAAATCAATACAACTAAAACATGATCCCCTACT

QA 1 394 1 394
DS 



AS 1 2

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CCTTTGGAACTATTACATCATGCAAGGTGATGCGTGACCCTACTAGAGTGAGTAGAGGAT
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CTCCTGCTATGATTCCTCCTCAGCCTGGATACGGGTATCAACAACAGCTTGTACCGGGCA
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AACAACCTTCTCCTATGATGCAGCCACAGCAGATGCATCCAAGGGGTAGAATGTATAGGT
ATCCACAGAGAGATGTAAACCCAATGCCTGGTCTTACTCCAAACATGCTTTCTGTCCCAT
ATGACGTGTCTGGTGGTGCTCATCTTCGTGATTCACCTGCTGCTTCTCAACCTGTTCCTA
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TGAGATCTGTACCCACTTGTGGAGCAGCTTGAGCAGATCAGCA


BQ
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1H324TF U 1
AF RS1C840TF U 176
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TGAGACCTGGTGGGGCACCGATGCCAAACTTCTTCATGCCTATGATGCAAC

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DS 

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G
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GGCATGAGACCTGGTGGGGCACCGATGCCAAACTT**TCATGCCTATGATGCAACAAGGC
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AGGTATCCACAGAGAGATGTAAACCCAATGCCTGGTCTTACTCCAAACATGCTTTCTGTC
CCATATGACGTGTCTGGTGGTGCTCATCTTCGTGATTCACCTGCTGCTTCTCAACCTGTT
CCTATTGGAGCTTTGGCTACATCACTCGCTAATGCAGCTCCGAGCATCAGAGAACGATGC
TTGGTGAGATCTGTACCCACTTGTGGAGCAGCTTGAGCAGATCAGCA

QA 2 768 2 768
DS 



AS 1 2

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TCCTTACATCTTAGGCTCTCTTGTCGGAATGGTCCCTGAGATCTTTGTCTCCATCTACAC
GGGAATAATGCTAAGAACACTAGCTGTTGCATCAGAAAAGAGACACGGTCTTTCGGCCAT
GGAGATAGTAGTGAATGTTCTTGGTTTCTGTGTAACTGCGAGCGCGACTATAGTCTGCAC
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AAAGTACACACGCTGCTTGAAGAACTCTTTTCATCACCAAACCGCTTAAAGAGCCAGTCA
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ACGAAAATATTTTGTTTTTGTTTCGTTCAAATTAATATCTCTGCTTTTTTTGTATAGATA
TAATTCAACTAGATAATCTAA


BQ
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AF RS1BL19TF U 1
AF RS1BL19JQ C 573
BS 1 737 RS1BL19TF
BS 738 738 RS1BL19JQ
BS 739 839 RS1BL19TF
BS 840 840 RS1BL19JQ
BS 841 854 RS1BL19TF
BS 855 1281 RS1BL19JQ

RD RS1BL19TF 857 0 0
GGCTCCCAAATTTGATCCAACGGTCTAATTCTCTCGTAACTCTTTTGATTTTCTCGGGAA
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AGGTCCAGAGAATGGAGATTACGTGAAATTAAGAGGAAGATCGGATGAAGAAGAAGAAGA
AGAAGAAGGATCATCGTGTGGGGGATGTTCGTTAGGGTCGGTGACGTCTGTGTGGTTCTG
GCTTAAATTCATCTCCCTCCTCGCTTGTCTTGCTGTATTGGCCTTTGTTATCATTAAATG
GATTGCTCCTTTTTTGATCGAAAAGGAACTGATTCCGTTTATAAATTGGGTGGGAAGCAC
ATTCAGCATCCCGGTGCTCGGACTTCTCCTCTTTGCCTCTGTTGCATTGTTCCCAACCAT
TCTTCTTCCTTCCTCTCCTTCCATGTGGATGGCTGGTCTCACCTTTGGTTATGGCAAAGG
TTTTCTCTTGATTCTATCTGCAGCATCCATCGGTGTTACTCTTCCTTTCTTAATTGTACA
TCTCTTCCTCCACAACATGCAAGAATGGTTGAAGCAATACCCGAAAAAAGCAGCCATACT
TCGAGCTGCCGGTGAAG*AACCTGGTTCCATCAGTTTCAAGCAGTCACCTTGATCCGTGT
CTCTCCATTCCCTTACATGATTTACAACTACTGCGCATTGGCCACTGGAGTTCACTACG*
TCCTTACATCTTAG
CTC

QA 1 854 1 854
DS 

RD RS1BL19JQ 709 0 0
CTGGTCTCACCTTTGGTTATGGCAAAGGTTTTCTCTTGATTCTATCTGCAGCATCCATCG
GTGTTACTCTTCCTTTCTTAATTGTACATCTCTTCCTCCACAACATGCAAGAATGGTTGA
AGCAATACCCGAAAAAAGCAGCCATACTTCGAGCTGCCGGTGAAGGAACCTGGTTCCATC
AGTTTCAAGCAGTCACCTTGATCCGTGTCTCTCCATTCCCTTACATGATTTACAACTACT
GCGCATTGGCCACTGGAGTTCACTACGGTCCTTACATCTTAGGCTCTCTTGTCGGAATGG
TCCCTGAGATCTTTGTCTCCATCTACACGGGAATAATGCTAAGAACACTAGCTGTTGCAT
CAGAAAAGAGACACGGTCTTTCGGCCATGGAGATAGTAGTGAATGTTCTTGGTTTCTGTG
TAACTGCGAGCGCGACTATAGTCTGCACTATCTATGCGAAGAAGAAGCTAAGCGCAATGC
GATCAGAGGAAGCAGCAGAGACATTATAAAAGTACACACGCTGCTTGAAGAACTCTTTTC
ATCACCAAACCGCTTAAAGAGCCAGTCACTAAACGTATCACCACCATCTAACACGATCTT
GGAAGTTGTATGTAACTGACCATATTATACGAAAATATTTTGTTTTTGTTTCGTTCAAAT
TAATATCTCTGCTTTTTTTGTATAGATATAATTCAACTAGATAATCTAA

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 2

CO CL5294Contig1 489 2 2 U
CAATGAATAAGTTAGAGAGCCTTTATTGGAAACTTCTATGGTGTGTGGAGCCAATAGATC
TAACCAAATCCACAAAAAGTTAACATGTGTAGTACTTTTTTTTGGTCGAAACATGTGAGG
TACTTCGGGGTAAGAAGATAAACGTTAAAAACATACGTTGGAGTGTAGATGAGATAACGT
AGGATTGGTAGAGTCTTGAATAGCTTGTGAGAGAAGATTTCAACGTTACAATGTCCTAAA
CATCTTAGGAAATCAAACATGATAGCGTATCCGTAGATCAAGCTTATTGATCCAACACCT
AACAAGCAAGAACCAATCAAAGGAACTCCAGCTACTACACAGAGGATAAGGTTCTCCAAT
AACGTCGCATTTCCAGCAGTCATGGGGTGTGGAACAGGAGATGAGTGGTGGAGCAAGTGG
TAATGTGTGAATAAGTAGTTGTTACGGTGTAAATATCTATGAAGATAATAGTATAAAGGC
TCTGAAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RS1CS79TF C 1
AF RS1CS79JQ U 96
BS 1 95 RS1CS79TF
BS 96 489 RS1CS79JQ

RD RS1CS79TF 489 0 0
CAATGAATAAGTTAGAGAGCCTTTATTGGAAACTTCTATGGTGTGTGGAGCCAATAGATC
TAACCAAATCCACAAAAAGTTAACATGTGTAGTACTTTTTTTTGGTCGAAACATGTGAGG
TACTTCGGGGTAAGAAGATAAACGTTAAAAACATACGTTGGAGTGTAGATGAGATAACGT
AGGATTGGTAGAGTCTTGAATAGCTTGTGAGAGAAGATTTCAACGTTACAATGTCCTAAA
CATCTTAGGAAATCAAACATGATAGCGTATCCGTAGATCAAGCTTATTGATCCAACACCT
AACAAGCAAGAACCAATCAAAGGAACTCCAGCTACTACACAGAGGATAAGGTTCTCCAAT
AACGTCGCATTTCCAGCAGTCATGGGGTGTGGAACAGGAGATGAGTGGTGGAGCAAGTGG
TAATGTGTGAATAAGTAGTTGTTACGGTGTAAATATCTATGAAGATAATAGTATAAAGGC
TCTGA
GAAC

QA 1 485 1 485
DS 

RD RS1CS79JQ 394 0 0
TTTTTTTTGGTCGAAACATGTGAGGTACTTCGGGGTAAGAAGATAAACGTTAAAAACATA
CGTTGGAGTGTAGATGAGATAACGTAGGATTGGTAGAGTCTTGAATAGCTTGTGAGAGAA
GATTTCAACGTTACAATGTCCTAAACATCTTAGGAAATCAAACATGATAGCGTATCCGTA
GATCAAGCTTATTGATCCAACACCTAACAAGCAAGAACCAATCAAAGGAACTCCAGCTAC
TACACAGAGGATAAGGTTCTCCAATAACGTCGCATTTCCAGCAGTCATGGGGTGTGGAAC
AGGAGATGAGTGGTGGAGCAAGTGGTAATGTGTGAATAAGTAGTTGTTACGGTGTAAATA
TCTATGAAGATAATAGTATAAAGGCTCTGAAAAC

QA 1 394 1 394
DS 



AS 1 2

CO CL5295Contig1 504 2 6 U
TCCAAACAATTTTATCATATAAAACTAACTAGTCATGAAGATCTTGGCATTGACACTCAT
GGTTTTGGTCATCCTTTCGCCATCATTTGCGGCTCCAACTGAAGTGGTAGACACTGCTGT
TGGAGCGGCATGTGACGCCAAGCAGCTTCAGCCTTGCCTGGCAGCGATTACAGGAGGAGG
CCAACCCTCGGGTGATTGTTGTGCAAAGCTGAAGGAGCAACAGCCATGCTTGTGTGGGTT
TGCTAAGAACCCTGCGTTTGCTCAGTACATTAGCTCTCCCAACTCTCGCAAACTCCTATC
CGCTTGTGGTGTTCCTTATCCAAGTTGCTAAAAATCTAGAGATTTTATAATTAACTAAAT
AAATAAATAACGAGTACGGAAGATAAATAATATTTTATCAAACTATGTTTATGAAGCAAT
GTAAACGTTTGGATTAATGTAATCGTTTATACCTAACATTTTATCGTAGTTGATGCGAAA
TCATAATAAGATCGTTATGATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B975TF U 1
AF RS1FF60TF U 44
BS 1 213 RS1B975TF
BS 214 214 RS1FF60TF
BS 215 337 RS1B975TF
BS 338 338 RS1FF60TF
BS 339 453 RS1B975TF
BS 454 504 RS1FF60TF

RD RS1B975TF 453 0 0
TCCAAACAATTTTATCATATAAAACTAACTAGTCATGAAGATCTTGGCATTGACACTCAT
GGTTTTGGTCATCCTTTCGCCATCATTTGCGGCTCCAACTGAAGTGGTAGACACTGCTGT
TGGAGCGGCATGTGACGCCAAGCAGCTTCAGCCTTGCCTGGCAGCGATTACAGGAGGAGG
CCAACCCTCGGGTGATTGTTGTGCAAAGCTGAATGAGCAACAGCCATGCTTGTGTGGGTT
TGCTAAGAACCCTGCGTTTGCTCAGTACATTAGCTCTCCCAACTCTCGCAAACTCCTATC
CGCTTGTGGTGTTCCTTATCCAAGTTGCTAAAAATCTGGAGATTTTATAATTAACTAAAT
AAATAAATAACGAGTACGGAAGATAAATAATATTTTATCAAACTATGTTTATGAAGCAAT
GTAAACGTTTGGATTAATGTAATCGTTTATACC

QA 1 453 1 453
DS 

RD RS1FF60TF 461 0 0
TTGGCATTGACACTCATGGTTTTGGTCATTCTTTCGCCATCATTTGCGGCTCCAACTGAA
GTGGTAGACACTGCTGTTGGGGCGGCATGTGACGCCAAGCAGCTTCAGCCTTGCCTGGCA
GCGATTACAGGAGGAGGCCAACCCTCGGGTGATTGTTGTGCAAAGCTGAAGGAGCAACAG
CCATGCTTGTGTGGGTTTGCTAAGAACCCTGCGTTTGCTCAGTACATTAGCTCTCCCAAC
TCTCGCAAACTCCTATCCGCTTGTGGTGTTCCTTATCCAAGTTGCTAAAAATCTAGAGAT
TTTATAATTAACTAAATAAATAAATAACGAGTACGGAAGATAAATGATATTTTATCAAAC
TATGTTTATGAAGCAATGTAAACGTTTGGATTAATGTAATCGTTTATACCTAACATTTTA
TCGTAGTTGATGCGAAATCATAATAAGATCGTTATGATACC

QA 1 461 1 461
DS 



AS 1 2

CO CL5296Contig1 843 2 2 U
AGCAGAAAAAAAAAGGTAGTTGAGCTGAATTTCAGGATCATTTTATGGCGACACAGACGA
GACCCAGTTCGGTCAAGAGCGAGAAACGCGATGGATCTTCTTCTCTTGCTTCCAGAGTTA
AGATCGATCCGTCTTTTAAGGACAAGAAGAAGATCGCAGGCACAAGCAAACCGATCATGT
CGGATACTAAACCCAGATCCTCTGCTTCCACCGCCACGGCCAAATCTGAGGCAAAGCCCA
AGAACGTTGTAAACTCGGTGAAATCCACATCAACAACATCTGCAGCAGCGAGCTTGGTGA
AAGGTAAAGCCAAAAGAGAGAAGAAGGTTTATTCGTTAGCCGGACAAAAATATGATCCTC
CTGAAGAGAGAGAGCCCTTGAGGATATTCTATGAGTCATTGTCGAAACAAATACCCGGAA
GCGAAATGGCAGAGTTCTGGCTGATGGAACATGGAATGTTGTCTCCGGAAAAGGCGAAGC
GAGCTCATGAGAAAAAGCTAAGAAAGATGAAGCAATTCCGAACGGGAACACCGGCTAAAC
CGACGCCATCATATTCTAGTAAACCGGAGAGTTCTCAAAGACCATCTGCGTCCAAGAACA
ACGGTTCAGATGCGAGAAAGAAGAAAAAAGTCGCCGATGATAATGACGATGATGATGAGT
TCATCCTAAGCCCCAAGAGAAGGAAAGTGTAAACTGTGAAATTTTAAAAGACTCATTTCG
TCATTTGGGAAAAATTATCCAATAGTGGATGATCAGATCAAGAACCTTTAGTTATTTCTT
AGTATTCATCGAATAAGTGACGGAAGATCGTTCATGTAAGATTCCTTATAACGTTGTTTG
TGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1G460TF U 1
AF RS1G460JQ C 340
BS 1 456 RS1G460TF
BS 457 843 RS1G460JQ

RD RS1G460TF 456 0 0
AGCAGAAAAAAAAAGGTAGTTGAGCTGAATTTCAGGATCATTTTATGGCGACACAGACGA
GACCCAGTTCGGTCAAGAGCGAGAAACGCGATGGATCTTCTTCTCTTGCTTCCAGAGTTA
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DS 



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AAGTTGCTGACCTTACTGAGAAGTACGAAGACACTAAGAGAATGCTGGATATAGAACTCA
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GAGATCGTGTCTCTGACTTGGAAACGCTGCTGGATGAGTCTAGAGCTTTGTGTTCAAAGT
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AAGATCGACTGAAGAAAGCTAGAGACGAGATTGAGGCACTAACCCGTGAAGTGGAAGAAT
CTTCTGTCAAGAACCAGAGTCTCCAGAAGGAACTGGTGGAGATTTACAAGAAAGCTGAAA
CCACTAACAAGGAATCAGAAGAAGATGAAGTATGGAGGGTTGCCGAAGAGCACGAGCGTA
GGGATGGCGAGGATAGATGAAGATGAAGAAGGAGAGGAAGGATCTGTGAAACCGAAGACG
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CCTAAGTTTTAGTTTTTGTTTCTCTCTCTCTCTTTTTAATAGTAGTACTTTGTGGATTGA
TTTTTGATATTTTTTCAAAGAAATAATGATAGAATTCGATAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1E872TF U 1
AF RS1E872JQ C 490
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BS 767 1245 RS1E872JQ

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AGGATAGATGAAGATGAAGAAGGAGAGGAAGGATCTGTGAAACCGAAGACGACTAAGAAA
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TTTTTTCAAAGAAATAATGATAGAATTCGATAAACC

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

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ACCTCTCTCGGTGGTGGTGGTGGCGGCGGAGGGAGGTTTACGTCGTCTCTTTCGGTTCCT
CCTTCTGTTCCTCAGTCGCCTAACTACTCCGGTTGGATCCGATCACAGTCTTCTTCTATA
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B067TF U 1
AF RS1H110TF U 1
BS 1 273 RS1B067TF
BS 274 670 RS1H110TF

RD RS1B067TF 273 0 0
GGACAACAACATCATCTTCTCTGGTCTTCATACTCTCCGCCGCTACATCCTCTGACCTCC
TCCTTCGGCTCTGCTCAGATCCCTTGTGAAACGTTACTGCCTTCAGAGATGATGATGATG
ACCTCTCTCGGTGGTGGTGGTGGCGGCGGAGGGAGGTTTACGTCGTCTCTTTCGGTTCCT
CCTTCTGTTCCTCAGTCGCCTAACTACTCCGGTTGGATCCGATCACAGTCTTCTTCTATA
TTCGTTGAGCAGGAGAAGTATCTTTCAGAGTTA

QA 1 273 1 273
DS 

RD RS1H110TF 670 0 0
GGACAACAACATCATCTTCTCTGGTCTTCATACTCTCCGCCGCTACATCCTCTGACCTCC
TCCTTCGGCTCTGCTCAGATCCCTTGTGAAACGTTACTGCCTTCAGAGATGATGATGATG
ACCTCTCTCGGTGGTGGTGGTGGCGGCGGAGGGAGGTTTACGTCGTCTCTTTCGGTTCCT
CCTTCTGTTCCTCAGTCGCCTAACTACTCCGGTTGGATCCGATCACAGTCTTCTTCTATA
TTCGTTGAGCAGGAGAAGTATCTTTCAGAGTTACTTGCAGAGCGTCGTAATCTTACTCCG
TTCTTACCTGTGCTTCCACATGTATGTCGCCTACTGAACCAGGAGATTTTGCGTGTAACC
ACAATGTTGGAGAATGCCACAGTTTTAAGTCAGACTGGGCTTGACCACACCAGCCCTGGA
GGGATATATCAGAATGCAAGAGCTGATATGAGCGGATGGGCCACGCCGTTTCCATCTGAA
AGATCTGTTCCATCATCTCCGGGACCAAACTGGCATAACTCACCTGGTAGTCCGTCCGGT
CTGATCGCCAAACGAACAATCAGGATTGATATTCCAGTCGACGATTATCCAAATTTCAAC
TTCGTTGGTCGCCTCTTGGGACCTAGAGGAAACTCACTGACGCGAGTTGAAGCAAGTACT
GGTTGCCGTT

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

CO CL5299Contig1 887 2 2 U
GGGCCGGTTCTAGTAAAAAAGAAGACAAACCCTAGCGGCCGTTACTCTCTCTCAATCTCT
TGAGCGATTCCGGTGAAGTCAACCCGTCTCAGCCGCTTACACTGGTTGCTGTCTCGCTGC
TGTTGCTATATCTTCCCTCTGGTAAGGTAGTGATCTTCGATTTATTCTGTTTCATGTCGG
GTGTCGAAGTTGTTGTCAGAGTCATGTTCTCGTTGCTGCAGATCTTCTCTCCGCCGCGTC
TCCTCTCCGCCTCTCTCCACCGCGTCTCCTCTTCGCGTCTCTTTCTCTCACCGCAGTTCA
CTCTCCGTCTCTCTCTCAAGTGATCATATTCAGATACAACTTCCATTTTCAATGACCTCT
GTTCATGAAGGAGAAAGATTTCATCATCTCAGAGCAGAAAAAAATCTGGTTGAGGTGAGT
GATGCAGATCTTCTTTCATTGATAGAAAATTACTGCAGAGAAGCAGGAGTTAGGAATCTC
CAGAAATAAATCGAGAAGATTTACAAGAAGGCAGGGTGAGAGACTATCATATTTCCGGAA
GCAAACATGAGAGACTTTGAAGAGCTTTCGGAGGATGTGAAAGAAGGGCTTGATGTTCAC
TTTGTGGATGACTATTAAAATATCTCCGACCTTGCATTTGTCTCTGAGAATAAGCAACAT
GACTGAGATAACTCAGAAGTCATTTTGACCTTCTTTCCCCGTTGTCTCTGTTTAAACAAG
AAGACCGACCATTCTTGATTCTTTTTTTTTCTATATACTTCTGTCCCTTCAAGAAGTGTC
CTATTGTAACCTTTTTTTTTCATTAGGATAGTTTATTTATGTGGTTGGACTGTTGTGGTA
TATTTTCACAGCCAGATCATTATGAATCAAAATAAAATTGTTCTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DC23TF U 1
AF RS1DC23JQ C 321
BS 1 696 RS1DC23TF
BS 697 887 RS1DC23JQ

RD RS1DC23TF 696 0 0
GGGCCGGTTCTAGTAAAAAAGAAGACAAACCCTAGCGGCCGTTACTCTCTCTCAATCTCT
TGAGCGATTCCGGTGAAGTCAACCCGTCTCAGCCGCTTACACTGGTTGCTGTCTCGCTGC
TGTTGCTATATCTTCCCTCTGGTAAGGTAGTGATCTTCGATTTATTCTGTTTCATGTCGG
GTGTCGAAGTTGTTGTCAGAGTCATGTTCTCGTTGCTGCAGATCTTCTCTCCGCCGCGTC
TCCTCTCCGCCTCTCTCCACCGCGTCTCCTCTTCGCGTCTCTTTCTCTCACCGCAGTTCA
CTCTCCGTCTCTCTCTCAAGTGATCATATTCAGATACAACTTCCATTTTCAATGACCTCT
GTTCATGAAGGAGAAAGATTTCATCATCTCAGAGCAGAAAAAAATCTGGTTGAGGTGAGT
GATGCAGATCTTCTTTCATTGATAGAAAATTACTGCAGAGAAGCAGGAGTTAGGAATCTC
CAGAAATAAATCGAGAAGATTTACAAGAAGGCAGGGTGAGAGACTATCATATTTCCGGAA
GCAAACATGAGAGACTTTGAAGAGCTTTCGGAGGATGTGAAAGAAGGGCTTGATGTTCAC
TTTGTGGATGACTATTAAAATATCTCCGACCTTGCATTTGTCTCTGAGAATAAGCAACAT
GACTGAGATAACTCAGAAGTCATTTTGACCTTCTTT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RS1DC23JQ 567 0 0
TGATCATATTCAGATACAACTTCCATTTTCAATGACCTCTGTTCATGAAGGAGAAAGATT
TCATCATCTCAGAGCAGAAAAAAATCTGGTTGAGGTGAGTGATGCAGATCTTCTTTCATT
GATAGAAAATTACTGCAGAGAAGCAGGAGTTAGGAATCTCCAGAAATAAATCGAGAAGAT
TTACAAGAAGGCAGGGTGAGAGACTATCATATTTCCGGAAGCAAACATGAGAGACTTTGA
AGAGCTTTCGGAGGATGTGAAAGAAGGGCTTGATGTTCACTTTGTGGATGACTATTAAAA
TATCTCCGACCTTGCATTTGTCTCTGAGAATAAGCAACATGACTGAGATAACTCAGAAGT
CATTTTGACCTTCTTTCCCCGTTGTCTCTGTTTAAACAAGAAGACCGACCATTCTTGATT
CTTTTTTTTTCTATATACTTCTGTCCCTTCAAGAAGTGTCCTATTGTAACCTTTTTTTTT
CATTAGGATAGTTTATTTATGTGGTTGGACTGTTGTGGTATATTTTCACAGCCAGATCAT
TATGAATCAAAATAAAATTGTTCTCTG

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 2

CO CL5300Contig1 1309 2 8 U
GGTACCGTTGGTGGTTCAGCTGGTTTATCTGGGACTACTAGGAGTACACCACTAAGAGCT
GTTAGGATGTCTCCTGGTGCTCAGAAATTTACGACTCCTCCAAAGAAAGGAGAGGGTGAT
TTCCCCACACCCATGTCCTTGGAACAAGCTATCGAAGGTTTTAGGCACCTAGGCGTGTAT
CCTCAGATTGAATACTGGCGTGATAGACTAAGGCAGTGGTGTTCCTCGGTTTTGCTCAAA
CCTCTGCTTCACAAGATTGAAACCAGTCACATTCAGGTAATGCAAACAGCAGCGAAGCTA
GGTGTTGCTGTCACCGTTTGTCAAGTTGGAAGTGATATGTCAACAAATGGAACAGCTCCT
ACTGCATTACCAGCTGATCGTACAAAAGGGTGGCAGCCATCTTATTCTCTCGATGAAGAC
GCTATTCTTCACCAGTTACGCGCTAATCTTGTACAGGCTATTGATGCCGCCATGCTAAAG
CTGCGTACAGAGAACCAGCAGTTTCAGCAACAACAACATCAACAGCAAGCGGCACTAATA
CCCGTTATGCAGGAATGTGTTGATGCTATAAGCGAACATCAGAGGCTTCAGGGTTTAATG
AAAGGAGAGTGGGTGAAGGGACTACTTCCGCGCAGCAGCATTCCAGCAGACTACACGGTG
CAAAGAATCCGAGAGCTCGCGGAAGGAACTTGTGTGAAGAACTACGAATACAACGGTAGG
GCAGATGCCCGTGAGAAAAACAAGAAATGGAGCCTGGAGCCTCCAACCGATTCTCATCTG
CTTCTGTACTTGTTCTGTGCTTACTTGGAACACCCAAAATGGATGTTACATCTGGACCCA
AGTTCTTATACAGGGACTCAGTCAAGCCGGAACCCGTTGTTTTTAGGGGTTTTGCCTCCA
AAAGAAAGATTCCCGGAGAAGTACATAGCTGTGGTATCAGGTGTTCCTTTTACGCTTCAT
CCTGGTGCATGTGTACTTGCTGTGGACAAGCAATGCCCCCCTACGTTTGCCTTGTACTGG
GATAAGAAAGTGCAGTTTACCCTTCAGGGACGAATAGCGCTATGGGACTCTATCCTGATG
ATGTGCCACAGAATCAAGGTGGGATATGGAGGTGTTGTTCGTGGGATGAATCTTGGTTCT
TCGGCTCTTAACATCCTTCAAGTTGTTGATTCTGAAACTGATGATTAAAACATCTAACAT
TTGAAGGAAAATGTGCTTTGCTTGAGACTGCTAAGTTTTACTCGGTGGAAGAGAAATTGT
AGTGAGGATAGTTATAATCTTTGGATATCAATGTATTCTTGTGTTGAGG


BQ
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AF RS1E857TF U 1
AF RS1E857JQ C 445
BS 1 687 RS1E857TF
BS 688 688 RS1E857JQ
BS 689 697 RS1E857TF
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CCTCAGATTGAATACTGGCGTGATAGACTAAGGCAGTGGTGTTCCTCGGTTTTGCTCAAA
CCTCTGCTTCACAAGATTGAAACCAGTCACATTCAGGTAATGCAAACAGCAGCGAAGCTA
GGTGTTGCTGTCACCGTTTGTCAAGTTGGAAGTGATATGTCAACAAATGGAACAGCTCCT
ACTGCATTACCAGCTGATCGTACAAAAGGGTGGCAGCCATCTTATTCTCTCGATGAAGAC
GCTATTCTTCACCAGTTACGCGCTAATCTTGTACAGGCTATTGATGCCGCCATGCTAAAG
CTGCGTACAGAGAACCAGCAGTTTCAGCAACAACAACATCAACAGCAAGCGGCACTAATA
CCCGTTATGCAGGAATGTGTTGATGCTATAAGCGAACATCAGAGGCTTCAGGGTTTAATG
AAAGGAGAGTGGGTGAAGGGACTACTTCCGCGCAGCAGCATTCCAGCAGACTACACGGTG
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GCAGATGCCCGTG

QA 1 733 1 733
DS 

RD RS1E857JQ 865 0 0
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GCTATAAGCGAACATCAGAGGCTTCAGGGTTTAATGAAAGGAGAGTGGGTGAAGGGACTA
CTTCCGCGCAGCAGCATTCCAGCAGACTACACGGTGCAAAGAATCCGAGAGCTCGCGGAA
GGAACTTGTGTGAAGAACTACGAATACAACGGTAGGGCAGATGCCCGTGAGAAAAACAAG
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TTGGAACACCCAAAATGGATGTTACATCTGGACCCAAGTTCTTATACAGGGACTCAGTCA
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ATAGCTGTGGTATCAGGTGTTCCTTTTACGCTTCATCCTGGTGCATGTGTACTTGCTGTG
GACAAGCAATGCCCCCCTACGTTTGCCTTGTACTGGGATAAGAAAGTGCAGTTTACCCTT
CAGGGACGAATAGCGCTATGGGACTCTATCCTGATGATGTGCCACAGAATCAAGGTGGGA
TATGGAGGTGTTGTTCGTGGGATGAATCTTGGTTCTTCGGCTCTTAACATCCTTCAAGTT
GTTGATTCTGAAACTGATGATTAAAACATCTAACATTTGAAGGAAAATGTGCTTTGCTTG
AGACTGCTAAGTTTTACTCGGTGGAAGAGAAATTGTAGTGAGGATAGTTATAATCTTTGG
ATATCAATGTATTCTTGTGTTGAGG

QA 1 865 1 865
DS 



AS 1 2

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CACAAGATAAGGAATCCGTCATGGAGAAAGTTGGGCTTGGTGGGTCTGCAGATTCAGGGA
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CCCATTTGTTTGACAACATCTTGAAAGAGCCAAATTTCTGGCAAGAACCTGAGAAAGCGA
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ATCATGAGCCAAACATGGAGAAGGATGAAGTAGAGAACAGAGGCGGATTCGTTTCAAACT
TTCCTGGGGACGTTCCTAGAGTTGATGGTCAACTGGCTGTGACAAGAGCCTTTGGTGATA
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ATGCAGAGTTTCTTATCCTCGCAAGTGATGGACTTTGGAAGGTCATGTCTAACCAAGAAG
CGGTTGACTCTGTCAAGGGAATAAAAGATGCAAAGTCTGCAGCAAAGCACCTTGCAGAAG
AGGCTGTTGCAAGAAAAAGTTCAGACGATATCTCAGTGGTGGTCGTGAAGTTTCAGTGAG
CTCGCTTCACGGAGGGAAGAAGAGAGACGTCTGGTGATTCCATTTTTTCATAGAGAGGAG
AATGCGTATTTACGTTTGTATACATGCAGTTTTTGAAGATATCTACAAACAAAAAAGATT
GTTACTTTTCGTAGCTTAATTCATTGTTTTAAAGCTAATAAAAGCAAATTGAAATCAAAT
GTAACAACGGTTCACTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CN72TF U 1
AF RS1CN72JQ C 378
BS 1 761 RS1CN72TF
BS 762 762 RS1CN72JQ
BS 763 773 RS1CN72TF
BS 774 1097 RS1CN72JQ

RD RS1CN72TF 773 0 0
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AAGGCAAGAGCAAGATGTCAAAGCAGATCACACATGGTTTCCACTTGTTGAAAGGGAAAG
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ACGTTGGTGATTCTCGAGCCGTTTTTTGCAAAGGTGGTGTTGCCAAGCCACTCTCTGTTG
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TTCCTGGGGACGTTCCTAGAGTTGATGGTCAACTGGCTGTGACAAGAGCCTTTGGTGATA
AGAGTTTGAAGATGCATTTGAGTTCAGAACCATATGTTACAGTGGAGATCATTGGTGATG
ATGCAGAGTTTCTTATCCTCGCAAGTGATGGACTTTGGAAG*TCATGTCTAAC

QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1CN72JQ 720 0 0
ATAACAGACACTAAGATTCTGGACAAAGCTTCTGACTTGGGGAAGGGTGGTTCCACTGCT
GTGACTGCTATACTAATCAACTGTCAGAAGTTAGTAGTTGCTAACGTTGGTGATTCTCGA
GCCGTTTTTTGCAAAGGTGGTGTTGCCAAGCCACTCTCTGTTGATCATGAGCCAAACATG
GAGAAGGATGAAGTAGAGAACAGAGGCGGATTCGTTTCAAACTTTCCTGGGGACGTTCCT
AGAGTTGATGGTCAACTGGCTGTGACAAGAGCCTTTGGTGATAAGAGTTTGAAGATGCAT
TTGAGTTCAGAACCATATGTTACAGTGGAGATCATTGGTGATGATGCAGAGTTTCTTATC
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AGTTCAGACGATATCTCAGTGGTGGTCGTGAAGTTTCAGTGAGCTCGCTTCACGGAGGGA
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GTATACATGCAGTTTTTGAAGATATCTACAAACAAAAAAGATTGTTACTTTTCGTAGCTT
AATTCATTGTTTTAAAGCTAATAAAAGCAAATTGAAATCAAATGTAACAACGGTTCACTC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

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GGAACTACCAAACACAACAAAATCCCTAGTTTTCCAACCGTCTGTCTGTCTTCTCCGTGG
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TCTTCATGGAAAAAACTGTTTTTCCCGAACAAAGTGGGATCAGTGAAGAAAACAGAGATT
GTGTTTGTTGCTCCAACGGGTGAGGAGATCAGTAACAGGAAGCAGCTGGATCAGTATCTC
AAATCTCACCCTGGAAACCCATCCGTCACTGAGTTTGATTGGACTACTAGTGGAACGCCT
AGGAGATCTGCAAGGATCAGTGATAAGAAGACTAAGTCGACTCCCTCACCGGATAAAGAG
CCACCCAAGAAGCGAGGTCGGACTAAATCTTCAGGGTCAAAGAAATATGGAGAAGAAGGT
GAGAAACCAGAGGGAGGAGGAGTGGAGAACTCTCATGTTCAAGAAGAAGATACTGAGATG
TCTGCTCTCAAGGGAACGGAAGATAATGTAACTGTTAAGGATGGGACTGGTGAAACTGAG
AAGGCTAATGATAAAAGACGAAAAGGTTGCAGAGAAGACTCCTGATCCTGCTCCAGTTCA
AGAAGCTGGTGGTGAGTCGATGAAGGAGCAAACGCATGATCTAGTTGGAGATGGTAGTAA
GGAGAGAGTGGAGTCTCAGACAGACAAGGAAGAGGAGACTGGCTCGGTCGTAAAGACATC
AGTCGATACTGAGATCAAGACTGCTGGAGCTAACACTGAGCAGAAGAAGGAAGTTGCAGG
ACAAGGCGCACCTGAGTTTGAGCCCGAAGCCGAGACTAGAAACCAGGAGGGAAATGGTCT
GACAACAGAAGCTGAGGGGAAAGAGAAAGCGGCAGAAGCAGAAGCTGCTGAGTAACCCTG
CCCTGCTCTCCTTTTGTAAGAGCATGAAATGTAAGAGTTTGTTTCTGTTTATCTATTCAT
GCTCTTTTTTGTATCTAATCAATGGTTATATTAAGTCGGTGAAAGAAGATGTTATTAGGC
TGAGATATGTACTATTTGAATGACTTCAGTACTATGCATGTTCTCTTAGGTGAAACATTA
TGTAGAGAGTTAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BS79TF U 1
AF RS1BS79JQ C 357
BS 1 593 RS1BS79TF
BS 594 594 RS1BS79JQ
BS 595 688 RS1BS79TF
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BS 690 752 RS1BS79TF
BS 753 753 RS1BS79JQ
BS 754 764 RS1BS79TF
BS 765 1093 RS1BS79JQ

RD RS1BS79TF 764 0 0
GGAACTACCAAACACAACAAAATCCCTAGTTTTCCAACCGTCTGTCTGTCTTCTCCGTGG
GATTGCAAAAACAAAATGGGTACAGAAGAGGAAAGTGTATCTGTGGAGCTACCAGCACCT
TCTTCATGGAAAAAACTGTTTTTCCCGAACAAAGTGGGATCAGTGAAGAAAACAGAGATT
GTGTTTGTTGCTCCAACGGGTGAGGAGATCAGTAACAGGAAGCAGCTGGATCAGTATCTC
AAATCTCACCCTGGAAACCCATCCGTCACTGAGTTTGATTGGACTACTAGTGGAACGCCT
AGGAGATCTGCAAGGATCAGTGATAAGAAGACTAAGTCGACTCCCTCACCGGATAAAGAG
CCACCCAAGAAGCGAGGTCGGACTAAATCTTCAGGGTCAAAGAAATATGGAGAAGAAGGT
GAGAAACCAGAGGGAGGAGGAGTGGAGAACTCTCATGTTCAAGAAGAAGATACTGAGATG
TCTGCTCTCAAGGGAACGGAAGATAATGTAACTGTTAAGGATGGGACTGGTGAAACTGAG
AAGGCTAATGATAAAAGACGAAAAGGTTGCAGAGAAGACTCCTGATCCTGCTCTAGTTCA
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GGAGAGAGTGGAGTCTCAGACAGACAAG*AAGAGGAGACTGGCTCGGTCGTAAAGACATC
AGTCGATACTGAGATCAAGACTGCTGGAGCTA*CACTGAGCAGA

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1BS79JQ 737 0 0
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AGGTGAGAAACCAGAGGGAGGAGGAGTGGAGAACTCTCATGTTCAAGAAGAAGATACTGA
GATGTCTGCTCTCAAGGGAACGGAAGATAATGTAACTGTTAAGGATGGGACTGGTGAAAC
TGAGAAGGCTAATGATAAAAGACGAAAAGGTTGCAGAGAAGACTCCTGATCCTGCTCCAG
TTCAAGAAGCTGGTGGTGAGTCGATGAAGGAGCAAACGCATGATCTAGTTGGAGATGGTA
GTAAGGAGAGAGTGGAGTTTCAGACAGACAAGGAAGAGGAGACTGGCTCGGTCGTAAAGA
CATCAGTCGATACTGAGATCAAGACTGCTGGAGCTAACACTGAGCAGAAGAAGGAAGTTG
CAGGACAAGGCGCACCTGAGTTTGAGCCCGAAGCCGAGACTAGAAACCAGGAGGGAAATG
GTCTGACAACAGAAGCTGAGGGGAAAGAGAAAGCGGCAGAAGCAGAAGCTGCTGAGTAAC
CCTGCCCTGCTCTCCTTTTGTAAGAGCATGAAATGTAAGAGTTTGTTTCTGTTTATCTAT
TCATGCTCTTTTTTGTATCTAATCAATGGTTATATTAAGTCGGTGAAAGAAGATGTTATT
AGGCTGAGATATGTACTATTTGAATGACTTCAGTACTATGCATGTTCTCTTAGGTGAAAC
ATTATGTAGAGAGTTAA

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

CO CL5303Contig1 803 2 2 U
TTTTTTTTGCGATTCACCACTACTGTCAAACCAGTTTCTCAGATCTCTTCAGATATATCT
CCTATCTCTTATTTATTCTTGATCCATATATAATTGTATCGTCCCAACTATTTTCCAGTT
TCTTTCCAACTGATCTAATTTTTTTCCCATTTCAAGCCTATTTTTTGCATGTCTGATAAC
TTATTCGTACAATCCGATGATCGATCTGAGCAAGATTCATCTTAGTCGTACTGTTTCTTT
TTCCTGTCAAAACATCATCGAACACAAAAGAAATCTTATCCAAGAGGTTGAAGTATTAGC
TACATGATGTGCCTAACGCATCTATGAAGAAAGAAAAGTTTGATTTGTGCAAGGTCGGGC
AGAAATATAATCAAAGCTGGAGTAAAGTGTCTAACATTGAAAACCATTGAAGATAAAAAT
GGGAATGTCAAACACTTTCAGAATTACAATGGAGTAAGAGATTGTATAGATTTCGGTAGC
TATTATTGTCCGGAAGGTTGAATACATTAACTGGTTTTGAATACATCAACAGGTTTTAAA
TGGTTTCACATCAGGAAGGCGTGGATGACTTTGGCTTCTCAACCAAGTTGTTAATCGCAT
CAAGAATCCAATAAACTTTGAACCCTGGATGTCCATGGAGCATTATTATAAATATACAAA
GATTTGGTACAAATACTGTCTATGAAATGAGAATTAGTGTGTTATAACAATTGAAACTTC
GACGTAATCTATACATCTTTGATAAGAAGCCGCATGTAGAGTAACGTAAATGTTGTTTTT
AAAGAAAAAGGTTTTTCTGCTGC


BQ
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AF RS1E740TF U 1
AF RS1E740JQ C 162
BS 1 551 RS1E740TF
BS 552 803 RS1E740JQ

RD RS1E740TF 551 0 0
TTTTTTTTGCGATTCACCACTACTGTCAAACCAGTTTCTCAGATCTCTTCAGATATATCT
CCTATCTCTTATTTATTCTTGATCCATATATAATTGTATCGTCCCAACTATTTTCCAGTT
TCTTTCCAACTGATCTAATTTTTTTCCCATTTCAAGCCTATTTTTTGCATGTCTGATAAC
TTATTCGTACAATCCGATGATCGATCTGAGCAAGATTCATCTTAGTCGTACTGTTTCTTT
TTCCTGTCAAAACATCATCGAACACAAAAGAAATCTTATCCAAGAGGTTGAAGTATTAGC
TACATGATGTGCCTAACGCATCTATGAAGAAAGAAAAGTTTGATTTGTGCAAGGTCGGGC
AGAAATATAATCAAAGCTGGAGTAAAGTGTCTAACATTGAAAACCATTGAAGATAAAAAT
GGGAATGTCAAACACTTTCAGAATTACAATGGAGTAAGAGATTGTATAGATTTCGGTAGC
TATTATTGTCCGGAAGGTTGAATACATTAACTGGTTTTGAATACATCAACAGGTTTTAAA
TGGTTTCACAT

QA 1 551 1 551
DS 

RD RS1E740JQ 642 0 0
TTTTTGCATGTCTGATAACTTATTCGTACAATCCGATGATCGATCTGAGCAAGATTCATC
TTAGTCGTACTGTTTCTTTTTCCTGTCAAAACATCATCGAACACAAAAGAAATCTTATCC
AAGAGGTTGAAGTATTAGCTACATGATGTGCCTAACGCATCTATGAAGAAAGAAAAGTTT
GATTTGTGCAAGGTCGGGCAGAAATATAATCAAAGCTGGAGTAAAGTGTCTAACATTGAA
AACCATTGAAGATAAAAATGGGAATGTCAAACACTTTCAGAATTACAATGGAGTAAGAGA
TTGTATAGATTTCGGTAGCTATTATTGTCCGGAAGGTTGAATACATTAACTGGTTTTGAA
TACATCAACAGGTTTTAAATGGTTTCACATCAGGAAGGCGTGGATGACTTTGGCTTCTCA
ACCAAGTTGTTAATCGCATCAAGAATCCAATAAACTTTGAACCCTGGATGTCCATGGAGC
ATTATTATAAATATACAAAGATTTGGTACAAATACTGTCTATGAAATGAGAATTAGTGTG
TTATAACAATTGAAACTTCGACGTAATCTATACATCTTTGATAAGAAGCCGCATGTAGAG
TAACGTAAATGTTGTTTTTAAAGAAAAAGGTTTTTCTGCTGC

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 2

CO CL5304Contig1 991 2 2 U
GGACTCTGGATTGGATTAGAGTTTTGTTTTGTATTGTTCTCATTCGATATTTCAATCTTG
TTTGCATCCCGTCCCTCCCCTTCGTATATAATCTCGTCACACAAAAGTGATTTTTATCCG
TTGATGATGATGGAGGAGAACAAGAGAAGCAGGTTCAGCAAAGTTTGTGTCTTTTGCGGA
AGCAACTCTGGTAATAGAGAAGTTTTCAGTGATGCTGCCATCGAACTCGGCAATGAACTC
GTGAAGAGGAAGATAGACTTGGTTTATGGAGGAGGAAGTGTTGGGTTAATGGGTCTTATA
TCCAGGAGAGTCTATGAAGGTGGTTTCCATGTACTAGGGATCATTCCCAAAGCTTTGATG
CCAATTGAGATATCTGGTGAGACTGTTGGAGAAGTAAGGGTTGTTGCTGACATGCACGAA
CGAAAAGCTGCAATGGCACAAGAAGCTGAGGCCTTCATTGCTCTCCCTGGAGGTTATGGA
ACAATGGAGGAGCTGCTGGAGATGATAACATGGTCACAACTTGGTATCCATAAGAAGACG
GTTGGTCTATTGAATGTTGATGGGTACTATAACAATTTGCTTGCTTTGTTTGACACGGGC
GTCCAAGAAGGTTTTATCAAACCAGAGGCACGTAATATTGTGGTTTTTGCACCAACAGCC
AAAGAGCTTATGGAGAAGATGGAGGAGTACACTCCTTCGCATAAGCATGTTGCTCACGAA
AGCTGAAATGTTGAAGAACTTGGAGCTTACCCTGGACAACAGAGCAAGCAGCAATAAAGA
AAACAAAAACAAAAAACCATTCTTATTGATTAGCATATGCTACTTCTTCCATTTCAAGTT
TTATTAGTCTCTGATTTTATTTGCAGAATCAACAATGTGTATAAGAAAACTCAAAATCTT
GTTGCAATTTGATACATCACATTGGGTCACAAATAGTTAAATTTGTTTTTCTTTTGGGAT
GGTTTCTCTATAAAGAAGAAAAAAAAGTTCG


BQ
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AF RS1GC48TF U 1
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AGCAACTCTGGTAATAGAGAAGTTTTCAGTGATGCTGCCATCGAACTCGGCAATGAACTC
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DS 

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TTGATGGGTACTATAACAATTTGCTTGCTTTGTTTGACACGGGCGTCCAAGAAGGTTTTA
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AGATGGAGGAGTACACTCCTTCGCATAAGCATGTTGCTCACGAAAGCTGAAATGTTGAAG
AACTTGGAGCTTACCCTGGACAACAGAGCAAGCAGCAATAAAGAAAACAAAAACAAAAAA
CCATTCTTATTGATTAGCATATGCTACTTCTTCCATTTCAAGTTTTATTAGTCTCTGATT
TTATTTGCAGAATCAACAATGTGTATAAGAAAACTCAAAATCTTGTTGCAATTTGATACA
TCACATTGGGTCACAAATAGTTAAATTTGTTTTTCTTTTGGGATGGTTTCTCTATAAAGA
AGAAAAAAAAGTTCG

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

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CTGCAGTAAACGAGTGACTCTTAGCGAGTTTGTTGAGCTTAACAGAAGATCAAAGAACAT
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TTTTCATGTAATCACCAGTAAACGTATTTTTACTGGTAAACGTATTTTTTTCCCCTTTCG
GTTCAATTAACCATTCGTTTTATGTAACAATACAAATTAAAATCCATTAGTAGCCC


BQ
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AF RS1FK87TF U 1
AF RS1FK87JQ C 460
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CTAGCGCCAAAGCTTCGGAAATATCGACCAGCGTATCCATGGCTAAGAATCCAGCGAAAT
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ATAAGTTTCAGGTAAAGCGAGTTTAGATTTGATTTGTGTTTAGTTTGGTTAGAAGAATTG
TTTTTGTTTGTTAATTCGTTTTTAAGGTACAGTCATCTGATGCTGAACATGGTGTCACTT
CTGCAGTAAACGAGTGACTCTTAGCGAGTTTGTTGAGCTTAACAGAAGATCAAAGAACAT
GTGGCAACGAAAAA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1FK87JQ 497 0 0
TAGCACTAATGGTCCTGTCAGATAAGTTTCAGGTAAAGCGAGTTTAGATTTGATTTGTGT
TTAGTTTGGTTAGAAGAATTGTTTTTGTTTGTTAATTCGTTTTTAAGGTACAGTCATCTG
ATGCTGAACATGGTGTCACTTTTGCAGTAAACGAGTGACTTTTAGGGAGTTTGTTGAGCT
TAACAGAAGATCAAAGAACATGTGGCAACGAAAAATGATGTCCATATCAGAAGCCATGTT
CAAACAATCCTTATCCTACAAAGACCAGAACTGGAACATGTGTTTGAATGATAGAAAAGA
GTCCTTTCGATCAGAAAAAGTTTCCCTTCCTTAGGTCAAATTTCATGGTCAACATGACAT
CTAGATGGAAAAGAGTTTTATTTTTCATGTAATCACCAGTAAACGTATTTTTACTGGTAA
ACGTATTTTTTTCCCCTTTCGGTTCAATTAACCATTCGTTTTATGTAACAATACAAATTA
AAATCCATTAGTAGCCC

QA 1 497 1 497
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GTGACGATTGGGTTAGGAAGCGAAGAGGGCAGATACGTCAGTATGCTACTGGCTACCTCA
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GTGGTAGCCCAAGTTATGGACAGAGAAGCAACAGTTCAAGCAGTGCTTCAAAGATGGCAT
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ATGCGGGGAAGTACATAAAGTACACACCAGATGACCTGGAGAGTTACTTACCAGACCTAT
TCGAAGGAAATCAAATGGTAATTCACCCCAGAAGGAAAAGTTCTTAAGAGGAAGTGCAGG
CATTGGGAGACGGCTCTTCTTACTGGAAGGAGAATCTTATATGTATGAAAGATGACAGTG
GGTGGCACGTAATTTTATAAATCAGGGGTTTTAAGTTTATATATATATGTTAAAAGTCAG
AATTTATACCCTTCTCTATACCGTGTCTAAATTCTTGTGTACATGTCTTAATACTTCTTT
ATCATGTTATGGAACCATGGGTTTTCTATATATTGACTGTGTTCTTGAGTCAAATGTGGT
GTTTGCTCTGTTGTTGATGTTGAGATCACACAGAGGAACTTGTGGCGAGAAGTACATTTA
TTACAGGTTGTAGCTTGAGTGTTTTCTCGATAATATATGGTGTTTTCTCTGTTGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1DU05TF U 1
AF RS1FH54TF U 202
BS 1 229 RS1DU05TF
BS 230 230 RS1FH54TF
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BS 528 621 RS1DU05TF
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GGGCTTCGTGGAGCAAGGTGTTAGCTGCTTTGAGGGACGAGAGTATGGGTGGAGGCTCAA
GTGGTAGCCCAAGTTATGGACAGAGAAGCAACAGTTCAAGCAGTGCTTCGAAGATGGCAT
TAAAGGAGAGATTCAAAGGTTTCAATGCTAGTTTTGAAGAGTTATACAGGCTTCAAACAG
CTTGGAAGGTCCCGGATCCCCAACTGCGTGAAGAACTGAGAATATCAATACAAGAGAAAG
TGATTCCGGCTTACCGGGCATTCTTTGGAAGGAACAAGAGTCAACTTGAAGGTGGTAGGC
ATGCGGGGAAGTACATAAAGTACACACCAGATGACCTGGAGAGTTACTTACCAGACCTAT
TCGAAGGAAATCAAATGGTAATTCACCCCAGAAGGAAAAGTTCTTAGGAGGAAGTGCAGG
CATTGGGAGACGGCTCTTCTTACTGGAAGGAGAATCTTATATGTATGAAAGATGACAGTG
GGTGGCACGTAATTTTATAAA

QA 1 621 1 621
DS 

RD RS1FH54TF 696 0 0
G
GAGAAGCAACAGTTCAAGCAGTGCTTCAAAGATGGCATTAAAGGAGAGATTCAAAGGTTT
CAATGCTAGTTTTGAAGAGTTATACAGGCTTCAAACAGCTTGGAAGGTCCCGGATCCTCA
ACTGCGTGAAGAACTGAGAATATCAATACAAGAGAAAGTGATTCCGGCTTACCGGGCATT
CTTTGGAAGGAACAAGAGTCAACTTGAAGGTGGTAGGCATGCGGGGAAGTACATAA*GTA
CACACCAGATGACCTGGAGAGTTACTTGCCAGACCTATTCGAAGGAAATCAAATGGTAAT
TCACCCCAGAAGGAAAAGTTCTTAAGAGGAAGTGCAGGCATTGGGAGACGGCTCTTCTTA
CTGGAAGGAGAATCTTATATGTATGAAAGATGACAGTGGTTGGCAGGTAATTTTATAAAT
CAGGGGTTTTAAGTTTATATATATATGTTAAAAGTCAGAATTTATACCCTTCTCTATACC
GTGTCTAAATTCTTGTGTACATGTCTTAATACTTCTTTATCATGTTATGGAACCATGGGT
TTTCTATATATTGACTGTGTTCTTGAGTCAAATGTGGTGTTTGCTCTGTTGTTGATGTTG
AGATCACACAGAGGAACTTGTGGCGAGAAGTACATTTATTACAGGTTGTAGCTTGAGTGT
TTTCTCGATAATATATGGTGTTTTCTCTGTTGTTG

QA 2 696 2 696
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5309Contig1 1088 2 4 U
GGTCAACAACGTGAATGGAACAGATTCACCGAGAAACAATTTCAATGATACTGCGGGGCT
TACGCAGATAGCATCTCCAAAGGTTCAGGATCTTTCTGATCAGTCAAAATCGACAACTGA
TCATCGTGAGCAGGGAAGACCATTCCAGGTTAAGAATCCTCATCCGAAGGACGTTCATAC
TAAATCAAACTCAAGTAGGAGTTGTACAAAGGTTCATAAGCAGGGCATTGCACTCGGCCG
GTCAGTGGATCTCTCAAAGTTCCAGAACTACGAGGAGTTGATAGCTAACTGGATAGTATG
TTTGAGTTCAACGGAGAGTTGATGGCTCCTAAAAAGGATTGGCTGATAGTTTACACAGAT
GCCGAGGATGATATGATGCTTGTTGGTGACGATCCCTGGCAGGAGTTTTGTGGGATGGTT
CGAAAAATCTCCATATACACGAAAGAGGAAGTGAGGAAGATGAACCCGGGAACTCTAAGC
TGTAGGAGCGAGGAAGAAGCAGTTGTTGGGGAAGGATCAGATCCAAAGGACGCCAAGTCT
GCTTCGAATCCTTCACTGTCCAGCGCCTGAAACTCTTACACCAGAAAAAAACAGCACCCT
TTTGCTACAAGCTGAGGGGAAGAGAGGTAGGAACAGAAATCAAGAAGAGTTTGATATGGT
GGAGACTGGAGAGTAAGAAAAAGGGATTATGGAGGGTTATTAAGTAATGGTATTAAAAAT
GCAATTTTTGAAGTATTTTGTTGGGCACTTAGGTTATAAGCATCTTCCACCATCCTAATA
TCTAATAATAATCAAATATAAATATATATTATTGAAGTAAACAAAAATGGTTAGAGGTAT
TATATGGTTAGAATATGGAAAGGGTCTTTTTATAAGTAGAAAAAAGATGGTGAGGAGTTG
TAGATGGAGGCTTGGTTTCGTTTCTTTGCCTATATGTAATTTCTTCTTCTTTCACCAAAT
GATCACTTGAAAGTCTTTTATTGTTTATATATTAATCTCAATGTACATAAGTTTTTAATA
TTTTACCTTTTGAATAGTATTCGAATCTACATTCCTCTCTACCTGTTTAAATAGTTTATG
AGTGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GI87TF U 1
AF RS1GI87JQ C 409
BS 1 590 RS1GI87TF
BS 591 591 RS1GI87JQ
BS 592 682 RS1GI87TF
BS 683 1088 RS1GI87JQ

RD RS1GI87TF 682 0 0
GGTCAACAACGTGAATGGAACAGATTCACCGAGAAACAATTTCAATGATACTGCGGGGCT
TACGCAGATAGCATCTCCAAAGGTTCAGGATCTTTCTGATCAGTCAAAATCGACAACTGA
TCATCGTGAGCAGGGAAGACCATTCCAGGTTAAGAATCCTCATCCGAAGGACGTTCATAC
TAAATCAAACTCAAGTAGGAGTTGTACAAAGGTTCATAAGCAGGGCATTGCACTCGGCCG
GTCAGTGGATCTCTCAAAGTTCCAGAACTACGAGGAGTTGATAGCTAACTGGATAGTATG
TTTGAGTTCAACGGAGAGTTGATGGCTCCTAAAAAGGATTGGCTGATAGTTTACACAGAT
GCCGAGGATGATATGATGCTTGTTGGTGACGATCCCTGGCAGGAGTTTTGTGGGATGGTT
CGAAAAATCTCCATATACACGAAAGAGGAAGTGAGGAAGATGAACCCGGGAACTCTAAGC
TGTAGGAGCGAGGAAGAAGCAGTTGTTGGGGAAGGATCAGATCCAAAGGACGCCAAGTCT
GCTTCGAATCCTTCACTGTCCAGCGCCTGAAACTCTTACACCAGAAAAAA*CAGCACCCT
TTTGCTACAAGCTGAGGGGAAGAGAGGTAGGAACAGAAATCAAGAAGAGTTTGATATGGT
GGAGACTGGAGAGTAAGAAAAA

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1GI87JQ 680 0 0
TGTGGGATGGTTCGAAAAATCTCCATATACACGAAAGAGGAAGTGAGGAAGATGAACCCG
GGAACTCTAAGCTGTAGGAGCGAGGAAGAAGCAGTTGTTGGGGAAGGATCAGATCCAAAG
GACGCCAAGTCTGCTTCGAATCCTTCACTGTCCAGCGCCTGAAACTCTTACACCAGAAAA
AAACAGCACCCTTTTGCTACAAGCTGAGGGGAAGAGAGGTAGGAACAGAAATCAAGAAGA
GTTTGATATGGTGGAGACTGGAGAGTAAGAAAAAGGGATTATGGAGGGTTATTAAGTAAT
GGTATTAAAAATGCAATTTTTGAAGTATTTTGTTGGGCACTTAGGTTATAAGCATCTTCC
ACCATCCTAATATCTAATAATAATCAAATATAAATATATATTATTGAAGTAAACAAAAAT
GGTTAGAGGTATTATATGGTTAGAATATGGAAAGGGTCTTTTTATAAGTAGAAAAAAGAT
GGTGAGGAGTTGTAGATGGAGGCTTGGTTTCGTTTCTTTGCCTATATGTAATTTCTTCTT
CTTTCACCAAATGATCACTTGAAAGTCTTTTATTGTTTATATATTAATCTCAATGTACAT
AAGTTTTTAATATTTTACCTTTTGAATAGTATTCGAATCTACATTCCTCTCTACCTGTTT
AAATAGTTTATGAGTGTTTT

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

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CTTGTGGTGGTTCCGGCGGTGGCGTGTCTTCACCGTCGCCGTCGGAGCTAGATGGTTATT
AGTCGTTTGTGGTTGTCTCTTTTGGTTTACTCAACCCTTCTCTTCCTTTTGTGTAGCCCT
CTGTGGTTTTTGATGGCTTGGTTCTGCTATTGTTTACTACTGTTAAGGATCTTTGTTGAT
AGATCTGTGATTTCTTCTCGGATTTATTATCAAATCCTTGGTAGATCTGGGTTTTGTGGT
GTTGCAGGTTGTTTACTTTTCAAATCTGCTTATCTCACGTTCAGATCTAGCCGGTGAGAA
TGTCTACGGCGGTCGCGAGTTGTTTGGCTCTGGCTTCTCTGCTCATGCTTTGGTGTCTCC
GCAAGGATAACTCTTAAGCTTCGTTCCCGTCGTCCTCCATTATTGGTGCGAATCTCCGGC
CGAGGGTTTCAATCCGGTTAATCTCTCATGGGTTTGGAGCTTGTCTTAGTTGGTGCTTGA
TTCAGCAACGGTGTAGAATTTTGTGGTGATGTGTGGTGAGCATGTGAGGGTTTTGGTTCT
TGAGAAGTAGGTCGTTTCAGGATACCTATTTGTCTCTCAGGTTTGTTGCAATTGGAGGCC
TTCTCCCGCCATATGATTTAGTGTTTATCCTGGTCTACCTTTGGTCTCTGTTTTCCTCGT
GGCTTCGTATGGTTGAGGCAATATAAAGAGGTTGAGGCATGGAGGCTTACGGTTTTAAGG
TGCGGTTGAGTATGGTGCTCTCGTAGGTGTTGTTACATCCTGGTTTTATGTGTTGAGTTC
GTGGTACGGTGGTAGTAGTGTGGTGATTTTCATCGTGAACAAGTGGTTCAGATGATGTTT
ATGCTCTTCATGAAGAAGTCATTGCGAAGTTCGTTGCAAGAAAACCGGCTAATTATAGTG
CCTTAAGTCTTTGTTCTTTTATCTTTGGGTGGTTGTTTCTGGGTTTAAGGAGAATAGGTG
TTTAGTTCACTTTCTGATGTTGGTTTGTAGCCCTTGTATTTGGGTTCTAGATTCCCGATT
TTGGGCTTAGCTTCCGGGGATATCTTTGTATTCCGCCGGCCTTAGTATCTCAACTTTGTA
GCGTTTTTATATTATCAATGAAATCAGATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AGATCTGTGATTTCTTCTCGGATTTATTATCAAATCCTTGGTAGATCTGGGTTTTGTGGT
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TTCAGCAACGGTGTAGAATTTTGTGGTGATGTGTGGTGAGCATGTGAGGGTTTTGGTTCT
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QA 1 616 1 616
DS 

RD RS1GU50JQ 828 0 0
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TGTTGCAATTGGAGGCCTTCTCCCGCCATATGATTTAGTGTTTATCCTGGTCTACCTTTG
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TTTTATGTGTTGAGTTCGTGGTACGGTGGTAGTAGTGTGGTGATTTTCATCGTGAACAAG
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QA 1 828 1 828
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TTCAAGACACTTGCAATGTTCACTATTTTCCAAACGGTTTATCTGTTAATCTGCTTTGGC
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GGAGAGTTTAGACACACGAGTAGTCCAAAGGTCACGAGTTCGAGTTCGACTCCTGTCAAT
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AGTCCTCGGGTCGTTGGGAATAGTCCAAAGCCGGCTAGTTGTGGAAGGAGTCCCTTGAAC
CAGTACTCTTCAAAGTGATGAGATGATATAATATATTCAGGAAGCTCAATAAAACAAAAC
CATCCCAATGAGGATGAATGTTTAATTAGTTAATTAATTTGGTCTTTAGTTATTATAAGA
AACAAAAGCTTCTTGAATAATCTCTCTTTAGTTTATGTGTTGTATGTGTTTGTAATCCCC
TTCCCTTGTGTTTTTTATCTTTTGAGTTTTTGTAAAATCTTTACTTATTTCGTAATATAT
GTAACTTTGTGTGGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G605TF U 1
AF RS1G605JQ C 183
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BS 546 546 RS1G605JQ
BS 547 582 RS1G605TF
BS 583 915 RS1G605JQ

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TTCAAGACACTTGCAATGTTCACTATTTTCCAAACGGTTTATCTGTTAATCTGCTTTGGC
CTCACATGGATCCCAATAGCAGGAGTCATGTTCCCTTTAATGATCATGTTCTTAATCCCC
GTTAGACAATACATCCTCCCTAGATTCTACAAAGGAGCTCATCTTCAAGACTTGGACGCA
GCAGAGTACGAAGAAGCTCCAGCTTTACCTTTCAATCTCGCAGCGGAAACGGAGATTGGA
TCGACAACTTCGTATCCAGGAGACTCAGAGATTCTTGATGAGGTTATTACACGAAGCAGA
GGAGAGTTTAGACACACGAGTAGTCCAAAGGTCACGAGTTCGAGTTCGACTCCTGTCAAT
AATAG*AGTTTGTCTCAAGTGTTTAGTCCACGTGTGAGCGAA

QA 1 582 1 582
DS 

RD RS1G605JQ 733 0 0
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CACATGGATCCCAATAGCAGGAGTCATGTTCCCTTTAATGATCATGTTCTTAATCCCCGT
TAGACAATACATCCTCCCTAGATTCTACAAAGGAGCTCATCTTCAAGACTTGGACGCAGC
AGAGTACGAAGAAGCTCCAGCTTTACCTTTCAATCTCGCAGCGGAAACGGAGATTGGATC
GACAACTTCGTATCCAGGAGACTCAGAGATTCTTGATGAGGTTATTACACGAAGCAGAGG
AGAGTTTAGACACACGAGTAGTCCAAAGGTCACGAGTTCGAGTTCGACTCCTGTCAATAA
TAGGAGTTTGTCTCAAGTGTTTAGTCCACGTGTGAGCGAACTAAGGTTCGGTCAGATGAG
TCCTCGGGTCGTTGGGAATAGTCCAAAGCCGGCTAGTTGTGGAAGGAGTCCCTTGAACCA
GTACTCTTCAAAGTGATGAGATGATATAATATATTCAGGAAGCTCAATAAAACAAAACCA
TCCCAATGAGGATGAATGTTTAATTAGTTAATTAATTTGGTCTTTAGTTATTATAAGAAA
CAAAAGCTTCTTGAATAATCTCTCTTTAGTTTATGTGTTGTATGTGTTTGTAATCCCCTT
CCCTTGTGTTTTTTATCTTTTGAGTTTTTGTAAAATCTTTACTTATTTCGTAATATATGT
AACTTTGTGTGGC

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 2

CO CL5313Contig1 1172 2 4 U
GGAGAAAAATCTGATGGAGATCTGCACTTACTTCAGTTCCCAGCCGACATGGCTCCTCCT
CCTCTTCGCCCTGGGCTCCCTCCAACTCCTCAAACTCACCCTCTCCCTCCTCACCTCCCT
CTACATCTACTTCCTCCGCCCCGCCAAAAACCTCCGCCGCCGCTACGGCTCCTGGGCCAT
CATCACCGGCCCCACCGACGGCATCGGCAAAGCCTTCGCCTTCCAGCTCGCCAGCAAAGG
CCTCAACCTCGTCCTCGTCGCCCGCAACCCCGACAAGCTCGCCGACGTCTCCGACTCCAT
CAGATCCAAACACCCCGACGTCCAGATCAAGACCGTGCTCATGGACTTCTCCGGGGACAT
CGACGACGGCGTGAGGCGGATCAAGGAGGCGATCGAAGGGTTGGAGGTTGGTGTTCTGAT
TAACAATGCGGGCATGTCGTATCCTTACGCGAAGTACTTCCACGAGGTTGATGAGGAGTT
GGTTAAGGGTTTGATTAAGATTAATGTGGAAGGGACGACGAAGGTGACGCAGGCTGTGTT
GCCTGGGATGCTGGAGAGGAAGCGTGGGGGCGATTGTTAATATGGGTTCTGGTGCTGCTG
CGCTTATTCCTTCGTATCCTTTCTACTCTGTTTACGCCGGTGCGAAAACGTATGTGGATC
AGTTCACGAGGTGTCTACATGTTGAGTACAGGAAGAGTGGGATTGATGTTCAGTGTCAGG
TACCCTTGTACGTTGCGACGAAGATGACATCGATAAGAAGAGCATCCTTCTTAGTGGCAT
CTCCAGAGGGTTACGCAAAGGCAGCAATGCGTTTTATAGGGTATGAAGCACGCTGCACAC
CGTACTGGCCTCACGCCCTCATGGGTTATGTTGTCTCTGCATTGCCCGAGAGCGTCTTTG
AATCCTTTAACATTAAGAGGTGCCTCCAGATCAGGAAGAAGGGTATGCTTAAAGACTCCA
GGAAAAAGGAATGAAACTTTTCCCAGGGTGCAAGATTTTCTTCTGCCGCTTGCAAGTTTC
TGTTTAGACTTTGCAAGACTTGTACGCTTTAGTTTCCGATGTTTCCAAGGTTGTTTCCTT
GTTTCTTTAAAATTAAAAACCATAACGTCCACCACTAATCATTCATGTTCTCACTGTTAT
TATTTATTTATTCAAATAAAACTGAATGTTTG


BQ
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AF RS1BH90TF U 1
AF RS1BH90JQ C 426
BS 1 670 RS1BH90TF
BS 671 671 RS1BH90JQ
BS 672 687 RS1BH90TF
BS 688 1172 RS1BH90JQ

RD RS1BH90TF 687 0 0
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CCTCTTCGCCCTGGGCTCCCTCCAACTCCTCAAACTCACCCTCTCCCTCCTCACCTCCCT
CTACATCTACTTCCTCCGCCCCGCCAAAAACCTCCGCCGCCGCTACGGCTCCTGGGCCAT
CATCACCGGCCCCACCGACGGCATCGGCAAAGCCTTCGCCTTCCAGCTCGCCAGCAAAGG
CCTCAACCTCGTCCTCGTCGCCCGCAACCCCGACAAGCTCGCCGACGTCTCCGACTCCAT
CAGATCCAAACACCCCGACGTCCAGATCAAGACCGTGCTCATGGACTTCTCCGGGGACAT
CGACGACGGCGTGAGGCGGATCAAGGAGGCGATCGAAGGGTTGGAGGTTGGTGTTCTGAT
TAACAATGCGGGCATGTCGTATCCTTACGCGAAGTACTTCCACGAGGTTGATGAGGAGTT
GGTTAAGGGTTTGATTAAGATTAATGTGGAAGGGACGACGAAGGTGACGCAGGCTGTGTT
GCCTGGGATGCTGGAGAGGAAGCGTGGGGGCGATTGTTAATATGGGTTCTGGTGCTGCTG
CGCTTATTCCTTCGTATCCTTTCTACTCTGTTTACGCCGGTGCGAAAACGTATGTGGATC
AGTTCACGAG*TGTCTACATGTTGAGT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1BH90JQ 747 0 0
ATGCGGGCATGTCGTATCCT*ACGCGAAGTACTTCCACGAGGTTGATGAGGAGTTGGTTA
AGGGTTTGATTAAGATTAATGTGGAAGGGACGACGAAGGTGACGCAGGCTGTGTTGCCTG
GGATGCTGGAGAGGAAGCGTGGGG*CGATTGTTAATATGGGTTCTGGTGCTGCTGCGCTT
ATTCCTTCGTATCCTTTCTACTCTGTTTACGCCGGTGCGAAAACGTATGTGGATCAGTTC
ACGAGGTGTCTACATGTTGAGTACAGGAAGAGTGGGATTGATGTTCAGTGTCAGGTACCC
TTGTACGTTGCGACGAAGATGACATCGATAAGAAGAGCATCCTTCTTAGTGGCATCTCCA
GAGGGTTACGCAAAGGCAGCAATGCGTTTTATAGGGTATGAAGCACGCTGCACACCGTAC
TGGCCTCACGCCCTCATGGGTTATGTTGTCTCTGCATTGCCCGAGAGCGTCTTTGAATCC
TTTAACATTAAGAGGTGCCTCCAGATCAGGAAGAAGGGTATGCTTAAAGACTCCAGGAAA
AAGGAATGAAACTTTTCCCAGGGTGCAAGATTTTCTTCTGCCGCTTGCAAGTTTCTGTTT
AGACTTTGCAAGACTTGTACGCTTTAGTTTCCGATGTTTCCAAGGTTGTTTCCTTGTTTC
TTTAAAATTAAAAACCATAACGTCCACCACTAATCATTCATGTTCTCACTGTTATTATTT
ATTTATTCAAATAAAACTGAATGTTTG

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

CO CL5314Contig1 676 2 3 U
ATCCTCTCAGCTGCCAAACCCAAGAGTACATAATACCAACAGCACAGTATGTTGAGATCA
ACATCAAAGGCATGAACGCAAATGTGTCACCTAAAAAATAAGGATGCAAGAACTGAAACA
CTATCTCTACTATAACCAAACCCATCAAAAAGCTCTTCTCAATACATCCAATCTCAAACT
TGCTCTTCCTTTCACCACCATCTCCCTTCTTCTCCTTCAACGCCTTCTCGTCTGCATATT
GAGCCGAAAAGCCAAGCCACATTACCATGGAGTGAAGTAGCAACAACAGAACCTTGATTG
GATACTCCCGGGGCTCATATAGAAGTGGAAAGAGAGAGTAACAAGACACTATGGAAACCA
GGAAGTAGTGTTTAGCATCTTCTAAACTCTGCGCTGCAACGATTGCAAGTGGGATAGTGA
AGTGAAGCGACGCTTTCTCATGTACATGCCATCCAAACAGAAACCCGCATGTGTATGCAT
AAGCTATCCATCTAGCGACGAGCCCGGGTTGCGGTTTTCTCCAAGCTTTGATCAGACACG
GAGTAAGAGCAAGTAGCACCATTACAAAAGTAGTCAATGGAGTGATCTGAGGGAGAACCG
CGAAAGGTGACGAGTCCCCAACTAAACCTCCAGTGAAAGAAGCTGAAGGAACATGAACGT
CGACGCCGAGCTTACC


BQ
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AF RS1GU39JQ U 46
AF RS1GU39TF C 1
BS 1 45 RS1GU39TF
BS 46 467 RS1GU39JQ
BS 468 676 RS1GU39TF

RD RS1GU39JQ 422 0 0
AGTATGTTGAGATCAACATCAAAGGCATGAACGCAAATGTGTCACCTAAAAAATAAGGAT
GCAAGAACTGAAACACTATCTCTACTATAACCAAACCCATCAAAAAGCTCTTCTCAATAC
ATCCAATCTCAAACTTGCTCTTCCTTTCACCACCATCTCCCTTCTTCTCCTTCAACGCCT
TCTCGTCTGCATATTGAGCCGAAAAGCCAAGCCACATTACCATGGAGTGAAGTAGCAACA
ACAGAACCTTGATTGGATACTCCCGGGGCTCATATAGAAGTGGAAAGAGAGAGTAACAAG
ACACTATGGAAACCAGGAAGTAGTGTTTAGCATCTTCTAAACTCTGCGCTGCAACGATTG
CAAGTGGGATAGTGAAGTGAAGCGACGCTTTCTCATGTACATGCCATCCAAACAGAAACC
CG

QA 1 422 1 422
DS 

RD RS1GU39TF 676 0 0
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ACATCAAAGGCATGAACGCAAATGTGTCACCTAGAAAATAAGGATGCAAGAACTGAGACA
CTATCTCTACTATAACCACACCCATCAGATAGCTCTTCTCAATACATCCAATCTCAAACT
TGCTCTTCCTTTCACCACCATCTCCCTTCTTCTCCTTCAACGCCTTCTCGTCTGCATATT
GAGCCGAAAAGCCAAGCCACATTACCATGGAGTGAAGTAGCAGCAACAGAACCTTGATTG
GATACTCCCGGGGCTCATATAGAAGTGGAAAGAGAGAGTAGCAAGACACTATGGAAACCA
GGAAGTAGTGTTTAGCATCTTCTAAACTCTGCGCTGCAACGATTGCAAGTGGGATAGTGA
AGTGAAGCGACGCTTTCTCATGTACATGCCATCCAAACAGAAACCCGCATGTGTATGCAT
AAGCTATCCATCTAGCGACGAGCCCGGGTTGCGGTTTTCTCCAAGCTTTGATCAGACACG
GAGTAAGAGCAAGTAGCACCATTACAAAAGTAGTCAATGGAGTGATCTGAGGGAGAACCG
CGAAAGGTGACGAGTCCCCAACTAAACCTCCAGTGAAAGAAGCTGAAGGAACATGAACGT
CGACGCCGAGCTTACC

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL5315Contig1 394 2 1 U
GATGACGAACAACAACAACAACAATCTGAAGATGAGTTCGGCACAAGAAAGTGGCAATCG
TACTACTAACATCGTTATTAAGAGACGAGGAATAACAAGAAGGTAGAGAGGAAGGCATCC
ATGGACGTGGACAAGTGCGCGGAAGCTTTCATCACAAACTTCAGAAAGCAGCTTCTTCTC
CAGCGTCTCGAATCCATCGAAAACATGCTCTCCCGTGGCCTATAATACCTTTTATCAATA
AACTTGTATGTATGTATGTATTAGTCCTCAACTCCTAGTATGCATATTGCTAGTTGGTAA
CAAAAAAATTTATGTCATTTTTTTATTTTACCTGTCTGCTGTAATTCGGGTAACTCGATA
AATCTAAAGCAAAAATAAGAGAGCATTCTAATTG


BQ
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AF RS1H608JQB C 1
AF RS1H608TF U 1
BS 1 394 RS1H608TF

RD RS1H608JQB 394 0 0
GATGACGAACAACAACAACAACAATCTGAAGATGAGTTCGGCACAAGAAAGTGGCAATCG
TACTACTAACATCGTTATTAAGAGACGAGGAATAACAAGAAGGTAGAGAGGAAGGCATCC
ATGGACGTGGACAAGTGCGCGGAAGCTTTCATCACAAACTTCAGAAAGCAGCTTCTTCTC
CAGCGTCTCGAATCCATCGAAAACATGCTCTCCCGTGGCCTATAATACCTTTTATCAATA
AACTTGTATGTATGTATGTATTAGTCCTCAACTCCTAGTATGCATATTGCTAGTTGGTAA
CAAAAAAATTTATGTCATTTTTTTATTTTACCTGTCTGCTGTAATTCGGGTAACTCGATA
AATCTAAAGCAAAAATAAGAGAGCATTCTAATTG

QA 1 394 1 394
DS 

RD RS1H608TF 394 0 0
GATGACGAACAACAACAACAACAATCTGAAGATGAGTTCGGCACAAGAAAGTGGCAATCG
TACTACTAACATCGTTATTAAGAGACGAGGAATAACAAGAAGGTAGAGAGGAAGGCATCC
ATGGACGTGGACAAGTGCGCGGAAGCTTTCATCACAAACTTCAGAAAGCAGCTTCTTCTC
CAGCGTCTCGAATCCATCGAAAACATGCTCTCCCGTGGCCTATAATACCTTTTATCAATA
AACTTGTATGTATGTATGTATTAGTCCTCAACTCCTAGTATGCATATTGCTAGTTGGTAA
CAAAAAAATTTATGTCATTTTTTTATTTTACCTGTCTGCTGTAATTCGGGTAACTCGATA
AATCTAAAGCAAAAATAAGAGAGCATTCTAATTG

QA 1 394 1 394
DS 



AS 1 2

CO CL5316Contig1 860 2 4 U
GGCATTTATAGAGGCATACCGTCACGAACTACTAGAAGCATATGAATGTTGTATCAATTA
CAAGAGAACTGGAAAAGGCGCTGAACTTACACAGGCTTGGGATCTTTATTATCACGTTTT
CAAACGGATTGACAAACAGCTAGCCAGTCTCACGACCTTGGATTTGGAGTCTGTATCTCC
TGAATTGCTGCTGTGTCGTGACTTGGAGCTAGCTGTTCCTGGAACATACCGCGCGGATGC
CCCCGTTGTGACGATAGCATCGTTTTCTCGTCAACTTCTTGTCATAACTTCTAAACAACG
ACCACGGAAATTGACTATTCACGGAAATGACGGTGAGGACTATGCCTTTTTGTTGAAGGG
ACATGAAGATCTAAGGCAAGATGAGCGTGTTATGCAGCTTTTTGGTTTGGTGAACACTTT
GCTCGAGAATTCCAGGAAAACAGCAGAAAAGGATCTCTCCATCCAACGGTATTCTGTAAT
ACCATTATCTCCCAATAGTGGACTCATTGGATGGGTTCCGAACTGCGATACCCTTCACCA
TCTTATTCGAGAATACAGAGATGCACGAAAGATCATTCTTAATCAAGAACACAAACATAT
GTTGAGTTTTGCTCCAAACTACGACAATCTACCGCTCATAGCAAAGATTGAAGTATTTGA
GTACGCTCTAGAAAACACAGAGGGAAATGATCTGTCCAGGGTTCTCTGGTTAAAAAGTCG
CTCGTCAGAGGTATGGCTGGAGAGAAGAACCAACTATACTAGAAGTTTAGCCGTTATGAG
TATGGTTGGTTATATTCTTGGATTAGGTGATCGACACCCAAGTAACCTTATGCTAGATAT
ATACAGTGGGAAAATCTTGC


BQ
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AF RS1EF85TF U 1
AF RS1D644TF U 347
BS 1 715 RS1EF85TF
BS 716 716 RS1D644TF
BS 717 745 RS1EF85TF
BS 746 860 RS1D644TF

RD RS1EF85TF 745 0 0
GGCATTTATAGAGGCATACCGTCACGAACTACTAGAAGCATATGAATGTTGTATCAATTA
CAAGAGAACTGGAAAAGGCGCTGAACTTACACAGGCTTGGGATCTTTATTATCACGTTTT
CAAACGGATTGACAAACAGCTAGCCAGTCTCACGACCTTGGATTTGGAGTCTGTATCTCC
TGAATTGCTGCTGTGTCGTGACTTGGAGCTAGCTGTTCCTGGAACATACCGCGCGGATGC
CCCCGTTGTGACGATAGCATCGTTTTCTCGTCAACTTCTTGTCATAACTTCTAAACAACG
ACCACGGAAATTGACTATTCACGGAAATGACGGTGAGGACTATGCCTTTTTGTTGAAGGG
ACATGAAGATCTAAGGCAAGATGAGCGTGTTATGCAGCTTTTTGGTTTGGTGAACACTTT
GCTCGAGAATTCCAGGAAAACAGCAGAAAAGGATCTCTCCATCCAACGGTATTCTGTAAT
ACCATTATCTCCCAATAGTGGACTCATTGGATGGGTTCCGAACTGCGATACCCTTCACCA
TCTTATTCGAGAATACAGAGATGCACGAAAGATCATTCTTAATCAAGAACACAAACATAT
GTTGAGTTTTGCTCCAAACTACGACAATCTACCGCTCATAGCAAAGATTGAAGTATTTGA
GTACGCTCTAGAAAACACAGAGGGAAATGATCTGTCCAGGGTTCTCTGGTTAAAA*GTCG
CTCGTCAGAGGTATGGCTGGAGAGA

QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1D644TF 514 0 0
TTTTTGTTGAAGGGACATGAAGATCTAAGGCAAGATGAGCGTGTTATGCAGCTTTTTGGT
TTGGTGAACACTTTGCTCGAGAATTCCAGGAAAACAGCAGAAAAGGATCTCTCCATCCAA
CGGTATTCTGTAATACCATTATCTCCCAATAGTGGACTCATTGGATGGGTTCCGAACTGC
GATACCCTTCACCATCTTATTCGAGAATACAGAGATGCACGAAAGATCATTCTTAATCAA
GAACACAAACATATGTTGAGTTTTGCTCCAAACTACGACAATCTACCGCTCATAGCAAAG
ATTGAAGTATTTGAGTACGCTCTAGAAAACACAGAGGGAAATGATCTGTCCAGGGTTCTC
TGGTTAAAAAGTCGCTCGTCAGAGGTATGGCTGGAGAGAAGAACCAACTATACTAGAAGT
TTAGCCGTTATGAGTATGGTTGGTTATATTCTTGGATTAGGTGATCGACACCCAAGTAAC
CTTATGCTAGATATATACAGTGGGAAAATCTTGC

QA 1 514 1 514
DS 



AS 1 2

CO CL5317Contig1 395 2 1 U
GGACGCATCACATAAAGAACTCGGAGAAGAAGGTTCTCGCTAGGAAGAACCTTGAGCACA
AGATCAAATCCATTGACTTTGCTCGCAAACTCCAGTCCATCCTCATTAAGAAAGTCAGAG
GTTTATGAGAGAGAGCTGAATGAGCGGTGTTGCTATAAACATTCATCATCTTTCTTTACA
TTACATTTTCGGGGAATGAATCTTTGATCAGTGCTAGTATTCTTTTTGATGAATGAAATC
ATTTTGGAATTGGTATAATCCTGGATTACTGTTAGTTGTTTACTCTAAATGATGTTTTTT
CTATAATCAACTTCAGATTCATGAAGTACATTTACTCTCGAAGTTTGTTTTTAATGGATG
TTAGATAGTTAATGACAGGACACTGCGTCCTGCTT


BQ
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AF RS1BA55JQ C 1
AF RS1BA55TF U 1
BS 1 395 RS1BA55TF

RD RS1BA55JQ 395 0 0
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ATTTTGGAATTGGTATAATCCTGGATTACTGTTAGTTGTTTACTCTAAATGATGTTTTTT
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QA 1 395 1 395
DS 

RD RS1BA55TF 395 0 0
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AGATCAAATCCATTGACTTTGCTCGCAAACTCCAGTCCATCCTCATTAAGAAAGTCAGAG
GTTTATGAGAGAGAGCTGAATGAGCGGTGTTGCTATAAACATTCATCATCTTTCTTTACA
TTACATTTTCGGGGAATGAATCTTTGATCAGTGCTAGTATTCTTTTTGATGAATGAAATC
ATTTTGGAATTGGTATAATCCTGGATTACTGTTAGTTGTTTACTCTAAATGATGTTTTTT
CTATAATCAACTTCAGATTCATGAAGTACATTTACTCTCGAAGTTTGTTTTTAATGGATG
TTAGATAGTTAATGACAGGACACTGCGTCCTGCTT

QA 1 395 1 395
DS 



AS 1 2

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CGCATGGAACATGAAGAAGCCCCAGAAAATGAATCAACGAGCTAAATGATCACATTCCTT
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TATTAGAGAGGAGAGACTTATTGTGTTTCTTTTCTATCGATTCATTTGTACATAGTCCAT
TGCTTTTATGGACTGGAATCTCAATAAAAACACTGTTTAG


BQ
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AF RS1CI84TF U 27
AF RS1CI84JQ C 1
BS 1 26 RS1CI84JQ
BS 27 198 RS1CI84TF
BS 199 700 RS1CI84JQ

RD RS1CI84TF 172 0 0
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QA 1 172 1 172
DS 

RD RS1CI84JQ 700 0 0
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TGGAGCAAAAGGAAAGACAGTGATAACATCTCGAGTGTATCCGACCAAAGCTGTAGGTGA
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CGCATGGAACATGAAGAAGCCCCAGAAAATGAATCAACGAGCTAAATGATCACATTCCTT
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TATTAGAGAGGAGAGACTTATTGTGTTTCTTTTCTATCGATTCATTTGTACATAGTCCAT
TGCTTTTATGGACTGGAATCTCAATAAAAACACTGTTTAG

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

CO CL5319Contig1 942 2 4 U
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TCCGGAAAGAACTTTGGAGTGGAGATTTGACAAGGGAATTGAGTGGCAACACGACAGAGA
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AGTGGATCCACATGGAGATCAAAATCCAAATCAGAAGCCAAGGAATCTTGCGAACAAAGA
TAAGCAGAGATGCGAGAGACGTGACCAACAGATTCTCCAACAAAAGTCAAAGAGATCAGA
TAGTTACGCAGAAGAGGACATGTCCATGAAGCTATACTAGAGAAGATATGTGGAAAAATA
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CACTATCTAAACAGGTTAAAACAAAAGAAAACATCAAGGTTAGAGTTTTCACCAAGAGCA
TCTGAATAATGCAGAGTTAGAGCTATTGCAGACGGAGAGCTCAAACTTTTGATTGAAGCA
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AATGATTTTAGAGATGCAGTGGTTGAGATGACCATGGAGAATGGTGTCAACCACCCAGAA
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GTATTATTATCAAAAGAACATTTTAGGATAATCATCAGCTTACGCTCAAATCATGGATAT
TGGTTAAAATGGTGTAAAGCTTATATGACTTTTTCTAACATC


BQ
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AF RS1DJ22TF U 1
AF RS1DJ22JQ C 207
BS 1 333 RS1DJ22TF
BS 334 334 RS1DJ22JQ
BS 335 367 RS1DJ22TF
BS 368 942 RS1DJ22JQ

RD RS1DJ22TF 367 0 0
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CCACCCCTACCACGATTTCCTCCCTCCCGATCTTCAACTATAAAAAAGTATGACTATCCC
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TGCAGACGGAGAGCTCAAACTTTTGATTGAAGCAGCAGATGGAGGAAAGAGAACGGAAGG
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GACTTTTTCTAACATC

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DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GAATCGGAGATCTTACATTATGATCGCTTATTACGGATGTCTTTGGCTTGTCAGCTTGCT
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CTTTCTCTTCCAAGGAAACTATGCAAGTGGCCCTGAAGCACTGACACGGACTTTCCTCAT
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GGTACAGTTGTTTATTGACAACAATGAACATATACAAAAGGTCAAATGGGGGTTATGGGT
CATCCACAAGCTCTTGCTTGCGGCCATTTATGGGATGATATTCTTCATGTACAACTCTAA
GTGGAGAGAAAGATTGCCAGCAAGACCTGCTTTCTATAAGTACATAACTTGCATGCTCGC
CTTAAATGGACTCTCCCTATTTGCTTGTACTCTTGCGGCAAACGGCACTCACTTTGGATT
ATGGTTGTATGGGATCACAACTGTTTGTTACCACGCCTTCTACCTTCCTCTCTTGTATGT
TACTTTCCTTGCAGACTTTTTCCAGGAGGAAGATCTGAACTTGGAGAACGTCTACTATTC
AGAGATGAAAGATGCTGGATTCTTTGATGCTGATTGGGAATAATAAGAACCTGTAGATAC
AAGGTTGAATAGAAATGCTTATAAATCAAGCTATTGTCACTCACTTCCTTTAGGGCCTAC
TCTTCTTGTGCATGTGTAAAGACTCTTTGTACATTATATGATACAACAGTTTGCTT


BQ
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GGTACAGTTGTTTATTGACAACAATGAACATATACAAAAG*TCAAATGGGGGTTATG

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CTTTGTACATTATATGATACAACAGTTTGCTT

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

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TCTTTTCATATACGGGAGCTGGATAGATCAGCAATTTGCTCTTTTATTCCCCTCTGTTTC
AAGCAATAAATTTGGTTGGAGAGACCAGAAGCGGGAAATCTATAATGTAATTGCGATGTT
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CCGTCGTACCAAACATTGCTTGTGGAGGATGATAAGCTATCTGCAGCTCAGCTATTTAAT
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CTCTAAATTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AY12TF U 1
AF RS1AY12JQ C 247
BS 1 642 RS1AY12TF
BS 643 1091 RS1AY12JQ

RD RS1AY12TF 642 0 0
CTTGATTAGTCCCATTAATTTGATTGCCCACAATTACGTCTTCAATGCGTGGCTTAGATC
TTTAAGGCGGTGCGTTTTCAGATATAAATATGTTGCGTAAGATTTAGGAACTTGGCTCTA
ATTAGTAAGGCTACTTCATGTGTTGTTGATCTGTTGAACATGTGATGGCTTACTCGCTTT
GTATATCTTAAAAGATATATGATCTCAATTTTTTTTCGAGTTCAGCTAAGTTTTGTTTAA
TTGTTAAGTCATGTTCAGAGTAGGCTATGGATGGATCATGGTGCTGTTATATAGGTGGGT
ACAAAGCGTGGGCTCGCTCCTGGGAATGCAGCTAGCAAAAATGGTTATCACTGTAGAGAA
ATTATTCTCTCTGTTATCTTAGTAGCCTAGGAAATGTGTTGTAAACCTTTCTTGCTGATG
GTTACAAAAGATCAACAAGGCAAACCGTGGTCACCTTACTTCCCATGAGTTGAAAGAACG
ACAAGCCAATGTAGGACCGGCAACCAGAAAATTCTCACAGATTCTGCAATAATACATGTT
TTGTTTGATCTGTGACCCAGACTTATCAAGAAAGCTCTCACGGAGAAATGTAACCTTAAC
TCGTTGAAGATGTTGTGGTCATATTTCTTTTTATAGAGAAAT

QA 1 642 1 642
DS 

RD RS1AY12JQ 845 0 0
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CGTGGGCTCGCTCCTGGGAATGCAGCTAGCAAAAATGGTTATCACTGTAGAGAAATTATT
CTCTCTGTTATCTTAGTAGCCTAGGAAATGTGTTGTAAACCTTTCTTGCTGATGGTTACA
AAAGATCAACAAGGCAAACCGTGGTCACCTTACTTCCCATGAGTTGAAAGAACGACAAGC
CAATGTAGGACCGGCAACCAGAAAATTCTCACAGATTCTGCAATAATACATGTTTTGTTT
GATCTGTGACCCAGACTTATCAAGAAAGCTCTCACGGAGAAATGTAACCTTAACTCGTTG
AAGATGTTGTGGTCATATTTCTTTTTATAGAGAAATCGAATGAGGCTAAGAGATTGGTGG
TTCTGGTGTTTGCTTCTCAGATTGTTTTAAAAGATGCGCTTGGATCACACCCAAGTCTGG
CAAAGGTTTCTATGGAACAAGGATCTTATATATGGGAGCTGGATAGATCAGCAATCTTTT
CATATACGGGAGCTGGATAGATCAGCAATTTGCTCTTTTATTCCCCTCTGTTTCAAGCAA
TAAATTTGGTTGGAGAGACCAGAAGCGGGAAATCTATAATGTAATTGCGATGTTGCAGAG
GTTACAAGATTTTGATCACGTCAGCAAAGCTAGAACCGGTTTTGCTCAAAGAAACCGTCG
TACCAAACATTGCTTGTGGAGGATGATAAGCTATCTGCAGCTCAGCTATTTAATGCTCAT
GGCTTTTTAGTGTACCAAGCATGTAACTTTAACGGCACTTGAAAGAATGTGCAGCTCTAA
ATTCC

QA 1 845 1 845
DS 



AS 1 2

CO CL5323Contig1 1257 2 4 U
GAGTGCATATTTTCAGTCGGCCCTTCGTAGTCTCAGGTCGCTCGGAGCGGATCAAGTGCA
TCCCAAGAACTGGTATCCAATCCCCCTTGTTTTCTGCAGACCATGGGGACAGCTCCCAGA
AAATGTTCCGTGCCACCCTAAGCTGGCTGATTTTGCTAACTGTATGAAGAAAAAAGGTCG
TGGAATGTCGATCTTTGTCTCAATACTAGACGGCGACTACTACGAGTGCGCTGAAGAAGC
AAAAGAAGCCTGCAAACAACTAGCCACCTACATTGAGTACAAGCGTTGCGAAGGTGTAGC
TGAAATCGTCGTAGCGCCAAACATGACCGAAGGCTTCCGTGGGATCATCCAGACGATGGG
ACTCGGAAATCTCAAACCCAACATCGTCGTGATGCGTTACCCTGAGATCTGGCGACGTGA
GAATCTAACAGAGATTCCATCCACGTTTGTTGGGATAATCAACGACTGCATCACAGCGAA
CAAAGGAGTCGTCATCATCAAAGGGTTAGAGGAATGGCCCAACGAGTACCAAAGACAGTA
CGGAACGATCGACTTGTACTGGATCGTGAGAGACGGTGGTCTCATGCTTCTCCTCTCGCA
GCTTCTTCTGACGAAAGAAAGCTTCGAGAGCTGCAAGATCCAGCTCTTCTGCATAGCCGA
AGAGGATTCAGACGCGGAAGCACTAAAAGCCGACGTGAAGAAGTTCCTGTACGACCTCAG
GATGCAAGCGGAAGTCATCGTGGTGACGATGAAGTCATGGGACATAAGATCAGAAGGAAA
CAGCAAAGAAGATTCGTTGGAGGCCTTTGATGCTGCGCAGAGACGAATCTCGGATTACTT
GGGAGAGATAAAGAGTCAAGGTTCGACTCCTCGGTTGGCGAATGGGAAAGCGATGGTGGT
GAATGAGCAACAAGTGGAGAAGTTTCTGTATACGATGCTGAAACTGAACTCGACCATACT
CAGTTACTCGAGGATGGCCGCGGTGGTTCTGGTTAGTCTTCCTCCGCCTCCGTTGAACCC
CCCGGCGTATTTCTACATGGAGTATATGGATTTGCTGGTGGAGAATGTCCCAAGGATGTT
GATCGTGAGAGGGTATCACAGAGATGTTGTAACTTTGTTTACATAGTTTCATATTTTTCT
TATTACTCACCAACAAAACCAAAGACCTTGACCTTCAAGGTTAGGTTTTTTTTCCCTCAT
AATATTTTTTAACCTTGTAGTACAAAGAACTCCATTTGTTGAAATGATTGAATTGGC


BQ
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AF RS1C103TF U 1
AF RS1C103JQ C 490
BS 1 720 RS1C103TF
BS 721 721 RS1C103JQ
BS 722 762 RS1C103TF
BS 763 1257 RS1C103JQ

RD RS1C103TF 762 0 0
GAGTGCATATTTTCAGTCGGCCCTTCGTAGTCTCAGGTCGCTCGGAGCGGATCAAGTGCA
TCCCAAGAACTGGTATCCAATCCCCCTTGTTTTCTGCAGACCATGGGGACAGCTCCCAGA
AAATGTTCCGTGCCACCCTAAGCTGGCTGATTTTGCTAACTGTATGAAGAAAAAAGGTCG
TGGAATGTCGATCTTTGTCTCAATACTAGACGGCGACTACTACGAGTGCGCTGAAGAAGC
AAAAGAAGCCTGCAAACAACTAGCCACCTACATTGAGTACAAGCGTTGCGAAGGTGTAGC
TGAAATCGTCGTAGCGCCAAACATGACCGAAGGCTTCCGTGGGATCATCCAGACGATGGG
ACTCGGAAATCTCAAACCCAACATCGTCGTGATGCGTTACCCTGAGATCTGGCGACGTGA
GAATCTAACAGAGATTCCATCCACGTTTGTTGGGATAATCAACGACTGCATCACAGCGAA
CAAAGGAGTCGTCATCATCAAAGGGTTAGAGGAATGGCCCAACGAGTACCAAAGACAGTA
CGGAACGATCGACTTGTACTGGATCGTGAGAGACGGTGGTCTCATGCTTCTCCTCTCGCA
GCTTCTTCTGACGAAAGAAAGCTTCGAGAGCTGCAAGATCCAGCTCTTCTGCATAGCCGA
AGAGGATTCAGACGCGGAAGCACTAAAAGCCGACGTGAAGAAGTTCCTGTACGACCTCAG
*ATGCAAGCGGAAGTCATCGTGGTGACGATGAAGTCATGGGA

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1C103JQ 768 0 0
CGTCATCATCAAAGGGTTAGAGGAATGGCCCAACGAGTACCAAAGACAGTACGGAACGAT
CGACTTGTACTGGATCGTGAGAGACGGTGGTCTCATGCTTCTCCTCTCGCAGCTTCTTCT
GACGAAAGAAAGCTTCGAGAGCTGCAAGATCCAGCTCTTCTGCATAGCCGAAGAGGATTC
AGACGCGGAAGCACTAAAAGCCGACGTGAAGAAGTTCCTGTACGACCTCAGGATGCAAGC
GGAAGTCATCGTGGTGACGATGAAGTCATGGGACATAAGATCAGAAGGAAACAGCAAAGA
AGATTCGTTGGAGGCCTTTGATGCTGCGCAGAGACGAATCTCGGATTACTTGGGAGAGAT
AAAGAGTCAAGGTTCGACTCCTCGGTTGGCGAATGGGAAAGCGATGGTGGTGAATGAGCA
ACAAGTGGAGAAGTTTCTGTATACGATGCTGAAACTGAACTCGACCATACTCAGTTACTC
GAGGATGGCCGCGGTGGTTCTGGTTAGTCTTCCTCCGCCTCCGTTGAACCCCCCGGCGTA
TTTCTACATGGAGTATATGGATTTGCTGGTGGAGAATGTCCCAAGGATGTTGATCGTGAG
AGGGTATCACAGAGATGTTGTAACTTTGTTTACATAGTTTCATATTTTTCTTATTACTCA
CCAACAAAACCAAAGACCTTGACCTTCAAGGTTAGGTTTTTTTTCCCTCATAATATTTTT
TAACCTTGTAGTACAAAGAACTCCATTTGTTGAAATGATTGAATTGGC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5325Contig1 1220 2 2 U
GGGGATTATGTTACTGATTTTCATGCTAGATGTTCAATGAAGGAGAAGAAATATAGCATA
GAGTGTGCTGAAAACGTCATCAAATCTCTGAAGTTACCCATTGAGAAGGTCAAGAAATGC
ATGGGCGATCCTGAAGCTGATACCGACAACGAAGTTCTGAAAATGGAGCAAGTAGTTCAG
CTTGGACGAGGAAAGCGAGGAGATGTTACTATTTTGCCAACATTTGTCATCAATAGCGCC
CAATATCGAGGGAGATTGGAGAGAACCGCTGTTCTGAAGGCAATATGCGCGGGGTTCAAT
GAAACATCTGATCCTCCCATTTGCTTAAACACAGGTCTAGAGACTAATGAATGTCTTGAA
AATAATGGTGGTTGCTGGAAGGATACAAGAGCAAACATGACTGCTTGTAAAGACACTTTC
AGAGGAAGAATCTGCGAGTGTCCCATTGTAAAAGGTGTTCAATATAAAGGAGATGGGTAC
ACTTCATGTACACCTTATGGGCCTGCGAGGTGTACTATTAACAATGGAGGTTGCTGGTCT
GATACAAGAAATGGAGTGACATTCTCTGCTTGCTCAGACGCTATGTCTACTGGCTGCACA
TGTCCTCCTGGTTTCAGAGGCAATGGACTCACATGTGAAGATATCAACGAATGTAAAGAG
GGTTTGGTGTGTCAATGCAGCGGTTGCAAATGCAAGAACACATGGGGAGGACACAGATGT
AGTTGTTCTGGTGACAAGCTTTACATATACGATCAAGATACTTGTATAGAGAGAAATGGG
TCCAAAACAGCATGGTGGCTCACACTCTTGATACTAGCAATCGTTGCAGTAGCGGGTTTA
GCTGGTTATCTATTCTACAAATACCGTTTCAGGTCTTACATGGATTCAGAGATTATGACG
ATAATGTCACAGTATATGCCACTTGAGAGCCAAAGAGCTCGTGAAGTTCCATCAGAAGCT
GAGCCTTTCACTCACAACTCTACTGCCTAATACAATACTATGACAAAAGGAACCAAACAT
GTCCTGTAGTTGTATATTTCAGGAACAGATTCACAAAGAAATGTTTGAGATCGATCACTC
ACAGTATATATTATATATACCTTGTAAAAATAAAAGAGAGTGAGATAGAGAGATGTCTAA
TTTCATGCCATGAACAATAAGTTAATGTTTGGATGTTTTCTGTTTAAGATACAACAAGGT
TTCAGAGATATGTTTGTGGG


BQ
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TGTCCTCCTGGTTTCAGAGGCAATGGACTCACATGTGAAGATATCAACGAATGTAAAGA

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DS 

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ATACGATCAAGATACTTGTATAGAGAGAAATGGGTCCAAAACAGCATGGTGGCTCACACT
CTTGATACTAGCAATCGTTGCAGTAGCGGGTTTAGCTGGTTATCTATTCTACAAATACCG
TTTCAGGTCTTACATGGATTCAGAGATTATGACGATAATGTCACAGTATATGCCACTTGA
GAGCCAAAGAGCTCGTGAAGTTCCATCAGAAGCTGAGCCTTTCACTCACAACTCTACTGC
CTAATACAATACTATGACAAAAGGAACCAAACATGTCCTGTAGTTGTATATTTCAGGAAC
AGATTCACAAAGAAATGTTTGAGATCGATCACTCACAGTATATATTATATATACCTTGTA
AAAATAAAAGAGAGTGAGATAGAGAGATGTCTAATTTCATGCCATGAACAATAAGTTAAT
GTTTGGATGTTTTCTGTTTAAGATACAACAAGGTTTCAGAGATATGTTTGTGGG

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

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GGAAAGGTAACTCGGATCCCAATCTCATCGGAGTAACTGTCGACGGCTGAGCAGAGGGAA
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CAAGTTGGAGACGAGTCGAGGCTGTTGCTTGAGGAAAGAGTCTCGTCGATCCCACTTGAG
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CGGTGAGGATCTCCAGCGGAAGGCTTCGTCTTAATTACTTGAGGAGAGTCGTAGCTAACG
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GCGCCTCGATAATTGGACCAGGGAGCAAAAGTATTAGGGCGAACTCCTTAAGCTGCGATT
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CTCTAGGACCGTTTACTT


BQ
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GCTCTGACCACGAGATTTACGGAGAGGAGAGTTCCTTGCAGGGGGTGAGTGAGAGGTGTC
CGGTGAGGATCTCCAGCGGAAGGCTTCGTCTTAATTACTTGAGGAGAGTCGTAGCTAACG
GATCTGTGGTAAACGCTTGAGAAGCCCAAGCGAAGCCTTTGATGAAGTGAGTAGATGTGG
TGACGCAAGGAGTCGCAAGCATAACCGGTGATGACGTGAGGAGCTGGTGAGGCCGTGAGT
CGATGGAAGCAGTAGAGGTGGTGATTACGAGATGGACGGAGGAGACAGTGACTACGAATA
GACCTAGATGGACGACTGCGAAAATACGAGACGATGACATGAAGCAAACGAGAAACGACG
ACA*TGGACTGTGAGGAGAC*TTGAACCGAGA*CTGAAGATAGA
GACGAGAGGGGAT

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DS 

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AGTGAGAGGTGTCCGGTGAGGATCTCCAGCGGAAGGCTTTGTTTTAATTACTTGAGGAGA
GTCGTAGCTAACGGATTTGTGGTAAACGCTTGAGAAGCCCAAGCGAAGCCTTTGATGAAG
TGAGTAGATGTGGTGACGCAAGGAGTCGCAAGCATAACCGGTGATGACGTGAGGAGCTGG
TGAGGCCGTGAGTCGATGGAAGCAGTAGAGGTGGTGATTACGAGATGGACGGAGGAGACA
GTGACTACGAATAGACCTAGATGGACGACTGCGAAAATACGAGACGATGACATGAAGCAA
ACGAGAAACGACGACAATGGACTGTGAGGAGACCTTGAACCGAGAACTGAAGATAGAAGA
CGAAGAGGGGGATGAAACGCCGGACGCCGGCGAACCGTGGTTCCACCGGCGTCGGAGGGA
AGCTGAAAACGCGGCGCCTCGATAATTGGACCAGGGAGCAAAAGTATTAGGGCGAACTCC
TTAAGCTGCGATTTTGATTTGAATTTATGCTACAATTATAATAAAGATTGAAGTTTTTTT
GTAAGTATTTTATCTCTAGGACCGTTTACTT

QA 1 631 1 631
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GAGATGGGTGTTGTAGAGGAAGCTCACAACGTGAAAGTGATCGGCACAGGAACTCAAGCA
ACGATCGTCTTAGGTCATGGGTTCGGCACGGACCAGTCATTGTGGAAACACCTGGTCCCA
CATCTGCTCGAAGATTACCGCATCGTTCTCTACGACAACATGGGAGCCGGTACGACTAAC
CCAGACTACTTTGACTTCGATCGTTACTCAACTCTAGAAGGTTTCTCCTTTGATTTGATC
GCAATCTTGGAAGATCTTCAAATCGAGTCTTGTATCTTTGTTGGTCACTCTGTTTCCGCC
ATGGTTGGTCTCTTGGCTTCTCTTAACCGACCTGATCTCTTCTCCAAAATCGTCATGATC
TCTGCTTCCCCAAGGTACGTGAACGATGTTGATTACCAAGGTGGATTCGAGCAAGACGAC
TTAAACCAACTCTTCGAAGCGATGCGAAGCAACTACAAAGCGTGGTGCTTAGGTTTCGCA
CCACTCGCGGTAGGTGGCGACTTAGACTCAGTCGCGGTTCAAGAATTCAGCAGAACGCTC
TTCAACATGCGTCCAGACATAGCTCTCTCCGTGGCTCAGACCATTTTCCAAAGTGACATG
AGACAGATCTTACCTTTTGTAGCTGTCCCTTGTCACATTCTCCAAAGCGTTAAGGACTTA
GCCGTACCAGTGGCAGTCTCCGAGTATCTTCACACCAATCTTGGATGTGAATCTGTTGTC
GAGGTTATTCCTTCAGATGGTCATCTTCCTCAGCTTAGCTCGCCGGACTCTGTTATTCCT
GTGCTCCTCCGTCACATTCGTAATGACATCGCTGTCTGATTGGTGGGGAAGTGCATTTTT
AATTAAATTAATGGAAAATTAAATATCTGATGTGATATGTCTGTCTATTGAGAATATACG
GTCTCGGTGTCGTTTAGTTCTTGGATTATATTTGCTCGTTGTCGTTGTTGATCTTATCTT
TGTTTAAGGAAAAGACTTTTGTCTTTTGTGTTTAAGGAAAAGTCTTCGTTGTCAGCTCTG
CTGCTCGACCTCACTATCGCTGTTCTTGTATAATGTCCATGTAAAAGTTTTATTCTC


BQ
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AF RS1D981JQ C 497
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CATCTGCTCGAAGATTACCGCATCGTTCTCTACGACAACATGGGAGCCGGTACGACTAAC
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GCAATCTTGGAAGATCTTCAAATCGAGTCTTGTATCTTTGTTGGTCACTCTGTTTCCGCC
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TCTGCTTCCCCAAGGTACGTGAACGATGTTGATTACCAAGGTGGATTCGAGCAAGACGAC
TTAAACCAACTCTTCGAAGCGATGCGAAGCAACTACAAAGCGTGGTGCTTAGGTTTCGCA
CCACTCGCGGTAGGTGGCGACTTAGACTCAGTCGCGGTTCAAGAATTCAGCAGAACGCTC
TTCAACATGCGTCCAGACATAGCTCTCTCCGTGGCTCAGACCATTTTCCAAAGTGACATG
AGACAGATCTTACCTTTTGTAGCTGTCCCTTGTCACATTCTCCAAAGCGTTAAGGACTTA
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TCTGTTG

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DS 

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GCGACTTAGACTCAGTCGCGGTTCAAGAATTCAGCAGAACGCTCTTCAACATGCGTCCAG
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TTGTAGCTGTCCCTTGTCACATTCTCCAAAGCGTTAAGGACTTAGCCGTACCAGTGGCAG
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ATGGTCATCTTCCTCAGCTTAGCTCGCCGGACTCTGTTATTCCTGTGCTCCTCCGTCACA
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TCGCTGTTCTTGTATAATGTCCATGTAAAAGTTTTATTCTC

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DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TACCCAATCCCCAAAAGCTTCCTTCTTTCTCCCCCTTCCCGTTACAAACGTAACCCTAAT
AATCTCATCTCTTGCTCCACCAAACCCATCTCTCCTCTGCAAACAACAACCCATCGAATC
CAAATCCAAAAGCAGAGTCTTCCTCTCCCACCCACTTTCGAAGATTCCTTTCTCCTCTAC
CAATTCAGCTCCCCGACCGAAGACCCAGGATTCTCTAACCGGATCTCCGACGGAGAACCG
GTCGAATTGGTTATCCGCGGCGTGGAAGAAGGAGACAACAAAAGCTTGGTAATTTCGTCG
AACATGTGGTGGGCAGATCTGAAAGCGGCTCTTGGGCAACGAATCAACGTGGAGGGCATC
GTCTCTTCCGTCTCCGTGATCGTGAAAGATCGTCACTTGGTTCTTCCCCATGTTTCCGTC
AGAGATTTACGCTACATTGACTGGGGAGAGCTGAAGAGAAAGGGGTTCAAGGGTGTAGTC
TTCGATAAAGATAATACTCTCACTGCTCCTTACTCTCTAGCGATCTGGCCACCCCTCAGG
CCTTCTATTGAGCAGTGTAAAGCCGTGTTCGGTCATGACATCGCCGTGTTTAGCAACTCC
GCTGGGCTTACGGAGTATGATCACGATGATTCGAAAGCTAAAGCATTGGAGGCTGAAACA
GGGATTAGAGTGTTGAGACATAAGACAAAGAAGCCTGCGGGAACTGCTGAAGAAGTTGAG
AAACACTTTGGTTGCGCTTCTTCAGAGCTAATCATGGTGGGTGATCGACCTTTCACGGAT
ATTGTTTACGGGAACAGAAACGGGTTTCTAACTGTGTTAACTGAACCGTTGAGTCGAGCT
GAGGAGCCTTTCATTGTTAGACAGGTGAGGAGATTAGAGTTGGCCTTGTTGAAACGTTGG
TTGAGAAAAGGTTTGAAGCCTGTGGATCACATTTTGGTATCAGATGTAACACCATTTGTA
AAGGATCCTTCAGATTTATAAGAAGGGTTCTCATTTTGCTCAAGCAACAACTCTGTTCCT
TGTTTTCTTTTTGGTGTAATGGCCATTTTGACTTTTGGCTAAATGAGTAATGGTAATTCA
AAGTTTGGGTTTCG


BQ
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AF RS1E527TF U 1
AF RS1E527JQ C 316
BS 1 595 RS1E527TF
BS 596 1154 RS1E527JQ

RD RS1E527TF 595 0 0
GGAATTATAAAGAAGGGGGAGATGCAGACCCCATCGATGGCTGCCTCCACTACTTCCTAC
TACCCAATCCCCAAAAGCTTCCTTCTTTCTCCCCCTTCCCGTTACAAACGTAACCCTAAT
AATCTCATCTCTTGCTCCACCAAACCCATCTCTCCTCTGCAAACAACAACCCATCGAATC
CAAATCCAAAAGCAGAGTCTTCCTCTCCCACCCACTTTCGAAGATTCCTTTCTCCTCTAC
CAATTCAGCTCCCCGACCGAAGACCCAGGATTCTCTAACCGGATCTCCGACGGAGAACCG
GTCGAATTGGTTATCCGCGGCGTGGAAGAAGGAGACAACAAAAGCTTGGTAATTTCGTCG
AACATGTGGTGGGCAGATCTGAAAGCGGCTCTTGGGCAACGAATCAACGTGGAGGGCATC
GTCTCTTCCGTCTCCGTGATCGTGAAAGATCGTCACTTGGTTCTTCCCCATGTTTCCGTC
AGAGATTTACGCTACATTGACTGGGGAGAGCTGAAGAGAAAGGGGTTCAAGGGTGTAGTC
TTCGATAAAGATAATACTCTCACTGCTCCTTACTCTCTAGCGATCTGGCCACCCC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RS1E527JQ 839 0 0
CGCGGCGTGGAAGAAGGAGACAACAAA*GCTTGGTAATTTCGTCGAACATGTGGTGGGCA
GATCTGAAAGCGGCTCTTGG*CAACGAATCAACGTGGAGGGCATCGTCTCTTCCGTCTCC
GTGATCGTGAAAGATCGTCACTTGGTTCTTCCCCATGTTTCCGTCAGAGATTTACGCTAC
ATTGACTGGGGAGAGCTGAAGAGAAAGGGGTTCAAGGGTGTAGTCTTCGATAAAGATAAT
ACTCTCACTGCTCCTTACTCTCTAGCGATCTGGCCACCCCTCAGGCCTTCTATTGAGCAG
TGTAAAGCCGTGTTCGGTCATGACATCGCCGTGTTTAGCAACTCCGCTGGGCTTACGGAG
TATGATCACGATGATTCGAAAGCTAAAGCATTGGAGGCTGAAACAGGGATTAGAGTGTTG
AGACATAAGACAAAGAAGCCTGCGGGAACTGCTGAAGAAGTTGAGAAACACTTTGGTTGC
GCTTCTTCAGAGCTAATCATGGTGGGTGATCGACCTTTCACGGATATTGTTTACGGGAAC
AGAAACGGGTTTCTAACTGTGTTAACTGAACCGTTGAGTCGAGCTGAGGAGCCTTTCATT
GTTAGACAGGTGAGGAGATTAGAGTTGGCCTTGTTGAAACGTTGGTTGAGAAAAGGTTTG
AAGCCTGTGGATCACATTTTGGTATCAGATGTAACACCATTTGTAAAGGATCCTTCAGAT
TTATAAGAAGGGTTCTCATTTTGCTCAAGCAACAACTCTGTTCCTTGTTTTCTTTTTGGT
GTAATGGCCATTTTGACTTTTGGCTAAATGAGTAATGGTAATTCAAAGTTTGGGTTTCG

QA 1 839 1 839
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TATCCTCCGCATCAATTTTTCTAGGGTTTCTTTGTTCCCCAAATCCCTATCCGAACTTCC
TCTCGTCTTTCTCTTCTCTTTTGAGTTACTCCATGGACGGGAGCTAGCTCAAGAGATACT
CCGCAGTCCGCACCATCCTCCAATATCCTTTGCTAACCGGTCCAACACATCTGAATCCAG
AACCGTAACAATACAAATCGACTCATCTCTCAAACTCTCATTCACCCTGGGCAATATGAC
ACTATTTCAAGACATTGCCTCAGCTGTTCTACGATTCCACAACAATTCGATGACAGAAGA
CGAACTTCAGAGTTACGTACACTCTCTGGATGATTCCATCAAACTGAAGATCCGTGGTGC
CAGCTTTACCGAGTTTCTTTCCTCTTGGAGAGAAAAAAATCCACACACTGTTCCCGAACC
TTTCAAACAAGAAGCCGATGACGATTCATGTTGGGCTATTGCGTTGTACAGGGGTCAAAA
TGCTTTGCTTACTATAAACCAATCTGGTTTAAAGCTCCTCACTCTCAAAATTCTCC


BQ
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AF RS1EY82TF U 76
AF RS1B528TF U 1
BS 1 264 RS1B528TF
BS 265 265 RS1EY82TF
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RD RS1EY82TF 291 0 0
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CTCTTTTGAGTTACTCCATGGACGGGAGCTAGCTCAAGAGATACTCCGCAGTCCGCACCA
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AATCGACTCATCTCTCAAACTCTCATTCACCCTGGGCAATATGACACTATTTCAAGACAT
TGCCTCAGCTGTTCTACGATTCCACAACAATTCGATGACAGAAGACGAACT

QA 1 291 1 291
DS 

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TATCCTCCGCATCAATTTTTCTAGGGTTTCTTTGTTCCCCAAATCCCTATCCGAACTTCC
TCTCGTCTTTCTCTTCTCTTTTGAGTTACTCCATGGACGGGAGCTAGCTCAAGAGATACT
CCGCAGTCCGCACCATCCTCCAATATCCTTTGCTAACCGGTCCAACACATCTGAATCCAG
AACCGTAACAATACAAATCGACTCTTCTCTCAAACTCTCATTCACCCTGGGCAATATGAC
ACTATTTCAAGACATTGCCTCAGCTGTTCTACGATTCCACAACAATTCGATGACAGAAGA
CGAACTTCAGAGTTACGTACACTCTCTGGATGATTCCATCAAACTGAAGATCCGTGGTGC
CAGCTTTACCGAGTTTCTTTCCTCTTGGAGAGAAAAAAATCCACACACTGTTCCCGAACC
TTTCAAACAAGAAGCCGATGACGATTCATGTTGGGCTATTGCGTTGTACAGGGGTCAAAA
TGCTTTGCTTACTATAAACCAATCTGGTTTAAAGCTCCTCACTCTCAAAATTCTCC

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 2

CO CL5333Contig1 270 2 1 U
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TTACTTGTCACATCGCCTACTAGTTTGTTTTCTTCATTTTTATTAGGGTTTTTTTCTTTA
GTGGTTTTCTTCTTGTTTTGGTTCGTTTTTAGTTCATGCAATATTGTTTTCGTCCTCTTT
CGTTATATGAATAAATATGGCTTTCTTTCT


BQ
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AF RS1AM01JQ C 1
AF RS1AM01TF U 1
BS 1 270 RS1AM01TF

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TTACTTGTCACATCGCCTACTAGTTTGTTTTCTTCATTTTTATTAGGGTTTTTTTCTTTA
GTGGTTTTCTTCTTGTTTTGGTTCGTTTTTAGTTCATGCAATATTGTTTTCGTCCTCTTT
CGTTATATGAATAAATATGGCTTTCTTTCT

QA 1 270 1 270
DS 

RD RS1AM01TF 270 0 0
GCACTAGGAGGTTTCAAGTCAGTGACTATTGTTGCAATATTGTCGTCAACGTGAAAAATG
AATGCGAAGATGCCATTTGGGGATATTTCACCGATCCTTACTTTGTTGCTCTAGTTCGTT
TTACTTGTCACATCGCCTACTAGTTTGTTTTCTTCATTTTTATTAGGGTTTTTTTCTTTA
GTGGTTTTCTTCTTGTTTTGGTTCGTTTTTAGTTCATGCAATATTGTTTTCGTCCTCTTT
CGTTATATGAATAAATATGGCTTTCTTTCT

QA 1 270 1 270
DS 



AS 1 2

CO CL5334Contig1 1108 2 2 U
GGATATATTAAACGCAAACCTCATCTTGAGACAAAACGTCGAACGGATGGCTTCAGCATC
AGGGGAGACGTCAGTGATGTGAGGGATGCTGAATCTTTCCTCGAACTCTCTCTCGTACTT
TGTTTTCCAATCCGGATCGCTGAGATCGATCGAAGAAGCCGAGCTTCTGCTGTGTTCAAC
CGCCGAAGCTCGAGTGAAAGAGCTGCGAGAAGAGATCAGCGCCGGAGATCTCGGTTTCCG
GAGGAGGAGTAACGAGCTGAGACCGTGAGACCTGACGAGAGCGGAGCTGTTGTTACTGTG
AGGAATCGAGACGGTGGAGGTGATCGCCTGAGAAAGAGTTTCCATGGCGGCGGCGAAGAA
ACTGAGGTAACCGTACCGATCGGATCTTTGTTTTTTTCTTTTGTCTTCAGTCAACTAATG
AGTGGAGAGGGAGTTTTTGACTAAAAACCCTTTGAGACTAACGAAGAAGTACAAAACAGA
CGGATCTTAAGATTCTCTTCCCTAATAACTTTTGTCTGCGACCCTTTTTTTTTTTTTTTT
TTCTCTTTTTTCAAGTAAAATTGTAAAATCTCCATTATTGTAAGGTGTTCTTGTTTTCCA
CTAAATTTTTTTTATTTTGTGAAAAAGTCCATTTATATTCTTCCTGTTTTATGATATTAG
ATTATTCTTAGCTAGAAGTGTGGAGATTTTAAAGTTTTATTTGCTTTCAAAAACATTAAC
AGAAAAATAAATTAAATAAAATTCATTCAGTGGTAGAAAATTGGAATGTATTTGGTTAAA
ATGTATTAAGTGAACTACGTGTGGTCGGGTGGTGTACGGTGTCGTAAGTATTTTTAAAAG
ATCTGGATTCGAATCCACTCTATTCAGATTTACCCATCTATATGGTCAGGCGATAGGAGT
TTTAATTTCCCTTGCGAGAAATTGGATCTGACTGGCGCCGGTGATCAAGCTTTCAGGAAA
TTAGTCGGTTGGGACATGGTCCGTCGGACACCCCTAAATTATCAAAAAAAAATGTATCTA
ACTGATGTAATTTTTTTACTGTTTTTGTACCAACAATGTTTTGTCAATGTTTATTTTAGT
TTATTATTTAATTAACGTAGAGTTAGAC


BQ
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AF RS1AC11JQ C 552
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AGGAATCGAGACGGTGGAGGTGATCGCCTGAGAAAGAGTTTCCATGGCGGCGGCGAAGAA
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AGTGGAGAGGGAGTTTTTGACTAAAAACCCTTTGAGACTAACGAAGAAGTACAAAACAGA
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TTCTCTTTTTTCAAGTAAAATTGTAAAATCTCCATTATTGTAAGGTGTTCTTGTTTTCCA
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DS 

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GAACTACGTGTGGTCGGGTGGTGTACGGTGTCGTAAGTATTTTTAAAAGATCTGGATTCG
AATCCACTCTATTCAGATTTACCCATCTATATGGTCAGGCGATAGGAGTTTTAATTTCCC
TTGCGAGAAATTGGATCTGACTGGCGCCGGTGATCAAGCTTTCAGGAAATTAGTCGGTTG
GGACATGGTCCGTCGGACACCCCTAAATTATCAAAAAAAAATGTATCTAACTGATGTAAT
TTTTTTACTGTTTTTGTACCAACAATGTTTTGTCAATGTTTATTTTAGTTTATTATTTAA
TTAACGTAGAGTTAGAC

QA 1 557 1 557
DS 



AS 1 2

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CTCTCTGTCTCTTCTGAGATCTTTTAATCGCTCTCTGCTGTCTTGTATATGATTTTTCAA
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CGACAAGATGAAAAACCTCTATTGCTAAAAGTGAAGTTTTTTTTTGTTTTGTCTGAAAAT
TTTGATCCGCCTGCTAATTTAAAAGTCTTTTCTTTTGCTATCTGGGTTTCCCTAAAGGTT
TCACCTTTCTTATTTTTCACCTGCGCCAATTGCACTTGGCAATCGTCAAGGCTGCTGATT
TTTGGTCCGATTGATTTTATTTGCTTAGGGTTTGATTGGATCGCAACCCTAATCTGATTT
GGGGGGAATTGGGTTTCTCCACATTGAATAAAGAGGCCAACTTGTTGGCGGCTGCTGACA
AAAGGTTAACGAGGAATCTCCCTCGCGGTTCCACGGTGGTCACTTTCGAGTTAGGATTTG
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TGGATCATAGTCTCTGATCTGGTCAGGTGCTGGGATAAAGGATCGAGAAAGTAAAGAAAA
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GACTTTCTTTTTCAGAATTTATCTTATAAATGTAACTAAATGCTATATTGAGAATCTTGA
ATTGAATGTTGAAAGACTTGAACAACCC


BQ
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CGACAAGATGAAAAACCTCTATTGCTAAAAGTGAAGTTTTTTTTTGTTTTGTCTGAAAAT
TTTGATCCGCCTGCTAATTTAAAAGTCTTTTCTTTTGCTATCTGGGTTTCCCTAAAGGTT
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TTTGGTCCGATTGATTTTATTTGCTTAGGGTTTGATTGGATCGCAACCCTAATCTGATTT
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TGGATCATAGTCTCTGA

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DS 

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AAAGAAAAAAAGTGGTTGAAAGTATAACCACTTTACGGAACACTTGAGGGAGAAGTGTCA
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CGGACTCTTTGATAAAGGTTACCCTCATAGGATCTACTCTCCTTTGAATTCGTGGTCTTT
TCTGGTGTTTCTAAGTTCGTATGTTGTGATTTTGTTGGAGAGTGACTAGTGTACTTAGGT
TAAAATAGGTACTTAGAAACTGATGAAGGAAACTTACCACGAGACTGTGAGTCTAATGAA
TATTTTAAGCTAATGGCGGAGGGTGGTGAAAGGCCAGAGTTCATGAGATTCTTTTGTGTT
GTCTCCTAGACTTTCTTTTTCAGAATTTATCTTATAAATGTAACTAAATGCTATATTGAG
AATCTTGAATTGAATGTTGAAAGACTTGAACAACCC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL5336Contig1 775 2 4 U
CAACAAAAGATTCCATCATTTAACTTTTCTTCTGTTAAGACAGAAAACTAGTCTAAAAAC
ATCTGATAATGGCTGCTAGGAGTTTTAAGTTGTTCATAAAGTAAAAAAAAAAAACAGATA
AAGAAAAAATGCAACACTACAAAAAGAAAAAAAACTTGTCATGGTCTATTCATCATCTTG
TGACTTAGTTTTCTTCTTCTTTTTCTTCTTGCTGTGACCATTATCTGTTGTCGTTTCCTC
TTCAACTACTTTGCTTTTCTTCTTTTTCTTTGATTTCACCTCTTCTTCTACTTCCTCCTC
ATCCTTCTCCTCTGCCTTTCTCTTCTCTTTCTTCTTTTTCTTCTCAAAGGCCTCCACCAC
TTTCTCTTCTCCCTCATCTTTCTTGTCAAGATTCTCCATCACTTCTTTCATTACATCCAC
ATTCTTACGTGGGGCAACACCTTTGTCATAAAATTCTAGTCGTTCCTCTACTTGTTCCCT
AAGTTTCTCACCAAAAGCCGTAGTGCTGCTATCAGCGAAACAATCAATCCGGGAAGCAAT
GGAACACTTGTTTGCCAGGTAACGAGCAATACGTCCCTTGTTTTTAGCAGCCGCGCGTCC
AATGAACGAAGAATGGAATATAAGACCGTACTTGGGCGTGTTCCCACGCGTTTTAAGCGC
CCTGAAAAGTGCCTTCTCAGCACCAAGAATCTGGAGAGTTGAAGAGGGGCACTTGGCGAG
ATTCGTCAGGCTCCCAGCATGTGAGATCAGCCTTGCACCAACCATATCTCCGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BD79TF C 1
AF RS1BB18JQ U 13
BS 1 12 RS1BD79TF
BS 13 113 RS1BB18JQ
BS 114 114 RS1BD79TF
BS 115 775 RS1BB18JQ

RD RS1BD79TF 425 0 0
CAACAAAAGATTCCATCATTTAACTTTTCTTCTGTTAAGACAGAAAACTAGTCTAAAAAC
ATCTGATAATGGCTGCTAGGAGTTTTAAGTTGTTCATAAAGTAAAAAAAAAAAACAGATA
AAGAAAAAATGCAACACTACAAAAAGAAAAAAA*CTTGTCATGGTCTATTCATCATCTTG
TGACTTAGTTTTCTTCTTCTTTTTCTTCTTGCTGTGACCATTATCTGTTGTCGTTTCCTC
TTCAACTACTTTGCTTTTCTTCTTTTTCTTTGATTTCACCTCTTCTTCTACTTCCTCCTC
ATCCTTCTCCTCTGCCTTTCTCTTCTCTTTCTTCTTTTTCTTCTCAGAGGCCTCCACCAC
TTTCTCTTCTCCCTCATCTTTCT*GTCAAGATTCTCCATCACTTCTTTCATTACATCCAC
ATTC
C

QA 1 424 1 424
DS 

RD RS1BB18JQ 763 0 0
CCATCATTTAACTTTTCTTCTGTTAAGACAGAAAACTAGTCTAAAAACATCTGATAATGG
CTGCTAGGAGTTTTAAGTTGTTCATAAAGTAAAAAAAAAAA*CAGATAAAGAAAAAATGC
AACACTACAAAAAGAAAAAAAACTTGTCATGGTCTATTCATCATCTTGTGACTTAGTTTT
CTTCTTCTTTTTCTTCTTGCTGTGACCATTATCTGTTGTCGTTTCCTCTTCAACTACTTT
GCTTTTCTTCTTTTTCTTTGATTTCACCTCTTCTTCTACTTCCTCCTCATCCTTCTCCTC
TGCCTTTCTCTTCTCTTTCTTCTTTTTCTTCTCAAAGGCCTCCACCACTTTCTCTTCTCC
CTCATCTTTCTTGTCAAGATTCTCCATCACTTCTTTCATTACATCCACATTCTTACGTGG
GGCAACACCTTTGTCATAAAATTCTAGTCGTTCCTCTACTTGTTCCCTAAGTTTCTCACC
AAAAGCCGTAGTGCTGCTATCAGCGAAACAATCAATCCGGGAAGCAATGGAACACTTGTT
TGCCAGGTAACGAGCAATACGTCCCTTGTTTTTAGCAGCCGCGCGTCCAATGAACGAAGA
ATGGAATATAAGACCGTACTTGGGCGTGTTCCCACGCGTTTTAAGCGCCCTGAAAAGTGC
CTTCTCAGCACCAAGAATCTGGAGAGTTGAAGAGGGGCACTTGGCGAGATTCGTCAGGCT
CCCAGCATGTGAGATCAGCCTTGCACCAACCATATCTCCGATC

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

CO CL5337Contig1 807 2 3 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGATTAAGAAA
AAACAAAAAAAAAACTACAAAAATATAAATTTTTCTTTTTAATTTTAATAAAACAAAAAA
ATAAAACAAAAATAAAACAATGAGATGCACAAACGTGTCCATATTATTAGCCTTGGTGAT
GGTGTTTGTCACGCAGATGGTGTTGGCAGATGATGTAACACCAATTTCAGAGGCCAAAGT
TCAAGTGGAGCAGTGGTTCAAGACCAACGTAGCTCCTTTGCCTTCGCGTAAAGGTCTAGA
TCCTGCTCTCGTAGCTGTTGAGGCTGAGCCACGTACCATCACCGTGGATCCAAAGGGAGG
TGAATTCAAAACACTAACGGACGCAATAAAGAGCGTTCCTGCAGCGAACACAAAGCGTGT
GATCATCAAGATAGCCCATGGGCTGTCAACATCGTCGTTAAGAGTACAGCGCCGGCACCG
GATGGTAAAGCGAAGGGAGCACAAGCTTTATCTATGAGAATCTCTGGAAACAAGGCTGCT
TTCTACAACTGTAAATTCTACGGATTCCAAGACACAATTTGTGACGATACCGGAAACCAT
TTCTTCAAGGATTGTTACGTCGAAGGGACATTCGATTTCATCTTCGGAAGCGGGACCTCT
CTTTACTTGGGTACACAATTGCACGTGGTGGGAGATGGCATTAGAGTGATAACAGCGCAT
GCGGGAAAGACCGCAGACGAGAAGACCGGGATACTCTTTCGTGCATTGCAAGGTGACTGG
AGTTGGTCAAGGAATCTATTTGGGTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A167TF U 365
AF RS1A167TV U 1
BS 1 441 RS1A167TV
BS 442 442 RS1A167TF
BS 443 807 RS1A167TV

RD RS1A167TF 403 0 0
TTCAAAACACTAACGGACGCAATAAAGAGCGTTCCTGCAGCGAACACAAAGCGTGTGATC
ATCAAGATAGCCCATGGGCTGTCAACATCGTCGTTAAGAGTACAGCGCCGGCACCGGATG
GTAAAGCGAAGGGAGCACAAGCTTTATCTATGAGAATCTCTGGAAACAAGGCTGCTTTCT
ACAACTGTAAATTCTACGGATTCCAAGACACAATTTGTGACGATACCGGAAACCATTTCT
TCAAGGATTGTTACGTCGAAGGGACATTCGATTTCATCTTCGGAAGCGGGACCTCTCTTT
ACTTGGGTACACAATTGCACGTGGTGGGAGATGGCATTAGAGTGATAACAGCGCATGCGG
GAAAGACCGCAGACGAGAAGACCGG*ATACTCTTTCGTGCATT

QA 1 403 1 403
DS 

RD RS1A167TV 807 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGATTAAGAAA
AAACAAAAAAAAAACTACAAAAATATAAATTTTTCTTTTTAATTTTAATAAAACAAAAAA
ATAAAACAAAAATAAAACAATGAGATGCACAAACGTGTCCATATTATTAGCCTTGGTGAT
GGTGTTTGTCACGCAGATGGTGTTGGCAGATGATGTAACACCAATTTCAGAGGCCAAAGT
TCAAGTGGAGCAGTGGTTCAAGACCAACGTAGCTCCTTTGCCTTCGCGTAAAGGTCTAGA
TCCTGCTCTCGTAGCTGTTGAGGCTGAGCCACGTACCATCACCGTGGATCCAAAGGGAGG
TGAATTCAAAACACTAACGGACGCAATAAAGAGCGTTCCTGCAGCGAACACAAAGCGTGT
GATCATCAAGATAGCCCATGG*CTGTCAACATCGTCGTTAAGAGTACAGCGCCGGCACCG
GATGGTAAAGCGAAGGGAGCACAAGCTTTATCTATGAGAATCTCTGGAAACAAGGCTGCT
TTCTACAACTGTAAATTCTACGGATTCCAAGACACAATTTGTGACGATACCGGAAACCAT
TTCTTCAAGGATTGTTACGTCGAAGGGACATTCGATTTCATCTTCGGAAGCGGGACCTCT
CTTTACTTGGGTACACAATTGCACGTGGTGGGAGATGGCATTAGAGTGATAACAGCGCAT
GCGGGAAAGACCGCAGACGAGAAGACCGGGATACTCTTTCGTGCATTGCAAGGTGACTGG
AGTTGGTCAAGGAATCTATTTGGGTAG

QA 1 807 1 807
DS 



AS 1 2

CO CL5338Contig1 724 2 4 U
GGGTCATCTTTGTGGTGAGAGAAAACTAGGCAACAATGGCGGAACCTCCGGTGAAAGTCA
ACCTGATCCCGACCGAAGGTACACCTGAAAGCTTCGCGGATTATGGCCAAGTCATCGAAG
CCACTTCCGACGGTGATCGCTTCGGTCCTAACGATGCTCAGTTAGATCTCTCCAGAGGAA
TCCCACGATTCTATATCATGCGGCTCCGAGATCGATCCTTGGGCTTCTCCACGATCACGC
ACCACGCGAACGTGACGCAGTGTCTGGGATCAATAGGAGGTCACGTTTGGTATCTAGGAG
TAGCGAAGCCATCTCTCATCGAAGATGTTGCTGAGAGAGAAAGAGTTGGAGATAATAATG
TAGAGTCAGGATCCGGTGGTCACTTGTACGCTCCTCCTACGGTTGAAGAAGTGCGCGTCT
TCAGGTTTTCAGGACCCAAGTTTGTTAAACTGAACCGTGGCACGTGGCATGCTGGACCGT
TGTTCAGTGAGAGTTCCATGGACTTCTACAACTTAGAGCTCAGCAACACAAATGAGGTGG
ATCACACCACACATGATTTCAAGAAGAAGAATGGGGTCACCTTCCGGTTTGAGGATAGCG
CATCTTCCTAAGTCAAAATCCTATATTGGTGGGTGATCAGTGTGGTTCTGTTTTCATGTC
TTGTAAGCAAAACAGAGTGAGAAACGTTTTCTTGTATCATAATGTTCCAAGACTGTCTGT
GTGT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RS1E469TF U 1
AF RS1CF68TF U 5
BS 1 259 RS1E469TF
BS 260 260 RS1CF68TF
BS 261 276 RS1E469TF
BS 277 724 RS1CF68TF

RD RS1E469TF 276 0 0
GGGTCATCTTTGTGGTGAGAGAAAACTAGGCAACAATGGCGGAACCTCCGGTGAAAGTCA
ACCTGATCCCGACCGAAGGTACACCTGAAAGCTTCGCGGATTATGGCCAAGTCATCGAAG
CCACTTCCGACGGTGATCGCTTCGGTCCTAACGATGCTCAGTTAGATCTCTCCAGAGGAA
TCCCACGATTCTATATCATGCGGCTCCGAGATCGATCCTTGGGCTTCTCCACGATCACGC
ACCACGCGAACGTGACGCA*TGTCTGGGATCAATAG

QA 1 276 1 276
DS 

RD RS1CF68TF 720 0 0
G
ATCTTTGTGGTGAGAGAAAACTAGGCAACAATGGCGGAACCTCCGGTGAAAGTCAACCTG
ATCCCGACCGAAGGTACACCTGAAAGCTTCGCGGATTATGGCCAAGTCATCGAAGCCACT
TCCGACGGTGATCGCTTCGGTCCTAACGATGCTCAGTTAGATCTCTCCAGAGGAATCCCA
CGATTCTATATCATGCGGCTCCGAGATCGATCCTTGGGCTTCTCCACGATCACGCACCAC
GCGAACGTGACGCAGTGTCTGGGATCAATAGGAGGTCACGTTTGGTATCTAGGAGTAGCG
AAGCCATCTCTCATCGAAGATGTTGCTGAGAGAGAAAGAGTTGGAGATAATAATGTAGAG
TCAGGATCCGGTGGTCACTTGTACGCTCCTCCTACGGTTGAAGAAGTGCGCGTCTTCAGG
TTTTCAGGACCCAAGTTTGTTAAACTGAACCGTGGCACGTGGCATGCTGGACCGTTGTTC
AGTGAGAGTTCCATGGACTTCTACAACTTAGAGCTCAGCAACACAAATGAGGTGGATCAC
ACCACACATGATTTCAAGAAGAAGAATGGGGTCACCTTCCGGTTTGAGGATAGCGCATCT
TCCTAAGTCAAAATCCTATATTGGTGGGTGATCAGTGTGGTTCTGTTTTCATGTCTTGTA
AGCAAAACAGAGTGAGAAACGTTTTCTTGTATCATAATGTTCCAAGACTGTCTGTGTGT

QA 2 720 2 720
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGGCCTCTGGACCCTGACCATCTTCCTCAAAACACGATTCGATTAAACTTCGTCTTGATC
TCTGCCTTGTTTTTTCTCCGTGCATTCCCTGATGTTTGTTCCGAGAATTCTCTCGCGAGT
TTCCCGCAGCGCGGGCTTACGCTCCTCTCTCTCCGCCGCCGCTCTTCCGGCGAGGAACGG
GGCTCCTATATTCTCGAGCCGGTATCACTCCATCGTTAACGAATTTTCACAAAAGATTGC
TGCAGCTCAGGTGCTGCCTCTTGGTTCGTTTCCACTCCAAAGGTTCTCTTTTTCTTCTTC
CTCCACCACGCCTGAATCAAATGAAAAGGAGAGCAACCCTGAGGCCTCGAAGACATCTGG
GGAGAAAGCTACAGCTGAGGCAAACGAGTCAGGCCCTGACTCAGAACCCTCCAAAGTTTC
GTGAAGGAGGAGAAGTGATAAACGAGCTGCAGTTCCTGATTCAGATTCCGGGAGTGATGA
TGATGATGATGAGGAGTTGTTGTCCGTGGATGATTTGAGGAAGCTCGTTGCTGAGAAGGA
AGAGCTGCTTTCTGAAAAGGAGGAAGAGATTAAGCAAATGAAAGACAAAGTTCTTCGCAC
TTACGCAGAGATGGAGAATGTTATGGACAGAACAAGACGTGATGCTGAAAACACCAAGAA
GTATGCCATACAGAATTTTGCAAAGAGCCTTTTGGATGTGGCGGATAATCTTGGAAGAGC
TTCTTCCGTTGTCAAGGAAAGCTTCTCAAAGCTTGACACTACGGAAGATTCGGCTGGAGC
TACTCCGCTCTTAAAGACCCTTTTAGAAGGTGTGGAGATGACTGAGAAACAGCTTGCTGA
GGTGTTTAAGAAATTTGGTATGGAGAAGTACGATCCTATCAACGAGCCGTTTGATCCAAA
CAGACATAACGCAGTGTTTCAAGTCCCGGATGCTTTTAAGCCAGAAGGCACAATTGCTCA
TGTCCTGAAGTCTGGTTACACGTTGTTTGATCGAGTTATAAGACCGGCTGAGGTTGGTGT
TACTCAAGGAGGAGAGGCTGAAGAAGACAAGAAAGAGTCTGATGCTTAACAAGGAGTCAG
CCGGTTTTTTCATAAGTTTTGCTGCTGTTCTTTGTTTCGAGCAACTCAATTAACAGAAGT
CATAGTTTTCTCGTCGTTTGGTTATTCATTGGATGAACAGGATCTTCCCATTAGTTGCTG
GACATGGCAGCTTGCCTTTGTACC


BQ
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AF RS1BO94TF U 1
AF RS1BO94JQ C 437
BS 1 650 RS1BO94TF
BS 651 651 RS1BO94JQ
BS 652 715 RS1BO94TF
BS 716 1224 RS1BO94JQ

RD RS1BO94TF 717 0 0
GGGCCTCTGGACCCTGACCATCTTCCTCAAAACACGATTCGATTAAACTTCGTCTTGATC
TCTGCCTTGTTTTTTCTCCGTGCATTCCCTGATGTTTGTTCCGAGAATTCTCTCGCGAGT
TTCCCGCAGCGCGGGCTTACGCTCCTCTCTCTCCGCCGCCGCTCTTCCGGCGAGGAACGG
GGCTCCTATATTCTCGAGCCGGTATCACTCCATCGTTAACGAATTTTCACAAAAGATTGC
TGCAGCTCAGGTGCTGCCTCTTGGTTCGTTTCCACTCCAAAGGTTCTCTTTTTCTTCTTC
CTCCACCACGCCTGAATCAAATGAAAAGGAGAGCAACCCTGAGGCCTCGAAGACATCTGG
GGAGAAAGCTACAGCTGAGGCAAACGAGTCAGGCCCTGACTCAGAACCCTCCAAAGTTTC
GTGAAGGAGGAGAAGTGATAAACGAGCTGCAGTTCCTGATTCAGATTCCGGGAGTGATGA
TGATGATGATGAGGAGTTGTTGTCCGTGGATGATTTGAGGAAGCTCGTTGCTGAGAAGGA
AGAGCTGCTTTCTGAAAAGGAGGAAGAGATTAAGCAAATGAAAGACAAAGTTCTTCGCAC
TTACGCAGAGATGGAGAATGTTATGGACAGAACAAGACGTGATGCTGAAA*CACCAAGAA
GTATGCCATACAGAATTTTGCAAAGAGCCTTTTGGATGTGGCGGATAATCTTGGA
GA

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1BO94JQ 788 0 0
GATAAACGAGCTGCAGTTC*TGATTCAGATTCCGGGAGTGATGATGATGATGATGAGGAG
TTGTTGTCCGTGGATGATTTGAGGAAGCTCGTTGCTGAGAAGGAAGAGCTGCTTTCTGAA
AAGGAGGAAGAGATTAAGCAAATGAAAGACAAAGTTCTTCGCACTTACGCAGAGATGGAG
AATGTTATGGACAGAACAAGACGTGATGCTGAAAACACCAAGAAGTATGCCATACAGAAT
TTTGCAAAGAGCCTTTTGGATGTGGCGGATAATCTTGGAAGAGCTTCTTCCGTTGTCAAG
GAAAGCTTCTCAAAGCTTGACACTACGGAAGATTCGGCTGGAGCTACTCCGCTCTTAAAG
ACCCTTTTAGAAGGTGTGGAGATGACTGAGAAACAGCTTGCTGAGGTGTTTAAGAAATTT
GGTATGGAGAAGTACGATCCTATCAACGAGCCGTTTGATCCAAACAGACATAACGCAGTG
TTTCAAGTCCCGGATGCTTTTAAGCCAGAAGGCACAATTGCTCATGTCCTGAAGTCTGGT
TACACGTTGTTTGATCGAGTTATAAGACCGGCTGAGGTTGGTGTTACTCAAGGAGGAGAG
GCTGAAGAAGACAAGAAAGAGTCTGATGCTTAACAAGGAGTCAGCCGGTTTTTTCATAAG
TTTTGCTGCTGTTCTTTGTTTCGAGCAACTCAATTAACAGAAGTCATAGTTTTCTCGTCG
TTTGGTTATTCATTGGATGAACAGGATCTTCCCATTAGTTGCTGGACATGGCAGCTTGCC
TTTGTACC

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 2

CO CL5341Contig1 727 2 5 U
GCACCAAAATGAAAATAACAACAAGAGCTCTGATAGTTTTCAAAAGGTGGATGCTGTCAC
TGGCTCAAAGCCCTCTTACTATGCCCAAGATTCTGCGAAAAAGATTTTCCAGCGGCCTGT
GAAGCGACAGCGTTTTTCTAGTGGTTCATCTACTGCCAATGATAATGATTCATCTAGTGA
TAGTGAGAAGGATCTCACGCCTTACTATTCCAGCGCAATGTCGCTTGCTAGTTCTGCCGA
CGAAAAGAAGCGGCGTGATAGCCGTTCCAAGCGTTTTGAGAAAGTTCAAGGGCACAGCCG
AGGGAATGATATTCCTAAACCTAAAATTTCAAATTTTAGAAGGGGCACTGCACTGAGACT
TGGCCAAGATCTTGATGAAAGTGGCAGCAGAGCTGTGGAAGACATGGACTGGGATGCACT
GACCGTTAAAGGAACTTGCCAGGAAATTGAGAAACGTTATCTCCGTCTTACTTCCGCACC
TGAACCTTCAACCGTAAGACCAGAGGATGTGCTGGAGAAAGCTCTGTTAATGGTCCAGGA
TTCTCCAAAGAATTATCTTTATAAATGTGATCAGCCAAAATCTATTCGCCAAGACCTCAC
GGTACAGCGGATACACAATCATCTAACAGCGAAGGTTTATGAAACACATGCTAGATTTGC
TTTGGAAGCTGGGGATTTAACTGAGTATAATCAGTGCCTGTCACAGTTGAAATCCTTTAT
GCCGAAG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E794TF U 180
AF RS1EK86TF U 1
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G
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TGGCCAAGATCTTGATGAAAGTGGCAGCAGAGCTGTGGAAGACATGGACTGGGATGCACT
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QA 2 280 2 280
DS 

RD RS1EK86TF 727 0 0
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TGGCTCAAAGCCCTCTTACTATGCCCAAGATTCTGCGAAAAAGATTTTCCAGCGGCCTGT
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CGAAAAGAAGCGGCGTGATAGCCGTTCCAAGCGTTTTGAGAAAGTTCAAGGGCACAGCCG
AGGGAATGATATTCCTAAACCTAAAATTTCAAATTTTAGAAGGGGCACTGCACTGAGACT
TGGCCAAGATCTTGATGAAAGTGGCAGCAGAGCTGTG*AAGACATGGACTGGGATGCACT
GACCGTTAAAGGAACTTGCCAGGAAATTGAGAAATGTTATCTCCGTCTTACTTCCGCACC
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TTTGGAAGCTGGGGATTTAACTGAGTATAATCAGTGCCTGTCACAGTTGAAATCCTTTAT
GCCGAAG

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

CO CL5342Contig1 1332 2 4 U
GGGGAAAATTTTATTTCTTCCGTTTCATGATTACGCCGTCCGATAATCTCTCAATCGCCG
ATAAAACTCATCATCATCACTCAGTAGCGATCTTGAAACCAGTCTTCTTGCTCCCTCTTC
GCGCTCAAGATTCCTCTGCGTTTTATATAATATCTAGTTCTCGAGATCGTTGATTCGGAA
CTTCTGATTCGATCAATCTGAATCCTCCTCCTTCTCGACGGATGGAGAGATTGTGAGGTG
AGATCAAAAGGAGAGAGAGATGGATGATAGAGAAGGCTCGTTCGTAGCCGTCAGGCGTAT
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TACGAATTCCACCTTTGATCTTACACCTGCTCAGGAGGAATGCTTGCAGAGTTTGCAGAG
CCGTATTGATGTAGCTTATGACAGTACCATACCTCTGCATCAGGAAGCGCTGAGGGATCT
GTGGAAACTTGCCTTTCCTGAAGAAGAGCTTCATGGATTGATATCTGAGTAGTGGAAAGA
GATGGGTTGGCAGGGCAAAGATCCGTCTACTGATTTTAGGGGTGGTGGTTTCATATCGCT
TGAAAACCTGCTGTTCTTCGCCAGAAACTTTCAGAAATCCTTCCAGGACCTTTTGAGGAA
GCAGGTTGGGGATAGGTCCGTATGGGAATACCCTTTTGCTGTTGCTGGTATCAACCTAAC
ATTCATGCTCATTCAGATGCTTGACCTTGAAGCAGTAAAACCACGAACAGTTGTTGGGGC
AACTTTTTTGAAGTTCCTCTTTGAGAACGAGTCTGCCTTTGACCTTCTGTATTGCATTGC
ATTCAAGCTAATGGATCAGCAATGGCTTTCAATGCGTGCCTCATACATGGAGTTTAACAC
GGTGATGAAATCAACAAGGAGACAGCTGGAGAGGGAGCTGATGCTGGAAGACATAATGCA
TCTTGAAGACTTGCCCTCCTATGCCCTTCTCTCTCAATAGCCTTTTAAGAGTCTCTAACC
TCAACACTCCCGCTTTAATAACACAAAAGGTTGCTCGCTTGTGCCTCTTCTTTGACATTT
TCTTTTACTGTTTGTTGGTTGCCTATATGAAACAACTCTAAAACTGAGTTGTTGTTGTTA
TATTAAAACAAGGAAGAGGGAGATAGAGAAGGAGGGTTGGGATAAAACTCAATTTGGTTG
TGGGGTTGGAATGGAGTGAGTTTGTAACAACGTTAAGGTTTTTTAGTAACTGAGTGTTGA
TTGATCTTTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EI49TF U 1
AF RS1EI49JQ C 517
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GGGGAAAATTTTATTTCTTCCGTTTCATGATTACGCCGTCCGATAATCTCTCAATCGCCG
ATAAAACTCATCATCATCACTCAGTAGCGATCTTGAAACCAGTCTTCTTGCTCCCTCTTC
GCGCTCAAGATTCCTCTGCGTTTTATATAATATCTAGTTCTCGAGATCGTTGATTCGGAA
CTTCTGATTCGATCAATCTGAATCCTCCTCCTTCTCGACGGATGGAGAGATTGTGAGGTG
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TTCTCAGGGTCTCGAACGTGGAAGCGTTTACAATTCGTCTTCTGGTGAGGGTGTGCCTGG
ATCAGCAGCTTGGTTAGGCCGAGGTCTTTCCTGTGTTTGTGCTCAGCGAAGAGATAGTGA
TACGAATTCCACCTTTGATCTTACACCTGCTCAGGAGGAATGCTTGCAGAGTTTGCAGAG
CCGTATTGATGTAGCTTATGACAGTACCATACCTCTGCATCAGGAAGCGCTGAGGGATCT
GTGGAAACTTGTCTTTCCTGAAGAAGAGCTTCATGGATTGATATCTGAGTAGTGGAAAGA
GATGGGTTG

QA 1 609 1 609
DS 

RD RS1EI49JQ 816 0 0
GCATCAGGAAGCGCTGAGGGATCTGTGGAAACTTGCCTTTC*TGAAGAAGAGCTTCATGG
ATTGATATCTGAGTAGTGGAAAGAGATGGGTTGGCAGGGCAAAGATCCGTCTACTGATTT
TAGGGGTGGTGGTTTCATATCGCTTGAAAACCTGCTGTTCTTCGCCAGAAACTTTCAGAA
ATCCTTCCAGGACCTTTTGAGGAAGCAGGTTGGGGATAGGTCCGTATGGGAATACCCTTT
TGCTGTTGCTGGTATCAACCTAACATTCATGCTCATTCAGATGCTTGACCTTGAAGCAGT
AAAACCACGAACAGTTGTTGGGGCAACTTTTTTGAAGTTCCTCTTTGAGAACGAGTCTGC
CTTTGACCTTCTGTATTGCATTGCATTCAAGCTAATGGATCAGCAATGGCTTTCAATGCG
TGCCTCATACATGGAGTTTAACACGGTGATGAAATCAACAAGGAGACAGCTGGAGAGGGA
GCTGATGCTGGAAGACATAATGCATCTTGAAGACTTGCCCTCCTATGCCCTTCTCTCTCA
ATAGCCTTTTAAGAGTCTCTAACCTCAACACTCCCGCTTTAATAACACAAAAGGTTGCTC
GCTTGTGCCTCTTCTTTGACATTTTCTTTTACTGTTTGTTGGTTGCCTATATGAAACAAC
TCTAAAACTGAGTTGTTGTTGTTATATTAAAACAAGGAAGAGGGAGATAGAGAAGGAGGG
TTGGGATAAAACTCAATTTGGTTGTGGGGTTGGAATGGAGTGAGTTTGTAACAACGTTAA
GGTTTTTTAGTAACTGAGTGTTGATTGATCTTTGAG

QA 1 816 1 816
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

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TCAAGTAAAAAGTAAATTCCTTTTTTCGAATTCTTCTGCTTTTTCTCATGTCTGATTGTT
ATCTCAACTGGAATCTATTCTTTTCCAATTACTTATACTTTTGTCTCTTTCCTCATCTGA
TCAACGCTTAATCTATAGTCTTTGGATATAATATATTATCTATGTATGGTGGTGGTTATA
TAACTCTTCCTTGGAAACCCTTTTACTCTGTTTTTGTTTTCAGAAATCAAAATCTGTTTT
CTGCTTTCCAATCTGGGCACATAAAGTTTGCACCTTGGAAAAAAAAAAGGACAAAAGAGG
TCTTGTCTAATTGGTTGATGTGATTGGGTGTTTTCAAAGACCCAACATATGTTTTGATGA
GGGTTTTGCTGTGTAAGATCCAGTGCCCTTCTTTCCTCTGCTTCTGTAAGCCTTCTCCTC
ACATCTACACGGCATCAGGCTCGCTTAAATTGGAGGAGAACACGCCTCCTCAAGTGTCTA
CTACCACGGTTGTTGTTGATGACAACGATGATGATGATGATGATCATTATGTTGATGCAC
ATGCCGCAGAATGTGTTGATCATGCTACAGAGGAAAAGGAAGAAGCTTGTGCTGTAGAGG
AGAAACAAGAAGAAGAAGAGCAAGGCGAGATCTTGAAAAGCAGTCTCAAGAAGGCGGCTT
TGGATTCACCAAGGGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGTACAGTGGGTGGATTTGA
TGGGGAAAGAACTTGCTGAGATCCGTGAGTTCGAGTCTAGTGAAGAAGATGATATAAGAT
ATGATGTCGACCAAAGCTGTGTTTGCGTTATTCTGTGATCAACTCAGTTTAGTTTCTTCT
TTTACTCGGAGAGAAGACAATGGTGAGAGGTGAAGAAGCTTGCTGGAGATGGATCCATGT
TGGTCCTGTGGCCTTGGCTGTAGAGTCCATATACATTGAGGTAGTACATATAGTAGAATC
TACATTTGCTAGCCTGAGGTTATATCATGTTTCTATATATAACATGGCAGCATTTTGTTA
TGGTTGTTTTAGGATTGTGAAAAGAATTGATTTCTATTACAATTGTTTCTTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BI87TF U 1
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ATCTCAACTGGAATCTATTCTTTTCCAATTACTTATACTTTTGTCTCTTTCCTCATCTGA
TCAACGCTTAATCTATAGTCTTTGGATATAATATATTATCTATGTATGGTGGTGGTTATA
TAACTCTTCCTTGGAAACCCTTTTACTCTGTTTTTGTTTTCAGAAATCAAAATCTGTTTT
CTGCTTTCCAATCTGGGCACATAAAGTTTGCACCTTGGAAAAAAAAAAGGACAAAAGAGG
TCTTGTCTAATTGGTTGATGTGATTGGGTGTTTTCAAAGACCCAACATATGTTTTGATGA
GGGTTTTGCTGTGTAAGATCCAGTGCCCTTCTTTCCTCTGCTTCTGTAAGCCTTCTCCTC
ACATCTACACGGCATCAGGCTCGCTTAAATTGGAGGAGAACACGCCTCCTCAAGTGTCTA
CTACCACGGTTGTTGTTGATGACAACGATGATGATGATGATGATCATTATGTTGATGCAC
ATGCCGCAGAATGTGTTGATCATGCTACAGAGGAAAAGGAAGAAGCTTGTGCTGTAGAGG
AGAA
CAAGA

QA 1 664 1 664
DS 

RD RS1BI87JQ 740 0 0
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CTCTGCTTCTGTAAGCCTTCTCCTCACATCTACACGGCATCAGGCTCGCTTAAATTGGAG
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GATGATGATCATTATGTTGATGCACATGCCGCAGAATGTGTTGATCATGCTACAGAGGAA
AAGGAAGAAGCTTGTGCTGTAGAGGAGAAACAAGAAGAAGAAGAGCAAGGCGAGATCTTG
AAAAGCAGTCTCAAGAAGGCGGCTTTGGATTCACCAAGGGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
AAGAAGGTACAGTGGGTGGATTTGATGGGGAAAGAACTTGCTGAGATCCGTGAGTTCGAG
TCTAGTGAAGAAGATGATATAAGATATGATGTCGACCAAAGCTGTGTTTGCGTTATTCTG
TGATCAACTCAGTTTAGTTTCTTCTTTTACTCGGAGAGAAGACAATGGTGAGAGGTGAAG
AAGCTTGCTGGAGATGGATCCATGTTGGTCCTGTGGCCTTGGCTGTAGAGTCCATATACA
TTGAGGTAGTACATATAGTAGAATCTACATTTGCTAGCCTGAGGTTATATCATGTTTCTA
TATATAACATGGCAGCATTTTGTTATGGTTGTTTTAGGATTGTGAAAAGAATTGATTTCT
ATTACAATTGTTTCTTTGAC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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ATCGACATCTTAAGCCACCTCTTCCGGTACTTGTAAGCTTCATCAACTTTGGCCTGAGCA
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
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AF RS1H431JQB U 5
AF RS1AD37TF C 1
BS 1 8 RS1AD37TF
BS 9 430 RS1H431JQB
BS 431 575 RS1AD37TF

RD RS1H431JQB 426 0 0
CCAA
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ACATAATGAACATATAAATACAAAAAGGTTTATTGCTTTATTCAGTTATGAAATTTATAA
TATATTGACTTTGGAGCTGTGTGGATGTAAAGAGGCCATGGTAAAAGGCAAAGTCTGGGG
CAACGATATAAGGAATTAAGGAACAGGGCATGCCTCAATGTTCCAAATCTCTTTGGCATA
CTGAGCTATTGTCCGGTCGCTGCTGAACTTTCCTGATCCGGCTGTGCTCATTATCGACAT
CTTAAGCCACCTCTTCCGGTACTTGTAAGCTTCATCAACTTTGGCCTGAGCATCCATGTA
GCTCACGAAGTCATACCCAACCAGGAAGTAATCACCACGCCCATAACCAGTGTTTCCCTC
AA

QA 5 426 5 426
DS 

RD RS1AD37TF 575 0 0
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TTATGCAAACATAATGAACATATAAATACGAAAAGGTTTATTGCTTTATTCAGTTATGAG
ATTTATAATATATTGACTTTGGAGCTGTGTGGATGTAGAGAGGCCATGGTAAAAGGCAGA
GTCTGGGGCAACGATATAAGGAATTAAGGAACAGGGCATGCCTCAATGTTCCAAATCTCT
TTGGCATACTGAGCTATTGTCCGGTCGCTGCTGAACTTTCCTGATCCGGCTGTGCTCATT
ATCGACATCTTAAGCCACCTCTTCCGGTCCTTGTAAGCTTCATCAACTTTGGCCTGAGCA
TCCATGTAGCTCGCGAAGTCATACCCAACCAGGAAGTAATCACCACGCCCATAACCAGTG
TTTCCCTCAAGAGAATCAAGGAGCGGACCATAGTCATAGGTTCCAAACACTCCACTTTTG
GCAAACTGCTTCGCCTCTTCAAATCGAGGATCTGGTTTGAAGAGTCCGTCTTCTCTTTCT
TTACGCAGTCGAGGGACCTGATCGGCTGTTGCACC

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 2

CO CL5348Contig1 394 2 1 U
GGAACTAAATCTCATCAAAACAAAAGAAAGAAACAATAAAGAATAACAGACAAATAATGG
CCAAAGGTGTACAATTTTTTAGCTTCATCACTTTTGTGATGATCTTCATGTTGATATCAA
CAGAAACTGTTGGAGCGAGGAGGCCTTTGATTAAATGTACAAGTGTACATCTGCCCTGCA
ATCCACATGTTGTGCCTTTTTGCTTAAGAGCGTGCAAACAAATGTCTAAACTATTAAAAC
TGAAGTACAAGTTTGAAATATCCCTTAGTTTTCCTCAAAAATTACAATCTTATGCCACTG
CATTTAATTTTAAATAAAAACAAAGAAAACTATTACTTACTTACCAAAATTGTAGGATCT
ATATTTACCTTAAATAAAATATATATGACCATTT


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AF RS1CR67JQ C 1
AF RS1CR67TF U 1
BS 1 394 RS1CR67TF

RD RS1CR67JQ 394 0 0
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QA 1 394 1 394
DS 

RD RS1CR67TF 394 0 0
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ATCCACATGTTGTGCCTTTTTGCTTAAGAGCGTGCAAACAAATGTCTAAACTATTAAAAC
TGAAGTACAAGTTTGAAATATCCCTTAGTTTTCCTCAAAAATTACAATCTTATGCCACTG
CATTTAATTTTAAATAAAAACAAAGAAAACTATTACTTACTTACCAAAATTGTAGGATCT
ATATTTACCTTAAATAAAATATATATGACCATTT

QA 1 394 1 394
DS 



AS 0 0

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AAATGAAGAAGAGGATGGGTGTGTGACTCAGAAGCCTATTCAGACATGTAATAATCAGGG
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GTAGATGTATAACATGAGAGAGGGAATATAGATAGAGAGAAAGAGAGAGAGATCAAACTC
CTCAGGCTTGTGTTTTAGTTTTTTTGTTACTTCATAAGAAAGTGAAACTGATAAATCAAA


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BS 651 1260 RS1F829JQ

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ATTAGAGGAAGAGAGGAGAAAGATCGATGTTTTTAAACGGGAGCTACCTCTATGCATGCT
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ATCAAATGGTAAATTAGATGTGGGTGAAGGGGTAATATTGGAAAGTGACAATAATAAGAA
GAACTGGATGAGCTCTGCCCAGTTATGGATCTCCAATCCTAACTCTCAATTGCAATCGAC
AAATGAAGAAGAGGATGGGTGTGTGACTCAGAAGCCTATTCAGACATGTAATAATCAGGG
AGGAGCATTTCCACCACCATATAACCCTCCACCACCGCCTCCTCCGGCTCCTCTGTCTCT
CAGGACTCCAACATCAGAAATACTGATGGATTATAGGAGAATTGAGCAGAATCATCCTCA
ATTCAGCAAACCTATTATACAGAGCCATCACGTTCCGAAGAAAGATCAGA

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DS 

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TGAAGTCAAGAGCCATTTACAAAAATATAGAATGCATATCCGTAAGCATCCGCTGCATCC
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AATAAGTTTGACGAGGTCGGATTCACCACAGAGCCCGCTTGTTGTTGATAGAGGTTGTTT
GTTCAGTAATAATGGTCATAGCTCAGAGGATGAAGTGAAATTTGATGGACGTAGCAGCTG
GAAAAGTGTGTCAAATAAAAATAGACCAGCGTTGGATCTTGAGCTTTGAAGACATGCATA
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GTTTTGGTAGATGTATAACATGAGAGAGGGAATATAGATAGAGAGAAAGAGAGAGAGATC
AAACTCCTCAGGCTTGTGTTTTAGTTTTTTTGTTACTTCATAAGAAAGTGAAACTGATAA
ATCAAA

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL5351Contig1 1304 2 2 U
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GGTACTTCCCTTCCTGGTAAGAGAGCGCTTCCACGGAACAAGGATCCTATGATGATTTCT
CGCCGTGCTTGTCGGCTCAGTTTGAAGTTGTTGATGAAGCTAAGCACCGTGTCTGGAGTG
TGTTTCGTATGGAAAAACACAGACTCCAGTGATTCGCAGTCGTCAGCGTATAGGTTGTTG
AGTGAACCAGGGAGCTCTGGCAACGAACCGAGTCTTCTGCAGCCAGAGAGATTAAGTTCC
TGAAGCTGATGAAGAGCCTTCATGCAATCTGGTATCTTCTCAATCCCGGAGTAGCTTACG
TTCACCAAAAGTACATTCAGGGGAAGATGTGTTATCCCCTTGAGCTTTCCATTGTTCCAC
ATAGAAAGAGACTCAAGACGTGACCACGTCGCTATCGATGCAGGTACATCTTCGACCGCT
GTCTTGGATATATCCAGTTTTCTTATGTTGGTGGACATGTCTGGAAATTTCCTCAGTTTT
GAGCATCCTTGCATGTCGACTGAATCGAGAGACGCCAAGTTTATGTGGGATGGAATGACT
TCTAAGTTTATGCAGCCACCCATCTTCAACTTCTTTAGTTTGTGAAGATGCGAAAAGGAG
GAAGGAATCTCTACCAACCTCATGCAACCTTTCAGATTTAACGTCTCCAAATTTTTAGCA
TTGGAAAGATCCGGTAGCTCCTTCAAACGAGAAGAGCCTGACAAATCCATCTTCGTAAGA
TTCTTAAGCAGCTGAAATGCAAAACAACATCATTATATAACATGACATAAAGTATATATT
CATATAGTGTTAAGTAGTAACAACACCAACCTGAGCTCCTTGCCAGAGGTACTCGAGTTG
GCTACATGTCATTTCAAGTTCTACAAGATATCCCGGATGAAATGTAGGAGGAAGACACTT
ATTTGGGTATGCCTCCCAATGTAGTAACCTTAGACGACGAGGAAGCTCCATCGTATCAGG
TATGTACATCATTCTATCATTCCCATCAGCTCTGCTTTTGTAGACCCTGAGGTATCGAAG
ATTAGGCATTTTTTTAAAAGCTTTCTTGCCTATCATTACTTCATCGATTCTTGATATATC
AAATGATATGCCGGACACAACTCCAGTACCCTAAACAAAATTCC


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AF RS1H067TF U 1
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BS 746 1304 RS1H067JQB

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CGCCGTGCTTGTCGGCTCAGTTTGAAGTTGTTGATGAAGCTAAGCACCGTGTCTGGAGTG
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TGAAGCTGATGAAGAGCCTTCATGCAATCTGGTATCTTCTCAATCCCGGAGTAGCTTACG
TTCACCAAAAGTACATTCAGGGGAAGATGTGTTATCCCCTTGAGCTTTCCATTGTTCCAC
ATAGAAAGAGACTCAAGACGTGACCACGTCGCTATCGATGCAGGTACATCTTCGACCGCT
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GAGCATCCTTGCATGTCGACTGAATCGAGAGACGCCAAGTTTATGTGGGATGGAATGACT
TCTAAGTTTATGCAGCCACCCATCT

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DS 

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ACAACATCATTATATAACATGACATAAAGTATATATTCATATAGTGTTAAGTAGTAACAA
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CAAGATATCCCGGATGAAATGTAGGAGGAAGACACTTATTTGGGTATGCCTCCCAATGTA
GTAACCTTAGACGACGAGGAAGCTCCATCGTATCAGGTATGTACATCATTCTATCATTCC
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TCTTGCCTATCATTACTTCATCGATTCTTGATATATCAAATGATATGCCGGACACAACTC
CAGTACCCTAAACAAAATTCC

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 2

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AAGAGATTTTGGGGCAAGACACATGAGTCATCAGAGAAGCAAAGATCCTAAACTCATGTT
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TGAAGAGAGCTTCTATTTGAAAATTGAAGAGATTAATGGTGCTATTGCGATCTCCGAATG
CTGCGATGGCCTTGTCTGCTTTTACGGCTTGACGTATGCAGTGAGAGTGGTAAATATGGC
CACAAAAACATTGGTACCACCACTCCCCTTGGCGAAATTTCAGCAGGTCCATAAATACCA
TCCAGACCCAGATCTGGAGGTGGAGATAGAGGACGTGATTGATGAAGATGATCGAAATCC
TGTTCCAGTGCCATTCGTATTATATACTAGGTTTGGATTTGGGAAAGACAGCGTCACAGG
ACAATATAAGATAGTGTGGCTCTATAATATATATCCTGCCACTTTGAACAAGAAGAAGAA
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CTGGCTTACTACGGGTGACGAACGAGGAGATCCATCAACACAAACCAAGCTCATAGTTTT
CGATATTCATACAGAGATGTTTCAAGTCACCTCAACACCACCTTTTATTTCCCCTGGCGC
CTCTGGTGACAAAATTGGTCTATGCAATCTTGACGGCCATCTGTGCATTTCTGAGCTCGA
GAGCGATTGTAAGCAAGAGTTTTGGTGGAGGGTTGAAGAATGCGACGACAAGTGGGAGAG
AATCTTTTCTGTTGACTTGAATTCTACTTCCTGTTGGTTTGGTCGTATCACTTCACTGCC
TCTCACTCCTTTGGCCATTTCAAGGGTTGAGAACAAGGTCGTCCTCTCGCTTACCTATCA
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CTAGCTTCTCTCTCTCTTTTTTCTTCTTTCTGAAACTATTTATCTTCTTCTGTAACATTA
AAATGTGTTTTTGTATGCAATGAGAGCACTTCTTATTTTA


BQ
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AF RS1AL08TF U 1
AF RS1AL08JQ C 537
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AAGAGAGTGGAAGACTGAGATCCCCAATGATGTGATGGAAGAAATCGTGATGAGGCTTCC
GGTGAGATCGATTGCGAGGTTCCAAACCGTTTCAAAGCATTGGGAATCGGTGATTAGGTC
AAGAGATTTTGGGGCAAGACACATGAGTCATCAGAGAAGCAAAGATCCTAAACTCATGTT
TGTCTCTTATGGTCAGAATCATATCCGTTTTGAGCAAAGGGACTTGGAGACGACTTCTGT
TGAAGAGAGCTTCTATTTGAAAATTGAAGAGATTAATGGTGCTATTGCGATCTCCGAATG
CTGCGATGGCCTTGTCTGCTTTTACGGCTTGACGTATGCAGTGAGAGTGGTAAATATGGC
CACAAAAACATTGGTACCACCACTCCCCTTGGCGAAATTTCAGCAGGTCCATAAATACCA
TCCAGACCCAGATCTGGAGGTGGAGATAGAGGACGTGATTGATGAAGATGATCGAAATCC
TGTTCCAGTGCCATTCGTATTATATACTAGGTTTGGATTTGGGAAAGACAGCGTCACAGG
ACAATATAAGATAGTGTGGCTCTATAATATATATCCTGCCACTTTGAACAAGAAGAAGAA
GACCAGATGCGAGGTTTTTGATTTTGAGGAATGGAGATGGAGATTTGTGACTACCCGACC
TCTTGATCATCACCAAATCTTGTCTAAACAGATGCCATCGTTTGCTAACGGATCATTATA
CTGGCTTACTACGGGTGACGAACGAGGAGATCCATCAACACAAACCAAGCTCATAGTTTT
CGATAT*CATACAGAGATGTTTCAAGTCAC*TCAACACCACCTTTTATTTCCCCTG

QA 1 896 1 896
DS 

RD RS1AL08JQ 824 0 0
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CAGGACAATATAAGATAGTGTGGCTCTATAATATATATCCTGCCACTTTGAACAAGAAGA
AGAAGACCAGATGCGAGGTTTTTGATTTTGAGGAATGGAGATGGAGATTTGTGACTACCC
GACCTCTTGATCATCACCAAATCTTGTCTAAACAGATGCCATCGTTTGCTAACGGATCAT
TATACTGGCTTACTACGGGTGACGAACGAGGAGATCCATCAACACAAACCAAGCTCATAG
TTTTCGATATTCATACAGAGATGTTTCAAGTCACCTCAACACCACCTTTTATTTCCCCTG
GCGCCTCTGGTGACAAAATTGGTCTATGCAATCTTGACGGCCATCTGTGCATTTCTGAGC
TCGAGAGCGATTGTAAGCAAGAGTTTTGGTGGAGGGTTGAAGAATGCGACGACAAGTGGG
AGAGAATCTTTTCTGTTGACTTGAATTCTACTTCCTGTTGGTTTGGTCGTATCACTTCAC
TGCCTCTCACTCCTTTGGCCATTTCAAGGGTTGAGAACAAGGTCGTCCTCTCGCTTACCT
ATCAAGGAAGCCTTGTTGACTTTGATCTTGATCCTGACTCAACTGTTTATCATCTCTATT
ATCCTGGTTACTATGGCTTAGCTGTTCCTTATTTTCCAAGTTTATCACTTGTTCATGCAA
CTTTCTAGCTTCTCTCTCTCTTTTTTCTTCTTTCTGAAACTATTTATCTTCTTCTGTAAC
ATTAAAATGTGTTTTTGTATGCAATGAGAGCACTTCTTATTTTA

QA 1 824 1 824
DS 



AS 1 2

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TACAGATCCATTGCATTAAACACCTTTAATCCAGCAACCACAATTCTACCTCTAATTCGA
TTATTGCTTCTGAAAGGCGTTCTGTGTGAGTATAAATAGATATGTCTTTTTCCTCTCAAA
AATCATATTCTCGATTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAAAGGGCTTTCATATTCTCGATCTC
TTGGAACAGCGAAATAATTTTTTAAGATGGCAGCCTCCTCTGTCCTCCTCATAGATTCTG
GTTCGATGTGGTAGAGAACGTCTAGATCCGATAATCTTCGATCTACGCCAGCCATATTTG
TGGTTCTTCCCGGAAAGATCGAACCGGTTAAAAGAGATGAACAAATAGTGAACCGATGTT
CCGGTAGCCGGAAGAAATTTGTGTTGTCCAGATTCGTGTACCGATCCGGTGACATTTCTG
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GTTTAGGCGGCTAAGATAAAGCCAAGAGGCATGTTTTCAAAAAGTGCATAGGAAAAAACA
GAGGTTGTCAGACAAGAGCTACAAGAAGGTTCGCCTATAAATTATAAGCCTTTGGCCGGA
GCTTCTCACGCCAAAGGAATCGTCCTTGAGCTCATAGGAATGGAGGCTAAGCAGCCAAAC
TCTGGTATATGTTAGTGCGCTAGAGTAAAACTTCTCAAGAATTGAAAGAAGGTTGCTGCT
TTTGTCCCCAACGATGGTTGTTTGAACCTCATTGAGCCAAATGAAGAGGTATTAGTCTCT
GGATTTGGGCGTAAGAGTCATTCTGTGGGAGATATTCCAGGAGTAGGGTACAAGGTCGTC
AAAGTTTCTGGTGTTTTACTCTGAAGGATAAGCCAAGGTCTTAAAACAAAACATTCAAAG
ATTTTGAATTTTATTTTTGATGGCATAAGCACATTTTAGTATTTTAGTTAAATAAAAGAA
TTGCTGTCCAAAAAAAGGTTAAATAAAAGAACTCCTGTGTTCTGTTC


BQ
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AF RS1B162TF U 1
AF RS1B162JQ C 293
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TACAGATCCATTGCATTAAACACCTTTAATCCAGCAACCACAATTCTACCTCTAATTCGA
TTATTGCTTCTGAAAGGCGTTCTGTGTGAGTATAAATAGATATGTCTTTTTCCTCTCAAA
AATCATATTCTCGATTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAAAGGGCTTTCATATTCTCGATCTC
TTGGAACAGCGAAATAATTTTTTAAGATGGCAGCCTCCTCTGTCCTCCTCATAGATTCTG
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QA 1 651 1 651
DS 

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TAGATTCT
GTTCGATGTGGTAGAGAACGTCTAGATCCGATAATCTTCGATCTACGCCAGCCATATTTG
TGGTTCTTCCCGGAAAGATCGAACCGGTTAAAAGAGATGAACAAATAGTGAACCGATGTT
CCGGTAGCCGGAAGAAATTTGTGTTGTCCAGATTCGTGTACCGATCCGGTGACATTTCTG
CGCCGAGCATAGTTACTCAGATTGCCATGATTGCAGGCTGCGGTTAGAGAAATCCCAGTT
GTTTAGGCGGCTAAGATAAAGCCAAGAGGCATGTTTTCAAAAAGTGCATAGGAAAAAACA
GAGGTTGTCAGACAAGAGCTACAAGAAGGTTCGCCTATAAATTATAAGCCTTTGGCCGGA
GCTTCTCACGCCAAAGGAATCGTCCTTGAGCTCATAGGAATGGAGGCTAAGCAGCCAAAC
TCTGGTATATGTTAGTGCGCTAGAGTAAAACTTCTCAAGAATTGAAAGAAGGTTGCTGCT
TTTGTCCCCAACGATGGTTGTTTGAACCTCATTGAGCCAAATGAAGAGGTATTAGTCTCT
GGATTTGGGCGTAAGAGTCATTCTGTGGGAGATATTCCAGGAGTAGGGTACAAGGTCGTC
AAAGTTTCTGGTGTTTTACTCTGAAGGATAAGCCAAGGTCTTAAAACAAAACATTCAAAG
ATTTTGAATTTTATTTTTGATGGCATAAGCACATTTTAGTATTTTAGTTAAATAAAAGAA
TTGCTGTCCAAAAAAAGGTTAAATAAAAGAACTCCTGTGTTCTGTTC

QA 9 775 9 775
DS 



AS 1 2

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GGGAGCCCTAATTTTCGAAATCCATTCCTGATCTCTCGAAGAAGATGACGAAGGACTTCG
CGATTCCACCCGTGGTCTTCCCCTCCGGCGGATCCACATCCAACCCCAACGTCCAGCAAC
GCCGCTTCCCCGCCGCTCCGTTCCAACCTCCACGCCCCTCCTCCTCCGCGATCCCTTTCA
TGTCCTTCGACATCGGATCCGCCGCGGCTTCCTCCGCCGCCCCCGCGGGACCGTTCACCG
GGACCTTAAACTCCTCCGCGCCTTTCGGAGGAGGAGGATCGTCCTCCTTCGAGGACGAGG
AGCCTCTCCTCGACGAGCTCGGCATCCACCCCGATCAGATCTGGAAGAAGACCAGATCCA
TCCTCAACCCGTTCCGGATCAACCAGACCGTCCACCACGACTCGGATCTATCGGGGCCGA
TCTTCCTCTACCTCGCGCTCTGCCTATTCCAGCTCCTCGCCGGGAAGATCCAGTTCGGGG
TGATACTCGGGTGGATCGTGGTGTCGTCCATCTTCCTATACGCGGTGTTCAACATGCTCG
CGGGGAGGAACGGGAACTTGAACCTGCACACGTGTACGAGTCTGGTTGGGTATTGTTTGC
TTCCGGTGGTGATTCTGTCTGCCGTGTCGTTGTTCGTGCCGCAGGGAGCTGGGGCGGTTA
GGTTTGTGGTTGCGGGGGTGTTTGTGCTTTGGTCGACGAGGGCTTGCTCGGCGTTGGTTG
TGTCTTTGGCTGATGGTGGGGAGGAGCATCGTGGGTTGATCTCGTACGCTTGTTTCTTGA
TCTATACTCTCTTCCCTCTTCTTGCTATATTCTGAAGATTTTACGAAAAATTTGATAGTT
TTGCTGATTAGTAAGAAACGAATGGCATAATCTAAAGTTGTTTGGTTTTGTGGTGGTGGG
AATAGTGGAGCGATGTGTAAAGGCTTCTCTTTGTTCTTTTTTTTTTCTGGGAAACCATGT
TTAATTTGATTCAGTGTTTGTATCTTTCAAGTGGATTATATTTACAGAGTTTATCAATGT
GTTCTCTTTTCTCG


BQ
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DS 



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BQ
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TTCATATCTGCACTTTATAATTTTAGTGGCACTAAGCACTACTAACCATCTACTGATTTA
CTTCATCATAATGGGCTTTTTATAATGGGCTTTATCACAGTATCCAATTACTAAGGCTTA
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ATTTATACTCAACTTGTCTACTCTGTTCTGTAATATCAAATAGAAATTGTTTATTACACG
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ATTACGTACCTTCGTAAGCTTCTCTGCATCTTAACCTCCGAAGATTCTTTGTTCTCTTTT
ATACATAATCTTC

QA 1 733 1 733
DS 

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TGATCTATTATTGTAAATTGCTTTTCTTCTTGTTTTCTTCACCTTCTTATCGTAATTCGG
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TCTGCATCTTAACCTCCGAAGATTCTTTGTTCTCTTTTATACATAATCTTCATTCAATAC
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TAAAACTTGTTAATTGTTTGGATGATGGTGGGGGAAAAATCATTCGGGTTCCAAATGCTA
AAAATGTGATTGTTTACCATCTACTTTTGATTCATTCATCATCAAACAATCATTTTCTTT
TTTTTGATTAATTAACTTTTCAGAATTTGTTTTTCTTTTGGGTTTTGGCCAGTGATGTTA
TAAATATATTTGCTACTTCTTGATGAAGAAATTCATTTGATTACTCCGTACCACCAAAAT
CTCTGAGGCCTGGTTATATTTTTTCCCGATATTACATCTTTTACAGACCTCACATTACAA
AGTTCAGTTTACCACATGTAAACTAGAATTTTTAAAAAAGAAAAACTAGAACAAAATGAA
ATTAAAGTCAATAAATTATAAAACCAAAATTGTAACG

QA 1 817 1 817
DS 



AS 1 2

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TATTTCTTTAGAACAGATTCCCATGATTTTTCTTTAATATGCGCAACCTATATCTATTCA
TTATCATTTTTCTAGACATTCTTGAATTATTATCTTACAGTATTCACTTTGTTAGTTCAT
TTGTTTCTATTCTCACTCAAAGTTTATTATACTACAACGGTTTCTTAAATAATCACTAAC
TAGTTACTAGAGTTTTACTCGCTTGATTATTGTTTGGCAGTACAAATTTGTATTTAATTG
ATTGGTTTTTAAGATTCAATTTTTTTTGTTGATTTTGTTAAGTGATTAAAGTTTTTGGGG
TTTAAAATGGGAAAAATGCCATTTAAATCCCAAACCTTCGAATAAGCAAAAAAACTTAAC
ATTTAGGTAAGACAAATAAATCTTAAACATTTAAAATTTATCCAAACTAATCCTAAATTT
CTGTTGACTTGGCCTTTTTAATTATCTCCAAATCAACTGTTAGTTAGACTTAACGTCTGT
TTAATTAGTAAAACAGTTTAATTAGTAAAACAGTGCAGTTTGGTGACTCGTTAAATTTAG
GGTTCATGGGTTACCCAACAAATGCATATATGGTGATATTATAAAGATGTATTTCAATTA
ATGAATGATGTTTAGACTGTTGTTCATGGTAACGTTTGAACAAGTTTGTGTATTTTTCAC
GACCATGTTGCTGGTTATTTTATAATGGTGTTTTGTTATGATCATAACCATTAAATAAGA
CGACATGAAAAAGATTGTGAACAGTTAGATAACATGGAGTTTAGAACCAATACATAAAAA
TGAACACATGACATAGAGTTTTGAAGCACTACATAAAAAAGAGTTAAGGATTGTAAACCA
TTACATAACAAAAGACTCATGAAACAACCGGGCTTCGTAGCCTGGTGGTAATGGAACCTC
GGCTGAGGTGCCCGCCACCCAGCTTCGAAACCCGGCCACAGCGATTTAACATCCTTACTG
CTGGGGCGCTGGACCCCTTCGGGGGATATTTGGGAAAGTGGCTGCCCAGACACCAGAGAT
ATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1D450TF U 1
AF RS1D450JQ C 465
BS 1 654 RS1D450TF
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RD RS1D450TF 781 0 0
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TTTAAAATGGGAAAAATGCCATTTAAATCCCAAACCTTCGAATAAGCAAAAAAACTTAAC
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TTAATTAGTAAAACAGTTTAATTAGTAAAACAGTGCAGTTTGGTGACTCGTTAA*TTTAG
GGTTCATGGGTTACCCAACAAATGCATATATGGTGATATTATAAAGATGTATTTCAATTA
ATGAATGATGTTTAGACTGTTGTTCATGGTAACGTTTGAA*AAGTTTGTGTATTTT
CACGA

QA 1 776 1 776
DS 

RD RS1D450JQ 679 0 0
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GACTCGTTAAATTTAGGGTTCATGGGTTACCCAACAAATGCATATATGGTGATATTATAA
AGATGTATTTCAATTAATGAATGATGTTTAGACTGTTGTTCATGGTAACGTTTGAACAAG
TTTGTGTATTTTTCACGACCATGTTGCTGGTTATTTTATAATGGTGTTTTGTTATGATCA
TAACCATTAAATAAGACGACATGAAAAAGATTGTGAACAGTTAGATAACATGGAGTTTAG
AACCAATACATAAAAATGAACACATGACATAGAGTTTTGAAGCACTACATAAAAAAGAGT
TAAGGATTGTAAACCATTACATAACAAAAGACTCATGAAACAACCGGGCTTCGTAGCCTG
GTGGTAATGGAACCTCGGCTGAGGTGCCCGCCACCCAGCTTCGAAACCCGGCCACAGCGA
TTTAACATCCTTACTGCTGGGGCGCTGGACCCCTTCGGGGGATATTTGGGAAAGTGGCTG
CCCAGACACCAGAGATATC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

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ATCGATTCGGTAGGTTCTCTCTTCATCATCATCATATGTTTTTTTGCTGTGGATTGGATT
CTCATTTAGAGAATTGAAATCTGAATCCCTGTTTATCTATTTTGATTATTCTGATCTATA
ATGTTTTCCCGTTGCATAGTTTAAGCAAAAAGAGATCGATCTCTAGAGATTTTGATTAGA
AGTCACAAATCAAAGAAATTAAGTTATTTTGGTTTGTAGATTTAGCGACTTTTGCCTCCC
ATGGAAGGAAACTTCTTCAGCTCTGATGATGGCTCCACGGTCAAACAAAAACCTAATCTC
GTCACGGTTCCAACAGGATCTCAATCCAACGAAAGCAGCGGATGCTTTGATTGCAACATC
TGTCTAGACATAGCTCTTGATCCGGTGGTCACTCTCTGCGGACACCTTTTCTGCTGGCCT
TGCATCTACAAGTGGCTCCATGTTCAGCTCTCTTCTTCTCTCTCCATCGATCACCACCAG
AACAACAACAACAACAACAACAACTTCCCTGTCTGCAAATCCAACATTGCCATCACCTCA
TTGGTTCCTCTCTACGGAAGAGGCATCTCTTCTCCATCCTTTGACTCCAAGGAACAACAA
GACTCAATACCTCGGAGACCTTTTCCATCAAACACTCCCACCACTCCAGATTTACCTTTG
CGACAACACCGAACAATGTTTCCAACGTTTCACAACCACCACCGATACTCCTCCCGTGGC
TTCACCACCACAACTGAATCGACAGACCTTGCCAACGCGGTGATGATGAGCTTGCTGTAC
CCGGTGATCGGGATTTTTGGGGACATGGTCTACACCAGGATATTCGGAACTTTCACGAAC
GCGATAGCTCAGCCTTACCAACAAAACCAGAGGATGATGCATCATGAGAAGTCTCTTAAT
CGGGTATCCATTTTCTTCTTCTTTTGCATCTTCCTCTGCCTCCTTCTCTTCTAGCTCTCT
CTCTCTCTCTCTCCCTCTTGTATACACTTTTGTTGTAAATAGACTGTAAAAAAACTCAAA
AGTCGCTGTGGTATAACAACTACATATACACTTTTGTTCTGTGCTTGTAACAAATCTTCA
TGAACCATATACATTTTTAAATGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EX60TF U 1
AF RS1EX60JQ C 496
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AACAACAACAACAACAACAACAACTTCCCTGTCTGCAAATCCAACATTGCCATCACC

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DS 

RD RS1EX60JQ 669 0 0
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AACAACAACTTCCCTGTCTGCAAATCCAACATTGCCATCACCTCATTGGTTCCTCTCTAC
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ATGTTTCCAACGTTTCACAACCACCACCGATACTCCTCCCGTGGCTTCACCACCACAACT
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TACCAACAAAACCAGAGGATGATGCATCATGAGAAGTCTCTTAATCGGGTATCCATTTTC
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TCTTGTATACACTTTTGTTGTAAATAGACTGTAAAAAAACTCAAAAGTCGCTGTGGTATA
ACAACTACATATACACTTTTGTTCTGTGCTTGTAACAAATCTTCATGAACCATATACATT
TTTAAATGA

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 2

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TCTTTTCTCTACTCACTACAACAAACAAGGGGTTACAAATACTTGATGTGATATAGCAGA
TAACTCACAAACCGAGCCATGGACACTGCTTCCTTGCATGTTCCGGTACTAACTTAGCCA
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AACGTCCATTGGGCAACCGTGCATTAGGATCTCTAAGCTCGTCAAAGAACGGGTGGACCA
ATGCATCAAGAGCACCACAACGGAGATTAGGAGAGTATTGAAGAAGCCTTGAGACCAAAT
CAACAGCTTCTGGAGGCATCCTCTTGTGGAAAATCTTATGCCATGGATGAGCTTTAATCT
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GCTGACCGAGAAGAAGCTCGGCGAGAACACATCCAGCAGACCAGACATCAATGGCTGTAG
TATACTCTGTAGCTCCAAAAATAAGCTCAGGTGCTCTGTAACACCTCGAGCATATATATG
AAATGTTTGGCTCTCCTTTGACCAATACTTTAGCACTTCCAAAATCACATAGCTTCACTT
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TACATCGGTGAATTTTCATGTGATTCATCTCTTCAGGTAACCTATCAGCATCAGTAACAG
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GAACACTTGAACTTGTTTTTTTTTTTAAATAAAAGATTCTTCCTTTGTCACTCCTTCAAA
TCTCAGCCCCTTGGAGGAAGAATCAAGAAGATATGATTAGATCCATTGGAAGGAAAGATG
GAAGATGGTTTGATGATGATGAATGTCTCTCTCTCTCTTTTCTCTTCTGTGTCTCTTCCT
TTTTTTGGATTTTGGTGTGATGAATAATAATAGTTTTGTGAGAATCC


BQ
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AF RS1BT91JQ U 1
AF RS1BN41TF C 353
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RD RS1BT91JQ 731 0 0
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GAGGGAACTTGAACTCAGTGTAGTTCGGGTTCATGCATTTGATCTCTTCCCTTGTTGGTG
TCCCCAAAACCTTAATAATCTCAACCAGTTGATCAACCCCACTCTCACCAGGGAACAATG
GCTGACCGAGAAGAAGCTCGGCGAGAACACATCCAGCAGACCAGACATCAATGGCTGTAG
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AAATGTTTGGCTCTCCTTTGACCAATACTTTAGCACTTCCAAAATCACATAGCTTCACTT
GATGAGTGTGT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RS1BN41TF 775 0 0
T
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TTAATCTGAGGGAACTTGAACTCAGTGTAGTTTGGGTTCATGCATTTGATCTCTTCCCTT
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AACAATGGCTGACCGAGAAGAAGCTCGGCGAGAATACATCCAGCAGACCAGACATCAATG
GCTGTAGTATACTCTGTAGCTCCAAAAATAAGCTCAGGTGCTCTGTAACACCTCGAGCAT
ATATATGAAATGTTTGGCTCTCCTTTGACCAATACTTTAGCACTTCCAAAATCACATAGC
TTCACTTGATGAGCGTGTGGGTTTACCAACAAGTTTTGAGGCTTAATGTCACGATGACAC
ACGCCTATACATCGGTGAATTTTCATGTGATTCATCTCTTCAGGTAACCTATCAGCATCA
GTAACAGCGTTTCCATTAGAGTCTCTAACCGCGGCACTAGGCTCTACGCCCACCGTGGCC
ATCTCTGGAACACTTGAACTTGTTTTTTTTTTTAAATAAAAGATTCTTCCTTTGTCACTC
CTTCAAATCTCAGCCCCTTGGAGGAAGAATCAAGAAGATATGATTAGATCCATTGGAAGG
AAAGATGGAAGATGGTTTGATGATGATGAATGTCTCTCTCTCTCTTTTCTCTTCTGTGTC
TCTTCCTTTTTTTGGATTTTGGTGTGATGAATAATAATAGTTTTGTGAGAATCC

QA 2 775 2 775
DS 



AS 1 2

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GGGAAGTGTTTGATTGAATCGTAGATTTGGCGATGATGAATATACTGAGAAGAGCCGTCT
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TTGTTTATAGTACAGATACAGGAACGAGAATATCAGTGGCTATTCCAGAATCTATTCGGG
AATCTAAGTCGGTACCGTGGCAGATTTCACAGGGCTTGATTCATCGTACAGAGCAAAGCT
TGTTTGGAAATTTCTCTGCGTTTTCTGCCAGAGCTAGTCCAAAACCAGAAGCAGCTGCAG
ATAATAATGAGAAGAGAGCTCCTGTTGAAGATTCAGATAGTGTGAAACCTCCATTTGGTG
GGTTCTTGGGGAGGGATACAATCGCCAATGCGGCTGCCCGAATTGGACCAGCTGTTGTCA
ATCTATCTGTTCCTCAAGGATTTCATGGGAT


BQ
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AF RS1BQ59TF U 1
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AATCTAAGTCGGTACCGTGGCAGATTTCACAGGGCTTGATTCATCGTACAGAGCAAAGCT
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DS 

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G
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GGAATCTAAGTCGGTACCGTGGCAGATTTCACAGGGCTTGATTCATCGTACAGAGCAAAG
CTTGTTTGGAAATTTCTCTGCGTTTTCTGCCAGAGCTAGTCCAAAACCAGAAGCAGCTGC
AGATAATAATGAGAAGAGAGCTCCTGTTGAAGATTCAGATAGTGTGAAACCTCCATTTGG
TGGGTTCTTGGGGAGGGATACAATCGCCAATGCGGCTGCCCGAATTGGACCAGCTGTTGT
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QA 2 394 2 394
DS 



AS 1 2

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TGCAGTTGGATGGACAGGACCTTCATGGTCGAAGAATTAGAGTGAACTACGCTACTGAAA
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ATGTTGCCAAGAGAGCTTAATCTCTCCACATAATGTTGGGCCGCTGCAGTTTCAGAATAA
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TTAATAAGATACTTC


BQ
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AF RS1BQ89TF U 1
AF RS1BQ89JQ C 386
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GTAGATCGAGGGGTTTTGCTTTCGTAACGTTTACTTCTACCGAGGAGGCTAGTAATGCAA
TGCAGTTGGATGGACAGGACCTTCATGGTCGAAGAATTAGAGTGAACTACGCTACTGAAA
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QA 1 744 1 744
DS 

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TGAGCAGTTTGGTGGCAGTGACAGTCAGTTTGGTGACTCAGAGAAGGGTCAAACAGAGGC
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QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

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TAGACAAAAAAAAAAAAAGAGATTTGCTATTATCATTAGCTTTTCTGAAACTCAGTTCAA
AGATTATCTCGAGCAAAGCTCATTTCATTACCAGAAGAACAAATGAAGTTGACATTTTCG
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GGCGTTTTCTTGGTGTCCAACAATGTATCTATCACCTGAAAAATATGAAACCCCTAAGTA
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GCAGAATTTAATTTGGTTCTATGATTTTGTGAACTGTTAAAAGTTTGCCCAATTCTTGTC
ATAAAACCCTATGTTCCAGAAAAGCATGCGGTCTTAAGCAAAACTATTAGTTGACCTAAG
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AGAGACTTCAAAGAAAGTAACACGTCGTGTATAGCAATGCACATTTGCTACGTCCATCTT
GCAAAAGTTCCTGAAATCATGCTCTCCAATGAACTTCTTACCAGCAATGTCCATGGCCTA
GAGAAAAAAATGCAAATCAAATTAAGCATCTTAGATTGTTTCAATACAGTGAC


BQ
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AF RS1D085TF U 1
AF RS1D085JQ C 359
BS 1 653 RS1D085TF
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QA 1 653 1 653
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AGTAAATGATCAGAAAAGACTGGTCAGAGCTTAACAATGGGTGCCATTGTACCTAACAGG
ATGCAGAATTTAATTTGGTTCTATGATTTTGTGAACTGTTAAAAGTTTGCCCAATTCTTG
TCATAAAACCCTATGTTCCAGAAAAGCATGCGGTCTTAAGCAAAACTATTAGTTGACCTA
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AAACAGAAAAACTTGCTTCAATGAGCTCTTTTTTTTACCAAAGCCGACCTATTTTGACAA
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TAGAGAAAAAAATGCAAATCAAATTAAGCATCTTAGATTGTTTCAATACAGTGAC

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

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AAAAATTGCATTGGACGAACAAACACCTGGCAGGCATAATGTTCTCCGACC


BQ
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AF RS1CC48JQ C 1
AF RS1CC48TF U 1
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GTTCCTAATAACCGGCTTTGAATGGGTAACTAAAAAGCAGAACATGGTTTATCATTATGT
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AAAAATTGCATTGGACGAACAAACACCTGGCAGGCATAATGTTCTCCGACC

QA 1 351 1 351
DS 

RD RS1CC48TF 351 0 0
GCTGTGGGAAGAGCTTGCAATCATTGACATTGTCTCCTCCTCCTAATTCAAATACCCAAA
ACGAATGGCTCCGTTAATATAAAAAAAGTAAAAACAATAGTAGTAATGATTGCAGAATGC
TGAGTAAAAATAAATGTTGTCTACATAACATCACAAAAAACATAATGCAGTTTCAGTTAT
GTTCCTAATAACCGGCTTTGAATGGGTAACTAAAAAGCAGAACATGGTTTATCATTATGT
CCGAAACAAGAAAAAAAGAAGAAAACTTTGAATATACGCTTGGCTCGAAATACCCAAAAA
AAAAATTGCATTGGACGAACAAACACCTGGCAGGCATAATGTTCTCCGACC

QA 1 351 1 351
DS 



AS 1 2

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CTCTGTTTCACCATAAATACGTGCAATCTTGTTCATCATTCCTTCTTTAATTTCTTCATC
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TTTATTAGTTATAATTTAAACAACATCTAAGATAGTTATGAATAAAACAATAGCTTCTAA
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GCCGTTTGTTTTTTTTAGTTT


BQ
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AF RS1D175JQ U 2
AF RS1CF53JQ U 1
BS 1 99 RS1CF53JQ
BS 100 100 RS1D175JQ
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RD RS1D175JQ 359 0 0
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TCTGTTTCACCATAAATACGTGCAATCTTGTTCATCATTCCTTCTTTAATTTCTTCATCA
TCGTGAATTTATTACACACACTCTTTCACTTCTTGTTCCATTTGCAATAATAATTGATTG
AAAACAACGACACCAGAAGCCGGACCTGTGATTTACGGGGCCCTATTCGAAAATAAAAA

QA 1 359 1 359
DS 

RD RS1CF53JQ 501 0 0
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GGACAATCATTCATGTTTCTGAGGCTGCAAATGAGCTAAGATAGATAGACATCGCCTTCT
GTAATCAAAGCTCACAGGGACCCATCTCTCACCCCTAACAAAGGACCACACACAAATTAA
CTCTGTTTCACCATAAATACGTGCAATCTTGTTCATCATTCCTTCTTTAATTTCTTCATC
ATCGTGAATTTATTACACACACTCTTTCACTTCTTGTTCCATTTGCAATAATAATTGATT
GAAAACAACGACACCAGAAGCCGGACCTGTGATTTACGGGGCCCTATTCGAAAATAAAAA
TTTATTAGTTATAATTTAAACAACATCTAAGATAGTTATGAATAAAACAATAGCTTCTAA
GGGAAGGAGCTGAAAAGACATCCAGCATAAGTGTATGTCTTCTAATTTAAAAGAGATGAT
GCCGTTTGTTTTTTTTAGTTT

QA 1 501 1 501
DS 



AS 1 2

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AGTTATAAAAATGATCTTCAGTTCTGTAATCTCATGAGATCTTAACTGATAAAAGTTTGA
ATATTAAGTCTTCTCTCTGTTGCTTCTTACTTATAACATCAGTAGTATTGTGTGTTTCCT
T


BQ
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10 

AF RS1BU28TF U 61
AF RS1F005TF U 1
BS 1 141 RS1F005TF
BS 142 142 RS1BU28TF
BS 143 421 RS1F005TF

RD RS1BU28TF 314 0 0
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CGGGTTTGTTGAGGCTGTTTAAATACGGAGGCTTCCCTCCTACAGCTAACTATTTATTCT
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ATATTAAGTCTT
AC

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DS 

RD RS1F005TF 421 0 0
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TGAAACTCCTTGAGCTCGAAGCTCCCATCAAGATCTACGGTGATATTCATGGACAGTACT
CGGGTTTGTTGAGGCTGTTTAGATACGGAGGCTTCCCTCCTACAGCTAACTATTTATTCT
TAGGAAATTAAATGGACCGAAGAACCAACCTGATGAAGTTGAAGCAAAGTTGTTCAAGGA
GAGCTGGAAAAGACAGCTCAGAAGCTAAATATCAGAAGCTGTATCAGCCTTTGTATACTA
AGTTATAAAAATGATCTTCAGTTCTGTAATCTCATGAGATCTTAACTGATAAAAGTTTGA
ATATTAAGTCTTCTCTCTGTTGCTTCTTACTTATAACATCAGTAGTATTGTGTGTTTCCT
T

QA 1 421 1 421
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5366Contig1 982 2 2 U
GGCTTGGTCATTCTGGCGAATTGTGTCTAACTCTTTCTGTAGAAGATCTATCCTCCTGCT
TAACCATTCGACATTGTTGTTGAGAGGGCTGTAGACGTCTCCAATCCGTGTATTGATGTA
GGCAACCTCCCATTCATCTTTCTTAGGTGATGAACAGTCTGGTCGGTCCATGGGTGTAGT
CTTGCCGATGTCGACCGATGGTATAGGTACTCTGTCGGTCGATACTGGTGGCGTAGCCTC
TTTCTCAAGCATGGTCAATATGTTTCCAAGCTCCACTCTTATTTCAGCCATATCATTATG
GAAGTCCTTGTAACTGACATCCAAAGGCTGGAAAGTGTCTTCCACCAATGTGTGCATGTT
TGCCTCAAGGTGCGCCTGAGCTCTCCATACATCAGTCACCATATCATCCACCTCCTCTCT
ACTGTAGGGCACTGGTGGTGGTGTGTATGCATGGTAAGGGCGTGTGTGTATTGGAAGACG
CAAATAACCTCTGTGAAAAAGGGATGCTCTATCCAAAAGTCTTTTTACTTGCTCCTTGGT
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TTATGTCTACAGCTCCCCACCGCCTCCTCCATATGTTTACAAATCTCCTCCACCACCTCC
CTACGTCTATAGCTCTCCACCACCTCCAAGCTATAGTTATAGCTATAGCTCACCCCCTCC
ACCGATATACTAACCATATATATCATATTGAAGTGAATTTCAAAAGAAGCGTTTACGTAA
TAAGTTACGACCATGGTATCCACGGTTTTAAAATATATCACTTTCGAGACTTCAATATAA
GACGAAATGTTATTTCGTTTGTACTTTTACTTTGTGCATTTTGACTTTGGGTTGTTGCTT
TTGATGTTTGTTACTTATGCCTACTAAAAGGCCAGTGTATTGTTTTAATTTATAGCCATT
GAATAAACTCAATTACCTTTTC


BQ
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AF RS1FK71TF U 1
AF RS1FK71JQ C 649
BS 1 761 RS1FK71TF
BS 762 982 RS1FK71JQ

RD RS1FK71TF 761 0 0
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TAACCATTCGACATTGTTGTTGAGAGGGCTGTAGACGTCTCCAATCCGTGTATTGATGTA
GGCAACCTCCCATTCATCTTTCTTAGGTGATGAACAGTCTGGTCGGTCCATGGGTGTAGT
CTTGCCGATGTCGACCGATGGTATAGGTACTCTGTCGGTCGATACTGGTGGCGTAGCCTC
TTTCTCAAGCATGGTCAATATGTTTCCAAGCTCCACTCTTATTTCAGCCATATCATTATG
GAAGTCCTTGTAACTGACATCCAAAGGCTGGAAAGTGTCTTCCACCAATGTGTGCATGTT
TGCCTCAAGGTGCGCCTGAGCTCTCCATACATCAGTCACCATATCATCCACCTCCTCTCT
ACTGTAGGGCACTGGTGGTGGTGTGTATGCATGGTAAGGGCGTGTGTGTATTGGAAGACG
CAAATAACCTCTGTGAAAAAGGGATGCTCTATCCAAAAGTCTTTTTACTTGCTCCTTGGT
AACATGGATGATCTCCCCACCACCACCTCCATATGTTTACAAGTCTCCTCCACCACCTCC
TTATGTCTACAGCTCCCCACCGCCTCCTCCATATGTTTACAAATCTCCTCCACCACCTCC
CTACGTCTATAGCTCTCCACCACCTCCAAGCTATAGTTATAGCTATAGCTCACCCCCTCC
ACCGATATACTAACCATATATATCATATTGAAGTGAATTTC

QA 1 761 1 761
DS 

RD RS1FK71JQ 334 0 0
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CTCACCCCCTCCACCGATATACTAACCATATATATCATATTGAAGTGAATTTCAAAAGAA
GCGTTTACGTAATAAGTTACGACCATGGTATCCACGGTTTTAAAATATATCACTTTCGAG
ACTTCAATATAAGACGAAATGTTATTTCGTTTGTACTTTTACTTTGTGCATTTTGACTTT
GGGTTGTTGCTTTTGATGTTTGTTACTTATGCCTACTAAAAGGCCAGTGTATTGTTTTAA
TTTATAGCCATTGAATAAACTCAATTACCTTTTC

QA 1 334 1 334
DS 



AS 1 2

CO CL5367Contig1 1130 2 2 U
GTGCGTGCCAAGGTTCACCACGTGTTGACTTTTATTACTTTTTTATTTTTTATTTTTCGT
TTGTTTTTACTAAAAAAAAAATAACAGTTGGACCAATCGTGGGCCACCACGTGTTGTGGG
GCTCACGAAATTCACATGATATCGCCTCTTCCGAGTGATACTGCAAGAGGCGGGTTCATT
GGTTTTGCCTTATTTTAATATTTTTTTTCTTAGATTCCGTGCCATAATCCGCTAATGCGG
ATGGCCTTAGTGGTCGCTTAGGCACCCGAGAATCTGTTAACTCTCTTGTCTGTGTTTGAT
TGTAGCTGTACCAAACTAAACTCACATTTGGTTTGATTTAATTTGTAATTTCATCGCAGA
AAGACATTATTGATGCTATTCCAGGATTGGCTAACATACCAAAACAGGCAGCTACTTGAT
TATTTTTAGTTGTGGGATCCATTATTTTGTTACTATATACTGCTTTCTTGATGATTCGAA
AATTATTCTACAATGCTCTTTTAGCTTTTGATCTATATATATCCCCTACAATTTTGAAAA
TAATTTACATTGACTTATAACTCCAAATTTATAAAAGAAAAATAATTATAATTTTTCAAT
TAAATTATATATAACTCCTAAAACGTCAGGGTTGTCTCTGTACACGTGTATAGTGTTCAC
TAAGCAGAATCTAAGGAATTGTATACGACTATGACATTTGGTGTAATAGTTTTATGCTAG
TGTTATTGTTGTAGTCACTAATGTCATTAAAATTGGGACAAATGAATCCATTTCCAATAT
AGAACAACTGAAACTGTTCATTTTTTCAAACTTTGATCAAGGTTTTTTTTCTCTCCAAAT
TTGGGCTAGGTTCGGTTTATGTATATGTGATACAAAAACAAAAGCAGTATACAATAATTA
ACATTTGATTTGGTTTTAGTTTAGGCAGATTTATCTTGTTATTAAAGTCAAAACGATGGG
AAAAGCAACGGAAAGAGTATTAGCCGTTGGATCTGGAGAGGTGACGAATCTGACGTCCCA
GGTAAAATGAGTTTCTCTACTGACAAACGGCGTCGTGGCGGGTCCCACTGATTATTATCT
GTAATCGCAGTTTTTCAAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTCGTCCCC


BQ
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AF RS1DO68TF U 1
AF RS1DO68JQ C 318
BS 1 668 RS1DO68TF
BS 669 1130 RS1DO68JQ

RD RS1DO68TF 672 0 0
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TTGTTTTTACTAAAAAAAAAATAACAGTTGGACCAATCGTGGGCCACCACGTGTTGTGGG
GCTCACGAAATTCACATGATATCGCCTCTTCCGAGTGATACTGCAAGAGGCGGGTTCATT
GGTTTTGCCTTATTTTAATATTTTTTTTCTTAGATTCCGTGCCATAATCCGCTAATGCGG
ATGGCCTTAGTGGTCGCTTAGGCACCCGAGAATCTGTTAACTCTCTTGTCTGTGTTTGAT
TGTAGCTGTACCAAACTAAACTCACATTTGGTTTGATTTAATTTGTAATTTCATCGCAGA
AAGACATTATTGATGCTATTCCAGGATTGGCTAACATACCAAAACAGGCAGCTACTTGAT
TATTTTTAGTTGTGGGATCCATTATTTTGTTACTATATACTGCTTTCTTGATGATTCGAA
AATTATTCTACAATGCTCTTTTAGCTTTTGATCTATATATATCCCCTACAATTTTGAAAA
TAATTTACATTGACTTATAACTCCAAATTTATAAAAGAAAAATAATTATAATTTTTCAAT
TAAATTATATATAACTCCTAAAACGTCAGGGTTGTCTCTGTACACGTGTATAGTGTTCAC
TAAGCAGA
TCTA

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DS 

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ATTCCAGGATTGGCTAACATACCAAAACAGGCAGCTACTTGATTATTTTTAGTTGTGGGA
TCCATTATTTTGTTACTATATACTGCTTTCTTGATGATTCGAAAATTATTCTACAATGCT
CTTTTAGCTTTTGATCTATATATATCCCCTACAATTTTGAAAATAATTTACATTGACTTA
TAACTCCAAATTTATAAAAGAAAAATAATTATAATTTTTCAATTAAATTATATATAACTC
CTAAAACGTCAGGGTTGTCTCTGTACACGTGTATAGTGTTCACTAAGCAGAATCTAAGGA
ATTGTATACGACTATGACATTTGGTGTAATAGTTTTATGCTAGTGTTATTGTTGTAGTCA
CTAATGTCATTAAAATTGGGACAAATGAATCCATTTCCAATATAGAACAACTGAAACTGT
TCATTTTTTCAAACTTTGATCAAGGTTTTTTTTCTCTCCAAATTTGGGCTAGGTTCGGTT
TATGTATATGTGATACAAAAACAAAAGCAGTATACAATAATTAACATTTGATTTGGTTTT
AGTTTAGGCAGATTTATCTTGTTATTAAAGTCAAAACGATGGGAAAAGCAACGGAAAGAG
TATTAGCCGTTGGATCTGGAGAGGTGACGAATCTGACGTCCCAGGTAAAATGAGTTTCTC
TACTGACAAACGGCGTCGTGGCGGGTCCCACTGATTATTATCTGTAATCGCAGTTTTTCA
AATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTCGTCCCC

QA 1 813 1 813
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AGTATTACACATACTATGGCATCATGTATGTTCATTTGTTGAATGCCTCGTGTCTGTTTA
CTT


BQ
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10 10 10 

AF RS1B610TF U 1
AF RS1B610JQ C 408
BS 1 762 RS1B610TF
BS 763 763 RS1B610JQ
BS 764 778 RS1B610TF
BS 779 783 RS1B610JQ

RD RS1B610TF 782 0 0
GGAACTCTTGATTAGATGGTTTGAGCTTCCCAACTGCTTTATATTCCATAACGCCAATGC
TTGGGAAGAAGAGGATGAAGTCGTCCTCATCACTTGTCGCCTTGAGAATCCAGATCTTGA
CATGGTTAGTGGGAATGTGAAAGAAAAACTCGAGAATTTTAGCAACGAACTGTACGAAAT
GAGATTTAACATGAAAACGGGCTCAGCTTCCCAGAAAAAAATATCGGCATCTGCAGTTGA
TTTCCCCAGAATCAACGAGTGCTACACTGGAAAGAAACAGCGATATGTATATGGAACAAT
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GACAGGTAAAACAATGCTAGAAGTAGGAGGCAATATCATGGGAATCTATGATCTGGGTCA
AGGCAGATACGGTTCAGAGGCTATATTTGTCCCTCGTGAGGCAGGGGAAGAAGATGATGG
CTACTTGATCTTCTTTGTTCATGATGAAAACACAGGGAAATCATGTGTGAATGTGATAGA
CGCAAAAACAATGTCGGCCGAGCCAGTGGCGGTGGTGGATCTGCCGCATAGGGTCCCATA
TGGCTTCCATGCCTTCTTTGTTACAGAGGAACAACTCCAGGAACAATCTCTTACATAAAG
ACAAGTTGTGAGCATACTTTTATATATATACTACCGTGGAGATTGGATGATTCGGACACT
AGTATTACACATACTATGGCATCATGTATGTTCATTTGTTGA*TGCCTCGTGTCTGTT
ACTT

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DS 

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AAGAAGATGATGGCTACTTGATTTTCTTTGTTCATGATGAAAACACAGGGAAATCATGTG
TGAATGTGATAGACGCAAAAACAATGTCGGCCGAGCCAGTGGCGGTGGTGGATCTGCCGC
ATAGGGTCCCATATGGCTTCCATGCCTTTTTTGTTACAGAGGAACAACTCCAGGAACAAT
TTCTTACATAAAGACAAGTTGTGAGCATACTTTTATATATATACTACCGTGGAGATTGGA
TGATTCGGACACTAGTATTACACATACTATGGCATCATGTATGTTCATTTGTTGAATGCC
TCGTGTCTGTTTACTT

QA 1 376 1 376
DS 



AS 1 2

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CTGGTTCTTATGGCTACATGGCTCCTGAACATGGCTCTATGCAACGTATAACCGAGAAGA
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AGAAAGATCCGAGCAAGCTTCTTGACCCGAGACTTGATGGACGAACCGACTCGATTATGC
ATGAGATGCTTCAAACACTTGCGGTCGCGTTCCTTTGTGTGAGTAACAAGGCAAGTGAAA
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ATGACTCTGTTTGAAACATACTAACGGTGAAAAGTGTGAATTGTGTGTGTATTTACAAAG
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ACACAACAGAAAGTCTTATAATTGCAATAGATTTATTTCTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EY36TF U 1
AF RS1EY36JQ C 349
BS 1 650 RS1EY36TF
BS 651 1002 RS1EY36JQ

RD RS1EY36TF 656 0 0
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TGTTCTACGATTATCTTCCCAACGGAAGCCTGAGCTCTCGGCTTCACGGCGCAGGAGGGA
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TTGCGTATCTCCACCACGATTGTCTCCCCGCGATTATACACGGCGACGTTAAAGCTATGA
ACGTCTTATTGGGCCCCCAGTTCGAGCCCTATTTAGCCGATTTCGGTTTAGCGAGGACCG
TATCCGGTAATCCAGATATCGGAATTGATTCATCAAAACCGAGCAATCGGCCTCCTTTGG
CTGGTTCTTATGGCTACATGGCTCCTGAACATGGCTCTATGCAACGTATAACCGAGAAGA
GCGATGTGTATAGTTACGGAGTGGTGTTATTAGAGGTTTTAACCGGGAAGCATCCATTAG
ACCCGGATCTACCAGGGGGTGCACATTTGGTTAAGTGGGTGAGAGATCATTTAGCTGAGA
AGAAAGATCCGAGCAAGCTTCTTGACCCGAGACTTGATGGACGAACCGACTCGATTATGC
ATGAGATGCTTCAAACACTTGCGGTCGCGTTCCTTTGTGTGAGTAACAAG
CAAGTG

QA 1 650 1 650
DS 

RD RS1EY36JQ 654 0 0
GGCCTCCTTTGGCTGGTTCTTATGGCTACATGGCTCCTGAACATGGCTCTATGCAACGTA
TAACCGAGAAGAGCGATGTGTATAGTTACGGAGTGGTGTTATTAGAGGTTTTAACCGGGA
AGCATCCATTAGACCCGGATCTACCAGGGGGTGCACATTTGGTTAAGTGGGTGAGAGATC
ATTTAGCTGAGAAGAAAGATCCGAGCAAGCTTCTTGACCCGAGACTTGATGGACGAACCG
ACTCGATTATGCATGAGATGCTTCAAACACTTGCGGTCGCGTTCCTTTGTGTGAGTAACA
AGGCAAGTGAAAGGCCTATGATGAAAGACGTTGTTGCCATGCTCACCGAGATAAGGGATA
TTGATGTTGGATGTTCTGAGATTGATAAGATAAAAGATGGTGGTAGTTGCGGAAGCAAAG
AGCCGCAGGTGATATCGCATGAGAAAATCATCATCTCTCACGGTTCATCTAATTGTTCAT
TTGCCTTCTCGGATGACTCTGTTTGAAACATACTAACGGTGAAAAGTGTGAATTGTGTGT
GTATTTACAAAGTTGTGTGAATAAATTTTGTTGGAATTTTAAGCATTTTGAACAGTTTTT
GTGCAAGGGTCGACACAACAGAAAGTCTTATAATTGCAATAGATTTATTTCTGT

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 2

CO CL5371Contig1 784 2 2 U
GGAGTTTCAATCCTGTTTACGACATCAACCTTTATCGCAGCGAACTCTCAAAGGTTTGTC
TTCTTAAGTCGATTTGCTGCTACACAAAAGATCTGTAAACTCAACTGTCTTAGACCACAA
CATGGCCAACTTCGATGGGCCAGGGTTTGCGATGGTTGACGGTTACTGGATCCAGACCAA
AGCCATAGACGTCGAATCATCAACCGACATCTCTCCGTACCTCTCCCGTCTCTCCTCGGT
GAAGCTGAGCACCAAGAACTTGTGTCTCTTCCTCCGCCTCCCGAACCCGTTCACCGACAA
CCTCAAGGATCTCTACCGCTTCTTCGCTTCCAAGTTCGTCACGTTCGTCGGCGTTCAGAT
CCAAGAAGACCTTGTCTTGCTCAAGGAGAATCACGGGATTGTGATCAGGAGCTCCTTGGA
GATTGGGAAGCTTGCTGCGAAAGCGAGAGGGACTCCGATCGTTGAGTTCCTTGGGACGAG
GGAGTTGGCTCATAAGATACTTTGGTATGATATGAGCAGGCTCGATTCGATTCAGTCCAA
GTGGGATGAAGCTGGGGGGAATGATCGTCTTGAAGCTGCGGCTATTGAAGGTTGGCTTAT
TTATAGTGTTTATGATCAGTTGCAGCAGTGATGTGTTGTTCTTGATCTTATGGATTTTCT
GAGACTGCTTGCGCTTGATATTGATTGCAGTTTGTGCATTTTGATCTCTTTGTTGGTTGT
TATGAGTGAACAAAATAATAATGTACTGAATAAAGAAAAAAAAACATGTCGGGCTTGTTT
TCTT


BQ
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10 10 10 10 

AF RS1GI75TF U 1
AF RS1GI75JQ C 224
BS 1 527 RS1GI75TF
BS 528 784 RS1GI75JQ

RD RS1GI75TF 527 0 0
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TTCTTAAGTCGATTTGCTGCTACACAAAAGATCTGTAAACTCAACTGTCTTAGACCACAA
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AGCCATAGACGTCGAATCATCAACCGACATCTCTCCGTACCTCTCCCGTCTCTCCTCGGT
GAAGCTGAGCACCAAGAACTTGTGTCTCTTCCTCCGCCTCCCGAACCCGTTCACCGACAA
CCTCAAGGATCTCTACCGCTTCTTCGCTTCCAAGTTCGTCACGTTCGTCGGCGTTCAGAT
CCAAGAAGACCTTGTCTTGCTCAAGGAGAATCACGGGATTGTGATCAGGAGCTCCTTGGA
GATTGGGAAGCTTGCTGCGAAAGCGAGAGGGACTCCGATCGTTGAGTTCCTTGGGACGAG
GGAGTTGGCTCATAAGATACTTTGGTATGATATGAGCAGGCTCGATT

QA 1 527 1 527
DS 

RD RS1GI75JQ 561 0 0
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AACCCGTTCACCGACAACCTCAAGGATCTCTACCGCTTCTTCGCTTCCAAGTTCGTCACG
TTCGTCGGCGTTCAGATCCAAGAAGACCTTGTCTTGCTCAAGGAGAATCACGGGATTGTG
ATCAGGAGCTCCTTGGAGATTGGGAAGCTTGCTGCGAAAGCGAGAGGGACTCCGATCGTT
GAGTTCCTTGGGACGAGGGAGTTGGCTCATAAGATACTTTGGTATGATATGAGCAGGCTC
GATTCGATTCAGTCCAAGTGGGATGAAGCTGGGGGGAATGATCGTCTTGAAGCTGCGGCT
ATTGAAGGTTGGCTTATTTATAGTGTTTATGATCAGTTGCAGCAGTGATGTGTTGTTCTT
GATCTTATGGATTTTCTGAGACTGCTTGCGCTTGATATTGATTGCAGTTTGTGCATTTTG
ATCTCTTTGTTGGTTGTTATGAGTGAACAAAATAATAATGTACTGAATAAAGAAAAAAAA
ACATGTCGGGCTTGTTTTCTT

QA 1 561 1 561
DS 



AS 1 2

CO CL5372Contig1 464 2 3 U
GTGCAAAGACGAAGCTGTAACTGTAAGTAGAAATACATCACGTCATGTGGGCAGTCAAAT
CTCAAATCTGTTTAAAAAGTTTTATACAAGAGGAGAGAGACAAACTTGTGTGCTTCCTCC
ATCACTTTCCGACTCTAAAACAGATGGAATTTTGTTCAAAAAGAAACCTGGAGAATCTCA
AATCCCAAATAAAAGCCAAAGTTTCAGGAAACGGATGACAAAAATAGGAAGGTAAAAGCT
GATTTTGTTGCGTCAGTGGGCGATACATATCTTTTTTTTTTTTTTGGAATACGGATGAAA
TGATAATAAATACTCAAAGTTCCTTATGCTGAAAATACAATCAGCCTCACAAGCCACGAG
GGAAGTTGTTGATCTGTCCTTCCTCCAGTACATCTTTTCCGTTTACTTTGTACCCAATCC
TCATGCGCATCACAAGAAATTTCTTTCCGTGCTGGCTGTTAGTG


BQ
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AF RS1A227TR U 1
AF RS1A227JQ U 1
BS 1 298 RS1A227JQ
BS 299 299 RS1A227TR
BS 300 464 RS1A227JQ

RD RS1A227TR 355 0 0
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CTCAAATCTGTTTAAAAAGTTTTATACAAGAGGAGAGAGACAAACTTGTGTGCTTCCTCC
ATCACTTTCCGACTCTAAAACAGATGGAATTTTGTTCAAAAAGAAACCTGGAGAATCTCA
AATCCCAAATAAAAGCCAAAGTTTCAGGAAACGGATGACAAAAATAGGAAGGTAAAAGCT
GATTTTGTTGCGTCAGTGGGCGATACATATCTTTTTTTTTTTTTTGGAATACGGATGAAA
TGATAATAAATACTCAAAGTTCCTTATGCTGAAAATACAATCAGCCTCACAAGCC

QA 1 355 1 355
DS 

RD RS1A227JQ 464 0 0
GTGCAAAGACGAAGCTGTAACTGTAAGTAGAAATACATCACGTCATGTGGGCAGTCAAAT
CTCAAATCTGTTTAAAAAGTTTTATACAAGAGGAGAGAGACAAACTTGTGTGCTTCCTCC
ATCACTTTCCGACTCTAAAACAGATGGAATTTTGTTCAAAAAGAAACCTGGAGAATCTCA
AATCCCAAATAAAAGCCAAAGTTTCAGGAAACGGATGACAAAAATAGGAAGGTAAAAGCT
GATTTTGTTGCGTCAGTGGGCGATACATATCTTTTTTTTTTTTTTGGAATACGGATGATA
TGATAATAAATACTCAAAGTTCCTTATGCTGAAAATACAATCAGCCTCACAAGCCACGAG
GGAAGTTGTTGATCTGTCCTTCCTCCAGTACATCTTTTCCGTTTACTTTGTACCCAATCC
TCATGCGCATCACAAGAAATTTCTTTCCGTGCTGGCTGTTAGTG

QA 1 464 1 464
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GTGTGTACTTATTCTGGGATCCAGACTATGCGTTCTTGTCTCTCGGGAAGTATTCTGCAA
TACAGGAGATTAACTGGGTGAGAGAGAACCAAGTTCACTGCCAGGGTCTTGAGTATTACT
ATCTTGGCTATTATATACATTCTTGTAGCAAGATGAGATATAAAGCATCTTATCGTCCCT
CCGAGCTTCTATGTCCTCTCCGTTTCCAGTGGGTTCCATTTGAAGTAGCGAGACCATTGC
TTGATAGAAAGCCATATGTCATCTTGTCTGATATCACGGAATCACAAAACCAATGTTCTT
CTTCGCTACCTCATGGTTCCGAACCGAGGACAAATGAACATGAAGAGATGGAACAAGGGG
AGACGAATGACCATTTTATGGGCGGCAGTGATGATGATGATGATGATGAAGAAATGGATG
AAAGTGAATCAGAAGACACTCACATTGAGTCAGATATAGACAACATCATTGTCGGTCTTT
ATGGATCGCAATATAGATACAAGGATTTACGGAAAATGCTGACTCCTGTGGGCCGGAAGC
AATTGGAGCCGATGTTGCAGAGCTACCGTAAGGTTGTGGTAGACGAGCTTTCAGAGAGGA
TGGTGTATGAGCTCAGGTAAAGGCTTAATATCAAACTCCATTGAGCTCGTTAATTATCAC
AAATACTAAATAAATTGTTTGTATTAATTTCGTTCTGAGAGTTTTGTCATGTTTCAGTTT
GTTGTCTGCATGAGAATTCTTGTGTACACTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EG85TF U 1
AF RS1EG85JQ C 369
BS 1 559 RS1EG85TF
BS 560 813 RS1EG85JQ

RD RS1EG85TF 559 0 0
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GTGTGTACTTATTCTGGGATCCAGACTATGCGTTCTTGTCTCTCGGGAAGTATTCTGCAA
TACAGGAGATTAACTGGGTGAGAGAGAACCAAGTTCACTGCCAGGGTCTTGAGTATTACT
ATCTTGGCTATTATATACATTCTTGTAGCAAGATGAGATATAAAGCATCTTATCGTCCCT
CCGAGCTTCTATGTCCTCTCCGTTTCCAGTGGGTTCCATTTGAAGTAGCGAGACCATTGC
TTGATAGAAAGCCATATGTCATCTTGTCTGATATCACGGAATCACAAAACCAATGTTCTT
CTTCGCTACCTCATGGTTCCGAACCGAGGACAAATGAACATGAAGAGATGGAACAAGGGG
AGACGAATGACCATTTTATGGGCGGCAGTGATGATGATGATGATGATGAAGAAATGGATG
AAAGTGAATCAGAAGACACTCACATTGAGTCAGATATAGACAACATCATTGTCGGTCTTT
ATGGATCGCAATATAGATA

QA 1 559 1 559
DS 

RD RS1EG85JQ 445 0 0
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GACCATTTTATGGGCGGCAGTGATGATGATGATGATGATGAAGAAATGGATGAAAGTGAA
TCAGAAGACACTCACATTGAGTCAGATATAGACAACATCATTGTCGGTCTTTATGGATCG
CAATATAGATACAAGGATTTACGGAAAATGCTGACTCCTGTGGGCCGGAAGCAATTGGAG
CCGATGTTGCAGAGCTACCGTAAGGTTGTGGTAGACGAGCTTTCAGAGAGGATGGTGTAT
GAGCTCAGGTAAAGGCTTAATATCAAACTCCATTGAGCTCGTTAATTATCACAAATACTA
AATAAATTGTTTGTATTAATTTCGTTCTGAGAGTTTTGTCATGTTTCAGTTTGTTGTCTG
CATGAGAATTCTTGTGTACACTGTT

QA 1 445 1 445
DS 



AS 1 2

CO CL5375Contig1 1130 2 12 U
GGAGGGCTCCACTTCTCTTTCCTACCATCACGTTTTCTCGAGATTTGAATAGTTTTTCGA
AGATATTTGGTCATTGGATGAAACTAGAGACAAAAGAAAAGGATGAAGATTCAGTGTAAC
GTGTGCGAGGCGGCGGAAGCGGCGGTGCTATGTTGCGCCGACGAAGCTGCGTTGTGTTTG
GCTTGCGATGAGAAAGTTCACGCCGCTAATAAACTCGCCGGAAAACACCAGAGACTCCCT
CTCTCTGTCTCTTCCTCTTCCATACCCAAATGCGACATCTGTCAGGAAGCTTCTGGATTC
TTCTTTTGTCTGCAAGACAGAGCTTTGCTATGTAGGAAATGTGATGTAGCAATCCACACT
GTGAACCCTCATGTTTCAGCTCACCAGCGGTTTCTTCTCACTGGAATCAGAGTTGGTCTT
GAGTCTACTACGGACACTGGTCCTTCTACAAAACCTTCACCACCATCCAATGATGATAAA
ACCAGTGAGACAAAACAAGTTAACTTGCCAATATCTGAGTCTCAGAAGATGGACTTTAGT
CATCATCATCATCAGGTTGTTTTACCGGAAACTAATGTAAGTGATCACATTTCGACAAAG
CTCCCTTTTGCAAGCAGTGGATCAGCTGCTGGGAGCATTCCTCAGTGGCAAATAGAGGAG
ATTTTCAGATTAACTGATTTCAGTCAGAGCTATGAATACATGGAGATCAATGGATCATCT
AAGGCGGATACTAGTAAGCGAGGAGATTCAGACAGCTCTTCAATGATGCGGTCTGGAGAA
GAAGATGGAGAAGATAACAGTAACTGCTTGGGAGGGGAGACATCATGGGCTGTTCCACAG
ATTCCTTCTCCACCAACAGCTTTTGGTTTAAACTGGCCCAAACATTTTAACCGCCACTCA
GCAGTGTTTGTTCCGGACATATTTTCCTCAACTCCTTACACAGGTTCTTCCCCTAACCAG
AGGGTTGGGAAGCGGCGGCGACGGTTTTAAGCCATTTTCAACAACCGGCTGGTTTGTCAA
GAGAGAATGTGAGACCATTACAATGATCTGGAAACTGGTGTTATTGTAGTTTGCATGTTA
ATCAATGTTGAATGTTTCTTTGTTATATTAATTTAAAAACATGATTTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EG05TF U 1
AF RS1EG05JQ C 447
BS 1 723 RS1EG05TF
BS 724 724 RS1EG05JQ
BS 725 747 RS1EG05TF
BS 748 748 RS1EG05JQ
BS 749 791 RS1EG05TF
BS 792 792 RS1EG05JQ
BS 793 796 RS1EG05TF
BS 797 797 RS1EG05JQ
BS 798 802 RS1EG05TF
BS 803 803 RS1EG05JQ
BS 804 820 RS1EG05TF
BS 821 1130 RS1EG05JQ

RD RS1EG05TF 820 0 0
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AGATATTTGGTCATTGGATGAAACTAGAGACAAAAGAAAAGGATGAAGATTCAGTGTAAC
GTGTGCGAGGCGGCGGAAGCGGCGGTGCTATGTTGCGCCGACGAAGCTGCGTTGTGTTTG
GCTTGCGATGAGAAAGTTCACGCCGCTAATAAACTCGCCGGAAAACACCAGAGACTCCCT
CTCTCTGTCTCTTCCTCTTCCATACCCAAATGCGACATCTGTCAGGAAGCTTCTGGATTC
TTCTTTTGTCTGCAAGACAGAGCTTTGCTATGTAGGAAATGTGATGTAGCAATCCACACT
GTGAACCCTCATGTTTCAGCTCACCAGCGGTTTCTTCTCACTGGAATCAGAGTTGGTCTT
GAGTCTACTACGGACACTGGTCCTTCTACAAAACCTTCACCACCATCCAATGATGATAAA
ACCAGTGAGACAAAACAAGTTAACTTGCCAATATCTGAGTCTCAGAAGATGGACTTTAGT
CATCATCATCATCAGGTTGTTTTACCGGAAACTAATGTAAGTGATCACATTTCGACAAAG
CTCCCTTTTGCAAGCAGTGGATCAGCTGCTGGGAGCATTCCTCAGTGGCAAATAGAGGAG
ATTTTCAGATTAACTGATTTCAGTCAGAGCTATGAATACATGGAGATCAATGGATCATCT
AAG*CGGATACTAGTAAGCGAGGAGAT*CAGACAGCTCTTCAATGATGCGGTCTGGAGAA
GAAGATGGAGA*GATA*CAGTA*CTGCTTGGGAGGGGAGA

QA 1 820 1 820
DS 

RD RS1EG05JQ 684 0 0
TACAAAACCTTCACCACCATCCAATGATGATAAAACCAGTGAGACAAAACAAGTTAACTT
GCCAATATCTGAGTCTCAGAAGATGGACTTTAGTCATCATCATCATCAGGTTGTTTTACC
GGAAACTAATGTAAGTGATCACATTTCGACAAAGCTCCCTTTTGCAAGCAGTGGATCAGC
TGCTGGGAGCATTCCTCAGTGGCAAATAGAGGAGATTTTCAGATTAACTGATTTCAGTCA
GAGCTATGAATACATGGAGATCAATGGATCATTTAAGGCGGATACTAGTAAGCGAGGAGA
TTCAGACAGCTCTTCAATGATGCGGTCTGGAGAAGAAGATGGAGAAGATAACAGTAACTG
CTTGGGAGGGGAGACATCATGGGCTGTTCCACAGATTCCTTCTCCACCAACAGCTTTTGG
TTTAAACTGGCCCAAACATTTTAACCGCCACTCAGCAGTGTTTGTTCCGGACATATTTTC
CTCAACTCCTTACACAGGTTCTTCCCCTAACCAGAGGGTTGGGAAGCGGCGGCGACGGTT
TTAAGCCATTTTCAACAACCGGCTGGTTTGTCAAGAGAGAATGTGAGACCATTACAATGA
TCTGGAAACTGGTGTTATTGTAGTTTGCATGTTAATCAATGTTGAATGTTTCTTTGTTAT
ATTAATTTAAAAACATGATTTTTG

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL5376Contig1 1232 2 6 U
GGAGTCAGCAAAGGAGCTCAAGAAAATGATTGCTTTCAACACGTTAGTTGTGACTGAAAT
GGTGGCTGACATTAAGGGAGAATCTTCTGACAAGGAACCTGAAGAGCCTGTTCAAGTGAA
AGCAGAAGATGGCGAAGATGAGGAATGGGGATCCCTTGAATCGCTCAAAAAGACAAGACC
TGACAAAGAACTCTCCGAGAAGATGGGAAAGCCTGGCCAGACTGAGATAACTCTCAAAGA
TGACCTTCCCGACAGAGACAGGATCGATCTCTACAAAACGTACCTGCTCTACTGTGTGAC
GGGAGAGGTCACAAGAATCCCGTTTGGCGCCCAGATCACAACAAAGAGAGACGACTCAGA
GTACTTGCTTCTCAATCAGCTCGGTGGGATTCTCGGATTTACTTCGAAAGAAATAGTCAA
CATTCACGTAGGTTTAGCCGAGCAGGCTTTCAGGCAACAAGCTGAAGTGATTTTAGCTGA
TGGGCAACTGACAAAAGCTAGAGTAGAGCAGTTAGACGAGCTGCAGAAACAAGTTGGGTT
ACCTCAGCCACAAGCTGAGAAGGTTATAAAGAACATAACGACCACAAAAATGGCGAACGC
GATAGAAACTGCTGTTAACCAAGGAAGACTGAACATAAAGCAAATACGTGAGCTCAAGGA
AGCAAACGTCAGCCTAGACAGCATGATCGCTGTGAGTCTGAGAGAGAAGCTATTCAAGAA
GACGGTGAATGATATATTCTCATCAGGAACAGGCGAGTTCGATGAAACGGAAGTCTACGA
GACCATCCCGTCTGATCTCAGTATCGATGTTGAAAAGGCGAAGAGCGTTGTCCATGATCT
TGCTAGGAGTAGACTGTCAAACTCCCTGATCCAATCCGTAGCATTACTCAGGCAAAGAAA
CCGTAAAGGAGTGGTCTCGTCGTTGAATGATTTACTGGCATGCGACAAAGCTGTACCGGC
TGAGCCACTGTCATGGGAAGTCGCAGAGGAACTGTCTGATCTGTATGACATTTATTCAAA
GAGTGATCCCAAACCTGCGCCTGAAAAAGTGTCGAGGCTACAATATCTACTGGGGATAGA
TGATTCAACTGCAACTGCCCTCCGTGAGATGGAAGATGGGGTGTTCTCTTCAGCTGCAGA
AGAGGGCAACTTTGTCTTCTAAATCTTTTGATGAATATGTCTTTAGCTTTTGAAAACGAT
TTGATTGAGAGATGAAAAATGATTTTTGAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EP39TF U 1
AF RS1EP39JQ C 443
BS 1 719 RS1EP39TF
BS 720 720 RS1EP39JQ
BS 721 724 RS1EP39TF
BS 725 725 RS1EP39JQ
BS 726 743 RS1EP39TF
BS 744 1232 RS1EP39JQ

RD RS1EP39TF 743 0 0
GGAGTCAGCAAAGGAGCTCAAGAAAATGATTGCTTTCAACACGTTAGTTGTGACTGAAAT
GGTGGCTGACATTAAGGGAGAATCTTCTGACAAGGAACCTGAAGAGCCTGTTCAAGTGAA
AGCAGAAGATGGCGAAGATGAGGAATGGGGATCCCTTGAATCGCTCAAAAAGACAAGACC
TGACAAAGAACTCTCCGAGAAGATGGGAAAGCCTGGCCAGACTGAGATAACTCTCAAAGA
TGACCTTCCCGACAGAGACAGGATCGATCTCTACAAAACGTACCTGCTCTACTGTGTGAC
GGGAGAGGTCACAAGAATCCCGTTTGGCGCCCAGATCACAACAAAGAGAGACGACTCAGA
GTACTTGCTTCTCAATCAGCTCGGTGGGATTCTCGGATTTACTTCGAAAGAAATAGTCAA
CATTCACGTAGGTTTAGCCGAGCAGGCTTTCAGGCAACAAGCTGAAGTGATTTTAGCTGA
TGGGCAACTGACAAAAGCTAGAGTAGAGCAGTTAGACGAGCTGCAGAAACAAGTTGGGTT
ACCTCAGCCACAAGCTGAGAAGGTTATAAAGAACATAACGACCACAAAAATGGCGAACGC
GATAGAAACTGCTGTTAACCAAGGAAGACTGAACATAAAGCAAATACGTGAGCTCAAGGA
AGCAAACGTCAGCCTAGACAGCATGATCGCTGTGAGTCTGAGAGAGAAGCTATTCAAGA*
GACG*TGAATGATATATTCTCAT

QA 1 743 1 743
DS 

RD RS1EP39JQ 790 0 0
CAGGCTTTCAGGCAACAAGCTGAAGTGATTTTAGCTGATGGGCAACTGACAAAAGCTAGA
GTAGAGCAGTTAGACGAGCTGCAGAAACAAGTTGGGTTACCTCAGCCACAAGCTGAGAAG
GTTATAAAGAACATAACGACCACAAAAATGGCGAACGCGATAGAAACTGCTGTTAACCAA
GGAAGACTGAACATAAAGCAAATACGTGAGCTCAAGGAAGCAAACGTCAGCCTAGACAGC
ATGATCGCTGTGAGTCTGAGAGAGAAGCTATTCAAGAAGACGGTGAATGATATATTCTCA
TCAGGAACAGGCGAGTTCGATGAAACGGAAGTCTACGAGACCATCCCGTCTGATCTCAGT
ATCGATGTTGAAAAGGCGAAGAGCGTTGTCCATGATCTTGCTAGGAGTAGACTGTCAAAC
TCCCTGATCCAATCCGTAGCATTACTCAGGCAAAGAAACCGTAAAGGAGTGGTCTCGTCG
TTGAATGATTTACTGGCATGCGACAAAGCTGTACCGGCTGAGCCACTGTCATGGGAAGTC
GCAGAGGAACTGTCTGATCTGTATGACATTTATTCAAAGAGTGATCCCAAACCTGCGCCT
GAAAAAGTGTCGAGGCTACAATATCTACTGGGGATAGATGATTCAACTGCAACTGCCCTC
CGTGAGATGGAAGATGGGGTGTTCTCTTCAGCTGCAGAAGAGGGCAACTTTGTCTTCTAA
ATCTTTTGATGAATATGTCTTTAGCTTTTGAAAACGATTTGATTGAGAGATGAAAAATGA
TTTTTGAATC

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 2

CO CL5377Contig1 349 2 1 U
GGCAGTGAGGTCATGAACGAGGTGGCTGAGTATGATAGTGAGGGGATCATTGAGCTACAT
AATTACTGCACGAGCGTGTATGAGGAAGGAGACGCGAGATCAGCACTAATCACGATGTTG
CAGTCATTGCACCACGCCAAGAACGGCATTGACATTGTGTCAGGTACCAGGGTCCGAACC
CATTTCGCGAGACCTGATTGGCGCAGCGTTTTCAAGCATGTTGCGGTGAACCACGTCAAT
CAACGAGTTGGGGTTTTCTACTGTGGTAAATCATGCATCATAGGAGAGTTGAAGGGACTG
GCTCAAGATTTCTCTAGGAAAACTTCGACCAAGTTTGAGTTCCACAAGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EE13JQ C 1
AF RS1EE13TF U 1
BS 1 349 RS1EE13TF

RD RS1EE13JQ 349 0 0
GGCAGTGAGGTCATGAACGAGGTGGCTGAGTATGATAGTGAGGGGATCATTGAGCTACAT
AATTACTGCACGAGCGTGTATGAGGAAGGAGACGCGAGATCAGCACTAATCACGATGTTG
CAGTCATTGCACCACGCCAAGAACGGCATTGACATTGTGTCAGGTACCAGGGTCCGAACC
CATTTCGCGAGACCTGATTGGCGCAGCGTTTTCAAGCATGTTGCGGTGAACCACGTCAAT
CAACGAGTTGGGGTTTTCTACTGTGGTAAATCATGCATCATAGGAGAGTTGAAGGGACTG
GCTCAAGATTTCTCTAGGAAAACTTCGACCAAGTTTGAGTTCCACAAGG

QA 1 349 1 349
DS 

RD RS1EE13TF 349 0 0
GGCAGTGAGGTCATGAACGAGGTGGCTGAGTATGATAGTGAGGGGATCATTGAGCTACAT
AATTACTGCACGAGCGTGTATGAGGAAGGAGACGCGAGATCAGCACTAATCACGATGTTG
CAGTCATTGCACCACGCCAAGAACGGCATTGACATTGTGTCAGGTACCAGGGTCCGAACC
CATTTCGCGAGACCTGATTGGCGCAGCGTTTTCAAGCATGTTGCGGTGAACCACGTCAAT
CAACGAGTTGGGGTTTTCTACTGTGGTAAATCATGCATCATAGGAGAGTTGAAGGGACTG
GCTCAAGATTTCTCTAGGAAAACTTCGACCAAGTTTGAGTTCCACAAGG

QA 1 349 1 349
DS 



AS 1 2

CO CL5378Contig1 1076 2 2 U
GGAAAGGCAAAACACAGTTTGGGTCAAAACTTTCCATTTTATTACACAGAAACAAAATTC
GTAGATCGTTAAAAGAAGGAAACCAAATCCCCTCTCTCCCCAATTCAATTCAAGCTCTTC
GTCCTTCATCAGATCTGATCCCCCTCGATTCATCCGCCATTCTTCGAAAGGGGTGTTGAT
TGGTGATAAATCGGGAAAGGAAAAATGGCGAGTAGGATGGATCAGGAATACGATTATTTG
TTTAAGATCGTGTTGATCGGAGACTCGGGTGTGGGGAAATCGAACATCTTGTCCAGATTC
ACCAGGAATGAGTTCTGCTTGGAATCCAAATCCACCATCGGTGTCGAATTCGCCACTAGA
ACTACTCAGGTGGAAGGAAAGACGATCAAAGCTCAGATCTGGGACACTGCAGGCCAGGAG
AGGTACAGAGCCATCACCAGCGCTTACTACAGAGGCGCGGTGGGTGCACTCCTTGTCTAC
GACATCACCAAGAGGCAGACATTCGACAACGCCCTGAGGTGGCTCCGCGAACTCAGAGAC
CATGCTGATTCCAACATCGTCATCATGATGGCTGGTAACAAATCCGATCTCAACCACTTG
AGATCCGTCGCTGAGGAGGATGGTCAGAACCTGGCCGAGAAGGAAGGTCTCTCTTTCCTG
GAGACGTCTGCCCTCGAAGCTACAAACGTGGAGAAAGCGTTTCAGACCATCTTGGGAGAG
ATCTACCACACCATAAGCAAGAAGGCACTGGCTGCACAAGAAGCAGCTGCAGCTAACTCC
GCGATTCCGGGCCAGGGAACTACGATTAACGTCGATGATACGTCTGGAGGCGTGAAACGA
GGTTGCTGCTCTACCTAAAACGGAAAAGGTAATAATATACGTTGTTTTCTGGCTTCCCAA
GATTCAAAACTTTTGTCTTCATTGGCTTATTCCTTATCCCTTATCCCAAGATTCGAACTT
TTGTTTTCATTGGCTCCTCTTTCGTTTCAACTTTTGGCTCATGCAAGACCATGTAGAATA
CTTGTCACTTACTCTGTTTTTATTTTTTCTTAATGCTCTTCGGCTGTGTTCATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B145TF U 1
AF RS1B145JQ C 295
BS 1 646 RS1B145TF
BS 647 1076 RS1B145JQ

RD RS1B145TF 653 0 0
GGAAAGGCAAAACACAGTTTGGGTCAAAACTTTCCATTTTATTACACAGAAACAAAATTC
GTAGATCGTTAAAAGAAGGAAACCAAATCCCCTCTCTCCCCAATTCAATTCAAGCTCTTC
GTCCTTCATCAGATCTGATCCCCCTCGATTCATCCGCCATTCTTCGAAAGGGGTGTTGAT
TGGTGATAAATCGGGAAAGGAAAAATGGCGAGTAGGATGGATCAGGAATACGATTATTTG
TTTAAGATCGTGTTGATCGGAGACTCGGGTGTGGGGAAATCGAACATCTTGTCCAGATTC
ACCAGGAATGAGTTCTGCTTGGAATCCAAATCCACCATCGGTGTCGAATTCGCCACTAGA
ACTACTCAGGTGGAAGGAAAGACGATCAAAGCTCAGATCTGGGACACTGCAGGCCAGGAG
AGGTACAGAGCCATCACCAGCGCTTACTACAGAGGCGCGGTGGGTGCACTCCTTGTCTAC
GACATCACCAAGAGGCAGACATTCGACAACGCCCTGAGGTGGCTCCGCGAACTCAGAGAC
CATGCTGATTCCAACATCGTCATCATGATGGCTGGTAACAAATCCGATCTCAACCACTTG
AGATCCGTCGCTGAGGAGGATGGTCAGAACCTGGCCGAGAAGGAAG
TCTCTCT

QA 1 646 1 646
DS 

RD RS1B145JQ 782 0 0
CAGA
TCACCAGGAATGAGT*CTGCTTGGAATCCAAATCCACCATCGGTGTCGAATTCGCCACTA
GAACTACTCAGGTGGAAGGAAAGACGATCAAAGCTCAGATCTGGGACACTGCAGGCCAGG
AGAGGTACAGAGCCATCACCAGCGCTTACTACAGAGGCGCGGTGGGTGCACTCCTTGTCT
ACGACATCACCAAGAGGCAGACATTCGACAACGCCCTGAGGTGGCTCCGCGAACTCAGAG
ACCATGCTGATTCCAACATCGTCATCATGATGGCTGGTAACAAATCCGATCTCAACCACT
TGAGATCCGTCGCTGAGGAGGATGGTCAGAACCTGGCCGAGAAGGAAGGTCTCTCTTTCC
TGGAGACGTCTGCCCTCGAAGCTACAAACGTGGAGAAAGCGTTTCAGACCATCTTGGGAG
AGATCTACCACACCATAAGCAAGAAGGCACTGGCTGCACAAGAAGCAGCTGCAGCTAACT
CCGCGATTCCGGGCCAGGGAACTACGATTAACGTCGATGATACGTCTGGAGGCGTGAAAC
GAGGTTGCTGCTCTACCTAAAACGGAAAAGGTAATAATATACGTTGTTTTCTGGCTTCCC
AAGATTCAAAACTTTTGTCTTCATTGGCTTATTCCTTATCCCTTATCCCAAGATTCGAAC
TTTTGTTTTCATTGGCTCCTCTTTCGTTTCAACTTTTGGCTCATGCAAGACCATGTAGAA
TACTTGTCACTTACTCTGTTTTTATTTTTTCTTAATGCTCTTCGGCTGTGTTCATTTT

QA 5 782 5 782
DS 



AS 1 2

CO CL5379Contig1 889 2 2 U
GGAGTTTAACAGCTATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAACTTTGGAA
AAACATTCGCCGCCTCTAGGACGAAGAAGAAAATGGCCGGAGGAGGCGGATACGGCGGCG
CATCGGGAAAAGTGGATTACGTGTTCAAGGTAGTTCTGATCGGAGATTCAGCAGTTGGGA
AATCACAGCTACTAGCTCGATTCGCAAGAGACGAGTTCAGCTTGGACTCCAAAGCCACCA
TCGGTGTCGAGTTTCAGACTCGTACGCTCCTCATTGAAGAGAAGAGCGTCAAGGCTCAGA
TCTGGGATACCGCCGGCCAAGAAAGATACAGAGCGGTTACGAGCGCATACTACAGAGGAG
CAGTTGGTGCGATGCTTGTTTATGATATCACCAAGCGTGAGACCTTTGACCACATCCCTC
GTTGGCTTGAAGAATTGCGAGCTCATGCTGATAAGAACATTGTCATCATCCTCATTGGTA
ACAAGTCTGATCTCGAAGATCAGAGAGCGATTCCCACCGAAGACGCTAAAGAGTTTCCTG
AGAAGGAAGGTCTTTTCTTCCTCGAGACCTTTGCTTTGAACGCAACCAATGTCGAAAACT
CCTTCAACACTCTCATGACAGAGATCTTCAACACTGTTAACAAGAAGAGTCTCTCATCTG
CTGGTGAGTCTAATAACCCTGGTTCGTTGGCTGGTAAGAAGATTGTCATCCCAGGTCCTG
GACAGGAGGTTCCCGCTAAGACCAGCACGTGTTGTAGTTCTGCTTGATCTGTGTCGTTTA
CAAAAGCAAAAATTCATTTGTCCCGTCTCCCCCTTTGAACTATGGTGATGATAGAGAATG
CTTACTTTCATATTGTATATTCTTTTTGGAATCTGGCTTGTGTTACTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1E370TF U 1
AF RS1E370JQ C 235
BS 1 542 RS1E370TF
BS 543 889 RS1E370JQ

RD RS1E370TF 542 0 0
GGAGTTTAACAGCTATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAACTTTGGAA
AAACATTCGCCGCCTCTAGGACGAAGAAGAAAATGGCCGGAGGAGGCGGATACGGCGGCG
CATCGGGAAAAGTGGATTACGTGTTCAAGGTAGTTCTGATCGGAGATTCAGCAGTTGGGA
AATCACAGCTACTAGCTCGATTCGCAAGAGACGAGTTCAGCTTGGACTCCAAAGCCACCA
TCGGTGTCGAGTTTCAGACTCGTACGCTCCTCATTGAAGAGAAGAGCGTCAAGGCTCAGA
TCTGGGATACCGCCGGCCAAGAAAGATACAGAGCGGTTACGAGCGCATACTACAGAGGAG
CAGTTGGTGCGATGCTTGTTTATGATATCACCAAGCGTGAGACCTTTGACCACATCCCTC
GTTGGCTTGAAGAATTGCGAGCTCATGCTGATAAGAACATTGTCATCATCCTCATTGGTA
ACAAGTCTGATCTCGAAGATCAGAGAGCGATTCCCACCGAAGACGCTAAAGAGTTTCCTG
AG

QA 1 542 1 542
DS 

RD RS1E370JQ 655 0 0
CCC
CCATCGGTGTCGAGTTTCAGACTCGTACGCTCCTCATTGAAGAGAAGAGCGTCAAGGCTC
AGATCTGGGATACCGCCGGCCAAGAAAGATACAGAGCGGTTACGAGCGCATACTACAGAG
GAGCAGTTGGTGCGATGCTTGTTTATGATATCACCAAGCGTGAGACCTTTGACCACATCC
CTCGTTGGCTTGAAGAATTGCGAGCTCATGCTGATAAGAACATTGTCATCATCCTCATTG
GTAACAAGTCTGATCTCGAAGATCAGAGAGCGATTCCCACCGAAGACGCTAAAGAGTTTC
CTGAGAAGGAAGGTCTTTTCTTCCTCGAGACCTTTGCTTTGAACGCAACCAATGTCGAAA
ACTCCTTCAACACTCTCATGACAGAGATCTTCAACACTGTTAACAAGAAGAGTCTCTCAT
CTGCTGGTGAGTCTAATAACCCTGGTTCGTTGGCTGGTAAGAAGATTGTCATCCCAGGTC
CTGGACAGGAGGTTCCCGCTAAGACCAGCACGTGTTGTAGTTCTGCTTGATCTGTGTCGT
TTACAAAAGCAAAAATTCATTTGTCCCGTCTCCCCCTTTGAACTATGGTGATGATAGAGA
ATGCTTACTTTCATATTGTATATTCTTTTTGGAATCTGGCTTGTGTTACTCG

QA 4 655 4 655
DS 



AS 1 2

CO CL5380Contig1 1193 2 16 U
GGAAGCTTTGAAGCCATCAAGGGTCCGTCTAACCTTAGATTTTCTCCGTCCCCAGTGAGA
AAAGGTTCGTCTTTTCTGCCCAGATGCTCGATTTCCACCTCGACCGTTTCCGATTCCGAC
AGCCCTTTCCTTAGCAAGTTCCGACAGCTTCTCGATAAAGTCTCTCAGGTGAAAGTGAAG
CCCTTTGATGCCGTCAAGTTAACTCTTGTACTATCAATTGCGACTCTGGCCGCGAAAAAG
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TGCCTCGGCGAAGCCAACGCCTTTGAGCAGCTTGGCGTCGTAACTTCACTCTTCACGTGG
CTTACCCTCGTCCCTCCTGCTTACTTCAATGGCTATCTCCAAGGCTGGCCCTTTGTCTTC
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GACTACTACGCACGCACTCACGATCCCAAATGGGATGTGGAGACGCCTCTGTGGTCTCGT
GTTTTGTTCGGTGTTGACGTCGTGGTTGGACACTGGCTCGCGGCTTTCGAAGGCCCCGAG
CTCCACCGTTTACCAGGTGGTTGGGCTAATGTAGGGATATGGGGTTTGATTGTGGTTACA
ATGCTTATGCATTATGATTCGACGCTTTATCTAGCTAGATATTCAGAAAAAGTGGTTGTT
CCGACGGATGTTGTGCAGTTTGGTCCTTATAGATGGATCAGGCATCCGATATACGCTTCT
ACGATGCTTCTTTTCTCCACGTACTGCACCGCGCTGCGTGCGCCGTTGAGTCTGTTGTTT
CTTGTGGCGGTTTGTTTGGTTTACTACAGCAAGAAGGCAAAGCAGGAGGAAGAGTTGATG
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CTGGTATCTATCTATCAGTCAAAGATGTATGAATGAAGATGAGTTGGATTGTTCCATTTT
TATGTGGAAATGTTAGGCATGTGAAAAGGATATGCTGTTATGTTATTTGGGAC


BQ
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AF RS1BV20TF U 1
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DS 

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TGGTTGGACACTGGCTCGCGGCTTTCGAAGGCCCCGAGCTCCACCGTTTACCAGGTGGTT
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ACTACAGCAAGAAGGCAAAGCAGGAGGAAGAGTTGATGGTGGAGAGCTTCGGGCAAAGGT
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GAAAAGGATATGCTGTTATGTTATTTGGGAC

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 2

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GGAGACAAGACCAAGCTTAGTCTCTTCTCTATGTCACCGAGTAATGGTTAGGCCAGATGG
AGACGAGGAAGGGATATTGCTTCTCGAGTTTCAAGGTAACGGTGACCGCTCGTGGCAGCT
AAACTTCGACGCTTTCCAGGTTTCTCCGGAGCACAAGGAGAAGAAATCGCAGAGCAAACT
CCATAACTGTCTTGGTTGCTTGGGTCCGGAAGACAATGTGGCGGATTATTACCAGCAACA
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TGGAATGTCAAAGGAAGAGCAAGACAATCTGGCTAAAAGCGAGACATTGGCGATTAGAAT
ATCAAACATTGCAAACATGGTTCTTTTTGCTGCTAAAGTCTATGCCTCCGTCACAAGCGG
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GAAAAGGATGCAACCACTGGGAATCCTAGTCTTTGCATCAGTGATGGCCACACTTGGATT
GCAAATCATCTTGGAATCTCTTCGGACAATGTTATCCAGTCACAAGGAGTTCAGCCTAAC
AAAAGAGCAAGAGAGCTGGGGGGTTGGGATCATGCTCTCCGTAACATTGGTCAAACTGCT
TCTCGTCCTTTACTGCAGATCCTTCAGTAACGAGATCGTTAAAGCTTATGCTCAAGACCA
TTTTTTCGACGTCATCACAAACATCATTGGACTCATCGCAGTGATCCTCGCCAACTACAT
TGATAACTGGATGGATCCAGTTGGAGCCATCATTCTTGCACTGTACACGATAAGGACTTG
GTCAATGACGGTTTTGGAGAACGTGAACTCTCTAGTTGGGAAAACAGCGACGCCAGAGTA
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CTAGTTTTGTTGTTCTACTGGCAATAAAACTATAATTTTTAAGTCC


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AF RS1BG15TF U 1
AF RS1BG15JQ C 620
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GCAAATCATCTTGGAATCTCTTCGGACAATGTTATCCAGTCACAAGGAGTTCAGCCTAAC
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TCTCGTCCTTTACTG

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DS 

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GTTGGAGCCATCATTCTTGCACTGTACACGATAAGGACTTGGTCAATGACGGTTTTGGAG
AACGTGAACTCTCTAGTTGGGAAAACAGCGACGCCAGAGTATCTGCAGAAACTGACTTAC
CTGTGTTGGAACCACCATAGAGAGATTAGGCATATTGACACGGTGAGGGCGTACACGTTT
GGATCTCATTACTTTGTGGAGGTTGATATAGTTCTACCTGCTGATATGCCTCTGCAAGTG
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TAGCTTGGTTTCTTCTTCTTCCATCTCTCTACGTCTAAAAGTTCTTAATAGAGCTTAAGA
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QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1D022TF U 1
AF RS1D022JQ C 450
BS 1 707 RS1D022TF
BS 708 708 RS1D022JQ
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BS 749 764 RS1D022TF
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CAAGTTTGCAGAGGTTGAAGGAGAGAGACAAAAGCTGATGATGACACTGAAGAACGTAAG
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GCACAGATGTTACTATGTATATATGTCCCAAGGATGTTGAATAATAG*TCCAAGTTCTAA
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CAAAAAA

QA 1 764 1 764
DS 

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TCATTTTCAGCAACTCTTGGTGAACATTAGTGCACAGATGTTACTATGTATATATGTCCC
AAGGATGTTGAATAATAGGTCCAAGTTCTAACAGTGGTCTCAAGTTATAGATAGCTTAAT
ATAAATGTTCGTTATTCAAAAAA

QA 1 323 1 323
DS 



AS 1 2

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CGATAATCTCTCTGCAGTTGAGATTGCAAAGGAAGATATGCACAAAACGCTTCTAAAATG
CCTGGAAGATTCAAGAACTGGAACTCAACAGTGGAAGACTGCTAAAGAATCATTGGTCGA
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TGCAAACAGAGATATCGTCTCATCCATTGACAACTCGTTACAGCTTGATAAAGATGCTTC
GGCTGATATTAACTCCACCATAGCTCCTACTTATGGAAGCTTGAAAGAATTAAGAACTCA
CCATGACAACAATGTTGTCCAAATCAAAGACAACACAGGGAAATGTCTTGGTCACGAATA
CAAGGTGGATGAAGCAACAAGCTCAACGCCGAGGAAGAGACAGTACAACATTCCAACAGT
TGACTCGATTGAGGAACTTAAAACGCCATCGTTTGAGGAATTGTTGAAGGCTTTTCATGA
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CGGTGGTCGACCTCCGTTAACGGCCATCAACTGAGAGAAGCAAAGGATCTGTCGACTACC
GTGAGATTATTAATAGGAACACGAGAAATAGTTTGTATAGCGACAAACAAATATCTCCAT
TTGTTTCTTTTTTTGAATCCAAACTTTAGTTATATTTTACGGCTTTTCTTTTGTTCAACC
GCTTTTATTATTATAATAACAGATAAGTTCCTAAGTTTGATTTCATCTATGATTCAAAAT
AACAAGTAATGATATATTGAACCTTTCCATGAGC


BQ
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AF RS1E093TF U 1
AF RS1E093JQ C 297
BS 1 645 RS1E093TF
BS 646 994 RS1E093JQ

RD RS1E093TF 645 0 0
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CGATAATCTCTCTGCAGTTGAGATTGCAAAGGAAGATATGCACAAAACGCTTCTAAAATG
CCTGGAAGATTCAAGAACTGGAACTCAACAGTGGAAGACTGCTAAAGAATCATTGGTCGA
TCTAGAAAAGAAGAATGTTGCAAACACAGATTCTCTCATCCGAGGAGCAATAGAAAACAA
TGAGAAGCTACGAACTCAGTTATCTTCTGCCGTCTCGAACACTCTAAGAGACTCTGATTC
TGCAAACAGAGATATCGTCTCATCCATTGACAACTCGTTACAGCTTGATAAAGATGCTTC
GGCTGATATTAACTCCACCATAGCTCCTACTTATGGAAGCTTGAAAGAATTAAGAACTCA
CCATGACAACAATGTTGTCCAAATCAAAGACAACACAGGGAAATGTCTTGGTCACGAATA
CAAGGTGGATGAAGCAACAAGCTCAACGCCGAGGAAGAGACAGTACAACATTCCAACAGT
TGACTCGATTGAGGAACTTAAAACGCCATCGTTTGAGGAATTGTT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1E093JQ 698 0 0
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ATTCTGCAAACAGAGATATCGTCTCATCCATTGACAACTCGTTACAGCTTGATAAAGATG
CTTCGGCTGATATTAACTCCACCATAGCTCCTACTTATGGAAGCTTGAAAGAATTAAGAA
CTCACCATGACAACAATGTTGTCCAAATCAAAGACAACACAGGGAAATGTCTTGGTCACG
AATACAAGGTGGATGAAGCAACAAGCTCAACGCCGAGGAAGAGACAGTACAACATTCCAA
CAGTTGACTCGATTGAGGAACTTAAAACGCCATCGTTTGAGGAATTGTTGAAGGCTTTTC
ATGATTCTTCCAAGTCGCCTAAACAAATGCAGCACTCTAACGGAGAAGCGAAACACGTTA
GTAACGGTGGTCGACCTCCGTTAACGGCCATCAACTGAGAGAAGCAAAGGATCTGTCGAC
TACCGTGAGATTATTAATAGGAACACGAGAAATAGTTTGTATAGCGACAAACAAATATCT
CCATTTGTTTCTTTTTTTGAATCCAAACTTTAGTTATATTTTACGGCTTTTCTTTTGTTC
AACCGCTTTTATTATTATAATAACAGATAAGTTCCTAAGTTTGATTTCATCTATGATTCA
AAATAACAAGTAATGATATATTGAACCTTTCCATGAGC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL5384Contig1 1082 2 2 U
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TCATTCAAGATTATGAGAAGCATAATAAGTACACAGGGTTTCCTGTGATTGGGATTGAGT
GGCAGAAGATGGAGAATCCAGACTTGCGTAAGAAAATGGGGATGGAGTCTCATCAAAAGG
GAGTGAGGATAAGGAGGATCGAACCTACCGCCCCGGAGTCACAGGTTTTGAAGCCTTCTG
ATATCATACTTAGCTTTGATGTAGTTAATATTGCTAATGATGGAACTGTTCCATTTAGGC
ACGGAGAGCGAATTGGGTTTAGCTATCTTATATCTCAAAAGTACACTGGAGATTCTGCGC
TTGTGAAGATTCTGCGTAACAAAGAGATTCTCGAGTTCAACATAAAACTTGCAATCCACA
AGAAGCTAATCCCTGGTCACATAGGTGGCAAACCTCCTTCCTACTTCATTGTTGCTGGCT
TTGTGTTTACAACTGTCTCTGTTCCTTATCTTCGCTCTGAGTATGGAAAAGAATATGAAT
TTGATGCGCCTGTCAAGCTTTTGGACAAACATCTTCATGCAATGGCTCAACCTGTGGACG
AGCAGCTTGTTGTCGTTTCACAGGTTCTTGTTTCTGACATCAACATTGGTTATGAGGAGA
TTGTCAATACCCAGGTTCTTGCTTTCAATGGTAAACCTGTGAGAAACTTGAAATGTTTGG
CTGAGATGGTGGAGAATTGTGATGATGAATACATGGAGTTCAGTCTTGATTATGATCAGA
TTGTTGTTCTGCAAACGAAGACTGCAAAAGAGGCAACTTTAGATATTCTGACCACACATT
GCATACCTTTTGCTATGTTTGATGATCTCAAGAATTGAACAAGAATTTGAAACAGTAGTA
GCCATAAACAGAACATGGAAGGAGAAAGAGAGAGATTTTGCCCATGGAAGCCACACAGAA
GCAAATACAGAGTCATGGAAGACGGAGCTTTGAAAGCTCAAAACATATCATTTATCTTCT
TTGATTCTTACTCTGTTACACTTTTGTACTTTTGGCAAAATATGCACTGGTTGACAGACG
AA


BQ
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10 10 

AF RS1BV46TF U 1
AF RS1BV46JQ C 321
BS 1 670 RS1BV46TF
BS 671 1082 RS1BV46JQ

RD RS1BV46TF 670 0 0
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TCATTCAAGATTATGAGAAGCATAATAAGTACACAGGGTTTCCTGTGATTGGGATTGAGT
GGCAGAAGATGGAGAATCCAGACTTGCGTAAGAAAATGGGGATGGAGTCTCATCAAAAGG
GAGTGAGGATAAGGAGGATCGAACCTACCGCCCCGGAGTCACAGGTTTTGAAGCCTTCTG
ATATCATACTTAGCTTTGATGTAGTTAATATTGCTAATGATGGAACTGTTCCATTTAGGC
ACGGAGAGCGAATTGGGTTTAGCTATCTTATATCTCAAAAGTACACTGGAGATTCTGCGC
TTGTGAAGATTCTGCGTAACAAAGAGATTCTCGAGTTCAACATAAAACTTGCAATCCACA
AGAAGCTAATCCCTGGTCACATAGGTGGCAAACCTCCTTCCTACTTCATTGTTGCTGGCT
TTGTGTTTACAACTGTCTCTGTTCCTTATCTTCGCTCTGAGTATGGAAAAGAATATGAAT
TTGATGCGCCTGTCAAGCTTTTGGACAAACATCTTCATGCAATGGCTCAACCTGTGGACG
AGCAGCTTGTTGTCGTTTCACAGGTTCTTGTTTCTGACATCAACATTGGTTATGAGGAGA
TTGTCAATAC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RS1BV46JQ 762 0 0
AGCTATCTTATATCTCAAAAGTACACTGGAGATTCTGCGCTTGTGAAGATTCTGCGTAAC
AAAGAGATTCTCGAGTTCAACATAAAACTTGCAATCCACAAGAAGCTAATCCCTGGTCAC
ATAGGTGGCAAACCTCCTTCCTACTTCATTGTTGCTGGCTTTGTGTTTACAACTGTCTCT
GTTCCTTATCTTCGCTCTGAGTATGGAAAAGAATATGAATTTGATGCGCCTGTCAAGCTT
TTGGACAAACATCTTCATGCAATGGCTCAACCTGTGGACGAGCAGCTTGTTGTCGTTTCA
CAGGTTCTTGTTTCTGACATCAACATTGGTTATGAGGAGATTGTCAATACCCAGGTTCTT
GCTTTCAATGGTAAACCTGTGAGAAACTTGAAATGTTTGGCTGAGATGGTGGAGAATTGT
GATGATGAATACATGGAGTTCAGTCTTGATTATGATCAGATTGTTGTTCTGCAAACGAAG
ACTGCAAAAGAGGCAACTTTAGATATTCTGACCACACATTGCATACCTTTTGCTATGTTT
GATGATCTCAAGAATTGAACAAGAATTTGAAACAGTAGTAGCCATAAACAGAACATGGAA
GGAGAAAGAGAGAGATTTTGCCCATGGAAGCCACACAGAAGCAAATACAGAGTCATGGAA
GACGGAGCTTTGAAAGCTCAAAACATATCATTTATCTTCTTTGATTCTTACTCTGTTACA
CTTTTGTACTTTTGGCAAAATATGCACTGGTTGACAGACGAA

QA 1 762 1 762
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL5387Contig1 1050 2 2 U
GAAAACTCAAAAGTCGTGTGAGAGAGAAAAATAAAAAAATGGGATTAGGCGGCGGAGAAG
GTGGTGAGGAGAGGAGAAGCGGGGAGAGAAGATGATGATGGCGATGTCCAGCTTGTTCAG
CGACAACCAGCAGCAGAATCCAATTCAGCAGATGCAAGTGAAGTTCAAGGAGGTAGAAGT
GGGTGTCAAGACGTGGCTGTCGAAGCAATCGATACCTGTGGAAGCAGCCGTGGTAGCAAC
CATGAGCGGTGTGCAGGGAGCTTTCATCGGAGGACTCATGGGAACACTCTCCCCTGAGAT
GCCTCAGACCAGCAACGACCCTCAAGCCATGGCGTCGATGAAGCAAGCTCAGGCTCTTGT
GGGTGGGCCATGGGTCCAGGCTCGGAACTTTGCTGCCATTACTGGTGTTAACGCTGGAAT
TGCGTGTGTTATGAAACGGGTTAGAGGCAAAGAGGATCTTGAATCTGCCGTGGTCGCAGC
ATTAGGATCTGGATTTGCATACTCTTTGGTGAGCCAAGGCTTGCAAGGACAGCCTGTTAA
CGCAATCACCACTGCTGCTGGTTTCGCCGTCTTCCAAGGAATCTTTTTCAAGTTGGGAGA
AAGATTCTCTAAACCGAGTCCTGAAGATCCGTTTTACACACGATCGAGATCCATGCTGTT
GAAGCTTGGTCTTCAGAAGTACGAGAAGAACTTCAAGAAAGGACTTCTAACTGATCCCAC
CTTGCCATTACTCACCGATAGTGCGCTAAGAGATGTGAGCATCCCACCAGGGCCAAGGCT
TTTGATACTAGACCATATCCAGAGGGACCCTGAGATAAAGGGCAAACGAGGGAAGTAGTA
GCTGAGCCTGCCCTTTTGTTTGTTTATATGGTCATTACTGGAATCAAATCTGTTTTGGCT
GTAAGGATATGTCGAAACACAAATGTATGGTCTTGTTTTAATGTTTTCCTTAGCTGATAT
TGCTAGGAAGAACTCTTGTTAGATTCTTCTGCCTCTACTAGCAATGTTGTTTTGAATTCT
CTTTAAAATTTGAAAGCATTTTATATTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1F812TF U 1
AF RS1F812JQ C 407
BS 1 760 RS1F812TF
BS 761 1050 RS1F812JQ

RD RS1F812TF 760 0 0
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GTGGTGAGGAGAGGAGAAGCGGGGAGAGAAGATGATGATGGCGATGTCCAGCTTGTTCAG
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GGGTGTCAAGACGTGGCTGTCGAAGCAATCGATACCTGTGGAAGCAGCCGTGGTAGCAAC
CATGAGCGGTGTGCAGGGAGCTTTCATCGGAGGACTCATGGGAACACTCTCCCCTGAGAT
GCCTCAGACCAGCAACGACCCTCAAGCCATGGCGTCGATGAAGCAAGCTCAGGCTCTTGT
GGGTGGGCCATGGGTCCAGGCTCGGAACTTTGCTGCCATTACTGGTGTTAACGCTGGAAT
TGCGTGTGTTATGAAACGGGTTAGAGGCAAAGAGGATCTTGAATCTGCCGTGGTCGCAGC
ATTAGGATCTGGATTTGCATACTCTTTGGTGAGCCAAGGCTTGCAAGGACAGCCTGTTAA
CGCAATCACCACTGCTGCTGGTTTCGCCGTCTTCCAAGGAATCTTTTTCAAGTTGGGAGA
AAGATTCTCTAAACCGAGTCCTGAAGATCCGTTTTACACACGATCGAGATCCATGCTGTT
GAAGCTTGGTCTTCAGAAGTACGAGAAGAACTTCAAGAAAGGACTTCTAACTGATCCCAC
CTTGCCATTACTCACCGATAGTGCGCTAAGAGATGTGAGC

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DS 

RD RS1F812JQ 644 0 0
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GCCGTGGTCGCAGCATTAGGATCTGGATTTGCATACTCTTTGGTGAGCCAAGGCTTGCAA
GGACAGCCTGTTAACGCAATCACCACTGCTGCTGGTTTCGCCGTCTTCCAAGGAATCTTT
TTCAAGTTGGGAGAAAGATTCTTTAAACCGAGTCCTGAAGATCCGTTTTACACACGATCG
AGATCCATGCTGTTGAAGCTTGGTCTTCAGAAGTACGAGAAGAACTTCAAGAAAGGACTT
CTAACTGATCCCACCTTGCCATTACTCACCGATAGTGCGCTAAGAGATGTGAGCATCCCA
CCAGGGCCAAGGCTTTTGATACTAGACCATATCCAGAGGGACCCTGAGATAAAGGGCAAA
CGAGGGAAGTAGTAGCTGAGCCTGCCCTTTTGTTTGTTTATATGGTCATTACTGGAATCA
AATCTGTTTTGGCTGTAAGGATATGTCGAAACACAAATGTATGGTCTTGTTTTAATGTTT
TCCTTAGCTGATATTGCTAGGAAGAACTCTTGTTAGATTCTTCTGCCTCTACTAGCAATG
TTGTTTTGAATTCTCTTTAAAATTTGAAAGCATTTTATATTTTG

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 2

CO CL5388Contig1 1046 2 6 U
GGGAGCTACTTTCCTCGGCCTGAAGAAAGTCTCTCTACAAGAATCTAAACGACTAAGCTT
TAAATCTAATGGGACTCGGCCCTAAATGGGCTGAGATGACTCGGGAATGTCTTCTGGACA
TCTTCTCACGCCTTAGCCAGGAAGAAAGATGGATGGGACCGATGCTTGTCTGCAAGACTT
GGATGAACACATGCCATGAACCGTCACTCAACACCATCTTCGATCTCGAATCTCGGTTTC
AGTCATTCCCTGAGTCGATCAACTGGTGGACTCCCGAGTTTGAAGACAAGGTTGATTCCT
TCTTCAGATCCGTCGTTGACTGGAGCGAAGGCGGTCTCACAGAGATTCGTGTCAGACACT
GCACAGATCGCTCTCTATCTTACGCTGCTGAGAGGTGTCCTAAGTTAGAGGTGCTTTGGA
TTAAGAGCTGCCCTCACGTCACTGATGCAACGATGGCAAAAATAGCCTCAAACTGTCCAA
AGCTAAGAGAGCTTGATGCAAGCTACTCTTATGGTATATCTCACGAGTCTCTGTCCATGT
TAGGGAGGCATTGCCCGAACCTAGAGATCTTGAAAAGGAATCTGTTTCCTTGGCAAGGTC
CCAGCGTGCCTACAATTGTAGCGCCGGTTGATTATATACGTGCATTTCCAAGATACGGTA
ACATAGAGGCTCAAATAATAGGGAGACACATGCCTAGGCTGAAGCACTCGGAGCCTCAAT
ACTGTACAATGACTGTTAAAGGTCTTACCTCGGTTTGTAAAGGATGTTCTAATCTAGAGT
ACCTAGACTTATGCGGGTGTATAGCCTTGACAAACAGTGATATAACGAGATGTATCTCGA
GCTTGAAGAGTTTGATGGAGATCAAGAAGCCTGACTTCAACCGTCCTGTTGATATTTTAC
GCCTTCCAAGAAATGATAATTGAAGAAAATAATATGGTGATGATTACTTCACCGTTTTCG
GCTCGCTTCTGTGTTATTTTTATTTTGTTATTTGCTTATTGTTGTTGATAAGAAGAGAGT
TGATATTTCTTGCGTGTTAAGAAACC


BQ
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AF RS1GU04TF U 1
AF RS1GU04JQ C 635
BS 1 697 RS1GU04TF
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BS 742 1046 RS1GU04JQ

RD RS1GU04TF 749 0 0
GGGAGCTACTTTCCTCGGCCTGAAGAAAGTCTCTCTACAAGAATCTAAACGACTAAGCTT
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TCTTCTCACGCCTTAGCCAGGAAGAAAGATGGATGGGACCGATGCTTGTCTGCAAGACTT
GGATGAACACATGCCATGAACCGTCACTCAACACCATCTTCGATCTCGAATCTCGGTTTC
AGTCATTCCCTGAGTCGATCAACTGGTGGACTCCCGAGTTTGAAGACAAGGTTGATTCCT
TCTTCAGATCCGTCGTTGACTGGAGCGAAGGCGGTCTCACAGAGATTCGTGTCAGACACT
GCACAGATCGCTCTCTATCTTACGCTGCTGAGAGGTGTCCTAAGTTAGAGGTGCTTTGGA
TTAAGAGCTGCCCTCACGTCACTGATGCAACGATGGCAAAAATAGCCTCAAACTGTCCAA
AGCTAAGAGAGCTTGATGCAAGCTACTCTTATGGTATATCTCACGAGTCTCTGTCCATGT
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ACATAGAGGCTCAAATAATAGGGAGACACATGCCTAG*CTGAAGCACTCGGAGCCTCAAT
ACTGTACA*TGACTGTTAAAG
TCTTACCT

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DS 

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TTGTAAAGGATGTTCTAATCTAGAGTACCTAGACTTATGCGGGTGTATAGCCTTGACAAA
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CTTCAACCGTCCTGTTGATATTTTACGCCTTCCAAGAAATGATAATTGAAGAAAATAATA
TGGTGATGATTACTTCACCGTTTTCGGCTCGCTTCTGTGTTATTTTTATTTTGTTATTTG
CTTATTGTTGTTGATAAGAAGAGAGTTGATATTTCTTGCGTGTTAAGAAACC

QA 1 412 1 412
DS 



AS 1 2

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TCACCGAACTGGTTCTGACCAAAACTGCCATATTCCCCTCTTGGTCTGCTATGTTCTCCT
CAAACAACAACCGTAAGCAGCATTTGATAGCTGATGGAACAGTTGTTGTGAGCAAGAAGT
TCCCAAGAAGATATATCACTTGTTTGGTTCTTGACCAGGGTTCCTGCACTACCCCGCTAA
GAGCTTAATTGTTCAGGACATTCCCAGCAGGTTCGAAGTCAGGGTTTGCCAAGTTCACTG
TGAGGTTTCTCATCAGTAGCAGAACAGTCTCGAAGTTTATAGGATCCATTTCCCTGAGCT
TTTTCATGCGGCCTTTGATGTCAGGATCGAAGACACTCCCAATGAAGTTATAAACTTCAG
CAAAATCAGGAAGACCGTGCATTGAGGGAGCTTGAGTCGCCGGCTGTAGACACTTGGAAT
CTGATAGTGTTCTGCTTGAGCTTCCTATACCAGATTCTGAAGGACTACCCCCACTTATAG
AGTCATTCGATTCAATAACATCTTCTCCTCCACAAAGAGTAGCAAGTTCATCTTTTGGTA
GGACAACCTCGCTTACAGCTATGTTAAGCAATGCAGAGGTATCATCATCCCATGAAGTAT
AGCCAGGCACGTTATTTATTTGAGTAGGAAATGCCATTGAAACGTGAAGCGACATTTGAG
CATTCTTAGATGCCTTTTGAGGATATGGATGAGCAGCTTTGCGTTTAGGCCTAGGGGGTG
GCACGTGTGCTAAAGTCCCGTTCTTCTGGACCTCCAAAAAGTATTTTTGTGCATGGCTCC
TGATCTGAATTACTGTCTTTGAACCTACAAAATCTTCAATCTTTTTCCAGTCACGATCAA
ACAATTGAAGAGCTTCGAGAAACTTATCGTGCTCTCCTTCAGTCCAACTCTCTCTGGACT
TGGTGATGGTGTAAGCTTTCCTCACCTTCTTCTCCGGAGTTTCTGAAGTCACCGTAGTCG
TCTCTGTAAGATCTGTAGACGGTCTTTCTTCAGCTACAACCGGATTGCTTGACAGCGACG
ACGAAGAAGTCATCGGTTTTTCTCAAGATAGCGATCGTTTAGACAGGGAGAGAGAGAACA
GAGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1FI19JQ U 1
AF RS1DF80TF C 402
BS 1 413 RS1FI19JQ
BS 414 414 RS1DF80TF
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BS 600 743 RS1FI19JQ
BS 744 1206 RS1DF80TF

RD RS1FI19JQ 743 0 0
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GGACAACCTCGCTTACAGCTATGTTAAGCAATGCAGAGGTATCATCATCCCATGAAGTAT
AGCCAGGCACGTTATTTATTTGA

QA 1 743 1 743
DS 

RD RS1DF80TF 805 0 0
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GCAAGTTCATCTTTTGGTGGGACAACCTCGCTTACGGCTATGTTAAGCAATGCAGAGGTA
TCATCATCCCATGAAGTATAGCCAGGCACGTTATTTATTTGAGTAGGAAATGCCATTGAA
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TATTTTTGTGCATGGCTCCTGATCTGAATTACTGTCTTTGAACCTACAAAATCTTCAATC
TTTTTCCAGTCACGATCAAACAATTGAAGAGCTTCGAGAAACTTATCGTGCTCTCCTTCA
GTCCAACTCTCTCTGGACTTGGTGATGGTGTAAGCTTTCCTCACCTTCTTCTCCGGAGTT
TCTGAAGTCACCGTAGTCGTCTCTGTAAGATCTGTAGACGGTCTTTCTTCAGCTACAACC
GGATTGCTTGACAGCGACGACGAAGAAGTCATCGGTTTTTCTCAAGATAGCGATCGTTTA
GACAGGGAGAGAGAGAACAGAGAGC

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 2

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CACCAAGCTCGACTCTTTCCTATTCCAACATCCACCATCAGTTCCCCAACCCGTCTTCTT
CATTTCCCGTCTCGTTATCAGTCTCGTCCCCGAGCAACACCCGCCGCCATCTTCGTCTCT
CCATCACCTCCGCGTTGAATCCTCAGACGAAGAAAGCTTCAACGGGTGGTAGTAACGGGA
ACGGTGGTAGTACCAACAAGAAACGGAAGAAAAGGGTAAAAGTTCGAATCTTAAGGAGAT
TTGGGAAGTGAGAGATGCTGTTGTTCTTAAAGAGGAAGAAGATTATAATGATGATGATGA
TGATGCTTCTCTTGCAAACTCTCCTCCCACCATACCCAAACCACCTGCTGGGTTCGTTAT
TGATGAAACCGGTAGAGTTCTTATGGCCTCCAAGAAGCGAATCGCTACTGTGGTTGATCC
GACAAACAATAGCCCTTTGGATTGTGTAATAAGAAGAGTGTTTACAAGTAGTAAAGGAGA
GGATTGTATGCTTCTTTGCCCTGTTGATACGCCAGTTATATTTTGAAGAGCACAAACATA
GATGGATGGTCAGCTGTCAGTGATGAAGAGGTTGAATCTCTTCTTCCTGCTGCTGCTTAT
GCTCTTGCAAAGATCCATATGCATCTTGTACACAGCGGATTCTGTTACACTGCAAGGGGA
GGCTTTTGCTACACTGAAGATAATGTCTTCGATTTTCGCACAGATGATGGCCAAGATGTT
GAAGGCTTGCCAACTGAAGGGGTTGAGATTACATGTTTTCATCTGGATGGATCACACTAT
ATGGTCTACACGCCTTCAGATCCACTTCTCTTTGTTGCTGCTAAGGATCCGAATGGGCTG
CTTCAAATTGCTGATGATGAGCTACTAGACGACCCAGCCGTGATCAGCGCCATAGACGAG
GAAACCGAATTCAATGCACTGGTGGAGGAAGAGGCGGCTCTTCTGGAATCATTGCTTGGG
GAAGAAATTTAAAAGCTTTCATAGGGAAACAGACCTACTTACTTAGCTTTCTTTCTTTTT
TATATGTTTCATATCAGTGCTATCTATTCCTTGTGATGTTTTCCTGTTTATCATGAAAAA
AGATGTTTTTCTATTGCATATCTTCATCTTTGGGAAAGGAATGTTAATTGAGTTCGATCA
TTTGTATGCAAAAGTGTACAGAGACTTATGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FS25TF U 1
AF RS1FS25JQ C 423
BS 1 718 RS1FS25TF
BS 719 719 RS1FS25JQ
BS 720 755 RS1FS25TF
BS 756 756 RS1FS25JQ
BS 757 771 RS1FS25TF
BS 772 772 RS1FS25JQ
BS 773 784 RS1FS25TF
BS 785 1232 RS1FS25JQ

RD RS1FS25TF 788 0 0
GCTCAACTTCTTTGTCTCTCTAAGGTTCAATGGCTTTCTCCTTCTCCTTAACTTCGCCTT
CACCAAGCTCGACTCTTTCCTATTCCAACATCCACCATCAGTTCCCCAACCCGTCTTCTT
CATTTCCCGTCTCGTTATCAGTCTCGTCCCCGAGCAACACCCGCCGCCATCTTCGTCTCT
CCATCACCTCCGCGTTGAATCCTCAGACGAAGAAAGCTTCAACGGGTGGTAGTAACGGGA
ACGGTGGTAGTACCAACAAGAAACGGAAGAAAAGGGTAAAAGTTCGAATCTTAAGGAGAT
TTGGGAAGTGAGAGATGCTGTTGTTCTTAAAGAGGAAGAAGATTATAATGATGATGATGA
TGATGCTTCTCTTGCAAACTCTCCTCCCACCATACCCAAACCACCTGCTGGGTTCGTTAT
TGATGAAACCGGTAGAGTTCTTATGGCCTCCAAGAAGCGAATCGCTACTGTGGTTGATCC
GACAAACAATAGCCCTTTGGATTGTGTAATAAGAAGAGTGTTTACAAGTAGTAAAGGAGA
GGATTGTATGCTTCTTTGCCCTGTTGATACGCCAGTTATATTTTGAAGAGCACAAACATA
GATGGATGGTCAGCTGTCAGTGATGAAGAGGTTGAATCTCTTCTTCCTGCTGCTGCTTAT
GCTCTTGCAAAGATCCATATGCATCTTGTACACAGCGGATTCTGTTACACTGCAAGGG*A
GGCTTTTGCTACACTGAAGATAATGTCTTCGATTT*CGCACAGATGATGGC*AAGATGTT
GAAG
CTTG

QA 1 784 1 784
DS 

RD RS1FS25JQ 810 0 0
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CAAACAATAGCCCTTTGGATTGTGTAATAAGAAGAGTGTTTACAAGTAGTAAAGGAGAGG
ATTGTATGCTTCTTTGCCCTGTTGATACGCCAGTTATATTTTGAAGAGCACAAACATAGA
TGGATGGTCAGCTGTCAGTGATGAAGAGGTTGAATCTCTTCTTCCTGCTGCTGCTTATGC
TCTTGCAAAGATCCATATGCATCTTGTACACAGCGGATTCTGTTACACTGCAAGGGGAGG
CTTTTGCTACACTGAAGATAATGTCTTCGATTTTCGCACAGATGATGGCCAAGATGTTGA
AGGCTTGCCAACTGAAGGGGTTGAGATTACATGTTTTCATCTGGATGGATCACACTATAT
GGTCTACACGCCTTCAGATCCACTTCTCTTTGTTGCTGCTAAGGATCCGAATGGGCTGCT
TCAAATTGCTGATGATGAGCTACTAGACGACCCAGCCGTGATCAGCGCCATAGACGAGGA
AACCGAATTCAATGCACTGGTGGAGGAAGAGGCGGCTCTTCTGGAATCATTGCTTGGGGA
AGAAATTTAAAAGCTTTCATAGGGAAACAGACCTACTTACTTAGCTTTCTTTCTTTTTTA
TATGTTTCATATCAGTGCTATCTATTCCTTGTGATGTTTTCCTGTTTATCATGAAAAAAG
ATGTTTTTCTATTGCATATCTTCATCTTTGGGAAAGGAATGTTAATTGAGTTCGATCATT
TGTATGCAAAAGTGTACAGAGACTTATGGT

QA 1 810 1 810
DS 



AS 1 2

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CATACCCATCCCAAAGGAACTTTTTCTTCTTCTTCTCATATACCCTATGATACTAACACA
AGTATAAATAAAAGAAGATGGTACGTACACAAAAGACCCGACACTTCCCAAATATATTAA
GAGTCACATTACAAGGAAGTATCGAAATCTAAGTAAATAATGGAGGTGTTGTCCTTTGTA
CGCATCACTATAGCTTCATCCAGCAAACCGTTTGCTATTTTCTCTGCACTACTCTCTTTC
TCTCTCATCTCGAGCACCAACTGCACAGCTTTCTTCGGACTCACAACATCCCATAACCCA
TCACTTGCCAATACAGCAAACGCGTCTTTACTAGATTGATCGATGCGCAAAGGCTCACTT
ATATATGGCTCTGCGCTGAACCGACCGTCTTGCTGCTTTGGAAATTTGTCTCCAAGCATC
CTCGCAAGGTTTATACCAAAGATCCTGGTCTCTTTATCTCTCAAAGATAGTCCTGCTTCT
TGTATTCTTCTTCTCTCCGTCAAGCTAGTCACTCGATGATCTTCAGTCATTTGTATATAT
CTCCCATCATGGTTGATTACACATGCTGAATCCCCGAGATTAGCACATTGTGCGAATAAA
TGTTCTTCACTGTCTTTCCAAACCAAGAGAACTGTAGCTGTACAACCCTCATATAGGTGA
TCATCCAAGCGAGCTTCTGTTTTCACAAGCACGTCCCTCAGGACATCCGAAGCATCTCCT
TGTGATAACACTTTCTCCTTCTTCAGAGAGTCTGATAAAATATT


BQ
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AF RS1F855JQ U 1
AF RS1EE38JQ U 64
BS 1 249 RS1F855JQ
BS 250 250 RS1EE38JQ
BS 251 421 RS1F855JQ
BS 422 824 RS1EE38JQ

RD RS1F855JQ 421 0 0
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CATACCCATCCCAAAGGAACTTTTTCTTCTTCTTCTCATATACCCTATGATACTAACACA
AGTATAAATAAAAGAAGATGGTACGTACACAAAAGACCCGACACTTCCCAAATATATTAA
GAGTCACATTACAAGGAAGTATCGAAATCTAAGTAAATAATGGAGGTGTTGTCCTTTGTA
CGCATCACTCTAGCTTCATCCAGCAAACCGTTTGCTATTTTCTCTGCACTACTCTCTTTC
TCTCTCATCTCGAGCACCAACTGCACAGCTTTCTTCGGACTCACAACATCCCATAACCCA
TCACTTGCCAATACAGCAAACGCGTCTTTACTAGATTGATCGATGCGCAAAGGCTCACTT
A

QA 1 421 1 421
DS 

RD RS1EE38JQ 761 0 0
G
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TAAATAAAAGAAGATGGTACGTACACAAAAGACCCGACACTTCCCAAATATATTAAGAGT
CACATTACAAGGAAGTATCGAAATCTAAGTAAATAATGGAGGTGTTGTCCTTTGTACGCA
TCACTATAGCTTCATCCAGCAGACCGTTTGCTATTTTCTCTGCACTACTCTCTTTCTCTC
TCATCTCGAGCACCAACTGCACAGCTTTCTTCGGACTCACAACATCCCATAACCCATCAC
TTGCCAATACAGCAAACGCGTCTTTACTAGATTGATCGATGCGCAAAGGCTCACTTATAT
ATGGCTCTGCGCTGAACCGACCGTCTTGCTGCTTTGGAAATTTGTCTCCAAGCATCCTCG
CAAGGTTTATACCAAAGATCCTGGTCTCTTTATCTCTCAAAGATAGTCCTGCTTCTTGTA
TTCTTCTTCTCTCCGTCAAGCTAGTCACTCGATGATCTTCAGTCATTTGTATATATCTCC
CATCATGGTTGATTACACATGCTGAATCCCCGAGATTAGCACATTGTGCGAATAAATGTT
CTTCACTGTCTTTCCAAACCAAGAGAACTGTAGCTGTACAACCCTCATATAGGTGATCAT
CCAAGCGAGCTTCTGTTTTCACAAGCACGTCCCTCAGGACATCCGAAGCATCTCCTTGTG
ATAACACTTTCTCCTTCTTCAGAGAGTCTGATAAAATATT

QA 2 761 2 761
DS 



AS 1 2

CO CL5392Contig1 1133 2 4 U
GATGAGAGTCAATAATATTTCTTCCAATTCTATACTCTCGTCAATCTATTATTACTCACT
AATACAGAAGAAAACTGAAACATGTAGTTGCTCATAAACTATAAAGAAACAATCGTCACT
ATTGTTTCGTGTGATGGTGAAGTACAAAGTTGTAGCAATTTTGTTTCTATGGTTCCAGAA
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TGAGACCATGATTTGATGGGTTGGATGTCGTCACTGATGAAATCTCTGGCAGATCGATGC
CAAAATGGTCGTTTACTGGATTACAAGATGAGGCCTTCAGCTGACAAATATAAGATATTA
ACAGTAAGTCTTCTGAAACACTTTCTAAGAACGAATACCACTCGTAAAGGTAAAAGCTTG
GTTTTTGGAATTCCTGATCCTCAAGTAATTGATTTTTTCATCCAAATGGATTTCATAGCT
TACAGTAAATAGTTATACTGAACACAATTTTTTTAATGTCAATTGTGAAGAGGCTCTGTT
TATTCTGTTTGCTTACTTCTCTAACTGGTTGAGCGAGTGTCAGTGGCCAGGATTCATTCT
ATTGTGATATCGGTGTACCACTGCTCAGTTGAATTCATAGTTTGCTCCTTAACACCCCTT
TTATTTTATTGGCTGCTATCATCATGGGTTCATTGATTCAGAAGAGAAATTCAGTGAGTT
GATAAAGCGGTTGATAGCTCAGACTCAGAAGGACATCGACGAGGTGACTTAAATGAGAAT
GTCATTGTTCCAAATGCCAAGGAAACTTTGCAGATGGGAAATGCTGAGGGTGGTTCTTCC
ACTTGCGTAGAGGAATCTGCAGATGGGAGAGTTAAAAGGGTTCTGATCGTGTTGAGTCGG
AAGAAGCTAAACGTTCAAAATGTGGCTAATAGGTCTCAGAAATTGGTTTTGTACTTTTTA
TAAGACTCTACTTTGTTTATGCTTTGTTTACTTTCATTTTCAAACTTTGTCTTTGCAACT
CTTTAGCTATGCTTTTAGCGTTAACAGTTTGAGTTATCTATGTTAATTGAGTCTTTAGGA
TTTCTTTGTTATTGATTTTCTTCTTACACTGGTTTTAGAATCTTCTTATACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GT87TF U 1
AF RS1GT87JQ C 439
BS 1 702 RS1GT87TF
BS 703 703 RS1GT87JQ
BS 704 747 RS1GT87TF
BS 748 1133 RS1GT87JQ

RD RS1GT87TF 747 0 0
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ATTGTTTCGTGTGATGGTGAAGTACAAAGTTGTAGCAATTTTGTTTCTATGGTTCCAGAA
GAAGCCATGATCTCTAATCCAGACGGATCAATCGGAGCTCAGATCTGTCACCTCGGAAAT
TGAGACCATGATTTGATGGGTTGGATGTCGTCACTGATGAAATCTCTGGCAGATCGATGC
CAAAATGGTCGTTTACTGGATTACAAGATGAGGCCTTCAGCTGACAAATATAAGATATTA
ACAGTAAGTCTTCTGAAACACTTTCTAAGAACGAATACCACTCGTAAAGGTAAAAGCTTG
GTTTTTGGAATTCCTGATCCTCAAGTAATTGATTTTTTCATCCAAATGGATTTCATAGCT
TACAGTAAATAGTTATACTGAACACAATTTTTTTAATGTCAATTGTGAAGAGGCTCTGTT
TATTCTGTTTGCTTACTTCTCTAACTGGTTGAGCGAGTGTCAGTGGCCAGGATTCATTCT
ATTGTGATATCGGTGTACCACTGCTCAGTTGAATTCATAGTTTGCTCCTTAACACCCCTT
TTATTTTATTGGCTGCTATCATCATGGGTTCATTGATTCAGA*GAGAAATTCAGTGAGTT
GATAAAGCGGTTGATAGCTCAGACTCA

QA 1 747 1 747
DS 

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TGAACACAATTTTTTTAATGTCAATTGTGAAGAGGCTCTGTTTATTCTGTTTGCTTACTT
CTCTAACTGGTTGAGCGAGTGTCAGTGGCCAGGATTCATTCTATTGTGATATCGGTGTAC
CACTGCTCAGTTGAATTCATAGTTTGCTCCTTAACACCCCTTTTATTTTATTGGCTGCTA
TCATCATGGGTTCATTGATTCAGAAGAGAAATTCAGTGAGTTGATAAAGCGGTTGATAGC
TCAGACTCAGAAGGACATCGACGAGGTGACTTAAATGAGAATGTCATTGTTCCAAATGCC
AAGGAAACTTTGCAGATGGGAAATGCTGAGGGTGGTTCTTCCACTTGCGTAGAGGAATCT
GCAGATGGGAGAGTTAAAAGGGTTCTGATCGTGTTGAGTCGGAAGAAGCTAAACGTTCAA
AATGTGGCTAATAGGTCTCAGAAATTGGTTTTGTACTTTTTATAAGACTCTACTTTGTTT
ATGCTTTGTTTACTTTCATTTTCAAACTTTGTCTTTGCAACTCTTTAGCTATGCTTTTAG
CGTTAACAGTTTGAGTTATCTATGTTAATTGAGTCTTTAGGATTTCTTTGTTATTGATTT
TCTTCTTACACTGGTTTTAGAATCTTCTTATACCC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

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ATCAAGAAAGTAACATATGCCAAGAGATTAAACATGTCGAAGCCACTGTCTCGGAAATTT
TTTCATCACAGTTCTCTGAGAAAATGATGATTAAGCGAGTTACACCCCACTTGTTGCATA
GCAAGATCATGCTCCAAATCGAAGTTGCGATGCCGTCAACCATGACAATACAGGACGCGA
TGAGAGCCGCTGAAGATGCAGAGAAGGAGATTCTGAAGGCAGCATCAAATGTGGCTCGTG
TCAGTATTCAGCTTAGTCTCAAGAAGTCCCTGCCTCAGTAATTACCTGGTTCAGCGC


BQ
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AF RS1GY43JQ C 1
AF RS1GY43TF U 1
BS 1 357 RS1GY43TF

RD RS1GY43JQ 357 0 0
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TTTCATCACAGTTTTCTGAGAAAATGATGATTAAGCGAGTTACACCCCACTTGTTGCATA
GCAAGATCATGCTCCAAATCGAAGTTGCGATGCCGTCAACCATGACAATACAGGACGCGA
TGAGAGCCGCTGAAGATGCAGAGAAGGAGATTCTGAAGGCAGCATCAAATGTGGCTCGTG
TCAGTATTCAGCTTAGTCTCAAGAAGTCCCTGCCTCAGTAATTACCTGGTTCAGCGC

QA 1 357 1 357
DS 

RD RS1GY43TF 357 0 0
GAGCTTTCTTACAGTTTTCTAGTAGCATGATGGATCACGATAGTTTAAAAAAGGAAGCTA
ATCAAGAAAGTAACATATGCCAAGAGATTAAACATGTCGAAGCCACTGTCTCGGAAATTT
TTTCATCACAGTTCTCTGAGAAAATGATGATTAAGCGAGTTACACCCCACTTGTTGCATA
GCAAGATCATGCTCCAAATCGAAGTTGCGATGCCGTCAACCATGACAATACAGGACGCGA
TGAGAGCCGCTGAAGATGCAGAGAAGGAGATTCTGAAGGCAGCATCAAATGTGGCTCGTG
TCAGTATTCAGCTTAGTCTCAAGAAGTCCCTGCCTCAGTAATTACCTGGTTCAGCGC

QA 1 357 1 357
DS 



AS 1 2

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AGGGCGGAGACTGAGAGAAGACTGAAAGAGGAGCTCGAACAAGAAGAGATGAGGCTAAAA
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GAAGAGAGGAGAAGGAAAGAACAAGAAGAGTATGAAAGGAGGCTAAAAGAAGCTTTTGAA
AAGGAAGAAAAGAACCGTAGAATGAGAGAGGCCCGTGAGAAGGCAGAAGAGAATGAAAGG
AAAATGAAAGAAGCACGTGAAAAAGAAGAAAACGAACGGAGAAGAATAAAAGAGGCTCAT
GAGAAGGCAGAGGTGGAGCGAAGGATGAAAGAAACTCTTGAACAAGAAGAGAAGGAAAGA
CAAATTAAAGAGAGGGAAGCATATGAGAGGAGAGCCAGAGAGGCTCTTGAGCAGGCAGAG
AATGAGAGGAGAGCCAGAGGCTATTGAGCAGAAGGAGAAAGAAAGGAGGTTGAAAGAGGA
GAATGAGAAGAAGCTGAAGGAAGCTATTGAGCTAGAAGAGAAAGAAAAAAGACTGATAGA
AGCTTTTGAGAGGGCGGAGACTGAGAGAAGACTGAAAGAGGAGCTTAAACAAGAAGAAGA
AGAAGCTCGTCAGCAAAACCACACCACCACCTAACTAAGGCTGCCTCTTTTCATTTCCTA
GCTTTGAATCTTTGTACTTCTCTAGCCTATAATAAACTCGTATCTTTTCTTTATTCAACT
CCTGCTTGCCCCGGTTTGCAGCAAGCTCCGCCCTTTACTAATACCATCGCCATTTAGTTT
GTATTCCATTACTTAACTATAAACAAGCAAACAATTACCACATGTAACTCTTGTTTCTTG
CAAAACAAAAAAAAAATTATAGCAATTTCAGTGATACTTAATATCTTGTTCGTTTTATTC
AAACTTGCCAATCTCATCTTTCTTTCTCTGTGTCTTCTTGTAAGACTTTTAGTAAACTGA
TGTTTGTATTAGTTGCTCCACATAAAAGAATCACATATACATCAGCCGTGCATTTCTTAA
CAATTTTTTTTATATAAAAAACGGTTGCTTGGCAAACCCTTTACC


BQ
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AF RS1BO24TF U 1
AF RS1BO24JQ C 406
BS 1 699 RS1BO24TF
BS 700 700 RS1BO24JQ
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BS 740 766 RS1BO24TF
BS 767 1125 RS1BO24JQ

RD RS1BO24TF 766 0 0
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AGGGCGGAGACTGAGAGAAGACTGAAAGAGGAGCTCGAACAAGAAGAGATGAGGCTAAAA
GAAGCCTTTGAAAAGGAAGAAGAAGAGAGGAGAAAGAGAGAGGCTCGCGAAAAGGCAGAA
GAAGAGAGGAGAAGGAAAGAACAAGAAGAGTATGAAAGGAGGCTAAAAGAAGCTTTTGAA
AAGGAAGAAAAGAACCGTAGAATGAGAGAGGCCCGTGAGAAGGCAGAAGAGAATGAAAGG
AAAATGAAAGAAGCACGTGAAAAAGAAGAAAACGAACGGAGAAGAATAAAAGAGGCTCAT
GAGAAGGCAGAGGTGGAGCGAAGGATGAAAGAAACTCTTGAACAAGAAGAGAAGGAAAGA
CAAATTAAAGAGAGGGAAGCATATGAGAGGAGAGCCAGAGAGGCTCTTGAGCAGGCAGAG
AATGAGAGGAGAGCCAGAGGCTATTGAGCAGAAGGAGAAAGAAAGGAGGTTGAAAGAGGA
GAATGAGAAGAAGCTGAAGGAAGCTATTGAGCTAGAAGAGAAAGAAAAAAGACTGATAGA
AGCTTTTGAGAGGGCGGAGACTGAGAGAAGACTGAAAGAGGAGCTTAAACAAGAAGAAGA
AGAAGCTCGTCAGCAAAACCACACCACCACCTAACTAAG*CTGCCTCTTTTCATTTCCTA
GCTTTGAATCTTTGTACT*CTCTAGCCTATAATAAACTCGTATCTT

QA 1 766 1 766
DS 

RD RS1BO24JQ 720 0 0
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CTTGAGCAGGCAGAGAATGAGAGGAGAGCCAGAGGCTATTGAGCAGAAGGAGAAAGAAAG
GAGGTTGAAAGAGGAGAATGAGAAGAAGCTGAAGGAAGCTATTGAGCTAGAAGAGAAAGA
AAAAAGACTGATAGAAGCTTTTGAGAGGGCGGAGACTGAGAGAAGACTGAAAGAGGAGCT
TAAACAAGAAGAAGAAGAAGCTCGTCAGCAAAACCACACCACCACCTAACTAAGGCTGCC
TCTTTTCATTTCCTAGCTTTGAATCTTTGTACTTCTCTAGCCTATAATAAACTCGTATCT
TTTCTTTATTCAACTCCTGCTTGCCCCGGTTTGCAGCAAGCTCCGCCCTTTACTAATACC
ATCGCCATTTAGTTTGTATTCCATTACTTAACTATAAACAAGCAAACAATTACCACATGT
AACTCTTGTTTCTTGCAAAACAAAAAAAAAATTATAGCAATTTCAGTGATACTTAATATC
TTGTTCGTTTTATTCAAACTTGCCAATCTCATCTTTCTTTCTCTGTGTCTTCTTGTAAGA
CTTTTAGTAAACTGATGTTTGTATTAGTTGCTCCACATAAAAGAATCACATATACATCAG
CCGTGCATTTCTTAACAATTTTTTTTATATAAAAAACGGTTGCTTGGCAAACCCTTTACC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL5395Contig1 986 2 2 U
GGGAGGAGGTTATGGCCTTACCCTTGGCCGGAATCGAGGCGATACTATCAAGCGATGATC
TCCAAATTGCTTCTGAGGATGCTGTTTACGACTTTGTGTTGAAATGGGCGAGGGGACAGT
ACAGTTCGTTGGAAGACCGTAGAGAGATTCTTGGCTCACGCCTTGCCCTCTACATCCGCT
TCCCATACATGACGTGCAGAAAACTCAAAAAGGTACTAACATGCAGTGACTTTGATCACG
AAGTAGCGTCAAAGCAGGTCCTAGAAGCGCTCTTCTTCAAAGCAGAAGCCCCGCACAGGC
AACGCATCCTAGCCGCGGAAGGATCAGACTCAGTGAACCGCCGTTTCATAGAGAGGGCTT
ACAAATACAGACCTGTGAAAGTCGTCGAGTTCGAGCTTCCTCGTCCGCAGTGCGTAGTGT
ACCTGGACTTGAAACGAGAGGAATGCACAGGGCTCTTCCCTTCGGGGAGAGTCTACTCTC
AGGCCTTTCACTTAGGTGGTCGAGGCTTCTTCCTCTCTGCTCATTGTAACATGGACCAGC
AAAGCTCGTTCCACTGCTTTGGTCTCTTCCTTGGGATGCAAGAGAAAGGAGCTGTGAGCT
TTGGTGTGGACTACGAGTTCGCGGCTAGAGAGAAGCCTTTTCAGGATTACGCTTGCAAAT
ACAAAGGGAGCTACACGTTCACTGGTGGCAAAGCTGTTGGTTACAGAAACCTCTTTGGGA
TTCCTTGGACTTCGTTCATCGCTGAGGATAGTCAATACTTCATCAATGGCATTTTCCATT
TCCGAGCTGAGCTCACCATTAAAAAATCAACAGAACTTCACTGATCAACAACTCTTTACT
CTCTTTTTGTTTTTCTCTCTCTCACCTCTTCATGTAGCAGCTCAAACCAAGAGTGTTTTT
TGTAATTTGCTTACGAGCAGTAAAAGAGTATCCACGCTGTAAATTTAATTGGAAGTTAAC
TTATCTATTTGCACTAGTTTTTCTTT


BQ
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AF RS1FO41TF U 1
AF RS1FO41JQ C 507
BS 1 639 RS1FO41TF
BS 640 986 RS1FO41JQ

RD RS1FO41TF 640 0 0
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TCCAAATTGCTTCTGAGGATGCTGTTTACGACTTTGTGTTGAAATGGGCGAGGGGACAGT
ACAGTTCGTTGGAAGACCGTAGAGAGATTCTTGGCTCACGCCTTGCCCTCTACATCCGCT
TCCCATACATGACGTGCAGAAAACTCAAAAAGGTACTAACATGCAGTGACTTTGATCACG
AAGTAGCGTCAAAGCAGGTCCTAGAAGCGCTCTTCTTCAAAGCAGAAGCCCCGCACAGGC
AACGCATCCTAGCCGCGGAAGGATCAGACTCAGTGAACCGCCGTTTCATAGAGAGGGCTT
ACAAATACAGACCTGTGAAAGTCGTCGAGTTCGAGCTTCCTCGTCCGCAGTGCGTAGTGT
ACCTGGACTTGAAACGAGAGGAATGCACAGGGCTCTTCCCTTCGGGGAGAGTCTACTCTC
AGGCCTTTCACTTAGGTGGTCGAGGCTTCTTCCTCTCTGCTCATTGTAACATGGACCAGC
AAAGCTCGTTCCACTGCTTTGGTCTCTTCCTTGGGATGCAAGAGAAAGGAGCTGTGAGCT
TTGGTGTGGACTACGAGTTCGCGGCTAGAGAGAAGCCTT
C

QA 1 639 1 639
DS 

RD RS1FO41JQ 480 0 0
TTTTTCCTTTT
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GCAAGAGAAAGGAGCTGTGAGCTTTGGTGTGGACTACGAGTTCGCGGCTAGAGAGAAGCC
TTTTCAGGATTACGCTTGCAAATACAAAGGGAGCTACACGTTCACTGGTGGCAAAGCTGT
TGGTTACAGAAACCTCTTTGGGATTCCTTGGACTTCGTTCATCGCTGAGGATAGTCAATA
CTTCATCAATGGCATTTTCCATTTCCGAGCTGAGCTCACCATTAAAAAATCAACAGAACT
TCACTGATCAACAACTCTTTACTCTCTTTTTGTTTTTCTCTCTCTCACCTCTTCATGTAG
CAGCTCAAACCAAGAGTGTTTTTTGTAATTTGCTTACGAGCAGTAAAAGAGTATCCACGC
TGTAAATTTAATTGGAAGTTAACTTATCTATTTGCACTAGTTTTTCTTT

QA 12 480 12 480
DS 



AS 1 2

CO CL5396Contig1 1280 2 2 U
GAAACTCTTCTTCTAAACTCTTCTTCCCTCTACAACTCTTATTCATTACTTCTGCCCCCA
TAAGAGCAGAACAGAGCAAAGAAGAGTAGCTGAAGCTTTGATCTTCCGAGAGAAAATCAA
GCGGGACTTTGACAGAGTAGCTTCTTATGGATGTCTTTGCTTTCCATGGTTCTTTCTCCA
TGTGGAAAGATGTTGCTGGAATCGCAGGCAACGTATTTGCATTTGGACTATTCGTTTCAC
CAATGCCAACCTTTAGGAGAATCTTGAGGAACAAATCAACCGAGCAATTCTCTGGTTTAC
CATACATTTACTCTCTCTTGAACTGCTTGATCTGCCTTTGGTATGGCTCACCATTCATAT
CCCAAAGAAACCTCATGCTTGTGACTGTGAACTCCGTTGGAGCCACTTTTCAGCTTTGCT
ACATTATCCTCTTCATCATGCATACAGACAAGAAGAATAAGATGAGGATGCTTGTTTTGC
TTCTTGTGGTGTTTGCCGCGGTCGGGCCGATTGCAGCTGGAAGTTTGCAGATACCTGACA
AGCTCGCACGATGGTACTTTGTTGGGTTCTTGAGCTGCGCTTCACTTGTCTCAATGTTTG
CATCTCCTTTGTTTGTTATTAACTTAGTGATTAGGACTAAGAGCGTTGAGTTTATGCCGT
TTTATCTCTCTCTATCAACGTTCTTGTTGAGCGGTTCCTTCCTCCTTTACGGGCTATTCA
ACAACGACGCCTTTGTTTATACACCAAATGGAATAGGAACGGTTCTTGGTATTGTGCAGC
TATCTTTGTACTGTTACTACCATAGGAGTTCCGAAGAGGAAGAAACAAAAGAGCCTTTGA
TTGTTTCTTATGTGTGAGAGTCTTAATCTATGGTGGGGAAAAAAGAAAACAAGAATGTGG
TACATACAAGATTCTTTGTTGTTTTTTTATTGTTGTCGTTACATTGTGTAGCACCTTGTG
TCCTATATCTACCGGCTTTCGTTCTCTCGTGGCATCAAGATGTTTATCCTCTTGGCTTCT
GTCATGATTGAAAGATGGAGATCTTTTTCAGTATGGCTCCATTGCTGAAGATTATCTGAG
ACCACATGAAGAGTTCGTTTTTCTTTTTCGTGTGATGGAAATCTCTGGTGGGTATATTTG
AAGAACATTTGTCCATGTGTTGTTTGTGTTTAGAAGATTATCTGTCTGCTCATAAGATTT
TACATCTTTGTAAAAAAAAAATATAGAATAAACTTCGCATATTCTTGTAGCAAATTGTTT
GTTCATAAGATTTTGTTTTC


BQ
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AF RS1DI09TF U 1
AF RS1DI09JQ C 512
BS 1 748 RS1DI09TF
BS 749 1280 RS1DI09JQ

RD RS1DI09TF 748 0 0
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TAAGAGCAGAACAGAGCAAAGAAGAGTAGCTGAAGCTTTGATCTTCCGAGAGAAAATCAA
GCGGGACTTTGACAGAGTAGCTTCTTATGGATGTCTTTGCTTTCCATGGTTCTTTCTCCA
TGTGGAAAGATGTTGCTGGAATCGCAGGCAACGTATTTGCATTTGGACTATTCGTTTCAC
CAATGCCAACCTTTAGGAGAATCTTGAGGAACAAATCAACCGAGCAATTCTCTGGTTTAC
CATACATTTACTCTCTCTTGAACTGCTTGATCTGCCTTTGGTATGGCTCACCATTCATAT
CCCAAAGAAACCTCATGCTTGTGACTGTGAACTCCGTTGGAGCCACTTTTCAGCTTTGCT
ACATTATCCTCTTCATCATGCATACAGACAAGAAGAATAAGATGAGGATGCTTGTTTTGC
TTCTTGTGGTGTTTGCCGCGGTCGGGCCGATTGCAGCTGGAAGTTTGCAGATACCTGACA
AGCTCGCACGATGGTACTTTGTTGGGTTCTTGAGCTGCGCTTCACTTGTCTCAATGTTTG
CATCTCCTTTGTTTGTTATTAACTTAGTGATTAGGACTAAGAGCGTTGAGTTTATGCCGT
TTTATCTCTCTCTATCAACGTTCTTGTTGAGCGGTTCCTTCCTCCTTTACGGGCTATTCA
ACAACGACGCCTTTGTTTATACACCAAA

QA 1 748 1 748
DS 

RD RS1DI09JQ 769 0 0
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GAGCTGCGCTTCACTTGTCTCAATGTTTGCATCTCCTTTGTTTGTTATTAACTTAGTGAT
TAGGACTAAGAGCGTTGAGTTTATGCCGTTTTATCTCTCTCTATCAACGTTCTTGTTGAG
CGGTTCCTTCCTCCTTTACGGGCTATTCAACAACGACGCCTTTGTTTATACACCAAATGG
AATAGGAACGGTTCTTGGTATTGTGCAGCTATCTTTGTACTGTTACTACCATAGGAGTTC
CGAAGAGGAAGAAACAAAAGAGCCTTTGATTGTTTCTTATGTGTGAGAGTCTTAATCTAT
GGTGGGGAAAAAAGAAAACAAGAATGTGGTACATACAAGATTCTTTGTTGTTTTTTTATT
GTTGTCGTTACATTGTGTAGCACCTTGTGTCCTATATCTACCGGCTTTCGTTCTCTCGTG
GCATCAAGATGTTTATCCTCTTGGCTTCTGTCATGATTGAAAGATGGAGATCTTTTTCAG
TATGGCTCCATTGCTGAAGATTATCTGAGACCACATGAAGAGTTCGTTTTTCTTTTTCGT
GTGATGGAAATCTCTGGTGGGTATATTTGAAGAACATTTGTCCATGTGTTGTTTGTGTTT
AGAAGATTATCTGTCTGCTCATAAGATTTTACATCTTTGTAAAAAAAAAATATAGAATAA
ACTTCGCATATTCTTGTAGCAAATTGTTTGTTCATAAGATTTTGTTTTC

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

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ATGGGACCATCTGTCCTAAAAAGAGGGATCAGATGAAAGTCTATGGAGAATCGTTTCATG
GTTCCTTCAAACGGATCAAACAAGAAGATCAAACGCAGGCAAAACTTGAGAAGAACACTA
CTCTGTCGAAGTCGGAGAACGCCAAGTTGATAAAACCTGATGTCCAGCTTTACCTAGACA
CTAAGGTCCATTCTGAGACATTTGAAGATCATAGGACATCCCTGGACCTCGAGTTAAACC
TTTGTTCGTCGTCAAGTTCCGTAGTAAAAAGAATCATGAAAAAAGAGGAATCTTCGAAAG
GCAAAACTTTGATCATGAGCCCAAGTAAAAAGAGGAAATCTGGTGATAGAGGGGTAAGCC
AATCCCCGTCTTGGCTAGCGTTTGAATGTGAGAATGATACTGATGAGCAGAAAAAGCAAG
AGATGATAACGACGGTGTGCATGAAGTGTCACATGCTGGTTATGCTCTGCAAATCAACTC
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TTTAAGCTTTTATGCTAGGCTTTGCCTTTTCATATTCGTAGTTAATGGGTCCAAGAATTA
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ATGAATTGCTTTAGCAT


BQ
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AF RS1H290TF U 1
AF RS1EJ41JQ C 305
BS 1 618 RS1H290TF
BS 619 619 RS1EJ41JQ
BS 620 672 RS1H290TF
BS 673 673 RS1EJ41JQ
BS 674 714 RS1H290TF
BS 715 737 RS1EJ41JQ

RD RS1H290TF 714 0 0
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ATGGGACCATCTGTCCTAAAAAGAGGGATCAGATGAAAGTCTATGGAGAATCGTTTCATG
GTTCCTTCAAACGGATCAAACAAGAAGATCAAACGCAGGCAAAACTTGAGAAGAACACTA
CTCTGTCGAAGTCGGAGAACGCCAAGTTGATAAAACCTGATGTCCAGCTTTACCTAGACA
CTAAGGTCCATTCTGAGACATTTGAAGATCATAGGACATCCCTGGACCTCGAGTTAAACC
TTTGTTCGTCGTCAAGTTCCGTAGTAAAAAGAATCATGAAAAAAGAGGAATCTTCGAAAG
GCAAAACTTTGATCATGAGCCCAAGTAAAAAGAGGAAATCTGGTGATAGAGGGGTAAGCC
AATCCCCGTCTTGGCTAGCGTTTGAATGTGAGAATGATACTGATGAGCAGAAAAAGCAAG
AGATGATAACGACGGTGTGCATGAAGTGTCACATGCTGGTTATGCTCTGCAAATCAACTC
TTGTGTGTCCCAACTGCAAGTTCACGCACCCTGATGATGATCACAGGCCTTTGAGTTTGT
TTTAAGCTTTTATGCTAG*CTTTGCCTTTTCATATTCGTAGTTAATGGGTCCAAGAATTA
ATGTCAAACTAG*TGTATGTATATACAAGTACTTATAACACTATCATTCTATGC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RS1EJ41JQ 433 0 0
TTT
GTCGTCAAGTTCCGTAGTAAAAAGAATCATGAAAAAAGAGGAATTTTTGAAAGGCAAAAC
TTTGATCATGAGCCCAAGTAAAAAGAGGAAATTTGGTGATAGAGGGGTAAGCCAATCCCC
GTTTTGGCTAGGGTTTGAATGTGAGAATGATACTGATGAGCAGAAAAAGCAAGAGATGAT
AACGACGGTGTGCATGAAGTGTCACATGCTGGTTATGCTTTGCAAATCAACTTTTGTGTG
TCCCAACTGCAAGTTCACGCCCCCTGATGATGATCACAGGCCTTTGAGTTTGTTTTAAGC
TTTTATGTTAGGCTTTGCCTTTTCATATTTGTAGTTAATGGGTCCAAGAATTAATGTCAA
ACTAGGTGTATGTATATACAAGTACTTATAACACTATCATTTTATGCTTATGTATGAATT
GCTTTAGCAT

QA 4 433 4 433
DS 



AS 1 2

CO CL5398Contig1 979 2 2 U
GACCTAACCGAACTCCCTTTTGCATCCGAGAGGCTTAAAATATTCACCGCCGATCTCAAC
GAACCGGAGAGCTTTAAACCGGCGATCGAAGGATGCAAAGCCGTGTTCCACGTGGCACAT
CCTATGGACCCGAACAGCAACGAGACCGAGGAGATCGTCACGAAACGCACCGTGCAAGGT
CTCATGGGAATTCTAAAGTCGTGTGTAGATGCTAAAACCGTGAAACGTTTTTTCTACACC
TCAAGCGCCGTGACCGTTTTCTACGGCGCCGGGAGCGGTGCTGGAGGAAACGGAGGAGAG
GTAGACGAGAGCGTTTGGAGCGACGTGGAGGTGTTTAGGAATCAGGAGGAGAAGAGAGTG
AGTAGCTCTTACGTCGTGTCAAAAATGGCGGCGGAGACGGCGGCGCTTGAGTTCGGAGGG
AATAATGGATTGGAAGTTGTGACGGTCGTGCTTCCCCTCGTCGTCGGACCTTTTATATCT
CCGTCGTTGCCTTCCTCCGTCTTCATCTCTCTCGCCATGATCTTTGGAAATTACAAGGAG
AAGTATTTGTTCGATACTTACAACATGGTGCATATTGATGACGTGGCAAGGGCGATGATA
TTCCTATTAGAAAGACCAGTAGCCAAAGGCAGATACATATGTTCGTCGGTGGAGATGAAG
ATCGATGAGGTGTTTGAGTTTTTGTCCACGAGGTTTCCTCAGTTTCAGCTACCTTCAGTT
GATCTGAAGAGTTATAGAGTAGAGAAAAGGATGGGCCTGTCAACAAAGAAGCTGAGGGGT
ACAGGGTTCGAGTTTAAGTATGGAGCTGATGAAATATTCACTGGAGCTATATATAGCTGC
CAAGCTAGAGGCTTTCTCTAAACTCGTTTGTGACATTTGTGTTAAAAATTGTATATGTTC
ATTTTGTAATATGTTCTTAATTAGTGACGAAAGATAAAAAAAAATGTTTCTACTTCATAG
TATATTTTTTCACTTCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1G253TF U 1
AF RS1G253JQ C 271
BS 1 624 RS1G253TF
BS 625 979 RS1G253JQ

RD RS1G253TF 624 0 0
GACCTAACCGAACTCCCTTTTGCATCCGAGAGGCTTAAAATATTCACCGCCGATCTCAAC
GAACCGGAGAGCTTTAAACCGGCGATCGAAGGATGCAAAGCCGTGTTCCACGTGGCACAT
CCTATGGACCCGAACAGCAACGAGACCGAGGAGATCGTCACGAAACGCACCGTGCAAGGT
CTCATGGGAATTCTAAAGTCGTGTGTAGATGCTAAAACCGTGAAACGTTTTTTCTACACC
TCAAGCGCCGTGACCGTTTTCTACGGCGCCGGGAGCGGTGCTGGAGGAAACGGAGGAGAG
GTAGACGAGAGCGTTTGGAGCGACGTGGAGGTGTTTAGGAATCAGGAGGAGAAGAGAGTG
AGTAGCTCTTACGTCGTGTCAAAAATGGCGGCGGAGACGGCGGCGCTTGAGTTCGGAGGG
AATAATGGATTGGAAGTTGTGACGGTCGTGCTTCCCCTCGTCGTCGGACCTTTTATATCT
CCGTCGTTGCCTTCCTCCGTCTTCATCTCTCTCGCCATGATCTTTGGAAATTACAAGGAG
AAGTATTTGTTCGATACTTACAACATGGTGCATATTGATGACGTGGCAAGGGCGATGATA
TTCCTATTAGAAAGACCAGTAGCC

QA 1 624 1 624
DS 

RD RS1G253JQ 709 0 0
GGGAGCGGTGCTGGAGGAAACGGAGGAGAGGTAGACGAGAGCGTTTGGAGCGACGTGGAG
GTGTTTAGGAATCAGGAGGAGAAGAGAGTGAGTAGCTCTTACGTCGTGTCAAAAATGGCG
GCGGAGACGGCGGCGCTTGAGTTCGGAGGGAATAATGGATTGGAAGTTGTGACGGTCGTG
CTTCCCCTCGTCGTCGGACCTTTTATATCTCCGTCGTTGCCTTCCTCCGTCTTCATCTCT
CTCGCCATGATCTTTGGAAATTACAAGGAGAAGTATTTGTTCGATACTTACAACATGGTG
CATATTGATGACGTGGCAAGGGCGATGATATTCCTATTAGAAAGACCAGTAGCCAAAGGC
AGATACATATGTTCGTCGGTGGAGATGAAGATCGATGAGGTGTTTGAGTTTTTGTCCACG
AGGTTTCCTCAGTTTCAGCTACCTTCAGTTGATCTGAAGAGTTATAGAGTAGAGAAAAGG
ATGGGCCTGTCAACAAAGAAGCTGAGGGGTACAGGGTTCGAGTTTAAGTATGGAGCTGAT
GAAATATTCACTGGAGCTATATATAGCTGCCAAGCTAGAGGCTTTCTCTAAACTCGTTTG
TGACATTTGTGTTAAAAATTGTATATGTTCATTTTGTAATATGTTCTTAATTAGTGACGA
AAGATAAAAAAAAATGTTTCTACTTCATAGTATATTTTTTCACTTCTTT

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 2

CO CL5399Contig1 1254 2 2 U
GGGTCCACATTCAATTTGCTTCGCTTTCTCAGATTCTATCCCGTGATCCTGTGCTCCTGC
TCGTATAATATAACTAAGTGGTTAGATACTAAAAAGGGTATACTCTATTGATCAGATTCC
ATTGATTTGGAGAGAGAAAAATGGACAAGTATGAGGTTGTGAAGGATCTAGGAACTGGAA
ACTTCGGTGTGGCTCGTCTTCTGAAGCACAAGGAGACCAATGAGCTCGTTGCCATGAAAT
ACATCGAGAGAGGCCGAAAGATAGATGAGAACGTGGCTAGAGAGATTATCAATCACAGAT
CACTTAAGCATCCTAATATCATCCGCTTCAAGGAGGTGATTCTGACACCTACTCATCTTG
CTATCGTGATGGAGTATGCTGCTGGAGGAGAGCTCTTTGATCGAATCTGCACTTCTGGTA
GATTCAGTGAAGCTGAGGCTAAGTACTTCTTTCAACAGCTGATTTGTGGCGTCGACTACT
GCCACTCCTTGCAAATATGCCACAGAGATCTGAAGCTTGAAAACACACTGCTTGATGGGA
GCCCTGCTCCGCTTTTGAAAATCTGTGACTTTGGTTACTCCAAGTCATCTATACTACAAT
CTAGGCCTAAATCAACCGTTGGAACTCCATCATACATTGCACCTGAAGTTCTTTCCCGGA
GAGAATATGATGGCAAGCACGCTGATGTGTGGTTATGTGGAGTAACCCTATATGTGATGC
TGGTTGGAGCTTACCCATTTGAGGATCCTAATGATCCAAAGAACTTCAGGAAAACAATCC
AACGTATAATGGCTACACAATACAAGATCCCGGACTACGTTCACTTATCTCAGGAATGCA
AACACCTTCTCTCTCGCATATTCGTCACTAACCCCGCTAAGAGAATCACGCTTAAGGAGA
TCAAGAATCATCCATGGTACACGAAGAATTTGCCAAAGGAGCTGGTAGAGTCGGCTCAAG
CGGTGTATTACAAGAGAGACAACACGAGCTATTCTCTTCAGAGCATAGAGGACATAATGA
AGATAGTTGGAGAAGCTAGGAATCTACCTTCATCTTCTAGTGTTAGCAAAAGCTTGGGAT
CAGGGGCTGAAGATGAAGAGGAAGAGGACGTTGAAGAAGAAGATGAATACGAGAAGCATG
TCAAAGAGGCACATTCTTCTTGTCAAGAGCCTGATAAAGCTCAAGAAGAAAGAAAATGAT
CTGTTGCTCTAAACTACTTCGTACATGTTATTTCACTTTTCGATTTGATGTCTG


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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C584TF U 1
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ATTGATTTGGAGAGAGAAAAATGGACAAGTATGAGGTTGTGAAGGATCTAGGAACTGGAA
ACTTCGGTGTGGCTCGTCTTCTGAAGCACAAGGAGACCAATGAGCTCGTTGCCATGAAAT
ACATCGAGAGAGGCCGAAAGATAGATGAGAACGTGGCTAGAGAGATTATCAATCACAGAT
CACTTAAGCATCCTAATATCATCCGCTTCAAGGAGGTGATTCTGACACCTACTCATCTTG
CTATCGTGATGGAGTATGCTGCTGGAGGAGAGCTCTTTGATCGAATCTGCACTTCTGGTA
GATTCAGTGAAGCTGAGGCTAAGTACTTCTTTCAACAGCTGATTTGTGGCGTCGACTACT
GCCACTCCTTGCAAATATGCCACAGAGATCTGAAGCTTGAAAACACACTGCTTGATGGGA
GCCCTGCTCCGCTTTTGAAAATCTGTGACTTTGGTTACTCCAAGTCATCTATACTACAAT
CT

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DS 

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GAAAATCTGTGACTTTGGTTACTCCAAGTCATCTATACTACAATCTAGGCCTAAATCAAC
CGTTGGAACTCCATCATACATTGCACCTGAAGTTCTTTCCCGGAGAGAATATGATGGCAA
GCACGCTGATGTGTGGTTATGTGGAGTAACCCTATATGTGATGCTGGTTGGAGCTTACCC
ATTTGAGGATCCTAATGATCCAAAGAACTTCAGGAAAACAATCCAACGTATAATGGCTAC
ACAATACAAGATCCCGGACTACGTTCACTTATCTCAGGAATGCAAACACCTTCTCTCTCG
CATATTCGTCACTAACCCCGCTAAGAGAATCACGCTTAAGGAGATCAAGAATCATCCATG
GTACACGAAGAATTTGCCAAAGGAGCTGGTAGAGTCGGCTCAAGCGGTGTATTACAAGAG
AGACAACACGAGCTATTCTCTTCAGAGCATAGAGGACATAATGAAGATAGTTGGAGAAGC
TAGGAATCTACCTTCATCTTCTAGTGTTAGCAAAAGCTTGGGATCAGGGGCTGAAGATGA
AGAGGAAGAGGACGTTGAAGAAGAAGATGAATACGAGAAGCATGTCAAAGAGGCACATTC
TTCTTGTCAAGAGCCTGATAAAGCTCAAGAAGAAAGAAAATGATCTGTTGCTCTAAACTA
CTTCGTACATGTTATTTCACTTTTCGATTTGATGTCTG

QA 1 758 1 758
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

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GGATGCGCTGAACACCCTTCTTTTCATTTCGTCTAATTATGTTAATTCGGCTACCTTACT
CAAACTACTACCTCGGGACTTTTGTGGGGATACTTTTATTTATGTTTGGTAGACTAGACA
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ATACAAGTTTTAATTCCCTTTTTTCAGGAAAAAAAAAACACAAATAAAGCATAACTGGAA
AAGGAAAAAAAAATAGCAAAAAACAGAACAAACCACCACACCAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAATCAAGACATTGTGTTGCAACGGAGCGAGACTGCAGCCTTTCATTTTCTTAATCTT
CCGTTGAATCAGACAAGCATTCCAGCGTTCAGGAGAAGCAATTAGAGATGATCGGAGAGA
CAAGAGAAGCAAAGGTCAGAAGTTTCTGTAAGAAGATACCATGTTCTGTAACAAAATCGG
TTTGTGTAAGGCTCTGTTCGTTTGTAAATCTGAAAGATGCATCCAGATGCTCCATCTGGG
TGTTATTCGTCTTTGAATTTCGTTTATTCATGATGAATCATCTGAATGCAACTATGTTTG
TTTGTTTTTTTTCAATTTGCATCTATATCGAGATGAATTTGTTACTAAAATAATTAAAAC
AGACTTGTTTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DQ59TF U 1
AF RS1DQ59JQ C 167
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BS 553 672 RS1DQ59JQ

RD RS1DQ59TF 553 0 0
GGATGCGCTGAACACCCTTCTTTTCATTTCGTCTAATTATGTTAATTCGGCTACCTTACT
CAAACTACTACCTCGGGACTTTTGTGGGGATACTTTTATTTATGTTTGGTAGACTAGACA
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ATACAAGTTTTAATTCCCTTTTTTCAGGAAAAAAAAAACACAAATAAAGCATAACTGGAA
AAGGAAAAAAAAATAGCAAAAAACAGAACAAACCACCACACCAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAATCAAGACATTGTGTTGCAACGGAGCGAGACTGCAGCCTTTCATTTTCTTAATCTT
CCGTTGAATCAGACAAGCATTCCAGCGTTCAGGAGAAGCAATTAGAGATGATCGGAGAGA
CAAGAGAAGCAAAGGTCAGAAGTTTCTGTAAGAAGATACCATGTTCTGTAACAAAATCGG
TTTGTGTAAGGCTCTGTTCGTTTGTAAATCTGAAAGATGCATCCAGATGCTCCATCTGGG
TGTTATTCGTCT
C

QA 1 552 1 552
DS 

RD RS1DQ59JQ 506 0 0
TTTTTTCCCAAAGAATACAAGTTTTAATTCCCTTTTTTCAGGAAAAAAAAAACCCAAATA
AAGCATAACTGGAAAAGGAAAAAAAAATGGCAAAAAACAGAACAAACCCCCCCCCCAAAA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAGACATTGTGTTGCAACGGAGCGAGACTGCAGCCTTTC
ATTTTTTTAATCTTCCGTTGAATCAGACAAGCATTCCAGCGTTCAGGAGAAGCAATTAGA
GATGATCGGAGAGACAAGAGAAGCAAAGGTCAGAAGTTTCTGTAAGAAGATACCATGTTC
TGTAACAAAATCGGTTTGTGTAAGGCTCTGTTCGTTTGTAAATTTGAAAGATGCATCCAG
ATGCTCCATCTGGGTGTTATTCGTCTTTGAATTTCGTTTATTCATGATGAATCATCTGAA
TGCAACTATGTTTGTTTGTTTTTTTTCAATTTGCATCTATATCGAGATGAATTTGTTACT
AAAATAATTAAAACAGACTTGTTTTT

QA 1 506 1 506
DS 



AS 1 2

CO CL5404Contig1 861 2 2 U
GGTGGAAAATCAACCAAAGGATAGTGAAAGTGATGGTGGAACTCATGAGAAATCATGGCA
GGCCTGAGTCACTGGTGATCCTGGCAAGTGCATCGGATCTTCTTCTCAGGGCAACTGATG
GAATGCTTGTTGATGGAGAAGCTTGTACTTTACCTCAACTTGAGCTACTTGAAGCAACGG
CAAGAGCAATACAGCCAGTGTTAGCTTGGGGGCCATCTGGACTAGCAGTAGTTGACGGTT
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CACACGTACGTGCCTTGAGCACATCAGTACTACGAGACATCATGAACCAAAGCGCTATAA
CCACCACCACCACCAAGGCAACTCCAAAACCACCACCGCCAACAATAACAACAGAGAAGA
ATGGAACGGACAGCCCGTCGTACAGGTTCTTCAACGCGGGGGCAATAGACTGGAAAGCAG
ACATACAAAAGTGTTTGAACTGGGAAGCTCACAGCTTGCTGTCCATAACGATGCCGACTC
AGTTTCTTGACACAGCGGCTCGAGAATTAGGATGTACCATATCAATGTCGTCCCAATAAC
ACGAGCAGCAGCGGCTTTTTTATTTAATGGAATTGGAAGTAGACAACCAATATGATGTTG
TTACTTTTGTATTTAGTATGTATGTATGTATGATGAGTGAGTGACTAACGAAAATCCTAT
TCCCACCGGTGCTTCGCGCTTGGGTCTCTTTATCGGTTGTACATTTTTAACATGATGAAG
CAGCACAAATCCACTTTTCTATTTTTTTGTTGTTCGTTCTTGACTACTACAAGGGATTTA
AACCGATATTTATCTTTCTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GJ80TF U 1
AF RS1GJ80JQ C 268
BS 1 567 RS1GJ80TF
BS 568 861 RS1GJ80JQ

RD RS1GJ80TF 567 0 0
GGTGGAAAATCAACCAAAGGATAGTGAAAGTGATGGTGGAACTCATGAGAAATCATGGCA
GGCCTGAGTCACTGGTGATCCTGGCAAGTGCATCGGATCTTCTTCTCAGGGCAACTGATG
GAATGCTTGTTGATGGAGAAGCTTGTACTTTACCTCAACTTGAGCTACTTGAAGCAACGG
CAAGAGCAATACAGCCAGTGTTAGCTTGGGGGCCATCTGGACTAGCAGTAGTTGACGGTT
TATCCAATCTATTGAAGTGTCGTCTGCCGGCAACAATACGGTGCCTATCACACCCAAGTG
CACACGTACGTGCCTTGAGCACATCAGTACTACGAGACATCATGAACCAAAGCGCTATAA
CCACCACCACCACCAAGGCAACTCCAAAACCACCACCGCCAACAATAACAACAGAGAAGA
ATGGAACGGACAGCCCGTCGTACAGGTTCTTCAACGCGGGGGCAATAGACTGGAAAGCAG
ACATACAAAAGTGTTTGAACTGGGAAGCTCACAGCTTGCTGTCCATAACGATGCCGACTC
AGTTTCTTGACACAGCGGCTCGAGAAT

QA 1 567 1 567
DS 

RD RS1GJ80JQ 594 0 0
CGGCAACAATACGGTGCCTATCACACCCAAGTGCACACGTACGTGCCTTGAGCACATCAG
TACTACGAGACATCATGAACCAAAGCGCTATAACCACCACCACCACCAAGGCAACTCCAA
AACCACCACCGCCAACAATAACAACAGAGAAGAATGGAACGGACAGCCCGTCGTACAGGT
TCTTCAACGCGGGGGCAATAGACTGGAAAGCAGACATACAAAAGTGTTTGAACTGGGAAG
CTCACAGCTTGCTGTCCATAACGATGCCGACTCAGTTTCTTGACACAGCGGCTCGAGAAT
TAGGATGTACCATATCAATGTCGTCCCAATAACACGAGCAGCAGCGGCTTTTTTATTTAA
TGGAATTGGAAGTAGACAACCAATATGATGTTGTTACTTTTGTATTTAGTATGTATGTAT
GTATGATGAGTGAGTGACTAACGAAAATCCTATTCCCACCGGTGCTTCGCGCTTGGGTCT
CTTTATCGGTTGTACATTTTTAACATGATGAAGCAGCACAAATCCACTTTTCTATTTTTT
TGTTGTTCGTTCTTGACTACTACAAGGGATTTAAACCGATATTTATCTTTCTTT

QA 1 594 1 594
DS 



AS 1 2

CO CL5405Contig1 1107 2 2 U
GCATGAGTTTGGACTTCCTTTGTTCCGGGAATCGTTCCTTCCTCAAATGGACCCAAACAA
GATCACCTTCCTGGAAGATCACTTCTTTTCTCTTCTTGTCTGCAAGTCGTTTGTAGCCTT
TGGTTTTGGCTTCAATGTTGGCCCGGACCTGTTCATGCAGCTTCTTGATCGTATCCACCT
TCCTCTTGTCATCTGTACTAACTCGTTCACTCAAAGGCAAAGGTAAAAGATCAAGTGGAG
ACAAGGGATTAAATCCATAAACAACCTCAAAAGGAGAAAACATAGTAGCTGAATGCAATG
CATGGTTATAAGCAAACTCAACATGAGGCAAACATTCTTCCCAAGTCCTAAGATTCTTTT
TAACCAAAGATCTAAGCAAAGCAAACATGGTTCGATTAACTACTTCAGTTTGTCCATCAG
TTTGCGGATGACAAGTTGTAGAAAACATCAATCTAGTACCTAGCTTAGACCACAAGGTCT
TCCAAAAATAGCTAAGGAACTTAGCATCACGATCAGAGACAATGGTCTTAGGCATTCCAT
GCAATCTAACAACTTCCTTAAAGAACAAATCTGCAACTTGCACAGCATCATCAGTTTTGT
GACAAGGAATGAAATGAGCCATTTTTGAGAACCTATCAACAACCACAAGGATAGAATCTC
GTCCAGCTTTGGACCTAGGCAAACCAAGCACAAAATCCATAGAAATGTCTACCCAAGGAT
GAGAGGGAATGGATAGAGCTGAGTACAAACCGTGGTTTGATGCTTTGGGCTTAGACTTCT
TGCACACCACACATCGGCTACAGATCCTCTCAACATCTTTCATCAAACTCGGCCAATAGA
AGTGGTCATGAACCGCCTTGTAAGTCTTCTTGGCACCAAAGTGTTCCATAAGTCCTCCTC
CATGAGCTTCCCTGAGAAACAACTCCCTCAAAGAACATTGAGGCACACATAAACGGTTAT
CAAAGAATAAGAAACCAGAACTTTGAAAGTATTTCCCATAAGCAACCTTGGTGCATTTTC
GAAAAATCTCTTTAAAATCCTGATCAGAGGCATAAAGATCTTTGATAAATTCAAAGCCAA
GCAATTTAGTCTCAATGGCTGAGAGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1A741TF U 1
AF RS1A741JQ C 362
BS 1 661 RS1A741TF
BS 662 1107 RS1A741JQ

RD RS1A741TF 661 0 0
GCATGAGTTTGGACTTCCTTTGTTCCGGGAATCGTTCCTTCCTCAAATGGACCCAAACAA
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TGGTTTTGGCTTCAATGTTGGCCCGGACCTGTTCATGCAGCTTCTTGATCGTATCCACCT
TCCTCTTGTCATCTGTACTAACTCGTTCACTCAAAGGCAAAGGTAAAAGATCAAGTGGAG
ACAAGGGATTAAATCCATAAACAACCTCAAAAGGAGAAAACATAGTAGCTGAATGCAATG
CATGGTTATAAGCAAACTCAACATGAGGCAAACATTCTTCCCAAGTCCTAAGATTCTTTT
TAACCAAAGATCTAAGCAAAGCAAACATGGTTCGATTAACTACTTCAGTTTGTCCATCAG
TTTGCGGATGACAAGTTGTAGAAAACATCAATCTAGTACCTAGCTTAGACCACAAGGTCT
TCCAAAAATAGCTAAGGAACTTAGCATCACGATCAGAGACAATGGTCTTAGGCATTCCAT
GCAATCTAACAACTTCCTTAAAGAACAAATCTGCAACTTGCACAGCATCATCAGTTTTGT
GACAAGGAATGAAATGAGCCATTTTTGAGAACCTATCAACAACCACAAGGATAGAATCTC
G

QA 1 661 1 661
DS 

RD RS1A741JQ 746 0 0
AACCAAAGATCTAAGCAAAGCAAACATGGTTCGATTAACTACTTCAGTTTGTCCATCAGT
TTGCGGATGACAAGTTGTAGAAAACATCAATCTAGTACCTAGCTTAGACCACAAGGTCTT
CCAAAAATAGCTAAGGAACTTAGCATCACGATCAGAGACAATGGTCTTAGGCATTCCATG
CAATCTAACAACTTCCTTAAAGAACAAATCTGCAACTTGCACAGCATCATCAGTTTTGTG
ACAAGGAATGAAATGAGCCATTTTTGAGAACCTATCAACAACCACAAGGATAGAATCTCG
TCCAGCTTTGGACCTAGGCAAACCAAGCACAAAATCCATAGAAATGTCTACCCAAGGATG
AGAGGGAATGGATAGAGCTGAGTACAAACCGTGGTTTGATGCTTTGGGCTTAGACTTCTT
GCACACCACACATCGGCTACAGATCCTCTCAACATCTTTCATCAAACTCGGCCAATAGAA
GTGGTCATGAACCGCCTTGTAAGTCTTCTTGGCACCAAAGTGTTCCATAAGTCCTCCTCC
ATGAGCTTCCCTGAGAAACAACTCCCTCAAAGAACATTGAGGCACACATAAACGGTTATC
AAAGAATAAGAAACCAGAACTTTGAAAGTATTTCCCATAAGCAACCTTGGTGCATTTTCG
AAAAATCTCTTTAAAATCCTGATCAGAGGCATAAAGATCTTTGATAAATTCAAAGCCAAG
CAATTTAGTCTCAATGGCTGAGAGGG

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 2

CO CL5406Contig1 1190 2 6 U
ATCCGGAAGGCAAAACCGCAACGTCACGCACCCGAGCCGCGGTTCTTGAGAACTCAGCGG
ATCTTGGGGTTGTGTTTGACACGGATGTTGATAGGAGTGGAGTTGTGGATAACAAAGGGA
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CAGGAAGTACAATAGTGACGGACGCAAGAACGAGTATGGGGCTAACTAGGTTTATAACGG
AGAGAGGAGGGAGACATTGTTTGTACAGAGTAGGGTATAGAAACGTGATTGACAAGGGAG
TTGAGCTGAACAAAGATGGCATCGAGACTCATCTCATGATGGAAACTTCAGGACATGGTG
CTGTTAAAGAGAATCACTTCTTAGATGACGGTGCATACATGGTGGTGAAAATTATAATTG
AAATGGTGAGAATGAGACTGGCGGGATCAAAGGAAGGTATTGGTAGCCTGATAGAAGATC
TCGAGGAGCCATTAGAATCGGCTGAGCTGCGGATGAATATTTTGTCGGAGCCAAGAGATG
CCAAAGCAAAAGGCATTGAAGCCATTGAGACATTCAGGTAATACATTGAGGAAGGAAAAC
TAGATGGATGGGAATTGGATTCTTGTGGAGAATGTTGGGTTAGTGAAAGGTTGTTTGGTA
GACTCAAATGATCATCCATCTGCCATTGATGCTCACATGTACAGGGCAAAAGTGATGGAC
AAAAAGAGTGGGGAAGAGTATGGATGGGTACACATGAGGCAGAGCATTCACAATCCTAAC
ATTGCTTTTAATATGCAATCAGTGCTTCCTGGTGGATGTCTTTCCATGACAAGTCTTTTC
AGAGACCGGTTTTTGGAAGCTAGCGGGATAGCTAGATTCCTCGACATAAGTGATATCGAC
AATTATATCGGAAGTCAATCCTGAAGGCTTTTCAATCAAATTGCAAATGGTAGAGCATTA
AACGACAGTGTGAAGGCTACTTTTTTTTGAAAAAAAGAAAAAATTCATGTGCTATGTTTT
TGTATCCTTTTTGAGGATACACTTAGCTAGGCCATTAACCAAAAACGTTCGCCATTTCAT
TATATGATCATCTGTAACGTATAGTAATCGGTAGATGTGATTATAAAATGAATGTGTAAT
ATACGTGGATATAATTGATGAACGATAATAATGTCAATGGAAGGTAATTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AG33TF U 1
AF RS1AG33JQ C 382
BS 1 724 RS1AG33TF
BS 725 725 RS1AG33JQ
BS 726 734 RS1AG33TF
BS 735 735 RS1AG33JQ
BS 736 754 RS1AG33TF
BS 755 1190 RS1AG33JQ

RD RS1AG33TF 754 0 0
ATCCGGAAGGCAAAACCGCAACGTCACGCACCCGAGCCGCGGTTCTTGAGAACTCAGCGG
ATCTTGGGGTTGTGTTTGACACGGATGTTGATAGGAGTGGAGTTGTGGATAACAAAGGGA
ATCCTATCAACGGAGATAAACTCATTGCGCTTATGTCAGCTATTGTGCTTAAAGAACATC
CAGGAAGTACAATAGTGACGGACGCAAGAACGAGTATGGGGCTAACTAGGTTTATAACGG
AGAGAGGAGGGAGACATTGTTTGTACAGAGTAGGGTATAGAAACGTGATTGACAAGGGAG
TTGAGCTGAACAAAGATGGCATCGAGACTCATCTCATGATGGAAACTTCAGGACATGGTG
CTGTTAAAGAGAATCACTTCTTAGATGACGGTGCATACATGGTGGTGAAAATTATAATTG
AAATGGTGAGAATGAGACTGGCGGGATCAAAGGAAGGTATTGGTAGCCTGATAGAAGATC
TCGAGGAGCCATTAGAATCGGCTGAGCTGCGGATGAATATTTTGTCGGAGCCAAGAGATG
CCAAAGCAAAAGGCATTGAAGCCATTGAGACATTCAGGTAATACATTGAGGAAGGAAAAC
TAGATGGATGGGAATTGGATTCTTGTGGAGAATGTTGGGTTAGTGAAAGGTTGTTTGGTA
GACTCAAATGATCATCCATCTGCCATTGATGCTCACATGTACAGGGCAAAAGTGATGGAC
AAAA*GAGTGGGGA*GAGTATGGATGGGTACACA

QA 1 754 1 754
DS 

RD RS1AG33JQ 809 0 0
TAGATGACGGTGCATACATGGTGGTGAAAATTATAATTGAAATGGTGAGAATGAGACTGG
CGGGATCAAAGGAAGGTATTGGTAGCCTGATAGAAGATCTCGAGGAGCCATTAGAATCGG
CTGAGCTGCGGATGAATATTTTGTCGGAGCCAAGAGATGCCAAAGCAAAAGGCATTGAAG
CCATTGAGACATTCAGGTAATACATTGAGGAAGGAAAACTAGATGGATGGGAATTGGATT
CTTGTGGAGAATGTTGGGTTAGTGAA*GGTTGTTTGGTAGACTCAAATGATCATCCATTT
GCCATTGATGCTCACATGTACAGGGCAAAAGTGATGGACAAAAAGAGTGGGGAAGAGTAT
GGATGGGTACACATGAGGCAGAGCATTCACAATCCTAACATTGCTTTTAATATGCAATCA
GTGCTTCCTGGTGGATGTCTTTCCATGACAAGTCTTTTCAGAGACCGGTTTTTGGAAGCT
AGCGGGATAGCTAGATTCCTCGACATAAGTGATATCGACAATTATATCGGAAGTCAATCC
TGAAGGCTTTTCAATCAAATTGCAAATGGTAGAGCATTAAACGACAGTGTGAAGGCTACT
TTTTTTTGAAAAAAAGAAAAAATTCATGTGCTATGTTTTTGTATCCTTTTTGAGGATACA
CTTAGCTAGGCCATTAACCAAAAACGTTCGCCATTTCATTATATGATCATCTGTAACGTA
TAGTAATCGGTAGATGTGATTATAAAATGAATGTGTAATATACGTGGATATAATTGATGA
ACGATAATAATGTCAATGGAAGGTAATTG

QA 1 809 1 809
DS 



AS 1 2

CO CL5407Contig1 355 2 1 U
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GATTTCATTACTACACTTGCCACACTTTTATAGTCTTGCTGAGTTGCTTCACGTATCCCA
ACATTTGGTTACCCATTTAGACAAAACATCATTGAATTTGTCAAATCATTACACCACATA
TTAGACATAAAATGTTGTCTAAAGTTTTGAAATGGGAAACAACCATGAATTGTTCTTTCC
CTTGTCCCCACACACACCTAAATCTCACAACGAGAAACAGAAACCTCCTCCTAGTAGATT
GCCACATCCAGATAATCTCCAATCTACAAAAAGATGATTAATTGCAGTTATAGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1FP87JQ C 1
AF RS1FP87TF U 1
BS 1 355 RS1FP87TF

RD RS1FP87JQ 355 0 0
GGCTTACGCTTCATATTGAAGGAGGACTCCATCTCCATGCAATCCCAAGGACAAGCACTT
GATTTCATTACTACACTTGCCACACTTTTATAGTCTTGCTGAGTTGCTTCACGTATCCCA
ACATTTGGTTACCCATTTAGACAAAACATCATTGAATTTGTCAAATCATTACACCACATA
TTAGACATAAAATGTTGTCTAAAGTTTTGAAATGGGAAACAACCATGAATTGTTCTTTCC
CTTGTCCCCACACACACCTAAATCTCACAACGAGAAACAGAAACCTCCTCCTAGTAGATT
GCCACATCCAGATAATCTCCAATCTACAAAAAGATGATTAATTGCAGTTATAGCC

QA 1 355 1 355
DS 

RD RS1FP87TF 355 0 0
GGCTTACGCTTCATATTGAAGGAGGACTCCATCTCCATGCAATCCCAAGGACAAGCACTT
GATTTCATTACTACACTTGCCACACTTTTATAGTCTTGCTGAGTTGCTTCACGTATCCCA
ACATTTGGTTACCCATTTAGACAAAACATCATTGAATTTGTCAAATCATTACACCACATA
TTAGACATAAAATGTTGTCTAAAGTTTTGAAATGGGAAACAACCATGAATTGTTCTTTCC
CTTGTCCCCACACACACCTAAATCTCACAACGAGAAACAGAAACCTCCTCCTAGTAGATT
GCCACATCCAGATAATCTCCAATCTACAAAAAGATGATTAATTGCAGTTATAGCC

QA 1 355 1 355
DS 



AS 1 2

CO CL5408Contig1 907 2 6 U
GACTTCAACAATGGAGTCTCCATGGCTAGATTCCTTCTCTCCTACTCTTCCATCCTTTCT
TTATCCTTCTCTCGACCAACCTGATGAATTCAAGAACCATAACATCAATTTTCATCCTCA
TCACATGAATCTTGCTCACATAAATGGTAGTAACAAGAACAGTAACAATGATCAAAAAGA
AGATGAAAGAGAATTGGTTTTGGAGAAGAAACTGAACCACAACGCTAGCGAACGCGACCG
CCGTAGAAAGCTAAACGCCTTATACTCTTCACTTCGTGCTCTCTTGCCTCCTTCTGATCA
AAAGAGGAAGTTGAGCATTCCAATGACCGTAGCGGGAGTGGTGAAGTATATACCAGAGCA
GGAGCAAGAACTTGAACGTTTGTCTAGGAGGAAAGAAGAGCTCATGAAGACAATCTCCAG
TAAGACAGCGACTTTGAGTCATCAACAAGAACAGCTGAGACATAGAGCAATGATGGACTC
AGTAGATTCGTCTCCTCAAAAGATTGCAGCAAATTGGATTACAGACACAGAGATAGCTGT
CCAGATTGCTACATGGAAATGGGCACCTATCTCAGACATGTTGCTTAGGTTAGAAGAAAA
CGGGCTTAATGTCACAAGCGTCTCTTCTTCTGTTTCTTCCACCTCAAGGATCTTCTACAC
TATGCATCTTCAGATGAGAGGAGATTGCAAAGTGAGGTTGGAGGAACTCAGCGATATGCT
ATTCGGATTACGCCAATCATACTGAGGGATGAGAGTTTCAATAAGTTGAATCTTCTTAGT
TAATGTTATAGACTTTTATCACACTTTAGAACTGTACTCTTTTGTAACGTTTTCTTGTTA
TACTTTTTTTCTTATTGTTAAATTAATGATATTATTTTACTTCAGAACTTTATTCAATGA
TCATGCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DR91TF U 1
AF RS1DW91TF U 220
BS 1 412 RS1DR91TF
BS 413 413 RS1DW91TF
BS 414 565 RS1DR91TF
BS 566 566 RS1DW91TF
BS 567 584 RS1DR91TF
BS 585 907 RS1DW91TF

RD RS1DR91TF 584 0 0
GACTTCAACAATGGAGTCTCCATGGCTAGATTCCTTCTCTCCTACTCTTCCATCCTTTCT
TTATCCTTCTCTCGACCAACCTGATGAATTCAAGAACCATAACATCAATTTTCATCCTCA
TCACATGAATCTTGCTCACATAAATGGTAGTAACAAGAACAGTAACAATGATCAAAAAGA
AGATGAAAGAGAATTGGTTTTGGAGAAGAAACTGAACCACAACGCTAGCGAACGCGACCG
CCGTAGAAAGCTAAACGCCTTATACTCTTCACTTCGTGCTCTCTTGCCTCCTTCTGATCA
AAAGAGGAAGTTGAGCATTCCAATGACCGTAGCGGGAGTGGTGAAGTATATACCAGAGCA
GGAGCAAGAACTTGAACGTTTGTCTAGGAGGAAAGAAGAGCTCATGAAGACA*TCTCCAG
TAAGACAGCGACTTTGAGTCATCAACAAGAACAGCTGAGACATAGAGCAATGATGGACTC
AGTAGATTCGTCTCCTCAAAAGATTGCAGCAAATTGGATTACAGACACAGAGATAGCTGT
CCAGATTGCTACATGGAAATGGGCATCTATCTCAGACATGTTGC

QA 1 584 1 584
DS 

RD RS1DW91TF 688 0 0
G
AACGCTAGCGAACGCGACCGCCGTAGAAAGCTAAACGCCTTATACTCTTCACTTCGTGCT
CTCTTGCCTCCTTCTGATCAAAAGAGGAAGTTGAGCATTCCAATGACCGTAGCGGGAGTG
GTGAAGTATATACCAGAGCAGGAGCAAGAACTTGAACGTTTGTCTAGGAGGAAAGAAGAG
CTCATGAAGACAATCTCCAGTAAGACAGCGACTTTGAGTCATCAACAAGAACAGCTGAGA
CATAGAGCAATGATGGACTCAGTAGATTCGTCTCCTCAAAAGATTGCAGCAAATTGGATT
ACAGACACAGAGATAGCTGTCCAGATTGCTACATGGAAATGGGCACCTATCTCAGACATG
TTGCTTAGGTTAGAAGAAAACGGGCTTAATGTCACAAGCGTCTCTTCTTCTGTTTCTTCC
ACCTCAAGGATCTTCTACACTATGCATCTTCAGATGAGAGGAGATTGCAAAGTGAGGTTG
GAGGAACTCAGCGATATGCTATTCGGATTACGCCAATCATACTGAGGGATGAGAGTTTCA
ATAAGTTGAATCTTCTTAGTTAATGTTATAGACTTTTATCACACTTTAGAACTGTACTCT
TTTGTAACGTTTTCTTGTTATACTTTTTTTCTTATTGTTAAATTAATGATATTATTTTAC
TTCAGAACTTTATTCAATGATCATGCA

QA 2 688 2 688
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5410Contig1 921 2 4 U
GAGCTAAGAAGATAACTACTTAGCTAGGAGGTTGCAGATGAAATAATTTCTGATTTTGCA
ACAATTAAACAGAATTCAGAGAAGCCTTTGAATGACAATGAGTATAACGAGAAGAACATA
AGGAGGAGAGTGTATGATGCACTAAATGTCTTCATGGCGTTGGATATCATCGCAAGGGAT
AAAAAGGAAATCCGTTGGAAAGGCCTTCCCATTACCTGCAAGAAAGATGTGGAAGAAGTT
AAGATGGATCGAAATAAGATTACGAACAGTGTGCAAAAGAAGGCTGCTTTCCTCAAAGAA
TTGAGAGAAAAGGTATCAAGTCTTGAGAGTCTTATGTCGAGAAACAAGGAGATGGTTGTG
AAGACTGAAGGTCCAGCAGAAGGATTTACTTTACCATTCATTCTACTTGAGACAAATCCT
CATGCAGTAGTCGAAATCGAGATTTCTGAAGACATGCAACTTGTACACCTCGACTTCAAT
AGCACGCCTTTCTCGGTCCATGACGATGCCTACATATTGAAACTGATGCAAGAACACAAG
CTGCAGCAGCAGCAGCAGCAGAACAGAGTTTCTTCGCCTTCCTCTACACATCAACACTCT
TCTTCTGCTCATTCTTCCTCCAGTTCTTGCATTGCTTCTGGAACCTCAGGCCCCGTTTCC
TGGAACTCCGGGATCCATTGATACTCGCTGACCACCCACCGAGAAAAAAAGAACCGTCAT
TCTGTTCCCAATTCTCGAAAAAGAAAGAACAAGCCATCTAATTTGGTGTACTTGAAGAAA
AAAAATTATACATTTGGTTTAAATGCCATTTGAGAGAGAGAGAGACTGTGAATTTATGAT
CCCATATGCCAACAACAAATGTTTGTTCATCCAATTTACAAATGTTTGTAAAACCGATTC
GGTTAACTATTTATCTGAGGT


BQ
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AAGATGGATCGAAATAAGATTACGAACAGTGTGCAAAAGAAGGCTGCTTTCCTCAAAGAA
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CAACACTCTTTTTCTGCTCATTCTTCCTCCAGTTCTTGCATTGCTTCTGGAACCTCAGGC
CCCGTTTCCTGGAACTCCGGGATCCATTGATACTCGCTGACCACCCACCGAGAAAAAAAG
AACCGTCATTCTGTTCCCAATTCTCGAAAAAGAAAGAACAAGCCATCTAATTTGGTGTAC
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ATTTATGATCCCATATGCCAACAACAAATGTTTGTTCATCCAATTTACAAATGTTTGTAA
AACCGATTCGGTTAACTATTTATCTGAGGT

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 2

CO CL5411Contig1 1114 2 2 U
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AATTTGATCTTTATTGTTCATTATTGGATCTGTCGCAGCAGCCTCAAGAGGATTAATTCA
CGAAGCCTCAGATAGATCTTCGGGAGCAGTCAATTTGCAGAGAAGATAACCGATGATCCG
GTAACGTATAAGACCGCACAAAGCACCGTGACATGCATGTATCAAACGCATATATCTGGA
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ATGGTCACAAGCGTGGAAGGCGATATGAATTATTGCTGCAAGGTTGACCTTAAGCCGTGG
CATTTCTGGAACAAGAAAGGGTACAAGTCTTTTGAGGTCGAAGGAAACCCTGTAGAGGTG
TATTGGGATTTCAGGTCTGCGAAATTCACGAGTAGCCCCGAGCCTAGCTCCGACTTCTAC
GTGGCTCTAGTCGCGGAGGAAGAGGTGATTTTGTTGGTGGGTGATTACAAGAAGAAGGCT
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CTTGAATAGTAGTCTATCAAAAAGAGAAGCTTTTGTCAAGAAAATGTATTATACGGGTTT
GATTGATCTCAAATGGTGACATAACATTATCACG


BQ
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AGAAAGAAAACGTGTTTGGGAAGAAGAGTTTCGCCACGAGGGCTAAGTTTTACGACAGGA
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GGATAAGTATTGACGGGATTGTGTTGGTACAGGTCAAGAATCTGCAGTGGAAATTCAGAG
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GGTTGTTCAGTGCGCCGGGGACAGGACATGGTCTGTTTATATTCAAACCAGGGACCGCAG
AAGACAGCGACATGGAAGGAAGTGGTCATGGTGGTGGTGAGAGTGATACAAGCACAGGGA
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CTTGGAAACTTGAATAGTAGTCTATCAAAAAGAGAAGCTTTTGTCAAGAAAATGTATTAT
ACGGGTTTGATTGATCTCAAATGGTGACATAACATTATCACG

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

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AAGCCAGTTGATGTGATAAGCAAGACCGAGCTGGTCCACATGGTCGATGCTCCTGCCAAG
AAGTCTGTTAATACTGCTGAGGTCAAGAAGGTTGTTGCTGCTGAAGCTACTCCTCCTCCT
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GGAGCCAAGAAATCGTATGCTGCGATGGTTCAATCAATGTTGAGGAACGCTGCTCCCTTC
CAAGTTAAAGCAGCCCCCGCCGTTCAGAAACCTAAAACCATGGCACCATCCAAAGGGCGT
GCAGCTCCAGCACCTGCTGCTTCTGCTGTTGGTAAACCTGAAAAGAAAAGTGACCAGAGG
ATCGTCGACGAACCAGGAACTTCGGTATTTGTGTCAAATCTGCCGATGGATGCAAAGGCA
CCTCAGCTCTATGAACTGTTCAAGGCTTTTGGCCCTATCAAAGAAGGTGGAGTTCAAATC
AGAAGCTCCAGGGCTAGTGGAAGATGCTTTGGTTTTGTTTCCTTTGAATCTGTTGCATCT
GTCCAGAGCATGCTTAAAGCTGCCAAGAGCAATCCCTTCAAGCTTGGGGATCATAAGCTT
CGTGTAAAAGAAAAGCAAGTTGAGTATGATGGAAGCAAACAGTCTGGTGGGAGAAGTGGA
GGTGGAGGAAGCAAGGCACAGAATGGCTCTGTAGAGGAGAGCAAGACTCCGACTGGTTCT
GTTGTAGATGAGAGCAAGACACCGACTGGTTCTGCAGATGGAAGCAAGTCTGAGAATGGT
TCTTCTGCTGGTGGTGGGGAAGATGATGATGGCTTCAAGACTATCAGAAACCGTAAGAAC
AGAAACAAGAAAAACAGTGAAGTAGCTCCTAAGGTCAAAGCTTGATATAATCTCCCTCAC
CTCCTCTGCAAAACACCAACAAGTACAAGAAAGAGTGTTAGAGTTTTCAAAGCCTTTTGA
TAGATAATTAAATTGGTTTAAAGAGAGATAAGGGAAGAGATTTGCAACTTGAGATAAATT
TTTCAGACTATTACAGATTTACATCTCTTTTACTTGTTTAGGTCTTTTTTTTTTTGCTTT
CTTACTCATGGAACTCATCATAGTTGTTGTTCTGTTGTT


BQ
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AF RS1AO45TFB U 1
AF RS1AO45JQ C 351
BS 1 717 RS1AO45TFB
BS 718 1179 RS1AO45JQ

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AAGTCTGTTAATACTGCTGAGGTCAAGAAGGTTGTTGCTGCTGAAGCTACTCCTCCTCCT
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AGAAGCTCCAGGGCTAGTGGAAGATGCTTTGGTTTTGTTTCCTTTGAATCTGTTGCATCT
GTCCAGAGCATGCTTAAAGCTGCCAAGAGCAATCCCTTCAAGCTTGGGGATCATAAGCTT
CGTGTAAAAGAAAAGCAAGTTGAGTATGATGGAAGCAAACAGTCTGGTGGGAGAAGT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1AO45JQ 829 0 0
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TGTTGCATCTGTCCAGAGCATGCTTAAGGCTGCCAAGAGCAATCCCTTCAAGCTTGGGGA
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GACTGGTTCTGTTGTAGATGAGAGCAAGACACCGACTGGTTCTGCAGATGGAAGCAAGTC
TGAGAATGGTTCTTCTGCTGGTGGTGGGGAAGATGATGATGGCTTCAAGACTATCAGAAA
CCGTAAGAACAGAAACAAGAAAAACAGTGAAGTAGCTCCTAAGGTCAAAGCTTGATATAA
TCTCCCTCACCTCCTCTGCAAAACACCAACAAGTACAAGAAAGAGTGTTAGAGTTTTCAA
AGCCTTTTGATAGATAATTAAATTGGTTTAAAGAGAGATAAGGGAAGAGATTTGCAACTT
GAGATAAATTTTTCAGACTATTACAGATTTACATCTCTTTTACTTGTTTAGGTCTTTTTT
TTTTTGCTTTCTTACTCATGGAACTCATCATAGTTGTTGTTCTGTTGTT

QA 1 829 1 829
DS 



AS 1 2

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GGAAATAAAAAAAGATTGATTCTGAAAGAAAGATAAAAAAACGAAACTTGTTGAGATAAG
AAGAAGATTCGGTTTGTGCAGAGAGAGAAGAGACATGGTGTTCCGAGGCGACACGGTGAT
GTCCGTAGCCCACTTATCTACGTATATATTTCAAAGGTGGATTCCTGCGTCGGATCGAAT
CAGAAGCGGGGAGATGCTGCAGCTCGTCTGCTGTTTTCCGCTTCAAGAGCTTGGTCGATT
CGTGTCATGGTTCTGGAACTACATCTGTGTTCCACCGCCTGAGATTTTATATTATGAGAG
ATCATTATCATCATCATCGTCTTCTTCTTCGATTGTTAATAACCAGAATTACTATCATCT
TCATTTGGAGTGACTATGTTAATCATTTCAAGTGTTTTTATTCTCTCCCTTCTTGTATAG
AAAAAAAAAACTCCTTGGCTAGAGTTTCTTGGGATTGTTGGACAGATCGGAGTATGTTTA
TCAATCCTTGTTTATTAGAATCAAAGTAATCAGGAGATCTTGAGCTTGTGGTGATGTGTT
ATATAGGTTACTCTTTCGTCCATTTAGGAGTCAAATGAGCGTGTTGTGATGTCTTCTTAG
GTGTGTATAAAATCTCTTAGTAATAACAAAAATTAATAATTACTCCTTCATGTTTTCAAA
GTGTTGTGATCTCTTACAGAGCTTTTCGGTAGATCAGCCTTTGTTGATTACTTTATATTA
ATTCGTGAAAGTTCCTATAAGGATACATGGTACAGTCCCTGGACGTGATGTATGGTTTGA
AAAGTTTAATGGAATCCAGTTCAGGATTAACGTTATAAGGCAGCAGTGGCTTGACACGAG
TTTGGGCCTTCTCCAGTACATTAATACCATTGTTCTAGATGCAGAGCACCGTACCTTCTC
TCAAGATTTGTTCTAAAGAAGAAAAAGGTTACATATCCCTTTGTTGGTTGAATCGGTTTG
GTTATCATTTGGCTCAACCAGGATCTTTGACTCTGTGCTTGTAGCAGCATAATAAGATTA
GTCTCGTTTTTACTTTCGCCAAATGTAAGTTAAACGAATCTAACTTGGGCCAGTAGCCAA
GTCTGCGAATGTGGTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GF95TF U 1
AF RS1GF95JQ C 493
BS 1 594 RS1GF95TF
BS 595 1097 RS1GF95JQ

RD RS1GF95TF 594 0 0
GGAAATAAAAAAAGATTGATTCTGAAAGAAAGATAAAAAAACGAAACTTGTTGAGATAAG
AAGAAGATTCGGTTTGTGCAGAGAGAGAAGAGACATGGTGTTCCGAGGCGACACGGTGAT
GTCCGTAGCCCACTTATCTACGTATATATTTCAAAGGTGGATTCCTGCGTCGGATCGAAT
CAGAAGCGGGGAGATGCTGCAGCTCGTCTGCTGTTTTCCGCTTCAAGAGCTTGGTCGATT
CGTGTCATGGTTCTGGAACTACATCTGTGTTCCACCGCCTGAGATTTTATATTATGAGAG
ATCATTATCATCATCATCGTCTTCTTCTTCGATTGTTAATAACCAGAATTACTATCATCT
TCATTTGGAGTGACTATGTTAATCATTTCAAGTGTTTTTATTCTCTCCCTTCTTGTATAG
AAAAAAAAAACTCCTTGGCTAGAGTTTCTTGGGATTGTTGGACAGATCGGAGTATGTTTA
TCAATCCTTGTTTATTAGAATCAAAGTAATCAGGAGATCTTGAGCTTGTGGTGATGTGTT
ATATAGGTTACTCTTTCGTCCATTTAGGAGTCAAATGAGCGTGTTGTGATGTCT

QA 1 594 1 594
DS 

RD RS1GF95JQ 605 0 0
TATTAGAATCAAAGTAATCAGGAGATCTTGAGCTTGTGGTGATGTGTTATATAGGTTACT
CTTTCGTCCATTTAGGAGTCAAATGAGCGTGTTGTGATGTCTTCTTAGGTGTGTATAAAA
TCTCTTAGTAATAACAAAAATTAATAATTACTCCTTCATGTTTTCAAAGTGTTGTGATCT
CTTACAGAGCTTTTCGGTAGATCAGCCTTTGTTGATTACTTTATATTAATTCGTGAAAGT
TCCTATAAGGATACATGGTACAGTCCCTGGACGTGATGTATGGTTTGAAAAGTTTAATGG
AATCCAGTTCAGGATTAACGTTATAAGGCAGCAGTGGCTTGACACGAGTTTGGGCCTTCT
CCAGTACATTAATACCATTGTTCTAGATGCAGAGCACCGTACCTTCTCTCAAGATTTGTT
CTAAAGAAGAAAAAGGTTACATATCCCTTTGTTGGTTGAATCGGTTTGGTTATCATTTGG
CTCAACCAGGATCTTTGACTCTGTGCTTGTAGCAGCATAATAAGATTAGTCTCGTTTTTA
CTTTCGCCAAATGTAAGTTAAACGAATCTAACTTGGGCCAGTAGCCAAGTCTGCGAATGT
GGTCC

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 2

CO CL5414Contig1 1002 2 2 U
GGGGCTTTTCAGAACTCTTTTGCCGGCGATCCCCGTCTCTCTCTCTCTCCGAATAGGCAA
TTGAGATGGCAACTCCAATGGTAGAAGACACGTCAAGCTTCGAAGAGGATCAGCTCGCGT
CCATGTCCACCGAAGACATCGTTAGAGCTACTCGTCTCCTCGACAACGAGATTCGAATTC
TCAAGGAAGATGCACAAAGAACAAATCTAGAATGCGATTCTTACAAGGAGAAGATAAAGG
AGAATCAGGAGAAGATTAAACTCAACAAGCAGCTTCCTTACTTGGTTGGCAACATTGTTG
AGATATTGGAGATGAATCCGGAAGATGATGCTGAGGAAGACGGTGCTAATATCGACCTTG
ACTCTCAAAGGAAGGGAAAGTGTGTTGTCTTGAAAACATCTACACGACAGACAATCTTTC
AATCAGCTTGATGGATTCAGTAGCGATGAGCGTATTAAGGTGATAGCAGCCACTAACCGT
GCAGATATTCTGGACCCAGCACTCATGCGTTCTGGTCGACTAGACAGGAAGATTGAGTTC
CCACATCCAACGGAAGAAGCAAGAGCCAGAATCTTGCAGATTCACTCGAGGAAGATGAAT
GTACACCCAGACGTCAACTTTGAGGAGCTTGCAAGATCGACAGATGATTTCAATGGCGCT
CAACTGAAAGCTGTATGTGTGGAGGCTGGCATGTTAGCTTTTCGTCGCGATGCCACAGAG
GTGAACCATGAGGACTTCAATGAAGGTATAATCCAAGTCCAGGCCAAGAAGAAAGCAAGT
TTGAACTACTACGCCTAGTCTCTCCCTGTCAGTTATATTCGTGTTTGCTCTCTATCTTTC
AACTAGTGTTTATTCCGGTTGGAAACTTTTCATATTTTCGAATCAGGATATCTTTTATCA
AAGTGCATTTAGTTTTGTTCATCTTATTTTTCTTCTGAAACAAGAAAAGGAACTTTAATA
GTTTACCACCTCTTATAATTTTATTGTTGAATTGTGTTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GB40TF U 1
AF RS1GB40JQ C 339
BS 1 693 RS1GB40TF
BS 694 1002 RS1GB40JQ

RD RS1GB40TF 693 0 0
GGGGCTTTTCAGAACTCTTTTGCCGGCGATCCCCGTCTCTCTCTCTCTCCGAATAGGCAA
TTGAGATGGCAACTCCAATGGTAGAAGACACGTCAAGCTTCGAAGAGGATCAGCTCGCGT
CCATGTCCACCGAAGACATCGTTAGAGCTACTCGTCTCCTCGACAACGAGATTCGAATTC
TCAAGGAAGATGCACAAAGAACAAATCTAGAATGCGATTCTTACAAGGAGAAGATAAAGG
AGAATCAGGAGAAGATTAAACTCAACAAGCAGCTTCCTTACTTGGTTGGCAACATTGTTG
AGATATTGGAGATGAATCCGGAAGATGATGCTGAGGAAGACGGTGCTAATATCGACCTTG
ACTCTCAAAGGAAGGGAAAGTGTGTTGTCTTGAAAACATCTACACGACAGACAATCTTTC
AATCAGCTTGATGGATTCAGTAGCGATGAGCGTATTAAGGTGATAGCAGCCACTAACCGT
GCAGATATTCTGGACCCAGCACTCATGCGTTCTGGTCGACTAGACAGGAAGATTGAGTTC
CCACATCCAACGGAAGAAGCAAGAGCCAGAATCTTGCAGATTCACTCGAGGAAGATGAAT
GTACACCCAGACGTCAACTTTGAGGAGCTTGCAAGATCGACAGATGATTTCAATGGCGCT
CAACTGAAAGCTGTATGTGTGGAGGCTGGCATG

QA 1 693 1 693
DS 

RD RS1GB40JQ 664 0 0
GACGGTGCTAATATCGACCTTGACTCTCAAAGGAAGGGAAAGTGTGTTGTCTTGAAAACA
TCTACACGACAGACAATCTTTCAATCAGCTTGATGGATTCAGTAGCGATGAGCGTATTAA
GGTGATAGCAGCCACTAACCGTGCAGATATTCTGGACCCAGCACTCATGCGTTCTGGTCG
ACTAGACAGGAAGATTGAGTTCCCACATCCAACGGAAGAAGCAAGAGCCAGAATCTTGCA
GATTCACTCGAGGAAGATGAATGTACACCCAGACGTCAACTTTGAGGAGCTTGCAAGATC
GACAGATGATTTCAATGGCGCTCAACTGAAAGCTGTATGTGTGGAGGCTGGCATGTTAGC
TTTTCGTCGCGATGCCACAGAGGTGAACCATGAGGACTTCAATGAAGGTATAATCCAAGT
CCAGGCCAAGAAGAAAGCAAGTTTGAACTACTACGCCTAGTCTCTCCCTGTCAGTTATAT
TCGTGTTTGCTCTCTATCTTTCAACTAGTGTTTATTCCGGTTGGAAACTTTTCATATTTT
CGAATCAGGATATCTTTTATCAAAGTGCATTTAGTTTTGTTCATCTTATTTTTCTTCTGA
AACAAGAAAAGGAACTTTAATAGTTTACCACCTCTTATAATTTTATTGTTGAATTGTGTT
TGCC

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

CO CL5415Contig1 1176 2 4 U
TCTTGTTTGATGAGGTATGCGCATATGTATGGAAGCGACTCCAGGATCTTCTCTTGCTTA
GCTGAGCTTGGTGTTGCGTTGACTCACGAACCTGGGTTTCATCAGATTGATGTAAGAGGG
AACCTATTTGGACTGCTATGCGCGCACCCTCTAGCTCCACTGGTATCACTTCATCACCTG
GACGCGGTTGATCCGTTCTTTCCAAAAACAAACCGGACCGAGTCCGTGGCTCGTCTAATC
GGTGCCGCGAGTTTTGATTCCGCAAGGATATTGCAGCAGAGCGTGTGCTATGATTCTTCA
AACATAGTGACTGTTTCGGTCGTGTGGGGCTACACGATTCAAGTCTACGAAGGCAATAAA
CTCCTCCCGGATCTTCTCACCTTGCAAAAGACGTTCTCTACGTGGAGGAGAGGGTCAGGT
GTCCGAAGCAACTATATGTTCAGCACAAGAGAATATCCCAGAGATCCATGTGCCAGACCG
CTCGTCTTTTTCTTGAATGGTGTGGCTCAGATGAGACTGGTGGGACATGGAGTAGCTATA
GACTTCATAGTGTCGGCAACTGCCACAGAGCAGAAGCGGTTAAGCGACTACAACGCATCC
GAGTTCGGTCTCGTAAGCTGAAACTCAATGTTGAACAGATGAATCCGCCTCGCCGTCAAT
GCTGTGACATCTCATCGCCTTATAACACTTCAATGGTCATTAACATAAGGCAATGCATGC
CTGATGAGCTAATTGCCTTGAACACCTAGCGTTTTTTTTCTCTCTAACCATTCGCTTCAA
GAATTAGCTAAACAGCGCCTGAGCCTAATATTCTACTGATGTAAATCAATGGCAGAATCC
TGAGCTTGTAGGTGGGTTAGTTTTGTCTTCCAGACTAACTTCAGAGGTAAATGTCTTATA
GAAGAGACCTGTTCAAAGGGTTGTGTATTTTCCACCAAGTTTGTTTCTTTGTCTTCCTTT
TGGCCAAGGAGAAGAATAAAGCTCAGATCCTTCCTCTTGTATATACAGTTGTGCAGGCAT
TGATGTTTCTCATACTTCATGATCCTAAGTTTTGAGTTCTTTTTTTGTCATGTGGTGAGA
GTCACTTTGCTCTTTGAATGTTACTACTCAACCGTTGTTTTTTTTTGTGTGGGAACAACT
GTAATAGATCTAGAAAGCTTGGTTTATTTATTTGCC


BQ
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AF RS1AJ90TF U 1
AF RS1AJ90JQ C 385
BS 1 709 RS1AJ90TF
BS 710 710 RS1AJ90JQ
BS 711 744 RS1AJ90TF
BS 745 1176 RS1AJ90JQ

RD RS1AJ90TF 744 0 0
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GCTGAGCTTGGTGTTGCGTTGACTCACGAACCTGGGTTTCATCAGATTGATGTAAGAGGG
AACCTATTTGGACTGCTATGCGCGCACCCTCTAGCTCCACTGGTATCACTTCATCACCTG
GACGCGGTTGATCCGTTCTTTCCAAAAACAAACCGGACCGAGTCCGTGGCTCGTCTAATC
GGTGCCGCGAGTTTTGATTCCGCAAGGATATTGCAGCAGAGCGTGTGCTATGATTCTTCA
AACATAGTGACTGTTTCGGTCGTGTGGGGCTACACGATTCAAGTCTACGAAGGCAATAAA
CTCCTCCCGGATCTTCTCACCTTGCAAAAGACGTTCTCTACGTGGAGGAGAGGGTCAGGT
GTCCGAAGCAACTATATGTTCAGCACAAGAGAATATCCCAGAGATCCATGTGCCAGACCG
CTCGTCTTTTTCTTGAATGGTGTGGCTCAGATGAGACTGGTGGGACATGGAGTAGCTATA
GACTTCATAGTGTCGGCAACTGCCACAGAGCAGAAGCGGTTAAGCGACTACAACGCATCC
GAGTTCGGTCTCGTAAGCTGAAACTCAATGTTGAACAGATGAATCCGCCTCGCCGTCAAT
GCTGTGACATCTCATCGCCTTATAACACTTCAATGGTCATTAACATAAG*CAATGCATGC
CTGATGAGCTAATTGCCTTGAACA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1AJ90JQ 792 0 0
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ACAAGAGAATATCCCAGAGATCCATGTGCCAGACCGCTCGTCTTTTTCTTGAATGGTGTG
GCTCAGATGAGACTGGTGGGACATGGAGTAGCTATAGACTTCATAGTGTCGGCAACTGCC
ACAGAGCAGAAGCGGTTAAGCGACTACAACGCATCCGAGTTCGGTCTCGTAAGCTGAAAC
TCAATGTTGAACAGATGAATCCGCCTCGCCGTCAATGCTGTGACATCTCATCGCCTTATA
ACACTTCAATGGTCATTAACATAAGGCAATGCATGCCTGATGAGCTAATTGCCTTGAACA
CCTAGCGTTTTTTTTCTCTCTAACCATTCGCTTCAAGAATTAGCTAAACAGCGCCTGAGC
CTAATATTCTACTGATGTAAATCAATGGCAGAATCCTGAGCTTGTAGGTGGGTTAGTTTT
GTCTTCCAGACTAACTTCAGAGGTAAATGTCTTATAGAAGAGACCTGTTCAAAGGGTTGT
GTATTTTCCACCAAGTTTGTTTCTTTGTCTTCCTTTTGGCCAAGGAGAAGAATAAAGCTC
AGATCCTTCCTCTTGTATATACAGTTGTGCAGGCATTGATGTTTCTCATACTTCATGATC
CTAAGTTTTGAGTTCTTTTTTTGTCATGTGGTGAGAGTCACTTTGCTCTTTGAATGTTAC
TACTCAACCGTTGTTTTTTTTTGTGTGGGAACAACTGTAATAGATCTAGAAAGCTTGGTT
TATTTATTTGCC

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 2

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ATGTAGAAGAAAAGGGATCGTTGATCTCAGGCTTGTTGGACAAAGCCAAAGGTTTCTTCG
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GTGTGACTGGTCAAGGAGCTGATTATCACGCCAAGGTCTCCGTCAAGAATCCTTACCCTC
AAGCAATCCCTATTTGCCAGATCTCTTACCTCCTCAAGAGTGACACAAGGATGATAGCGT
CTGGCACGATACCGGATCCGGGTTCGTTGATTGCGAACGGGTCGACGGTTCTGGACGTAC
CGGTTAAGGTGCCTTACAGCATAGCGATAAGTTTGATGAAGGACATGTTTTTGGACTGGG
ACATCGACTATCAACTTGACATCGGACTAACCATCGACCTTCCTGTTATTGGTGACATTA
CCATCCCTGTCTCTACTCAGGGTGAGATCAAGCTTCCTTCCTTTGCCGACATCTTTAACT
CTAAACCCTCTGAGTGATTTTCAATAAGTACGATCCGTAAACGATCGTTGGATGTTTCAG
TTGTGGAGTACTCTTGTTTTGTTGTTGAATTGATAAAGGACTTTTATTTGGTT


BQ
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AF RS1AE95TF U 1
AF RS1FQ96TF U 259
BS 1 562 RS1AE95TF
BS 563 653 RS1FQ96TF

RD RS1AE95TF 562 0 0
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ATGTAGAAGAAAAGGGATCGTTGATCTCAGGCTTGTTGGACAAAGCCAAAGGTTTCTTCG
CAGAGAAGCTTGCCAATATTCCGACGCCGGAAGCCACCGTGGACGACGTAGACTTCGTAC
GTGTGACTGGTCAAGGAGCTGATTATCACGCCAAGGTCTCCGTCAAGAATCCTTACCCTC
AAGCAATCCCTATTTGCCAGATCTCTTACCTCCTCAAGAGTGACACAAGGATGATAGCGT
CTGGCACGATACCGGATCCGGGTTCGTTGATTGCGAACGGGTCGACGGTTCTGGACGTAC
CGGTTAAGGTGCCTTACAGCATAGCGATAAGTTTGATGAAGGACATGTTTTTGGACTGGG
ACATCGACTATCAACTTGACATCGGACTAACCATCGACCTTCCTGTTATTGGTGACATTA
CCATCCCTGTCTCTACTCAGGGTGAGATCAAGCTTCCTTCCTTTGCCGACATCTTTAACT
CTAAACCCTCTGAGTGATTTTC

QA 1 562 1 562
DS 

RD RS1FQ96TF 395 0 0
G
GATCTCTTACCTCCTCAAGAGTGACACAAGGATGATAGCGTCTGGCACGATACCGGATCC
GGGTTCGTTGATTGCGAACGGGTCGACGGTTCTGGACGTACCGGTTAAGGTGCCTTACAG
CATAGCGATAAGTTTGATGAAGGACATGTTTTTGGACTGGGACATCGACTATCAACTTGA
CATCGGACTAACCATCGACCTTCCTGTTATTGGTGACATTACCATCCCTGTCTCTACTCA
GGGTGAGATCAAGCTTCCTTCCTTTGCCGACATCTTTAACTCTAAACCCTCTGAGTGATT
TTCAATAAGTACGATCCGTAAACGATCGTTGGATGTTTCAGTTGTGGAGTACTCTTGTTT
TGTTGTTGAATTGATAAAGGACTTTTATTTGGTT

QA 2 395 2 395
DS 



AS 1 2

CO CL5417Contig1 866 2 2 U
TTTTTCTTCTTCCGTTGAGAGAACTTCTCCGTCGAAAAGATGCCTACCCCGGCCAGCTTG
ACTATAGGCAAGATGATGATCCTCATAACTCTTGGCCATCCAATGCCTTCCGTCGACACC
TCATCATACGCTGATGCTAAGACAGGCGTCTTCTGGGACGTGGAGGACTGTCCGATCCCG
GAAGATCTCGACCCCGAGTCTGTTTATCAGAACATCAGATCTGCTCTCGCTAACAGTGGT
TACCACGGCGAGGTGAAAATCAAGGCGTTTGGTGACAGGAACCAGATCCCTGGTTACTAC
GAATCTGCCGGAATCCAAATCTTTCCCAAAGGAGATAAGTATGAGAGGAATGGTCAGATG
CAGTTGGAGTTTTTCGGGTGGATGAGGGATAATAAGACTGAGTACACGAGCATGATGGTC
GTGTCACGATCCGCGATGGAGCTGGTTTCTTATCTCGAGTATAAACATACTCATCACAAC
CTTCTCTTTGCGGATCCTCTGAACCCAATAAAAAAGGCTTGCGGCTGCAAATTCGGAGCT
CGGTCCGAAGATCCTTGCACTGAGAGATGGGTCTGGGAAACCCTAGCTGTCGGAGGAGAC
CCCCCCCCCAAAACAGAAGAAGAAGAGCCTTGCAGATATCGTAATTAGTTAAATGTTTCT
AGGTAGAGCTACTTAATTGCTTAGTACTAGTTAAATATTTATAACTTGCTACATAGTAGT
ATTGCTTAGTACTTAATGTTTATAAAGTTGCTTACTTAATTGCTTAGTAGTTCATGTATT
TAATTTGCTACATATTTCTTAGTGGTTAATGTTTCGTGTTACTAATATTGCTTAGTTGTG
AATGTTTCTAAGTTGCTAATAGATTT


BQ
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AF RS1EK48TF U 1
AF RS1EK48JQ C 216
BS 1 567 RS1EK48TF
BS 568 866 RS1EK48JQ

RD RS1EK48TF 567 0 0
TTTTTCTTCTTCCGTTGAGAGAACTTCTCCGTCGAAAAGATGCCTACCCCGGCCAGCTTG
ACTATAGGCAAGATGATGATCCTCATAACTCTTGGCCATCCAATGCCTTCCGTCGACACC
TCATCATACGCTGATGCTAAGACAGGCGTCTTCTGGGACGTGGAGGACTGTCCGATCCCG
GAAGATCTCGACCCCGAGTCTGTTTATCAGAACATCAGATCTGCTCTCGCTAACAGTGGT
TACCACGGCGAGGTGAAAATCAAGGCGTTTGGTGACAGGAACCAGATCCCTGGTTACTAC
GAATCTGCCGGAATCCAAATCTTTCCCAAAGGAGATAAGTATGAGAGGAATGGTCAGATG
CAGTTGGAGTTTTTCGGGTGGATGAGGGATAATAAGACTGAGTACACGAGCATGATGGTC
GTGTCACGATCCGCGATGGAGCTGGTTTCTTATCTCGAGTATAAACATACTCATCACAAC
CTTCTCTTTGCGGATCCTCTGAACCCAATAAAAAAGGCTTGCGGCTGCAAATTCGGAGCT
CGGTCCGAAGATCCTTGCACTGAGAGA

QA 1 567 1 567
DS 

RD RS1EK48JQ 651 0 0
CAGATCTGCTCTCGCTAACAGTGGTTACCACGGCGAGGTGAAAATCAAGGCGTTTGGTGA
CAGGAACCAGATCCCTGGTTACTACGAATCTGCCGGAATCCAAATCTTTCCCAAAGGAGA
TAAGTATGAGAGGAATGGTCAGATGCAGTTGGAGTTTTTCGGGTGGATGAGGGATAATAA
GACTGAGTACACGAGCATGATGGTCGTGTCACGATCCGCGATGGAGCTGGTTTCTTATCT
CGAGTATAAACATACTCATCACAACCTTCTCTTTGCGGATCCTCTGAACCCAATAAAAAA
GGCTTGCGGCTGCAAATTCGGAGCTCGGTCCGAAGATCCTTGCACTGAGAGATGGGTCTG
GGAAACCCTAGCTGTCGGAGGAGACCCCCCCCCCAAAACAGAAGAAGAAGAGCCTTGCAG
ATATCGTAATTAGTTAAATGTTTCTAGGTAGAGCTACTTAATTGCTTAGTACTAGTTAAA
TATTTATAACTTGCTACATAGTAGTATTGCTTAGTACTTAATGTTTATAAAGTTGCTTAC
TTAATTGCTTAGTAGTTCATGTATTTAATTTGCTACATATTTCTTAGTGGTTAATGTTTC
GTGTTACTAATATTGCTTAGTTGTGAATGTTTCTAAGTTGCTAATAGATTT

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 2

CO CL5418Contig1 1128 2 2 U
GGGTATAAACACTATAAAGGTACTCTCAGTCACCTCTCTCTTCCCGCTTTCGCAGAACAA
GAAAGAAACAATGGGGATATCTGAAACGCCGAAGAAGAAGAAGAAGATCCAGAGAAAGAA
ACAGCTTGAAGACGAGAAGATTATTGCAGACGAGATAGAACGATTGATGGAACTAGCGGT
GGAAGAAGAATATCAAGAACTAGAAACGGAGAAAGCCGACGAGATGGTTTTGCTAATGAA
GTGTCCACCAAGGGTCGACAAGGCGTGGCGCCAACTTTCTTCGTCTTCTTCCTTTTCTCA
GGAACTTGGTCTCGTGGCCAAGTATAGCGAATCCTTCAATCTCCTGCGTCCCGATTTGTC
GCCTGGGTTGAGAATGGAGATGGCTAGTGCTGAGCTACAGAACATTTCGAAGCTCTATTC
TGTAAACAAATCCAAAGACTTTGTTGGTCCAGTGCGTATCTTCTCCGAATCAAATCAAGG
TAAACTTGAGGTGGAAGGAACGGTGACGCATAAACTCGATATGAGACCTCATGATTGCAT
TGAAGAATACGGAAAGCTTTTACGTGTGAGGAACATGAAACCGGTGGCTGAAAATAGACA
TATTCAGGTTCTTGATGGTTGCCGGGGAGAACACTTGACGCCCACGCCTGCATTGGTGGT
GACAGAGAAGCTTAATAAGCGAAGGGAAAAGAGGACAAGAAGCGATCGTAGTGAGGTGGA
AGCGAAAGTGTTCCAACTATTTGAAAGAGAACCGAGATGGACACTGAGACAGCTTGCTCA
AAAAACCAACCAACCAGAGATATTCTTGAAAGAGATACTCAAAGAGCTTTGTGTGTATTC
AAGGAGTGGTCGTGCTTACGAGCTTAAACCAGAATACAAGAAATGTGTTTGAGAAGGGCG
GGCACACACAACAGGATGCTCAGTAAAGACTAAAAAGGCATCATCAGAAAATCAGAAGAA
AAAAAGGTTGTAAAAATTGGATCCTTTTTTTTTAACACTAGAAAAAAAAGTGGAACTTTT
CTTTTTGAACAGGTAAAAGATTGGAACTTTTGAACTCTAATGTGAAAAGGTATCTTTCAT
GAGGTTGTTTTCTGTAACACAAGTATACAGATACAGAACTTACAATGT


BQ
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AF RS1FR62TF U 1
AF RS1FR62JQ C 367
BS 1 689 RS1FR62TF
BS 690 1128 RS1FR62JQ

RD RS1FR62TF 689 0 0
GGGTATAAACACTATAAAGGTACTCTCAGTCACCTCTCTCTTCCCGCTTTCGCAGAACAA
GAAAGAAACAATGGGGATATCTGAAACGCCGAAGAAGAAGAAGAAGATCCAGAGAAAGAA
ACAGCTTGAAGACGAGAAGATTATTGCAGACGAGATAGAACGATTGATGGAACTAGCGGT
GGAAGAAGAATATCAAGAACTAGAAACGGAGAAAGCCGACGAGATGGTTTTGCTAATGAA
GTGTCCACCAAGGGTCGACAAGGCGTGGCGCCAACTTTCTTCGTCTTCTTCCTTTTCTCA
GGAACTTGGTCTCGTGGCCAAGTATAGCGAATCCTTCAATCTCCTGCGTCCCGATTTGTC
GCCTGGGTTGAGAATGGAGATGGCTAGTGCTGAGCTACAGAACATTTCGAAGCTCTATTC
TGTAAACAAATCCAAAGACTTTGTTGGTCCAGTGCGTATCTTCTCCGAATCAAATCAAGG
TAAACTTGAGGTGGAAGGAACGGTGACGCATAAACTCGATATGAGACCTCATGATTGCAT
TGAAGAATACGGAAAGCTTTTACGTGTGAGGAACATGAAACCGGTGGCTGAAAATAGACA
TATTCAGGTTCTTGATGGTTGCCGGGGAGAACACTTGACGCCCACGCCTGCATTGGTGGT
GACAGAGAAGCTTAATAAGCGAAGGGAAA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1FR62JQ 762 0 0
GTTGAGAATGGAGATGGCTAGTGCTGAGCTACAGAACATTTCGAAGCTCTATTCTGTAAA
CAAATCCAAAGACTTTGTTGGTCCAGTGCGTATCTTCTCCGAATCAAATCAAGGTAAACT
TGAGGTGGAAGGAACGGTGACGCATAAACTCGATATGAGACCTCATGATTGCATTGAAGA
ATACGGAAAGCTTTTACGTGTGAGGAACATGAAACCGGTGGCTGAAAATAGACATATTCA
GGTTCTTGATGGTTGCCGGGGAGAACACTTGACGCCCACGCCTGCATTGGTGGTGACAGA
GAAGCTTAATAAGCGAAGGGAAAAGAGGACAAGAAGCGATCGTAGTGAGGTGGAAGCGAA
AGTGTTCCAACTATTTGAAAGAGAACCGAGATGGACACTGAGACAGCTTGCTCAAAAAAC
CAACCAACCAGAGATATTCTTGAAAGAGATACTCAAAGAGCTTTGTGTGTATTCAAGGAG
TGGTCGTGCTTACGAGCTTAAACCAGAATACAAGAAATGTGTTTGAGAAGGGCGGGCACA
CACAACAGGATGCTCAGTAAAGACTAAAAAGGCATCATCAGAAAATCAGAAGAAAAAAAG
GTTGTAAAAATTGGATCCTTTTTTTTTAACACTAGAAAAAAAAGTGGAACTTTTCTTTTT
GAACAGGTAAAAGATTGGAACTTTTGAACTCTAATGTGAAAAGGTATCTTTCATGAGGTT
GTTTTCTGTAACACAAGTATACAGATACAGAACTTACAATGT

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL5419Contig1 353 2 1 U
TCCGCAACAAGTTCTACTGCCCCATCGTCAACCTCGACAAGCTATGGTCACTCGTCCCCG
AGGATGTGAAGGGGAAGGCCACAAAGGACAAGGTGCCGATGATCGATGTGACGCAGCACG
GGTTCTTCAAGGTTCTTGGGAAAGGTCATTTGCCTGAGGGAAAGCCTTTCGTTGTGAAGG
CCAAGCTCATTTCCAAGACTGCTGAGAAGAAGATCAAGGAGGCTGGTGGCGCCGTCGTGC
TCACTGCCTAGGGTTAGGTCTGTTTTTTACGTTTTGCTTTTTTAAGTATTGTCTTTTGGA
ATCGTTGTTGGACTCAGAGTTTGTTGCTTTTTGGAATGAGAGATCTTTTAATC


BQ
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AF RS1BU33JQ C 1
AF RS1BU33TF U 1
BS 1 353 RS1BU33TF

RD RS1BU33JQ 353 0 0
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ATCGTTGTTGGACTCAGAGTTTGTTGCTTTTTGGAATGAGAGATCTTTTAATC

QA 1 353 1 353
DS 

RD RS1BU33TF 353 0 0
TCCGCAACAAGTTCTACTGCCCCATCGTCAACCTCGACAAGCTATGGTCACTCGTCCCCG
AGGATGTGAAGGGGAAGGCCACAAAGGACAAGGTGCCGATGATCGATGTGACGCAGCACG
GGTTCTTCAAGGTTCTTGGGAAAGGTCATTTGCCTGAGGGAAAGCCTTTCGTTGTGAAGG
CCAAGCTCATTTCCAAGACTGCTGAGAAGAAGATCAAGGAGGCTGGTGGCGCCGTCGTGC
TCACTGCCTAGGGTTAGGTCTGTTTTTTACGTTTTGCTTTTTTAAGTATTGTCTTTTGGA
ATCGTTGTTGGACTCAGAGTTTGTTGCTTTTTGGAATGAGAGATCTTTTAATC

QA 1 353 1 353
DS 



AS 1 2

CO CL5420Contig1 734 2 2 U
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CTGGCGGAGTATATGATGAAGATTAACTACTATCCCCCGTGTCCTCGGCCGGATTTAGCA
TTAGGAGTACCGGCGCACACCGATCTCAGTGGGATCACTCTGCTTGTGCCTAACGAAGTT
CCTGGACTTCAAGTCTTCAAAGACGATCACTGGTTCGACGCCGAGTATATTCCTTCCGCC
GTCATTGTTCACATCGGCGATCAGATTTTGAGGCTGAGTAATGGGAGGTATAAGAACGTG
TTGCATAGGACGACGGTGGATAAGGACAGGACAAGGATGTCGTGGCCAGTTTTCTTGGAG
CCTCACCGTGAAATGGTCGTCGGGCCATTACCGGAGCTTATCAGCGATGGTAATCCTCCA
AAGTACAAGCCTTTTGCTTTCAAGGACTACAGTTACCGCAAGCTCAATAAGCTTCCTCTG
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TTTATTTTAAAAACTATTGTGTTTGAAATAAGGTGTGGTTGTTGTTTTCCCGCGATAAGA
AGTTTCGATGTATCTCTTCTTGTGTTCAGTTTTTATGATTAAATAAAGACCATAAAGACA
TGTTCTTGTTGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1H638TF U 1
AF RS1H638JQB C 168
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QA 1 470 1 470
DS 

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GTATAAGAACGTGTTGCATAGGACGACGGTGGATAAGGACAGGACAAGGATGTCGTGGCC
AGTTTTCTTGGAGCCTCACCGTGAAATGGTCGTCGGGCCATTACCGGAGCTTATCAGCGA
TGGTAATCCTCCAAAGTACAAGCCTTTTGCTTTCAAGGACTACAGTTACCGCAAGCTCAA
TAAGCTTCCTCTGGATTAAGAATGAAAAATAAAATCAAAAGTATGAAGAAAAGTGTTGTT
GAATTTAAATTAATTTATTTTAAAAACTATTGTGTTTGAAATAAGGTGTGGTTGTTGTTT
TCCCGCGATAAGAAGTTTCGATGTATCTCTTCTTGTGTTCAGTTTTTATGATTAAATAAA
GACCATAAAGACATGTTCTTGTTGTCT

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 2

CO CL5421Contig1 1011 2 6 U
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GCTTTGTAATAAATAACAATGATGAGACATGGTAAATTCACATAATGTTTTTATTTACCT
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AGTTAAACTCTTCAAGCTTCCTTTTGATCTTATCACCTTCATCAACCTCTCCCAGAGTTT
GATTCTGCAGCTCTCCCGAACCGGTTACCGGCGTCGGAGAGGAACACGAAGCCGGAAAAG
ATTCCGACCGACGGAACGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGTCGGGAAGGGATTAATCGTAATT
CTCGGCGAATAGAGGGGCAGAAGCGGAATTTCGCAGAGGAGGTAAAGAGATGAACGGGTC
GGAGGTGGAAGAAAGACGACGGACACACACGCAACGACGACATCTCTCCGTCTCTTTTTC
TCCTCTTCACATTTTTTTTCTATCCCAAGTTTTGTTGAAATTTTAATTTCGGACCGAACC
GCCTTCATTTCCGGTTTATTTGATTCAGACCAATGCCGGTTCACTTTTTTATTTGTCGTT
TGTTGTTTTAGCCAAACCGATTTCTGTATGTTGGTAAACTAAAACCGATATTACAGTATG
AATTATTTCAAACCGGGTTTAAGACAGAACCGAAGAAAGAGATACTAAATCAAAAACACG
ACAAATCTTGCCGTCGTTTTGCGAAACTCCAAACCAAACCTATCGACTGGG


BQ
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AF RS1G572TF U 1
AF RS1G572JQ C 317
BS 1 641 RS1G572TF
BS 642 642 RS1G572JQ
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RD RS1G572TF 677 0 0
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TTTAAAACCAAAGTCGCAAGTAGAAAGAGGAGCACTCTTTTAAAGACTAAAGAGGTGGCA
AGAATCAAAACTCACTCTTTATGATCTAGTTCCAAGAGGTCTGCAACAGAATCAGACCAT
GATACAAGCTGAGGATCGTTTACTTGTACTGATGGGGAAACTTTTGAGTAGCAAGCATGT
AATACCTGCCCCAAATTACAATATAAACAAATCAAAATCCTGATTGGCCAAAGTTAATTA
GCTTTGTAATAAATAACAATGATGAGACATGGTAAATTCACATAATGTTTTTATTTACCT
TACGCGAGATAACATCGCTTCTGGGATCACCAGGCAACTCCTTAACAAAGGAGTGGTCCC
AGTTAAACTCTTCAAGCTTCCTTTTGATCTTATCACCTTCATCAACCTCTCCCAGAGTTT
GATTCTGCAGCTCTCCCGAACCGGTTACCGGCGTCGGAGAGGAACACGAAGCCGGAAAAG
ATTCCGACCGACGGAACGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGTCGGGAAGGGATTAATCGTAATT
CTCGGCGAATAGAGGGGCAGAAGCGGAATTTCGCAGAGGAG*TAAAGAGATGAACGGGTC
GGAG*TGGAAGAAAGAC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RS1G572JQ 695 0 0
CAATGATGAGACATGGTAAATTCACATAATGTTTTTATTTACCTTACGCGAGATAACATC
GCTTCTGGGATCACCAGGCAACTCCTTAACAAAGGAGTGGTCCCAGTTAAACTCTTCAAG
CTTCCTTTTGATCTTATCACCTTCATCAACCTCTCCCAGAGTTTGATTCTGCAGCTCTCC
CGAACCGGTTACCGGCGTCGGAGAGGAACACGAAGCCGGAAAAGATTCCGACCGACGGAA
CGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGTCGGGAAGGGATTAATCGTAATTCTCGGCGAATAGAGGG
GCAGAAGCGGAATTTCGCAGAGGAGGTAAAGAGATGAACGGGTCGGAGGTGGAAGAAAGA
CGACGGACACACACGCAACGACGACATCTCTCCGTCTCTTTTTCTCCTCTTCACATTTTT
TTTCTATCCCAAGTTTTGTTGAAATTTTAATTTCGGACCGAACCGCCTTCATTTCCGGTT
TATTTGATTCAGACCAATGCCGGTTCACTTTTTTATTTGTCGTTTGTTGTTTTAGCCAAA
CCGATTTCTGTATGTTGGTAAACTAAAACCGATATTACAGTATGAATTATTTCAAACCGG
GTTTAAGACAGAACCGAAGAAAGAGATACTAAATCAAAAACACGACAAATCTTGCCGTCG
TTTTGCGAAACTCCAAACCAAACCTATCGACTGGG

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

CO CL5422Contig1 868 2 4 U
ACGAGAGACCATGTCGTGGCTGAGAACTGCTGTGAATAAGGCGGTGGAGGTCGGAAACCG
CAAAAACATCACACGAACCGTCAAGAACTACGCCGACTCCGTCGTTCAGCAGGCTGGCCA
AGCCGTCGCTGAAGGAGCCAAATTGTTCCAGGACCGCATTCGTGTTGGGGCCTATAAGAG
TGTTAATCAGACGATTCAGAGACTGGAGGAAGCTGCAGTCTCTTTCAGGGGTCATGAAAG
AGCTTTGCTTATTACCAGGTGGTTATCTGTGCTTAAGGAGATCGATAAAGCTCTTGGAAC
TTCTTCCGTCAAGGATAAAGATGTGACTTCTGAGGAGGAACATCTTGCTTCTGATGAACC
AAAGAGGCGTGAATGGGTTTTGTATTACGATCCAGATATAGGAGGTCAGCCACTGAACTT
CCGTGATGTTTTTCTACAAAGTCAAGCTCTGGAGGGCATCGTCCTGTCCATGATTATGGA
GCCACCACATGATGAGGAAGTTACTCTACTCCTGGGCATGTTTAGGCTTTGTCTAAATGG
AGGAAAGGAAGTTCATGATGCTATAGTCAGCAGTGCTTCATCACCCAAAGCCCCTAAGCC
CAGCAGTAGCAGCATGGATTCTCCTCTCGAATCTACTACTACTACTACTCTGACACAGAA
GCCAGAGTTGAGCGAGACAGCACCGACTACTACTACTCCTGCTGCTGGTTCCAGTCAAGA
GTTTAACCATGAAGCAGAGCTAGCGGAGCTTGAATCTGAATTTGGTAAGGTGGCTCGTGA
TTACTCTGCAGATGAGGTTGATGGATGGGAATTCGATGAACTAGAGAAAGAACTGCAGTA
GTAGTAGTAGTAGTAGTAGAAGCTCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AK46TF U 1
AF RS1AK46JQ C 458
BS 1 759 RS1AK46TF
BS 760 760 RS1AK46JQ
BS 761 764 RS1AK46TF
BS 765 868 RS1AK46JQ

RD RS1AK46TF 764 0 0
ACGAGAGACCATGTCGTGGCTGAGAACTGCTGTGAATAAGGCGGTGGAGGTCGGAAACCG
CAAAAACATCACACGAACCGTCAAGAACTACGCCGACTCCGTCGTTCAGCAGGCTGGCCA
AGCCGTCGCTGAAGGAGCCAAATTGTTCCAGGACCGCATTCGTGTTGGGGCCTATAAGAG
TGTTAATCAGACGATTCAGAGACTGGAGGAAGCTGCAGTCTCTTTCAGGGGTCATGAAAG
AGCTTTGCTTATTACCAGGTGGTTATCTGTGCTTAAGGAGATCGATAAAGCTCTTGGAAC
TTCTTCCGTCAAGGATAAAGATGTGACTTCTGAGGAGGAACATCTTGCTTCTGATGAACC
AAAGAGGCGTGAATGGGTTTTGTATTACGATCCAGATATAGGAGGTCAGCCACTGAACTT
CCGTGATGTTTTTCTACAAAGTCAAGCTCTGGAGGGCATCGTCCTGTCCATGATTATGGA
GCCACCACATGATGAGGAAGTTACTCTACTCCTGGGCATGTTTAGGCTTTGTCTAAATGG
AGGAAAGGAAGTTCATGATGCTATAGTCAGCAGTGCTTCATCACCCAAAGCCCCTAAGCC
CAGCAGTAGCAGCATGGATTCTCCTCTCGAATCTACTACTACTACTACTCTGACACAGAA
GCCAGAGTTGAGCGAGACAGCACCGACTACTACTACTCCTGCTGCTGGTTCCAGTCAAGA
GTTTAACCATGAAGCAGAGCTAGCGGAGCTTGAATCTGATTTTG

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1AK46JQ 411 0 0
ATCGTCCTGTCCATGATTATGGAGCCACCACATGATGAGGAAGTTACTCTACTCCTGGGC
ATGTTTAGGCTTTGTCTAAATGGAGGAAAGGAAGTTCATGATGCTATAGTCAGCAGTGCT
TCATCACCCAAAGCCCCTAAGCCCAGCAGTAGCAGCATGGATTCTCCTCTCGAATCTACT
ACTACTACTACTCTGACACAGAAGCCAGAGTTGAGCGAGACAGCACCGACTACTACTACT
CCTGCTGCTGGTTCCAGTCAAGAGTTTAACCATGAAGCAGAGCTAGCGGAGCTTGAATCT
GAATTTGGTAAGGTGGCTCGTGATTACTCTGCAGATGAGGTTGATGGATGGGAATTCGAT
GAACTAGAGAAAGAACTGCAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGAAGCTCAGC

QA 1 411 1 411
DS 



AS 1 2

CO CL5423Contig1 1088 2 4 U
GAAGGATTTTCCCAATACACAGAACACCAGAAGAGAGCCTGGTCAGTTGATTTTTCTCCA
TCTGACCCGACAAAATTTGTCAGTGGAAGTGATGACTGTTCGGTAAAGCTTTGGAGCGTC
AATGAGAAACGGTCATTAGGTACGATCTGGAGTCCAGCAAATGTGTGTTGCGTGCAATTC
TCTGCATATTCCAATCATTTACTGGCATTTGGGTCAGCGGATTACAAGGTCTATTGCTAT
GATCTTCGGTATGTCAAAACTCCTTGGTGCACATTGGCAGGCCATGAGAAAGCTGTTAGC
TATGTTAAGTTCGTGGATTCAGAGACCATTGTCACTGCTTCCACTGATAACTCTCTCAAG
CTTTGGAATCTCAACAAGACAACTTCCTCTGGGTTGTCTCCTGGTGCTTGTTCAATGACG
TATAAAGGACACACAAATCAAAAGAACTTTGTCGGCTTATCGGTCTTGGATGGATACATA
GCCTGTGGTTCAGAGACCAATGAGGTATATAGTTACTATAGATCGTTACCAATGCCAATG
ACTTCATACAAGTTTGGATCAGTGGATCCCATTTCTGGAAACGAATACTTTGATGACAAT
GGCCAGTTTGTGTCGAGCGTCTGTTGGAGAAAAAAGTCGAATATGCTTGTAGCTGCGAAT
TCTACGGGAAACATGAAGCTACTAAAACTGGTTTGACATTGTGGCACTGGACTCCTCTTT
GAGTAAGTTCTTTGGAAAGAAAACGTCTTGACTTTGAAGCGACTGTTTTTGTCCTGGAAA
CTGTGATCCTATATATGACCATATGAGAGTTCATGAAAGACAACCAAATCTCAGAGAAGT
TGAAGCTCAAAAAAAGCTGTTTATGCCTGTGATAGTATTTGATTCTTCTTCATGTTAACT
CTATATATGATTAGTTTGAGATCAAAGTTCGCTGATTCTTCGGAAGTTGGTTCAGATTTG
GTCTTAGCACAAGTTGTGCATCAATGTGTAATGAGTAGAGGTATATAATCTGTACAAGTG
TTTTTCTTTAATTATGTAATTGTTGTTGGATATTTACTGTTGTGGGATAAATAGAGAGAA
AAGAGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G636TF U 1
AF RS1GD14TF U 310
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TCTGCATATTCCAATCATTTACTGGCATTTGGGTCAGCGGATTACAAGGTCTATTGCTAT
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TATGTTAAGTTCGTGGATTCAGAGACCATTGTCACTGCTTCCACTGATAACTCTCTCAAG
CTTTGGAATCTCAACAAGACAACTTCCTCTGGGTTGTCTCCTGGTGCTTGTTCAATGACG
TATAAAGGACACACAAATCAAAAGAACTTTGTCGGCTTATCGGTCTTGGATGGATACATA
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TCTACGGGAA

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DS 

RD RS1GD14TF 779 0 0
G
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ACACAAATCAAAAGAACTTTGTCGGCTTATCGGTCTTGGATGGATACATAGCCTGTGGTT
CAGAGACCAATGAGGTATATAGTTACTATAGATCGTTACCAATGCCAATGACTTCATACA
AGTTTGGATCAGTGGATCCCATTTCTGGAAACGAATACTTTGATGACAATGGCCAGTTTG
TGTCGAGCGTCTGTTGGAGAAAAAAGTCGAATATGCTTGTAGCTGCGAATTCTACGGGAA
ACATGAAGCTACTAAAACTGGTTTGACATTGTGGCACTGGACTCCTCTTTGAGTAAGTTC
TTTGGAAAGAAAACGTCTTGACTTTGAAGCGACTGTTTTTGTCCTGGAAACTGTGATCCT
ATATATGACCATATGAGAGTTCATGAAAGACAACCAAATCTCAGAGAAGTTGAAGCTCAA
AAAAAGCTGTTTATGCCTGTGATAGTATTTGATTCTTCTTCATGTTAACTCTATATATGA
TTAGTTTGAGATCAAAGTTCGCTGATTCTTCGGAAGTTGGTTCAGATTTGGTCTTAGCAC
AAGTTGTGCATCAATGTGTAATGAGTAGAGGTATATAATCTGTACAAGTGTTTTTCTTTA
ATTATGTAATTGTTGTTGGATATTTACTGTTGTGGGATAAATAGAGAGAAAAGAGTTC

QA 2 779 2 779
DS 



AS 1 2

CO CL5424Contig1 1171 2 10 U
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CATGGACCAGCCTCCCGAAAATTATTCAGTTGTCGCCGACACGAGATTCGTCGACGTAGT
ATCTACATATATACTAATTCTTAAGTACTCCAACCCCAACAAAAGCTCTAGAAATAACCC
TAATAGAGAACCAGATAATGATGTAGACTTATCTATTAAACAGGCTCGGTCCATTAAGAC
TAACCTGACTGCGTCCGGGCAAAGGAAAAATGCTCAGGGCTCATCCCATTATGGTCGAGT
CAAGATTTCCAGGACATTAATACTTGAAAGCTCAGCAGGCGTTGTGAATAGGAAGCAACG
ATATGGCATAAATGGCGTATCATTCGTTCCTGCTGGTACACCACTGAAGCTAGCAGATTA
CTTTAAGATCAAAGGTGTTTACAAAGTAGGAAGCATCCCTGATAAGCCTGGAAGAGAAGG
GATGAGACCAAACAGCAGTGATGGGAGTGAGCCACAAAGATTTTATTGAGATTGTCTTTC
AAAACCGCGAGAAGATCGTCCAGACTTACCACCTTGATGGATACAACTTCTGGGTTGTCG
GGATTGGTAATAGATGGTCTAAATGGTCACAGGCGAGCAGACGAGATTATAACCTCAAGG
ATGCTATTTCTCGCTCCACTACTCAGGTCTTTCCAAAATCTTGGACAGCTGTATATGTGG
CATTAGATAATGTCGGGATGTGGAACTTCAGAACTGAGTTTTGGGCAAGACAATACCTAG
GTCAACAATTCTACATCCGAGTTTACACTCCAGCTAACTCTATCAGAGATGAATATCCTT
TGCCTAAAAATGCTTTGTTGTGTGGTCGAGCCTCCAACAGACACAGGCGCGACTTAACTC
CCTAGCTCCTATTGACATGATGCCATTCATATCATCTTGAAGGAATTAACCAATATATTC
TAATCAGTAATATAATATATCCACACTTTAGTTTACAAAACAAAAAATATCCACACCAAA
AAGATAAAAGTTTACCTTTATTTTACACCCATAATCTTCAAAGTACATAGCTTCTGTCTA
TGTACTTCAAAATACAATTCACATTATGTTTGTAATCATTCTTATTGTATAACTAGATGA
TAATATGCTCCCTGTGTGGAGTGAGTTTTTC


BQ
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AF RS1DA14TF U 1
AF RS1DA14JQ C 396
BS 1 659 RS1DA14TF
BS 660 660 RS1DA14JQ
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BS 762 1171 RS1DA14JQ

RD RS1DA14TF 776 0 0
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ATCTACATATATACTAATTCTTAAGTACTCCAACCCCAACAAAAGCTCTAGAAATAACCC
TAATAGAGAACCAGATAATGATGTAGACTTATCTATTAAACAGGCTCGGTCCATTAAGAC
TAACCTGACTGCGTCCGGGCAAAGGAAAAATGCTCAGGGCTCATCCCATTATGGTCGAGT
CAAGATTTCCAGGACATTAATACTTGAAAGCTCAGCAGGCGTTGTGAATAGGAAGCAACG
ATATGGCATAAATGGCGTATCATTCGTTCCTGCTGGTACACCACTGAAGCTAGCAGATTA
CTTTAAGATCAAAGGTGTTTACAAAGTAGGAAGCATCCCTGATAAGCCTGGAAGAGAAGG
GATGAGACCAAACAGCAGTGATGGGAGTGAGCCACAAAGATTTTATTGAGATTGTCTTTC
AAAACCGCGAGAAGATCGTCCAGACTTACCACCTTGATGGATACAACTTCTGGGTTGTCG
GGATTGGTAATAGATGGTCTAAATGGTCACAGGCGAGCAGACGAGATTATAACCTCAAG*
ATGCTATTTCTCGCTCCACTACTCAG*TCTTTCCAAA*TCTTGGACAGCTGTATATGTGG
CATTAGATA*TGTCGGGATGTGGAACTTCAGAACTGAGTTT
GGGCAGACATACCTA

QA 1 761 1 761
DS 

RD RS1DA14JQ 776 0 0
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TCCCTGATAAGCCTGGAAGAGAAGGGATGAGACCAAACAGCAGTGATGGGAGTGAGCCAC
AAAGATTTTATTGAGATTGTCTTTCAAAACCGCGAGAAGATCGTCCAGACTTACCACCTT
GATGGATACAACTTCTGGGTTGTCGGGATTGGTAATAGATGGTCTAAATGGTCACAGGCG
AGCAGACGAGATTATAACCTCAAGGATGCTATTTCTCGCTCCACTACTCAGGTCTTTCCA
AAATCTTGGACAGCTGTATATGTGGCATTAGATAATGTCGGGATGTGGAACTTCAGAACT
GAGTTTTGGGCAAGACAATACCTAGGTCAACAATTCTACATCCGAGTTTACACTCCAGCT
AACTCTATCAGAGATGAATATCCTTTGCCTAAAAATGCTTTGTTGTGTGGTCGAGCCTCC
AACAGACACAGGCGCGACTTAACTCCCTAGCTCCTATTGACATGATGCCATTCATATCAT
CTTGAAGGAATTAACCAATATATTCTAATCAGTAATATAATATATCCACACTTTAGTTTA
CAAAACAAAAAATATCCACACCAAAAAGATAAAAGTTTACCTTTATTTTACACCCATAAT
CTTCAAAGTACATAGCTTCTGTCTATGTACTTCAAAATACAATTCACATTATGTTTGTAA
TCATTCTTATTGTATAACTAGATGATAATATGCTCCCTGTGTGGAGTGAGTTTTTC

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

CO CL5425Contig1 942 2 4 U
GAGACACGAAAGCAACTTATTCTCTATCCTTTTCAAAAATGCGTCTAACCAATCTTCTCT
CATCGGTCTTCTTGCTTCTCCCCGTGAGCGCAACTGTTGTCTCGGCGCAGATTTGCTTGG
AAAACTTTGGAACTTTTAGACCAGGTGGTACTTTTGACAGGAACCGTCAACTTATCCTCT
CGTCTCTTGCATCTGAGGTCACAGCTCATGATGGTTTCTTCAACGGTTCCACTGGGAAAG
ATCCTGACCAAGTCTATGCCATGGGGATGTGCATCCCAGGCGCTAAACAGGAGCTTTGTT
CAGAGTGTATCAAGGCCTCGTCTGACCAGTTAAGACTGAGTTGTCCCAACCAAACAGCAT
CATTTTATTGGTCAGGTGGAGGTAAAACTCTATGTATGGCACGCTACTCTAACAGGCCAT
CTTTTAGTCAGTTTTATACTGATCCACCTTCTATTGGTTACAATACTGGAGATCTCAGGA
CAAATTTAACTGCTTTTGATAGGTTATTGGCACGATTATTAGTTCGTATGGTGTCTGAAA
CTTCGTCATCATCAGGAAAGGATTTATCAGTTTCTAACAGTAGATTCTACGTAGCTGATG
TAGCAGCCTTGACAAATTATCAAATGATATATGCCTTGATGCAATGTACCCCAGACGTCT
CTCCCTCCAGCTGTAACACATGTTTACGGCAGAGTATTGATAATTATGTGGATTGCTGTC
GTGGGAAACAAGGCGGCTATGTGTATTGGCCTAATTGCATTTTGCGGTGGGATCTGTACC
CCTTCGACGGCGCCTTTGATCTTCTTTCGATAGCACCTTCTTACGAACCTGAGCTGCAAC
CCCCACCTCCCCTCCTGGCCAACAAAGATGGTAAAACGATTGGTAAAGGAGCTATCATAG
GGATTGTCACTGCAACGGTCGTAAGCGTAGCTATTTTCGCTC


BQ
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AF RS1AN78TF U 1
AF RS1AN78JQ C 451
BS 1 732 RS1AN78TF
BS 733 733 RS1AN78JQ
BS 734 758 RS1AN78TF
BS 759 942 RS1AN78JQ

RD RS1AN78TF 758 0 0
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CATCGGTCTTCTTGCTTCTCCCCGTGAGCGCAACTGTTGTCTCGGCGCAGATTTGCTTGG
AAAACTTTGGAACTTTTAGACCAGGTGGTACTTTTGACAGGAACCGTCAACTTATCCTCT
CGTCTCTTGCATCTGAGGTCACAGCTCATGATGGTTTCTTCAACGGTTCCACTGGGAAAG
ATCCTGACCAAGTCTATGCCATGGGGATGTGCATCCCAGGCGCTAAACAGGAGCTTTGTT
CAGAGTGTATCAAGGCCTCGTCTGACCAGTTAAGACTGAGTTGTCCCAACCAAACAGCAT
CATTTTATTGGTCAGGTGGAGGTAAAACTCTATGTATGGCACGCTACTCTAACAGGCCAT
CTTTTAGTCAGTTTTATACTGATCCACCTTCTATTGGTTACAATACTGGAGATCTCAGGA
CAAATTTAACTGCTTTTGATAGGTTATTGGCACGATTATTAGTTCGTATGGTGTCTGAAA
CTTCGTCATCATCAGGAAAGGATTTATCAGTTTCTAACAGTAGATTCTACGTAGCTGATG
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CTCCCTCCAGCTGTAACACATGTTTACGGCAGAGTATTGATAATTATGTGGATTGCTGTC
GTGGGAAACAAG*CGGCTATGTGTATTGGCCTAATTGC

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1AN78JQ 492 0 0
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ATGCCTTGATGCAATGTACCCCAGACGTCTCTCCCTCCAGCTGTAACACATGTTTACGGC
AGAGTATTGATAATTATGTGGATTGCTGTCGTGGGAAACAAGGCGGCTATGTGTATTGGC
CTAATTGCATTTTGCGGTGGGATCTGTACCCCTTCGACGGCGCCTTTGATCTTCTTTCGA
TAGCACCTTCTTACGAACCTGAGCTGCAACCCCCACCTCCCCTCCTGGCCAACAAAGATG
GTAAAACGATTGGTAAAGGAGCTATCATAGGGATTGTCACTGCAACGGTCGTAAGCGTAG
CTATTTTCGCTC

QA 1 492 1 492
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CACTGTGGTTCTCATGTCCTCATCACTGATACTCAATTGCAGAAGATGCCGAAGAGGAAG
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TGTATTGGTTGTGAGCTTTTTGTTTGTTATCGCGCTGAAGAGTCTCTGGAAACAGCCTCC
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GTGGAAGACCGTGCGCAACGTTCAGCAATCACGAGAGTAAACGCTGATGTTGTTCGTGTT
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AAACTCCTCGTGGTCGAGGATTTATCTGCCAGACAGGTGTATGAGAAGCTTCTTGAGGCC
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CTTGGGAAGATATAGACAAAATTGCTTTCTTATATCTCTGTTTTCATGCTTCCAAACCAC
TACTCTTTTTATACGATCCCCCATTATTAT


BQ
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AF RS1GH60TF U 1
AF RS1GH60JQ C 339
BS 1 634 RS1GH60TF
BS 635 930 RS1GH60JQ

RD RS1GH60TF 634 0 0
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TCGAGCGAGGACGCGGCGCCGGAAGGACCCGACTCCGATCTCTTCGTGTACTACTGCAAG
CACTGTGGTTCTCATGTCCTCATCACTGATACTCAATTGCAGAAGATGCCGAAGAGGAAG
ACCGACAGATCCAGTGTGCTGGACAAGAAGAAGCACCTTGCTAGGTTAAATGTCAGCGAG
GGAGGGAAAGTTTTACTAAAACGCGGCGAAGGGAAACTGGAGAGGCAGTTTAGAATGAAC
TGTATTGGTTGTGAGCTTTTTGTTTGTTATCGCGCTGAAGAGTCTCTGGAAACAGCCTCC
TTCGTTTACATTGTTGATGGTGCACTTAGCGCTGTTGCTGCAGAAACTAACCCACAGGAT
GCACCGGTACCTCCCTGCATTTCACAGCTCGACGGTGGACTTGTTCAGGTTGCTATAGAA
GTGGAAGACCGTGCGCAACGTTCAGCAATCACGAGAGTAAACGCTGATGTTGTTCGTGTT
ACTATTGCCGCACCAGCAGCTCGTGGGGAAGCTAACAACGAGCTTCTGGAATTCATGGGA
AGGGTACTTGGTTTAAGGTTGAGCCAGATGACTC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1GH60JQ 592 0 0
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TGCAGAAACTAACCCACAGGATGCACCGGTACCTCCCTGCATTTCACAGCTCGACGGTGG
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AAACGCTGATGTTGTTCGTGTTACTATTGCCGCACCAGCAGCTCGTGGGGAAGCTAACAA
CGAGCTTCTGGAATTCATGGGAAGGGTACTTGGTTTAAGGTTGAGCCAGATGACTCTCCA
AAGAGGCTGGAATAGCAAATCGAAACTCCTCGTGGTCGAGGATTTATCTGCCAGACAGGT
GTATGAGAAGCTTCTTGAGGCCGTTGTACCATAAATTCTGAGGTCCGTGCATGTTGGTGA
AAGACATTAACCGAGAACTCTGCAATCAGTCAATCACCCTGTAATTGGTTTATTTCAGAG
ACGAAAGAGTTTTAATATTTTGCTTGGGAAGATATAGACAAAATTGCTTTCTTATATCTC
TGTTTTCATGCTTCCAAACCACTACTCTTTTTATACGATCCCCCATTATTAT

QA 1 592 1 592
DS 



AS 1 2

CO CL5428Contig1 301 2 1 U
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CTCTTATCTCGCCGTCGCAGGCTTCGCCGCCGGCAAGCCCTACCCCTTTTCATCTTCCCT
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AAAAATCGAATCTTTTGTTGTTGTGTTATTACTTTCCGCTTCATTTCTCCTTCGTTCAAT
CCGATTTAGTTTTTACAGTCTAAAATAACGAAGAGGGGAGGGAAGAGTAATTGAAAACCC
C


BQ
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20 

AF RS1C426JQ C 1
AF RS1C426TF U 1
BS 1 301 RS1C426TF

RD RS1C426JQ 301 0 0
GGTCTCTTCAATCTTCACCAATTCGTCTCGCCTACAATCTCTCTACCCAGTTTTTTTTCT
CTCTTATCTCGCCGTCGCAGGCTTCGCCGCCGGCAAGCCCTACCCCTTTTCATCTTCCCT
CTCCTCTAATATCCCCAAAAAGAGAAAAAAAAACAGAAAAAAGTAAAACGATCAGAAAAA
AAAAATCGAATCTTTTGTTGTTGTGTTATTACTTTCCGCTTCATTTCTCCTTCGTTCAAT
CCGATTTAGTTTTTACAGTCTAAAATAACGAAGAGGGGAGGGAAGAGTAATTGAAAACCC
C

QA 1 301 1 301
DS 

RD RS1C426TF 301 0 0
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CTCTTATCTCGCCGTCGCAGGCTTCGCCGCCGGCAAGCCCTACCCCTTTTCATCTTCCCT
CTCCTCTAATATCCCCAAAAAGAGAAAAAAAAACAGAAAAAAGTAAAACGATCAGAAAAA
AAAAATCGAATCTTTTGTTGTTGTGTTATTACTTTCCGCTTCATTTCTCCTTCGTTCAAT
CCGATTTAGTTTTTACAGTCTAAAATAACGAAGAGGGGAGGGAAGAGTAATTGAAAACCC
C

QA 1 301 1 301
DS 



AS 1 2

CO CL5429Contig1 521 2 3 U
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AGGTCGCCGGAAAGAGAAAAGGTCGCCGGAAAGAGAGCGCCTGAAAGAGACTGAAAAAGA
GAGAGAGAAGGCGCCAGAAACTGAAAGAAAAAAAGAGGTTTCTCTTAATGAAAAAAATGA
AAAGACCCACCACAGATTCAAGAAAACGAAAGAGGTTTCTCAATTTGGATTCATGTTTTG
AGATTCATCGACACAGAGAGGAGAGACGAGAGAGACGGCCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B206TF C 1
AF RS1B206JQ U 112
BS 1 111 RS1B206TF
BS 112 509 RS1B206JQ
BS 510 521 RS1B206TF

RD RS1B206TF 521 0 0
AACAAATCTCAAATGAACTAGATAGTGCACAATCTCAATAAAAATAGTTTTGCATCAAGC
TTGTGTTTGAAATAAAAACATCAAAAACAACAAAACAGTTTTGCATCTCTGTTTCTCCCT
CCCCCATTGCATTTTCCATATTCAAAGCATCTTCTTCATTCATGTCCATGTATTCCCTTT
GAGCATCAAGGATTGCTATTGTATTAAGAGACTCCAAATCCATCCTGAGACCAAGCTTCT
GCAATGAACTCAAGCTGCTGTACGGTTGCTACTTAGATCCGGAATCTGAGCGAGAGAGAG
AGGTCGCCGGAGAGAGAAGAGGTCGCCGGAGAGAGAGCGCCTGAGAGAGACTGAGAAAGA
GAGAGAGAAGGCGCCAGAGACTGAAAGAGAAAAAGAGGTTTCTCTTAATGAAGAAAATGA
AGAGACCCACCACAGATTCAAGAAAACGAAAGAGGTTTCTCAATTTGGATTCATGTTTTG
AGATTCATCGACACAGAGAGGAGAGACGAGAGAGACGGCCC

QA 1 521 1 521
DS 

RD RS1B206JQ 400 0 0
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ATTCCCTTTGAGCATCAAGGATTGCTATTGTATTAAGAGACTCCAAATCCATCCTGAGAC
CAAGCTTCTGCAATGAACTCAAGCTGCTGTACGGTTGCTACTTAAATCCGGAATCTGAGC
GAGAGAAAGAGGTCGCCGGAAAGAGAAAAGGTCGCCGGAAAGAGAGCGCCTGAAAGAGAC
TGAAAAAGAGAGAGAGAAGGCGCCAGAAACTGAAAGAAAAAAAGAGGTTTCTCTTAATGA
AAAAAATGAAAAGACCCACCACAGATTCAAGAAAACGAAAGAGGTTTCTCAATTTGGATT
CATGTTTTGAGATTCATCGACACAGAGAGGAGAGACGA
AA

QA 1 398 1 398
DS 



AS 1 2

CO CL5430Contig1 588 2 1 U
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TCACACCGCTTCACCAGCATGAGACGGATGACCTAACCGGTAAAGTTCAGTCTACGTGTT
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TCAAGAGGGCTGTGGAGAATGGTGCGGTGGCAGTGAGCGAGCCGGAGGACAAGGAGTGGG
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TTAAGTGAACACCATACAAACACTAGATCACAGAACATGATCATTAACAATATAAATATA
TATGCATGCAAATAATACAAGATACTATGGTTTTCTTCTTCCTTTTGTTGTTGATGGGTA
CTCTTATCCAAAAATAACAGTTGAAAATAAAAGGTTTTGGCAATGTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1D850TF U 1
AF RS1D850JQ C 235
BS 1 588 RS1D850TF

RD RS1D850TF 588 0 0
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ACGTTAGGGACGTAGCGAAATCCGTAGAATTCTACTCGAGAGCCTTTGGTTACAACGTTC
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TCACACCGCTTCACCAGCATGAGACGGATGACCTAACCGGTAAAGTTCAGTCTACGTGTT
CAGAACGTGAGAGAGCACCCCTTGAAGTCTGTTTCTGTTACCTTGATGTTGACGCGGCCT
TCAAGAGGGCTGTGGAGAATGGTGCGGTGGCAGTGAGCGAGCCGGAGGACAAGGAGTGGG
GCCAGAAGGTTGGATACGTTCGAGACATTGACGGAATTGTTGTACGCATCGGAAGCCACG
TTAAGTGAACACCATACAAACACTAGATCACAGAACATGATCATTAACAATATAAATATA
TATGCATGCAAATAATACAAGATACTATGGTTTTCTTCTTCCTTTTGTTGTTGATGGGTA
CTCTTATCCAAAAATAACAGTTGAAAATAAAAGGTTTTGGCAATGTAC

QA 1 588 1 588
DS 

RD RS1D850JQ 354 0 0
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CGGCCTTCAAGAGGGCTGTGGAGAATGGTGCGGTGGCAGTGAGCGAGCCGGAGGACAAGG
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GCCACGTTAAGTGAACACCATACAAACACTAGATCACAGAACATGATCATTAACAATATA
AATATATATGCATGCAAATAATACAAGATACTATGGTTTTCTTCTTCCTTTTGTTGTTGA
TGGGTACTCTTATCCAAAAATAACAGTTGAAAATAAAAGGTTTTGGCAATGTAC

QA 1 354 1 354
DS 



AS 1 2

CO CL5431Contig1 285 2 1 U
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TCGTGGCTGTAGCTATGTTCTCCTTCTTTCTATACAAGCTATGGC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1GP82JQ C 1
AF RS1GP82TF U 1
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CTCTGCACTTCGTCTTAGGTCTATCAGGCGATTCCAAGAGTACAAACACAGGAGTCAAGG
CAGAGTCACACGCTTCTTCCAGCAGAACAGGCACAAAAGTATTCCTAATACTGGTCGGAT
TCGTGGCTGTAGCTATGTTCTCCTTCTTTCTATACAAGCTATGGC

QA 1 285 1 285
DS 

RD RS1GP82TF 285 0 0
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TCGTGGCTGTAGCTATGTTCTCCTTCTTTCTATACAAGCTATGGC

QA 1 285 1 285
DS 



AS 1 2

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ATAGGCGGCGGTGGCGGATCCACGCCACACGGCATCATACTCGCCGTCGTTGTGGCATTG
GTAGTGTTCGTTCCCTTCTTCCTCGGAGACGGCGGCGAAGCCATCACAGAAGGGATCGCA
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TTCCTCTCGTCCGAGCGCGGTTCCTTCGTGTCTGCCATTTTCTCCACCGGAGAGCCAGAG
TCGATTCACAGGGTTAGCGGATCTCCTGTCGGCGTCGCGCTGTTCCTAGTCCTGATCTTG
TTCTTGCTCTACAACCGCTTCTCTATCTTTGGGGGAGGTGATGATTCCGACGACTGAAGC
GACGTCGTATCTTCAGATCTGTAGTTTTTTTTTTAATTTTATTTCGAAAACAATTAATGG
ATTATTAATATATTTATTCGATTTTGTGTCTTTTATTTATTTTTTATTTTCTTTTGATTT
ATTTAACGGTTGAAGTCAACTATACAGCGGTTTGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CL27TF U 11
AF RS1CL27JQ C 1
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BS 243 261 RS1CL27TF
BS 262 262 RS1CL27JQ
BS 263 303 RS1CL27TF
BS 304 304 RS1CL27JQ
BS 305 334 RS1CL27TF
BS 335 577 RS1CL27JQ

RD RS1CL27TF 324 0 0
ACTCTCTCTCACACTCATCAGACAAAATG*ATCAAGATCG*CAAGGCGTTATAGGCGGCG
GTGGCGGATCCACGCCACACGGCATCATACTCGCCGTCGTTGTGGCATTGGTAGTGTTCG
TTCCCTTCTTCCTCGGAGACGGCGGCGAAGCCATCACAGAAGGGATCGCAGAGCTTCTAA
GTCCGGTGGGACTTCTCTTGCTTCCCATCGTGCTTCTCCTCACCATTCAGT*CCTCTCGT
CCGAGCGCGGT*CCTTCGTGTCTGCCATTTTCTCCACCGGAGAGCCAGAGTCG*TTCACA
GGGTTAGCGGATCTCCTGTCGGCG

QA 1 324 1 324
DS 

RD RS1CL27JQ 577 0 0
GGAAAGACACACTCTCTCTCACACTCATCAGACAAAATGTATCAAGATCGTCAAGGCGTT
ATAGGCGGCGGTGGCGGATCCACGCCACACGGCATCATACTCGCCGTCGTTGTGGCATTG
GTAGTGTTCGTTCCCTTCTTCCTCGGAGACGGCGGCGAAGCCATCACAGAAGGGATCGCA
GAGCTTCTAAGTCCGGTGGGACTTCTCTTGCTTCCCATCGTGCTTCTCCTCACCATTCAG
TTCCTCTCGTCCGAGCGCGGTTCCTTCGTGTCTGCCATTTTCTCCACCGGAGAGCCAGAG
TCGATTCACAGGGTTAGCGGATCTCCTGTCGGCGTCGCGCTGTTCCTAGTCCTGATCTTG
TTCTTGCTCTACAACCGCTTCTCTATCTTTGGGGGAGGTGATGATTCCGACGACTGAAGC
GACGTCGTATCTTCAGATCTGTAGTTTTTTTTTTAATTTTATTTCGAAAACAATTAATGG
ATTATTAATATATTTATTCGATTTTGTGTCTTTTATTTATTTTTTATTTTCTTTTGATTT
ATTTAACGGTTGAAGTCAACTATACAGCGGTTTGATT

QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 2

CO CL5433Contig1 597 2 3 U
GGGTAGTCTGTCTCTGTTCTCTATCGCCGCGACACGTCAAGCATCCCTCTCCGCTGTCTC
ATCGCGTCTGTCTCTTCTTTTCTTCATCGTGGTGGCCGTAAAAACTCGGTGGTAAGAGAG
GAGAAGATGAGTAACGCAGATATGAATAATCAATCAATGGAAGAAGAAGAAGACGAGGGA
GACGTTTTCCTCGGTGAATCCGATGTCCTCCATGAAATCGACGTCGACGGAGAAGATCTT
CCTGACGCATATGATGAGGATGGTAATGACAACGACAATGATGATGAAGTGTTTGATGAA
AACGATGACTCCATCCACACATTCACTGGTCACAAAGGTGAGCTTTATGCATTGGCATGT
AGCCCTTTAGACCCCACCCTAGTAGCAACCGGAGGTGGAGATGACAAAGCCTTTCTCTGG
AAAATCGGCAACGGAGACTGGGCTGCCGAGCTTCTAGGTCACAAAGACTCTGTTTCTTCT
CTAGCTTTTAGCTACGATGGACAGTTAGTTGCCTCTGGTGGGCTGGATGGTGTCGTTCAG
ATCTTTGACGCATCGTCTGGGACTTTGAAATGTGTTTTGGACGGACCTGGTGGTGGC


BQ
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AF RS1E577TF U 127
AF RS1H311TF U 1
BS 1 333 RS1H311TF
BS 334 334 RS1E577TF
BS 335 597 RS1H311TF

RD RS1E577TF 328 0 0
GG
GAGTAACGCAGATATGAATAATCAATCAATGGAAGAAGAAGAAGACGAGGGAGACGTTTT
CCTCGGTGAATCCGATGTCCTCCATGAAATCGACGTCGACGGAGAAGATCTTCCTGACGC
ATATGATGAGGATGGTAATGACAACGACAATGAT*ATGAAGTGTTTGATGAAAACGATGA
CTCCATTCACACATTCACTGGTCACAAAGGTGAGCTTTATGCATTGGCATGTAGCCCTTT
AGACCCCACCCTAGTAGCAACCGGAGGTGGAG*TGACAAAGCCTTTCTCTGGAAAATCGG
*AACGGAGACTGGGCTGC
GAGCTTCT

QA 3 320 3 320
DS 

RD RS1H311TF 597 0 0
GGGTAGTCTGTCTCTGTTCTCTATCGCCGCGACACGTCAAGCATCCCTCTCCGCTGTCTC
ATCGCGTCTGTCTCTTCTTTTCTTCATCGTGGTGGCCGTAAAAACTCGGTGGTAAGAGAG
GAGAAGATGAGTAACGCAGATATGAATAATCAATCAATGGAAGAAGAAGAAGACGAGGGA
GACGTTTTCCTCGGTGAATCCGATGTCCTCCATGAAATCGACGTCGACGGAGAAGATCTT
CCTGACGCATATGATGAGGATGGTAATGACAACGACAATGATGATGAAGTGTTTGATGAA
AACGATGACTCCATCCACACATTCACTGGTCACGAAGGTGAGCTTTATGCATTGGCATGT
AGCCCTTTAGACCCCACCCTAGTAGCAACCGGAGGTGGAGATGACAAAGCCTTTCTCTGG
AAAATCGGCAACGGAGACTGGGCTGCCGAGCTTCTAGGTCACAAAGACTCTGTTTCTTCT
CTAGCTTTTAGCTACGATGGACAGTTAGTTGCCTCTGGTGGGCTGGATGGTGTCGTTCAG
ATCTTTGACGCATCGTCTGGGACTTTGAAATGTGTTTTGGACGGACCTGGTGGTGGC

QA 1 597 1 597
DS 



AS 1 2

CO CL5434Contig1 1174 2 2 U
GGACTCACTCAAAACTAAAAAACACACTTGATATTCTCTAGCTAAAAACCCTAAAATATA
AAACATATTCAAGATGAATTTTGTTATTAGATCATTGTGCGTTTTTATTACCTTCCTCAG
TTGTCTAGTCATCTCGGTCCATGGCCAAGCTGCCGCGAGGCCCGGTCCTGGTTCTGGCAC
GAGGATAGGGTTTTACTCAACCACATGTCCTAATGCGGAAACCATTGTCCGAAACGCCGT
GACAGCTGGATTCAGCTCTAACCCTAGAATTGCACCAGGAATACTAAGAATGCATTTCCA
CGACTGCTTCGTCCAAGGCTGTGACGGTTCCATCCTTATAACGGGAACTAACACCGAGAG
AACAGCCGTTCCGAACCTCAACCTCCGTGGATTTGAAGTAATAGACAACGCCAAAACCCA
GCTCGAAGCTGCGTGCCCTGGAGTCGTCTCTTGTGCTGATATTTTAGCTTTAGCCGCTCG
TGACTCCGTTGTCCTCACAAGAGGAATAAGTTGGCCCGTACCAACCGGACGTAGAGATGG
TCGAGTTTCTTTGGCTTCGAACACTAATAATCTCCCTGGTCCTGGTGATTCTGTCGCCGT
TCAACAACAGAAGTTCTCCGCTTTGGGACTCGGTACCCGCGAACTCGTCGTCCTAGTCGG
AGGACACACGATCGGAACAGCGGGATGCGCTACATTCAGGAACAGACTATACAACAGCAC
CACAGGCCCTGCGGATCCAACCATTGACCCGACGTTTTTGGCGCAGCTTCAGACACAATG
TCCCCAAAACGGTGATGCCAGCGTACGCGTTGATCTCGACACCGGAAGTGCAACCACTTT
TGACACATCCTATTTCAACAACCTAAGCCGTGGCCGTGGAGTCCTCCAATCCGACCAGGT
CCTCTGGACCGACCCAGCAACTAGACCCTTTGTGCAACAGTTGATGAGTCCTAGAAGCAC
CTTCAACGGTGATTTTGCCAGGGCAATGGTCAGGATGAGTAATATTGGTGTACTTACTGG
GGCTACTGGAGAAATTCGTAGGGTTTGCTCCGCGGTTAATTAAGTAAATGATTAAAACAG
TGGTTAGCGATGGATAAACTTTTTCATTGCTGGCTAAGTACTTGTTTCAAGTGTGATTTT
AGTTTCAATAATAAATAAACCAATAGAAAACGAC


BQ
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AAACTTTTTCATTGCTGGCTAAGTACTTGTTTCAAGTGTGATTTTAGTTTCAATAATAAA
TAAACCAATAGAAAACGAC

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DS 



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TGCAACGATGAACATGCTTTTGAGTTCTTGGTTTGAGACTCATTTCAGTTTATAACATTT
TTCTCAAATGG


BQ
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AF RS1FJ30TF U 1
AF RS1FJ30JQ C 615
BS 1 705 RS1FJ30TF
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RD RS1FJ30TF 783 0 0
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TATTCATTAACACTATTACCTGAAAATCTCAAGAGAGAATAAAAAAAGTTGGAAGCTTTT
GATTTCATCCATCCATCCATCTTCTGCTTTTTTTTCTTTTTTTTTCTGGTGAACTGTTTG
TTTGTTGTGGTGGGGTTTTCTAAAATTACTTTGAAATTTTCTGATCTAATGGCTGATGTT
GATTCTGTTCACGACCTTGTCACTGACGGAATTGAGAAGAGCCTGGTGACCGATTCTAAA
CCGGAATCGGAATCGGAATCGGACCTCAAACCCAAATCTAAACCGGAATCGGACGTTGGT
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AAGTACGATCAGTCTCTGTCTTCTGAAGATTTTGCGACCGCTAAGAAGCTGTCTGGTGAA
GATCTTAAAGCCGACAACAAAAAGGATGGCAATTTCCGGAGGAGCAGAAACAATTATAAC
CAAGGGAGGAAAGCGAGAGTAACTGGAAGAGCTTCAAAGGCTCAAAGAGAGGATAGTATT
AGAAGAACTGTATATGTCTCTGACATTGATCAAAGTGTGACTGAG*AAGTCTTAGCTGGT
TTGTCAGCAGCTATGGACAAGTTGTTGATTGTCGTATCTGTGGAGATCCACAT
CAGTCTCGCT

QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1FJ30JQ 837 0 0
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GGTTATTACCCAGTTAGGGTCTTACCTTCTAAAACTGCTATTCTTCCTGTGAATCCCACA
TTTCTCCCCAGGTCAGAAGATGAGAGGGAGATGTGTAGCAGAACCATCTACTGCACTAAT
GTTGACAAGAATGCCACTGAAGATGATGTCAAAATCTTCTTTGAGTCTGCCTGCGGTGAG
GTAACTCGCATAAGGCTTCTCGGTGACCAGCTGCATTCTACTCGTATAGCTTTTGTTGAA
TTTGCCATGGCGGAGAGTGCAGTTGGGGCGCTCAACTGCAGTGGAGTAGTCTTAGGATCG
CAGCCGATAAGGGTAAGCCCTTCAAAGACACCAGTGAGACCAAGATTCAGTCGATCACCA
TCCTCAAACTAGGGAGAGAAAAAGAACCAACCCCAAGAGGCTTTGTTGGTGCTGGAGAGT
GATGAAACATTTCGTTGAGTAATTTTTCTTTTCGGTTATCTTTTTAATTGTTCTCTAATC
TCTAGAGCAGAGTTATATCTCCAGTTCTATAGTATCTGGAAACAAATGCAACGATGAACA
TGCTTTTGAGTTCTTGGTTTGAGACTCATTTCAGTTTATAACATTTTTCTCAAATGG

QA 1 837 1 837
DS 



AS 1 2

CO CL5436Contig1 973 2 2 U
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TATGATAGATACATATGAACCCAATGAATGAAATACAATTATTTGAATGCACTGTATGTA
GTTTCGAAGATAAATTACCCCAAACATGACACAGGAGACACAGAGAGAGACTGAATTAGA
ACGTACGTAGGTTATACTGATGAGCTGGCTTATGCTTTTTTGCATTTAATTAATCCAAAA
TCAATGAGGTAGGTAGGTCCAGTATCGTATATAGTATTACCACTTGACCAGTACTATAGA
TTCTTTGATTCATACAGTACATTCTAGTAATCTTTTGACAAACAAAAGAAACATACATAT
TCTCGTAGATATATAACCTTAATAAAAGTAGATTAGTTGATGGGATGATATATTTGATCT
GTCTCTTCTTCGTTACGTTGATGACGTGGCAGAATGCGGCGGAGAAGCCGCCGTTCTTTT
TGCCAAGCTGGAGCGGAGTTTACGTGATAAATGCATTCGTGGTGGTTTGGGTGCTTGTTC
TAGGGTTCGGGTTTGGAGGATGGGCTAGCATGACCAACTTCATCGGGCAAATTGACACTT
TTGGCCTCTTTGCCAAGTGCTATCAATGCAAGTCGCCGATTCCTCCTCCTCCTACTCCGG
TCACCGGTAGTAATCACCACCGCCGTTAGTGAAGTATTGAAGTGTGAGCTTCTTCAGTTT
TCTTTTGTTTTTCCTATGTATAAAAAGAAACATACCTATATCAGCGAATTAACAATGCTA
CATATATAAATTTGAAATTTGGTTTAACATCACACGTGAATAAGGATCGGGCAGCCCGTT
GTGTGTTGTCACGTGCCCTTTTTCAGGTTTATGACGAACTTATTTCCAGACTGGTAAAAG
ACAACTGGATGCTGACAAATCTGGTTATAAATTATTTAATCATTCATTCAGCCCATCTGT
CAAATTTTTGAAT


BQ
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BS 598 973 RS1CI89JQ

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TATGATAGATACATATGAACCCAATGAATGAAATACAATTATTTGAATGCACTGTATGTA
GTTTCGAAGATAAATTACCCCAAACATGACACAGGAGACACAGAGAGAGACTGAATTAGA
ACGTACGTAGGTTATACTGATGAGCTGGCTTATGCTTTTTTGCATTTAATTAATCCAAAA
TCAATGAGGTAGGTAGGTCCAGTATCGTATATAGTATTACCACTTGACCAGTACTATAGA
TTCTTTGATTCATACAGTACATTCTAGTAATCTTTTGACAAACAAAAGAAACATACATAT
TCTCGTAGATATATAACCTTAATAAAAGTAGATTAGTTGATGGGATGATATATTTGATCT
GTCTCTTCTTCGTTACGTTGATGACGTGGCAGAATGCGGCGGAGAAGCCGCCGTTCTTTT
TGCCAAGCTGGAGCGGAGTTTACGTGATAAATGCATTCGTGGTGGTTTGGGTGCTTGTTC
TAGGGTTCGGGTTTGGAGGATGGGCTAGCATGACCAACTTCATCGGGCAAATTGACA

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DS 

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TTTGATTCATACAGTACATTCTAGTAATCTTTTGACAAACAAAAGAAACATACATATTCT
CGTAGATATATAACCTTAATAAAAGTAGATTAGTTGATGGGATGATATATTTGATCTGTC
TCTTCTTCGTTACGTTGATGACGTGGCAGAATGCGGCGGAGAAGCCGCCGTTCTTTTTGC
CAAGCTGGAGCGGAGTTTACGTGATAAATGCATTCGTGGTGGTTTGGGTGCTTGTTCTAG
GGTTCGGGTTTGGAGGATGGGCTAGCATGACCAACTTCATCGGGCAAATTGACACTTTTG
GCCTCTTTGCCAAGTGCTATCAATGCAAGTCGCCGATTCCTCCTCCTCCTACTCCGGTCA
CCGGTAGTAATCACCACCGCCGTTAGTGAAGTATTGAAGTGTGAGCTTCTTCAGTTTTCT
TTTGTTTTTCCTATGTATAAAAAGAAACATACCTATATCAGCGAATTAACAATGCTACAT
ATATAAATTTGAAATTTGGTTTAACATCACACGTGAATAAGGATCGGGCAGCCCGTTGTG
TGTTGTCACGTGCCCTTTTTCAGGTTTATGACGAACTTATTTCCAGACTGGTAAAAGACA
ACTGGATGCTGACAAATCTGGTTATAAATTATTTAATCATTCATTCAGCCCATCTGTCAA
ATTTTTGAAT

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

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TGCCAAAGACCACAGTGACAAATGTTTTCAGGGAGCTTTTAACCGGCCGCAATGCAGAAG
CATATCTCAGAGTTTCACAGAAAAGAGCTCTTGAGAGGAGTAATAATGGTACGAGTGGTG
GTGTGGGTTCTTCTTCGACAAAGTAATTGTTTGGTTTACTTTTCTAGATTGTGATATTTA
CAAATTCATGCAGACGTTTTATTAGCTTCGATTTGGATTTTTGTAAGGGTTTATTTTACA
ATATTTTTTTTCTTCC


BQ
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BS 12 316 RS1B227TF

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TGCCAAAGACCACAGTGACAAATGTTTTCAGGGAGCTTTTAACCGGCCGCAATGCAGAAG
CATATCTCAGAGTTTCACAGAAAAGAGCTCTTGAGAGGAGTAATAATGGTACGAGTGGTG
GTGTGGGTTCTTCTTCGACAAAGTAATTGTTTGGTTTACTTTTCTAGATTGTGATATTTA
CAAATTCATGCAGACGTTTTATTAGCTTCGATTTGGATTTTTGTAAGGGTTTATTTTACA
ATATTTTTTTTCTTCC

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DS 

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ACAGTGACAAATGTTTTCAGGGAGCTTTTAACCGGCCGCAATGCAGAAGCATATCTCAGA
GTTTCACAGAAAAGAGCTCTTGAGAGGAGTAATAATGGTACGAGTGGTGGTGTGGGTTCT
TCTTCGACAAAGTAATTGTTTGGTTTACTTTTCTAGATTGTGATATTTACAAATTCATGC
AGACGTTTTATTAGCTTCGATTTGGATTTTTGTAAGGGTTTATTTTACAATATTTTTTTT
CTTCC

QA 1 305 1 305
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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ACCGACCGACTTTGTCCTCTTGTCTGGCCCATTACAGAACCCCCACACTACTCTGCGTTG
ATACCACTGCTTACGGCCGGGGGAGGAGGAGAAGACGGAGGGACATCTACGTTGAAGTCG
GAGCTGAGATTCTCCGGCGGAAGTAGTAGTAACTATCAAGAACATAACACTCTACCTAGA
ATATCGGAGGTACAAGCGGCTGGGGCGGCTATAAACGGTGTCGCATCGACGAGTATGAGT
TTTGGAAATGATAATAACAATTGGAACAGGCCGTCTTCTCATATCAGTTTCACCATTGAT
GAACCTGGAAAACGGTCCAAGACCACCGACTTTTTCACCTTAGAAACTCAGTTTAGCATG
CCACAAACGTCTCTGGAAATGGCGAGAATGGAGAGTTTGATGAACATCCCAGAGGGTTCG
GTGCCCTGTAGAGTAAGGGCCAAACGTGGATGTGCGACTCACCCGCGTAGTATAGCTGAA
AGGAAGAACGAGAATAAGCGGGAAGCTGAAGAAGCTACAAGAACTGGTGCCTAATATAGA
CAATCAAACAAGCTATGCAGAAATGTTGGATTTGGCTGCTGAGCATATCAAAGGTTTTCA
ACACGAAGTAGAGTCACTAGAAAAGGGGATGGAGAGATGCACTTGTGGGGCGTGCAAGAA
GCGATGATGAAAAATGATATGTTTTTAAAGATGATCCAAGAAAGTATAGAAGAAAAAGAG
ACGAAGGAAATAATTCAAAGAGAAAGAACATAATTTTTTTTTTTTGATTATATAACTTAA
GCATACTCATTATATATTCATAACCGGTTGCAACTTG


BQ
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AF RS1FO17TF U 1
AF RS1FO17JQ C 336
BS 1 649 RS1FO17TF
BS 650 877 RS1FO17JQ

RD RS1FO17TF 649 0 0
CCGTCTCTGTATTTTGCTTTAATCCCTCTTTTCTTTTTCCAGTAGAGAAACCCTAATTAC
ACCGACCGACTTTGTCCTCTTGTCTGGCCCATTACAGAACCCCCACACTACTCTGCGTTG
ATACCACTGCTTACGGCCGGGGGAGGAGGAGAAGACGGAGGGACATCTACGTTGAAGTCG
GAGCTGAGATTCTCCGGCGGAAGTAGTAGTAACTATCAAGAACATAACACTCTACCTAGA
ATATCGGAGGTACAAGCGGCTGGGGCGGCTATAAACGGTGTCGCATCGACGAGTATGAGT
TTTGGAAATGATAATAACAATTGGAACAGGCCGTCTTCTCATATCAGTTTCACCATTGAT
GAACCTGGAAAACGGTCCAAGACCACCGACTTTTTCACCTTAGAAACTCAGTTTAGCATG
CCACAAACGTCTCTGGAAATGGCGAGAATGGAGAGTTTGATGAACATCCCAGAGGGTTCG
GTGCCCTGTAGAGTAAGGGCCAAACGTGGATGTGCGACTCACCCGCGTAGTATAGCTGAA
AGGAAGAACGAGAATAAGCGGGAAGCTGAAGAAGCTACAAGAACTGGTGCCTAATATAGA
CAATCAAACAAGCTATGCAGAAATGTTGGATTTGGCTGCTGAGCATATC

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1FO17JQ 542 0 0
TTCTCATATCAGTTTCACCATTGATGAACCTGGAAAACGGTCCAAGACCACCGACTTTTT
CACCTTAGAAACTCAGTTTAGCATGCCACAAACGTTTCTGGAAATGGCGAGAATGGAGAG
TTTGATGAACATCCCAGAGGGTTCGGTGCCCTGTAGAGTAAGGGCCAAACGTGGATGTGC
GACTCACCCGCGTAGTATAGCTGAAAGGAAGAACGAGAATAAGCGGGAAGCTGAAGAAGC
TACAAGAACTGGTGCCTAATATAGACAATCAAACAAGCTATGCAGAAATGTTGGATTTGG
CTGCTGAGCATATCAAAGGTTTTCAACACGAAGTAGAGTCACTAGAAAAGGGGATGGAGA
GATGCACTTGTGGGGCGTGCAAGAAGCGATGATGAAAAATGATATGTTTTTAAAGATGAT
CCAAGAAAGTATAGAAGAAAAAGAGACGAAGGAAATAATTCAAAGAGAAAGAACATAATT
TTTTTTTTTTGATTATATAACTTAAGCATACTCATTATATATTCATAACCGGTTGCAACT
TG

QA 1 542 1 542
DS 



AS 1 2

CO CL5440Contig1 310 2 1 U
GCAAACAGGCTTTTGAGGAAGCCATCGCTGAGCTGGACACGTTGGGAGAGGAGTCATACA
AGGACAGTACTCTCATCATGCAGTTGCTAAGGGACAATCTAACCCTCTGGACCTCCGACA
TGCAGGAGCAGATGGATGAGGCCTGAAGATCTCGTGGAAGAACAGACGGTTATGTAATTT
CCCCCGCAACCATGGCCGAAAATCTAGTTCAAATTCAATTACCCCCTTTGCTGTAAAACT
TGTCGAAAAAAATGGTCTGTTTATGACAGTTATGTGCACAGCTTTGGTGTTATATCTGCT
TCTCTGTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1ER59JQ C 1
AF RS1ER59TF U 1
BS 1 310 RS1ER59TF

RD RS1ER59JQ 310 0 0
GCAAACAGGCTTTTGAGGAAGCCATCGCTGAGCTGGACACGTTGGGAGAGGAGTCATACA
AGGACAGTACTCTCATCATGCAGTTGCTAAGGGACAATCTAACCCTCTGGACCTCCGACA
TGCAGGAGCAGATGGATGAGGCCTGAAGATCTCGTGGAAGAACAGACGGTTATGTAATTT
CCCCCGCAACCATGGCCGAAAATCTAGTTCAAATTCAATTACCCCCTTTGCTGTAAAACT
TGTCGAAAAAAATGGTCTGTTTATGACAGTTATGTGCACAGCTTTGGTGTTATATCTGCT
TCTCTGTTCC

QA 1 310 1 310
DS 

RD RS1ER59TF 310 0 0
GCAAACAGGCTTTTGAGGAAGCCATCGCTGAGCTGGACACGTTGGGAGAGGAGTCATACA
AGGACAGTACTCTCATCATGCAGTTGCTAAGGGACAATCTAACCCTCTGGACCTCCGACA
TGCAGGAGCAGATGGATGAGGCCTGAAGATCTCGTGGAAGAACAGACGGTTATGTAATTT
CCCCCGCAACCATGGCCGAAAATCTAGTTCAAATTCAATTACCCCCTTTGCTGTAAAACT
TGTCGAAAAAAATGGTCTGTTTATGACAGTTATGTGCACAGCTTTGGTGTTATATCTGCT
TCTCTGTTCC

QA 1 310 1 310
DS 



AS 1 2

CO CL5441Contig1 606 2 1 U
GGGTATCTACCCCGGGATGAACTGGTTCTTCCTCATCGGTATCTTGGCTCCAGTTCCCTT
CTGGTACCTATCCAAGAAGTTCCCAGAGAAGAAATGGCTCAAGCTTATCCACATTCCATT
GATCTTCTCAGCAGTAAGCCCAATGCCACAGGCCAAGGCTGTGCATTACTGGTCATGGAC
CATTGTTGGGGTTGTGTTCAACTACTACATTTTCAGGAAGTTTAAAACTTGGTGGGCGAG
GCACAACTACATCCTCTCTGCGGCGCTTGATGCAGGTACCGCCATCATGGGAGTGTTGAT
ATTCTTTGCGTTTCAGAACAATGATATAAGCATACCTGATTGGTGGGGGCCTGAGAACTC
AGACCATTGCCCTCTTGCGCATTGTCCCACAGCTAAAGGGGTTGTTGTTGAAGGCTGTCC
TGTGTTTTAAGGTTTGATGCAGATCAAAGTGTTGTTGTTGCCCCAAAAGGGTTAATGTTG
ATATTTAAAAAAATGTAAAGCATTATATTTGGTTTCTTGTTCTTTAGGTTTTTAACCATG
TACTTTTCATGCTTAAGAGCAAATCAAGCATAGCTTTCGTTCCAAATATATAATCAAAAT
GCAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 

AF RS1EL42TF U 1
AF RS1EL42JQ C 255
BS 1 606 RS1EL42TF

RD RS1EL42TF 606 0 0
GGGTATCTACCCCGGGATGAACTGGTTCTTCCTCATCGGTATCTTGGCTCCAGTTCCCTT
CTGGTACCTATCCAAGAAGTTCCCAGAGAAGAAATGGCTCAAGCTTATCCACATTCCATT
GATCTTCTCAGCAGTAAGCCCAATGCCACAGGCCAAGGCTGTGCATTACTGGTCATGGAC
CATTGTTGGGGTTGTGTTCAACTACTACATTTTCAGGAAGTTTAAAACTTGGTGGGCGAG
GCACAACTACATCCTCTCTGCGGCGCTTGATGCAGGTACCGCCATCATGGGAGTGTTGAT
ATTCTTTGCGTTTCAGAACAATGATATAAGCATACCTGATTGGTGGGGGCCTGAGAACTC
AGACCATTGCCCTCTTGCGCATTGTCCCACAGCTAAAGGGGTTGTTGTTGAAGGCTGTCC
TGTGTTTTAAGGTTTGATGCAGATCAAAGTGTTGTTGTTGCCCCAAAAGGGTTAATGTTG
ATATTTAAAAAAATGTAAAGCATTATATTTGGTTTCTTGTTCTTTAGGTTTTTAACCATG
TACTTTTCATGCTTAAGAGCAAATCAAGCATAGCTTTCGTTCCAAATATATAATCAAAAT
GCAACC

QA 1 606 1 606
DS 

RD RS1EL42JQ 352 0 0
TTTTTGG
GGCGCTTGATGCAGGTACCGCCATCATGGGAGTGTTGATATTTTTTGCGTTTCAGAACAA
TGATATAAGCATACCTGATTGGTGGGGGCCTGAGAACTCAGACCATTGCCCTCTTGCGCA
TTGTCCCACAGCTAAAGGGGTTGTTGTTGAAGGCTGTCCTGTGTTTTAAGGTTTGATGCA
GATCAAAGTGTTGTTGTTGCCCCAAAAGGGTTAATGTTGATATTTAAAAAAATGTAAAGC
ATTATATTTGGTTTCTTGTTCTTTAGGTTTTTAACCATGTACTTTTCATGCTTAAGAGCA
AATCAAGCATAGCTTTCGTTCCAAATATATAATCAAAATGCAACC

QA 8 352 8 352
DS 



AS 1 2

CO CL5442Contig1 783 2 2 U
GGGATTCGTTTTACCGTGGTTTAACAACTGAAAAGCTGCAGCGTGTGCACGAGTACAACT
TCGATCATCCTGATGCGTTTGACACGGAGCAGCTTTTGCATTGTGCTGAGACTCTCAAGA
GCGGCCAACCTTATCAAGTTCCCATCTACGACTTTAAGACCCATCAGCGTAGATCTGACT
CTTTCCGCCAGGTGAATGCTTCTGATGTTATAATTTTGGAAGGGATTCTTGTTTTCCATG
ACTCCCGAGTTCGCAATCTTATGAACATGAAGATCTTCGTTGACACAGATACTGATGTGA
GGCTTGCTCGCAGACTCAGGCGTGACTTAGTTGAGAGGGGCAGGGATGCCGAATCTGTCC
TCGACCAGTATGCAAAGTTCGTGAAACCGGCGTTTGATGACTTTGTCCTTCCCTCTAAGA
AATATGCTGACGTGATCATTCCTCGAGGAGGTGACAATCACGTCGCTGTTGATTTGATTA
CCCAACACATCCACACAAAACTCGGGCAGCATGATCTCTGCAAAATCTACCCAAATGTTT
ATGTCATCCAATCAACATTTCAGATAAGAGGCATGCATACACTTATCAGGGAGAAGGACA
TATCAAAGCATGATTTTGTGTTTTATTCAGACCGACTCATTCGTCTGGTGGTGGAGCATG
GTCTTGGTCATTTGCCCTTCACTGAGAAACAAGTAGTTACTCCAACAGGATCTGTGTACA
CTGGAGTTGATTTCTGCAAGAAACTTTGTGGGATCTCTATTATTCGAAGTGGTGAAAGCA
TGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 

AF RS1E074TF U 1
AF RS1E074JQ C 183
BS 1 526 RS1E074TF
BS 527 783 RS1E074JQ

RD RS1E074TF 526 0 0
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GCGGCCAACCTTATCAAGTTCCCATCTACGACTTTAAGACCCATCAGCGTAGATCTGACT
CTTTCCGCCAGGTGAATGCTTCTGATGTTATAATTTTGGAAGGGATTCTTGTTTTCCATG
ACTCCCGAGTTCGCAATCTTATGAACATGAAGATCTTCGTTGACACAGATACTGATGTGA
GGCTTGCTCGCAGACTCAGGCGTGACTTAGTTGAGAGGGGCAGGGATGCCGAATCTGTCC
TCGACCAGTATGCAAAGTTCGTGAAACCGGCGTTTGATGACTTTGTCCTTCCCTCTAAGA
AATATGCTGACGTGATCATTCCTCGAGGAGGTGACAATCACGTCGCTGTTGATTTGATTA
CCCAACACATCCACACAAAACTCGGGCAGCATGATCTCTGCAAAAT

QA 1 526 1 526
DS 

RD RS1E074JQ 601 0 0
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TCCCGAGTTCGCAATCTTATGAACATGAAGATCTTCGTTGACACAGATACTGATGTGAGG
CTTGCTCGCAGACTCAGGCGTGACTTAGTTGAGAGGGGCAGGGATGCCGAATCTGTCCTC
GACCAGTATGCAAAGTTCGTGAAACCGGCGTTTGATGACTTTGTCCTTCCCTTTAAGAAA
TATGCTGACGTGATCATTCCTCGAGGAGGTGACAATCACGTCGCTGTTGATTTGATTACC
CAACACATCCACACAAAACTCGGGCAGCATGATCTCTGCAAAATCTACCCAAATGTTTAT
GTCATCCAATCAACATTTCAGATAAGAGGCATGCATACACTTATCAGGGAGAAGGACATA
TCAAAGCATGATTTTGTGTTTTATTCAGACCGACTCATTCGTCTGGTGGTGGAGCATGGT
CTTGGTCATTTGCCCTTCACTGAGAAACAAGTAGTTACTCCAACAGGATCTGTGTACACT
GGAGTTGATTTCTGCAAGAAACTTTGTGGGATCTCTATTATTCGAAGTGGTGAAAGCATG
G

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 2

CO CL5443Contig1 1240 2 4 U
GGGATCTTACTCTGATAACTTCTCGAGTTCGTGGAAATGGGTTCTTCTGTGGAGCAGAAC
ATTCTTGTTACCGGTGGTGCTGGATTTATTGGGACACATACTGTTGTTCAGCTTCTGAAA
GAGGGTTTCAAGGTTTCGATCATCGATAATCTTGATAACTCTGTTATCGAAGCCGTCGAT
AGGGTTAGGGAGCTCGTTGGTCCTGATCTCTCCAAGAAGCTCGAGTTTAATCTGGGTGAT
CTAAGAAACAAAGGGGATATTGAGAAACTCTTTTCCAAGCAGAGATTTGATGCTGTGATC
CATTTTGCGGGTCTTAAAGCTGTGGGTGAAAGTGTTGGCAACCCTCGTCGCTACTTTGAC
AATAACTTGGTCGGAACAATCAATCTATATGAGACCATGGCAAAGTACAACTGCAAAATG
ATGGTGTTTTCATCATCTGCAACTGTTTATGGACAACCTGAGAAAATTCCATGCGTGGAA
GACTTTGAATTGAAAGCAATGAATCCTTATGGTCGTACCAAGCTGTTTCTTGAAGAAATA
GCTAGAGATATCCACGCAGCGGAACCAGAATGGAGGATTGTTCTGCTGAGGTACTTCAAT
CCTGTGGGAGCGCATGAGAGTGGCAGAATTGGTGAGGATCCAAAGGGAATCCCCAATAAC
CTCATGCCTTATATCCAACAAGTGGCTGTGGGACGTCTACCTGAGCTCAATGTCTACGGA
CATGACTACCCTACCGAGGATGGTAGTGCGGTAAGAGACTACATCCATGTGATGGATTTG
GCTGATGGCCATATCGCTGCGCTAAGGAAGCTATTTGCTGATCCGACGATTGGCTGTACT
GCTTACAATCTAGGGACAGGACGAGGAACGTCTGTGTTAGAAATGGTTGCAGCTTTTGAA
AAAGCTTCCGGCAAGAAAATACCTATCAAGCTCTGTCCAAGAAGGGCAGGAGATGCAACT
GCAGTTTATGCTTCAACGGAGAGAGCTGAGAAAGAACTTGGCTGGAAGGCAAAATACAGA
GTTGATGAGATGTGCAGAGATCAGTGGAACTGGGCAAACAACAATCCATGGGGCTACCAG
AAGAAGCTTTGAGTGCTCACATCTCTCTCTGTTTTTCTTAGTTACCATGTCTAATCACCC
AATATAAAAGAAAAGTGTGTATACACATCATATAGTGTTTGCTTTATTTTCTATGTATCG
AACCAGTCTCCTACTTCATTGAATAAATAGCTTTATACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EI13TF U 1
AF RS1EI13JQ C 392
BS 1 718 RS1EI13TF
BS 719 719 RS1EI13JQ
BS 720 743 RS1EI13TF
BS 744 1240 RS1EI13JQ

RD RS1EI13TF 743 0 0
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ATTCTTGTTACCGGTGGTGCTGGATTTATTGGGACACATACTGTTGTTCAGCTTCTGAAA
GAGGGTTTCAAGGTTTCGATCATCGATAATCTTGATAACTCTGTTATCGAAGCCGTCGAT
AGGGTTAGGGAGCTCGTTGGTCCTGATCTCTCCAAGAAGCTCGAGTTTAATCTGGGTGAT
CTAAGAAACAAAGGGGATATTGAGAAACTCTTTTCCAAGCAGAGATTTGATGCTGTGATC
CATTTTGCGGGTCTTAAAGCTGTGGGTGAAAGTGTTGGCAACCCTCGTCGCTACTTTGAC
AATAACTTGGTCGGAACAATCAATCTATATGAGACCATGGCAAAGTACAACTGCAAAATG
ATGGTGTTTTCATCATCTGCAACTGTTTATGGACAACCTGAGAAAATTCCATGCGTGGAA
GACTTTGAATTGAAAGCAATGAATCCTTATGGTCGTACCAAGCTGTTTCTTGAAGAAATA
GCTAGAGATATCCACGCAGCGGAACCAGAATGGAGGATTGTTCTGCTGAGGTACTTCAAT
CCTGTGGGAGCGCATGAGAGTGGCAGAATTGGTGAGGATCCAAAGGGAATCCCCAATAAC
CTCATGCCTTATATCCAACAAGTGGCTGTGGGACGTCTACCTGAGCTCAATGTCTACG*A
CATGACTACCCTACCGAGGATGG

QA 1 743 1 743
DS 

RD RS1EI13JQ 849 0 0
GAGACCAT
GCAAAGTACAACTGCAAAATGATGGTGTTTTCATCATCTGCAACTGTTTATGGACAAC*T
GAGAAAATTCCATGCGTGGAAGACTTTGAATTGAAAGCAATGAATCCTTATGGTCGTACC
AAGCTGTTTCTTGAAGAAATAGCTAGAGATATCCACGCAGCGGAACCAGAATGGAGGATT
GTTCTGCTGAGGTACTTCAATCCTGTGGGAGCGCATGAGAGTGGCAGAATTGGTGAGGAT
CCAAAGGGAATCCCCAATAACCTCATGCCTTATATCCAACAAGTGGCTGTGGGACGTCTA
CCTGAGCTCAATGTCTACGGACATGACTACCCTACCGAGGATGGTAGTGCGGTAAGAGAC
TACATCCATGTGATGGATTTGGCTGATGGCCATATCGCTGCGCTAAGGAAGCTATTTGCT
GATCCGACGATTGGCTGTACTGCTTACAATCTAGGGACAGGACGAGGAACGTCTGTGTTA
GAAATGGTTGCAGCTTTTGAAAAAGCTTCCGGCAAGAAAATACCTATCAAGCTCTGTCCA
AGAAGGGCAGGAGATGCAACTGCAGTTTATGCTTCAACGGAGAGAGCTGAGAAAGAACTT
GGCTGGAAGGCAAAATACAGAGTTGATGAGATGTGCAGAGATCAGTGGAACTGGGCAAAC
AACAATCCATGGGGCTACCAGAAGAAGCTTTGAGTGCTCACATCTCTCTCTGTTTTTCTT
AGTTACCATGTCTAATCACCCAATATAAAAGAAAAGTGTGTATACACATCATATAGTGTT
TGCTTTATTTTCTATGTATCGAACCAGTCTCCTACTTCATTGAATAAATAGCTTTATACA
C

QA 9 849 9 849
DS 



AS 1 2

CO CL5444Contig1 909 2 2 U
GGCCTTCACTTTCGCTTTTCTCTCACTCTCTCTCTGTCCTTTTCCTCATTATCTCCTTAA
CTCATGCCGTCTGAATCAAACCAAACCCGACCCGCCCGAGTTCAGGGCTCAACGGCGGCT
TACCCACCTCCGAATCTGGCGGAGCCACTGCCTTGTCCTCGTTGCAACTCCATCATCACC
AAGTTCTGTTACTACAACAACTACAACCTCTTACAGCCTCGCTACTTCTGCAAATCTTGC
CGCCGTTACTGGACTCAAGGTGGTGCACTCCGCGACGTCCCCGTCGGCGGTGGAACCCGC
CGGAGCTCTTCCAAACGCAACCGCTCTTTCTCCTCCAACGCCACTACTGCATCCTCCTCT
TCCTGCTCTTCTTCCATCATTACAACGGCCAACGGTTCGGAACCAATGAACCAAGGAACC
GTCACAAACGAAGCAAAGGGTGGTAATGAGATCTCAGGTTACGGAAGCTTTGCGTCTCTG
TTAAGTGGGCAGAGCGACGGAGCAGGGTTTCTGGCGTTGGGAAACGGAAGTGGAAGCGGT
GGGTTAGATTATGGGTTCGGGTACGGATACGGGTTGGAGGAGATGAGTATTGGGTATCTT
GGAGGAGGCTCTGGAGGAGAGATACCGGTGGTGGGGTGGTAGTGACACGTGGCAGATTGG
GGAGATGGAAGGTAAAAGTGGGGACAGTTTATGGCCTGGTCTCGAGATCTCCATGCAAAG
CAACGGTGCTAAGTGAAAAAAAACCGTTTATGACTCTTGTCTTCTTCTTCCTCTGTTTCT
GTCTTTTGTTTGTTTCCTTTTGGAAATTTCTGTTTGTGTTTTTTATTATTTCCTAGTGTG
ATAGAGAGAGAGATCAAAGAAGCAAATTAAACAGGAATGAAAAAAAAAATAGGAGGAAGG
TTTAATGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BE70TF U 1
AF RS1BE70JQ C 325
BS 1 668 RS1BE70TF
BS 669 909 RS1BE70JQ

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CTCATGCCGTCTGAATCAAACCAAACCCGACCCGCCCGAGTTCAGGGCTCAACGGCGGCT
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CGCCGTTACTGGACTCAAGGTGGTGCACTCCGCGACGTCCCCGTCGGCGGTGGAACCCGC
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TCCTGCTCTTCTTCCATCATTACAACGGCCAACGGTTCGGAACCAATGAACCAAGGAACC
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GGAGATGG

QA 1 668 1 668
DS 

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ACGGCCAACGGTTCGGAACCAATGAACCAAGGAACCGTCACAAACGAAGCAAAGGGTGGT
AATGAGATCTCAGGTTACGGAAGCTTTGCGTCTCTGTTAAGTGGGCAGAGCGACGGAGCA
GGGTTTCTGGCGTTGGGAAACGGAAGTGGAAGCGGTGGGTTAGATTATGGGTTCGGGTAC
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CCGGTGGTGGG*TGGTAGTGACACGTGGCAGATTGGGGAGATGGAAGGTAAAAGTGGGGA
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CGTTTATGACTCTTGTCTTCTTCTTCCTCTGTTTCTGTCTTTTGTTTGTTTCCTTTTGGA
AATTTCTGTTTGTGTTTTTTATTATTTCCTAGTGTGATAGAGAGAGAGATCAAAGAAGCA
AATTAAACAGGAATGAAAAAAAAAATAGGAGGAAGGTTTAATGCC

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 2

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AAGACATGGAACAATAGTGCTTTAAAATAGCGTTCTCAAAAACAGTTCTGAGAGATTCCC
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BQ
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AF RS1G187TF U 1
AF RS1G187JQ C 393
BS 1 743 RS1G187TF
BS 744 806 RS1G187JQ

RD RS1G187TF 743 0 0
GCAACTCTTGCGACTGAAGAAGAGTTAGAGCCTTTCAGTCCTTACCAGAACCGGCTTGCT
GCGTTGGACTATATCGTGGCCCTTGAAAGCGATGTTTTGTGTATACATACGATGGAAATA
TGGCTAAGGCAGTCCAAGGGCACAGAAGGTTTGAAGGGTTTAGAAAGTCGATAAATCCAG
ACAGGTTGAATTTTGTTAGACTGATAGATCATTTTGATGATGGCTTCATATCTTGGGAAG
AGTTTGCTTCAGAGGTTAAGCGACTAAACAGAGACAGGATTGGAGCGCCATATGCGAGAC
TGCCTGCTGCACTTCCCAGGCTAGAGGAGAATTTCTATGCGAATCCACAACCCGATTGCA
TCTGTACCAAGTCTCATTCTGGCAGCTCTGGAAAAAAAATCAAGTCTAAGAACGGAGACA
AAGACATGGAACAATAGTGCTTTAAAATAGCGTTCTCAAAAACAGTTCTGAGAGATTCCC
ACGTCAAACACTGCAGGATCAGGACACAGAACAACCTGCTTCGAGTTTATAGCGTTTTTG
TACAACATAGGTAAAGAGGTAACCCGAGTTCTGCTCAGAGAGCTTGTAGAATCGATTTTC
CTTACAGAAATAGCATCAAGACTTGGATCACAGCTATAGAGCATTTTTGGGGACTCTGCA
CGGTTATCTGAGCAGAACCAAACATAGACTTCATTAGGGTATCATGTTCTCACCACCCTC
TCACATTGTTGTTATCAGTGAAC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RS1G187JQ 414 0 0
AAAAAAATCAAGTTTAAGAACGGAGACAAAGACATGGAACAATAGTGCTTTAAAATAGCG
TTCTCAAAAACAGTTCTGAGAGATTCCCACGTCAAACACTGCAGGATCAGGACACAGAAC
AACCTGCTTGGAGTTTATAGCGTTTTTGTACAACATAGGTAAAGAGGTAACCCGAGTTCT
GCTCAGAGAGCTTGTAGAATCGATTTTCCTTACAGAAATAGCATCAAGACTTGGATCACA
GCTATAGAGCATTTTTGGGGACTCTGCACGGTTATTTGAGCAGAACCAAACATAGACTTC
ATTAGGGTATCATGTTCTCACCACCCTCTCACATTGTTGTTATCAGTGAACTCAAAAAAA
AAAGATTGTACATTGGATTACAGTTTTGAAATCAGTATACATCTCACATTGTCC

QA 1 414 1 414
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5447Contig1 948 2 2 U
GCTCTCGATCGAAATAAAAATATCTTCGCGTCGTTGTCGTTGTCGCTCCGTCCTTCTAGG
GTTTACTCAAAGTTCTTTCTTTCTTTCAGTAATCATGAGTCACCATCCAGAAGTGAAGTG
GGCAGAGAGAGAGGATAAGGTTTACTTAACAGTGCTGTTGCCTGATGCTAAGGATGCGAA
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CATTGGGTTAAGAAGCATATTCTGCATCGTGGAGAAAGCAGAGTCGAAATGGTGGAGTAA
GCTGTTGCGTGGTGGGAAACCTCCTCACTATGTTAAAGTTGACTGGGACAAGTGGGTTGA
TGAGGATGAAGATCCCGCCACTGGTCCTGGAGATATGGATATGGGCGGAATGGGTGGCAT
GGGCGGGATGGATTTCTCGAACTTTGGTGGAATGGGAGGAATGGGAGGTATGGGTGGGAT
GGGCGGTATGGGAGGTCTCGAGGGGCTTGGTGGAATGGCCGGGCTTGAAGGTCTCGGTGG
AATGGGCGGTATGGGAGGGCTTGGTGGAATGGGTGGTATGGAAGAATTTGAAGATAGTGA
TGATGAAGGAGAAGAAGTCAAGTCTGGAGAGAAAAAGGAGGAAGCTCAAGCTCCTGCATC
AGAGGAAACGAAAACCGAAGAGCAGACAACTGTTAAGAGTGACAAATGAAGACACTATCC
TTAAACCTTATGGTATGGCTGACCAAGAGTTGTTTATGCGTTTATGAAAACTGCTGATTG
GTTTGCTCTTTTAAATCTTTTTTCCCTCTGCTTTCTACTTCCTGGATTGTTGTATTCCCG
ATTTGGGTCTTATATGGTTTGCTTTATTTTATTTTATTGTTGTTTGTT


BQ
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AF RS1GA73TF U 1
AF RS1GA73JQ C 245
BS 1 552 RS1GA73TF
BS 553 948 RS1GA73JQ

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GTTTACTCAAAGTTCTTTCTTTCTTTCAGTAATCATGAGTCACCATCCAGAAGTGAAGTG
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GCTTTATGAGCTTAAGCTTGAGCTTAATGACAAGGTCAATGTAGAGGAAAGCAAAATCAA
CATTGGGTTAAGAAGCATATTCTGCATCGTGGAGAAAGCAGAGTCGAAATGGTGGAGTAA
GCTGTTGCGTGGTGGGAAACCTCCTCACTATGTTAAAGTTGACTGGGACAAGTGGGTTGA
TGAGGATGAAGATCCCGCCACTGGTCCTGGAGATATGGATATGGGCGGAATGGGTGGCAT
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GGGCGGTATGGG
GAGGTCT

QA 1 552 1 552
DS 

RD RS1GA73JQ 704 0 0
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GGGTTAAGAAGCATATTCTGCATCGTGGAGAAAGCAGAGTCGAAATGGTGGAGTAAGCTG
TTGCGTGGTGGGAAACCTCCTCACTATGTTAAAGTTGACTGGGACAAGTGGGTTGATGAG
GATGAAGATCCCGCCACTGGTCCTGGAGATATGGATATGGGCGGAATGGGTGGCATGGGC
GGGATGGATTTCTCGAACTTTGGTGGAATGGGAGGAATGGGAGGTATGGGTGGGATGGGC
GGTATGGGAGGTCTCGAGGGGCTTGGTGGAATGGCCGGGCTTGAAGGTCTCGGTGGAATG
GGCGGTATGGGAGGGCTTGGTGGAATGGGTGGTATGGAAGAATTTGAAGATAGTGATGAT
GAAGGAGAAGAAGTCAAGTCTGGAGAGAAAAAGGAGGAAGCTCAAGCTCCTGCATCAGAG
GAAACGAAAACCGAAGAGCAGACAACTGTTAAGAGTGACAAATGAAGACACTATCCTTAA
ACCTTATGGTATGGCTGACCAAGAGTTGTTTATGCGTTTATGAAAACTGCTGATTGGTTT
GCTCTTTTAAATCTTTTTTCCCTCTGCTTTCTACTTCCTGGATTGTTGTATTCCCGATTT
GGGTCTTATATGGTTTGCTTTATTTTATTTTATTGTTGTTTGTT

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

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ATGAGCCTCGGAGTTTGATGTGACTTAACCTGAAGTGTGATCTTTAACTTCAGCATCTGA
TCTCATAAGATCCAGCTTTTGTTATGTATCGAACCCACTCCACCGTGTTGTAACCGCTCT
TCTCCCACACCTTGAGGAAACGAACTCGCAAACCAGAGGCTGTGAACATTGGCACTTGAA
ATTCCATTTGGATTGGTGGCCTTGTCCAAGATTTCTTTTCTCCCATTGTTGAGATCAACT
CAATCTCTGCACTTAGTGTGGACTCTGTTTGTCCGGGAAATTTTCTTATCTTCCAAACCA
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CACCATCCGGTGGTACAAAGCTAACGGTCTTCTCGGAGTTAAATCTTGTCAGGTTCACAC
ACTGGTGAAAAGTGACATCATCCAGCTCAATAGTTTTACCACTCTTAGCTGGGCGAGATT
TCATTTCAGATTCTTTCTCAAGACCAATTTTATCATTCAACCCCAACTTCAAATCAGGCA
TTCCCGAAAGGAAACATTTCATTAAAACTTTCCCCGTCACATCACACCGAAGAACATTGC
CTTTGGGGGACATAAGAAGGTTTACACTTTCCACAATATCCAGAAACACCTCATTCTTCT
TATAAGAAAGACCCTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D865JQ U 1
AF RS1A858TF C 309
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BS 670 1036 RS1A858TF

RD RS1D865JQ 669 0 0
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ACGATGACGCAAACTACAAATTAATTTAAAATATAATTCGTAGAAAACCACAAAAGAGAA
GAGAAAACCAATTCAATGATATTTAACTCTTGTTTGAACAAGGAACAAAAGCTAGAAGCC
ATGAGCCTCGGAGTTTGATGTGACTTAACCTGAAGTGTGATCTTTAACTTCAGCATCTGA
TCTCATAAGATCCAGCTTTTGTTATGTATCGAACCCACTCCACCGTGTTGTAACCGCTCT
TCTCCCACACCTTGAGGAAACGAACTCGCAAACCAGAGGCTGTGAACATTGGCACTTGAA
ATTCCATTTGGATTGGTGGCCTTGTCCAAGATTTCTTTTCTCCCATTGTTGAGATCAACT
CAATCTCTGCACTTAGTGTGGACTCTGTTTGTCCGGGAAATTTTCTTATCTTCCAAACCA
AGCAATCGATTGATAGGTTGTACTTAGCACGACCAGTTGTCACTTGGAAGTTAGTCTTTG
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GCAATACAC

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DS 

RD RS1A858TF 728 0 0
CA
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ACTTAGTGTGGACTCTGTTTGTCCGGGAAATTTTCTTATCTTCCAAACCAAGCAATCGAT
TGATGGGTTGTACTTAGCACGACCAGTTGTCACTTGGAAGTTAGTCTTTGCTGTTTGTTT
CGGCACTGGAATTTTAACCACGACTCCAAGCGCAAACATTTTAGCACCAAACACACTTTT
GACCTTCACATTTACTTCCATTCGTGTGCGACCAAGTTCTTTAATTGTTGGCAATACACG
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TGGTACAAAGCTAACGGTCTTCTCGGAGTTAAATCTTGTCAGGTTCACACACTGGTGAAA
AGTGACATCATCCAGCTCAATAGTTTTACCACTCTTAGCTGGGCGAGATTTCATTTCAGA
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GAAACATTTCATTAAAACTTTCCCCGTCACATCACACCGAAGAACATTGCCTTTGGGGGA
CATAAGAAGGTTTACACTTTCCACAATATCCAGAAACACCTCATTCTTCTTATAAGAAAG
ACCCTC

QA 3 728 3 728
DS 



AS 1 2

CO CL5449Contig1 870 2 2 U
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CCTGCCGCAATGAACTTACAATCGAAGGAATCTCATCAGAAACAAAGCAGTAACCCTTTC
CAGTTCGGTCTCATCTCCTCTGACTCGTTACTTAATCCCTCCCATAAACAACCCTCCTAC
GCAAACTCCTCCAAAGGCTTTGGATCGTATCTGGACTTCAGCAACCAAGCAAAGAACTCC
AATGTCGATTCCTGGACAGAAGAGCTGAAATCTGATTGGACTCAGCTCTCAATGTCAATC
CCCATGGCTCCATCTTCCCCTGTTCAAGATAAACTTGCTCTCTCTCCTCTAAGGCTTTCG
CGCGAGTTTGACCCTGCTATCCACATGGGGCTAGGCGTTAACACTGAGTTTCTTGAGCCT
GTGAAGAAGACGAATAACTGGATACCAATCTCATGGGGTAATAATAACTCCATGGGAGGT
CCTCTCGGTGAAGTACTAAACAGCACGACGAATAGTCCCAAGTTTGGTTCTTCCCCGACA
GGCGTCTTGCAGAAGTCGACGTTTGGTTCTCTTTCTAACAGCAGCTCAGGAAGCAGCACT
GTTCTTGGCGATACCAGCAACAAGAACTGCGATGGAAAGGATCCACTTGGCCCGACCACA
CTGATGAACTCTTCTGCTTCTGCTCCATCTCTGTGAAACTAAGACGATGGCGAAAAAACT
CAAAAACATTCTGTTTCTTTTTTTCATTGGTGCATTGTCGTTGTTGTTGTTTTCGATATA
AAGACGGAAGAAACTAAAGGAGAAATGGACATGTCTTCTCTCCTTCTTTCTGATTTCTGA
ATCCATGGATTTATTGGTTCTCTATCATCA


BQ
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AF RS1CN08TF U 1
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BS 217 870 RS1CN08JQ

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DS 

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CCTCTAAGGCTTTCGCGCGAGTTTGACCCTGCTATCCACATGGGGCTAGGCGTTAACACT
GAGTTTCTTGAGCCTGTGAAGAAGACGAATAACTGGATACCAATCTCATGGGGTAATAAT
AACTCCATGGGAGGTCCTCTCGGTGAAGTACTAAACAGCACGACGAATAGTCCCAAGTTT
GGTTCTTCCCCGACAGGCGTCTTGCAGAAGTCGACGTTTGGTTCTCTTTCTAACAGCAGC
TCAGGAAGCAGCACTGTTCTTGGCGATACCAGCAACAAGAACTGCGATGGAAAGGATCCA
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GATGGCGAAAAAACTCAAAAACATTCTGTTTCTTTTTTTCATTGGTGCATTGTCGTTGTT
GTTGTTTTCGATATAAAGACGGAAGAAACTAAAGGAGAAATGGACATGTCTTCTCTCCTT
CTTTCTGATTTCTGAATCCATGGATTTATTGGTTCTCTATCATCA

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1C670JQ C 1
AF RS1C670TF U 1
BS 1 358 RS1C670TF

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DS 

RD RS1C670TF 358 0 0
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CTGTTCTATAACACCGGAGAAGAAAGGTTTTCTTTGTTTTTTGAAAGGCACAACAACTAC
TCTTTGATTTGGTTTTGACACTTCTCTCTCTATTTACGAACATATCTCTCTCTATCTCTC
TTTTCCGACCATTTTTATATTTAAGATCATATGGAATGTTTATTTCTGGTTTGTTGTT

QA 1 358 1 358
DS 



AS 1 2

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AAGTCTTATCCTTTGGGTTTTGATTAGCTATCACTTTCTTTCTGATCTGGGTTTTCCTCT
CTGTGCCAGGTTTAGTTGTTAGACCAGTTGAAAGTACCAATAAAGATTAGAAAAGAGTAG
CCCTTTATAGGTTTTATTGGGGTTTTGTCTCATTTTGAGAAATGGGTTCAGAGCTAGGAT
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AGGAGAAAGAGAAGAGATTGCGGAGAAGGATGATGATAATACAAACGGTTCAGTAACAAG
TAAAGAAGATGTGGCAGAGAATGGGAGGAGGGGGAGAAAGCGGTAGAAGAGTCTAAAGAG
AGCAATGTAACAGAAGAAGAGAAGGTGTTAGGATCGAAATCAAGCGCAGATGATTCAGTG
AAGTCATCGTTGTCCACAGGGTTTAGACAAGTTGGGAGTAGAAGGAAGAACAAACCAAGA
CGAGCTGCAGAAGCTGTTGTTGAATGTAATGGTGTTTGAAGAAAGAGATTTTTAGAGACT
GCCTTTTTGATTTGTTTTTCGTTGACTTGAATGTTACCTTTTTGTGGTAAGGACTTTTGA
TGCAGTTGCGTTTTAGTTTTCAATTTTCATACATGG


BQ
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AF RS1EW47TF U 1
AF RS1EW47JQ C 265
BS 1 548 RS1EW47TF
BS 549 549 RS1EW47JQ
BS 550 578 RS1EW47TF
BS 579 996 RS1EW47JQ

RD RS1EW47TF 578 0 0
GGGTGAGAGGAAAGCGTCATTCTTACGTTTTATAGCTTCACAGAAAAAAAACAAAAAGGG
AGAAACTCTTTTGAAAGCAAATCATCATCTTCTTTTTCTATATTTCAACGACACTTTCAA
CCAACACTTCTTATCGTTAGTTGTTGTTTCTTTGTTTTCTTAAGATCTCTCTTTTTTTTA
AAGTCTTATCCTTTGGGTTTTGATTAGCTATCACTTTCTTTCTGATCTGGGTTTTCCTCT
CTGTGCCAGGTTTAGTTGTTAGACCAGTTGAAAGTACCAATAAAGATTAGAAAAGAGTAG
CCCTTTATAGGTTTTATTGGGGTTTTGTCTCATTTTGAGAAATGGGTTCAGAGCTAGGAT
ACTGCATGTAACTGAAAAGGATTGAAAAGAAACAACCTTTTCACTTGGAGGGTTCTTGTC
TAGTTGCTTTTAGGCTTTTTGGTTTGGTAGAGAAATTGAATTAGTAGTAATGAGAAGAGG
TAGAGGGAAAAGAAAGAGGCAGAATGCTACTGCTAGAGAAGATGGTGATGAAGAAGAAGA
AAAGATTCTAGCTTACAGGAGAAGAGGGAGGCCACAGA

QA 1 578 1 578
DS 

RD RS1EW47JQ 732 0 0
CAGTTGAAAGTACCAATAAAGATTAGAAAAGAGTAGCCCTTTATAGGTTTTATTGGGGTT
TTGTCTCATTTTGAGAAATGGGTTCAGAGCTAGGATACTGCATGTAACTGAAAAGGATTG
AAAAGAAACAACCTTTTCACTTGGAGGGTTCTTGTCTAGTTGCTTTTAGGCTTTTTGGTT
TGGTAGAGAAATTGAATTAGTAGTAATGAGAAGAGGTAGAGGGAAAAGAAAGAGGCAGAA
TGCTACTGCTAGAGAAGATGGTGATGAAGAAGAAGAAAAGATTCCAGCTTACAGGAGAAG
AGGGAGGCCACAGAAGCCGTTAAAAGATGAAACCGAAGGAGAAAGAGAAGAGATTGCGGA
GAAGGATGATGATAATACAAACGGTTCAGTAACAAGTAAAGAAGATGTGGCAGAGAATGG
GAGGAGGGGGAGAAAGCGGTAGAAGAGTCTAAAGAGAGCAATGTAACAGAAGAAGAGAAG
GTGTTAGGATCGAAATCAAGCGCAGATGATTCAGTGAAGTCATCGTTGTCCACAGGGTTT
AGACAAGTTGGGAGTAGAAGGAAGAACAAACCAAGACGAGCTGCAGAAGCTGTTGTTGAA
TGTAATGGTGTTTGAAGAAAGAGATTTTTAGAGACTGCCTTTTTGATTTGTTTTTCGTTG
ACTTGAATGTTACCTTTTTGTGGTAAGGACTTTTGATGCAGTTGCGTTTTAGTTTTCAAT
TTTCATACATGG

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL5452Contig1 716 2 6 U
AACATCTCTCTGCTTTGGTGTCATCTTTCATTACAACAATAATGCCAATTCAAATTAACA
ATATACTACTACATGTATGTATGTATGCAAGGCCAATTCAACACAAGCGTCGTTTATTAC
ATTTATTTTCCTTTCCAGATTCAGACCTAAACCCATAGTGCTCCATCACCTTCTCCATCT
CACAGCTTTGCCATTGCTAAGGCAGGCAAATTTTTCCTTGGTGGAAGCTTTAGATCCTCA
ACTTCCTCCACTCTCTTGAAGTACTGCTCTACCATCATATCCTTCATCTCCTCCAGCCGC
CATGGCACCCACTTTGGATTCTTATCTTTGTCAATCAATATGGCTCTGCACCCCTCCACA
AAATCTTTGCTTATATCTCCCTTTAGCACATGACACACCATTCTATACTCACGGCTAAGG
CACTGCCCCACCCCTTGTAATCGTCCTTCTCTTATCGATCTAAGAGAGATTTTAAGGCTT
GCTGGTGAAGCCTTTTTCAATGCTCTAATAGTGGCTGAAATCCAATTGTCGCCTCCATGA
GTGGCCTCTCTCTCAAGTGCAGCTATAACTTCTTCCACTGTTCTCCCCGAGAAGCACCTA
TCAATAACATCCAACCTGTGGTAAGCACTCTGCTGTTTTAGGTGCGGATTCTGTGTGTAC
GCATCGAGAATTGTTGAGACCAAGATTGGATCAGTTGAATCAACTCTGCAAAGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1E149JQ U 1
AF RS1CU65JQ U 102
BS 1 167 RS1E149JQ
BS 168 168 RS1CU65JQ
BS 169 181 RS1E149JQ
BS 182 183 RS1CU65JQ
BS 184 465 RS1E149JQ
BS 466 716 RS1CU65JQ

RD RS1E149JQ 466 0 0
AACATCTCTCTGCTTTGGTGTCATCTTTCATTACAACAATAATGCCAATTCAAATTAACA
ATATACTACTACATGTATGTATGTATGCAAGGCCAATTCAACACAAGCGTCGTTTATTAC
ATTTATTTTCCTTTCCAGATTCAGACCTAAACCCATAGTGCTCCATCGCCTTCTCCATCT
C**AGCTTTGCCATTGCTAAGGCAGGCAAATTTTTCCTTGGTGGAAGCTTTAGATCCTCA
ACTTCCTCCACTCTCTTGAAGTACTGCTCTACCATCATATCCTTCATCTCCTCCAGCCGC
CATGGCACCCACTTTGGATTCTTATCTTTGTCAATCAATATGGCTCTGCACCCCTCCACA
AAATCTTTGCTTATATCTCCCTTTAGCACATGACACACCATTCTATACTCACGGCTAAGG
CACTGCCCCACCCCTTGTAATCGTCCTTCTCTTATCGATCTAAGA
A

QA 1 465 1 465
DS 

RD RS1CU65JQ 615 0 0
CACAAGCGTCGTTTATTACATTTATTTTCCTTTTCAGATTCAGACCTAAACCCATAGTGC
TCCATCACCTTCTCCATCTCACAGCTTTGCCATTGCTAAGGCAGGTAAATTTTTCCTTGG
TGGAAGCTTTAGATCCTCAACTTCCTCCACTCTCTTGAAGTACTGCTCTACCATCATATC
CTTCATCTCCTCCAGCCGCCATGGCACCCACTTTGGATTCTTATCTTTGTCAATCAATAT
GGCTCTGCACCCCTCCACAAAATCTTTGCTTATATCTCCCTTTAGCACATGACACACCAT
TCTATACTCACGGCTAAGGCACTGCCCCACCCCTTGTAATCGTCCTTCTCTTATCGATCT
AAGAGAGATTTTAAGGCTTGCTGGTGAAGCCTTTTTCAATGCTCTAATAGTGGCTGAAAT
CCAATTGTCGCCTCCATGAGTGGCCTCTCTCTCAAGTGCAGCTATAACTTCTTCCACTGT
TCTCCCCGAGAAGCACCTATCAATAACATCCAACCTGTGGTAAGCACTCTGCTGTTTTAG
GTGCGGATTCTGTGTGTACGCATCGAGAATTGTTGAGACCAAGATTGGATCAGTTGAATC
AACTCTGCAAAGTTC

QA 1 615 1 615
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5454Contig1 451 2 1 U
TTTTTCTTCTGAAAAAAAAAACATTTTTCTTCTGAAACGAGGCAATGCCGACTAGTCAGA
AAATCCCAACTTGGGTTGCCGCTGCGGCTATCATTGCCATCTTGGCTGTGGTTTCATATC
AGACTCCATTTGCGGCGGACAATGTAGAGGGCACCAAAATGGTTTTGCCGTTTGCTAAGA
CCATTCCAATTCCTGTTGCTGGACCAGAGAGCATCGAGTTCGACCCACAAGGAGAAGGTC
CTTATGCTGCCGTCGTGGACGGTCGTATTCTCAAGTGGCGAGGCGATGACCTAGGCTGGG
TTGAGTTTGCCCACACATCTCCCCACAGAGGGAACTGTTCAAGCCGTGAAGTAGTGCCTA
CTTGTGGAAGACCATTGGGACTTACTTTTGAGGAGAAAACGGGAGATCTATACATATGCG
ATGGTTACCTAGGGCTCATGAAGGTTGGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1E033TF U 3
AF RS1FW69TF U 1
BS 1 451 RS1FW69TF

RD RS1E033TF 395 0 0
TTTTTCTTCTG
AAAAAAAACATTTTTCTTCTGAAACGAGGCAATGCCGACTAGTCAGAAAATCCCAACTTG
GGTTGCCGCTGCGGCTATCATTGCCATCTTGGCTGTGGTTTCATATCAGACTCTATTTGC
GGCGGACAATGTAGAGGGCACCAAAATGGTTTTGCCGTTTGCTAAGACCATTCCAATTCC
TGTTGCTGGACCAGAGAGCATCGAGTTCGACCCACAAGGAGAAGG*CCTTATGCTGCCGT
C*TGGACGGTCGTATTCTCAAGTGGCGAGGCGATGACCTAG*CTGGGTTGAGTTTGCCCA
C*CATCTCCCCACAGAGGGAACTGTTCA*GCCGTGAA*TA*TGCCTACTTGTGGAA*ACC
ATTGGGACTTACTTTTGA
AAAAAA

QA 12 389 12 389
DS 

RD RS1FW69TF 451 0 0
TTTTTCTTCTGAAAAAAAAAACATTTTTCTTCTGAAACGAGGCAATGCCGACTAGTCAGA
AAATCCCAACTTGGGTTGCCGCTGCGGCTATCATTGCCATCTTGGCTGTGGTTTCATATC
AGACTCCATTTGCGGCGGACAATGTAGAGGGCACCAAAATGGTTTTGCCGTTTGCTAAGA
CCATTCCAATTCCTGTTGCTGGACCAGAGAGCATCGAGTTCGACCCACAAGGAGAAGGTC
CTTATGCTGCCGTCGTGGACGGTCGTATTCTCAAGTGGCGAGGCGATGACCTAGGCTGGG
TTGAGTTTGCCCACACATCTCCCCACAGAGGGAACTGTTCAAGCCGTGAAGTAGTGCCTA
CTTGTGGAAGACCATTGGGACTTACTTTTGAGGAGAAAACGGGAGATCTATACATATGCG
ATGGTTACCTAGGGCTCATGAAGGTTGGACC

QA 1 451 1 451
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL5457Contig1 950 2 2 U
TCCGAACTGGTTTTACGCTTGAGGATGCTACTGGTCTAACTGTTACTGGAGATATAGATG
TTCACGCTGTTTTCGCTGGCTCTCTCCCAACCTCGCACCCTGGTTTTGCTCCTCAGAGGC
ATCTTGATCTCTCGAGAAGTTGGCAGGCGCCATCGGTTCCTGATGAAGAAGTTGAGTTAT
TCATCGGTATCCTCTCTGCGGGTAATCATTTTGCTGAGCGGATGGCCGTGAGGAAGTCTT
GGATGCAACATAAACTTATCAGATCTTCCAAAGTGGTGGCTCGGTTCTTTGTGGCATTGC
ACTCGAGGAAGTCAATTAATGAGGAGCTAAAGAAGGAAGCTGAGTTTTTTGGGGACATAA
TTGTAGTGCCTTACTTGGACAGCTATGATCTAGTTGTCCTGAAAACTGTTGCAATTTGCG
AGTATGGGGCTCATCAGTTAGCTGCCAGATACATAATGAAGTGTGACGATGACACATTTG
TCCGAGTAGATGCAGTTCTTAGGGAAGCAAAGAAAACACCCACAGAACGAAGCTTGTACA
TCGGCAACATCAACTATTATCACAAGCCTCTTCGCCAGGGGAAGTGGGCTGTTACCTATG
AGGAATGGCCAGAGGAAGATTATCCACCTTATGCCAATGGTCCTGGCTACATATTATCAA
CTGATATCGCTAGCTTCATTGTTAAAGAGTTCGAGCAACACAAACTAAGGTTATTCAAGA
TGGAAGACGTGAGCGTGGGAATGTGGGTGGAACAGTTCAACAACAGCGTGAAACCTGTGG
ATTATGAGCACAGCATTAGCTTTTGCCAGTTTGGTTGCATAGAGAATTACTTAACGGCGC
ATTATCAATCGCCAAGACAGATGATCTGCTTGTGGGACAAATTGTTATTGACGGGAAAAC
CTCATTGCTGCAACATGAGATGACCCAACGGTGTATGTTTTTTTTCTGTG


BQ
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AF RS1EY56TF U 1
AF RS1EY56JQ C 385
BS 1 697 RS1EY56TF
BS 698 950 RS1EY56JQ

RD RS1EY56TF 703 0 0
TCCGAACTGGTTTTACGCTTGAGGATGCTACTGGTCTAACTGTTACTGGAGATATAGATG
TTCACGCTGTTTTCGCTGGCTCTCTCCCAACCTCGCACCCTGGTTTTGCTCCTCAGAGGC
ATCTTGATCTCTCGAGAAGTTGGCAGGCGCCATCGGTTCCTGATGAAGAAGTTGAGTTAT
TCATCGGTATCCTCTCTGCGGGTAATCATTTTGCTGAGCGGATGGCCGTGAGGAAGTCTT
GGATGCAACATAAACTTATCAGATCTTCCAAAGTGGTGGCTCGGTTCTTTGTGGCATTGC
ACTCGAGGAAGTCAATTAATGAGGAGCTAAAGAAGGAAGCTGAGTTTTTTGGGGACATAA
TTGTAGTGCCTTACTTGGACAGCTATGATCTAGTTGTCCTGAAAACTGTTGCAATTTGCG
AGTATGGGGCTCATCAGTTAGCTGCCAGATACATAATGAAGTGTGACGATGACACATTTG
TCCGAGTAGATGCAGTTCTTAGGGAAGCAAAGAAAACACCCACAGAACGAAGCTTGTACA
TCGGCAACATCAACTATTATCACAAGCCTCTTCGCCAGGGGAAGTGGGCTGTTACCTATG
AGGAATGGCCAGAGGAAGATTATCCACCTTATGCCAATGGTCCTGGCTACATATTATCAA
CTGATATCGCTAGCTTCATTGTTAAAGAGTTCGAGCA
CACAAC

QA 1 697 1 697
DS 

RD RS1EY56JQ 566 0 0
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CCAGATACATAATGAAGTGTGACGATGACACATTTGTCCGAGTAGATGCAGTTCTTAGGG
AAGCAAAGAAAACACCCACAGAACGAAGCTTGTACATCGGCAACATCAACTATTATCACA
AGCCTTTTCGCCAGGGGAAGTGGGCTGTTACCTATGAGGAATGGCCAGAGGAAGATTATC
CACCTTATGCCAATGGTCCTGGCTACATATTATCAACTGATATCGCTAGCTTCATTGTTA
AAGAGTTCGAGCAACACAAACTAAGGTTATTCAAGATGGAAGACGTGAGCGTGGGAATGT
GGGTGGAACAGTTCAACAACAGCGTGAAACCTGTGGATTATGAGCACAGCATTAGCTTTT
GCCAGTTTGGTTGCATAGAGAATTACTTAACGGCGCATTATCAATCGCCAAGACAGATGA
TCTGCTTGTGGGACAAATTGTTATTGACGGGAAAACCTCATTGCTGCAACATGAGATGAC
CCAACGGTGTATGTTTTTTTTCTGTG

QA 1 566 1 566
DS 



AS 1 2

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CTGTTTGACCTCGCTGGGATAATGTGTGGACAATTTGGAATACCGTTTTGGGAGTTCTTT
CTGGCGACTTTGATCGGAAAAGCGATCATCAAAACTCACATACAGACGATATTTATCATC
TGTGTCTGTAACAACCAACTGCTCGATTGGATGGAGAACGAGCTGATCTGGATACTTAGC
CATGTCCCCGGTTTGGCTGCTGTGTTGCCTGGACTCACAGCCAAACTCCATGCCATGAAA
GAAAAGTATATTGATGCACCACCTCCGGTTCCATCTCATATCAAGGTGAAAAGATGGGAT
TTTTCATTTGCATCAATCTGGAATGGGATAGTATGGCTGATGCTCCTCAACTTCTTTGTC
AAGATTGTGACAGCGACTGCACAGAGACACTTGAGGAAGAAGCAAGAGAAAGAAGTAGCT
GCTTTGACTTACTTAGATTGATCTTTCTTCCTTATATGCTCTCCAACATCAAAACTGAAG
AAGGACCAAAACTAATCAAGAAAATGGCAGTTTTTCTTCTTCTCATTTTCGCATCGTTGA
CACATTGTTCTGGTGGGATTTGTACTTTATAGAACATAAAAGGGTTAGGAGGAATTGGGA
TTATGAGATTGCAGGAGGCTTATTTTGACCCTGTGATTCCATTGAGAATGATTTGTTGGA
ATAATTCAGAAAATGG


BQ
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AF RS1FM80TF U 1
AF RS1FM80JQ C 317
BS 1 638 RS1FM80TF
BS 639 736 RS1FM80JQ

RD RS1FM80TF 638 0 0
GCGCATTCGCAGCATTTGAATTTCTTCACCGTCTTGGTTCTTGCTTCGGTCCCAAATCCT
CTGTTTGACCTCGCTGGGATAATGTGTGGACAATTTGGAATACCGTTTTGGGAGTTCTTT
CTGGCGACTTTGATCGGAAAAGCGATCATCAAAACTCACATACAGACGATATTTATCATC
TGTGTCTGTAACAACCAACTGCTCGATTGGATGGAGAACGAGCTGATCTGGATACTTAGC
CATGTCCCCGGTTTGGCTGCTGTGTTGCCTGGACTCACAGCCAAACTCCATGCCATGAAA
GAAAAGTATATTGATGCACCACCTCCGGTTCCATCTCATATCAAGGTGAAAAGATGGGAT
TTTTCATTTGCATCAATCTGGAATGGGATAGTATGGCTGATGCTCCTCAACTTCTTTGTC
AAGATTGTGACAGCGACTGCACAGAGACACTTGAGGAAGAAGCAAGAGAAAGAAGTAGCT
GCTTTGACTTACTTAGATTGATCTTTCTTCCTTATATGCTCTCCAACATCAAAACTGAAG
AAGGACCAAAACTAATCAAGAAAATGGCAGTTTTTCTTCTTCTCATTTTCGCATCGTTGA
CACATTGTTCTGGTGGGATTTGTACTTTATAGAACATA

QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1FM80JQ 420 0 0
CACCACCTCCGGTTCCATCTCATATCAAGGTGAAAAGATGGGATTTTTCATTTGCATCAA
TCTGGAATGGGATAGTATGGCTGATGCTCCTCAACTTCTTTGTCAAGATTGTGACAGCGA
CTGCACAGAGACACTTGAGGAAGAAGCAAGAGAAAGAAGTAGCTGCTTTGACTTACTTAG
ATTGATCTTTCTTCCTTATATGCTCTCCAACATCAAAACTGAAGAAGGACCAAAACTAAT
CAAGAAAATGGCAGTTTTTTTTCTTTTCATTTTCGCATCGTTGACACATTGTTTTGGTGG
GATTTGTACTTTATAGAACATAAAAGGGTTAGGAGGAATTGGGATTATGAGATTGCAGGA
GGCTTATTTTGACCCTGTGATTCCATTGAGAATGATTTGTTGGAATAATTCAGAAAATGG

QA 1 420 1 420
DS 



AS 1 2

CO CL5459Contig1 758 2 3 U
GGGACTAAAAATCAGCTTCGCTTTAATCAGGAACCAAACCAAAACAAAGGAAATAAAATA
AACATAAGAGCCAAGAACTGAAGACTTGATATTTAACCAGAATTCAAGCTATCCGGGAGT
AAATATTGACATGGTCGCATACCTCCGAGCAAAGAACCAACCACATTCCCAGCCACATCC
GCTGTAAACTTCACTGGGATATCGCGGGAAACCACCTTCATGAACCCATACGCAAATTCT
GCCTTCAAACGGACGACACTGTCCACACGATAATTCCAAACCACGCTGCCGTTAACTACC
GGTGTCACCACCTTTTTGAAGTTGGCAACTGTAACCGGCTCATCAGTTTTCTCGAATCCG
AAATCATCCAACAACGGAGATACCTGGGAGATAACCTCATCGCCACGAAGGAGACGCCAC
GTGACTGTATGTAGAGAGAGTTCACACCCTGTGACTGGACTCTTAGCGACCAAACCGGTT
CTCCAATCAGCGGTTGTAACGTTTGCGGCGTTTGTAGCGTTTGAGACGGAGACGGATTGA
GCAAAGAGCTCTATGTAACAAGCATGTTTGCCGTCGAGGAGATAACTCAAGCCTCCCAAG
ACGAGAGTGGAAACGGATACGAAAATAATGATAGAGGAGTAGCAAGAGCACCAATATTTT
GGAGTAATCTCGCAGGACTTATCGTCAGGGCCGCCCGAATCGGTGGTTGAAGCGTGCTCT
ATAGACATTGACATGTTAAAATTCTTAACGTTTTGTCC


BQ
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AF RS1EB88JQ U 28
AF RS1EB88TF C 1
BS 1 40 RS1EB88TF
BS 41 356 RS1EB88JQ
BS 357 758 RS1EB88TF

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AAAACAAAGGAAATAAAATAAACATAAGAGCCAAGAACTGAAGACTTGATATTTAACCAG
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CCACATTCCCAGCCACATCCGCTGTAAACTTCACTGGGATATCGCGGGAAACCACCTTCA
TGAACCCATACGCAAATTCTGCCTTCAAACGGACGACACTGTCCACACGATAATTCCAAA
CCACGCTGCCGTTAACTACCGGTGTCACCACCTTTTTGAAGTTGGCAACTGTAACCGGCT
CATCAGTTTTCTCGAA

QA 14 329 14 329
DS 

RD RS1EB88TF 758 0 0
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AACATAAGAGCCAAGAACTGAAGACTTGATATTTAACCAGAATTCAAGCTATCCGGGAGT
AAATATTGACATGGTCGCATAC*TCCGAGCAAAGAACCAACCACATTCCCAGCCACATCC
GCTGTAAACTTCACTGGGATATCGCGGGAAACCACCTTCATGAACCCATACGCAAATTCT
GCCTTCAAACGGACGACACTGTCCACACGATAATTCCAAACCACGCTGCCGTTAACTACC
GGTGTCACCACCTTTTTGAAGTTGGCAACTGTAACCGGCTCATCAGTTTTCTCGAATCCG
AAATCATCCAACAACGGAGATACCTGGGAGATAACCTCATCGCCACGAAGGAGACGCCAC
GTGACTGTATGTAGAGAGAGTTCACACCCTGTGACTGGACTCTTAGCGACCAAACCGGTT
CTCCAATCAGCGGTTGTAACGTTTGCGGCGTTTGTAGCGTTTGAGACGGAGACGGATTGA
GCAAAGAGCTCTATGTAACAAGCATGTTTGCCGTCGAGGAGATAACTCAAGCCTCCCAAG
ACGAGAGTGGAAACGGATACGAAAATAATGATAGAGGAGTAGCAAGAGCACCAATATTTT
GGAGTAATCTCGCAGGACTTATCGTCAGGGCCGCCCGAATCGGTGGTTGAAGCGTGCTCT
ATAGACATTGACATGTTAAAATTCTTAACGTTTTGTCC

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL5460Contig1 1123 2 2 U
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CTTTCAAGGGAGGAAGCGAATTATTTCTTCGGGATGTGTTTGAGAATATATTGAAGACGT
ACTTGAAGAAGAACCCAACAACGAAAAGGATATGGGAACTGGTTCAGTCGGTGGACAATG
AGAAGATTTGCTACGACCATTTCACTTTCATGACACTTAAGATCGATGGTTATGGAATAG
ACTCAATGTCAAGTTTCTTCATGGATAATGGGTATAAAATAGGAGGTGGTCTTGATTTTC
CAAATAAGAACCTGCGAGGTCTCTGGTTTTCTCCTCCCGATATTAACATCCCTGAGGATG
GTCACGGCCTAAGCAATGGACCCTTACCCCGACTTGTTATGGGAGAGATTCTTGTGACGA
ATTGAGCCCTGCATCACAGGAAATAATAAGGAAGTATCTGAAACCAGCAGGAGGAAAGCA
AGCCCTTCTGTCAAGTATTCTTGGGTCCCTAATATGGGAGAAGCCAACATGGAGCGAATT
TAAGCAAATTGCCGTAGAAAACGAGTTGGCGGCTTGGGCGTTCATCAACGGTTACACAAT
GAATCATCTGGCGTTCGCTGTTCATCGACTTAAGCACCGTTTCAGTGACATCAATTGCAT
CATACAGTATCTAGAGGAAAATGGATTTGACCTCAACCAGGACGGAGGAGTTCTGAAAGT
GAGTACTGATGGGCTACTGATGCAAGTGTCGTCACTCTCGGAGCAGCTTCCGGTAGAATT
TTCAGGCGGTGTAGTCAAATCGGTCCCTGCTTCATACATTGAGTTCACTGAACGTCTTGT
TTTGCCACAGTTCAAAGATCTGTCTCATGATCAGATTAAAGAGATCCATAGACGTGAAGA
CTTTGCGCTCAATAACGCGGACAACATTTTAGAAAGCTCCCGTTTTACGTCAGATGTTTA
GAATCACTTTGGTTTGGTCCAATCCTGTATGAAACAAAAGAGTATTAAGTACTATATATG
TTCACTCTGCGTGCCTTTCTTCTCTATGAAAACGTGAGTCTCGTGTTGAGTAATGATTAC
TCATAAGTTTAGTTACATATATAAGAGCATCATCAATGTTCAG


BQ
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AF RS1E871TF U 1
AF RS1E871JQ C 390
BS 1 700 RS1E871TF
BS 701 1123 RS1E871JQ

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CTTTCAAGGGAGGAAGCGAATTATTTCTTCGGGATGTGTTTGAGAATATATTGAAGACGT
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AGAAGATTTGCTACGACCATTTCACTTTCATGACACTTAAGATCGATGGTTATGGAATAG
ACTCAATGTCAAGTTTCTTCATGGATAATGGGTATAAAATAGGAGGTGGTCTTGATTTTC
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GTCACGGCCTAAGCAATGGACCCTTACCCCGACTTGTTATGGGAGAGATTCTTGTGACGA
ATTGAGCCCTGCATCACAGGAAATAATAAGGAAGTATCTGAAACCAGCAGGAGGAAAGCA
AGCCCTTCTGTCAAGTATTCTTGGGTCCCTAATATGGGAGAAGCCAACATGGAGCGAATT
TAAGCAAATTGCCGTAGAAAACGAGTTGGCGGCTTGGGCGTTCATCAACGGTTACACAAT
GAATCATCTGGCGTTCGCTGTTCATCGACTTAAGCACCGTTTCAGTGACATCAATTGCAT
CATACAGTATCTAGAGGAAAATGGATTTGACCTCAACCAG

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DS 

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TAATATGGGAGAAGCCAACATGGAGCGAATTTAAGCAAATTGCCGTAGAAAACGAGTTGG
CGGCTTGGGCGTTCATCAACGGTTACACAATGAATCATCTGGCGTTCGCTGTTCATCGAC
TTAAGCACCGTTTCAGTGACATCAATTGCATCATACAGTATCTAGAGGAAAATGGATTTG
ACCTCAACCAGGACGGAGGAGTTCTGAAAGTGAGTACTGATGGGCTACTGATGCAAGTGT
CGTCACTCTCGGAGCAGCTTCCGGTAGAATTTTCAGGCGGTGTAGTCAAATCGGTCCCTG
CTTCATACATTGAGTTCACTGAACGTCTTGTTTTGCCACAGTTCAAAGATCTGTCTCATG
ATCAGATTAAAGAGATCCATAGACGTGAAGACTTTGCGCTCAATAACGCGGACAACATTT
TAGAAAGCTCCCGTTTTACGTCAGATGTTTAGAATCACTTTGGTTTGGTCCAATCCTGTA
TGAAACAAAAGAGTATTAAGTACTATATATGTTCACTCTGCGTGCCTTTCTTCTCTATGA
AAACGTGAGTCTCGTGTTGAGTAATGATTACTCATAAGTTTAGTTACATATATAAGAGCA
TCATCAATGTTCAG

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

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TGAAGCCAAAGAATCCGTCACAGCCACTGCAGAATCCGTTGGTGCTTCTCTAACTGATGC
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AGGAGCCAAGTCCTTATTTCATGGTTTGGAGGAGAAGAAGACCGAAATTTCCTCCAAGCT
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AGACCTTCCAATATCCACAGACAATCAGCCTTTGTTAACTGGTGAGCGCGGGGTTGATGC
GACGCCATGGTGGAAAAACTGTTGTGGAGTTCTTGATCTTCTCAAGACATCTACTACAAA
ATAAAAGGTCAAGCTGATGAAGAACAGAGAGAGCACTAGAACAATATATAAAAGCCTTTT
GATTTTTTTATTTCCTTCCTTTTTCTTATTTTGATTTGAGATTGTGTCTTTTTTTTTGAA
ACAAAGTTTGAGATTGTGTCTATGTCTTTGTTTTTATTTGTATTTTGATATGTTGATTGT
TCCCATGAACTTGTGTAAGAAGTAAGAACCAATAAATCCAAAACAAGTAATTTTTTTTGT
GATGAGTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GG86TF U 1
AF RS1GG86JQ C 245
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ATAAAAGGTCAAGCTGATG

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DS 

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GCCAAGTCCTTATTTCATGGTTTGGAGGAGAAGAAGACCGAAATTTCCTCCAAGCTTGTT
GGAGCTGTTACTAATGTCGTTGGTGGAGCATCGAGCAGCACCACCGTGGCAAGCCGAGAC
CTTCCAATATCCACAGACAATCAGCCTTTGTTAACTGGTGAGCGCGGGGTTGATGCGACG
CCATGGTGGAAAAACTGTTGTGGAGTTCTTGATCTTCTCAAGACATTTACTACAAAATAA
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TTTTTATTTCCTTCCTTTTTCTTATTTTGATTTGAGATTGTGTCTTTTTTTTTGAAACAA
AGTTTGAGATTGTGTCTATGTCTTTGTTTTTATTTGTATTTTGATATGTTGATTGTTCCC
ATGAACTTGTGTAAGAAGTAAGAACCAATAAATCCAAAACAAGTAATTTTTTTTGTGATG
AGTG

QA 1 544 1 544
DS 



AS 1 2

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TCTTCACTTTTGTTTAAAAATTTCAAACCACATTCTACATTTGAATTAATGTACTCTAAA
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TTCATATACTCACTAGATTAGTGGAATTAACATTATAAAATCTTCAGAATCTTGAGAAAC
GAAGACAACAGAGGTTCTAAACTCGTTGACAATCATATTATGTTAGTCCTCGATGAAACT
ATACACTAAAACCAGATTTTCAAATTTTTGAAAATTTTCCAAAATCCGTGAGTTAACCCC
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AGTTAAAAAATTTCAAACCACATTCTACATTTGAATTTATGTACTCTAAACTATCTTTCA
TGGTATATAGGAATCATAATAATTTTGTTTAATATTTAGTCTACTAAAATTTCATATACT
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ACCAGATTTTCAAATTTTGGAAAACTTTCCAAAATCCGTAAGTCCCCTTATAAAATAATG
ACCTTTCGTAAATACTCTATATACTGAAGTTTATACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1E165TF U 1
AF RS1E165JQ C 95
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AGTTTTCGTAAATACTCTATATACTGAAGTTTATACT

QA 1 757 1 757
DS 

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ATAAAATCTTCAGTATCTTGAGAAACGGAGACAACAGAGGTTTTAAATTTTTTGACAATT
ATCTTATGTTAGTCCTCGATGAAACTATACACTAAAACCAGATTTTCTTATTTT*GAAAT
TTTTCCAAAATCCGTGAGT***CCCCTTATAAAATAATGAGTTTTCGGTAAATACTCTAT
ATACTGAAGTTTATACTCTTCAATCTAGTTAAAAAATTTCAAACCACATTGTACATTTGA
ATTTATGTACTCTAAACTATCTTTCATGTTATATAGGAATTGTAATAATTTT**TTAATA
TTTATTCTACTAAAGTTTCATATATTGACTAGATTAGTGGAATTAGGATCATAAAATCTT
CATTATCTAGAGAAATGAAGACGACAGAGGTTCTAAACTCTTTGACCATCATATTATGTT
AGTGCTCGATGAAACCATACACTAAAACCAGATTTTCAAATTTTTGAAAACTTTCCAAAA
TCCGTA***CCCCTTCTAAAATTTTGCCC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 2

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ATCTGATTCTCCTCTCTATACTCTTTTGACCAGAAGACAAACCGTGATCCACGATGATCG
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GAGATCCTGTGGAAGAGTTTCAGCCGCTCTGTGAAGTTCAGAGCGATAAAGCTACCATTG
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1FT95TF U 306
AF RS1EZ79TF U 1
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CGGGGGGT
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AGAGTTTCAGCCGCTCTGTGAAGTTCAGAGCGATAAAGCTACCATTGAGATAACTAGTCG
TTTCAAAGGGAAAGTAGCTCTCATTTCACATTCTCCTGGTGACATTATCAAGGTTGGAGA
G

QA 9 309 9 309
DS 

RD RS1EZ79TF 759 0 0
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CACACTTCTTAAAATTAGAACCTAAAAAAGGGGAATCTTATTCATCTTGCTTGTTTCTTC
ATCTGATTCTCCTCTCTATACTCTTTTGACCAGAAGACAAACCGTGATCCACGATGATCG
CGCGGCGGATCTGGCGGAACCATCAGTTTCTCCGCCCATTCAGCTCGTCTTCTTCTGTTT
GCGCTCCGCCTATTCGGGTTCCGGAGTATCGTTCTCAGTCGTTCTCCTCTCCGACGTCGC
GCCCATTCCTTGCTCCTTCCCTCTCCTTGATGAAATGGTGTGGAGGAAGTAGAAGCTGGT
ATTCGAACGAAGCCATGTCCATAGATTCAAATGCGAGAGGAGGGTTCCTTGATGTGCCAC
TTGCACAAACTGGGGAAGGTATTGCTGAATGTGAGCTTCTCAAGTGGTTTGTCAAAGAGG
GAGATCCTGTGGAAGAGTTTCAGCCGCTCTGTGAAGTTCAGAGCGATAAAGCTACCATTG
AGATAACTAGTCGTTTTAAAGGGAAAGTAGCTCTCATTTCACATTCTCCTGGTGACATTA
TCAAGGTTGGAGAGACTCTGGTTAAGCTGGCCGTAGAAGACGCCAACGATGCTCCTCTTC
AAGTATCATCTGACACTCCAGGAAATGTAGAACCGAGCGGTTCAAAGCCAAACTAGACAG
TCTTGTTGGAGCTCTGTCACGCCTGCTGTTCGTACCTTG

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 2

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AAACTGATCATACACAATCTCAAAACGTCAAAAATAGTAAAAGCCAATAGAGAAAGAAGA
ATTTTTTCAAGACGTGGTTGCAGCTTGTAACTGTCTAACCTTACTCTGCAAGACCATCCC
TGCTTCATCTGCCACGCTTTTCTTTTTGGCCAACACCTCAAAAAGCTGTTCATAGTTGGA
TTTCAACAAGTTAATCTTCCTCTGACAATAGTCTTTACCATCATCCATTGTTTTCTCGAT
GAAGTAACCAGTGCCGATGTCAACAAGAACCTTGTCAGCTTCGTCGAGCGTCCCAGGCAC
GTAGAGAGACGCGGTGAGTGGCACGAGCATCTTCTTGCCTTGAGGTCTGAGGGAGAGATC
GTTGAGAGCTCCCGCGGCGGATTCGAGGCGGGCATTGGCTGTGCGGATGTTGTTCAGACT
GTCTTGGAGGAGGTTCACTTCGAGATCCGCTTGCTCCTTCAACGCTTTCAGCTGATCGAT
TCCCATCTTCTCCATCTCTCCTCTCGCCGACGATGATGATGACGCCATTCTCTTTCTTTC
TCTCTTTTAGCGGCGTCTCCTCCGTGTCGGCTGAGCTCTGCGGCCC


BQ
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AF RS1CS38TF C 1
AF RS1CS38JQ U 539
BS 1 538 RS1CS38TF
BS 539 646 RS1CS38JQ

RD RS1CS38TF 646 0 0
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TGCTTCATCTGCCACGCTTTTCTTTTTGGCCAACACCTCAAAAAGCTGTTCATAGTTGGA
TTTCAACAAGTTAATCTTCCTCTGACAATAGTCTTTACCATCATCCATTGTTTTCTCGAT
GAAGTAACCAGTGCCGATGTCAACAAGAACCTTGTCAGCTTCGTCGAGCGTCCCAGGCAC
GTAGAGAGACGCGGTGAGTGGCACGAGCATCTTCTTGCCTTGAGGTCTGAGGGAGAGATC
GTTGAGAGCTCCCGCGGCGGATTCGAGGCGGGCATTGGCTGTGCGGATGTTGTTCAGACT
GTCTTGGAGGAGGTTCACTTCGAGATCCGCTTGCTCCTTCAACGCTTTCAGCTGATCGAT
TCCCATCTTCTCCATCTCTCCTCTCGCCGACGATGATGATGACGCCATTCTCTTTCTTTC
TCTCTTTTAGCGGCGTCTCCTCCGTGTCGGCTGAGCTCTGCGGCCC

QA 1 646 1 646
DS 

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TCTCTCTTTTAGCGGCGTCTCCTCCGTGTCGGCTGAGCTCTGCGGCCC

QA 1 108 1 108
DS 



AS 1 2

CO CL5465Contig1 863 2 2 U
GGAACTCTAGGCAGGCGATAATGGCGTCGAAGCAAGAATACAGCATCCCTTATACACCTC
TTCCTTCATCATCATCACAGCCTTCTCAAACCGTCATCGTTTTAACTCCTTATCGCCGCC
ACCGTCGCCCTTTCTTCCTCCGCAACCCCCGCTGCTCTCTCCTCTTCACCGCCGCAATCC
TCCTCCTCTCCGCCGCCGTTTACCTCCTCTACCCTTCCGATCCAGAAATCAAAGTCTCTC
GAATCCAGCTCAACCACATACGAGTCCTCGATTCGTTTAAACCCACCCTCGATCTCTCGT
TTTCCCTCACGATCAAAGTCAGGAACCGCGACTTCTTCTCCCTTGATTACGATTCGCTCG
TGGTCTCGATCGGGTATAGAGGGAGAGAGCTAGGGCTTGTCAAGTCTAATGGCGGACACC
TTCGCGCTCGTGATAGCTCTTATATTAATGCCACTCTTGAACTCGATGGTCTAGAGGTTG
TTCACGATGTGATTTATTTGATCGGTGATTTGGCTAAAGGAGTTATTCCTTTTGATACTA
TCGCTCAGGTCAAAGGTGATCTTGGTGTTCTTCTCTTTCAAATCCCAATTCAGGGAAAAG
TGTCATGCGAGGTGTTTGTTAATGTTAACAACCAAAAAATTTCACACCAAGATTGTCATC
GTAAGTGAAACAAAATCCTGAGCTGGTCCAAACATGAGAGAGGAGTAGACCAGAGATACA
TATGTTGAATACTTGAATATCTTTTGGATATGGAGAAATGATTTGTAAGATATTTGTATA
GATAAATACTACTGGATTGCCATTTCTTAGTCGTGTAATTTCGTACGTGAACTATACTTT
AACGAGATAGTAACAATTGGGTC


BQ
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AF RS1G776TF U 1
AF RS1G776JQ C 300
BS 1 639 RS1G776TF
BS 640 863 RS1G776JQ

RD RS1G776TF 639 0 0
GGAACTCTAGGCAGGCGATAATGGCGTCGAAGCAAGAATACAGCATCCCTTATACACCTC
TTCCTTCATCATCATCACAGCCTTCTCAAACCGTCATCGTTTTAACTCCTTATCGCCGCC
ACCGTCGCCCTTTCTTCCTCCGCAACCCCCGCTGCTCTCTCCTCTTCACCGCCGCAATCC
TCCTCCTCTCCGCCGCCGTTTACCTCCTCTACCCTTCCGATCCAGAAATCAAAGTCTCTC
GAATCCAGCTCAACCACATACGAGTCCTCGATTCGTTTAAACCCACCCTCGATCTCTCGT
TTTCCCTCACGATCAAAGTCAGGAACCGCGACTTCTTCTCCCTTGATTACGATTCGCTCG
TGGTCTCGATCGGGTATAGAGGGAGAGAGCTAGGGCTTGTCAAGTCTAATGGCGGACACC
TTCGCGCTCGTGATAGCTCTTATATTAATGCCACTCTTGAACTCGATGGTCTAGAGGTTG
TTCACGATGTGATTTATTTGATCGGTGATTTGGCTAAAGGAGTTATTCCTTTTGATACTA
TCGCTCAGGTCAAAGGTGATCTTGGTGTTCTTCTCTTTCAAATCCCAATTCAGGGAAAAG
TGTCATGCGAGGTGTTTGTTAATGTTAACAACCAAAAAA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RS1G776JQ 564 0 0
TTTTCCCTCACGATCAAAGTCAGGAACCGCGACTTCTTCTCCCTTGATTACGATTCGCTC
GTGGTCTCGATCGGGTATAGAGGGAGAGAGCTAGGGCTTGTCAAGTCTAATGGCGGACAC
CTTCGCGCTCGTGATAGCTCTTATATTAATGCCACTCTTGAACTCGATGGTCTAGAGGTT
GTTCACGATGTGATTTATTTGATCGGTGATTTGGCTAAAGGAGTTATTCCTTTTGATACT
ATCGCTCAGGTCAAAGGTGATCTTGGTGTTCTTTTCTTTCAAATCCCAATTCAGGGAAAA
GTGTCATGCGAGGTGTTTGTTAATGTTAACAACCAAAAAATTTCACACCAAGATTGTCAT
CGTAAGTGAAACAAAATCCTGAGCTGGTCCAAACATGAGAGAGGAGTAGACCAGAGATAC
ATATGTTGAATACTTGAATATCTTTTGGATATGGAGAAATGATTTGTAAGATATTTGTAT
AGATAAATACTACTGGATTGCCATTTCTTAGTCGTGTAATTTCGTACGTGAACTATACTT
TAACGAGATAGTAACAATTGGGTC

QA 1 564 1 564
DS 



AS 1 2

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GGAGGTTCGGATCAACCCGAATCAAAGAATACATCAGTGAGATTGGACTGTCCGCCCGCG
TTCCGAGCGGGGATTCTCTAGCCCCGTTGTAGAGTCAAAATGGCGGCCGGTGAACGAAAG
AATCAGCCGTTATCTCCTCCGACGACGATTGTGCAGCCAACTACTCCGACGAAGCGTGTT
TTGATCACTACCCTTCTCGCAGGAGTTATTGGAGGAGGAGCTGGTTTAGTCTCTAAACAC
CGCAAAGCTTATCCCAATATTCCCACTATTTATGCCACCAACTTCGCCATCGTTGCTGGT
TGCTATTACGGAGCTCGTGAGTTTGTGAGGATAACTCGAAGATCAGCACATGATGATGTG
TTGAACTCAACTATTGGAGGGCTTTTCAGTGGTGCTTTGCTTGGAAGACTTCAAGGAGGT
CCATATGGTGCATTGCGGTACTCTGTCATTTTTGCTGCTATGGGCACTGCATCTAACTAT
GCCGGCCATAAAGCAAAAGAAATGTTGGAGAACTACCGTAACAAGGATTCGATCAAGTTG
CCTGAGTGGTTTCCTGTTCAAATACTCGATGAAGAAGCCTTAGCAAAGAAGAAAGCTCGG
GAACAGAAGATATTCGCTGAAAGATCATTTGGGAGATTGAACAAGGAAGAGACTTGACTA
CTTGGATTCATTGTTAGTCTCTAGGTTAGCTGTTTCGTGAATGTAACTCTGTGGTGTTTA
GATGGGACTTGAAGAGGACTTCTTTTGTGTTTCCTATTGGGAAACAAATCTTTTCATTAG
CCTCAAGAAAACCTCGTCTAGAGACAAGTTGTATGGTGACCTACCGTGAACGTATCTATA
TA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1E356TF U 1
AF RS1E356JQ C 306
BS 1 640 RS1E356TF
BS 641 842 RS1E356JQ

RD RS1E356TF 640 0 0
GGAGGTTCGGATCAACCCGAATCAAAGAATACATCAGTGAGATTGGACTGTCCGCCCGCG
TTCCGAGCGGGGATTCTCTAGCCCCGTTGTAGAGTCAAAATGGCGGCCGGTGAACGAAAG
AATCAGCCGTTATCTCCTCCGACGACGATTGTGCAGCCAACTACTCCGACGAAGCGTGTT
TTGATCACTACCCTTCTCGCAGGAGTTATTGGAGGAGGAGCTGGTTTAGTCTCTAAACAC
CGCAAAGCTTATCCCAATATTCCCACTATTTATGCCACCAACTTCGCCATCGTTGCTGGT
TGCTATTACGGAGCTCGTGAGTTTGTGAGGATAACTCGAAGATCAGCACATGATGATGTG
TTGAACTCAACTATTGGAGGGCTTTTCAGTGGTGCTTTGCTTGGAAGACTTCAAGGAGGT
CCATATGGTGCATTGCGGTACTCTGTCATTTTTGCTGCTATGGGCACTGCATCTAACTAT
GCCGGCCATAAAGCAAAAGAAATGTTGGAGAACTACCGTAACAAGGATTCGATCAAGTTG
CCTGAGTGGTTTCCTGTTCAAATACTCGATGAAGAAGCCTTAGCAAAGAAGAAAGCTCGG
GAACAGAAGATATTCGCTGAAAGATCATTTGGGAGATTGA

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1E356JQ 537 0 0
TTACGGAGCTCGTGAGTTTGTGAGGATAACTCGAAGATCAGCACATGATGATGTGTTGAA
CTCAACTATTGGAGGGCTTTTCAGTGGTGCTTTGCTTGGAAGACTTCAAGGAGGTCCATA
TGGTGCATTGCGGTACTCTGTCATTTTTGCTGCTATGGGCACTGCATCTAACTATGCCGG
CCATAAAGCAAAAGAAATGTTGGAGAACTACCGTAACAAGGATTCGATCAAGTTGCCTGA
GTGGTTTCCTGTTCAAATACTCGATGAAGAAGCCTTAGCAAAGAAGAAAGCTCGGGAACA
GAAGATATTCGCTGAAAGATCATTTGGGAGATTGAACAAGGAAGAGACTTGACTACTTGG
ATTCATTGTTAGTCTCTAGGTTAGCTGTTTCGTGAATGTAACTCTGTGGTGTTTAGATGG
GACTTGAAGAGGACTTCTTTTGTGTTTCCTATTGGGAAACAAATCTTTTCATTAGCCTCA
AGAAAACCTCGTCTAGAGACAAGTTGTATGGTGACCTACCGTGAACGTATCTATATA

QA 1 537 1 537
DS 



AS 1 2

CO CL5467Contig1 1002 2 8 U
GGGCCGGAATCATCTTCTTCACACGCTTTCACGGCTTCTTTTTTTTTTGCAATAAACTTT
AGCCGAAGCTTCGTGTTCCAGTGATCGAAGTTGAAAGAAAGAGAGAGCTTAGCGGCGGAG
TCTCGGATGCTAAACAAGCTCACGCGCGACGGTTTCATCTACCGTGCCGGCGTCACGATG
TTATCTTCGTCTACTTCCTCCTCCTCCTCTGCTGCTTTATGGAAGTCTCCGAGATTTCTC
AGCTCCGGTGTGTTCTCGGCTGGCACTTCGAGGAATCGCGTCGCTTTCCCCGTTCGGTTT
CACCGCGCTCAGCTGTTCGATGTTTTGCCTCTTCTGGCGGCGGCTCTGATAGGATTTAGG
TTCAGAACCCAATCGTTGAAATGGATGGTGATGAAATGACGAGGGTGATATGGAGTATGA
TCAAGGATAAACTTATTTTGCCTTATCTGGATCTGGACATCAAGTACTTCGACTTGGGAA
TTCTGAATCGCGATGCTACTGATGACAGAGTTACGGTTGAAAGTGCTGAAGCTGCTCTTA
AGTACAACGTTGCTATCAAATGTGCCACTATAACTCCTGATGAGGGCAGAGTGAAGGAGT
TTGGACTGAAATCAATGTGGCGGAGTCCTAATGGGACAATCAGAAACATTTTGGATGGAA
CTGTCTTCCGTGAACCTATCATGTGTGGCAATATCCCTCGGCTTGTTCCTGGTTGGAGAA
AACCAATATGCATTGGTAGGCATGCCTTTGGCGACCAGTATCGTGCCACTGATGCAGTTA
TTAAAGGGCCAGGAAAGCTGAAAATGGTTTTTGTCCCAGAAGATGGGAGCGCACCTGAGG
AACTAGACGTATATGATTTCAAAGGCCCAGGTGTCGCTCTGGCCATGTACAACGTAGATG
AGTCAATTCGTGCTTTTGCTGAGTCATCTATGGCGATGGCACTTGCAAAGAAATGGCCAC
TATACTTGAGCACCAAGAACACAATTCTCAAGAAATATGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GM54TF U 1
AF RS1DL06TF U 382
BS 1 673 RS1GM54TF
BS 674 674 RS1DL06TF
BS 675 690 RS1GM54TF
BS 691 691 RS1DL06TF
BS 692 721 RS1GM54TF
BS 722 722 RS1DL06TF
BS 723 733 RS1GM54TF
BS 734 1002 RS1DL06TF

RD RS1GM54TF 733 0 0
GGGCCGGAATCATCTTCTTCACACGCTTTCACGGCTTCTTTTTTTTTTGCAATAAACTTT
AGCCGAAGCTTCGTGTTCCAGTGATCGAAGTTGAAAGAAAGAGAGAGCTTAGCGGCGGAG
TCTCGGATGCTAAACAAGCTCACGCGCGACGGTTTCATCTACCGTGCCGGCGTCACGATG
TTATCTTCGTCTACTTCCTCCTCCTCCTCTGCTGCTTTATGGAAGTCTCCGAGATTTCTC
AGCTCCGGTGTGTTCTCGGCTGGCACTTCGAGGAATCGCGTCGCTTTCCCCGTTCGGTTT
CACCGCGCTCAGCTGTTCGATGTTTTGCCTCTTCTGGCGGCGGCTCTGATAGGATTTAGG
TTCAGAACCCAATCGTTGAAATGGATGGTGATGAAATGACGAGGGTGATATGGAGTATGA
TCAAGGATAAACTTATTTTGCCTTATCTGGATCTGGACATCAAGTACTTCGACTTGGGAA
TTCTGAATCGCGATGCTACTGATGACAGAGTTACGGTTGAAAGTGCTGAAGCTGCTCTTA
AGTACAACGTTGCTATCAAATGTGCCACTATAACTCCTGATGAGGGCAGAGTGAAGGAGT
TTGGACTGAAATCAATGTGGCGGAGTCCTAATGGGACAATCAGAAACATTTTGGATGGAA
CTGTCTTCCGTGA*CCTATCATGTGTGGCA*TATCCCTCGGCTTGTTCCTGGTTGGAGAA
A*CCAATATGCAT

QA 1 733 1 733
DS 

RD RS1DL06TF 621 0 0
G
GGATGGTGATGAAATGACGAGGGTGATATGGAGTATGATCAAGGATAAACTTATTTTGCC
TTATCTGGATCTGGACATCAAGTACTTCGACTTGGGAATTCTGAATCGCGATGCTACTGA
TGACAGAGTTACGGTTGAAAGTGCTGAAGCTGCTCTTAAGTACAACGTTGCTATCAAATG
TGCCACTATAACTCCTGATGAGGGCAGAGTGAAGGAGTTTGGACTGAAATCAATGTGGCG
GAGTCCTAATGGGACAATCAGAAACATTTTGGATGGAACTGTCTTCCGTGAACCTATCAT
GTGTGGCAATATCCCTCGGCTTGTTCCTGGTTGGAGAAAACCAATATGCATTGGTAGGCA
TGCCTTTGGCGACCAGTATCGTGCCACTGATGCAGTTATTAAAGGGCCAGGAAAGCTGAA
AATGGTTTTTGTCCCAGAAGATGGGAGCGCACCTGAGGAACTAGACGTATATGATTTCAA
AGGCCCAGGTGTCGCTCTGGCCATGTACAACGTAGATGAGTCAATTCGTGCTTTTGCTGA
GTCATCTATGGCGATGGCACTTGCAAAGAAATGGCCACTATACTTGAGCACCAAGAACAC
AATTCTCAAGAAATATGATG

QA 2 621 2 621
DS 



AS 1 2

CO CL5468Contig1 1053 2 2 U
GGCAGATGATGGACCTGGATCTCTCCGCGAAGGAGGAAGGAGGAGAGAGCCGTTATGGAT
CGTGTTCGCGGTTTCCGGAACTATACATCTCAATTCGTACTTGAGCGTGTCGTCTCACAA
GACGATCGATGGGAGAGGACAACGGATCAAGATCACAGGGAAAGGGATAAGGCTCAAGGA
ATGCGAACATATCATCATTTGCAATTTGGAGTTTGAAGGTGGAAGAGGGCATGATGTTGA
TGGGATTCAGATTAAGCCGAAGTCTAGACACATTTGGATTGATAGGTGTAGCTTGAGGGA
TTACGATGATGGACTTATTGATATCACTAGGCAGAGCACTGATATCACCGTTTCTAGATG
TTACTTTGGGCAGCATGATAAGACGATGTTGATTGGGGCGGATCCTTCTCATGTTGATGA
TAGATGCATCAGAGTGACTATTCATCATTGTTTCTTTGATGGAACTAGGCAGAGGCATCC
TCGTCTCAGGTTTGGTAAAGTTCATTTGTATAACAATTATACAAGAAACTGGGGGATATA
TGCTGTTTGTGCTAGCGTTGAAGCACAGGTATTTTCTCAATGCAATATATACGAAGCAGG
AGGGAAGAAGAAAACTTTTGAGTACTACCCAGAGAAGGCTGCTGACAAGGAAGAAGTAAG
AGCTGGGTTGGTTCGATCTGAGAATGACTTGTTCTTGAACGGAGCTCAAGCTTCCTTGTT
GACAGGGGCCGGTGGAGAATGTGTGTTCCATCCAAGCGAGCATTACCCGACTTGGACCGT
GGAGCCTCCATCTGATACTCTCAAGCAAATCATCAAAATCTGTACTGGTTGGCAATCTTT
ATCTTCTCCTTCAGATCATGGAGTTCCCAAGTAGTTGTTGCAATCCGTTTTTGTTTTGTT
GCGTATCTTATTTTCTTTATTTTCTAGTTATTTGAGGAGTGAACAATGCTTTATGTTCTA
AACACATTATATGCTATTTGTGATGAGAAACTCGGTTAAATATTTTAAATATGTAAACAA
TTTTGGTTTTTATCTTCATTTTCTATTGCACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GA18TF U 1
AF RS1GA18JQ C 260
BS 1 595 RS1GA18TF
BS 596 1053 RS1GA18JQ

RD RS1GA18TF 595 0 0
GGCAGATGATGGACCTGGATCTCTCCGCGAAGGAGGAAGGAGGAGAGAGCCGTTATGGAT
CGTGTTCGCGGTTTCCGGAACTATACATCTCAATTCGTACTTGAGCGTGTCGTCTCACAA
GACGATCGATGGGAGAGGACAACGGATCAAGATCACAGGGAAAGGGATAAGGCTCAAGGA
ATGCGAACATATCATCATTTGCAATTTGGAGTTTGAAGGTGGAAGAGGGCATGATGTTGA
TGGGATTCAGATTAAGCCGAAGTCTAGACACATTTGGATTGATAGGTGTAGCTTGAGGGA
TTACGATGATGGACTTATTGATATCACTAGGCAGAGCACTGATATCACCGTTTCTAGATG
TTACTTTGGGCAGCATGATAAGACGATGTTGATTGGGGCGGATCCTTCTCATGTTGATGA
TAGATGCATCAGAGTGACTATTCATCATTGTTTCTTTGATGGAACTAGGCAGAGGCATCC
TCGTCTCAGGTTTGGTAAAGTTCATTTGTATAACAATTATACAAGAAACTGGGGGATATA
TGCTGTTTGTGCTAGCGTTGAAGCACAGGTATTTTCTCAATGCAATATATACGAA

QA 1 595 1 595
DS 

RD RS1GA18JQ 794 0 0
AAGTCTAGACACATTTGGATTGATAGGTGTAGCTTGAGGGATTACGATGATGGACTTATT
GATATCACTAGGCAGAGCACTGATATCACCGTTTCTAGATGTTACTTTGGGCAGCATGAT
AAGACGATGTTGATTGGGGCGGATCCTTCTCATGTTGATGATAGATGCATCAGAGTGACT
ATTCATCATTGTTTCTTTGATGGAACTAGGCAGAGGCATCCTCGTCTCAGGTTTGGTAAA
GTTCATTTGTATAACAATTATACAAGAAACTGGGGGATATATGCTGTTTGTGCTAGCGTT
GAAGCACAGGTATTTTCTCAATGCAATATATACGAAGCAGGAGGGAAGAAGAAAACTTTT
GAGTACTACCCAGAGAAGGCTGCTGACAAGGAAGAAGTAAGAGCTGGGTTGGTTCGATCT
GAGAATGACTTGTTCTTGAACGGAGCTCAAGCTTCCTTGTTGACAGGGGCCGGTGGAGAA
TGTGTGTTCCATCCAAGCGAGCATTACCCGACTTGGACCGTGGAGCCTCCATCTGATACT
CTCAAGCAAATCATCAAAATCTGTACTGGTTGGCAATCTTTATCTTCTCCTTCAGATCAT
GGAGTTCCCAAGTAGTTGTTGCAATCCGTTTTTGTTTTGTTGCGTATCTTATTTTCTTTA
TTTTCTAGTTATTTGAGGAGTGAACAATGCTTTATGTTCTAAACACATTATATGCTATTT
GTGATGAGAAACTCGGTTAAATATTTTAAATATGTAAACAATTTTGGTTTTTATCTTCAT
TTTCTATTGCACGC

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

CO CL5469Contig1 346 2 1 U
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ATCTATGAGCAATACGAGCTTGAGCTGTACCACATAGCCCGGATCTTCATCGAACGCTTA
GCAGTTGTTAAAGAAGTGGTGCTGAAGAATCTGCCTCTACCTGATGGTTCATCTAAACCA
ATGTTCATGTGAAAGCTTTCAAGTCCAGGAAACAATCTCAGAGACTAACCAGCAGTTATT
AAATGTCTATGTAACTGGCAAAGATGCTATTAAAAAGTCCTTATTTTCAGACTGTAATCC
TGGTGACATGAACAGTATCTCTTACTGAGACAATTTCGTGGTGTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CA93JQ C 1
AF RS1CA93TF U 1
BS 1 346 RS1CA93TF

RD RS1CA93JQ 346 0 0
GCACGTTCCTTGGCAACATTTATTTTCACAGCGATGTCATTTTCGTTCACTGCTTTCTTC
ATCTATGAGCAATACGAGCTTGAGCTGTACCACATAGCCCGGATCTTCATCGAACGCTTA
GCAGTTGTTAAAGAAGTGGTGCTGAAGAATCTGCCTCTACCTGATGGTTCATCTAAACCA
ATGTTCATGTGAAAGCTTTCAAGTCCAGGAAACAATCTCAGAGACTAACCAGCAGTTATT
AAATGTCTATGTAACTGGCAAAGATGCTATTAAAAAGTCCTTATTTTCAGACTGTAATCC
TGGTGACATGAACAGTATTTCTTACTGAGACAATTTCGTGGTGTCC

QA 1 346 1 346
DS 

RD RS1CA93TF 346 0 0
GCACGTTCCTTGGCAACATTTATTTTCACAGCGATGTCATTCTCGTTCACTGCTTTCTTC
ATCTATGAGCAATACGAGCTTGAGCTGTACCACATAGCCCGGATCTTCATCGAACGCTTA
GCAGTTGTTAAAGAAGTGGTGCTGAAGAATCTGCCTCTACCTGATGGTTCATCTAAACCA
ATGTTCATGTGAAAGCTTTCAAGTCCAGGAAACAATCTCAGAGACTAACCAGCAGTTATT
AAATGTCTATGTAACTGGCAAAGATGCTATTAAAAAGTCCTTATTTTCAGACTGTAATCC
TGGTGACATGAACAGTATCTCTTACTGAGACAATTTCGTGGTGTCC

QA 1 346 1 346
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5471Contig1 1112 2 2 U
GGCTTGTGTAACGCAGCTTAGCATTAGCCATCCTACGCTTGCTGCAGATATGCAGAGTCT
GTGTGGTATGAGTTCGTCTATTGGGTCCTTGGTTGGTTTCTCACTTAGTGGCGTTTTGGT
TCACTTGTTTGGGTCCAAGGGTGTGTACGGTTTACTTGGTTTGACTGCAGGATTGATTGT
TGTGGTTGGGTTGCTTCTGAAAGAATCTCCTTCCCGTAGTCCAGGTCGCAAGCATGTGAA
TGAGAAGTTTATAGACGCCGGAAGTGCGATATGGAAAACCTTTCAATATGGTGAGGTGTG
GCGCCCATGCTTGTTCATGTTGTTGTCAGCTGCAGTGAGCTTGCACATTCATGAAGGCAT
GTTCTATTGGTACACAGATTCAAAGGATGGGCCTTCCTTCTCTAAGGAAGCAGTTGGATC
CATTATGTCTTTTGGTGCAATTGGCTCACTGATGGGTATACTGCTTTATCAGAACTTTCT
GAAGAACTTCCCTTTCAGGAATGTAGTCTTCTGGGCACTTTCCCTATCTGTCCTGTCAGG
ATTTCTGGACTTGATCCTTGTGCTACGCATAAATCTGAAGCTAGGTGTACCTGATTACTT
CTTCATTGTGGTAGATGAGTTTGTTTCACATATGATCAGTAGAATCAAGTGGCTACCCTT
GCTTGTTTTCAGTTCCAAGCTCTGCCCTTCTGGTATGGAAGGCACTTTCTTTGCTTTGCT
CATGTCTATTGAACATGTAGGCCACCTGCTGTCGTCATGGGGAGGAGGAGTATTGCTACA
CGCCTTGAAAGTTACACGTACTCAGTTTGATAATCTCTGGTTGGTTATTGTGATCAGGAG
TTTACTGAGGGTAATTCCAATAGGTTTGGTCTTTTTGATACCAAACGTTGATCCCAGCTC
AACGATTCTTCCGGCTGATATGTTAATGAACAGAAGAAGTGAAGATGTGGTTGAAACTGA
CAAGATAGAGATGACTGCTCTGTTAAATAATGAAGCTTGATCCAGATTCTTAGACAAACC
TATCTAGTGGATTTCACTTAGATGTATTTGTTTGTTCATCTGTTTTAGATAATTTTTCTT
CCTTGCAGAATATCATTAAAGCATTGTTTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BH83TF U 1
AF RS1BH83JQ C 328
BS 1 665 RS1BH83TF
BS 666 1112 RS1BH83JQ

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GTGTGGTATGAGTTCGTCTATTGGGTCCTTGGTTGGTTTCTCACTTAGTGGCGTTTTGGT
TCACTTGTTTGGGTCCAAGGGTGTGTACGGTTTACTTGGTTTGACTGCAGGATTGATTGT
TGTGGTTGGGTTGCTTCTGAAAGAATCTCCTTCCCGTAGTCCAGGTCGCAAGCATGTGAA
TGAGAAGTTTATAGACGCCGGAAGTGCGATATGGAAAACCTTTCAATATGGTGAGGTGTG
GCGCCCATGCTTGTTCATGTTGTTGTCAGCTGCAGTGAGCTTGCACATTCATGAAGGCAT
GTTCTATTGGTACACAGATTCAAAGGATGGGCCTTCCTTCTCTAAGGAAGCAGTTGGATC
CATTATGTCTTTTGGTGCAATTGGCTCACTGATGGGTATACTGCTTTATCAGAACTTTCT
GAAGAACTTCCCTTTCAGGAATGTAGTCTTCTGGGCACTTTCCCTATCTGTCCTGTCAGG
ATTTCTGGACTTGATCCTTGTGCTACGCATAAATCTGAAGCTAGGTGTACCTGATTACTT
CTTCATTGTGGTAGATGAGTTTGTTTCACATATGATCAGTAGAATCAAGTGGCTACCCTT
GCTTG

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DS 

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TGGGCCTTCCTTCTCTAAGGAAGCAGTTGGATCCATTATGTCTTTTGGTGCAATTGGCTC
ACTGATGGGTATACTGCTTTATCAGAACTTTCTGAAGAACTTCCCTTTCAGGAATGTAGT
CTTCTGGGCACTTTCCCTATCTGTCCTGTCAGGATTTCTGGACTTGATCCTTGTGCTACG
CATAAATCTGAAGCTAGGTGTACCTGATTACTTCTTCATTGTGGTAGATGAGTTTGTTTC
ACATATGATCAGTAGAATCAAGTGGCTACCCTTGCTTGTTTTCAGTTCCAAGCTCTGCCC
TTCTGGTATGGAAGGCACTTTCTTTGCTTTGCTCATGTCTATTGAACATGTAGGCCACCT
GCTGTCGTCATGGGGAGGAGGAGTATTGCTACACGCCTTGAAAGTTACACGTACTCAGTT
TGATAATCTCTGGTTGGTTATTGTGATCAGGAGTTTACTGAGGGTAATTCCAATAGGTTT
GGTCTTTTTGATACCAAACGTTGATCCCAGCTCAACGATTCTTCCGGCTGATATGTTAAT
GAACAGAAGAAGTGAAGATGTGGTTGAAACTGACAAGATAGAGATGACTGCTCTGTTAAA
TAATGAAGCTTGATCCAGATTCTTAGACAAACCTATCTAGTGGATTTCACTTAGATGTAT
TTGTTTGTTCATCTGTTTTAGATAATTTTTCTTCCTTGCAGAATATCATTAAAGCATTGT
TTCAT

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

CO CL5472Contig1 1195 2 6 U
GGGCTCCTCCTTTAGGTCTCTCCGAATCATCATTCTCATTTCACTTTCCTCTCTTTCTAT
CTATCTCTCTGAGCTCTAGACGACTCTTCTTCGTCAGATTACTCGATTAGTTTCTTTTTT
TTCCGTCTGCTTGCGTAATAGATAGATTTCAAAGAAATAATTTTTCTTCTTATCATCTGA
TCTCTCGTTCTCAGATTCTGGGGGAGCCAATTTTCTTCTTCTTTTCTCTTCCTTTCGCCA
TGAGTTCCTCGATCCAGATCGTTGTTGAGACGCAAGTGGAAGCTTCTTTGTCTCTTAAAG
ATCAGGATGAAAAGAAGACTGAAGTAGTGAGCAACGAGCTGAGTTTCGGGAACCATGGCG
GATGCTGTGCAATATGTTTGGATACTATACCTCTTCAAGAAACTGCTATGGTCAAAGGCT
GTGAACATGCTTACTGTGTGACGTGTATACTCCGTTGGGCAAGTTACAAAGAGAAACCTA
CCTGCCCACAATGTAAGCATCCATTTGATTTTCTCAATCTCCACCGCGCTCTTGATGGAA
GCGTTGAAGATTTCATGTTCGAGGAGAGCGTCTGCCTCCTCCTAAGAGCATCGTGGTTTC
CTCACTAGAAGCAGTGGAACGAGTATCATACAACGGCAACGACAACTATGACTTCGACAT
TCCACCGGAGTACGAAGAGGAAGACGAAGATGACCTTGACGAGTTTTATCTGCACGGTTC
GAATCTTCGTTTAGGAAACAGGAGGTGGGGAGACAACGGATTCGTCAGGTCAGGCCGCCA
AGAAGCAAGGCCGGCTCAAGCCCAACATAAGCACCACCGAGGTGGCCAAGCCTCTGGTTC
CGAATCAGGCTCTTCTTCTTCTTCCTCGCGTGAGGTAAAGGAGAAGACTAACAGCAGTCC
TGCAACGGGTAGGCGTGCCAAGAGGGCGATGAAGCGTGAAGCTGCGAACAAAGCTGCAGA
AGTAGTTGCTGCTGCAAAGCATGAGGCTCTTTTGGTTAGGCTGGGAAGGAAGTGAGTGAT
GGTTGTATCTCTGTAATTAAAATCAAGCCACAACCTCTAAATGCAACTAACTTCTTTACT
AATCTGTACAGCAATTAGTGTTCAATAATGGTCGAACGACAAGACTTGCTTTATCTTTGT
CGTCGAAGATACTTTGTTAGAGTTTTATTTGTTTAATCTCACAAATTTCTTGATC


BQ
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AF RS1E643TF U 1
AF RS1E643JQ C 365
BS 1 681 RS1E643TF
BS 682 682 RS1E643JQ
BS 683 687 RS1E643TF
BS 688 688 RS1E643JQ
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BS 713 1195 RS1E643JQ

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CTATCTCTCTGAGCTCTAGACGACTCTTCTTCGTCAGATTACTCGATTAGTTTCTTTTTT
TTCCGTCTGCTTGCGTAATAGATAGATTTCAAAGAAATAATTTTTCTTCTTATCATCTGA
TCTCTCGTTCTCAGATTCTGGGGGAGCCAATTTTCTTCTTCTTTTCTCTTCCTTTCGCCA
TGAGTTCCTCGATCCAGATCGTTGTTGAGACGCAAGTGGAAGCTTCTTTGTCTCTTAAAG
ATCAGGATGAAAAGAAGACTGAAGTAGTGAGCAACGAGCTGAGTTTCGGGAACCATGGCG
GATGCTGTGCAATATGTTTGGATACTATACCTCTTCAAGAAACTGCTATGGTCAAAGGCT
GTGAACATGCTTACTGTGTGACGTGTATACTCCGTTGGGCAAGTTACAAAGAGAAACCTA
CCTGCCCACAATGTAAGCATCCATTTGATTTTCTCAATCTCCACCGCGCTCTTGATGGAA
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DS 

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ACATGCTTACTGTGTGACGTGTATACTCCGTTGGGCAAGTTACAAAGAGAAACCTACCTG
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TGAAGATTTCATGTTCGAGGAGAGCGTCTGCCTCCTCCTAAGAGCATCGTGGTTTCCTCA
CTAGAAGCAGTGGAACGAGTATCATACAACGGCAACGACAACTATGACTTCGACATTCCA
CCGGAGTACGAAGAGGAAGACGAAGATGACCTTGACGAGTTTTATCTGCACGGTTCGAAT
CTTCGTTTAGGAAACAGGAGGTGGGGAGACAACGGATTCGTCAGGTCAGGCCGCCAAGAA
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ACGGGTAGGCGTGCCAAGAGGGCGATGAAGCGTGAAGCTGCGAACAAAGCTGCAGAAGTA
GTTGCTGCTGCAAAGCATGAGGCTCTTTTGGTTAGGCTGGGAAGGAAGTGAGTGATGGTT
GTATCTCTGTAATTAAAATCAAGCCACAACCTCTAAATGCAACTAACTTCTTTACTAATC
TGTACAGCAATTAGTGTTCAATAATGGTCGAACGACAAGACTTGCTTTATCTTTGTCGTC
GAAGATACTTTGTTAGAGTTTTATTTGTTTAATCTCACAAATTTCTTGATC

QA 1 831 1 831
DS 



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GTACTCTCTCTTCTTCGCGAACTGCGCTCCCGAGACTAAAGTCTCCATGGCGGTTCGAAC
CGAGATGTACAACAAAGATCCGAACGGATCTAAAGACTACTTACCCGCCGGAGCCACACA
GCTACCGTCTCTCTACTCTTTCTTCTTCCTCTGCTACGCAACCTTCCTCGGCTTGGGGAT
ACACTTGTTATACCAACAAGCGAGTCGTTCACCGGATCCATCTCCTCATGGCAGGTTTAC
TTCTAATCGAATCGTTGAATCTGATCTGTGCAGCTGAAGACAAACACTACGTGAAGATCA
CGGGGACGCCTCACGGATGGGACATCCTCTTCTACATCTTCCAGTTCATCCGAGTCGTGC
TCCTCTTCACCGTGATCATCTTGATCGGAACCGGATGGTCGTTCTTGAAGCCGTTCTTGC
AGGAGAAGGAGAAGAACGTGTTGATGATTGTGATCCCTCTTCAGGTACTTGCCAACATTG
CTTCGATTGTGATCGGTGAGACCGGACCTTTTATTAAGGATTGGGTTACTTGGAACCAAG
TGTTCTTGCTTGTTGATATCATATGCTGCTGTGCGATTATCTTCCCTATCGTTTGGTCGA
TTAGAGCGTTGAGGGAAACTTCGAAAACCGATGGTAAAGCGGCGAGGAATCTGTCGAAGC
TGACGTTGTTTAGGCAGTTCTACATTGTTGTCATTGGGTATTTATACTTCACGAGGATTG
TTGTGTTTGCGCTTAAGACGATTGCGGCGTATAAGTACCAGTGGGTGAGTTTTGCAGCGG
AGGAGATTGTGAGCTTGGTGTTCTATTTGATTATGTTTTATATGTTTAGGCCTGAGGAGA
AGAATGAGTACTTTGCTGTTGATGATGATGAAGAAGAAGCTGCTGCTATTGCCCTTAGAG
ACGATGAGTTTGAGCTTTGAGATAAAAAAAAGGGCAAAAGTCTGAGGCTCTGGAAGACAC
TGAGTATGTCTTATGTTAATGTCGGCTAATATTGCAACTACCTTCTTTTTTTATTCTGTG
TGTTAAATTTTGTTCTTCTTTACATTGAAAACTCCATTGTTACAAACGTTCAACACTTTT
TTTATAGCTTTAATCGTTGCAAATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F313TF U 1
AF RS1F313JQ C 402
BS 1 686 RS1F313TF
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BS 709 1166 RS1F313JQ

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GCTACCGTCTCTCTACTCTTTCTTCTTCCTCTGCTACGCAACCTTCCTCGGCTTGGGGAT
ACACTTGTTATACCAACAAGCGAGTCGTTCACCGGATCCATCTCCTCATGGCAGGTTTAC
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CGGGGACGCCTCACGGATGGGACATCCTCTTCTACATCTTCCAGTTCATCCGAGTCGTGC
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CTTCGATTGTGATCGGTGAGACCGGACCTTTTATTAAGGATTGGGTTACTTGGAACCAAG
TGTTCTTGCTTGTTGATATCATATGCTGCTGTGCGATTATCTTCCCTATCGTTTGGTCGA
TTAGAGCGTTGAGGGAAACTTCGAAA*CCGATGGTAAAGCGGCGAGGA
TCTGTCGAGCTGACG

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DS 

RD RS1F313JQ 765 0 0
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CAGGTACTTGCCAACATTGCTTCGATTGTGATCGGTGAGACCGGACCTTTTATTAAGGAT
TGGGTTACTTGGAACCAAGTGTTCTTGCTTGTTGATATCATATGCTGCTGTGCGATTATC
TTCCCTATCGTTTGGTCGATTAGAGCGTTGAGGGAAACTTCGAAAACCGATGGTAAAGCG
GCGAGGAATCTGTCGAAGCTGACGTTGTTTAGGCAGTTCTACATTGTTGTCATTGGGTAT
TTATACTTCACGAGGATTGTTGTGTTTGCGCTTAAGACGATTGCGGCGTATAAGTACCAG
TGGGTGAGTTTTGCAGCGGAGGAGATTGTGAGCTTGGTGTTCTATTTGATTATGTTTTAT
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GCTGCTATTGCCCTTAGAGACGATGAGTTTGAGCTTTGAGATAAAAAAAAGGGCAAAAGT
CTGAGGCTCTGGAAGACACTGAGTATGTCTTATGTTAATGTCGGCTAATATTGCAACTAC
CTTCTTTTTTTATTCTGTGTGTTAAATTTTGTTCTTCTTTACATTGAAAACTCCATTGTT
ACAAACGTTCAACACTTTTTTTATAGCTTTAATCGTTGCAAATTC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CTCTTCCCCTTTTTGTGCTTTGGGATCGGCTTTATCCTAAACACAATTGCCATATTCTAT
GGATCCCTTGCGGCTATTCCTTTCGGGACATTGGTAGTTGTGTTTGTAATTTGGGGTTTC
ATTTCCTTCCCCTTAGCCCTCCTCGGGACAGTCGTTGGGAGAAACTGGAGTGGTGCTCCA
AACAATCCATGCCGTGTGAAGACCATTCCACGTCCAATCCCTGAGAAAAAATGGTACTTG
ACTCCATCGGTTGTCTCCCTGATGGGAGGTTTGCTACCATTTGGAAGCATATTCATTGGG
ATGTACTTCGTCTTCACATCCTTCTGGAATTACAAGGTGTACTACGTGTAAGGATTCATG
CTGCTGGTGTTTGTGATTCTGGTCATAGTGACGGTCTGTGTGACAATAGTGGGAACGTAT
TTCCTGCTGAATGCAGAGAATTATCACTGGCAATGGACTTCGTTTTTCTCTGCTGCATCA
ACGGCCGTCTATGTCTACCTATACTCCATCTATTACTACTACGAGAAGACGAAGATGTCA
GGATTCTTCCAGACAAGCTTCTACTTTGGGTACACCATGATGTTCTGTCTTGGCCTTGGA
ATCCTTTGCGGAGCTGTTGGATTCTTGGGATCAAACCTGTTTGTGAGGAGAATCTACAGA
AACATCAAATGCGACTAGAGGAAAAAAAACATCCAGTTGAGAAGGAAGGAAGCTTGTTAT
GGTGGACATACATCTCTATATAAAAAAGCAGTAGAGAGGGAGAATATATACATGTATCAT
CCTTCAATGGGGGCTTTTTGTCAGTCTTATTTTATTCCCAATTTGGTAAGTGAACTGTTT
TTTCTATTTAGATTAGAATTTGAGTGGGTGTAATATACAACAACACAACTACTGCTACTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D757TF U 1
AF RS1D757JQ C 357
BS 1 694 RS1D757TF
BS 695 960 RS1D757JQ

RD RS1D757TF 702 0 0
GGAATGTACTCAAGAAGCGGGGGTAAGCACTGGATCAAATGCATGGTCCTCACGGCATCT
CTCTTCCCCTTTTTGTGCTTTGGGATCGGCTTTATCCTAAACACAATTGCCATATTCTAT
GGATCCCTTGCGGCTATTCCTTTCGGGACATTGGTAGTTGTGTTTGTAATTTGGGGTTTC
ATTTCCTTCCCCTTAGCCCTCCTCGGGACAGTCGTTGGGAGAAACTGGAGTGGTGCTCCA
AACAATCCATGCCGTGTGAAGACCATTCCACGTCCAATCCCTGAGAAAAAATGGTACTTG
ACTCCATCGGTTGTCTCCCTGATGGGAGGTTTGCTACCATTTGGAAGCATATTCATTGGG
ATGTACTTCGTCTTCACATCCTTCTGGAATTACAAGGTGTACTACGTGTAAGGATTCATG
CTGCTGGTGTTTGTGATTCTGGTCATAGTGACGGTCTGTGTGACAATAGTGGGAACGTAT
TTCCTGCTGAATGCAGAGAATTATCACTGGCAATGGACTTCGTTTTTCTCTGCTGCATCA
ACGGCCGTCTATGTCTACCTATACTCCATCTATTACTACTACGAGAAGACGAAGATGTCA
GGATTCTTCCAGACAAGCTTCTACTTTGGGTACACCATGATGTTCTGTCTTGGCCTTGGA
ATCCTTTGCGGAGCTGTTGGATTCTTGGGATCAA
CCTGTTTG

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DS 

RD RS1D757JQ 604 0 0
TGGGATGTACTTCGTCTTCACATCCTTCTGGAATTACAAGGTGTACTACGTGTAAGGATT
CATGCTGCTGGTGTTTGTGATTCTGGTCATAGTGACGGTCTGTGTGACAATAGTGGGAAC
GTATTTCCTGCTGAATGCAGAGAATTATCACTGGCAATGGACTTCGTTTTTTTCTGCTGC
ATCAACGGCCGTCTATGTCTACCTATACTCCATCTATTACTACTACGAGAAGACGAAGAT
GTCAGGATTCTTCCAGACAAGCTTCTACTTTGGGTACACCATGATGTTCTGTCTTGGCCT
TGGAATCCTTTGCGGAGCTGTTGGATTCTTGGGATCAAACCTGTTTGTGAGGAGAATCTA
CAGAAACATCAAATGCGACTAGAGGAAAAAAAACATCCAGTTGAGAAGGAAGGAAGCTTG
TTATGGTGGACATACATCTCTATATAAAAAAGCAGTAGAGAGGGAGAATATATACATGTA
TCATCCTTCAATGGGGGCTTTTTGTCAGTCTTATTTTATTCCCAATTTGGTAAGTGAACT
GTTTTTTCTATTTAGATTAGAATTTGAGTGGGTGTAATATACAACAACACAACTACTGCT
ACTA

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 2

CO CL5476Contig1 1179 2 2 U
GGATACTTCCAAGCTTTTCTCTCACAAAGAGGACGAACAAAAAATGTATGCAGATTCAGG
GTTAATGCCCCGTTACGTGCAAACTTGTTCTCCAGATATTCACCAATTTGAAGACCTCTT
CAAATCATACAAGCTCTCGGATGAAGAAATGAGAAATGGTTTTGCTGAACGATCAAACCT
ACCTGAGTATGATATTGGAGAAGAAGGAGATCTCTTCAACGCTCCTGATTCAATTCTTGA
AGAGCCAATCTTAACCGTTGATCCGCTCTCAGCTGCCTTAACGATGATCTCTTGCGGGGA
AGACTCTTCCCAAGGGCTTTGTGATCTTCCTGACCTCGATCTCGGGTCGTTTCAGAGCGA
TCAGCAGCTTCTTGACAATGCCTTCTATGAATGCGAGCAAGATCTCATGATGAAATCAGC
TACGATGGAGTCTCCACTATCTGAAGTTTTGGACGTCAAGAACATCTCTGTCGTGACTAC
GGGGATCAACGAGAGCCAGGATATGCAGAAGAGCGTAAGCTCGGGGAAGCTGCGCTCTAT
GGATTGGTCACATGCACAGCAAGAGGCTGTTGTGGTTCAGAACTTCCCTGGTTTTGCTCA
GTTGGATTTTGGTTCTGATTATAGGATGCGACGAACCTTTAGTGAAGGCGACATACAGAA
ACTAGGGACTGGTCATTTTCAGTCTCCGTTGGATATGATTATTGTGAGCTGTACTTCAGA
GGATCGACGTGAGAAGCTTTCTCGATACAGGAACAAGAAGAGCAGGCGAAATTTCGGGCG
TAAAATCAAGTATGCTTGTAGGAAAGCTCTTGCAGATAACCAACCGAGGATCCGAGGAAG
GTTTGCGAAAACAGAGGAGCGGGAATAGAATGGTTTCAAGTGAATGGGGCTGAGTAAAAT
GAAGAACTTGAAAACATAAGGAGATAAAGCCTATCGCATCAGAAACTAGTTTTGTTTAAT
ATATGTATAGAATTAAAATGTTATAAGCCTTTAGTTAGTGTTTTCTTGTGTATAAAAATG
GTTTATCTGAATAAGCTTCTTGTTGAAAGAAATGTAGGTACAGAAGTGTTAAGTAATGGA
GGTGAAATATGTGAAAATGTATGAATGTATAAAATTCTGAATATTTATTATATACATTAG
ATCATGTGAAATGAAAAATGTGATTGATGTTTCTTTGCG


BQ
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AF RS1GB43TF U 1
AF RS1GB43JQ C 453
BS 1 592 RS1GB43TF
BS 593 1179 RS1GB43JQ

RD RS1GB43TF 592 0 0
GGATACTTCCAAGCTTTTCTCTCACAAAGAGGACGAACAAAAAATGTATGCAGATTCAGG
GTTAATGCCCCGTTACGTGCAAACTTGTTCTCCAGATATTCACCAATTTGAAGACCTCTT
CAAATCATACAAGCTCTCGGATGAAGAAATGAGAAATGGTTTTGCTGAACGATCAAACCT
ACCTGAGTATGATATTGGAGAAGAAGGAGATCTCTTCAACGCTCCTGATTCAATTCTTGA
AGAGCCAATCTTAACCGTTGATCCGCTCTCAGCTGCCTTAACGATGATCTCTTGCGGGGA
AGACTCTTCCCAAGGGCTTTGTGATCTTCCTGACCTCGATCTCGGGTCGTTTCAGAGCGA
TCAGCAGCTTCTTGACAATGCCTTCTATGAATGCGAGCAAGATCTCATGATGAAATCAGC
TACGATGGAGTCTCCACTATCTGAAGTTTTGGACGTCAAGAACATCTCTGTCGTGACTAC
GGGGATCAACGAGAGCCAGGATATGCAGAAGAGCGTAAGCTCGGGGAAGCTGCGCTCTAT
GGATTGGTCACATGCACAGCAAGAGGCTGTTGTGGTTCAGAACTTCCCTGGT

QA 1 592 1 592
DS 

RD RS1GB43JQ 727 0 0
ACGTCAAGAACATCTCTGTCGTGACTACGGGGATCAACGAGAGCCAGGATATGCAGAAGA
GCGTAAGCTCGGGGAAGCTGCGCTCTATGGATTGGTCACATGCACAGCAAGAGGCTGTTG
TGGTTCAGAACTTCCCTGGTTTTGCTCAGTTGGATTTTGGTTCTGATTATAGGATGCGAC
GAACCTTTAGTGAAGGCGACATACAGAAACTAGGGACTGGTCATTTTCAGTCTCCGTTGG
ATATGATTATTGTGAGCTGTACTTCAGAGGATCGACGTGAGAAGCTTTCTCGATACAGGA
ACAAGAAGAGCAGGCGAAATTTCGGGCGTAAAATCAAGTATGCTTGTAGGAAAGCTCTTG
CAGATAACCAACCGAGGATCCGAGGAAGGTTTGCGAAAACAGAGGAGCGGGAATAGAATG
GTTTCAAGTGAATGGGGCTGAGTAAAATGAAGAACTTGAAAACATAAGGAGATAAAGCCT
ATCGCATCAGAAACTAGTTTTGTTTAATATATGTATAGAATTAAAATGTTATAAGCCTTT
AGTTAGTGTTTTCTTGTGTATAAAAATGGTTTATCTGAATAAGCTTCTTGTTGAAAGAAA
TGTAGGTACAGAAGTGTTAAGTAATGGAGGTGAAATATGTGAAAATGTATGAATGTATAA
AATTCTGAATATTTATTATATACATTAGATCATGTGAAATGAAAAATGTGATTGATGTTT
CTTTGCG

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

CO CL5477Contig1 1063 2 2 U
GACTGCCTCTCTTCTCTCTCTTGTTAGTTCACTCCACATAATAAACACCAAGAGAAAAAC
TAATTTCTTCTTATCGTAATTTCGAAATTTCTTGAAATTAGGTTTGTTTCTTGATTGAGT
TCTTGAATCGGGCTGTCTTCTCTTGTTACTATATTCAGAGTTTATAATCATGATGAGTCA
AGATCATCATGACGTTGGTAGTGACCAGACACAAATCATAAAGGGTAAGCGTACGAAGCG
ACAGAGATCATCTTCGTCGGCCTTTTTTGTGGCGGCGGCTACCACCATCACCTCCACAAG
CTCATCGGCCGAGGATGGCAGCGGAGGAAGAACAGTTCCCGATGAATACAACTCGGCGGT
TTCGTCTCCAGTAACCACAACTGATTGTACCGAAGAAGAGGAAGACATGGCTGTTTGTCT
CATCATGCTTGCGCGCGGAGCGGATCTCAAGAATTCGAGAAAAAACGGCAAAGTTCTTTC
GTCCGCAGAGAATTCGAGTTTCTTTGTCTACGAGTGTAAAACGTGCAACCGGACGTTCTC
GTCGTTCCAAGCTCTCGGTGGACACAGGGCGAGCCACAAGAAGCCTAGAGCGTCGATAGA
AGAAAAGACCAAACTACCCCTGTTGTTGACCAAGTCTAGTGGGTTAGTGGAAGGGCAAAA
AGGTAATTTCAGAGTTTTTGGTTCAGCACTAGCATCGCAGTCAAGTAACATCATCATCGC
CAAGGCAAACAAAGTACATGAGTGTTCGATCTGCGGTTCTGAGTTCGCTTCGGGACAAGC
CCTCGGCGGCCACATGAGGCGGCACAGGACAGCCACCACTGCGGTAATACCTGTCGCTAC
CATGGAAGTTAGCAGAAACAGTACAGAGGATGAGACTGAGAATTTGAGCTCTTCCATTGA
ACAGAGGAAATACTTACCATTGGATCTTAATCTACCTGCACCAGATGATGATCTAAGAGA
GTCAAAGTTTCAAGGGATAGTGTTCTCAACTACACCAGCGTTAATAGATTGTCATTACTA
GTTGTTTGAAGTTAAATGCATAGTTACATGATAACATATTTGC


BQ
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AF RS1DT64TF U 1
AF RS1DT64JQ C 320
BS 1 657 RS1DT64TF
BS 658 1063 RS1DT64JQ

RD RS1DT64TF 657 0 0
GACTGCCTCTCTTCTCTCTCTTGTTAGTTCACTCCACATAATAAACACCAAGAGAAAAAC
TAATTTCTTCTTATCGTAATTTCGAAATTTCTTGAAATTAGGTTTGTTTCTTGATTGAGT
TCTTGAATCGGGCTGTCTTCTCTTGTTACTATATTCAGAGTTTATAATCATGATGAGTCA
AGATCATCATGACGTTGGTAGTGACCAGACACAAATCATAAAGGGTAAGCGTACGAAGCG
ACAGAGATCATCTTCGTCGGCCTTTTTTGTGGCGGCGGCTACCACCATCACCTCCACAAG
CTCATCGGCCGAGGATGGCAGCGGAGGAAGAACAGTTCCCGATGAATACAACTCGGCGGT
TTCGTCTCCAGTAACCACAACTGATTGTACCGAAGAAGAGGAAGACATGGCTGTTTGTCT
CATCATGCTTGCGCGCGGAGCGGATCTCAAGAATTCGAGAAAAAACGGCAAAGTTCTTTC
GTCCGCAGAGAATTCGAGTTTCTTTGTCTACGAGTGTAAAACGTGCAACCGGACGTTCTC
GTCGTTCCAAGCTCTCGGTGGACACAGGGCGAGCCACAAGAAGCCTAGAGCGTCGATAGA
AGAAAAGACCAAACTACCCCTGTTGTTGACCAAGTCTAGTGGGTTAGTGGAAGGGCA

QA 1 657 1 657
DS 

RD RS1DT64JQ 744 0 0
AGCGGAGGAAGAACAGTTCCCGATGAATACAACTCGGCGGTTTCGTCTCCAGTAACCACA
ACTGATTGTACCGAAGAAGAGGAAGACATGGCTGTTTGTCTCATCATGCTTGCGCGCGGA
GCGGATCTCAAGAATTCGAGAAAAAACGGCAAAGTTCTTTCGTCCGCAGAGAATTCGAGT
TTCTTTGTCTACGAGTGTAAAACGTGCAACCGGACGTTCTCGTCGTTCCAAGCTCTCGGT
GGACACAGGGCGAGCCACAAGAAGCCTAGAGCGTCGATAGAAGAAAAGACCAAACTACCC
CTGTTGTTGACCAAGTCTAGTGGGTTAGTGGAAGGGCAAAAAGGTAATTTCAGAGTTTTT
GGTTCAGCACTAGCATCGCAGTCAAGTAACATCATCATCGCCAAGGCAAACAAAGTACAT
GAGTGTTCGATCTGCGGTTCTGAGTTCGCTTCGGGACAAGCCCTCGGCGGCCACATGAGG
CGGCACAGGACAGCCACCACTGCGGTAATACCTGTCGCTACCATGGAAGTTAGCAGAAAC
AGTACAGAGGATGAGACTGAGAATTTGAGCTCTTCCATTGAACAGAGGAAATACTTACCA
TTGGATCTTAATCTACCTGCACCAGATGATGATCTAAGAGAGTCAAAGTTTCAAGGGATA
GTGTTCTCAACTACACCAGCGTTAATAGATTGTCATTACTAGTTGTTTGAAGTTAAATGC
ATAGTTACATGATAACATATTTGC

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL5478Contig1 930 2 2 U
GGCGCAACCATAGCTTCCCTCTTTGATGAAGATCACTGGAATCTTCCTCCTGCAAGATCG
GAGGATCAGTTGGCAGTTCAAATTCATCTAACAACTATATCTCTTTCGGAGGTGGAAGAC
ACTTACGAATGGGTTGTCAATGGCAGAGCAACTGGAAAGTTTAGTACTGGAGACATCTAC
ACCTACATCAAAGGACCGCATCTAACGGTTCCTTGGTCCTCAGTGGTGTGGTGCTCCTAT
GGCATCCCGAGACAGAGCTTCTTCACTTGGTTAGTTCAACTTGATCGATGCCCTACTAAG
GACAGAATGATCCGATGGGGAATTGAAGGCATAGACCCGATGTGTCTCCTATGCAACGCG
GATGGAGAATCTAGGAATCACCTATACTTTCAATGCTCCTACAGCTGTAGGGTTTGGGCC
TCCGTCTCTCGCCGTTGCCAGCTTCATCTAACGCCAGACTGGACAGATACCATCACTCAG
CTACAGACACTCCGATCAAGCAAAGACCTGAAACGACTCGCCCTCATCTCCTTCCAAGCG
GTGATCTATTGGTTGTGGAATGAAAGGAACAATCGACTACATCAAAACAACTTTCGATCG
TCAGATTCTCTCCTCACTATGATAGATAGACAGATAAGGAATAGGCTTCAGAGCATCAGG
GAAACGAACCCCCGTTCTTCTTCTGTGATGACTCTACTCTGGTTTCTCCATGACTAGCTC
TTGGTTTCATCGACACAAACTCATCGGTCTCCTTCTTCATCATCAACTGGGCCCAAATGC
CTCTTTGTTTCAGTTTAGCCCAACTAAGTTTTCAAATATGTGTGTTTTGTTTATTGTCAC
TGGGCCTAGCCAGCCCAAATCAACACTAAAAAGCCTGTGGGTTGTATCTTTTTTATTTCT
TTTCTGTTTTTAATATGAAAGCCCTGTTTC


BQ
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AF RS1B283TF U 1
AF RS1B283JQ C 297
BS 1 634 RS1B283TF
BS 635 930 RS1B283JQ

RD RS1B283TF 634 0 0
GGCGCAACCATAGCTTCCCTCTTTGATGAAGATCACTGGAATCTTCCTCCTGCAAGATCG
GAGGATCAGTTGGCAGTTCAAATTCATCTAACAACTATATCTCTTTCGGAGGTGGAAGAC
ACTTACGAATGGGTTGTCAATGGCAGAGCAACTGGAAAGTTTAGTACTGGAGACATCTAC
ACCTACATCAAAGGACCGCATCTAACGGTTCCTTGGTCCTCAGTGGTGTGGTGCTCCTAT
GGCATCCCGAGACAGAGCTTCTTCACTTGGTTAGTTCAACTTGATCGATGCCCTACTAAG
GACAGAATGATCCGATGGGGAATTGAAGGCATAGACCCGATGTGTCTCCTATGCAACGCG
GATGGAGAATCTAGGAATCACCTATACTTTCAATGCTCCTACAGCTGTAGGGTTTGGGCC
TCCGTCTCTCGCCGTTGCCAGCTTCATCTAACGCCAGACTGGACAGATACCATCACTCAG
CTACAGACACTCCGATCAAGCAAAGACCTGAAACGACTCGCCCTCATCTCCTTCCAAGCG
GTGATCTATTGGTTGTGGAATGAAAGGAACAATCGACTACATCAAAACAACTTTCGATCG
TCAGATTCTCTCCTCACTATGATAGATAGACAGA

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1B283JQ 634 0 0
TAAGGACAGAATGATCCGATGGGGAATTGAAGGCATAGACCCGATGTGTCTCCTATGCAA
CGCGGATGGAGAATCTAGGAATCACCTATACTTTCAATGCTCCTACAGCTGTAGGGTTTG
GGCCTCCGTCTCTCGCCGTTGCCAGCTTCATCTAACGCCAGACTGGACAGATACCATCAC
TCAGCTACAGACACTCCGATCAAGCAAAGACCTGAAACGACTCGCCCTCATCTCCTTCCA
AGCGGTGATCTATTGGTTGTGGAATGAAAGGAACAATCGACTACATCAAAACAACTTTCG
ATCGTCAGATTCTCTCCTCACTATGATAGATAGACAGATAAGGAATAGGCTTCAGAGCAT
CAGGGAAACGAACCCCCGTTCTTCTTCTGTGATGACTCTACTCTGGTTTCTCCATGACTA
GCTCTTGGTTTCATCGACACAAACTCATCGGTCTCCTTCTTCATCATCAACTGGGCCCAA
ATGCCTCTTTGTTTCAGTTTAGCCCAACTAAGTTTTCAAATATGTGTGTTTTGTTTATTG
TCACTGGGCCTAGCCAGCCCAAATCAACACTAAAAAGCCTGTGGGTTGTATCTTTTTTAT
TTCTTTTCTGTTTTTAATATGAAAGCCCTGTTTC

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 2

CO CL5479Contig1 930 2 2 U
GCATTGATCTCGCTAAACAGCTTCTCCAGGTCCAACCAAACTCATACGCCCTAGTGGTGA
GCACAGAGAACATAACCCAAAACTGGTACTTAGGCAATGACCGATCAATGCTTCTATCTA
ATTGCATCTTCCGTATGGGTGGAGCCGCCGTACTTCTCTCGAACCGTTCGTCCGATCGCA
GGCGCTCAAAATATCAGCTCATCCACACCGTCCGTACCCACAAAGGAGCTGACGACAACG
CATTTGGCTGTGTTTACCAACGAGAAGACAACAACGCAGAAGAAACCGGCAAAGTCGGAG
TCTCTCTTTCTAAAAACCTAATGGCAATAGCCGGAGAAGCACTCAAGACAAACATCACAA
CTCTCGGACCGCTCGTCCTACCCATGTCCGAACAGCTTCTCTTTTTCGCAACCCTGGTGG
CACGCAAAGTCTTCAAAGTCAAGAAAATAAAGCCTTACATTCCCGACTTCAAGCTAGCGT
TCGAGCATTTCTGCATCCATGCTGGAGGTAGAGCCGTGCTCGACGAGATAGAGAAGAATT
TGGATTTGTCCGAATGGCATATGGAGCCATCGAGGATGACGTTGAACCGTTTTGGTAATA
CTTCGAGTAGTTCGCTTTGGTATGAACTTGCTTATAGTGAAGCTAAAGGGAGGATTAAGA
GAGGAGACAGGACTTGGCAGATTGCTTTTGGATCGGGCTTTAAGTGTAATAGTGCGGTCT
GGAAAGCCTTGAGAACGATTGATCCGGTTGAGAAGTCTAACCCATGGAGCGATGAGATTC
ATGAGTTCCCTGTTGCAGTTCCTAGAATCACCCCCGTTACGTCCTCGTAGTGTTTCTTTT
ATTTAATTCTTTGGAGAAATATTTGTTACGTTTATGTTGTACTTATGCGACTTATCTTAT
CTATTACAATATATAATTGCATTTTCTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GE57TF U 1
AF RS1GE57JQ C 315
BS 1 624 RS1GE57TF
BS 625 930 RS1GE57JQ

RD RS1GE57TF 624 0 0
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GCACAGAGAACATAACCCAAAACTGGTACTTAGGCAATGACCGATCAATGCTTCTATCTA
ATTGCATCTTCCGTATGGGTGGAGCCGCCGTACTTCTCTCGAACCGTTCGTCCGATCGCA
GGCGCTCAAAATATCAGCTCATCCACACCGTCCGTACCCACAAAGGAGCTGACGACAACG
CATTTGGCTGTGTTTACCAACGAGAAGACAACAACGCAGAAGAAACCGGCAAAGTCGGAG
TCTCTCTTTCTAAAAACCTAATGGCAATAGCCGGAGAAGCACTCAAGACAAACATCACAA
CTCTCGGACCGCTCGTCCTACCCATGTCCGAACAGCTTCTCTTTTTCGCAACCCTGGTGG
CACGCAAAGTCTTCAAAGTCAAGAAAATAAAGCCTTACATTCCCGACTTCAAGCTAGCGT
TCGAGCATTTCTGCATCCATGCTGGAGGTAGAGCCGTGCTCGACGAGATAGAGAAGAATT
TGGATTTGTCCGAATGGCATATGGAGCCATCGAGGATGACGTTGAACCGTTTTGGTAATA
CTTCGAGTAGTTCGCTTTGGTATG

QA 1 624 1 624
DS 

RD RS1GE57JQ 616 0 0
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GTCCTACCCATGTCCGAACAGCTTCTCTTTTTCGCAACCCTGGTGGCACGCAAAGTCTTC
AAAGTCAAGAAAATAAAGCCTTACATTCCCGACTTCAAGCTAGCGTTCGAGCATTTCTGC
ATCCATGCTGGAGGTAGAGCCGTGCTCGACGAGATAGAGAAGAATTTGGATTTGTCCGAA
TGGCATATGGAGCCATCGAGGATGACGTTGAACCGTTTTGGTAATACTTCGAGTAGTTCG
CTTTGGTATGAACTTGCTTATAGTGAAGCTAAAGGGAGGATTAAGAGAGGAGACAGGACT
TGGCAGATTGCTTTTGGATCGGGCTTTAAGTGTAATAGTGCGGTCTGGAAAGCCTTGAGA
ACGATTGATCCGGTTGAGAAGTCTAACCCATGGAGCGATGAGATTCATGAGTTCCCTGTT
GCAGTTCCTAGAATCACCCCCGTTACGTCCTCGTAGTGTTTCTTTTATTTAATTCTTTGG
AGAAATATTTGTTACGTTTATGTTGTACTTATGCGACTTATCTTATCTATTACAATATAT
AATTGCATTTTCTACG

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 2

CO CL5480Contig1 689 2 2 U
GGAAGAATCTGAAGCACAAAACATTTAGGTAAACTATCTTTCTCAATGAGAGACTCCTCA
CCAACATCTACCAAATCGTCACCGCTATGGAAACCCTTTGCCTCAAACTGTTGCTCCGTC
GATGACGAAACGGTCTTGGGAAATTTAAGCCGTTGCCGACCTTCGAAATCAGAGTTCTCC
AAGAACCATCTCGGACCACTTCCTTCTTTCAGGCGTCTCTCCTTCGCCGATATAAGCCGT
TCTTCTTCGGCTAGGATCAACGAAGATCTCGCAGAGGCTCTCGGAGCCGATTTAGTGGAT
TTTCAGATGTGTGAGCTTAAAATGATCACGCAGTGCTTCTCTCGGAACTATCTTCTCGGA
GAAGGTGGGTTCGGTAAAGTTTATAAAGGTTACATCGATGAGAATCTCCGACAAAGCCTC
AAGGCTCAGCCTGTTGCTGTCAAGATACTGGACATTGAAGGGCTTCAAGGACATCGTGAA
TGGCTTTCTGAGGTCATACTCCTTGGACAACTAAAGCACCCGAATCTAGTCAAACTTATC
GGTTACTGCTGCGAGCAGCAAGAACGAGTCCTCATCTACGAGTTCATGTCACGTGGTAGC
TTGGAAAACCACCTCTTCAAACGGATTTCAATATCGCTGCCGTGGGCGACGAGGCTGAAA
ATCGCTGTCGCGCTGCTAAGGGTTGGCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1C945TF U 1
AF RS1BS27TF U 270
BS 1 612 RS1C945TF
BS 613 689 RS1BS27TF

RD RS1C945TF 612 0 0
GGAAGAATCTGAAGCACAAAACATTTAGGTAAACTATCTTTCTCAATGAGAGACTCCTCA
CCAACATCTACCAAATCGTCACCGCTATGGAAACCCTTTGCCTCAAACTGTTGCTCCGTC
GATGACGAAACGGTCTTGGGAAATTTAAGCCGTTGCCGACCTTCGAAATCAGAGTTCTCC
AAGAACCATCTCGGACCACTTCCTTCTTTCAGGCGTCTCTCCTTCGCCGATATAAGCCGT
TCTTCTTCGGCTAGGATCAACGAAGATCTCGCAGAGGCTCTCGGAGCCGATTTAGTGGAT
TTTCAGATGTGTGAGCTTAAAATGATCACGCAGTGCTTCTCTCGGAACTATCTTCTCGGA
GAAGGTGGGTTCGGTAAAGTTTATAAAGGTTACATCGATGAGAATCTCCGACAAAGCCTC
AAGGCTCAGCCTGTTGCTGTCAAGATACTGGACATTGAAGGGCTTCAAGGACATCGTGAA
TGGCTTTCTGAGGTCATACTCCTTGGACAACTAAAGCACCCGAATCTAGTCAAACTTATC
GGTTACTGCTGCGAGCAGCAAGAACGAGTCCTCATCTACGAGTTCATGTCACGTGGTAGC
TTGGAAAACCAC

QA 1 612 1 612
DS 

RD RS1BS27TF 420 0 0
CGCAGAGGCTCTCGGAGCCGATTTAGTGGATTTTCAGATGTGTGAGCTTAAAATGATCAC
GCAGTGCTTCTCTCGGAACTATCTTCTCGGAGAAGGTGGGTTCGGTAAAGTTTATAAAGG
TTACATCGATGAGAATCTCCGACAAAGCCTCAAGGCTCAGCCTGTTGCTGTCAAGATACT
GGACATTGAAGGGCTTCAAGGACATCGTGAATGGCTTTCTGAGGTCATACTCCTTGGACA
ACTAAAGCACCCGAATCTAGTCAAACTTATCGGTTACTGCTGCGAGCAGCAAGAACGAGT
CCTCATCTACGAGTTCATGTCACGTGGTAGCTTGGAAAACCACCTCTTCAAACGGATTTC
AATATCGCTGCCGTGGGCGACGAGGCTGAAAATCGCTGTCGCGCTGCTAAGGGTTGGCCT

QA 1 420 1 420
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5482Contig1 1248 2 4 U
GGGTCTTGGTTCCAAAGGTTTCATCTGACGGGTAAAATGAGCTCTGAAGGCTATTCAGCC
AACATTGATGCATACGGCGAGCGTGGATATCTAACAGAAGCCGAGAGAGTGTTTATCTGC
TGCCAAGAAGTGAACAAGAGAACGGTTATTGAGTACAATGTGATGATCAAAGCGTATGGA
ATCGGTAAAAGCTGTGAAAAGACTTGTGACTTATTTGAGAGCATGATGAGTTATGGCGTC
ACGCCGGATAAGTGTACGTACAACACTCTCGTCCAGATCCTTGCGAGCTCCGACATGCCT
CATAAAGCCAGATCGTACCTGGAGAAAATGAGAGAGACGGGTTACGTGAGCGATTGCATA
CCGTACTGCGCTGTGATATCGAGCTTTGTGAAACTTGGTCAGCTCAATATGGCAGAGGAA
GTGTACAAAGAGATGGTTGACTTCAATATTGAGCCTGATGTTGTTGTCTATGGAGTGTTG
ATCAATGCTTTTGCGGATACTGGAAACGTTCAAGAAGCTATGAGTTATGTATGAGCGATG
AGAAAAGCTGGAATTACAGGAAACTCTGTTATACAGAGTTCACTGATTAAGCTCTACACT
AAAGTTGGGTACTTGAACGAAGCCGAAGCTATCTACAGAGAGCTTCTTGAATCATGTAAC
ACGACGCAGTATCCAGACGTGTACACATCAAACTGTATGATCAACCTGTACAGCGAAAGA
TCGATGGTGGGAAAAGCAGAAGCGATATTCCATAGCATGAAACAGAGAGGAGAAGCAAAC
GAGTTCAGTTTTGCTATGATGCTATTTATGTACAAGAAGAACGGTAGGTTCAAAGAAGCG
ACTCAGGTAGCGAAACAGATGAGGGAGATGAAGATTCTCACTGATCCTTTGAGTTACAAC
AGCGTTCTTGGTTTATACGCTTTGGACGGGAGGTTGAAGAAGCTGTTGAGACTTTTAAAG
AGATGGTTGCGTCCGGGGTTAGACCAGATGACTCGACGTTTAAGTCGCTTGGGACCATAC
TGATCAAACTCGGCTTGTCGAAGAAAGCTGTCCGTAAGATCGAAGGAGTGAGGAAACAAG
AGATCAAGAGAGGTTTGGAGTTGTGGATCTCCACTCTCTCTTCTCTCGTTGGGATTCAAA
GCAGTAACGAAGATTGCGATGAGCTTTAGGGTTTAGTTTTGGTAGATTGTTGTGCCTATG
TATATCTGTTTACATGTCAACCTGCAACTACAACTAATCACAAATTAC


BQ
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AF RS1H575TF U 1
AF RS1H575JQB C 622
BS 1 734 RS1H575TF
BS 735 735 RS1H575JQB
BS 736 769 RS1H575TF
BS 770 1248 RS1H575JQB

RD RS1H575TF 772 0 0
GGGTCTTGGTTCCAAAGGTTTCATCTGACGGGTAAAATGAGCTCTGAAGGCTATTCAGCC
AACATTGATGCATACGGCGAGCGTGGATATCTAACAGAAGCCGAGAGAGTGTTTATCTGC
TGCCAAGAAGTGAACAAGAGAACGGTTATTGAGTACAATGTGATGATCAAAGCGTATGGA
ATCGGTAAAAGCTGTGAAAAGACTTGTGACTTATTTGAGAGCATGATGAGTTATGGCGTC
ACGCCGGATAAGTGTACGTACAACACTCTCGTCCAGATCCTTGCGAGCTCCGACATGCCT
CATAAAGCCAGATCGTACCTGGAGAAAATGAGAGAGACGGGTTACGTGAGCGATTGCATA
CCGTACTGCGCTGTGATATCGAGCTTTGTGAAACTTGGTCAGCTCAATATGGCAGAGGAA
GTGTACAAAGAGATGGTTGACTTCAATATTGAGCCTGATGTTGTTGTCTATGGAGTGTTG
ATCAATGCTTTTGCGGATACTGGAAACGTTCAAGAAGCTATGAGTTATGTATGAGCGATG
AGAAAAGCTGGAATTACAGGAAACTCTGTTATACAGAGTTCACTGATTAAGCTCTACACT
AAAGTTGGGTACTTGAACGAAGCCGAAGCTATCTACAGAGAGCTTCTTGAATCATGTAAC
ACGACGCAGTATCCAGACGTGTACACATCAAACTGTATGATCAACCTGTACAGCGAAAGA
TCGATGGTGGGAAA*GCAGAAGCGATATTCCATAGCATGAAACAGAGAG
AGA

QA 1 769 1 769
DS 

RD RS1H575JQB 627 0 0
GCCGAAGCTATCTACAGAGAGCTTCTTGAATCATGTAACACGACGCAGTATCCAGACGTG
TACACATCAAACTGTATGATCAACCTGTACAGCGAAAGATCGATGGTGGGAAAAGCAGAA
GCGATATTCCATAGCATGAAACAGAGAGGAGAAGCAAACGAGTTCAGTTTTGCTATGATG
CTATTTATGTACAAGAAGAACGGTAGGTTCAAAGAAGCGACTCAGGTAGCGAAACAGATG
AGGGAGATGAAGATTCTCACTGATCCTTTGAGTTACAACAGCGTTCTTGGTTTATACGCT
TTGGACGGGAGGTTGAAGAAGCTGTTGAGACTTTTAAAGAGATGGTTGCGTCCGGGGTTA
GACCAGATGACTCGACGTTTAAGTCGCTTGGGACCATACTGATCAAACTCGGCTTGTCGA
AGAAAGCTGTCCGTAAGATCGAAGGAGTGAGGAAACAAGAGATCAAGAGAGGTTTGGAGT
TGTGGATCTCCACTCTCTCTTCTCTCGTTGGGATTCAAAGCAGTAACGAAGATTGCGATG
AGCTTTAGGGTTTAGTTTTGGTAGATTGTTGTGCCTATGTATATCTGTTTACATGTCAAC
CTGCAACTACAACTAATCACAAATTAC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL5483Contig1 622 2 3 U
GTTGAGAGAAATAATGGTAAAATATTTTGGTACATAACGATTCTGGTCAAGCTACAAACA
GATAAGACCGGTATGAAGATTAAAGCAAATACACAACACTTCTTTTTAGGTCTCTCTCAT
TTTTAAGCTTTAACTTCTTCAATCTCGTCCAATGCATAGTTGTTGGTCGATATGTTTGCG
TAATTCACTTTCGCAAACCTGACCACAACAGGGTACCGGGTCTTCGGGTCCTGATCAACG
GCCACAACCGATCCAGTGCTCTTGAACCAGTAGGATTCTTTCCTTAGAATCTTGACCTTG
GTCCCTCTCTTAGGGCCAATAGGAGGCGGCTTGGGTTTCGCGGCAGGAGCTGCAGCTGGC
GCCGCTACAGCTGCCGGAGCACCTTCTGGCGCAGCTGGTTCTGGAGCCGCCTCATCGGCT
GCTCTGACTACGAGCCTAGAACCGGCGTTTCTCATCGGTAAGAAAGACACGGAGTTTCTG
GACGACGAAGATCCAGCGGCCACTGTGACGTTGGCCGGCAAAAGAAACACCGAAGATGCT
GACATCATCGCCATCTGTAGAGTTTTTTTTCTTTTCTGTTGCTTCTTACTGTTTCTTCCG
ACACGAAAGAGTGAGTTCTTCC


BQ
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AF RS1BU50JQ U 140
AF RS1BU50TF C 1
BS 1 139 RS1BU50TF
BS 140 485 RS1BU50JQ
BS 486 622 RS1BU50TF

RD RS1BU50JQ 346 0 0
CAATCTCGTCCAATGCATAGTTGTTGGTCGATATGTTTGCGTAATTCACTTTCGCAAACC
TGACCACAACAGGGTACCGGGTCTTCGGGTCCTGATCAACGGCCACAACCGATCCAGTGC
TCTTGAACCAGTAGGATTCTTTCCTTAGAATCTTGACCTTGGTCCCTCTCTTAGGGCCAA
TAGGAGGCGGCTTGGGTTTCGCGGCAGGAGCTGCAGCTGGCGCCGCTACAGCTGCCGGAG
CACCTTCTGGCGCAGCTGGTTCTGGAGCCGCCTCATCGGCTGCTCTGACTACGAGCCTAG
AACCGGCGTTTCTCATCGGTAAGAAAGACACGGAGTTTCTGGACGA

QA 1 346 1 346
DS 

RD RS1BU50TF 622 0 0
GTTGAGAGAAATAATGGTAAAATATTTTGGTACATAACGATTCTGGTCAAGCTACAAACA
GATAAGACCGGTATGAAGATTAAAGCAAATACACAACACTTCTTTTTAGGTCTCTCTCAT
TTTTAAGCTTTAACTTCTTCAATCTCGTCCAATGCATAGTTGTTGGTCGATATGTTTGCG
TAATTCACTTTCGCAAACCTGACCACAACAGGGTACCGGGTCTTCGGGTCCTGATCAACG
GCCACAACCGATCCAGTGCTCTTGAACCAGTAGGATTCTTTCCTTAGAATCTTGACCTTG
GTCCCTCTCTTAGGGCCAATAGGAGGCGGCTTGGGTTTCGCGGCAGGAGCTGCAGCTGGC
GCCGCTACAGCTGCCGGAGCACCTTCTGGCGCAGCTGGTTCTGGAGCCGCCTCATCGGCT
GCTCTGACTACGAGCCTAGAACCGGCGTTTCTCATCGGTAAGAAAGACACGGAGTTTCTG
GACGACGAAGATCCAGCGGCCACTGTGACGTTGGCCGGCAAAAGAAACACCGAAGATGCT
GACATCATCGCCATCTGTAGAGTTTTTTTTCTTTTCTGTTGCTTCTTACTGTTTCTTCCG
ACACGAAAGAGTGAGTTCTTCC

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 2

CO CL5484Contig1 1045 2 2 U
GATGGGAAAGGAGCGGAAGGACACAAGGTAAGCTTCAAAACCTACACGCCCAACTCCACA
TTCAAAGACTACGCCAAAAACGGCGTCGGTTTCGCCAAGTACAACGTCTCCTCCACGTCA
GCAACGGCAACGGCCCTCGGCGATGGCAAAACCGTGAATAAGTGGATCGAGCCGGGCAAA
TTCTTCAGAGAGTCGTCGCTTAAAGAAGGAACAGTGATTCCCATGCCTGATATTAAAGAT
AAAATGCCTAAAAGGTCGTTTTTGCCCCGGAGCATCATCTCGAAGCTTCCCTTCTCCGCC
TCCAAGCTCGCCGAGATCAACGGGATCTTCCACGCCGGAGAGAACTCCACGATGGAGAAG
ATCATCTCCGACGCTGTGACGGAGTGCGAGAGGCCGCCGAGCGCGGGGGAGACGAAGCGG
TGCGTCGGATCGGCGGAGGACATGATCGACTTCGCCACGTCTGTGCTCGGTCGGAGCGTG
GTGCTGAGAACGACGGAGAACGTGGCGGGGTCGAAGCAGAAGGTGGTGATCGGGAAAGTC
AACGGGGTCAACGGCGGGAGAGTGACGAGAGCTGTTTCGTGTCACCAGAGCCTGTACCCG
TACCTCATGTATTACTGCCACTCCGTTCCTAAAGTTCGGGTCTACGAGGCGGATCTTCTC
GAGCTGAAGAGTAAGACCAAGATCAACCACGGAATCGCCATCTGTCACATGGACACGTCA
TCGTGGGGTCCGAAGCATGGAGCTTTCTTAGCTCTCGGGTCGAAACCGGGTCTGATTGAG
GTTTGTCACTGGATATTTGAGAACGACATGAACTGGGCGATCGCTGATTGAAAACCTTGG
TCGGGTCTGGATCTATCGTGCTTTTTTTCAAGTTATTAAATATGAATATTATCTTATCGC
CGAGATTTGGATAGAGGAATGTTAATTTTCTACTATTGTTATTATGCTTTCCTAAGCATT
TTTCAGTAACAGTAAAGACTCGTTACTGATTTGTTTGTGGCGGCACGAATAATATTTAAG
ATATTTAGTGAATGTTTGTTGACGC


BQ
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AF RS1CG62JQ C 371
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GAGCT

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DS 

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ATCTATCGTGCTTTTTTTCAAGTTATTAAATATGAATATTATCTTATCGCCGAGATTTGG
ATAGAGGAATGTTAATTTTCTACTATTGTTATTATGCTTTCCTAAGCATTTTTCAGTAAC
AGTAAAGACTCGTTACTGATTTGTTTGTGGCGGCACGAATAATATTTAAGATATTTAGTG
AATGTTTGTTGACGC

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

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TGATTGGTAAAGAGGTGACACGTCAGTATTTATTTATTCATCAACTCTATGTTTTTTAAT
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ATTACGTTGTTTTCTTTGCGAGTCATTTCGGGCATATGAAACATTGTTAGGCTTTTGAGA
TATCACTTATCTCAGCTTAAAAAGATGTCAGGTAAATGAAATGAAATGACAAGTGGGTTG
TCTGTGGGGCACTTCGATGTTTTGTTAACATGCATTTGGCTAAACGTACGAAACTCTTTC
TTTTAGGATATATTTTATTCCAAATTTACGAATAAATGTTAGGTATGGGAGGTTCGGTTA
TGGAAAACCAAGGAACAAGAGAAGACGAAAATGATATCAACTTCCCGTGTTACTCTCTTA
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TCCAAGTTGTAATTTTCATTTTGTATTTATCTGACTCTCACAGCCTTTGTTCGGAATAAA
GAACGGTTTATTGT


BQ
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BS 608 1154 RS1GK23JQ

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CGATCGTTAAATCCTAAGAAATGGATCCAAAATCGGTGGAGTTTACAGCGGACAATCCGC
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ATACTTGTTCGGTCGTATATAAAATATCATTGTTTAATTAGATGTTTTTTTGGTCAACGA
CATATTGATATGTTAGTCTTCTTTTATAAAAGGAATTGGTCAAGGATATACACTATCAGA
TGTATACATTTATATAAAAATAAATTCACGATTAAACATAGGATATATTTTTGGGGGTTT
TGATTGG

QA 1 607 1 607
DS 

RD RS1GK23JQ 682 0 0
GTCAACGACATATTGATATGTTAGTCTTCTTTTATAAAAGGAATTGGTCAAGGATATACA
CTATCAGATGTATACATTTATATAAAAATAAATTCACGATTAAACATAGGATATATTTTT
GGGGGTTTTGATTGGTAAAGAGGTGACACGTCAGTATTTATTTATTCATCAACTCTATGT
TTTTTAATCAGTTGATTATTCAAATCTGAATACGTTTTTGATGACATAATGAAATGGTAA
GAAAACGAATTACGTTGTTTTCTTTGCGAGTCATTTCGGGCATATGAAACATTGTTAGGC
TTTTGAGATATCACTTATCTCAGCTTAAAAAGATGTCAGGTAAATGAAATGAAATGACAA
GTGGGTTGTCTGTGGGGCACTTCGATGTTTTGTTAACATGCATTTGGCTAAACGTACGAA
ACTCTTTCTTTTAGGATATATTTTATTCCAAATTTACGAATAAATGTTAGGTATGGGAGG
TTCGGTTATGGAAAACCAAGGAACAAGAGAAGACGAAAATGATATCAACTTCCCGTGTTA
CTCTCTTAAGTGGTTTACCTGTACCGGACCACGCTAAAGATTCTTTGGACCATCTCAAGA
AGTTTGTATCCAAGTTGTAATTTTCATTTTGTATTTATCTGACTCTCACAGCCTTTGTTC
GGAATAAAGAACGGTTTATTGT

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 2

CO CL5486Contig1 209 2 2 U
GAGGCACTGGATTTGATATGATATGATATGATATGATGTGATATGATTATCTCTCCATCG
TCAGCGAAAACAACTGATTAGGAAACTGTAAGATTCGTTTGTATTATTCTTGAGAAAGGG
AAGATTCTGTAAATCTTGTAAGAGTTAATTATTGTGTATATGAATCTTCATCATATCTTG
ATCACTTATGGTATATGATTTTATTCCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BX02JQ C 1
AF RS1BX02TF U 104
BS 1 103 RS1BX02JQ
BS 104 209 RS1BX02TF

RD RS1BX02JQ 209 0 0
GAGGCACTGGATTTGATATGATATGATATGATATGATGTGATATGATTATCTCTCCATCG
TCAGCGAAAACAACTGATTAGGAAACTGTAAGATTCGTTTGTATTATTCTTGAGAAAGGG
AAGATTCTGTAAATCTTGTAAGAGTTAATTATTGTGTATATGAATCTTCATCATATCTTG
ATCACTTATGGTATATGATTTTATTCCGC

QA 1 209 1 209
DS 

RD RS1BX02TF 106 0 0
TTATTCTTGAGAAAGGGAAGATTCTGTAAATCTTGTAAGAGTTAATTATTGTGTATATGA
ATCTTCATCATATCTTGATCACTTATGGTATATGATTTTATTCCGC

QA 1 106 1 106
DS 



AS 1 2

CO CL5487Contig1 931 2 2 U
GGGCGGGCATCTTCAACTCTCACGAAGCCGATGGAAGAAACCTCCGATCATCTGAATCCG
ACCACGTCCACTCCCGGAAACACGCCGGAGCTCGATCCGAAGACGACCATGCGTTCTTCA
AAACCCGGACTAAAGCGCCTCTTCATCACCACCACCGTACTCTTCTCCTTCCTCTCAGGC
CTGCCGTTTCCATGGAAGTCAGTCGAAATCTACCGATCTCAATTACCTTTCCACGACGTC
GACTCACTCTCCGACCAAGTAAAGTCTACGCCTTTTCGCTTCCCGTGCACTTTCCACGCC
GTGTTCGTGGGGTTCCGATCGAACGACCCGGATCGGTTGCGATCCGAGATACAAGACGGT
ATCGATCAGCTGACCCGTGGAAGTTCACAGTGCGGTTCTTGCAACGTGTCCCTCTCCGTC
ACCGTTCAAAGCCCGGATGAGCACTGCTCTGAGACTCTTCCTCCTTCCACGTGCTCTTAC
AGATGCGGAGTGATTAAAAGAGATGTCTTTGGTGTTGGCTTGGAGGATGATAGGGTGGAT
GAGTCGTTGGATGATGTGTTCAGTGGCTGCTCTGGGGATGGTGGGAAGGTGTATAGTGTT
GTTGTGGTGAATAAAGAGAAGGGGGATGGTGTGGCGAAGGCTGTGGTGGGGAAGAGAAGG
CACGCTTGGATTGTGGGGAGTGGGTTGGAAGAGAGGTACGTGGTGGCTAGAGTTTCTGAG
GTTTTCGTGAAGGTGTTTATGAATGGTGGAAGAGAGGATGAAGACTCTATTCGTGGGGAG
TTTATGCCTGTGGGATCAGATGGGAGGCTTCTTCTTTCTTTTAGCTTATTAAATTCCAAT
CCACGTGATTGGATCTATGATTGGTATGATCGTCACTATGATTTTGCACTGCCATTGTAA
CATTTACTTACCAATGACTTGTTGTCTGTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CX65TF U 1
AF RS1CX65JQ C 273
BS 1 617 RS1CX65TF
BS 618 931 RS1CX65JQ

RD RS1CX65TF 617 0 0
GGGCGGGCATCTTCAACTCTCACGAAGCCGATGGAAGAAACCTCCGATCATCTGAATCCG
ACCACGTCCACTCCCGGAAACACGCCGGAGCTCGATCCGAAGACGACCATGCGTTCTTCA
AAACCCGGACTAAAGCGCCTCTTCATCACCACCACCGTACTCTTCTCCTTCCTCTCAGGC
CTGCCGTTTCCATGGAAGTCAGTCGAAATCTACCGATCTCAATTACCTTTCCACGACGTC
GACTCACTCTCCGACCAAGTAAAGTCTACGCCTTTTCGCTTCCCGTGCACTTTCCACGCC
GTGTTCGTGGGGTTCCGATCGAACGACCCGGATCGGTTGCGATCCGAGATACAAGACGGT
ATCGATCAGCTGACCCGTGGAAGTTCACAGTGCGGTTCTTGCAACGTGTCCCTCTCCGTC
ACCGTTCAAAGCCCGGATGAGCACTGCTCTGAGACTCTTCCTCCTTCCACGTGCTCTTAC
AGATGCGGAGTGATTAAAAGAGATGTCTTTGGTGTTGGCTTGGAGGATGATAGGGTGGAT
GAGTCGTTGGATGATGTGTTCAGTGGCTGCTCTGGGGATGGTGGGAAGGTGTATAGTGTT
GTTGTGGTGAATAAAGA

QA 1 617 1 617
DS 

RD RS1CX65JQ 659 0 0
TTTTCGCTTCCCGTGCACTTTCCACGCCGTGTTCGTGGGGTTCCGATCGAACGACCCGGA
TCGGTTGCGATCCGAGATACAAGACGGTATCGATCAGCTGACCCGTGGAAGTTCACAGTG
CGGTTCTTGCAACGTGTCCCTCTCCGTCACCGTTCAAAGCCCGGATGAGCACTGCTCTGA
GACTCTTCCTCCTTCCACGTGCTCTTACAGATGCGGAGTGATTAAAAGAGATGTCTTTGG
TGTTGGCTTGGAGGATGATAGGGTGGATGAGTCGTTGGATGATGTGTTCAGTGGCTGCTC
TGGGGATGGTGGGAAGGTGTATAGTGTTGTTGTGGTGAATAAAGAGAAGGGGGATGGTGT
GGCGAAGGCTGTGGTGGGGAAGAGAAGGCACGCTTGGATTGTGGGGAGTGGGTTGGAAGA
GAGGTACGTGGTGGCTAGAGTTTCTGAGGTTTTCGTGAAGGTGTTTATGAATGGTGGAAG
AGAGGATGAAGACTCTATTCGTGGGGAGTTTATGCCTGTGGGATCAGATGGGAGGCTTCT
TCTTTCTTTTAGCTTATTAAATTCCAATCCACGTGATTGGATCTATGATTGGTATGATCG
TCACTATGATTTTGCACTGCCATTGTAACATTTACTTACCAATGACTTGTTGTCTGTGT

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

CO CL5488Contig1 827 2 12 U
GATCTACATATAGATACTGATACGAACGTATATTCTCTAGCTAACTCACATCTATGCTGT
GATTCGTGCACAGATATTTGCACACACACATAGTTCAATTCAAGCATATTACATCTTCAA
AGTAAATGGCTTCTCTCGTGTTATTAACATTTTCCCTCCTTTTTGCAACTTTCTCTTCTC
CTCTTGTAGATGCTTTTAATTATACTGATGGTGGTAATTCCACCCTCGCCGCGCCAGCAC
TAAACCCTATTGATGCTTGCTGGCGAAGAGACGCTAAATGGTCGACTAACCGTCAAGCCC
TGGCCAGATGCGCGGTAGGGTTCGGGAAAAACGCGCAAGGGGGCAGCAAAGGGCCTATCT
ACGTGGTTACAAGCCCAGCAGATGACGTTGGAAAGCCTAAACCCGGAACTTTAAGATTTG
GGGCGACCCAACCTAAACCACTATGGATCACATTCCAACGTGACATGGTCATAAGGTTGA
AAACCGAGCTCGAAGTGACGAGCCACAAGACGATAGACGGGAGAGGAGCAAAAGTTGACA
TTGGCAACGGACCATGCATTGCGATCAAACGTGCGACCAATGTCATTATACATGGGCTAA
CTATCCATGATTGTAAATTGAGCAAAGGATTTGATGGTGACGGAATCCGCGTGTTTCAAT
CTAGTAATGTTTGGATCGATCATTGTCACTTATCTCGGTGCCAAGATGGTTTGATCGATG
TGGTTACATCTTCTACGGCTGTCACGATTTCTAATAATCGTTTTATAAATCACCAGAAAG
CGATGTTGCTCGGACATTCTGACCAACATATGGCTGATAAGAATATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EH18TF U 1
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RD RS1EH18TF 816 0 0
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CTCTTGTAGATGCTTTTAATTATACTGATGGTGGTAATTCCACCCTCGCCGCGCCAGCAC
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ACGTGGTTACAAGCCCAGCAGATGACGTTGGAAAGCCTAAACCCGGAACTTTAAGATTTG
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TTGGCAACGGACCATGCATTGCGATCAAACGTGCGACCAATGTCATTATACATGGGCTAA
CTATCCATGATTGTAAATTGAGCAAAGGATTTGATGGTGACGGAATCCGCGTGTTTCAAT
CTAGTAATGTTTGGATCGATCATTGTCACTTATCTCGGTGCCA*GATGGTTTGATCGATG
TGGTTACATCTTCTACG*CTGTCACGATTTCTA*TAATCGTTTTATAAATCACCAGAAAG
CGATGTTGCTCGGACAT*CTGACCA*CATATGGCTG

QA 1 816 1 816
DS 

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ACAAGACGATAGACGGGAGAGGAGCAAAAGTTGACATTGGCAACGGACCATGCATTGCGA
TCAAACGTGCGACCAATGTCATTATACATGGGCTAACTATCCATGATTGTAAATTGAGCA
AAGGATTTGATGGTGACGGAATCCGCGTGTTTCAATCTAGTAATGTTTGGATCGATCATT
GTCACTTATCTCGGTGCCAAGATGGTTTGATCGATGTGGTTACATCTTTTACGGCTGTCA
CGATTTCTAATAATCGTTTTATAAATCACCAGAAAGCGATGTTGCTCGGACATTCTGACC
AACATATGGCTGATAAGAATATG

QA 1 383 1 383
DS 



AS 1 2

CO CL5489Contig1 865 2 6 U
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AGTGCGTTGACGATCCTAAATCAATGGCATCGGAGTTAACCGGAGAGTCACTTCTAGACT
TTGCTGTTGCAACAAACAGAGACATTATAAGCATTGCTCTCTCCAATCTGATTAGGGTTC
ATTGGAGACGTGCTTCGAAGCCAACACCTGGACAAATGCTGACTGCTCCACTTAGTGAAC
TTAACAACTTCAGGATTTCTAATTTTCCTTTGTTGCGGCCTCAAGACCTTAGGTACTCAA
GAAGCTTCTCCGCCTATATGCAGTTTTATGAAGGGATTAATGGATCCTATATAATAGTCT
AAACATTCGGTTTTGTGGTGATGAGGGTAGGTTGGCTATTGCGGCTGCAGAAAGGCTGTT
GATATTGGAACCTAATAACTGGATAGTTCGAAGAGAACTTGGCATGATGTACTACTACGT
CAGGTAACAGTAGAGATTATAGTTGCCTTGTTTGGTTTAGTTTTTGATGGAATTGGATGA
AACTGTTGGAGCAGGCAATGTAGAGATGCGATTTTTGAGCTGAGCATATGCATAGCCAAC
TTTGCGATTGGGGAAGAAGAAGCAAAAGAGTTGGAGATTTTTGTTGAGAAACTTCATCGA
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CCCTGTTTCACTTGTAAATACTCTCTTTCTATTAGTCTCTGTTGTGTTTGGAAAAGACCC
TTTTGTGGGAGACCATGGAGCTTTTGGTTGTGTAGCTCTTTTACTTTCTTCTGATCAGAG
TAATAAACAATTTGTTTCCAAACCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FE80TF U 1
AF RS1FE80JQ C 478
BS 1 717 RS1FE80TF
BS 718 718 RS1FE80JQ
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BS 738 738 RS1FE80JQ
BS 739 793 RS1FE80TF
BS 794 865 RS1FE80JQ

RD RS1FE80TF 794 0 0
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AAACATTCGGTTTTGTGGTGATGAGGGTAGGTTGGCTATTGCGGCTGCAGAAAGGCTGTT
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CCCTGTTTCACTTGTAA*TACTCTCTTTCTATTAGTCTCTGTTGTGTTTGGAAAAGACCC
TTTTGTGGGAGAC
A

QA 1 793 1 793
DS 

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AACTTTGCGATTGGGGAAGAAGAAGCAAAAGAGTTGGAGATTTTTGTTGAGAAACTTCAT
CGACTCTTTTCATTGATGTCTTCTCCCTTAGACTCTGATCGCTTGGCCGTTCATTAGAAA
ACTCCCTGTTTCACTTGTAAATACTCTCTTTCTATTAGTCTCTGTTGTGTTTGGAAAAGA
CCCTTTTGTGGGAGACCATGGAGCTTTTGGTTGTGTAGCTCTTTTACTTTCTTCTGATCA
GAGTAATAAACAATTTGTTTCCAAACCG

QA 1 388 1 388
DS 



AS 1 2

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CGCAGTGGCGCGCGTGGTAGTCGGGGCCGCCCTCCTCTCCCCTTTCATATTTGTTATTTG
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CTGATCGTCTGCGGTAGTTGGCTTCGATCTGGAGTTTCAGTGAGGTGGGTGGGCTGTGAG
TGAACGGAGTCGGCATTTAGGGTTTGGAGGCGGCGATTAGACGTGATTTTCAGCTTTCTC
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AGTTCTGTCATTGCTCTGTGTTGTGTGGCAGCACCTCCCTCTTCTTCCGGCCAAGTAGTA
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CTTGACAGTGTCATGTTTGGTCGTCGGTTTGTTTCTCGAATGGGCCATCTATAACCTGTG
TTTAGAACTCTCCGGTCACCGTTGCTACTTTGTCTCCTCGTTTCACGCCTCTCTTGTGTT
GTTATATCGTGTCTGGTCAATGTGGTCGGCGTTACCAAGGTATCATCCATTGTAATCTCT
TCGACAAGGCTTTGTAGAGCTCCCATCGGTTCTCGGTGTGAACGCGAGTTAAGGTATAAG
ACACATGAATTGTTACCCATTTAGGTTTCTGATCACACATATAATCTTACTTCTAGTTTA
TTTCCTCTCTTTTTCACTTTACTCAGTTTATTTCTCCCAAAATTTGTTGGGTATCATTTT
ATTTTTTTCAGTGGAAGAATTCATTGGATATAATTCCATGAGATGTGAGCACTAATGGGA
GTAATCTTAAAGTACATTTCACCTTTTATAACTTATAACATTTATTCTCTTTTATTAAAA
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

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CTGATCGTCTGCGGTAGTTGGCTTCGATCTGGAGTTTCAGTGAGGTGGGTGGGCTGTGAG
TGAACGGAGTCGGCATTTAGGGTTTGGAGGCGGCGATTAGACGTGATTTTCAGCTTTCTC
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TCTCT

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DS 

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AGTTCTGTCATTGCTCTGTGTTGTGTGGCAGCACCTCCCTCTTCTTCCGGCCAAGTAGTA
CTCCAGAGCTCATTCTGGAGACACACCTGTGGTGGTCCAGTTACTGTGTGGTTGCCATCC
CTTGACAGTGTCATGTTTGGTCGTCGGTTTGTTTCTCGAATGGGCCATCTATAACCTGTG
TTTAGAACTCTCCGGTCACCGTTGCTACTTTGTCTCCTCGTTTCACGCCTCTCTTGTGTT
GTTATATCGTGTCTGGTCAATGTGGTCGGCGTTACCAAGGTATCATCCATTGTAATCTCT
TCGACAAGGCTTTGTAGAGCTCCCATCGGTTCTCGGTGTGAACGCGAGTTAAGGTATAAG
ACACATGAATTGTTACCCATTTAGGTTTCTGATCACACATATAATCTTACTTCTAGTTTA
TTTCCTCTCTTTTTCACTTTACTCAGTTTATTTCTCCCAAAATTTGTTGGGTATCATTTT
ATTTTTTTCAGTGGAAGAATTCATTGGATATAATTCCATGAGATGTGAGCACTAATGGGA
GTAATCTTAAAGTACATTTCACCTTTTATAACTTATAACATTTATTCTCTTTTATTAAAA
G

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DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TTCTTCTCCGGCTTCCGTATGTGTCTCTATTCGAGCAGATGGTTCTGTTTCGATCCTGTT
TCTGTAAGTTTTGGGTCCACTCGTGGTGGTTCTGATGTGGAAAGTGTGTTGGTTTTCTCG
GTATTGGAGTAGCTTCTCTTCTACCCGCTTGTTTTTGGAGAATGCTCCGCCTGGAGCGTA
TATCTGCTTCAGTTCTCGTTCTCCTTGCTCGACATTCATCATGATGTGTTGTTGTCGGTT
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TGCAGCTAATCTTTTGCTACTAAAGGTCATTGATTTCAATCATATGTAGCTGTGGGAGTT
CTGCGTTGGCCCTCTCATATCAGGAATCATCTTCATTTAAGATGTCACAGCTTGGTTATC
TAACGGGTCTATCGAGCATTCTCTGTTCTGTCTCGACTCTTAGGTTTGTGAGACTCTGGG
ATCTCTTCTACCCCTCTATTGAGGATGGTTTGTGAGACTCTGGGATATTTTTCTACCCTT
CTATTGAGGATGGTTGTATGAATGCCTACTGGCGTTTTTCATTATTTATGTTTCGTCTTC
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CTTTTTTATCCTAATAAAAA


BQ
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AF RS1EO91TF U 1
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GTTGTTTCTCTGCCATGAATGTCGTTCTCTGGGTGAAGCTTGACGGTATTCAGACCCGGT
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TTCTTCTCCGGCTTCCGTATGTGTCTCTATTCGAGCAGATGGTTCTGTTTCGATCCTGTT
TCTGTAAGTTTTGGGTCCACTCGTGGTGGTTCTGATGTGGAAAGTGTGTTGGTTTTCTCG
GTATTGGAGTAGCTTCTCTTCTACCCGCTTGTTTTTGGAGAATGCTCCGCCTGGAGCGTA
TATCTGCTTCAGTTCTCGTTCTCCTTGCTCGACATTCATCATGATGTGTTGTTGTCGGTT
TGTTTAGTTTTAGTTCTTTCTAAGAGTGGTGATTAGTCATGTCTTGGAAGTAAGGA*TAA
TGCAGCTAATCTTTTGCTACTAAAGGTCATTGATTTCA*TCATATGTAGCTGTGGGAGTT
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TA*CGGGTCTATCG

QA 1 854 1 854
DS 

RD RS1F208TF 588 0 0
G
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TTTGGAGAATGCTCCGTCTGGAGCGTATATCTGCTTCAGTTCTCGTTCTCCTTGCTCGAC
ATTCATCATGATGTGTTGTTGTCGGTTTGTTTAGTTTTAGTTCTTTCTAAGAGTGGTGAT
TAGTCATGTCTTGGAAGTAAGGAATAATGCAGCTAATCTTTTGCTACTAAAGGTCATTGA
TTTCAATCATATGTAGCTGTGGGAGTTCTGCGTTGGCCCTCTCATATCAGGAATCATCTT
CATTTAAGATGTCACAGCTTGGTTATCTAACGGGTCTATCGAGCATTCTCTGTTCTGTCT
CGACTCTTAGGTTTGTGAGACTCTGGGATCTCTTCTACCCCTCTATTGAGGATGGTTTGT
GAGACTCTGGGATATTTTTCTACCCTTCTATTGAGGATGGTTGTATGAATGCCTACTGGC
GTTTTTCATTATTTATGTTTCGTCTTCAGTTCTTCTTCTCTAATTTTAGTACTGTGTGCC
ATATGGCATTTACTTTGAGTTGTAGTCCTTTTTTATCCTAATAAAAA

QA 2 588 2 588
DS 



AS 1 2

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TCTGTTGAGGCATTGTGGTCACAATTGTTTGTATCAAAACATTTGGCTAATGAAAAGTTG
AAGTTGAGTT


BQ
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AF RS1F860JQ C 1
AF RS1F860TF U 1
BS 1 370 RS1F860TF

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AAGTTGAGTT

QA 1 370 1 370
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AAATAAGTGATCCTAGATGATGCTATATCTACTTCCATAGATCACATTGTGGTTAAAGTC
TCTGTTGAGGCATTGTGGTCACAATTGTTTGTATCAAAACATTTGGCTAATGAAAAGTTG
AAGTTGAGTT

QA 1 370 1 370
DS 



AS 1 2

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CTCTCTGTTGGTCTTACCAACTACGCTGCTGCTTACTGTACTGGGCTTCTTTTGGCTCGC
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AAGATGTTGAACGAGGATGAGCCAGAGAAGTTTCAGACTCACTTCAGTCAGTACTTGAAG
AAGGGAGTTGATGCTGAGAAGATGGAGGAGTTGTACAAGAAGGTTCATGCTGCCATCCGT
GCTGACCCCAACTCTAAGAAGACTGTGAAACCTGCTCC


BQ
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AF RS1G691TF U 1
AF RS1EC34TF U 291
BS 1 352 RS1G691TF
BS 353 353 RS1EC34TF
BS 354 604 RS1G691TF
BS 605 818 RS1EC34TF

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AACC

QA 1 604 1 604
DS 

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QA 1 528 1 528
DS 



AS 1 2

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BQ
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BS 758 1121 RS1CV81JQ

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ACAAAACCGAAGGCTACTTTCTCCTGGCTCACAAATAAGATCCTCAAACTGAAAGATGTT
GTCTTCCCACTGATTAAACTACGACTAGAGGATGGACTATCAGCCAGATTCTGGGTTGAC
AACTGGTCACCGCTTGGCAATATTGAAACGTTGCTGAATGCAACCTCAACGAGGCTTGAG
ATTCCACGACAAGCAACAGTGGCATCTCTTTACAGGAATGGCTCGTGGCGTCTCCCTCTT
GTGCTCGCTCCGACGCTCAGCTACAACTGCAAGCACACTTAACTACAGTTAACCTTACTG
CAGTGCCTGACTACTTTGATGGGAAATAGAAGGGAAAATCTCAAACCGATACTCCACAGG
AGAGGTCTATCATTACCTGCGGGAACAACACGACGAGGTTGACTGGGCGAAAGTGGTATG
GACCTCCTATGGGATACCAAGGCACAATTTCCACATGTGGCTTGTTGTTCTGAACCGATG
CCCAACACGAGATCGTCTTCTACGATGGGGACTTCCCGTCTCTCCGCTATGCTTACTCTG
CAACAGGTCACCGGAATCGCGAGATCATCTCTACTTCGACTGCGATTTCGCCTATACCCT
GTGGCTCAATAGCACACGCCGCTGCTCCCTCAATCCCACACGCACTTGGACGGACACGCT
ACAGCAGATGATCGCCTTACCTGCAAACCGCAACTCA

QA 1 757 1 757
DS 

RD RS1CV81JQ 716 0 0
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GGCGAAAGTGGTATGGACCTCCTATGGGATACCAAGGCACAATTTCCACATGTGGCTTGT
TGTTCTGAACCGATGCCCAACACGAGATCGTCTTCTACGATGGGGACTTCCCGTCTCTCC
GCTATGCTTACTCTGCAACAGGTCACCGGAATCGCGAGATCATCTCTACTTCGACTGCGA
TTTCGCCTATACCCTGTGGCTCAATAGCACACGCCGCTGCTCCCTCAATCCCACACGCAC
TTGGACGGACACGCTACAGCAGATGATCGCCTTACCTGCAAACCGCAACTCAAGGCCTCA
TCGACTACTCTCCCTACTGGCTTGGCAATTTACGACTTACTGGATATGGAATGAAAGGAA
CACTAGGTTGCACAAGAACACCTTCAAATCGACTGATCATATCTTTCGGTCGGTTGATCT
TCAGGTTAGGAATAGGATTCAGAGCTTCAGGGAATCGAATCCAAGCCTCTGCTCGAACAT
GATGCAGATATGGTTTCGCCTTGCATGAGGCTCTAACTCCTCCTTTGGTTTCATCGGTGA
ACTCCTCCTCTCGCCACTGAAGAATTGAAGAGTCTCGACTTTCTTTTCTTTGATTTGGAC
TCTAGCATACAATATGGGAATTGAGCTTGGGAAGGCTCTAATGTGTATTTTCAACT

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

CO CL5496Contig1 1026 2 2 U
GATCCAAATCGAAACTCGCTTCGACCGGTCGGTTTTCCTCCGCTTCAAAACCTTGTGAAA
TCCGAAAATCGTTGATGACCCTTGTACAAAGAGGAGCATCAAGGCAGCAAGCCATTACCG
ATTCTGGTCTCACGGGTGGTGTGGTCTCAAATGGAGCTAAGGGACTGTTGTTTCCTTCCG
GAATCCGCAAGGTATGGAATCTTGTCCAGTGAACATCAGGCCCTCTTACTTGTTGGCTAG
ATCTTTTGCGTCCAGAACTTCCACAAGCTGGGAAACATCAGAATAAGGCTAAGAAAGAGG
TGGTGACTGTGGAGGATCCTTTTGATTCTCCGACCTACCATATCCCGGAAAAGCCTGTAA
CGTTTACAGAAGGTGCTTCCTACAGTTTTGTTATTCTGGCCGGGCTTGCGGTCGCTGGGG
CTGGGTACGCTGTGTTTAAAGAGCTCATATTTCAACCAAAAGAGTACAAGGTCTTTGACA
AAGCGTTGAAGAGAATTCAAGATGACGGTCAGGTGAGGGTAAGGATTGGATCCCCCATCA
CAGGCTACGGACAAGAAACCAGAAACCGAGCTGCTCGCCAACGTATACCCAACAGAATAT
TTACAGATGAAGACGGAGTCGAGCATGTGGAGGTAAACTTCTACATCCGTGGGCCTCATG
GTCGCGGGAAAGTGTACACGGAGATGTTTAAAGACAAGGCAGATAAGGAATGGAAATACA
CATACCTGATCGTTGAGATTTTAGCTCCCTCCCCAGCCAAGCTGATGCTGGAGTCCTATC
TGCCCGCCTAGATATCTATTTTATTGCGATTCAGTTTAGTCCGGAAAAGACGCATAAAAG
GCTAGATTGTTTTATCAATCAGTTAAGGGTGATTTTGATTTTGAGAACAAAGAGAGTGAT
CGTGTTTTACACTTGTGCTCTAGGTTTAATCATCAACTCTGGGATCGGACATCTGTCGCA
CTAGCATTGCTAGCTTGAAAACACATAAATTTCATATATTTTTATTAATTAATTTTCACG
AGCATC


BQ
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AF RS1BR41TF U 1
AF RS1BR41JQ C 253
BS 1 557 RS1BR41TF
BS 558 1026 RS1BR41JQ

RD RS1BR41TF 561 0 0
GATCCAAATCGAAACTCGCTTCGACCGGTCGGTTTTCCTCCGCTTCAAAACCTTGTGAAA
TCCGAAAATCGTTGATGACCCTTGTACAAAGAGGAGCATCAAGGCAGCAAGCCATTACCG
ATTCTGGTCTCACGGGTGGTGTGGTCTCAAATGGAGCTAAGGGACTGTTGTTTCCTTCCG
GAATCCGCAAGGTATGGAATCTTGTCCAGTGAACATCAGGCCCTCTTACTTGTTGGCTAG
ATCTTTTGCGTCCAGAACTTCCACAAGCTGGGAAACATCAGAATAAGGCTAAGAAAGAGG
TGGTGACTGTGGAGGATCCTTTTGATTCTCCGACCTACCATATCCCGGAAAAGCCTGTAA
CGTTTACAGAAGGTGCTTCCTACAGTTTTGTTATTCTGGCCGGGCTTGCGGTCGCTGGGG
CTGGGTACGCTGTGTTTAAAGAGCTCATATTTCAACCAAAAGAGTACAAGGTCTTTGACA
AAGCGTTGAAGAGAATTCAAGATGACGGTCAGGTGAGGGTAAGGATTGGATCCCCCATCA
CAGGCTACGGACAAGAA
CCAG

QA 1 557 1 557
DS 

RD RS1BR41JQ 774 0 0
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AGGATCCTTTTGATTCTCCGACCTACCATATCCCGGAAAAGCCTGTAACGTTTACAGAAG
GTGCTTCCTACAGTTTTGTTATTCTGGCCGGGCTTGCGGTCGCTGGGGCTGGGTACGCTG
TGTTTAAAGAGCTCATATTTCAACCAAAAGAGTACAAGGTCTTTGACAAAGCGTTGAAGA
GAATTCAAGATGACGGTCAGGTGAGGGTAAGGATTGGATCCCCCATCACAGGCTACGGAC
AAGAAACCAGAAACCGAGCTGCTCGCCAACGTATACCCAACAGAATATTTACAGATGAAG
ACGGAGTCGAGCATGTGGAGGTAAACTTCTACATCCGTGGGCCTCATGGTCGCGGGAAAG
TGTACACGGAGATGTTTAAAGACAAGGCAGATAAGGAATGGAAATACACATACCTGATCG
TTGAGATTTTAGCTCCCTCCCCAGCCAAGCTGATGCTGGAGTCCTATCTGCCCGCCTAGA
TATCTATTTTATTGCGATTCAGTTTAGTCCGGAAAAGACGCATAAAAGGCTAGATTGTTT
TATCAATCAGTTAAGGGTGATTTTGATTTTGAGAACAAAGAGAGTGATCGTGTTTTACAC
TTGTGCTCTAGGTTTAATCATCAACTCTGGGATCGGACATCTGTCGCACTAGCATTGCTA
GCTTGAAAACACATAAATTTCATATATTTTTATTAATTAATTTTCACGAGCATC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL5497Contig1 1091 2 4 U
GGAGTCGCCGGTTTCTGACTCGCGGAAAGGCGAAATCAAGGGCTAACGCCGTGGATTAGA
CGAGGCCGGATCCAGCGACGAGGGTGAGGGGAAGGAGAGTGATGACGAAGAAGATGAAGA
AGCGTACGATGTTGAGAAGGAGATGAAGAGGAGAGCTAAGGAGCTGCAGGACATGAAGGA
GCTTGAGAGGAAAGCAGAGGAGTTGCAGTATAAGATTGATGAAGAAGGTGATGATGATGA
TTCAGAAGAGAAGAAGAGGATGAGGGTTAAACGAGAGCTTGAAAAGGTAGCTCAGGAGCA
GGCAGAGAGGAGAGCAACTGCAGAATTGATGTTTGAGTTGGGACAAAAGGCTTATGGTAA
AGGCATGTATGGACGAGCGATTGAGTTTCTTGAAGGAGCTCTTACTATTATCCCAAGGCC
AACGCTCTTTGGTGGTGAGATTCAAATTTGGTTAGCTATGGCATATGAGGCCAATAATCG
CCACGCTGATTGCATTGATCTTTATCAGCAATTAGAGAAGAGACACCCGAGTCCTGGTAT
CCGTCGTCAAGCCTCTGAGCTTAGGTATATCTTGCAAGCTCCTAAGCTCAAGATCTCTCA
GGAGGAAATGGTTACCATACCCATGATCGGTTCAAGCTACGACAGCTATGCAGTGACATG
GAGTGACAAGGAGAGGGACAGGGACAGGAGGATGAATGAATCGACTACGAATCAGGTCGA
GTCGAGTGAAGACTTTCTAGGAAAGCTCTTGGTTTGGCGACCCCCTGTCGGGATGGAGAA
GAACAAAGTCTTTTGGCTTTCTTTGACACTGTGGTTTGGTTTAGTTGGAGCAGCACTTTT
GCTACAAAGATAAGTGAGAGGAGGAAAAGACTCTTTCGTCCCAGGTCTGGTACTGTTTCA
TCTCTCTTTCTTTCACACTTGTCTTGTAATTATATTTGAATATGGATGTATAAAACTTGC
AAGTAGATGTAATCATATCTCATTGTAGATAAAAAGTGTTTGATGTCTGGAATTATTTTT
CACTTTGTTCTGTATTACTACTGTACTGTAATTGTTTATTCAGAAAAAAAATTGTTTAAA
GGCAAAAGCCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B745TF U 1
AF RS1B745JQ C 575
BS 1 601 RS1B745TF
BS 602 602 RS1B745JQ
BS 603 682 RS1B745TF
BS 683 1091 RS1B745JQ

RD RS1B745TF 685 0 0
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CGAGGCCGGATCCAGCGACGAGGGTGAGGGGAAGGAGAGTGATGACGAAGAAGATGAAGA
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GCTTGAGAGGAAAGCAGAGGAGTTGCAGTATAAGATTGATGAAGAAGGTGATGATGATGA
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AGGCATGTATGGACGAGCGATTGAGTTTCTTGAAGGAGCTCTTACTATTATCCCAAGGCC
AACGCTCTTTGGTGGTGAGATTCAAATTTGGTTAGCTATGGCATATGAGGCCAATAATCG
CCACGCTGATTGCATTGATCTTTATCAGCAATTAGAGAAGAGACACCCGAGTCCTGGTAT
CCGTCGTCAAGCCTCTGAGCTTAGGTATATCTTGCAAGCTCCTAAGCTCAAGATCTCTCA
G*AGGAAATGGTTACCATACCCATGATCGGTTCAAGCTACGACAGCTATGCAGTGACATG
GAGTGACAAGGAGAGGGACAGG
ACA

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1B745JQ 517 0 0
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AGCTACGACAGCTATGCAGTGACATGGAGTGACAAGGAGAGGGACAGGGACAGGAGGATG
AATGAATCGACTACGAATCAGGTCGAGTCGAGTGAAGACTTTCTAGGAAAGCTCTTGGTT
TGGCGACCCCCTGTCGGGATGGAGAAGAACAAAGTCTTTTGGCTTTCTTTGACACTGTGG
TTTGGTTTAGTTGGAGCAGCACTTTTGCTACAAAGATAAGTGAGAGGAGGAAAAGACTCT
TTCGTCCCAGGTCTGGTACTGTTTCATCTCTCTTTCTTTCACACTTGTCTTGTAATTATA
TTTGAATATGGATGTATAAAACTTGCAAGTAGATGTAATCATATCTCATTGTAGATAAAA
AGTGTTTGATGTCTGGAATTATTTTTCACTTTGTTCTGTATTACTACTGTACTGTAATTG
TTTATTCAGAAAAAAAATTGTTTAAAGGCAAAAGCCC

QA 1 517 1 517
DS 



AS 1 2

CO CL5498Contig1 1211 2 2 U
GGGGGAACGAGCTTGACGTATAGGGCAGAAGAAGGATGTTACAGTTTACAGATTGATCAC
ACGAGGGACAATTGGGGAGAAAGTATATCATAGACAGATATATAAACATTTTCTCACCAA
TAGGATCCTGAAGAATCCACAGCAGAAAAGATTCTTCAAAGCTAGGGATATGAAAGATCT
TTTCATCCTGAATGATGATGGTGACAGCAACGCATCCACGGAGACTTCTAACATCTTCAG
TCAGCTGTCTGAAGATATAAACATCATAGGAGCTCAAACAGAGAGTACAACCGATACCAC
CACACAACTTGATATTCACGATGCAGCAGATGAAGTCTCAGGGGAAAAAGGTGCGGAAAC
CACAGATAGAAATGGTGAGCCAGTGGATGAAGAGACGAATATCTTGAAGAGTCTCTTCGA
CGCACATGGAATACATAGTGCTGTGAACCACGACGCCATCATTAACGCAAACGACGAGGA
AGAGAAGATGAGACTTGAACACCAGGCATCTCAAGTAGCACAGAGAGCCGCGGAAGCATT
GCGCCAATCACGGATGCTGCGTAGCCGAGAAAGCATCTCAGTGCCCACATGGACGGGAAG
ATCTGGCTGTGCAGGTGCACCTTCATCTGTCCGGAGGAGATTCGGTTCAACTGTGAATTC
CCGGTTAACCACAGCAGACAAATCATCAGCTGTCAAGAACGGTATCAGCGCGGGTCTATC
TTCAGGCAAAGCACCGTCTTCCGCAGAGCTTCTCAGCAAAATCCGAGGGAACAGAGAACA
AGCCATTGGCGTTGCCCTTGAGCATACGCAAACTCCAAACCCGTCTTCTTCTTCGTTGCA
GCCCGAGGTCCTGATCCGACAGATATGCAGCTTTGTACAACGAAGAGGCGGAAGCACGGA
CACGAGCAGCATTGTCAACCATTTTTCGGACAGAGTCCCTGCTAAAGATGTACCGTTGTT
TAAGAGTCTCTTGAAGGAGATTGCCACGCTTAGGAAGGATCCAAACGGTTCGGTGTGGGT
CCTCAAATCAGAGTACAAAGACTGAAACGAGGAGTCTTTGTCACAACATAGAAATGTCTC
TTCGAAATTTTTTGGACCATGCAAAAGCGATCTTGCTTTGCTGTACAGTTAGATGGCTGA
GTTAAACACATTTATGATGGTACGATGAAGATGTTTAGGCTTAAATAATAACAGGCCTTG
TTTGAGCTTTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AH87TF U 1
AF RS1AH87JQ C 339
BS 1 675 RS1AH87TF
BS 676 1211 RS1AH87JQ

RD RS1AH87TF 675 0 0
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ACGAGGGACAATTGGGGAGAAAGTATATCATAGACAGATATATAAACATTTTCTCACCAA
TAGGATCCTGAAGAATCCACAGCAGAAAAGATTCTTCAAAGCTAGGGATATGAAAGATCT
TTTCATCCTGAATGATGATGGTGACAGCAACGCATCCACGGAGACTTCTAACATCTTCAG
TCAGCTGTCTGAAGATATAAACATCATAGGAGCTCAAACAGAGAGTACAACCGATACCAC
CACACAACTTGATATTCACGATGCAGCAGATGAAGTCTCAGGGGAAAAAGGTGCGGAAAC
CACAGATAGAAATGGTGAGCCAGTGGATGAAGAGACGAATATCTTGAAGAGTCTCTTCGA
CGCACATGGAATACATAGTGCTGTGAACCACGACGCCATCATTAACGCAAACGACGAGGA
AGAGAAGATGAGACTTGAACACCAGGCATCTCAAGTAGCACAGAGAGCCGCGGAAGCATT
GCGCCAATCACGGATGCTGCGTAGCCGAGAAAGCATCTCAGTGCCCACATGGACGGGAAG
ATCTGGCTGTGCAGGTGCACCTTCATCTGTCCGGAGGAGATTCGGTTCAACTGTGAATTC
CCGGTTAACCACAGC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1AH87JQ 873 0 0
CAGGGGAAAAAGGTGCGGAAACCACAGATAGAAATGGTGAGCCAGTGGATGAAGAGACGA
ATATCTTGAAGAGTCTCTTCGACGCACATGGAATACATAGTGCTGTGAACCACGACGCCA
TCATTAACGCAAACGACGAGGAAGAGAAGATGAGACTTGAACACCAGGCATCTCAAGTAG
CACAGAGAGCCGCGGAAGCATTGCGCCAATCACGGATGCTGCGTAGCCGAGAAAGCATCT
CAGTGCCCACATGGACGGGAAGATCTGGCTGTGCAGGTGCACCTTCATCTGTCCGGAGGA
GATTCGGTTCAACTGTGAATTCCCGGTTAACCACAGCAGACAAATCATCAGCTGTCAAGA
ACGGTATCAGCGCGGGTCTATCTTCAGGCAAAGCACCGTCTTCCGCAGAGCTTCTCAGCA
AAATCCGAGGGAACAGAGAACAAGCCATTGGCGTTGCCCTTGAGCATACGCAAACTCCAA
ACCCGTCTTCTTCTTCGTTGCAGCCCGAGGTCCTGATCCGACAGATATGCAGCTTTGTAC
AACGAAGAGGCGGAAGCACGGACACGAGCAGCATTGTCAACCATTTTTCGGACAGAGTCC
CTGCTAAAGATGTACCGTTGTTTAAGAGTCTCTTGAAGGAGATTGCCACGCTTAGGAAGG
ATCCAAACGGTTCGGTGTGGGTCCTCAAATCAGAGTACAAAGACTGAAACGAGGAGTCTT
TGTCACAACATAGAAATGTCTCTTCGAAATTTTTTGGACCATGCAAAAGCGATCTTGCTT
TGCTGTACAGTTAGATGGCTGAGTTAAACACATTTATGATGGTACGATGAAGATGTTTAG
GCTTAAATAATAACAGGCCTTGTTTGAGCTTTC

QA 1 873 1 873
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5500Contig1 1208 2 4 U
GGGATCTAGAGGAGCCAGAGAGCGAGAGAGAGAGAGAAACCATTACATTGATCATGAGCG
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AGAAATGGAACAAATGGTGTATATAGTCTCTGTTGTTTTCACTTGTCTTGCTCTTCTTAT
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TGGAAGATTTGATATTTTACAAGCTTGCAAAAGTCTTGCAGAGAAGGCGAAAAACGGGCT
GATCCAAGTAGAGGACATTGACGAGGATGTGATGGAGAAAGAGTTGATGACAAACTGTAG
TGAGTTCCCAAACCCTGACCTATTGATTAGAACGAGCGGAGAGCAAAGGATCAGTAACTT
CTTCTTATGGCAATCTGCTTACACTGAGCTCTACTTTCCTAACGTTCTATGGCCTGACTT
CGGTGAGGCTGAGTATCTTGAAGCCTTGACTTGGTATCAGCAAAGGCAGAGGCGATTCGG
TCTAAGAGTTTAGAATTTGAGTGTTATGTCCCACAAATAAATTGTTTCAAGTATAGTAGT
GGTCCGATTGTTTCAAACATATATACTTTGCCTTTGTTTTTTACGTTTACTAATTATAAG
TGACTTTTTCACACTCACAAATTATGAAAGTTGTAAATAACTATTTAAAACTATATCATG
ATTTAAGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H308TF U 1
AF RS1H308JQB C 363
BS 1 647 RS1H308TF
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CCCTGTTATCTTCGTAACTCGGCGTCTAAGTGTTCATCTCTCCTTCAAAAACATCCTCAG
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TACAATGGGAGAGGAAGAGAAACGACGGAGACTGCCAAAGCACGTGGCGATTATATTGGA
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TG

QA 1 722 1 722
DS 

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TCTCGGTGATTGGAAACCGAACAAAAATCTCCCAGTCGCTTCTAGGTTTGATAACAGAAG
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GTGAGGCTGAGTATCTTGAAGCCTTGACTTGGTATCAGCAAAGGCAGAGGCGATTCGGTC
TAAGAGTTTAGAATTTGAGTGTTATGTCCCACAAATAAATTGTTTCAAGTATAGTAGTGG
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TTAAGT

QA 1 846 1 846
DS 



AS 1 2

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AACCATCTCAAATCACTCGGTTCCTCTTCACCAAGCCAACACGGTCTTGTTTCTTCAGGG
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ATCAGAAACTTCGATGTGGTGCCTCAGGAGTGCGTGTCTCACGTCCAGAATTACATGACG
TCATCGCAGTACGAGAATGACGTGGAGAGAGCCGGTGATGAGGTCATCCTTCATTTCGGG
AGCATGTGTTGTGGCAAGAGCAAGTGTGATGGTATGGACGCTTGGATCTTTGATATCGAT
GACACGCTTCTCTCTACCATTCCTTACCACAAGAGCAATGGCTTCTTCGGAGGAGAGAAA
CTGAATTCTACGAAGTTTGAGGATTGGATAAGGAAGAGGAAAGCACCATCAGTGCCACAC
ATGGTGAAGTTGTACCATGAGATCAGAGAAAGAGGCATCAAGATTTTCTTAATCTCTTCC
CGGAAAGAGTATCTCAGATCTGCCACCGTTGACAACCTGATCCAAGCCGGTTACTATGGC
TGGTCCAACCTCATCCTCAGGGGGCTAGAAGATGAACAAAAAGAAGTCAAACAATACAAG
GCAGAGACAGGACATGGCTAACGAGTCTTGGTTACAGAGTTTTGGGAGTGATGGCAGACC
AATGGAGCAGCTTCGCAGGCTGTCCTCTTCCCAAGAGAACCTTCAAGCTCCCCAACTCCA
TCTACTATGTCGCCTGATCAAAACACAATAAAAACGTTGGTTTTAGCTTTCATTGTACAA
GAAGAAGAATCCATAAATAAGAGAGAACAGTTTTGGTTCTGATTCTTGTTTTTTTGCTTT


BQ
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DS 

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AGCATGTGTTGTGGCAAGAGCAAGTGTGATGGTATGGACGCTTGGATCTTTGATATCGAT
GACACGCTTCTCTCTACCATTCCTTACCACAAGAGCAATGGCTTCTTCGGAGGAGAGAAA
CTGAATTCTACGAAGTTTGAGGATTGGATAAGGAAGAGGAAAGCACCATCAGTGCCACAC
ATGGTGAAGTTGTACCATGAGATCAGAGAAAGAGGCATCAAGATTTTCTTAATCTCTTCC
CGGAAAGAGTATCTCAGATCTGCCACCGTTGACAACCTGATCCAAGCCGGTTACTATGGC
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GCAGAGACAGGACATGGCTAACGAGTCTTGGTTACAGAGTTTTGGGAGTGATGGCAGACC
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DS 



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AGCTTCTACTTACACACTCCAAGAAGGAGATCTCCCCTCCCGATCCAGCTCTCTCTATCT
ATTCGACGTCGAACACTCTCGTTTAAATCTCTTACACAAAGTCGACACCACCGGAGTCTT
CGATATCCGTTGGAGCCACGGTGGTATCGGAAGCTTGGCGCTTGCTCAAGCTGACGCTGA
TGGTTGCTTGAGAGTTTACAAGGTTGATGACACTGAAGTAGACAAAGGTTACTCTCTGAG
AGAAGTCGCTGGCGAAAAAATCAGTTCATCGATGTGTCTTTATCTCGATTGGGATTATCA
ATCATCGACATCGATTGTGGTTGGTTTATCAGACGGCTCTGCTTCGGTTGTTTCGTTCAC
TGATTCTAATCTAGAAACAGTTCAAGAATGGAAAGGACACGACTTTGAGGTGTGGACAGC
TTCGTTTGATCTCAACAACCCTAGTTTGGTTTATACTGGATCAGATGATTGCAAGTTCAG
CTGTTGGGATATCAGAGATAGTCCCGGGGACAATCGGGTTTTCCAGAATTCGAAAGCTCA
TACGATGGGTGTTTGCTGCGTCTCGCCGAGTCCTAGTGACCCTTACTCTGTGTTCACTGG
GAGTTATGATGAGACCTTGAGGGTTTGGGACACGAGGTCTGTTTCTAGGCCTGTGAACGA
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TGTTGTTTTGGCGGCTTGTATGCATAATGGTTTTGCTGTGGTGAAGGTAGGTGGTGGGGA
AGGTGAAGTGATGGAGAGGTATTACAAGCATGAGTCTCTTGCTTATGGAGCGGATTGGTA
TAAGGGGAAAGATGAGAAGCGGAGTCTTGTGGCAACTTGCTCGTTTTATGATAAGCTTCT
TCGTTTGTGGACGCCTGAAACTGCGTTTGAGCTTTGAAGTTGCTTTGATATTTTTATACT
AGTGTTGAATTTCAAATTGCTATGTTTTTTTTTCTCTCAATAAGAGCTTCAAAATTGGTT
TACGGTGATTCAGCAAAAGACATCAGTTTACCC


BQ
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AF RS1A836JQ C 439
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DS 

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GAGGGTTTGGGACACGAGGTCTGTTTCTAGGCCTGTGAACGAGATATCTGTGTCTTTGGG
GGGAGGAGTGTGGAGAATCAAGCATCATCCGTCTGTGAGCGGTGTTGTTTTGGCGGCTTG
TATGCATAATGGTTTTGCTGTGGTGAAGGTAGGTGGTGGGGAAGGTGAAGTGATGGAGAG
GTATTACAAGCATGAGTCTCTTGCTTATGGAGCGGATTGGTATAAGGGGAAAGATGAGAA
GCGGAGTCTTGTGGCAACTTGCTCGTTTTATGATAAGCTTCTTCGTTTGTGGACGCCTGA
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GACATCAGTTTACCC

QA 1 735 1 735
DS 



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AGATCTTGGGTTGAAAAGGGCAAAGCTTTTCGATTGCCAAACACATATGCCTTCACCAAA
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ACCATAGACGCTGGGATCGTATCATACGGGAAGGGAATGCTTAAGTGTTTACTCGTTGAT
CAAAAAACAGCATGTGATATTATACCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTG
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ATATTTAAGCAAATTGCTGAACTTATGATTCGTTATTTCAAGAAAAGCCCTCTGGTCGGT
CGCAGTGGTGTTCCTATAGTCCCAAAACCTCCAGTACTTTTATCCACAATGACTATGTTC
CGTCTCTACACGGGCCTTCACTTTAAAATACCTTTAAAGATATTGGGATTACTTAGCAAA
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ATGAGATTGGTTAAACTTTATGAACCTTATTTACTCTTCAAGGGCGTATTCGACGATAAA
AACCTGGAAATATTACGAATCAAGAGTGAGGCCGAAGAGACAAACGACTTGCCCGGGTTC
AGCCCCAAATGCATTGATTGGGAAGATTATTTTATCAATACTCATTTCCCTGGCCTCGTT
ACACACGTACTCAATAAGTAAACTCCGAATACAAGTATTATATGAAGTACTATCTATTAA
AAAAGGTATTGTATGAAGTGAAATAAAAAGATATTTGATTGTGTGAATTAAGCCTATAAT
ATAAAATAACTAATT


BQ
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AF RS1DU31TF U 1
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CCG

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CATTTCCCTGGCCTCGTTACACACGTACTCAATAAGTAAACTCCGAATACAAGTATTATA
TGAAGTACTATCTATTAAAAAAGGTATTGTATGAAGTGAAATAAAAAGATATTTGATTGT
GTGAATTAAGCCTATAATATAAAATAACTAATT

QA 1 573 1 573
DS 



AS 1 2

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TACTATCTCTCTTTTGTATGTTTTTGTTTTTATTTCTTACCTTATTATTCGATTATTTAC
GTAATAATTAAGAAGACCATCACTTC


BQ
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AF RS1ES54TF U 1
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GTTAGTCTTTTGGTCGA

QA 1 737 1 737
DS 

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TTCTCTATAATAGGTGCACTTGTGGTTACTCTGTACCACGGTCCAGTGCTTATGTCTTCA
CACTCTGATTGGGTTATTGGAGGTGGCCTTCTTGCTCTTCAATACATCCTTATCTCCTTC
TCTTATCTTGTTATGGCGCACACAATGAGTCGATATCCATCTACGGTCATTGTAACGCTA
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GCTTTGAATTCGGGATACTATATTATACATACATGGGCGGTGAGTCAAAAGGACCAGTGT
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TCGGCGAGACGATCTACCTTGGAATTTTGATAGGAGGAATATTGATAGCAATAGGATTTT
ACATGGTATTGTGGGGCAAAGCCAAGGAAGCCAAAGTGGACATACTAGATTCGCCTCCTT
CACAAAAAGCTCCTCTTTTGGGAAATTAAAAGCTACTAAATATGTTTATATTATAAACCT
AGATAATTTTTAAATTATAACAAGAAAGCATTCTTCTACTATCTCTCTTTTGTATGTTTT
TGTTTTTATTTCTTACCTTATTATTCGATTATTTACGTAATAATTAAGAAGACCATCACT
TC

QA 19 860 19 860
DS 



AS 1 2

CO CL5505Contig1 324 2 1 U
GGGTTTCGCGGCGTCTCAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGGGATAGTAAGTAAAGCT
GGAGAATGGTCGTTCAAGGCCTTCACGGCGGGGCTAGGGTTCGCCACCATCTACCTTACA
GCCACTTTCTCCGTTAATGTCTACCGTGGCCTTTCCTGGCACAATGCTCAATCTAAGCTG
GAGATGGAGCAATCTGAAGAAGAAACCGAATGATCTGAATTAGGCTCTGCTCTCTCACCA
GCAGATGCTTCTTTCCATTAATATTGCGAATGTTGTTTTGTCGCATACACAAAGTATATC
TTTGTTTCGATTCTAGGAGCAATG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1G902JQ C 1
AF RS1G902TF U 1
BS 1 324 RS1G902TF

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GGGTTTCGCGGCGTCTCAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGGGATAGTAAGTAAAGCT
GGAGAATGGTCGTTCAAGGCCTTCACGGCGGGGCTAGGGTTCGCCACCATCTACCTTACA
GCCACTTTTTCCGTTAATGTCTACCGTGGCCTTTCCTGGCACAATGCTCAATTTAAGCTG
GAGATGGAGCAATCTGAAGAAGAAACCGAATGATTTGAATTAGGCTTTGCTCTCTCACCA
GCAGATGCTTCTTTCCATTAATATTGCGAATGTTGTTTTGTCGCATACACAAAGTATATC
TTTGTTTCGATTCTAGGAGCAATG

QA 1 324 1 324
DS 

RD RS1G902TF 324 0 0
GGGTTTCGCGGCGTCTCAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGGGATAGTAAGTAAAGCT
GGAGAATGGTCGTTCAAGGCCTTCACGGCGGGGCTAGGGTTCGCCACCATCTACCTTACA
GCCACTTTCTCCGTTAATGTCTACCGTGGCCTTTCCTGGCACAATGCTCAATCTAAGCTG
GAGATGGAGCAATCTGAAGAAGAAACCGAATGATCTGAATTAGGCTCTGCTCTCTCACCA
GCAGATGCTTCTTTCCATTAATATTGCGAATGTTGTTTTGTCGCATACACAAAGTATATC
TTTGTTTCGATTCTAGGAGCAATG

QA 1 324 1 324
DS 



AS 1 2

CO CL5506Contig1 650 2 2 U
GGAGCGGTGGTGGTGTAGAGTCGAAGATGAAGATGAAATCATTCAAGGAAGAATTGACGT
TGGATGAAAGGCTCGCGGAATCGAGGGAGATCATCGCCAAGTACCCTACTCGGATTCCTG
TAATTGCTGAGAAGTATTCTAAAACCGATCTGCCTGCAATCGAGAAAAAGAAGTTTCTAG
TTCCACGAGATATGTCGGTTGGACAATTCATCTATATCTTGAGTGCTAGGTTACACTTGT
CTCCTGGCAAAGCCTTGTTCGTCTTCGTCAACAACACTCTCCCTCAAACTTCTGCTCTGA
TGGACTCCGTCTACGAGACTTACAAAGACGAAGATGGATTCGTTTGCATGTGCTACAGCA
GTGAGAAAACCTTTGGTTGATTTGATACACCAAACCATGCTTGTACATACACTTCTTTCT
TCATAAGCTGTTGTTGTTCACTACTTCATAAGAGACTTGTAAGCTTATGTTGAGTACTGC
TTGTTTTTTACCCTTGAGACTTGGTTCATATGTCGCAATTACAATATCCACAAAAAGCTC
TCTTTGTCATCATTGTTCTTTTGTGTTGCCAGGGGAAGAGTTTTTGCACTTACCTTTGGA
GTTCGCTAGTAGTTTTTTGTCAGGCTTTCATTTTACATACAAAAAAGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CX89TF U 1
AF RS1CX89JQ C 263
BS 1 615 RS1CX89TF
BS 616 650 RS1CX89JQ

RD RS1CX89TF 619 0 0
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TAATTGCTGAGAAGTATTCTAAAACCGATCTGCCTGCAATCGAGAAAAAGAAGTTTCTAG
TTCCACGAGATATGTCGGTTGGACAATTCATCTATATCTTGAGTGCTAGGTTACACTTGT
CTCCTGGCAAAGCCTTGTTCGTCTTCGTCAACAACACTCTCCCTCAAACTTCTGCTCTGA
TGGACTCCGTCTACGAGACTTACAAAGACGAAGATGGATTCGTTTGCATGTGCTACAGCA
GTGAGAAAACCTTTGGTTGATTTGATACACCAAACCATGCTTGTACATACACTTCTTTCT
TCATAAGCTGTTGTTGTTCACTACTTCATAAGAGACTTGTAAGCTTATGTTGAGTACTGC
TTGTTTTTTACCCTTGAGACTTGGTTCATATGTCGCAATTACAATATCCACAAAAAGCTC
TCTTTGTCATCATTGTTCTTTTGTGTTGCCAGGGGAAGAGTTTTTGCACTTACCTTTGGA
GTTCGCTAGTAGTTT
CTTG

QA 1 615 1 615
DS 

RD RS1CX89JQ 388 0 0
TTTT
GTCAACAACACTTTCCCTCAAACTTTTGTTTTGATGGACTCCGTTTACGAGACTTACAAA
GACGAAGATGGATTCGTTTGCATGTGCTACAGCAGTGAGAAAACCTTTGGTTGATTTGAT
ACACCAAACCATGCTTGTACATACACTTCTTTTTTCATAAGCTGTTGTTGTTCACTACTT
CATAAGAGACTTGTAAGCTTATGTTGAGTACTGCTTGTTTTTTACCCTTGAGACTTGGTT
CATATGTCGCAATTACAATATCCCCAAAAAGCTTTTTTTGTCATCATTGTTTTTTTGTGT
TGCCAGGGGAAGAGTTTTTGCACTTACCTTTGGAGTTCGCTAGTAGTTTTTTGTCAGGCT
TTCATTTTACATACAAAAAAGCTT

QA 5 388 5 388
DS 



AS 1 2

CO CL5507Contig1 624 2 1 U
GGGTTCTTCTGATTCACTCTAACACTTGTGCCCGCTCTCTTCTTTGTCTTCTTCCCTCCT
TCCTCCGTCCTCAAATTTGCTTCGTTCACTTACAGATTCTCTCACCAGACACAAACTCCA
GATTCACTCCGACAATGGAAACATTCCGAACATTCCATCTCTTCTTTTTCTTCTCTCACT
TTATCTTCTTGACGACACACACTACGCTTACGTCCGCAAACTCTCAGATCGTTGACTGTA
CAATGTGCACGTCTTGCGACAATCCATGTCAGCCAAATCCCTCTCCTCCACCACCGACTC
CATCTCCGCCACCTCCAACCACGACCACTGCCTGTCCTCCGCCTCCTAGCTCTGGGGGTG
GTGGTAGTGGTGGTCCTTACTATTACTACCCACCTCCTTCTCCTCCTCCTTACGCTCCTA
CTTTATAACTCAGAATCATGATGTGTTGACTTTATGATTTTTCTTTGAGTTGAGTCGTGT
AATCCAGAGCCTTCGTTGTAAATAAAATCTTTCCTAATGATGCATCCTTTTGTTGAAAAC
ACAAAAGAAACAAGTTACAGAGCTTTGTTTGTATCTCCTTTTGTTATATTTTTCTTCAAT
TGATCTGTTAAAGAAGATTTTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AS53TF U 1
AF RS1AS53JQ C 270
BS 1 624 RS1AS53TF

RD RS1AS53TF 624 0 0
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TCCTCCGTCCTCAAATTTGCTTCGTTCACTTACAGATTCTCTCACCAGACACAAACTCCA
GATTCACTCCGACAATGGAAACATTCCGAACATTCCATCTCTTCTTTTTCTTCTCTCACT
TTATCTTCTTGACGACACACACTACGCTTACGTCCGCAAACTCTCAGATCGTTGACTGTA
CAATGTGCACGTCTTGCGACAATCCATGTCAGCCAAATCCCTCTCCTCCACCACCGACTC
CATCTCCGCCACCTCCAACCACGACCACTGCCTGTCCTCCGCCTCCTAGCTCTGGGGGTG
GTGGTAGTGGTGGTCCTTACTATTACTACCCACCTCCTTCTCCTCCTCCTTACGCTCCTA
CTTTATAACTCAGAATCATGATGTGTTGACTTTATGATTTTTCTTTGAGTTGAGTCGTGT
AATCCAGAGCCTTCGTTGTAAATAAAATCTTTCCTAATGATGCATCCTTTTGTTGAAAAC
ACAAAAGAAACAAGTTACAGAGCTTTGTTTGTATCTCCTTTTGTTATATTTTTCTTCAAT
TGATCTGTTAAAGAAGATTTTTGG

QA 1 624 1 624
DS 

RD RS1AS53JQ 355 0 0
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GCCTGTCCTCCGCCTCCTAGCTCTGGGGGTGGTGGTAGTGGTGGTCCTTACTATTACTAC
CCACCTCCTTTTCCTCCTCCTTACGCTCCTACTTTATAACTCAGAATCATGATGTGTTGA
CTTTATGATTTTTCTTTGAGTTGAGTCGTGTAATCCAGAGCCTTCGTTGTAAATAAAATC
TTTCCTAATGATGCATCCTTTTGTTGAAAACACAAAAGAAACAAGTTACAGAGCTTTGTT
TGTATCTCCTTTTGTTATATTTTTCTTCAATTGATCTGTTAAAGAAGATTTTTGG

QA 1 355 1 355
DS 



AS 1 2

CO CL5508Contig1 1212 2 2 U
GGATCCCATCTCTCAAAAAACCCTAATCACTCTCTCTCATTTCTCCACCGCCGCTGTTCA
ACGGTGGTCATTTTCTCATCCGATCAAAACCGATCTTCTCCTACACAAACACCAACACCA
TGGCTCCTACCTCTTCTGCTACCGCGATTGCGACTGCAACATCTTCCTCAGACGCCAGCG
AAGGACCAGTGATGGGACTCATCAACAAACGCCTCCGCGCCCTCCGCAAGAAACTCAACC
GAATCGCTCAGATGGAAGAATCGATCTCCCAGGGTAAAACCCTAAACAAGGAGCAACAAG
AAGTCCTCCGCTCAAAACCTTCCGTCCTCGTCCTCATCGAAGAGCTCGACAAGCTCCGCG
CTCCTCTCTCCTCCGCCGTCTCCGAAGAAATCACCCTCGCCACCACTCACATCCACCACC
ACAATCAATCTCCTCCTCCCTCTTCGACGTGAGGTCGCAGAGCGAGTTGGCTTCGATCAT
GCTGACGAGGACGCACGAGAGGGGTTGCTGTTTGGTTTACGATACGGTTACGGATGAATC
CACTGATCTGCTCTGTGATAAGGATCTGGATTCGTTCTTGTCTCATAAGAACGCCTTGGA
GCGTTGCGTCGAGCATGCTAAGCTTTGGTTGGCTAATTCCGACCAGCCGATTGCTTCCAA
CTGCAATGTTTCATATGCTGGATTGAGAGAGAAGTTGAAGAAGATTATGGGTTCTAATTA
CTTCACTATTACTCCTGAGATGGTAGCTCCCGTTGAAGCAGCAGCGGCTGCATCTGGTGG
TAACTATGGTGCTTTCCAAGTCGCTGGTGACAGTGAACAAAAGGAAGAAGACGCATCAAA
CCGTAAAGAACAAGAATCTGCTGTTAATGATCAACCTGAGCAACCAAAGGACGAGTCAGT
GACTGAAGGAGAGGTGGTTCAAGAACAGCAGGAACAAGGCTATACTCAGGTGGAAGGAGG
GAGGCCAAGGAGAGATTATCAGCAACAGTATGTGCCTCGTGGGACCTACCAGAACCAGAG
AGGTCATAGAGGTGCTCGAAGAGGTCATTCCAATGGCCCCCGAGGAGGTCGAGGTGGTGG
CGGTGGAGGCTACTCGAATGGGCGGTATGAATCTTATGATAACGCCGGTGGAAACGGTCA
CCAAAGGAGCTACTACAACAACAGAGGAAGGGGACGTGGTGGTGGTGGAGGAAATGGTCA
TTCATACAACAA


BQ
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CAA

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DS 



AS 1 2

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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BU86TF U 1
AF RS1BU86JQ C 360
BS 1 635 RS1BU86TF
BS 636 636 RS1BU86JQ
BS 637 696 RS1BU86TF
BS 697 697 RS1BU86JQ
BS 698 707 RS1BU86TF
BS 708 1091 RS1BU86JQ

RD RS1BU86TF 715 0 0
GCAGAACAAAGTGACATAGTATGACGAACCAGCACACCAATATCTGCCTGAGATGCTCCA
CTGATCATATTTGGTACGTAACTCTTATGACCCTGCAAGTTCAGGAAAGGGAAGAAAATT
TGAAAAATATACTCACCATGAAAGACAAATGAACAAAAAACTATTACTTTAGGTTGATCC
TTACCGGAGCATCCAGAATTGTAAATCTAGTGGTCTCAGTTTCAAAATGAGCCCTTCCAA
CTTCAACAGTTTTACCCTGTCAGGGTAGCAACTAAGTCATACCACATAGCAAAGTTCAAA
ATGCACCATAAACATTGCAGGGAATACAACAACAAGTGAATTCTGTCATTAAAGGCAAAC
AAAGAAACATTAATCAGCCCCAGGAAGTACCTTGGCCCTCTCTTCTTCATTTGTATCCAT
TATATATGCCATACACCTAGCATAGAGGACAATAACAAGTATGAAAACAGTAAAACAGAG
GCATTCCTCATCAGTTAGGATTAATCAGAAAGACTCACCAGCTTTCCCTACTTTTTTCTT
TTGCTTCCTTTTCATACTTCTGGATTTGTCGGTCGTCCACCTGACCGCTAAGGAAGAGAA
TTTGTCCTCCGATTGTGGACTTTCCAGCATCTACA*TGGAAAAAGTGGGCATGTCAGTAT
TAATTAATTAGCTTTGAAACCATGTGTCTAGACAAG*CAACTTTCTA
CAATCTAA

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1BU86JQ 732 0 0
CAAAGAAACATTAATCAGCCCCAGGAAGTACCTTGGCCCTCTCTTCTTCATTTGTATCCA
TTATATATGCCATACACCTAGCATAGAGGACAATAACAAGTATGAAAACAGTAAAACAGA
GGCATTCCTCATCAGTTAGGATTAATCAGAAAGACTCACCAGCTTTCCCTACTTTTTTCT
TTTGCTTCCTTTTCATACTTCTGGATTTGTCGGTCGTCCACCTGACCGCTAAGGAAGAGA
ATTTGTCCTCCGATTGTGGACTTTCCAGCATCTACAATGGAAAAAGTGGGCATGTCAGTA
TTAATTAATTAGCTTTGAAACCATGTGTCTAGACAAGGCAACTTTCTAACAATCTAAACT
GGAACAGACTTTCCCGGAAACTACAGACTAATTAATAACTACTCATTAAGAAAATTGAAT
CGATGGAAACAAATCATCAAGTAGACGGCCATACCAACATGTCCAATGAACACCACATTC
AAATGTCTCTTTTTGTTTGCCTCTGCCTCTTCTTCAGCTTCCTCTTTGGCAGCCTTCTCT
TGAGCTGCCTTCTCTTTAACTAAATTGATTGAATAGACAAGAGACATAAACAAATCTTCA
ATCAGACAACACGATCACAGAAAGATGAAAAACGAGAAGTATAAGAGATATAAGAACCTT
TCGCTGGGTTATGCACTGGATGGAGCACTTCCTGATCATGTTCCTCGGAAGCTGAAACCA
CCAATGTCCAGC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL5510Contig1 672 2 3 U
GCCAACAATTTTGTATGTTAATACTACACGTGTTTGCTTACAGACTGTAACAGCTACATA
TTCCAGAGTGACTAACCAAATTGAGATTCAAACATTTGTAAGTGTGAATTAACTGATCAT
CTAAGTCCTGCTGAAGCTGTTGGATTGCCTCCTCCAGGTCTTCCCATGGCTCTCTGGGCA
AGAGACCCATCGTAATCCCGTTTCTCAAAGGAACTATCCTGAGAGTCAGCTATCTTGTCT
GCGACTCCATAGTCAATGGCTGCTTGTGCTTGGAGATATTTCGGTCGCTTGATGTCCTCG
TTGATCTGCTCTTTAGATTTACATGTTCCCTTAGCTAACAGCTCGATGTAATACTCAGTA
TTTGCATCAAGTTCCTTGGCCTTTATCCACATATCTATGGCAGCTCCACTCGATCTGTTT
ACTTTTGGCAGATATAGTTTTGTTGATGAATGTGGTTGTACGGCACGATAACCCTTTTTA
CCAAGAGAAAGAAGCATTGCTGCTTGACCAAAAGCCATTCCACAATTGATTGTGTATACA
TCTGATTTGCAATAAGAAATGGTGTCAGCTATGGCATAAGCCTCTGTTTCTGACCCAACA
GTCTCCATCTTCTCATTCTGAGTCCCAGGTGAGTTTAGTAGATCCCGACATGAAGGGTGA
GTTGCGAAGCAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B395JQ U 70
AF RS1CK12JQ U 1
BS 1 75 RS1CK12JQ
BS 76 76 RS1B395JQ
BS 77 672 RS1CK12JQ

RD RS1B395JQ 111 0 0
GACTAACCAAATTGAGATTCAAACATTTGTAAGTGTGAATTAACTGATCATCTAAGTCCT
GCTGAAGCTGTTGGATTGCCTCCTCCAGGTCTTCCCATGGCTCTCTGGGCA

QA 1 111 1 111
DS 

RD RS1CK12JQ 672 0 0
GCCAACAATTTTGTATGTTAATACTACACGTGTTTGCTTACAGACTGTAACAGCTACATA
TTCCAGAGTGACTAAGCAAATTGAGATTCAAACATTTGTAAGTGTGAATTAACTGATCAT
CTAAGTCCTGCTGAAGCTGTTGGATTGCCTCCTCCAGGTCTTCCCATGGCTCTCTGGGCA
AGAGACCCATCGTAATCCCGTTTCTCAAAGGAACTATCCTGAGAGTCAGCTATCTTGTCT
GCGACTCCATAGTCAATGGCTGCTTGTGCTTGGAGATATTTCGGTCGCTTGATGTCCTCG
TTGATCTGCTCTTTAGATTTACATGTTCCCTTAGCTAACAGCTCGATGTAATACTCAGTA
TTTGCATCAAGTTCCTTGGCCTTTATCCACATATCTATGGCAGCTCCACTCGATCTGTTT
ACTTTTGGCAGATATAGTTTTGTTGATGAATGTGGTTGTACGGCACGATAACCCTTTTTA
CCAAGAGAAAGAAGCATTGCTGCTTGACCAAAAGCCATTCCACAATTGATTGTGTATACA
TCTGATTTGCAATAAGAAATGGTGTCAGCTATGGCATAAGCCTCTGTTTCTGACCCAACA
GTCTCCATCTTCTCATTCTGAGTCCCAGGTGAGTTTAGTAGATCCCGACATGAAGGGTGA
GTTGCGAAGCAC

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

CO CL5511Contig1 1266 2 2 U
TTGTAAGAGATTGTCTTGTCTTCCGTCTCTACCTTCCATCTCACCCGATCTTTTCGGAGA
ATCAACTTCCAATTTGCCTCTGATTCGTTCCTCGAATCAATAATCAATCACCTGGAGCCA
ATCTCCAAGCTCATGATCTCCAATTGTTTTTGGAACTAAACCTGTATTTGTCCTGACTTG
AAGAGACTTGTGATGGCTTGTAAAGAAGATACTAATGCAGCAGCACAAGACGAAGAAGAA
GCCACCGAGATATGGAAGAGTGAATTGGAATCTCGTCGGTTTCAGGTAGATAGTTTAGAA
GCTGAGCTTTTGGATGTCAAGAGGGCTGCTTACCTTGACTTTGGCTCAGAAGAAGACGCG
AGGAAGGAGTTAGGTCTTCTTTCCGGTAGGGTGAGAGCGACTGCAGTAATGTTGCGCTAT
TTGAGATCAAAAGCTAGACTCTTGGCCATTCCTGATCATCTACCTCAAGTGGAACTGAAA
GGATTAGACTTTCTTGGTTCTTCGTCTTCTTGTGAAGAGGATGGAGCTTATACTAGCGAG
ATGCTCCAGTCCATAGAGATGGTTACCGGTGTGCTGGAGTCTCTTGTTGGGAGAGTTACA
GCAGCAGAGTCCGAGACGGCTGTTCAGAAGGAGATGGCACTTTTGGGAGAGGAGGAGCTT
AGTAGGAAGGCAGTCCAGATCGAGAATCTGTCTTTGAAATTACAGGAGATGGAGAGATTT
GCTCACGGGACTAACGGTGTTCTGAGCGAAATGAGGGAAAGGATTGAGGAACTAGTTGAG
GAGACGATGAGGCAGAGGGAAAAAGCTGTCGAAAATGAAGGGTAGCTGTGTCGTGTGAAG
AGAGAGTTCGAGTCTCTCAAAAGCTATGTCAGTACTTTTACCAGCGTTAGAGAAACACTT
CTTTCTTCCGAGAGACAATTCAAAACCATCGAAGGGCTCTTTGAACGGTTGGTGACTAAG
ACGACACAACTAGAGGGGGAGAAGGCGCAAAAGGAGGTTGAAGTTCAGAAACTGATGGAA
GAGAATGTGAAGCTGACGGCACTTCTTGACAAGAAAGAAGCTCAGCTTCTAGTTTTGAAT
GAACAATGCAAAGTCATGGCTTTAAGTGCGTCAGACATCTGAAATAATTGGCTTATATCT
TGTCCAGCGTTGTTTTTTTTTTTGGGTCTTCAGATTTGTTGCAAGGCTTCTTAACTCTAA
TGGTCTTTTGTTTCAGAGAGAACATTCTTGTGACTCTTTTATCTGTAAATTTATTAAGGC
TTGTGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1DK37TF U 1
AF RS1DK37JQ C 493
BS 1 597 RS1DK37TF
BS 598 1266 RS1DK37JQ

RD RS1DK37TF 597 0 0
TTGTAAGAGATTGTCTTGTCTTCCGTCTCTACCTTCCATCTCACCCGATCTTTTCGGAGA
ATCAACTTCCAATTTGCCTCTGATTCGTTCCTCGAATCAATAATCAATCACCTGGAGCCA
ATCTCCAAGCTCATGATCTCCAATTGTTTTTGGAACTAAACCTGTATTTGTCCTGACTTG
AAGAGACTTGTGATGGCTTGTAAAGAAGATACTAATGCAGCAGCACAAGACGAAGAAGAA
GCCACCGAGATATGGAAGAGTGAATTGGAATCTCGTCGGTTTCAGGTAGATAGTTTAGAA
GCTGAGCTTTTGGATGTCAAGAGGGCTGCTTACCTTGACTTTGGCTCAGAAGAAGACGCG
AGGAAGGAGTTAGGTCTTCTTTCCGGTAGGGTGAGAGCGACTGCAGTAATGTTGCGCTAT
TTGAGATCAAAAGCTAGACTCTTGGCCATTCCTGATCATCTACCTCAAGTGGAACTGAAA
GGATTAGACTTTCTTGGTTCTTCGTCTTCTTGTGAAGAGGATGGAGCTTATACTAGCGAG
ATGCTCCAGTCCATAGAGATGGTTACCGGTGTGCTGGAGTCTCTTGTTGGGAGAGTT

QA 1 597 1 597
DS 

RD RS1DK37JQ 774 0 0
CTTGGTTCTTCGTCTTCTTGTGAAGAGGATGGAGCTTATACTAGCGAGATGCTCCAGTCC
ATAGAGATGGTTACCGGTGTGCTGGAGTCTCTTGTTGGGAGAGTTACAGCAGCAGAGTCC
GAGACGGCTGTTCAGAAGGAGATGGCACTTTTGGGAGAGGAGGAGCTTAGTAGGAAGGCA
GTCCAGATCGAGAATCTGTCTTTGAAATTACAGGAGATGGAGAGATTTGCTCACGGGACT
AACGGTGTTCTGAGCGAAATGAGGGAAAGGATTGAGGAACTAGTTGAGGAGACGATGAGG
CAGAGGGAAAAAGCTGTCGAAAATGAAGGGTAGCTGTGTCGTGTGAAGAGAGAGTTCGAG
TCTCTCAAAAGCTATGTCAGTACTTTTACCAGCGTTAGAGAAACACTTCTTTCTTCCGAG
AGACAATTCAAAACCATCGAAGGGCTCTTTGAACGGTTGGTGACTAAGACGACACAACTA
GAGGGGGAGAAGGCGCAAAAGGAGGTTGAAGTTCAGAAACTGATGGAAGAGAATGTGAAG
CTGACGGCACTTCTTGACAAGAAAGAAGCTCAGCTTCTAGTTTTGAATGAACAATGCAAA
GTCATGGCTTTAAGTGCGTCAGACATCTGAAATAATTGGCTTATATCTTGTCCAGCGTTG
TTTTTTTTTTTGGGTCTTCAGATTTGTTGCAAGGCTTCTTAACTCTAATGGTCTTTTGTT
TCAGAGAGAACATTCTTGTGACTCTTTTATCTGTAAATTTATTAAGGCTTGTGC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL5512Contig1 906 2 2 U
GGGAAGAAGGAGATCACCTTAAGAGTACTCGTGTTGATGATAAAGAAATGGAGTTTGGTT
CCTCCGAAAGCGAAACAGAGTCATCGAGGAATATTAACCCAACTCGGAGACGATCCAAGC
GAACTAGGAAACTCGGATCGTTCGATTTCGACTTCAAGAAGCTCAAAACGGTCCAAGCCG
GTGAGACAGAACATCACCATAGCTCAGCTTCCGACACAACCACGGAGGAAGATCTCGCCT
TTTGTCTCATTATGCTCTCGAGAGACAAGTGGAAGAAGAAGCAAACTGTAGTAGAAGAAG
AAGAAGAAGACGATGACGTGTCAGATCATCATGAATGCAAGAACAGAGGAGGAAGAGGGA
GATTCAAGTGCGAGACTTGTGGTAAAGTGTTCAAATCTTATCAAGCACTAGGAGGACACA
GAGCAAGCCACAAAAAGAACAAGACTTTCACCAAAACAGAGCATGAGAAAACAGAGTACT
CTGTTAATGGAGGAGGAGTCAGTGAGAAGAAAATTCACCAATGTCCGATCTGTTTTAGGG
TTTTCAGTTCAGGACAATCGCTCGGAGGTCATAAGAGGTCACACGGGATCAACAACATCG
TGTCAGGAAGAGTCTTGTCTGTGAATGACGTTGTCCGAATCCCTAAAGAAGTGAAAGATC
ATAGGATGATAGATCTTAATCTTCCTGCACCAAACGAAGACGATCATGAACATGAACCCT
CTGTGGTGTTTGATGAATGGTGAAAAACAAAAAGGTAACAAACAGACTTTGCGTGATCTT
ATCGGTTTATTATTATTCTTTTTTTTTTGGTTTGATCGAACTTTAAAAACAAGTTTATGT
TTTTATTTGTTTTTGGTTATTATTATGATTTATAATTTTAAATGCAATGGTGGCTACTTT
TACATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1FX93TF U 1
AF RS1FX93JQ C 261
BS 1 603 RS1FX93TF
BS 604 906 RS1FX93JQ

RD RS1FX93TF 603 0 0
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GTGAGACAGAACATCACCATAGCTCAGCTTCCGACACAACCACGGAGGAAGATCTCGCCT
TTTGTCTCATTATGCTCTCGAGAGACAAGTGGAAGAAGAAGCAAACTGTAGTAGAAGAAG
AAGAAGAAGACGATGACGTGTCAGATCATCATGAATGCAAGAACAGAGGAGGAAGAGGGA
GATTCAAGTGCGAGACTTGTGGTAAAGTGTTCAAATCTTATCAAGCACTAGGAGGACACA
GAGCAAGCCACAAAAAGAACAAGACTTTCACCAAAACAGAGCATGAGAAAACAGAGTACT
CTGTTAATGGAGGAGGAGTCAGTGAGAAGAAAATTCACCAATGTCCGATCTGTTTTAGGG
TTTTCAGTTCAGGACAATCGCTCGGAGGTCATAAGAGGTCACACGGGATCAACAACATCG
TGT

QA 1 603 1 603
DS 

RD RS1FX93JQ 646 0 0
AGAGACAAGTGGAAGAAGAAGCAAACTGTAGTAGAAGAAGAAGAAGAAGACGATGACGTG
TCAGATCATCATGAATGCAAGAACAGAGGAGGAAGAGGGAGATTCAAGTGCGAGACTTGT
GGTAAAGTGTTCAAATCTTATCAAGCACTAGGAGGACACAGAGCAAGCCACAAAAAGAAC
AAGACTTTCACCAAAACAGAGCATGAGAAAACAGAGTACTCTGTTAATGGAGGAGGAGTC
AGTGAGAAGAAAATTCACCAATGTCCGATCTGTTTTAGGGTTTTCAGTTCAGGACAATCG
CTCGGAGGTCATAAGAGGTCACACGGGATCAACAACATCGTGTCAGGAAGAGTCTTGTCT
GTGAATGACGTTGTCCGAATCCCTAAAGAAGTGAAAGATCATAGGATGATAGATCTTAAT
CTTCCTGCACCAAACGAAGACGATCATGAACATGAACCCTCTGTGGTGTTTGATGAATGG
TGAAAAACAAAAAGGTAACAAACAGACTTTGCGTGATCTTATCGGTTTATTATTATTCTT
TTTTTTTTGGTTTGATCGAACTTTAAAAACAAGTTTATGTTTTTATTTGTTTTTGGTTAT
TATTATGATTTATAATTTTAAATGCAATGGTGGCTACTTTTACATG

QA 1 646 1 646
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

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CCTTCCAGATCTGCAAGTTCATGAGGCAGTTAGTTCATATCTCAGATGTTACAATGATCA
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CAGAGGGCCAAATTGTCTACCAGGGACCAAGGGACAATGTTCTTGAGTTCTTTGAGTACA
TGGGGTTCCAGTGTCCTGAGAGGAAAGGTGTTGCAGACTTTCTTCAAGAAGTCACCTCTA
AGAAAGACCAAGAACAGTATTGGAAAAGCAGAGAACAACCTTACAGCTATGTGTCAGTGA
GTGATTTCTCAAACGGATTCAAATCTTTCCACACCGGACAACAACTCGCTTCAGAGATCA
GGACTCCTTATGACAAATCCAAAACCCATCCTGCTGCGTTAGTGACAGAGAAGTATGGCA
TATCAAACTGGGAGCTCTTCAAGGCATGCTTTGACAGAGAATGGCTGCTAATGAAGCGCA
ACTCCTTTGTGTACGTGTTCAAGACCGTCCAGATCACAATCATGTCCTTGATTACCCTGA
CGGTCTATCTCAGGACAGAGATGCATGTAGGCACGGTGCAAGACGGTCAAAAGTTCTATG
GTGTTTTGTTCTTCAGCTTGATCAATGTGATGTTTAATGGTATGGCTGAACTAGCATTCA
CAGTGATGAGGCTCCCAGTTTTCTACAAGCAGAGGGACTTCTTGTTCTATCCTCCATGGG
CTTTTGCCTTACCAGCTTGGCTTTTAAAGATTCCATTGTTTCTTATTGAGTCTGGAATAT
GGATTGTTCTTACATACTACACTGTTGGTTTTGCTCCTGCTGCTTCCAGGTACATTTTTT
TATGAATGAAACCTTCTTGTATATTTTCTTGAACTAAACCAAAACTTGTGTCCATTTTTA
GGTTTTTCAAACAGTTGCTGGCATACTTCTGTGTGAATCAGATGGCTCTTTCCTTGTTTA
GATTCCTTGGAGCTGTTGGAAGAACAGAAGTCGTCTCCAACTCGGTTGGTACCTTCACTT
TGCTCATTGTGTTTACTCTTGGAGGCTTCATTATTGCTAAAGGTAAAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AR39TFB U 1
AF RS1AR39JQ C 456
BS 1 803 RS1AR39TFB
BS 804 1130 RS1AR39JQ

RD RS1AR39TFB 803 0 0
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TCTCTCTTCTGCAACCTGCACCCGAGACATTCGAGCTTTTCGACGACATCATCCTGCTCT
CAGAGGGCCAAATTGTCTACCAGGGACCAAGGGACAATGTTCTTGAGTTCTTTGAGTACA
TGGGGTTCCAGTGTCCTGAGAGGAAAGGTGTTGCAGACTTTCTTCAAGAAGTCACCTCTA
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GGACTCCTTATGACAAATCCAAAACCCATCCTGCTGCGTTAGTGACAGAGAAGTATGGCA
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ACTCCTTTGTGTACGTGTTCAAGACCGTCCAGATCACAATCATGTCCTTGATTACCCTGA
CGGTCTATCTCAGGACAGAGATGCATGTAGGCACGGTGCAAGACGGTCAAAAGTTCTATG
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CTTTTGCCTTACCAGCTTGGCTT

QA 1 803 1 803
DS 

RD RS1AR39JQ 675 0 0
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AGAGAATGGCTGCTAATGAAGCGCAACTCCTTTGTGTACGTGTTCAAGACCGTCCAGATC
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GTGCAAGACGGTCAAAAGTTCTATGGTGTTTTGTTCTTCAGCTTGATCAATGTGATGTTT
AATGGTATGGCTGAACTAGCATTCACAGTGATGAGGCTCCCAGTTTTTTACAAGCAGAGG
GACTTCTTGTTCTATCCTCCATGGGCTTTTGCCTTACCAGCTTGGCTTTTAAAGATTCCA
TTGTTTCTTATTGAGTCTGGAATATGGATTGTTCTTACATACTACACTGTTGGTTTTGCT
CCTGCTGCTTCCAGGTACATTTTTTTATGAATGAAACCTTCTTGTATATTTTCTTGAACT
AAACCAAAACTTGTGTCCATTTTTAGGTTTTTCAAACAGTTGCTGGCATACTTCTGTGTG
AATCAGATGGCTCTTTCCTTGTTTAGATTCCTTGGAGCTGTTGGAAGAACAGAAGTCGTC
TCCAACTCGGTTGGTACCTTCACTTTGCTCATTGTGTTTACTCTTGGAGGCTTCATTATT
GCTAAAGGTAAAAGC

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

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CAGAACACCAGATGCTGAAACTCAAGTAATGACAACCCCTAAGAAGACCCTTCATCCAAT
GAGTGTGCAAACTGGAGAGAAGACGGCTGAAGAGCATAACAACAAAGGAATCAGTCACGA
CTCAAACCTTGAAGGTTATACTGCAGAAGAGGCTTTGATCGCTGATACAAATGACAAGGA
TGATTATGATCAGCCCCTCTCTGCATGGATCCAAGGAGGAAAATCATCTAATGATTCTGA
CAAATCTAAGATGATGTATCCAACAGAGTTATCAACTCCTGATAAAACCACCGGAGCAAG
TGAGGATACAACAGTGGTTCTGCCGTTTGTGAAACGCTCACCCGTCTGGAAAGCGATTGA
ATCAATGGAAGTCTATAAGAAAGCAAAGCAGAATCCTCATTTCACCCCGTTGCTCGGTAC
AAGAGAAGAGCTCCGTGAAGGGTTAGCAGTTGGTGTGATGGTGAATTTTTCTAGTTTATT
AGAGAGAGTAACAGATCTGCACCTTCACACTCCCAAAAGCATACTGGAGGGACTGAAAGA
GTGCTTTTACGAGAGTGAGAAGTATGGATTTGATGTTGCTGAGCCTATATCTCGGATTGC
AATGCTGGTCTCTCTCGTAGAAGAAAACTTTAGCAGAGAGGATAAGCTAAAAGAAATGGA
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TGAGTGCAAGATTCTCGAGCTGCAGAACCAAAAAGGAGACTTGAAAGTGAAGGAGGATGC
TGAAGAGAAAAAGATTGCTTATTTACAGATGTGTGCTGAAGAGATTGACAAAAGGTCGCA
AGAAGCTGAGCTTAAGTTTCAGGAGATCGTGTCTGCTTCTTGGTGATGCCTCCACCATCA
ACCTGTTTATGTGAGGTTAGGTTAGAGTTGGAAACAAGAAGAAAAAAAAACTATGATGAG
CTGCTCTAAGCTCTCTATCTTTTGCAAATGAAAGCTAGACTAAGTTTAACAAGGAAGAAT
ACTTTTGGTTATGTTAAGGTAGATGATTGATTGAGCTGGTTTTAACTCTACTGTCACTTT
TGATGAAAACTATGAAGTTAGTGGGTATTCTGGTGATTATGAATTGCTAATTTGTGG


BQ
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AF RS1DU92TF U 1
AF RS1DU92JQ C 361
BS 1 686 RS1DU92TF
BS 687 687 RS1DU92JQ
BS 688 704 RS1DU92TF
BS 705 1197 RS1DU92JQ

RD RS1DU92TF 720 0 0
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CAGAACACCAGATGCTGAAACTCAAGTAATGACAACCCCTAAGAAGACCCTTCATCCAAT
GAGTGTGCAAACTGGAGAGAAGACGGCTGAAGAGCATAACAACAAAGGAATCAGTCACGA
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TGAGGATACAACAGTGGTTCTGCCGTTTGTGAAACGCTCACCCGTCTGGAAAGCGATTGA
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GCTAAAGAAATGGAGA

QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1DU92JQ 837 0 0
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ATCAATGGAAGTCTATAAGAAAGCAAAGCAGAATCCTCATTTCACCCCGTTGCTCGGTAC
AAGAGAAGAGCTCCGTGAAGGGTTAGCAGTTGGTGTGATGGTGAATTTTTCTAGTTTATT
AGAGAGAGTAACAGATCTGCACCTTCACACTCCCAAAAGCATACTGGAGGGACTGAAAGA
GTGCTTTTACGAGAGTGAGAAGTATGGATTTGATGTTGCTGAGCCTATATCTCGGATTGC
AATGCTGGTCTCTCTCGTAGAAGAAAACTTTAGCAGAGAGGATAAGCTAAAAGAAATGGA
GAAAGGGAAGGCAGAGGCAGTTAGCAAAGTGGGAAAAGTTAGAGAAGATTTGAGAGATGT
TGAGTGCAAGATTCTCGAGCTGCAGAACCAAAAAGGAGACTTGAAAGTGAAGGAGGATGC
TGAAGAGAAAAAGATTGCTTATTTACAGATGTGTGCTGAAGAGATTGACAAAAGGTCGCA
AGAAGCTGAGCTTAAGTTTCAGGAGATCGTGTCTGCTTCTTGGTGATGCCTCCACCATCA
ACCTGTTTATGTGAGGTTAGGTTAGAGTTGGAAACAAGAAGAAAAAAAAACTATGATGAG
CTGCTCTAAGCTCTCTATCTTTTGCAAATGAAAGCTAGACTAAGTTTAACAAGGAAGAAT
ACTTTTGGTTATGTTAAGGTAGATGATTGATTGAGCTGGTTTTAACTCTACTGTCACTTT
TGATGAAAACTATGAAGTTAGTGGGTATTCTGGTGATTATGAATTGCTAATTTGTGG

QA 1 837 1 837
DS 



AS 1 2

CO CL5518Contig1 1325 2 8 U
GGGTAAGAAGAAACGATTTCCAAAAGTCAACGACGACGACGACATTGGATTTGCAATTAA
GCTAAGCCCCTTCTTCTCTTCAGTCTCGTCTGTTATCATCTCAAAGCTTAAAACCACTTT
CAGATCCATCCCCTTCTAACCCAAAAATCCATAAGAATGAACGATTTGGTTGACCTGGCA
TCAGGCTCTTTCGGAGGAGCTTTTGTCTCGGAGGGTCTGAAACTTGCCATCGCCGAAGCC
AAGAAGTACAGATCATTCAAACCCTTGTCCAAAGATCTGGTCACAACGATGAGCAGTTTG
CTTCCACTGACACAAAAGATCGATACAATGCGGAACAAGCTAGACCACAGTGCTACGGAG
CTAAAGGAACTCAGGGAGACGATCAGACGAGCTCGCCTACTGATCGACAAGTCCCCAAGC
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ACCAAGTTCTGCGGCATCGATCTGCAGCTTCTTCAGTACAGGGACCAGCTGGGTTTGTCC
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GTTGCCTTATTGGGTCTGTGAAGTTGTTTCGTTGAGGACACTTAGCATCACCAACTGTAA
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AGGTTGAAGCCCAAAATGAGAAACTTGAGAGTTCAAGAGGAGGAAACAGAACATAATCTA
AACTTGTTGCAAATGTTTTAATGTTTGTTTGTGTTTTTGGAGTATTTATAAATCTAATTT
TCCCC


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RS1A745TF U 1
AF RS1A745JQ C 546
BS 1 709 RS1A745TF
BS 710 710 RS1A745JQ
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AGTGTTGTTTTTGCGGATCATCATCTTTGTTCTGTTCCAAAGCTTGATAAGGTTCCCGTT
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DS 

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GGATTGGCCTTTGATGGATCTTAAAAAGAGACTCCTTGACGACGGTCGTATACTGTTGGT
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GTTGCAAATGTTTTAATGTTTGTTTGTGTTTTTGGAGTATTTATAAATCTAATTTTCCCC

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL5519Contig1 1049 2 4 U
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TCTGCAGATTACATATTGAAAGTGAGCATCTCCAATTTCAGGAATGCATGGGAAAGCATG
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CCGAGCAATGCAAGGTCGCACACTTGCTTACTGTCAGGTGTGTACATAGGGAACGTGAAA
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GTTAGAGCAGAGGATGTTTCTGTCGCTGAGGCCATTCACGAGATTGTTGCCAACGGCTAA
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AAGTACGAGACCAGAAATAAACAAAGAGATTTTTTCATGTTGCTAAAGATCATCACTTAC
CCAACCTCATAGTACAATCTTTTTTTTTTAAATAGTATATTACCTTGTTTTTTTTTTACA
TTATTACTGTCAGAGGCTTGAGTTTTTTCCTTTTATTGATCTATTGGTCTTCAAGTTTCA
TGGAATAATTTGAGTTTGAAGTGCAGGCT


BQ
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AF RS1ET35TF U 1
AF RS1ET35JQ C 426
BS 1 637 RS1ET35TF
BS 638 638 RS1ET35JQ
BS 639 737 RS1ET35TF
BS 738 1049 RS1ET35JQ

RD RS1ET35TF 737 0 0
TCTATTCCAGAGTTTGCCGCCTTTGGAAAACTTTTCAAGTCTTCTTCACCTGTGGAGCTA
ACTGAAGCAGAAACAGAATACGCCGTCAATGTTGTTAAGCATATTTTTGATAATCATGTG
GTGTTTCAGTACAACTGCACTAACACAATACCGGAGCAGTTGTTGGAGAGGGTCAATGTC
ATAGTAGATGCTTCAGAAGCAGAGGAATTCAGTGAACTAACTTCAAAGGCACTAAACTCA
CTTCCTTACGATTCGCCTGGTCAAGCCTTTGTTGCTTTTGAGAAGCCAACAGGTGTCCCT
GCTGTTGGAAAGTTCTCCAACACATTGACTTTTGTTGTTAAGGAGGTTGACCCAAGCACA
GGGGAAGCAGAGGATGATGGGGTGGAAGATGAGTACCAGCTGGAGGATCTTGAGGTTGTA
TCTGCAGATTACATATTGAAAGTGAGCATCTCCAATTTCAGGAATGCATGGGAAAGCATG
AATGAAGAAGATGAGCACGTGGACGAATATGGCCTCGGGCAAAGAGATAGTTTGGGAGAA
GCTATAAAGGCTGTCATCGATCTTCTTGGCATGCAGCCTTGTGAGGGAACGGAGACAGTT
CCGAGCAATGCAAGGTCGCACACTTGCTTACTGTCAG*TGTGTACATAGGGAACGTGAAA
GTGTTAGTGAGGGCACAGTTTGGGATGGACAGTTCAAAGGACATTGTAATGAAACTAGCG
GTTAGAGCAGAGGATGT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RS1ET35JQ 624 0 0
AGATTACATATTGAAAGTGAGCATCTCCAATTTCAGGAATGCATGGGAAAGCATGAATGA
AGAAGATGAGCACGTGGACGAATATGGCCTCGGGCAAAGAGATAGTTTGGGAGAAGCTAT
AAAGGCTGTCATCGATCTTCTTGGCATGCAGCCTTGTGAGGGAACGGAGACAGTTCCGAG
CAATGCAAGGTCGCACACTTGCTTACTGTCAGGTGTGTACATAGGGAACGTGAAAGTGTT
AGTGAGGGCACAGTTTGGGATGGACAGTTCAAAGGACATTGTAATGAAACTAGCGGTTAG
AGCAGAGGATGTTTCTGTCGCTGAGGCCATTCACGAGATTGTTGCCAACGGCTAAAACTT
TTGAGGGATCATCACCTCTCACGTATTTACTTCAAGTACGTAAGAGGGGTATTATAAGTA
CGAGACCAGAAATAAACAAAGAGATTTTTTCATGTTGCTAAAGATCATCACTTACCCAAC
CTCATAGTACAATCTTTTTTTTTTAAATAGTATATTACCTTGTTTTTTTTTTACATTATT
ACTGTCAGAGGCTTGAGTTTTTTCCTTTTATTGATCTATTGGTCTTCAAGTTTCATGGAA
TAATTTGAGTTTGAAGTGCAGGCT

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

CO CL5520Contig1 942 2 2 U
GGACATCTGAACTCTCTAATAACGTGTTACATCCAAATCATCGACGTCATATTTCCACAT
GCAACAAGGCTTGTTAGTCGTTACGCGATGGCGTCAAGTGATAAGGCTCCCGTGGCGTGT
CCAGCAAGCATCGGAGAAGATAAGGAGCCAATGGGAGATCCTACAAAGACCACTACGGCG
ATGCGAGAAAAAGGAACGGCTATGATGCAGTCGATGAAACCGATCAGACAAATGAGTCTC
CACATGTGTTCATTCGCTTGCTATAGCCACGATCCTGGCCGTCAGTCGAAGTTCATATCT
ACGGTCACCGTGTAAACCAAGACTTTCTCCAGTGTGCCGTCTACGATTCGAGTTCCTCTA
AGGCCATCTCATAGGGATTGAATATATGGTGTCAGAGAAGTTATTCGAAAGCCTCTCACC
GGAGGAACAAAAGCTTTGGCATTCCCATGATTATGAGATCCAGATGGCTCTTCTAGTAAC
TCCAAGGGTCCCAGAGCTCGTTGCAAAGCCGGAGCTTAAAAATCTTGCCAAGTCTTACGG
GAAATTTTGGTGTACTTGGCAAATCGATCGTGTTTTGTTGACCCCGGTAAACTTTGTGGC
TGGCTCCGCCACACAAGACGTGAATCTAGGGAGGATCAAACCGGAGCTGGTGAAAAAGAG
AGATGAAGAACATGGAATCTCGACTGAATATTCGTTAAAGCCGTCACGAGAAGAGATTTG
TGGACCGGAGAAAAAGAATGTTGTCGCTGATTATCGGGTTCGGTTTAGGAAAGGCTTTGC
GCTTGATGTCGTTGAGACAGATATGAAGAAAACAGTTCCCTTCCCGTGACTTTTCTTTTT
GTTTTGCTTTTTTTCCTTAATGAATTTCGAGACATTTTAAGTTCGTAAGCTTATAGTACG
TGTTATATTACAAGCGTTTCAATCTATATAACTTATAAGCCA


BQ
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AF RS1AM92TF U 1
AF RS1AM92JQ C 283
BS 1 589 RS1AM92TF
BS 590 942 RS1AM92JQ

RD RS1AM92TF 589 0 0
GGACATCTGAACTCTCTAATAACGTGTTACATCCAAATCATCGACGTCATATTTCCACAT
GCAACAAGGCTTGTTAGTCGTTACGCGATGGCGTCAAGTGATAAGGCTCCCGTGGCGTGT
CCAGCAAGCATCGGAGAAGATAAGGAGCCAATGGGAGATCCTACAAAGACCACTACGGCG
ATGCGAGAAAAAGGAACGGCTATGATGCAGTCGATGAAACCGATCAGACAAATGAGTCTC
CACATGTGTTCATTCGCTTGCTATAGCCACGATCCTGGCCGTCAGTCGAAGTTCATATCT
ACGGTCACCGTGTAAACCAAGACTTTCTCCAGTGTGCCGTCTACGATTCGAGTTCCTCTA
AGGCCATCTCATAGGGATTGAATATATGGTGTCAGAGAAGTTATTCGAAAGCCTCTCACC
GGAGGAACAAAAGCTTTGGCATTCCCATGATTATGAGATCCAGATGGCTCTTCTAGTAAC
TCCAAGGGTCCCAGAGCTCGTTGCAAAGCCGGAGCTTAAAAATCTTGCCAAGTCTTACGG
GAAATTTTGGTGTACTTGGCAAATCGATCGTGTTTTGTTGACCCCGGTA

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1AM92JQ 660 0 0
CAGTCGAAGTTCATATCTACGGTCACCGTGTAAACCAAGACTTTCTCCAGTGTGCCGTCT
ACGATTCGAGTTCCTCTAAGGCCATCTCATAGGGATTGAATATATGGTGTCAGAGAAGTT
ATTCGAAAGCCTCTCACCGGAGGAACAAAAGCTTTGGCATTCCCATGATTATGAGATCCA
GATGGCTCTTCTAGTAACTCCAAGGGTCCCAGAGCTCGTTGCAAAGCCGGAGCTTAAAAA
TCTTGCCAAGTCTTACGGGAAATTTTGGTGTACTTGGCAAATCGATCGTGTTTTGTTGAC
CCCGGTAAACTTTGTGGCTGGCTCCGCCACACAAGACGTGAATCTAGGGAGGATCAAACC
GGAGCTGGTGAAAAAGAGAGATGAAGAACATGGAATCTCGACTGAATATTCGTTAAAGCC
GTCACGAGAAGAGATTTGTGGACCGGAGAAAAAGAATGTTGTCGCTGATTATCGGGTTCG
GTTTAGGAAAGGCTTTGCGCTTGATGTCGTTGAGACAGATATGAAGAAAACAGTTCCCTT
CCCGTGACTTTTCTTTTTGTTTTGCTTTTTTTCCTTAATGAATTTCGAGACATTTTAAGT
TCGTAAGCTTATAGTACGTGTTATATTACAAGCGTTTCAATCTATATAACTTATAAGCCA

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL5521Contig1 1362 2 4 U
GGACAACCGTTCCCTCTCCCATCTCTCTTATCTCTCGTTTTCCCTCTCTCTTATCTCTCA
TTTTCCCTCTTTCTCCTATAACCCTAAGAAAAAAAATCCTCGTCAATCACCACAACCCTC
TCTCTTCGATTCACAAATAATCAACCAAGATTCAAGTCTGTCTCGGCCATGATGAATATG
CTTGGAGCAACATACATAGATGGTTTAATCCCTATCATCAATGACATCATCATATTTCTC
AGATCCAGAGTCTGATTCAGATATCATCAACGAACTTGTTCATATCAACCTCTGAATCAG
GCGTAATCCATCTCGACGACTATGTAATCTCCAAATTCATCATCTCCCCTCCCACTCCAC
GACCTTGCTTCATCCTCGTCTTCTTCGTCGCCACTCAACTCCACAGCAATACCGAGCTCA
GTCTCCAAGAGTTTCGCCGCGAGTTCAACCACGTCCCCGCTTCTTTCCTCGCTAACAACA
ACTTATCCGACATAGATATGCTCTTATTCTGCGAAATTGACTTTTCTCAGTCCCAGTCTT
CGCTTGATCCAAAGCAAAACTAACTCCGTCTCCAAGAGCTTTGCCGCTGAGTTCGTCGTT
GATGGAGGTGGTCTCATCGTCAACCGATTTGCAGACTGGCCTAGAAAAGGAGATAACTGT
GTTATGATCTGTTTCAGTTATGATAGAACTGTTTCTGGTTCAGGACTTGTTGTAATCTAT
CTTGAATCTTATGTTTGATGTGTGTGCTTTCTTTGATACTGATATCTAGTTGTCTTGTTT
ATGGTTTATGTAGGTGGTGATTCTAGGCAGTGGCCTCTGGTCTCCAAAATACAAAGCATC
TGTACAAATGCAGAGCAGTGGCCTCTAACCTTCAAATACAGAGCATCTGTTACGTAGGTA
AGCTGTTTAGCATGAGAGTTGCAGATCCTTAAACTAGGAAAAAGAAGAATGAGAATTGCA
GTTTCTACAGTGGTTGATGAAGACAATATGTTGGTGTTGGAAACTGACAGCAATTCTCTC
GCTCAGTTCCTCTGTCCCTTTAGCTAAAGGATTCTACTTCTTTTGATTATTTGTTGCCGT
GCATCTAACCTGCAGTAGGCGGATTAAGCTCTAAGAGAAAGGCTACTCTTTAGAAGTCAT
TGTACTCTGTATTTCCACAACACAAGAGCTCATCTCACAACAACTACAAAAATGGCCATA
CGATGAAGCTCATAAACTATTTAAAGGGCATTATTTTTTAACCGATAAAGTCCCTAGACT
TAGCTTTGGTGTATGTATATTTTGGATGATATATAAAATAATGAATGTTTTATATGAAAT
ATAAATTTTTGTTTGTAGATCAAATTGTAATGAATAGATGAT


BQ
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AF RS1CT49TF U 1
AF RS1CT49JQ C 571
BS 1 703 RS1CT49TF
BS 704 704 RS1CT49JQ
BS 705 744 RS1CT49TF
BS 745 1362 RS1CT49JQ

RD RS1CT49TF 744 0 0
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TTTTCCCTCTTTCTCCTATAACCCTAAGAAAAAAAATCCTCGTCAATCACCACAACCCTC
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CTTGGAGCAACATACATAGATGGTTTAATCCCTATCATCAATGACATCATCATATTTCTC
AGATCCAGAGTCTGATTCAGATATCATCAACGAACTTGTTCATATCAACCTCTGAATCAG
GCGTAATCCATCTCGACGACTATGTAATCTCCAAATTCATCATCTCCCCTCCCACTCCAC
GACCTTGCTTCATCCTCGTCTTCTTCGTCGCCACTCAACTCCACAGCAATACCGAGCTCA
GTCTCCAAGAGTTTCGCCGCGAGTTCAACCACGTCCCCGCTTCTTTCCTCGCTAACAACA
ACTTATCCGACATAGATATGCTCTTATTCTGCGAAATTGACTTTTCTCAGTCCCAGTCTT
CGCTTGATCCAAAGCAAAACTAACTCCGTCTCCAAGAGCTTTGCCGCTGAGTTCGTCGTT
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GTTATGATCTGTTTCAGTTATGATAGAACTGTTTCTGGTTCAG*ACTTGTTGTAATCTAT
CTTGAATCTTATGTTTGATGTGTG

QA 1 744 1 744
DS 

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GCAGACTGGCCTAGAAAAGGAGATAACTGTGTTATGATCTGTTTCAGTTATGATAGAACT
GTTTCTGGTTCAGGACTTGTTGTAATCTATCTTGAATCTTATGTTTGATGTGTGTGCTTT
CTTTGATACTGATATCTAGTTGTCTTGTTTATGGTTTATGTAGGTGGTGATTCTAGGCAG
TGGCCTCTGGTCTCCAAAATACAAAGCATCTGTACAAATGCAGAGCAGTGGCCTCTAACC
TTCAAATACAGAGCATCTGTTACGTAGGTAAGCTGTTTAGCATGAGAGTTGCAGATCCTT
AAACTAGGAAAAAGAAGAATGAGAATTGCAGTTTCTACAGTGGTTGATGAAGACAATATG
TTGGTGTTGGAAACTGACAGCAATTCTCTCGCTCAGTTCCTCTGTCCCTTTAGCTAAAGG
ATTCTACTTCTTTTGATTATTTGTTGCCGTGCATCTAACCTGCAGTAGGCGGATTAAGCT
CTAAGAGAAAGGCTACTCTTTAGAAGTCATTGTACTCTGTATTTCCACAACACAAGAGCT
CATCTCACAACAACTACAAAAATGGCCATACGATGAAGCTCATAAACTATTTAAAGGGCA
TTATTTTTTAACCGATAAAGTCCCTAGACTTAGCTTTGGTGTATGTATATTTTGGATGAT
ATATAAAATAATGAATGTTTTATATGAAATATAAATTTTTGTTTGTAGATCAAATTGTAA
TGAATAGATGAT

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 2

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GCGAGCAGCCGCCGCATTGATTATTATGTTCCAACTCTTGTCTCTCTCAAACGCCCACAA
CATAACCAAAATCTTGGCCAAAGACCCTGAGTTCTCCACATTCAACCACTACCTCTCAGC
CACTCATCTCGCCGACGAGATCAACCGCCGCCAAACCATCACCGTCCTGGCCGTTGACAG
CTCAGCAATGAACTCAATCCTCTCCAAAGGCTACTCACTCTACACAATCCGCAACATTCT
CTCCCTCCACGTCCTCGTCGATTACTTCGGCGCCAAGAAGCTCCACC


BQ
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AF RS1EC49JQ C 1
AF RS1EC49TF U 1
BS 1 347 RS1EC49TF

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GCGAGCAGCCGCCGCATTGATTATTATGTTCCAACTCTTGTCTCTCTCAAACGCCCACAA
CATAACCAAAATCTTGGCCAAAGACCCTGAGTTCTCCACATTCAACCACTACCTTTCAGC
CACTCATCTCGCCGACGAGATCAACCGCCGCCAAACCATCACCGTCCTGGCCGTTGACAG
CTCAGCAATGAACTCAATCCTCTCCAAAGGCTACTCACTCTACACAATCCGCAACATTCT
CTCCCTCCACGTCCTCGTCGATTACTTCGGCGCCAAGAAGCTCCACC

QA 1 347 1 347
DS 

RD RS1EC49TF 347 0 0
GGACCACACAACTCCCACTAATCACATAGCCGCCGACACTCCCAAAATGGCTTATCTCCG
GCGAGCAGCCGCCGCATTGATTATTATGTTCCAACTCTTGTCTCTCTCAAACGCCCACAA
CATAACCAAAATCTTGGCCAAAGACCCTGAGTTCTCCACATTCAACCACTACCTCTCAGC
CACTCATCTCGCCGACGAGATCAACCGCCGCCAAACCATCACCGTCCTGGCCGTTGACAG
CTCAGCAATGAACTCAATCCTCTCCAAAGGCTACTCACTCTACACAATCCGCAACATTCT
CTCCCTCCACGTCCTCGTCGATTACTTCGGCGCCAAGAAGCTCCACC

QA 1 347 1 347
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GCCCGGACTCGTTTTCAATTCAAATCTGGAGAACACAGAGTGAGAGATACCATTTTTCGA
AATCTCTCTCTCTATCGTTCCCAGATCTGTTCGTCCCCTCTCTCTCTATCTATCTCAAAT
CAATCGCAGACGATTTCAAAAAACCCTAACATCGCACTCCCCTTCCAAATGCCAACACTC
GTCGAAACCTAAAAAGTCTCCTCCTTTAACACAATCAAAAAAAAAAAATGCAGAGCGCAT
CGAGCTCAGCTCCAACCCCAGAAGCCATACTGGAATGGCTCCAGAAGGAGATGGGTTACC
GGAGCAAGTCCCACGTGCCGTCCGTCGACGCAATCAGGAAGATTTGCAGAGGGAACATGA
TCCCCGTTTGGAGTTTTCTGATGAACCGAGCCAAGTCCGAGAAGACTGTCGAGAGCATTA
GGCGTAACATCACGGTCCATGGCGGTGGAGGTGGTGTTGCTAATCCGGAGAGTAAGGGTA
AAGGGAGGAGGAAAGAGAAGGGCTTTGGTGGGGAGAGTGAGAGTGAGAGCAGAGAGGCTG
CGTTTCGTGAGAGAGAGGTGGCTGCGAAGGAGGTGGAGAGGTTGAGGAACGTTGTGAGGA
GGCAGAGGAAGGAGGTTAAAGCTCGAAACCTAAAAAGTCTCCTCCTTTAACACAACC


BQ
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AF RS1GU42TF U 1
AF RS1GU42JQ C 179
BS 1 384 RS1GU42TF
BS 385 385 RS1GU42JQ
BS 386 546 RS1GU42TF
BS 547 657 RS1GU42JQ

RD RS1GU42TF 553 0 0
GCCCGGACTCGTTTTCAATTCAAATCTGGAGAACACAGAGTGAGAGATACCATTTTTCGA
AATCTCTCTCTCTATCGTTCCCAGATCTGTTCGTCCCCTCTCTCTCTATCTATCTCAAAT
CAATCGCAGACGATTTCAAAAAACCCTAACATCGCACTCCCCTTCCAAATGCCAACACTC
GTCGAAACCTAAAAAGTCTCCTCCTTTAACACAATCAAAAAAAAAAAATGCAGAGCGCAT
CGAGCTCAGCTCCAACCCCAGAAGCCATACTGGAATGGCTCCAGAAGGAGATGGGTTACC
GGAGCAAGTCCCACGTGCCGTCCGTCGACGCAATCAGGAAGATTTGCAGAGGGAACATGA
TCCCCGTTTGGAGTTTTCTGATGA*CCGAGCCAAGTCCGAGAAGACTGTCGAGAGCATTA
GGCGTAACATCACGGTCCATGGCGGTGGAGGTGGTGTTGCTAATCCGGAGAGTAAGGGTA
AAGGGAGGAGGAAAGAGAAGGGCTTTGGTGGGGAGAGTGAGAGTGAGAGCAGAGAGGCTG
CGTTTC
TGAGAGA

QA 1 546 1 546
DS 

RD RS1GU42JQ 479 0 0
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ATCGAGCTCAGCTCCAACCCCAGAAGCCATACTGGAATGGCTCCAGAAGGAGATGGGTTA
CCGGAGCAAGTCCCACGTGCCGTCCGTCGACGCAATCAGGAAGATTTGCAGAGGGAACAT
GATCCCCGTTTGGAGTTTTCTGATGAACCGAGCCAAGTCCGAGAAGACTGTCGAGAGCAT
TAGGCGTAACATCACGGTCCATGGCGGTGGAGGTGGTGTTGCTAATCCGGAGAGTAAGGG
TAAAGGGAGGAGGAAAGAGAAGGGCTTTGGTGGGGAGAGTGAGAGTGAGAGCAGAGAGGC
TGCGTTTCGTGAGAGAGAGGTGGCTGCGAAGGAGGTGGAGAGGTTGAGGAACGTTGTGAG
GAGGCAGAGGAAGGAGGTTAAAGCTCGAAACCTAAAAAGTCTCCTCCTTTAACACAACC

QA 1 479 1 479
DS 



AS 1 2

CO CL5525Contig1 368 2 1 U
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CGAAGATCAGAGCCAGGAGCTGCAGCATCTGAGGCAGATGGTCACTCAGTACCAGGAGCA
GCTGAGGACTCTTGAGGTCAATAACTATGCTCTCACGCTTCATCTGAAACAAGCGCAGCA
GAACAACGGGTCAATCCCGGGACGGTTTCATCCTGACGTGTTCTAATGCTATTTGGAAGT
CGAGAGGAATGCTCAGTCAGACGTATATCTAATTTCAGTTTGCAGTGTTTGTTGTATGTT
TCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCCCGTTGGCTTGTGACTTATCTTTATTATACATGAAT
TATGGAGC


BQ
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AF RS1AU29JQ C 1
AF RS1AU29TF U 1
BS 1 368 RS1AU29TF

RD RS1AU29JQ 368 0 0
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CGAAGATCAGAGCCAGGAGCTGCAGCATCTGAGGCAGATGGTCACTCAGTACCAGGAGCA
GCTGAGGACTCTTGAGGTCAATAACTATGCTCTCACGCTTCATCTGAAACAAGCGCAGCA
GAACAACGGGTCAATCCCGGGACGGTTTCATCCTGACGTGTTCTAATGCTATTTGGAAGT
CGAGAGGAATGCTCAGTCAGACGTATATCTAATTTCAGTTTGCAGTGTTTGTTGTATGTT
TCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCCCGTTGGCTTGTGACTTATCTTTATTATACATGAAT
TATGGAGC

QA 1 368 1 368
DS 

RD RS1AU29TF 368 0 0
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CGAAGATCAGAGCCAGGAGCTGCAGCATCTGAGGCAGATGGTCACTCAGTACCAGGAGCA
GCTGAGGACTCTTGAGGTCAATAACTATGCTCTCACGCTTCATCTGAAACAAGCGCAGCA
GAACAACGGGTCAATCCCGGGACGGTTTCATCCTGACGTGTTCTAATGCTATTTGGAAGT
CGAGAGGAATGCTCAGTCAGACGTATATCTAATTTCAGTTTGCAGTGTTTGTTGTATGTT
TCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCCCGTTGGCTTGTGACTTATCTTTATTATACATGAAT
TATGGAGC

QA 1 368 1 368
DS 



AS 1 2

CO CL5526Contig1 368 2 1 U
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TTAGTCCCAAAACTCTCTCTCTCTGTCGTCAAAAAAAGATGCCGTCAATAGCGTCTGGTA
CAGTTACATCACCAAATTTGCTGCTTGTTTCAGTAGAATAAGTCTGCAACTTTTCCATCT
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CCGCCAAGTACAATGGCATTATACACGAAGGACTCGACTTGCAGCTCTTTAAAAACGCTG
GAAGAATGTCCTGAAACTTTTCATCGCTGAATCTCTGTACTGAAAACAGCCATCTTCTTT
TATGGCTT


BQ
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AF RS1CY22JQ C 1
AF RS1CY22TF U 1
BS 1 368 RS1CY22TF

RD RS1CY22JQ 368 0 0
GGTCCCTAATTCGTCTCTTTGGCAATGCAAAACTACATAAAATCTATGTTTACCTTATGA
TTAGTCCCAAAACTCTCTCTCTCTGTCGTCAAAAAAAGATGCCGTCAATAGCGTCTGGTA
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ATGCTTCATTAAACCCTTCAGGCGCAGGAGAGAAGCTGATAGACTTGCACAAGAAAGATA
CCGCCAAGTACAATGGCATTATACACGAAGGACTCGACTTGCAGCTCTTTAAAAACGCTG
GAAGAATGTCCTGAAACTTTTCATCGCTGAATCTCTGTACTGAAAACAGCCATCTTCTTT
TATGGCTT

QA 1 368 1 368
DS 

RD RS1CY22TF 368 0 0
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TTAGTCCCAAAACTCTCTCTCTCTGTCGTCAAAAAAAGATGCCGTCAATAGCGTCTGGTA
CAGTTACATCACCAAATTTGCTGCTTGTTTCAGTAGAATAAGTCTGCAACTTTTCCATCT
ATGCTTCATTAAACCCTTCAGGCGCAGGAGAGAAGCTGATAGACTTGCACAAGAAAGATA
CCGCCAAGTACAATGGCATTATACACGAAGGACTCGACTTGCAGCTCTTTAAAAACGCTG
GAAGAATGTCCTGAAACTTTTCATCGCTGAATCTCTGTACTGAAAACAGCCATCTTCTTT
TATGGCTT

QA 1 368 1 368
DS 



AS 1 2

CO CL5527Contig1 1122 2 2 U
GGAAAAACAAAAAAACAAAATGGAATCGAAAGCTATTTGCTTAGGGTTTCTTCCGCCAAG
ACTTCAACTTTCATCTCGACTCTCACTCTCCCGTCTTCACGGTTCTTCCACATCTCCAAA
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TGATAGTTATGCTCCTCGATCTGAGCTGTTCCGTGGAAAGTCTGGTTCTGTTTCTTTCAA
CGGCCTGACCCACCAGCTGGTTGAAGAAAGTAAACTTGTCTCGGCTCCGTTTCAGGAAGA
AGACAAAGGTTCCTTCTTGTGGGTCTTGGCTCCTGCTGTCTTGATATCCTCACTGATTCT
TCCTCAGTTCTTTCTCAGTGATGCCATTTAATCTACCTTTAAAAACGAGACCGTTGCAGA
GATTGTGACTTCTTTCTGCTTTGAGACGGCGTTTTATACTGGTTTAGCGATATTCCTGTC
TGTGACGGACAGAGTGCAGAGGCCGTACTTAGACTTCAGCACCAAGAGATGGGGTCTAAT
CACTGGACTTAGAGGATACCTCATGTCCACATTTCTGATGATGGGTTTGAAAGTTGTAGT
CCCTGTGTTTGCTGTCTACATGACTTGGCCAGCTCTCGGAATGGATGCGTTGATTGCTGT
CCTTCCTTTCTTGGTTGGATGTGCGGTTCAGCGTGGTTTTGAGGCTCAGCTTGAACGACG
TGGCTCGTCCTGTTGGCCCATTGTTCCAATAGTCTTTGAGGTGTATAGGCTGTATCAGGT
GACAAGAGCAGCCACATTTGTTCAGAGGCTGATGTTTATGATGAAAGATGCGTCAACGAC
TGTAGAGATTACAGAGCGAGGAGTTGCGCTGGTTGGTTTGGTTGTGACTTTGCAGTTTCT
AGCTGTTCTGTGTCTCTGGTCGCTGATCACTTTTCTAATGCGCCTCTTTCCTTCGAGACC
TGTAGCTGAAAACTACTAAACAGTAATGTTTTAGTGAAAGCCATTGAGGCTTTGATTTTC
TGTGTTTATTTTCAGAGGATTAATGGGCTGTATTGAGTCAGAAATCGCAGTGTAGGACAC
TTTTTGAGAGTTGTTTGATTTATGAGGGATGAAATTGGCTAC


BQ
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BS 735 1122 RS1BW94JQ

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CGGCCTGACCCACCAGCTGGTTGAAGAAAGTAAACTTGTCTCGGCTCCGTTTCAGGAAGA
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TCCTCAGTTCTTTCTCAGTGATGCCATTTAATCTACCTTTAAAAACGAGACCGTTGCAGA
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CACTGGACTTAGAGGATACCTCATGTCCACATTTCTGATGATGGGTTTGAAAGTTGTAGT
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TGGCTCGTCCTGTT

QA 1 734 1 734
DS 

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ACTTAGAGGATACCTCATGTCCACATTTCTGATGATGGGTTTGAAAGTTGTAGTCCCTGT
GTTTGCTGTCTACATGACTTGGCCAGCTCTCGGAATGGATGCGTTGATTGCTGTCCTTCC
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GTCCTGTTGGCCCATTGTTCCAATAGTCTTTGAGGTGTATAGGCTGTATCAGGTGACAAG
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GATTACAGAGCGAGGAGTTGCGCTGGTTGGTTTGGTTGTGACTTTGCAGTTTCTAGCTGT
TCTGTGTCTCTGGTCGCTGATCACTTTTCTAATGCGCCTCTTTCCTTCGAGACCTGTAGC
TGAAAACTACTAAACAGTAATGTTTTAGTGAAAGCCATTGAGGCTTTGATTTTCTGTGTT
TATTTTCAGAGGATTAATGGGCTGTATTGAGTCAGAAATCGCAGTGTAGGACACTTTTTG
AGAGTTGTTTGATTTATGAGGGATGAAATTGGCTAC

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

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TTTGTTGTTTTTACTGGTCTTGCTCTTATTCTCATCCCTGGGCTCTTCATCTCTTGGCGT
CTAAGTGTGCCTATCTCCTTCAAAAATATCCTCGGATTCATTAAGCTCATAACTTCTCGG
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TGCTTGATGTTTTTGTTCGAAAGATACCTCAACTCAAAGTTACAATATTTCAAAAGAGAA
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GATTACAGCGGGAGATTCGACATCTTGAACGCCTGCAAGAATCTAATGAAGAAATCACAA
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CGATTTGGACGTCGGCTTTGATGGCATATGATCCTATGTTCTATAGAAGAATCTAGGAGA
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AGAGACACATTATGAGTTTACAATTACACTTGGACACACATTCTACTTGTCAC


BQ
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GAGGCAGGAGCCAAACGGCTTTTAGAGTTCGCTGATCTCTGCTTCAAACTAGGGATAGAA
ACAGTGTCAGCTTTTGCTTTCTCCACTGAGAATTGGGGAAGACAAAAGGTCGAAGTTAAT
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GAAATCCGAGTTTCTGTTATTGGGAATCTTGAAAAGATCCCGGAATCTCTCCTCAAGACA
ATCAAAGAGCT

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DS 

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TTAGAGTTCGCTGATCTCTGCTTCAAACTAGGGATAGAAACAGTGTCAGCTTTTGCTTTC
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AGATACCTCAACTCAAAGTTACAATATTTCAAAAGAGAAGAAATCCGAGTTTCTGTTATT
GGGAATCTTGAAAAGATCCCGGAATCTCTCCTCAAGACAATCAAAGAGCTAAAGGAATCT
ACGAAGAGCTACAATAAGAAGCATCTCATCTTGGCCATAGATTACAGCGGGAGATTCGAC
ATCTTGAACGCCTGCAAGAATCTAATGAAGAAATCACAACAAGGTTTGATCAGTGAGGAA
GACGTGGACGAGACGCTTTTCGAGGGAGAGCTTGTGACAAAGTGTGCTGAGTTCCCAAGT
CCCGACCTATTGATTAGGACAAGTGGAGAACAGAGGATTAGTAACTTCTTCTTGTGGCAG
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TTGCTAGAGGCCCTGGTTTCGTACCAGTGCAGGGAAAGACGATTTGGACGTCGGCTTTGA
TGGCATATGATCCTATGTTCTATAGAAGAATCTAGGAGATCGTAAATATCATTGTTAATA
TTGGATATTCACTGTATATTCTATGAAAAATTTACTTTCAGAGACACATTATGAGTTTAC
AATTACACTTGGACACACATTCTACTTGTCAC

QA 1 812 1 812
DS 



AS 1 2

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ATTTGGTTGTGGAACGACATAGCAATTTCGATGTGGAGACTTACACTATTACGGTGCCAT
CACTACAGAGGCTAACCATAGAAGAGGATAGTAGCCAAGATATGGATGGTGGAGGCTATG
TGATAAATGCACCATCTTTGAAATACTTGAACATCGAAGGTCTCTATCGTATTGACTTCT
GTCTAATTGAGAACGCGCCAGAGCTTGTGGAAGCAAAGATCGGAGATGTTTCTGATATAG
CCAATGAAAACATTCTTGCGTCTCTAATTTTAGCCAAGCGTCTTTCCTTTTACTTCCCGT
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CTTAGTCATCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DL10TF U 1
AF RS1DL10JQ C 418
BS 1 468 RS1DL10TF
BS 469 469 RS1DL10JQ
BS 470 724 RS1DL10TF
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BS 793 804 RS1DL10TF
BS 805 1151 RS1DL10JQ

RD RS1DL10TF 810 0 0
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CCGTCAGTTTGATTTTTTTTCTCCTGCGGCTCGCTCATCCTTTTACTACTAAACTTTAGC
AAGTTTGCGTGTAGGCTGTGTCATGTCTTTGTCTTTGCGGTCTTAATCTGAAGTAATTAT
CGTTGTTTCTGTTCACAGAAATGGAACAAAAACGCAAAATGGTCGGTGATGATAGTTTGA
GAAATGAAGATGCTATGGAGAAGGACGTGATCAGTGAGTTGCCTGAAGCGTTGCTCCTGC
ATATATTGTCTTATGTTCCAACAGAAGATGTCATAGCAACGAGTGTGTTGTCTAAACGGT
GGAAATCTCTTTGGAAGATGGTGCCAAATCTCAAACTTTACTTTGATCATGACTCTTCAG
AGGATGTTTACAGGTTGCTGATTTTGCATAAAGCTCCAATCCTGGAAA*GTTTGCATTTG
TCCATTGAAGATAAAAGTGCTCGTTTGGATATTGGAATATTGATTGGAATCGCATTTTCA
CGCCACGTGCGTGAATTGGTGTTGTCTTTCTGCCATGAGGATCAACATACAGTAAGGTTC
CCGAGTGTATTGTGTAGCTACAACGATACACTCGAGGTATTAAAGCTCACGCAGCACATT
CTTTTAGACTTTCCTTCTCGGGTTTGTTCAAATCCCTTAGAGAGCTGCATCTTTACTACG
TGGA*TTCGATGATGA*GCATCTGTTTGCAACCTTTTATCTGGCTGCCCTAG*CTTCAAG
ATTTGGTTGTG*AACGACATAGCA
TTTCGA

QA 1 804 1 804
DS 

RD RS1DL10JQ 734 0 0
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TTGTCCATTGAAGATAAAAGTGCTCGTTTGGATATTGGAATATTGATTGGAATCGCATTT
TCACGCCACGTGCGTGAATTGGTGTTGTCTTTCTGCCATGAGGATCAACATACAGTAAGG
TTCCCGAGTGTATTGTGTAGCTACAACGATACACTCGAGGTATTAAAGCTCACGCAGCAC
ATTCTTTTAGACTTTCCTTCTCGGGTTTGTTCAAATCCCTTAGAGAGCTGCATCTTTACT
ACGTGGAATTCGATGATGAAGCATCTGTTTGCAACCTTTTATCTGGCTGCCCTAGGCTTC
AAGATTTGGTTGTGGAACGACATAGCAATTTCGATGTGGAGACTTACACTATTACGGTGC
CATCACTACAGAGGCTAACCATAGAAGAGGATAGTAGCCAAGATATGGATGGTGGAGGCT
ATGTGATAAATGCACCATCTTTGAAATACTTGAACATCGAAGGTCTCTATCGTATTGACT
TCTGTCTAATTGAGAACGCGCCAGAGCTTGTGGAAGCAAAGATCGGAGATGTTTCTGATA
TAGCCAATGAAAACATTCTTGCGTCTCTAATTTTAGCCAAGCGTCTTTCCTTTTACTTCC
CGTTAGAGGTAAAAAGTTAACAATGTTTTTGTATCTGCCTCTGTTTTTTTTTTAGTACTA
ATGCTTAGTCATCC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL5530Contig1 919 2 4 U
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AGTTATTTCTCTGTTGTTGTGACGGACCCTGGTGGTGTTCCACCGGGATGGAGGCCGGAA
CTAGACATAGAGAAAAGCGATGGAAGCCAAGAGTACACTTCACTTACGGTTGGAGATTCC
TCATCTCATATTGTAAGATACTGCCGCAAGTGCAACCAGTATAAACCTCCTCGTTCTCAC
CACTGTTCTGTCTGTGGAAGATGCATTCTAAAGATGGGCCATCACTGTGTTTGGGTTGTG
AATTGTGTTGGGGCAAAGAATTACAAGTCTTTTCTCCTCTTCTTGTTTTACACATTTCTT
GAGACAACGGTGGTTGCAGTATCGCTGTTTCCAGTTTTCCTCGTATTCTTTAACGATGGA
GATAGTGATGTTACAGTATCACCAGGAAGCCTAGCAGCCACCTTTGTTGCATTTGTATTG
AACATAACGTTTGCGCTAAGTGTACTAGGCTTCCTAATCATGCACATAATGTTGGTCATG
CGTAACACCACAACTATTGAGGCATATGAGAAACATACAGCTCCTAACTCTCCTTATAAC
CTTGGTCGTAAGCAAAACTTTGAACAGGTTTTTGGAAGGGATAAACTGTATTGGTTCGTG
CCACTGTACACAGAAGACGATATGAAAAGGATGCCAGCACTTCGAGGGTTAGACTTCACG
AGCAGGTTTGAGGAGTTTGAGCCGCTTCAGTCTTTATGACGTTAAGCTTCAAACTTTTGG
GAATGGGTTTCTGCTTTTGTGTATGTATCATTAATGTCTTTATTAAAAAGATCAATGCTT
CTTTTATTGAATTTGATTCTTCGTGTAAAGAAAATACTCAAAACTTTTTGCGTTGCATAC
ATAAATGATATTCCTCCTC


BQ
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AF RS1GV29TF U 1
AF RS1GV29JQ C 340
BS 1 627 RS1GV29TF
BS 628 628 RS1GV29JQ
BS 629 632 RS1GV29TF
BS 633 919 RS1GV29JQ

RD RS1GV29TF 633 0 0
GCATTACTATCTCTTCTCGTCTTATCCCTCTTTCACTTTCTGCTTATAATGTTACTGTGG
AGTTATTTCTCTGTTGTTGTGACGGACCCTGGTGGTGTTCCACCGGGATGGAGGCCGGAA
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TCATCTCATATTGTAAGATACTGCCGCAAGTGCAACCAGTATAAACCTCCTCGTTCTCAC
CACTGTTCTGTCTGTGGAAGATGCATTCTAAAGATGGGCCATCACTGTGTTTGGGTTGTG
AATTGTGTTGGGGCAAAGAATTACAAGTCTTTTCTCCTCTTCTTGTTTTACACATTTCTT
GAGACAACGGTGGTTGCAGTATCGCTGTTTCCAGTTTTCCTCGTATTCTTTAACGATGGA
GATAGTGATGTTACAGTATCACCAGGAAGCCTAGCAGCCACCTTTGTTGCATTTGTATTG
AACATAACGTTTGCGCTAAGTGTACTAGGCTTCCTAATCATGCACATAATGTTGGTCATG
CGTAACACCACAACTATTGAGGCATATGAGAAACATACAGCTCCTAACTCTCCTTATAAC
CTTGGTCGTAAGCAAAACTTTGAACAGTTTTT
G

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1GV29JQ 580 0 0
TTCTTGTTTTACACATTTCTTGAGACAACGGTGGTTGCAGTATCGCTGTTTCCAGTTTTC
CTCGTATTCTTTAACGATGGAGATAGTGATGTTACAGTATCACCAGGAAGCCTAGCAGCC
ACCTTTGTTGCATTTGTATTGAACATAACGTTTGCGCTAAGTGTACTAGGCTTCCTAATC
ATGCACATAATGTTGGTCATGCGTAACACCACAACTATTGAGGCATATGAGAAACATACA
GCTCCTAACTCTCCTTATAACCTTGGTCGTAAGCAAAACTTTGAACAGGTTTTTGGAAGG
GATAAACTGTATTGGTTCGTGCCACTGTACACAGAAGACGATATGAAAAGGATGCCAGCA
CTTCGAGGGTTAGACTTCACGAGCAGGTTTGAGGAGTTTGAGCCGCTTCAGTCTTTATGA
CGTTAAGCTTCAAACTTTTGGGAATGGGTTTCTGCTTTTGTGTATGTATCATTAATGTCT
TTATTAAAAAGATCAATGCTTCTTTTATTGAATTTGATTCTTCGTGTAAAGAAAATACTC
AAAACTTTTTGCGTTGCATACATAAATGATATTCCTCCTC

QA 1 580 1 580
DS 



AS 1 2

CO CL5531Contig1 538 2 9 U
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TGTCTCTTCAATTATTCTTCCCCGAGCTGTAAAAAGATTCTCTCCCAACTCTCTCTAGCC
GGCTCTTCAATGGAAGACTACAACCGTCAAAGAGCCTACGGAGACGGAGGGATGCAGATC
CAGCCTTACAACGGCGGCGGTCCGGGAACCGGCGACTTCAGGAGCTATAGCACCTCGTAC
GCGACGGAGAACAACATCTACGATATCAAGAAGGAGAAATCTATAGCGAGGTCGAAGTCT
TGGGGGATAACGGACCCGGAGCTATTGAGAAAGAAAAGGGTCGCGAGCTACAAGATGTAT
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TACACACAGGTCGTCTATGGCTGGTGGTGATCAAAGAGTTTCCACCTTAATCTTATTTGA
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BQ
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AF RS1G601TF U 57
AF RS1G764TF U 1
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GCGACGGAGAACAACATCTACGATATCAAGAAGGAGAAATCTATAGCGAGGTCGAAGTTT
TGGGGGATAACGGACCCGGAGCTATTGAGAAAGAAAAGGGTCGCGAGCTACAAGATGTAT
AGTGTTGAAGGCAAAGTCAAAGGCTCTTTTAGAAAAAGTTTCAGATGGCTTAAGCAGAGG
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DS 



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TGATGGTGTTTTGCGCACTATGATCCATCGTGCTGGAAATAAACTCAGATCCCTTAAACT
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ATCATCCTCTGATCCTGAATTTACTTGGAATTTATTAACAAGCCTACACATTTACAATCT
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ATATTCTACCATCGAAGCGTTTGTGGCCAACTGCCCCAAGTTAACTTGTCTAACACTTAA
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CATACTTGCAAAGACAGTCCGCTTGAGACTCTAATATTGCGTGACTGTTCTCTAGAGGAG
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GTTGATGTATCAAGTGGCAACGGTTTAGCTTGTGATGGAGATGAAAGAACTTTGGAACTA
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BQ
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AF RS1AL05TF U 1
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DS 

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QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 2

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AF RS1FS33TF U 1
AF RS1FS33JQ C 369
BS 1 736 RS1FS33TF
BS 737 1012 RS1FS33JQ

RD RS1FS33TF 736 0 0
GGGCGCTTCCTTTTCCGAATCCGAGGAATTAAATTTAGTAACTCGATCTCTTCGCCTCCT
CCGTGCACGTTGTTTGCCATCAAAGCGATTTCGTTTCCCATAAGGCCTTCTCCTCCTCCT
TTATATAGACGTTGTGGGTGAAATACGCTTTGTGCAGGAGTCCGATCTTAGGAACGATGC
AGCCACCACCAGGGATGTAATTGTCTACTTATCTTTGTGGACGAGGCTGCATCAACCTGT
AGGGGGAGTAGATAAATCCCAGTCTGTGATATTGTTGACCACGGTCAATCCTAAACTCTT
TGGAGGGAACCATTTTAATGCTGATTGACCGCATCTCTGAAGCTCTCCTCCTTGGTTAAA
AACCCTTCCAAAGCTAAGTCTTACAGCTCTCTGATCAACTCTTGCTTGAAGGTGGCCAAC
CTAGATACTCACTACATCAAAAGGCGTCCTTGAATTCTTTGACAGAGGGAACAAATACCT
AGGTCTCCACCACCTTGAGATCGCTACTAGGGGAGGTCATCCAGGAAGAACCTATCTTTT
TGGGGTGATGCTCATGTGTTTTGGGAGGTTTAAAAAAAAGGTAAAAAAAGTCCTCAACAG
TTTAACCAACACTGCAGGCATCACTGTCGTTGAGCGAAGCTGGGAAACTATCCAGATCAC
ATTGAGCGGGTTTGACATCTCTATGAAGAAAGTTTATTTGGAATCATATGAAAACATGCA
GACTGCACTTCATTGC

QA 1 736 1 736
DS 

RD RS1FS33JQ 644 0 0
CAAAGCTAAGTCTTACAGCTCTCTGATCAACTCTTGCTTGAAGGTGGCCAACCTAGATAC
TCACTACATCAAAAGGCGTCCTTGAATTCTTTGACAGAGGGAACAAATACCTAGGTCTCC
ACCACCTTGAGATCGCTACTAGGGGAGGTCATCCAGGAAGAACCTATCTTTTTGGGGTGA
TGCTCATGTGTTTTGGGAGGTTTAAAAAAAAGGTAAAAAAAGTCCTCAACAGTTTAACCA
ACACTGCAGGCATCACTGTCGTTGAGCGAAGCTGGGAAACTATCCAGATCACATTGAGCG
GGTTTGACATCTCTATGAAGAAAGTTTATTTGGAATCATATGAAAACATGCAGACTGCAC
TTCATTGCCACCCCGATGAGCTCAACACCGTATGTAGTGAGTGTTTTCACTTCTTGGTGT
CTGAGTTCATTGAGATGATCATGGGTCTCAACATCATCGTCCACCGTTGAGGAGCACATG
TATTCACTTTCTTCTCGAAACGGACCAAGAACACTCATTTCCCGTTTCCTGTTGTTACTG
AGCGTAGACTCAGATCCTTTGTTTCATGTTTGCACAAAACAAACAGATCCTTTGTTTCTT
CATGTTTGCACAAAAAACAAAACAAAACAGATGCCTCTGTTTTT

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 2

CO CL5534Contig1 944 2 2 U
GAAAAGGAATTGATCGTGATTTTGAACCTGTTCTTTCTATGACTCCTCTTAACTAAAGTA
GTAGTTAAAATAGGAAAGTAAAAATCGGGTCATAGTAAAAAGTCTTCTTTCTTTCTTTCA
ATTCAATCTCATTTTTTCTGGCTCGGCTATACTATCCAGCCGAGCCATTCTCCTTTTTTA
TGATGCTAAGAAGTAAAAAAGCCAATAAATAAAAAAATCTATTCATCCAACAAAAGGAGA
GAGAGGGATTCGAACCCTCGATAGTTATTTTTTATGAACTATACCGGTTTTCAAGACCGG
AGCCATCAACCACTCGGCCATCTCTCCGAAAGATAATTTCTATTTTATCTTTTTTTTCGC
CAAATAGAACATAGCTCGATGAGTTAATACGATCACTATGTAGAAAAAGATATAGGGTGT
GACTTTCTTTATAAGTCTATCAATTGGTCTATATAAATAAATGAGATACATGATCCAGTC
TACCCATTTGTGAAGTCAAAAAGAACCTTTAACTTCATGTCCGAATAGAATAAAAGTGGT
AAAAAGAAGTTGGAAATAAGGCATCTCGAATAAACGGATTCATGATAAAATCCCTTTATT
TATTAAAATTTTTTAGTGGGTAAGAGGATTAAATGGTGTATATTGTTAATAGCTTGGAGG
ATTAAAACCATGACTATTGCTTTTCAATTGGTTGTTTTTGCATTAATTATTACTTCATTA
ATCTTACTGATTAGTGTACCCGTTGTATTTGCGTCTCCTGATGGGTGGTCGAGTAACAAA
AATGTTGTATTTTCTGGTACATCTTTATGGATTGGATTAGTCTTCTTGGTGGGTATCCTT
AATTCTCTTATCTCTTGAATTCATTCGTTGCAGATCAAAAAATGAGATGACCCCTCCCAT
TCCGTGAATTACACATTCAAATTCAATATAAGTCCATAAAATGC


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AF RS1CZ46TF U 1
AF RS1CZ46JQ C 274
BS 1 643 RS1CZ46TF
BS 644 944 RS1CZ46JQ

RD RS1CZ46TF 643 0 0
GAAAAGGAATTGATCGTGATTTTGAACCTGTTCTTTCTATGACTCCTCTTAACTAAAGTA
GTAGTTAAAATAGGAAAGTAAAAATCGGGTCATAGTAAAAAGTCTTCTTTCTTTCTTTCA
ATTCAATCTCATTTTTTCTGGCTCGGCTATACTATCCAGCCGAGCCATTCTCCTTTTTTA
TGATGCTAAGAAGTAAAAAAGCCAATAAATAAAAAAATCTATTCATCCAACAAAAGGAGA
GAGAGGGATTCGAACCCTCGATAGTTATTTTTTATGAACTATACCGGTTTTCAAGACCGG
AGCCATCAACCACTCGGCCATCTCTCCGAAAGATAATTTCTATTTTATCTTTTTTTTCGC
CAAATAGAACATAGCTCGATGAGTTAATACGATCACTATGTAGAAAAAGATATAGGGTGT
GACTTTCTTTATAAGTCTATCAATTGGTCTATATAAATAAATGAGATACATGATCCAGTC
TACCCATTTGTGAAGTCAAAAAGAACCTTTAACTTCATGTCCGAATAGAATAAAAGTGGT
AAAAAGAAGTTGGAAATAAGGCATCTCGAATAAACGGATTCATGATAAAATCCCTTTATT
TATTAAAATTTTTTAGTGGGTAAGAGGATTAAATGGTGTATAT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RS1CZ46JQ 671 0 0
ATGAACTATACCGGTTTTCAAGACCGGAGCCATCAACCACTCGGCCATCTCTCCGAAAGA
TAATTTCTATTTTATCTTTTTTTTCGCCAAATAGAACATAGCTCGATGAGTTAATACGAT
CACTATGTAGAAAAAGATATAGGGTGTGACTTTCTTTATAAGTCTATCAATTGGTCTATA
TAAATAAATGAGATACATGATCCAGTCTACCCATTTGTGAAGTCAAAAAGAACCTTTAAC
TTCATGTCCGAATAGAATAAAAGTGGTAAAAAGAAGTTGGAAATAAGGCATCTCGAATAA
ACGGATTCATGATAAAATCCCTTTATTTATTAAAATTTTTTAGTGGGTAAGAGGATTAAA
TGGTGTATATTGTTAATAGCTTGGAGGATTAAAACCATGACTATTGCTTTTCAATTGGTT
GTTTTTGCATTAATTATTACTTCATTAATCTTACTGATTAGTGTACCCGTTGTATTTGCG
TCTCCTGATGGGTGGTCGAGTAACAAAAATGTTGTATTTTCTGGTACATCTTTATGGATT
GGATTAGTCTTCTTGGTGGGTATCCTTAATTCTCTTATCTCTTGAATTCATTCGTTGCAG
ATCAAAAAATGAGATGACCCCTCCCATTCCGTGAATTACACATTCAAATTCAATATAAGT
CCATAAAATGC

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 2

CO CL5535Contig1 459 2 6 U
GGGGCATAGACTTATAATAACAGATTAAACTGGTTTTTCCTTTAATGCCAGTGGTTGTCT
GTCTGTTTTTTTGCGTAAAATACAACTCATTTCCCTCTCTCTATCTCACACCATGGTGAT
GTTTCGTTAGTTAGTTGGTTCAGAATATCAAAAAGTTCTATGAATTCATAATTGATTAGT
ACCGAGATCTTATTATAATATCGATTCAAGAAAATTGTTTTGTTGACACAAAGCTATTTT
TATATAAAAACTAAAACTATGGTATGAGACTGATGAGATACATAGCTTGATCCATGATAC
CCATGTCGGAAAGAATCCGAGTTTCAAGAGTAGTGTTTATAAGAATGACCATTCGACTCT
ATCAAAAGCTTTGCTCATATCTATTTTGATTGCCACAAATTTTGACCTACACCCAGGATT
AATTCGTAGGGTGTGGAAAACTTCGTGAGCTACCAGAAC


BQ
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AF RS1CA54TF C 1
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TATATAAAAACTAGAACTATGGTATGAGACTGATGAGATACATAGCTTGATCCATGATAC
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AATTCGTAGGGTGTGGAAGACTTCGTGAGCTACCAGAAC

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DS 

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GTTAGTTAGTTGGTTCAGAATATCAAAAAGTTCTATGAATTCATAATTGATTAGTACCGA
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AAAAACTAAAACTATGGTATGAGACTGATGAGATACATAGCTTGATCCATGATACCCATG
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AAGCTTTGCTCATATCTATTTTGATTGCCACAAATTTTGACCTACACCCAGGATTAATTC
GTAGGGTGTGGAAAACTTCGTGAGCTACCAGAAC

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DS 



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CTAGCTCACCAAACGAGGCTGAAGGTTTGTTAGAAGGAAAAGCGAGTGAGAAAATTCATG
CGGGTCTTATCCTCGTACTGGCGCAGCTCTCTGTCGTCATCGAACAAAAGGTCATCCCGA
GAATTGCTGGAAATAACTGCTTCCTTCTCTAGCGGAAACTCCCAAACTTTTATTCCTGGA
GAACTCTGCCGGGTCTTCCACGCAGCCAGCGAGAAACTTCTCCAGCATTACATAGACACG
AGAACACAGAAGATATCAAATGTACTAAGAAAGAGGTTCAAGACACCAAACTGGGTTAAG
CACAAGGAGCCACGAGAGGTTCACATGTATGTCGACATGCTTCTACAACAGTTAGAAGAA
GTCGGTAAAGAAGTGAAACAAATTTTACCACAAGGGACTTTCCGTAAGCACAAGAGATCA
GACAGCAATGGTAGTAACACTACAACCTCGTCACGGAGCACTACGCTGCATAGCGATAAG
ATGGCACGGTCGAATTCACAGAGAGCTCGTAGTCAGCTTTTCGAGACGCATCTTGCAAAG
CTGTTCAAGCAAAAAGTAGAAATATTCACCAAAGTTGAATTTACCCAGGAATCAGTTGTT
ACGACAACAGTGAAGCTGTGTCTGAAGAGTTTGCAAGAATATGTACGGCTCCAAACGTTT
AACAGGAGCGGGTTCCAGCAGATTCAGCTAGACATTCAGTTCTTGAAAGCTCCTTTGAAA
GAAACAGTTGAGGACGAAGCTGCAATTGACTTCTTACTCGATGAGGTGATCGTTGCGGCT
TCGGAGAGGTGTCTTGATGTGACTCCATTGGAGCCACCAATCTTGGACAAACTCATACAA
GCCAAGCTCGCTAAATCAAAGGAGCACAACAACAACACAGCTTCTTCTTGAAAATAATAA
GCCCGTAGCTCAAAACCCAAATGTGTGTTTCTGTGTCTCATGATTCTTGAATCTTTTGGT
ACATTTGCTCTGAGTTGATACATTATTTTTTTTGGGACAAAAGCTGACATTAAACTTCAA
AATTACATTAAAGTTAGCCAAAGTAAAATAAAGTTATTACTTGTT


BQ
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BS 1 698 RS1E072TF
BS 699 1125 RS1E072JQ

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DS 

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CTGCATAGCGATAAGATGGCACGGTCGAATTCACAGAGAGCTCGTAGTCAGCTTTTCGAG
ACGCATCTTGCAAAGCTGTTCAAGCAAAAAGTAGAAATATTCACCAAGGTTGAATTTACC
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CGGCTCCAAACGTTTAACAGGAGCGGGTTCCAGCAGATTCAGCTAGACATTCAGTTCTTG
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GACAAACTCATACAAGCCAAGCTCGCTAAATCAAAGGAGCACAACAACAACACAGCTTCT
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GACATTAAACTTCAAAATTACATTAAAGTTAGCCAAAGTAAAATAAAGTTATTACTTGTT

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

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TACAACAGACAAAACGACAACGTAGAGAGAGACAAAGATGCAGATACAGAGTAGTTGTCA
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AE14JQ U 149
AF RS1AE14TF C 1
BS 1 148 RS1AE14TF
BS 149 522 RS1AE14JQ
BS 523 806 RS1AE14TF

RD RS1AE14JQ 374 0 0
GAGACAAAGATGCAGATACAGAGTAGTTGTCACAGTATCAGTGGTTGTTGGTTATTACCA
TTCTTTCCTTCTTGATTTGTCATCACACACACTGTCTAAGTTCAGTAATAAGGTTGCTGA
TGGTGGGCGTGTTGGTGGTGCTGCTGAGGGTAGTGCGGGTGGTAAACCGGAGGAGCTGGA
GCTGGAACAGGGACAGGACCGTTGCAATAAGCGTTGTACGCTGGGTAACCCATAGGTGAG
GCTTGGTATGAGGCAGGGATAAGCTCAGGGGAGTATGGATAAGGTGGGCTCCTGTTGCTG
TAGACAGTGGTAGGTGGTGATGGGTAAGATGCTGCAGGTGAAGCGTACTGAGGGGAGTGA
GAGGGTGATCTGAT

QA 1 374 1 374
DS 

RD RS1AE14TF 806 0 0
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TTTTAACACACAACAGGAAGATAGCTAACTTACTAAAACAGAGTTAGGCTTCGAAAATAT
TACAACAGACAAAACGACAACGTAGAGAGAGACAAAGATGCAGATACAGAGTAGTTGTCA
CAGTATCAGTGGTTGTTGGTTATTACCATTCTTTCCTTCTTGATTTGTCATCACACACAC
TGTCTAAGTTCAGTAGTAAGGTTGCTGATGGTGGGCGTGTTGGTGGTGCTGCTGAGGGTA
GTGCGGGTGGTAAACCGGAGGAGCTGGAGCTGGAACAGGGACAGGACCGTTGCAATAAGC
GTTGTACGCTGGGTAACCCATAGGTGAGGCTTGGTATGAGGCAGGGATAAGCTCAGGGGA
GTATGGATAAGGTGGGCTCCTGTTGCTGTAGACAGTGGTAGGTGGTGATGGGTAAGATGC
TGCAGGTGAAGCGTACTGAGGGGAGTGAGAGGGTGATCTGATGAACGGGAAGGAAGAGAC
GTATGCGTTTGTGATACGCCCGGCTTTCGCTGGTGGCATTGGACCGTTGTAGCTGGCTCT
GGTTCTCTTGTTCGCCGGTACAGCTGCTGGTTTCCTCTTCTCGGTTTTGGTCTTCTCTAG
CTGTTCCAACCGCTTCTTGAGGTTCTCTGGAGGGAACTCTTCCTCGAGTTTGTACTCTTC
TATGCATTTCAAGACTGCCTTGAGAGCTGATTGCTCCTTGCGCGCCACAAGATGCGAAGC
TCGGCCAGTATTGCTGGAGTCTTCCC

QA 1 806 1 806
DS 



AS 1 2

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TATAAGTTCGTACTGAACAAAATAAGGAGAAACAAGAATGAAAGTGGACACAGACAGTGT
TTTAGTGCCCTTGAGTGTGTTCATAGCAGTGGGATATCATGTCTTCCTCTGGAACACCTT
CAAGCACAATCCTTCTCGTACTTCTCTTGGCATCGATTCCTCCAAACGCAAATCTTGGTT
CCGTGATATCAAATAGGGTGACGATAAGACTGGCATGTTGGCAGTGCAAAGCCTGAGGAA
CAAAAAAATGGTTACAATTCTCACTGCTACAGTCTCCATCCTTATCTTGCTTTCTCTAGC
TGCGGTTACTAACAACGCGTTTAAAGCAAGCCACCTCTTCACAACCGCGGACGACATTGT
TTTAGGCTCCAAAAACCCTACAATCTTCGTCCTCAAGTATGCATCTACCTCTCTGCTTCT
GGCAGTAAGTTTTTTCTTCAGCTCACTTTGCTGTGAGTTTACTTTGGTGGATGCCAATTT
TTCTCATAAACGCCAATTTGCTAAAATGCATGAAGGAGACTGCGATTTGCGATTATGAAT
TTGACGGGGACTGGATCGTTTAGGGAGTATACAAGATTAGTGTTGGAGAGAGGGTTTTTT
TATGGCTATGATTGGGAACAGAGTTATGTGCGTTTCTGTACCGCTATTGCTATGGGATGT
TTGGGCCGTTACCAGTGTTTGTGTCTTCACTAGCCTTGTTTGGGTATTGTACCAGATTGA
TTT


BQ
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10 10 10 

AF RS1A334TV U 416
AF RS1A334TF U 1
BS 1 508 RS1A334TF
BS 509 509 RS1A334TV
BS 510 519 RS1A334TF
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BS 716 716 RS1A334TV
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RD RS1A334TV 334 0 0
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CTTCTGGCAGTAAGTTTTTTCTTCAGCTCACTTTGCTGTGAGTTTACTTTGGTGGATGCC
AATTTTTCTCATAAACGCCCATTTGCTAAAATGCATGAAGGAGACTGCGATTTGCGATTA
TGAATTTGACGGGGACTGGATCGTTTAGGGAGTATACAAGATTAGTGTTGGAGAGAGGGT
TTTTTTATGGCTATGATTGGGAACAGAGTTATGTGCGTTTCTGTACCGCTATTGCTATGG
GATGTTTGGGCCGTTACCAGTGTTTGTGTCTTCA

QA 1 334 1 334
DS 

RD RS1A334TF 783 0 0
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TATAAGTTCGTACTGAACAAAATAAGGAGAAACAAGAATGAAAGTGGACACAGACAGTGT
TTTAGTGCCCTTGAGTGTGTTCATAGCAGTGGGATATCATGTCTTCCTCTGGAACACCTT
CAAGCACAATCCTTCTCGTACTTCTCTTGGCATCGATTCCTCCAAACGCAAATCTTGGTT
CCGTGATATCAAATAGGGTGACGATAAGACTGGCATGTTGGCAGTGCAAAGCCTGAGGAA
CAAAAAAATGGTTACAATTCTCACTGCTACAGTCTCCATCCTTATCTTGCTTTCTCTAGC
TGCGGTTACTAACAACGCGTTTAAAGCAAGCCACCTCTTCACAACCGCGGACGACATTGT
TTTAGGCTCCAAAAACCCTACAATCTTCGTCCTCAAGTATGCATCTACCTCTCTGCTTCT
GGCAGTAAGTTTTTTCTTCAGCTCACTT*GCTGTGAGTT*ACTT*GGTGGATGCCAATTT
T*CTCATAAACGCCA**TTGCTAAAATGCATGAAGGAGACTGCGATT*GCGATTATGAAT
T*GACGGGGACTGGATCGTTTAGGGAGTATACAAGATTAGTGTTGGAGAGAGGGTTTTTT
*ATGGCTATGATTGGGAACAGAGTTATGTGCGTTTCTGTACCGCTATTGCTATGG*ATGT
TTGGGCCGTTACCAGTGTTTGTGTCTTCACTAGCCTTGTTTGGGTATTGTACCAGATTGA
TTT

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 2

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GGAACACGTTTAGTATAATAACTAAATAATAATAATCTCCGGCTCCTGGTTCAGCTGCGT
CGACGAGATCCGTCGTTACGATCTCAGATTTGATACTCCGGCGACATGAGTTCTCCGGGA
GCGAGTATGTTCACAAATTTCACCAAGCTCTGCAAAGGACTCGCTCTCGTGCTTGTGATC
GGACACGTCTTGGTTCACTTCGTTCCCTCCACCGTCACGTACCTCGCTCTCATCCCAGCC
AGGACTATTCCATTTGGATGGAATCTGATTACAAGCGGCTATTTTGAACTCTCAGTATAT
GGTGTTGTCTTCAGCGTTGTTTCTCTCCTCTTTATGGGAAAGTTCCTTGAACCTGTCTGG
GGTTCCAAGGAGTTCCTTAAGTTCATCTTCGTAGTCAACTTCCTTACCTATCTCTGCGTT
TTCGTCACAGCCATTGCTTTGTACTACATTACCAGGCTCGAAATCTACCTATATATGCCC
TTCGCAGGTTTTCATGGTGTCTTGGCAGGCCTTCTTGTTGGGATTAAGCAGATAATACCT
GACCAGGAGGTACTACTCGTAAAGATAAAAGCAAAGTGGTTGCCCTCTATTATGCTAGTT
TTGTCAATAGCCTCAAGCTTCTTCACACTAAACTCAGCAGCATACCTTCCCACTTTGATT
TTTGGTACGTATATGGGCTGGTTATACCTCAGATACTTGCAGAGGAGGCCAGAGACAAAG
CTCAGAGGTGATCCGAGTGACGACTTTGCCTTCTCCACTTTCTTTCCTGAATTCCTCAGA
CCGATTATTGATCCTATAGCCTCAATATTTCATCGGATGCTTTGTGGACGATCAAATGCG
ACCAGCGAAGACCATGGTTATACTACCAGCGGTGCTCCATTACCCGGCTCTGACTCTGCT
GAAGCTTCCAGGAGGAGAGAAAGAGGAGCAAGAGCTCTAGAGGAGAGACTTGCAACGGAA
AGGTTAGTTCCTCCAAGGAACAAAGATGAGTTGCAGAGTGATGCTTTGGATAGCGTTTAA
GTGGTGGAGACTGCAACTAGTTTTGTTGAAGAAGTTGTGTGGGTTCTTGTTTTTTTCTTC
TTTTTCTGTTTGTTTATGAAATTGGTTTTATACAGACAGAACCGATCAGCTTCTGCGTAA
ATTCTTATGACAGCT


BQ
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AF RS1CG91TF U 1
AF RS1CG91JQ C 407
BS 1 709 RS1CG91TF
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GACCAGGAGGTACTACTCGTAAAGATAAAAGCAAAGTGGTTGCCCTCTATTATGCTAGTT
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CTCAGAGGTGATCCGAGTGACGACTTTGCCTTCTCCACTTT
TTTCTGATTCTCAGAC

QA 1 761 1 761
DS 

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ACCTATATATGCCCTTCGCAGGTTTTCATGGTGTCTTGGCAGGCCTTCTTGTTGGGATTA
AGCAGATAATACCTGACCAGGAGGTACTACTCGTAAAGATAAAAGCAAAGTGGTTGCCCT
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TTCCCACTTTGATTTTTGGTACGTATATGGGCTGGTTATACCTCAGATACTTGCAGAGGA
GGCCAGAGACAAAGCTCAGAGGTGATCCGAGTGACGACTTTGCCTTCTCCACTTTCTTTC
CTGAATTCCTCAGACCGATTATTGATCCTATAGCCTCAATATTTCATCGGATGCTTTGTG
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TTGTTTTTTTCTTCTTTTTCTGTTTGTTTATGAAATTGGTTTTATACAGACAGAACCGAT
CAGCTTCTGCGTAAATTCTTATGACAGCT

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

CO CL5540Contig1 1156 2 4 U
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TTTGATTTGATTTGATTGTCATTTTCTCATCACTCCCTCGTTCGTATCGTTATCGGCATC
GGTTTCATAATCTCAATCCCTCTCTGCCTTACATTCTCTGTCTCGAATCCATTGCCTCCA
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TAAGAAGATCTGGAAGCTTACAGATACCATGCAATCAAAGAGTGTTGATTGGTCAAAGGC
CGGCTAAGTACTTGAGTCTCAGGACAACTCTTGGATCTGTGAAAGCTGTCCAAGTGTCTA
CTGTCACACCTGCTGAATCTACAGCTACTGTTGAATTAGAAGATGCTGAGACGGCGAAGC
CATCTCCGTTGAACGCTCAGCTCGTTCCCAGCCCTCTGAGGTGGAAGCTCTTGTAACTGA
AATATGCGACTCCTTATCAATTGCAGAGTTTGAACTGAAACTAGGAGGTTTCCGCCTATA
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ATCTCCAAAAGTAGGGTTCTTTAGGAGATCCAAAACCATAAAGGGTAAACGTACTCCTTC
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CGGTGGCCAATTCCCTATCGAGTCTGATGTTACTGGCGAGGTTGTCAAAATACTCCGAGA
GGATGGAGAGCCTGTAGGATACAATGATGCTCTCATCTCGATCCTTCCTTCCTTCCCTGG
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CTGTGCCCTGTGTATGTTTTTTCTTTAGAACAAATAAAACTTCATTCATGTCCCCTATGT
TTCTGTTTGTCTTTTTACTTGTCTGAAAGTTCTTTCTCAAGACACTGTTTTATTCTCTTC
TTTTTTTATATAAACA


BQ
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AF RS1DI44TF U 1
AF RS1DI44JQ C 436
BS 1 704 RS1DI44TF
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BS 706 729 RS1DI44TF
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TAAGAAGATCTGGAAGCTTACAGATACCATGCAATCAAAGAGTGTTGATTGGTCAAAGGC
CGGCTAAGTACTTGAGTCTCAGGACAACTCTTGGATCTGTGAAAGCTGTCCAAGTGTCTA
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AATATGCGACTCCTTATCAATTGCAGAGTTTGAACTGAAACTAGGAGGTTTCCGCCTATA
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TGCCGTTTCTGCAAATGCAACCACGGAGAGTGTTGATTCGAATGGATCAGCTTCCTCTAC
TTCACTGGCTATCATAAAACCAACATCCTCAGCTGCTGATCAGG*TTTGGTGGTTCTCCA
ATCTCCAAA

QA 1 729 1 729
DS 

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ATCAATTGCAGAGTTTGAACTGAAACTAGGAGGTTTCCGCCTATATGTAGCAAGGAACTT
AGCTGACAACAACAGTAGCCCACCACAACCTCAGCCCATTCCTGCTGCCGTTTCTGCAAA
TGCAACCACGGAGAGTGTTGATTCGAATGGATCAGCTTCCTCTACTTCACTGGCTATCAT
AAAACCAACATCCTCAGCTGCTGATCAGGGTTTGGTGGTTCTCCAATCTCCAAAAGTAGG
GTTCTTTAGGAGATCCAAAACCATAAAGGGTAAACGTACTCCTTCGTCATGTAAAGAGAA
AGACCAAGTGAAAGAAGGTCAAGTTCTTTGCTACATTGAACAACTCGGTGGCCAATTCCC
TATCGAGTCTGATGTTACTGGCGAGGTTGTCAAAATACTCCGAGAGGATGGAGAGCCTGT
AGGATACAATGATGCTCTCATCTCGATCCTTCCTTCCTTCCCTGGGATCAAGAAGCTTCA
GTAGTACTAAGAACCAGACCTGAGCTGGTTTTTTGAGTTGTGAAACTGTGCCCTGTGTAT
GTTTTTTCTTTAGAACAAATAAAACTTCATTCATGTCCCCTATGTTTCTGTTTGTCTTTT
TACTTGTCTGAAAGTTCTTTCTCAAGACACTGTTTTATTCTCTTCTTTTTTTATATAAAC
A

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL5541Contig1 907 2 2 U
GCACCATTCCTCTGCTCCAAATCACTTTGACTCACATGTTGACAGTTTTGGAGGGAAACG
AATGAGAAAGCATACACAGAGAAGAGCTGTTGATTACACGAGCACCGTTGTCAATTATAT
TCAAGCTCGAACATGGCAGCGAGACTCAAGGGATATGACCTCTTTGCAACCAACTCCAGC
TGCTGCAGTTGATATGCTTCCCCCAGTTGCCTATTCAGATAACCCTTCTACAAGCTTTGC
TGCTAAGTTTGTTCACTCATCTCTAAACAAGAACCGTTGCTCAATCAACTGTGTAGTGTG
GACACCTTCTGGAAGACGTCTTATCACCGGCTCCCAAAGTGGGGAGTTTACTCTTTGGAA
TGGGCAATCTTTCAATTTCGAGATGATTCTTCAGGCACATGAACAATGTGAAGGCCAATA
GGACTGCTCACATGCCACCTTCCTCAATGCCTATGTCTCATCCAATGCCTGGACCAATGG
GGATGCAAGGAGGCATGAATCCTCAGATGTCGCAAGTCCATTATATGGGTGCTCCTTCGG
GAGCCTTTCCAGGACCACCAAGCAGTGGTGGACCACCCCCAATGTATCCCCAAGGACGTG
GTTTCAACCGTCCACAGATGATGCCAGGATACAACAACCCTTTCCAACAGCCGCCTTTAC
CTGCAGGCCCTCCACCAAACACCAATCAGCAACATCAGTAGACCACCCTTGTAACAAGTA
CATATCCTGTTTGTAGACTTGGCCAATTCTTACCAAGGAGTTGTGTCTAAGATAATTCAA
AGCTGTGAAATGGTTTTGCTGTTCATGTGTTGATGTTCTTTTAGCTGAACAAGTTACTAT
AGTGAAGTTCTAGTGACTTTCACATGTCATACTCATATTCCAGTTTAGTTTTCGTTTAAC
AAACTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D596TF U 1
AF RS1D596JQ C 216
BS 1 588 RS1D596TF
BS 589 907 RS1D596JQ

RD RS1D596TF 588 0 0
GCACCATTCCTCTGCTCCAAATCACTTTGACTCACATGTTGACAGTTTTGGAGGGAAACG
AATGAGAAAGCATACACAGAGAAGAGCTGTTGATTACACGAGCACCGTTGTCAATTATAT
TCAAGCTCGAACATGGCAGCGAGACTCAAGGGATATGACCTCTTTGCAACCAACTCCAGC
TGCTGCAGTTGATATGCTTCCCCCAGTTGCCTATTCAGATAACCCTTCTACAAGCTTTGC
TGCTAAGTTTGTTCACTCATCTCTAAACAAGAACCGTTGCTCAATCAACTGTGTAGTGTG
GACACCTTCTGGAAGACGTCTTATCACCGGCTCCCAAAGTGGGGAGTTTACTCTTTGGAA
TGGGCAATCTTTCAATTTCGAGATGATTCTTCAGGCACATGAACAATGTGAAGGCCAATA
GGACTGCTCACATGCCACCTTCCTCAATGCCTATGTCTCATCCAATGCCTGGACCAATGG
GGATGCAAGGAGGCATGAATCCTCAGATGTCGCAAGTCCATTATATGGGTGCTCCTTCGG
GAGCCTTTCCAGGACCACCAAGCAGTGGTGGACCACCCCCAATGTATC

QA 1 588 1 588
DS 

RD RS1D596JQ 692 0 0
TCAGATAA
CCTTCTACAAGCTTTGCTGCTAAGTTTGTTCACTCATCTCTAAACAAGAACCGTTGCTCA
ATCAACTGTGTAGTGTGGACACCTTCTGGAAGACGTCTTATCACCGGCTCCCAAAGTGGG
GAGTTTACTCTTTGGAATGGGCAATCTTTCAATTTCGAGATGATTCTTCAGGCACATGAA
CAATGTGAAGGCCAATAGGACTGCTCACATGCCACCTTCCTCAATGCCTATGTCTCATCC
AATGCCTGGACCAATGGGGATGCAAGGAGGCATGAATCCTCAGATGTCGCAAGTCCATTA
TATGGGTGCTCCTTCGGGAGCCTTTCCAGGACCACCAAGCAGTGGTGGACCACCCCCAAT
GTATCCCCAAGGACGTGGTTTCAACCGTCCACAGATGATGCCAGGATACAACAACCCTTT
CCAACAGCCGCCTTTACCTGCAGGCCCTCCACCAAACACCAATCAGCAACATCAGTAGAC
CACCCTTGTAACAAGTACATATCCTGTTTGTAGACTTGGCCAATTCTTACCAAGGAGTTG
TGTCTAAGATAATTCAAAGCTGTGAAATGGTTTTGCTGTTCATGTGTTGATGTTCTTTTA
GCTGAACAAGTTACTATAGTGAAGTTCTAGTGACTTTCACATGTCATACTCATATTCCAG
TTTAGTTTTCGTTTAACAAACTTG

QA 9 692 9 692
DS 



AS 1 2

CO CL5542Contig1 1133 2 2 U
GAAGGATCTCACACTCTGCGCTATGAAAGACGCACATCTGACTGAAGCCGGCAAACCAAT
CCGTAGCTCCCATGCCTCAAAGGCCTGCAACTCTCGTTTCAATTCCTGTGCTTCAAATTG
CAGTACAGGCCACAACCCAGGTTTTTTGATTGCCTCAACGAAGTCACCAAAGGTTGAGAG
GAAGATAACCTTTGATTTCTTTAGGCTTTTCATACTTTCTAAAACCCACATCCATACTTG
CAACTTTGCTTCCCCCACTGACTTGATATTCGAAAAAGCTCTCCTACTGTGCATCAGTAC
TTTTCCGCTTTCTTCTCTCACAATCCAAGCCACTCCCATCTCTTGAGAATGCTTACTCCA
GTCCATATCGAATTCACACAAGACCCAACCTGCTGGAATCGATTGCTTTGGACAATTCAA
GTCTCTTGTTGCGACCTCTGTTTCTGCTCTCTCCATTCCACTCTGTACCTGTTGGGCCAA
AAACCAAGCTTCTGTTTCGTCTATGGCTTTTTTGATGATCTCTTCTGCCTCAAAAGATCC
GTCCTGTTTATTCTATTGGAATTATTTTTTTTATATTTCTTCTTTTTGCAGCTATCGGTG
GTTTTGTTGATAAAGCATGCGTTTGATGTGGTTTACGGAACCGACGAATATCCCTTCACG
ATTTTGACGGTATTTTTAGTAGTCTTTAATTACTATACCCCATCTAATTTTGTATGCTTT
AAACTTTAAATTAGTTGGGGGAAATTAATGACAGGTATTAACACTGAAGGCCATTGGTAT
ACTACTGCCAATGCCCGTAATCATTCGGACTATCGCAGCTGTTCAGAGCAGTTTCCGACG
TCAGTTTATCGTACGCTCCTTGAAACATTTTCCTCTTCTTATCACCATCTTTTACCATAT
TCTTAAATAGTTGAGATTTTAATAGGAATCTGAAGAAGATAGGTTGAGCTCTGAAGAAGA
AGATGATGACTTGGAGGAGGAAGAGCAACAGCAACATTTGGCTTGATCTTTATTTTTTTC
GTTAAACCTTTGTCTTTTTTATGAAAGCATAAGACTCTCATATACAAATAGAAATCTGTA
ACCACTATCAACTGTAACGTATGTTAAATTAATAATCATAAGAGTTTTAAGTC


BQ
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AF RS1F780TF U 1
AF RS1F780JQ C 372
BS 1 740 RS1F780TF
BS 741 1133 RS1F780JQ

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GAAGGATCTCACACTCTGCGCTATGAAAGACGCACATCTGACTGAAGCCGGCAAACCAAT
CCGTAGCTCCCATGCCTCAAAGGCCTGCAACTCTCGTTTCAATTCCTGTGCTTCAAATTG
CAGTACAGGCCACAACCCAGGTTTTTTGATTGCCTCAACGAAGTCACCAAAGGTTGAGAG
GAAGATAACCTTTGATTTCTTTAGGCTTTTCATACTTTCTAAAACCCACATCCATACTTG
CAACTTTGCTTCCCCCACTGACTTGATATTCGAAAAAGCTCTCCTACTGTGCATCAGTAC
TTTTCCGCTTTCTTCTCTCACAATCCAAGCCACTCCCATCTCTTGAGAATGCTTACTCCA
GTCCATATCGAATTCACACAAGACCCAACCTGCTGGAATCGATTGCTTTGGACAATTCAA
GTCTCTTGTTGCGACCTCTGTTTCTGCTCTCTCCATTCCACTCTGTACCTGTTGGGCCAA
AAACCAAGCTTCTGTTTCGTCTATGGCTTTTTTGATGATCTCTTCTGCCTCAAAAGATCC
GTCCTGTTTATTCTATTGGAATTATTTTTTTTATATTTCTTCTTTTTGCAGCTATCGGTG
GTTTTGTTGATAAAGCATGCGTTTGATGTGGTTTACGGAACCGACGAATATCCCTTCACG
ATTTTGACGGTATTTTTAGTAGTCTTTAATTACTATACCCCATCTAATTTTGTATGCTTT
AAACTTTAAATTAGTTGGGG

QA 1 740 1 740
DS 

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ATTCACACAAGACCCAACCTGCTGGAATCGATTGCTTTGGACAATTCAAGTCTCTTGTTG
CGACCTCTGTTTCTGCTCTCTCCATTCCACTCTGTACCTGTTGGGCCAAAAACCAAGCTT
CTGTTTCGTCTATGGCTTTTTTGATGATCTCTTCTGCCTCAAAAGATCCGTCCTGTTTAT
TCTATTGGAATTATTTTTTTTATATTTCTTCTTTTTGCAGCTATCGGTGGTTTTGTTGAT
AAAGCATGCGTTTGATGTGGTTTACGGAACCGACGAATATCCCTTCACGATTTTGACGGT
ATTTTTAGTAGTCTTTAATTACTATACCCCATCTAATTTTGTATGCTTTAAACTTTAAAT
TAGTTGGGGGAAATTAATGACAGGTATTAACACTGAAGGCCATTGGTATACTACTGCCAA
TGCCCGTAATCATTCGGACTATCGCAGCTGTTCAGAGCAGTTTCCGACGTCAGTTTATCG
TACGCTCCTTGAAACATTTTCCTCTTCTTATCACCATCTTTTACCATATTCTTAAATAGT
TGAGATTTTAATAGGAATCTGAAGAAGATAGGTTGAGCTCTGAAGAAGAAGATGATGACT
TGGAGGAGGAAGAGCAACAGCAACATTTGGCTTGATCTTTATTTTTTTCGTTAAACCTTT
GTCTTTTTTATGAAAGCATAAGACTCTCATATACAAATAGAAATCTGTAACCACTATCAA
CTGTAACGTATGTTAAATTAATAATCATAAGAGTTTTAAGTC

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL5543Contig1 907 2 2 U
GCAACTGTTTCTTGATTTCTTGAGTTAGTTTTCCCCTTTCATCCGAAAAAGAGGGAAAAG
TTTCGATCTTGTTGTTTGGAGTAATGGTGGGTGCTCTGTTTGTTGTTGGCTCATCGGTGA
TGGATTCATGTCTATGTATGGATGCTCACACCAGGACCACCAGGAGCAAGAAGAAGATCC
TTGGCAGTGCAAGAAAGATGGAACTAGGGAGCTCCTTTACTGGTTCAGGCATTGTTTTCA
GGATTTCTTCCAAGAAGCGTGTCCCAAGGATTGCGAATCGAAGAAAGAAGCTCTTGATTG
TGAGTGAGGACGTTGCTGGGAACTGCGATGATACCTTCGGGGATGTCAAAACGAACCTTG
TTAACTATTTCACATACAAAGCTGTGAGGACGGTTCTTCATCAGCTCTACGAAATGAATC
CTCCTCAATACACTTGGTTCTATAATTACGTCGTATCGAACAGACCAACCGATGGTAAAC
GATTCCTCCGCAAACTCGGCAAGGAAAATCAGGAGCTTGCAGAAAGAGTGATGATCACGC
GTCTACACTTGTATGGCAAGTGGATCAAGAAATGCGACCATGGGAAGATATACCAAGATA
TATCGGATGAGAACTTGGCGTTGATGCGTGAACGCCTCATGGAGACGGTGATATGGCCTT
CCGATTACTCGAACTCCGAGGTTATTGGCTGAAGAAGGCTGTGTCACAAACGCAGCATTT
ACTTTGCTTTCGTCAACTCGCTTCACAATTTTAGGATCTTGAGTTTCTTTTAGTTTGATT
TACATATAATGAATCATTAATGATACAGTCATTGAGCATTGTGTATATCAGTATATGTAT
CTATTCTTTCTTGGCATGTACTATTTATGACAATAGGGAAAAAAACCTATACCCTTCTTG
TGCTCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1G483TF U 1
AF RS1G483JQ C 210
BS 1 578 RS1G483TF
BS 579 907 RS1G483JQ

RD RS1G483TF 578 0 0
GCAACTGTTTCTTGATTTCTTGAGTTAGTTTTCCCCTTTCATCCGAAAAAGAGGGAAAAG
TTTCGATCTTGTTGTTTGGAGTAATGGTGGGTGCTCTGTTTGTTGTTGGCTCATCGGTGA
TGGATTCATGTCTATGTATGGATGCTCACACCAGGACCACCAGGAGCAAGAAGAAGATCC
TTGGCAGTGCAAGAAAGATGGAACTAGGGAGCTCCTTTACTGGTTCAGGCATTGTTTTCA
GGATTTCTTCCAAGAAGCGTGTCCCAAGGATTGCGAATCGAAGAAAGAAGCTCTTGATTG
TGAGTGAGGACGTTGCTGGGAACTGCGATGATACCTTCGGGGATGTCAAAACGAACCTTG
TTAACTATTTCACATACAAAGCTGTGAGGACGGTTCTTCATCAGCTCTACGAAATGAATC
CTCCTCAATACACTTGGTTCTATAATTACGTCGTATCGAACAGACCAACCGATGGTAAAC
GATTCCTCCGCAAACTCGGCAAGGAAAATCAGGAGCTTGCAGAAAGAGTGATGATCACGC
GTCTACACTTGTATGGCAAGTGGATCAAGAAATGCGAC

QA 1 578 1 578
DS 

RD RS1G483JQ 698 0 0
AGCTCCTTTACTGGTTCAGGCATTGTTTTCAGGATTTCTTCCAAGAAGCGTGTCCCAAGG
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GATACCTTCGGGGATGTCAAAACGAACCTTGTTAACTATTTCACATACAAAGCTGTGAGG
ACGGTTCTTCATCAGCTCTACGAAATGAATCCTCCTCAATACACTTGGTTCTATAATTAC
GTCGTATCGAACAGACCAACCGATGGTAAACGATTCCTCCGCAAACTCGGCAAGGAAAAT
CAGGAGCTTGCAGAAAGAGTGATGATCACGCGTCTACACTTGTATGGCAAGTGGATCAAG
AAATGCGACCATGGGAAGATATACCAAGATATATCGGATGAGAACTTGGCGTTGATGCGT
GAACGCCTCATGGAGACGGTGATATGGCCTTCCGATTACTCGAACTCCGAGGTTATTGGC
TGAAGAAGGCTGTGTCACAAACGCAGCATTTACTTTGCTTTCGTCAACTCGCTTCACAAT
TTTAGGATCTTGAGTTTCTTTTAGTTTGATTTACATATAATGAATCATTAATGATACAGT
CATTGAGCATTGTGTATATCAGTATATGTATCTATTCTTTCTTGGCATGTACTATTTATG
ACAATAGGGAAAAAAACCTATACCCTTCTTGTGCTCGG

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

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GCATTAAACTGAGAATAGCTCTGGGCTCTCTCCATGCAGCTCTTCCTGATGCAACTTCTG
AAGAGCTACGGGCGTATGATGATGAATGTGCTATATGCCGGGAACCTATGGCTAAAGCTA
AAAGGCTTCACTGCAACCACCTTTTCCACCTTGGTTGCCTCCGATCCTGGTTGGATCAAG
GTCTTAATGAGGTTTACTCTTGTCCTACATGTCGTAAACCTCTTTTTGTTGAAACTGAGG
TGAACACTCGCTCAGTGGAAGTCTCAAGTGATGAGCAGTTAGCCCGTCAGCTTCAAAGAC
AAAACATTCCTGAGATGCCAAACTCCATTGAAAGTGATCCTTCAAGGAACTTAGGATTGG
ATCCACTTCTTCTACAACCATACCTCTAGGTACTGGTGGAAGGACAGGTGGTCTGCATTT
GAGAAATGTATCAAGTGGGGCGAATGAAAGCTTGGCAAATATACTAGCTGTGGCCGAGAC
AGTGATGGATGTCATGCCACATGTGCCAGATGAAATTATCTTCCAGGACTTGCAGAGAAC
AAACTCTGTTTCTGTTACAGTGAACAATCTTCTCCAGATGTGATGATAGTTTGTGTAAAA
ATACTGAGCACTTGCTGCAATCTTGTTCCAACCCTAAGTATAGATTAATGGTTCGGGAGA
CATATACTTTAAGTTTACACACCACCAAACTTCCCAAGCTTCACCGGCTGTAAATAGAAG
GCGTTGTGCATATAGAGAAGAAGAGGCTCTAGTGTATAGCTTCTGTTCATTGCCCTACTG
CGGAAAATAAAGTTTGTATATTTACACAAGGTGCTATACCCTGGAGATATCTTGTAGCAA
TCTTGATCTCGGATCCATTCTCGAGTGGTACTGATCATTCTATGCTGCTAGGACTCCTGT
ATAAGAATTTGTAATTTACAACAAATGAAGTTAATTATAGAGTCTATACTGTTTATTG


BQ
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AF RS1GB81TF U 1
AF RS1GB81JQ C 370
BS 1 601 RS1GB81TF
BS 602 958 RS1GB81JQ

RD RS1GB81TF 601 0 0
GCATTAAACTGAGAATAGCTCTGGGCTCTCTCCATGCAGCTCTTCCTGATGCAACTTCTG
AAGAGCTACGGGCGTATGATGATGAATGTGCTATATGCCGGGAACCTATGGCTAAAGCTA
AAAGGCTTCACTGCAACCACCTTTTCCACCTTGGTTGCCTCCGATCCTGGTTGGATCAAG
GTCTTAATGAGGTTTACTCTTGTCCTACATGTCGTAAACCTCTTTTTGTTGAAACTGAGG
TGAACACTCGCTCAGTGGAAGTCTCAAGTGATGAGCAGTTAGCCCGTCAGCTTCAAAGAC
AAAACATTCCTGAGATGCCAAACTCCATTGAAAGTGATCCTTCAAGGAACTTAGGATTGG
ATCCACTTCTTCTACAACCATACCTCTAGGTACTGGTGGAAGGACAGGTGGTCTGCATTT
GAGAAATGTATCAAGTGGGGCGAATGAAAGCTTGGCAAATATACTAGCTGTGGCCGAGAC
AGTGATGGATGTCATGCCACATGTGCCAGATGAAATTATCTTCCAGGACTTGCAGAGAAC
AAACTCTGTTTCTGTTACAGTGAACAATCTTCTCCAGATGTGATGATAGTTTGTGTAAAA
A

QA 1 601 1 601
DS 

RD RS1GB81JQ 589 0 0
TTCTACAACCATACCTCTAGGTACTGGTGGAAGGACAGGTGGTCTGCATTTGAGAAATGT
ATCAAGTGGGGCGAATGAAAGCTTGGCAAATATACTAGCTGTGGCCGAGACAGTGATGGA
TGTCATGCCACATGTGCCAGATGAAATTATCTTCCAGGACTTGCAGAGAACAAACTCTGT
TTCTGTTACAGTGAACAATCTTCTCCAGATGTGATGATAGTTTGTGTAAAAATACTGAGC
ACTTGCTGCAATCTTGTTCCAACCCTAAGTATAGATTAATGGTTCGGGAGACATATACTT
TAAGTTTACACACCACCAAACTTCCCAAGCTTCACCGGCTGTAAATAGAAGGCGTTGTGC
ATATAGAGAAGAAGAGGCTCTAGTGTATAGCTTCTGTTCATTGCCCTACTGCGGAAAATA
AAGTTTGTATATTTACACAAGGTGCTATACCCTGGAGATATCTTGTAGCAATCTTGATCT
CGGATCCATTCTCGAGTGGTACTGATCATTCTATGCTGCTAGGACTCCTGTATAAGAATT
TGTAATTTACAACAAATGAAGTTAATTATAGAGTCTATACTGTTTATTG

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 2

CO CL5545Contig1 811 2 7 U
GTTTAATAGCACAACTTGAATCTTTAAAAGAAAAGCTAAACAAAAAATACAAAATTACTC
GTAGCAAAATTTTGATGAGTATATCTCAGAAAACAACACAAAAGAGAGTATATGTTTATC
GTTTGAACTTCTTAGAAGATTTCTTGTCTTTGTTGTGACCTCCCTTGTTACCACCACCCA
AGTACCTCTCACTCTCTTCATCATCCTCTCCTCTTCTCTTGTTCCTACCTCCTGACTCTT
TCATATTCATTGCTGATAATTTTTTAGCGTCTGCAACTCTCTACAACAATGACAAGACTT
CATCTTCCTCAGCTGGATACTCTGATAGTTTCTTACCTATGAGTTTTTCAATTTGTAAGT
ACCATTCAAGCTCATACTGGTTTACAAGTGATATCCCAACACCAGAACGTCCAGCACGAG
CGGTTCTTCCCACTCTATGAATGTAATCCTTTGAATTTGTGGGGATGTCATAGTTGATAA
CCATATCAACAGATGGGATATCAAGCCCTCTACTAGCGACATCAGTGCAGACCAAGATGT
TGCATTCCCCTGCTTTGAACTTATTCAATGCTTCTAGTCTCTTTGTCTGAGTCATTTGAC
CACTGATGGGAATGGCTCTAAAACCAAGGCTCCGAAGCATCAGAGCCATGAAACGAGTAC
CATCACAAGTCCGGGTGAATATCATTGATGTTGAGTCAGGCATTTCAGCCAGAATGTACA
CAAGATAGCAGTCCTTGTATTTAGCAGCAACAAACCGATACTGCTGTTTTAGAGTATCAA
CTGTGGAGTATTTGGAGGCAGCTTCATCTTG


BQ
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AF RS1AL80JQ U 168
AF RS1B537JQ U 1
BS 1 268 RS1B537JQ
BS 269 269 RS1AL80JQ
BS 270 282 RS1B537JQ
BS 283 283 RS1AL80JQ
BS 284 324 RS1B537JQ
BS 325 325 RS1AL80JQ
BS 326 811 RS1B537JQ

RD RS1AL80JQ 377 0 0
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CCTCCTGACTCTTTCATATTCATTGCTGATAATTTTTTAGCGTCTGCAACTCTCTACAAC
AATGACAAGACTTCATCTTCCTCAGCTGGATACTCTGATAGTTTCTTACCTATGAGTTTT
TCAATTTGTAAGTACCATTCAAGCTCATACTGGTTTACAAGTGATATCCCAACACCAGAA
CGTCCAGCACGAGCGGTTCTTCCCACTCTATGAATGTAATCCTTTGAATTTGTGGGGATG
TCATAGTTGATAACCATATCAACAGATGGGATATCAAGCCCTCTACTAGCGACATCAGTG
CAGACCAAGATGTTGCA

QA 1 377 1 377
DS 

RD RS1B537JQ 811 0 0
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GTTTGAACTTCTTAGAAGATTTCTTGTCTTTGTTGTGACCTCCCTTGTTACCACCACCCA
AGTACCTCTCACTCTCTTCATCATCCTCTCCTCTTCTCTTGTTCCTACCTCCTGACTCTT
TCATATTCATTGCTGATAATTTTTTAGCTTCTGCAACTCTCTCCAACAATGACAAGACTT
CATCTTCCTCAGCTGGATACTCTGGTAGTTTCTTACCTATGAGTTTTTCAATTTGTAAGT
ACCATTCAAGCTCATACTGGTTTACAAGTGATATCCCAACACCAGAACGTCCAGCACGAG
CGGTTCTTCCCACTCTATGAATGTAATCCTTTGAATTTGTGGGGATGTCATAGTTGATAA
CCATATCAACAGATGGGATATCAAGCCCTCTACTAGCGACATCAGTGCAGACCAAGATGT
TGCATTCCCCTGCTTTGAACTTATTCAATGCTTCTAGTCTCTTTGTCTGAGTCATTTGAC
CACTGATGGGAATGGCTCTAAAACCAAGGCTCCGAAGCATCAGAGCCATGAAACGAGTAC
CATCACAAGTCCGGGTGAATATCATTGATGTTGAGTCAGGCATTTCAGCCAGAATGTACA
CAAGATAGCAGTCCTTGTATTTAGCAGCAACAAACCGATACTGCTGTTTTAGAGTATCAA
CTGTGGAGTATTTGGAGGCAGCTTCATCTTG

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 2

CO CL5546Contig1 1235 2 4 U
GGACCTCTTGGGAGATCAGTTGAGAAAAGTGCTGTGATTGGTAGTTCAACTGAACTGGAT
CTCCCAAAATTCACAGATATTGATTCTGATGACAAGGATCCTTTATTGTGCTGCCTCTAC
GCCCCTGAAATCTACTACAATTTGCGTGTTTCAGAGCTTAAACGCAGACCTGTTCCTGAC
TTTATGGAGAGGATACAGAAGGACATCACCCAGTCCATGCGGGGGATTCTGGTTGATTGG
CTTGTTGAGGTCTCTGAGGAATACACGCTTGTACCTGACACTCTTTACCTCACAGTGTAT
CTCATAGACTGGTTCCTCCATGGAAACTACCTGGAAAGACAGAGACTTCAACTCCTCGGC
ATCACTTGCATGCTAATTGCCTCGAAGTATGAGGAAATCAATGCGCCACGCATTGAAGAG
TTCTGCTTCATCACAGATAACACCTACACAAGAGATCAGGTCCTGGAGATGGAGAACCAA
GTACTTGCGCATTTTAGCTTTCAGATATACACTCCCACTCCAAAAACGTTCCTAAGGAGA
TTCCTCAGAGCAGCTCAAGCCTCTTACCTGAGACCGCGCCTTGAACTCGAGTGTCTAGCC
AGCTATCTAACGGAGTTGACGTTGATAGACTATCACTTCTTGAAGTTTCTTCCTTCGGTC
ATCGCTGCTTCAGCTGTTTTTCTTGCCAAGTGGACATTAGACCAATCAAACCACCCATGG
AATCCAACACTTGAGCACTATACAACGTACAAAGCGTCAGATCTGAAAGCATCTGTTCAT
GCCTTGCAAGATCTGCAGCTTAACACCAAAGGTTGCCCTTTGAGCGCTGTACGCATGAAG
TATAGGCAAGAGAAGTTCAAATCTGTGGCGGTTCTCATGTCTCCAAAACTACTTGACACG
CTATTTTGAAGGGCTAAGCCAACCCGGTTCAGCTCCTAACCGATGATAGATCTTCTGTGA
CATTGATGGTCCGGTTCGTCTTCATTCAAATCTGTTACTCTTTTTGTTCATAAAACAGTT
TCCACAGTCCCATTCATCTAATACCTGATTAGAATTCGGTTTAGCTCGGTTTAGTTGGAA
CTGGGGTTTGGTTCTTCCAAACACCAGACCTGGTTTAATCTAATCGGTAACAAGAGGTTA
TTTTAGTTGTATCGAGAATGTACATTTTCTCCCCATCTTGAGGCAATGTAAACAGTTTCG
GGAATTTCATAATATTTATGTATTTTCCGATGAGG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1E455TF U 1
AF RS1E455JQ C 482
BS 1 767 RS1E455TF
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BS 769 785 RS1E455TF
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RD RS1E455TF 785 0 0
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CTCCCAAAATTCACAGATATTGATTCTGATGACAAGGATCCTTTATTGTGCTGCCTCTAC
GCCCCTGAAATCTACTACAATTTGCGTGTTTCAGAGCTTAAACGCAGACCTGTTCCTGAC
TTTATGGAGAGGATACAGAAGGACATCACCCAGTCCATGCGGGGGATTCTGGTTGATTGG
CTTGTTGAGGTCTCTGAGGAATACACGCTTGTACCTGACACTCTTTACCTCACAGTGTAT
CTCATAGACTGGTTCCTCCATGGAAACTACCTGGAAAGACAGAGACTTCAACTCCTCGGC
ATCACTTGCATGCTAATTGCCTCGAAGTATGAGGAAATCAATGCGCCACGCATTGAAGAG
TTCTGCTTCATCACAGATAACACCTACACAAGAGATCAGGTCCTGGAGATGGAGAACCAA
GTACTTGCGCATTTTAGCTTTCAGATATACACTCCCACTCCAAAAACGTTCCTAAGGAGA
TTCCTCAGAGCAGCTCAAGCCTCTTACCTGAGACCGCGCCTTGAACTCGAGTGTCTAGCC
AGCTATCTAACGGAGTTGACGTTGATAGACTATCACTTCTTGAAGTTTCTTCCTTCGGTC
ATCGCTGCTTCAGCTGTTTTTCTTGCCAAGTGGACATTAGACCAATCAAACCACCCATGG
AATCCAACACTTGAGCACTATACAACGTACAAAGCGTCAGATCTGAA*GCATCTGTTCAT
GCCTT

QA 1 785 1 785
DS 

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AGTACTGCGCA
TTTAGCTTTCAGATATACACTCCCACTCCAAAAACGTTCCTAAGGAGATTCCTCAGAGCA
GCTCAAGCCTCTTACCTGAGACCGCGCCTTGAACTCGAGTGTCTAGCCAGCTATCTAACG
GAGTTGACGTTGATAGACTATCACTTCTTGAAGTTTCTTCCTTCGGTCATCGCTGCTTCA
GCTGTTTTTCTTGCCAAGTGGACATTAGACCAATCAAACCACCCATGGAATCCAACACTT
GAGCACTATACAACGTACAAAGCGTCAGATCTGAAAGCATCTGTTCATGCCTTGCAAGAT
CTGCAGCTTAACACCAAAGGTTGCCCTTTGAGCGCTGTACGCATGAAGTATAGGCAAGAG
AAGTTCAAATCTGTGGCGGTTCTCATGTCTCCAAAACTACTTGACACGCTATTTTGAAGG
GCTAAGCCAACCCGGTTCAGCTCCTAACCGATGATAGATCTTCTGTGACATTGATGGTCC
GGTTCGTCTTCATTCAAATCTGTTACTCTTTTTGTTCATAAAACAGTTTCCACAGTCCCA
TTCATCTAATACCTGATTAGAATTCGGTTTAGCTCGGTTTAGTTGGAACTGGGGTTTGGT
TCTTCCAAACACCAGACCTGGTTTAATCTAATCGGTAACAAGAGGTTATTTTAGTTGTAT
CGAGAATGTACATTTTCTCCCCATCTTGAGGCAATGTAAACAGTTTCGGGAATTTCATAA
TATTTATGTATTTTCCGATGAGG

QA 12 754 12 754
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AAATATGCACCAA


BQ
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AF RS1ET19JQ U 1
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TTGGAACGCAACATACAAGGCATCATCACAACAAAAACAACACAAATCCTAACTTACTTT
AAATATGCACCAA

QA 1 193 1 193
DS 



AS 1 2

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AGACCGAAGTGGCAGAACACAACAAGAGAGACGATTGTTGGATCATAATCAAAGATAAAG
TCTATGATGTCACTTCTTACGTTGAAGAGCATCCTGGTGGCGACGCTATTCTAGATCATG
CTGGTGACGATTCTACTGAGGGGTTCTTCGGACCGCAACACGCCACTCGTGTTTTCGACA
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TGTGTTTGTGTTTCTCTTTGTCTATTTGTTGTTTTTGTAATGCCAAGTTTCGTCCTTTTC
TGTCACTTTTTCATGAAAAATCTCGAATTTCAACCTTAGGGTTAGTACTGAGAGCGAGCT
CTTGATCTATGATGATCTGTTTTAAAGTGTTCTAAACCCATCAGTTTTGGTACATTGAGT
AATAGAGATTCTT


BQ
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AF RS1DF10TF U 1
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BS 1 365 RS1DF10TF
BS 366 673 RS1DF10JQ

RD RS1DF10TF 365 0 0
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AGACCGAAGTGGCAGAACACAACAAGAGAGACGATTGTTGGATCATAATCAAAGATAAAG
TCTATGATGTCACTTCTTACGTTGAAGAGCATCCTGGTGGCGACGCTATTCTAGATCATG
CTGGT

QA 1 365 1 365
DS 

RD RS1DF10JQ 673 0 0
GAAGTCTCTAAACCCATCATTCTCTCTCTTCACTTGTAAACCAAAAGAAACCCAGATTCA
TCCTCCCTCTCTCTCTCTCTCAGAAGATGATAGCTGTGATTGGATTGCTTCTGGGTTTTC
TAGTTTCAGCGTTGTTCTTAATCCAAGGAAAGCGAAGATCATCTAATGGTGGTCAAGAGA
AGAAGAAGCAATCTAGTAATGATGACGAGCCTAAAGATTTAAAGCCAAAAAGTTACAGCA
AGACCGAAGTGGCAGAACACAACAAGAGAGACGATTGTTGGATCATAATCAAAGATAAAG
TCTATGATGTCACTTCTTACGTTGAAGAGCATCCTGGTGGCGACGCTATTCTAGATCATG
CTGGTGACGATTCTACTGAGGGGTTCTTCGGACCGCAACACGCCACTCGTGTTTTCGACA
TGATCGAGGATTTCTACATCGGACAACTTCGCTTGTAAGATTTGAGATTGTTAACCTTTT
TGTGTTTGTGTTTCTCTTTGTCTATTTGTTGTTTTTGTAATGCCAAGTTTCGTCCTTTTC
TGTCACTTTTTCATGAAAAATCTCGAATTTCAACCTTAGGGTTAGTACTGAGAGCGAGCT
CTTGATCTATGATGATCTGTTTTAAAGTGTTCTAAACCCATCAGTTTTGGTACATTGAGT
AATAGAGATTCTT

QA 1 673 1 673
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5551Contig1 1180 2 4 U
GGCGAGTGAGTGAGAGAAAGAAAAAAACAATGGAGAAGATCGAGCACACGACGGTTTCCA
CCAATGGCATCAACATGCACGTAGCTTCAATCGGTTCAGGACCAGTGATCCTATTCCTCC
ATGGCTTCCCCGATCTCTGGTACTCATGGCGCCACCAGCTTCTCTCTTTCGCCGACTTAG
GCTACCGCGCAATCGCTCCTGATCTCCGAGGTTACGGCGATTCCGACTCTCCCCCGTCTC
ATGAGTCGTACACCGTGCTCCACATCGTCGGAGACCTCGTCGGGTTGCTGGACTCGCTCG
GCGTTGACCAGGTTTTCCTGGTTGGTCATGACTGGGGAGCCATCATCGCGCGGTGGATGT
GTATGATCAGGCCTGATCGAGTCAAGGCGTTGGTGAACATGAGCGTTGAGTTTCATCCGA
GGAATCCTTCTGTGAAGCCTGTTGAAGCGTTTAAGGCTTTGTTCGGCGAGGATTACTACG
TCTGCAGGTTTCAGGAGCCTGGAGATATTGAGGAAGACTTTGCTCAAGTTGATACGAAGA
AGTTAATAAATGGTTTTTTCACCTCGCATAGCACACGCCCGCCTTGCATTCCAAAGTCAG
TTTTCAAATATTTACCTGATCCACCTGCTTTACCTGCTTGGTTCACCGAGGAAGACATCT
GTTTCTATGCTGACAAGTTTAGCCAAAAAGGCTACACTGGTGGGCTAAACTACTATCGCG
CCCTGAACCTAAGCTGGGAATTAACGGCTCCATGGGATGGTCTACAGATCAAGGTCCCCG
TGAAGTACATTGTGGGTGATCTTGACCCTACATACCACATCCCCGGAACAAAGGAATACA
TACATGAAGGTGGTTTGAAGAAACATGTTCCATTTTTACAAGAAGTGGTGGTAATGGAAG
GTGTTGGTCACTTCCTTCAGCAAGAGAAGCCCAACGAAATCACTGACCATATATATGGTT
TCTTCAAGAAATTCTGAACCTGTGAAATCAAGTTTTGCTGAGCTTCCTCAAGGGTGCTTT
CTTGGTGTGAGCTTCTACTTGCAATGGGATTTGAAATGAATGGATAATGTGTGTATTTTT
ACTTGTTTAGTAATTCGAATTTATAAAACATTTGTATCTCAATAATCAATTCCGACTTGT
TCGGATCTTGTCTCTGAAAATAAAGTTATCAGTTAATCCG


BQ
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AF RS1B971TF U 1
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GCTACCGCGCAATCGCTCCTGATCTCCGAGGTTACGGCGATTCCGACTCTCCCCCGTCTC
ATGAGTCGTACACCGTGCTCCACATCGTCGGAGACCTCGTCGGGTTGCTGGACTCGCTCG
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TTTTCAAATATTTACCTGATCCACCTGCTTTACCTGCTTGGTTCACCGAGGAAGACATCT
GTTTCTATGCTGACAAGTTTAGCCAAAAAG*CTACACTGGTGGGCTAAACTACTATCGCG
CCCTGA

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CGTTGAGTT*CATCCGAGGAATCCTTCTGTGAAGCCTGTTGAAGCGTTTAAGGCTTTGTT
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TTGCATTCCAAAGTCAGTTTTCAAATATTTACCTGATCCACCTGCTTTACCTGCTTGGTT
CACCGAGGAAGACATCTGTTTTTATGCTGACAAGTTTAGCCAAAAAGGCTACACTGGTGG
GCTAAACTACTATCGCGCCCTGAACCTAAGCTGGGAATTAACGGCTCCATGGGATGGTCT
ACAGATCAAGGTCCCCGTGAAGTACATTGTGGGTGATCTTGACCCTACATACCACATCCC
CGGAACAAAGGAATACATACATGAAGGTGGTTTGAAGAAACATGTTCCATTTTTACAAGA
AGTGGTGGTAATGGAAGGTGTTGGTCACTTCCTTCAGCAAGAGAAGCCCAACGAAATCAC
TGACCATATATATGGTTTCTTCAAGAAATTCTGAACCTGTGAAATCAAGTTTTGCTGAGC
TTCCTCAAGGGTGCTTTCTTGGTGTGAGCTTCTACTTGCAATGGGATTTGAAATGAATGG
ATAATGTGTGTATTTTTACTTGTTTAGTAATTCGAATTTATAAAACATTTGTATCTCAAT
AATCAATTCCGACTTGTTCGGATCTTGTCTCTGAAAATAAAGTTATCAGTTAATCCG

QA 1 837 1 837
DS 



AS 1 2

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GGAATGTGAAAGGACCGGTGAGGGAAGGAGACATCCTCACTCTCCTCGAGTCCGAGAGAG
AAGCCAGAAGACTCCGTTGATTCTTACATTTTGATGGTCATTTAGTTTCTTTTTTTTTGT
CGAAGTATCTGCTCTGTTTTAATTATTACGACAATGTCTGGAGTCTAGAAATGAGATCTT
GAACACAGAACAT


BQ
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AF RS1H747TF U 1
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DS 

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ACAGAATGGATTCTCAGATCAAGCATGCTGTGGTAGTGAAAGTGATGGGGAGGACTGGTT
CGCGTGGTCAGGTGACTCAGGTGAGAGTGAAGTTCACGGATTCAGACCGTTTTATCATGA
GGAATGTGAAAGGACCGGTGAGGGAAGGAGACATCCTCACTCTCCTCGAGTCCGAGAGAG
AAGCCAGAAGACTCCGTTGATTCTTACATTTTGATGGTCATTTAGTTTCTTTTTTTTTGT
CGAAGTATCTGCTCTGTTTTAATTATTACGACAATGTCTGGAGTCTAGAAATGAGATCTT
GAACACAGAACAT

QA 1 373 1 373
DS 



AS 1 2

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GGCGCTTCCGGTCGCTCATTAAATCGCCTAGGTTGTACAAGAGAAGGTCTACCTTGGATT
GCGCTGATCACTATCTCAATGTTGTTCTCTACAACAGGGACAACGGTGATGAGCGTTTGT
ATACTATTCTACCGAAAGCCAACCGCAATGGCCTACGCTTGGTTCTTTTCCCTCGCATTC
CCTCTATGCCTCGCGGTGGAAGCTTTGTCGCGGTTGGTTGGAGGATTTACGTGTTTGGTG
GGATCAACTATGATGACATCGAGTGCTTTCAGTATCGACTTTATATCCAACACTCGGCAA
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ATTTACGTCGTTGGGAATCGTTGCGGTGTTGATTCAAAGGTGGTGGTGTTCGATACCGAA
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GCCATGGGTGGTAAGATTTACATGAGGGATATTAACAAGAGCTTTGTTTATGAGCCAAAG
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AAGCAGAGGTGTTGGGGAGTGGTGAAAGGCGTGGATAAATTGTTGGCTGAAACGATACGG
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GGAGGTCTGATTTGGGGTCATGTTGATCAGTCATATGATCTCCGTTTGACTGCGGGTGGT
AATTTTCACATTACCAAAGCTCTTGCTGTTGCGGTTTGATTGAGTAACCCTCTCCCTCCA
TTTATCCCCGTTGCGGTTTGAAGTTGCTGCTGCTGTTTGTGTTGTTCTATTTTGTATTTT
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GTAAAATAAATTACTGC


BQ
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AF RS1AH05TF U 1
AF RS1AH05JQ C 417
BS 1 781 RS1AH05TF
BS 782 1337 RS1AH05JQ

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G

QA 1 781 1 781
DS 

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ACGGGTTGGTTGGTCGCAGACTGTTAGCTATGGTGGGAAACTGGTTTTGTTGTTTCCTAA
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CGATGGAGGTCTGATTTGGGGTCATGTTGATCAGTCATATGATCTCCGTTTGACTGCGGG
TGGTAATTTTCACATTACCAAAGCTCTTGCTGTTGCGGTTTGATTGAGTAACCCTCTCCC
TCCATTTATCCCCGTTGCGGTTTGAAGTTGCTGCTGCTGTTTGTGTTGTTCTATTTTGTA
TTTTCCTGTATTTCTCAACCTTTCCTGCTTTGAATCTTCAATAATACAGTGTGTGGAATT
TCTTGTAAAATAAATTACTGC

QA 1 921 1 921
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1AG93TF U 1
AF RS1AG93JQ C 452
BS 1 743 RS1AG93TF
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QA 1 743 1 743
DS 

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AGAAGAAGATTCAAGGAAAGTAGATGAAAGCGATAAGGCCTCGACAGAGAACGTTGATGA
AACTGCAGAAGATGAGGTTGTGATGGAGAAGAAACTCAACAAGAAGAAGAAGACTTTGCT
TGGTAAAGTTGGGAACCTTCTCAAAAAGAAAGCAGCAGTGAACCCGAAATAACAAACTCT
TGGAGGGTAAGGAAGAAAACAAAAAAAGCTTGTTATATGTAGAAAGAAACCTCAAACATT
TATACATTTGTATACTCTTTTGATTTGTGTCAGTGTTCTTTATATATATCTTTGTTGGTT
ATTGATTCTTTGCTTCTTTTCGATTGT

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL5555Contig1 541 2 2 U
GGGAGATGAAGAGAGTGATGCAAACAGCTTCAATGTGCATACACCATGTGCCCACTATGC
GTCCTGATATGAACCGGTTGGTGCAGCTACTGCGGGGAGGAGGAGGAGATGGCAGGTTAG
CTGAGACGCAACTGATATCAAGAAGAAAGAGTCTAGACGGGTGCGACTTACAAGATCACA
CATCTTCCTCGTACCTTAACGATCTCACTCGGCATAGACAACTATTGATGGAGTGAAGCA
ATCTGATAAATCAATACACACACACACACACCAAAAAAGAACTGTATCTTCAAAAACTCA
ACTCCAAAGAAAAAGAATCAACAACAGAAGTGACGAAGTGATCTTTTCTTCTTCTTAACT
GTGATTTTGCTTCAGCTACTACTCCATTTTAAAAGTATATATATCCAAAAGAGGAAAGTG
TTGTATGCATAGTTTTCCATTAGTCTCAGCTTTTATGCTTTTGTATTTCAACCTGTGCTC
GTCTCTGTCTCTCTATATGAAAGCTGTAGTAACTTTTGGAATCAATTTGGACAATTAATC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 

AF RS1GL57TF U 1
AF RS1GL57JQ C 245
BS 1 539 RS1GL57TF
BS 540 541 RS1GL57JQ

RD RS1GL57TF 539 0 0
GGGAGATGAAGAGAGTGATGCAAACAGCTTCAATGTGCATACACCATGTGCCCACTATGC
GTCCTGATATGAACCGGTTGGTGCAGCTACTGCGGGGAGGAGGAGGAGATGGCAGGTTAG
CTGAGACGCAACTGATATCAAGAAGAAAGAGTCTAGACGGGTGCGACTTACAAGATCACA
CATCTTCCTCGTACCTTAACGATCTCACTCGGCATAGACAACTATTGATGGAGTGAAGCA
ATCTGATAAATCAATACACACACACACACACCAAAAAAGAACTGTATCTTCAAAAACTCA
ACTCCAAAGAAAAAGAATCAACAACAGAAGTGACGAAGTGATCTTTTCTTCTTCTTAACT
GTGATTTTGCTTCAGCTACTACTCCATTTTAAAAGTATATATATCCAAAAGAGGAAAGTG
TTGTATGCATAGTTTTCCATTAGTCTCAGCTTTTATGCTTTTGTATTTCAACCTGTGCTC
GTCTCTGTCTCTCTATATGAAAGCTGTAGTAACTTTTGGAATCAATTTGGACAATTAAT

QA 1 539 1 539
DS 

RD RS1GL57JQ 297 0 0
GATAAATCAATACACACACACACACACCAAAAAAGAACTGTATCTTCAAAAACTCAACTC
CAAAGAAAAAGAATCAACAACAGAAGTGACGAAGTGATCTTTTCTTCTTCTTAACTGTGA
TTTTGCTTCAGCTACTACTCCATTTTAAAAGTATATATATCCAAAAGAGGAAAGTGTTGT
ATGCATAGTTTTCCATTAGTTTCAGCTTTTATGCTTTTGTATTTCAACCTGTGCTCGTCT
CTGTCTCTCTATATGAAAGCTGTAGTAACTTTTGGAATCAATTTGGACAATTAATCC

QA 1 297 1 297
DS 



AS 1 2

CO CL5556Contig1 1092 2 2 U
GAGTTGGCAGAAACCCTAAAACTTGCCTTTTCTCCCAAATCTCTCCTTCTCTCCTGCTCC
AACAATGGAGTTCTGGGGAGCTAAAGTTAAGGCGGGCAAGACTCTCAAAGTGAAGCCTGG
TGATAACTGTCTCATCCACATCTCTCAGGCTTCACTAAGCAAAGCGGAAAAGGGAGTATC
TGCACTCTTGTATGCCACCATCGATGACAAGAAACTCCTCCTCGGAACACTCTCTCAAGA
CATCAGCTTTGATCATCTCTTCTTTGACAGAGAATTCGAGCTCTCCCACAGCTTGGACAG
AGGATACGTCCATTTCATTGGCCACCAGCGCAACAAGAAGAAGAAGAAGACGGCTAATGA
ATCTTCATCGATTTTGCAGGAAATCAAAGAAATGAATAAATCTATCAAAGAGCTGTCTGA
AGCTGTGAAAACGCTGCAACAGATTCTATTGACAAAAGCCGATCTACCAGAGGAGAAAGA
AACCCCAAAGGACAAGGAGGAGGAGGAAGATTCTTGCTGTTTCGGATGTAAAGAAGCCAA
GGGAAACGACGACCGAACCATTTTCGTTAAAGGATTTGAAAATCTGCGACCTAGGAATGA
AATCAAGAATGCATTGACCAACTTTTTCGCTTCTTGTGGAGAGGTCACTAGGGTTTATGT
TCCTTTTGAGTGTAGAAACCGCCTTCCCTTGGGGTTCGCTTTCATTGATCTGAGAAATGG
TAAAGGCAATGAGAAGGCGTTAGAACTAAATGGAAGTTACATGGGAGGAAGGAAGCTTGA
GGTGACGATGGCTAGTCATAGAGAGGAATACCATGGCTTTACTGACTTTCATGGTTGTGA
TCGCTGTCAAACGTTTCTAGCCCCCCCTGTTCACAACCCCTCCTCGATTAAAAAGCATCG
TATTTATTATTGGTGAGATTCACAAGTCTACTTCCTTTTGGCATCCCTTACAGACGAACC
GCAGCTAATATTGCTAATCAGCTGCATCAAACTTTTTTATTTGACTAATTTATGTAGCAT
ATTTCATGTGTTCAACCAAATATCACAACCCAAGTCCAATCATATATGCTGTCTACCAAT
TTTTTAGTCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AG41TF U 1
AF RS1AG41JQ C 356
BS 1 721 RS1AG41TF
BS 722 1092 RS1AG41JQ

RD RS1AG41TF 721 0 0
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AACAATGGAGTTCTGGGGAGCTAAAGTTAAGGCGGGCAAGACTCTCAAAGTGAAGCCTGG
TGATAACTGTCTCATCCACATCTCTCAGGCTTCACTAAGCAAAGCGGAAAAGGGAGTATC
TGCACTCTTGTATGCCACCATCGATGACAAGAAACTCCTCCTCGGAACACTCTCTCAAGA
CATCAGCTTTGATCATCTCTTCTTTGACAGAGAATTCGAGCTCTCCCACAGCTTGGACAG
AGGATACGTCCATTTCATTGGCCACCAGCGCAACAAGAAGAAGAAGAAGACGGCTAATGA
ATCTTCATCGATTTTGCAGGAAATCAAAGAAATGAATAAATCTATCAAAGAGCTGTCTGA
AGCTGTGAAAACGCTGCAACAGATTCTATTGACAAAAGCCGATCTACCAGAGGAGAAAGA
AACCCCAAAGGACAAGGAGGAGGAGGAAGATTCTTGCTGTTTCGGATGTAAAGAAGCCAA
GGGAAACGACGACCGAACCATTTTCGTTAAAGGATTTGAAAATCTGCGACCTAGGAATGA
AATCAAGAATGCATTGACCAACTTTTTCGCTTCTTGTGGAGAGGTCACTAGGGTTTATGT
TCCTTTTGAGTGTAGAAACCGCCTTCCCTTGGGGTTCGCTTTCATTGATCTGAGAAATGG
T

QA 1 721 1 721
DS 

RD RS1AG41JQ 737 0 0
AATGAATCTTCATCGATTTTGCAGGAAATCAAAGAAATGAATAAATCTATCAAAGAGCTG
TCTGAAGCTGTGAAAACGCTGCAACAGATTCTATTGACAAAAGCCGATCTACCAGAGGAG
AAAGAAACCCCAAAGGACAAGGAGGAGGAGGAAGATTCTTGCTGTTTCGGATGTAAAGAA
GCCAAGGGAAACGACGACCGAACCATTTTCGTTAAAGGATTTGAAAATCTGCGACCTAGG
AATGAAATCAAGAATGCATTGACCAACTTTTTCGCTTCTTGTGGAGAGGTCACTAGGGTT
TATGTTCCTTTTGAGTGTAGAAACCGCCTTCCCTTGGGGTTCGCTTTCATTGATCTGAGA
AATGGTAAAGGCAATGAGAAGGCGTTAGAACTAAATGGAAGTTACATGGGAGGAAGGAAG
CTTGAGGTGACGATGGCTAGTCATAGAGAGGAATACCATGGCTTTACTGACTTTCATGGT
TGTGATCGCTGTCAAACGTTTCTAGCCCCCCCTGTTCACAACCCCTCCTCGATTAAAAAG
CATCGTATTTATTATTGGTGAGATTCACAAGTCTACTTCCTTTTGGCATCCCTTACAGAC
GAACCGCAGCTAATATTGCTAATCAGCTGCATCAAACTTTTTTATTTGACTAATTTATGT
AGCATATTTCATGTGTTCAACCAAATATCACAACCCAAGTCCAATCATATATGCTGTCTA
CCAATTTTTTAGTCACC

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

CO CL5557Contig1 643 2 11 U
GGGATTTTGATTATCTCTCTCTCTCCTCTGTAGGAACAAGCCAAAAGCAAAGGATAAAAA
AAGAGAGATGGAGTCTAGCAGAGGTCAAGGTGGGATCCAGCAGTTGCTTGCTGCTGAACA
AGAAGCTCAACACATCGTCAATGCTGCAAGGACCGCAAAGATGGGAAGGCTGAAGCAAGC
AAAGGAAGAGGCTGAGAAGGAGATAGCTGAATACAAAGCGAAAACTTGAGGAGACAAGTG
GAGACTCGGGTGCGAATGTGAAGAGGCTGGAGCAAGAGACTGATGAGAAGATCGAGCAGC
TCAAAAGCGAAGCATCCAGGATTTCCAACGATGTTGTGGAGATGCTCCTCAAACATGTCA
CCACTGTCAAGAACTGAGAGAGAGATTCCTGTAATAATAATAAAAAAAAATGTCATTTAT
GAGTGTTTATGCTCCTCCTATGTTTCTCCTTCTTTTTCATTCACGCGTGTGGTGTTACTG
GATGGGGATCTCAGTGGACTCAATGTGTCGTTTTTGTAATTTATTCTCTACCATCTTCTT
CTGGTTGTTGTTGTGGTTGTATTCATCATTTCCCTTTTGAGGGAGGATTGTAATAAAAAA
ACAATTGAAATCTAAGATCTACATAATAAATACCATTATTATT


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GZ29TF U 2
AF RS1GZ29JQ C 1
BS 1 5 RS1GZ29JQ
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BS 391 643 RS1GZ29JQ

RD RS1GZ29TF 389 0 0
GGGA
TTTGATTATCTCTCTCTCTCCTCTGTAGGAACAAGCCAAAAGCAAAGGATAAAAAAAGAG
AGATGGAGTCTAGCAGAGGTCAAGGTGGGATCCAGCAGTTGCTTGCTGCTGAACAAGAAG
CTCAACACATCGTCAATGCTGCAAGGACCGCAAAGATGGGAAGGCTGAAGCAAGCAAAGG
AAGAGGCTGAGAAGGAGATAGCTGAATACAAAGCGAAAACTTGAGGAGACAAGTGGAGAC
TCGGGTGCGAATGTGAAGAGGCTGGAGCAAGAGACTGATGAGAAGATCGAGCAGCTCAAA
AGCGAA*CATCCAGGATTTCCAACGATGTTGTGGAGATGCTCCTCAA*CATGTCACCACT
GTCA*GAACTGA*AGAGAGATTCCT

QA 5 389 5 389
DS 

RD RS1GZ29JQ 643 0 0
GGGATTTTGATTATCTCTCTCTCTCCTCTGTAGGAACAAGCCAAAAGCAAAGGATAAAAA
AAGAGAGATGGAGTCTAGCAGAGGTCAAGGTGGGATCCAGCAGTTGCTTGCTGCTGAACA
AGAAGCTCAACACATCGTCAATGCTGCAAGGACCGCAAAGATGGGAAGGCTGAAGCAAGC
AAAGGAAGAGGCTGAGAAGGAGATAGCTGAATACAAAGCGAAAACTTGAGGAGACAAGTG
GAGACTCGGGTGCGAATGTGAAGAGGCTGGAGCAAGAGACTGATGAGAAGATCGAGCAGC
TCAAAAGCGAAGCATCCAGGATTTCCAACGATGTTGTGGAGATGCTCCTCAAACATGTCA
CCACTGTCAAGAACTGAGAGAGAGATTCCTGTAATAATAATAAAAAAAAATGTCATTTAT
GAGTGTTTATGCTCCTCCTATGTTTCTCCTTCTTTTTCATTCACGCGTGTGGTGTTACTG
GATGGGGATCTCAGTGGACTCAATGTGTCGTTTTTGTAATTTATTCTCTACCATCTTCTT
CTGGTTGTTGTTGTGGTTGTATTCATCATTTCCCTTTTGAGGGAGGATTGTAATAAAAAA
ACAATTGAAATCTAAGATCTACATAATAAATACCATTATTATT

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 2

CO CL5558Contig1 746 2 4 U
GGATTTCACGGTTGTCGTTTCTCTCTCTTGTTCTTGAGCTTTTGTGGGGAGAGAGAGAGA
TGGGAAGGGGTAGGGTTCAGCTGAAGAGGATAGAAAACAAGATCAATAGGCAAGTTACTT
TCTCAAAGAGAAGGTCTGGTTTGCTCAAGAAAGCTCATGAGATCTCTGTTCTCTGCGATG
CTGAGGTTGCTCTCGTTATCTTCTCTTCCAAAGGCAAACTCTTCGAATATTCCACCGACT
CTTGCATGGAAAGGATACTTGAACGCTATGATCGCTATTTGTATTCAGACAAACAACTCG
TTGGCCGAGACATTTCACAGAGTGAAAATTGGGTTCTCGAACATGCTAAGCTCAAGGCAA
GAGTTGAGGTACTTGAGAAGAACAAAAGGAATTTTATGGGGGAAGATCTTGATTCGTTGA
GCTTAAAGGACCTCCAAAGTTTGGAGCATCAGCTCCATGCTGCAATCAAGAGCATTAGGT
CAAGAAAGAACCAAGCTATGTACGAATCCATATCGGCACTCCAGAAGAAGGATAAGGCCT
TGCAAGATCACAATAATGCGCTTCTCAAAAAGATTAAGGAGAGGGAGAAGAAGAACACGG
TTCAGCAAGGAGAACTGATCCAATGCTCTAACAATTCTTCGATTCTTCAGCCCCAATACT
GCTTAACCTCCTCCGGGGATGTCTTTGTGGGGAGAGTTGGGGGAGACAACGGCGGTGCAT
CGTCATTGGTGGAACCAAACTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GZ88TF U 1
AF RS1GZ88JQ C 413
BS 1 578 RS1GZ88TF
BS 579 579 RS1GZ88JQ
BS 580 708 RS1GZ88TF
BS 709 746 RS1GZ88JQ

RD RS1GZ88TF 708 0 0
GGATTTCACGGTTGTCGTTTCTCTCTCTTGTTCTTGAGCTTTTGTGGGGAGAGAGAGAGA
TGGGAAGGGGTAGGGTTCAGCTGAAGAGGATAGAAAACAAGATCAATAGGCAAGTTACTT
TCTCAAAGAGAAGGTCTGGTTTGCTCAAGAAAGCTCATGAGATCTCTGTTCTCTGCGATG
CTGAGGTTGCTCTCGTTATCTTCTCTTCCAAAGGCAAACTCTTCGAATATTCCACCGACT
CTTGCATGGAAAGGATACTTGAACGCTATGATCGCTATTTGTATTCAGACAAACAACTCG
TTGGCCGAGACATTTCACAGAGTGAAAATTGGGTTCTCGAACATGCTAAGCTCAAGGCAA
GAGTTGAGGTACTTGAGAAGAACAAAAGGAATTTTATGGGGGAAGATCTTGATTCGTTGA
GCTTAAAGGACCTCCAAAGTTTGGAGCATCAGCTCCATGCTGCAATCAAGAGCATTAGGT
CAAGAAAGAACCAAGCTATGTACGAATCCATATCGGCACTCCAGAAGAAGGATAAGGCCT
TGCAAGATCACAATAATGCGCTTCTCAAAAAGATTAAG*AGAGGGAGAAGAAGAACACGG
TTCAGCAAGGAGAACTGATCCAATGCTCTAACAATTCTTCGATTCTTCAGCCCCAATACT
GCTTAACCTCCTCCGGGGATGTCTTTGTGGGGAGAGTTGGGGGAGACA

QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1GZ88JQ 334 0 0
TTCGTTGAGCTTAAAGGACCTCCAAAGTTTGGAGCATCAGCTCCATGCTGCAATCAAGAG
CATTAGGTCAAGAAAGAACCAAGCTATGTACGAATCCATATCGGCACTCCAGAAGAAGGA
TAAGGCCTTGCAAGATCACAATAATGCGCTTCTCAAAAAGATTAAGGAGAGGGAGAAGAA
GAACACGGTTCAGCAAGGAGAACTGATCCAATGCTCTAACAATTCTTCGATTCTTCAGCC
CCAATACTGCTTAACCTCCTCCGGGGATGTCTTTGTGGGGAGAGTTGGGGGAGACAACGG
CGGTGCATCGTCATTGGTGGAACCAAACTTTTTT

QA 1 334 1 334
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5560Contig1 654 2 2 U
GAACTTCGGCTGTTTTAAGGTTTAGACTTGTCCCGTCCACCAAAGAGGAAAAAAAAATGC
CGGCAGGACATGGAGTTCGTGCTCGAACGAGGGATCTGTTCACGAGGGGGTTCAGGAAGA
AGGGTACAATCCCATTGTCCACGTACCTCAGAACCTTCAAGGTCGGCGATTACGTCGATG
TTAAAGTGAACGGTGCGATCCACAAGGGTATGCCTCACAAATTCTACCATGGTCGTACCG
GTCGTGTCTGGAACGTCACCAAACGCGCCGTTGGTGTCGAAGTCAACAAACAGATTGGAA
ACAGGATCATAAAGAAGAGACTTCATGTGCGTGTGGAGCATGTGCAGCAGTCCAGATGTG
CTGAGGAGTTCAAACTGAGAAAGAAGAAGAACGATGAGCTCAAAGCTGCAGCCAAAGCCA
GAGGAGAGACGGTAAGCACCAAGAGGCAGCCTAAAGGACCCAAACCTGGATTCATGGTTG
AAGGTATGACCTTGGAGACCGTCACCCCAATCCCCTACGACGTCGTCAACGATCTCAAAG
GAGGCTATTAGTTTCTTACTTTCTTCCTTATTCTGGCTGTGTGTTTTTGCATATGTTTTC
TTTGTAACTCGAACTAAGAATGCGATTTTATATGAGAATTTTGCAATCCAGTCC


BQ
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AF RS1DB84TF U 1
AF RS1DB84JQ C 251
BS 1 616 RS1DB84TF
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CGGCAGGACATGGAGTTCGTGCTCGAACGAGGGATCTGTTCACGAGGGGGTTCAGGAAGA
AGGGTACAATCCCATTGTCCACGTACCTCAGAACCTTCAAGGTCGGCGATTACGTCGATG
TTAAAGTGAACGGTGCGATCCACAAGGGTATGCCTCACAAATTCTACCATGGTCGTACCG
GTCGTGTCTGGAACGTCACCAAACGCGCCGTTGGTGTCGAAGTCAACAAACAGATTGGAA
ACAGGATCATAAAGAAGAGACTTCATGTGCGTGTGGAGCATGTGCAGCAGTCCAGATGTG
CTGAGGAGTTCAAACTGAGAAAGAAGAAGAACGATGAGCTCAAAGCTGCAGCCAAAGCCA
GAGGAGAGACGGTAAGCACCAAGAGGCAGCCTAAAGGACCCAAACCTGGATTCATGGTTG
AAGGTATGACCTTGGAGACCGTCACCCCAATCCCCTACGACGTCGTCAACGATCTCAAAG
GAGGCTATTAGTTTCTTACTTTCTTCCTTATTCTGGCTGTGTGTTTTTGCATATGTTTTC
TTTGTAACTCGAACTA

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DS 

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AAAGAAGAGACTTCATGTGCGTGTGGAGCATGTGCAGCAGTCCAGATGTGCTGAGGAGTT
CAAACTGAGAAAGAAGAAGAACGATGAGCTCAAAGCTGCAGCCAAAGCCAGAGGAGAGAC
GGTAAGCACCAAGAGGCAGCCTAAAGGACCCAAACCTGGATTCATGGTTGAAGGTATGAC
CTTGGAGACCGTCACCCCAATCCCCTACGACGTCGTCAACGATCTCAAAGGAGGCTATTA
GTTTCTTACTTTCTTCCTTATTCTGGCTGTGTGTTTTTGCATATGTTTTCTTTGTAACTC
GAACTAAGAATGCGATTTTATATGAGAATTTTGCAATCCAGTCC

QA 1 404 1 404
DS 



AS 1 2

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TGAAAGAAGTATTTCAAAGGGAAGAGTCTCTGCTCGTATGTAAATGAGGCAATAAGTTTT
AAAGAGTCTCATCCTCTAAAAAGAAACTTTAAAAAGATCCCAAACTACAGCAACAACGCA
GACCTCCCTTGATCTTAGAGAAGGTAGTAGTAACCCAAGACAAGAAGCATCAGTACCACA
AGAGCAGCTGGAGCAGCCCATACCCAGTAGTTAGTCTGCTTCTTACCCTTGATCATTGGT
CTCGGTAGTGTTTCTGGTACTCCTCTATTGCGGATCCTGTTCCTTACTGGTTTCCCCTTC
AAAACTTTTTCCTTCACCTGCGGTTTCTCCTCCACTGGAGCTTCAATCTCCTCCTTCTCA
GCCTCAAAGGCTTCTGGAACATCCTCAAAAATGGCATCGTATTTGTTGCTGCCTCCTGTC
TTCTTCTTGGCCGCCTTCTCTTGCTCCTTTCTTTCTTTCTTCTCAGCTTCCTTTTGAGCT
CTTATGGCAGCTTTAGCAGCAGCTTTTTCCGCCTGCTTCTTTTTCCTTTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1F918TF C 1
AF RS1F918JQ U 202
BS 1 201 RS1F918TF
BS 202 591 RS1F918JQ

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TCTTTCTTCAAAAGTTAAAGCCTCAACAACAGAAGAGAAAACAACAAAGAAAATGAAATG
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AAAGAGTCTCATCCTCTAAAAAGAAACTTTAAAAAGATCCCAAACTACAGCAACAACGCA
GACCTCCCTTGATCTTAGAGAAGGTAGTAGTAACCCAAGACAAGAAGCATCAGTACCACA
AGAGCAGCTGGAGCAGCCCATACCCAGTAGTTAGTCTGCTTCTTACGCTTGATCATTGGT
CTCGGTAGTGTTTCTGGTACTCCTCTATTGCGGATCCTGTTCCTTACTGGTTTCGCCTTC
AAGACTTTTTCCTTCACCTGCGGTTTCTCCTCCACTGGAGCTTCAATCTCCTCCTTCTCA
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TTCTTCTTGGCCGCCTTCTCTTGCTCCTTTCTTTCTTTCTTCTCAGCTTCCTTTTGAGCT
CTTATGGCAGCTTTAGCAGCAGCTTTTTCCGCCTGCTTCTTTTTCCTTTCC

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DS 

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ACCCAGTAGTTAGTCTGCTTCTTACCCTTGATCATTGGTCTCGGTAGTGTTTCTGGTACT
CCTCTATTGCGGATCCTGTTCCTTACTGGTTTCCCCTTCAAAACTTTTTCCTTCACCTGC
GGTTTCTCCTCCACTGGAGCTTCAATCTCCTCCTTCTCAGCCTCAAAGGCTTCTGGAACA
TCCTCAAAAATGGCATCGTATTTGTTGCTGCCTCCTGTCTTCTTCTTGGCCGCCTTCTCT
TGCTCCTTTCTTTCTTTCTTCTCAGCTTCCTTTTGAGCTCTTATGGCAGCTTTAGCAGCA
GCTTTTTCCGCCTGCTTCTTTTTCCTTTCC

QA 1 390 1 390
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGCCCCAACAATCAATCAGCCGGTTCTGAACAGAGCAAACAGGGATCTTGGACTTGGTGG
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CTTTGGAACTGTTCATCGTGCTGAGTGGCATGGCTCGGATGTTGCTGTGAAAATTCTCAT
GGAGCAAGACTTCCATGCTGAGCGTGTCAATGAGTTCTTGAGAGGGGTTGCAATAATGAA
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GTCAATAGTGACAGAATATTTGTCAAGAGGTAGTTTATTCAGACTTTTGCATAAAAGTGG
AGCAAGGGAGCAACTGGATGAGAGACGCCGCTTGAGTATGGCATATGATGTGGCTAAAGG
AATGAATTATCTTCATAATCGCAATCCTCCAATTGTACATAGAGATCTAAAATCTCCAAA
CTTGTTGGTCGACAAAAAATACACCGTCAAGGTTTGTGATTTTGGTCTCTCGCGGTTAAA
GGCCAGCACGTTCCTTTCATCAAAGTCGGCAGCTGGAACCCCTGAGTGGATGGCACCAGA
GGTCCTGCGGGATGAGCAATCTAATGAGAAGTCAGACGTGTACAGCTTTGGGGTCATCTT
GTGGGAGCTTGCTACATTGCAGCAACCATGGGGTAATTTGAATCCTGCTCAGGTTGTAGC
TGCGGCTGGTTTCAAGAATAAACGGCTTGAAATCCCACGCAACCTGAACCCTCAAGTTGC
AGCAATAATCGAGGGTTGTTGGACAAATGAGCCGTGGAAGCGTCCATCATTTGCAACAAT
AATGGACTTGCTAAGACCATTGATCAAATCAGCGGTTCCTCCACCCAACCGCTTGGATCT
GTGAGACACCGGCCCACTTGGAAACACGGTATTAATAATTGATGATGTGCACATATACTT
TCAGCATTATTTTGCTGCCCAGGAGGGAGACACTAGTTAAGATAGCTGTAAGGGAAGGAA
AAAAAAGTAAATTCAAAAGTAGTCATGGAAACAGTAAGGGATATTCTATTATCGACCTCC
CAGGGGTGAGCAATATATTGTTGTAAGCCTTTTGTAGTAGTGACACTTGCTATTTTTTTT
TGTCTAATCCTACATATAATGTTTCCGTAAAGTTACCTTGTTGTACATTTAAGCTACTAA
ATTAGTAGCTCCTAGTAACTAAGAGAGTCCAAACCAAGAAAAAGAGTTGTGTGTCAGTGT
GGTTTTGCAAACTCTGTATGATTCATTGAATTGTACATTTATTCACACGAGATTATC


BQ
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AF RS1AY31TF U 1
AF RS1AY31JQ C 586
BS 1 683 RS1AY31TF
BS 684 1317 RS1AY31JQ

RD RS1AY31TF 683 0 0
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TGATGACATGGACATCCCATGGTGTGATCTTAATATAAAAGAGAAGATTGGAGCAGGTTC
CTTTGGAACTGTTCATCGTGCTGAGTGGCATGGCTCGGATGTTGCTGTGAAAATTCTCAT
GGAGCAAGACTTCCATGCTGAGCGTGTCAATGAGTTCTTGAGAGGGGTTGCAATAATGAA
ACGCCTTCGTCACCCTAATATTGTTCTCTTCATGGGGGCTGTCACTCAACCTCCAAATTT
GTCAATAGTGACAGAATATTTGTCAAGAGGTAGTTTATTCAGACTTTTGCATAAAAGTGG
AGCAAGGGAGCAACTGGATGAGAGACGCCGCTTGAGTATGGCATATGATGTGGCTAAAGG
AATGAATTATCTTCATAATCGCAATCCTCCAATTGTACATAGAGATCTAAAATCTCCAAA
CTTGTTGGTCGACAAAAAATACACCGTCAAGGTTTGTGATTTTGGTCTCTCGCGGTTAAA
GGCCAGCACGTTCCTTTCATCAAAGTCGGCAGCTGGAACCCCTGAGTGGATGGCACCAGA
GGTCCTGCGGGATGAGCAATCTAATGAGAAGTCAGACGTGTACAGCTTTGGGGTCATCTT
GTGGGAGCTTGCTACATTGCAGC

QA 1 683 1 683
DS 

RD RS1AY31JQ 732 0 0
GTGGATGGCACCAGAGGTCCTGCGGGATGAGCAATCTAATGAGAAGTCAGACGTGTACAG
CTTTGGGGTCATCTTGTGGGAGCTTGCTACATTGCAGCAACCATGGGGTAATTTGAATCC
TGCTCAGGTTGTAGCTGCGGCTGGTTTCAAGAATAAACGGCTTGAAATCCCACGCAACCT
GAACCCTCAAGTTGCAGCAATAATCGAGGGTTGTTGGACAAATGAGCCGTGGAAGCGTCC
ATCATTTGCAACAATAATGGACTTGCTAAGACCATTGATCAAATCAGCGGTTCCTCCACC
CAACCGCTTGGATCTGTGAGACACCGGCCCACTTGGAAACACGGTATTAATAATTGATGA
TGTGCACATATACTTTCAGCATTATTTTGCTGCCCAGGAGGGAGACACTAGTTAAGATAG
CTGTAAGGGAAGGAAAAAAAAGTAAATTCAAAAGTAGTCATGGAAACAGTAAGGGATATT
CTATTATCGACCTCCCAGGGGTGAGCAATATATTGTTGTAAGCCTTTTGTAGTAGTGACA
CTTGCTATTTTTTTTTGTCTAATCCTACATATAATGTTTCCGTAAAGTTACCTTGTTGTA
CATTTAAGCTACTAAATTAGTAGCTCCTAGTAACTAAGAGAGTCCAAACCAAGAAAAAGA
GTTGTGTGTCAGTGTGGTTTTGCAAACTCTGTATGATTCATTGAATTGTACATTTATTCA
CACGAGATTATC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL5564Contig1 987 2 4 U
GGTGATGTTGTGGATGATCCAGAGTTGTTGGAGCTTGTTGAGATGGAACTACGTGAACTT
CTCAGCTTCTACAAGTTTCCTGGTGATGATATCCCCATCATCCGTGGTTCAGCTCTGTGT
GCACTTCAGGGCACAAACGATGAAATTGGAAGGCAAGCTATTTTAAAGCTGATGGATGCT
GTTGATGAGTACATTCCTGACCCTGTTTGTGTGCTCGACAAACCTTTCTTGATGCCTATT
GAAGATGTTTTCTCAATCCAAGGACGTGGAACTGTTGCAACCGGTCGTATTGAACAAGGA
GTCATCAAAGTCGGTGAAGAAGTTGAGATATTGGGTTTAAAAGACGGACCTCCAATGAAA
TCAACTGTAACTGGGGTTGAGATGTTCAAGAAGATTCTGGATAATGGACAGGCTGGTGAT
AACGTAGGACTTCTTCTGCGTGGGCTCAAGAGAGAAGACATTCAACGTGGAATGGTGATT
GCTAAGCCTGGTTCATGCAAGACGTACAAGTTTGAAGCAGAGATCTACGTGCTCACCAAG
GACGAAGGTGGACGTCACACTGCCTTTTTATCAAACTACAGGCCTCAGTTTTACTTGAGG
ACTGCAGATATCACTGGAAGAGTAGAGTTACCAGAAGAGGTGAAGATGGTTATGCCTGGT
GACAATGTCACTGCAGTGTTTGAGCTTATCATGCCTGTCCCACTCGAAATAGGTCAAAGA
TTTGCCCTGAGGGAAGGAGGTAGAACAGTTGGGGCTGGTGTTGTATCCAAAGTGATGACT
TGAAGAGTTCTCAAAAGGCACATCCTTAGGTTTTCTCTAGGAAGAACCCATCAATGATGT
GATTTTTTTTTTTTCTTCTGTTCCGCTGCTTTGAGATTTGAACTATATCAAATAACAGAG
GGAGAAACATAGTTTAAGTTTCCAACTCTTGATTTGTTGTTTCCTACTCTGTGAAAAACT
ATAAAAGAGCCACTTCCCATTCTCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FL06TF U 1
AF RS1FL06JQ C 434
BS 1 712 RS1FL06TF
BS 713 713 RS1FL06JQ
BS 714 726 RS1FL06TF
BS 727 987 RS1FL06JQ

RD RS1FL06TF 732 0 0
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GTTGATGAGTACATTCCTGACCCTGTTTGTGTGCTCGACAAACCTTTCTTGATGCCTATT
GAAGATGTTTTCTCAATCCAAGGACGTGGAACTGTTGCAACCGGTCGTATTGAACAAGGA
GTCATCAAAGTCGGTGAAGAAGTTGAGATATTGGGTTTAAAAGACGGACCTCCAATGAAA
TCAACTGTAACTGGGGTTGAGATGTTCAAGAAGATTCTGGATAATGGACAGGCTGGTGAT
AACGTAGGACTTCTTCTGCGTGGGCTCAAGAGAGAAGACATTCAACGTGGAATGGTGATT
GCTAAGCCTGGTTCATGCAAGACGTACAAGTTTGAAGCAGAGATCTACGTGCTCACCAAG
GACGAAGGTGGACGTCACACTGCCTTTTTATCAAACTACAGGCCTCAGTTTTACTTGAGG
ACTGCAGATATCACTGGAAGAGTAGAGTTACCAGAAGAGGTGAAGATGGTTATGCCTGGT
GACAATGTCACTGCAGTGTTTGAGCTTATCATGCCTGTCCCACTCGAAATAG*TCAAAGA
TTTGCC
TGAGGG

QA 1 726 1 726
DS 

RD RS1FL06JQ 554 0 0
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CATGCAAGACGTACAAGTTTGAAGCAGAGATCTACGTGCTCACCAAGGACGAAGGTGGAC
GTCACACTGCCTTTTTATCAAACTACAGGCCTCAGTTTTACTTGAGGACTGCAGATATCA
CTGGAAGAGTAGAGTTACCAGAAGAGGTGAAGATGGTTATGCCTGGTGACAATGTCACTG
CAGTGTTTGAGCTTATCATGCCTGTCCCACTCGAAATAGGTCAAAGATTTGCCCTGAGGG
AAGGAGGTAGAACAGTTGGGGCTGGTGTTGTATCCAAAGTGATGACTTGAAGAGTTCTCA
AAAGGCACATCCTTAGGTTTTCTCTAGGAAGAACCCATCAATGATGTGATTTTTTTTTTT
TCTTCTGTTCCGCTGCTTTGAGATTTGAACTATATCAAATAACAGAGGGAGAAACATAGT
TTAAGTTTCCAACTCTTGATTTGTTGTTTCCTACTCTGTGAAAAACTATAAAAGAGCCAC
TTCCCATTCTCACT

QA 1 554 1 554
DS 



AS 1 2

CO CL5565Contig1 558 2 1 U
GGACTTCACAGAGCGATCTTTAGAAGAAATTTCTTGAGAGATATACGTTACTTCCATATA
GATATATAAAAAGTAAAGGGAAATGGCGGGACCGGAACAAGCAGCAAGGCAGTCAAGTGA
AGTATTGGGCCAGCGGCGAGCATTAGGGATGTGTCCGGTGAGAGCAGCAGCGGTTGGATT
TGTGATTGTTGGTGGACTTGGCTACATGGTCTTGTACAGCAAAAAGAAGCCAGAAGCTTC
AGCAGGTGATGTCGCTAAAGTTATATCCGGTGTCTCTGGTACTACTGAGAGTACTCGTCC
TCGTAACTGACATTTTCTCAAATTTAAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAACTGACATTTTTGC
TATATTTGTTTGATTGAAGTATATAGTGAATCTTTAAATATTTTAAAAATTTCAGTATTT
GAATTTGTTATTCATTTATTCTTGACATCGATCCTTTTTTTTTTTTTTTTGTAAACTGCA
TATTGACATCACTCCTTCCAAAGTCAGTTATTTGCTCTTATTTTTTTTGGGAATGTGAAA
TCATATGTATGGCATGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GQ41TF U 1
AF RS1GQ41JQ C 328
BS 1 558 RS1GQ41TF

RD RS1GQ41TF 558 0 0
GGACTTCACAGAGCGATCTTTAGAAGAAATTTCTTGAGAGATATACGTTACTTCCATATA
GATATATAAAAAGTAAAGGGAAATGGCGGGACCGGAACAAGCAGCAAGGCAGTCAAGTGA
AGTATTGGGCCAGCGGCGAGCATTAGGGATGTGTCCGGTGAGAGCAGCAGCGGTTGGATT
TGTGATTGTTGGTGGACTTGGCTACATGGTCTTGTACAGCAAAAAGAAGCCAGAAGCTTC
AGCAGGTGATGTCGCTAAAGTTATATCCGGTGTCTCTGGTACTACTGAGAGTACTCGTCC
TCGTAACTGACATTTTCTCAAATTTAAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAACTGACATTTTTGC
TATATTTGTTTGATTGAAGTATATAGTGAATCTTTAAATATTTTAAAAATTTCAGTATTT
GAATTTGTTATTCATTTATTCTTGACATCGATCCTTTTTTTTTTTTTTTTGTAAACTGCA
TATTGACATCACTCCTTCCAAAGTCAGTTATTTGCTCTTATTTTTTTTGGGAATGTGAAA
TCATATGTATGGCATGAT

QA 1 558 1 558
DS 

RD RS1GQ41JQ 231 0 0
GCAAAAAAAAAAAAAAAAAACTGACATTTTTGCTATATTTGTTTGATTGAAGTATATAGT
GAATCTTTAAATATTTTAAAAATTTCAGTATTTGAATTTGTTATTCATTTATTTTTGACA
TCGATCCTTTTTTTTTTTTTTTTGTAAACTGCATATTGACATCACTCCTTCCAAAGTCAG
TTATTTGCTCTTATTTTTTTTGGGAATGTGAAATCATATGTATGGCATGAT

QA 1 231 1 231
DS 



AS 1 2

CO CL5566Contig1 285 2 1 U
GCATTGGCAGGAACGTGATCCATGGGAGTGACTCCGTGGAGAGTGCTAACAAGGAAGCTG
CGTTGTGGTTCCCTGACGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTTCATTCTTGGATCTACG
AATGATTCTATCGTGTGTGGTTGTTTTGTTACCTTTTTTTGTTCCTTCGGTTATGAAACT
CAAAACATGTTTGTTCTGGCTTTGTTACTTCTGCCTTCTTTCGTGGTAATCTATGAAGAC
CTATCTTCTGTCTTTTATTTTCATATATAATAAGTTTCCTTGAGC


BQ
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AF RS1FZ14JQ C 1
AF RS1FZ14TF U 1
BS 1 285 RS1FZ14TF

RD RS1FZ14JQ 285 0 0
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CGTTGTGGTTCCCTGACGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTTCATTCTTGGATCTACG
AATGATTCTATCGTGTGTGGTTGTTTTGTTACCTTTTTTTGTTCCTTCGGTTATGAAACT
CAAAACATGTTTGTTCTGGCTTTGTTACTTCTGCCTTCTTTCGTGGTAATCTATGAAGAC
CTATCTTCTGTCTTTTATTTTCATATATAATAAGTTTCCTTGAGC

QA 1 285 1 285
DS 

RD RS1FZ14TF 285 0 0
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CGTTGTGGTTCCCTGACGGACCTGTGAACTGGCAGAGCAGCCTTCATTCTTGGATCTACG
AATGATTCTATCGTGTGTGGTTGTTTTGTTACCTTTTTTTGTTCCTTCGGTTATGAAACT
CAAAACATGTTTGTTCTGGCTTTGTTACTTCTGCCTTCTTTCGTGGTAATCTATGAAGAC
CTATCTTCTGTCTTTTATTTTCATATATAATAAGTTTCCTTGAGC

QA 1 285 1 285
DS 



AS 1 2

CO CL5567Contig1 289 2 1 U
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GTGACCTTATGACATGAACCAAGTATGTTTATGATGTTTGTATGTTTTCTGTGATACTGT
CAAGTATGTTTTATGCATGTTTTCTCCGATAATATAAAGTTTTATGTAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FJ23JQ C 1
AF RS1FJ23TF U 1
BS 1 289 RS1FJ23TF

RD RS1FJ23JQ 289 0 0
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CCCATATCACAGGTGTATCTGCTACTTCCCATGTTAATCTACCAAAACTCATTGGTTGTA
CCAAAACTATGTGGTGCTTGTGTGTTTATTTACATTTAATAAGTCTGTGTCACTCTATGA
GTGACCTTATGACATGAACCAAGTATGTTTATGATGTTTGTATGTTTTCTGTGATACTGT
CAAGTATGTTTTATGCATGTTTTTTCCGATAATATAAAGTTTTATGTAC

QA 1 289 1 289
DS 

RD RS1FJ23TF 289 0 0
GACACACTTCACACAAATACATCGAAAACAAATTCCTAATAGTCATGGCCAAGTTTGTTT
CCCATATCACAGGTGTATCTGCTACTTCCCATGTTAATCTACCAAAACTCATTGGTTGTA
CCAAAACTATGTGGTGCTTGTGTGTTTATTTACATTTAATAAGTCTGTGTCACTCTATGA
GTGACCTTATGACATGAACCAAGTATGTTTATGATGTTTGTATGTTTTCTGTGATACTGT
CAAGTATGTTTTATGCATGTTTTCTCCGATAATATAAAGTTTTATGTAC

QA 1 289 1 289
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5569Contig1 1128 2 4 U
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GAAGAAGGTTCTTAGATTAATGGAACTGCTCTATCTCCTCTGCTCAATCGTCTACACTTC
AACCACGACCTTCTTCCTCTCTCTCCTCCTCCCCTTCCGCCTCCTTATCCACCGTCTCCT
ACCTTCACGACGCTCCGCCGTCGATTCCAACGTCTCTTACTACGAAGGCACCGTCTGGCA
CGACCGTCTCCGTCCCGTCCGTCACTCCTTGCTCGTACCTCCGGGCCGATTTTTCTATTG
ACGATACCTCCAAGCGTTGGATATGAACAGAACCCATTGAGTTTGTATTATTGCTACAAC
TTAGAAGGATCAAGAAAGCGCTTAACCAAATGCATTGCACAGGTTACAAATACGCCATGG
GGGGAACGTGTGACATTCGTTTTCGACCCTGATTCTGACTTGGTTGCTAAATCATTACAA
GTCAGTCCTTTCATGGATATGCTTGGGAATTGGAAGATCAGAGCAAATGAACCTGGAGAT
GAGTTATCTGTCTCCATTGAATCACAGCATCCTCATCATGGTAACTACTTCTCTGCGACA
CTGAAGGCGAAAAGAATAGACCAAACACGAGTTTCTGATCCCGCGGTCTTCTTCTGGTTG
ATGCCTCATAAAGTTGCGATATGGATCTATTGGCATGCACTTAAACTCTGGTGGAAGAAT
GTACCTTTCATTCAACACCCCAGGTACTCAAACCCATCCTATAAAGAGGATGCAGCGAAA
CGCGATGAAGATTTTCGTTGTGTTGGTTTGAATGGATCAAACTCTGGTGAAACCATCAAA
TTTGATGGCTGTAGCAGTGGTTTTGGAGGGTGTCGCTTTGCCTGGCGAGATGCTAATTGG
CCTTGGTCATGATCATACACACACACACTTGGGATTATCAGGTTGTCAGAGTTTGGACTT
TACAAAATCATTCATCGAATGGTAGGATTGGTGGACTTGTTTAGGCTTTTGCTTAGTAAC
AAAAATGAAAGGTATTTGATGATAAGCCTACGATGTAGCTCGACTTATTGCAAGTTAAGA
AAACAAACCTGCATTTTAAGTATTATACCATATCCATATTGATTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H401TF U 1
AF RS1H401JQB C 344
BS 1 710 RS1H401TF
BS 711 711 RS1H401JQB
BS 712 727 RS1H401TF
BS 728 1128 RS1H401JQB

RD RS1H401TF 727 0 0
GGATCATCATCAATGCCTATCTTGAAAGGATCAGAGAGAGAAGAGAAGAGAAGCTTGAGT
GAAGAAGGTTCTTAGATTAATGGAACTGCTCTATCTCCTCTGCTCAATCGTCTACACTTC
AACCACGACCTTCTTCCTCTCTCTCCTCCTCCCCTTCCGCCTCCTTATCCACCGTCTCCT
ACCTTCACGACGCTCCGCCGTCGATTCCAACGTCTCTTACTACGAAGGCACCGTCTGGCA
CGACCGTCTCCGTCCCGTCCGTCACTCCTTGCTCGTACCTCCGGGCCGATTTTTCTATTG
ACGATACCTCCAAGCGTTGGATATGAACAGAACCCATTGAGTTTGTATTATTGCTACAAC
TTAGAAGGATCAAGAAAGCGCTTAACCAAATGCATTGCACAGGTTACAAATACGCCATGG
GGGGAACGTGTGACATTCGTTTTCGACCCTGATTCTGACTTGGTTGCTAAATCATTACAA
GTCAGTCCTTTCATGGATATGCTTGGGAATTGGAAGATCAGAGCAAATGAACCTGGAGAT
GAGTTATCTGTCTCCATTGAATCACAGCATCCTCATCATGGTAACTACTTCTCTGCGACA
CTGAAGGCGAAAAGAATAGACCAAACACGAGTTTCTGATCCCGCGGTCTTCTTCTGGTTG
ATGCCTCATAAAGTTGCGATATGGATCTATTGGCATGCACTTAAACTCTG*TGGAAGAAT
GTACCTT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1H401JQB 785 0 0
TGTATTATTGCTACAACTTAGAAGGATCAAGAAAGCGCTTAACCAAATGCATTGCACAGG
TTACAAATACGCCATGGGGGGAACGTGTGACATTCGTTTTCGACCCTGATTCTGACTTGG
TTGCTAAATCATTACAAGTCAGTCCTTTCATGGATATGCTTGGGAATTGGAAGATCAGAG
CAAATGAACCTGGAGATGAGTTATCTGTCTCCATTGAATCACAGCATCCTCATCATGGTA
ACTACTTCTCTGCGACACTGAAGGCGAAAAGAATAGACCAAACACGAGTTTCTGATCCCG
CGGTCTTTTTCTGGTTGATGCCTCATAAGGTTGCGATATGGATCTATTGGCATGCACTTA
AACTCTGGTGGAAGAATGTACCTTTCATTCAACACCCCAGGTACTCAAACCCATCCTATA
AAGAGGATGCAGCGAAACGCGATGAAGATTTTCGTTGTGTTGGTTTGAATGGATCAAACT
CTGGTGAAACCATCAAATTTGATGGCTGTAGCAGTGGTTTTGGAGGGTGTCGCTTTGCCT
GGCGAGATGCTAATTGGCCTTGGTCATGATCATACACACACACACTTGGGATTATCAGGT
TGTCAGAGTTTGGACTTTACAAAATCATTCATCGAATGGTAGGATTGGTGGACTTGTTTA
GGCTTTTGCTTAGTAACAAAAATGAAAGGTATTTGATGATAAGCCTACGATGTAGCTCGA
CTTATTGCAAGTTAAGAAAACAAACCTGCATTTTAAGTATTATACCATATCCATATTGAT
TTTCG

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

CO CL5570Contig1 1180 2 2 U
GGGGCTGTGTGAAACGTCGTCTTCCGGTGGTTTTATCCTTGCCGGCCACGGAGGGTTCCG
GTGTGGTGGCCGTGAAGTCTGTCTTGCCTGGAAATGGCATATCCATCATGGTGAATGTAT
GCAGTGGCAAAATGGGGAAGGCTGTAATCAAAGCAGCAGACTCTGCAGGAGTAAACATCG
TTCCCACATCGTTTGGATCCGCTGCTGAGGCTGGTCAGACTGTTGAGGTGTGTGGAAAAG
AGATTACTGTGTACGGTCCTGCAGAGAGAGAGAAGGTTCTTTCGTCTGTGTTTGAGAAGC
ACCCGGAGCTGATTGTTGTCGACTACACAATCCCATCTGCAGTCAATGATAATGCGGAGC
TGTACAGCAAAGTAGGTGTTCCTTTCGTCATGGGAACAACTGGTGGAGACAGGAACAAAC
TGTATGAAACTGTTGAAGAAGCGAAGATTTATGCTGTGATTTCTCCACAGATGGGTAAAC
AAGTTGTTGCATTTCTTGCGGCCATGGAGATTATGGCTGATCAGTTTCCAGGAGCCTTTG
CTGGTTACTCCTTGGAGGTGATGGAGTCTCATCAAGCTAGCAAATTGGATGCATCACGAA
CAGCTAAAGCTGTTATCTCTTGCTTCCAGGAACTGGGAGTGTCTTACGACATGGATCAGG
TGCATTGCTTTTACTTTATTCTCAACTTATTTGATCTCCGGATATGAATGTTCTGTGTAT
ACAACTTGTTGTGGTAGATACAATTGATTAGGGATCCTAAACAGCAAGTTGAGATGGTGG
GGGTTCCTGAAGAGCATGTCTCTGGTCACGCTTTCCATCTCTATCACTTGACATCACCTG
ATAAAACTGTCTCTTTTGAGTTCCAGCACAACGTCTGTGGCAGATCAATATACGCTGAGG
GAACTGTCGATGCTGTGCTTTTCCTTGCCAAAAAGATTCGATTGAAAGCAGAGCAGCGAA
TCTTCAACATGATTGATGTTTTGAGAGAGGGAAACATGCGGTGAGCTTCCTGAGTTTTTG
TCCAAATGGTGTTGGTTCTAGAAGAGCTGAGGTAGGTTTACCACTTCTTCAGTTACACCA
ACTGGTGTTTTGTAGCTCTTTTCTTTTCTTTCTGTCTATCCTAGAACTTTCCATTGCATT
GTTCATGTAAACTTTTTATTTTATCATAAATGTTACTCCC


BQ
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AF RS1G337TF U 1
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BS 656 1180 RS1G337JQ

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AGATTACTGTGTACGGTCCTGCAGAGAGAGAGAAGGTTCTTTCGTCTGTGTTTGAGAAGC
ACCCGGAGCTGATTGTTGTCGACTACACAATCCCATCTGCAGTCAATGATAATGCGGAGC
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TGTATGAAACTGTTGAAGAAGCGAAGATTTATGCTGTGATTTCTCCACAGATGGGTAAAC
AAGTTGTTGCATTTCTTGCGGCCATGGAGATTATGGCTGATCAGTTTCCAGGAGCCTTTG
CTGGTTACTCCTTGGAGGTGATGGAGTCTCATCAAGCTAGCAAATTGGATGCATCACGAA
CAGCTAAAGCTGTTATCTCTTGCTTCCAGGAACTGGGAGTGTCTTACGACATGGA

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CTCTTGCTTCCAGGAACTGGGAGTGTCTTACGACATGGATCAGGTGCATTGCTTTTACTT
TATTCTCAACTTATTTGATCTCCGGATATGAATGTTCTGTGTATACAACTTGTTGTGGTA
GATACAATTGATTAGGGATCCTAAACAGCAAGTTGAGATGGTGGGGGTTCCTGAAGAGCA
TGTCTCTGGTCACGCTTTCCATCTCTATCACTTGACATCACCTGATAAAACTGTCTCTTT
TGAGTTCCAGCACAACGTCTGTGGCAGATCAATATACGCTGAGGGAACTGTCGATGCTGT
GCTTTTCCTTGCCAAAAAGATTCGATTGAAAGCAGAGCAGCGAATCTTCAACATGATTGA
TGTTTTGAGAGAGGGAAACATGCGGTGAGCTTCCTGAGTTTTTGTCCAAATGGTGTTGGT
TCTAGAAGAGCTGAGGTAGGTTTACCACTTCTTCAGTTACACCAACTGGTGTTTTGTAGC
TCTTTTCTTTTCTTTCTGTCTATCCTAGAACTTTCCATTGCATTGTTCATGTAAACTTTT
TATTTTATCATAAATGTTACTCCC

QA 1 624 1 624
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GACCAATGGGGATAATAATCTGAGACCTCAAGAGATCGAGGATTTATTTTCCACTGCACC
TGAGAGTCCTTGGAATGAAGTTCCATATGCGGATGCGGCAGAGAAAACTGCGCGTGGAGG
ACTTTCCCTTGACGCTTTCCTGTCACTGTGGTCACTGATGACATTATTAGAACCTGCTCG
GAGTGTGGAACATTTGATTTGCATTGGATTCCAGGGCAAACCATCTTCTGCCATCCGTAT
TATTAGGAGAAGGCTTTTAGATCTCAAAAAGAAACGATGTGAAAGAAAAGTTTTCCAGTG
CTTTGTTTTTGGACCCAACAGCGCTGGAAAATCTGCTTTACTGAATTGCTTCCTTGGAAG
GTCATATGCTGATAACCCGGGATCAACCACTGACGAGCGGTATGCAGTGAATATGGTCGA
TGTACCTGGGAGTGCAAAGAAAACTCTTGTGATGAGGGAAATTCCTGAAGGTGGGGCTCA
AGGTCTATTCTCATCCAAGGAGTCTTTGGCTGCATGTGACATAGCTGTTTTCGTGTATGA
CAGTTCTGATGAGTCGTCATGGAAGCGAGCGACTGAGTTGCTTGTAGAACTTGCAAATCA
CGGTGAGGCCACTGGATATGAGGTACCTTGCCTTATGGTTTCAGCGAAATACGATATTGT
ATCATCCCAGATTTCCAGACAAGCATCCACCAAGGTGACACAAGATATGTGGATAGACCC
TCCGGTATCCATCAGCTCGAAACTGGGGGATCTCAACAACTTATTCCGCAAAGTTATAAC
TGCAGCGCAACATCCTCATCTGAGTATTCCAGAGACCGAAGCAGGAAAAATCCGCAAACA
TCATTACAACAGGCTTTTCAACCGCTCTCTTATGGTTGTTTCAATCGTAGCCGCTGTTTT
GGCTGTTGTGCTTGCTGCATACTTTGCGTATGTCTCAAGAGAGAGCGCTTCTGACTGAGA
ATGAAGAACCCAGTGTTGCAAGGTGCCAACGCTAAACGAAAATAGCAAGTCTCTTGTTAT
GATCTTATATTAGTAGAGCATTCTTGTTCCTACAACAATGTATTTGTAACAAATCCTTTT
GTGTGTACCAGTGAGTTACAATTTTCTTGCAACT


BQ
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AF RS1CF89TF U 1
AF RS1CF89JQ C 382
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BS 695 695 RS1CF89JQ
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BS 730 730 RS1CF89JQ
BS 731 761 RS1CF89TF
BS 762 1114 RS1CF89JQ

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GAGTGTGGAACATTTGATTTGCATTGGATTCCAGGGCAAACCATCTTCTGCCATCCGTAT
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ATCATCCCAGATTTCCAGACAAGCATCCACCAAG*TGACACAAGATATGTGGATAGACCC
TCCGGTATC*ATCAGCTCGAAACTGGGGGATCTCAACAACT

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DS 

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AGCATCCACCAAGGTGACACAAGATATGTGGATAGACCCTCCGGTATCCATCAGCTCGAA
ACTGGGGGATCTCAACAACTTATTCCGCAAAGTTATAACTGCAGCGCAACATCCTCATCT
GAGTATTCCAGAGACCGAAGCAGGAAAAATCCGCAAACATCATTACAACAGGCTTTTCAA
CCGCTCTCTTATGGTTGTTTCAATCGTAGCCGCTGTTTTGGCTGTTGTGCTTGCTGCATA
CTTTGCGTATGTCTCAAGAGAGAGCGCTTCTGACTGAGAATGAAGAACCCAGTGTTGCAA
GGTGCCAACGCTAAACGAAAATAGCAAGTCTCTTGTTATGATCTTATATTAGTAGAGCAT
TCTTGTTCCTACAACAATGTATTTGTAACAAATCCTTTTGTGTGTACCAGTGAGTTACAA
TTTTCTTGCAACT

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 2

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TGGAGAAGGGATGGGTATGGGGGGAAATACTGACAACAATAACCACAAGACTATTACGCA
GGATTCACCTGATCAAGACTTTCATAATTTTGAACTGACAACAAGCTGTTTTGCTGTCAA
CCAGGTGTGGTCTCTGTATGATCCAACCGACGGTATGCCTCGGTATTATGCTCGGATAAC
AAAAGTAATTGATTCCGAGTTCAAGCTTGGTATTACATGGCTTGACCCCTTACAAGATTA
TAACGACAACTCTATCCCCATTGCTTGTGGAATCTTCCAAGATAAAGAGTCAGAGGAAGT
TGACGACCGTTTTATATTCTCTTGTGAGATGCTTCACATACGTCGTGACAACAACATCGT
CATTTATCCAAGAACAGGGGAAGTCTGGGCAGTTTTCAGAGGCTGGGATGTCAGCTGGAG
TGGTGGTAGTAGCTCGGAAAATCGCAAAGGGGATTATGAATATGACTTTGTTGAAGTTTT
GTGTGAGTATGAAGATGAGAATGGCCTTGGAGTGGCCTACCTAGGGAAAGTGGAAGGGTT
TGTTTCTCTGTTTCGCCGAGATGCAAAGTGTGGAGTTCTCCAGTTCCAATTCCACCGAAC
GAGATGCTTAGATTTTCTCACAAAGTCCCGTCATTCAAAATGACCGGAAGAGAGGGTGAA
GGTGTTCCTCCCGGGTGCTTCGAACTAGACATTGCCGCTTTACCAAAAGATATGTTCGAG
GTTGCTAAACAGGAAACGGACTCGGCGAAGAAGAAGGCCAAGAAGAGTGTCAAAGCTGTG
GATGGCTTGGAACTGAGAAAATCTCCTCGTCTTGTGACTGTGAGTGAAACAAACAAACAA
GCAACTTCAAGGCTACGCCAAGGAAAAGCTGAGAAGAAGAGTGCTAAGAAGGGTGCATCC
TGTGAACAGCCAAATGGATCTTCTTTATCTGATGAGACGACGCCTCCACCAAAGAAACCT
GCAAAAGTCACTGCGGCTGATTCCTCAAGAATCAAACCCACGGGGAACTCAAAGAAACGT
GGGAGAAATGGTGGGTCATTGTCTCAGTCCAGAGGTAAATGATTTTACGGACTCGGTTAA
ATGGTAGTACAGATTCTATGAGTCTCTTTTTTGTTTTGTTAATCTCACATCTTTGTGTAG
TTGGGGCGATAAACTTGTGGAATGTGATGTGAAGTTAGAGTTT


BQ
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AF RS1B654TF U 1
AF RS1B654JQ C 573
BS 1 648 RS1B654TF
BS 649 649 RS1B654JQ
BS 650 675 RS1B654TF
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BS 677 694 RS1B654TF
BS 695 1243 RS1B654JQ

RD RS1B654TF 707 0 0
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TGGAGAAGGGATGGGTATGGGGGGAAATACTGACAACAATAACCACAAGACTATTACGCA
GGATTCACCTGATCAAGACTTTCATAATTTTGAACTGACAACAAGCTGTTTTGCTGTCAA
CCAGGTGTGGTCTCTGTATGATCCAACCGACGGTATGCCTCGGTATTATGCTCGGATAAC
AAAAGTAATTGATTCCGAGTTCAAGCTTGGTATTACATGGCTTGACCCCTTACAAGATTA
TAACGACAACTCTATCCCCATTGCTTGTGGAATCTTCCAAGATAAAGAGTCAGAGGAAGT
TGACGACCGTTTTATATTCTCTTGTGAGATGCTTCACATACGTCGTGACAACAACATCGT
CATTTATCCAAGAACAGGGGAAGTCTGGGCAGTTTTCAGAGGCTGGGATGTCAGCTGGAG
TGGTGGTAGTAGCTCGGAAAATCGCAAAGGGGATTATGAATATGACTTTGTTGAAGTTTT
GTGTGAGTATGAAGATGAGAATGGCCTTGGAGTGGCCTACCTAGGGAAAGTGGAAGGGTT
TGTTTCTCTGTTTCGCCGAGATGCAAAGTGTGGAGTTCTCCAGTTCCA*TTCCACCGAAC
GAGATGCTTAGATTT*CTCACAAAGTCCCGTCAT
CAAATGACGGAGA

QA 1 694 1 694
DS 

RD RS1B654JQ 671 0 0
GTGGCCTA
CTAGGGAAAGTGGAAGGGTTTGTTTCTCTGTTTCGCCGAGATGCAAAGTGTGGAGTTCTC
CAGTTCCAATTCCACCGAACGAGATGCTTAGATTTTCTCACAAAGTCCCGTCATTCAAAA
TGACCGGAAGAGAGGGTGAAGGTGTTCCTCCCGGGTGCTTCGAACTAGACATTGCCGCTT
TACCAAAAGATATGTTCGAGGTTGCTAAACAGGAAACGGACTCGGCGAAGAAGAAGGCCA
AGAAGAGTGTCAAAGCTGTGGATGGCTTGGAACTGAGAAAATCTCCTCGTCTTGTGACTG
TGAGTGAAACAAACAAACAAGCAACTTCAAGGCTACGCCAAGGAAAAGCTGAGAAGAAGA
GTGCTAAGAAGGGTGCATCCTGTGAACAGCCAAATGGATCTTCTTTATCTGATGAGACGA
CGCCTCCACCAAAGAAACCTGCAAAAGTCACTGCGGCTGATTCCTCAAGAATCAAACCCA
CGGGGAACTCAAAGAAACGTGGGAGAAATGGTGGGTCATTGTCTCAGTCCAGAGGTAAAT
GATTTTACGGACTCGGTTAAATGGTAGTACAGATTCTATGAGTCTCTTTTTTGTTTTGTT
AATCTCACATCTTTGTGTAGTTGGGGCGATAAACTTGTGGAATGTGATGTGAAGTTAGAG
TTT

QA 9 671 9 671
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5575Contig1 850 2 6 U
TTTTTTTTTCCCCAATTAATTGTCTCTCTCTCTCGGTGTGAGTTGCTCGTTTATGGGAGA
ATCGTGTCTCTTTGATTAATTTAATATATTAAAAAATAAAAAGAGTTTGCAGAGAGTGAA
AAGATCTTGTGGGTTGGCCATTATATATATACAGGTCTTTCTCCTTCTTCTCCTCTTCGG
AACTCACTGAAACTTACTTTAGCTTTTTTCTCGAGAATCATAACACCTAAAAAGTAACGA
TTATGGATGTTAGCATGAGTTTTTCACAGGATATGGATGATGAGTATGAGAAGCTCATTA
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TAAGGGTGGACAGTGCAAATGAATATGGGATTCTTCTTGAAGTTGTGCAAATCCTCACTG
ATCTCAACCTCACTATCACCAAAGCTTACATCTCCTCTGATGGTGGTTGGTTCATGGATG
TATTTAACGTCACTGACCAAGATGGTAACAAAGTCACAGACGAAGTTGTTCTAGACTATA
TCCAAAAATCTCTTGGTCCTGAAGCTTGTTTCTCCACTTCCATGAGAACCGTCGGTGTCA
CACCATCAACAGACAGCACTGTCATCGAGCTAACCGGCTGTGACAGACCAGGTCTCCTCT
CTGAGCTGACAGCTGTCCTGACCCATCTCAAATGCAGCGTCCTAAACGCAGAGGTCTGGA
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TCCCCGACCCGGAGAGGCTCTCTCGGATCAAGAACCTTCTCAGAACGTGCTCAAGGGAAG
CAGCAACACA


BQ
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BQ
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TTTCCACAAGTGTGTACTGTGTAGCGTTTCAGAATTACTTGACAACCACAATGTGCATTT
AAAATTCGAAGTACCAATATATGCTTTCCAAGGATTTTAATAAGTTCTATATATGTTTTA
GATTTTTAGTGCTTCATCATTCATGTGTTCACATGGTAGTCTCAAACAGGAGATATCGTC
ACGGCAAATCATAAATACTAAAGGTAACAGAACGATATATGACGACTTTAATTTGGTCAA
TGCCTTCTGGATAAGAAACAAGAAAGAGGCATATTTTTCCAAATAATATTGTACCGCGAG
GCTTGAGTACATATGGTTCAACACATATGTTAGAAGGATTCGTATTTCATATCCCATGAA
GAACGGTTCATTTTGACCTTAGGGATTTTTTCTTTAGGAGGATTTCGTTAGATTTTCCTA
ATATCAACAAACATCAATATAAGT

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 2

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CCGGTGAAAAAAAAGAGCCGCGATTTCGTTTCATTCGTGTTTTTTTTCGTAGTTAACTCA
TTTCACGGGATATTTTAGAGATTAAATGGCTGAGGAAGCGCATAAAGTTACATTGAATGT
CTACGACCTAAGCAGAGGTTTGGCTCGCCAGCTCTCTGCTTCTCTTTTGGGAAAAGTCAT
CGAAGGTGTCTGGCACACGGGGATAGTTGTGTATGGGAACGAATACTTTTTTGGAGGAGG
GATACAGCATTTACCAACCGGAACAACTCCGTACGGAGCACCATTACGAACCGTAGAGAT
GGGTGAGACGCACGTTCCCAAAGACGTGTTCGAGATGTACTTGGAGGAGATCATTCCTCG
TTACACCGCCGAGTCCTACAGTTTGCTCGCTCACAACTGCAACAACTTCAGCAACGAGGT
CTCTCAGTTTCTTGTCGGTAAAGGAATCCCTGACTACATTCTCCAGCTTCCTACTGAGGT
CATGAACAGCCCCATGGGTGGTGGTCTTCTAATGCCTATGATACAAAACCTGGAAGCAAC
TCTGAGAGCTGGAGCTGTTCCTAACGCTCCACAGTTTAAGCCTCAACCACAAGCTTCCAA
GTCTGAGGATGCCAAAACTGAGAAAGTGTCACCGGTTGTTGTTCAGCCTTCAGCTGCTGG
TAAAGAGAAGGTGAAAGAGGACCCGCTGGGTGATGCTAGGAGCAAGATTCAGGAAGAGAT
TACTCGTGAGTTTTCAGCTCTCATGGCGCAAGGCACATTGAGAGCAAGTGAAGCAGCTAC
TATAGCTACTAAGCGAGTGATGCAAAAGTATGGTCATCTCAATGCAGCTGCTTAGAGTCT
AATAATAAAACAGATGAAACCGTTTATTATTACAACTGTATTGGAACTGAGTCAATAATC
TTGAAATAATTGTATTTTTCTATTTACCAGCTACACTTGTATTCAACGACTTACAGATTA
ATCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RS1CO20TF U 1
AF RS1CO20JQ C 356
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BS 729 1025 RS1CO20JQ

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TAAAGAGA

QA 1 728 1 728
DS 

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CCTCGTTACACCGCCGAGTCCTACAGTTTGCTCGCTCACAACTGCAACAACTTCAGCAAC
GAGGTCTCTCAGTTTCTTGTCGGTAAAGGAATCCCTGACTACATTCTCCAGCTTCCTACT
GAGGTCATGAACAGCCCCATGGGTGGTGGTCTTCTAATGCCTATGATACAAAACCTGGAA
GCAACTCTGAGAGCTGGAGCTGTTCCTAACGCTCCACAGTTTAAGCCTCAACCACAAGCT
TCCAAGTCTGAGGATGCCAAAACTGAGAAAGTGTCACCGGTTGTTGTTCAGCCTTCAGCT
GCTGGTAAAGAGAAGGTGAAAGAGGACCCGCTGGGTGATGCTAGGAGCAAGATTCAGGAA
GAGATTACTCGTGAGTTTTCAGCTCTCATGGCGCAAGGCACATTGAGAGCAAGTGAAGCA
GCTACTATAGCTACTAAGCGAGTGATGCAAAAGTATGGTCATCTCAATGCAGCTGCTTAG
AGTCTAATAATAAAACAGATGAAACCGTTTATTATTACAACTGTATTGGAACTGAGTCAA
TAATCTTGAAATAATTGTATTTTTCTATTTACCAGCTACACTTGTATTCAACGACTTACA
GATTAATCAA

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

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GGGAAAGATGGGAAGCGTGGTGAAGGCGTATTGTCAGTACAAGATGCCCTCCTCCTTTCA
CCATTATTACAGACCTTCCAACCCTATTTCTCTCTTCGCCATCACTTCTCCGTCCATTTC
ACCCTCAGACCCTTCTTCTCCTACTCCTCCTCCTAGCAATAGTAATGGTTTCAAAATCCA
ATTCGGCGGCCACTTGATCGTCCCCGCCGTCGCAGTCGCAGCTTCCGCCTGGTTCTTCCT
TCGCCTCCACCGATACCCTCCAATCATCACCGCTCCTGTTGATCTAGAACTGGAGGAAGA
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CTACGAATCCCTGAAAGCACGGATTCGCTTGTCCGCCGAGTGGCTAGAAAGGGCGAGGAG
AGAGTTGGAGGAGGTGGTGGAGAGAGACCCGGGTCGGGTCATGGAGTATTTTCAGGTGGT
TGACGAGCTGATGGATCTCCTCAGGGATATGGAGGTTTATGTGGATCAATGCCAGAAGGA
CAAGGTTAAGGGTTACCTTACCTCTTGCAATCGGTTGCTTGCCCGTGTCAGGAAAATGGA
AGCTCGGATTCTCAATGCCCTCAAACACTTTCACGATGATGATGATGCTGATGGTGAACC
AGGAGGAGGACACAACTAGCATTTGGACCCTCTCTCACTCTTTGTCACTTGTCATTTCGC
ATTTTTATTTTAAAAAGTTTTCATGAGAGTATTATGCTTTGCTTCTATGAATGGAACTAT
GATGCTTCATTAAGCTCTGTAGGATGATAAACAAGTCGAACTCTCTCTCTCTCAAGTTTA
AAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1G332TF U 1
AF RS1G332JQ C 363
BS 1 650 RS1G332TF
BS 651 1026 RS1G332JQ

RD RS1G332TF 651 0 0
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TGGGGGTTTAGGGTTGTTGGTAGTAAATTGAATTAGTCGAAAAAACATTTTACAAGTTGG
GGGAAAGATGGGAAGCGTGGTGAAGGCGTATTGTCAGTACAAGATGCCCTCCTCCTTTCA
CCATTATTACAGACCTTCCAACCCTATTTCTCTCTTCGCCATCACTTCTCCGTCCATTTC
ACCCTCAGACCCTTCTTCTCCTACTCCTCCTCCTAGCAATAGTAATGGTTTCAAAATCCA
ATTCGGCGGCCACTTGATCGTCCCCGCCGTCGCAGTCGCAGCTTCCGCCTGGTTCTTCCT
TCGCCTCCACCGATACCCTCCAATCATCACCGCTCCTGTTGATCTAGAACTGGAGGAAGA
AGGTGCGGTCAAAGAGCTACCTTTGAAGCACAAGCCGCGGGGTCATGTCAAAGCTCTCCA
CTTTTACAAAACCAAGCCAGGTACTGTCTTCAAACTCTACTCCTCCTCCGATGATGGTAA
CTACGAATCCCTGAAAGCACGGATTCGCTTGTCCGCCGAGTGGCTAGAAAGGGCGAGGAG
AGAGTTGGAGGAGGTGGTGGAGAGAGACCCGGGTCGGGTCATGGAGTATT
C

QA 1 650 1 650
DS 

RD RS1G332JQ 664 0 0
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GTGCGGTCAAAGAGCTACCTTTGAAGCACAAGCCGCGGGGTCATGTCAAAGCTCTCCACT
TTTACAAAACCAAGCCAGGTACTGTCTTCAAACTTTACTCCTCCTCCGATGATGGTAACT
ACGAATCCCTGAAAGCACGGATTCGCTTGTCCGCCGAGTGGCTAGAAAGGGCGAGGAGAG
AGTTGGAGGAGGTGGTGGAGAGAGACCCGGGTCGGGTCATGGAGTATTTTCAGGTGGTTG
ACGAGCTGATGGATCTCCTCAGGGATATGGAGGTTTATGTGGATCAATGCCAGAAGGACA
AGGTTAAGGGTTACCTTACCTCTTGCAATCGGTTGCTTGCCCGTGTCAGGAAAATGGAAG
CTCGGATTCTCAATGCCCTCAAACACTTTCACGATGATGATGATGCTGATGGTGAACCAG
GAGGAGGACACAACTAGCATTTGGACCCTCTCTCACTCTTTGTCACTTGTCATTTCGCAT
TTTTATTTTAAAAAGTTTTCATGAGAGTATTATGCTTTGCTTCTATGAATGGAACTATGA
TGCTTCATTAAGCTCTGTAGGATGATAAACAAGTCGAACTCTCTCTCTCTCAAGTTTAAA
AAAA

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

CO CL5580Contig1 913 2 2 U
GGGCAGAAGAAGCTCAGATATACAGAAACTGACTACAAAGAACAAAGCTGAGAGGGAAAA
AGTTGTTCTTTTCTTCTGCCAGTCACAACCCCAACAAGACTTTGCTGTTTGTTTTGCATA
GGCTATTAAATCATACCCTGGAACACAATACAAAAAAGGTTGAACCACCAATAATCTCAA
AAAGCAGCCAACTCTCTCTCTCTCCCATGGATTTGCAACTTCGTTTGCTTTTGGCGGTGG
TGAGGAAGTGGGTCAAGGAGGATCTCCTTGTTTCTTCTTCTCTGGCTCCTCCAACTCTTC
ATCTGAACTTCTCAACCTTAGTCAAAGTTGTTCAGATATGAAGCAAGAAAGCAACAACAA
GAGGCCGTATGAGTCCCATGGATTCGGCAACAACAACACATCAGACGGAGGCCACACTTT
AAGGCACTTCCTTGACGACTGGCCTCGTTCCGAAGCCGACAACAGTTCAACCCCTATGAC
CTCGGCTACTTGTCTCTCCATCTCCATGTCCGGAAACTCTTCCTCAGACGTCTCTCTGAA
GCTGTCCACTGGCAACGAAGAGGAAGAAGCTAGGACCAATAATAATAATAACAATGGGAG
GGACCAGCAAAACATGAGCAGCTGGTGGAGCGGTGGTGGAGGAGGGTCCCATCTCAACAA
CAACCACCAAATGGGTGGACCGTTGGCAGAAGCCCTGAGATCTTCCTCCTCGACTTCTCC
AACCAGTGTTCTCCATCAGCTCGGTGTTACGACACAAGCCTTTCATTAAACAATGTAACA
ACCAAACAACACAACTTTGCAGATTTTTTTTACTGTTTTGTTTTGGGTTCTTATCCTTTT
TCTTTTAAGCTGTCCCTTGTATCTGTAATATTTACTCTACAGATTTGTCTCTAAAAATTG
TCAGTTTATTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EL36TF U 1
AF RS1EL36JQ C 287
BS 1 659 RS1EL36TF
BS 660 913 RS1EL36JQ

RD RS1EL36TF 659 0 0
GGGCAGAAGAAGCTCAGATATACAGAAACTGACTACAAAGAACAAAGCTGAGAGGGAAAA
AGTTGTTCTTTTCTTCTGCCAGTCACAACCCCAACAAGACTTTGCTGTTTGTTTTGCATA
GGCTATTAAATCATACCCTGGAACACAATACAAAAAAGGTTGAACCACCAATAATCTCAA
AAAGCAGCCAACTCTCTCTCTCTCCCATGGATTTGCAACTTCGTTTGCTTTTGGCGGTGG
TGAGGAAGTGGGTCAAGGAGGATCTCCTTGTTTCTTCTTCTCTGGCTCCTCCAACTCTTC
ATCTGAACTTCTCAACCTTAGTCAAAGTTGTTCAGATATGAAGCAAGAAAGCAACAACAA
GAGGCCGTATGAGTCCCATGGATTCGGCAACAACAACACATCAGACGGAGGCCACACTTT
AAGGCACTTCCTTGACGACTGGCCTCGTTCCGAAGCCGACAACAGTTCAACCCCTATGAC
CTCGGCTACTTGTCTCTCCATCTCCATGTCCGGAAACTCTTCCTCAGACGTCTCTCTGAA
GCTGTCCACTGGCAACGAAGAGGAAGAAGCTAGGACCAATAATAATAATAACAATGGGAG
GGACCAGCAAAACATGAGCAGCTGGTGGAGCGGTGGTGGAGGAGGGTCCCATCTCAACA

QA 1 659 1 659
DS 

RD RS1EL36JQ 627 0 0
TCCTCCAACTCTTCATCTGAACTTCTCAACCTTAGTCAAAGTTGTTCAGATATGAAGCAA
GAAAGCAACAACAAGAGGCCGTATGAGTCCCATGGATTCGGCAACAACAACACATCAGAC
GGAGGCCACACTTTAAGGCACTTCCTTGACGACTGGCCTCGTTCCGAAGCCGACAACAGT
TCAACCCCTATGACCTCGGCTACTTGTCTCTCCATCTCCATGTCCGGAAACTCTTCCTCA
GACGTCTCTCTGAAGCTGTCCACTGGCAACGAAGAGGAAGAAGCTAGGACCAATAATAAT
AATAACAATGGGAGGGACCAGCAAAACATGAGCAGCTGGTGGAGCGGTGGTGGAGGAGGG
TCCCATCTCAACAACAACCACCAAATGGGTGGACCGTTGGCAGAAGCCCTGAGATCTTCC
TCCTCGACTTCTCCAACCAGTGTTCTCCATCAGCTCGGTGTTACGACACAAGCCTTTCAT
TAAACAATGTAACAACCAAACAACACAACTTTGCAGATTTTTTTTACTGTTTTGTTTTGG
GTTCTTATCCTTTTTCTTTTAAGCTGTCCCTTGTATCTGTAATATTTACTCTACAGATTT
GTCTCTAAAAATTGTCAGTTTATTTGC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL5581Contig1 645 2 3 U
GATTCTGACCTGTTTATTGTTTGTTGATATGTGGTAAAAGGACTCCACAAAATCCAAATA
CAGATAAGTACACAGAAGGTTAGAAAATGATTGATCACAAAAGTTGTACACAACTTAAAA
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CTATCCTTCTCTTCTTACAAACCCTTCGCCTGTTTCATCTCCTTCTCCAGCTGGCTTTTC
GTTTGGTCCCTTTTCTTTGTTGCTCATCAACTTGTACCCGTAAAACGCCAACACACCGCC
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CTCTCTCAAAAATATGATTGCCACTATGGCCATCTGTCCTTTTAAGAACTTAGCAGATGA
CTCTCCAATCCTCTGAGCCTTAAGACTAACCATGCTCAGTGCAAAAAGAGCTCCACCAAG
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CCTCAGATCCTCAGTGGAAGAGAAAGCTTCAACAATCTCCTTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D769JQ U 60
AF RS1H448JQB U 1
BS 1 234 RS1H448JQB
BS 235 235 RS1D769JQ
BS 236 645 RS1H448JQB

RD RS1D769JQ 386 0 0
G
CAGATAAGTACACAGAAGTTTAGAAAATGATTGATCACAAAAGTTGTACACAACTTAAAA
GAGAGAACATAGACTTCGGATATCACTAAAACAGAGTATGATGCTCATGTTACCATTTCT
CTATCCTTCTCTTCTTACAAACCCTTCGCCTGTTTCATCTCCTTCTCCAGCTGGCTTTTC
GTTTGGTCCCTTTTCTTTGTTGCTCATCAACTTGTACCCGTAAAACGCCAACACACCGCC
ACTAGTAAGGGTGGTCAAAAACCCCATGAACGTAGATCTCTGAAATAGTACCAACTTCAA
CTCTCTCAAAAATATGATTGCCACTGTGGCCATCTGTCCTTTTAAGAACTTAGCAGATGA
CTCTCCAATCCTCTGAGCCTTAAGA

QA 2 386 2 386
DS 

RD RS1H448JQB 645 0 0
GATTCTGACCTGTTTATTGTTTGTTGATATGTGGTAAAAGGACTCCACAAAATCCAAATA
CAGATAAGTACACAGAAGGTTAGAAAATGATTGATCACAAAAGTTGTACACAACTTAAAA
GAGAGAACATAGACTTCGGATATCACTAAAACAGAGTATGATGCTCATGTTACCATTTCT
CTATCCTTCTCTTCTTACAAACCCTTCGCCTGTTTCATCTCCTTCTCCAGCTGGTTTTTC
GTTTGGTCCCTTTTCTTTGTTGCTCATCAACTTGTACCCGTAAAACGCCAACACACCGCC
ACTAGTAAGGGTGGTCAAAAACCCCATGAACGTAGATCTCTGAAATAGTACCAACTTCAA
CTCTCTCAAAAATATGATTGCCACTATGGCCATCTGTCCTTTTAAGAACTTAGCAGATGA
CTCTCCAATCCTCTGAGCCTTAAGACTAACCATGCTCAGTGCAAAAAGAGCTCCACCAAG
AATGACCCCAAACCTAATGGCAGGAATGCTCCCCGATATCATAAAGGAAAGGAAACCACC
CACAAACAGAAGCAGACCATAAGGTATCCCAACATGAAAATCTTGAGTCCGAGACACATC
CCTCAGATCCTCAGTGGAAGAGAAAGCTTCAACAATCTCCTTCAC

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 2

CO CL5582Contig1 372 2 1 U
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AAGAATCCTCTGAATTTCAGTGAAGCTGTTCAGATGGTAGTTTGAGTTGTTTGGGTTGTT
GAAGTCTTGCTCAATCGAGATGGTAGTTGACATGTTGAAGAACAGGAAGGTGAAAGTCAG
AGCAACCATGATCATCCCCGAAACAAATTTTCATTTCTGTTACAATATATTTGACGGATA
TCATGCATATTAACAGTTAAGTTTATATTTTAACTGACTCATATATACCATTAGATATCA
TGCAATTCAGGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CX53JQ C 1
AF RS1CX53TF U 1
BS 1 372 RS1CX53TF

RD RS1CX53JQ 372 0 0
TCCTCATTTCCTTATTCCTTATTTGATTATAGCTATTGTGCTTAAACCCTCTCTTTCGAC
CAATCTTGTTTTCAGACATGGAAGACCTAAATCTACCACCTCAAATCTTTGTGGCCGGTG
AAGAATCCTCTGAATTTCAGTGAAGCTGTTCAGATGGTAGTTTGAGTTGTTTGGGTTGTT
GAAGTCTTGCTCAATCGAGATGGTAGTTGACATGTTGAAGAACAGGAAGGTGAAAGTCAG
AGCAACCATGATCATCCCCGAAACAAATTTTCATTTCTGTTACAATATATTTGACGGATA
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TGCAATTCAGGT

QA 1 372 1 372
DS 

RD RS1CX53TF 372 0 0
TCCTCATTTCCTTATTCCTTATTTGATTATAGCTATTGTGCTTAAACCCTCTCTTTCGAC
CAATCTTGTTTTCAGACATGGAAGACCTAAATCTACCACCTCAAATCTTTGTGGCCGGTG
AAGAATCCTCTGAATTTCAGTGAAGCTGTTCAGATGGTAGTTTGAGTTGTTTGGGTTGTT
GAAGTCTTGCTCAATCGAGATGGTAGTTGACATGTTGAAGAACAGGAAGGTGAAAGTCAG
AGCAACCATGATCATCCCCGAAACAAATTTTCATTTCTGTTACAATATATTTGACGGATA
TCATGCATATTAACAGTTAAGTTTATATTTTAACTGACTCATATATACCATTAGATATCA
TGCAATTCAGGT

QA 1 372 1 372
DS 



AS 1 2

CO CL5583Contig1 816 2 2 U
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TTCTCACGGCTTACTTTCTTCTTCGTCAGCTTCAGATAATGAATCTTCTTCTTCTTCTCG
ATTCCTTTCGGAGCTCGTACCTTTCCTGCTACAACCATCCGGCGACCTTGATATTGAATC
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ATCTAGGTCAGTTCAGCGAGAGGATGAACCTAAACCACTAATCACCAGTTCAGAGTGTCA
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TTTCTTATGTAACCGACTTTTTTTTTTTCTCTTTTTGTTTTTTCTTTAATATTTTGGATA
TAATATTTAACTCTTTTAAATTTAAATTTATCTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1G383TF U 1
AF RS1G383JQ C 380
BS 1 663 RS1G383TF
BS 664 816 RS1G383JQ

RD RS1G383TF 663 0 0
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TACTCGTTTGGAGAAGCTAAGGTGATTGGAGAAGTTACGGAGTGTTGTATCAGCCATCTC
TTCTCACGGCTTACTTTCTTCTTCGTCAGCTTCAGATAATGAATCTTCTTCTTCTTCTCG
ATTCCTTTCGGAGCTCGTACCTTTCCTGCTACAACCATCCGGCGACCTTGATATTGAATC
GAAACTCGTTTTGATCTCTGATTTCATACCTAAAGTATCTGGAACTTTCCTCGATGAGAT
ATCTAGGTCAGTTCAGCGAGAGGATGAACCTAAACCACTAATCACCAGTTCAGAGTGTCA
AAAGAGTTGTGTGAAGAGGAGTTTCATGGACAGGAGGGAGTGAACTCCTCATGGTGGTGG
TGATGATGATGCCAGTTTTTTTGTGTGTGTTGTTTAACAATCGAGCGAGCGAAAGAGACA
AGA

QA 1 663 1 663
DS 

RD RS1G383JQ 437 0 0
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AGTTTCATGGACAGGAGGGAGTGAACTCCTCATGGTGGTGGTGATGATGATGCCAGTTTT
TTTGTGTGTGTTGTTTAACAATCGAGCGAGCGAAAGAGACAAGAAGGTTGAGAAGATTCG
GAAGAGTAAGAGAAAACTTGTTTTTTATTGTATTTTTTTTGTTTCTTATGTAACCGACTT
TTTTTTTTTCTCTTTTTGTTTTTTCTTTAATATTTTGGATATAATATTTAACTCTTTTAA
ATTTAAATTTATCTCAT

QA 1 437 1 437
DS 



AS 1 2

CO CL5584Contig1 372 2 1 U
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TTAGTTATTTATGTTTTCCTGTTTTATTAGTAGTTTATTGTGCTTGCAATTGTCTTGTAA
TTTGGCTATAAAGCCCCCCACATGTAACCCACGAAATTCTAAGGAGAATTGAACTCTCTC
CTTCATTATTAT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CX86JQ C 1
AF RS1CX86TF U 1
BS 1 372 RS1CX86TF

RD RS1CX86JQ 372 0 0
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ACTATCATACCAAGCTGTATGTGCCATCTTCCTCAAGTCACTTTCTCTCATGCTGTATGT
GCCATTGCAGTCTGCCCCAGCCAGTTCTGAACCTGCTCTGATCTCTCTTTCCCTACAAAA
TTAGTTATTTATGTTTTCCTGTTTTATTAGTAGTTTATTGTGCTTGCAATTGTCTTGTAA
TTTGGCTATAAAGCCCCCCACATGTAACCCACGAAATTCTAAGGAGAATTGAACTCTCTC
CTTCATTATTAT

QA 1 372 1 372
DS 

RD RS1CX86TF 372 0 0
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CTGGTTTGATTTGGACAAGAATAAGTCACATGGGTGCTTTGGAGAAGCAGCTGACCTGTC
ACTATCATACCAAGCTGTATGTGCCATCTTCCTCAAGTCACTTTCTCTCATGCTGTATGT
GCCATTGCAGTCTGCCCCAGCCAGTTCTGAACCTGCTCTGATCTCTCTTTCCCTACAAAA
TTAGTTATTTATGTTTTCCTGTTTTATTAGTAGTTTATTGTGCTTGCAATTGTCTTGTAA
TTTGGCTATAAAGCCCCCCACATGTAACCCACGAAATTCTAAGGAGAATTGAACTCTCTC
CTTCATTATTAT

QA 1 372 1 372
DS 



AS 1 2

CO CL5585Contig1 373 2 1 U
GCACCGCCACCGCCGCCGCCACATTACTCGTTACCTCCACCACCGCACTCACCACCACCA
CCGGTTTATCACTATCCATCCCCACCACCTCCACCAACGCCAGTATATTCTCCTCCTCCT
CCTCCTTACTTTCACTAGTGACAAAAAAGGTGATGGTGAATGTGACTGTGACTCTCTCTC
TCTCTCTCTCTTCTATGGTGTTAACTTGTGGCAGCTCTTTAACCCCTACCTACTCTCCTA
CTAGTCGTTTCCCTTTCATGTTGTTGTGTACGGATGATTTTAGTATTTTTAAGGATCAAC
CCTACTCAAAACAAAAACAAAAATTACTCTTTTAAGTATGTATTTCTTTTAATTATATGT
TCAATGTTGTATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AG49JQ C 1
AF RS1AG49TF U 1
BS 1 373 RS1AG49TF

RD RS1AG49JQ 373 0 0
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CCGGTTTATCACTATCCATCCCCACCACCTCCACCAACGCCAGTATATTCTCCTCCTCCT
CCTCCTTACTTTCACTAGTGACAAAAAAGGTGATGGTGAATGTGACTGTGACTCTCTCTC
TCTCTCTCTCTTCTATGGTGTTAACTTGTGGCAGCTCTTTAACCCCTACCTACTCTCCTA
CTAGTCGTTTCCCTTTCATGTTGTTGTGTACGGATGATTTTAGTATTTTTAAGGATCAAC
CCTACTCAAAACAAAAACAAAAATTACTCTTTTAAGTATGTATTTCTTTTAATTATATGT
TCAATGTTGTATC

QA 1 373 1 373
DS 

RD RS1AG49TF 373 0 0
GCACCGCCACCGCCGCCGCCACATTACTCGTTACCTCCACCACCGCACTCACCACCACCA
CCGGTTTATCACTATCCATCCCCACCACCTCCACCAACGCCAGTATATTCTCCTCCTCCT
CCTCCTTACTTTCACTAGTGACAAAAAAGGTGATGGTGAATGTGACTGTGACTCTCTCTC
TCTCTCTCTCTTCTATGGTGTTAACTTGTGGCAGCTCTTTAACCCCTACCTACTCTCCTA
CTAGTCGTTTCCCTTTCATGTTGTTGTGTACGGATGATTTTAGTATTTTTAAGGATCAAC
CCTACTCAAAACAAAAACAAAAATTACTCTTTTAAGTATGTATTTCTTTTAATTATATGT
TCAATGTTGTATC

QA 1 373 1 373
DS 



AS 1 2

CO CL5586Contig1 1018 2 4 U
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TCGGGGTTGGTTTAGTTAATTCCGAGAAATGTCGCGTTTTCCGCGAGGGTTCGTGGAGAA
TTCGCCAATGGAGGAACCCAAAATCTCTGCTAGTCCAAGTATCTGCTTCAGGCCGATAAA
CCCTTCTGATTTAGAACGTCTGGAGCAAATCCATCGCGACATTTTCCCAATCAGGTATGA
GTCTGAGTTTTTTCAGAATGTTGTCAACGGTGGTGATATCCTCTCTTGGGCTGCTGTTGA
TCGGAGCCGCCCTGATAGTCTTTCTGACGAACTTATTGGTTTTGTTACTGCCAAAATCGG
GCCTGCTAAAGAAACCGAAATATCAGATTTAATAAGATATGACTCGTGTAAGGGAGAGGA
GACATTGGTGTACATTCTAACGCCTGGAGTTGTAGAAAGCTACAGAAAGCGTGGAATAGC
TAAGTTGCTTATTAAGGAGGTCATCAAATATGCTTCTAGTATCCCTGTGTGCCGTGGTGT
TTACCTTCATGTGATTGCACACAACAGCCCCGCAATCCGATTGTACAAAAGAATGTCTTT
CAGATGTGTGAGGAGGTTACACGGATTCTACATAATCAATGGCCAGCATTTCGATTCTTT
CTTGTTCGTCTACTTTATCAATGGTTCTCGCTCTCCTTGCTCACCCTTTGATCTTCTGGT
GTTGGTTCTGAATTATATGAGGAGCGGAATCAAATCAGTGGCATCAAAGCTAACAATGAA
GCACGAAGAGAAAGGCTTGAAATGGATTAAATGCAAAGACATGACGAGGTGTCTCATGCC
TACTCAGACCAAAAGAAACCTTGCGTCTGAAAGAGTATCATCCGGCTACGATTACGTTTA
GTATTTGGTCTTTGATTCATAGACTTTGTAAACTCATTCATTTACATGTCTTCATTAAGC
TCTGGTTATATGATCCTATTGTGGTATGTAATAAAAATGTAAATATTGTGTGATTAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1F940TF U 1
AF RS1F940JQ C 317
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BS 610 1018 RS1F940JQ

RD RS1F940TF 609 0 0
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GTCTGAGTTTTTTCAGAATGTTGTCAACGGTGGTGATATCCTCTCTTGGGCTGCTGTTGA
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TTACCTTCATGTGATTGCACACAACAGCCCCGCAATCCGATTGTACAAAAGA*TGTCTTT
CAGATGTGT

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DS 

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TTACACGGATTCTACATAATCAATGGCCAGCATTTCGATTCTTTCTTGTTCGTCTACTTT
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ATGAGGAGCGGAATCAAATCAGTGGCATCAAAGCTAACAATGAAGCACGAAGAGAAAGGC
TTGAAATGGATTAAATGCAAAGACATGACGAGGTGTCTCATGCCTACTCAGACCAAAAGA
AACCTTGCGTCTGAAAGAGTATCATCCGGCTACGATTACGTTTAGTATTTGGTCTTTGAT
TCATAGACTTTGTAAACTCATTCATTTACATGTCTTCATTAAGCTCTGGTTATATGATCC
TATTGTGGTATGTAATAAAAATGTAAATATTGTGTGATTAGA

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 2

CO CL5587Contig1 718 2 2 U
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TTGCGATCGCCGATTTATCCCTTCATCGCCGCGATCGAACTCTTTAATCAATCGGAGTTA
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AATACAAACAGCAATGATTCGAGTAACTTCGAATGTAACATCTGCTTTGACTTGGCTCAA
GACCCCATTGTGACTCTCTGTGGTCACTTGTTCTGTTGGCCTTGCTTGTACAAATGGCTC
CATCTCCACTCCACCTCAAGTGAATGTCCCGTTTGTAAAGCCGTGATCCAAGAAGACAGG
TTGGTTCCTCTGTACGGTAGAGGCAAATCATCTACCGACCCTAGGTCCAAGTCCATTCCT
GGAATCCAAGTGCCGAACCGTCCATCCGGACAGAGACCCGAAACAGCGCAACCTCCCGAG
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GTTGCGAGTGCTCGGTTCGGTAACTTTACCGCGTTGCCTGCAGCGTTTGGAGGTTTGATA
CCTTCGTTGTTCAACCTCCATTTCCATGGGTTCCCTGATGCAGCCATGTATGGAGCTGCT
GCTGCTGCTGCTTCTGGTGGTTTCCCTCACGGGTTTTCAAACCCTTTCCATGGGGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AE87TF U 1
AF RS1AE87JQ C 396
BS 1 695 RS1AE87TF
BS 696 718 RS1AE87JQ

RD RS1AE87TF 695 0 0
GGGTCCCCTCCCTGCCTCCGGCCAATCTTAGCCCTTAAGCGAACTTTGCTCCTCCCAGGA
TTGCGATCGCCGATTTATCCCTTCATCGCCGCGATCGAACTCTTTAATCAATCGGAGTTA
GAGAATCAGATGTTCGTCTGGTGAATCATGTCTGATATACCTTCTTGTTCTAGCGGCAAC
AATACAAACAGCAATGATTCGAGTAACTTCGAATGTAACATCTGCTTTGACTTGGCTCAA
GACCCCATTGTGACTCTCTGTGGTCACTTGTTCTGTTGGCCTTGCTTGTACAAATGGCTC
CATCTCCACTCCACCTCAAGTGAATGTCCCGTTTGTAAAGCCGTGATCCAAGAAGACAGG
TTGGTTCCTCTGTACGGTAGAGGCAAATCATCTACCGACCCTAGGTCCAAGTCCATTCCT
GGAATCCAAGTGCCGAACCGTCCATCCGGACAGAGACCCGAAACAGCGCAACCTCCCGAG
CCAAACCATGGGTTTGGTCATCACGGTTTTGGTGGGTTCATGGGAGGTTTTGCAGCTCCC
GTTGCGAGTGCTCGGTTCGGTAACTTTACCGCGTTGCCTGCAGCGTTTGGAGGTTTGATA
CCTTCGTTGTTCAACCTCCATTTCCATGGGTTCCCTGATGCAGCCATGTATGGAGCTGCT
GCTGCTGCTGCTTCTGGTGGTTTCCCTCACGGGTT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1AE87JQ 323 0 0
CGACCCTAGGTCCAAGTCCATTCCTGGAATCCAAGTGCCGAACCGTCCATCCGGACAGAG
ACCCGAAACAGCGCAACCTCCCGAGCCAAACCATGGGTTTGGTCATCACGGTTTTGGTGG
GTTCATGGGAGGTTTTGCAGCTCCCGTTGGGAGTGCTCGGTTCGGTAACTTTACCGCGTT
GCCTGCAGGGTTTGGAGGTTTGATACCTTCGTTGTTCAACCTCCATTTCCATGGGTTCCC
TGATGCAGCCATGTATGGAGCTGCTGCTGCTGCTGCTTTTGGTGGTTTCCCTCACGGGTT
TTCAAACCCTTTCCATGGGGGAC

QA 1 323 1 323
DS 



AS 1 2

CO CL5588Contig1 958 2 2 U
GGGAGCAGAAACAAACAAACCCTAGAGTTCAGACGATGATGATGAGAAGTCTCTTTTCCG
GCGCCAAGCGGCTATCAACTCCGTCACTAATCTCGACGACCACAAGAAGCTACAGCCTCA
TTCCGATGGTAATCGAGCACTCGTCGCGAGGAGAGAGAGCCTACGACATCTTCTCTCGCT
TGCTCAAGGAGCGTATCATCTGCATCAACGGCCCAATCAACGACGACACCTCCCACGTCG
TCGTAGCTCAGCTCCTCTTCCTCGAATCCGAGAACCCTTCCAAGCCGATCCATATGTATC
CCAATTCACCCGGAGGCCACGTCACCGCCGGTCTAGCAATTTATGATACTATGCAGTACA
TTCGTTCTCCGATAAGCTCAATCTGTTTAGGCCAGGCTGCATCGATGGCCTCTCTCCTCT
TGGCAGCTGGCGCCAAGGGACAGAGGCGGTCGCTGCCTAACGCGACGGTTATGATTCATC
AGCCTTCGGGTGGGTATAGCGGTCAGGCCAAGGATATAACGATTCATACGAAGCAGATTG
TTCGTGTGTGGGATGCGTTGAATGGTCTGTATGCCAAACACACGGGTCAGCCTATTGATT
TGATCGCGGAGAACATGGATAGGGATAACTTCATGACTCCTGAGGAGGCTAAGGCGTTTG
GGATAATCGATGAGGTGATTGATGAGAGGCCGTTGGAGTTGGTGAAAGATGCAGTTGGGA
GTGGAAGCAAAGATGATAAGAAGAGTTCGAGTTAAAGGAAGAAGTAATGCTGGTAAATCA
AAAGTACCTTCTTTTTTTGCTTTGCTTCAGTTAGATCACACTTTTCTTCTATGGATGAAT
ATTGATGCACTGCAGGGGCGTGATCTCTTAAAAACTTCTTTTAATAAATCGTTCATGTTG
TTTCAGTACTCTTTTTTTCCTTTGGGTGTTTTTACACAGTTTCATATCTGATTTGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GV35TF U 1
AF RS1GV35JQ C 485
BS 1 580 RS1GV35TF
BS 581 958 RS1GV35JQ

RD RS1GV35TF 580 0 0
GGGAGCAGAAACAAACAAACCCTAGAGTTCAGACGATGATGATGAGAAGTCTCTTTTCCG
GCGCCAAGCGGCTATCAACTCCGTCACTAATCTCGACGACCACAAGAAGCTACAGCCTCA
TTCCGATGGTAATCGAGCACTCGTCGCGAGGAGAGAGAGCCTACGACATCTTCTCTCGCT
TGCTCAAGGAGCGTATCATCTGCATCAACGGCCCAATCAACGACGACACCTCCCACGTCG
TCGTAGCTCAGCTCCTCTTCCTCGAATCCGAGAACCCTTCCAAGCCGATCCATATGTATC
CCAATTCACCCGGAGGCCACGTCACCGCCGGTCTAGCAATTTATGATACTATGCAGTACA
TTCGTTCTCCGATAAGCTCAATCTGTTTAGGCCAGGCTGCATCGATGGCCTCTCTCCTCT
TGGCAGCTGGCGCCAAGGGACAGAGGCGGTCGCTGCCTAACGCGACGGTTATGATTCATC
AGCCTTCGGGTGGGTATAGCGGTCAGGCCAAGGATATAACGATTCATACGAAGCAGATTG
TTCGTGTGTGGGATGCGTTGAATGGTCTGTATGCCAAACA

QA 1 580 1 580
DS 

RD RS1GV35JQ 474 0 0
TTCGGGTGGGTATAGCGGTCAGGCCAAGGATATAACGATTCATACGAAGCAGATTGTTCG
TGTGTGGGATGCGTTGAATGGTCTGTATGCCAAACACACGGGTCAGCCTATTGATTTGAT
CGCGGAGAACATGGATAGGGATAACTTCATGACTCCTGAGGAGGCTAAGGCGTTTGGGAT
AATCGATGAGGTGATTGATGAGAGGCCGTTGGAGTTGGTGAAAGATGCAGTTGGGAGTGG
AAGCAAAGATGATAAGAAGAGTTCGAGTTAAAGGAAGAAGTAATGCTGGTAAATCAAAAG
TACCTTCTTTTTTTGCTTTGCTTCAGTTAGATCACACTTTTCTTCTATGGATGAATATTG
ATGCACTGCAGGGGCGTGATCTCTTAAAAACTTCTTTTAATAAATCGTTCATGTTGTTTC
AGTACTCTTTTTTTCCTTTGGGTGTTTTTACACAGTTTCATATCTGATTTGAGC

QA 1 474 1 474
DS 



AS 1 2

CO CL5589Contig1 867 2 2 U
GAAACCACATCAATGGCATCATCATCCATTATCATCCCTCCGTTCCTCTCAGCTTCCATC
AGCCGTCGCAACCTCCTCCTCTCCACCACCACGATCGCCACCGTATCTCCCTCCCCTCAG
ATCCCTTCCCCACCAGACGTAACAATCACCGACCGCGTCTTCCTCGATTTCTCCCTCTGC
CCAACTTACTTCCGCTCTGATCCCTCCTCCACACTCTCCTCCACCACTCCTTGCCCCGAC
TCCACTCCCCTCGGCCGCGTCGTTCTCGGTCTATACGGCCGTCACGTTCCTCTCACTGTC
TCCACTTTCAGACTCATGTGCACTTCCTCCTCCTCCTCCTCTACCTCTTACAAGAACACT
CCCATTCACAAAATCTTCCCCGGTCAGTTTTTCCTCGCCGGAAGACAAGGATTACGGCGA
GTCACGGCGGAGGTCGGTCCTCTTCTGAAGAGTTTGCCTCGGAACACCGACGTCGTCAAT
TCCAAGTCGTTCCTCATCCCTCACGCTCGTCCCGGACTCGTCTCTCTTTGCTTGTCTGAA
AACGACGACGACGATGAGACCAGACTCGATCCTGAGTACAGAAACGTCGAGTTCTTGATC
ACTACGGGACCTGGTCCTTGTCCGCAGCTCGACGGTGGCAACATTGTCTTCGGTACTGTT
CTTGAAGGGTTAGATGTGGTGACGAGTATAGCTGCGGTGCCAACTTTTAAGCCGTCGGAG
AAGATTCGACAGTTCAACGATTTCGCAGAGTTTCTGGGAGACGAAAGAGCTCAGAACGCA
AGATCATTGTGGAACAGACCTCTTAAGACGGTTTTCATTAGTGACTGTGGAGAGCTTAAG
GTCACTAAGCCTTCTCTCTCTCCTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CW07TF U 1
AF RS1CW07JQ C 315
BS 1 602 RS1CW07TF
BS 603 867 RS1CW07JQ

RD RS1CW07TF 602 0 0
GAAACCACATCAATGGCATCATCATCCATTATCATCCCTCCGTTCCTCTCAGCTTCCATC
AGCCGTCGCAACCTCCTCCTCTCCACCACCACGATCGCCACCGTATCTCCCTCCCCTCAG
ATCCCTTCCCCACCAGACGTAACAATCACCGACCGCGTCTTCCTCGATTTCTCCCTCTGC
CCAACTTACTTCCGCTCTGATCCCTCCTCCACACTCTCCTCCACCACTCCTTGCCCCGAC
TCCACTCCCCTCGGCCGCGTCGTTCTCGGTCTATACGGCCGTCACGTTCCTCTCACTGTC
TCCACTTTCAGACTCATGTGCACTTCCTCCTCCTCCTCCTCTACCTCTTACAAGAACACT
CCCATTCACAAAATCTTCCCCGGTCAGTTTTTCCTCGCCGGAAGACAAGGATTACGGCGA
GTCACGGCGGAGGTCGGTCCTCTTCTGAAGAGTTTGCCTCGGAACACCGACGTCGTCAAT
TCCAAGTCGTTCCTCATCCCTCACGCTCGTCCCGGACTCGTCTCTCTTTGCTTGTCTGAA
AACGACGACGACGATGAGACCAGACTCGATCCTGAGTACAGAAACGTCGAGTTCTTGATC
AC

QA 1 602 1 602
DS 

RD RS1CW07JQ 553 0 0
CATGTGCACTTCCTCCTCCTCCTCCTCTACCTCTTACAAGAACACTCCCATTCACAAAAT
CTTCCCCGGTCAGTTTTTCCTCGCCGGAAGACAAGGATTACGGCGAGTCACGGCGGAGGT
CGGTCCTCTTCTGAAGAGTTTGCCTCGGAACACCGACGTCGTCAATTCCAAGTCGTTCCT
CATCCCTCACGCTCGTCCCGGACTCGTCTCTCTTTGCTTGTCTGAAAACGACGACGACGA
TGAGACCAGACTCGATCCTGAGTACAGAAACGTCGAGTTCTTGATCACTACGGGACCTGG
TCCTTGTCCGCAGCTCGACGGTGGCAACATTGTCTTCGGTACTGTTCTTGAAGGGTTAGA
TGTGGTGACGAGTATAGCTGCGGTGCCAACTTTTAAGCCGTCGGAGAAGATTCGACAGTT
CAACGATTTCGCAGAGTTTCTGGGAGACGAAAGAGCTCAGAACGCAAGATCATTGTGGAA
CAGACCTCTTAAGACGGTTTTCATTAGTGACTGTGGAGAGCTTAAGGTCACTAAGCCTTC
TCTCTCTCCTTCT

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 2

CO CL5590Contig1 477 2 2 U
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AGACATGGGATGTTCAAGAACAGCTTCTTCAGACATCACTGCTTGGTGTTCTGCTGTTGT
GTTGTTGTCTCTAATACTTCTGTTATCCGTTCGAGAGAACAACGCTTCTAATGATTCGGT
CAGAGGGTTTCAATTCTCAGAGAAACCTTGTGAAGAGATTTACGTCGTCGGAGAAGGAGA
AACGCTTCACACCATCGGAGATAAATGCGGCGACCCGTTTATTGTCGAGCGTAACCCGCA
TATCCATGACCTGGATGATGTCTTTCCCGGTCTTGTTCTCAGGATCGCACCTTTTTACTT
CTCTAGAAAAATTCAAAGTATTTGAAAAACGTTTCTTCTTTTCTTGTAGTTTTGTCTAAA
GCATACTCTCCCCTCTGTCTGTATGTATTTATGTATATACTAAAGGAGTTTTAAAAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AC78JQ C 1
AF RS1AC78TF U 191
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GTTGTTGTCTCTAATACTTCTGTTATCCGTTCGAGAGAACAACGCTTCTAATGATTCGGT
CAGAGGGTTTCAATTCTCAGAGAAACCTTGTGAAGAGATTTACGTCGTCGGAGAAGGAGA
AACGCTTCACACCATCGGAGATAAATGCGGCGACCCGTTTATTGTCGAGCGTAACCCGCA
TATCCATGACCTGGATGATGTCTTTCCCGGTCTTGTTCTCAGGATCGCACCTTTTTACTT
CTCTAGAAAAATTCAAAGTATTTGAAAAACGTTTCTTCTTTTCTTGTAGTTTTGTCTAAA
GCATACTCTCCCCTCTGTCTGTATGTATTTATGTATATACTAAAGGAGTTTTAAAAC

QA 1 477 1 477
DS 

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ACCATCGGAGATAAATGCGGCGACCCGTTTATTGTCGAGCGTAACCCGCATATCCATGAC
CTGGATGATGTCTTTCCCGGTCTTGTTCTCAGGATCGCACCTTTTTACTTCTCTAGAAAA
ATTCAAAGTATTTGAAAAACGTTTCTTCTTTTCTTGTAGTTTTGTCTAAAGCATACTCTC
CCCTCTGTCTGTATGTATTTATGTATATACTAAAGGAGTTTTAAAAC

QA 1 287 1 287
DS 



AS 1 2

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AAGATTTTCGAGAGGGCTTTAGCCGTTTACGACAAAGACACTCCCGACCGTTGGCAAAAC
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GATGTTGGAAGTAAATCACGAGGCATCAATGACTTTGATCTGAGGTTAATGAAGAATATG
AGAATCCAGTGAAGCACACATTGATATGAAGCAATACTGATATGCAAACATTCAGATGAA
TATATTCGCTTGCTGATGATTACTGATCATTGTCTCGTTATCTTTTCACTCTGCTACATA
TTTATTTGTCTTTCTTTTTTTCACATCAAATAAATCAAATTCTGTATCTATTATGGTTTT
GTTTTTT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BD30TF U 1
AF RS1BD30JQ C 245
BS 1 547 RS1BD30TF

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GTTTATAATACAAAAATGGCCTCAAGTTCTATGAGCCCGTCTTGGACGTCTAAACAAAAT
AAGATTTTCGAGAGGGCTTTAGCCGTTTACGACAAAGACACTCCCGACCGTTGGCAAAAC
GTGGCAAAAGCCGTCGGAAGTAAATCGGCAGAGGAAGTCAAACGTCACTACGACATTCTC
GTCGAAGATGTTAAGAACATCGAACAAGACTTAGTCCCTTTGCCCAAATACAAGACCATC
GATGTTGGAAGTAAATCACGAGGCATCAATGACTTTGATCTGAGGTTAATGAAGAATATG
AGAATCCAGTGAAGCACACATTGATATGAAGCAATACTGATATGCAAACATTCAGATGAA
TATATTCGCTTGCTGATGATTACTGATCATTGTCTCGTTATCTTTTCACTCTGCTACATA
TTTATTTGTCTTTCTTTTTTTCACATCAAATAAATCAAATTCTGTATCTATTATGGTTTT
GTTTTTT

QA 1 547 1 547
DS 

RD RS1BD30JQ 303 0 0
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TTGGAAGTAAATCACGAGGCATCAATGACTTTGATTTGAGGTTAATGAAGAATATGAGAA
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TTCGCTTGCTGATGATTACTGATCATTGTCTCGTTATCTTTTCACTTTGCTACATATTTA
TTTGTCTTTTTTTTTTTCACATCAAATAAATCAAATTCTGTATTTATTATGGTTTTGTTT
TTT

QA 1 303 1 303
DS 



AS 1 2

CO CL5592Contig1 1179 2 4 U
GTACCTCATCAGACCCTTCTAAGGCAAAGAATGCTAATCCAACTGAAGTCAGGAGGATAT
TCACAATGGGACTTCCTTTCACATCACACCATGCTGGACAGATTCTCTTTGGTCCTTCAG
ATGGGTACTTATACTTTATGATGGGAGATGGAGGTGGAGGCGCAGACCCTTATAACTTCT
CACAGAACAAGAAGTCTCTGCTTGGGAAGATCATGAGGCTTGATGTAGATAACATTCCTA
GTGCTTCTGATATCTCCAGAAGAGGTCTCTGGGGAAACTACTCTATACCTAAAGACAACC
CTTTCCGTGAAGACAAGGAGCTTGAGCCTGAGATATGGGCTGTTGGACTGAGAAACCCTT
GGAGATGCAGCTTTGATTCTTCTAGGCCTTCCTACTTCATGTGTGCTGATGTTGGACAGG
ACACGTATGAGGAGGTGGATCTCATTACTAAAGGAGGAAACTACGGTTGGCGTGTTTATG
AAGGACCTGAGCTTTTTCATCCTGAGTCATCTCCTGGAGGTAACACATCTGCTAAATCCA
TAAACTCTATATTTCCAGTGATGGGTTACAACCACTCTGAAGTTGACTCAAGCGGAAAAT
CAGCTTCAATCACTGGAGGATACTTTTATAGATCAGAGACTGATCCTTGCTTAGATGGAA
TGTACTTGTATGCTGATCTTTATGGAAATGGAGTGTGGGCAGGGATTGAAACGCCTGCTA
TAGCGGGAACTTTGTGTCACACAGGATAACCTTCAGCTGCGCCAGTGACTCACCAATGAA
ATGCGAAGATTCTCCGGGGACTTCAGGGGTAACACTAGGCTATATCTTCTCGTTTGGTGA
GGACAACAACAAAGACATCTACTTGCTCACACAAAATGGTGTCTATAGAGTTATTAGGCC
TAGCCGCTGCAACTTGGCTTGCTCCAAGGAGAGCTCCACAGCGGCTAGAAGAAACCCTGG
TCCCTCGGTTTCTCCTTCTTCTTCTTCGTCTTCTTGTTATGGTTTCCATGGAAGCTTGGT
GTCTTTGTCTTTGATTCTGCTGGCTTTGTTAGTGTAATTTGTATGTAGCTTTGTTATTCA
ATTTGTATGATCAGGGATGTTATGAGAGAATACAATACACAAGACATACATGTAACGATG
AATTGAGACAAATTGAGGAGACATTTACAGATTTATGCT


BQ
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AF RS1B515TF U 1
AF RS1B515JQ C 396
BS 1 659 RS1B515TF
BS 660 660 RS1B515JQ
BS 661 689 RS1B515TF
BS 690 1179 RS1B515JQ

RD RS1B515TF 689 0 0
GTACCTCATCAGACCCTTCTAAGGCAAAGAATGCTAATCCAACTGAAGTCAGGAGGATAT
TCACAATGGGACTTCCTTTCACATCACACCATGCTGGACAGATTCTCTTTGGTCCTTCAG
ATGGGTACTTATACTTTATGATGGGAGATGGAGGTGGAGGCGCAGACCCTTATAACTTCT
CACAGAACAAGAAGTCTCTGCTTGGGAAGATCATGAGGCTTGATGTAGATAACATTCCTA
GTGCTTCTGATATCTCCAGAAGAGGTCTCTGGGGAAACTACTCTATACCTAAAGACAACC
CTTTCCGTGAAGACAAGGAGCTTGAGCCTGAGATATGGGCTGTTGGACTGAGAAACCCTT
GGAGATGCAGCTTTGATTCTTCTAGGCCTTCCTACTTCATGTGTGCTGATGTTGGACAGG
ACACGTATGAGGAGGTGGATCTCATTACTAAAGGAGGAAACTACGGTTGGCGTGTTTATG
AAGGACCTGAGCTTTTTCATCCTGAGTCATCTCCTGGAGGTAACACATCTGCTAAATCCA
TAAACTCTATATTTCCAGTGATGGGTTACAACCACTCTGAAGTTGACTCAAGCGGAAAAT
CAGCTTCAATCACTGGAGGATACTTTTATAGATCAGAGACTGATCCTTGCTTAGATGGA*
TGTACTTGTATGCTGATCTTTATGGAAAT

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1B515JQ 784 0 0
TTCATGTGTGCTGATGTTGGACAGGACACGTATGAGGAGGTGGATCTCATTACTAAAGGA
GGAAACTACGGTTGGCGTGTTTATGAAGGACCTGAGCTTTTTCATCCTGAGTCATCTCCT
GGAGGTAACACATCTGCTAAATCCATAAACTCTATATTTCCAGTGATGGGTTACAACCAC
TCTGAAGTTGACTCAAGCGGAAAATCAGCTTCAATCACTGGAGGATACTTTTATAGATCA
GAGACTGATCCTTGCTTAGATGGAATGTACTTGTATGCTGATCTTTATGGAAATGGAGTG
TGGGCAGGGATTGAAACGCCTGCTATAGCGGGAACTTTGTGTCACACAGGATAACCTTCA
GCTGCGCCAGTGACTCACCAATGAAATGCGAAGATTCTCCGGGGACTTCAGGGGTAACAC
TAGGCTATATCTTCTCGTTTGGTGAGGACAACAACAAAGACATCTACTTGCTCACACAAA
ATGGTGTCTATAGAGTTATTAGGCCTAGCCGCTGCAACTTGGCTTGCTCCAAGGAGAGCT
CCACAGCGGCTAGAAGAAACCCTGGTCCCTCGGTTTCTCCTTCTTCTTCTTCGTCTTCTT
GTTATGGTTTCCATGGAAGCTTGGTGTCTTTGTCTTTGATTCTGCTGGCTTTGTTAGTGT
AATTTGTATGTAGCTTTGTTATTCAATTTGTATGATCAGGGATGTTATGAGAGAATACAA
TACACAAGACATACATGTAACGATGAATTGAGACAAATTGAGGAGACATTTACAGATTTA
TGCT

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 2

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ATTTGCAGGGAGGGCAAAGATGGGGGACAAAGAGTTATACTTCTTCTGTCAAAGGGACAG
GAAATACCCGACCGGGCTGAGGACGAGCCGTGCAACCGAGTCCGGCTACTGGAAAGCGAC
CGGGAAGGACAAGGAGATCTTCAAAGGCAAAGGTTGTCTCGTTGGGATGAAGAAAACACT
TGTGTTTTATAGAGGAAGAGCTCCACGAGGTGAAAAGACTAATTGGGTCATGCATGAGTA
TCGTCTTGAAGGCAAATATTCTTACCACAATCTCCCAAAGTCTGCAAGGGATGAGTGGGT
CGTGTGTAGGGTTTTCCACAAGAACAATCCTGCTACTACAACCCAACAAATGACGAGAAT
ACCCCTTGAAAATCTAACGAGAATGGATTCTCTAGATAACATTGACCATCTCCTAGACTT
CTCATCTCTTCCACCTCTCATGGATCCGAGTTTCACGGGCCAACCTGAACAACACAACTT
CAAATCCACCAGCCCTCCAACCTACGACATCGTCTCATCACCAATCCAACCTCGTCACTT
CAACTCTAGTTACCAGTCAATCTTTGACCACCAGGGTTTCGGTTCTGGTTCCGGATCTTC
ATATAACAACAACAACAAAGAGATGATCAAGATGGAGCACTCGCTTGTTAGTGTATCTCA
AGAAACGTGCCTGAGCTCAGATGTGAATGCAGCCACGGCCACGGAGGTATCTTCGGTTCC
GGCAATGAAGCAAGAGATGAGTATGATGGGAATGATGAATGGTAGCAAGTCTTATGACGA
TCTATGTGACTTAAGAGGGATTTTATGGGACTACTGATTAGCTTTAGTCTGGGAGAATTA
TAGTTAATTAATGATTCAATTGTGATTAAAGAGTGTATTCGTTGGGTTTTAAATTATGTA
GTTAATACATTACATATAGGATTTGCTAGGGGGTTAATCCTATGTATTATCTTCGCTTCA
TTGATCTTATTTAGTTGATTGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1A734TF U 1
AF RS1A734JQ C 424
BS 1 713 RS1A734TF
BS 714 984 RS1A734JQ

RD RS1A734TF 713 0 0
ATTTGCAGGGAGGGCAAAGATGGGGGACAAAGAGTTATACTTCTTCTGTCAAAGGGACAG
GAAATACCCGACCGGGCTGAGGACGAGCCGTGCAACCGAGTCCGGCTACTGGAAAGCGAC
CGGGAAGGACAAGGAGATCTTCAAAGGCAAAGGTTGTCTCGTTGGGATGAAGAAAACACT
TGTGTTTTATAGAGGAAGAGCTCCACGAGGTGAAAAGACTAATTGGGTCATGCATGAGTA
TCGTCTTGAAGGCAAATATTCTTACCACAATCTCCCAAAGTCTGCAAGGGATGAGTGGGT
CGTGTGTAGGGTTTTCCACAAGAACAATCCTGCTACTACAACCCAACAAATGACGAGAAT
ACCCCTTGAAAATCTAACGAGAATGGATTCTCTAGATAACATTGACCATCTCCTAGACTT
CTCATCTCTTCCACCTCTCATGGATCCGAGTTTCACGGGCCAACCTGAACAACACAACTT
CAAATCCACCAGCCCTCCAACCTACGACATCGTCTCATCACCAATCCAACCTCGTCACTT
CAACTCTAGTTACCAGTCAATCTTTGACCACCAGGGTTTCGGTTCTGGTTCCGGATCTTC
ATATAACAACAACAACAAAGAGATGATCAAGATGGAGCACTCGCTTGTTAGTGTATCTCA
AGAAACGTGCCTGAGCTCAGATGTGAATGCAGCCACGGCCACGGAGGTATCTT

QA 1 713 1 713
DS 

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ATCTCTTCCACCTCTCATGGATCCGAGTTTCACGGGCCAACCTGAACAACACAACTTCAA
ATCCACCAGCCCTCCAACCTACGACATCGTCTCATCACCAATCCAACCTCGTCACTTCAA
CTCTAGTTACCAGTCAATCTTTGACCACCAGGGTTTCGGTTCTGGTTCCGGATCTTCATA
TAACAACAACAACAAAGAGATGATCAAGATGGAGCACTCGCTTGTTAGTGTATCTCAAGA
AACGTGCCTGAGCTCAGATGTGAATGCAGCCACGGCCACGGAGGTATCTTCGGTTCCGGC
AATGAAGCAAGAGATGAGTATGATGGGAATGATGAATGGTAGCAAGTCTTATGACGATCT
ATGTGACTTAAGAGGGATTTTATGGGACTACTGATTAGCTTTAGTCTGGGAGAATTATAG
TTAATTAATGATTCAATTGTGATTAAAGAGTGTATTCGTTGGGTTTTAAATTATGTAGTT
AATACATTACATATAGGATTTGCTAGGGGGTTAATCCTATGTATTATCTTCGCTTCATTG
ATCTTATTTAGTTGATTGTGC

QA 1 561 1 561
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGATCCGTGTCCAGTGGTGTCTGTCCTAGGTGTCTGTGTATCTGCTTCATCTTCGATCAG
GAAAAAATGGCAGAGAAGGCAGAGTTGTTGGAGTGGCCAAAGAAGGATAAGCGTCGTTTT
CTCCATGTTGTCTACCGCGTTGGTGATCTTGATCGCACTATCCAGTTTTACACTGAGTGC
TTTGGGATGAAGGTGTTGAGGAAAAGAGATGTCCCTGAGGAGAAGTACTCTAATGCTTTC
CTTGGTTTTGGTCCTGAAACTTCCAACTTCGTCGTCGAGCTCACATACAATTATGGTGTT
ACCTCGTATGACATTGGGACTGGATTTGGGCATTTCGCCATTTCCACACAAGATGTTGCC
AAGATGGTTGAGACTGTCCGTGCCAAGGGTGGAAATGTCACCAGAGAGCCTGGTCCTGTC
AAAGGTGGAAACAGTGTCATTGCCTTTGTGAAGGACCCTGATGGTTACACTTTTGAGCTC
ATCCAGAGAAGGATTGAGAGACCTGAATACAAGTACACCATAGGCATGATGGGATATGCT
GAGGAACATGAGTCGATAGTTTTGGAGCTGACCTATAACTACGGTGTGACTGAGTACACA
AAGGGCAATGCGTATGCACAGATTGCAATAGGCACGGATGATGTGTACAAAAGCGGTGAA
GTTGTGAAGATAATGAACCAAGAGCTAGGAGGAAAGACCACTAGAGAAGCCGGACCTCTT
CCTGGACTCGGCACCAAGATTGTCTCGTTCCTCGATCCTGATGGCTGGAAAACAGTTTTG
GTAGACAATGAAGATTTTTTGAAGGAACTGGAATGAGGAGAGAGAGAGGGATGATGATGG
TCAAGATCACAGCTAAAACGTAACCATAATAATAAAATATGTGATCTTATCAAAGTAGAG
AGAAGACTTAGTATTTGATCTAAATAAGACGTTGGTGGTTCAGTTTGTGTGTTGTGTTCT
ATGTGCTCGTTCCTTTTGTCTTTTGAGCTAAAACTCTGTTACGTTCCTGAATAAAATATA
TACACCACCTGGTTTTGGTGTTTACCG


BQ
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AF RS1C539TF U 1
AF RS1C539JQ C 316
BS 1 685 RS1C539TF
BS 686 1047 RS1C539JQ

RD RS1C539TF 685 0 0
GGATCCGTGTCCAGTGGTGTCTGTCCTAGGTGTCTGTGTATCTGCTTCATCTTCGATCAG
GAAAAAATGGCAGAGAAGGCAGAGTTGTTGGAGTGGCCAAAGAAGGATAAGCGTCGTTTT
CTCCATGTTGTCTACCGCGTTGGTGATCTTGATCGCACTATCCAGTTTTACACTGAGTGC
TTTGGGATGAAGGTGTTGAGGAAAAGAGATGTCCCTGAGGAGAAGTACTCTAATGCTTTC
CTTGGTTTTGGTCCTGAAACTTCCAACTTCGTCGTCGAGCTCACATACAATTATGGTGTT
ACCTCGTATGACATTGGGACTGGATTTGGGCATTTCGCCATTTCCACACAAGATGTTGCC
AAGATGGTTGAGACTGTCCGTGCCAAGGGTGGAAATGTCACCAGAGAGCCTGGTCCTGTC
AAAGGTGGAAACAGTGTCATTGCCTTTGTGAAGGACCCTGATGGTTACACTTTTGAGCTC
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GAGGAACATGAGTCGATAGTTTTGGAGCTGACCTATAACTACGGTGTGACTGAGTACACA
AAGGGCAATGCGTATGCACAGATTGCAATAGGCACGGATGATGTGTACAAAAGCGGTGAA
GTTGTGAAGATAATGAACCAAGAGC

QA 1 685 1 685
DS 

RD RS1C539JQ 732 0 0
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GTCCGTGCCAAGGGTGGAAATGTCACCAGAGAGCCTGGTCCTGTCAAAGGTGGAAACAGT
GTCATTGCCTTTGTGAAGGACCCTGATGGTTACACTTTTGAGCTCATCCAGAGAAGGATT
GAGAGACCTGAATACAAGTACACCATAGGCATGATGGGATATGCTGAGGAACATGAGTCG
ATAGTTTTGGAGCTGACCTATAACTACGGTGTGACTGAGTACACAAAGGGCAATGCGTAT
GCACAGATTGCAATAGGCACGGATGATGTGTACAAAAGCGGTGAAGTTGTGAAGATAATG
AACCAAGAGCTAGGAGGAAAGACCACTAGAGAAGCCGGACCTCTTCCTGGACTCGGCACC
AAGATTGTCTCGTTCCTCGATCCTGATGGCTGGAAAACAGTTTTGGTAGACAATGAAGAT
TTTTTGAAGGAACTGGAATGAGGAGAGAGAGAGGGATGATGATGGTCAAGATCACAGCTA
AAACGTAACCATAATAATAAAATATGTGATCTTATCAAAGTAGAGAGAAGACTTAGTATT
TGATCTAAATAAGACGTTGGTGGTTCAGTTTGTGTGTTGTGTTCTATGTGCTCGTTCCTT
TTGTCTTTTGAGCTAAAACTCTGTTACGTTCCTGAATAAAATATATACACCACCTGGTTT
TGGTGTTTACCG

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL5596Contig1 827 2 2 U
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AAAGAAATGGCGGCGACACAACTTACAGCATCACCAGTGACTGTGTCAGCCAGGAGCTTT
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ATCAAAGCCTCAAGGAGGTGAAGTCATTGCTGTTGGTGAAAGAAGAACTATTGGGAAGAC
CAAAGTTGATATCACTATCCCTACTGGAGCACAAATCATTTACTCCAAGTACGCAGGAAC
CGAGGTGGAGTTCAACGATGTGAAGCATCTCATTCTCAAGGAAGATGACATTGTTGGTCT
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TGCTGAAGCAGAGGAGAAAACAGCTGGAGGGTTGTTGCTTACCGAGACCACCAAAGAGAA
GCCTTCTATTGGCACGGTGATCAGTTGGACCAGGTACTCTAGATGAGGAAGGTAAGGTTC
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TTTCTTAGTTTATTATATCTTTTGTAAACCTGCAAAATTTGTATCCCAATTGTGGAATTT
TTTTCGTAGACGACCTGAGCATAATTTGAAATAAAGACTTGAATTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GI55TF U 1
AF RS1GI55JQ C 188
BS 1 475 RS1GI55TF
BS 476 827 RS1GI55JQ

RD RS1GI55TF 475 0 0
GGACTTCTGCAATTCTTAGGGTTTTATCCTCCAAAGTCACAGTCCTCTTCTCTTATCCTC
AAAGAAATGGCGGCGACACAACTTACAGCATCACCAGTGACTGTGTCAGCCAGGAGCTTT
GCCTCCCTGGATGGTCTCAGAGCTTCGAGTGCCATCAAGTTTGGAACTTTGAAACCAGGC
ACCCTTAAGCAGAGCCAGTTCCGTTCTTTGGTTGTCAGAGCTGCTTCCATCCACAGCTCA
ATCAAAGCCTCAAGGAGGTGAAGTCATTGCTGTTGGTGAAAGAAGAACTATTGGGAAGAC
CAAAGTTGATATCACTATCCCTACTGGAGCACAAATCATTTACTCCAAGTACGCAGGAAC
CGAGGTGGAGTTCAACGATGTGAAGCATCTCATTCTCAAGGAAGATGACATTGTTGGTCT
TCTTGAGACAGAGGATATCAAAGATCTCAAGCCCTTGAATGACCGTGTCTTCATT

QA 1 475 1 475
DS 

RD RS1GI55JQ 640 0 0
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CCTCAAGGAGGTGAAGTCATTGCTGTTGGTGAAAGAAGAACTATTGGGAAGACCAAAGTT
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GAGTTCAACGATGTGAAGCATCTCATTCTCAAGGAAGATGACATTGTTGGTCTTCTTGAG
ACAGAGGATATCAAAGATCTCAAGCCCTTGAATGACCGTGTCTTCATTAAGGTTGCTGAA
GCAGAGGAGAAAACAGCTGGAGGGTTGTTGCTTACCGAGACCACCAAAGAGAAGCCTTCT
ATTGGCACGGTGATCAGTTGGACCAGGTACTCTAGATGAGGAAGGTAAGGTTCAGCCACT
ATCGATATCGACTGGAAGCACAGTTCTCTACTCCAAGTATGCTGGTAACGACTTCAAGGG
CAAGGATGGTTCAAACTACATTGCCCTGAGAGCTTCAGATGTGATGGCTATCCTTTCTTA
GTTTATTATATCTTTTGTAAACCTGCAAAATTTGTATCCCAATTGTGGAATTTTTTTCGT
AGACGACCTGAGCATAATTTGAAATAAAGACTTGAATTCG

QA 1 640 1 640
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5598Contig1 1350 2 4 U
GGGGAAGAATGTGATGGGAGTGGCGACGAAGACGATGTATAGCATCGCCACCAAGACTGC
GTTTCGAAACAAAAACTCTACCCTCGCTACGCTCCTCCTCTACTCTCCTCAGGCTCGCTC
AATCTCCAGCCAAAGTGAACTAGTTAAACCCAAGAGAATGGTTGAGAAAGAAAACAAGAA
AGTAACTCGTGTTCTGTTTTGCGGCCCTCACTTTCCCGATTCCTACAATTTCACTAGAGA
TTACTTGCAGCCTTACCCTTTTATCCAGGCAGATGTTGCACATCTCCGTGATGTTCCTGA
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CTCTCGTGCCAGCAACATGAAGCTTCTTATGCGATTCGGTGTTGGTCTCGACGGTGTTGA
TATTGATGCTGCTACTAAACATGGGATCAAGGTCGCTAGAATCCCCAGTGAGGGTAACGG
AAACGCAATATCTTGTTCTGAAATGGCTATTTATCTAATGCTTGGCCTCCTTAAGAAACA
GAACGAAATGCAGATGGCTGTGCAAAGTAGACTACTTGGACAGCCAACCGGCGGAACGCT
TCTCGGGAAAACTGTGTTTATCTTGGGATATGGTAACATTGGAATAGAGCTGGCTAAACG
GTTGAAGCCGTTTGGGTCTAGAGTGATAGCTACCAAAAGAAGCTGGCCTGCTTCCATCAT
GGACTCAGACTCGAATCTAGTTGATGAGAAAGGTAGCCATAAAGACATTTTCACATTCGC
TAGCAAAGCAGATATAGTCGTTGTGTGCTTGAGGCTGAGCAAAGAAACGGCTGAAATCGT
GGACAACAAGTTCATATCTTCAATGAAAAAGGGTGCTCTTCTTGTAAATATTGCTAGAGG
CGGTCTGGTAAACTACGAATCAGCTTACCAAAGTCTGGAGTCCGGTCATCTTGGAGGCCT
AGGGACTGACGTGGCGTGGTCTGAGCCGTTTGATCCAAACGATCCGATCTTGAAGTTTAA
AAACGTAATCATGACCCCACATGTCGCTGGAGTTACTGAGTATTCATATAGGTCCATGGC
CAAGGTGGTCGGAGATGTTGCCTTACAATTTCATGAAGGACTTCCTCTCACCGGAATCGA
ACTTGTTAACTGATGAGATAGCTTTGACAAGAACCAAACCATGTTTACGCCATACTTTTT
GTATTGTATTTTATTTTACTCGAGTTACAGAGAAGCTTTTGTGACTAGTCTCTATTGATC
AGCGTCTTCAAGCTTCCTCACGACCTCTCTCATGTTTGGTCTGAGACTAGGGAGCTTTGT
AGTGCAGAGAAGACCCATTTTCAGAATCTC


BQ
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AF RS1CG29TF U 1
AF RS1CG29JQ C 596
BS 1 693 RS1CG29TF
BS 694 694 RS1CG29JQ
BS 695 703 RS1CG29TF
BS 704 1350 RS1CG29JQ

RD RS1CG29TF 703 0 0
GGGGAAGAATGTGATGGGAGTGGCGACGAAGACGATGTATAGCATCGCCACCAAGACTGC
GTTTCGAAACAAAAACTCTACCCTCGCTACGCTCCTCCTCTACTCTCCTCAGGCTCGCTC
AATCTCCAGCCAAAGTGAACTAGTTAAACCCAAGAGAATGGTTGAGAAAGAAAACAAGAA
AGTAACTCGTGTTCTGTTTTGCGGCCCTCACTTTCCCGATTCCTACAATTTCACTAGAGA
TTACTTGCAGCCTTACCCTTTTATCCAGGCAGATGTTGCACATCTCCGTGATGTTCCTGA
GGTTATAAAGAACTATCATATATGTGTGACTATGTTGATGCAAATGGATTCATATGTTAT
CTCTCGTGCCAGCAACATGAAGCTTCTTATGCGATTCGGTGTTGGTCTCGACGGTGTTGA
TATTGATGCTGCTACTAAACATGGGATCAAGGTCGCTAGAATCCCCAGTGAGGGTAACGG
AAACGCAATATCTTGTTCTGAAATGGCTATTTATCTAATGCTTGGCCTCCTTAAGAAACA
GAACGAAATGCAGATGGCTGTGCAAAGTAGACTACTTGGACAGCCAACCGGCGGAACGCT
TCTCGGGAAAACTGTGTTTATCTTGGGATATGGTAACATTGGAATAGAGCTGGCTAAACG
GTTGAAGCCGTTTGGGTCTAGAGTGATAGCTAC*AAAAGAAGC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1CG29JQ 755 0 0
AACGC
TCTCGGGAAAACTGTGTTTATCTTGGGATATGGTAACATTGGAATAGAGCTGGCTAAACG
GTTGAAGCCGTTTGGGTCTAGAGTGATAGCTACCAAAAGAAGCTGGCCTGCTTCCATCAT
GGACTCAGACTCGAATCTAGTTGATGAGAAAGGTAGCCATAAAGACATTTTCACATTCGC
TAGCAAAGCAGATATAGTCGTTGTGTGCTTGAGGCTGAGCAAAGAAACGGCTGAAATCGT
GGACAACAAGTTCATATCTTCAATGAAAAAGGGTGCTCTTCTTGTAAATATTGCTAGAGG
CGGTCTGGTAAACTACGAATCAGCTTACCAAAGTCTGGAGTCCGGTCATCTTGGAGGCCT
AGGGACTGACGTGGCGTGGTCTGAGCCGTTTGATCCAAACGATCCGATCTTGAAGTTTAA
AAACGTAATCATGACCCCACATGTCGCTGGAGTTACTGAGTATTCATATAGGTCCATGGC
CAAGGTGGTCGGAGATGTTGCCTTACAATTTCATGAAGGACTTCCTCTCACCGGAATCGA
ACTTGTTAACTGATGAGATAGCTTTGACAAGAACCAAACCATGTTTACGCCATACTTTTT
GTATTGTATTTTATTTTACTCGAGTTACAGAGAAGCTTTTGTGACTAGTCTCTATTGATC
AGCGTCTTCAAGCTTCCTCACGACCTCTCTCATGTTTGGTCTGAGACTAGGGAGCTTTGT
AGTGCAGAGAAGACCCATTTTCAGAATCTC

QA 6 755 6 755
DS 



AS 1 2

CO CL5599Contig1 429 2 1 U
CAAGTATCATCTCGTGCTACAGCTGATAATGATCAACACACGTATGCAGAGGAAAAAAAG
GATCAAACAAAACTTATGTTTCTGAAAACTCAAATTATCTAGAGCCCCTGTCTGTTCTTG
TCATCTCCATGTTTCTAACATCTTCGATTGTTTGCTTCTTCCGTTGGATCCACCTCTCAA
GCCTATCCCTATCTGCATCTGGAAGTTTACATGGTCGGTCCAGAAAAGGTACAGCTCTTG
ATTTTTCAAGTAAATCCCGCTCTTTTTGCTGCAAAGCAAGGCAATGTTCCTTCACAGACC
TCTTTAGCTGAAGGAGGCTTCACCGGTTTGAACTTCTGAAGCTTTGAGTACTCTGTGATG
AGATGAAACATGTAGTCATACACCCGGTTCATGCTAATGCTTTCCATGTAACCCTGTCCT
CTTTTTCCT


BQ
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AF RS1AO20JQ U 310
AF RS1DE36JQ U 1
BS 1 429 RS1DE36JQ

RD RS1AO20JQ 109 0 0
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ATGTAGTCATACACCCGGTTCATGCTAATGCTTTCCATGTAACCCTGTC

QA 1 109 1 109
DS 

RD RS1DE36JQ 429 0 0
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GATCAAACAAAACTTATGTTTCTGAAAACTCAAATTATCTAGAGCCCCTGTCTGTTCTTG
TCATCTCCATGTTTCTAACATCTTCGATTGTTTGCTTCTTCCGTTGGATCCACCTCTCAA
GCCTATCCCTATCTGCATCTGGAAGTTTACATGGTCGGTCCAGAAAAGGTACAGCTCTTG
ATTTTTCAAGTAAATCCCGCTCTTTTTGCTGCAAAGCAAGGCAATGTTCCTTCACAGACC
TCTTTAGCTGAAGGAGGCTTCACCGGTTTGAACTTCTGAAGCTTTGAGTACTCTGTGATG
AGATGAAACATGTAGTCATACACCCGGTTCATGCTAATGCTTTCCATGTAACCCTGTCCT
CTTTTTCCT

QA 1 429 1 429
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5601Contig1 1217 2 2 U
GGGGACGTTGCCAGGGTTCTGATGGTGGATATGGTGGTGGTCCTGGACAACTTCCCCATC
TTGCAACAAGTTATGCTGCAGTGAACACACTTGTTACTTTGGGAGGTGACAAAGCTTTTT
CTTCAATTAACAGAGAACAAATGGCTTGCTTCTTAAGACGAATGAAGGATACAAATGGAG
GCTTCAGGATGCACAATATGGGAGAAATAGATGTGCGAGCGTGCTACACTGCGATTTCGA
TTGCACGCATCCTGAACATTGTGGATGATGAACTCACCCGAGGCTTAGGAGATTACATCT
TGAGTTGCCAAACTTATGAAGGTGGCATTGGAGGGGAACCTGGCTCCGAAGCTCATGGTG
GGTACACCTACTGTGGGTTGGCTACTATGATTTTAATCAATGAAGTCGACCGCTTGAATT
TGGATTCATTAATGAATTGGGTTGTACATCGACAAGGAGTAGAAATGGGATTCCAAGGTA
GGACGAACAAATTGGTCGATGGTTGCTACACTTTTTGGCAGGCAGCCCCTTGTGTTCTAC
TTCAGCGATTTTTTTCATTCCGGGATCTGGTACGTCATGGATCATCACATATGTCACAAG
AGACAGATGAAGATCACGAGGAACATGCTCATGATGAAGATGATCCCGAAGACAGTGATG
AAGATGATTCTGAAGAGGACAGCGATGAAGATTCAGGGAATGGTCACCAAGTCCATCATA
CATCAACCTACATTAACAGAAGAGTTCAACCTGTTTTTGATAGCCTCGGCTTGCAAAGAT
ATGTGCTCGTGTGCTCTAAGGTTGCTGAGGGTGGATTTTGAGATAAGCTGAGGAAACCCC
GTGACTTTTACCACACATGTTACTGTTTAAGCGGTCTTTCCGTGGCTCAACACGCTTGGT
CAAAAGACGAGGACACTCCTCCTTTGACTCGTGACATTTTGGGTGGCTACGGAAACCACC
TTGAACCTGTTCACCTCCTCCACAACGTTGTCATGGATCGGTACAACGAAGCTATCGAGT
TCTTCCATAGAGCAGCATGACCCCTTCTCGTCACATACGGGAAACTCCTAAAGCCTGATT
GTATTTGTATTGAGAGAGTTTCTCGTTCTGTTGTATGTGTGTGTTTTCAGCAGAAGTTTT
ACCAATATAACCTATGGAAGAGTACGATTAAGTTTGTTTTAAAATAATATTACGATTCAA
TGATATCGATGATTGTT


BQ
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AF RS1FZ30JQ C 569
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TTGCAACAAGTTATGCTGCAGTGAACACACTTGTTACTTTGGGAGGTGACAAAGCTTTTT
CTTCAATTAACAGAGAACAAATGGCTTGCTTCTTAAGACGAATGAAGGATACAAATGGAG
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TTGCACGCATCCTGAACATTGTGGATGATGAACTCACCCGAGGCTTAGGAGATTACATCT
TGAGTTGCCAAACTTATGAAGGTGGCATTGGAGGGGAACCTGGCTCCGAAGCTCATGGTG
GGTACACCTACTGTGGGTTGGCTACTATGATTTTAATCAATGAAGTCGACCGCTTGAATT
TGGATTCATTAATGAATTGGGTTGTACATCGACAAGGAGTAGAAATGGGATTCCAAGGTA
GGACGAACAAATTGGTCGATGGTTGCTACACTTTTTGGCAGGCAGCCCCTTGTGTTCTAC
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AAGATGATTCTGA

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DS 

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TCATGATGAAGATGATCCCGAAGACAGTGATGAAGATGATTCTGAAGAGGACAGCGATGA
AGATTCAGGGAATGGTCACCAAGTCCATCATACATCAACCTACATTAACAGAAGAGTTCA
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GGGTGGATTTTGAGATAAGCTGAGGAAACCCCGTGACTTTTACCACACATGTTACTGTTT
AAGCGGTCTTTCCGTGGCTCAACACGCTTGGTCAAAAGACGAGGACACTCCTCCTTTGAC
TCGTGACATTTTGGGTGGCTACGGAAACCACCTTGAACCTGTTCACCTCCTCCACAACGT
TGTCATGGATCGGTACAACGAAGCTATCGAGTTCTTCCATAGAGCAGCATGACCCCTTCT
CGTCACATACGGGAAACTCCTAAAGCCTGATTGTATTTGTATTGAGAGAGTTTCTCGTTC
TGTTGTATGTGTGTGTTTTCAGCAGAAGTTTTACCAATATAACCTATGGAAGAGTACGAT
TAAGTTTGTTTTAAAATAATATTACGATTCAATGATATCGATGATTGTT

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DS 



AS 1 2

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GGGGATCTTATTATTCACTCTCTCCTTCCTCTCTGCTCTCCGCCCAAGTATCGCAGTTCC
GGCCACCAGAGAACACAAAGGGGTATCCAAGTATGGCTTCAGAGTCTCCGGTGAGGCACA
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ATAGAGGAAGACGTGAGAGGTCTGCTTCACCGTCAGATAGGAATAGTCGGAAGATTAGGC
GTTCACCAGGCAGACCTTCTGCATCAAGGCATGATGAGGGATCTAATGCAAGAGGGAGGG
GCGAGGAACCCAATGCTGAAGATGATTCGATTGCTAGAATGAAAGCAGCTGAAGAAGCTT
TGGCAAAGAAGAAAAAGGAAGAACCATCGTTTGAGCTATCAGGGAAACTTGCGGAAGAAA
CCAACAAATACAGAGGTATTCCACTCCTCTTCAATGAGCCACCAGAGGCTAGAAAGCCCA
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TCCATCGCCAAAGCTGCTACCTCTTTGGACGTGAGAGAAGAGTCGCTGACATTCCTACTG
ATCACCCTTCTTGCAGCAAGCAGCATGCTGTTATCCAGTACCGGGAAGTGACAGTGGAGA
AACCAGATGGCATGGTGGAGAAGCAAGTGAAGCCTTACCTTATGGATCTTGGCAGCACCA
ACAAGACTCACATCAACAAAGACCCTATTGAATCAGAACGCTACTATGAGCTGCGCGAGA
AAGATACCATCAAGTTTGGTAACAGCAGCCGAGAGTACGTACTGTTGCACGAGGGTTCTG
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AGAGGATAGTTGAGCAGCTTCGTTTCTACTTTCCTCAGATAGCGTATCTACTGTGTTGGC
TACACAGTCCCGACATTTTGTTAATACTTACCATTTTAGCATTTGCTTACCGACCCCCAA
TGTTAAATTTGAAAGAGATTTTAATTCC


BQ
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TGGCAAAGAAGAAAAAGGAAGAACCATCGTTTGAGCTATCAGGGAAACTTGCGGAAGAAA
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AT

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AGGGAAACTTGCGGAAGAAACCAACAAATACAGAGGTATTCCACTCCTCTTCAATGAGCC
ACCAGAGGCTAGAAAGCCCAACAAAAGATGGAGACTTTATGTTTTCAAGGATAGTGAACC
ACTGGATGAGCCACTCCAGCTCCATCGCCAAAGCTGCTACCTCTTTGGACGTGAGAGAAG
AGTCGCTGACATTCCTACTGATCACCCTTCTTGCAGCAAGCAGCATGCTGTTATCCAGTA
CCGGGAAGTGACAGTGGAGAAACCAGATGGCATGGTGGAGAAGCAAGTGAAGCCTTACCT
TATGGATCTTGGCAGCACCAACAAGACTCACATCAACAAAGACCCTATTGAATCAGAACG
CTACTATGAGCTGCGCGAGAAAGATACCATCAAGTTTGGTAACAGCAGCCGAGAGTACGT
ACTGTTGCACGAGGGTTCTGCGGAGTGAATTAAATCAGAGTCAAGCAGCAAGGAGATCGC
TTTTCTCAGGGGGTTTAAAGAGAGGATAGTTGAGCAGCTTCGTTTCTACTTTCCTCAGAT
AGCGTATCTACTGTGTTGGCTACACAGTCCCGACATTTTGTTAATACTTACCATTTTAGC
ATTTGCTTACCGACCCCCAATGTTAAATTTGAAAGAGATTTTAATTCC

QA 6 833 6 833
DS 



AS 1 2

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TTGAAGCTAGTTCAAACTAGTGGGAGGTTGATCCACGTTCTAACTTCAAATCCAAACTTA
AACACAAATCCAAACTTTAAATCATCATATAGAGATGGTTCGTGGAAAGATTCAGCTGAA
GAGGATTGAGAACCCGGTTCACAGACAAGTGACGTTCTGCAAGAGGAGAACCGGTCTTCT
CAAGAAGGCGAAGGAGCTCTCTGTGCTCTGCGACGCCGAGATTGGTGTTGTGATCCTTTC
TCCTCAAGGCAAGCTCTTTGAGCTTGCAACTAAAGGAACAATGGAGGGGGTGATTGATAA
GTACATGAAGTGTACTAGTGGAGGTTGCAGTTCTTCTTCTGCTACTTATACTGCTCAAGA
ACAACTTAAACCCCAGAATCATGATCCGAAAGATGAGGTTAATGTGCTTAAGCAAGAGAT
TGAGATGCTTCAGAAAGGAATAAGGTATAGGTTTGGAGGAGGAGAAGGGGCGATGAATCT
TGAAGAACTTCTTCTGCTTGAGAAGCATCTTGAGTATTGGATATCTCAGATCCGTTCTGC
TAAGATGGAGATTATGTTTCAAGAGATTCAGTCCTTGAGAAACAAGGAAGGAGTCCTCAA
AAATACCAACAAGTATCTCCTCGATAAGATAGAAGAGAACAACAACAGCATTTTATATGC
TAACCTCGCAACAGTGGAGACTAACTATTCTTATCCACTAGCCATGCCAAATGAAATATT
TCAGTTCTAGACCATGGGATATTTGAAGACTATGTCTTACGAATTCAAATACTCTTTGGT
AAGCATAATTAGTGTTGTTAAACCACACACAATATAATAAAGCCTGTGGTACTTTACTAG
GCTGTTGAAAATCTATTTGTAACTTTTTCCTCTTGTTTTGAATTTGTTGGTGTGAGCAAT
GAAATGACGACAAGTGTTGTTTACACTTTGTACTTAAACTCTTTCTA


BQ
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TGAGATGCTTCAGAAAGGAATAAGGTATAGGTTTGGAGGAGGAGAAGGGGCGATGAATCT
TGAAGAACTTCTTCTGCTTGAGAAGCATCTTGAGTATTGGATATCTCAGATCCGTTCTGC
TAAGATGGAGATTATGTTTCAAGAGATTCAGTCCTTGAGAAA

QA 1 642 1 642
DS 

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AAGCAAGAGATTGAGATGCTTCAGAAAGGAATAAGGTATAGGTTTGGAGGAGGAGAAGGG
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TACTTTACTAGGCTGTTGAAAATCTATTTGTAACTTTTTCCTCTTGTTTTGAATTTGTTG
GTGTGAGCAATGAAATGACGACAAGTGTTGTTTACACTTTGTACTTAAACTCTTTCTA

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DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AATGAGCATAGTGCTTATGTCACATTCAAAGATCCTCAAGGAGCAGAGACCGCTGTGCTC
TTATCTGGTGCAAGTATTGCCGATCAATCAGCCATCATTGAGATGGCTCCTAACTACACT
CCACCTACTGCCCCTCATGCTGAAACACAGAGCGGTGGCGGAGGCGTCGCAGAATCAGTT
GTCCAGAAGGCAGAAGATGTTGTGAGCAGTATGTTAGCAAAGGGTTTCATCCTCGGTAAA
GACGCGGTCGGCACCGAAAGCGTTCGATGAGAAACTCGGTTTCACTTCAACGGCAACCGC
AGGAGTTGCTTCTATAGACCAAAAAATCGGCCTAACCCAAAAAATCACAGCTGGTACAAG
CTTGGTGACCGAGAAGATCAAAGGAGTGGACCAAAGCTTCCAGGTCACAGAGAGGACCAA
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ATGAAAAATGTGGGATTTTTTTTTTTGTCTTTTGGATTGTAACATAAAAGCTATGTTTGG
ATCTTCTACATTCCTAGTTCGTGTTTCTTATAAGATATCATATAGTATTCACT


BQ
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AF RS1H583TF U 1
AF RS1H583JQB C 329
BS 1 468 RS1H583TF
BS 469 893 RS1H583JQB

RD RS1H583TF 468 0 0
GATGGTATCAAAGAGTTCTTCTCTTTCTCCGGTGATGTTGAAAGCATTGACATCCAAAGC
AATGAGCATAGTGCTTATGTCACATTCAAAGATCCTCAAGGAGCAGAGACCGCTGTGCTC
TTATCTGGTGCAAGTATTGCCGATCAATCAGCCATCATTGAGATGGCTCCTAACTACACT
CCACCTACTGCCCCTCATGCTGAAACACAGAGCGGTGGCGGAGGCGTCGCAGAATCAGTT
GTCCAGAAGGCAGAAGATGTTGTGAGCAGTATGTTAGCAAAGGGTTTCATCCTCGGTAAA
GACGCGGTCGGCACCGAAAGCGTTCGATGAGAAACTCGGTTTCACTTCAACGGCAACCGC
AGGAGTTGCTTCTATAGACCAAAAAATCGGCCTAACCCAAAAAATCACAGCTGGTACAAG
CTTGGTGACCGAGAAGATCAAAGGAGTGGACCAAAGCTTCCAGGTCAC

QA 1 468 1 468
DS 

RD RS1H583JQB 565 0 0
GAGAAACTCGGTTTCACTTCAACGGCAACCGCAGGAGTTGCTTCTATAGACCAAAAAATC
GGCCTAACCCAAAAAATCACAGCTGGTACAAGCTTGGTGACCGAGAAGATCAAAGGAGTG
GACCAAAGCTTCCAGGTCACAGAGAGGACCAAGTCTGCCTTTGCAACTGCGGAACAGACT
GTGAGCAGCGCGGGAACGGCCGTGATGAAGAACCGTTTTGTATTAACAGGTGTGAGCTGG
GCGGCAGGAGCGTTCAACAGAGTTGCTAAAGCGGCTGGAGAGGTTAGTCAGAAAACAAAA
GAAAAGGTTGAAGCTGAGCAACCACCACAACCGTCGCAGACAGAGCATCAACCACCAGAA
GGGTATTTTCCGATTCATTCGTTTGAATCGAAGCACTAATCTCATTACAGTGAAAAAGGT
TGCATTTTCTTTTTCTTGTTGGTTTCTTTGATATGAAAAATGTGGGATTTTTTTTTTTGT
CTTTTGGATTGTAACATAAAAGCTATGTTTGGATCTTCTACATTCCTAGTTCGTGTTTCT
TATAAGATATCATATAGTATTCACT

QA 1 565 1 565
DS 



AS 1 2

CO CL5606Contig1 1048 2 2 U
TTGAAGCAAAATCACGAATCAGAATCTCATCTTCGCCGCTCTCTCACTGACTGACAAAAA
TTTTGGCAGTTGGTAGAAGATATGTCGGAAGAAGTGGAGTACCGGTGCTTCATTGGTGGG
CTTGCGTGGGCAACGTCTGATCGTGGCCTCAGAGATGCCTTTGAGAAGTATGGTCACCTC
ACTGAGGCTAAGGTGGTTCTTGACAAGTTTTCTGGGCGTTCACGTGGTTTTGGGTTCATC
ACATTTGATGAGAAGAAAGCTATGGATGAAGCCATTGCGGCAATGAATGGGGTGGATTTA
GATGGGCGGACAATCACTGTTGATAAAGCTCAGCCACAGGGTGGTGGATCCGGCAGGGAT
CATGATGGTGACCGCAGTCGTGATCGTGATCGTGATCGCGGGTATGACCGTGACCGTAGC
CGTCCATCTGGTGGTGGGAGAGGTGGTTCAGGTGGCGGTGATTGCTTTAAATGTGGCAAG
CCTGGACATTTTGCGAGGGAGTGTCCTGATGAATCCGGTAGAGGTGGTGGTGGGGGAAGG
TACAGCTCGAGAGATGATAGGTACAGCTCTAGGGATGATAGGTACGGTGCAAAGGATGAT
AGGTATGGTGGAAAAGAAGATAGGTATGGTAGGGATCGGTATGGACCTGATCGCAGTGGG
GAACGCTTTGGTGGAGGACGTAGCAGGGATGATGGCAGCCGTGGGGGTTCAGGAGGTGAG
AGGCATGGCCGTGTTCCATACGATCGCCCCAGAGACTAGAATTCTTCTCCAGAGGTCAAA
CAAGTGGAAGGTTTCTGCTTTTCAGCTCTCATCAAGCGGGAAGTTAGATGGTCTGCTTTG
TTGAATGTATTTGGATAGCTCGAGAAAGAAGAATGTGTATCTGTTTTGGCACCTTAAACT
CAAGAGTCGGCTAATGTCCTAAGTACTCTCCTTTTGATATGTTGATCCTTTGGAAACCTT
GTGCTTAGTTGGTTTGAGATTGAGAGACACAAATGTGCTACTTTAAGCTTATCGTAATGA
ATGAGTTGGTTATCCCCAACACCAAAGG


BQ
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AF RS1DN57TF U 1
AF RS1DN57JQ C 289
BS 1 575 RS1DN57TF
BS 576 1048 RS1DN57JQ

RD RS1DN57TF 575 0 0
TTGAAGCAAAATCACGAATCAGAATCTCATCTTCGCCGCTCTCTCACTGACTGACAAAAA
TTTTGGCAGTTGGTAGAAGATATGTCGGAAGAAGTGGAGTACCGGTGCTTCATTGGTGGG
CTTGCGTGGGCAACGTCTGATCGTGGCCTCAGAGATGCCTTTGAGAAGTATGGTCACCTC
ACTGAGGCTAAGGTGGTTCTTGACAAGTTTTCTGGGCGTTCACGTGGTTTTGGGTTCATC
ACATTTGATGAGAAGAAAGCTATGGATGAAGCCATTGCGGCAATGAATGGGGTGGATTTA
GATGGGCGGACAATCACTGTTGATAAAGCTCAGCCACAGGGTGGTGGATCCGGCAGGGAT
CATGATGGTGACCGCAGTCGTGATCGTGATCGTGATCGCGGGTATGACCGTGACCGTAGC
CGTCCATCTGGTGGTGGGAGAGGTGGTTCAGGTGGCGGTGATTGCTTTAAATGTGGCAAG
CCTGGACATTTTGCGAGGGAGTGTCCTGATGAATCCGGTAGAGGTGGTGGTGGGGGAAGG
TACAGCTCGAGAGATGATAGGTACAGCTCTAGGGA

QA 1 575 1 575
DS 

RD RS1DN57JQ 760 0 0
GGGGTGGATTTAGATGGGCGGACAATCACTGTTGATAAAGCTCAGCCACAGGGTGGTGGA
TCCGGCAGGGATCATGATGGTGACCGCAGTCGTGATCGTGATCGTGATCGCGGGTATGAC
CGTGACCGTAGCCGTCCATCTGGTGGTGGGAGAGGTGGTTCAGGTGGCGGTGATTGCTTT
AAATGTGGCAAGCCTGGACATTTTGCGAGGGAGTGTCCTGATGAATCCGGTAGAGGTGGT
GGTGGGGGAAGGTACAGCTCGAGAGATGATAGGTACAGCTCTAGGGATGATAGGTACGGT
GCAAAGGATGATAGGTATGGTGGAAAAGAAGATAGGTATGGTAGGGATCGGTATGGACCT
GATCGCAGTGGGGAACGCTTTGGTGGAGGACGTAGCAGGGATGATGGCAGCCGTGGGGGT
TCAGGAGGTGAGAGGCATGGCCGTGTTCCATACGATCGCCCCAGAGACTAGAATTCTTCT
CCAGAGGTCAAACAAGTGGAAGGTTTCTGCTTTTCAGCTCTCATCAAGCGGGAAGTTAGA
TGGTCTGCTTTGTTGAATGTATTTGGATAGCTCGAGAAAGAAGAATGTGTATCTGTTTTG
GCACCTTAAACTCAAGAGTCGGCTAATGTCCTAAGTACTCTCCTTTTGATATGTTGATCC
TTTGGAAACCTTGTGCTTAGTTGGTTTGAGATTGAGAGACACAAATGTGCTACTTTAAGC
TTATCGTAATGAATGAGTTGGTTATCCCCAACACCAAAGG

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

CO CL5607Contig1 909 2 2 U
GGACATTCCTTCTTCTTCTTCACAACTCTCTCTCTCTCGAAAAAAAAAAGTCCCTCTTCC
TAGCTCGATTTCGATCTCAACTTTTCGTGTGGAAACGTTTGTGAATGGCGGAAACGAATC
CGATCAGTGGTGAGTTTACGCTTTCCCTTCAAATCCAAAGGGCGAGCTTCCTCCTCCTCC
CTCACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGGCCGTCAGTTCTACAGAAACTGC
GTCGTATCAGGAACAGTCGACTTCATCTTCGGCAAATCCGCGACAGTCATCCAAAACTCA
CTCATCGTCATCCGCAAAGGAAACAAGGGACAATACAACACGGTCACAGCCGACGGAAAC
GAAAAGGGTCTATCCATGAAAATCGGTATCGTCATCCAGAACTGCCGCATCGTTCCCGAC
AAGAAGCTAGCGGCGGAGAGGCTGACCGTTAAGTCGTACTTGGGAAGGCCATGGAAGCAG
TTCTCGGCCACCGTGGTGATCAACACGGAGATCGGAGATGTGATTAGACCAGAAGGGTGG
AGAATGTGGGACGGAGAGAACTTCCACAAGTCATGTAGGTACGTTGAGTACAACAACCGT
GGACCGGGAGCTATCACCAATAGGAGAGTTAGCTGGGCTAAGGTCGCTAGGTCTGCTGGT
GAGATTAATCAGTACACTGTGGCTAACTGGTTGGCTCCGGTTAACTGGATCCAAGAAGCT
AACGTACCTGTCACGCTTGGATTATAAAGCGTATAAAAATCATTTGAATAAAAAGAAAAA
AAAAAGACTAGTACGTGTACGTGTGTCGTCCATGTAAAAAGTGAAAATTACATTTTCGAT
AGAAAAGTTGTAAGATTTGCTTTTTGTTTGTCTTACGTACTAAAAAAAATTGAAAATTTA
TGTTTGTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EJ17TF U 1
AF RS1EJ17JQ C 267
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BS 637 909 RS1EJ17JQ

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CGATCAGTGGTGAGTTTACGCTTTCCCTTCAAATCCAAAGGGCGAGCTTCCTCCTCCTCC
CTCACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGGCCGTCAGTTCTACAGAAACTGC
GTCGTATCAGGAACAGTCGACTTCATCTTCGGCAAATCCGCGACAGTCATCCAAAACTCA
CTCATCGTCATCCGCAAAGGAAACAAGGGACAATACAACACGGTCACAGCCGACGGAAAC
GAAAAGGGTCTATCCATGAAAATCGGTATCGTCATCCAGAACTGCCGCATCGTTCCCGAC
AAGAAGCTAGCGGCGGAGAGGCTGACCGTTAAGTCGTACTTGGGAAGGCCATGGAAGCAG
TTCTCGGCCACCGTGGTGATCAACACGGAGATCGGAGATGTGATTAGACCAGAAGGGTGG
AGAATGTGGGACGGAGAGAACTTCCACAAGTCATGTAGGTACGTTGAGTACAACAACCGT
GGACCGGGAGCTATCACCAATAGGAGAGTTAGCTGG

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DS 

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CGTTAAGTCGTACTTGGGAAGGCCATGGAAGCAGTTCTCGGCCACCGTGGTGATCAACAC
GGAGATCGGAGATGTGATTAGACCAGAAGGGTGGAGAATGTGGGACGGAGAGAACTTCCA
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CTGGTTGGCTCCGGTTAACTGGATCCAAGAAGCTAACGTACCTGTCACGCTTGGATTATA
AAGCGTATAAAAATCATTTGAATAAAAAGAAAAAAAAAAGACTAGTACGTGTACGTGTGT
CGTCCATGTAAAAAGTGAAAATTACATTTTCGATAGAAAAGTTGTAAGATTTGCTTTTTG
TTTGTCTTACGTACTAAAAAAAATTGAAAATTTATGTTTGTTT

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 2

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CTATATTTAATCCCTTCTTTGCCTTGAATATCATCACAGATCTCTCTCCTTTTTTCTAAC
TCTTCCCCTGTCCTAAATTGCAACCTGCCATCTCCAATATTCCATCTTTTAACTTTGTCT
TTTAACAGGTTTGCATATACATATATAAATATTTTTACAAAAATCCCTTCCGTTTTTCAC
TTTAACTAAAAAGACTCTGTTTTTCTATTTAGGAATTCATTAAATTTTCTGGG


BQ
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AF RS1C039JQ C 1
AF RS1C039TF U 1
BS 1 293 RS1C039TF

RD RS1C039JQ 293 0 0
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CTATATTTAATCCCTTCTTTGCCTTGAATATCATCACAGATCTCTCTCCTTTTTTCTAAC
TCTTCCCCTGTCCTAAATTGCAACCTGCCATCTCCAATATTCCATCTTTTAACTTTGTCT
TTTAACAGGTTTGCATATACATATATAAATATTTTTACAAAAATCCCTTCCGTTTTTCAC
TTTAACTAAAAAGACTCTGTTTTTCTATTTAGGAATTCATTAAATTTTCTGGG

QA 1 293 1 293
DS 

RD RS1C039TF 293 0 0
GTAGCACCAATAATGATGGATTGTAGTTAGCCACCTGACAAGATCTCATTACTCCAAGTC
CTATATTTAATCCCTTCTTTGCCTTGAATATCATCACAGATCTCTCTCCTTTTTTCTAAC
TCTTCCCCTGTCCTAAATTGCAACCTGCCATCTCCAATATTCCATCTTTTAACTTTGTCT
TTTAACAGGTTTGCATATACATATATAAATATTTTTACAAAAATCCCTTCCGTTTTTCAC
TTTAACTAAAAAGACTCTGTTTTTCTATTTAGGAATTCATTAAATTTTCTGGG

QA 1 293 1 293
DS 



AS 1 2

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TTCTCCGATGCTAACATGGGACCGAACTACGACGAAGTCGAAGAGGAAGATGAAGGCTCC
GACAAGGACGGGGACTCTGACGGGGAGGATCACGGGGAGATTCAGTCTGGGATCGCTAGG
TTCGGTGATGATGATGGATGCAATGCGTTCAAGATGGCTTTTAAATCTATCATGAAGAGT
AAAGGAGATGATGCATTGGGACCTGTTTTATCAGCACATAAGCATCTTATTGCACAGAAG
CTAGCTGATGAGGAAGCTGAGAAGAAGTCTAAGGGTCAAGCCAGAAAGGCTAAACATTTG
GTTGCTGAGAAAGGGCATGTTAAACCTGCAAACCATTTGGAGTCTCGTAAGAAGGTTCTT
ATAGGTGTTGCAACTAAAGGAGTGGTCAAGCTATTTAATGCTGTAAACAAGGCTCAACAT
GCTCAGAAGGGTTTGAATGCTTTTAGATCAAAGGACGCTAAAGTGTTAAAGAAGGGGAGA
AAAGAAGCATTTTTTTCGGAGTTGGGGAAACCACCTAGAATAGACTCCAAGGCTCAAGAA
ACGTCAAATACCAATGAAGAAGAAGCTCCTGCTTGGGCTCCTCTACGTGATAATTACATG
TTAGCCAACCCAAAGCTGAAAGACTGGGACAAAAAACAGGAAACAAACGAAGGAGATGAT
TTTGGCGCAATGTCAGGAGATGAGAGTTATGAAGACTGAGCTACCAGTTTGTTTGTAGTA
CGTGTAGCTTTTGTTTTATCAAATATGAATGCAGTTTTTTTTTTGGTAATGCAAAAAGGA
ACTTGAAAGCAAGATAATGC


BQ
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AF RS1DL90TF U 1
AF RS1DL90JQ C 350
BS 1 649 RS1DL90TF
BS 650 1100 RS1DL90JQ

RD RS1DL90TF 649 0 0
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GATGAAACTCACGCGGCGGCGGTGTCCGAGAGAGGCAGAGGAAAGAGAAGAGTCGGCGCC
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TTCAAGCTCACTCAGAAGAACAAGAAGCTCTTTCAGAAGAGAGCGAGAGACTACAACTCA
GACGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGACGAATCGAAGAAGGTAACCATCCGCGAGAAGATC
TTCTCCGATGCTAACATGGGACCGAACTACGACGAAGTCGAAGAGGAAGATGAAGGCTCC
GACAAGGACGGGGACTCTGACGGGGAGGATCACGGGGAGATTCAGTCTGGGATCGCTAGG
TTCGGTGATGATGATGGATGCAATGCGTTCAAGATGGCTTTTAAATCTATCATGAAGAGT
AAAGGAGATGATGCATTGGGACCTGTTTTATCAGCACATAAGCATCTTATTGCACAGAAG
CTAGCTGATGAGGAAGCTGAGAAGAAGTCTAAGGGTCAAGCCAGAAAGGCTAAACATTTG
GTTGCTGAGAAAGGGCATGTTAAACCTGCAAACCATTTGGAGTCTCGTA

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1DL90JQ 751 0 0
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GGATCGCTAGGTTCGGTGATGATGATGGATGCAATGCGTTCAAGATGGCTTTTAAATCTA
TCATGAAGAGTAAAGGAGATGATGCATTGGGACCTGTTTTATCAGCACATAAGCATCTTA
TTGCACAGAAGCTAGCTGATGAGGAAGCTGAGAAGAAGTTTAAGGGTCAAGCCAGAAAGG
CTAAACATTTGGTTGCTGAGAAAGGGCATGTTAAACCTGCAAACCATTTGGAGTCTCGTA
AGAAGGTTCTTATAGGTGTTGCAACTAAAGGAGTGGTCAAGCTATTTAATGCTGTAAACA
AGGCTCAACATGCTCAGAAGGGTTTGAATGCTTTTAGATCAAAGGACGCTAAAGTGTTAA
AGAAGGGGAGAAAAGAAGCATTTTTTTCGGAGTTGGGGAAACCACCTAGAATAGACTCCA
AGGCTCAAGAAACGTCAAATACCAATGAAGAAGAAGCTCCTGCTTGGGCTCCTCTACGTG
ATAATTACATGTTAGCCAACCCAAAGCTGAAAGACTGGGACAAAAAACAGGAAACAAACG
AAGGAGATGATTTTGGCGCAATGTCAGGAGATGAGAGTTATGAAGACTGAGCTACCAGTT
TGTTTGTAGTACGTGTAGCTTTTGTTTTATCAAATATGAATGCAGTTTTTTTTTTGGTAA
TGCAAAAAGGAACTTGAAAGCAAGATAATGC

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

CO CL5610Contig1 495 2 3 U
TTTTTGATGAAGTTGAACAACGAAACTGTGTCGATCGAGCTGAAGAACGGGACTGTGGTC
CATGGAACCATCACTGGTGTTGATGTGAGCATGAACACTCACTTGAAGACTGTTAAAATG
ACTCTCAAGGGCAAGAACCCTGTGACGATGGACCATCTGAGCTTGAGGGGTAACAACATA
CGTTACTACATTCTTCCTGATAGCTTGAACTTGGAGACTTTGCTTGTTGAAGACACTCCT
CGACTTAAACCCAAGAAGCCTGTTGCTGGGAAGCCTGTTGGGAGAGGTCGTGGACGTGGT
GGTCGTGGCCGTGGTGGTGCTGGTCGTGGCAGAGGTCGTTAAATGCAGCAACAAGTTTAA
GGTGTGTGAGTTGAATTGAATCTGTAGGAAGAAGAACCCTTTGGGGGTGTCTCAGTTATG
TATTCAGAAACTCTTGCAGAGGAAGTTAATGTGTAATGCAACTCTATGGATTTAAAGGAT
TAAGCTTTTCATGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EV54TF U 1
AF RS1EV54JQ C 97
BS 1 404 RS1EV54TF
BS 405 405 RS1EV54JQ
BS 406 495 RS1EV54TF

RD RS1EV54TF 495 0 0
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CATGGAACCATCACTGGTGTTGATGTGAGCATGAACACTCACTTGAAGACTGTTAAAATG
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CGTTACTACATTCTTCCTGATAGCTTGAACTTGGAGACTTTGCTTGTTGAAGACACTCCT
CGACTTAAACCCAAGAAGCCTGTTGCTGGGAAGCCTGTTGGGAGAGGTCGTGGACGTGGT
GGTCGTGGCCGTGGTGGTGCTGGTCGTGGCAGAGGTCGTTAAATGCAGCAACAAGTTTAA
GGTGTGTGAGTTGAATTGAATCTGTAGGAAGAAGAACCCTTTGGTGGTGTCTCAGTTATG
TATTCAGAAACTCTTGCAGAGGAAGTTAATGTGTAATGCAACTCTATGGATTTAAAGGAT
TAAGCTTTTCATGTT

QA 1 495 1 495
DS 

RD RS1EV54JQ 399 0 0
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TTGAGCTTGAGGGGTAACAACATACGTTACTACATTTTTCCTGATAGCTTGAACTTGGAG
ACTTTGCTTGTTGAAGACACTCCTCGACTTAAACCCAAGAAGCCTGTTGCTGGGAAGCCT
GTTGGGAGAGGTTGTGGACGTGGTGGTTGTGGCCGTGGTGGTGCTGGTCGTGGCAGAGGT
CGTTAAATGCAGCAACAAGTTTAAGGTGTGTGAGTTGAATTGAATTTGTAGGAAGAAGAA
CCCTTTGGGGGTGTTTCAGTTATGTATTCAGAAACTTTTGCAGAGGAAGTTAATGTGTAA
TGCAACTTTATGGATTTAAAGGATTAAGCTTTTCATGTT

QA 1 399 1 399
DS 



AS 1 2

CO CL5611Contig1 1387 2 4 U
GCTATAATTATAACTCTATAATATAATTTAAATCACAAAAGTTTTAATATAATTTAATAA
AATATGCTGAAATAAACTTAGTATTCAGATATTTTACACTTTAATGTTTACATAACCAAG
TAAAATTTATAGTTGTACAACAAAAATAAAAATGCATCCTCATGGTTTAAAACGGAACAC
TGGACAAACTATAAAATATACATCAATCCCAAAACTCAATAAATTATGAATTAGTAACAT
GAATGTATAACATATTATTACGCGGAACACGCGTGTGCGGACGCACGGGTCCAAAATCTA
GTTTTCTTCTTATTCCAAAGATCACTTGTTTGTAATATCTTCTTCTTCCTTTTATGCAGG
TTGATTTTTGTTACATTTGAGATTATAACGGCTTTACAAGCGTGTATTGAATCGTAGCAT
TACCAAAAGGAACCAATATATGACCGAATCACTAGGAACTCTCATCTCTCTCCCTGGACA
CTAATAATTCATATAAACCTTGAAGCCAAGGAGGGAGAGAGCATAAGTCTCTTTCTATGT
CATTGTTAACCAAGAATAAAATCACTTGGTTTGGTGAGAAGAGCCCTAAAAGAATTCTTT
TGCCTTAGTTATTGACTTGGCTAATTAGAATATAGAGTTGTATTAGAGAAGAAAGGATAA
GACACAGATGAAATAGAGAGAAATATTTTCATCTGTACTGACACACAACTGAAGTAGACC
TAGTCCAAGAACCAGAGGTCTTGTGACCCGGTAAAAAAGGTAAACAACCAATCATCAATG
AACAGAGGAAGAAACTTTAAAACTTAAGGTTTGAGTAACTGTAATGTTCTCTGCCTATGA
ATGCACCGTCTGAGGTTAGTACTTAGTTGTAATTCTATTTCAGATTTGGCATTTCCATAA
CCGCCAGAGATATGTAAAAAAATCCTAACTCCCTTTCTTTCTGTTGCATGTTATAAAACC
ACCACTTTAGCTTCTTCTTCTACATATAGACAAAGTTCTTCTTCTACTTCCTGCTTTTTA
TCAGTCTCTACTTTTCTGCAACCAAAGAAAATTAAAACGATGCAACAGTTATAGTAAGGA
GCTTCAAAGTTCCAAAGGAAGAGAATGAAACACAGGTTTAATGATTGGAGAATTTTTAAC
ATACCAATATAGCTAGGCTGATTCAAGTGTTGAGGCTGGCTTGCTTTCCACGGTAGCAGA
AAGAGTAGCACAGTTCTCTTGCTCAGACTCGGACTGATCTTGGGTTTCACCGGTCTTTGA
TGGGGAAGCAAAGAAGCAATCAGGCAGAGCGTTCTTCAGACTTGTCTCTTGCCTTAACCA
ATGATAACAAAAAAGCACTGATAAGCATTGATGTAGTACTAACCAGTTCATGAGACTTGA
GATGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G358TF U 1
AF RS1G358JQ C 654
BS 1 737 RS1G358TF
BS 738 738 RS1G358JQ
BS 739 757 RS1G358TF
BS 758 1387 RS1G358JQ

RD RS1G358TF 757 0 0
GCTATAATTATAACTCTATAATATAATTTAAATCACAAAAGTTTTAATATAATTTAATAA
AATATGCTGAAATAAACTTAGTATTCAGATATTTTACACTTTAATGTTTACATAACCAAG
TAAAATTTATAGTTGTACAACAAAAATAAAAATGCATCCTCATGGTTTAAAACGGAACAC
TGGACAAACTATAAAATATACATCAATCCCAAAACTCAATAAATTATGAATTAGTAACAT
GAATGTATAACATATTATTACGCGGAACACGCGTGTGCGGACGCACGGGTCCAAAATCTA
GTTTTCTTCTTATTCCAAAGATCACTTGTTTGTAATATCTTCTTCTTCCTTTTATGCAGG
TTGATTTTTGTTACATTTGAGATTATAACGGCTTTACAAGCGTGTATTGAATCGTAGCAT
TACCAAAAGGAACCAATATATGACCGAATCACTAGGAACTCTCATCTCTCTCCCTGGACA
CTAATAATTCATATAAACCTTGAAGCCAAGGAGGGAGAGAGCATAAGTCTCTTTCTATGT
CATTGTTAACCAAGAATAAAATCACTTGGTTTGGTGAGAAGAGCCCTAAAAGAATTCTTT
TGCCTTAGTTATTGACTTGGCTAATTAGAATATAGAGTTGTATTAGAGAAGAAAGGATAA
GACACAGATGAAATAGAGAGAAATATTTTCATCTGTACTGACACACAACTGAAGTAGACC
TAGTCCAAGAACCAGAG*TCTTGTGACCCGGTAAAAA

QA 1 757 1 757
DS 

RD RS1G358JQ 734 0 0
AGGATAAGACACAGATGAAATAGAGAGAAATATTTTCATCTGTACTGACACACAACTGAA
GTAGACCTAGTCCAAGAACCAGAGGTCTTGTGACCCGGTAAAAAAGGTAAACAACCAATC
ATCAATGAACAGAGGAAGAAACTTTAAAACTTAAGGTTTGAGTAACTGTAATGTTCTCTG
CCTATGAATGCACCGTCTGAGGTTAGTACTTAGTTGTAATTCTATTTCAGATTTGGCATT
TCCATAACCGCCAGAGATATGTAAAAAAATCCTAACTCCCTTTCTTTCTGTTGCATGTTA
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CTTTTTATCAGTCTCTACTTTTCTGCAACCAAAGAAAATTAAAACGATGCAACAGTTATA
GTAAGGAGCTTCAAAGTTCCAAAGGAAGAGAATGAAACACAGGTTTAATGATTGGAGAAT
TTTTAACATACCAATATAGCTAGGCTGATTCAAGTGTTGAGGCTGGCTTGCTTTCCACGG
TAGCAGAAAGAGTAGCACAGTTCTCTTGCTCAGACTCGGACTGATCTTGGGTTTCACCGG
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TTAACCAATGATAACAAAAAAGCACTGATAAGCATTGATGTAGTACTAACCAGTTCATGA
GACTTGAGATGTCC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

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ACCTCGTCACGACTACTATCCTCTAACCCTCGAAGCGCAAGAGCAAGTTCCTAGATTTAT
GCGTAGTTGGATAACTCCACGTGAACCACCTCAAGATCATGTAGTCTTGACTACCGGAGC
TTTACACGGGATCGATTATGCCACACTCCGTAAATCAGCTAGTGCCTGGCATGATGAGTT
TGCTGCTCTTCCAAAGCCCTTAGTTGTGGTTAACATTGGCTGGCCTAGACGTAACTGCCG
CTATGGAGCAGACCTCGCAAAACAGCTAACAGACGCTCTTCTTAATGTCCTTGATAGCTG
TGGAAGTGTCAGAATCGCTCTCTCCTACAAAACCCCTGAAAAGGTTTCAAGAGTAGTTTT
CAAAGAACTAGGAGATAACCCAAAAGTCTTTATTTGGAATGGACAAGAACCAAATCCTTA
CATGGGACATTTAGCTTGGGGTGATGCCTTTGTAGTGACAGCAGATTCTGTCAGTCTCAT
AAGCGAAGCCTGCAGCACCGGGAAACCAGTGTATGTGATTGGAGCCGATCACTGTAAATG
GAAGATTGCAGATTTCCACAAGTCTTTGAGGGAACGAGGAGTCGTTCGCCCATTTACAGG
TCTCGAAGACATGTCGGAAAGTTGGAGTTATCCGCCATTGAATGACACAGCAGAAGCAGC
AGCAAGAGTACGGAGTGCATTAGCTACACGTGGATGGAGTTTACGCTCTTGAAAACTATC
ATACGTTTTTTTTGTTTGTACAATTTATTTCGGGAATCAACATATTTCTCGAAAGCTATA
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ATTTTGAATGGATTTTATTCACATTTCTTGTAACCCTAAAAAAAGAACAAGAATCAAAAT
TGTCAATAAAATGTGAAAACAAAGCATAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FN45TF U 1
AF RS1FN45JQ C 569
BS 1 782 RS1FN45TF
BS 783 1172 RS1FN45JQ

RD RS1FN45TF 789 0 0
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GA
GATTGCA

QA 1 782 1 782
DS 

RD RS1FN45JQ 604 0 0
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TTTATTTGGAATGGACAAGAACCAAATCCTTACATGGGACATTTAGCTTGGGGTGATGCC
TTTGTAGTGACAGCAGATTCTGTCAGTCTCATAAGCGAAGCCTGCAGCACCGGGAAACCA
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CGTGGATGGAGTTTACGCTCTTGAAAACTATCATACGTTTTTTTTGTTTGTACAATTTAT
TTCGGGAATCAACATATTTCTCGAAAGCTATAGAGAAAGAGAAGCCTAACACAATAATGG
ATGTGCAGAAAGAAAGAAAAGGTGACTACACCATTTTGAATGGATTTTATTCACATTTCT
TGTAACCCTAAAAAAAGAACAAGAATCAAAATTGTCAATAAAATGTGAAAACAAAGCATA
AACC

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 2

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TTCTCGAATCATCTTCTTCTTCGTTCCAAGTGAAAGATGGCTGATGGTGAGGACATTCAG
CCCCTTGTCTGTGACAACGGAACTGGAATGGTGAAGGCTGGTTTTGCTGGTGACGATGCC
CCCAGGGCTGTGTTCCCAAGTATTGTTGGTCGTCCCAGGCACACTGGTGTCATGGTTGGG
ATGGGTCAGAAAGATGCTTACGTTGGTGACGAAGCTCAGTCCAAAAGAGGTATTCTCACG
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GAGGCGCCTCTTAACCCTAAAGCCAACAGGGAGAAGATGACTCAGATCATGTTCGAGACT
TTCAATGTCCCTGCCATGTATGTTGCCATTCAGGCAGTTCTTCCTCTCTATGCCAGTGGG
CGTACTACAGGTATTGTGCTCGACTCTGGTGATGGTGTGTCTCACACTGTGCCAATCTAC
GAGGGGTATGCTCTTCCCCATGCCATCCTTCGTCTGGATCTTGCGGGTCGGGATCTCACA
GATTCTCTAATGAAGATTCTCACCGAGAGAGGTTACATGTTCACCACTACCGCCGAGCGA
GAAATCGTCCGTGACATCAAAGAGAAACTTGCTTGTGTCGCTCTCGACTTCGAGCAAGAG
CTCGAGACAGCTAAGAGCAGTTCTTCAGTGGAGAAAAACTACGAGCTACCTGATGGACAA
GTCATCACAATTGGAGCTGAGAGATTCCGTTGCCCTGAAGTACTCTTCCAGCCATCGCTT
ATCGGAATGGAGGCTCCTGGAATCCATGAAACGACTTACAACTCCATCATGAAGTGTGAC
GTGGATATCAGGAAGGATCTGTATGGAAACATCGTGCTCAGTGGTGGTTCAACCACGTTC
CCAGGAATCGCTGACCGTATGAGCAAGGAGATCACGGCGCTCGCTCCAAGCAGCATGAAG
ATCAAGGTGGTCGCACCGCCCGAGAGGAAATACAGTGTCTGGATTGGAGGATCTATCCTT
GCATCCCTCAGCACTTTCCAACAGATGTGGATCTCGAAGGGAGAGTACGATGAGTCCGGT
CCGTCGATTGTCCACAGGAAATGCTTTTAAGTGGTTTCTTGTGGTGAGTGTTGTTTTACA
AATCTATTTCCCGAAGTTGAGATGGGAAGTGAAACTATCTGTTGTTATGTGGTTGTTGTT
TTCGTGGGTCTCTTTTTAAAAACCTTCTCTTGAGTCTGTGTACTTTAGTTTTACCTCTGT
TTATTATTTTCTCTTTAGGATGCTTGTGATGATGCTGGTTTTTTTGTCCTTATTAAGCAA
AAAAAAAATATCGTATTCC


BQ
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AF RS1AR26TFB U 1
AF RS1AR26JQ C 638
BS 1 750 RS1AR26TFB
BS 751 1459 RS1AR26JQ

RD RS1AR26TFB 750 0 0
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TTCTCGAATCATCTTCTTCTTCGTTCCAAGTGAAAGATGGCTGATGGTGAGGACATTCAG
CCCCTTGTCTGTGACAACGGAACTGGAATGGTGAAGGCTGGTTTTGCTGGTGACGATGCC
CCCAGGGCTGTGTTCCCAAGTATTGTTGGTCGTCCCAGGCACACTGGTGTCATGGTTGGG
ATGGGTCAGAAAGATGCTTACGTTGGTGACGAAGCTCAGTCCAAAAGAGGTATTCTCACG
TTGAAGTATCCGATCGAGCATGGTATTGTGAGCAACTGGGATGACATGGAAAAGATCTGG
CATCACACTTTCTACAACGAGCTCCGTGTGGCCCCTGAGGAGCACCCGGTTCTTCTCACT
GAGGCGCCTCTTAACCCTAAAGCCAACAGGGAGAAGATGACTCAGATCATGTTCGAGACT
TTCAATGTCCCTGCCATGTATGTTGCCATTCAGGCAGTTCTTCCTCTCTATGCCAGTGGG
CGTACTACAGGTATTGTGCTCGACTCTGGTGATGGTGTGTCTCACACTGTGCCAATCTAC
GAGGGGTATGCTCTTCCCCATGCCATCCTTCGTCTGGATCTTGCGGGTCGGGATCTCACA
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GAAATCGTCCGTGACATCAAAGAGAAACTT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RS1AR26JQ 822 0 0
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TGTTCACCACTACCGCCGAGCGAGAAATCGTCCGTGACATCAAAGAGAAACTTGCTTGTG
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AAGTACTCTTCCAGCCATCGCTTATCGGAATGGAGGCTCCTGGAATCCATGAAACGACTT
ACAACTCCATCATGAAGTGTGACGTGGATATCAGGAAGGATCTGTATGGAAACATCGTGC
TCAGTGGTGGTTCAACCACGTTCCCAGGAATCGCTGACCGTATGAGCAAGGAGATCACGG
CGCTCGCTCCAAGCAGCATGAAGATCAAGGTGGTCGCACCGCCCGAGAGGAAATACAGTG
TCTGGATTGGAGGATCTATCCTTGCATCCCTCAGCACTTTCCAACAGATGTGGATCTCGA
AGGGAGAGTACGATGAGTCCGGTCCGTCGATTGTCCACAGGAAATGCTTTTAAGTGGTTT
CTTGTGGTGAGTGTTGTTTTACAAATCTATTTCCCGAAGTTGAGATGGGAAGTGAAACTA
TCTGTTGTTATGTGGTTGTTGTTTTCGTGGGTCTCTTTTTAAAAACCTTCTCTTGAGTCT
GTGTACTTTAGTTTTACCTCTGTTTATTATTTTCTCTTTAGGATGCTTGTGATGATGCTG
GTTTTTTTGTCCTTATTAAGCAAAAAAAAAATATCGTATTCC

QA 1 822 1 822
DS 



AS 1 2

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CTCTTCAGCAACTCTACTCCGCCAAACCGTTTGGCGGTCTACCATGCTCCCGAAGTTCTC
GAGACTCGGAAAGTAACTTTCAAATCTGACGCGTACAGTTTTGGGGTGTTACTGCTTGAA
CTGTTGACCGGTAAATCGCCAAACCAGGCATCGCTTGGCGAAGAAGGTATTGATCTACCT
CGTTGGGTGCTTTCCGTGGTTAGAGAGGAATGGACCGCTGAAGTTTTCGACGTTGAGCTG
ATGCGATACCACAACATAGAGGAAGAGATGGTTCAGCTTCTTCAAATCGCAATGGCGTGC
GTCTCTACGGTTCCTGATCAACGACCAGTGATGCAAGAAGTGCTGAGAATGATCGAGGAT
GTGAACAGAAGTGAGACTACCGATGACGGGTTAAGACAATCGTCTGATGACCCGTCAAAA
GGATCGGAGGGTCAGACTCCTCCAGGGGAGTCAAGGACGCCGCCACGTTCTGTCACGCCT
TAGTAAATTAAAGCAGCTTTAGTTTTTTCGTGTGTGTTCACTTTCTCCTTAAAAGGAGAT
GAAGAAAAATGAGGGTTTAGTGTGTGAGGGTCTTTGGTTGGTTACGGTAAAGCAAAAAAG
ACAGACTATTCTGGCATTTGGACCAAGTTCTAAAAGATGGCATCTCCCATCTATTTTTTC
TTATTTGAATATTGTGTTTACAGGTTTAAATCAAAGTTCAGTTTACCCCC


BQ
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AF RS1AK82TF U 1
AF RS1AK82JQ C 359
BS 1 724 RS1AK82TF
BS 725 890 RS1AK82JQ

RD RS1AK82TF 724 0 0
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CTCTTCAGCAACTCTACTCCGCCAAACCGTTTGGCGGTCTACCATGCTCCCGAAGTTCTC
GAGACTCGGAAAGTAACTTTCAAATCTGACGCGTACAGTTTTGGGGTGTTACTGCTTGAA
CTGTTGACCGGTAAATCGCCAAACCAGGCATCGCTTGGCGAAGAAGGTATTGATCTACCT
CGTTGGGTGCTTTCCGTGGTTAGAGAGGAATGGACCGCTGAAGTTTTCGACGTTGAGCTG
ATGCGATACCACAACATAGAGGAAGAGATGGTTCAGCTTCTTCAAATCGCAATGGCGTGC
GTCTCTACGGTTCCTGATCAACGACCAGTGATGCAAGAAGTGCTGAGAATGATCGAGGAT
GTGAACAGAAGTGAGACTACCGATGACGGGTTAAGACAATCGTCTGATGACCCGTCAAAA
GGATCGGAGGGTCAGACTCCTCCAGGGGAGTCAAGGACGCCGCCACGTTCTGTCACGCCT
TAGTAAATTAAAGCAGCTTTAGTTTTTTCGTGTGTGTTCACTTTCTCCTTAAAAGGAGAT
GAAG

QA 1 724 1 724
DS 

RD RS1AK82JQ 532 0 0
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TGATGCGATACCACAACATAGAGGAAGAGATGGTTCAGCTTCTTCAAATCGCAATGGCGT
GCGTCTTTACGGTTCCTGATCAACGACCAGTGATGCAAGAAGTGCTGAGAATGATCGAGG
ATGTGAACAGAAGTGAGACTACCGATGACGGGTTAAGACAATCGTCTGATGACCCGTCAA
AAGGATCGGAGGGTCAGACTCCTCCAGGGGAGTCAAGGACGCCGCCACGTTCTGTCACGC
CTTAGTAAATTAAAGCAGCTTTAGTTTTTTCGTGTGTGTTCACTTTCTCCTTAAAAGGAG
ATGAAGAAAAATGAGGGTTTAGTGTGTGAGGGTCTTTGGTTGGTTACGGTAAAGCAAAAA
AGACAGACTATTCTGGCATTTGGACCAAGTTCTAAAAGATGGCATCTCCCATCTATTTTT
TCTTATTTGAATATTGTGTTTACAGGTTTAAATCAAAGTTCAGTTTACCCCC

QA 1 532 1 532
DS 



AS 1 2

CO CL5615Contig1 362 2 1 U
GGGATCCAAACATTTTGAAAACTCCAACAAATTTTACAAGGCCACAAAAAGAAAGTGGGA
GTAGGAGGAGGAAGTGGTGGTGGTGGTTTGAAAGAGAGGGTTTTAGAGACGGGTCGAGTT
CTTGGAGTTGTGGCTCAAGTCTCGGTCAGGGTTCATGGTCCATGGTTGGCTCATCTCATG
CAGCATTGAAAGCACCACTCTGGTAACATTGTATGTATAGCTATTTGTATATATATATAG
TATTTTTAATAACACGTGTGATGTAATATATTAATAAGCTGCTTTTATGATTTGATGATG
ATGATGCAATAATAATGCATACATGCTGATTTGTAAAAACAAAAACGGCTTTGAATTGGG
TC


BQ
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20 20 

AF RS1EV14JQ C 1
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QA 1 362 1 362
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1EA67TF U 1
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QA 1 498 1 498
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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AF RS1EF92TF U 1
AF RS1EF92JQ C 565
BS 1 605 RS1EF92TF
BS 606 606 RS1EF92JQ
BS 607 670 RS1EF92TF
BS 671 1186 RS1EF92JQ

RD RS1EF92TF 670 0 0
GCAGTCCCATCATTAGGCAGACCCTGTGCTCATATCAATCAAGTAAGACACAAATATTAC
AAAAGACAAACAGAAACATCAGAAACTGAGGCTCACCACCACCAGACGACTCTCGAGTCC
TACAGTATCAGCCAGAACCTTGAACAAAATCGCCCTAGCACGACAGCAACCACGCTTGAT
TTGGCCAAGCAACTGAGCACCATGGTTTTCAAACAAGAAGGCGTTTTCCTCCAGAGCAAG
TTTCGAAGGGCTTTCAAGTGTAGGACGTTTTGTAAAAATCAGATACCTGTTTAATAGAGA
TAACGGATTGTATAATAAATAAATGAATAAAATGCGGAAACTGTAACATAAAGAGAGAAG
AGTGGTTGGTTACACAATTTAATTTCCCTACCGTTCCAGCTATTTTCTTGATCACCGAAG
CAGGATTAGAGCCGCTGACAAGTGTGGTGATCAACTGTTTAAGCATAGCGAGCTTCTTAT
CTTTTTGAAAATCAACAAGAATGACTTCGATCCTGACACCTTCCTCTCCCAAAGCATGAA
GCTCACTCGGTGTTGGTAGTCTATTATACACTTCCTTCACTCTCTTGTCCTACAGCAAAA
AAAAA*TCACATTAGAAGCTGCATCAGTCCAACAAGAGAGGACATAAAGAAAGATAGATG
CTGACCGGAA

QA 1 670 1 670
DS 

RD RS1EF92JQ 622 0 0
TATACACTTCCTTCACTCTCTTGTCCTACAGCAAAAAAAAAATCACATTAGAAGCTGCAT
CAGTCCAACAAGAGAGGACATAAAGAAAGATAGATGCTGACCGGAACAACAGAGTAGAAA
CCATTAGGAATGGGTTCACAAAGCATCCCTGCATCCCAAAGAAGGTGGGATGCTTTTTGA
CCTGGTGAGACGACATCATGCTCAACGCTTTTAGGGGACTCTTTAATCATCATCAAACCA
TCGCCTTGAGATTCAACAGAGAGTGACTTAACCCTTTCCGCAAGCTTTGAAGATTCGTCA
TCATCTCGTTTTTCCTTCATCCTCTACCAAAATGTTTTTTTTTTGGTACGTTACGTGATC
GATCACTAGTCTCTTTACCCCATAAGAGGCTTTCTATATCGACAACAATGCTCTGATTGG
TGTGGAATTCGACCCATCTCCTCTTGTTTTTCTGCACTAAGTGAGAAAAAGACGTGTGAC
CTTTTCAGACAGAGAAAGTTTTTTTTTTTCTTTTTTCGAAAAGACATCAATTCGTTATTA
CACACCACCCATTGTCCCACAACGATTTAATTCGTGAAATATCCTCAAAAAATCCGCACA
GAAAAGTGCAATTCATCGACCG

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 2

CO CL5619Contig1 1034 2 4 U
GAATCGGATGCTTTCGGCTGACCTTAAGAGCACCTGGAGTCTACTTTCTAAACAGTATAC
AGAGCATTATGAAGAGTGCATAGAGAGTATTCTGAATAAGGAAAAAGCGGACAAGTTTGA
CTACGAGGGTTTATGTGAAGCACTAGAGCAGCTGTCAGAGTTTGAGAAGAAGGCAAACGA
TCGAGTGATAGAGTCTGGTGTACTAAAGGGCCTGAATCTCGATGACATCAAGCGAGCTGG
GGAAAGGTTAATTCTTCAAGATGGCTGCATCAATGTCTTCCAGAAAATTTTGAAGACTCA
GGATGTGAATGCAAAACTCCACGTGCTTTCGTATTGTTGGTGTGGTGACCTCATCAGAGC
AGCCTTTTCTGCACGGGGAGTAGATGCAGTGGAAGTACATGCAAATGAATTCACGTTCTA
GGAATCCATCTCTACTGGTGAAATAGAAAGAAAAGTGGAATCCCCAATCGATAAGGCTCA
ACAGTTCAAGAGCATCCTAGAAAACAGAAAGAAGGATGAGGACAAGGAGGAGAAAAGCAT
CCTTACTGTTTACATTGGAGATCCAGTAGGTGACTTGCTCTGTCTCCTGGAAGCGGATAT
AGGAATCGTGGTTGCCTCTAGCTCGAGCCTCACGAGAGTGGGAAGCCATTTCGGGGTCTT
GTTTGTGCCTTTGTTCTCTGGAGTTGTGCAAAAACAGAAGCAAGAAGAAACCTGGAAGGG
ACTTTCTGGCACTCTCTACACGGTATCAAGCTGGGCTGAAATACATTCCTTCGCTCTTGG
ATGGGAGTAAACGGCAGAAGAAATATATGATTGAAGTTTGTATATACTGCCGGGGGTGGC
TAGTTTTTATCAAGGGCCACGTATAAGTTTCAGTCTTTCCCTTTGAAAGTGTGACATGAT
GAACTTTGGTAGGTCTCGTCTTAGAATCTATGAGCTTCTGTTGCTTTTTTGCAATGATCT
CTTGGCTTTTGACAGAAAAGATGTGATGCAGAGATGTCATTTGATGATATGCATATACAA
TAAAACATTTTTGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E836TF U 1
AF RS1E836JQ C 354
BS 1 562 RS1E836TF
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BS 564 694 RS1E836TF
BS 695 1034 RS1E836JQ

RD RS1E836TF 694 0 0
GAATCGGATGCTTTCGGCTGACCTTAAGAGCACCTGGAGTCTACTTTCTAAACAGTATAC
AGAGCATTATGAAGAGTGCATAGAGAGTATTCTGAATAAGGAAAAAGCGGACAAGTTTGA
CTACGAGGGTTTATGTGAAGCACTAGAGCAGCTGTCAGAGTTTGAGAAGAAGGCAAACGA
TCGAGTGATAGAGTCTGGTGTACTAAAGGGCCTGAATCTCGATGACATCAAGCGAGCTGG
GGAAAGGTTAATTCTTCAAGATGGCTGCATCAATGTCTTCCAGAAAATTTTGAAGACTCA
GGATGTGAATGCAAAACTCCACGTGCTTTCGTATTGTTGGTGTGGTGACCTCATCAGAGC
AGCCTTTTCTGCACGGGGAGTAGATGCAGTGGAAGTACATGCAAATGAATTCACGTTCTA
GGAATCCATCTCTACTGGTGAAATAGAAAGAAAAGTGGAATCCCCAATCGATAAGGCTCA
ACAGTTCAAGAGCATCCTAGAAAACAGAAAGAAGGATGAGGACAAGGAGGAGAAAAGCAT
CCTTACTGTTTACATTGGAGATTCAGTAGGTGACTTGCTCTGTCTCCTGGAAGCGGATAT
AGGAATCGTGGTTGCCTCTAGCTCGAGCCTCACGAGAGTGGGAAGCCATTTCGGGGTCTT
GTTTGTGCCTTTGTTCTCTGGAGTTGTGCAAAAA

QA 1 694 1 694
DS 

RD RS1E836JQ 681 0 0
TCAGAGCAGCCTTTTCTGCACGGGGAGTAGATGCAGTGGAAGTACATGCAAATGAATTCA
CGTTCTAGGAATCCATCTCTACTGGTGAAATAGAAAGAAAAGTGGAATCCCCAATCGATA
AGGCTCAACAGTTCAAGAGCATCCTAGAAAACAGAAAGAAGGATGAGGACAAGGAGGAGA
AAAGCATCCTTACTGTTTACATTGGAGATCCAGTAGGTGACTTGCTCTGTTTCCTGGAAG
CGGATATAGGAATCGTGGTTGCCTCTAGCTCGAGCCTCAGGAGAGTGGGAAGCCATTTCG
GGGTCTTGTTTGTGCCTTTGTTTTCTGGAGTTGTGCAAAAACAGAAGCAAGAAGAAACCT
GGAAGGGACTTTCTGGCACTCTCTACACGGTATCAAGCTGGGCTGAAATACATTCCTTCG
CTCTTGGATGGGAGTAAACGGCAGAAGAAATATATGATTGAAGTTTGTATATACTGCCGG
GGGTGGCTAGTTTTTATCAAGGGCCACGTATAAGTTTCAGTCTTTCCCTTTGAAAGTGTG
ACATGATGAACTTTGGTAGGTCTCGTCTTAGAATCTATGAGCTTCTGTTGCTTTTTTGCA
ATGATCTCTTGGCTTTTGACAGAAAAGATGTGATGCAGAGATGTCATTTGATGATATGCA
TATACAATAAAACATTTTTGC

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

CO CL5620Contig1 1016 2 4 U
GGGCCTATTTAATTGAAGCTATTGCTTGTAACGTCAGTTTTGGGAGTTCGGTTTGTTGTA
CAGTCTCTCTCTCTCTCCCCTTTCTCTCTCCTCTCTTCTCTGTCTTTGTAAGCTCTCTCA
TATGGCCGGCCTGAGATGGAGAGAGTGGTGGAACACGATGGCGTTCCCCACGCGGCGAAT
CTGGAATTGTTTCACCGTTCGCGTCGGATTCCACCACAGCGGTAAGCTCTGATCCTCCCT
CCACCGTCCACGTCTGATGATCATCTCTCTCCCTGTTCCTGTTTCGGTTTCTGTTTCTGT
TTCTGTATCATCTCTTTAAGAAAAAAAAATAATCGAATTCCTCCTCATGTTTTTCATCAT
AGTTTTTTTATTATTACTTTTTGAGAAAAGTTTTTCATCATAATTAAGATTAGATTTTGT
CTTATTAGGTGCTTCCTGAAACTGTCGGTAGAAGATTTAAATTGTAATTCAGAATCTTCT
TTTTGGTTTGGATTTAAATTCAGAGTTGGCTCTTGTTTACAAATATCATATTTTCTTGTT
CTCGACAAACAATTAAGTGATGGGTCTTTCTTGTGTGTTGCAGGACTTTTGAGGTTACAA
AACGACGTGAGTTCTTGCGAGTACGAAGACATACACATCATGTGGAATCTGTTGCACAAG
ATCGAAGATCCTTCACCGACGCCTAGCACACAGTTTAATAAACGAATTCAACAGAAGAAG
AAAGCTTGTTGGAATCTTTTCGGTTCATATCTTTGCCAAAGATTCTGATCATAAATATTT
TTTTTTTTTTTAAACCTAAACAAGTTCCAAACCATAGTTGTAATTTGTGAGAGCCTTGAC
GGGTCCCCTGCAACTGTGGTGAGGTTATTGACAAATCTCGCGAAATAATAAAATCTGAGG
TTGGACGGTTTTATCTGGCGTATTTCCATGGCATGTTTCCATGTATGTAATATGAGTTTT
ATCATTACATGAATGTTGTTGTATATAAGATATAAAATGCTTCCATACTTTGATGC


BQ
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AF RS1DS34TF U 1
AF RS1DS34JQ C 350
BS 1 388 RS1DS34TF
BS 389 389 RS1DS34JQ
BS 390 714 RS1DS34TF
BS 715 1016 RS1DS34JQ

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CAGTCTCTCTCTCTCTCCCCTTTCTCTCTCCTCTCTTCTCTGTCTTTGTAAGCTCTCTCA
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CTGGAATTGTTTCACCGTTCGCGTCGGATTCCACCACAGCGGTAAGCTCTGATCCTCCCT
CCACCGTCCACGTCTGATGATCATCTCTCTCCCTGTTCCTGTTTCGGTTTCTGTTTCTGT
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AGTTTTTTTATTATTACTTTTTGAGAAA*GTTTTTCATCATAATTAAGATTAGATTTTGT
CTTATTAGGTGCTTCCTGAAACTGTCGGTAGAAGATTTAAATTGTAATTCAGAATCTTCT
TTTTGGTTTGGATTTAAATTCAGAGTTGGCTCTTGTTTACAAATATCATATTTTCTTGTT
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DS 

RD RS1DS34JQ 667 0 0
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TTAGATTTTGTCTTATTAGGTGCTTCCTGAAACTGTCGGTAGAAGATTTAAATTGTAATT
CAGAATCTTCTTTTTGGTTTGGATTTAAATTCAGAGTTGGCTCTTGTTTACAAATATCAT
ATTTTCTTGTTCTCGACAAACAATTAAGTGATGGGTCTTTCTTGTGTGTTGCAGGACTTT
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TGTTGCACAAGATCGAAGATCCTTCACCGACGCCTAGCACACAGTTTAATAAACGAATTC
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CATAAATATTTTTTTTTTTTTTAAACCTAAACAAGTTCCAAACCATAGTTGTAATTTGTG
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AAAATCTGAGGTTGGACGGTTTTATCTGGCGTATTTCCATGGCATGTTTCCATGTATGTA
ATATGAGTTTTATCATTACATGAATGTTGTTGTATATAAGATATAAAATGCTTCCATACT
TTGATGC

QA 1 667 1 667
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGATCTTCCATAGCACGAGTTTCATCTCTAAAGATTGTTGGGGGGAGATGGACACAAAAG
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CATCCCAAGACGTGGAAGCTGTGACAACAAGGCTTAGTGAGCTAGTTGCTCAACAAGAAT
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ACATTCCAATACTCACAGAGAAGTCTTCAGCAATTGAAGCTGATCTTGATTTGCTTCTCA
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CTTTTGAAACTGAGCTGGACTCTCTTCTCAACTCTCATGCTGGTGCAGAAGAACCATTCA
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CTTCGGCAGTTGGAAAATCCAAAGTTTTAGATGAGTTTGATTCTTGGTTGGATACGATTT
GAGTTTTTTTGTTAGCTTAATACTTTTTTTTGTATTACCTATGTAAACGAGAACATTCTA
TTAGGAAAAAAACTATTCAGAGCGAC


BQ
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AF RS1AU53TF U 1
AF RS1AU53JQ C 577
BS 1 685 RS1AU53TF
BS 686 1286 RS1AU53JQ

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GGATCTTCCATAGCACGAGTTTCATCTCTAAAGATTGTTGGGGGGAGATGGACACAAAAG
CTATGGCGAAATCGAAGAGAGCTCACACTCAACACCACAGCAAGAAACCACATAAGCCCA
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CGAATTGGGATCGGTACGATGACGAACTCAATCCCGGTTCGGAAACTGCGCCTGGTGATT
TGTTGAATCAACCTGCGGATGATGCAATCGTGCCGAAAAGCAAAGGAGCAGATTATCTGC
ATCTGATATCTGAAGCTCAAGCTGAGTCTCACTCAAAGATTGACATCGATTCAGATTCTC
TAGATGATCTTTTGCACGATGAGTTTAGTCGCGTGGTTGGATCTATGATCTCGGCTAGAG
GGGAAGGTATAGTTTCGTGGATGGAAGATGATAACTTTGTTGTTGGGGAAGAAGAAGAAG
ACGGATCAGCTTCACATCATGAGCCTGGATTCCTGTCTTTGGATTTGAATGCACTGGAGA
AAATGCTAGAGAAAGTGGATGTGCATGAGAGACTATACATTGACGCTGATCTTTTGCCTC
CCCAGCTGTGTACAATCCAATCAAA
TTGAGCGG

QA 1 685 1 685
DS 

RD RS1AU53JQ 710 0 0
CTTTGGATTTGAATGCACTGGAGAAAATGCTAGAGAAAGTGGATGTGCATGAGAGACTAT
ACATTGACGCTGATCTTTTGCCTCCCCAGCTGTGTACAATCCAATCAAAATTGAGCGGAG
GTAAAGAACCTTGTCGTTCACACACATCCCAAGACGTGGAAGCTGTGACAACAAGGCTTA
GTGAGCTAGTTGCTCAACAAGAATCAAGTGGAAACATCGACTCTGCTGTTGAATCACCGG
CTGAGTCTCTGGATCAAGTCAAGCACATTCCAATACTCACAGAGAAGTCTTCAGCAATTG
AAGCTGATCTTGATTTGCTTCTCAACTCCTTTAGTGGAGAGTCTAACCCAGTGGCCAGTG
CCTTCAGTCAGAAGCCTCCTTCAGCTTTTGAAACTGAGCTGGACTCTCTTCTCAACTCTC
ATGCTGGTGCAGAAGAACCATTCAACAGACCAGAGAACCCATCTAATCAAAAGCTTAATA
CGACGGATTTTGGCGACGTGCTTGATGAGTTGCTCGAGAGTACTTCATTACCAATCAAAC
CACAGGGGATCCAGACCTCTTCGTCTTCGGCAGTTGGAAAATCCAAAGTTTTAGATGAGT
TTGATTCTTGGTTGGATACGATTTGAGTTTTTTTGTTAGCTTAATACTTTTTTTTGTATT
ACCTATGTAAACGAGAACATTCTATTAGGAAAAAAACTATTCAGAGCGAC

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL5623Contig1 364 2 1 U
GAAGGTCAACGAGTGATGGCTACGATGCCTCTGGTGGAGAAGACAGTGATCAGGTTCCTT
CTAGAAACATTCACAAATCAAGATGAGAAGTGTAATAAGTTTTGAGCTTATTCTTTGATA
TATGCTGTGGTCACATTTCAAGAGAAGTCAACATTCTTAGACAAATGTTTACAGTGTCTG
GCAAGAGCTCTTAGGTGAAGGCATCAGGAGGAGTTGTGGATTCTGAAGATTTTTTTTATT
TTTATTTTAAGGTAATGAGAACATTTTGAACGTGATCTTTTTAGGGTTTGACCAGAAGTT
TCATTTCTTGTTTTGTAAGGAAAAAATCTTGTTTTTTTTTCATGAAAAGAATGTCAAGTT
GCAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RS1G931JQ C 1
AF RS1G931TF U 1
BS 1 364 RS1G931TF

RD RS1G931JQ 364 0 0
GAAGGTCAACGAGTGATGGTTACGATGCCTCTGGTGGAGAAGACAGTGATCAGGTTCCTT
CTAGAAACATTCACAAATCAAGATGAGAAGTGTAATAAGTTTTGAGCTTATTCTTTGATA
TATGCTGTGGTCACATTTCAAGAGAAGTCAACATTCTTAGACAAATGTTTACAGTGTCTG
GCAAGAGCTCTTAGGTGAAGGCATCAGGAGGAGTTGTGGATTCTGAAGATTTTTTTTATT
TTTATTTTAAGGTAATGAGAACATTTTGAACGTGATCTTTTTAGGGTTTGACCAGAAGTT
TCATTTCTTGTTTTGTAAGGAAAAAATCTTGTTTTTTTTTCATGAAAAGAATGTCAAGTT
GCAC

QA 1 364 1 364
DS 

RD RS1G931TF 364 0 0
GAAGGTCAACGAGTGATGGCTACGATGCCTCTGGTGGAGAAGACAGTGATCAGGTTCCTT
CTAGAAACATTCACAAATCAAGATGAGAAGTGTAATAAGTTTTGAGCTTATTCTTTGATA
TATGCTGTGGTCACATTTCAAGAGAAGTCAACATTCTTAGACAAATGTTTACAGTGTCTG
GCAAGAGCTCTTAGGTGAAGGCATCAGGAGGAGTTGTGGATTCTGAAGATTTTTTTTATT
TTTATTTTAAGGTAATGAGAACATTTTGAACGTGATCTTTTTAGGGTTTGACCAGAAGTT
TCATTTCTTGTTTTGTAAGGAAAAAATCTTGTTTTTTTTTCATGAAAAGAATGTCAAGTT
GCAC

QA 1 364 1 364
DS 



AS 1 2

CO CL5624Contig1 694 2 3 U
TCGCCTTCTTCTCTCTGATACTCTTCGGTGGCCCGTTCGCTCCGCTGGTCGCCAAGCTCG
GTATGACGCCGCTGCTCGCAGCTGTGTACGTTGGTGCCCTCCAGAACATCTTCAGTAAGA
GCGCCAAGTACAGCTTGTTCGATCCTTGTAAAGAAATGGCTTATATCCCATTGGATGAGG
ACACCAAGGTTAAAGGCAAAAGCTGCGATTGATGTTGTGTGCAACCCATTGGGGAAATCA
GGCGGTGCACTGATCCAGCAGTTTATGATCCTCACGTTCGGTTCACTGGCCAGCTCCACT
CCTTACCTTGGAGTCATCTTGCTAGGTATAGTCACTGCTTGGCTAGCTGCGGCGAAGTCT
CTGGAGGGACAGTTCAACACTCTGATGTCTGAGGAAGAGCTTGAAAAGGAGATGGAGAGA
GCTGCATCGCTCAAGATTCCTGTTGTGTCTTCGGAAGAACCGGCGTCAGGAGAATCTACC
AGCCAGCTACCGGAGACATCTTCCCCGACTAGCATTTAGACGATGATGATGACGGATAAA
AATGGATTTTGAGAGATGGGTTACGTGAGTTTGTGTTTTTTTAAGGGTTTGGTCGGAACG
AAGATTTTGATAGTGAGAAAGACTTTTTAAGTCAAACCGTTTAGTCATGCTTTTTGTTGT
TGTTCTCTCCATACGAAATAGCATACTAAATTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EC25TF U 36
AF RS1EC25JQ C 1
BS 1 35 RS1EC25JQ
BS 36 395 RS1EC25TF
BS 396 694 RS1EC25JQ

RD RS1EC25TF 360 0 0
TTCGCTCCGCTGGTCGCCAAGCTCGGTATGACGCCGCTGCTCGCAGCTGTGTACGTTGGT
GCCCTCCAGAACATCTTCAGTAAGAGCGCCAAGTACAGCTTGTTCGATCCTTGTAAAGAA
ATGGCTTATATCCCATTGGATGAGGACACCAAGGTTAAAGGCAAAAGCTGCGATTGATGT
TGTGTGCAACCCATTGGGGAAATCAGGCGGTGCACTGATCCAGCAGTTTATGATCCTCAC
GTTCGGTTCACTGGCCAGCTCCACTCCTTACCTTGGAGTCATCTTGCTAGGTATAGTCAC
TGCTTGGCTAGCTGCGGCGAAGTCTCTGGAGGGACAGTTCAACACTCTGATGTCTGAGGA

QA 1 360 1 360
DS 

RD RS1EC25JQ 694 0 0
TCGCCTTCTTCTCTCTGATACTCTTCGGTGGCCCGTTCGCTCCGCTGGTCGCCAAGCTCG
GTATGACGCCGCTGCTCGCAGCTGTGTACGTTGGTGCCCTCCAGAACATCTTCAGTAAGA
GCGCCAAGTACAGCTTGTTCGATCCTTGTAAAGAAATGGCTTATATCCCATTGGATGAGG
ACACCAAGGTTAAAGGCAAAAGCTGCGATTGATGTTGTGTGCAACCCATTGGGGAAATCA
GGCGGTGCACTGATCCAGCAGTTTATGATCCTCACGTTCGGTTCACTGGCCAGCTCCACT
CCTTACCTTGGAGTCATCTTGCTAGGTATAGTCACTGCTTGGCTAGCTGCGGCGAAGTCT
CTGGAGGGACAGTTCAACACTCTGATGTCTGAGGAAGAGCTTGAAAAGGAGATGGAGAGA
GCTGCATCGCTCAAGATTCCTGTTGTGTCTTCGGAAGAACCGGCGTCAGGAGAATCTACC
AGCCAGCTACCGGAGACATCTTCCCCGACTAGCATTTAGACGATGATGATGACGGATAAA
AATGGATTTTGAGAGATGGGTTACGTGAGTTTGTGTTTTTTTAAGGGTTTGGTCGGAACG
AAGATTTTGATAGTGAGAAAGACTTTTTAAGTCAAACCGTTTAGTCATGCTTTTTGTTGT
TGTTCTCTCCATACGAAATAGCATACTAAATTTA

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL5625Contig1 296 2 1 U
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TGTTTTTGAGTTTCTTTACCTTTTAAATGTTCTAAAGTTCTGCTCTTTTTTTAAGAGCTA
AAACGGTTAATTTTGCTGGTTTATGCTTTATCTTAGAGAGATATTATTTCAATTGTGTAA
GAATTGTTGCACCTTTTGAGTCTTGTTTGAATTTTGATCTAAAACGGGTAATTTTGCTGA
TTTGAATGCTCTTTAAGTTCAGTTGCTTTTGCGTTTTAAGAGGTAGAAATGATTCG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1E282JQ C 1
AF RS1E282TF U 1
BS 1 296 RS1E282TF

RD RS1E282JQ 296 0 0
GGAGCTTCAGAGGATAAGAAACCCGCTGATGAGGCCTGATTATGGTAAATGTCAAAGAGT
TGTTTTTGAGTTTCTTTACCTTTTAAATGTTCTAAAGTTCTGCTCTTTTTTTAAGAGCTA
AAACGGTTAATTTTGCTGGTTTATGCTTTATCTTAGAGAGATATTATTTCAATTGTGTAA
GAATTGTTGCACCTTTTGAGTCTTGTTTGAATTTTGATCTAAAACGGGTAATTTTGCTGA
TTTGAATGCTCTTTAAGTTCAGTTGCTTTTGCGTTTTAAGAGGTAGAAATGATTCG

QA 1 296 1 296
DS 

RD RS1E282TF 296 0 0
GGAGCTTCAGAGGATAAGAAACCCGCTGATGAGGCCTGATTATGGTAAATGTCAAAGAGT
TGTTTTTGAGTTTCTTTACCTTTTAAATGTTCTAAAGTTCTGCTCTTTTTTTAAGAGCTA
AAACGGTTAATTTTGCTGGTTTATGCTTTATCTTAGAGAGATATTATTTCAATTGTGTAA
GAATTGTTGCACCTTTTGAGTCTTGTTTGAATTTTGATCTAAAACGGGTAATTTTGCTGA
TTTGAATGCTCTTTAAGTTCAGTTGCTTTTGCGTTTTAAGAGGTAGAAATGATTCG

QA 1 296 1 296
DS 



AS 1 2

CO CL5626Contig1 911 2 2 U
TCCATGCGTACATCTTTGGCCCGTGCAAAGCAGCACCCCCTCCTTAAGGGATTAAACGTC
TGCATAACTCCCAACATTAAACCGGACAGAGGTATGATTGCTCACTTAGTGAAGTTGACT
CAAGGGCAGGTAGTGGAGATAAGTGAAATAATTGCTGCAGCGAATAGAAAAATTCCAGAT
GATCTATTGATTATTTCTTGCGAAGACGATAGAGATCTCTGTCTTCCTTTCATTGATCAA
GGAGCTGAAATCTACACCGCAGAGCTTTTGCTGAATGGAATCGTGATTCAGAAATTGGAA
TATGACAGGCATTGTCTCTTCTAAAATTGCTGGCAAAAGGAAACACAAAGTTTGCAGCAA
CACATACGGATCTACTGGTTGGTGCAAGCAGTGAATGAAAGCCATTTTATCAAAATCTTT
CAAAACCTGACTGTTTGTTATAAGAGATCTTTCATCATTCTATGGAAATAAGAATCTAGT
ACATAAAATTATGCAATTAACGTACATTACATCTAGACCTCTTCACACGGATTAGATTAG
AAAAGGAGATTCAGCACCAGGGTTCTGATTGTTGAAGCCAACACTTGGTGGAGCAGCAGC
TTGATTTGTATGATAAGGAGGAGGAGGAGGAAGTCCACTGTAATTGGGAGGTGGCGCACC
ACCTTGACCTGGTATTGGAGCCAATCCTGGTGGCCTAAGAATACCATTTTGTGGAGGTGG
TGGTGGTAGAGGACCGCCGGGTGGTGCCATCATCTGTGGTACTCCTGGAGGAGGCATGTA
ACCTGTAAAGGTAATAGACAGTACCTTGGCCAGGGATCATGGGTCTAAACAGAATAGGAG
GTCGCATCCCCATAGGCATAGGCATGGGCATCATAGGAAGGCGAGGTCTAGCGAGCATAT
GCTGATTAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A444TF U 1
AF RS1A444JQ C 255
BS 1 619 RS1A444TF
BS 620 911 RS1A444JQ

RD RS1A444TF 619 0 0
TCCATGCGTACATCTTTGGCCCGTGCAAAGCAGCACCCCCTCCTTAAGGGATTAAACGTC
TGCATAACTCCCAACATTAAACCGGACAGAGGTATGATTGCTCACTTAGTGAAGTTGACT
CAAGGGCAGGTAGTGGAGATAAGTGAAATAATTGCTGCAGCGAATAGAAAAATTCCAGAT
GATCTATTGATTATTTCTTGCGAAGACGATAGAGATCTCTGTCTTCCTTTCATTGATCAA
GGAGCTGAAATCTACACCGCAGAGCTTTTGCTGAATGGAATCGTGATTCAGAAATTGGAA
TATGACAGGCATTGTCTCTTCTAAAATTGCTGGCAAAAGGAAACACAAAGTTTGCAGCAA
CACATACGGATCTACTGGTTGGTGCAAGCAGTGAATGAAAGCCATTTTATCAAAATCTTT
CAAAACCTGACTGTTTGTTATAAGAGATCTTTCATCATTCTATGGAAATAAGAATCTAGT
ACATAAAATTATGCAATTAACGTACATTACATCTAGACCTCTTCACACGGATTAGATTAG
AAAAGGAGATTCAGCACCAGGGTTCTGATTGTTGAAGCCAACACTTGGTGGAGCAGCAGC
TTGATTTGTATGATAAGGA

QA 1 619 1 619
DS 

RD RS1A444JQ 657 0 0
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TCTCTTCTAAAATTGCTGGCAAAAGGAAACACAAAGTTTGCAGCAACACATACGGATCTA
CTGGTTGGTGCAAGCAGTGAATGAAAGCCATTTTATCAAAATCTTTCAAAACCTGACTGT
TTGTTATAAGAGATCTTTCATCATTCTATGGAAATAAGAATCTAGTACATAAAATTATGC
AATTAACGTACATTACATCTAGACCTCTTCACACGGATTAGATTAGAAAAGGAGATTCAG
CACCAGGGTTCTGATTGTTGAAGCCAACACTTGGTGGAGCAGCAGCTTGATTTGTATGAT
AAGGAGGAGGAGGAGGAAGTCCACTGTAATTGGGAGGTGGCGCACCACCTTGACCTGGTA
TTGGAGCCAATCCTGGTGGCCTAAGAATACCATTTTGTGGAGGTGGTGGTGGTAGAGGAC
CGCCGGGTGGTGCCATCATCTGTGGTACTCCTGGAGGAGGCATGTAACCTGTAAAGGTAA
TAGACAGTACCTTGGCCAGGGATCATGGGTCTAAACAGAATAGGAGGTCGCATCCCCATA
GGCATAGGCATGGGCATCATAGGAAGGCGAGGTCTAGCGAGCATATGCTGATTAAAC

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 2

CO CL5627Contig1 1072 2 2 U
GAAACAAACAATGGCGACTCTGAAACTCACTCTGTCCTCACCTTCTCCCTCTTTAATTCA
GTCAAAGTTATCTGCGGCGTCTTTCATCCCAAGTGCATCGCGTGCGTTTAATGCGACAGC
AAAGGCTTCGAAGTCGCGGTTCATTGGTAAATGCTTGAGATCAAGCCCTATGACAATACA
CAGAGGATCTCGCTCCGTAGAAATCATTTGTTCTGCTTCATCTTCTCCATCTGCTACTCT
TCCCTCAGCTCTTCTCTTCGATTGCGATGGCGTGCTTGTTGATACGGAGAAGGACGGTCA
CAGGATCTCCTTCAACGACACTTTCAAAGAGAGAGATTTGGGTGTTACCTGGGATGTCGA
TTTGTACGGAGAACTACTGAAAATCGGTGGCGGGAAAGAAAGAATGACAGCATATTTTAA
TAAGGTGGGTTGGCCTGAGAAAGCTCCCAAGGATGAGGCAGAGAGGAAAGCGTTTATAGC
AGGGCTTCACAAGCAGAAGACTGAGCTTTTCATGGTTCTCATCGAGAAAAAGCTGCTTCC
TCTTCGACCCGGTGTTGCCAAATTGGTTGATCAAGCTTTAACGAATGAGTAAAGGTTGCT
GTGTACAGCACTTCAAATGAGAAGGCGGTTTCTGCTATAGTTTCATGCTTGCTTGGACCA
GAACGAGCAGAGAATATCAAGATATTCGCTGGAGATGTAGTTCCTAAAAAGAAACCTGAC
TCGGCCATCTACAACTTAGCTGCAGAAACCCTTGGAGTTGATCCCTCAAAATGTGTTGTG
GTTGAAGATAGCGCTATTGGACTAGCAGCTGCAAAAGCTGCGGGTATGACTTGTATAGTA
ACAAAGAGTGGATACACAGCAGATGAAGATTTTGTGAACGCAGACGCGGTTTTCGACTGC
ATTGGAGACCCTCCAGAAGAGAGATTTGATCTATCATTCTGTGGAAGCCTTCTCCAGAAA
CAATTCGTTAGCTAAACTACAAAACTCTCTCAAACATTAGTTGTGTATATTGAAAAGACT
TAATTCACTGTAAACTACAAACTCTCTCAAACATTGGTTGAGATTTTGTCTC


BQ
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AF RS1DG62TF U 1
AF RS1DG62JQ C 258
BS 1 622 RS1DG62TF
BS 623 1072 RS1DG62JQ

RD RS1DG62TF 622 0 0
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GTCAAAGTTATCTGCGGCGTCTTTCATCCCAAGTGCATCGCGTGCGTTTAATGCGACAGC
AAAGGCTTCGAAGTCGCGGTTCATTGGTAAATGCTTGAGATCAAGCCCTATGACAATACA
CAGAGGATCTCGCTCCGTAGAAATCATTTGTTCTGCTTCATCTTCTCCATCTGCTACTCT
TCCCTCAGCTCTTCTCTTCGATTGCGATGGCGTGCTTGTTGATACGGAGAAGGACGGTCA
CAGGATCTCCTTCAACGACACTTTCAAAGAGAGAGATTTGGGTGTTACCTGGGATGTCGA
TTTGTACGGAGAACTACTGAAAATCGGTGGCGGGAAAGAAAGAATGACAGCATATTTTAA
TAAGGTGGGTTGGCCTGAGAAAGCTCCCAAGGATGAGGCAGAGAGGAAAGCGTTTATAGC
AGGGCTTCACAAGCAGAAGACTGAGCTTTTCATGGTTCTCATCGAGAAAAAGCTGCTTCC
TCTTCGACCCGGTGTTGCCAAATTGGTTGATCAAGCTTTAACGAATGAGTAAAGGTTGCT
GTGTACAGCACTTCAAATGAGA

QA 1 622 1 622
DS 

RD RS1DG62JQ 815 0 0
TCGATTGCGATGGCGTGCTTGTTGATACGGAGAAGGACGGTCACAGGATCTC*TTCAACG
ACACTTTCAAAGAGAGAGATTTGGGTGTTACCTGGGATGTCGATTTGTACGGAGAACTAC
TGAAAATCGGTGGCGGGAAAGAAAGAATGACAGCATATTTTAATAAGGTGGGTTGGCCTG
AGAAAGCTCCCAAGGATGAGGCAGAGAGGAAAGCGTTTATAGCAGGGCTTCACAAGCAGA
AGACTGAGCTTTTCATGGTTCTCATCGAGAAAAAGCTGCTTCCTCTTCGACCCGGTGTTG
CCAAATTGGTTGATCAAGCTTTAACGAATGAGTAAAGGTTGCTGTGTACAGCACTTCAAA
TGAGAAGGCGGTTTCTGCTATAGTTTCATGCTTGCTTGGACCAGAACGAGCAGAGAATAT
CAAGATATTCGCTGGAGATGTAGTTCCTAAAAAGAAACCTGACTCGGCCATCTACAACTT
AGCTGCAGAAACCCTTGGAGTTGATCCCTCAAAATGTGTTGTGGTTGAAGATAGCGCTAT
TGGACTAGCAGCTGCAAAAGCTGCGGGTATGACTTGTATAGTAACAAAGAGTGGATACAC
AGCAGATGAAGATTTTGTGAACGCAGACGCGGTTTTCGACTGCATTGGAGACCCTCCAGA
AGAGAGATTTGATCTATCATTCTGTGGAAGCCTTCTCCAGAAACAATTCGTTAGCTAAAC
TACAAAACTCTCTCAAACATTAGTTGTGTATATTGAAAAGACTTAATTCACTGTAAACTA
CAAACTCTCTCAAACATTGGTTGAGATTTTGTCTC

QA 1 815 1 815
DS 



AS 1 2

CO CL5628Contig1 1079 2 2 U
GGGACCAGGTCAAACCACTAACGTTCTAGTCAAAACCGACCGCTCTCCAAACCGTTACTT
CATGGCAGCTGGTCCGTTCATGGACGCTCCAGTATCCGTAGACAACAAAACCGCAACCGC
TATTCTTCAATACAAAGGTGTACCAAACACGGTCATACCGATCTTACCAAAGCTTCCTTC
ACCTAATGACACATCATTTGCTTTGGACTATAACGGAAAGCTTAGGAGTCTCAATACACC
AAACTTTCCAGCTCTTGTACCTCTTAAAGTTGACCGTAGATTGTTTTACACGATCGGCCT
AGGCATTAATGCTTGCCCAACCTGTGTGAACGGGACCAATCTTGCGGCTTCCATAAACAA
TATCACGTTCATTATGCCAAAAATCGCGCTTTTGAAAGCTCATTACTTCAACCTTCCAGG
AGTTTTCAGGACCGACTTCCCCGATAGACCACCTAAAGCGTTTAACTACACTGGTGTGCC
ACTCACGGCTAACCTGGGGACATCTACGGGGACAAGACTAAGTCGAGTTAAGTTCAATAC
AACAATTGAGCTAGTCTTGCAAGACGCAAATCTACTAACTGTTGATTCACATCCTTTCCA
TCTTCACGGCTACAACTTCTTCGTGGTTGGAACTGGTGTTGGGAACTTTGACCCCAAGAA
AGATCCAGCTAAGTTTAATCTCATTGACCCGCCCGAGAGAAACACGGTTGGAGTACCTAC
CGGTGGTTGGGCAGCCATCAGATTCAGGGCTGATAATCCAGGTGTTTGGTTTATGCATTG
TCACTTGGAAGTCCATACAATGTGGGGTCTAAAAATGGCTTTTGTCGTTGAGAACGGAAA
TACACCTGAGCTTTCCGTTCTACCACCGCCCAAAGATTATCCATCATGTTAAGAATCTGA
AACCGGAACACGTTCACTCGGTTCTTCTTCCTATATATTTGTTTAAGTCACTGATGACAT
TCTTTGTTGATTGTATTTTCCTTTCTGTTGGTTTATGTGTTTGAGATTATTTCATGGGGG
GCTGTACAACAACAACATCACCCCTGAATTTGCATAAGAAATGTAACTAAATGTTTCAC


BQ
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AF RS1E719TF U 1
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CATGGCAGCTGGTCCGTTCATGGACGCTCCAGTATCCGTAGACAACAAAACCGCAACCGC
TATTCTTCAATACAAAGGTGTACCAAACACGGTCATACCGATCTTACCAAAGCTTCCTTC
ACCTAATGACACATCATTTGCTTTGGACTATAACGGAAAGCTTAGGAGTCTCAATACACC
AAACTTTCCAGCTCTTGTACCTCTTAAAGTTGACCGTAGATTGTTTTACACGATCGGCCT
AGGCATTAATGCTTGCCCAACCTGTGTGAACGGGACCAATCTTGCGGCTTCCATAAACAA
TATCACGTTCATTATGCCAAAAATCGCGCTTTTGAAAGCTCATTACTTCAACCTTCCAGG
AGTTTTCAGGACCGACTTCCCCGATAGACCACCTAAAGCGTTTAACTACACTGGTGTGCC
ACTCACGGCTAACCTGGGGACATCTACGGGGACAAGACTAAGTCGAGTTAAGTTCAATAC
AACAATTGAGCTAGTCTTGCAAGACGCAAATCTACTAACTGTTGATTCACATCC

QA 1 594 1 594
DS 

RD RS1E719JQ 785 0 0
CGGCCTAGGCATTAATGCTTGCCCAACCTGTGTGAACGGGACCAATCTTGCGGCTTCCAT
AAACAATATCACGTTCATTATGCCAAAAATCGCGCTTTTGAAAGCTCATTACTTCAACCT
TCCAGGAGTTTTCAGGACCGACTTCCCCGATAGACCACCTAAAGCGTTTAACTACACTGG
TGTGCCACTCACGGCTAACCTGGGGACATTTACGGGGACAAGACTAAGTCGAGTTAAGTT
CAATACAACAATTGAGCTAGTCTTGCAAGACGCAAATCTACTAACTGTTGATTCACATCC
TTTCCATCTTCACGGCTACAACTTCTTCGTGGTTGGAACTGGTGTTGGGAACTTTGACCC
CAAGAAAGATCCAGCTAAGTTTAATCTCATTGACCCGCCCGAGAGAAACACGGTTGGAGT
ACCTACCGGTGGTTGGGCAGCCATCAGATTCAGGGCTGATAATCCAGGTGTTTGGTTTAT
GCATTGTCACTTGGAAGTCCATACAATGTGGGGTCTAAAAATGGCTTTTGTCGTTGAGAA
CGGAAATACACCTGAGCTTTCCGTTCTACCACCGCCCAAAGATTATCCATCATGTTAAGA
ATCTGAAACCGGAACACGTTCACTCGGTTCTTCTTCCTATATATTTGTTTAAGTCACTGA
TGACATTCTTTGTTGATTGTATTTTCCTTTCTGTTGGTTTATGTGTTTGAGATTATTTCA
TGGGGGGCTGTACAACAACAACATCACCCCTGAATTTGCATAAGAAATGTAACTAAATGT
TTCAC

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

CO CL5629Contig1 627 2 2 U
GGAAAGAAACAAAAAGAAAAAAAAGAAATTATGAAGACAAAGACTTACAACTTCATATGT
ATTGCAGCGTCTGTCCTTACTTTTCTCATCAATGGCTCATCAGCATCAACATCTCAAAAC
GGTAACTCTACAACTTCATGTAGCAAAACCTGTGGAGGAATCTCGATCCCGTTCCCTTTT
GGAATCGGCGGGAAGGATTGCTATCTCAACAACTGATTTCATTGAGGCCATGAAAGAAAA
CAGAGTTGTCGACATCATTGATGATCGGATCAAAGAGGAAGGCAAGATGGACCAAGTGAT
GGCAGTCGCAGAACTCGCTAGAAGGTGTCTAAGCCAGAAAGGAAGGAAGCGGCCAAACAT
GAGAGAGATTTCTATTGAGCTGGAGAGGATTCGTTCATCACCTGAAGATCTAAAACTACA
TTTCCTTAACAATGAAGAAGATGATAAAGTCTGCTCAAGCCATGCAAATCAAGAAAACAT
AATCATATAGGAGAGTGTACGAGGACTGTTCCATCCTCAATGCTGAATGTATCTCCAAAC
CGGTGGCTCCTCAATGATAAAAACCTGTAAGAAACTTCATTTTTCTTTGCATTCATGAAC
AAAATGAATTATGTTTCCGATTATAAA


BQ
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AF RS1B551TF U 1
AF RS1B551JQ C 204
BS 1 306 RS1B551TF
BS 307 627 RS1B551JQ

RD RS1B551TF 306 0 0
GGAAAGAAACAAAAAGAAAAAAAAGAAATTATGAAGACAAAGACTTACAACTTCATATGT
ATTGCAGCGTCTGTCCTTACTTTTCTCATCAATGGCTCATCAGCATCAACATCTCAAAAC
GGTAACTCTACAACTTCATGTAGCAAAACCTGTGGAGGAATCTCGATCCCGTTCCCTTTT
GGAATCGGCGGGAAGGATTGCTATCTCAACAACTGATTTCATTGAGGCCATGAAAGAAAA
CAGAGTTGTCGACATCATTGATGATCGGATCAAAGAGGAAGGCAAGATGGACCAAGTGAT
GGCAGT

QA 1 306 1 306
DS 

RD RS1B551JQ 424 0 0
TCTCAACAACTGATTTCATTGAGGCCATGAAAGAAAACAGAGTTGTGGACATCATTGATG
ATCGGATCAAAGAGGAAGGCAAGATGGACCAAGTGATGGCAGTCGCAGAACTCGCTAGAA
GGTGTCTAAGCCAGAAAGGAAGGAAGCGGCCAAACATGAGAGAGATTTCTATTGAGCTGG
AGAGGATTCGTTCATCACCTGAAGATCTAAAACTACATTTCCTTAACAATGAAGAAGATG
ATAAAGTCTGCTCAAGCCATGCAAATCAAGAAAACATAATCATATAGGAGAGTGTACGAG
GACTGTTCCATCCTCAATGCTGAATGTATCTCCAAACCGGTGGCTCCTCAATGATAAAAA
CCTGTAAGAAACTTCATTTTTCTTTGCATTCATGAACAAAATGAATTATGTTTCCGATTA
TAAA

QA 1 424 1 424
DS 



AS 1 2

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GAAAACGAAGTTACTCAAGGTAGAGAATATTTTCTTGCGTCTAGAGAGAGAGATGGGGGG
TGTGGTAGAGGAAGCTCACAACGTGAAGGTGATTGGGTCAGGAAATCAAGGGACGATCGT
ATTAGGTCACGGGTTTGGCACGGACCAGTCAGTGTGGAAACACTTGGTTCCACATCTGGT
CGATGATTACAGCATCGTACTCTACGACAACATGGGAGCCGGTACGACCAATCCGGAATA
TTTCGACTTCGAACGTTATTCAACTCTCGAAGGTTTCTCTTTTGATTTGATTGCAATTTT
AGAGGATCTTCAAATCGAGTCTTGTATCTTTGTTGGTCACTCTCTATCCGCCATGGTTGG
TGTCTTGGCTTCTCTTAACCGACCTGACCTCTTCTCCAAAATTGTCATGATTTCTGCTTC
CCCACGATACGTGAACGATGCTGATTACCAAGGTGGGTTCGAGCAAGACGATCTAAACCA
ACTTTTTGAAGCGATGCGAAGCAACTACAAAGCGTGGTGCTTAGGTTTCGCTCCACTCGC
GGTAGGTGGAGACTTAGACTCAGTAGCCGTTCAAGAATTCAGCAGAACGCTCTTCAACAT
GCGTCCGGACATAGCACTTTCCCTGGCTCAAACCATTTTCCAAAGCGACATGAGACAATT
GTTACCTTTTGTCTCTGTCCCTTGTCACATCGTCCAAAGCGTTAAAGATTTAGCCGTGCC
GGTCGCCGTATCCGAGTATCTTCACAAAAATCTCGGATGTGAATCTGTCGTCGAGGTTAT
GTCTTCAGATGGTCCCCTTCCTCAGCTTAGCTCGCCGGACTCTGTTATTCCCGTTCTACT
CCGTCATATCCGCAACGACATTGCTGTATGATGATGAGAGGAGATGTTAATTAAGTTTAG
CGAAATTAAATGTATGATGTGATATGTCTGGCTGGGTAAGTGAGTATATCGTATCGTTGT
CGTTTGTTCTTGGATTCTGAATTTGATCAGTTTGTTGTTGCC


BQ
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AF RS1AB49TF U 1
AF RS1AB49JQ C 387
BS 1 743 RS1AB49TF
BS 744 1002 RS1AB49JQ

RD RS1AB49TF 743 0 0
GAAAACGAAGTTACTCAAGGTAGAGAATATTTTCTTGCGTCTAGAGAGAGAGATGGGGGG
TGTGGTAGAGGAAGCTCACAACGTGAAGGTGATTGGGTCAGGAAATCAAGGGACGATCGT
ATTAGGTCACGGGTTTGGCACGGACCAGTCAGTGTGGAAACACTTGGTTCCACATCTGGT
CGATGATTACAGCATCGTACTCTACGACAACATGGGAGCCGGTACGACCAATCCGGAATA
TTTCGACTTCGAACGTTATTCAACTCTCGAAGGTTTCTCTTTTGATTTGATTGCAATTTT
AGAGGATCTTCAAATCGAGTCTTGTATCTTTGTTGGTCACTCTCTATCCGCCATGGTTGG
TGTCTTGGCTTCTCTTAACCGACCTGACCTCTTCTCCAAAATTGTCATGATTTCTGCTTC
CCCACGATACGTGAACGATGCTGATTACCAAGGTGGGTTCGAGCAAGACGATCTAAACCA
ACTTTTTGAAGCGATGCGAAGCAACTACAAAGCGTGGTGCTTAGGTTTCGCTCCACTCGC
GGTAGGTGGAGACTTAGACTCAGTAGCCGTTCAAGAATTCAGCAGAACGCTCTTCAACAT
GCGTCCGGACATAGCACTTTCCCTGGCTCAAACCATTTTCCAAAGCGACATGAGACAATT
GTTACCTTTTGTCTCTGTCCCTTGTCACATCGTCCAAAGCGTTAAAGATTTAGCCGTGCC
GGTCGCCGTATCCGAGTATCTTC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RS1AB49JQ 616 0 0
ACCTCTTCTCCAAAATTGTCATGATTTCTGCTTCCCCACGATACGTGAACGATGCTGATT
ACCAAGGTGGGTTCGAGCAAGACGATCTAAACCAACTTTTTGAAGCGATGCGAAGCAACT
ACAAAGCGTGGTGCTTAGGTTTCGCTCCACTCGCGGTAGGTGGAGACTTAGACTCAGTAG
CCGTTCAAGAATTCAGCAGAACGCTCTTCAACATGCGTCCGGACATAGCACTTTCCCTGG
CTCAAACCATTTTCCAAAGCGACATGAGACAATTGTTACCTTTTGTCTCTGTCCCTTGTC
ACATCGTCCAAAGCGTTAAAGATTTAGCCGTGCCGGTCGCCGTATCCGAGTATCTTCACA
AAAATCTCGGATGTGAATCTGTCGTCGAGGTTATGTCTTCAGATGGTCCCCTTCCTCAGC
TTAGCTCGCCGGACTCTGTTATTCCCGTTCTACTCCGTCATATCCGCAACGACATTGCTG
TATGATGATGAGAGGAGATGTTAATTAAGTTTAGCGAAATTAAATGTATGATGTGATATG
TCTGGCTGGGTAAGTGAGTATATCGTATCGTTGTCGTTTGTTCTTGGATTCTGAATTTGA
TCAGTTTGTTGTTGCC

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 2

CO CL5631Contig1 1080 2 2 U
GGATTTCTCATTAGATAAAGAGAGAGAGAGATAGAAACTTCAGAGCTCAGTGAGGAAGGA
AACGCATCGCCATGGACGATCGACCTCCCCTCAGCCGCAGAATCCGTTTCCTTCTTCTCG
CCTGGCTTCGCCGTACTCGCTCCGGTAGAATAGAGTTTGTGAGACGATTCGGATACAAGG
AACTCGTGAAAGCAACCGAAGGTTTCCGTAAGGTTATTTACACCAACTACCACGGTTCTG
CATACGCTGCCAAATTCAAAGGCGGCGAGGTTGCTCTGGTCAAAGAACTCAAGTCTCTCG
ATCTCGGACGTGAGAGGTTCTATGAGGAAGTCCAGCTCTTGGGACGCTTACGTCACCGCC
GTCTCCTCACTCTTCGCGGCTTTTGCACCGGACGCAAAAGGATGCTAGTGTATGACAATA
TTGAAAATGGAAGCTTGAAAGAACATCTCAATGATCCGCTTAAGACTCCTTTGAACTGGA
AGACTCGCATCCAAATAGCTATTGGGGTCGCAGCTGCATTAGAATATTTGCTGATCTTTA
GCAGTAGTGATGCACAGATCTATGATGTTTCAGTGAACTCATGTAACATCATGCTGGATC
AAAACTTCACCCCAAAAATTACAGACATCCGCATCAACAGACACACACAAAGCCATCCCA
AACAACCAACGATGCTTGCTCCGAAGGATCATGTACGGATGAGGAATGCGGAAACGTGAT
ATTCCAGCTAGGAGTGTTGATGTTGGAACTGATCACAGGACAATCATCAGACAGACAAGG
CGAAGACTTGATCGAATGGGTACAACACTCTTGCATTGCAAACTCCATTGATAAGATGAT
TGATCCAGATCTCGGCAACAGCTACAACTCTAGAGAACTCCAGAAGGTGCTGGCAGTGGC
TCGACTCTGTATAAAATCGAGGTACGAGCCACCTTCCTTCTCAATAACACATGTTTACCG
GTATCTACAGAAGAAGATTGATGTTGCATCATAACGGTCGAAACTGTGATGACATATGGC
CCATTTCAGACAATTCTAGATGTAATAATAATAGCTAATAGAGTGATATATCATTGTACC


BQ
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AF RS1BR05TF U 1
AF RS1BR05JQ C 332
BS 1 686 RS1BR05TF
BS 687 1080 RS1BR05JQ

RD RS1BR05TF 692 0 0
GGATTTCTCATTAGATAAAGAGAGAGAGAGATAGAAACTTCAGAGCTCAGTGAGGAAGGA
AACGCATCGCCATGGACGATCGACCTCCCCTCAGCCGCAGAATCCGTTTCCTTCTTCTCG
CCTGGCTTCGCCGTACTCGCTCCGGTAGAATAGAGTTTGTGAGACGATTCGGATACAAGG
AACTCGTGAAAGCAACCGAAGGTTTCCGTAAGGTTATTTACACCAACTACCACGGTTCTG
CATACGCTGCCAAATTCAAAGGCGGCGAGGTTGCTCTGGTCAAAGAACTCAAGTCTCTCG
ATCTCGGACGTGAGAGGTTCTATGAGGAAGTCCAGCTCTTGGGACGCTTACGTCACCGCC
GTCTCCTCACTCTTCGCGGCTTTTGCACCGGACGCAAAAGGATGCTAGTGTATGACAATA
TTGAAAATGGAAGCTTGAAAGAACATCTCAATGATCCGCTTAAGACTCCTTTGAACTGGA
AGACTCGCATCCAAATAGCTATTGGGGTCGCAGCTGCATTAGAATATTTGCTGATCTTTA
GCAGTAGTGATGCACAGATCTATGATGTTTCAGTGAACTCATGTAACATCATGCTGGATC
AAAACTTCACCCCAAAAATTACAGACATCCGCATCAACAGACACACACAAAGCCATCCCA
AACAACCAACGATGCTTGCTCCGAAG
ATCATG

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1BR05JQ 749 0 0
CCAGCTCTTGGGACGCTTACGTCACCGCCGTCTCCTCACTCTTCGCGGCTTTTGCACCGG
ACGCAAAAGGATGCTAGTGTATGACAATATTGAAAATGGAAGCTTGAAAGAACATCTCAA
TGATCCGCTTAAGACTCCTTTGAACTGGAAGACTCGCATCCAAATAGCTATTGGGGTCGC
AGCTGCATTAGAATATTTGCTGATCTTTAGCAGTAGTGATGCACAGATCTATGATGTTTC
AGTGAACTCATGTAACATCATGCTGGATCAAAACTTCACCCCAAAAATTACAGACATCCG
CATCAACAGACACACACAAAGCCATCCCAAACAACCAACGATGCTTGCTCCGAAGGATCA
TGTACGGATGAGGAATGCGGAAACGTGATATTCCAGCTAGGAGTGTTGATGTTGGAACTG
ATCACAGGACAATCATCAGACAGACAAGGCGAAGACTTGATCGAATGGGTACAACACTCT
TGCATTGCAAACTCCATTGATAAGATGATTGATCCAGATCTCGGCAACAGCTACAACTCT
AGAGAACTCCAGAAGGTGCTGGCAGTGGCTCGACTCTGTATAAAATCGAGGTACGAGCCA
CCTTCCTTCTCAATAACACATGTTTACCGGTATCTACAGAAGAAGATTGATGTTGCATCA
TAACGGTCGAAACTGTGATGACATATGGCCCATTTCAGACAATTCTAGATGTAATAATAA
TAGCTAATAGAGTGATATATCATTGTACC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

CO CL5632Contig1 576 2 1 U
GGAATCCACCGTATCCGCCATGTCAGAAACCTCCGTCGGATCCTCAATCGACCCTCTCTT
CCACCTCCTCCGCACCGTCCCATTCTCCTTCCTCCGACCACCTCGTCTCCGCCTCAAGCT
CCCAACCTTCACACTCCCATCTCCCATGACCGTCTTCTCCCTCATCCTCCTCACCTACTT
CCTCGTCATCTCGGGATTCATCTACGACGTCATCGTCGAGCCTCCGGGCATCTGACCGAC
CCAGGATCCGGTCACCGGGACGATCCGCCCCGTCGTGTTCATGTCGGGTCGGGTCAACGG
GCAGTACATAATCGAGGGGCTCTCGTCGGGGTTCATGTTCGTGATGGGTGGGGTCGGGAT
CGTGATGCTGGATCTGGCGCTTGATAAGAATCGAGCTAAGAGTGTGAATGCGTCTTATGC
CACGGCGGGTGTTTCGTCGATTGTGATTGGTTATGTTATGAGTATGTTGCATTTTCATGG
ATGTATCTTTGACAATGAGTTTTTAATAGGCCCCAAGCTTGTATAATAGTGTGTTATTTT
CTTAAAATTTAAAATAAAGAGTTATTATGGTGGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1G233TF U 1
AF RS1G233JQ C 220
BS 1 576 RS1G233TF

RD RS1G233TF 576 0 0
GGAATCCACCGTATCCGCCATGTCAGAAACCTCCGTCGGATCCTCAATCGACCCTCTCTT
CCACCTCCTCCGCACCGTCCCATTCTCCTTCCTCCGACCACCTCGTCTCCGCCTCAAGCT
CCCAACCTTCACACTCCCATCTCCCATGACCGTCTTCTCCCTCATCCTCCTCACCTACTT
CCTCGTCATCTCGGGATTCATCTACGACGTCATCGTCGAGCCTCCGGGCATCTGACCGAC
CCAGGATCCGGTCACCGGGACGATCCGCCCCGTCGTGTTCATGTCGGGTCGGGTCAACGG
GCAGTACATAATCGAGGGGCTCTCGTCGGGGTTCATGTTCGTGATGGGTGGGGTCGGGAT
CGTGATGCTGGATCTGGCGCTTGATAAGAATCGAGCTAAGAGTGTGAATGCGTCTTATGC
CACGGCGGGTGTTTCGTCGATTGTGATTGGTTATGTTATGAGTATGTTGCATTTTCATGG
ATGTATCTTTGACAATGAGTTTTTAATAGGCCCCAAGCTTGTATAATAGTGTGTTATTTT
CTTAAAATTTAAAATAAAGAGTTATTATGGTGGTGG

QA 1 576 1 576
DS 

RD RS1G233JQ 357 0 0
GCCTCCGGGCATCTGACCGACCCAGGATCCGGTCACCGGGACGATCCGCCCCGTCGTGTT
CATGTCGGGTCGGGTCAACGGGCAGTACATAATCGAGGGGCTCTCGTCGGGGTTCATGTT
CGTGATGGGTGGGGTCGGGATCGTGATGCTGGATCTGGCGCTTGATAAGAATCGAGCTAA
GAGTGTGAATGCGTCTTATGCCACGGCGGGTGTTTCGTCGATTGTGATTGGTTATGTTAT
GAGTATGTTGCATTTTCATGGATGTATCTTTGACAATGAGTTTTTAATAGGCCCCAAGCT
TGTATAATAGTGTGTTATTTTCTTAAAATTTAAAATAAAGAGTTATTATGGTGGTGG

QA 1 357 1 357
DS 



AS 1 2

CO CL5633Contig1 1165 2 4 U
CCTCCATCTCCAATGGCAACAGAGACCGTATCCGACACTACCGTGCCAAACCATGACGAG
ACCAAGTCAACAGAGTTCGAGAAGGATCAGAAACGGTACCAAGACCTGATCACCACGTTG
CCTCACGTGAAAGGCTGGAGGCCCAAAGCTCCCCTGATTGGGTACGGTGGTCATTGGTGG
ATACAGTTTTTCCTTGAAGGTACCCTTTACGCACGAGAGTTCTTCCAAGCGCGACCCAAA
GACTTCCTCGTTTGTAGTTACCCAAAGACAGGTTCTACTTGGCTCAAATCACTAACATTC
GCAATAGCCAATCGATCTCGCTTCGAAGATTCCACAAACCCTCTCCTCAAACGTAACCCT
CACGAGCTTATTCCTTTCATTGAGATCCAGTTCCCTCAGTTCCCTAACATTGATGTTCTC
CAAGACAAAGGGAACCATCTTTTTTCAACCCATATGCCACACGATTTCTTACCCGATTCG
GTTGTGAAGTCGGGTTGTAAGATGGTTTACATCTGGAGAGACCCAAAGGACACTTTCATC
TCCAGGTGGAGTTTCTTCCAAAAGCAAAGGTTGGAACATGGCCCGCTCAATAGTCTTGAG
GAGTGTTTTGATATGTTCTGTAAAGGTTTTTGTGCGTACGGTCCTTATCTTGATCATGTC
CTGGGATATTGGAAAGCTCACCAAGAGAATCCAGATAAGATTTTGTTCCTCAAGTACGAG
ACTGTGAGAGCTGATCCTTTGCCTTATGTGAAGAGATTGGCTGAGTTCATGAGTTATGGA
TTCACAGCTGAGGAAGAGAAGAGTGGGGTTGTTGAGAAAGTTGTGAATCTTTGCAGCTTT
GAGACAATGAAGAATCTTGAAGCTAACAAAGGAGATAAGGAGAGAGAAGATCATCCTTCT
CCTTATACAAATAGCGCGTATTTCAGGAAAGGAAAAACCGGAGATTGGGTGAATTATCTG
ACCCCAGACATGGCTGCTCGTATGGATGGAATAATGGAAGAGAAATTCAAGGGTACTGGT
TTGCTTGAAAATGGTAAATGAGCTAGTTCTTGTTCGCGGGAAATGATCGGTCCTTGTTTA
AAGCATATGTTCGCTCCTTTTGTCACGCTTATCTATATGTACTACGTTATATGTTGATGA
ATAAAAGATGTTTCTGTTTCATGCC


BQ
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AF RS1AF36TF U 1
AF RS1AF36JQ C 446
BS 1 664 RS1AF36TF
BS 665 665 RS1AF36JQ
BS 666 749 RS1AF36TF
BS 750 1165 RS1AF36JQ

RD RS1AF36TF 749 0 0
CCTCCATCTCCAATGGCAACAGAGACCGTATCCGACACTACCGTGCCAAACCATGACGAG
ACCAAGTCAACAGAGTTCGAGAAGGATCAGAAACGGTACCAAGACCTGATCACCACGTTG
CCTCACGTGAAAGGCTGGAGGCCCAAAGCTCCCCTGATTGGGTACGGTGGTCATTGGTGG
ATACAGTTTTTCCTTGAAGGTACCCTTTACGCACGAGAGTTCTTCCAAGCGCGACCCAAA
GACTTCCTCGTTTGTAGTTACCCAAAGACAGGTTCTACTTGGCTCAAATCACTAACATTC
GCAATAGCCAATCGATCTCGCTTCGAAGATTCCACAAACCCTCTCCTCAAACGTAACCCT
CACGAGCTTATTCCTTTCATTGAGATCCAGTTCCCTCAGTTCCCTAACATTGATGTTCTC
CAAGACAAAGGGAACCATCTTTTTTCAACCCATATGCCACACGATTTCTTACCCGATTCG
GTTGTGAAGTCGGGTTGTAAGATGGTTTACATCTGGAGAGACCCAAAGGACACTTTCATC
TCCAGGTGGAGTTTCTTCCAAAAGCAAAGGTTGGAACATGGCCCGCTCAATAGTCTTGAG
GAGTGTTTTGATATGTTCTGTAAAGGTTTTTGTGCGTACGGTCCTTATCTTGATCATGTC
CTGG*ATATTGGAAAGCTCACCAAGAGAATCCAGATAAGATTTTGTTCCTCAAGTACGAG
ACTGTGAGAGCTGATCCTTTGCCTTATGT

QA 1 749 1 749
DS 

RD RS1AF36JQ 720 0 0
CAACCCATATGCCACACGATTTCTTACCCGATTCGGTTGTGAAGTCGGGTTGTAAGATGG
TTTACATCTGGAGAGACCCAAAGGACACTTTCATCTCCAGGTGGAGTTTCTTCCAAAAGC
AAAGGTTGGAACATGGCCCGCTCAATAGTCTTGAGGAGTGTTTTGATATGTTCTGTAAAG
GTTTTTGTGCGTACGGTCCTTATCTTGATCATGTCCTGGGATATTGGAAAGCTCACCAAG
AGAATCCAGATAAGATTTTGTTCCTCAAGTACGAGACTGTGAGAGCTGATCCTTTGCCTT
ATGTGAAGAGATTGGCTGAGTTCATGAGTTATGGATTCACAGCTGAGGAAGAGAAGAGTG
GGGTTGTTGAGAAAGTTGTGAATCTTTGCAGCTTTGAGACAATGAAGAATCTTGAAGCTA
ACAAAGGAGATAAGGAGAGAGAAGATCATCCTTCTCCTTATACAAATAGCGCGTATTTCA
GGAAAGGAAAAACCGGAGATTGGGTGAATTATCTGACCCCAGACATGGCTGCTCGTATGG
ATGGAATAATGGAAGAGAAATTCAAGGGTACTGGTTTGCTTGAAAATGGTAAATGAGCTA
GTTCTTGTTCGCGGGAAATGATCGGTCCTTGTTTAAAGCATATGTTCGCTCCTTTTGTCA
CGCTTATCTATATGTACTACGTTATATGTTGATGAATAAAAGATGTTTCTGTTTCATGCC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL5634Contig1 1190 2 4 U
GGGAGAGTCACCACCACCAACACTACCAACTATGGCTTTTGCGTCTTCCTCCGTGATTTC
GTCGTTCTTGTGTCACTCTCGATCAAAAGAATCGATCTTTTCTTCGAAAAGTTCATCTTC
GGTTTTGACGGGAAGGAGAGCGTTTGGATCTATCAGAGCAGCTCAAGTGAGTAGCCAGGC
GAACCCTAGACGACGCAATCAGAACGTAGAAGGAGATATATATGTTGACAGTACTTGTAT
TGATTGCGATACTTGTCGTTGGATGGTTCCGGAAGTGTTCACCAGAGTGGATAACATGTC
TGCGGTTATTAAACAACCAACCTGTAAGGAAGAAAGGCTGAACGCTCTTCAGGCCTTGTT
GTCTTGTCCCACGGGATCTATCCGCACTGAAACTCCACCTACTGACATAGGGGAAGCTCA
AGAGACCTTTCCACTTGCACTGGACGAACACAAACTACCTGGCGTTTTTCATTGTGGGTT
TCATTCCAAGAAATCTTTCGGAGCAACTTCCTACTTGATACTTCATCATGAGGGGAATAT
ACTTGTTGATAGTCCCAGGTTCGTAGAGAAACTTGCTGGGAAGATTGAGAAGATGGGTGG
TGTTCGCTACATGTTTTTGACACACAGGGATGATGTTGCGGATCACAAGAAATGGGCAGA
TCGATTCAAGTGTACCAGAATTCTGCATTCTGGAGATGTCCAACCTTCGACCACTGATGT
GGAGTTAAAGCTGGAAGGAAGTGGACCATGGAGACTCTATGAAGATGTGGAGCTTATACA
CACTCCTGGTCACACTGAAGGATCAGTGTGCCTGTTCCATAAACCCCTCAAGGCATTGTT
CACTGGAGACCATCTAACTAAGTACGAATCTGGAATGAGCATTATAGAGAAGTACAATCA
TTGTTCAGTGCCTCTCCAGCTCGAGAGCGTAGAAAGATTGATCAAGCTGGATTTCAATTG
GGTGATACCAGGACATGGAAGAAGAGTACATTTCAAAGATGGAGAAGAGAAGGCAAAGAA
GCTGGAAGCACTTGTTCAGAAGCACAGAGAGGAACAACTTGTTTCTTCTAGCAAATTCGG
TTATGCTTGAGAGACCTTTGTATGCTGATTATAATAAACCAGTGAATCAAACTAAACCAA
GATGTTCTTCACTCTGTACTTTGCTTAATTCAAATTACGAATCTTTGACG


BQ
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AF RS1AT74TF U 1
AF RS1AT74JQ C 625
BS 1 702 RS1AT74TF
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RD RS1AT74TF 728 0 0
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GTCTTGTCCCACGGGATCTATCCGCACTGAAACTCCACCTACTGACATAGGGGAAGCTCA
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TCATTCCAAGAAATCTTTCGGAGCAACTTCCTACTTGATACTTCATCATGAGGGGAATAT
ACTTGTTGATAGTCCCAGGTTCGTAGAGAAACTTGCTGGGAAGATTGAGAAGATGGGTGG
TGTTCGCTACATGTTTTTGACACACAGGGATGATGTTGCGGATCACAAGAAATGGGCAGA
TCGATTCAAGTGTACCAGAATTCTGCATTCTGGAGATGTCCA*CCTTCGACCACTGATGT
GGAGTTAA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1AT74JQ 566 0 0
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GCATTCTGGAGATGTCCAACCTTCGACCACTGATGTGGAGTTAAAGCTGGAAGGAAGTGG
ACCATGGAGACTCTATGAAGATGTGGAGCTTATACACACTCCTGGTCACACTGAAGGATC
AGTGTGCCTGTTCCATAAACCCCTCAAGGCATTGTTCACTGGAGACCATCTAACTAAGTA
CGAATCTGGAATGAGCATTATAGAGAAGTACAATCATTGTTCAGTGCCTCTCCAGCTCGA
GAGCGTAGAAAGATTGATCAAGCTGGATTTCAATTGGGTGATACCAGGACATGGAAGAAG
AGTACATTTCAAAGATGGAGAAGAGAAGGCAAAGAAGCTGGAAGCACTTGTTCAGAAGCA
CAGAGAGGAACAACTTGTTTCTTCTAGCAAATTCGGTTATGCTTGAGAGACCTTTGTATG
CTGATTATAATAAACCAGTGAATCAAACTAAACCAAGATGTTCTTCACTCTGTACTTTGC
TTAATTCAAATTACGAATCTTTGACG

QA 1 566 1 566
DS 



AS 1 2

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TTATCGAATCTTATTCACCATGTGTTTTACTTCTGTTAGTTTAGATAGAATTGTCTGAAA
GATGTACATACTTTGTCAGTCGTCGATGATGTTAAATTGAATCTTTTCTTATCCATTTC


BQ
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AF RS1B569JQ C 1
AF RS1B569TF U 1
BS 1 299 RS1B569TF

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CGTGGAGGAGGAGAAGAGACTAGGTGAGTTATTGTAACTACAATTTTATTACAGGATTGA
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TTATCGAATCTTATTCACCATGTGTTTTACTTCTGTTAGTTTAGATAGAATTGTCTGAAA
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DS 

RD RS1B569TF 299 0 0
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CGTGGAGGAGGAGAAGAGACTAGGTGAGTTATTGTAACTACAATTTTATTACAGGATTGA
TAAAAGTCAACAAGGCTTTGTCGACGGTTGATTTAAGTTCCCGTGACACGTGGCGTAATC
TTATCGAATCTTATTCACCATGTGTTTTACTTCTGTTAGTTTAGATAGAATTGTCTGAAA
GATGTACATACTTTGTCAGTCGTCGATGATGTTAAATTGAATCTTTTCTTATCCATTTC

QA 1 299 1 299
DS 



AS 1 2

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TCACTTTGGTTTGTCTGAAATTAGAGTTTAAGGATTGTCTGAAAAACAAAAAAAAAACAT
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CAGCTTCATCTCTGCCATTTTCTTGTATCCTTTGTAATTGGCTGTGCTTGAGACGC


BQ
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AF RS1G490JQ U 1
AF RS1H227JQB U 1
BS 1 356 RS1G490JQ

RD RS1G490JQ 356 0 0
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TCACTTTGGTTTGTCTGAAATTAGAGTTTAAGGATTGTCTGAAAAACAAAAAAAAAACAT
ACCAATCAATCATCAAACATTGCAAATTACCGGAACTCCCCCTAAGATTTTCCTTTAATT
CAGCTTCATCTCTGCCATTTTCTTGTATCCTTTGTAATTGGCTGTGCTTGAGACGC

QA 1 356 1 356
DS 

RD RS1H227JQB 356 0 0
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ATAAACAAACACCAAACCAAACCAAATAATCCAATAAGAAAGAAAGAAAGAAAAAGGAAA
TGACTCTATACAAAAGAACCATCCCCCCCTCCACTCTCGGTTCCTCCTCTTCCACATCTG
TCACTTTGGTTTGTCTGAAATTAGAGTTTAAGGATTGTCTGAAAAACAAAAAAAAAACAT
ACCAATCAATCATCAAACATTGCAAATTACCGGAACTCCCCCTAAGATTTTCCTTTAATT
CAGCTTCATCTCTGCCATTTTCTTGTATCCTTTGTAATTGGCTGTGCTTGAGACGC

QA 1 356 1 356
DS 



AS 1 2

CO CL5637Contig1 929 2 2 U
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GGGTGGACATTAAGAAGATCAATGAGATATACCGTTACAAGACGGAAGAGTATTCAACTG
ATGCTACTAACAAGTTCAACATCTATCCTGAGCAAATTCCTCCATGGCTCATGGACTGGA
TTCCCGAGCAAGGTGGGTATCTCCTCGGGAATCTACAGCCTGCACACATGGATTTCAGAT
TCTTCACCCTTGGCAACTTCTGGTCTGTTGTTTCCTCTTTGAGTACACCGAAGCAGAACG
AAGCTATATTGAACTTAATTGAAGCTAAATGGGACGACATTATCGGGCATATGCCTCTTA
AGATTTGTTACCCTGCGTTGGAGTATGATGATTGGCGTATAATCACAGGAAGCGATCCAA
AGAACACGCCTTGGTCGTATCACAACAGTGGATCCTGGCCAACGCTTCTTTGGCAGTTCA
CATTAGCATGTATGAAGATGGGTAGACCAGAGCTAGCTGAGGAAGCTCTTGCATTGGCTG
AGAAGAGACTTATGGCAGATCGTTGGCCCGAGTATTACGACACCAGATCTGGCAAATTCA
TTGGAAAGCAGTCTCGGCTTTACCAGACATGGACAGTCGCTGGATTCTTGACTTCTAAAC
TCCTCTTGGCCAATCCTGAGATGGCGTCCAAGTTATTTTGGAAGAAGATTACGAACTTCT
GGATATATGTGTCTGTGGTCTCAGCAAATCTGGTCGGAAAAAATGCTCTCGAGTCGCTGC
CAAGACTCAGATTCTTGTCCGATGAGTGCAAAACATTCTCTGTTTGCTTCTCGCAACGTT
TCAATCGCAATTAGCTTCTATAGGCTAAAGATACTACGGGAATTTTATATTTACAGATAC
ATGACTGTCACATATAATATTGATCATCC


BQ
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AF RS1C111TF U 1
AF RS1C111JQ C 306
BS 1 661 RS1C111TF
BS 662 929 RS1C111JQ

RD RS1C111TF 661 0 0
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GGGTGGACATTAAGAAGATCAATGAGATATACCGTTACAAGACGGAAGAGTATTCAACTG
ATGCTACTAACAAGTTCAACATCTATCCTGAGCAAATTCCTCCATGGCTCATGGACTGGA
TTCCCGAGCAAGGTGGGTATCTCCTCGGGAATCTACAGCCTGCACACATGGATTTCAGAT
TCTTCACCCTTGGCAACTTCTGGTCTGTTGTTTCCTCTTTGAGTACACCGAAGCAGAACG
AAGCTATATTGAACTTAATTGAAGCTAAATGGGACGACATTATCGGGCATATGCCTCTTA
AGATTTGTTACCCTGCGTTGGAGTATGATGATTGGCGTATAATCACAGGAAGCGATCCAA
AGAACACGCCTTGGTCGTATCACAACAGTGGATCCTGGCCAACGCTTCTTTGGCAGTTCA
CATTAGCATGTATGAAGATGGGTAGACCAGAGCTAGCTGAGGAAGCTCTTGCATTGGCTG
AGAAGAGACTTATGGCAGATCGTTGGCCCGAGTATTACGACACCAGATCTGGCAAATTCA
TTGGAAAGCAGTCTCGGCTTTACCAGACATGGACAGTCGCTGGATTCTTGACTTCTAAAC
T

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DS 

RD RS1C111JQ 624 0 0
ATATTGAACTTAATTGAAGCTAAATGGGACGACATTATCGGGCATATGCCTCTTAAGATT
TGTTACCCTGCGTTGGAGTATGATGATTGGCGTATAATCACAGGAAGCGATCCAAAGAAC
ACGCCTTGGTCGTATCACAACAGTGGATCCTGGCCAACGCTTCTTTGGCAGTTCACATTA
GCATGTATGAAGATGGGTAGACCAGAGCTAGCTGAGGAAGCTCTTGCATTGGCTGAGAAG
AGACTTATGGCAGATCGTTGGCCCGAGTATTACGACACCAGATCTGGCAAATTCATTGGA
AAGCAGTCTCGGCTTTACCAGACATGGACAGTCGCTGGATTCTTGACTTCTAAACTCCTC
TTGGCCAATCCTGAGATGGCGTCCAAGTTATTTTGGAAGAAGATTACGAACTTCTGGATA
TATGTGTCTGTGGTCTCAGCAAATCTGGTCGGAAAAAATGCTCTCGAGTCGCTGCCAAGA
CTCAGATTCTTGTCCGATGAGTGCAAAACATTCTCTGTTTGCTTCTCGCAACGTTTCAAT
CGCAATTAGCTTCTATAGGCTAAAGATACTACGGGAATTTTATATTTACAGATACATGAC
TGTCACATATAATATTGATCATCC

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

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GGACATTCGTGTTCTGCGTTTCTCATCGATCGGCTGAGACGATGACGTTCTAGTTCCGTA
ACGGGGGCGTTGTAATTTCTGCGTCTTTAATCTCATTGTCTTTAATCCCATTAAATCAGA
CGCTCATTACGATCTCTTCTGTTGCGTTGTTCATTCTGCAATTTCGTGTATAATAGGTTC
GTATCTCACATCTGCGAATCGCGATCTCGAAATCTCTCTGTTATCCTTCTCTTTCATATT
CATCTCTTAATACTCATCTCTCTGTTCTTCTGTTGTCGAGGCGAGGCTTCTGAGATTCTG
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CGTTAACACCATGATGAACTACTCTCTCATGGTCAAACGGTCCAAATATCTCATGGAAGC
TCAAGTGGCCGGGTGTGTTCGACGTCTGAAGCAGAGCGGTATCTGGGCAGAAGAAGAAGC
GATAGAACGAAGGGATATGGGGTCTAGACCTCCTATGCAAACATTTTCAAGCAATGTGTA
TTTATTGAGATCTGATTGGTTTCACGGACCCGCTATTGCTGTCTGAAATTGTAGGGAGAT
ACTAAATACGTCGAACAAACAAACGTGATATGAGTTTTGTGTTGTGATTGGAAGAGAGTT
GTTTGTTTGTTTGA


BQ
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AF RS1F041TF U 1
AF RS1EW65TF U 1
BS 1 674 RS1EW65TF

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ACGGGGGCGTTGTAATTTCTGCGTCTTTAATCTCATTGTCTTTAATCCCATTAAATCAGA
CGCTCATTACGATCTCTTCTGTTGCGTTGTTCATTCTGCAATTTCGTGTATAATAGGTTC
GTATCTCACATCTGCGAATCGCGATCTCGAAATCTCTCTGTTATCCTTCTCTTTCATATT
CATCTCTTAATACTCATCTCTCTGTTCTTCTGT*GTCGAGGCGAGGCTTCTGAGATTCTG
GAAA

QA 1 304 1 304
DS 

RD RS1EW65TF 674 0 0
GGACATTCGTGTTCTGCGTTTCTCATCGATCGGCTGAGACGATGACGTTCTAGTTCCGTA
ACGGGGGCGTTGTAATTTCTGCGTCTTTAATCTCATTGTCTTTAATCCCATTAAATCAGA
CGCTCATTACGATCTCTTCTGTTGCGTTGTTCATTCTGCAATTTCGTGTATAATAGGTTC
GTATCTCACATCTGCGAATCGCGATCTCGAAATCTCTCTGTTATCCTTCTCTTTCATATT
CATCTCTTAATACTCATCTCTCTGTTCTTCTGTTGTCGAGGCGAGGCTTCTGAGATTCTG
GAAAGGTAGGAATATCAACCGTGGTGGGGAGCATATGTGGGCTGATCTGCTCATGGTTGA
CGTTAACACCATGATGAACTACTCTCTCATGGTCAAACGGTCCAAATATCTCATGGAAGC
TCAAGTGGCCGGGTGTGTTCGACGTCTGAAGCAGAGCGGTATCTGGGCAGAAGAAGAAGC
GATAGAACGAAGGGATATGGGGTCTAGACCTCCTATGCAAACATTTTCAAGCAATGTGTA
TTTATTGAGATCTGATTGGTTTCACGGACCCGCTATTGCTGTCTGAAATTGTAGGGAGAT
ACTAAATACGTCGAACAAACAAACGTGATATGAGTTTTGTGTTGTGATTGGAAGAGAGTT
GTTTGTTTGTTTGA

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

CO CL5639Contig1 494 2 1 U
GGCCAAACATCATAAGAAACATACAAACAGAAATCTTCTGGCTTCACTACCGTTTTGTGA
TGGAGAACAAGAAAAAGGCCAATCATGAAGATGAAGGTCGTGATTGTGTTCTTCCTGTAC
ATAGCCAAGTAGTGAAGATCAAGAAAGAGTGCGAGAAGATTCATCAGCCGGAGATGCTGA
GGGTGCTTCTCCATATCACGGGTCCACGGCGTTCCCGTTCTCCCCTTGGGTTAGGGCAGA
GAGACAATAGACCCATCACCGTTGGGAATTGATAACAAAGAAAGAGAGAGAGAGATGGAG
ATAAGTTATTCTCTGTGTATTTTAGGCTTCTCTCTTTTGTCTTTGAACGTAAATATCTTT
AGTTAATATAAACAAATATTTTGCTTATCTTCTAATCTTTTGAGGGGATAAACCATAACT
AGCTCATAGAGAAGGGCTCATATAGTTAGTTATATGTATTCAAAAGTGGACAAGCTTAAA
CAGACCCATCATGG


BQ
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GGGTGCTTCTCCATATCACGGGTCCACGGCGTTCCCGTTCTCCCCTTGGGTTAGGGCAGA
GAGACAATAGACCCATCACCGTTGGGAATTGATAACAAAGAAAGAGAGAGAGAGATGGAG
ATAAGTTATTCTCTGTGTATTTTAGGCTTCTCTCTTTTGTCTTTGAACGTAAATATCTTT
AGTTAATATAAACAAATATTTTGCTTATCTTCTAATCTTTTGAGGGGATAAACCATAACT
AGCTCATAGAGAAGGGCTCATATAGTTAGTTATATGTATTCAAAAGTGGACAAGCTTAAA
CAGACCCATCATGG

QA 1 494 1 494
DS 

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TT
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TATGTATTCAAAAGTGGACAAGCTTAAACAGACCCATCATGG

QA 3 104 3 104
DS 



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TTTTTCTTCTCCTCTTCTTTGTCCTAAAGTCTCAAGCTTTGGTCTCGAAAGATGTCGGTA
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AGTTTGTAAAGTATAATACTTTCAGGGTTTATTCCGCAAATTCGATTTTTGGGTCAAAAA
CACTTTTTCATTATTATCCTGTGATCAAAGGTTCTTCATTGAATTGATTTGAATTGAATT
GGGGTTGGATACACAGAAGAAGAAGAAGAAGTTTAGAAAGGGTTACTTAGATTTTGG


BQ
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CACTTTTTCATTATTATCCTGTGATCAAAGGTTCTTCATTGAATTGATTTGAATTGAATT
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DS 

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ACAGCTCGATGATGATGGTTTTGTAAATGGATGATGTTAGTTTGGTTGTAGCAGAATCTA
AGTTTGTAAAGTATAATACTTTCAGGGTTTATTCCGCAAATTCGATTTTTGGGTCAAAAA
CACTTTTTCATTATTATCCTGTGATCAAAGGTTCTTCATTGAATTGATTTGAATTGAATT
GGGGTTGGATACACAGAAGAAGAAGAAGAAGTTTAGAAAGGGTTACTTAGATTTTGG

QA 1 357 1 357
DS 



AS 1 2

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ATTGCTGCCAAGCTTGTGGCTAATCTGATAACAAAGTCTGGTGCTGACCGTGTTCTTGCT
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GATGCTCCTTTAGCCATAGTTGACAAAAGACGTCATGGACACAATGTTGCCGAGGTGATG
AACTTAATTGGGGATGTTAAAGGGAAAGTAGCTATAATGGTGGATGACATGATTGACACA
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TTCCAAGAGGTGATCATAACCAACACGATTCCACTGTCGGAGCAAAACTACTTTCCTCAG
CTTACAGTTCTCTCAGTAGCAAACCTTCTCGCGGAGACCATACGGCGTGTTCATGATGAT
TGTTCTGGAGACATTGAGCCATTTTCGACACTGGGGATTGATTGACTGATACAACAATGG
TCAAGAATCGACTCAACCGCTCTCAATAGTAATGGATTTCTGATCGTGTAAATGTTAGAC
ATGTGTGATGTGTGTGTGTGTGAATGATTTTAGAGGAAACAACTTGTAAGATCACATTTT
CT


BQ
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10 10 

AF RS1E793TF U 1
AF RS1E793JQ C 626
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BS 752 785 RS1E793TF
BS 786 1382 RS1E793JQ

RD RS1E793TF 785 0 0
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TCTCCACGCTCAATTTCACCTAGTTTACCGACGGCGAATCTCCGGCGATCTTCTCCTCTG
ATTCATCGTCCTCCTCCTACTTCCGTTCGTTTTCCTCTTAGGTGTAAGGCGGTGGATTCG
TACGGCGGGAACTCCGACGATTTGTATCTGCTTACAGGCGACACGGTTCCCGAGAGCGCT
CTTCTCTCGAGGACGCGGTTGGAAGATGCGATTAACAAGAACTCTACGCGGCTCCGTATC
TTCTCCGGCACTGCTAATCCTTCCTTGGCTCAGGAGATTTCATGCTATTTGGGACTGGAG
CTAGGGAAAATCAAGATTAAACGGTTTGCTGATGGGGAGATCTATGTTCAGCTTCAAGAG
AGTGTTAGGGGATGCGATGTGTTTCTTGTACAGCCTACGTGTCCACCTGCCAATGAGAAC
CTTATGGAACTGCTCGTTATGATTGATGCCTGTCGTAGAGCATCTGCCGAAACCATCACC
GCTGTGATTCCTTACTTTGGCTATGCTCGAGCTGATAGGAAGACTCAGGGACGTGAATCT
ATTGCTGCCAAGCTTGTGGCTAATCTGATAACAAAGTCTGGTGCTGACCGTGTTCTTGCT
TGTGACCTTCACTCTGGACAGTCTATGGGTTACTTTGATATTCCAGTTGACCATGTTTAT
GGCCAGCCTGTGATACTTGATTACCTGACA*GCAAAGGCATATCCTCTGATGATTTGGTG
GTTGT

QA 1 785 1 785
DS 

RD RS1E793JQ 757 0 0
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TGACAAGCAAAGGCATATCCTCTGATGATTTGGTGGTTGTTTCGCCTGATGTTGGTGGAG
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AAGTAGCTATAATGGTGGATGACATGATTGACACAGCCGGAACCATAAGCAAAGGTGCAG
CTCTGTTACACCAAGAAGGAGCAAGAGAAGTCTACGCATGTACTACTCATGCCGTTTTCA
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CGACACTGGGGATTGATTGACTGATACAACAATGGTCAAGAATCGACTCAACCGCTCTCA
ATAGTAATGGATTTCTGATCGTGTAAATGTTAGACATGTGTGATGTGTGTGTGTGTGAAT
GATTTTAGAGGAAACAACTTGTAAGATCACATTTTCT

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

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TACTAAATCCATAAATGAAAACGTTCTTCTCGAAATGCCAGTACCATCCATTATCAAAGA
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AGAATCAACCACAGTGGATGAAATCCTTGTATCTCTCAAGCTTGGGACCGAACATACTGC
GCTCGAGACTGTTAACAAGTTAGAATCTGCTATATTTGCATGGAAGGAAAGGATTACAGA
GCAGGAAATCAACACTAAATCTCCTGTGAGGACACCGTGGTCATTTGCTAAAGATCCATT
GTCTGACACTGGTCGGAATGAGTTTCTCTTGAACAGAGCGGAACACTTAGAAGTCAGATC
AAATCCAAGTACCCTAATCTTCCTCAGTCGTTTCTTGATGCCACAAAAATTCAGTATGGC
AAGGACGTAGGTCATGCGGTTCTTGAGGCATATTCAAGAACACTTGCTAATTTGGCGTAC
AGGATACTTTCAAGAATGGGAGAGATATTGAAAGAAGATTCTTTGAGTAACCCAAACTCT
CCTGCGCCACCGAGTTGTTTCCCTAGCTCTCGTGATCTTTACAGAACACCTGAGAGGCCT
TTGCCCTCGTCTCGTGCAAGGCATTCTCTAACAGATGACATGAAGAAAGCCGATGGGATA
CAGGCGGAAACTGGTTTAGATTTCTTGTTCGCAGATGCTAAGGTCAGTTCGGTGAATGCA
GCAACTCCGAGTAGGAGCAGTAGGATATGGTGTATGAGCAAAGTACCACCTGATGCTTCT
CCTTGATTCAGAGGGCTTAACTTAAAGTTCGATGCGTGCCCCCTGAAGCTTCTCCTTTTC
TTTTGTTTTAGAGGGTCCCTTTAAATTATGGAGTCTCGGATATTGTAGATGTATTGATAA
CATGCTCTAAACTATGAATATTGGCAATTTTGTTCATAACTGTGGAGGAAAAAAATGAAC
TTCCAATCGGATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C626TF U 1
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BS 1 728 RS1C626TF
BS 729 729 RS1C626JQ
BS 730 774 RS1C626TF
BS 775 1154 RS1C626JQ

RD RS1C626TF 774 0 0
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GCAGGAAATCAACACTAAATCTCCTGTGAGGACACCGTGGTCATTTGCTAAAGATCCATT
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AAATCCAAGTACCCTAATCTTCCTCAGTCGTTTCTTGATGCCACAAAAATTCAGTATGGC
AAGGACGTAGGTCATGCGGTTCTTGAGGCATATTCAAGAACACTTGCTAATTTGGCGTAC
AGGATACTTTCAAGAATGGGAGAGATATTGAAAGAAGATTCTTTGAGTAACCCAAACTCT
CCTGCGCC*CCGAGTTGTTTCCCTAGCTCTCGTGATCTTTACAGAACACCTGAG

QA 1 774 1 774
DS 

RD RS1C626JQ 743 0 0
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AGATCCATTGTCTGACACTGGTCGGAATGAGTTTCTCTTGAACAGAGCGGAACACTTAGA
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CAGTATGGCAAGGACGTAGGTCATGCGGTTCTTGAGGCATATTCAAGAACACTTGCTAAT
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GAGAGGCCTTTGCCCTCGTCTCGTGCAAGGCATTCTCTAACAGATGACATGAAGAAAGCC
GATGGGATACAGGCGGAAACTGGTTTAGATTTCTTGTTCGCAGATGCTAAGGTCAGTTCG
GTGAATGCAGCAACTCCGAGTAGGAGCAGTAGGATATGGTGTATGAGCAAAGTACCACCT
GATGCTTCTCCTTGATTCAGAGGGCTTAACTTAAAGTTCGATGCGTGCCCCCTGAAGCTT
CTCCTTTTCTTTTGTTTTAGAGGGTCCCTTTAAATTATGGAGTCTCGGATATTGTAGATG
TATTGATAACATGCTCTAAACTATGAATATTGGCAATTTTGTTCATAACTGTGGAGGAAA
AAAATGAACTTCCAATCGGATTG

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

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CGCATAACTTGAGGAAGTATGGGATTAGGGAGTTTTTGTTCGTCGATCAACTCAGTGGTC
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GACTATGGTCACTCATATGTTTTGTACTGAAAGCCGTTCGGGAGATTATCCGGATGTTAT
ACGTACCTCATGACCAGCCATGGCTATCCGTTATAATCCTCTTATCGATGATCTTGTCAT
GGACTTACCTAAGCACTATATTCCTTGCTGCGAGCTCCATGTTTCATCTGGTCTGCAACT
TGCAAGTCATTCACTTCGAAGATTACGCAAAGCTCTTAGATGAGGAGTCCGAGATCTCCT
TTTTCATCGGCGAGCACTCCAATTTGCGCCGTTACCTGTCCAAAATAAGCCACAGGTTCC
GCATCTTCCTGGTTCTCCAGTTTCTTGTTGTCACTGCTAGCCAGATCACTACACTCGTCC
AGACCACTGCGTACAGTGGGCGTATCACTTATATAAACGGTGGCGATTTCGCTGTCTCGG
CGGTGGTCCAAGTCGTTGGGATAATTTTATGTCTGCACGCAGCAACGAAGATATCTCATA
GAGCACAAGCGATAGCATCAGTTGCAAGTAAATGGCATGCGATAATGTCTTGTTCATCTA
CGGATTCAACTCAGATAAGGACTTCTCCTAGTGGTGTTCACTTGGAAGCCACCACGAATC
CACCCGTCTCCTTTCGGATTTCAAATTCAGAAAGCGATGTGGAATCAATGGATCATCATC
ACTACGTGAGGATGCCTGCTAGTAGTAATAACAACCACTTTTCTTCGTACATGTCTATGT
CCGCATACCACAGAAGACAAGCTTTTGTGTTGTATTTGCAGATGAATCCAGGTGGGATAA
CGATATTCGGGTGGACAGTAGACAGGCATTTGATTAACACGATATTCTTCATTGAGCTCT
CTCTTGTTACCTTTGTACTTGGGAGGACTGTTGTCTTCACTTCTGAATGACCACACAACA
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TTCAATTTTATTTTTTTGCAACTGAGAGGAGGAGAAACTTGTCATGAGCTTCTCTTAATT
TGTTTACGTGTACAGTGTTTTATAAGCTGTTATTGACGGCTTTGATTGATTTTCTACACC
TG


BQ
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10 10 

AF RS1B421TF U 1
AF RS1B421JQ C 398
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CGCATAACTTGAGGAAGTATGGGATTAGGGAGTTTTTGTTCGTCGATCAACTCAGTGGTC
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GACTATGGTCACTCATATGTTTTGTACTGAAAGCCGTTCGGGAGATTATCCGGATGTTAT
ACGTACCTCATGACCAGCCATGGCTATCCGTTATAATCCTCTTATCGATGATCTTGTCAT
GGACTTACCTAAGCACTATATTCCTTGCTGCGAGCTCCATGTTTCATCTGGTCTGCAACT
TGCAAGTCATTCACTTCGAAGATTACGCAAAGCTCTTAGATGAGGAGTCCGAGATCTCCT
TTTTCATCGGCGAGCACTCCAATTTGCGCCGTTACCTGTCCAAAATAAGCCACAGGTTCC
GCATCTTCCTGGTTCTCCAGTTTCTTGTTGTCACTGCTAGCCAGATCACTACACTCGTCC
AGACCACTGCGTACAGTGGGCGTATCACTTATATAAACGGTGGCGATTTCGCTGTCTCGG
CGGTGGTCCAAGTCGTTGGGATAATTTTATGTCTGCACGCAGCAACGAAGATATCTCATA
GAGCACAAGCGATAGCATCAGTTGCAAGTAA*TGGCATGCGATAATGTCTTGTTCATCTA
C
AGATCACTC

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DS 

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ATAAGCCACAGGTTCCGCATCTTCCTGGTTCTCCAGTTTCTTGTTGTCACTGCTAGCCAG
ATCACTACACTCGTCCAGACCACTGCGTACAGTGGGCGTATCACTTATATAAACGGTGGC
GATTTCGCTGTCTCGGCGGTGGTCCAAGTCGTTGGGATAATTTTATGTCTGCACGCAGCA
ACGAAGATATCTCATAGAGCACAAGCGATAGCATCAGTTGCAAGTAAATGGCATGCGATA
ATGTCTTGTTCATCTACGGATTCAACTCAGATAAGGACTTCTCCTAGTGGTGTTCACTTG
GAAGCCACCACGAATCCACCCGTCTCCTTTCGGATTTCAAATTCAGAAAGCGATGTGGAA
TCAATGGATCATCATCACTACGTGAGGATGCCTGCTAGTAGTAATAACAACCACTTTTCT
TCGTACATGTCTATGTCCGCATACCACAGAAGACAAGCTTTTGTGTTGTATTTGCAGATG
AATCCAGGTGGGATAACGATATTCGGGTGGACAGTAGACAGGCATTTGATTAACACGATA
TTCTTCATTGAGCTCTCTCTTGTTACCTTTGTACTTGGGAGGACTGTTGTCTTCACTTCT
GAATGACCACACAACAAAATAAAGGTTTGCTGTATCATACACATTTTTTTTACCCTTTTG
CCACATATGTAACATTTTCAATTTTATTTTTTTGCAACTGAGAGGAGGAGAAACTTGTCA
TGAGCTTCTCTTAATTTGTTTACGTGTACAGTGTTTTATAAGCTGTTATTGACGGCTTTG
ATTGATTTTCTACACCTG

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DS 



AS 0 0

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GTTTTGGTGTTATGATGGATGGATTGAGTATGACTTTTATCCCTGGCCATCCCCTTGAAT
GTTTTTTACTTTTTAGTTGAGAACTGGTTTGTCTATTTGTTCGCAAATATTTTACTTTTC
GC


BQ
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AF RS1EZ85JQ C 1
AF RS1EZ85TF U 1
BS 1 302 RS1EZ85TF

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AGGAGCAGATGACTCCATTGTCCGACTTCGAAGACAGGCTGTAAGCAGCAGCAGCAGGCA
ACAACAAGACCACCTCTTTTTATATTTCACTCTGGTCACCTTTTGATCTCTTTGTTTTCT
GTTTTGGTGTTATGATGGATGGATTGAGTATGACTTTTATCCCTGGCCATCCCCTTGAAT
GTTTTTTACTTTTTAGTTGAGAACTGGTTTGTCTATTTGTTCGCAAATATTTTACTTTTC
GC

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DS 

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AGGAGCAGATGACTCCATTGTCCGACTTCGAAGACAGGCTGTAAGCAGCAGCAGCAGGCA
ACAACAAGACCACCTCTCTTTATATTTCACTCTGGTCACCTTTTGATCTCTTTGTTTTCT
GTTTTGGTGTTATGATGGATGGATTGAGTATGACTTTTATCCCTGGCCATCCCCTTGAAT
GTTTTTTACTTTTTAGTTGAGAACTGGTTTGTCTATTTGTTCGCAAATATTTTACTTTTC
GC

QA 1 302 1 302
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GCTGCTTCTGTGCAGCCGCTGCAGCCGCCACAGATGGAGCAGCCGTTGGTTAAGAAGAAG
CGTGGACGGCCGAGGAAGTACGCTCCTCCTGATGGACAAGTCTCTTTAGGGCTTTCTCCT
GTGCCTTGTTCTTCTGGTGGTAGTAGTAAAGCAGCTAAGGACTCTTCTGCAGTGACTGAT
CCAAATGCTCCTAAACGAGCTAGAGGTCGACCTCCTGGTACTGGAAGGAAGCAACGTTTA
GCTAATCTTGGTGAGTGGATGAACACTTCAGCTGGACTTGCTTTTGCACCTCATGTCATC
AGTGTTGGAGCAGGAGAAGATATCGTTTCAAAAGTCATGTCATTCTCACAGCAAAGACCT
CGAGCTCTTTGTATAATGTCAGGCACCGGAACAGTTTCTTCAGTCACTCTACGTCAACCC
GCTACAACAGAGTCTTCTTTGACATATGAGGGACGTTTTGAGATACTAAGTCTAGGGGGA
TCTTATTTGGTGAATGAAGAAGGTGGATCCAAAAGCCGAACAGGCGGTTTGAGTGTCTCC
CTTTCTGGTCCTGAAGGTCATGTTATTGGCGGTGGGATTGGAATGCTTATTGCAGCCAGC
CTCGTTCAGGTTGTGGCTTGTAGTTTTATATACGTAGGAGTTAATAACAGTAACAAGACT
ATCAAACAAGAAAATAAACCAAAGGAAGAGCACAAGGATAGCGAAATGGAGACTAATCCA
CAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGCACAGGTGGGTCAGGAGACGCCACAGAACTTC
TCAGGTCAGGGAATGAGTGGATGGCCCGGTTCAGGGGAAGGTTCAGTCTCAGTTTCAGGC
AGATCACTTGACTCTATTAGCGGAAGAAACCTATTCACTGATATTGACTTGACTCGCGGA
TGATTCAGAACGAGACAGTATTTAATCTTTCTTCCTATTTTACTACCTTCTTAGCTATTG
AAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCATACGTGCAGAATGTGAATGCTGTAAATATCTTCTTTG
TTGTTGTAGATTTTATCTGAGAATGTTAAAACCAGAAATCTCGGAGAATTGAGACAGATC
TCTGTGTTCCTTGTAACATTGTTAATGTAGCAACTAGCTAGACCCCTTTCTTCAGGTTAT
TATTTAAGGAGATGTTTAACCTTAGCTATCCCATAAAGCTCTCTCTCTCTTTCTTTGTGG
TCGCCACCAAGAAACCTGGTTTTCATCAGTAGAGAGGTCTTAAGTTCAGC


BQ
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AF RS1FS07TF U 1
AF RS1FS07JQ C 508
BS 1 605 RS1FS07TF
BS 606 1250 RS1FS07JQ

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CGTGGACGGCCGAGGAAGTACGCTCCTCCTGATGGACAAGTCTCTTTAGGGCTTTCTCCT
GTGCCTTGTTCTTCTGGTGGTAGTAGTAAAGCAGCTAAGGACTCTTCTGCAGTGACTGAT
CCAAATGCTCCTAAACGAGCTAGAGGTCGACCTCCTGGTACTGGAAGGAAGCAACGTTTA
GCTAATCTTGGTGAGTGGATGAACACTTCAGCTGGACTTGCTTTTGCACCTCATGTCATC
AGTGTTGGAGCAGGAGAAGATATCGTTTCAAAAGTCATGTCATTCTCACAGCAAAGACCT
CGAGCTCTTTGTATAATGTCAGGCACCGGAACAGTTTCTTCAGTCACTCTACGTCAACCC
GCTACAACAGAGTCTTCTTTGACATATGAGGGACGTTTTGAGATACTAAGTCTAGGGGGA
TCTTATTTGGTGAATGAAGAAGGTGGATCCAAAAGCCGAACAGGCGGTTTGAGTGTCTCC
CTTTCTGGTCCTGAAGGTCATGTTATTGGCGGTGGGATTGGAATGCTTATTGCAGCCAGC
CTCGT

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DS 

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ATATACGTAGGAGTTAATAACAGTAACAAGACTATCAAACAAGAAAATAAACCAAAGGAA
GAGCACAAGGATAGCGAAATGGAGACTAATCCACAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA
GCACAGGTGGGTCAGGAGACGCCACAGAACTTCTCAGGTCAGGGAATGAGTGGATGGCCC
GGTTCAGGGGAAGGTTCAGTCTCAGTTTCAGGCAGATCACTTGACTCTATTAGCGGAAGA
AACCTATTCACTGATATTGACTTGACTCGCGGATGATTCAGAACGAGACAGTATTTAATC
TTTCTTCCTATTTTACTACCTTCTTAGCTATTGAAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCATACG
TGCAGAATGTGAATGCTGTAAATATCTTCTTTGTTGTTGTAGATTTTATCTGAGAATGTT
AAAACCAGAAATCTCGGAGAATTGAGACAGATCTCTGTGTTCCTTGTAACATTGTTAATG
TAGCAACTAGCTAGACCCCTTTCTTCAGGTTATTATTTAAGGAGATGTTTAACCTTAGCT
ATCCCATAAAGCTCTCTCTCTCTTTCTTTGTGGTCGCCACCAAGAAACCTGGTTTTCATC
AGTAGAGAGGTCTTAAGTTCAGC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

CO CL5648Contig1 1183 2 2 U
GGACACAATTTTCTGGAGCTGGAAATAGAAAACAAAAGCTTTGTTTTTTCCCCTTTTTTT
TATTTCTGGGGGGTGTAGATAGAAAGATTGATCTGAAGCTAAAGAAGAAAATGGGAGAGT
CTGCAGTTCTAGCTCATTCGTATTCCTTCGCAGCTCCTATTACCCATTCTGATTCTCATG
AGGATAACACGATCCCTGCGCTTAGCCAATCGATATCCTTTGGGAAGTTCATGAGTGAGG
ATCTCGAATGGGGAAAATGGTCTACCTTTTCGCACAAGAAGTACGTTGAAGAAGCTGAGA
AGTACTCTCGTCCTGGCTCCGTTGCTCAGAAGAAAGCTTTCTTCGAAGCTCACTACAAGC
GTATAGCCGAAGCCAAGAAAGCTGCAGCGGAAGAACAACCAACGGTCACGCCTGCCGAAG
TTTTGCTCCACGCTTTGGAGACACAGCCTCCGTTGAGTTTGTTACCAGAGGAAGAACCAC
TCGAAAGGAGAAGTATTCATAACCATGAAGACGTTCTTGTTCTTGTGGATGATGGTTCCT
TGGAAGAGAAGAAGAATCAAGATGAAGAAGAGGTGGTGTTGAAAGAGGATTGCTCTGTTG
ATGAAAAGGAGAAGGCTAAAACAAAGAACAAACCGGTGTTTAGATTGTCTCTGGAGAAGA
CAATCCCCCCTGCTAAATCTTTAGAGATTGCTTCATCAGATAAAACAAGTGAAAGACATC
AGATGATTCAGAGTTCAGGGGTTCAACGCCAGAAATTCAGTTTCTTGAACTGTTTCATTG
GTAATTCTAAAACTCGAGATCAGAGTCAAAACATGAGAAAGACGGAGAAGAAGAACCAAA
AGAAGAAGCAGTTCATGTGTCTTTGTTTGAAACCAAAGACTATAAGAGAATCATAAGGAA
AGCAAAAAGAATACAACTTTGAAGCAAGCTCTACCCAAGTCTGCAAAAATGGCAAATGGG
AGAAATAAAAAGATTTGGACTTCATGGTTCGATCAAGCTACTTAAAGTGATTAAACCCAG
AACGATTTTATTACCGTAGAATGGCCCCGATTATACTCTTTTATCACCAATTTTAAAGAG
TCTGAGTGCATTAGGAAGAAGAAGAAGAAGAATAGCTTCTTTTGTTTAAGTCCTTTTGAT
CTCAGACTACTTATGTAATGAAAGAACAAGTCCGATTCTTTAC


BQ
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AF RS1A985TF U 1
AF RS1A985JQ C 545
BS 1 657 RS1A985TF
BS 658 1183 RS1A985JQ

RD RS1A985TF 657 0 0
GGACACAATTTTCTGGAGCTGGAAATAGAAAACAAAAGCTTTGTTTTTTCCCCTTTTTTT
TATTTCTGGGGGGTGTAGATAGAAAGATTGATCTGAAGCTAAAGAAGAAAATGGGAGAGT
CTGCAGTTCTAGCTCATTCGTATTCCTTCGCAGCTCCTATTACCCATTCTGATTCTCATG
AGGATAACACGATCCCTGCGCTTAGCCAATCGATATCCTTTGGGAAGTTCATGAGTGAGG
ATCTCGAATGGGGAAAATGGTCTACCTTTTCGCACAAGAAGTACGTTGAAGAAGCTGAGA
AGTACTCTCGTCCTGGCTCCGTTGCTCAGAAGAAAGCTTTCTTCGAAGCTCACTACAAGC
GTATAGCCGAAGCCAAGAAAGCTGCAGCGGAAGAACAACCAACGGTCACGCCTGCCGAAG
TTTTGCTCCACGCTTTGGAGACACAGCCTCCGTTGAGTTTGTTACCAGAGGAAGAACCAC
TCGAAAGGAGAAGTATTCATAACCATGAAGACGTTCTTGTTCTTGTGGATGATGGTTCCT
TGGAAGAGAAGAAGAATCAAGATGAAGAAGAGGTGGTGTTGAAAGAGGATTGCTCTGTTG
ATGAAAAGGAGAAGGCTAAAACAAAGAACAAACCGGTGTTTAGATTGTCTCTGGAGA

QA 1 657 1 657
DS 

RD RS1A985JQ 639 0 0
AGAGAAGAAGAATCAAGATGAAGAAGAGGTGGTGTTGAAAGAGGATTGCTCTGTTGATGA
AAAGGAGAAGGCTAAAACAAAGAACAAACCGGTGTTTAGATTGTCTCTGGAGAAGACAAT
CCCCCCTGCTAAATCTTTAGAGATTGCTTCATCAGATAAAACAAGTGAAAGACATCAGAT
GATTCAGAGTTCAGGGGTTCAACGCCAGAAATTCAGTTTCTTGAACTGTTTCATTGGTAA
TTCTAAAACTCGAGATCAGAGTCAAAACATGAGAAAGACGGAGAAGAAGAACCAAAAGAA
GAAGCAGTTCATGTGTCTTTGTTTGAAACCAAAGACTATAAGAGAATCATAAGGAAAGCA
AAAAGAATACAACTTTGAAGCAAGCTCTACCCAAGTCTGCAAAAATGGCAAATGGGAGAA
ATAAAAAGATTTGGACTTCATGGTTCGATCAAGCTACTTAAAGTGATTAAACCCAGAACG
ATTTTATTACCGTAGAATGGCCCCGATTATACTCTTTTATCACCAATTTTAAAGAGTCTG
AGTGCATTAGGAAGAAGAAGAAGAAGAATAGCTTCTTTTGTTTAAGTCCTTTTGATCTCA
GACTACTTATGTAATGAAAGAACAAGTCCGATTCTTTAC

QA 1 639 1 639
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GTGGTTCTTGTGCACTCTCAGGAACCTTTGTAACTGGTTTTGAGACTGGCTTAAGAGAAG
TTTGTTTTGTGTTCTTGCTGATGATCTGTTGAGTAGACCAGGAACCAAACTTATCAACTA
GTTGTTTGTCTCCTTCAGGTGGTTGTATGGCAGGGGGTTTAATTGTATCATAATCTGGCC
TCCTTTGCTGATCTTGTACTAAAGCATTGACTGCTTCTTGTATCTCTTGCCTGTTTACAT
CTTGGAATTGTTGGCTGTGCAAGTAACCAAATTGATCACTTTTCTTTTGATCTCCACGAC
CATAACAGACCTTTTTCTCATCTCTGGATGCTCTAGGGCGTGCCCTAACTGACCTTGATT
GGCTCTGTAACCTTTCCAGATCAAGATGACCATACTTCTTGGCTACAAACCTTTTCTTCA
TGACAGCCTTCATCTCAAACCAAGAAGAGACTTGAAACTCTCCAGTGTGTCTCCTATGGT
TAGCAAGCTGATACCACCAATCAAGTGCATACCCAGATAATCCAGTAGTTGCTAGCTGAA
CTTGCCACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGGTGTAACCACGGTGGAGTTT
CAGAGACAGAAAGCTAAAGAGCTTCAGGATTACTTTAAGCAGAAGAAGCTTGAAGCTGCT
GGTCAAGGTCCCTTTTTTGGTTTCCAACCCAAAAACGAGATCTCCAATGGAAGGTGGGCT
ATGTTTGGTTTTGCGGTGGGGATGCTGACAGAGTATGCAACAGGATCAGACCTTGTGGAC
CAAGTTAAAATCCTTCTCTCCAATTTCGGCATTCTAGACTTGGAATAATAATGAAAAAAA
GAGTGTTGTTGGTGTTATATAGATATGATCTTTCTCTGATTCCCTTATGTTCAATCTTCA
TCTGCTTGTTTATTATTCTTCCTCCTGTATATGCTGCATCTCTTAAGATCTTTAAATACA
GGGCCCTTTTGTTGTTCAACCACTTTTTATCTTCAAATGTTATAAATATGATCTATGGAT
CGATTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BI02TF U 1
AF RS1BI02JQ C 266
BS 1 623 RS1BI02TF
BS 624 1027 RS1BI02JQ

RD RS1BI02TF 623 0 0
GTGGTTCTTGTGCACTCTCAGGAACCTTTGTAACTGGTTTTGAGACTGGCTTAAGAGAAG
TTTGTTTTGTGTTCTTGCTGATGATCTGTTGAGTAGACCAGGAACCAAACTTATCAACTA
GTTGTTTGTCTCCTTCAGGTGGTTGTATGGCAGGGGGTTTAATTGTATCATAATCTGGCC
TCCTTTGCTGATCTTGTACTAAAGCATTGACTGCTTCTTGTATCTCTTGCCTGTTTACAT
CTTGGAATTGTTGGCTGTGCAAGTAACCAAATTGATCACTTTTCTTTTGATCTCCACGAC
CATAACAGACCTTTTTCTCATCTCTGGATGCTCTAGGGCGTGCCCTAACTGACCTTGATT
GGCTCTGTAACCTTTCCAGATCAAGATGACCATACTTCTTGGCTACAAACCTTTTCTTCA
TGACAGCCTTCATCTCAAACCAAGAAGAGACTTGAAACTCTCCAGTGTGTCTCCTATGGT
TAGCAAGCTGATACCACCAATCAAGTGCATACCCAGATAATCCAGTAGTTGCTAGCTGAA
CTTGCCACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGGTGTAACCACGGTGGAGTTT
CAGAGACAGAAAGCTAAAGAGCT

QA 1 623 1 623
DS 

RD RS1BI02JQ 762 0 0
ACCAAATTGATCACTTTTCTTTTGATCTCCACGACCATAACAGACCTTTTTCTCATCTCT
GGATGCTCTAGGGCGTGCCCTAACTGACCTTGATTGGCTCTGTAACCTTTCCAGATCAAG
ATGACCATACTTCTTGGCTACAAACCTTTTCTTCATGACAGCCTTCATCTCAAACCAAGA
AGAGACTTGAAACTCTCCAGTGTGTCTCCTATGGTTAGCAAGCTGATACCACCAATCAAG
TGCATACCCAGATAATCCAGTAGTTGCTAGCTGAACTTGCCACTCTGCGTTGATACCACT
GCTTACGGCCGGGGGGTGTAACCACGGTGGAGTTTCAGAGACAGAAAGCTAAAGAGCTTC
AGGATTACTTTAAGCAGAAGAAGCTTGAAGCTGCTGGTCAAGGTCCCTTTTTTGGTTTCC
AACCCAAAAACGAGATCTCCAATGGAAGGTGGGCTATGTTTGGTTTTGCGGTGGGGATGC
TGACAGAGTATGCAACAGGATCAGACCTTGTGGACCAAGTTAAAATCCTTCTCTCCAATT
TCGGCATTCTAGACTTGGAATAATAATGAAAAAAAGAGTGTTGTTGGTGTTATATAGATA
TGATCTTTCTCTGATTCCCTTATGTTCAATCTTCATCTGCTTGTTTATTATTCTTCCTCC
TGTATATGCTGCATCTCTTAAGATCTTTAAATACAGGGCCCTTTTGTTGTTCAACCACTT
TTTATCTTCAAATGTTATAAATATGATCTATGGATCGATTCC

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

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TGGCCAACGGATGGTCATAAATATGCGACGCCGAAACTAGCAGAGAAGTTCTATGCAGGA
CTTATGAAAAGACTTGCTAAGGATGTTGGGACTCCATTGAGACCTGAGAAATTAGAAGTT
TATCTCTTTGGTTTACTCGACGAAGACATGAAGAGTATTCTTCCTGGACCATTCGAAAGA
CATTGGGGAATCTTCAGATACGATGGAACACCGAAGTTTATGCTAGATTTCACGGGACAA
GAACGCAAGATCGTACCCGTGGCAGCCAAAGGTGTGCAATACTTAGATAAGCAATGGTGC
GTTGTGAACAAAGACACGATCAATCTAGATGAAGTTGGTCCGGACCTAGACTATGCGTGT
TGCCATGGCGACTGCACCTCGATGCTTTACGGGTCCACATGTAGTAACCTCGACAAAATC
CAAAACATATCGTACGCATTTAACATGTTTTTCCAGATTCAGGGCCAAGACGTTAGGGCT
TGTGATTTCAGAGGATCTGCTATGATTACTAAGAACAATGCATCCGTCGGAAGTTGCTTG
TTCCCTATTCAGATCGTTAGTGGAAGTGACGATTTCAGGATCAGCTTTGTGTTCGGAAGA
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TTTGTTTTTGCACTTTTGGGGTATTTATTCTATTCGATTAATTGTTATATATTGTTCGTT
TGTTAACATTTGAGTTAGTACTCCTGTTGTC


BQ
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AF RS1GF78JQ C 1
AF RS1F575TF U 460
BS 1 460 RS1GF78JQ
BS 461 618 RS1F575TF
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RD RS1GF78JQ 768 0 0
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TGGCCAACGGATGGTCATAAATATGCGACGCCGAAACTAGCAGAGAAGTTCTATGCAGGA
CTTATGAAAAGACTTGCTAAGGATGTTGGGACTCCATTGAGACCTGAGAAATTAGAAGTT
TATCTCTTTGGTTTACTCGACGAAGACATGAAGAGTATTCTTCCTGGACCATTCGAAAGA
CATTGGGGAATCTTCAGATACGATGGAACACCGAAGTTTATGCTAGATTTCACGGGACAA
GAACGCAAGATCGTACCCGTGGCAGCCAAAGGTGTGCAATACTTAGATAAGCAATGGTGC
GTTGTGAACAAAGACACGATCAATCTAGATGAAGTTGGTCCGGACCTAGACTATGCGTGT
TGCCATGGCGACTGCACCTCGATGCTTTACGGGTCCACATGTAGTAACCTCGACAAAATC
CAAAACATATCGTACGCATTTAACATGTTTTTCCAGATTCAGGGCCAAGACGTTAGGGCT
TGTGATTTCAGGGGATCTGCTATGATTACTAAGAACAATGCATCCGTCGGAAGTTGCTTG
TTCCCTATTCAGATCGTTAGTGGAAGTGACGATTTCAGGATCAGCTTTGTGTTCGGAAGA
TTCATTGTCGCTGGACTTATTCTTCTTGGATTAGTCACGGCTATATAATTTGTTTGTTTG
TTTGTTTTTGCACTTTTGGGGTATTTATTCTATTCGATTAATTGTTAT

QA 1 768 1 768
DS 

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G
GTAGTAACCTCGACAAAATCCAAAACATATCGTACGCATTTAACATGTTTTTCCAGATTC
AGGGCCAAGACGTTAGGGCTTGTGATTTCAGAGGATCTGCTATGATTACTAAGAACAATG
CATCCGTCGGAAGTTGCTTGTTCCCTATTCAGATCGTTGGTGGAAGTGACGATTTCAGGA
TCAGCTTTGTGTTCGGAAGATTCATTGTCGCTGGACTTATTCTTCGTGGATTAGTCACGG
CTATATAATTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGCACTTTTGGGGTATTTATTCTATTCGATTA
ATTGTTATATATTGTTCGTTTGTTAACATTTGAGTTAGTACTCCTGTTGTC

QA 2 352 2 352
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GTTTGGAGTGTGAAGGCGTCCGTGGAAGAAGCTCTTTTGGTAAAGATGGCGAAATACAAT
GAGATAGCGAAGAAGAAGAGAGAGGCGAAAGCGGATAGAAAGCGAGCTATCCACGGAGAT
CCACTCACCAATAAACTGAAGAGCAGAGCTCCGGTTCTCTCCGTCTCCGGAAAACGTCAG
AGAAAACTCCTCCGAAAATGGCGCCGAGAGCAGAAAGAGATGGTGGAGAAGGGTCTTGTA
ACCATGGAGGATGTGGAGATGGCTTCTGCTGATGCTGCATCAGAAGAATCAAAGAGATCC
CCTAGAAAGTTTAGCGTGAAGAAGACCTTGAAGCTTAAACTAAAGAATAAAAGGCAAGAA
GAAGAAGCCAGGGAGCCGCTGCTGGCCGAGTATCTGCTGCTGATCAGATGCTGGAATGAG
TGTAAATCTTTGAATCAGCATTGGATCTCATTTTTATAAGTTTTCCGAATCTTATAGTTT
CTTCTAAAAAGATCTCATTTTGTATTCTGGCCGGGAATCGGGTTCTCGTTATATGTCAAA
TTTACAATACTACT


BQ
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DS 

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GAGATAGCGAAGAAGAAGAGAGAGGCGAAAGCGGATAGAAAGCGAGCTATCCACGGAGAT
CCACTCACCAATAAACTGAAGAGCAGAGCTCCGGTTCTCTCCGTCTCCGGAAAACGTCAG
AGAAAACTCCTCCGAAAATGGCGCCGAGAGCAGAAAGAGATGGTGGAGAAGGGTCTTGTA
ACCATGGAGGATGTGGAGATGGCTTCTGCTGATGCTGCATCAGAAGAATCAAAGAGATCC
CCTAGAAAGTTTAGCGTGAAGAAGACCTTGAAGCTTAAACTAAAGAATAAAAGGCAAGAA
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CTTCTAAAAAGATCTCATTTTGTATTCTGGCCGGGAATCGGGTTCTCGTTATATGTCAAA
TTTACAATACTACT

QA 1 554 1 554
DS 



AS 1 2

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CCTGGAAGGCTCGAAGACCATATCGAGAACACTTCTGGATTTGCCACAAGATTGAATGGT
GTGAAAGTCCTTGTGCTTGATGAAGCTGATCATCTCTTGGACATGGGTTTCCGAAGGGAT
ATCGAGAGGATCATCGCTGCTGTTCCTAAGCAGAGACAAACGTTTTTATTTTCTGCCACA
GTACCTGAAGAGGTCCGCCAAATATGCCACATTGCTTTGAAACGGGATCATGAGTTCATC
AATTGCGTTCAAGAGGGATCTGGGGAGACGCATCAAAAGGTCAAACAAATGTACATGATT
GCATCACTGGATAGACATTTCTCGCTTCTATATGTGCTTCTTAAAGAACACATCGCAGAT
AATCCAGACTATAAGGTTATTATTTTCTGCACAACTGCCATGGTTACAAGATTGGTTGCT
GATCTGCTTGGTCAGCTAAGCTTGAACGTCAGAGAGATCCATTCTAGAAAACCCCAGGGT
TACAGAACCAAAGTCTCCGACGAGTTCCGCAAGTCGAAGAGTATTATCCTTGTGACATCA
GATGTATCTGCTCGTGGTGTTGATTACCCTGATGTGTCACTAGTCGTACAGATGGGATTG
CCATCAGACAGAGAACAATACATACATAGACTTGGGAGAACGGGGAGGAAAGGTAAGGAA
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AGAGGGCTTAACCAAGTGGAAATGAAGAACAAGGAAGCGGCGTATCAGGCGTGGTTGGGT
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AAACACTTGATAAAAAAGTCTCTTAGATTG


BQ
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AF RS1B318TF U 1
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CCATCAGACAGAGAACA*TACATACATAGACTTGGGAGA
C

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DS 

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GTCAAGAGGATCT
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CGCTTCTATATGTGCTTCTTAAAGAACACATCGCAGATAATCCAGACTATAAGGTTATTA
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TGAACGTCAGAGAGATCCATTCTAGAAAACCCCAGGGTTACAGAACCAAAGTCTCCGACG
AGTTCCGCAAGTCGAAGAGTATTATCCTTGTGACATCAGATGTATCTGCTCGTGGTGTTG
ATTACCCTGATGTGTCACTAGTCGTACAGATGGGATTGCCATCAGACAGAGAACAATACA
TACATAGACTTGGGAGAACGGGGAGGAAAGGTAAGGAAGGAGAAGGTGTACTAATGTTGG
CACCATGGGAAGAGTACTTTTTGTCATCTGTTAAAGACTTGCCCATCAACAAGTCTCCTC
TACCGCCAATAGACCCTGAGACTGTGAAAAAGGTGCAGAGAGGGCTTAACCAAGTGGAAA
TGAAGAACAAGGAAGCGGCGTATCAGGCGTGGTTGGGTTACTACAAATCTCAGAAGATGA
TTGCAAGAGACACGACCAGACTGGTGGAGTTGGCCAATGAGTTTAGCCGCAGCATGGGAC
TTGACATGCCACCAGCTATCCCCAAAAATGTTCTTGGCAAGATGGGTCTCAAAAACGTTC
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TTAGATTG

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DS 



AS 1 2

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AGAGAACCCTCAATGTAACGTGTTTCATAGTTTTCAAAATCTTTACTTTACCTCGTTTAG
CTTGAGAGAACGAAGTTTCGGGGAATGTCGGAGAAAAGACATAAGTAGATCCCACTCTGT
TTCACATGTGCAAAACTCCAAATGTTCAAGCTGGTGGAAGATACTACCAGAAGGAAACTG
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BQ
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AF RS1G584TF U 1
AF RS1G584JQ C 368
BS 1 620 RS1G584TF
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BS 622 665 RS1G584TF
BS 666 994 RS1G584JQ

RD RS1G584TF 665 0 0
GTTCTCAACTACTGGAGTTCATGCCAGTCTTATGTTTGTCAGTTAATGTTTTATCCTTAA
AGTTTGTTTATTTTATGTTCAATAATGTAAGAGAACCAGTTGCATATGGTTACATCTTAT
GTTGTTTGATGAAACCAATTAGTTCTCTTCTCTTGTACTTGAATATTATACAATGTATTT
GAAGTCCGAGTAAGTTCTAAGGCAAATAAATCATTTCTACTCTAACTATATGTCCTGGAA
AATCAAATTTCTTCCCATGTAGAAGCAACAATGTTTCAAGAAATGCATAGCACAAAATTG
GCTTTTCAAATATTATTATCCAGTGAGAATGTTTGTTTGTCGATTATTCTACTACCTTTC
CTCCTCACAAAACAGAACCTTATTCAACCAAACACAAGCTCACACTCAGCCGAGCCCCTC
CGCAAACACACCAACTCCGTGATCATACGATACTTCCTAATAAGCGTGGTATACAGTTGT
GTTCTACCTGGGGGAGAAAACGTCGCAACCTTTAGACGCCTTGCATGTTTTAACACAAAA
CTTGCGAGTTCTCTCTCTACTTCCCATCCTCTGTAGTTTCTCCACTCAAAAGTCTCAAGA
ACGAACTTCAGCGTCTCAGG*ACTGAGCTTGGTTCATCCCAATGAAGTGCACGATATCCA
CACAC

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1G584JQ 627 0 0
CAAAACAGAACCTTATTCAACCAAACACAAGCTCACACTCAGCCGAGCCCCTCCGCAAAC
ACACCAACTCCGTGATCATACGATACTTCCTAATAAGCGTGGTATACAGTTGTGTTCTAC
CTGGGGGAGAAAACGTCGCAACCTTTAGACGCCTTGCATGTTTTAACACAAAACTTGCGA
GTTCTCTCTCTACTTCCCATCCTCTGTAGTTTCTCCACTCAAAAGTCTCAAGAACGAACT
TCAGCGTCTCAGGGACTGAGCTTGGTTCATCCCAATGAAGTGCACGATATCCACACACAT
TGCCATGTGTCTGATTGCATATATATAATTATTAGACCATTAAGTTTAAGTCAAGAGAAC
CCTCAATGTAACGTGTTTCATAGTTTTCAAAATCTTTACTTTACCTCGTTTAGCTTGAGA
GAACGAAGTTTCGGGGAATGTCGGAGAAAAGACATAAGTAGATCCCACTCTGTTTCACAT
GTGCAAAACTCCAAATGTTCAAGCTGGTGGAAGATACTACCAGAAGGAAACTGAGGCTGC
GGTTCGAAAAACACAAACAAGCATAGATACTTAAGCTTGATTCAATGTACAAAAGAAATC
TAAGTTCATTCGCATCAACTATTTCTC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL5656Contig1 995 2 6 U
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AGTAACAACCAAGCTCTCAAAAAGTTGTGGAAAAAAATAGAGGAAAGGTACAATGAAACA
AAATATGAGAGTTGGGAAGTTAGAAGTAGTAGATCTCTTCAAGGTAGGATGGGTACAATT
TTGTATGCTGTTAGAAACTTGAAGAGTTGTGTGATCCAAGTGGAGAATATGCATCCAAGT
GGTGCATCTGAACATGACATTATGGAGAAGGCAAAAAAGTTGTTGGTGCAAGATCCAAAA
CTAAAAAAGGGTTTCAAATTTGATCATGTGTGGGTATTGATGAAAGATATTCCAAAGTTT
ACCGACAATGTTAATGTCGGTATTCCAGATAATGAGAGTGAAACTCTCGGTTCTCCAACA
TCACAATCTCCAGGACTTTCATCCTTTTCTATCAATTTAAACAACGATGATGGTGGATCA
AATTCATCACAGCGTCCCATTGGATCGAAGAAAGCAAAACTGAAAAGAAAACTTGATCAA
GGTAATAACTCATCTACAGCTACTACGGTTTCATCAAATGAGGAAATCCTTAGTTTCTTA
AAGGAAAATGCAACAACTAGAGAAAAAAATTACGAGATGGCCCAATTGCGTATACAAAAT
CAAGCAAAGAAATTAGCATTAAAAGAAATAGATCAAGAAAATAAAATACTGCTAACGAGT
TTAAGCTCTATCGATGATGCTAATACACGTGAGTTTATTCGATCTGAACAAGCAAGAATC
ATCCAGAAAAGAAGAGAGCAACAACAGTCTCCTAGCACACCAAATTTTTATGGACCATAT
TTTGGTGATCTTGGAGGCTCGGGATCAAATCTACCTGATTATTAATATCAATGTATTGAT
TATAATTTGTGTAATATATATGTGTGTAATATTTATTGTAAAATATTTAGTCTTGTACTT
TTGATCTTTAATTTGTAATATATTGTTCAATTTAA


BQ
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AF RS1CX24TF U 1
AF RS1CX24JQ C 465
BS 1 628 RS1CX24TF
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RD RS1CX24TF 768 0 0
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AGTAACAACCAAGCTCTCAAAAAGTTGTGGAAAAAAATAGAGGAAAGGTACAATGAAACA
AAATATGAGAGTTGGGAAGTTAGAAGTAGTAGATCTCTTCAAGGTAGGATGGGTACAATT
TTGTATGCTGTTAGAAACTTGAAGAGTTGTGTGATCCAAGTGGAGAATATGCATCCAAGT
GGTGCATCTGAACATGACATTATGGAGAAGGCAAAAAAGTTGTTGGTGCAAGATCCAAAA
CTAAAAAAGGGTTTCAAATTTGATCATGTGTGGGTATTGATGAAAGATATTCCAAAGTTT
ACCGACAATGTTAATGTCGGTATTCCAGATAATGAGAGTGAAACTCTCGGTTCTCCAACA
TCACAATCTCCAGGACTTTCATCCTTTTCTATCAATTTAAACAACGATGATGGTGGATCA
AATTCATCACAGCGTCCCATTGGATCGAAGAAAGCAAAACTGAAAAGAAAACTTGATCAA
GGTAATAACTCATCTACAGCTACTACGGTTTCATCAAATGAGGAAATCCTTAGTTTCTTA
AAGGAAAATGCAACAACTAGAGAAAAAA*TTACGAGATGGCCCAATTGCGTATACAAAAT
CAAGCAAAGAAATTAGCATTAAAAGAAATAGATCAAGAAAATAAAATACTGCTAACGAGT
TTAAGCTCTATCGATGATGCTA*TACACGTGAGTTTATTCGATCTGA
C

QA 1 767 1 767
DS 

RD RS1CX24JQ 531 0 0
CGATGATGGTGGATCAAATTCATCACAGCGTCCCATTGGATCGAAGAAAGCAAAACTGAA
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AATCCTTAGTTTCTTAAAGGAAAATGCAACAACTAGAGAAAAAAATTACGAGATGGCCCA
ATTGCGTATACAAAATCAAGCAAAGAAATTAGCATTAAAAGAAATAGATCAAGAAAATAA
AATACTGCTAACGAGTTTAAGCTCTATCGATGATGCTAATACACGTGAGTTTATTCGATC
TGAACAAGCAAGAATCATCCAGAAAAGAAGAGAGCAACAACAGTCTCCTAGCACACCAAA
TTTTTATGGACCATATTTTGGTGATCTTGGAGGCTCGGGATCAAATCTACCTGATTATTA
ATATCAATGTATTGATTATAATTTGTGTAATATATATGTGTGTAATATTTATTGTAAAAT
ATTTAGTCTTGTACTTTTGATCTTTAATTTGTAATATATTGTTCAATTTAA

QA 1 531 1 531
DS 



AS 1 2

CO CL5657Contig1 679 2 7 U
AACTCGACACTTGGCTAAGCAGAAATGTGTGCACCGCATGCTCTCTTCCTCCGACGTTGT
CCCTAACTGCTCCACGAATATTATCCCATCCGGCATCTCCGCCTCTCCTCTCTCCCATCT
ACCCTTCACCGCCGCCCACTCCTCGGCTTTCATCACCACCACCGTCCCCTTCTCCTCATC
TCCGGCGTACAGATGGACTAACAAAGGGGCTTCACTCAAATTCTTCACGATCTCCGTCAC
AGATTCCTTCATCCACCTGTCCAGCTTCTCACGCGTCACATCCACCTCTCTACGATCCTT
CCCCCCGCTTCTTCCTCCTCTCTGTTTCTCTATCTCCGATACCGCCTCCGCCACAGACGC
CGAGATCGTTCCGACGTTGATACGACGACTTCCATCGCGATTGATCGGAAACGACGATGA
AAGCGATCTCGCATTGTTATCGGACTCCAATATGCCGCGGTGCACCAGATAAGTACCACC
GTAACATATTCTTGCATAGGCCATCTTTCTTCGGCGAGGTGATAAGATTTTACTTCCGAT
GAAAGTTAATTAATCACAAAACCTAAAAACTACAACTTGCCAGATTCGAATTATTAACAA
AATATTCTGAAAAGAGAAAAGAAGAATGATTACGACGACGGTTTGGAGGCGAAGAAATAT
ATATCCAGCGGTGGAATCC


BQ
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AF RS1DU75JQ U 29
AF RS1DU75TF C 1
BS 1 28 RS1DU75TF
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BS 340 679 RS1DU75TF

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TCTATCTCCGA

QA 1 311 1 311
DS 

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CCCCCCGCTTCTTCCTCCTCTCTGTTTCTCTATCTCCGATACCGCCTCCGCCACAGACGC
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ATATCCAGCGGTGGAATCC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

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TTGTTAAATTTATCACAAAACATTATCTGGAAGTTCTGTCTTGTTTGTAGAGGCTTTAGG
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AGAACAATAAGTTCCAAATC


BQ
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QA 1 734 1 734
DS 

RD RS1FA71JQ 729 0 0
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AAGATGAGCAACTCAGGGAAGAGCCTCCAACTAAGGTTTTGCTTGATAAAGTCCAGAGGA
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AACAATTTGATGGACAACCACCTGATGACAAATGTGGTGAAGCTCAAGTTTTGCCTGATC
AGCCACCAAAACCCCATGAATCATGATTTTTCTTTAAGCCAAGGTCTAGTTGAATGAGAA
ACTGGATGAGAACTATCATCTCCTCCCTGTCTCGAAGATCTTTTCATTTTTGTTAAATTT
ATCACAAAACATTATCTGGAAGTTCTGTCTTGTTTGTAGAGGCTTTAGGGAAGTGATTCC
TTACATGTTTGAATGTTTTTTTGGGGAAAGATTTTTAATTAATCGAAGCAGAACAATAAG
TTCCAAATC

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

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CAGTGGCAAAGCAGTCCGGCAACTATGGCAGCGTCTCCAATGGAAGGCAAATGGGTTCAG
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GTTGGGAGACAGATTGTGATATTCGGAGGGGAGGTTGATCCTAGTGACTTGGGGCACATG
GGAGCAGGGTGTTTCACGGCTGAGGCTTATGGGCTTGACACGGAGACGTTTGAGTGGAGG
AAGTGGGAGGATGGGTTTGGATCAGAGGAGGAGGAGCATCCAGGGGCTAGAGGATGGTGT
GCGTTTGCAGCTGGGTCGAGGGATGGTAAGGAAGGTTTGTTGGTTTATGGAGGGAACTCG
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TGGTAACTAAATATGGTTTGGTTTGGTGAGTCCAATGTATGGTTCTGTGAGCTTTTAAGC
CAATGAGTCTGTTACTAAGTTGTTTCTGTTTTGGGTGAAGCTTATGTTTATCTACGCTTT
TGTAAAATTTGAATGATCATTGAAGAATCATAAATAAAAC


BQ
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GTT

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TGTAAAATTTGAATGATCATTGAAGAATCATAAATAAAAC

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DS 



AS 1 2

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TATTTTTGTATTGGCTCTGCTAGTAGAAGAAGAACCGATTTGAAATCC


BQ
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AF RS1FU89JQ C 360
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CGCAGGGTTTCCACTTCCCGCAATCAACGGCTCCGGGTAGCCTCCGTACGAACCTATCCG
TGCGCCAGAGGAGCGTAAAGTGTATGGCGAACCCGAGGTGGGTAAAGATGGTGGTTAAGC
AGATAATGAGGGAGCTCTCCGACATGCTTCTCACAGACACTGTATTGCAACACGCCGTGT
TGCCTGAAGCAGCTCTTGGAGCCGACCGATACCTCTCTTCTCTCACCACCATCAGCGATG
TCGAGGTCTCCAACGATTTGCAGATTGTGAAGGTATATGTATCAGTGTTTGGAGATGATA
GAGGGAAAGACGTTGCGATTGCAGGGTTGAAATCGAAAGCTAAGTACGTTAGGAGTGAGC
TCGGGAAGCGAATGAAGTTGAGACTGACGCCTGAGGTCAGATTCATTGAGGATGAATCCA
TGGAAAGAGGAAGCAGAGTAATAGCGATACTAGACAAAATTAAAGCTGAGAAAGGAGGCG
AAGGAGGGCCAGAAACATCTGATTCACCAGAGGATGATTAAGAATGGGGCGTGGATGACC
CCGACGAAGACATCATCTATGTAAAGTAAATGGTCTCAAACAGTTTTTAGTACGCATATT
ACTTGA
GAT

QA 1 726 1 726
DS 

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AGAGGGAAAGACGTTGCGATTGCAGGGTTGAAATCGAAAGCTAAGTACGTTAGGAGTGAG
CTCGGGAAGCGAATGAAGTTGAGACTGACGCCTGAGGTCAGATTCATTGAGGATGAATCC
ATGGAAAGAGGAAGCAGAGTAATAGCGATACTAGACAAAATTAAAGCTGAGAAAGGAGGG
GAAGGAGGGCCAGAAACATCTGATTCACCAGAGGATGATTAAGAATGGGGCGTGGATGAC
CCCGACGAAGACATCATCTATGTAAAGTAAATGGTCTCAAACAGTTTTTAGTACGCATAT
TACTTGAAGATTTTCCCCTGACAAGACTATAAGGAAGATGTTGATGGCCTCGAATTGAGA
ACTAGAGAAGATGGACACCGATATATACAGCTCACATGACTCATGCCTGAAGCATAGATC
CTGAGAGCTTATATGGTCCTTGGAATCAATATCTCTCCAGTGAAATGTTTTTTTGTTTTT
GTATTTTTGTATTGGCTCTGCTAGTAGAAGAAGAACCGATTTGAAATCC

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 2

CO CL5661Contig1 1227 2 10 U
GCGAACCTGAAATATCTGAGCAGGGTTTACCCCCCACCACATCTGGACGGAGGTCTTCTT
CAGGAGGATCTCCGTTGTCCTCCTCACCCCGTTTCAGCGACCAGCCTGTGATGTTAGATG
TTTACTCACCAGATCGGTTGGCTGGAGAGCTCTTCTTTTTAGATGTTTCGCTAAAACTCA
CAGCAGAAGAGTTATCTCGAGCCCCAGCAGAAGTTCTAGGTAGAAGCAGTCACGGAACGC
TATACAAAGCAACGCTGGACGATGGGCATATGTTAACCGTGAAATGGTTGAGAGTTGGAC
TCGTGAGGCATAAGAAAGATTTCCACAAGGAAGCTAAAAAAATCGGCTGTTTAAAACATC
CAAACATTGTCCCGTTGCGAGCTTACTATTGGGGTCCCAGAGAACAAGAACGGCTTCTCC
TTTCTGATTACATGGGAGGAGAAAGCTTGGCCATGCATCTATACGAGACTACTCCTCGGA
GGTATTCACCGATGTCTTTCACACAGAGACTAAAAGTTGCGGTTGAGGTGGCGCAGTGTC
TCCTATACCTTCATGATAGAGCAATGCCACACGGGAACTTAAAGCCAACAAACATAATCC
TCACAAGTCCCAACAATACCGTGCGGATAACAGATTACTGTATTCACCGTCTGATGAGTT
CATCTGGTGTAGCGGAACAGATACTAACCATGAGTGCGCTCGGCTACTCTGCTCCTGAAC
TTGCCTCAGCTCCCAAACCCGTTCCGACGCTCAAATCAGATGTCTATGCGTTTGGAGTGA
TCCTTATGGAGCTTTTGACTAGACGTAGCGCGGGTGACATAATCTCGGGTCAATCAGGAG
CCGTTGATCTGACAGATTGGGTGAGGTTGTGTGATCAAGAAGGTAGGAGGATGGATTGCA
TAGACAGAGACATTGCAGGTGGGGAAGAGTTCTCGAAGGCAATGGATGATGCACTTGCTG
TAGCAATCATGTGCATTGTCTCTGTGAATGAAAGGCCTAGCATCAGACAAGTTCTTGATC
AGCTTACCTCAATTTCTCCTTGAGATCTATTTATTTTGTTTGTATATCTCAATGGATATC
TATTCATCCACATCCCATTTTTTCTTCTTCTTTCTGTTCTTTTTTTTTGTCTTTTTTTCC
TAGGTGTTCTCACATTTATATTGTGTTGATTATTTTTCCCTTCCTTGTAAAGGTAGATGA
AAAACTAATCCCATTTTTTTCTGACAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DT27TF U 1
AF RS1DT27JQ C 502
BS 1 736 RS1DT27TF
BS 737 737 RS1DT27JQ
BS 738 754 RS1DT27TF
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BS 756 782 RS1DT27TF
BS 783 784 RS1DT27JQ
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BS 797 823 RS1DT27TF
BS 824 1227 RS1DT27JQ

RD RS1DT27TF 823 0 0
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CAGGAGGATCTCCGTTGTCCTCCTCACCCCGTTTCAGCGACCAGCCTGTGATGTTAGATG
TTTACTCACCAGATCGGTTGGCTGGAGAGCTCTTCTTTTTAGATGTTTCGCTAAAACTCA
CAGCAGAAGAGTTATCTCGAGCCCCAGCAGAAGTTCTAGGTAGAAGCAGTCACGGAACGC
TATACAAAGCAACGCTGGACGATGGGCATATGTTAACCGTGAAATGGTTGAGAGTTGGAC
TCGTGAGGCATAAGAAAGATTTCCACAAGGAAGCTAAAAAAATCGGCTGTTTAAAACATC
CAAACATTGTCCCGTTGCGAGCTTACTATTGGGGTCCCAGAGAACAAGAACGGCTTCTCC
TTTCTGATTACATGGGAGGAGAAAGCTTGGCCATGCATCTATACGAGACTACTCCTCGGA
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TCCTATACCTTCATGATAGAGCAATGCCACACGGGAACTTAAAGCCAACAAACATAATCC
TCACAAGTCCCAACAATACCGTGCGGATAACAGATTACTGTATTCACCGTCTGATGAGTT
CATCTGGTGTAGCGGAACAGATACTAACCATGAGTGCGCTCGGCTACTCTGCTCCTGAAC
TTGCCTCAGCTCCCAA*CCCGTTCCGACGCTCAA*TCAGATGTCTATGCGTTTGGAGTGA
TC**TATGGAGCTTT*GACTAGACGTAGCGCGGGTGACATAAT

QA 1 823 1 823
DS 

RD RS1DT27JQ 726 0 0
CACAGAGACTAAAAGTTGCGGTTGAGGTGGCGCAGTGTCTCCTATACTTTCATGATAGAG
CAATGCCACACGGGAACTTAAAGCCAACAAACATAATCCTCACAAGTCCCAACAATACCG
TGCGGATAACAGATTACTGTATTCACCGTCTGATGAGTTCATCTGGTGTAGCGGAACAGA
TACTAACCATGAGTGCGCTCGGCTACTCTGCTCCTGAACTTGCCTCAGCTCCCAAACCCG
TTCCGACGCTCAAATCAGATGTCTATGCGTTTGGAGTGATTCTTATGGAGCTTTTGACTA
GACGTAGCGCGGGTGACATAATCTCGGGTCAATCAGGAGCCGTTGATCTGACAGATTGGG
TGAGGTTGTGTGATCAAGAAGGTAGGAGGATGGATTGCATAGACAGAGACATTGCAGGTG
GGGAAGAGTTCTCGAAGGCAATGGATGATGCACTTGCTGTAGCAATCATGTGCATTGTCT
CTGTGAATGAAAGGCCTAGCATCAGACAAGTTCTTGATCAGCTTACCTCAATTTCTCCTT
GAGATCTATTTATTTTGTTTGTATATCTCAATGGATATCTATTCATCCACATCCCATTTT
TTCTTCTTCTTTCTGTTCTTTTTTTTTGTCTTTTTTTCCTAGGTGTTCTCACATTTATAT
TGTGTTGATTATTTTTCCCTTCCTTGTAAAGGTAGATGAAAAACTAATCCCATTTTTTTC
TGACAG

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

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GGATAATCAATTCGCTGAGAGTATGGCCTCGCGTTTGTCATCAACCACACTCATCACACC
GCCGCCCAATCTCAACAAATCGTCGGCGAATCTAACAACTATCGTTAAGCTGAGAAAGGG
AAGGCTTAGTATCAGGGCAGTGAGCAACAGCTCTCAAGGAGAAACCGTTTACAGAGGCGT
TTACGGTCCCTGGACCGTCGAACAGTCCGATGTCAAAGAGGTTGTTCTGTACAGATCAGG
ACTTGTAACTGCTGCTGCGTCCTTTGTTACCGCTTCTTCTGCAGCCTTTTTACCGGAGAA
CTCATGGCTGAGTGAAACAATCAAGCAAAACCAGGACTTGTTCTACCTTGTTGGTGCTGG
TGGTTTGGGGCTTTCTCTGTTTCTTATTCATATATATGTAACTGAGATCAAGAGGACTCT
TCAGGCTTTATGGGCACTTGGTGCTGTTGGTTCCTTTGCCACTTACGCTGCCCTTGCTAT
ACCAGCCAGTGATAGCTTGGTTCATTATGTCGTTGATCATCCAACTGCTGTTTGGTTTGT
TGGTCCTCTTTTCGCTTCCCTCACTGGGCTCGTTTTCAAAGAAGGGCTCTGTTACGGTAA
GCTAGAAGCTGGCCTTCTTACATTCATCATACCCATAGTACTTCTCGGGCATTTGAGTGG
CCTGATGAATGATGAGGCGAAACTGGTGTTACTAGGAACATGGATGGCACTCTTTGTAGT
ATTTGCTGGAAATTCACTCAGCCTATTAAGGATGATATTGGGGATAAATCTGTTTTCATG
TTCATGGCTCTTCCGGAAGATGAGAAAAAAGCTGTAGTTGCAAAACTCGAGCAAGATAAC
TCTGGGTAAGACTTATTAGAAAATATAAACAGTGTACATCTTATGAGCATTGATAGATTT
CCTGCTTGACATGGGCTGTTGTAATGGGCCTGTCCAGCCCAGTCGGACTCTGACTTGGCC
TTTATTTCATTATCAATATTAAGGTCTTGTCGTCCC


BQ
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AF RS1GD46TF U 1
AF RS1GD46JQ C 379
BS 1 746 RS1GD46TF
BS 747 996 RS1GD46JQ

RD RS1GD46TF 746 0 0
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GCCGCCCAATCTCAACAAATCGTCGGCGAATCTAACAACTATCGTTAAGCTGAGAAAGGG
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TGGTTTGGGGCTTTCTCTGTTTCTTATTCATATATATGTAACTGAGATCAAGAGGACTCT
TCAGGCTTTATGGGCACTTGGTGCTGTTGGTTCCTTTGCCACTTACGCTGCCCTTGCTAT
ACCAGCCAGTGATAGCTTGGTTCATTATGTCGTTGATCATCCAACTGCTGTTTGGTTTGT
TGGTCCTCTTTTCGCTTCCCTCACTGGGCTCGTTTTCAAAGAAGGGCTCTGTTACGGTAA
GCTAGAAGCTGGCCTTCTTACATTCATCATACCCATAGTACTTCTCGGGCATTTGAGTGG
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ATTTGCTGGAAATTCACTCAGCCTAT

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DS 

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TGGTGCTGTTGGTTCCTTTGCCACTTACGCTGCCCTTGCTATACCAGCCAGTGATAGCTT
GGTTCATTATGTCGTTGATCATCCAACTGCTGTTTGGTTTGTTGGTCCTCTTTTCGCTTC
CCTCACTGGGCTCGTTTTCAAAGAAGGGCTCTGTTACGGTAAGCTAGAAGCTGGCCTTCT
TACATTCATCATACCCATAGTACTTTTCGGGCATTTGAGTGGCCTGATGAATGATGAGGC
GAAACTGGTGTTACTAGGAACATGGATGGCACTCTTTGTAGTATTTGCTGGAAATTCACT
CAGCCTATTAAGGATGATATTGGGGATAAATCTGTTTTCATGTTCATGGCTCTTCCGGAA
GATGAGAAAAAAGCTGTAGTTGCAAAACTCGAGCAAGATAACTCTGGGTAAGACTTATTA
GAAAATATAAACAGTGTACATCTTATGAGCATTGATAGATTTCCTGCTTGACATGGGCTG
TTGTAATGGGCCTGTCCAGCCCAGTCGGACTCTGACTTGGCCTTTATTTCATTATCAATA
TTAAGGTCTTGTCGTCCC

QA 1 618 1 618
DS 



AS 1 2

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AAGGAGTTCTTTTCGTTCTGTGAGGCAATGGAACTTGTTCCGGAAGAGGAGTTGGAGGCT
TCTTCACGAGGTGGTTCTGCTCCACCTGCTGATCGAAGAGCTCTCAAGATAGCTCGGTTC
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GGACGTTCAAAGAGGGCTGCTGCCTTGTCTACCCCGGTTGAATCTGGAGAAGATGACATC
CCTGATGATGACAGCGAAGAAGAAAGAGATGCGTGGCTCGCCACAATTAACTTGGCTATT
TGTAAGGCTATTGATCTGTTGGAAATGCTAAAGAGAGAAGAGGAAATGCTCTCTGCAATC
AAGGAGAGACAGTTGAAGGATGGAGAGGATGTGTTTTCGCGAGATGCTCTAGATGATCGC
ACAAAGAAAGCTGAAACATGGCACAGAGATGCTGCTGCGAGGGTACAGTACTCTAGACCG
GCACAACCAATCACTTGTGCCACATTTGCACAAGATGTGTTAGAAGGTAGAGCTTCAGTA
TCACAGGGTCACGAACACAAGCATCAACCTCTTATCTTCGGTCCAGCAAGCATCGTGAAT
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ATGCCGACGATGAGCATAGAGGATGCGGGGTTAACAGAGATGAATATAATGAATGATTGG
CAAGAGCAGACGAAAAAAGCAATTGAAGAAGCAACCACCTCATGGCACAATGACAAACCA
CTGAGAGGAAAGGAAGAGGATGAAGAAGATGATGATGAAGACGAAGATGCTGTGATGAAA
GCCAGAGCTTTCGATGATTGGAAGGACGATGATCCTCGTGGTGCAGGTAACAAGAAACTC
ACTCCTTGTGGCTGAACCTTTGACTGTGACGATACACATTTTAAACACTTTCTCTCCCTC
TTTTGTTACTTATATCCGAACCCTTCTTTTTTCAATTATGTCTTGTAATGTAATCGTTAG
ACTGAGTTAAGTACTATTCGAATATTATTTTT


BQ
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AF RS1D622TF U 1
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BS 1 638 RS1D622TF
BS 639 1112 RS1D622JQ

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AAGGAGTTCTTTTCGTTCTGTGAGGCAATGGAACTTGTTCCGGAAGAGGAGTTGGAGGCT
TCTTCACGAGGTGGTTCTGCTCCACCTGCTGATCGAAGAGCTCTCAAGATAGCTCGGTTC
AAACGTCAAAAGGCTGCAGAGGCGAAGCTCCTTGAGATTAAAGAGAGGAAGGAGCGACGC
GGACGTTCAAAGAGGGCTGCTGCCTTGTCTACCCCGGTTGAATCTGGAGAAGATGACATC
CCTGATGATGACAGCGAAGAAGAAAGAGATGCGTGGCTCGCCACAATTAACTTGGCTATT
TGTAAGGCTATTGATCTGTTGGAAATGCTAAAGAGAGAAGAGGAAATGCTCTCTGCAATC
AAGGAGAGACAGTTGAAGGATGGAGAGGATGTGTTTTCGCGAGATGCTCTAGATGATCGC
ACAAAGAAAGCTGAAACATGGCACAGAGATGCTGCTGCGAGGGTACAGTACTCTAGACCG
GCACAACCAATCACTTGTGCCACATTTGCACAAGATGTGTTAGAAGGTAGAGCTTCAGTA
TCACAGGGTCACGAACACAAGCATCAACCTCTTATCTT

QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1D622JQ 844 0 0
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ATGCGTGGCTCGCCACAATTAACTTGGCTATTTGTAAGGCTATTGATCTGTTGGAAATGC
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ATGTGTTTTCGCGAGATGCTCTAGATGATCGCACAAAGAAAGCTGAAACATGGCACAGAG
ATGCTGCTGCGAGGGTACAGTACTCTAGACCGGCACAACCAATCACTTGTGCCACATTTG
CACAAGATGTGTTAGAAGGTAGAGCTTCAGTATCACAGGGTCACGAACACAAGCATCAAC
CTCTTATCTTCGGTCCAGCAAGCATCGTGAATGGAGGTCTTTCTACGGAGAGAGAGAGAA
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GGTTAACAGAGATGAATATAATGAATGATTGGCAAGAGCAGACGAAAAAAGCAATTGAAG
AAGCAACCACCTCATGGCACAATGACAAACCACTGAGAGGAAAGGAAGAGGATGAAGAAG
ATGATGATGAAGACGAAGATGCTGTGATGAAAGCCAGAGCTTTCGATGATTGGAAGGACG
ATGATCCTCGTGGTGCAGGTAACAAGAAACTCACTCCTTGTGGCTGAACCTTTGACTGTG
ACGATACACATTTTAAACACTTTCTCTCCCTCTTTTGTTACTTATATCCGAACCCTTCTT
TTTTCAATTATGTCTTGTAATGTAATCGTTAGACTGAGTTAAGTACTATTCGAATATTAT
TTTT

QA 1 844 1 844
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGATGGCGTTGACGAAGAAGGTTTTGGAGACTAGAGGTGAGGATATCAACGGTAAAGAGG
AGTTTAAAGGGATTCTCAGGAACCTGAAGGGGGAGGTAAACAACGAGATTAAGATTCAAC
AGTCTCTCTTGGAGATTCAGGGTGTTATTGCTCCTTTGATGAGAATTGCTGGAAGATGAT
GAATTAATGTAAGGTTTGGCTGCTTTGTTTTATTGTAATGCTATTCTAGATTATTTCTTA
AGTTTTGTTTTATCTCAATTGCTGGGAGATGATGTGAATCAATGCAAGTTTTGTTTGTTA
C


BQ
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20 

AF RS1EL65JQ C 1
AF RS1EL65TF U 1
BS 1 301 RS1EL65TF

RD RS1EL65JQ 301 0 0
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AGTTTAAAGGGATTTTCAGGAACCTGAAGGGGGAGGTAAACAACGAGATTAAGATTCAAC
AGTCTTTCTTGGAGATTCAGGGTGTTATTGCTCCTTTGATGAGAATTGCTGGAAGATGAT
GAATTAATGTAAGGTTTGGCTGCTTTGTTTTATTGTAATGCTATTCTAGATTATTTCTTA
AGTTTTGTTTTATCTCAATTGCTGGGAGATGATGTGAATCAATGCAAGTTTTGTTTGTTA
C

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DS 

RD RS1EL65TF 301 0 0
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AGTTTAAAGGGATTCTCAGGAACCTGAAGGGGGAGGTAAACAACGAGATTAAGATTCAAC
AGTCTCTCTTGGAGATTCAGGGTGTTATTGCTCCTTTGATGAGAATTGCTGGAAGATGAT
GAATTAATGTAAGGTTTGGCTGCTTTGTTTTATTGTAATGCTATTCTAGATTATTTCTTA
AGTTTTGTTTTATCTCAATTGCTGGGAGATGATGTGAATCAATGCAAGTTTTGTTTGTTA
C

QA 1 301 1 301
DS 



AS 1 2

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ATCCAACTCAGTCGTCATCATCATCTCCACCGTACAACTTCCGATCAAACTTCAAATACT
CGATGGCTCTGATTCTATCTCTTCCGATTGGAACACCTGCTCAGACTCAAGAGCTTGTCC
TCGACACAGGGAGCCAACTCTCGTGGATCCAGTGCCATCGCAAGAAGAAGAAACCACCAA
CGACGTCGTTTGATCCGTCGCTGTCTTCGTCCTTCTCCAACTTGCCTTGCTCTCATCCTT
TCTGTAAACCAAGAATTCCCGATTTTACCCTTCCCACAACCTGCGACTCGAACCGTCTCT
GTCACTACTCTTACTTCCACGCAGACGGAACCTACGCCGAAGGCAATCTCGTCAAAGAAA
AATTCACCTTCTCAAATACCCAAACTACCCCTCCTTTGATTCTAGGCTGTGCTGCCGAGT
CCACAGATGACAGGGGTATTTTGGGGATGAATCTTGGTCGCCTTTCTTTCATCTCGCAAG
CGAAAATATCCAAGTTCTCTTATTGCATTCCAACCAGGTCGAACCGGCCCGGTTTTACCC
CGACAGGGTCTTTCTACCTCGGGAAAAATCCCATCTCTCGAGGATTTAAATACGTCTCTC
TTTTGACTTTTCCTCAGAGTCAACGCATGCCGAATCTAGACCCTCTGGCTTATACAGTAC
CTTTGCAAGGTATCCGAATAGGACAAAAGAGGCTAGATATCCCAGCCTCTGTCTTTAGAC
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AAAAAGGTTACGTCTACGGCGAAACGGCTGACATGTGTTTTGAAGGAAACAATCCTGTGG
AGATCGGACGGTTGATAGGAGATCTTGCGTTTGAGTTCGGGAGAGGAGTGGAGATTCTCG
TTGAAAAACAAAGGCTTCTTATTAACGTAGGAGGTGGGGTCCACTGTGTTGGCATCGGAC
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GGGTTGAGTTTGATGTAATCAATAAGAGAGTGGGATTCAGTAAAGCTGACTGCAGCAGAT
CATTACCTTAATGAGAAGGCTCCAGTATTTATCTACGGTCCTGCGTATTATTCGAAAATG
TTCCCCGATTATGATCATCTTTGGGTGATTGTTCGATCGGACAGTGTATATTATTAGATC
AGTTTTATTCTGGGACTGTGTGGTCCCGTTAGAAGGACATCTGTCTGAAGCAAACTTGTT
GTCTTATTAAGTTCTGTAACTATAATAATTAAATAGTTCATGTATGTGTTAATT


BQ
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AF RS1A594TF U 1
AF RS1A594JQ C 725
BS 1 783 RS1A594TF
BS 784 1554 RS1A594JQ

RD RS1A594TF 784 0 0
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GTCTCACCACCAACTCATCCTCCTCTTCTTCCCTCCAAACCTCCCTAGCCTCTCGCCGGA
ATCCAACTCAGTCGTCATCATCATCTCCACCGTACAACTTCCGATCAAACTTCAAATACT
CGATGGCTCTGATTCTATCTCTTCCGATTGGAACACCTGCTCAGACTCAAGAGCTTGTCC
TCGACACAGGGAGCCAACTCTCGTGGATCCAGTGCCATCGCAAGAAGAAGAAACCACCAA
CGACGTCGTTTGATCCGTCGCTGTCTTCGTCCTTCTCCAACTTGCCTTGCTCTCATCCTT
TCTGTAAACCAAGAATTCCCGATTTTACCCTTCCCACAACCTGCGACTCGAACCGTCTCT
GTCACTACTCTTACTTCCACGCAGACGGAACCTACGCCGAAGGCAATCTCGTCAAAGAAA
AATTCACCTTCTCAAATACCCAAACTACCCCTCCTTTGATTCTAGGCTGTGCTGCCGAGT
CCACAGATGACAGGGGTATTTTGGGGATGAATCTTGGTCGCCTTTCTTTCATCTCGCAAG
CGAAAATATCCAAGTTCTCTTATTGCATTCCAACCAGGTCGAACCGGCCCGGTTTTACCC
CGACAGGGTCTTTCTACCTCGGGAAAAATCCCATCTCTCGAGGATTTAAATACGTCTCTC
TTT
G

QA 1 783 1 783
DS 

RD RS1A594JQ 830 0 0
CAGGGTC
TTCTACCTCGGGAAAAATCCCATCTCTCGAGGATTTAAATACGTCTCTCTTTTGACTTTT
CCTCAGAGTCAACGCATGCCGAATCTAGACCCTCTGGCTTATACAGTACCTTTGCAAGGT
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GGGTCGGGTCAAACCATGGTCGATTCGGGTTCTGAATTCACTCACTTGGTCGACGTGGCG
TATGATAAAGTGAGGGAAGAAATAGTGAAGCGTGTAGGGCCCAGAATGAAAAAAGGTTAC
GTCTACGGCGAAACGGCTGACATGTGTTTTGAAGGAAACAATCCTGTGGAGATCGGACGG
TTGATAGGAGATCTTGCGTTTGAGTTCGGGAGAGGAGTGGAGATTCTCGTTGAAAAACAA
AGGCTTCTTATTAACGTAGGAGGTGGGGTCCACTGTGTTGGCATCGGACGGTCAAGCATG
CTCGGTGCAGCTAGTAATATAATCGGGAACGTTCATCAGCAGAATCTATGGGTTGAGTTT
GATGTAATCAATAAGAGAGTGGGATTCAGTAAAGCTGACTGCAGCAGATCATTACCTTAA
TGAGAAGGCTCCAGTATTTATCTACGGTCCTGCGTATTATTCGAAAATGTTCCCCGATTA
TGATCATCTTTGGGTGATTGTTCGATCGGACAGTGTATATTATTAGATCAGTTTTATTCT
GGGACTGTGTGGTCCCGTTAGAAGGACATCTGTCTGAAGCAAACTTGTTGTCTTATTAAG
TTCTGTAACTATAATAATTAAATAGTTCATGTATGTGTTAATT

QA 8 830 8 830
DS 



AS 1 2

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AAAGCAACTTTAGGACCATCCATTGGTGTTTTCGACATTGGTGTCAATAAATATGCTTAC
TTCTTCCAGGTTGCTTTGCCTGGTGTCTGCAAAGATTCCGGTGAATTCAGCTGTGAGATT
GAGTCAGATGGAAAGGTTAAACTGGAGGGATCAACCACTACAGGATGTAAAACGATAAAG
AGGCATTCTCGGGTTTTTAAGATGAATATCCGGAAGCTGTGTCCTCCTGGACCGTTCAAG
CTGGCCTTTAGCCTCCCAGGACCAGTTGATCCCCGGCTATTCTCTCCTAACTTCAGATCA
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CACTTCAAGCGGGGAACACATTAGATTTTTTATAGATATTTTAATGTGGCTATAGAAGCT
AGGCCCCCAATCAAACATCTTGTATGGATATATCTCTCATTGTTTTTGCAGATGACGCAT
GATATGCTTGATCAC


BQ
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AF RS1EO16TF U 1
AF RS1EO16JQ C 378
BS 1 670 RS1EO16TF
BS 671 1035 RS1EO16JQ

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GAGTCAGATG

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DS 

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TAAGATGAATATCCGGAAGCTGTGTCCTCCTGGACCGTTCAAGCTGGCCTTTAGCCTCCC
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TCTTGTATGGATATATCTCTCATTGTTTTTGCAGATGACGCATGATATGCTTGATCAC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

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GACGGCGCTGCAGCCTCCACTGTCGATCCAGATTCTTGCGCATGAACGGCTTCTTAAAGA
CGGTGATTACTCTCATCTAATCATACCCCTCAACGCGACGTCTTCAATGCTGTTCGTGGA
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GCTCAAGAACTAAAACCTCCCAATTCAATGTTATGAATTTTCTTTAAAGTATTCTATGTA
CTAATCCTTTGTTTAGTATTTTATTTCATACT


BQ
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AAATATGAAGCGTGGTGTCAAGCTTATGGGTGTAGACAAGGAGATGGGCATTAAATTGCT
ATCAAGTTCTGTTATCAAGCACTACTCCACAGCCATGGAGATTGACGATGAATAAATATC
TTAGATCCTATTGTCCAGATCAAATCCTCATGATGTTCATCTGGAGATGGGAAAGGTAGT
ATTACTTCCACTGTCAAGCTGATTGAATAGTGATATGTT*CTTCCCAC**AAGTGATTGA
CTTGATTGA

QA 1 729 1 729
DS 

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AAAGGTAGTATTACTTCCACTGTCAAGCTGATTGAATAGTGATATGTTTCTTCCCAACAA
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AAGGCAAATAAAGTGAAGAAAGCTGAGACTGAAGATGGTCAATCTCTTACTGCCACTGAA
TCCAAGATCTAACATTATCTCCACCCCGACATGAGTCCTGGTTGAGAAAGTCTGATGAAT
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ATGTGTTGGGCTCAAGAACTAAAACCTCCCAATTCAATGTTATGAATTTTCTTTAAAGTA
TTCTATGTACTAATCCTTTGTTTAGTATTTTATTTCATACT

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 2

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ACGAGAAGGGAGGAGAGAAGGGGCCAGAGAAATGGGGAACACTAAATCCAGAATGGAAAA
TGTGTGGAAACGGCACGATGCAGTCACCTATTGATCTTACGGACAATAGAGTCTTCATTG
ATCATAAGATTGGATCGTTACACAGCCATTATCTACCTTCTAATGGCACCATTAAGAACA
GAGGCCATGATATCATGTTGGAATTCGAAGGAGGAAATGCAGGTATGGGTATAACTATCA
ATGGTACTGTATATCAACTTCAACAGCTTCATTGGCACTCTCCTTCCGAACACACGATCA
ACGGTAAAAGGTTTGTTCTCGAGGAACACATGGTTCATCAGAGCAAAGATGGACGCTTCG
CCGTTGTGGCGTTCCTCTACAATTTGGGAAGACCTGACCCTTTTCTCCTTTCGTTGGAAA
GACAATTGAAGAGGATAACTGATAGACATGAGTCCGAGGAATTTATCAGTATGATTGATC
CTAGAATGATCAATTTCAAATCAAGATTCTATTACAGATATTTAGGATCACTCACAACTC
CCCCCTGTTCTGAAAATGTTACTTGGTCCATTTCCAGAGAGACGAGGACTGTAACGTTGA
AACAGTTGAGCCTGCTTCGTGTGACTGTACATGATCAATCTAATTCGAATGCTAGACCGC
TTCAACGTCAAAACCAGCGTCCAGTGAAACTCTACTTACCAACATGGCATATTTAACCAA
TATAAAAGTTGTTGTTCACTCTATTTGAGCTTTGGTTAAACCTAGTTTTCATTAGTTTTA
TGTACTGAGAACCAAAAGAGAACACTAATAAAAA


BQ
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AF RS1H203JQB C 332
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DS 

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TTGGTTAAACCTAGTTTTCATTAGTTTTATGTACTGAGAACCAAAAGAGAACACTAATAA
AAA

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

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TGTTCAATGAGATTAGTAAGTACTGGAAGAAGAGGGTTATAACTCCTGTTATCATTACTC
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TGATCTAACGAGCATGTAAAATCATTTTTCAAGTCTTCTTTATATGTTTGCTAGAATAGA
TGAATATTTGATGTCAACCTCCTCAGTATTTTCATGACAGAGAGATTCTGTTTGTTATTG
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TAGTAAGAATCATTAGCCGCC


BQ
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AF RS1EM02TF U 1
AF RS1EM02JQ C 404
BS 1 661 RS1EM02TF
BS 662 662 RS1EM02JQ
BS 663 771 RS1EM02TF
BS 772 1221 RS1EM02JQ

RD RS1EM02TF 771 0 0
GGGAAAACTGAAGAGGATATTATGACTTCTCAATTACTCCACCGCTTCCTGATCATTATA
TAAACTGTCTAGGACCGTGATTTACGATTCACCTCCTTATCACAAGAAAGCCCAACCGAT
CGATGGTTTTGCCTCTCAGAAGAACATCCAGTAGCTGTGCACGGAAGCTCTGATCTCTGC
TCCAGTTCATTTTTATGACATTGAGATTATGGTGCCAACACGTAACTCCACAGCTTACGA
TGATTACCTTCAGGTCGGTCTCTATCTTTCTAAATGTTTTTTTCCATTCAGCAGGATGTG
TGACAGGCTTTCAACAGCAACCTCTCATCCTCTTTCTGAATTTATCTTCTTTCTTAACAA
CCATTGTTAACAATTGAGTGACATGGACAAGGTAAAGATCATGCATGAGCTCTCATCCGC
ATCTTTCTCAGTCTCTCACTCTATTTTTTCTGCTTAGTTTATAGGTAAATTTTTAAGCTT
TCTTGATTGGATCAGTGGCTGAGAAGATAGAGAGCTTTGCATCAACAGCTTGGAAACCAC
AAAGAGGCGTACCTATAAAATATGTGTCTCCTTAGCTCTTTGAACATTTCCTGAATCCGA
AAATTGAAAGACTCAAAGAAGAGAGGAAATAATCTTTTTGCTTCTGTGCAAGTGATTAGA
ATGTGATTGTTATTTGCTGCTTCAGTGAGTTTTGAGTACTCCTTATGGAAGAAATTGATA
GTCTCTGTCACTTTAGCCTTCACTGAACATTGATAATCCAGAAATGAACAT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RS1EM02JQ 818 0 0
CATGAGCTCTCATCCGCATCTTTCTCAGTCTCTCACTCTATTTTTTCTGCTTAGTTTATA
GGTAAATTTTTAAGCTTTCTTGATTGGATCAGTGGCTGAGAAGATAGAGAGCTTTGCATC
AACAGCTTGGAAACCACAAAGAGGCGTACCTATAAAATATGTGTCTCCTTAGCTCTTTGA
ACATTTCCTGAATCCGAAAATTGAAAGACTCAAAGAAGAGAGGAAATAATCTTTTTGCTT
CTGTGCAAGTGATTAGAAGGTGATTGTTATTTGCTGCTTCAGTGAGTTTTGAGTACTCCT
TATGGAAGAAATTGATAGTCTCTGTCACTTTAGCCTTCACTGAACATTGATAATCCAGAA
ATGAACATTTGTTCGAAGTGATCAGCTCGAGAGATGATGTGCTTAGGACGTTGATGAGAA
GGCGTACGTATCTCAGGAAGCTGTTAGGGATGATGATATTGACTTGAATGGTATTCCATC
GACTGAGTCATTCTACGTGTTCAATGAGATTAGTAAGTACTGGAAGAAGAGGGTTATAAC
TCCTGTTATCATTACTCTGGCCAAGGGTGTGGAAGCAGAGTTTGAACCTCATCCTTGGAT
TGTTACTCATGTTTAAATGATCTAACGAGCATGTAAAATCATTTTTCAAGTCTTCTTTAT
ATGTTTGCTAGAATAGATGAATATTTGATGTCAACCTCCTCAGTATTTTCATGACAGAGA
GATTCTGTTTGTTATTGTTTGATATTGTGTATGGGTTATTTACCAGAAATAACAAATCGC
TTGATTGTGTGTAATGTTAGTAAGAATCATTAGCCGCC

QA 1 818 1 818
DS 



AS 1 2

CO CL5671Contig1 1002 2 4 U
GAACAGTTTGATATGTGGAGTCCAAGCTTCAGGAAAAACTCTGCTTTTGATGATCAGTTC
GAGTTCAGCGGACCTTATAGCTCAATGATCGAAGTGTCACACTTTCATAAAAACCATAGG
AGAGGACGTGACCTTGACTTGATGAATCGAAACTTCAGGTTGATGATTAAGCAACTGGAG
AGTGTTGATCCGAGAGATCTTACTCAGCAAGAGAAACTAGCATTTTGGATTAACATACAT
AACGCACTTGTGATGCACACATTTCTAGCAAATGGGATTCCACAGAACAACGGGAAGCGA
TTTTTACTGCTCTCCAAGCCAGCTTACAACATAGGAGGTCGCATGGTAAGCATAGAAGCG
ATACAAAGTTATATTCTTCGCATCAAGATGCCTCGTCCTGGCCAGTGGCTGAAGTTACTA
CTCATTCCAAGAAAGTTCAGAACCGGAGATAAGCATCAAGAGTATTCCCTCGACCATTCT
GAGCCTCTCTTATACTTTGCTCTTTGCTCAGGCAACCATTCTGATCCGGCGATTCGTGTT
TATACGCCCAAGGGGATCTACCAAGAGCTAGTAACCGCGAGAGAGGAGTATGTTCGTGCA
ACGTTTGGGGTAAAGAAGGACCAGAAGCTAGTCTTACCAAAGATCATTGAGTCTTTTAGC
AAAGACTCAGGTTTGAGTCAAGCAGCACTGATGGAGATGGTTCAAGAATGTCTCCCAGAG
ACAATGAAGAAAAGAGTAAAGAAACTTAGCTCAGGGAGGTCCAGAAAGAGCATTGTTGAG
TGGATACCACATAGTTTCGTGTTTCGGTATTTGATAGCCAGAGAACTTGTTTGATGAATC
TGTTCTTCTCTTTTGTAATGGTTATTGGTCAAGTGTATAGGAGGAGGGGAATGTATGTGT
AGAGAGTAGAAATAGAGAGAGGGAGAACTGCATGCCGTTTGCCGGGATGATGTTTTGGCT
TTGTTGTCTTTGTTTTATGTGGTTACTGTGTACATACTAAAT


BQ
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AF RS1CA58TF U 1
AF RS1CA58JQ C 281
BS 1 618 RS1CA58TF
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BS 620 662 RS1CA58TF
BS 663 1002 RS1CA58JQ

RD RS1CA58TF 663 0 0
GAACAGTTTGATATGTGGAGTCCAAGCTTCAGGAAAAACTCTGCTTTTGATGATCAGTTC
GAGTTCAGCGGACCTTATAGCTCAATGATCGAAGTGTCACACTTTCATAAAAACCATAGG
AGAGGACGTGACCTTGACTTGATGAATCGAAACTTCAGGTTGATGATTAAGCAACTGGAG
AGTGTTGATCCGAGAGATCTTACTCAGCAAGAGAAACTAGCATTTTGGATTAACATACAT
AACGCACTTGTGATGCACACATTTCTAGCAAATGGGATTCCACAGAACAACGGGAAGCGA
TTTTTACTGCTCTCCAAGCCAGCTTACAACATAGGAGGTCGCATGGTAAGCATAGAAGCG
ATACAAAGTTATATTCTTCGCATCAAGATGCCTCGTCCTGGCCAGTGGCTGAAGTTACTA
CTCATTCCAAGAAAGTTCAGAACCGGAGATAAGCATCAAGAGTATTCCCTCGACCATTCT
GAGCCTCTCTTATACTTTGCTCTTTGCTCAGGCAACCATTCTGATCCGGCGATTCGTGTT
TATACGCCCAAGGGGATCTACCAAGAGCTAGTAACCGCGAGAGAGGAGTATGTTCGTGCA
ACGTTTGGGGTAAAGAAG*ACCAGAAGCTAGTCTTACCAAAGATCATTGAGTCTTTTAGC
AA
G

QA 1 662 1 662
DS 

RD RS1CA58JQ 722 0 0
CACAGAACAACGGGAAGCGATTTT*ACTGCTCTCCAAGCCAGCTTACAACATAGGAGGTC
GCATGGTAAGCATAGAAGCGATACAAAGTTATATTCTTCGCATCAAGATGCCTCGTCCTG
GCCAGTGGCTGAAGTTACTACTCATTCCAAGAAAGTTCAGAACCGGAGATAAGCATCAAG
AGTATTCCCTCGACCATTTTGAGCCTCTCTTATACTTTGCTCTTTGCTCAGGCAACCATT
TTGATCCGGCGATTCGTGTTTATACGCCCAAGGGGATCTACCAAGAGCTAGTAACCGCGA
GAGAGGAGTATGTTCGTGCAACGTTTGGGGTAAAGAAGGACCAGAAGCTAGTCTTACCAA
AGATCATTGAGTCTTTTAGCAAAGACTCAGGTTTGAGTCAAGCAGCACTGATGGAGATGG
TTCAAGAATGTCTCCCAGAGACAATGAAGAAAAGAGTAAAGAAACTTAGCTCAGGGAGGT
CCAGAAAGAGCATTGTTGAGTGGATACCACATAGTTTCGTGTTTCGGTATTTGATAGCCA
GAGAACTTGTTTGATGAATCTGTTCTTCTCTTTTGTAATGGTTATTGGTCAAGTGTATAG
GAGGAGGGGAATGTATGTGTAGAGAGTAGAAATAGAGAGAGGGAGAACTGCATGCCGTTT
GCCGGGATGATGTTTTGGCTTTGTTGTCTTTGTTTTATGTGGTTACTGTGTACATACTAA
AT

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL5672Contig1 992 2 4 U
GAAGATGGAGAGAGGTGGGCTTCAGAGAAGGTGGCAAGAGACAGTGTTCTCGTTTTCCGA
TTCGCTGATGTCGGGAAGCTTCCACCTCCTGTGCTTCAGTTTGTGGAAGTGTCTTTCGGG
TACACGCCGGACTATCTTATATACAAGAACATCGACTTTGGTGTTGACTTGGACTCAAGA
GTGGCTCTTGTTGGACCTAACGGAGCTGGGAAGAGTACTTTATTGAAGTTAATGACTGGT
GAGCTGCACCCGACTGAAGGAATGGTGAGGCGTCACAACCACTTGAAGATTGCTCAGTAC
CATCAGCATCTAGCTGAGAAGCTGGACCTGGAAGTGCCTGCGCTTATCTACATGATGAAC
GAGTTCCCTGGTAACGAAGAGGAGAAGATGAGAGCTGCCATTGGTAGGTTCGGTCTAACC
GGTAAGGCTCAAGTGATGCCGATGAAGAATCTCTCTGATGGACAGAGGAGCCGTGTGATA
TTCGCGTGGTTGGCTTATAAGCAGCCTAACATGCTTCTGTTGGATGAGCCTACCAACCAT
TTGGATATTGAGTCATGACTTCAGGTTGATTAACCAAGTGGCTCATGAGATATGGGTGTG
TGAGAAGCAGTGCATTACTAAATGGAATGGTGGTATGGACTTCAAGAAGCATCTCAAGGC
TAAAGCTGGACTTGATGATTGAAGATAGAGTTAAGTCAGAAGACTCTGTTGGGTCTTGGC
TAGAGAGTGAGAGGGATGGTTTTGGGAATGGTTGTTAACGACTTCTTAAGCCAACACGTT
AGAGAGAAAGAGACACCATACTCGTGATCTCTGCAACTTCTTACTTATTAAGAGGTCAGT
GGTTCTATATCATAATTAGTAATGTGCACTTTTATTATTGTTCTTGAACGTTTTTTTGAA
GGCGAAACGGAGATGGAAAAAGTAATACTTTTGGTTGTATGGATTATTTGTTTCATTTTA
TAAAGACTGAGATGTTGACGATTATACTATTT


BQ
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AF RS1D433TF U 1
AF RS1D433JQ C 273
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BS 643 992 RS1D433JQ

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QA 1 642 1 642
DS 

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GTATGGACTTCAAGAAGCATCTCAAGGCTAAAGCTGGACTTGATGATTGAAGATAGAGTT
AAGTCAGAAGACTCTGTTGGGTCTTGGCTAGAGAGTGAGAGGGATGGTTTTGGGAATGGT
TGTTAACGACTTCTTAAGCCAACACGTTAGAGAGAAAGAGACACCATACTCGTGATCTCT
GCAACTTCTTACTTATTAAGAGGTCAGTGGTTCTATATCATAATTAGTAATGTGCACTTT
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GGTTGTATGGATTATTTGTTTCATTTTATAAAGACTGAGATGTTGACGATTATACTATTT

QA 1 720 1 720
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TTGTGTGTGGTTAATAAAA


BQ
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AF RS1BA49TF U 1
AF RS1BA49JQ C 379
BS 1 676 RS1BA49TF
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RD RS1BA49TF 768 0 0
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CATATACACTCTGCGTCTACGGGTGGTAAACTCCTCCTCCACGGGAACATCAAGTCACCG
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ATGGCTTGTGTGTCCAAGCATCCGGATTCTAGGCCTTCCATGGAGGAAGTTGTTAGCATG
ATGGAAGAGATTAGCC*TTCTGCAGGTTCTCGCAACAGAGCCTCTTCAC*AGAGATGAT*
AGAAGCTCTGATAGCCCGGTTTAGAT*GGTTATTTTTT
CTTATTTCTC

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1BA49JQ 541 0 0
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CATCCGGATTTTAGGCCTTCCATGGAGGAAGTTGTTAGCATGATGGAAGAGATTAGCCCT
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TTTTTACTTCTTCTTCTTGGGAAGAGTAAAGCTTTTAGTAGTTCGCTGTCTCACTAATGT
AACTGAAACTCTGTCCTTGAATTGTTGTAGTTCTTACATTGGTTGTGTGTGGTTAATAAA
A

QA 1 541 1 541
DS 



AS 1 2

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GTTCTTGGAGGGATATGCGTTGGATTTTCCGTCATTGTCTTCGCAGCCCCTTTAAGTTCA
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TTACACTTAGTGCCATCACGTGGCTCTTCTACGGTCTTGCTATTAAAGACTTCTACGTTG
CGCTTCCAAATGTGTCGGGCGCGTTCTTAGGAGCTATTCAAATGATTCTCTACATAATAT
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ATTCCATCGACATAGCGAAGCTAACTACCGTTATGCCGGGTCCAGTTTTGGATTCGGCGG
TTCATCTACTGCCTGCTATTCATACTGTTCCCGACACTGAGCTTCAAGTGACCGAGATCC
AGAGCCAGAACATCACGGGTCCAAAAGATCAGCGCAACAAGGATTTCGAGAACCAAGGCC
CAGTTTAACTAGTGAATCTTATTTAGAGACATTAATAATGCATTGCTTGAGTTGTGCACT
TAGCTAAACTTTTCATATATTTTCGTATTTTATGGTTTTCGTATTTCTTGTTAGGACTCG
TCTACTACCTCTTTCCCGCTATCAGTTTATTTCCAGGTATCCGGAAATTGTGCTATGATC
AAT


BQ
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10 10 10 

AF RS1FP58TF U 1
AF RS1FP58JQ C 441
BS 1 734 RS1FP58TF
BS 735 735 RS1FP58JQ
BS 736 760 RS1FP58TF
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BS 800 803 RS1FP58TF
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BS 805 822 RS1FP58TF
BS 823 1143 RS1FP58JQ

RD RS1FP58TF 829 0 0
GGATAGCTGAAACTCACAAAACTAGAGCTTCGCTTTCGAGAGCTAGTGGAGGCTTAAAGA
GCTCTATAAGGAAAACATCAAGAAATGGCTCTACCTCACAATGTATGGGCATTTGTGTTC
GGGATCATGGGCAACATCATATCATTCGTCGTGTTCCTAGCCCCAGTGCCGACTTTTGTA
AGGATATGTAAGAAGAAATCTACAGAAGGCTTTCAGTCTCTTCCGTATCTTTCAGCTTTA
TTTAGCGCGTTGCTTTGGATTTACTATGCAATGCAAAAAGATGGCTCAGGCTTCCTTCTC
ATCACCATAAACTCTGTTGGGTGCTTCATTGAAAGCATTTATATCATCCTTTTCATAACC
TATGCTAACAAGAAAACTAGAGTATCCACTTTGAAGGTCCTTGGTCTCCTGAACTTTTTG
GGGTTTGCCGCCATTGTTCTGATCTGCGAGCTCTTAACCAAAGGATCAACACGTGAGAAA
GTTCTTGGAGGGATATGCGTTGGATTTTCCGTCATTGTCTTCGCAGCCCCTTTAAGTTCA
TGAGACTAGTGGTACGAACAAGAGGTGTGGAGTTTATGCCATTCTCTTTATCTTTGTTTC
TTACACTTAGTGCCATCACGTGGCTCTTCTACGGTCTTGCTATTAAAGACTTCTACGTTG
CGCTTCCAAATGTGTCGGGCGCGTTCTTAGGAGCTATTCAAATGATTCTCTACATAATAT
TCAAGTACTACAAA*CTCCAGTGGCTGAGACGACCGAGAA*TCCAAAACAGTGTCTGAC*
ATTCCATCGACATAGCGA*GCTA*CTACCGTTATGCCGGGTC
AGTTTGG

QA 1 822 1 822
DS 

RD RS1FP58JQ 703 0 0
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TGGATTTTCCGTCATTGTCTTCGCAGCCCCTTTAAGTTCATGAGACTAGTGGTACGAACA
AGAGGTGTGGAGTTTATGCCATTCTCTTTATCTTTGTTTCTTACACTTAGTGCCATCACG
TGGCTCTTCTACGGTCTTGCTATTAAAGACTTCTACGTTGCGCTTCCAAATGTGTCGGGC
GCGTTCTTAGGAGCTATTCAAATGATTCTCTACATAATATTCAAGTACTACAAAACTCCA
GTGGCTGAGACGACCGAGAAATCCAAAACAGTGTCTGACCATTCCATCGACATAGCGAAG
CTAACTACCGTTATGCCGGGTCCAGTTTTGGATTCGGCGGTTCATCTACTGCCTGCTATT
CATACTGTTCCCGACACTGAGCTTCAAGTGACCGAGATCCAGAGCCAGAACATCACGGGT
CCAAAAGATCAGCGCAACAAGGATTTCGAGAACCAAGGCCCAGTTTAACTAGTGAATCTT
ATTTAGAGACATTAATAATGCATTGCTTGAGTTGTGCACTTAGCTAAACTTTTCATATAT
TTTCGTATTTTATGGTTTTCGTATTTCTTGTTAGGACTCGTCTACTACCTCTTTCCCGCT
ATCAGTTTATTTCCAGGTATCCGGAAATTGTGCTATGATCAAT

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 2

CO CL5676Contig1 786 2 2 U
GGGGTTCTTCCGAGTCATCCATCCAAGGGGAGAGGAAAGAAACGCTACGATCACGAGAAG
GGCAAAAGATTCGTTCCGATCCGATTCTCCAGAAGAGGAGAGAGGCATATCATCATCATT
CATCATGATAGGGTTGTTCAAGGTTAAGGAGAAGCAAAAAGAAGAAGCTAAGAACAACAA
CACAAGAGGAGCTTCTGCCAAGAAACAATCTGCTGGTGAACTTCGTCTTCACAAAGATAT
AACAGAGCTGAATTTGCCAAAGTCTTGTTCCATATCTTTTCCTAATGGAAAGAATGACTT
GATGAACTTTGAGGTCACCATCAAACCCGACGATGGCTATTACTTAGGTGGTAAATTTGT
TTTCACGTTCCAAGTCTCTCCGGTGTATCCACATGAAGCTCCAAAAGTTAAGTGCAAGAC
CAAGGTGTACCATCCGAATATCGATTTAGAAGGAAACGTTTGTCTCAACATCTTGCGTGA
AGACTGGAAACCTGTTCTCAACATTAACACTCTCATCTACGGTCTTTTCCATCTCTTCAC
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CAAGCAGTTTGAGTCTAATGTCAAGAGGGCTATGAGTGGTGGCTATGTTGGCCAAACCTC
ATTCCCTCGCTGCATCTAAGTTATAATAAGCTATGCTTCTGTTTCACTTCACTTTTCTTC
TTCTCTAGAGACTTTTTGTGTTTGCTCTCTTGTACATTTTGGCTTTTATGACATCGCTTT
TATTAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1H153TF U 1
AF RS1H153JQB C 228
BS 1 588 RS1H153TF
BS 589 786 RS1H153JQB

RD RS1H153TF 588 0 0
GGGGTTCTTCCGAGTCATCCATCCAAGGGGAGAGGAAAGAAACGCTACGATCACGAGAAG
GGCAAAAGATTCGTTCCGATCCGATTCTCCAGAAGAGGAGAGAGGCATATCATCATCATT
CATCATGATAGGGTTGTTCAAGGTTAAGGAGAAGCAAAAAGAAGAAGCTAAGAACAACAA
CACAAGAGGAGCTTCTGCCAAGAAACAATCTGCTGGTGAACTTCGTCTTCACAAAGATAT
AACAGAGCTGAATTTGCCAAAGTCTTGTTCCATATCTTTTCCTAATGGAAAGAATGACTT
GATGAACTTTGAGGTCACCATCAAACCCGACGATGGCTATTACTTAGGTGGTAAATTTGT
TTTCACGTTCCAAGTCTCTCCGGTGTATCCACATGAAGCTCCAAAAGTTAAGTGCAAGAC
CAAGGTGTACCATCCGAATATCGATTTAGAAGGAAACGTTTGTCTCAACATCTTGCGTGA
AGACTGGAAACCTGTTCTCAACATTAACACTCTCATCTACGGTCTTTTCCATCTCTTCAC
GGAACCCAATCACGAGGATCCTCTCAACCATGACGCAGCAGCGGTTTT

QA 1 588 1 588
DS 

RD RS1H153JQB 559 0 0
TTCACAAAGATATAACAGAGCTGAATTTGCCAAAGTCTTGTTCCATATCTTTTCCTAATG
GAAAGAATGACTTGATGAACTTTGAGGTCACCATCAAACCCGACGATGGCTATTACTTAG
GTGGTAAATTTGTTTTCACGTTCCAAGTCTCTCCGGTGTATCCACATGAAGCTCCAAAAG
TTAAGTGCAAGACCAAGGTGTACCATCCGAATATCGATTTAGAAGGAAACGTTTGTCTCA
ACATCTTGCGTGAAGACTGGAAACCTGTTCTCAACATTAACACTCTCATCTACGGTCTTT
TCCATCTCTTCACGGAACCCAATCACGAGGATCCTCTCAACCATGACGCAGCAGCGGTTT
TAAGGGATAACCCCAAGCAGTTTGAGTCTAATGTCAAGAGGGCTATGAGTGGTGGCTATG
TTGGCCAAACCTCATTCCCTCGCTGCATCTAAGTTATAATAAGCTATGCTTCTGTTTCAC
TTCACTTTTCTTCTTCTCTAGAGACTTTTTGTGTTTGCTCTCTTGTACATTTTGGCTTTT
ATGACATCGCTTTTATTAT

QA 1 559 1 559
DS 



AS 1 2

CO CL5677Contig1 803 2 7 U
GAAGCTAGTAGGGAGAGACTCCGGCGAGAGAAAATGGGATTCATAGTGGGCCTTGTGTTC
GGACTCGTAGTCGGAATCACAATCATCATCGGCTTTGTCAAGGCCGAGAATTACCGATCC
AAGCTCCGCTCCAAACTCGCGAAGACGGTGGCTGCTTTCGCGAGGATGACGGTGGAGGAT
TCGAGGAAGCTTTTGCCTGCTGAGTTCTATCCTTCCTGGGTCGTCTTCTCCGAGCGTCAG
AAGTTGACGTGGCTGAACCATCACTGACAAAGATCTGGCCTTATGTTGACAAGGCAGCCT
CGGAGCTTATAAAGGCATCCGTGGAGCCTGTTCTCGAGCAATATAGACCTGCCATTGTCG
CCTCCTTGACGTTTTCTAAGCTCACTCTCGGTACCGTGGCGCCTCACTTTACAGGTGTTT
CCATTGTGGAAGGTGATTATAGTGATCTGGAGCTAAAGCCTGTTGGAATGTTGGAGGTAA
AGCTTGTGCAAGCGAAGAACTTGACCAACAAAGATCTAGTGGGAAAATCAGACCCCTTTG
CTAAAATGTTCATACGCCCTTTACGAGAAAAAACTCCAAGAAGCAAGACAATTAACAATG
ACCTGAATCCCATCTGGAATGAGCATTTTGAATTTGTCGTGGAAGACGCGTCAACCCAAC
ATCTAGTGGTTAGAGTATATGACGACGAGGGTGTGCAGGCATCTGATCTTCTTGGTTGTG
CCAAATCCGCTTTGTGACTTGAACCTGGTAAAGTGAAAGACGTCTGGTTGAGCTGGTCAA
GATTTAGAGATCAGAGAGATACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EQ14TF U 71
AF RS1F615TF U 1
BS 1 132 RS1F615TF
BS 133 133 RS1EQ14TF
BS 134 290 RS1F615TF
BS 291 291 RS1EQ14TF
BS 292 406 RS1F615TF
BS 407 407 RS1EQ14TF
BS 408 803 RS1F615TF

RD RS1EQ14TF 341 0 0
TCGGAATCACAATCATCATCGGCTTTGTCAAGGCCGAGAATTACCGATCCAAGCTCCGCT
CCAAACTCGCGAAGACGGTGGCTGCTTTCGCGAGGATGACGGTGGAGGATTCGAGGAAGC
TTTTGCCTGCTGAGTTCTATCCTTCCTGGGTCGTCTTCTCCGAGCGTCAGAAGTTGACGT
GGCTGAACCATCACTGACAAAGATCTGGCCTTATGTTGACAAGGCAGCCTCGGAGCTTAT
AAAGGCATCCGTGGAGCCTGTTCTCGAGCAATATAGACCTGCCATTGTCGCCTCCTTGAC
GTTTTCTAAGCTCACTCTCGGTACCGTGGCGCCTCACTTTA

QA 1 341 1 341
DS 

RD RS1F615TF 803 0 0
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GGACTCGTAGTCGGAATCACAATCATCATCGGCTTTGTCAAGGCCGAGAATTACCGATCC
AAGCTCCGCTCCGAACTCGCGAAGACGGTGGCTGCTTTCGCGAGGATGACGGTGGAGGAT
TCGAGGAAGCTTTTGCCTGCTGAGTTCTATCCTTCCTGGGTCGTCTTCTCCGAGCGTCAG
AAGTTGACGTGGCTGAACCATCACTGACAAAGATCTGGCCTTATGTTGACGAGGCAGCCT
CGGAGCTTATAAAGGCATCCGTGGAGCCTGTTCTCGAGCAATATAGACCTGCCATTGTCG
CCTCCTTGACGTTTTCTAAGCTCACTCTCGGTACCGTGGCGCCTCAGTTTACAGGTGTTT
CCATTGTGGAAGGTGATTATAGTGATCTGGAGCTAAAGCCTGTTGGAATGTTGGAGGTAA
AGCTTGTGCAAGCGAAGAACTTGACCAACAAAGATCTAGTGGGAAAATCAGACCCCTTTG
CTAAAATGTTCATACGCCCTTTACGAGAAAAAACTCCAAGAAGCAAGACAATTAACAATG
ACCTGAATCCCATCTGGAATGAGCATTTTGAATTTGTCGTGGAAGACGCGTCAACCCAAC
ATCTAGTGGTTAGAGTATATGACGACGAGGGTGTGCAGGCATCTGATCTTCTTGGTTGTG
CCAAATCCGCTTTGTGACTTGAACCTGGTAAAGTGAAAGACGTCTGGTTGAGCTGGTCAA
GATTTAGAGATCAGAGAGATACA

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

CO CL5678Contig1 827 2 3 U
GGTGGAATATTAATTATATTAGCCATGTAACATGTATTAGAGTTCATCAACATCATACTT
CCACTTGTAGATTCAATCAAAGTGTAACAAGTGAAATATACTTTTGGGTATAGACCAGAT
TGAAACAGAGGTTTTCAAGTGTACTTCGAAGACTAAGCTGTAGTATTAGAAACCGCAGCA
GATTGAAGTCTCTGCAACCATGCGATTTTCAAACTAGGCTTCTTCAGCTCTAAGAAGATC
TCTCTATACTCCCTCTTCAGAAACTGATCCAACGCAAACATGTAGAGGTCACTCCCTTCC
TCCACCTCCTTCATCGCGTTGAGGCTTTCAATGCATTCTCCAATACAGTACATCCGCTTT
GCTGATTCTATCTCAACAACGCGTGCTGGACTCTCCTGCAACGTACCGTCACTCATTAGC
TTCACAGCATCCAACCTTTTACCCGGTTTCACGTTGTAATTCCCTTCATCTTCTTGGAAC
CGCGGTGACTCGGAACGATCGCGGAGGAGGAGTTTCTTCCGAGAGGGAGGAGTGTATGAC
TCTCCTGGTTCTATAACTCCACTGAAGATGATTGAGAGTTTGTCAGCATGAGGAACTTCC
TTGTGGCGAAACTGTCCTGCTCTTGGGTTCTCCCGAATATAGTTTCTCCATTCCTCTTCT
GTTGCACCGAAACTACCAGTTTCTGGATCCCATTTCATGCTATCGTCTCCAACGAGCCGA
CACCAGATCTTCCAAGCTTTCCTAGTGCAATCCCAATGGTTCTTCAGCTGCCCTCTTGTG
TAACCGAGTCCCGTTCTTTCATTAATCGTCTCGAAAATCGTCTTCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1C842JQ U 262
AF RS1D880JQ U 1
BS 1 462 RS1D880JQ
BS 463 463 RS1C842JQ
BS 464 827 RS1D880JQ

RD RS1C842JQ 304 0 0
AACTGATCCAACGCAAACATGTAGAGGTCACTCCCTTCCTCCACCTCCTTCATCGCGTTG
AGGCTTTCAATGCATTCTCCAATACAGTACATCCGCTTTGCTGATTCTATCTCAACAACG
CGTGCTGGACTCTCCTGCAACGTACCGTCACTCATTAGCTTCACAGCATCCAACCTTTTA
CCCGGTTTCACGTTGTAATTCCCTTCATCTTCTTGGAACCGCGGTGACTCGGAACGATCG
CGGAGGAGGAGTTTCTTCCGAGAGGGAGGAGTGTATGACTCTCCTGGTTCTATAACTCCC
CTGA

QA 1 304 1 304
DS 

RD RS1D880JQ 827 0 0
GGTGGAATATTAATTATATTAGCCATGTAACATGTATTAGAGTTCATCAACATCATACTT
CCACTTGTAGATTCAATCAAAGTGTAACAAGTGAAATATACTTTTGGGTATAGACCAGAT
TGAAACAGAGGTTTTCAAGTGTACTTCGAAGACTAAGCTGTAGTATTAGAAACCGCAGCA
GATTGAAGTCTCTGCAACCATGCGATTTTCAAACTAGGCTTCTTCAGCTCTAAGAAGATC
TCTCTATACTCCCTCTTCAGAAACTGATCCAACGCAAACATGTAGAGGTCACTCCCTTCC
TCCACCTCCTTCATCGCGTTGAGGCTTTCAATGCATTCTCCAATACAGTACATCCGCTTT
GCTGATTCTATCTCAACAACGCGTGCTGGACTCTCCTGCAACGTACCGTCACTCATTAGC
TTCACAGCATCCAACCTTTTACCCGGTTTCACGTTGTAATTCGCTTCATCTTCTTGGAAC
CGCGGTGACTCGGAACGATCGCGGAGGAGGAGTTTCTTCCGAGAGGGAGGAGTGTATGAC
TCTCCTGGTTCTATAACTCCACTGAAGATGATTGAGAGTTTGTCAGCATGAGGAACTTCC
TTGTGGCGAAACTGTCCTGCTCTTGGGTTCTCCCGAATATAGTTTCTCCATTCCTCTTCT
GTTGCACCGAAACTACCAGTTTCTGGATCCCATTTCATGCTATCGTCTCCAACGAGCCGA
CACCAGATCTTCCAAGCTTTCCTAGTGCAATCCCAATGGTTCTTCAGCTGCCCTCTTGTG
TAACCGAGTCCCGTTCTTTCATTAATCGTCTCGAAAATCGTCTTCCA

QA 1 827 1 827
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5680Contig1 888 2 2 U
CAACTGCACATTTGGTTCACGCAGACCGTGACCCGGAAAAAGCCCGGAGCCAGAAATGTA
TAGAGTTGGCAAACCTTCACTCCAGGGCTGTTGATTTTGCTAAAACTGGAGCTCCAGCTG
AGATGCCTTTTGCCTTAAAGCCCAGAGAGTTCCCTGATTTCCTGGAACGGTTCGAGAAGC
CAACATACATCTCTGGCTCCGTGTTTGGGAAACTATACCGTGCTGTGAAAAGCGCTTTAG
CACAGAGAAAGCCAGAAGACGCTGAGAGAGAGAGCAAGATGGCTTATGACCCAACACTTG
AAGCTGCTGGCTTCGAGAGCTTCATAGAGACGGCGAAAGCTCATAGAGACATGTATGCTG
AGAAACTGAGGTCGTTGATGAACTACTACGGAGCCGCTAACGAAGAAGAGATTCTCACGG
GGATTTTGAGAACCAAGGAGATGTATTTGCAGAGAGACAACCGGAGGTATGGTGACATGA
AGGATAGGATTACATTGTCGGTTAAGGATTTGCAGAGAGAGGCCATGGGATGGTTCGAGA
AGAGCTGCGAGGATGGACAAGAGAGGAAGAAGCTAGCGTCGGCTTGGTACTATGTAACAT
ACAACCCGAGCCATGACGATGAGAAGCCGAAATTCTTGAGCTTTCCGTGGATCGTAGGAG
ACGTTTTGCTGGGGATAGAGGCTGAAAGTGCGGAGAGAGAGACAGAGGGAATGGTGATAG
CGTGAAGAGCAAGCATGTGGACTACTATCTGTTTGGTTACCCTAATAATCACTTGTAGGT
TTTAGTATAAGTTAAAACCGCCTGTATATGCGTCAGTGTTTTGAGGCAAACAAAAATCAG
GAAGTAGTAGCAAAATTAGTGAATCTAATCAAACAAGTGTTAAAAGGG


BQ
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AF RS1AN29TF U 1
AF RS1AN29JQ C 158
BS 1 256 RS1AN29TF
BS 257 888 RS1AN29JQ

RD RS1AN29TF 256 0 0
CAACTGCACATTTGGTTCACGCAGACCGTGACCCGGAAAAAGCCCGGAGCCAGAAATGTA
TAGAGTTGGCAAACCTTCACTCCAGGGCTGTTGATTTTGCTAAAACTGGAGCTCCAGCTG
AGATGCCTTTTGCCTTAAAGCCCAGAGAGTTCCCTGATTTCCTGGAACGGTTCGAGAAGC
CAACATACATCTCTGGCTCCGTGTTTGGGAAACTATACCGTGCTGTGAAAAGCGCTTTAG
CACAGAGAAAGCCAGA

QA 1 256 1 256
DS 

RD RS1AN29JQ 731 0 0
TTTCCTGGAACGGTTCGAGAAGCCAACATACATCTCTGGCTCCGTGTTTGGGAAACTATA
CCGTGCTGTGAAAAGCGCTTTAGCACAGAGAAAGCCAGAAGACGCTGAGAGAGAGAGCAA
GATGGCTTATGACCCAACACTTGAAGCTGCTGGCTTCGAGAGCTTCATAGAGACGGCGAA
AGCTCATAGAGACATGTATGCTGAGAAACTGAGGTCGTTGATGAACTACTACGGAGCCGC
TAACGAAGAAGAGATTCTCACGGGGATTTTGAGAACCAAGGAGATGTATTTGCAGAGAGA
CAACCGGAGGTATGGTGACATGAAGGATAGGATTACATTGTCGGTTAAGGATTTGCAGAG
AGAGGCCATGGGATGGTTCGAGAAGAGCTGCGAGGATGGACAAGAGAGGAAGAAGCTAGC
GTCGGCTTGGTACTATGTAACATACAACCCGAGCCATGACGATGAGAAGCCGAAATTCTT
GAGCTTTCCGTGGATCGTAGGAGACGTTTTGCTGGGGATAGAGGCTGAAAGTGCGGAGAG
AGAGACAGAGGGAATGGTGATAGCGTGAAGAGCAAGCATGTGGACTACTATCTGTTTGGT
TACCCTAATAATCACTTGTAGGTTTTAGTATAAGTTAAAACCGCCTGTATATGCGTCAGT
GTTTTGAGGCAAACAAAAATCAGGAAGTAGTAGCAAAATTAGTGAATCTAATCAAACAAG
TGTTAAAAGGG

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

CO CL5681Contig1 953 2 2 U
GGTGGCAATTCGCGATAAGAGGGCCGAGCGAGAGTGAATTTGAAGGAGGGATATATCATG
GGAGGATTCAGTTGCCTTCCGATTATCCTTTCAAGCCTCCTTCCTTCTTGTTATTGACCC
CAAGTGGTCGTTTTGAAACTAACACCAAGATTTGTTTGAGTATTTCTAATTACCATCCTG
AGCATTGGCAACCCTCATGGAGTGTTCGGACTGCATTGGTGGCTCTCATTGCGTTCATGC
CTTCAAACCCTAGTGGAGCAATTGGCTCTGTAGATTACCCAAAAGAGGAGAGACGCGCGC
TTGCCACTAAATCACGCGAGGCACCACCCAAATTTGGTTCTCCTGAGCGTCAAAAAGTTA
TTGATGAGATTCATCAATACATGCTAAGCAAAACACCTTCTCCTAAACCTATTCCTGAGG
GATGTAACAAACCCTCTTCTGCTGATTCGGACGGTCAGTCCCAAACCAAGCCGCAGGACA
CTGAAGCTGCTGAGCCTGTTATACCAGAAGCTGTTACAGCTGCTGCAGAAAATGTAATCG
ATCAAATCGCTGAAGAGGCAGGTCAGACAGTTGTTCCTGGAGCAAATGCAACGGTCGAGG
TTGCAGCAGGAGACAACAGAAACGGTTTGGTGAGGCGGAGGGAGCAAGGGACTGTTGTTG
TCAGGGCGGCTCAGAGAAGGGGTGATGATAGGCTGTTCACGTGGGCAGCGGTTGGACTCA
CGATTGCGATAGTGTTTCTTTTGCTGAAGAAGTTGGTAAGGTCAAGGGGTCATGGCGCTG
TGTTTATGGATGAGTCGTGAACGCTTTGGGAGATGTGGACGAAGAAAGCATCAGTTGGAA
GTATTTATATTATTATATATCATATGTACCTATTACTTAGATGTGGAAATAAGTAATTAA
TTATTATACTAAACGAGTTTGTTTGATAATGTGCTAAAAACTCGTTCTTTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D547TF U 1
AF RS1D547JQ C 311
BS 1 605 RS1D547TF
BS 606 953 RS1D547JQ

RD RS1D547TF 605 0 0
GGTGGCAATTCGCGATAAGAGGGCCGAGCGAGAGTGAATTTGAAGGAGGGATATATCATG
GGAGGATTCAGTTGCCTTCCGATTATCCTTTCAAGCCTCCTTCCTTCTTGTTATTGACCC
CAAGTGGTCGTTTTGAAACTAACACCAAGATTTGTTTGAGTATTTCTAATTACCATCCTG
AGCATTGGCAACCCTCATGGAGTGTTCGGACTGCATTGGTGGCTCTCATTGCGTTCATGC
CTTCAAACCCTAGTGGAGCAATTGGCTCTGTAGATTACCCAAAAGAGGAGAGACGCGCGC
TTGCCACTAAATCACGCGAGGCACCACCCAAATTTGGTTCTCCTGAGCGTCAAAAAGTTA
TTGATGAGATTCATCAATACATGCTAAGCAAAACACCTTCTCCTAAACCTATTCCTGAGG
GATGTAACAAACCCTCTTCTGCTGATTCGGACGGTCAGTCCCAAACCAAGCCGCAGGACA
CTGAAGCTGCTGAGCCTGTTATACCAGAAGCTGTTACAGCTGCTGCAGAAAATGTAATCG
ATCAAATCGCTGAAGAGGCAGGTCAGACAGTTGTTCCTGGAGCAAATGCAACGGTCGAGG
TTGCA

QA 1 605 1 605
DS 

RD RS1D547JQ 643 0 0
ATCACGCGAGGCACCACCCAAATTTGGTTCTCCTGAGCGTCAAAAAGTTATTGATGAGAT
TCATCAATACATGCTAAGCAAAACACCTTCTCCTAAACCTATTCCTGAGGGATGTAACAA
ACCCTCTTCTGCTGATTCGGACGGTCAGTCCCAAACCAAGCCGCAGGACACTGAAGCTGC
TGAGCCTGTTATACCAGAAGCTGTTACAGCTGCTGCAGAAAATGTAATCGATCAAATCGC
TGAAGAGGCAGGTCAGACAGTTGTTCCTGGAGCAAATGCAACGGTCGAGGTTGCAGCAGG
AGACAACAGAAACGGTTTGGTGAGGCGGAGGGAGCAAGGGACTGTTGTTGTCAGGGCGGC
TCAGAGAAGGGGTGATGATAGGCTGTTCACGTGGGCAGCGGTTGGACTCACGATTGCGAT
AGTGTTTCTTTTGCTGAAGAAGTTGGTAAGGTCAAGGGGTCATGGCGCTGTGTTTATGGA
TGAGTCGTGAACGCTTTGGGAGATGTGGACGAAGAAAGCATCAGTTGGAAGTATTTATAT
TATTATATATCATATGTACCTATTACTTAGATGTGGAAATAAGTAATTAATTATTATACT
AAACGAGTTTGTTTGATAATGTGCTAAAAACTCGTTCTTTCTG

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 2

CO CL5682Contig1 1135 2 4 U
TTTTTGGATCTGAGAAAGAATTTGATCTTACGCATCTGGAGACATGCGAGGCTTGTGCTG
GCACCGGTGCTAAACCAGGATCTAAGATGAGAATATGCTCCACTTGTGGTGGCCGGGGTC
AAGTTATGAGAACTGAGCAAACACCTTTCGGCTTGTTTTCACAGGTTTCTGTATGTCCAA
ACTGTGGTGGAGATGGTGAGATCATTTCGGAAAATTGCCGGAAATGCTCTGGAGAAGGAC
GTGTGCGTATTAAAAAAAGCATCAAGGTCAAAATTCCTCCAGGTGTTAGCGCAGGTAGCA
TCCTCAGAGTTGCCGGGGAAGGTGATTCTGGTCCCAGAGGTGGACCTCCAGGAGATTTGT
ATGTACATCTTGATGTTGAAGATGTCCGTGGAATTCAAAGGGATGGCATAAACCTTTTAT
CTACTCTTTCCATCACTTACCTTGATGCTATACTGGGTGCGGTTGTTAAGGTGAAAACAG
TAGAAGGAGACACTGAACTGCAGATACCTCCGGGTACTCAACCTGGTGATGTGCTGGTCC
TGGCAAAGAAAGGAGCACCAAAACTGAATAGACCATCTATCCGCGGTGACCACTTGTTTA
CAGTCAAAGTTACTATACCAAATCAAATAAGTGCTGGAGAGCGGGAGTTGCTGGAGGAAC
TTGCTTCTCTAAGTGATACGTCTGGCAACCGGCTGCGAACTCGTGCTAAGACTCAGCAAT
CCACTACTCTAAACAGTGCACCTATTAGCTCAGAAAACAGGACGGATGAAGTTAGGGAGA
AAAGCCAAGAACCAGAGCAAGAAAACGACTTGTGGAAGAACATCAAAGATTTTGCAGGAT
CGGTCGCAAATGGAGCCATGAAATGGCTGAGAGATAACCTCTAGAGATCCATGTTCAACT
AACATGACCTGCTTTAAAAGGTATTTTCGGCTGCACCCATGGTACCAATGTGGAAGGAAA
TGTTAATTGTTTCATTTGTTGATGTGAGGGTCTTTTGCAGAAAGCTCTTTATTCCTTTTC
AGTTTGGTGGATGTTATTTGCCAAGTCATAATGATTTGATGCGTGAAAAGAGAGCGATTC
TGCTCTAACTGCCCCAATTCCTTTTATTAGTACAAATACAACCGGTGTTTCGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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BQ
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ATTCAAGTTGAGAACATCAACGATTTTAAGTGGCTCAACTCCTCTTACTGCTCTGTTCTA
CGGCAGCTTGAATCCGCAAGGCTTAAAGAATACTATTTCAAAGCAAATCATCCTTCCTCT
ATCTCTGCTGGCGCAGACA*TCTCAAGTATCGAAACCCTAAGTATCTATCGATGCTGA*T
CATCTGAGAT*CTACCTTCCTGAG*TGTATCCGAAGCTGGACA*GATCCTGTTTCTTGAC
GATGA

QA 1 785 1 785
DS 

RD RS1CW56TF 596 0 0
GTCCTCGCAACATCAGTCGTAGTCAACTCCACTGTCCTGAATGCAAAGGAACCGGAGAAG
CATGTGTTCCATATAGTAACAGACAAATTGAACTTTGCTGCAATGAAGATGTGGTTTCGC
GTCAATGCTCCTACTGATGCCACGATTCAAGTTGAGAACATCAACGATTTTAAGTGGCTC
AACTCCTCTTGCTGCTCTGTTCTACGGCAGCTTGAATCCGCAAGGCTTAAAGAATACTAT
TTCAAAGCAAATCATCCTTCCTCTATCTCTGCTGGCGCAGACAATCTCAAGTATCGAAAC
CCTAAGTATCTATCGATGCTGAATCATCTGAGATTCTACCTTCCTGAGGTGTATCCGAAG
CTGGACAAGATCCTGTTTCTTGACGATGACATTGTGGTGCAAAAGGACCTGGCACCTCTA
TGGGAAGTAGACATGCAAGGAAAAGTGAATGGAGCTGTAGAGACGTGCAAGGAGAGCTTC
CACAGATTTGACAAGTACCTCAACTTCTCTAATCCAAAGATCTCAGAGAATTTCGATGCG
GGGGCTTGCGGTTGGGCATTTGGCATGAATATGTTCGACCTGAGAGAGTGGAGGAA

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 2

CO CL5684Contig1 705 2 2 U
GGACCAAAAAAGCTAACTCCAACCTTCATCTTAACATAACTCCTTCTCCACTTGGACCAC
TTCCATTCTTCAAAGCTCTCTTTATTTAGTGATCCTCCAATGGGGACGACCCTTCCATTC
CCTCATGTGCACCATATATATTTTCTTAACTCGCCTCATTTGCACAGAACCGTTGACATG
AACCACTCGATTCGCTTTCTCACAAGTGATCTTTTCTAGACGGATATGAGCTATTGCATC
TAATGGAGCCTTTTTAATCAGGTTTCATGCTTTGGAAGAGTTTGATGAAGGAAACGTCTT
GATGGACACCATCGTACAAGACGGAAGCCTCAGCCCCGACCATATCGTTCCTCCTGCAAA
CTTCTTCCAAGGTTTTGTCCTACGTACACCGTATTCGACCTCATGTAACATAACGATATG
TGGATTCTGCCAATCTGATAGGGCCATTGGAGAAATGCCATATCAAATGTTGTCCATGTG
CATAGCGCCTGTATCGAATGGATATTACAAAAGATCTTATTCTCTGTGAATCAGCAGTCA
TAGAGTGATAAGGTCAGTACTAAGCATCTTACCACAAGAGACAAGACAACCAAGAAACCC
CATCCTTTGTGGATGTGTCTACTTTGGTTCAAAGTTTAATAGAGCTTTTGCAAACAAAAA
GACTAACCTTTGCATTGCTTTGCTTTTCCATAGTGATGGATCCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CU75TF U 1
AF RS1CU75JQ C 525
BS 1 637 RS1CU75TF
BS 638 705 RS1CU75JQ

RD RS1CU75TF 637 0 0
GGACCAAAAAAGCTAACTCCAACCTTCATCTTAACATAACTCCTTCTCCACTTGGACCAC
TTCCATTCTTCAAAGCTCTCTTTATTTAGTGATCCTCCAATGGGGACGACCCTTCCATTC
CCTCATGTGCACCATATATATTTTCTTAACTCGCCTCATTTGCACAGAACCGTTGACATG
AACCACTCGATTCGCTTTCTCACAAGTGATCTTTTCTAGACGGATATGAGCTATTGCATC
TAATGGAGCCTTTTTAATCAGGTTTCATGCTTTGGAAGAGTTTGATGAAGGAAACGTCTT
GATGGACACCATCGTACAAGACGGAAGCCTCAGCCCCGACCATATCGTTCCTCCTGCAAA
CTTCTTCCAAGGTTTTGTCCTACGTACACCGTATTCGACCTCATGTAACATAACGATATG
TGGATTCTGCCAATCTGATAGGGCCATTGGAGAAATGCCATATCAAATGTTGTCCATGTG
CATAGCGCCTGTATCGAATGGATATTACAAAAGATCTTATTCTCTGTGAATCAGCAGTCA
TAGAGTGATAAGGTCAGTACTAAGCATCTTACCACAAGAGACAAGACAACCAAGAAACCC
CATCCTTTGTGGATGTGTCTACTTTGGTTCAAAGTTT

QA 1 637 1 637
DS 

RD RS1CU75JQ 181 0 0
TGTGAATCAGCAGTCATAGAGTGATAAGGTCAGTACTAAGCATCTTACCACAAGAGACAA
GACAACCAAGAAACCCCATCCTTTGTGGATGTGTCTACTTTGGTTCAAAGTTTAATAGAG
CTTTTGCAAACAAAAAGACTAACCTTTGCATTGCTTTGCTTTTCCATAGTGATGGATCCA
A

QA 1 181 1 181
DS 



AS 1 2

CO CL5685Contig1 1247 2 2 U
AAATCATATAGTATATACAATACATGATTTGTCCCGTCTCGTATCTATATCTCTGACACT
CTTTCGATCGTCATATCACTTTGGGGCCTAAATTTTCAGTGTGTAAATGGGTATATTTCC
TGAGTTTGGTGGCTGGATCAGTCAGAACACTCAACAGCTTAAAGAATCTGAAAATGTTAA
ATCCAAGCCTGTGAGAGAGACAAAAACTCATGATGAGAGAGATGAGACGAGGGAGCAATT
AAAACTGTGGAGAGATGCAAATAAGAAGAAACAATATAATGAACCTTCTCCTACGGTGAA
GGTGCATACAGACCATAATATTGATAGCTCTTCCAGTATGGAAATGGAATTTACATTAGG
ATTGCCACCTCAAGCAGCTTGCGACTTTTTAACTAATCATGACAACAAAACATACTCTAG
AGAAATCAATGGCCGCCCACTTCTGAAAGCCATATCAAGAAAAGTTACATCAGAGAGAGG
TCTAGGGGATAGGCCGATCCTGGAGGTTGATAAAGAGTTGTCATGGAACTTCCTTTTCTT
TTCAGGAACTATCCCAATACGTCTATATGTCCTCGAAAATCCAGAAGAACTTTCTACATA
TAACTGGAAAAGTAGAAAAGGAATGGACTACATGGAAACGTTCAGGGTTGACTACACAGT
GGAGCCAATATATGTTGATGCAGAACGCTTGTGCAAGCACAAGAAGCCGAAGAGTATTGA
AGAATACAGAAAATGTAGTGGTGGAAAAGGATTGATTGCGTCCAAGGTTATAGTGGACCA
GAGTTTTAGGCTTTCTTTTCCTTGGAATCTGCCTTTGCTGTCTTTGTACTTCCACCGGTT
CACTGTTGAGACCACTAAGAAAGTGGCGGAAGATTTTCAAACGCGGGCGGGTGATATCCG
AGGTTTTTGAAATACACAAAACCCATGTATCCGTCGGTTGTAACGTTTTCGTAAAACAAC
ACATCAAATAGTGTTTTAAAATCGCGTTATCATAAATTCGAATAGCAGAATTTTTAAAGT
TAAAATCTTGATATTTTCACGAATAAGTACTGGGGAAAGATATGCACCTTGCCAGGGATG
AAAGTGATGAACAAATTTTCCTAGACATGATATTAATTATGTTATATCGATTATTTGCAT
CGGTAAAATAAGGAATTTTACAACCCTGAAAAGGCAGAAAACAGATGTACTATACTCTAT
ATGGTGTAATATACAGTAGTGGAAACAAAGCATTTTGTGTAAAGTGG


BQ
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AF RS1EY22TF U 1
AF RS1EY22JQ C 544
BS 1 641 RS1EY22TF
BS 642 1247 RS1EY22JQ

RD RS1EY22TF 641 0 0
AAATCATATAGTATATACAATACATGATTTGTCCCGTCTCGTATCTATATCTCTGACACT
CTTTCGATCGTCATATCACTTTGGGGCCTAAATTTTCAGTGTGTAAATGGGTATATTTCC
TGAGTTTGGTGGCTGGATCAGTCAGAACACTCAACAGCTTAAAGAATCTGAAAATGTTAA
ATCCAAGCCTGTGAGAGAGACAAAAACTCATGATGAGAGAGATGAGACGAGGGAGCAATT
AAAACTGTGGAGAGATGCAAATAAGAAGAAACAATATAATGAACCTTCTCCTACGGTGAA
GGTGCATACAGACCATAATATTGATAGCTCTTCCAGTATGGAAATGGAATTTACATTAGG
ATTGCCACCTCAAGCAGCTTGCGACTTTTTAACTAATCATGACAACAAAACATACTCTAG
AGAAATCAATGGCCGCCCACTTCTGAAAGCCATATCAAGAAAAGTTACATCAGAGAGAGG
TCTAGGGGATAGGCCGATCCTGGAGGTTGATAAAGAGTTGTCATGGAACTTCCTTTTCTT
TTCAGGAACTATCCCAATACGTCTATATGTCCTCGAAAATCCAGAAGAACTTTCTACATA
TAACTGGAAAAGTAGAAAAGGAATGGACTACATGGAAACGT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1EY22JQ 704 0 0
AGGAACTATCCCAATACGTCTATATGTCCTCGAAAATCCAGAAGAACTTTCTACATATAA
CTGGAAAAGTAGAAAAGGAATGGACTACATGGAAACGTTCAGGGTTGACTACACAGTGGA
GCCAATATATGTTGATGCAGAACGCTTGTGCAAGCACAAGAAGCCGAAGAGTATTGAAGA
ATACAGAAAATGTAGTGGTGGAAAAGGATTGATTGCGTCCAAGGTTATAGTGGACCAGAG
TTTTAGGCTTTCTTTTCCTTGGAATCTGCCTTTGCTGTCTTTGTACTTCCACCGGTTCAC
TGTTGAGACCACTAAGAAAGTGGCGGAAGATTTTCAAACGCGGGCGGGTGATATCCGAGG
TTTTTGAAATACACAAAACCCATGTATCCGTCGGTTGTAACGTTTTCGTAAAACAACACA
TCAAATAGTGTTTTAAAATCGCGTTATCATAAATTCGAATAGCAGAATTTTTAAAGTTAA
AATCTTGATATTTTCACGAATAAGTACTGGGGAAAGATATGCACCTTGCCAGGGATGAAA
GTGATGAACAAATTTTCCTAGACATGATATTAATTATGTTATATCGATTATTTGCATCGG
TAAAATAAGGAATTTTACAACCCTGAAAAGGCAGAAAACAGATGTACTATACTCTATATG
GTGTAATATACAGTAGTGGAAACAAAGCATTTTGTGTAAAGTGG

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

CO CL5686Contig1 718 2 2 U
GGAGACACTCTCTCTCTATCCTCGTGGTTTGGCATAACTCGTCCTCCACCAACAAGTCTG
TCTTTCTGTTTCTCTTATCAGATCTCTTGGCTACTTGTGTAACCAAAGAATCAATGGCTC
TCAAGTTCGTATCTGGAGCTCTTTTCTTCTGTTCTCTACTCGCAATATTTCCTTCTTTCT
CATCCTCCAGTTTCATCTCAGATGGTGTGTTCGGATCTCAGGCTTTGGTTACTGGAAGAA
ACCTACTTCAGACCAAGAAAACATGTCCAGTGAACTTTGAGTTTATGAACTACACAATCA
TAACAAGCCAGTGCAAAGGTCCCAAATTCCCACCAAAGGAATGCTGCTCCGCTTTTTTGG
ACTTTGCGTGTCCTTACACGGAAGAGCTCAACGACCTGAGCAATGACTGTGCAACTACTA
TGTTCAGTTACATCAATCTCTATGGGAAATACCCGCCTGGACTTTTCGCTAACCAGTGCA
AAGGAAGTAAAGAAGGTCTCGAGTGCCCTGCTACGTCTCCCGCTTCAGCTGCAGACGTAA
ACGCAGCCATCACCACCGCTTTTTTTCCACTTTGGCTGACCATTTTTGCATCTTTCTTGG
TTTTTGTTAAATTGTTATGAGGCCAGGAAAGCCAGATGTTTGCAATGTACTAGTAACAAA
CCTGAGGAAGGGAGTGTTTGTGTGCCCCCCGATTTGTTTTATTTGTATCATTCTTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CN94TF U 1
AF RS1CN94JQ C 186
BS 1 283 RS1CN94TF
BS 284 718 RS1CN94JQ

RD RS1CN94TF 283 0 0
GGAGACACTCTCTCTCTATCCTCGTGGTTTGGCATAACTCGTCCTCCACCAACAAGTCTG
TCTTTCTGTTTCTCTTATCAGATCTCTTGGCTACTTGTGTAACCAAAGAATCAATGGCTC
TCAAGTTCGTATCTGGAGCTCTTTTCTTCTGTTCTCTACTCGCAATATTTCCTTCTTTCT
CATCCTCCAGTTTCATCTCAGATGGTGTGTTCGGATCTCAGGCTTTGGTTACTGGAAGAA
ACCTACTTCAGACCAAGAAAACATGTCCAGTGAACTTTGAGTT

QA 1 283 1 283
DS 

RD RS1CN94JQ 533 0 0
TCCAGTTTCATCTCAGATGGTGTGTTCGGATCTCAGGCTTTGGTTACTGGAAGAAACCTA
CTTCAGACCAAGAAAACATGTCCAGTGAACTTTGAGTTTATGAACTACACAATCATAACA
AGCCAGTGCAAAGGTCCCAAATTCCCACCAAAGGAATGCTGCTCCGCTTTTTTGGACTTT
GCGTGTCCTTACACGGAAGAGCTCAACGACCTGAGCAATGACTGTGCAACTACTATGTTC
AGTTACATCAATCTCTATGGGAAATACCCGCCTGGACTTTTCGCTAACCAGTGCAAAGGA
AGTAAAGAAGGTCTCGAGTGCCCTGCTACGTCTCCCGCTTCAGCTGCAGACGTAAACGCA
GCCATCACCACCGCTTTTTTTCCACTTTGGCTGACCATTTTTGCATCTTTCTTGGTTTTT
GTTAAATTGTTATGAGGCCAGGAAAGCCAGATGTTTGCAATGTACTAGTAACAAACCTGA
GGAAGGGAGTGTTTGTGTGCCCCCCGATTTGTTTTATTTGTATCATTCTTTTG

QA 1 533 1 533
DS 



AS 1 2

CO CL5687Contig1 1074 2 2 U
GGGACAAGTGGTGAGGTACAACCAATTAAGGCAGAAAATGCTGCCCGCGAAGATCCCAGT
TTGATTCAGAAAATAGAGGGCTTAAATGCAAAAACTACATTCAATTCTGGGACCTCTGCA
AATAAAGTTTCAGCAAGAATGCCTCGAAGTGGTCATGCAAGTGATAGTAAGAACTCATTA
CCCTATAAACAAGTTGATCCTGCCACCAACAAAAACGTTGAGCTGGCAGCTATTAGTGGA
AGGAAATCTACTCAACAGACTCAAGGTGGAGCAGATCATCAGGCCAAACAAAGAGTAAAC
AGCGGAGGCAATGATGGTTGGCGGAAGACAGCTGTTGTGTCAGGCTCCTCTGCTGTAACT
TTAGCTCCAAACTCAGAAAGATTTGCTGAGGTAAATGTAGGTGACTCGCTGGAAATCGAT
TCCATCGGGAAGCCTGGGTCTGGAATATCCGTGGAGCCAAACGACAACCAGCGTACTACA
ATGAGAGAGTTAGCCAGGCAGCGTGCTCAACAGAGACAAAAAGAGGAGGAAGAAAGGGCA
AGAGATCAGCGGGCTAAGGCTCTTGCAAAACTAGAAGAATTGAACAGACGTCCCCAACTG
GCTGAGGAAGGTTCAGTCCAGAACTTGGAAGATGCACACAATGCTTCTACCCCTGACATG
CCAGAAGTTCCTCGGTCACATTTTCCTGCACGTATGGCATCAAAGTCAGATGATGTTCAT
ACCCGTATATCACGGGAGAAGAAGACCACTGTTACAGCTGCAGAGTCAATAGAAGCTACT
GAAGATTCAGGAAAAACGTTACTGCAAGACGCGATGCCTTCCGCAAAATATACAAATAAT
GAGGGCTCTACTCAACAGGATAACTTTCCACGTCACCGTGATGGCGATGCCTCAAAACAG
AAGCGCTTGGGTTATAAGCAGAAGCAAAATATCGTTTCTGAGAAAAAAATGGCGGGGAGC
TCTTTCTCTGAAGCTGCCACAGAGGTGGTTGATGTTGTTCCACCTCCTGAGGTGTCAAAC
GAAGGTGTTCTAGGTCATAACTCAGACATGCCAGAAGCGTCAAGCGCTTCAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BO65TF U 1
AF RS1BO65JQ C 303
BS 1 602 RS1BO65TF
BS 603 1074 RS1BO65JQ

RD RS1BO65TF 602 0 0
GGGACAAGTGGTGAGGTACAACCAATTAAGGCAGAAAATGCTGCCCGCGAAGATCCCAGT
TTGATTCAGAAAATAGAGGGCTTAAATGCAAAAACTACATTCAATTCTGGGACCTCTGCA
AATAAAGTTTCAGCAAGAATGCCTCGAAGTGGTCATGCAAGTGATAGTAAGAACTCATTA
CCCTATAAACAAGTTGATCCTGCCACCAACAAAAACGTTGAGCTGGCAGCTATTAGTGGA
AGGAAATCTACTCAACAGACTCAAGGTGGAGCAGATCATCAGGCCAAACAAAGAGTAAAC
AGCGGAGGCAATGATGGTTGGCGGAAGACAGCTGTTGTGTCAGGCTCCTCTGCTGTAACT
TTAGCTCCAAACTCAGAAAGATTTGCTGAGGTAAATGTAGGTGACTCGCTGGAAATCGAT
TCCATCGGGAAGCCTGGGTCTGGAATATCCGTGGAGCCAAACGACAACCAGCGTACTACA
ATGAGAGAGTTAGCCAGGCAGCGTGCTCAACAGAGACAAAAAGAGGAGGAAGAAAGGGCA
AGAGATCAGCGGGCTAAGGCTCTTGCAAAACTAGAAGAATTGAACAGACGTCCCCAACTG
GC

QA 1 602 1 602
DS 

RD RS1BO65JQ 772 0 0
CGGAGGCAATGATG*TTGGCGGAAGACAGCTGTTGTGTCAGGCTCCTCTGCTGTAACTTT
AGCTCCAAACTCAGAAAGATTTGCTGAGGTAAATGTAGGTGACTCGCTGGAAATCGATTC
CATCGGGAAGCCTGGGTCTGGAATATCCGTGGAGCCAAACGACAACCAGCGTACTACAAT
GAGAGAGTTAGCCAGGCAGCGTGCTCAACAGAGACAAAAAGAGGAGGAAGAAAGGGCAAG
AGATCAGCGGGCTAAGGCTCTTGCAAAACTAGAAGAATTGAACAGACGTCCCCAACTGGC
TGAGGAAGGTTCAGTCCAGAACTTGGAAGATGCACACAATGCTTCTACCCCTGACATGCC
AGAAGTTCCTCGGTCACATTTTCCTGCACGTATGGCATCAAAGTCAGATGATGTTCATAC
CCGTATATCACGGGAGAAGAAGACCACTGTTACAGCTGCAGAGTCAATAGAAGCTACTGA
AGATTCAGGAAAAACGTTACTGCAAGACGCGATGCCTTCCGCAAAATATACAAATAATGA
GGGCTCTACTCAACAGGATAACTTTCCACGTCACCGTGATGGCGATGCCTCAAAACAGAA
GCGCTTGGGTTATAAGCAGAAGCAAAATATCGTTTCTGAGAAAAAAATGGCGGGGAGCTC
TTTCTCTGAAGCTGCCACAGAGGTGGTTGATGTTGTTCCACCTCCTGAGGTGTCAAACGA
AGGTGTTCTAGGTCATAACTCAGACATGCCAGAAGCGTCAAGCGCTTCAACT

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

CO CL5688Contig1 852 2 2 U
CGGAAACCGAAAAATCTGAAAATTGATTTAGCCACACCGAATCAAACCGAATACACAGAC
TTAGCATCGATGAAGAATATCATTGGTACATCATATCCTCAAGTCTCAAAATTCAAGATC
AGTGTAACTACAACGTTAGTTAAGTCGTCAAGACAGCAGGAAGAGTAGGAGGAGAGACCA
GCTCAGGAAGAAAACAGGAATGTGGGAAGACGAATGAGAAGTGTCAAGCTGAACCCAGAA
CCTGCATTTTTCCTCAGAAGGATCAACGGTGGTAATCAAACCAAGCCCACCAAAGTCACA
GCTTTCTGCCTTGTGATCACTTTGCTGATACAAGCTATTGAACGCGTACGACACGTTTCT
TGGCCATCCTATCCCTGAACACGACCCACCAGGAAGTATCGAGGTGCAGTCTGAGAGAGA
ACACGCCTCCAACGCTTTAGCTGACGCGTTTGACAAGTCCTTGTTATCGTTCACGGCGCA
CCACTTAGGAGGAAGGTACTGAACGTTCTGCGCGTTAATCAGCGTCTTTGAGTTGTGGTT
GAAGCTGAAACTGTACTTGGCTTGACCATCGAACGTGAACATTCCCCAGTGCCGCTCAAA
GTTCCCAGAAGATACGTTTCTCTTATCTTCGTCCAAGAGGTTTTCGACGTAGGTTTCCAC
GGGAGGACGCGGCACAGAGCCGGTCTTTTTCTCCAGGTGACCAATCAACCCTTTAAAGAA
GGCCTCAGCGGTCGTTGACGTGGCGTTTGCTGCTCCATCAGTAGGCCAACCGATCTTCGA
CACGACGATATCCACATCCGGGTACCCGATACTGGACAGTGCGGAGACAAGTGTGGCGTA
GCTAGATCAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GQ94JQ U 1
AF RS1DV68JQ U 43
BS 1 413 RS1GQ94JQ
BS 414 852 RS1DV68JQ

RD RS1GQ94JQ 413 0 0
CGGAAACCGAAAAATCTGAAAATTGATTTAGCCACACCGAATCAAACCGAATACACAGAC
TTAGCATCGATGAAGAATATCATTGGTACATCATATCCTCAAGTCTCAAAATTCAAGATC
AGTGTAACTACAACGTTAGTTAAGTCGTCAAGACAGCAGGAAGAGTAGGAGGAGAGACCA
GCTCAGGAAGAAAACAGGAATGTGGGAAGACGAATGAGAAGTGTCAAGCTGAACCCAGAA
CCTGCATTTTTCCTCAGAAGGATCAACGGTGGTAATCAAACCAAGCCCACCAAAGTCACA
GCTTTCTGCCTTGTGATCACTTTGCTGATACAAGCTATTGAACGCGTACGACACGTTTCT
TGGCCATCCTATCCCTGAACACGACCCACCAGGAAGTATCGAGGTGCAGTCTG

QA 1 413 1 413
DS 

RD RS1DV68JQ 810 0 0
CAAACCGAATACACAGACTTAGCATTGATGAAGAATATCATTGGTACATCATATCCTCAA
GTCTCAAAATTCAAGATCAGTGTAACTACAACGTTAGTTAAGTCGTCAAGACAGCAGGAA
GAGTAGGAGGAGAGACCAGCTCAGGAAGAAAACAGGAATGTGGGAAGACGAATGAGAAGT
GTCAAGCTGAACCCAGAGCCTGCATTTTTCCTCAGAAGGATCAACGGTGGTAATCAAACC
AAGCCCACCAAAGTCACAGCTTTCTGCCTTGTGATCACTTTGCTGATACAAGCTATTGAA
CGCGTACGACACGTTTCTTGGCCATCCTATCCCTGAACACGACCCACCAGGAAGTATCGA
GGTGCAGTCTGAGAGAGAACACGCCTCCAACGCTTTAGCTGACGCGTTTGACAAGTCCTT
GTTATCGTTCACGGCGCACCACTTAGGAGGAAGGTACTGAACGTTCTGCGCGTTAATCAG
CGTCTTTGAGTTGTGGTTGAAGCTGAAACTGTACTTGGCTTGACCATCGAACGTGAACAT
TCCCCAGTGCCGCTCAAAGTTCCCAGAAGATACGTTTCTCTTATCTTCGTCCAAGAGGTT
TTCGACGTAGGTTTCCACGGGAGGACGCGGCACAGAGCCGGTCTTTTTCTCCAGGTGACC
AATCAACCCTTTAAAGAAGGCCTCAGCGGTCGTTGACGTGGCGTTTGCTGCTCCATCAGT
AGGCCAACCGATCTTCGACACGACGATATCCACATCCGGGTACCCGATACTGGACAGTGC
GGAGACAAGTGTGGCGTAGCTAGATCAAAG

QA 1 810 1 810
DS 



AS 1 2

CO CL5689Contig1 362 2 1 U
GGAACTCTGATGCTCTGGTGAGTGAATTGAACGGCCATTTTGATAAGTGCCAGCAGCTGT
TGAATTCGATTTCAGGATCCCTTGGATCCAAAACTACTATGACTGTTGACGGCCAAAAGA
GGAATCTAGAAGAAAGTGAGCAATTACTTCAACAAAGAAGGGACTTGATTATGGAATATA
GAAAATCTATTGAAGACCTTGTCAAGATTGAGCCTTAGTTCCAGATCTCTCGCTTAGATG
TGGTGTATCTTTATTTACGTCTACTCTACACTTGTAGCTTTCTAATAAAAGACCAAGATT
TGTAATCAGTGAACCACTTCTTAGTTCAAAGAATAATGATGAAAATGTTTTTTTTTTGTC
TT


BQ
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20 20 

AF RS1AW55JQ C 1
AF RS1AW55TF U 1
BS 1 362 RS1AW55TF

RD RS1AW55JQ 362 0 0
GGAACTCTGATGCTCTGGTGAGTGAATTGAACGGCCATTTTGATAAGTGCCAGCAGCTGT
TGAATTCGATTTCAGGATCCCTTGGATCCAAAACTACTATGACTGTTGACGGCCAAAAGA
GGAATCTAGAAGAAAGTGAGCAATTACTTCAACAAAGAAGGGACTTGATTATGGAATATA
GAAAATCTATTGAAGACCTTGTCAAGATTGAGCCTTAGTTCCAGATCTCTCGCTTAGATG
TGGTGTATCTTTATTTACGTCTACTCTACACTTGTAGCTTTCTAATAAAAGACCAAGATT
TGTAATCAGTGAACCACTTCTTAGTTCAAAGAATAATGATGAAAATGTTTTTTTTTTGTC
TT

QA 1 362 1 362
DS 

RD RS1AW55TF 362 0 0
GGAACTCTGATGCTCTGGTGAGTGAATTGAACGGCCATTTTGATAAGTGCCAGCAGCTGT
TGAATTCGATTTCAGGATCCCTTGGATCCAAAACTACTATGACTGTTGACGGCCAAAAGA
GGAATCTAGAAGAAAGTGAGCAATTACTTCAACAAAGAAGGGACTTGATTATGGAATATA
GAAAATCTATTGAAGACCTTGTCAAGATTGAGCCTTAGTTCCAGATCTCTCGCTTAGATG
TGGTGTATCTTTATTTACGTCTACTCTACACTTGTAGCTTTCTAATAAAAGACCAAGATT
TGTAATCAGTGAACCACTTCTTAGTTCAAAGAATAATGATGAAAATGTTTTTTTTTTGTC
TT

QA 1 362 1 362
DS 



AS 1 2

CO CL5690Contig1 1243 2 8 U
GGGTGGTTCTCTTTTGTTGCGAAGACCAGACTCTCTCGGACTCGGAGATGGCAGCACGTT
ATTGTACATCCCTGTTTGTAGCCTTGTCATGTCTTCTCAGTGTTTCTTATGCTAGTCCCG
GCGATGCTGATCCAATTTACAGGGCATGTGTTAGAGAATGCGAGGTAAGCGGTTGCGTTG
GACAGTTATGCTTTCCTCAGTGCAACTCTTCGTCCAAAGGTGGTCCATGGTACACACAAG
AGCCTCTGTATCTACAATGGCAAAAGTGGGGCTGCCAAGGCGATTGCCGTTATCACTGTA
TGGTTAACAGAGAGAAAGAACGCGAAACTCTCGGTCATTCCCCACTCAAGTATCATGGTA
AATGGCTTTTCAAGCGTCTCCTTGGGTTCCAGGAGCCTGCTTCTGTTGCTTTCTCCGTGC
TAAACCTAGCCATGCATTTCCACGGCTGGCTCTCCTTCTTCGCCACGCCATACTATAAGT
TGCCTCTCAAACAAGACAAGACTGCTTACTATGAGTACGTCGGTTTGTGGCATATCTACG
GTTTCCTGTCCATGAACTCTTGGTTCTGGAGTGCAGTTTTCCACACTCGGGACGTTGACA
TCACAGAGAGGTTGGACTACTCATCTGCGATAGCCGTTCTTGGGTTCTCACTCATTGTAT
CCATCTTAAGAACCTTTGATGTTCGGGTCGAGGCTTCAAGAGTCATGTTATCTGCTCCAG
TACTAGCTTTTGTCACCACCCACATACTCTATATTAACTTCTACGAACTCGACTATGGTT
GGAACATGATTGTGTGTGTGGCCATGGGAATAGCTCAGCTTCTCCTATGGGCAAGATGGG
CTGCTGTCTCTAGACATCCTTCTAACTGGAAACTGTGGGTGGTTGTGATAGCTTCAGGCT
TAGCTATGCTTTTGGAGATATATGACTTTCCTCCATATGAAGGCTATTTCGATGCTCACT
CCATTTGGCACGCTGCCACGGTTCCTCTAACCGTTCTCTGGTGGAGCTTTATTAGAGACG
ATGCTGAGTTCAGAACTTCCAGTCTTCTCAAGAAATTTAAGACAAAGGCGAAGTGAGATT
TGTCTTTAGTGTTTTTTTCAATGTTTTTTATTCAGAGATTTGTCTTGTCCTTGCTTTTTG
CCGGTTGAGTTTTTGATATTAGTTTCTCATTCATTACACCCACTTTTTTCTATCTTATTG
GAGTCTAGACTTTTGTTCATATTATGAGAAAATCTTGTGATCT


BQ
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AF RS1E920TF U 1
AF RS1E920JQ C 485
BS 1 736 RS1E920TF
BS 737 737 RS1E920JQ
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BS 780 780 RS1E920JQ
BS 781 801 RS1E920TF
BS 802 1243 RS1E920JQ

RD RS1E920TF 801 0 0
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GACAGTTATGCTTTCCTCAGTGCAACTCTTCGTCCAAAGGTGGTCCATGGTACACACAAG
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AATGGCTTTTCAAGCGTCTCCTTGGGTTCCAGGAGCCTGCTTCTGTTGCTTTCTCCGTGC
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GTTTCCTGTCCATGAACTCTTGGTTCTGGAGTGCAGTTTTCCACACTCGGGACGTTGACA
TCACAGAGAGGTTGGACTACTCATCTGCGATAGCCGTTCTTGGGTTCTCACTCATTGTAT
CCATCTTAAGAACCTTTGATGTTCGGGTCGAGGCTTCAAGAGTCATGTTATCTGCTCCAG
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GGAACATGATTGTGTGTGTGG

QA 1 801 1 801
DS 

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TCTCAAACAAGACAAGACTGCTTACTATGAGTACGTCGGTTTGTGGCATATCTACGGTTT
CCTGTCCATGAACTCTTGGTTCTGGAGTGCAGTTTTCCACACTCGGGACGTTGACATCAC
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CTTAAGAACCTTTGATGTTCGGGTCGAGGCTTCAAGAGTCATGTTATTTGCTCCAGTACT
AGCTTTTGTCACCACCCACATACTCTATATTAACTTTTACGAACTCGACTATGGTTGGAA
CATGATTGTGTGTGTGGCCATGGGAATAGCTCAGCTTCTCCTATGGGCAAGATGGGCTGC
TGTCTCTAGACATCCTTCTAACTGGAAACTGTGGGTGGTTGTGATAGCTTCAGGCTTAGC
TATGCTTTTGGAGATATATGACTTTCCTCCATATGAAGGCTATTTCGATGCTCACTCCAT
TTGGCACGCTGCCACGGTTCCTCTAACCGTTCTCTGGTGGAGCTTTATTAGAGACGATGC
TGAGTTCAGAACTTCCAGTCTTCTCAAGAAATTTAAGACAAAGGCGAAGTGAGATTTGTC
TTTAGTGTTTTTTTCAATGTTTTTTATTCAGAGATTTGTCTTGTCCTTGCTTTTTGCCGG
TTGAGTTTTTGATATTAGTTTCTCATTCATTACACCCACTTTTTTCTATCTTATTGGAGT
CTAGACTTTTGTTCATATTATGAGAAAATCTTGTGATCT

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 2

CO CL5691Contig1 1233 2 2 U
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AAAGAAGATCCAATGTCGAGAGAGAGAACCAGACGTGAACTACCTCCCGTTCAAGAGCAT
ATTGATAAATTGAAGAAAGTGGTAGAGGAAGGCAATGGCTACGGAGCGTTGCAGATGTAC
AAATCCATCAGTGCCAGATATGTTACAGCTCAGAGATTCTCTGAAGCTCTTGACATCCTC
TTCTCAGGGGCATGCGTTGAGCTAGAGCACGGCCTGGTGAATTGTGGGGCCGACCTTGCT
ATTTTGTTCGTTGACACACTTGTTAAAGCCAAGTCACCTTGCAATGATGAATATCTTGAT
CGTATCAGGTGTATGTTCAAGTTGTTTCCTCGGGTTCCTGTACCTCCTCATTTGGTTGAT
GTGAGCGATGATGAGGATGTACATAATATTCAAGAATCTCTTGGGGAAGCTAGATCACGT
GTTGATAACTTGACTTCCTTCTTGAGAGCTGCTATAAGATGGTCTGCGGAGTTTGGAGGG
CCAAGTACAGGGTATCCTGAGTTGCATGCTATGCTAGCTGATTATCTTTACACCGAGTGT
CCTGAACTTGACATGGTTCGAATATCAAGGCATTTTGTTAGGGCCGAGGACCCTGAGAAG
TTTGCATCTATGCTGATCAACTTTATGGGGGAGGTGTTATCCTGGTGAAGATGACCTTGC
CATTGCACGAGCAGTTCTCATGTATTTATCTATGGGTAACATGAAAGATGCAAATATTTT
GATGGATGAGATTAAGAAACAAGCGGAGACCCTTTCAGAATCAGACCTTATCCAATTTAT
CACTTATCTTCTGGAAACGTTGCAGAGAGATGCATTGCCTCTTCTCAGTATGTTAAGAGC
GAAATTTAGGTCTTGCGTAGATAGAGAACCGCTGCTTAATGAGTTGCTGGACGAGATTGC
AGAGAGGTTTTACGGTGTGCAGCGTAAGAATCCTTTGCAAGGAATGTTTGGAGACATCTT
CAAGATGATGGGCTAAGGAAGAAGATAGAAGAGGCAACTTTCTTTCCCCATTTTGTTTTT
TTTTTTTGTATTTGGCAATGATCTAATAATGGATAGCTTCTGAGAATTCAATTTGTTTCT
CTTTATCCTCAAGTGGGTAAGAGTTTTTGTTCTTTGTAACATTATACATTTGTTTTCATC
ATTACTATATCTTCAACATAAACGAAAAGGAAA


BQ
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AF RS1CR15TF U 1
AF RS1CR15JQ C 424
BS 1 794 RS1CR15TF
BS 795 1233 RS1CR15JQ

RD RS1CR15TF 794 0 0
AGAGAGAGACATTGGAAGATCCAATCAATCAATCAATCAATTGAAGCTGCAAACTCAACC
AAAGAAGATCCAATGTCGAGAGAGAGAACCAGACGTGAACTACCTCCCGTTCAAGAGCAT
ATTGATAAATTGAAGAAAGTGGTAGAGGAAGGCAATGGCTACGGAGCGTTGCAGATGTAC
AAATCCATCAGTGCCAGATATGTTACAGCTCAGAGATTCTCTGAAGCTCTTGACATCCTC
TTCTCAGGGGCATGCGTTGAGCTAGAGCACGGCCTGGTGAATTGTGGGGCCGACCTTGCT
ATTTTGTTCGTTGACACACTTGTTAAAGCCAAGTCACCTTGCAATGATGAATATCTTGAT
CGTATCAGGTGTATGTTCAAGTTGTTTCCTCGGGTTCCTGTACCTCCTCATTTGGTTGAT
GTGAGCGATGATGAGGATGTACATAATATTCAAGAATCTCTTGGGGAAGCTAGATCACGT
GTTGATAACTTGACTTCCTTCTTGAGAGCTGCTATAAGATGGTCTGCGGAGTTTGGAGGG
CCAAGTACAGGGTATCCTGAGTTGCATGCTATGCTAGCTGATTATCTTTACACCGAGTGT
CCTGAACTTGACATGGTTCGAATATCAAGGCATTTTGTTAGGGCCGAGGACCCTGAGAAG
TTTGCATCTATGCTGATCAACTTTATGGGGGAGGTGTTATCCTGGTGAAGATGACCTTGC
CATTGCACGAGCAGTTCTCATGTATTTATCTATGGGTAACATGAAAGATGCAAATATTTT
GATGGATGAGATTA

QA 1 794 1 794
DS 

RD RS1CR15JQ 810 0 0
AGCGATGATGAGGATGTACATAATATTCAAGAATCTCTTGGGGA*GCTAGATCACGTGTT
GATAACTTGACTTCCTTCTTGAGAGCTGCTATAAGATGGTCTGCGGAGTTTGGAGGGCCA
AGTACAGGGTATCCTGAGTTGCATGCTATGCTAGCTGATTATCTTTACACCGAGTGTCCT
GAACTTGACATGGTTCGAATATCAAGGCATTTTGTTAGGGCCGAGGACCCTGAGAAGTTT
GCATCTATGCTGATCAACTTTATGGGG*AGGTGTTATCCTGGTGAAGATGACCTTGCCAT
TGCACGAGCAGTTCTCATGTATTTATCTATGGGTAACATGAAAGATGCAAATATTTTGAT
GGATGAGATTAAGAAACAAGCGGAGACCCTTTCAGAATCAGACCTTATCCAATTTATCAC
TTATCTTCTGGAAACGTTGCAGAGAGATGCATTGCCTCTTCTCAGTATGTTAAGAGCGAA
ATTTAGGTCTTGCGTAGATAGAGAACCGCTGCTTAATGAGTTGCTGGACGAGATTGCAGA
GAGGTTTTACGGTGTGCAGCGTAAGAATCCTTTGCAAGGAATGTTTGGAGACATCTTCAA
GATGATGGGCTAAGGAAGAAGATAGAAGAGGCAACTTTCTTTCCCCATTTTGTTTTTTTT
TTTTGTATTTGGCAATGATCTAATAATGGATAGCTTCTGAGAATTCAATTTGTTTCTCTT
TATCCTCAAGTGGGTAAGAGTTTTTGTTCTTTGTAACATTATACATTTGTTTTCATCATT
ACTATATCTTCAACATAAACGAAAAGGAAA

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DS 



AS 1 2

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AGTGGCTTCGCTTTTCGAGCTATGGAATCTAATGGACACACCACATGAAGAGAGAACTAA
ATTTGGAAGAGTTACATATGTTGTGAGATCATCTGAATCTAACGTCACTGAGCCAGGCAT
CTTATCAGCCGAGACAATTGAACAGGTGTCTACGGAAGTGGAGAGTCTGAGTAAACTGAA
AGCTAGCAAAATGAAGGAACTGGTGATGAAACGGAGGTCCGAGTTGGAGGATCTTTGCAG
ACTAACTCACATTCAACCTGATACAAGCACTTCGGCTGAGAAATCAAGTGCACTAATAGA
TTCTGGGTTAGTGGAACCTTCGGAGCTTCTTGCAAATATAGAAATGGAAATAAACAAGAT
TAAAGAGGAAGCACAGAGCCGTAAAGACATCATGGACAGAATTGACCGTTGGCTCTCTGC
ATGTGAAGAGGAAAACTGGTTGGAAGAATATAATTTGGATGAGAACCGTTATAGTGCTGG
AAGAGGTGGACATGTAAACCTTAAGCGTGCAGAACGAGCCAGAGTTACAATCAATAAGAT
CCCAGCGATGGTTGACAATCTTATTAAGAAAACTCTAGTTTGGGAAGAGGAAACGCACAA
GTCATTTCTCTATGATGGTGTTCGGTTGGTTAACATACTAGAAGACTACAAGTTAACAAG
GAAACAACAGG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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DS 

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CTACAAGTTAACAAGGAAACAACAGG

QA 1 686 1 686
DS 



AS 0 0

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CTTTCCGTCGGTTAGCACGATCCCATGGTCTCATCGTCATTATCAACATGGCAGAGGGGA
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BQ
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AF RS1AN74TF U 1
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BS 1 746 RS1AN74TF
BS 747 1248 RS1AN74JQ

RD RS1AN74TF 746 0 0
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AGAGTTTTTCTTTTATTTAAGGATTGTTTTTTTTTCCTTCAGTCTTGTTTTTGCAGATTT
CTGATATTGAAACCAAGCAGAGATGTGTAGTTTGGCGACAAATCTCTTATTCCCATCAAA
GATGAAACCAGCTTTTGCAGAGAAACAGAACACTAGCTCACTCTTTGTTACAAATAAAAG
ATCCTTGATGAAGAACAGATCCACTGTTCCTGTTGCAAGATTATTTGGACCGGCGATTTT
TGAAGCCTCCAAATTGAAAGTATCATTCTTAGGAGTAGATGAGAAGAAGCATCCATCAAA
GCTCCCAAGAACTTACACTCTCACTCACAGTGACATAACAGCTAAGTTAACATTGGCCAT
TTCCCAATCTATCAATAATTCTCAGTTGCAGGGATGGGCTAATAGATTATTTCGGGACGA
AGTAGTGGCCGAGTGGAAGAAAGTGAAGGGTAAAATGTCCCTTCACGTTCATTGCCACAT
TAGCGGAGGCCACTTTCTTTTGGATCTCATAGCGAAGCTTCGGTACTACATATTTTGCAA
GGAATTACCGGTGGTACTGAAAGCTTTTGTTCATGGAGATGGGAACTTGTTGAACAGTTA
CCCTGAGCTACAAGAATCTCCTGTTTGGGTTTATTTCCACCCAAACATCCCCGAGTACAA
TAAGGTTGAATGTTGGGGGCCGCTTT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1AN74JQ 881 0 0
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TCTATCAATAATTCTCAGTTGCAGGGATGGGCTAATAGATTATTTCGGGACGAAGTAGTG
GCCGAGTGGAAGAAAGTGAAGGGTAAAATGTCCCTTCACGTTCATTGCCACATTAGCGGA
GGCCACTTTCTTTTGGATCTCATAGCGAAGCTTCGGTACTACATATTTTGCAAGGAATTA
CCGGTGGTACTGAAAGCTTTTGTTCATGGAGATGGGAACTTGTTGAACAGTTACCCTGAG
CTACAAGAATCTCCTGTTTGGGTTTATTTCCACCCAAACATCCCCGAGTACAATAAGGTT
GAATGTTGGGGGCCGCTTTGGGAGGCTACGCAGCACAATCACGATGGAAATATAACACGC
AAAAAATGTGAAACTCTCCCGGAGCTAGCGTGTCCCCACGAGTGCGAATGTTGCTTTCCG
TCGGTTAGCACGATCCCATGGTCTCATCGTCATTATCAACATGGCAGAGGGGATGAGAAT
GAGAATTTCAGGGGTGGAGAGTTGGGAATATCTATCCCTAACTTTGAGAGATTGAAGTGA
TAGATCTCGTGAGGATGTTTCTTTTTTTATTTCCTTTGGTGGTTAGGAAAGTTGGAAGGA
ATATTGAAGTTATTTGTTTAGTGTTAACAGTGAGTAGATGAAAGTTGTCCAACAGTGTTA
TCCTTAGGGGTGGGCGCAAGGCGATTACTTGCATTTTTATGTATACTTGATATTTGCCTT
GCCTTGAACGAGTAATTGATTTTTGGACTTGTACTTGCTTTGTCGAAAACGAGTACTTGT
TATTTCGAGTACTTGTCAAAAAAATATGTTACTTGCAAGCG

QA 1 881 1 881
DS 



AS 1 2

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TCTCAGGGAGGAATCGGCAACGCGCTGGCTCGTGAATTCTCTGCGAAGGGTTGCCGAGTG
GTGGCGACGAGTCGATTGCAGAGCACGATGGCCGATTTGGAGAAAGATCCCAAGTTTTTA
GTGCAGGAGCTCGATGTTGGGTCGGAACAGAGCGTGAGTAAAGTCTTGTCGGAAGTTTTC
GACAAGTTTGGTCAGATCGATGTTCTGGTCAACAACGCCGGAGTTCAATGCATCGGACCA
CTCGCGGAGGTTCCAATTCAGACCATGGAGAACACTTTTAACACCAATGTGTTCGGTTCC
ATGAGGATGACTCAAGCTGTTATACCTCACATGGCGTTAAAGAAGAAAGGAAAGATTGTG
AACATAGGAAGTATCAGCACGATGGCACCAGGACCATTGGTAGGGGTTTATACCGCATCA
AAAGCTGCTCTTCATGCTCTTACAGACACATTACGGTTCTTCATTCTTTTGTGCACCAAA
CTTTCATTAATAAAACGAGAAAGCCCAAGAATTCGGCCCATTTAGGGATTACTATGATCT
TGGGCCTTCTAAATACTATGTTCTTGTTTTGTGGTTTGTTTCTTTTTCTAAGGTTGGAGC
TAAGGCCATTTGGGATTGATGTAATCAACATTGTCCCAGGAGGTATTCAATCAAACATAG
CCGAGTCAGGAGTATCTAGCTTCAACGATTTACCTGAACTGAAACTATACAAGCCGTTCG
AGGAAGCTATCCGTGAAAGGGCGTTTTTGTCGCAAAACGTTAAGCCGATACCCGCAGAGA
CATTTGCGAAAGAGGTGGTATCGGTGGTGCTGAAGGAACACCCACCGGCTTGGTACTTTA
CAGGAAGATTATCCACCGTCGCCGCTATCATGCACCATATGCCCATTTCAGTCAAAGATT
TTTTCCTGACTAAGAGCTTCATGAAAAAGGGGCCAAAAGAAACTGTTTGAATGTGTGTAT
CCAGCAAGTAAAAATGTTGCCTAACCATGAAACAAGCTAAATACAAAGCCACACAAAAAG
TTATAAGACCAACACAGTTAGAATAAGATCCCAGTAAGACTAAAGTCTGGT


BQ
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AF RS1EI14TF U 1
AF RS1EI14JQ C 412
BS 1 642 RS1EI14TF
BS 643 1131 RS1EI14JQ

RD RS1EI14TF 642 0 0
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TCTCAGGGAGGAATCGGCAACGCGCTGGCTCGTGAATTCTCTGCGAAGGGTTGCCGAGTG
GTGGCGACGAGTCGATTGCAGAGCACGATGGCCGATTTGGAGAAAGATCCCAAGTTTTTA
GTGCAGGAGCTCGATGTTGGGTCGGAACAGAGCGTGAGTAAAGTCTTGTCGGAAGTTTTC
GACAAGTTTGGTCAGATCGATGTTCTGGTCAACAACGCCGGAGTTCAATGCATCGGACCA
CTCGCGGAGGTTCCAATTCAGACCATGGAGAACACTTTTAACACCAATGTGTTCGGTTCC
ATGAGGATGACTCAAGCTGTTATACCTCACATGGCGTTAAAGAAGAAAGGAAAGATTGTG
AACATAGGAAGTATCAGCACGATGGCACCAGGACCATTGGTAGGGGTTTATACCGCATCA
AAAGCTGCTCTTCATGCTCTTACAGACACATTACGGTTCTTCATTCTTTTGTGCACCAAA
CTTTCATTAATAAAACGAGAAAGCCCAAGAATTCGGCCCATTTAGGGATTACTATGATCT
TGGGCCTTCTAAATACTATGTTCTTGTTTTGTGGTTTGTTTC

QA 1 642 1 642
DS 

RD RS1EI14JQ 720 0 0
AAGATTGTGAACATAGGAAGTATCAGCACGATGGCACCAGGACCATTGGTAGGGGTTTAT
ACCGCATCAAAAGCTGCTCTTCATGCTCTTACAGACACATTACGGTTCTTCATTCTTTTG
TGCACCAAACTTTCATTAATAAAAGGAGAAAGCCCAAGAATTCGGCCCATTTAGGGATTA
CTATGATCTTGGGCCTTCTAAATACTATGTTCTTGTTTTGTGGTTTGTTTCTTTTTCTAA
GGTTGGAGCTAAGGCCATTTGGGATTGATGTAATCAACATTGTCCCAGGAGGTATTCAAT
CAAACATAGCCGAGTCAGGAGTATCTAGCTTCAACGATTTACCTGAACTGAAACTATACA
AGCCGTTCGAGGAAGCTATCCGTGAAAGGGCGTTTTTGTCGCAAAACGTTAAGCCGATAC
CCGCAGAGACATTTGCGAAAGAGGTGGTATCGGTGGTGCTGAAGGAACACCCACCGGCTT
GGTACTTTACAGGAAGATTATCCACCGTCGCCGCTATCATGCACCATATGCCCATTTCAG
TCAAAGATTTTTTCCTGACTAAGAGCTTCATGAAAAAGGGGCCAAAAGAAACTGTTTGAA
TGTGTGTATCCAGCAAGTAAAAATGTTGCCTAACCATGAAACAAGCTAAATACAAAGCCA
CACAAAAAGTTATAAGACCAACACAGTTAGAATAAGATCCCAGTAAGACTAAAGTCTGGT

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL5696Contig1 914 2 2 U
GGTAGATAGTCTACCAAAGCTTGATGGAGATCAGAGAGCGTGGAGCCTCCTGCCAAAAAA
ACATTTTTTCCCTTAGAGACGTAAACAGTAGAAAGCAGAACAAAGATACAAAACATACAA
AAGATCTTCTCAGACATAAATATACCATGTTGTGTCTTTCTCCTAGTTCTTGTTATTGTA
GGACCTTCTTGATTGGCCATCACTACTATACGCGTTCTTAAAGCTGTCAAGCGTTCCACT
AGAGTCTTTGGCAACTGATCACCAACTGCCTGCGAAAACTCCACTGGTCTCGGTATCCTT
AAACCGGGCACATATACTGAAACCTCACCGATGCTTGTTGGCTTTCTTCTGTTCCCACCA
GTGTCTTTGGGCGTTGATGCAAAGCATCCCATTTTTTTTACTAACAGAGCTTTAAAGAAA
TCTACAAACAGGAAAGTCAAATCAAACGCTATAAGTGCCAAATTTTGATAAAATGCTTCA
CTGAAGAATCTTGTTTGTGATAAACAATTAGTGACGAGGAAATGATCAAAGGTAGAAGAA
GAGAGAAGAATGATTCAAAGGAGAAAACTTGGTAAGTAATAATGGCCAACCAAAAAAGAA
ACAGCTCAACTCCTTCCTCATCCACTAGATTCATAAGGATAAAGTTAACACCCAGCTCAC
GAGCTATCTGCCATTACTTGCTCATTCAACGTGACAACGTGACTAGAACTCTAACACGAT
TTTTTTTAATAACAATAATTTACTTTACGACCGAGGAAAGTCCAACCAGAAACAAACAAG
CAAAGCAAATGAAGACGTTGTAAGAATATTACCAATATCATGTAAAAAAAGAGGTTAGAT
TTCTCACTTTTACCTTTAATCAGATGATTGGCTATGAGCTATCTTATGCAACTAACTGGT
TGCTGCATCAAAGG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EU19TF U 1
AF RS1EU19JQ C 191
BS 1 630 RS1EU19TF
BS 631 914 RS1EU19JQ

RD RS1EU19TF 630 0 0
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ACATTTTTTCCCTTAGAGACGTAAACAGTAGAAAGCAGAACAAAGATACAAAACATACAA
AAGATCTTCTCAGACATAAATATACCATGTTGTGTCTTTCTCCTAGTTCTTGTTATTGTA
GGACCTTCTTGATTGGCCATCACTACTATACGCGTTCTTAAAGCTGTCAAGCGTTCCACT
AGAGTCTTTGGCAACTGATCACCAACTGCCTGCGAAAACTCCACTGGTCTCGGTATCCTT
AAACCGGGCACATATACTGAAACCTCACCGATGCTTGTTGGCTTTCTTCTGTTCCCACCA
GTGTCTTTGGGCGTTGATGCAAAGCATCCCATTTTTTTTACTAACAGAGCTTTAAAGAAA
TCTACAAACAGGAAAGTCAAATCAAACGCTATAAGTGCCAAATTTTGATAAAATGCTTCA
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ACAGCTCAACTCCTTCCTCATCCACTAGAT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RS1EU19JQ 724 0 0
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GCAACTGATCACCAACTGCCTGCGAAAACTCCACTGGTCTCGGTATCCTTAAACCGGGCA
CATATACTGAAACCTCACCGATGCTTGTTGGCTTTCTTCTGTTCCCACCAGTGTCTTTGG
GCGTTGATGCAAAGCATCCCATTTTTTTTACTAACAGAGCTTTAAAGAAATCTACAAACA
GGAAAGTCAAATCAAACGCTATAAGTGCCAAATTTTGATAAAATGCTTCACTGAAGAATC
TTGTTTGTGATAAACAATTAGTGACGAGGAAATGATCAAAGGTAGAAGAAGAGAGAAGAA
TGATTCAAAGGAGAAAACTTGGTAAGTAATAATGGCCAACCAAAAAAGAAACAGCTCAAC
TCCTTCCTCATCCACTAGATTCATAAGGATAAAGTTAACACCCAGCTCACGAGCTATCTG
CCATTACTTGCTCATTCAACGTGACAACGTGACTAGAACTCTAACACGATTTTTTTTAAT
AACAATAATTTACTTTACGACCGAGGAAAGTCCAACCAGAAACAAACAAGCAAAGCAAAT
GAAGACGTTGTAAGAATATTACCAATATCATGTAAAAAAAGAGGTTAGATTTCTCACTTT
TACCTTTAATCAGATGATTGGCTATGAGCTATCTTATGCAACTAACTGGTTGCTGCATCA
AAGG

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

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TATAACTTCGATCTCTCGTGTGTCTGTGTTTGTTTCTTTCCAGGGTTTTGATTATATAAA
AACATATCATAGCGATAATCACTAGCTGGTCGTGTAAGCAGTATATGCACGCCAACTGTT
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TGATATCTATTAGAGGATTAGGTGCCGGCGTGAATGGGAAGCTTAGCGAGACTATAGCTG
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BQ
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AF RS1FA56TF U 1
AF RS1FA56JQ C 199
BS 1 646 RS1FA56TF
BS 647 755 RS1FA56JQ

RD RS1FA56TF 646 0 0
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TACCAGTCGACGCTGTCACATGCTCCGACATCCTCAAGGACGCTACTAAGGCCGTCGCTA
AGATCATCGGCAAACCTGAATCCGTATTTAAAAACTCTAAAACCCTCTGTTTCCGACATT
TATAACTTCGATCTCTCGTGTGTCTGTGTTTGTTTCTTTCCAGGGTTTTGATTATATAAA
AACATATCATAGCGATAATCACTAGCTGGTCGTGTAAGCAGTATATGCACGCCAACTGTT
TGATGAAATTCCTGTGTGAATCTGGTCTTAACTTGCGAGCTACGTTTCGTTACAACAATG
ACTGCTCTTTCCTCTTTTTCTTTTTCTTGGTTGGGGTTTTGCAGTATGTGATGATACTGC
TAAACAGCGGAGTGCCCATTGCATTTGCGGGTACCGAGGAACCTGCTGCTTATGGAGAAT
TGATATCTATTAGAGGATTAGGTGCCGGCGTGAATGGGAAGCTTAGCGAGACTATAGCTG
AGATTCTCCAAATTAAGCTCTCTATTGATAGCTCCCGCTTTTACATCAAGTTCTACGATT
CCCCACGACCCTTCTTTGGATTCAACGGATCAACTTTCTGAACACA

QA 1 646 1 646
DS 

RD RS1FA56JQ 557 0 0
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TCTTTTTCTTGGTTGGGGTTTTGCAGTATGTGATGATACTGCTAAACAGCGGAGTGCCCA
TTGCATTTGCGGGTACCGAGGAACCTGCTGCTTATGGAGAATTGATATTTATTAGAGGAT
TAGGTGCCGGCGTGAATGGGAAGCTTAGCGAGACTATAGCTGAGATTCTCCAAATTAAGC
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GATTCAACGGATCAACTTTCTGAACACACGGGTTCAATCGTTGTGGCCAAGAGGCGGTGA
ATTCAACTTCCTAATGAAATTATTTTGAGTTCAGAAGCTGTAGATTCTTGAGTTTGATTT
ATAATATGATACTCCCC

QA 1 557 1 557
DS 



AS 1 2

CO CL5698Contig1 1111 2 2 U
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CTACCGGTCGATTTACTAATGGCCGTACCATTGGTGACATCGTTGGGGAAGAGCTAGGAT
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ATAGGTTAGGTATGGATGTACAAGTAGATTTCTTCAACACCACACGTAAACAATTCGATG
ACCTACTTGGAAAGGACAAAGCAAAAGAGTATATAAGCAAGAAATCAATATTCTCAATCA
CTATCGGAGCCAACGACTTCCTCAACAACTATCTATTCCCACTTCTCTCTGTTGGAACAC
GGCTCACGGAAACTCCTGATATTTTTATTGGCGACATGCTTGATCATCTACGCGACCAAC
TAACCAGGTTGTATCAATTGGATGCGAAGAAGTTTGTGATCGGGAACGTTGGACCGATCG
GATGCATACCGTACCAGAAAACCATTAATCAATTAAACGAAGACGAGTGTGTGGACTTGG
CTAATAAGCTAGCAAATCAATACAACGTTCGACTAAAGAGTTTATTGGAGGACCTAAACA
AGAAGCTTCCTGGAGCAATGTTCGTGCATGCAAATGTTTACGATTTGGTCATGGAACTCA
TCACTAACTACAAAAAATACGGGTTCAAATTTGCGACAAAGGCTTGTCGCGGTAATGGAG
GACAGTATGCAGGTATAATACCGTGCGGACCGACTTCGAGTTTGTGCGAGGAAAGGGACA
AGTATGTGTTTTGGGATCCTTATCATCCGAGTGAAGCAGCAAATGTTATCATCGCGAAGC
AATTGTTGTATGGTGATATTAAAGTTATATCTCCGGTTAATCTCAGCAAACTTAGAGATA
TGTGATTCGATTGTTTGTTGACAAAGCGTCTCCTTGGAGATTCTATACCTATTTTTCTTG
CATTTACGTTTGATATACGCAAAGCTAAGATCCATGTTTGTATGTGTTTGTGTTGTTTTT
AATTTTAGTGAGAATGCTTTAGTTTTTGTTT


BQ
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AF RS1CQ13TF U 1
AF RS1CQ13JQ C 463
BS 1 689 RS1CQ13TF
BS 690 1111 RS1CQ13JQ

RD RS1CQ13TF 689 0 0
GCTTGTCTAGGGCCAATATGAAGCCTAATGGTATCGATTTCAAAGCCTCCGGAGGAAACC
CTACCGGTCGATTTACTAATGGCCGTACCATTGGTGACATCGTTGGGGAAGAGCTAGGAT
CAGCAAACTATGCGGTCCCATTCTTGTCTCCAAACGCTACCGGAAAAGCTTTATTAGCCG
GTGTGAATTACGCGTCTGGAGGAGGAGGAATCATGAATGCAACCGGAAGAATCTTTGTGA
ATAGGTTAGGTATGGATGTACAAGTAGATTTCTTCAACACCACACGTAAACAATTCGATG
ACCTACTTGGAAAGGACAAAGCAAAAGAGTATATAAGCAAGAAATCAATATTCTCAATCA
CTATCGGAGCCAACGACTTCCTCAACAACTATCTATTCCCACTTCTCTCTGTTGGAACAC
GGCTCACGGAAACTCCTGATATTTTTATTGGCGACATGCTTGATCATCTACGCGACCAAC
TAACCAGGTTGTATCAATTGGATGCGAAGAAGTTTGTGATCGGGAACGTTGGACCGATCG
GATGCATACCGTACCAGAAAACCATTAATCAATTAAACGAAGACGAGTGTGTGGACTTGG
CTAATAAGCTAGCAAATCAATACAACGTTCGACTAAAGAGTTTATTGGAGGACCTAAACA
AGAAGCTTCCTGGAGCAATGTTCGTGCAT

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1CQ13JQ 649 0 0
ATCATCTACGCGACCAACTAACCAGGTTGTATCAATTGGATGCGAAGAAGTTTGTGATCG
GGAACGTTGGACCGATCGGATGCATACCGTACCAGAAAACCATTAATCAATTAAACGAAG
ACGAGTGTGTGGACTTGGCTAATAAGCTAGCAAATCAATACAACGTTCGACTAAAGAGTT
TATTGGAGGACCTAAACAAGAAGCTTCCTGGAGCAATGTTCGTGCATGCAAATGTTTACG
ATTTGGTCATGGAACTCATCACTAACTACAAAAAATACGGGTTCAAATTTGCGACAAAGG
CTTGTCGCGGTAATGGAGGACAGTATGCAGGTATAATACCGTGCGGACCGACTTCGAGTT
TGTGCGAGGAAAGGGACAAGTATGTGTTTTGGGATCCTTATCATCCGAGTGAAGCAGCAA
ATGTTATCATCGCGAAGCAATTGTTGTATGGTGATATTAAAGTTATATCTCCGGTTAATC
TCAGCAAACTTAGAGATATGTGATTCGATTGTTTGTTGACAAAGCGTCTCCTTGGAGATT
CTATACCTATTTTTCTTGCATTTACGTTTGATATACGCAAAGCTAAGATCCATGTTTGTA
TGTGTTTGTGTTGTTTTTAATTTTAGTGAGAATGCTTTAGTTTTTGTTT

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 2

CO CL5699Contig1 478 2 1 U
GGCCGTGGCCATTACGTCAGACAACCGATCCGTCTCCTGAAGGAGGAAGGAGGAGGAGAT
GATCTTGAAACAGAACATGCTTTGTCGTGCGTGGTGGAGGCGTACTACGCGCACAAGAGC
TACGAGGAGGAGCTGTGGGAGAGGAATAGGAGGAGATCGTTCGGCGCGTACACGGAGAAG
GAAGCGCGTGGGTACGTGAAGCGGAACGATAGGCCGCAGCATCTTAGCTTCTTGGATCAT
ATCCGTATTTTCGTTTCTTCTCCATGTGACTGATTTTAATTTTTCCCTCTCTCTCTTTCT
CTCTTGGTGGAAAAAAATAAAAAACAAAATAGTTATTACAAAAAAATACTATAAGGGGTC
CTACCGATCTGTCGTATCCGTACTACGGTTGTCCTTTGATTAGGTTCTGTAATGGACCAA
TGGCTGTTTGGATGTAAAACAATTTAAGTACTCTATCTTGATAAGTTCTTGGTCGCTC


BQ
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AF RS1CQ27TF U 1
AF RS1CQ27JQ C 39
BS 1 478 RS1CQ27TF

RD RS1CQ27TF 478 0 0
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GATCTTGAAACAGAACATGCTTTGTCGTGCGTGGTGGAGGCGTACTACGCGCACAAGAGC
TACGAGGAGGAGCTGTGGGAGAGGAATAGGAGGAGATCGTTCGGCGCGTACACGGAGAAG
GAAGCGCGTGGGTACGTGAAGCGGAACGATAGGCCGCAGCATCTTAGCTTCTTGGATCAT
ATCCGTATTTTCGTTTCTTCTCCATGTGACTGATTTTAATTTTTCCCTCTCTCTCTTTCT
CTCTTGGTGGAAAAAAATAAAAAACAAAATAGTTATTACAAAAAAATACTATAAGGGGTC
CTACCGATCTGTCGTATCCGTACTACGGTTGTCCTTTGATTAGGTTCTGTAATGGACCAA
TGGCTGTTTGGATGTAAAACAATTTAAGTACTCTATCTTGATAAGTTCTTGGTCGCTC

QA 1 478 1 478
DS 

RD RS1CQ27JQ 440 0 0
GAAGGAGGAAGGAGGAGGAGATGATCTTGAAACAGAACATGCTTTGTCGTGCGTGGTGGA
GGCGTACTACGCGCACAAGAGCTACGAGGAGGAGCTGTGGGAGAGGAATAGGAGGAGATC
GTTCGGCGCGTACACGGAGAAGGAAGCGCGTGGGTACGTGAAGCGGAACGATAGGCCGCA
GCATCTTAGCTTCTTGGATCATATCCGTATTTTCGTTTCTTCTCCATGTGACTGATTTTA
ATTTTTCCCTCTCTCTCTTTCTCTCTTGGTGGAAAAAAATAAAAAACAAAATAGTTATTA
CAAAAAAATACTATAAGGGGTCCTACCGATCTGTCGTATCCGTACTACGGTTGTCCTTTG
ATTAGGTTCTGTAATGGACCAATGGCTGTTTGGATGTAAAACAATTTAAGTACTCTATCT
TGATAAGTTCTTGGTCGCTC

QA 1 440 1 440
DS 



AS 1 2

CO CL5700Contig1 1093 2 6 U
GGAAGAAGACGACCTTTGAAAAAAAGCTTCCGGGTTTATCCATCCATCCATCCATCAATC
AATCATCTTTTCGTAATCGAAAGAAGAAATGAGGCATAATTGTTGCCATATTTCGTTCGC
CTCAACTCTCAAGATCCTCAATTTCGTTCAAGCTTTCTTCGGTGTTTCCATCATCATCTA
CTCCATATGGATGCTCTATCAATTCCACCGTCACGTCCCCGTCGATCCTCCCACTTTGAA
CAATCCTGCTGGTCTCATGGCGAGCGTCGTTCTAAGGTCTAGTGGTGGTGGTGGTCATGG
GTTTAGCCTCCGTTCCTTGGACCTTCCTGCTCCATGTTTCATCTACTCTTTTATGGCGGT
TGGTGTATTGGTCTGCATTGTTACCTTCATTGGTTTCATTGCTGCTGAAGCTATCAATAC
CTGTTGCTTGTGTTTCTACTCTATTCTCAAAACTCTGCTCATTCTACTTGAAGCTGCCCT
TGTTGCATTCATCGCCATTGATCGTCACTGGGAAAAGGATCTTCCGTATGATCCAACTGG
AGAGCTCAATAGTCTTCGGGCTTCCATTGAGGACAACATTGATATATGCAAATGGGTCGG
GGCTGCTGTAGTAGTCGTCCAGCTACTGTCACTGCTACTAGCCATGGTTCTCAGAGCTAT
GGTTTCACCTAAGAGACCCGAGCTTGACGACGAGGAAGACTACGAGAACCCGAGGAGTAG
AGCTTGGGATCCACTTCTTGGTTCTCAAGCAAACCAAGCCTCTGCTGGATCTAGCAAGAG
TGAAAACTGGAGCTCTCGCATCAGAGAAAAGTATGGACTGAACCAGACTCAGGCGGGGTG
AACCCTAAAGGCTGATGATGAAGCCAAATAAACATGATTCTGAAACTGCATGCGTCCATA
TGGTCTCTGTGTAGCTCTCCTTCTCTATGTTTTGCTCTCTGTAACTTTCTCTTGAGTGTG
TGCTTAAATAGTTAACTCGATAACAGTGTCCTTTCCTTTTGTGTGTCGCAAGAACATCAT
AAACATCTCTATTTGTGTGTGTTTGCCTGTAGAATCCTCTCTAAATTATCATTTCCACTA
TAAAGATTTTACC


BQ
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AF RS1A644TF U 1
AF RS1A644JQ C 377
BS 1 563 RS1A644TF
BS 564 564 RS1A644JQ
BS 565 714 RS1A644TF
BS 715 715 RS1A644JQ
BS 716 832 RS1A644TF
BS 833 1093 RS1A644JQ

RD RS1A644TF 837 0 0
GGAAGAAGACGACCTTTGAAAAAAAGCTTCCGGGTTTATCCATCCATCCATCCATCAATC
AATCATCTTTTCGTAATCGAAAGAAGAAATGAGGCATAATTGTTGCCATATTTCGTTCGC
CTCAACTCTCAAGATCCTCAATTTCGTTCAAGCTTTCTTCGGTGTTTCCATCATCATCTA
CTCCATATGGATGCTCTATCAATTCCACCGTCACGTCCCCGTCGATCCTCCCACTTTGAA
CAATCCTGCTGGTCTCATGGCGAGCGTCGTTCTAAGGTCTAGTGGTGGTGGTGGTCATGG
GTTTAGCCTCCGTTCCTTGGACCTTCCTGCTCCATGTTTCATCTACTCTTTTATGGCGGT
TGGTGTATTGGTCTGCATTGTTACCTTCATTGGTTTCATTGCTGCTGAAGCTATCAATAC
CTGTTGCTTGTGTTTCTACTCTATTCTCAAAACTCTGCTCATTCTACTTGAAGCTGCCCT
TGTTGCATTCATCGCCATTGATCGTCACTGGGAAAAGGATCTTCCGTATGATCCAACTGG
AGAGCTCAATAGTCTTCGGGCTTTCATTGAGGACAACATTGATATATGCAAATGGGTCGG
GGCTGCTGTAGTAGTCGTCCAGCTACTGTCACTGCTACTAGCCATGGTTCTCAGAGCTAT
GGTTTCACCTAAGAGACCCGAGCTTGACGACGAGGAAGACTACGAGAACCCGAG*AGTAG
AGCTTGGGATCCACTTCTTGGTTCTCAAGCAAACCAAGCCTCTGCTGGATCTAGCAAGAG
TGAAAACTGGAGCTCTCGCATCAGAGAAAAGTATGGACTGAACCAGACTCAG
CGGGT

QA 1 832 1 832
DS 

RD RS1A644JQ 717 0 0
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TACTCTATTCTCAAAACTCTGCTCATTCTACTTGAAGCTGCCCTTGTTGCATTCATCGCC
ATTGATCGTCACTGGGAAAAGGATCTTCCGTATGATCCAACTGGAGAGCTCAATAGTCTT
CGGGCTTCCATTGAGGACAACATTGATATATGCAAATGGGTCGGGGCTGCTGTAGTAGTC
GTCCAGCTACTGTCACTGCTACTAGCCATGGTTTTCAGAGCTATGGTTTCACCTAAGAGA
CCCGAGCTTGACGACGAGGAAGACTACGAGAACCCGAGGAGTAGAGCTTGGGATCCACTT
CTTGGTTCTCAAGCAAACCAAGCTTCTGCTGGATCTAGCAAGAGTGAAAACTGGAGCTCT
CGCATCAGAGAAAAGTATGGACTGAACCAGACTCAGGCGGGGTGAACCCTAAAGGCTGAT
GATGAAGCCAAATAAACATGATTCTGAAACTGCATGCGTCCATATGGTCTCTGTGTAGCT
CTCCTTCTCTATGTTTTGCTCTCTGTAACTTTCTCTTGAGTGTGTGCTTAAATAGTTAAC
TCGATAACAGTGTCCTTTCCTTTTGTGTGTCGCAAGAACATCATAAACATCTCTATTTGT
GTGTGTTTGCCTGTAGAATCCTCTCTAAATTATCATTTCCACTATAAAGATTTTACC

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 2

CO CL5701Contig1 1222 2 2 U
GGGAGTTTGGTCCTCTTCTTCGTCTTCCCTCTGCAGTAGGGATTGTCTTTCAGGAAAAGA
TCGAAACTTTATTAGATTTCCTGAAAGATGGGTAACGCTCTTGGATATCTCTACGGAAAA
TGCTGCAAACCCACCACGGACGACGACTCTCTCGGTCCGCACGGCGTCTCCACCGTCGGT
CTTTCAGCTCTCGCTCACGATCTCTTCAACTTCGAGATCACTTCCCAAGTTCCTGAAGGA
CTTGGGAGGTACGTTGTGTCATCAAGAAAAGCTCAAGCAAACTGGTATAGAAAAATACTT
GAGGCATGGAAGCAAGCAAAACCTCCACCACAGACAGCAGAGGATGCTTCTAGGCTTGTT
ATTGAGATCTTGAAAAGGCATCAGAAAGCAGATGTTGAGGGGCTTTTGTCTTTCTATGGA
CTCCCTTTGCCTCACACTCTCGTTGAGCTCTCTACTGAAGCTCCTCCTGTATCTTTACCT
GAAGGAGTTCTTTTCGAGTTTCAAACCCTCCCGGTGGATCCAAAAGCTGTGGCAGATGGA
GACACCATCACAGTCTATGTCAGTAGTTCAGACCCGGTTGTGTCATCTTCTGTTCCAAGG
GAAGTGAATGTTGCAGCGGTTAAAAGAGCAAAGGCGAGAGAGAGGAAAGATTACACAAAA
GCAGACGCGCTTCACCAGAAGATCATTGATTCTGGTTACAGAGTGCTAAACATTCAGAAT
GAAGAAGTGCTTGCTCGCAAGTTCAGAATCAGACTAAGGGGAATAGATGCACCAGAAAGC
CAGATGCCGTTTGGGAAAGAGGCACAAGAAGGGCTGCTTAAGATTGTTCAATGGAAAAGC
TTGAAGGTGTTTGTTTATGGAGAAGATCGGTATGGGAGGTGTGTTGGAGATTTATACTGC
AATGGAGTTTTTGTTCAGGAGGCAATGCTAAAGAAAGGTCTTGCTTGGCATTATATAGAT
TATGACAAGCGCATTGTTCTTGCAAAGTGGGAAAAGGAAGCAAGGCAGAAGCGTATTGGC
TTGTGGGCTTCTTCGAATCCAGAAAAGCCATGGGACTGGAGAAAGAATAGGCGTGAGCAA
AACAACTGATTAAACTGAAATCCGAGTTTAAGACAGTTGAGATTTTATGATTATTGAAGT
TTTTTTTCTGATTTGGACTTATCTGATTCTATCGTAAGATGTTTAAAAATGGTAAACTTA
TGTATAAATGGTGCTTACATCG


BQ
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AF RS1E572TF U 1
AF RS1E572JQ C 433
BS 1 501 RS1E572TF
BS 502 1222 RS1E572JQ

RD RS1E572TF 501 0 0
GGGAGTTTGGTCCTCTTCTTCGTCTTCCCTCTGCAGTAGGGATTGTCTTTCAGGAAAAGA
TCGAAACTTTATTAGATTTCCTGAAAGATGGGTAACGCTCTTGGATATCTCTACGGAAAA
TGCTGCAAACCCACCACGGACGACGACTCTCTCGGTCCGCACGGCGTCTCCACCGTCGGT
CTTTCAGCTCTCGCTCACGATCTCTTCAACTTCGAGATCACTTCCCAAGTTCCTGAAGGA
CTTGGGAGGTACGTTGTGTCATCAAGAAAAGCTCAAGCAAACTGGTATAGAAAAATACTT
GAGGCATGGAAGCAAGCAAAACCTCCACCACAGACAGCAGAGGATGCTTCTAGGCTTGTT
ATTGAGATCTTGAAAAGGCATCAGAAAGCAGATGTTGAGGGGCTTTTGTCTTTCTATGGA
CTCCCTTTGCCTCACACTCTCGTTGAGCTCTCTACTGAAGCTCCTCCTGTATCTTTACCT
GAAGGAGTTCTTTTCGAGTTT

QA 1 501 1 501
DS 

RD RS1E572JQ 790 0 0
CACACTCTCGTTGAGCTCTCTACTGAAGCTCCTCCTGTATCTTTACCTGAAGGAGTTCTT
TTCGAGTTTCAAACCCTCCCGGTGGATCCAAAAGCTGTGGCAGATGGAGACACCATCACA
GTCTATGTCAGTAGTTCAGACCCGGTTGTGTCATCTTCTGTTCCAAGGGAAGTGAATGTT
GCAGCGGTTAAAAGAGCAAAGGCGAGAGAGAGGAAAGATTACACAAAAGCAGACGCGCTT
CACCAGAAGATCATTGATTCTGGTTACAGAGTGCTAAACATTCAGAATGAAGAAGTGCTT
GCTCGCAAGTTCAGAATCAGACTAAGGGGAATAGATGCACCAGAAAGCCAGATGCCGTTT
GGGAAAGAGGCACAAGAAGGGCTGCTTAAGATTGTTCAATGGAAAAGCTTGAAGGTGTTT
GTTTATGGAGAAGATCGGTATGGGAGGTGTGTTGGAGATTTATACTGCAATGGAGTTTTT
GTTCAGGAGGCAATGCTAAAGAAAGGTCTTGCTTGGCATTATATAGATTATGACAAGCGC
ATTGTTCTTGCAAAGTGGGAAAAGGAAGCAAGGCAGAAGCGTATTGGCTTGTGGGCTTCT
TCGAATCCAGAAAAGCCATGGGACTGGAGAAAGAATAGGCGTGAGCAAAACAACTGATTA
AACTGAAATCCGAGTTTAAGACAGTTGAGATTTTATGATTATTGAAGTTTTTTTTCTGAT
TTGGACTTATCTGATTCTATCGTAAGATGTTTAAAAATGGTAAACTTATGTATAAATGGT
GCTTACATCG

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 2

CO CL5702Contig1 1159 2 6 U
GCCGCAAGAAACCGAACACGCCTCCTATGACTTTGAAGCCAGTGGTTTATTAGACATTGA
TTCAAATGACCCTGGGGAATCTTTTCATGATGATGACGATGATCATGAAAATGATGAAGA
TCATGTCTCCGATGCGCTAGTTAATGGAACTGTCGTTAACCATGGCGGATTGGAAGGTGG
TTCTGACAAATGCAATCAAGGAGATGAGCTACATCTTGAAGTTGGATCTGAGAATGGCTT
TGTTCCTCTGGAGAGAGAACATTCTGCAGATTCTCTTGTGTCTAATGCATCAGTTGCAAA
GTCTCCTAAGAATACCTCGTCTAGGGATAACAAGTGGATTCAGGTTCGAAAAGGCACCAA
GATAATTGTGCAAGTTGTTAAAGAGGGCCTTGGTACAAAAGGTCCAACTCTCACTGCTTA
CCCAAAACTGAGAAGCAGATTCTGGGTATTAATGACTCGTTTTATGAAGAGGTTAAGAAA
GCAGTGGGGAAAGATAGGTCACTGGTAAAAGTCTCAGAGCTGTCTAGACACGGACTCATG
GAGATAACAAGAAAAAGGGTTCGGCCGAGTGTAACATTCATGATCAGTGAACCCTGTTCT
TGCTGTCACGCAACTGGTAGAGTGGAGGCACTGGAGACTTCCTTTTCAAAAATTGAACAA
GAGATTTGTCGGCAGCTCGCAAAGATGGAGAAAAGAGGAGACCTTGAAAACCCCAAGTCT
TGGCCAAGATCCATATTGCGTGTGGACAGTCATATGTCCAGCTTCTTGACTACCGGGAAG
AGGACGCGGCTTGCAATCCTAAGTAGTGCCCTGAAAGTATGGATTCTCTTAAAGGTTGCT
AGACATTTCACAAGAGGAACCTTTGAGGTTAAACCGTTCATGGATGATAAGACTGTAAAT
GAAAGACCGCATCAAGTTGCCATATCATTGCTCAAGAAAGCTGACGCCATAGCAGACTCC
TCAGGCAAGAAGAAGCTCGCTCTTATTCCGATGAAGAAGGATAAGACCGGTGGTAAACAC
AGACGATGAAACATCTGTTAAATTTCACATCACTTTTGCTAGATGCCTCAAATGATACTG
TTGAGCGTGTTGTACCGAATCGATTTTGTGTATTAGTATCATCTTTTTCCTTCATGTTTT
GCATTTTAAAGATATAGAA


BQ
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AF RS1AL65TF U 1
AF RS1AL65JQ C 406
BS 1 462 RS1AL65TF
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BS 836 852 RS1AL65TF
BS 853 1159 RS1AL65JQ

RD RS1AL65TF 869 0 0
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TTCTGACAAATGCAATCAAGGAGATGAGCTACATCTTGAAGTTGGATCTGAGAATGGCTT
TGTTCCTCTGGAGAGAGAACATTCTGCAGATTCTCTTGTGTCTAATGCATCAGTTGCAAA
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GATAATTGTGCAAGTTGTTAAAGAGGGCCTTGGTACAAAAGGTCCAACTCTCACTGCTTA
CCCAAAACTGAGAAGCAGATTCTGGGTATTAATGACTCGTTT*ATGAAGAGGTTAAGAAA
GCAGTGGGGAAAGATAGGTCACTGGTAAAAGTCTCAGAGCTGTCTAGACACGGACTCATG
GAGATAACAAGAAAAAGGGTTCGGCCGAGTGTAACATTCATGATCAGTGAACCCTGTTCT
TGCTGTCACGCAACTGGTAGAGTGGAGGCACTGGAGACTTCCTTTTCAAAAATTGAACAA
GAGATTTGTCGGCAGCTCGCAAAGATGGAGAAAAGAGGAGACCTTGAAAACCCCAAGTCT
TGGCCAAGATCCATATTGCGTGTGGACAGTCATATGTCCAGCTTCTTGACTACCGGGAAG
AGGACGCGGCTTGCAATCCTAAGTAGTGCCCTGAAAGTATGGATTCTCTTAAAG*TTGCT
AGACATTTCACA
GAGAACCTTTGAGTAAA

QA 1 852 1 852
DS 

RD RS1AL65JQ 754 0 0
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GAAGAGGTTAAGAAAGCAGTGGGGAAAGATAGGTCACTGGTAAAAGTCTCAGAGCTGTCT
AGACACGGACTCATGGAGATAACAAGAAAAAGGGTTCGGCCGAGTGTAACATTCATGATC
AGTGAACCCTGTTCTTGCTGTCACGCAACTGGTAGAGTGGAGGCACTGGAGACTTCCTTT
TCAAAAATTGAACAAGAGATTTGTCGGCAGCTCGCAAAGATGGAGAAAAGAGGAGACCTT
GAAAACCCCAAGTCTTGGCCAAGATTCATATTGCGTGTGGACAGTCATATGTCCAGCTTC
TTGACTACCGGGAAGAGGACGCGGCTTGCAATCCTAAGTAGTGCCCTGAAAGTATGGATT
CTCTTAAAGGTTGCTAGACATTTCACAAGAGGAACCTTTGAGGTTAAACCGTTCATGGAT
GATAAGACTGTAAATGAAAGACCGCATCAAGTTGCCATATCATTGCTCAAGAAAGCTGAC
GCCATAGCAGACTCCTCAGGCAAGAAGAAGCTCGCTCTTATTCCGATGAAGAAGGATAAG
ACCGGTGGTAAACACAGACGATGAAACATCTGTTAAATTTCACATCACTTTTGCTAGATG
CCTCAAATGATACTGTTGAGCGTGTTGTACCGAATCGATTTTGTGTATTAGTATCATCTT
TTTCCTTCATGTTTTGCATTTTAAAGATATAGAA

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

CO CL5703Contig1 1122 2 4 U
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GTTCATGGCAGCTTTGCAAATGTCTCGTGAATGGATCGGTATTCAACAGTTCCCACCTGC
TACTCAATCTAAGTTGCTCGAGATCCTTGGCAAGTTCAAAGAAGAGGATGTGAGCTCGCT
AACAGTACTTGTGATGGGGAAAGGAGGTGTTGGAAAGTCTTCTACTGTGAATTCAGTTAT
AGGCGAGAGAGCTGCTGCAGTCAGTACTTTCCAGTCTGAAGGACTGAGACCTTCCTTGGT
CTCGCTCAAGGTCGGGTTTTACATTAAACATAATCGACACTCCTGGTCTTATTGAGGGAG
GATATGTGAATGATCAAGTCGTCAACCTTATAAAAGGATTTCTCCTGAACAAGACTATAG
ATGTGCTACTATACGTAGACCGTTTGGATGTGTATCGGGTGGATGACTTGGATAAGCAGG
TGGTGACGGCTATAACCGATGCATTTGGTAAAGAGATATGGAAGAAGTCTGCTCTTGTCC
TCAGTCATGCTCAGTTCTCTCCCCCGGACGGGTTAAACTATGATCTCTTTGTCTCCAGAA
GATCCGACGCTCTTCTGAAACTGATCTATGCTAGCGCTCAACTGAAGAAACAGGATATGC
AGGATTCATCTCTTCCTGTTATTCTTGTTGAGAACAGCGGGAGATGTCATAAGAATGAAA
GCGATGAAAAGATTCTTCCAGACGGAAGTAGTTGGATTACGAATCTGTACAAGACAATCA
CAGAGATCTCCTTTAATGGCAACAAGTCGATCCACGTTGACAAGAAACTGGTGGAAGGGC
CAAACCCAAACGCAAGAGGAAAACGACTAATCCCACTAATCATTGCATTCCAATACCTGC
TAGTGATGAAGCCATTGTTTCGAGCAATCAAGTCGGATGTCTCCAGAGAGAGTAAACCGG
CGTGGGAGATGCGAGAACCCGGTTCATCAGCAACTCGAAGGTCTTAATTCGGGTTTTATT
TTGGTTTAGTTCGGTTTTTCTGAGAAAATTTCCGTACTCGAATGAAATATGTTTTACTCT
GTAATGACTTTTTGTAAGCTTTATTTATTGGTCTTCTTTGGC


BQ
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AF RS1AA57TF U 1
AF RS1AA57JQ C 594
BS 1 771 RS1AA57TF
BS 772 772 RS1AA57JQ
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AACAGTACTTGTGATGGGGAAAGGAGGTGTTGGAAAGTCTTCTACTGTGAATTCAGTTAT
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CTCGCTCAAGGTCGGGTTTTACATTAAACATAATCGACACTCCTGGTCTTATTGAGGGAG
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ATGTGCTACTATACGTAGACCGTTTGGATGTGTATCGGGTGGATGACTTGGATAAGCAGG
TGGTGACGGCTATAACCGATGCATTTGGTAAAGAGATATGGAAGAAGTCTGCTCTTGTCC
TCAGTCATGCTCAGTTCTCTCCCCCGGACGGGTTAAACTATGATCTCTTTGTCTCCAGAA
GATCCGACGCTCTTCTGAAACTGATCTATGCTAGCGCTCAACTGAAGAAACAGGATATGC
AGGATTCATCTCTTCCTGTTATTCTTGTTGAGAACAGCGGGAGATGTCATAAGAATGAAA
GCGATGAAAAGATTCTTCCAGACGGAAGTAGTTGGATTACGAATCTGTACA*GACAATCA
CAGAGATCTCCTTTAATGGCAACAAGTCGATCCACGTTGACA
GAACCTGGTG

QA 1 822 1 822
DS 

RD RS1AA57JQ 529 0 0
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GATATGCAGGATTCATCTCTTCCTGTTATTCTTGTTGAGAACAGCGGGAGATGTCATAAG
AATGAAAGCGATGAAAAGATTCTTCCAGACGGAAGTAGTTGGATTACGAATCTGTACAAG
ACAATCACAGAGATCTCCTTTAATGGCAACAAGTCGATCCACGTTGACAAGAAACTGGTG
GAAGGGCCAAACCCAAACGCAAGAGGAAAACGACTAATCCCACTAATCATTGCATTCCAA
TACCTGCTAGTGATGAAGCCATTGTTTCGAGCAATCAAGTCGGATGTCTCCAGAGAGAGT
AAACCGGCGTGGGAGATGCGAGAACCCGGTTCATCAGCAACTCGAAGGTCTTAATTCGGG
TTTTATTTTGGTTTAGTTCGGTTTTTCTGAGAAAATTTCCGTACTCGAATGAAATATGTT
TTACTCTGTAATGACTTTTTGTAAGCTTTATTTATTGGTCTTCTTTGGC

QA 1 529 1 529
DS 



AS 1 2

CO CL5704Contig1 987 2 4 U
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AAGAGCACGGTGGCTCCGGTAGAAGGTCTTTATCAGAGATTGCTTTTGCTGATCATCGTA
ACCCTTCTTCTGGAAACGTCTCTTTGCGCAAACAGTTTAACACCGAAGAAGAGTACAGAG
CAGTGGTTGAACCACCGCCTGCAAAGTCCTTAGAAGAAGAAAAGATTACAGATGAAGACA
GTGGAGGAAAGATTACAGCGGAGAGAACACTCTCTACTGTGTCTGACCGTGAGATGTCTA
ATCTCCACAAGCAATCCTCTGAATCGTTTCCTTTTGCACACGTTGATGATGCCTTGATAT
TCCCTGAAATGGATAATAACGCCACTTTAGCAGCAGCATCAACGAGCGTGTACCAGTTCC
ACGAGGCGAAAATGACGGCTCTCATAAGAAGAAACGGGGTTCTTGAAGGGCAGCTAGAAG
CAGCGTTGGCCGGGAGAGAAGCGGCTGAGAGAAACGTGTCGGTTGCGCTGAGGAGCAAAC
AAGAGACTGATAAGAAGCTAAGTGACCCCTTGAGAGATGTTGAGTTGCTTAAGGAGAAGC
TCACAGGTTTAGAGTTAGCACAAGAGGAAGCTAATAGTTTGTCAAACATGGTTCACTCTG
ACAATGTCAGGCTCGAGCATGATGTAGCGTTCCTAAGAGCTGTCCTAGACGATACACAGA
AGGAGTTGCATTCCCCAAGAGGTGTTCTTGCAGGAGAAAGAGCAAGAGCGTTTCAGTTGC
AGGTTGAAGTGTTTCATTTGAAGCAAAGGTTGCAATTTTTGGAGAACAGAGCTGCTACAC
CAAGAAAGCCTTTCCATGTTTAAACAAAGACCTGCGTGTAGTAGAGAGAAGACAAGACTT
GCATTTGTAATCCTCAAGAGACGAATGAAAACTATTTTGTGTGTTTGTGGATTAATGTAA
AAAGAAATTAAGAAAACTCAATTATTT


BQ
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AF RS1EU36TF U 1
AF RS1EU36JQ C 430
BS 1 566 RS1EU36TF
BS 567 567 RS1EU36JQ
BS 568 666 RS1EU36TF
BS 667 987 RS1EU36JQ

RD RS1EU36TF 666 0 0
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AAGAGCACGGTGGCTCCGGTAGAAGGTCTTTATCAGAGATTGCTTTTGCTGATCATCGTA
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CAGTGGTTGAACCACCGCCTGCAAAGTCCTTAGAAGAAGAAAAGATTACAGATGAAGACA
GTGGAGGAAAGATTACAGCGGAGAGAACACTCTCTACTGTGTCTGACCGTGAGATGTCTA
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TCCCTGAAATGGATAATAACGCCACTTTAGCAGCAGCATCAACGAGCGTGTACCAGTTCC
ACGAGGCGAAAATGACGGCTCTCATAAGAAGAAACGGGGTTCTTGAAGGGCAGCTAGAAG
CAGCGTTGGCCGGGAGAGAAGCGGCTGAGAGAAACGTGTCGGTTGCGCTGAGGAGCAAAC
AAGAGACTGATAAGAAGCTAAGTGACGCCTTGAGAGATGTTGAGTTGCTTAAGGAGAAGC
TCACAGGTTTAGAGTTAGCACAAGAGGAAGCTAATAGTTTGTCAAACATGGTTCACTCTG
ACAATG

QA 1 666 1 666
DS 

RD RS1EU36JQ 558 0 0
AAATGACGGCTCTCATAAGAAGAAACGGGGTTCTTGAAGGGCAGCTAGAAGCAGCGTTGG
CCGGGAGAGAAGCGGCTGAGAGAAACGTGTCGGTTGCGCTGAGGAGCAAACAAGAGACTG
ATAAGAAGCTAAGTGACCCCTTGAGAGATGTTGAGTTGCTTAAGGAGAAGCTCACAGGTT
TAGAGTTAGCACAAGAGGAAGCTAATAGTTTGTCAAACATGGTTCACTTTGACAATGTCA
GGCTCGAGCATGATGTAGCGTTCCTAAGAGCTGTCCTAGACGATACACAGAAGGAGTTGC
ATTCCCCAAGAGGTGTTCTTGCAGGAGAAAGAGCAAGAGCGTTTCAGTTGCAGGTTGAAG
TGTTTCATTTGAAGCAAAGGTTGCAATTTTTGGAGAACAGAGCTGCTACACCAAGAAAGC
CTTTCCATGTTTAAACAAAGACCTGCGTGTAGTAGAGAGAAGACAAGACTTGCATTTGTA
ATCCTCAAGAGACGAATGAAAACTATTTTGTGTGTTTGTGGATTAATGTAAAAAGAAATT
AAGAAAACTCAATTATTT

QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 2

CO CL5705Contig1 1077 2 6 U
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TGGAATCTAAGCCTCAACCGAATGTGGATATCACCAGAAACGACAGTGTTGATGACGTTT
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ATATGTACCATGTCTCATGCGCGCGTCCCGGTGAGAAAGAGATGTCTTCAGACAGTTGGT
ATTGCCTAAACTGCACATCTGATGGATTAGGATGGCCTCACGAGAACTGCGTAGTGTGCG
AGAAAAAGAAAAACAAAAAGCTGATGGTAAAGACAGATAACGGATGTGTTGATGGAACGA
GTACAGAAGAGAATGCAAGAAGCTGCAACATGAATCAAGGAGGTGAGGAGAAGATAGATT
CTGAAGAACTCTGTAGGACCTGTGGAACAAAAGTGGAGAAAGGCGGCGGCGATGACAGGT
TCATCACATGTGATCACCCTTTCTGCCCACACAAGTATTACCACATCTGGTGTCTGACTT
CGAAGCAGATAAAGATACACAACGTTCGTTGGTACTGCTCCTCGTGCCTTTGCAGAAACT
GCTTAACCGACAAGGATGATGATAAGATTGTCTTGTGCGACGGGTGTGATGATGCTTACC
ACATCTACTGCATGAAACCTCCATGTGCATCGGTTCCAGAAGGAGAATGGTTTTGCACTA
CTTGCAAAGTTGCTATCCAGAAATTGCGCAAAATTCGAAATGTGGTTGATAAGAAGAAGG
TGGGGGCTTTGCAGAAGCAAAAAGGGAAGATGATAGAGAGCAAACCGGGAAGTAAAGGCA
ATGGAGGGTTGGATAATAGCGTAGGAGGAATGGATATGCTACTAAACGCAGCTGACACAT
TGAAAGATCAAGAACAGATGACTTCATAATCCATTAAACGAAGGATTGGTTCAGAAAAAA
AAAAGAACAGGCACTCTATACATTTCTTGTCTCTAAAAAACAATTTTTTCTTTTGTTCAT
CTTCCCTAATGTTTCAAAGCAGGACAGGGGTTTCTAAAGACCACATTTTTAGGATTA


BQ
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AF RS1BT89TF U 1
AF RS1BT89JQ C 322
BS 1 702 RS1BT89TF
BS 703 703 RS1BT89JQ
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BS 707 707 RS1BT89JQ
BS 708 752 RS1BT89TF
BS 753 1077 RS1BT89JQ

RD RS1BT89TF 758 0 0
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TGGAATCTAAGCCTCAACCGAATGTGGATATCACCAGAAACGACAGTGTTGATGACGTTT
GCAAGCTATGTGGAGAGAAGGCAGTGGTAAGCGAATGTTTAGCATGTGACCACTGTGAAG
ATATGTACCATGTCTCATGCGCGCGTCCCGGTGAGAAAGAGATGTCTTCAGACAGTTGGT
ATTGCCTAAACTGCACATCTGATGGATTAGGATGGCCTCACGAGAACTGCGTAGTGTGCG
AGAAAAAGAAAAACAAAAAGCTGATGGTAAAGACAGATAACGGATGTGTTGATGGAACGA
GTACAGAAGAGAATGCAAGAAGCTGCAACATGAATCAAGGAGGTGAGGAGAAGATAGATT
CTGAAGAACTCTGTAGGACCTGTGGAACAAAAGTGGAGAAAGGCGGCGGCGATGACAGGT
TCATCACATGTGATCACCCTTTCTGCCCACACAAGTATTACCACATCTGGTGTCTGACTT
CGAAGCAGATAAAGATACACAACGTTCGTTGGTACTGCTCCTCGTGCCTTTGCAGAAACT
GCTTAACCGACAAGGATGATGATAAGATTGTCTTGTGCGACGGGTGTGATGATGCTTACC
ACATCTACTGCATGAAACCTCCATGTGCATCGGTTCCAGAAG*AGA*TGGTTTTGCACTA
CTTGCAAAGTTGCTATCCAGAAATTGCGCAAA
TTCGAA

QA 1 752 1 752
DS 

RD RS1BT89JQ 756 0 0
TGATGGTAAAGACAGATAACGGATGTGTTGATGGAACGAGTACAGAAGAGAATGCAAGAA
GCTGCAACATGAATCAAGGAGGTGAGGAGAAGATAGATTCTGAAGAACTCTGTAGGACCT
GTGGAACAAAAGTGGAGAAAGGCGGCGGCGATGACAGGTTCATCACATGTGATCACCCTT
TCTGCCCACACAAGTATTACCACATCTGGTGTCTGACTTCGAAGCAGATAAAGATACACA
ACGTTCGTTGGTACTGCTCCTCGTGCCTTTGCAGAAACTGCTTAACCGACAAGGATGATG
ATAAGATTGTCTTGTGCGACGGGTGTGATGATGCTTACCACATTTACTGCATGAAACCTC
CATGTGCATCGGTTCCAGAAGGAGAATGGTTTTGCACTACTTGCAAAGTTGCTATCCAGA
AATTGCGCAAAATTCGAAATGTGGTTGATAAGAAGAAGGTGGGGGCTTTGCAGAAGCAAA
AAGGGAAGATGATAGAGAGCAAACCGGGAAGTAAAGGCAATGGAGGGTTGGATAATAGCG
TAGGAGGAATGGATATGCTACTAAACGCAGCTGACACATTGAAAGATCAAGAACAGATGA
CTTCATAATCCATTAAACGAAGGATTGGTTCAGAAAAAAAAAAGAACAGGCACTCTATAC
ATTTCTTGTCTCTAAAAAACAATTTTTTCTTTTGTTCATCTTCCCTAATGTTTCAAAGCA
GGACAGGGGTTTCTAAAGACCACATTTTTAGGATTA

QA 1 756 1 756
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5707Contig1 1018 2 2 U
GGAGGGAGAAGGGAGAAGGGAGAAGGGAGAAGGGAGAAGGGAGAAGATGTCGAGGCGAGA
GAGCAGAGGTTCAGAGCCTAAACGAGATCGTTCTAGATTCGATCGCGAATCCAGCCCTAA
GGGGTCTAGGAGAGATGCACAACCTGAAGCTGAAGGAGTTCTTCTGAGTAAGAAGGATTT
TGATGTTAGTACTGAGACAGATAAGAAGCCACGCCAGTCCCTGAGAGATCCTGCTCCACT
CGAACCTGATCCTCAGGGCTTGACAAAAGACGATGACAAGAAGACGACCAAACGAGCTCC
CCATCTGTCAGAAGGACCTCGTTCTAGACCTTACCATCAGCAGCATGATGATCGTCGTAC
TACTGGGAGAGGAGACAGAAGGCCAACTCCTGAGAGAGGATCTTGGAGAGGTTCGAGAGA
TCAGAGCAATCGTCGAGCTGGAGATGATCGTAGAGACCAAGACAAAAGCACTTGGCGACA
CGACAAGTTCCGTGAGAGTGACGACACCAAAGGAGCACTCTCTCGGAAACGCCCTGCCTT
CAGGGAGAAGAAGATTCCAGAGGAATCTAGGAACGGCACAGACAGAACAAGAACTGAGGA
GGCAAAAGACACGAATCTAAACACTCGCAGACAGAACGAGAGAAACTGGAGGAGCAACAA
CAATGAGAGACCGGCAATGGGAAGAGACAGGGTGTGGAACAGAGACGATGGAAGCAGACA
GAGTTATCGAGCTGATAGAGAGGTGGGATTCAACAGAAATGGACGAAGTGGTTTTCATGT
AAGCTGGACAAAGGCTGAGAAGAAATGGGACCATGACTTGTACGAGGAGGCGAACAAGAG
TCCTGGTAGAGCCAACGAGGAAGAACAGATTGCAAAGGTCGAAGCTTTGTTGGCTTCTTA
AAGCTATTGCTTATTGTTATGTTTCTTGGTGTGGATTTTGCATCTAATCTCTTTTAATGT
CTTAGTTTTGCAAGTGTAGAAGATAATCTCTGAGTTTATATAATGAAAAACTTTGTTC


BQ
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AF RS1CO82TF U 1
AF RS1CO82JQ C 566
BS 1 791 RS1CO82TF
BS 792 1018 RS1CO82JQ

RD RS1CO82TF 791 0 0
GGAGGGAGAAGGGAGAAGGGAGAAGGGAGAAGGGAGAAGGGAGAAGATGTCGAGGCGAGA
GAGCAGAGGTTCAGAGCCTAAACGAGATCGTTCTAGATTCGATCGCGAATCCAGCCCTAA
GGGGTCTAGGAGAGATGCACAACCTGAAGCTGAAGGAGTTCTTCTGAGTAAGAAGGATTT
TGATGTTAGTACTGAGACAGATAAGAAGCCACGCCAGTCCCTGAGAGATCCTGCTCCACT
CGAACCTGATCCTCAGGGCTTGACAAAAGACGATGACAAGAAGACGACCAAACGAGCTCC
CCATCTGTCAGAAGGACCTCGTTCTAGACCTTACCATCAGCAGCATGATGATCGTCGTAC
TACTGGGAGAGGAGACAGAAGGCCAACTCCTGAGAGAGGATCTTGGAGAGGTTCGAGAGA
TCAGAGCAATCGTCGAGCTGGAGATGATCGTAGAGACCAAGACAAAAGCACTTGGCGACA
CGACAAGTTCCGTGAGAGTGACGACACCAAAGGAGCACTCTCTCGGAAACGCCCTGCCTT
CAGGGAGAAGAAGATTCCAGAGGAATCTAGGAACGGCACAGACAGAACAAGAACTGAGGA
GGCAAAAGACACGAATCTAAACACTCGCAGACAGAACGAGAGAAACTGGAGGAGCAACAA
CAATGAGAGACCGGCAATGGGAAGAGACAGGGTGTGGAACAGAGACGATGGAAGCAGACA
GAGTTATCGAGCTGATAGAGAGGTGGGATTCAACAGAAATGGACGAAGTGGTTTTCATGT
AAGCTGGACAA

QA 1 791 1 791
DS 

RD RS1CO82JQ 453 0 0
TCTAGGAACGGCACAGACAGAACAAGAACTGAGGAGGCAAAAGACACGAATCTAAACACT
CGCAGACAGAACGAGAGAAACTGGAGGAGCAACAACAATGAGAGACCGGCAATGGGAAGA
GACAGGGTGTGGAACAGAGACGATGGAAGCAGACAGAGTTATCGAGCTGATAGAGAGGTG
GGATTCAACAGAAATGGACGAAGTGGTTTTCATGTAAGCTGGACAAAGGCTGAGAAGAAA
TGGGACCATGACTTGTACGAGGAGGCGAACAAGAGTCCTGGTAGAGCCAACGAGGAAGAA
CAGATTGCAAAGGTCGAAGCTTTGTTGGCTTCTTAAAGCTATTGCTTATTGTTATGTTTC
TTGGTGTGGATTTTGCATCTAATCTCTTTTAATGTCTTAGTTTTGCAAGTGTAGAAGATA
ATCTCTGAGTTTATATAATGAAAAACTTTGTTC

QA 1 453 1 453
DS 



AS 1 2

CO CL5708Contig1 637 2 1 U
GTAACAAGCTCTTCCCTTCCATCTCTGGTAAGGACTGAGCCTCTTATCATACCGTGTTTT
GCTCTCATCCAGCTGTCAGGCTTCAGATCTCAAATCTCCACGAGACTAGATCTTAATTGC
TTAGATGTTTCTTTACTCTACTCGTCTCAAGTGGTGCTTTCTGCCCTTGCGTGGATACTC
CTCAACGGCTGTAACATTATTTTAAAGATGTACGAAGGGTTCTTCGAGATGTATAAGCTG
AGATTATTGCAATATCAATTCTTTGTGAAGAATTTCCTTGTGGGTTCACCAACTCTGGTA
TGGGTTTTATCATCCTCCTCAAAAGAGGAGAGTATTTCACAACTATGCCTCCCTTCAATG
AACGGAGATGCTCTCTCGGATTCTCTGCTGAGTCCTTGTTTCAATTTACTCACCGGTTTG
TTACCTTGCGTAGCGGTCTGTACGGGGCCAGAAGGTGCAATCGAGACTACTTCGGTTTTT
CTCGTTGATGAGGGTTGTTCCTCAACGTCACTTGTGACTATTTCTCAGCTATCCGACTTT
GTTGTAGCTTCTTAGACGCATTCAAACTTTGTTTTGAATTTGCTGTCAACTTCATATGAA
GATTTATCCTGTTTGATTTCATTAGTTTGTGATTTGT


BQ
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AF RS1BQ73TF U 76
AF RS1FI43TF U 1
BS 1 637 RS1FI43TF

RD RS1BQ73TF 447 0 0
G
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TCTACTCGTCTCAAGTGGTGCTTTCTGCCCTTGCGTGGATACTCCTCAACGGCTGTAACA
TTATTTTAAAGATGTAC*AAGGGTTCTTCGAGATGTATAAGCTGAGATTATTGCAATATC
AATTCTTTGTGAAGAATTTCCTTGTGGGTTCACCAACTCTGGTATGGGTTTTATCATCCT
CCTCAAAAGAGGAGAGTATTTCACAACTATGCCTCCCTTCAATGAACGGAGATGCTCTCT
CGGATTCTCTGCTGAGTCCTTGTTTCAATTTACTCACCGGTTTGTTACCTTGCGTAGCGG
TCTGTACGGGGCCAGAAGGTGCAATCGAGACTACTTCGGTTTTTCTCGTTGATGAGGGTT
GTTCCTCAACGTCACTTGTGACTATT

QA 2 447 2 447
DS 

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GCTCTCATCCAGCTGTCAGGCTTCAGATCTCAAATCTCCACGAGACTAGATCTTAATTGC
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CTCAACGGCTGTAACATTATTTTAAAGATGTACGAAGGGTTCTTCGAGATGTATAAGCTG
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GTTGTAGCTTCTTAGACGCATTCAAACTTTGTTTTGAATTTGCTGTCAACTTCATATGAA
GATTTATCCTGTTTGATTTCATTAGTTTGTGATTTGT

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 2

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CCGGTAGTGGTTGGCTCAGGCTGCTTGTATAAATATGTGGACCGCAAAACTCTTCCCTAA
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GTGCGGAAGCAGCAATGGTGACGAAATTTTGAGCCC


BQ
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AF RS1CX58JQ U 27
AF RS1CX58TF C 1
BS 1 26 RS1CX58TF
BS 27 495 RS1CX58JQ
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CAATGTTGAAGTTGAAACCTTCTTCTAAAAAATGCCGGTAGTGGTTGGCTCAGGCTGCTT
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CGGAAACTCACCACGCCATCTTTAGATTCCGAAAATCCATCTTTAAACAGCCAGTAAAAA
CAATATCATTCATTCCTCAGTTCTCCATTAGTTTTGCAATTACAGCAGA

QA 1 469 1 469
DS 

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ATCTATGCAACCTCACCTTATCGCTGATTAGGTGTTCAGGGGCTTGAAAGTAGTCAAGCT
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CGAAAAACTTTGAAAACTCTATGATCCAATGTTGAAGTTGAAACCTTCTTCTAAGAGATG
CCGGTAGTGGTTGGCTCAGGCTGCTTGTATAAATATGTGGACCGCAGAGCTCTTCCCTAG
AATCGTGTGCTGATATCAGGGAAAGTCGGAGACTCACCACGCCATCTTTAGATTCCGAAA
ATCCATCTTTAAACAGCCAGTAAAAACAATATCATTCATTCCTCAGTTCTCCATTAGTTT
TGCAATTACAGCAGAGTTTCTTGCGATATTGATAGATCCTCACTGCCCCGAAACGGATGC
GTGGCTCGAAAATCTGTGGGGAAGACCATCCGTTATGCAGATTGTCTAAAGTGATGTAAG
GTGCGGAAGCAGCAATGGTGACGAAATTTTGAGCCC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

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ATAAAGGTTTGGAACAACTCCAATGGTCACTACAAGAAAACACGCAGATACTATTCCGTA
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TGTGAGGACGAGGGTTCGTCACAAAAATCCTCAAAATTTTCCTAGGGACGTAGTCGTCGA
AATATTCTGAGGGAACCTTTTTCTCGGAATTTTC


BQ
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AF RS1DJ87JQ C 1
AF RS1DJ87TF U 1
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BS 442 454 RS1DJ87JQ

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ATAAAGGTTTGGAACAACTCCAATGGTCACTACAAGAAAACACGCAGATACTATTCCGTA
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CCTCGAAATTTTTTCGAAATTTTTTGACGAAATTTCGAGGAACAATAATTCCGAGGAAAC
TGTGAGGACGAGGGTTCGTCACAAAAATCCTCAAAATTTTCCTAGGGACGTAGTCGTCGA
AATATTCTGAGGGAACCTTTTTCTCGGAATTTTC

QA 1 454 1 454
DS 

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AGGACTAATTGAGACTTGTGACAGTCCACCTTATGATCATGTATGTAAGACATGACCAAA
ATAAAGGTTTGGAACAACTCCAATGGTCACTACAAGAAAACACGCAGATACTATTCCGTA
TTCCGACGACATACCGAGGAAAAAGATCCTCGAATAAAAACTCCTCGAAATTTCATTTTC
CCTCGAAATTTTTTCGAAATTTTTTGACGAAATTTCGAGGAACAATAATTCCGAGGAAAC
TGTGAGGACGAGGGTTCGTCACAAAAATCCTCAAAATTTTCCTAGGGACGTAGTCGTCGA
AATATTCTGAGGGAACCTTTT

QA 1 441 1 441
DS 



AS 1 2

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GAAAAAATAGTAAAATCACAAATGAAACGCAAATGTAAATTTGAAGATGTGCTCCCCAAC
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TCCATTCATCAGCTTGTCTAAAACAGTATTCAGGTCCACAGCTTGACCGTTCTCAGTCAA
CGACCTCACTGTTCCTCTCACTTGGTCTCTTGGGAACCCCATGCTACTCACTTTGTCGAT
CACATCGTCCACTGGGACATTACTTCCGGCTCTTGGCGAACCTGATCCTCCCCCACTTCC
ACCGCTGCTGATAGCTGTAGCCATTGGTAAAGCTTGTGGTAGTGGGCGAGCCATAGGGAT
TTGCGGATAACCAGATCCGCCTCCTCCACTCTGATGCGACGATTTCAGTGACTGGGTGTT
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CGGGTAAGACTGCATAGGGTAAGGTGGTTCCTCCGGGTTGTAGCCTGACGACGGTTGTTG
AAGCTGAGGAGGTTGCTGTTGGGGGTACTGCGGCTGTTGAGGAGGTGGCTGGTAAGGTGG
TTGATGGGTTTGAGGAGGTTGAGGTTGATAAGGAGGATTGTTCACCGGAGGAGGCGGCTG
GGACTGACCACCACCAGGTGGGGAGAAATAAGACTCCTGTTGGGGAGGAAACTGC


BQ
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AF RS1BJ20JQ U 1
AF RS1A721TF C 208
BS 1 411 RS1BJ20JQ
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GAAAAAATAGTAAAATCACAAATGAAACGCAAATGTAAATTTGAAGATGTGCTCCCCAAC
TAGCGATCCATCATGGAGGGAGATGAGACTCTATACAAATGTCATGAGAGGGAGACGCAG
CTAACGACCCCCAAACCAACCTCTTGGTGGTTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGCGTCACACC
TCCATTCATCAGCTTGTCTAAAACAGTATTCAGGTCCACAGCTTGACCGTTCTCAGTCAA
CGACCTCACTGTTCCTCTCACTTGGTCTCTTGGGAACCCCATGCTACTCACTTTGTCGAT
CACATCGTCCACTGGGACATTACTTCCGGCTCTTGGCGAACCTGATCCTCCTCCACTTCC
ACCGCTGCTGATAGCTGTAGCCATTGGTAAAGCTTGTGGTAGTGGGCGAGCCATAGGGAT
TTGCGGATATCCAGATCCGCCTCCTCCACTCTGATGCGACGATTTCAGTGACTGGGTGTT
GCCAAACTGTGAAGAGGGTGGAGTGGTATACGGGTAAGTTTCAGGAGAGTACCCGGAAGA
GAAACCTGAACTGGATCTACCACCTGGTCCGTCGTACATTGATGGTGGCGTTGGAGGACC
ATTG

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DS 

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ATTCAGGTCCACAGCTTGACCGTTCTCAGTCAACGACCTCACTGTTCCTCTCACTTGGTC
TCTTGGGAACCCCATGCTACTCACTTTGTCGATCACATCGTCCACTGGGACATTACTTCC
GGCTCTTGGCGAACCTGATCCTCCCCCACTTCCACCGCTGCTGATAGCTGTAGCCATTGG
TAAAGCTTGTGGTAGTGGGCGAGCCATAGGGATTTGCGGATAACCAGATCCGCCTCCTCC
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ATACGGGTAAGTTTCAGGAGAGTACCCGGAAGGGAAACCTGAACTGGATCTACCACCTGG
TCCGTCGTACATTGATGGTGGCGTTGGAGGACCATTGTAGTACTGTTGAGATGGGGCGGG
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TTCCTCCGGGTTGTAGCCTGACGACGGTTGTTGAAGCTGAGGAGGTTGCTGTTGGGGGTA
CTGCGGCTGTTGAGGAGGTGGCTGGTAAGGTGGTTGATGGGTTTGAGGAGGTTGAGGTTG
ATAAGGAGGATTGTTCACCGGAGGAGGCGGCTGGGACTGACCACCACCAGGTGGGGAGAA
ATAAGACTCCTGTTGGGGAGGAAACTGC

QA 1 748 1 748
DS 



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ACATGGTTATGAACTGCAAGGCACACAAACAAATCAAAGGCTGTTGGAAAGAAATAGCTA
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AAGGATCTAAAGGGGTATGGACCAAAGAGGATTGGAGCTCGTTGTGCAGCATCAGAAGAA
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AGACGCTTGGAGGAGGATTAGACTGGCGTCCAAGAAGAAAGGACATTGGTCTATGGAGGA
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CGGAACAAGGGACCGTGCCGTTTGCTGCGTGAAATGGTATGATCAGTTGACATCACCGAT
GGTGGCCAATGGGATGTGGGCTAACGTGGATGACTATAGGCTCTTGGACGAGCTTACGAA
TCTGGATGCTGCTTGTGTCGACGACGTGGATTGGGATAATCTTTTGGATAATAGAGATGG
AGATGCTTGTAGAAGTCGGTGGAACCAAATGGTGAATCATATCGGATTGCCTGGAAGCAA
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TTATGTTATACTTTAATGTAAGTTGTGTTTGTGAGCTTGAAAAACTATGTTTAAGGTTTT
CGATCGGGATTCTCTTTGCTTCTCTATTTTCTTAGCATTAATGTTTATCAGTCATAGGAT
ATCTAGTGAATGCATCCATAAATTATTTGTG


BQ
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AF RS1AS21TF U 1
AF RS1AS21JQ C 505
BS 1 699 RS1AS21TF
BS 700 700 RS1AS21JQ
BS 701 729 RS1AS21TF
BS 730 730 RS1AS21JQ
BS 731 740 RS1AS21TF
BS 741 1291 RS1AS21JQ

RD RS1AS21TF 740 0 0
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AAAGTGAAGATCCAGAGGCTGAAGTAAACAAGGAGAAAAGGAAGAAGAAGAAGAAGCAGA
AGGGTAGTAAGAGTGATGAAGTTGTGACCACCCCATCACCCAAAACCGCTAAAAAGGTAA
ACTTTTCCGACCAAGTTGAAGTTTTTCCTGCGGAGTCTGAAGAAAGCGATGATGAAGAAG
AAGAAGAAGAAAAAGTTGACCTGGTGAGGGGTAAGCGGTTTACAAAGGAAGAAGACGAGC
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CTGCTTTACCCTGGAGGCCATACCTTGGTGTCTACTATCGTGCGCATACTTTGTTTGAAG
AAGGATCTAAAGGGGTATGGACCAAAGAGGATTGGAGCTCGTTGTGCAGCATCAGAAGAA
ACGCGGCAACGATTGGAGGACTCTCGCGGATGCCATGGGTAAACACAGGAACCATGTTAA
AGACGCTTGGAGGAGGATTAGACTGGCGTCCAAGAAGAAAGGACATTGGTCTATGGAGGA
GTACCAAAGCCTCTTTGATCTTGTCAACAGAGACCTTAG*ATAAAAGCGTTCAAAGAGAA
GCACTCTAA*CATGGGATGC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RS1AS21JQ 787 0 0
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CGCGGATGCCATGGGTAAACACAGGAACCATGTTAAAGACGCTTGGAGGAGGATTAGACT
GGCGTCCAAGAAGAAAGGACATTGGTCTATGGAGGAGTACCAAAGCCTCTTTGATCTTGT
CAACAGAGACCTTAGGATAAAAGCGTTCAAAGAGAAGCACTCTAAACATGGGATGCTCAG
GGATAACATCCCTTGGATGGCTATAAGCGACCAGCTCGGAACAAGGGACCGTGCCGTTTG
CTGCGTGAAATGGTATGATCAGTTGACATCACCGATGGTGGCCAATGGGATGTGGGCTAA
CGTGGATGACTATAGGCTCTTGGACGAGCTTACGAATCTGGATGCTGCTTGTGTCGACGA
CGTGGATTGGGATAATCTTTTGGATAATAGAGATGGAGATGCTTGTAGAAGTCGGTGGAA
CCAAATGGTGAATCATATCGGATTGCCTGGAAGCAAAACGTTTGCAGAACAAGTTGAGGT
TCTGTCTCAAAGGTATTGCCCTGACATAGCTGAAGACAGAGAAGACTTTGACAACAGACC
TTTTGATCCTGAAGATTAATCAAGTCTAGTAAGAGTTTATGTTATACTTTAATGTAAGTT
GTGTTTGTGAGCTTGAAAAACTATGTTTAAGGTTTTCGATCGGGATTCTCTTTGCTTCTC
TATTTTCTTAGCATTAATGTTTATCAGTCATAGGATATCTAGTGAATGCATCCATAAATT
ATTTGTG

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

CO CL5713Contig1 1260 2 8 U
GTCGATGATTCATATCGTCATCTCCCTATTCTCTACTTGACTTTTCTATCGATCTGGTCT
CTCTCCGCTTGTTCTTGGACCGTTAACACTTTCAAGAACCGCAATTTTCAGACAAATAGT
TTACAATGGATTCTTGCTTCAGTTCCTCTGATCAAAGCATTACAGCTAACTCTATCTTTC
CTCTTTTGGCATTCATGTTTTCATCACCAAATATGCTCTCTCTGGATGTCTTTTGGTGTA
TATGTGACTGGTGTTCTGTTTCAGGCGGCTTCCTTTGTGTCTTTTTTACTCATCTCTCAC
GGTTATTGCATCACATGTGAACGGCTCTCGTTGACGGAACGTAGAACCACAGCTTCACTT
GGTTGTGTCTTTTACTTGACTCTCGTCGGATACAGAGCTTCTGTTCCTTATTTCGCAGTG
CTTCTGATACTTAACTACATGATCTCATTCTATGTGATTTTCCACCATATATCTCAAAAC
TTATCGGTGTTACGAGAACAGCTGAGTTTCATTGAGGATGAGAATGTTCAAGCTATGCAT
GATGCTGTATATGCTAAATACATCATGTTCAAAAAGTTCCAAGGAGCTATGCAGATAGTA
GCAATGGCAGAAACTGTGATCTATATGAACATGGATAACTCCTCACAGAACTATTGGCTC
AGGCTACTGATTCGAGAGTGGGCTCAGTTTTGCATTTTTCTCTATATTGGCTGGACTTTC
AGGTCTCAGGACATGGCACCACGGTTCTCGGTCATGCCTACGCTAAAACCCAAAGATCAT
ACAATCATTCCTCCAATTTACAGCATGGAAATGGATGCAAAAGCATTTAAAGAATTCAGA
AGTCATGAATGGAACATTGGAGTGCCAATGCCGCATTCAAACTATGAAAGGCACAAAGAT
TCAGTTCTAGTGATAATACAGCATCCACGATAGCATTCAGACACAAAGCCACATATACAG
CGCTGCCTCTCTCTTTTATCTTCCTAGAAAGGGCAAAAATTCACACAAACGGACAAAGAA
ACAAAGTTTCTTCTTCCTCAGCAACTAGCAACTGCATTGTTCTATCCTCACAGCCTTCTC
TGCCTACATCAACTACATCTCTCTCTCTCTCTTTTATATCTTATGTTTTAGTTTTGTTTC
TTGGTTTTCTCTCTTTTGGGTATATTATATAGAGAAATAAAGGTATACTTTCTTGTATAG
ATGCAAAAGTTAACTAGTAGAGTTATAACATTTCTAATGAGAATGTTAACATAGTTCCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FZ36TF U 1
AF RS1FZ36JQ C 515
BS 1 662 RS1FZ36TF
BS 663 663 RS1FZ36JQ
BS 664 722 RS1FZ36TF
BS 723 723 RS1FZ36JQ
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BS 731 755 RS1FZ36TF
BS 756 1260 RS1FZ36JQ

RD RS1FZ36TF 755 0 0
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CTCTCCGCTTGTTCTTGGACCGTTAACACTTTCAAGAACCGCAATTTTCAGACAAATAGT
TTACAATGGATTCTTGCTTCAGTTCCTCTGATCAAAGCATTACAGCTAACTCTATCTTTC
CTCTTTTGGCATTCATGTTTTCATCACCAAATATGCTCTCTCTGGATGTCTTTTGGTGTA
TATGTGACTGGTGTTCTGTTTCAGGCGGCTTCCTTTGTGTCTTTTTTACTCATCTCTCAC
GGTTATTGCATCACATGTGAACGGCTCTCGTTGACGGAACGTAGAACCACAGCTTCACTT
GGTTGTGTCTTTTACTTGACTCTCGTCGGATACAGAGCTTCTGTTCCTTATTTCGCAGTG
CTTCTGATACTTAACTACATGATCTCATTCTATGTGATTTTCCACCATATATCTCAAAAC
TTATCGGTGTTACGAGAACAGCTGAGTTTCATTGAGGATGAGAATGTTCAAGCTATGCAT
GATGCTGTATATGCTAAATACATCATGTTCAAAAAGTTCCAAGGAGCTATGCAGATAGTA
GCAATGGCAGAAACTGTGATCTATATGAACATGGATAACTCCTCACAGAACTATTGGCTC
AG*CTACTGATTCGAGAGTGGGCTCAGTTTTGCATTTTTCTCTATATTGGCTGGACTTTC
AG*TCTCAG*ACATGGCACCACGGTTCTCGGTCAT

QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1FZ36JQ 746 0 0
AGGATGAGAATGTTCAAGCTATGCATGATGCTGTATATGCTAAATACATCATGTTCAAAA
AGTTCCAAGGAGCTATGCAGATAGTAGCAATGGCAGAAACTGTGATCTATATGAACATGG
ATAACTCCTCACAGAACTATTGGCTCAGGCTACTGATTCGAGAGTGGGCTCAGTTTTGCA
TTTTTCTCTATATTGGCTGGACTTTCAGGTCTCAGGACATGGCACCACGGTTCTCGGTCA
TGCCTACGCTAAAACCCAAAGATCATACAATCATTCCTCCAATTTACAGCATGGAAATGG
ATGCAAAAGCATTTAAAGAATTCAGAAGTCATGAATGGAACATTGGAGTGCCAATGCCGC
ATTCAAACTATGAAAGGCACAAAGATTCAGTTCTAGTGATAATACAGCATCCACGATAGC
ATTCAGACACAAAGCCACATATACAGCGCTGCCTCTCTCTTTTATCTTCCTAGAAAGGGC
AAAAATTCACACAAACGGACAAAGAAACAAAGTTTCTTCTTCCTCAGCAACTAGCAACTG
CATTGTTCTATCCTCACAGCCTTCTCTGCCTACATCAACTACATCTCTCTCTCTCTCTTT
TATATCTTATGTTTTAGTTTTGTTTCTTGGTTTTCTCTCTTTTGGGTATATTATATAGAG
AAATAAAGGTATACTTTCTTGTATAGATGCAAAAGTTAACTAGTAGAGTTATAACATTTC
TAATGAGAATGTTAACATAGTTCCCT

QA 1 746 1 746
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5715Contig1 791 2 7 U
TCATGCTCAGACACTGCCGCCGTGAAGGTAGGGAGCCAGAGCTCTACACGAGTACCGCCA
GCTCTATGCTGCATCGTGGATACGAGGTGAGATAACCCTGATCACGCATCCGTAACTCTC
CAGGAACTCTCGTGCTACGGTTAAACCCGCCACAAAATTCCATGTCATATTGTCTTCAAC
CATGTTCTCCGACAAGAGTTCTGCTCCAAATGGTGTTAGCGAATGCATTTGCGTCATATA
GCGCATATCAGGACCATCGTCATCGATTACTACCAGACTACCGCCAGCAGGAGCTCTGGT
CGACAAGATTTCAACTTTTCCTCCAACATGAGTGCGCAACAGAACACCTTCAATGAGGTT
ACTCAGAACCTGCCTCAAAGCCGGTTCTTCAACAGCAACTTGAAGGGAAGCTGAGTTTTC
ACCTAGCTCCACCACTCTTTGCTGAGTAAGGGCAAGTGGTCTCACAGTCTCGACCATATC
TAAAAGCACACTAGAAATGTCGCATGGTCTTATGCTACGCGTTTTTAGGGGTGCCAGTGC
TAAAGGTGGCATAGGCATTTCTGAATCATCAGATCCAGAACCCAGGGAAAGGCGTGTACT
TGTGATCTGTGACCCATCGATGGGGTCCTTTTGTTCATAGTCATCGGAATAACTTGATCT
CATTGTTTCATTATGTGTTTTGCTCATCTTCTTCAATACTTCTTCGTTGTGGCGGACTAT
ATTGGCCTTTGTCAAGTGAACTGCATCCTGAAGTTCTTGAAGGGTATCTCTTATTTGTTC
GCCTTGGACTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AB81JQ U 106
AF RS1AB81TF C 1
BS 1 105 RS1AB81TF
BS 106 156 RS1AB81JQ
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RD RS1AB81JQ 466 0 0
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QA 1 466 1 466
DS 

RD RS1AB81TF 791 0 0
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GCGCATATCAGGACCATCGTCATCGATTACTACCAGACTACCGCCAGCAGGAGCTCTGGT
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ACCTAGCTCCACCACTCTTTGCTGAGTAAGGGCAAGTGGTCTCACAGTCTCGACCATATC
TAAAAGCACACTAGAAATGTCGCATGGTCTTATGCTACGCGTTTTTAGGGGTGCCAGTGC
TAAAGGTGGCATAGGCATTTCTGAATCATCAGATCCAGAACCCAGGGAAAGGCGTGTACT
TGTGATCTGTGACCCATCGATGGGGTCCTTTTGTTCATAGTCATCGGAATAACTTGATCT
CATTGTTTCATTATGTGTTTTGCTCATCTTCTTCAATACTTCTTCGTTGTGGCGGACTAT
ATTGGCCTTTGTCAAGTGAACTGCATCCTGAAGTTCTTGAAGGGTATCTCTTATTTGTTC
GCCTTGGACTC

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 2

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GCGATATTGAAAGAAAGAAAGAAAAGAGATAATAATATCAATAATGGGTAGATGGGCAAT
CGCAGTACACGGCGGCGCCGGAATCGACCCTAATCTTCCCGTAGAGAGACAAGAACAGGC
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TGCCATTGACGTCGTTGAGCTCGTCATTAGAGAATTAGAGACGGATCCTTTGTTCAACTC
GGGCCGTGGATCTGCTTTGACGGAACAAGGAACGGTGGAGATGGAAGCGAGCATTATGGA
CGGTACGAAGAGACGATGCGGCGCCGTTTCGGGGATAACCACCGTGAAGAATCCTATCTC
TCTCGCTCGTCTCGTTATGGACAAATCTCCCCACTCTTATCTAGCCTTCTCAGGCGCGGA
GGAGTTCGCTCGTAAACAGGGAGTTGAGATTGTAGACAACGAGTACTTTGCCACGGAAGA
CAACGTGGGGATGCTTAAGCTGGCCAAAGAAGCTAACTCAATCTTGTTTGATTACCGTAT
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CGCTGGACTTATTGCTGTGTCGAATAAAGGAGAGGTGGTTTGTGGTTTTAATTGTAATGG
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GAGATTTTATTTATTTATTTATTTTAAATGGCTTAGTGTGCTATTATTATCATCATCCCT
TCTTTGTTGCTTAGTACCTTTTCATGAATCCAAATCTCGATGTACTTGTGGACACGATCT
CTGAAAGTTTTAAGCAGCTCCATTCCATGCT


BQ
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AF RS1E065TF U 1
AF RS1E065JQ C 442
BS 1 676 RS1E065TF
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CGCAGTACACGGCGGCGCCGGAATCGACCCTAATCTTCCCGTAGAGAGACAAGAACAGGC
GAAACAGCTTTTAACTCGTTGTCTTAACCTCGGCATAGCAGCTTTACGCTCTAACGTCTC
TGCCATTGACGTCGTTGAGCTCGTCATTAGAGAATTAGAGACGGATCCTTTGTTCAACTC
GGGCCGTGGATCTGCTTTGACGGAACAAGGAACGGTGGAGATGGAAGCGAGCATTATGGA
CGGTACGAAGAGACGATGCGGCGCCGTTTCGGGGATAACCACCGTGAAGAATCCTATCTC
TCTCGCTCGTCTCGTTATGGACAAATCTCCCCACTCTTATCTAGCCTTCTCAGGCGCGGA
GGAGTTCGCTCGTAAACAGGGAGTTGAGATTGTAGACAACGAGTACTTTGCCACGGAAGA
CAACGTGGGGATGCTTAAGCTGGCCAAAGAAGCTAACTCAATCTTGTTTGATTACCGTAT
CCCGCTAGGATGCGCCGGTGCAGCCGTAACCGACAGTCCTATAGTGATGAACGGTCTACC
GATAAGCATTTACGCG

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1E065JQ 790 0 0
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AGTTGAGATTGTAGACAACGAGTACTTTGCCACGGAAGACAACGTGGGGATGCTTAAGCT
GGCCAAAGAAGCTAACTCAATCTTGTTTGATTACCGTATCCCGCTAGGATGCGCCGGTGC
AGCCGTAACCGACAGTCCTATAGTGATGAACGGTCTACCGATAAGCATTTACGCGCCGGA
GACGGTAGGATGCGTGGTGGTTGACAGAGAAGGACGGTGCGCCGCCGGGACATCAACGGG
AGGTCTAATGAACAAGATGATGGGGAGGATAGGAGACTCGCCGTTGATAGGAGCCGGGAC
GTATGCGTCTGAGCTTTGTGGCGTGTCGTGTACCGGAGAAGGAGAAGCTATCATAAGGTC
GACGCTGGCGCGTGACGTGTCGGCTGTTATGGAGTATAAAGGGGTCGGGCTTCAGGAAGC
GGTTGATTATGTGATCAAGCATCGACTGGACGAAGGGTTCGCTGGACTTATTGCTGTGTC
GAATAAAGGAGAGGTGGTTTGTGGTTTTAATTGTAATGGGATGTTCAGAGGATGTGCAAC
TGAAGATGGGTTCATGGAAGTTGCTATGTGGGAGTGAGAGAGATTTTATTTATTTATTTA
TTTTAAATGGCTTAGTGTGCTATTATTATCATCATCCCTTCTTTGTTGCTTAGTACCTTT
TCATGAATCCAAATCTCGATGTACTTGTGGACACGATCTCTGAAAGTTTTAAGCAGCTCC
ATTCCATGCT

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 2

CO CL5717Contig1 960 2 2 U
GCCTCTTCTTCGTCTGATGTTCATTACGTTAGAGTTTTGGATTCCTTGTTTGGCTGCTGC
GTTTGGTTGAAAGGCGAGGGTCCTCGTGGTGGTAGTGTCACTCATGGTCTGATGATTCTT
CATTTGGCCGAGTGGGTTGTGTCAGGTTACATGAGGTCTAACTATGTAGACAAGATGTCT
CTTTTTGCGAACGAGGTACTAGAGACTTCCAAGGCAAACTACACTGTTTTTGCTGTCCTC
ATGGCAGCAGCGGGAGTACTGAGAGCTTCCGCGGCAGGATCCAGTGGTGGTTCACAGAAT
CTTGAGGTTGTTTCCAAATTTAGAAACTCAGCGGAGAAACGTTTAGAAGCTGTAGCTCAG
ATTTTAGTTGCTAATGGTACTGTTACACCTCCAACCGCTCATAGAGATGATCTTCTATTG
AAGTGCTTTGCTATAGCATCTGCTCGATGTGGGGCCGTTTCTCACTCTGCTCCTCTGCTT
CTGTGCCTCGCTTCTGCATTGTTAACTCAGGTGTTCCCTTTAAGCCAGATATATGAATCT
TTTGGTAAAGATCCTTTTGGACCAAGACTCATTTGGGTCAGAGAGCATCTTTCTGATGTT
CTCTTCAAGGAATCAGGAGCCATAACTGGGGCTTTCTGCAATCAATACGCAAAAGCAAAT
GAAGAGAACAAATATATTGTGGAGAATATGATTTGGGATTTCTGTCAAAACCTCTACTCA
CAGTACCGTCAGATTGCTCTGTTGCTTCGTGGCTTAGAAGATGCATTACTTGGAGACATA
GAGAAGATTGCAGAGTCATCTTTCCTTATGGTTGTCGTCTTCGCGCTAGCTGTTACGAAA
CAATGGTTGAATCCAACAGTGTCTGAAGAAAGAAAGATGGAGACATCAGTGAAGATATTA
GTTTCATTCTCATGTGTAGAGTATTTCAGACATATTCGTTTACCTGAATACATGGAGACA


BQ
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AF RS1GJ05TF U 369
BS 1 599 RS1GH10TF
BS 600 960 RS1GJ05TF

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CTTTTTGCGAACGAGGTACTAGAGACTTCCAAGGCAAACTACACTGTTTTTGCTGTCCTC
ATGGCAGCAGCGGGAGTACTGAGAGCTTCCGCGGCAGGATCCAGTGGTGGTTCACAGAAT
CTTGAGGTTGTTTCCAAATTTAGAAACTCAGCGGAGAAACGTTTAGAAGCTGTAGCTCAG
ATTTTAGTTGCTAATGGTACTGTTACACCTCCAACCGCTCATAGAGATGATCTTCTATTG
AAGTGCTTTGCTATAGCATCTGCTCGATGTGGGGCCGTTTCTCACTCTGCTCCTCTGCTT
CTGTGCCTCGCTTCTGCATTGTTAACTCAGGTGTTCCCTTTAAGCCAGATATATGAATCT
TTTGGTAAAGATCCTTTTGGACCAAGACTCATTTGGGTCAGAGAGCATCTTTCTGATGT

QA 1 599 1 599
DS 

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G
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GCTATAGCATCTGCTCGATGTGGGGCCGTTTCTCACTCTGCTCCTCTGCTTCTGTGCCTC
GCTTCTGCATTGTTAACTCAGGTGTTCCCTTTAAGCCAGATATATGAATCTTTTGGTAAA
GATCCTTTTGGACCAAGACTCATTTGGGTCAGAGAGCATCTTTCTGATGTTCTCTTCAAG
GAATCAGGAGCCATAACTGGGGCTTTCTGCAATCAATACGCAAAAGCAAATGAAGAGAAC
AAATATATTGTGGAGAATATGATTTGGGATTTCTGTCAAAACCTCTACTCACAGTACCGT
CAGATTGCTCTGTTGCTTCGTGGCTTAGAAGATGCATTACTTGGAGACATAGAGAAGATT
GCAGAGTCATCTTTCCTTATGGTTGTCGTCTTCGCGCTAGCTGTTACGAAACAATGGTTG
AATCCAACAGTGTCTGAAGAAAGAAAGATGGAGACATCAGTGAAGATATTAGTTTCATTC
TCATGTGTAGAGTATTTCAGACATATTCGTTTACCTGAATACATGGAGACA

QA 2 592 2 592
DS 



AS 1 2

CO CL5718Contig1 1075 2 2 U
GGACTCCCTTCTTCTATCTCTCACAATTCTCCCTCTAATGGCTTCTTCAATAATAACCTC
AAGCTTGAGGCCATTAGCCATGTCAGAATCCTCCTCCTCGACTATCTTCTCCCACCCTTC
AATCTCCACTATCTACTCCTCCAAAACCCGCTGCTCCTTACTCACCAAACGCACTAATCT
CCCTCTCTCCTTCTCTCTCAAATCCAAAACCCATCTAAAGAAGTCACCTTTCGTTACCTT
AGTCGCCGAGACTTCGGATTGGTCCGGGGAAGAAGATGGGAGCTCATCATCGGTCGCCGT
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AGGAGACTTCCAGGAGCCACCGGAAGAAGCGAAGCTCTTCGTCGGGAACTTGTCTTACGA
CGTTGACAGCCAGGCCTTGGCTATGCTCTTTGAGCAAGCCGGTACTGTTGAAATCGCCGA
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GGTTGAAGAAGCTGAGACAGCCGTTGAGAAGTTTAACCGTTATGATTTGAACGGAAGGCT
TTTGACAGTAAACAAGGCAGCTCCCAAAGGATCACGTCCAGAGCGTCAACCTCGGGTATA
CGAACCTGCATTCAGAGTGTATGTTGGAAACCTACCGTGGGATGTGGACAGTGGTCGTCT
AGAACAAGTTTTCAGTGAGCACGGCAAAGTTGTGGAAGCTAAAGTGGTTTATGACCGTGA
GACAGGTCGTTCACGTGGATTTGGTTTTGTGACAATGTCTAATGAGACTGAACTCAATGA
TGCCGTCGCTGCTCTTGACGGACAGAACATGGAGGGTAGAGCGATCAGAGTAAATGTAGC
GGAGGAGCGTCCAAGGCGTGGATTTTAAGGGACTGAGAAGTTCTCTCCTGTACCCTCTCT
GTCTCTTGCATTTTGTCTAGAAGGGATTCATCACACTTTTGGTGATTTTTTTTTTTGGTC
AGAACTCTGAATGCGAAGCTTCTTCTAAATTCTAATGTAATTTGTATAATCATTC


BQ
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AF RS1CY15TF U 1
AF RS1CY15JQ C 302
BS 1 739 RS1CY15TF
BS 740 1075 RS1CY15JQ

RD RS1CY15TF 739 0 0
GGACTCCCTTCTTCTATCTCTCACAATTCTCCCTCTAATGGCTTCTTCAATAATAACCTC
AAGCTTGAGGCCATTAGCCATGTCAGAATCCTCCTCCTCGACTATCTTCTCCCACCCTTC
AATCTCCACTATCTACTCCTCCAAAACCCGCTGCTCCTTACTCACCAAACGCACTAATCT
CCCTCTCTCCTTCTCTCTCAAATCCAAAACCCATCTAAAGAAGTCACCTTTCGTTACCTT
AGTCGCCGAGACTTCGGATTGGTCCGGGGAAGAAGATGGGAGCTCATCATCGGTCGCCGT
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AGGAGACTTCCAGGAGCCACCGGAAGAAGCGAAGCTCTTCGTCGGGAACTTGTCTTACGA
CGTTGACAGCCAGGCCTTGGCTATGCTCTTTGAGCAAGCCGGTACTGTTGAAATCGCCGA
GGTTATATACAACAGGGAAACCGACCAGAGTCGTGGGTTTGGGTTTGTGACAATGAGTAC
GGTTGAAGAAGCTGAGACAGCCGTTGAGAAGTTTAACCGTTATGATTTGAACGGAAGGCT
TTTGACAGTAAACAAGGCAGCTCCCAAAGGATCACGTCCAGAGCGTCAACCTCGGGTATA
CGAACCTGCATTCAGAGTGTATGTTGGAAACCTACCGTGGGATGTGGACAGTGGTCGTCT
AGAACAAGTTTTCAGTGAG

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1CY15JQ 774 0 0
GAGGAGAGCGACCCAGAAGAAGCCGCGTTTTCTGAAGGGGAAGGAGACGTGAGCGAAGGA
GGAGACTTCCAGGAGCCACCGGAAGAAGCGAAGCTCTTCGTCGGGAACTTGTCTTACGAC
GTTGACAGCCAGGCCTTGGCTATGCTCTTTGAGCAAGCCGGTACTGTTGAAATCGCCGAG
GTTATATACAACAGGGAAACCGACCAGAGTCGTGGGTTTGGGTTTGTGACAATGAGTACG
GTTGAAGAAGCTGAGACAGCCGTTGAGAAGTTTAACCGTTATGATTTGAACGGAAGGCTT
TTGACAGTAAACAAGGCAGCTCCCAAAGGATCACGTCCAGAGCGTCAACCTCGGGTATAC
GAACCTGCATTCAGAGTGTATGTTGGAAACCTACCGTGGGATGTGGACAGTGGTCGTCTA
GAACAAGTTTTCAGTGAGCACGGCAAAGTTGTGGAAGCTAAAGTGGTTTATGACCGTGAG
ACAGGTCGTTCACGTGGATTTGGTTTTGTGACAATGTCTAATGAGACTGAACTCAATGAT
GCCGTCGCTGCTCTTGACGGACAGAACATGGAGGGTAGAGCGATCAGAGTAAATGTAGCG
GAGGAGCGTCCAAGGCGTGGATTTTAAGGGACTGAGAAGTTCTCTCCTGTACCCTCTCTG
TCTCTTGCATTTTGTCTAGAAGGGATTCATCACACTTTTGGTGATTTTTTTTTTTGGTCA
GAACTCTGAATGCGAAGCTTCTTCTAAATTCTAATGTAATTTGTATAATCATTC

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL5719Contig1 1100 2 2 U
GGACGCCCCCTCCCTCGACCGTACCAAATTGATCGTAGATAGGAGCTCTGAGAAAACGAT
TTGCTGAGAGATAAGAGAGAGATGAGTTTTCAAGATTTAGAAGCTGGAAGAGGAAGATCG
AGGAAGACCAATGGTGGTGGTGGTGGTGGTCGGCAAGATTCGACGCAAGCCGTGGCTTCG
GGAATATTCCAGATCAATACCGGAGTTTCCACGTTTCAACGTCTCGTCAACACGCTCGGT
ACTCCCAGAGACACGCCTGAGCTCCGTGATAAGCTGCACAAGACACGGTTGCATATAGGG
CAGCTTGTGAAGGACACGTCAGCTAAACTTAAAGAAGCTAGTGAAACTGATCATCAAACT
GGTGTCAATCCAAGTAAGAAGATTGCAGATGCTAAGCTTGCAAAGGACTTTCAAGCTGTG
TTGAAAGAGTTTCAGAAAGCTCAGCAAACTGCTGCTGAAAGAGAAACTGCTTATGCTCCT
TTGGTGCCTCCTTCTGCTCATCCTTCTAGCTATTCAGCGGGTGAAGTAGATAATATCTCG
GAACAGCGGGCGCAAGTTATGGAGTCGAAAAGGCAGGAGCTTGTGTTGTTAGACAACGAG
ATTGCATTCAACGAGGCAGTGATCGAAGAAAGAGAGCAAGGGATACAAGAAATCCATACT
CAGATTGGCGAGGTTAACGAGATATTCAAAGATCTCGCGGTTCTGGTTAACGATCAAGGA
GTCATGATAGATGATATCGGTACTCACATTGACAACTCTCGAGCTGCAACTTCACAAGGA
AGATCTCAGCTCGCTCAGGCCGCAAAAACACAAAGATCAAACTCATTTTTGACATGCTTG
CTCTTGGTGATATTTGGCATTGTACTCCTGATCGTGATAATCGTACTCGCAGCTTGATTT
TGGAAACCAAGAACAAGTGGTTTTGAATGTGTTTATGGATCTTAAAGCATCAATGAGTGA
ATTACTTGGTATATATTACGTAATTTGGATTCAAAACTTAGAAGTTGGGTTTTGTATTGG
TTTGGTATGGTTGTAATATAATGCGTGGTTTTGTTGTGCAAACTGTGTTGGAGATGAGTG
AAAAAAAGTCTGTTCTGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EX24TF U 1
AF RS1EX24JQ C 439
BS 1 668 RS1EX24TF
BS 669 1100 RS1EX24JQ

RD RS1EX24TF 668 0 0
GGACGCCCCCTCCCTCGACCGTACCAAATTGATCGTAGATAGGAGCTCTGAGAAAACGAT
TTGCTGAGAGATAAGAGAGAGATGAGTTTTCAAGATTTAGAAGCTGGAAGAGGAAGATCG
AGGAAGACCAATGGTGGTGGTGGTGGTGGTCGGCAAGATTCGACGCAAGCCGTGGCTTCG
GGAATATTCCAGATCAATACCGGAGTTTCCACGTTTCAACGTCTCGTCAACACGCTCGGT
ACTCCCAGAGACACGCCTGAGCTCCGTGATAAGCTGCACAAGACACGGTTGCATATAGGG
CAGCTTGTGAAGGACACGTCAGCTAAACTTAAAGAAGCTAGTGAAACTGATCATCAAACT
GGTGTCAATCCAAGTAAGAAGATTGCAGATGCTAAGCTTGCAAAGGACTTTCAAGCTGTG
TTGAAAGAGTTTCAGAAAGCTCAGCAAACTGCTGCTGAAAGAGAAACTGCTTATGCTCCT
TTGGTGCCTCCTTCTGCTCATCCTTCTAGCTATTCAGCGGGTGAAGTAGATAATATCTCG
GAACAGCGGGCGCAAGTTATGGAGTCGAAAAGGCAGGAGCTTGTGTTGTTAGACAACGAG
ATTGCATTCAACGAGGCAGTGATCGAAGAAAGAGAGCAAGGGATACAAGAAATCCATACT
CAGATTGG

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1EX24JQ 662 0 0
GCTCAGCAAACTGCTGCTGAAAGAGAAACTGCTTATGCTCCTTTGGTGCCTCCTTCTGCT
CATCCTTCTAGCTATTCAGCGGGTGAAGTAGATAATATCTCGGAACAGCGGGCGCAAGTT
ATGGAGTCGAAAAGGCAGGAGCTTGTGTTGTTAGACAACGAGATTGCATTCAACGAGGCA
GTGATCGAAGAAAGAGAGCAAGGGATACAAGAAATCCATACTCAGATTGGCGAGGTTAAC
GAGATATTCAAAGATCTCGCGGTTCTGGTTAACGATCAAGGAGTCATGATAGATGATATC
GGTACTCACATTGACAACTCTCGAGCTGCAACTTCACAAGGAAGATCTCAGCTCGCTCAG
GCCGCAAAAACACAAAGATCAAACTCATTTTTGACATGCTTGCTCTTGGTGATATTTGGC
ATTGTACTCCTGATCGTGATAATCGTACTCGCAGCTTGATTTTGGAAACCAAGAACAAGT
GGTTTTGAATGTGTTTATGGATCTTAAAGCATCAATGAGTGAATTACTTGGTATATATTA
CGTAATTTGGATTCAAAACTTAGAAGTTGGGTTTTGTATTGGTTTGGTATGGTTGTAATA
TAATGCGTGGTTTTGTTGTGCAAACTGTGTTGGAGATGAGTGAAAAAAAGTCTGTTCTGT
TG

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

CO CL5720Contig1 936 2 2 U
GGGGCGACTCTTACATTCCCAGCAGACACTTTCAATTCAATTTCTAAAACCCTAATTTTT
CTCGCTTCAGTCAACCACCACTGCACTGTACACATCGATGGTGAAGAAGCCATGATGATT
TGAAAAAGAGTGAAGTATCTGTTTTTTCTTTTCTTACACTTCTTATTAATTTTCAGAATG
GGGGATTCCGACAAGGACTCCGGTGGAGGACAAAACGGACAGTCTCCGTTGTCTCCCAGA
GAGCAAGACAGGTTCCTACCGATCGCTAACGTGAGCCGGATCATGAAGAAGGCCTTGCCG
GCAAACGCCAAGATCTCCAAAGATGCTAAAGAGACGATGCAGGAGTGCGTCTCCGAGTTT
ATAAGCTTCGTCACGGGAGAGGCGTCGGATAAGTGCCAGAAGGAGAAGAGGAAGACGATC
AACGGCGACGATTTGCTTTGGGCTATGACCACTCTAGGGTTCGAGGATTACGTTGAGCCG
CTGAAGGTTTACTTGCAGAGGTTTAGGGAGATCGAAGGGGAGAGGGCTGGACTTGGGAGG
CCACATACAGGTGGCGAAGCTGGAGAGCATCAGAGAGATGCAGGTGTTGGTGAGGGCGGT
GGGTTTTACGGTGGTGGGATGCAGTATCACCAGCATCAGTTTCTTCACCACCAGCAGAAC
CATATGTATGGGTCAACAGGCGGTGACGGTGGAGGAGGAGCTGCCTCCGGTAGGACAAGG
ACCTGAGAGATTGGTGAGAGTGGATTTCTGTATATAGATACATTTATAAACATGCCTATT
CATACCCATAAGAGTTCGCAACATCAATTTATTTAAATATCATGTTGGTTATGTAGGCTG
TGTAAAGAGGATCAAGTGTGTTTGGAAATATATGATTCGCTAAAGAATTTGCTCCGTTTA
ATCTTGTATTCAAACTATTGGATTTGGATCCCATTG


BQ
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AF RS1EB16TF U 1
AF RS1EB16JQ C 430
BS 1 675 RS1EB16TF
BS 676 936 RS1EB16JQ

RD RS1EB16TF 675 0 0
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CTCGCTTCAGTCAACCACCACTGCACTGTACACATCGATGGTGAAGAAGCCATGATGATT
TGAAAAAGAGTGAAGTATCTGTTTTTTCTTTTCTTACACTTCTTATTAATTTTCAGAATG
GGGGATTCCGACAAGGACTCCGGTGGAGGACAAAACGGACAGTCTCCGTTGTCTCCCAGA
GAGCAAGACAGGTTCCTACCGATCGCTAACGTGAGCCGGATCATGAAGAAGGCCTTGCCG
GCAAACGCCAAGATCTCCAAAGATGCTAAAGAGACGATGCAGGAGTGCGTCTCCGAGTTT
ATAAGCTTCGTCACGGGAGAGGCGTCGGATAAGTGCCAGAAGGAGAAGAGGAAGACGATC
AACGGCGACGATTTGCTTTGGGCTATGACCACTCTAGGGTTCGAGGATTACGTTGAGCCG
CTGAAGGTTTACTTGCAGAGGTTTAGGGAGATCGAAGGGGAGAGGGCTGGACTTGGGAGG
CCACATACAGGTGGCGAAGCTGGAGAGCATCAGAGAGATGCAGGTGTTGGTGAGGGCGGT
GGGTTTTACGGTGGTGGGATGCAGTATCACCAGCATCAGTTTCTTCACCACCAGCAGAAC
CATATGTATGGGTCA

QA 1 675 1 675
DS 

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TACTTGCAGAGGTTTAGGGAGATCGAAGGGGAGAGGGCTGGACTTGGGAGGCCACATACA
GGTGGGGAAGCTGGAGAGCATCAGAGAGATGCAGGTGTTGGTGAGGGCGGTGGGTTTTAC
GGTGGTGGGATGCAGTATCACCAGCATCAGTTTTTTCACCCCCAGCAGAACCATATGTAT
GGGTCAACAGGCGGTGACGGTGGAGGAGGAGCTGCCTCCGGTAGGACAAGGACCTGAGAG
ATTGGTGAGAGTGGATTTCTGTATATAGATACATTTATAAACATGCCTATTCATACCCAT
AAGAGTTCGCAACATCAATTTATTTAAATATCATGTTGGTTATGTAGGCTGTGTAAAGAG
GATCAAGTGTGTTTGGAAATATATGATTCGCTAAAGAATTTGCTCCGTTTAATCTTGTAT
TCAAACTATTGGATTTGGATCCCATTG

QA 1 507 1 507
DS 



AS 1 2

CO CL5721Contig1 927 2 2 U
GCTCCTCCAGATCTCATTATAATACATTTCTTCCCCTTCTTCATTTAAACATATACACCT
GTTTTAATGAAGTTCGGTAAGAGGATTAAGGAGCAGATACAAGAGTCGTTGCCGGAGTGG
CGTGACAAGTTTTTGCGTTATAAAGAACTCAAGAATCTGATCTCTTCTCCTGCTCCAGCT
GAATCTATCTTCGTCTGTTTGCTGAACGCCGAGATTGAGAAGTTTAATGCTTTCTTCGTC
GAGCAAGAAGAAGATTTCATCATCCACCATAAGGAATTGCAATATCGGATTCAGAGATTG
GTAGAAAAATGTGGAGACAATGATGATGTAATGTTCAGAGAAGAGATTGGTGAGATCAGA
AAGGATATCGTTAACTTCCATGGGGAGATGGTACTTCTCGTTAATTACAGCAACATAAAT
TACACTGGGTTAGCAAAGATTCTGAAGAAGTACGACGAGAGAACAGGAGGAGCATTGCGA
TCACCGTTTATCCAAAAAGTTCTTCGTCAGCCGTTTTTCAAGACTGATCTGGTGTCGAGG
CTCGTAAGAGAGTGGGAGACGACGATGGACGCGATGTTTCCGGCGCTGAATAGGGAGGTG
GAGGGATACGAGAGATCTGTGGCGGTGAGTTCGGCTGCGGCGGGAGAAGGGATATTTAGG
AATACGGTTGCGGCGTTGATGACGATGAGAGAGATGAGAAGAGGGAGTTCTACTTACGGT
GCTTACTCGCTTCCGCCGCTTAATCTTTCTGATTCCGATCTTGTTTTACGGCCGGTCCAC
GTCCCTTCTCCGATACCTATTCCTTATTGATAAATCTTTATAGATATTTAATCACACGGG
AAATGGACTTATCGTAATATTTGTACTTTTTTCGTTTGACTTACCTTAAATCATATTGAA
AATGGCATTATCTTAATATTCCGCATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FV84TF U 1
AF RS1FV84JQ C 191
BS 1 628 RS1FV84TF
BS 629 927 RS1FV84JQ

RD RS1FV84TF 628 0 0
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GTTTTAATGAAGTTCGGTAAGAGGATTAAGGAGCAGATACAAGAGTCGTTGCCGGAGTGG
CGTGACAAGTTTTTGCGTTATAAAGAACTCAAGAATCTGATCTCTTCTCCTGCTCCAGCT
GAATCTATCTTCGTCTGTTTGCTGAACGCCGAGATTGAGAAGTTTAATGCTTTCTTCGTC
GAGCAAGAAGAAGATTTCATCATCCACCATAAGGAATTGCAATATCGGATTCAGAGATTG
GTAGAAAAATGTGGAGACAATGATGATGTAATGTTCAGAGAAGAGATTGGTGAGATCAGA
AAGGATATCGTTAACTTCCATGGGGAGATGGTACTTCTCGTTAATTACAGCAACATAAAT
TACACTGGGTTAGCAAAGATTCTGAAGAAGTACGACGAGAGAACAGGAGGAGCATTGCGA
TCACCGTTTATCCAAAAAGTTCTTCGTCAGCCGTTTTTCAAGACTGATCTGGTGTCGAGG
CTCGTAAGAGAGTGGGAGACGACGATGGACGCGATGTTTCCGGCGCTGAATAGGGAGGTG
GAGGGATACGAGAGATCTGTGGCGGTGA

QA 1 628 1 628
DS 

RD RS1FV84JQ 737 0 0
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AAGATTTCATCATCCACCATAAGGAATTGCAATATCGGATTCAGAGATTGGTAGAAAAAT
GTGGAGACAATGATGATGTAATGTTCAGAGAAGAGATTGGTGAGATCAGAAAGGATATCG
TTAACTTCCATGGGGAGATGGTACTTCTCGTTAATTACAGCAACATAAATTACACTGGGT
TAGCAAAGATTCTGAAGAAGTACGACGAGAGAACAGGAGGAGCATTGCGATCACCGTTTA
TCCAAAAAGTTCTTCGTCAGCCGTTTTTCAAGACTGATCTGGTGTCGAGGCTCGTAAGAG
AGTGGGAGACGACGATGGACGCGATGTTTCCGGCGCTGAATAGGGAGGTGGAGGGATACG
AGAGATCTGTGGCGGTGAGTTCGGCTGCGGCGGGAGAAGGGATATTTAGGAATACGGTTG
CGGCGTTGATGACGATGAGAGAGATGAGAAGAGGGAGTTCTACTTACGGTGCTTACTCGC
TTCCGCCGCTTAATCTTTCTGATTCCGATCTTGTTTTACGGCCGGTCCACGTCCCTTCTC
CGATACCTATTCCTTATTGATAAATCTTTATAGATATTTAATCACACGGGAAATGGACTT
ATCGTAATATTTGTACTTTTTTCGTTTGACTTACCTTAAATCATATTGAAAATGGCATTA
TCTTAATATTCCGCATT

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

CO CL5722Contig1 1271 2 4 U
GGAAAACGGAACTCCAGATCTGAATCCGCCTCTCAAGATTAGAGTTACACTGTAGGAGGA
AGGGAGTAACAATGATTTGCGAGAGAGATGATTTCAGCCTCACTGGCCCATTACACTTAA
CATCTGTAGATTGGGCTAATGAACACCATAGGCGATCTGTAGCTGCCTCTTTGGTCCAAG
GAATCTATGTAGCGGAGCGTGACCGTCAGCTACAAAGGGAAGGTCCCGACCTAGCTCTGT
CTCCACTATGGTCTGAGTTTTTCCATTTCCGCCTCATTCGCAAGCTTGTAGACGACGCTG
ACTTCTCCGTATTCGGAGGAATCTACGAGTACAAACCGTCTTCTAATACTACTGTCAAGT
CCCAAGAACTGAGTCCGCGTTTCGTGATTGCGTTCAGAGGAACCGTTAACAAAGCCGATT
CCATCTCCCGCGACATCGAGCTAGACATCCACATCATTAAAAACGGCCTGCACACCACCA
CCCGGTTTGAGATAGCTATGCAGGCTGTGAGAAACATGGTGGCTTCGGTTGGTTGTTCGA
ATGTCTGGCTCGCTGGTCATTCTCTTGGTGCTTCCATGGCTTTGCTCGCCGGGAAAACAG
TTGCTAGAACCGGTGTTCTTCCCGAGTGTTTCGCCTTTAATCCGCCTTTCTTGTCTCCTC
CTATCGAAAAAATCAAAGATAAGAGGATCAAACACGGGATACGTATCGCAGGTAGTGTGA
TCACGGCTGGACTTGCTCTAGCCAAAAAAAGCCACCCAACAAGTCAGCCAAAACCACCAC
CGTGCATTACCAGCACCACCCGACCCGTTTGCCGCCTTGTCCGACTGGTTTCCACGGCTT
TACGTCAATCCCGGGGACCACTTGTGCTCGGAGTTTATCGGTTACTTCGAGCACCGAAAC
AAGATGGAGGAAATAGGAGCCGGTTTTGTAGAGAGGTTAGCTACACAGCACTCGTTGGGC
GGTTTGGTGATGGATGTTGTGAGCGGAGGAAAGAACACTGAAGCACCGGTTCATTTGATT
CCCACGGCGGTTTTAACTGTTAACAAGAGTTTTTCGAGAGATTTTAAAGAAGCTCATGGG
ATTCACCAGTGGTGGAGGGAGGACAAGATATTCGAGACCAAAATCTACCAGTACAAGTGA
TTGATAAATTAAATCGGGTTAACCGGTATGTATGTTAAACCAATACTTGGTCTTTTGCTT
ATCTTCTTTCCGGTTTAGCCGGTTCAATGTATCGCAGTCCTTTTATATAAATAAAAATCC
CTCGTCGTCTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C983TF U 1
AF RS1C983JQ C 486
BS 1 671 RS1C983TF
BS 672 672 RS1C983JQ
BS 673 721 RS1C983TF
BS 722 1271 RS1C983JQ

RD RS1C983TF 721 0 0
GGAAAACGGAACTCCAGATCTGAATCCGCCTCTCAAGATTAGAGTTACACTGTAGGAGGA
AGGGAGTAACAATGATTTGCGAGAGAGATGATTTCAGCCTCACTGGCCCATTACACTTAA
CATCTGTAGATTGGGCTAATGAACACCATAGGCGATCTGTAGCTGCCTCTTTGGTCCAAG
GAATCTATGTAGCGGAGCGTGACCGTCAGCTACAAAGGGAAGGTCCCGACCTAGCTCTGT
CTCCACTATGGTCTGAGTTTTTCCATTTCCGCCTCATTCGCAAGCTTGTAGACGACGCTG
ACTTCTCCGTATTCGGAGGAATCTACGAGTACAAACCGTCTTCTAATACTACTGTCAAGT
CCCAAGAACTGAGTCCGCGTTTCGTGATTGCGTTCAGAGGAACCGTTAACAAAGCCGATT
CCATCTCCCGCGACATCGAGCTAGACATCCACATCATTAAAAACGGCCTGCACACCACCA
CCCGGTTTGAGATAGCTATGCAGGCTGTGAGAAACATGGTGGCTTCGGTTGGTTGTTCGA
ATGTCTGGCTCGCTGGTCATTCTCTTGGTGCTTCCATGGCTTTGCTCGCCGGGAAAACAG
TTGCTAGAACCGGTGTTCTTCCCGAGTGTTTCGCCTTTAATCCGCCTTTCTTGTCTCCTC
CTATCGAAAAA*TCAAAGATAAGAGGATCAAACACGGGATACGTATCGCAGGTAGTGTGA
T

QA 1 721 1 721
DS 

RD RS1C983JQ 786 0 0
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TGGCTCGCTGGTCATTCTCTTGGTGCTTCCATGGCTTTGCTCGCCGGGAAAACAGTTGCT
AGAACCGGTGTTCTTCCCGAGTGTTTCGCCTTTAATCCGCCTTTCTTGTCTCCTCCTATC
GAAAAAATCAAAGATAAGAGGATCAAACACGGGATACGTATCGCAGGTAGTGTGATCACG
GCTGGACTTGCTCTAGCCAAAAAAAGCCACCCAACAAGTCAGCCAAAACCACCACCGTGC
ATTACCAGCACCACCCGACCCGTTTGCCGCCTTGTCCGACTGGTTTCCACGGCTTTACGT
CAATCCCGGGGACCACTTGTGCTCGGAGTTTATCGGTTACTTCGAGCACCGAAACAAGAT
GGAGGAAATAGGAGCCGGTTTTGTAGAGAGGTTAGCTACACAGCACTCGTTGGGCGGTTT
GGTGATGGATGTTGTGAGCGGAGGAAAGAACACTGAAGCACCGGTTCATTTGATTCCCAC
GGCGGTTTTAACTGTTAACAAGAGTTTTTCGAGAGATTTTAAAGAAGCTCATGGGATTCA
CCAGTGGTGGAGGGAGGACAAGATATTCGAGACCAAAATCTACCAGTACAAGTGATTGAT
AAATTAAATCGGGTTAACCGGTATGTATGTTAAACCAATACTTGGTCTTTTGCTTATCTT
CTTTCCGGTTTAGCCGGTTCAATGTATCGCAGTCCTTTTATATAAATAAAAATCCCTCGT
CGTCTG

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

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AGAAGCGAGAACGACGCCGTTTAGTCTCGTCGTTACATTCCCTATGGGAGCTACCGAGGG
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GTCACAGGTGAAGGAAGGCAAGTTCGCGTTGAGCAAAGGATGGGTCATTGAGAAAGTTAG
TGTTTTGGGACTTAAAGGGGCAGGGCCAGCTTCTGAGATTGAGATCAATGGAAGTCCCAT
CTCGAACGAGGCTAAGAAGATTGAGGTAAGCTCGAAGGAGCATACTTATGTGGTCGGGTT
GGAAGAGGAAGGAGAGAACAAGAGTGTGATGGTTGAAGTTAAGGGGCTTGAGATGATGGT
TGGTAAGGACTTTAACATGTCGTGGAAAATGGGTGTTAATGGTGCAAATTAATTTGCATG
TGGGAGTTTGGTGAAGTATTGGAGAAGAGAATGAGATTATTTACTAAAGAAGGGTGTAAT
CATTCTTATTCGTTTGGATTATAAATGGGAATAGAGGTTTATTTTGAGATTGTGTCCCCT
CTTTTATCAGAAGATGTGTTGTTTTTCGTTGGAATAAAAATTGAAAGTAAAAATATTATA
ATTATGTGATTTTAATTTCAGAAGG


BQ
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AF RS1DC70TF U 1
AF RS1DC70JQ C 505
BS 1 569 RS1DC70TF
BS 570 745 RS1DC70JQ

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AGAAGCGAGAACGACGCCGTTTAGTCTCGTCGTTACATTCCCTATGGGAGCTACCGAGGG
ATACGCGACGGGTAAGCTCTACCAAGACGAGGACGAGCTTCCGGAGATGAAGCTAGGAAA
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GTCACAGGTGAAGGAAGGCAAGTTCGCGTTGAGCAAAGGATGGGTCATTGAGAAAGTTAG
TGTTTTGGGACTTAAAGGGGCAGGGCCAGCTTCTGAGATTGAGATCAATGGAAGTCCCAT
CTCGAACGAGGCTAAGAAGATTGAGGTAAGCTCGAAGGAGCATACTTATGTGGTCGGGTT
GGAAGAGGAAGGAGAGAACAAGAGTGTGATGGTTGAAGTTAAGGGGCTTGAGATGATGGT
TGGTAAGGACTTTAACATGTCGTGGAAAATGGGTGTTAATGGTGCAAATTAATTTGCATG
TGGGAGTTTGGTGAAGTATTGGAGAAGAG

QA 1 569 1 569
DS 

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ATGGGAATAGAGGTTTATTTTGAGATTGTGTCCCCTCTTTTATCAGAAGATGTGTTGTTT
TTCGTTGGAATAAAAATTGAAAGTAAAAATATTATAATTATGTGATTTTAATTTCAGAAG
G

QA 1 241 1 241
DS 



AS 1 2

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TTCGTTTATTCCTATCTATTTTCTGTTAGATTAGTCTGTGTTCTCTGTTTCGATATTGTT
TTGGATGAATCGGAGATTTCATCTTTACTTTCCGATTTCCGGTGGAAATCATGGGGTGTC
ACTAACTCCGATGGTGACAGATTCTCCATACTTCCCGTTTTGGTTATCGATGTTGGTCCT
CGTTGGTTTCGGCGTGATTGTTTTCCCTTTACTTGGGTGGTATTTTCCGGTCATTGATCT
TCGATTCAGTGGCGGCGTTCGTCCATCAAATCCCGGGTTTGACGATGTCTTTCCGGTGGT
AGAGATTTGGTCATCTTATCTTCAGCCATTCGATGTTTGTCTGTTAGCCTCACAGTTTAA
TGGTGTGAGGCGAGCACTGAAACAACCATGGCCACCACCAGATTTCATCTTCTTGAATGA
ACGGTACGGGAATCTTTCATCATGTACGGGTTGGTGTGGAATGATAGTAATGTTTTATAT
GGTGGTAGTTATGTGTGATTGGTTTCAACCATTCGCTCAAATATTTCGAAAGGTTATATT
GATAATCAATGGATGGGTTATAGTCTCGTCGGTTCCACCATGTAAGGGATTACTACAAGG
AAGTGAAAACTTCAAAGCAATAAAAAGGCAGAAGATGCTGTTTCGACAGTACAATAAATT
GGAGATATGGTGTTATGGGTTTCAAAACAAAAGGATAGAGATGTCACGGACATATACAAC
TAAGTATGTTATCTCCTGTAGCAGAAGTGTTTGGGACGGATTGCGATGTAACAGATGGAT
CGCATCCAAAGATCTTTTTGATAAAAGATGTTTACTCAGAAAAATTGAGAGCCAAAAAAA
GATTTTAAAAGACCAAGAACGAAATGGAGAAAAGCTGGCGAATCAGCCTGTCCTACGAAG
GCGTTAGGAAGCATCGTGTTATTGCTGTCTCTGTTAAAAGTTTTTTTTAACAACATATCT
TTTGTAATCTATGTTTCATGTAATTTGTTACACTGATTTGAAATCAATAAAGTTAGACGT
T


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RS1E071TF U 1
AF RS1E071JQ C 382
BS 1 611 RS1E071TF
BS 612 1141 RS1E071JQ

RD RS1E071TF 611 0 0
TGTAAAAACAATCACGGAAAACGCTCTGAGTGCGAGAAAAAATACGACGCTTTACACAAA
CCGCTCCGTACATCTCCTTCACCGATTGTCGGCGGCGTTTGGCCGCCGGATCTTTTCTTT
TTCGTTTATTCCTATCTATTTTCTGTTAGATTAGTCTGTGTTCTCTGTTTCGATATTGTT
TTGGATGAATCGGAGATTTCATCTTTACTTTCCGATTTCCGGTGGAAATCATGGGGTGTC
ACTAACTCCGATGGTGACAGATTCTCCATACTTCCCGTTTTGGTTATCGATGTTGGTCCT
CGTTGGTTTCGGCGTGATTGTTTTCCCTTTACTTGGGTGGTATTTTCCGGTCATTGATCT
TCGATTCAGTGGCGGCGTTCGTCCATCAAATCCCGGGTTTGACGATGTCTTTCCGGTGGT
AGAGATTTGGTCATCTTATCTTCAGCCATTCGATGTTTGTCTGTTAGCCTCACAGTTTAA
TGGTGTGAGGCGAGCACTGAAACAACCATGGCCACCACCAGATTTCATCTTCTTGAATGA
ACGGTACGGGAATCTTTCATCATGTACGGGTTGGTGTGGAATGATAGTAATGTTTTATAT
GGTGGTAGTTA

QA 1 611 1 611
DS 

RD RS1E071JQ 760 0 0
TCCATCAAATCCCGGGTTTGACGATGTCTTTCCGGTGGTAGAGATTTGGTCATCTTATCT
TCAGCCATTCGATGTTTGTCTGTTAGCCTCACAGTTTAATGGTGTGAGGCGAGCACTGAA
ACAACCATGGCCACCACCAGATTTCATCTTCTTGAATGAACGGTACGGGAATCTTTCATC
ATGTACGGGTTGGTGTGGAATGATAGTAATGTTTTATATGGTGGTAGTTATGTGTGATTG
GTTTCAACCATTCGCTCAAATATTTCGAAAGGTTATATTGATAATCAATGGATGGGTTAT
AGTCTCGTCGGTTCCACCATGTAAGGGATTACTACAAGGAAGTGAAAACTTCAAAGCAAT
AAAAAGGCAGAAGATGCTGTTTCGACAGTACAATAAATTGGAGATATGGTGTTATGGGTT
TCAAAACAAAAGGATAGAGATGTCACGGACATATACAACTAAGTATGTTATCTCCTGTAG
CAGAAGTGTTTGGGACGGATTGCGATGTAACAGATGGATCGCATCCAAAGATCTTTTTGA
TAAAAGATGTTTACTCAGAAAAATTGAGAGCCAAAAAAAGATTTTAAAAGACCAAGAACG
AAATGGAGAAAAGCTGGCGAATCAGCCTGTCCTACGAAGGCGTTAGGAAGCATCGTGTTA
TTGCTGTCTCTGTTAAAAGTTTTTTTTAACAACATATCTTTTGTAATCTATGTTTCATGT
AATTTGTTACACTGATTTGAAATCAATAAAGTTAGACGTT

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

CO CL5725Contig1 905 2 2 U
GGATGGGCAGACGCGTTCTTTGTCTCTCGTCTTGTCGGAAAATGTCGCTTCCAAACTCCT
GTCGGAATATAATCCCGATTTAACTCCAAAAAAAAAAGGTTTCTATCTTTTACCGAAAAT
GTCGTCGTCAAACTTCACGGTGGAGTCGTGTAAAGTTGATTCGGAGGAAGGGGTGAAGCT
TCACACGAGAATCTTCAAACCCAGAGACGCCGACGCCGACGACGACGATGACAAAAATCT
TGTGATAGTGTTGGTACATCCCTTCTCGCTCATGGGTGGTTGTCAAGCTTTGCTCAAGGG
CATCGCTTCCGATTTGGCCTGTAAGGGATTCTGCTCTGTCACTTTCGACACGAGAGGCGC
TGGAAAGTCCACGGGAAGGGCTACTCTTACTGGCTTCGCTGAGGTCAAGGACGTGATCGC
CGTTTGTCGGTGGCTTTCTCAGGAATTCGAGGTTGATAGGATCTTGCTCGTGGGTTCTTC
TGCCGGTGCACCAATTGCAGGATCAGCAGTGGAGCAAGTAGAGCAAGTGGTGGGATATGT
GAGTTTGGGATACCCGTTTGGTCTACTAGCCTCAGTTCTATTTGGACGGCACCACAAGGC
CATTCTCTCATCCCCTAAACCAAAACTCTTCGTTATGGGAACAAAAGACAGCTTCACTAG
CGTTAGCCAGCTCAAGAAGAAGCTGAAATCTGCAGCGGGACGCACAGAAACACACCTCAT
CGAAGGCGTTAGCCATTTCCAGATGGAAGGACCTGAATATGATTCTCAAATGACCGATGT
CATTTGCAACTTTATTTCATCCATGTAAAAGAAGTCATTATGCAACCTGATGATGAGTAT
CCATGTAAGAGTTAAACGTAACTTGTATCACATAATACAGAATGGAGGATAACAACAATC
TTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RS1FW03TF U 1
AF RS1FW03JQ C 222
BS 1 663 RS1FW03TF
BS 664 905 RS1FW03JQ

RD RS1FW03TF 673 0 0
GGATGGGCAGACGCGTTCTTTGTCTCTCGTCTTGTCGGAAAATGTCGCTTCCAAACTCCT
GTCGGAATATAATCCCGATTTAACTCCAAAAAAAAAAGGTTTCTATCTTTTACCGAAAAT
GTCGTCGTCAAACTTCACGGTGGAGTCGTGTAAAGTTGATTCGGAGGAAGGGGTGAAGCT
TCACACGAGAATCTTCAAACCCAGAGACGCCGACGCCGACGACGACGATGACAAAAATCT
TGTGATAGTGTTGGTACATCCCTTCTCGCTCATGGGTGGTTGTCAAGCTTTGCTCAAGGG
CATCGCTTCCGATTTGGCCTGTAAGGGATTCTGCTCTGTCACTTTCGACACGAGAGGCGC
TGGAAAGTCCACGGGAAGGGCTACTCTTACTGGCTTCGCTGAGGTCAAGGACGTGATCGC
CGTTTGTCGGTGGCTTTCTCAGGAATTCGAGGTTGATAGGATCTTGCTCGTGGGTTCTTC
TGCCGGTGCACCAATTGCAGGATCAGCAGTGGAGCAAGTAGAGCAAGTGGTGGGATATGT
GAGTTTGGGATACCCGTTTGGTCTACTAGCCTCAGTTCTATTTGGACGGCACCACAAGGC
CATTCTCTCATCCCCTAAACCAAAACTCTTCGTTATGGGAACAAAAGACAGCTTCACTAG
CGT
AGCAGTCAGA

QA 1 663 1 663
DS 

RD RS1FW03JQ 684 0 0
ACGACGATGACAAAAATCTTGTGATAGTGTTGGTACATCCCTTCTCGCTCATGGGTGGTT
GTCAAGCTTTGCTCAAGGGCATCGCTTCCGATTTGGCCTGTAAGGGATTCTGCTCTGTCA
CTTTCGACACGAGAGGCGCTGGAAAGTCCACGGGAAGGGCTACTCTTACTGGCTTCGCTG
AGGTCAAGGACGTGATCGCCGTTTGTCGGTGGCTTTCTCAGGAATTCGAGGTTGATAGGA
TCTTGCTCGTGGGTTCTTCTGCCGGTGCACCAATTGCAGGATCAGCAGTGGAGCAAGTAG
AGCAAGTGGTGGGATATGTGAGTTTGGGATACCCGTTTGGTCTACTAGCCTCAGTTCTAT
TTGGACGGCACCACAAGGCCATTCTCTCATCCCCTAAACCAAAACTCTTCGTTATGGGAA
CAAAAGACGGCTTCACTAGCGTTAGCCAGCTCAAGAAGAAGCTGAAATCTGCAGCGGGAC
GCACAGAAACACACCTCATCGAAGGCGTTAGCCATTTCCAGATGGAAGGACCTGAATATG
ATTCTCAAATGACCGATGTCATTTGCAACTTTATTTCATCCATGTAAAAGAAGTCATTAT
GCAACCTGATGATGAGTATCCATGTAAGAGTTAAACGTAACTTGTATCACATAATACAGA
ATGGAGGATAACAACAATCTTGGC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL5726Contig1 1120 2 4 U
GGACAGAGAGAGAAGAGGAGAAAGAAAAGGCGAGTTTCAGCTGTTGTGAACAGAGGAAGA
GACACGTGATTTTGTGGTCTTAGAGATAATAAGAGACAATGGTTGGACCGTCGCGGCCTC
AGATCGTTCTTTTTGGATCATCCATCGTCCAGATGAGCTTTGGTCATGGTGGTTGGGGCG
CCATTCTCTCCGAGGTCTATGCTCGCAAGGCCGACATCATTCTGCGAGGATATTATGGAT
GGAACTCAACTCGTGCTTTGGAAGTTATTGACAAAGTGTTCCCCAAGGATGCCTTGGTAC
AACCTTCTCTGGTAGTTGTCTATTTTGGAGGAAACGACTCAATGGGGCCTCACCCTTCTG
GTCTATGACCTCACGTCCCATTATCTGAATACGTCCAAAACATGAAGAAGATCGCTCTTC
ATCTTCAGAGCCTTTCAGACTCTACTCGTATCATATTCCTTAGTTGCCCTCCAGTGGACG
AAGCCAAAGTTCGTCAAAACCAGAGCCCGTATTTGAGCGAGGTAATCCGCACAAACGAGC
TCTGCAAGACGTATTCAGACGCTTGTGTGGAGCTGTGCAAAGAGTTAGGCCTACAAGTAG
TTGATCTCTACTCTGCTTTTCAGAAAGCAGATGACTGGGAAACCGTTTGCTTCACAGATG
GGATTCATTTGTCAGCACAAGGAAGCAAACTTGTAGCAGCAGAGATACCGAGAGTGGTTA
AAGAAGCGGAGTGGAGACCGTCGCTTCACTGGGAATCGATGCCGACAGAATTCTCTGAGG
ACTCACCTTATGATCTTGTTGCAGCTGATGGCAAAACGACGTTGAACTCTTCGGAGTGGA
CGTACTTCTGGGGAGAACAATGGGAGTAAAAACATTACACCACACACAACAATAACAAGA
CCTTATGATATACTGTTGGCTTGTCTGAAACGTTATTATTTTTCAAGTAATGTGTGTGAC
TTTTCGTCATGCTTGAGTAGTTTCTTGAATCTATTTTTATATTATTGAACCTTAGTTTCT
TCAAATAAATAGTACTATAATCTCCATCTATTATTTACAAACTTATATCTTTAAGTTTGA
TTCGTGTAAAAGTTTGGTGAGTTGAAAGTTGAAATCCATT


BQ
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AF RS1DA62TF U 1
AF RS1DA62JQ C 477
BS 1 681 RS1DA62TF
BS 682 682 RS1DA62JQ
BS 683 711 RS1DA62TF
BS 712 1120 RS1DA62JQ

RD RS1DA62TF 711 0 0
GGACAGAGAGAGAAGAGGAGAAAGAAAAGGCGAGTTTCAGCTGTTGTGAACAGAGGAAGA
GACACGTGATTTTGTGGTCTTAGAGATAATAAGAGACAATGGTTGGACCGTCGCGGCCTC
AGATCGTTCTTTTTGGATCATCCATCGTCCAGATGAGCTTTGGTCATGGTGGTTGGGGCG
CCATTCTCTCCGAGGTCTATGCTCGCAAGGCCGACATCATTCTGCGAGGATATTATGGAT
GGAACTCAACTCGTGCTTTGGAAGTTATTGACAAAGTGTTCCCCAAGGATGCCTTGGTAC
AACCTTCTCTGGTAGTTGTCTATTTTGGAGGAAACGACTCAATGGGGCCTCACCCTTCTG
GTCTATGACCTCACGTCCCATTATCTGAATACGTCCAAAACATGAAGAAGATCGCTCTTC
ATCTTCAGAGCCTTTCAGACTCTACTCGTATCATATTCCTTAGTTGCCCTCCAGTGGACG
AAGCCAAAGTTCGTCAAAACCAGAGCCCGTATTTGAGCGAGGTAATCCGCACAAACGAGC
TCTGCAAGACGTATTCAGACGCTTGTGTGGAGCTGTGCAAAGAGTTAGGCCTACAAGTAG
TTGATCTCTACTCTGCTTTTCAGAAAGCAGATGACTGGGAAACCGTTTGCTTCACAGATG
GGATTCATTTGTCAGCACAAG*AAGCAAACTTGTAGCAGCAGAGATACCGA

QA 1 711 1 711
DS 

RD RS1DA62JQ 644 0 0
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GAGCTCTGCAAGACGTATTCAGACGCTTGTGTGGAGCTGTGCAAAGAGTTAGGCCTACAA
GTAGTTGATCTCTACTCTGCTTTTCAGAAAGCAGATGACTGGGAAACCGTTTGCTTCACA
GATGGGATTCATTTGTCAGCACAAGGAAGCAAACTTGTAGCAGCAGAGATACCGAGAGTG
GTTAAAGAAGCGGAGTGGAGACCGTCGCTTCACTGGGAATCGATGCCGACAGAATTCTCT
GAGGACTCACCTTATGATCTTGTTGCAGCTGATGGCAAAACGACGTTGAACTCTTCGGAG
TGGACGTACTTCTGGGGAGAACAATGGGAGTAAAAACATTACACCACACACAACAATAAC
AAGACCTTATGATATACTGTTGGCTTGTCTGAAACGTTATTATTTTTCAAGTAATGTGTG
TGACTTTTCGTCATGCTTGAGTAGTTTCTTGAATCTATTTTTATATTATTGAACCTTAGT
TTCTTCAAATAAATAGTACTATAATCTCCATCTATTATTTACAAACTTATATCTTTAAGT
TTGATTCGTGTAAAAGTTTGGTGAGTTGAAAGTTGAAATCCATT

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 2

CO CL5727Contig1 823 2 2 U
GGAAGACAGAGAAACATAGACAAGGATATTGTCAGGTTTTCTTACAAGTCTTTTAATTTC
TTGTCGGAAGAATCATAATGGCTTCAGGAGGATCAAAGTCGGCAGCTTTCATGCTTCTGT
TGCTGAATCTTGGTCTCTACTTTGTCGTCACCATCATCGCTTCCTGGGCTGTTAATCACG
GCATCGAGAGAGCTCGGGAGTCTGCGTCGGTGCTTTCTCTTCCGGCGAAGATCTTCCCTA
TATACTTCCCGGTGGGGAACATGGCGACTGGCTTTTTTCGTAATTTTCTCGCTGATCGCC
GGCGTCGTCGGAATGGCGACTTCACTCACCGGAATCATGAACGTTCTTGAGTGGGACTCT
CCGAATCTCCACTCCGCAGCGGCGTCTTCTCTCATCTCCTGGTCTCTCACTCTCCTCGCC
ATGGGATTGGCATGCAAGGAGATCAACATAGGCTGGACCGAGGCCAATTTAAGAACTCTT
GAAGTTATGACAATCATTGTGAGTGCTACACAGTTATTGTGCACCGGAGCCATTCACGTC
GGAGTTGGAGAAACAGTCGCCGGTGAAAGGCCTCATGCGGGAAGAGTTTGAGTTTCTACA
CTTAAAAGAGAACTATATATATCGGTTAGATTTTCTTATTCGAAGCGTGTGGTTTACTCA
AAACAAGAGTTTGTGATCGTGTAATCTATTGTGTGTTCATTGTTTTCATTCGTTTAATTT
TTTTCTATTATATGCACTGTTTGTATACGGCACTACCTGAAATATGAATTAATATTATTG
CTGTTAAGGAATGAATGAAGATGATAAAAAAATTCTGATTTGC


BQ
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AF RS1GY47TF U 1
AF RS1GY47JQ C 99
BS 1 537 RS1GY47TF
BS 538 823 RS1GY47JQ

RD RS1GY47TF 537 0 0
GGAAGACAGAGAAACATAGACAAGGATATTGTCAGGTTTTCTTACAAGTCTTTTAATTTC
TTGTCGGAAGAATCATAATGGCTTCAGGAGGATCAAAGTCGGCAGCTTTCATGCTTCTGT
TGCTGAATCTTGGTCTCTACTTTGTCGTCACCATCATCGCTTCCTGGGCTGTTAATCACG
GCATCGAGAGAGCTCGGGAGTCTGCGTCGGTGCTTTCTCTTCCGGCGAAGATCTTCCCTA
TATACTTCCCGGTGGGGAACATGGCGACTGGCTTTTTTCGTAATTTTCTCGCTGATCGCC
GGCGTCGTCGGAATGGCGACTTCACTCACCGGAATCATGAACGTTCTTGAGTGGGACTCT
CCGAATCTCCACTCCGCAGCGGCGTCTTCTCTCATCTCCTGGTCTCTCACTCTCCTCGCC
ATGGGATTGGCATGCAAGGAGATCAACATAGGCTGGACCGAGGCCAATTTAAGAACTCTT
GAAGTTATGACAATCATTGTGAGTGCTACACAGTTATTGTGCACCGGAGCCATTCAC

QA 1 537 1 537
DS 

RD RS1GY47JQ 725 0 0
TCGGCAGCTTTCATGCTTCTGTTGCTGAATCTTGGTCTCTACTTTGTCGTCACCATCATC
GCTTCCTGGGCTGTTAATCACGGCATCGAGAGAGCTCGGGAGTCTGCGTCGGTGCTTTCT
CTTCCGGCGAAGATCTTCCCTATATACTTCCCGGTGGGGAACATGGCGACTGGCTTTTTT
CGTAATTTTCTCGCTGATCGCCGGCGTCGTCGGAATGGCGACTTCACTCACCGGAATCAT
GAACGTTCTTGAGTGGGACTCTCCGAATCTCCACTCCGCAGCGGCGTCTTCTCTCATCTC
CTGGTCTCTCACTCTCCTCGCCATGGGATTGGCATGCAAGGAGATCAACATAGGCTGGAC
CGAGGCCAATTTAAGAACTCTTGAAGTTATGACAATCATTGTGAGTGCTACACAGTTATT
GTGCACCGGAGCCATTCACGTCGGAGTTGGAGAAACAGTCGCCGGTGAAAGGCCTCATGC
GGGAAGAGTTTGAGTTTCTACACTTAAAAGAGAACTATATATATCGGTTAGATTTTCTTA
TTCGAAGCGTGTGGTTTACTCAAAACAAGAGTTTGTGATCGTGTAATCTATTGTGTGTTC
ATTGTTTTCATTCGTTTAATTTTTTTCTATTATATGCACTGTTTGTATACGGCACTACCT
GAAATATGAATTAATATTATTGCTGTTAAGGAATGAATGAAGATGATAAAAAAATTCTGA
TTTGC

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL5728Contig1 1097 2 6 U
ATTTTCACCCTAAAACCGAGCAAGACGGGAGCTAGCGATTCTTACATTTGGTTTGCGTCA
AAGTCTGGACAATACACTACTAAGTCTGGCTACGCTTCAGCTATCGAGCTCCAGAACCAT
GATCTTCAGGAGGAATCGAGGCCAGAGGAGTTTGACTGGTACAGATCGGTGTGGTCTCCC
ACTACTGCTCCAAAGCTTCATCTTTTCATCTGGAAAGCGATCCAAGGAGCTCTTCCAACT
GGTGACAGTCTGCGTAAGCGAGGCCTATTGCAGAACACCAATTGCATCCACTGTGGTTTG
TTGGAAACGACGGAGCATATCTTCCTCCATTGCTCCTTTGCTAAGCAAGTGTGGAAAGCG
ATCCACACCTCCACTGATTTCAACCCTGAGCTTCTCCTCTCCTTTACAGAAGCGCTAATA
GCCTCCGCAAACTGGATTTGTCCCCCTCTTTATGGCATCACAGGAGACCTATTCTCATGG
GTTTGCTAGAGTATCTGGACCTCATGAAACCACCTCCTGTTTGAAGCTAGACCTGCAGTG
GCTCTGAATACTGCTTCGAAAGCTCTCCAGGATGCCAGAGAATGGACGCTTGTTCAGAAC
ACCGACGCTCCCCACCAAAAGGATATCAGATCCAGAGAAAACCGCCGACTGCTCCATCCA
ATGTGGTGGTCTGCAACACAGATGCAGCTTGGAACAAAGACTCCTCCTCTGCCGGTCTTA
CTTGGATCTTCGATTCTCCCTCACCGTTGCATGCATCTGATTGCTGTCAATACCAGGATC
GAATCGCATCGGCTCTTGCTGCTGAATATCTTGCTATTAGAGAAACCCTCTCCCACGCTC
CCCATCTGGGAATCACCTCGATCTGGCTACGCTCAGACTCCCTATCGCTCATCAAAGCGA
TAGATTCGATCACCAAGTCGATGAATCTCTATGGGATCTTATCGAACATCGAATCGTTAT
CTCTCTGTTTCGACTTCTGTTGTTTTTCGTTTGTTCCTAGAGACTGTAGCGGGTCGGCGG
AGAGTTTAGCCAAAGCCTGTTTATTTCATGCTTGTACCTCTTGGACCTGAGGCCTCTTCC
TATTAATCTATTCGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BW19TF U 1
AF RS1BW19JQ C 390
BS 1 714 RS1BW19TF
BS 715 715 RS1BW19JQ
BS 716 832 RS1BW19TF
BS 833 833 RS1BW19JQ
BS 834 837 RS1BW19TF
BS 838 1097 RS1BW19JQ

RD RS1BW19TF 837 0 0
ATTTTCACCCTAAAACCGAGCAAGACGGGAGCTAGCGATTCTTACATTTGGTTTGCGTCA
AAGTCTGGACAATACACTACTAAGTCTGGCTACGCTTCAGCTATCGAGCTCCAGAACCAT
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ACTACTGCTCCAAAGCTTCATCTTTTCATCTGGAAAGCGATCCAAGGAGCTCTTCCAACT
GGTGACAGTCTGCGTAAGCGAGGCCTATTGCAGAACACCAATTGCATCCACTGTGGTTTG
TTGGAAACGACGGAGCATATCTTCCTCCATTGCTCCTTTGCTAAGCAAGTGTGGAAAGCG
ATCCACACCTCCACTGATTTCAACCCTGAGCTTCTCCTCTCCTTTACAGAAGCGCTAATA
GCCTCCGCAAACTGGATTTGTCCCCCTCTTTATGGCATCACAGGAGACCTATTCTCATGG
GTTTGCTAGAGTATCTGGACCTCATGAAACCACCTCCTGTTTGAAGCTAGACCTGCAGTG
GCTCTGAATACTGCTTCGAAAGCTCTCCAGGATGCCAGAGAATGGACGCTTGTTCAGAAC
ACCGACGCTCCCCACCAAAAGGATATCAGATCCAGAGAAAACCGCCGACTGCTCCATCCA
ATGTGGTGGTCTGCAACACAGATGCAGCTTGGAACAAAGACTCCTCCTCTGCCG*TCTTA
CTTGGATCTTCGATTCTCCCTCACCGTTGCATGCATCTGATTGCTGTCAATACCAGGATC
GAATCGCATCGGCTCTTGCTGCTGAATATCTTGCTATTAGAGAAACCCTCTCTCACG

QA 1 837 1 837
DS 

RD RS1BW19JQ 708 0 0
GCTTCTCCTCTCCTTTACAGAAGCGCTAATAGCCTCCGCAAACTGGATTTGTCCCCCTCT
TTATGGCATCACAGGAGACCTATTCTCATGGGTTTGCTAGAGTATCTGGACCTCATGAAA
CCACCTCCTGTTTGAAGCTAGACCTGCAGTGGCTCTGAATACTGCTTCGAAAGCTCTCCA
GGATGCCAGAGAATGGACGCTTGTTCAGAACACCGACGCTCCCCACCAAAAGGATATCAG
ATCCAGAGAAAACCGCCGACTGCTCCATCCAATGTGGTGGTCTGCAACACAGATGCAGCT
TGGAACAAAGACTCCTCCTCTGCCGGTCTTACTTGGATCTTCGATTCTCCCTCACCGTTG
CATGCATCTGATTGCTGTCAATACCAGGATCGAATCGCATCGGCTCTTGCTGCTGAATAT
CTTGCTATTAGAGAAACCCTCTCCCACGCTCCCCATCTGGGAATCACCTCGATCTGGCTA
CGCTCAGACTCCCTATCGCTCATCAAAGCGATAGATTCGATCACCAAGTCGATGAATCTC
TATGGGATCTTATCGAACATCGAATCGTTATCTCTCTGTTTCGACTTCTGTTGTTTTTCG
TTTGTTCCTAGAGACTGTAGCGGGTCGGCGGAGAGTTTAGCCAAAGCCTGTTTATTTCAT
GCTTGTACCTCTTGGACCTGAGGCCTCTTCCTATTAATCTATTCGGTT

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

CO CL5729Contig1 447 2 1 U
GGCTATCAAAAGAAGAAAACTGATAAACAATGGCTGACGCAACCGAGAAAGCTGAGCACG
ACCGTGTTTTCAAGAAGTTTGATGCCAACGGAGATGGAAAAATCTCTGCCACCGAGCTTG
GAGATGCTCTCAAGAACCTTGGCTCGGCCACACACGATGACATTAAGCGTATGATGGCTG
AGATTGATACGGACGGTGATGGATACATATCGTACCAAGAGTTTTCTGATTTCGCAAGTG
CCAACCGTGGTCTCATGAAAGATGTTGCCAAGATTTTCTAAGAGGAGTTTCAAAATCTCT
ATAATTCACATGAAATGGATTTGAGATCTAATCATGTTTAATTCGTTTTTTAAATGACAG
CATTTGATTAAGTATGTATTTTTGGTTGTAAAAGTAAAAAAATTATAGTTAACTCAGTGA
TATCTTAATAATACTTTCTCTCTTTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1E088JQ C 1
AF RS1E088TF U 1
BS 1 447 RS1E088TF

RD RS1E088JQ 447 0 0
GGCTATCAAAAGAAGAAAACTGATAAACAATGGCTGACGCAACCGAGAAAGCTGAGCACG
ACCGTGTTTTCAAGAAGTTTGATGCCAACGGAGATGGAAAAATTTCTGCCACCGAGCTTG
GAGATGCTCTCAAGAACCTTGGTTCGGCCACACACGATGACATTAAGCGTATGATGGCTG
AGATTGATACGGACGGTGATGGATACATATCGTACCAAGAGTTTTCTGATTTCGCAAGTG
CCAACCGTGGTCTCATGAAAGATGTTGCCAAGATTTTCTAAGAGGAGTTTCAAAATCTCT
ATAATTCACATGAAATGGATTTGAGATCTAATCATGTTTAATTCGTTTTTTAAATGACAG
CATTTGATTAAGTATGTATTTTTGGTTGTAAAAGTAAAAAAATTATAGTTAACTCAGTGA
TATCTTAATAATACTTTCTCTCTTTTC

QA 1 447 1 447
DS 

RD RS1E088TF 447 0 0
GGCTATCAAAAGAAGAAAACTGATAAACAATGGCTGACGCAACCGAGAAAGCTGAGCACG
ACCGTGTTTTCAAGAAGTTTGATGCCAACGGAGATGGAAAAATCTCTGCCACCGAGCTTG
GAGATGCTCTCAAGAACCTTGGCTCGGCCACACACGATGACATTAAGCGTATGATGGCTG
AGATTGATACGGACGGTGATGGATACATATCGTACCAAGAGTTTTCTGATTTCGCAAGTG
CCAACCGTGGTCTCATGAAAGATGTTGCCAAGATTTTCTAAGAGGAGTTTCAAAATCTCT
ATAATTCACATGAAATGGATTTGAGATCTAATCATGTTTAATTCGTTTTTTAAATGACAG
CATTTGATTAAGTATGTATTTTTGGTTGTAAAAGTAAAAAAATTATAGTTAACTCAGTGA
TATCTTAATAATACTTTCTCTCTTTTC

QA 1 447 1 447
DS 



AS 1 2

CO CL5730Contig1 244 2 2 U
AGCGTTTCCTCTTTTAAAATCTCTCTAAATCTCCTCCTTCCTCACGCATCTTCTCTCCTT
CCCTCTGAGCTTAGAGCACTTTTATGGCATTGGAGCACTTGTGCAGCAACCTCTGTTTCC
TTAAATTAGGGAAACAACTAGAGCTCCTCCTCCTCCTCAATATTGGTTTGCCTCTTCTTA
GTGTTCTACTCATTAACAGGACACCCTAAACCAATCTGGTGAAGCTTTTTCTCTGTGATT
GCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 

AF RS1AI67JQ C 1
AF RS1AI67TF U 12
BS 1 11 RS1AI67JQ
BS 12 244 RS1AI67TF

RD RS1AI67JQ 244 0 0
AGCGTTTCCTCTTTTAAAATCTCTCTAAATCTCCTCCTTCCTCACGCATCTTCTCTCCTT
CCCTTTGAGCTTAGAGCACTTTTATGGCATTGGAGCACTTGTGCAGCAACCTCTGTTTCC
TTAAATTAGGGAAACAACTAGAGCTCCTCCTCCTCCTCAATATTGGTTTGCCTCTTCTTA
GTGTTCTACTCATTAACAGGACACCCTAAACCAATCTGGTGAAGCTTTTTCTCTGTGATT
GCCG

QA 1 244 1 244
DS 

RD RS1AI67TF 233 0 0
TTTTAAAATCTCTCTAAATCTCCTCCTTCCTCACGCATCTTCTCTCCTTCCCTCTGAGCT
TAGAGCACTTTTATGGCATTGGAGCACTTGTGCAGCAACCTCTGTTTCCTTAAATTAGGG
AAACAACTAGAGCTCCTCCTCCTCCTCAATATTGGTTTGCCTCTTCTTAGTGTTCTACTC
ATTAACAGGACACCCTAAACCAATCTGGTGAAGCTTTTTCTCTGTGATTGCCG

QA 1 233 1 233
DS 



AS 1 2

CO CL5731Contig1 422 2 1 U
GGACGATTAGAATTTGCCGTAGTACGAAACAAAGAGAATAAGCGTAGTAAAAGGCATTGA
TTGTTTGAATGGAACAACCGAGTTACGATATCTCTCAAGAAGAAGCACGTGAGTCTCTCA
TTGCCATCTCCTACACTTCACCGGAGGAGGTTGAAGAGTCTCTTCTAACGTCCTCAGATG
TGAAACCTATCGCCGCCACTACAACAAACGGAGTCGTCACTAAAAGAAACTCTGAAGATG
CTGAAAAGCTCAGATCAGAGCTGATTTCCATCTCCTACGACGAGTCACTCTCATCACCCT
CACCACCTGTAGCAGTCTGATAGGACTAATTGTACAGATCCAAAGTCTTTTCCTTTCATG
CATTCGACTTTGGTTTTGTTTGAAAGTTAGACCCTCTTCAACTATATGATTGAAAATTGA
CG


BQ
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20 20 

AF RS1B709JQ C 1
AF RS1B709TF U 1
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CG

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CG

QA 1 422 1 422
DS 



AS 1 2

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TTGTTTT


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BS 1 716 RS1AN27TF
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QA 1 814 1 814
DS 



AS 1 2

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AF RS1AZ91TF U 1
AF RS1BB46TF U 1
BS 1 434 RS1AZ91TF

RD RS1AZ91TF 434 0 0
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TTGTTCGGAAGCTGGGTTCTCCGTGCTGTTCCATACGTCCTCTCCTATTTCTCCGATTCC
AAAGATGAGCTCAAGCTCGACTTCTAAGACGGAGACTCCTTCTCTCTTTTCCGTTTTCAG
TGTTGAAGCGGTGGTGATATAACAACAGATGCACTATGAGGCTGTGGAAGACATTTTTCT
CCTACTTTTGTCTATTTCTTAGGACCTGAAATAACACCAAGTTGTGAGGCATGATGTTAT
ATTATAGTGATGTTCTTTTGTTTGCTATTCGTTTTTTAAATGTACTCTTAAAGCCTTTCT
ACTCACGCCTCTCT

QA 1 434 1 434
DS 

RD RS1BB46TF 434 0 0
GGATAGAATCTTCCCAATCTTAGAGAAGCGAAGAAAGAAGAAGAAGCCATGTTTCCTGGA
ATGTTCATGGAGAAGCCAGACAAAGGCTTGGCCCTGAAGCAGCTACGGACCCATGTTGCT
TTGTTCGGAAGCTGGGTTCTCCGTGCTGTTCCATACGTCCTCTCCTATTTCTCCGATTCC
AAAGATGAGCTCAAGCTCGACTTCTAAGACGGAGACTCCTTCTCTCTTTTCCGTTTTCAG
TGTTGAAGCGGTGGTGATATAACAACAGATGCACTATGAGGCTGTGGAAGACATTTTTCT
CCTACTTTTGTCTATTTCTTAGGACCTGAAATAACACCAAGTTGTGAGGCATGATGTTAT
ATTATAGTGATGTTCTTTTGTTTGCTATTCGTTTTTTAAATGTACTCTTAAAGCCTTTCT
ACTCACGCCTCTCT

QA 1 434 1 434
DS 



AS 1 2

CO CL5734Contig1 977 2 2 U
GCGGCGAAAGATTTAGCTTCAGGGACCGTTGGAGGAGCGGCTCAGCTCATCGTAGGCCAC
CCGTTTGACACGATCAAGGTCAAACTCCAGAGCCAGCCTGCTCCATCACCGGGACAACCA
CCGAGGTACAAAGGTGCTATCGATGCGGTTAAACAGACCGTTGCTTCCGAAGGACCTAAA
GGTTTGTACAAAGGTATGGGAGCTCCTCTCGCAACCGTTGCCGCCTTTAATGCTGTCCTG
TTCACCGTGAGAGGTCAGATGGAAGGGCTGCTTAGGTCTGAACCTGGAGTGCCGTTGACT
ATAAGTCAACAGTTTGTTTGTGGGGCTGGCGCTGGTTTCGCTGTCTCGTTCCTTGCTTGT
CCTACCGAATTGATCAAATGCAGGTTACAAGCACAAGGTGCTGGAGCTGGAGTCTCTACC
CCGGGCTCAGTGGTTGCAGCCGTGAAATACGGTGGACCAATGGACGTGGCCCGCCACGTG
CTACGGTCAGAAGGTGGAGCAAGAGGTCTATTCAAAGGTTTGTTTCCGACGCTTGCACGT
GAAGTCCCGGGAAACGCGACGATGTTTGCAGTCTACGAAGCTTTCAAGCGGTTCTTAGCT
GGTGGTTCTGACACTTCGAGCTTAGGACAGGGGTCGTTGATCATGGCTGGTGGAGTTGCT
GGTGCGTCGTTCTGGGGGTTTGTGTACCCGACCGATGTTGTGAAGAGTGTTCTTCAAGTG
GATGATTATAAGAACCCTAAGTACAAAGGTTCGATGGATGCTTTTAGGAAGATTTTGAAA
GCTGAAGGGGTTAAAGGTTTGTATAAAGGGTTTGGTCCAGCTATGGCTAGGAGTGTTCCC
GCTAATGCTGCTTGTTTCTTGGCTTATGAGATGACAAGGTCAAGCTTGGGATAAAACTGG
TTTGCTTTGGTTTTTTTTAACTGTTGGTCTGTCCAATTTGTGGATGGTTCCATTGATTAA
TCTTTCTGTCTCTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AG68TF U 1
AF RS1AG68JQ C 182
BS 1 624 RS1AG68TF
BS 625 977 RS1AG68JQ

RD RS1AG68TF 626 0 0
GCGGCGAAAGATTTAGCTTCAGGGACCGTTGGAGGAGCGGCTCAGCTCATCGTAGGCCAC
CCGTTTGACACGATCAAGGTCAAACTCCAGAGCCAGCCTGCTCCATCACCGGGACAACCA
CCGAGGTACAAAGGTGCTATCGATGCGGTTAAACAGACCGTTGCTTCCGAAGGACCTAAA
GGTTTGTACAAAGGTATGGGAGCTCCTCTCGCAACCGTTGCCGCCTTTAATGCTGTCCTG
TTCACCGTGAGAGGTCAGATGGAAGGGCTGCTTAGGTCTGAACCTGGAGTGCCGTTGACT
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CCTACCGAATTGATCAAATGCAGGTTACAAGCACAAGGTGCTGGAGCTGGAGTCTCTACC
CCGGGCTCAGTGGTTGCAGCCGTGAAATACGGTGGACCAATGGACGTGGCCCGCCACGTG
CTACGGTCAGAAGGTGGAGCAAGAGGTCTATTCAAAGGTTTGTTTCCGACGCTTGCACGT
GAAGTCCCGGGAAACGCGACGATGTTTGCAGTCTACGAAGCTTTCAAGCGGTTCTTAGCT
GGTGGTTCTGACACTTCGAGCTTA
TG

QA 1 624 1 624
DS 

RD RS1AG68JQ 796 0 0
GTTTGTACAAAGGTATGGGAGCTCCTCTCGCAACCGTTGCCGCCTTTAATGCTGTCCTGT
TCACCGTGAGAGGTCAGATGGAAGGGCTGCTTAGGTCTGAACCTGGAGTGCCGTTGACTA
TAAGTCAACAGTTTGTTTGTGGGGCTGGCGCTGGTTTCGCTGTCTCGTTCCTTGCTTGTC
CTACCGAATTGATCAAATGCAGGTTACAAGCACAAGGTGCTGGAGCTGGAGTCTCTACCC
CGGGCTCAGTGGTTGCAGCCGTGAAATACGGTGGACCAATGGACGTGGCCCGCCACGTGC
TACGGTCAGAAGGTGGAGCAAGAGGTCTATTCAAAGGTTTGTTTCCGACGCTTGCACGTG
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GTGGTTTTGACACTTCGAGCTTAGGACAGGGGTCGTTGATCATGGCTGGTGGAGTTGCTG
GTGCGTCGTTCTGGGGGTTTGTGTACCCGACCGATGTTGTGAAGAGTGTTCTTCAAGTGG
ATGATTATAAGAACCCTAAGTACAAAGGTTCGATGGATGCTTTTAGGAAGATTTTGAAAG
CTGAAGGGGTTAAAGGTTTGTATAAAGGGTTTGGTCCAGCTATGGCTAGGAGTGTTCCCG
CTAATGCTGCTTGTTTCTTGGCTTATGAGATGACAAGGTCAAGCTTGGGATAAAACTGGT
TTGCTTTGGTTTTTTTTAACTGTTGGTCTGTCCAATTTGTGGATGGTTCCATTGATTAAT
CTTTCTGTCTCTTTAC

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 2

CO CL5735Contig1 871 2 2 U
GCTCTCTGGTTTGTTTGCACTTGGTGCTGGACAAGGCTTCATTGGTTGGTGGATGGTTAA
AAGTGGCTTAGAGGAGCCACCTTCTGAGTATTCTCAGCCGAGGGTAAGCCCATACCGTCT
TGCGGCTCACCTAACCTCAGCTTTCGCTATATATTGTGGACTATTCTGGACCGCTCTCTC
TGTTGTTATGCCTGAACCACCAGCTGAGTCGTTGGCTTGGGTTCGGGGAGCTGCTAAAGT
GAAGAAGCTTGCTTTACCAGTAAGCTTCATTGTTGGTATCACTGCCATCTCTGGAGCCTT
TGTTGCTGGAAATGATGCTGGTCGTGCATTCAACACGTTCCCGAAGATGGGTGATACATG
GATCCCAGATGATATATTTGAGATGAAACCACTTATACGCAACTTTTTCGAGAACACAGC
AACTGTTCAGCTCGATCATCGCCTTCTGGCGACCACAACGCTACTGTCAATTGGAACAAT
GTGGTGGTTCACGAGGAAGCTAGACATACATCCAGCTGTTAAGGCTTTGATTGGAAGCAC
TGTGGGAATGACTGCTGTTCAGGTGACGTTAGGTGTCTCAACGCTTTTGAGTTATGTACC
CGTTTCACTAGGGAGTGCACACCAAGCAGGAGCTTTAACACTTCTCACTTTGATGCTCCT
TCTCAATCACACTCTTCGGAGGCCATCACCTTCTCTTCTCAAATCTCTTCCACAAGTCGT
TAAGTCAAATTTCAGCTAAGCTCTCTTCAGCAAAATCATTTACTAAAAGAAAGAAAACGA
TTCTTACTTACATGATATATTTTATATTATCCAGTTTTCATTGAATGCTTGGTCAGTTAT
GTTTTGTATTATCAATATGTGACAGATTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DW12TF U 1
AF RS1DW12JQ C 120
BS 1 558 RS1DW12TF
BS 559 871 RS1DW12JQ

RD RS1DW12TF 558 0 0
GCTCTCTGGTTTGTTTGCACTTGGTGCTGGACAAGGCTTCATTGGTTGGTGGATGGTTAA
AAGTGGCTTAGAGGAGCCACCTTCTGAGTATTCTCAGCCGAGGGTAAGCCCATACCGTCT
TGCGGCTCACCTAACCTCAGCTTTCGCTATATATTGTGGACTATTCTGGACCGCTCTCTC
TGTTGTTATGCCTGAACCACCAGCTGAGTCGTTGGCTTGGGTTCGGGGAGCTGCTAAAGT
GAAGAAGCTTGCTTTACCAGTAAGCTTCATTGTTGGTATCACTGCCATCTCTGGAGCCTT
TGTTGCTGGAAATGATGCTGGTCGTGCATTCAACACGTTCCCGAAGATGGGTGATACATG
GATCCCAGATGATATATTTGAGATGAAACCACTTATACGCAACTTTTTCGAGAACACAGC
AACTGTTCAGCTCGATCATCGCCTTCTGGCGACCACAACGCTACTGTCAATTGGAACAAT
GTGGTGGTTCACGAGGAAGCTAGACATACATCCAGCTGTTAAGGCTTTGATTGGAAGCAC
TGTGGGAATGACTGCTGT

QA 1 558 1 558
DS 

RD RS1DW12JQ 752 0 0
TTGCGGCTCACCTAACCTCAGCTTTCGCTATATATTGTGGACTATTCTGGACCGCTCTCT
CTGTTGTTATGCCTGAACCACCAGCTGAGTCGTTGGCTTGGGTTCGGGGAGCTGCTAAAG
TGAAGAAGCTTGCTTTACCAGTAAGCTTCATTGTTGGTATCACTGCCATCTCTGGAGCCT
TTGTTGCTGGAAATGATGCTGGTCGTGCATTCAACACGTTCCCGAAGATGGGTGATACAT
GGATCCCAGATGATATATTTGAGATGAAACCACTTATACGCAACTTTTTCGAGAACACAG
CAACTGTTCAGCTCGATCATCGCCTTCTGGCGACCACAACGCTACTGTCAATTGGAACAA
TGTGGTGGTTCACGAGGAAGCTAGACATACATCCAGCTGTTAAGGCTTTGATTGGAAGCA
CTGTGGGAATGACTGCTGTTCAGGTGACGTTAGGTGTCTCAACGCTTTTGAGTTATGTAC
CCGTTTCACTAGGGAGTGCACACCAAGCAGGAGCTTTAACACTTCTCACTTTGATGCTCC
TTCTCAATCACACTCTTCGGAGGCCATCACCTTCTCTTCTCAAATCTCTTCCACAAGTCG
TTAAGTCAAATTTCAGCTAAGCTCTCTTCAGCAAAATCATTTACTAAAAGAAAGAAAACG
ATTCTTACTTACATGATATATTTTATATTATCCAGTTTTCATTGAATGCTTGGTCAGTTA
TGTTTTGTATTATCAATATGTGACAGATTTAG

QA 1 752 1 752
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5737Contig1 899 2 6 U
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TGCCAAGACATTTGCAGAATGGGGAATAGATTACTTGAAGTATGACAACTGCAACACCGA
TGGCACGAGACCAACCGTCAGGTATCCAGTTATGACCCAAGCTCTGACGAAATCTGGCCG
TCCCATCTTTCACTCCTTGTGTGAATGGGGGGACATGCATCCAGCTCTCTGGGGATCTCC
ACTAGGCAACAGTTGGAGAACCACTATTGACATCAATGATAGTTGGCTTAGTATGATTGC
AAATGCAGACATGAACGAAATCTATGCTGAGCATGCAAGGCCTGGTGGCTGGAACGATCC
TGACATGCTTGAAGTGGGAAATGGAGGGATGACTAAAGACGAGTACATAGTCCATTTCAG
CATATGGGCAATCTCAAAGGCTCCTCTTCTACTTGGTTGTGACATAAGAAACATGACTAA
AGAAACTATGGAGATTGTGGCAAACCAGGAGGTCATTGCTATTAATCAAGATTCACTTGG
TGTTCAGGCCAAGAAAGCTAGAATGGAAGGTGATATCCAGATTTGGGCAGGGCCATTGTC
AGGTTACAGAGTAGCTTTGCTTCTGTTGAACCGTGGACCAACAAGATTATCTATTACTGC
TTTTTGGGATGATATTGAGATTCCTCCAAATAGCATCGTTGAAGCAAGAGATCTATGGGA
GCACAAGACATTGAAGCAAAAGTTTGTGGGGAACTTGACTGCAACAGTTGATTTTCATGC
GTGTAAGCTGTATGTTCTCAAACCTGTTGCCTGAGAGATATAGGCTACGTTGTAATATCC
AATTTATTATGTAGAAACAATGATCGGTTCCTTAATAAAATTGTTCGACGCTTTGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EJ10TF U 1
AF RS1EJ10JQ C 324
BS 1 740 RS1EJ10TF
BS 741 741 RS1EJ10JQ
BS 742 763 RS1EJ10TF
BS 764 764 RS1EJ10JQ
BS 765 773 RS1EJ10TF
BS 774 899 RS1EJ10JQ

RD RS1EJ10TF 776 0 0
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TGGCACGAGACCAACCGTCAGGTATCCAGTTATGACCCAAGCTCTGACGAAATCTGGCCG
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AAATGCAGACATGAACGAAATCTATGCTGAGCATGCAAGGCCTGGTGGCTGGAACGATCC
TGACATGCTTGAAGTGGGAAATGGAGGGATGACTAAAGACGAGTACATAGTCCATTTCAG
CATATGGGCAATCTCAAAGGCTCCTCTTCTACTTGGTTGTGACATAAGAAACATGACTAA
AGAAACTATGGAGATTGTGGCAAACCAGGAGGTCATTGCTATTAATCAAGATTCACTTGG
TGTTCAGGCCAAGAAAGCTAGAATGGAAGGTGATATCCAGATTTGGGCAGGGCCATTGTC
AGGTTACAGAGTAGCTTTGCTTCTGTTGAACCGTGGACCAACAAGATTATCTATTACTGC
TTTTTGGGATGATATTGAGATTCCTCCAAATAGCATCGTTGAAGCAAGAGATCTATGGGA
GCACAAGACATTGAAGCAAA*GTTTGTGGGGAACTTGACTGCA*CAGTTGATT
CTC

QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1EJ10JQ 576 0 0
ATGCTGAGCATGCAAGGCCTGGTGGCTGGAACGATCCTGACATGCTTGAAGTGGGAAATG
GAGGGATGACTAAAGACGAGTACATAGTCCATTTCAGCATATGGGCAATCTCAAAGGCTC
CTCTTCTACTTGGTTGTGACATAAGAAACATGACTAAAGAAACTATGGAGATTGTGGCAA
ACCAGGAGGTCATTGCTATTAATCAAGATTCACTTGGTGTTCAGGCCAAGAAAGCTAGAA
TGGAAGGTGATATCCAGATTTGGGCAGGGCCATTGTCAGGTTACAGAGTAGCTTTGCTTC
TGTTGAACCGTGGACCAACAAGATTATCTATTACTGCTTTTTGGGATGATATTGAGATTC
CTCCAAATAGCATCGTTGAAGCAAGAGATCTATGGGAGCACAAGACATTGAAGCAAAAGT
TTGTGGGGAACTTGACTGCAACAGTTGATTTTCATGCGTGTAAGCTGTATGTTCTCAAAC
CTGTTGCCTGAGAGATATAGGCTACGTTGTAATATCCAATTTATTATGTAGAAACAATGA
TCGGTTCCTTAATAAAATTGTTCGACGCTTTGCTCC

QA 1 576 1 576
DS 



AS 1 2

CO CL5738Contig1 459 2 1 U
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AGTCATCCACCCTGCCAAAACCGAAAGCGGCATCCTTCTCCCCGAGAAAGCCTCCAAGCT
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TCCGGTCTCTGTTAAGGAAGGCGACACCGTTCTTCTTCCGGAATACGGCGGTACTGAGGT
CAAGCTCGGCGGGAAGGAGTACCATCTCTTCCGTGACGAGGATGTCTTAGGAACCTTGCA
CGAGGATTGACAAGGCTAACTGGCTAAGCCAGTGTTCTTTCTTGTTGGCTTTTATAAGAA
ACAAGTCATTTATTTATAAGTTAATTATCCTTGAAGATGTGGTCGGACATTGTCGTTTGT
TTAATTGAAATCTTACGTTAATGGACTATCTTAATCCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1B963JQ C 1
AF RS1B963TF U 1
BS 1 459 RS1B963TF

RD RS1B963JQ 459 0 0
GGGAGTGAGAAGAAATGATGAAACGTCTGGTCCCAACGTTAACCGCATCCTGGTGCAGAG
AGTCATCCACCCTGCCAAAACCGAAAGCGGCATCCTTCTCCCCGAGAAAGCCTCCAAGCT
GAACTCAGGCAAGGTGATAGCAGTGGGGCCCGGTTCGAGAGATAAGGACGGGAAATTGAT
TCCGGTTTCTGTTAAGGAAGGCGACACCGTTCTTCTTCCGGAATACGGCGGTACTGAGGT
CAAGCTCGGCGGGAAGGAGTACCATTTCTTCCGTGACGAGGATGTTTTAGGAACCTTGCA
CGAGGATTGACAAGGCTAACTGGTTAAGCCAGTGTTCTTTCTTGTTGGCTTTTATAAGAA
ACAAGTCATTTATTTATAAGTTAATTATCCTTGAAGATGTGGTCGGACATTGTCGTTTGT
TTAATTGAAATCTTACGTTAATGGACTATCTTAATCCCC

QA 1 459 1 459
DS 

RD RS1B963TF 459 0 0
GGGAGTGAGAAGAAATGATGAAACGTCTGGTCCCAACGTTAACCGCATCCTGGTGCAGAG
AGTCATCCACCCTGCCAAAACCGAAAGCGGCATCCTTCTCCCCGAGAAAGCCTCCAAGCT
GAACTCAGGCAAGGTGATAGCAGTGGGGCCCGGTTCGAGAGATAAGGACGGGAAATTGAT
TCCGGTCTCTGTTAAGGAAGGCGACACCGTTCTTCTTCCGGAATACGGCGGTACTGAGGT
CAAGCTCGGCGGGAAGGAGTACCATCTCTTCCGTGACGAGGATGTCTTAGGAACCTTGCA
CGAGGATTGACAAGGCTAACTGGCTAAGCCAGTGTTCTTTCTTGTTGGCTTTTATAAGAA
ACAAGTCATTTATTTATAAGTTAATTATCCTTGAAGATGTGGTCGGACATTGTCGTTTGT
TTAATTGAAATCTTACGTTAATGGACTATCTTAATCCCC

QA 1 459 1 459
DS 



AS 1 2

CO CL5739Contig1 756 2 2 U
GGCGGGCCACGGAGAATGCACTGCACCATGAACTCCATCCCAACTTCATCTCTCGAACCG
GGCGGCTCGGTTCCTAACCAGCCTGAGAAGCTCCTCCCGCCGCCGCCACGGCGCTCTCTC
GACGAGTCGTTCCGCAGCAACATCTCCTTCTCCAAGTCATCGCTAGACCACCGCTCCCTA
GACTTCAGCAGCTCTAGATTCTCCGACATCGGAGGAGGAGTATCGTGCGAGGAAGACCGA
GAAGAAGAGACGAGTTTCAGACCGTTGGTTCTGAAGAACAAGCAGCCGAGGTGGCACGAG
CAGCTGCAGTGCTGGTGTTTGAATTTCCGCGGACGCGTGACGGTTGCGTCCGTTAAGAAC
TTCCAGCTTGTGGCGGTGAGACAGCCGCCTCAGACGCAGGGGACAGGCGGCGGCGGAGTT
GCACCAGCACCGGGGGCTCATGGAGAGCAGCAAGACAAGGTGATTCTGCAGTTTGGTAAA
GTGGGGAAAGATATGTTCACGATGGATTATAGGTATCCGTTGTCGGCGTTTCAGGCGTTT
GCGATTTGCTTGAGCAGCTTTGACACCAAGCTCGCTTGTGAATAAAAAGAAGCAACATTC
ATCGTCTACTTATCCTAGACAATTCATACTAATCGGTATTTGTGTCTCTTTATCTATGTT
ACTTGTCTATCAATTTGTCTCAGTACTCGGGTGTTTACTGTGAGAGTCAGACGTCTATTA
TTAACCTCTTCTCTGTCAATTGAAAATTTAATGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GG60TF U 1
AF RS1GG60JQ C 209
BS 1 651 RS1GG60TF
BS 652 756 RS1GG60JQ

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GGCGGCTCGGTTCCTAACCAGCCTGAGAAGCTCCTCCCGCCGCCGCCACGGCGCTCTCTC
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GACTTCAGCAGCTCTAGATTCTCCGACATCGGAGGAGGAGTATCGTGCGAGGAAGACCGA
GAAGAAGAGACGAGTTTCAGACCGTTGGTTCTGAAGAACAAGCAGCCGAGGTGGCACGAG
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TTCCAGCTTGTGGCGGTGAGACAGCCGCCTCAGACGCAGGGGACAGGCGGCGGCGGAGTT
GCACCAGCACCGGGGGCTCATGGAGAGCAGCAAGACAAGGTGATTCTGCAGTTTGGTAAA
GTGGGGAAAGATATGTTCACGATGGATTATAGGTATCCGTTGTCGGCGTTTCAGGCGTTT
GCGATTTGCTTGAGCAGCTTTGACACCAAGCTCGCTTGTGAATAAAAAGAAGCAACATTC
ATCGTCTACTTATCCTAGACAATTCATACTAATCGGTATTTGTGTCTCTTT

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DS 

RD RS1GG60JQ 548 0 0
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TTCTGAAGAACAAGCAGCCGAGGTGGCACGAGCAGCTGCAGTGCTGGTGTTTGAATTTCC
GCGGACGCGTGACGGTTGCGTCCGTTAAGAACTTCCAGCTTGTGGCGGTGAGACAGCCGC
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AGCAAGACAAGGTGATTCTGCAGTTTGGTAAAGTGGGGAAAGATATGTTCACGATGGATT
ATAGGTATCCGTTGTCGGCGTTTCAGGCGTTTGCGATTTGCTTGAGCAGCTTTGACACCA
AGCTCGCTTGTGAATAAAAAGAAGCAACATTCATCGTCTACTTATCCTAGACAATTCATA
CTAATCGGTATTTGTGTCTCTTTATCTATGTTACTTGTCTATCAATTTGTCTCAGTACTC
GGGTGTTTACTGTGAGAGTCAGACGTCTATTATTAACCTCTTCTCTGTCAATTGAAAATT
TAATGGAC

QA 1 548 1 548
DS 



AS 1 2

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GATGGCGTGGTGTACTTTGCACGACTAATGCTTGCAGATATGAATAAAGAAATAAAGGGA
TTAAGATGTGTTGTGAGTGGTTGCGGGAAGATAGCGATGCATGTTGTAGAGAAGCTAATT
GCCTGTGGGGCTCACCCTGTTACAGTTTCAGATTCAAAAGGATATTTGGTGGATGACGAT
GGATTTGATTATATGAAACTTGCCTTCTTGAGAGATATAAAATCCCAACAGAGAAGTCTG
AGAGACTATTCAAAGACGTATGCAAGGGCGAAGTACTTTGATGAAGTAAAGCCGTGGAAT
GAAAGGTGTGATGTGGCGTTCCCCTGTGCTTCTCAGAATGAAGTTGATCAAGCAGATGCT
ATTAATCTGGTCAATGCAGGCTGTCGCTTACTGGTAGAAGGTTCAAACATGCCGTGTACA
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GAGCTGGAGGAGTTGCTGCCGGAGAAATTGAAGAACTCCTTGAATCTAATTCAATGCAAT
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BQ
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AF RS1DK40TF U 1
AF RS1DK40JQ C 192
BS 1 550 RS1DK40TF
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RD RS1DK40TF 655 0 0
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TTAAGATGTGTTGTGAGTGGTTGCGGGAAGATAGCGATGCATGTTGTAGAGAAGCTAATT
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AGAGACTATTCAAAGACGTATGCAAGGGCGAAGTACTTTGATGAAGTAAAGCCGTGGAAT
GAAAGGTGTGATGTGGCGTTCCCCTGTGCTTCTCAGAATGAAGTTGATCAAGCAGATGCT
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CTCTCAAAGCAGCTAATGATTTCG*TTATCAGAAAGAGAGTCCTGAG
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QA 1 647 1 647
DS 

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TGTGGCGTTCCCCTGTGCTTCTCAGAATGAAGTTGATCAAGCAGATGCTATTAATCTGGT
CAATGCAGGCTGTCGCTTACTGGTAGAAGGTTCAAACATGCCGTGTACAGCTAAGCAGTT
GATGTTTTCAGAAAGGCGAATGTCCTGATTGCTCCTGCCATTGCTGCTGGAGCTGGAGGA
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GATTTTGAGTCTAGATTACAGGAAGCACTGAAGCAGACTTATGAGAAAGCTCTCAAAGCA
GCTAATGATTTCGGTTATCAGAAAGAGAGTCCTGAGGCTCTTCTACACGGAGCAACAATT
GCAGCATTTTTGAATATAGCTCAAGCTATGACAGACCAAGGTTGTGTCTAGCTATAAAAT
GATCCTGCATCTAAGAGTCCCAGCAGGGTTTGTCTTAAAGTTAAAATCCAAGCGAAGAAG
GCGTATTGTACTCTCTGTGACATGTCGTTATTTAGAAACTATATACTTTGATAGCATTAA
TGTTTATTAGCTATATAAACATAGCTTTCCATTGCTTATATGTTCTTTAACTTTATAGGT
AATGAATGGAATACACTAATG

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

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GGATGATGAAGAATCTGATGGAGGAAGGAAAATGATTCCGCCGCATCTGATCGTTGGACG
GAGGACGGAAGGTTTTCAAATGGCGTTTTCCGTTTGTACAGGTAACGGGAGGACACTCAA
AGGACGAGATCTTAGCCGGGTTCGTAATTCAGTTCACAGGTTAACCGGTTTTTTGGAGGC
TTAGTTTCAGACCGGTTCCCTATTTATCAAAATTTTCTGTCTTCCAATTTTTTTTTCTCT
TTAGCGGAAGAAATCAGCGGTCTTATTGTTTTTTTTCTTTTAGTTTAATTTGATGTTCAA
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TTGTTCTCAAATGTAATAGAGAAAAGCAGAAAAATAATTTCGGATTACGGTTTTTTTTT


BQ
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AAGGAAAATGTTA

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TTTTT

QA 1 245 1 245
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AAGCAAACATGAGACCTCCTCTAACTGGTGGACGTGGTGGTGGTGGGTTCAGTGGTGGAG
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AGGGTAAAGAAGAAGCTCTTGTCACTAAGAACTTGGTCCCTGGTGAAGCTGTTTACAACG
AGAAGAGAATCTCTGTTCAGAATGAAGATGGAACTAAGACTGAATACAGAGTGTGGAATC
CTTTCCGTTCTAAGTTGGCCGCTGCTATTCTCGGTGGTGTTGATAACATTTATATTAAAC
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ATCTTGTTGGACCTGAGGGATGCGTTTACGCTGTTGAGTTTTCTCACAGAAGTGGTAGAG
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ACCCTGCTAAATACAGAATGATCGTTGGCATGGTTGATGTTATCTTCGCTGATGTTGCTC
AGCCAGATCAGGCTAGGATCGTGGCTTTGAACTCAAGCTTCTTTCTCAAAACAGGAGGTC
ACTTTGTTATCTCAATCAAGGCTAACTGTATTGACTCAACAGTTCCAGCAGAAGCAGTGT
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GTTTTACTCTTTTCACAGTTCCTCAGATTTTGCCTCTCTCTTCTTCTCTTTATAATCTCC
AAAGGCGTTTTAGGTTTTATTTAAGTTTGTAATCATCTTGAATCTTGTTTACTTCAATGT
CTCAACTTACAAAGCCC


BQ
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AF RS1GE20TF U 1
AF RS1GE20JQ C 328
BS 1 770 RS1GE20TF
BS 771 1157 RS1GE20JQ

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GAGGAAGAGGTAGAGCAGAGCGTCCTCGCGGAAGAGGAGCACCTAGAGGACGTGGAGGAA
TGAAGGGAGGCAGCAAAGTGATTGTGGAGCCACACAGACACGCTGGAGTGTTCATTGCAA
AGGGTAAAGAAGAAGCTCTTGTCACTAAGAACTTGGTCCCTGGTGAAGCTGTTTACAACG
AGAAGAGAATCTCTGTTCAGAATGAAGATGGAACTAAGACTGAATACAGAGTGTGGAATC
CTTTCCGTTCTAAGTTGGCCGCTGCTATTCTCGGTGGTGTTGATAACATTTATATTAAAC
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ATCTTGTTGGACCTGAGGGATGCGTTTACGCTGTTGAGTTTTCTCACAGAAGTGGTAGAG
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ACCCTGCTAAATACAGAATGATCGTTGGCATGGTTGATGTTATCTTCGCTGATGTTGCTC
AGCCAGATCAGGCTAGGATCGTGGCTTTGAACTCAAGCTTCTTTCTCAAA
CAGAGTCA

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ATGGAACTAAGACTGAATACAGAGTGTGGAATCCTTTCCGTTCTAAGTTGGCCGCTGCTA
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CTGCTTCTGGAACTACAGTATCCCATGTATCTGATCTTGTTGGACCTGAGGGATGCGTTT
ACGCTGTTGAGTTTTCTCACAGAAGTGGTAGAGACTTGGTGAACATGGCTAAGAAGAGAA
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GCATGGTTGATGTTATCTTCGCTGATGTTGCTCAGCCAGATCAGGCTAGGATCGTGGCTT
TGAACTCAAGCTTCTTTCTCAAAACAGGAGGTCACTTTGTTATCTCAATCAAGGCTAACT
GTATTGACTCAACAGTTCCAGCAGAAGCAGTGTTTCAGAGCGAAGTGAAGAAGCTGCAAC
AGGAGCAGTTCAAGCCAGCAGAGCAGGTGACGCTTGAGCCATTTGAGCGTGACCATGCCT
GTGTCGTTGGTACCTACCGTGCGCCTAAGAAGGCCAAGGCTGTTACTGCTGCTTAGAAAA
ATTCAGAACATTCCTTGTTTTGTTTTTGGATTTGTTTTACTCTTTTCACAGTTCCTCAGA
TTTTGCCTCTCTCTTCTTCTCTTTATAATCTCCAAAGGCGTTTTAGGTTTTATTTAAGTT
TGTAATCATCTTGAATCTTGTTTACTTCAATGTCTCAACTTACAAAGCCC

QA 1 830 1 830
DS 



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ATATTTGGGTGGACAGTGGACAGGCATTTGATAAACACAATATTCTTCATTGAGCTCTCT
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AAGGTGTGGTATATTAAACACAAGGCTTTACCCTTTTTGCCAAATATAGTGATTTTTTTT
GCAATTGATATGAGAAGAAACGGAACACAGGTTTCTCTTAATTTGTTTACGTCTAGTGTG
TATAATAAGCTTTTTTTGTTGG


BQ
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AF RS1BK52TF U 1
AF RS1BK52JQ C 77
BS 1 302 RS1BK52TF
BS 303 802 RS1BK52JQ

RD RS1BK52TF 302 0 0
TCTCTTTTCATCTACGAGCACATCCGTTTGCGTCATTACCTCTCTAAGATAAGCCACAGG
TTCCGCATCTTCCTGCTTCTTCAGTTTCTGGTCGTCACGGTTAGCCAGTTTACCACGCTT
TTCCAGACCACCGCGTATAGCGGAACTATCACGTATATAAACGGTGGTGACTTCGCGGTC
TCGGCGGTGGTCCAAGTTGTTGGGATTATTTTATGTCTGCACGCAGCAACGAAGATATCT
CACAGAGCTCAAGCGATAGCATCGGTTGCAAGTAAATGGCATGCGGTAATGTCTTGTTCA
TC

QA 1 302 1 302
DS 

RD RS1BK52JQ 726 0 0
TTCTTCAGTTTCTGGTCGTCACGGTTAGCCAGTTTACCACGCTTTTCCAGACCACCGCGT
ATAGCGGAACTATCACGTATATAAACGGTGGTGACTTCGCGGTCTCGGCGGTGGTCCAAG
TTGTTGGGATTATTTTATGTCTGCACGCAGCAACGAAGATATCTCACAGAGCTCAAGCGA
TAGCATCGGTTGCAAGTAAATGGCATGCGGTAATGTCTTGTTCATCTACGGATTCAACTC
AGATAAGGACTTCTCCTAGTGGAGCTCACTTGGAGGCCACCACGAATCTACCCATCTCCT
TTCAGATTTCCCATTCGGAAAGCGATGTGGAGTCAATGGATCACTACATGAGAATGCCTG
CTGGTAGTAATAACAACCACTTCCCTTTGTACATGTCCATGTCCGCATACCATAAAAGAC
AAGCTTTTGTGTTGTATTTGCAGATGAATCCAGGAGGGATAACGATATTTGGGTGGACAG
TGGACAGGCATTTGATAAACACAATATTCTTCATTGAGCTCTCTCTCGTTACCTTTGTAC
TTGGGAAGACTATAGTTTTCAGTCCTGAATGACTCAAAAAGAAAAAGGTGTGGTATATTA
AACACAAGGCTTTACCCTTTTTGCCAAATATAGTGATTTTTTTTGCAATTGATATGAGAA
GAAACGGAACACAGGTTTCTCTTAATTTGTTTACGTCTAGTGTGTATAATAAGCTTTTTT
TGTTGG

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL5745Contig1 948 2 2 U
GGGAGAGGGGATTCTCTAGCCCCGTTGTAGAGTCAAAATGGCGGCCGGTGAACGAAAGAA
TCAGCCGTTATCTCCTCCGACGACGATTGTGCAGCCAACTACTCCGACGAAGCGTGTTTT
GATCACTACCCTTCTCGCAGGAGTTATTGGAGGAGGAGCTGGTTTAGTCTCTAAACACCG
CAAAGCTTATCCCAATATTCCCACTATTTATGCCACCAACTTCGCCATCGTCGCTGGTTG
CTATTGCGGAGCTCGTGAGTTTGTGAGGATAACTCGAAGATCAGCACATGATGATGTGTT
GAACTCAACTATTGGAGGGCTTTTCAGTGGTGCTTTGCTTGGAAGACTTCAAGGTTCTTC
TATTCTATTTCACTCTGTCTTCCTCTGTATGATACTCCCTGAAGATTTGATTGTCTTTAA
TACTACTCTCAAGAAGCTGAAAATGAGAATGATAACTCTGTCATCTGAATCTACTGAAAG
GACTCTATCATTAATTTCCAGGAGGTCCATATGGTGCATTGCGGTACTCTGTCATTTTTG
CTGCTATGGGCACTGCATCTAACTATGCCGGCCATAAAGCAAAAGAAATGTTGGAGAACT
ACCGTAACAAGGATTCGATCAAGTTGCCTGAGTGGTTTCCTGTTCAAATACTCGATGAAG
AAGCCTTAGCAAAGAAGAAAGCTCGGGAACAGAAGATATTCGCTGAAAGATCATTTGGGA
GATTGAACAAGGAAGAGACTTGACTACTTGGATTCATTGTTAGTCTCTAGGTTAGCTGTT
TCGTGAATGTAACTCTGTGGTGTTTAGATGGGACTTGAAGAGGACTTCTTTTGTGTTTCC
TATTGGGAAACAAATCTTTTCATTAGCCTCAAGAAAACCTCGTCTAGAGACAAGTTGTAT
GGTGACCTACCGTGAACGTATCTATATATAAAATATTATTCATGGTCG


BQ
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AF RS1E995TF U 1
AF RS1E995JQ C 248
BS 1 690 RS1E995TF
BS 691 948 RS1E995JQ

RD RS1E995TF 690 0 0
GGGAGAGGGGATTCTCTAGCCCCGTTGTAGAGTCAAAATGGCGGCCGGTGAACGAAAGAA
TCAGCCGTTATCTCCTCCGACGACGATTGTGCAGCCAACTACTCCGACGAAGCGTGTTTT
GATCACTACCCTTCTCGCAGGAGTTATTGGAGGAGGAGCTGGTTTAGTCTCTAAACACCG
CAAAGCTTATCCCAATATTCCCACTATTTATGCCACCAACTTCGCCATCGTCGCTGGTTG
CTATTGCGGAGCTCGTGAGTTTGTGAGGATAACTCGAAGATCAGCACATGATGATGTGTT
GAACTCAACTATTGGAGGGCTTTTCAGTGGTGCTTTGCTTGGAAGACTTCAAGGTTCTTC
TATTCTATTTCACTCTGTCTTCCTCTGTATGATACTCCCTGAAGATTTGATTGTCTTTAA
TACTACTCTCAAGAAGCTGAAAATGAGAATGATAACTCTGTCATCTGAATCTACTGAAAG
GACTCTATCATTAATTTCCAGGAGGTCCATATGGTGCATTGCGGTACTCTGTCATTTTTG
CTGCTATGGGCACTGCATCTAACTATGCCGGCCATAAAGCAAAAGAAATGTTGGAGAACT
ACCGTAACAAGGATTCGATCAAGTTGCCTGAGTGGTTTCCTGTTCAAATACTCGATGAAG
AAGCCTTAGCAAAGAAGAAAGCTCGGGAAC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1E995JQ 701 0 0
GGAGCTCGTGAGTTTGTGAGGATAACTCGAAGATCAGCACATGATGATGTGTTGAACTCA
ACTATTGGAGGGCTTTTCAGTGGTGCTTTGCTTGGAAGACTTCAAGGTTCTTCTATTCTA
TTTCACTCTGTCTTCCTCTGTATGATACTCCCTGAAGATTTGATTGTCTTTAATACTACT
CTCAAGAAGCTGAAAATGAGAATGATAACTCTGTCATCTGAATCTACTGAAAGGACTCTA
TCATTAATTTCCAGGAGGTCCATATGGTGCATTGCGGTACTCTGTCATTTTTGCTGCTAT
GGGCACTGCATCTAACTATGCCGGCCATAAAGCAAAAGAAATGTTGGAGAACTACCGTAA
CAAGGATTCGATCAAGTTGCCTGAGTGGTTTCCTGTTCAAATACTCGATGAAGAAGCCTT
AGCAAAGAAGAAAGCTCGGGAACAGAAGATATTCGCTGAAAGATCATTTGGGAGATTGAA
CAAGGAAGAGACTTGACTACTTGGATTCATTGTTAGTCTCTAGGTTAGCTGTTTCGTGAA
TGTAACTCTGTGGTGTTTAGATGGGACTTGAAGAGGACTTCTTTTGTGTTTCCTATTGGG
AAACAAATCTTTTCATTAGCCTCAAGAAAACCTCGTCTAGAGACAAGTTGTATGGTGACC
TACCGTGAACGTATCTATATATAAAATATTATTCATGGTCG

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 2

CO CL5746Contig1 778 2 8 U
GGGAACTCCCTATCTCTCTCTCTCTGTGTGGGGAAATGGTGATGGGTTCATCGAAAGGTA
GAGTGATAGCATGGTTCAATAAGAAAATCACCGATCCTCTTCTCCAGATCTTGCGTAGAG
GTACTGAGCCTAAGCAGCTTGCTTTCTCCGCCGCACTCGGCATTACCTTGGGAATATTTC
CAATTTGCGGTGTTCCTGTGTTTCTATGTGGAGTAGCTATTGCATTTTTTGGATCTGCTT
GTCATGCTCCAACCGTCATGTTGTCTAACATTATTGCCACTCCTGTAGAAATAGCTCTGG
TGGTGCCTTTCCTACGACTTGGTGAAAGAGTCACCGGTGGTCCTCATTTTCCTTTGACGT
CAGATGCCCTTAAGAAGGTTTTCACTGGCCAAGCCTCGCAGGATGTCTTTTTAAGCATTG
GTAATGCGTTACTAGGGTGGCTCGTAGCAACTCCATTTTTCTTTATTGCGCTATACGTTG
TGTTGATGCCATGTTTCAAAATCCTTGTCCGCAAGTTTGGCGCCGTTGCTTCAACCCCAA
AGACGCCTACAAGTGTTGACATAGAGCTCAACCCAAAGCCAAGATTGGCTTGAATTCAAG
AAACCTTATTGTTCTGTTATCAACACGAAAACCCTTGGAGTGTAACACTAATGTATAGGG
TATACACAGCTTGCGCTGTCAGATCGCTACACTTTGTTTAAACTTCCTTTTGAAAACAAC
TTTAACCGGAAATATTGGTTATTGCATATGAATCAAATATAAGCATAAAGTTCATTGT


BQ
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AF RS1B190TF U 1
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GTCATGCTCCAACCGTCATGTTGTCTAACATTATTGCCACTCCTGTAGAAATAGCTCTGG
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TATACACAGCTTGCGCTGTCAGATCGCTACACTTT

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CTATACGTTGTGTTGATGCCATGTTTCAAAATCCTTGTCCGCAAGTTTGGCGCCGTTGCT
TCAACCCCAAAGACGCCTACAAGTGTTGACATAGAGCTCAACCCAAAGCCAAGATTGGCT
TGAATTCAAGAAACCTTATTGTTCTGTTATCAACACGAAAACCCTTGGAGTGTAACACTA
ATGTATAGGGTATACACAGCTTGCGCTGTCAGATCGCTACACTTTGTTTAAACTTCCTTT
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TTCATTGT

QA 1 548 1 548
DS 



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BQ
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AF RS1AM54TF C 1
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QA 1 231 1 231
DS 

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TCTTATATGAGTTTGGGCATCATCAACCTCCTTTTGAGTACCAATTATGTTCAGGTCATC
TACACATACATCGATGATCACAAAGCCAGAGGACGATTTCCTTAC

QA 1 225 1 225
DS 



AS 1 2

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AACTTTGTTGAATCCTGCAAAGGGTTTGTGGGTGCAACAGTCACACCGCAACATCTCCTT
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TGTGCTGTATTTACAGCGCACCTGTTGCCTTGTCCTTATACGCCAAGGTCTTTGATGAGG
CTGGTGCTCTTGACAAGTTGGAAGCTTTCACAAGCTTCAATGGACCTGATTTTTATGGCC
TCCCGAGAAACTCGTCAAAGATCACTCTCAAGAGAGCTCCTTGGAAGGTTCCAGAGGCTT
TCTCCTTCTCCTTTGGGGATATCATTCCAATGTTTGCTGGAGAAACCCTTCAATGGCAAC
CATTCTTCGAATGAAACCGGAGTACTTATTTGTATCTTTTTGGATTGGATTCTCTTATGA
CTGAGGAATAAAAGCAAAGAAAATGTTTTACC


BQ
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AF RS1A676TF U 1
AF RS1A676JQ C 425
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BS 744 744 RS1A676JQ
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AGTCTTTGGCTTCCCCTTGTAGTTTCTTGTAAGAAACTGAAGCAGAGAGTAGTGAGAATG
GAACTCACGATCACTCAACCTGATGATTGGCATCTTCATCTCCGTGACGGTGATCTTCTT
CAGGCTGTTGTTCCCCACAGTGCGAGTAACTTTAAGAGAGCGATTGTGATGCCAAATCTG
AAACCGCCTGTTACAACCACTGCAGCTGCCATTACTTACCATGAATCCATCACGAAAGCT
TTGCCACATGGGAGCAGCTTTGATCCATTAATGACTCTTTATTTGACTGACAAAACCCAT
CCTGATGAAATCAAGCTTGCCCGGGAAAGTGGTGTGGTTTATGCGGTGAAGCTCTACCCT
GCTGGAGCCACAACCAACTCTCAAGATGGTGTCACAGACCCCTTTGGAAAATGCTTACCA
GTACTTGAAGAGATGGTCAAACAAAACGTGCCTCTGCTGGTTCATGGAGAGGTCACAGAT
CCAAATATTGATGTCTTTGACCGCGAGAAAATCTTCATTGAGACAGTACTCCAGCCTCTA
ATCCAGCGCCTTCCACAGCTTAAAGTAGTGATGGAACACATCACCACCATGGAAGCTGTG
AACTTTGTTGAATCCTGCAAAGGGTTTGTGGGTGCAACAGTCACACCGCAACATCTCCTT
CTCAACAGGAACGCTCTTTTCCA*GGTGGATTACAACCTCACAACTACTGCCTTCCCGTT
CTCAAA*GAGAGATACATCGAGAAGCCATTGTTAAAGCTGTGACTA

QA 1 826 1 826
DS 

RD RS1A676JQ 808 0 0
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TTGAAGAGATGGTCAAACAAAACGTGCCTCTGCTGGTTCATGGAGAGGTCACAGATCCAA
ATATTGATGTCTTTGACCGCGAGAAAATCTTCATTGAGACAGTACTCCAGCCTCTAATCC
AGCGCCTTCCACAGCTTAAAGTAGTGATGGAACACATCACCACCATGGAAGCTGTGAACT
TTGTTGAATCCTGCAAAGGGTTTGTGGGTGCAACAGTCACACCGCAACATCTCCTTCTCA
ACAGGAACGCTCTTTTCCAAGGTGGATTACAACCTCACAACTACTGCCTTCCCGTTCTCA
AAAGAGAGATACATCGAGAAGCCATTGTTAAAGCTGTGACTAGTGGAAGCAAGAAGTTCT
TCCTAGGTACAGATAGTGCTCCACATGAACGGAGAAGAAAAGAATCATCCTGCGGATGTG
CTGTATTTACAGCGCACCTGTTGCCTTGTCCTTATACGCCAAGGTCTTTGATGAGGCTGG
TGCTCTTGACAAGTTGGAAGCTTTCACAAGCTTCAATGGACCTGATTTTTATGGCCTCCC
GAGAAACTCGTCAAAGATCACTCTCAAGAGAGCTCCTTGGAAGGTTCCAGAGGCTTTCTC
CTTCTCCTTTGGGGATATCATTCCAATGTTTGCTGGAGAAACCCTTCAATGGCAACCATT
CTTCGAATGAAACCGGAGTACTTATTTGTATCTTTTTGGATTGGATTCTCTTATGACTGA
GGAATAAAAGCAAAGAAAATGTTTTACC

QA 1 808 1 808
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GCAAAGAGCCGTGCAAGAAAGAAGCTTGCGACATTCAAGCCTGTCTTTCTAAGAACAATT
TTCTTCCTCAAAGGTGCCAGGGAGTGATAGAGAAGTTACAGGCTTGTTGTGAGAAATGCA
ATAACGAGTCGACGCATTGTGGATCTGTAGTTGCCCTCTTGAAACAAATCAAGAAATAAT
GTCTTTGTAAACAAAGGAACTATCTCCTTTTGCCTCAACATCAAGAAGAGACTTCAATGC
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1B040JQ C 1
AF RS1B040TF U 1
BS 1 457 RS1B040TF

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AACAGTTGAGAAAGCCTGCGAGAGAGCTAGATAGAGAGAGGAGGGGGATGCCGCAACCAA
GCAAAGAGCCGTGCAAGAAAGAAGCTTGCGACATTCAAGCCTGTCTTTTTAAGAACAATT
TTTTTCCTCAAAGGTGCCAGGGAGTGATAGAGAAGTTACAGGCTTGTTGTGAGAAATGCA
ATAACGAGTCGACGCATTGTGGATCTGTAGTTGCCCTCTTGAAACAAATCAAGAAATAAT
GTCTTTGTAAACAAAGGAACTATCTCCTTTTGCCTCAACATCAAGAAGAGACTTCAATGC
ACCAACATTTATTTACTCATAATATTCTGTATCCTCAGCAATAATACGATAAATCTTTTG
TATAAATTTGTCGTCACTTTGGAATAAACATTCTTTT

QA 1 457 1 457
DS 

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AACAGTTGAGAAAGCCTGCGAGAGAGCTAGATAGAGAGAGGAGGGGGATGCCGCAACCAA
GCAAAGAGCCGTGCAAGAAAGAAGCTTGCGACATTCAAGCCTGTCTTTCTAAGAACAATT
TTCTTCCTCAAAGGTGCCAGGGAGTGATAGAGAAGTTACAGGCTTGTTGTGAGAAATGCA
ATAACGAGTCGACGCATTGTGGATCTGTAGTTGCCCTCTTGAAACAAATCAAGAAATAAT
GTCTTTGTAAACAAAGGAACTATCTCCTTTTGCCTCAACATCAAGAAGAGACTTCAATGC
ACCAACATTTATTTACTCATAATATTCTGTATCCTCAGCAATAATACGATAAATCTTTTG
TATAAATTTGTCGTCACTTTCGAATAAACATTCTTTT

QA 1 457 1 457
DS 



AS 1 2

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GTCAAGGCGGAATCCTCCAATCATCGACATGCAAATTCGATCTGAAAGAACCTTATTATA
GAATGTCTCAGCCACAAGCATACCCTGTTGCACAAGAACCACCACTACCACCACAACCGC
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TTGGTTCCTTGCGAGTTTGGTCTGGTTCTATTTTAAATGGTAGCACGAAACAGAATTTTA
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CAAGTTATCTATCGACATGATTTTTTTAC


BQ
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20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BE10JQ C 1
AF RS1BE10TF U 1
BS 1 449 RS1BE10TF

RD RS1BE10JQ 449 0 0
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GTCAAGGCGGAATCCTCCAATCATCGACATGCAAATTCGATCTGAAAGAACCTTATTATA
GAATGTTTCAGCCACAAGCATACCCTGTTGCACAAGAACCACCACTACCACCACAACCGC
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CAAGTTATCTATCGACATGATTTTTTTAC

QA 1 449 1 449
DS 

RD RS1BE10TF 449 0 0
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GTCAAGGCGGAATCCTCCAATCATCGACATGCAAATTCGATCTGAAAGAACCTTATTATA
GAATGTCTCAGCCACAAGCATACCCTGTTGCACAAGAACCACCACTACCACCACAACCGC
AGCTAAATACTCAGGACATACAGATACATAACGATGACTTCGAAGACGAGTTATTACAAG
AACCGCCACAGAAGTCGAGTAACCAGCTCTAAAGCTTAGATCATTGAATCTCAGTCATCT
TTGGTTCCTTGCGAGTTTGGTCTGGTTCTATTTTAAATGGTAGCACGAAACAGAATTTTA
TCATTCCCAATGCTTCCATGTAACAGTGTCTTTACCTTTGTGTTTTTTTTCCACATGAAT
CAAGTTATCTATCGACATGATTTTTTTAC

QA 1 449 1 449
DS 



AS 1 2

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GATGAGGTATGCTAACATGGCGAATCAGAGGAAACTGTGGAGTGACGTGTACGCTAGGCT
CCTACCTGAGCTGGTGAGTGAGTACGAAGGTCTAGTTAGCTTGAAGAAGAGTCAGAAGAC
TTCAAAGTCGAGTGGCATCGGCACCAAAGAAGGAATGGATGATTTAACACTTGAAGAAGA
AGAAGAGGAGGAGGAAGAGTACAGTGAAGATAATGACGATTACAATAGCATTTTGAAACC
TGCCTTTGAGGTGGAAGGAGAACCTGATTTTGAATCTGGACCACCAGAAGATGGCTTTGA
ATACTTGAGACGAGTCAGGTGGGAAGCTAAGCGTGTTCCTAATGTAAAAGTAGCCAAGAT
AGATGAAAGCAAGTACATAACGAAAGAGCAAAGTGTCTACATGCCACAGATACCTGAAAT
CCCCAAATGCCCAGAGCACTTATTACCACTCAAGGAATGGGAAGACTCATTGCTTTCTGA
CTTCTCACATCTTCGCCTGGCTTTATCACAAACTGACAACAACTTCTTCGGTGACGAGAT
CATGTCATCAAGTCCGTCTACAGAGTATATGCTTATGGGGATGTTCAGTACACGTCTCAA
CACGGTTACAGACGAGTCATTTGGTGTGGTGGTTTCCGAAATACAAGGAATGGACTCGGT
GACGCGGGTATCAAGGCTGAAAAAGAGGATATGTTTGGTTGAGAAGGAGAGCGGTTTACT
GGGCAGTGACTGTATATGGGTAGTAGCATTGTGTGCATCGGTGGACACTCCTTTGGATGG
CGATACTTGTGCTTGTCTCAGGGCTCTTTTGAGGAAGTGTGCGAGTGTTCGTGCGTTGGA
GGTTGAAGATGAACAAGTCATCATCATGGCAAATATGCTCATCACCATCGCAGGCAGATA
TTTTGGCCAAATGGAATAAGAGATGTTAGATTGTAACATCATGCTCTTGCTTTGAATCTG
TCTTTGTTGAGTGAAATTAGAAGAATAATTACTTGAGTATTTTTCCTTTTATGTATCCTA
TCCATATTTTAATTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DR58TF U 1
AF RS1DR58JQ C 389
BS 1 719 RS1DR58TF
BS 720 720 RS1DR58JQ
BS 721 726 RS1DR58TF
BS 727 727 RS1DR58JQ
BS 728 740 RS1DR58TF
BS 741 1156 RS1DR58JQ

RD RS1DR58TF 740 0 0
GGGAACCGCACACGGTGATGATAAGGAAGCACCGAGGAAGCATAAGAAAACTGGAGTGAA
GCATCAACATGTTGAAGCAAGTGGCGGCAAGATAATGTACTCTTTGAACCAGATTAAGTC
GATGAGGTATGCTAACATGGCGAATCAGAGGAAACTGTGGAGTGACGTGTACGCTAGGCT
CCTACCTGAGCTGGTGAGTGAGTACGAAGGTCTAGTTAGCTTGAAGAAGAGTCAGAAGAC
TTCAAAGTCGAGTGGCATCGGCACCAAAGAAGGAATGGATGATTTAACACTTGAAGAAGA
AGAAGAGGAGGAGGAAGAGTACAGTGAAGATAATGACGATTACAATAGCATTTTGAAACC
TGCCTTTGAGGTGGAAGGAGAACCTGATTTTGAATCTGGACCACCAGAAGATGGCTTTGA
ATACTTGAGACGAGTCAGGTGGGAAGCTAAGCGTGTTCCTAATGTAAAAGTAGCCAAGAT
AGATGAAAGCAAGTACATAACGAAAGAGCAAAGTGTCTACATGCCACAGATACCTGAAAT
CCCCAAATGCCCAGAGCACTTATTACCACTCAAGGAATGGGAAGACTCATTGCTTTCTGA
CTTCTCACATCTTCGCCTGGCTTTATCACAAACTGACAACAACTTCTTCGGTGACGAGAT
CATGTCATCAAGTCCGTCTACAGAGTATATGCTTATGGGGATGTTCAGTACACGTCTCA*
CACGGT*ACAGACGAGTCAT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RS1DR58JQ 768 0 0
TTTGAATCTGGACCACCAGAAGATGGCTTTGAATACTTGAGACGAGTCAGGTGGGAAGCT
AAGCGTGTTCCTAATGTAAAAGTAGCCAAGATAGATGAAAGCAAGTACATAACGAAAGAG
CAAAGTGTCTACATGCCACAGATACCTGAAATCCCCAAATGCCCAGAGCACTTATTACCA
CTCAAGGAATGGGAAGACTCATTGCTTTCTGACTTCTCACATCTTCGCCTGGCTTTATCA
CAAACTGACAACAACTTCTTCGGTGACGAGATCATGTCATCAAGTCCGTCTACAGAGTAT
ATGCTTATGGGGATGTTCAGTACACGTCTCAACACGGTTACAGACGAGTCATTTGGTGTG
GTGGTTTCCGAAATACAAGGAATGGACTCGGTGACGCGGGTATCAAGGCTGAAAAAGAGG
ATATGTTTGGTTGAGAAGGAGAGCGGTTTACTGGGCAGTGACTGTATATGGGTAGTAGCA
TTGTGTGCATCGGTGGACACTCCTTTGGATGGCGATACTTGTGCTTGTCTCAGGGCTCTT
TTGAGGAAGTGTGCGAGTGTTCGTGCGTTGGAGGTTGAAGATGAACAAGTCATCATCATG
GCAAATATGCTCATCACCATCGCAGGCAGATATTTTGGCCAAATGGAATAAGAGATGTTA
GATTGTAACATCATGCTCTTGCTTTGAATCTGTCTTTGTTGAGTGAAATTAGAAGAATAA
TTACTTGAGTATTTTTCCTTTTATGTATCCTATCCATATTTTAATTTT

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL5753Contig1 970 2 2 U
GCTGAGAAGCCTGTCATTTACCGCGATTTCAAAACATCTAATATCTTACTAGACGCGGAA
TATAACGCAAAGCTGTCTGATTTTGGACTTGCTAAAGATGCACCAGACGAGAAAAAATCA
CATGTATCAACCAGAGTCATGGGAACATATGGTTATGCAGCTCCTGAGTATGTAATGACT
GGACATTTGAGTACAAATAGCGATGAATACAGCTTTGGAGTAGTGTTACTCGAGATACTA
ACCGGACGTAGAGCGGTGGATAAAACCCGTCCCAACGGCGAACAGAACCTGGTCAAATGC
GCGAGACCTCATCTTTTAGACAAGAAGAGGTTTTACAGACTGTTGGATCCTCGCTTAGAA
GGTCACTACTCGATCAAGGGTGCTCAGAAGGCTACACAAGTAGCGGCGCAGTGTTTGAAC
CGAGACTGCAAAGCTAGACCGAAGATGAGCGAAGTGGTCGAGGCTTTGAAGCCGTTGCCG
AGTCTTAAAGACTTCGCTAGCTCGTCTTCTTCTTTCCAAACGATGCAGCCTGTTGGGAAG
AACGGTGTTAGAACACAAGGAGGAGGAGGTGGGTTTGTGTCGAGGAATGGAGTGCCTTTG
AGGAGTTTGTCTAGTTTGAACTTGCCTCAAGGTTCTTCGCCTTATCGGTATGCTCGTGGA
TCACCAAAGCCTAAAGGATAAAAGTCAAGACTTGGATATAGGAATTAGCTCTTCTTCATG
TCTGACCGGTTGGATGTTCCTGCAAAAGAGATGGTTCTGTGGAAAGTGAAGCTTGGGGAG
TTTGGAATGTTCGGATCCTTGTTTTGTGTTCCTTTTGAGTTGATGGAACTCAGGAAGATA
GTCTTTGGTTCTGAAGGTCTAGAGATTTTGATCTGTGACTTGTTATTGTGTAGAAATGTA
AAGGTTGAGAGTGTAAAGTGAACCTGTTGTTTGTACGACGTTATGTTTACACTGTCATGC
TATGCATTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CG48TF U 1
AF RS1CG48JQ C 183
BS 1 627 RS1CG48TF
BS 628 970 RS1CG48JQ

RD RS1CG48TF 627 0 0
GCTGAGAAGCCTGTCATTTACCGCGATTTCAAAACATCTAATATCTTACTAGACGCGGAA
TATAACGCAAAGCTGTCTGATTTTGGACTTGCTAAAGATGCACCAGACGAGAAAAAATCA
CATGTATCAACCAGAGTCATGGGAACATATGGTTATGCAGCTCCTGAGTATGTAATGACT
GGACATTTGAGTACAAATAGCGATGAATACAGCTTTGGAGTAGTGTTACTCGAGATACTA
ACCGGACGTAGAGCGGTGGATAAAACCCGTCCCAACGGCGAACAGAACCTGGTCAAATGC
GCGAGACCTCATCTTTTAGACAAGAAGAGGTTTTACAGACTGTTGGATCCTCGCTTAGAA
GGTCACTACTCGATCAAGGGTGCTCAGAAGGCTACACAAGTAGCGGCGCAGTGTTTGAAC
CGAGACTGCAAAGCTAGACCGAAGATGAGCGAAGTGGTCGAGGCTTTGAAGCCGTTGCCG
AGTCTTAAAGACTTCGCTAGCTCGTCTTCTTCTTTCCAAACGATGCAGCCTGTTGGGAAG
AACGGTGTTAGAACACAAGGAGGAGGAGGTGGGTTTGTGTCGAGGAATGGAGTGCCTTTG
AGGAGTTTGTCTAGTTTGAACTTGCCT

QA 1 627 1 627
DS 

RD RS1CG48JQ 788 0 0
ACATTTGAGTACAAATAGCGATGAATACAGCTTTGGAGTAGTGTTACTCGAGATACTAAC
CGGACGTAGAGCGGTGGATAAAACCCGTCCCAACGGCGAACAGAACCTGGTCAAATGCGC
GAGACCTCATCTTTTAGACAAGAAGAGGTTTTACAGACTGTTGGATCCTCGCTTAGAAGG
TCACTACTCGATCAAGGGTGCTCAGAAGGCTACACAAGTAGCGGCGCAGTGTTTGAACCG
AGACTGCAAAGCTAGACCGAAGATGAGCGAAGTGGTCGAGGCTTTGAAGCCGTTGCCGAG
TCTTAAAGACTTCGCTAGCTCGTCTTCTTCTTTCCAAACGATGCAGCCTGTTGGGAAGAA
CGGTGTTAGAACACAAGGAGGAGGAGGTGGGTTTGTGTCGAGGAATGGAGTGCCTTTGAG
GAGTTTGTCTAGTTTGAACTTGCCTCAAGGTTCTTCGCCTTATCGGTATGCTCGTGGATC
ACCAAAGCCTAAAGGATAAAAGTCAAGACTTGGATATAGGAATTAGCTCTTCTTCATGTC
TGACCGGTTGGATGTTCCTGCAAAAGAGATGGTTCTGTGGAAAGTGAAGCTTGGGGAGTT
TGGAATGTTCGGATCCTTGTTTTGTGTTCCTTTTGAGTTGATGGAACTCAGGAAGATAGT
CTTTGGTTCTGAAGGTCTAGAGATTTTGATCTGTGACTTGTTATTGTGTAGAAATGTAAA
GGTTGAGAGTGTAAAGTGAACCTGTTGTTTGTACGACGTTATGTTTACACTGTCATGCTA
TGCATTGA

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 2

CO CL5754Contig1 1022 2 4 U
GGCTGGGAGTGCTGAACACAGCAGTGGACCTAGGAATTCTCAGAGCTCCGAGAATGATGA
TTCCAGCAATGGTAGTGATGGGAATACAACTGGGGGAGAACACTCTAGGAAGAAAAGAAG
CCGGGAAGGATCACCGAACAATGATGGGAAACCTTCATCTCAAATTGTTCCTCTTCTTAG
AGATGAAAATGATAAACCTGCAGTGACTGTGGGGACTCCTGTTATGCCCACAGCTATGGA
TTTCCCACAGCCATGCCATGGTGCGCCTCATGAAGTCTGGAATGAAAAAGAGGTTAAAAG
AGAGAAGAGAAAACAGTCAAACCGAGAATCTGCTAGAAGATCAAGACTAAGGAAGCAGGC
TGAAACTGAAGAACTCTCTGTCAAGGTTGACGCACTAGTTGCTGAGAACATGACTCTGAG
GTCCAAACTAGGCCAACTAAACGATGAGTCTGAAAAACTACGGCTGGAGAACGAAGCTTT
ATTGGCTCAACTGAAAGCGACGCAGACGCAAGCAACTGGGAAAACAGAGAACCTTATATC
TCGAGTTGATAACAACAACAACAACAACTCTGTATCAGGTAGTAGTAAGAATGTGGAACA
ACAACTCTTAAACGTAAGTCTAAGAACCGATTCTGTGGCGGCTAGCTAAGCCGACTGTGG
CGCAGAAGTGAAAAAAACCCATTTCATTTCTTCTAATGGGTTCTGATTGTAACTTTAAAA
AAAAAAAGTTTTTTCTTAGATTTATAGCTCTCTCATCTCTGCATGGTGAGTAGAAACTGA
TATAATATCCTTAAGCAGAAGAGATTCAGTGTGGTCTTGATTGATTAGTTTTAGTGATAT
CATACTATACAAGCGAATGGATTCAAGAAAAGGGGAGACCTATTTTGATGGTCTCTCTTC
TTCATGATCGTTTGTGTATTCTTCTTTTATGAAAACACTCTTTCGTGTGTGTGTGTGTGT
GTTTGTATTAGATTAACGTGTTGTAAGACTTATCAATGCAAGACTTATCAATTATTCTAT
AG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RS1CF18TF U 1
AF RS1CF18JQ C 265
BS 1 676 RS1CF18TF
BS 677 677 RS1CF18JQ
BS 678 717 RS1CF18TF
BS 718 1022 RS1CF18JQ

RD RS1CF18TF 717 0 0
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TTCCAGCAATGGTAGTGATGGGAATACAACTGGGGGAGAACACTCTAGGAAGAAAAGAAG
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AGATGAAAATGATAAACCTGCAGTGACTGTGGGGACTCCTGTTATGCCCACAGCTATGGA
TTTCCCACAGCCATGCCATGGTGCGCCTCATGAAGTCTGGAATGAAAAAGAGGTTAAAAG
AGAGAAGAGAAAACAGTCAAACCGAGAATCTGCTAGAAGATCAAGACTAAGGAAGCAGGC
TGAAACTGAAGAACTCTCTGTCAAGGTTGACGCACTAGTTGCTGAGAACATGACTCTGAG
GTCCAAACTAGGCCAACTAAACGATGAGTCTGAAAAACTACGGCTGGAGAACGAAGCTTT
ATTGGCTCAACTGAAAGCGACGCAGACGCAAGCAACTGGGAAAACAGAGAACCTTATATC
TCGAGTTGATAACAACAACAACAACAACTCTGTATCAGGTAGTAGTAAGAATGTGGAACA
ACAACTCTTAAACGTAAGTCTAAGAACCGATTCTGTGGCGGCTAGCTAAGCCGACTGTGG
CGCAGAAGTGAAAAAA*CCCATTTCATTTCTTCTAATGGGTTCTGATTGTAACTTTA

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1CF18JQ 758 0 0
GCCTCATGAAGTCTGGAATGAAAAAGAGGTTAAAAGAGAGAAGAGAAAACAGTCAAACCG
AGAATCTGCTAGAAGATCAAGACTAAGGAAGCAGGCTGAAACTGAAGAACTCTCTGTCAA
GGTTGACGCACTAGTTGCTGAGAACATGACTCTGAGGTCCAAACTAGGCCAACTAAACGA
TGAGTTTGAAAAACTACGGCTGGAGAACGAAGCTTTATTGGCTCAACTGAAAGCGACGCA
GACGCAAGCAACTGGGAAAACAGAGAACCTTATATCTCGAGTTGATAACAACAACAACAA
CAACTCTGTATCAGGTAGTAGTAAGAATGTGGAACAACAACTCTTAAACGTAAGTTTAAG
AACCGATTCTGTGGCGGCTAGCTAAGCCGACTGTGGCGCAGAAGTGAAAAAAACCCATTT
CATTTCTTCTAATGGGTTCTGATTGTAACTTTAAAAAAAAAAAGTTTTTTCTTAGATTTA
TAGCTCTCTCATCTCTGCATGGTGAGTAGAAACTGATATAATATCCTTAAGCAGAAGAGA
TTCAGTGTGGTCTTGATTGATTAGTTTTAGTGATATCATACTATACAAGCGAATGGATTC
AAGAAAAGGGGAGACCTATTTTGATGGTCTCTCTTCTTCATGATCGTTTGTGTATTCTTC
TTTTATGAAAACACTCTTTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTATTAGATTAACGTGTTGT
AAGACTTATCAATGCAAGACTTATCAATTATTCTATAG

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL5755Contig1 1203 2 2 U
GGAAGGTCTCTCTGTCTTGTGTAAAAAAGCAGGAGTGTGAAGAAGCAACTCTCTGTTTTC
TCTAACAATGGCTTCTTGTGTTGTGACGACGACAAGCAGTTTCTGTACTCTTTCAGATTC
TTCTAGTATTCGTTTGAAGTCCTCCAAGCTTGTCCCTCTGAGTAATCAGCAGAGAAGACG
TTCTCTTCGGTCAGGAGGTGGTTTAAAGGTTGAAGCTTACTATGGTCTGAAGACCCCTCC
TTATCCTCTTGATGCTTTGGAACCGTATATGAGTCAGAGAACACTAGAATTGCATTGGGG
TAAACACCACCGAGGCTATGTGGACAATCTTAATAAACAGTTAGGGAAAGACGATAGACT
CTATGGATACACCATGGAAGAGCTTATCAAGGCCACATACAACAACGGCAATCCTTTACC
TGAGTTCAACAACGCTGCGCAGGTCTATAACCATGATTTCTTCTGGGAGTCGATGCAACC
TGGTGGTGGAGACATGCCTCAAAAGGGTGTTCTTGAGCAGATTGAGAAAGATTTTGGGTC
GTTTACGAATTTCAGAGAGAAGTTCACTAACGCAGCTCTTACTCAGTTTGGTTCTGGCTG
GGTCTGGCTTGTTTGTGAGATAACTCTACAAAGCTTTTTTCACTTGTCATAAGATTAACT
TGAAACTAAAAGAATGACTCTGAAGATTGGGAATCTTGATTCTCCTTTTTTGCAGTGAAG
AGGGAAGAGAGAAGACTTGAAGTGGTTAAAACCTCAAACGCCATTAACCCACTAGTGTGG
GACGATATTCCAATCATTTGCCTGGATGTGTGGGAGCACTCTTATTATTTGGACTACAAG
AACGAGAGGGCTATGTACATAAACACGTTTTTGAACCATTTGGTGTCGTGGAACGCTGCA
ATGAGTAGGATGGCCCGTGCTGAGGCGTTTGTGAACCTTGGTGAACCCAACATCCCAGTT
GCCTAAGCTAATAAAAGAAGAACTCTTTCTCGAGAGTCCATGTGAAAGCGTATCCTTGAC
AGTTTGAGCAGTCTCATTTTTGCAACAGGGGTCCCAAACAAGAAACAGTTGCTGCTTCCT
CCATCATGTGACCCATCTTTTTGTCATGTGTAGTTGAGAGGTTTAATATGAGTCATATGA
CATAGACTTGTTTGTTTGTTATATACCAAAACGATTTTGCTAGTGTTAAAACTTAAAATT
GCG


BQ
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10 10 10 

AF RS1FQ89TF U 1
AF RS1FQ89JQ C 426
BS 1 650 RS1FQ89TF
BS 651 1203 RS1FQ89JQ

RD RS1FQ89TF 650 0 0
GGAAGGTCTCTCTGTCTTGTGTAAAAAAGCAGGAGTGTGAAGAAGCAACTCTCTGTTTTC
TCTAACAATGGCTTCTTGTGTTGTGACGACGACAAGCAGTTTCTGTACTCTTTCAGATTC
TTCTAGTATTCGTTTGAAGTCCTCCAAGCTTGTCCCTCTGAGTAATCAGCAGAGAAGACG
TTCTCTTCGGTCAGGAGGTGGTTTAAAGGTTGAAGCTTACTATGGTCTGAAGACCCCTCC
TTATCCTCTTGATGCTTTGGAACCGTATATGAGTCAGAGAACACTAGAATTGCATTGGGG
TAAACACCACCGAGGCTATGTGGACAATCTTAATAAACAGTTAGGGAAAGACGATAGACT
CTATGGATACACCATGGAAGAGCTTATCAAGGCCACATACAACAACGGCAATCCTTTACC
TGAGTTCAACAACGCTGCGCAGGTCTATAACCATGATTTCTTCTGGGAGTCGATGCAACC
TGGTGGTGGAGACATGCCTCAAAAGGGTGTTCTTGAGCAGATTGAGAAAGATTTTGGGTC
GTTTACGAATTTCAGAGAGAAGTTCACTAACGCAGCTCTTACTCAGTTTGGTTCTGGCTG
GGTCTGGCTTGTTTGTGAGATAACTCTACAAAGCTTTTTTCACTTGTCAT

QA 1 650 1 650
DS 

RD RS1FQ89JQ 778 0 0
TCAACAACGCTGCGCAGGTCTATAACCATGATTTCTTCTGGGAGTCGATGCAACCTGGTG
GTGGAGACATGCCTCAAAAGGGTGTTCTTGAGCAGATTGAGAAAGATTTTGGGTCGTTTA
CGAATTTCAGAGAGAAGTTCACTAACGCAGCTCTTACTCAGTTTGGTTCTGGCTGGGTCT
GGCTTGTTTGTGAGATAACTCTACAAAGCTTTTTTCACTTGTCATAAGATTAACTTGAAA
CTAAAAGAATGACTCTGAAGATTGGGAATCTTGATTCTCCTTTTTTGCAGTGAAGAGGGA
AGAGAGAAGACTTGAAGTGGTTAAAACCTCAAACGCCATTAACCCACTAGTGTGGGACGA
TATTCCAATCATTTGCCTGGATGTGTGGGAGCACTCTTATTATTTGGACTACAAGAACGA
GAGGGCTATGTACATAAACACGTTTTTGAACCATTTGGTGTCGTGGAACGCTGCAATGAG
TAGGATGGCCCGTGCTGAGGCGTTTGTGAACCTTGGTGAACCCAACATCCCAGTTGCCTA
AGCTAATAAAAGAAGAACTCTTTCTCGAGAGTCCATGTGAAAGCGTATCCTTGACAGTTT
GAGCAGTCTCATTTTTGCAACAGGGGTCCCAAACAAGAAACAGTTGCTGCTTCCTCCATC
ATGTGACCCATCTTTTTGTCATGTGTAGTTGAGAGGTTTAATATGAGTCATATGACATAG
ACTTGTTTGTTTGTTATATACCAAAACGATTTTGCTAGTGTTAAAACTTAAAATTGCG

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 2

CO CL5756Contig1 1102 2 6 U
GAAAACCAGAGAGAGTGAGAAAGACCCTCTGACCAAAGTCAAAACTTCTTAAACTTGGTT
TCAGATCTGAAAAGGGCTTCATCGAACTCTCCGGCGTCGTTTCATGATCTGACTCCCTTC
TTCTTCGTTATCTCTTTACTTAGGACTAAGCAAAGCTGACAACACAATCTGGTTTTAAAG
ACGGTTCCTTTTAGTTTTCACTCACAAAGACCATTTCAAGTGCTCTTATGAACATGGATT
CAGCAAACAGTGAGTTCAACAAACGGGCTAGATTGTTTGAGGACCATGAAAACAAAGGCT
CCAAGGTGATTCATTCAATGATCCCTGAATCTACCACACCCCTGAACAAAGGGTATGACG
CTTCTACAACCACTCAAAACTTGTTCGTTGAATCAAAACCTGAAGCTACGACGCCAAAAG
TCCTTAAGAAGAGAGGAAGGAAGAAGAAGAATCCTAACCCCGAGGAAACAAACTCGTCAA
CTCCAGGTGGAGAGGACTCAGAGAACCGCTCAAAGTTCTACGAAAGTGCTTCTGCTAGAA
TGAGAACTGCAACTGCAGAGGAAAGAGAGAGAGCCATCACTGCAGCCAAAACCTACGAAC
CAACCAATCCATTCTTTAGAGTTGTTCTGCGACCATCTTATCTCTACAGAGGCTGCATCA
TGTACTTGCCTTCTGGCTTCATCAAGATCCAGCTAGGGGAGAAACAATGGCCAGTGAGGT
GTCTTTACAAGGCAGGGAGAGCTAAATTCAGCCAAGGATGGTATGAGTTCACGCTTGAGA
ACAATATAGGTGAAGGGGATGTTTGTGTGTTTGAGCTTCTCAGTACTCGGGACTTCGTTC
TGAAAGTCACTGCCTTCCGCGTCAACCAGTACGTGTGACTCTTCATGAGTGGTCTTCGTT
CCCAAAGTTCAAAAATTTCATGTAGGGTCTTTTATCTGTTTGTTCTGAGTGAAATTTCAG
GTAACCGTGCTTTCAATGTGATTAAGTATTCGAAGATTGAGTGAAAAACTCTGTATGAAT
GGGTAGTTAGGGTCAAAAGTAGAAGATGTTATTACTTTTATGTGAATGTTGACTATGATG
TGGTTTAAGGGTTTTGGCTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GU26TF U 1
AF RS1GU26JQ C 259
BS 1 698 RS1GU26TF
BS 699 699 RS1GU26JQ
BS 700 703 RS1GU26TF
BS 704 704 RS1GU26JQ
BS 705 718 RS1GU26TF
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TCAGATCTGAAAAGGGCTTCATCGAACTCTCCGGCGTCGTTTCATGATCTGACTCCCTTC
TTCTTCGTTATCTCTTTACTTAGGACTAAGCAAAGCTGACAACACAATCTGGTTTTAAAG
ACGGTTCCTTTTAGTTTTCACTCACAAAGACCATTTCAAGTGCTCTTATGAACATGGATT
CAGCAAACAGTGAGTTCAACAAACGGGCTAGATTGTTTGAGGACCATGAAAACAAAGGCT
CCAAGGTGATTCATTCAATGATCCCTGAATCTACCACACCCCTGAACAAAGGGTATGACG
CTTCTACAACCACTCAAAACTTGTTCGTTGAATCAAAACCTGAAGCTACGACGCCAAAAG
TCCTTAAGAAGAGAGGAAGGAAGAAGAAGAATCCTAACCCCGAGGAAACAAACTCGTCAA
CTCCAGGTGGAGAGGACTCAGAGAACCGCTCAAAGTTCTACGAAAGTGCTTCTGCTAGAA
TGAGAACTGCAACTGCAGAGGAAAGAGAGAGAGCCATCACTGCAGCCAAAACCTACGAAC
CAACCAATCCATTCTTTAGAGTTGTTCTGCGACCATCTTATCTCTACAGAGGCTGCATCA
TGTACTTGCCTTCTGGCTTCATCAAGATCCAGCTAGGG*AGAA*CAATGGCCAGTGAG
TGTCTT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1GU26JQ 844 0 0
ACAAACGGGCTAGATTGTTTGAGGACCATGAAAACAAAGGCTCCAAGGTGATTCATTCAA
TGATCC*TGAATCTACCACACCC*TGAACAAAGGGTATGACGCTTCTACAACCACTCAAA
ACTTGTTCGTTGAATCAAAACCTGAAGCTACGACGCCAAAAGTCCTTAAGAAGAGAGGAA
GGAAGAAGAAGAATCCTAACCCCGAGGAAACAAACTCGTCAACTCCAGGTGGAGAGGACT
CAGAGAACCGCTCAAAGTTCTACGAAAGTGCTTCTGCTAGAATGAGAACTGCAACTGCAG
AGGAAAGAGAGAGAGCCATCACTGCAGCCAAAACCTACGAACCAACCAATCCATTCTTTA
GAGTTGTTCTGCGACCATCTTATCTCTACAGAGGCTGCATCATGTACTTGCCTTCTGGCT
TCATCAAGATCCAGCTAGGGGAGAAACAATGGCCAGTGAGGTGTCTTTACAAGGCAGGGA
GAGCTAAATTCAGCCAAGGATGGTATGAGTTCACGCTTGAGAACAATATAGGTGAAGGGG
ATGTTTGTGTGTTTGAGCTTCTCAGTACTCGGGACTTCGTTCTGAAAGTCACTGCCTTCC
GCGTCAACCAGTACGTGTGACTCTTCATGAGTGGTCTTCGTTCCCAAAGTTCAAAAATTT
CATGTAGGGTCTTTTATCTGTTTGTTCTGAGTGAAATTTCAGGTAACCGTGCTTTCAATG
TGATTAAGTATTCGAAGATTGAGTGAAAAACTCTGTATGAATGGGTAGTTAGGGTCAAAA
GTAGAAGATGTTATTACTTTTATGTGAATGTTGACTATGATGTGGTTTAAGGGTTTTGGC
TCCG

QA 1 844 1 844
DS 



AS 1 2

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TTTTTGTAACTTCGATCTCCATACCGGCAAAAATACTTTGTGGTTCTTCTCTCTTGTCCA
TATTCATCTTCCGTTTTAGCCGTCCAAACAAAACCGTGATCATTCTTGTTTTATAAATCC
AAAGGTTTAGGTTCAGATTCTTCAAACCCTTTGTTTTTAAAAAATAAAATGGTGTGCGTG
GTTTCTCGTACTGGTCGTCAGTTCCAAAGATACAACAAGGGACGCCGTCAAGTCGTAGGA
TGTATACCGTATAGACTCAAGATTTCGAGCGATGGCACAATCAGCGACGAATTTGAAGTT
TTGGTTATCTCATCACAGAAGGGTCATGCTCTAATGTTCCCAAAGGGTGGTTGGGAGCTT
GATGAATCTGTAGAAGAAGCTGCATCAAGAGAGTCTTTGGAAGAAGCTGGAGTTATTGGA
GACGTTGAGAGACAACTTGGAAAATGGGATTTCTTGAGCAAAAGCAGAGGAACATTCTAT
GAAGGACTAATGTTCCCGATGCTTGTGAAAGAAGAGCTTGATCTCTGGCCTGAACAACAT
CTTCGTCAAAGAATGTGGATGAAAGTAGATGAAGCAAGAGAAGCTTGTAGAGATTGATGG
ATGAAGGAAGCTTTGGATGTTTTGGTCCACAGGCTTTCTTCATCACCATCAGTGAAGCCA
ATGGAAGAAGACACGAAGATTCCACTGATGTCCACGTGCTAAAACGAAGACTAATCTCTC
ATGTGCTCGTGATTATTATTAACATCTTATGCCAGAGCAACGAGAAGATTGTAGATTTTT
AGGTGTTTGAAGCAAGAGTACACCATGTGAACTCGACCGACCGACAGATACGTGGCCACA
TGGGGTTAGTTGGAACTTCGGTTTGTTACCAGAGAAAAACGTTTTGTGATTGTTGTTGTA
TTATGCTTGTGCAACTGCTTAAGATGGGAGGAAGAAGATTATAAAAAAGTAGAGACTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G292TF U 1
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AAAGGTTTAGGTTCAGATTCTTCAAACCCTTTGTTTTTAAAAAATAAAATGGTGTGCGTG
GTTTCTCGTACTGGTCGTCAGTTCCAAAGATACAACAAGGGACGCCGTCAAGTCGTAGGA
TGTATACCGTATAGACTCAAGATTTCGAGCGATGGCACAATCAGCGACGAATTTGAAGTT
TTGGTTATCTCATCACAGAAGGGTCATGCTCTAATGTTCCCAAAGGGTGGTTGGGAGCTT
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GACGTTGAGAGACAACTTGGAAAATGGGATTTCTTGAGCAAAAGCAGAGGAACATTCTAT
GAAGGACTAATGTTCCCGATGCTTGTGAAAGAAGAGCTTGATCTCTGGCCTGAACAACAT
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ATGAAGGAAG

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DS 

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T
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CTGGAGTTATTGGAGACGTTGAGAGACAACTTGGAAAATGGGATTTCTTGAGCAAAAGCA
GAGGAACATTCTATGAAGGACTAATGTTCCCGATGCTTGTGAAAGAAGAGCTTGATCTCT
GGCCTGAACAACATCTTCGTCAAAGAATGTGGATGAAAGTAGATGAAGCAAGAGAAGCTT
GTAGAGATTGATGGATGAAGGAAGCTTTGGATGTTTTGGTCCACAGGCTTTCTTCATCAC
CATCAGTGAAGCCAATGGAAGAAGACACGAAGATTCCACTGATGTCCACGTGCTAAAACG
AAGACTAATCTCTCATGTGCTCGTGATTATTATTAACATCTTATGCCAGAGCAACGAGAA
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GATACGTGGCCACATGGGGTTAGTTGGAACTTCGGTTTGTTACCAGAGAAAAACGTTTTG
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AAGTAGAGACTGC

QA 2 794 2 794
DS 



AS 1 2

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ATATCCATACATTTTGATGTATGG


BQ
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AF RS1FU46JQ C 1
AF RS1FU46TF U 1
BS 1 444 RS1FU46TF

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ATATCCATACATTTTGATGTATGG

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DS 

RD RS1FU46TF 444 0 0
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TGGTGATTTTTTGACCCCAAATTCTGCCTTTTAGAGCCTCAAACAGGCTGTCGAATGTTT
CGGGCCGTGATTGAGATGCGATACGCTGTTTCCGGGTGTTTTTTGCAGTTTCCTATATCA
ATATCCATACATTTTGATGTATGG

QA 1 444 1 444
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GAATGAAAAATAAAAATCAAGAATGAAGATGTGTGCATCTTGAAAACAGAGGATTGATCA
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TTACTTTGTAGCTTTTATAGAGAAGTTTTTCGGATGTTTGTTTGAAACTTTGAATATATA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1G511TF U 1
AF RS1G511JQ C 398
BS 1 623 RS1G511TF
BS 624 932 RS1G511JQ

RD RS1G511TF 623 0 0
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GCAGGTGGAAGACTTGGTGAAGGAAGTTACATTCCTCAGGTGAATTCTGCAATGGAGAGA
TTAGAAGCCTTAGTTAGTTTTGTAAATCAGGCTGATCACCTGAGACACGAGGCGTTGCAA
CAAATGCATAGGATCTTGACCACACGACAAGCGGCTCGAGGGTTATTGGCTCTTGGTGAG
TATTTTCAACGGCTTAGAGCCTTGAGTTCGAGTTGGGCAACTAGAGACCGTGAACAAACA
TAGGTTTTGAGTTTTTGGAAACA

QA 1 623 1 623
DS 

RD RS1G511JQ 535 0 0
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CAACTAGAGACCGTGAACAAACATAGGTTTTGAGTTTTTGGAAACAAAAGAAAAAACAAG
AAAAGACCAACAAGAAGAATCAAGAATGAAAAATAAAAATCAAGAATGAAGATGTGTGCA
TCTTGAAAACAGAGGATTGATCACTCAGAACAAATGGGGTTGCTGCCGGTAATTAATTTT
TATTTGCGATGGAATTAGAGAATTTGAGAAATATATTGATAAAGTTGTAAATATCAAAAG
AGGGAGTTGAGTGCAAAGATTTTTTACTTTGTAGCTTTTATAGAGAAGTTTTTCGGATGT
TTGTTTGAAACTTTGAATATATAGAACTTGGTTCCTGATAGATAATATTACATAC

QA 1 535 1 535
DS 



AS 1 2

CO CL5761Contig1 702 2 6 U
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AAAAATCTTCATTGGATTTCTAAACAAACAAACAAACAAAAAAAAAAAATAGAAAAAATT
TAAGAAAAGAATTACAAGAAATCAAATTAAACAGATCTCTCACATGAAAAAAACATTCTG
ATGCAAAAAAAGAAGTTAATAAACAATTGTGCATAATGGGTATTGTAAAGAGTCCATTGA
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TAACTGGGACTTTTCAGTTGTTGGTTGCAGCTGCTGAGAGGTGACTCTGTATCCAGTGAT
CACAGGAAGTAGTCTGGTGTTCTCCGAGTAACGTCTGGTTCTCCTCTCCTCGGTGCTGGT
TCAAACTGAATAAAGGTGTGGTTCCTGCAGTCATCAACTTCGAGAATCGAAGCCATGTTC
CCACAACGGTAACAATAGTTTGGTGCACTGAAGATAGTTACCACTTTTTGCTCATGAGCC
CAGTTGTATCCATCCATAACCAGCTGATGGGCTCTGGCGATCAGCTTTAAGCTGTTTGAG
TGGTTGAACTGTTCGGATATGTCCTGACCAAACGTATATCCC


BQ
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AF RS1FZ47JQ U 1
AF RS1D920TF C 39
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DS 

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TCCC

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1E167TF U 1
AF RS1DL51TF U 230
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G
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GGTGTTGCAATGTAGGTTGTTTTTGGACCCAAAAAAACTCAAGGTTTTGTAGGAGATGTT
ATGACATTGAGATAAACAACGTGTGGTTTGGTTTGTAGGAGATGTTATGCCATTTAACTA
GCCT

QA 2 365 2 365
DS 



AS 1 2

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ATGCTACAAGAAAGTTGACACTAATGAGGCTGCATCTTGTCTAGAGCGAGCAGTGGATAT
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CTTTCAAAATGAAGAAGTGACCACCTCTGCAAACCAGTGTAATCTGAAGGTGGCACAGTA
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CCTTATTAATTACTGCTGGTTCGTATCATCACTAGTGTTAGTGTTACTTCTTCATTCATG
TTTGGTTTTATTGTGTGAGGT


BQ
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AF RS1AL40TF U 1
AF RS1AL40JQ C 385
BS 1 790 RS1AL40TF
BS 791 793 RS1AL40JQ
BS 794 843 RS1AL40TF
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RD RS1AL40TF 843 0 0
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GGGGGATCATCTGGTGAGAGCCGAGGAATTCGAGAAGAAGGCTGAGAAGAAGCTCAACGG
ATGGGGAATCTTCGGATCTAAGTACGAGGATGCTGCTGATCTCCTCGAGAAATCTGCTAA
TTCTTATAAGCTCGCCAAATCATGGGATCTAGCTGGAAAGGCTTATCTTAAACTTGCTGA
TTGTCACTTAAAGTCCGACAGCAAACATGATGCTGCTAACGCTTACGCCGAAGCTGCTAA
ATGCTACAAGAAAGTTGACACTAATGAGGCTGCATCTTGTCTAGAGCGAGCAGTGGATAT
ATTCTGCGAGATAGGAAGGCTGAATATGGCTGCCAGATACTACAAGGAAATTGCTGAGTA
TTATGAAGCTGACCAGAAGATCGACCAGGCTATTTCTTACTTTGAAAAGGCAGCTGAGTT
CTTTCAAAATGAAGAAGTGACCACCTCTGCAAACCAGTGTAATCTGAAGGTGGCACAGTA
TGCTGCACAGTTGGAGCAATATGAGAAGGCCATCAAGATTTATGAAGAGATAGCATGCCA
ATCTCTCAACAATAACTTGCTTAAGTATGGGAGTTAAGGGACATCTTCTTAATGCTGGCA
TGTGCCACCTTTGCAAAGCTGATGTTGTTTCCATCACCAATGCGTTGGAGAAATATCACG
ATCTTGATCCAACTTTTACAGGAACAAGAGAATGCAAATTCTTATCGGACCTTGCTTCTG
CTATTGATGA**GAGACATAGCAAAGTTCACAGACGTTGTCAAGGAGTTGGATAGCATGA
CTC

QA 1 843 1 843
DS 

RD RS1AL40JQ 657 0 0
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CTCTGCAAACCAGTGTAATCTGAAGGTGGCACAGTATGCTGCACAGTTGGAGCAATATGA
GAAGGCCATCAAGATTTATGAAGAGATAGCATGCCAATCTCTCAACAATAACTTGCTTAA
GTATGG*AGTTAAGGGACATCTTCTTAATGCTGGCATGTGCCACCTTTGCAAAGCTGATG
TTGTTTCCATCACCAATGCGTTGGAGAAATATCAGGATCTTGATCCAACTTTTACAGGAA
CAAGAGAATGCAAATTCTTATCGGACCTTGCTTCTGCTATTGATGAAGAAGACATAGCAA
AGTTCACAGACGTTGTCAAGGAGTTGGATAGCATGACTCCTCTGGATTCATGGAAGACGA
CTATGTTGTTGAGGGTGAAGGAGAAGCTGAAGGCAAAGGAGCTTGGGGAAGATGTTCTTA
CCTAAACATATCTCTCTCTATCTAACCCAAGCTATCCCTTATTAATTACTGCTGGTTCGT
ATCATCACTAGTGTTAGTGTTACTTCTTCATTCATGTTTGGTTTTATTGTGTGAGGT

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1EH03JQ C 1
AF RS1EH03TF U 1
BS 1 226 RS1EH03TF

RD RS1EH03JQ 226 0 0
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GAGGAAGAGAGGGAGAGTGTTGTTCATCGTTTGGTTTTTGAGAATGTTTTAGATCACATC
ATCATTTGTTTGTATAGTGTTTGTTGTATCGTTTGCTTCTCTACGTTTCTCAATGTAGGT
TGTTTTTGGACCAAGAAAATGCTAGGCTATGTCAAGTTCTTCGTAG

QA 1 226 1 226
DS 

RD RS1EH03TF 226 0 0
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GAGGAAGAGAGGGAGAGTGTTGTTCATCGTTTGGTTTTTGAGAATGTTTTAGATCACATC
ATCATTTGTTTGTATAGTGTTTGTTGTATCGTTTGCTTCTCTACGTTTCTCAATGTAGGT
TGTTTTTGGACCAAGAAAATGCTAGGCTATGTCAAGTTCTTCGTAG

QA 1 226 1 226
DS 



AS 1 2

CO CL5765Contig1 939 2 2 U
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AAACCTGATTAATAGTCTTTTACCTCTTTTAATTAAATTTATTTTTGTTATTTCTTTTTA
AAACTTTTTTGGTGAAAAAAAACTAAAAACAGTCATTTGAGAATATGATTAATATATTTT
TTATCATTGGAACTTTTTTTTTGAAAAAGTCTAAATTAGTCAGTTATAAACTGTAAGTCT
AAATTATTATTGAAACTATTTTTAAAAAAAAATTTTGAATTTTATTTTTTTAATTCGTAC
CCCAAAATTTCATCCCTTAATTCTAAAACTTAAATCTATATTAATTAATCATAGTGATAT
AAAGTCTATTTACTTTTTAATGAAATATTTTATATTTGTTTTGATCCTTGAGACATATAT
ATTTGTGATAAAAAATCTTTTGAATGTCAACGTAGAGAAATTCTCTTAATATATCATCAT
GTTAATTACAGTTTCTATTGTTAATAATATATTAATATTGGTTAGTGATAGCCTGATCAG
GTAGCTGACAATCATTTGCTTTATATTCTATCATCAATTGGGCTCATGTAGTTTCCTAAA
CTAACAAAGTAACCAGAAACTAGAACATGATTTGACTTTGCTTTTGCATAAAGTATTATA
TATCCCTTTGGCTTTGCGTCGACCTGTGTCTTTTGTTCTACAAAACCATCTGCAATTCAA
CAGTATTCAGCTTTTATTTAATTAAAACACACACCCATTCAAATAATAAACTACCATTTT
GCTCTAACAAGCTGCTCAAAAGCAAAATTTGACTTTTTATTCACTTTATTCTCATTCTGC
AACTGTTTTGGTAAACAAACTATAAAAAGCAGAACCTCATAACAATCTCTCTACAACACA
AAACTTCAAACATCAATCAAAGCCTTATACTCTCTTTCC


BQ
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AF RS1GA21TF U 1
AF RS1GA21JQ C 348
BS 1 573 RS1GA21TF
BS 574 939 RS1GA21JQ

RD RS1GA21TF 573 0 0
GAAATATATTAATATCATTAATTATACAAACTATTTGATTGATATGATAACAATATATAT
AAACCTGATTAATAGTCTTTTACCTCTTTTAATTAAATTTATTTTTGTTATTTCTTTTTA
AAACTTTTTTGGTGAAAAAAAACTAAAAACAGTCATTTGAGAATATGATTAATATATTTT
TTATCATTGGAACTTTTTTTTTGAAAAAGTCTAAATTAGTCAGTTATAAACTGTAAGTCT
AAATTATTATTGAAACTATTTTTAAAAAAAAATTTTGAATTTTATTTTTTTAATTCGTAC
CCCAAAATTTCATCCCTTAATTCTAAAACTTAAATCTATATTAATTAATCATAGTGATAT
AAAGTCTATTTACTTTTTAATGAAATATTTTATATTTGTTTTGATCCTTGAGACATATAT
ATTTGTGATAAAAAATCTTTTGAATGTCAACGTAGAGAAATTCTCTTAATATATCATCAT
GTTAATTACAGTTTCTATTGTTAATAATATATTAATATTGGTTAGTGATAGCCTGATCAG
GTAGCTGACAATCATTTGCTTTATATTCTATCA

QA 1 573 1 573
DS 

RD RS1GA21JQ 592 0 0
ATCATAGTGATATAAAGTCTATTTACTTTTTAATGAAATATTTTATATTTGTTTTGATCC
TTGAGACATATATATTTGTGATAAAAAATCTTTTGAATGTCAACGTAGAGAAATTCTCTT
AATATATCATCATGTTAATTACAGTTTCTATTGTTAATAATATATTAATATTGGTTAGTG
ATAGCCTGATCAGGTAGCTGACAATCATTTGCTTTATATTCTATCATCAATTGGGCTCAT
GTAGTTTCCTAAACTAACAAAGTAACCAGAAACTAGAACATGATTTGACTTTGCTTTTGC
ATAAAGTATTATATATCCCTTTGGCTTTGCGTCGACCTGTGTCTTTTGTTCTACAAAACC
ATCTGCAATTCAACAGTATTCAGCTTTTATTTAATTAAAACACACACCCATTCAAATAAT
AAACTACCATTTTGCTCTAACAAGCTGCTCAAAAGCAAAATTTGACTTTTTATTCACTTT
ATTCTCATTCTGCAACTGTTTTGGTAAACAAACTATAAAAAGCAGAACCTCATAACAATC
TCTCTACAACACAAAACTTCAAACATCAATCAAAGCCTTATACTCTCTTTCC

QA 1 592 1 592
DS 



AS 1 2

CO CL5766Contig1 695 2 1 U
GGAATGGCCCGAAGCTTCGAGAAGCTTCTAAGAAAACTTCACGCGAGGTTCTCCAATGGA
CTCGTCGAGGCAGCCCGCTTCGTGCACTGCTTGTCATCACTATTGGAACAATAGTTCTTG
TTACGACGATGGCTTTGGTTGTCTTCACTCTCTTCTTCGTAGCTGCGACATTCAATGCGA
TCATAATCTCTCTTTTGGTTTCACTCGCTGCTGCTGGTGGCTTCTTGGCTCTCTTCTTTC
TCTCCTTGGCTGGTATTTACATCGGAGCTTTATCCGTTGCCGCTTCCGTCATCTCCACCG
TTACAATATCAGCGGTTGTTTGCGTTTTAATTGCTTCAGGTTGGATAGGGTTTTTCTATG
CTGTGTGGTTGGGAGCAAGAGGAAGCCTCCGCTTGGCGAAGCAATCGCTTTCAGTGATGG
GAGGTAACACTTTCAGTCGTCATCATCAACACAAAGGTCGAGAGGTTAGCATCGAATCAT
CCAGCTGAGGATAGGATGATTGGTCAAGCGTGTTGTTTGTGGAATTTTTATATATAAACG
TTTATTTGTTGCGAAGAAGCAGAGAACCATAAGAGAGTCGTCGTTTTTGAATCAATGTCT
ACGTTTGGATTATGACTTTGGATCTGTGTATGCAGAAATTTGTGTTTAATGTACTTCAGA
ATGATGGATATACATTATGAGAACTCAAATTAGAG


BQ
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AF RS1GX62TF U 1
AF RS1GX62JQ C 235
BS 1 695 RS1GX62TF

RD RS1GX62TF 695 0 0
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CTCGTCGAGGCAGCCCGCTTCGTGCACTGCTTGTCATCACTATTGGAACAATAGTTCTTG
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TCATAATCTCTCTTTTGGTTTCACTCGCTGCTGCTGGTGGCTTCTTGGCTCTCTTCTTTC
TCTCCTTGGCTGGTATTTACATCGGAGCTTTATCCGTTGCCGCTTCCGTCATCTCCACCG
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CTGTGTGGTTGGGAGCAAGAGGAAGCCTCCGCTTGGCGAAGCAATCGCTTTCAGTGATGG
GAGGTAACACTTTCAGTCGTCATCATCAACACAAAGGTCGAGAGGTTAGCATCGAATCAT
CCAGCTGAGGATAGGATGATTGGTCAAGCGTGTTGTTTGTGGAATTTTTATATATAAACG
TTTATTTGTTGCGAAGAAGCAGAGAACCATAAGAGAGTCGTCGTTTTTGAATCAATGTCT
ACGTTTGGATTATGACTTTGGATCTGTGTATGCAGAAATTTGTGTTTAATGTACTTCAGA
ATGATGGATATACATTATGAGAACTCAAATTAGAG

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1GX62JQ 461 0 0
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TTTATGCTGTGTGGTTGGGAGCAAGAGGAAGCCTCCGCTTGGGGAAGCAATCGCTTTCAG
TGATGGGAGGTAACACTTTCAGTCGTCATCATCAACACAAAGGTCGAGAGGTTAGCATCG
AATCATCCAGCTGAGGATAGGATGATTGGTCAAGCGTGTTGTTTGTGGAATTTTTATATA
TAAACGTTTATTTGTTGGGAAGAAGCAGAGAACCATAAGAGAGTCGTCGTTTTTGAATCA
ATGTTTACGTTTGGATTATGACTTTGGATCTGTGTATGCAGAAATTTGTGTTTAATGTAC
TTCAGAATGATGGATATACATTATGAGAACTCAAATTAGAG

QA 1 461 1 461
DS 



AS 1 2

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CGACGTTTCTTCATAGCTCTTCATACGTGTCCCCTATATAAATTGCAGGAATTATTTTCC
AGGGGTTGTATCTTTTCACACCGGAACGGTCGTCATCTTCCTTTAGTATTTGTATGTTTT
TATAAGTTTACATATTGAAGAGATCGCACAGGCTTTCTCTCTTCTGTCCCTTATCTCTCT
CTCTCCGTCTCCCCTTAGTTTAATTTTGCGGCAGAACTCAAAGGTATTGCTATTGATCTG
CAATTTGCAAACTATTGTCTCGTTGAAGTTTCTGCTATTACAGTAAACGTACTTTTGCTT
AGATGTCCTCTGGTAAGGCTTTTTAGTGGGATTAGCGTCGGTAGGATCCACAATTCAGAA
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CTTTCTGGTATTTTTAAATCGATTTCTGATACGTGAGGAGGTACGTCTTCAAGAGAACCA
GAGGACATATAAGCAAAAATTACTGATCAAACAAGGAACCACAGGAGGGTATCTCTTCAA
GATAACAATTCTGATACCTGAAGCCTCATCTCCAGAGTGAGCTCCTTCTCCGGCGTATTC
CCCGACGATGGCTTCTCTCTCTGATAGGCGGCGTCTCCTCTTCACTGCTGCTGCTTTAGT
TGTCCACACAATCAGTAATTTTGCTTAGATGTCATCTGGTTCATTGATTCTTTATCATTT
CCATTCATCATTGTTCTTACTCCCATC


BQ
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AF RS1AV73TF U 1
AF RS1DK72TF U 297
BS 1 308 RS1AV73TF
BS 309 309 RS1DK72TF
BS 310 687 RS1AV73TF
BS 688 688 RS1DK72TF
BS 689 724 RS1AV73TF
BS 725 725 RS1DK72TF
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BS 747 760 RS1AV73TF
BS 761 807 RS1DK72TF

RD RS1AV73TF 772 0 0
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CGACGTTTCTTCATAGCTCTTCATACGTGTCCCCTATATAAATTGCAGGAATTATTTTCC
AGGGGTTGTATCTTTTCACACCGGAACGGTCGTCATCTTCCTTTAGTATTTGTATGTTTT
TATAAGTTTACATATTGAAGAGATCGCACAGGCTTTCTCTCTTCTGTCCCTTATCTCTCT
CTCTCCGTCTCCCCTTAGTTTAATTTTGCGGCAGAACTCAAAGGTATTGCTATTGATCTG
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AGATGTCCTCTGGTAAGGCTTTTTAGTGGGATTAGCGTCGGTAGGATCCACAATTCAGAA
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CTTTCTGGTATTTTTAAATCGATTTCTGATACGTGAGGAGGTACGTCTTCAAGAGAACCA
GAGGACATATAAGCAAAAATTACTGATCAAACAAGGAACCACAGGAGGGTATCTCTTCAA
GATAACAATTCTGATACCTGAAGCCTCATCTCCAGAGTGAGCTCCTTCTCCGGCGTATTC
CCCGACGATGGCTTCTCTCTCTGATAG*CGGCGTCTCCTCTTCACTGCTGCTGCTTTAGT
TGTC*ACACAATCAGTAATTT*GCT*AGATGTCATCTGGT
CATGATCTTATC

QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1DK72TF 511 0 0
G
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CTTAGATGTCCTCTGGTAAGGCTTTTTAGTGGGATTAGCGTCGGTAGGATCCACAATTCA
GAACAACTCAATCATTCGCTGATGACTGATAATTTCAGAATCAGATTAAGGATGGAGTGT
GTCCTTTCTGGTATTTTTAAATCGATTTCTGATACGTGAGGAGGTACGTCTTCAAGAGAA
CCAGAGGACATATAAGCAAAAATTACTGATCAAACAAGGAACCACAGGAGGGTATCTCTT
CAAGATAACAATTCTGATACCTGAAGCCTCATCTCCAGAGTGAGCTCCTTCTCCGGCGTA
TTCCCCGACGATGGCTTCTCTCTCTGATAGGCGGCGTCTCCTCTTCACTGCTGCTGCTTT
AGTTGTCCACACAATCAGTAATTTTGCTTAGATGTCATCTGGTTCATTGATTCTTTATCA
TTTCCATTCATCATTGTTCTTACTCCCATC

QA 2 511 2 511
DS 



AS 1 2

CO CL5768Contig1 595 2 1 U
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AAACTATGGGCCGTTGGTTGAGAAAGACGCTAGTTCGAGCAAGTACGTGAGGTACACGGT
GGTGGCTTTGGAGAAGATTCTCAGCTCTCTTTACGTGCCTAGGCCTATGAGATATGGGAG
TTTCAAAGGAACACCGCCGCCGAGTGAGAAACTCAAGAATGATGTTGACTTGAGACGCAC
TACTTCTGCTGTTGTATGATTGAAGAAGCCATGTTCTGTTGTCATGTTGTGTCTGCTCTT
GCATCTCCCGGGAAGCTTATCTTTCAATGGAGGAGCAGATGTAGTCTTTTTATACTTATA
TAAAAATACTGTCAAATGAGGTACAGCTTTTTTAGTCATTGATCAAGTCCCTTTAGTTCA
TTTATGTCTTAAGGTTTCATGTTAGGGACCAAGTGAGTTTAGATTATTCTATTTAATGGG
ATAACCAGAAGATGGGCAATTTTCTTGTTCTTGCTTAGTTGTTGTGCTTACTCATTTGTG
ACGCTTTATGAAGTTTAAAACAATAATGGAAATGTAGTAGAACCAGTTTTGTTTT


BQ
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AF RS1FN40TF U 1
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TTTCAAAGGAACACCGCCGCCGAGTGAGAAACTCAAGAATGATGTTGACTTGAGACGCAC
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GCATCTCCCGGGAAGCTTATCTTTCAATGGAGGAGCAGATGTAGTCTTTTTATACTTATA
TAAAAATACTGTCAAATGAGGTACAGCTTTTTTAGTCATTGATCAAGTCCCTTTAGTTCA
TTTATGTCTTAAGGTTTCATGTTAGGGACCAAGTGAGTTTAGATTATTCTATTTAATGGG
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ACGCTTTATGAAGTTTAAAACAATAATGGAAATGTAGTAGAACCAGTTTTGTTTT

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TCTTGTTCTTGCTTAGTTGTTGTGCTTACTCATTTGTGACGCTTTATGAAGTTTAAAACA
ATAATGGAAATGTAGTAGAACCAGTTTTGTTTT

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DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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TGGAGATGCTGATGAATGAATCGAAGGAGAAAATGTCTGAACTTGAAGCCAATCCTCTGT
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TTTTGGGTCTTGCTTGAAAGATTGATACTTATATTTATGTATGATACTGAGACTTTTACA
CTCT

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AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

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TTGTCCCTTTGCGCCGTTGCTCCTTCCTCCTCCTCCCGAACCGCCGCCGCTCGTGTTTCT
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AGTATGCGGTCTCAATTCCGGGTTCTATCCGGCTTGTTATAACTCTGTCAGTATGCAGGG
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TTATCTTATCTTTTGAGGATTCACATGTATCTCTTGTGTTTTCTGATGGTTGTAATATGG
CAAGTTGTCCCTTTCTACTTTGTATTTCCTCCTCTAATGAAGGTTGAGACTTTAAATTA


BQ
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AF RS1CV08TF U 1
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BS 1 750 RS1CV08TF
BS 751 899 RS1CV08JQ

RD RS1CV08TF 750 0 0
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AACCCGATTAGGGTTTTCCTGTGAACCATCTCCGCCGCCGTCGGTGTGGCCTCTCGCCCA
CTGACGAGAACATTCCTCTTTCTCCCTCCTCTTCCTTTCTTCCATGGCTCTGCTGGTTCC
TTGTCCCTTTGCGCCGTTGCTCCTTCCTCCTCCTCCCGAACCGCCGCCGCTCGTGTTTCT
CATAGATCTCCCAGTCGAGTGCTCTCCTCACGTCCTTTCCGTTCCTCCCCACCCACCGGA
TCCGTCTCTGTTCCTGTGCGGCTTCTTTGACTCTGCAGTGACTATACTGTCTGTCCGTTT
AGTAACTCTATCAGTTCCGGTGATGTTCGTTCTTGTGGTTTTCTGTGATTCCTCTACTGC
AGTATGCGGTCTCAATTCCGGGTTCTATCCGGCTTGTTATAACTCTGTCAGTATGCAGGG
TTTTATATGTCTGTGTTTTAACTGTGGAGGTGTATAATTTGCTTTCTAACCATTGGTGGC
AATTTGGAAAGAAAAGCAACAGTATTTACTTCCTTACAGTGCATCAGATTTGTTTGATCC
CACGAAGACTTGGTTGCTCATTGTCCTGGTATCATGACCTCACTGCCTTAGTTGCAGAGT
GTCTAGCCCTTTTGGGCGTTTCTAAGCTGGTTTGCAAGTCAGACTGCCATGAACTCAGTT
GCCTCCTTTCAGAGAGTTGGTCTTTTGATG

QA 1 750 1 750
DS 

RD RS1CV08JQ 596 0 0
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AACTCTATCAGTTCCGGTGATGTTCGTTCTTGTGGTTTTCTGTGATTCCTCTACTGCAGT
ATGCGGTCTCAATTCCGGGTTCTATCCGGCTTGTTATAACTCTGTCAGTATGCAGGGTTT
TATATGTCTGTGTTTTAACTGTGGAGGTGTATAATTTGCTTTCTAACCATTGGTGGCAAT
TTGGAAAGAAAAGCAACAGTATTTACTTCCTTACAGTGCATCAGATTTGTTTGATCCCAC
GAAGACTTGGTTGCTCATTGTCCTGGTATCATGACCTCACTGCCTTAGTTGCAGAGTGTC
TAGCCCTTTTGGGCGTTTTTAAGCTGGTTTGCAAGTCAGACTGCCATGAACTCAGTTGCC
TCCTTTCAGAGAGTTGGTCTTTTGATGCTCATTGGATCTTATTGGCTATTCGGTCCCTTA
TCTTATCTTTTGAGGATTCACATGTATCTCTTGTGTTTTCTGATGGTTGTAATATGGCAA
GTTGTCCCTTTCTACTTTGTATTTCCTCCTCTAATGAAGGTTGAGACTTTAAATTA

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 2

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CTCACGTCAACGATGGACCTGCAGCACGTAGCTTCCACTCGATGGCTGTTGATGGCAATA
ATATTTATATCTTTGGTGGAGTGACTACTAAGGAACGGGTCAACACACTACATGCTTACA
ACATTGTTGATCAAAAGTGGACTGAGCTTCCGAATCCAGGAGAGTCTTGCAAACCTAGAG
GTGGAGCGGGGCTTGCGGTTGTGAAAGGGAAGATTTGGGTTGTGTATGGGTTTATTGGGG
AAGAAGTGGAAGATGTTCACTGCTTTGATCCAATTGAAAGTAAGTGGACTAAAGTGGAAA
CACGGGGTGAAAAGCCTTGGGCGAGAAGCGTGTTTGCGCTAGCAGTTGTTGGGAAATATA
TAATAATATCTGGAGGTGAGATTGAGATGGACGTAAAGGCTCATTTGGGTCCGGGGTCAT
TGACCGGTGGGGCTTTTGTGTTGGACACTGAGGGTTTGTTGTGGGAGAAACTTGAGGAAG
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CATGGGAGGCATCTGGTTTGTCAGTGAGACTGTTTAAGATTTGTGAGTTTTAAGA


BQ
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AF RS1CN14TF U 1
AF RS1CN14JQ C 370
BS 1 595 RS1CN14TF
BS 596 835 RS1CN14JQ

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ATATTTATATCTTTGGTGGAGTGACTACTAAGGAACGGGTCAACACACTACATGCTTACA
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GTGGAGCGGGGCTTGCGGTTGTGAAAGGGAAGATTTGGGTTGTGTATGGGTTTATTGGGG
AAGAAGTGGAAGATGTTCACTGCTTTGATCCAATTGAAAGTAAGTGGACTAAAGTGGAAA
CACGGGGTGAAAAGCCTTGGGCGAGAAGCGTGTTTGCGCTAGCAGTTGTTGGGAAATATA
TAATAATATCTGGAGGTGAGATTGAGATGGACGTAAAGGCTCATTTGGGTCCGGGGTCAT
TGACCGGTGGGGCTTTTGTGTTGGACACTGAGGGTTTGTTGTGGGAGAAACTTGA

QA 1 595 1 595
DS 

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AAGATGTTCACTGCTTTGATCCAATTGAAAGTAAGTGGACTAAAGTGGAAACACGGGGTG
AAAAGCCTTGGGCGAGAAGCGTGTTTGCGCTAGCAGTTGTTGGGAAATATATAATAATAT
CTGGAGGTGAGATTGAGATGGACGTAAAGGCTCATTTGGGTCCGGGGTCATTGACCGGTG
GGGCTTTTGTGTTGGACACTGAGGGTTTGTTGTGGGAGAAACTTGAGGAAGGTCATAGCC
CTCGTGGATGGATCGCATTTACGACTGCGTCCATTGATGGGAAAAAGGGGCTGTTGATGT
ACGGAGGGAAGGCTCCCCCCAACGGTCGTTATGAGGACATCTTTTTTTATGGGGTAGACT
CTGCTTAAGACCGCTGGGTGTTGGTGAGTTTGTGAGCTGTAAAAGTTGCATCATGGGAGG
CATCTGGTTTGTCAGTGAGACTGTTTAAGATTTGTGAGTTTTAAGA

QA 1 466 1 466
DS 



AS 1 2

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GGACTGAAACCAATTTTCACAACAAAGGAGTTTCCCGAACTAAAAGTTCCTCTCAGACAA
AACCTAACCCCACCATCACACATTTGTCAAAATCGTCATTCCAAAAAAAAAGAAATCGCA
TCTAGGATGTTTCAATTAACCGGCGCGGCGGCTCCGGCTATGCCTATGACGGCATCACCT
CCCAATCTACTTAAACGGCCGGTGGCGTTCCCTCCTTATTCGTCAAGGCGATCCCTTAAT
TTACCTCTCCAGAGCTCAAAAACCATCAAACCTCTCGCAATTCTCGATCTCAAAGGCGGA
AAAGGAATGAGCGAGTTCCACGAGGTAGAGCTCAAAGTTCGTGATTACGAATTGGATCAA
TTTGGTGTTGTCAACAATGCTGTTTACGCTAACTACTGCCAACACGCCCGACACGAGTTT
CTGGAGAGTATCGGTATCAACTGTGATGAAGTCGCACGCTCTGGCCAAGCCTTAGCCCTT
TCAGAGTTGCCTATTAAGTTCATTGCTCCTTTACGCAGCGGAGACAGGTTTGTGGTGAAA
GCGAGGCTATCGGGGTTATCTGCTGCGCGTATTTACTTTGAGCATTTCATCTTCAAACTT
CCAAATCTAGAGCCTGTATTAGAGGCAACGGGAGTAGCTGTGTGGCTTGACAACAAGTAC
CGTCCTGTTCGTATCCCTCCTCACATCCGCTCTAAATTTGTTCTGTTCCAACGCCAAGAA
GACGCTCTCTGATTTGTTCCAACCCCACATTCTCATGATTTTACTGTATTCCAATGAGCC
CAGTTAATGTTATTGCATGTGTCCTATAAAAATATAAATGTTCATTTCCGGATAACACAA
GCTCCTGAGCTGCATACTTGGATGTGAAAG


BQ
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AF RS1B460TF U 1
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CCAAATCTAGAGCCTGTATTAGAGGCA

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CTCTCCAGAGCTCAAAAACCATCAAACCTCTCGCAATTCTCGATCTCAAAGGCGGAAAAG
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CTGTTCGTATCCCTCCTCACATCCGCTCTAAATTTGTTCTGTTCCAACGCCAAGAAGACG
CTCTCTGATTTGTTCCAACCCCACATTCTCATGATTTTACTGTATTCCAATGAGCCCAGT
TAATGTTATTGCATGTGTCCTATAAAAATATAAATGTTCATTTCCGGATAACACAAGCTC
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QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 2

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ACTCTTTTGTTT


BQ
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CTCTTTTGTTT

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

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BQ
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QA 1 226 1 226
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1G434TF U 1
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BS 1 543 RS1G434TF
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TTGATTTCGATTCCAAAGTGCTAAAGTTTGCTCCTTTTTAGTTGATTTGTAGAGGGGGGG
GGG

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DS 

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QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

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GTATTTGAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EV81TF U 1
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CGATTCAAAACCCTCTTCTTTCTTTTT*CTACCATTCTTGTTTTCGTTTTGCGTAG*TGG
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ACTCTCTTT
CTCTTTTATCT

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DS 

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AAGAAAGATGATGATGAAGAAGAATATATTGGCTATCGATTCAAAACCCTCTTCTTTCTT
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TGATGGGATCTCATTTAAAGAACCAACCAAATGATGACTCTCTTTTCTCTTTATATCTTT
TTGTGCTGTCTAGAATTTAGAAAACCACCAAGTATTTGAGACTTGTTTTTAGCCGTTACT
TCTCCCTGCTTTGTTTTTCTTATGTTTGTTTTGGTCTTGAACTATGTTTGTTTCTTATCT
TTTTGTGCTGTCTAGAATTTAGAAAACCACCAAGTATTTGAGACTTGTTTTTAGCCGTTA
CACTTCTCCCTGCTTTTTTTTCTTATGTTTGTTTTGGTCTTGAACTATGTTTGTTTCTTA
TCTTGTTGTGCTGTCTAGAATTTAGAAAACCACCAAGTATTTGAG

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DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CTGGGTTTGATGTGAGGGATGCATTGGTAGGGCATGCTGTTTCTTACGAGTTTGATCTCG
AGATCGATAAGAAGGTTCTTCCAATCAAGCTTCTTGAAGACGTGAACCGATGGGAGTACG
TTGATCTCCCTATTTTCCAAGTAGAGCAACCTAATGAGAATGGTTTGGTTCCTATGAGTA
ATAATAAGAAGAAGAAGTCGTCTGGTGGTGATGTTTCGCCTGTTTTAGCTCCGTTTCAAC
TCGCTGGCCCCATGGAACTTTGGATCCAAGATGCTAACGATATGCGTCTTTCTTTGCCTT
ATGATGTGGATGCTGGTGTTTTGAAGAAAGTGATATTAGGAGATGGTGCTGTTGTGACTG
TCAAGGGAGCTAGATCTGTTAGTCTGCGTCACCCTATTGATTTGCCACTTCCGTTGAACC
AAAGCTCCAGTGAGTTCGCCTCTGGTCTTCTCTCTTTAGCTGAGCAGCTTCGACGTGGTG
CTTCATCAGCTGATCAAGAAACTCCACTTCTATCTCTCCGCATTGTTGGTCCTACTTCTC
TTGCATCGACCTCTCGATCTCCTGAGAGCAAACTCAAGCTTAAGCGCCTTGCGCCTGGAC
TTGTGGAGCTATCTTCCATGTCTAAAGACAAAGTAGTAGAGATGTCTCAACCATTGAGGT
GTTACTACTACTGTTCTTGCTCCGAGGGAGTTCACAACCATGTGGCCGATCACTTCAATC
AACGGCTCAAACGCTAACTTACTCGGCTTTGGGAAGCTGTTGACCTCTGTGTTAGGTCCC
AGAGCTCAGGAAGAAGGTTTTTTTAAGGTGTTGAAAGCAGACGTGGCAGCTCAGACTTTT
ATGAAGATTGGTTTTGGTGTAGAGAGGAAGCTGAAGGAAAGTGATTTTGAAGGCGTGGAC
TTTCCAGAGTGGAGAACGAAACCCAAAACGATGAGAATGCATTTTGAGGTTCTTGCTAAG
GTTGATGGTGACAAGGTTATACCAGAGAATGTGGTGAGGGTTGATCCTATACCACTGGAG
GATACGGTTGCGCAGAATGTGATTAATGGAAATGTAACCATGTCGACACTTCCTATCGTT
CAGCCTCCTCCAAGCCCTTTCACCTTGTAAATCATGTGGACATAGTTGATGTTTTATCAG
AAAATTTTAATGACTTGACATAAACGCCTTTGTTTCCCTTTTTTTTTCTAACCGTATCCG
CAGAAGAAGTGTGTGTTATATACTTCACTGCTACTTGTAATTACTACTATTTTTGGTTTA
AATATACATGATATTATGATAATGGCTTCCTTAGATATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BR42TF U 1
AF RS1BR42JQ C 713
BS 1 777 RS1BR42TF
BS 778 1360 RS1BR42JQ

RD RS1BR42TF 787 0 0
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CTGGGTTTGATGTGAGGGATGCATTGGTAGGGCATGCTGTTTCTTACGAGTTTGATCTCG
AGATCGATAAGAAGGTTCTTCCAATCAAGCTTCTTGAAGACGTGAACCGATGGGAGTACG
TTGATCTCCCTATTTTCCAAGTAGAGCAACCTAATGAGAATGGTTTGGTTCCTATGAGTA
ATAATAAGAAGAAGAAGTCGTCTGGTGGTGATGTTTCGCCTGTTTTAGCTCCGTTTCAAC
TCGCTGGCCCCATGGAACTTTGGATCCAAGATGCTAACGATATGCGTCTTTCTTTGCCTT
ATGATGTGGATGCTGGTGTTTTGAAGAAAGTGATATTAGGAGATGGTGCTGTTGTGACTG
TCAAGGGAGCTAGATCTGTTAGTCTGCGTCACCCTATTGATTTGCCACTTCCGTTGAACC
AAAGCTCCAGTGAGTTCGCCTCTGGTCTTCTCTCTTTAGCTGAGCAGCTTCGACGTGGTG
CTTCATCAGCTGATCAAGAAACTCCACTTCTATCTCTCCGCATTGTTGGTCCTACTTCTC
TTGCATCGACCTCTCGATCTCCTGAGAGCAAACTCAAGCTTAAGCGCCTTGCGCCTGGAC
TTGTGGAGCTATCTTCCATGTCTAAAGACAAAGTAGTAGAGATGTCTCAACCATTGAGGT
GTTACTACTACTGTTCTTGCTCCGAGGGAGTTCACAACCATGTGGCCGATCACTTCA
TCACGCTCAA

QA 1 777 1 777
DS 

RD RS1BR42JQ 648 0 0
TTGAG
GGTGTTACTACTACTGTTCTTGCTCCGAGGGAGTTCACAACCATGTGGCCGATCACTTCA
ATCAACGGCTCAAACGCTAACTTACTCGGCTTTGGGAAGCTGTTGACCTCTGTGTTAGGT
CCCAGAGCTCAGGAAGAAGGTTTTTTTAAGGTGTTGAAAGCAGACGTGGCAGCTCAGACT
TTTATGAAGATTGGTTTTGGTGTAGAGAGGAAGCTGAAGGAAAGTGATTTTGAAGGCGTG
GACTTTCCAGAGTGGAGAACGAAACCCAAAACGATGAGAATGCATTTTGAGGTTCTTGCT
AAGGTTGATGGTGACAAGGTTATACCAGAGAATGTGGTGAGGGTTGATCCTATACCACTG
GAGGATACGGTTGCGCAGAATGTGATTAATGGAAATGTAACCATGTCGACACTTCCTATC
GTTCAGCCTCCTCCAAGCCCTTTCACCTTGTAAATCATGTGGACATAGTTGATGTTTTAT
CAGAAAATTTTAATGACTTGACATAAACGCCTTTGTTTCCCTTTTTTTTTCTAACCGTAT
CCGCAGAAGAAGTGTGTGTTATATACTTCACTGCTACTTGTAATTACTACTATTTTTGGT
TTAAATATACATGATATTATGATAATGGCTTCCTTAGATATGT

QA 6 648 6 648
DS 



AS 1 2

CO CL5781Contig1 964 2 12 U
GAGATATACTCCTGGATCAAGTCAAAGAGCATACTAGGGATCAGTTACAATCTCTATGAG
AAGCTTGCAGGAGCTAAAGACGAGGGCAAGAAGACAAAGAAAGGGAAAGCAGTGAAACCA
GACAAAGAGCTAGAAGATATAAGAGAGGTAAGTAATGGGGATGCCTGGACTGCTGGTTCT
TGACGAGGCACACACGCCCAGGAACCAGAGAAGCTGTATATGGAAGACACTGTCCAAAGT
CGAGACACAGAAACGGATCTTGCTCTCTGGAACGCCTTTCCAGAACAACTTCTTGGAGCT
TGGCAATGTTTTGGGGCTTGCAAGGCCTAAGTATCTAGAGAGGCTCATGTCCACACTCAA
GAAGAGTGGCATGACTGTCACCAAAAGAGGGAAGAGAGCTTTGGGAGAGGAAGTAAACAA
CCGTGGGATTGAGGAGCTTAAGGCTGTTATGTTACCCTTTGTGCATGCTCACAAAGGAAG
CATTCTTCAGAAGAGCCTCCCTGGTTTGAGAGAGTGTGTTGTGGTGTTGAACCCACCTGA
TCCGCAGAGGAAAGTCCTGGAGTCCATTGAAGTCACACACAACCAGAAAACGAAGAATGT
CTTTGAGACAGAACACAAGCTCTCTCTGGTCTCGGTCCATCCTTCTCTTGTCTCTCACTG
CAAACTCACTGGGAAAGAAAAACAGACCATCAACGAGGCCCTGCTTGCACAGCTAAAGAA
GGTGAGGCTTGACCCAAACCAAAGCGTGAAAACAAAATTCCTCATGGAGTTTATCAAGCT
GTGTGTGGTGATTAAGGAGAAAGTGCTGGTCTTCAGCCAATACATTGACCCGCTGAAACT
GATTATGAAGCATTTGGTCAACTGGTTCAAGTGGACTGAAGGGGAAGAAGTGTTGTACAT
GCACGGCAAACTCGAGCAGAAGCAGATACAGACCTTGATCAACGAGTTCAACGATCCTAA
ATCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1BU61TF U 1
AF RS1BY10TF U 253
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TGACGAGGCACACACGCCCAGGAACCAGAGAAGCTGTATATGGAAGACACTGTCCAAAGT
CGAGACACAGAAACGGATCTTGCTCTCTGGAACGCCTTTCCAGAACAACTTCTTGGAGCT
TGGCAATGTTTTGGGGCTTGCAAGGCCTAAGTATCTAGAGAGGCTCATGTCCACACTCAA
GAAGAGTGGCATGACTGTCACCAAAAGAGGGAAGAGAGCTTTGGGAGAGGAAGTAAACAA
CCGTGGGATTGAGGAGCTTAAGGCTGTTATGTTACCCTTTGTGCATGTTCACAAAGGAAG
CATTCTTCAGAAGAGCCTCCCTGGTTTGATAGAGTGTGTTGTGGTGTTGAACCCACCTGA
TCCGCAGAGGAAAGTCCTGGAGTCCATTGAAGTCACACACAACCAGAAAACGAAGAATGT
CTTTGAGACAGAACACAAGCTCTCTCTGGTCTCGGTCCATCCTTCTCTTGTCTCTCACTG
CAA*CTCACTGGGAAAGAAAA*CAGACCATCAACGAG*CCCTGCTTGCACAGCT

QA 1 714 1 714
DS 

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G
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GGGCTTGCAAGGCCTAAGTATCTAGAGAGGCTCATGTCCACACTCAAGAAGAGTGGCATG
ACTGTCACCAAAAGAGGGAAGAGAGCTTTGGGAGAGGAAGTAAACAACCGTGGGATTGAG
GAGCTTAAGGCTGTTATGTTACCCTTTGTGCATGCTCACAAAGGAAGCATTCTTCAGAAG
AGCCTCCCTGGTTTGAGAGAGTGTGTTGTGGTGTTGAACCCACCTGATCTGCAGAGGAAA
GTCCTGGAGTCCATTGAAGTCACACACAACCAGAAAACGAAGAATGTCTTTGAGACAGAA
CACAAGCTCTCTCTGGTCTCGGTCCATCCTTCTCTTGTCTCTCACTGCAAACTCACTGGG
AAAGAAAAACAGACCATCAACGAGGCCCTGCTTGCACAGCTAAAGAAGGTGAGGCTTGAC
CCAAACCAAAGCGTGAAAACAAAATTCCTCATGGAGTTTATCAAGCTGTGTGTGGTGATT
AAGGAGAAAGTGCTGGTCTTCAGCCAATACATTGACCCGCTGAAACTGATTATGAAGCAT
TTGGTCAACTGGTTCAAGTGGACTGAAGGGGAAGAAGTGTTGTACATGCACGGCAAACTC
GAGCAGAAGCAGATACAGACCTTGATCAACGAGTTCAACGATCCTAAATCA

QA 2 712 2 712
DS 



AS 1 2

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ATATAACCTATTCCAACATCTGCGCGAATCTGGTGAGGAAATGTCTAAAGGAACCTTTCA
AGGCTGAATCAATCAATCGCGAGAAGGTTCACTTCTCCCTCTCCAAATGGGCTAATGGAA
AGCCCCAGAAACCAGTTCTGCGCTCAGATGCACCTGAAGTTTGAGACATTTTGATCAAAG
ATATATGGTTTCTTAGTTTGATGATGTATTGCTTCTCTGTATGGATGAGATAGTAAAAGG
AATGCAATAACGTCTCTCCGCATATTTTATTTCCTTTATTGTTTGTAATGAAAGATTGAT
GATACTCTCCCATCAAATAATGATATAAACACGGGTACTTCTGTTTCTATTATGTTGTGG
ATTCTTCTGATATACTATTATTCTCAAATGA


BQ
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AF RS1CD33TF U 1
AF RS1G719TF U 10
BS 1 147 RS1CD33TF
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BS 149 183 RS1CD33TF
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BS 467 511 RS1G719TF

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ATATAACCTATTCCAACATCTGCGCGAGTCTGGTGAGGAAATGTCTAAAGGAACCTTTCA
AGGTTGAATCAATCAATCGCGAGAAGGTTCACTTCTCCCTCTCCAAATGGGCTGATGGAA
AGCCCCAGAAACCAGTTCTGCGCTCAGATGCACCTGAAGTTTGAGACATTTTGATCAAAG
ATATATGGTTTCTTAGTTTGATGATGTATTGCTTCTCTGTATGGATGAGATAGTAAAAGG
AATGCAATAACGTCTCTCCGCATATTTTATTTCCTTTATTGTTTGTAATGAAAGATTGAT
GATACTCTCCCATCAAATAATGATATAAACACGGGTACTTCTGTTT

QA 1 466 1 466
DS 

RD RS1G719TF 502 0 0
GG
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ATGGCATCGAACGCAGCGGTTCCGTTCTGGAGAGCGGCGGGGATGACGTATATAACCTAT
TCCAACATCTGCGCGAATCTGGTGAGGAAATGTCTAAAGGAACCTTTCAAGGCTGAATCA
ATCAATCGCGAGAAGGTTCACTTCTCCCTCTCCAAATGGGCTAATGGAAAGCCCCAGAAA
CCAGTTCTGCGCTCAGATGCACCTGAAGTTTGAGACATTTTGATCAAAGATATATGGTTT
CTTAGTTTGATGATGTATTGCTTCTCTGTATGGATGAGATAGTAAAAGGCATGCAATAAC
GTCTCTCCGCATATTTTATTTCCTTTATTGTTTGTAATGAAAGATTGATGATACTCTCCC
ATCAAATAATGATATAAACACGGGTACTTCTGTTTCTATTATGTTGTGGATTCTTCTGAT
ATACTATTATTCTCAAATGA

QA 3 502 3 502
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGACCTTAAACTGAAAACCTAATTCGCTCATCGCTGCCGAAAGCTTATTCATCCATTCTT
CGCTTAGTTTGTGATAATGTCTGCTGGTAAAAGAGAACGTCCAGAGATCGGTATCGACCT
GGGTACGACCTACTCGAGCGTCGGAGTATTTGACTCTGGTCCTGTCGGCAACAGGACGAC
TCTGTCTGCTGGTAAAAGAGAACGTCCAGCGATCGGTATCGACCTGGGTACGACCTACTC
GAGCGTCGGAGTATTTGACTCTGGTCCTGTCGGCAACAGGACGACTCTGTCTGCTGGTAA
AAAAGAACGTCCAGCGATCAGTATCGACCTGGGTACGACCTACTCGAGCGTCGGAGTATT
TGACTCTGGTCCTGTCGGCAACAGGACGACTCTGTCTGCTGGTAAAAAAGAACGTCCAGT
CATCGGTATCGACCTGGGTACGACCTACTCGAGCGTCGGAGTATTTGACTCTGGTCCTGT
CGGCAACAGGACGACTCTGTCTGCTGGTAAAAAAGAACGTCCAGTCATCGGTATCGACCT
GGGTACGACCTACTCGAGCGTCCGAGTATTTGACTCTGGTCCTGTCGGCAACAGGACGAC
TCTGTCTGCTGGTAAAAAAGAACGTCCAGCCATCGGTATCGACCTGGGTACGACCTACTC
GAGCGTCGGAGTATTTAACTCTGGTCCTGTCGGCAACGGCAACAGGACGTCTCTGTCTTA
CTTGCCCTTCACCGACTCCGAGAAGTTGATTGGTGATGCCGCCAAAAGCAAGTCACCACG
AACCCCATTAACACCGTCTTCGATGCAAAGAGATTGATTGGTCGAAGATTCAGAGACTCA
TCTGTCCAGAGCGACATGAAGCTATGTGACAGGTTGGCTGTGCCTTCGCCAATGATGGAA
AGACTCAAAGCGGCTGAAGTAACCGTTGAAGAGGAATAGAGGATACTCTCCATGAGAAAG
AGAGTTTAGTCTATGCTTTATGTT


BQ
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AF RS1AA44TF U 1
AF RS1AA44JQ C 216
BS 1 562 RS1AA44TF
BS 563 563 RS1AA44JQ
BS 564 629 RS1AA44TF
BS 630 630 RS1AA44JQ
BS 631 676 RS1AA44TF
BS 677 677 RS1AA44JQ
BS 678 695 RS1AA44TF
BS 696 984 RS1AA44JQ

RD RS1AA44TF 695 0 0
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CGCTTAGTTTGTGATAATGTCTGCTGGTAAAAGAGAACGTCCAGAGATCGGTATCGACCT
GGGTACGACCTACTCGAGCGTCGGAGTATTTGACTCTGGTCCTGTCGGCAACAGGACGAC
TCTGTCTGCTGGTAAAAGAGAACGTCCAGCGATCGGTATCGACCTGGGTACGACCTACTC
GAGCGTCGGAGTATTTGACTCTGGTCCTGTCGGCAACAGGACGACTCTGTCTGCTGGTAA
AAAAGAACGTCCAGCGATCAGTATCGACCTGGGTACGACCTACTCGAGCGTCGGAGTATT
TGACTCTGGTCCTGTCGGCAACAGGACGACTCTGTCTGCTGGTAAAAAAGAACGTCCAGT
CATCGGTATCGACCTGGGTACGACCTACTCGAGCGTCGGAGTATTTGACTCTGGTCCTGT
CGGCAACAGGACGACTCTGTCTGCTGGTAAAAAAGAACGTCCAGTCATCGGTATCGACCT
GGGTACGACCTACTCGAGCGTCGGAGTATTTGACTCTGGTCCTGTCGGCAACAGGACGAC
TCTGTCTGCTGGTAAAAAAGAACGTCCAGTCATCGGTATCGACCTGGGTACGACCTACTC
GAGCGTCGGAGTATTTGACTCTGGTCCTGTCGGCA

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1AA44JQ 769 0 0
GTATCGACCTGGGTACGAC*TACTCGAGCGTCGGAGTATTTGACTCTGGTCCTGTCGGCA
ACAGGACTACTCTGTCTGCTGGTAAAAGAGAACGTCCAGCGATCGGTATCGACCTGGGTA
CGACCTACTCGAGCGTCGGAGTATTTGACTCTGGTCCTGTCGGCAACAGGACGACTCTGT
CTGCTGGTAAAAAAGAACGTCCAGTCATCGGTATCGACCTGGGTACGACCTACTCGAGCG
TCGGAGTATTTGACTCTGGTCCTGTCGGCAACAGGACGACTCTGTCTGCTGGTAAAAAAG
AACGTCCAGTCATCGGTATCGACCTGGGTACGACCTACTCGAGCGTCCGAGTATTTGACT
CTGGTCCTGTCGGTAACAGGACGACTCTGTCTGCTGGTAAAAGAGAACGTCCAGCGATCG
GTATCGACCTGGGTACGACCTACTCGAGCGTCGGAGTATTTAACTTTGGTCCTGTCGGCA
ACGGCAACAGGACGTCTCTGTCTTACTTGCCCTTCACCGACTCCGAGAAGTTGATTGGTG
ATGCCGCCAAAAGCAAGTCACCACGAACCCCATTAACACCGTCTTCGATGCAAAGAGATT
GATTGGTCGAAGATTCAGAGACTCATCTGTCCAGAGCGACATGAAGCTATGTGACAGGTT
GGCTGTGCCTTCGCCAATGATGGAAAGACTCAAAGCGGCTGAAGTAACCGTTGAAGAGGA
ATAGAGGATACTCTCCATGAGAAAGAGAGTTTAGTCTATGCTTTATGTT

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

CO CL5785Contig1 1371 2 2 U
GGACGAGACCTCCTACAAGTTCCAGGATAAAGAAGGGAACCCTCTGTACTGCAAGCTCCC
TATGCCTGGGTTCACAGACTTCTTATCCTTGGAGAACATTGTGTTCTCACTCAATGAAGA
GCACCTCTGCGATGATTCGAAGGCGCCGGTTCAGCACGATGATGAAGACATGGATGATGT
GGAGCATGTGACCCCACCAGCTGATGGTGAGTATGACTTGGAGGACTTCACCGATGTGAC
TGATGATCATGCCTACAGACGCTGGATGGTTGATTCCCAGAAGAAGAACAACAGCCTCAT
GAAGAGGATACTCAGGGCGATCACAGGCGGCTGCATTGGAGCACAGGAGGAGCGTACGCC
ACAGAGAACAAGGCGCCCAGGCAAGGAACACGCGGGAACGTCGACATGAGCAGAGAGACT
GCCGAGGAACAGGAGGACAGCTGGTCACTCCGGTAGCGGCGATTCAGACTGAATCCGAGA
GGACTATTTCTATCCCTTGTCTTATTCATCAGAACTATTTATTTTTTATGTTATTTGCTT
CTGTTTGGTGTGTTTCTGTTTCCTCTGATTTATTTTCACAACCAGGGATGGTGTGAACTA
AGTCTGGGGGAGCGATTGTACTATATTCTTGCGTGCTTCTTGAGTCAGTCCTTGTGTCAT
TTTTATGTTTTTATCGAGTCAGTCTTTAGGATCGAGTCAGTCAAAACTGTTGTGGGAATC
AAGACCTTATTTTGTGATGCTCTTTAACCACCTCGTGCTTTAACCTTCTTATTCAGTGAC
CTTAGCAGTGATGAAAGACCCACACATGGACCTGGAACACCCTGACTTATCTCATTTGAC
ACTCCAGAAGTTCTATACCGATCAGGTTACACTGGGCAGACTTAACTCCACTTCATCTGA
ACCTAATCTGGACTTTAATTCTTCTTGTCATGGGCACTAGATCAGGGTAGAATGAGAACT
ACACTCAGGACTTCTTATCCGATTTTTATCCCTCTTGTTGTTCCTGAGTGGCTAGCTCAT
CTTTAGCTAGTTCCCACCTTGAACCCTGACCTTTTATTCCACCCTCATGCATTTGCTTTT
CTAGTACTTTATGTGCAGATATGCGCAAAAAGGTCGGAGAGGAAAGGATCGACGCAGTTC
TTACTCATCAATGCTCACACAGTGGAAGCAGGCAGAACAACCGGAGTGCTTGTTCCGGCA
CGAAGAGAACAACCAAGATACCTGCTCCGATACCATAGAGAACAACGAAGAAGTAAGAGC
ATCAATATTGGGGGGGTTTTAAAAGAGCCCTTAAGGGAGAAGGGGAGGGGACCAAGGCAA
AAAATGAAGGGAAAGCCCTTATGTAAGGGCTGCCCTTACACATTCATGACC


BQ
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AF RS1BW14TF U 1
AF RS1BW14JQ C 610
BS 1 685 RS1BW14TF
BS 686 1371 RS1BW14JQ

RD RS1BW14TF 685 0 0
GGACGAGACCTCCTACAAGTTCCAGGATAAAGAAGGGAACCCTCTGTACTGCAAGCTCCC
TATGCCTGGGTTCACAGACTTCTTATCCTTGGAGAACATTGTGTTCTCACTCAATGAAGA
GCACCTCTGCGATGATTCGAAGGCGCCGGTTCAGCACGATGATGAAGACATGGATGATGT
GGAGCATGTGACCCCACCAGCTGATGGTGAGTATGACTTGGAGGACTTCACCGATGTGAC
TGATGATCATGCCTACAGACGCTGGATGGTTGATTCCCAGAAGAAGAACAACAGCCTCAT
GAAGAGGATACTCAGGGCGATCACAGGCGGCTGCATTGGAGCACAGGAGGAGCGTACGCC
ACAGAGAACAAGGCGCCCAGGCAAGGAACACGCGGGAACGTCGACATGAGCAGAGAGACT
GCCGAGGAACAGGAGGACAGCTGGTCACTCCGGTAGCGGCGATTCAGACTGAATCCGAGA
GGACTATTTCTATCCCTTGTCTTATTCATCAGAACTATTTATTTTTTATGTTATTTGCTT
CTGTTTGGTGTGTTTCTGTTTCCTCTGATTTATTTTCACAACCAGGGATGGTGTGAACTA
AGTCTGGGGGAGCGATTGTACTATATTCTTGCGTGCTTCTTGAGTCAGTCCTTGTGTCAT
TTTTATGTTTTTATCGAGTCAGTCT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RS1BW14JQ 762 0 0
GAGCGATTGTACTATATTCTTGCGTGCTTCTTGAGTCAGTCCTTGTGTCATTTTTATGTT
TTTATCGAGTCAGTCTTTAGGATCGAGTCAGTCAAAACTGTTGTGGGAATCAAGACCTTA
TTTTGTGATGCTCTTTAACCACCTCGTGCTTTAACCTTCTTATTCAGTGACCTTAGCAGT
GATGAAAGACCCACACATGGACCTGGAACACCCTGACTTATCTCATTTGACACTCCAGAA
GTTCTATACCGATCAGGTTACACTGGGCAGACTTAACTCCACTTCATCTGAACCTAATCT
GGACTTTAATTCTTCTTGTCATGGGCACTAGATCAGGGTAGAATGAGAACTACACTCAGG
ACTTCTTATCCGATTTTTATCCCTCTTGTTGTTCCTGAGTGGCTAGCTCATCTTTAGCTA
GTTCCCACCTTGAACCCTGACCTTTTATTCCACCCTCATGCATTTGCTTTTCTAGTACTT
TATGTGCAGATATGCGCAAAAAGGTCGGAGAGGAAAGGATCGACGCAGTTCTTACTCATC
AATGCTCACACAGTGGAAGCAGGCAGAACAACCGGAGTGCTTGTTCCGGCACGAAGAGAA
CAACCAAGATACCTGCTCCGATACCATAGAGAACAACGAAGAAGTAAGAGCATCAATATT
GGGGGGGTTTTAAAAGAGCCCTTAAGGGAGAAGGGGAGGGGACCAAGGCAAAAAATGAAG
GGAAAGCCCTTATGTAAGGGCTGCCCTTACACATTCATGACC

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL5786Contig1 1283 2 8 U
GGAGTTACCACCAGTTGTAACAAAGAATCTCCAATTCCAGACACCGACAAGTTCGTATAC
CAAATCCTCAACGGCCCAAACGAGCAATGCCAGGAGAATTTCCGGATGGACAAAACCGTC
TTCTACAAGCTCTGCCACGTCCTCCAAACCAGAGGCCTCCTACGCCACACCAACCGAATC
AAGATCGAGGAGCAGCTCGCCATCTTCCTCTTCGTCATCGGCCACAACCTCCGCACCCGC
GCCGTCCAAGACCTCTTCGGATACTCCGGCGGGACGATCAGCCGCCACTTCAACAACGTC
TTGAACGCCGTCACCTCCATCTCCGCCAGTTTCTTTCGATCCGATGTCGTTGATCATCAA
TCCGATCCTTGCTTCAAGGACTGTGTTGGAGTCGTTGGTTGCATTCAAATGCCTGTGATG
GTCGGCGTCGACGAGCAAGGTCCTTTCCGTAACAGCGATAACGGACTGCTCACGCAGAAC
GTGCTCGTCGCGTGTTCCTTTGATCTCAGGTTCCGTTACGTTTTAGCTGGTTGGGAAGGC
TCTGCTTCTGATCAGCAAGTTCTCAATGCCGCTTTGACTCGTCCTAACAACCTACAAGTC
CCTCTAGGAAAGTACTATATTGTGGACAGTAAGTACGAGAATCTTCCGGGATTTATAGCG
CCGTATCGTGGTGTTTCAACCAGCAACAAAGAAGAGCCCAAGGGGATGTTCAACGAGCGG
CACAAGGTGTTGCATCGAGCGATTGACAGAGCTTTTGGAGCCTTGAAAGAACGGTTCCCG
ATCTTGCTATCGGCTCCTCCGTATCCTCTTCAAACACAAGTGAAGCTGGTGATTGCGGCT
TGTGCGTTGCACAACTATGTGCGCTTGGAGAAGCCTGATGATTTTGTGTTTAGGATGTTT
GAAGAAGAAGAACAAGAAGAAACATTATTGGCGGAAACAACAGAAACAGAAGAAGGTAGA
GGAATGACATTGGAGGAGGAGGAGGAGAATCAGGGACATGAGCATGGCTCGTTTAGACCA
GAAGAAGTGGAAGATAGTTTAAGGTTAAGAGATGAGATCACATCTCATCTCTGGAACCAT
TATGTCCAAACCTTCTAAAACTTGTCTTCTTTGCTTAAGTGCTTTTATTTGTTAGAGAGT
TCATTCCAGCTTGCACATCAATGTTATTTTCAAATATAAATAACCAGATAGAGAGATATT
ACGGGATGTCAAAATTTGGTTGCAAGTATCTTTGAGTCTTTCTACCATCTGTTAATAATC
AACAAACTTGAGTCATTCTTGAT


BQ
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BQ
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QA 1 584 1 584
DS 

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AGCTAAGGACTTGCAGAAAGAAGAGAAGGCTCCTCTGATTTCTTCATGGATCGGGAGAGC
CAGGGAGAGTGGTAAAGGACGTTGATGATCTCCCAAGTCTCCGTTTTGGTGTCTCAAGGA
GACAGAGTGAGCCAAAGCTGTTTGTCTTTTGTTTAGTCCCTCAAGGATAAAAGAGAAAGC
CCCAAAAGTGAGGCAACTCTGTAGAAGAGCTTGTGGAGCACCAGGGAAACTAAGAGCAAG
ACCGGTGCAGCACCCAGCAACTCCAACATTAATGGCGTCATCTTTCCCTCTGAGTTGTTT
CAGAATGCAAACAACCAAACTGTGTACTCCAGACAAAACAGCAAAAGTCTTTGCAGACCG
CCCTGCATCTGCAAATGATCCTTTAAAGCCTTTCTTCTTGAACAATCCTGAACCATATCC
AAAGATAGAGCCCATGACGGCACCACCAGCTGCATCTCCAGCAAACCGGACAAGACAAAC
GGCGGGAGCAGGAATAGTCAATGCCTTTGAGGAATCATTATCGGCTGCATCGTCACCGTC
AGAGTTAAGGTTTGAATTGAGCTCTCGCTTCCCGTCGATATCTGTAACATTTGAAGAATC
ATCGGCCGACATAGCTAAGAGAAGTTGAATTCTGAAGATCC

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 2

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GCAGAGGATTATCAAAGAATCAGTAACGATAATCGTATTCTTCATTCCATGGCACCCAGA
TGGAAATGGAAAGGTGCTGAAGCGAAAGCTCTTGCGGAACCCATTTCAAACTCAGTCTCT
CAGCTCCAACTCTCTCTAGCCAAATCAGAGACATCAGGGTCCCTCTCGAGTTGCAACGTG
CTTCTAGCGGTTGAGCCAGAGCAAGCTAAGCTACTAGTCCGCTGTTGTTTTGGCACACTC
GTCCCATCCCCTGAGAAAGTCAAGAAATGGATTCAGTTATCCTTTGAAGAAGCTTTCTAC
TTGCACTACAATCTCAAATGCATCAAAATCTATCTTCAAGGTCGTTGCTTGGAGAACGAA
GTCGACACATGGATGTACATGAGATCAAAAAGACCAAACTTCCCGATATTTTTCAAAGCT
TATTCACATTTACGGTCCAAGAACTGGGTCTTGAGGTCAGGGTTGCAGTACGGTGTGGAT
TTCGTGGCATACCGTCACCATCCATCTCTTGTCCACTCTGAATACTCTGTTTTGGTTCAG
TCTGGTGACAGTAACCGGTTAAGAGTGTGGTCAGATGTCCATTGTGCTGTTCGGTTAAGC
GGGAGTGTTGCGAAAACGTTATTGACTCTCCATGTTAGTGGTAAATCTTACAAAGAGGAT
TTGAATCTACCTTTGTGCTTGGATAACTACACAGTGGAAGAGCATACTATTTGTAGATGG
AGCCCAGAACTCAGCCGTGAAGATGAAACCATTAATTCAAAACCAAATGCTACCACTGTG
AGTAATTTGAAATCCCCTTGATGATCCTACCCTGGTTAACTGAGTACTGGTTTTGATTTT
CCACAACAATATCTTAAACAATGGTTTTCAATTATATTTGATAGTGAGATGCAACAACAT
GTCTCATTTCAAAACAATGAGTCAAGTCTCAACTGTTTTGTTGTCCATTGAATTCAAATA
CTAAGCACTATGTTTTTGATGGTGTTCTAGAGCTATGGATAAGCAGGTTCATTTGAATAG
AATAGTCTTAAGCAAAAAAAGAAGGTTCATTTGTTATAAAATCAGATGTTTGCCAAAGAC
ACAATCCAACGAATCTCTATGCAAACATAAGACATTAGTGAGAAGTGCGAGAAAAGTGTT
TGTTTTTTCTTTAAGATGTTCATTTGCTGGTAATGAATATGATTTCAGACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BX20TF U 1
AF RS1BX20JQ C 562
BS 1 800 RS1BX20TF
BS 801 1252 RS1BX20JQ

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CTTCTAGCGGTTGAGCCAGAGCAAGCTAAGCTACTAGTCCGCTGTTGTTTTGGCACACTC
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TATTCACATTTACGGTCCAAGAACTGGGTCTTGAGGTCAGGGTTGCAGTACGGTGTGGAT
TTCGTGGCATACCGTCACCATCCATCTCTTGTCCACTCTGAATACTCTGTTTTGGTTCAG
TCTGGTGACAGTAACCGGTTAAGAGTGTGGTCAGATGTCCATTGTGCTGTTCGGTTAAGC
GGGAGTGTTGCGAAAACGTTATTGACTCTCCATGTTAGTGGTAAATCTTACAAAGAGGAT
TTGAATCTACCTTTGTGCTTGGATAACTACACAGTGGAAGAGCATACTATTTGTAGATGG
AGCCCAGAACTCAGCCGTGA
GATGAAA

QA 1 800 1 800
DS 

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GATAACTACACAGTGGAAGAGCATACTATTTGTAGATGGAGCCCAGAATTCAGCCGTGAA
GATGAAACCATTAATTCAAAACCAAATGCTACCACTGTGAGTAATTTGAAATCCCCTTGA
TGATCCTACCCTGGTTAACTGAGTACTGGTTTTGATTTTCCACAACAATATCTTAAACAA
TGGTTTTCAATTATATTTGATAGTGAGATGCAACAACATGTCTCATTTCAAAACAATGAG
TCAAGTCTCAACTGTTTTGTTGTCCATTGAATTCAAATACTAAGCACTATGTTTTTGATG
GTGTTCTAGAGCTATGGATAAGCAGGTTCATTTGAATAGAATAGTCTTAAGCAAAAAAAG
AAGGTTCATTTGTTATAAAATCAGATGTTTGCCAAAGACACAATCCAACGAATCTCTATG
CAAACATAAGACATTAGTGAGAAGTGCGAGAAAAGTGTTTGTTTTTTCTTTAAGATGTTC
ATTTGCTGGTAATGAATATGATTTCAGACGC

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

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TTCAAGTGGATGAAGAATCTTGTGCATAAGAAGAAGACGACGAAAGACTCTAATTCTTGA
AAATGGAAAGAAAGACAACATTTGTTTATTTTATTCTAAAGATATCAATCTATCATTGTA
TTTGATTGTTTTCATGTCGAGATTCATGTGAGTTATGTATGGTGCTCCCCACGATTGAAT
GTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTACAGGACATGGCTCAAATCTTCTTTAAAAATAAAATG
TTATATTTTCTCGCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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AF RS1C574TF U 1
BS 1 435 RS1C574TF

RD RS1C574JQ 435 0 0
GGTAAAGAAGACCTCTCAACACATAAGAGTTTGCGGAAAGATATGACAAGTGAAGCACCA
AGCTGGGCGGATCAATGGGGAACCGGAGGCATCGGAGAGATGCCGGAGGAAGATAAGACC
AAAAGTGCCGGCGGTAAGAAGTCCGGCAAGACCAAAGCCAAGATTGTTGACTTCATAAGT
TTCAAGTGGATGAAGAATCTTGTGCATAAGAAGAAGACGACGAAAGACTCTAATTCTTGA
AAATGGAAAGAAAGACAACATTTGTTTATTTTATTCTAAAGATATCAATCTATCATTGTA
TTTGATTGTTTTCATGTCGAGATTCATGTGAGTTATGTATGGTGCTCCCCACGATTGAAT
GTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTACAGGACATGGCTCAAATCTTCTTTAAAAATAAAATG
TTATATTTTCTCGCC

QA 1 435 1 435
DS 

RD RS1C574TF 435 0 0
GGTAAAGAAGACCTCTCAACACATAAGAGTTTGCGGAAAGATATGACAAGTGAAGCACCA
AGCTGGGCGGATCAATGGGGAACCGGAGGCATCGGAGAGATGCCGGAGGAAGATAAGACC
AAAAGTGCCGGCGGTAAGAAGTCCGGCAAGACCAAAGCCAAGATTGTTGACTTCATAAGT
TTCAAGTGGATGAAGAATCTTGTGCATAAGAAGAAGACGACGAAAGACTCTAATTCTTGA
AAATGGAAAGAAAGACAACATTTGTTTATTTTATTCTAAAGATATCAATCTATCATTGTA
TTTGATTGTTTTCATGTCGAGATTCATGTGAGTTATGTATGGTGCTCCCCACGATTGAAT
GTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTACAGGACATGGCTCAAATCTTCTTTAAAAATAAAATG
TTATATTTTCTCGCC

QA 1 435 1 435
DS 



AS 1 2

CO CL5790Contig1 1033 2 2 U
GAGAGATATGCCATCCCCTCCAGCGATGCCAGTCCGTCCACGATCTGTTGTTGAATCCAT
TGGTTCGTTTGTCAGTAAAGCCATACTTGAGTACCCGTCTGCCACAAGGAGGGCTTGTTC
TTGTGTCCACACGTTGTTACATGTGCCAGACAACTCGTCTGACATCGAAGGGGTAAGGCA
ATCATTGGCGGTGGTCTTCAGTGGAGCAGCCTTTTCTCATTTTCTACAATTGCGTGAGAA
ACCTTGTTCGTTGTGGAGGCCTCTTTTGCTGGCAATATCATCATGCTATATCTCCCATTC
TGATATTGTGGAATGCGTTTTAGAGAAAGCAGTGCCCGGTGGTTTCGAGTTATGGGTATC
CTCGTTGGCGTTTTCATATTCGCTTACGCTTGATGCCAGTCCATCAACAGCGTCGGAAGT
AAAACTATATTTGTTGACGTTAGCAAAGGTGATCGAGCTGCTTTTAGATGCAAGGCAAGG
GCAAGGGAATGATGCAACTGATGATTTGGTAAGGAAGTGCTTTGTTTCACTGATGGAGGC
TTCTCGGAGGCTAGAGGAAATAGCTGAAGAATCAGACGATGATGAAGATGATGGAGAACC
TGAGGAAGAAGAGGAAGAATCTGATGAAAATGATTCAAATGACGAGGATTCTGAGAGTGA
CGATGAGTGTGAAGAAACAGAGGAAGAATTTCTGGAAAGATATGCTAAAGCTGCAGCAGA
ATTGGAGGATAGTGAAGTTATTGAAGAAGCAGATGAAGAAGATGATGAGCGTGAGATTGA
TTTGGGTCGTCTGAATGAAATCGATCCGCAGAAGCTGGTTTTATCGTTAATGGAGAGGCA
TCATCAGAAAGTAGTAAAGCTCGTACCCTCTGAAGTGATCTCGACATTTCTAAATGTTTT
TCCTGCATATACCGGTTTCTTCAGTTGAGAGTGCCACTGAACACTAAACTGCACTTTTCT
CTCTTTGTCCAAGTGTGTTGGTGTGGTTTGGTTTTGTTCATGTTCTGTTTTGTGATTTCT
GAACCAGTCTATG


BQ
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BS 1 697 RS1DK62TF
BS 698 1033 RS1DK62JQ

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AAAACTATATTTGTTGACGTTAGCAAAGGTGATCGAGCTGCTTTTAGATGCAAGGCAAGG
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GTATGCTAA

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DS 

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TGTTTCACTGATGGAGGCTTCTCGGAGGCTAGAGGAAATAGCTGAAGAATCAGACGATGA
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TGATGAGCGTGAGATTGATTTGGGTCGTCTGAATGAAATCGATCCGCAGAAGCTGGTTTT
ATCGTTAATGGAGAGGCATCATCAGAAAGTAGTAAAGCTCGTACCCTCTGAAGTGATCTC
GACATTTCTAAATGTTTTTCCTGCATATACCGGTTTCTTCAGTTGAGAGTGCCACTGAAC
ACTAAACTGCACTTTTCTCTCTTTGTCCAAGTGTGTTGGTGTGGTTTGGTTTTGTTCATG
TTCTGTTTTGTGATTTCTGAACCAGTCTATG

QA 1 571 1 571
DS 



AS 1 2

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TATCTCTATCTTTATCTCTGTATAATCCGATTTGGGGAGGTCTTTGAGGCAAAGCTGCTT
CTATGCCATATTGTAGAGAAAATGGGCGATTCTAAGGGGTATGGAAAGTAGGAGGAGGAG
TGATTTCAAATGTTATGTCTGCAAATTCTTACAACGTCTCCCTTAAGTTATCTCCAGTTG
TTTCTTTTTGGGATTGTATTGTCCGCACCATGAGGTATTCCTATATACCTGAGTGGGTGT
AGTACTAGTTCTTCACATCCTTCCACCACAGCAGCAGCGAGTTTTTTTAGTTCAGTTTAT
TTTTAGTTACAATTATAGATATACACATAGAAAGAGAGAGAGTGAAAGCTAGTATGGATT
GCAAGCAAGTTCAGGCAGTAGCTAGGAAAGGTAAGAAGAAACATAATGGCAAAGATGAAT
TCGATCGTGTCAAACAAGCTGAGAAGAAGAAGAGACGTCTCGAGAAAGCTCTTGCTACTT
CTGCTGCCATCAGGGCTGAGCTGGAAAAGAAGAAGCAGAGGAAACTTGAAGAACAACAGA
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AAGATTCTGATGATTCATCATCTAGAGTCATGCTTGGCCAAGAAAAGGCTTGTTTCAAGA
TGGATCATCTGTTTAGAGGTGAAAACTACGTTCCTCTTCAAAGCTGCGCTAGCTATGCGG
TTCAAGGGATTGGGTTTGTCTCCAACGGTTATGGACTAGGAGACAGTAGCTGGTCGCCCT
TCATGAGGGAATCTTGGGATAGCAACATGGGAGTTTCAGCTGATCTGATCGCTGCTCAGG
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TGTTCCGGGGATGAGAAGTTGCCATGATTCCAGATTTGATTGCTAAATTCAGCTTTTGTT
ATGATATAAGTTGCGAATAATGTTCGTCTTATTTCGGTGTGAGTTTGGTGTGTTTTTTTT
TTCTTTTTTTCACTAAACGCTAGATTTATACTCTGTTTTCTTTCCTTCCCTGCAATATAT
TATGGACGCATTGCGAGTTGTATCC


BQ
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AF RS1GX15JQ C 450
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TATCTCTATCTTTATCTCTGTATAATCCGATTTGGGGAGGTCTTTGAGGCAAAGCTGCTT
CTATGCCATATTGTAGAGAAAATGGGCGATTCTAAGGGGTATGGAAAGTAGGAGGAGGAG
TGATTTCAAATGTTATGTCTGCAAATTCTTACAACGTCTCCCTTAAGTTATCTCCAGTTG
TTTCTTTTTGGGATTGTATTGTCCGCACCATGAGGTATTCCTATATACCTGAGTGGGTGT
AGTACTAGTTCTTCACATCCTTCCACCACAGCAGCAGCGAGTTTTTTTAGTTCAGTTTAT
TTTTAGTTACAATTATAGATATACACATAGAAAGAGAGAGAGTGAAAGCTAGTATGGATT
GCAAGCAAGTTCAGGCAGTAGCTAGGAAAGGTAAGAAGAAACATAATGGCAAAGATGAAT
TCGATCGTGTCAAACAAGCTGAGAAGAAGAAGAGACGTCTCGAGAAAGCTCTTGCTACTT
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AAGAT*CTGATGAT*CATCATCTAGAGTCATGCTTGGCCA
G

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DS 

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AAGAGACGTCTCGAGAAAGCTCTTGCTACTTCTGCTGCCATCAGGGCTGAGCTGGAAAAG
AAGAAGCAGAGGAAACTTGAAGAACAACAGAGGTTAGATGACGAAGGTGCTGCTATTGCA
GAAGCGGTTGCTCTCCACGTCCTACTGGGCGAAGATTCTGATGATTCATCATCTAGAGTC
ATGCTTGGCCAAGAAAAGGCTTGTTTCAAGATGGATCATCTGTTTAGAGGTGAAAACTAC
GTTCCTCTTCAAAGCTGCGCTAGCTATGCGGTTCAAGGGATTGGGTTTGTCTCCAACGGT
TATGGACTAGGAGACAGTAGCTGGTCGCCCTTCATGAGGGAATCTTGGGATAGCAACATG
GGAGTTTCAGCTGATCTGATCGCTGCTCAGGCTGTCTCGTCACTAAGGATATCTGAAAAC
ACTGACAGGAATCCCTTTGTGCTTAAGGGGATGTTCCGGGGATGAGAAGTTGCCATGATT
CCAGATTTGATTGCTAAATTCAGCTTTTGTTATGATATAAGTTGCGAATAATGTTCGTCT
TATTTCGGTGTGAGTTTGGTGTGTTTTTTTTTTCTTTTTTTCACTAAACGCTAGATTTAT
ACTCTGTTTTCTTTCCTTCCCTGCAATATATTATGGACGCATTGCGAGTTGTATCC

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

CO CL5792Contig1 1026 2 4 U
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GTGAGCGCAGAGCTTTACGGGAAAGACTTGATTGTACTTAGAGATATAATCGACAAAATG
TATAAAGACTCTCGGTTGGTAAAGCCTTCGCTTGTCGCTCCTGGAGGGTTCTATGAACAG
CAATGGTACACAAAACTTCTGGAGATCTCCGGTCCTGGTGTTGTCGACGTGGTGACTCAC
CATATATACAATCTTGGTTCAGGGAATGATCCACAGCTAGTGAAGAAGATACTGAATCCT
AGTTACTTAAGCAAAGGAGCCGAAACATTCAAGAACGTGAACAAGACGATTCAAGAACAT
GGACCGTGGGCTTCTCCTTGGGTTGGAGAGTCCGGTGGAGCTTACAATAGTGGTGGCCAA
CATGTCTCTGATACATTCATAGACAGCTTCTGGTATCTAGACCAGCTTGGAATGTCGTCC
AAACACAACACTAAAGTGTACTGCAGACAGACTTTGGTCGGAGGGTTTTACGGTCTGCTC
GAAAAGGGAACTTTTGTTCCAAATCCTGATTACTATAGTGCACTGCTTTGGCATCGGTTA
ATGGGTAAAGGTGTTCTTGCGGTTCAGTCAGATGGACCACCTCAGCTACGTGTTTACGCT
CACTGTTCAAAAGGAAGAGAGGGTGTAACGTTGCTTCTGATCAACTTAAGCAACCAATCA
GACTTTACGGTTAGTGTGAGCAACGGTGTGAACAACATGGCATTGAACGTGGAGTCAAAG
CCGAAGAAGAAGTCGTTGTTGGATACTTTGAAGAAACCTTTTGCTTGGATTGGAAACAAA
GCTTCGGATGGTTATCTGAGCAGAGAGAGTATCATCTAACACCAGAGAAGGTGAGTTGCG
TAGCAGACATGGTCTTGATGGTAACCGTTGAACCGACAGAAACCGGAGATATCCGACTTG
ACCGTCATCGTGAGTGACTCTCGTTCTGTCTCGTCATGTCATGTCGTCGTGTGTGCTAGT
TTGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1B386TF U 1
AF RS1CN33TF U 216
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GAAAAGGGAACTTTTGTTCCAAATCCTGATTACTATAGTGCACTGCTTTGGCATCGGTTA
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QA 1 656 1 656
DS 

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G
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TGTCATGTCGTCGTGTGTGCTAGTTTGATG

QA 2 811 2 811
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TGAAGACATGGCTGATGCTAAGCATTTTTCCACCACCGGCACTTCTGCACTGCAACTTCC
TACTACTCCTACTCCAAGGAGACCTAATGTAAGGCTGGATAGCCTCATAATGGAAGCAAT
ATCTACTATGAAAGAGCTTGGTGGCTCTAACAAAACAACTATTGGTGCCTACATTGAGGA
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AGCTTGTGGTAAACTCATCAAGATTAAACGCAGGTATAGAATTCCACATACCACTCCTTT
GTCTTCCCACAGGAGAAGACATTTGGGAACACCGTCTGGAAAACAGAGTGTTCTTTCTTT
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AGAGTTAGCCAGAATGAAGACTATGAACGCACACGAGGCGCAAGCGGCTGCAGAGCAGGC
AGTGGAGGAGGCAGAAGCTGCCATGGCAGCGGCTGAAGAAGTTGCAAAGGAAGCAGAGGC
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AGGAAGAAACAACTGCAAAATGATGGTCTGTACGTGAGGTGACAGAGAAGAAGAAGAAGC
TAAATGTGTTGCAGGTGAAGAGAGAGAAGCGTAGAAGTAGTGTTTGTGTGTTGATGATTC
TCTACTTGGGAACTCTTTTTAGTTGTAAGCCAGTAATCTCAGATGCTAAAGCCATTGTAT
TTCTGTTCACACTTTACTTCACAGCCAAAATAAGTTTTAAAAACATGTCCACTGCAGCTT
TTCGTGTAAAACTTGATAAGAAAGGTGTGAATTTGTGAAAATATTTTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1C785TF U 1
AF RS1C785JQ C 473
BS 1 672 RS1C785TF
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BS 674 713 RS1C785TF
BS 714 1250 RS1C785JQ

RD RS1C785TF 713 0 0
GGGAATCTTCATCTCCCATTAACCCTAATCTCATTGTACCAAAATCTCCACCAAGAAAAA
TCTGAATCGGTCTCGCGAAGATCAAATCCCCCTCGGAAAATCACCGAACATACTTAACAT
TGACTGTAGGGTGCGTTTGGAACCCGTGATGGGTGCTCCTAAGCAGAAATGGACTCAAGA
AGAAGAGTCAGCTCTAAAGTCTGGCGTTGTCAAGCATGGACCTGGCAAATGGCGCACCAT
TCTCAAAGACCCTGAGTTTAGCGGAGTCTTGTACCTCCGTTCCAATGTGGATCTTAAGGA
CAAGTGGAGAAATATGAGTGTCATGGCCAATGGGTGGGGATCGCGTGATAAGTCTAGTGA
TGAAGACATGGCTGATGCTAAGCATTTTTCCACCACCGGCACTTCTGCACTGCAACTTCC
TACTACTCCTACTCCAAGGAGACCTAATGTAAGGCTGGATAGCCTCATAATGGAAGCAAT
ATCTACTATGAAAGAGCTTGGTGGCTCTAACAAAACAACTATTGGTGCCTACATTGAGGA
ACAATATCACGCTCCGCCAGACTTCAAACGGTTGCTGTCTACCAAGCTAAAGTACTTGAC
AGCTTGTGGTAAACTCATCAAGATTAAACGCAGGTATAGAATTCCACATACCACTCCTTT
GTCTTCCCACAG*AGAAGACATTTGGGAACACCGTCTGGAAAACAGAGTGTTC

QA 1 713 1 713
DS 

RD RS1C785JQ 778 0 0
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ATTGAGGAACAATATCACGCTCCGCCAGACTTCAAACGGTTGCTGTCTACCAAGCTAAAG
TACTTGACAGCTTGTGGTAAACTCATCAAGATTAAACGCAGGTATAGAATTCCACATACC
ACTCCTTTGTCTTCCCACAGGAGAAGACATTTGGGAACACCGTCTGGAAAACAGAGTGTT
CTTTCTTTGCCTTCACCTAAAACAGAGAGAGATGAAGTGAATGTTCAGACAAAGGCTCAG
ATTGATACAGAGTTAGCCAGAATGAAGACTATGAACGCACACGAGGCGCAAGCGGCTGCA
GAGCAGGCAGTGGAGGAGGCAGAAGCTGCCATGGCAGCGGCTGAAGAAGTTGCAAAGGAA
GCAGAGGCAGCAGAAGCCGAAGCAGAAGAAGCTCAAGCTTACGCTGAAGAAGCTTTAAAA
ACACTGAGAGGAAGAAACAACTGCAAAATGATGGTCTGTACGTGAGGTGACAGAGAAGAA
GAAGAAGCTAAATGTGTTGCAGGTGAAGAGAGAGAAGCGTAGAAGTAGTGTTTGTGTGTT
GATGATTCTCTACTTGGGAACTCTTTTTAGTTGTAAGCCAGTAATCTCAGATGCTAAAGC
CATTGTATTTCTGTTCACACTTTACTTCACAGCCAAAATAAGTTTTAAAAACATGTCCAC
TGCAGCTTTTCGTGTAAAACTTGATAAGAAAGGTGTGAATTTGTGAAAATATTTTCAT

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 2

CO CL5795Contig1 985 2 2 U
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CTTCTTCCTATCCTTCCTCCGACCTTTATTTAACAATAAACTATTTTTTAAGTACTGTTT
AATCAGTTTATGCTTTTTATATCAACAAAACGAGGAGCTACTATTATAAGAGAAAGAAGA
GAGAGAGAAAGAAGAACAAGAGCCTCCGATCGTCTTCCTCCGCTCCGGCCGACGTTGGTG
GGTTTCTTCCGCCACGGCGTCGGTTGGACCCTCTGATCTGTTTTCTTTTTTTTTTCTTTT
CGGCTTGGTTTGTACAGTTTTGGTTTCGGAGTTGCACCTCCATGGTGGTCGTCCGCTTTT
GGCTCCGGGAGGCGGTGGCTTATCCAGCATCGTTGATCGCCGGGCTTTTGACTCCAGTAC
CCGCGCTAGTCTCTCCGGTATTGGATGTCTCGTTTTGTTTTTTATTTCTAGTTTAGTTTG
TAGTTTGTTTCGAAACAGTTCTCTTGCTCGGGATTTAATTTTAATTTGGCAGATGAGATC
TCGATATGGTATCGTTTGAAGCTATCCGACTATAACGTTGAAGAAGCAAGAGAAGGGTAT
GGTGGTTGTCCGTAGCCTCGGATGAGATCTCGGGACAGTTTCGGTGAAGCTCTCCGATTA
GAAAAGGGCTTCAGCGACGATCTCCGATTAGAAAAGGGCTTCGGCGACGAAGAAAAGTGC
GGAGGTTCAAGCTCCGGCGAGAATTCCCGGCGAAGGACGTGTCGCAGTGGTCTCGGTTTG
TGTCCGGATTGTGTGACGCGTGTTCTGTCGGTGTAGGAATTGCAACACGTGGACGCCTAC
GTGATCAGTTTAGACGCGTGACGGTGAAAAGTGTGTGGGCTGGGTTTCAGGCTCATTGGT
TTTAACTTGCCCTTTATGTTGGGCCTTTGTATCTGTACTTTCGTTGTTATCTGGGCTTTA
GTCTCATAATAAATTAGACGGCACG


BQ
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AF RS1DD60TF U 1
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BS 1 693 RS1DD60TF
BS 694 985 RS1DD60JQ

RD RS1DD60TF 693 0 0
GGATGGTCGGGAAAATTCAGATTCTCTTGTTAAGCCGCACGCTCCCAACACCGTCCACAC
CTTCTTCCTATCCTTCCTCCGACCTTTATTTAACAATAAACTATTTTTTAAGTACTGTTT
AATCAGTTTATGCTTTTTATATCAACAAAACGAGGAGCTACTATTATAAGAGAAAGAAGA
GAGAGAGAAAGAAGAACAAGAGCCTCCGATCGTCTTCCTCCGCTCCGGCCGACGTTGGTG
GGTTTCTTCCGCCACGGCGTCGGTTGGACCCTCTGATCTGTTTTCTTTTTTTTTTCTTTT
CGGCTTGGTTTGTACAGTTTTGGTTTCGGAGTTGCACCTCCATGGTGGTCGTCCGCTTTT
GGCTCCGGGAGGCGGTGGCTTATCCAGCATCGTTGATCGCCGGGCTTTTGACTCCAGTAC
CCGCGCTAGTCTCTCCGGTATTGGATGTCTCGTTTTGTTTTTTATTTCTAGTTTAGTTTG
TAGTTTGTTTCGAAACAGTTCTCTTGCTCGGGATTTAATTTTAATTTGGCAGATGAGATC
TCGATATGGTATCGTTTGAAGCTATCCGACTATAACGTTGAAGAAGCAAGAGAAGGGTAT
GGTGGTTGTCCGTAGCCTCGGATGAGATCTCGGGACAGTTTCGGTGAAGCTCTCCGATTA
GAAAAGGGCTTCAGCGACGATCTCCGATTAGAA

QA 1 693 1 693
DS 

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ATTTTAATTTGGCAGATGAGATCTCGATATGGTATCGTTTGAAGCTATCCGACTATAACG
TTGAAGAAGCAAGAGAAGGGTATGGTGGTTGTCCGTAGCCTCGGATGAGATCTCGGGACA
GTTTCGGTGAAGCTCTCCGATTAGAAAAGGGCTTCAGCGACGATCTCCGATTAGAAAAGG
GCTTCGGCGACGAAGAAAAGTGCGGAGGTTCAAGCTCCGGCGAGAATTCCCGGCGAAGGA
CGTGTCGCAGTGGTCTCGGTTTGTGTCCGGATTGTGTGACGCGTGTTCTGTCGGTGTAGG
AATTGCAACACGTGGACGCCTACGTGATCAGTTTAGACGCGTGACGGTGAAAAGTGTGTG
GGCTGGGTTTCAGGCTCATTGGTTTTAACTTGCCCTTTATGTTGGGCCTTTGTATCTGTA
CTTTCGTTGTTATCTGGGCTTTAGTCTCATAATAAATTAGACGGCACG

QA 1 528 1 528
DS 



AS 1 2

CO CL5796Contig1 1305 2 6 U
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GCTTAACGCCACTCTAGTGCTCCCGCGGTTTCTTTACAGCAATGTCTGGAAAGATCCTAG
CCAGTTTGGTGATATATACCAGGATGAACGTTTCATAGAGTATCTGAAAGATGATGTGCA
TATAGTGAAGGATCTTCCTCAAAATCTAAAGCCATTGATAACAAGAATCTCAGCTTGGTC
ACTGATACAGAGCTTATAAAAGAGGCAAAACCAGATGATTACATCAAAAATGTTCTTCCT
TTGTTAAAGAAGTATGGAATGGTTCATCTTTTTGGATACGGGAATCGCCTCGGTTTTGAT
CCGTTGCCTTTTGATGTTCAGAGATTAAGATGTAAGTGCAACTTTCACGCGTTGAAGTTC
GCTCCCAAGATTCAAGAAGCAGGATCTCTCCTGGTGAAACGGATAAGAAGATACGAAACT
TCGCGGAGCAAACTGGACGAAACATTGGTTGGTGAATCCATGGCTAAATATTCAGCTAAA
GAAGATCAAGAACCATTGAAGTATCTTGCTTTGCATCTAAGGTTTGAAGAGGACATGGTT
GCTCTCTATGTGATTTTGGAGGAGGGGAAACCGAACGTAAAGAGCTTCAAGCGTGCCGAG
AAGAACATTTCCCTCTTCTCCTCCAACGTTTGAAGGAATCAAAGTCTGTCTCTCCGGAAG
TGTTGAGGAAAACAGGAAGGTGTCCATTAACACCAGAGGAAGCAACTTTAGTGCTCGCTG
GTCTTGGCTTCAATAGAGGAACATATATATACTTAGCTGGATCTCAAATCTATGGAGGTT
CTTTTCGTATGCTTCCTTTAACAACGCTTTACCCAAATCTTGTGACTAAAGAAACTCTCC
TTACACCACAAGAACTCGCACCATTCAAAAACTTTTCTTTTCAGCTGGCTGCACTGGATT
TCATAGCTTGTGCAGCTTCAGATGTGTTTGCAATGACTGATTCCGGGAGTCAGTTATCGT
CGTTAGTCTCTGGATTTAGAACATACTATGGCAACGGTCACGCACCAACATTGAGACCTA
ACAAGGAGAGGCTTGCAGCCATCTTATCGGAGAGTGAAACAATAAACTGGAAGACCTTTG
AAAGCCGTGTGAGGAAAATGATAGAGGAAGGTCACAAAGTTCGTCTTAGGCCTTATGGAC
GCAGTATCTATAGACAACCGAAATGCCCAGAGTGTATGTGTAAATTTTGATTCTTGGAAC
GTAAAACATTACTGTTCTGAAAATTTCGATGTCTCGTTAGTACAC


BQ
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AF RS1EI64TF U 1
AF RS1EI64JQ C 487
BS 1 697 RS1EI64TF
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BS 720 731 RS1EI64TF
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GCTCTCTATGTGATTTTGGAGGAGGGGAAACCGAACGTAAAGAGCTTCAAGCGTGCCGAG
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DS 

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ATTTCCCTCTTCTCCTCCAACGTTTGAAGGAATCAAAGTCTGTCTCTCCGGAAGTGTTGA
GGAAAACAGGAAGGTGTCCATTAACACCAGAGGAAGCAACTTTAGTGCTCGCTGGTCTTG
GCTTCAATAGAGGAACATATATATACTTAGCTGGATCTCAAATCTATGGAGGTTCTTTTC
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TCTCTGGATTTAGAACATACTATGGCAACGGTCACGCACCAACATTGAGACCTAACAAGG
AGAGGCTTGCAGCCATCTTATCGGAGAGTGAAACAATAAACTGGAAGACCTTTGAAAGCC
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TCTATAGACAACCGAAATGCCCAGAGTGTATGTGTAAATTTTGATTCTTGGAACGTAAAA
CATTACTGTTCTGAAAATTTCGATGTCTCGTTAGTACAC

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DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TCAACAAAATAATTTTTTTTTCCTCTTCCTCATTCATCTTCGTGATTTTTTTCTTCTGAT
TTAATGTTTTTTTGTTTCTTCTCTTCTACTCATCTGTTTTTAGATTCCCATTTGGATGAT
AATAGCAGTGGCAGCTCGAGACCTGAGTCTGGAAACATTTTCCATCAAAACTTCTCTAGT
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GGGTCATGCCCTGGGATATTACTGTTAAATGACAAAACAATAACGGAGCCCTTGCAGCAG
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CATTCTTTGCTCTTTTGCAATTCTCACGCAACGTTGGCG


BQ
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AF RS1FE30TF U 1
AF RS1FE30JQ C 547
BS 1 667 RS1FE30TF
BS 668 668 RS1FE30JQ
BS 669 721 RS1FE30TF
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BS 753 753 RS1FE30JQ
BS 754 772 RS1FE30TF
BS 773 773 RS1FE30JQ
BS 774 787 RS1FE30TF
BS 788 788 RS1FE30JQ
BS 789 810 RS1FE30TF
BS 811 1119 RS1FE30JQ

RD RS1FE30TF 810 0 0
TTTTTTTTCTTCTGAAAACTCAATCTCTCCATAGATTCTCTCTCAATCTCTTAATCTCTA
TCAACAAAATAATTTTTTTTTCCTCTTCCTCATTCATCTTCGTGATTTTTTTCTTCTGAT
TTAATGTTTTTTTGTTTCTTCTCTTCTACTCATCTGTTTTTAGATTCCCATTTGGATGAT
AATAGCAGTGGCAGCTCGAGACCTGAGTCTGGAAACATTTTCCATCAAAACTTCTCTAGT
AAATTGAGATTAGAGCTTTCTCCAGCCGTTTCAGATATGAACATGGTTTCACACAGTATA
CAAAGCTCCAACGAAGGAGCGAGTCCCAAGGGTATGCTATCAGGTAGTGATCCAAAAACT
ACACAAACAAGAAGAGAAGGTTTACCGTTTGCACCTGAAGCACTAGAGCTTGCGGATACC
GGGTCATGCCCTGGGATATTACTGTTAAATGACAAAACAATAACGGAGCCCTTGCAGCAG
ATGATAACTTCTTCAGAGGAGACTGATGGTAGCTTTTCATGTCATTTAAATCTTACCTTG
GCTTCTGCTCCATTACCAGACAAGACAGCTTCGCAGATAGCTAAGACAAGTCATAAAAGT
CAGGAGATTGGAAGAGTTACTGAGTTAAACTTTAACTCAATAGAAACAAGTGCAGCAAGT
GAGAAAA*CCGAGGTCAACAAGAAGTTGCAGCTGGAGGAGGTAAACAAGCAAATGCAGCA
C*TCCGGCTAGGGTGAATGATGTATTCTGGGA*CAGTTCCTAACAGAAAGGC*AGGGTCT
TCAGATA*CGAGGAGGCAAGCTCCACTTAT

QA 1 810 1 810
DS 

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ATTGGAAGAGTTACTGAGTTAAACTTTAACTCAATAGAAACAAGTGCAGCAAGTGAGAAA
AACCGAGGTCAACAAGAAGTTGCAGCTGGAGGAGGTAAACAAGCAAATGCAGCACCTCCG
GCTAGGGTGAATGATGTATTCTGGGAACAGTTCCTAACAGAAAGGCCAGGGTTTTCAGAT
AACGAGGAGGCAAGCTCCACTTATAGAGAAAACCCATGTGAAGAGCCAGAGGAGAAAAGA
AACGGGCATGTGATGTCCCGTAATACAAAGAATATTTAGCAGCTGACCCTGTAACGAAAC
AAGACCGGTCATATCAACGATAATAGTCTGTGGTAAGTATTGAAACATTGGACTGAAACA
GCGTCTAAAGAGTAAGTAGCCTTGCATAAACGTATGTATCCTCACCTTTTTTGTTTGTTT
CGACACTTGTAATTGACTGTAGATTTAAGAAATATTGACTTATTAGTTTTGTAACATTCT
TTGCTCTTTTGCAATTCTCACGCAACGTTGGCG

QA 1 573 1 573
DS 



AS 1 2

CO CL5799Contig1 1231 2 2 U
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TACCAAAGCTCTAATCATCTTGAAGGCATGGCTAATCGCTATGATCGGAATCCATTCGCT
GAGGAAGAAGAAGTCAATCCTTTCGCTAATACTGGGAGTGTTCCGGCTGCATCGAACTCA
AGACTCTCGCCTTTGCCTCCAGAGCCTGTCGGTTTCGATTATGGTCGAACCGTTGACATT
CCTCTTGACAATAACAGATCTGGTGGTGCTACACAGAATTTGAACAAAAAAGAAAAGGAA
CTTCAAGCCAAGGAAGCTGACCTAAGACGACGGGAGCAGGAGGTGAAACGGAAAGAGGAT
GCAGCTGCACGAGCTGGAATAACGATTGAAGTGAAAAACTGGCCGCCTGTCTTCCCACTT
ATCCACCATGACATTGCTAATGAAATTCCTGTTCATCTCCAAAGGCTACAGTATGTTGCC
TTTGCGTCCTATTTGGGGTTGGTCCTTTGTCTGTTCTGGAATATTATTGCCATTACTACA
GCTTGGATCAAAGGAGAAGGAGTGACGATATGGCTTCTTGCCCTTATTTACTTCATAGCT
GGTGTCCCAGGAGGCTATGTGTTATGGTATCGTCCCCTCTACCGTGCCTTCAGGTTTGGA
CTTGTCTACTTTCAAACTTCTGATTTTTATTATTATTTGTTACTGCGTTTTTTCATATAT
TACTTTTTTTTTCTTGTTTAATGTATGCAGAACTGATAGTGCATTGAGCTTTGGATGGTT
TTTCATGTTCTATATGCTCCACATTGCTTTCTGTGTCTTTGCTGCGGTTGCTCCACCTGT
TGTCTTCAAAGGAAAATCTCTTGCTGGGATCTTACCTGCAGTAGATGTCTTAAGCGGTAA
TACATTGGTTGGGATATTCTACTTCATTGGGTTTGGGTTTTTCTGCCTCGAATCAGTGGT
CAGCATCTGGGTTATTCAGCAAGTATATATGTACTTCCGAGGCAGTGGGAAACAAGATGA
ACTGAGACGAGAAGCAGCGAGAGGAGCCCTGAGAGCCGCCGTATGAGACAGCTTTATGTA
GCATTTTGGCTTGTGTATGAAATCTTCACTGTTTTTTTTTTCAGTTTCTGAACTTTGTTT
TGTAAGCAAAAGAAAAGATTCTATTTTTGTTTATACTGTCATGTAAATCGGTGTTATATT
CAAAAAGTCAAGAGTTCAACTTCAAATTCAT


BQ
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AF RS1AW03TF U 1
AF RS1AW03JQ C 413
BS 1 649 RS1AW03TF
BS 650 1231 RS1AW03JQ

RD RS1AW03TF 649 0 0
GGAGTTCTCGGTCAGCTGGCTAAGATCTTAAAATCGATTCCAAGTCTTCTTCTTCTCTGA
TACCAAAGCTCTAATCATCTTGAAGGCATGGCTAATCGCTATGATCGGAATCCATTCGCT
GAGGAAGAAGAAGTCAATCCTTTCGCTAATACTGGGAGTGTTCCGGCTGCATCGAACTCA
AGACTCTCGCCTTTGCCTCCAGAGCCTGTCGGTTTCGATTATGGTCGAACCGTTGACATT
CCTCTTGACAATAACAGATCTGGTGGTGCTACACAGAATTTGAACAAAAAAGAAAAGGAA
CTTCAAGCCAAGGAAGCTGACCTAAGACGACGGGAGCAGGAGGTGAAACGGAAAGAGGAT
GCAGCTGCACGAGCTGGAATAACGATTGAAGTGAAAAACTGGCCGCCTGTCTTCCCACTT
ATCCACCATGACATTGCTAATGAAATTCCTGTTCATCTCCAAAGGCTACAGTATGTTGCC
TTTGCGTCCTATTTGGGGTTGGTCCTTTGTCTGTTCTGGAATATTATTGCCATTACTACA
GCTTGGATCAAAGGAGAAGGAGTGACGATATGGCTTCTTGCCCTTATTTACTTCATAGCT
GGTGTCCCAGGAGGCTATGTGTTATGGTATCGTCCCCTCTACCGTGCCT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1AW03JQ 819 0 0
TCCCACTTATCCACCATGACATTGCTAATGAAATTCCTGTTCATCTCCAAAGGCTACAGT
ATGTTGCCTTTGCGTCCTATTTGGGGTTGGTCCTTTGTCTGTTCTGGAATATTATTGCCA
TTACTACAGCTTGGATCAAAGGAGAAGGAGTGACGATATGGCTTCTTGCCCTTATTTACT
TCATAGCTGGTGTCCCAGGAGGCTATGTGTTATGGTATCGTCCCCTCTACCGTGCCTTCA
GGTTTGGACTTGTCTACTTTCAAACTTCTGATTTTTATTATTATTTGTTACTGCGTTTTT
TCATATATTACTTTTTTTTTCTTGTTTAATGTATGCAGAACTGATAGTGCATTGAGCTTT
GGATGGTTTTTCATGTTCTATATGCTCCACATTGCTTTCTGTGTCTTTGCTGCGGTTGCT
CCACCTGTTGTCTTCAAAGGAAAATCTCTTGCTGGGATCTTACCTGCAGTAGATGTCTTA
AGCGGTAATACATTGGTTGGGATATTCTACTTCATTGGGTTTGGGTTTTTCTGCCTCGAA
TCAGTGGTCAGCATCTGGGTTATTCAGCAAGTATATATGTACTTCCGAGGCAGTGGGAAA
CAAGATGAACTGAGACGAGAAGCAGCGAGAGGAGCCCTGAGAGCCGCCGTATGAGACAGC
TTTATGTAGCATTTTGGCTTGTGTATGAAATCTTCACTGTTTTTTTTTTCAGTTTCTGAA
CTTTGTTTTGTAAGCAAAAGAAAAGATTCTATTTTTGTTTATACTGTCATGTAAATCGGT
GTTATATTCAAAAAGTCAAGAGTTCAACTTCAAATTCAT

QA 1 819 1 819
DS 



AS 1 2

CO CL5800Contig1 1107 2 4 U
GCAGCAAGTGGATGGAGACAACCCTAATCTTTACCTGAAACCAAACGACGTCGTGCTCTG
CGTTTTGCCTCTTTTCCACATCTACTCGCTCAATAGCGTCCTTCTCAATTCCATCCGATC
CGGTGCGACGGTTCTTTTGATGCACAAATTCGAAATCGGGGCGTTATTGGATCTAATACA
GAGACACAAGGTGACGGTAGCGGCGCTTGTTCCGCCGCTTGTGATTGCTTTGGCCAAGAA
CCCAACTGTTAACTCTTACGATCTCTCTTCCGTTAGATTGGTTCTCTCCGGTGCAGCTCC
CTTAGGCAAAGATCTCGAGGATAGTCTACGCAGCCGTCTCCCTCAGGCCGTCCTTGGCCA
GGGATATGGTATGACAGAGGCAGGACCAGTGTTGTCAATGAGCCTTGGTTTTGCTAAAGA
GCCAATTCCGTCAAAATCAGGCTCTTGTGGGACTGTTGTCCGAAACGCAGAGCTTAAAGT
GGTTCACCTTGAGACACGTCTCTCTCTTGGCTACAACCAAACTGGCGAGATTTGTATCCG
TGGTCAACAAATCATGAAAGAGTACTTGAAGGATCCGGAAGCCACGTCAGCTACAATTGA
CGAGGAAGGTTGGCTTCACACAGGGGACATTGAGTATGTTGACGAAGATGACGAGATATT
CATTGTTGATCGACTCAAAGAGGTCATCAAGTTCAAAGGCTTTCAGGTGCCTCCGGCTGA
GCTAGAGGCTTTGCTCATCAGTCACCACTCTATTGCGGATGCTGCGGTTGTTCCTCAAAG
AGATGAAGTGGCTGGAGAAGTTCCGGTGGCTTTCGTAGTCCGATCAAATGGAAACGTCAT
CACGGAAGAAGATATAAAAGAATATATATCCAAACAGGTGGTATTTTACAAGAGATTGCA
CAAGGTCTTCTTTGTTCCCTCCATTCCCAAATCTCCTTCCGGAAAAATTCTGAGAAAGGA
TCTTAAAGCCAAACTCTGTTGAATGTAATTTTTTTTTCTTTTATATGATTTAAATGTCCC
TCTGTATTCACGATATTCGTGACTTTCTTTTGGATCCTTTGTCGCAACATGTGTTGACAA
TTAAGAGTAATAATCTATTATTTGGAC


BQ
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AF RS1ED79TF U 1
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AGAGTAATAATCTATTATTTGGAC

QA 1 744 1 744
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CTTTCTTCCAAACTTT


BQ
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AF RS1EH06TF U 1
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TCTTATTTATCTTATTAGTTTTCTTTCTGTTCTTCATTTTAATCTTCTAAGAAAACTCAT
AAAAATCTCCCTTTGTTTCAGGTACAATTCCAGCACCATTCATCTCTCCATCCAGCCGGC
CACTCTCTCTCTAAACCAACCATCCGGATAGTTTGAGATCTTGCCCACAACATTTTGGTA
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TTCTGTCATTGTCATCATATTTTAATTTTGCATCAAAAAGTCAAAAAAATTGTTGCATTG
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CATTTTTT
G

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DS 

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TCATTCTGTCATTGTCATCATATTTTAATTTTGCATCAAAAAGTCAAAAAAATTGTTGCA
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AGATCATTTTCGTGCCTTAGGTTGATCAGTCAAAGTGTTTTTGTGATTGTTGATCCGAGC
TTCCATTTTTTTGAACTAGATTGGCAATTTGCATTAACTTTTGATTGTAATTGCATCAAT
CATATAGAAAAATTAGTTTGCATTCATTTTTAATTTGCATTTCATTTATTTTGATTGCTT
GCATTCATTTTAGATCATCAATCATCATTAAAAAAAAAAAAGATTTCAATCATCATTTAA
TTTCGATTTGCATTTAGTTTTTCAATCTTTTTCCATTTTTTTAAACTTTGTCAACTTTAA
ATTCTTTCTTCCAAACTTT

QA 1 499 1 499
DS 



AS 1 2

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ATCCTTACTGTACTTTGTTCGTGGGTCGAATCTCTCATCTTACGTCGGAGGAGACTCTTC
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AGTTGGTTCTGCTGAGTTTAGGCAGTTTAAGATGTTGTCTTAAGATGTTACATTGTCTTG
TTACCGTTTTTTATTGTAGTGACGGGTGCTTCACGAGGGTATGCTTTTGTTGAGTATGAG
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GGAGGTGGACTTGGGGGTAGGAAAGAATCTGGACAACTTCGTTTTGGAGGACGAGAAAGA
CCTTTCCGTGCACCCTTGCGGCCAATTCCTCATGAAGATTTGAAAAAGCTTGGGATCCAG
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CAAAGTGTGTTTCATACAGAGGAGGCAAATCATCGGGAAGAAGAGTTTGAAGAGCAGAGG
AGTCCTGTCAAGAGAGAACGGTCTTATCACAGTCATAGAAGACGCAGCAAGGACAGAGAG
GAGCGTTACAGAGTAGAGTCTCGATCTGACAGAGAAGAGAGAAAAGAGAGATCAAGAGGA
AGGGAAGATAGATATGCTGACGACAAGGAAGAAATTTTTGGGAGCAAAAGATCAAACCGT
GGAGAAGAAGAAGAACGCTCTCACAAACGTCATAAACACAAGCGTTTTCATAAGTAGCTA
TCTGCCTGTATTTGGAACTCTTATTATTGTATATTTTAAGAAACCAACACAAGACTAGTG
TCGTGATACTTGCGGTAATTAGGAATCTCATAAGTAGCC


BQ
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AF RS1FB12JQ C 482
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BS 720 1119 RS1FB12JQ

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CTTCCACCAGAGGGAAGATACATGTCACGTACTCAGATCCCGTCACCCCCTAGGAGAAA

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CTTTCCGTGCACCCTTGCGGCCAATTCCTCATGAAGATTTGAAAAAGCTTGGGATCCAGC
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CTGCCTGTATTTGGAACTCTTATTATTGTATATTTTAAGAAACCAACACAAGACTAGTGT
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QA 1 638 1 638
DS 



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GTCTTCTCTTCATCATCGCGATTTCAATGGAGGGAGTTGAAGAAAAGACCACGACGACGA
CGTCGTCGGAAGGGAATATGATATCAGCAGCAGCGTTTGTGGAAGGAGGAATCCAAGAGG
CTTGTGATGATGCTTGTAGCATCTGTCTCGAACCCTTCTGCGATTCCGATCCTTCTACTT
TGACTAGTTGCAAGCATGAGTATCATCTTCAATGCATCCTTGAGTGGTGTCAAAGGAGTT
CACAGTGCCCTATGTGTTGGCAATCTATTAGTCTCAAAGACCCCACTGGTCAGGAATTGC
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TTCGCCATCCTACTCTCGGTGATTTTGAATTACAGCATCTCCCAGCGGGGGTGGATAATG
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GGCATGGAGCAAGAAGGGAAGGCCACAGAAGCAGGTCATCGTCAACTCAAGGTGGTCATC
CACAGTTCATGGTGTTCTCTCCTCCTCCGCCTTCTCCTCCTCCCATGCTTTCCTCTCCAT
CTCAGAGAGACGAGAATGACACAGTCACAAACCTTCCTCACAATGCTTCTGTAGGAGAGG
GTTCTATACAGTCAAACATGCAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BP65TF U 1
AF RS1FI60TF U 176
BS 1 219 RS1BP65TF
BS 220 220 RS1FI60TF
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BS 249 488 RS1BP65TF
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BS 490 504 RS1BP65TF
BS 505 505 RS1FI60TF
BS 506 520 RS1BP65TF
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BS 656 656 RS1FI60TF
BS 657 661 RS1BP65TF
BS 662 863 RS1FI60TF

RD RS1BP65TF 669 0 0
GGGAGAAAAAAAGGGAACCCTAGATTTCTTCGATCGTGTCAACAACAGAGACGACGACGA
CGCGCAGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGGAAGAGTCTTTGTAGTATC
AAATCATGAATCCAGGGTTTCGTTATCTCTCTCAACCCTAGATTATAGATTTCATCGATC
GTCTTCTCTTCATCATCGCGATTTCAATGGAGGGAGTTGGAGGAGATACGACTACGACGA
CGTCGTCTGAAGGGAATATGATATCAGCAGCAGCGTTTGTGGAAGGAGGAATCCAAGAGG
CTTGTGATGATGCTTGTAGCATCTGTCTCGAACCCTTCTGCGATTCCGATCCTTCTACTT
TGACTAGTTGCAAGCATGAGTATCATCTTCAATGCATCCTTGAGTGGTGTCAAAGGAGTT
CACAGTGCCCTATGTGTTGGCAATCTATTAGTCTCAAAGACCCCACTGGTCAGGAATTGC
TTGAGGCTGTTGTACAGGAGAGGACTCTCCGCTTCAATCCGTCTAGAAACGCCACCATAT
TTCGCCATCCTACTCTCGGTGATTTTGAATTACAGCATCTCCCAGCGGGGGTGGATAATG
CAGAGATTGAAGAACGCATCATCCAGCACTTGGCTGCTGCTGCTGCTATGGGCCGTGCAA
G
CATGGGAC

QA 1 661 1 661
DS 

RD RS1FI60TF 688 0 0
G
GATCGTCTTCTCTTCATCATCGCGATTTCAATGGAGGGAGTTGAAGATACGACCACGACG
ACGACGTCGTCGGAAGGGAATATGATATCAGCAGCAGCGTTTGTGGAAGGGGGAATCCAA
GAGGCTTGTGATGATGCTTGTAGCATCTGTCTCGAACCCTTCTGCGATTCCGATCCTTCT
ACTTTGACTAGTTGCAAGCATGAGTATCATCTTCAATGCATCCTTGAGTGGTGTCAAAGG
AGTTCACAGTGCCCTATGTGTTGGCAATCTATTAGTCTCAAAGACCCCACTGGTCAGGAA
TTGCTTGAGGCTATTGTACAGGAGAGGAATCTCCGCTTCAATCCATCTAGAAACGCCACC
ATATTTCGCCATCCTACTCTCGGTGATTTTGAATTACAGCATCTCCCAGCGGGGGTGGAT
AATGCAGAGATTGAAGAACGCATCATCCAGCACTTGGCTGCTGCTGCTGCTATGGGCCGA
GCAAGGCATGGAGCAAGAAGGGAAGGCCACAGAAGCAGGTCATCGTCAACTCAAGGTGGT
CATCCACAGTTCATGGTGTTCTCTCCTCCTCCGCCTTCTCCTCCTCCCATGCTTTCCTCT
CCATCTCAGAGAGACGAGAATGACACAGTCACAAACCTTCCTCACAATGCTTCTGTAGGA
GAGGGTTCTATACAGTCAAACATGCAG

QA 2 688 2 688
DS 



AS 1 2

CO CL5805Contig1 621 2 5 U
GGGAGCTGAAGAAAGCATCGGTAACAAGGCAGCTCCTGAATCCCTAAAGCCTAAACCTTT
CTCCCTCGCTGAGAGTACTCACTTTCACAAAGGCGATGAGTACCCCAATGGAGCTGATGT
CCATCAGAACCCCTAATTCAACCTTCCTCCCCAGACCTCACTCTCGCCTCCTACCACACG
CCACGCTTCCTTCTCTCCGTTCCCAACACCTCCCCACCCGACGCCTCCCCACTTCTCCAT
CTCTCGTTTCTTCTACTGGGAGGCTGCGTCTCGGGTTTAGCTCAGATACCAAGCTTAATC
GCTCCTTCTTCGTTGCTTCCGCTGCTTCCCACGAGGATTCGGAACCATCAAGTGTTGAGG
TGGAGAAGGAGAAGGAGAAGAGTGTAGTAGATGGTGACGATGTTGATACATCTCAGGAAG
CGTGGAAGCAAACCCTCGCGTCTGTCAAGGAGCAGGTTTCGAAGATTCAGAGCGTGTCGT
CGGAGGCGTACAATGTGAACTCGCAAAAGGCGATGACTATTTTGAAAGATACTTCCGAGC
AGCTTAGGATTCAAGCGGAGAAGGCCAAGGAAGAGTTGGGTACTAAGGCTAAAGAGGTTG
GGGGAGGAAGGGAGAGAGTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RS1H448TF U 1
AF RS1D769TF U 170
BS 1 524 RS1H448TF
BS 525 525 RS1D769TF
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BS 604 604 RS1D769TF
BS 605 621 RS1H448TF

RD RS1H448TF 621 0 0
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CTCCCTCGCTGAGAGTACTCACTTTCACAAAGGCGATGAGTACCCCAATGGAGCTGATGT
CCATCAGAACCCCTAATTCAACCTTCCTCCCCAGACCTCACTCTCGCCTCCTACCACACG
CCACGCTTCCTTCTCTCCGTTCCCAACACCTCCCCACCCGACGCCTCCCCACTTCTCCAT
CTCTCGTTTCTTCTACTGGGAGGCTGCGTCTCGGGTTTAGCTCAGATACCAAGCTTAATC
GCTCCTTCTTCGTTGCTTCCGCTGCTTCCCACGAGGATTCGGAACCATCAAGTGTTGAGG
TGGAGAAGGAGAAGGAGAAGAGTGTAGTAGATGGTGACGATGTTGATACATCTCAGGAAG
CGTGGAAGCAAACCCTCGCGTCTGTCAAGGAGCAGGTTTCGAAGATTCAGAGCGTGTCGT
CGGAGGCGTACAATGTGAACTCGCAAAAGGCGATGACTATTTTGGAAGATACTTCCGAGC
AGCTTAGGATTCAAGCGGAGAAGGCCAAGGAAGAGTTGGGTACTAAGGCTAAAGAGGTTG
GGG*AGGAAGGGAGAGAGTAT

QA 1 621 1 621
DS 

RD RS1D769TF 448 0 0
G
CTACCACACGCCACGCTTCCTTCTCTCCGTTCCCAACACCTCCCCACCCGACGCCTCCCC
ACTTCTCCATCTCTCGTTTCTTCTACTGGGAGGCTGCGTCTCGGGTTTAGCTCAGATACC
AAGCTTAATCGCTCCTTCTTCGTTGCTTCCGCTGCTTCCCACGAGGATTCGGAACCATCA
AGTGTTGAGGTGGAGAAGGAGAAGGAGAAGAGTGTAGTAGATGGTGACGATGTTGATACA
TCTCAGGAAGCGTGGAAGCAAACCCTCGCGTCTGTCAAGGAGCAGGTTTCGAAGATTCAG
AGCGTGTCGTCGGAGGCGTACAATGTGAACTCGCAAAAGGCGATGACTATTTTGAAAGAT
ACTTCCGAGCAGCTTAGGATTCAAGCGGAGAAGGCCAAGGAAGAGTTGGGTACTAAGG*T
AAAGAGGTTGGGGGAGGAAGGGAGAGA

QA 2 448 2 448
DS 



AS 1 2

CO CL5806Contig1 436 2 2 U
GGGTAACAAACAAAAATATTCTAGGAACTAGCGTGTAGAGAGAGAGAAAAAGCGAACCCT
AAATTTCTTCACGACCATGCCGCCAAATATGAGATCAATCCTTGCTAAGTTACATCGAAC
ATCGATGTCAATGGTGTCTCGCCGCAATTTTTCATCACCCGCAGTTGACGGCAAAGATCC
AAAGAAAAGATCAACAGTGAAATATGCGGTAACTCGAGCCCTAGGATTTGGTATCCTAGG
ATATGCTACGGGACTTTACATTGGCCATCGTCTATCTCTGGAGGGAGGCTGACGAACCAT
TTAAGAAATCCGAAAAGTTGTCTGGGTGGTCTATGTAATAACTATGTCTCTGTGTAAGCT
GAAAAACTCTTATTTGATATTGTTTCTCTCTTTGCTCTGTCGGAAAATTAAAACTCGTGC
GTGTTCGTAGACTCAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1A955JQ C 1
AF RS1A955TF U 1
BS 1 434 RS1A955TF
BS 435 436 RS1A955JQ

RD RS1A955JQ 436 0 0
GGGTAACAAACAAAAATATTCTAGGAACTAGCGTGTAGAGAGAGAGAAAAAGCGAACCCT
AAATTTCTTCACGACCATGCCGCCAAATATGAGATCAATCCTTGCTAAGTTACATCGAAC
ATCGATGTCAATGGTGTCTCGCCGCAATTTTTCATCACCCGCAGTTGACGGCAAAGATCC
AAAGAAAAGATCAACAGTGAAATATGCGGTAACTCGAGCCCTAGGATTTGGTATCCTAGG
ATATGCTACGGGACTTTACATTGGCCATCGTCTATCTCTGGAGGGAGGCTGACGAACCAT
TTAAGAAATCCGAAAAGTTGTCTGGGTGGTCTATGTAATAACTATGTCTCTGTGTAAGCT
GAAAAACTCTTATTTGATATTGTTTCTCTCTTTGCTCTGTCGGAAAATTAAAACTCGTGC
GTGTTCGTAGACTCAA

QA 1 436 1 436
DS 

RD RS1A955TF 434 0 0
GGGTAACAAACAAAAATATTCTAGGAACTAGCGTGTAGAGAGAGAGAAAAAGCGAACCCT
AAATTTCTTCACGACCATGCCGCCAAATATGAGATCAATCCTTGCTAAGTTACATCGAAC
ATCGATGTCAATGGTGTCTCGCCGCAATTTTTCATCACCCGCAGTTGACGGCAAAGATCC
AAAGAAAAGATCAACAGTGAAATATGCGGTAACTCGAGCCCTAGGATTTGGTATCCTAGG
ATATGCTACGGGACTTTACATTGGCCATCGTCTATCTCTGGAGGGAGGCTGACGAACCAT
TTAAGAAATCCGAAAAGTTGTCTGGGTGGTCTATGTAATAACTATGTCTCTGTGTAAGCT
GAAAAACTCTTATTTGATATTGTTTCTCTCTTTGCTCTGTCGGAAAATTAAAACTCGTGC
GTGTTCGTAGACTC

QA 1 434 1 434
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5808Contig1 788 2 2 U
GGACAACTCGCCGTCTCTCTCTCTCTCTCCCCCTCTCTCTCTCTCTTGATCATCAAACTT
GCTCAGCTCCGGTCATAAGATGTCTGAGGGATCAGTAAAGGTAGACTCTGCAGGAGAGTT
ATCAGATGTTGACAACGAGAACTGCAGTAGCGGCGGCGGAGGTGGGAGCAGCAGTGGTGA
TACGAAGAGGATTTGCGTTGATTGCGGAACACTCCGAACTCCTCTCTGGCGCGGTGGCCC
TGCTGGTCCTAAGTCGTTGTGCAATGCTTGTGGGATCAAGAGCAGGAAGAAGAGGCAAGC
AGCAGCTCTTGGAATCAAACCAGAAGAGAAGAAGAGAAAGAGAAGAAGCAATAGCAGTAG
TGATAGTGATCTAAGCTTCGATGAACATCGAGACGCTAAGAAGAAGATCATCAACAAAGG
TGATGATGATGATCTCACCAGTAGAAGTAACAGCGAAGGAGTGAGCAAGTATTTGGATAT
AGGGTTCAAAGTTCCGGCGATGAAGCGATCGGCGGTTGAGAAGAAGAGGCTATGGAAGAA
ACTCGGAGAGGAAGAAAGAGCCGCCGTGCTTCTCATGGCGCTCTCTTGTGGCTATGTTTA
TTCATAAAACGAAGAAGAATTCGTTTCTTTTTGAGGGAATAATTAATTTAACTAGATAGA
GGAGAGATATGTATGAATGTGTAATAGTTAGTGATGTCGTGTTTTTTTTTTGTTCTGGTT
CCCACTAATGTTATGTATTCATTTGTTAATGAATTTACATATTGAGAGCAATTCAGTTTA
ATTAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GT91TF U 1
AF RS1GT91JQ C 16
BS 1 448 RS1GT91TF
BS 449 788 RS1GT91JQ

RD RS1GT91TF 448 0 0
GGACAACTCGCCGTCTCTCTCTCTCTCTCCCCCTCTCTCTCTCTCTTGATCATCAAACTT
GCTCAGCTCCGGTCATAAGATGTCTGAGGGATCAGTAAAGGTAGACTCTGCAGGAGAGTT
ATCAGATGTTGACAACGAGAACTGCAGTAGCGGCGGCGGAGGTGGGAGCAGCAGTGGTGA
TACGAAGAGGATTTGCGTTGATTGCGGAACACTCCGAACTCCTCTCTGGCGCGGTGGCCC
TGCTGGTCCTAAGTCGTTGTGCAATGCTTGTGGGATCAAGAGCAGGAAGAAGAGGCAAGC
AGCAGCTCTTGGAATCAAACCAGAAGAGAAGAAGAGAAAGAGAAGAAGCAATAGCAGTAG
TGATAGTGATCTAAGCTTCGATGAACATCGAGACGCTAAGAAGAAGATCATCAACAAAGG
TGATGATGATGATCTCACCAGTAGAAGT

QA 1 448 1 448
DS 

RD RS1GT91JQ 773 0 0
TCTCTCTCTCTCTCCCCCTCTCTCTCTCTCTTGATCATCAAACTTGCTCAGCTCCGGTCA
TAAGATGTCTGAGGGATCAGTAAAGGTAGACTCTGCAGGAGAGTTATCAGATGTTGACAA
CGAGAACTGCAGTAGCGGCGGCGGAGGTGGGAGCAGCAGTGGTGATACGAAGAGGATTTG
CGTTGATTGCGGAACACTCCGAACTCCTCTCTGGCGCGGTGGCCCTGCTGGTCCTAAGTC
GTTGTGCAATGCTTGTGGGATCAAGAGCAGGAAGAAGAGGCAAGCAGCAGCTCTTGGAAT
CAAACCAGAAGAGAAGAAGAGAAAGAGAAGAAGCAATAGCAGTAGTGATAGTGATCTAAG
CTTCGATGAACATCGAGACGCTAAGAAGAAGATCATCAACAAAGGTGATGATGATGATCT
CACCAGTAGAAGTAACAGCGAAGGAGTGAGCAAGTATTTGGATATAGGGTTCAAAGTTCC
GGCGATGAAGCGATCGGCGGTTGAGAAGAAGAGGCTATGGAAGAAACTCGGAGAGGAAGA
AAGAGCCGCCGTGCTTCTCATGGCGCTCTCTTGTGGCTATGTTTATTCATAAAACGAAGA
AGAATTCGTTTCTTTTTGAGGGAATAATTAATTTAACTAGATAGAGGAGAGATATGTATG
AATGTGTAATAGTTAGTGATGTCGTGTTTTTTTTTTGTTCTGGTTCCCACTAATGTTATG
TATTCATTTGTTAATGAATTTACATATTGAGAGCAATTCAGTTTAATTAACCC

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

CO CL5809Contig1 1092 2 2 U
GATGTCTATCTTTTGTAACCACAATGATTCTGCTTCCACTTCCGAACCAATGAGCTTGAC
CCGCCAATGCATCTAGTACCACTTGATCATCCAAATCATCAATGAAGATAAAGACTTTCT
GGTGTTTTAGCCTATTTTCCACCGCGCCTAAGTGATCTATCTGTGTGTGCCTTGTGCCTA
AAATCTCAGACAGAAAATGCCTTTGCAAACTCAACTTCATGTTATAGTCATCAGGGTTGG
CTCCCCTATAACCTTCCATAATCTTAGATATGAATCTCCTGTCAGTGAAAACACTGCATT
GGAACCGTCGAGAGAGTCGACTAAATAGAGCTCTTGCAATGGTAGTCTTGCCAATTCCGG
ATGGACCCCATATCCCAACCATTCTCACTTCCTCAGATTCCAAATCCAACAGAAAGCTCA
TCTCTGCGATATGGTCTTCAATGCCAACACATTCCTCAAAATCTTTTGATGGAGTAAAAT
TCAGTTTGCCCAAAAGGTCATTTACGATTACTTCAATCATTTTTGCTTCGTTATTGCTAA
CATGAACAACAAGAATACATTGTCAAATGTCACGTAGAAACATATATTCAAGACATACAA
TATAGCACTAGTAGAGTTTGAAATAGTCGTACAAATTTTGCGAATGATATCCGAGTAGAT
TCGCAACAACGGTCAACGCCTGCTGCCATCTGATTTTCACTGCTTTCGTTTTCACCTTAC
AAGTCTTGGCAAAACCCTCTCCAAATTTTCCCGTTTGTTTCCTGACATGAGAAGGATCTA
GACCATAGAAAATGGGTAGAACCAGTTGACCCAACTCTTCCTTACATCTCACGATCTCGA
CCAACTCGTCCAGACACCAACTGGAAGAGGCATACTTTGGCGAGAACACAACGACCGCAA
TCCTGGAAGTCCTGATCGCCATTTCAAGCGCAGGGGCAATCGAGTGGCTTCTCTCGATCT
CGTTGTCTTTGAAAACATTGATCAGTTTTCGATCTAGCTCCTTGAGGAAATGGCTAAGGA
AAGTTATGCGCACATCTTCCCCACTGAAGCTCGGAAAAACATCGTATAGCCAATTACGAG
AATCCATTAGCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ES85TF U 1
AF RS1ES85JQ C 445
BS 1 682 RS1ES85TF
BS 683 1092 RS1ES85JQ

RD RS1ES85TF 682 0 0
GATGTCTATCTTTTGTAACCACAATGATTCTGCTTCCACTTCCGAACCAATGAGCTTGAC
CCGCCAATGCATCTAGTACCACTTGATCATCCAAATCATCAATGAAGATAAAGACTTTCT
GGTGTTTTAGCCTATTTTCCACCGCGCCTAAGTGATCTATCTGTGTGTGCCTTGTGCCTA
AAATCTCAGACAGAAAATGCCTTTGCAAACTCAACTTCATGTTATAGTCATCAGGGTTGG
CTCCCCTATAACCTTCCATAATCTTAGATATGAATCTCCTGTCAGTGAAAACACTGCATT
GGAACCGTCGAGAGAGTCGACTAAATAGAGCTCTTGCAATGGTAGTCTTGCCAATTCCGG
ATGGACCCCATATCCCAACCATTCTCACTTCCTCAGATTCCAAATCCAACAGAAAGCTCA
TCTCTGCGATATGGTCTTCAATGCCAACACATTCCTCAAAATCTTTTGATGGAGTAAAAT
TCAGTTTGCCCAAAAGGTCATTTACGATTACTTCAATCATTTTTGCTTCGTTATTGCTAA
CATGAACAACAAGAATACATTGTCAAATGTCACGTAGAAACATATATTCAAGACATACAA
TATAGCACTAGTAGAGTTTGAAATAGTCGTACAAATTTTGCGAATGATATCCGAGTAGAT
TCGCAACAACGGTCAACGCCTG

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1ES85JQ 648 0 0
CAACACATTCCTCAAAATCTTTTGATGGAGTAAAATTCAGTTTGCCCAAAAGGTCATTTA
CGATTACTTCAATCATTTTTGCTTCGTTATTGCTAACATGAACAACAAGAATACATTGTC
AAATGTCACGTAGAAACATATATTCAAGACATACAATATAGCACTAGTAGAGTTTGAAAT
AGTCGTACAAATTTTGCGAATGATATCCGAGTAGATTCGCAACAACGGTCAACGCCTGCT
GCCATCTGATTTTCACTGCTTTCGTTTTCACCTTACAAGTCTTGGCAAAACCCTCTCCAA
ATTTTCCCGTTTGTTTCCTGACATGAGAAGGATCTAGACCATAGAAAATGGGTAGAACCA
GTTGACCCAACTCTTCCTTACATCTCACGATCTCGACCAACTCGTCCAGACACCAACTGG
AAGAGGCATACTTTGGCGAGAACACAACGACCGCAATCCTGGAAGTCCTGATCGCCATTT
CAAGCGCAGGGGCAATCGAGTGGCTTCTCTCGATCTCGTTGTCTTTGAAAACATTGATCA
GTTTTCGATCTAGCTCCTTGAGGAAATGGCTAAGGAAAGTTATGCGCACATCTTCCCCAC
TGAAGCTCGGAAAAACATCGTATAGCCAATTACGAGAATCCATTAGCC

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 2

CO CL5810Contig1 1349 2 4 U
GGCTCCCAAATCCTTTCACCTTCATCAGCCTCGATTCAAGTTTTGAGGAGCATTGTGGTG
CTAGGATGGGTGTGAAGCAGGCTCTAAGGAGCATCGATGCGTTCCCAAGAGCCGAGGATC
ATCTGCTTCAGAAAACTCAATCTGGTGCCGTTGTATCCATTGTTGGGCTCTTTATAATGG
CTACGTTGTTCTTGAGCGAGCTGAGTTTCTATCTTAACACACTTACCGTGCACCAGATGT
CAGTGGACTTAAAGCGTGGAGAAACTCTTCCAATTCATGTAAACATGACGTTCCCATCTT
GAAGTGGATCTTGATACAAACATTTGGAAGCTCCGTCTCAACAGTCATGGTCATATCATT
GGCACAGAATATATATCTGATCTTGTTGAAAAGGAGCATGATCACTCTTCTCACAAGCAC
GATGAACACAAGAATGAGACGGAAGCATTAAATATACTTGGGTTTGACGAAGCTGCTGAG
ACGTTGATTAAAAAGGTGAAGCAAGCATTGGCGGATGGAGAAGGATGTCGGGTTTATGGA
GTCCTAGATGTACAAAGGGTTGCTGGAAACTTCCACGTTTCAGTTCACGGACTGAACATC
TACGTTGCTCAAATGATATTTGGAGGGTCCAAAAACGTTAACGTGAGCCATATGATTCAT
GATCTATCGTTTGGGCCCAAGTACCCTGGAATTCACAACCCACTTGATGACACAAACCGA
ATGCTGCATGACACTAGTGGAACATTCAAGTACTACATTAAGATTGTTCCGACAGAATAT
AGATATCTTTCAAAAGACATACTGACAACGAATCAGTACTCTGTAACGGAATATTACACA
CCTATGAACGAATTTGACCGGACATGGCCAGCCGTCTACTTCTTATGATCTTTCACCCAT
CACTGTGACCATAAAGGAAGAACGCCGTAGTTTTCTCCACTTGATCACTCGGCTTTGCGC
TGTATTAGGGGGTACCTTTGCTTTGACGGGAATGCTAGATCGTTGGATGTTCCGTTTGAT
AGAATCATTCACCAAGAAACCGAGTACCAGAAGCATACACAAGTGAGAAACCGAGAGAAG
AGAAAAAGATCAAGGAAGGAAGAAGAATCTGTCAAACCCTAAATCATGAATCTACCTTCT
GAGACAACACCCACCAGAGAGATTACAAGAAACTCCTGGGGAGTGATACATTGCAAGATA
AAAAATCAGAACATGGATGTAGTTTTGCATGTTGTCGGTCTTTTTGAGTATTTTTATCTC
TTATGTATTCTCTGGTCCTCCCTACATCATCTAGTAGAATTATATGTAATTTTATAAAAA
CATTGCATCTTGCGATATGATAGTTTTGT


BQ
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ACGAATTTGACCGGACATGGCCAGCCGTCTACTTCTTATGATCTTTCACCCATCACTGTG
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GGGGGTACCTTTGCTTTGACGGGAATGCTAGATCGTTGGATGTTCCGTTTGATAGAATCA
TTCACCAAGAAACCGAGTACCAGAAGCATACACAAGTGAGAAACCGAGAGAAGAGAAAAA
GATCAAGGAAGGAAGAAGAATCTGTCAAACCCTAAATCATGAATCTACCTTCTGAGACAA
CACCCACCAGAGAGATTACAAGAAACTCCTGGGGAGTGATACATTGCAAGATAAAAAATC
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TTCTCTGGTCCTCCCTACATCATCTAGTAGAATTATATGTAATTTTATAAAAACATTGCA
TCTTGCGATATGATAGTTTTGT

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DS 



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CGACCTTGACACCTCCCGGCGTCGTCTTCATCTCATCCTCAATTATCAACAAGCCTCAAT
CTCTCAGATTCGTCTCCTCATCACCCGCCGTCCGCTCCAATCTCAAACTCAAACCATCTC
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AATGCAACTCTCTGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F644TF U 1
AF RS1F644JQ C 327
BS 1 683 RS1F644TF
BS 684 684 RS1F644JQ
BS 685 732 RS1F644TF
BS 733 733 RS1F644JQ
BS 734 784 RS1F644TF
BS 785 915 RS1F644JQ

RD RS1F644TF 784 0 0
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CGACCTTGACACCTCCCGGCGTCGTCTTCATCTCATCCTCAATTATCAACAAGCCTCAAT
CTCTCAGATTCGTCTCCTCATCACCCGCCGTCCGCTCCAATCTCAAACTCAAACCATCTC
CCCACGCCGCGAAGTTCCGATGCTCCGCTTCTTCGTCGACGTCGCTCACGCCGCAGCTGA
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GCTCGTGAAGCTGATCTTTTTTTATCCTGAACGAAGGTGCTGTTGATGTGTTGAAAGAGT
CTATGTCTGGTAACATTGTGAGACGTGTTGTATGATGGAACTATACACTATGGTTATAGA
ACAACTATGTGTCTGAAAAAAAA*TCTGTACTTTACTGTCTTAGAGTCTCCTTATTGATT
AAGATCTTTTTT*GACATGTGCCTTTATCTTTCATTAGTTTGGTTACAAAGATTTAGTCT
TTGA

QA 1 784 1 784
DS 

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GAGAACGAGATGGTGAGGCAAGGGCTTAAAGAGTACTCCAGCTGGCCGACGTTTCCTCAG
CTTTACATCGGCGGCGAGTTTTTCGGGGGGTGCGATATCACTCTCGAGGCGTTTCAGAGT
GGTGAGTTGCAGGAGGTTGTGGAGAGAGCTATGTGCTCGTGAAGCTGATCTTTTTTTATC
CTGAACGAAGGTGCTGTTGATGTGTTGAAAGAGTTTATGTCTGGTAACATTGTGAGACGT
GTTGTATGATGGAACTATACACTATGGTTATAGAACAACTATGTGTTTGAAAAAAAAATC
TGTACTTTACTGTTTTAGAGTCTCCTTATTGATTAAGATCTTTTTTTGACATGTGCCTTT
ATCTTTCATTAGTTTGGTTACAAAGATTTAGTCTTTGAAGGTTTCAGGATCTTCCTGAGT
ATTAGACTCTGTCTCCGTCTAGCGTCATGTGTTGTTCTTCTCATTATTGAAGATGGGTCT
GTATGAGAAACGGAGTTATTAAGAGATTAGAATCAATGCAACTCTCTGT

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 2

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GGAGAGGTAGATCTCTTAGCGGCCGGAACCATTTGCAGTGGATAGAAGAAAACTATCGAG
TTTCAGCTGCTGTGAAGAGAGGACAGACACGTGTGGTTTGTGCCATTTGAGCGTGAGAGA
CAATGGTTGGACCGTCGAGGCCTCAGATCGTTCTGTTTGGATCCTCCATCGTTCAGATGA
GTTTTGGCCATGGAGGTTGGGGCGCCATTCTCTCCGAGGTTTATGCTCGTAAGGCCGACA
TCATTCTGCGAGGATATTATGGATGGAACTCAACTCGTGCTTTGGAAGTTGTGGACCAAG
TGTTTCCCAAGGATGCTGAGGTACAACCTTCTCTGGTAGTTGTGTATTTTGGAGGAAACG
ACTCAATGGCGCCTCACCCTTCTGGTCTAGGACCTCACGTTCCACTTACCGAATACGTTG
ACAACATGAAAAACATCGCTCTTCATCTTCAGAGCCTTTCGGACTCAACACGTATCATAT
TTCTAAGCTGCCCTCCAGTGGACGAGGGCAAACTTCGCCAGAACCAAAGCCCATACTTGA
GCGAGGTGATCCGCACAAACGAGCTCTGCAAGACTTATTCAGACGCTTGCGTGGAGCTGT
GCCAAGAGCTAGGTTTACAAGTAGTTGATCTCTTCTCCACTCTTCAGAAATCAGATGACT
GGGAAACCGTTTGCTTCACAGATGGGATTCATTTGTCAGCGCAAGGAAGCAAACTGGTGG
CTGCAGAGATACTGAGAGTGGTGAAAGAAGCGGAATGGACACCGTCGCTTCACTGGAAAT
CGATGCCAACTGAATTCTCTGAGGACTCACGTTATGATCTTGTTTCAGCTGATGGCAAAA
ACACGGTCAACTCTTCAGAGTGGACCTACTTCTGGGAACAACAATGGGACTAATTAACAT
TACAACAACAACAACAAGAAAACCTTTATAGAATATGTTGTTGTTACCTTGGCTGCTTTG
TTTTTGTTTTCTGAAACGTTATTTATCATCATGCTTTGCGTGGTTTTTTTTTCTTTCTCC
AAGAATTACTGATAGGAATCAAAGACTTGAAGTTTGTGCTTGGGTAGTTTCTTCTTTAGT
ATTAATAATCTCCATTGAGTTGCTTTTCC


BQ
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AF RS1E375TF U 1
AF RS1E375JQ C 440
BS 1 612 RS1E375TF
BS 613 613 RS1E375JQ
BS 614 682 RS1E375TF
BS 683 1109 RS1E375JQ

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TTTCAGCTGCTGTGAAGAGAGGACAGACACGTGTGGTTTGTGCCATTTGAGCGTGAGAGA
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GTTTTGGCCATGGAGGTTGGGGCGCCATTCTCTCCGAGGTTTATGCTCGTAAGGCCGACA
TCATTCTGCGAGGATATTATGGATGGAACTCAACTCGTGCTTTGGAAGTTGTGGACCAAG
TGTTTCCCAAGGATGCTGAGGTACAACCTTCTCTGGTAGTTGTGTATTTTGGAGGAAACG
ACTCAATGGCGCCTCACCCTTCTGGTCTAGGACCTCACGTTCCACTTACCGAATACGTTG
ACAACATGAAAAACATCGCTCTTCATCTTCAGAGCCTTTCGGACTCAACACGTATCATAT
TTCTAAGCTGCCCTCCAGTGGACGAGGGCAAACTTCGCCAGAACCAAAGCCCATACTTGA
GCGAGGTGATCCGCACAAACGAGCTCTGCAAGACTTATTCAGACGCTTGCGTGGAGCTGT
GCCAAGAGCTAG*TTTACAAGTAGTTGATCTCTTCTCCACTCTTCAGAAATCAGATGACT
GGGAAACCGTTTGCTTCACAGA

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DS 

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TCTTCATCTTCAGAGCCTTTCGGACTCAACACGTATCATATTTCTAAGCTGCCCTCCAGT
GGACGAGGGCAAACTTCGCCAGAACCAAAGCCCATACTTGAGCGAGGTGATCCGCACAAA
CGAGCTCTGCAAGACTTATTCAGACGCTTGCGTGGAGCTGTGCCAAGAGCTAGGTTTACA
AGTAGTTGATCTCTTCTCCACTCTTCAGAAATCAGATGACTGGGAAACCGTTTGCTTCAC
AGATGGGATTCATTTGTCAGCGCAAGGAAGCAAACTGGTGGCTGCAGAGATACTGAGAGT
GGTGAAAGAAGCGGAATGGACACCGTCGCTTCACTGGAAATCGATGCCAACTGAATTCTC
TGAGGACTCACGTTATGATCTTGTTTCAGCTGATGGCAAAAACACGGTCAACTCTTCAGA
GTGGACCTACTTCTGGGAACAACAATGGGACTAATTAACATTACAACAACAACAACAAGA
AAACCTTTATAGAATATGTTGTTGTTACCTTGGCTGCTTTGTTTTTGTTTTCTGAAACGT
TATTTATCATCATGCTTTGCGTGGTTTTTTTTTCTTTCTCCAAGAATTACTGATAGGAAT
CAAAGACTTGAAGTTTGTGCTTGGGTAGTTTCTTCTTTAGTATTAATAATCTCCATTGAG
TTGCTTTTCC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

CO CL5813Contig1 603 2 5 U
ACGGTTCTCGTCACGAAATTGGCCGCGGATTACCGTAAAGTCGCCGGTCCTTATGCCGGA
CCGTCGCCTGGTATTAGAGCTGGAGCTTTAAGTCTCTTCGCTGTTCTTGGTATTCCATTA
GCTATTACTTTCAGTATTCCGTTTGCATTAGCCTCCATATTTTCAAGCAGCTCCGGTGCC
GGCCAAGGACTGTCGTTAGGAGTTTTGAATTTGGCTATTGTGATACCCCAAATGATAGTA
TCACTAGGAGGAGGACCTTTCGACGCCCTTTTTGGCGGTGGAAACTTACCGGCGTTTATA
GTCGGAGCAATCGCAGCGGCGGTCAGTGGAGTATTAGCTATAACTGTTTTACCTTCACCA
CCACCGGACGCACCTACCTTGAAGACAGGAGCCATGGGATTCCATTAGTTTATATTATGT
TTTATTTTCTTTATGAAACTCGTGATCAAATACAGTACTATTGCGCAAAACTGCAAGACC
CAAAAGCAAAAAATAGAAAAGAACAGAAGATGATAAAGTCTAATAAGCTTGGGTTGTCTG
TATTTCACCTTTTCTTTTAGTTTCTTGTTTTTGTTACCGATATCAAATTGAACAAGATTT
TCC


BQ
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10 10 10 

AF RS1FO38TF U 20
AF RS1GL37JQ C 1
BS 1 20 RS1GL37JQ
BS 21 309 RS1FO38TF
BS 310 310 RS1GL37JQ
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BS 467 603 RS1GL37JQ

RD RS1FO38TF 447 0 0
G
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TGGAGCTTTAAGTCTCTTCGCTGTTCTTGGTATTCCATTAGCTATTACTTTCAGTATTCC
GTTTGCATTAGCCTCCATATTTTCAAGCAGCTCCGGTGCCGGCCAAGGACTGTCGTTAGG
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GGTCAGTGGAGTATTAGCTATAACTGTTTTACCTTCACCACCACCGGACGCACCTACCTT
GAAGACAGGAGCCATGGGATTCCATTAGTTTATATTATGTTTTATTTTCTTTATGAAACT
CGTGATCAAATACAGTACTATTGCGC

QA 2 447 2 447
DS 

RD RS1GL37JQ 603 0 0
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GGCCAAGGACTGTCGTTAGGAGTTTTGAATTTGGCTATTGTGATACCCCAAATGATAGTA
TCACTAGGAGGAGGACCTTTCGACGCCCTTTTTGGCGGTGGAAACTTACCGGCGTTTATA
GTCGGAGCAATCGCAGCGGCGGTCAGTGGAGTATTATCTATAACTGTTTTACCTTCACCA
CCACCGGACGCACCTGCCTTGAAGACAGGAGCCATGGGATTCCATTAGTTTATATTATGT
TTTATTTTCTTTATGAAACTCGTGATCAAATACAGTACTATTGCGCAAAACTGCAAGACC
CAAAAGCAAAAAATAGAAAAGAACAGAAGATGATAAAGTCTAATAAGCTTGGGTTGTCTG
TATTTCACCTTTTCTTTTAGTTTCTTGTTTTTGTTACCGATATCAAATTGAACAAGATTT
TCC

QA 1 603 1 603
DS 



AS 1 2

CO CL5814Contig1 959 2 2 U
GGGTGCGTCGTCGGAGCTCCGTTGGTAGTTACTCGAGACTCTAGACGGATTCCGAAGACC
TTAAAGTGCTTCGCTTCCACCGCCGATTCCGAGCTTCTCCGTTCCCAGCTCGATCGTCTT
CACGCGGAGGCAGAGTCCACTCGTGCTAAAGCAAATAGTAACAGGTTGAGACTTTTGAGA
TTATCCGAAGCTGCAGAGAATCTAAGGAGACAAGCATCTGTAAGCGTTCAGACCGGGAAA
GAGAACGATGCAAGAGAGTTGCTTCTCCAGAAGAAGAAAGTCATGCAAGCTTTGGACAAG
GCCAAATCTCGTATCGAGTTGCTCGATACCCTTTCTTCCAGACTTAACGAGGCAATATCT
GTCAAGGAAACACAGCTGATTGGGAACATATCTTTAGATCTCCAAGTAGATACTGACAAC
AATAATACTTCAGATGGAGGAGTTCACATTGTATCTCCAAAGCCTGAGTCTACTCAAGAG
AATGACACAAACGACTTGGATCCTCAGGAAAGTCAACTTACTGAAAACAACTTTGAGGAA
CAACACCAAGAAGAGGCTTTAACTGGCAGCATCTTCAGAGAAGTGTCTTCTTATGACTCT
TTCCTGAAAAATCTAGACCAGAAACTTGGCAGAATCGAGGATGAACTTGTCAACGTTGTG
AATGTTGCGTCGTTGGTGCTTAGTCATGAAGATAAACCCAATAATTTAAAGGTTCAGCAA
ACATCGGAAGTTCTTGAAGAGATTCGTTCTGTCAGGGAAAGGATTGCAAATATCATTTCC
AAAGAAGCAAACATCAGTTAGTGCCTCAAGCTCCTTTGGTATGAACAGTTTTAAGCATCT
CTATACTCCATTCAGGTCTATGGCTCTTCTTGATGTGATGTGATGTGATGTGATGTGATA
TGCTGTGAATATTAAATTTCTTGTTAAGTTGGGTACAAACTTAGGTGTTAGGACCGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D145TF U 1
AF RS1D145JQ C 238
BS 1 671 RS1D145TF
BS 672 959 RS1D145JQ

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GTCAAGGAAACACAGCTGATTGGGAACATATCTTTAGATCTCCAAGTAGATACTGACAAC
AATAATACTTCAGATGGAGGAGTTCACATTGTATCTCCAAAGCCTGAGTCTACTCAAGAG
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CAACACCAAGAAGAGGCTTTAACTGGCAGCATCTTCAGAGAAGTGTCTTCTTATGACTCT
TTCCTGAAAAATCTAGACCAGAAACTTGGCAGAATCGAGGATGAACTTGTCAACGTTGTG
AATGTTGCGTC

QA 1 671 1 671
DS 

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AACAATAATACTTCAGATGGAGGAGTTCACATTGTATCTCCAAAGCCTGAGTCTACTCAA
GAGAATGACACAAACGACTTGGATCCTCAGGAAAGTCAACTTACTGAAAACAACTTTGAG
GAACAACACCAAGAAGAGGCTTTAACTGGCAGCATCTTCAGAGAAGTGTCTTCTTATGAC
TCTTTCCTGAAAAATCTAGACCAGAAACTTGGCAGAATCGAGGATGAACTTGTCAACGTT
GTGAATGTTGCGTCGTTGGTGCTTAGTCATGAAGATAAACCCAATAATTTAAAGGTTCAG
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TCCAAAGAAGCAAACATCAGTTAGTGCCTCAAGCTCCTTTGGTATGAACAGTTTTAAGCA
TCTCTATACTCCATTCAGGTCTATGGCTCTTCTTGATGTGATGTGATGTGATGTGATGTG
ATATGCTGTGAATATTAAATTTCTTGTTAAGTTGGGTACAAACTTAGGTGTTAGGACCGA
GC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

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AGAGAAGCACTACGTATAACTTCACATCTGACGTAGCTCTTGAAGACATTTTCATGGAGC
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CCGTTGCGACTTCCGATCACCGGTCAACGTCTCCGGCAACGGAGTCAACGATTTTATTGG
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AGCTAGTAAAAGCGAGAGTGGGAAGTGTAAGACGGCTGATACAACGTTGGCCTACAAGAA
ACTAACCGGGAACGGTTTAAAAAACAATGGTTTGATCTTTACCGGATATCCGGTTATCGG
CAACCAAGGAAAGATTCAGACATCAGGGTCTTGTCTTTACTCATCCTCCCTGAGAATTGA
TGTCTCTTGTGCTTGGGATCCGAGATATAACGGTCTTTTCTTCTATGAAACGACTGCTAT
ATTCCCGGTATCTCGGTTTAGAGACTTTATCATCGACCTGAAGAAGCTACGAGACATGAA
ACCCGAAAGACTTTGCGGGATTGATATCTATAATGGTATCCTCATCCGTTTCATCAAGGG
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TGACGATGCCTTGACCCCGAGGTTAGACCAAGATGTGATGGAGGAGATGGAGCAGATGGC
GTTTTTCAAATACGAGGCAAAGCCGCATTGGGGGAAGAATAGGAAAGTGGGTTTCTTTGG
TGTGAAGCAAAAATATGGACCTAACTTTGACAAGTTCTTGGAAGTGAAGAACAAGTTAGA
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CAAGTATGATGGATGTGCACTTGAAGGGAACTGTGTGTGTTCAGAAGACAGGCATTGTAG
TCCTTCCAAAGGCTACTTTTGTAGACAAGGTCTTGTTTATACACAAGCTAGGGTTTGCGG
ATTCTCCTCCTCTCAAGTTTCAATGGCTTAATTAAAAAAATTGTTGTTTCCAGTGACTAA
AAGATAATAAGAATGAAAATTCATTTTTTCATCATCAATGTATTGGACTCCTCCAAGATC
ATTAATAAAATAAATATAGAATTGCTACTAAGATTTATTGG


BQ
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AF RS1BZ62TF U 1
AF RS1BZ62JQ C 659
BS 1 780 RS1BZ62TF
BS 781 1421 RS1BZ62JQ

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CGGTTCACGATCATGTTGTCGGAATCAACCTTGTGGTTCCCGCGAATTCATCTGAAGGTT
ACGCCAAAGTCATTAGAGTCGAAGAAGGAAGAGACGATAAGCTTCTTAACGCCGTTAAAG
TCTCATTGGGTGTTTTAGGAGTCATCTCAAAGGTGAAGCTTTCGATAGAGAAAGCCTTCA
AGAGAAGCACTACGTATAACTTCACATCTGACGTAGCTCTTGAAGACATTTTCATGGAGC
ATGGCAAGAAATTCGAGTTCGGAGACATAACTTGGTATCCTTCTAGAAAAACTCGGTTTA
CCGTTGCGACTTCCGATCACCGGTCAACGTCTCCGGCAACGGAGTCAACGATTTTATTGG
TTTTCAGTCAAACCCTATCTTGATCTCTAAAGGGGTTCGAGCATTAGAGAAGTCACTTGA
AGCTAGTAAAAGCGAGAGTGGGAAGTGTAAGACGGCTGATACAACGTTGGCCTACAAGAA
ACTAACCGGGAACGGTTTAAAAAACAATGGTTTGATCTTTACCGGATATCCGGTTATCGG
CAACCAAGGAAAGATTCAGACATCAGGGTCTTGTCTTTACTCATCCTCCCTGAGAATTGA
TGTCTCTTGTGCTTGGGATCCGAGATATAACGGTCTTTTCTTCTATGAAACGACTGCTAT
ATTCCCGGTATCTCGGTTTAGAGACTTTATCATCGACCTGAAGAAGCTACGAGACATGAA
CCCGAAA

QA 1 780 1 780
DS 

RD RS1BZ62JQ 763 0 0
GATGTCTCTTGTGCTTGGGATCCGAGATATAACGGTCTTTTCTTCTATGAAACGACTGCT
ATATTCCCGGTATCTCGGTTTAGAGACTTTATCATCGACCTGAAGAAGCTACGAGACATG
AAACCCGAAAGACTTTGCGGGATTGATATCTATAATGGTATCCTCATCCGTTTCATCAAG
GGCTCAAGGGCTTATCTCGGCCAAACAGAGGATTCAGTCATTGACTTTAACTATTACCGA
GCTGACGATGCCTTGACCCCGAGGTTAGACCAAGATGTGATGGAGGAGATGGAGCAGATG
GCGTTTTTCAAATACGAGGCAAAGCCGCATTGGGGGAAGAATAGGAAAGTGGGTTTCTTT
GGTGTGAAGCAAAAATATGGACCTAACTTTGACAAGTTCTTGGAAGTGAAGAACAAGTTA
GATCCTAAAAATATGTTCTCTAGTGAGTGGTCAGATGAGGTTCTTTTTGGACGAGAAGGT
TCCAAGTATGATGGATGTGCACTTGAAGGGAACTGTGTGTGTTCAGAAGACAGGCATTGT
AGTCCTTCCAAAGGCTACTTTTGTAGACAAGGTCTTGTTTATACACAAGCTAGGGTTTGC
GGATTCTCCTCCTCTCAAGTTTCAATGGCTTAATTAAAAAAATTGTTGTTTCCAGTGACT
AAAAGATAATAAGAATGAAAATTCATTTTTTCATCATCAATGTATTGGACTCCTCCAAGA
TCATTAATAAAATAAATATAGAATTGCTACTAAGATTTATTGG

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

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CGCAAACATTGGTGAGAATCCAATGCCCCGAAAACCCAAGGGTTCCTCCGCAAGGTTCGT
CCACGGAGGGTGAGTCAGGGCCTAAGATCAGGCCGAAAGGCGTAGTCGATGGACAACAGG
TGAATATTCCTGTACTACCCCTTGTTGGTCCCGAGGGACGGAGGAGGCTAGGTTAGCCGA
AAGATGGTTATCGGTTCAAGAACGCAAGGTGTCCCTGTTTTTTCAGGGTAAGAAGGGGTA
GAGAAAAAGCCCCGAGCCAATGTTCGAGTACCAGGCGCTACGGCGCTGAAGTAACCCATG
CTATACTCCCAGGAAAAGCTCGAACGACCTTCAACAAAAGGGTACCTGTACCCGAAACCG
ACACAGGTGGGTAGGTAGAGAATACCTAGGGGCGCGA


BQ
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AF RS1FP75TF U 1
AF RS1DC49TF U 7
BS 1 457 RS1FP75TF

RD RS1FP75TF 457 0 0
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CGCAAACATTGGTGAGAATCCAATGCCCCGAAAACCCAAGGGTTCCTCCGCAAGGTTCGT
CCACGGAGGGTGAGTCAGGGCCTAAGATCAGGCCGAAAGGCGTAGTCGATGGACAACAGG
TGAATATTCCTGTACTACCCCTTGTTGGTCCCGAGGGACGGAGGAGGCTAGGTTAGCCGA
AAGATGGTTATCGGTTCAAGAACGCAAGGTGTCCCTGTTTTTTCAGGGTAAGAAGGGGTA
GAGAAAAAGCCCCGAGCCAATGTTCGAGTACCAGGCGCTACGGCGCTGAAGTAACCCATG
CTATACTCCCAGGAAAAGCTCGAACGACCTTCAACAAAAGGGTACCTGTACCCGAAACCG
ACACAGGTGGGTAGGTAGAGAATACCTAGGGGCGCGA

QA 1 457 1 457
DS 

RD RS1DC49TF 451 0 0
G
AACCGCGCGAGCGGCGGTGGACGAAGCGGAAGCGAGAATGTCGGCTTGAGTAACGCAAAC
ATTGGTGAGAATCCAATGCCCCGAAAACCCAAGGGTTCCTCCGCAAGGTTCGTCCACGGA
GTGTGAGTCAGGGCCTAAGATCAGGCCGAAAGGCGTAGTCGATGGACAACAGGTGAATAT
TCCTGTACTACCCCTTGTTGGTCCCGAGGGACGGAGGAGGCTAGGTTAGCCGAAAGATGG
TTATCGGTTCAAGAACGCAAGGTGTCCCTGTTTTTTCAGGGTAAGAAGGGGTAGAGAAAA
TGCCCCGAGCCAATGTTCGAGTACCAGGCGCTACGGCGCTGAAGTAACCCATGCTATACT
CCCAGGAAAAGCTCGAACGACCTTCAACAAAAGGGTACCTGTACCCGAAACCGACACAGG
TGGGTAGGTAGAGAATACCTAGGGGCGCGA

QA 2 451 2 451
DS 



AS 1 2

CO CL5817Contig1 884 2 2 U
GGGAGAACGCGAAACTAAAAGCTGACCTTGCTTCTGCAATCTCTAGGATATGTTCATTAG
GGCCACAAGTTGAATACGAGGAGCTATTTGAGAAGTGCCGGAATCTTGAAGCTACAAGTG
AACAGACGATAAAGGACTTGAAGGAAAAGAAAGAGCTGGTGAAAACATTGTACACTAAGC
ACCAACTTGGGAAGCAGGCGAATAAGGAAAAGATATCATTTGGTCGTCTTGAAGTCCATG
AGATAGCAGCATTTGTGCTAAACCAAGCAGGGCATTACGAGGCAATCAACAGGAACTGCC
CAAACTACTACTTGTCCTCTGAATCCGAGGCATTGTTCACAGATCACCTCCCGAACCGGC
CTACATACATCGTTGGACAGATTGTACACATCGAGCGCCAAGCAGTGAAGCAGGCACCGA
CTCTTTCAGCTTCTGCATCTCCTGAGGCTGGTAAGAAAGATTATCTCGGCTCAAGAAATC
TGGGATCAAGTTCAATGTCAACATCATCATCTTCGGGAGCAACGACAACAAACCCTTATG
GTCTCTCTTCAGGATGTGAATACTTCATAGTGACAATAGCAATGCTTCCTGACACTGCTA
TTCATCAACAAGCTTCCTGATCCTTTTGTGATATGATGGAAGAAACCCCTCCCCTTAAAA
AAAAGAACCAAAAAAATGTAAATACTTAAATAACCGGACAGCCCTTGTGTTTGATTTATG
GGTGTTGGGTTTCATTTGTCTTTTTCAAAAAAATATATTTTATTTCATGTTCTTTCTGTA
CAGCTGATGATTCCTAATCTTAGTTTAATCTTTTATCCTTGTACATACTCTTCTTTGCTG
TAATATGTGAACAATAAAAATACATAAAAAAGTTTAGGATAGAC


BQ
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BS 662 884 RS1DQ11JQ

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A

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DS 

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AACAGGAACTGCCCAAACTACTACTTGTCCTCTGAATCCGAGGCATTGTTCACAGATCAC
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AAGCAGGCACCGACTCTTTCAGCTTCTGCATCTCCTGAGGCTGGTAAGAAAGATTATCTC
GGCTCAAGAAATCTGGGATCAAGTTCAATGTCAACATCATCATCTTCGGGAGCAACGACA
ACAAACCCTTATGGTCTCTCTTCAGGATGTGAATACTTCATAGTGACAATAGCAATGCTT
CCTGACACTGCTATTCATCAACAAGCTTCCTGATCCTTTTGTGATATGATGGAAGAAACC
CCTCCCCTTAAAAAAAAGAACCAAAAAAATGTAAATACTTAAATAACCGGACAGCCCTTG
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TGTTCTTTCTGTACAGCTGATGATTCCTAATCTTAGTTTAATCTTTTATCCTTGTACATA
CTCTTCTTTGCTGTAATATGTGAACAATAAAAATACATAAAAAAGTTTAGGATAGAC

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 2

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TCAGAGTTCGTGAAGAAAGAGTACGGAGGATACCACAACGTGTTCGTGTCCACGTTCGGT
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ATCTTGAAAAGTACGACGGTTTCGTTATTAGTGGAAGCTCTCACGATTCCTTCGAGAATG
ATCCTTGGATCCTTAAGCTATGTGAGATCGTCAAGAAACTTGATGAGATGAAGAAGAAAA
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AGGTGGAGATGTTCTCCATTGAGGATCATTTATTCTGTATCCAAGGACATCCCGAGTATA
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ATTTTGCGGATGCGGCAAAGGCCTCGATGGAGAATAGGGGAGCGGACAGGAAACTTTTGG
AGACGATTTGCAAGAATTTCCTCAAAGGCAGAGTTCCAGCTAATTAATTAGTTTCACTCC
CAAATTATCTATTTGGCTCTTGTTATATTGGAGCACTTATGGATTTATTACCTTGTTGTA
TTCTTATTCAATATAACCTATTATTCTCATCTTTGTCAAGAAAACAAAAACTCATATTTA
TCTCAAGGTCATATTTATGTGTTGTACCCATAAGTAAAATAATTCAATAAAAAATATAGT
TTGCATATCATCC


BQ
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AGGTGGAGATGTTCTCCATTGAGGATCATTTATTCTGTATCCAAG*ACATCCCGAGTATA
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ATTTTGCGGATGCG*CAAAG*CCTCGATGGAGAATAGGG
AGCGGAC

QA 1 759 1 759
DS 

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AGCAAGGAAGGGACCAGAACTTAAGCTTACAGACATAACCCTCGTGAAGGATGCAATTAA
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GGTGGAGATGTTCTCCATTGAGGATCATTTATTCTGTATCCAAGGACATCCCGAGTATAA
CAGAGAGATATTCCACGAGATCGTTGATCGTGTTCTTGGTCTTGGCTTCATCAAGCAAGA
TTTTGCGGATGCGGCAAAGGCCTCGATGGAGAATAGGGGAGCGGACAGGAAACTTTTGGA
GACGATTTGCAAGAATTTCCTCAAAGGCAGAGTTCCAGCTAATTAATTAGTTTCACTCCC
AAATTATCTATTTGGCTCTTGTTATATTGGAGCACTTATGGATTTATTACCTTGTTGTAT
TCTTATTCAATATAACCTATTATTCTCATCTTTGTCAAGAAAACAAAAACTCATATTTAT
CTCAAGGTCATATTTATGTGTTGTACCCATAAGTAAAATAATTCAATAAAAAATATAGTT
TGCATATCATCC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

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CCATTCAACATACTTAGCAAGACCATTTTCAACTAGCTCCAACCCCAAGTCTTTAACTGC
TTCCCCATCAGAGTAATGGACTGAACCAATCAGGTTGTTGAATTTGTCAACTCCTTCAAG
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AGCCGACGTTAGAGGACTTTGGACTCACTAGAAGCATCTCCGTTGGACTCATCTGGAACC
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BQ
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AF RS1EY06JQ U 5
AF RS1EY06TF C 1
BS 1 4 RS1EY06TF
BS 5 454 RS1EY06JQ
BS 455 645 RS1EY06TF

RD RS1EY06JQ 450 0 0
TGAAGTTCAGCAGATTTCAGCTTTCTCTTGGCTTCCTCCTCCATCATGTTAGCACTCCAT
TCAACATACTTAGCAAGACCATTTTCAACTAGCTCCAACCCCAAGTCTTTAACTGCTTCC
CCATCAGAGTAATGGACTGAACCAATCAGGTTGTTGAATTTGTCAACTCCTTCAAGAACA
ATGCGAACATCTCTGCTAAAAACACGGTGCTCAGTGAAGTACTTGGCTTCAGCTGCAAAA
GGATCAGCAAAAACCTCAACAGACGATGCTGCTGCAAAAAAGGCAGCAAGTCTCTGAGCC
GACGTTAGAGGACTTTGGACTCACTAGAAGCATCTCCGTTGGACTCATCTGGAACCGTCT
CAACGACGTTTCCATTTGTGTTTCTTCTTCCCATTGATGGAGACTGGATTCCAGCAACGA
ACACTTGCACAAACTGGAACTCTGGAAGAA

QA 1 450 1 450
DS 

RD RS1EY06TF 645 0 0
GCATTGAAGTTCAGCAGATTTCAGCTTTCTCTTGGCTTCCTCCTCCATCATGTTAGCACT
CCATTCAACATACTTAGCAAGACCATTTTCAACTAGCTCCAACCCCAAGTCTTTAACTGC
TTCCCCATCAGAGTAATGGACTGAACCAATCAGGTTGTTGAATTTGTCAACTCCTTCAAG
AACAATGCGAACATCTCTGCTAAGAACACGGTGCTCAGTGAAGTACTTGGCTTCAGCTGC
AAAAGGATCAGCAGAAACCTCAACAGACGATGCTGCTGCAGAAGAGGCAGCAAGTCTCTG
AGCCGACGTTAGAGGACTTTGGACTCACTAGAAGCATCTCCGTTGGACTCATCTGGAACC
GTCTCAACGACGTTTCCATTTGTGTTTCTTCTTCCCATTGATGGAGACTGGATTCCAGCA
ACGAACACTTGCACAAACTGGAACTCTGGAAGAAGATACACACGGATAGTACTTCCATCG
CGGACTTGCTCAACGATGCCTTCCATAGGCTTGCCTTTGTTGGCAGCTAAAAGCCCCATT
GCGTCAAAGCCTGCAGAGTCTCCAATGGCAGAAGGAGGAAGGTCTCTGATAGATGCCTCA
GCAGCACCAGGAACCTTGCTAAAACAACCATACCCTTCTTGGTTC

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 2

CO CL5820Contig1 640 2 4 U
GGAGAAGAGAGAGATGGGAGAGATTGTGTTTACGGAGAAGCAAGAAGCTCTGGTGAAGGA
GTCTTGGGAGATACTAAAGCAAGACATCCCCAAATACAGTCTTCACTTCTTCTCACAGAT
ACTGGAGATTGCACCAGCAGTAAAGGACATGTTTTCTTTCCTAAGAGACACAGATGAAGT
CCCTCATAACAATCCTAAACTCAAAGCTCATGCTGTTAAAGTCTTCAAGATGACATGTGA
AACGGCAATACAGCTGAGGGAGAAAGGAAAGGTAGTGGTGGCTGACACAACCCTCCAATA
CTTGGGCTCTGTTCATCTCAAGAGCGGTGTTCTTGATCCTCACTTTGAGGTGGTGAAAGA
GGCTTTGGTGAGGACACTGAAAGAAGGGTTGGGAGAGAAATACAATGAAGAAGTCGAAGG
AGCTTGGTCTCAAGCTTATGATCACTTGGCTTTAGCCATTAAAACCGAGATGAAACAAGA
AGACTCACAGAAACCCTAAATATCGCTAGAGTATTTGCTCTCATACATATTTGGGTATGT
GTGTACTAATACTACATGCTTTGAGTTTCTACAGTTCATTGTTTTTGAATAAGGATTTTG
AGATATTGTGAGGGAGATACATGGTACCGTTGTTTTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FM43TF U 1
AF RS1FM43JQ C 116
BS 1 533 RS1FM43TF
BS 534 534 RS1FM43JQ
BS 535 585 RS1FM43TF
BS 586 640 RS1FM43JQ

RD RS1FM43TF 587 0 0
GGAGAAGAGAGAGATGGGAGAGATTGTGTTTACGGAGAAGCAAGAAGCTCTGGTGAAGGA
GTCTTGGGAGATACTAAAGCAAGACATCCCCAAATACAGTCTTCACTTCTTCTCACAGAT
ACTGGAGATTGCACCAGCAGTAAAGGACATGTTTTCTTTCCTAAGAGACACAGATGAAGT
CCCTCATAACAATCCTAAACTCAAAGCTCATGCTGTTAAAGTCTTCAAGATGACATGTGA
AACGGCAATACAGCTGAGGGAGAAAGGAAAGGTAGTGGTGGCTGACACAACCCTCCAATA
CTTGGGCTCTGTTCATCTCAAGAGCGGTGTTCTTGATCCTCACTTTGAGGTGGTGAAAGA
GGCTTTGGTGAGGACACTGAAAGAAGGGTTGGGAGAGAAATACAATGAAGAAGTCGAAGG
AGCTTGGTCTCAAGCTTATGATCACTTGGCTTTAGCCATTAAAACCGAGATGAAACAAGA
AGACTCACAGAAACCCTAAATATCGCTAGAGTATTTGCTCTCATACATATTTGTGTATGT
GTGTACTAATACTACATGCTTTGAGTTTCTACAGTTCATTGTTTT
GA

QA 1 585 1 585
DS 

RD RS1FM43JQ 525 0 0
CAGATACTGGAGATTGCACCAGCAGTAAAGGACATGTTTTTTTTCCTAAGAGACACAGAT
GAAGTCCCTCATAACAATCCTAAACTCAAAGCTCATGCTGTTAAAGTTTTCAAGATGACA
TGTGAAACGGCAATACAGCTGAGGGAGAAAGGAAAGGTAGTGGTGGCTGACACAACCCTC
CAATACTTGGGCTTTGTTCATTTCAAGAGCGGTGTTTTTGATCCTCACTTTGAGGTGGTG
AAAGAGGCTTTGGTGAGGACACTGAAAGAAGGGTTGGGAGAGAAATACAATGAAGAAGTC
GAAGGAGCTTGGTTTCAAGCTTATGATCACTTGGCTTTAGCCATTAAAACCGAGATGAAA
CAAGAAGACTCACAGAAACCCTAAATATCGCTAGAGTATTTGCTTTCATACATATTTGGG
TATGTGTGTACTAATACTACATGCTTTGAGTTTTTACAGTTCATTGTTTTTGAATAAGGA
TTTTGAGATATTGTGAGGGAGATACATGGTACCGTTGTTTTTTTT

QA 1 525 1 525
DS 



AS 1 2

CO CL5821Contig1 516 2 2 U
GTAAAAATGTTTTTATTGCAAAGAACAAAGATATATCTGAGGCAGAAAAATCCTTTAAAA
CCTCATTCATCTCAGTAAAATACAAAGAGCAAATGTTAAACTTTCTGGTAGGGGTTTCTG
TACAAGGAAGAACCAGATTTCTCTCACACAACCACGCCACTAGCGGTAGTCAGGAGAGAC
CAAGGCTTGGAATGAGACCAAAACATGTCATTAGAACACTGCTCTATCGCCATTCAAAAA
CCATACCAACCATGAAGAACCTCTGAAACTACAACATGTCCTTGAGATTATCGGTTGCCG
TAAAACAAGGTACAAAATTTCAAGTCTTTCTTTACATCAATCGTCTCGGCGACGAGACAA
ATTGCAAAGCACATACCGAGGTGGACATGGAAGAGCTGCGGCGAAAAAGTAAGAAATGCT
GTAAGAAAAGCTTGAATCTGGGTTTGCTTGTGTTCAGGTGATGATGCCGCAAAGAGAATC
CGACCAGGGTAATCACGGCGGCGTGTAAAGAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1EZ34TF C 1
AF RS1EZ34JQ U 21
BS 1 20 RS1EZ34TF
BS 21 516 RS1EZ34JQ

RD RS1EZ34TF 474 0 0
GTAAAAATGTTTTTATTGCAAAGAACAAAGATATATCTGAGGCAGAGAAATCCTTTAAAA
CCTCATTCATCTCAGTAAAATACAAAGAGCAAATGTTAAACTTTCTGGTAGGGGTTTCTG
TACAAGGAAGAACCAGATTTCTCTCACACAACCACGCCACTAGCGGTAGTCAGGAGAGAC
CAAGGCTTGGAATGAGACCAAAACATGTCATTAGAACACTGCTCTATCGCCATTCAGAAA
CCATACCAACCATGAAGAACCTCTGAAACTACAACATGTCCTTGAGATTATCGGTTGCCG
TAAAACAAGGTACAAAATTTCAAGTCTTTCTTTACATCAATCGTCTCGGCGACGAGACAA
ATTGCAAAGCACATACCGAGGTGGACATGGAAGAGCTGCGGCGAAGAAGTAAGAGATGCT
GTAAGAGAAGCTTGAATCTGGGTTTGCTTGTGTTCAGGTGATGATGCCGCAAAG

QA 1 474 1 474
DS 

RD RS1EZ34JQ 496 0 0
AAGAACAAAGATATATCTGAGGCAGAAAAATCCTTTAAAACCTCATTCATCTCAGTAAAA
TACAAAGAGCAAATGTTAAACTTTCTGGTAGGGGTTTCTGTACAAGGAAGAACCAGATTT
CTCTCACACAACCACGCCACTAGCGGTAGTCAGGAGAGACCAAGGCTTGGAATGAGACCA
AAACATGTCATTAGAACACTGCTCTATCGCCATTCAAAAACCATACCAACCATGAAGAAC
CTCTGAAACTACAACATGTCCTTGAGATTATCGGTTGCCGTAAAACAAGGTACAAAATTT
CAAGTCTTTCTTTACATCAATCGTCTCGGCGACGAGACAAATTGCAAAGCACATACCGAG
GTGGACATGGAAGAGCTGCGGCGAAAAAGTAAGAAATGCTGTAAGAAAAGCTTGAATCTG
GGTTTGCTTGTGTTCAGGTGATGATGCCGCAAAGAGAATCCGACCAGGGTAATCACGGCG
GCGTGTAAAGAAAAAA

QA 1 496 1 496
DS 



AS 1 2

CO CL5822Contig1 1144 2 8 U
GCATACATTTACAGATGGGTCAGTCACGTACACAATGACATCGATGAGTGTTCCTGAACC
TGTTATGTCCTTGGCTGTTCAACCAGTTTCAAAAGATTCGGGTGGACAGTTCTCGAAAGC
ATTGCAACGATTCCAGAAAGAGGATCCTACTTTCAGAGTGGGATTGGATCCCGACAGTAA
CCAGACGATTATTTCTGGTATGGGGGAATTGCATTTGGATATTTATGTTGAACGTATGCG
CAGAGAATATAAGGTTGATGCGACTGTTGGCAAACCTCGTGTCAACTTCAGGGAGACTAT
CACTAAGCGGGCTGAGTTCGATTATCTACACAAGAAACAAAGTGGAGGAGCGGGTCAGTA
CGGTAGAGTTACTGGGTACGTGGAACCATTACCATCGGACTCTAAAGAGAAGTTTGAGTT
TGAAAACATGATTGTTGGACAAGCGATTCCTTCTGGTTTTATACCCGCAATTGAGAAAGG
TTTCAAAGAAGCTGCAAACTCTGGGTCACTAATTGGTCATCCTGTAGAGAATATTCGGAT
AGTATTGACAGACGGAGCTTCACACGCGGTAGATTCCAGTGAACTTGCGTTTAAAATGGC
TGCAATATATGCGTTCAGACTGTGTTACACAGCGGCTAAACCGGTGATTCTAGAGCCTGT
CATGTTGGTTGAGTTGAAAGTACCGACAGAGTTTCAGGGCACTGTTGCTGGTGACCTCAA
CAAGAGGAAAGGTATAATCGTTGGAAACGATCAAGAGGGTGATGATTCAGTAATCCAAGC
TCACGTGCCTTTGAACAACATGTTTGGCTATTCCACATCTCTCCGCTCCATGACACAGGG
AAAAGGAGAATTCACGATGGAATACAAAGAACACTGTGCTGTGTCAAACGATGTCCAAAC
TCAGCTCGTCAACGCCCACAATGCCACCAAACCAACTGCTTAGTTCCTCCAATCGCTATC
TATGGTTTTGTCATCATCTTTTAATCGATGATTTGTTTTGTGTTTTTTTCATAGCTCAGC
ATTATTTATACGGTTCCTTCATAGAGGGAACAAAATTACTCGGCATAAACTGTTAATGCT
TGATGGGCTTTGTCTAAAGAAGTCTATTTCAAGATTACTGGGGTATAAGCCCCTCAACCT
TTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RS1CI70TF U 1
AF RS1CI70JQ C 322
BS 1 698 RS1CI70TF
BS 699 699 RS1CI70JQ
BS 700 719 RS1CI70TF
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BS 754 1144 RS1CI70JQ

RD RS1CI70TF 753 0 0
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CACTAAGCGGGCTGAGTTCGATTATCTACACAAGAAACAAAGTGGAGGAGCGGGTCAGTA
CGGTAGAGTTACTGGGTACGTGGAACCATTACCATCGGACTCTAAAGAGAAGTTTGAGTT
TGAAAACATGATTGTTGGACAAGCGATTCCTTCTGGTTTTATACCCGCAATTGAGAAAGG
TTTCAAAGAAGCTGCAAACTCTGGGTCACTAATTGGTCATCCTGTAGAGAATATTCGGAT
AGTATTGACAGACGGAGCTTCACACGCGGTAGATTCCAGTGAACTTGCGTTTAAAATGGC
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CATGTTGGTTGAGTTGAAAGTACCGACAGAGTTTCAGG*CACTGTTGCTGGTGACCTCA*
CAAGAGGAA*GGTATAATCGTTGGAAACGATCA

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1CI70JQ 823 0 0
TTT
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ACCATTACCATCGGACTCTAAAGAGAAGTTTGAGTTTGAAAACATGATTGTTGGACAAGC
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GTCACTAATTGGTCATCCTGTAGAGAATATTCGGATAGTATTGACAGACGGAGCTTCACA
CGCGGTAGATTCCAGTGAACTTGCGTTTAAAATGGCTGCAATATATGCGTTCAGACTGTG
TTACACAGCGGCTAAACCGGTGATTCTAGAGCCTGTCATGTTGGTTGAGTTGAAAGTACC
GACAGAGTTTCAGGGCACTGTTGCTGGTGACCTCAACAAGAGGAAAGGTATAATCGTTGG
AAACGATCAAGAGGGTGATGATTCAGTAATCCAAGCTCACGTGCCTTTGAACAACATGTT
TGGCTATTCCACATCTCTCCGCTCCATGACACAGGGAAAAGGAGAATTCACGATGGAATA
CAAAGAACACTGTGCTGTGTCAAACGATGTCCAAACTCAGCTCGTCAACGCCCACAATGC
CACCAAACCAACTGCTTAGTTCCTCCAATCGCTATCTATGGTTTTGTCATCATCTTTTAA
TCGATGATTTGTTTTGTGTTTTTTTCATAGCTCAGCATTATTTATACGGTTCCTTCATAG
AGGGAACAAAATTACTCGGCATAAACTGTTAATGCTTGATGGGCTTTGTCTAAAGAAGTC
TATTTCAAGATTACTGGGGTATAAGCCCCTCAACCTTTTT

QA 4 823 4 823
DS 



AS 1 2

CO CL5823Contig1 895 2 10 U
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GCTTCTAAAACCATTCCAAATGAGGATGATTCTAAAGGTCTATTTGATACTCCGTCGGGA
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GGGCAACCCATACAACCCGGTCAATCTTCAAGCAACCTCGGTGTCATTGGACGCAGAAGT
AACTCTGACTTAGGAGTCATTGGTGACCCTTCAGCTTTAGGGGCAATGCGTGATCAGATG
CACAATCTCCAGATGCTTGAAGCTGCGTACTATAGACTTCCTCAACCCAAAGATTCAGAA
CGTCCTAGACCCTATACTCCGAGGAACCCAGCAATCACACCTCAAACATTTCCCCAAACA
CAAGCGCCAATCGTAAATAACCCTTTGTTCTGGGAACGTTTAGGCAGCGATGCTTATGGA
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AGAGATATATGTTTCATAATGTATATACTCTTCCGCAATGTTTTCTTTCTTTCAATAAAC
AAATTACTTTTCCGTTTCAAAGTTTGAGATAGTAATATTTTATTGGTTTTAAGCC


BQ
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AF RS1EW93TF U 1
AF RS1EW93JQ C 294
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RD RS1EW93TF 747 0 0
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GCAAAAGAGCTGAAGAAACAGTCATGGAGATACCACAGAAAGTTCAACACATGGTTTCAG
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GATTTCCAAACCCCTAAAGACGAGAGCCAAGAAG*CGGATGGTGTCAA*GGATCAAAA*C
GAGTTCACGTTTGA*TACAGTTATCTT

QA 1 747 1 747
DS 

RD RS1EW93JQ 602 0 0
TCAGATGCACAATCTCCAGATGCTTGAAGCTGCGTACTATAGACTTCCTCAACCCAAAGA
TTCAGAACGTCCTAGACCCTATACTCCGAGGAACCCAGCAATCACACCTCAAACATTTCC
CCAAACACAAGCGCCAATCGTAAATAACCCTTTGTTCTGGGAACGTTTAGGCAGCGATGC
TTATGGAACCGATACTTTGTTCTTTGCATTTTATTATCAGCAGAACTCGTATCAGCAGTA
TCTAGCGGCAAAAGAGCTGAAGAAACAGTCATGGAGATACCACAGAAAGTTCAACACATG
GTTTCAGAGACACAAGGAGCCAAAGATTGCAACGGATGAGTATGAACAAGGAGCCTATGT
GTACTTTGATTTCCAAACCCCTAAAGACGAGAGCCAAGAAGGCGGATGGTGTCAAAGGAT
CAAAAACGAGTTCACGTTTGAATACAGTTATCTTGAAGATGAACTCGCCGTATAGAAAAG
ATAAAAGAGAGATATATGTTTCATAATGTATATACTCTTCCGCAATGTTTTCTTTCTTTC
AATAAACAAATTACTTTTCCGTTTCAAAGTTTGAGATAGTAATATTTTATTGGTTTTAAG
CC

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 2

CO CL5824Contig1 988 2 2 U
GGATGGACGCGGCTCGGAAAAGAGCTCAGCGTCGAGCCATCTTCTTAGCTAAACGCCGCG
GAGACCCCATCCAATCGATCCAAGCCGTTGGATCCCGCTACAAAATCTTCCAACAGATCA
ATCCGCGTCGTTTCATTTAATCAGAAACGTTAATTGGCTTTTACATTTGTTTTGCTTCTT
TGCTTACAAGAGTTAATTTCCGGGCCCATTTGCCCAGCTTCTCGAAGCGCTGCTGTTTTC
TCTGCTAATCCAACGACGCCGACAAGACTCTCCGACTTCACCACGAATCGAAATGGAGAG
GTTATGGTAATCAATTCAGACGCCCACTAAGAGGTCTTCAATGCGTCGATCTTGGGTATG
GGGCGGTGTGCAATCTGTATAAATATGGTTTTCTTCTCCGATCTGAAGACCGGCAAGAGC
TCCGGCGCCGTGGAAACTCAGCTTTTGCTGTTCTTGGAGGCGAGGAATGTGAAGCGCACC
GTGAGCTAATGTGGGTGGACATGCTTCTGATTGATGTTAATGTGAGTTCATCTTTTTATG
TTCTTAGATTCCAATTTGTTTTTTTCTCAACTTGTAAACATGTTCTCTGTCTGCAGAAGA
CACAGACGAAGCAGAAGTAGAAGTAGAAGCCGAAGCAGAAGCAGGAGATCCCGCAGGCAT
GGTTCAAGATCACGGTTTAGGTCCCCTTTTAGGTCACGATCACGCTCTCCTAAACGCTCT
CGCAGACGCTCTTCCTCGTATTCAAGATCTCCCAGGCGAAGAAGCAGGACAAGGCACTGA
GCTAAGAAGGAACGGGATAAAGAGGGAACTCTTATTTTTGAAACCAAAAGACTATATGTT
GCCTCTTTTCCTATATTTTATATATTTGTTATGTATGTTTTCTTCTCATCCTTTTTTTTT
TTCTTTACTGTTTATCCTGAATAAAGTTTGACTGCGACATTGTGTCATACTACAGTTGTT
TTGCATCCATGGTAAGAATTAAGCTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AC83TF U 1
AF RS1AC83JQ C 200
BS 1 640 RS1AC83TF
BS 641 988 RS1AC83JQ

RD RS1AC83TF 640 0 0
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GAGACCCCATCCAATCGATCCAAGCCGTTGGATCCCGCTACAAAATCTTCCAACAGATCA
ATCCGCGTCGTTTCATTTAATCAGAAACGTTAATTGGCTTTTACATTTGTTTTGCTTCTT
TGCTTACAAGAGTTAATTTCCGGGCCCATTTGCCCAGCTTCTCGAAGCGCTGCTGTTTTC
TCTGCTAATCCAACGACGCCGACAAGACTCTCCGACTTCACCACGAATCGAAATGGAGAG
GTTATGGTAATCAATTCAGACGCCCACTAAGAGGTCTTCAATGCGTCGATCTTGGGTATG
GGGCGGTGTGCAATCTGTATAAATATGGTTTTCTTCTCCGATCTGAAGACCGGCAAGAGC
TCCGGCGCCGTGGAAACTCAGCTTTTGCTGTTCTTGGAGGCGAGGAATGTGAAGCGCACC
GTGAGCTAATGTGGGTGGACATGCTTCTGATTGATGTTAATGTGAGTTCATCTTTTTATG
TTCTTAGATTCCAATTTGTTTTTTTCTCAACTTGTAAACATGTTCTCTGTCTGCAGAAGA
CACAGACGAAGCAGAAGTAGAAGTAGAAGCCGAAGCAGAA

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1AC83JQ 789 0 0
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CGACAAGACTCTCCGACTTCACCACGAATCGAAATGGAGAGGTTATGGTAATCAATTCAG
ACGCCCACTAAGAGGTCTTCAATGCGTCGATCTTGGGTATGGGGCGGTGTGCAATCTGTA
TAAATATGGTTTTCTTCTCCGATCTGAAGACCGGCAAGAGCTCCGGCGCCGTGGAAACTC
AGCTTTTGCTGTTCTTGGAGGCGAGGAATGTGAAGCGCACCGTGAGCTAATGTGGGTGGA
CATGCTTTTGATTGATGTTAATGTGAGTTCATCTTTTTATGTTCTTAGATTCCAATTTGT
TTTTTTCTCAACTTGTAAACATGTTCTCTGTCTGCAGAAGACACAGACGAAGCAGAAGTA
GAAGTAGAAGCCGAAGCAGAAGCAGGAGATCCCGCAGGCATGGTTCAAGATCACGGTTTA
GGTCCCCTTTTAGGTCACGATCACGCTCTCCTAAACGCTCTCGCAGACGCTCTTCCTCGT
ATTCAAGATCTCCCAGGCGAAGAAGCAGGACAAGGCACTGAGCTAAGAAGGAACGGGATA
AAGAGGGAACTCTTATTTTTGAAACCAAAAGACTATATGTTGCCTCTTTTCCTATATTTT
ATATATTTGTTATGTATGTTTTCTTCTCATCCTTTTTTTTTTTCTTTACTGTTTATCCTG
AATAAAGTTTGACTGCGACATTGTGTCATACTACAGTTGTTTTGCATCCATGGTAAGAAT
TAAGCTTGT

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 2

CO CL5825Contig1 1077 2 10 U
GGAAGACGTTACGGTCTGCAAAACCGGAGGATGCGGTTACAAGACGGTTCAGGACGCCGT
TAACTCGGCGCCCGATAACAGCGTAAGGAGCAAGTTCGTGATTAAGATTAGCGAGGGAGT
GTATGAGGAGACCGTTAGGATTCCGTTTGAGAAGAAGAACGTTGTCTTCATCGGAGACGG
TATGGGCAAAACGGTCATTACAGGATCTTTGAACGCCAGGATGCCTGGAATGAGCACGTT
CAAATCTGCAACTGTCGGAGTCATGGGAGATGGTTTCATGGCTCGTGATATAACGTTCCA
AAACGCAGCGGGACCAGAGGGTCACCAAGCGGTTGCGTTTAGATCCGACAGCGACTTTTC
TCTGCTAGAGAACTGTGAGTTCCTTGGGAACCAAGACACACTCTATGCACATGGTCTCCG
TCAGTTTTACAAAAAATGCCGTATCCAAGGGAACATTGACTTCATATTCGGAAACTCAGC
TTCAGTCTTCCAAGACTGTGAGATCCTCATCGCGCCGCGTCAAGTTACCCCCGAAAAGGG
GGAGAAAAACGCTGTCACCGCGCATGGAAGAATCGACCCGACGCAGTCGACAGGGTTTGT
GTTCTTGAACTGTCTGATAAACGGGACGGAGGAGTACATGAAGTTGTATAAAGCTAACCC
TAAGGTGCATATAAACTTCTTAGGGAGACCGTGGAAAGAGTTCTCGAGGGCTGTCTTTAT
AGGATGCAATATGGAGGCTTTGATAAGTCCTGATGGTTGGTCACCGTGGGGCGAGGATTT
TGCTCTTCGGACGCTGTATTATGGAGAGTCTAAGAACACGGGTTTGGGATCAGATAGGTC
ACAGAGGGTTTCGTGGAGCAGTGAGATACCAGACGAGCATGTTCATGTGTACTCGGTGGC
TAACTTTATTCAAGCTGATGAGTGGGGGGCTTTGATGTAGTCTGGTTGAATTAAGTTATG
ACTAAGAAATGTTGAGGGAAAGCTTTATTATAAAGCCTTTATAAGATGAAAACCATGTCA
TTGTACTGTTGGTTATATCAACTGAAAGTTCAGAACATCTAAACTGAATTTTATATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1C643TF U 1
AF RS1C643JQ C 317
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BS 665 665 RS1C643JQ
BS 666 701 RS1C643TF
BS 702 702 RS1C643JQ
BS 703 736 RS1C643TF
BS 737 737 RS1C643JQ
BS 738 745 RS1C643TF
BS 746 746 RS1C643JQ
BS 747 771 RS1C643TF
BS 772 1077 RS1C643JQ

RD RS1C643TF 771 0 0
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TAACTCGGCGCCCGATAACAGCGTAAGGAGCAAGTTCGTGATTAAGATTAGCGAGGGAGT
GTATGAGGAGACCGTTAGGATTCCGTTTGAGAAGAAGAACGTTGTCTTCATCGGAGACGG
TATGGGCAAAACGGTCATTACAGGATCTTTGAACGCCAGGATGCCTGGAATGAGCACGTT
CAAATCTGCAACTGTCGGAGTCATGGGAGATGGTTTCATGGCTCGTGATATAACGTTCCA
AAACGCAGCGGGACCAGAGGGTCACCAAGCGGTTGCGTTTAGATCCGACAGCGACTTTTC
TCTGCTAGAGAACTGTGAGTTCCTTGGGAACCAAGACACACTCTATGCACATGGTCTCCG
TCAGTTTTACAAAAAATGCCGTATCCAAGGGAACATTGACTTCATATTCGGAAACTCAGC
TTCAGTCTTCCAAGACTGTGAGATCCTCATCGCGCCGCGTCAAGTTACCCCCGAAAAGGG
GGAGAAAAACGCTGTCACCGCGCATGGAAGAATCGACCCGACGCAGTCGACAGGGTTTGT
GTTCTTGAACTGTCTGATAAACGGGACGGAGGAGTACATGAAGTTGTATAAAGCTAACCC
TAAG*TGCATATAAACTTCTTAGGGAGACCGTGGAAAGAGT*CTCGAGGGCTGTCTTTAT
AGGATGCAATATGGAG*CTTTGATA*GTCCTGATGGTTGGTCACCGTGGGG

QA 1 771 1 771
DS 

RD RS1C643JQ 761 0 0
GAGGGTCACCAAGCGGTTGCGTTTAGATCCGACAGCGACTTTTCTCTGCTAGAGAACTGT
GAGTTCCTTGGGAACCAAGACACACTCTATGCACATGGTCTCCGTCAGTTTTACAAAAAA
TGCCGTATCCAAGGGAACATTGACTTCATATTCGGAAACTCAGCTTCAGTCTTCCAAGAC
TGTGAGATCCTCATCGCGCCGCGTCAAGTTACCCCCGAAAAGGGGGAGAAAAACGCTGTC
ACCGCGCATGGAAGAATCGACCCGACGCAGTCGACAGGGTTTGTGTTCTTGAACTGTCTG
ATAAACGGGACGGAGGAGTACATGAAGTTGTATAAAGCTAACCCTAAGGTGCATATAAAC
TTCTTAGGGAGACCGTGGAAAGAGTTCTCGAGGGCTGTCTTTATAGGATGCAATATGGAG
GCTTTGATAAGTCCTGATGGTTGGTCACCGTGGGGCGAGGATTTTGCTCTTCGGACGCTG
TATTATGGAGAGTCTAAGAACACGGGTTTGGGATCAGATAGGTCACAGAGGGTTTCGTGG
AGCAGTGAGATACCAGACGAGCATGTTCATGTGTACTCGGTGGCTAACTTTATTCAAGCT
GATGAGTGGGGGGCTTTGATGTAGTCTGGTTGAATTAAGTTATGACTAAGAAATGTTGAG
GGAAAGCTTTATTATAAAGCCTTTATAAGATGAAAACCATGTCATTGTACTGTTGGTTAT
ATCAACTGAAAGTTCAGAACATCTAAACTGAATTTTATATC

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL5826Contig1 973 2 4 U
GGGTGATTATCAATTTCACGACCTGTTGGAATCTGCTGGCATGGTTCTAGTCCAATCCTT
GCATGGTCTCGGGAGGGCAGGTGAGATTGTAAGTGAGCTAAGACTAGTGTTTGGCGAAGT
TGGGGGTATTCCTGTTCAGGTTCTTCTCACTGGAATATGCCTTCAAATATCAAACGGTTC
CTACTCTGGTGTACGTGAGGTTCTGGAAGAGTTCTTTAGCATATGGGTTTACAAGGACGA
CCACTATATCTTAAACGATGCTGGACTAAATGAAAAAGTGTTGCACGGGAAAATATCGTT
GGATGCTGATGAGTACGTGGAAGTTGTGGAGCTGTATACCTTTGGAGTTCTTGGAAAAGA
TACAAACGACGTGGGTTTAGCCATTTCTTGGGTTGAGCAAGCTGCATTACCTGAGGAAAG
ACGACAGGGACCTTTTGAGAAGATTGCATTCTCTGCAATCAGTAAACGTTCGAGAGGCGG
CTACTTCTTTAGAGGAAAATCCTTCTTATCCAGTAGTGAAGAGCAACAAGTCTTTGGCTA
ATGAAAAGAACGTTGAGATTGATTCTATTCTGAAACTCTCTAAACAACATGAACCTTGGT
CATCCCGTCCTCTACACCTAAGGCTCGGTAATACCCAATTTAGCATTTCCAGGGGGAAAG
TTGCCATAAGCCTTGTTGGATTAGTCATATGCTATGCTTTGAAGAGAAAACGAGCTGCTT
TAATACGGATCATTCGCAGACAAATGGAGTCCACGAGAAAAGCAATTGTAGATTTCTGGA
AGCTTGCGTTTTCATACCAAGTGAATCCTCTTGCAGCTATTCAATCCATACCAAGCACCA
CAACTTGAGGCAGTTCCCACAGTCATAGAAGATTGGATCAAAGACCTGATTTTGAATTGA
AATAAAGCTACAGGCTTCATTACACCTTTTATTTAGTTAAAAAATGGGTTGTATAATCGG
ATCCATACTCCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BE78TF U 1
AF RS1H524TF U 372
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BS 601 601 RS1H524TF
BS 602 618 RS1BE78TF
BS 619 973 RS1H524TF

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GCATGGTCTCGGGAGGGCAGGTGAGATTGTAAGTGAGCTAAGACTAGTGTTTGGCGAAGT
TGGGGGTATTCCTGTTCAGGTTCTTCTCACTGGAATATGCCTTCAAATATCAAACGGTTC
CTACTCTGGTGTACGTGAGGTTCTGGAAGAGTTCTTTAGCATATGGGTTTACAAGGACGA
CCACTATATCTTAAACGATGCTGGACTAAATGAAAAAGTGTTGCACGGGAAAATATCGTT
GGATGCTGATGAGTACGTGGAAGTTGTGGAGCTGTATACCTTTGGAGTTCTTGGAAAAGA
TACAAACGACGTGGGTTTAGCCATTTCTTGGGTTGAGCAAGCTGCATTACCTGAGGAAAG
ACGACAGGGACCTTTTGAGAAGATTGCATTCTCTGCAATCAGTAAACGTTCGAGAGGCGG
CTACTTCTTTAGAGGAAAATCCTTCTTATCCAGTAGTGAAGAGCAACAAGTCTTTGGCTA
ATGAAAAGAACGTTGAGATTGATTCTATTCTGAAACTCTCTAAACAACATGAACCTTGGT
TATCCCGTCCTCTACACC

QA 1 618 1 618
DS 

RD RS1H524TF 602 0 0
G
GGGTTTAGCCATTTCTTGGGTTGAGCAAGCTGCATTACCTGAGGAAAGACGACAGGGAC*
TTTTGAGAAGATTGCATTCTCTGCAATCAGTAAACGTTCGAGAGGCGGCTACTTCTTTAG
AGGAAAATCCTTCTTATCCAGTAGTGAAGAGTAACAAGTCTTTGGCTAATGAAAAGAACG
TTGAGATTGATTCTATTCTGAAACTCTCTAAACAACATGAACCTTGGTCATCCCGTCCTC
TACACCTAAGGCTCGGTAATACCCAATTTAGCATTTCCAGGGGGAAAGTTGCCATAAGCC
TTGTTGGATTAGTCATATGCTATGCTTTGAAGAGAAAACGAGCTGCTTTAATACGGATCA
TTCGCAGACAAATGGAGTCCACGAGAAAAGCAATTGTAGATTTCTGGAAGCTTGCGTTTT
CATACCAAGTGAATCCTCTTGCAGCTATTCAATCCATACCAAGCACCACAACTTGAGGCA
GTTCCCACAGTCATAGAAGATTGGATCAAAGACCTGATTTTGAATTGAAATAAAGCTACA
GGCTTCATTACACCTTTTATTTAGTTAAAAAATGGGTTGTATAATCGGATCCATACTCCG
T

QA 2 602 2 602
DS 



AS 1 2

CO CL5827Contig1 938 2 10 U
GGTCCAGTTCTGGAAATTTTGCATCTGTACGCATGTGTATGAAGCTTGTGTAGTCTGGTT
TGTATTCTTTGTGTAGTCTAGTCGCTTGTGTAATGTCTTTTCTTAAAAACCCCTAAATAA
AAAAACTTGCATTGGAGGACATAAATATTCGTGTCTCTTAAATATACCTCTTAACTTCAC
ATTTACTACTAATATTATTAAAAAAATATTAAGAGATCCATTTTGAGTATTTGGGATAAA
GATGCTATTAGACTTTTTTGCCAAATTATCAACCCTTACATACGTAATTTGAATATAAAC
AAACTAAATTATTTATTAGCGAGAGGTAGTTCATGAATTTGTCGTGGTTCACCTACTAGC
AATGTGGCCGTTTGTAATTGGTGCTTCGGTAGAGAGAAACGAAGATGATTGGTCTAATTT
CATAATTCAATTCATAAGGAAATACCAACGCATGAGACATGATACTACATTATACAGAGT
AACATATATTCATTATTCTTGAGTTTAGGGGAGTGCATGATCAACGCATGAGACATACTA
CATATACAGAGTAACATATATTCGTTATTCTTCAGTTTAGGGGAGTGCATGATTTCATCA
GAACGTCCGTTACGTGAGGACCACTTTAAGATTTAACCACCAAACATCTGTCTTTTTCCA
GCGAAGTCGGTACTGACCAATTAGGTGACGTCTTTATGAAGAAAGTGTAGTTTGTAAGTA
CTAACAGTAGTGTTTCTTTTTTATGTGCTACCTCCATTTATGCCTTCGTTTTATGGCATG
GGGACCGACATAGGCATCACAAATATGACAAAGATAGAGAGATAAGACACTGTTGCGTCC
CTGCAATTTGCAGTGAAACTTATGCTTAGTTTTGGAATTGCTTGATTCTCAACTTAGGTT
GTTAGTCTGTTGTATATATATTCCTTTTGTATTTTTCT


BQ
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AF RS1GP33TF U 1
AF RS1GP33JQ C 330
BS 1 669 RS1GP33TF
BS 670 670 RS1GP33JQ
BS 671 684 RS1GP33TF
BS 685 685 RS1GP33JQ
BS 686 699 RS1GP33TF
BS 700 700 RS1GP33JQ
BS 701 741 RS1GP33TF
BS 742 742 RS1GP33JQ
BS 743 784 RS1GP33TF
BS 785 938 RS1GP33JQ

RD RS1GP33TF 784 0 0
GGTCCAGTTCTGGAAATTTTGCATCTGTACGCATGTGTATGAAGCTTGTGTAGTCTGGTT
TGTATTCTTTGTGTAGTCTAGTCGCTTGTGTAATGTCTTTTCTTAAAAACCCCTAAATAA
AAAAACTTGCATTGGAGGACATAAATATTCGTGTCTCTTAAATATACCTCTTAACTTCAC
ATTTACTACTAATATTATTAAAAAAATATTAAGAGATCCATTTTGAGTATTTGGGATAAA
GATGCTATTAGACTTTTTTGCCAAATTATCAACCCTTACATACGTAATTTGAATATAAAC
AAACTAAATTATTTATTAGCGAGAGGTAGTTCATGAATTTGTCGTGGTTCACCTACTAGC
AATGTGGCCGTTTGTAATTGGTGCTTCGGTAGAGAGAAACGAAGATGATTGGTCTAATTT
CATAATTCAATTCATAAGGAAATACCAACGCATGAGACATGATACTACATTATACAGAGT
AACATATATTCATTATTCTTGAGTTTAGGGGAGTGCATGATCAACGCATGAGACATACTA
CATATACAGAGTAACATATATTCGTTATTCTTCAGTTTAGGGGAGTGCATGATTTCATCA
GAACGTCCGTTACGTGAGGACCACTTTAAGATTTAACCACCAAACATCTGTCTTTTTCCA
GCGAAGTCG*TACTGACCAATTAG*TGACGTCTTTATGA*GAAAGTGTAGTTTGTAAGTA
CTAACAGTAGTGTTTCTTTTT*ATGTGCTACCTCCATTTATGCCTTCGTTTTATGGCATG
GGGA

QA 1 784 1 784
DS 

RD RS1GP33JQ 609 0 0
TTCATGAATTTGTCGTGGTTCACCTACTAGCAATGTGGCCGTTTGTAATTGGTGCTTCGG
TAGAGAGAAACGAAGATGATTGGTCTAATTTCATAATTCAATTCATAAGGAAATACCAAC
GCATGAGACATGATACTACATTATACAGAGTAACATATATTCATTATTCTTGAGTTTAGG
GGAGTGCATGATCAACGCATGAGACATACTACATATACAGAGTAACATATATTCGTTATT
CTTCAGTTTAGGGGAGTGCATGATTTCATCAGAACGTCCGTTACGTGAGGACCACTTTAA
GATTTAACCACCAAACATCTGTCTTTTTCCAGCGAAGTCGGTACTGACCAATTAGGTGAC
GTCTTTATGAAGAAAGTGTAGTTTGTAAGTACTAACAGTAGTGTTTCTTTTTTATGTGCT
ACCTCCATTTATGCCTTCGTTTTATGGCATGGGGACCGACATAGGCATCACAAATATGAC
AAAGATAGAGAGATAAGACACTGTTGCGTCCCTGCAATTTGCAGTGAAACTTATGCTTAG
TTTTGGAATTGCTTGATTCTCAACTTAGGTTGTTAGTCTGTTGTATATATATTCCTTTTG
TATTTTTCT

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 2

CO CL5828Contig1 978 2 2 U
GTTTGCTGACTCATCAATCAACCAGTTTAGCTTTACAATATCTGTTTATAAGGATAATAA
ACGTCACGATATCAGGATCAGATCCCTTGCAAACCATCAAATCCATCATCTGATTGGCTT
CATCTAAGCGGTTTATGATGCAAAACCCATATATCAAAGAATTATGAGTTACGATGTATG
TCTCTTGTGATCATCTCATTGTACAATTCTTTAGCCTTAGTAGTAAGCGTTTGGGTTGAT
TCCTTTGGTTTCCATTTCAATGAAAAGTCTGAGGGCACATATTGGTGGCTCCCATCTTTG
CAAAGACTATTAATACCACCATACTGTATGCAACAATTGATCAAATCAATTGCTTCAGAC
ACTTAACCTTTGAGAGTCAAAGTGTTAGCTTAACACTGTTAAGTATGACGAGATTTGGTA
TAACCTCCCTTTCTACCAATCAATAAACAAACTCCACAGCGTCAGAAACTCGACCTTGGA
GACATAATCCGTTTATCAGAGTTGATAATGTGATTGTGTTAGGATCGTACCCAAGTTTTA
AGATCTTTCCCATAACAGAAAAAGGATAACCGAGCTTCCGGCGGCGGAAGAAGCGGTTGA
TCATCATGTTGAGAGAGTTGATGTTGTGCACAATCCCGTTCAGTTCCATCTGAGAGCAAA
GATGTAACACGAGGTCATACTGTTTTGTTTTGGCAACTGCACTAAACAATCTACTGAAAT
CAACAATGGTAGGAAGAGGACGAGACAGAAGCTTTGAAAGAGATCGACAGCAATATCTTT
CTTGATACCAACAATCCAACTTCTCAAATCTCTCTTTGTTAAAAAACATTATCATCCAAA
AACATTCCGGTGAACCGGTAATCTCTATTTATGTAAGTAGGCCCATTTTTGTAGATGACC
GTTTTGGGCCTACGTCTGGTTTATGCATCATAGTTTTTTTTTATTCCATATTGAATGTGT
TAAAAGTTATTTGTCCCC


BQ
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AF RS1DK19TF U 1
AF RS1DK19JQ C 224
BS 1 350 RS1DK19TF
BS 351 978 RS1DK19JQ

RD RS1DK19TF 350 0 0
GTTTGCTGACTCATCAATCAACCAGTTTAGCTTTACAATATCTGTTTATAAGGATAATAA
ACGTCACGATATCAGGATCAGATCCCTTGCAAACCATCAAATCCATCATCTGATTGGCTT
CATCTAAGCGGTTTATGATGCAAAACCCATATATCAAAGAATTATGAGTTACGATGTATG
TCTCTTGTGATCATCTCATTGTACAATTCTTTAGCCTTAGTAGTAAGCGTTTGGGTTGAT
TCCTTTGGTTTCCATTTCAATGAAAAGTCTGAGGGCACATATTGGTGGCTCCCATCTTTG
CAAAGACTATTAATACCACCATACTGTATGCAACAATTGATCAAATCAAT

QA 1 350 1 350
DS 

RD RS1DK19JQ 755 0 0
TAAGCGTTTGGGTTGATTCCTTTGGTTTCCATTTCAATGAAAAGTCTGAGGGCACATATT
GGTGGCTCCCATCTTTGCAAAGACTATTAATACCACCATACTGTATGCAACAATTGATCA
AATCAATTGCTTCAGACACTTAACCTTTGAGAGTCAAAGTGTTAGCTTAACACTGTTAAG
TATGACGAGATTTGGTATAACCTCCCTTTCTACCAATCAATAAACAAACTCCACAGCGTC
AGAAACTCGACCTTGGAGACATAATCCGTTTATCAGAGTTGATAATGTGATTGTGTTAGG
ATCGTACCCAAGTTTTAAGATCTTTCCCATAACAGAAAAAGGATAACCGAGCTTCCGGCG
GCGGAAGAAGCGGTTGATCATCATGTTGAGAGAGTTGATGTTGTGCACAATCCCGTTCAG
TTCCATCTGAGAGCAAAGATGTAACACGAGGTCATACTGTTTTGTTTTGGCAACTGCACT
AAACAATCTACTGAAATCAACAATGGTAGGAAGAGGACGAGACAGAAGCTTTGAAAGAGA
TCGACAGCAATATCTTTCTTGATACCAACAATCCAACTTCTCAAATCTCTCTTTGTTAAA
AAACATTATCATCCAAAAACATTCCGGTGAACCGGTAATCTCTATTTATGTAAGTAGGCC
CATTTTTGTAGATGACCGTTTTGGGCCTACGTCTGGTTTATGCATCATAGTTTTTTTTTA
TTCCATATTGAATGTGTTAAAAGTTATTTGTCCCC

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL5829Contig1 1072 2 8 U
GGATGTTCTTCACAAGAATGCCTAAACATGGTTCTCGTTCTGTTGGGTATTCTAAAGAAG
AAGATAAACTTTTATGTCAAATTTATATGAAAGTTTCTCAAAATCCAATCACAGATTTTT
ATCAAACAGCAGATCAATTCTGGGATTATGTGGTAGAAGCTTTCAAGAATGGTACACCCA
AAACTTCGAGTGAACGTTCAAAAAAATCTCTTCAGTGTCGATTTCAAACGATCGAAAGAG
CAACAAAAAAACTACATGCATGCATCAAACAATGCGAAAACAGACATTCAAATGGTGTTT
CAAATGTTAATATTTGTAATCAAGCTAAAGAAATGCTAATGGAAGATCCAAAATTCAAAT
CTGGTTGGAAATTTGATCATGTGTGGAACATTATTAAGAATTCTGAAAAGTTTGAAGATG
GCGTTACTTATGCTAAAAATGTATCAGAATCTTGCGGTTTCGAGACTACATATTCAGATT
CAGAGAATCCAACAACTAATTCTGAGATACAAGCATTTCCAAGCGTACCTTCATTTTCTA
TTAACTTAGGTGGCAAAGATGATTCTATTGGTGGATCACTATCTCAACAACAAATTGGTG
GATCCTTTTCTCAACGACCAATTGGAGTAAGAAAAGCTACACTAAAAAGAAGAAGCAATG
ATCGAACATCGGCTGTAATCAAGATTTTAAAAGAAGGAAACAGACAACTTCTGAAACATT
TAATGGAGACAAGTGCGCACATACAACACTATATGGAAATTCAAAGTAAGAATTATGCAT
TAAAAAAATTTAAGGAAGAAAATACTTTTTTACTTCAAGACTTGAATTCCATACAAGATT
CAAATATTCGTGCTTACGTTCAAAGTGAACAAAAAAGAATATTAAGAAATAGGGTTGATC
AAAAAGACCCTTCTGCATCTACTTCGTTCGAGAAATAAATGCATCTGGAAGCCATCTACA
AAACAATTAAGTTACTAGTTTATATTGTTTTAAGTTTTTTTTTGAAACAACAATTCTTTT
ATTTATATTTGTTTTTGGTTATTGAATATGTTATTTTAATTTATTTTATTTT


BQ
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DS 

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TTCGTGCTTACGTTCAAAGTGAACAAAAAAGAATATTAAGAAATAGGGTTGATCAAAAAG
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TTAAGTTACTAGTTTATATTGTTTTAAGTTTTTTTTTGAAACAACAATTCTTTTATTTAT
ATTTGTTTTTGGTTATTGAATATGTTATTTTAATTTATTTTATTTT

QA 1 586 1 586
DS 



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ATCTTGTCTCCCTCTCTGGAAGTCACACCATCGGAAACTCGAGGTGCACAAGTTTCCGGC
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AAGTGCACT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E150TF U 1
AF RS1E150JQ C 514
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TAGGAAGAAGAGACGCGAGAGGAGCAAGCTTGAGTGGTTCCAACAATGACATTCCTGCTC
CCAACAACACTTTTCAAACTATCCTCACTAAGTTCAAGCGTCAAGGCCTTAATCTCGTCG
ATCTTGTCTCCCTCTCTGGAAGTCACACCATCGGAAACTCGAGGTGCACAAGTTTCCGG*
AGAG*CTATACA*CCAGTCTGGCAACGGCAAGCCTGATCTA
CT

QA 1 761 1 761
DS 

RD RS1E150JQ 756 0 0
CAGGTGGACCGAGTTGGGAAGTACCTCTAGGAAGAAGAGACGCGAGAGGAGCAAGCTTGA
GTGGTTCCAACAATGACATTCCTGCTCCCAACAACACTTTTCAAACTATCCTCACTAAGT
TCAAGCGTCAAGGCCTTAATCTCGTCGATCTTGTCTCCCTCTCTGGAAGTCACACCATCG
GAAACTCGAGGTGCACAAGTTTCCGGCAGAGGCTATACAACCAGTCTGGCAACGGCAAGC
CTGATCTAACTTTAAACCAATACTACGCCTACGCGTTGCGTAACCAATGTCCAAGATCCG
GCGGTGACCAAAACCTCTTCTTCCTCGACTTGGCGACGCCCTTCAAGTTCGACAACCACT
ACTACAAGAACCTCATCATGTACAAAGGGCTATTGAGCTCTGACGAGGTCCTGTTCACGA
AGAACAGAGAGTCCAAGGAGCTGGTGAAGCTCTACGCAGAGAATCAAGAGGCCTTCTTTG
AGCAGTTTGCGAAATCGATGGTGAAGATGGGGAATATCTCTCCTTTGACGGGCGCGAGGG
GAGAGATCCGGAGAATCTGTCGGAGGGTTAACCCTGCAGCTTATTAATCAAACCTTTATA
CTATATCATGGTTTAGTTTCATGCATTTGTTTGGCATGGACGACGTGTCAATCTTATTTC
TTTTGCCTTTGCTTGTATGAATGTGTTCTCTCCTTCGAGTGTGTATTTATTTTGGTGATT
GCTTAATTTTCATTACTCTAATTTTCAAAGTGCACT

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL5831Contig1 731 2 2 U
GGATGGTTCAGTGGTTTTCCAAAATGGAAAGACGGTTTACGCAGATACCATTATGCATTG
TACCGGGTACAAGTATTACTTCCCGTTTCTTGACACAATAGGCGAAGTGACGGTCGACGA
AATCGCGTTGGACCGTTGTATAAACATGTATTCCCTCCGGCTCTTGCCCCCGGACTTTCA
TTCATCGGCTTACCATGGCAGATCACTCCCTTCCCGATGTTTGAGCTTCAAAGCAAGTGG
GTCGCAGCGGTTTTATCTGGTCGAGTATCTCTCCCATCGCAAGATGAGATGATGGAAGAC
ACCAAGGCTTTCTACGATAAGCTCGAAGCCGCTGGTATTCCCAAACGTTATACGCATTTG
ATGCCTGATGACTCCCAGTTTGAATACGATAACTGGCTTGCGGATCAATGTGACTATCCA
CGGATAGAGAAATGGAGAGAAGAGATGTTTTACATTGGGTTCAAGAGAATTTATGCACAA
TCCGCTACGTACAGGGATAATTGGGACGACGATCACCTCATCGCAGAAGCATATGATGAT
TTTGTTAAATTTATGTCAAGCTATCCAGAACTTTTACCGTTGCTGAAAACCTAAAATTAA
AAATATGGCTTTGGAAGTTGTGTTACGGGAATACGGGGGGTGTGTATGTTTTGTAAGTTT
TTTGTGGCTACTGTGTTTCCAAAATGTGAAAGTAGAGCAATAAGGTTAATACGCTAATAG
GGTAATAAGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DL18TF U 1
AF RS1DL18JQ C 527
BS 1 603 RS1DL18TF
BS 604 731 RS1DL18JQ

RD RS1DL18TF 603 0 0
GGATGGTTCAGTGGTTTTCCAAAATGGAAAGACGGTTTACGCAGATACCATTATGCATTG
TACCGGGTACAAGTATTACTTCCCGTTTCTTGACACAATAGGCGAAGTGACGGTCGACGA
AATCGCGTTGGACCGTTGTATAAACATGTATTCCCTCCGGCTCTTGCCCCCGGACTTTCA
TTCATCGGCTTACCATGGCAGATCACTCCCTTCCCGATGTTTGAGCTTCAAAGCAAGTGG
GTCGCAGCGGTTTTATCTGGTCGAGTATCTCTCCCATCGCAAGATGAGATGATGGAAGAC
ACCAAGGCTTTCTACGATAAGCTCGAAGCCGCTGGTATTCCCAAACGTTATACGCATTTG
ATGCCTGATGACTCCCAGTTTGAATACGATAACTGGCTTGCGGATCAATGTGACTATCCA
CGGATAGAGAAATGGAGAGAAGAGATGTTTTACATTGGGTTCAAGAGAATTTATGCACAA
TCCGCTACGTACAGGGATAATTGGGACGACGATCACCTCATCGCAGAAGCATATGATGAT
TTTGTTAAATTTATGTCAAGCTATCCAGAACTTTTACCGTTGCTGAAAACCTAAAATTAA
AAA

QA 1 603 1 603
DS 

RD RS1DL18JQ 205 0 0
AAGCATATGATGATTTTGTTAAATTTATGTCAAGCTTTCCAGAACTTTTACCGTTGCTGA
AAACCTAAAATTAAAAATATGGCTTTGGAAGTTGTGTTACGGGAATACGGGGGGTGTGTA
TGTTTTGTAAGTTTTTTGTGGCTACTGTGTTTCCAAAATGTGAAAGTAGAGCAATAAGGT
TAATACGCTAATAGGGTAATAAGAA

QA 1 205 1 205
DS 



AS 1 2

CO CL5832Contig1 437 2 1 U
GAGAGAGAGAGAACCTGTTCTTGAGATGGGGAACTGCGCTGAACACAAAGCACAGGAGGC
TTCAGCTGGCGCATCGTCTATGGTCAGAGAACAAAGACATGGAACATGTCCGAGAGAGCG
CCTCTGTTGTGGGGAAGCTGATGGGGTTCGTTGACATGGATTTGGCGTCAAAGGAGATGT
ATGGCCTCAACTTCGCTATTAAACCCCGTCCCAAGAAATCCAGCCTGTGGAAACGGAGCG
TTTTGTCGCTCTCCATACTGTAATTAAAGGGGATCACAATTGATTCAATGCAGAGTACTG
AACTGAAAATGGTGTGTGTAAGCTTCTGTGAGACGTACAGTCGCTTTATGTAAATTTTGA
TTTGGCTCTGAGACTGAGAGTCAACGATCTCAAATGTTTTTTCAAAATGCTAATTCTCCC
AAAATTTCGTTGATATT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A913TF U 1
AF RS1AB14TF U 1
BS 1 437 RS1A913TF

RD RS1A913TF 437 0 0
GAGAGAGAGAGAACCTGTTCTTGAGATGGGGAACTGCGCTGAACACAAAGCACAGGAGGC
TTCAGCTGGCGCATCGTCTATGGTCAGAGAACAAAGACATGGAACATGTCCGAGAGAGCG
CCTCTGTTGTGGGGAAGCTGATGGGGTTCGTTGACATGGATTTGGCGTCAAAGGAGATGT
ATGGCCTCAACTTCGCTATTAAACCCCGTCCCAAGAAATCCAGCCTGTGGAAACGGAGCG
TTTTGTCGCTCTCCATACTGTAATTAAAGGGGATCACAATTGATTCAATGCAGAGTACTG
AACTGAAAATGGTGTGTGTAAGCTTCTGTGAGACGTACAGTCGCTTTATGTAAATTTTGA
TTTGGCTCTGAGACTGAGAGTCAACGATCTCAAATGTTTTTTCAAAATGCTAATTCTCCC
AAAATTTCGTTGATATT

QA 1 437 1 437
DS 

RD RS1AB14TF 437 0 0
GAGAGAGAGAGAACCTGTTCTTGAGATGGGGAACTGCGCTGAACACAAAGCACAGGAGGC
TTCAGCTGGCGCATCGTCTATGGTCAGAGAACAAAGACATGGAACATGTCCGAGAGAGCG
CCTCTGTTGTGGGGAAGCTGATGGGGTTCGTTGACATGGATTTGGCGTCAAAGGAGATGT
ATGGCCTCAACTTCGCTATTAAACCCCGTCCCAAGAAATCCAGCCTGTGGAAACGGAGCG
TTTTGTCGCTCTCCATACTGTAATTAAAGGGGATCACAATTGATTCAATGCAGAGTACTG
AACTGAAAATGGTGTGTGTAAGCTTCTGTGAGACGTACAGTCGCTTTATGTAAATTTTGA
TTTGGCTCTGAGACTGAGAGTCAACGATCTCAAATGTTTTTTCAAAATGCTAATTCTCCC
AAAATTTCGTTGATATT

QA 1 437 1 437
DS 



AS 1 2

CO CL5833Contig1 651 2 4 U
TTCGGTGCGATTAGATCGATTCTCCGACCACTGTCAAGAACCCTAGCCTCGCGTGTCCTC
GCAGCTAGCTGCTCGCCTACTGCGGCGATCCCGGCTGCGAGACACGAGGTATGGTCCTCC
TTCTCCGGTGGATCGAGGTTGCCATGGATTCCGATGGCAAATCATTTTCATAGCTTGAGC
TTAACCGATGCTCGGCTCCCGAAGAGACGGCCCATGAGTCATCCCAAGAAGAAAAGATTC
AAACTTAAACCTCCAGGCCCTTATGCATATGTTCAGTATACTCCTGGCGAGCCAATTGCT
TCAAACAATCCCAACAAGGGTAGTGTCAAAAGAAGGAATGCGAAGAAGCGGATCGGTCAG
CCCCGTGCTTTCATACTTTTTGAGAAGAAGAAGAGACAAGCGCTGGTGCAAGAGGCGAAG
AGGAAGAAGAGAATCAAGGAAGTGGAACGCAAGATGGCTAAAGTCGCAAGGGAGCGAGCT
TGGGAAGAAAGGCTGGCTGAGCTTCAGCGACTCGAAGAAGAGAAGAAGAAGTCAATGTTT
TCTTGAATTGCTTTTTTTATTCAACCAAAAAAAAACATAGAATAAATCTCTCGAGTTAGG
TTTTGCTGCTACCTCTTTGTTGTGTTGCCGAGATTCACTCACTCTAGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1C390TF U 1
AF RS1C390JQ C 137
BS 1 257 RS1C390TF
BS 258 258 RS1C390JQ
BS 259 271 RS1C390TF
BS 272 651 RS1C390JQ

RD RS1C390TF 271 0 0
TTCGGTGCGATTAGATCGATTCTCCGACCACTGTCAAGAACCCTAGCCTCGCGTGTCCTC
GCAGCTAGCTGCTCGCCTACTGCGGCGATCCCGGCTGCGAGACACGAGGTATGGTCCTCC
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AAACTTAAACCTCCAGGGCCTTATGCATATG

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DS 

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TCCCGAAGAGACGGCCCATGAGTCATCCCAAGAAGAAAAGATTCAAACTTAAACCTCCAG
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TTATTCAACCAAAAAAAAACATAGAATAAATCTCTCGAGTTAGGTTTTGCTGCTACCTCT
TTGTTGTGTTGCCGAGATTCACTCACTCTAGTCCC

QA 1 515 1 515
DS 



AS 1 2

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CTTGTTGTTGTATCTACTTCTTCAGAACGAAGCAATAGACAAACTGAGTGTATTGGATTT
GGTAAGGAAGAGGAAGAAGCAGCAGAAGCAAAAGTTCTTGAAAGATGGCCTGAAGAAGAT
AACTTCAAAGAGTGCCAATGTCATAAAAGGGGTCCTATGGCACACAGGGTTAAGTCAGGC
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TACATTGATGGTAACACTCAAGTATTTTAATGTTAACTAGGATGTTGATCTAGATAGGTT
CTTGTAAAGTATGTATTAGCATTAATAATATTCTTGAAGCTTACGTCTATTATATTCTAA
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AATTCAACCCATGTTGTAATGCAGTGTTTCAGACAACGGTATTGGTTCGTTGTTCGTTAT
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TAAAAAATGTTGATTAACAAAAAAATATATATTTTTTTTATAATCCAGTATCCGACCACT
AAGCGTGATCGACTAGCCCACCGGGCCTAAATCCATGCCATTACAGGATTTTTAAGCCTC
CACATTTTAACAAAAAAATGTGTTTGTGTACAACTAGTAAAAACAATGAAACAAGATTTT
GTGAAGAAATTTAACATTTTACCAACAAGAAAAAAGATTTTGTAAAGAAATAGATAAGAT
CGGATTCTATATTAGGTGAATGTTATTGAGCTGAACCACGTATAGAGAAGAAGTTCTTCC
AATATGCAAGAGTTGCGTAGTGGAGAGAAGATATCCAATTTCTAATAGAATTGTCAGTGA
AGCGAGTGAGAAGAGAAGATTGAATTTATCTTGCGTTTCATTTAGAGATGGTAGATGATC
GATTTCAAATGTTGGTTTCTAACGATTTCAAATTTATCCTGCAAAAGGAATTTAAAAGTC
ACACTATCTAATGATGCTTGGGACGAAACTACTATATGTGTTACAGTTTGGAGGACTTAC
TAGATTCGTTCCAAAACCTCCTGGTACTTAGAAAAGAAAAAAAGAAGATTATTGAAGAAT
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TTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RS1EJ60TF U 1
AF RS1EJ60JQ C 500
BS 1 626 RS1EJ60TF
BS 627 1324 RS1EJ60JQ

RD RS1EJ60TF 626 0 0
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CTTGTTGTTGTATCTACTTCTTCAGAACGAAGCAATAGACAAACTGAGTGTATTGGATTT
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AACTTCAAAGAGTGCCAATGTCATAAAAGGGGTCCTATGGCACACAGGGTTAAGTCAGGC
AAAATAAAGAAATTAAAACAAAAGGTAAATATTTATATACAGCAAAATGGATTTTAGATC
TTTCAAAGGGATTGCTCACCACTGTTACGAATACTTATTTTCCTTTTATTATACCTTTAA
TACATTGATGGTAACACTCAAGTATTTTAATGTTAACTAGGATGTTGATCTAGATAGGTT
CTTGTAAAGTATGTATTAGCATTAATAATATTCTTGAAGCTTACGTCTATTATATTCTAA
ATGTATACAATAACATTCTTTCTCAATATGAATTTGCAACATTAATGTTTAGAACAACCC
AATTCAACCCATGTTGTAATGCAGTGTTTCAGACAACGGTATTGGTTCGTTGTTCGTTAT
TACGTTGCTGGATAACTTGGATTGAT

QA 1 626 1 626
DS 

RD RS1EJ60JQ 825 0 0
TTCTCAATATGAATTTGCAACATTAATGTTTAGAACAACCCAATTCAACCCATGTTGTAA
TGCAGTGTTTCAGACAACGGTATTGGTTCGTTGTTCGTTATTACGTTGCTGGATAACTTG
GATTGATTTATCATGCTCGACTTTGAACGTGTGTATTTTTCTAAAAAATGTTGATTAACA
AAAAAATATATATTTTTTTTATAATCCAGTATCCGACCACTAAGCGTGATCGACTAGCCC
ACCGGGCCTAAATCCATGCCATTACAGGATTTTTAAGCCTCCACATTTTAACAAAAAAAT
GTGTTTGTGTACAACTAGTAAAAACAATGAAACAAGATTTTGTGAAGAAATTTAACATTT
TACCAACAAGAAAAAAGATTTTGTAAAGAAATAGATAAGATCGGATTCTATATTAGGTGA
ATGTTATTGAGCTGAACCACGTATAGAGAAGAAGTTCTTCCAATATGCAAGAGTTGCGTA
GTGGAGAGAAGATATCCAATTTCTAATAGAATTGTCAGTGAAGCGAGTGAGAAGAGAAGA
TTGAATTTATCTTGCGTTTCATTTAGAGATGGTAGATGATCGATTTCAAATGTTGGTTTC
TAACGATTTCAAATTTATCCTGCAAAAGGAATTTAAAAGTCACACTATCTAATGATGCTT
GGGACGAAACTACTATATGTGTTACAGTTTGGAGGACTTACTAGATTCGTTCCAAAACCT
CCTGGTACTTAGAAAAGAAAAAAAGAAGATTATTGAAGAATGAAACATAAACTCATAACG
TCTTGTACAAATAAACATGAAGCATATTCGTCTAGTCGGGTTTGC

QA 1 825 1 825
DS 



AS 1 2

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TTTTTTTTTGACTAAACTAAAATGCTCATAAAATAAAAAGTTTTAACACATCAAGTTCTT
GAATCTCAAAGTAGAACAGAACACAAGAGTTCCTTTAAAATAAAAAAGCTAAAATACTGA
AAAGTTCTTAGCCATCAAAATAAAATTCAAAAGGTTTGAAGCTTTTGTTTAAGATCTTGG
CTTCTCCTTCTTGCCCTTGTAGAGAGAAGAGAGTGAAACACCAGCAACCATGACGACCTT
GTACCTTACTCCTGGAATATCTCCCACAGCATGACCCTTACGCCCAAATCCAGAGATCAA
CACCTCGTCATTTGGCTCAATGAGGTTCAAACAACCATCGTTGGGGACAAAAGCAGCAAC
TTTCTTTCCATTCTTGACAAGCTGTACTCTAGCACACTTACGGATAGCAGAGTTTGGCTG
CTTAGCCTCCATTCCTATGAGCTCAAGGACGATTCCTTTGGCGTGAGAAGATCCAGCCAA
AGGCTTATTCCATTCATTTCCTAGGTGAGCCTTCTTGAAGCTCTTGTCTGACCACCTCTG
TTTTTTCCTATGCACTTTTTGAACACGTGCAGATACCATACCCCTTGTCTTTCCCATGTT
TGTGGATGGAGGAGAAGATTAACAGCAACGATGCTTTTGCAACACGCAAACAATATGAGA
TAAAAAAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C327TF C 1
AF RS1C327JQ U 10
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GTACCTTACTCCTGGAATATCTCCCACAGCATGACCCTTACGCCCAAATCCAGAGATCAA
CACCTCGTCATTTGGCTCAATGAGGTTCAAACAACCATCGTTGGGGACAAAAGCAGCAAC
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CTTAGCCTCCATTCCTATGAGCTCAAG

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CTTGCCCTTGTAGAGAGAAGAGAGTGAAACACCAGCAACCATGACGACCTTGTACCTTAC
TCCTGGAATATCTCCCACAGCATGACCCTTACGCCCAAATCCAGAGATCAACACCTCGTC
ATTTGGCTCAATGAGGTTCAAACAACCATCGTTGGGGACAAAAGCAGCAACTTTCTTTCC
ATTCTTGACAAGCTGTACTCTAGCACACTTACGGATAGCAGAGTTTGGCTGCTTAGCCTC
CATTCCTATGAGCTCAAGGACGATTCCTTTGGCGTGAGAAGATCCAGCCAAAGGCTTATT
CCATTCATTTCCTAGGTGAGCCTTCTTGAAGCTCTTGTCTGACCACCTCTGTTTTTTCCT
ATGCACTTTTTGAACACGTGCAGATACCATACCCCTTGTCTTTCCCATGTTTGTGGATGG
AGGAGAAGATTAACAGCAACGATGCTTTTGCAACACGCAAACAATATGAGATAAAAAAA

QA 1 659 1 659
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TTATTCACTTTATTTTATATGTTGTTATACTTTTTAAACATGGTTGGTTCATCATCATCA
TAATCTTTCATTACTTTAGAAGTTTGGACCAGCTGCAAGAATCTCTTCAGTCAATTTTCC
ATCTTCTCCAATCTTATGACTTGTGAATGTCTCAAAATTGTTTCTAAACAAACCAGCCAA
CTTCAACAATGTGTCCTTATAAGCCACTTTGTCTTCCCATGCATTCATAGGCTCCAAAAT
CTCAGAAGGCACTCCTTCAACTTCATTTGGAATCTCCAAACCAAAAATCTCTGTTTTCCG
ATAAGTTGCATTCAAGAGACTACCCGAATGTATAGCGTCAATAATCTTTCGTGTATAGGC
CAACTTGATTCGACTTCCAGATCCATAGCTTCCACCAGACCAGCCGGTGTTAACAAGCCA
ACCAGTGGCTCCTTGAGCTTGCATTTTCTCGGCTAACATGGCTGCATATTTGGTTGGGTG
AAGCATAACGAAAGCAGCACCAAAACAAGCTGAGAAAGTCGCTCTTGGCTCCTTAACTCC
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GTTTTTAGGGTGTGGTCCAACGCACGGTATCTTCGAGTTGGGGATATACTCC


BQ
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AF RS1CI07JQ U 159
AF RS1CI07TF C 1
BS 1 158 RS1CI07TF
BS 159 278 RS1CI07JQ
BS 279 279 RS1CI07TF
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BS 394 772 RS1CI07TF

RD RS1CI07JQ 235 0 0
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QA 1 235 1 235
DS 

RD RS1CI07TF 772 0 0
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TAATCTTTCATTACTTTAGAAGTTTGGACCAGCTGCAAGAATCTCTTCAGTCAATTTTCC
ATCTTCTCCAATCTTATGACTTGTGAATGTCTCAAAATTGTTTCTAAACAAACCAGCCAA
CTTCAACAATGTGTCCTTATAAGCCACTTTGTCTTCCCATGCATTCATAGGCTCCAAAAT
CTCAGAAGGCACTCCTTCAACTTCATTTGGAATCTCCAAACCAAAAATCTCTGTTTTCCG
ATAAGTTGCATTCAAGAGACTACCCGAATGTATAGCGTCAATAATCTTTCGTGTATAGGC
CAACTTGATTCGACTTCCAGATCCATAGCTTCCACCAGACCAGCCGGTGTTAACAAGCCA
ACCAGTGGCTCCTTGAGCTTGCATTTTCTCGGCTAACATGGCTGCATATTTGGTTGGGTG
AAGCATAACGAAAGCAGCACCAAAACAAGCTGAGAAAGTCGCTCTTGGCTCCTTAACTCC
TTCCTCTGTTCCCGCAACGAGAGCAGTGTAGCCACTGATGAAATGATACATAGTCTGAGC
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GTTTTTAGGGTGTGGTCCAACGCACGGTATCTTCGAGTTGGGGATATACTCC

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

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GTGATGGATGAGAAGACGGAGGAGTTTAGAAGGAACGCGGCAAGGTGGAGAGATATAGCG
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CACATGTGAGATTAGAAATTCAAGAATTCAGTTCTGTAGTTTCCTTTATTTTTATGGACC
TAGAGTCGTTTTATTTATTATTTAGGTTTATGTTCTATTATGTTATGTTCTTAGTTGTTT
GGCTTGTTCAATCTTGTTTTTAGTTTACTTTGGGGATGTTTACTCTTAACCAGCTCTGGT
GCTTGTGTTTGTTCTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GQ96TF U 1
AF RS1GQ96JQ C 202
BS 1 639 RS1GQ96TF
BS 640 676 RS1GQ96JQ

RD RS1GQ96TF 639 0 0
TTTTTGTGGGTGATTACGGAGAAGTTGCACACAAGTAAAGAAGAAGAGAACGAAGAAGAG
AGCATAAGTAGTTTCAGAAAAGAGCTGGGTGAGATAGGAATGGTGGTTTCTTGGTGCGAT
CAGTTTAGTGTTTTGAAGCATAGATCGATAGGTTGTTTTGTGACGCATTGTGGGTGGAAC
TCATCGCTTGAGAGCTTGGTGGCAGGAGTTCCTGTGGTTGCTTTTCCGCAGTGGACTGAT
CAAACGACGAATGCCAAACTTCTAGAAGAGTGTTGGAGGACAGGTGTGAGAGTGATGGAA
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GTGATGGATGAGAAGACGGAGGAGTTTAGAAGGAACGCGGCAAGGTGGAGAGATATAGCG
GCCGATACGATCAGAGAAGGAGGATCTTCGTTTAATCATCTCAAAGCTTTTGTCGATGAG
CACATGTGAGATTAGAAATTCAAGAATTCAGTTCTGTAGTTTCCTTTATTTTTATGGACC
TAGAGTCGTTTTATTTATTATTTAGGTTTATGTTCTATTATGTTATGTTCTTAGTTGTTT
GGCTTGTTCAATCTTGTTTTTAGTTTACTTTGGGGATGT

QA 1 639 1 639
DS 

RD RS1GQ96JQ 475 0 0
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GTGGTTGAGAGTGGGGAGATACAGAGATGCATTGAGGAAGTGATGGATGAGAAGACGGAG
GAGTTTAGAAGGAACGCGGCAAGGTGGAGAGATATAGCGGCCGATACGATCAGAGAAGGA
GGATCTTCGTTTAATCATCTCAAAGCTTTTGTCGATGAGCACATGTGAGATTAGAAATTC
AAGAATTCAGTTCTGTAGTTTCCTTTATTTTTATGGACCTAGAGTCGTTTTATTTATTAT
TTAGGTTTATGTTCTATTATGTTATGTTCTTAGTTGTTTGGCTTGTTCAATCTTGTTTTT
AGTTTACTTTGGGGATGTTTACTCTTAACCAGCTCTGGTGCTTGTGTTTGTTCTG

QA 1 475 1 475
DS 



AS 1 2

CO CL5839Contig1 1246 2 2 U
GGATATCTTCAAATTTGTTCAAAACCAAAATTTCTTGTATCGTCCGTTGAGGAGAAACTT
CAAACCAACCAGCCAGCCATGAACGATCTTCTCTCCCGCTCTTTCAAACGGTCCGTAGCC
GACGGCTCATCGCCACCTCACTCCCACAGTATCGAGATGCCAAAGGCTAAGCACTCAGGC
GGGAGCGACCTCGACAAGTTCTTCCTCGACGTGGAGGAGGTGAACAGTGATCTGAAAGAG
CTCGATCGCCTCTGTCACAGCCTCCAAGTGAGCCACGACAAGAGCAAGACGCTCCATAAC
GCTAAGGCGGTCAAGGAGTTGAAGGACAAGATGGACTCTGATGTCTCTAAGGCGCTCAAG
ACGGCTAAGCGCGTGAAAGGAAACCTGCAGGCGCTGGATCGTGCGAATGAAGCGAACCGG
AGTTTACCGGAAAATGGACCGGGTTCGTCTTCTGACCGGCAGAGGATGGCGGTGGTCAAC
GGTTTGAGGACGAAGCTGAAAGATGCGATGGATCATTTTATGAGAGTGAGAGAGACGATC
TCGGCGGAGTACATAGACACAATTCGCCGGTTGTACTTCACCGTCACCGGCGAAAATCCC
GACGAAGATACCGTCGATCACCTAATCTCTACAGGAGAAAGTGAAACGTTTATGCAGAAA
GCTATACAAGAACAAGGCCGGGGTAGGATTTTGGACACCATAAACGAGATACAAGAGAGG
CATGACGCAGTGAAAGACATCGAGAAGAGTTTGAACGAGCTGCATCAGGTGTTTCTAGAC
ATGGCTGTCTTGGTTCAGAGCCAGGGTGAACAGCTGGACACTATTGAAGACAGCCTGAAA
AGAACCAATACGCTTATCCGGTCTGGTGCAGACCAGCTTGTTAAGGCGCGGTTCTATCAG
AAGAACACGCGTAAGTGGACTTGCTACGCCGTTTTGATATTGATCATTATTGTGGTCTTG
GTTGTGTTGTTTACGGTTAAACCGTGGAAAAACAATGGTGGCGGAGGAGGAGGTTCTAAC
CGTCAACCCACTCCGGTGCAAGCTCAGCCACCTCCATCTCAGGCTCGACGTCTACTTCGT
TAAATTTTGTTCCTTTTTTAGTTCTCTTGGTCTATGCGCCTCTGATTTGGAGATTTGACT
ATTTATCTTTTTCAGTAATGTTTTTGATTGGTTCAAGTCCTTGTGTGTATATATCTCATG
CGAGGAGTACATAAATTATTTACATTCTATAAATAACGTGATAGCG


BQ
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AF RS1BO82TF U 1
AF RS1BO82JQ C 444
BS 1 674 RS1BO82TF
BS 675 1246 RS1BO82JQ

RD RS1BO82TF 677 0 0
GGATATCTTCAAATTTGTTCAAAACCAAAATTTCTTGTATCGTCCGTTGAGGAGAAACTT
CAAACCAACCAGCCAGCCATGAACGATCTTCTCTCCCGCTCTTTCAAACGGTCCGTAGCC
GACGGCTCATCGCCACCTCACTCCCACAGTATCGAGATGCCAAAGGCTAAGCACTCAGGC
GGGAGCGACCTCGACAAGTTCTTCCTCGACGTGGAGGAGGTGAACAGTGATCTGAAAGAG
CTCGATCGCCTCTGTCACAGCCTCCAAGTGAGCCACGACAAGAGCAAGACGCTCCATAAC
GCTAAGGCGGTCAAGGAGTTGAAGGACAAGATGGACTCTGATGTCTCTAAGGCGCTCAAG
ACGGCTAAGCGCGTGAAAGGAAACCTGCAGGCGCTGGATCGTGCGAATGAAGCGAACCGG
AGTTTACCGGAAAATGGACCGGGTTCGTCTTCTGACCGGCAGAGGATGGCGGTGGTCAAC
GGTTTGAGGACGAAGCTGAAAGATGCGATGGATCATTTTATGAGAGTGAGAGAGACGATC
TCGGCGGAGTACATAGACACAATTCGCCGGTTGTACTTCACCGTCACCGGCGAAAATCCC
GACGAAGATACCGTCGATCACCTAATCTCTACAGGAGAAAGTGAAACGTTTATGCAGAAA
GCTATACAAGAACA
GGC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1BO82JQ 803 0 0
TTCGTCTTCTGACCGGCAGAGGATGGCGGTGGTCAACGGTTTGAGGACGAAGCTGAAAGA
TGCGATGGATCATTTTATGAGAGTGAGAGAGACGATCTCGGCGGAGTACATAGACACAAT
TCGCCGGTTGTACTTCACCGTCACCGGCGAAAATCCCGACGAAGATACCGTCGATCACCT
AATCTCTACAGGAGAAAGTGAAACGTTTATGCAGAAAGCTATACAAGAACAAGGCCGGGG
TAGGATTTTGGACACCATAAACGAGATACAAGAGAGGCATGACGCAGTGAAAGACATCGA
GAAGAGTTTGAACGAGCTGCATCAGGTGTTTCTAGACATGGCTGTCTTGGTTCAGAGCCA
GGGTGAACAGCTGGACACTATTGAAGACAGCCTGAAAAGAACCAATACGCTTATCCGGTC
TGGTGCAGACCAGCTTGTTAAGGCGCGGTTCTATCAGAAGAACACGCGTAAGTGGACTTG
CTACGCCGTTTTGATATTGATCATTATTGTGGTCTTGGTTGTGTTGTTTACGGTTAAACC
GTGGAAAAACAATGGTGGCGGAGGAGGAGGTTCTAACCGTCAACCCACTCCGGTGCAAGC
TCAGCCACCTCCATCTCAGGCTCGACGTCTACTTCGTTAAATTTTGTTCCTTTTTTAGTT
CTCTTGGTCTATGCGCCTCTGATTTGGAGATTTGACTATTTATCTTTTTCAGTAATGTTT
TTGATTGGTTCAAGTCCTTGTGTGTATATATCTCATGCGAGGAGTACATAAATTATTTAC
ATTCTATAAATAACGTGATAGCG

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

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CAGCACTCTTAACCCCAAGCAGAAGCAAGCTTTGGCTAAGCAGCTAGGATTAAGAGCAAG
ACAAGTGGAAGTTTGGTTTCAGAACAGACGAGCAAGGACAAAGCTGAAGCAGACGGAGGT
TGACTGCGAGTTCTTAAGGCGATGCTGCGAGAATCTAACGGAAGAGAACCGTCGGCTACA
GAAAGAAGTAACGGAGCTGAGGTCGCTTAAGCTCTCTCCTCAGTTCTACATGCACATGAA
CCCACCCACCACTTTGACCATGTGCCCTTCATGTGAGCACGTGTCGGTCCCACCACCACC
ACCACAACCACAACCTCAAGGTGCTGCGTTAGGACACCACCAGAGGTCGATGCCGGTCAA
TCCGTGGGCTCCTGCTACGAGGGTTTCTCACGGCTTGACGTTTGACGCGTTTCGTCCTCG
GTCCTAGTCTCTCTAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAACCAAAAGGCATTCCGGTCATT
TTACTCAGTTTCTTGGGGACCAGATGCATGTTGTTGTTGTTGTCAACAAGTAGTATGTAC
TATTTCTAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AE75TF U 1
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BS 1 454 RS1AE75TF
BS 455 549 RS1AE75JQ

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ACAAGTGGAAGTTTGGTTTCAGAACAGACGAGCAAGGACAAAGCTGAAGCAGACGGAGGT
TGACTGCGAGTTCTTAAGGCGATGCTGCGAGAATCTAACGGAAGAGAACCGTCGGCTACA
GAAAGAAGTAACGGAGCTGAGGTCGCTTAAGCTCTCTCCTCAGTTCTACATGCACATGAA
CCCACCCACCACTTTGACCATGTGCCCTTCATGTGAGCACGTGTCGGTCCCACCACCACC
ACCACAACCACAACCTCAAGGTGCTGCGTTAGGACACCACCAGAGGTCGATGCCGGTCAA
TCCGTGGGCTCCTGCTACGAGGGTTTCTCACGGCTTGACGTTTGACGCGTTTCGTCCTCG
GTCCTAGTCTCTCTAGTTTTTTTTTTTTTTTTTT

QA 1 454 1 454
DS 

RD RS1AE75JQ 540 0 0
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AGTTTGGTTTCAGAACAGACGAGCAAGGACAAAGCTGAAGCAGACGGAGGTTGACTGCGA
GTTCTTAAGGGGATGCTGCGAGAATCTAACGGAAGAGAACCGTCGGCTACAGAAAGAAGT
AACGGAGCTGAGGTCGCTTAAGCTCTCTCCTCAGTTTTACATGCACATGAACCCACCCAC
CACTTTGACCATGTGCCCTTCATGTGAGCACGTGTCGGTCCCACCACCACCACCACAACC
ACAACCTCAAGGTGCTGCGTTAGGACACCACCAGAGGTCGATGCCGGTCAATCCGTGGGC
TCCTGCTACGAGGGTTTCTCACGGCTTGACGTTTGACGCGTTTCGTCCTCGGTCCTAGTC
TCTCTAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAACCAAAAGGCATTCCGGTCATTTTACTCAGT
TTCTTGGGGACCAGATGCATGTTGTTGTTGTTGTCAACAAGTAGTATGTACTATTTCTAG

QA 1 540 1 540
DS 



AS 1 2

CO CL5841Contig1 894 2 2 U
TCACCGAGCTTCTAAGCGTAGCCGGTCCGTTCCACACGTTCCTCGACTATCTCCTCTCGT
CAGGAGTCATCGAAACGTTCCAGAACCAAGCCAACAACACAGAGGAAGGCGTCACGATCT
TCGTCCCCAAAGACGACGCTTTCAAGGCTCAGAAGAACCCTCCTCTCTCAAACCTCACGA
AGGACCAGCTCAAGCAGCTTCTTCTCTCCCACGCCCTCCCTCACTACTACTCCCTCTCCG
AGTTCAAGAACCTGAGCCAGTCCGGTCCGGTCAGCACTTTCGCCGGTGGACAGTACCCTC
TGAAATTCACAGACGTCTCCGGTACGGTTAGGATCGAGACGCTCTGGACCAGGACTAAAG
TCAGCAGCAGCGTTTTCTCCACCGACCCTGTGGCGGTTTACCAGGTGAACCGGGTGCTTC
TACCTGAAGCTATCTTTGGAACTGACGTCCCTCCAATGCCTGCTCCGGCTCCTGCTCCCG
TGGTTAGCGCTCCTTCTGATTCGCCTACTGCTGATTCTGATGACGCCAAGGCTTCTTCGC
CTAAGTCATCGCACAAGAACTCCGCGCAGACGCTTGCTTTTGGTCCAGTCGCTATGGTGG
TTTCCGGTTTGGTGGCATTGTTCTTGTGAGAATAATAATAAGGATGGATTTGTTTTGCAG
GTTGAGTATGTCGTAAGTTCCCAATTGTCAAAGAGATTTGTATTACATCATCATTCCAAA
TTTGTCTTTTTGATTTTTTCTTTTTTTAAGCACCATTTTTTATTTTATACATTTTACCAT
TATTATTGTCATTTATCAGTGTTTGTGAATTGAGCTTTTTCTTCCTTTTTTGTTTTTATT
TTAGTTTATTTTTGCTTCATTTGCAAGCTAAGTTAAGACCATCTTTTGAACTTT


BQ
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AF RS1GD48TF U 1
AF RS1GD48JQ C 243
BS 1 582 RS1GD48TF
BS 583 894 RS1GD48JQ

RD RS1GD48TF 582 0 0
TCACCGAGCTTCTAAGCGTAGCCGGTCCGTTCCACACGTTCCTCGACTATCTCCTCTCGT
CAGGAGTCATCGAAACGTTCCAGAACCAAGCCAACAACACAGAGGAAGGCGTCACGATCT
TCGTCCCCAAAGACGACGCTTTCAAGGCTCAGAAGAACCCTCCTCTCTCAAACCTCACGA
AGGACCAGCTCAAGCAGCTTCTTCTCTCCCACGCCCTCCCTCACTACTACTCCCTCTCCG
AGTTCAAGAACCTGAGCCAGTCCGGTCCGGTCAGCACTTTCGCCGGTGGACAGTACCCTC
TGAAATTCACAGACGTCTCCGGTACGGTTAGGATCGAGACGCTCTGGACCAGGACTAAAG
TCAGCAGCAGCGTTTTCTCCACCGACCCTGTGGCGGTTTACCAGGTGAACCGGGTGCTTC
TACCTGAAGCTATCTTTGGAACTGACGTCCCTCCAATGCCTGCTCCGGCTCCTGCTCCCG
TGGTTAGCGCTCCTTCTGATTCGCCTACTGCTGATTCTGATGACGCCAAGGCTTCTTCGC
CTAAGTCATCGCACAAGAACTCCGCGCAGACGCTTGCTTTTG

QA 1 582 1 582
DS 

RD RS1GD48JQ 652 0 0
TTCAAGAACCTGAGCCAGTCCGGTCCGGTCAGCACTTTCGCCGGTGGACAGTACCCTCTG
AAATTCACAGACGTCTCCGGTACGGTTAGGATCGAGACGCTCTGGACCAGGACTAAAGTC
AGCAGCAGCGTTTTCTCCACCGACCCTGTGGCGGTTTACCAGGTGAACCGGGTGCTTCTA
CCTGAAGCTATCTTTGGAACTGACGTCCCTCCAATGCCTGCTCCGGCTCCTGCTCCCGTG
GTTAGCGCTCCTTCTGATTCGCCTACTGCTGATTCTGATGACGCCAAGGCTTCTTCGCCT
AAGTCATCGCACAAGAACTCCGCGCAGACGCTTGCTTTTGGTCCAGTCGCTATGGTGGTT
TCCGGTTTGGTGGCATTGTTCTTGTGAGAATAATAATAAGGATGGATTTGTTTTGCAGGT
TGAGTATGTCGTAAGTTCCCAATTGTCAAAGAGATTTGTATTACATCATCATTCCAAATT
TGTCTTTTTGATTTTTTCTTTTTTTAAGCACCATTTTTTATTTTATACATTTTACCATTA
TTATTGTCATTTATCAGTGTTTGTGAATTGAGCTTTTTCTTCCTTTTTTGTTTTTATTTT
AGTTTATTTTTGCTTCATTTGCAAGCTAAGTTAAGACCATCTTTTGAACTTT

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 2

CO CL5842Contig1 1014 2 4 U
GGGTCTTCTTCCAGACTCTTTTCTCGTTTCCACCTGAGGAAAAAATAAGAAAAAAGAAAA
CTCTTTCCCTCTCTCTCTCGATCGCTTTATCGCCATGAGTCTGTTTGGATTGGGAAGAAA
TCAGAAGACATTCCGTCCTAAGAAGAGTGCACCTTCTGGAAGCAAGGGTGCACAGCTTCG
ACAGCATATAGATGCAACTTTAGGAAGTGGCAACTTGAGAGAAGCTGTTCGACTTCCTCC
TGGAGAGGATGCCAACGAGTGGCTTGCTGTCAACACCTGATAACTGTCCTACTATGACTG
CTGGCCCCAAGTATGCTTCTCTTCTCTCTTTTGCTTGATTATGCATCTTCATTTGTTATG
TACATCTCTGTACTAGTTTGTTCTGAGGAAATGCTTTTATCATGCAAAAGCTAAATGTTC
AAAATACACACGTTTCTGTTTCGTTCCAATAGAGGTTTCTGCTCCAAAGTATGTCGAGTA
CTTGATGGATTGGATCGAGACACAGCTCGATGATGAGACTTTATTCCCTCAAAGGCTTGG
AGCACCGTTTCCTCAGAACTTCAAGGATGTGGTGAAGACAATATTTAAACGACTTTTCCG
TGTGTATGCCCACATATACCATTCTCATTTCCAGAAAATCGTTAGCCTTAAAGAAGAAGC
TCATCTCAACACTTGCTTCAAACACTTCATCCTCTTCACTCATGAGTTTGGACTGATTGA
CAAGAAAGAACTGGCGCCTCTACAAGAGCTCATAGAATCTATCGTTTCACCGTATTGAGC
AAAAGAAGCCATCTTCAGATATTAAAATCAAAAGAAATAAATTAAATGGTAATATGGTTT
TTAATTATAAATCTATCCCGTTTGTTTCCAGTTTTCTTTTTCTTCCTAATTTTCTCTGTA
AAATTGAAACATTTACTATGTAAGAAAATCGATGTTGATGAGTCCTTGAATATCTCCTTT
ACTCATGTGTTTGATGCATGTGAAAGAAAAAGGAACTTTACATTATTTTAATTG


BQ
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AF RS1GS71TF U 1
AF RS1GS71JQ C 279
BS 1 681 RS1GS71TF
BS 682 682 RS1GS71JQ
BS 683 722 RS1GS71TF
BS 723 1014 RS1GS71JQ

RD RS1GS71TF 728 0 0
GGGTCTTCTTCCAGACTCTTTTCTCGTTTCCACCTGAGGAAAAAATAAGAAAAAAGAAAA
CTCTTTCCCTCTCTCTCTCGATCGCTTTATCGCCATGAGTCTGTTTGGATTGGGAAGAAA
TCAGAAGACATTCCGTCCTAAGAAGAGTGCACCTTCTGGAAGCAAGGGTGCACAGCTTCG
ACAGCATATAGATGCAACTTTAGGAAGTGGCAACTTGAGAGAAGCTGTTCGACTTCCTCC
TGGAGAGGATGCCAACGAGTGGCTTGCTGTCAACACCTGATAACTGTCCTACTATGACTG
CTGGCCCCAAGTATGCTTCTCTTCTCTCTTTTGCTTGATTATGCATCTTCATTTGTTATG
TACATCTCTGTACTAGTTTGTTCTGAGGAAATGCTTTTATCATGCAAAAGCTAAATGTTC
AAAATACACACGTTTCTGTTTCGTTCCAATAGAGGTTTCTGCTCCAAAGTATGTCGAGTA
CTTGATGGATTGGATCGAGACACAGCTCGATGATGAGACTTTATTCCCTCAAAGGCTTGG
AGCACCGTTTCCTCAGAACTTCAAGGATGTGGTGAAGACAATATTTAAACGACTTTTCCG
TGTGTATGCCCACATATACCATTCTCATTTCCAGAAAATCGTTAGCCTTAAAGAAGAAGC
TCATCTCAACACTTGCTTCAA*CACTTCATCCTCTTCACTCATGAGTTTGGACTGATTGA
CA
GAAAGA

QA 1 722 1 722
DS 

RD RS1GS71JQ 736 0 0
GATAACTGTC*TACTATGACTGCTGGCCCCAAGTATGCTTCTCTTCTCTCTTTTGCTTGA
TTATGCATCTTCATTTGTTATGTACATCTCTGTACTAGTTTGTTCTGAGGAAATGCTTTT
ATCATGCAAAAGCTAAATGTTCAAAATACACACGTTTCTGTTTCGTTCCAATAGAGGTTT
CTGCTCCAAAGTATGTCGAGTACTTGATGGATTGGATCGAGACACAGCTCGATGATGAGA
CTTTATTCCCTCAAAGGCTTGGAGCACCGTTTCCTCAGAACTTCAAGGATGTGGTGAAGA
CAATATTTAAACGACTTTTCCGTGTGTATGCCCACATATACCATTCTCATTTCCAGAAAA
TCGTTAGCCTTAAAGAAGAAGCTCATCTCAACACTTGCTTCAAACACTTCATCCTCTTCA
CTCATGAGTTTGGACTGATTGACAAGAAAGAACTGGCGCCTCTACAAGAGCTCATAGAAT
CTATCGTTTCACCGTATTGAGCAAAAGAAGCCATCTTCAGATATTAAAATCAAAAGAAAT
AAATTAAATGGTAATATGGTTTTTAATTATAAATCTATCCCGTTTGTTTCCAGTTTTCTT
TTTCTTCCTAATTTTCTCTGTAAAATTGAAACATTTACTATGTAAGAAAATCGATGTTGA
TGAGTCCTTGAATATCTCCTTTACTCATGTGTTTGATGCATGTGAAAGAAAAAGGAACTT
TACATTATTTTAATTG

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

CO CL5843Contig1 967 2 2 U
GGGGTCCGCCGGACCTGAGCGACCACACGCTGGCGGAGTGCGGAGAGAGGCTGATGCTGG
TGGGTCTTCTGACTAAGAACGCTGCCACGTGCGTATGCATATGGGAGCTGCAGAAGATGA
CGTTGTTGTGGAAGGAGGTTGACAGAATGCCAAACATATGGTGCTTGGAATTTTACGGAA
AGCACATAAGGATGAATTGTCTAGGCAACAAAGGTTGTCTGATGATGTTGTCCTTGAGGT
CCAGACAGATGAACCGTCTGATTACCTACAATGCGGTTACTAAGGAGTGGACCAAGGTCC
CTGGGTGTACCGTTCCTCGTGGGAGAAAGAGGCTTTGGATCGCTTGCGGAACAGCGTTCC
ATCCCTCCCCTACGGCTAGGGCTTGATCAATCTATCTCCATCTTTTGAGGTTTGTATATC
CTCTCGGAATCGACACTCGGTTGGTTTGTTTGTTTCTGTTCTTTTGATTTTTCGTTTTTT
TGGATATTTGGGACTGTAATATACTTACAAAGCATTCGTGTTGTGTAATAAATAACTTTG
GGTTGTGTGATAAAACTGGTCGGAACTTCTTGACACAGATCCGAGTTAACACGGAGGAAA
CTGTTGAACCCTTTTGGTGTTCAGTATTAACCTCGTGTGGAGTACCAAGTGACCGGGAAG
CATAACAAGAACGGCGTTTAAACTTGACAAGAAAAATATTCTTGATAACATTAACATGTT
GTAAATACAAAGTTGATGCATTCTACAATTAGTATAAAGGAGGGGAAAAGAGACAAGACG
GAAGAAGAGAGCAGCCTTCTCATATTGCAAAATGGATTTTTCTAGCTTCAACAGTGATTC
CGTTTATGCCATGCCTTTGCTTGTTGCGGTCCTGATGATCTGGAAGAGAGCTGTAAACAA
AGTATATGGAAGGTCAAATACCTAAACACAAAAATTATATAATCAAATGGTTTATATATA
TAATGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D852TF U 1
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BS 1 451 RS1D852TF
BS 452 967 RS1D852JQ

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TGGGTCTTCTGACTAAGAACGCTGCCACGTGCGTATGCATATGGGAGCTGCAGAAGATGA
CGTTGTTGTGGAAGGAGGTTGACAGAATGCCAAACATATGGTGCTTGGAATTTTACGGAA
AGCACATAAGGATGAATTGTCTAGGCAACAAAGGTTGTCTGATGATGTTGTCCTTGAGGT
CCAGACAGATGAACCGTCTGATTACCTACAATGCGGTTACTAAGGAGTGGACCAAGGTCC
CTGGGTGTACCGTTCCTCGTGGGAGAAAGAGGCTTTGGATCGCTTGCGGAACAGCGTTCC
ATCCCTCCCCTACGGCTAGGGCTTGATCAATCTATCTCCATCTTTTGAGGTTTGTATATC
CTCTCGGAATCGACACTCGGTTGGTTTGTTT

QA 1 451 1 451
DS 

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GGGCTTGATCAATCTATCTCCATCTTTTGAGGTTTGTATATCCTCTCGGAATCGACACTC
GGTTGGTTTGTTTGTTTCTGTTCTTTTGATTTTTCGTTTTTTTGGATATTTGGGACTGTA
ATATACTTACAAAGCATTCGTGTTGTGTAATAAATAACTTTGGGTTGTGTGATAAAACTG
GTCGGAACTTCTTGACACAGATCCGAGTTAACACGGAGGAAACTGTTGAACCCTTTTGGT
GTTCAGTATTAACCTCGTGTGGAGTACCAAGTGACCGGGAAGCATAACAAGAACGGCGTT
TAAACTTGACAAGAAAAATATTCTTGATAACATTAACATGTTGTAAATACAAAGTTGATG
CATTCTACAATTAGTATAAAGGAGGGGAAAAGAGACAAGACGGAAGAAGAGAGCAGCCTT
CTCATATTGCAAAATGGATTTTTCTAGCTTCAACAGTGATTCCGTTTATGCCATGCCTTT
GCTTGTTGCGGTCCTGATGATCTGGAAGAGAGCTGTAAACAAAGTATATGGAAGGTCAAA
TACCTAAACACAAAAATTATATAATCAAATGGTTTATATATATAATGCC

QA 1 589 1 589
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GAGTTCAGCCTAAGAGATGATTGGATCAGTTGTGATCAAAAGAAATCGCTAAAGGTTGAG
GTTTTGAAAATAACCAGTGATTTGAAGGGGTGAGGTTTCAGAAGAAGGCATTGAGGAGGA
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TAAGAAGAAAGGGTCAAAGAAAGTAAACAAGATGTGATCTGATGAAGATTGAAAAACAAA
AAAAAAAAGGCAGTAAGCCTGCACGGTGTAGATTTTGCATCCAAAATTTATAGTGATACT
CAATGACTTTAGCCTGTTATTCGTTCTTCTGCTGATTTCGTATACGTTTTGGATTATGAT
AGTTTCGTTGACTCTTCAATTTCTGTTTTGATCCAACTCTTCTAAGCTTTACGGTAAAAT
AAGTTAATGCCACTTGTTTTGGTTATTTCACTGGCTTTGGATGTGTTTTAAAGGTTTTAC
TGGGCACAGAGGCAGTTATGAGAATGCAGTTATCAAAACACGAGAGAAATAATAAAATTT
GCTAAGGTGAATATAACCTTACACTTAAGCAACTATACAATAGAGATAGAAAGATATAAT
CAAAAATGAAACAGATCCACATTTGTGCGGTTGTAAATATGAG


BQ
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AF RS1EL55TF U 1
AF RS1EL55JQ C 256
BS 1 703 RS1EL55TF

RD RS1EL55TF 703 0 0
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GAGTTCAGCCTAAGAGATGATTGGATCAGTTGTGATCAAAAGAAATCGCTAAAGGTTGAG
GTTTTGAAAATAACCAGTGATTTGAAGGGGTGAGGTTTCAGAAGAAGGCATTGAGGAGGA
AGATGAAGAAAATGAGGATGAAGAGAATTATGAAAGCAAATATAGTGAGGAGGAGGAAGA
TAAGAAGAAAGGGTCAAAGAAAGTAAACAAGATGTGATCTGATGAAGATTGAAAAACAAA
AAAAAAAAGGCAGTAAGCCTGCACGGTGTAGATTTTGCATCCAAAATTTATAGTGATACT
CAATGACTTTAGCCTGTTATTCGTTCTTCTGCTGATTTCGTATACGTTTTGGATTATGAT
AGTTTCGTTGACTCTTCAATTTCTGTTTTGATCCAACTCTTCTAAGCTTTACGGTAAAAT
AAGTTAATGCCACTTGTTTTGGTTATTTCACTGGCTTTGGATGTGTTTTAAAGGTTTTAC
TGGGCACAGAGGCAGTTATGAGAATGCAGTTATCAAAACACGAGAGAAATAATAAAATTT
GCTAAGGTGAATATAACCTTACACTTAAGCAACTATACAATAGAGATAGAAAGATATAAT
CAAAAATGAAACAGATCCACATTTGTGCGGTTGTAAATATGAG

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1EL55JQ 448 0 0
AAAGAAAGTAAACAAGATGTGATTTGATGAAGATTGAAAAACAAAAAAAAAAAGGCAGTA
AGCCTGCACGGTGTAGATTTTGCATCCAAAATTTATAGTGATACTCAATGACTTTAGCCT
GTTATTCGTTCTTTTGCTGATTTCGTATACGTTTTGGATTATGATAGTTTCGTTGACTCT
TCAATTTCTGTTTTGATCCAACTCTTTTAAGCTTTACGGTAAAATAAGTTAATGCCACTT
GTTTTGGTTATTTCACTGGCTTTGGATGTGTTTTAAAGGTTTTACTGGGCACAGAGGCAG
TTATGAGAATGCAGTTATCAAAACACGAGAGAAATAATAAAATTTGCTAAGGTGAATATA
ACCTTACACTTAAGCAACTATACAATAGAGATAGAAAGATATAATCAAAAATGAAACAGA
TCCACATTTGTGCGGTTGTAAATATGAG

QA 1 448 1 448
DS 



AS 1 2

CO CL5846Contig1 854 2 2 U
TTTTTTTTCCAGACATATAAAATGGCTTTCTCCACCAAACTCGCCGTCTTACAACAAATT
ACAAGTGTTTCACTGACATCAATGCTCGGTTCACTCCGTTACAATTCCACAAAGCTCTTC
GTTGGTGGCCTATCACCCGGAACTGACGACAGTTCCTTGAAGGACGCTTTCTCCACCTTC
AGCGGAGTGTCAGATGCAAGAGTGATGACAAACAAAGTGACTGGGAGGTCTCGAGGTTAT
GGATTCGTTAACTTCATGAGCGAGGATGCTGCTAAATCTGCTATTTCAGCTATGGATGGA
CAGGAGTTGAATGGGGTTAACATCCGTGTGGATGCTGCAAAAGAATGGCCAAGCTTGCCT
TTGGGAGAGAGTGTAGAGGATGAGAAGAAAGGCAATAATAAGATGATGGTAAGCCGATCT
GTATGGAAAGATCCGTTCGTTGACGCCTTCTTGATGAAGAAGAAAAACGCAGCACTGAAC
AGGAAGATATGGTCAAGGAGATCGACGATTCTGCCAGAGTATGTTGATTCTTCTGTGAGG
ATCTACAATGGGAAAACGCATGTGCGTTGTAAGATCACAGAGGGGAAAGTTAGGCACAAG
TTTGGAGAGTTTGCGTTTACGAGAAAAGTTACCAAGCATCCTAGAGCAAAGTAAGTGTAG
TGAAGTGAAGTAAGTTCTTGAGAATGATCTTTAGGATGCTCATTTTTCGAAAGATGAGAA
ACTTTTGTAAGCCATTGATCATTGGAAGTGTTTTCTGTTGTTGTTCATGATTCTTAGGTA
GTGATTTTTCGAGATGTGGAAAATCAACTTTAAATCCATCATTTCATCTACATGAAGATA
GTTATTTGACTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G994TF U 1
AF RS1G994JQ C 155
BS 1 590 RS1G994TF
BS 591 854 RS1G994JQ

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GGATTCGTTAACTTCATGAGCGAGGATGCTGCTAAATCTGCTATTTCAGCTATGGATGGA
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QA 1 590 1 590
DS 

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AAGTGACTGGGAGGTCTCGAGGTTATGGATTCGTTAACTTCATGAGCGAGGATGCTGCTA
AATCTGCTATTTCAGCTATGGATGGACAGGAGTTGAATGGGGTTAACATCCGTGTGGATG
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TCACAGAGGGGAAAGTTAGGCACAAGTTTGGAGAGTTTGCGTTTACGAGAAAAGTTACCA
AGCATCCTAGAGCAAAGTAAGTGTAGTGAAGTGAAGTAAGTTCTTGAGAATGATCTTTAG
GATGCTCATTTTTCGAAAGATGAGAAACTTTTGTAAGCCATTGATCATTGGAAGTGTTTT
CTGTTGTTGTTCATGATTCTTAGGTAGTGATTTTTCGAGATGTGGAAAATCAACTTTAAA
TCCATCATTTCATCTACATGAAGATAGTTATTTGACTGAG

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

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TTCTGAGTGGTCCAGCCATACTCAGGCACCCTCATTTGGATCCTCACCAACTGGACGAGA
GCGATGGCGGAGACGAGAGCATAAGCTCCACAGAGAGAGAAGAAGATCCCATCTTGCCAC
TGAGTTGACTCGTTAACCTCGTCCCACCAATTCGTCATCGCCGCCGCGAAGATTTGTGCC
ATCTCCAACGGCATCGCCGCGCTCGAATCCGTCATCCTCCACCTCGTTTCTCTGCTACCT
TTTCAGGGTGAGGATGGATTGCACACTCAATCCGCTGGAATCGAGGAAAAGGAACGGTTT
TTCAATCGGAATCCAGAAACCCTAATCGACTCTGGAGAATCGGAGAGAGAGGCGAGTAAA
AGGGGGGTGAGTTGTTTGAATATCTGCAAACCCACTGGTCAGATGGCAGAGAGAGAGAGT
GAGAGGGAGAAGAATCAAGAGAGATGAAATGAAGATCTAACGGCTGAGAAAGTTTTGATC
TTTTCGACACTGTGTAGGTTGGCTGTAGCTTCTGGCTTGTTCCTTCTTCACACGTCCTCT
TACTATTTTATGATTTTTTATTAACCCATAAATTAAATATAAATGGATTTTTTTACCCCC
AAAATCCAAAACTCTTTTTTGTTTGCTAATTTACAAAACACATTTTGTTACAAAGTAAAG
AGTTTACAATAAAAAAAAA


BQ
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AF RS1H496TF C 1
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BS 311 859 RS1FY46TF

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CCCGGAAGATCCAATAATATCCAGCAAAGAGCCTTCGGATGCACGAGAAAGACTTGATGG
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TTCTGAGTGGTCCAGCCATACTCAGGCACCCTCATTTGGATCCTCACCAACTGGACGAGA
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TGAGTTGACTCGTTAACCTCGTCCCACCAATTCGTCATCGCCGCCGCGAAGATTTGTGCC
ATCTCCAACGGCATCGCCGCGCTCGAATCCGTCATCCTCCACCTCGTTTCTCTGCTACCT
TTTCAGGGTGAGGATGGATTGCACACTCAATCCGCTGGAATCGAGGAAAAGGAACGGTTT
TTCAATCGGAATCCAGAAACCCTAATCGGCTCTGGAGAATCGGAGAGAGAGGCGAGTAAG
AGGGGGGTGAGTT
CC

QA 1 553 1 553
DS 

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GCATCGCCGCGCTCGAATCCGTCATCCTCCACCTCGTTTCTCTGCTACCTTTTCAGGGTG
AGGATGGATTGCACACTCAATCCGCTGGAATCGAGGAAAAGGAACGGTTTTTCAATCGGA
ATCCAGAAACCCTAATCGACTCTGGAGAATCGGAGAGAGAGGCGAGTAAAAGGGGGGTGA
GTTGTTTGAATATCTGCAAACCCACTGGTCAGATGGCAGAGAGAGAGAGTGAGAGGGAGA
AGAATCAAGAGAGATGAAATGAAGATCTAACGGCTGAGAAAGTTTTGATCTTTTCGACAC
TGTGTAGGTTGGCTGTAGCTTCTGGCTTGTTCCTTCTTCACACGTCCTCTTACTATTTTA
TGATTTTTTATTAACCCATAAATTAAATATAAATGGATTTTTTTACCCCCAAAATCCAAA
ACTCTTTTTTGTTTGCTAATTTACAAAACACATTTTGTTACAAAGTAAAGAGTTTACAAT
AAAAAAAAA

QA 1 549 1 549
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CCTCTGTTGCCAACTTGAAGGGTAGGATTGGTCAATTCATGAAACGTGTGTGGGTAGAAG
GGGTCGAGCAGAAACCAGGCCAAGCTTTCCTAGTAGTAGCCGGTACAATGGGGTACGCTT
TCCATGACCAGTTTGAGAAGGTACGCAAAATAAGAAAGAAACTTCTTGAACAAGAAGCGG
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ATGATTTGTTGATGCAGATGGCTGTCGACTTTTTCTGGATAAAGAAGAAGTGAGGTTGCG
GACAAGTCAAGTAATCAAAACAATCATATATGCTCTGGCTTATGTAATAATACATGTGGC
AAACACCTATTTCAGAAGTGGATTTATTTATGTGTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1G031TF U 1
AF RS1G031JQ C 18
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RD RS1G031TF 457 0 0
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CCTCTGTTGCCAACTTGAAGGGTAGGATTGGTCAATTCATGAAACGTGTGTGGGTAGAAG
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TCCATGACCAGTTTGAGAAGGTACGCAAAATAAGAAAGAAACTTCTTGAACAAGAAGCGG
AATGTGAGATCATGAGGAAACGGGTTCTTGAGAGAAATGCAGATTTTAATGCTAAAAAGG
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AAACACCTATTTCAGAAGTGGATTTATTTATGTGTGG

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DS 

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GGCCAAGCTTTCCTAGTAGTAGCCGGTACAATGGGGTACGCTTTCCATGACCAGTTTGAG
AAGGTACGCAAAATAAGAAAGAAACTTTTTGAACAAGAAGCGGAATGTGAGATCATGAGG
AAACGGGTTCTTGAGAGAAATGCAGATTTTAATGCTAAAAAGGATGATTTGTTGATGCAG
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AAACAATCATATATGCTCTGGCTTATGTAATAATACATGTGGCAAACACCTATTTCAGAA
GTGGATTTATTTATGTGTGG

QA 1 440 1 440
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CTGGGGATCCTCTTAGATCAAGCAGTAGTATGAAAGGTGTAGAGTTGGTCCAGATCTCAA
AGAAAGGAAGAGTCATTAAGAAAATCAAAGAAACAAGCACAGACGTGTGGCAAGGTACTC
AGCTTCTTGGATCTGATTCAGCTGCTGCGATGGAGCTGCTTCGGAGGTCTGTAATAGGAG
ATGAATTAGAGAAAGAAAAAAAAGCTCTGCGCAGAACCGTGGCTGACTTAGCATCAGTTC
TTCCCATTGGTGTTCTTATGATTCTTCCTGTCACACCAGTTGGCCATGCGGCTATACTTG
CTGCAATTCAAAGATATGTGCCAGGCTTGATACCTTCGACATACGGATCCGAAAGATTGA
ACCTATTAAGACAGCTCGAGCAAGTCAAGCAAATGCAAAATGAAACGGAGTCTGAGGAAG
AAACTGAACCTTAACTAGATGAAGATGCAAATTCATTTTATAC


BQ
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AF RS1CA33TF U 1
AF RS1CA33JQ C 1
BS 1 236 RS1CA33TF
BS 237 583 RS1CA33JQ

RD RS1CA33TF 236 0 0
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CTGGGGATCCTCTTAGATCAAGCAGTAGTATGAAAGGTGTAGAGTTGGTCCAGATCTCAA
AGAAAGGAAGAGTCATTAAGAAAATCAAAGAAACAAGCACAGACGTGTGGCAAGGT

QA 1 236 1 236
DS 

RD RS1CA33JQ 583 0 0
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CTGGGGATCCTCTTAGATCAAGCAGTAGTATGAAAGGTGTAGAGTTGGTCCAGATCTCAA
AGAAAGGAAGAGTCATTAAGAAAATCAAAGAAACAAGCACAGACGTGTGGCAAGGTACTC
AGCTTCTTGGATCTGATTCAGCTGCTGCGATGGAGCTGCTTCGGAGGTCTGTAATAGGAG
ATGAATTAGAGAAAGAAAAAAAAGCTCTGCGCAGAACCGTGGCTGACTTAGCATCAGTTC
TTCCCATTGGTGTTCTTATGATTCTTCCTGTCACACCAGTTGGCCATGCGGCTATACTTG
CTGCAATTCAAAGATATGTGCCAGGCTTGATACCTTCGACATACGGATCCGAAAGATTGA
ACCTATTAAGACAGCTCGAGCAAGTCAAGCAAATGCAAAATGAAACGGAGTCTGAGGAAG
AAACTGAACCTTAACTAGATGAAGATGCAAATTCATTTTATAC

QA 1 583 1 583
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5853Contig1 1081 2 2 U
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GCGTCAGGAAGCTATAGCGGAAGAAATTGACTTGTTTCGTGAATTGCCTGACAGCAAAAT
TGGAAAGCTCACTCTGGCAAGGCTTTTGATGGCTAAAGCTATGATATCGGATGCTGCTGT
TAAGGGTGTTCACTATAACGAAATCCTCGACCTGTATAAAGATCTAATGGTGCTGGATTC
TTCGCACTATCAGTATTACAAGGATGAGCACAGCGTAGCTTTGCTCCGCAAGGTGACTTC
AAGCACTGAAGATTTGTCAGGACGCCTCTTTCGATACAGGAATATGAACAACTCTGTATG
TCTACGGTTAAATAACTTATCGTTATCTCGGATAGCCTCTGTCGAGAAGTTGCTGTTTGT
CCAAATGTTAGACCTTAGTCACAATGAGCTTCATTCAACTGAAGGATTGGAGGCAATGCA
ACTTCTCTCTTGCCTAAATCTGAGTCACAACAGAATCCGGAGTTTTTCAGCTCTGGACTC
ACTGAGACATTTGAATCAGCTGAGAGTGTTGAATGTTTCACACAACCACATCGGTGAGCA
CTCAGTGGACACAACACGGTACCTTTGTTCCTCACCGCTCTCTAATTCTGAGTGCACTCG
GGATGAAGTTGGTAGACAGATGCCTAGTTTGGTCACTAAGTACTGGGATGCGTATTTCGT
CTTGAGAGATCTGAATCTCAAACAGTTAGATATAACAGGCAACGCAATCGCAGGGGACGA
GTTCAGGTCTTTTGTCCTACAGGTTGTGCCAAAGCTTGTATGGATCGATGGCAAGAAACT
TGAGAGTTAGATCATAGGCCAAGGTTTTTTTGCTTTATTTATGGCTCATCAAACTTGAGA
TGATGCTTGTTGTTGTGATCTATTTCTTAACAATCTTGTTAAATGACCTTCTATAATGAC
TCTGCACCCTTTGTTTAACACATTTAAAGGACCTATGTGTAGGGATGCTCTTTTTTCTGC
C


BQ
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10 

AF RS1G596TF U 1
AF RS1G596JQ C 583
BS 1 708 RS1G596TF
BS 709 1081 RS1G596JQ

RD RS1G596TF 708 0 0
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AAAGGATTTGAACTCTCTTGTTAACTTGGATCAATCAAATGCTCAGTTGGATTCTAAATG
GCGTCAGGAAGCTATAGCGGAAGAAATTGACTTGTTTCGTGAATTGCCTGACAGCAAAAT
TGGAAAGCTCACTCTGGCAAGGCTTTTGATGGCTAAAGCTATGATATCGGATGCTGCTGT
TAAGGGTGTTCACTATAACGAAATCCTCGACCTGTATAAAGATCTAATGGTGCTGGATTC
TTCGCACTATCAGTATTACAAGGATGAGCACAGCGTAGCTTTGCTCCGCAAGGTGACTTC
AAGCACTGAAGATTTGTCAGGACGCCTCTTTCGATACAGGAATATGAACAACTCTGTATG
TCTACGGTTAAATAACTTATCGTTATCTCGGATAGCCTCTGTCGAGAAGTTGCTGTTTGT
CCAAATGTTAGACCTTAGTCACAATGAGCTTCATTCAACTGAAGGATTGGAGGCAATGCA
ACTTCTCTCTTGCCTAAATCTGAGTCACAACAGAATCCGGAGTTTTTCAGCTCTGGACTC
ACTGAGACATTTGAATCAGCTGAGAGTGTTGAATGTTTCACACAACCACATCGGTGAGCA
CTCAGTGGACACAACACGGTACCTTTGTTCCTCACCGCTCTCTAATTC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1G596JQ 499 0 0
TTTTTCAGCTCTGGACTCACTGAGACATTTGAATCAGCTGAGAGTGTTGAATGTTTCACA
CAACCACATCGGTGAGCACTCAGTGGACACAACACGGTACCTTTGTTCCTCACCGCTCTC
TAATTCTGAGTGCACTCGGGATGAAGTTGGTAGACAGATGCCTAGTTTGGTCACTAAGTA
CTGGGATGCGTATTTCGTCTTGAGAGATCTGAATCTCAAACAGTTAGATATAACAGGCAA
CGCAATCGCAGGGGACGAGTTCAGGTCTTTTGTCCTACAGGTTGTGCCAAAGCTTGTATG
GATCGATGGCAAGAAACTTGAGAGTTAGATCATAGGCCAAGGTTTTTTTGCTTTATTTAT
GGCTCATCAAACTTGAGATGATGCTTGTTGTTGTGATCTATTTCTTAACAATCTTGTTAA
ATGACCTTCTATAATGACTCTGCACCCTTTGTTTAACACATTTAAAGGACCTATGTGTAG
GGATGCTCTTTTTTCTGCC

QA 1 499 1 499
DS 



AS 1 2

CO CL5854Contig1 929 2 2 U
GGACACATCTCCTCCTCTCTTTTAACATCTTCTTCTTGAATCCTCCATCTCCTTCATCTA
ACCCTAAAGAACTTCATCAAAGATCGATCAAGATTCTATAAAACACAAGAACATGCTTGC
CGTCCACCGCCCTTCATCCGCCGTATCAGACGGAGACTCCCTCCAGATTCCAACGATGGT
TCAAAAACGTTTCCCTTCACTCTCATGCGACGCAACAGCAGCTCGTTTCCACACGCACGA
GGTCGGTCCTAACCAGTGCTGCTCCGCCGTGATACAAGAGATCTCCGCACCTATCTCCAC
CGTATGGTCCGTCGTCAGACGCTTTGACAACCCGCAAGCCTACAAACACTTCCTCAAAAG
CTGCAGCGTCATCGACGGGGACGGTGGGAACGTTGGTAGCTTACGTCAAGTCCACGTCGT
CTCTGGCCTCCCCGCTGCTAGCTCCACCGAGCGTCTTGACATACTAGACGACGAGAGGCA
CGTCATTAGTTTCAGCGTCGTCGGTGGTGATCATAGGCTCTCTAACTACCGATCCGTCAC
GACTCTTCACTCTTCTCCGGTCTCGGGGACCGTCGTTGTTGAGTCTTACGTCGTCGATGT
GCCTCCGGGGAACACGAAGGAAGAGACATGCGACTTTGTTGACGTTATAGTACGATGCAA
TCTTCAGTCTCTTGCTAAGATAGCTGAGATATTTGCGGCGGAGGGGAACAAGAAGACGTC
CATTTGATATGTGGTTACGTCGTCTGAATAGTTTCGTTGGGATCCGACGTCGTTTCTTGA
TTTTTTTAGCCGTCGTGTGATCTATGTTTTTTACCGGCTTATTGTGTGAAAAAAATGAAA
AATACATTAGTAAATTAATCTCTCATGCATCATAATCTTATATAATTATTTACTTCTTTT
GTATTTTATATCCATAAAGAACCGATTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F101TF U 1
AF RS1F101JQ C 266
BS 1 500 RS1F101TF
BS 501 929 RS1F101JQ

RD RS1F101TF 500 0 0
GGACACATCTCCTCCTCTCTTTTAACATCTTCTTCTTGAATCCTCCATCTCCTTCATCTA
ACCCTAAAGAACTTCATCAAAGATCGATCAAGATTCTATAAAACACAAGAACATGCTTGC
CGTCCACCGCCCTTCATCCGCCGTATCAGACGGAGACTCCCTCCAGATTCCAACGATGGT
TCAAAAACGTTTCCCTTCACTCTCATGCGACGCAACAGCAGCTCGTTTCCACACGCACGA
GGTCGGTCCTAACCAGTGCTGCTCCGCCGTGATACAAGAGATCTCCGCACCTATCTCCAC
CGTATGGTCCGTCGTCAGACGCTTTGACAACCCGCAAGCCTACAAACACTTCCTCAAAAG
CTGCAGCGTCATCGACGGGGACGGTGGGAACGTTGGTAGCTTACGTCAAGTCCACGTCGT
CTCTGGCCTCCCCGCTGCTAGCTCCACCGAGCGTCTTGACATACTAGACGACGAGAGGCA
CGTCATTAGTTTCAGCGTCG

QA 1 500 1 500
DS 

RD RS1F101JQ 664 0 0
GCCGTGATACAAGAGATCTCCGCACCTATCTCCACCGTATGGTCCGTCGTCAGACGCTTT
GACAACCCGCAAGCCTACAAACACTTCCTCAAAAGCTGCAGCGTCATCGACGGGGACGGT
GGGAACGTTGGTAGCTTACGTCAAGTCCACGTCGTCTCTGGCCTCCCCGCTGCTAGCTCC
ACCGAGCGTCTTGACATACTAGACGACGAGAGGCACGTCATTAGTTTCAGCGTCGTCGGT
GGTGATCATAGGCTCTCTAACTACCGATCCGTCACGACTCTTCACTCTTCTCCGGTCTCG
GGGACCGTCGTTGTTGAGTCTTACGTCGTCGATGTGCCTCCGGGGAACACGAAGGAAGAG
ACATGCGACTTTGTTGACGTTATAGTACGATGCAATCTTCAGTCTCTTGCTAAGATAGCT
GAGATATTTGCGGCGGAGGGGAACAAGAAGACGTCCATTTGATATGTGGTTACGTCGTCT
GAATAGTTTCGTTGGGATCCGACGTCGTTTCTTGATTTTTTTAGCCGTCGTGTGATCTAT
GTTTTTTACCGGCTTATTGTGTGAAAAAAATGAAAAATACATTAGTAAATTAATCTCTCA
TGCATCATAATCTTATATAATTATTTACTTCTTTTGTATTTTATATCCATAAAGAACCGA
TTCG

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

CO CL5855Contig1 1127 2 4 U
GGGAAGCAACTAGGAGAGTTAGCCATGTCCTCTGGGAAGCTGCAATTGGCAGAGGAATGC
ATGAAGTATGCGATGGATTTGAGTGGTTTGTTACTGCTTTATTCTTCTCTGGGAGATGCT
GAAGGCGTGTCAAAACTTGCAACACTTGCTAGAGAACAAGGGAAGAACAATGTCGCCTTC
CTTTGCCTGTTCATGCTGGGTAAATTGGAAGATTGTTTGGACTTATTAGTGGAGAGTAAC
CGGATACCAGAAGCTGCTCTGAAGGCAAGATCATATCTTCCAAGCAAAGTCTCTGAGATC
GTAGCTCTGTGGAGGAAAGATTTGAGCAAGATTAATTCAAAAGCAGCAGAATCTTTGGCC
GATCCTGAGGAGTACTCAAATCTTTTTGATGATTGGCAAGTTGCTCTTTCCGTCGAAGCA
AAAGCTGCAGAGACAAGGGGAGTTTACTCAGCTGCCGAAAACTATCCTAGCCATGCTGAT
AGATCATCCATGACCCTAGTGGAAGCCTTTAGAAACTTGCAAGTTGAGGAAGAGGAATCA
TTTGAAAATGGAGACATGGATCATGAGCAGGAGGTAGTAGCAGAAGAAGAAAATGGAGAT
GAAGAAAGGAATGAAGAAGAAGGAGTGGTTGTTGATGGTGACTCAACCGATGGAGCAGTG
CTTGTAAATGGAAGTGAGGCTGAAGAAGAGTGGGATACGAATAATGAAGGAAACCCATCA
GCTTAATAGCAAAAGTAGTTGCAAGGCCAATGTCTGAATATTTTGTCTTGAGTGAGCAAT
GGCCAAAGTTGAAGCAACAATGGTGATGAGGTGACTAAGATTGTTTCTGAACAACATGGC
TCAAGTATTCGAGCAGCATGGAACCACATTCCTTGAAGAGTTTGATACCCATTGTAATAA
GAAGTTTTTAAAAGAAGATTTTGAGGATTTAGATGAAAAGAGAGAGAGAGTTGCTCAAAG
GAAAAATGGTAGTAGTGTTCCTTTTGTTCGTCTCTTTTGCACTGAGAGGGAGATTCTTAG
TATTATTATTACACATGGTTTTGTTTCTTCTTACAAATTACTGTTTTTTTATCTTGCCTG
TAAAATGATTTGTTTTGTTTTTGTCGATGTTACAAAAATTTATTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1H760TF U 1
AF RS1H760JQB C 488
BS 1 712 RS1H760TF
BS 713 713 RS1H760JQB
BS 714 727 RS1H760TF
BS 728 1127 RS1H760JQB

RD RS1H760TF 727 0 0
GGGAAGCAACTAGGAGAGTTAGCCATGTCCTCTGGGAAGCTGCAATTGGCAGAGGAATGC
ATGAAGTATGCGATGGATTTGAGTGGTTTGTTACTGCTTTATTCTTCTCTGGGAGATGCT
GAAGGCGTGTCAAAACTTGCAACACTTGCTAGAGAACAAGGGAAGAACAATGTCGCCTTC
CTTTGCCTGTTCATGCTGGGTAAATTGGAAGATTGTTTGGACTTATTAGTGGAGAGTAAC
CGGATACCAGAAGCTGCTCTGAAGGCAAGATCATATCTTCCAAGCAAAGTCTCTGAGATC
GTAGCTCTGTGGAGGAAAGATTTGAGCAAGATTAATTCAAAAGCAGCAGAATCTTTGGCC
GATCCTGAGGAGTACTCAAATCTTTTTGATGATTGGCAAGTTGCTCTTTCCGTCGAAGCA
AAAGCTGCAGAGACAAGGGGAGTTTACTCAGCTGCCGAAAACTATCCTAGCCATGCTGAT
AGATCATCCATGACCCTAGTGGAAGCCTTTAGAAACTTGCAAGTTGAGGAAGAGGAATCA
TTTGAAAATGGAGACATGGATCATGAGCAGGAGGTAGTAGCAGAAGAAGAAAATGGAGAT
GAAGAAAGGAATGAAGAAGAAGGAGTGGTTGTTGATGGTGACTCAACCGATGGAGCAGTG
CTTGTAAATGGAAGTGAGGCTGAAGAAGAGTGGGATACGAATAATGAAGGAA*CCCATCA
GCTTAAT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1H760JQB 640 0 0
CCATGACCCTAGTGGAAGCCTTTAGAAACTTGCAAGTTGAGGAAGAGGAATCATTTGAAA
ATGGAGACATGGATCATGAGCAGGAGGTAGTAGCAGAAGAAGAAAATGGAGATGAAGAAA
GGAATGAAGAAGAAGGAGTGGTTGTTGATGGTGACTCAACCGATGGAGCAGTGCTTGTAA
ATGGAAGTGAGGCTGAAGAAGAGTGGGATACGAATAATGAAGGAAACCCATCAGCTTAAT
AGCAAAAGTAGTTGCAAGGCCAATGTCTGAATATTTTGTCTTGAGTGAGCAATGGCCAAA
GTTGAAGCAACAATGGTGATGAGGTGACTAAGATTGTTTCTGAACAACATGGCTCAAGTA
TTCGAGCAGCATGGAACCACATTCCTTGAAGAGTTTGATACCCATTGTAATAAGAAGTTT
TTAAAAGAAGATTTTGAGGATTTAGATGAAAAGAGAGAGAGAGTTGCTCAAAGGAAAAAT
GGTAGTAGTGTTCCTTTTGTTCGTCTCTTTTGCACTGAGAGGGAGATTCTTAGTATTATT
ATTACACATGGTTTTGTTTCTTCTTACAAATTACTGTTTTTTTATCTTGCCTGTAAAATG
ATTTGTTTTGTTTTTGTCGATGTTACAAAAATTTATTGTT

QA 1 640 1 640
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL5858Contig1 503 2 7 U
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CTTATGAGATTGGTGCTGATCGCTCTGCATCTATAGAAACTGTCATGAATCACTTGCAGG
AAACGGCTCTGAACCATGTGAAGTCAGCTGGACTGCTGGGAGATGGGTTTGGTTCTACAC
CTGAGATGGTTAAGAAGAACTTGATATGGGTCGTTACTCGTATGCAGGTCGTCGTTGATA
AATATCCTACTTGGGGAGATGTTGTTGAAGTAGATACATGGGTCAGTAAGTCTGGAAAGA
ACGGTATGCGTCGTGATTGGCTAGTTCGGGATTGCAACACTGGAGAAATCTTAACTCGAG
CATCAAGTGTGTGGGTGATGATGAATAAAGTGACGAGGAGATTATCAAAGCTTCCTGAAG
AGGTTCGAGGGGAGATAGAGCCTTACTTTGTGAACTCTGACCCTATCCTTGCTGAGGACA
GCAGGAAGTTAACAAAACTAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DS54TF U 140
AF RS1FJ36TF U 1
BS 1 229 RS1FJ36TF
BS 230 230 RS1DS54TF
BS 231 301 RS1FJ36TF
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BS 303 322 RS1FJ36TF
BS 323 323 RS1DS54TF
BS 324 503 RS1FJ36TF

RD RS1DS54TF 254 0 0
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CTTGATATGGGTCGTTACTCGTATGCAGGTCGTCGTTGATAAATATCCTACTTGGGGAGA
TGTTGTTGAAGTTGATACATGGGTCAGTAAGTCTGGAAAGAACGGTATGCGTCGTGATTG
GCTAGTTCGGGATTGCAACACTGGAGAAATCTTAACTCGAGCATCAAGTGTGTGGGTGAT
GATGAATAAAGTGA

QA 1 254 1 254
DS 

RD RS1FJ36TF 503 0 0
GTGGTCTAGGGAGAATCGTTCAGGACGGGCTTGTGTTCCGTCAGAGTTTCGATATCAGGT
CTTATGAGATTGGTGCTGATCGCTCTGCATCTATAGAAACTGTCATGAATCACTTGCAGG
AAACGGCTCTGAACCATGTGAAGTCAGCTGGACTGCTGGGAGATGGGTTTGGTTCTACAC
CTGAGATGGTTAAGAAGAACTTGATATGGGTCGTTACTCGTATGCAGGTTGTCGTTGATA
AATATCCTACTTGGGGAGATGTTGTTGAAGTAGATACATGGGTCAGTAAGTCTGGAAAGA
ATGGTATGCGTCGTGATTGGCTTGTTCGGGATTGCAACACTGGAGAAATCTTAACTCGAG
CATCAAGTGTGTGGGTGATGATGAATAAAGTGACGAGGAGATTATCAAAGCTTCCTGAAG
AGGTTCGAGGGGAGATAGAGCCTTACTTTGTGAACTCTGACCCTATCCTTGCTGAGGACA
GCAGGAAGTTAACAAAACTAGAT

QA 1 503 1 503
DS 



AS 1 2

CO CL5859Contig1 1381 2 2 U
GGTTGTTCGTAGGGCTGATTGTTGAAGGGAAACATGGATGGGAACAAAGAGATGCGTTGA
AATGCCTGAACATCGTCAAGGAAGCGATCAAATCCGGAGATCGAGAGAGAGCTCGGAAGT
TCCTCTCCAAAGCTCGTCGTCTCGATCCGGATCTCCCGATCGACGATCTCAAATCCCAGC
TCAACAACAACCAATCAGACGAACCAGGATCTCAAAAATCTCCCTCCGCCGCGGCGAAAG
ATACCCCAAGTTCATCATCTCAGCCTTCTCTACGCCAACGTGGATCGTCCTCGTCGTCTT
CTTCAATCTCCTACACAGAAGAACAGATCTCGATCGTGAGAAAGATCAAATCGAAGAAAG
ACTACTACGAGATCCTAGGCCTCGAAAACAAATGCTCGGTAGACGACGTGAGGAAAGCGT
ATCGGAAACTCTCCTTGAAAGTCCATCCCGATAAGAACCCAGCTCCCGGCTCCGAAGAAG
CTTTCAAATCCGTCTCCAAGGCGTTTCAGTGCTTGAGCAACGAAGAGTCCAGAAGAAAGT
ACGACGTCAGTGGCTCCGATGAGCCGATCTACCAACCAAGACGGTCCGCTAACGGATTCA
ACGGCGGTGGTTACTACTACGAAGACGAGTTCGATCCCAACGAGATCTTCAGAAGCTTCT
TCGGTGGAGGGTTCGGTGGAGGAGGGATGATGCCTCCCGCGAATGCTCAGTTCCGAACAT
TCAACTTCGGAGCTACACGGCATAGAGCAGCAGCTAATCATAATAACAATCAAGCTCATG
ATGCAGGTTTTAATGCTCGTGTGCTTCTCCAGCTTCTACCGGTTCTACTCATTCTCCTCC
TCAACTTCATTCCTTCTTCACAGCCTGTTTACTCGCTCTCGGCGACTTACCCTTACCATT
ACAAGTTCACTACGGAGAAGGGTGTTAATTACTATGTGAGGTCGTCCAATTTCGAGCAGG
AGTACCCACGAGACAGTCACGAGCGACAGAGTGTGGAAGAGGATGTTGAGAGAGATTACG
TCTCTATACTTGGTCAGAATTGTAGGTATGAGCTGCAGAGGAAGCAATGGGGTTTCGTTC
GTGAAACGCCTCACTGTGACATGATGAGGAAGTTCGAGACACCTTCTGCTTAAGAAAACC
ACTCAAGGTACTTATAAGCATCTCCATGTCGATGCCTAAGAGTCACAAAACAGATATATG
TTTTTTTTTTTTTGCTTTTGGACTATGTTGCAGAACATAACATACGAATTCTTGGATCTT
GTGTGATTATGTCTGAATTAAGATTTTGCTTTTGTTATAAAATACTTGTTAGGAAGGAAA
AACATATCTCGTTTTTAAGGTTTTGACAAGTGCAAAGAGATTATTAGAGTTTCTCAAATT
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1B231TF U 1
AF RS1B231JQ C 526
BS 1 663 RS1B231TF
BS 664 1381 RS1B231JQ

RD RS1B231TF 667 0 0
GGTTGTTCGTAGGGCTGATTGTTGAAGGGAAACATGGATGGGAACAAAGAGATGCGTTGA
AATGCCTGAACATCGTCAAGGAAGCGATCAAATCCGGAGATCGAGAGAGAGCTCGGAAGT
TCCTCTCCAAAGCTCGTCGTCTCGATCCGGATCTCCCGATCGACGATCTCAAATCCCAGC
TCAACAACAACCAATCAGACGAACCAGGATCTCAAAAATCTCCCTCCGCCGCGGCGAAAG
ATACCCCAAGTTCATCATCTCAGCCTTCTCTACGCCAACGTGGATCGTCCTCGTCGTCTT
CTTCAATCTCCTACACAGAAGAACAGATCTCGATCGTGAGAAAGATCAAATCGAAGAAAG
ACTACTACGAGATCCTAGGCCTCGAAAACAAATGCTCGGTAGACGACGTGAGGAAAGCGT
ATCGGAAACTCTCCTTGAAAGTCCATCCCGATAAGAACCCAGCTCCCGGCTCCGAAGAAG
CTTTCAAATCCGTCTCCAAGGCGTTTCAGTGCTTGAGCAACGAAGAGTCCAGAAGAAAGT
ACGACGTCAGTGGCTCCGATGAGCCGATCTACCAACCAAGACGGTCCGCTAACGGATTCA
ACGGCGGTGGTTACTACTACGAAGACGAGTTCGATCCCAACGAGATCTTCAGAAGCTTCT
TCG
TGGA

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DS 

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ACATTCAACTTCGGAGCTACACGGCATAGAGCAGCAGCTAATCATAATAACAATCAAGCT
CATGATGCAGGTTTTAATGCTCGTGTGCTTCTCCAGCTTCTACCGGTTCTACTCATTCTC
CTCCTCAACTTCATTCCTTCTTCACAGCCTGTTTACTCGCTCTCGGCGACTTACCCTTAC
CATTACAAGTTCACTACGGAGAAGGGTGTTAATTACTATGTGAGGTCGTCCAATTTCGAG
CAGGAGTACCCACGAGACAGTCACGAGCGACAGAGTGTGGAAGAGGATGTTGAGAGAGAT
TACGTCTCTATACTTGGTCAGAATTGTAGGTATGAGCTGCAGAGGAAGCAATGGGGTTTC
GTTCGTGAAACGCCTCACTGTGACATGATGAGGAAGTTCGAGACACCTTCTGCTTAAGAA
AACCACTCAAGGTACTTATAAGCATCTCCATGTCGATGCCTAAGAGTCACAAAACAGATA
TATGTTTTTTTTTTTTTGCTTTTGGACTATGTTGCAGAACATAACATACGAATTCTTGGA
TCTTGTGTGATTATGTCTGAATTAAGATTTTGCTTTTGTTATAAAATACTTGTTAGGAAG
GAAAAACATATCTCGTTTTTAAGGTTTTGACAAGTGCAAAGAGATTATTAGAGTTTCTCA
AATTC

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DS 



AS 1 2

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TCTACTCGTAAAGCCAATGCCAAAACCCGCCTCCGTCGCGTTTGGCAGAATGAGGCTGTT
CTAAAGGCGTGCGGGACATCAGATGCATCAGTTTCTCCGGGAGTTAGCAGCAACGCGGAA
ATCTGTGCCAGTGATGCGAAAAATTGAGTGAGGAGGAGGAGGACGAGAAGCTACAAAACA
TGGTTGTTACTGTAGTGATATTTGAACTTTGTGGTGTTACTTGTTAGGTTATATTGGTTT
TAAACATGTTGAATCTGCAGCAAGAAGAGACTTTTGTGTTGTTATTGTGATCAAGAAAAC
AATTGGTCAGCTACTC


BQ
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DS 

RD RS1G336TF 436 0 0
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ATGGAAATAGTGAAGAAGCACGATTCAGGTGGTCTCATTTGGAAGCGAATCAAGCTTACC
TCTACTCGTAAAGCCAATGCCAAAACCCGCCTCCGTCGCGTTTGGCAGAATGAGGCTGTT
CTAAAGGCGTGCGGGACATCAGATGCATCAGTTTCTCCGGGAGTTAGCAGCAACGCGGAA
ATCTGTGCCAGTGATGCGAAAAATTGAGTGAGGAGGAGGAGGACGAGAAGCTACAAAACA
TGGTTGTTACTGTAGTGATATTTGAACTTTGTGGTGTTACTTGTTAGGTTATATTGGTTT
TAAACATGTTGAATCTGCAGCAAGAAGAGACTTTTGTGTTGTTATTGTGATCAAGAAAAC
AATTGGTCAGCTACTC

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DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGTATTCGGGGACAGTCATGGTTCCTTTGGGTTGGATTGGTGGTGTCGTTGGTCTCATTC
TTGCTACCGCAATCTCTCTTTACGCAAACTCTCTTATAGCCAAGCTTCATGAGTTTGGTG
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TTACTGGACCTCTTTGGGTTAAAGCTCTGGCTAACATTTCAGCCTTTCTCCAATCTGTTA
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AF20TF U 1
AF RS1AF20JQ C 596
BS 1 815 RS1AF20TF
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RD RS1AF20TF 838 0 0
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ATTCATGGTTTCAGGTAGCATTTGTACTAACAACCGGTATAAACAGCGCCTATGTGTTGG
GGTATTCGGGGACAGTCATGGTTCCTTTGGGTTGGATTGGTGGTGTCGTTGGTCTCATTC
TTGCTACCGCAATCTCTCTTTACGCAAACTCTCTTATAGCCAAGCTTCATGAGTTTGGTG
GCAAACGACACATTCGTTATAGAGATCTCGCGGGCTTCATCTACGGTAAAAAGATGTATC
GTGTCACATGGGGATTGCAATATGTCAATCTTTTCATGATTAATTGTGGCTACATCATAC
TTGCCGGTTCCGCTTTAAAGGCTGTTTATGTACTTTTTAGAGATGACAGTGTAATGAAAC
TGCCTCACTGTATTGCCATTGCGGGTGTTGTATGTGCGCTTTTCGCAATCGGGATTCCTC
ATTTATCAGCTCTTGGAATCTGGCTAGGAGTTTCAACAATCCTCAGCTTGATCTACATTG
TTGTTGCTATAGTTCTATCAGTTAAAGATGGAGTAAACAAACCTTCAAGAGATTACAACA
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TTGCATTCAACACGGGAATGCTCCCTGAAATACAG*CCACAGTGAAGCAATCG
TGGTC

QA 1 833 1 833
DS 

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CATTGTTGTTGCTATAGTTCTATCAGTTAAAGATGGAGTAAACAAACCTTCAAGAGATTA
CAACATACAAGGATCATCAATAGACAAAATCTTTACAATAACAGGAGCAGCAGCAAATCT
AGTTTTTGCATTCAACACGGGAATGCTCCCTGAAATACAGGCCACAGTGAAGCAATCGGT
GGTCAAAAACATGATGAAGGCTCTGTATTTTCAATTCACTGCTGGTGTATTGCCTATGTA
TGCCGTTACATTCATTGGTTATTGGGCCTACGGGTCCTCGACATCGACTTATCTTTTAAA
CAGCGTTACTGGACCTCTTTGGGTTAAAGCTCTGGCTAACATTTCAGCCTTTCTCCAATC
TGTTATCGCTTTACACATTTTTGCAAGTCCGACATATGAGTTTATGGATACAAAATATGG
AATCAAAGGAAGTCCATTAGCTTTGAAGAATCTGTTGTTTAGAACAGTAGCACGAGGAAG
CTACATCGCGGTGAGCACTCTTCTCTCAGCGCTTTTGCCGTTTCTTGGAGATTTCATGAG
CCTCACGGGAGCTATGAGTACTTTCCCTCTCACCTTCATATTAGCAAACCACATGTATGC
TGTAGCGATGAACGATAAGCTTAGCCCTACTCAGAAGCTGTGGCATTGGCTTAACGTTTG
CTTCTTTGGGCTAATGTCTCTTGCTGCTGCTATTGCTGCTGTTAGACTCATTGCTGTTGA
CTCCAAGAACTTCCATGTTTTTGCTGATGTCTGAATTTCTTCTTTTTGTTTGTTTATGTT
GTAATTTATATATAGGTGTGATCCTTTTATTGTTACTTGTGCTTCTC

QA 1 887 1 887
DS 



AS 1 2

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ATGGCTAGAGTACTAAAATCATGCCACTTCCCTTCACCTCCAAGCTCCTCCCTAGGCAAT
GATGGTAGTAGTAGTAACAGAGACCCACATTCTCTTTTTAACATTACCCTCGAGGAAGAC
GAGAGAGAAAGATCCGAGCTTTCCTCTTCTTTGGAGATTCTCGTCTCTGCTTTCAGAAGA
TCTGTGATTGGTGGCTGCGTTGGCGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGAGTCTTCTTTCTTCC
ATGGAGATTGGTGTCCCTACCGACGTTAGACACGTGGCTCATGTCACCTTTGATCGTTTC
CACGGCTTCCTCGGCTTGCCTGTTGAGTTCGAACCTGAAGTCCCTAGACGTGCTCCTAGT
GCAAGTGCAACGGTGTTTGGTGTGTCGACAGAGTCAATGCAGCTGTCTTACGATACTAGA
GGGAACGTTGTGCCTACCATACTCTTGATGATGCAGAGTCACTTGTACAGTAGAGGCGGG
TTAAGGGTAGAAGGAATCTTCAGGATTAATGGTGAGAATGCTCAAGAGGAGTACGTAAGA
GAAGAGTTGAACAGAGGTGTTATACCTGATAACATTGATGTACATTGTTTGGCAAGTCTC
ATTAAGCTTGGTTTAGGGAGCTTCCAAGTGGTGTGTTGGATACACTCTCACCAGAGAAAG
TGATGGAGTCTGAAAGCGAAGATGAGTGTGTGGAGCTTGTGAGGATGCTTCCTTCAACGG
AAGCGTCTTTGTTAGATTGGTCAATCAATCTGATGGCTGATGTTGTGGAGATGGAATGTC
TTAACAAGATGAATGCTCGGAACATAGCTATGGTTTTCGTACCTAACATGACTCAGATGT
TGGATCCACTGACTGCTTTGATGTATGCTGTGCAAGTCATGCACTTTCTCAAGACCCTTA
TTGTAAAGACGCTTAAAGAACGGAAAGAGTCTCGAGATAGGTTGGTTCAAGCCTCGAACC
CGGGTCCTAGTGACGAGAATGGTGATCAGAGTAGCAGCCAGTTGTTGCATTTCATGGAAG
CTAACAAGGAGGAAGCTGTAGATACCGTTGAGGTTGAAATGAAAGACAAGGAAGATGAAG
AATGCTAGTAGTATTGTTGGACGTGTGAACTACAGAGTTGAGCTGTTTGAAGCTTGGCGG
TGAAAAAGAAAAGATTGCATTCATTCATGTTTTTGATCCAACTTTGGGATTTTCTTGATT
TTGGTTTTGTGGGAGGGTTGCTTGTGTATCAAGAAATGCTGCATGTCTGCATATAATGTC
AAAGATCATTTTTTTTGTTGCT


BQ
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AF RS1FN95TF U 1
AF RS1FN95JQ C 701
BS 1 773 RS1FN95TF
BS 774 1342 RS1FN95JQ

RD RS1FN95TF 773 0 0
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ATGGCTAGAGTACTAAAATCATGCCACTTCCCTTCACCTCCAAGCTCCTCCCTAGGCAAT
GATGGTAGTAGTAGTAACAGAGACCCACATTCTCTTTTTAACATTACCCTCGAGGAAGAC
GAGAGAGAAAGATCCGAGCTTTCCTCTTCTTTGGAGATTCTCGTCTCTGCTTTCAGAAGA
TCTGTGATTGGTGGCTGCGTTGGCGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGAGTCTTCTTTCTTCC
ATGGAGATTGGTGTCCCTACCGACGTTAGACACGTGGCTCATGTCACCTTTGATCGTTTC
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GAAGAGTTGAACAGAGGTGTTATACCTGATAACATTGATGTACATTGTTTGGCAAGTCTC
ATTAAGCTTGGTTTAGGGAGCTTCCAAGTGGTGTGTTGGATACACTCTCACCAGAGAAAG
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QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1FN95JQ 642 0 0
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ACCTAACATGACTCAGATGTTGGATCCACTGACTGCTTTGATGTATGCTGTGCAAGTCAT
GCACTTTCTCAAGACCCTTATTGTAAAGACGCTTAAAGAACGGAAAGAGTCTCGAGATAG
GTTGGTTCAAGCCTCGAACCCGGGTCCTAGTGACGAGAATGGTGATCAGAGTAGCAGCCA
GTTGTTGCATTTCATGGAAGCTAACAAGGAGGAAGCTGTAGATACCGTTGAGGTTGAAAT
GAAAGACAAGGAAGATGAAGAATGCTAGTAGTATTGTTGGACGTGTGAACTACAGAGTTG
AGCTGTTTGAAGCTTGGCGGTGAAAAAGAAAAGATTGCATTCATTCATGTTTTTGATCCA
ACTTTGGGATTTTCTTGATTTTGGTTTTGTGGGAGGGTTGCTTGTGTATCAAGAAATGCT
GCATGTCTGCATATAATGTCAAAGATCATTTTTTTTGTTGCT

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 2

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AAGAGGAGGAGGAGGAGGAGAGGAGCCAAACAACCGTCGGCGGCAGCGACTTGAAATCTC
CGGTGGTTTCGTTCGCTGGCCGCGAGAACAACAGACGAGGATTGAAGACGAGCAGTCATG
TCCATAATGCTCCTTCTGACGACGACAACAACATGTATTCTAAAGATTCTAAACCCAAAA
GGATCTACCAACTCTGGCCTGGCAACAATAAATTTTACTGCGGAGGGAGACTAGTGTTTG
GTCCAGATGCATCTTCACTTCTTCTGACCACAGCTATGATTGGAGCTCCAGCGATCACTT
TCTCCATTCGTATGGCTTTCATGATCGGAAAGCGCTATCCTTTCTTCCACTCCCTTGTCT
TGATGGGTTCCCTTTTGCTCACTGTCTTGGATTTCACATTTCTGTTCTTAACATCGTCGA
GAGACCCTGGTATCATCCCAAGGAACAAAGACACACCTGAAGGAGAAGGCCTTGATAAGT
TCACTCACTCCTCAGAGTGGGTAAACAACAAACTCGGTAACACAAAGTTACCTCGAACCA
AGGACATATTAGTGAATGGCTACACTGTCAAAGTTAAGTTCTGTGATACTTGTTTGCTCT
ACCGTCCTCCTCGCGCCTCTCACTGCTCCATCTGCAATAACTGTGTCCAAAGATTTGATC
ATCACTGTCCATGGGTTGGCCAATGCATCGCTTTAAGAAACTATCCTTTCTTCATATGTT
TCATATCAACTTCAACACTCCTCTGCTTGTACGTCTTTGTATTCTCATGGGTCAGCATAC
TTGAGGCAAACGGCAAGATGCTGTTAATGGTCATAACGGATGATGCAATATTTATTGTTC
TCATCGTCTACTGCTTTGTCGTTGTCTGGTTTGTTGGTGGACTCACTGTTTTTCATCTCT
ATCTCATCTGCACCAATCAGACAACTTATGAGAATTTCCGGTACAGATATGACAAGAAAG
AGAACCCTTATGGAAAAGGTCTGTTCAAGAACCTATATGAGTTGTTCTTTGCTAGGATCC
CACCTCCAGTGATCAACTTCAGAGACTGGGCCCCAGAGGAAGCTGATGTGGAGGTTGGTT
CCATTGCATCTGAGCTAGACAGAGCTTTTGGACCAAGGGGAGGAGGAGATAAACATGATA
TGGATATGGACATTGGAGGAGACTGGAAAACTAACAAAGGCGGTTTGCTTCTCCAGACAC
TCGAGTATGACATCAACAACAAGAACAACAACAAAGTTGAAGAAACTGTTAAGAAGAAAG
GTTTAAGTGATGGAACCGTAGAGACCACCACCACCACCACAATGTTTGATGTGAGATCGA
GATAAAAGACAGAGAGATCTGTTGTGGAATCTTTGACGCCTGTAAAAAATTTAAATCCTT
GATTACTTTGTGTAAACTTACTTTCTTACTCCTAAAGCCATACAACTCTTGTCTC


BQ
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AF RS1BM08TF U 1
AF RS1BM08JQ C 636
BS 1 766 RS1BM08TF
BS 767 1435 RS1BM08JQ

RD RS1BM08TF 766 0 0
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CGGTGGTTTCGTTCGCTGGCCGCGAGAACAACAGACGAGGATTGAAGACGAGCAGTCATG
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GTCCAGATGCATCTTCACTTCTTCTGACCACAGCTATGATTGGAGCTCCAGCGATCACTT
TCTCCATTCGTATGGCTTTCATGATCGGAAAGCGCTATCCTTTCTTCCACTCCCTTGTCT
TGATGGGTTCCCTTTTGCTCACTGTCTTGGATTTCACATTTCTGTTCTTAACATCGTCGA
GAGACCCTGGTATCATCCCAAGGAACAAAGACACACCTGAAGGAGAAGGCCTTGATAAGT
TCACTCACTCCTCAGAGTGGGTAAACAACAAACTCGGTAACACAAAGTTACCTCGAACCA
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ACCGTCCTCCTCGCGCCTCTCACTGCTCCATCTGCAATAACTGTGTCCAAAGATTTGATC
ATCACTGTCCATGGGTTGGCCAATGCATCGCTTTAAGAAACTATCCTTTCTTCATATGTT
TCATATCAACTTCAACACTCCTCTGCTTGTACGTCTTTGTATTCTC

QA 1 766 1 766
DS 

RD RS1BM08JQ 800 0 0
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ACGGATGATGCAATATTTATTGTTCTCATCGTCTACTGCTTTGTCGTTGTCTGGTTTGTT
GGTGGACTCACTGTTTTTCATCTCTATCTCATCTGCACCAATCAGACAACTTATGAGAAT
TTCCGGTACAGATATGACAAGAAAGAGAACCCTTATGGAAAAGGTCTGTTCAAGAACCTA
TATGAGTTGTTCTTTGCTAGGATCCCACCTCCAGTGATCAACTTCAGAGACTGGGCCCCA
GAGGAAGCTGATGTGGAGGTTGGTTCCATTGCATCTGAGCTAGACAGAGCTTTTGGACCA
AGGGGAGGAGGAGATAAACATGATATGGATATGGACATTGGAGGAGACTGGAAAACTAAC
AAAGGCGGTTTGCTTCTCCAGACACTCGAGTATGACATCAACAACAAGAACAACAACAAA
GTTGAAGAAACTGTTAAGAAGAAAGGTTTAAGTGATGGAACCGTAGAGACCACCACCACC
ACCACAATGTTTGATGTGAGATCGAGATAAAAGACAGAGAGATCTGTTGTGGAATCTTTG
ACGCCTGTAAAAAATTTAAATCCTTGATTACTTTGTGTAAACTTACTTTCTTACTCCTAA
AGCCATACAACTCTTGTCTC

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 2

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GGTGAAGAAGACTGCTGGGATGTTGTCGTAGAAAAAGAAGCTTTTGAAGGAGGAAATGAT
GAATGATTCCGACAAAAAAAGCTTTGCTTCTTCGGGCTTCTGCTACAAATCTTGAGCAAA
TAGTGCTATGTCGCTTTTATCTTCTTTGGCTTGACAGTGAGTTTTAAGTCGCCATGTTTT
TCCGTTATGATTTCTTAAATTGTAACAGTAGAAGAAAAGAAAAGAACAAATAGTATAAGT
ACAATCCACAAATTCT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1H094JQB C 1
AF RS1H094TF U 1
BS 1 436 RS1H094TF

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GAATGATTCCGACAAAAAAAGCTTTGCTTCTTCGGGCTTCTGCTACAAATCTTGAGCAAA
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ACAATCCACAAATTCT

QA 1 436 1 436
DS 

RD RS1H094TF 436 0 0
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GATGAGCTAAACGGAGAGTACTATTACGAAGAAGATGGAGAATACGCCTATGAAGAAGGC
GAAGAAGTTGCTTACGCGGCTGAGGAAGGAGAAGAAGCAACAGAAGGAGTTGAAGCGGAG
GGTGAAGAAGACTGCTGGGATGTTGTCGTAGAAAAAGAAGCTTTTGAAGGAGGAAATGAT
GAATGATTCCGACAAAAAAAGCTTTGCTTCTTCGGGCTTCTGCTACAAATCTTGAGCAAA
TAGTGCTATGTCGCTTTTATCTTCTTTGGCTTGACAGTGAGTTTTAAGTCGCCATGTTTT
TCCGTTATGATTTCTTAAATTGTAACAGTAGAAGAAAAGAAAAGAACAAATAGTATAAGT
ACAATCCACAAATTCT

QA 1 436 1 436
DS 



AS 1 2

CO CL5866Contig1 330 2 1 U
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ACCTTCTTCAAGCCCTTACGATGAGTTCTTGAAAGCAGCCGGATGTTAAGACGGTACATT
CTTTGAAATCTTGCATGTAACTTTATATATATAGACACACGGCATGATGTATACATATAT
ATATTATTACGTGTAATCTTGTGCTTCACC


BQ
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AF RS1GE04JQ C 1
AF RS1GE04TF U 1
BS 1 330 RS1GE04TF

RD RS1GE04JQ 330 0 0
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CTTTGAAATCTTGCATGTAACTTTATATATATAGACACACGGCATGATGTATACATATAT
ATATTATTACGTGTAATCTTGTGCTTCACC

QA 1 330 1 330
DS 

RD RS1GE04TF 330 0 0
GGAGGCAACCAAAGCTATAACTCTCTCAGAAGAGGATGAACTCTTTCTTCTCGATGATGA
GACAGAAGAAGAAGCTGATGAAGATGATCAGAAGGTACTGAATGTGGTACAAGTCCAACA
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ACCTTCTTCAAGCCCTTACGATGAGTTCTTGAAAGCAGCCGGATGTTAAGACGGTACATT
CTTTGAAATCTTGCATGTAACTTTATATATATAGACACACGGCATGATGTATACATATAT
ATATTATTACGTGTAATCTTGTGCTTCACC

QA 1 330 1 330
DS 



AS 1 2

CO CL5867Contig1 454 2 1 U
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BQ
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QA 1 454 1 454
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1C864TF U 1
AF RS1C864JQ C 145
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TTTT
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TTCC

QA 5 548 5 548
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1BX11TF U 1
AF RS1BX11JQ C 73
BS 1 283 RS1BX11TF
BS 284 800 RS1BX11JQ

RD RS1BX11TF 283 0 0
GGATACCAAGCTTCTACTCAAGATCCATCTTAAAGTTTAAAACCTTTTGTTTCATACTTC
AGATCGTCCTCTTTCACTCGAACACTTGAGTCTTTGGAAATGGCAACGGCGTCATTTAAC
ATGCAGTCAGTCTTCGCCGGTGGATTGACCCTTCGCAAGATCAACACAAACAACCTTTTC
TTCGCCGGAAACTTCCCTAATCTCAAGAGGAAGTTTCCTGTGGGAGTGAGATGCATGGCT
GAGGGAGAAGCAATGAAGGATGAGTCTGCCCCGTCGACCTCAG

QA 1 283 1 283
DS 

RD RS1BX11JQ 728 0 0
TTCACTCGAACACTTGAGTCTTTGGAAATGGCAACGGCGTCATTTAACATGCAGTCAGTC
TTCGCCGGTGGATTGACCCTTCGCAAGATCAACACAAACAACCTTTTCTTCGCCGGAAAC
TTCCCTAATCTCAAGAGGAAGTTTCCTGTGGGAGTGAGATGCATGGCTGAGGGAGAAGCA
ATGAAGGATGAGTCTGCCCCGTCGACCTCAGCGGCTCAGCCTTTGCCTAAGTCATCGCCC
CCACCACCACCACCTCCTCCTACTAAGCCTAAGGTGAGCACCAAGTTTAGCGACTTGCTA
GCGTTTAGCGGTCCAGCACCAGAGAGAATAAATGGCCGTTTAGCGATGGTTGGATTCGTG
GCTGCGTTGGCAGTTGAACTTTCCAAAGGAGAAAATGTTTTCGCCCAGATCTCCGACGGT
GGAGTCTCGTGGTTCCTTGGCACGACGGCTATCTTGACACTTGCGTCGCTTGTGCCACTT
TTCCAAGGCGTCACCGTTGAGTCGAAGTCCAAAGGTTTCATGACATCAAACGCTGAGCTT
TGGAATGGGCGATTTGCAATGCTTGGTTTAGTAGCTTTGGCGTTCACTGAGTTCGTCAAG
GGTGGAACCCTCATCTGAGGACATATAATTTTGGTTTGCCCCTGAATTCTGTAAAGTAAA
ATCTGGCTTGCTCTTTATGTCCAGTTATGTACTAGTGAGTTTGGGTTATATGAAAAACTT
TTGGTTAC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL5870Contig1 743 2 2 U
GTCAGATTGTTGTCTTGAAGCACAAAGTGTGGCGTGTCAAAGGTCTCAAGATCTATTGGT
GATGCCTACTTAAAGAGATCAGAGTTCAACCGGGAGCCATTATTAGCAAAGTTCAGGGTG
CCTGAGGTTTTTCAAACGCCTATCCTTAAAGCAGAGCCTGCGATCACAGTACACAAAATC
CATCCAGAGGATCAGTTTCTTATATTTGCATCCGACGGCTTGTGGGAGCACATGAACAAT
CAGGAAGCTGTTGACATTGTGAACACTAACCCTCGAAATGGGGTTGCTAGGAAGCTTATA
AAAACAGCTCTAAGAGAGGCAGCAAAGAAGAGAGAGATGAGATATTCAGACCTGAAAAAG
ATTGATAGAGGAGTGAGGAGACATTTTCATGATGACATAACTGTCATTGTTGTGTTTCTT
GATTCGCATCTCGTCAGTAAAAGTGTCTCACGCCGACCTCTCATCTCCATCTCAGGCGGT
GGTGACTTGGCAGGTGGACCTTCTACCACTTGACACACTCTCACCACAATCTATATCTAT
AAATTCTATATATTCATATCAACTATATATAAAACACATTGCAGAGAAAACACTTCAAGC
TCCTTTTTTTTCCTTTATATATAACAAAATTTCATTTTTAATTCTTTCCAAACAAAATGA
TGAGTTGAAGCACCAATGTATAGGTCTCTTGGCAAACTGAGTTTATAAATGATTTATGAT
AAAGAGATATTATCATTTGTTGG


BQ
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AF RS1GH57TF U 1
AF RS1GH57JQ C 129
BS 1 582 RS1GH57TF
BS 583 743 RS1GH57JQ

RD RS1GH57TF 582 0 0
GTCAGATTGTTGTCTTGAAGCACAAAGTGTGGCGTGTCAAAGGTCTCAAGATCTATTGGT
GATGCCTACTTAAAGAGATCAGAGTTCAACCGGGAGCCATTATTAGCAAAGTTCAGGGTG
CCTGAGGTTTTTCAAACGCCTATCCTTAAAGCAGAGCCTGCGATCACAGTACACAAAATC
CATCCAGAGGATCAGTTTCTTATATTTGCATCCGACGGCTTGTGGGAGCACATGAACAAT
CAGGAAGCTGTTGACATTGTGAACACTAACCCTCGAAATGGGGTTGCTAGGAAGCTTATA
AAAACAGCTCTAAGAGAGGCAGCAAAGAAGAGAGAGATGAGATATTCAGACCTGAAAAAG
ATTGATAGAGGAGTGAGGAGACATTTTCATGATGACATAACTGTCATTGTTGTGTTTCTT
GATTCGCATCTCGTCAGTAAAAGTGTCTCACGCCGACCTCTCATCTCCATCTCAGGCGGT
GGTGACTTGGCAGGTGGACCTTCTACCACTTGACACACTCTCACCACAATCTATATCTAT
AAATTCTATATATTCATATCAACTATATATAAAACACATTGC

QA 1 582 1 582
DS 

RD RS1GH57JQ 615 0 0
TTTTCAAACGCCTATCCTTAAAGCAGAGCCTGCGATCACAGTACACAAAATCCATCCAGA
GGATCAGTTTCTTATATTTGCATCCGACGGCTTGTGGGAGCACATGAACAATCAGGAAGC
TGTTGACATTGTGAACACTAACCCTCGAAATGGGGTTGCTAGGAAGCTTATAAAAACAGC
TCTAAGAGAGGCAGCAAAGAAGAGAGAGATGAGATATTCAGACCTGAAAAAGATTGATAG
AGGAGTGAGGAGACATTTTCATGATGACATAACTGTCATTGTTGTGTTTCTTGATTCGCA
TCTCGTCAGTAAAAGTGTCTCACGCCGACCTCTCATCTCCATCTCAGGCGGTGGTGACTT
GGCAGGTGGACCTTCTACCACTTGACACACTCTCACCACAATCTATATCTATAAATTCTA
TATATTCATATCAACTATATATAAAACACATTGCAGAGAAAACACTTCAAGCTCCTTTTT
TTTCCTTTATATATAACAAAATTTCATTTTTAATTCTTTCCAAACAAAATGATGAGTTGA
AGCACCAATGTATAGGTCTCTTGGCAAACTGAGTTTATAAATGATTTATGATAAAGAGAT
ATTATCATTTGTTGG

QA 1 615 1 615
DS 



AS 1 2

CO CL5871Contig1 1679 2 2 U
GTGATCGTCGAGTTTATTCTGGATGTGAAAAAGAGAGTAATAAAGTAGAGTGATTAGACC
AAAAGAGTAGAGGTGAAGCATACTTTCCAAAAGCAGATTAATCATTAAAGGAGTTTGAAT
TTACGAGCGACAAGCAGTAGCAGCAGATTTCACTTTGGGATGACCAATGAATGCTTCCGT
GTGTATGACCTGGAGGTAAAAAAAAAACAAAAGAGATGGCAAATCAATTAGCATAAGGTA
GTAGTATCTTTTGTTAAGCTCCCGTACCATAGAAAGTGTCAAGAAAAAAGAAAGAGCTGC
GAGATGAGATTTTTTTTCTACAAATAGTACCTGCCTATGCATATTGTTGAGTTCTACAAC
ATCATGATCGATAATACCCAATCGACCTAGAAGGATACAATTAAAAGATAATAAGGGAAA
CGCAATAGTTTCTCGAGAAAGAAAGAAAGAAAAAAGGAATATAGATTTGAGGTTAGAGTC
TAAAGAACATACCAACACCACAAGCTGCGAGATACAATAAAGCAGGTGAACCAAGCCCTC
CAGCACCGATGACTAGTACTGAAGACTTCAATAGATTTGACTGCCCTAAACTCATACAAA
CCCACAGAACAGAAACAAATATTAGTATGAGAAACAAGCAAACTAGGTATTGACCAAATG
CATTTGAGTGTTTAAGAGCAAAGTAGTACCTTCAACACCAAAGGAAGGGAGTAACAGTTG
GCGACTGTAACGGTAAATCTGATCAGGAGACATCCCATGTTCAAGCCCGTGTTCATCACA
GAGCAGCCGTTAGACACGCGTCGCACCGTCAACCGCCGCCGTCGTCTCATGGAGCTTTGC
TTCGAGAGCAGAGATACGTTGCTCGATTTCCGCTTTCTGTAGCTTTAGCTCTTTCAGTTC
ACGGACGATTTCCCCACCGTTCGCCTCCATCCCACCAATGTTAAACAGAGGAACCCTAGA
GTAAGCAGTAAAAGAGGACGACGTTAGTCAACGTGATAATACGTTGACTGTTTTTTTATT
GATGTTTTGAATCCGTGTCCACGTGTCACATAACGGCGCGTTTTGTTTCTTTTTTGTAAC
GTTATTGGTACAGCTTTTCGTTAACTATAACAATTTTTTTTTTTTGTGTTGTTCAAAAAA
AAAAATTTGCTAAAATTTAGTGCAATTAATTATAACAAGTGTTGTAGCAAAATACAAGAA
TGGCCTTCTCAAATTTGTAATTGCAGGTGCAGATTCTTGTTTATGTTGCGTGTACTTTGC
TTCATCTTCACTTGTCTATCTTCCTCACGTCAACTTGGGATATGGTCAATGTACCAAACC
ACGACTCCCATCACATGTCTGGACGTTCTTGTATGTGGTCCGCGCTCTGACATGAAGGCA
TTGATGACCAATGCTGCAAATAATATCCAAAGCCGAAACCATGGTCACTTTTTCATGACT
TATTAAGATCATGTGTGGGTCGATCTCGAAGCCCATCAAAATTTAAACTACGACCCATCA
TTATAACACGTAAGACACCACACGTGGCATCATAACCATAACCCCGTTGATGAGACACCC
ATCAGCCATCATACATAAACTTTCTAATAGGAGAGAACCCAACTCATAAAGTGATCAGAT
AAACTCCATCTATGGTTTGATCTGATCTTACTTGCAGTTTTAAAGCGAGAGACCTCCCC


BQ
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AF RS1AB58TF U 1
AF RS1AB58JQ C 821
BS 1 886 RS1AB58TF
BS 887 1679 RS1AB58JQ

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AAAAGAGTAGAGGTGAAGCATACTTTCCAAAAGCAGATTAATCATTAAAGGAGTTTGAAT
TTACGAGCGACAAGCAGTAGCAGCAGATTTCACTTTGGGATGACCAATGAATGCTTCCGT
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GTAGTATCTTTTGTTAAGCTCCCGTACCATAGAAAGTGTCAAGAAAAAAGAAAGAGCTGC
GAGATGAGATTTTTTTTCTACAAATAGTACCTGCCTATGCATATTGTTGAGTTCTACAAC
ATCATGATCGATAATACCCAATCGACCTAGAAGGATACAATTAAAAGATAATAAGGGAAA
CGCAATAGTTTCTCGAGAAAGAAAGAAAGAAAAAAGGAATATAGATTTGAGGTTAGAGTC
TAAAGAACATACCAACACCACAAGCTGCGAGATACAATAAAGCAGGTGAACCAAGCCCTC
CAGCACCGATGACTAGTACTGAAGACTTCAATAGATTTGACTGCCCTAAACTCATACAAA
CCCACAGAACAGAAACAAATATTAGTATGAGAAACAAGCAAACTAGGTATTGACCAAATG
CATTTGAGTGTTTAAGAGCAAAGTAGTACCTTCAACACCAAAGGAAGGGAGTAACAGTTG
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TTCGAGAGCAGAGATACGTTGCTCGATTTCCGCTTTCTGTAGCTTT

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ACGTTGACTGTTTTTTTATTGATGTTTTGAATCCGTGTCCACGTGTCACATAACGGCGCG
TTTTGTTTCTTTTTTGTAACGTTATTGGTACAGCTTTTCGTTAACTATAACAATTTTTTT
TTTTTGTGTTGTTCAAAAAAAAAAATTTGCTAAAATTTAGTGCAATTAATTATAACAAGT
GTTGTAGCAAAATACAAGAATGGCCTTCTCAAATTTGTAATTGCAGGTGCAGATTCTTGT
TTATGTTGCGTGTACTTTGCTTCATCTTCACTTGTCTATCTTCCTCACGTCAACTTGGGA
TATGGTCAATGTACCAAACCACGACTCCCATCACATGTCTGGACGTTCTTGTATGTGGTC
CGCGCTCTGACATGAAGGCATTGATGACCAATGCTGCAAATAATATCCAAAGCCGAAACC
ATGGTCACTTTTTCATGACTTATTAAGATCATGTGTGGGTCGATCTCGAAGCCCATCAAA
ATTTAAACTACGACCCATCATTATAACACGTAAGACACCACACGTGGCATCATAACCATA
ACCCCGTTGATGAGACACCCATCAGCCATCATACATAAACTTTCTAATAGGAGAGAACCC
AACTCATAAAGTGATCAGATAAACTCCATCTATGGTTTGATCTGATCTTACTTGCAGTTT
TAAAGCGAGAGACCTCCCC

QA 1 859 1 859
DS 



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ATTGTCACGACCATGTTTGTTGGGAATTTCGTTGGCGTTGTTTGTGCTCGTTCTCTGCAT
TACCAATTCTATTCATGGTACTTTTATTCGCTACCATATCTGCTATGGAGAACTTCGTTT
CCTACTTGGCTGCGCTTGATATTGTTCCTGGGCATCGAGCTTTGCTGGAACGTCTATCCA
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TGGTTTGCTCCTTCAGATTATCCTTACTTACTCAAACAAGATCAAAGACACAAAAAGCAC
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TATGGTGGTTTATATTAAAAAAATTTCTGTTTCTGTCC


BQ
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AF RS1EO81TF U 1
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BS 1 638 RS1EO81TF

RD RS1EO81TF 638 0 0
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TGGTGCAAGCATGAAGGTGGGATTATAGGCTTCATGCGTTCTAGGCGTTTCTTCTTGACG
CTTCCTTCTTCACTCTCGTTCAGTGATTTGTCAACTTCAGGAATTCTTGCGAAAGAACAT
ATTGTCACGACCATGTTTGTTGGGAATTTCGTTGGCGTTGTTTGTGCTCGTTCTCTGCAT
TACCAATTCTATTCATGGTACTTTTATTCGCTACCATATCTGCTATGGAGAACTTCGTTT
CCTACTTGGCTGCGCTTGATATTGTTCCTGGGCATCGAGCTTTGCTGGAACGTCTATCCA
TCAACAGCAGTCTCATCAGCTTTGTTACTGTGTCTACACTTGACCCTCCTATTTGGTCTC
TGGTTTGCTCCTTCAGATTATCCTTACTTACTCAAACAAGATCAAAGACACAAAAAGCAC
AAGTGAACCTTTGATATTAGCTAAAAAATTTACAGTTATATGTATGGGTTTAGCTAATCA
TATGGTGGTTTATATTAAAAAAATTTCTGTTTCTGTCC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1EO81JQ 454 0 0
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TCACGACCATGTTTGTTGGGAATTTCGTTGGCGTTGTTTGTGCTCGTTCTCTGCATTACC
AATTCTATTCATGGTACTTTTATTCGCTACCATATCTGCTATGGAGAACTTCGTTTCCTA
CTTGGCTGCGCTTGATATTGTTCCTGGGCATCGAGCTTTGCTGGAACGTCTATCCATCAA
CAGCAGTCTCATCAGCTTTGTTACTGTGTCTACACTTGACCCTCCTATTTGGTCTCTGGT
TTGCTCCTTCAGATTATCCTTACTTACTCAAACAAGATCAAAGACACAAAAAGCACAAGT
GAACCTTTGATATTAGCTAAAAAATTTACAGTTATATGTATGGGTTTAGCTAATCATATG
GTGGTTTATATTAAAAAAATTTCTGTTTCTGTCC

QA 1 454 1 454
DS 



AS 1 2

CO CL5873Contig1 869 2 4 U
GGATGGTTCTTTCTGGTGAAGGCTCTGATGAGATTCTCGGAGGATACTTGTACTTCCACA
AGGCACCTAACAAGAAAGAGTTTCACGAAGAAACATGCCGAAAGATCAAAGCTCTCCACC
AATATGATTGTTTGAGAGCTAACAAGTCAACATCTGCTTGGGGTGTTGAAGCTCGTGTGC
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AGAAGCCTTATCTTCCGAAGCACATTCTGTATAGACAGAAAGAGCAGTTCAGTGATGGAG
TTGGGTATAGCTGGATTGATGGTTTGAAAGATCATGCAAACAAACATGTCTCTGATACTA
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ACTACAGAACCATTTTCGAAAAGTTCTTCCCTAAGAGCGCTGCAAGGGCTACTGTACCAG
GAGGTCCAAGTATAGCTTGCAGTACAGCGAAGGCTATAGAGTGGGATGCAACTTGGTCAA
AGAATCTTGATCCTTCGGGACGTGCGGCTCTTGGAGTTCATGTCGCGTCTTATGAGGAAG
ATAAAGAGAAAGCTGCTAATGGCGACGCCCTAAGAAGTTAAGACGGATGAAAAGAGAATG
TTACAAGGCGTTGTCTGCATGCATTTCCAGTTCCTGCAAATTTGATACACGTTGTTCTGC
ATCTTGTACCTAAGTTCTAGTTCTTTTGTATGTTTGTTTCAGACAAATCTTGTACGCTCC
TTGAATATTTAAGATTTTAAACGTTAATT


BQ
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AF RS1FK66TF U 1
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AGAAGCCTTATCTTCCGAAGCACATTCTGTATAGACAGAAAGAGCAGTTCAGTGATGGAG
TTGGGTATAGCTGGATTGATGGTTTGAAAGATCATGCAAACAAACATGTCTCTGATACTA
TGCTGTCAAACGCAAGCTTTGTCTTCCCAGACAACACACCAATGACAAAAGAAGCTTACT
ACTACAGAACCATTTTCGAAAAGTTCTTCCCTAAGAGCGCTGCAAGGGCTACTGTACCAG
GAGGTCCAAGTATAGCTTGCAGTACAGCGAAG*CTATAGAGTGGGATGCAACTTGGTCAA
AGAATCTTGATCCTTCGGGACGTGCGGCTCTTGGAGTTCATGTCGCGTCTTATGAG
AGATA

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DS 

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AGGATTGAGAAATGGGTGCTACGCAATGCCTTCGATGATGAAGAGAAGCCTTATCTTCCG
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GAAAAGTTCTTCCCTAAGAGCGCTGCAAGGGCTACTGTACCAGGAGGTCCAAGTATAGCT
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GGACGTGCGGCTCTTGGAGTTCATGTCGCGTCTTATGAGGAAGATAAAGAGAAAGCTGCT
AATGGCGACGCCCTAAGAAGTTAAGACGGATGAAAAGAGAATGTTACAAGGCGTTGTCTG
CATGCATTTCCAGTTCCTGCAAATTTGATACACGTTGTTCTGCATCTTGTACCTAAGTTC
TAGTTCTTTTGTATGTTTGTTTCAGACAAATCTTGTACGCTCCTTGAATATTTAAGATTT
TAAACGTTAATT

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

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TTTGATGTCGTTATCCTTCACGTTTGGTTAAGAGGAAGAAGGTACACATCCTTCTTTTCT
TATTTTAAGTTCTTATTATTAGTCATTTTATCAAATGCTTTTATTTGCTTTTCCTTAAAA
TTTAATATATATAAAATAAATATAATTTCAGAAC


BQ
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AF RS1A640JQ C 1
AF RS1A640TF U 1
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GGTTGTTAATCATGAAGGATTTGTGAGTTAGTTACTCTTCAAGACACTTTTTTCTTTTTT
TTGACATGTTTAGACACATTCTGCTGGAGGCATACTTTTTCCTTTTTTTTCTCTATGTGT
TTTGATGTCGTTATCCTTCACGTTTGGTTAAGAGGAAGAAGGTACACATCCTTCTTTTCT
TATTTTAAGTTCTTATTATTAGTCATTTTATCAAATGCTTTTATTTGCTTTTCCTTAAAA
TTTAATATATATAAAATAAATATAATTTCAGAAC

QA 1 454 1 454
DS 

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ATGGAGCATCGGAGTCAACTAGTACTGGATCAAGAAAAAGAAGGAGAAGGTAGATCATTT
GGTTGTTAATCATGAAGGATTTGTGAGTTAGTTACTCTTCAAGACACTTTTTTCTTTTTT
TTGACATGTTTAGACACATTCTGCTGGAGGCATACTTTTTCCTTTTTTTTCTCTATGTGT
TTTGATGTCGTTATCCTTCACGTTTGGTTAAGAGGAAGAAGGTACACATCCTTCTTTTCT
TATTTTAAGTTCTTATTATTAGTCATTTTATCAAATGCTTTTATTTGCTTTTCCTTAAAA
TTTAATATATATAAAATAAATATAATTTCAGAAC

QA 1 454 1 454
DS 



AS 1 2

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TTGGTAAACGTAACCACAGCCACAGGGAACAGATCAGGCGGATCAGTGAAGCCGTCAGGG
CTGAAAATCTTAGTCATAGCTGGGCTGAGCCTGCACTTATGTGGTTCTTCTGGGCTAGGC
TTGAGAGCATGCTCTACTCCAAAATTCAACTCGGTAAATCCGATGATCACGATGAGGTGA
TGCAAGGAATCAAGAAGATACTGAGCTACGACAAGCTTGGAGGATGGGCACTGCTGAGCA
AAGGAGCTGAGATAGTGATGATAACTCACGGTGTCATCGAGAGGACTGTGATCGTCTACG
ACCGAATCTGGAAAACTCACGTCCCGACCAAAGGCTACACCAAAGCTATGTACGACCACC
ACCATGACGAGGTTCTCAGGGAAACCGGACATCCATGCGCCCACTTTGATTTCCACATCA
CTGCTCGCAGCGGTCGGATTCCAGAGAAGATGAACTGCTTCGAGTGCCACCGCCCCATGG
AGAAGTACATGAGCTTCGCTTGTTGTCACGATGAGAAGCTCCTTGACCAAGACGAGAACT
ACAACTTCTAGATAAATTTAATAATAATAAAAAAAAAAACTATACTCTCTTCGTCTTCGC
GGTTCTTTTCTTTACTTCCAAATTTGGAAATTCTCTCATTTCCCTTTTTCAATAATTTCA
GTGTTTGTATAACAGAACTGGCCTGTCCATATGTGTGGTTTGTCCTTTGTGGACTATGTT
TCGTTAATTTATTCCTAAATAATTCACAATAATAAAGTATTTCACC


BQ
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AF RS1EK18TF U 1
AF RS1EK18JQ C 358
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RD RS1EK18TF 795 0 0
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TTGAGAGCATGCTCTACTCCAAAATTCAACTCGGTAAATCCGATGATCACGATGAGGTGA
TGCAAGGAATCAAGAAGATACTGAGCTACGACAAGCTTGGAGGATGGGCACTGCTGAGCA
AAGGAGCTGAGATAGTGATGATAACTCACGGTGTCATCGAGAGGACTGTGATCGTCTACG
ACCGAATCTGGAAAACTCACGTCCCGACCAAAGGCTACACCAAAGCTATGTACGACCACC
ACCATGACGAGGTTCTCAGGGAAACCGGACATCCATGCGCCCACTTTGATTTCCACATCA
CTGCTCGCAGCGGTCGGATTCCAGAGAAGATGA*CTGCTTCGAGTGCCACCGCCCCATGG
AGAAGTACATGAGCTTCGCTTGTTGTCACGATGAGAAGCTCCTTGAC*AAGACGAGAACT
ACAACTTCTAGATAA

QA 1 795 1 795
DS 

RD RS1EK18JQ 649 0 0
GGCTTGAGAGCATGCTCTACTCCAAAATTCAACTCGGTAAATCCGATGATCACGATGAGG
TGATGCAAGGAATCAAGAAGATACTGAGCTACGACAAGCTTGGAGGATGGGCACTGCTGA
GCAAAGGAGCTGAGATAGTGATGATAACTCACGGTGTCATCGAGAGGACTGTGATCGTCT
ACGACCGAATCTGGAAAACTCACGTCCCGACCAAAGGCTACACCAAAGCTATGTACGACC
ACCACCATGACGAGGTTCTCAGGGAAACCGGACATCCATGCGCCCACTTTGATTTCCACA
TCACTGCTCGCAGCGGTCGGATTCCAGAGAAGATGAACTGCTTCGAGTGCCACCGCCCCA
TGGAGAAGTACATGAGCTTCGCTTGTTGTCACGATGAGAAGCTCCTTGACCAAGACGAGA
ACTACAACTTCTAGATAAATTTAATAATAATAAAAAAAAAAACTATACTCTCTTCGTCTT
CGCGGTTCTTTTCTTTACTTCCAAATTTGGAAATTCTCTCATTTCCCTTTTTCAATAATT
TCAGTGTTTGTATAACAGAACTGGCCTGTCCATATGTGTGGTTTGTCCTTTGTGGACTAT
GTTTCGTTAATTTATTCCTAAATAATTCACAATAATAAAGTATTTCACC

QA 1 649 1 649
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5877Contig1 875 2 4 U
CTTAACACGACAGTTGAGCTATTACAGGATGTATCAAAACAGAGTGAGGGGCATGATAGG
GAGGGAAAGAGCACGCACTATGTTCTCTAAATCTATCCATATTTTGAGTGCGGGATCTAG
CGACTTTCTTCAGAACTATTACGTTAATCCTCTGCTCAACATCCTAAATACACCTGAACA
GTTCTCTGATATTCTCATGCGATCTTATTCAGAGTTCATCCAGAATCTGTATGAACTAGG
AGCAAGGAGAATTGGAGTGATATCGTTACCGCCAATGGGTTGCTTGCCCGCAGCTATCAC
TCTTTTCGGTGCAGGAAACAAGAGCTGTGTCGAACGGCTGAACAATGATGCTATCATGTT
CAACACCAAACTTGAAACCACAACCCAGACATTGATGAAACGGCACTCAGGCCTCAAGCT
CGTCGCCTTTAACGCCTACCAACCTCTCATGGACATCATCACCAACCCATATGATAATGG
ATTCTTTGAAACAAAAAGGGCGTGCTGTGGAACAGGAACAATAGAGACATCATTCCTTTG
CAATTCTCTATCATTAGGAACGTGTTCAAATGCCACAGGATATATGTTTTGGGATGGATT
TCATCCCACAGAGGCTGTGTACGAGCTGTTGGCTGGTCAACTATTGAGCCAAGGGATTTC
TCTAATTTCTTGAATTAAATTCCATCTCGATGAATTCAAATGGTATACCTACCATTGTCT
CTCTGTATTTCTAAGGACATGTCTGTGTGACGAAGTACTGACTTTCATAAAACTTACAAA
TAAGAGAGTCAGTATCTGTGTGATAAATGTAGAAACTACTAAGAGCATCTGTGATCAGTG
TGATGGGTCAATAGGTACAAGCTTTGTTAAAGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CR54TF U 1
AF RS1CR54JQ C 152
BS 1 314 RS1CR54TF
BS 315 315 RS1CR54JQ
BS 316 366 RS1CR54TF
BS 367 875 RS1CR54JQ

RD RS1CR54TF 366 0 0
CTTAACACGACAGTTGAGCTATTACAGGATGTATCAAAACAGAGTGAGGGGCATGATAGG
GAGGGAAAGAGCACGCACTATGTTCTCTAAATCTATCCATATTTTGAGTGCGGGATCTAG
CGACTTTCTTCAGAACTATTACGTTAATCCTCTGCTCAACATCCTAAATACACCTGAACA
GTTCTCTGATATTCTCATGCGATCTTATTCAGAGTTCATCCAGAATCTGTATGAACTAGG
AGCAAGGAGAATTGGAGTGATATCGTTACCGCCAATGGGTTGCTTGCCCGCAGCTATCAC
TCTTTTCGGTGCAG*AAACAAGAGCTGTGTCGAACGGCTGAACAATGATGCTATCATGTT
CAACAC

QA 1 366 1 366
DS 

RD RS1CR54JQ 724 0 0
CTGCTCAACATCCTAAATACACCTGAACAGTTCTCTGATATTCTCATGCGATCTTATTCA
GAGTTCATCCAGAATCTGTATGAACTAGGAGCAAGGAGAATTGGAGTGATATCGTTACCG
CCAATGGGTTGCTTGCCCGCAGCTATCACTCTTTTCGGTGCAGGAAACAAGAGCTGTGTC
GAACGGCTGAACAATGATGCTATCATGTTCAACACCAAACTTGAAACCACAACCCAGACA
TTGATGAAACGGCACTCAGGCCTCAAGCTCGTCGCCTTTAACGCCTACCAACCTCTCATG
GACATCATCACCAACCCATATGATAATGGATTCTTTGAAACAAAAAGGGCGTGCTGTGGA
ACAGGAACAATAGAGACATCATTCCTTTGCAATTCTCTATCATTAGGAACGTGTTCAAAT
GCCACAGGATATATGTTTTGGGATGGATTTCATCCCACAGAGGCTGTGTACGAGCTGTTG
GCTGGTCAACTATTGAGCCAAGGGATTTCTCTAATTTCTTGAATTAAATTCCATCTCGAT
GAATTCAAATGGTATACCTACCATTGTCTCTCTGTATTTCTAAGGACATGTCTGTGTGAC
GAAGTACTGACTTTCATAAAACTTACAAATAAGAGAGTCAGTATCTGTGTGATAAATGTA
GAAACTACTAAGAGCATCTGTGATCAGTGTGATGGGTCAATAGGTACAAGCTTTGTTAAA
GACG

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL5878Contig1 670 2 10 U
ACGAACCATGTCAAAATTAGCAACATAAAACGAGAAACAAAACAAAAAAACATTACATAA
CTCAACAAAATTCGTCTATATTATATCATCATAGTGAACGAGTTTTTAAATCCCGATAAA
ACTAATTGAAATGTTCTGAGAATGTAAAAATATAATAAAACCAAATATAGAGAAAGACGC
TAAAGTTCTCTCATGCATTGTCAACTTGTCACTAAAATAAAAGAACAACTTGAAGGACTC
AAAACAGCAACAGAACCTCACGTTTGAAAAAAATGAATTGATCAGCGGACCTGAGACGGA
GAGCATACCAAACCAGATGCGTCTGCGCCAATGACTGCAAGATCACAGACCCCGCATATG
TTTCCTTCCTGGCTTGGTACAAACCTGGCGGTGCAGTATGGACAGGAAACGTCTTTCTGA
CCTCTGTAGATTGGGACATAGGTTGATCCGCATATCACAAACGGGTTTCTGAAGTCATAG
TTGAGCTCGGTTGCATCAGTCATGTTGCGCTCGGCTGCTTGAACAATTTGTCTAGCCGTC
CTGGCCTGGGTCTCCATTGGGTTGGTTTCCAACAATCTTTTGGCGAAGTTATAGGCAGTG
GCGAGGTTCTTCGCCTTGTAGCAGACACCCATTGCACTAAACAGGGCGAGTCTTAAGTGA
GGTAGTTGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G069JQ U 1
AF RS1FO67JQ U 63
BS 1 215 RS1G069JQ
BS 216 216 RS1FO67JQ
BS 217 220 RS1G069JQ
BS 221 221 RS1FO67JQ
BS 222 268 RS1G069JQ
BS 269 269 RS1FO67JQ
BS 270 271 RS1G069JQ
BS 272 272 RS1FO67JQ
BS 273 292 RS1G069JQ
BS 293 670 RS1FO67JQ

RD RS1G069JQ 292 0 0
ACGAACCATGTCAAAATTAGCAACATAAAACGAGAAACAAAACAAAAAAACATTACATAA
CTCAACAAAATTCGTCTATATTATATCATCATAGTGAACGAGTTTTTAAATCCCGATAAA
ACTAATTGAAATGTTCTGAGAATGTAAAAATATAATAAAACCAAATATAGAGAAAGACGC
TAAAGTTCTCTCATGCATTGTCAACTTGTCACTAAGATAAGAGAACAACTTGAAGGACTC
AAAACAGCAACAGAACCTCACGTTTGAAGAAGATGAATTGATCAGCGGACCT

QA 1 292 1 292
DS 

RD RS1FO67JQ 608 0 0
CAACAAAATTCGTCTATATTATATCATCATAGTGAACGAGTTTTTAAATCCCGATAAAAC
TAATTGAAATGTTCTGAGAATGTAAAAATATAATAAAACCAAATATAGAGCAAGACGCTA
AAGTTCTCTCATGCATTGTCAACTTGTCACTAAAATAAAAGAACAACTTGAAGGACTCAA
AACAGCAACAGAACCTCACGTTTGAAAAAAATGAATTGATCAGCGGACCTGAGACGGAGA
GCATACCAAACCAGATGCGTCTGCGCCAATGACTGCAAGATCACAGACCCCGCATATGTT
TCCTTCCTGGCTTGGTACAAACCTGGCGGTGCAGTATGGACAGGAAACGTCTTTCTGACC
TCTGTAGATTGGGACATAGGTTGATCCGCATATCACAAACGGGTTTCTGAAGTCATAGTT
GAGCTCGGTTGCATCAGTCATGTTGCGCTCGGCTGCTTGAACAATTTGTCTAGCCGTCCT
GGCCTGGGTCTCCATTGGGTTGGTTTCCAACAATCTTTTGGCGAAGTTATAGGCAGTGGC
GAGGTTCTTCGCCTTGTAGCAGACACCCATTGCACTAAACAGGGCGAGTCTTAAGTGAGG
TAGTTGGA

QA 1 608 1 608
DS 



AS 1 2

CO CL5879Contig1 937 2 2 U
GCTGCTGGAGACTCTTGACATGGATGCTGCTGGCAATGAGGATGAGATCTTGAAGCTGAT
TCCTATGGTCTCGCGTCGCCGCCAGGCGGCTGAGCTTTGCCGTTCTCTTGGATTGTCTGG
AAAAATGCCTGGTGTGATTGAAGTTCTAGTGAACAGTGGTAAACAGATTGATGCTGTGAA
CTTGGCATTTGCGTTTGGACTCACAGAACAGTTCCCACCTGTTGAGTTGCTTAAATGTTA
CTTGACTGAGGCAAGTAGATCTACCTCCCAAGGCGGACCTGGCGATGCATCTCCTGCTGT
TCAGGATGAGTTCAGTGAGAGGGAGCTGACGAGTCTTAAGGCTGTGATAAAGTGTGTGGA
AGAGCATAACCTGGAAGAGCAGTACCCAGTTGAGCCACTTCACAAAAGGATTCTCCAGCT
GGAGAAGGCCAAAGCTGAGAAAAAGAGAGCAACGGAGCCCACGAAGCCTCAGACAAAGCG
ACCACGTGGTCCTCAACCCCGAGCCACTGACAACAACAACAACAATAACAGTAAGACAGG
ATATGGTAGAGTGATACCTGAGAGGTATCCGCAGTATGTGTATGACGACATATCGTTCCT
TAGCGGTCCAATCATGGCAGCACAACCTCCTCCTCCTCAGACTTACACTTTCAGTCCAGC
TGCTGCTGCTCATGGGAACTTCTATGGAAACTGCTATCAGTACCAGGCTCCTCCTCCTGC
TTACTTTCACTAAGGTTGATGGTGAATGTGACTGTAACTCGTTCTCTTCTATGGTGTTAA
CTAGTGGCAGCAGCTCTTTAATCCCTCCTCTCCTACTAGTCGTTTCCCTTTGGTGTTACA
TTGTTGTGTATGGATGATTTTAGTATTTTTAAGGATCAACCCTACTCAAAACAAAAATAC
TCTGAATTTCTATTAATTATATCTTCACTGTTGTATT


BQ
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TCACTGTTGTATT

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

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TCATTAGTATTTTTTTTACCTTTTACTGAACTTAACGTTTGAGGTCATTGAATGTCTTTG
GATATGGAAGTAAATTATTTATTTTAGTTATCGTTATGAACT


BQ
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BS 1 737 RS1AN73TF
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QA 1 737 1 737
DS 

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AACGTTTTTGTGCAGAGAAGTTTTCTTACCGGCTGATTATGTTGGTTTTACAGATTCAAG
TTTGTCCTAAGAACAAGTTCATTAGTATTTTTTTTACCTTTTACTGAACTTAACGTTTGA
GGTCATTGAATGTCTTTGGATATGGAAGTAAATTATTTATTTTAGTTATCGTTATGAACT

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL5881Contig1 830 2 10 U
CTAAATTCCACCGACTATAAATGAGATGTAACTTTTCCGTCGTCATTGAAATTTCATCAT
TAAGTTTCACTGTTAATTCTCGAATTCAAGGTCTTCCACGACGTTTGGTTTTAGTTTTCT
CCTTTCTCATTTCAATCGTATGTCCCTAATTTCTTCAACTATAAATAAGGATGTAGACTA
CTGGGAATCTCACTGCTTCACTTGATTCAACCATACTACTTCTTTTACATACAAGACCCT
CGACAATGGCTTGGCGGTTGATTACAAGGGGAATGCTTACGTCACCAACTCAGCCAAAAA
CTTTATCTGGAAAGTGGATCATGACTCCGTATCTTCGATCTTTTCCAGATCGTCGTTATC
TAACTCGCAGCCGGTGGTGGCTGACGCGGACGCAAGCTTTTGCGATTTCAGTTTGAACGT
GATTTTGTACAACATCGAAGTATAACTCTTGCTGGTCTTGGTGGTGAGAGCAACACATGA
AAGATGTTTAAGGTCGAGGAAGAAACCAGGACGGCGAGGATTGTGTTGCTGAATGGAGAT
CTGGCTGCGGCAGATGGGATTTTGAGGAGACAGAGAGAGAAACGGTTGTGGTGGTGTCCG
AGAAGAAGCTTTGGTTTGTTCAGAGCCAAGATAATATGGATATCAAAAATCAGGTAAGTG
ATTGATAAGTACTCAGATGGGCAGTTAGTGGGTCTCGGAAGGAGAGGAATTAAATGAAGC
CCAAGACATATATTTTCTACTTTCTCTTTATATGTTGCAGTTGTTCTTTGTAAACATTTG
ATCGAAAAACGATCATAAACATATTTGGGTAAATCCCTAACTTCTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BZ65TF U 1
AF RS1BZ65JQ C 332
BS 1 648 RS1BZ65TF
BS 649 649 RS1BZ65JQ
BS 650 748 RS1BZ65TF
BS 749 749 RS1BZ65JQ
BS 750 768 RS1BZ65TF
BS 769 769 RS1BZ65JQ
BS 770 788 RS1BZ65TF
BS 789 789 RS1BZ65JQ
BS 790 804 RS1BZ65TF
BS 805 830 RS1BZ65JQ

RD RS1BZ65TF 804 0 0
CTAAATTCCACCGACTATAAATGAGATGTAACTTTTCCGTCGTCATTGAAATTTCATCAT
TAAGTTTCACTGTTAATTCTCGAATTCAAGGTCTTCCACGACGTTTGGTTTTAGTTTTCT
CCTTTCTCATTTCAATCGTATGTCCCTAATTTCTTCAACTATAAATAAGGATGTAGACTA
CTGGGAATCTCACTGCTTCACTTGATTCAACCATACTACTTCTTTTACATACAAGACCCT
CGACAATGGCTTGGCGGTTGATTACAAGGGGAATGCTTACGTCACCAACTCAGCCAAAAA
CTTTATCTGGAAAGTGGATCATGACTCCGTATCTTCGATCTTTTCCAGATCGTCGTTATC
TAACTCGCAGCCGGTGGTGGCTGACGCGGACGCAAGCTTTTGCGATTTCAGTTTGAACGT
GATTTTGTACAACATCGAAGTATAACTCTTGCTGGTCTTGGTGGTGAGAGCAACACATGA
AAGATGTTTAAGGTCGAGGAAGAAACCAGGACGGCGAGGATTGTGTTGCTGAATGGAGAT
CTGGCTGCGGCAGATGGGATTTTGAGGAGACAGAGAGAGAAACGGTTGTGGTGGTGTCCG
AGAAGAAGCTTTGGTTTGTTCAGAGCCAAGATAATATGGATATCAAAA*TCAGGTAAGTG
ATTGATAAGTACTCAGATGGGCAGTTAGTGGGTCTCGGAAGGAGAGGAATTAAATGAAGC
CCAAGACATATATTTTCTACTTTCTCTT*ATATGTTGCAGTTGTTCTT*GTAAACATTTG
ATCGAAAA*CGATCATAAACATAT

QA 1 804 1 804
DS 

RD RS1BZ65JQ 499 0 0
TCTTCGATCTTTTCCAGATCGTCGTTATCTAACTCGCAGCCGGTGGTGGCTGACGCGGAC
GCAAGCTTTTGCGATTTCAGTTTGAACGTGATTTTGTACAACATCGAAGTATAACTCTTG
CTGGTCTTGGTGGTGAGAGCAACACATGAAAGATGTTTAAGGTCGAGGAAGAAACCAGGA
CGGCGAGGATTGTGTTGCTGAATGGAGATCTGGCTGCGGCAGATGGGATTTTGAGGAGAC
AGAGAGAGAAACGGTTGTGGTGGTGTCCGAGAAGAAGCTTTGGTTTGTTCAGAGCCAAGA
TAATATGGATATCAAAAATCAGGTAAGTGATTGATAAGTACTCAGATGGGCAGTTAGTGG
GTCTCGGAAGGAGAGGAATTAAATGAAGCCCAAGACATATATTTTCTACTTTCTCTTTAT
ATGTTGCAGTTGTTCTTTGTAAACATTTGATCGAAAAACGATCATAAACATATTTGGGTA
AATCCCTAACTTCTTTTCC

QA 1 499 1 499
DS 



AS 1 2

CO CL5882Contig1 643 2 3 U
GATCAAACTTTCCAGCTCGACAAAATCATAACCAGTTTAACAAACTTTAAAGAACTGAAC
TACCCCAAAATAACTAAAAATATACATAGTTTACAAGGATCGAAAACACACATGATTCTC
TCGTTTATGTTCATAGTATTAGATGATAAATACATATAACTTGGTTTTCCAACGCTTGCA
TCACTTTACTTTTTCATAAATATTTTATCTTTTCTTACCAGACCGATATTTCAAATTTGT
AGTAAACGTTGGAAGTAAAGCTCATCTGGAGGCTATACAGGAAGGAGGGTCAAGCAGAGC
TGGTCGAATGGAAGATGTTGTTCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGACAATGATGGAGCCAC
GGTGTCGACCAGAGATAGGGACGTGAAAACGACCAAGATGAGAGTAATGAGACCAGCTCC
GATTAATATTCTTGATCGAGTGTGGTTAAACGACACCAAAGAGACACCTCGCTCTACCAT
CAAAGGATTTCTCCAGATAACGGAGCAGGCCGATTTAAAATTCAGCAGGGAAAATCTGAT
GATGGTCGAGGAGAAGCTGCGGCAAGCTTTATTCGTGTTTTATCAGAAGCTGAGGCTTCT
CAAGAGCTACAGGTGCGTATGGGGTTTATTTGTAGGATTGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BS65JQ U 104
AF RS1BS65TF C 1
BS 1 103 RS1BS65TF
BS 104 313 RS1BS65JQ
BS 314 643 RS1BS65TF

RD RS1BS65JQ 210 0 0
AAACACACATGATTCTCTCGTTTATGTTCATAGTATTAGATGATAAATACATATAACTTG
GTTTTCCAACGCTTGCATCACTTTACTTTTTCATAAATATTTTATCTTTTCTTACCAGAC
CGATATTTCAAATTTGTAGTAAACGTTGGAAGTAAAGCTCATCTGGAGGCTATACAGGAA
GGAGGGTCAAGCAGAGCTGGTCGAATGGAA

QA 1 210 1 210
DS 

RD RS1BS65TF 643 0 0
GATCAAACTTTCCAGCTCGACAAAATCATAACCAGTTTAACAAACTTTAAAGAACTGAAC
TACCCCAAAATAACTAAAAATATACATAGTTTACAAGGATCGAAAACACACATGATTCTC
TCGTTTATGTTCATAGTATTAGATGATAAATACATATAACTTGGTTTTCCAACGCTTGCA
TCACTTTACTTTTTCATAAATATTTTATCTTTTCTTACCAGACCGATATTTCAAATTTGT
AGTAAACGTTGGAAGTAAAGCTCATCTGGAGGCTATACAGGAAGGAGGGTCAAGCAGAGC
TGGTCGAATGGAAGATGTTGTTCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGACAATGATGGAGCCAC
GGTGTCGACCAGAGATAGGGACGTGAAAACGACCAAGATGAGAGTAATGAGACCAGCTCC
GATTAATATTCTTGATCGAGTGTGGTTAAACGACACCAAAGAGACACCTCGCTCTACCAT
CAAAGGATTTCTCCAGATAACGGAGCAGGCCGATTTAAAATTCAGCAGGGAAAATCTGAT
GATGGTCGAGGAGAAGCTGCGGCAAGCTTTATTCGTGTTTTATCAGAAGCTGAGGCTTCT
CAAGAGCTACAGGTGCGTATGGGGTTTATTTGTAGGATTGTGC

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 2

CO CL5883Contig1 839 2 11 U
TCGAGCCCGAGTCTGGAGGCTTGTTGACTATGAGGACGATGAAGATGATGAAGACTATAA
ACCTCCTCCCAGGAAACAGCCCGAAGTCTCTGAGGAGGAGGAAGGCGAGCTCCTGGGTCT
GAAACGCAAATCCCCTTTCGCAGAAAGAGAACAAGAGCCTTCCCCCAAGAAACCTCGACT
GGGTAAAAACCCGAAAAGAGAAAACGTGTTTGCTGTGCTGTGCTCGACGTTGAGCCATGC
AGTGCTTGCAAAGAAAAGTCAAGGCACCGCTGGATCTGCAGCCCGGTCTATTGTAACCAA
GGAACCTGGGGAATCGAGAAGTAGTGAAGAGAATAATAGCAGCAGTTCGGATGATGAGAA
GAATCATAAGGATGATGGAGTTTCTAGTTCAGAACAGGGAACATCAGACAATGGAAAGAA
GCTAAATGGGGAAGAATCAGTGGTAGTTGCTCCAAAATCATCACCTGAAATGGCTGTAAA
TGGATCCTGAGGTTATAACACTCTGGACTTGTAAGTTGGCTGTGGACGGAAGGCACTCAT
GGGTGGCTTATAAAAGAACCCTTCAATGTTAAAGACTGAGGAGGAGACCATGAGAAACTG
CAATCAACAACCAATAGAAGAAGAAATGTATAGAGAGCGCCAGTTTGAGAGGGTAACAGG
TTTCTTCGTCCATTGTGTTTGCAGCCGGTTTTATTTATATATTCATCATTTGGAAAAGAA
AAAAAAAACTTAGAAGTCTCTGGTCTTGTCAAAATTGCATATTGTAAGAAACACCATATG
GTCTATCAGCAACTAACTCTGTTTTTTCTTCTAAATTCAAGTTCCTAGTGGTTTCGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FE76TF U 56
AF RS1CH26JQ C 1
BS 1 55 RS1CH26JQ
BS 56 69 RS1FE76TF
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BS 516 546 RS1FE76TF
BS 547 839 RS1CH26JQ

RD RS1FE76TF 491 0 0
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GGTCTGAAACGCAAATCCCCTTTTGCAGAAAGAGAACAAGAGCCTTCCCCCAAGAAACCT
CGACTGGGTAAAAACCCGAAAAGAGAAAACGTGTTTGCTGTGCTGTGCTCGACGTTGAGC
CATGCAGTGCTTGCAAAGAAAAGTCAAGGCACCGCTGGATCTGCAGCCCGGTCTATTGTA
ACCAAGGAACCTGGGGAATCGAGAAGTAGTGAAGAGAATAATAGCAGCAGTTCGGATGAT
GAGAAGAATCATAAGGATGATGGAGTTTCTAGTTCAGAACAGGGAACATCAGACAATGGA
AAGAAGCTAAATGGG*AAGAATCAGTGGTAGTTGCTCCAAAATCATCACCTGAAATGGCT
GTAAATGGATCCTGAGGTTATAACACTCTGGACTTGTAGTTTGGCTGTGGACGGAAGGCA
CTCATGGGTGG

QA 1 491 1 491
DS 

RD RS1CH26JQ 839 0 0
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ACCTCCTCCCAGGAAACAGCCCGAAGTCTCTGAGGAGGAGGAAGGCGAGCTCCTGGGTCT
GAAACGCAA*TCCCCTTTCGCAGAAAGAGAACAAGAGCCTTCCCCCAAGAAACCTCGACT
GGGTAAAAACCCGGAAAGAGAAAACGTGTTTGCTGTGCTGTGCTCGACGTTGAGCCATGC
AGTGCTTGCAAAGAAAAGTCAAGGCACCGCTGGATCTGCAGCCCGGTCTATTGTTACCAA
GGAACCTGGGGAATCGAGAAGTAGTGAAGAGAATAATAGCAGCAGTTCGGATGATGAGAA
GAATCATAAGGATGATGGAGTTTCTAGTTCGGAACAGGGAACATCAGACAATGGAAAGAA
GCTAAATGGGGAAGAATCAGTGGTAGTTGCTCCAAAATCATCACCTGAAATGGCTGTAAA
TGGATCCTGAGGTTATAACACTCTGGACTTGTTAGTTGGCTGTGGACGGAAGGCACTCAT
GGGTGGCTTATAAAAGAACCCTTCAATGTTAAAGACTGAGGAGGAGACCATGAGAAACTG
CAATCAACAACCAATAGAAGAAGAAATGTATAGAGAGCGCCAGTTTGAGAGGGTAACAGG
TTTCTTCGTCCATTGTGTTTGCAGCCGGTTTTATTTATATATTCATCATTTGGAAAAGAA
AAAAAAAACTTAGAAGTCTCTGGTCTTGTCAAAATTGCATATTGTAAGAAACACCATATG
GTCTATCAGCAACTAACTCTGTTTTTTCTTCTAAATTCAAGTTCCTAGTGGTTTCGTGC

QA 1 839 1 839
DS 



AS 1 2

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TCGATCAGATCATCTACACAGAGTGAAGCAAGGATGGGATTATCGTTCGCGAAGCTATTT
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AAGACCACCATTTTGTACAAGCTCAAGCTCGGTGAGATCGTCACCACCATCCCCACTATT
GGGTTCAATGTTGAGACTGTGGAGTACAAGAACATCAGCTTCACTGTCTGGGATGTCGGG
GGTCAAGACAAGATTCGTCCATTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACTCAAGGTCTCATC
TTTGTGGTGGATAGCAATGACAGAGACCGTGTTGTTGAGGCTAGAGATGAATTGCACAGA
ATGCTCAATGAGGATGAGCTGCGTGATGCTGTTTTGCTCGTGTTTGCTAACAAGCAGGAT
CTTCCAAATGCTATGAACGCAGCTGAAATCACTGATAAGCTTGGTCTTCACTCTCTCCGT
CAGCGTCACTGGTACATCCAGAGCACATGTGCCACTTCGGGCGAGGGGCTTTACGAAGGT
CTTGACTGGCTGTCCAACAACATTGCCGGCAAGGCGTAGAGAGAGTTTGTGTTTGAGTTG
ATTTTGCTGGCAGATCTGGATGCAGGGCCAAAACATTATCTGAGTTTTTTTCGGTTTTTT
TATATTGTTTTTTTTTTTTTCGGGTATGTGAATTGATTTTGTGATCGTTGTTATAACTTG
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GCTTGTTATCGAAGATTTATGCTACTGCTTTCTTCTTCAC


BQ
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
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AF RS1C519TF U 1
AF RS1C519JQ C 227
BS 1 688 RS1C519TF
BS 689 690 RS1C519JQ
BS 691 710 RS1C519TF
BS 711 880 RS1C519JQ

RD RS1C519TF 724 0 0
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TCGATCAGATCATCTACACAGAGTGAAGCAAGGATGGGATTATCGTTCGCGAAGCTATTT
AGCAGGCTTTTCGCCAAGAAGGAGATGAGGATTCTCATGGTTGGTCTTGATGCTGCTGGT
AAGACCACCATTTTGTACAAGCTCAAGCTCGGTGAGATCGTCACCACCATCCCCACTATT
GGGTTCAATGTTGAGACTGTGGAGTACAAGAACATCAGCTTCACTGTCTGGGATGTCGGG
GGTCAAGACAAGATTCGTCCATTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACACTCAAGGTCTCATC
TTTGTGGTGGATAGCAATGACAGAGACCGTGTTGTTGAGGCTAGAGATGAATTGCACAGA
ATGCTCAATGAGGATGAGCTGCGTGATGCTGTTTTGCTCGTGTTTGCTAACAAGCAGGAT
CTTCCAAATGCTATGAACGCAGCTGAAATCACTGATAAGCTTGGTCTTCACTCTCTCCGT
CAGCGTCACTGGTACATCCAGAGCACATGTGCCACTTCGGGCGAGGGGCTTTACGAAGGT
CTTGACTGGCTGTCCAACAACATTGCCGGCAAGGCGTAGAGAGAGTTTGTGTTTGAGTTG
ATTTTGCTGGCAGATCTGGATGCAGGGC**AAACATTATCTGAGTTTTTT
CGTTTCTTATATTG

QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1C519JQ 654 0 0
CCATCCCCACTATTGGGTTCAATGTTGAGACTGTGGAGTACAAGAACATCAGCTTCACTG
TCTGGGATGTCGGGGGTCAAGACAAGATTCGTCCATTGTGGAGGCACTACTTCCAGAACA
CTCAAGGTTTCATTTTTGTGGTGGATAGCAATGACAGAGACCGTGTTGTTGAGGCTAGAG
ATGAATTGCACAGAATGCTCAATGAGGATGAGCTGCGTGATGCTGTTTTGCTCGTGTTTG
CTAACAAGCAGGATTTTCCAAATGCTATGAACGCAGCTGAAATCACTGATAAGCTTGGTC
TTCACTCTTTCCGTCAGCGTCACTGGTACATCCAGAGCACATGTGCCACTTCGGGCGAGG
GGCTTTACGAAGGTCTTGACTGGCTGTCCAACAACATTGCCGGCAAGGCGTAGAGAGAGT
TTGTGTTTGAGTTGATTTTGCTGGCAGATCTGGATGCAGGGGCAAAACATTATTTGAGTT
TTTTTCGGTTTTTTTATATTGTTTTTTTTTTTTTCGGGTATGTGAATTGATTTTGTGATC
GTTGTTATAACTTGAGTAAGGAGGGGAGGGGCCTCTTGTACGTAGAACACAGAAACTACC
TTATTACATATATAGCTTGTTATCGAAGATTTATGCTACTGCTTTCTTCTTCAC

QA 1 654 1 654
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL5887Contig1 821 2 3 U
AACAAGAAACTTTTATTTTAGACATAACATATAACAAGCTTACAAGCATAACTTAGACAT
TGGAACAAATCACTAAAGATGATTCTTGTTTTAATACGTTTAAGCTGATCTGATTCTCTC
TCCCATGTCATTCATGTGTTCAACATGTTCCTCTCTTGGAGGAATACAATCCTTGACAAA
CTCAGCCTTCTCAAGATTCTTCACCCATCTCTTGTACTCAGGAAACTTCTCCGCTGAGAT
TACTTCCAGTCCAATTCCTTCCCAACCTCTCTCCAAACAAAAAGGGATTACACTTCCGGC
GACTAAGTCCAAGAATCCGACAGTCTTACCACCAAAGAAATCTTTTCCCACAAGTTCCTT
CTCAAGATTCATAATCAGTTCTCTAGTCTGCTCGGCAAGAACTTCTCTTCCTTTCTCATC
TGCTCTTGCCATTGATACAAACCCTGTGGTTAAAATCTGCTCATCGACGAGTTTAGCCAA
GAACCGAGCCTTAGATCTCTCGTAAGGATCCTGAGGGAGAAGTGGATTATGTTTCCAAGT
CTCATCGATGTACTCAAGAATCACTTGAGACTCGAGAATGGTTTTATCATTGTGGACAAG
AACAGGGATCTTCTTGTGAATAGGGTTTAGAGCAAGGAGCAAAGGGCTTTTCTTCTCCAA
TATCTCTTCAACGTATTCGTACGGTACGCCTTTGAGTTTGAGAGCCATCTCTATCCGACG
GCTATAAGGACTCGCCCATATCCCCAAAAGCTTCACTTCTTCTTTATCAGCCATTGGTTT
TCTTCTCTTTGTCTCTGTTTGTTGGAAATGGTTTTGTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AN71JQ U 130
AF RS1AN71TF C 1
BS 1 129 RS1AN71TF
BS 130 340 RS1AN71JQ
BS 341 821 RS1AN71TF

RD RS1AN71JQ 211 0 0
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CTCAAGATTCTTCACCCATCTCTTGTACTCAGGAAACTTCTCCGCTGAGATTACTTCCAG
TCCAATTCCTTCCCAACCTCTCTCCAAACAAAAAGGGATTACACTTCCGGCGACTAAGTC
CAAGAATCCGACAGTCTTACCACCAAAGAAA

QA 1 211 1 211
DS 

RD RS1AN71TF 821 0 0
AACAAGAAACTTTTATTTTAGACATAACATATAACAAGCTTACAAGCATAACTTAGACAT
TGGAACAAATCACTAAAGATGATTCTTGTTTTAATACGTTTAAGCTGATCTGATTCTCTC
TCCCATGTCATTCATGTGTTCAACATGTTCCTCTCTTGGAGGAATACAATCCTTGACAAA
CTCAGCCTTCTCAAGATTCTTCACCCATCTCTTGTACTCAGGAAACTTCTCCGCTGAGAT
TACTTCCAGTCCAATTCCTTCCCAACCTCTCTCCAAACAAAAAGGGATTACACTTCCGGC
GACTAAGTCCAAGAATCCGACAGTCTTACCACCAAAGAAATCTTTTCCCACAAGTTCCTT
CTCAAGATTCATAATCAGTTCTCTAGTCTGCTCGGCAAGAACTTCTCTTCCTTTCTCATC
TGCTCTTGCCATTGATACAAACCCTGTGGTTAAAATCTGCTCATCGACGAGTTTAGCCAA
GAACCGAGCCTTAGATCTCTCGTAAGGATCCTGAGGGAGAAGTGGATTATGTTTCCAAGT
CTCATCGATGTACTCAAGAATCACTTGAGACTCGAGAATGGTTTTATCATTGTGGACAAG
AACAGGGATCTTCTTGTGAATAGGGTTTAGAGCAAGGAGCAAAGGGCTTTTCTTCTCCAA
TATCTCTTCAACGTATTCGTACGGTACGCCTTTGAGTTTGAGAGCCATCTCTATCCGACG
GCTATAAGGACTCGCCCATATCCCCAAAAGCTTCACTTCTTCTTTATCAGCCATTGGTTT
TCTTCTCTTTGTCTCTGTTTGTTGGAAATGGTTTTGTGTCC

QA 1 821 1 821
DS 



AS 1 2

CO CL5888Contig1 849 2 2 U
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TTTCTCCTTCTCGGGGTATTACGTTTCGATTTAGGGTTTGTTTTGGGTCAATCGACGGGA
TTTATCGTTTTTGGGTTTGTAACTCTTCGATGTGTTCTGGATTGATGCTTGCAAGCTCAA
TCGTCGGATACTGATTCGATGCTGGTGGGTGTGGGATGTGGTCTCGTCTTTCTCCTTTCT
CCTCTCCCTAGAAGTTCCATGTATTATTTCTTCACCGGGTGTGGTGTGGATCCGTCTATC
CTGTGGCGGTCTAGAGGTTTGTTACCTCAATCGGAGGTTCTTCTCGGTTCTTCTAATACA
GATCCTCAACCATCGTCTTCTGATCTGTTGTGACCGGTGCGGGTTTGGAGTTTGTGGGGT
TTGATTGTGACTTCTTGACCATTGAGCTGCAGGATCTGTCTTCCTTGATTTGGCTAGGAG
CTTATGGCCATTTTCCGTTCCTAGCTGGTCTATGATGTCTATGGCCTATTTGGTAAAACG
GATGTTGATTGTACCGAAGGGAACTCATGGCTTCGACAACGTAATGACATGTTGGTGTGA
GGGTTAAGTGAGAAGTTCGGTCTCAGTCTTTATTCACTGTTTTTTGTGGTTCTGGTCAAG
TTTATGGTTTGATGGGTCTTGTAAGTTTAGCCTTCTTGTTTAGAATCTTAGTTGTTTGTT
TGATGTTGTTTCAGTTTGTTTTCCCACTTGTGGGCTTAGTTTCCAGGGACATCCATGTCG
TCCGCTGGCTTAGTATGCTCGACTCTGTAATGGTTGATGTTGCAAGCTCTAATAAAATCT
GTTCAGAGG


BQ
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AF RS1B923TF U 1
AF RS1B923JQ C 456
BS 1 527 RS1B923TF
BS 528 849 RS1B923JQ

RD RS1B923TF 527 0 0
GCTAAGGTGGCTCCGGTGGCTTCTTGAGCACCGGAGCCGTGTCTCCTTTTGTTTTATGTA
TTTCTCCTTCTCGGGGTATTACGTTTCGATTTAGGGTTTGTTTTGGGTCAATCGACGGGA
TTTATCGTTTTTGGGTTTGTAACTCTTCGATGTGTTCTGGATTGATGCTTGCAAGCTCAA
TCGTCGGATACTGATTCGATGCTGGTGGGTGTGGGATGTGGTCTCGTCTTTCTCCTTTCT
CCTCTCCCTAGAAGTTCCATGTATTATTTCTTCACCGGGTGTGGTGTGGATCCGTCTATC
CTGTGGCGGTCTAGAGGTTTGTTACCTCAATCGGAGGTTCTTCTCGGTTCTTCTAATACA
GATCCTCAACCATCGTCTTCTGATCTGTTGTGACCGGTGCGGGTTTGGAGTTTGTGGGGT
TTGATTGTGACTTCTTGACCATTGAGCTGCAGGATCTGTCTTCCTTGATTTGGCTAGGAG
CTTATGGCCATTTTCCGTTCCTAGCTGGTCTATGATGTCTATGGCCT

QA 1 527 1 527
DS 

RD RS1B923JQ 394 0 0
CTGTTTTCCTTGATTTGGCTAGGAGCTTATGGCCATTTTCCGTTCCTAGCTGGTCTATGA
TGTCTATGGCCTATTTGGTAAAACGGATGTTGATTGTACCGAAGGGAACTCATGGCTTCG
ACAACGTAATGACATGTTGGTGTGAGGGTTAAGTGAGAAGTTCGGTCTCAGTCTTTATTC
ACTGTTTTTTGTGGTTCTGGTCAAGTTTATGGTTTGATGGGTCTTGTAAGTTTAGCCTTC
TTGTTTAGAATCTTAGTTGTTTGTTTGATGTTGTTTCAGTTTGTTTTCCCACTTGTGGGC
TTAGTTTCCAGGGACATCCATGTCGTCCGCTGGCTTAGTATGCTCGACTCTGTAATGGTT
GATGTTGCAAGCTCTAATAAAATCTGTTCAGAGG

QA 1 394 1 394
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5890Contig1 1246 2 4 U
GAAGAGGATTCAAACGGAGAGTCTTGAGAAAGGTTTTGTTGAAGTTATGAGTCAATGTAG
GCTAACGATTTGTAGCATCTTGATATGTCTTTGTTTCGGAGCCAAGATCAACGAGGAAAA
GATCAAGAACATAGAGAATGTTCTCAAGTACGTCATGCTTATAACTTCTCCGAAGTTACC
AGACTTTTTACCGGTTTTCACTCCGTTGTTTCGGCGTCAGGTTAGAGAAGCGAGAGAGCT
AAGGAAGACGCAGCTCGAGTGTCTCGTGCCATTGATCAAGAACCGTCGTGCGTTTGTTGA
CGCTAAGGAGAGTCCTAACGAAGACATGGTGAGTCCAATAGGTGCAGCTTATGTGGACTC
TTTGTTTAGTTTGAAGCCGGTGGAGAGAGGCGGTGAGCTCCGAGATGAAGAGATAGTGAC
TTTATGTTCGGAGATTGTCTCGACCGGTACGGACACAAGTGCAACTACGCTTGAATGGGC
GTTACTTCATCTAGTGACCGACCAAAACATACAAGAGAGGCTGTACGAGGAAGTTGTTGG
AGTTGTTGGCAAAAACGGCGTCGTTGAAGAGGATGACGTGGCGAAAATGCCTTACCTGGA
GGCAATAGTGAAAGAGACTCTCCGTAGACATCCTCCGGGACATTTTCTTCTCTCTCACGC
CGCCGTGAAAGATACTGAGCTTGGCGGGTACGATATTCCGGCAGGGGCGTACGTGGAGTT
TTACACTGCTTGGGTTACTGAGAACCCGGAGATATGGTCGGATCCGGGTATGTTTCGACC
CGAGAGGTTTCTAGCGGGTGGAGATGGAGTTAATGCTGACTGGACCGGGACACGTGGTGT
AACAATGTTGCCTTTTGGTGCGGGTCGTCGGATCTGTCCGGCTTGGTTATTAGGGATTTT
GCACATTAACTTGATGCTTGCTAGGATGATCCATTCGTTTAACTGGATCCCGGTTCCGGA
TTCTCCACCCGACCCGACCGAGACTTACGCGTTTACGGCCGTGATGAAGAATTCTCTCAA
AGCTCGGATCCAGTCAAGGACTTGATGGATACATTCGAGCTGGAACGGGTCAGGTTTGTG
ATGTGTTAATTGTTATGCTTTTGTATCCGTGTGTGGTAATTAATAATTGCTTACTCAGAA
CGTCGCATTAATCTTATATTTAATAGTGTGGTTTTTTTTTTTTTTGAAAAAAGGCTTTTA
ATAGTGTGGTTTGTTACTATCATTTTCAATATTTATTCCAAAGAAG


BQ
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AF RS1EL61TF U 1
AF RS1EL61JQ C 656
BS 1 706 RS1EL61TF
BS 707 707 RS1EL61JQ
BS 708 727 RS1EL61TF
BS 728 1246 RS1EL61JQ

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TTACACT

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DS 

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ATTTTGCACATTAACTTGATGCTTGCTAGGATGATCCATTCGTTTAACTGGATCCCGGTT
CCGGATTCTCCACCCGACCCGACCGAGACTTACGCGTTTACGGCCGTGATGAAGAATTCT
CTCAAAGCTCGGATCCAGTCAAGGACTTGATGGATACATTCGAGCTGGAACGGGTCAGGT
TTGTGATGTGTTAATTGTTATGCTTTTGTATCCGTGTGTGGTAATTAATAATTGCTTACT
CAGAACGTCGCATTAATCTTATATTTAATAGTGTGGTTTTTTTTTTTTTTGAAAAAAGGC
TTTTAATAGTGTGGTTTGTTACTATCATTTTCAATATTTATTCCAAAGAAG

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 2

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CGGTGATTGATTCAACCAAACCGCTACCTCCCCAAGCAACTTTTAGAGGACCATACATTA
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ATCGAATCAAAACCCACACAAACTGTAAACATGAGCTGTCCCGTTGGTCATATCTCTTTA
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GTCCAATCTATCCATTGAAATGGTTATGATTAATAGCTTGAGAATTTGATTTTTATTTTG
TTATAATGTCATAAGAATGCAAAAA


BQ
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AF RS1B404TF U 1
AF RS1CG41TF U 1
BS 1 348 RS1B404TF
BS 349 349 RS1CG41TF
BS 350 455 RS1B404TF
BS 456 505 RS1CG41TF

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TGGTTGTTTTCGCATCTGCAGGCTTAGCTTTCCCCTTTTACATGGCATCGTCAAAGAAAC
CGGTGATTGATTCAACCAAACCGCTACCTCCCCAAGCAACTTTTAGAGGACCATACATTA
ACACCGGTTCTCGCGATGTTGGACCTGACCATCGAACTTACCCTAAGAAATAATATCCCC
ATCGAATCAAAACCCACACAAACTGTAAACATGAGCTGTCCCGTTGGTTATATCTCTTTA
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GTCCAATCTATCCATTGAAATGGTTATGATTAATA

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GGCCAAAGACGCTGGTTTTGCCAATGGCACCATCACGTAACATGATTGTAGCCACGGGTC
TGGTTGTTTTCGCATCTGCAGGCTTAGCTTTCCCCTTTTACATGGCATCGTCAAAGAAAC
CGGTGATTGATTCAACCAAACCGCTACCTCCCCAAGCAACTTTTAGAGGACCATACATTA
ACACCGGTTCTCGCGATGTTGGACCTGACCATCGAACTTACCCTAAGAAATAATATCCCC
ATCGAATCAAAACCCACACAAACTGTAAACATGAGCTGTCCCGTTGGTCATATCTCTTTA
GTAGGAGTTTGTGATACAGTCCATTATGTTTCATTCATGTAACGCTGATGAATACAACCT
GTCCAATCTATCCATTGAAATGGTTATGATTAATAGCTTGAGAATTTGATTTTTATTTTG
TTATAATGTCATAAGAATGCAAAAA

QA 1 505 1 505
DS 



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GTTCATCACTCTCTCCTCTCCAGCGATCAAAAGACTTATCTTTCAAAAAAAACCATGAAC
CCAGATCCCTATCACCCTCAGCTCCCCACCATCTCGCCAAGCCGTTGAAGGAGAGCGGGT
TCCCTTACAAGATCCATATATTGAAGGATCACGACATGAGGGAGAGGCTGTGCCTTGAGA
TCGAGAGGCTTGGTTTGAGCGCTGTGATCATGGGGAGTAGAGGGTTCGGTGCTGAGAAGA
AAGGGAGTGATGGGAAGCTTGGGTCTGTTAGTGATTACTGTCTTCATCACTGTGTTTGTC
CTGTTGTTGTCGTTAGATACCCTGATGATCGTGATGGGCCTGTCGTTACTGTTAAGACCG
GTGTGGATGATGATGATGATGTTGGTGTTGCTGTTCATCATGAACACCATATCAAAGATG
AGTAACTCTTGTTGGGGTTTGATCAGGTTTAACACTCTCTACATCATCATCCAGGTGCAT
AAAGCAAGTAGGAGTTTGAGCGGAATGGTGGAGGAGTGTTTGTGTGTTCTATCTTTAGCG
ATCTCAGGGTTATGTTGGAGTCTCTTGTCTTCTCCATCTAATGTTTTCCTCATTAAACAT
GGAGTTTGTATGATTACTAAAACCTATTTTATTTTCTTAGGAAAGAAAAAGATTATGAAC
TTACAATAAAGATTATGGACTTACAATAAAGATTATGAAAAAGGTTTGCC


BQ
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AF RS1DL47TF U 1
AF RS1BQ31TF U 403
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GTTCATCACTCTCTCCTCTCCAGCGATCAAAAGACTTATCTTTCAAAAAAAACCATGAAC
CCAGATCCCTATCACCCTCAGCTCCCCACCATCTCGCCAAGCCGTTGAAGGAGAGCGGGT
TCCCTTACAAGATCCATATATTGAAGGATCACGACATGAGGGAGAGGCTGTGCCTTGAGA
TCGAGAGGCTTGGTTTGAGCGCTGTGATCATGGGGAGTAGAGGGTTCGGTGCTGAGAAGA
AAGGGAGTGATGGGAAGCTTGGGTCTGTTAGTGATTACTGTCTTCATCACTGTGTTTGTC
CTGTTGTTGTCGTTAGATACCCTGATGATCGTGATGGGCCTGTCGTTACTGTTAAGACCG
GTGTGGATGATGATGAT***GTTGGTGTTGCTGTTCATCATGAACACCATATCAAAGATG
AGTAACTCTTGTTGGGGTTTGATCAGGTTTAACACTCTCTACATCATCATCCAGGTGCAT
AAAGCAAGTAGGAGTTTGAGCGGAATGGTGGAGGAGTGTTTGTGTGTTCTATCTTTAGCG
ATCTCAGGGTTATGTTGGAGTCTCTTGTC

QA 1 629 1 629
DS 

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TT
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CACCATATCAAAGATGAGTAACTCTTGTTGGGGTTTGATCAGGTTTAACACTCTCTACAT
CATCATCCAGGTGCATAAAGCAAGTAGGAGTTTGAGCGGAATGGTGGAGGAGTGTTTGTG
TGTTCTATCTTTAGCGATCTCAGGGTTATGTTGGAGTCTCTTGTCTTCTCCATCTAATGT
TTTCCTCATTAAACATGGAGTTTGTATGATTACTAAAACCTATTTTATTTTCTTAGGAAA
GAAAAAGATTATGAACTTACAATAAAGATTATGGACTTACAATAAAGATTATGAAAAAGG
TTTGCC

QA 3 368 3 368
DS 



AS 1 2

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AAAAAAAAAAAAATCATACAAAAACTCACTTTAAAGAAAGAAAAGAAAAACAAAAAAAAA
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TTCCTTCTTTTTGATACAAGGCGCTTCCTTTTCTTCCTACTTGCTACGGAAATCTCTATC
TTCTTCTCAAACCATTTTCCCTATCAATTTTCCCTTGTGATTTCCATGAAAATTGTATTT
ATTTTGCTGAAATTTAATAATTTTTTTCCTTTCCCCTGAAACGCAAACTACTAACTCGGA
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TAGC


BQ
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AF RS1AC77JQ U 3
AF RS1AC77TF C 1
BS 1 2 RS1AC77TF
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BS 454 484 RS1AC77TF

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AAAAAAAAAAATCATACAAAAACTCACTTTAAAGAAAGAAAAGAAAAACAAAAAAAAACA
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TTTTAAAAGCAGCAAAATGATGATAAATAAAAAGAACCCTTCGAGCCTCTCTCCTCTTTT
CCTTCTTTTTGATACAAGGCGCTTCCTTTTCTTCCTACTTGCTACGGAAATCTCTATCTT
CTTCTCAAACCATTTTCCCTATCAATTTTCCCTTGTGATTTCCATGAAAATTGTATTTAT
TTTGCTGAAATTTAATAATTTTTTTCCTTTCCCCTGAAACGCAAACTACTAACTCGGAAC
ATAAGTCCCAATCCAGCCAAGCCCACTGATG

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DS 

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CACAAGAAGAAACAATTGAAATCTCAGTCACTGAATAACAAATCCCATAGCTAAATATTC
TTTTTTAAAAGCAGCAAAATGATGATAAATAAAAAGAACCCTTCGAGCCTCTCTCCTCTT
TTCCTTCTTTTTGATACAAGGCGCTTCCTTTTCTTCCTACTTGCTACGGAAATCTCTATC
TTCTTCTCAAACCATTTTCCCTATCAATTTTCCCTTGTGATTTCCATGAAAATTGTATTT
ATTTTGCTGAAATTTAATAATTTTTTTCCTTTCCCCTGAAACGCAAACTACTAACTCGGA
ACATAAGTCCCAATCCAGCCAAGCCCACTGATGAAGAAGGACATCGTCTGAAGAAACAAG
TAGC

QA 1 484 1 484
DS 



AS 1 2

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GGATTAGTTTCGGTTTTAGAGTTGTGGCGCTTGATCCTAACTTTAGGAAGCTTTCGATAC
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GGACTCTGATGCCTCAAAACTCTATTAATAAAGCTCCCAGCCAGGAAGTTATGGACTTCT
TGGATGAGCTTTGTGAGGACGAGAAGAATACTGTTTTCATTGTGAGCGGAAGAGGAAGGG
AAAGCTTAGGCGAATGGTTCTCTCCGTGTAAAAACGTTGGGATTGCAGCAGAGCATGGAT
ACTTCTTAAAGTGGCCAGGGAGTGAAGAATGGGAAACATGTGGCCAGGGAACTGATTTTG
GTTGGATGCAGATAGTGGAACCTGTAATGAAACAGTACACGGAATCTACAGATGGGTCTT
CCATTGAAGTAAAAGATAGTGCTCTGGTTTGGCAATACAGGGATGCAGATCCAGGCTTTG
GTTCTTTGCAATCAAAGGAAATGTTAGAGCATCTAGAGAGTGTTCTAGCTAATGAGCCTG
TTGCAGTCAAGAGCGGTCACTACATTGTAGAAGTCAAGCCTCAGGGAGTGAGCAAAGGAT
CTGTATCAGAAAAGATATTTTCATCAATGGGTGAAGATGGGAAGCCAGCTGATTTTGTGC
TCTGTATTGGAGATGACAGATCTGACGATGACATGTTTGAGGCGATTGGTAATGCAATGT
CGAAAAACTTGCTCTGCGCAGATGCTCTTGTGTTTGCATGCACAGTTGGGCAAAAACCAA
GCAAGGCTAAATATTATTTGGACGATACTATGGAAGTGAGGAGTATGCTTGAATCTCTAG
CTGAAGCATCAGAGGCTTCAAACTTTTCTATGCGTGAACTTGATGATGCCCTTTGATTTG
GAAACCAGAGTTTTGCCAGGTTTATGTCCTCTACTTGCTCTGTTTGTGCAACAAACGATG
GTCTTGTTCTCATAGAACAGTATCAATGATAATGTGCATAGATGGCTAAAGAGATGATAC
AGACAAAGACAAGGAACATAGCTGTGTGGTTTGGTCTGTTGTGATTGAAAGAAAGGATAA
AAGCTGATGTGAAATTTTGTTCTGTTCAGATGGTGTTTGGGGGGAGCAAAAGACGAGGAA
AATAGCTGTGTGGTTGGTTTCTTAAAAATCTTTGCAGGATGTTGAAGTAATAACAAGCAA
AAGCTTTGGTCTTTATTTTTTTCATTTCTAGTAGTATTATTAAAATTGTAATTAGATGAT
CTTGTTAAACTTTCATTTTG


BQ
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AF RS1GV22TF U 1
AF RS1GV22JQ C 541
BS 1 751 RS1GV22TF
BS 752 1340 RS1GV22JQ

RD RS1GV22TF 751 0 0
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GGATTAGTTTCGGTTTTAGAGTTGTGGCGCTTGATCCTAACTTTAGGAAGCTTTCGATAC
CGAGCATTGTGTCGGATTACAAGAGGGCGAAAAGGAGAGCGATACTGTTGGATTATGATG
GGACTCTGATGCCTCAAAACTCTATTAATAAAGCTCCCAGCCAGGAAGTTATGGACTTCT
TGGATGAGCTTTGTGAGGACGAGAAGAATACTGTTTTCATTGTGAGCGGAAGAGGAAGGG
AAAGCTTAGGCGAATGGTTCTCTCCGTGTAAAAACGTTGGGATTGCAGCAGAGCATGGAT
ACTTCTTAAAGTGGCCAGGGAGTGAAGAATGGGAAACATGTGGCCAGGGAACTGATTTTG
GTTGGATGCAGATAGTGGAACCTGTAATGAAACAGTACACGGAATCTACAGATGGGTCTT
CCATTGAAGTAAAAGATAGTGCTCTGGTTTGGCAATACAGGGATGCAGATCCAGGCTTTG
GTTCTTTGCAATCAAAGGAAATGTTAGAGCATCTAGAGAGTGTTCTAGCTAATGAGCCTG
TTGCAGTCAAGAGCGGTCACTACATTGTAGAAGTCAAGCCTCAGGGAGTGAGCAAAGGAT
CTGTATCAGAAAAGATATTTTCATCAATGGGTGAAGATGGGAAGCCAGCTGATTTTGTGC
TCTGTATTGGAGATGACAGATCTGACGATGA

QA 1 751 1 751
DS 

RD RS1GV22JQ 800 0 0
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TTGCAGTCAAGAGCGGTCACTACATTGTAGAAGTCAAGCCTCAGGGAGTGAGCAAAGGAT
CTGTATCAGAAAAGATATTTTCATCAATGGGTGAAGATGGGAAGCCAGCTGATTTTGTGC
TCTGTATTGGAGATGACAGATCTGACGATGACATGTTTGAGGCGATTGGTAATGCAATGT
CGAAAAACTTGCTCTGCGCAGATGCTCTTGTGTTTGCATGCACAGTTGGGCAAAAACCAA
GCAAGGCTAAATATTATTTGGACGATACTATGGAAGTGAGGAGTATGCTTGAATCTCTAG
CTGAAGCATCAGAGGCTTCAAACTTTTCTATGCGTGAACTTGATGATGCCCTTTGATTTG
GAAACCAGAGTTTTGCCAGGTTTATGTCCTCTACTTGCTCTGTTTGTGCAACAAACGATG
GTCTTGTTCTCATAGAACAGTATCAATGATAATGTGCATAGATGGCTAAAGAGATGATAC
AGACAAAGACAAGGAACATAGCTGTGTGGTTTGGTCTGTTGTGATTGAAAGAAAGGATAA
AAGCTGATGTGAAATTTTGTTCTGTTCAGATGGTGTTTGGGGGGAGCAAAAGACGAGGAA
AATAGCTGTGTGGTTGGTTTCTTAAAAATCTTTGCAGGATGTTGAAGTAATAACAAGCAA
AAGCTTTGGTCTTTATTTTTTTCATTTCTAGTAGTATTATTAAAATTGTAATTAGATGAT
CTTGTTAAACTTTCATTTTG

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 2

CO CL5895Contig1 1036 2 2 U
GGAAATCGAGGAACTTCATAATAAGCGAGGAGCACTTCTTCTCGATCTCTCCTTGGTGCT
CGGGAGAGAGAGAGAGAGATCATTTTCTTGTTGAAGACTGAGGAGAAATAGAGAGAGAGA
AGAAGAAATCTGCAAAATTTATATTTGAGCAATTTATTCTCCTATACAAGAAGAGGGGAA
GAAAAATGGATGATGTTGGTGGTTTACAAGAGGCAGCTGGAGCCAGATTTAGCCAGGTTG
AGTTGATTGGTAGAGGTTCCTTTGGTGACGTCTACAAAGCGTTTGATTCGTACCTTAACA
AAGAAGTTGCCATTAAAGTTATTGATCTAGAAGAATCAGAAGATGAGATTGAAGATATTC
AGAAGGAAATTTCAGTATTATCACAATGCCGCTGCCCATATATCACGGAATACTATGGTT
CTTACCTCCACCAGACCAAATTATGGATCATCATGGAATATATGGCTGGTGGCTCAGTTG
CTGACCTGCTACAACCAGGTCATCCATTGGATGAAATTTCAATTGCTTGTATTACGCGGG
ATCTACTTCATGCTGTTGAATATCTCCACACTGAGGGAAAGATCCACAGAGATATCAAAG
CCGCAAATATTTTGCTGTCCGAGAATGGTGATGTTAAGGTTGCGGATTTTGGTGTATTTG
CACAATTAACCCGGACAATTTCAAGAAGAAAGACATTTGTAGGAACACCATTTTGGATGG
CACCGGAAGTTATTCAGAATTCAGAAGGGTATAATGAGAAGGCAGATATATGGTCGCTCG
GAATCACAATGATTGAGATGGCAAAAGGAGAACCTCCCCTTGCTGACCTTCATCCTATGA
GAGTGCTTTTTATCATTCCCCGGGAAAGCCCTCCTCAGTTAGATGAACACTTTTCACGTC
CCTTGAAGGAATTTGTTTCATTATGCTTGAAAAAGGCTCCTGCTGAGAGACCAAGTGCCA
AAGAACTTTTCAAACATAGATTTATAAAGAGTGCTAGGAAAAGCCCGAAACTTCTCGACA
GAATAATAGAGCGACC


BQ
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AF RS1F935TF U 1
AF RS1F935JQ C 415
BS 1 633 RS1F935TF
BS 634 1036 RS1F935JQ

RD RS1F935TF 633 0 0
GGAAATCGAGGAACTTCATAATAAGCGAGGAGCACTTCTTCTCGATCTCTCCTTGGTGCT
CGGGAGAGAGAGAGAGAGATCATTTTCTTGTTGAAGACTGAGGAGAAATAGAGAGAGAGA
AGAAGAAATCTGCAAAATTTATATTTGAGCAATTTATTCTCCTATACAAGAAGAGGGGAA
GAAAAATGGATGATGTTGGTGGTTTACAAGAGGCAGCTGGAGCCAGATTTAGCCAGGTTG
AGTTGATTGGTAGAGGTTCCTTTGGTGACGTCTACAAAGCGTTTGATTCGTACCTTAACA
AAGAAGTTGCCATTAAAGTTATTGATCTAGAAGAATCAGAAGATGAGATTGAAGATATTC
AGAAGGAAATTTCAGTATTATCACAATGCCGCTGCCCATATATCACGGAATACTATGGTT
CTTACCTCCACCAGACCAAATTATGGATCATCATGGAATATATGGCTGGTGGCTCAGTTG
CTGACCTGCTACAACCAGGTCATCCATTGGATGAAATTTCAATTGCTTGTATTACGCGGG
ATCTACTTCATGCTGTTGAATATCTCCACACTGAGGGAAAGATCCACAGAGATATCAAAG
CCGCAAATATTTTGCTGTCCGAGAATGGTGATG

QA 1 633 1 633
DS 

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ATGGTTCTTACCTCCACCAGACCAAATTATGGATCATCATGGAATATATGGCTGGTGGCT
CAGTTGCTGACCTGCTACAACCAGGTCATCCATTGGATGAAATTTCAATTGCTTGTATTA
CGCGGGATTTACTTCATGCTGTTGAATATTTCCACACTGAGGGAAAGATCCACAGAGATA
TCAAAGCCGCAAATATTTTGCTGTCCGAGAATGGTGATGTTAAGGTTGCGGATTTTGGTG
TATTTGCACAATTAACCCGGACAATTTCAAGAAGAAAGACATTTGTAGGAACACCATTTT
GGATGGCACCGGAAGTTATTCAGAATTCAGAAGGGTATAATGAGAAGGCAGATATATGGT
CGCTCGGAATCACAATGATTGAGATGGCAAAAGGAGAACCTCCCCTTGCTGACCTTCATC
CTATGAGAGTGCTTTTTATCATTCCCCGGGAAAGCCCTCCTCAGTTAGATGAACACTTTT
CACGTCCCTTGAAGGAATTTGTTTCATTATGCTTGAAAAAGGCTCCTGCTGAGAGACCAA
GTGCCAAAGAACTTTTCAAACATAGATTTATAAAGAGTGCTAGGAAAAGCCCGAAACTTC
TCGACAGAATAATAGAGCGACC

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 2

CO CL5896Contig1 679 2 4 U
TCGATCATGAAGTGTGGTCAAATTCGATCTGTAAGTTGTAGAAAATAAATAAAGAAAATG
GAAACTTTTGCCTTTTAGAGGTTTGATGCATTATCTTGGTAGGTTTGTCTTAATGGTGCT
ATTTGCTTGACTTTATCAGTTGCAGATTTATAAAATTAATTTCTTTTTGTGGATCCCAGC
ATATATTTCTTTTGATTCTGGCTAGGCTTGACATGAATGTTTAAGATTGTGTATATGATT
TTATGGAACTGGCTGATTCCTTTGGAACAGGTGTTTTAAAAACAAGCGAATTAGCAATGT
CCAAGCCCGTCATGCTCGTCTGTCTACTAGTTATACTTATAGTCACCTCTCAGTTTGAAT
GGAGACAACCACTCGTTGACCTTGATTCACCCACCACTATCTCTCAGAAACAGCAGCAAT
TTTCAGACAAGGAAGAAGCTGTCAAAGAGAAGATCATCATATCGCAAGAGAGACATATCC
AGAAGCTAAATGAGCTTGTCAGGAGTCTTCAGTTGCAGTTGCTGCAATGCAAAGGGAGAT
AATGGGACCCAAAATGCCACCAAAAGCTTTCATTCAGATAAACAATTCATTGAGTCGAGA
GGAAACAAATCTTTCAAGGCTAATCTCCCCTGCAAAAATGAAATGATACGTCAAAGATCA
CTCACTCTTTATAATGTAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A271TF U 1
AF RS1A271TV U 178
BS 1 532 RS1A271TF
BS 533 533 RS1A271TV
BS 534 633 RS1A271TF
BS 634 679 RS1A271TV

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GAAACTTTTGCCTTTTAGAGGTTTGATGCATTATCTTGGTAGGTTTGTCTTAATGGTGCT
ATTTGCTTGACTTTATCAGTTGCAGATTTATAAAATTAATTTCTTTTTGTGGATCCCAGC
ATATATTTCTTTTGATTCTGGCTAGGCTTGACATGAATGTTTAAGATTGTGTATATGATT
TTATGGAACTGGCTGATTCCTTTGGAACAGGTGTTTTAAAAACAAGCGAATTAGCAATGT
CCAAGCCCGTCATGCTCGTCTGTCTACTAGTTATACTTATAGTCACCTCTCAGTTTGAAT
GGAGACAACCACTCGTTGACCTTGATTCACCCACCACTATCTCTCAGAAACAGCAGCAAT
TTTCAGACAAGGAAGAAGCTGTCAAAGAGAAGATCATCATATCGCAAGAGAGACATATCC
AGAAGCTAAATGAGCTTGTCAGGAGTCTTCAGTTGCAGTTGCTGCAATGCAA*GGGAGAT
AATGGGACCCAAAATGCCACCAAAAGCTTTCATTCAGATAAACAATTCATTGAGTCGAGA
GGAAACAAATCTTTCAAGGCTAATCTCCCCTGC

QA 1 633 1 633
DS 

RD RS1A271TV 502 0 0
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ATTTTATGGAACTGGCTGATTCCTTTGGAACAGGTGTTTTAAAAACAAGCGAATTAGCAA
TGTCCAAGCCCGTCATGCTCGTCTGTCTACTAGTTATACTTATAGTCACCTCTCAGTTTG
AATGGAGACAACCACTCGTTGACCTTGATTCACCCACCACTATCTCTCAGAAACAGCAGC
AATTTTCAGACAAGGAAGAAGCTGTCAAAGAGAAGATCATCATATCGCAAGAGAGACATA
TCCAGAAGCTAAATGAGCTTGTCAGGAGTCTTCAGTTGCAGTTGCTGCAATGCAAAGGGA
GATAATGGGACCCAAAATGCCACCAAAAGCTTTCATTCAGATAAACAATTCATTGAGTCG
AGAGGAAACAAATCTTTCAAGGCTAATCTCCCCTGCAAAAATGAAATGATACGTCAAAGA
TCACTCACTCTTTATAATGTAT

QA 1 502 1 502
DS 



AS 1 2

CO CL5897Contig1 764 2 2 U
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CTTGGATCTCTTTCTTTCTTCTCATCACTTCCTCTCCCTCTAAAGTTTTCACCTTCTTTT
ACTGAAGAGGAAGCTCTAATCTTCTGATAGCAAGGTTTCTCTTTTAGCTTCGATTTGCTC
TCTACGGATCTCTAAATCTTCTAATTCGAGAAGATGCTTCCTCTTTCGCTGCTCAAGACT
GCTCAAGGGTATCCCATGCTTGTGGAGCTCAAGAATGGAGAGACCTACAATGGGCATTTA
GTAAATTGCGATACGTGGATGAACATTCATCTGCGTGAAGTCATCTGCACATCAAAGGAC
GGAGACAGGTTTTGGAGGATGCCCGAATGTTACATCCGCGGTAACACAATCAAGTACCTT
CGAGTTCCAGATGAGGTGATTGATAAAGTACAGGAGGAGAAGACCCGTACAGATAGAAAA
CCACCGGGGGTTGGACGTGGAAGAGGACGTGGTATGGATGATGGAGGGGGCAGAGGCCGA
GGCCGAGGAGCTCCAATGGCGAAGATGACTGGCAACAGAGGAGCAGGTCGTGGCCGTGGT
TGATACAACAACTTATATAAAAAGACTATCCAATCTCTGCTGCTGCTGCTGCTGCACTCG
CATTTTAAGAGTTCTCTTGTTTGTTCTTTTTTTCATCTTTGAGCTGAATATATAAAACTA
AATCACAATGAGCCGAATATAAAAAAATTCGAAGCTGTTCTAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GG26TF U 1
AF RS1GG26JQ C 126
BS 1 576 RS1GG26TF
BS 577 764 RS1GG26JQ

RD RS1GG26TF 576 0 0
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CTTGGATCTCTTTCTTTCTTCTCATCACTTCCTCTCCCTCTAAAGTTTTCACCTTCTTTT
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TCTACGGATCTCTAAATCTTCTAATTCGAGAAGATGCTTCCTCTTTCGCTGCTCAAGACT
GCTCAAGGGTATCCCATGCTTGTGGAGCTCAAGAATGGAGAGACCTACAATGGGCATTTA
GTAAATTGCGATACGTGGATGAACATTCATCTGCGTGAAGTCATCTGCACATCAAAGGAC
GGAGACAGGTTTTGGAGGATGCCCGAATGTTACATCCGCGGTAACACAATCAAGTACCTT
CGAGTTCCAGATGAGGTGATTGATAAAGTACAGGAGGAGAAGACCCGTACAGATAGAAAA
CCACCGGGGGTTGGACGTGGAAGAGGACGTGGTATGGATGATGGAGGGGGCAGAGGCCGA
GGCCGAGGAGCTCCAATGGCGAAGATGACTGGCAAC

QA 1 576 1 576
DS 

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AGGGTATCCCATGCTTGTGGAGCTCAAGAATGGAGAGACCTACAATGGGCATTTAGTAAA
TTGCGATACGTGGATGAACATTCATCTGCGTGAAGTCATCTGCACATCAAAGGACGGAGA
CAGGTTTTGGAGGATGCCCGAATGTTACATCCGCGGTAACACAATCAAGTACCTTCGAGT
TCCAGATGAGGTGATTGATAAAGTACAGGAGGAGAAGACCCGTACAGATAGAAAACCACC
GGGGGTTGGACGTGGAAGAGGACGTGGTATGGATGATGGAGGGGGCAGAGGCCGAGGCCG
AGGAGCTCCAATGGCGAAGATGACTGGCAACAGAGGAGCAGGTCGTGGCCGTGGTTGATA
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TAAGAGTTCTCTTGTTTGTTCTTTTTTTCATCTTTGAGCTGAATATATAAAACTAAATCA
CAATGAGCCGAATATAAAAAAATTCGAAGCTGTTCTAAG

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 2

CO CL5898Contig1 924 2 6 U
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CTTATCAAAATCCGTTCGAAAGACGCCCAATCGTGAAATCCATGGCTCCTGCTGTTAAGT
GGATCAAGGAGTGGGTTCCACAAGATATTGTTGCTACAGGTGGGAAGTGTTATCTTCACA
AATGGGTCACAGAGGAAACGGTGAAGAGACTGAAAGAAACAGAGAAAGTATCAAGGACTC
CCAAAACACCTGCAACGGTTTATGGCTCAGCAACTTCGGAACGGCCATATGCATGCCCTT
ACGAAGGGTGTGAGAAGGCTTACATACATGAGTACAAGCTTAAACTCCACTTGAAGAGAG
AGCATCCAGGGCATTTACCAGAAGAGAACGCAGAGAACCCCACACCCAACAAGCAAGAGT
TGGAAGAAGGCAGTGACCAAGATTTTTACCGGAAACACGCTAGCAACGGGAAAAGCCAGA
CGCATAATAAACTGCAGAGCAGAGCTAAGCCAAACATGAGGACACCACCAGCCAAAGCTA
GAAAGAAAGGCTCAACCTCTTCACCGGCCAAAGCAAGGATTGCCAAAAAACCATGGCAAG
TAAAAGAAACGTATGAAGGAGAAAGAGAAGAAGAGGAAGAAGATAGTGAGGAGACTGAGG
AAGATAGAGAGAACGTGTATGATGGGCTGGAGGTTTGGGGGAAACAATGAAGAGGAGGAC
GATGAAGAGACCGAGGATGAAGGCTAAGATATTGCTTGTCTGAAAGCCGTAGGCAGATAT
TTTGGCTATCTTTCCATATTTATATGGGAAGGTAAAATTGAATGAGTTACTGTGTTTTTT
CATTCCTCCTTTTTTTTTCGTTTGCATCCGCTTGACAATTTTTTAGTTTTAAAGCTCTGT
ACAGTTACTGGGTTTTCGCAACAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AJ10TF U 1
AF RS1AJ10JQ C 306
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CTTATCAAAATCCGTTCGAAAGACGCCCAATCGTGAAATCCATGGCTCCTGCTGTTAAGT
GGATCAAGGAGTGGGTTCCACAAGATATTGTTGCTACAGGTGGGAAGTGTTATCTTCACA
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TAAAAGAAACGTATGAAGGAGAAAGAGAAGAAGAGGAAGAAGATAGTGAGGAGACTGAGG
AAGATAGAGAGAACGTGTATGATGGGCTGGAGGTTTGGGGGAAACAATGAAGAGGAGGAC
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TTTGGCTATCTT

QA 1 792 1 792
DS 

RD RS1AJ10JQ 619 0 0
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AATAAACTGCAGAGCAGAGTTAAGCCAAACATGAGGACACCCCCAGCCAAAGCTAGAAAG
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GAAACGTATGAAGGAGAAAGAGAAGAAGAGGAAGAAGATAGTGAGGAGACTGAGGAAGAT
AGAGAGAACGTGTATGATGG*CTGGAGGTTTGGGGGAAACAATGAAGAGGAGGACGATGA
AGAGACCGAGGATGAAGGTTAAGATATTGCTTGTTTGAAAGCCGTAGGCAGATATTTTGG
CTATCTTTCCATATTTATATGGGAAGGTAAAATTGAATGAGTTACTGTGTTTTTTCATTC
CTCCTTTTTTTTTCGTTTGCATCCGCTTGACAATTTTTTAGTTTTAAAGCTCTGTACAGT
TACTGGGTTTTCGCAACAT

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 2

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TTAAGTTCAATGGTCTAAATTAAAAACCTTATTACCATGACTGGTCCAAAAAAAAAGCAT
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TTTCCAATACTTAGCGATATCCTCCAACGACATCTTAGCAGTCTTATCTTCACCACCACT
AACCTTTGCAGCTGCTGCTATATGTGCAATCCGGCTAGGAAGCCCTTCAATCTCTTTCAG
TACCTGTAAAATGTGTGTGATGAGTCTGTCTGCAAGGCCTCGGCTAAAGTCTTCCCCGAT
AACAACTCTAAGCACAGCAATGTGTTGTGCATCAGCAGGCATAGTGTAAGCTGGTATGAT
CCACCCAAACTTCCTCAAAGACTCTGCAATCTCAAACACTGTGTGTTTGCTACTGTCCTT
GAGAGAGAATGCAACTAGTGGCACACCAATATCTTTAGACACAATGTTGAACCTCCCTGT
CATCTCTATTCCTTCTCTTAGCCTCCTTGCATTGTCCATGCAGTTTTCCATTATGTTCTT
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TTTAGAGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E117JQ U 1
AF RS1G722JQ U 87
BS 1 233 RS1E117JQ
BS 234 234 RS1G722JQ
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BS 430 430 RS1G722JQ
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BS 478 557 RS1E117JQ
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RD RS1E117JQ 559 0 0
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CCACCCAAACTTCCTCA
GA

QA 1 557 1 557
DS 

RD RS1G722JQ 703 0 0
CG
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ATCTCAAACACTGTGTGTTTGCTACTGTCCTTGAGAGAGAATGCAACTAGTGGCACACCA
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GCATTGTCCATGCAGTTTTCCATTATGTTCTTGTATCCCTCAAATCCTAGGCGGATAAAC
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QA 3 703 3 703
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1D552JQ C 1
AF RS1D552TF U 1
BS 1 453 RS1D552TF

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AAAAAAAATTACTCTGTTTTTATGTTTCTTTCTCTTTTGAGAGTTTGTGTTAAAGACTCT
TTTTTTTTATCATTGATGGTTAGTTTGTTGTCAAAAAACTACTCTTATCGGATTCAACAG
ACTTGAGTTTTCACCATCAAAGAAAGGGCTCTGCTTTGGGTTTTGATTGTTTGCTTTTTG
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AATGCTATTAGCGGCTAAAAATTAGCCTTCTTC

QA 1 453 1 453
DS 

RD RS1D552TF 453 0 0
GCAGAGGAACAGACGAAGAGACGCATTTCAATGTGAAGATCGTGTCGAAAGGATTCGAAG
GGATGAATCTGGTGAAGAGACACAGGCTCGTTTACGATCTGCTCAGGGAGGAGCTTGATA
GTGGATTGCACGCGCTTTCCATCGTCTCCAAGACTCCCTCCGAGTCCACTCGCTAGCAAT
AAAAAAAATTACTCTGTTTTTATGTTTCTTTCTCTTTTGAGAGTTTGTGTTAAAGACTCT
TTTTTTTTATCATTGATGGTTAGTTTGTTGTCAAAAAACTACTCTTATCGGATTCAACAG
ACTTGAGTTTTCACCATCAAAGAAAGGGCTCTGCTTTGGGTTTTGATTGTTTGCTTTTTG
AATTGGTTAGAGAGTTCACTTTTCTGGTATTCAAAGTTTCAATGTTCATGGCTTGATCAA
AATGCTATTAGCGGCTAAAAATTAGCCTTCTTC

QA 1 453 1 453
DS 



AS 1 2

CO CL5901Contig1 458 2 1 U
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GATCGATTAGTTTGGAGCTCCAACGACTTGGGATCGGTAGAAATGGGAGGAGCTGACTGG
GGTCCGGTGGCGGTAGCGGTGGTGCTGTTCGTAGTGTTATCTCTGGGACTTCTCTTTCAG
TTGCCAGCGAGAAGAAGGGTGTTGGAGTGCGGCAACATGACCACGAGTGGCATATCCATA
TTGGTTCATGCCATCCTTTTTTTCGCTATTATCACGATTTTGGTCATCGCCATTCAAATT
CACATCCACATCTAGTTTGTGTGGGTTTTTTTATTTCTCCTATAATTATAAAAGGTCTAC
AAGTTAGGCTGTACAAATTCCCCCTCATGGGATCGATGTTGGTGTAAAATCATGGAATGC
ATTATTCAAGAATCAACAATATAAATTATCTTCGTTAT


BQ
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AF RS1DZ56JQ C 1
AF RS1DZ56TF U 1
BS 1 458 RS1DZ56TF

RD RS1DZ56JQ 458 0 0
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GATCGATTAGTTTGGAGCTCCAACGACTTGGGATCGGTAGAAATGGGAGGAGCTGACTGG
GGTCCGGTGGCGGTAGCGGTGGTGCTGTTCGTAGTGTTATCTCTGGGACTTCTCTTTCAG
TTGCCAGCGAGAAGAAGGGTGTTGGAGTGCGGCAACATGACCACGAGTGGCATATCCATA
TTGGTTCATGCCATCCTTTTTTTCGCTATTATCACGATTTTGGTCATCGCCATTCAAATT
CACATCCACATCTAGTTTGTGTGGGTTTTTTTATTTCTCCTATAATTATAAAAGGTCTAC
AAGTTAGGCTGTACAAATTCCCCCTCATGGGATCGATGTTGGTGTAAAATCATGGAATGC
ATTATTCAAGAATCAACAATATAAATTATTTTCGTTAT

QA 1 458 1 458
DS 

RD RS1DZ56TF 458 0 0
GGATATGTTATACAATAAATTTTGGCTCTAGTTAATTACTTCTTTGATAGCTGATAAAAC
GATCGATTAGTTTGGAGCTCCAACGACTTGGGATCGGTAGAAATGGGAGGAGCTGACTGG
GGTCCGGTGGCGGTAGCGGTGGTGCTGTTCGTAGTGTTATCTCTGGGACTTCTCTTTCAG
TTGCCAGCGAGAAGAAGGGTGTTGGAGTGCGGCAACATGACCACGAGTGGCATATCCATA
TTGGTTCATGCCATCCTTTTTTTCGCTATTATCACGATTTTGGTCATCGCCATTCAAATT
CACATCCACATCTAGTTTGTGTGGGTTTTTTTATTTCTCCTATAATTATAAAAGGTCTAC
AAGTTAGGCTGTACAAATTCCCCCTCATGGGATCGATGTTGGTGTAAAATCATGGAATGC
ATTATTCAAGAATCAACAATATAAATTATCTTCGTTAT

QA 1 458 1 458
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

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GGCTAGCTGCATTCTTTTTCATTTTCCTGGACTAAGATAAATCATAAAAGGACATCACAA
CTACTAAAAAAAAAAACTACTACTAAAATTGGTGCATATGCGTAACGACGAGAACAATAT
AAAACCACATATAATGGATCAACACACGCACGTATCCAAATTGCAAAGGGAACACGGCGG
GTTGTGGTCCAAGCAAGGATCAACATCGTTGTTGTAAATATCATAATGACAATAATAATA
TACACATGTCCAAGTATTCATAAATTGAATTTGTCAATTGCGCGAGTCCGTTTGGCGCTA
TTCCTTTTTATTTTTAACATTTTATCAAATCTTCTACCGATCGACCATACATTAAATAAT
CATATACTGTATAATATTACACAAAATCAGAATCCGGCATAAACACTAATGAAAACCATT
GAATTGCATAATCTGTAATTCTCTTATTATGTCGCTTTTGGTATAGTTCATACTTTCATA
AAATGATCAAACATATTGTAATTCCACATTTATAATCAATCACAAGATTTTCCATATTAG
TAACTCTCTTTTAACTTTTTCGTTAAAAGATAACCCTTTTAATAATAAAAATCCACCATT
CTCCTACACATATTATATATTTATATTGATTTTCTGTCAGACAACTTCACCAGTTTTGAC
CCAAAAAAAAACTTCACCAGGTAGTTCTTTTTTTCTTGAAACACTTCACCAGTTAGTTCT
GCAGTTTTATTTCATTTCATCAATCAACGTGTTCACAACATTTATTACGGTTATTATTAA
CAAAAAAAACCATTAGGGTTTGAAGAATTTATTAAAACAATACTAACTTTTACTGGGACT
AAACAACACTGACTACTTCATAAATAACGTTGCCAGACCAAAAGGATAAAATAACGGTGA
GTTAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FM84TF U 1
AF RS1FM84JQ C 226
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BS 683 968 RS1FM84JQ

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AAAACCACATATAATGGATCAACACACGCACGTATCCAAATTGCAAAGGGAACACGGCGG
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TACACATGTCCAAGTATTCATAAATTGAATTTGTCAATTGCGCGAGTCCGTTTGGCGCTA
TTCCTTTTTATTTTTAACATTTTATCAAATCTTCTACCGATCGACCATACATTAAATAAT
CATATACTGTATAATATTACACAAAATCAGAATCCGGCATAAACACTAATGAAAACCATT
GAATTGCATAATCTGTAATTCTCTTATTATGTCGCTTTTGGTATAGTTCATACTTTCATA
AAATGATCAAACATATTGTAATTCCACATTTATAATCAATCACAAGATTTTCCATATTAG
TAACTCTCTTTTAACTTTTTCGTTAAAAGATAACCCTTTTAATAATAAAAATCCACCATT
CTCCTACACATATTATATATTT

QA 1 682 1 682
DS 

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ATGACAATAATAATATACACATGTCCAAGTATTCATAAATTGAATTTGTCAATTGCGCGA
GTCCGTTTGGCGCTATTCCTTTTTATTTTTAACATTTTATCAAATCTTCTACCGATCGAC
CATACATTAAATAATCATATACTGTATAATATTACACAAAATCAGAATCCGGCATAAACA
CTAATGAAAACCATTGAATTGCATAATCTGTAATTCTCTTATTATGTCGCTTTTGGTATA
GTTCATACTTTCATAAAATGATCAAACATATTGTAATTCCACATTTATAATCAATCACAA
GATTTTCCATATTAGTAACTCTCTTTTAACTTTTTCGTTAAAAGATAACCCTTTTAATAA
TAAAAATCCACCATTTTCCTACACATATTATATATTTATATTGATTTTCTGTCAGACAAC
TTCACCAGTTTTGACCCAAAAAAAAACTTCACCAGGTAGTTCTTTTTTTCTTGAAACACT
TCACCAGTTAGTTCTGCAGTTTTATTTCATTTCATCAATCAACGTGTTCACAACATTTAT
TACGGTTATTATTAACAAAAAAAACCATTAGGGTTTGAAGAATTTATTAAAACAATACTA
ACTTTTACTGGGACTAAACAACACTGACTACTTCATAAATAACGTTGCCAGACCAAAAGG
ATAAAATAACGGTGAGTTAGACC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

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CAATCCTCCCAACGGACCAACAAACATTTCTAAAAAAAAAGTCTGAAACTTTGATACCTT
TAAGCGTGGGAGCTGATGATTCCATTAACACCAGTTTCCTTAGCTCATAGGTTACTATCT
TGTCCAACCTCGTCTTCTTCTTCATCAAAATCGAGAGTGAAGTTACTTAAATTTTCCATC
TCAGCTCCGAGAGGCCGATACTTAGAGTGATCCTCCTCACGGAGATAACCTTTCCTGTTC
GCAACGACAGAGAACAACGCAGTAGCTAAAACCACCATGAGAGCCAAATGGCAGTTAAAC
TGAAGCGTAGCTATAGCTTTGGCCCTGTGATAATCACCGTGCCCTCTGCACTTGATGGTG
AAATTGCCTCTGGTCTTCTCGTGAAAGGAGCAGTTGTTAGTGATCAAACCGGTGAAAAAC
GAAACACCCATCTGCAGAAACCACGTGCCTTGCAGAATCAAACCGATCCCGCGCCCTAGC
TTCGCGAACTGACGATGCGTGGTGTTGTTAGAGTCGGATCTAAGGTCGAAGAGGGTGGAG
AAGACGCAGATGGCGATGGGGACGAGCATGAGATCGTAGTAGCGATTCTCGATTCCGGAT
GTGTCCTTCTTCTGGAGGTAGAACATGAGAAACTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CG89JQ U 2
AF RS1CG89TF C 1
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RD RS1CG89JQ 236 0 0
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TGATGATTCCATTAACACCATTTTCCTTAGCTCATAGGTTACTATCTTGTCCAACCTCGT
CTTCTTCTTCATCAAAATCGAGAGTGAAGTTACTTAAATTTTCC

QA 13 236 13 236
DS 

RD RS1CG89TF 696 0 0
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CAATCCTCCCAACGGACCAACAAACATTTCTAGAAAAAAAGTCTGAAACTTTGATACCTT
TAAGCGTGTGAGCTGATGATTCCATTAACACCAGTTTCCTTAGCTCATAGGTTACTATCT
TGTCCAACCTCGTCTTCTTCTTCATCAGAATCGAGAGTGAAGTTACTTAAATTTTCCATC
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GCAACGACAGAGAACAACGCAGTAGCTAAAACCACCATGAGAGCCAAATGGCAGTTAAAC
TGAAGCGTAGCTATAGCTTTGGCCCTGTGATAATCACCGTGCCCTCTGCACTTGATGGTG
AAATTGCCTCTGGTCTTCTCGTGAAAGGAGCAGTTGTTAGTGATCAAACCGGTGAAAAAC
GAAACACCCATCTGCAGAAACCACGTGCCTTGCAGAATCAAACCGATCCCGCGCCCTAGC
TTCGCGAACTGACGATGCGTGGTGTTGTTAGAGTCGGATCTAAGGTCGAAGAGGGTGGAG
AAGACGCAGATGGCGATGGGGACGAGCATGAGATCGTAGTAGCGATTCTCGATTCCGGAT
GTGTCCTTCTTCTGGAGGTAGAACATGAGAAACTCC

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

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ATGGTTCTAAGTCGAGCGGCCCGCGAAAGTGACGAAAATGTTTGCTCGACGTTCGGATCT
CGCTATGTCCGCACTTCACTGCCCAAGTATGAGATTGGTGAGGGCTCGATACCGAAAGAG
GCTGCGTATCAGATCATAAAAGATGAGCTGATGCTTGATGGTAACCCGAGGCTTAACCTG
GCTTCCTTTGTGACGACATGGATGGAGCCTGAGTGTGACAAACTCATCATGGAATCTATC
AACAAGAACTACGTCGACATGGACGAGTATCCTGTCACCACCGAGCTCCAGAACCGATGT
GTAAACATGATAGCTCGGCTGTTCAATGCACCACTTGGGGAAACTGAGACCGCCATGGGA
GTAGGCACTGTTGGGTCTTCGGAAGCCATCATGTTAGCCGGACTAGCCTTCAAAAGGAAT
TGGCAGAACAAACGCAAAGCTGAGGGTAAACCCTATGACAAACCCAACATTGTCACCGGA
GCCAATGTTCAAGTGTGCTGGGAGAAATTCGCTAGGTACTTCGAGGTGGAGCTAAAAGAA
GTGAAGCTTAGTGAAGGTTACTACGTGATGGATCCAGATAAAGCAGCTGAAATGGTAGAC
GAGAACACAATCTGTGTTGCTGCCATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1FM96TF U 1
AF RS1G286TF U 15
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BS 463 463 RS1G286TF
BS 464 532 RS1FM96TF
BS 533 687 RS1G286TF

RD RS1FM96TF 532 0 0
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GTAAACATGATAGCTCGGCTGTTCAATGCACCACTTGGGGAAACTGAGACCGCCATGGGA
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QA 1 532 1 532
DS 

RD RS1G286TF 673 0 0
AGGG
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GCTGAGGGTAAACCCTATGACAAACCCAACATTGTCACCGGAGCCAATGTTCAAGTGTGC
TGGGAGAAATTCGCTAGGTACTTCGAGGTGGAGCTAAAAGAAGTGAAGCTTAGTGAAGGT
TACTACGTGATGGATCCAGATAAAGCAGCTGAAATGGTAGACGAGAACACAATCTGTGTT
GCTGCCATA

QA 5 673 5 673
DS 



AS 1 2

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CTCCGCCGCAACAACCTCCCACTCTCTCTCCTCTGGAGAACTCTTACGCAGTTTCCAAAT
TCGAGCAGAACAACCCTGGAGTCGAGGCTTACGACGTCGTTTACTCGACCAAAGTCTCTC
AAGCCGGTAAGCTTTTGGGCTTACTATAAAACCCGACCCGAATGCCGACCGGTTCAGAAT
CTGCTGTTCTCCGATTGTAAACTGGGTATCAACGATTTGCCCAACTTCGTGTACGAGATC
GAGTGGGATGTGATTTTGGTTGATGGGCCGCGTGGGTACGCCGGAGATTCCCCGGGAAGG
ATGGCTCCGATTTTTACGTCGGCGGTTTTGGCGAAGAGCAAAGATTCCGGCGAGAAGAAG
AAGAAGAAGACGACGGATGTTTTTGTGCATGAGTTCGGGAGGAAGCTTGAGAGAGTGTAC
AGTGAGGAGTTTCTGTGTGAGGAGAATCTGATTGAGGTCGTCGGAGAGTTGGGGCATTTT
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TTGTCGGAGCCATTTACGCCGGATATTGGTGGAGATGCAGAGGTCGGTGTCGATGATGAC
TGAAAGTGAGTTACTTTTGGACTTTTGGTGGCTCTTTTGTAATTAATCTAGCTTTGAGGT
TTTTTTTTTACTGTCGTTTAGTTTTCTCGTATGTTTTAATTTGGAGACGGTTACGCATGA
AACCATGATGTAATCCAAAATTCCAAATATAAATGTCAACTATATGATGAAAGCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CC47TF U 1
AF RS1CC47JQ C 277
BS 1 685 RS1CC47TF
BS 686 686 RS1CC47JQ
BS 687 696 RS1CC47TF
BS 697 697 RS1CC47JQ
BS 698 738 RS1CC47TF
BS 739 1017 RS1CC47JQ

RD RS1CC47TF 738 0 0
GGAACACATTTCGTCTTTGTTCTCTCATTCTTTCTTTTCTTTTCTTCAGATAAAAAAAAA
AAGTCCGAAAATGAAGAACAATGCAGATACTAATTTGATCCTCTTCCACCACCACACTCC
CCTAACCTCAAAATCAGCTTCCGCCATCGCCGCCGCGAATCACCACCGTCTCTTGTTCAT
CTTCTTCCTATCTTTCTTCACCTTTCTCTTCTCTCTCACTCTCTTCTCATCCTCACTCCA
CTCCGCCGCAACAACCTCCCACTCTCTCTCCTCTGGAGAACTCTTACGCAGTTTCCAAAT
TCGAGCAGAACAACCCTGGAGTCGAGGCTTACGACGTCGTTTACTCGACCAAAGTCTCTC
AAGCCGGTAAGCTTTTGGGCTTACTATAAAACCCGACCCGAATGCCGACCGGTTCAGAAT
CTGCTGTTCTCCGATTGTAAACTGGGTATCAACGATTTGCCCAACTTCGTGTACGAGATC
GAGTGGGATGTGATTTTGGTTGATGGGCCGCGTGGGTACGCCGGAGATTCCCCGGGAAGG
ATGGCTCCGATTTTTACGTCGGCGGTTTTGGCGAAGAGCAAAGATTCCGGCGAGAAGAAG
AAGAAGAAGACGACGGATGTTTTTGTGCATGAGTTCGGGAGGAAGCTTGAGAGAGTGTAC
AGTGAGGAGTTTCTGTGTGAGGAGA*TCTGATTGAG*TCGTCGGAGAGTTGGGGCATTTT
GTTGTGGCGGCAGAGAAA

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1CC47JQ 741 0 0
AGAACTCTTACGCAGTTTCCAAATTCGAGCAGAACAACCCTGGAGTCGAGGCTTACGACG
TCGTTTACTCGACCAAAGTCTCTCAAGCCGGTAAGCTTTTGGGCTTACTATAAAACCCGA
CCCGAATGCCGACCGGTTCAGAATCTGCTGTTCTCCGATTGTAAACTGGGTATCAACGAT
TTGCCCAACTTCGTGTACGAGATCGAGTGGGATGTGATTTTGGTTGATGGGCCGCGTGGG
TACGCCGGAGATTCCCCGGGAAGGATGGCTCCGATTTTTACGTCGGCGGTTTTGGCGAAG
AGCAAAGATTCCGGCGAGAAGAAGAAGAAGAAGACGACGGATGTTTTTGTGCATGAGTTC
GGGAGGAAGCTTGAGAGAGTGTACAGTGAGGAGTTTCTGTGTGAGGAGAATCTGATTGAG
GTCGTCGGAGAGTTGGGGCATTTTGTTGTGGCGGCAGAGAAAGGGGGAAAACAGGGGAAT
GGGTTTTGTCGGAATTCTACGAAATTGTCGGAGCCATTTACGCCGGATATTGGTGGAGAT
GCAGAGGTCGGTGTCGATGATGACTGAAAGTGAGTTACTTTTGGACTTTTGGTGGCTCTT
TTGTAATTAATCTAGCTTTGAGGTTTTTTTTTTACTGTCGTTTAGTTTTCTCGTATGTTT
TAATTTGGAGACGGTTACGCATGAAACCATGATGTAATCCAAAATTCCAAATATAAATGT
CAACTATATGATGAAAGCATC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL5908Contig1 892 2 2 U
GGGATCGCCATCTCTTTTGACTTTGTTTGGCAAATTATTTAGTTGTCAAAACGAAGAAAA
TGGCGGAGTTGCTACTGAGTTCGCCGGCACAGTCTTCTCTCCTTAACGTGAGACCCAGGC
TCCTCCTCACCCCTTCTGCTTCTTCACCGACCCAAAGTCTCGCCTTCACTAACTCCAAAG
GTTTCCATCCTCTAGCGTTCAAATCCGGTCGTCACCAAAGACTCCCCTTCGGTGCCAAGA
CTATTACGGTTAGATGCGCAGTAGATTCGGGAGCCAAATCTGTTGAAGTTGAACCTGCGA
TCGGCGGAGGAGGAAGTGATGGTGGAATCGGAGGGGACAAGTTCGGCGGCGGCGGGGGAG
GCGGCGATGATAATGAGGAGAAAGAGGAGAGTGGTGGGAAGACGCCTTTGTCCATGTCGC
AGAAGTTGACTCTCGGTTACGCCTTCCTTGTCGGAGTTGGTGGGCTGATGGGTTATGTGA
AGAGCGGAAGCCAGAAATCAGCGATTGCGGGTGGAGTTTCAGCTGCTGTTCTGCTCTTTG
TCTTCCGTGAACTCCCTACTAAACCTGTTCTTGCTTCAACCATTGGTGTAGTGATGGCGG
ATGCATTAACGTGGGTGATGGGAACTCGGTACATGGGTTCCAAGAAGATATTTCCGGCTG
GAGTCGTGTCCTTCATGTCTTTCATTATGACCGGAGGATACATTCATGGCATCATGCGCA
GCCTTCACTAAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCATCACTTAGCTTTGCAGTTGTGTCTA
AACGTTTTCTCGGGCTTAAATTGGAGACTGTTTTTTTTCGTTCTTATGTAAAAACAGCTT
TATGCTTTGTTTTGTTTGAACCGTACCAGAAATAAGAAAAGAACCTTATAAT


BQ
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AF RS1AU54TF U 1
AF RS1AU54JQ C 194
BS 1 648 RS1AU54TF
BS 649 892 RS1AU54JQ

RD RS1AU54TF 648 0 0
GGGATCGCCATCTCTTTTGACTTTGTTTGGCAAATTATTTAGTTGTCAAAACGAAGAAAA
TGGCGGAGTTGCTACTGAGTTCGCCGGCACAGTCTTCTCTCCTTAACGTGAGACCCAGGC
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GTTTCCATCCTCTAGCGTTCAAATCCGGTCGTCACCAAAGACTCCCCTTCGGTGCCAAGA
CTATTACGGTTAGATGCGCAGTAGATTCGGGAGCCAAATCTGTTGAAGTTGAACCTGCGA
TCGGCGGAGGAGGAAGTGATGGTGGAATCGGAGGGGACAAGTTCGGCGGCGGCGGGGGAG
GCGGCGATGATAATGAGGAGAAAGAGGAGAGTGGTGGGAAGACGCCTTTGTCCATGTCGC
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AGAGCGGAAGCCAGAAATCAGCGATTGCGGGTGGAGTTTCAGCTGCTGTTCTGCTCTTTG
TCTTCCGTGAACTCCCTACTAAACCTGTTCTTGCTTCAACCATTGGTGTAGTGATGGCGG
ATGCATTAACGTGGGTGATGGGAACTCGGTACATGGGTTCCAAGAAGA

QA 1 648 1 648
DS 

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ATGCGCAGTAGATTCGGGAGCCAAATCTGTTGAAGTTGAACCTGCGATCGGCGGAGGAGG
AAGTGATGGTGGAATCGGAGGGGACAAGTTCGGCGGCGGCGGGGGAGGCGGCGATGATAA
TGAGGAGAAAGAGGAGAGTGGTGGGAAGACGCCTTTGTCCATGTCGCAGAAGTTGACTCT
CGGTTACGCCTTCCTTGTCGGAGTTGGTGGGCTGATGGGTTATGTGAAGAGCGGAAGCCA
GAAATCAGCGATTGCGGGTGGAGTTTCAGCTGCTGTTCTGCTCTTTGTCTTCCGTGAACT
CCCTACTAAACCTGTTCTTGCTTCAACCATTGGTGTAGTGATGGCGGATGCATTAACGTG
GGTGATGGGAACTCGGTACATGGGTTCCAAGAAGATATTTCCGGCTGGAGTCGTGTCCTT
CATGTCTTTCATTATGACCGGAGGATACATTCATGGCATCATGCGCAGCCTTCACTAAGC
AGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCATCACTTAGCTTTGCAGTTGTGTCTAAACGTTTTCTCGG
GCTTAAATTGGAGACTGTTTTTTTTCGTTCTTATGTAAAAACAGCTTTATGCTTTGTTTT
GTTTGAACCGTACCAGAAATAAGAAAAGAACCTTATAAT

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 2

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GAGGGGAGGCGTTCACGTGGACGTCCTCCAGGATCTAAGAACAAGCCGAAGCCACCGGTG
ATTGTGACAAGAGATAGCCCTAACGTGCTTATATCTCATGTTCTTGAAATCTCTTCTGGA
GCCGACATAGTTGAGAGCGTCAACATTTACGCTCGCCAGAGAGGAAGAGGTGTATCCGTT
CTCAGTGGTAACGGCGCGGTGTCTAACATCGTTCTCCGGCAGCCGGTGACGGCTCATGGG
AGTAATGGTGGAGCCGGCTGGAGCCGGAGGGGTTTTGACTTTACATGGTAGGTTTGATAT
TCTTTCCATCACTGGTACGGTGCTTCCTCCACCTGCGCCGCCGGGATCCGGTGGTCTGTC
AATCTTTGTTGCCGGTGCACAAGGTCAGATGATAGGAGGAAGCGTGATGGCTCCACTTGT
GGCTTCGGGTCCAGTGATACTGATGGCTGCATCGTTCTCTAATGCAACTTTTGAAAGGCT
TCCGCTGGAAGATGAAGGAGGAGGAGATGGCGGAGGAGGAGGGGATCCACTGCCCGCCAC
GTCAGCATCACCACCGTCTGGAGCTGGTCAGCTGGGAGAGTTAAGAGGTAATATGAGTGG
TTATGATCAGTTTTCTGGTGATCCTCATTTGCTTGGTTGGGGAGCTGGAGCTGCTTCAAG
ACCATCTTTCTAGATTTGAACATTATGTCTGTCAAATAGCTATAACTTCGAATTTTTAAA
ATAAGATAATCATTTCATGATGACATGTTCTTAATTATATATGTGTTCTTTTGGTTTTCA
AAATAGTTTATCATGAACATTCGGATTCCTATTTATAATATAATTCACCACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E411TF U 1
AF RS1E411JQ C 51
BS 1 507 RS1E411TF
BS 508 832 RS1E411JQ

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ATTGTGACAAGAGATAGCCCTAACGTGCTTATATCTCATGTTCTTGAAATCTCTTCTGGA
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CTCAGTGGTAACGGCGCGGTGTCTAACATCGTTCTCCGGCAGCCGGTGACGGCTCATGGG
AGTAATGGTGGAGCCGGCTGGAGCCGGAGGGGTTTTGACTTTACATGGTAGGTTTGATAT
TCTTTCCATCACTGGTACGGTGCTTCCTCCACCTGCGCCGCCGGGATCCGGTGGTCTGTC
AATCTTTGTTGCCGGTGCACAAGGTCAGATGATAGGAGGAAGCGTGATGGCTCCACTTGT
GGCTTCGGGTCCAGTGATACTGATGGCTGCATCGTTCTCTAATGCAACTTTTGAAAGGCT
TCCGCTGGAAGATGAAGGAGGAGGAGA
AAGCGG

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DS 

RD RS1E411JQ 782 0 0
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CTCTTCTGGAGCCGACATAGTTGAGAGCGTCAACATTTACGCTCGCCAGAGAGGAAGAGG
TGTATCCGTTCTCAGTGGTAACGGCGCGGTGTCTAACATCGTTCTCCGGCAGCCGGTGAC
GGCTCATGGGAGTAATGGTGGAGCCGGCTGGAGCCGGAGGGGTTTTGACTTTACATGGTA
GGTTTGATATTCTTTCCATCACTGGTACGGTGCTTCCTCCACCTGCGCCGCCGGGATCCG
GTGGTCTGTCAATCTTTGTTGCCGGTGCACAAGGTCAGATGATAGGAGGAAGCGTGATGG
CTCCACTTGTGGCTTCGGGTCCAGTGATACTGATGGCTGCATCGTTCTCTAATGCAACTT
TTGAAAGGCTTCCGCTGGAAGATGAAGGAGGAGGAGATGGCGGAGGAGGAGGGGATCCAC
TGCCCGCCACGTCAGCATCACCACCGTCTGGAGCTGGTCAGCTGGGAGAGTTAAGAGGTA
ATATGAGTGGTTATGATCAGTTTTCTGGTGATCCTCATTTGCTTGGTTGGGGAGCTGGAG
CTGCTTCAAGACCATCTTTCTAGATTTGAACATTATGTCTGTCAAATAGCTATAACTTCG
AATTTTTAAAATAAGATAATCATTTCATGATGACATGTTCTTAATTATATATGTGTTCTT
TTGGTTTTCAAAATAGTTTATCATGAACATTCGGATTCCTATTTATAATATAATTCACCA
CC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

CO CL5910Contig1 962 2 4 U
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AGGTGTTACCGTCAGATCAAGGGCAAGCCATACCCTAAATCCCGCTACTGCCGCGGTGTC
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CTTTCTGCGTCCACTTGGTCTCGTGGGAGAAGGAGAACGTCTCCAGCGAAGCGCTCGAGG
CCGCGCGTATCGCCTGCAACAAGTACATGGTGAAATCCGCCGGGAAAGACGCTTTCCACC
TGAGGATTAGGGTTCACCCGTTCCATGTCCTGAGGATCAACAAGATGCTTTCGTGCGCTG
GAGCCGATAGGCTTCAGACCGGGATGAGAGGCGCTTTCGGAAAGGCCTTGGGGACTTGTG
CTAGGGTTGCGATCGGGCAGGTGCTTTTGTCTGTGAGGTGTAAGGATGCTCATGGTCATC
ATGCTCAGGAGGCTCTCAGGAGGGCTAAGTTTAAGTTTCCTGGTCGTCAAAAGATTATTG
TCAGCAGGAAATGGGGTTTCACGAAGTTTAACAGAGCAGACTTCACGAAGTTGGGGCAAG
AGAAGCGTGTTGTTCCTGATGGTGTTAATGCTAAGTTCCTGTCATGCCATGGGCCTTTGG
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TTTACTCTCTTTTCCTCCTGTGAAAGATTATTAGTCAGTTTGAAACTTGTCTTTGATATG
ATATTGTTCTTTTTTATGCTGGCCAATTTCCTCTTTTTTTTTTCTTTTGCAAGTATTTTT
CTTATTGCGAAATCATAGGATTTGAGAGCAAAAATTGACCAAAATGAGCTGGAATGTATG
TTCCTCAAACGCTCACAGTGCTAATTGTATAATCATTGAATTCATTTTTAAGCAAGAGAT
GT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1B774TF U 1
AF RS1B774JQ C 219
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BS 674 962 RS1B774JQ

RD RS1B774TF 673 0 0
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GAGCCGATAGGCTTCAGACCGGGATGAGAGGCGCTTTCGGAAAGGCCTTGGGGACTTGTG
CTAGGGTTGCGATCGGGCAGGTGCTTTTGTCTGTGAGGTGTAAGGATGCTCATGGTCATC
ATGCTCAGGAGGCTCTCAGGAGGGCTAAGTTTAAGTTTCCTGGTCGTCAAAAGATTATTG
TCAGCAGGAAATGGGGTTTCACGAAGTTTAACAGAGCAGACTTCACGAAGTTGGG*CAAG
AGAAGCGTGTTGTTCCTGATGGTGTTAATGCTAAGTTCCTGTCATGCCATGGGCCTTTGG
CTAACCGTCAGCC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RS1B774JQ 744 0 0
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CTGTCATGCCATGGGCCTTTGGCTAACCGTCAGCCCGGAAGTGCATTTTTGCCAGCCACC
TATTGAAGTTTCAGATCTCTTGTTTACTCTCTTTTCCTCCTGTGAAAGATTATTAGTCAG
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TTTTTCTTTTGCAAGTATTTTTCTTATTGCGAAATCATAGGATTTGAGAGCAAAAATTGA
CCAAAATGAGCTGGAATGTATGTTCCTCAAACGCTCACAGTGCTAATTGTATAATCATTG
AATTCATTTTTAAGCAAGAGATGT

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL5911Contig1 188 2 1 U
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ACCCATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CP16JQ C 1
AF RS1CP16TF U 1
BS 1 188 RS1CP16TF

RD RS1CP16JQ 188 0 0
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TCCTTCCGAGTTTCCCTAAAAGTACGAACTACTCCTCTTCTACAAACCCATCTGCTTGAA
TTACCAAAATCATCTGCAAATATTCCCAGATTTCGAGACGAAAGAGAATGATGGGAGGAG
ACCCATCC

QA 1 188 1 188
DS 

RD RS1CP16TF 188 0 0
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TCCTTCCGAGTTTCCCTAAAAGTACGAACTACTCCTCTTCTACAAACCCATCTGCTTGAA
TTACCAAAATCATCTGCAAATATTCCCAGATTTCGAGACGAAAGAGAATGATGGGAGGAG
ACCCATCC

QA 1 188 1 188
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5913Contig1 914 2 2 U
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AAAGGACGAGAAGCTGAGATTCAACGAGCACTTGCGCTACAACATGCTTTAGATGAAAAG
GAAATGGAGCCAGAGATGGTAGAAATTGTCAAGGTTTCAAAGACAAGAGCGAAAGCAATG
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ATCCAAGAAGCCTTAGACATGATTGGCAAACCTCATCCGTTACGCAGCTCTATTGTAATC
AAACAGGAGGAACATGCAAATGTCAGCATTGAGCATCAACACAACGCATCTCCCTCAGAC
GCATCAAAGCCGATGGCTAACAAAGATTTCATCTCACAAGATGGTTCAGAGAAAAACGAG
TCTCAAATGACTTCAGAGCTAATCACCTCCTGTGTTGCCACTTGGATCATGATTCAGATG
TGCACGGAGAGGCAGTACCCTCCAGCTGATGTGGCACAGCTTATAGATACAGCAGTCACA
AGCTTGCAGCCTAGATGCCCCCAGAACCTACCAATCTACAGAGAAATCCAAATGTGTATG
GGCCGAATCAATACTCAAATCATGTCTCTAGTACCAAGTTGAAAGGCTAATTCATCTGGG
TTAGTGTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTGTGTCTCCTTAGGTAAGTCAATTCTCCTTTTTA
AGTTAGAGTAGATGATGGCATCATCACCTGAAAAATGGTGTTAGAAGTTAACGGGTTCAA
TTGTTTGCACCATTGGTTATGTAACTTAAAATCTGATGCGTATGGTTTTTATTATGTAAC
TTAAAATCTGATGCATATGGTTTTTATTGTTTTGAATCTTCATGGCAATGGCTAGGGATG
GATTGTTTATCAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TCTCAAATGACTTCAGAGCTAATCACCTCCTGTGTTGCCACTTGGATCATGATTCAGATG
TGCACGGAGAGGCAGTACCCTCCAGCTGATGTGGCACAGCTTATAGATACAGCAGTCACA
AGCTTGCAGCCTAGATGCCCCCAGAACCTACCAATCTACAGAGAAATCCAAATGTGTATG
GGCCGAATCAATACTCAAATCATGTCTCTAGTACCAAGTTGAAAGGCTAATTCATCTGGG
TTAGTGTTTTTTTTTT
GTTT

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DS 

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AGATACAGCAGTCACAAGCTTGCAGCCTAGATGCCCCCAGAACCTACCAATTTACAGAGA
AATCCAAATGTGTATGGGCCGAATCAATACTCAAATCATGTCTCTAGTACCAAGTTGAAA
GGCTAATTCATCTGGGTTAGTGTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTGTGTCTCCTTAGGTAAG
TCAATTCTCCTTTTTAAGTTAGAGTAGATGATGGCATCATCACCTGAAAAATGGTGTTAG
AAGTTAACGGGTTCAATTGTTTGCACCATTGGTTATGTAACTTAAAATCTGATGCGTATG
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GCAATGGCTAGGGATGGATTGTTTATCAGT

QA 1 690 1 690
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TTTGGATATGCCTCTGAATTGGAGAGAGACCAAACCGATGTGCATGCCAGCCGGTGGGTC
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CTCTGGATGCATTTATTTAGTTACAGCCGATTCTTCAATTGTGGACATGGTTAGAAGAGA
AATCTAGTAAAGGAGGAGCCATGGAAAAGACTTGGTTTTCACATGTATCTGCTTGAGCAT
TTTTCACAAACATGTAACTTTGCCATTCCGTTTGGGCATTACTACTACATAAGTCTTGCA
TCGCTTGTGGATAAGATAAGAAGAGCAAAATTAGAAATTATTTATTTTCATGGCAGCTTG
GAAATTAAAATTATAGTCTTACGTGCTACTTTGCTGTCTATTATGGTTGCTTATTTTCCA
GAGGTGTATCATGTGTATGAACACGTTAAAGATTATATAAGAGTGATGCAAATAGTTTGC
TTCT


BQ
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AF RS1GV45TF U 1
AF RS1GV45JQ C 77
BS 1 544 RS1GV45TF

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CTCTGGATGCATTTATTTAGTTACAGCCGATTCTTCAATTGTGGACATGGTTAGAAGAGA
AATCTAGTAAAGGAGGAGCCATGGAAAAGACTTGGTTTTCACATGTATCTGCTTGAGCAT
TTTTCACAAACATGTAACTTTGCCATTCCGTTTGGGCATTACTACTACATAAGTCTTGCA
TCGCTTGTGGATAAGATAAGAAGAGCAAAATTAGAAATTATTTATTTTCATGGCAGCTTG
GAAATTAAAATTATAGTCTTACGTGCTACTTTGCTGTCTATTATGGTTGCTTATTTTCCA
GAGGTGTATCATGTGTATGAACACGTTAAAGATTATATAAGAGTGATGCAAATAGTTTGC
TTCT

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TCTTACGTGCTACTTTGCTGTCTATTATGGTTGCTTATTTTCCAGAGGTGTATCATGTGT
ATGAACACGTTAAAGATTATATAAGAGTGATGCAAATAGTTTGCTTCT

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DS 



AS 1 2

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CTCCGTATCGACCGTTTTATATGTTACTTCTCATCCCCGCAGCTTTGTTATGTAGACGAT
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TGGAGTGAAGATATAAAGAAACCTAGCAAGAGAACTGTGGACGAGGTGAAGAGAATTTTC
AAGTCTGATGATGATGACGTGATCGCGATTGGGGATGTTTTCTATGCTGATATGGAGCAA
GAATGGGTGATGCAGCCTGGTGGACCTATTAACCACAAGTGCAAGACCTTGATTGAACCC
AGTAAGCTTATTCTGTTGACAGCTCAGCGGTTCATACAGACCTTCTTGGGGAACCATTTC
GTCGCGGTTCATTTCCGTCGACATGGGTTCCTCAAATTTTGCAATGCGAAAGCGCCGAGT
TGCTTTTATCCGATTCCACAAGCGGCAGAGTGTATTGCTAGGATGGTGGAAAGATCCAAC
GGTGCAGTAATCTATCTTTCGACAGATGCTGCGGAAAGTGAAACAAGTCTGCTTCAGTCA
CTTGTTGTGGTCGATGGAAAAATTGTGCCACTTGTCAAACGTCCACCGCGTAATTCAGCT
GAGAAATGGGACGCATTGTTATATCGACATGGTATAGAGGATGACTCTCAGGTGGATGCA
ATGTTGGGTAAAACGATATGTGCTATGTCCAGCGTCTTCATTGGAGCCTCTGGATCGACT
TTCACGGAGGATATCTTGAGGCTAAGGAAAGATTGGGGGACGTCTTCTACATGCGATGAG
TACTTATGTCGAGGGGAAGAACCAACCTTCATAGCAGAAGATGAATAGGTAAAAAGCACA
CATTTTTTTTTTCTTCTTACGAACTTGTCTTATTACCACATTCCATTGTTCTCTTATTCT
AGTTGAATCGTAGTTAGTGTTAGAAATCCGATTTTGGATACCTTTTTCCACTTTTATTTT
TTCCATTTTTATTTTTTCCGTGATGGTGTGGAGATAACAGTGTGGATCGATAGAAGAAAG
AGCCTCGGTTTCTC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ER08TF U 1
AF RS1ER08JQ C 363
BS 1 711 RS1ER08TF
BS 712 712 RS1ER08JQ
BS 713 761 RS1ER08TF
BS 762 762 RS1ER08JQ
BS 763 789 RS1ER08TF
BS 790 790 RS1ER08JQ
BS 791 800 RS1ER08TF
BS 801 801 RS1ER08JQ
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BS 807 807 RS1ER08JQ
BS 808 841 RS1ER08TF
BS 842 1094 RS1ER08JQ

RD RS1ER08TF 841 0 0
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CTCCGTATCGACCGTTTTATATGTTACTTCTCATCCCCGCAGCTTTGTTATGTAGACGAT
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TGGAGTGAAGATATAAAGAAACCTAGCAAGAGAACTGTGGACGAGGTGAAGAGAATTTTC
AAGTCTGATGATGATGACGTGATCGCGATTGGGGATGTTTTCTATGCTGATATGGAGCAA
GAATGGGTGATGCAGCCTGGTGGACCTATTAACCACAAGTGCAAGACCTTGATTGAACCC
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CTTGTTGTGGTCGATGGAAAAATTGTGCCACTTGTCAAACGTCCACCGCGTAATTCAGCT
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ATGTTGGGTAAAACGATATGTGCTATGTCCAGCGTCTTCAT*GGAGCCTCTGGATCGACT
TTCACGGAG*ATATCTTGAG*CTAAG*AAAGATTGGGGGACGTCTTCTACATGCGATGAG
T

QA 1 841 1 841
DS 

RD RS1ER08JQ 732 0 0
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CGCGGTTCATTTCCGTCGACATGGGTTCCTCAAATTTTGCAATGCGAAAGCGCCGAGTTG
CTTTTATCCGATTCCACAAGCGGCAGAGTGTATTGCTAGGATGGTGGAAAGATCCAACGG
TGCAGTAATCTATCTTTCGACAGATGCTGCGGAAAGTGAAACAAGTCTGCTTCAGTCACT
TGTTGTGGTCGATGGAAAAATTGTGCCACTTGTCAAACGTCCACCGCGTAATTCAGCTGA
GAAATGGGACGCATTGTTATATCGACATGGTATAGAGGATGACTCTCAGGTGGATGCAAT
GTTGGGTAAAACGATATGTGCTATGTCCAGCGTCTTCATTGGAGCCTCTGGATCGACTTT
CACGGAGGATATCTTGAGGCTAAGGAAAGATTGGGGGACGTCTTCTACATGCGATGAGTA
CTTATGTCGAGGGGAAGAACCAACCTTCATAGCAGAAGATGAATAGGTAAAAAGCACACA
TTTTTTTTTTCTTCTTACGAACTTGTCTTATTACCACATTCCATTGTTCTCTTATTCTAG
TTGAATCGTAGTTAGTGTTAGAAATCCGATTTTGGATACCTTTTTCCACTTTTATTTTTT
CCATTTTTATTTTTTCCGTGATGGTGTGGAGATAACAGTGTGGATCGATAGAAGAAAGAG
CCTCGGTTTCTC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL5917Contig1 512 2 1 U
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CTTTGGAGACTGTACGGAGCTGAAAGTAAAGCTTCTTCATTGTTTCCGCCAAGAGAAAGC
TGTGAAGAGGAAGGTAAATTTCGAACAAAGCAAGAAACTTCAAGAAAGACTGAAAGCTAT
AAGGAAAGAAGAAATTGCAGAGACTTGAGAGCATTGTTGGATGATCCTCATCTCAGATAT
ATGTATTTGTCTTTTTTTTTTCAAAACAAAAACATTTTTCTTAAAAATCGATGATATTGA
GTAGGGCGAAATGAGGTATTTATTGGAGTACCAAGTAGCTACACAACTTCATCCATTGTG
GCTACAAAATAATATTTGCATTCGAAGCAGAA


BQ
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AF RS1AC94TF U 1
AF RS1AC94JQ C 52
BS 1 512 RS1AC94TF

RD RS1AC94TF 512 0 0
TCTCTAAAGTCTCAGGTCATCGGATACCAAATCCAAGAGTTTTGTGTTCTTACACAACTT
TTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGATGCATCCTCCACTTACACCACACAGACATCCAAT
GTGTCTCGAGATAATTGAGGAATTCCAAAAGTGTCATTTAGATCATCCAATTGGAAAATT
CTTTGGAGACTGTACGGAGCTGAAAGTAAAGCTTCTTCATTGTTTCCGCCAAGAGAAAGC
TGTGAAGAGGAAGGTAAATTTCGAACAAAGCAAGAAACTTCAAGAAAGACTGAAAGCTAT
AAGGAAAGAAGAAATTGCAGAGACTTGAGAGCATTGTTGGATGATCCTCATCTCAGATAT
ATGTATTTGTCTTTTTTTTTTCAAAACAAAAACATTTTTCTTAAAAATCGATGATATTGA
GTAGGGCGAAATGAGGTATTTATTGGAGTACCAAGTAGCTACACAACTTCATCCATTGTG
GCTACAAAATAATATTTGCATTCGAAGCAGAA

QA 1 512 1 512
DS 

RD RS1AC94JQ 461 0 0
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ACATCCAATGTGTCTCGAGATAATTGAGGAATTCCAAAAGTGTCATTTAGATCATCCAAT
TGGAAAATTCTTTGGAGACTGTACGGAGCTGAAAGTAAAGCTTCTTCATTGTTTCCGCCA
AGAGAAAGCTGTGAAGAGGAAGGTAAATTTCGAACAAAGCAAGAAACTTCAAGAAAGACT
GAAAGCTATAAGGAAAGAAGAAATTGCAGAGACTTGAGAGCATTGTTGGATGATCCTCAT
TTCAGATATATGTATTTGTCTTTTTTTTTTCAAAACAAAAACATTTTTCTTAAAAATCGA
TGATATTGAGTAGGGCGAAATGAGGTATTTATTGGAGTACCAAGTAGCTACACAACTTCA
TCCATTGTGGCTACAAAATAATATTTGCATTCGAAGCAGAA

QA 1 461 1 461
DS 



AS 1 2

CO CL5918Contig1 743 2 2 U
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GCCGTGGTGACTCTTATGGTTCTAAATGTCGTGCATGCGTTGCTATCGCCATCGCGGAGT
TTCTTAAGAGGTGTCCAAGGAACAAAGGTGGAATAATATGGTATGACCAATGTTTTCTCC
GTGTTAGTATGATCAAAGAAGAAGTTCCAATCAAGACTAATTTCAAGAATATTTTTTCAA
TGCACAACCCAAATAATGTGAGAGGGGATGCAACATTGTTTGCCAAAAGGGCGATTGATT
TTTTCTATGAGCTAACACTCAAAGTCAGGAAAACCACCAATGGCGGCCTCAGCCTCATAT
TTTACGCGGCAGGGAAAAAGAAAATAGGGAAAAATAAATTGTATGCAATGGTGCAGTGTG
TAGGACTAACATTAGATTGTAAAAGTTGTTTGATATGGAGTATCACTACCCTTTTCAAGA
ACGGGGAAGTTAAAGAAGGAGCGAGAGTTTTAGGTACCAACTGTGATGTAAGGTATGAGC
TATATCCTTTTCTTAGAAGTTAAGCATTTTTATGGTGGCAATGAATACATTCTCTTTATA
ATTTTCAATTATATTATATTTTTCTTTACGTTTTTCCTCTTTTGCTGAAATGTAATATTC
ATATATCAATAAAAAGAGTGTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DG43TF U 1
AF RS1DG43JQ C 113
BS 1 569 RS1DG43TF
BS 570 743 RS1DG43JQ

RD RS1DG43TF 569 0 0
GCGAACAAAACCTCAACCAAGTCTTCCATCACATTTCTACTAGTGCTTATAATAATGTCG
GTTTCGCACACACAACTATTGGAACAACACCTCAAAATTCTGTTACCGCCACTCTTCAGT
GCCGTGGTGACTCTTATGGTTCTAAATGTCGTGCATGCGTTGCTATCGCCATCGCGGAGT
TTCTTAAGAGGTGTCCAAGGAACAAAGGTGGAATAATATGGTATGACCAATGTTTTCTCC
GTGTTAGTATGATCAAAGAAGAAGTTCCAATCAAGACTAATTTCAAGAATATTTTTTCAA
TGCACAACCCAAATAATGTGAGAGGGGATGCAACATTGTTTGCCAAAAGGGCGATTGATT
TTTTCTATGAGCTAACACTCAAAGTCAGGAAAACCACCAATGGCGGCCTCAGCCTCATAT
TTTACGCGGCAGGGAAAAAGAAAATAGGGAAAAATAAATTGTATGCAATGGTGCAGTGTG
TAGGACTAACATTAGATTGTAAAAGTTGTTTGATATGGAGTATCACTACCCTTTTCAAGA
ACGGGGAAGTTAAAGAAGGAGCGAGAGTT

QA 1 569 1 569
DS 

RD RS1DG43JQ 631 0 0
TCTTCAGTGCCGTGGTGACTCTTATGGTTCTAAATGTCGTGCATGCGTTGCTATCGCCAT
CGCGGAGTTTCTTAAGAGGTGTCCAAGGAACAAAGGTGGAATAATATGGTATGACCAATG
TTTTCTCCGTGTTAGTATGATCAAAGAAGAAGTTCCAATCAAGACTAATTTCAAGAATAT
TTTTTCAATGCACAACCCAAATAATGTGAGAGGGGATGCAACATTGTTTGCCAAAAGGGC
GATTGATTTTTTCTATGAGCTAACACTCAAAGTCAGGAAAACCACCAATGGCGGCCTCAG
CCTCATATTTTACGCGGCAGGGAAAAAGAAAATAGGGAAAAATAAATTGTATGCAATGGT
GCAGTGTGTAGGACTAACATTAGATTGTAAAAGTTGTTTGATATGGAGTATCACTACCCT
TTTCAAGAACGGGGAAGTTAAAGAAGGAGCGAGAGTTTTAGGTACCAACTGTGATGTAAG
GTATGAGCTATATCCTTTTCTTAGAAGTTAAGCATTTTTATGGTGGCAATGAATACATTC
TCTTTATAATTTTCAATTATATTATATTTTTCTTTACGTTTTTCCTCTTTTGCTGAAATG
TAATATTCATATATCAATAAAAAGAGTGTAC

QA 1 631 1 631
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TCTTGATCTGCGTAACATTTGTTTGGATCTACGCCATTATCTTGACCGCTAGTGGAGCAT
ACAGACACAAGCCATCGCTTACACAGCATAGTTGTCGCACAGACAAAGCTAATCTTATAT
CAACCGCTCCATGGTTCAAATTCCCATACCCTCTCCAATGGGGCCCTCCAACGTTTGCAG
TAGGCCATTCGTTTGCTATGATGTCTGCGGTTCTTGTATCCATGGTCGAGTCTACTGGGG
CTTACATGGCGGCTTCAAGATTAGCTATAGCCACACCTCCTCCTGCTTATGTATTGAGTA
GAGGCATTGGATGGCAGGGGATTGGTGTGTTGCTTGATGGTCTTTTCGGAACAGGCACAG
GCTCTACTGTTCTAGTAGAGAATGTAGGACTACTTGGGTTAACAAGAGTAGGAAGCCGTC
GTGTTGTCCAAGTATCAGCAGGCTTCATGATCTTCTTCTCTATATTGGGCAAATTCGGTG
CTGTTTTCGCGTCTATACCAGTGCCTATATACGCAGCATTGCACTGTGTCCTCTTCGGCC
TCGTTGCTGCGGTTGGTCTCTCGTTTCTTCAGTTCACAAACATGAACAGCATGAGAAACT
TAATGATCACTGGTCTTTCGCTCTTTCTCGGAATCTCGATACCTCAGTTCTTTGTTCACT
ACTGGGACGCAAGACATTACGGGCTAGTTCACACAGACGCGGGATGGTTCAACGCGTTCT
TGAACACGTTGTTCATGTCTCCAGCCACTGTTGGTCTCATCATTGCGGTTTTTATGGACA
ATACAGTTGAAGTGGAGAGTTCGAAGAAAGACAGAGGGATGCCTTGGTGGGTCAAGTTTA
GAACCTTTCGAGGTGATAACCGTAATGAAGAGTTCTACACTTTGCCCTTTAACCTCAACA
GATTCTTCCCTCCTACTTAGTAAATTATTGACATGCTTCGATGAGGAAACAGAGCCTGCT
GGTTTTAGATTCTGTTTATTATTCTTTTTCTTTGGTGATGGTTCTTTAATTCGATGACTT
CCATTATTGAAGTAGTCTGTTTACTTTTAAGATTTAATCTCTTCTTCCTGTAGATTATAG
AGATGGTTACTAAAACAATGTTTTTAGTTTTTGTGTGAATGGAATCAAGTCTCGTAAGCT
TTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

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BS 1 687 RS1E507TF
BS 688 1205 RS1E507JQ

RD RS1E507TF 687 0 0
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TCTTGATCTGCGTAACATTTGTTTGGATCTACGCCATTATCTTGACCGCTAGTGGAGCAT
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GAGGCATTGGATGGCAGGGGATTGGTGTGTTGCTTGATGGTCTTTTCGGAACAGGCACAG
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TAATGATCACTGGTCTTTCGCTCTTTC

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DS 

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CTGTTTTCGCGTCTATACCAGTGCCTATATACGCAGCATTGCACTGTGTCCTCTTCGGCC
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TAATGATCACTGGTCTTTCGCTCTTTCTCGGAATCTCGATACCTCAGTTCTTTGTTCACT
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TGAACACGTTGTTCATGTCTCCAGCCACTGTTGGTCTCATCATTGCGGTTTTTATGGACA
ATACAGTTGAAGTGGAGAGTTCGAAGAAAGACAGAGGGATGCCTTGGTGGGTCAAGTTTA
GAACCTTTCGAGGTGATAACCGTAATGAAGAGTTCTACACTTTGCCCTTTAACCTCAACA
GATTCTTCCCTCCTACTTAGTAAATTATTGACATGCTTCGATGAGGAAACAGAGCCTGCT
GGTTTTAGATTCTGTTTATTATTCTTTTTCTTTGGTGATGGTTCTTTAATTCGATGACTT
CCATTATTGAAGTAGTCTGTTTACTTTTAAGATTTAATCTCTTCTTCCTGTAGATTATAG
AGATGGTTACTAAAACAATGTTTTTAGTTTTTGTGTGAATGGAATCAAGTCTCGTAAGCT
TTTCC

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

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AGGCCTCCAAGCCCAACTTGTTCATGTGAAAACAGTCTCTCTCTCTCTGATTGACCGACG
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TGTTTTGTTTCCCTTTTCAAGGATATTTTTCTTTATCAACAACATTTTAGTATTATTCAT
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GGGGCATGTCATGTGTTCTATTGTCTCGGTTAAATAACTTTTTCTTTTTCTCACAGTTCC
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ATGGGTGCGAGATTTGCTGTGAAATAATGATCGCCATACTCCTTCCTCCACTCGGGGCTT
GTTTAAGGCATGGATGTTGCACTACGGAGTTCATGATATGTCTGATCCTAACGATTCTGG
GATACATACCGGGCATCATCTACGCACTCTATGCAATCGTTTACGTTGATCGTGATCGGT
TCTTCGACGAGTACCGTCGTCCACTCTTCTACGCTCAGTCACCTTAATTTAATTTACGCA
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GCTCACTTTCTTTCTGTATACTTTGTTTATTTGATCATAATC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FS11TF U 1
AF RS1FS11JQ C 220
BS 1 677 RS1FS11TF
BS 678 822 RS1FS11JQ

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ATGGGTGCGAGATTTGCTGTGAAATAATGATCGCCATACTCCTTCCTCCACTCGGGGCTT
GTTTAAGGCATGGATGTTGCACTACGGAGTTCATGATATGTCTGATCCTAACGATTCTGG
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TCTTCGACGAGTACCGTCGTCCACTCTTCTACGCTCAGTCACCTTAATTTAATTTACGCA
TTCTCTATTGTCTGTTT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RS1FS11JQ 603 0 0
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TTTTCTTTTTCTCACAGTTCCTCTACGCGATAAAATAGTGTATGATCCAACAAAAGAGAT
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TCCTTCCTCCACTCGGGGCTTGTTTAAGGCATGGATGTTGCACTACGGAGTTCATGATAT
GTCTGATCCTAACGATTCTGGGATACATACCGGGCATCATCTACGCACTCTATGCAATCG
TTTACGTTGATCGTGATCGGTTCTTCGACGAGTACCGTCGTCCACTCTTCTACGCTCAGT
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TGTTAATTTTATCTATTCCATCAATTACATTTTCATCATTCTCTCAATAATTTCAAGACT
TAACACTTGTTTTTGTTACATGCTCACTTTCTTTCTGTATACTTTGTTTATTTGATCATA
ATC

QA 1 603 1 603
DS 



AS 1 2

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ACCCAGTTCCTCCGTAACTCAGTCTCGTGAACCGACCACCGTCATCTCTCAGACGACGCC
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CAAAAATCTTTCCTTTCGAGATGAGTTTATCTCTACCGATTTCTGCAGCTTTATCGCTTC
TCAGGCGGAAGTGTGCGCCTCCTCTGCTGCGTGAGCGACCCTGTCTCCCTTCAGCTCCTT
ACTTGGCTGTTTAAGACATTGCTTGTGTCGCTTTTAATCATGTCTGGTGATCCATTGAGC
TTCCTTGTTACGCTTGAGCATGCTCCACCTGCAACTGATATCACCTTGTCTCGCCATTTG
GTGCTTCCTTTGATAGTGAAAGTTGGATGCGGTCTTCTGATAAACAATGCATCTCCGGTC
ATCCTCTCTGACCGTCCACCGTATCCCACGGCATTATTTTCCAACGCCATTAGCTCCTTT
AATCTCGATTCCAAGGTTCTTATGGTGAATCATCATCTCTCACCACCACGTTCTGAAGCA
ATCCCAGACAACTTTAAACCTGAGATGTCTATGTCTGTGTCTCTGGTGAAGTGAAGCTTA
TCTTCTTCTGCTCCAACACCAAGCACTCTCCTGTGATTCAGACAATGTTCCTCCTTCGCT
TTCCTGGTATCAAACTCGCCATTGATACCACCAGTACTCTAAACTTTTCCAGACATAATT
AAAACTTCCCATCGTAGCCACTACAAGTAAGCTACTCTGACGACCTCCTTCATCTTATCC
GCTATTCTGATGGTTCCAGCTACTCCATCTGAAGCATTTTCTTTTGCTTTTCCTGTAGCT
ACTCCACCTGAAGCTAATATCTCTCCACCCTAGCTTCATAATTTTCGCAGGATCAGGGAG
TTGGGCCAAGACAAAGATTATTTAGGCCCATTAGTTTAACATTCTTCTTCATCATAAGTG
AAAATGCTGATTTGATTTTTCTTCTGTTGTTTCACCTATTTCACCGTCTTAATTTCTCTA
AAAGAGAAAAGCAAAGTAATTAATAAAATGTCTGGATGCAGAGATACGCATGCAAGTATT
ATGTATGTAATCTTCCAGGGGATTTTCGGTATATATAATAGCAATTTAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AU28TF U 1
AF RS1AU28JQ C 483
BS 1 615 RS1AU28TF
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RD RS1AU28TF 703 0 0
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GACAGACCCTTCGTCAAGGGTCTTCGATCTCCCCTCCGCCACGCCTCTTGAAGAGTTCTA
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CAAAAATCTTTCCTTTCGAGATGAGTTTATCTCTACCGATTTCTGCAGCTTTATCGCTTC
TCAGGCGGAAGTGTGCGCCTCCTCTGCTGCGTGAGCGACCCTGTCTCCCTTCAGCTCCTT
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AATCTCGATTCCAAG*TTCTTATGGTGAATCATCATCTCTCACCACCACGTTCTGAAGCA
*TCCCAGACA*CTTTAAACCTGAGATGTCTATGTCTGTGTCTC

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1AU28JQ 769 0 0
GCTTCCTTTGATAGTGAAAGTTGGATGCGGTCTTCTGATAAACAATGCATCTCCGGTCAT
CCTCTCTGACCGTCCACCGTATCCCACGGCATTATTTTCCAACGCCATTAGCTCCTTTAA
TCTCGATTCCAAGGTTCTTATGGTGAATCATCATCTCTCACCACCACGTTCTGAAGCAAT
CCCAGACAACTTTAAACCTGAGATGTCTATGTCTGTGTCTCTGGTGAAGTGAAGCTTATC
TTCTTCTGCTCCAACACCAAGCACTCTCCTGTGATTCAGACAATGTTCCTCCTTCGCTTT
CCTGGTATCAAACTCGCCATTGATACCACCAGTACTCTAAACTTTTCCAGACATAATTAA
AACTTCCCATCGTAGCCACTACAAGTAAGCTACTCTGACGACCTCCTTCATCTTATCCGC
TATTCTGATGGTTCCAGCTACTCCATCTGAAGCATTTTCTTTTGCTTTTCCTGTAGCTAC
TCCACCTGAAGCTAATATCTCTCCACCCTAGCTTCATAATTTTCGCAGGATCAGGGAGTT
GGGCCAAGACAAAGATTATTTAGGCCCATTAGTTTAACATTCTTCTTCATCATAAGTGAA
AATGCTGATTTGATTTTTCTTCTGTTGTTTCACCTATTTCACCGTCTTAATTTCTCTAAA
AGAGAAAAGCAAAGTAATTAATAAAATGTCTGGATGCAGAGATACGCATGCAAGTATTAT
GTATGTAATCTTCCAGGGGATTTTCGGTATATATAATAGCAATTTAAGC

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

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AGATCTCAGGAATAACGATCGTGTTAGTGGCCTTAATCGCAGTGCTAGCTTCTTCAGTAC
GTAGCCAGCAACCGCCGCTTAGCCAATGTACTCCGTCTATGATGACCACCGTAGGTCCTT
GTATGAGCATTTTAACCAACAGCAGTAGCAACGGAACTTCACCTTCCACTGATTGTTGTA
ACTCATTAAAGTCTTTGACTACCGGAGGAATGGGATGTCTCTGTCTTATTGTCACTGGAA
GCGTTCCTTTTAATATCCCGATTAACCGTACAACCGCCGTATCTCTTCCACGTGCTTGCA
ACATGCCTAGAGTCCCTCTTCAATGCAAAGCCAATATTGCTCCAGCTGCTGCTCCTGGAC
CTGCTGGTACATTTGGACCGGCGATGTCTCCAGGTCCATCAACAACTCCCATAGTTCCAG
AGCCAACTCCAGCAGCTCAGACGCCACAGTCCGATGCAACTAGACCTTTTACACCAACCG
TGGACGGAGCTGCTCCTACGTCTGACGACGGAGGAAGCACCAGTCAACCTTCTCTCACTC
CTTCATCCGCCTATGCTCTCTCACCATCTCTTCTCTTCTTCGGAGTCAGCCTCCTAGCTC
TAAAATTCTACTGATTCCATTTGCTTCCCTTTGTATTCCATATGTGATTTCATTTATGCT
TTGTGTATATTTGTTTTGAGACATTGTCATTGTTTTGGGCGAGATTTTACTTCGTACTGT
CTGAAGAAATATATCATTTGCTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EY78TF U 1
AF RS1EY78JQ C 290
BS 1 767 RS1EY78TF
BS 768 768 RS1EY78JQ
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RD RS1EY78TF 781 0 0
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GTAGCCAGCAACCGCCGCTTAGCCAATGTACTCCGTCTATGATGACCACCGTAGGTCCTT
GTATGAGCATTTTAACCAACAGCAGTAGCAACGGAACTTCACCTTCCACTGATTGTTGTA
ACTCATTAAAGTCTTTGACTACCGGAGGAATGGGATGTCTCTGTCTTATTGTCACTGGAA
GCGTTCCTTTTAATATCCCGATTAACCGTACAACCGCCGTATCTCTTCCACGTGCTTGCA
ACATGCCTAGAGTCCCTCTTCAATGCAAAGCCAATATTGCTCCAGCTGCTGCTCCTGGAC
CTGCTGGTACATTTGGACCGGCGATGTCTCCAGGTCCATCAACAACTCCCATAGTTCCAG
AGCCAACTCCAGCAGCTCAGACGCCACAGTCCGATGCAACTAGACCTTTTACACCAACCG
TGGACGGAGCTGCTCCTACGTCTGACGACGGAGGAAGCACCAGTCAACCTTCTCTCACTC
CTTCATCCGCCTATGCTCTCTCACCATCTCTTCTCTTCTTCGGAGTCAGCCTCCTAGCTC
TAAAATTCTACTGATTCCATTTGCTTCCCTTTGTATTCCATATGTGATTTCATTTATGCT
TTGTGTATATTTGTTTTGAGACATTGTCATTGTTTTGGGCGAGATTT*ACTTCGTACTGT
C

QA 1 781 1 781
DS 

RD RS1EY78JQ 516 0 0
TGTCACTGGAAGCGTTCCTTTTAATATCCCGATTAACCGTACAACCGCCGTATTTTTTCC
ACGTGCTTGCAACATGCCTAGAGTCCCTTTTCAATGCAAAGCCAATATTGCTCCAGCTGC
TGCTCCTGGACCTGCTGGTACATTTGGACCGGCGATGTCTCCAGGTCCATCAACAACTCC
CATAGTTCCAGAGCCAACTCCAGCAGCTCAGACGCCACAGTCCGATGCAACTAGACCTTT
TACACCAACCGTGGACGGAGCTGCTCCTACGTCTGACGACGGAGGAAGCACCAGTCAACC
TTCTCTCACTCCTTCATCCGCCTATGCTCTCTCACCATCTTTTTTTTTTTTCGGAGTCAG
CCTCCTAGCTCTAAAATTCTACTGATTCCATTTGCTTCCCTTTGTATTCCATATGTGATT
TCATTTATGCTTTGTGTATATTTGTTTTGAGACATTGTCATTGTTTTGGGCGAGATTTTA
CTTCGTACTGTCTGAAGAAATATATCATTTGCTTAC

QA 1 516 1 516
DS 



AS 1 2

CO CL5924Contig1 938 2 2 U
GTATATTCTCACCTCACTGACTATACGTAATTATATAGGATTTGAATGAATTTTAATGAT
ATTTATATAGGATCCGAAATTAGATATCCCTATAATCATTTCGTCACAATCACTTTATTC
TCATGATTATGGTAGATTGCAGGTATTGGGCTAATCACACATTTATAGAAAGGACAACTA
TTTTACACGTATGTCATATCAAAATCAACCATAATTGATATAAATTAAATATTGATGTAA
ATATTGATATCAAGATTGAGTGATTTATGAGTCGTATATTATTCATTAATTACTAAATGT
GTACTGTTATGGGTATATATAAGAGTCTACATCTAGAGGAAATATGCATTCTAAAGTCAG
TATCATCTCTAAAACTCATGTTCAGTGCAAAGCGTAAACAATGAACAGCAGAATTCAGTT
TTCGTTGATTAATATGCAGTATGTATTCTTATTCATCTTTTTGTACAAGGCTCGAGTACT
AACTTAGATTGAATACTAACTAAAACCCATTATTATACTATTTGCAGGTTCACACAGATC
AAGTGTGTGGCCTATAGAACTATTGCTCAACAGTTACATGATTTCTAGACCTCTAATGAT
GCTTATGATGTACTTTGTGTTTTACAGTTCTGGCGAATTGATTGGAGAGAAGGTAACTTA
CTGACCGATTTCTTACAGAGTGATTATGTATCATATATAAAATTAATTTGTTAATCAATC
TAAAGAATTTTTTTTTATATGCAAAGGTGGCTTCAGGAATGTGACTAACATTGAACAGAT
TTCTAAAATTATGTGACCCTGAAGATGTTCAAAAAATACAGGCCCTTGGGAAGAGGTAAA
GGGGCAGGCCTTAAGGGAAAGGGGGAGGGGACCGATGCAAATAATGGGGGAAAAGCTCTT
AGATAAGGGCTGCCCTTATCTGCCCTTAAGTTTTAGTG


BQ
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AF RS1FQ17TF U 1
AF RS1FQ17JQ C 167
BS 1 625 RS1FQ17TF
BS 626 938 RS1FQ17JQ

RD RS1FQ17TF 625 0 0
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ATTTATATAGGATCCGAAATTAGATATCCCTATAATCATTTCGTCACAATCACTTTATTC
TCATGATTATGGTAGATTGCAGGTATTGGGCTAATCACACATTTATAGAAAGGACAACTA
TTTTACACGTATGTCATATCAAAATCAACCATAATTGATATAAATTAAATATTGATGTAA
ATATTGATATCAAGATTGAGTGATTTATGAGTCGTATATTATTCATTAATTACTAAATGT
GTACTGTTATGGGTATATATAAGAGTCTACATCTAGAGGAAATATGCATTCTAAAGTCAG
TATCATCTCTAAAACTCATGTTCAGTGCAAAGCGTAAACAATGAACAGCAGAATTCAGTT
TTCGTTGATTAATATGCAGTATGTATTCTTATTCATCTTTTTGTACAAGGCTCGAGTACT
AACTTAGATTGAATACTAACTAAAACCCATTATTATACTATTTGCAGGTTCACACAGATC
AAGTGTGTGGCCTATAGAACTATTGCTCAACAGTTACATGATTTCTAGACCTCTAATGAT
GCTTATGATGTACTTTGTGTTTTAC

QA 1 625 1 625
DS 

RD RS1FQ17JQ 772 0 0
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AAATATTGATGTAAATATTGATATCAAGATTGAGTGATTTATGAGTCGTATATTATTCAT
TAATTACTAAATGTGTACTGTTATGGGTATATATAAGAGTCTACATCTAGAGGAAATATG
CATTCTAAAGTCAGTATCATCTCTAAAACTCATGTTCAGTGCAAAGCGTAAACAATGAAC
AGCAGAATTCAGTTTTCGTTGATTAATATGCAGTATGTATTCTTATTCATCTTTTTGTAC
AAGGCTCGAGTACTAACTTAGATTGAATACTAACTAAAACCCATTATTATACTATTTGCA
GGTTCACACAGATCAAGTGTGTGGCCTATAGAACTATTGCTCAACAGTTACATGATTTCT
AGACCTCTAATGATGCTTATGATGTACTTTGTGTTTTACAGTTCTGGCGAATTGATTGGA
GAGAAGGTAACTTACTGACCGATTTCTTACAGAGTGATTATGTATCATATATAAAATTAA
TTTGTTAATCAATCTAAAGAATTTTTTTTTATATGCAAAGGTGGCTTCAGGAATGTGACT
AACATTGAACAGATTTCTAAAATTATGTGACCCTGAAGATGTTCAAAAAATACAGGCCCT
TGGGAAGAGGTAAAGGGGCAGGCCTTAAGGGAAAGGGGGAGGGGACCGATGCAAATAATG
GGGGAAAAGCTCTTAGATAAGGGCTGCCCTTATCTGCCCTTAAGTTTTAGTG

QA 1 772 1 772
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5926Contig1 1291 2 2 U
GGACATTGATTAAAGCTAAAGCTTGGCTGCTTCCTTTCTCTCTCACTCTCTCTCTCTCTC
TCACTTTTCTCGCCGCGGATCCTCTCTTCCTTTGCGTCCATTTTCTCCGAGATATTTTCC
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AAATCAAAAATCAAATAAAATAATAATAATAATAATCTGCAATGTCGTCGACTTCTTTGC
AAACGATTGGGGCCATAAAGGCTTATCATCATCAAGCTCAGCATTTGGTTAACAACTATC
TCTTGGCTGATCCTTTTATTCCTTACACTTCTATTCTCACCGGCATGCTCCTCTGCAAAG
TGGTCTATGATCTTTGTCACTTCATCAGCAACTCCCATTCCAAGACCTATATCATCCTCA
CCAAGATTCAACGTATCGAATGGAACAACCGTGGTATCTCGACGGTTCATGCTATCTTTA
TCTCCGCAATGTCCCTCTACTTTGTCTTCTGATCCGATCTCTTTTCTGATAGGTGGCACA
ATGACCTTGTTGTCTTCCGGAGCTCACGTCTTTCCTCTCTTGGTTTAGGGTTATCCATTG
GTTACTTCATTGCTGATCTTGGCATGATCTTCTGGAAATATCCTTCTTTGGGTGGACTTG
AGTATATTGTGCATCACTCGCTCTCGGGGGTAGCTGTTGCCTACTCCTTGTTTTCTGGGG
AAGGACAGTTGTATACATACATGGTCCTCATCTCCGAGATTACAACCCCAGAGATCAACT
TGAGATGGTACCTGGACACAGCTGGTATGAAGAAGTCAATGGCTTATGTTGTCAATGGCG
TTTTCATCTTCTTGGCTTGGCTGGTTGCTAGAATTCTTCTATTCATATACATGTTTTATC
ATGTCTATCTGCACTACAACCAGGTCATGAGGATGCACATCTTCGGATACGCTCTGGTAT
TTGGGGTACCAGCTGCGCTTGGTGTCATGAACTTGATATGGTTCGGTAAGATTGTGAGAG
GAGTAAAGAAAACATTAGCAAAGAGATGTGAATGCTGAGAGATTGGTGAGTCTACCTCAC
AATGTTTCATCAGATATCATCTTTACTGCTTCTTTCTTCCCTCTGACATGTATGTCTGTC
TCTCTAGTGTAAGTAGTTTTTGTCTGATGGAGAAACGATAAGAAACTAAAACAAAAACAA
AAATGATACTATCCTCTGACGTCACTGTAAATGATCAAAAATTATGTCAATTTACGTTTT
TCATTAAAAGACGTAACTCTGTTTTCATTCT


BQ
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TCACTTTTCTCGCCGCGGATCCTCTCTTCCTTTGCGTCCATTTTCTCCGAGATATTTTCC
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ATGACCTTGTTGTCTTCCGGAGCTCACGTCTTTCCTCTCTTGGTTTAGGGTTATCCATTG
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TCTTGGCTTGGCTGGTTGCTAGAATTCTTCTATTCATATACATGTTTTATCATGTCTATC
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AAACATTAGCAAAGAGATGTGAATGCTGAGAGATTGGTGAGTCTACCTCACAATGTTTCA
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TATCCTCTGACGTCACTGTAAATGATCAAAAATTATGTCAATTTACGTTTTTCATTAAAA
GACGTAACTCTGTTTTCATTCT

QA 1 742 1 742
DS 



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TCTGTCTCTGTTATTGATTGTGTTTTTCTTGATAATGCCTCTTATTTCC


BQ
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AF RS1CO94TF U 1
AF RS1CO94JQ C 252
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TCTCTGAAACAGAGGAACACAAAATGGTTTCTGCATCGTCCAAGACCAAAGCTTTAGACC
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GTCTTCCCGTTTCTCCAATCTGCTGCCAGGTCCCTTCTCCTTCTTCTTTCTCAATTTTGA
TAATTGTCCCCTTTTTTTCTTACAAATTCTGAGAGATTTGATTTTTTTTTCTCAAAGCCT
TTCAAGGTGTTACACGGTGGTGTATCTGCTCTGATCGCCGAGTCTTTAGCAAGTATGGGA
GCTCACATGGCTTCTGGCTTCAAAAGGGTCGCTGGGATTCAACTCTTGATCAACCATATA
AAGAGTGCTGATCTCGGAGACCTTGTCTTCGCCGAAGCATCTCCTGTGAGTACAGGAAAG
ACTATTCAGGTTTGGGAAGTTAAGCTGTGGAAGTCAAAGGAAGGGTCAGAGAACAGAACC
TTAATATCTTCCTCTAGAGTCACACTCCTCTGTAATCTTCCTGTCCCTGATCGCGTCAAA
GATGCATCAGACCCTCTCAAATTGATCTCTAAATTGTAAATCTCAAAAAGCTTCTTTTTC
TCTGTCTCTGTTATTGATTGTGTTTTTCTTGATAATGCCTCTTATTTCC

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DS 

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TCTCGGAGACCTTGTCTTCGCCGAAGCATCTCCTGTGAGTACAGGAAAGACTATTCAGGT
TTGGGAAGTTAAGCTGTGGAAGTCAAAGGAAGGGTCAGAGAACAGAACCTTAATATCTTC
CTCTAGAGTCACACTCCTCTGTAATCTTCCTGTCCCTGATCGCGTCAAAGATGCATCAGA
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TATTGATTGTGTTTTTCTTGATAATGCCTCTTATTTCC

QA 1 458 1 458
DS 



AS 1 2

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BQ
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TCCGTACTTGGTCTGTTCCTTCGCTCTTTCTTTGTGTTGGATGGATGATGATGTTCCTAC
TATTCTAAATAAAGTATTAAGACTGCGCGCTTTATTTC

QA 1 458 1 458
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1C868TF U 1
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DS 



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BQ
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AF RS1BL11TF U 1
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BS 673 972 RS1BL11JQ

RD RS1BL11TF 675 0 0
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TGGAGGAAGTCATAGCTATGGCAAGAGGAAGAAGAAGAAGCAGTTTCAGACAGTGGAGCT
CAAAGTGAGAATGGATTGTGATGGTTGTGTCCTCAAAGTCAAGAACTCTCTTTCTTCTCT
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TTTTACAATCTAAATTAATATTTGGTTATCAAAATTCTCGTTTCCATCCTATATGAAAGT
GTGTAGTCAGTTAAGCTACTTTGGCTTTTGTATTTTCTTTCACGCCCCGTTTTGCCGCTC
ATACTAAACTCGTTTTGTTCAAACTCTATCTAAAACATATACATGTACGTGAATACACAA
AAGATACATCGTTTGTTAACATTTTCAAATATTTTAATATGCTTTCTCAGGAGTTAAATC
GGTGGAGATAAACAAGAAGCAGCAAAAGGTGACGGTGAGTGGTTACGCGGAACCGAGCAA
GGTGCTGAAGAA
AGC

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DS 

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AGTCAAGAACTCTCTTTCTTCTCTAAAAGGTAAAAAATTTTTTTTTTGCCAAAAGATTTC
TAAAAGGTAAATTAACTAGCAACTTTTTACAATCTAAATTAATATTTGGTTATCAAAATT
CTCGTTTCCATCCTATATGAAAGTGTGTAGTCAGTTAAGCTACTTTGGCTTTTGTATTTT
CTTTCACGCCCCGTTTTGCCGCTCATACTAAACTCGTTTTGTTCAAACTCTATCTAAAAC
ATATACATGTACGTGAATACACAAAAGATACATCGTTTGTTAACATTTTCAAATATTTTA
ATATGCTTTCTCAGGAGTTAAATCGGTGGAGATAAACAAGAAGCAGCAAAAGGTGACGGT
GAGTGGTTACGCGGAACCGAGCAAGGTGCTGAAGAAGGCCAAAGCGACGGGGAAGAAGGC
TGAGATATGGCCTTACGTTCCCTACAACTTGGTGGCTCAGCCCTACATCGCTCAGGCTTA
CGACAAGAAGGCGCCGCCTGGTTACGTCAGAAAAGTCGACCCATACGCCACCACGGGGAC
GATGGCTGTTTACAACGATGACCCTTCTTACACTTCTATGCTTAGTGATGATAATCCTAA
TTCTTGCTCCATTATGTAATTACTAAATCAATAATAAAGACGGTTTATATGTATATGTAT
AAATATGAGTTATATAGATTTTGGTGTTTTTTGTCC

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1DU76TF U 1
AF RS1DU76JQ C 185
BS 1 617 RS1DU76TF
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BS 619 643 RS1DU76TF
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RD RS1DU76TF 643 0 0
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TCAAAGTTCAAGAGTTTCCAGATTCCGGTTGATTGGATGCTCGAAACAGGCATTACTAGT
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CTCGAAGCCATTGGAGGCGGTGGCCCTGAAGAGGAAGAACTTATTGTTCAAGGGGTTCGA
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ATTTGTTTGTCCAAACTCTTTAAAAATCTGTTTTTGTGTGTGTTTTCAGTTCGCAGGAGG
GTTTGATGCCGAGACAATGAGGGCGTTTCAAGAGCTAAGAGATAAAGCGAGATCATGTCA
TATTCAATGTCAAAGCCCAACACATCAACATAAGCTTGTTTTT

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DS 

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GATGCCGAGACAATGAGGGCGTTTCAAGAGCTAAGAGATAAAGCGAGATCATGTCATATT
CAATGTCAAAGCCAAACACATCAACATAAGCTTGTTTTTCGATCTACCCCTTGTTGAAGC
AACCTTAGCTTCTTATATCCACACCTCATTGGTATTTGTCTTGAATTTCTCTA

QA 1 533 1 533
DS 



AS 1 2

CO CL5932Contig1 813 2 4 U
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AAGAGTTGGAGCCTACATTTCTGTTTCTTTGTTCAAAAGAGTATTTTTGTTGTCAAATTT
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AGACTTTTTTTTTTCAGAATATGTTTCATTTTCTGTTTATTCTTTGATCTTATAACTTAC
ATTATACATTATTTAAACATTCTGAGATTATGAATACCTTTGTCGCTCTATTTTGATAAG
GTTTCGTCATTAGGATGCTTCGTGTGCAGAGATTGTGGCGTCGTGTTGTTACTAATGGGA
AAGTTTGTGTTATAGTAGATCTGTAAGCTCAAAATGGCAGAGCTCTCGTTATGAGAGGTT
GGTGGTTCGAATCCACCCAGATCTGTCTACTTCTTAGTCTTTTCACCTCTTTTACATGAA
CGCACTTTTGAATTCGTTTTAGTTATAATCTATCAGTGTTATTGCACTTATTATTAGGGT
AATGCCACAAAACGAATTTGCTTGCAAAAGGACATCCTTTTGATTTGGCAATTGGCGGAG
GGACCGATGAACTTATCATCGGTAAAGCAATGACGCTGTTCAACTATGTGAATTGGATTG
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TTAATGCATACATTACGTTGTCTTGGGGTCCTACATTCATTCCAAAAAGGTTGTTTTGTG
CCTTGAATAAACAAAAAAAAACATTTTTGGGCC


BQ
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AF RS1A808TF U 1
AF RS1A808JQ C 231
BS 1 349 RS1A808TF
BS 350 350 RS1A808JQ
BS 351 369 RS1A808TF
BS 370 813 RS1A808JQ

RD RS1A808TF 369 0 0
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AAGAGTTGGAGCCTACATTTCTGTTTCTTTGTTCAAAAGAGTATTTTTGTTGTCAAATTT
GAAGAAATTATTCAATTTGGAGTTTGAAGCTTGAATTATATATTGCTGTTGCTATGTATT
AGACTTTTTTTTTTCAGAATATGTTTCATTTTCTGTTTATTCTTTGATCTTATAACTTAC
ATTATACATTATTTAAACATTCTGAGATTATGAATACCTTTGTCGCTCTATTTTGATAAG
GTTTCGTCATTAGGATGCTTCGTGTGCAGAGATTGTGGCGTCGTGTTGT*ACTAATGGGA
AAGTTTGTG

QA 1 369 1 369
DS 

RD RS1A808JQ 583 0 0
TATAACTTACATTATACATTATTTAAACATTCTGAGATTATGAATACCTTTGTCGCTCTA
TTTTGATAAGGTTTCGTCATTAGGATGCTTCGTGTGCAGAGATTGTGGCGTCGTGTTGTT
ACTAATGGGAAGGTTTGTGTTATAGTAGATCTGTAAGCTCAAAATGGCAGAGCTCTCGTT
ATGAGAGGTTGGTGGTTCGAATCCACCCAGATCTGTCTACTTCTTAGTCTTTTCACCTCT
TTTACATGAACGCACTTTTGAATTCGTTTTAGTTATAATCTATCAGTGTTATTGCACTTA
TTATTAGGGTAATGCCACAAAACGAATTTGCTTGCAAAAGGACATCCTTTTGATTTGGCA
ATTGGCGGAGGGACCGATGAACTTATCATCGGTAAAGCAATGACGCTGTTCAACTATGTG
AATTGGATTGCAAGCAGCTGAGCTAGGACTTTATTCATGTAGGGTTACACAAAAGGAGAC
GATTTTTTGCTTAATGCATACATTACGTTGTCTTGGGGTCCTACATTCATTCCAAAAAGG
TTGTTTTGTGCCTTGAATAAACAAAAAAAAACATTTTTGGGCC

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 2

CO CL5933Contig1 825 2 2 U
GGAAAGGAAAGCTCTTTGAAACGCCGCTCCGTCTTCTTCGTCGTTCTGTGCTTGCCATCT
CTCTTCTCTCTTTACCCCCTATCAACATTTAATCGAGATATGGGTCTAACGGAAGAAGAA
ATCAAAAGACTTTACAGGATCCAGAAGACGTTGATGCAGATGCTCAAGGACCGTGGCTAC
TTCATCGCCGACTCTGAGATCACCATGAGCTTATCGCAGTTCGTTAGGAAGTACGGAGAC
AACATGAAAAGAGAAGATCTTGTTACTCTCAAAGCTAAGCGAAACGACAGCAGTGACCAG
CTCTATATCTTCTTCCCTGATGAGGCGAAAGTTGGGGTTAAGACGATGAAGGTGTACACA
AACAGGATGAAGTCAGAGAATGTTTACAGAGCTATCTTGGTGGTGCAGCAGAACTTGACT
CCTTTTGCTCGAACTTGCATCAGTGAGGTCTCTTCTAAGTTTCATTTGGAAGTCTTCCAG
GAGGCGGAAATGCTTGAACATTAAAGAACATGTTCTTGTTCCGGAGCACCAAGTTCTAAC
CACTGAGGAGAAGAAAACTCTTCTTGAGAGATACACTGTCAAGGAGACACAGCTTCCAAG
GATCCAAGTGACTGATCCAATCGCAAGATACTTTGGGCTAAAACGTGGACAAGTTGTGAA
GATCATACGTCCGAGTGAAACTGCTGGGCGTTATGTTACCTACCGTTATGTTGTATAAGC
AAAAAGGTTTTGTTGTGCGACTGGAAACGCTTAGAGTTGCTGTGTACCAAATTGTTGACG
ATATTGTTTGTTAAGTGTACGAATTAAAAAAACCTTACAACGACG


BQ
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AF RS1DN42TF U 1
AF RS1DN42JQ C 140
BS 1 595 RS1DN42TF
BS 596 825 RS1DN42JQ

RD RS1DN42TF 595 0 0
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CTCTTCTCTCTTTACCCCCTATCAACATTTAATCGAGATATGGGTCTAACGGAAGAAGAA
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TTCATCGCCGACTCTGAGATCACCATGAGCTTATCGCAGTTCGTTAGGAAGTACGGAGAC
AACATGAAAAGAGAAGATCTTGTTACTCTCAAAGCTAAGCGAAACGACAGCAGTGACCAG
CTCTATATCTTCTTCCCTGATGAGGCGAAAGTTGGGGTTAAGACGATGAAGGTGTACACA
AACAGGATGAAGTCAGAGAATGTTTACAGAGCTATCTTGGTGGTGCAGCAGAACTTGACT
CCTTTTGCTCGAACTTGCATCAGTGAGGTCTCTTCTAAGTTTCATTTGGAAGTCTTCCAG
GAGGCGGAAATGCTTGAACATTAAAGAACATGTTCTTGTTCCGGAGCACCAAGTTCTAAC
CACTGAGGAGAAGAAAACTCTTCTTGAGAGATACACTGTCAAGGAGACACAGCTT

QA 1 595 1 595
DS 

RD RS1DN42JQ 686 0 0
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TCACCATGAGCTTATCGCAGTTCGTTAGGAAGTACGGAGACAACATGAAAAGAGAAGATC
TTGTTACTCTCAAAGCTAAGCGAAACGACAGCAGTGACCAGCTCTATATCTTCTTCCCTG
ATGAGGCGAAAGTTGGGGTTAAGACGATGAAGGTGTACACAAACAGGATGAAGTCAGAGA
ATGTTTACAGAGCTATCTTGGTGGTGCAGCAGAACTTGACTCCTTTTGCTCGAACTTGCA
TCAGTGAGGTCTCTTCTAAGTTTCATTTGGAAGTCTTCCAGGAGGCGGAAATGCTTGAAC
ATTAAAGAACATGTTCTTGTTCCGGAGCACCAAGTTCTAACCACTGAGGAGAAGAAAACT
CTTCTTGAGAGATACACTGTCAAGGAGACACAGCTTCCAAGGATCCAAGTGACTGATCCA
ATCGCAAGATACTTTGGGCTAAAACGTGGACAAGTTGTGAAGATCATACGTCCGAGTGAA
ACTGCTGGGCGTTATGTTACCTACCGTTATGTTGTATAAGCAAAAAGGTTTTGTTGTGCG
ACTGGAAACGCTTAGAGTTGCTGTGTACCAAATTGTTGACGATATTGTTTGTTAAGTGTA
CGAATTAAAAAAACCTTACAACGACG

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 2

CO CL5934Contig1 1272 2 2 U
GGCCGCCTCTTACATCTTCTTCAAAACGCTTCCTTCTTCTACAAAGCCAAAACGAAAACC
AACAAGTGATTTTCGATTGTACCATCTCTCCGATTCAATCGATTCCAATGATGAGTTCCG
AACCGTTAGATAACGACGATGACTCGGAGCCTTTCGTGGAATCAGATCCCACCGGCAGGT
ACGGCCGTTACGACGAGCTATTAGGCTCAGGCGCCGTCAAAAAAGTCTACAGAGCATTTG
ACCAAGAGGAAGGCATCGAAGTCGCGTGGAACCAAGTCAAGCTGAGATGTTTCTCCTCCG
ACACAGCCATGCTCGAGAGGCTCTACTCCGAGGTCAGGCTGCTGAAGAGCCTCGATAACA
GCAACATCATCGCCTTGTACAAGGTCTGGAGAGACGAGAGGAGCAACACGTTGAACTTCA
TCACGGAGATATGCACCTCCGGGAACCTGAGAGAGTACCGGAAGAAGCACAGGCACGTGT
CCATGAGAGCTTTGAAGAAATGGTCCAAGCAGATTCTCAAGGGGTTGGATTATCTCCACA
CGCGTGAGCCGTGTATCATCATCCACAGAGATCTCAACTGCAGCAACGTGTTTGTCAACG
GAAACATCGGCCAGGTCAAGATTGGTGATTTTGGTTTAGCTGCGGTCGTGGGGGAGAACC
ATGAGGCTCATTCGATCCTCGGGACGCCGGAGTTCATGGCTCCTGAGATGTACGAGGAGA
GGTACACGGAGATGGTTGACATTTACTCGTACGGGATGTGCGTTTTGGAGCTTGTGTCGC
TCGAGATTCCGTATAGTGAGTGCGATAGCGTGGCTAAGATATACAGGAGGGTGAGCGGTG
GAGTCAGACCAGAGGCTCTGGAGAAAGTGAAGGATGTGGAAGCTAAGGCCTTTATTGAGA
AGTGCCTTGGGAAACCCAAGGCGAGGCCTTCTGCTGCTGAGCTTTTTCGTGACCCGTTCT
TTGATGGGATAGCCGTAGATGATGATTATGAAGAATTAGAAAACAATGACAGTAGTGCAA
CTGGTCGTGTTGTTTCTTGATGATGTAGGGATACATACATGCACTATGGTTTGAGTCCAT
CTTTACATTTTGAGATGCATTGTTTTGTTCTTTTTTTCTTTTAGTTTGTACAGAGACCTC
TGTTTCGACATGGATTGCATCCAGCTTCTTCCTTTTAGTTCGTAGCTGGTTTCAAACATG
GGAGAGCGGAAGCTACAATTTTATTTGAATCATTGAACAAAACTTTGTAAATCATTCTCA
TTAATCCGTTAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ET89TF U 1
AF RS1ET89JQ C 451
BS 1 580 RS1ET89TF
BS 581 1272 RS1ET89JQ

RD RS1ET89TF 580 0 0
GGCCGCCTCTTACATCTTCTTCAAAACGCTTCCTTCTTCTACAAAGCCAAAACGAAAACC
AACAAGTGATTTTCGATTGTACCATCTCTCCGATTCAATCGATTCCAATGATGAGTTCCG
AACCGTTAGATAACGACGATGACTCGGAGCCTTTCGTGGAATCAGATCCCACCGGCAGGT
ACGGCCGTTACGACGAGCTATTAGGCTCAGGCGCCGTCAAAAAAGTCTACAGAGCATTTG
ACCAAGAGGAAGGCATCGAAGTCGCGTGGAACCAAGTCAAGCTGAGATGTTTCTCCTCCG
ACACAGCCATGCTCGAGAGGCTCTACTCCGAGGTCAGGCTGCTGAAGAGCCTCGATAACA
GCAACATCATCGCCTTGTACAAGGTCTGGAGAGACGAGAGGAGCAACACGTTGAACTTCA
TCACGGAGATATGCACCTCCGGGAACCTGAGAGAGTACCGGAAGAAGCACAGGCACGTGT
CCATGAGAGCTTTGAAGAAATGGTCCAAGCAGATTCTCAAGGGGTTGGATTATCTCCACA
CGCGTGAGCCGTGTATCATCATCCACAGAGATCTCAACTG

QA 1 580 1 580
DS 

RD RS1ET89JQ 822 0 0
GAGAGTACCGGAAGAAGCACAGGCACGTGTCCATGAGAGCTTTGAAGAAATGGTCCAAGC
AGATTCTCAAGGGGTTGGATTATCTCCACACGCGTGAGCCGTGTATCATCATCCACAGAG
ATCTCAACTGCAGCAACGTGTTTGTCAACGGAAACATCGGCCAGGTCAAGATTGGTGATT
TTGGTTTAGCTGCGGTCGTGGGGGAGAACCATGAGGCTCATTCGATCCTCGGGACGCCGG
AGTTCATGGCTCCTGAGATGTACGAGGAGAGGTACACGGAGATGGTTGACATTTACTCGT
ACGGGATGTGCGTTTTGGAGCTTGTGTCGCTCGAGATTCCGTATAGTGAGTGCGATAGCG
TGGCTAAGATATACAGGAGGGTGAGCGGTGGAGTCAGACCAGAGGCTCTGGAGAAAGTGA
AGGATGTGGAAGCTAAGGCCTTTATTGAGAAGTGCCTTGGGAAACCCAAGGCGAGGCCTT
CTGCTGCTGAGCTTTTTCGTGACCCGTTCTTTGATGGGATAGCCGTAGATGATGATTATG
AAGAATTAGAAAACAATGACAGTAGTGCAACTGGTCGTGTTGTTTCTTGATGATGTAGGG
ATACATACATGCACTATGGTTTGAGTCCATCTTTACATTTTGAGATGCATTGTTTTGTTC
TTTTTTTCTTTTAGTTTGTACAGAGACCTCTGTTTCGACATGGATTGCATCCAGCTTCTT
CCTTTTAGTTCGTAGCTGGTTTCAAACATGGGAGAGCGGAAGCTACAATTTTATTTGAAT
CATTGAACAAAACTTTGTAAATCATTCTCATTAATCCGTTAC

QA 1 822 1 822
DS 



AS 1 2

CO CL5935Contig1 567 2 2 U
CAAGCACGATCTAGACCGTACAAACACAAACGACGATACACAATCCAACGGTTTTTTGAG
TATCATCGATCGAAAATCAACATTTTAGTTGGATGGGACTATTATTATTATTTATATGAT
TAGAGAACCCGTGACCCGATCCGGGTTATCATTCGTTGATCCGAACGGACACGTCAGACG
CGAGTCGTGACGCGATGGCCGAATGATACATGACTTCGTGGAACGTGGAGACTTGGGCGA
TTTTCATTCGCAGTTGCTTCGCCTTCTCCTCCGTGAGACACCTCCGCGTAGTCCTCTGAT
CCAGGTCCGATTCCCGATTCGATGAGGAGCTGTTATCCACGACGTAATCAGGTTCCGATG
ACCAGCCGAAAAGAGGAGCCCACCATGAACCGGGCTTCTTTCCGGTTGGATCGGGTTTTC
TGATGGATCCGGAAGATGCACGGATCGAAGGGAGAGCGGAGCAGGAGATGATTGTAGCCA
TTGTAATGGATCGTGAGAGAAATGAGCAAAACGTAAAGAGTGTTGTTATTTATTTGGGGA
AGAAGATAAGGAACGTGGATTGGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1A864TF C 1
AF RS1A864JQ U 113
BS 1 112 RS1A864TF
BS 113 567 RS1A864JQ

RD RS1A864TF 567 0 0
CAAGCACGATCTAGACCGTACAAACACAAACGACGATACACAATCCAACGGTTTTTTGAG
TATCATCGATCGAAAATCAACATTTTAGTTGGATGGGACTATTATTATTATTTATATGAT
TAGAGAACCCGTGACCCGATCCGGGTTATCATTCGTTGATCCGAACGGACACGTCAGACG
CGAGTCGTGACGCGATGGCCGAATGATACATGACTTCGTGGAACGTGGAGACTTGGGCGA
TTTTCATTCGCAGTTGCTTCGCCTTCTCCTCCGTGAGACACCTCCGCGTAGTCCTCTGAT
CCAGGTCCGATTCCCGATTCGATGAGGAGCTGTTATCCACGACGTAATCAGGTTCCGATG
ACCAGCCGAAAAGAGGAGCCCACCATGAACCGGGCTTCTTTCCGGTTGGATCGGGTTTTC
TGATGGATCCGGAAGATGCACGGATCGAAGGGAGAGCGGAGCAGGAGATGATTGTAGCCA
TTGTAATGGATCGTGAGAGAAATGAGCAAAACGTAAAGAGTGTTGTTATTTATTTGGGGA
AGAAGATAAGGAACGTGGATTGGTTCC

QA 1 567 1 567
DS 

RD RS1A864JQ 455 0 0
TATATGATTAGAGAACCCGTGACCCGATCCGGGTTATCATTCGTTGATCCGAACGGACAC
GTCAGACGCGAGTCGTGACGCGATGGCCGAATGATACATGACTTCGTGGAACGTGGAGAC
TTGGGCGATTTTCATTCGCAGTTGCTTCGCCTTCTCCTCCGTGAGACACCTCCGCGTAGT
CCTCTGATCCAGGTCCGATTCCCGATTCGATGAGGAGCTGTTATCCACGACGTAATCAGG
TTCCGATGACCAGCCGAAAAGAGGAGCCCACCATGAACCGGGCTTCTTTCCGGTTGGATC
GGGTTTTCTGATGGATCCGGAAGATGCACGGATCGAAGGGAGAGCGGAGCAGGAGATGAT
TGTAGCCATTGTAATGGATCGTGAGAGAAATGAGCAAAACGTAAAGAGTGTTGTTATTTA
TTTGGGGAAGAAGATAAGGAACGTGGATTGGTTCC

QA 1 455 1 455
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5937Contig1 295 2 2 U
AAAACAATATATGTAACATTGATTTCCTAGAGAATTATCATCTCCTCTAGGGGATTCACA
TTCACTGATTCACCAAGCGAGGGAACTATCATTTCCTCTAGGGGAATCACATACACTGAT
TCACCTCGGTCTCTTATTCATTACATCCAAAATCAAACACACCCAATGTGTACAGACAAA
CGACACACGACAACAACAACAGAAACCAACTAAAACAATATATGTAACATTAATTCCCTT
GGTGGTTATATCATATAACGAGAATGATCATTCCCGCGGGGGAGAGGGGGGGGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DU46JQ U 1
AF RS1CB66JQ U 71
BS 1 282 RS1DU46JQ
BS 283 295 RS1CB66JQ

RD RS1DU46JQ 282 0 0
AAAACAATATATGTAACATTGATTTCCTAGAGAATTATCATCTCCTCTAGGGGATTCACA
TTCACTGATTCACCAAGCGAGGGAACTATCATTTCCTCTAGGGGAATCACATACACTGAT
TCACCTCGGTCTCTTATTCATTACATCCAAAATCAAACACACCCAATGTGTACAGACAAA
CGACACACGACAACAACAACAGAAACCAACTAAAACAATATATGTAACATTAATTCCCTT
GGTGGTTATATCATATAACGAGAATGATCATTCCCGCGGGGG

QA 1 282 1 282
DS 

RD RS1CB66JQ 225 0 0
CG
CCAAGCGAGGGAACTATCATTTCCTCTAGGGGAATCACATACACTGATTCACCTCGGTCT
CTTATTCATTACATCCAAAATCAAACACACCCAATGTGTACAGACAAACGACACACGACA
ACAACAACAGAAACCAACTAAAACAATATATGTAACATTAATTCCCTTGGTGGTTATATC
ATATAACGAGAATGATCATTCCCGCGGGGGAGAGGGGGGGGGG

QA 3 225 3 225
DS 



AS 1 2

CO CL5938Contig1 1033 2 6 U
GGGACCATTCTTCTTTGTAGTTGGGATGCAGAAGAGTTCGGAATGATTGGATCAACTGAA
TGGGTTGAAGACAATATTCTCAACTTAGGTGCAAGTGCTGTGGCTTATCTCAATGTAGAT
TGCGCGGTCCAAGGCTCTGGGTTCTTTGCTGGTGCAACTCCTCAGTTAGATGGTCTTCTT
TTTGATGTCTTGAAGTTGGTTCAAGATCCTGATGATGTAGCCTTGACAGTTGAAGATACA
TTCAAATCTCAGAACAACATTATAGAGAGGCTAAGTAGAGTAGATTCTGATTTCTCCGGG
TTTCTTCATCATGCCGGGATATCATCTATAGACATGTACTATGGTGCAGATTATCCTGTG
TATCACACAGCTTTTGACTCCTATGATTGGATGGTCCGCAATGCAGATCCCTTGTTTCAT
CGTCATGTTGCCATGGCTGGAGTATGGGGACTTTTAGGAATTATATTGGCTGATGAGCCA
GTCTTACCGTTCAATTACATCTCGTATACTGAACAGTTGCAGGCACATAGCGATTCATTG
AGCAAGCTCTTACAGGGGAAAGCCTCTGTTGACCCCTTGAGCGTGGCGATACAAGAGTTC
TCATTAGTTGCTAAAGAAGCTGCAGATGAAGCAAAGAAGTTAAAGGAACAAGAATATAGC
AAAAATGATGTTGCATCAGCTGCCAAGAGAAGAGATCTGAATGACAGGATGATGCTTGCA
GAAAGAGGGTTTTTGGATTCACAAGGGATCAAAGGGAAAGAATGGTTCAAGCATCTTGTG
TATGGGCCTGCAGCTGAACCTGAGAGCAAGTTAGGGTTTTTCCCGGGGATAGCAGATGCG
ATTGCAACAAACTCATCACAGGGAATAATTCAGCATGAGATATGGAGAGTTGCGAGAGCG
ATTCAGAGAGCAAGCAAAGCTCTTAAAGGAGGGTTCACATGAGAAAAGAAAAACTTTGTC
GTTTGTATATGTATTGTGTGACTGTAGATTGTAGAATCATTAACCATCTTACCCTTATCA
TATCATGTTAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GD60TF U 1
AF RS1GD60JQ C 474
BS 1 560 RS1GD60TF
BS 561 561 RS1GD60JQ
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BS 649 690 RS1GD60TF
BS 691 1033 RS1GD60JQ

RD RS1GD60TF 696 0 0
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TGGGTTGAAGACAATATTCTCAACTTAGGTGCAAGTGCTGTGGCTTATCTCAATGTAGAT
TGCGCGGTCCAAGGCTCTGGGTTCTTTGCTGGTGCAACTCCTCAGTTAGATGGTCTTCTT
TTTGATGTCTTGAAGTTGGTTCAAGATCCTGATGATGTAGCCTTGACAGTTGAAGATACA
TTCAAATCTCAGAACAACATTATAGAGAGGCTAAGTAGAGTAGATTCTGATTTCTCCGGG
TTTCTTCATCATGCCGGGATATCATCTATAGACATGTACTATGGTGCAGATTATCCTGTG
TATCACACAGCTTTTGACTCCTATGATTGGATGGTCCGCAATGCAGATCCCTTGTTTCAT
CGTCATGTTGCCATGGCTGGAGTATGGGGACTTTTAGGAATTATATTGGCTGATGAGCCA
GTCTTACCGTTCAATTACATCTCGTATACTGAACAGTTGCAGGCACATAGCGATTCATTG
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TCATTAGTTGCTAAAGAAGCTGCAGATGAAGCAAAGAAGTTAAAGGA*CAAGAATATAGC
AAAAATGATGTTGCATCAGCTGCCAAGAGA
GAGATC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1GD60JQ 560 0 0
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TTCATTGAGCAAGCTCTTACAGGGGAAAGCCTCTGTTGACCCCTTGAGCGTGGCGATACA
AGAGTTCTCATTAGTTGCTAAAGAAGCTGCAGATGAAGCAAAGAAGTTAAAGGAACAAGA
ATATAGCAAAAATGATGTTGCATCAGCTGCCAAGAGAAGAGATCTGAATGACAGGATGAT
GCTTGCAGAAAGAGGGTTTTTGGATTCACAAGGGATCAAAGGGAAAGAATGGTTCAAGCA
TCTTGTGTATGGGCCTGCAGCTGAACCTGAGAGCAAGTTAGGGTTTTTCCCGGGGATAGC
AGATGCGATTGCAACAAACTCATCACAGGGAATAATTCAGCATGAGATATGGAGAGTTGC
GAGAGCGATTCAGAGAGCAAGCAAAGCTCTTAAAGGAGGGTTCACATGAGAAAAGAAAAA
CTTTGTCGTTTGTATATGTATTGTGTGACTGTAGATTGTAGAATCATTAACCATCTTACC
CTTATCATATCATGTTAACC

QA 1 560 1 560
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGATCCTTCTTCTATCTCATATCAAAGAGAAAAATCTCTTCTCATTTTTTATTTTTGTAT
AAGCCTGAAAGACTCGAACCCTCCAGAAGAACAGCATAGATAAGTAACAACGATAATAAA
TTCCATTTCTTTCAACTCAAACAGCCCAATGCTCTGCTCAGCGCAGACACCAAGTTGCAT
TTTTTACCATTTTCATGTCAACAAGCCCGTTTGTCGGAAACCGAGGTTTCGGGTTTGTTC
ATCCACATCTAGCGAGAGTGACAGGTTCAAAGTAGAGTACACTCCATGGCTTATCGTAGG
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AAAAAAACATATCATTTTTCAAAAAAAAAGTTAGATTGGTCTGAGTCTGCAATTTTCCTA
CAAGTGTGTGTTGTTTTTTTTTACAGGTTGGTTTCGAGATGATTGATAAGTTGGCTAGGA
AAGAAGGTGTTTTGATGAACACAATACAGTCCAAAGCTCTGATCGGAATAGTACAGGTGC
TATAGAAGAGGTACCTATCTTGTTGGCTAAACCTCAGACTTACATGAACTTCAGCGGCGA
GTCGGTTTGTATTTGTTTATTCATCACAATACTCTTTATCATAATCGAAACTCTCACTAC
CTAGAACCGTAATTAATGTTGTTGTTTAAAGGTTGAATCTTTAGCTGCACATTATCAAGT
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GGACGGTCGTAGAAACTTTCCTCGACTAAGCATAGGCATTGGTCATCCACCTGGAAACAT
GGATATGAAAGCTTTCCTTCTTCAGAAGTTCAGTCCATCGGAAAGGAAACAGATTGATGA
AGCACTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AL52TF U 1
AF RS1AL52JQ C 577
BS 1 695 RS1AL52TF
BS 696 696 RS1AL52JQ
BS 697 790 RS1AL52TF
BS 791 968 RS1AL52JQ

RD RS1AL52TF 790 0 0
GGATCCTTCTTCTATCTCATATCAAAGAGAAAAATCTCTTCTCATTTTTTATTTTTGTAT
AAGCCTGAAAGACTCGAACCCTCCAGAAGAACAGCATAGATAAGTAACAACGATAATAAA
TTCCATTTCTTTCAACTCAAACAGCCCAATGCTCTGCTCAGCGCAGACACCAAGTTGCAT
TTTTTACCATTTTCATGTCAACAAGCCCGTTTGTCGGAAACCGAGGTTTCGGGTTTGTTC
ATCCACATCTAGCGAGAGTGACAGGTTCAAAGTAGAGTACACTCCATGGCTTATCGTAGG
GTTGGGTAATCCAGGGAACAAGTATCATGGAACAAGACACAATGTAATGTTAAAAAAGAA
AAAAAAACATATCATTTTTCAAAAAAAAAGTTAGATTGGTCTGAGTCTGCAATTTTCCTA
CAAGTGTGTGTTGTTTTTTTTTACAGGTTGGTTTCGAGATGATTGATAAGTTGGCTAGGA
AAGAAGGTGTTTTGATGAACACAATACAGTCCAAAGCTCTGATCGGAATAGTACAGGTGC
TATAGAAGAGGTACCTATCTTGTTGGCTAAACCTCAGACTTACATGAACTTCAGCGGCGA
GTCGGTTTGTATTTGTTTATTCATCACAATACTCTTTATCATAATCGAAACTCTCACTAC
CTAGAACCGTAATTAATGTTGTTGTTTAAAGGTTGGATCTTTAGCTGCACATTATCAAGT
ACCATTGCGCCACATTTTGCTGATATACGATGAGATGGCATTACCAAATGGGGTTTTGAG
ACTTCAACCA

QA 1 790 1 790
DS 

RD RS1AL52JQ 392 0 0
GACTTACATGAACTTCAGCGGCGAGTCGGTTTGTATTTGTTTATTCATCACAATACTCTT
TATCATAATCGAAACTCTCACTACCTAGAACCGTAATTAATGTTGTTGTTTAAAGGTTGA
ATCTTTAGCTGCACATTATCAAGTACCATTGCGCCACATTTTGCTGATATACGATGAGAT
GGCATTACCAAATGGGGTTTTGAGACTTCAACCAAAAGGAGGTCAAGGCTATCACAACGG
AGTAAAGAGTGTAATGGGGAACTTGGACGGTCGTAGAAACTTTCCTCGACTAAGCATAGG
CATTGGTCATCCACCTGGAAACATGGATATGAAAGCTTTCCTTCTTCAGAAGTTCAGTCC
ATCGGAAAGGAAACAGATTGATGAAGCACTCG

QA 1 392 1 392
DS 



AS 1 2

CO CL5941Contig1 755 2 6 U
GGCAGGCGAATGTGTTACGTTTTCATACCAAATCAGGGATAGTTTTGGGATTACCAAAAA
TGCTACAGCGTCTTTACCAACTAGCTAATTTCAGAGGAAACTTTACCATGTAATGCAAAT
TCCCTAAAAAATAAAAAAAGACAAGAAAACAAACCGCAAACAGACAATAGTACTTTGTGT
ACTCATCCAAAGAAAATAACAAAAATACACACATTTTATCACGGATTTAATCTGATAGAA
AAAAAAATCTCGGATTTGAGATGCTTAATCTATCAAATCGCCATCAAATAAACTTTAGGT
TAACCGGTAATACCATTTCTTCTCTTTTCCTCTCCATTTGCAGCGCCTGTTGTAGCTCTG
TCCGAATCAAAAACTTTCTTTGTTGACGCAAGAAAAATTGAAGAAGAAAGCCTCTTCTTT
GGCAATACCATTTGCGGAAGTTTATTTTTATCGGACACAACCTTCTTTTGGGAGCCCAAG
TTGCTCGGTTCTTGTTCCCACACTATCTTTTGATTTCTTAGCTTGCGTGGTAACCATGTT
TTTTGCTGTTCCCACACTTGCCTTGGATTTCTTCAACGGAAGGGGTTTAGTCATCTTGCT
TGCTGTTTCCTCACTAGCCTTGGATTTTTCAGTTTCCGTATTGCCAAAAGAACTTCTGCG
TGATAAAGAACTATCAAGGCTCTCAGCATCTTTGACATTTTTAGATGATCCACCACCGAT
GCTGTGCCTATGATTAACCCCCTCGCTCTGGTTAG


BQ
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15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1FE29JQ U 1
AF RS1BC53JQ U 2
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AAAAAAATCTCGGATTTGAGATGCTTAATCTATCAAATCGCCATCAAATAAACTTTAGGT
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DS 

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A
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AAAA*TCTCGGATTTGAGATGCTTAATCTATCAAATCGCCATCAAATAAACTTTAGGTTA
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GCTCGGTTCTTGTTCCCACACTATCTTTTGATTTCTTAGCTTGCGTGGTAACCATGTTTT
TTGCTGTTCCCACACTTGCCTTGGATTTCTTCAACGGAAGGGGTTTAGTCATCTTGCTTG
CTGTTTCCTCACTAGCCTTGGATTTTTCAGTTTCCGTATTGCCAAAAGAACTTCTGCGTG
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QA 2 754 2 754
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

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CCTACAAAACCAGTTGGAGTTTACACTTGAAATCAGACTTTGGAAGCAAATCTCTTGAAT
GCATTGTCGCGGATGAACAAAAGCAAATGGGCACTGGAATTGATTTACCTTGTTCTAACA
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TGAATGAGCGGACCTGGTTCTGAAGTCCAAACCCGAGCCAAGTTTTATGAGTCTACGTTC
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AGGTCCTGGACAAATCCTTTAATTTCTCATATGCAGCAAGATCGATACCGGCATAAGGAA
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AAATGTCTTTAGTGAGCGTTCCAATCCGAGGACAAGCGGCACCTGCTTGGCTAGTGCAAG
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CTACCTTCACTATATTCAAACCGTTACCACGAAAAAACCCCCGAACCCCACCCTGATTCC
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TTAAGCGATCTAGAGGTGCAGTTGCAGTCCTAGAAGCAGCACCGGCTATGCCACCTGTGA
CAGTACTATCTTGTTGTCAAAAGCCAGTTCTGTGTTTATGTTTATTCAGAAAATAAGAAC
AATTAAAGAAGTCCCACCTGCAATGAAGTAGTTGCTTCTCTTTACATGTTTGCTCATTCC
TTCGGGGATAACGGCTTGTTCTCCAATGTCTACAAGACACACTCTTTCCCAGTGATGATA
AATGTTTTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GA92TF U 1
AF RS1GA92JQ C 268
BS 1 618 RS1GA92TF
BS 619 1089 RS1GA92JQ

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TGAATGAGCGGACCTGGTTCTGAAGTCCAAACCCGAGCCAAGTTTTATGAGTCTACGTTC
AAGTACATTTATACATGAATGTGAAATAAGGAGATTTACCGGCGTCCTCTTGAAGAATAT
AGGTCCTGGACAAATCCTTTAATTTCTCATATGCAGCAAGATCGATACCGGCATAAGGAA
TAATCCCGAGAAGAGAAGGGAAAAGACCTTTGTAGAAGGCACGTGGACCCTCATGAACCA
AAATGTCTTTAGTGAGCGTTCCAATCCGAGGACAAGCGGCACCTGCTTGGCTAGTGCAAG
TCTGCAACCTAGTTTTCACAAGATCCAGAGGGTATATAGAGTCTTGAGCCACTGCGCCAG
CCATACCTCCAGCAAAAA

QA 1 618 1 618
DS 

RD RS1GA92JQ 822 0 0
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AAGGAGATT*ACCGGCGTCCTCTTGAAGAATATAGGTCCTGGACAAATCCTTTAATTTCT
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CTTTGTAGAAGGCACGTGGACCCTCATGAACCAAAATGTCTTTAGTGAGCGTTCCAATCC
GAGGACAAGCGGCACCTGCTTGGCTAGTGCAAGTCTGCAACCTAGTTTTCACAAGATCCA
GAGGGTATATAGAGTCTTGAGCCACTGCGCCAGCCATACCTCCAGCAAAAAGTCTAGCGG
TCGTGCCTATATCCGCTTTATCTTCACCCATGTTTTCACCAATAGCGTTTTTGAAAAGTT
CATACGCGTAGAACTTGATGGCACTTTCTGGGGCTACCTTCACTATATTCAAACCGTTAC
CACGAAAAAACCCCCGAACCCCACCCTGATTCCATATCGTCTTTACTGCTTCTCTGATTT
TAGCATCCGTTTTCTGAATTTGCAAGAGAACTTTTAAGCGATCTAGAGGTGCAGTTGCAG
TCCTAGAAGCAGCACCGGCTATGCCACCTGTGACAGTACTATCTTGTTGTCAAAAGCCAG
TTCTGTGTTTATGTTTATTCAGAAAATAAGAACAATTAAAGAAGTCCCACCTGCAATGAA
GTAGTTGCTTCTCTTTACATGTTTGCTCATTCCTTCGGGGATAACGGCTTGTTCTCCAAT
GTCTACAAGACACACTCTTTCCCAGTGATGATAAATGTTTTC

QA 1 822 1 822
DS 



AS 1 2

CO CL5946Contig1 722 2 2 U
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CGGCTCGAGCTCTCTCGTCTCCATCTCCGACGCAGACCTGGAGATCTCTCATCTCCAGCT
CGAGCTCTCTCTACTCCAACCCGAGCTCTCTCTTCTCTGACGCCGACCACAAGCTCTCTC
ATCTCCGCCTCGAGTTCTCTCTTCTCCGTCGAAGACCTCGAGCTCTATATCTGACGAAGA
CCACGAGCTCTCTCATCTCCTCTGATTTGGGTTTCAAGCACTGTTGAGGCAACTAAGACA
AGAAGAAGCTGTTACTCTAGAGTCTCAGCCTCTCTCCTCTCAGCCTCTCTCTCGTCTTCA
TCGATCTCAGGCTCTCTCTTGAGTTTTGTGTTTCTTTGTTGATGCTTAGATTCTGCAAGT
GTGAGATGACTGGTGGTCCTCCTGCAAATGTCTACGAGTGTCAATTGTCTCTATTCTGAG
TGAAATGTACAAAAAAGCAGAGAACCAGTTCGAGTCCTGTTGTATCAAAGGAAGAGTCTG
ATGAGCTTTATGAAGAAGATAAATGTAATAGAGCTTTAAGGTTGTTGGCTTTATAAAAAG
GCGCAGCTCTGTGATTACATAGAACATGTATACAGACTCATGATAGAGTTTTATCTGTGT
GTAGTGTACATACATGTATTTACTTTTTTTTTGGGGCAATCATACATGTATTTACATTTT
TT


BQ
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CTCAGCCTATCCACGAGCTTAACTTTACTCATCACATGGTTAA*AATGCGTCTAT

QA 1 835 1 835
DS 

RD RS1G021JQ 754 0 0
AGGACTGATAACTCTGTCAAGAACCATTGGCATGTTATCATGGCTCGTAAGTATAGAGAA
CACTCATCTGCTTACCGTAGGAGGAAACTCATGATTAATAATCCCCTTAAACCTCATCTT
CCTAACCCTAACCCTAATTACCACTCTTTTATCTCCACTCATCATTACTTTACTCAGCCT
ATCCACGAGCTTAACTTTACTCATCACATGGTTAATAATGCGTCTATCACGCCTGACCAC
AACCAGCTTGTGTTGCCTATCAATTGTTTTCAAGGTTACGAGAGCAATGAGAATCCAATG
GTTGTGAGCATGTTTGGCAACCAAATTATGGGCCGCGATAATGTTGGTGCCATGTCAGAA
GGGTTATATGATTTTCCGTACATTGACTCTACGAGCCACGAGAAAGGAGTGTCAAATGAG
CCAGTGAGCTGGATCGGAATGGAAGGTGAAGATGAGGAGGAGAAGGCAAAGCAACAACCA
CAATTTTTCGATTTTCTTGGCTTGGGGACGGCATGAAACTTGAACAAATTAAGTGGTGTT
ATAATGAGTTAACTAAAGTTATTAATTTGGTTAGAGAAAAGCAAGTTATCTGTACTAGCT
AGAAATCAAACAAACCAAGATCCGAGTCCCTTTTGTCTGCTTTAATTAGTAAGATGTAGA
TTGTTGTTGTGGGGAGTTTTTTTTTAACAATTGTTGTGGGGCGTCTAATGTGTAAACATT
TGATAAATCTCGCTAATTATAGTAACTCTTTGGT

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

CO CL5948Contig1 859 2 2 U
CTCTTTCTACAAAAAGTCTTCTTGGTCTTTCCACAAACTCAAGGTTCATATTATATACAC
TTCCTACTTATCTTTTCTTGATTGTGAATTTTATATATCATCACTTTGAGCCAGTTCTCG
CGGAGCAGGGTGTTTTTTCTCTTCCGATGAACAGATACAACCAACGAAATCAGCAACCTT
CTTATATTGCTGATCATTTCAACAGCTTGGATCAGGTTTCCAACTTTCTTTCTTTTTATT
CTTGATTTAAACATAGTTAATGAAGCAAATTGATGATGAAATCATAAGAAGACTTGTTTT
TTTTTTTATTTTAGGTGATAACTTCTCTGAGAGAAGCTGGACTAGAATCTTCAAATTTGA
TCTTAGGAATTGACTTCACCAAGAGCAATGAGTGGACAGGTTATTATTTAATCAACATGT
TGTTAAAAAAATGATTACAAAATGGTTTTTAGTGTTTTATGTTCTAATTCTTGTTGCAGA
AAGACACTCATTCAATAGAAAAAGCCTTCACGCCATTGGTAAAAGACAGAATCCATATGA
GCAAGCAATATCCATAATTGGCCGTACATTGTCTCCATTTGATGAAGACGATCTTATACC
TTGTTGCGGCTTCGGAGATGGTTAGTTTCTTTAACTCTAGCTTTCAAGGCGAAGATTTAA
AAAGAAAAAGAAAAAACTCTAAATGGTTTAATTATACGTATATCTTCCTCTTCATGCAGT
AACAACACGAGATCAATACGTATTCAGCTTTTATTCCGAGAACAAAAGCTGCGATGGATT
TGAAAACGCGGTTAAAAGATACAGAGAGATTGTTCCACATTTGAAGTTGTCCGGTATTTA
TGTCTCTACACTACACACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BF39TF U 1
AF RS1BF39JQ C 155
BS 1 610 RS1BF39TF
BS 611 859 RS1BF39JQ

RD RS1BF39TF 610 0 0
CTCTTTCTACAAAAAGTCTTCTTGGTCTTTCCACAAACTCAAGGTTCATATTATATACAC
TTCCTACTTATCTTTTCTTGATTGTGAATTTTATATATCATCACTTTGAGCCAGTTCTCG
CGGAGCAGGGTGTTTTTTCTCTTCCGATGAACAGATACAACCAACGAAATCAGCAACCTT
CTTATATTGCTGATCATTTCAACAGCTTGGATCAGGTTTCCAACTTTCTTTCTTTTTATT
CTTGATTTAAACATAGTTAATGAAGCAAATTGATGATGAAATCATAAGAAGACTTGTTTT
TTTTTTTATTTTAGGTGATAACTTCTCTGAGAGAAGCTGGACTAGAATCTTCAAATTTGA
TCTTAGGAATTGACTTCACCAAGAGCAATGAGTGGACAGGTTATTATTTAATCAACATGT
TGTTAAAAAAATGATTACAAAATGGTTTTTAGTGTTTTATGTTCTAATTCTTGTTGCAGA
AAGACACTCATTCAATAGAAAAAGCCTTCACGCCATTGGTAAAAGACAGAATCCATATGA
GCAAGCAATATCCATAATTGGCCGTACATTGTCTCCATTTGATGAAGACGATCTTATACC
TTGTTGCGGC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RS1BF39JQ 705 0 0
ATACAACCAACGAAATCAGCAACCTTCTTATATTGCTGATCATTTCAACAGCTTGGATCA
GGTTTCCAACTTTCTTTCTTTTTATTCTTGATTTAAACATAGTTAATGAAGCAAATTGAT
GATGAAATCATAAGAAGACTTGTTTTTTTTTTTATTTTAGGTGATAACTTCTCTGAGAGA
AGCTGGACTAGAATCTTCAAATTTGATCTTAGGAATTGACTTCACCAAGAGCAATGAGTG
GACAGGTTATTATTTAATCAACATGTTGTTAAAAAAATGATTACAAAATGGTTTTTAGTG
TTTTATGTTCTAATTCTTGTTGCAGAAAGACACTCATTCAATAGAAAAAGCCTTCACGCC
ATTGGTAAAAGACAGAATCCATATGAGCAAGCAATATCCATAATTGGCCGTACATTGTCT
CCATTTGATGAAGACGATCTTATACCTTGTTGCGGCTTCGGAGATGGTTAGTTTCTTTAA
CTCTAGCTTTCAAGGCGAAGATTTAAAAAGAAAAAGAAAAAACTCTAAATGGTTTAATTA
TACGTATATCTTCCTCTTCATGCAGTAACAACACGAGATCAATACGTATTCAGCTTTTAT
TCCGAGAACAAAAGCTGCGATGGATTTGAAAACGCGGTTAAAAGATACAGAGAGATTGTT
CCACATTTGAAGTTGTCCGGTATTTATGTCTCTACACTACACACC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL5949Contig1 856 2 2 U
GGATACCTTATTTGCATTTCTTCGTCATCATCTACTTTCTTCCTGCAATTATTTTTGTTT
TCTCTTACCATCTGCGGAAAAAATAAAAAAAAAACTCGATTCGAAGTAGCATCTTCAGAT
TTGGAACTTAAGTAATCAGAATTGCTAGACCACATCATGGAGGATGCAACTCAAGTAGCC
AGCTCTGAGGTCCCTGTGGTGAAAGGTGATGCTGTTGACCTCAAGACAGTCGATGTTTCC
GTGAAGGCTGTGAATGGAGATGTGACGAAGGAAGGTAAAGAAGAAGAAGATACAACATTT
GATGGAGAATTCATAAAAGTTGAGAAGGAAGCTTTTGATGCCAAGGATGATGCTGAGAAA
GCAGAGAATATTCCTGTTCAAGATCAAACGCAAGTCTCAGTTGAAAGAAGCTCGGGTGGT
TCAGATAGAGAACTACATGAATCACAAGAGAAGGCGAAGGAACTAGAGGTCGAACTGGAA
AGAGTAGCAGGGGAACTGAAACGGTACGAATCTGAGAATACCCACTTGAAGGATGAGCTC
TTGTCTGCGAAAGAGAAGTTGGAAGAAACGGAAAAGAAGCAGGTAGAGCTCGAAGCTGTC
CAAAAGAAGCAGCAGGAGAAGATTGTTGAAGGAGAAGAAAGATACAGCTCCCAGTTGAAG
TCCTTGGAAGATGCTTTGCAGTCCCATGATGCCAAAGGCAAGGAACTAACTGAAGTTAAG
GAAGCTTTTGATGCACTGGGCCTAGAACTCGAGAACTCACGAAAGAAGTTGATAGAGTTG
GATGAGGGGCTAAAACGTTCAGCTGAAGAGGTTCAGAAATTTGAAGAGCTGCATAAGCAA
AGCGCTTCTCATGCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A722TF U 1
AF RS1A722JQ C 550
BS 1 693 RS1A722TF
BS 694 856 RS1A722JQ

RD RS1A722TF 693 0 0
GGATACCTTATTTGCATTTCTTCGTCATCATCTACTTTCTTCCTGCAATTATTTTTGTTT
TCTCTTACCATCTGCGGAAAAAATAAAAAAAAAACTCGATTCGAAGTAGCATCTTCAGAT
TTGGAACTTAAGTAATCAGAATTGCTAGACCACATCATGGAGGATGCAACTCAAGTAGCC
AGCTCTGAGGTCCCTGTGGTGAAAGGTGATGCTGTTGACCTCAAGACAGTCGATGTTTCC
GTGAAGGCTGTGAATGGAGATGTGACGAAGGAAGGTAAAGAAGAAGAAGATACAACATTT
GATGGAGAATTCATAAAAGTTGAGAAGGAAGCTTTTGATGCCAAGGATGATGCTGAGAAA
GCAGAGAATATTCCTGTTCAAGATCAAACGCAAGTCTCAGTTGAAAGAAGCTCGGGTGGT
TCAGATAGAGAACTACATGAATCACAAGAGAAGGCGAAGGAACTAGAGGTCGAACTGGAA
AGAGTAGCAGGGGAACTGAAACGGTACGAATCTGAGAATACCCACTTGAAGGATGAGCTC
TTGTCTGCGAAAGAGAAGTTGGAAGAAACGGAAAAGAAGCAGGTAGAGCTCGAAGCTGTC
CAAAAGAAGCAGCAGGAGAAGATTGTTGAAGGAGAAGAAAGATACAGCTCCCAGTTGAAG
TCCTTGGAAGATGCTTTGCAGTCCCATGATGCC

QA 1 693 1 693
DS 

RD RS1A722JQ 307 0 0
AAAGAGAAGTTGGAAGAAACGGAAAAGAAGCAGGTAGAGCTGGAAGCTGTCCAAAAGAAG
CAGCAGGAGAAGATTGTTGAAGGAGAAGAAAGATACAGCTCCCAGTTGAAGTCCTTGGAA
GATGCTTTGCAGTCCCATGATGCCAAAGGCAAGGAACTAACTGAAGTTAAGGAAGCTTTT
GATGCACTGGGCCTAGAACTCGAGAACTCACGAAAGAAGTTGATAGAGTTGGATGAGGGG
CTAAAACGTTCAGCTGAAGAGGTTCAGAAATTTGAAGAGCTGCATAAGCAAAGCGCTTCT
CATGCTG

QA 1 307 1 307
DS 



AS 1 2

CO CL5950Contig1 994 2 2 U
TAGAAGCTGAGCGATTTAGATGTTGGTGATCTAAGTGCACAACAAGATGGAGAGAAGGAT
GAAGGTTCACCTAACATTGCGTCGAATCTTATCACAGTTGTATCTACAGGCAATGCAGCT
CTTCTTGGTGAGATACTCAAGGCTAAGTTAAGCCCTGACATTACAGATTCCAAAGGAAAA
ACTCCACTGCATATAGCAGCCTCTAAAGGCTATGAAGATTGTGTTCTAGTACTCCTAAAG
CATGTATGCAACATTCACATAAGAGATGTGAGTGGCAACACGGCTCTATGGGAAGCAATC
TCAAAGAAGCACCACTCGATTTTCAGAATCCTTTATCATTTTGCAGCCATATCGGATCCA
CACGTAGCTGGAGATCTATGTGAAGCTGTGAGACAGAACAATGTAGAAGTAATAAAGGAT
CTTCTGAAACAGGGGATCAATATTGACACGAAGGACCACCATGGTTTCACAGCTTTGCAG
GTCTCAATGTCCGAGAACCAAATGGATATGGTTAATCTCCTAACTACGAACGGTGCAGAT
GTGGTGGGTGTCAACGCAAACAAGTTCACATCATTGGAGAAGTTAAGTGTTGCGGAAAAA
GAAAAAGAAAGAGTGAGTATTTTCAGAGGACATCCATTGGAGAGAAAAGCAAAAAATAGC
TATGAAGCTGGGATGCTTATTTTGCTTCCTCCTTCACTGAATGATCTCAAGAAAATTGCA
GATGAAGAGCTTGGGTTTGACGGAAGTGAGATGATGGTGACGAATGAAGATGGAGCTGAG
ATTGACAGTATTGAAGTGATTAGAGACAATGACAAGCTTTACTTTGTGGAAAATATAATA
ATTTAGAAAACGAAGTTCAAAAAAAATGTATGAGATATAAGATTATTAGCGTGAAAAAAT
GAATTCGAAGTTAAGAAAAAAAAAGCGAAGATATGATATTATTGGATGTAAAATGTATTA
TTGCTGGAGTAAGAAAATGTAAAAGTGATCTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F582TF U 1
AF RS1F582JQ C 379
BS 1 599 RS1F582TF
BS 600 994 RS1F582JQ

RD RS1F582TF 601 0 0
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GAAGGTTCACCTAACATTGCGTCGAATCTTATCACAGTTGTATCTACAGGCAATGCAGCT
CTTCTTGGTGAGATACTCAAGGCTAAGTTAAGCCCTGACATTACAGATTCCAAAGGAAAA
ACTCCACTGCATATAGCAGCCTCTAAAGGCTATGAAGATTGTGTTCTAGTACTCCTAAAG
CATGTATGCAACATTCACATAAGAGATGTGAGTGGCAACACGGCTCTATGGGAAGCAATC
TCAAAGAAGCACCACTCGATTTTCAGAATCCTTTATCATTTTGCAGCCATATCGGATCCA
CACGTAGCTGGAGATCTATGTGAAGCTGTGAGACAGAACAATGTAGAAGTAATAAAGGAT
CTTCTGAAACAGGGGATCAATATTGACACGAAGGACCACCATGGTTTCACAGCTTTGCAG
GTCTCAATGTCCGAGAACCAAATGGATATGGTTAATCTCCTAACTACGAACGGTGCAGAT
GTGGTGGGTGTCAACGCAAACAAGTTCACATCATTGGAGAAGTTAAGTGTTGCGGAAAA
GA

QA 1 599 1 599
DS 

RD RS1F582JQ 616 0 0
TGTGAAGCTGTGAGACAGAACAATGTAGAAGTAATAAAGGATTTTTTGAAACAGGGGATC
AATATTGACACGAAGGACCACCATGGTTTCACAGCTTTGCAGGTCTCAATGTCCGAGAAC
CAAATGGATATGGTTAATTTCCTAACTACGAACGGTGCAGATGTGGTGGGTGTCAACGCA
AACAAGTTCACATCATTGGAGAAGTTAAGTGTTGCGGAAAAAGAAAAAGAAAGAGTGAGT
ATTTTCAGAGGACATCCATTGGAGAGAAAAGCAAAAAATAGCTATGAAGCTGGGATGCTT
ATTTTGCTTCCTCCTTCACTGAATGATCTCAAGAAAATTGCAGATGAAGAGCTTGGGTTT
GACGGAAGTGAGATGATGGTGACGAATGAAGATGGAGCTGAGATTGACAGTATTGAAGTG
ATTAGAGACAATGACAAGCTTTACTTTGTGGAAAATATAATAATTTAGAAAACGAAGTTC
AAAAAAAATGTATGAGATATAAGATTATTAGCGTGAAAAAATGAATTCGAAGTTAAGAAA
AAAAAAGCGAAGATATGATATTATTGGATGTAAAATGTATTATTGCTGGAGTAAGAAAAT
GTAAAAGTGATCTGGC

QA 1 616 1 616
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GTCAGAACCAAGAGCTCATTTCTTCACAAGAGTCGTCATCGCAGACGATGCCTCAGGAGC
CTTCAGCTAAAAACGAAGATTTCGAAGAGGACACAGATGTGCAGGTTTCAGAAACCTCAA
GAGGTCAGAAAGATGGTCCTGAAACCGAAGCGTTGACACCACCTCAGTCAGCAAAGGTAG
AAGATAATGGTCATTCTGATCCTGATGCTTCAAATGCAGAAACAGCAGAACCATCAAACT
CTTCGGTTCAGAAGATAACTCCTGCTTCTGTGGGAGATGCTATGTGGCCTGTCAACGCAT
TCACTGTTGCACCTACATTGGATACAGATAAACTAGAAGAGGTCCCTATGGTTAAACTTC
CCCGTCCAAGAAGTCCGCTTGTCGATGCCGTTGCAGCTCATGACAGACGCACGCTGAAGA
AAGTCTCTGAGAGGGTCCAACCACCAATCAAATCAAAGCAAGATGACAAAGATTCATTGC
TTGCACAAATACGAAACAAGTCCGTTAGTCTGAAACCTGCTGTAGCGACGCGTCCAAGCA
TTCAAACTGGTCCTAAAACGAACCTAAAGGGTAGCTGCAATCTTAGAAAAAGCAAACACA
ATACGCCAGGCAATGGCTGGAAGCGATGAGGATGAAGATTCAGATAGTTGGAGTGATTCT
TGAGTCATGATCGCTGAGTACATAGTTAACTTTTTCTGTCGTGTTGGTTCTTGTTTGATG
ATGAGTGCACCAAGCAGCGCTCGGAGTCAGGTGGGTTATACAATTTATTTTCGAGGCATC
ACATCAAATATGTACTGTCATTGCTTAAATATATGTTACCATGTATACCGTATAATACTA
TTTTATATATAGGTGTGTGTGTGTGCATGTTGTAAGTAAACTCCGGAATTTGTATTAGTG
TAACGGATGTTTATGGTTTTTCTAACCACTCTTTTTCTTTCATG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DL93JQ C 167
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BS 630 944 RS1DL93JQ

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CTTCAGCTAAAAACGAAGATTTCGAAGAGGACACAGATGTGCAGGTTTCAGAAACCTCAA
GAGGTCAGAAAGATGGTCCTGAAACCGAAGCGTTGACACCACCTCAGTCAGCAAAGGTAG
AAGATAATGGTCATTCTGATCCTGATGCTTCAAATGCAGAAACAGCAGAACCATCAAACT
CTTCGGTTCAGAAGATAACTCCTGCTTCTGTGGGAGATGCTATGTGGCCTGTCAACGCAT
TCACTGTTGCACCTACATTGGATACAGATAAACTAGAAGAGGTCCCTATGGTTAAACTTC
CCCGTCCAAGAAGTCCGCTTGTCGATGCCGTTGCAGCTCATGACAGACGCACGCTGAAGA
AAGTCTCTGAGAGGGTCCAACCACCAATCAAATCAAAGCAAGATGACAAAGATTCATTGC
TTGCACAAATACGAAACAAGTCCGTTAGTCTGAAACCTGCTGTAGCGACGCGTCCAAGCA
TTCAAACTGGTCCTAAAACGAACCTAAAGGGTAGCTGCAATCTTAGAAAAAGCAAACACA
ATACGCCAGGCAATGGCTGGAAGCGATGA
CGA

QA 1 629 1 629
DS 

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GTCAGCAAAGGTAGAAGATAATGGTCATTCTGATCCTGATGCTTCAAATGCAGAAACAGC
AGAACCATCAAACTCTTCGGTTCAGAAGATAACTCCTGCTTCTGTGGGAGATGCTATGTG
GCCTGTCAACGCATTCACTGTTGCACCTACATTGGATACAGATAAACTAGAAGAGGTCCC
TATGGTTAAACTTCCCCGTCCAAGAAGTCCGCTTGTCGATGCCGTTGCAGCTCATGACAG
ACGCACGCTGAAGAAAGTTTTTGAGAGGGTCCAACCACCAATCAAATCAAAGCAAGATGA
CAAAGATTCATTGCTTGCACAAATACGAAACAAGTCCGTTAGTTTGAAACCTGCTGTAGC
GACGCGTCCAAGCATTCAAACTGGTCCTAAAACGAACCTAA*GGGTAGCTGCAATCTTAG
AAAAAGCAAACACAATACGCCAGGCAATGGCTGGAAGCGATGAGGATGAAGATTCAGATA
GTTGGAGTGATTCTTGAGTCATGATCGCTGAGTACATAGTTAACTTTTTCTGTCGTGTTG
GTTCTTGTTTGATGATGAGTGCACCAAGCAGCGCTCGGAGTCAGGTGGGTTATACAATTT
ATTTTCGAGGCATCACATCAAATATGTACTGTCATTGCTTAAATATATGTTACCATGTAT
ACCGTATAATACTATTTTATATATAGGTGTGTGTGTGTGCATGTTGTAAGTAAACTCCGG
AATTTGTATTAGTGTAACGGATGTTTATGGTTTTTCTAACCACTCTTTTTCTTTCATG

QA 1 778 1 778
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL5955Contig1 765 2 13 U
GGCTGTTGTTCTGTTCTGTTCTCCCACCATATTGTAAGCTTTAAAAGTCCCCAAAAAAGT
TGAAAAAAACAGATTTTTAACTTCTTGTTACCTTATGAAACAGAGCAGCGAACAACTTCG
CATTCTGATCTCACTATCATATCAAATTTAAAGCAGAGAGAAGAAATAAAACACAGATAT
AAAGCTTTTTCCACACCATTTTGCTGCAGCTAGTCGAGAACTCTCTCTCCGGTTGAGAAC
AAGTTCCAGACCAGAGTTCCAATTAAATACAGTCCAACTGCTACTTTAAACACATCGTCC
CATGAACCTCGTTGGAGGATGTAGCCAGTGGCTGCAGTGCCAAAGACACCGGCGAGGACT
CCTGCTGTGTTTGAAAGTCCTAATAGTACACCAGCGTAACGTGGGCCAATGTCTTGATGA
TTAAAGTAAAGACCCGACTGAGAGAATGAATCAGCGCCCTGACTGCATGCCATGCAGAGA
ACCGCCATTGCTGGAGTTTTGACACGGCTCAGCTGAGTCAGGAAGAAGGCAGGACCAAGA
AAACCAATTGATTGCATGATCTTCCGAACGGATGTAATTGAAAGACCTCTGCTCACGAGA
GTATCAGCAATCCAACCTCCAACATTAGCCAATACAGCCATGGTAAACCATGGCAAGAAG
CATAGGAGCCCTGACTCAGTGAGGTTGGACTTCAAGACCTGATTGTAATATGTGGGCATC
CATGTCAAGAGTATGAATGTTCCCCAATTATGGCAGAAGTGGGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A943JQ U 59
AF RS1FT24JQ U 1
BS 1 106 RS1FT24JQ
BS 107 107 RS1A943JQ
BS 108 271 RS1FT24JQ
BS 272 272 RS1A943JQ
BS 273 398 RS1FT24JQ
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BS 400 423 RS1FT24JQ
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BS 430 493 RS1FT24JQ
BS 494 494 RS1A943JQ
BS 495 765 RS1FT24JQ

RD RS1A943JQ 464 0 0
GTTGAAAAAAACAGATTTTTAACTTCTTGTTACCTTATGAAACAGAGCAGCGAACAACTT
CGCATTCTGATCTCACTATCATATCAAATTTAAAGCAGAGAGAAGAAATAAAACACAGAT
ATAAAGCTTTTTCCACACCATTTTGCTGCAGCTAGTCGAGAACTCTCTCTCCGGTTGCGA
ACAAGTTCCAGACCAGAGTTCCAATTAAATTCAGTCCAACTGCTACTTTAAACACATCGT
CCCATGAACCTCGTTGGAGGATGTAGCCAGTGGCTGCAGTGCCAAAGACACCGGCGAGGA
CTCCTGCTGTGTTTGAAAGTCCTAATAGTACACCAGCGTAACGTGGGCCAATGTCTTGAT
GATTAAAGTAAAGACCCGACTGAGAGAATGCATCAGCGCCCTGACTGCATGCCATGCAGA
GAACCGCCATTGCTGGAGTTTTGACACGGCTCAGCTGAGTCAGG

QA 1 464 1 464
DS 

RD RS1FT24JQ 765 0 0
GGCTGTTGTTCTGTTCTGTTCTCCCACCATATTGTAAGCTTTAAAAGTCCCCAAAAAAGT
TGAAAAAAACAGATTTTTAACTTCTTGTTACCTTATGAAACAGAGCGGCGAACAACTTCG
CATTCTGATCTCACTATCATATCAAATTTAAAGCAGAGAGAAGAAATAAAACACAGATAT
AAAGCTTTTTCCACACCATTTTGCTGCAGCTAGTCGAGAACTCTCTCTCCGGTTGAGAAC
AAGTTCCAGACCAGAGTTCCAATTAAATACATTCCAACTGCTACTTTAAACACATCGTCC
CATGAACCTCGTTGGAGGATGTAGCCAGTGGCTGCAGTGCCAAAGACACCGGCGAGGACT
CCTGCTGTGTTTGAAAGTCCTAATAGTACACCAGCGTAGCGTGGGCCAATGTCTTGATGA
TTAGAGTAGAGACCCGACTGAGAGAATGAATCAGCGCCCTGACTGCATGCCATGCAGAGA
ACCGCCATTGCTG*AGTTTTGACACGGCTCAGCTGAGTCAGGAAGAAGGCAGGACCAAGA
AAACCAATTGATTGCATGATCTTCCGAACGGATGTAATTGAAAGACCTCTGCTCACGAGA
GTATCAGCAATCCAACCTCCAACATTAGCCAATACAGCCATGGTAAACCATGGCAAGAAG
CATAGGAGCCCTGACTCAGTGAGGTTGGACTTCAAGACCTGATTGTAATATGTGGGCATC
CATGTCAAGAGTATGAATGTTCCCCAATTATGGCAGAAGTGGGAA

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL5956Contig1 844 2 8 U
GATAGACCCGTCTTTATGTATTGTTGTCTCAGTCTTTGGATGTTATAACGAGCAGACCCA
ATGCACCGATGAGTATATACTGAAAGAAGAGAACATAAACAAGAGATTATATATACATAT
CTCTAATCAAAAACCATAAACATTACATAATCGCAGAGGCCTGTGTAAGAAGATTGTACC
TTGATGATAGGCTTTTCTGTCATGATAATAGTAACCCATCCAACATAAGGCAAGAACCTG
AAAAAAAAATACAAAAAGGAAAACCATTTACTACTATTGCCCTTATCCTACCATCATCAG
TGTGAGATCATGCGGTTTCTTTTTTAGAGTATACTTACGCAACAGCTCTGCCCATTATAT
GGTGACGATGAAGCCACATTTGTCCATCAGCATAGAGACCGATGTCATCCACCTCATTGT
TGTCACCTGGAAAATCCAAAGGTTAATCCATGAAATATACACAGTTTACTGTAAATGGGT
AGTAACAAAAGTAGCACCTTTTGTTAGAACATCAACTGCTCCAGTAGTTTTCCTCTCATG
AACCTGTAATGTGTCATAAGGAGTATATCTTTAATACTTTTGTCTCCAGAGATGATAATG
AGAAAAAAAAACAAAACATTACTTCGATTGCACGATGGACGATGGGTATATCACGACCCT
GAAAGAAGAAACATAAACCAATTAGGAGAGGCAAACACACACACACACACGAACACAAAG
CAGCGCCCACCACTTACATCAATTTTGAAAACAACAATCTCGCCTGTTCTAATGGGCTCT
TTGGTCATGGTCAAGAACAATATATCCCCCTGTCACATACATTTTTGCCCTCAAAACTGA
TTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 

AF RS1DS67TF U 1
AF RS1DS67JQ C 327
BS 1 685 RS1DS67TF
BS 686 686 RS1DS67JQ
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BS 773 794 RS1DS67TF
BS 795 844 RS1DS67JQ

RD RS1DS67TF 812 0 0
GATAGACCCGTCTTTATGTATTGTTGTCTCAGTCTTTGGATGTTATAACGAGCAGACCCA
ATGCACCGATGAGTATATACTGAAAGAAGAGAACATAAACAAGAGATTATATATACATAT
CTCTAATCAAAAACCATAAACATTACATAATCGCAGAGGCCTGTGTAAGAAGATTGTACC
TTGATGATAGGCTTTTCTGTCATGATAATAGTAACCCATCCAACATAAGGCAAGAACCTG
AAAAAAAAATACAAAAAGGAAAACCATTTACTACTATTGCCCTTATCCTACCATCATCAG
TGTGAGATCATGCGGTTTCTTTTTTAGAGTATACTTACGCAACAGCTCTGCCCATTATAT
GGTGACGATGAAGCCACATTTGTCCATCAGCATAGAGACCGATGTCATCCACCTCATTGT
TGTCACCTGGAAAATCCAAAGGTTAATCCATGAAATATACACAGTTTACTGTAAATGGGT
AGTAACAAAAGTAGCACCTTTTGTTAGAACATCAACTGCTCCAGTAGTTTTCCTCTCATG
AACCTGTAATGTGTCATAAGGAGTATATCTTTAATACTTTTGTCTCCAGAGATGATAATG
AGAAAAAAAAACAAAACATTACTTCGATTGCACGATGGACGATGGGTATATCACGACCCT
GAAAGAAGAAACATAAACCAATTAG*AGAGGCAAACACACACACACACACGAACACAAAG
CAGCGCCCACCACTTACATCAATTTTGAAA*CAACAATCTCGCCTGTTCTA*TGGGCTCT
TTGGTCATGGTCAA
AACATATATCCCCTGTCA

QA 1 794 1 794
DS 

RD RS1DS67JQ 518 0 0
GAGTATACTTACGCAACAGCTCTGCCCATTATATGGTGACGATGAAGCCACATTTGTCCA
TCAGCATAGAGACCGATGTCATCCACCTCATTGTTGTCACCTGGAAAATCCAAAGGTTAA
TCCATGAAATATACACAGTTTACTGTAAATGGGTAGTAACAAAAGTAGCACCTTTTGTTA
GAACATCAACTGCTCCAGTAGTTTTCCTTTCATGAACCTGTAATGTGTCATAAGGAGTAT
ATCTTTAATACTTTTGTCTCCAGAGATGATAATGAGAAAAAAAAACAAAACATTACTTGG
ATTGCACGATGGACGATGGGTATATCACGACCCTGAAAGAAGAAACATAAACCAATTAGG
AGAGGCAAACACACACACACACACGAACACAAAGCAGCGCCCACCACTTACATCAATTTT
GAAAACAACAATTTCGCCTGTTTTAATGGGCTCTTTGGTCATGGTCAAGAACAATATATC
CCCCTGTCACATACATTTTTGCCCTCAAAACTGATTAC

QA 1 518 1 518
DS 



AS 1 2

CO CL5957Contig1 546 2 2 U
CATGTCTGAATGCGATAATTCAATTAAACCGGAATTCGTGAACCGGAACCGAACTGGTTT
ACAATAGACAATTCAATTACACAGCCACAGAGCTGGTGTAGTACAACAAAGGAGGAGTTT
TTTTTTTTTGAAAATGCAAATGTTTTAAACCAAAGTGAAGTTATTGAGGCCATAATAAGC
ATCTTAAAGTTTCAGGGAATAGTGATACACTTTCCAAATTGTAATGTGATAAATATATAT
GAGTTACAACAAAACAATATAATATCTTCTTCCTGCAGGGTCCTAATCCATCATTTCTTA
AAAGCCTCAGTTTGCTACTTGGTAATCACGTCCCAACGCCATATGGTCCCGTCCTCGCAG
GCAGCAAGAATTGTGTTTCCATCAACGGACATAGCGGTTTGCCTGATCACACATTTGGAT
TGATTGTGTGATAACTTTGTAATCAAAACAGGAGGGCAACTTTTCAAATCCCAGACATAA
ATCTTTCCTTCCTGGTTCCCTATTGCAAGAAAACTGAATTGGAAGTCGCAAGAAAACTTG
ATAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1F924TF C 1
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BS 71 546 RS1F924JQ

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TTTTTTTTTGAAAATGCAAATGTTTTAAACCAAAGTGAAGTTATTGAGGCCATAATAAGC
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GAGTTACAACAAAACAATATAATATCTTCTTCCTGCAGGGTCCTAATCCATCA
GTT

QA 1 293 1 293
DS 

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AAAATGCAAATGTTTTAAACCAAAGTGAAGTTATTGAGGCCATAATAAGCATCTTAAAGT
TTCAGGGAATAGTGATACACTTTCCAAATTGTAATGTGATAAATATATATGAGTTACAAC
AAAACAATATAATATCTTCTTCCTGCAGGGTCCTAATCCATCATTTCTTAAAAGCCTCAG
TTTGCTACTTGGTAATCACGTCCCAACGCCATATGGTCCCGTCCTCGCAGGCAGCAAGAA
TTGTGTTTCCATCAACGGACATAGCGGTTTGCCTGATCACACATTTGGATTGATTGTGTG
ATAACTTTGTAATCAAAACAGGAGGGCAACTTTTCAAATCCCAGACATAAATCTTTCCTT
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QA 1 476 1 476
DS 



AS 1 2

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TTGCCTTTAAGACTGACTTTTCGATCTCAACGATCGCGTTTCGTTTTCACGTTCGAAAGT
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TTCCCTGCTGCTCGTATAAAAAAATAATGCAAGCTGACGAGGACGTTGGCAAGATCGCTT
TGGCTGTGCCTGTCCTAGTCTCAAAAGCTTTGGAATTGTTCTTACAAGACCTTTGTGATC
GTACCTATGAAATCACCCTCCAGAGAGGAGCAAAGACCGTGAGCTCATTGCATCAAAAAA
ATTGTGTAGAAACATACAACGTGTTTGACTTTCTGAGGGAAGTTGTCAGCAAGGTTCCTG
ACTATGGGCATGGGCATGGGCATGGTCACGGTAATGGCCAGGCTGATGCTACCATGGACG
ATCGCACTATCTCCAAGAGAAGGAAGCCTACGGGTGATGAAGCTAATGACAGCGATGAGG
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TTCAACGCGAGATGGAAACAGAGCCACCAACCATATTGTCAACACCACCACCACAGCTTA
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CGGATGACATGTCTACCCACGCAAAGCAAGAGCTGCAAAGTCCAAAAGCAGGCAACGACA
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CAAAGCCACCAGTGGTGGTCACAGCCTCAAGAGAGTCGAAACCAGAGGAATATCCGGGTT
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TTTTTAGTAGGAAACATGACATGATGTAGGATTAAATAGAGGTTAGCAGTGTTTAACAGT
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BQ
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AF RS1CU06TF U 1
AF RS1CU06JQ C 572
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RD RS1CU06TF 645 0 0
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TTAAAATTTTCCTTCCTTTAAAACAAAAAAAAAACACACGATTTCTCAAATTCAATCAAT
TTGCCTTTAAGACTGACTTTTCGATCTCAACGATCGCGTTTCGTTTTCACGTTCGAAAGT
TGCGTCCTTTTGATCGCGATCCCACAAAAAAAAAGCATGAGGAAGAAGCTCGACACACGT
TTCCCTGCTGCTCGTATAAAAAAATAATGCAAGCTGACGAGGACGTTGGCAAGATCGCTT
TGGCTGTGCCTGTCCTAGTCTCAAAAGCTTTGGAATTGTTCTTACAAGACCTTTGTGATC
GTACCTATGAAATCACCCTCCAGAGAGGAGCAAAGACCGTGAGCTCATTGCATCAAAAAA
ATTGTGTAGAAACATACAACGTGTTTGACTTTCTGAGGGAAGTTGTCAGCAAGGTTCCTG
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ATCGCACTATCTCCAAGAGAAGGAAGCCTACGGGTGATGAAGCTAATGACAGCGATGAGG
ACCTAAAGAAAACCAAAGTGCAG*AGACAGGGCAAGTGGGACCGA

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1CU06JQ 673 0 0
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GCAAGTGGGACCGAGTGGAAGGGGTAGAGGCAGAGGGCGTGGAAGGGGACGTGGACGAAG
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CATATTGTCAACACCACCACCACAGCTTACTCAAGACGGTATCACGATGCCTGCACCAAC
AACACAACAAGACGTGGAGAAGAAGGATGCGGATGACATGTCTACCCACGCAAAGCAAGA
GCTGCAAAGTCCAAAAGCAGGCAACGACACAAACTCAGGTTTGGGTCGAGATTTCGATCT
CAACACACAGTCTCTAGACATGGTGGAGGCAAAGCCACCAGTGGTGGTCACAGCCTCAAG
AGAGTCGAAACCAGAGGAATATCCGGGTTGGTCCATGTCGGATATAGGGAATATGGATCC
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TTAAATAGAGGTTAGCAGTGTTTAACAGTTTCTGTTTATGGAAAAGATGTATCATATGGT
TCTTCTTGTTTTT

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

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GTTCATACATAAGAGAGAAACGAAAAGAGAGCCAAATCACTCTCCCTTCCTTCCTTTATA
TATAAACAACCCATTTTACAAATCTTTTTCCCTCCCCCAATCCTCTCAGATCTGTATATA
AAAGCCTCACCATCTCTGCAAAATCTCATCTGCACGAAACCCTAGATTTCGTGTCCGAAT
CTCTAAAAGGCAAATGACAGATCAAGGATTGGAAGGGAGTAATCCAGTGGACCTAGTCGA
GCATCCTTCTGGGATCGTTCCCACCCTACAAAACATTGTCTCAACGGTGAACTTGGATTG
CAAACTAGATCTCAAAGCCATAGCTCTCCAAGCTCGTAATGCTGAATACAATCCCAAGCG
TTTTGCTGCTGTGATCATGCGGATTAGAGAGCCCAAGACCACTGCATTAATTTTTGCCTC
TGGTAAAATGGTTTGTACTGGAGCCAAGAGTGAATACTTTTCAAAGATGGCTGCAAGAAA
GTATGCTCGGATTGTCCAAAAGCTTGGGTTTCCTGCAAAGTTCAAGGATTTCAAGATTCA
GAATATAGTAGGTTCTTGTGATGTCAAGTTCCCTATCAGACTTGAAGGTCTTGCATACTC
TCACGCCGCTTTCTCTAGTTACGAGCCTGAGTTGTTTCCGGGGCTGATCTACAGGATGAA
AGTGCCTAAGATTGTCCTACTAATTTTTGTGTCTGGCAAGATAGTCATCACTGGAGCCAA
GATGAGAGAGGAGACCTATAAAGCCTTTGAGAATATATACCCGGTCCTCACAGAGTTCAG
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CTTAACTTGCTGAGAATTTTGTCCTTGAACAAAGGGCTCTCGAAGTTGCCAGATTCTTCT
TACTTTTGTATTACTGTTTAAGATTCTAATAGAACATTTGTAAATACTCAAATGGAGACA
AATTTTCTGTTGTTTTTCTCCTCC


BQ
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AF RS1CD05TF U 1
AF RS1CD05JQ C 335
BS 1 732 RS1CD05TF
BS 733 733 RS1CD05JQ
BS 734 747 RS1CD05TF
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BS 749 758 RS1CD05TF
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BS 781 795 RS1CD05TF
BS 796 1044 RS1CD05JQ

RD RS1CD05TF 809 0 0
GGAATCCCAAAACGCAACCGATAGCCTCTTTCCTCACAGATCTAAAAGACCTCCCTCCTC
GTTCATACATAAGAGAGAAACGAAAAGAGAGCCAAATCACTCTCCCTTCCTTCCTTTATA
TATAAACAACCCATTTTACAAATCTTTTTCCCTCCCCCAATCCTCTCAGATCTGTATATA
AAAGCCTCACCATCTCTGCAAAATCTCATCTGCACGAAACCCTAGATTTCGTGTCCGAAT
CTCTAAAAGGCAAATGACAGATCAAGGATTGGAAGGGAGTAATCCAGTGGACCTAGTCGA
GCATCCTTCTGGGATCGTTCCCACCCTACAAAACATTGTCTCAACGGTGAACTTGGATTG
CAAACTAGATCTCAAAGCCATAGCTCTCCAAGCTCGTAATGCTGAATACAATCCCAAGCG
TTTTGCTGCTGTGATCATGCGGATTAGAGAGCCCAAGACCACTGCATTAATTTTTGCCTC
TGGTAAAATGGTTTGTACTGGAGCCAAGAGTGAATACTTTTCAAAGATGGCTGCAAGAAA
GTATGCTCGGATTGTCCAAAAGCTTGGGTTTCCTGCAAAGTTCAAGGATTTCAAGATTCA
GAATATAGTAGGTTCTTGTGATGTCAAGTTCCCTATCAGACTTGAAGGTCTTGCATACTC
TCACGCCGCTTTCTCTAGTTACGAGCCTGAGTTGTTTCCGGGGCTGATCTACAGGATGAA
AGTGCCTAAGAT*GTCCTACTAATTTT*GTGTCTGGCA*GATAGTCATCACTGGAGCCA*
GATGAGAGAGGAGAC
TATAAGCTTTGAGA

QA 1 795 1 795
DS 

RD RS1CD05JQ 710 0 0
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CGTAATGCTGAATACAATCCCAAGCGTTTTGCTGCTGTGATCATGCGGATTAGAGAGCCC
AAGACCACTGCATTAATTTTTGCCTCTGGTAAAATGGTTTGTACTGGAGCCAAGAGTGAA
TACTTTTCAAAGATGGCTGCAAGAAAGTATGCTCGGATTGTCCAAAAGCTTGGGTTTCCT
GCAAAGTTCAAGGATTTCAAGATTCAGAATATAGTAGGTTCTTGTGATGTCAAGTTCCCT
ATCAGACTTGAAGGTCTTGCATACTCTCACGCCGCTTTCTCTAGTTACGAGCCTGAGTTG
TTTCCGGGGCTGATCTACAGGATGAAAGTGCCTAAGATTGTCCTACTAATTTTTGTGTCT
GGCAAGATAGTCATCACTGGAGCCAAGATGAGAGAGGAGACCTATAAAGCCTTTGAGAAT
ATATACCCGGTCCTCACAGAGTTCAGGAAGATCCAACAATAAGTCGCAGGTTTGTTCTGT
GTGGTGTTTTAGCACCTTTGGAGTTGCTTAACTTGCTGAGAATTTTGTCCTTGAACAAAG
GGCTCTCGAAGTTGCCAGATTCTTCTTACTTTTGTATTACTGTTTAAGATTCTAATAGAA
CATTTGTAAATACTCAAATGGAGACAAATTTTCTGTTGTTTTTCTCCTCC

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

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CAACGAGGTAAACAACACCCCTCGGTATCAAGAGAGAAACAACAACGAGAAAACTAGCTT
AAACTAAAACAAGGAAGGCAAATATCACTACCGGAGAGAAGAGCTCCACCACACACTCAA
AGGCGAGCTTACCATACGAGAACTCAACCACAAATAGCACCAAATGAAACGATCACTGAG
ATAGACTGGAGACACACAAACATCACCATCACATAAAACAGAATCGAGAGAGGTTAGAAT
CCTAAACCGTCGCTGAATACACCATTCAATCCCAACTAAAACTCGCCATTAGACCTTGAA
TGGGCTCACTACGCGCCTCATACGCACCATCACTCTACGGCAAAGCCTATAGAAGCTTTC
CGAACACGTCTTATTCACACAGCCGGTAAATGGATAAAAACCACTCCAATCCTGAACAAT
AACGAACAAACCGATGACACCACCAATGGAGCATTCGCTCCTGAAACCATCTAACTTCTG
ACGACCATATCAAACTTAAAAGAGAACTCGCAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DL81TF C 1
AF RS1BS95JQ U 70
BS 1 69 RS1DL81TF
BS 70 138 RS1BS95JQ
BS 139 139 RS1DL81TF
BS 140 183 RS1BS95JQ
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BS 193 193 RS1DL81TF
BS 194 576 RS1BS95JQ

RD RS1DL81TF 313 0 0
GAAATCACCTTGCATTACACAAAGCCGGCAAAGGAACAAAGCCTTTCCGGAATCAGAAGC
CAACGAGGTAAACAACACCCCTCGGTATCAAGAGAGAAACAACAACGAGAAAACTAGCTT
AAACTAAAACAAGGAAGGCAAATATCACTACCGGAGAGAAGAGCTCCACCACACAC*CAA
AGGCGAGCTTACCATACGAGAACTCAACCACAAATAGCACCAAATGAAACGATCACTGAG
ATAGACTGGAGACACACAAACATCACC*TCACATAAAACAGAATCGAGAGAGGTTAGAAT
CCTAAACCGTCGC

QA 1 313 1 313
DS 

RD RS1BS95JQ 507 0 0
AAACAACACCCCTCGGTATCAAGAGAGAAACAACAACGAGAAAACTAGCTTAAACTAAAA
CAAGGAAGGGAAATATCACTACCGGAGAGAAGAGCTCCACCACACACTCAAAGGTGAGCT
TACGATACGAGAACTCAACCACAAATAGCACCAAATGAAACGATCACTGAGATAGACTGG
AGACACACAAACATCACCATCACATAAAACAGAATCGAGAGAGGTTAGAATCCTAAACCG
TCGCTGAATACACCATTCAATCCCAACTAAAACTCGCCATTAGACCTTGAATGGGCTCAC
TACGCGCCTCATACGCACCATCACTCTACGGCAAAGCCTATAGAAGCTTTCCGAACACGT
CTTATTCACACAGCCGGTAAATGGATAAAAACCACTCCAATCCTGAACAATAACGAACAA
ACCGATGACACCACCAATGGAGCATTCGCTCCTGAAACCATCTAACTTCTGACGACCATA
TCAAACTTAAAAGAGAACTCGCAAAAA

QA 1 507 1 507
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGAACCTCTCTCAGCCGAGCAAAGTCTCGGAGCCTCTTCTACTTCTTCTTCTTCTCCCAT
GGCGGCAGGTCTCTCAACAGCCCTTACATTCAAACCGCTCCACCGCGCTTTCTCTTCTTC
CTCCTCTTCCAGTCTCCGCCTGCATCACCCCACATCCTTAACCGGATTCCCGTCGTCTCT
CCTCCGGTTCAGAGGATTATCCGTCTGCTACGTCGTCTCGGACCGGAGGCAGAGCTCCCC
TATCGACAAAGATGACAGTCCTCCCGAGAGCACGGAGACAACAACAACAACAACAACAGC
CATAGACGCGGTGTACCTGGCGCTGCGTTTAGCTGAGAAGCTGCAGCGGAAGAAATCTGA
GAGGTTCACTTATCTGATCGCCGCAGTGATGTCGAGCTTCGGTATCACTTCGATGGCTAT
TATGGCCGTTTACTACAGATTCTCTTGGCAGATGGAGGGTGGTGAGATCCCAATGTCGGA
GATGTTCGGTACATTTGCTCTTTCTGTTGGGGCTGCTGTTGGCATGGAGTTCTGGGCAAG
ATGGGCTCATAAAGCTCTTTGGCACGCTTCTTTATGGAATATGCATGAGTCACATCACAA
ACCTAGAGAAAGTCCTTTTGAGTTGAACGATGTGTTCGCCATAATCAACGCTGTTCCTGC
CATTGGTCTCCTCTCTTACGGTTTCTTCAATAAGGGACTCGTTCCTGGCCTCTGCTTTGG
CGCTGGGTTAGGAATAACAGTGTTCGGAATCGCCTACATGTTCGTCCACGATGGTTTGGT
GCACAAGCGCTTCCCTGTAGGTCCCATCGCTGACGTTCCTTATCTCCGAAGGGTCGCCGC
TGCTCACCAGCTGCATCACACAGACAAATTCGACGGTGTGCCATATGGGCTGTTTCTTGG
ACCGAAGGAATTGGAGGAAGTTGGAGGAGATGAAGAGTTAGAGAAAGAGATAAGTCGGAG
AATCAAGATGTACAAAAGGGGGTCTGGTTCCGGGTCGACTTCTTGACTTTAAAACATGTT
TTAATTAAGTCTCAAACTTTTTTTTTGTCTTGTATCATGATCTGAAATACGATCTATGTT
TATAAATCCTATAAGCCGATTTTGATTTTAAATACTAAAATAGAAGCCATGCTAATTATG
ATTAGCCCGTGGTCTACC


BQ
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AF RS1D961TF U 1
AF RS1D961JQ C 512
BS 1 689 RS1D961TF
BS 690 690 RS1D961JQ
BS 691 743 RS1D961TF
BS 744 1158 RS1D961JQ

RD RS1D961TF 743 0 0
GGAACCTCTCTCAGCCGAGCAAAGTCTCGGAGCCTCTTCTACTTCTTCTTCTTCTCCCAT
GGCGGCAGGTCTCTCAACAGCCCTTACATTCAAACCGCTCCACCGCGCTTTCTCTTCTTC
CTCCTCTTCCAGTCTCCGCCTGCATCACCCCACATCCTTAACCGGATTCCCGTCGTCTCT
CCTCCGGTTCAGAGGATTATCCGTCTGCTACGTCGTCTCGGACCGGAGGCAGAGCTCCCC
TATCGACAAAGATGACAGTCCTCCCGAGAGCACGGAGACAACAACAACAACAACAACAGC
CATAGACGCGGTGTACCTGGCGCTGCGTTTAGCTGAGAAGCTGCAGCGGAAGAAATCTGA
GAGGTTCACTTATCTGATCGCCGCAGTGATGTCGAGCTTCGGTATCACTTCGATGGCTAT
TATGGCCGTTTACTACAGATTCTCTTGGCAGATGGAGGGTGGTGAGATCCCAATGTCGGA
GATGTTCGGTACATTTGCTCTTTCTGTTGGGGCTGCTGTTGGCATGGAGTTCTGGGCAAG
ATGGGCTCATAAAGCTCTTTGGCACGCTTCTTTATGGAATATGCATGAGTCACATCACAA
ACCTAGAGAAAGTCCTTTTGAGTTGAACGATGTGTTCGCCATAATCAACGCTGTTCCTGC
CATTGGTCTCCTCTCTTACGGTTTCTTCA*TAAGGGACTCGTTCCTGGCCTCTGCTTTGG
CGCTGGGTTAGGAATAACAGTGT

QA 1 743 1 743
DS 

RD RS1D961JQ 647 0 0
GCTGCTGTTGGCATGGAGTTCTGGGCAAGATGGGCTCATAAAGCTCTTTGGCACGCTTCT
TTATGGAATATGCATGAGTCACATCACAAACCTAGAGAAGGTCCTTTTGAGTTGAACGAT
GTGTTCGCCATAATCAACGCTGTTCCTGCCATTGGTCTCCTCTCTTACGGTTTCTTCAAT
AAGGGACTCGTTCCTGGCCTCTGCTTTGGCGCTGGGTTAGGAATAACAGTGTTCGGAATC
GCCTACATGTTCGTCCACGATGGTTTGGTGCACAAGCGCTTCCCTGTAGGTCCCATCGCT
GACGTTCCTTATCTCCGAAGGGTCGCCGCTGCTCACCAGCTGCATCACACAGACAAATTC
GACGGTGTGCCATATGGGCTGTTTCTTGGACCGAAGGAATTGGAGGAAGTTGGAGGAGAT
GAAGAGTTAGAGAAAGAGATAAGTCGGAGAATCAAGATGTACAAAAGGGGGTCTGGTTCC
GGGTCGACTTCTTGACTTTAAAACATGTTTTAATTAAGTCTCAAACTTTTTTTTTGTCTT
GTATCATGATCTGAAATACGATCTATGTTTATAAATCCTATAAGCCGATTTTGATTTTAA
ATACTAAAATAGAAGCCATGCTAATTATGATTAGCCCGTGGTCTACC

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 2

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CCGATGGGAGGAATGCCAGGAATGCCTCCAATGCCACCGTATGGAATGCCTCCGATGGGC
GGCTACTAAGCCTGTCGAAAGCAAAAGCCATCCATTCACGTTATCGAGAACTGGTAGTCG
CGCGCGGAATCTCTTGTGGTGGTATTTGTCGGAATGTTTTCGTTGTTTGATTCTATAGGT
GTATGTGTGGATAATAAACTCGTACTTTCGTTTGTAATATTTCTTTTGAGGGGTTTTTTA
GGTGAGTCATTTTTGGTCGAGGCCATGTTACTATTTTTCTTTTGAGGGGAGAGAGATGTT
AACTCCTAACTGGTCTACTTGTCGTTACTTCGATGTTTCTCTCATGAGTTGTTCTTTCTT
TTCAGCTTAATATTTTTCACTTATAATT


BQ
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AF RS1AT54JQ C 1
AF RS1AT54TF U 1
BS 1 448 RS1AT54TF

RD RS1AT54JQ 448 0 0
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CCGATGGGAGGAATGCCAGGAATGCCTCCAATGCCACCGTATGGAATGCCTCCGATGGGC
GGCTACTAAGCCTGTCGAAAGCAAAAGCCATCCATTCACGTTATCGAGAACTGGTAGTCG
CGCGCGGAATCTCTTGTGGTGGTATTTGTCGGAATGTTTTCGTTGTTTGATTCTATAGGT
GTATGTGTGGATAATAAACTCGTACTTTCGTTTGTAATATTTCTTTTGAGGGGTTTTTTA
GGTGAGTCATTTTTGGTCGAGGCCATGTTACTATTTTTCTTTTGAGGGGAGAGAGATGTT
AACTCCTAACTGGTCTACTTGTCGTTACTTCGATGTTTCTCTCATGAGTTGTTCTTTCTT
TTCAGCTTAATATTTTTCACTTATAATT

QA 1 448 1 448
DS 

RD RS1AT54TF 448 0 0
GCACCGATGCCAGGAATGGGAGGAGGTCCAGGGATGGGAGGGGGTTATGGTCCACCACCA
CCGATGGGAGGAATGCCAGGAATGCCTCCAATGCCACCGTATGGAATGCCTCCGATGGGC
GGCTACTAAGCCTGTCGAAAGCAAAAGCCATCCATTCACGTTATCGAGAACTGGTAGTCG
CGCGCGGAATCTCTTGTGGTGGTATTTGTCGGAATGTTTTCGTTGTTTGATTCTATAGGT
GTATGTGTGGATAATAAACTCGTACTTTCGTTTGTAATATTTCTTTTGAGGGGTTTTTTA
GGTGAGTCATTTTTGGTCGAGGCCATGTTACTATTTTTCTTTTGAGGGGAGAGAGATGTT
AACTCCTAACTGGTCTACTTGTCGTTACTTCGATGTTTCTCTCATGAGTTGTTCTTTCTT
TTCAGCTTAATATTTTTCACTTATAATT

QA 1 448 1 448
DS 



AS 1 2

CO CL5964Contig1 1016 2 4 U
GGGCCGCAGGACGGAGGTGCACTCAGGAGAAAACGCCAGATCCTCCTAGAAGGACTAGCG
ACAGCATTCCAGCTCGCTGATCCGTTCAGCAAAACCGGTCAGAAGTCAGGTTTGACTGCT
AAGGATGATGTTGTCTTCCTCCGCATAGCAACTCTTCCAAAGGGTCGCAAAATGCTTACA
AAGTACATACAGCTTCTAGTTCCAGGTACTGAGATTGCTCGAGTTGTCTGTATGGCTATC
TTCCGGCACTTGAGATTTCTCTTCGGGGGCTTGCCTTCGGATACTTCAGCAGCAGAGACG
ATTGCTAATCTCGCCAAGGCAGTCACGGTCTGTGTTCAAGCTATGGACCTCCGAGCGCTG
AGTGCTTGCCTTGCAGCTGTAGTTTGTTCTTCGGAGCAGCCACCTCTGCGTCCTGTTGGA
AGCTCTTCAGGGGATGGTGCTTCGGTTGTCTTGATCTCTCTTCTCGAGAGAGCTGCTGAG
GTAGTGGTGGTTCCTCGAGGCGTGCATGGGAGCGCTAACGATGGTCTCTGGAGGGCCTCG
TTTAATGAGTTCTTCAACCTTCTTACAAAATACTGCAGGAGCAAGTATGAGACGATCCGC
AGCCAGAACCAAGGGAGTGCAGCGGATGTATTGGAGCTGGCGATAAAGAGGGAAATGCCG
GCTGAGCTTTTACGTGCGAGCCTGCGTCACACTAGTGACGACCAGAGGAACTATTTGTTG
AACTTTGGTCGTAAACCGGCGGCTGTTAGTGAGTCGGCGTCGCATGCAAGGGGTGGTCAG
ATCAACTCTGAGTCTGTGATGGGTTGATCAAAAGGAGAGAGACAGTTGAGGGATTTGTGG
GTTGGACTCAGGAGCCAAACTTGTAAGTAACTTGGTGGTGTAGGAATCTTTTTCACATGG
GTTCCAGGTGGTGACAAGTGCTTTTAGATTCTAATCTCTTTTTTTTCTTCAGTTTGAACT
TTTTTTTTAATTGTTATAATGGTGGACAAATGCAAACTCTGCTTGGTTTGTGTATT


BQ
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AF RS1BX10TF U 1
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BS 785 1016 RS1BX10JQ

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AAGTACATACAGCTTCTAGTTCCAGGTACTGAGATTGCTCGAGTTGTCTGTATGGCTATC
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ATCA

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GTTTGAACTTTTTTTTTAATTGTTATAATGGTGGACAAATGCAAACTCTGCTTGGTTTGT
GTATT

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DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGAAGAGCTTCGATTCGCTCTGACCCCAACAGATTGCATGTATGTGGCCAAGTGCAGACA
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TGTGATTGCCAACAAGAAATGGGTTCCTCCTCCGGGTAAAGGAGCTTTGTATATAAGGCC
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CATCTACGCATCTCCCGTTGGAGATTACCACAAGGGAAGCTCAGGTCTGAATCTTAAAGT
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CTATTCCCCAATTGTGAAATCGCTGGTTGAAGCAAAGTCATCAGGCTTCTCTGATGTCTT
GTTCCTAGATGCTGCAACTGGCAGGAACATCGAAGAGGCGTCTGCATGTAACATCTTCAT
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AAGGAAAAGCATAAGCGAGCTAGTTCGTGATATCGGCTACCAGGTTCAAGAACGTGATGT
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CACAAAAGGTTGGATGGTTGATGTCGATCGTTGTCAAGGTTGAGAAGAAGAAGATCTCTG
AATAAGCTGTGATGCTAATGATCTTCATCTTTACTCAGTGGTGTATCTTTTCTCTTTTAA
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GTTGAATAAAAAGTATTAGGAAGG


BQ
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AF RS1CG55TF U 1
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BS 1 703 RS1CG55TF
BS 704 1344 RS1CG55JQ

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GCCTTCTTCATCACCTCTTCGTACAAGTGAAGGCGATGAAAAATATGCGAATGTGAAATG
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GGACGACCGGATTCTGATTTTCAGGCCTCATGAAAACGCTCTTCGTATGCAAGATGGTGC
AGAGAGGCTTTGTATGGCATCACCTTCTGTGGAATTCTTCGTCGAAGCAGTTAAGCAAAC
TGTGATTGCCAACAAGAAATGGGTTCCTCCTCCGGGTAAAGGAGCTTTGTATATAAGGCC
TCTGCTAATAGGGAGTGGCGCTAGCCTCGGAGTAGCTCCAGCACCTGAGTACACGTTCCT
CATCTACGCATCTCCCGTTGGAGATTACCACAAGGGAAGCTCAGGTCTGAATCTTAAAGT
TGATCATAAGCATCACCGATCACATTCTGGTGGGACTGGTGGTGTCAAGAGTTGCACGAA
CTATTCCCCAATTGTGAAATCGCTGGTTGAAGCAAAGTCATCA
CGC

QA 1 703 1 703
DS 

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AGGGAAGCTCAGGTCTGAATCTTAAAGTTGATCATAAGCATCACCGATCACATTCTGGTG
GGACTGGTGGTGTCAAGAGTTGCACGAACTATTCCCCAATTGTGAAATCGCTGGTTGAAG
CAAAGTCATCAGGCTTCTCTGATGTCTTGTTCCTAGATGCTGCAACTGGCAGGAACATCG
AAGAGGCGTCTGCATGTAACATCTTCATTGTCAAGGGGAACATTGTGTCCACTCCACCGA
CTTCAGGAACCATTTTACCAGGAATCACAAGGAAAAGCATAAGCGAGCTAGTTCGTGATA
TCGGCTACCAGGTTCAAGAACGTGATGTTTCTGTGGATGAGTTATTAGAGGCGGAAGAAG
TGTTCTGCACGGGAACTGCAGTGGTCGTTAAAGCTGTTGAAACCGTGACCTTCCATGACA
AAAAGGTAAAATACAGGACAGGAGAAGAGGCATTGTCTAAGAAGCTTCACTCGATGTTGA
CGAGTATTCAGACAGGTCTTGTTGAAGACACAAAAGGTTGGATGGTTGATGTCGATCGTT
GTCAAGGTTGAGAAGAAGAAGATCTCTGAATAAGCTGTGATGCTAATGATCTTCATCTTT
ACTCAGTGGTGTATCTTTTCTCTTTTAAGTGTTTTCTTTGTTTGCTTTATGAGACCTGTT
ACAGACTTACAATACACTAGGCAGTGTTGGTCACAGTTTCAAGGTCCTGTACGCCATCGT
TTTGATTTGGGAGACCAGAGTCGTCGCCGTTGAATAAAAAGTATTAGGAAGG

QA 1 832 1 832
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL5968Contig1 586 2 6 U
AATCACGTAACAAGAAAGTTATAACAAAATGCCAACAAAACAATAAAGCCATGAGATGAG
TTCTCTTCTCATTTTGCCAAAAACTCTAAAGTAAGCTGGAAACAAAAACATAGTAAAACT
GCAGTAAAAAGAAAGAAAGAAGTTACCATGCTCTGCCACACAACAGGAGGACTCAGAGAA
GATCAGCAACATTGTTTGGCAACTCTTCAACGACCACATTGTAAAACTTCTGAATATCAA
ACATCATCCTCTCATCATCACTTGTCATGAAGTTGAACGCCACTCCCTTCCTCCCAAACC
TCCCACTTCTTCCAATACGGTGAAGGTAGTTCTCAGGCTGCGTCGGCAGGTCAAAGTTAA
TGACCAGAGACACCTGCTGAACATCGATACCACGTGCAAGAAGGTCAGTGGTTATGAGCA
CACGCGAAAAACCAGACCTGAACTCGCGCATGATGATGTCTCTCGTGTTCTGGTCCATGT
CCCCGTGCGTGGCCGAAACAGTATGGTCACGGCTCCTCATTTTATCGGTCAGTCAATCAA
CCTTACGCCTCGTGTTCACAAAGATGACGCTCTGCGTGATGGCCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GB45JQ U 1
AF RS1AO07JQ U 199
BS 1 239 RS1GB45JQ
BS 240 240 RS1AO07JQ
BS 241 276 RS1GB45JQ
BS 277 277 RS1AO07JQ
BS 278 428 RS1GB45JQ
BS 429 586 RS1AO07JQ

RD RS1GB45JQ 430 0 0
AATCACGTAACAAGAAAGTTATAACAAAATGCCAACAAAACAATAAAGCCATGAGATGAG
TTCTCTTCTCATTTTGCCAAAAACTCTAAAGTAAGCTGGAAACAAAAACATAGTAAAACT
GCAGTAAAAAGAAAGAAAGAAGTTACCATGCTCTGCCACACAACAGGAGGACTCAGAGAA
GATCAGCAACATTGTTTGGCAACTCTTCAACGACCACATTGTAAAACTTCTGAATATCAG
ACATCATCCTCTCATCATCACTTGTCATGAAGTTGATCGCCACTCCCTTCCTCCCAAACC
TCCCACTTCTTCCAATACGGTGAAGGTAGTTCTCAGGCTGCGTCGGCAGGTCAAAGTTAA
TGACCAGAGACACCTGCTGAACATCGATACCACGTGCAAGAAGGTCAGTGGTTATGAGCA
CACGCGAA
GA

QA 1 428 1 428
DS 

RD RS1AO07JQ 388 0 0
GCAACTCTTCAACGACCACATTGTAAAACTTCTGAATATCAAACATCATCCTCTCATCAT
CACTTGTCATGAAGTTGAACGCCACTCCCTTCCTCCCAAACCTCCCACTTCTTCCAATAC
GGTGAAGGTAGTTCTCAGGCTGCGTCGGCAGGTCAAAGTTAATGACCAGAGACACCTGCT
GAACATCGATACCACGTGCAAGAAGGTCAGTGGTTATGAGCACACGCGAAAAACCAGACC
TGAACTCGCGCATGATGATGTCTCTCGTGTTCTGGTCCATGTCCCCGTGCGTGGCCGAAA
CAGTATGGTCACGGCTCCTCATTTTATCGGTCAGTCAATCAACCTTACGCCTCGTGTTCA
CAAAGATGACGCTCTGCGTGATGGCCAG

QA 1 388 1 388
DS 



AS 1 2

CO CL5969Contig1 673 2 13 U
GGAAGACGGAATCAACACTTTCATTGTGATCCCATACCTTCCTCCCTTCTTCTCCAAATA
AAGAAAATTAAAAAAGACAATCTCATCTCACTCTCTCTCTCTCTGTCTCTTCAGCTGATT
CAGATGGGCGTTGATCTGGAATCCATCTCGGAGGCTACATCTGGAGCTATAGGCTCGCTT
CTCAGCACAACCATTCTGTACCCTCTCGATACCTGCAAATCCAAGTTCCAGGCCGAGATC
AGCGTTCGCGGTCAGCAGAAATACAGATACTTGTCGGATGTATTTTGGGAAGCGATTTCT
ACAGGGAATGTTCTGTCGCTGTATCAAGGCCTTGGGACTAAGAATCTCCAGTCCTTCGTT
TCCTCTTTCATCTACTTTTATAGTTATAGCTATTTCAAGAGGTTGCATTGTGAAAGGATT
GGTTCTAAGTCAATTGGTACAAAGGCTAACCTGCTCCTTGCTGCTGCTGCTGGAGTTTGT
ACCTCTGTTCTCACCCAACCTCTAGATACAGCTTCGTCAAGGATGCAAACAAGCGAGTTT
GGAAAAGCTAAAGGGTTGTGGAAGACCTTAACCGAAGGTGCTTGGGGAAATGCATTTGAC
GGCATTGGGATCTCTCTTCTACTCACCTCCAATCCTGCAATTCAGTATACAGTGTTTGAT
CAGCTGAAACAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FT35TF U 21
AF RS1DD73TF U 1
BS 1 80 RS1DD73TF
BS 81 84 RS1FT35TF
BS 85 90 RS1DD73TF
BS 91 91 RS1FT35TF
BS 92 158 RS1DD73TF
BS 159 159 RS1FT35TF
BS 160 188 RS1DD73TF
BS 189 189 RS1FT35TF
BS 190 254 RS1DD73TF
BS 255 255 RS1FT35TF
BS 256 495 RS1DD73TF
BS 496 496 RS1FT35TF
BS 497 673 RS1DD73TF

RD RS1FT35TF 516 0 0
GG
ATTGTGATCCCATACCTTCCTCTCTTCTTCTCCAAATAAAGAAAATTAAAAA*GACAATC
TCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTTCAGCTGATTCAGATGGGCGTTGATCTGGAAT
CCATCTCGGAGGCTACATCTGGAGCTATAGGCTCGCTTCTCAGCACAACCATTCTGTACC
CTCTCTATACCTGCAAATCCAAGTTCCAGGCCGAGATCAGCGTTCGCGGTCAGCAGAAAT
ACAGATACTTGTCGGATGTATTTTGGGAAGCGATTTCTTCAGGGAATGTTCTGTCTCTGT
ATCAAGGCCTTGGGACTAAGAATCTGCAGTCCTTCGTTTCCTCTTTCATCTACTTTTATA
GTTATAGCTATTTCAAGAGGTTGCATTGTGAAAGGATTGGTTCTAAGTCAATTGGTACAA
AGGCTAACCTGCTCCTTGCTGCTGCTGCTGGAGTTTGTACCTCTGTTCTCACCCAACCTC
TAGATACAGCTTCGTCAAGGATGCAAACAAGCGA

QA 3 516 3 516
DS 

RD RS1DD73TF 673 0 0
GGAAGACGGAATCAACACTTTCATTGTGATCCCATACCTTCCTCCCTTCTTCTCCAAATA
AAGAAAATTAAAAAAGACAA****ATCTCA*TCTCTCTCTCTCTGTCTCTTCAGCTGATT
CAGATGGGCGTTGATCTGGAATCCATCTCGGAGGCTACGTCTGGAGCTATAGGCTCGCTT
CTCAGCACGACCATTCTGTACCCTCTCGATACCTGCAAATCCAAGTTCCAGGCCGAGATC
AGCGTTCGCGGTCATCAGAAATACAGATACTTGTCGGATGTATTTTGGGAAGCGATTTCT
ACAGGGAATGTTCTGTCGCTGTATCAAGGCCTTGGGACTAAGAATCTCCAGTCCTTCGTT
TCCTCTTTCATCTACTTTTATAGTTATAGCTATTTCAAGAGGTTGCATTGTGAAAGGATT
GGTTCTAAGTCAATTGGTACAAAGGCTAACCTGCTCCTTGCTGCTGCTGCTGGAGTTTGT
ACCTCTGTTCTCACCTAACCTCTAGATACAGCTTCGTCAAGGATGCAAACAAGCGAGTTT
GGAAAAGCTAAAGGGTTGTGGAAGACCTTAACCGAAGGTGCTTGGGGAAATGCATTTGAC
GGCATTGGGATCTCTCTTCTACTCACCTCCAATCCTGCAATTCAGTATACAGTGTTTGAT
CAGCTGAAACAGA

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

CO CL5970Contig1 1092 2 2 U
GCATCCATGAAAGGATGTTAAAGAAAGCTTATTGGGTTAGGTTGTTTGCTTATGGTGCTC
TAGCACAATCTGAAGACTGTAGCATTCATTATCCAGTTTGGAAGTTGCAAGCTCCCTAAG
AATTTCAGTGGATGTCAAAATCTTGCCAACCAAAAGATTCTTTGCAAAAACTCAACCTTT
CTTTATATTTTTCTTTCTCTTCAAATAAATGTTATCAAAGGAAGAAAATCGGTAGCAAGG
ATGGAGACAATGGGATGATGGGAGGAATGAATAGCAACTGCTTCTATATTATTAACACAA
ACACAAACATTTCGTAAGCTCTATCCAGTATGATATCAATTAAGTCTTTTAAATCTGAAG
TTTGTGATATCATTGCAGACTTCAACTGCTGCTAGCTACTATAAATTTGTGAACCATGAA
ATAAGAAGTGCTTTAAGGTCATTCTATCCCTAATCAATTCAGTGGTAGGCAGTTATCATG
CACTGTTTCCAGAATGAACTCCCATGGAGTTTCAGCACATCATTAAACTCAAGGTCTTAT
GAAAGCTCAGCAGAGCATACTTGATGATCTCATCAAGCATGGCCCAAGGTTTACACAGCC
CTCTGTTGCAGGGGTAATGCCACAAGTGGTTCCAACCCACCTGCACTGCGCTGGTAATCA
CTAATCCGGGTACAACAGCTAGGTTTATAGCAAACAGCGAGGATGTGTTAACCAGGCAGA
AGCTCTTGGCAGAGGAGCTGAAACCACTGGCTTTAATAATTTAATTGCTCTTACTAAAAC
TGCCAAAGACCTCAAAGATGGTCTCTCTCTCACTTTTAACAGGACAAACAAGCTTTCTTC
AAGACTTTCTTCACTTGGCTTAAACCAGGTTCATCAGCGACTGATGTAGGAGCTTGAAAG
CTCCATCTCCTGAGTTTTCAGAATACATCAAACAGAGAAGATATGATCTCCATGATGTTC
AAGCATATGCGAAGGTTTTTTTTCTTTTGTCAATCATATGTGTTTCTGTGTGTATCAAAA
TCCTTTGTCAAGCTCTAATCCGTGTAACAAAAATATTCATTGTATTATGCTAAAGATGCC
AGTTTTAAGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DI12TF U 1
AF RS1DI12JQ C 289
BS 1 726 RS1DI12TF
BS 727 1092 RS1DI12JQ

RD RS1DI12TF 726 0 0
GCATCCATGAAAGGATGTTAAAGAAAGCTTATTGGGTTAGGTTGTTTGCTTATGGTGCTC
TAGCACAATCTGAAGACTGTAGCATTCATTATCCAGTTTGGAAGTTGCAAGCTCCCTAAG
AATTTCAGTGGATGTCAAAATCTTGCCAACCAAAAGATTCTTTGCAAAAACTCAACCTTT
CTTTATATTTTTCTTTCTCTTCAAATAAATGTTATCAAAGGAAGAAAATCGGTAGCAAGG
ATGGAGACAATGGGATGATGGGAGGAATGAATAGCAACTGCTTCTATATTATTAACACAA
ACACAAACATTTCGTAAGCTCTATCCAGTATGATATCAATTAAGTCTTTTAAATCTGAAG
TTTGTGATATCATTGCAGACTTCAACTGCTGCTAGCTACTATAAATTTGTGAACCATGAA
ATAAGAAGTGCTTTAAGGTCATTCTATCCCTAATCAATTCAGTGGTAGGCAGTTATCATG
CACTGTTTCCAGAATGAACTCCCATGGAGTTTCAGCACATCATTAAACTCAAGGTCTTAT
GAAAGCTCAGCAGAGCATACTTGATGATCTCATCAAGCATGGCCCAAGGTTTACACAGCC
CTCTGTTGCAGGGGTAATGCCACAAGTGGTTCCAACCCACCTGCACTGCGCTGGTAATCA
CTAATCCGGGTACAACAGCTAGGTTTATAGCAAACAGCGAGGATGTGTTAACCAGGCAGA
AGCTCT

QA 1 726 1 726
DS 

RD RS1DI12JQ 804 0 0
TTATTAACACAAACACAAACATTTCGTAAGCTCTATCCAGTATGATATCAATTAAGTCTT
TTAAATCTGAAGTTTGTGATATCATTGCAGACTTCAACTGCTGCTAGCTACTATAAATTT
GTGAACCATGAAATAAGAAGTGCTTTAAGGTCATTCTATCCCTAATCAATTCAGTGGTAG
GCAGTTATCATGCACTGTTTCCAGAATGAACTCCCATGGAGTTTCAGCACATCATTAAAC
TCAAGGTCTTATGAAAGCTCAGCAGAGCATACTTGATGATCTCATCAAGCATGGCCCAAG
GTTTACACAGCCCTCTGTTGCAGGGGTAATGCCACAAGTGGTTCCAACCCACCTGCACTG
CGCTGGTAATCACTAATCCGGGTACAACAGCTAGGTTTATAGCAAACAGCGAGGATGTGT
TAACCAGGCAGAAGCTCTTGGCAGAGGAGCTGAAACCACTGGCTTTAATAATTTAATTGC
TCTTACTAAAACTGCCAAAGACCTCAAAGATGGTCTCTCTCTCACTTTTAACAGGACAAA
CAAGCTTTCTTCAAGACTTTCTTCACTTGGCTTAAACCAGGTTCATCAGCGACTGATGTA
GGAGCTTGAAAGCTCCATCTCCTGAGTTTTCAGAATACATCAAACAGAGAAGATATGATC
TCCATGATGTTCAAGCATATGCGAAGGTTTTTTTTCTTTTGTCAATCATATGTGTTTCTG
TGTGTATCAAAATCCTTTGTCAAGCTCTAATCCGTGTAACAAAAATATTCATTGTATTAT
GCTAAAGATGCCAGTTTTAAGTTC

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 2

CO CL5971Contig1 906 2 2 U
GGGAAGAAAGAAGGCAACTCGCCGCTGTATTCGAGACGGAGGAGTAAAAATGTTGAGGAG
AGTGATCGGTAACGTCGCAGTCCGGCGTCAATTTCAAAGAGCCTTATCCAGCAAATCAGG
TGGAAGCGGAAAGCCAAGCGACGTTTCAGCCGCCGTCGATTCGATGCTACTCCGTTCCCT
AAAGGAACATTACCTAGAAGTCTCCAAGATGACTCCTCCTCCCAAAGTGACACCTCCTTC
ACCGTTCGAGATTGTGAAAGGATCGCTCGAGGGAACCGGCGCTGTTCTGAAGAAATCTGT
CGGAAACGAAGAGATTAGTCTCTTTGTGATGAGGCTTGCTCACGGAGGTGGTGATGATGA
AGACGAGGATGGGATTAACCAGCTGTTCCTCCACGTGGCTGTGTCGAAGCCGAACCAGGC
TGAGTCTCTTCATTTCCTTTGCGGGCTTTACCCGGATGCGTTGGGTATTCACTCTGTTTC
CATGAGGCCCAAGCTCGAGGATTTGGAGTTGTCCGATAATCCTGCTCGTTACACTGGCCC
TTCTTTTGAAGAGCTGGATGAGAAGATGAGAGACGTATTCCATAGCTTCCTGGAGGAGCG
AGGTGTGAACGAGAGTCTCTTCCCGTTTCTTCAGGCATGGCTCTATGTAAAGGATCATCG
TAACTTGCTGCGATGGTTCAAATCAGTTGGCACGTATGTGCATGAGAACCCATCTGCGGA
AAACGCCTAGGGGGGGCTCTCAATCAGAGGGACGTATCTTCTCAGTCTTTTGGTAGAGGT
TTATGCGGTTAATTGTTTTGACAAGGCACTGTACCGCTCTTATATGATACATTTCCAGGA
ATCGAGTTACTTTTGCTTCTTTCAGACCCTTCTTTCAAGAAAACATATGCATCAGTGATG
TTGTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1GB66TF U 1
AF RS1GB66JQ C 185
BS 1 631 RS1GB66TF
BS 632 906 RS1GB66JQ

RD RS1GB66TF 631 0 0
GGGAAGAAAGAAGGCAACTCGCCGCTGTATTCGAGACGGAGGAGTAAAAATGTTGAGGAG
AGTGATCGGTAACGTCGCAGTCCGGCGTCAATTTCAAAGAGCCTTATCCAGCAAATCAGG
TGGAAGCGGAAAGCCAAGCGACGTTTCAGCCGCCGTCGATTCGATGCTACTCCGTTCCCT
AAAGGAACATTACCTAGAAGTCTCCAAGATGACTCCTCCTCCCAAAGTGACACCTCCTTC
ACCGTTCGAGATTGTGAAAGGATCGCTCGAGGGAACCGGCGCTGTTCTGAAGAAATCTGT
CGGAAACGAAGAGATTAGTCTCTTTGTGATGAGGCTTGCTCACGGAGGTGGTGATGATGA
AGACGAGGATGGGATTAACCAGCTGTTCCTCCACGTGGCTGTGTCGAAGCCGAACCAGGC
TGAGTCTCTTCATTTCCTTTGCGGGCTTTACCCGGATGCGTTGGGTATTCACTCTGTTTC
CATGAGGCCCAAGCTCGAGGATTTGGAGTTGTCCGATAATCCTGCTCGTTACACTGGCCC
TTCTTTTGAAGAGCTGGATGAGAAGATGAGAGACGTATTCCATAGCTTCCTGGAGGAGCG
AGGTGTGAACGAGAGTCTCTTCCCGTTTCTT

QA 1 631 1 631
DS 

RD RS1GB66JQ 722 0 0
GAACATTACCTAGAAGTCTCCAAGATGACTCCTCCTCCCAAAGTGACACCTCCTTCACCG
TTCGAGATTGTGAAAGGATCGCTCGAGGGAACCGGCGCTGTTCTGAAGAAATCTGTCGGA
AACGAAGAGATTAGTCTCTTTGTGATGAGGCTTGCTCACGGAGGTGGTGATGATGAAGAC
GAGGATGGGATTAACCAGCTGTTCCTCCACGTGGCTGTGTCGAAGCCGAACCAGGCTGAG
TCTCTTCATTTCCTTTGCGGGCTTTACCCGGATGCGTTGGGTATTCACTCTGTTTCCATG
AGGCCCAAGCTCGAGGATTTGGAGTTGTCCGATAATCCTGCTCGTTACACTGGCCCTTCT
TTTGAAGAGCTGGATGAGAAGATGAGAGACGTATTCCATAGCTTCCTGGAGGAGCGAGGT
GTGAACGAGAGTCTCTTCCCGTTTCTTCAGGCATGGCTCTATGTAAAGGATCATCGTAAC
TTGCTGCGATGGTTCAAATCAGTTGGCACGTATGTGCATGAGAACCCATCTGCGGAAAAC
GCCTAGGGGGGGCTCTCAATCAGAGGGACGTATCTTCTCAGTCTTTTGGTAGAGGTTTAT
GCGGTTAATTGTTTTGACAAGGCACTGTACCGCTCTTATATGATACATTTCCAGGAATCG
AGTTACTTTTGCTTCTTTCAGACCCTTCTTTCAAGAAAACATATGCATCAGTGATGTTGT
TT

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL5972Contig1 1123 2 4 U
GACGGAAGGGAAGTTGCGGTTAAACAGTTGAAGATCGGTGGAAGCCAAGGAGAAAGAGAG
TTCAAAGCTGAAGTTGAAATCATTTCTCGTGTTCGTCACCGACATTTGGTTACGCTTGTT
GGTTATTGCATCTCGGAGCAGCATAGGTTGCTTGTTTATGATTATGTACCTAACAACACT
CTCCATTGCCGTCTCCATGCTCCAGGGAGACCAGTTATGACTTGGGAAACTCGGGTGAAG
GTTGCTGGTGCTGCTCGTGGAATTGCCTACTTACATGAAGATTGTCATCCTCGGATTATT
CACCGTGACATTAAATCTTCAAACATACTCTTAGACAACAGCTTTGAAGCCTTGGTTGCG
GATTTCGGGCTAGCTAAAATAGCGCAGGAACTGGATTTAAACACACACGTCTCGACCCGT
GTAATGGGAACCTTCGGATACATGGCTCCTGAGTATGCAACAAGTGGGAAGCTTTCTGAA
AAAGCAGATGTTTATTCGTATGGTGTAATACTCTTGGAGCTTATTACTGGTCGGAAACCT
GTGGATACGTCTCAGCCACTTGGTGACGAAAGCCTTGTTGAATGGGCAAGGCCATTGTTG
AGTCAAGCAATCGAAAATGAAGAGTTTGAGGACCTAGTTGATCCGAGGCTAGGGGACAAT
TTCATCCCTGGGGAGACGTTTCGAATGGTAGAAGCTGCGGCTGCATGCGTGCGCCACTCA
GCTGCAAGAAGACCAAAGATGAGCCAAGTGGTGAGAGCACTGGACACGCTTGAAGAAGCT
TCGGATATTACAAACGGAATGAGACCAGGACAGAGCCAAGTGTATGACTCGAGACAACAG
TTTGCTCAGATAAGGATGTTTCAGAGAATGGCGTTTGGGAGTCAAGATTATAGTTTTGAC
TTCTTTGATCGGTCACAGTCTCATAGTAGCTGGGGAAGTCGTGAGACCCGTGACCAGTCC
AAATTTGTACCTTAGCAGTATTTTTTTTTTTTTTTCGATTAAAACCTTGTACCTTGGTAG
TTAATACTGGTTTTTTGCTACTTTCTTCTTTCCATTAAAACACCTTTTGTATATTGTTTT
GTATGATTTTAAAGTTTACATATAAATTTGGAGATGCTCTTAG


BQ
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AF RS1ED56TF U 1
AF RS1ED56JQ C 479
BS 1 658 RS1ED56TF
BS 659 659 RS1ED56JQ
BS 660 713 RS1ED56TF
BS 714 1123 RS1ED56JQ

RD RS1ED56TF 713 0 0
GACGGAAGGGAAGTTGCGGTTAAACAGTTGAAGATCGGTGGAAGCCAAGGAGAAAGAGAG
TTCAAAGCTGAAGTTGAAATCATTTCTCGTGTTCGTCACCGACATTTGGTTACGCTTGTT
GGTTATTGCATCTCGGAGCAGCATAGGTTGCTTGTTTATGATTATGTACCTAACAACACT
CTCCATTGCCGTCTCCATGCTCCAGGGAGACCAGTTATGACTTGGGAAACTCGGGTGAAG
GTTGCTGGTGCTGCTCGTGGAATTGCCTACTTACATGAAGATTGTCATCCTCGGATTATT
CACCGTGACATTAAATCTTCAAACATACTCTTAGACAACAGCTTTGAAGCCTTGGTTGCG
GATTTCGGGCTAGCTAAAATAGCGCAGGAACTGGATTTAAACACACACGTCTCGACCCGT
GTAATGGGAACCTTCGGATACATGGCTCCTGAGTATGCAACAAGTGGGAAGCTTTCTGAA
AAAGCAGATGTTTATTCGTATGGTGTAATACTCTTGGAGCTTATTACTGGTCGGAAACCT
GTGGATACGTCTCAGCCACTTGGTGACGAAAGCCTTGTTGAATGGGCAAGGCCATTGTTG
AGTCAAGCAATCGAAAATGAAGAGTTTGAGGACCTAGTTGATCCGAGGCTAGGGGACA*T
TTCATCCCTGGGGAGACGTTTCGAATGGTAGAAGCTGCGGCTGCATGCGTGCG

QA 1 713 1 713
DS 

RD RS1ED56JQ 645 0 0
AAAAAGCAGATGTTTATTCGTATGGTGTAATACTCTTGGAGCTTATTACTGGTCGGAAAC
CTGTGGATACGTTTCAGCCACTTGGTGACGAAAGCCTTGTTGAATGGGCAAGGCCATTGT
TGAGTCAAGCAATCGAAAATGAAGAGTTTGAGGACCTAGTTGATCCGAGGCTAGGGGACA
ATTTCATCCCTGGGGAGACGTTTTGAATGGTAGAAGCTGCGGCTGCATGCGTGCGCCACT
CAGCTGCAAGAAGACCAAAGATGAGCCAAGTGGTGAGAGCACTGGACACGCTTGAAGAAG
CTTCGGATATTACAAACGGAATGAGACCAGGACAGAGCCAAGTGTATGACTCGAGACAAC
AGTTTGCTCAGATAAGGATGTTTCAGAGAATGGCGTTTGGGAGTCAAGATTATAGTTTTG
ACTTCTTTGATCGGTCACAGTCTCATAGTAGCTGGGGAAGTCGTGAGACCCGTGACCAGT
CCAAATTTGTACCTTAGCAGTATTTTTTTTTTTTTTTCGATTAAAACCTTGTACCTTGGT
AGTTAATACTGGTTTTTTGCTACTTTCTTCTTTCCATTAAAACACCTTTTGTATATTGTT
TTGTATGATTTTAAAGTTTACATATAAATTTGGAGATGCTCTTAG

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 2

CO CL5973Contig1 911 2 2 U
TTTTTCTTTCAATTCAGTTTGGTCCGATGATTGTTTTTACTTCTTGAATTCGCGTATGCG
TAAGAGCACATATCGAAGGCTTGCAGATAACGTATTGTTAAATCGCCTGTGAGCTCAATA
TTTGTGCGAAACCCTAAAACCATCCATTGAGATTTTAAAAAGATCTCTGTGTTATAAGAA
TCTCTCTTTTCTTATCGACAATTCTAATGAATGGGACATTTCTTTGTACTTGAATCGCTA
GTTGTTTTGATTTCAGACAGTAGTAAGAACTTAGTTATATCTACTGTAGTTTAAGTGTTC
ATTAAGTGGTGATGACTACACAAGTGTTGTTCTTCGAACAGTTTGAGAGATTTGGTTGAT
GGGTTTGTTGTAGATATAACAAAGCATTATGTATAGATCCACGGCTCTAGTTTCTTACAT
TGAGTTGCTTGATCATGTTGTGATGGAGCTATTTGCAGATGTGACACCGAGAAGGGAATT
GGGTGGGCATGGAAGGCATTACACACTACAAAGGCTCAGCCTTTCGTTGTATAATCCCAG
GGTTCACGGTGCCAAGGTGTAGATTTCACACGTGGTGAATCGATTTATGGGACTAAGTTT
CAGGAAGAGAGATCTTTAAGTTGAAGCATAAGGGTCCAGGGATTTTGTCTATGGCTAATT
CAGGTCCCAACAGTTCTTTGTTTGCACGGAGAAGACCTCATGGCTTTGGTTTTGTGTTTG
GGAAAGTTGTGGATGGGGTACAATGTGGTGAAGGCAAATGGAGTAGAGTTCTGGATACTA
CATAAATATCAAACAAGTTGGGGATTTTCGTTTTTGTGGTTTCTAGTTATGTGTTTGTAA
TCAAAGTTGTACAATTGTAAGACTTTTGGGATGTGTATATAAGTTATAATGGATCGTCTG
GTTCCTGCCGC


BQ
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AF RS1BL74TF U 1
AF RS1BL74JQ C 214
BS 1 658 RS1BL74TF
BS 659 911 RS1BL74JQ

RD RS1BL74TF 658 0 0
TTTTTCTTTCAATTCAGTTTGGTCCGATGATTGTTTTTACTTCTTGAATTCGCGTATGCG
TAAGAGCACATATCGAAGGCTTGCAGATAACGTATTGTTAAATCGCCTGTGAGCTCAATA
TTTGTGCGAAACCCTAAAACCATCCATTGAGATTTTAAAAAGATCTCTGTGTTATAAGAA
TCTCTCTTTTCTTATCGACAATTCTAATGAATGGGACATTTCTTTGTACTTGAATCGCTA
GTTGTTTTGATTTCAGACAGTAGTAAGAACTTAGTTATATCTACTGTAGTTTAAGTGTTC
ATTAAGTGGTGATGACTACACAAGTGTTGTTCTTCGAACAGTTTGAGAGATTTGGTTGAT
GGGTTTGTTGTAGATATAACAAAGCATTATGTATAGATCCACGGCTCTAGTTTCTTACAT
TGAGTTGCTTGATCATGTTGTGATGGAGCTATTTGCAGATGTGACACCGAGAAGGGAATT
GGGTGGGCATGGAAGGCATTACACACTACAAAGGCTCAGCCTTTCGTTGTATAATCCCAG
GGTTCACGGTGCCAAGGTGTAGATTTCACACGTGGTGAATCGATTTATGGGACTAAGTTT
CAGGAAGAGAGATCTTTAAGTTGAAGCATAAGGGTCCAGGGATTTTGTCTATGGCTAA

QA 1 658 1 658
DS 

RD RS1BL74JQ 698 0 0
GGACATTTCTTTGTACTTGAATCGCTAGTTGTTTTGATTTCAGACAGTAGTAAGAACTTA
GTTATATCTACTGTAGTTTAAGTGTTCATTAAGTGGTGATGACTACACAAGTGTTGTTCT
TCGAACAGTTTGAGAGATTTGGTTGATGGGTTTGTTGTAGATATAACAAAGCATTATGTA
TAGATCCACGGCTCTAGTTTCTTACATTGAGTTGCTTGATCATGTTGTGATGGAGCTATT
TGCAGATGTGACACCGAGAAGGGAATTGGGTGGGCATGGAAGGCATTACACACTACAAAG
GCTCAGCCTTTCGTTGTATAATCCCAGGGTTCACGGTGCCAAGGTGTAGATTTCACACGT
GGTGAATCGATTTATGGGACTAAGTTTCAGGAAGAGAGATCTTTAAGTTGAAGCATAAGG
GTCCAGGGATTTTGTCTATGGCTAATTCAGGTCCCAACAGTTCTTTGTTTGCACGGAGAA
GACCTCATGGCTTTGGTTTTGTGTTTGGGAAAGTTGTGGATGGGGTACAATGTGGTGAAG
GCAAATGGAGTAGAGTTCTGGATACTACATAAATATCAAACAAGTTGGGGATTTTCGTTT
TTGTGGTTTCTAGTTATGTGTTTGTAATCAAAGTTGTACAATTGTAAGACTTTTGGGATG
TGTATATAAGTTATAATGGATCGTCTGGTTCCTGCCGC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL5974Contig1 969 2 2 U
GGCATGGACTCTCATATATATGCCTTCAAGAGATCAGTCCTGCAGAAAGTTTTGGATCAA
AAACCTACTTTTCGGAGCCTAAAACAGGATGTGCTCCCGTATCTTGTTCGTACCCAGCTG
AGATCAGAGGTCTTCCCTGACGAAAAAACTGTAGAGGACAATGGAAAGAATAATATGCAG
AGCAACGAGGTGGTTTTGTCTCAAATTCTCTCCAACGCATCGTTGCCAAGCTTTCATCAA
CTTTACGAATCAGGTCTGAATAGCCGAAAAACCCATAAATGCTGTGTTTATATAGCGGAC
GAGAGTAAGTATTGCGTCCGCTTAAATAGCATTCAAGCCTTCATGGACGTAAACAGAGAT
GTTATTGGTGACGCAAACCACCTATCCGGATACTCCTTTTCTTCTCATCACAACATTGTC
CACCCATCAGCTGAGCTTGGATCAAAAACCACCGTTGGACCTCATTGTATGCTTGGAGAA
GGCTCTCAAGTCGGTGATAAATGCAGTGTCAAAAGATCTGTAATTGGGAGACATTGCCGG
ATAGGCTCCAACGTGAAGGTGGTTAATTCAGTTGTGATGGACCATGCCACAATAGGAGAC
GGATGCTCAATACAAGGCTCAGTGATTTGCAGCAATGCACAGCTTCAAGAGCGTGTTGCT
CTGAGAGACTGCCAAGTGGAAGCAGGCTATGTAGTTTATGCCGGGGGTGAGCACAAGGGA
GAGACATTCGCCAGAAAATGATGATAGCATTCATTCGTTTGGTGAGCAGAGCGGTGATGA
GAAGAGTGAGAAGTCCCCACCACTAAGGTTTTGTTGAGCTTTTAAGTGTGAGATTTTTCA
TTGCTATGTTTTTGCTGATAGGATTTTGATATGTTGCTGTTGGAACTCAAAACTTGATGA
AGTCTTGAAAACTGTTTTGTACCGAAACTCTTTCATGTAAGATATACTATTTGTTTTTGG
TAGTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GI21TF U 1
AF RS1GI21JQ C 285
BS 1 508 RS1GI21TF
BS 509 969 RS1GI21JQ

RD RS1GI21TF 508 0 0
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AAACCTACTTTTCGGAGCCTAAAACAGGATGTGCTCCCGTATCTTGTTCGTACCCAGCTG
AGATCAGAGGTCTTCCCTGACGAAAAAACTGTAGAGGACAATGGAAAGAATAATATGCAG
AGCAACGAGGTGGTTTTGTCTCAAATTCTCTCCAACGCATCGTTGCCAAGCTTTCATCAA
CTTTACGAATCAGGTCTGAATAGCCGAAAAACCCATAAATGCTGTGTTTATATAGCGGAC
GAGAGTAAGTATTGCGTCCGCTTAAATAGCATTCAAGCCTTCATGGACGTAAACAGAGAT
GTTATTGGTGACGCAAACCACCTATCCGGATACTCCTTTTCTTCTCATCACAACATTGTC
CACCCATCAGCTGAGCTTGGATCAAAAACCACCGTTGGACCTCATTGTATGCTTGGAGAA
GGCTCTCAAGTCGGTGATAAATGCAGTG

QA 1 508 1 508
DS 

RD RS1GI21JQ 685 0 0
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GGACGTAAACAGAGATGTTATTGGTGACGCAAACCACCTATCCGGATACTCCTTTTCTTC
TCATCACAACATTGTCCACCCATCAGCTGAGCTTGGATCAAAAACCACCGTTGGACCTCA
TTGTATGCTTGGAGAAGGCTCTCAAGTCGGTGATAAATGCAGTGTCAAAAGATCTGTAAT
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TGCCACAATAGGAGACGGATGCTCAATACAAGGCTCAGTGATTTGCAGCAATGCACAGCT
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AGCAGAGCGGTGATGAGAAGAGTGAGAAGTCCCCACCACTAAGGTTTTGTTGAGCTTTTA
AGTGTGAGATTTTTCATTGCTATGTTTTTGCTGATAGGATTTTGATATGTTGCTGTTGGA
ACTCAAAACTTGATGAAGTCTTGAAAACTGTTTTGTACCGAAACTCTTTCATGTAAGATA
TACTATTTGTTTTTGGTAGTTTTCC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL5975Contig1 854 2 2 U
GGAGGGTTGTTGGTGTCTCCATCTCTCGCGTTATCCAGAAGCGTTCTTCCGTCGAGAGAT
CTTTCGTCTTCTTCGTCCGAGGCGCGGCGGCAACCGATATCCCTCACTAAGCCCTCTTTA
ATCAATCACACACGATCCCCATTCAATGCGACCCTGGAGAGTTCAAGGCGGTGGAAACTC
TGCTATAAAAAAGACTGGCCGCTCTTCCTCCTCTGTTCAAGTTCGCCTGCTCCGATTTTG
GGAGGCCAAGAACGTCTGGCGTGGCGGAGAGTTTATGGGAGTCGACATGCTCCTTCTTGA
TTCTCAGGCGGCCACTATCAGTGTCAACCGGCTAGAGACCCACCGGTGTAACAGAGTTTG
AACGTTTTATGATTCCTCTATGTCACCAAATTGCTCAGTGCTTGAGCAGCTCTCACTTTC
AGGTAGCGGAACGGGCTCTATACTCATGGAACAAAATCATGTTAGTGACTTGGTGAGACA
TAACAGCGGAATCAATCTACCGATAGCGTTTCCAGCTTTGGAGAAAAAACGGTAGTAGCC
ATTGGAACCAGGCTGTGAAGAACTTGACGAAAAATGTGCTCAAGGTTTTGTATGATACAA
ATCCAAAGTTGTTTAAAGAATGTTTGTGCAAGTTTCAAGAGGATCAGCTAAATGCAGAGG
ATAACAAAAAGAAGAATGGAGAAACATGAAGACAGCTAGAGGAGATTGTTGCTTCAATGG
CGAAGTCAAGAGTTTTATATTCTGCACTTTTCACGCTATACAAAAGAAAAGAAGAAAATT
GGTTTATGTTTTGTTTTTCTTACGCCTGAAAGGTATATACAGTTTTTACTTTTTGCTTTG
CTTGGTTCAAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FM72TF U 1
AF RS1FM72JQ C 182
BS 1 517 RS1FM72TF
BS 518 854 RS1FM72JQ

RD RS1FM72TF 517 0 0
GGAGGGTTGTTGGTGTCTCCATCTCTCGCGTTATCCAGAAGCGTTCTTCCGTCGAGAGAT
CTTTCGTCTTCTTCGTCCGAGGCGCGGCGGCAACCGATATCCCTCACTAAGCCCTCTTTA
ATCAATCACACACGATCCCCATTCAATGCGACCCTGGAGAGTTCAAGGCGGTGGAAACTC
TGCTATAAAAAAGACTGGCCGCTCTTCCTCCTCTGTTCAAGTTCGCCTGCTCCGATTTTG
GGAGGCCAAGAACGTCTGGCGTGGCGGAGAGTTTATGGGAGTCGACATGCTCCTTCTTGA
TTCTCAGGCGGCCACTATCAGTGTCAACCGGCTAGAGACCCACCGGTGTAACAGAGTTTG
AACGTTTTATGATTCCTCTATGTCACCAAATTGCTCAGTGCTTGAGCAGCTCTCACTTTC
AGGTAGCGGAACGGGCTCTATACTCATGGAACAAAATCATGTTAGTGACTTGGTGAGACA
TAACAGCGGAATCAATCTACCGATAGCGTTTCCAGCT

QA 1 517 1 517
DS 

RD RS1FM72JQ 673 0 0
GCTATAAAAAAGACTGGCCGCTCTTCCTCCTCTGTTCAAGTTCGCCTGCTCCGATTTTGG
GAGGCCAAGAACGTCTGGCGTGGCGGAGAGTTTATGGGAGTCGACATGCTCCTTCTTGAT
TCTCAGGCGGCCACTATCAGTGTCAACCGGCTAGAGACCCACCGGTGTAACAGAGTTTGA
ACGTTTTATGATTCCTCTATGTCACCAAATTGCTCAGTGCTTGAGCAGCTCTCACTTTCA
GGTAGCGGAACGGGCTCTATACTCATGGAACAAAATCATGTTAGTGACTTGGTGAGACAT
AACAGCGGAATCAATCTACCGATAGCGTTTCCAGCTTTGGAGAAAAAACGGTAGTAGCCA
TTGGAACCAGGCTGTGAAGAACTTGACGAAAAATGTGCTCAAGGTTTTGTATGATACAAA
TCCAAAGTTGTTTAAAGAATGTTTGTGCAAGTTTCAAGAGGATCAGCTAAATGCAGAGGA
TAACAAAAAGAAGAATGGAGAAACATGAAGACAGCTAGAGGAGATTGTTGCTTCAATGGC
GAAGTCAAGAGTTTTATATTCTGCACTTTTCACGCTATACAAAAGAAAAGAAGAAAATTG
GTTTATGTTTTGTTTTTCTTACGCCTGAAAGGTATATACAGTTTTTACTTTTTGCTTTGC
TTGGTTCAAGTCC

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

CO CL5976Contig1 595 2 2 U
GGACTTTTGCTCTAATCAGTTTTAGTAGGCTAAACTTTCGAATATAAAATGGGTGTGTTC
ACTGGATTTGGTAGCTGGATCAATCTGAACAGTCAACAGCCTCTTAAGGCCGATTCCCAG
AGATCTGAAAACGGCGAATCTAAGTCGGCGTCAGAAAAGACACTACTAAGAAGGAGGAGG
AGGAGGTGGTATATTATGATGAAAAAGAGGACACGAGACAAGAGGGACTTTGGCATGAAG
CAGAGAAGAAGCATCCATGGCATAATTCACCTCCCAAGATCAAGATGACAAATAAGAATA
CAAAAAATGTAGCGGTGGCCAAGGAAGGATTGGGTCAAAACTTATAATAAACCAATACTT
CCAGCCATATCCTCCATTTAATCTACCTCCGCTTTCTTGGTTCATCCGTGGGTTCACCAT
TAAAACCTCCAAAAAAATGCTCAACTTGCTTCAGGACATGGCTTTTTCTTTACGGCAGGC
AGGGCCTCCCTCAGAATAAGCCATCAAAGTTAGAGAAAACTATGTTGTTGAATACATAGT
TTTTAGAAATTTAGAAGATTGTACGTAAACATACAAAAAAAACTGTTTATCGAGT


BQ
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CAAAAAATGTAGCGGTGGCCAAGGAAGGATTGGGTCAAAACTTATAATAAACCAATACTT
CCAGCCATATCCTCCATTTAATCTACCTCCGCTTTCTTGGTTCATCCGTGGGTTCACCAT
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TTTTAGAAATTTAGAAGATTGTACGTAAACATACAAAAAAAA

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GATGAAAAAGAGGACACGAGACAAGAGGGACTTTGGCATGAAGCAGAGAAGAAGCATCCA
TGGCATAATTCACCTCCCAAGATCAAGATGACAAATAAGAATACAAAAAATGTAGCGGTG
GCCAAGGAAGGATTGGGTCAAAACTTATAATAAACCAATACTTCCAGCCATATCCTCCAT
TTAATCTACCTCCGCTTTCTTGGTTCATCCGTGGGTTCACCATTAAAACCTCCAAAAAAA
TGCTCAACTTGCTTCAGGACATGGCTTTTTCTTTACGGCAGGCAGGGCCTCCCTCAGAAT
AAGCCATCAAAGTTAGAGAAAACTATGTTGTTGAATACATAGTTTTTAGAAATTTAGAAG
ATTGTACGTAAACATACAAAAAAAACTGTTTATCGAGT

QA 1 458 1 458
DS 



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BQ
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AF RS1EA54TF U 1
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QA 1 224 1 224
DS 



AS 1 2

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AGAAAACTGGGAAGCATCCTCTTCAAGCGAGAACGAAGAAGCTGGTTTTGCGATTGATGA
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BQ
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AF RS1FN84TF U 1
AF RS1FN84JQ C 143
BS 1 579 RS1FN84TF
BS 580 870 RS1FN84JQ

RD RS1FN84TF 579 0 0
AGGGGGAGCTTGTGTTACCAAAAAAAAACCATTTGAGCTTTGAGGCCTTTTTGAAGCTGT
ACACCAACTGTTCGACGAATTGCCCCGGAGAGTTTGTAGAACAGAAAGGCTTATGGAGGA
AGAAAACTGGGAAGCATCCTCTTCAAGCGAGAACGAAGAAGCTGGTTTTGCGATTGATGA
CGATGAAGAGTTCCAATCAGGACCCAAGTTACAATTCAGAGTCGGATCTTCAAAGGCTCG
TTGGATCACTGAGTTAGAAATGGGAGAAGTTGAGGTTAAAAGAGGGAAGCTTTGGACAAC
AACTGGAATCATTCGTAGCGGGAAGACATACTGTTTCATTGAAGAGGCTTTGTATTTGAG
TGAGATAGGAGAGTTGCAGATCTTGGGTAATAAAGATGATGATGATGTAGTGATCTCGTT
GAAGGGTTTGTATGAGATGATTGCAGAGGAAAAAAGTGGATGCTGTTGGGAAAGCTATGA
GGTTTATAGATACTTGAAGGGTCTTGGTTACATCTAGGCAGGCATGGGGTTCCTTGGACG
TCAAAGGGTGATGCTATCATGACACCAAGTGGTGGTGAA

QA 1 579 1 579
DS 

RD RS1FN84JQ 728 0 0
TCAAGCGAGAACGAAGAAGCTGGTTTTGCGATTGATGACGATGAAGAGTTCCAATCAGGA
CCCAAGTTACAATTCAGAGTCGGATCTTCAAAGGCTCGTTGGATCACTGAGTTAGAAATG
GGAGAAGTTGAGGTTAAAAGAGGGAAGCTTTGGACAACAACTGGAATCATTCGTAGCGGG
AAGACATACTGTTTCATTGAAGAGGCTTTGTATTTGAGTGAGATAGGAGAGTTGCAGATC
TTGGGTAATAAAGATGATGATGATGTAGTGATCTCGTTGAAGGGTTTGTATGAGATGATT
GCAGAGGAAAAAAGTGGATGCTGTTGGGAAAGCTATGAGGTTTATAGATACTTGAAGGGT
CTTGGTTACATCTAGGCAGGCATGGGGTTCCTTGGACGTCAAAGGGTGATGCTATCATGA
CACCAAGTGGTGGTGAATGTCCTGAAGAGGATGATACTGTCACTAAACTCTTGGGAGATA
TGCAACTCTGTTGTGATGCAAGAGCCGTGTTTGACGTGTATTTGCCAAACAGCCGGTTCA
AGAAGTCTTCTCCTGGTGAACCTAGCTGGCTTGCTTATCAGGGGACTCTCCACCAAGCAA
AGAAGATGTCAGAGTCCTGCAAAGCCGCATAGCTGCACCGTTGAGGTTCTGTCATATCGC
TCAGGGCCGTGTTAGTTTCTTTTCATTCAGTTCCATAAACCTCCCTGTCTTACCATAAAA
ATGTAACC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL5979Contig1 1049 2 2 U
TTTTTCTTACAAAAAAAAAAAAAATCTCACATTCTCTCTCTCCAATGGCGGCGACGACAC
TAGGCAGAGACCAGTACGTGTACATGGCGAAGCTCGCCGAGCAGGCGGAGCGTTACGGGG
AGATGGTCCAGTTCATGGAGCAGCTCGTCACATCCGCCGCTCCATCATCATCGGAGCTCA
CGGTGGAGGAGCGCAACCTCCTCTCGGTCGCGTACAAAAACGTGATCGGATCTCTGCGCG
CCGCGTGGAGGATCGTCTCCTCGATCGAGCAGAAGGAAGAGAGCAGGAAGAACGAGGAGC
ACGCGGCGCTCGTCAAGAACTACAGATCCAAGGTGGAGGCGGAGCTCTCGTCGGTGTGCT
CGGGGATCCTCAGGCTCCTGGACTCGCATCTGATCCCGTCGGCGGCGGGGAGCGAGTCGA
AGGTGTTTTACATGAAGATGAAGGGGGATTACCATAGGTACATGGCGGAGTTTAAGTCTG
GCGAGGAGAGGAAAGCTGCTGCTGAAGATACCATGCTCGCTTACAAGGCTGCTCAGGATA
TTGCAGCGGCTGAGATGGCGCCTACACATCCGATAAGGCTTGGTCTTGCGTTGAATTTCT
CTGTGTTTTACTATGAGATACTCAATTCTTCCGACAAAGCTTGTAACATGGCCAAACAGG
CATTTGAAGAAGCCATAGCAGAGCTTGACACACTGGGAGAAGAATCCTACAAAGACAGTA
CTCTCATTATGCAGTTGCTCAGGGACAATCTTACCCTCTGGACCTCTGATATGCAGGAGC
AGATGGACGAGGCCTGAGGAGGATCTTTGATGGAAAAAGGGAGAGAGTTATGCTGCCATG
TTTCCGATCTCAAGATCCTTATATAACATCGGCTTGAAAAATATTATTCTTTTAAGTGTT
TATGATGAGTATGTGCACAGCTTGATGATTTGTCTACTTTTATCTTAAAAGTCTAAAACT
ATGTGCTCTAAAACTTGTAATCTCTTAAGACTTTGATGAAGCCTTGAAAACCTCTTTATC
CTTATACTCAAATTTTTGATTCTCCTACC


BQ
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AF RS1CC90TF U 1
AF RS1CC90JQ C 206
BS 1 655 RS1CC90TF
BS 656 1049 RS1CC90JQ

RD RS1CC90TF 655 0 0
TTTTTCTTACAAAAAAAAAAAAAATCTCACATTCTCTCTCTCCAATGGCGGCGACGACAC
TAGGCAGAGACCAGTACGTGTACATGGCGAAGCTCGCCGAGCAGGCGGAGCGTTACGGGG
AGATGGTCCAGTTCATGGAGCAGCTCGTCACATCCGCCGCTCCATCATCATCGGAGCTCA
CGGTGGAGGAGCGCAACCTCCTCTCGGTCGCGTACAAAAACGTGATCGGATCTCTGCGCG
CCGCGTGGAGGATCGTCTCCTCGATCGAGCAGAAGGAAGAGAGCAGGAAGAACGAGGAGC
ACGCGGCGCTCGTCAAGAACTACAGATCCAAGGTGGAGGCGGAGCTCTCGTCGGTGTGCT
CGGGGATCCTCAGGCTCCTGGACTCGCATCTGATCCCGTCGGCGGCGGGGAGCGAGTCGA
AGGTGTTTTACATGAAGATGAAGGGGGATTACCATAGGTACATGGCGGAGTTTAAGTCTG
GCGAGGAGAGGAAAGCTGCTGCTGAAGATACCATGCTCGCTTACAAGGCTGCTCAGGATA
TTGCAGCGGCTGAGATGGCGCCTACACATCCGATAAGGCTTGGTCTTGCGTTGAATTTCT
CTGTGTTTTACTATGAGATACTCAATTCTTCCGACAAAGCTTGTAACATGGCCAA

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1CC90JQ 844 0 0
GGTCGCGTACAAAAACGTGATCGGATCTCTGCGCGC*GCGTGGAGGATCGTCTCCTCGAT
CGAGCAGAAGGAAGAGAGCAGGAAGAACGAGGAGCACGCGGCGCTCGTCAAGAACTACAG
ATCCAAGGTGGAGGCGGAGCTCTCGTCGGTGTGCTCGGGGATCCTCAGGCTCCTGGACTC
GCATCTGATCCCGTCGGCGGCGGGGAGCGAGTCGAAGGTGTTTTACATGAAGATGAAGGG
GGATTACCATAGGTACATGGCGGAGTTTAAGTCTGGCGAGGAGAGGAAAGCTGCTGCTGA
AGATACCATGCTCGCTTACAAGGCTGCTCAGGATATTGCAGCGGCTGAGATGGCGCCTAC
ACATCCGATAAGGCTTGGTCTTGCGTTGAATTTCTCTGTGTTTTACTATGAGATACTCAA
TTCTTCCGACAAAGCTTGTAACATGGCCAAACAGGCATTTGAAGAAGCCATAGCAGAGCT
TGACACACTGGGAGAAGAATCCTACAAAGACAGTACTCTCATTATGCAGTTGCTCAGGGA
CAATCTTACCCTCTGGACCTCTGATATGCAGGAGCAGATGGACGAGGCCTGAGGAGGATC
TTTGATGGAAAAAGGGAGAGAGTTATGCTGCCATGTTTCCGATCTCAAGATCCTTATATA
ACATCGGCTTGAAAAATATTATTCTTTTAAGTGTTTATGATGAGTATGTGCACAGCTTGA
TGATTTGTCTACTTTTATCTTAAAAGTCTAAAACTATGTGCTCTAAAACTTGTAATCTCT
TAAGACTTTGATGAAGCCTTGAAAACCTCTTTATCCTTATACTCAAATTTTTGATTCTCC
TACC

QA 1 844 1 844
DS 



AS 1 2

CO CL5980Contig1 1222 2 2 U
GGATCAAACTAATTAACACGAGAGACCATTCAGAGGTTAAATATTTACATTTAGCATCGT
GTTCTACACGGTTTGATTCTTTTCTAGTGTTTCCAATGGATTACGCAAGAACCGAGTCGT
TTCAAGCTAGTTTAGATTCAGAGCAAGAAGGATCAACGATATCTGAATCTGGAAGCTGTG
ATGCTTATGATCATCCAAGACCGTCTTTCGCCGAGGAATACGGGCTTGTGGAGCTGCTCG
AAGGCGACAAGGCTTACGATCTAATCTACCGAAACTGTAAGTCTGGTCTTGGTGGAGACC
AATGCCAGCTCCTCTCCATCCTCAGAAACGGGTTTGGAACCCTCGGGGCTCGTGCAAACC
TCAAGTCCTTCCAGGTTTTTCAAGAGGCGGTGGAGATGAAACACGTCGGTGAAGAAGGCG
GCGGCGTGGGGAGTAGAGTCAAATACGGTTGGTGCGCCGTCACGAAAACAGAGTTGAAGT
CTGTTTTGGAATACGGGTTTAGCCAGCCGAGTAACGACGGATCTTATGGTCGTGGCTTGT
ATCTCTCCCCGGATAATGCGCTCCTTGAATGTGTGAAGGATTCAGCTGCGGACTCAGAAG
AAGATGGGATGAGATTCTTACTGCTTTCGAGAGTTATACTTGGAAAGTCGGAGGTTGTTC
CACGAGGCTCGACTCAGTCGTGTCCTAGCTCACCAGAGTTTGATTCTGGTGTAGATGATT
TAGCTTCTCCGAAGAAGTATATCGTGTGGAGCACACACATGAACACACACGTCTTGCCTG
AGTTTCTTGTCTGCATCAAAACTCCGTTTAACTTCAACCGTAAGCAAAACCAAAACCAAA
ACCAAAACCAAAACCAATCGCCAAGAAGATTGAGATCGCCATGGATGCCATTTCCTGTAC
TGATCAAAGCATTATCGAAGTTCCTACCTCCTTCTCAGATATTCATCATTCAAAAACACT
ATAGAGATCAGCAAGACATGAGAATCTCGCGGAGCGAACTAATACAACGAGTAAGAAGAG
TAACAGGAGACAAACTGCTTGTTCATATCATCAAAACTTTAGGACATAAAGTACAACAAC
GTTGAAAACTCCATTGCCGAGAGAGATATCACACAGCATCACAAAGGATCAAGACCGGCT
CAGAGATTTGTATGTGTAAAAAACATAGAGGAGTCTGCTGCTGTTTGTCTTTTTCCATGA
TAGTGACGAAATTTTATTCTTT


BQ
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AAGATGGGATGAGATTCTTACTGCTTTCGAGAGTTATACTTGGAAAGTCGGAGGTTGTTC
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TAGCTTC

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AATCTCGCGGAGCGAACTAATACAACGAGTAAGAAGAGTAACAGGAGACAAACTGCTTGT
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ACATAGAGGAGTCTGCTGCTGTTTGTCTTTTTCCATGATAGTGACGAAATTTTATTCTTT

QA 1 720 1 720
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BQ
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BS 8 673 RS1BX69JQ

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ACAGGAATAATGACTTCGTTGGTCTTGAACGGAGGTATTGTCCATGGAGGATTGTACCTA
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TTCACCTTCTCGCTCACCACACTCTCCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTTCCTTGGTCACGA
CCGGAGCAGTCATGGCGATCTTCTCTCCTTCTTTGGTGATCACAGGAGCAGTCATGGCGA
TCTTCTCAGGCTTCTGGTTCTCAGGCTTGCCGAACACGCCTATGTACTTGGCCAAGACCG
TGAAACCGCCGTCTTTGTTGTCTTTGAACTCG

QA 1 452 1 452
DS 

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GTGTTTTTTTGAGACCAAAAGCTATAAACTTTGGATATAGTTTTCATCATTCAACAGGAA
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TCTCGCTCACCACACTCTCCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTTCCTTGGTCACGACCGGAGC
AGTCATGGCGATCTTCTCTCCTTCTTTGGTGATCACAGGAGCAGTCATGGCGATCTTCTC
AGGCTTCTGGTTCTCAGGCTTGCCGAACACGCCTATGTACTTGGCCAAGACCGTGAAACC
GCCGTCTTTGTTGTCTTTGAACTCGGAAGGATCGTAAGTGATCTCGGCCGCAACGGTCGG
TGGATACTCACGGATCTCGTAACCGTCGCCGGATTTAACCACGGTGTATTTGGGTGTCTC
CACCGAGATTTTACCAAATACCATTCCCATTATGTAAAACTTTACCAAAAAGAAAGAGAT
TCTGCCCACAGGTTTTGTTATTTTATCAGTTTGGTTCTTGCGGTTGCGAAACGCAAATGT
GTGTCC

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

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GATAACCGTCGTCACCGGTTACGATTACCCTTCCGCCGTTCACATCGATACGGCCGGGAT
CGATGTTTGTCTCGTCGGAGATTCAGCTTCCATGGTTGTTCATGGCCACGACACCACCCT
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TTCACCTTCAAGGATTACTGCTGCAAAATCCATTGTGGAAGCAGGCATTGCGGTTATGGG
ACATGTTGGCTTGACTCCTCAAGCTATCAGTGTTCTTGGTGGTTTCAGACCACAAGGGAG
AAACATAGCTAGTGCTGTTAAGGTTGTGGAAACTGCAATGGCTTTACAAGAAGCTGGATG
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TCATATTCCAACCATTGGCATAGGAGCTGGCCCTTTCTGCAGTGGACAGGTTTTAGTCTA
TCATGATCTCCTGGGAATGATGCAGCATCCACATCATGCTAAGGTCACACCAAAGTTTTG
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AGTAACTAAACACTCGTTTCCAGGTCCTTCTCACAGCCCTTACAAGATCTCCTCAAACGA
CCTGGACGGATTCTTAAGCGAGTTACAAAAAATGGGATTAGATAAAGCTGCTTCTGATGC
AGCAGCATCTGCTGAAAAGATGGAGTCTTCAGATCCAGTGTAGAAACTCTCAGCATCTTC
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CTGGGTAGCATTTGATGTGATAATAAAAAGAGTAATTCCAGAGTTTACTGCAGGGTTGTA
TCAACGATTAGTAAAATAAGTGCTAGTTTTTACGAAACAAATAAAGGTTTGTCCTCCAAA
TGTAATTAATCCTTTTTGTATTAATAATATAAT


BQ
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10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CZ90TF U 1
AF RS1CZ90JQ C 543
BS 1 622 RS1CZ90TF
BS 623 623 RS1CZ90JQ
BS 624 669 RS1CZ90TF
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BS 770 770 RS1CZ90JQ
BS 771 790 RS1CZ90TF
BS 791 1293 RS1CZ90JQ

RD RS1CZ90TF 791 0 0
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CACCGCCCGGTTTATGAGCAACGTACCGGAGAATACAGTTTACGGAGGACCCAAACCGCA
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GATAACCGTCGTCACCGGTTACGATTACCCTTCCGCCGTTCACATCGATACGGCCGGGAT
CGATGTTTGTCTCGTCGGAGATTCAGCTTCCATGGTTGTTCATGGCCACGACACCACCCT
TCCTATCTCCTTAGATGAGATGCTCGTTCACTGTCGCGCCGTTGCTCGTGGAGCCAAAAG
GCCGCTTCTTGTCGGCGATTTGCCCTTTGGTACGTATGAGTCCAGCACCAAACGGGCTGT
TGATACTGCAGTTAGAGTGTTGAAAGAAGGAGGAATGGATGCTATTAAACTTGAAGGAGG
TTCACCTTCAAGGATTACTGCTGCAAAATCCATTGTGGAAGCAGGCATTGCGGTTATGGG
ACATGTTGGCTTGACTCCTCAAGCTATCAGTGTTCTTGGTGGTTTCAGACCACAAGGGAG
AAACATAGCTAGTGCTGTTAAG*TTGTGGAAACTGCAATGGCTTTACAAGAAGCTGGATG
TTTTTCGGT*GTGTTAGAATGTGTTCCTCCCC*TGTGGCTGCTGCTGCAACCTCTGCTCT
TCATATTCCAACCATTGGCATAG*AGCTGGCCCTTTCTGCAGTGGACAG*TTTTAGTCTA
TCATGATCTC
T

QA 1 790 1 790
DS 

RD RS1CZ90JQ 751 0 0
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ACATAGCTAGTGCTGTTAAGGTTGTGGAAACTGCAATGGCTTTACAAGAAGCTGGATGTT
TTTCGGTTGTGTTAGAATGTGTTCCTCCCCCTGTGGCTGCTGCTGCAACCTCTGCTCTTC
ATATTCCAACCATTGGCATAGGAGCTGGCCCTTTCTGCAGTGGACAGGTTTTAGTCTATC
ATGATCTCCTGGGAATGATGCAGCATCCACATCATGCTAAGGTCACACCAAAGTTTTGCA
AGCAGTACGCTCAAGTAGGAGAAGTGATCAACAGAGCACTGTTGGAGTACAAGGAAGAAG
TAACTAAACACTCGTTTCCAGGTCCTTCTCACAGCCCTTACAAGATCTCCTCAAACGACC
TGGACGGATTCTTAAGCGAGTTACAAAAAATGGGATTAGATAAAGCTGCTTCTGATGCAG
CAGCATCTGCTGAAAAGATGGAGTCTTCAGATCCAGTGTAGAAACTCTCAGCATCTTCAT
TTTGAGTTAGTTAAGACATGGTTTGAAGAAATAAAAAGTCCTTTTGTTAGGAGTTTTGCT
GGGTAGCATTTGATGTGATAATAAAAAGAGTAATTCCAGAGTTTACTGCAGGGTTGTATC
AACGATTAGTAAAATAAGTGCTAGTTTTTACGAAACAAATAAAGGTTTGTCCTCCAAATG
TAATTAATCCTTTTTGTATTAATAATATAAT

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

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ATGAGGACCAAATCCCAATCTTCTGTTAATCTGAAGGTCATATTCACATGTTGCTCAATC
TTGATCTTTCTTGTCATCTTCTTTGCAAGATCAAACATCTCCTCTTCAAAGCCCATCTCC
AAAACCAATCTCTCTCAAGAGAAAGAAGAGCAAAACCAGGCTACACCAGAAGGATGTCCA
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TAATCGCCGCCGTTGATTTTGTGCCGGGAAATATCTCTGCGTTGTGGACCCAGAGTGACT
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ATGGATTCAGTGCATTTACTGAAACGCTATAGTAAAATAGTATTCTTCATATAATTATTT
GAATAAAAATAATGAATTACCAGATATGTTCTTTTTGCC


BQ
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AF RS1FG26TF U 1
AF RS1FG26JQ C 538
BS 1 691 RS1FG26TF
BS 692 692 RS1FG26JQ
BS 693 719 RS1FG26TF
BS 720 720 RS1FG26JQ
BS 721 756 RS1FG26TF
BS 757 757 RS1FG26JQ
BS 758 773 RS1FG26TF
BS 774 819 RS1FG26JQ

RD RS1FG26TF 791 0 0
GGACCACCAACTGCTGTTGTATTGGAAGAACAGCAAACTTAGTAGCTTTCATGTCCTCCT
CAACTTCCTCAATCATTCACATTCTTTTCTCCTACATTATACAATAACTCCTCTATATAT
GCATTATACATTTCTCATTATTTTCAGAACCCTTCATTGTTGCATTTATTCATCGAGAAA
ATGAGGACCAAATCCCAATCTTCTGTTAATCTGAAGGTCATATTCACATGTTGCTCAATC
TTGATCTTTCTTGTCATCTTCTTTGCAAGATCAAACATCTCCTCTTCAAAGCCCATCTCC
AAAACCAATCTCTCTCAAGAGAAAGAAGAGCAAAACCAGGCTACACCAGAAGGATGTCCA
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ACCAGTAACGTCACTCCACAACAGACGTTTTCGTTCACGACGTTAACCGTCCGGTGGAAG
ATGAGTTCTCGGCGACGTTCTTGTGTAAGGTTACATGAGGGAGCAAAACGGGAGGCTAAG
GCATTTCACCATCCCTAGCCATCGGGCTCGTGCTGGCAGACCGTTTTGTCCAGTGGATGT
TAATCGCCGCCGTTGATTTTGTGCCGGGAAATATCTCTGCGTTGTGGACCCAGAGTGACT
ATGCTTAGCTGGCTTTTTGTTTGTTTGTTTT*GCTTTTATCTTGATGATTACGTTTTTT*
ATGGATTCAGTGCATTTACTGAAACGCTATAGTAAA*TAGTATTCTTCATATA
TTATTTGATAAAATATGA

QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1FG26JQ 282 0 0
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TGTTAATCGCCGCCGTTGATTTTGTGCCGGGAAATATCTTTGCGTTGTGGACCCAGAGTG
ACTATGCTTAGCTGGCTTTTTGTTTGTTTGTTTTTGCTTTTATCTTGATGATTACGTTTT
TTTATGGATTCAGTGCATTTACTGAAACGCTATAGTAAAATAGTATTCTTCATATAATTA
TTTGAATAAAAATAATGAATTACCAGATATGTTCTTTTTGCC

QA 1 282 1 282
DS 



AS 1 2

CO CL5984Contig1 1131 2 2 U
ATCATTTCATTCTCCACGGAAAAATGGCGTCCGGTTTAATCGGAAGATTAGTCAGAACCA
AACCGGCGAGATTAACCACGGCGGCTAGGTTAATCCCGTCGCGATGCACATCCTCCTCAA
CCGAAACGGAATCAAAACCTTCGTCCGGCGGCGGAGGAGGGAGAGGATCGAACCTGAAGA
CGTTCCAGATCTACCGGTGGAACCCCGACAGCCCCGGCAAACCGGAGCTCCAAGACTACC
AGATCGATCTCAAGGACTGTGGTCCCATGGTGCTAGACGCCCTGATCAAGATCAAAAACG
AGATGGATCCTTCTCTCACCTTCCGCCGCTCCTGCCGCGAAGGGATCTGCGGCTCGTGCG
CGATGAACATCGACGGGTGCAACGGCCTCGCGTGCCTGACGAAGATCGAAGGAGACGGGG
CCAAGGAGACGACGATCACTCCCTTGCCTCATATGTTTGTGATCAAGGATCTCGTGGTGG
ATATGACGAACTTTTATAATCAGTATAAGAGTATTGAGCCGTGGTTGAAGAGGAAGAGTC
CGGGGGATGAGGCTGGGAAGGAGATTTTGCAGAGTAAGAAGGATGGGGCGAAGCTTGATG
GGATGTATGAGTGTATTCTGTGTGCTTGTTGTAGCACGTCGTGTCCTAGTTACTGGTGGA
ATCCTGAGTCTTACCTTGGCCCTGCCGCTTTGCTACATGCAAACAGGTGGATAAGCGACA
GTCGGGATGAGTACACAAAGGAAAGACTCGAGGCTATTGACGACGAGTTCAAGCTATACC
GTTGCCATACAATCTTGAACTGTGCTCGTGCCTGTCCAAAGGGTTTGAACCCTGGCAAAC
AGATCGCACACATCAAGCAACTTCAGCGTTGAACAACCAACCCCTTTTATGCATTATTGC
GGTGTCCTTGGTTGGGAAACTCATCACCCTTTTTTAAAGTTTGAAGTTAATAATCTTCAG
AGAACCTCCGGATTTTTTTTATTGATTCTTGTATTGTTGTTGCCAAATATCAGCACTTGA
TGAAAGAAAACTCTTTTGCAAGTCCTCCACCCAAAGTAGATGAGCTTTGTGGTTGTATCT
TGCTGAAATTATCTCTTTCTTTAAGTAATAAAACTCCATAAAACTTAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AD69TF U 1
AF RS1AD69JQ C 665
BS 1 737 RS1AD69TF
BS 738 1131 RS1AD69JQ

RD RS1AD69TF 737 0 0
ATCATTTCATTCTCCACGGAAAAATGGCGTCCGGTTTAATCGGAAGATTAGTCAGAACCA
AACCGGCGAGATTAACCACGGCGGCTAGGTTAATCCCGTCGCGATGCACATCCTCCTCAA
CCGAAACGGAATCAAAACCTTCGTCCGGCGGCGGAGGAGGGAGAGGATCGAACCTGAAGA
CGTTCCAGATCTACCGGTGGAACCCCGACAGCCCCGGCAAACCGGAGCTCCAAGACTACC
AGATCGATCTCAAGGACTGTGGTCCCATGGTGCTAGACGCCCTGATCAAGATCAAAAACG
AGATGGATCCTTCTCTCACCTTCCGCCGCTCCTGCCGCGAAGGGATCTGCGGCTCGTGCG
CGATGAACATCGACGGGTGCAACGGCCTCGCGTGCCTGACGAAGATCGAAGGAGACGGGG
CCAAGGAGACGACGATCACTCCCTTGCCTCATATGTTTGTGATCAAGGATCTCGTGGTGG
ATATGACGAACTTTTATAATCAGTATAAGAGTATTGAGCCGTGGTTGAAGAGGAAGAGTC
CGGGGGATGAGGCTGGGAAGGAGATTTTGCAGAGTAAGAAGGATGGGGCGAAGCTTGATG
GGATGTATGAGTGTATTCTGTGTGCTTGTTGTAGCACGTCGTGTCCTAGTTACTGGTGGA
ATCCTGAGTCTTACCTTGGCCCTGCCGCTTTGCTACATGCAAACAGGTGGATAAGCGACA
GTCGGGATGAGTACACA

QA 1 737 1 737
DS 

RD RS1AD69JQ 467 0 0
TGAGTTTTACCTTGGCCCTGCCGCTTTGCTACATGCAAACAGGTGGATAAGCGACAGTCG
GGATGAGTACACAAAGGAAAGACTCGAGGCTATTGACGACGAGTTCAAGCTATACCGTTG
CCATACAATCTTGAACTGTGCTCGTGCCTGTCCAAAGGGTTTGAACCCTGGCAAACAGAT
CGCACACATCAAGCAACTTCAGCGTTGAACAACCAACCCCTTTTATGCATTATTGCGGTG
TCCTTGGTTGGGAAACTCATCACCCTTTTTTAAAGTTTGAAGTTAATAATCTTCAGAGAA
CCTCCGGATTTTTTTTATTGATTCTTGTATTGTTGTTGCCAAATATCAGCACTTGATGAA
AGAAAACTCTTTTGCAAGTCCTCCACCCAAAGTAGATGAGCTTTGTGGTTGTATCTTGCT
GAAATTATCTCTTTCTTTAAGTAATAAAACTCCATAAAACTTAAACC

QA 1 467 1 467
DS 



AS 1 2

CO CL5985Contig1 895 2 2 U
TTTGATCGAAGAGAGTTAAGATCTAAGGGAAGAAGATGGAGAACAGACAATCGAGCAAGA
ACTCGGTCCATGTCTTCTTATTGCTTACCTTGATACTACTGAGTTCGATCAAGCGAATCT
CGTCGCTCTCTGTGACGGTCAGCGACGATGAATGCGTCCAAGAGTATGTCCTTTACGAAG
GAGACACCGTCTCCGGTAACTTCGTCGTCGTCGACCATGAAATCTTCTGGGGATCAGACC
ATCCCGGTTTGGATTTCACGGTGACGTCTCCTGCTGGGAACATTGTACAGACGTTGAAGG
GGACATCAGGAGATAAGTTTGAGTTTAAGGCACCGAGAAGTGGAATGTACAAGTTCTGTT
TCCATAATCCTTACTCTACTCCTGAAACTGTCTCCTTCTACATTCACGTTGGTCATATCC
CCAACGAGCATGACTTAGCCAAAGATGAACATTTGGACCCGGTGAATGTTAAGATAGCTG
AGCTGAGAGAAGCTTTGGAGTCTGTTGTTGCTGAGCAAAAGTACTTGAAAGCACGTGATA
CTCGTCACCGTCATACTAATGAGAGCACGAGAAAGCGAGTGATATTCTACACAGTAGGAG
AGTACATATTCCTGGCAGCAGCTAGTGGTCTTCAGGTTCTCTACATCCGCAAGCTCTTCA
GCAAGTCTGTTGCATACAACAGGGTTTGAACCATCACCAAAACCAAAACCCCATCAAGGT
TGTTATGTTAGAACTGATGAGAACACAAGAGTGGTAGTGTTAATTAAGAGCTTTAATAGC
TAAAAAGACTCCCTTTTCTACAATCTTTCATGGGCTTCAGTTATACTTCAGTTATACATG
AAGAACTTGATAAAAGCTTATATTCTTATTCATCAATCTTATCTCCTCTTGGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DG45TF U 1
AF RS1DG45JQ C 97
BS 1 542 RS1DG45TF
BS 543 895 RS1DG45JQ

RD RS1DG45TF 542 0 0
TTTGATCGAAGAGAGTTAAGATCTAAGGGAAGAAGATGGAGAACAGACAATCGAGCAAGA
ACTCGGTCCATGTCTTCTTATTGCTTACCTTGATACTACTGAGTTCGATCAAGCGAATCT
CGTCGCTCTCTGTGACGGTCAGCGACGATGAATGCGTCCAAGAGTATGTCCTTTACGAAG
GAGACACCGTCTCCGGTAACTTCGTCGTCGTCGACCATGAAATCTTCTGGGGATCAGACC
ATCCCGGTTTGGATTTCACGGTGACGTCTCCTGCTGGGAACATTGTACAGACGTTGAAGG
GGACATCAGGAGATAAGTTTGAGTTTAAGGCACCGAGAAGTGGAATGTACAAGTTCTGTT
TCCATAATCCTTACTCTACTCCTGAAACTGTCTCCTTCTACATTCACGTTGGTCATATCC
CCAACGAGCATGACTTAGCCAAAGATGAACATTTGGACCCGGTGAATGTTAAGATAGCTG
AGCTGAGAGAAGCTTTGGAGTCTGTTGTTGCTGAGCAAAAGTACTTGAAAGCACGTGATA
CT

QA 1 542 1 542
DS 

RD RS1DG45JQ 799 0 0
TACTGAGTTCGATCAAGCGAATCTCGTCGCTCTCTGTGACGGTCAGCGACGATGAATGCG
TCCAAGAGTATGTCCTTTACGAAGGAGACACCGTCTCCGGTAACTTCGTCGTCGTCGACC
ATGAAATCTTCTGGGGATCAGACCATCCCGGTTTGGATTTCACGGTGACGTCTCCTGCTG
GGAACATTGTACAGACGTTGAAGGGGACATCAGGAGATAAGTTTGAGTTTAAGGCACCGA
GAAGTGGAATGTACAAGTTCTGTTTCCATAATCCTTACTCTACTCCTGAAACTGTCTCCT
TCTACATTCACGTTGGTCATATCCCCAACGAGCATGACTTAGCCAAAGATGAACATTTGG
ACCCGGTGAATGTTAAGATAGCTGAGCTGAGAGAAGCTTTGGAGTCTGTTGTTGCTGAGC
AAAAGTACTTGAAAGCACGTGATACTCGTCACCGTCATACTAATGAGAGCACGAGAAAGC
GAGTGATATTCTACACAGTAGGAGAGTACATATTCCTGGCAGCAGCTAGTGGTCTTCAGG
TTCTCTACATCCGCAAGCTCTTCAGCAAGTCTGTTGCATACAACAGGGTTTGAACCATCA
CCAAAACCAAAACCCCATCAAGGTTGTTATGTTAGAACTGATGAGAACACAAGAGTGGTA
GTGTTAATTAAGAGCTTTAATAGCTAAAAAGACTCCCTTTTCTACAATCTTTCATGGGCT
TCAGTTATACTTCAGTTATACATGAAGAACTTGATAAAAGCTTATATTCTTATTCATCAA
TCTTATCTCCTCTTGGATT

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 2

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AAGAACTAAAAAGAAAAACCACAAAAGATAATTGTACATAATTAAAAATAATAATTGTAG
AAAAATGAATGACTTATTCTCAAATTCATTCAAGAGGAACCAGGCTCAATTTGGCGATGT
CGAGGCAGGTCAAGAAACGATGAACCTCGACAAATTCTTCGAGGACGTCGAGAATGTGAA
GGATGACATGAAAAGAATCGAGAGTCTTTATAAGAAGCTTCAAGACTCTAACGAAGAATG
CAAGACGGTGCACAATGCCAAGAAGGTGAAGGAGCTACGAGCTAAGATGGATGGAGACAT
AGGTCAAGTCCTTAAGAGGGTCAAAATGATTAAGCAGAAGCTCGAAGCCCTTGAGAAAGC
CAACGCTAATAGCCGTAACGTCCCTGGTTGTGGGCCCGGTTCGTCTACGGATAGGACTCG
GTCTTCTGTGGTTAGTGGTCTCGGGAAGAAGCTCAAGGACTTGATGGATAGTTTCCAAGG
TCTACGTGCACGAATGAACGATGAGTATAAAGAAACCGTAGAGCGCAGGTATTTCACGAT
AACAGGAGAACAAGCGGACGAGCAAACAATAGATAACCTGATTGCAAGCGGTGAGAGTGA
GAATTTTCTCCAAAAGCTATTCAGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D949TF U 1
AF RS1CG68TF U 1
BS 1 685 RS1CG68TF

RD RS1D949TF 450 0 0
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AAAAATGAATGACTTATTCTCAAATTCATTCAAGAGGAACCAGGCTCAATTTGGCGATGT
CGAGGCAGGTCAAGAAACGATGAACCTCGACAAATTCTTCGAGGACGTCGAGAATGTGAA
GGATGACATGAAAAGAATCGAGAGTCTTTATAAGAAGCTTCAAGACTCTAACGAAGAATG
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CAACGCTAATAGCCGTAACGTCCCTGGTTG

QA 1 450 1 450
DS 

RD RS1CG68TF 685 0 0
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AAGAACTAAAAAGAAAAACCACAAAAGATAATTGTACATAATTAAAAATAATAATTGTAG
AAAAATGAATGACTTATTCTCAAATTCATTCAAGAGGAACCAGGCTCAATTTGGCGATGT
CGAGGCAGGTCAAGAAACGATGAACCTCGACAAATTCTTCGAGGACGTCGAGAATGTGAA
GGATGACATGAAAAGAATCGAGAGTCTTTATAAGAAGCTTCAAGACTCTAACGAAGAATG
CAAGACGGTGCACAATGCCAAGAAGGTGAAGGAGCTACGAGCTAAGATGGATGGAGACAT
AGGTCAAGTCCTTAAGAGGGTCAAAATGATTAAGCAGAAGCTCGAAGCCCTTGAGAAAGC
CAACGCTAATAGCCGTAACGTCCCTGGTTGTGGGCCCGGTTCGTCTACGGATAGGACTCG
GTCTTCTGTGGTTAGTGGTCTCGGGAAGAAGCTCAAGGACTTGATGGATAGTTTCCAAGG
TCTACGTGCACGAATGAACGATGAGTATAAAGAAACCGTAGAGCGCAGGTATTTCACGAT
AACAGGAGAACAAGCGGACGAGCAAACAATAGATAACCTGATTGCAAGCGGTGAGAGTGA
GAATTTTCTCCAAAAGCTATTCAGA

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL5987Contig1 525 2 4 U
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AGCATGATGCTCAATGTATACACTCACCCCCCGTTGAAAGTAGTGGCTCGAATAAAAAAT
AATGCGCCCGTTCTGTTTTATTATTCACAATGTCTGATGAAAAAA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1EJ36TF U 1
AF RS1GZ28TF U 46
BS 1 258 RS1EJ36TF
BS 259 259 RS1GZ28TF
BS 260 499 RS1EJ36TF
BS 500 525 RS1GZ28TF

RD RS1EJ36TF 499 0 0
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AACATACACGTCTTGATTATCTTTGAGGAGAACACAAGCCATGGATTCTTTAAGAGGGCA
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AGAGTATCGGTCCCGTCTTGAAGAAGAGTATCAGACACAAATTTCTGGGACGGAACAAGA
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TAGTTCAAAGGTCTCAAAGGAGATCGTGAAGATGCTCATCAAGTATGTTACCACTACTGG
AGCATGATGCTCAATGTATACACTCACCCCCCGTTGAAAGTAGTGGCTCGAATAAAAAAT
AATGCGCCCGTTCTGTTTT

QA 1 499 1 499
DS 

RD RS1GZ28TF 480 0 0
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GAACCTTAAGGAATCTAGTTCAAAGGTCTCAAAGGAGATTGTGAAGATGCTCATCAAGTA
TGTTACCACTACTGGAGCATGATGCTCAATGTATACACTCACCCCCCGTTGAAAGTAGTG
GCTCGAATAAAAAATAATGCGCCCGTTCTGTTTTATTATTCACAATGTCTGATGAAAAAA

QA 1 480 1 480
DS 



AS 1 2

CO CL5988Contig1 894 2 2 U
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AGATGATGTCTTCCTCCACCTCCAGAAACTCCTATCTCTCTCGCCGCAACTCCTCCTCCG
CCTCCTCGTCTTCTCCCTCCGTGAGATCCAACCATCTCAGACGAGATCCTCACGCTGCCG
ATCACTCCAGGATCAGTTTCTGCTACGGCGGCGGAGGAGGGAACGACGCGACGACGACGG
TTCACGATTACGCCTTCGCGGCGTCCGATTCGATGATGGATGTCGATCGGAGGAGCAACG
GAGACAGGAACAGCGTCAACGGAGGAGGAGGAGGGAGGAAGAGCGTGGACGATGTCTGGA
GAGAGATCGTGTCGGGAGAGAAGAAGACGGTCATGAAGGAGGAGGCGCAGGATGAGTACG
TGATGACGCTTGAGGACTTTTTAGCGAAAGCGGCGGAGATGGATGATAATGATGATGAAA
TCGATGTTAAGATTCCGCCGGAGAGACTCGACTACGGAGATCTCTCCGGTACATTCGATT
ATCTAATGATGCCTCAGCAGCAGCAGCAGCATGATCAGGTTGAAGGATCGACGAGGAGGA
AGCTGGAGCGAGAGAATGGACAGCTTTTGAAGGAGATTGAAGAGAAGACCAGAGAGAGAT
ACAGGAACCTTATGGAGCAATTGATTCCTGTTGACGATGAGAAACGAAGACCATCGTCTT
CTTCGTCGAGGTCGTCTTTAAGCAGGAGCTACTCCTTGGAATGGTAAAAAAAGAGTTATT
TTAACTAAGTCTTTTGGTAAGTGGTTAAATAATGATTGATGTATGTAAATAAAAACATAT
GGACTTGATTCCCTTATATTACTACTACGTAATCGATATAGTAAGGTGATGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1B584TF U 1
AF RS1B584JQ C 129
BS 1 574 RS1B584TF
BS 575 894 RS1B584JQ

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GGAATCTTCTTCTATCAACATCGAGAAACACGTTTCCGATCACAGAGATGGCATCCTTCA
AGATGATGTCTTCCTCCACCTCCAGAAACTCCTATCTCTCTCGCCGCAACTCCTCCTCCG
CCTCCTCGTCTTCTCCCTCCGTGAGATCCAACCATCTCAGACGAGATCCTCACGCTGCCG
ATCACTCCAGGATCAGTTTCTGCTACGGCGGCGGAGGAGGGAACGACGCGACGACGACGG
TTCACGATTACGCCTTCGCGGCGTCCGATTCGATGATGGATGTCGATCGGAGGAGCAACG
GAGACAGGAACAGCGTCAACGGAGGAGGAGGAGGGAGGAAGAGCGTGGACGATGTCTGGA
GAGAGATCGTGTCGGGAGAGAAGAAGACGGTCATGAAGGAGGAGGCGCAGGATGAGTACG
TGATGACGCTTGAGGACTTTTTAGCGAAAGCGGCGGAGATGGATGATAATGATGATGAAA
TCGATGTTAAGATTCCGCCGGAGAGACTCGACTACGGAGATCTCTCCGGTACATTCGATT
ATCTAATGATGCCTCAGCAGCAGCAGCAGCATGA

QA 1 574 1 574
DS 

RD RS1B584JQ 766 0 0
TCTTCTCCCTCCGTGAGATCCAACCATCTCAGACGAGATCCTCACGCTGCCGATCACTCC
AGGATCAGTTTCTGCTACGGCGGCGGAGGAGGGAACGACGCGACGACGACGGTTCACGAT
TACGCCTTCGCGGCGTCCGATTCGATGATGGATGTCGATCGGAGGAGCAACGGAGACAGG
AACAGCGTCAACGGAGGAGGAGGAGGGAGGAAGAGCGTGGACGATGTCTGGAGAGAGATC
GTGTCGGGAGAGAAGAAGACGGTCATGAAGGAGGAGGCGCAGGATGAGTACGTGATGACG
CTTGAGGACTTTTTAGCGAAAGCGGCGGAGATGGATGATAATGATGATGAAATCGATGTT
AAGATTCCGCCGGAGAGACTCGACTACGGAGATCTCTCCGGTACATTCGATTATCTAATG
ATGCCTCAGCAGCAGCAGCAGCATGATCAGGTTGAAGGATCGACGAGGAGGAAGCTGGAG
CGAGAGAATGGACAGCTTTTGAAGGAGATTGAAGAGAAGACCAGAGAGAGATACAGGAAC
CTTATGGAGCAATTGATTCCTGTTGACGATGAGAAACGAAGACCATCGTCTTCTTCGTCG
AGGTCGTCTTTAAGCAGGAGCTACTCCTTGGAATGGTAAAAAAAGAGTTATTTTAACTAA
GTCTTTTGGTAAGTGGTTAAATAATGATTGATGTATGTAAATAAAAACATATGGACTTGA
TTCCCTTATATTACTACTACGTAATCGATATAGTAAGGTGATGGTC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

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GAAGGACTGGAAACTTCTCAATGAGCGATTCTCAATCTCTCGAAGAAGCGTGGTCAGCTT
AAACAGGCTGTGCAATCCATGGTGCAGCAAGCAATGCAGTATATCGATCAGACACCAGAC
ATAGAAACTCGGATTGAGCTTATCAAGACGCTGAACAATGTTTCTGCTGGAAAGATATAT
GTTGAAATTGAGAGGGCTCGGCTCACAAGGAAGCTTGCTCAATGCAACTTTGGAAGATAA
GAATTTATCAGAGATTCCTGATTTCAAGATGCTTCTAAAACAGGTAGTGACAATGGAGGT
TATTCAGTGGACCTCTCTCTGGAACAAATACAAGGATGAGTTTGAGAAAGAAAGAACCAT
GGTTGGAGGTTCTTTGGGTGACAAGGCAGGTGAAGATCTGAAACTGAGAATCATTGAACA
TAATATACTCGTTGTCTCAAAGTACTACTCAAGGATAACCTTAAAGAGACTTGCAGAGCT
TTTATGTCTGAGCATTGAGGAGGCGGAGAAGCATCTCTCGGAGATGGTCGTGTCGAAAGC
ACTGATTGCAAAAATAGACAGACCATCAGGGATTGTGTGCTTCCAGGTCTCAAAGGACAG
CAACGAGATTCTAAACTCGTGGGCAGTGAATCTGGAGAAGCTCTTAGATCTTGTTGAAAA
GAGTTGCCACCAAATTCACAAGGAAACCATGGTTCACAAAGCCGCACTGAGACCTTGAAC
ATCCATCTGCTCTTCCATGAAACTTTTCAGGATCTTCGTTGAGTTTATTAGCATCTTTGG
GTGGAAAAAGACTCCAAACACTTGTTTCCTTGTCAAGACTTCAGATATGTAGTATGGTTT
TGTACACTAGTTGGTTTTATCAGCAATTTGTTTTTCAAAGATTTTTGGTGAATTATTTAT
TTTTAAGATTAAGAAACACATAGAGTGTATTCAATCTATAATTTCAAGTGATTTGATT


BQ
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AF RS1FO47TF U 1
AF RS1FO47JQ C 323
BS 1 682 RS1FO47TF
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RD RS1FO47TF 789 0 0
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AAACAGGCTGTGCAATCCATGGTGCAGCAAGCAATGCAGTATATCGATCAGACACCAGAC
ATAGAAACTCGGATTGAGCTTATCAAGACGCTGAACAATGTTTCTGCTGGAAAGATATAT
GTTGAAATTGAGAGGGCTCGGCTCACAAGGAAGCTTGCTCAATGCAACTTTGGAAGATAA
GAATTTATCAGAGATTCCTGATTTCAAGATGCTTCTAAAACAGGTAGTGACAATGGAGGT
TATTCAGTGGACCTCTCTCTGGAACAAATACAAGGATGAGTTTGAGAAAGAAAGAACCAT
GGTTGGAGGTTCTTTGGGTGACAAGGCAGGTGAAGATCTGAAACTGAGAATCATTGAACA
TAATATACTCGTTGTCTCAAAGTACTACTCAAGGATAACCTTAAAGAGACTTGCAGAGCT
TTTATGTCTGAGCATTGAGGAGGCGGAGAAGCATCTCTCGGAGATGGTCGTGTCGAAAGC
ACTGATTGCAAAAATAGACAGACCATCAGGGATTGTGTGCTTCCAGGTCTCAAAGGACAG
CAACGAGATTCTAAACTCGTGGGCAGTGAATCTGGAGAAGCTCTTAGATCTTGTTGAAAA
GAGTTGCCACCAAATTCACAAG*AAACCATGGTTCACAAAGCCGCACTGAGACCTTGAAC
ATCCATCTGCTCTTCCATGAAACTTTTCAG*ATCTTCGTTGAGTTTATTAGCATCTTTGG
GTGGAAAAA

QA 1 789 1 789
DS 

RD RS1FO47JQ 636 0 0
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TACTACTCAAGGATAACCTTAAAGAGACTTGCAGAGCTTTTATGTTTGAGCATTGAGGAG
GCGGAGAAGCATCTTTCGGAGATGGTCGTGTCGAAAGCACTGATTGCAAAAATAGACAGA
CCATCAGGGATTGTGTGCTTCCAGGTTTCAAAGGACAGCAACGAGATTTTAAACTCGTGG
GCAGTGAATTTGGAGAAGCTTTTAGATCTTGTTGAAAAGAGTTGCCACCAAATTCACAAG
GAAACCATGGTTCACAAAGCCGCACTGAGACCTTGAACATCCATTTGCTTTTCCATGAAA
CTTTTCAGGATTTTCGTTGAGTTTATTAGCATCTTTGGGTGGAAAAAGACTCCAAACACT
TGTTTCCTTGTCAAGACTTCAGATATGTAGTATGGTTTTGTACACTAGTTGGTTTTATCA
GCAATTTGTTTTTCAAAGATTTTTGGTGAATTATTTATTTTTAAGATTAAGAAACACATA
GAGTGTATTCAATCTATAATTTCAAGTGATTTGATT

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

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TTTTTAGAATTTTGCTTTGGATATTTGGTTACTTTTGCAACCACCAGTTTTAGGAATCAT
TCGTGTTAGGCAGCAGCCATGTTCTATGGCACAGCATTATGGGATCCTTGGCTTATCGTT
GGCCAGATTATATGCCTTCAGTGCTCCTTCTATCTCTCCCTTGGAGTCTTCATGGTTCTC
TTTCTTGGCCTTCGTGTTCCTCGCCTTAGCCTTGTCTACTTCTTCGATTACGCCACTCTC
ACCACTTCTACCCTCACCGGCTGGTGTGTCATTGCCTCTTTCCTCTTCACTTCCCTTGCA
GTGGCTGTGTACATGATATTTGTGGTGGAGCGAGCGCGGAAATACCTGGATTTCTCTGCA
ACTCTCTACATCATACATCTCTACTTGTGCATCCTCAATGGTGGATGGCCTTCCTCTATG
GCATGGTGGGTTGTTAATGGCACGGGGCTTGCTGTTATGGCGTTGCTAGCTGAGTACCTC
TGCATTAAACGCGAGCAGCGTGAGATTCCTATGGATCGTTTCCATTCAAGGGTTTGATGA
ACAAGTGATGTATGTACAGAGATGAGAATTGGGCAAAAGAAGTGTTTGGACTACT


BQ
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AF RS1FX57TF U 1
AF RS1FX57JQ C 287
BS 1 526 RS1FX57TF
BS 527 595 RS1FX57JQ

RD RS1FX57TF 526 0 0
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TCGTGTTAGGCAGCAGCCATGTTCTATGGCACAGCATTATGGGATCCTTGGCTTATCGTT
GGCCAGATTATATGCCTTCAGTGCTCCTTCTATCTCTCCCTTGGAGTCTTCATGGTTCTC
TTTCTTGGCCTTCGTGTTCCTCGCCTTAGCCTTGTCTACTTCTTCGATTACGCCACTCTC
ACCACTTCTACCCTCACCGGCTGGTGTGTCATTGCCTCTTTCCTCTTCACTTCCCTTGCA
GTGGCTGTGTACATGATATTTGTGGTGGAGCGAGCGCGGAAATACCTGGATTTCTCTGCA
ACTCTCTACATCATACATCTCTACTTGTGCATCCTCAATGGTGGATGGCCTTCCTCTATG
GCATGGTGGGTTGTTAATGGCACGGGGCTTGCTGTTATGGCGTTGCTAGCTGAGTACCTC
TGCATTAAACGCGAGCAGCGTGAGATTCCTATGGATCGTTTCCATT

QA 1 526 1 526
DS 

RD RS1FX57JQ 309 0 0
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TGGATTTTTTTGCAACTCTCTACATCATACATCTCTACTTGTGCATCCTCAATGGTGGAT
GGCCTTCCTTTATGGCATGGTGGGTTGTTAATGGCACGGGGCTTGCTGTTATGGCGTTGC
TAGCTGAGTACCTTTGCATTAAACGCGAGCAGCGTGAGATTCCTATGGATCGTTTCCATT
CAAGGGTTTGATGAACAAGTGATGTATGTACAGAGATGAGAATTGGGCAAAAGAAGTGTT
TGGACTACT

QA 1 309 1 309
DS 



AS 1 2

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AATCACCACGTCTTCGATTCTCGTCTGTATCACCTCGTTTCTCAGCAGCTTCTAATCACC
ATAGACCTTCGTTGCATTTAGCTGGGAAGCTTATAAGCCGTCACAAAGATGCTGCCTTCA
CTAGCTTATCAAGTTCGTGTATGCGGTCGAAACTTGTTTCAACTAATTTCAGAAAAATCT
CGATCCGGGCATGTTCTCAGGTTGGTGCTGCTGGTTCTGATCCAGTTCTGGATAGAATCT
CGCGTTTTCAGAATGCTTGCTGGAGGTTTCTTAGGCCACATACGATCCGTGGAACAGCTT
TAGGATCAACTGCCTTGGTGGCAAGAGCTTTGATAGAGAACACTCATCTCATCAAATGGA
GTCTCGTTCTCAAGGCACTTTCAGGTCTTCTTGCTCTTATATGTGGAAATGGTTATATTG
TTGGCATCAATCAGATCTACGACATTGGAATTGACAAAGTGAACAAGCCATACTTGCCAA
TAGCAGCAGGAGATCTCTCAGTGCAGTCTGCGTGGCTATTGGTGATATTCTTTGCAATTG
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GCCTCTTTCTGGGGACCATCTATTCTGTTCCACCACTTAGAATGAAAAGATTTCCAGTTG
CAGCTTTTCTTATAATTGCCACGGTAAGAGGTTTCCTTCTTAATTTTGGTGTGTACCATG
CTACAAGAGCTGCCCTTGGACTTTCGTTTCAGTGGAGTGCACCTGTGGCTTTCATCACGT
CTTTTGTGACACTGTTTGCACTGGTCATTGCTATTACAAAAGATCTCCCTGATGTTGAAG
GAGATCGCAAGTTTCAAATATCAACGCTAGCAACAAAGCTTGGAGTGAGGAACATTGCGT
TCCTCGGTTCTGGACTTCTGCTAGTGAACTATGTTTCTGCCATATCTCTAGCTTTCTACA
TGCCTCAGGTTTTCAGAGGTAGCTTGATGATTCCTGCACATATGATCTTGGCTTCATGCT
TGATTTTCCAGACATGGATACTAGAAAAAGCAAACTACACAAAGGAAGCTATTGCAGGAT
ATTACCGGTTTATATGGAATCTTTTCTACGCAGAGTATCTGTTATTCCCATTCTTCTAGC
TTTCATGGTGAAACCTTTCCTCTTCCTCTTTTTGTTGGTTGGAGTCAAAATCAGTTTGTT
CATGTACATACTAACAGGATATATGTCCTTTTGAATTTTGATATCTTGCAATGATAATGA
TTGTACCAATACCAATCC


BQ
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AF RS1C046TF U 1
AF RS1C046JQ C 513
BS 1 707 RS1C046TF
BS 708 708 RS1C046JQ
BS 709 734 RS1C046TF
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RD RS1C046TF 745 0 0
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AATCACCACGTCTTCGATTCTCGTCTGTATCACCTCGTTTCTCAGCAGCTTCTAATCACC
ATAGACCTTCGTTGCATTTAGCTGGGAAGCTTATAAGCCGTCACAAAGATGCTGCCTTCA
CTAGCTTATCAAGTTCGTGTATGCGGTCGAAACTTGTTTCAACTAATTTCAGAAAAATCT
CGATCCGGGCATGTTCTCAGGTTGGTGCTGCTGGTTCTGATCCAGTTCTGGATAGAATCT
CGCGTTTTCAGAATGCTTGCTGGAGGTTTCTTAGGCCACATACGATCCGTGGAACAGCTT
TAGGATCAACTGCCTTGGTGGCAAGAGCTTTGATAGAGAACACTCATCTCATCAAATGGA
GTCTCGTTCTCAAGGCACTTTCAGGTCTTCTTGCTCTTATATGTGGAAATGGTTATATTG
TTGGCATCAATCAGATCTACGACATTGGAATTGACAAAGTGAACAAGCCATACTTGCCAA
TAGCAGCAGGAGATCTCTCAGTGCAGTCTGCGTGGCTATTGGTGATATTCTTTGCAATTG
CAGGGCTGTTAGTTGTAGGATTCAACTTCGGTCCATTCATTACATGCCTATACTCTCTTG
GCCTCTTTCTGGGGACCATCTATTCTGTTCCACCACTTAGAATGAAA*GATTTCCAGTTG
CAGCTTTTCTTATA*TTGCCACGGT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1C046JQ 826 0 0
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TGGCTATTGGTGATATTCTTTGCAATTGCAGGGCTGTTAGTTGTAGGATTCAACTTCGGT
CCATTCATTACATGCCTATACTCTCTTGGCCTCTTTCTGGGGACCATCTATTCTGTTCCA
CCACTTAGAATGAAAAGATTTCCAGTTGCAGCTTTTCTTATAATTGCCACGGTAAGAGGT
TTCCTTCTTAATTTTGGTGTGTACCATGCTACAAGAGCTGCCCTTGGACTTTCGTTTCAG
TGGAGTGCACCTGTGGCTTTCATCACGTCTTTTGTGACACTGTTTGCACTGGTCATTGCT
ATTACAAAAGATCTCCCTGATGTTGAAGGAGATCGCAAGTTTCAAATATCAACGCTAGCA
ACAAAGCTTGGAGTGAGGAACATTGCGTTCCTCGGTTCTGGACTTCTGCTAGTGAACTAT
GTTTCTGCCATATCTCTAGCTTTCTACATGCCTCAGGTTTTCAGAGGTAGCTTGATGATT
CCTGCACATATGATCTTGGCTTCATGCTTGATTTTCCAGACATGGATACTAGAAAAAGCA
AACTACACAAAGGAAGCTATTGCAGGATATTACCGGTTTATATGGAATCTTTTCTACGCA
GAGTATCTGTTATTCCCATTCTTCTAGCTTTCATGGTGAAACCTTTCCTCTTCCTCTTTT
TGTTGGTTGGAGTCAAAATCAGTTTGTTCATGTACATACTAACAGGATATATGTCCTTTT
GAATTTTGATATCTTGCAATGATAATGATTGTACCAATACCAATCC

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 2

CO CL5992Contig1 1243 2 6 U
GGTAGAAAGTTTGGAACTTTATGGAACTTGTTTGCGAAAAGAAGCTTCAACAAGCAAACA
CCACCTTTTGCTCGACGACGATCATCAACTGGGATGATTTAGTTTGCCCCATTTGCTTGG
ACTCCCCTCACAACGCCGTCCTCCTCCAGTGCTCTTCTTACCAAAACGGATGCCGTGCCT
TCGTCTGCAACACTGATCACCTCCACTCCAACTGCTTAGATCGTTTCATCACCGCCTGTG
GAACAACAACAGACTCCCCTCCTCCTCCAGCTCCTGCTCCTCCTGATGGTGAAACACTGT
CTAAAGTTCTGGAAGAGAACTGCAAACCGGTGTGTCCACTCTGCAGAGGAGAGGTCACCG
GGTGGGTGGTTGTGGAAGAAGCTCGTGTTCTTCTCGACGAGAAGAAACGTTCTTGCGAGG
AACACCGGTGCAGGTTCGCCGGTACTTACGCCGAGCTTCGTGAACACGCTAAGTCAGAGC
ATCCGGACTCTCGCCCTTCCAAGATTGATCCGGCGAGGAAGCTTGACTGGGAGAATTTCC
AGCAGTCGTCTGAGATTATCGACGTGCTGAGCACGATTCACTCTGAGGTTCCGAGAGGTG
TGGTGTTAGGAGACTATGTGATTGAGTATGGAGATGATGATGGCACTGGAGATGAGTTAG
AGGATGTTCCTGGCAATGCAGGGAGCAGCTGGTGGACTTCTTGTATTTTGTATAAAGTGT
TTGATAATAAGGAATGCGAGGAGGAATCGAAGAAGGTCGAGGATGATGATTAATGAGAGT
AGGAGAGGGAGTCGCCGCTCTAGCTATGATAATTCAAATTCTGATGACAGCAGCAGCTCA
GTAGCGTCGATAGAGTTCCCTGTGTATAGAGTAGATGAGATCGATGATGAGTTCATCACC
ACCACCACAAGTGGAATTAACACAAGTAGCGCTGTGCATCAAAGGTTCTCTCTGGTTTAC
AATTCAAGAAGGCGTCGTTCTCGCTTCTATGCAAATTAGGGTATCAGTGCTGTCTCTACC
TGTTCTATCTTCTTGGAAGCAAATGAAGCAGACCAGCCTACTCGTAGCCCAGTGTTGTTC
TTGGTTTTGAACCTCTCTCTTCTTTTCTCGTCTTTCAATACAAATTTTATTTTAGGTTTG
TTTGTCTTGTGACATGTACTGTTCCTTGTACAAAAACCATAAACAGGAAAAAAAACCAAA
AAAGCTTTTTTTGGATATTGTACCATGTTTCGTTCGTTGTCCC


BQ
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AF RS1CI96TF U 1
AF RS1CI96JQ C 514
BS 1 682 RS1CI96TF
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ACTCCCCTCACAACGCCGTCCTCCTCCAGTGCTCTTCTTACCAAAACGGATGCCGTGCCT
TCGTCTGCAACACTGATCACCTCCACTCCAACTGCTTAGATCGTTTCATCACCGCCTGTG
GAACAACAACAGACTCCCCTCCTCCTCCAGCTCCTGCTCCTCCTGATGGTGAAACACTGT
CTAAAGTTCTGGAAGAGAACTGCAAACCGGTGTGTCCACTCTGCAGAGGAGAGGTCACCG
GGTGGGTGGTTGTGGAAGAAGCTCGTGTTCTTCTCGACGAGAAGAAACGTTCTTGCGAGG
AACACCGGTGCAGGTTCGCCGGTACTTACGCCGAGCTTCGTGAACACGCTAAGTCAGAGC
ATCCGGACTCTCGCCCTTCCAAGATTGATCCGGCGAGGAAGCTTGACTGGGAGAATTTCC
AGCAGTCGTCTGAGATTATCGACGTGCTGAGCACGATTCACTCTGAGGTTCCGAGAGGTG
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CGATTCACTCTGAGGTTCCGAGAGGTGTGGTGTTAGGAGACTATGTGATTGAGTATGGAG
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GGACTTCTTGTATTTTGTATAAAGTGTTTGATAATAAGGAATGCGAGGAGGAATCGAAGA
AGGTCGAGGATGATGATTAATGAGAGTAGGAGAGGGAGTCGCCGCTCTAGCTATGATAAT
TCAAATTCTGATGACAGCAGCAGCTCAGTAGCGTCGATAGAGTTCCCTGTGTATAGAGTA
GATGAGATCGATGATGAGTTCATCACCACCACCACAAGTGGAATTAACACAAGTAGCGCT
GTGCATCAAAGGTTCTCTCTGGTTTACAATTCAAGAAGGCGTCGTTCTCGCTTCTATGCA
AATTAGGGTATCAGTGCTGTCTCTACCTGTTCTATCTTCTTGGAAGCAAATGAAGCAGAC
CAGCCTACTCGTAGCCCAGTGTTGTTCTTGGTTTTGAACCTCTCTCTTCTTTTCTCGTCT
TTCAATACAAATTTTATTTTAGGTTTGTTTGTCTTGTGACATGTACTGTTCCTTGTACAA
AAACCATAAACAGGAAAAAAAACCAAAAAAGCTTTTTTTGGATATTGTACCATGTTTCGT
TCGTTGTCCC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL5993Contig1 915 2 4 U
GGAAAGAGGGAGAGATAGAAGAGCACAAGACGAAACCCTCACCGGCGATGGCTCTTTTCA
CCACGCGGCGCAAATTAGCGACAGTCCTAACCAGAACACTCTCTTCTTCGTCGTCGTTGT
CGTCGTTTTCTACGCTCTCTTCTCGTTCACGATTCGCTGTGCATCTAATCGACAAGGTTT
CCTCGACCAGAACCGGACTGGGCCCGTGCTACATAACGACCCGACCCAAGACATCCGGGT
CAGGATACTCTCCGCTGAACGATCCGTCGCCGAACTGGAGCAACCGCCCGCCGAAGGAGA
CGATTCTTCTCGATGGGTGCGATTACGAGCACTGGCTCATCGTCATGGAGTTCGATGATC
CCAAACCTACAGAAGATGAGATGATCAATGCTTATGTCAAAACCTTAACTTCCGTTGTCG
GAAGCGAGGAGGAGGCAAAGAAGAAGATCTACTCTGTTTCCACTTCGACTTACACTGGCT
TTGGTGCTTTGATCTCTGAAGAGCTCTCTTGCAAAGCCAAAGGATTGCCTGGTGTTCTTT
GGGTCCTACCAGATTCTTATCTTGATGTACCCAACAAAGACTATGGAGGTGACTTGTACA
TTGAAGGAAAAGTGATACCCAGACCACAGTACAGGTTCACTGACCGGCGCCAGACCAGAA
ACCGGTCTAGGCCTCGGTACGATAGGCGCCGTGAGACTATGCAGGTGGAGAGGAGAGAGC
CAACACAACAGAACTGGAATCAAAATCAACCACCATCATCCATGGGTCATCAAGCTCCGG
AGAATTAGACAAAGCGCAGCAGGGCTTAAATAAAATATAAACCCTAGTTCCTTATATTTT
TGCATGAACAAAAGTACGCATCTGTAATGGATTTTATTAGGCTTATGAGTTATTACATGT
CCACCCCCTTAAACC


BQ
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AF RS1BB59TF U 1
AF RS1BB59JQ C 263
BS 1 704 RS1BB59TF
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BS 723 915 RS1BB59JQ

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GGAAAGAGGGAGAGATAGAAGAGCACAAGACGAAACCCTCACCGGCGATGGCTCTTTTCA
CCACGCGGCGCAAATTAGCGACAGTCCTAACCAGAACACTCTCTTCTTCGTCGTCGTTGT
CGTCGTTTTCTACGCTCTCTTCTCGTTCACGATTCGCTGTGCATCTAATCGACAAGGTTT
CCTCGACCAGAACCGGACTGGGCCCGTGCTACATAACGACCCGACCCAAGACATCCGGGT
CAGGATACTCTCCGCTGAACGATCCGTCGCCGAACTGGAGCAACCGCCCGCCGAAGGAGA
CGATTCTTCTCGATGGGTGCGATTACGAGCACTGGCTCATCGTCATGGAGTTCGATGATC
CCAAACCTACAGAAGATGAGATGATCAATGCTTATGTCAAAACCTTAACTTCCGTTGTCG
GAAGCGAGGAGGAGGCAAAGAAGAAGATCTACTCTGTTTCCACTTCGACTTACACTGGCT
TTGGTGCTTTGATCTCTGAAGAGCTCTCTTGCAAAGCCAAAGGATTGCCTGGTGTTCTTT
GGGTCCTACCAGATTCTTATCTTGATGTACCCAACAAAGACTATGGAGGTGACTTGTACA
TTGAAGGAAAAGTGATACCCAGACCACAGTACAGGTTCACTGACCGGCGCCAGACCAGAA
ACCGGTCTAGGCCTCGGTACGATAGGCGCCGTGAGACTATGCAG*TGGAGAGGAGAGAGC
CA
CACAA

QA 1 722 1 722
DS 

RD RS1BB59JQ 653 0 0
TCCGTCGCCGAACTGGAGCAACCGCCCGCCGAAGGAGACGATTCTTCTCGATGGGTGCGA
TTACGAGCACTGGCTCATCGTCATGGAGTTCGATGATCCCAAACCTACAGAAGATGAGAT
GATCAATGCTTATGTCAAAACCTTAACTTCCGTTGTCGGAAGCGAGGAGGAGGCAAAGAA
GAAGATTTACTCTGTTTCCACTTCGACTTACACTGGCTTTGGTGCTTTGATTTCTGAAGA
GCTCTCTTGCAAAGCCAAAGGATTGCCTGGTGTTCTTTGGGTCCTACCAGATTCTTATCT
TGATGTACCCAACAAAGACTATGGAGGTGACTTGTACATTGAAGGAAAAGTGATACCCAG
ACCACAGTACAGGTTCACTGACCGGCGCCAGACCAGAAACCGGTTTAGGCCTCGGTACGA
TAGGCGCCGTGAGACTATGCAGGTGGAGAGGAGAGAGCCAACACAACAGAACTGGAATCA
AAATCAACCACCATCATCCATGGGTCATCAAGCTCCGGAGAATTAGACAAAGCGCAGCAG
GGCTTAAATAAAATATAAACCCTAGTTCCTTATATTTTTGCATGAACAAAAGTACGCATC
TGTAATGGATTTTATTAGGCTTATGAGTTATTACATGTCCACCCCCTTAAACC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 2

CO CL5994Contig1 750 2 2 U
CCTGGATATCATTTACATTTTGAGGTCTCAGAAGAATCTCAGCAACAGAACAAATCGTGT
GGTTCTTGTTTTTCTCTCCACAATGGCTGCTTTCACCTGTACTTCTTGTCCGCCGATTTG
TCTCCGGTCAGAGATGAGGATCGCATCCTCTAAGAAGGTTTCACTCTCTACTCGACATAT
GTTCTCTGTGTTACCGCAATCGGGAGGGCTGAGGACTCGCGTCTCATTATCATCATCGGT
CTCCAAGAATTCTAGATTACGACAACGAGGAGGGAACATCATCTGTGAAGCTCAGGAAGC
TACTACAGGGATTCCGTTGGTGAACGATTCAACATGGGAGTCTCTTGTACTCAAGGCAGA
TGAGCCTGTTGTTGTTGACTTTTGGGCACCATGGTGTGGACCCTGCAAAATGATCGATCC
CATCGTCAATGAACTAGCACAGCAGTACACAGGGAAGCTGAAGTTCTTCAAGCTAAACAC
GGACGAGTCTCCTGCAACCCCGGGAAAGTACGGTGTTAGAAGCATACCAACCATCATGAT
CTTTGTTAAGGGCGAGAAGAAGGATACAATCATCGGCGCGGTGTCTAAAACCACATTAGC
AACAAGCTTTGATAAATTCTTGCAGTGAAGCATGTGATGTGGATCTCTCTCTCTTTTCTT
CTCTATATGTATTTGGACTTAACGTTCACTCTTCACTGTTCATCATCTAGACATGTATAA
TGATGATAATAAATATAATGTTGTTTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FG17TF U 1
AF RS1FG17JQ C 103
BS 1 230 RS1FG17TF
BS 231 750 RS1FG17JQ

RD RS1FG17TF 230 0 0
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GGTTCTTGTTTTTCTCTCCACAATGGCTGCTTTCACCTGTACTTCTTGTCCGCCGATTTG
TCTCCGGTCAGAGATGAGGATCGCATCCTCTAAGAAGGTTTCACTCTCTACTCGACATAT
GTTCTCTGTGTTACCGCAATCGGGAGGGCTGAGGACTCGCGTCTCATTAT

QA 1 230 1 230
DS 

RD RS1FG17JQ 648 0 0
TTCTTGTCCGCCGATTTGTCTCCGGTCAGAGATGAGGATCGCATCCTCTAAGAAGGTTTC
ACTCTCTACTCGACATATGTTCTCTGTGTTACCGCAATCGGGAGGGCTGAGGACTCGCGT
CTCATTATCATCATCGGTCTCCAAGAATTCTAGATTACGACAACGAGGAGGGAACATCAT
CTGTGAAGCTCAGGAAGCTACTACAGGGATTCCGTTGGTGAACGATTCAACATGGGAGTC
TCTTGTACTCAAGGCAGATGAGCCTGTTGTTGTTGACTTTTGGGCACCATGGTGTGGACC
CTGCAAAATGATCGATCCCATCGTCAATGAACTAGCACAGCAGTACACAGGGAAGCTGAA
GTTCTTCAAGCTAAACACGGACGAGTCTCCTGCAACCCCGGGAAAGTACGGTGTTAGAAG
CATACCAACCATCATGATCTTTGTTAAGGGCGAGAAGAAGGATACAATCATCGGCGCGGT
GTCTAAAACCACATTAGCAACAAGCTTTGATAAATTCTTGCAGTGAAGCATGTGATGTGG
ATCTCTCTCTCTTTTCTTCTCTATATGTATTTGGACTTAACGTTCACTCTTCACTGTTCA
TCATCTAGACATGTATAATGATGATAATAAATATAATGTTGTTTTCTC

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 2

CO CL5995Contig1 681 2 1 U
GGATAACATTCAATTAATTAAAAAAATCGTAAACAAAGAAGAAAAAAGCATGTATAAAAG
AGAAAAAGTAGTTTCCTCCTCTATTATTCTTCTGATACCTTTGGTAATTTTGACAGAAAG
AATAAATGCTTATAAACCAAAAGATTTCGAGCGCGACTGTCGTGGAAGTCCACTCAAAAA
TCCACCTCCGGATATGTGTACTAAACTAAATGCTCGTGCTGATTGTGAGCGTCTTTGCAA
GGCGTCATCCAAAAAAACCGGATTTTATAGAGGTGAGTGTGTTGTTAGGAGCAATGTTCA
CTATTGCCACTGCTACATGTTTATATGCGCTTCACCAGCACCACCCATGCTTCCTGGCAA
GAACGGAAAATAAACATATATACATCTATATTTGTTTATTCCAATAAGATCTTTTGTTTT
TTTTAAACAAGAAATAATAACTATATATTTATATTATCTCCATCTATTTATAGATCAGCG
GGAAAAATATAATTTATAATTTGTTGTAAAACTCAATGTGTTTCTATAGATCAGCAAAAA
ATAATATTCGTAGAAAGTATTTCACCTCTATGGATTTGCAATAATACAGAATTCACATTA
AATGTGACTCCCCTTGTCAATCGCCAACTTATTATTTTGTAAGAGGTTCATGTACTAATA
AAACAATTTTTTTCTTTTGCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FC75TF U 1
AF RS1FC75JQ C 224
BS 1 681 RS1FC75TF

RD RS1FC75TF 681 0 0
GGATAACATTCAATTAATTAAAAAAATCGTAAACAAAGAAGAAAAAAGCATGTATAAAAG
AGAAAAAGTAGTTTCCTCCTCTATTATTCTTCTGATACCTTTGGTAATTTTGACAGAAAG
AATAAATGCTTATAAACCAAAAGATTTCGAGCGCGACTGTCGTGGAAGTCCACTCAAAAA
TCCACCTCCGGATATGTGTACTAAACTAAATGCTCGTGCTGATTGTGAGCGTCTTTGCAA
GGCGTCATCCAAAAAAACCGGATTTTATAGAGGTGAGTGTGTTGTTAGGAGCAATGTTCA
CTATTGCCACTGCTACATGTTTATATGCGCTTCACCAGCACCACCCATGCTTCCTGGCAA
GAACGGAAAATAAACATATATACATCTATATTTGTTTATTCCAATAAGATCTTTTGTTTT
TTTTAAACAAGAAATAATAACTATATATTTATATTATCTCCATCTATTTATAGATCAGCG
GGAAAAATATAATTTATAATTTGTTGTAAAACTCAATGTGTTTCTATAGATCAGCAAAAA
ATAATATTCGTAGAAAGTATTTCACCTCTATGGATTTGCAATAATACAGAATTCACATTA
AATGTGACTCCCCTTGTCAATCGCCAACTTATTATTTTGTAAGAGGTTCATGTACTAATA
AAACAATTTTTTTCTTTTGCG

QA 1 681 1 681
DS 

RD RS1FC75JQ 458 0 0
TGTGAGCGTCTTTGCAAGGCGTCATCCAAAAAAACCGGATTTTATAGAGGTGAGTGTGTT
GTTAGGAGCAATGTTCACTATTGCCACTGCTACATGTTTATATGCGCTTCACCAGCACCA
CCCATGCTTCCTGGCAAGAACGGAAAATAAACATATATACATCTATATTTGTTTATTCCA
ATAAGATCTTTTGTTTTTTTTAAACAAGAAATAATAACTATATATTTATATTATCTCCAT
CTATTTATAGATCAGCGGGAAAAATATAATTTATAATTTGTTGTAAAACTCAATGTGTTT
TTATAGATCAGCAAAAAATAATATTCGTAGAAAGTATTTCACCTCTATGGATTTGCAATA
ATACAGAATTCACATTAAATGTGACTCCCCTTGTCAATCGCCAACTTATTATTTTGTAAG
AGGTTCATGTACTAATAAAACAATTTTTTTTTTTTGCG

QA 1 458 1 458
DS 



AS 1 2

CO CL5996Contig1 836 2 2 U
GGGTATCAGCCCACCGGATAATCCCCAGGTGAAGGAAATCCGTTGTGTTGTGATGGTGCC
GCAGTGGGGAAGTCACCAGCATGTGAACCTGCCTTCAGCTCTTCCTGAGCATGATTTCTT
AAATGATCTCGAACCATTGGGATGGCTGCACACACAGCCTAACGAGCTCCCTCAATTGTC
ACCACAGGATGTGACCGCTCATTCCCGCATTCTGGAGAGCAACAAGCAATGGGATGGAGA
AAAATGTATCATCCTGACATGCAGTTTCACTCCGGGGTCCTGCTCTTTGACATCATATAA
GCTGACCCAAGCTGGATATGAATGGGGACGTCTCAACAAGGACACAGGCAGCAATCCTCA
TGGCTACCTTCCCACCCATTATGAGAAGGTTCAGATGCTATTGAGTGACCGCTTCCTCGG
GTTTTACATGGTTCCTGAGAACGGACCGTGGAACTACAACTTTATGGGCGTGAAGCACAC
GGTGGGCATGAAATACAGCGTTAAACTTGGATCCCCAAAGGAGTACTATCACGAGGAACA
TCGACCCACTCATTTCCTCGAGTTCAGCAACATGGAAGACGCTGACATCGTTGAGGGAGA
TCGTGAAGACACCTTTGCTTGATCATTATGTTTTTACCATGTTATGTACTACGAGTGACT
TGAGTTTTACTCTTGTGTGTGTGTGGTAGTATTGTAATGTACCCAAGTCTCTGACATCTT
TTGCCACTAGAGCCAAAATCTTTTTATGTAAAAACTTATAGTTACCTTTCAAAGCTTGAG
AGGTAGAAAGGCAACTAACTTTCTTGTAACAAAAGGGGAAAAAGCTTCGTATCTCC


BQ
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AF RS1G718TF U 1
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BS 738 836 RS1G718JQ

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TTGCCACTAGAGCCAAA
TCTT

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DS 

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TACTATCACGAGGAACATCGACCCACTCATTTCCTCGAGTTCAGCAACATGGAAGACGCT
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ATGTACTACGAGTGACTTGAGTTTTACTCTTGTGTGTGTGTGGTAGTATTGTAATGTACC
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GCTTCGTATCTCC

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 2

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AATAATTGTTCGCTATTCTAATTTAACACTCTCTGACAAATTTGCACACAAATATAAATA
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CCTCATCTTCTCAGCCGGTAAAACCTCAATCTCTCTTAATCTTCCGACATCGTTTCCAGA
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BQ
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AF RS1G525TF U 1
AF RS1G525JQ C 189
BS 1 654 RS1G525TF
BS 655 703 RS1G525JQ

RD RS1G525TF 654 0 0
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TCTTATATCATTTTTAACGCTGAATAGTTATGCTATTAGAAATTATGAAAACTATTACAC
ACAATTTTACAATAAACCATTTGGTGGAAAATATTTGTTTTCAAGTTTTTGAAAACGTAA
AATTATTTTTTTCTAAGTTTTCGGAAAGGTGAATTATTTTCTGTTTTTTGACAAAAAAAA
AATAATTGTTCGCTATTCTAATTTAACACTCTCTGACAAATTTGCACACAAATATAAATA
TAGGTGAAATAAAGAGTCGAAACTCAAAAACGGTGCCCGAGACTAAAAACCATCCCGAAA
CGGTGCGTTTAGATATTCTCGGCGTTGCTTCATTCATTATGGCGAACGGAGGACCGTCCT
CCTCATCTTCTCAGCCGGTAAAACCTCAATCTCTCTTAATCTTCCGACATCGTTTCCAGA
TCTCTGTCGTTTTTTTCTCTTAATCAAACTCTCGTTCTCAGGAAGTTGCAGATGAAACCC
AAGACTGGATTCTCGGAGCCGGGTCGGGTTGGGTCGAAGCCCGAACATCTTGCGATCACT
TGAATTCTCTTTCTCCCGATTTAGCTCGCTTACCAAATCCTGATACTCCCTGTT

QA 1 654 1 654
DS 

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ATAAAGAGTCGAAACTCAAAAACGGTGCCCGAGACTAAAAACCATCCCGAAACGGTGCGT
TTAGATATTTTCGGCGTTGCTTCATTCATTATGGCGAACGGAGGACCGTCCTCCTCATCT
TCTCAGCCGGTAAAACCTCAATCTCTCTTAATCTTCCGACATCGTTTCCAGATTTCTGTC
GTTTTTTTCTCTTAATCAAACTCTCGTTCTCAGGAAGTTGCAGATGAAACCCAAGACTGG
ATTTTCGGAGCCGGGTCGGGTTGGGTCGAAGCCCGAACATCTTGCGATCACTTGAATTCT
CTTTCTCCCGATTTAGCTCGCTTACCAAATCCTGATACTCCCTGTTCAAGGTTTTTACCC
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QA 1 515 1 515
DS 



AS 1 2

CO CL5998Contig1 837 2 2 U
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CTTCTCGCCTTTTCTCTGTCGTCGTTTCTCCTCGCTTCCATCCTCCCATTTACTCGTCTC
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ACACAGGAGAAGGGTTTAAAACCCTGAAACTCAAGGTGGGGAAGAACCTTAAGGTCGACA
TATATGTTCTCCAGAGACTTAGCTTTAGGTTTTATATTTTTGGTGGTCATGGCGATGATG
GTGAAGACTTAGCTTTAGGTTTATGTTTTTAGGTTTATGTTTGGTTTAGTTATGGTTTAG
ATTTTTGGTTTTGTTTTTGGTTATTTTGTAAACAATTTCGATATATAAAATTCTTTT


BQ
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AF RS1DA09TF U 1
AF RS1DA09JQ C 193
BS 1 651 RS1DA09TF
BS 652 837 RS1DA09JQ

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CTTCTCGCCTTTTCTCTGTCGTCGTTTCTCCTCGCTTCCATCCTCCCATTTACTCGTCTC
CGTCACAACCTCGCTCTCTCTCTGCTCTCTTGTCTCCGGTGGCAAGGCGGAGCTTCGTCG
AAGGCGGCAGCGAAGCTTCTGATTTTCTCAAAGAGTTTCTCAGCCGCTGTGGCGACTCTC
TTCCCTTATCGACCGTGATGAGTTCTCTCATCCCTCAGTGTTGAGACGGAGAGAACAGAT
CCGGAGGTGGAGAGAAAGATCCGGAGACTGTGTGAAATTGGAGAATGAACAAATAAATTG
GAGGATGCACAAGAGGCTTGACTATGGAGGGGACAAGGCATGGTCTCGGCGGCAATGGTG
CAAGGCGTGGTCTCGAAGCCAGGGTATGAGATTGGATTTTCAGGAGTAATAGAGCTTGTT
AAGGAGGTTAAGTTCTTAGTTAAAGGAGGAACTATATAAACAGATGTCTACACTTCAAGA
TATCGGTGTATCAGGATCGGATAGTTTCTCCACCTGAAGCTTCGAAGTTGGCCGCAAAGT
ACACAGGAGAAGGGTTTAAAACCCTGAAACTCAAGGTGGGGAAGAACCTTA

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1DA09JQ 645 0 0
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CCGTGATGAGTTCTCTCATCCCTCAGTGTTGAGACGGAGAGAACAGATCCGGAGGTGGAG
AGAAAGATCCGGAGACTGTGTGAAATTGGAGAATGAACAAATAAATTGGAGGATGCACAA
GAGGCTTGACTATGGAGGGGACAAGGCATGGTCTCGGCGGCAATGGTGCAAGGCGTGGTC
TCGAAGCCAGGGTATGAGATTGGATTTTCAGGAGTAATAGAGCTTGTTAAGGAGGTTAAG
TTTTTAGTTAAAGGAGGAACTATATAAACAGATGTCTACACTTCAAGATATCGGTGTATC
AGGATCGGATAGTTTCTCCCCCTGAAGCTTCGAAGTTGGCCGCAAAGTACACAGGAGAAG
GGTTTAAAACCCTGAAACTCAAGGTGGGGAAGAACCTTAAGGTCGACATATATGTTCTCC
AGAGACTTAGCTTTAGGTTTTATATTTTTGGTGGTCATGGCGATGATGGTGAAGACTTAG
CTTTAGGTTTATGTTTTTAGGTTTATGTTTGGTTTAGTTATGGTTTAGATTTTTGGTTTT
GTTTTTGGTTATTTTGTAAACAATTTCGATATATAAAATTCTTTT

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 2

CO CL5999Contig1 454 2 1 U
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TCCTTGGACCTCTTCAAGGAATAGACCAATTGGTCTCTGAAGAAGGCTAAAGTCGCGACT
CACTACGGATTCATCCCTCTCATCATCGTCATCGGCATGAACTCCGATCCCAAGCCCCAT
CTCTTCCAGCTCCTTAGCCCTGTCTGATCCTCCTATTTCAAAACCAGATCAATCAATCGT
TTCCGATCTTCTCCGGGTTGGGCTTATTCGTTAGATCTATTTATGTTCAGTAACTAAGTT
TTCAAATGGTTCTTATCTGTATGGAATCAATTATGTTATGATAAATTTAGCAAGAACCAG
TAACTATTTGAAAGTTTCTTTATGCATCAAGTGTTCGAATGTCTTGTATCTCTTTACAGC
ATCTGCTGAATATTAGGTCGATCTTATTGGTTGC


BQ
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GA76JQ C 1
AF RS1GA76TF U 1
BS 1 454 RS1GA76TF

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TCCTTGGACCTCTTCAAGGAATAGACCAATTGGTCTCTGAAGAAGGCTAAAGTCGCGACT
CACTACGGATTCATCCCTCTCATCATCGTCATCGGCATGAACTCCGATCCCAAGCCCCAT
TTCTTCCAGCTCCTTAGCCCTGTCTGATCCTCCTATTTCAAAACCAGATCAATCAATCGT
TTCCGATCTTCTCCGGGTTGGGCTTATTCGTTAGATCTATTTATGTTCAGTAACTAAGTT
TTCAAATGGTTCTTATCTGTATGGAATCAATTATGTTATGATAAATTTAGCAAGAACCAG
TAACTATTTGAAAGTTTCTTTATGCATCAAGTGTTCGAATGTCTTGTATCTCTTTACAGC
ATCTGCTGAATATTAGGTCGATCTTATTGGTTGC

QA 1 454 1 454
DS 

RD RS1GA76TF 454 0 0
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TCCTTGGACCTCTTCAAGGAATAGACCAATTGGTCTCTGAAGAAGGCTAAAGTCGCGACT
CACTACGGATTCATCCCTCTCATCATCGTCATCGGCATGAACTCCGATCCCAAGCCCCAT
CTCTTCCAGCTCCTTAGCCCTGTCTGATCCTCCTATTTCAAAACCAGATCAATCAATCGT
TTCCGATCTTCTCCGGGTTGGGCTTATTCGTTAGATCTATTTATGTTCAGTAACTAAGTT
TTCAAATGGTTCTTATCTGTATGGAATCAATTATGTTATGATAAATTTAGCAAGAACCAG
TAACTATTTGAAAGTTTCTTTATGCATCAAGTGTTCGAATGTCTTGTATCTCTTTACAGC
ATCTGCTGAATATTAGGTCGATCTTATTGGTTGC

QA 1 454 1 454
DS 



AS 1 2

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CGGATGATGATAAAATGGCAAATTACTTAGCCTCATTGAACCACGAGGAAACAAGACTAG
CGGTTGCATGCGAGAGAGCGTTTCTTGAAACACTGGACGGCTCATGTCGTACTCCGATTG
CTGGATACGCGGCCAAGGACGAAGAAGGCAACTGCTATTTCAGAGGATTGGTTGCATCAC
CTGACGGTACCCGAGTTCTTGAGACCTCAAGAAAAGGACCATACGTGTTTGAGGACATGG
TGAAGATGGGAAAAGACGCCGGGCAAGAACTGCTTTCTCGTGCTGGTCCAGGCTTCTTTG
GCAAATAAGCCATTCGAAGAAGAGGAAGAAGAAGGTGAAGAAGGGCTGTGGACATTGACA
GAGTCTAGGTTTTTAGGAGTTTTCCAACATCATAGACAGATCCCTTTTCTTCCTCTTAAA
TCTGTTGTAAATTTTTTGATTTAGAGAGAAAGATATTGATTGTTTTCTTGTATGCAGAGA
TAAAATTTCCTCTTGCAGTTGTACCTTTTTCATCCCACTATGAAACTTTTCCTCTAGTTC
CC


BQ
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10 10 

AF RS1GV23TF U 1
AF RS1GV23JQ C 146
BS 1 364 RS1GV23TF
BS 365 365 RS1GV23JQ
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BS 582 602 RS1GV23JQ

RD RS1GV23TF 581 0 0
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CGGATGATGATAAAATGGCAAATTACTTAGCCTCATTGAACCACGAGGAAACAAGACTAG
CGGTTGCATGCGAGAGAGCGTTTCTTGAAACACTGGACGGCTCATGTCGTACTCCGATTG
CTGGATACGCGGCCAAGGACGAAGAAGGCAACTGCTATTTCAGAGGATTGGTTGCATCAC
CTGACGGTACCCGAGTTCTTGAGACCTCAAGAAAAGGACCATACGTGTTTGAGGACATGG
TGAAGATGGGAAAAGACGCCGGGCAAGAACTGCTTTCTCGTGCTGGTCCAGGCTTCTTTG
GCAACTAAGCCATTCGAAGAAGAGGAAGAAGAAGGTGAAGAAGGGCTGTGGACATTGACA
GAGTCTAGGTTTTTAGGAGTTTTCCAACATCATAGACAGATCCCTTTTCTTCCTCTTAAA
TCTGTTGTAACTTTTTTGATTTAGAGAGAAAGATATTGATTGTTTTCTTGTATGCAGAGA
TAAAATTTCCTCTTGCAGTTGTACCTTTTTCATCCCACTAT

QA 1 581 1 581
DS 

RD RS1GV23JQ 457 0 0
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AGGCAACTGCTATTTCAGAGGATTGGTTGCATCCCCTGACGGTACCCGAGTTTTTGAGAC
CTCAAGAAAAGGACCATACGTGTTTGAGGACATGGTGAAGATGGGAAAAGACGCCGGGCA
AGAACTGCTTTTTCGTGGTGGTCCAGGCTTTTTTGGCAAATAAGCCATTTGAAGAAGAGG
AAGAAGAAGGTGAAGAAGGGCTGTGGACATTGACAGAGTTTAGGTTTTTAGGAGTTTTCC
AACATCATAGACAGATCCCTTTTTTTCCTTTTAAATCTGTTGTAAATTTTTTGATTTAGA
GAGAAAGATATTGATTGTTTTTTTGTATGCAGAGATAAAATTTCCTTTTGCAGTTGTACC
TTTTTCATCCCCCTATGAAACTTTTCCTCTAGTTCCC

QA 1 457 1 457
DS 



AS 1 2

CO CL6001Contig1 560 2 3 U
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CAATAGTCTTGAGTAGAGATACAATGGAATATAAGAAAATCTGAAAGGGTGTTTTTGCTG
CTATACAGAACCAAAATGGGGGGTAAAAGGTTTCATTGTCTTCCTGCAAATATGAAAAGC
CTTCATCATCAATCAATCATCTTCCGGATGAGGAGCTTGATCATCATCATCATCATCCGT
TGACTTCTTGTTCTCGTTCCTCTCATTCCATCTCGCCCAAGCCCACTTCAGGACAAAAAA
CCCTCCAAGTGCATATACCTGCCAAATGACAAGGGAATTGGAAGTGGTCCCGGAACTAGG
CTCGGCTTCAACCTTGAGTGGCTCAGTGCTCTTGGGAGGATTGTAAGGGAAAGTGACCGT
CGAGTTCTGAGTCTCCTTATCTCCTCCCGTGGGTTTAGGACCACCATCGGCAACGTTAGC
AGAAGACTTAGGTTTGAGGAAGGGGAACAGGTTGACGACGAAAGAAGGTAAGTTCAGCTG
AGGAGGAGGGGGAGAATCGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G432JQ U 147
AF RS1G432TF C 1
BS 1 146 RS1G432TF
BS 147 385 RS1G432JQ
BS 386 560 RS1G432TF

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GATGAGGAGCTTGATCATCATCATCATCATCCGTTGACTTCTTGTTCTCGTTCCTCTCAT
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ATG

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DS 

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CTTCATCATCAATCAATCATCTTCCGGATGAGGAGCTTGATCATCATCATCATCATCCGT
TGACTTCTTGTTCTCGTTCCTCTCATTCCATCTCGCCCAAGCCCACTTCAGGACAAGAAA
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CGAGTTCTGAGTCTCCTTATCTCCTCCCGTGGGTTTAGGACCACCATCGGCAACGTTAGC
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QA 1 560 1 560
DS 



AS 1 2

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GACTATTCTGGTTTTGTCGCGCGGATGTATGATGTTGATATGAGCTCGCTTGTCGAAGCT
AGGCTGGATCTTCTAAAGGATGATGGAGATGGAGATGGAGATGATATTTTGGCTCATGTT
ACAAATTTGGTTGCAGGGATAAGCAATGTTAAAACACTTCACTTGTCTTCTGAGTCTCTT
GAGGTGTTTCACCTATACTGTAAATCAATGCCTGTCTTTCACAAGCTCCTTACTCTGTCT
TTTGAGAGTCACAAAGAAAGAGGATGGCAAGTGGTGCCACTTCTTCTCAACAACTCTCCC
AACCTAGAAACCTTAGTCATCAAGGGTCTTGTGCACCAAGTTACAGATAGATGCGGAAGT
GCCTGTGTTTGCACCGCTAGGAAGAAGAAAAAGAAGATCATGAAGGGGGAAGTATGTTGT
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AATGCTCTTACTAAGCTACCCAAAGCTTCATCAAGTTGTCAAATCCATTTCTTTTGATTA
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G


BQ
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10 

AF RS1EK38TF U 1
AF RS1EK38JQ C 433
BS 1 651 RS1EK38TF
BS 652 961 RS1EK38JQ

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TTTGAGAGTCACAAAGAAAGAGGATGGCAAGTGGTGCCACTTCTTCTCAACAACTCTCCC
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QA 1 651 1 651
DS 

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AATCGCCGAGAAGACAACAATGTTAACAAGAACTACCAGAGAATCATCAATGCTCTTACT
AAGCTACCCAAAGCTTCATCAAGTTGTCAAATCCATTTCTTTTGATTACCTCTTATAAAT
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CAGTGCGGGTATGTCTTAAAAGATCAGAAAGAAAAAAAATCTCGATTTG

QA 1 529 1 529
DS 



AS 1 2

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CTAGATGGTATTTTAATATGGGATTTGAAGTTTGAAATCTCAGATCTAAAGCGAGAGTAT
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CTGCATTAATAAGTTTTGTACGGGAAGCTCTTCGAGGCTTTGCCGTGGTGTGGTGGCCCG
TGGTTAGCCCATTCAAAGTCCGATGGCAGAGGGTGTTTACAGCGAAGATTTCATTAGTAA
ACGTGACGCTCTAGTTTCTCTCATTATCACTTTTATTACCATCTAGGGTTGTTAGTCTTT
GGTATTTTGTAGATTATTGTGCTTGTCTCATGGTTTGGTTTGTGAATCTTGGTGGCGACC
CAAAATGTCTCAGGTTGATTTGGTGTCTTGCTTATGGTCGTTTGGCTTCTGGGGTGTTTC
TTTAGCAACTGCCGGCTTGTTGCTTCGGTTTTAAATTTCATCTAAATTGCCGACTTAGTT
ATCTTTCTTTTGGTATATAGTTCCCATGTTTCAGACTTGTAACCATCCATGTTTGGGTTT
CTAATGTTTCAAACTTGTAACCGCCCATATTT


BQ
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AF RS1DD11TF U 1
AF RS1DD11JQ C 473
BS 1 691 RS1DD11TF
BS 692 692 RS1DD11JQ

RD RS1DD11TF 691 0 0
GGGAGAAAGGATGTGAGAAAGAGAACAAAAATGCAGAGCGAGAGGAAAATAAAAAGAGAT
CCTATTGTCTCCACTTTCTCCGGTCATGTTGTTTTAGTTGTCTTAATTTCTTTTCTTCTT
CTAGATGGTATTTTAATATGGGATTTGAAGTTTGAAATCTCAGATCTAAAGCGAGAGTAT
CAAATCGGGTTCTGTCGACTCCGATCTTATCAGATCTGGTGATAAGTCTTTGGTTACTGG
CTGCATTAATAAGTTTTGTACGGGAAGCTCTTCGAGGCTTTGCCGTGGTGTGGTGGCCCG
TGGTTAGCCCATTCAAAGTCCGATGGCAGAGGGTGTTTACAGCGAAGATTTCATTAGTAA
ACGTGACGCTCTAGTTTCTCTCATTATCACTTTTATTACCATCTAGGGTTGTTAGTCTTT
GGTATTTTGTAGATTATTGTGCTTGTCTCATGGTTTGGTTTGTGAATCTTGGTGGCGACC
CAAAATGTCTCAGGTTGATTTGGTGTCTTGCTTATGGTCGTTTGGCTTCTGGGGTGTTTC
TTTAGCAACTGCCGGCTTGTTGCTTCGGTTTTAAATTTCATCTAAATTGCCGACTTAGTT
ATCTTTCTTTTGGTATATAGTTCCCATGTTTCAGACTTGTAACCATCCATGTTTGGGTTT
CTAATGTTTCAAACTTGTAACCGCCCATATT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1DD11JQ 220 0 0
TGGCGACCCAAAATGTCTCAGGTTGATTTGGTGTCTTGCTTATGGTCGTTTGGCTTCTGG
GGTGTTTCTTTAGCAACTGCCGGCTTGTTGCTTCGGTTTTAAATTTCATCTAAATTGCCG
ACTTAGTTATCTTTCTTTTGGTATATAGTTCCCATGTTTCAGACTTGTAACCATCCATGT
TTGGGTTTCTAATGTTTCAAACTTGTAACCGCCCATATTT

QA 1 220 1 220
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6005Contig1 896 2 4 U
GGAAACGAAGAAGAAGGAGAAGAGAAGAAACAGCGAAAATGGCTTCCAAGAGTTAGCATC
CACTGCATCTGATCATCCTCTTCGTCTACGCTGTTGCTATCTCATCATCGTTTCTCGCCG
TCAGATCACACGAACAGAACAACGGAGACGAACAGATGAGAAGCGGCGGTAGGATCCTTC
TAGGTTTCAAAGAGACTCCAAAAGGAAGCAACGTCACCTTCGAGTGCTCTCCTTCAGGTC
CTTGCGTCTCCTGCAACTCCTCCGAAAAGAGAAAAGAGAAGTATCGTTGTAGTGAAACTG
GTTATCGGATTCCTTTTAAATGTAGAGAGGTGAGAGGAGGAGGAGAGGAAGCTTCTTCAC
ACAAGAAAGACGCAGAAGAGACGACGCAACAAAATGATCAATCTAATGCCAGTAATAATG
ATGACGAAGAAGTTGTTGATGCATCGTCGGTGAAGCAGAGGAACCTGCGTGATGACTCTT
CTTCTTCACCGGCATCGAAAGCTAAGAAGTCTCAGTCTTACAAAACTTACAGAAGCTGTG
TCCCTTCTGCGGATGAGGAGAGAGTTTCAGTTCTTGGTTTCGAGGCGGTTATGCTAGGAC
TGTTACTCGTGAGTGGATCCGCTGTATATTACAGAAAGAAACAGACAGTACCGATGGCCG
GAGTATCCAGTGGAAGATCACAGAGCAATTCCCGGTTTTAAGAGAAAACCTTTTTTCGAT
TTATGTAAAAGCTTTCAACGGTTTTTCCATTGTTGCGAGAAACAGAGATATTACTACGAG
TGTATAGAATATAAGCTTTTAGGGGCTTTGATATAACTGGATTACTTGTTTCTTTAGATG
ATGACTGATTGTTTATGAGATCAATTCCCATTTGAAAAAAGATGTTATCACTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AV29TF U 1
AF RS1AV29JQ C 255
BS 1 698 RS1AV29TF
BS 699 699 RS1AV29JQ
BS 700 710 RS1AV29TF
BS 711 896 RS1AV29JQ

RD RS1AV29TF 710 0 0
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CACTGCATCTGATCATCCTCTTCGTCTACGCTGTTGCTATCTCATCATCGTTTCTCGCCG
TCAGATCACACGAACAGAACAACGGAGACGAACAGATGAGAAGCGGCGGTAGGATCCTTC
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CTTGCGTCTCCTGCAACTCCTCCGAAAAGAGAAAAGAGAAGTATCGTTGTAGTGAAACTG
GTTATCGGATTCCTTTTAAATGTAGAGAGGTGAGAGGAGGAGGAGAGGAAGCTTCTTCAC
ACAAGAAAGACGCAGAAGAGACGACGCAACAAAATGATCAATCTAATGCCAGTAATAATG
ATGACGAAGAAGTTGTTGATGCATCGTCGGTGAAGCAGAGGAACCTGCGTGATGACTCTT
CTTCTTCACCGGCATCGAAAGCTAAGAAGTCTCAGTCTTACAAAACTTACAGAAGCTGTG
TCCCTTCTGCGGATGAGGAGAGAGTTTCAGTTCTTGGTTTCGAGGCGGTTATGCTAGGAC
TGTTACTCGTGAGTGGATCCGCTGTATATTACAGAAAGAAACAGACAGTACCGATGGCCG
GAGTATCCAGTGGAAGATCACAGAGCAATTCCCGGTTT*AAGAGAAAACC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1AV29JQ 642 0 0
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GAAGAGACGACGCAACAAAATGATCAATCTAATGCCAGTAATAATGATGACGAAGAAGTT
GTTGATGCATCGTCGGTGAAGCAGAGGAACCTGCGTGATGACTCTTCTTCTTCACCGGCA
TCGAAAGCTAAGAAGTCTCAGTCTTACAAAACTTACAGAAGCTGTGTCCCTTCTGCGGAT
GAGGAGAGAGTTTCAGTTCTTGGTTTCGAGGCGGTTATGCTAGGACTGTTACTCGTGAGT
GGATCCGCTGTATATTACAGAAAGAAACAGACAGTACCGATGGCCGGAGTATCCAGTGGA
AGATCACAGAGCAATTCCCGGTTTTAAGAGAAAACCTTTTTTCGATTTATGTAAAAGCTT
TCAACGGTTTTTCCATTGTTGCGAGAAACAGAGATATTACTACGAGTGTATAGAATATAA
GCTTTTAGGGGCTTTGATATAACTGGATTACTTGTTTCTTTAGATGATGACTGATTGTTT
ATGAGATCAATTCCCATTTGAAAAAAGATGTTATCACTTGCC

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 2

CO CL6006Contig1 1136 2 8 U
TAAGAAGGCAGCAGTAGATGCTGCTGCCTGGATGTTCAATGTCGTCACTTCTGTTGGTAT
CATCATTGTCAATAAAGCTTTAATGGCCACTTATGGTTATAGCTTTGCTACAACCTTAAC
CGGTTTACATTTCGCTTTTACAACTCTGATGACCATTGTTCTAAGATGTCTTGGTTACAT
TCAGCCCTCACATCTCCCCTTTACCGAGCTTCTGAGGTTTATTCTCTTCGCAAACTTCTC
CATCGTTGGAATGAACGTCAGCCTTATGTGGAACTCTGTCGGTTTTTATCAGATTGCAAA
GCTCAGCATGATTCCTGTATCCTGCTTGTTGGAAATGGTGTTAGATAAGATCCGTTACTC
CAGAGACACTAAGCTTAGCATAGGATTGGTTCTTGTGGGTGTTGGTGTTTGCACTGTCAC
TGACGTTAGTGTGAATAGCAAAGGCTTTGTAGTCGCTTTTGTTGCTGTGTGGAGTACTTC
TCTGCAACAATACTATGTACATTACCTTCAGCGCAAGTACTCGCTTAGCTCATTCAACCT
ATTGGGACATACCGCTCCAGCCCAAGCTGCAACACTACTGGTTGTTGGTCCGTTTCTTGA
TTATTTGCTCACAGAAAAAAGAGTAGACATGTACGATTACAACTTGGTCTCTGTGCTGTT
TATAACCCTCTCGTGCACAATAGCGATTGGGACCAACCTAAGTCAGTTCATCTGCATCGG
GAGATTCACAGCGGTATCGTTCCAAGTCCTGGGACACATGAAGACGATCCTGGTGCTGGT
AATGGGATTCTTCTTCTTTGGTAGAGAAGGTCTAAACTTGCACGTGGTTATTGGAATGAT
CATTGCAGTACTTGGTATGATCTGGTACGGCAATGCCTCTTCTAAGCCAGGTGGGAAAGA
GAGACGAAGCTATTCTCTTCCAACGACCCGTCAACAGAAACTTGGAGCTGCTTCTGATTC
TGACGACAACGAAGACAAAGCTTAGTATTAGTATCTATGTAGTAAGTTCAGGACAATCAC
ATAGTTTACAATTTTGTTTTTGAGTTCCGTTTTCTTGCTGGGGTCGACGAACAAACGATT
TTTTATAAAGATGATTGAGAATTTTTTTGCAATACTTAGCGGAATAAAGTTTATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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CATCATTGTCAATAAAGCTTTAATGGCCACTTATGGTTATAGCTTTGCTACAACCTTAAC
CGGTTTACATTTCGCTTTTACAACTCTGATGACCATTGTTCTAAGATGTCTTGGTTACAT
TCAGCCCTCACATCTCCCCTTTACCGAGCTTCTGAGGTTTATTCTCTTCGCAAACTTCTC
CATCGTTGGAATGAACGTCAGCCTTATGTGGAACTCTGTCGGTTTTTATCAGATTGCAAA
GCTCAGCATGATTCCTGTATCCTGCTTGTTGGAAATGGTGTTAGATAAGATCCGTTACTC
CAGAGACACTAAGCTTAGCATAGGATTGGTTCTTGTGGGTGTTGGTGTTTGCACTGTCAC
TGACGTTAGTGTGAATAGCAAAGGCTTTGTAGTCGCTTTTGTTGCTGTGTGGAGTACTTC
TCTGCAACAATACTATGTACATTACCTTCAGCGCAAGTACTCGCTTAGCTCATTCAACCT
ATTGGGACATACCGCTCCAGCCCAAGCTGCA*CACTACTGGTTGTTGGTCCGTTTCTTGA
TTATTTGCTCACAGAAAAA*GAGTAGACATGTACGATTACA*CTTGGTCTCTGTGCTGTT
TA

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DS 

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CAACACTACTGGTTGTTGGTCCGTTTCTTGATTATTTGCTCACAGAAAAAAGAGTAGACA
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TGGGACACATGAAGACGATCCTGGTGCTGGTAATGGGATTCTTCTTCTTTGGTAGAGAAG
GTCTAAACTTGCACGTGGTTATTGGAATGATCATTGCAGTACTTGGTATGATCTGGTACG
GCAATGCCTCTTCTAAGCCAGGTGGGAAAGAGAGACGAAGCTATTCTCTTCCAACGACCC
GTCAACAGAAACTTGGAGCTGCTTCTGATTCTGACGACAACGAAGACAAAGCTTAGTATT
AGTATCTATGTAGTAAGTTCAGGACAATCACATAGTTTACAATTTTGTTTTTGAGTTCCG
TTTTCTTGCTGGGGTCGACGAACAAACGATTTTTTATAAAGATGATTGAGAATTTTTTTG
CAATACTTAGCGGAATAAAGTTTATTT

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

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GGCTCTCTCCCCTCTGTACTTTGCTTCTCTCTCTAAACGAACGATGAAAGTTTTCGTGAA
GACTCTGAAAGGGACAAACTTCGAGATCGAAGTGAATCCGGCGGAGACGATCTCTGATAC
TAAAAAACGTATAGAAACGCTTCATGGTGCTCAATACCCAGCTGCCCAGCAGATGCTGAT
TCACCAAGGAAAAGTTCTCAAGGATGAGACTACATTGGAAGATAACAACGTTGTTGACAA
CAGTTTCATTGTTATCATGTTGTCCAAGGCCAAGGTTTCTTCAAGCGGGGCATCAACTGC
ATCTGCGCCTGCACCTAGTGCTACTCAGGCTCAACCTGCAGAGACAGTAGCTACACCTCA
GGTTGCTACTCCAACTGCCTCAGTTCCAGAGCCTACAAGTGGAGCTGCAACCGTTGCAGC
ACCTACTGCAGCTGCTGCTTCGACTCAAACAGATGTTTATGGACAAGCAGCGTCAAACCT
TGTTGCTGGAAACAACCTAGAATCTACTGTTCAGCAAATTCTTGACATGGGTGGAGGAAG
TTGGGACCGTGACACTGTTATCCGTGCCCTGAGAGCCGCCTTTAACAACCCTGAAAGAGC
TGTCGAATATCTGTACTCAGGAATCCCTGCACAAGCTGAAATCCCGCCAGCCCCTCAAGC
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GCTACAGAGCTCGGTAAACAAAACCCGCAGCTTGTACGACTTATCCAAGAGCACCAGGCG
GACTTCCTACGCTTGATAAATGAACCTGTCGAGGGAGAAGAGAATGTCATGGAACAGTTG
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CTTGAAGCGATGGGGTTTGATCGTGCAATGGTCTTAGAGGTGTTCTTTGCGTGTAACAAG
AACGAAGAACTTGCAGCTAACTACCTTCTAGATCACATGCACGAGTTTGAGGAACAATAG
TGGAAGAAGAAGAAATACATTCCTCCTTCCTGAAATCAGAGACCCATCTTTATGTTTCTT
CTTCTTGTTTTTCATTTTCTTTTATGAGATAATCTATCTTCTCCGATGCATTTGACAAGT
TTATGTTTATGTTCATGGGAGTGGATGTGTTTATGTTACATTTTAAAACTTGTCATATCA
TAGATTTATCTGGTTCAT


BQ
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AF RS1AL27TF U 1
AF RS1AL27JQ C 630
BS 1 803 RS1AL27TF
BS 804 804 RS1AL27JQ
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BS 838 856 RS1AL27TF
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RD RS1AL27TF 856 0 0
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GACTCTGAAAGGGACAAACTTCGAGATCGAAGTGAATCCGGCGGAGACGATCTCTGATAC
TAAAAAACGTATAGAAACGCTTCATGGTGCTCAATACCCAGCTGCCCAGCAGATGCTGAT
TCACCAAGGAAAAGTTCTCAAGGATGAGACTACATTGGAAGATAACAACGTTGTTGACAA
CAGTTTCATTGTTATCATGTTGTCCAAGGCCAAGGTTTCTTCAAGCGGGGCATCAACTGC
ATCTGCGCCTGCACCTAGTGCTACTCAGGCTCAACCTGCAGAGACAGTAGCTACACCTCA
GGTTGCTACTCCAACTGCCTCAGTTCCAGAGCCTACAAGTGGAGCTGCAACCGTTGCAGC
ACCTACTGCAGCTGCTGCTTCGACTCAAACAGATGTTTATGGACAAGCAGCGTCAAACCT
TGTTGCTGGAAACAACCTAGAATCTACTGTTCAGCAAATTCTTGACATGGGTGGAGGAAG
TTGGGACCGTGACACTGTTATCCGTGCCCTGAGAGCCGCCTTTAACAACCCTGAAAGAGC
TGTCGAATATCTGTACTCAGGAATCCCTGCACAAGCTGAAATCCCGCCAGCCCCTCAAGC
CCCTCAAGCCCCAGCTAGTGGTGGACATGCAGCAAACCCTCTAGCACAGACCCAACAAGA
GGCTGCTCCAGTGCCTGCAACTGGTGGTCCAAACGCTAATCCGTTAAACCTGTTTCCCCA
GGGCATGCCTGCTGCAGATGCCG*TGCCGGAGCTGGTAATCTTGATTTCCTGCGTA*CAG
TCAACAGTTCCAAGCC

QA 1 856 1 856
DS 

RD RS1AL27JQ 769 0 0
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CAGCAAACCCTCTAGCACAGACCCAACAAGAGGCTGCTCCAGTGCCTGCAACTGGTGGTC
CAAACGCTAATCCGTTAAACCTGTTTCCCCAGGGCATGCCTGCTGCAGATGCCGGTGCCG
GAGCTGGTAATCTTGATTTCCTGCGTAACAGTCAACAGTTCCAAGCCTTGAGAACTATGG
TACAAGCAAACCCGCAAATTCTACAGCCTATGCTACAGAGCTCGGTAAACAAAACCCGCA
GCTTGTACGACTTATCCAAGAGCACCAGGCGGACTTCCTACGCTTGATAAATGAACCTGT
CGAGGGAGAAGAGAATGTCATGGAACAGTTGGAAGCAGCAATGCCACAAGCTGTCACCGT
CACACCTGAAGAGCGTGAAGCCATTGAACGGCTTGAAGCGATGGGGTTTGATCGTGCAAT
GGTCTTAGAGGTGTTCTTTGCGTGTAACAAGAACGAAGAACTTGCAGCTAACTACCTTCT
AGATCACATGCACGAGTTTGAGGAACAATAGTGGAAGAAGAAGAAATACATTCCTCCTTC
CTGAAATCAGAGACCCATCTTTATGTTTCTTCTTCTTGTTTTTCATTTTCTTTTATGAGA
TAATCTATCTTCTCCGATGCATTTGACAAGTTTATGTTTATGTTCATGGGAGTGGATGTG
TTTATGTTACATTTTAAAACTTGTCATATCATAGATTTATCTGGTTCAT

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

CO CL6008Contig1 835 2 2 U
GGGATTTGGTAGACCACGAGAACCTGACACTCGAACAGATAGAAAATAACATTGTCAGGT
GCCCCAATCCAGAGTATGCTGAAAAGATGATAGCTGCCATTGATGCTGTCAGGACTAAAG
GGAACTCTGTTGGTGGTGTTGTGACCTGCATCGTTCGTAGTACTCCACGTGGGCTTGGTA
CGCCGGTGTTCGATAAACTTGAAGCAGAACTGGCAAAAGCTTGTATGTCGTTACCTGCAA
CAAAGGGCTTTGAGTTTGGAAGTGGCTTCTCAGGTACCTTTCTGACTGGTCTTGAACACA
ATGATGAGTTCTATACCGATGAAAACGGAAGAATACGAACAAAAACAAACCGATCCGGTG
GAATTCAGGGAGGGATATCGAATGGTGAGATAATAAACATGAGAGTAGCCTTCAAGCCAA
CATCTACAATCGGAAGGAAGCAGAACACTGTAACCAGAGACAAGCAAGAAACAGAGATGA
TTGCACGTGGACGTCATGATCCCTGTGTTGTTCCACGAGCTGTGCCGATGGTGGAAGCAA
TGGTGGCCTTAGTTCTTGTGGATCAATTGATGGCGTAGTACGCACAGTGCCATCTGTTTC
CAATAAATCCAGAGCTGCAGGAACCTCTCCGGACAGCTTCTCCTCCTGTCGAGCTTGAGC
AGCCGCAAAATGCTGCTGCGTTGTAAGCATAAACTCGAGAAGATTTTTTAGAGTGATGAG
ACCAAAGAGAGGCTTTCACTTTTGTTGTGTGATTATTATTACTATGAATAAAATTGGTTC
TTTTTTGTAAGATGATTTTACCACTTTCTCTATAATATTTACATCATTATTATTT


BQ
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AF RS1EI51TF U 1
AF RS1EI51JQ C 158
BS 1 616 RS1EI51TF
BS 617 835 RS1EI51JQ

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GGAACTCTGTTGGTGGTGTTGTGACCTGCATCGTTCGTAGTACTCCACGTGGGCTTGGTA
CGCCGGTGTTCGATAAACTTGAAGCAGAACTGGCAAAAGCTTGTATGTCGTTACCTGCAA
CAAAGGGCTTTGAGTTTGGAAGTGGCTTCTCAGGTACCTTTCTGACTGGTCTTGAACACA
ATGATGAGTTCTATACCGATGAAAACGGAAGAATACGAACAAAAACAAACCGATCCGGTG
GAATTCAGGGAGGGATATCGAATGGTGAGATAATAAACATGAGAGTAGCCTTCAAGCCAA
CATCTACAATCGGAAGGAAGCAGAACACTGTAACCAGAGACAAGCAAGAAACAGAGATGA
TTGCACGTGGACGTCATGATCCCTGTGTTGTTCCACGAGCTGTGCCGATGGTGGAAGCAA
TGGTGGCCTTAGTTCTTGTGGATCAATTGATGGCGTAGTACGCACAGTGCCATCTGTTTC
CAATAAATCCAGAGCT

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DS 

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AGCTTGTATGTCGTTACCTGCAACAAAGGGCTTTGAGTTTGGAAGTGGCTTTTCAGGTAC
CTTTCTGACTGGTCTTGAACACAATGATGAGTTCTATACCGATGAAAACGGAAGAATACG
AACAAAAACAAACCGATCCGGTGGAATTCAGGGAGGGATATCGAATGGTGAGATAATAAA
CATGAGAGTAGCCTTCAAGCCAACATTTACAATCGGAAGGAAGCAGAACACTGTAACCAG
AGACAAGCAAGAAACAGAGATGATTGCACGTGGACGTCATGATCCCTGTGTTGTTCCACG
AGCTGTGCCGATGGTGGAAGCAATGGTGGCCTTAGTTCTTGTGGATCAATTGATGGCGTA
GTACGCACAGTGCCATCTGTTTCCAATAAATCCAGAGCTGCAGGAACCTCTCCGGACAGC
TTCTCCTCCTGTCGAGCTTGAGCAGCCGCAAAATGCTGCTGCGTTGTAAGCATAAACTCG
AGAAGATTTTTTAGAGTGATGAGACCAAAGAGAGGCTTTCACTTTTGTTGTGTGATTATT
ATTACTATGAATAAAATTGGTTCTTTTTTGTAAGATGATTTTACCACTTTCTCTATAATA
TTTACATCATTATTATTT

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 2

CO CL6009Contig1 1209 2 2 U
GGATACAAAAAAAAAGCTTAAGTATTCTTTTCAGATTCCTAGAAAATGTCGGCTCTTGCA
GATTTAATCAACCTCGATCTCTCTGACTCCTCTGAGAAGATCATTGCCGAGTACATATGG
ATTGGTGGATCAGGCTTGGATATGAGAAGCAAAGCAATGACTTTGCCAGGACCAGTGAAG
GATCCATCGGAGTTACCAAAATGGAACTATGACGGTTCAAGCACCGGCCAAGCACCCGGC
GATGACAGTGAAGTCATCATCTACCCTCAAGCTATCTTCAAAGATCCATTCAGAAGAGGC
AACAACATCCTTGTGATGTGTGACGCATATACACCTGCTGGCGAACCCATCCCGCTGAAG
AAACATGGTATGGAATTGAGCAAGAGTATACTTTGCTACAAAAGGATATTAAGTGGCCGG
TTGGTTGGCCCGTCGGTGGCTTCCCAGGTCCTCAGGGGCCATACTACTGTGGAGTTGGAG
CAGACAAAGCCTTTGGAAGAGACATCGTAGATGCTCATTACAAAGCATGTCTTTACGCCG
GAATCAATGTCAGTGGCACTAACGGAGAAGTCATGCCCGGACAGTGGGAATTCCAAGTCG
GTCCAACCGTTGGAATAGCGGCCGCTGATCAGGTCTGGGTCGCTCGTTACATCCTGGAGA
GGATTACAGAATTGGCTGGAGTGATTTTGTCTCTTGACCCTAAACCAATTCCGGGAGATT
GGAATGGTGCAGGAGCACACACAAACTACAGTACCAAGTCGATGAGAGAAGATGGAGGGT
ACGAGGTGATCAAGAAAGCGATAGAGAAGCTTGGATTGCGTCACAAGGAACACATCGCTG
CTTATGGTGAAGGCAACGAGCGTCGTCTCACTGGAAGACACGAGACTGCTGATATCAACA
CTTTCTTATGGGGTGTTGCCAACCGTGGGGCATCGATTAGGGTTGGTCGCGACACTGAGA
AAGATGGAAAAGGATACTTTGAAGATCGTAGGCCAGCGTCTAACATGGATCCTTACACTG
TGACTTCCATGGTTGCTGAAACCACAATCCTCTGGAAACCATGATTGAAGAAACCTCTTA
TATCATCAGTTCATGTTCGTTTCTTCTACTTTCTCTCTCTCATTGTGAAACAGTTCTCAT
GTTTTCTTTGTTTTAAGAATGTTTGATTTAAACTCTTTCCAAGAAATAATGATAGTTCTT
TTCTCCAGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EU37TF U 1
AF RS1EU37JQ C 498
BS 1 565 RS1EU37TF
BS 566 1209 RS1EU37JQ

RD RS1EU37TF 565 0 0
GGATACAAAAAAAAAGCTTAAGTATTCTTTTCAGATTCCTAGAAAATGTCGGCTCTTGCA
GATTTAATCAACCTCGATCTCTCTGACTCCTCTGAGAAGATCATTGCCGAGTACATATGG
ATTGGTGGATCAGGCTTGGATATGAGAAGCAAAGCAATGACTTTGCCAGGACCAGTGAAG
GATCCATCGGAGTTACCAAAATGGAACTATGACGGTTCAAGCACCGGCCAAGCACCCGGC
GATGACAGTGAAGTCATCATCTACCCTCAAGCTATCTTCAAAGATCCATTCAGAAGAGGC
AACAACATCCTTGTGATGTGTGACGCATATACACCTGCTGGCGAACCCATCCCGCTGAAG
AAACATGGTATGGAATTGAGCAAGAGTATACTTTGCTACAAAAGGATATTAAGTGGCCGG
TTGGTTGGCCCGTCGGTGGCTTCCCAGGTCCTCAGGGGCCATACTACTGTGGAGTTGGAG
CAGACAAAGCCTTTGGAAGAGACATCGTAGATGCTCATTACAAAGCATGTCTTTACGCCG
GAATCAATGTCAGTGGCACTAACGG

QA 1 565 1 565
DS 

RD RS1EU37JQ 712 0 0
AGAGACATCGTAGATGCTCATTACAAAGCATGTCTTTACGCCGGAATCAATGTCAGTGGC
ACTAACGGAGAAGTCATGCCCGGACAGTGGGAATTCCAAGTCGGTCCAACCGTTGGAATA
GCGGCCGCTGATCAGGTCTGGGTCGCTCGTTACATCCTGGAGAGGATTACAGAATTGGCT
GGAGTGATTTTGTCTCTTGACCCTAAACCAATTCCGGGAGATTGGAATGGTGCAGGAGCA
CACACAAACTACAGTACCAAGTCGATGAGAGAAGATGGAGGGTACGAGGTGATCAAGAAA
GCGATAGAGAAGCTTGGATTGCGTCACAAGGAACACATCGCTGCTTATGGTGAAGGCAAC
GAGCGTCGTCTCACTGGAAGACACGAGACTGCTGATATCAACACTTTCTTATGGGGTGTT
GCCAACCGTGGGGCATCGATTAGGGTTGGTCGCGACACTGAGAAAGATGGAAAAGGATAC
TTTGAAGATCGTAGGCCAGCGTCTAACATGGATCCTTACACTGTGACTTCCATGGTTGCT
GAAACCACAATCCTCTGGAAACCATGATTGAAGAAACCTCTTATATCATCAGTTCATGTT
CGTTTCTTCTACTTTCTCTCTCTCATTGTGAAACAGTTCTCATGTTTTCTTTGTTTTAAG
AATGTTTGATTTAAACTCTTTCCAAGAAATAATGATAGTTCTTTTCTCCAGC

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 2

CO CL6010Contig1 651 2 2 U
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TCACAGGTCATATTCCTCTGTCTTTCTCCAATCTGAGCAAGCTGGAGTCACTAGACCTAT
CAAGCAACCAACTCTCAGGGACCATTCCTAATGGACTTGGGAGCCTCTCATTTTTGGCGT
GCATAAATGTGTCTCACAACCAACTCAAAGGTGAAATACCACAAGGAACACAGATAACGG
GTCAACCTAAATCTTCATTTGAAGGGAATGCAGGCCTTTGTGGTCTTCCTCTTTAGGACA
ATTTCTTTGGGACTAATGCGCCACCGACACAACAACCTCTGGAAGAAGAAGAAGTGTTGA
ACTGGGAAGGTGTCCCAATAGGGTATGGACCTGGAGTGGTGCTTGGACTTGCAATATCAC
ACCTCATTGCTACATACAAACCGGAGTGGCTCATCAAGATAATTGGTCCGAACAAGCACA
GAAATTGTTAGGATTGTTTTCAGTTTGAGTATGATCCTTCGATGTATGTCAAGTGGTTGA
TGATTCCTCTTGTATGGAAGCATCTCTTTATGTTTATTGTATCATTATCTGATGCTTAGT
TTCTTTTGTCGTTTTCTATAAAGTAAGAATGGTGAATGTTTTATTGTGAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1B636TF U 1
AF RS1B636JQ C 98
BS 1 229 RS1B636TF
BS 230 651 RS1B636JQ

RD RS1B636TF 229 0 0
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TCACAGGTCATATTCCTCTGTCTTTCTCCAATCTGAGCAAGCTGGAGTCACTAGACCTAT
CAAGCAACCAACTCTCAGGGACCATTCCTAATGGACTTGGGAGCCTCTCATTTTTGGCGT
GCATAAATGTGTCTCACAACCAACTCAAAGGTGAAATACCACAAGGAAC

QA 1 229 1 229
DS 

RD RS1B636JQ 554 0 0
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TGGGAGCCTCTCATTTTTGGCGTGCATAAATGTGTCTCACAACCAACTCAAAGGTGAAAT
ACCACAAGGAACACAGATAACGGGTCAACCTAAATCTTCATTTGAAGGGAATGCAGGCCT
TTGTGGTCTTCCTCTTTAGGACAATTTCTTTGGGACTAATGCGCCACCGACACAACAACC
TCTGGAAGAAGAAGAAGTGTTGAACTGGGAAGGTGTCCCAATAGGGTATGGACCTGGAGT
GGTGCTTGGACTTGCAATATCACACCTCATTGCTACATACAAACCGGAGTGGCTCATCAA
GATAATTGGTCCGAACAAGCACAGAAATTGTTAGGATTGTTTTCAGTTTGAGTATGATCC
TTCGATGTATGTCAAGTGGTTGATGATTCCTCTTGTATGGAAGCATCTCTTTATGTTTAT
TGTATCATTATCTGATGCTTAGTTTCTTTTGTCGTTTTCTATAAAGTAAGAATGGTGAAT
GTTTTATTGTGAAC

QA 1 554 1 554
DS 



AS 1 2

CO CL6011Contig1 714 2 4 U
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GGCTACGTCGACGTTGAGGAGCGGAGCAGCAGCTGCTACTCTCTCCAGACCTTGTTCGTT
CGAGTCGGCGAGGAGATGTCGCGGATTCTGCTCCGAACCAGAGAACGACGTACCAACATC
AGGAATCAGCAGACCTCTCGCCAAGATCCTCAAGGAGCTCAACAAAAAGGTTCCGGATTC
CGCCATCAAGACACGTGTCGAAGATGGTTTCGCCATGAAATACATTCCTTGGCATACTGT
GAATAGGATAATGAACCTGCATGCTCCAGAATGGTCAGGTGAAGTTCGGAGTGTCACTTA
CTCTCCTGATGGTAACACCGTCACTGTTGCTTACCGTGTCACTCTCTACGGCACTGATGC
TGAGATTTACAGGGAATCAACAGGGACCACTTCTGTAAATGACAAAGGCTATGGTGATGC
TTGCAAAAGGCCGTAGCAATGGCGTTTCGCCGTGCCTGTGCAAGACTTGGATTAGGGCTT
CATCTCTATCACGAGGATGCTCTGTAATAGCTCACGGTTTAACCATGGGAAACAAATTAC
ATTTGTTTGGGTGTTTCCGCTGCCTTAGTAGCAATAGCCGTTGAAGGTAAAAACTTAAGG
AAGGCAAGTTTTGTATCTACTGAAGATGCCCCTTCGGATTTTAAATCGGTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1E721TF U 1
AF RS1E721JQ C 546
BS 1 652 RS1E721TF
BS 653 653 RS1E721JQ
BS 654 687 RS1E721TF
BS 688 714 RS1E721JQ

RD RS1E721TF 687 0 0
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GGCTACGTCGACGTTGAGGAGCGGAGCAGCAGCTGCTACTCTCTCCAGACCTTGTTCGTT
CGAGTCGGCGAGGAGATGTCGCGGATTCTGCTCCGAACCAGAGAACGACGTACCAACATC
AGGAATCAGCAGACCTCTCGCCAAGATCCTCAAGGAGCTCAACAAAAAGGTTCCGGATTC
CGCCATCAAGACACGTGTCGAAGATGGTTTCGCCATGAAATACATTCCTTGGCATACTGT
GAATAGGATAATGAACCTGCATGCTCCAGAATGGTCAGGTGAAGTTCGGAGTGTCACTTA
CTCTCCTGATGGTAACACCGTCACTGTTGCTTACCGTGTCACTCTCTACGGCACTGATGC
TGAGATTTACAGGGAATCAACAGGGACCACTTCTGTAAATGACAAAGGCTATGGTGATGC
TTGCAAAAGGCCGTAGCAATGGCGTTTCGCCGTGCCTGTGCAAGACTTGGATTAGGGCTT
CATCTCTATCACGAGGATGCTCTGTAATAGCTCACGGTTTAACCATGGGAAACAAATTAC
ATTTGTTTGGGTGTTTCCGCTGCCTTAGTAGCAATAGCCGTTGAAGGTAAAA*CTTAAGG
AAGGCAAGTTTTGTATCTACTGAAGAT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1E721JQ 169 0 0
T
TATCACGAGGATGCTCTGTAATAGCTCACGGTTTAACCATGG*AAACAAATTACATTTGT
TTGGGTGTTTCCGCTGCCTTAGTAGCAATAGCCGTTGAAGGTAAAAACTTAAGGAAGGCA
AGTTTTGTATTTACTGAAGATGCCCCTTCGGATTTTAAATCGGTTTAT

QA 2 169 2 169
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6013Contig1 913 2 4 U
GCACTGCGAGGGGTTATTGTTATGCGTCCTCGAGGAAGACAGATCGAAGCTGTTGGCGTG
GAACCCTTATTTGGGGCAAACAAGGTCCACCAGTTCCAGGACGGGGGATGATTTCGACGC
TCTAGACGTTTATCTCTTTGGTTACGACATGAATCGTAACCACAAGATGTTGAGGTTTCA
CGGTTATTTATTGGCTGAGATGTACGAATTTAGCTCTAATTCATGGAGGGTTCTTGATGA
TGTCACGCTTCCCCAAAGCTGGGATGTAAAACACGGAGGTCATCGTTACGTGTCTTTGAA
GGGAAATTCTTATTTTCTGGCTCTGGAGATTATTACTACTACGGGTGGTGATGTTGTTGT
TGAAAAAGATGTTATCCTATGTTTTGATTTTTCAACAGATACGTTTGGACTAAAACCTCT
GCATCTTCCGTTTCTCGTTTCTTCTTGTGAAGAAGCTGTGACCCTCTCATCCTTCAGAGA
CGAAAAGCTAGCCCTTCTACATCAGAAAGGTCATGAAATCATTGAGGCGTTGGAGATTTG
GATCACGACTAAGTTTGATGATCAGCCCTTCAATGCTGCTGCTTTGACCTGGAGCAAGTT
CATGAACGTGGATATGAGACCTCTAATTGGTGATCGTTTCCTCCGGTTTGACGAGCACTT
TGCGGGCTTCTTCCTCATTGGCTCCGACGAGGAAGAGAAAGTCGCTGTGGTTTTTGATAT
GGACGGGTATGAGTTTTGTTTTGAACTTGTCACGACCCCCGATTATTACCCCACTGCTTT
TATCATTGGAGACGACGGATACTATAAGACTGTGAGTCTTGGAGTAGCTCCTAATACCTG
GAAACACGATCCTCTCCAAATATATGTTCCTACAGGATATGTTCCTCAGTGTTATTATCC
CCCATTTGTCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BP88TF U 1
AF RS1BP88JQ C 483
BS 1 693 RS1BP88TF
BS 694 694 RS1BP88JQ
BS 695 713 RS1BP88TF
BS 714 913 RS1BP88JQ

RD RS1BP88TF 713 0 0
GCACTGCGAGGGGTTATTGTTATGCGTCCTCGAGGAAGACAGATCGAAGCTGTTGGCGTG
GAACCCTTATTTGGGGCAAACAAGGTCCACCAGTTCCAGGACGGGGGATGATTTCGACGC
TCTAGACGTTTATCTCTTTGGTTACGACATGAATCGTAACCACAAGATGTTGAGGTTTCA
CGGTTATTTATTGGCTGAGATGTACGAATTTAGCTCTAATTCATGGAGGGTTCTTGATGA
TGTCACGCTTCCCCAAAGCTGGGATGTAAAACACGGAGGTCATCGTTACGTGTCTTTGAA
GGGAAATTCTTATTTTCTGGCTCTGGAGATTATTACTACTACGGGTGGTGATGTTGTTGT
TGAAAAAGATGTTATCCTATGTTTTGATTTTTCAACAGATACGTTTGGACTAAAACCTCT
GCATCTTCCGTTTCTCGTTTCTTCTTGTGAAGAAGCTGTGACCCTCTCATCCTTCAGAGA
CGAAAAGCTAGCCCTTCTACATCAGAAAGGTCATGAAATCATTGAGGCGTTGGAGATTTG
GATCACGACTAAGTTTGATGATCAGCCCTTCAATGCTGCTGCTTTGACCTGGAGCAAGTT
CATGAACGTGGATATGAGACCTCTAATTGGTGATCGTTTCCTCCGGTTTGACGAGCACTT
TGCGGGCTTCTTCCTCATTGGCTCCGACGAGGA*GAGAAAGTCGCTGTGGTTT

QA 1 713 1 713
DS 

RD RS1BP88JQ 431 0 0
AAAAGCTAGCCCTTCTACATCAGAAAGGTCATGAAATCATTGAGGCGTTGGAGATTTGGA
TCACGACTAAGTTTGATGATCAGCCCTTCAATGCTGCTGCTTTGACCTGGAGCAAGTTCA
TGAACGTGGATATGAGACCTTTAATTGGTGATCGTTTCCTCCGGTTTGACGAGCACTTTG
CGGGCTTTTTCCTCATTGGCTCCGACGAGGAAGAGAAAGTCGCTGTGGTTTTTGATATGG
ACGGGTATGAGTTTTGTTTTGAACTTGTCACGACCCCCGATTATTACCCCACTGCTTTTA
TCATTGGAGACGACGGATACTATAAGACTGTGAGTCTTGGAGTAGCTCCTAATACCTGGA
AACACGATCCTCTCCAAATATATGTTCCTACAGGATATGTTCCTCAGTGTTATTATCCCC
CATTTGTCTGC

QA 1 431 1 431
DS 



AS 1 2

CO CL6014Contig1 1177 2 2 U
GGGGCGCGTTATACTCTTTTCCAGAAATGGGGAAGAGACCGCCGAATCCATCAGACATCG
AAAACGGACTACCACCATTACCACCACCAGCTCGACCTCCGTTTCGCCCTCCCCTTCCCG
TGCCATGGTACGCATGGCTCGTGCCCCTCATCTTCGCAGCCAACTTCATCACATTCGCCA
TTACAATGTATGTGAACGATTGTCCGGCGAGATCAGATGAGTGTCTCTTGTTTGATGTCC
TTGGAAGGCTTTCCTTTCAACCGATGAAGGAGAATATTCTTATCGGTCCTTCTATTCCCA
CGCTGAGAAGACTTGGAGCACTCGAGAGGAGACTTGTGGAGGAAGGTGAGAGATGGCGTC
TCATATCTTGCATCTGGCTTCACGGTGGACTCCTCCATCTTCTGGCTAACATGATCAGCC
TTCTCTGTATAGGAATGCGTCTTGAACAAGAATTTGGATTCTTGAGAATCGGAGCTTTGT
ATGTTCTCTCCGGTCTTGGCGGAAGCCTTATGTCTTGCTTGACAGATTCACGAGGAGAAA
GGGTATCAGTAGGAGCATCTGGCGCCTTGTTCGGGTTACTAGGTGCAATGCTCTCAGAGC
TGATCACAAACTGGACAATCTATGAAAATAAGTGTACGGCACTTATGACATTGATCCTGA
TCATTGCACTGAACCTAAGCGTTGGATTCTTACCACGTGTAGACAACTCTGCTCACTGTG
GAGGGTTCCTAGCAGGTTTCTTACTAGGGTTTGTCCTTCTTCTCCGTCCGCAGTACGGAT
ACGTGAGCCCCAAGCACATTCCTCCTGGTTATGACATGAAACACAAGAAATCGAAATATA
AGTGTTATCAACACATCTTCATGTTTACATCTCTAGCCATCCTTCTTGCGGGATTCATTG
CGGGATATGCTAAGCTTCTCAGAGAACATACTAGAGGGAGCGATCCATTCAGGGATGTCA
ATTAGCATCTTGTAGCCAGCACCACTGATGACACATTCCCTGTAAAAGATCATTTCACAA
GATCCCAAGATTTTTCCATATTGGATACAAATATCATCATCAGAAAGGTTCATATATTTG
ACGATCCAAAAATATGTATCATACATGTTCAAAGGCTGTTGTAACTATACAATCTCTATG
AGAAAAGCATATATTAACTGTAGGAAACATTTTTCGC


BQ
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AF RS1EU90TF U 1
AF RS1EU90JQ C 413
BS 1 634 RS1EU90TF
BS 635 1177 RS1EU90JQ

RD RS1EU90TF 634 0 0
GGGGCGCGTTATACTCTTTTCCAGAAATGGGGAAGAGACCGCCGAATCCATCAGACATCG
AAAACGGACTACCACCATTACCACCACCAGCTCGACCTCCGTTTCGCCCTCCCCTTCCCG
TGCCATGGTACGCATGGCTCGTGCCCCTCATCTTCGCAGCCAACTTCATCACATTCGCCA
TTACAATGTATGTGAACGATTGTCCGGCGAGATCAGATGAGTGTCTCTTGTTTGATGTCC
TTGGAAGGCTTTCCTTTCAACCGATGAAGGAGAATATTCTTATCGGTCCTTCTATTCCCA
CGCTGAGAAGACTTGGAGCACTCGAGAGGAGACTTGTGGAGGAAGGTGAGAGATGGCGTC
TCATATCTTGCATCTGGCTTCACGGTGGACTCCTCCATCTTCTGGCTAACATGATCAGCC
TTCTCTGTATAGGAATGCGTCTTGAACAAGAATTTGGATTCTTGAGAATCGGAGCTTTGT
ATGTTCTCTCCGGTCTTGGCGGAAGCCTTATGTCTTGCTTGACAGATTCACGAGGAGAAA
GGGTATCAGTAGGAGCATCTGGCGCCTTGTTCGGGTTACTAGGTGCAATGCTCTCAGAGC
TGATCACAAACTGGACAATCTATGAAAATAAGTG

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1EU90JQ 765 0 0
TGATCAG
CTTCTCTGTATAGGAATGCGTCTTGAACAAGAATTTGGATTCTTGAGAATCGGAGCTTTG
TATGTTCTCTCCGGTCTTGGCGGAAGCCTTATGTCTTGCTTGACAGATTCACGAGGAGAA
AGGGTATCAGTAGGAGCATCTGGCGCCTTGTTCGGGTTACTAGGTGCAATGCTCTCAGAG
CTGATCACAAACTGGACAATCTATGAAAATAAGTGTACGGCACTTATGACATTGATCCTG
ATCATTGCACTGAACCTAAGCGTTGGATTCTTACCACGTGTAGACAACTCTGCTCACTGT
GGAGGGTTCCTAGCAGGTTTCTTACTAGGGTTTGTCCTTCTTCTCCGTCCGCAGTACGGA
TACGTGAGCCCCAAGCACATTCCTCCTGGTTATGACATGAAACACAAGAAATCGAAATAT
AAGTGTTATCAACACATCTTCATGTTTACATCTCTAGCCATCCTTCTTGCGGGATTCATT
GCGGGATATGCTAAGCTTCTCAGAGAACATACTAGAGGGAGCGATCCATTCAGGGATGTC
AATTAGCATCTTGTAGCCAGCACCACTGATGACACATTCCCTGTAAAAGATCATTTCACA
AGATCCCAAGATTTTTCCATATTGGATACAAATATCATCATCAGAAAGGTTCATATATTT
GACGATCCAAAAATATGTATCATACATGTTCAAAGGCTGTTGTAACTATACAATCTCTAT
GAGAAAAGCATATATTAACTGTAGGAAACATTTTTCGC

QA 8 765 8 765
DS 



AS 1 2

CO CL6015Contig1 1018 2 2 U
GGGGGTTTGTGAAAGAGGATAAGATTTCTAGGGTTTTTTTTGGGGATGAAATCGAATCTT
GAAGACAAAGAGGCCATGGCCCGTTTATCCGACCCGGATCCGGAAACCAACCCAGGTATG
CTCTTGAAAGAAGAAGACGACAACCTAAATAAGCAACACGAAGTTGGGTTTTTGCAGCCG
GTGACGAGTTCAATCACGGTTCCGAAGAAACCGTCAAAGGACCGTCACACGAAAGTAGAG
GGACGTGGTCGGAGGATCCGAATGCCCGCCGGTTGCGCTGCTCGGATCTTTCAGTTGACC
CGTGAGCTGGGTCACAAATCCGAAGGAGAAACCATTCGGTGGTTACTAGAACGGTCTGAA
CCGGCGATAATCGAAGCAACCGGAACCGGAACCATACCGGCGATTGCTGTATCGGTCAAC
GGTACTCTAAAGATCCCGACCGAACCTGCGCCGCAGTTTGAGAGTGACAGTGGGTCCGGG
AAACGTAGGAGGAGAAACTGCACGAGTGATTTCGTGGACGTTAAACGACGAGACAGCTCC
GTTACTTCTGGTCTTGCTCCGATAACGGCGCCGAGTTACGGCGTTAACCTAATGAACGTC
GTTAATACGCAGAATTTCGTGCCGTTTTGGCAAACTGGGTTCGTTACTGGTGGGCCGAAT
CAAATGGGTCATATGTGGGCCATACCCACCGTTGCTGCTCCATCGTTTCTGAACGGTGGT
ACTAGACCAGTCCCGAGTTATGTCTCAAACGCTTCGGATGCTAAGCCACAGATGGGAACA
AGCGGTGGTGGCGGTGACGGCCCAACTCAAACGCTGAGGGACTTTTCGTTCGAGACTTAT
GATAAAAAGGAGCGTCAGTTTCTGGGTGGCTCAGGGGACAACACATCTCCGTCTTCATGT
CACGAGACTTAAGAAAGTTATAGTTGGGTGTTTGTCTTGCTCTTAGGGCAGTTTGATTCT
TCCTGGTTGACCAAAAAGGCGTGTAATGGAGTTGATATAACAACTATTTCAATTAGGT


BQ
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AF RS1BL77TF U 1
AF RS1BL77JQ C 243
BS 1 665 RS1BL77TF
BS 666 1018 RS1BL77JQ

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GTGACGAGTTCAATCACGGTTCCGAAGAAACCGTCAAAGGACCGTCACACGAAAGTAGAG
GGACGTGGTCGGAGGATCCGAATGCCCGCCGGTTGCGCTGCTCGGATCTTTCAGTTGACC
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CCGGCGATAATCGAAGCAACCGGAACCGGAACCATACCGGCGATTGCTGTATCGGTCAAC
GGTACTCTAAAGATCCCGACCGAACCTGCGCCGCAGTTTGAGAGTGACAGTGGGTCCGGG
AAACGTAGGAGGAGAAACTGCACGAGTGATTTCGTGGACGTTAAACGACGAGACAGCTCC
GTTACTTCTGGTCTTGCTCCGATAACGGCGCCGAGTTACGGCGTTAACCTAATGAACGTC
GTTAATACGCAGAATTTCGTGCCGTTTTGGCAAACTGGGTTCGTTACTGGTGGGCCGAAT
CAAAT

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DS 

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GGCGATAATCGAAGCAACCGGAACCGGAACCATACCGGCGATTGCTGTATCGGTCAACGG
TACTCTAAAGATCCCGACCGAACCTGCGCCGCAGTTTGAGAGTGACAGTGGGTCCGGGAA
ACGTAGGAGGAGAAACTGCACGAGTGATTTCGTGGACGTTAAACGACGAGACAGCTCCGT
TACTTCTGGTCTTGCTCCGATAACGGCGCCGAGTTACGGCGTTAACCTAATGAACGTCGT
TAATACGCAGAATTTCGTGCCGTTTTGGCAAACTGGGTTCGTTACTGGTGGGCCGAATCA
AATGGGTCATATGTGGGCCATACCCACCGTTGCTGCTCCATCGTTTCTGAACGGTGGTAC
TAGACCAGTCCCGAGTTATGTCTCAAACGCTTCGGATGCTAAGCCACAGATGGGAACAAG
CGGTGGTGGCGGTGACGGCCCAACTCAAACGCTGAGGGACTTTTCGTTCGAGACTTATGA
TAAAAAGGAGCGTCAGTTTCTGGGTGGCTCAGGGGACAACACATCTCCGTCTTCATGTCA
CGAGACTTAAGAAAGTTATAGTTGGGTGTTTGTCTTGCTCTTAGGGCAGTTTGATTCTTC
CTGGTTGACCAAAAAGGCGTGTAATGGAGTTGATATAACAACTATTTCAATTAGGT

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

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ATTCACACTTCAAGCAAAATCCATGGACAAATCTACATCCCTGAAGTAAACTGGATGTTA
ATGTGCCTTTGCTTGGCTGTCACGGTAGGGTTAAGAGACACTAACATGATCGGTCACGCA
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AAACATGAGTTCGACGTTGAGAACAAGGTCTCAATAGACCGGATCATCGCTCTAGGACCG
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GTCCCAGCTGTGTTCGGACACTTCGTGACGAACCTGCCTGCCTTCCACAGGATCCTTGTC
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GTTGAAACCGAACCGGGAGGTGAAGGGTCTGAGTTGAGGATGGAGATAATGGAAGCGAAA
GAAGCAGGAGTAGCGTATATATTGGGACAGTCTTACGCAAAGGCGAAGCAGTCTTCTTCC
GTGTTGAAGAAGTTAGCGGTGAGTGTTGTGTTTGCGTTTATGAGCACGAATTGCAGAGGG
ACAGATGTTGTGCTTAATGTTCCTCATACTTCTCTGATTGAAGTTGGGATGGTTTATTAC
GTCTAAAAGAGAGAAAGATGTTTAGGTTTAACAGAAAGAAAGAAGTAGATCAATACACTA
CAGTGTAGTAGAGAGACAAGAGAGTTCTGACAGAGAAGTTAGTGTGTTACATTTGCTAGT
GTATAATGTGTAAATATACTTACACTTAATGAATGATATCTAAGAAATGATATATTTTTG
AGTTGTGATAGTT


BQ
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AF RS1D445TF U 1
AF RS1D445JQ C 383
BS 1 614 RS1D445TF
BS 615 1213 RS1D445JQ

RD RS1D445TF 614 0 0
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ATTCACACTTCAAGCAAAATCCATGGACAAATCTACATCCCTGAAGTAAACTGGATGTTA
ATGTGCCTTTGCTTGGCTGTCACGGTAGGGTTAAGAGACACTAACATGATCGGTCACGCA
TACGGGCTTGCTGTGACATCCGTGATGCTTGTAACCACATGTTTGATGACATTAGTAATG
ACAATCGTATGGAAACAGAGAACCATTACAGTTCTTGCTTTCTTGCTCTGTTTCGGTTCC
ATAGAGCTTCTCTACTTCTCGTCATGCGTCTACAAAATACCTGAAGGAGGATGGATCCCT
ATCCTCCTCTCCTTAACATTCATGGCTGTGATGTACATCTGGAACTACGGAACTACAAAG
AAACATGAGTTCGACGTTGAGAACAAGGTCTCAATAGACCGGATCATCGCTCTAGGACCG
AGTATTGGGATGGTTAGAGTTCCAGGGATAGGATTGGTCTATACTAATCTAGTGACAGGT
GTCCCAGCTGTGTTCGGACACTTCGTGACGAACCTGCCTGCCTTCCACAGGATCCTTGTC
TTTGTATGCGTGAA

QA 1 614 1 614
DS 

RD RS1D445JQ 831 0 0
AT
GCTGTGATGTACATCTGGA*CTACGGAACTACAAAGAAACATGAGTTCGACGT*GAGAAC
AAGGTCTCAATAGACCGGATCATCGCTCTAGGACCGAGTATTGGGATGGTTAGAGTTCCA
GGGATAGGATTGGTCTATACTAATCTAGTGACAGGTGTCCCAGCTGTGTTCGGACACTTC
GTGACGAACCTGCCTGCCTTCCACAGGATCCTTGTCTTTGTATGCGTGAAGTCGGTTCAG
GTTCCGTACGTTGGAGAAGAAGAGAGGTTTGTGATAAGCAGAATGGGGCCAAAAGAGTAT
GGGATGTTTAGAAGTGTGGTTAGGTATGGATACAGAGATGTTCCTAGGGAGATGTATGAT
TTCGAGAGCCGGTTAGTGTCTGCTATTGTGGAGTTCGTTGAAACCGAACCGGGAGGTGAA
GGGTCTGAGTTGAGGATGGAGATAATGGAAGCGAAAGAAGCAGGAGTAGCGTATATATTG
GGACAGTCTTACGCAAAGGCGAAGCAGTCTTCTTCCGTGTTGAAGAAGTTAGCGGTGAGT
GTTGTGTTTGCGTTTATGAGCACGAATTGCAGAGGGACAGATGTTGTGCTTAATGTTCCT
CATACTTCTCTGATTGAAGTTGGGATGGTTTATTACGTCTAAAAGAGAGAAAGATGTTTA
GGTTTAACAGAAAGAAAGAAGTAGATCAATACACTACAGTGTAGTAGAGAGACAAGAGAG
TTCTGACAGAGAAGTTAGTGTGTTACATTTGCTAGTGTATAATGTGTAAATATACTTACA
CTTAATGAATGATATCTAAGAAATGATATATTTTTGAGTTGTGATAGTT

QA 3 831 3 831
DS 



AS 1 2

CO CL6017Contig1 1002 2 8 U
GGAAGCACAAGTAAAAGAAGTGAAACCTAGACCGTTGTCTCCATATGCCGCCTATGAAGA
CTTGAAACCTCCAACATCTCCTATTCCGGCCACAGCACTTGGTTCCACCAAAGCTAAGGA
GGTGGATGCAACTCCGGTTCCGGAGGTGAAAGCAACTCAGGCTCCTGTTGAGGCCAATGT
AGCTCCACCACCAGAAAATCCTGTTGAGGTCAATGTCCCAGAAGGAGTAGAAGTGAAACA
AGTTGAGGAAAAGAAAGAGAGGCCTCTTTCTCCTTATGCTAGCTATGACAATCTAAAACC
CCCTTCATCACCCACTCCTAAAGCTTCGGGTATCCGCAAGAGCGACTCTGTGACGCCTGT
TCCAACCGATTCTGTTACTGTTGAAAGCTCAACAGTTGAAATAAGTGTCACTGAGGAGGC
AGAAGCACCAGTTATACCAAAAATGAGACCTCTTTCTCCTTATGCAGCTTACGCAGACCT
GAAACCACCAACCTCACCAACTCCTGCATCAACCGGTCCCAAGAAAACAGCACCTGCAGA
AGAAAACTCAGAGTTGCCTGGAGGCAATGACGTGGTGGAAACAGTTGATGGTAGTGTAAA
AACGACTGAATCTGCTTCCGTGCCAGAAGCAGAAACTGTTAACAATGTGACAGACACTTC
CCTTACACCAGAAGAAAGTGCAGCTAATCCGCCGAAGCCAAGACCATTGTCACCTTACAC
AATGTATGAGGACATGAAGCCTCCAACATCACCTCTTCCATCCCCGGTCATCAATCATTA
GTTATTTGTGAAATGATTTGCCCTTAAACCCCTGGAGTTTTTTTTTTTTTTCTTTGCTTC
AGATTTTAAGAAAAAATGAGAGAGGTGTGGGGCAAATCAGTTTTGCAGGTATGAATCATT
GAGCTTATATATGTAAAAGTAATACAAGATTCATCTTTTGCTTTCTTGAGTTCTGTTCAA
ATATTCATCCATTTCTTATAACCCATTTGTTTCCTTCCCAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C757TF U 1
AF RS1C757JQ C 509
BS 1 713 RS1C757TF
BS 714 714 RS1C757JQ
BS 715 730 RS1C757TF
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BS 752 1002 RS1C757JQ

RD RS1C757TF 751 0 0
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CTTGAAACCTCCAACATCTCCTATTCCGGCCACAGCACTTGGTTCCACCAAAGCTAAGGA
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AGTTGAGGAAAAGAAAGAGAGGCCTCTTTCTCCTTATGCTAGCTATGACAATCTAAAACC
CCCTTCATCACCCACTCCTAAAGCTTCGGGTATCCGCAAGAGCGACTCTGTGACGCCTGT
TCCAACCGATTCTGTTACTGTTGAAAGCTCAACAGTTGAAATAAGTGTCACTGAGGAGGC
AGAAGCACCAGTTATACCAAAAATGAGACCTCTTTCTCCTTATGCAGCTTACGCAGACCT
GAAACCACCAACCTCACCAACTCCTGCATCAACCGGTCCCAAGAAAACAGCACCTGCAGA
AGAAAACTCAGAGTTGCCTGGAGGCAATGACGTGGTGGAAACAGTTGATGGTAGTGTAAA
AACGACTGAATCTGCTTCCGTGCCAGAAGCAGAAACTGTTAACAATGTGACAGACACTTC
CCTTACACCAGAAGAAAGTGCAGCTAATCCGCCGAAGCCAAGACCATTGTCAC*TTACAC
AATGTATGAG*ACATGAAGC*TCCAACATCA

QA 1 751 1 751
DS 

RD RS1C757JQ 494 0 0
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GCAGAAACTGTTAACAATGTGACAGACACTTCCCTTACACCAGAAGAAAGTGCAGTTAAT
CCGCCGAAGCCAAGACCATTGTCACCTTACACAATGTATGAGGACATGAAGCCTCCAACA
TCACCTCTTCCATCCCCGGTCATCAATCATTAGTTATTTGTGAAATGATTTGCCCTTAAA
CCCCTGGAGTTTTTTTTTTTTTTCTTTGCTTCAGATTTTAAGAAAAAATGAGAGAGGTGT
GGGGCAAATCAGTTTTGCAGGTATGAATCATTGAGCTTATATATGTAAAAGTAATACAAG
ATTCATCTTTTGCTTTCTTGAGTTCTGTTCAAATATTCATCCATTTCTTATAACCCATTT
GTTTCCTTCCCAAA

QA 1 494 1 494
DS 



AS 1 2

CO CL6018Contig1 1402 2 4 U
GGAGAGAGAGAGAGAGTCGGAAGAAGGAAACGGAGGGAGTGGAAAAAATGGCGGAGGATG
AAGAACCACCGATGGCTGTTCAAATCCAACCAGATATTTCCGCCGTTAAGACCCTCTCTT
TAGAGGAATCAAGGGACGCTGTTGGTGTCACTGTCATCACTGGTTATCTCGGCGCCGGGA
AGTCCACCCTTGTGAATTATATTCTGAACGGGAAACACGGGAAGAAAATAGCGGTGATTT
TGAACGAGTTTGGGGAAGAGATTGGAGTAGAGAGGGCTATGATTAACGAAGGTGAATGAG
GTGCTCTTGTTGAAGAATGGGTCGAGCTTGCTAATGGCTGTATTTGCTGCACTGTCAAGC
ACAGTCTTGTTCAAGCTCTCGAGCAGCTTGTTCCGAGGAAAGACAGGCTTGATCATATAT
TACTGGAGACAACAGGTTTAGCAAATCCGGCTCCTCTTGCTTCTATTCTTTGGTTGGATG
ACCAGTTAGAATCAGAAGTCAAGCTTGACTGCATTGTTACTGTTGTGGATGCAAAGAACC
TTCGTTTTCAGCTCAATGAGCGCCGTGACTCATCCTCCTTTCCCGAGGCTTTTAATCAAA
TAGCATTTGCAGACACGGTGATAATGAACAAGGTTGACTTGATTTCTCAAGAGGAATCTT
ATGAACTGGAGAAAGAGATTCACTCCTCAACTCCCTCGCCAATGTCATCCGTTCTGTCAG
GTGTCGAGTTGATTTATCCAACATATTAGAATGCCAAGCATATGATTCTACCGTTAAGTC
TCTTAAACTTCTCTTTTCTGTGTACATGTTTGAGTACTATTTATGCTTTTGACTACAACC
AACAATTAAACCTTTCTTTCTTCACTGCTGCATTTTTAGCATGCTAGTCGTCTTGAATCC
CTGCTAGAAGCAAATAAATCATTAACGACAACGGATCTTCATGATAGTGGAGTGAGGACT
CTATGCATAAGTGAACCTCGGCCTATTAACCTCGACAAGGTTCGTTTATGGCTTGAGGAA
GTTCTGTGGGATAAAAAACTTGACATGGATGTATATCGCTGCAAGGCTGTATTAAGCATT
CAAAACTCAGACCAGCTGCATATATTGCAGGCTGTTAAAGAGATATATGAGATAGTTCCA
GCACGACAATGGAGTGAAGAAGAGAACAGAGTGAACAAAGTTGTGTTTATAGGGCACAAA
CTGGACGAAGAAGCTCTTAAAACCGGCTTAAGAGAGTGCACAACCTGAAGAAAAACCTTA
GATGTTGCAGTGAAAACCAGATTGGTCTAAACAGTTTTGTCTTTTGCCGATCTTGTACGA
AGCTCTCTAGTCAATTGCTGAGTTGGGGTATTAGAGATTGTAATTTTACCATCTTAGTGT
AATTTTACACTAGAATTTTATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D522TF U 1
AF RS1D522JQ C 547
BS 1 720 RS1D522TF
BS 721 721 RS1D522JQ
BS 722 788 RS1D522TF
BS 789 1402 RS1D522JQ

RD RS1D522TF 788 0 0
GGAGAGAGAGAGAGAGTCGGAAGAAGGAAACGGAGGGAGTGGAAAAAATGGCGGAGGATG
AAGAACCACCGATGGCTGTTCAAATCCAACCAGATATTTCCGCCGTTAAGACCCTCTCTT
TAGAGGAATCAAGGGACGCTGTTGGTGTCACTGTCATCACTGGTTATCTCGGCGCCGGGA
AGTCCACCCTTGTGAATTATATTCTGAACGGGAAACACGGGAAGAAAATAGCGGTGATTT
TGAACGAGTTTGGGGAAGAGATTGGAGTAGAGAGGGCTATGATTAACGAAGGTGAATGAG
GTGCTCTTGTTGAAGAATGGGTCGAGCTTGCTAATGGCTGTATTTGCTGCACTGTCAAGC
ACAGTCTTGTTCAAGCTCTCGAGCAGCTTGTTCCGAGGAAAGACAGGCTTGATCATATAT
TACTGGAGACAACAGGTTTAGCAAATCCGGCTCCTCTTGCTTCTATTCTTTGGTTGGATG
ACCAGTTAGAATCAGAAGTCAAGCTTGACTGCATTGTTACTGTTGTGGATGCAAAGAACC
TTCGTTTTCAGCTCAATGAGCGCCGTGACTCATCCTCCTTTCCCGAGGCTTTTAATCAAA
TAGCATTTGCAGACACGGTGATAATGAACAAGGTTGACTTGATTTCTCAAGAGGAATCTT
ATGAACTGGAGAAAGAGATTCACTCCTCAACTCCCTCGCCAATGTCATCCGTTCTGTCAG
*TGTCGAGTTGATTTATCCAACATATTAGAATGCCAAGCATATGATTCTACCGTTAAGTC
TCTTAAAC

QA 1 788 1 788
DS 

RD RS1D522JQ 856 0 0
TTCAGCTCAATGAGCGCCGTGACTCATCCTC*TTTCCCGAGGCTTT*AATCAAATAGCAT
T*GCAGACACGGTGATAATGAACAAGGTTGACTTGATTTCTCAAGAGGAATCTTATGAAC
TGGAGAAGGAGATTCACTCCTCAACTCCCTCGCCAATGTCATCCGTTCTGTCAGGTGTCG
AGTTGATTTATCCAACATATTAGAATGCCAAGCATATGATTCTACCGTTAAGTCTCTTAA
ACTTCTCTTTTCTGTGTACATGTTTGAGTACTATTTATGCTTTTGACTACAACCAACAAT
TAAACCTTTCTTTCTTCACTGCTGCATTTTTAGCATGCTAGTCGTCTTGAATCCCTGCTA
GAAGCAAATAAATCATTAACGACAACGGATCTTCATGATAGTGGAGTGAGGACTCTATGC
ATAAGTGAACCTCGGCCTATTAACCTCGACAAGGTTCGTTTATGGCTTGAGGAAGTTCTG
TGGGATAAAAAACTTGACATGGATGTATATCGCTGCAAGGCTGTATTAAGCATTCAAAAC
TCAGACCAGCTGCATATATTGCAGGCTGTTAAAGAGATATATGAGATAGTTCCAGCACGA
CAATGGAGTGAAGAAGAGAACAGAGTGAACAAAGTTGTGTTTATAGGGCACAAACTGGAC
GAAGAAGCTCTTAAAACCGGCTTAAGAGAGTGCACAACCTGAAGAAAAACCTTAGATGTT
GCAGTGAAAACCAGATTGGTCTAAACAGTTTTGTCTTTTGCCGATCTTGTACGAAGCTCT
CTAGTCAATTGCTGAGTTGGGGTATTAGAGATTGTAATTTTACCATCTTAGTGTAATTTT
ACACTAGAATTTTATA

QA 1 856 1 856
DS 



AS 1 2

CO CL6019Contig1 926 2 2 U
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TCCGCTTTACCCTTTTCTTCTCTTTCTGAATAGAGATGAATATCACAACAGGGAAACGGA
GGCGCTGCGTTGGTGGGAAGACGGAGAGACGCTTGGAGGTAGAGACCTCGTCGGCGGCGG
TACGTGGCTCGGTTGCACCAGGAAAGGCCGTATCGCTTTCCTCACCAATTTCAGGGAGAC
CTCCTCCATCCCCGATGCTAAATCCCGCGGACATCTCCCTCTTCGTTACTTGCAGAGCGA
AAAGAGCCCTGCCGAGTTTGCCCAGGAGATCGAAAAGGAGGCTTCTCTCTACAACGGCTT
CAACCTCCTTGTCGCTCATGTCTTGTCCAAATCCATGTTTTACATTACCAACCGCCCACT
CCACGGTGACAAGCAGCACCTCGTTACGCTTGTCTCTCCAGGGATCCATGTCCTTTCCAA
CGCCAACCTCGACTCTCCTTGGCCCAAGTGTCTCAGGTTGAGAGACGCTTTCAATCAGCT
TCTCACCCAAAACCAAGGTGTTGAATTCCCCCTTATGACTATGGTCGAGGAGGTGATGAC
TGATACTGTCAAGGACCAAGAACCTGTCCTGCCTCCCGTTTTCACCCCAGAGATTGAATA
CCATTTCAGCTCTATCTTCGTCGACATTCCTAGACCTGCTGGTCGTTATGGGACCAGAAG
CATCTCCGCACTCACCATCAAGTCCCACGGTGAGGTCTGTTTCTTCGAGAGGCATCTTGA
ACAAGGTGGTTCCTGGAAGGACCACATTCAACACTTTGTTATACAAAATCAATGCTTTAC
TTGACCCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTATAAGTCTTTCACATTTGTAATTTGTGCTTGT
ATCTACTACATATAGAGAAAACAGCG


BQ
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AF RS1BJ21TF U 1
AF RS1BJ21JQ C 388
BS 1 607 RS1BJ21TF
BS 608 926 RS1BJ21JQ

RD RS1BJ21TF 607 0 0
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TCCGCTTTACCCTTTTCTTCTCTTTCTGAATAGAGATGAATATCACAACAGGGAAACGGA
GGCGCTGCGTTGGTGGGAAGACGGAGAGACGCTTGGAGGTAGAGACCTCGTCGGCGGCGG
TACGTGGCTCGGTTGCACCAGGAAAGGCCGTATCGCTTTCCTCACCAATTTCAGGGAGAC
CTCCTCCATCCCCGATGCTAAATCCCGCGGACATCTCCCTCTTCGTTACTTGCAGAGCGA
AAAGAGCCCTGCCGAGTTTGCCCAGGAGATCGAAAAGGAGGCTTCTCTCTACAACGGCTT
CAACCTCCTTGTCGCTCATGTCTTGTCCAAATCCATGTTTTACATTACCAACCGCCCACT
CCACGGTGACAAGCAGCACCTCGTTACGCTTGTCTCTCCAGGGATCCATGTCCTTTCCAA
CGCCAACCTCGACTCTCCTTGGCCCAAGTGTCTCAGGTTGAGAGACGCTTTCAATCAGCT
TCTCACCCAAAACCAAGGTGTTGAATTCCCCCTTATGACTATGGTCGAGGAGGTGATGAC
TGATACT

QA 1 607 1 607
DS 

RD RS1BJ21JQ 539 0 0
CAAATCCATGTTTTACATTACCAACCGCCCACTCCACGGTGACAAGCAGCACCTCGTTAC
GCTTGTCTCTCCAGGGATCCATGTCCTTTCCAACGCCAACCTCGACTCTCCTTGGCCCAA
GTGTCTCAGGTTGAGAGACGCTTTCAATCAGCTTCTCACCCAAAACCAAGGTGTTGAATT
CCCCCTTATGACTATGGTCGAGGAGGTGATGACTGATACTGTCAAGGACCAAGAACCTGT
CCTGCCTCCCGTTTTCACCCCAGAGATTGAATACCATTTCAGCTCTATCTTCGTCGACAT
TCCTAGACCTGCTGGTCGTTATGGGACCAGAAGCATCTCCGCACTCACCATCAAGTCCCA
CGGTGAGGTCTGTTTCTTCGAGAGGCATCTTGAACAAGGTGGTTCCTGGAAGGACCACAT
TCAACACTTTGTTATACAAAATCAATGCTTTACTTGACCCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTT
TATAAGTCTTTCACATTTGTAATTTGTGCTTGTATCTACTACATATAGAGAAAACAGCG

QA 1 539 1 539
DS 



AS 1 2

CO CL6020Contig1 545 2 2 U
GCAAGAACTCTGTTGATTTGAGTGATATGGGTTTGGTGGCAATAGGGAGAGGATGTTGTA
AGCTGAGTAAGTTTGAGATTCAAGGGTGTGAGAATGTGACGGTGAAGGGAGTAAGGACAA
TGGTTACTCTTCTTGACTGGAATCGGTAACTTGAGCTTGAGCGAGCTAGATTATTGGCCG
CCGCAGGATAGAGATGTCAACCAGAGGAGTCTTTCGCTTCCCGGTGCGGGGTTGTTGCAA
GAATGTTTAACTCTGAGGAAGCTATTCATCCATGGAACGGCTCATGAGCATTTCATGAAT
TTTTTGTTGAGGATCCCTAACTTAAGGGATGTGCAGCTTAGAGAAGACTATTACCCAGCG
CCTGAGAATGATATGAGTACTGAGATGAGAGTTTGGTTCTTGTAGTAGATTCGAGGACCA
GTTGAACAGCCCGCAACATCATCGACTGAGAGACTAAACACTGAGTTACTTCCACACCAT
TTTTACATATGTATTGACTTCAGTTTCTGTTTACTCTGAATGTTACATATGTTATGTTTG
AATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 

AF RS1C215JQ C 1
AF RS1C215TF U 317
BS 1 316 RS1C215JQ
BS 317 545 RS1C215TF

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AGCTGAGTAAGTTTGAGATTCAAGGGTGTGAGAATGTGACGGTGAAGGGAGTAAGGACAA
TGGTTACTCTTCTTGACTGGAATCGGTAACTTGAGCTTGAGCGAGCTAGATTATTGGCCG
CCGCAGGATAGAGATGTCAACCAGAGGAGTCTTTCGCTTCCCGGTGCGGGGTTGTTGCAA
GAATGTTTAACTCTGAGGAAGCTATTCATCCATGGAACGGCTCATGAGCATTTCATGAAT
TTTTTGTTGAGGATCCCTAACTTAAGGGATGTGCAGCTTAGAGAAGACTATTACCCAGCG
CCTGAGAATGATATGAGTACTGAGATGAGAGTT*GGTTCTTGTAGTAGATTCGAGGACCA
GTTGAACAGCC*GCAACATCATCGACTGAGAGACTAAACACTGAGTTACTTCCACACCAT
TTTTACATATGTATTGACTTCAGTTTCTGTTTACTCTGAATGTTACATATGTTATGTTTG
AATGC

QA 1 545 1 545
DS 

RD RS1C215TF 229 0 0
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GTACTGAGATGAGAGTTTGGTTCTTGTAGTAGATTCGAGGACCAGTTGAACAGCCCGCAA
CATCATCGACTGAGAGACTAAACACTGAGTTACTTCCACACCATTTTTACATATGTATTG
ACTTCAGTTTCTGTTTACTCTGAATGTTACATATGTTATGTTTGAATGC

QA 1 229 1 229
DS 



AS 1 2

CO CL6021Contig1 222 2 1 U
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TCTTGTGGTGCTTGATTTTGGCCAAATCTTTCTCATTTCAATGCATTAAAAATCACATAG
CCAAAGAATCCAAAAAGAAACTTGTGTAACGTCAATCGAGTTATATCCCCTAATCTTTCT
TGTCTTCCACGAACCAAATCCCATCTTTAAATCATATCAGCT


BQ
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AF RS1F978JQ C 1
AF RS1F978TF U 1
BS 1 222 RS1F978TF

RD RS1F978JQ 222 0 0
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TCTTGTGGTGCTTGATTTTGGCCAAATCTTTCTCATTTCAATGCATTAAAAATCACATAG
CCAAAGAATCCAAAAAGAAACTTGTGTAACGTCAATCGAGTTATATCCCCTAATCTTTCT
TGTCTTCCACGAACCAAATCCCATCTTTAAATCATATCAGCT

QA 1 222 1 222
DS 

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TCTTGTGGTGCTTGATTTTGGCCAAATCTTTCTCATTTCAATGCATTAAAAATCACATAG
CCAAAGAATCCAAAAAGAAACTTGTGTAACGTCAATCGAGTTATATCCCCTAATCTTTCT
TGTCTTCCACGAACCAAATCCCATCTTTAAATCATATCAGCT

QA 1 222 1 222
DS 



AS 1 2

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GCCAGCTTACATGACACTCACATCTCAAACAGACGCAACCACTCAAAACAGATTCATAAA
AACCGAAACTTTCATAGATCCAACACCAAGTTCCACAAGCTTACACATCTTAAACCTCAA
AACAAAACTCAAAACAACAATTATAAAGAAAAAAGCCTTTCAAAGCTCGTCTTCATCCCT
CAGATACTCTCCAATATCAGCCTGATGAAGCACAACGATCCCATTCGGAACCAACTTCCG
ACAATCCTGCGTACTCTTCGCCGCGATCCCAAACCCCAACGGAACATCCGACATGGAGAA
CACAACAACCCCATCTCCAGGCACGATGCTGTCAGTAATCCTCCCTAACCCTCCTTTCAA
CACATGGTTCCCGTACAGAAACGACATCTCCGACGTGGGTTTCAGCCATACCTTGTGCTT
CGCGTTCGCCGCCAAGAGGTTGAGCGACATGATCGTCAGGTGGAAGCTCCCGGCGTGAGT
GTACTTCCCGATGCAGGTTCCGAGGGAGACCAGGCTTTTGCGGGAGATGTTGGTGGCTCG
CTTCACGAGCGACTCGCTGACGTAGTAGACTCTGCTCTTCTGGAGACGGAAGCAGTAGCG
GCCGGGGTCTGATTCGGGTCCTTCGTGAGATGGGTTCTCGACGATGTTCTTGAGGTTGTT
GCCCACGAACTTGAAGATCTTCTCGAAGACGACGGTCGTCTCGTTCTCGTCCAAAGGCCG
CATCTTTTTTGGTTTAGGACAAGGAAGATTCCC


BQ
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AF RS1AN81JQ U 19
AF RS1AN81TF C 1
BS 1 18 RS1AN81TF
BS 19 470 RS1AN81JQ
BS 471 813 RS1AN81TF

RD RS1AN81JQ 452 0 0
CTGGCTATAAAATCTAAAGCAAATGAAGCTGATCAAACACTTGCCAGCTTACATGACACT
CACATCTCAAACAGACGCAACCACTCAAAACAGATTCATAAAAACCGAAACTTTCATAGA
TCCAACACCAAGTTCCACAAGCTTACACATCTTAAACCTCAAAACAAAACTCAAAACAAC
AATTATAAAGAAAAAAGCCTTTCAAAGCTCGTCTTCATCCCTCAGATACTCTCCAATATC
AGCCTGATGAAGCACAACGATCCCATTCGGAACCAACTTCCGACAATCCTGCGTACTCTT
CGCCGCGATCCCAAACCCCAACGGAACATCCGACATGGAGAACACAACAACCCCATCTCC
AGGCACGATGCTGTCAGTAATCCTCCCTAACCCTCCTTTCAACACATGGTTCCCGTACAG
AAACGACATCTCCGACGTGGGTTTCAGCCATA

QA 1 452 1 452
DS 

RD RS1AN81TF 813 0 0
CTGAACATGAAGCATGTGCTGGCTATAAAATCTAAAGCAAATGAAGCTGATCAAACACTT
GCCAGCTTACATGACACTCACATCTCAAACAGACGCAACCACTCAAAACAGATTCATAAA
AACCGAAACTTTCATAGATCCAACACCAAGTTCCACAAGCTTACACATCTTAAACCTCAA
AACAAAACTCAAAACAACAATTATAAAGAAAAAAGCCTTTCAAAGCTCGTCTTCATCCCT
CAGATACTCTCCAATATCAGCCTGATGAAGCACAACGATCCCATTCGGATCCAACTTCCG
ACAATCCTGCGTACTCTTCGCCGCGATCCCAAACCCCAACGGAACATCCGACATGGAGAA
CACAACAACCCCATCTCCAGGCACGATGCTGTCAGTAATCCTCCCTAACCCTCCTTTCAA
CACATGGTTCCCGTACAGAAACGACATCTCCGACGTGGGTTTCAGCCATACCTTGTGCTT
CGCGTTCGCCGCCAAGAGGTTGAGCGACATGATCGTCAGGTGGAAGCTCCCGGCGTGAGT
GTACTTCCCGATGCAGGTTCCGAGGGAGACCAGGCTTTTGCGGGAGATGTTGGTGGCTCG
CTTCACGAGCGACTCGCTGACGTAGTAGACTCTGCTCTTCTGGAGACGGAAGCAGTAGCG
GCCGGGGTCTGATTCGGGTCCTTCGTGAGATGGGTTCTCGACGATGTTCTTGAGGTTGTT
GCCCACGAACTTGAAGATCTTCTCGAAGACGACGGTCGTCTCGTTCTCGTCCAAAGGCCG
CATCTTTTTTGGTTTAGGACAAGGAAGATTCCC

QA 1 813 1 813
DS 



AS 1 2

CO CL6023Contig1 448 2 1 U
GGAGAAAACAAATACTTGTCACAAGTTATAGTATCTCTATCTTTAACCATGAGATCTGCT
ACTTGGTGTATAGTTTCTTGTCTTCTCATCTTTCTCGTAATAGCTGCTGGTAAAGGACCT
AAAGTTGATCAAAATAATGTGTGTCCAAGAATAGAAGATATCGAAGGAAACTGCAAAGTT
GATGGACCGAAAGCGTGTGCGAAGTATTTTTCGTCAACTTATAACGAGAACTATTTTAAT
TGCACATGTGACAACGTCTACATGATACGTAAGATCAAGCGTTACTGCCGATGTCACTCG
ATATGTTAGTCCTTACTAATAACAAAGGAGAAGTTGTGAGAGTTTGTAGTGTGGAGATCA
CACACGAATAGGTTTTGTTAGTCACCAATCTTTCTTTTGTAATAAAGTCATGAGATTATA
TTTTATAACTAGTATGAGTTTCTCAATC


BQ
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AF RS1DY05JQ C 1
AF RS1DY05TF U 1
BS 1 448 RS1DY05TF

RD RS1DY05JQ 448 0 0
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AAAGTTGATCAAAATAATGTGTGTCCAAGAATAGAAGATATCGAAGGAAACTGCAAAGTT
GATGGACCGAAAGCGTGTGCGAAGTATTTTTCGTCAACTTATAACGAGAACTATTTTAAT
TGCACATGTGACAACGTCTACATGATACGTAAGATCAAGCGTTACTGCCGATGTCACTCG
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CACACGAATAGGTTTTGTTAGTCACCAATCTTTCTTTTGTAATAAAGTCATGAGATTATA
TTTTATAACTAGTATGAGTTTCTCAATC

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DS 

RD RS1DY05TF 448 0 0
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ACTTGGTGTATAGTTTCTTGTCTTCTCATCTTTCTCGTAATAGCTGCTGGTAAAGGACCT
AAAGTTGATCAAAATAATGTGTGTCCAAGAATAGAAGATATCGAAGGAAACTGCAAAGTT
GATGGACCGAAAGCGTGTGCGAAGTATTTTTCGTCAACTTATAACGAGAACTATTTTAAT
TGCACATGTGACAACGTCTACATGATACGTAAGATCAAGCGTTACTGCCGATGTCACTCG
ATATGTTAGTCCTTACTAATAACAAAGGAGAAGTTGTGAGAGTTTGTAGTGTGGAGATCA
CACACGAATAGGTTTTGTTAGTCACCAATCTTTCTTTTGTAATAAAGTCATGAGATTATA
TTTTATAACTAGTATGAGTTTCTCAATC

QA 1 448 1 448
DS 



AS 1 2

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GGGTTGTCAATTTATTTTATTTTTGAGTGTAGATATTAATAAACAATATATTTAGAGTGT
CTTCTTTTAACCTAGTCTTTATGTTTTATATAAAAAGAACGAAATATGATTATTTGGGTT
GTCTTGGAATGGACTTGCCAACTCATGTTAGTTCGTTTCCAACTTGCAAAGCAAACGTTG
TTTGGAATCTTTTAACTTTTCCAAAAGCATAAGGAACAGATTATATAAAGAACAACCTAA
CCCCATCTAGTTCTTGCTTTTTGCTCTATTATTTTACTCTCCAGTTTTGTTACATATAGT
AGTAATCAACAAGAGTCAGGTTATCAAAAGCCTACAAACAAAAAACATCCCTGCGTCTCA
TTTATTTATTAATTCAAGATCTAAGAATCATCTTTCTTGGAATCTTAGATCAGTTATTTA
ACGTTTGATGAGTACAACAACAAAAACGAAACACATAGGTCTATTAGTGATCTACCCTTG
AAATATTGGCCCATTAAAACCTTCAGCCCAAGATGTTTATTTTTTCCGGAGAACTACTTG
AGCACATCCACACGATAGAGTGATTCTTTTACCTACAAAATCAAAAGCAGCATGAGAGAA
ACGATCCTGTTGTTGTGAATGGAGAGTTTAGGCTGTGTTCTTTTGATCAACGAAATTTAA
ACCAGATAAAAAAAGCTGGCAAGTTTAAGAGTTTTTATAGATGAAAAAGAAGTTTAGTGA
GGTCTTACAAATCGTAGTATTGACTTAGTTTAAGTTTTGAACCAATGTTACCCTATTCAT
ATTGACAATAATCAAATATTCAAAATGTTACAAAATAACTCAACATGTAACAAGTTTGAC
TCATTACCTGACTTATCAGAGTTGCTCGTCCACCTATACCCTGTCGGTATTGAAAAGGGA
TCCACCATTTGTGCCTGCTCCTCCTCCAGCCGTCGCTGTGCACTTTTCCCGGTGCCCGTG
ATGTTCAGTTTCCGCCAAGACGACGCTGAAAACGATGAGCGTGAACTTGTTGACGCTTTT
ATGTCGGATGTTTCGTCACTCTCCACGTCGCATTGGTCTTCGACTGCAGCTGAGAGGTGT
CTCGGGCTTGATAGCGGTGTGTAGAACTGATCCATCGGCCGGAGAGGCACAAACTTGCTG
AATGTCATGACTACCTTCACCGTTGGTATCACCGGTATTGACAACTGCGTCCCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FY58TF U 1
AF RS1FY58JQ C 587
BS 1 709 RS1FY58TF
BS 710 710 RS1FY58JQ
BS 711 719 RS1FY58TF
BS 720 1256 RS1FY58JQ

RD RS1FY58TF 719 0 0
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GGGTTGTCAATTTATTTTATTTTTGAGTGTAGATATTAATAAACAATATATTTAGAGTGT
CTTCTTTTAACCTAGTCTTTATGTTTTATATAAAAAGAACGAAATATGATTATTTGGGTT
GTCTTGGAATGGACTTGCCAACTCATGTTAGTTCGTTTCCAACTTGCAAAGCAAACGTTG
TTTGGAATCTTTTAACTTTTCCAAAAGCATAAGGAACAGATTATATAAAGAACAACCTAA
CCCCATCTAGTTCTTGCTTTTTGCTCTATTATTTTACTCTCCAGTTTTGTTACATATAGT
AGTAATCAACAAGAGTCAGGTTATCAAAAGCCTACAAACAAAAAACATCCCTGCGTCTCA
TTTATTTATTAATTCAAGATCTAAGAATCATCTTTCTTGGAATCTTAGATCAGTTATTTA
ACGTTTGATGAGTACAACAACAAAAACGAAACACATAGGTCTATTAGTGATCTACCCTTG
AAATATTGGCCCATTAAAACCTTCAGCCCAAGATGTTTATTTTTTCCGGAGAACTACTTG
AGCACATCCACACGATAGAGTGATTCTTTTACCTACAAAATCAAAAGCAGCATGAGAGAA
ACGATCCTGTTGTTGTGAATGGAGAGTTTAGGCTGTGTTCTTTTGATCA*CGAAATTTA

QA 1 719 1 719
DS 

RD RS1FY58JQ 670 0 0
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GCAGCATGAGAGAAACGATCCTGTTGTTGTGAATGGAGAGTTTAGGCTGTGTTCTTTTGA
TCAACGAAATTTAAACCAGATAAAAAAAGCTGGCAAGTTTAAGAGTTTTTATAGATGAAA
AAGAAGTTTAGTGAGGTCTTACAAATCGTAGTATTGACTTAGTTTAAGTTTTGAACCAAT
GTTACCCTATTCATATTGACAATAATCAAATATTCAAAATGTTACAAAATAACTCAACAT
GTAACAAGTTTGACTCATTACCTGACTTATCAGAGTTGCTCGTCCACCTATACCCTGTCG
GTATTGAAAAGGGATCCACCATTTGTGCCTGCTCCTCCTCCAGCCGTCGCTGTGCACTTT
TCCCGGTGCCCGTGATGTTCAGTTTCCGCCAAGACGACGCTGAAAACGATGAGCGTGAAC
TTGTTGACGCTTTTATGTCGGATGTTTCGTCACTCTCCACGTCGCATTGGTCTTCGACTG
CAGCTGAGAGGTGTCTCGGGCTTGATAGCGGTGTGTAGAACTGATCCATCGGCCGGAGAG
GCACAAACTTGCTGAATGTCATGACTACCTTCACCGTTGGTATCACCGGTATTGACAACT
GCGTCCCACC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

CO CL6025Contig1 846 2 2 U
GGTAGAAGATCGAAAATTGAGATTAAATCAGAAATTTACTTATGCCAATCTGAATCATAA
ATCTTTAACTTGGAAGTCTTAAAATTCAATGCTAGCTGAGTCTTTTTTTTTTTTTTGTTT
TAAGAAAGATCGGAATGGCTCAGGCTGGTGGTCAAAGAAGAAGACGGAGAGACTTCAGCA
GCAACTCGTGTTGTGGTTTTGAGTTTAATGGAGCTCGAAGAGTGAAGCTCTGTGTTTTCA
CCTGAGGATGATGATAATGGAGCTAATGTGCTGAGCAGTGAGGACTCAAGAGGATAAGGT
ATGAGTGACATGCCAGTGAGTGAAGAAAGCGTCAGGCTGTAGCTTAGTGAAGAAGAAGAA
GAGCGCATAGAGTGATCAAATTTGCAGGTATGCCCAAACTTGCCAATCACACATTGCGGA
GCTGCATTGTTACCACATAGCTGTTTCTGTGGAGCCAAAAAAGCTATAAGGAAAGAATTA
CCAATATAATTTATTTCCGAAAGGCTACTTCTAACTACATGAGAAGAAAACCAGGAAAAA
TGCAAACATTCGAACTGACCTAACTAAATGATTAAAACTTTATAATTTCAAGTCCATAAA
AGTAGTATCTTTTATTAGACATAAGTATGCTCCTTTCTCAAATCATGCAACCAACAAAAA
CCAATAGAAAACCTTAAAGACATCTCAACGTAAGTTGCAGACTCAAGACGTAGGCTCATT
TTCAGAGAGAGAGAAATAAAACCATTATCGTTTTCATGACCTCCTTTGTAGAAAATTGCT
TATTCCATTCAGTTAAATTGACTTTTAGTCACAAATTCATTGCTATGAGAAACAACAATC
TGTGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1E416TF C 1
AF RS1C909JQ U 137
BS 1 140 RS1E416TF
BS 141 846 RS1C909JQ

RD RS1E416TF 371 0 0
GGTAGAAGATCGAAAATTGAGATTAAATCAGAAATTTACTTATGCCAATCTGAATCATAA
ATCTTTAACTTGGAAGTCTTAAAATTCAATGCTAGCTGAGTCTTTTTTTTTTTTTTGTTT
TAAGAAAGATCGGAATGGCTCAGGCTGGTGGTCAAAGAAGAAGACGGAGAGACTTCAGCA
GCAACTCGTGTTGTGGTTTTGAGTTTAATGGAGCTCGAAGAGTGAAGCTCTGTGTTTTCA
CCTGAGGATGATGATAATGGAGCTAATGTGCTGAGCAGTGAGGACTCAAGAGGATAAGGT
CTGAGTGACATGTCAGTGAGTGAAGAAAGCGTCAGGCTGTAGCTTAGTGAAGAAGAAGAA
GAGCGCATAG
C

QA 1 370 1 370
DS 

RD RS1C909JQ 710 0 0
TGGC
CAGGCTGGTGGTCAAAGAAGAAGACGGAGAGACTTCAGCAGCAACTCGTGTTGTGGTTTT
GAGTTTAATGGAGCTCGAAGAGTGAAGCTCTGTGTTTTCACCTGAGGATGATGATAATGG
AGCTAATGTGCTGAGCAGTGAGGACTCAAGAGGATAAGGTATGAGTGACATGCCAGTGAG
TGAAGAAAGCGTCAGGCTGTAGCTTAGTGAAGAAGAAGAAGAGCGCATAGAGTGATCAAA
TTTGCAGGTATGCCCAAACTTGCCAATCACACATTGCGGAGCTGCATTGTTACCACATAG
CTGTTTCTGTGGAGCCAAAAAAGCTATAAGGAAAGAATTACCAATATAATTTATTTCCGA
AAGGCTACTTCTAACTACATGAGAAGAAAACCAGGAAAAATGCAAACATTCGAACTGACC
TAACTAAATGATTAAAACTTTATAATTTCAAGTCCATAAAAGTAGTATCTTTTATTAGAC
ATAAGTATGCTCCTTTCTCAAATCATGCAACCAACAAAAACCAATAGAAAACCTTAAAGA
CATCTCAACGTAAGTTGCAGACTCAAGACGTAGGCTCATTTTCAGAGAGAGAGAAATAAA
ACCATTATCGTTTTCATGACCTCCTTTGTAGAAAATTGCTTATTCCATTCAGTTAAATTG
ACTTTTAGTCACAAATTCATTGCTATGAGAAACAACAATCTGTGGA

QA 5 710 5 710
DS 



AS 1 2

CO CL6026Contig1 448 2 1 U
GGACTTTTGTCTTTATTCCTTCTCAGGAAAAGACAGTTTTCACATTCCTCACCTCAAAGG
GAGAGATCTATATCATTTCATTCCCTTTCCTGGAAAGGAGTTCTCTCGGAATTATTTCTG
ATGAAAAATTCCAACTTTCTCACCAGTTTGTTTCTCTTGCGTACCGGTTTGTACGGAACC
TAAAGAGACAATCGAATTTGCTTTGTCGAATTTCGTAGGTGGGAGTTGCTGTCTAACGTC
ACTCTTTTCAAAATGACTAAGTTTCAACCTTCCGGCTATGCCGTGAACCTTCAATCGATG
CATTCGAGACTCGTTTCAGATTTGCAGGCATTTGAAGATCTATCTATTTTAATTTCTGTT
GTCTTTATGTTTTATTGTAATGATCAAAGAGGATGGTTTAATTCCCTCTTGTAACCCATA
AGTTTAGTTAATGAAGTTAATGTTTGGC


BQ
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AF RS1GY93JQ C 1
AF RS1GY93TF U 1
BS 1 448 RS1GY93TF

RD RS1GY93JQ 448 0 0
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GAGAGATCTATATCATTTCATTCCCTTTCCTGGAAAGGAGTTCTCTCGGAATTATTTCTG
ATGAAAAATTCCAACTTTCTCACCAGTTTGTTTCTCTTGCGTACCGGTTTGTACGGAACC
TAAAGAGACAATCGAATTTGCTTTGTCGAATTTCGTAGGTGGGAGTTGCTGTCTAACGTC
ACTCTTTTCAAAATGACTAAGTTTCAACCTTCCGGCTATGCCGTGAACCTTCAATCGATG
CATTCGAGACTCGTTTCAGATTTGCAGGCATTTGAAGATCTATCTATTTTAATTTCTGTT
GTCTTTATGTTTTATTGTAATGATCAAAGAGGATGGTTTAATTCCCTCTTGTAACCCATA
AGTTTAGTTAATGAAGTTAATGTTTGGC

QA 1 448 1 448
DS 

RD RS1GY93TF 448 0 0
GGACTTTTGTCTTTATTCCTTCTCAGGAAAAGACAGTTTTCACATTCCTCACCTCAAAGG
GAGAGATCTATATCATTTCATTCCCTTTCCTGGAAAGGAGTTCTCTCGGAATTATTTCTG
ATGAAAAATTCCAACTTTCTCACCAGTTTGTTTCTCTTGCGTACCGGTTTGTACGGAACC
TAAAGAGACAATCGAATTTGCTTTGTCGAATTTCGTAGGTGGGAGTTGCTGTCTAACGTC
ACTCTTTTCAAAATGACTAAGTTTCAACCTTCCGGCTATGCCGTGAACCTTCAATCGATG
CATTCGAGACTCGTTTCAGATTTGCAGGCATTTGAAGATCTATCTATTTTAATTTCTGTT
GTCTTTATGTTTTATTGTAATGATCAAAGAGGATGGTTTAATTCCCTCTTGTAACCCATA
AGTTTAGTTAATGAAGTTAATGTTTGGC

QA 1 448 1 448
DS 



AS 1 2

CO CL6027Contig1 666 2 2 U
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AAAGTTCAATCTTGAATGAATGGAACAAAACAATGCATATAGCAAGCTCAAGCGTGTGGG
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AAGCAAAAGAGTAAGTCCAGAGCAAAATCACTGAGCATTCACTTTCCCCAGCTCCAAACA
ACTGAGTTATTGTACCTAGATTCATTGCTGGGGGGACAGCATACTGTAAAAAAAAAACGA
ACTGGTACAAAGGCTCTGAGGTAATCAAATCAAACTTGTATGCTCCTCTTACGATCAAAA
CACCACTTATAGGCAAAAAAATGTAACGTGCAACCAATACACCGATAATACTTGATTTTT
TCATTCCTGAACTCCCCATGCCTTTGAGTAAGTTTCCTCCAATGATCAGTGTCATAACAG
GAATGGCTCCATCTCCCACTAAAGTTGCAGAGTCTTGAAGTACTCCCAGAGGAGCTCCGT
TGCCGATGATTAGCTTCCTTATAGGAGTAATGAGCCCGACCACAAGCGCGATCATCGCAG
CAATAGTTGATGGAGCAAATATTGTCCTTAAGTTGACTTTGTCAGCCAGTGAAACGAAGT
TATGAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1BZ18JQ U 1
AF RS1BP11TF C 1
BS 1 489 RS1BZ18JQ
BS 490 666 RS1BP11TF

RD RS1BZ18JQ 489 0 0
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AAAGTTCAATCTTGAATGAATGGAACAAAACAATGCATATAGCAAGCTCAAGCGTGTGGG
GGTGAGGATTCTAAGCCACAAGCCACATGAAGTATGTAGGCCAAACAGTGAGTGAAATCG
AAGCAAAAGAGTAAGTCCAGAGCAAAATCACTGAGCATTCACTTTCCCCAGCTCCAAACA
ACTGAGTTATTGTACCTAGATTCATTGCTGGGGGGACAGCATACTGTAAAAAAAAAACGA
ACTGGTACAAAGGCTCTGAGGTAATCAAATCAAACTTGTATGCTCCTCTTACGATCAAAA
CACCACTTATAGGCAAAAAAATGTAACGTGCAACCAATACACCGATAATACTTGATTTTT
TCATTCCTGAACTCCCCATGCCTTTGAGTAAGTTTCCTCCAATGATCAGTGTCATAACAG
GAATGGCTC

QA 1 489 1 489
DS 

RD RS1BP11TF 666 0 0
CAAGAAAATATATCTATTCTATAATGATGATGTTCAATACATGATGACTCAATCATCAAC
AAAGTTCAATCTTGAATGAATGGAACAAAACAATGCATATAGCAAGCTCAAGCGTGTGGT
GGTGAGGATTCTAAGCCACAAGCCACATGAAGTATGTAGGCCAAACAGTGAGTGAAATCG
AAGCAAAAGCGTAAGTCCAGAGCAGAATCACTGAGCATTCACTTTCCCCAGCTCCAAACA
ACTGAGTTATTGTACCTAGATTCATTGCTGGTGGGACAGCATACTGTAGAAGAAGAACGA
ACTGGTACAAAGGCTCTGAGGTAATCAAATCAAACTTGTATGCTCCTCTTACGATCAAAA
CACCACTTATAGGCAAGAAAATGTAACGTGCAACCAATACACCGATAATACTTGATTTTT
TCATTCCTGAACTCCTCATGCCTTTGAGTAAGTTTCCTCCAATGATCAGTGTCATAGCAG
GAATGGCTCCATCTCCCACTAAAGTTGCAGAGTCTTGAAGTACTCCCAGAGGAGCTCCGT
TGCCGATGATTAGCTTCCTTATAGGAGTAATGAGCCCGACCACAAGCGCGATCATCGCAG
CAATAGTTGATGGAGCAAATATTGTCCTTAAGTTGACTTTGTCAGCCAGTGAAACGAAGT
TATGAA

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

CO CL6028Contig1 449 2 1 U
GGACAGAGAACGAGAAAGAACAAGAAGATTCGATTTAGAAAAAGTAATAAGAATGTTGCT
GGTGACGGTATTGGCCGAGATGTTGAAGGACTACACGGTGGTACTCGCCGGAGCTTTGGA
GTATCTCTTCTCTCAGGCGCCTTTTCCGAGGAGAATTCGACTTCATATATTATATTCTCT
TCCTTTCCATCGCTCCAGTTCCTCTAACCCTTTTCTCCCTCCTTCTCCTCCTCCTTACGC
TCCTACTTTATAACTCAGAATCATGATGTGTTGACTTTATGATTTTTCTTTGAGTTGAGT
CGTGTAATCCAGAGCCTTCGTTGTAAATAAAATCTTTCCTAATGATGCATCCTTTTGTTG
AAAACACAAAAGAAACAAGTTACAGAGCTTTGTTTGTATCTCCTTTTGTTATATTTTTCT
TCAATTGATCTGTTAAAGAAGATTTTTGT


BQ
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AS 1 2

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BQ
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AF RS1CC26TF U 1
AF RS1CC26JQ C 312
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BQ
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BS 647 875 RS1DQ79JQ

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GTTTCGTCAATGAACCTTACCAATGAGTATCTCAACCACAAATGCCTCAATCAAGGGAAA
TATAACTCCGGAAGTGCGTTCGAGAAAAACCTCAACTGGATCTTTCATCACATTACTACT
AACTCTTATGCTGCAACCGGTTCCGCAGAAGCAAGTATTGGACATACAACGACGCCCGAT
TTTGTAAGCGTCATTTTTCAGTGTCGTGGTGACTCTTATGGATCGAAATGTCGTACATGT
ACTGACACTGCAATTGCGGGGTTTCGTAAGAGATGTCCGAGTAACAAAGGAGTAATAATA
TGGTACGATCAATGTCTTCTCTACATTAGTACGATCAAAGAAAAAGCTCTAACCAAGACT
AACTACAAGAATATTTTTTCTATGCACAACCCAAATAACGTGAGAGGGGATGCAAAACTG
TTTGCCATGAGGGTGGTGGATTTTTTCTCAGAGCTAACACTTCAAGTAGACAAAATTTCC
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DS 

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ATTTTTCAGTGTCGTGGTGACTCTTATGGATCGAAATGTCGTACATGTACTGACACTGCA
ATTGCGGGGTTTCGTAAGAGATGTCCGAGTAACAAAGGAGTAATAATATGGTACGATCAA
TGTCTTCTCTACATTAGTACGATCAAAGAAAAAGCTCTAACCAAGACTAACTACAAGAAT
ATTTTTTCTATGCACAACCCAAATAACGTGAGAGGGGATGCAAAACTGTTTGCCATGAGG
GTGGTGGATTTTTTTTCAGAGCTAACACTTCAAGTAGACAAAATTTCCAGTAACGATTAT
AATCACATTTTTTACGCGGCTGGGGAAAAGAAGCTTGGAAAAAATAAAGTATATGCAATG
GTGCAATGTACAGATGTAACATTAGATTGTAAAAGTTGTTTGGCTTGGAGTATCACAAAG
CTTTTCAAGAACAACATCATTAAACAAGGAGCTAGAATTTTGGGTACCAACTGTGATGTA
AGGTATGAGTTATACCCTTTTCTTAGGAGTTAAGCATTTTTAAGTTTTGTGACAAAAAAA
ACATTTTTAAGTTATGTTTGTTG

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

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TGCGTGCGTGTTGAATGGCGGGTTACAAAGCAGATGATGATTACGATTACCTATTCAAGG
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CTGTTAACGACAAAGTCATCAAAGCCCAGATTTGGGATACCGCTGGTCAAGAAAGGTACC
GAGCGATCACTAGTGCATACTACCGAGGAGCTGTTGGTGCGCTTCTTGTCTACGATGTTA
CTCGACACTCCACGTTCGAAAACGTTGAGAGATGGCTAAGGGAGCTTCGTGACCATACCG
ATCCAAACATAGTCGTGATGCTCGTGGGAAACAAATCTGATCTTCGTCATCTTATTGCGG
TTCAAACCGAAGATGCCAAGTCTTTTGCGGAGAAAGAATCAGTCTACTTCATGGAAACCT
CAGCTCTCGAGTCTACTAACGTCGAGAACGCGTTTTCTGAAGTACTCACTCAGATTCACC
AAGTTGTGAGCAAGAAAGCAATGGAGGCTGGTGGCGGTGACGATTCGAATTCGGGTAATG
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BQ
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CAGCTCTCGAGTCTACTAACGTCGAGAACGCGTTTTCTGAAGTACTCACTCAGATTCACC
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AAGCAATGGAGGCTGGTGGCGGTGACGATTCGAATTCGGGTAATGTTCCTTCTAAAGTAG
AGAAGATTGATATTGATGTATCGGCTGTGAAGAAAACTGGTTGCTGCTCGAGCTAAAAAA
CACTCGTTAGTCTCTTGCAGATTGTTACGGATTTGGTCTGTTTCCTTGATCGTTCTTTTA
TACATTCAAAATTCTTTTGAAGATGTCTGTCTTTTTTTTTTATAATTAGGAAACAAGCAA
TGTTATGCTTTGCTTGAAAACTGCTTTGCTGTGGTTCTGGTTCTGGTTCTGTACTGGTTA
AGCAATTTTGTAATTTAACTTGTTTTGGTCTATGGTTTATCC

QA 1 762 1 762
DS 



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TTCATCCGGGCTGCAATCAAGTACTAGTAGTCACACCTTTGTTAGGGGCACAAGGAATAC
CACCACCATCCGTTGATGTTATGTTGGTGATCGGCAGCTCCTGCATTCCTATTTTCTCCT
CCGTCGTCGAAATCACTTCGTCCTTAGCTTTTCCCCAAACAACACTGTATAGCCCAAAGA
CGATGAGACCCGCCCCGATTATACTTCCGAGATGGATCTTTTCGGCCAAAACTAACGCGC
CAAGGAAGGCAGTAATGATCATGCACATCGGACTAAATGACGTCGTAAATACTGGGCCTC
GTTCTCTAATCACAATGCTTTGTATGTAATACGCCATTCCAGAACAAACCACTCCGGAGT
AAACCGCTGCGAGCGTGCCCGAGTCCATGCCGATTTTCCATGCGCTCAAGTCACGAACCA
TCACCAGGGAAGCAGCGGTGTTTAAGATTGTCCCCATGCCGCATATCCACATCACTAGTG
ATAGCTCCCCCGGATATTTTTTCAATGTGAATGATTGTAAAATGAAGAAACCTGCCCAAC
TGATGATGCTAGCCATCAGCGCTAACGTTCCCATAACCCAATGTTGGTCGGTGGCC


BQ
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AF RS1FS19JQ U 1
AF RS1FO40JQ U 2
BS 1 15 RS1FS19JQ
BS 16 16 RS1FO40JQ
BS 17 234 RS1FS19JQ
BS 235 776 RS1FO40JQ

RD RS1FS19JQ 234 0 0
GGGGCAAAGCATTATGGTTATTATAAACCATAAAATCTAAAAATAAACACAAACAAACTT
GGACACGTAAATAGCATAAAAACAAAACAAGAAAGAAAGATAAAGAAATTTCCCTTCTTG
GAAATTTGGTGTTCAAAAATTGAGAGCAATTGACTTTTTCGTTTTTGTTTCTTTGATTGC
TTCATCCGGGCTGCAATCAAGTACTAGTAGTCACACCTTTGTTAGGGGCACAAG

QA 1 234 1 234
DS 

RD RS1FO40JQ 775 0 0
GT
GCAAAGCATTATAGTTATTATAAACCATAGAATCTAAAAATAAACACAAACAAACTTGGA
CACGTAAATAGCATAAAAACAAAACAAGAAAGAAAGATAAAGAAATTTCCCTTCTTGGAA
ATTTGGTGTTCAAAAATTGAGAGCAATTGACTTTTTCGTTTTTGTTTCTTTGATTGCTTC
ATCCGGGCTGCAATCAAGTACTAGTAGTCACACCTTTGTTAGGTGCACAAGGAATACCAC
CACCATCCGTTGATGTTATGTTGGTGATCGGCAGCTCCTGCATTCCTATTTTCTCCTCCG
TCGTCGAAATCACTTCGTCCTTAGCTTTTCCCCAAACAACACTGTATAGCCCAAAGACGA
TGAGACCCGCCCCGATTATACTTCCGAGATGGATCTTTTCGGCCAAAACTAACGCGCCAA
GGAAGGCAGTAATGATCATGCACATCGGACTAAATGACGTCGTAAATACTGGGCCTCGTT
CTCTAATCACAATGCTTTGTATGTAATACGCCATTCCAGAACAAACCACTCCGGAGTAAA
CCGCTGCGAGCGTGCCCGAGTCCATGCCGATTTTCCATGCGCTCAAGTCACGAACCATCA
CCAGGGAAGCAGCGGTGTTTAAGATTGTCCCCATGCCGCATATCCACATCACTAGTGATA
GCTCCCCCGGATATTTTTTCAATGTGAATGATTGTAAAATGAAGAAACCTGCCCAACTGA
TGATGCTAGCCATCAGCGCTAACGTTCCCATAACCCAATGTTGGTCGGTGGCC

QA 3 775 3 775
DS 



AS 1 2

CO CL6033Contig1 885 2 2 U
GCTGGTTTGCTTGCGCTATCTACTACCTTGCAATAAGCATGCAAATGACTTACCCCGTCT
TCCAAGCGCAACAGAGCGACAGGAGATTAGGTTCCGGTGGCTTCAAGATCCCCGCAGCCA
CCTATGTGGTGTTCTTGATGACCGGTATGACGGTTTTCATCATAATCTACGACCGTGTCC
TTGTCCCGTCGCTCAAAAGAGTGACCGGTCTAGACACTGGTATAACACTCTTGCAAAGAA
TAGGAGCGGGGATCTTTTTTGCGGTGCTGAGTTTATTGGTCTCCGGGTTCATAGAGGAAC
GTAGAAGAAGCATTGCGCTGACAAGACAGACCCTAGGGATGGAGCCTAGAGCGGGAGAGA
TCTCGTCCATGTCAGCGATGTGGCTGATCCCGCAGCTGGTTCTTGCAGGGATAGCTGAAG
CTTTTGCGGCCATCGGACAGATGGAGTTTTACTACAAGCAGTTTCCTGAGAACATGAGGA
GCTTCGCTGGTTCGATCTTCTACGTCGGTGGAGGTGTTTCTAGCTACCTCGCTAGCTTCT
TGATCTCCACTGTTCATCGGACGACTGAACATTCACCTTCGGGGAACTGGTTAGCTGAGG
ATCTGAACAAGGCGAAATTGGATTACTTCTATTTCATGCTCACGGGGCTCATGGTCGTTA
ACATGGTGTACTTCTTGATAGTGGCTAAGTTTTATAGATACAAAGGCAGTGATGATAAAG
GCATCTCTGCTATTGAGACCAATGGAGATGAGCGAAGCAGCGAGAGAAGAACTCGGTCTA
ATCTGTAAACTTTTATTATTTTTATTCTGGTCATCTAATTCAGTCACATCTTTGTTGTTG
TTGTACTGTAATCTCCTTAGATTCAAATGAATATGAATGTAAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D979TF U 1
AF RS1D979JQ C 127
BS 1 579 RS1D979TF
BS 580 885 RS1D979JQ

RD RS1D979TF 579 0 0
GCTGGTTTGCTTGCGCTATCTACTACCTTGCAATAAGCATGCAAATGACTTACCCCGTCT
TCCAAGCGCAACAGAGCGACAGGAGATTAGGTTCCGGTGGCTTCAAGATCCCCGCAGCCA
CCTATGTGGTGTTCTTGATGACCGGTATGACGGTTTTCATCATAATCTACGACCGTGTCC
TTGTCCCGTCGCTCAAAAGAGTGACCGGTCTAGACACTGGTATAACACTCTTGCAAAGAA
TAGGAGCGGGGATCTTTTTTGCGGTGCTGAGTTTATTGGTCTCCGGGTTCATAGAGGAAC
GTAGAAGAAGCATTGCGCTGACAAGACAGACCCTAGGGATGGAGCCTAGAGCGGGAGAGA
TCTCGTCCATGTCAGCGATGTGGCTGATCCCGCAGCTGGTTCTTGCAGGGATAGCTGAAG
CTTTTGCGGCCATCGGACAGATGGAGTTTTACTACAAGCAGTTTCCTGAGAACATGAGGA
GCTTCGCTGGTTCGATCTTCTACGTCGGTGGAGGTGTTTCTAGCTACCTCGCTAGCTTCT
TGATCTCCACTGTTCATCGGACGACTGAACATTCACCTT

QA 1 579 1 579
DS 

RD RS1D979JQ 759 0 0
GTGGTG
TCTTGATGACCGGTATGACGGTTTTCATCATAATCTACGACCGTGTCCTTGTCCCGTCGC
TCAAAAGAGTGACCGGTCTAGACACTGGTATAACACTCTTGCAAAGAATAGGAGCGGGGA
TCTTTTTTGCGGTGCTGAGTTTATTGGTCTCCGGGTTCATAGAGGAACGTAGAAGAAGCA
TTGCGCTGACAAGACAGACCCTAGGGATGGAGCCTAGAGCGGGAGAGATCTCGTCCATGT
CAGCGATGTGGCTGATCCCGCAGCTGGTTCTTGCAGGGATAGCTGAAGCTTTTGCGGCCA
TCGGACAGATGGAGTTTTACTACAAGCAGTTTCCTGAGAACATGAGGAGCTTCGCTGGTT
CGATCTTCTACGTCGGTGGAGGTGTTTCTAGCTACCTCGCTAGCTTCTTGATCTCCACTG
TTCATCGGACGACTGAACATTCACCTTCGGGGAACTGGTTAGCTGAGGATCTGAACAAGG
CGAAATTGGATTACTTCTATTTCATGCTCACGGGGCTCATGGTCGTTAACATGGTGTACT
TCTTGATAGTGGCTAAGTTTTATAGATACAAAGGCAGTGATGATAAAGGCATCTCTGCTA
TTGAGACCAATGGAGATGAGCGAAGCAGCGAGAGAAGAACTCGGTCTAATCTGTAAACTT
TTATTATTTTTATTCTGGTCATCTAATTCAGTCACATCTTTGTTGTTGTTGTACTGTAAT
CTCCTTAGATTCAAATGAATATGAATGTAAAGC

QA 7 759 7 759
DS 



AS 1 2

CO CL6034Contig1 1186 2 8 U
GGACAAACCCTCACTCAAATCGGAAAATTGTTGAAGAAGAAAAAGCACAAAGACATGAAC
TCATCTCTTCTAACTCCTTCCTCTTCTTCTTCTTCTCCTCATCATCTCCAGTCTCCTGCA
ACGTTCGACCACGATGACTTCCTCCAAAACTTCTTCTCCTCCGCTCCTTGGCCTTCCTCC
GTGCTCGAAGACGACGCTCCTCCCCCCACCTCCGACACCGCCGTGGCTAGCTTTCACCAT
CACGACGTTGATTCAAGAAACCAGATCACGATGATTCCTTTGTCTCACCACAATCCAAAC
GACGCCGTTGATGTTAACGCCCTCTACAGTGGCTTCTCCGCTGGATCGCTTCCTTTCCAC
TTCCCTCAGGGATCGGGGGGAGGAGTTATGAAACAAAGTCACACGCCAACTCAGTCGCAG
GCGACGGCGTCAACCACCACCCGGTGGAACGGCGACGACTCCTCAGACTAAGCCTAAAGT
CCGAGCTAGAAGAGGTCAAGCCACTGATCCTCACAGTATCGCCGAACGGTTACGAAGAGA
GAGAATAGCTGAAAGGATGAAATCTCTTCAAGAACTTGTCCCTAATGGCAACAAGACAGA
CAAAGCATCAATGCTCGATGAGATTATCGATTATGTCAAGTTCTTACAGCTCCAAGTCAA
GGTACTAAGCATGAGTAGACTGGGAGGTGCTGCTTCTGTTTCTTCTCAAATCTCTGAGGA
TGCCTGTGGGTCCCAGGAAAACACTTCCGGCGAGAATCAGACGGCAGCGAAAATGACGGA
GCACCAAGTGGCCAAGCTAATGGAAGAGGACATGGGATCGGCCATGCAGTACCTACAAGG
CAAAGGTCTATGCCTCATGCCCATATCCTTAGCCACCACCATCTCAACCGCTACTTGTCC
TTCTCGTAATCCTCTGGTCTCAGCCGTTAAAGAAGCCGGCGTTCTTTTGTCTCCTAACAC
AGCTACTACACCAGTCGTTGACGTTAAAGGTGCCTCGGTGATTACCGTTAAAGACGCTTC
ATCAGTTTCCAAGCCGTGATAACGGCAGTTTGAATCTAACTTTCCTTTTTTCGGGAGTTA
GGCTGAGTGGGAAACAGAGTCAATGAAAAGTGGGGTTGGTGGTTTTTGGTCTAAGTCTAG
AGAGAATAAGTGTTGCGTCTTGGAATACAACACCATATTTGCGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BI79TF U 1
AF RS1BI79JQ C 356
BS 1 441 RS1BI79TF
BS 442 442 RS1BI79JQ
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RD RS1BI79TF 698 0 0
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TCATCTCTTCTAACTCCTTCCTCTTCTTCTTCTTCTCCTCATCATCTCCAGTCTCCTGCA
ACGTTCGACCACGATGACTTCCTCCAAAACTTCTTCTCCTCCGCTCCTTGGCCTTCCTCC
GTGCTCGAAGACGACGCTCCTCCCCCCACCTCCGACACCGCCGTGGCTAGCTTTCACCAT
CACGACGTTGATTCAAGAAACCAGATCACGATGATTCCTTTGTCTCACCACAATCCAAAC
GACGCCGTTGATGTTAACGCCCTCTACAGTGGCTTCTCCGCTGGATCGCTTCCTTTCCAC
TTCCCTCAGGGATCGGGGGGAGGAGTTATGAAACAAAGTCACACGCCAACTCAGTCGCAG
GCGACGGCGTCAACCACCACC*GGTGGAACGGCGACGACTCCTCAGACTAAGCCTAAAGT
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GAGAATAGCTGAAAGGATGAAATCTCTTCAAGAACTTGTCCCTAATGGCAACAAGACAGA
CAAAGCATCAATGCTCGATGAGATTATCGATTATGTCAAGTTCTTACAGCTCCAAGTCAA
G*TACTAAGCATGAGTAGACTGGGAG*TGCTGCTTCTG

QA 1 698 1 698
DS 

RD RS1BI79JQ 831 0 0
TTCCAC
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AGAATAGCTGAAAGGATGAAATCTCTTCAAGAACTTGTCCCTAATGGCAACAAGACAGAC
AAAGCATCAATGCTCGATGAGATTATCGATTATGTCAAGTTCTTACAGCTCCAAGTCAAG
GTACTAAGCATGAGTAGACTGGGAGGTGCTGCTTCTGTTTCTTCTCAAATCTCTGAGGAT
GCCTGTGGGTCCCAGGAAAACACTTCCGGCGAGAATCAGACGGCAGCGAAAATGACGGAG
CACCAAGTGGCCAAGCTAATGGAAGAGGACATGGGATCGGCCATGCAGTACCTACAAGGC
AAAGGTCTATGCCTCATGCCCATATCCTTAGCCACCACCATCTCAACCGCTACTTGTCCT
TCTCGTAATCCTCTGGTCTCAGCCGTTAAAGAAGCCGGCGTTCTTTTGTCTCCTAACACA
GCTACTACACCAGTCGTTGACGTTAAAGGTGCCTCGGTGATTACCGTTAAAGACGCTTCA
TCAGTTTCCAAGCCGTGATAACGGCAGTTTGAATCTAACTTTCCTTTTTTCGGGAGTTAG
GCTGAGTGGGAAACAGAGTCAATGAAAAGTGGGGTTGGTGGTTTTTGGTCTAAGTCTAGA
GAGAATAAGTGTTGCGTCTTGGAATACAACACCATATTTGCGTGC

QA 7 831 7 831
DS 



AS 1 2

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GCAGTAAGACAGCTACCACACTTGATCATAAGAGTGAACATAAAGTGCAAGGAGGACAAC
AGGTCATGGGTGGTCAAGGTCAACATGACCATAAGAAGAAGGGTGATCATACCGAGATGG
TACTGATACAGATGATGATCATACCGATGATGATACTGATGATGATGCCGATGATGATGA
TGATGACAAGGCAAAGAAGAAGACAGTAAAAGCTTTATAAATTAATAATGTTGATATTAT
AACAATTTTATTAATTTATAGAATTGTTAATTTTTATATTTTTAAAATATCTTTATATTT
AGATAAATAAAAGGAATACATCATTTCCC


BQ
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AF RS1CH61JQ C 1
AF RS1CH61TF U 1
BS 1 449 RS1CH61TF

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AGGTCATGGGTGGTCAAGGTCAACATGACCATAAGAAGAAGGGTGATCATACCGAGATGG
TACTGATACAGATGATGATCATACCGATGATGATACTGATGATGATGCCGATGATGATGA
TGATGACAAGGCAAAGAAGAAGACAGTAAAAGCTTTATAAATTAATAATGTTGATATTAT
AACAATTTTATTAATTTATAGAATTGTTAATTTTTATATTTTTAAAATATCTTTATATTT
AGATAAATAAAAGGAATACATCATTTCCC

QA 1 449 1 449
DS 

RD RS1CH61TF 449 0 0
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TAAGTTTCTCATTTGCGCACGGCACGGAAACGACACAGTCGACACTGCAACATCAGGAGA
GCAGTAAGACAGCTACCACACTTGATCATAAGAGTGAACATAAAGTGCAAGGAGGACAAC
AGGTCATGGGTGGTCAAGGTCAACATGACCATAAGAAGAAGGGTGATCATACCGAGATGG
TACTGATACAGATGATGATCATACCGATGATGATACTGATGATGATGCCGATGATGATGA
TGATGACAAGGCAAAGAAGAAGACAGTAAAAGCTTTATAAATTAATAATGTTGATATTAT
AACAATTTTATTAATTTATAGAATTGTTAATTTTTATATTTTTAAAATATCTTTATATTT
AGATAAATAAAAGGAATACATCATTTCCC

QA 1 449 1 449
DS 



AS 1 2

CO CL6036Contig1 1164 2 8 U
GGATTCACAATCCCTAGTTTCTCTCTCCGCACAAAGAGATCGATTTCCCCCATCAAAGAT
GACTTCAACTGAGCACACAGAGAAGCGCAACGCTCCAGAACTTCAGATCTGGAACAACGC
AGCTTTCGACGACGGAGACTCCAATCTCCCTTCCGCCATGGCGGAAGCTCCCTGGTCTAA
CCTCAACGCATCTTTCGATTCCGATTGCAGCAAGGAGAATCGTTCCGGCGGAGTTCATGG
AGTCTCAGAAACAGACGGTGAAGTTCGAGACGGGATCGAAATCAAGAGCCACCAATCCAC
GTAGAGGCGTTAGCTTGGGTCCAGGGGAGATATACTCAGCTGCGAAGAAGTCTTCGGAGA
CGACGATGACTTCTCTTCAATCGGCTCAGAATCGGCGCAAGTCTTGTTTCTTTAAGCTTC
CCGGGATCGAGGAAGGGAAGGTAGGGACGAAAGGTAGAGGACGAAGCCTGAGTCCGAGAT
CTCGCAAAGCTAAGATGACGGCTCAGAAGCAAGCAGCGACGACTGGTGGGGCAAAGAGAG
CTGTGAAGAAAGAGGAGAGTGTTTTAGCATCGATCCAGCCTAAGAAGCTGTTCAAAGAAG
AGGTGAAGAGGAAGCCTTTGAAGCCAGGGAGAGTGGTGGCTAGCAGGTACAGTCTGATAA
ACAAGACGGGGGAGAAAGATGCGAGGAAACGGTCGTTGCCTGAGAATAACGAGGAGAAGG
AGAATCACAGGTCGGAGAAGAGAAGAGCTTCTGATGAGAACAGGAAGAGTGAAGGGAGAG
TGAAGAAGAGATGGGAGATTCCAAGTGAAGTTGAGGTGTATTGCAGTGGTGCGAGTGATG
AGAGTCCTATGGGTAAAGAGTTGCCTAAGATCAGAACGCTTCGCGGTCGTGTTGGAGAGA
GTCCTCGTGATTCAGGTGCTGCTAAAAGAGTTTCCGAGTTGGAAAGCAAGAATCGTGATT
TCACGTTTTGCCAGCTTCTGAGGTTTGAAGAATGAATGATGGATTAGTCATTTTGAGTTG
AAAAATCCACAACTCTTGTTGTGGGTGATGTGATTGTGAATTTGGGTTGTTGCTTAATGT
CTAAAATACACATATTAATGATTGTGAGTTTTGTTGTCTATCCTCTTGTAATATCAGCTC
CATGAATAATGAAATGATTCTCAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B017TF U 1
AF RS1B017JQ C 473
BS 1 646 RS1B017TF
BS 647 647 RS1B017JQ
BS 648 671 RS1B017TF
BS 672 672 RS1B017JQ
BS 673 676 RS1B017TF
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BS 678 705 RS1B017TF
BS 706 1164 RS1B017JQ

RD RS1B017TF 708 0 0
GGATTCACAATCCCTAGTTTCTCTCTCCGCACAAAGAGATCGATTTCCCCCATCAAAGAT
GACTTCAACTGAGCACACAGAGAAGCGCAACGCTCCAGAACTTCAGATCTGGAACAACGC
AGCTTTCGACGACGGAGACTCCAATCTCCCTTCCGCCATGGCGGAAGCTCCCTGGTCTAA
CCTCAACGCATCTTTCGATTCCGATTGCAGCAAGGAGAATCGTTCCGGCGGAGTTCATGG
AGTCTCAGAAACAGACGGTGAAGTTCGAGACGGGATCGAAATCAAGAGCCACCAATCCAC
GTAGAGGCGTTAGCTTGGGTCCAGGGGAGATATACTCAGCTGCGAAGAAGTCTTCGGAGA
CGACGATGACTTCTCTTCAATCGGCTCAGAATCGGCGCAAGTCTTGTTTCTTTAAGCTTC
CCGGGATCGAGGAAGGGAAGGTAGGGACGAAAGGTAGAGGACGAAGCCTGAGTCCGAGAT
CTCGCAAAGCTAAGATGACGGCTCAGAAGCAAGCAGCGACGACTGGTGGGGCAAAGAGAG
CTGTGAAGAAAGAGGAGAGTGTTTTAGCATCGATCCAGCCTAAGAAGCTGTTCAAAGAAG
AGGTGAAGAGGAAGCCTTTGAAGCCAGGGAGAGTGGTGGCTAGCAG*TACAGTCTGATAA
ACAAGACGGGG*AGAA*GATGCGAGGAAACGGTCGTTGCCTGAGA
TAC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RS1B017JQ 692 0 0
TCCGAGATCTCGCAAAGCTAAGATGACGGCTCAGAAGCAAGCAGCGACGACTGGTGGGGC
AAAGAGAGCTGTGAAGAAAGAGGAGAGTGTTTTAGCATCGATCCAGCCTAAGAAGCTGTT
CAAAGAAGAGGTGAAGAGGAAGCCTTTGAAGCCAGGGAGAGTGGTGGCTAGCAGGTACAG
TCTGATAAACAAGACGGGGGAGAAAGATGCGAGGAAACGGTCGTTGCCTGAGAATAACGA
GGAGAAGGAGAATCACAGGTCGGAGAAGAGAAGAGCTTCTGATGAGAACAGGAAGAGTGA
AGGGAGAGTGAAGAAGAGATGGGAGATTCCAAGTGAAGTTGAGGTGTATTGCAGTGGTGC
GAGTGATGAGAGTCCTATGGGTAAAGAGTTGCCTAAGATCAGAACGCTTCGCGGTCGTGT
TGGAGAGAGTCCTCGTGATTCAGGTGCTGCTAAAAGAGTTTCCGAGTTGGAAAGCAAGAA
TCGTGATTTCACGTTTTGCCAGCTTCTGAGGTTTGAAGAATGAATGATGGATTAGTCATT
TTGAGTTGAAAAATCCACAACTCTTGTTGTGGGTGATGTGATTGTGAATTTGGGTTGTTG
CTTAATGTCTAAAATACACATATTAATGATTGTGAGTTTTGTTGTCTATCCTCTTGTAAT
ATCAGCTCCATGAATAATGAAATGATTCTCAT

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 2

CO CL6037Contig1 873 2 2 U
GTGTGTATACCTCTGAGGATGGTAGTCGGTTTGTTGGAGAGTTCAAATGGGGTGTCAAAC
ATGGTCTTGGTCATTACCATTTCAGAAATGGTGATACATATGCTGGAGAGTACTTTGCAG
ACAGGATGCATGGTTTTGGAGTGTATCTATTTGCAAACGGACATCGGTATGAAGGAGCTT
GGCATGAGGGTAGAAGGCAAGGGCTTGGTATGTACACATTCAGGAACGGTGAGACACAGG
CAGGGCATTGGGAAAACGGTGTTCTCAGCTGTCCTACAGAGCAGACCACCCGTCCTGGTT
CATCTTTTTCAATCAGTTACTCCAAGGTTCTAGACACTGTCCGGCAAGCGAGGAAAGCAG
CAGAGAAAGCACGTGAAGTTGTGAAAGTGGAAGAGAGAGTGAACAGGGCAGTGATGGTCG
CAAACCGAGCAGCTAATGCTGCTAGAGTTGCTGCTACAAAGGCTGTTCAAACCCAAACAT
ATTACAGTAGCGGCGGCGGTGATGATCCCGTGTGAGTTGTTACTGTGGCAAAAGCTTTTG
ACATAGTCCACAACCATGAATCTTACCTCGAACTTCTTGGATGACACGAGAGAAAGAAAG
AAAGAGATAGAGAGACGTCTTAGAGAAGACACTCAAAAATTACATCTACCGTTGAGATTT
TTCGTGAAGAAGGTGAACCCCCACTTGGAACCAATGTCGAGATCTCAAATAAGTAAATAA
ATAGCAGATCTGGGCTACGGAGCAAGAAGCTATAAAGGTTTTCCCTCCCACTTCTTGTAA
ACTTGTTTGAAAAGCAAAGGCTGGTTGGTTTATAAACTGTACATAGAGGTTGTTGAAGAG
TAAGCAATGTGTGTTAACAATAGTTCGTTGTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BV31TF U 1
AF RS1BV31JQ C 203
BS 1 634 RS1BV31TF
BS 635 873 RS1BV31JQ

RD RS1BV31TF 634 0 0
GTGTGTATACCTCTGAGGATGGTAGTCGGTTTGTTGGAGAGTTCAAATGGGGTGTCAAAC
ATGGTCTTGGTCATTACCATTTCAGAAATGGTGATACATATGCTGGAGAGTACTTTGCAG
ACAGGATGCATGGTTTTGGAGTGTATCTATTTGCAAACGGACATCGGTATGAAGGAGCTT
GGCATGAGGGTAGAAGGCAAGGGCTTGGTATGTACACATTCAGGAACGGTGAGACACAGG
CAGGGCATTGGGAAAACGGTGTTCTCAGCTGTCCTACAGAGCAGACCACCCGTCCTGGTT
CATCTTTTTCAATCAGTTACTCCAAGGTTCTAGACACTGTCCGGCAAGCGAGGAAAGCAG
CAGAGAAAGCACGTGAAGTTGTGAAAGTGGAAGAGAGAGTGAACAGGGCAGTGATGGTCG
CAAACCGAGCAGCTAATGCTGCTAGAGTTGCTGCTACAAAGGCTGTTCAAACCCAAACAT
ATTACAGTAGCGGCGGCGGTGATGATCCCGTGTGAGTTGTTACTGTGGCAAAAGCTTTTG
ACATAGTCCACAACCATGAATCTTACCTCGAACTTCTTGGATGACACGAGAGAAAGAAAG
AAAGAGATAGAGAGACGTCTTAGAGAAGACACTC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1BV31JQ 671 0 0
GCTTGGTATGTACACATTCAGGAACGGTGAGACACAGGCAGGGCATTGGGAAAACGGTGT
TCTCAGCTGTCCTACAGAGCAGACCACCCGTCCTGGTTCATCTTTTTCAATCAGTTACTC
CAAGGTTCTAGACACTGTCCGGCAAGCGAGGAAAGCAGCAGAGAAAGCACGTGAAGTTGT
GAAAGTGGAAGAGAGAGTGAACAGGGCAGTGATGGTCGCAAACCGAGCAGCTAATGCTGC
TAGAGTTGCTGCTACAAAGGCTGTTCAAACCCAAACATATTACAGTAGCGGCGGCGGTGA
TGATCCCGTGTGAGTTGTTACTGTGGCAAAAGCTTTTGACATAGTCCACAACCATGAATC
TTACCTCGAACTTCTTGGATGACACGAGAGAAAGAAAGAAAGAGATAGAGAGACGTCTTA
GAGAAGACACTCAAAAATTACATCTACCGTTGAGATTTTTCGTGAAGAAGGTGAACCCCC
ACTTGGAACCAATGTCGAGATCTCAAATAAGTAAATAAATAGCAGATCTGGGCTACGGAG
CAAGAAGCTATAAAGGTTTTCCCTCCCACTTCTTGTAAACTTGTTTGAAAAGCAAAGGCT
GGTTGGTTTATAAACTGTACATAGAGGTTGTTGAAGAGTAAGCAATGTGTGTTAACAATA
GTTCGTTGTAA

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 2

CO CL6038Contig1 1253 2 2 U
GCGCACGGTGTTCCCAAATGCCTCCATTGCCTTTCCCTCAGGTTAACAGAAGAGTACTCT
GTAAACGCAATGGCTCGAACGCGTCTGCCTCCACCTGAATCCGTCTCTCGTCTAACCGAT
CCATCTTTTCACCATGTTGTCATCTTGACCGACAATGTCCTGGCTGCCTCTGTCGTCATA
TCTTCAACTGTGCAAAACGCTGTGAATCCAGACAAGTTTGTCTTTCATATCGTCACCGAT
AAGAAAACATATACCCCTATGCACGCCTGGTTTGCTATCAACTCTGTTTCATCCCCAGTT
GTTGAAGTAAAAGGTCTTCATCAGTATGATTGGCCTCAAGAAGTGAATGTCAGAGTTAAA
GAGATGCTTGAAATTCACCGCATGATTTGGAGACGTCACTATCAGAATTTAAAGGATTCT
GATTATAGTTTCGTCGAGGGTACTCATGAGCAGTCCTTACAAGCTCTAAACCCTAGCTGC
CTCGCCCTTTTGAATCATCTTCGCATCTACATTCCCAAGCTCTTTCCAGACCTAGACAAG
ATAGTGTTGTTGGATGATGATGTAGTCGTACAGCGTGACCTTTCCTCTTTATGGGAAACG
GATCTCAACGGTAAGGTCGTTGGTGCAGTTGTTGATTCGTGGTGTGGAAGTAACTGTTGC
CCGGGAAGAAAATACAAAGACTATTTCAACTTCTCACATCCTGTGATCTCATCAAACTTT
CTTCAAGATGACTGCGCTTGGCTTTCTGGTATGAATGTCTTTGATCTCAAGGCCTGGAGA
CAAACCAATATCACACAAGCTTACTCCACATGGTTAAGACTCAGTGTTAGCTCCGGGCTA
CAACTATGGCAACCAGGAGCCTTACCACCGACTCTACTTGCTTTCAAAGGACTCACTCAG
CCTCTGGACCCATCATGGCACGTAGCTGGACTAGGATCTCGATCAGTTAAACCCCCTGAA
GAGATTCTGAAATCTGCTGCGGTTCTACATTTCAGCGGTCCAGCAAAACCGTGGCTAGAG
ATTAGTAAACCTGAGGTACGATCTTACTGGTATAGATACGTAAAGTCATCGAACATCTTC
GTTAGAAAATGTAAAATCATGAACTGATGAAAAAAGATTAAACAAAAAAATCAGCAAATC
TGTATGAGAGAAGGGAGGGAAGAAGGTTTTAGCCTTCAGCCTCTGCTCATGTTTCTCTCA
TGTCCGTATACTAAAGAGTAATCTAGATTCTATGAATATGTAGCGTTTTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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CTTCAAGATGACTGCGCTTGGCT

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DS 

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CTAAAGAGTAATCTAGATTCTATGAATATGTAGCGTTTTCTCC

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

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ATATTTGTTTTTTTCTTTTTAATTATATTTGTGTTTTTTATAATAATATTTGTGTATAAA
TCTTAAGATGTTAATAAACACATTCTTATAACC


BQ
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AF RS1A602TF U 1
AF RS1A602JQ C 654
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AACCGCCGTTCTCGCCTCCCGTCGCTTCTTCTTCTCTTCCCCTGGCCGTTCCAACTTAAT
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GTATAAATCTTAAGATGTTAATAAACACATTCTTATAACC

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DS 



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ATAACTCACCGGGAAATGCTGTTAGCCGCAACTCTTCTTCTGGTTCAAGAAGTTCACAGC
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ATACTTTTTCTGTTGCTTCCTCATCAGCAACATCTGTAAGAACTATTAAACCCAAGGTAA
CCATTGGAGTTGCTCCTACGTTTAGCAGCACCTCTCGGTTGGAGAGACGCAAAGAGTTTT
ACAAGAAGCTAGAGGAGAAACAGAAAGCACTCGAGGAAGAGAAGAGAGAAAACGAGAAAA
GGCTTAAGGAAGAGCAAGAGATAGCCACTAAGCAACTCCGGAAGAATATGGCTTACAAAG
CTAATCCCGTACCCACTTTCTACCACGAGCCTCCTCCACAGAAACCTCCACTCAAAAAGC
TTCTTCTGACTCGGCCCAAGTCACCAAACCTTAACCGTAGAAAGAGCTGCAGTGACACAG
TTAACTCATCACATCAGGAGGTGAAAGGGAAGCATTGTGCTCGACATCGCCACAGCGTAG
ATGGTCGCAAGGACGAGTCCAAAGCTAGTAGTAGCCCGATGAGGACACCAGATAATAAGA
AGAAGTCCACAAAGGAAACACCAAAGTCTGAAGAAGTTTATGGAAAAAACAAGAGCGGCC
ATGAGGGAGAGGTAGGTGAGAATTGAATTTGATGCTGTGGAGTGACGTGACGTTTAGTTT
ATAGCTTCGTTTTGACTAACTTGGTGATTGAGAAACAAGAAAAATGGGTGAGAAGTGTAA
GAGGAAGAACAGGTTCTAGAGTGAAAAAAAACGAGTTTGAAAGTTTCAGTTGTTTTGTTT
TGCTTATTATTCTAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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BS 699 1215 RS1DD82JQ

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DS 

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AAAACGAGTTTGAAAGTTTCAGTTGTTTTGTTTTGCTTATTATTCTAT

QA 1 708 1 708
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GAAAAAAATGGCGATGGACAGAGCCCAATTGATACTCTTGGGTTTACCGATATTCTTATT
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ACCACCACCGCATGTCCCTCACCACCACCACCACCAGCGTCCGGCTGGATTCACACCCGA
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TGGAAACACCGTGGACATCAACTTCTGCGTCTCCTGTTCTTTCAAGGGAACAGCAGTGAC
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AGCACCAGCACCAAAGCGTATTCTAGCCAAGGTTGTACCGGTTGCTCAGATGGGAGTCAT
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TTGGTTCAACTCCTTGAGGGCCAATAGATTTGGTTCCATGGCTTCTACTTGGCTTCTCGG
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GCAGTGTTTCGATCTTATGTGCTTAAAAGCTGCTTATGTAGCAATACCGTTTTGTTCATT
TGGTTTAACTAGCTTTTTTACTCTTTTGATTT


BQ
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AF RS1AF71TF U 1
AF RS1AF71JQ C 210
BS 1 629 RS1AF71TF
BS 630 932 RS1AF71JQ

RD RS1AF71TF 629 0 0
GGGGTTTTGGTACTTGCTCTCTCTGTCTCGCTTCTGACTCAGTCGAGATCATCGGAGATT
GAAAAAAATGGCGATGGACAGAGCCCAATTGATACTCTTGGGTTTACCGATATTCTTATT
TTGTTCTGATCTGTTCAACCTATTCACTCCTCCGCCTCCAAAACCTCCTACTCATCAGGC
ACCACCACCGCATGTCCCTCACCACCACCACCACCAGCGTCCGGCTGGATTCACACCCGA
AACCCTAGATTTCCCTTTTTCTCAGAAGAAACAAAGTGGACTAGGAGGAGCTGTTGGATA
TGGAAACACCGTGGACATCAACTTCTGCGTCTCCTGTTCTTTCAAGGGAACAGCAGTGAC
CATGAAGAAGATGTTAGAGACGGAGTTTCCAGGTTTGGACGTGATTCTCGCCAACTACCC
AGCACCAGCACCAAAGCGTATTCTAGCCAAGGTTGTACCGGTTGCTCAGATGGGAGTCAT
CGGTATGATAGTTGCAGGTGACCGCGTCTTCCCCATGATTGGAATCACGCAGCCACCAGC
TTGGTTCAACTCCTTGAGGGCCAATAGATTTGGTTCCATGGCTTCTACTTGGCTTCTCGG
AAACTTTCTCCAGTCTTACCTTCAAAGCT

QA 1 629 1 629
DS 

RD RS1AF71JQ 723 0 0
ACCACCAGCGTCCGGCTGGATTCACACCCGAAACCCTAGATTTCCCTTTTTCTCAGAAGA
AACAAAGTGGACTAGGAGGAGCTGTTGGATATGGAAACACCGTGGACATCAACTTCTGCG
TCTCCTGTTCTTTCAAGGGAACAGCAGTGACCATGAAGAAGATGTTAGAGACGGAGTTTC
CAGGTTTGGACGTGATTCTCGCCAACTACCCAGCACCAGCACCAAAGCGTATTCTAGCCA
AGGTTGTACCGGTTGCTCAGATGGGAGTCATCGGTATGATAGTTGCAGGTGACCGCGTCT
TCCCCATGATTGGAATCACGCAGCCACCAGCTTGGTTCAACTCCTTGAGGGCCAATAGAT
TTGGTTCCATGGCTTCTACTTGGCTTTTCGGAAACTTTCTCCAGTCTTACCTTCAAAGCT
CAGGCGCCTTTGAAGTTCTCTGCAATGGAGAACTGGTGTTTTCTAAATTGAAAGAAGGTA
GATTCCCGGGAGAGATCGAGCTGAGAGATCTCATCAGTAAGAAGTTGACAAGGACCTAGC
AGGAGGTAGCTACGGAAGCAGAGTATCATCAGCAGAAAGATATATGTCGGTATGAAAGGT
ATATATGGAGAATATATAAACCTTTCCACAAGCAGTGTTTCGATCTTATGTGCTTAAAAG
CTGCTTATGTAGCAATACCGTTTTGTTCATTTGGTTTAACTAGCTTTTTTACTCTTTTGA
TTT

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

CO CL6043Contig1 832 2 2 U
GGACAATGAAGATGTTTCAAAATAACAAAATGATATACTTCATTGTGTTTGCTTTTCTTT
TCAATGGTTGCACAGCCAACAAAGTGGCAGATTCTTTGATTCAAAATTCTTGCAAAAACG
CTTCAAAGTCTCCAGGTCCGGACATGATTCCACATTTCGAAGAAGTTTGCATTGCATCTC
TCAAAGAGAATCTGAAGAGCCAAAAAGCAAGAAATCTCTGTGATTTGACTATGGTAGGAG
CAAATAACGCCATATCAAACTTAACGAACGTGAAAAAAAATGGTGGAGAAGATTATAAAA
GAAAAAAAATATAAAAATAATCTTACTAAAAAGTTGTTGGAAGAATGCCCTAAGCTTTAC
TCCAATAGCTTTAAATCGCTAACTTCAGGTTTGAATTACGTCAAAATGCGGAATTTTGAT
AAGGCTGCAGATGATTTTATGAATGCAGAGGATGGGCCAGCATTTTGCGGATTGAAATTT
AACGGCGATAATCAACAAATATCTCCTGTGAAAGAAGAGAATATTTTTCTCATAACAATG
TTCCAAATTCCAGGGACGTTTGCTCGGGACGTCTCGTACGAACAAAGAAATAATAAAAAC
AAAAAGGAAGAAACAAACTAGTGGAGTATCTCGTTAGAAATAAATTAGGTTTGTGAAGAT
GCTCAGCCAGACTAGCGTCCAGTTAAATAAAAGGGTGCTACGTGAGTTCTACTGAGCAAC
AGTTATGAAAAATATAGTTAGTTCTCGTTAATAATTTTGTTTGTGTGTTATTTTTTTGTT
TGGATCGTGTAGTTAAATGATATTTACTAGTTATATTATTCTGCTTATTGTC


BQ
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AF RS1B983TF U 1
AF RS1B983JQ C 177
BS 1 591 RS1B983TF
BS 592 832 RS1B983JQ

RD RS1B983TF 591 0 0
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TCAAAGAGAATCTGAAGAGCCAAAAAGCAAGAAATCTCTGTGATTTGACTATGGTAGGAG
CAAATAACGCCATATCAAACTTAACGAACGTGAAAAAAAATGGTGGAGAAGATTATAAAA
GAAAAAAAATATAAAAATAATCTTACTAAAAAGTTGTTGGAAGAATGCCCTAAGCTTTAC
TCCAATAGCTTTAAATCGCTAACTTCAGGTTTGAATTACGTCAAAATGCGGAATTTTGAT
AAGGCTGCAGATGATTTTATGAATGCAGAGGATGGGCCAGCATTTTGCGGATTGAAATTT
AACGGCGATAATCAACAAATATCTCCTGTGAAAGAAGAGAATATTTTTCTCATAACAATG
TTCCAAATTCCAGGGACGTTTGCTCGGGACGTCTCGTACGAACAAAGAAAT

QA 1 591 1 591
DS 

RD RS1B983JQ 656 0 0
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GGAGCAAATAACGCCATATCAAACTTAACGAACGTGAAAAAAAATGGTGGAGAAGATTAT
AAAAGAAAAAAAATATAAAAATAATCTTACTAAAAAGTTGTTGGAAGAATGCCCTAAGCT
TTACTCCAATAGCTTTAAATCGCTAACTTCAGGTTTGAATTACGTCAAAATGCGGAATTT
TGATAAGGCTGCAGATGATTTTATGAATGCAGAGGATGGGCCAGCATTTTGCGGATTGAA
ATTTAACGGCGATAATCAACAAATATCTCCTGTGAAAGAAGAGAATATTTTTCTCATAAC
AATGTTCCAAATTCCAGGGACGTTTGCTCGGGACGTCTCGTACGAACAAAGAAATAATAA
AAACAAAAAGGAAGAAACAAACTAGTGGAGTATCTCGTTAGAAATAAATTAGGTTTGTGA
AGATGCTCAGCCAGACTAGCGTCCAGTTAAATAAAAGGGTGCTACGTGAGTTCTACTGAG
CAACAGTTATGAAAAATATAGTTAGTTCTCGTTAATAATTTTGTTTGTGTGTTATTTTTT
TGTTTGGATCGTGTAGTTAAATGATATTTACTAGTTATATTATTCTGCTTATTGTC

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 2

CO CL6044Contig1 1042 2 4 U
GGATGCGAGTTCCAAACTTCCTGGCGCTCGTTCTCCGACCACAAATGATCTCCTGAAACC
TTCGCCTGCTTCAGAGAAACACGACCACGAGACTGACCTGCCATGGCGAAATCCAAAAAA
ACCAACGACTTCTATCTAGCTATTCGTGCAAAGATTTAACCGTCCGATGATGCCGATTCA
TACGCGCCTCGAGAAATTCAAGCTATACGAGACCCAGAGCGTACAGAGGTATGATCCCTA
CATACGAGTCAACCAAAATGCATTTTGAAGACCTGGTGAATCTTAGTTGTTATGATCAGA
TTCTACCTGCACTCTGGGAGCTGCATTCTGATCACTTCCTCCATGTGTCAGGGATTGGAG
ATGGTATTTTCCCTGGAAGCGGGGTCCTCTCCATCCCGAAACCCATGAGTGGTATTGGAG
TCAAGCTTGCACCAGTGAGAAGACTTCTCACGGAAGCAGCTGACGTCGTTTGACAAACTG
ATCGAGCATACGTGCAGTTCAATAAAGAATGTGAGGCCTTGTAGCGAGACAGAGAGTGGC
TCTGCCACAAAACCTGATCGAGCATACGTGCAGTTCAATAAAAGAGAGTGGCTCTGCCAC
AAAACCTGGCGCAGACGACAGTGAGATACGTGTGGCCTGGCGTGAGGGAGTCAGCGATTT
CTGCAACTCGGACTGGCTTTCTGAGCCCCACAATCATGAGGATGATATCTTCCAAAGGTA
CCTACCGATCACATCAACCAATGAGGCCAATGGTTGGTATGGTGCGAAATTTACAGACAT
TATGCTGAGTTCTGTCAGTGTCCAGCTATGGAACCATTTGACAACGATCATGAGTTAGAA
CAGAAGAGCTCTGCGGAAGTTCTGCGCATGAACACAGTCGATGTAATGGACTTGGGAGAA
GAAGAAACGGATACTTCGCCGAATGATTTTTCCACAACCGATGATTTTTTTCTGCCACAA
GAACATAACGTCTCACACCACACCAGAGACTCTCCTCTTTTGCTTGTATGATTTACATGA
AATCTTATTTTGAGAATTGTGC


BQ
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AF RS1CH41TF U 1
AF RS1CH41JQ C 310
BS 1 717 RS1CH41TF
BS 718 718 RS1CH41JQ
BS 719 737 RS1CH41TF
BS 738 1042 RS1CH41JQ

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TCAAGCTTGCACCAGTGAGAAGACTTCTCACGGAAGCAGCTGACGTCGTTTGACAAACTG
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AAAACCTGGCGCAGACGACAGTGAGATACGTGTGGCCTGGCGTGAGGGAGTCAGCGATTT
CTGCAACTCGGACTGGCTTTCTGAGCCCCACAATCATGAGGATGATATCTTCCAAAG*TA
CCTACCGATCACATCAA

QA 1 737 1 737
DS 

RD RS1CH41JQ 733 0 0
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TCCCTGGAAGCGGGGTCCTCTCCATCCCGAAACCCATGAGTGGTATTGGAGTCAAGCTTG
CACCAGTGAGAAGACTTCTCACGGAAGCAGCTGACGTCGTTTGACAAACTGATCGAGCAT
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CGCAGACGACAGTGAGATACGTGTGGCCTGGCGTGAGGGAGTCAGCGATTTCTGCAACTC
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TCTGCGGAAGTTCTGCGCATGAACACAGTCGATGTAATGGACTTGGGAGAAGAAGAAACG
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GTCTCACACCACACCAGAGACTCTCCTCTTTTGCTTGTATGATTTACATGAAATCTTATT
TTGAGAATTGTGC

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 2

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GGACCATTGGTGACATCGTTGGGGAAGAACTCGGATCAGCAAACTATGCTATTCCATTCT
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GAATCATGAATGCAACCGGAAGAATCTTTGTGAACAGGTTAGGCATGGATGTACAAGTAG
ATTTCTTCAACACCACACGTAAACAATTCGATGAACTACTTGGAAAAGAGAAAGCAAAAG
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TTGACGACATGATCGACCATCTTCGCGACCAACTAACCAGGTTGTACCAATTGGATGCGA
GAAAGTTTGTGATCGGGAACGTTGGACCTATCGGATGCATACCGTACCAGAAAACGATTA
ATCAACTAAACGAAAATGAGTGTGCGGACCTTGCTAATAAGCTAGCAAATCAATACAATG
TTCGACTTCAGAGTTTATTAGAGGACCTAAACAAGAAGCTTCCTGGAGCAATGTTCGTGC
ATGCCAATGTCTACGATCTCGTCATGGAACTCATTACTAATTACGAAAAATATGGGTTCA
AAACGGCGACAAAAGCTTGTTGCGGTAATGGAGGACAGTTCGCAGGAATAATACCTTGCG
GACCGACATCGAGTATGTGCGAGGAAAGGGACAAGTATGTGTTTTGGGATCCTTATCATC
CTAGTGAAGCAGCAAATGTAATCATCGCTAAGCAATTCTTGTATGGTGATATTAACGTCA
TCTCTCCTGTTAATCTTAGCAAGCTTAGGGATATGTGATTTGATTGTTTGGAGATTCTAC
ACTTCATTTCTTGCATTTACCTTTGTTATAAGCAAAGTTAAAACCGATGTTTGTATGTAT
ATGTGTTGTGGCTTTTAAGTTTAGTGACAAGATGTGATGAAATTTTTCT


BQ
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AF RS1AH11TF U 1
AF RS1AH11JQ C 471
BS 1 804 RS1AH11TF
BS 805 1309 RS1AH11JQ

RD RS1AH11TF 804 0 0
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TCTTCTTCTTTTTCTCCTTCCTCTTAACTCTCACTGCTTTTGTGGAAGCCGCTGGCCGTG
GGGTTAACAACGATAATAACAAAAATGGAGGATTAGGAGCTTCGTTTATATTTGGAGATT
CTCTAGTGGATGCAGGAAACAATAACTATCTACCGACCTTGTCTAGGGCCAATATGAAGC
CTAATGGTATCGATTTCAAAGCTTCGGGAGGAAACCCAACCGGTCGGTTTACTAATGGCC
GGACCATTGGTGACATCGTTGGGGAAGAACTCGGATCAGCAAACTATGCTATTCCATTCT
TAGCACCAAACGCTACCGGAAAAGCTTTACTGGCCGGTGTAAACTACGCGTCTGGAGGAG
GAATCATGAATGCAACCGGAAGAATCTTTGTGAACAGGTTAGGCATGGATGTACAAGTAG
ATTTCTTCAACACCACACGTAAACAATTCGATGAACTACTTGGAAAAGAGAAAGCAAAAG
AGTATATAAGCAAGAAATCAATATTCTCCATCACTATCGGAGCCAACGACTTCCTCAACA
ACTATCTATTCCCTCTTCTCTCCATTGGAACACGGCTCACTCAAACTCCTGATAATTTTA
TTGACGACATGATCGACCATCTTCGCGACCAACTAACCAGGTTGTACCAATTGGATGCGA
GAAAGTTTGTGATCGGGAACGTTGGACCTATCGGATGCATACCGTACCAGAAAACGATTA
ATCAACTAAACGAAAATGAGTGTG

QA 1 804 1 804
DS 

RD RS1AH11JQ 839 0 0
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AAAGCAAAAGAGTATATAAGCAAGAAATCAATATTCTCCATCACTATCGGAGCCAACGAC
TTCCTCAACAACTATCTATTCCCTCTTCTCTCCATTGGAACACGGCTCACTCAAACTCCT
GATAATTTTATTGACGACATGATCGACCATCTTCGCGACCAACTAACCAGGTTGTACCAA
TTGGATGCGAGAAAGTTTGTGATCGGGAACGTTGGACCTATCGGATGCATACCGTACCAG
AAAACGATTAATCAACTAAACGAAAATGAGTGTGCGGACCTTGCTAATAAGCTAGCAAAT
CAATACAATGTTCGACTTCAGAGTTTATTAGAGGACCTAAACAAGAAGCTTCCTGGAGCA
ATGTTCGTGCATGCCAATGTCTACGATCTCGTCATGGAACTCATTACTAATTACGAAAAA
TATGGGTTCAAAACGGCGACAAAAGCTTGTTGCGGTAATGGAGGACAGTTCGCAGGAATA
ATACCTTGCGGACCGACATCGAGTATGTGCGAGGAAAGGGACAAGTATGTGTTTTGGGAT
CCTTATCATCCTAGTGAAGCAGCAAATGTAATCATCGCTAAGCAATTCTTGTATGGTGAT
ATTAACGTCATCTCTCCTGTTAATCTTAGCAAGCTTAGGGATATGTGATTTGATTGTTTG
GAGATTCTACACTTCATTTCTTGCATTTACCTTTGTTATAAGCAAAGTTAAAACCGATGT
TTGTATGTATATGTGTTGTGGCTTTTAAGTTTAGTGACAAGATGTGATGAAATTTTTCT

QA 1 839 1 839
DS 



AS 1 2

CO CL6046Contig1 1091 2 8 U
GGAACTTCGTTTCGCAATCCAATAAGACGCGGATCTGTGAGATAGAGATCTAGAGGAAGA
AGAAGCAAAGCAATGGCAGGCATGGGAGCAGGGCCAGATCACCTCTTCAATCTGAGAAAC
CAATTCTATCTGGGAGCTTATCAAACGGCGATCAACAACAGCGAGATCCGTAACCTCTCG
CCGAGGACGCCGTGGAGCGCGACTGCCTCGTCTTCCGATCTTACATCGCCCTCGGTAGCT
ATCAGCTCGTCATCAGCGAGATCGATGAATCCGCCGCTACTCCACTGCAGGCAGTTAAGC
TCCTCGCGATGTATCTATCGAGTCCTGCAAATAAGGAATCAACGATTTCGAGCTTGAGGG
AGTGGTTGGCAGATCCAACAATAGGAAACAATGCTACTTTGCGACTGGTTGCTGGTGTTG
TTTTCATGCATGAGGAAGATTATAGTGAAGCTCTCAAGCACACTCATGCTGGAGGAACTA
TGGATCTGCATGCCTTGAACGTCCAGATATTCATTAAGATGCATAGAACAGATTATGCTG
AGAAGCAGCTTGGAGTTATGCAGCAATATGACGAAGACCACACTCTCACTCAACTTGCTA
CCGCCTGGTTTAACCTGGCAGTGGGTGGCTCGAAGATACAGGAAGCTTATCTCATTTTCC
AGGATTTCTGTGAGAAGTATCCCATCTCATGCTTGATCTTGAATGGCAAAGCAGTTTGCT
GTATGCAAATGGGTAACTTTGATGAAGCTGAAACACTACTCCTTGAAGCACTCAACAAGG
ATGCTAAAGACCCAGAAACTCTTGCAAACCTTGTCGTCTGCAGTCTTCATGTTGGCAAAT
CATCTTCACGTTACTTAAGCCAGCTGAAACTATCACATCCAGAACATGTGCTCGTGAAGC
GTGTATCATCAGCCGAAGATAACTTCGAGAGAGCGGTTCAATCTGTGGCCTGAAGACTCT
TTCATGGTTCAACCACCTGTGCAGGATCGGTTTGATTTATCACATATATTCCCGTGTTTG
GTAAACCCACCAGAATAACTTTTTGTCTTGTCTTTTTTTTTTAATCAGTATAAAGAACAC
CAGATTTTGCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GE34TF U 1
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TGGATCTGCATGCCTTGAACGTCCAGATATTCATTAAGATGCATAGAACAGATTATGCTG
AGAAGCAGCTTGGAGTTATGCAGCAATATGACGAAGACCACACTCTCACTCAACTTGCTA
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AGGATTTCTGTGAGAAGTATCCCATCTCATGCTTGATCTTGAATGGCAAAGCAGTTTGCT
GTATGCAAATGGGTAACTTTGATGAAGCTGAAACACTACTCCTTGAAGCACTCA*CAAG*
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TCATCTTC

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DS 

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GAACTATGGATCTGCATGCCTTGAACGTCCAGATATTCATTAAGATGCATAGAACAGATT
ATGCTGAGAAGCAGCTTGGAGTTATGCAGCAATATGACGAAGACCACACTCTCACTCAAC
TTGCTACCGCCTGGTTTAACCTGGCAGTGGGTGGCTCGAAGATACAGGAAGCTTATCTCA
TTTTCCAGGATTTCTGTGAGAAGTATCCCATCTCATGCTTGATCTTGAATGGCAAAGCAG
TTTGCTGTATGCAAATGGGTAACTTTGATGAAGCTGAAACACTACTCCTTGAAGCACTCA
ACAAGGATGCTAAAGACCCAGAAACTCTTGCAAACCTTGTCGTCTGCAGTCTTCATGTTG
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TGAAGCGTGTATCATCAGCCGAAGATAACTTCGAGAGAGCGGTTCAATCTGTGGCCTGAA
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TGTTTGGTAAACCCACCAGAATAACTTTTTGTCTTGTCTTTTTTTTTTAATCAGTATAAA
GAACACCAGATTTTGCC

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DS 



AS 1 2

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GTGGAATCCAGAGACTTTTGGTTTATGAGTATATGCCAAACCAAAGCGTTGAGTTCCATC
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CAGCTAGGGGTTTGACATACCTCCATGAAGAAATGGACTTTCAAATAATATTTAGAGATT
TCAAGTCATCAAACATTCTACTAGACGGGGACTGGAAAGCAAAGCTATCAGATTTTGGTT
TGGCTCGGTTAGGTCCTTCGCCAGGATCAACTCATGTTTCTACTGGTGTAAGTTGTTTAT
GCACATTTCACTTCATTTGGTATAGAAATCATCACCGACATATCTAGCAGCACCGTCTAA
TATACACGTGCAAAAGAAGCGGTCGAACAAAAATTCTGAATCTAAAAATTAAAACAAATA
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ATTCGTTAAATATACAGTTAACATGACCTATAAATAGTTTGAGACAGCACTGATATGAGA
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ATATATCCAAACTGGTCGTCTAACATCGAAGAGTGACGTGTGGGGTTATGGAGTTTTCAT
GTATGAGCTCATTACAGGAAGAAGGCCTCTAGACAAGAACAGGCCTAAAGGAGAGCAAAA
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TGGCGACGGAGGTTGGTTAGATAAGTTATGGAACCCAAAGAATGTGAGAGCTTGTTGATT
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CAAATTCAAATGTTGGGGTGGGGC


BQ
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AF RS1EN61TF U 1
AF RS1EN61JQ C 610
BS 1 691 RS1EN61TF
BS 692 1284 RS1EN61JQ

RD RS1EN61TF 691 0 0
GGGGGTGGTTGCATCCGAACTTGGTGAAACTGTTGGGTCATTGTGCAGAAGACGATGATC
GTGGAATCCAGAGACTTTTGGTTTATGAGTATATGCCAAACCAAAGCGTTGAGTTCCATC
TAGCTCCACGTTCACCTACTGTGCTTACTTGGGACCTCAGGTTGAGAATAGCACAAGACG
CAGCTAGGGGTTTGACATACCTCCATGAAGAAATGGACTTTCAAATAATATTTAGAGATT
TCAAGTCATCAAACATTCTACTAGACGGGGACTGGAAAGCAAAGCTATCAGATTTTGGTT
TGGCTCGGTTAGGTCCTTCGCCAGGATCAACTCATGTTTCTACTGGTGTAAGTTGTTTAT
GCACATTTCACTTCATTTGGTATAGAAATCATCACCGACATATCTAGCAGCACCGTCTAA
TATACACGTGCAAAAGAAGCGGTCGAACAAAAATTCTGAATCTAAAAATTAAAACAAATA
TACAAATTATTGTCTAAATCACTAAATTTTTAGATACATTACTAAATTTAGAGTATAATT
TCAAAAGAAACATCAAATATATAGAGATTGAACTATGAATTTTTAAATATCCTTCACTAC
ATTCGTTAAATATACAGTTAACATGACCTATAAATAGTTTGAGACAGCACTGATATGAGA
AAGTTGTTTTGGTTTCTTGGTTTGACAGGTA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1EN61JQ 675 0 0
ATATACAGTTAACATGACCTATAAATAGTTTGAGACAGCACTGATATGAGAAAGTTGTTT
TGGTTTCTTGGTTTGACAGGTAGTAGGAACAATGGGCTACGCAGCACCAGAATATATCCA
AACTGGTCGTCTAACATCGAAGAGTGACGTGTGGGGTTATGGAGTTTTCATGTATGAGCT
CATTACAGGAAGAAGGCCTCTAGACAAGAACAGGCCTAAAGGAGAGCAAAAGCTTTTAGA
ATGGGTGAGACCTTACTTAACCGACACAAAGAGGTTTAGTCTCGTTATAGACCTGAGGCT
TGAAGGCAAATACTCGATTAAACACGTCCAGAAACTAGCGGTTGTAGCCAACCTTTGCCT
TACTAGGAACTCAAAGGCACGTCCAAAGATGAGTGAGGTGTTGGAGATGGTGACAAAGAT
TGTTGAAGATTCTTCGTCTAGGAATGGTGGTAAGAAGAGGCAGCTGGTCCCTTTGAGGAG
TCTAGGACCGTCTAGCGACGTGGAAGAGAAGAATAAGAAGGTTCTTGATGGTGGCGACGG
AGGTTGGTTAGATAAGTTATGGAACCCAAAGAATGTGAGAGCTTGTTGATTGGCGTAGAG
TTTAATACAACTTTAGTACATTATACCCTTTGCTTATTTTCTGTAATTCAACAAATTCAA
ATGTTGGGGTGGGGC

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL6048Contig1 721 2 5 U
CAGAGCTTATCATCTTTGACATTATCTGCTGGAACGGTATTAGTTTTGGGAAGGGCTCAT
GATTCGAACCAAATCCGCAGGGATTACACAAACCACATTTTAAACAGAGAAACTAGAGAA
TAAAAAAAAAAAAGAGTATTACAGAACAACACCAAGGACATACAAGATCAGCTAGGTTGT
GGTTACTTGGAAACTTTCTTCTTGCCAGCAATAGCAACTTTCTTGCCCTTAAAAGTCCTG
CAGTTGTTCTTGGTTCTCTGTCCACAACATGGCAGGCCTTGGATGTGCCTTACCCCACGG
TAACACTGGATTTCCTTAAATCTCTTTATAGCAAGCGCATTGAATCTCCTCAGATCACCC
TCGATCATATACTTGGAGACTTAATCACGAAGCACGATGAGCTCTTCCTCAGCCATGTCT
TTGGTGATTTTGTTCTCCATCTGAAGATCAACGAGAATCTGGCGAGCCCTAGTTCGACCA
ATGCCGTGAATGTACTGAAGAGAGTATTCAATCCTCTTGTTACTCGGAATCTCCACACCA
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AAATAGTGTTGCGAGTGAGAGGATTCGATTTCGTCCAGTTGCATATGAGTGACAGCGAGT
GCGCTACGGGCATCGCAACCATCTGCGCCATTTTTTTTTTCTTCTGTATCCTTTGCGACC
C


BQ
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10 

AF RS1BZ01JQ U 6
AF RS1BZ01TF C 1
BS 1 5 RS1BZ01TF
BS 6 150 RS1BZ01JQ
BS 151 151 RS1BZ01TF
BS 152 270 RS1BZ01JQ
BS 271 721 RS1BZ01TF

RD RS1BZ01JQ 265 0 0
CTTATCATCTTTGACATTATCTGCTGGAACGGTATTAGTTTTGGGAAGGGCTCATGATTC
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AAAAAAAAGAGTATTACAGAACAACCCCAAGGACATACAAGATCAGCTAGGTTGTGGTTA
CTTGGAAACTTTCTTCTTGCCAGCAATAGCAACTTTCTTGCCCTTAAAAGTCCTGCAGTT
GTTCTTGGTTCTCTGTCCACAACAT

QA 1 265 1 265
DS 

RD RS1BZ01TF 721 0 0
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TAAAAAAAAAAAAGAGTATTACAGAACAACACCAAGGACATACAAGATCAGCTAGGTTGT
GGTTACTTGGAAACTTTCTTCTTGCCAGCAATAGCAACTTTCTTGCCCTTAAGAGTCCTG
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TCGATCATATACTTGGAGACTTAATCACGAAGCACGATGAGCTCTTCCTCAGCCATGTCT
TTGGTGATTTTGTTCTCCATCTGAAGATCAACGAGAATCTGGCGAGCCCTAGTTCGACCA
ATGCCGTGAATGTACTGAAGAGAGTATTCAATCCTCTTGTTACTCGGAATCTCCACACCA
CCAACACGAGCACATCTGATGCTTAGACTCGCTTATTGGGAGCGTTTGAAGGTGGGAGAG
AAATAGTGTTGCGAGTGAGAGGATTCGATTTCGTCCAGTTGCATATGAGTGACAGCGAGT
GCGCTACGGGCATCGCAACCATCTGCGCCATTTTTTTTTTCTTCTGTATCCTTTGCGACC
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL6049Contig1 981 2 2 U
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TTGATTCGTCGTCTTTGTGTATAATTAGTTTCGTATCTCATTTGCTTTCCATTTTCGCGA
TCTCTAAACTCTCTGCTATCCATCGAGGGTTACTTCGACGACACCATCTTCCACCGTGTA
ATCCCCGGGTTCCTCGACCCCATCGGCTCCGGCCCAGGTGGAGAGAATATATACGGAGGT
GTCTTTGCCGATAGTTCCACTCGACGCTGAGATTTAACCACCGGGGGACTGTGGCCATGG
CTAATGAGAGCTCACCGAATACTAATATTAGCCAGTTTTTTTTTCACTTTGGATAAGTGT
AATTGGCTTTATAAGAAGCACACTATGTTTGGAAAGATGATCATCCCCTGGATCCTGCCC
CCAAAATATTATCTGTTGAGGTTTTGTGGAACCCTTTCGAAGATATTGTTCCTAGAGTGT
TAGCAAAGACATCACATGCTCCTGTTGATGAAGTCAAGGAATCCCCCAAAAAAGCCTGTG
AAGAAATTGAATCTACTGTCATTCGGAGAAGAAGCTGAAGAAGAGGAGAAGGAACTGCCA
GTTGTAAAGCAAAATATTAAGAGCAGTCATGACGTGTTGAACGATCCTCGACTATTGAAG
CCAGAATCTACAAATAAAGAACGGAATGCATCTGACTTGAAGGAGGTGCTATCTGTGCGG
GAAGCTCTCGGTTCTAAGAAGGAAGATGCTCAAGAGGAACTCTGGCTTGTATCCGATCCA
GTTGGACATAGTGATGATGACGATGATGGTGGAGAGGAGACTAAATTTGATGCAAAGATG
AGGAATCAGGTGCTTAGCTGGAGGAAATAGATGGGAGATATTCTCTTCCAAAACCAACTC
AGAAAAAAGTAATTAGTTTTTCCATCTCTCAAAACTGATATATTGAACTTATGAATTACA
TAACAAAAGTTCAAACCAACT


BQ
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AF RS1H148TF U 1
AF RS1H148JQB C 336
BS 1 586 RS1H148TF
BS 587 981 RS1H148JQB

RD RS1H148TF 586 0 0
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TTGATTCGTCGTCTTTGTGTATAATTAGTTTCGTATCTCATTTGCTTTCCATTTTCGCGA
TCTCTAAACTCTCTGCTATCCATCGAGGGTTACTTCGACGACACCATCTTCCACCGTGTA
ATCCCCGGGTTCCTCGACCCCATCGGCTCCGGCCCAGGTGGAGAGAATATATACGGAGGT
GTCTTTGCCGATAGTTCCACTCGACGCTGAGATTTAACCACCGGGGGACTGTGGCCATGG
CTAATGAGAGCTCACCGAATACTAATATTAGCCAGTTTTTTTTTCACTTTGGATAAGTGT
AATTGGCTTTATAAGAAGCACACTATGTTTGGAAAGATGATCATCCCCTGGATCCTGCCC
CCAAAATATTATCTGTTGAGGTTTTGTGGAACCCTTTCGAAGATATTGTTCCTAGAGTGT
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AAGAAATTGAATCTACTGTCATTCGGAGAAGAAGCTGAAGAAGAGG

QA 1 586 1 586
DS 

RD RS1H148JQB 646 0 0
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GATGATCATCCCCTGGATCCTGCCCCCAAAATATTATCTGTTGAGGTTTTGTGGAACCCT
TTCGAAGATATTGTTCCTAGAGTGTTAGCAAAGACATCACATGCTCCTGTTGATGAAGTC
AAGGAATCCCCCAAAAAAGCCTGTGAAGAAATTGAATCTACTGTCATTCGGAGAAGAAGC
TGAAGAAGAGGAGAAGGAACTGCCAGTTGTAAAGCAAAATATTAAGAGCAGTCATGACGT
GTTGAACGATCCTCGACTATTGAAGCCAGAATCTACAAATAAAGAACGGAATGCATCTGA
CTTGAAGGAGGTGCTATCTGTGCGGGAAGCTCTCGGTTCTAAGAAGGAAGATGCTCAAGA
GGAACTCTGGCTTGTATCCGATCCAGTTGGACATAGTGATGATGACGATGATGGTGGAGA
GGAGACTAAATTTGATGCAAAGATGAGGAATCAGGTGCTTAGCTGGAGGAAATAGATGGG
AGATATTCTCTTCCAAAACCAACTCAGAAAAAAGTAATTAGTTTTTCCATCTCTCAAAAC
TGATATATTGAACTTATGAATTACATAACAAAAGTTCAAACCAACT

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 2

CO CL6050Contig1 738 2 5 U
AAGAAAACAGTCTGGGTCATGAATGTTGTCCCTACGGCTGCTGGACCTAACCACCTCCCT
ATGATCCTTGACCGTGGCTTCGTCGGTGTTTTACACGACTGGTGAGAGTCATAACAACTA
TTCTTTGTCTTCTCATAGTTTCTCTCAACTTGTCTTTGTACAAACTTTCAGGTGTGAGGC
GTTCCCTAGTTATCCAAGAACATATGACCTTGTCCACGCAGACAATCTTTTGTCTCTCCA
GACAAGTCAGCACCGGAGCTCATGCTCGCTTCTGAACATATTCACAGAGATCGATAGATT
ACTTCGTCCAGAGGGATGGGTGATAATACGTGACACGGCACAGCTGGTGGAAGCTGCAAG
AGCTTTGACAACGCAGTTGAAGTGGGAAGCTAGAGTCATAGAGGTTGAAAGCAGCAGTGA
ACATAGACTCCTCATCTGCCAAAAACCTTTCACCAAGAGACTATCAATCTAAAACAAGAA
CAAGAACAAGAACAAGGGACAGACATAATTAGTGAACTTTGTGTTGACTATACGGGGAAG
AAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGGAGAAAGAAGCCAGGGGACGTAAGACCACCGGTGA
AAAAGTTTCATGAGTTCCCCATTTTACAGAATCTTAGATTTTTTATTATATACAGTGAAA
ATAAATATGATCCAAACATTTGTAAAGATGTTTTAAGAAATAAAATGTATTTCATTTTCA
ATACCAAATGTTTCATGC


BQ
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AF RS1ED69TF U 71
AF RS1ED69JQ C 1
BS 1 70 RS1ED69JQ
BS 71 473 RS1ED69TF
BS 474 474 RS1ED69JQ
BS 475 507 RS1ED69TF
BS 508 738 RS1ED69JQ

RD RS1ED69TF 437 0 0
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TCTCATAGTTTCTCTCAACTTGTCTTTGTACAAACTTTCAGGTGTGAGGCGTTCCCTAGT
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GAGGGATGGGTGATAATACGTGACACGGCACAGCTGGTGGAAGCTGCAAGAGCTTTGACA
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AACAAGGGACAGACATA

QA 1 437 1 437
DS 

RD RS1ED69JQ 738 0 0
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ACATAGACTCCTCATCTGCCAAAAACCTTTCACCAAGAGACTATCAATTTAAAACAAGAA
CAAGAACAAGAACAAGGGACAGACATAATTAGTGAACTTTGTGTTGACTATACGGGGAAG
AAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGGAGAAAGAAGCCAGGGGACGTAAGACCACCGGTGA
AAAAGTTTCATGAGTTCCCCATTTTACAGAATCTTAGATTTTTTATTATATACAGTGAAA
ATAAATATGATCCAAACATTTGTAAAGATGTTTTAAGAAATAAAATGTATTTCATTTTCA
ATACCAAATGTTTCATGC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

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GCTGGAACCAGCCGAGGCTAAAAACCGAAGGGGACTTCAGTAGAAGCCATCTCCCGAAGG
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GTGATTTGGATGTTATCTTCACACCGAAGTGAGCCGGCTTGATCGCTGACCAGAACGATT
CTCTCTTTTGTATCCGCTCAGGACTCTCGTTAACCCCAGGGAGACCATGCGGCTTCTCCG
TTAGAGTGGTGAGTGTTCTACGAACAACTACTGCATCAGCAGAAGGTAGCTTCAGAGCCC
AAAGACCAATCTTCTTTTGGTTTTCTAGCGTTGGCCCTTTAGCAGGTGGACCATGAATCT
GCAAAACACACATTCAATATTAGTCACTTCAAGAAATGTCACATTATGATGTAATCATAT
GCATTATTAACTCACAGATGGTCTAGGTTATCTTGGTCTTGAGCGTCTCAGTTCTTTAAA
AGCTTATCTGCATTGGCAACACTTAGAAACGCAGACTCGTAAGTCCCGAAGTTTCCAGCC
ATCTTCTTGGTAGACTCCAAGGCGAGGTATGCTTCGATCTGGTTAGGGACCAATATAACA
AGCAAACCAAACATAACAAGATTTACACTTTTGCAATTAAAGTTACAAGCTTTAACCATT
CTTTGATTACATCACCTCATAAACACACTTAAGTTCCACTTTTTTTTTAAAGTTCACACA
GTAACCAACAAATGAAAACAGAGTAAGAAGACGATTTTACACTGAGTCTGCAGAAGCAGA
GACAAAGAACCAATGTAACAAGCAAACCAAACATAACAAGAATTACACTTTTGTCATCAA
AGCCACAAGCTTTAACCATTCCTTGAATTGCATGAACTCATAAACACACACAGTTCCACT
CTTACACAGTAACTAACAAGTGAAAGATAACACAAGTATAACTTAACAGGGTTTGTTGTA
AAGGTGAGCGACTTCGTCACGAGATGAAGCGCCATAGAGGCGCAACTCAGCCTGATCTAT
AACACAAGCATAACTTAAAATATAAAAAACAGACGCACACAAACGACAAAAACAATGTTT
TCTGCAAACCCCTAAGCATAAAGGTTTCAAATTTTCGTCGGTATTACATCAAGTGTATTG
GACTAATTTCCACCAAACATAGATTAGATAAAAGGCTAATTTCCACCAAACATAGAATAG
ATAAAAGTGTGCGTTGCCC


BQ
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AF RS1EU68JQ C 462
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TTAGAGTGGTGAGTGTTCTACGAACAACTACTGCATCAGCAGAAGGTAGCTTCAGAGCCC
AAAGACCAATCTTCTTTTGGTTTTCTAGCGTTGGCCCTTTAGCAGGTGGACCATGAATCT
GCAAAACACACATTCAATATTAGTCACTTCAAGAAATGTCACATTATGATGTAATCATAT
GCATTATTAACTCACAGATGGTCTAGGTTATCTTGGTCTTGAGCGTCTCAGTTCTTTAAA
AGCTTATCTGCATTGGCAACACTTAGAAACGCAGACTCGTAAGTCCCGAAGTTTCCAGCC
ATCTTCTTGGTAGACTCCAAGGCGAGGTATGCTTCGATCTGG

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DS 

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AGTCCCGAAGTTTCCAGCCATCTTCTTGGTAGACTCCAAGGCGAGGTATGCTTCGATCTG
GTTAGGGACCAATATAACAAGCAAACCAAACATAACAAGATTTACACTTTTGCAATTAAA
GTTACAAGCTTTAACCATTCTTTGATTACATCACCTCATAAACACACTTAAGTTCCACTT
TTTTTTTAAAGTTCACACAGTAACCAACAAATGAAAACAGAGTAAGAAGACGATTTTACA
CTGAGTCTGCAGAAGCAGAGACAAAGAACCAATGTAACAAGCAAACCAAACATAACAAGA
ATTACACTTTTGTCATCAAAGCCACAAGCTTTAACCATTCCTTGAATTGCATGAACTCAT
AAACACACACAGTTCCACTCTTACACAGTAACTAACAAGTGAAAGATAACACAAGTATAA
CTTAACAGGGTTTGTTGTAAAGGTGAGCGACTTCGTCACGAGATGAAGCGCCATAGAGGC
GCAACTCAGCCTGATCTATAACACAAGCATAACTTAAAATATAAAAAACAGACGCACACA
AACGACAAAAACAATGTTTTCTGCAAACCCCTAAGCATAAAGGTTTCAAATTTTCGTCGG
TATTACATCAAGTGTATTGGACTAATTTCCACCAAACATAGATTAGATAAAAGGCTAATT
TCCACCAAACATAGAATAGATAAAAGTGTGCGTTGCCC

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

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GAATTGATTGAAACACCAATGCTACGGTGTTGCCCTGGAGATCTCCGCCGTCCCTCGCCG
CTGGTAGGATGCCTCGTCACTACCAGTACCTCAATCTCATTATCCCTTCTCCGGTGGTGG
CTTCAGTTCGAGCTCGATCAATGGAAACTTCAATCCCGAGTTACTATTACCTCAGAGAGG
AAGATGAAGAAGTAGGCTGGTGGTGATTTGTGGAACGTGACGGCGTATCACGACGGTCCC
AGTCGTCGCCCATCTCAACCTCGTCTCCTTCAGTTTCTCATCTCTGTCGAGAATGATTTT
ACGCCTTTTGGAGGTGATTTGATTGGAGAGTTGAAGAATGCACTTTTGAAGCAGAGAACG
ACCAGAGCATCAGGTTCTCGATTGGAAAAAAAGCAGTATAATCAGAATAAGAGTCTTATC
CAACGCCGCTTATCCGAATAAGAGACATCTAAAATCAGTATGGTGTCGTTGGGAGATTTT
GTTCATCATAGCTTCTCTGCATTTGCTCTATTTGGTGTTTCCCATTTTATCAGGGAATAA
AAGTTATAGATGAATCTCATGAGCAATATACCACAGATCTTGATAATTCCTTTGGTTATT
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ATCTTTGGAGGATCTTCTAGGAAATGCAGTAGCTTCTGAATAATGCAAGGGTTGATCTTT
GGTGATTTCTTCTTGACTTGGTTTGCGCCTCTTCTCACCTCTCATGCGGACAGTGGAGTG
TCTTTGTGCGGGAAGTTACCTCTCTTGCAGAGATTCCAGCGATCTTATGTTTGTTTTGTA
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CACTGGAATATATATGCAGGGTGTTGCATTAACATAAGAAAAATCGTTGATGATAGATTT
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TCTTTAATGGAAAAGTATATGGTATTTATGATTT


BQ
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AF RS1DO21TF U 1
AF RS1DO21JQ C 443
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BS 694 1114 RS1DO21JQ

RD RS1DO21TF 693 0 0
GGAGGGTTTCGTTCTTCAACTTCCATAAAACAAAGTCGTTTCCTAACCAACTCTTTGCTT
GAATTGATTGAAACACCAATGCTACGGTGTTGCCCTGGAGATCTCCGCCGTCCCTCGCCG
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AAGATGAAGAAGTAGGCTGGTGGTGATTTGTGGAACGTGACGGCGTATCACGACGGTCCC
AGTCGTCGCCCATCTCAACCTCGTCTCCTTCAGTTTCTCATCTCTGTCGAGAATGATTTT
ACGCCTTTTGGAGGTGATTTGATTGGAGAGTTGAAGAATGCACTTTTGAAGCAGAGAACG
ACCAGAGCATCAGGTTCTCGATTGGAAAAAAAGCAGTATAATCAGAATAAGAGTCTTATC
CAACGCCGCTTATCCGAATAAGAGACATCTAAAATCAGTATGGTGTCGTTGGGAGATTTT
GTTCATCATAGCTTCTCTGCATTTGCTCTATTTGGTGTTTCCCATTTTATCAGGGAATAA
AAGTTATAGATGAATCTCATGAGCAATATACCACAGATCTTGATAATTCCTTTGGTTATT
TTGTTTTCTGTTTTCTGCAGTGTCAGTGGAGAA

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DS 

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AGACATCTAAAATCAGTATGGTGTCGTTGGGAGATTTTGTTCATCATAGCTTCTCTGCAT
TTGCTCTATTTGGTGTTTCCCATTTTATCAGGGAATAAAAGTTATAGATGAATCTCATGA
GCAATATACCACAGATCTTGATAATTCCTTTGGTTATTTTGTTTTCTGTTTTCTGCAGTG
TCAGTGGAGAAAACAAGCATTACAAGTCTCTCCCACAGATCTTTGGAGGATCTTCTAGGA
AATGCAGTAGCTTCTGAATAATGCAAGGGTTGATCTTTGGTGATTTCTTCTTGACTTGGT
TTGCGCCTCTTCTCACCTCTCATGCGGACAGTGGAGTGTCTTTGTGCGGGAAGTTACCTC
TCTTGCAGAGATTCCAGCGATCTTATGTTTGTTTTGTAGGTTGGAGATGAAGTCACTAGG
CTTAGGAATTGTTTTGGTTTTTGTATATTTGGATTGAACACTGGAATATATATGCAGGGT
GTTGCATTAACATAAGAAAAATCGTTGATGATAGATTTGATGGCTACATGTTCTCCTATG
GAGTTCATGTGTTTCATGTATTGATTTGTATGTTTTGATCTTTAATGGAAAAGTATATGG
TATTTATGATTT

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

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GGGAAATAATCAATACATTAATTGGCCAACAACAGTCTCACAACCTGAGAGAACAGAAAA
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AAAGAGCAGAAAAACTACAGACAAGCCTGCCTTGAAGACTACTAAAAGTAAGACAATGTG
TGTGTTTGTGAATTTTCACAGGTAACCTTGATATAAGAAAACCGAGAATCCTTAGCTGTG
ATAACAATTCTGTAGCTTCTAAGTTCATGAAGAAAACTCTGTTTCTGAGTTTATCTACTG
GATCCTGTGACCACATCAAACAAGCCGCAACAACTTAACCATGAGGTTCTTTCCGCAACT
CCATGTGTTGGTCCCACGGAACCCTCTTCTTCATAAGAACTGGTAGTAGCGTCAGACTCC
TTGCTGACTTCAGGAGCAAGAGACGAAGCTTTTCCCTCAGTTTCTTTTTTAACAGCGGTG
GTTGCACTTGAAGACGCCTGCTTAACCTCATCAGAGGCAAGAGAAACCTCAGCAGTGATC
TCGTTTGGTTTAGGCAAAGAACTCTCCTCATTCTCGGCTGAGACCACTGTACCAACAGTC
GCGATTTCAATCACTTTTTCGGTGTTTGGATCACTAGGAGTAGCTGAATCCATCAAACCG
ATACTCTCTACGATCACATTAGCAGTGATTGCTTCAGAGACAGATTCACCACTCTCCTTC
TTCTTCTTCTTCTTAACTTCACTAGATTCATCATCCGAGCTGCTGCTGCTACTACTGCTG
CTGGTAGAGTTCTTGTCATGATCACGACTTGAATCAGCGATCTCTATCCGCTCATCAGAG
TCCTTGTCGGTACTTCTGACAGAATCTTCTTCGCTCGAATCATGATTGGTGGGTATGAGA
TTGGTTTGAGTAGAAGATGCTTCTTGTTGTTGTTGCTGCTTTTTCTTTGCAGCTTTCCTT
TTCTTAGCACCTGGAGGCATGATTAGGGTTTCCTTTTGGATGGTGGGGATCTGTACAGGT
ATGGCGGATCCTGGCTTGTCTCTTCCCTTTTCTCTCTCTCTCTCGCGGTAAATGTACAAG
TTGGGAGCCGTAAAGTTTCGAAACTCAAAATGGTAGCC


BQ
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AF RS1DZ37JQ U 1
AF RS1AO49TFB C 391
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AAAGAGCAGAAAAACTACAGACAAGCCTGCCTTGAAGACTACTAAAAGTAAGACAATGTG
TGTGTTTGTGAATTTTCACAGGTAACCTTGATATAAGAAAACCGAGAATCCTTAGCTGTG
ATAACAATTCTGTAGCTTCTAAGTTCATGAAGAAAACTCTGTTTCTGAGTTTATCTACTG
GATCCTGTGACCACATCAAACAAGCCGCAACAACTTAACCATGAGGTTCTTTCCGCAACT
CCATGTGTTGGTCCCACGGAACCCTCTTCTTCATGAGAACTGGTAGTAGCGTCAGACTCC
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TCGTTTGGTTTAGGCAAAGAACTCTCCTCATTCTCGGCTGAGACCACTGTACCAACAGTC
GCGATTTCAATCACTTTTTCGGTGTTTGGATCACTAGGAGTAGCTGAATCCAT

QA 1 653 1 653
DS 

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TTCTCGGCTGAGACCACTGTACCAACAGTCGCGATTTCAATCACTTTTTCGGTGTTTGGA
TCACTAGGAGTAGCTGAATCCATCAAACCGATACTCTCTACGATCACATTAGCAGTGATT
GCTTCAGAGACAGATTCACCACTCTCCTTCTTCTTCTTCTTCTTAACTTCACTAGATTCA
TCATCCGAGCTGCTGCTGCTACTACTGCTGCTGGTAGAGTTCTTGTCATGATCACGACTT
GAATCAGCGATCTCTATCCGCTCATCAGAGTCCTTGTCGGTACTTCTGACAGAATCTTCT
TCGCTCGAATCATGATTGGTGGGTATGAGATTGGTTTGAGTAGAAGATGCTTCTTGTTGT
TGTTGCTGCTTTTTCTTTGCAGCTTTCCTTTTCTTAGCACCTGGAGGCATGATTAGGGTT
TCCTTTTGGATGGTGGGGATCTGTACAGGTATGGCGGATCCTGGCTTGTCTCTTCCCTTT
TCTCTCTCTCTCTCGCGGTAAATGTACAAGTTGGGAGCCGTAAAGTTTCGAAACTCAAAA
TGGTAGCC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

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AGACCGTTCGTCCAAGACTCAAGCACGTCTGTTCTTCCCCAGCCCATCTTGTTAAAGTCT
CAGAAGACTAATCCAAAGTGGAACCGGCAAAGGAAGTGGTGGTTCTTTTAACAGTCCCGG
TTCATCGAAACAGAGCTGGAGATAAATTGGATTTTTGAATCGAGTTTGTGCTTCACTTAT
GAAAATATGTTTTCACAATAACTTGGTGAGTCTATGGCACTTGACTTGAGTCAGTCAATC
TTTATATTAAAAATATTTGTTGTTGAGGACATCTTTATATGACCGATTCATCGCGC


BQ
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AF RS1GK34JQ C 1
AF RS1GK34TF U 1
BS 1 416 RS1GK34TF

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GAAAATATGTTTTCACAATAACTTGGTGAGTCTATGGCACTTGACTTGAGTCAGTCAATC
TTTATATTAAAAATATTTGTTGTTGAGGACATCTTTATATGACCGATTCATCGCGC

QA 1 416 1 416
DS 

RD RS1GK34TF 416 0 0
GTGTACGAGAAGACAGTTCTTCTCAATGCGCAAAGGGAAATCGCTGACAAGATCTTGGAT
GCACAATGGGAAGCCAAGTGACGTCAAGAAAAGGTAGAGGAAATGCTGGAGGAGAAAGTG
AGACCGTTCGTCCAAGACTCAAGCACGTCTGTTCTTCCCCAGCCCATCTTGTTAAAGTCT
CAGAAGACTAATCCAAAGTGGAACCGGCAAAGGAAGTGGTGGTTCTTTTAACAGTCCCGG
TTCATCGAAACAGAGCTGGAGATAAATTGGATTTTTGAATCGAGTTTGTGCTTCACTTAT
GAAAATATGTTTTCACAATAACTTGGTGAGTCTATGGCACTTGACTTGAGTCAGTCAATC
TTTATATTAAAAATATTTGTTGTTGAGGACATCTTTATATGACCGATTCATCGCGC

QA 1 416 1 416
DS 



AS 1 2

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CTTGGATCTCAGATGGCAAGAAAACGTCTGCAAGTGGTACATCGTTTCCAATCTTGGGTT
TGCCGAGCCTTGCCTCTTTCTCACACTCATGTTTCTTCTGCGAGCTCCTTTGAAGATCGA
CTCTGGGGCTTTGAGTGGCAAATGGAACAGGAACACTGCCTGTTACATTATTCTTTATTC
TCTACCCCATGCTTGCTCTTCAACTTGCGCTTGTTTTATCCGAGTCACGCCTAAACGGTG
GTTATGTTAAGCTATCAAGCCACTTCACTAGAACCTATTCCCAAGTTACTATTGATCATG
CTGAGATACTGAAACTGGTCATCAATAAGCGTCTGCAGAAGAGGGTACACACTTTGATAT
TCTCTGTCTTTAGTTTCCTTCCGTTGAGGATCGCTATGCTCTGTTTGTCGGTACTCGCAA
AAGCAGACAAGATTGTGTTCGAAGCCCTTTCCTTCTTAGCCTTCTTGTCCCTCTTCTGCT
TTTGCGTGGTTTCCATTTGCTTGCTTGTCTACTTCCCGGTTTCAGATTCAATGGCCCTAA
GAGGTCTAAGGGACATGGATGAAGATGATAGTAGGGGTGTGACTGAAGAACGCAGTGGTG
CTCTGTTGCTTGCACCACATAACGAGGATAGCTTGAGCTTAAGAGGTCGAAGATCTTCCT
CACAGGAGAGGTATGTGGAACTCAGCCTATTTCTTGAAGCTGAGAACTAAATTTTTCGGA
AGGCTGTTTCTTTGGCTTTTGGCTATGTTCATGTACAGATTCCTGGTGAAACAGTTAAAG
ACTTAAGTTTGCGCAAAAAGGCATAATTCAGTTTTGTGGCAAAGACACTTCGGCTGTAAA
GGAGGGTTTGGGGGATTTAACTCTTGTGAGGGTTTGTTGTTTGAAACGTTTTCTGCTTGA
TGGATAATATTTTTGTACCTTTATCATGTTGATCAGTTTTGATTTAGAAAAACAAAACAC
AAAACACAAAACTAATCAGTTTACGCTCAC


BQ
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AF RS1AG56TF U 1
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GAG
TCT

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DS 

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TCTTCCTCACAGGAGAGGTATGTGGAACTCAGCCTATTTCTTGAAGCTGAGAACTAAATT
TTTCGGAAGGCTGTTTCTTTGGCTTTTGGCTATGTTCATGTACAGATTCCTGGTGAAACA
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AAAACACAAAACACAAAACTAATCAGTTTACGCTCAC

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DS 



AS 1 2

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CCCTTACGGATTCGTTCCTCCTCCTGTTTTCCCTGTGGTTAGACTCCGTGGCCTGCCCTT
TGATTGCGCTGAGCTCGACGTTGTGGAGTTCTTCCGTGGCTTGGATGTGGTTGATGTCTT
GTTTGTTCACAAGAACAGTAAGGTCACTGGTGAAGCCTTTTGTGTTCTCGGTGTTCCTCT
CCAGGTCGATTTCGCTTTGCATAAGAACAGGCAGAACATGGGGAGGAGATATGTGGAGGT
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AATCGAGAGCCGCGATGGTCAAGGACAGGAAGATGCTCGGGAGCCGGTACATAGAGCTGT
TTCCTTCTTCGGTTGAAGAGTTAGATGATGCGCTGTCAAGAGGAAGGTGATCCACCACAC
ACTTGTCATGGTACTTTTCCATACTTTCTTTTCCTTAATGGTTGTCAGAAGATCACAACT
TCGACGCATTAGGGGTTTCGGTTTTGATGTACTGTCTGGTCAGGGTACTACTAGTTTTAT
CAGTTCTTTAAATTTTGCTGTGTTCTGCATCAATGTAGTAGGTTCTGAATCCTCTTTCGA
TTCACTCGCATTGCTCCTATTGTGGCTTTTGATTCAAGCCTTTGTTGGATTGTAACATTA
TTAGGCTTTTTGCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BO22TF U 1
AF RS1BO22JQ C 489
BS 1 700 RS1BO22TF
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RD RS1BO22TF 788 0 0
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TACAGAAAAAGGCTGACGTCGGAGATACTTCCCGCCGGCGACAATGTTCTACAGAGGATA
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AGCTCCTCCTCCTCCAGGAACATTCTATGGACCTCATCCTGGTTCCGCCTTTATGTTCAA
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AAGAAGACATACTTGATTTCTTCAAAGATTT*GATCTGTCTGAAGACTCTGT
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QA 1 772 1 772
DS 

RD RS1BO22JQ 726 0 0
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GGATATTCACCTCGTAGAATTGTGCAGAGGGCTAGATCGAGTGATGATGGGAAAGAGAAT
GCTGAGCATACGGGTATCTTGAGATTGAGAGGGTTACCTTTCTCTGCAGGGAAAGAAGAC
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TCGGTTGAAGAGTTAGATGATGCGCTGTCAAGAGGAAGGTGATCCACCACACACTTGTCA
TGGTACTTTTCCATACTTTCTTTTCCTTAATGGTTGTCAGAAGATCACAACTTCGACGCA
TTAGGGGTTTCGGTTTTGATGTACTGTCTGGTCAGGGTACTACTAGTTTTATCAGTTCTT
TAAATTTTGCTGTGTTCTGCATCAATGTAGTAGGTTCTGAATCCTCTTTCGATTCACTCG
CATTGCTCCTATTGTGGCTTTTGATTCAAGCCTTTGTTGGATTGTAACATTATTAGGCTT
TTTGCC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL6057Contig1 1032 2 8 U
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ATGACTCCCAATTTGACACCGAGAGCTATGGCGGCACAGCAGCTCGAGAACGCCGATCAG
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AAATTGATTGAGGGAGTTCCTGAAACTCTTGATATGCTCCGTGCCAAGGGAAAGAGGTTG
GTTTTTGTGACGAACAACTCAACTAAATCTAGGAAACAATATGGCAAAAAGTTTGAGACT
CTTGGCCTGAATGTTAACGAGGAGGAAATATTTGCTTCTTCTTTTGCTGCAGCTGCATAC
TTGCAGTCTATTAATTTCCCCAAAGATAAGAAGGTCTACGTGATTGGTGAGGAGGGTATT
TTGAAAGAGCTCGACCTTGCTGGTTTTCAATACCTTGGAGGTCCGGATGATGGTAAAAAA
CAAATTGAACTGAAGCCAGGATTTCTCATGGAGCATGATAATGATGTGGGAGCTGTGGTG
GTTGGATTTGACCGCTATTTCAACTACTACAAAATTCAGTATGGAACTCTCTGTATCCGC
GAAAACCCGGGCTGTCTTTTCATTGCTACAAACCGAGATGCTGTCACTCACCTTACCGAT
GCTCAAGAATGGGCAGGTGGTGGCTCTATGGTTGGTGCTTTTGTTGGATCCTGTCAACGT
GAACCTCTTGTAGTTGGCAAACCCTCAACTTTTATGATGTACTATTTGTCAGACAAATTT
GGAATTGAAAAGTCACAGATATGCATGGTGGGTGATAGATTGGACACTGATATTTTGTTT
GGGCAGAATGGTGGTTGTAAAACTCTTCTTGTCCTCTCTGGTGTTACTTCAATCTCCATG
TTGGAAAGCTCTGAGAACAAGATACAACCAGATTTCTACCCCAGCAAGATTTCTGATTTT
CTCTCCCTCAAAGCAGCTAATGTGTGATAGAACAAGAAATCACTTTACTCTGTACAACTC
AGCAACTACAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BU38TF U 1
AF RS1BU38JQ C 349
BS 1 562 RS1BU38TF
BS 563 563 RS1BU38JQ
BS 564 573 RS1BU38TF
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BS 606 614 RS1BU38TF
BS 615 1032 RS1BU38JQ

RD RS1BU38TF 614 0 0
CGTTCTTCCTCCTTCTCCGGCGGCTTCATTCGCAGAATCGACCATAAGCCTCTCCGTGTG
ATGACTCCCAATTTGACACCGAGAGCTATGGCGGCACAGCAGCTCGAGAACGCCGATCAG
CTCATCGATTCCGTTGAAACTTTTATCTTCGATTGTGACGGAGTCATTTGGAAGGGAGAT
AAATTGATTGAGGGAGTTCCTGAAACTCTTGATATGCTCCGTGCCAAGGGAAAGAGGTTG
GTTTTTGTGACGAACAACTCAACTAAATCTAGGAAACAATATGGCAAAAAGTTTGAGACT
CTTGGCCTGAATGTTAACGAGGAGGAAATATTTGCTTCTTCTTTTGCTGCAGCTGCATAC
TTGCAGTCTATTAATTTCCCCAAAGATAAGAAGGTCTACGTGATTGGTGAGGAGGGTATT
TTGAAAGAGCTCGACCTTGCTGGTTTTCAATACCTTGGAGGTCCGGATGATGGTAAAAAA
CAAATTGAACTGAAGCCAGGATTTCTCATGGAGCATGATAATGATGTGGGAGCTGTGGTG
GTTGGATTTGACCGCTATTTCA*CTACTACAAA*TTCAGTATGGAACTCTCTGTATCCGC
GAAA*CCCGGGCTG

QA 1 614 1 614
DS 

RD RS1BU38JQ 684 0 0
GCAGCTGCATACTTGCAGTCTATTAATTTCCCCAAAGATAAGAAGGTCTACGTGATTGGT
GAGGAGGGTATTTTGAAAGAGCTCGACCTTGCTGGTTTTCAATACCTTGGAGGTCCGGAT
GATGGTAAAAAACAAATTGAACTGAAGCCAGGATTTCTCATGGAGCATGATAATGATGTG
GGAGCTGTGGTGGTTGGATTTGACCGCTATTTCAACTACTACAAAATTCAGTATGGAACT
CTCTGTATCCGCGAAAACCCGGGCTGTCTTTTCATTGCTACAAACCGAGATGCTGTCACT
CACCTTACCGATGCTCAAGAATGGGCAGGTGGTGGCTCTATGGTTGGTGCTTTTGTTGGA
TCCTGTCAACGTGAACCTCTTGTAGTTGGCAAACCCTCAACTTTTATGATGTACTATTTG
TCAGACAAATTTGGAATTGAAAAGTCACAGATATGCATGGTGGGTGATAGATTGGACACT
GATATTTTGTTTGGGCAGAATGGTGGTTGTAAAACTCTTCTTGTCCTCTCTGGTGTTACT
TCAATCTCCATGTTGGAAAGCTCTGAGAACAAGATACAACCAGATTTCTACCCCAGCAAG
ATTTCTGATTTTCTCTCCCTCAAAGCAGCTAATGTGTGATAGAACAAGAAATCACTTTAC
TCTGTACAACTCAGCAACTACAGA

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL6058Contig1 834 2 2 U
AGGGACAACACACAAAATGATCAAACAAACGAATAAGTCAACACTAAAAAATCATGATTA
ATCGCGTCCTCCGTCTCCGGTGACCGGATATCCGACACCGTGCCTTCTCGCCGGGAAAAC
CAAAAACAATAAACCGCAAATAACTCCAACACCCATCGGAACAATATCCAAAACCTTCTT
GGTTTCTTGCTCCGGCGCTGGGTAGAAGCAGCTCACGGCGTTATTGTCCCTCATAGCCAC
CGCACCGAAGACAAGCATAGACAAAACAGCGTGGATCCAGTCAACGAACCGGATCCTGTA
TACTTAAATCGGGCAAACCCGAACCGGGAGGGTCAGGGTAGTCAAAAACCCACATACCTT
TACGAGTAGCAAACCCGTAGTACACGTTACCGTCTTCAGCCTTGACGCTGTCGGTGAAAG
AGCTTAGGAAACATGAGATGGAGAGAAGGGTTAGGAGCACTAAGGTTAAAACGCGAGTCG
CGTACTCGCACGAGCCGTTTGTTGTGAAGACAGGTATGAGCAGCTGGAAGGCTAAGAGGG
TTCCCGTCGGAAGGAGGTTGGCTAAGTTTGCAGCTGATGTTAGGGTTTGTGACATGGCCT
GGTGAGATGTCGAACGTTGTCTCCTTAGCTGTGGAGGTGGAGGCTCGGAGGGCTCTTGCT
CGGTGTCATTGGCTTCGGAACTAGTTGGGTTTCTCTGCTTCAGGGAAGATGACATGTTGT
TTAATCTCTCTCTCTCTCTCTTTCGTTTATTTTTTCTTAATTCCTCTCTTTGCGTTGAGA
ACTAATGGATGATTTAATAGATGAACGTGATCGTAGTTATATATAATACATATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CB88TF U 1
AF RS1CB88JQ C 108
BS 1 188 RS1CB88TF
BS 189 834 RS1CB88JQ

RD RS1CB88TF 188 0 0
AGGGACAACACACAAAATGATCAAACAAACGAATAAGTCAACACTAAAAAATCATGATTA
ATCGCGTCCTCCGTCTCCGGTGACCGGATATCCGACACCGTGCCTTCTCGCCGGGAAAAC
CAAAAACAATAAACCGCAAATAACTCCAACACCCATCGGAACAATATCCAAAACCTTCTT
GGTTTCTT

QA 1 188 1 188
DS 

RD RS1CB88JQ 727 0 0
TCGCCGGGAAAACCAAAAACAATAAACCGCAAATAACTCCAACACCCATCGGAACAATAT
CCAAAACCTTCTTGGTTTCTTGCTCCGGCGCTGGGTAGAAGCAGCTCACGGCGTTATTGT
CCCTCATAGCCACCGCACCGAAGACAAGCATAGACAAAACAGCGTGGATCCAGTCAACGA
ACCGGATCCTGTATACTTAAATCGGGCAAACCCGAACCGGGAGGGTCAGGGTAGTCAAAA
ACCCACATACCTTTACGAGTAGCAAACCCGTAGTACACGTTACCGTCTTCAGCCTTGACG
CTGTCGGTGAAAGAGCTTAGGAAACATGAGATGGAGAGAAGGGTTAGGAGCACTAAGGTT
AAAACGCGAGTCGCGTACTCGCACGAGCCGTTTGTTGTGAAGACAGGTATGAGCAGCTGG
AAGGCTAAGAGGGTTCCCGTCGGAAGGAGGTTGGCTAAGTTTGCAGCTGATGTTAGGGTT
TGTGACATGGCCTGGTGAGATGTCGAACGTTGTCTCCTTAGCTGTGGAGGTGGAGGCTCG
GAGGGCTCTTGCTCGGTGTCATTGGCTTCGGAACTAGTTGGGTTTCTCTGCTTCAGGGAA
GATGACATGTTGTTTAATCTCTCTCTCTCTCTCTTTCGTTTATTTTTTCTTAATTCCTCT
CTTTGCGTTGAGAACTAATGGATGATTTAATAGATGAACGTGATCGTAGTTATATATAAT
ACATATT

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

CO CL6059Contig1 562 2 15 U
AAACAGTCGTTAAATTGTATTGGACTCTGTATCTCACATAAAAGAATTCAAAAGACAATG
AAAAGAAGTATATCAAATGACTCAGTCACGAGGTATGTCTCAAACAGTAACAACATCAGA
GGTCAAGTCATACAAACAATGACCCCAAAACAATCCACCAACGTTCAACACTTTTGACCA
GAACTCATCATATACCAACGACGTGAATGTGTTTTAAAAGAAGAAGAAATAGAAGTCTCC
CGAGTCGGAAGAGAAACCACGCAAAGAGGAATTACTTTGGGTAAGCCTGAGGAGGATAAG
CCGGACCGGGAGGGTATTGAGGATAAGCTGGAGGGTTTTGAGGATAGCCAGAAGGTGGAT
AACCTTGTGGAGGGTGTTGAGGATAGCCAGAAGGTGGATAACCTTGTGGTGGGCGTTGCG
GATAACCAGAAGGGGGGTAACCTTGTGGAGGATAACCGATTGCGGGTGGAGTAGCTTGAT
CAATCCGTGACATTACCTGAGGGGGAGGCACTGCCATTGGCTGTGGACCGAACTTACCAT
CTCTCTTGTCCATTTCCACCTT


BQ
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AF RS1G768JQ U 1
AF RS1DT94JQ U 278
BS 1 301 RS1G768JQ
BS 302 302 RS1DT94JQ
BS 303 413 RS1G768JQ
BS 414 414 RS1DT94JQ
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BS 435 439 RS1G768JQ
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BS 473 473 RS1DT94JQ
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BS 492 492 RS1DT94JQ
BS 493 562 RS1G768JQ

RD RS1G768JQ 562 0 0
AAACAGTCGTTAAATTGTATTGGACTCTGTATCTCACATAAAAGAATTCAAAAGACAATG
AAAAGAAGTATATCAAATGACTCAGTCACGAGGTATGTCTCAAACAGTAACAACATCAGA
GGTCAAGTCATACAAACAATGACCCCAAAACAATCCACCAACGTTCAACACTTTTGACCA
GAACTCATCATATACCAACGACGTGAATGTGTTTTAAAAGAAGAAGAAATAGAAGTCTCC
CGAGTCGGAAGAGAAACCACGCAAAGAGGAATTACTTTGGGTAAGCCTGAGGAGGATAAG
CTGGACCGGGAGGGTATTGAGGATAAGCTGGAGGGTTTTGAGGATAGCCAGAAGGTGGAT
AACCTTGTGGAGGGTGTTGAGGATAGCCAGAAGGTGGATAACCTTGTGGTGGGTGTTGCG
GATAACCAGAAGGTGGGTAGCCTTGTGGAGGATAACCGATTGCGGGTGGAGTTGCTTGAT
CAATTCGTGACCTTACCTGAGGGGGAGGCACTGCCATTGGCTGTGGACCGAACTTACCAT
CTCTCTTGTCCATTTCCACCTT

QA 1 562 1 562
DS 

RD RS1DT94JQ 285 0 0
TGGGTAAGCCTGGGGAGGATAAGCCGGACCGGGAGGGTATTGAGGATAAGCTGGAGGGTT
TTGAGGATAGCCAGAAGGTGGATAACCTTGTGGAGGGTGTTGAGGATAGCCAGAAGGTGG
ATAACCTTGTGGTGGGCGTTGCGGATAACCAGAAGGGGGGTAACCTTGTGGAGGATAACC
GATTGCGGGTGGAGTAGCTTGATCAATCCGTGACATTACCTGAGGGGGAGGCACTGCCAT
TGGCTGTGGACCGAACTTACCATCTCTCTTGTCCATTTCCACCTT

QA 1 285 1 285
DS 



AS 1 2

CO CL6060Contig1 1174 2 4 U
GCAGGCCAGTTGTCTATGGCTGACATTGTAAAGATGGGCAGACCACAGAACAAGACAACA
GGCTCACAACGAAATGTCAACATGCGTTCTGAGATTAGTCACGACCATGAAGTTGATGCA
AACCATCAGGTCCCTGTTAAAGATGAATGGCCGTCGATTGAGAAGCCACTGGCTCCTAGT
ACCTTCTGCATCAGTATCACCAGCAGTAGCAGCAGAGTCAGAGGTATGCGGTGGTACAAG
TGATTTCCCATTAGAGAGAGTAGATCATCATCTGAGGGACCGGTTAGAAAATATACATTT
AGCAGAAAGTGGTCCGTCTGAAGATCTTGGTGTGGATCATGTGCAACCTAGCTCGGTTGG
CAATGTCCAAGAAGAGGACTCAGGAGTTTCGACTGAATCTAATGATAATCAGTACACTTA
TGAGACGCAGAGCCATCCTGTAGAGCACCACAAAGATGAAGAGAGGTTTCATCTGGTTCA
GCCGACTTTCAAGAACAAACCGTAGAAAGTCATGATCAAGAAGCCTCGCATGAAGAGGAT
AGACGTGCTGTTGTTATTCCGAAACATTTGCTAATCCATACAGAAGAGTGTTCGCAATTG
AGTTTTGGAAGTTTTGGAGGTTTTGGATCAAGGCCTTTGAGCAACAATGCAGAAGAAGAG
ACTCCTGATGTAGCTCCACAGAACGAACATTCAGATGCTAGAAATCCTGAGTTCTATGGA
GATGAACGTCTTGGAAGTACAGTTAATGGAAATATAGGCCACGCACCTGCTGCGGCTGGA
AATTATGATGATTCTTTGGAATCAAGGCGAGAGGTTCTGAAGCAAGAAAACCCTGAGACT
GTTCAGGAGAACCAGTACATATTTGGTCAGACCGAGCCAGAGTATGCTAATCAGCAGCAG
CAGCTGAATACTGCATATGATGTGTCACAGACAAATGTACAGAATCAGATGCAGAATCTT
GCTTCGTTATCAAATGTGATGCAGGGATATCCACACTCAGATCCCAACAGTTTATTGGCA
CAAAATGCTAGGGAGCTTGAATTCCAGTATACCTCGTTTGCACAGTCTATGCAGTCAAGA
AATGGCAACAACGCTTCTTCACTTGGTGGCCAAAGTATCTCCATGCCAGAGGCGCTCCGA
GGCAGTGGAATCCCGGGGACGCAGCCGATGCAGC


BQ
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AF RS1F705TF U 1
AF RS1F705JQ C 496
BS 1 731 RS1F705TF
BS 732 732 RS1F705JQ
BS 733 753 RS1F705TF
BS 754 1174 RS1F705JQ

RD RS1F705TF 753 0 0
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GGCTCACAACGAAATGTCAACATGCGTTCTGAGATTAGTCACGACCATGAAGTTGATGCA
AACCATCAGGTCCCTGTTAAAGATGAATGGCCGTCGATTGAGAAGCCACTGGCTCCTAGT
ACCTTCTGCATCAGTATCACCAGCAGTAGCAGCAGAGTCAGAGGTATGCGGTGGTACAAG
TGATTTCCCATTAGAGAGAGTAGATCATCATCTGAGGGACCGGTTAGAAAATATACATTT
AGCAGAAAGTGGTCCGTCTGAAGATCTTGGTGTGGATCATGTGCAACCTAGCTCGGTTGG
CAATGTCCAAGAAGAGGACTCAGGAGTTTCGACTGAATCTAATGATAATCAGTACACTTA
TGAGACGCAGAGCCATCCTGTAGAGCACCACAAAGATGAAGAGAGGTTTCATCTGGTTCA
GCCGACTTTCAAGAACAAACCGTAGAAAGTCATGATCAAGAAGCCTCGCATGAAGAGGAT
AGACGTGCTGTTGTTATTCCGAAACATTTGCTAATCCATACAGAAGAGTGTTCGCAATTG
AGTTTTGGAAGTTTTGGAGGTTTTGGATCAAGGCCTTTGAGCAACAATGCAGAAGAAGAG
ACTCCTGATGTAGCTCCACAGAACGAACATTCAGATGCTAGAAATCCTGAGTTCTATGGA
GATGAACGTCT*GGAAGTACAGTTAATGGAAAT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1F705JQ 679 0 0
CAAACCGTAGAAAGTCATGATCAAGAAGCCTCGCATGAAGAGGATAGACGTGCTGTTGTT
ATTCCGAAACATTTGCTAATCCATACAGAAGAGTGTTCGCAATTGAGTTTTGGAAGTTTT
GGAGGTTTTGGATCAAGGCCTTTGAGCAACAATGCAGAAGAAGAGACTCCTGATGTAGCT
CCACAGAACGAACATTCAGATGCTAGAAATCCTGAGTTCTATGGAGATGAACGTCTTGGA
AGTACAGTTAATGGAAATATAGGCCACGCACCTGCTGCGGCTGGAAATTATGATGATTCT
TTGGAATCAAGGCGAGAGGTTCTGAAGCAAGAAAACCCTGAGACTGTTCAGGAGAACCAG
TACATATTTGGTCAGACCGAGCCAGAGTATGCTAATCAGCAGCAGCAGCTGAATACTGCA
TATGATGTGTCACAGACAAATGTACAGAATCAGATGCAGAATCTTGCTTCGTTATCAAAT
GTGATGCAGGGATATCCACACTCAGATCCCAACAGTTTATTGGCACAAAATGCTAGGGAG
CTTGAATTCCAGTATACCTCGTTTGCACAGTCTATGCAGTCAAGAAATGGCAACAACGCT
TCTTCACTTGGTGGCCAAAGTATCTCCATGCCAGAGGCGCTCCGAGGCAGTGGAATCCCG
GGGACGCAGCCGATGCAGC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

CO CL6061Contig1 669 2 2 U
GGAAAGATTCTGTTATAAACGGGAAAAACATTGTCGCTGGAGATGTACTTATTGGCCTCC
CTTCTAGCGGTGTTCATTCCAATGGTTTCTCTTTAGTAAGAAAGGTCGTGGCTCGAAGCG
GTCTTTCGCTGAAAGATGAACTTCCAGGTGGATCAACTACCCTTGGAGAAGCTTTAATGG
CACCCACTGTCATTTATGTGAAGCAGGTACTTGACATAATTAGCAGAGGAGGAGTGAAAG
GGTTAGCTCATATAACAGGAGGAGGTTTCACAGACAACATTCCCCGTGTCTTCCCTGATG
GTTTGGGTGCTGTTATCCACACTGATGCTTGGTAACTTCCACCTTTGTTCAAATGGATCC
AACAGTCTGGGAGAATAGAAGACAGTGAGATGCGAAGGACGTTTAACCTGGGAATAGGGA
TGGTGATGGTGGTTAGCCCCAGAGGCTGCCTTTGAGAATACTTTGGAGAAGCCAAGAATG
GGAGACTATGTTTGCATATCGCATTGGGAGAGGTTATAAACGGTGAAGGCGTTACCTATC
AATAAGACCCGTGTTTTGTGTTTTCTACCAATCACTATTTGTGTTCTCAATAAGACCATG
CGAATTGTGTTTTCAGAGTTTGTGTCAGAGATGGGACAGAGGACCTCTTTGTTTCCCATG
TTTCAAAGC


BQ
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AF RS1AI21JQ C 1
AF RS1AI21TF U 376
BS 1 375 RS1AI21JQ
BS 376 669 RS1AI21TF

RD RS1AI21JQ 669 0 0
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CTTCTAGCGGTGTTCATTCCAATGGTTTCTCTTTAGTAAGAAAGGTCGTGGCTCGAAGCG
GTCTTTCGCTGAAAGATGAACTTCCAGGTGGATCAACTACCCTTGGAGAAGCTTTAATGG
CACCCACTGTCATTTATGTGAAGCAGGTACTTGACATAATTAGCAGAGGAGGAGTGAAAG
GGTTAGCTCATATAACAGGAGGAGGTTTCACAGACAACATTCCCCGTGTCTTCCCTGATG
GTTTGGGTGCTGTTATCCACACTGATGCTTGGTAACTTCCACCTTTGTTCAAATGGATCC
AACAGTCTGGGAGAATAGAAGACAGTGAGATGCGAAGGACGTTTAACCTGGGAATAGGGA
TGGTGATGGTGGTTAGCCC*AGAGGCTGCCTT*GAGAATACTT*GGAGAAGCCAAGAATG
G*AGACTATGTT*GCATATCGCATTGG*AGAGGTTATAAACGGTGAAGGCGTTACCTATC
AATAAGACC*GTGTTT*GTGTTTTCTACCAATCACTATT*GTGTTCTCAATAAGACCATG
CGAATTGTGTTTTCAGAGTTTGTGTCAGAGATGGGACAGAGGACCTCTTTGTTTCCCATG
TTTCAAAGC

QA 1 669 1 669
DS 

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GCCCCAGAGGCTGCCTTTGAGAATACTTTGGAGAAGCCAAGAATGGGAGACTATGTTTGC
ATATCGCATTGGGAGAGGTTATAAACGGTGAAGGCGTTACCTATCAATAAGACCCGTGTT
TTGTGTTTTCTACCAATCACTATTTGTGTTCTCAATAAGACCATGCGAATTGTGTTTTCA
GAGTTTGTGTCAGAGATGGGACAGAGGACCTCTTTGTTTCCCATGTTTCAAAGC

QA 1 294 1 294
DS 



AS 1 2

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CGTGGAGACGAGGTTTGATGAAGATGGGTTTCATGCGTGCGAGTTGTTTGATGAGAGCAA
AGCCAGGGCTCTGTATGACACCGTTGAGGCGTTTATGAAGAGTTGTTCCACGACTGCACC
GTCGTCCAACATGTAGTAGTCTTCTCCAGTGAAGTCCTTATGAGTTATATCTACCATAAA
ATGAATTATGCATGCAATATGTTGTAAGCGAGTTGCATTGCATGTAGCTCTGTGTCTATC
AAAATATATATGTATGATCTGGTACGTAATAATGGTTCTAAATCTATCTAATATTGTACG
GTGTTCAAAATGATACAAATGTTCAAGTGCCATTTAGTGCTAAATTATCGATGCTTGACC
T


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AF RS1GG29TF U 1
AF RS1GG29JQ C 1
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BS 254 421 RS1GG29JQ

RD RS1GG29TF 253 0 0
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GTCGTCCAACATGTAGTAGTCTTCTCCAGTGAAGTCCTTATGAGTTATATCTACCATAAA
ATGAATTATGCAT

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DS 

RD RS1GG29JQ 421 0 0
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CGTGGAGACGAGGTTTGATGAAGATGGGTTTCATGCGTGCGAGTTGTTTGATGAGAGCAA
AGCCAGGGCTCTGTATGACACCGTTGAGGCGTTTATGAAGAGTTGTTCCACGACTGCACC
GTCGTCCAACATGTAGTAGTCTTCTCCAGTGAAGTCCTTATGAGTTATATCTACCATAAA
ATGAATTATGCATGCAATATGTTGTAAGCGAGTTGCATTGCATGTAGCTCTGTGTCTATC
AAAATATATATGTATGATCTGGTACGTAATAATGGTTCTAAATCTATCTAATATTGTACG
GTGTTCAAAATGATACAAATGTTCAAGTGCCATTTAGTGCTAAATTATCGATGCTTGACC
T

QA 1 421 1 421
DS 



AS 1 2

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GTGAGAATCTAAAAAAATCATGTACGGAGGCGAGTTTGACGGTAACGCCGCTTTCGCCGG
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GAATCGGGATGCGCGTACGTTGCTTCCTCTGACGTTGAAGCAATTGAATAGTGTTTCAAC
CAGTGGTGAATCGAATTTCTCCATAGACGGCGTTGATATCAACACTGTTGCAATTGTCGG
ACGAGTTTCTAGAATTGAGAACCGAATCACACAGGTTGATTTTGTTGTAGATGATGGTAC
TGGCTGCGTTGAATGCATCAGATGGTGTCATGAACGCCAAGAAACTGAAGAAATGGAAGC
TGTCAGGTTGGGAATGTATGTTCGCCTACATGGACACCTGAAAAGCTTTCAGGGGAAGCG
ATCTATGAATGTTTTCTCAGTCAGGCCTGTCACTGACTTCAACGAGATTGTACACCACTT
TACCGAGTGTATCTATGTCCACATGTACAACACTAAGCCACGGGGTGGTTCTGTTACTCA
CGCTACGGAAACTCCTAGGCCCCAAATGCCATACTCAACGACGCCAACCCCTGCAAGGCC
ATTCCAAACCGGTCCCTCGAACCAGTTCAATGATCCAATGCATGGCGTAAGGCAGACAGT
CTTAAATTACCTGAATCGTCCTATGCACCTGAGATCTGAAGCTGGAGTTCACTGCGATGT
GATTGCACGCGACCTCGGGATTCCGCTGCCTCAAGTCAAGGACGCCTTGGAACAGCTCTC
AAACGATGGCTGCGTTTACTCTACTAGCGATGAGACTTGCTTCAAATCAACCGCAAACGC
ATGATCTAAATGGATTTATCTACAAACCGATCTTTTTAAGTACGGAAAAAGCCTTTGTAT
AGGCCCTATGGTACGACAGCTTATGGCTTTAAGACTACATCTATCTATTAGCTTTTGGAT
TTGTTAAAATCAACTCAAAGGTTCAATCAAAATCTTCCCCGTCGT


BQ
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AF RS1E260TF U 1
AF RS1E260JQ C 445
BS 1 701 RS1E260TF
BS 702 1065 RS1E260JQ

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GTGAGAATCTAAAAAAATCATGTACGGAGGCGAGTTTGACGGTAACGCCGCTTTCGCCGG
CGGCGGTTTCATGCCTTCTCAGTCAACCACGCAAGCGCCTGAGTCCTCATCTGCTTTCAG
GAATCGGGATGCGCGTACGTTGCTTCCTCTGACGTTGAAGCAATTGAATAGTGTTTCAAC
CAGTGGTGAATCGAATTTCTCCATAGACGGCGTTGATATCAACACTGTTGCAATTGTCGG
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TGGCTGCGTTGAATGCATCAGATGGTGTCATGAACGCCAAGAAACTGAAGAAATGGAAGC
TGTCAGGTTGGGAATGTATGTTCGCCTACATGGACACCTGAAAAGCTTTCAGGGGAAGCG
ATCTATGAATGTTTTCTCAGTCAGGCCTGTCACTGACTTCAACGAGATTGTACACCACTT
TACCGAGTGTATCTATGTCCACATGTACAACACTAAGCCACGGGGTGGTTCTGTTACTCA
CGCTACGGAAACTCCTAGGCCCCAAATGCCATACTCAACGACGCCAACCCCTGCAAGGCC
ATTCCAAACCGGTCCCTCGAACCAGTTCAATGATCCAATGC

QA 1 701 1 701
DS 

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GCCTGTCACTGACTTCAACGAGATTGTACACCACTTTACCGAGTGTATCTATGTCCACAT
GTACAACACTAAGCCACGGGGTGGTTCTGTTACTCAGGCTACGGAAACTCCTAGGCCCCA
AATGCCATACTCAACGACGCCAACCCCTGCAAGGCCATTCCAAACCGGTCCCTCGAACCA
GTTCAATGATCCAATGCATGGCGTAAGGCAGACAGTCTTAAATTACCTGAATCGTCCTAT
GCACCTGAGATCTGAAGCTGGAGTTCACTGCGATGTGATTGCACGCGACCTCGGGATTCC
GCTGCCTCAAGTCAAGGACGCCTTGGAACAGCTCTCAAACGATGGCTGCGTTTACTCTAC
TAGCGATGAGACTTGCTTCAAATCAACCGCAAACGCATGATCTAAATGGATTTATCTACA
AACCGATCTTTTTAAGTACGGAAAAAGCCTTTGTATAGGCCCTATGGTACGACAGCTTAT
GGCTTTAAGACTACATCTATCTATTAGCTTTTGGATTTGTTAAAATCAACTCAAAGGTTC
AATCAAAATCTTCCCCGTCGT

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 2

CO CL6064Contig1 1001 2 2 U
GGGTTTTAAGACTTCCAGATCTATAGAAAACAATGCAGATCGCATTAGACTTCTCCTCCG
CCTTCCGCCACCCACGCGCCGCCGCATTAGCCACCACAACCTCCAGTGTATCAGTTTCAC
ATCCTCCGGCGATAAAATTTCACACTCCATCCTTATATTCGCCTTCCTCGACACTACCGC
TAGCTTATTCTTCTCGTAGATGTCTCACCTGCCGATTCGGCGACGAAGATTATTATGATG
ATGAGGATGATTATTTGGTTGACTGCTTGACAGATGGGAAGACGGAGGATGGGGTTTTCA
TTTCGGTGGAGAAGCTCGAGGAGAAGATCTCGCGGCGAATCCGTTCGAAGATCGGAATGG
AAGCTAGCCTTGAATCCGTGTGGAGCGTGTTGACTGATTACGAGAAGCTGTCGGAGTTCA
TACCGGGCCTTGTCGTCAGCGAGTTGGTGGAGAAGGAAGGAAACCGTGTTCGTCTTTTCC
AGAATATACACCCGTGCGGACGCACGGGTCAAAAGCTAGTTGGGTCTTAAGTTCAATGCC
AAAGCTGTTCTAGATTGTTTCGAGAAGGAGCTTGAGATTCTGCCTCATGGGAGGAGACGT
GAAATCGACTTTAAGATGGTCGAAAGAGATTTTCAATTGTTTGAAGGCAAATGGTCCATC
GAACAATTAGACAAAGGGGAGGCTTTGGATTTACAGTTTAAAGATTTTCCGACCACGCTT
GCGTACACTGTGGATGTAAAACCAAAGATGTGGTTACCTGTACGGCTAGTTGAAGGAAGA
TTGTGCAATGAGATCAAAACAAACCTTTTGAGTGTTAGAGATGCAGCTCAGAAACTCATT
GAAGGTGTTATTCATGACCTTTGAGTTTTATTTTTTTCTCTCAAGACCCAAGTTTAAGTG
GTTTTCTACTTCTCTACCGCTTAGATAGATATACACACGTTTTTGTACTCACTTGTATAT
TCTGATCTATAAATCTTTGAATATACCAAGTTTTTTCCGGC


BQ
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AF RS1EU46TF U 1
AF RS1EU46JQ C 375
BS 1 672 RS1EU46TF
BS 673 1001 RS1EU46JQ

RD RS1EU46TF 672 0 0
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CCTTCCGCCACCCACGCGCCGCCGCATTAGCCACCACAACCTCCAGTGTATCAGTTTCAC
ATCCTCCGGCGATAAAATTTCACACTCCATCCTTATATTCGCCTTCCTCGACACTACCGC
TAGCTTATTCTTCTCGTAGATGTCTCACCTGCCGATTCGGCGACGAAGATTATTATGATG
ATGAGGATGATTATTTGGTTGACTGCTTGACAGATGGGAAGACGGAGGATGGGGTTTTCA
TTTCGGTGGAGAAGCTCGAGGAGAAGATCTCGCGGCGAATCCGTTCGAAGATCGGAATGG
AAGCTAGCCTTGAATCCGTGTGGAGCGTGTTGACTGATTACGAGAAGCTGTCGGAGTTCA
TACCGGGCCTTGTCGTCAGCGAGTTGGTGGAGAAGGAAGGAAACCGTGTTCGTCTTTTCC
AGAATATACACCCGTGCGGACGCACGGGTCAAAAGCTAGTTGGGTCTTAAGTTCAATGCC
AAAGCTGTTCTAGATTGTTTCGAGAAGGAGCTTGAGATTCTGCCTCATGGGAGGAGACGT
GAAATCGACTTTAAGATGGTCGAAAGAGATTTTCAATTGTTTGAAGGCAAATGGTCCATC
GAACAATTAGAC

QA 1 672 1 672
DS 

RD RS1EU46JQ 627 0 0
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GTCAGCGAGTTGGTGGAGAAGGAAGGAAACCGTGTTCGTCTTTTCCAGAATATACACCCG
TGCGGACGCACGGGTCAAAAGCTAGTTGGGTCTTAAGTTCAATGCCAAAGCTGTTCTAGA
TTGTTTCGAGAAGGAGCTTGAGATTCTGCCTCATGGGAGGAGACGTGAAATCGACTTTAA
GATGGTCGAAGGAGATTTTCAATTGTTTGAAGGCAAATGGTCCATCGAACAATTAGACAA
AGGGGAGGCTTTGGATTTACAGTTTAAAGATTTTCCGACCACGCTTGCGTACACTGTGGA
TGTAAAACCAAAGATGTGGTTACCTGTACGGCTAGTTGAAGGAAGATTGTGCAATGAGAT
CAAAACAAACCTTTTGAGTGTTAGAGATGCAGCTCAGAAACTCATTGAAGGTGTTATTCA
TGACCTTTGAGTTTTATTTTTTTCTCTCAAGACCCAAGTTTAAGTGGTTTTCTACTTCTC
TACCGCTTAGATAGATATACACACGTTTTTGTACTCACTTGTATATTCTGATCTATAAAT
CTTTGAATATACCAAGTTTTTTCCGGC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

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GGACCCTCTGATCTCAACTTCAGATTCATCGGCCGGTGTCTTCTTAAAATTCAGATCGTC
GAAGATGTCTACGTTCAGTGGCGATGAGACCGCTCCTTTCTTCGGCTTCCTTGGCGCTGC
CGCAGCCCTCGTCTTCTCCTGCATGGGAGCTGCATATGGGACTGCCAAGAGTGGTGTCGG
TGCGGCATCTATGGGTGTTATGAGACCTGAGTTGGTCATGAAGTCTATTGTCCCTGTTGT
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TAACCCCAAGGCTAAATCTTACTACCTCTTCGACGGTTATGCTCATCTCTCTTCTGGTCT
CGCTTGTGGCCTTGCTGGTCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGTATTGTTGGTGATGCTGG
TGTCGGGGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGTATGATTCTTATCCTCATTTT
CGCTGAAGCTCTGGCTCTATACGGTCTCATCGTCGGGATCGTCTTGTCTTCCCGAGCTGG
TCAGTCCAGAGCCGAATGAGAAGAGAATGCGCTTCTTCTTGGATTCTTTGCTTTGCTTTC
TCGCTCTCGTCTTATATTATTTCTCAGGTTAGTAGAGGGAGTCCCCCAGTGGTTTTGCTA
CTTTATGTAGCACGTTTCTTAAAAAAACCACACAATCACCAAAGTGTTGTTCGTTTTCCA
CCCTTGTGTTATGTTTGTAATATTTTTTTCTTCCCAGTTAAGAGAGACACCCTCTTATTT
ATACTTGTTTTTTGTCATTCTAATAAAATCACAG


BQ
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AF RS1F421JQ C 385
BS 1 642 RS1F421TF
BS 643 814 RS1F421JQ

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GAAGATGTCTACGTTCAGTGGCGATGAGACCGCTCCTTTCTTCGGCTTCCTTGGCGCTGC
CGCAGCCCTCGTCTTCTCCTGCATGGGAGCTGCATATGGGACTGCCAAGAGTGGTGTCGG
TGCGGCATCTATGGGTGTTATGAGACCTGAGTTGGTCATGAAGTCTATTGTCCCTGTTGT
TATGGCTGGTGTCTTGGGTATCTATGGTTTGATTATTGCTGTTATCATCAGTACCGGTAT
TAACCCCAAGGCTAAATCTTACTACCTCTTCGACGGTTATGCTCATCTCTCTTCTGGTCT
CGCTTGTGGCCTTGCTGGTCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGTATTGTTGGTGATGCTGG
TGTCGGGGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGTATGATTCTTATCCTCATTTT
CGCTGAAGCTCTGGCTCTATACGGTCTCATCGTCGGGATCGTCTTGTCTTCCCGAGCTGG
TCAGTCCAGAGCCGAATGAGAAGAGAATGCGCTTCTTCTTGGATTCTTTGCTTTGCTTTC
TCGCTCTCGTCTTATATTATTTCTCAGGTTAGTAGAGGGAGT

QA 1 642 1 642
DS 

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AAAGCTTTTCGTTGGTATGATTTTTATCCTCATTTTCGCTGAAGCTCTGGCTCTATACGG
TCTCATCGTCGGGATCGTCTTGTCTTCCCGAGCTGGTCAGTCCAGAGCCGAATGAGAAGA
GAATGCGCTTCTTCTTGGATTCTTTGCTTTGCTTTCTCGCTCTCGTCTTATATTATTTCT
CAGGTTAGTAGAGGGAGTCCCCCAGTGGTTTTGCTACTTTATGTAGCACGTTTCTTAAAA
AAACCACACAATCACCAAAGTGTTGTTCGTTTTCCACCCTTGTGTTATGTTTGTAATATT
TTTTTCTTCCCAGTTAAGAGAGACACCCTCTTATTTATACTTGTTTTTTGTCATTCTAAT
AAAATCACAG

QA 1 430 1 430
DS 



AS 1 2

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ATAAAGGTTCATTCAGGTGTGAATCAGCATGCAAGACCTGTACTACTACCCCACAATGCC
ACAGTTGAGGAGCATCAAACAGGTGAGCGTAAAGGCAATCAACAAGTGTTTCTTAAGAAG
GACGATCCAAAGGTAACAAACTTGATGCAACAAGCCGAGCTTCTCAGTTCATTGGCCCAT
AAAGTTAACTCAGACAACACTGAACAAAGCATGGAGAATGCATGGAAGGTCCTGCAAGAT
TTCTTGAATAAAAGCAAAGAGAATGATATATTCCGTTGTGGACTTCCGGAGATGGATTAC
CAGCTTGAGGAGTTCAAGGATCTTGTTGAAGACTTGAGGAGTAGTAATGAAGATATTCAA
GCATCTTATAGGCAACCTGATCTCCATGATTCACCAGCAAGCTCTGAGAATAGCTCAGGA
TCAAATGTAATGCCGTTCCCTTCTGGTGATGACACCCAACAACAACCAATGCATGATAGT
CAGACAATATCTCAAAATGGTGTGGAGTTAGTACAAGATAAAGGGACTGTGTCTGATGCA
ATTGTGGAACAACAAGTGGATTTACTCTCAACTTGTCATGATGTCGTCCTAAAGAACTCT
AATGAGATTGTGCCTATGTCTGGTGAAGAAGAGTTTAACTCGCCTGTTCAAGTCACTCCG
CTGTTCAGATCTCTAGCAGCAGGCATCCCTAGCCCTCAGTTCTCTGAAAGTGAGAGGAGC
TTTTTGCTAAAGACACTGGGTGTGGAGTCCCCATATCCATGTCCGAGTGCTAATCCTTCA
CAACCACCTCCTTGCAAAAGAGTCCTTCTTGATAGTTTGTAAACCAAACCAAAACCAACC
AGAAAAAGCTGTCCCTAAAAACCGCGGTTGTGTCCTCATGGAGATGGACATAACTTGCAT
TTTTCTTCCCTCTCTTTTTTTTGCTTAGATTTTTCTTCATAGGTTTGCAGCCATATCGGC
CTGAAAAAAGTTTTAGTTGAAGCGGGCGTGCCATGATCTGCATTTTTTCCCCCTCTCAGT
GGTCTAGACTCCATAGAATGTTAAAGGTAACATTTTTAAGTCTAGACCTATCTCAGAAAC
TGAGTTATCTCTTTCAGATACTCAGCATTCAAAAATCTTTGCTCACTCAGTAGGAGAGTT
TCCTTTCATCATCATTTCATACTTGAAGCCATTCATAAAAAAATGCTTCAAGTATGAGTG


BQ
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AF RS1E476TF U 1
AF RS1E476JQ C 506
BS 1 689 RS1E476TF
BS 690 690 RS1E476JQ
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BS 778 1260 RS1E476JQ

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ATAAAGGTTCATTCAGGTGTGAATCAGCATGCAAGACCTGTACTACTACCCCACAATGCC
ACAGTTGAGGAGCATCAAACAGGTGAGCGTAAAGGCAATCAACAAGTGTTTCTTAAGAAG
GACGATCCAAAGGTAACAAACTTGATGCAACAAGCCGAGCTTCTCAGTTCATTGGCCCAT
AAAGTTAACTCAGACAACACTGAACAAAGCATGGAGAATGCATGGAAGGTCCTGCAAGAT
TTCTTGAATAAAAGCAAAGAGAATGATATATTCCGTTGTGGACTTCCGGAGATGGATTAC
CAGCTTGAGGAGTTCAAGGATCTTGTTGAAGACTTGAGGAGTAGTAATGAAGATATTCAA
GCATCTTATAGGCAACCTGATCTCCATGATTCACCAGCAAGCTCTGAGAATAGCTCAGGA
TCAAATGTAATGCCGTTCCCTTCTGGTGATGACACCCAACAACAACCAATGCATGATAGT
CAGACAATATCTCAAAATGGTGTGGAGTTAGTACAAGATAAAGGGACTGTGTCTGATGCA
ATTGTGGAACAACAAGTGGATTTACTCTCAACTTGTCATGATGTCGTCCTAAAGAACTCT
AATGAGATTGTGCCTATGTCTGGTGAAGA*GAGTTTAACTCGCCTGTTCA*GTCACTCCG
CTGTTCAGATCTCTAGCAGCAG*CATCCCTAGCCCTCAGTTCTCTGAAAGTGAGAGG

QA 1 777 1 777
DS 

RD RS1E476JQ 755 0 0
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AGTTAGTACAAGATAAAGGGACTGTGTCTGATGCAATTGTGGAACAACAAGTGGATTTAC
TCTCAACTTGTCATGATGTCGTCCTAAAGAACTCTAATGAGATTGTGCCTATGTCTGGTG
AAGAAGAGTTTAACTCGCCTGTTCAAGTCACTCCGCTGTTCAGATCTCTAGCAGCAGGCA
TCCCTAGCCCTCAGTTTTCTGAAAGTGAGAGGAGCTTTTTGCTAAAGACACTGGGTGTGG
AGTCCCCATATCCATGTCCGAGTGCTAATCCTTCACAACCACCTCCTTGCAAAAGAGTCC
TTCTTGATAGTTTGTAAACCAAACCAAAACCAACCAGAAAAAGCTGTCCCTAAAAACCGC
GGTTGTGTCCTCATGGAGATGGACATAACTTGCATTTTTCTTCCCTCTCTTTTTTTTGCT
TAGATTTTTCTTCATAGGTTTGCAGCCATATCGGCCTGAAAAAAGTTTTAGTTGAAGCGG
GCGTGCCATGATCTGCATTTTTTCCCCCTCTCAGTGGTCTAGACTCCATAGAATGTTAAA
GGTAACATTTTTAAGTCTAGACCTATCTCAGAAACTGAGTTATCTCTTTCAGATACTCAG
CATTCAAAAATCTTTGCTCACTCAGTAGGAGAGTTTCCTTTCATCATCATTTCATACTTG
AAGCCATTCATAAAAAAATGCTTCAAGTATGAGTG

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL6067Contig1 938 2 12 U
GGATAAATACCAAATATGTGAGGCCATTTAAGTTTAGCTTTTTCACTAGAACACACAAGA
TGGGTCTCAATGCCTCCCTTTATCTATTCTCCCTCACCTTCTTACTCATATTTTTCTCTA
CAGCCACTACAGCAGACAACATCACACAAGCGTTTGAGAAATACTCCAACTTCAGCACCA
TGAATGACCTCTTGATCAAAACCAAGCTCAATATACCCATAAGCAAATACCTGACCGTAA
CCTTACTTGCTGTTAGCAACGAAGCCATCAGCCCTATCGTTAACAGATCCGACGTTGAGG
TCAAGAACATCCTTATGAATCATGTCATTCTCGATTACTACGATGAGATCAAGTTTAAAG
GGATGAAGGAGAAGAGCATAATGCTCACCACCTTATACCAAACAACCGGTTTAGGTGAAG
AGATGAATGGTTTTCTCAACTGTACCAAATCCAAAGGCAGAGTTTACTTTGGTTCAGGGG
TGAAGGGTTCACCTTTAGTCGCTGAGTATGTCAAGGCTCTGTACGACAATCCATATAACT
TGTCTATAGTCCAGATTAGTATGCCCATTGTGGCTCCTGGACTCAGCCTTGTTATTTTTC
CACCTCCACCACCACCTGCTCCTCCGGCTCCACCTCCTACAGATGCTGCAATGGCTCCAG
GTCCTGGACCAGCTGATGATGACAATGCCTCAGATACAGCTGTTCCAAAACATAAACCTG
CAACAGAAACAACGGAGGTTGATTCTCCAGCTCCTACTCCAAGCGCAGATAATGAGAAGA
TTGAAGCTGCTGATAAGGCTGGGTCATCTTTTTCTGCTTGTAAGGCAGGTTTAAGCTTTG
TTGTTGTTCTCTTGCTACTTGTTTTTGCTAGCTTTGCTGGTTTCTAAGTTTTGGAATTAG
GTGATATGGTTTGATGACAATAATGGTAGATGAGATTC


BQ
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AF RS1ED55TF U 1
AF RS1ED55JQ C 334
BS 1 684 RS1ED55TF
BS 685 685 RS1ED55JQ
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BS 772 938 RS1ED55JQ

RD RS1ED55TF 777 0 0
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TGGGTCTCAATGCCTCCCTTTATCTATTCTCCCTCACCTTCTTACTCATATTTTTCTCTA
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TGAATGACCTCTTGATCAAAACCAAGCTCAATATACCCATAAGCAAATACCTGACCGTAA
CCTTACTTGCTGTTAGCAACGAAGCCATCAGCCCTATCGTTAACAGATCCGACGTTGAGG
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TGAAGGGTTCACCTTTAGTCGCTGAGTATGTCAAGGCTCTGTACGACAATCCATATAACT
TGTCTATAGTCCAGATTAGTATGCCCATTGTGGCTCCTGGACTCAGCCTTGTTATTTTTC
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GTCCTGGACCAGCTGATGATGACA*TGCCTCAGATACAGCTGTTCCAAA*CATAAACCTG
CA*CAGAAACAACGGAGGT*GATTCTCCAGCTC*TACTCCAAGCGCAGATA
TGAGAG

QA 1 771 1 771
DS 

RD RS1ED55JQ 605 0 0
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TATACCAAACAACCGGTTTAGGTGAAGAGATGAATGGTTTTTTCAACTGTACCAAATCCA
AAGGCAGAGTTTACTTTGGTTCAGGGGTGAAGGGTTCACCTTTAGTCGCTGAGTATGTCA
AGGCTCTGTACGACAATCCATATAACTTGTCTATAGTCCAGATTAGTATGCCCATTGTGG
CTCCTGGACTCAGCCTTGTTATTTTTCCACCTCCACCACCACCTGCTCCTCCGGCTCCAC
CTCCTACAGATGCTGCAATGGCTCCAGGTCCTGGACCAGCTGATGATGACAATGCCTCAG
ATACAGCTGTTCCAAAACATAAACCTGCAACAGAAACAACGGAGGTTGATTCTCCAGCTC
CTACTCCAAGCGCAGATAATGAGAAGATTGAAGCTGCTGATAAGGCTGGGTCATCTTTTT
CTGCTTGTAAGGCAGGTTTAAGCTTTGTTGTTGTTCTCTTGCTACTTGTTTTTGCTAGCT
TTGCTGGTTTCTAAGTTTTGGAATTAGGTGATATGGTTTGATGACAATAATGGTAGATGA
GATTC

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 2

CO CL6068Contig1 961 2 10 U
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GCTTGCCTAAAAGCCATGTCCAAGCCATCACAATGCACCGTGATATCGTCCCCAGAGCTT
TCTCTTGTAACTACCCTTACCATGTGGCAGAGCTTCTCAAAGCTGTTAACGGCAACTTCC
GTAGCCATCCTTGTCTCAACAAGCAGAGCATGTTGTATTCTCCCATGGGAGAGCTTCTGA
TCCTTCAGCCTGATGAGTCATTCTCTCCCGGACATGATCTGCTTCCTCCGGGAAACGGTT
TGTATCTTCTCGAAGATACGGAGGAGGAGGAGGAAGAGAGGTTGAGAGCCGCGCAGACGG
TTTTCTTGAACACGCCGCACCCTCTCGACATTCTTGGCGACAGGTCGGCTTACGGCTCAA
GCGGGACCATTCAGAGGGACCATGACATGAACTCTTATCTGAAAGCGGTTAGGAGTGTGA
TAAGAAAAGAAGTAAGTCAGATAAGGAGAGCCAAGAGGGAGCATCGCCGGAGTCTCTGGT
GGCCTATTGTGGTGGCTAGAGAGAGCGGGAGCTCGGGGAGACAAATCAACGGTGGCCAGG
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GAGCTTTCAACGTCTTTAATTTCCGTTGAAAATGTTTTGTTTTGTTTTTGGCGGGTTAAA
GTCGTTATCGGCTTATACCGGTTTAGACCGGGTTCTGGTAATGACCAGGTTTAGATCATT
CTTTATTCATGTGTATTTTGTTTGTTTGTTGGGGGGGCCCATTGGAAAGGCTTTTTCTTG
TTAGATTCATTGGCTTATGCATAAAGATTGTGGAAAAGGGACCAATATATTTTCAAATAT
T


BQ
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10 

AF RS1AG91TF U 1
AF RS1AG91JQ C 462
BS 1 505 RS1AG91TF
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RD RS1AG91TF 741 0 0
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GCTTGCCTAAAAGCCATGTCCAAGCCATCACAATGCACCGTGATATCGTCCCCAGAGCTT
TCTCTTGTAACTACCCTTACCATGTGGCAGAGCTTCTCAAAGCTGTTAACGGCAACTTCC
GTAGCCATCCTTGTCTCAACAAGCAGAGCATGTTGTATTCTCCCATGGGAGAGCTTCTGA
TCCTTCAGCCTGATGAGTCATTCTCTCCCGGACATGATCTGCTTCCTCCGGGAAACGGTT
TGTATCTTCTCGAAGATACGGAGGAGGAGGAGGAAGAGAGGTTGAGAGCCGCGCAGACGG
TTTTCTTGAACACGCCGCACCCTCTCGACATTCTTGGCGACAGGTCGGCTTACGGCTCAA
GCGGGACCATTCAGAGGGACCATGACATGAACTCTTATCTGAAAGCGGTTAGGAGTGTGA
TAAGAAAAGAAGTAAGTCAGATAAG*AGAGCCAAGAGGGAGCATCGCCGGAGTCTCTGGT
GGCCTATTGTGGTGGCTAGAGAGAGCGGGAGCTCGGGGAGACAAATCAACGGTGGCCAGG
ATTTCTCGGGGATGATGAAGACAGGGAGAAAGTCGTTGCAGAG*TTTAGCCGCCTTGTGG
CGTCTCA*CATATGCCTTTGATTGTTGTTCTGTTGTTTCCGGTTAAGTTGATGTTCCTTG
GAGCTTTCA*CGTCTTTAATT

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1AG91JQ 500 0 0
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AGGTTTAGCCGCCTTGTGGCGTCTCAGCATATGCCTTTGATTGTTGTTCTGTTGTTTCCG
GTTAAGTTGATGTTCCTTGGAGCTTTCAACGTCTTTAATTTCCGTTGAAAATGTTTTGTT
TTGTTTTTGGCGGGTTAAAGTCGTTATCGGCTTATACCGGTTTAGACCGGGTTCTGGTAA
TGACCAGGTTTAGATCATTCTTTATTCATGTGTATTTTGTTTGTTTGTTGGGGGGGCCCA
TTGGAAAGGCTTTTTCTTGTTAGATTCATTGGCTTATGCATAAAGATTGTGGAAAAGGGA
CCAATATATTTTCAAATATT

QA 1 500 1 500
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGACAAAGACAACGGCGGAGACGAGGAGGCTGAGAAACACCGGCGGGGCAAAAGGTCGTT
TCCGATAACAAGTAGCTAACTTTTCGAAATCAAACCTCTACGGAAGATGGCATACATATC
GAATTGGGTCAGATACATGGCTCACAAGCTGGAGTATTCCCTCACTCTCAGCCTCAAGAA
TCATACTAAAGGGATAAATGACCGGGAACTAGCTGGTGTAGTCCTGAAGAATCTACTCTA
TGGAAGGCTAACCTACTTACACTCTGGTAAAGGGCAAGAGATGTCCCCAACCATGGGAGC
ACATGACAACACGCTGCTTGTCCGTAAGCTACCTGTTGTTGATACAAGGTATGTTTTTGT
TGGAGATGCTGTTGTGTTGAAGGACCCAAATGAAACAAGCAAGTATCTAGTGAGAAGATT
GGCAGCTTTAGAAGGATCCGAAATGGTATCAAGTGATGAGAAGGAGGAGCCTTTTGTTCT
CGAAAAGGATCAGTGCTGGGTCGTTGCTGAAAACAAAGAGATGAAATCTAAGGAAGCATA
CGATAGCCGAACATTTGGTCCGGTCTCGATGGCGGACATTGTAGGAAGAGCTATATATTG
TCTGAGGACAGCCGTTGATCATGGTCCAGTTAGTAACAGTGAATTCGCAATGGAAGAGGA
TTCTCCACTCTTGGCGGTAGAACTTGACGTGGATGAAATGGCTAAAGACCACAAAGCTTA
GTAATAACAATGAAACCTTTGTATCCCCTTTGTTTCCGTTGGTTCGAAACTCCAAATCTA
GATCCCATTGGAGTGTCAGAGATGTTTGTGGGCAGATTGTTTGGCCATTGGTTCTAAGCT
TTCATACTTGTTGAGAGTGTTGAAGAAAGCTTCATCA


BQ
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AF RS1AQ29TFB U 1
AF RS1AQ29JQ C 406
BS 1 863 RS1AQ29TFB
BS 864 877 RS1AQ29JQ

RD RS1AQ29TFB 863 0 0
GGACAAAGACAACGGCGGAGACGAGGAGGCTGAGAAACACCGGCGGGGCAAAAGGTCGTT
TCCGATAACAAGTAGCTAACTTTTCGAAATCAAACCTCTACGGAAGATGGCATACATATC
GAATTGGGTCAGATACATGGCTCACAAGCTGGAGTATTCCCTCACTCTCAGCCTCAAGAA
TCATACTAAAGGGATAAATGACCGGGAACTAGCTGGTGTAGTCCTGAAGAATCTACTCTA
TGGAAGGCTAACCTACTTACACTCTGGTAAAGGGCAAGAGATGTCCCCAACCATGGGAGC
ACATGACAACACGCTGCTTGTCCGTAAGCTACCTGTTGTTGATACAAGGTATGTTTTTGT
TGGAGATGCTGTTGTGTTGAAGGACCCAAATGAAACAAGCAAGTATCTAGTGAGAAGATT
GGCAGCTTTAGAAGGATCCGAAATGGTATCAAGTGATGAGAAGGAGGAGCCTTTTGTTCT
CGAAAAGGATCAGTGCTGGGTCGTTGCTGAAAACAAAGAGATGAAATCTAAGGAAGCATA
CGATAGCCGAACATTTGGTCCGGTCTCGATGGCGGACATTGTAGGAAGAGCTATATATTG
TCTGAGGACAGCCGTTGATCATGGTCCAGTTAGTAACAGTGAATTCGCAATGGAAGAGGA
TTCTCCACTCTTGGCGGTAGAACTTGACGTGGATGAAATGGCTAAAGACCACAAAGCTTA
GTAATAACAATGAAACCTTTGTATCCCCTTTGTTTCCGTTGGTTCGAAACTCCAAATCTA
GATCCCATTGGAGTGTCAGAGATGTTTGTGGGCAGATTGTTTGGCCATTGGTTCTAAGCT
TTCATACTTGTTGAGAGTGTTGA

QA 1 863 1 863
DS 

RD RS1AQ29JQ 472 0 0
TCTAGTGAGAAGATTGGCAGCTTTAGAAGGATCCGAAATGGTATCAAGTGATGAGAAGGA
GGAGCCTTTTGTTCTCGAAAAGGATCAGTGCTGGGTCGTTGCTGAAAACAAAGAGATGAA
ATTTAAGGAAGCATACGATAGCCGAACATTTGGTCCGGTCTCGATGGCGGACATTGTAGG
AAGAGCTATATATTGTTTGAGGACAGCCGTTGATCATGGTCCAGTTAGTAACAGTGAATT
CGCAATGGAAGAGGATTTTCCACTTTTGGCGGTAGAACTTGACGTGGATGAAATGGGTAA
AGACCACAAGGGTTAGTAATAACAATGAAACCTTTGTATCCCCTTTGTTTCCGTTGGTTT
GAAACTCCAAATTTAGATTCCATTGGAGTGTCAGAGATGTTTGTGGGCAGATTGTTTGGC
CATTGGTTTTAAGCTTTCATACTTGTTGAGAGTGTTGAAGAAAGCTTCATCA

QA 1 472 1 472
DS 



AS 1 2

CO CL6071Contig1 979 2 4 U
GGGATTATAAGTTCTCCACCAACAAAACTTCACGTTTATCTTGTTTTGTTGAAGCGTTTT
TGTGCCTATGCCCTATGTCCAGCTCCTACTGCAAAAGAAGTATATATTTAAATAATTTTC
CCCTGTTCGTTTTCTAATTTTTCTACCGGAAAAAACAAAATTTAGTTTTCAAGTTCTCTA
AAAAAAACTTGTAAAACCTATCCATCTGACGAAAACGTCAGAGAAAATCAAACGAAAGTG
ATAAATTATTTTTTGTTAGTACAATTGATTTAAGAATTATTATTAATTACTGAAATTTAT
TGTAAAATGTCGGGGATGGGCCGGTGTTCAAGGCAGAAGGAGCGTCGTTCCGGGATCAAC
CCTACGGTAGAGAACTTCCTCAGGGACTATGGACCACCGGTCTCTGTGACTGTCACCAAG
ATGGTCACATTTGTACATTCCCTTCTTAATCATATTCTCTTTTTTGTTAAAAAAAATCCT
AATCTCTTCTTGTTTGATTAATCTTTCTTTCTTGTCCCAAAATGGATCCTTAAAAAGGTG
TTCAGACAGCTATAATGCCATGCGTCTCCTTCGCTCAAAACACCGAGATCGTAAACAGAG
GAACCATACCTTGCATCAGCGCAGGTTTGATTCATCTAGCGTTAGGGTTTGTGGGTTGCT
GCTGGTTTTACGCGTCCCCAAGCAGGTCAAGGCTGAGGGAACATTTCGCATTGCCTGAGG
AACCATGCGGTGACTTTTGGGTCCATCTCTTTTGCACTTCTTGTGCTATCTGCCAAGAAT
CTAGAGAGCTCAAGAACCGTGGAGCCGATCCCTCCATCAGCTGGCTTTCAAATGTAGAGA
AATGGAGCCGAGAGAAAGTAACTCCTCCTATAGTTGTACCAGGCATGATCCGCTGAAGAG
TTTCATGATTGTATCTTACGTTGTATAATGTATATGTAGATCTTATTAGCTTCTCTTTTT
TTCTTTCAGTTAGCTTAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DO83TF U 1
AF RS1DO83JQ C 223
BS 1 622 RS1DO83TF
BS 623 623 RS1DO83JQ
BS 624 641 RS1DO83TF
BS 642 979 RS1DO83JQ

RD RS1DO83TF 641 0 0
GGGATTATAAGTTCTCCACCAACAAAACTTCACGTTTATCTTGTTTTGTTGAAGCGTTTT
TGTGCCTATGCCCTATGTCCAGCTCCTACTGCAAAAGAAGTATATATTTAAATAATTTTC
CCCTGTTCGTTTTCTAATTTTTCTACCGGAAAAAACAAAATTTAGTTTTCAAGTTCTCTA
AAAAAAACTTGTAAAACCTATCCATCTGACGAAAACGTCAGAGAAAATCAAACGAAAGTG
ATAAATTATTTTTTGTTAGTACAATTGATTTAAGAATTATTATTAATTACTGAAATTTAT
TGTAAAATGTCGGGGATGGGCCGGTGTTCAAGGCAGAAGGAGCGTCGTTCCGGGATCAAC
CCTACGGTAGAGAACTTCCTCAGGGACTATGGACCACCGGTCTCTGTGACTGTCACCAAG
ATGGTCACATTTGTACATTCCCTTCTTAATCATATTCTCTTTTTTGTTAAAAAAAATCCT
AATCTCTTCTTGTTTGATTAATCTTTCTTTCTTGTCCCAAAATGGATCCTTAAAAAGGTG
TTCAGACAGCTATAATGCCATGCGTCTCCTTCGCTCAAAACACCGAGATCGTAAACAGAG
GAACCATACCTTGCATCAGCGC*GGTTTGATTCATCTAGCG

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1DO83JQ 757 0 0
GAAAATCAAACGAAAGTGATAAATTATTTTTTGTTAGTACAATTGATTTAAGAATTATTA
TTAATTACTGAAATTTATTGTAAAATGTCGGGGATGGGCCGGTGTTCAAGGCAGAAGGAG
CGTCGTTCCGGGATCAACCCTACGGTAGAGAACTTCCTCAGGGACTATGGACCACCGGTC
TCTGTGACTGTCACCAAGATGGTCACATTTGTACATTCCCTTCTTAATCATATTCTCTTT
TTTGTTAAAAAAAATCCTAATCTCTTCTTGTTTGATTAATCTTTCTTTCTTGTCCCAAAA
TGGATCCTTAAAAAGGTGTTCAGACAGCTATAATGCCATGCGTCTCCTTCGCTCAAAACA
CCGAGATCGTAAACAGAGGAACCATACCTTGCATCAGCGCAGGTTTGATTCATCTAGCGT
TAGGGTTTGTGGGTTGCTGCTGGTTTTACGCGTCCCCAAGCAGGTCAAGGCTGAGGGAAC
ATTTCGCATTGCCTGAGGAACCATGCGGTGACTTTTGGGTCCATCTCTTTTGCACTTCTT
GTGCTATCTGCCAAGAATCTAGAGAGCTCAAGAACCGTGGAGCCGATCCCTCCATCAGCT
GGCTTTCAAATGTAGAGAAATGGAGCCGAGAGAAAGTAACTCCTCCTATAGTTGTACCAG
GCATGATCCGCTGAAGAGTTTCATGATTGTATCTTACGTTGTATAATGTATATGTAGATC
TTATTAGCTTCTCTTTTTTTCTTTCAGTTAGCTTAGG

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

CO CL6072Contig1 415 2 1 U
CCGGCGAAGAGATGAATGGAGGAAGCATCCGATGCTATCCAACCAAATGAGACACGCTCT
CCCCGGTCTCGGAATCGGCGTAGCCGCCTTCTGCGTGTACCTAGTCGGTGAGCAGATCTA
CAGCAAAGCTTTGGCTCCTTCCAAATCATCTCACCACAAACAGAATCAGCCTGCTCCCTC
TCACTGAATAGCATCGATCAGATGCTCGAAATAATGGGCTTAAGATGAGCTCAGAGGCTT
CTTCTCGGTTACTATTTTTCTTCGTGGACTGTCTTAATAAATCTGTTTGTTGTGTTGGAC
ACAAAGAATTTGATTCTCTGTTGAATTATAACAGCTTGTTGGCTCAAAGTTTCTCTTTTG
CATCGCACATGTAACATTGTTTTTGGAGTAACTTACATAAAAAGACACTTTCTGG


BQ
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AF RS1AZ74JQ C 1
AF RS1AZ74TF U 1
BS 1 415 RS1AZ74TF

RD RS1AZ74JQ 415 0 0
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TCACTGAATAGCATCGATCAGATGCTCGAAATAATGGGCTTAAGATGAGCTCAGAGGCTT
CTTCTCGGTTACTATTTTTCTTCGTGGACTGTCTTAATAAATCTGTTTGTTGTGTTGGAC
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CATCGCACATGTAACATTGTTTTTGGAGTAACTTACATAAAAAGACACTTTCTGG

QA 1 415 1 415
DS 

RD RS1AZ74TF 415 0 0
CCGGCGAAGAGATGAATGGAGGAAGCATCCGATGCTATCCAACCAAATGAGACACGCTCT
CCCCGGTCTCGGAATCGGCGTAGCCGCCTTCTGCGTGTACCTAGTCGGTGAGCAGATCTA
CAGCAAAGCTTTGGCTCCTTCCAAATCATCTCACCACAAACAGAATCAGCCTGCTCCCTC
TCACTGAATAGCATCGATCAGATGCTCGAAATAATGGGCTTAAGATGAGCTCAGAGGCTT
CTTCTCGGTTACTATTTTTCTTCGTGGACTGTCTTAATAAATCTGTTTGTTGTGTTGGAC
ACAAAGAATTTGATTCTCTGTTGAATTATAACAGCTTGTTGGCTCAAAGTTTCTCTTTTG
CATCGCACATGTAACATTGTTTTTGGAGTAACTTACATAAAAAGACACTTTCTGG

QA 1 415 1 415
DS 



AS 1 2

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TGACCCATGTTCTCATTGAGCGAAGGGTACGAAATAAATTCAATCATATTTTTTTTGATC
AAAAAAAATCACTATGTGAAATGTGAAATCTTCGTTTTTTTTTTCTCTTTCTCTATCGCT
TTCCCATAAGTACAGCACTTGTTGAATCGATAGAAAACCTTTTCTTCTGTATCGATATGA
ATCCATTATGAATCGATATTATTACATTCCAATTCCTTACCAATATCCCTCAAGGAAAAT
CCCGAATTGGATCCCAAATTGACGGGTTAGTGTGAGCTTATCCATGCGGTTATGCACTCT
TCGAATAGGAATTCATTTTCTGAAAAATCCTGGCTTTCGTGCTTTGGCGGGTCTCCGAAA
TCCTTTCGACGACCTATGTTGC


BQ
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AF RS1D845TF C 1
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TGACCCATGTTCTCATTGAGCGAAGGGTACGAAATAAATTCAATCATATTTTTTTTGATC
AAAAAAAATCACTATGTGAAATGTGAAATCTTCGTTTTTTTTTTCTCTTTCTCTATCGCT
TTCCCATAAGTACAGCACTTGTTGAATCGATAGAGAACCTTTTCTTCTGTATCGATATGA
ATCCATTATGAATCGATATTATTACATTCCAATTCCTTACCAATATCCCTCAAGGAAAAT
CCCGAATTGGATCCCAAATTGACGGGTTAGTGTGAGCTTATCCATGCGGTTATGCACTCT
TCGAATAGGAATTCATTTTCTGAAAGATCCTGGCTTTCGTGCTTTGGCGGGTCTCCGAGA
TCCTTTCGACGACCTATGTTGC

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DS 

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GTGAAATGTGAAATCTTCGTTTTTTTTTTCTCTTTCTCTATCGCTTTCCCATAAGTACAG
CACTTGTTGAATCGATAGAAAACCTTTTCTTCTGTATCGATATGAATCCATTATGAATCG
ATATTATTACATTCCAATTCCTTACCAATATCCCTCAAGGAAAATCCCGAATTGGATCCC
AAATTGACGGGTTAGTGTGAGCTTATCCATGCGGTTATGCACTCTTCGAATAGGAATTCA
TTTTCTGAAAAATCCTGGCTTTCGTGCTTTGGCGGGTCTCCGAAATCCTTTCGACGACCT
ATGTTGC

QA 1 427 1 427
DS 



AS 1 2

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ATGAACAGCCAACCTTCCAGTCGACTGTACTCGAGCTGAATAAGATATCAGGATTCCTCT
CTCCTGCTGATCGTGACACCCCAGCAGATTGATGTCCTCTTCTTGATCTTGAGACTGATG
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BQ
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AF RS1FQ25TF U 236
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BS 1 235 RS1FQ25JQ
BS 236 263 RS1FQ25TF
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BS 371 637 RS1FQ25JQ

RD RS1FQ25TF 135 0 0
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QA 1 135 1 135
DS 

RD RS1FQ25JQ 637 0 0
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TAAAGTCTGAAGTCAAACGTCTCAGGAAGTCACGGACTGATTTTGTTGCGAGGGAGAATA
TGTACAAAGAGCTGGTTGCGAAGTTTGCTTCTCGTTTTGAGGAGATGAGGAAGTATGTGA
ATGAACAGCCAACCTTCCAGTCGACTGTACTCGAGCTGAATAAGATATCAGGATTCCTCT
CTCCTGCTGATCGTGACACCCCAGCAGATTGATGTCCTCTTCTTGATCTTGAGACTGATG
AGGACGAGATTGACAAACTGTTAGGATGATTCTTACGTGGTTATTGTTTTGTCTTTTTGC
TGTTTATTTTGCGGCAGCCGTTGTCTTGTAGTTTGCTTTTGTAAAAGGCGACGGGTATTG
ACTTGATCATTTTGTTGACCATATCATGTTCTCAACG

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 2

CO CL6075Contig1 1285 2 2 U
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AGTAGTAGCACCAACCAAGATCAGATTCGAGGATGTTAATGCAACTTCACTCACAGTGAT
CCTCACCTCTAACGAAGTCACCTCGCCTGCGAACATCGTTCATTACAGTATTTGGCATCG
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AAGATTTGTCGTCTCTGGATTAGCTCCAGCGTCTGAGTATTGCTTCAAGGTTGTGTCCTT
TAGCGGAACACGAGAGCTCGGAGTCGATGTGATCAATGTAATGACACGTAGCCCTGATGA
AAGAAGCGAAAGCCCTCTCACAAACTGTAGTACTCTGTCTTCTGTTGAAGCTGAGTCCAA
CAACGGCTACATTGTTCCTCAGAACGGCAAGAAAGACTCTCCAACGACCGAGGAAAATGA
TGCGAAAAGGACAAGGGAAGCGGACGTTGTGCAGACTGAGAAGAACGTTGAAGGGGCTGT
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TCTTGTTAGTAATGGAAACAGTTCTCCGGTTACTCCTTTCAAGTCAGACCAGACCAAGAA
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GAGAGCTACCCCACAAGAGAGCAGAGTTGTGAAGATATTCATGGATACGTTTGCTGATGA
TCCTGTGGCTTTAGCTGAGCAGCTTGTTCATACTTTCAGCGACCGCGTTTCGATGAAGCG
TTTTGCGATTGGTGGTGGTGCGTCTGCGGTTGTTCAGTCTGGATTCTGCATGAAGTTGTG
TCATTAGGGATGGAGATTTGGGGTTTATCATCGGTTTTTATTTAAAATGTCTGTAGCTTT
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GTTATCAGAAGTGAGAAAGTCTACT


BQ
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AF RS1F424TF U 1
AF RS1F424JQ C 489
BS 1 745 RS1F424TF
BS 746 1285 RS1F424JQ

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GCAGAAACTCTGCTCTTCTGCTCTTGAATCTCTTGAAGTTGTTGCATCGCCTTCACCACG
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AGTAGTAGCACCAACCAAGATCAGATTCGAGGATGTTAATGCAACTTCACTCACAGTGAT
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AAGATTTGTCGTCTCTGGATTAGCTCCAGCGTCTGAGTATTGCTTCAAGGTTGTGTCCTT
TAGCGGAACACGAGAGCTCGGAGTCGATGTGATCAATGTAATGACACGTAGCCCTGATGA
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CAACGGCTACATTGTTCCTCAGAACGGCAAGAAAGACTCTCCAACGACCGAGGAAAATGA
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GTTGTTGGATGAGGAGCAAGAAGCTGTTCACGACAAGATCGTCGCGGTTACTACGGCGAA
TCTTGTTAGTAATGGAAACAGTTCT

QA 1 745 1 745
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CTAGAAACAAGAAGTCGGTTAAAGAAAACGGTAATAACAACGGAGATCATCATTCAGAGA
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CAGGACACATTGAGAAAGACTTCAGACAGAAGTTTTTGACTTGGTATAGCTTGAGAGCTA
CCCCACAAGAGAGCAGAGTTGTGAAGATATTCATGGATACGTTTGCTGATGATCCTGTGG
CTTTAGCTGAGCAGCTTGTTCATACTTTCAGCGACCGCGTTTCGATGAAGCGTTTTGCGA
TTGGTGGTGGTGCGTCTGCGGTTGTTCAGTCTGGATTCTGCATGAAGTTGTGTCATTAGG
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ATTTCTCAAAATCGTTACAAAACTTTATTTGTCATTATTGGAATATTTCCATGTTATCAG
AAGTGAGAAAGTCTACT

QA 1 797 1 797
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6077Contig1 920 2 2 U
GGGATAACCTTCTCTCTGGTCAAGGCAAAGCGAAAGCAAAAGGGGACAAAACGTAAAGTG
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CTATGTCGCCTAGTCGATAAAAAAAGGAATCAACTTTGACATCATTCATCAGGATCATTG
ATTCTCCCGCCCTAAAAGTCTCGACCTTTCCAGATCTTTCGGAGCTCCGTTTACTTCAAA
TCGATGGGTGCAGTGGTTGCCTGGCTTGCTACAGAGAACCTAGAACAACTGAAACTCTAA
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TTTTGGTCAACCAGCACAGTCGATATGGACAACACCACCTTCCCTTCTCAGGGGAGCATC
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GGCAAGGAAAGACGTAATCATCATAACCCACCGGATCACAGTCAAGGAGCTAAGATTAAT
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CCTCTCAATGAAATGGTGGATTTTCTGGTGGAGGTTTGGGAACAAGAAGGTCTATATGAC
TGATGAAACAAGACTGGGAGACAGCACTCTCATATACACACATACACAATGGTTCGAGTC
ATTTCAGATTTTTTTTTTCTGTTTCGGTTTTGGTTTGATTTCTGAAACCCCTTGTTGTAC
TATCTCAATGAGAAAATCCCTTTGTTGTACCATCTCTCAGTCTATAAAGTCTTAAAGATT
TATGTCCGGATTTGACCAAT


BQ
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AF RS1B621TF U 1
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CTATGTCGCCTAGTCGATAAAAAAAGGAATCAACTTTGACATCATTCATCAGGATCATTG
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TCGATGGGTGCAGTGGTTGCCTGGCTTGCTACAGAGAACCTAGAACAACTGAAACTCTAA
AGGATCCACCTTTAAACCCCACATCTAAAACGTTTAAGAAACCAAACGCCTCTGAAGATT
TTTTGGTCAACCAGCACAGTCGATATGGACAACACCACCTTCCCTTCTCAGGGGAGCATC
TCGTCGTCTAACCAGACTTTTGAGTCTCAGTCTGGTGCTAGGAACTCTAATCCCCCTCCT
CCTCCTGAATTTGTAAACCAAGGTCTTCTTCTTTGGAATCAGACCCGGGAGCGTTGGGTG
GGCAAGGAAAGACGTAATCATCATAACCCACCGGATCACAGTCAAGGAGCTAAGATTAAT
TGGAACGCAGCATCGTATGATAGCTTGCTGGGGAGCAACAAGTTATTTCCCCAACCCATT
CCTCTCAATGAAATGGTGGATTTTCTGGTG

QA 1 690 1 690
DS 

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AGAGAACCTAGAACAACTGAAACTCTAAAGGATCCACCTTTAAACCCCACATCTAAAACG
TTTAAGAAACCAAACGCCTCTGAAGATTTTTTGGTCAACCAGCACAGTCGATATGGACAA
CACCACCTTCCCTTCTCAGGGGAGCATCTCGTCGTCTAACCAGACTTTTGAGTCTCAGTC
TGGTGCTAGGAACTCTAATCCCCCTCCTCCTCCTGAATTTGTAAACCAAGGTCTTTTTCT
TTGGAATCAGACCCGGGAGCGTTGGGTGGGCAAGGAAAGACGTAATCATCATAACCCACC
GGATCACAGTCAAGGAGCTAAGATTAATTGGAACGCAGCATCGTATGATAGCTTGCTGGG
GAGCAACAAGTTATTTCCCCAACCCATTCCTCTCAATGAAATGGTGGATTTTCTGGTGGA
GGTTTGGGAACAAGAAGGTCTATATGACTGATGAAACAAGACTGGGAGACAGCACTCTCA
TATACACACATACACAATGGTTCGAGTCATTTCAGATTTTTTTTTTCTGTTTCGGTTTTG
GTTTGATTTCTGAAACCCCTTGTTGTACTATCTCAATGAGAAAATCCCTTTGTTGTACCA
TCTCTCAGTCTATAAAGTCTTAAAGATTTATGTCCGGATTTGACCAAT

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 2

CO CL6078Contig1 443 2 2 U
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CAGTTTCGTTGTTCGATCACGAGCTTACGTGTTGGGGAGGTTAGTGAAGCCCAAGTTCCT
CGAGAAGATCGAGTGTGACATCAACTTCGAACACAAGAAGCTCAATAAGCATATACCTAT
CACCAAGAACTGCACCGTCACTACTGTTTGAAAGAAAGAATTAAAAAAACATTTTTAGTG
AGGAAAAAAAGATGTCGTATAAGGGTAACGTGATTATAGCTCTACGGTCAGTATTTTGGG
TTGTCTGGGCAGCGCGTGGACGGGTAACGAATAAAAAACTGTCGGTGGCTTTAGTTTACT
TGAGTGGTTAGTTTTGGATGGTTACTTATTTTATTTTTATCTGTGAAAAAAAAATTAAAA
TTGTGTGGAGAATATATTAATCC


BQ
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AF RS1GU83TF U 1
AF RS1GU83JQ C 1
BS 1 414 RS1GU83TF
BS 415 443 RS1GU83JQ

RD RS1GU83TF 414 0 0
GGGAGCTCCGGTTGTTATTCCTGACCCGCCCGCACCTCCTGCACCGGTTCCTATGAGACT
CAGTTTCGTTGTTCGATCACGAGCTTACGTGTTGGGGAGGTTAGTGAAGCCCAAGTTCCT
CGAGAAGATCGAGTGTGACATCAACTTCGAACACAAGAAGCTCAATAAGCATATACCTAT
CACCAAGAACTGCACCGTCACTACTGTTTGAAAGAAAGAATTAAAAAAACATTTTTAGTG
AGGAAAAAAAGATGTCGTATAAGGGTAACGTGATTATAGCTCTACGGTCAGTATTTTGGG
TTGTCTGGGCAGCGCGTGGACGGGTAACGAATAAAAAACTGTCGGTGGCTTTAGTTTACT
TGAGTGGTTAGTTTTGGATGGTTACTTATTTTATTTTTATCTGTGAAAAAAAAA

QA 1 414 1 414
DS 

RD RS1GU83JQ 443 0 0
GGGAGCTCCGGTTGTTATTCCTGACCCGCCCGCACCTCCTGCACCGGTTCCTATGAGACT
CAGTTTCGTTGTTCGATCACGAGCTTACGTGTTGGGGAGGTTAGTGAAGCCCAAGTTCCT
CGAGAAGATCGAGTGTGACATCAACTTCGAACACAAGAAGCTCAATAAGCATATACCTAT
CACCAAGAACTGCACCGTCACTACTGTTTGAAAGAAAGAATTAAAAAAACATTTTTAGTG
AGGAAAAAAAGATGTCGTATAAGGGTAACGTGATTATAGCTCTACGGTCAGTATTTTGGG
TTGTCTGGGCAGCGCGTGGACGGGTAACGAATAAAAAACTGTCGGTGGCTTTAGTTTACT
TGAGTGGTTAGTTTTGGATGGTTACTTATTTTATTTTTATCTGTGAAAAAAAAATTAAAA
TTGTGTGGAGAATATATTAATCC

QA 1 443 1 443
DS 



AS 1 2

CO CL6079Contig1 1065 2 2 U
GGAAATATTCAGGGTGTGTGTTTGATTCCTTAACAAAGTCTCTGTCTTTTGTTGGTTGGT
GGGTTTTGTGAGGTTCATGGGGTTTGAAATGAAACAAGAGAAAGACGTTTTGGGATTGAT
TCCGAGTAAGACTAAAGGTAAAGCTAGCAGCTCTAACTCTAGTTCTGTTAATTCGCCTCA
TAATAAAAACAAGAAGAAAAAGAAGGATAATAAGAAGAAGGTGGTGATGACATGGCGCCG
GAAGAAGACTGATTCTCGGGCAGAAGAGATAACTGCGGTTCGGCAGCTGTTGCTTACTTG
CAAGGAAGTGTTCTCCAAGGGCGGTCCTGGAGTTGTTCCTTCTGAAGATAAAATCCAACA
GCTACGAGGAGTTCTTGAGGATGTCGGATTAACTCCGACCATGCCGTTTTTCCGACCAAT
CCCCGGACCGAGTGATGGGTCTTCACCACGGATAACGTACCTGCCTCTACACGAATGTGA
ACAATTTTCGATTGCGATTTTCTGTTTACCGCCTTCTGGTGCCATTCCTCTTCATAACCA
TCCAGGGATGACCGTTTTTAGCAAGCTTCTCTTTGGTACAATGCACATCAAGTCGTATGA
TTGGGTGGTTGATGCTCCATTGAGAGATCCGAAAACGCGGCTAGCAAAATTGAAGATGGA
CTCAACGTTAACCGCACCATGCAACACCTCCATCTTGTACCCGGAAGATGGAGGGAACAT
GCATCGGTTCACAGCGAAAACAGCGTGTGCGGTGCTAGATGTGCTTGGCCCTCCTTACTG
CAATGCAGAAGGCAGGCATTGCACTTATTTCCTAGAGTTCCCTTTGGGCAAGTTTTCATT
GGAGGAAGACGACGTTTTGAGAGGTCAAGTGGAGAAAGAAGGTCGTGCCTGGCTGCAAGA
AAGAGATGATAACCCAGAGGATCATAACGTAGTTGGAGCGCTATACGGAGGTCCAAAGGT
TGAGGACTAAGGGCTTTTTATCGAGTTTTCATTGGGTTTACCTCATAGGATAAATCTATA
GGTTCACCAACCAATATAACACAGTTATTTCAGATTCGAAATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FI32TF U 1
AF RS1FI32JQ C 387
BS 1 644 RS1FI32TF
BS 645 1065 RS1FI32JQ

RD RS1FI32TF 644 0 0
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GGGTTTTGTGAGGTTCATGGGGTTTGAAATGAAACAAGAGAAAGACGTTTTGGGATTGAT
TCCGAGTAAGACTAAAGGTAAAGCTAGCAGCTCTAACTCTAGTTCTGTTAATTCGCCTCA
TAATAAAAACAAGAAGAAAAAGAAGGATAATAAGAAGAAGGTGGTGATGACATGGCGCCG
GAAGAAGACTGATTCTCGGGCAGAAGAGATAACTGCGGTTCGGCAGCTGTTGCTTACTTG
CAAGGAAGTGTTCTCCAAGGGCGGTCCTGGAGTTGTTCCTTCTGAAGATAAAATCCAACA
GCTACGAGGAGTTCTTGAGGATGTCGGATTAACTCCGACCATGCCGTTTTTCCGACCAAT
CCCCGGACCGAGTGATGGGTCTTCACCACGGATAACGTACCTGCCTCTACACGAATGTGA
ACAATTTTCGATTGCGATTTTCTGTTTACCGCCTTCTGGTGCCATTCCTCTTCATAACCA
TCCAGGGATGACCGTTTTTAGCAAGCTTCTCTTTGGTACAATGCACATCAAGTCGTATGA
TTGGGTGGTTGATGCTCCATTGAGAGATCCGAAAACGCGGCTAG

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1FI32JQ 679 0 0
GATTAACTCCGACCATGCCGTTTT*CCGACCAATCCCCGGACCGAGTGATGGGTCTTCAC
CACGGATAACGTACCTGCCTCTACACGAATGTGAACAATTTTCGATTGCGATTTTCTGTT
TACCGCCTTCTGGTGCCATTCCTCTTCATAACCATCCAGGGATGACCGTTTTTAGCAAGC
TTCTCTTTGGTACAATGCACATCAAGTCGTATGATTGGGTGGTTGATGCTCCATTGAGAG
ATCCGAAAACGCGGCTAGCAAAATTGAAGATGGACTCAACGTTAACCGCACCATGCAACA
CCTCCATCTTGTACCCGGAAGATGGAGGGAACATGCATCGGTTCACAGCGAAAACAGCGT
GTGCGGTGCTAGATGTGCTTGGCCCTCCTTACTGCAATGCAGAAGGCAGGCATTGCACTT
ATTTCCTAGAGTTCCCTTTGGGCAAGTTTTCATTGGAGGAAGACGACGTTTTGAGAGGTC
AAGTGGAGAAAGAAGGTCGTGCCTGGCTGCAAGAAAGAGATGATAACCCAGAGGATCATA
ACGTAGTTGGAGCGCTATACGGAGGTCCAAAGGTTGAGGACTAAGGGCTTTTTATCGAGT
TTTCATTGGGTTTACCTCATAGGATAAATCTATAGGTTCACCAACCAATATAACACAGTT
ATTTCAGATTCGAAATTTT

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

CO CL6080Contig1 1071 2 12 U
CTGGGTTATACAAACATGTCTTTCTTGGTTTGCAGAGAGAGGGAGAGAGAGAAAATGGTG
AAGAAGAGTTACCCGGAAGTGGAGGAAGATTACAAGAAAGCTGTTAAGAGATGCAAGAGA
AAGCTCCGTGGTCTTATTGCGGAGAAGCACTGTGCTCCCATCGTTCTCCGTCTTGCATGG
CACTCGGCGGGGACATTTGATGTGAAGACGAAGACGGGAGGACCGTTTGGGACGATAAGG
ATTCCACAAGAGCTAGCTCATGATGCTAACAAAGGTCTTGATATTGCTGTTAGGCTTCTT
GAGCCTATCAAAGAGTTGTTCCCCATCTTGTCTTACGCTGATTTTTACCAGCTAGCTGGA
GTTGTTGCTGTTGAGATCACTGGAGGACCCGAGATTAGATTTCATCCTGGTAGAGTGGAC
AAAGTTATGCCAGCTCCTGATGGTCGTCTACCTCAGCCACCAAAGGCGTGGATCATCTGA
GAGAGATATTTGGTCGGATGGGACTAAATGACAAAGATATCGTTGCATTGTCTGGTGGAC
ACACCTTGGGTCGGTGCCACAAGGAACGCTCCGGATTCGAGGGGCCATGGACACAGAATC
CTCTCATTTTCGACAACTCTTATTTCAAAGAGATACTAAGCGGAGAGAAAGAAGGACTTC
TTCAACTTCCAACCGACAAGGCTCTCCTCGAGGATCCTCTCTTTCGTCCTCTCGTTGAGA
GATATGCTGCAGATGAGGATGCCTTCTTCGAAGACTATGCTAAAGCTCATCTCAAGTTGT
CAGAACTCGGGTTTTCTGACATGGAGTATGTGGAAGCTGGTGGTGTCTTATGTAGGCCTG
GGCACGGATCGGATATTCGGGTTTTTGAAGGTATTTGTGATTTGCTTCGAATGTTACGGA
TATCTGATTTTTCGATTTGCTTTGCTTCGGAAAAATACGGATATTCGGAAAAACGGATAT
CCGGAAAATAAATAGATATTTGCGGATATTCGCGGATACTTACGGATCTCTCATTTGTTT
TGATTAATACAAATAATCTTAAAAGTTTGATACAAATTTGTTTTGTAAAAT


BQ
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AF RS1DX16TF U 1
AF RS1DX16JQ C 348
BS 1 680 RS1DX16TF
BS 681 681 RS1DX16JQ
BS 682 737 RS1DX16TF
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BS 776 784 RS1DX16TF
BS 785 1071 RS1DX16JQ

RD RS1DX16TF 796 0 0
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AAGAAGAGTTACCCGGAAGTGGAGGAAGATTACAAGAAAGCTGTTAAGAGATGCAAGAGA
AAGCTCCGTGGTCTTATTGCGGAGAAGCACTGTGCTCCCATCGTTCTCCGTCTTGCATGG
CACTCGGCGGGGACATTTGATGTGAAGACGAAGACGGGAGGACCGTTTGGGACGATAAGG
ATTCCACAAGAGCTAGCTCATGATGCTAACAAAGGTCTTGATATTGCTGTTAGGCTTCTT
GAGCCTATCAAAGAGTTGTTCCCCATCTTGTCTTACGCTGATTTTTACCAGCTAGCTGGA
GTTGTTGCTGTTGAGATCACTGGAGGACCCGAGATTAGATTTCATCCTGGTAGAGTGGAC
AAAGTTATGCCAGCTCCTGATGGTCGTCTACCTCAGCCACCAAAGGCGTGGATCATCTGA
GAGAGATATTTGGTCGGATGGGACTAAATGACAAAGATATCGTTGCATTGTCTGGTGGAC
ACACCTTGGGTCGGTGCCACAAGGAACGCTCCGGATTCGAGGGGCCATGGACACAGAATC
CTCTCATTTTCGACAACTCTTATTTCAAAGAGATACTAAGCGGAGAGAAAGAAGGACTTC
TTCAACTTCCAACCGACAAG*CTCTCCTCGAGGATCCTCTCTTTCGTCCTCTCGTTGAGA
GATATGCTGCAGATGAG*ATGCCTTCTTCGA*GACTATGCTAA*GCTCATCTCA*GTTGT
CAGA
CTCGGTTTCTGA

QA 1 784 1 784
DS 

RD RS1DX16JQ 724 0 0
CCAGCTAGCTGGAGTTGTTGCTGTTGAGATCACTGGAGGACCCGAGATTAGATTTCATCC
TGGTAGAGTGGACAAAGTTATGCCAGCTCCTGATGGTCGTCTACCTCAGCCACCAAAGGC
GTGGATCATCTGAGAGAGATATTTGGTCGGATGGGACTAAATGACAAAGATATCGTTGCA
TTGTCTGGTGGACACACCTTGGGTCGGTGCCACAAGGAACGCTCCGGATTCGAGGGGCCA
TGGACACAGAATCCTCTCATTTTCGACAACTCTTATTTCAAAGAGATACTAAGCGGAGAG
AAAGAAGGACTTCTTCAACTTCCAACCGACAAGGCTCTCCTCGAGGATCCTCTCTTTCGT
CCTCTCGTTGAGAGATATGCTGCAGATGAGGATGCCTTCTTCGAAGACTATGCTAAAGCT
CATCTCAAGTTGTCAGAACTCGGGTTTTCTGACATGGAGTATGTGGAAGCTGGTGGTGTC
TTATGTAGGCCTGGGCACGGATCGGATATTCGGGTTTTTGAAGGTATTTGTGATTTGCTT
CGAATGTTACGGATATCTGATTTTTCGATTTGCTTTGCTTCGGAAAAATACGGATATTCG
GAAAAACGGATATCCGGAAAATAAATAGATATTTGCGGATATTCGCGGATACTTACGGAT
CTCTCATTTGTTTTGATTAATACAAATAATCTTAAAAGTTTGATACAAATTTGTTTTGTA
AAAT

QA 1 724 1 724
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL6083Contig1 943 2 4 U
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GGTCTTCCACACAAGGATGTGAAGATCATGTGCATAAAGTTTGCAGAGCTGGAGAGGAGT
CTGGGAGAGATTGACCGTTCTCGTGCGGTCTACAAGTATGCCTCTCAGTATGCTGATCCA
AGATCGGACCCGGACTTCTGGAACAACTGGCACGAGTTTGAGGTGTTGCATGGGAATGAA
TACACGTATAGAGAGATGCTTAGGATCAAGAGAAGTGTCTCCGCTAGTTACAGTCAGACT
CATTTCATTCTGCCAGAGAACATGATGCTAAAGGACAAGATAGATGTGGAGGAGGCGAAA
GACGAGCTTAAGAAAGCGGGTTTTGATGAAATGGCGGCTCTGGAGAGGCAGCTGATGGCT
CCAATGTCTACCACGGTTACATCAAAAGATGGTGGAAGGAGAGTTGGGTTTGTGAGCGCA
GGAGTCATCGCACAGTCGGGTGAGAATGCAGGGAAACCTGTGACAGGGAATGGGGAAGAT
ATCGAGCTTCCAGATGAGAGTGATGAAGAGGAGTCTGATGGAGAAGACAATGTAGAGATT
GCTCAGAAAGAAGTCCCTGCTGCTGTGTTTGGAGGACTTGCCAGAAAGAGAGAGGAAGAC
GGCAAAGAAGCTGAGGAAGACGGTGCCGGCAAGGCTCTGGGTGCGCTAGAGAGGATAAAG
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GATTTGGAATTGTAATATCCAGAACAGGATCTTGGGAGTGTCATGAGAATTTTTTGTACT
TTTGCTTGTCTCAGTTCCACCATGTTTTTAGTTTACGGCAGAGCTCTCTGTACTCTTTTT
TTTTTTTAATTTCCTTGGTCTTAATCAGAGTAACATTTTCTAT


BQ
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AF RS1BC83TF U 1
AF RS1BC83JQ C 246
BS 1 615 RS1BC83TF
BS 616 616 RS1BC83JQ
BS 617 671 RS1BC83TF
BS 672 943 RS1BC83JQ

RD RS1BC83TF 671 0 0
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GGTCTTCCACACAAGGATGTGAAGATCATGTGCATAAAGTTTGCAGAGCTGGAGAGGAGT
CTGGGAGAGATTGACCGTTCTCGTGCGGTCTACAAGTATGCCTCTCAGTATGCTGATCCA
AGATCGGACCCGGACTTCTGGAACAACTGGCACGAGTTTGAGGTGTTGCATGGGAATGAA
TACACGTATAGAGAGATGCTTAGGATCAAGAGAAGTGTCTCCGCTAGTTACAGTCAGACT
CATTTCATTCTGCCAGAGAACATGATGCTAAAGGACAAGATAGATGTGGAGGAGGCGAAA
GACGAGCTTAAGAAAGCGGGTTTTGATGAAATGGCGGCTCTGGAGAGGCAGCTGATGGCT
CCAATGTCTACCACGGTTACATCAAAAGATGGTGGAAGGAGAGTTGGGTTTGTGAGCGCA
GGAGTCATCGCACAGTCGGGTGAGAATGCAGGGAAACCTGTGACAGGGAATGGGGAAGAT
ATCGAGCTTCCAGATGAGAGTGATGAAGAGGAGTCTGATGGAGAAGACAATGTAGAGATT
GCTCAGAAAGAAGTCTCTGCTGCTGTGTTTGGAGGACTTGCCAGAAAGAGAGAGGAAGAC
GGCAAAGAAGC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1BC83JQ 698 0 0
GTATAGAGAGATGCTTAGGATCAAGAGAAGTGTCTCCGCTAGTTACAGTCAGACTCATTT
CATTCTGCCAGAGAACATGATGCTAAAGGACAAGATAGATGTGGAGGAGGCGAAAGACGA
GCTTAAGAAAGCGGGTTTTGATGAAATGGCGGCTCTGGAGAGGCAGCTGATGGCTCCAAT
GTCTACCACGGTTACATCAAAAGATGGTGGAAGGAGAGTTGGGTTTGTGAGCGCAGGAGT
CATCGCACAGTCGGGTGAGAATGCAGGGAAACCTGTGACAGGGAATGGGGAAGATATCGA
GCTTCCAGATGAGAGTGATGAAGAGGAGTTTGATGGAGAAGACAATGTAGAGATTGCTCA
GAAAGAAGTCCCTGCTGCTGTGTTTGGAGGACTTGCCAGAAAGAGAGAGGAAGACGGCAA
AGAAGCTGAGGAAGACGGTGCCGGCAAGGCTCTGGGTGCGCTAGAGAGGATAAAGAGACA
GAAGCTAGCTCAGTGAATAAAAATCCTGCAAGACAAATATGACTCTTGTGCTACAGATTT
GGAATTGTAATATCCAGAACAGGATCTTGGGAGTGTCATGAGAATTTTTTGTACTTTTGC
TTGTCTCAGTTCCACCATGTTTTTAGTTTACGGCAGAGCTCTCTGTACTCTTTTTTTTTT
TTAATTTCCTTGGTCTTAATCAGAGTAACATTTTCTAT

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL6084Contig1 1171 2 6 U
GGTTCCCGTGAAAATTTCCAAATAGAGAGAGAGAGAAAAAAGCCTTCCTCCATGATCACA
CAGATCACGTTGATCGAACTCCGGTGAGCACCTCAAAAAACCCCTTAGCTTCAATTCCCC
TCAGATCAAAACCAGATTCCTAGGGTTTCATCAATTCTCAGATTCTAATTCGTCTACATA
GCTCCTAGCTTCATTATCGGTGATCCATGGCGGCGTGTAATTAGAACACAAAGTTCCAAA
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GGATCTTCAATACCCTTTGTGCCCTAATCCTCTTCCTCTTCTTCTTTGATCTCAAAAACC
CTTTTGCTAAAGAATCAATCTTTCGTTGATGGGTCTACTCCTCCCTCCTCGTAGGCACAT
GATTGAAACCTACTCTGGTGATACTACTGCACTCTGCTCTGGTTTACACCAACACATCGG
TTACACTGACCAATGCCAGTTCTTGAAATCCAACCCTCTCTGTTATCCCGACAGCTTCTT
CGACTACCTTAGCTTCTTCTACTGCACCTGCCAACACTTCAAGATCTTGGGTTACATCGC
CTTAGGCGTCTGGCTCGTTGCTCTGTTCTACCTCCTCGGTAACACAGCCGCTGATTACTT
CTGTCCTTCGCTCGAGAAGCTCTCTAAGCTTCTCCGTTTGCCTCCAACTGTCGCTGGCGT
CACTCTGCTTCCCCTTGGTAACGGAGCTCCCGGTGTGCAGATCGCGTTGTCAGGTTGCTA
CGCAGGTCCTATGTTCAACACACTTGTTGGGTTAGGTGTGTCGATGCTTCTTGGTGCTTG
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CAGTTCTGCCATGGGGTTCATACCTTGGGCTGCTTGAAAGATTTAAGATTGTAATCAGCT
TATTGTATACAGATCATTCTAGTTAGAGATAGCCAACACTGGTTTCTGAATAAAATCTTG
TTTGTTGTATTATGTTGATTATATACTGATA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AO42TFB U 1
AF RS1AO42JQ C 339
BS 1 364 RS1AO42TFB
BS 365 365 RS1AO42JQ
BS 366 404 RS1AO42TFB
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BS 406 769 RS1AO42TFB
BS 770 1171 RS1AO42JQ

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CGACTACCTTAGCTTCTTCTACTGCACCTGCCAACACTTCAAGATCTTGGGTTACATCGC
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CACTCTGCTTCCCCTTGGTAACGGAGCTCCCGGTGTGCAGATCGCGTTG

QA 1 769 1 769
DS 

RD RS1AO42JQ 833 0 0
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CTGGTTTACACCAACACATCGGTTACACTGACCAATGCCAGTTCTTGAAATCCAACCCTC
TCTGTTATCCCGACAGCTTCTTCGACTACCTTAGCTTCTTCTACTGCACCTGCCAACACT
TCAAGATCTTGGGTTACATCGCCTTAGGCGTCTGGCTCGTTGCTCTGTTCTACCTCCTCG
GTAACACAGCCGCTGATTACTTCTGTCCTTCGCTCGAGAAGCTCTTTAAGCTTCTCCGTT
TGCCTCCAACTGTCGCTGGCGTCACTCTGCTTCCCCTTGGTAACGGAGCTCCCGGTGTGC
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CTGGTTTCTGAATAAAATCTTGTTTGTTGTATTATGTTGATTATATACTGATA

QA 1 833 1 833
DS 



AS 1 2

CO CL6085Contig1 959 2 4 U
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AAATTTGGAGATGAATCCTTAACTATTCAAACACAAAAAAAAATAGTATACTAATGCTAA
GGACTCCAATGGTGGTAACACCATTGGAGATGCTCTTGGGGACTAGCACTAAGGATTGGC
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AGAGTATACAAAAACTCGAGTAAGCTTTCTCGAGCAGGAGTCTCATTCCAGGATAGGCTG
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GAAGATATTCGAAGGTTAGAGTCTGCTCCTCCGCTCACTACGCTGTCTCCTTTCCACCAG
TCCGCACATAAAACCTTATCCTTGTGTGTGTCGATAATCGACAAAGGCCAAGCGGTTCTG
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TCGTGCCATTTACACGCGGATATCCATGATGAGTGTGAAGAGAATTGAAACACGGGAGCG
GATGTTCCAGGCTTACGAGGATCCCATACTCTAAGGACTGGATCTGAACCTCCAGCAGCT
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GAATAAATAACATCATGCTCTGGCCAAACAACTGATGAGACGCACTGTGTGTGTCCAACA
AACGTAGTCTCCGCTTCTCCCTCTAACTGAGTTTCCTCGGCCTGATTATTCCCTTTTCT


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AF RS1FK68JQ U 1
AF RS1FG42JQ U 246
BS 1 341 RS1FK68JQ
BS 342 342 RS1FG42JQ
BS 343 675 RS1FK68JQ
BS 676 959 RS1FG42JQ

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AAATTTGGAGATGAATCCTTAACTATTCAAACACAAAAAAAAATAGTATACTAATGCTAA
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TAACATCCCCCATTGCAGCTGCTCTAAGTCACTCCAGAATTAGAACATTTCAAAATATGA
AGAGTATACAAAAACTCGAGTAAGCTTTCTCGAGCAGGAGTCTCATTCCAGGATAGGCTG
TCCCTGATCCATATGGGACTGTAACAGAAAATCTTGGTGTTTCTGAGTATAACATCACAT
AAGACAACATATAGTCGACTCAAACCCTTTTTTTTAATTTTCTAAGAAATTGAGATTCCG
GAAGATATTCGAAGGTTAGAGTCTGCTCCTCCGCTCACTACGCTGTCTCCTTTCCACCAG
TCCGCACATAAAACCTTATCCTTGTGTGTGTCGATAATCGACAAAGGCCAAGCGGTTCTG
AGATCCCAGAGCATGATTTTGCCATCATAGGAAGCTGAGAGCAAGTGAAACCAAGAGCTT
TCGTGCCATTTACACGCGGATATCCATGATGAGTGTGAAGAGAATTGAAACACGGGAGCG
GATGTTCCAGGCTTA

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1FG42JQ 714 0 0
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GATCCATATGGGACTGTAACAGAGAATCTTGGTGTTCCTGAGTATAACATCACATAAGAC
AACATATAGTCGACTCAGACCCTTTTTTTTAATTTTCTAAGAAATTGAGATTCCGGAAGA
TATTCGAAGGTTAGAGTCTGCTCCTCCGCTCACTACGCTGTCTCCTTTCCACCAGTCCGC
ACATAAAACCTTATCCTTGTGTGTGTCGATAATCGACAAAGGCCAAGCGGTTCTGAGATC
CCAGAGCATGATTTTGCCATCATAGGAAGCTGAGAGCAAGTGAAACCAAGAGCTTTCGTG
CCATTTACACGCGGATATCCATGATGAGTGTGAAGAGAATTGAAACACGGGAGCGGATGT
TCCAGGCTTACGAGGATCCCATACTCTAAGGACTGGATCTGAACCTCCAGCAGCTACAAG
TGCTGAACCTTCACCGCCAACATCGACCGTGTTGAGAGCTTTTCCGCAGTACAAGTTCAA
AGTATCTTTCCCAGTCGGAACATCCCATCTCCTTACAGAATGGCCCCATGAACAAGAATA
AATAACATCATGCTCTGGCCAAACAACTGATGAGACGCACTGTGTGTGTCCAACAAACGT
AGTCTCCGCTTCTCCCTCTAACTGAGTTTCCTCGGCCTGATTATTCCCTTTTCT

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL6086Contig1 1210 2 2 U
GGATCGAAATGTACTCAAACTGTGGGCTGATGAACGAAGCCTCGAGTGTTTTCGAGGAAA
TCCCTGAGAAGGATCTCGAGACTTGGTGCGTTATGATCAGATGTTTGGCGAAGAACGGTC
TAGGAGAAGACGCTGTTGATATGTTTACTCGTTTCAAAACCGAAGGATACAAACCGGACG
GTCGACTGTTCAGAGGAGTGTTCTACGCTTGCGGGTTGCTAGGTGATGTTGATGAAGGGT
TGTCGCATTTTGTGTCGATGTCCAGAGACTACGGCATCGTCCCTACCGTGGAGGACTATG
TAAGCGTCGTTGAGATGTTGGCCTTGCCAGGGTTGTTAGACGAGGCTTTAGCCTTTGTTG
AGAGGATGCCCATGGAGCCAAGTGCTGATGTGTGGGAAACGTTGATGAACCTTTCTCGAG
TACATGGGGATGTAGAGCTCGGAGATCGGTGTGCTGAGATTGTCGAGGAGTTGGATCCTA
CACGATTGGACCAACAGTCGAGGGACGGTTATCTTCCGGTTAAGGCATCGGATGTTGAGA
AAGCGATCCTGAAGAAAAGATCAGGGATTCATGGTCTTGCTCGAATCGCAACTAGTAGAT
CGCATGAGTATAGAGCAGGGGATACCAATCTGCCTGAGAACGATGAGCTTTTACAGCTGT
TGAGAAACTTAAGGACGCATATGCTGGAGAGGGGGTATGTTTGCCAAACGAAGCTTTCTT
TGCACGATGTAGACGAAGAGAGTAAAGAGAATGCACTTCTTGCTCATAGCGAGAGAATAG
CTTTTGCTCGTGCTTTTCTCAACACTGCGCCTCGTCATCAGTTCACGATCATGAAAAACC
TTCGTGTGTGTGTTGATTGTCATAACGCCTTCAAGATTATGGCGGATATAGTCGGTAGGA
CAGTGATCATGCGAGATGCAAAGAGATTCCACCATCTCAAAGATGGAACATGCAGCTGCA
ATGACTATTGGTGATTTAACGAATAACCTTGAGGTTTGTTTTATGGTGTCTGCGTTCAAA
AGCTCTCTCTTCTTTATAAAATTCTTTAAAACACATTTCCATAATGTCTTGCATCATAAG
CAGCAACTTTCTATCATTGCTGTTGTCATTGATCAATCTCAGATTCTGTTTGTGTTCACG
TTATATGATCAGCTATGTCGTGGATGATGTATACTTGTTCTGGATAATATTATCGACATG
TTTCTGGCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EI85TF U 1
AF RS1EI85JQ C 418
BS 1 667 RS1EI85TF
BS 668 1210 RS1EI85JQ

RD RS1EI85TF 667 0 0
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TCCCTGAGAAGGATCTCGAGACTTGGTGCGTTATGATCAGATGTTTGGCGAAGAACGGTC
TAGGAGAAGACGCTGTTGATATGTTTACTCGTTTCAAAACCGAAGGATACAAACCGGACG
GTCGACTGTTCAGAGGAGTGTTCTACGCTTGCGGGTTGCTAGGTGATGTTGATGAAGGGT
TGTCGCATTTTGTGTCGATGTCCAGAGACTACGGCATCGTCCCTACCGTGGAGGACTATG
TAAGCGTCGTTGAGATGTTGGCCTTGCCAGGGTTGTTAGACGAGGCTTTAGCCTTTGTTG
AGAGGATGCCCATGGAGCCAAGTGCTGATGTGTGGGAAACGTTGATGAACCTTTCTCGAG
TACATGGGGATGTAGAGCTCGGAGATCGGTGTGCTGAGATTGTCGAGGAGTTGGATCCTA
CACGATTGGACCAACAGTCGAGGGACGGTTATCTTCCGGTTAAGGCATCGGATGTTGAGA
AAGCGATCCTGAAGAAAAGATCAGGGATTCATGGTCTTGCTCGAATCGCAACTAGTAGAT
CGCATGAGTATAGAGCAGGGGATACCAATCTGCCTGAGAACGATGAGCTTTTACAGCTGT
TGAGAAA

QA 1 667 1 667
DS 

RD RS1EI85JQ 793 0 0
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AGAAAGCGATCCTGAAGAAAAGATCAGGGATTCATGGTCTTGCTCGAATCGCAACTAGTA
GATCGCATGAGTATAGAGCAGGGGATACCAATCTGCCTGAGAACGATGAGCTTTTACAGC
TGTTGAGAAACTTAAGGACGCATATGCTGGAGAGGGGGTATGTTTGCCAAACGAAGCTTT
CTTTGCACGATGTAGACGAAGAGAGTAAAGAGAATGCACTTCTTGCTCATAGCGAGAGAA
TAGCTTTTGCTCGTGCTTTTCTCAACACTGCGCCTCGTCATCAGTTCACGATCATGAAAA
ACCTTCGTGTGTGTGTTGATTGTCATAACGCCTTCAAGATTATGGCGGATATAGTCGGTA
GGACAGTGATCATGCGAGATGCAAAGAGATTCCACCATCTCAAAGATGGAACATGCAGCT
GCAATGACTATTGGTGATTTAACGAATAACCTTGAGGTTTGTTTTATGGTGTCTGCGTTC
AAAAGCTCTCTCTTCTTTATAAAATTCTTTAAAACACATTTCCATAATGTCTTGCATCAT
AAGCAGCAACTTTCTATCATTGCTGTTGTCATTGATCAATCTCAGATTCTGTTTGTGTTC
ACGTTATATGATCAGCTATGTCGTGGATGATGTATACTTGTTCTGGATAATATTATCGAC
ATGTTTCTGGCCT

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

CO CL6087Contig1 1012 2 14 U
GGGACCTAATCCTCCTTCAAATTCTTCTGTCGAAATCTGATTCCTCTCTTGTGCTCTTCC
TTCTTCACAGGCCTGTGTGTTGCCTAGAAGATATTAAAGCAGTGAAGTTCGATTCATATG
CAATTAAACATCAGTTTTGACAGAGTAAGATGGGATCTGGTGAGTGGCACGTTGAGAAGA
GGTCTACTCTAAGGAATGATTCGTTTGTTAAGGAGTACGGTTCAGTTCCGGAGACTGGTT
GTCTTTCCGTCGTCGTCCTTGGCGCTTCAGGTGATCTTGCCAAGAAGAAGACTTTCCCTG
CCCTTTTCAACCTTTACCGCCAGGGGTTTCTCAATCCAGATGAAGTTCACATCTTTGGGT
ATGCCAGGACTAATCTCTCTGATGAACAGCTTAGAGATCGGATCCGTGGATACCTTGTTG
ATGAGAAGAACGCAGAAGCCTTGTCAAAGTTTCTACAGCTGATCAAGTATGTGAGTGGCC
CTTATGACTCTGAGGAAGGGTTCCAGAGACTAGACAGGGCAATTTCCGAGCACGAAATCT
CCAAAAATAGCTCTCATGGATCCTCGAGGAGACTCTTTTACCTAGCACTTCCACCCTCTG
TTTATCCTTCTGTACGCAAGATGATCAAGACATGCTGCATGAACAAATCTGACCTTGGTG
GATGGACACGGATTGTTGTTGAGAAGCCATTTGGAAAGGACCTGGAATCTGCAGAGCAAC
TCAGTTCTCAGATCGGAGAGTTGTTTGATGAATCGCAGATCTATCGTATTGATCATTATC
TTGGCAAAGAATTGGTCCAAGACATGTTGGTTCTCCGATTTGCCAATCGCTTTTTCCTGC
CCCTTTGGAACCGTGACAATATCGAGAACGTGCAGATTGTTTTCAGGGAAGATTTTGGAA
CTGACGGGCGGGGTGGATATTTCGATGATACGAATCATCCGTGATATTATTCAAACCATC
TGCTCCAGGTTCTTTGTCTTGTGCATGGAGAAACCATATCTCTAAACCCGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1G405TF U 1
AF RS1DQ43TF U 229
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ATGAGAAGAACGCAGAAGCCTTGTCAAAGTTTCTACTGCTGATCAAGTATGTGAGTGGCC
CTTATGACTCTGAGGAAGGGTTCCAGAGACTAGACAGGGCAATTTCCGAGCACGAAATCT
CCAAAAATAGCTCTCATGGATCCTCGAGGAGACTTTTTTACCTAGCACTTCCACCCTCTG
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GATGGACACGGATTGTTGTTGAG

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DS 

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G
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ATACCTTGTTGATGAGAAGAACGCAGAAGCCTTGTCAAAGTTTCTACAGCTGATCAAGTA
TGTGAGTGGCCCTTATGACTCTGAGGAAGGGTTCCAGAGACTAGACAGGGCTATTTCCGA
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TCCACCCTCTGTTTATCCTTCTGTACGCAAGATGATCAAGACGTGCTGCATGAACAAATC
TGACCTTGGTGGATGGACACGGATTGTTGTTGAGAAGCCATTTGGAAAGGACCTGGAATC
TGCAGAGCAACTCAGTTCTCAGATCGGAGAGTTGTTTGATGAATCGCAGATCTATCGTAT
TGATCATTATCTTGGCAAAGAATTGGTCCAAGACATGTTGGTTCTCCGATTTGCCAATCG
CTTTTTCCTGCCCCTTTGGAACCGTGACAATATCGAGAACGTGCAGATTGTTTTCAGGGA
AGATTTTGGAACTGACGGGCGGGGTGGATATTTCGATGATACGAATCATCCGTGATATTA
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GAG

QA 2 784 2 784
DS 



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ATTTATAAATTTCAGAGATTTCTGTGATGG


BQ
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AF RS1DG25JQ C 1
AF RS1DG25TF U 1
BS 1 270 RS1DG25TF

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ACCGGTGTTTAATCCTGGATTTATTAAATTAAAGCCAAACCAAACTGTAATAATTTTTAT
ATTTATAAATTTCAGAGATTTCTGTGATGG

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DS 

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TAATCTTGTGACAGTTTGTTGATTCATTGGTGAACATCTCAACCTCTCTCAGCCTTTTTG
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ACCGGTGTTTAATCCTGGATTTATTAAATTAAAGCCAAACCAAACTGTAATAATTCTTAT
ATTTATAAATTTCAGAGATTTCTGTGATGG

QA 1 270 1 270
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL6091Contig1 1033 2 2 U
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TTTTTTGCGCGTGTCCCATTCTCTTCTCCATAGTTCTCTCGTTAAGTCAAAAAAAAAGAT
GGAGGTCAAGTTGTGGAACGATAAGCGCGAGAGAGAAATGTACGAGAACTTCGCCGAGCT
CTACGCCATCATCAAAGCCACCGAGAAGCTCGAGAAGGCTTACATCCGCGACCTCATCTC
CCCTTCAGAGTACGAGACCGAGTGCCAGAAGCTCATCGTCCACTTCAAGACTCTCTCCGC
AACGCTCAGGGACCTGGTGCCTAGCATCGAGAGGTTCGCCGAGACGTACAAGATGGACTG
CTCGGCCGCTGTGTACCGGCTCGTGACCTCCGGTGTTCCGGCTACTGTGGAGCACCGAGC
TGCTGCGTTGGCTTCTACTTCCAGCTCTGCTTCCGTTGTCGCCGAGTGTGTTCAGAACTT
CATCACTTCCATGGATTCTCTCAAGCTCAACATGGTGGCGGTTGATCAGGTGTATCCGTT
GCTGTCTGATCTCTCTGCTTCGCTTCAGAAACTTAGCATTTTGCCGCCGGATTTTGAAGG
GAAGATTAAGATGAAAGAGTGGCTTTCGAGGTTGTCTAAGATGGGAGCTTCCGATGAGCT
CACTGAGCAGCAGGCTAGGCAGCTTCACTTTGATCTCGAGTCTTCTTATAACTCCTTCAT
GGCTGCTTTGCCTAACGCTGGTAACTAACCCAATGTGATGATGGTTGCGCTTGGTTACTT
TTGTTTAGTTACTACTTTGGCTTTAGGATAATGATTTTGGTTTTCAAGACTGTTTGCTGC
TGCTACACACCCTGGAGATGAATGTTGTGTAAGACCTTTCTTTTCTTGTGTAAAAGATCA
TGCCAAACCAGAGCATTGATTTCTTTCTGAATTGTATGAATCTAAACTCTACTTTGTTGC
TCTTTTGGCTCTTTCTTGTTAAAATGTTTGTTGTGTCTTTAGTTTCTACTATCTAAGACG
ATTTGCTCATTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GF38TF U 1
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CTACGCCATCATCAAAGCCACCGAGAAGCTCGAGAAGGCTTACATCCGCGACCTCATCTC
CCCTTCAGAGTACGAGACCGAGTGCCAGAAGCTCATCGTCCACTTCAAGACTCTCTCCGC
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CTCGGCCGCTGTGTACCGGCTCGTGACCTCCGGTGTTCCGGCTACTGTGGAGCACCGAGC
TGCTGCGTTGGCTTCTACTTCCAGCTCTGCTTCCGTTGTCGCCGAGTGTGTTCAGAACTT
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GCTGTCTGATCTCTCTGCTTCGCTTCAGAAACTTAGCATTTTGCCGCCGGATTTTGAAGG
GAAGATTAAGATGAAAGAGTGGCTTTCGAGGTTGTCTAAGATGGGAGCTTCCGATGAGCT
CACTGAGCAGCA

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ATTAAGATGAAAGAGTGGCTTTCGAGGTTGTCTAAGATGGGAGCTTCCGATGAGCTCACT
GAGCAGCAGGCTAGGCAGCTTCACTTTGATCTCGAGTCTTCTTATAACTCCTTCATGGCT
GCTTTGCCTAACGCTGGTAACTAACCCAATGTGATGATGGTTGCGCTTGGTTACTTTTGT
TTAGTTACTACTTTGGCTTTAGGATAATGATTTTGGTTTTCAAGACTGTTTGCTGCTGCT
ACACACCCTGGAGATGAATGTTGTGTAAGACCTTTCTTTTCTTGTGTAAAAGATCATGCC
AAACCAGAGCATTGATTTCTTTCTGAATTGTATGAATCTAAACTCTACTTTGTTGCTCTT
TTGGCTCTTTCTTGTTAAAATGTTTGTTGTGTCTTTAGTTTCTACTATCTAAGACGATTT
GCTCATTCC

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 2

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TCCAACATCTATTTCTTCAACCAACAAACTGTCTGCCGAAGGGTGTTTCCATGCTTTGCG
AATCAGACCGACCTGAATATTTAGCAAACTGACACTAAGCCCTGTCTCTTTGTTAGCTGG
TTCTGCTTCAGCAGGCTTCTTCTTTTCTTTCTTGGCATCCTTCTCTTTTGTAGCCTTTTT
CTTTGCCTCCTCAGGCTCAGTTTTCTTTGTGCTAGGCTGAGCTTCTGACTTGTCAACAGG
CTTTGGACTCTCTGCAGTTTTCTTTGTATTGGCATTTGCATCCACCTTGACAACACTTTT
TGATACCTCAAAGTCAAACTGTGGTAACTTCACAGGAATTGGTCCAAACAATGTGGACAA
CTCTTCTTTAATCTGGATGTAGTTCATCCACCTTATGACATGTGGGATCTTCTCCTTGTC
TGAACCAGAGAGACCAACCACTGAAGAATGCAAAGCTGCAAAGACAGCAACATCAGCTGC
AGATGGCGTCAATCCATTTCCCAAGACCACCGCCTTGACGGCTAACTCTGCATTCAACTT
TTCAAGAGCTGCAAAGCAATCCTTTGAATCTGCTGGGACACCTTCCGCAAATTCCAACCA
CTTTAAGACCTCCGCGTTGTTTTGTGCAGCAGCAGCAGATGCCTTCAAAACATTAGCATA
CATCGTCTTGATATCATCCTCACCAGATCCTCCCAGACCAATAGGGTCCACGGAGAAGTG
TTTACAGAGAGCTGATAGGATCATCTGCTTCCTCTTTGGATCCATCTTCAGTTTCTTTTC
TTTCTTTTGGGGCTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AH22JQ U 1
AF RS1A941TF C 257
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BS 282 637 RS1AH22JQ
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AATCAGACCGACCTGAATATTTAGCAAACTGACACTAAGCTCTGTCTCTTTGTTAGCTGG
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CTTTGCCTCCTCAGGCTCAGTTTTCTTTGTGCTAGGCTGAGCTTCTGACTTGTCAACAGG
CTTTGGACTCTCTGCAGTTTTCTTTGTATTGGCATTTGCATCCACCTTGACAACACTTTT
TGATACCTCAAAGTCAAACTGTGGTAACTTCACAGGAATTGGTCCAAACAATGTGGACAA
CTCTTCTTTAATCTGGATGTAGTTCATCCACCTTATGACATGTGGGATCTTCTCCTTGTC
TGAACCAGAGAGACCAACCACTGAAGAATGCAAAGCT

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DS 

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AACTGTGGTAACTTCACAGGAATTGGTCCAAACAATGTGGACAACTCTTCTTTAATCTGG
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CAATCCTTTGAATCTGCTGGGACACCTTCCGCAAATTCCAACCACTTTAAGACCTCCGCG
TTGTTTTGTGCAGCAGCAGCAGATGCCTTCAAAACATTAGCATACATCGTCTTGATATCA
TCCTCACCAGATCCTCCCAGACCAATAGGGTCCACGGAGAAGTGTTTACAGAGAGCTGAT
AGGATCATCTGCTTCCTCTTTGGATCCATCTTCAGTTTCTTTTCTTTCTTTTGGGGCTCT
CC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

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TGTCTTCTACAGGAACGAGTCGAGCTCGGCTGGCTCCTCCATGACTGATAACTCTGGCAT
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GATGAACAGCGTCGAAGGTGACGCCATCTCCACCATCCATGTGACCCCTGAAGACGGATT
CAGCTACGCTAGCTTTGAGGCTGTGGGGTACGATTTCACTACCATGGACTTGAGCCACCT
CGTCTCGAAGGTGCTGACTTGCTTCAAGCCAAAGCAATTCTCGGTAGCTGTACACTCTAG
CGCGGCGCATAAGAGCTACGACCCTGGTCTCTCTGTTGACCTGGAGGACTACGGATGCAA
GGAGTCGACGGTGGAGGCTCTAGGGGAAGAGAGAGGAACGGTTATGTATCAGAGGTTTGA
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CAGTAGCTGCACTAGTGAGGACGAGAAAGAAGAGGGAATCTAAAAGCTTTTTTAGTTTTG
TTGTTGTTTCGAATAATAATGTCGTGCGATTATGTTTTTTCTCCTTAAAAGCCTTTGATA
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TAAGCCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F022TF U 1
AF RS1F022JQ C 271
BS 1 696 RS1F022TF
BS 697 787 RS1F022JQ

RD RS1F022TF 696 0 0
GGAGACCAAGAAGTGGCATGTCTACTCTGCTTCCTCTGCGAAGAACTACTCCAACGGCGA
GAACAAGAATGTCTACACTCTCGAGATGTGTATGACTGGTCTGGATAAAGACAAGGCGTC
TGTCTTCTACAGGAACGAGTCGAGCTCGGCTGGCTCCTCCATGACTGATAACTCTGGCAT
CAGGAAGATACTTCCTGGATCACAAATCTGCGACTTTGAGTTCGAGCCATGCGGCTACTC
GATGAACAGCGTCGAAGGTGACGCCATCTCCACCATCCATGTGACCCCTGAAGACGGATT
CAGCTACGCTAGCTTTGAGGCTGTGGGGTACGATTTCACTACCATGGACTTGAGCCACCT
CGTCTCGAAGGTGCTGACTTGCTTCAAGCCAAAGCAATTCTCGGTAGCTGTACACTCTAG
CGCGGCGCATAAGAGCTACGACCCTGGTCTCTCTGTTGACCTGGAGGACTACGGATGCAA
GGAGTCGACGGTGGAGGCTCTAGGGGAAGAGAGAGGAACGGTTATGTATCAGAGGTTTGA
GAAGCTGGGAATGTATTGCGGTTCTCCGAGATCTACTTTGAAGTGTGAGTGGAGCAGCAA
CAGTAGCTGCACTAGTGAGGACGAGAAAGAAGAGGGAATCTAAAAGCTTTTTTAGTTTTG
TTGTTGTTTCGAATAATAATGTCGTGCGATTATGTT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RS1F022JQ 517 0 0
CACCATCCATGTGACCCCTGAAGACGGATTCAGCTACGCTAGCTTTGAGGCTGTGGGGTA
CGATTTCACTACCATGGACTTGAGCCACCTCGTCTCGAAGGTGCTGACTTGCTTCAAGCC
AAAGCAATTCTCGGTAGCTGTACACTCTAGCGCGGCGCATAAGAGCTACGACCCTGGTCT
TTCTGTTGACCTGGAGGACTACGGATGCAAGGAGTCGACGGTGGAGGCTCTAGGGGAAGA
GAGAGGAACGGTTATGTATCAGAGGTTTGAGAAGCTGGGAATGTATTGCGGTTCTCCGAG
ATCTACTTTGAAGTGTGAGTGGAGCAGCAACAGTAGCTGCACTAGTGAGGACGAGAAGGA
AGAGGGAATCTAAAAGCTTTTTTAGTTTTGTTGTTGTTTCGAATAATAATGTCGTGCGAT
TATGTTTTTTCTCCTTAAAAGCCTTTGATAAAATTGTGTGTTTGGTCTCTGTGAATTCAG
ATGATCAAGTATTATGAAATTATCTATCAATAAGCCC

QA 1 517 1 517
DS 



AS 1 2

CO CL6094Contig1 410 2 1 U
GGGAAGATAAAATCATTACGATCAAGAAGAAAGATGAGCCCTGTGGGGATCTTGTTTATA
GCGTTTGGAGGGCTTCTGTTGTTCATGTTCCTCTTATGGCTCACTCACTTTCTCTACCAC
AAAGCTAAGAAAGATGGCAAAGAAAGCATCGCCTGTCTGGGCAGTGGTTATGGCGGGGAT
TTCGGTGGTTAAAACCTAGGTGATATATATGCTATTAAAAAAACAAAAAACAAAAAAAAA
ATCATTTAGCGTGTATTAATAACTCCCATCCAATTTTATTTTTTCAGTGTTCTTGTTTTC
AGAGGTCAAAGGTTGTTCTAATTACTTATGCAAATATGTGTATGCATAAAGAACATGTGT
ATTAAACTATGTAAACTTTTTTGTATTCCACCAATAAAAATTTGCTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1EI67TF U 1
AF RS1EI67JQ C 159
BS 1 410 RS1EI67TF

RD RS1EI67TF 410 0 0
GGGAAGATAAAATCATTACGATCAAGAAGAAAGATGAGCCCTGTGGGGATCTTGTTTATA
GCGTTTGGAGGGCTTCTGTTGTTCATGTTCCTCTTATGGCTCACTCACTTTCTCTACCAC
AAAGCTAAGAAAGATGGCAAAGAAAGCATCGCCTGTCTGGGCAGTGGTTATGGCGGGGAT
TTCGGTGGTTAAAACCTAGGTGATATATATGCTATTAAAAAAACAAAAAACAAAAAAAAA
ATCATTTAGCGTGTATTAATAACTCCCATCCAATTTTATTTTTTCAGTGTTCTTGTTTTC
AGAGGTCAAAGGTTGTTCTAATTACTTATGCAAATATGTGTATGCATAAAGAACATGTGT
ATTAAACTATGTAAACTTTTTTGTATTCCACCAATAAAAATTTGCTTGGC

QA 1 410 1 410
DS 

RD RS1EI67JQ 252 0 0
GGGCAGTGGTTATGGCGGGGATTTCGGTGGTTAAAACCTAGGTGATATATATGTTATTAA
AAAAACAAAAAACAAAAAAAAAATCATTTAGCGTGTATTAATAACTCCCATCCAATTTTA
TTTTTTCAGTGTTCTTGTTTTCAGAGGTCAAAGGTTGTTCTAATTACTTATGCAAATATG
TGTATGCATAAAGAACATGTGTATTAAACTATGTAAACTTTTTTGTATTCCACCAATAAA
AATTTGCTTGGC

QA 1 252 1 252
DS 



AS 1 2

CO CL6095Contig1 419 2 1 U
GGGCCCTTGAGAAATACCCTAATTTACAAATTCTCAGGAAGGAGGATCAGGAAACATTTG
GAGAGACTCAAAGGACCGACCGACCATGTATCTTCAGTGCTATATCTACGAAAAGGGCGA
GAAAGTTTACACCACTAAGAAAGAATCACCACTCGGGTTAGCCACTGAATCTGCTCATCC
AGCCCGATTCTCCCCTGATGATAAATACTCAAAGGAGAGAGTTACTTTGAAGAAGCGTTT
CGGTCTCTTACCCATCCAGGGCGCACCTGTCAAGTACTGAAAGGCCTAAAACACTCTGTC
GTCCCTTTGGTTTTTTCATGTTTTGCTGCTACGTTGTTTCTTAATGAAACCGTCTTTGTA
ATTGTATCGTCTCCAAATAGTGGAGTGAACCTTAAAAGAAGCAAGACTTCGAGAGTTAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1C234JQ C 1
AF RS1C234TF U 1
BS 1 419 RS1C234TF

RD RS1C234JQ 419 0 0
GGGCCCTTGAGAAATACCCTAATTTACAAATTCTCAGGAAGGAGGATCAGGAAACATTTG
GAGAGACTCAAAGGACCGACCGACCATGTATCTTCAGTGCTATATCTACGAAAAGGGCGA
GAAAGTTTACACCACTAAGAAAGAATCACCACTCGGGTTAGCCACTGAATCTGCTCATCC
AGCCCGATTCTCCCCTGATGATAAATACTCAAAGGAGAGAGTTACTTTGAAGAAGCGTTT
CGGTCTCTTACCCATCCAGGGCGCACCTGTCAAGTACTGAAAGGCCTAAAACACTCTGTC
GTCCCTTTGGTTTTTTCATGTTTTGCTGCTACGTTGTTTCTTAATGAAACCGTCTTTGTA
ATTGTATCGTCTCCAAATAGTGGAGTGAACCTTAAAAGAAGCAAGACTTCGAGAGTTAT

QA 1 419 1 419
DS 

RD RS1C234TF 419 0 0
GGGCCCTTGAGAAATACCCTAATTTACAAATTCTCAGGAAGGAGGATCAGGAAACATTTG
GAGAGACTCAAAGGACCGACCGACCATGTATCTTCAGTGCTATATCTACGAAAAGGGCGA
GAAAGTTTACACCACTAAGAAAGAATCACCACTCGGGTTAGCCACTGAATCTGCTCATCC
AGCCCGATTCTCCCCTGATGATAAATACTCAAAGGAGAGAGTTACTTTGAAGAAGCGTTT
CGGTCTCTTACCCATCCAGGGCGCACCTGTCAAGTACTGAAAGGCCTAAAACACTCTGTC
GTCCCTTTGGTTTTTTCATGTTTTGCTGCTACGTTGTTTCTTAATGAAACCGTCTTTGTA
ATTGTATCGTCTCCAAATAGTGGAGTGAACCTTAAAAGAAGCAAGACTTCGAGAGTTAT

QA 1 419 1 419
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6097Contig1 248 2 1 U
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GGTTTTACAGAAAGCTCGTTGAGAGAAAAAATGTTTAATGATCTCAAAAGTTTTGATATT
AGATTGATCTTTAAGATTCAGTTAGTAACTGAGATACTCTCGAGTGGTCTTTTGCATTGT
CCTACTTTGTTTACTTGGCTACCTTCAGTTCTATTTTTGTCTACTTAATATACCTGAACT
ATTGAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CX42JQ C 1
AF RS1CX42TF U 1
BS 1 248 RS1CX42TF

RD RS1CX42JQ 248 0 0
GACCAATAATGAATACCAAAAGGTGATGCACGATCTCTGTGAAACTAGCTCTTCAGGATG
GGTTTTACAGAAAGCTCGTTGAGAGAAAAAATGTTTAATGATCTCAAAAGTTTTGATATT
AGATTGATCTTTAAGATTCAGTTAGTAACTGAGATACTCTCGAGTGGTCTTTTGCATTGT
CCTACTTTGTTTACTTGGCTACCTTCAGTTCTATTTTTGTCTACTTAATATACCTGAACT
ATTGAACC

QA 1 248 1 248
DS 

RD RS1CX42TF 248 0 0
GACCAATAATGAATACCAAAAGGTGATGCACGATCTCTGTGAAACTAGCTCTTCAGGATG
GGTTTTACAGAAAGCTCGTTGAGAGAAAAAATGTTTAATGATCTCAAAAGTTTTGATATT
AGATTGATCTTTAAGATTCAGTTAGTAACTGAGATACTCTCGAGTGGTCTTTTGCATTGT
CCTACTTTGTTTACTTGGCTACCTTCAGTTCTATTTTTGTCTACTTAATATACCTGAACT
ATTGAACC

QA 1 248 1 248
DS 



AS 1 2

CO CL6098Contig1 928 2 2 U
GGTCACGCAAACACACACACACATCGCCGCAGGGCCATTTCCATCTCTCTCTCGCAACTC
TCAACTTCGAAACAATGGCTGAACGTGGCGGAGAACGAGGCGCCGAGCGAGGAGGAGACC
GCGGAGGTTTCGGACGAGGCTTCGGAGGAGGCCGTGGCGACAGAGGCGGCCGCGGAGGTC
CTCGTGGCCGTGGAGGAAGACGCGGAGTACCAGATCACCGACCTCCTCGTCGGTCCCACT
TTAAAAGACGAGGTGATGAAGATCATGCCTGTCCAGAAACAGACAAGAGCCGGGCAGAGG
ACCAGGTTCAAGGCCTTTGTCGTTGTCGGAGACACGAACGGGCATGTCGGTTTGGGAGTG
AAATGCTCCAAGGAGGTTGCCACGGCTATTAGAGGTGGGATCATACTGGCGAAGCTGTCT
GTGATTCCGGTGAGGAGAGGGTACTGGGGGAACAAGATTGGGAAGCCTCACACGGTTCCT
TGTAAGGTTACGGGGAAGTGTGGGTCCGTTACGGTGAGGATGGTGCCTGCTCCGAGAGGT
GCTGGGATTGTGGCGGCTAGGGTTCCTAAGAAGGTGCTTCTTTCGCTGGGATTGATGACG
TGTTCACTTCCTCCAGGGGGTCTACCAAGACTCTTGGAAACTTCGTAAAGGCTACATTTG
ATTGCCTCCAGAAGACTTATGGATTCCTGACACCAGAGTTCTGGAAAGAGACGAGCTTTA
AGAAATCACCATACCAAGAGTACACTGATTTGCTCGCCAGTAAGGGAACTACGACCAAAG
TCATCACCGAGGTCGAAGACCAAGCCTCCTAAACAATGTCCCCCCTTGTTTTGTTTTTGG
ATCAACATCCTTTCATGAGTTTATTTTGTTCGAACCTTTAGTATATGTTTGTTGCTGGAT
TGCATCTTTTATATTCCATCATCTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BO35TF U 1
AF RS1BO35JQ C 230
BS 1 647 RS1BO35TF
BS 648 928 RS1BO35JQ

RD RS1BO35TF 647 0 0
GGTCACGCAAACACACACACACATCGCCGCAGGGCCATTTCCATCTCTCTCTCGCAACTC
TCAACTTCGAAACAATGGCTGAACGTGGCGGAGAACGAGGCGCCGAGCGAGGAGGAGACC
GCGGAGGTTTCGGACGAGGCTTCGGAGGAGGCCGTGGCGACAGAGGCGGCCGCGGAGGTC
CTCGTGGCCGTGGAGGAAGACGCGGAGTACCAGATCACCGACCTCCTCGTCGGTCCCACT
TTAAAAGACGAGGTGATGAAGATCATGCCTGTCCAGAAACAGACAAGAGCCGGGCAGAGG
ACCAGGTTCAAGGCCTTTGTCGTTGTCGGAGACACGAACGGGCATGTCGGTTTGGGAGTG
AAATGCTCCAAGGAGGTTGCCACGGCTATTAGAGGTGGGATCATACTGGCGAAGCTGTCT
GTGATTCCGGTGAGGAGAGGGTACTGGGGGAACAAGATTGGGAAGCCTCACACGGTTCCT
TGTAAGGTTACGGGGAAGTGTGGGTCCGTTACGGTGAGGATGGTGCCTGCTCCGAGAGGT
GCTGGGATTGTGGCGGCTAGGGTTCCTAAGAAGGTGCTTCTTTCGCTGGGATTGATGACG
TGTTCACTTCCTCCAGGGGGTCTACCAAGACTCTTGGAAACTTCGTA

QA 1 647 1 647
DS 

RD RS1BO35JQ 699 0 0
TCGGTCCCACTTTAAAAGACGAGGTGATGAAGATCATGCCTGTCCAGAAACAGACAAGAG
CCGGGCAGAGGACCAGGTTCAAGGCCTTTGTCGTTGTCGGAGACACGAACGGGCATGTCG
GTTTGGGAGTGAAATGCTCCAAGGAGGTTGCCACGGCTATTAGAGGTGGGATCATACTGG
CGAAGCTGTCTGTGATTCCGGTGAGGAGAGGGTACTGGGGGAACAAGATTGGGAAGCCTC
ACACGGTTCCTTGTAAGGTTACGGGGAAGTGTGGGTCCGTTACGGTGAGGATGGTGCCTG
CTCCGAGAGGTGCTGGGATTGTGGCGGCTAGGGTTCCTAAGAAGGTGCTTCTTTCGCTGG
GATTGATGACGTGTTCACTTCCTCCAGGGGGTCTACCAAGACTCTTGGAAACTTCGTAAA
GGCTACATTTGATTGCCTCCAGAAGACTTATGGATTCCTGACACCAGAGTTCTGGAAAGA
GACGAGCTTTAAGAAATCACCATACCAAGAGTACACTGATTTGCTCGCCAGTAAGGGAAC
TACGACCAAAGTCATCACCGAGGTCGAAGACCAAGCCTCCTAAACAATGTCCCCCCTTGT
TTTGTTTTTGGATCAACATCCTTTCATGAGTTTATTTTGTTCGAACCTTTAGTATATGTT
TGTTGCTGGATTGCATCTTTTATATTCCATCATCTTTCC

QA 1 699 1 699
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6100Contig1 934 2 2 U
GATTTTCGCAATATCTGAACTCTCTGGGTTTGTGCCTCTTGCTCTTCGACTCTCTCTATG
GCTATCTCCAAGTTGTTCTTCTCTGACCTGAGAACCGGCAGGTGCTCCTCCGTTGTTGAG
GCGAGACTGCTGCGGTTCTTGGAGGCCAAGAATGTGAAACGTGGTGGGGAGCTCATGTGG
GCAGATCTGCTATTCGTGGACGTCAATGAAGAGCATGACTGCTACCATTAATGTGAAGAT
GTTCGTGACCCATTTAGAAGCAAATGTGAGGTTGTACAAATCCAGATTTGATTGATCAGA
CGCATTGAGTGACAAACGCGGCCAATGTCGTTGGGAAAAAATGCGGGAGGGAAGATAGCC
ACATTACAGCTGGTGGACATGGAGTGCGATTACCTTACTGTTGGATTTTTCAAGAAGCTT
CTCCAGCTCTGAGAATGTTTCTAGGTTGTGGTCGTCCAGTATCTCCACTGCTAAAGAGTT
ATGTGAATGTGGAAACGCTTAGCATATCTGAGCTCAATGATTTTGTCATCACCGCTCCGT
CCCAGGACATTGGTTTTATTTGTACCGGAAAAGTTACTGGAATCAAGTTGGATAAGGGAT
GGTGCTACTTTTCCTGTTCAAACTGTTCCAGTAAACTTCAACGGTCTGTCTCATCTTTCA
CATGTGTGCTAAGCGTTTCCTCCGTGCGCTAGATACCGTGTGGAGATGTCAGTTGCAGAC
GAAACTGGAGAGGGTTTGTTTGTTGGGTTTGATGGAGCTTCAAAATGAGGCCTTGTGAAG
CTGTCAATCTCTTGGTGCGTCATTTTAAACTGTGCTCTATTTATGAGCTGACTATTTGTT
GATCGCATTGTTTCATTGTACATGCTGGTGATGGTGTCAATATCTATTTGTGTCACTTGA
CCAAATGTATTCTCTTTACGTTTGAAGGAACTTG


BQ
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AF RS1GG83TF U 1
AF RS1GG83JQ C 423
BS 1 592 RS1GG83TF
BS 593 934 RS1GG83JQ

RD RS1GG83TF 592 0 0
GATTTTCGCAATATCTGAACTCTCTGGGTTTGTGCCTCTTGCTCTTCGACTCTCTCTATG
GCTATCTCCAAGTTGTTCTTCTCTGACCTGAGAACCGGCAGGTGCTCCTCCGTTGTTGAG
GCGAGACTGCTGCGGTTCTTGGAGGCCAAGAATGTGAAACGTGGTGGGGAGCTCATGTGG
GCAGATCTGCTATTCGTGGACGTCAATGAAGAGCATGACTGCTACCATTAATGTGAAGAT
GTTCGTGACCCATTTAGAAGCAAATGTGAGGTTGTACAAATCCAGATTTGATTGATCAGA
CGCATTGAGTGACAAACGCGGCCAATGTCGTTGGGAAAAAATGCGGGAGGGAAGATAGCC
ACATTACAGCTGGTGGACATGGAGTGCGATTACCTTACTGTTGGATTTTTCAAGAAGCTT
CTCCAGCTCTGAGAATGTTTCTAGGTTGTGGTCGTCCAGTATCTCCACTGCTAAAGAGTT
ATGTGAATGTGGAAACGCTTAGCATATCTGAGCTCAATGATTTTGTCATCACCGCTCCGT
CCCAGGACATTGGTTTTATTTGTACCGGAAAAGTTACTGGAATCAAGTTGGA

QA 1 592 1 592
DS 

RD RS1GG83JQ 512 0 0
CCAGCTCTGAGAATGTTTCTAGGTTGTGGTCGTCCAGTATCTCCACTGCTAAAGAGTTAT
GTGAATGTGGAAACGCTTAGCATATCTGAGCTCAATGATTTTGTCATCACCGCTCCGTCC
CAGGACATTGGTTTTATTTGTACCGGAAAAGTTACTGGAATCAAGTTGGATAAGGGATGG
TGCTACTTTTCCTGTTCAAACTGTTCCAGTAAACTTCAACGGTCTGTCTCATCTTTCACA
TGTGTGCTAAGCGTTTCCTCCGTGCGCTAGATACCGTGTGGAGATGTCAGTTGCAGACGA
AACTGGAGAGGGTTTGTTTGTTGGGTTTGATGGAGCTTCAAAATGAGGCCTTGTGAAGCT
GTCAATCTCTTGGTGCGTCATTTTAAACTGTGCTCTATTTATGAGCTGACTATTTGTTGA
TCGCATTGTTTCATTGTACATGCTGGTGATGGTGTCAATATCTATTTGTGTCACTTGACC
AAATGTATTCTCTTTACGTTTGAAGGAACTTG

QA 1 512 1 512
DS 



AS 1 2

CO CL6101Contig1 1123 2 2 U
GAGATCATTGGTGTAGAGCCAGCTGATGCAAACACTGTGGCGTTGTCGCTGCATCACGGC
GAGAGAGTGATACTAGACCAGGTTGGGGGTTTTGCAGATGGTGTAGCAGTCAAAGTAGTT
GGTGAAGAGACCTTTCGTATATCCAGAAAGCTGGTGGATGGTGTTGTGCTCGTCACCCGT
GATGCTATCTGTGCATCGATAAAGGATATGTTTGAGGAGCAACGGAACATATTAGAACCA
GCAGGTGCGCTTGCGATCGCTGGAGCTGAAGCGTACTGTAAATATTACGGTCTGAAGGAC
TTGAACGTTGTAGCCGTAACCAGTGGTGCGAACATGAACTTTGACAAGCTGAGGATTGTC
ACGGAGCTCGCCAACGTCGGTAGGCAACAGGAGGCTGTTCTTGCTACTATCTTGCCGGAA
AAACCTGGAAGCTTTAAGCAGTTCGTGAATTGGTTGGACCAATGAACATAACTGAGTTCA
AGTATAGATGTGGGTCTGAAAAGGAATCTGTTGTACTCTACAGTGTTGGAGTGCACACAG
CCGGAGAGCTCAAAGCACTAGAGAAGAGAATGGAATCTTCTAAGCTCAGAACTAGGAACC
TCACAACCAGTGACTTAGTAAAAGATCACCTGCGTTACTTGATGGGTGGAAGATCAAGTG
TCGAAGAAGAGGTTCTCTGCCAGTTCACCTTCCCAGAGAGACCTGGTGCTTTGATGAACT
TCTTGGACTCTTTCAGTCCCCGTTGGAACATTAGCCTTTTCCATTATCGTGCAGAGGGTG
GGGCAGGTGCAAATGTTCTGGTCGGGATCCAAGTGCCGGAGCAAGAAATGGTTGAGTTCA
GAAACCGAGCTCAAGTTCTTGGTTACGAGTACGTCTTGGTAAGTGAAGACACTGTTTTCA
AGCTTCTTATGCACTGAGTTTAAAGCTGTGATGGAGAGACCAAAACCAAGAAGGGAGTAG
AAGAACACATGAGAGTTCTTCCTTGTGTCCATTGGTTGTTCTTGAGCTCTGTTAGAAACA
AATTACAGTATGTGAGTCTTAGGCTTTTATGTCACGGACCTGTTACGTTAGCCCTATATT
AACCTTTATTGCCTACGGGCTATAAATAATCGCTATGCTGTAG


BQ
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TCGAAGA

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CTCACAACCAGTGACTTAGTAAAAGATCACCTGCGTTACTTGATGGGTGGAAGATCAAGT
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TAACCTTTATTGCCTACGGGCTATAAATAATCGCTATGCTGTAG

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DS 



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BQ
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AF RS1AL24JQ C 1
AF RS1AL24TF U 1
BS 1 417 RS1AL24TF

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DS 

RD RS1AL24TF 417 0 0
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CAGCCATAGTGGAAAAACCTCTACAGGGGCCGTACACGAGCCCTCCGCCTCTTGGTTATC
CGACCAGAGATGCTATGTTGGGTGATCCTAAGGCGGCCGCAGTGGAGACGAAGTATAAAG
GAGATGGGTTTTGGAAAGGATGTTGTGCTGCTATATGCTGTTGTTGTGTTCTGGACGCAT
GCTTCTGAGACTTCGGAGTTTATGATTTCATGCACATTATTGCTTAATAAAATAAGTTTG
TAGCTGTTTTACTTAATTACTCTATGTGGAATATACTCTGTGGATGGTTGTCGTTGTTCT
GTTTCAGGTATATTAATAAGTGATTGTATTATATATCAAAGTGAATTTGGTTTGTCC

QA 1 417 1 417
DS 



AS 1 2

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TAGGCTTTGGGTCCTTTGAAAAGGTGCGATTGAAGTTTGTGCTCGACAAGATGTGTTCTT
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CTGAGTCTCTGTTTCTTCGCAGATCTGGGGAGGGTTGAAGATCTAGGGTTTGCGGGTCTT
GTTGCTTTAGTGAGCTCTGAGATCTTGGATTTGGAATCCTGTTGTGATGGATCTTATTTT
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TTTGTTTCTTAGGCTTATGCTTTCTTAGTAGGGAGTTTCAGATGCTGTTTCTGGTCTCGG
CCCTTTTATTCTTTTGCTGTCCTCTGTTTGGTTTGGTGGCTAATATCGGCTTCTATCTGT
TTTCTGGTATGCGGTGGTTGTACTTTGCCGGTTCAGATGTGGGGTCCTCATTTGTTTGGA
GCTGTCAGGCAGCCTATCGAGCGAGGCAACAAAGGTTTTAGGGGCTTAATTACTGGACGT
GTCTTCTTGTGAAGGTTGATGGGCTCAACCTCTTCCATCGTCTATATCATGTTGGTTTGG
CCGGGTATGAATGAACTGAGTATGGGTTATGCTTACAGCTTGGTTCTTGTATCAATAAAT
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CCAAATGGTTTAATTTGTGTTACGATATAGCTGGAGCTGATGGAAGTACCGGCTTAAGGC
TGTGCGAGCTTTGAGGTCTCTGCTAAATTGGTTCTTTGGTTCTTAGGATAGGAAGTATCT
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TCTTCTCCTGTGGTCACTTTCATCAGGACATCCACCTCAGTTCTCTATTATGAGTTTTTA
AGCTTAAGTTTTAGTAACCCACCCTTATGTTTTTTTCATGCCTTTGTAGTTTCGTCTGGC
TCCGGAAGGATTGTAATCCTTGTCGGCTTATGGCTCCGGAAGGAACGTGTTCCTTGCCGG
CTTTGTGTAAAAACTTTGATGTATTCAAATTAATCTATCAGATGAC


BQ
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AF RS1FR93TF U 1
AF RS1FR93JQ C 605
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BS 670 690 RS1FR93TF
BS 691 1306 RS1FR93JQ

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TCCTGATTTATTTTTCTTTGTCTTCTTCCTTAGCTTCTGTTTTCCTTGGCTTGTGTCTGA
TAGGCTTTGGGTCCTTTGAAAAGGTGCGATTGAAGTTTGTGCTCGACAAGATGTGTTCTT
TCCCCAGCTCTTCTTACTGTTTTCAGTGGTGGGCTGGTGATGGCAAGCCTCATTTTGTCT
CTGAGTCTCTGTTTCTTCGCAGATCTGGGGAGGGTTGAAGATCTAGGGTTTGCGGGTCTT
GTTGCTTTAGTGAGCTCTGAGATCTTGGATTTGGAATCCTGTTGTGATGGATCTTATTTT
TTGATTCCTCTTTCCTCTCTAGTGGTCAGCCTTTTTATTGGTTTCTATCAGCCTTTTGTG
TTTGTTTCTTAGGCTTATGCTTTCTTAGTAGGGAGTTTCAGATGCTGTTTCTGGTCTCGG
CCCTTTTATTCTTTTGCTGTCCTCTGTTTGGTTTGGTGGCTAATATCGGCTTCTATCTGT
TTTCTGGTATGCGGTGGTTGTACTTTGCCGGTTCAGATGTGGGGTCCTCATTTGTTTGGA
GCTGTCAG*CAGCCTATCGAGCGAGGCAAC

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DS 

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TCTTGTGAAGGTTGATGGGCTCAACCTCTTCCATCGTCTATATCATGTTGGTTTGGCCGG
GTATGAATGAACTGAGTATGGGTTATGCTTACAGCTTGGTTCTTGTATCAATAAATGTGG
AGGGTTTCTGCTTTGGTTTGTGACAAGAGTGTCATCCCTGGTTTTCTTATGAAGATCCAA
ATGGTTTAATTTGTGTTACGATATAGCTGGAGCTGATGGAAGTACCGGCTTAAGGCTGTG
CGAGCTTTGAGGTCTCTGCTAAATTGGTTCTTTGGTTCTTAGGATAGGAAGTATCTTCAA
GCCAATAAACAAGGGTTTTCGGCTTGCTTCTATTCGTACTTTGAAGATCGGCGCGCTCTT
CTCCTGTGGTCACTTTCATCAGGACATCCACCTCAGTTCTCTATTATGAGTTTTTAAGCT
TAAGTTTTAGTAACCCACCCTTATGTTTTTTTCATGCCTTTGTAGTTTCGTCTGGCTCCG
GAAGGATTGTAATCCTTGTCGGCTTATGGCTCCGGAAGGAACGTGTTCCTTGCCGGCTTT
GTGTAAAAACTTTGATGTATTCAAATTAATCTATCAGATGAC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 2

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AGATGGGGGGAGTATCCAGAGTGCACTTGGAGAGATTGTTGGAAGGCGAACTGTACCACA
GGTTTTCATTAACGGAAAGCACATCGGAGGATCAGATGATACCGTAGACGCGCATGAGAG
CGGGGAACTGGCCAAGCTTCTTGGCGTTTCCGGAAACACAAGAGCTGAACTCTAAGGCTG
AAATATAGTTCAAATAACTGATAAAACTCTGTGTCTGTGATGTTCAGGTGTAATCAATTA
TCAGTTGTTCGAAAATTTGTAATGGGGTTCTGAAGATTTTAAAACAGCTTGACAAGGCCT
TGTTAAAACATATATTATCAATTACTGCAAGTTGAGTTAAACAAAGTTGGATTGAGC


BQ
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AF RS1DF39JQ C 1
AF RS1DF39TF U 1
BS 1 417 RS1DF39TF

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AGATGGGGGGAGTATCCAGAGTGCACTTGGAGAGATTGTTGGAAGGCGAACTGTACCACA
GGTTTTCATTAACGGAAAGCACATCGGAGGATCAGATGATACCGTAGACGCGCATGAGAG
CGGGGAACTGGCCAAGCTTCTTGGCGTTTCCGGAAACACAAGAGCTGAACTCTAAGGCTG
AAATATAGTTCAAATAACTGATAAAACTCTGTGTCTGTGATGTTCAGGTGTAATCAATTA
TCAGTTGTTCGAAAATTTGTAATGGGGTTCTGAAGATTTTAAAACAGCTTGACAAGGCCT
TGTTAAAACATATATTATCAATTACTGCAAGTTGAGTTAAACAAAGTTGGATTGAGC

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DS 

RD RS1DF39TF 417 0 0
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AGATGGGGGGAGTATCCAGAGTGCACTTGGAGAGATTGTTGGAAGGCGAACTGTACCACA
GGTTTTCATTAACGGAAAGCACATCGGAGGATCAGATGATACCGTAGACGCGCATGAGAG
CGGGGAACTGGCCAAGCTTCTTGGCGTTTCCGGAAACACAAGAGCTGAACTCTAAGGCTG
AAATATAGTTCAAATAACTGATAAAACTCTGTGTCTGTGATGTTCAGGTGTAATCAATTA
TCAGTTGTTCGAAAATTTGTAATGGGGTTCTGAAGATTTTAAAACAGCTTGACAAGGCCT
TGTTAAAACATATATTATCAATTACTGCAAGTTGAGTTAAACAAAGTTGGATTGAGC

QA 1 417 1 417
DS 



AS 1 2

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CGCAGTCCAAGTTTGAAGAACTTACTGCATCTACTGGTTCCAGCAAAGCAATGGCGCTTT
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AGTGTGGCACCGAACTCTCTGTAACTTCTTCCCTTGATTCACTTGACAAGAAGTCGGACA
CTGAGGGTGCAGATTCCAAGGCTGAATCTAAGCTTCTAGAGAACGGCGGCACTCCCAAAA
CAGACCAAGCAGAGTTGATAGAAATTGATGTGAAAGCTGAAACTCCATTGGACGACCGTA
AAGAGGATGAAGTGGAGGTTTCAGTAACGCAGCATGAGTCAGTTGTTAGTACACCAGATT
CCAAAAGGAGACCTGCAGAAGATGGATCAGGGCTTCAAGCTTTAACTCCTATGTCAATCA
CTGAATCTCAGGCAACACCGGCAAGTCAAGCATCTTCCTCAGTTAGAGCAAGAAAGGAAA
AATCCGGTAAGAGTGGTTCAAGCCAGAAGAGGAAAGTTAGCAAGAAAATAACATCAACTC
CCAAACAGGAAACTGGTAACGGTGAGGGGGGTAAGAATACTAGGGAACAAGAAGAAGGGA
AAGAACAGAGAAGCGGGAGGAGAAACTCTTTTGGTAATGATCAAGAAGCAAGAGAGAGCA
GCGGAGGCAAGAACTCTCTTCCCAGGTTCATGCAGCCAACACAATCGGCAAAACTTAAGG
TTCAAGAACATAACTCACCAAGATCAAGCCCCGATTTTCAGGAAAGAGACGTTTCCATCA
AGAAGAGACATTCACTCCCTGTTGGTGCCAATGGGAAACAAGGTTTTTTTCCTAGAATCC
AACGGTTTGCGTCTCAAGCACAACCGGGAACAAAGGAGAGAAAATGGCAGAGATGAAGCT
GACCGGAGTGAAATGGGAAAAGGAAAATGTTAGAGGAGTATTTGATGATTGGTATGTTTT
GTTTTCAGACAATCCTTGACTCTAATTTCAGACAAACTAAGTGACAGGACGGAGAATGGA
GAAA


BQ
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10 10 10 10 

AF RS1F012TF U 1
AF RS1F012JQ C 464
BS 1 714 RS1F012TF
BS 715 1144 RS1F012JQ

RD RS1F012TF 714 0 0
GGGATGAACAGCCTAAACCTACTTTGAAGCGTAAGGCAAGCAACCCTTCATTCATCGCCG
CGCAGTCCAAGTTTGAAGAACTTACTGCATCTACTGGTTCCAGCAAAGCAATGGCGCTTT
CTTCTTCTAAAGATGGTGTTTTGGGTGAAGAAGGCAAAACAGATGTATATTCATCAGAGG
CTAACACTACAGACACGAAAAAGGACCAGTCTCTGGAAGATGTTACTCTCAGTGGATCCG
AGTGTGGCACCGAACTCTCTGTAACTTCTTCCCTTGATTCACTTGACAAGAAGTCGGACA
CTGAGGGTGCAGATTCCAAGGCTGAATCTAAGCTTCTAGAGAACGGCGGCACTCCCAAAA
CAGACCAAGCAGAGTTGATAGAAATTGATGTGAAAGCTGAAACTCCATTGGACGACCGTA
AAGAGGATGAAGTGGAGGTTTCAGTAACGCAGCATGAGTCAGTTGTTAGTACACCAGATT
CCAAAAGGAGACCTGCAGAAGATGGATCAGGGCTTCAAGCTTTAACTCCTATGTCAATCA
CTGAATCTCAGGCAACACCGGCAAGTCAAGCATCTTCCTCAGTTAGAGCAAGAAAGGAAA
AATCCGGTAAGAGTGGTTCAAGCCAGAAGAGGAAAGTTAGCAAGAAAATAACATCAACTC
CCAAACAGGAAACTGGTAACGGTGAGGGGGGTAAGAATACTAGGGAACAAGAAG

QA 1 714 1 714
DS 

RD RS1F012JQ 681 0 0
TGTTAGTACACCAGATTCCAAAAGGAGACCTGCAGAAGATGGATCAGGGCTTCAAGCTTT
AACTCCTATGTCAATCACTGAATCTCAGGCAACACCGGCAAGTCAAGCATCTTCCTCAGT
TAGAGCAAGAAAGGAAAAATCCGGTAAGAGTGGTTCAAGCCAGAAGAGGAAAGTTAGCAA
GAAAATAACATCAACTCCCAAACAGGAAACTGGTAACGGTGAGGGGGGTAAGAATACTAG
GGAACAAGAAGAAGGGAAAGAACAGAGAAGCGGGAGGAGAAACTCTTTTGGTAATGATCA
AGAAGCAAGAGAGAGCAGCGGAGGCAAGAACTCTCTTCCCAGGTTCATGCAGCCAACACA
ATCGGCAAAACTTAAGGTTCAAGAACATAACTCACCAAGATCAAGCCCCGATTTTCAGGA
AAGAGACGTTTCCATCAAGAAGAGACATTCACTCCCTGTTGGTGCCAATGGGAAACAAGG
TTTTTTTCCTAGAATCCAACGGTTTGCGTCTCAAGCACAACCGGGAACAAAGGAGAGAAA
ATGGCAGAGATGAAGCTGACCGGAGTGAAATGGGAAAAGGAAAATGTTAGAGGAGTATTT
GATGATTGGTATGTTTTGTTTTCAGACAATCCTTGACTCTAATTTCAGACAAACTAAGTG
ACAGGACGGAGAATGGAGAAA

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

CO CL6106Contig1 821 2 4 U
GGGGGAACTCAAATTCAGGACCTCCACGTCTGACTTCACCTTTAGCATGATGGTCTCCAT
GTTTAATAACTGGAGGAGGAGGTCCGCCTCTTTCTTGTTGCTTGTTATCAAATCCAAATT
CTATATCCTCACCCTGATCTCTTCCAGAGGGTTTCTCAATAGGCTTAGGCCGTTTCATAT
CCAACCCAAACTCCAAGTCACCTCTCTCCCTCGGCTCACGGTCCACAGGCCGAATCTCAC
GGCTCTTCTTAGACGACCCTTTCTCATGCTTTGGTTGCTTGCTATGCTGCTGCTTAGCCG
CACGGCTCTCACGGTTGCATAGCCTCCCGAAGATACAAGCCAGAACTGATAAGACAAGGA
TTACGGCTAGGACTATGAAGACCGTACCAAAAGAACCTCGAGAGCCAGAGGAGGAAGAAG
AAGAAGGTTGATATGGATACTGTTTAGTGTATGCGGTTGGATACACAACAACAGGCTGCT
GCATCTGTTGTACTCCTTGGTCTCCCATTTTTCTACTAGGTTTTGGCTTATGTTTGGTTC
TTAGAGATAAATCAAGAAGTGGTATATATAAGATGAAGTTGTCAGGTCTTACTTTGAAGT
TCCTTGAGTAGAGATCAAGGAAGGTTATTGTGAAGGTACTTGTGGAACAAGAAATGTGAA
TATGCTTCATTCCATGTGAGATAAGGGGTGATGAATTAATAGAAGCATATTGTGGATTGA
AATAAATTTATCATACCAAAAGTGATAGATAATAAAAGGAATAAGACTCATTAATGGGTT
TGAAACCAAAGTTTTAAATTGAGAGAACATTTTCTGTTGTT


BQ
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AF RS1EO44TF U 1
AF RS1EO44JQ C 252
BS 1 635 RS1EO44TF
BS 636 636 RS1EO44JQ
BS 637 681 RS1EO44TF
BS 682 821 RS1EO44JQ

RD RS1EO44TF 681 0 0
GGGGGAACTCAAATTCAGGACCTCCACGTCTGACTTCACCTTTAGCATGATGGTCTCCAT
GTTTAATAACTGGAGGAGGAGGTCCGCCTCTTTCTTGTTGCTTGTTATCAAATCCAAATT
CTATATCCTCACCCTGATCTCTTCCAGAGGGTTTCTCAATAGGCTTAGGCCGTTTCATAT
CCAACCCAAACTCCAAGTCACCTCTCTCCCTCGGCTCACGGTCCACAGGCCGAATCTCAC
GGCTCTTCTTAGACGACCCTTTCTCATGCTTTGGTTGCTTGCTATGCTGCTGCTTAGCCG
CACGGCTCTCACGGTTGCATAGCCTCCCGAAGATACAAGCCAGAACTGATAAGACAAGGA
TTACGGCTAGGACTATGAAGACCGTACCAAAAGAACCTCGAGAGCCAGAGGAGGAAGAAG
AAGAAGGTTGATATGGATACTGTTTAGTGTATGCGGTTGGATACACAACAACAGGCTGCT
GCATCTGTTGTACTCCTTGGTCTCCCATTTTTCTACTAGGTTTTGGCTTATGTTTGGTTC
TTAGAGATAAATCAAGAAGTGGTATATATAAGATGAAGTTGTCAGGTCTTACTTTGAAGT
TCCTTGAGTAGAGATCAAGGAAGGTTATTGTGAAG*TACTTGTGGAACAAGAAATGTGAA
TATGCTTCATTCCATGTGAGA

QA 1 681 1 681
DS 

RD RS1EO44JQ 570 0 0
GACGACCCTTTCTCATGCTTTGGTTGCTTGCTATGCTGCTGCTTAGCCGCACGGCTCTCA
CGGTTGCATAGCCTCCCGAAGATACAAGCCAGAACTGATAAGACAAGGATTACGGCTAGG
ACTATGAAGACCGTACCAAAAGAACCTCGAGAGCCAGAGGAGGAAGAAGAAGAAGGTTGA
TATGGATACTGTTTAGTGTATGCGGTTGGATACACAACAACAGGCTGCTGCATCTGTTGT
ACTCCTTGGTCTCCCATTTTTTTACTAGGTTTTGGCTTATGTTTGGTTTTTAGAGATAAA
TCAAGAAGTGGTATATATAAGATGAAGTTGTCAGGTCTTACTTTGAAGTTCCTTGAGTAG
AGATCAAGGAAGGTTATTGTGAAGGTACTTGTGGAACAAGAAATGTGAATATGCTTCATT
CCATGTGAGATAAGGGGTGATGAATTAATAGAAGCATATTGTGGATTGAAATAAATTTAT
CATACCAAAAGTGATAGATAATAAAAGGAATAAGACTCATTAATGGGTTTGAAACCAAAG
TTTTAAATTGAGAGAACATTTTCTGTTGTT

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 2

CO CL6107Contig1 827 2 2 U
GGAGAACGTCTCTCTCGGTTACATTGCGGCTTAGGACTGAGTCAGTGAGTCTCCAGATCG
AGTTAAGGGATGGGAGGCAACGGAGAATTGAAGTACGAGATCTCACAGAACGCGTACATC
AAACTCGTCCTCCACTCCCTCCTCTCGAGATCTCCCTCATCATGATAGAGGAGCATTACG
TGGCTCAAGGTTTGAGTATTGTTGGCTACTTCCATGCCAACGAGAGGTTCGACGATGTGG
AGCTCTCTGGTGCGGCTAAGAACGTCGGTGATCACATCTCTCGCTATTTCCCGCAGGCGC
CAATTCTCTTGTTGGACAACAAAAAGCTTGACGCCTTATCAAAGGGTAAAGATCGAAGCC
CTGTGATGCAGCTTTGTGTGAAAGATGCTTCCAAGAACTGGAGAGTGGTTGGAACAGACG
GAGGAAGCAAGCTACTCTTGAAAGAGCCATCGGCTAATGTAGTTTTGTCAGATTACATTT
CATCTGAGAAATGGAAGGACGTCACAGATTTTGATGATCATCTTGATGATGTCACCAAGG
ACTGGCTAAACTCTGGACTTTTCAACTGAAGACGGGTTTGTGATATAGCTTATCAGAGTT
TTGCTTTTATCATCTTCAGTCGAAAACAAAAACATGACCCTTGTTTACAATTTCCCTTGA
ATCTTGTTCAAGTGTTATCTTAGCTTGCGCAACGGTCATATCTCAAACCCTAGTTTTATC
ATTTGAATGATATCTTTTGGGGCTTGTTCTAGTGATTCACTTAGTTTATATATCTTTGTT
TGCACTTTGATTATATAGCTGAAATGAAAGCTTTGATTTATTTGGTT


BQ
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AF RS1CH37TF U 1
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QA 1 476 1 476
DS 

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AAACTCGTCCTCCACTCCCTCCTCTCGAGATCTCCCTCATCATGATAGAGGAGCATTACG
TGGCTCAAGGTTTGAGTATTGTTGGCTACTTCCATGCCAACGAGAGGTTCGACGATGTGG
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CAATTCTCTTGTTGGACAACAAAAAGCTTGACGCCTTATCAAAGGGTAAAGATCGAAGCC
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CATCTGAGAAATGGAAGGACGTCACAGATTTTGATGATCATCTTGATGATGTCACCAAGG
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TTGCTTTTATCATCTTCAGTCGAAAACAAAAACATGACCCTTGTTTACAATTTCCCTTGA
ATCTTGTTCAAGTGTTATCTTAGCTTGCGCAACGGTCATATCTCAAACCCTAGTTTTATC
ATTTGAATGATATCTTTTGGGGCTTGTTCTAGTGATTCACTTAGTTTATATATCTTTGTT
TGCACTTTGATTATATAGCTGAAATGAAAGCTTTGATTTATTTGGTT

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1G321JQ U 5
AF RS1G321TF C 1
BS 1 4 RS1G321TF
BS 5 480 RS1G321JQ
BS 481 672 RS1G321TF

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ATTTAAAGTTTCAATTCAGTTCTTGAAAATCCGTAAAGAAGCAAACTGAGCTGCTCTGGA
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QA 1 476 1 476
DS 

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TTAGCTGAGAATAGTAACGAGGTTTCAGGTGATGGTTGAGATGGTTGAGCAGGAGAGCGA
CGACGACGTGAATCTCGAGGGGATGAAGTCAGCCACAGGTGGTGCGGCTTGAGGTAATAG
TAACTGGGGTTTGGAGTTTCCATTGATTGAGCTTGAATTGAGATGTTGGTAGTGACGAGG
CATCCTAGCAGCGGCGAGGGGAGGTGGAGGAAATATTGGGGTTTCAATCAATCCAAGCAA
AGTCGAAGAGCC

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

CO CL6109Contig1 1264 2 2 U
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GGAAAATGGAGGTGGAGAGGAAAACAACAGGCTGGGCTGCTAGAGACCCATCTGGTTTAC
TCTCTCCTTACACTTACACTCTCAGGGAGACAGGACCAGAGGATGTACACATAAGAATCA
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ATCTTGGAGCCGATGATTACGTGATCGGATCCGACCAATCTAAGATGAAAGAATTGGCGG
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GCAC


BQ
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10 10 10 10 

AF RS1AD14TF U 1
AF RS1AD14JQ C 584
BS 1 847 RS1AD14TF
BS 848 1264 RS1AD14JQ

RD RS1AD14TF 847 0 0
GGAAGAGAGCTCAAAAATACTAAGCATTAAGAAACAGAGAACAGGTAGAATCAAGAATGG
GGAAAATGGAGGTGGAGAGGAAAACAACAGGCTGGGCTGCTAGAGACCCATCTGGTTTAC
TCTCTCCTTACACTTACACTCTCAGGGAGACAGGACCAGAGGATGTACACATAAGAATCA
TATGCTGTGGAATCTGCCACACCGATCTTCATCAAACCAAGAACGATCTCGGCATGTCAA
ACTACCCTATGGTTCCTGGGCACGAGGTTGTCGGGGAAGTTGTGGAGATGGGATCAGGTG
TGAGCAAGTTCACCGTAGGTGATATAGTTGGAGTTGGTTGTCTCGTTGGATGTTGCGGTG
GCTGTAGCCCCTGCGAGAAGGATCTGGAGCAGTACTGTCCTAAGAAGATCTGGAGCTACA
ACGATGTTTACATCGATGGTCAGCCTACACAAGGTGGCTTCGCTAAAGCCACCGTCGTTC
ATCAAAAGTTTGTGGTGAAGATTCCAGAAGGAATGGCGGTTGAGCAGGCGGCCCCGTTAC
TGTGCGCCGGTGACGGTGTACAGTCCACTGAGCCACTTCGGGCTGAAGAACCAGGCCTAA
GAGGAGGCATACTAGGGTTAGGTGGAGTTGGTCACATGGGCGTGAAAATAGCCAAAGCAA
TGGGTCACCATGTGACTGTCATAAGCTCATCAAACAAGAAGAGAGAAGAGGCTTTGCAAG
ATCTTGGAGCCGATGATTACGTGATCGGATCCGACCAATCTAAGATGAAAGAATTGGCGG
ATTCAATGGATTACATAATCGACACGGTCCCTGTTCATCATGCACTTGAGCCTTACTTGT
CTCTGCT

QA 1 847 1 847
DS 

RD RS1AD14JQ 681 0 0
GAAGA
AACCAGGCCTAAGAGGAGGCATACTAGGGTTAGGTGGAGTTGGTCACATGGGCGTGAAAA
TAGCCAAAGCAATGGGTCACCATGTGACTGTCATAAGCTCATCAAACAAGAAGAGAGAAG
AGGCTTTGCAAGATCTTGGAGCCGATGATTACGTGATCGGATCCGACCAATTTAAGATGA
AAGAATTGGCGGATTCAATGGATTACATAATCGACACGGTCCCTGTTCATCATGCACTTG
AGCCTTACTTGTTTCTGCTTAGACTTGATGGGAAGCTCATACTCATGGGAGTCATCAACA
ACCCGTTGCAGTTTCTCTCTCCTATGGTTATGATTGGGAGGAAAATGATAACTGGGAGCT
TCATAGGGAGCATGAAGGAAACAGAGGAGATGCTTGAATTCTGTAAGGAAAAGGGTTTAA
GTTCTATCATCGAAGTTGTGAAAATGGACTATGTGAACACTGCGTTTGAAAGACTCGAGA
AGAACGATGTGCGTTATAGGTTCGTGGTTGATGTCCAAGGAAGCAATCTCGAGGCTTGAT
TTTATGTCTTCTTTACAAAGCCCATGTATACCATTTTATGTTTTTTATGAGCATTCGATC
AGTATGGCTTATCACTGTTTTCATGGGAAAGGATACTAATGAAATTGGAATTAAAACGTC
TTTGTTTGAGCGGCAC

QA 6 681 6 681
DS 



AS 1 2

CO CL6110Contig1 797 2 2 U
GGAAACCGACGGGGGAGATTGCTGCGCCGCGTGGAAGTCCGCTCTGGATGGCTCCGGAGG
TGGTGAGGAAAGAGTATCAAGGACCTGAGAGCGACGTGTGGTCTCTCGGCTGTACGGTCA
TCGAGATGCTCACCGTGAAGCCAGCGTGGGAAGATCGCGGTTTCGACTCGCTGAGCCGAA
TCGGGTTTTCAAACGAGTTGCCTTTTGTTCCGGCGGGTGTTTCTGAACTCTGCCGCGACT
TCTTGGACAAATGCTTGAGACGAGACAGGGGTCAGCGGTGGAGTTGCGGACAGCTTTTGG
AGCATCCGTTTCTATTATGTCAAGATCATCACTCGTTCGTCACTACCGAGTCGTCTCCCC
GTTGCGTATTGGACTGGATCAACTCGGAGTTCGAAGAGTTGGAAGAGATGGGTGAGTCGA
GAGTTGAATCTATGGTCTCGGCGATGGCAAGGATAAGTAAATTAGCAACGACCGGAGAGG
CGGTTTGGGAATCTAGTGGTTGGAGTGAGGTTAGAGGCAATGCTTCCGAAGAGTCAGGGG
CAAAATGGGAATATCCGAGTCCAACAAGGGCAGAATCGGAATTAAACATTTTACCGGAGT
CTACCGATGACACCGGTACACGGACGGTGAATGAAGACTGGGAGTTGACGTCCGCGATAA
CGTGTGAGATATTGTTGTTGATGTTGTTATTGGTGGTAGAGAATATTCAGATATATGCCA
CGTTTTACGCCAGTGTATTTATTCGTATTCTATTTCGTTGTTATCATCATCAAAATAATA
ATAAGATGAAGTTGCGC


BQ
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AF RS1EK92TF U 1
AF RS1EK92JQ C 309
BS 1 671 RS1EK92TF
BS 672 797 RS1EK92JQ

RD RS1EK92TF 671 0 0
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TGGTGAGGAAAGAGTATCAAGGACCTGAGAGCGACGTGTGGTCTCTCGGCTGTACGGTCA
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TCGGGTTTTCAAACGAGTTGCCTTTTGTTCCGGCGGGTGTTTCTGAACTCTGCCGCGACT
TCTTGGACAAATGCTTGAGACGAGACAGGGGTCAGCGGTGGAGTTGCGGACAGCTTTTGG
AGCATCCGTTTCTATTATGTCAAGATCATCACTCGTTCGTCACTACCGAGTCGTCTCCCC
GTTGCGTATTGGACTGGATCAACTCGGAGTTCGAAGAGTTGGAAGAGATGGGTGAGTCGA
GAGTTGAATCTATGGTCTCGGCGATGGCAAGGATAAGTAAATTAGCAACGACCGGAGAGG
CGGTTTGGGAATCTAGTGGTTGGAGTGAGGTTAGAGGCAATGCTTCCGAAGAGTCAGGGG
CAAAATGGGAATATCCGAGTCCAACAAGGGCAGAATCGGAATTAAACATTTTACCGGAGT
CTACCGATGACACCGGTACACGGACGGTGAATGAAGACTGGGAGTTGACGTCCGCGATAA
CGTGTGAGATA

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1EK92JQ 489 0 0
TTTT
TATTATGTCAAGATCATCACTCGTTCGTCACTACCGAGTCGTCTCCCCGTTGCGTATTGG
ACTGGATCAACTCGGAGTTCGAAGAGTTGGAAGAGATGGGTGAGTCGAGAGTTGAATCTA
TGGTCTCGGCGATGGCAAGGATAAGTAAATTAGCAACGACCGGAGAGGCGGTTTGGGAAT
CTAGTGGTTGGAGTGAGGTTAGAGGCAATGCTTCCGAAGAGTCAGGGGCAAAATGGGAAT
ATCCGAGTCCAACAAGGGCAGAATCGGAATTAAACATTTTACCGGAGTCTACCGATGACA
CCGGTACACGGACGGTGAATGAAGACTGGGAGTTGACGTCGGCGATAACGTGTGAGATAT
TGTTGTTGATGTTGTTATTGGTGGTAGAGAATATTCAGATATATGCCACGTTTTACGCCA
GTGTATTTATTCGTATTCTATTTCGTTGTTATCATCATCAAAATAATAATAAGATGAAGT
TGCGC

QA 5 489 5 489
DS 



AS 1 2

CO CL6111Contig1 1204 2 2 U
GGGGAGATCGCCGTTTGGATCGGGTTTCTGTGAACCCATCGGAAAACAGAAAAAAAGAAG
GGAGAGAGAGAGAGAGCCAAACTCAGAGTTTCTCTCCTGTTTTGCCTTTCCGACGCTTCC
AACCTCTTACCTTTGTCCGAATTAAATCATCAGTTACGCACAAGGAATGACGAGTAACTC
GTCATCTAAGAAACAAGCTCAAGATCCGCCTGAATCCTCCGAGCCCACTTTGAAATCCCT
CAGAACCAAGATGACCAAATCCGACGAAAAGAAGAAGCTTAAAGACATTGAGATAAGCGT
TCCACTTGTCTATGGTAACATTGCTTTCTGGCTCGGCAAGAAGGCTAGCGAATACCAATC
TCACAAATGGGCTGTATATGTTCGTGGGGCAACAAATGAAGACATCAGTGTTGTAATCAA
GAAAGTCGTCTTCCAGCTTCATTCTAGTTTCAACAACCCCACAAGAGTCATCGAGGAGCC
TCCATTCGAGGTCTCCGAATCTGGCTGGGGAGAATTCGAGATTGCTATCACATTGCATTT
CCACAGCGACGTCTGTGACAAGCCATTGAGTTTATATCATCACTTGAAGTTATACCCAGA
AGATGAATCAGGTCCTTTGACAATGAAGAAGCCTGTGGTTGTCGAACACTACGACGAGAT
TGTGTTTCCTGACCCTTCTGAAAGTTTTCTTGCTAGGGTTCAGAATCACCCTGCTTTGAC
GTTTCCTAGATTACCCTCTGGTTACAACTTGCCTGCTCCTATGCAAGTTGATGATAACGG
GAAAAAGAAGAGAGGTGATACTAAAGATCATAGCTTGGGACAATGGTTCACGAGCTTCTC
TGAAGCCGATGAGTTGTTACAGCTTGCGGCTGCTCGTCAACAGGTTCAAGCTCATATTGC
TAAACTCAGGCGACAAATAAGCTTGCTAGAGGGACAGAATCAGACCATCAAAACAGGTTC
TGATCCGTGAAGCTGTAGCCAGTTTCCATTGGTGGAGTGGGAGATTGGTTTTGTTTTAAC
ATTAATGTGTATCAGTATTATTAGCGTAGCGCTTTTTTTACCAGTCTTTGATACATTCTC
TTTAAGAATCAGTTTACTCGGACTGTTGACTAGCTAGGGGTGGCCCTTGAGTGTTTCGCA
GTTTCGGGTTTTACATGATTTCGGCTCGGGTTTGGTTCATAATATCATGGGGTTCAGTTC
GTCC


BQ
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GGAGAGAGAGAGAGAGCCAAACTCAGAGTTTCTCTCCTGTTTTGCCTTTCCGACGCTTCC
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CAGAACCAAGATGACCAAATCCGACGAAAAGAAGAAGCTTAAAGACATTGAGATAAGCGT
TCCACTTGTCTATGGTAACATTGCTTTCTGGCTCGGCAAGAAGGCTAGCGAATACCAATC
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TCCATTCGAGGTCTCCGAATCTGGCTGGGGAGAATTCGAGATTGCTATCACATTGCATTT
CCACAGCGACGTCTGTGACAAGCCATTGAGTTTATATCATCACTTGAAGTTATACCCAGA
AGATGAATC

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DS 

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ACGTCTGTGACAAGCCATTGAGTTTATATCATCACTTGAAGTTATACCCAGAAGATGAAT
CAGGTCCTTTGACAATGAAGAAGCCTGTGGTTGTCGAACACTACGACGAGATTGTGTTTC
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ATGAGTTGTTACAGCTTGCGGCTGCTCGTCAACAGGTTCAAGCTCATATTGCTAAACTCA
GGCGACAAATAAGCTTGCTAGAGGGACAGAATCAGACCATCAAAACAGGTTCTGATCCGT
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GTATCAGTATTATTAGCGTAGCGCTTTTTTTACCAGTCTTTGATACATTCTCTTTAAGAA
TCAGTTTACTCGGACTGTTGACTAGCTAGGGGTGGCCCTTGAGTGTTTCGCAGTTTCGGG
TTTTACATGATTTCGGCTCGGGTTTGGTTCATAATATCATGGGGTTCAGTTCGTCC

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DS 



AS 1 2

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AGTCACATCAAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGTGAGTGGAACCGGTAGCAGC
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ACAGATAGTCACAGTCTAGCTGAAAGAGCGAGGAGAGAAAAGATAAGCGAGCGGATGAAA
ATCTTGCAAGATCTTGTCCCTGGTTGTAACAAGGTTATCGGAAAGGCGCTTGTTCTAGAT
GAGATAATCAATTACATACAGTCTCTGCAGCGTCAAGTTGAGTTTCTATCGATGAAGCTC
GAAGCAGTCAACTCAAGAATGGCTCCTGGTATCGAGGTTTTCCCGCCAAAAGAGTTTGAT
CAGCAAACGTTTGAAAATCCGGGAATGCAGTTCGGGTCACAAGCTACAAGGGAATACAGC
AGAGGAGCGTCACCGGAGTGGCTGCATATGCAGGTAGGAGGTGGTTTCGAAAGATCATAG
TGAATAACAGTGATAACGAAAGAAAGCTGGCACCAAGATCACAAAATAAACTTCGATCTT
CAATGTTAGTCACTAAAAAAGAAGCAGCAGCATACGTATAAAACATTTATGAAATATTTA
TATATTATTATACAAGGTTTTATTGTTATAGATTCCTAGTTTAGACATGAAGTAAAGTGG
AGGTAGATTGTGGTACACTTTCCTCTTTTGTTGTCTCAGAACATGTTAATAACTGTTTAA
AGCTTTTCACATGCTTTTCTTCTGTTTTATGTTGTGTTTGTAATCTATCTAAGGGAAGGT
TTGGTTCCCAAAAAA


BQ
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AF RS1BS87JQ C 562
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ACAGATAGTCACAGTCTAGCTGAAAGAGCGAGGAGAGAAAAGATAAGCGAGCGGATGAAA
*TCTTGCAAGATCTTGTCCCTGGTTGTA

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DS 

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TCTCTGCAGCGTCAAGTTGAGTTTCTATCGATGAAGCTCGAAGCAGTCAACTCAAGAATG
GCTCCTGGTATCGAGGTTTTCCCGCCAAAAGAGTTTGATCAGCAAACGTTTGAAAATCCG
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AAGCAGCAGCATACGTATAAAACATTTATGAAATATTTATATATTATTATACAAGGTTTT
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CCTCTTTTGTTGTCTCAGAACATGTTAATAACTGTTTAAAGCTTTTCACATGCTTTTCTT
CTGTTTTATGTTGTGTTTGTAATCTATCTAAGGGAAGGTTTGGTTCCCAAAAAA

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

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GGTTGGAACCAATCCGTTTGATCTCAAGCTTGGTCTACTTGCCTGTAAACCATTCGATGG
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TCAGAGCTCATTTTGGGTTGATTCATTACTCTTACTGGCTGCACGGAAGGTGCCAACTTC
AGATGACCAGTCCACCAATCGGAATCCTAATTTCTCATAACTGCACAACAAAGAGACGAT
GAAGAAGAAAAAACGGTTGTCCCAGTCTTCAAAGTCTCTAGCTTTGGTATGTTCTTCAAG
TATAGATCTGTATTTTCTTACCCACAAAATGTATAAAAGAAACAAGACCTAGTGGAAACT
GAATCCAAGAACAGAGATCGGAGTCTGTAATTCAATTTTCAAGATAAAAAAAACGAAAAG
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TATTAGATACAGCGGTCTCATATAGCTAAAAGTAAAGCAGAAATTGATTGGCTAAAACCG
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CCTAACAGAGGCTTTAAGAAAGACACCACATGTCAAATGGTAGACTGAAACAAGGATGAA
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GCAACCAAAACTCTTTCTCTATCTGCAGTCTCCATAAACCAACTTGCACCATTTGATTAA
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TGCTGTGATCCTAGCAATTCAAACTTGGCCATACCGCCATATGCAGCAGACCAATCTTGA
ATATTTTCTGATCCAATTCATCTCTCGAGCACTCTCAAAATGTAGACATGAAAACTTAAT
ATCAAGAAACCATAACAAAATAAACAAGACCTTGACACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GA79TF U 1
AF RS1GA79JQ C 551
BS 1 611 RS1GA79TF
BS 612 1299 RS1GA79JQ

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AGATGACCAGTCCACCAATCGGAATCCTAATTTCTCATAACTGCACAACAAAGAGACGAT
GAAGAAGAAAAAACGGTTGTCCCAGTCTTCAAAGTCTCTAGCTTTGGTATGTTCTTCAAG
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GAATCCAAGAACAGAGATCGGAGTCTGTAATTCAATTTTCAAGATAAAAAAAACGAAAAG
ATATTATGTTCCTAGGCAACAGATTCATAACTGGTCTCCATTTGACACAGTCCCAAGAAC
AGGGTTTAAAAAATTGTACTGTTGAACACACCTGAACCACCAGAGAAAATATTTAAGACC
AAAAGCAAAAG

QA 1 611 1 611
DS 

RD RS1GA79JQ 749 0 0
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CACAAGCAAAGTAAAAGGAAGCTTACCTATTTTCTAAAATATGCTAACATAGATGATTTT
AAAATAAAAAATCTCAACTAACATTAATGATTTGTACGGGAAACTTCAGATATTAGATAC
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CAGTAGACAGGCATGTAAAGTTGATTGTAAATAAAACCACACAAGTCTTACCTAACAGAG
GCTTTAAGAAAGACACCACATGTCAAATGGTAGACTGAAACAAGGATGAAGGATCAACTA
AAACTCCTTTCACATTTTTTTTATTGTTTTATCAGAAAGAAAGAAATAAAGCAACCAAAA
CTCTTTCTCTATCTGCAGTCTCCATAAACCAACTTGCACCATTTGATTAAAACAGTACCG
ACTTTGACTATCTAGACGAAAGAGAAAACTTTACCTTTACTTTCGTAAGATGCTGTGATC
CTAGCAATTCAAACTTGGCCATACCGCCATATGCAGCAGACCAATCTTGAATATTTTCTG
ATCCAATTCATCTCTCGAGCACTCTCAAAATGTAGACATGAAAACTTAATATCAAGAAAC
CATAACAAAATAAACAAGACCTTGACACC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TCTGTTCCTCCGGTCTCTGCCCAAGTAGATGATTCGATCGATGATGACGTTTTCGCGGCG
CCGTCTTCAGACTACGGCGGTTACTCTAACGGAGACGACGGTCCTATCTTGCCTCCTCCT
TCGGAGATGGAGTCTGATGAGGGAGCTGCTCTCAGAGAATGGAGAAGACAGAATGCGATT
CAACTTGAGGAGAAGGAGAAGAGAGAAAAGGAGTTAGCTTGTGAAAACAACAAAGCAGCC
AACAGAGAGAAAGAAAAGCTGTATGTGGAGACCCAAGAGAAGTTCTACGCAGAAGCCAGC
AAGAACTACTGGAAGGCAATAGCAGAGCTAGTGCCTAAAGAGGTTCCAACTATAGAGAAA
AGAAGAGGGAAGAAGAAAGAGGAAGATCCCAAGAAGCCAACAACAATCTCCGTGATTCAA
GGACCAAAGCCTGGTAAGCCAACCGATCTCTCGAGAATGAGACAGATATTGCTGAAGCTC
AAACAGAACCCGCCTGCTCACCTCAAACTCACTCCTCAACCTCCTCCATCTGAGGCTCCT
CCTCCAAAGAATGTTCCTGAAACCAACCCCGCCGAGGCAGTTGCTGCTTCTTAGGAAGCC
ATCTTCGCTTTTGTTATTCGTTTCTATGTGTTTGTTATATACAGCTGAGAGATATTGTAA
GGGCACATGTGTGTTATTATTATTAAC


BQ
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AF RS1BJ22TF U 1
AF RS1BJ22JQ C 299
BS 1 654 RS1BJ22TF
BS 655 655 RS1BJ22JQ
BS 656 749 RS1BJ22TF
BS 750 807 RS1BJ22JQ

RD RS1BJ22TF 749 0 0
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CTGGAGATGTCTGTCTTTGATGATGATTCGTTTGTTATACTCGGAGAGGATGCATCTGAG
TCTGTTCCTCCGGTCTCTGCCCAAGTAGATGATTCGATCGATGATGACGTTTTCGCGGCG
CCGTCTTCAGACTACGGCGGTTACTCTAACGGAGACGACGGTCCTATCTTGCCTCCTCCT
TCGGAGATGGAGTCTGATGAGGGAGCTGCTCTCAGAGAATGGAGAAGACAGAATGCGATT
CAACTTGAGGAGAAGGAGAAGAGAGAAAAGGAGTTAGCTTGTGAAAACAACAAAGCAGCC
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ATCTTCGCTTTTGTTATTCGTTTCTATGT

QA 1 749 1 749
DS 

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AAAGAAGAGGGAAGAAGAAAGAGGAAGATCCCAAGAAGCCAACAACAATTTCCGTGATTC
AAGGACCAAAGCCTGGTAAGCCAACCGATCTTTCGAGAATGAGACAGATATTGCTGAAGC
TCAAACAGAACCCGCCTGCTCACCTCAAACTCACTCCTCAACCTCCTCCATTTGAGGCTC
CTCCTCCAAAGAATGTTCCTGAAACCAACCCCGCCGAGGCAGTTGCTGCTTTTTAGGAAG
CCATTTTCGCTTTTGTTATTCGTTTTTATGTGTTTGTTATATACAGCTGAGAGATATTGT
AAGGGCACATGTGTGTTATTATTATTAAC

QA 1 509 1 509
DS 



AS 1 2

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ACACAGAGAGGTCAGATTCTCCACTTTAGCAAAAGATCTATAACACAACGCGTGGGCTGA
TGTGAAAAAAAAGAACTGAACCTGGGTAACGTTCATGGTGGGAATAGAGCGCATAAGATA
ATGAACTATCATGAACCCTGTGCGATTATGCCCGTGAGTACAGTGAACGAGGATATACTT
CTTAGGGTGTTTTTGATTAACGATGAACTGAATAGCCTGAAAGGATAGTACAGTGAGCTA
CTAACAAACAGTCGATAAGGTTGATTGAATTGGGGAAACAAGTACCTCGTTGACGAAGGA
GTTAACAGAGACATTATCTGGAACCGCATCACGACCCCTGCAAGCAATCTATAAAAGAAA
GATAAAGCAATCCGGTAAAGGAGGAGCAGACAATACAAACATAAAAAACAAGAATTGCAT
TTCACCTTAACATGCTTGATGTCATCCTTCTTTAAGTCTAATGTAGAATAGTAACGAGTT
GTATTAGTTAGATCAATCACTAGACCAAGCTGACACAGAAAAAAGAAGAGAGAGTACGTT
TAGGTCACAGAGGTTAGGTTAGAGAGTTGCAGATAGGATATAGAAAGAATAAGTGAAGAC
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CTTTTGCCAGGAGGAACATGTTCGTTGTAAGACTCGCTAAGGGGAACCTTAGAAGGAATG
ATGCATCCAATCTCCAGACCAAAACCAGGACAATCCAGCCAACCTAAAAGAAGAGCATTG
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RS1BK47TF U 1
AF RS1BK47JQ C 163
BS 1 584 RS1BK47TF
BS 585 841 RS1BK47JQ

RD RS1BK47TF 584 0 0
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GTTAACAGAGACATTATCTGGAACCGCATCACGACCCCTGCAAGCAATCTATAAAAGAAA
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GTATTAGTTAGATCAATCACTAGACCAAGCTGACACAGAAAAAA

QA 1 584 1 584
DS 

RD RS1BK47JQ 679 0 0
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AAGAAGAGAGAGTACGTTTAGGTCACAGAGGTTAGGTTAGAGAGTTGCAGATAGGATATA
GAAAGAATAAGTGAAGACAATTAACTTACTTTACGTCCATTGATTCTCTGGTTGCGGATA
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QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

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TAAAGTGAGAAAGACTGTGTATAGTCGTTGATATC


BQ
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AF RS1B105JQ C 1
AF RS1B105TF U 1
BS 1 335 RS1B105TF

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TAACCAAGTCTCGGAGGAGATTCTCTCCTTTTTCAACAAGTTATGTACAACAACAGAGTA
AAAAAACATCATGCCGTTTTTATGGCCTTATAAAAAGAAACTACAATGTTGCTACAACTA
ATTAATCTACTAATGTGTATCCAATAATGAAGCCGATCACTTGGCAAAATAATGGTTAAA
TAAAGTGAGAAAGACTGTGTATAGTCGTTGATATC

QA 1 335 1 335
DS 

RD RS1B105TF 335 0 0
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GCCTAACGTTGAGGTTGTAGTAATTGAGGATGGTCATCATTTTATCCAGCAAGAGAAGGC
TAACCAAGTCTCGGAGGAGATTCTCTCCTTCTTCAACAAGTTATGTACAACAACAGAGTA
AAAAAACATCATGCCGTTTTTATGGCCTTATAAAAAGAAACTACAATGTTGCTACAACTA
ATTAATCTACTAATGTGTATCCAATAATGAAGCCGATCACTTGGCAAAATAATGGTTAAA
TAAAGTGAGAAAGACTGTGTATAGTCGTTGATATC

QA 1 335 1 335
DS 



AS 1 2

CO CL6118Contig1 1065 2 6 U
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TGAATACGACATTGGAGACAACGGCAAGTTTGAGATTGGTGAAGAAGAAGACGAAGAGGA
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AGATAGTGACCATGAGAAGATGAACAGAGACGACAATAAGTGCTCTGGTCTTTGGGAAGA
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AGTGAATACACTAGTTGTTCACTAAAAAATATGATTAAAAGAAGAGATCACATGATTGGT
AGAGTCTTGATATCCAGAACTCTAGGAACTCTTCTTATTGATCACTCAACACACTACTCA
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AAAAAAAAGAACCAGTGAAGAAGGACTCATTACCACATCAACCTGCTGAATCAGATAGAG
GCTTTATTCCTCATGTATTTGTGCCATTCATTTGTCAGCTCAGCACCACATCTCCTACGT
TACTCAGCTCACAAATAGATGTCTATCAATGATGCGAGTGTCACCTGCATAAATTGTGTT
AAGCATGTAAGAATACACTTCTTTTATTCATATGGTCAGCATACTAGTATATATAGTATA
AACATAAATAGAAAGAAACACTTATGTGGCATATACGGTTTGAGTGTTGAGTATTGACCA
TTACGACAAGCAAAAACAGAGTATTTAAGCTTATTTCATTGCTAC


BQ
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AF RS1A886TF U 1
AF RS1A886JQ C 483
BS 1 826 RS1A886TF
BS 827 827 RS1A886JQ
BS 828 899 RS1A886TF
BS 900 900 RS1A886JQ
BS 901 909 RS1A886TF
BS 910 1065 RS1A886JQ

RD RS1A886TF 909 0 0
GCCTGATGACATTCGCTGGATGGTAGGAGCATGGAGAGACAGGATAATACTCTACTCAGG
AACATTTGGACCAACACAAGCTGTAGTTAAAGCCTTCTTAGACTCTGGTGCCAAAGCTGT
GATTGGTCCTTCAACCGAACCGCAAGAGACGCCTCTAATCACATCTCAAGGTTCCCCATT
TGAATACGACATTGGAGACAACGGCAAGTTTGAGATTGGTGAAGAAGAAGACGAAGAGGA
AGAGGAAGCGGATAGGGAACAGACGGAACCACCGACCCCGACAGCGACAAGTGACTGGGA
AGATAGTGACCATGAGAAGATGAACAGAGACGACAATAAGTGCTCTGGTCTTTGGGAAGA
CGAAGAAGAGCAAGTGTCTGAGTTTGTTTGCCAGTTATATGATATGTTGTTCAGAGAGAA
TGCAAGCGTCGATGTTGCTCTTCAGAAAGCTCTTGCCTCTCATCGAAAGCTCAGAAAAAC
AGTGAATACACTAGTTGTTCACTAAAAAATATGATTAAAAGAAGAGATCACATGATTGGT
AGAGTCTTGATATCCAGAACTCTAGGAACTCTTCTTATTGATCACTCAACACACTACTCA
GTGAATACAAGATAGCTTTGCAAATTCAGCAAATTGACTGATCCAACGATCTCATCGCAA
CCGTGTCGAGACTCATGGCGTCTACCAATAACATACAAAGAACAATAACATACAAAGCAT
AAAAAAAAGAACCAGTGAAGAAGGACTCATTACCACATCAACCTGCTGAATCAGATAGAG
GCTTTATTCCTCATGTATTTGTGCCATTCATTTGTCAGCTCAGCAC*ACATCTCCTACGT
TACTCAGCTCACAAATAGATGTCTATCAATGATGCGAGTGTCACCTGCATAAATTGTGT*
AAGCATGTA

QA 1 909 1 909
DS 

RD RS1A886JQ 583 0 0
TGAATACACTAGTTGTTCACTAAAAAATATGATTAAAAGAAGAGATCACATGATTGGTAG
AGTCTTGATATCCAGAACTCTAGGAACTCTTCTTATTGATCACTCAACACACTACTCAGT
GAATACAAGATAGCTTTGCAAATTCAGCAAATTGACTGATCCAACGATCTCATCGCAACC
GTGTCGAGACTCATGGCGTCTACCAATAACATACAAAGAACAATAACATACAAAGCATAA
AAAAAAGAACCAGTGAAGAAGGACTCATTACCACATCAACCTGCTGAATCAGATAGAGGC
TTTATTCCTCATGTATTTGTGCCATTCATTTGTCAGCTCAGCACCACATCTCCTACGTTA
CTCAGCTCACAAATAGATGTCTATCAATGATGCGAGTGTCACCTGCATAAATTGTGTTAA
GCATGTAAGAATACACTTCTTTTATTCATATGGTCAGCATACTAGTATATATAGTATAAA
CATAAATAGAAAGAAACACTTATGTGGCATATACGGTTTGAGTGTTGAGTATTGACCATT
ACGACAAGCAAAAACAGAGTATTTAAGCTTATTTCATTGCTAC

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 2

CO CL6119Contig1 899 2 2 U
GGAGGATAAAAGTGTCTCCATCTGCTCCTCTCGAAAGAGCAACAACGAAGAATCGTACCC
CTGGTGCCAAACCATTGAACTTCAGAGGTTTGCAGAGAATAAAGAGTTCAGGTTGAGAGG
AGAAAGGAGCGATGACGTCACTGCGTCAATGCTTCTGCGTATCGGTGACTCATCTGGCAA
AGGAAGAATCGTACACTTTGCATTCTATCTGAATTCAGACACAGCAACAGCAATCGCTGA
GGAAATGGTTGAGGAGCTGCATCTAACAAGCCAAGAGGTTGTAGTGATAGCTGATATGAT
CGATGACTTGATAATGCAACTTCACTCTGAGCGGACCTCATCGCATCCAAATCAAGTCTC
TCAGGATCTAGCCGTCCTTGAGGACCATGAAGCAGCAAATCAGCTAACTGCGAACTCCAA
AGATGAAGAATCAATGAAGTCTGGCATATCAACAGACTATTACTTACCTTTTTCCTCAAA
CGGAAGTGCTGCTAGGGAAGCTGGCCAGGATGCAGAGTCGATGAGCTCGTTTCTTGATTC
TTGCTCAATGATGTCAACCCTTTACATTTCAGACAACGAGTACCCAGAAGATCTCAAGAC
AGAACTGAACATGATTGAGTCACAATTTAACCAGTCCGTCCAAGATCTGATGAAACTGAA
GGAAGATGCTATAGAGAACGCAAAGAGAAAATGGATTATGAAAAAGCAATCAAAACCCTG
ATTTTGGTACTTATTCTTGGGGCCATGATTGGTGTAATGGTATACTTCAATTGGTGTTTG
GATATTTTGATTTGATGTATTTTGTACTTAGCAAACATGGAATAGTGTTATTCGACTTCT
ATTATTTCTGTACTTAACAAACATGGAATAGTGTTATTCGACTTCTATTATTTCTGACG


BQ
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AF RS1DP36TF U 1
AF RS1DP36JQ C 222
BS 1 638 RS1DP36TF
BS 639 899 RS1DP36JQ

RD RS1DP36TF 638 0 0
GGAGGATAAAAGTGTCTCCATCTGCTCCTCTCGAAAGAGCAACAACGAAGAATCGTACCC
CTGGTGCCAAACCATTGAACTTCAGAGGTTTGCAGAGAATAAAGAGTTCAGGTTGAGAGG
AGAAAGGAGCGATGACGTCACTGCGTCAATGCTTCTGCGTATCGGTGACTCATCTGGCAA
AGGAAGAATCGTACACTTTGCATTCTATCTGAATTCAGACACAGCAACAGCAATCGCTGA
GGAAATGGTTGAGGAGCTGCATCTAACAAGCCAAGAGGTTGTAGTGATAGCTGATATGAT
CGATGACTTGATAATGCAACTTCACTCTGAGCGGACCTCATCGCATCCAAATCAAGTCTC
TCAGGATCTAGCCGTCCTTGAGGACCATGAAGCAGCAAATCAGCTAACTGCGAACTCCAA
AGATGAAGAATCAATGAAGTCTGGCATATCAACAGACTATTACTTACCTTTTTCCTCAAA
CGGAAGTGCTGCTAGGGAAGCTGGCCAGGATGCAGAGTCGATGAGCTCGTTTCTTGATTC
TTGCTCAATGATGTCAACCCTTTACATTTCAGACAACGAGTACCCAGAAGATCTCAAGAC
AGAACTGAACATGATTGAGTCACAATTTAACCAGTCCG

QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1DP36JQ 678 0 0
CAGCAACAGCAATCGCTGAGGAAATGGTTGAGGAGCTGCATCTAACAAGCCAAGAGGTTG
TAGTGATAGCTGATATGATCGATGACTTGATAATGCAACTTCACTCTGAGCGGACCTCAT
CGCATCCAAATCAAGTCTCTCAGGATCTAGCCGTCCTTGAGGACCATGAAGCAGCAAATC
AGCTAACTGCGAACTCCAAAGATGAAGAATCAATGAAGTCTGGCATATCAACAGACTATT
ACTTACCTTTTTCCTCAAACGGAAGTGCTGCTAGGGAAGCTGGCCAGGATGCAGAGTCGA
TGAGCTCGTTTCTTGATTCTTGCTCAATGATGTCAACCCTTTACATTTCAGACAACGAGT
ACCCAGAAGATCTCAAGACAGAACTGAACATGATTGAGTCACAATTTAACCAGTCCGTCC
AAGATCTGATGAAACTGAAGGAAGATGCTATAGAGAACGCAAAGAGAAAATGGATTATGA
AAAAGCAATCAAAACCCTGATTTTGGTACTTATTCTTGGGGCCATGATTGGTGTAATGGT
ATACTTCAATTGGTGTTTGGATATTTTGATTTGATGTATTTTGTACTTAGCAAACATGGA
ATAGTGTTATTCGACTTCTATTATTTCTGTACTTAACAAACATGGAATAGTGTTATTCGA
CTTCTATTATTTCTGACG

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 2

CO CL6120Contig1 1074 2 2 U
GCTGTAAAGCGTCTCAAAGACTGTAACATCGCAGGCGGGGAAGTACAGTTTCAGACAGAA
GTAGAGACTATAAGTCTCGCTCTTCATCGCAATCTCCTCAGGCTTCGAGGTTTCTGTAGT
AGCAACAATGAGAGAATCTTGGTCTACCCTTACATGCCTAACGGAAGCGTCGCTTCACGG
TTAAAAGATCATATCCGAGGAGAACCAGCGTTAGACTGGTCGAGGAGGAAGAAGATAGCG
GTTGGTACGGCGAGGGGACTAGTGTACCTCCATGAGCAGTGTGACCCGAAGATTATACAC
CGTGATGTGAAAGCAGCTAACATTCTATTGGATGAGGACTTTGAGGCGGTTGTTGGTGAT
TTCGGGTTAGCCAAGCTTCTGGACCATAGAGAGTCACATGTCACGACCGCGGTCCGTGGA
ACCGTAGGCCACATTGCACCTGAGTACTTGTCCACTGGTCAGTCCTCGGAGAAGACTGAT
GTCTTTGGATTTGGTATACTGCTTCTTGAGCTCATCACGGGTCAGAAAGCTCTCGACTTT
GGTCGATCCTCGCACCAGAAAGGGGTCATGCTCGATTGGGTGAAGAAGCTGCATCAAGAA
GGGAAACTAAAGCAGTTAATAGACAAAGATCTTAGCGACAAGTTCGATAGAGTGGAGCTT
GAAGAAATAGTTCAAGTTGCTCTGCTTTGCACTCAGTTCAATCCATCTAACCGACCTAAA
ATGTCGGAAGTTATGAAAATGCTTGAAGGTGATGGTTTGGCTGAGAGATGGGAAGCTTCG
CAGAACGGTGGGGCGAAGTCGCTGCCTCCTCCGTTGCCGTCGGGGATGGTGAGTTCATCG
CCGCGTGTAAGATATTACTCCGATTACATCCAGGAATCGTCACTTGTCGTGGAAGCCATT
GAGCTCTCTGGTCCTCGATGAACAAGACTAATTATCATTCGCTTTTCTTTTCTTGGGTTT
GTTTTTATTTATTTTTTCTTAAAAAATGGTTTTATAGTTGTGGAGTTGAGTGTAATTTAC
TAGTTTTCTGTAAAAATAATATTTTTTATCTTCTGTAATATAATTGTTTAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CR75TF U 1
AF RS1CR75JQ C 305
BS 1 722 RS1CR75TF
BS 723 1074 RS1CR75JQ

RD RS1CR75TF 722 0 0
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GTAGAGACTATAAGTCTCGCTCTTCATCGCAATCTCCTCAGGCTTCGAGGTTTCTGTAGT
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TTAAAAGATCATATCCGAGGAGAACCAGCGTTAGACTGGTCGAGGAGGAAGAAGATAGCG
GTTGGTACGGCGAGGGGACTAGTGTACCTCCATGAGCAGTGTGACCCGAAGATTATACAC
CGTGATGTGAAAGCAGCTAACATTCTATTGGATGAGGACTTTGAGGCGGTTGTTGGTGAT
TTCGGGTTAGCCAAGCTTCTGGACCATAGAGAGTCACATGTCACGACCGCGGTCCGTGGA
ACCGTAGGCCACATTGCACCTGAGTACTTGTCCACTGGTCAGTCCTCGGAGAAGACTGAT
GTCTTTGGATTTGGTATACTGCTTCTTGAGCTCATCACGGGTCAGAAAGCTCTCGACTTT
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GGGAAACTAAAGCAGTTAATAGACAAAGATCTTAGCGACAAGTTCGATAGAGTGGAGCTT
GAAGAAATAGTTCAAGTTGCTCTGCTTTGCACTCAGTTCAATCCATCTAACCGACCTAAA
AT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RS1CR75JQ 770 0 0
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GGTTAGCCAAGCTTCTGGACCATAGAGAGTCACATGTCACGACCGCGGTCCGTGGAACCG
TAGGCCACATTGCACCTGAGTACTTGTCCACTGGTCAGTCCTCGGAGAAGACTGATGTCT
TTGGATTTGGTATACTGCTTCTTGAGCTCATCACGGGTCAGAAAGCTCTCGACTTTGGTC
GATCCTCGCACCAGAAAGGGGTCATGCTCGATTGGGTGAAGAAGCTGCATCAAGAAGGGA
AACTAAAGCAGTTAATAGACAAAGATCTTAGCGACAAGTTCGATAGAGTGGAGCTTGAAG
AAATAGTTCAAGTTGCTCTGCTTTGCACTCAGTTCAATCCATCTAACCGACCTAAAATGT
CGGAAGTTATGAAAATGCTTGAAGGTGATGGTTTGGCTGAGAGATGGGAAGCTTCGCAGA
ACGGTGGGGCGAAGTCGCTGCCTCCTCCGTTGCCGTCGGGGATGGTGAGTTCATCGCCGC
GTGTAAGATATTACTCCGATTACATCCAGGAATCGTCACTTGTCGTGGAAGCCATTGAGC
TCTCTGGTCCTCGATGAACAAGACTAATTATCATTCGCTTTTCTTTTCTTGGGTTTGTTT
TTATTTATTTTTTCTTAAAAAATGGTTTTATAGTTGTGGAGTTGAGTGTAATTTACTAGT
TTTCTGTAAAAATAATATTTTTTATCTTCTGTAATATAATTGTTTAAGCC

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 2

CO CL6121Contig1 962 2 2 U
GGAAGCGTTGAGAACCGAACCTAGATTTGATATCCCTTGTCTGCATCTGACGATGGAATT
CACTCCAGCCGATTTCGATAGGCTTATGATGGTCGACCTCGCTCGAAACGCTTGCGAGGA
ACAGTACATGAAGGATCCTCTTGATTCTGAGAATTTGCTAAAGTGGGGCGGAGCATTGCT
TGAGCTTTCACAGTTCCAGAGTGTTGCTGATGCCAAGCTCATGTTAGATGTTGCTCTATC
CAAGTTCGAGGAGGTATTGAAAATAAACCCAGGGAAGCATGAGGCTCTTTGGTGTCTTGG
CAACGCCTACTCTTCCCAAGCGTTTCTTAATCCAGACTCCGATGAAGCCCAAGCTCTCTT
TGATAAAGCCGCTGATTATTTCCAGAGAGCTGAAACTTTGGATCCAGGTAATGAGATGTA
TCTCAAGTCCATGGAAGTTCCAACAGAGGGGCCTAAACTGCATAAGGAGATACATAAGCA
TGGTGGAATGATACAGCAGGCACTAGCTGGAGGAGGAGGAGGTCCATCTGCTTCATCAAA
TGCTAGCGGTGGTGGTAAGAAGAACAAGAAGAAGAAGAACAATGACTTTACTTACGATGT
ATGCGGTTGGATAATTCTCGCCTTTGGGATTGTTGCTTGGGTTGGCATGGCTAAATCCCT
TGGCCCTCCCCCTCCCCCTGCTAGATAAAAAAAATGCTCTGCTTATTCGATTTCCCCAAC
AGAGAACGGTTCTAAAGTTGAATAGATCTTTTAACGTTTCTGGTGGCTATTATTGGTTTT
GTTTCGTTTACTCAGCCCAGCAAACTGTTTTTGTTTACTTAATTACATTAGGATGGTTTG
TTACTTGGTCTATTTCCGAGTAAAGAGCAACTATGTTTTGGTTTTGTGATACGAACACAT
TTTCTTTCTCTCTGTGTTTCACAGAAGGTGCTATGAGAATAAGCTCCGATGAAGCTCTAA
AC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RS1B247TF U 1
AF RS1B247JQ C 252
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BS 670 962 RS1B247JQ

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CACTCCAGCCGATTTCGATAGGCTTATGATGGTCGACCTCGCTCGAAACGCTTGCGAGGA
ACAGTACATGAAGGATCCTCTTGATTCTGAGAATTTGCTAAAGTGGGGCGGAGCATTGCT
TGAGCTTTCACAGTTCCAGAGTGTTGCTGATGCCAAGCTCATGTTAGATGTTGCTCTATC
CAAGTTCGAGGAGGTATTGAAAATAAACCCAGGGAAGCATGAGGCTCTTTGGTGTCTTGG
CAACGCCTACTCTTCCCAAGCGTTTCTTAATCCAGACTCCGATGAAGCCCAAGCTCTCTT
TGATAAAGCCGCTGATTATTTCCAGAGAGCTGAAACTTTGGATCCAGGTAATGAGATGTA
TCTCAAGTCCATGGAAGTTCCAACAGAGGGGCCTAAACTGCATAAGGAGATACATAAGCA
TGGTGGAATGATACAGCAGGCACTAGCTGGAGGAGGAGGAGGTCCATCTGCTTCATCAAA
TGCTAGCGGTGGTGGTAAGAAGAACAAGAAGAAGAAGAACAATGACTTTACTTACGATGT
ATGCGGTTGGATAATTCTCGCCTTTGGGATTGTTGCTTGGGTTGGCATGGCTAAATCCCT
TGGCCCTCC
ACC

QA 1 669 1 669
DS 

RD RS1B247JQ 711 0 0
AGGTATTGAAAATAAACCCAGGGAAGCATGAGGCTCTTTGGTGTCTTGGCAACGCCTACT
CTTCCCAAGCGTTTCTTAATCCAGACTCCGATGAAGCCCAAGCTCTCTTTGATAAAGCCG
CTGATTATTTCCAGAGAGCTGAAACTTTGGATCCAGGTAATGAGATGTATCTCAAGTCCA
TGGAAGTTCCAACAGAGGGGCCTAAACTGCATAAGGAGATACATAAGCATGGTGGAATGA
TACAGCAGGCACTAGCTGGAGGAGGAGGAGGTCCATCTGCTTCATCAAATGCTAGCGGTG
GTGGTAAGAAGAACAAGAAGAAGAAGAACAATGACTTTACTTACGATGTATGCGGTTGGA
TAATTCTCGCCTTTGGGATTGTTGCTTGGGTTGGCATGGCTAAATCCCTTGGCCCTCCCC
CTCCCCCTGCTAGATAAAAAAAATGCTCTGCTTATTCGATTTCCCCAACAGAGAACGGTT
CTAAAGTTGAATAGATCTTTTAACGTTTCTGGTGGCTATTATTGGTTTTGTTTCGTTTAC
TCAGCCCAGCAAACTGTTTTTGTTTACTTAATTACATTAGGATGGTTTGTTACTTGGTCT
ATTTCCGAGTAAAGAGCAACTATGTTTTGGTTTTGTGATACGAACACATTTTCTTTCTCT
CTGTGTTTCACAGAAGGTGCTATGAGAATAAGCTCCGATGAAGCTCTAAAC

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

CO CL6122Contig1 734 2 3 U
ATAAGAATGGCAATGTAAAAAGATAATTAATTAATGAGGATGATGATGTTGCTGAAGATA
GTTGGTAATGAAATTTAAAGAAGACTGAAAATAAAAATTATAAACAAAAAAATAAAAATA
AAGAACCAAACCAAGAACAGATATTCCATTTTTCTTCCCTTTCACACTTTGCATATGAAA
TCAAGATGTTGGTTTATTCTTCCTCTGCCCACAATGAAAGATCTCAGACATGGCAGCCAA
AGCAATTGCAGGATTTGGGAGTGAAGGAGCAGTAACCAAAGGGTCTGTTTGGGATGTTGC
AGTTAATTGCAAAGCAACAAGGTAGAGGTAGGCAAGCTCCTTTTACACCTCCACAACAAG
TGCAAACTGAACATATCTGGAAACTCCCAAGCTTCCTTCTTGTTTCATTCATTACGATAA
ACTTCTCCTCCATTAATGGCTCCATTCTCACCTCTCCTTCTCCTTCTTTTTTTAGATTGT
GCTGTTAGCTCATTTGCCTGGAGACTGAAAGTGACGAAGACTGAGAAGCAAAGAAGCAGC
AGAACAATAGAGATCTTAGATTCTTCTAAAGCTCTCATCTTCTTCTTTTTTTTTCTTTTT
TCCTTCTTTCGTTGCGAAAGAGTTGTGTTTTTTTTAGTAAAGTAGCTAATGACTTAATTT
TCTCTCTTCTTTCACTTTCGCCTTCTTCGTCCTCAACTCTCTCGAGCTACTTTTTTCAAT
TATTTGGTTAACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AN66JQ U 292
AF RS1AN66TF C 1
BS 1 296 RS1AN66TF
BS 297 547 RS1AN66JQ
BS 548 734 RS1AN66TF

RD RS1AN66JQ 265 0 0
GATGT
TTGCAGTTAATTGCAAAGCAACAAGGTAGAGGTAGGCAAGCTCCTTTTACACCTCCACAA
CAAGTGCAAACTGAACATATCTGGAAACTCCCAAGCTTCCTTCTTGTTTCATTCATTACG
ATAAACTTCTCCTCCATTAATGGCTCCATTCTCACCTCTCCTTCTCCTTCTTTTTTTAGA
TTGTGCTGTTAGCTCATTTGCCTGGAGACTGAAAGTGACGAAGACTGAGAAGCAAAGAAG
CAGCAGAACAA
ATAGAGATC

QA 6 256 6 256
DS 

RD RS1AN66TF 734 0 0
ATAAGAATGGCAATGTAAAAAGATAATTAATTAATGAGGATGATGATGTTGCTGAAGATA
GTTGGTAATGAAATTTAAAGAAGACTGAAAATAAAAATTATAAACAAAAAAATAAAAATA
AAGAACCAAACCAAGAACAGATATTCCATTTTTCTTCCCTTTCACACTTTGCATATGAAA
TCAAGATGTTGGTTTATTCTTCCTCTGCCCACAATGAAAGATCTCAGACATGGCAGCCAA
AGCAATTGCAGGATTTGGGAGTGAAGGAGCAGTAACCAAAGGGTCTGTTTGGGATGTTGC
AGTTAATTGCAAAGCAACAAGGTAGAGGTAGGCAAGCTCCTTTTACACCTCCACAACAAG
TGCAAACTGAACATATCTGGAAACTCCCAAGCTTCCTTCTTGTTTCATTCATTACGATAA
ACTTCTCCTCCATTAATGGCTCCATTCTCACCTCTCCTTCTCCTTCTTTTTT*AGATTGT
GCTGTTAGCTCATTTGCCTGGAGACTGAAAGTGACGAAGACTGAGAAGCAAAGAAGCAGC
AGAACAATAGAGATCTTAGATTCTTCTAAAGCTCTCATCTTCTTCTTTTTTTTTCTTTTT
TCCTTCTTTCGTTGCGAAAGAGTTGTGTTTTTTTTAGTAAAGTAGCTAATGACTTAATTT
TCTCTCTTCTTTCACTTTCGCCTTCTTCGTCCTCAACTCTCTCGAGCTACTTTTTTCAAT
TATTTGGTTAACAC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL6123Contig1 1058 2 6 U
GGAGAGGATTATTAATGAACCAACGGCTGCTGCTCTTTCGTATGGTATGACTAATAAGGA
GGGTTTGATTGCTGTGTTTGATCTTGGTGGTGGGACGTTCGATGTCTCTGTTTTGGAGAT
TTCTAATGGGGTTTTCGAGGTGAAAGCTACCAATGGTGATACCTTCTTGGGAGGAGAGGA
TTTTGATAATGCTCTGTTAGACTTCTTGGTAAATGAGTTCAAGACAAGTGAGGGAATAGA
CCTGGCAAAGGACAGACTTGCTCTGCAGAGGCTTCGAGAAGCTGCTGAGAAGGCGAAGAT
TGAACTGTCATCAACTTCTCAAACTGAGATTAATCTGCCGTTTATCACAGCTGATGCATC
TGGAGCGAAGCATTTTAACATCACCCTGACAAGGTCGAGGTTTGAGACTCTGGTGAATCA
CTTGATTGAGAGGACCCGTGATCCTTGCAAGAACTGCCTCAAGGATGCTGGTATAAGTGC
TAAGGAGGTTGATGAGGTTCTTCTTGTTGGAGGAATGACTCGTGTCCCCAAGGTGCAAAA
TGTGGTTGCGGAGATCTTTGGGAAGACTCCTAGTAAAGGTGTCAACCCTGATGAGGCTGT
TGCTATGGGGGCTGCGCTTCAAGGTGGTATCCTTCGTGGTGATGTCAAAGAGTTGCTGCT
CCTAGATGTCACACCTCTGTCGCTTGGTATTGAAACACTTGGTGGTGTCTTTACAAGATT
GATTGGCCGAAACACAACCATCCCCACGAAGAAGAGTCAGGTGTTCTCAACTGCAGCAGA
CAATCAGACGCAAGTCGGGATTAGAGTGCTTCAAGGTGTGCGTGAAATGGCATCAGACAA
CAAGCTGTTGGGAGAATTCGATCTAGTGGGCATTCCACCATCACCAAGAGGCATCCCTCA
GATCGAAGTAACATTCGACATCGATGCAAATGGCATTGTCACTGTTTCTGCCAAGGACAA
GACGACTGGTAAAGAGCAACAGATCACAATCCGATCGTCTGGTGGGCTGTCAGAGGATGA
TATCCAGAAGATGGTGAGAGACGCAGAGTTGCATGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BK08TF U 1
AF RS1CS32TF U 376
BS 1 551 RS1BK08TF
BS 552 552 RS1CS32TF
BS 553 760 RS1BK08TF
BS 761 761 RS1CS32TF
BS 762 806 RS1BK08TF
BS 807 1058 RS1CS32TF

RD RS1BK08TF 806 0 0
GGAGAGGATTATTAATGAACCAACGGCTGCTGCTCTTTCGTATGGTATGACTAATAAGGA
GGGTTTGATTGCTGTGTTTGATCTTGGTGGTGGGACGTTCGATGTCTCTGTTTTGGAGAT
TTCTAATGGGGTTTTCGAGGTGAAAGCTACCAATGGTGATACCTTCTTGGGAGGAGAGGA
TTTTGATAATGCTCTGTTAGACTTCTTGGTAAATGAGTTCAAGACAAGTGAGGGAATAGA
CCTGGCAAAGGACAGACTTGCTCTGCAGAGGCTTCGAGAAGCTGCTGAGAAGGCGAAGAT
TGAACTGTCATCAACTTCTCAAACTGAGATTAATCTGCCGTTTATCACAGCTGATGCATC
TGGAGCGAAGCATTTTAACATCACCCTGACAAGGTCGAGGTTTGAGACTCTGGTGAATCA
CTTGATTGAGAGGACCCGTGATCCTTGCAAGAACTGCCTCAAGGATGCTGGTATAAGTGC
TAAGGAGGTTGATGAGGTTCTTCTTGTTGGAGGAATGACTCGTGTCCCCAAGGTGCAAAA
TGTGGTTGCGGGGATCTTTGGGAAGACTCCTAGTAAAGGTGTCAACCCTGATGAGGCTGT
TGCTATGGGGGCTGCGCTTCAAGGTGGTATCCTTCGTGGTGATGTCAAAGAGTTGCTGCT
CCTAGATGTCACACCTCTGTCGCTTGGTATTGAAACACTTGGTGGTGTCTTTACAAGATT
GATTGGCCGAAACACAACCATCCCCACGAAGAAGAGTCAG*TGTTCTCAACTGCAGCAGA
CAATCAGACGCAAGTCGGGATTAGAG

QA 1 806 1 806
DS 

RD RS1CS32TF 683 0 0
G
AACATCACCCTGACAAGGTCGAGGTTTGAGACTCTGGTGAATCACTTGATTGAGAGGACC
CGTGATCCTTGCAAGAACTGCCTCAAGGATGTTGGTATAAGTGCTAAGGAGGTTGATGAG
GTTCTTCTTGTTGGAGGAATGACTCGTGTCCCCAAGGTGCAAAATGTGGTTGCGGAGATC
TTTGGGAAGACTCCTAGTAAAGGTGTCAACCCTGATGAGGCTGTTGCTATGGGGGCTGCG
CTTCAAGGTGGTGTCCTTCGTGGTGATGTCAAAGAGTTGCTGCTCCTAGATGTCACACCT
CTGTCGCTTGGTATTGAAACACTTGGTGGTGTCTTTACAAGATTGATTGGCCGAAACACA
ACCATCCCCACGAAGAAGAGTCAGGTGTTCTCAACTGCAGCAGACAATCAGACGCAAGTC
GGGATTAGAGTGCTTCAAGGTGTGCGTGAAATGGCATCAGACAACAAGCTGTTGGGAGAA
TTCGATCTAGTGGGCATTCCACCATCACCAAGAGGCATCCCTCAGATCGAAGTAACATTC
GACATCGATGCAAATGGCATTGTCACTGTTTCTGCCAAGGACAAGACGACTGGTAAAGAG
CAACAGATCACAATCCGATCGTCTGGTGGGCTGTCAGAGGATGATATCCAGAAGATGGTG
AGAGACGCAGAGTTGCATGCTC

QA 2 683 2 683
DS 



AS 1 2

CO CL6124Contig1 1336 2 2 U
TCACAGAAAACCCTAGCGCTCGCCTCGGTAATCAATCAACCAATGGAAGGAAGAAGTGCG
ATTCGGGGATGTAGTGGGAAGAAGAAGAAGGTGAGTGGGTTAATGTCCTGCCAGATGATG
TGTTTGTGGACTGCCTGGCTCAGTTGTCGCGATTGGACCTCGTGGCCTTATCTATGGTCT
CCAGGAGACACCGGTATCTCGCAGGGTCCCGTAAACTCTGGTCCATGAGGTATCGGATGG
ATAGGGTGGAGCCATATGTGTATGTATTTATGCACATGTATCCAGATCCAAACCCACGGT
GGTTCGTCTTCCACCCCGTGCAACGTCGGCTGAAACGGATCCATCCGAGCTTGTGTCCTG
CTGCTCCACTAGAAGGATCCTGTTTCGTGAGGACGGAATCGGGGATCTATACTATCGGTG
GACTCGTGGACGGCAAACCCACATCGGAAGTCACGTTTTTGGATTGTATCGATCACACAG
TGCACCGATTTGCGCCCATGAAGATGGCTCGAAGCGGAGCATCGGCATGCTTCATAGAGG
ACGGGGAGAATAAAAAGATATATGTGTTTGGGAGGGTGCTGGGATGCTGCTGATTCCTCC
TCAAACTGGGGTAGAGGTATATGATATCGATACAGAAACTTGGGAGTTGTTGTCTGTGTC
TATCCCCAAGATGCCCCTCAAAATCAAAGAAATTATGGTGATCGATGAGAAGCATGTCTA
CACGGTTGATGAGGATGGTGAAATCTTCTTTTTCTTAACTAGTGAATGTAAGTTTTGGAC
AGGCGGAGAAAAAGAATTTGACCCGGAAAATAAAAACGATTGGCGTTTGTTTGATCAGAC
ATTTTTCTGCCGTGGTGTCGGCGGGAGAATACTGTGGCGTTCTCTATCTTACTTGGATTG
GAAGGAAGTCAAAGGTTTGGAAGAGCTGCAGCAGAAACACATCATTACAATCTGCGGCTT
CTCTGTTGAGAGGATGGCCATCTTCTGGTCCCAAGGTCCTGCTTATCAGACTTTGGAGCT
TTGGTTTGCTGAGATTTCCCTCAATGTACGCTGGGAAGGTGAGGAATTGGAGGTTTGGGG
GAACATTGAGTGGTCCGGTGCTGTCTTCTCAGACTCATCATGTGCTGCCTTTAACTTATT
ATATGCTCATTCTCTCTATGTCTGAATATTCTTAATCCTTTTGTTTTTCAAAAAACCTAT
TTCAACTTTTATCTTACTGTTTGTGTGATTTATATAATTTTGGAATTCTGTCTGAAAGGG
CTTTACTCTTGTGCTAAGTGTATTTTTGCTTTTGAAGATAACATTATACTGCAAACATGT
TATTTGATTTTTGCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AI33TF U 1
AF RS1AI33JQ C 455
BS 1 726 RS1AI33TF
BS 727 1336 RS1AI33JQ

RD RS1AI33TF 730 0 0
TCACAGAAAACCCTAGCGCTCGCCTCGGTAATCAATCAACCAATGGAAGGAAGAAGTGCG
ATTCGGGGATGTAGTGGGAAGAAGAAGAAGGTGAGTGGGTTAATGTCCTGCCAGATGATG
TGTTTGTGGACTGCCTGGCTCAGTTGTCGCGATTGGACCTCGTGGCCTTATCTATGGTCT
CCAGGAGACACCGGTATCTCGCAGGGTCCCGTAAACTCTGGTCCATGAGGTATCGGATGG
ATAGGGTGGAGCCATATGTGTATGTATTTATGCACATGTATCCAGATCCAAACCCACGGT
GGTTCGTCTTCCACCCCGTGCAACGTCGGCTGAAACGGATCCATCCGAGCTTGTGTCCTG
CTGCTCCACTAGAAGGATCCTGTTTCGTGAGGACGGAATCGGGGATCTATACTATCGGTG
GACTCGTGGACGGCAAACCCACATCGGAAGTCACGTTTTTGGATTGTATCGATCACACAG
TGCACCGATTTGCGCCCATGAAGATGGCTCGAAGCGGAGCATCGGCATGCTTCATAGAGG
ACGGGGAGAATAAAAAGATATATGTGTTTGGGAGGGTGCTGGGATGCTGCTGATTCCTCC
TCAAACTGGGGTAGAGGTATATGATATCGATACAGAAACTTGGGAGTTGTTGTCTGTGTC
TATCCCCAAGATGCCCCTCAAAATCAAAGAAATTATGGTGATCGATGAGAAGCATGTCTA
CACGGT
GATG

QA 1 726 1 726
DS 

RD RS1AI33JQ 882 0 0
ACGTTTTGGA
TGTATCGATCACACAGTGCACCGATTTGCGCCCATGAAGATGGCTCGAAGCGGAGCATCG
GCATGCTTCATAGAGGACGGGGAGAATAAAAAGATATATGTGTTTGG*AGGGTGCTGGGA
TGCTGCTGATTCCTCCTCAAACTGGG*TAGAGGTATATGATATCGATACAGAAACTTGGG
AGTTGTTGTCTGTGTCTATCCCCAAGATGCCCCTCAAAATCAAAGAAATTATGGTGATCG
ATGAGAAGCATGTCTACACGGTTGATGAGGATGGTGAAATCTTCTTTTTCTTAACTAGTG
AATGTAAGTTTTGGACAGGCGGAGAAAAAGAATTTGACCCGGAAAATAAAAACGATTGGC
GTTTGTTTGATCAGACATTTTTCTGCCGTGGTGTCGGCGGGAGAATACTGTGGCGTTCTC
TATCTTACTTGGATTGGAAGGAAGTCAAAGGTTTGGAAGAGCTGCAGCAGAAACACATCA
TTACAATCTGCGGCTTCTCTGTTGAGAGGATGGCCATCTTCTGGTCCCAAGGTCCTGCTT
ATCAGACTTTGGAGCTTTGGTTTGCTGAGATTTCCCTCAATGTACGCTGGGAAGGTGAGG
AATTGGAGGTTTGGGGGAACATTGAGTGGTCCGGTGCTGTCTTCTCAGACTCATCATGTG
CTGCCTTTAACTTATTATATGCTCATTCTCTCTATGTCTGAATATTCTTAATCCTTTTGT
TTTTCAAAAAACCTATTTCAACTTTTATCTTACTGTTTGTGTGATTTATATAATTTTGGA
ATTCTGTCTGAAAGGGCTTTACTCTTGTGCTAAGTGTATTTTTGCTTTTGAAGATAACAT
TATACTGCAAACATGTTATTTGATTTTTGCCG

QA 11 882 11 882
DS 



AS 1 2

CO CL6125Contig1 1094 2 8 U
GGACCACTCCATTACCATTTCCTCTGTACTTTAGATTCCTTAACGTTGTAAGAAAGAAAA
CACCAGGGGAATAACATGGCGGATGGTAGTAGTAGCTGTACGTCGGAGTCCACCGTCGAC
GGAAGCTGCATCAGTAGAGAGATCATGCTGTTCGGTGTGAGGGTGGTTCTTGATCCGATG
AGGAAGAGTGTGAGTTTGAACAATTTGTCAGAGCACGAGCAGACCGAGGAGATCCCAAAG
ATCATGGCCGAGGATGAGAAGAACAAAACCTCCTCTGGTTACGCCTCAGCGGACGAGGCT
GTTCCGATAACTTCTAGCCGCGAGAGGAAACGAGGAGTTCCATGGACAGAGGAAGAGCAC
AAGCTGTTCTTGCTTGGGCTGCAGAAAGTAGGGAAAGGAGATTGGAAAGGAATATCTAAA
AACTTTGTCAAGAGCAGGACGTCTACACAAGTAGCTAGTCACGCTCAGAAGTACTTCCTC
CGGCGAAGTAATCTCAACCGTCGCCGGCGAAGATCTAGTCTTTTCGACATGACGACTGAC
ACGGTCATGCCCATGAAAGAAGATCAAGTGCTTGTACAGGAGAACACACCACAACAGGAA
GTTAACAACTTCTCTACACACCCGGTTATGCAAGTGTTTCCTTCTGGTGATAATGCATCA
GGGACTCAGTCTTATGGACATCATCTCTCTTCCTCTAACCTAATCAACTTGGTCCCATAT
ACTTTTCAAGCAAGACCTGAACCGATCTCACTCAGCCTCACACTAGCCTCATCTAATCTC
AACGAGCCTTCTTCCTCAAGGCACTCAGCATTCAACACGATTGGAGTCGCTTAGAGAAAC
CCCTCCCAGAAGGTTGAATCTGTAACACACCTTGTTTGTTTTTCTGTTGTACAGATAGGT
CTTGAGATTTTTTATGTATTTGGCTGAAGAGACCTGTGTCAAAAGAAGAATAATAGACAG
AGAAGTTTGGTTTTTTAGGGTTTCATCATCATCTTTTTTTTTTTTTTTTCCTTCCATGCT
TGGGAGTTGTTGTAATACTACTTATCTGGTCATTCGTGTGGATCTATATCAAAACTATAT
TAACGTTATGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FM10TF U 1
AF RS1FM10JQ C 521
BS 1 662 RS1FM10TF
BS 663 663 RS1FM10JQ
BS 664 715 RS1FM10TF
BS 716 716 RS1FM10JQ
BS 717 798 RS1FM10TF
BS 799 799 RS1FM10JQ
BS 800 811 RS1FM10TF
BS 812 1094 RS1FM10JQ

RD RS1FM10TF 811 0 0
GGACCACTCCATTACCATTTCCTCTGTACTTTAGATTCCTTAACGTTGTAAGAAAGAAAA
CACCAGGGGAATAACATGGCGGATGGTAGTAGTAGCTGTACGTCGGAGTCCACCGTCGAC
GGAAGCTGCATCAGTAGAGAGATCATGCTGTTCGGTGTGAGGGTGGTTCTTGATCCGATG
AGGAAGAGTGTGAGTTTGAACAATTTGTCAGAGCACGAGCAGACCGAGGAGATCCCAAAG
ATCATGGCCGAGGATGAGAAGAACAAAACCTCCTCTGGTTACGCCTCAGCGGACGAGGCT
GTTCCGATAACTTCTAGCCGCGAGAGGAAACGAGGAGTTCCATGGACAGAGGAAGAGCAC
AAGCTGTTCTTGCTTGGGCTGCAGAAAGTAGGGAAAGGAGATTGGAAAGGAATATCTAAA
AACTTTGTCAAGAGCAGGACGTCTACACAAGTAGCTAGTCACGCTCAGAAGTACTTCCTC
CGGCGAAGTAATCTCAACCGTCGCCGGCGAAGATCTAGTCTTTTCGACATGACGACTGAC
ACGGTCATGCCCATGAAAGAAGATCAAGTGCTTGTACAGGAGAACACACCACAACAGGAA
GTTAACAACTTCTCTACACACCCGGTTATGCAAGTGTTTCCTTCTGGTGATAATGCATCA
GG*ACTCAGTCTTATGGACATCATCTCTCTTCCTCTAACCTAATCAACTTGGTCC*ATAT
ACTTTTCAAGCAAGACCTGAACCGATCTCACTCAGCCTCACACTAGCCTCATCTAATCTC
AACGAGCCTTCTTCCTCA*GGCACTCAGCAT

QA 1 811 1 811
DS 

RD RS1FM10JQ 574 0 0
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AGAACACACCACAACAGGAAGTTAACAACTTCTCTACACACCCGGTTATGCAAGTGTTTC
CTTCTGGTGATAATGCATCAGGGACTCAGTTTTATGGACATCATCTTTCTTCCTCTAACC
TAATCAACTTGGTCCCATATACTTTTCAAGCAAGACCTGAACCGATCTCACTCAGCCTCA
CACTAGCCTCATTTAATTTCAACGAGCCTTTTTCCTCAAGGCACTCAGCATTCAACACGA
TTGGAGTCGCTTAGAGAAACCCCTCCCAGAAGGTTGAATCTGTAACACACCTTGTTTGTT
TTTCTGTTGTACAGATAGGTCTTGAGATTTTTTATGTATTTGGCTGAAGAGACCTGTGTC
AAAAGAAGAATAATAGACAGAGAAGTTTGGTTTTTTAGGGTTTCATCATCATCTTTTTTT
TTTTTTTTTCCTTCCATGCTTGGGAGTTGTTGTAATACTACTTATCTGGTCATTCGTGTG
GATCTATATCAAAACTATATTAACGTTATGTTCC

QA 1 574 1 574
DS 



AS 1 2

CO CL6126Contig1 754 2 5 U
GGGTTTTGAACCAGAATCCGTTTTCGCTCTTGTGATCGGCGGCTTTACGAGTTCTGCGTT
TGTCGGATTCTGAGTTTTGTCGTCTTCCTCTCTGTCGCCACAGAACCGAAAAAAAACCAA
ACCGTTAGATGCATCGAATCGAAGAATGCAATTGTGACGAAATCGAAGGAATGAACATGT
GCACTTCTTTGTAGCCCACCCTGCATAGACAGTAGATATCAGTGGAAAAGATGAGAAGAC
CGAGCCAAATGATGAAGCTACTTGTAGCATCCTTTTTCGGAGTTATAGTTGGTTTCCTTA
TGGGTATTACTTTTCCAACTCTCACCTTAACTAAGATGAATCTTCCTTCCTCACTGTTCC
CCTCCATTGACCTTGCATACATTGAGGATAACTTATCAAGAAAAAGACTGTTTAGCTCTT
GGTCTTCCACAAAGAGCCCCAAACCCAAGAATGACATCCCTGATCCCCCCTATACCTATA
ATGACACTAAGATATGGGTTGCTAGTAATCCCCGTGGTGCTGAGAGGCTGCCTCCTGATA
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GAAAACCAAGCAGCGGTATCTTGTAACGTTTACGGTTGGTTATGGTCAGAGGAAAAACAT
AGACGCTGCGTTGAAGAAGTTCTCAGATAACTTCACAATAATGCTGTTTCACTACGATGG
CCCGGGCTAGTGAATGGGAAGAGTTTGAATGGTC


BQ
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AF RS1DP46TF U 6
AF RS1H253TF U 1
BS 1 124 RS1H253TF
BS 125 128 RS1DP46TF
BS 129 229 RS1H253TF
BS 230 230 RS1DP46TF
BS 231 754 RS1H253TF

RD RS1DP46TF 439 0 0
GG
GAACCAGAATCCGTTTTCGCTCTTGTGATCGGCGGCTTTACGAGTTCTGCGTTTGTCGGA
TTCTGAGTTTTGTCGTCTTCCTCTCTGTCGCCACAGAACCGAAAAAAAACCAAACCGTTA
GATGCATCGAATCGAAGAATGCAATTGTGACGAAATCGAGGGAATGAACATGTGCACTTC
TTTGTAGCCCACCCTGCATAGACAGTAGATATCAGTGGAAAAGATGAGAAGACCGAGCCA
AATGATGAAGCTACTTGTAGCATCCTTTTTCGGAGTTATAGTTGGTTTCCTTATGGGTAT
TACTTTTCCAACTCTCACCTTAACTAAGATGAATCTTCCTTCCTCACTGTTCCCCTCCAT
TGACCTTGCATACATTGAGGATAGCTTATCAAGAAAAAGACTGTTTAGCTCTTGGTCTTC
CACAAAGAGCCCCAAAC

QA 3 439 3 439
DS 

RD RS1H253TF 754 0 0
GGGTTTTGAACCAGAATCCGTTTTCGCTCTTGTGATCGGCGGCTTTACGAGTTCTGCGTT
TGTCGGATTCTGAGTTTTGTCGTCTTCCTCTCTGTCGCCACAGAACCGAAAAAAAACCAA
ACCG****ATGCATCGAATCGAAGAATGCAATTGTGACGAAATCGAAGGAATGAACATGT
GCACTTCTTTGTAGCCCACCCTGCATAGACAGTAGATATCAGTGGAAAATATGAGAAGAC
CGAGCCAAATGATGAAGCTACTTGTAGCATCCTTTTTCGGAGTTATAGTTGGTTTCCTTA
TGGGTATTACTTTTCCAACTCTCACCTTAACTAAGATGAATCTTCCTTCCTCACTGTTCC
CCTCCATTGACCTTGCATACATTGAGGATAACTTATCAAGAAAAAGACTGTTTAGCTCTT
GGTCTTCCACAAAGAGCCCCAAACCCAAGAATGACATCCCTGATCCCCCCTATACCTATA
ATGACACTAAGATATGGGTTGCTAGTAATCCCCGTGGTGCTGAGAGGCTGCCTCCTGATA
TAGTCACCCCTGAATCAGATTTATACCTCCGTCGATTGTGGGGTGACCCAATGAGGATTT
GAAAACCAAGCAGCGGTATCTTGTAACGTTTACGGTTGGTTATGGTCAGAGGAAAAACAT
AGACGCTGCGTTGAAGAAGTTCTCAGATAACTTCACAATAATGCTGTTTCACTACGATGG
CCCGGGCTAGTGAATGGGAAGAGTTTGAATGGTC

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

CO CL6127Contig1 982 2 6 U
GGAGGACAGGAACAGCTTTTAGACTCTTCTGGGCACAGAGAGAAAGAAGAACACCTTCTT
CTTCCTCAGAATATACCAGTCCGAGATCGTAGAATCTATTTCAGATCCGTTTACTGTTTC
GATGCCTTCACGCAGACGTACCCTCCTCAAAGTCATCATCCTCGGTGATAGCGGGGTGGG
GAAGACCTCTTTGATGAATCAATATGTTAATAAAAAGTTTAGCAACCAGTACAAGGCCAC
CATCGGAGCTGACTTCTTGACTAAGGAAGTTCAGTTTGAAGACCGACTTTTCACTTTGCA
GATCTGGGATACAGCTGGACAAGAAAGGTTTCAGAGCCTTGGTGTAGCGTTCTACCGTGG
TGCCGATTGCTGTGTTCTCGTATATGATGTCAACTCCATGAAGTCATTTGAAAATCTCAA
CAACTGGAGAGAAGAGTTTCTCATCCGGGCGAGTCCATCGGATCCAGAGAACTTTCCGTT
TGTTCTTATTGGAAACAAGGTCGACGTGGATGGTGGAAACAGCAGAGTGGTTTCAGAGAA
AAAGGCTAAAGCTTGGTGTGCTTCAAAGGGAAACATCCCTTACTTTGAGACCTCTGCTAA
GGAAGGCACCAATGTAGAGGAAGCTTTCCAGTGCATCGCCAATAACGCATTAAAGAGCGG
AGAAGAGGAAGAGCTGTACCTGCCAGACACAATCGATGTCAGGACAAGCAATCAACAGAG
GTCTACAGGGTGTGAATGCTAAGGGATTTGATTCTCTCCCAGAAGAATGCTTTTGAGTTC
AACAACGGGAAGTTTGTCTCTCCTCCCATTACATCTTTTCTTCACCAGTTATCTCTCTAA
AGATATCATATTAAATGGCTGTACATTGTTCTTTCTCTTTGTGGGTAAAAGAACCCTTCA
AAGCGATTTAACTTGTTTAATAAGTATATTATGGTTTGAAAAACGTTATTATGCATCTTT
GGATATTTAATTATAAACAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FA01TF U 1
AF RS1FA01JQ C 308
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CTTCCTCAGAATATACCAGTCCGAGATCGTAGAATCTATTTCAGATCCGTTTACTGTTTC
GATGCCTTCACGCAGACGTACCCTCCTCAAAGTCATCATCCTCGGTGATAGCGGGGTGGG
GAAGACCTCTTTGATGAATCAATATGTTAATAAAAAGTTTAGCAACCAGTACAAGGCCAC
CATCGGAGCTGACTTCTTGACTAAGGAAGTTCAGTTTGAAGACCGACTTTTCACTTTGCA
GATCTGGGATACAGCTGGACAAGAAAGGTTTCAGAGCCTTGGTGTAGCGTTCTACCGTGG
TGCCGATTGCTGTGTTCTCGTATATGATGTCAACTCCATGAAGTCATTTGAAAATCTCAA
CAACTGGAGAGAAGAGTTTCTCATCCGGGCGAGTCCATCGGATCCAGAGAACTTTCCGTT
TGTTCTTATTGGAAACAAGGTCGACGTGGATGGTGGAAACAGCAGAGTGGTTTCAGAGAA
AAAGGCTAAAGCTTGGTGTGCTTCAAAGGGAAACATCCCTTACTTTGAGACCTCTGCTAA
GGAAGGCACCAATGTAGAGGAAGCTTTCCAGTGCATCGCCCATAACGCATTAAAGAGCGG
AGAAGAGGAAGAGCTGTACCTGCCAGACACAATCGATGTCAG*ACAAGCAATCAACAGAG
GTCT

QA 1 724 1 724
DS 

RD RS1FA01JQ 675 0 0
GATACAGCTGGACAAGAAAGGTTTCAGAGCCTTGGTGTAGCGTTCTACCGTGGTGCCGAT
TGCTGTGTTCTCGTATATGATGTCAACTCCATGAAGTCATTTGAAAATCTCAACAACTGG
AGAGAAGAGTTTCTCATCCGGGCGAGTCCATCGGATCCAGAGAACTTTCCGTTTGTTCTT
ATTGGAAACAAGGTCGACGTGGATGGTGGAAACAGCAGAGTGGTTTCAGAGAAAAAGGCT
AAAGCTTGGTGTGCTTCAAAGGGAAACATCCCTTACTTTGAGACCTCTGCTAAGGAAGGC
ACCAATGTAGAGGAAGCTTTCCAGTGCATCGCCAATAACGCATTAAAGAGCGGAGAAGAG
GAAGAGCTGTACCTGCCAGACACAATCGATGTCAGGACAAGCAATCAACAGAGGTCTACA
GGGTGTGAATGCTAAGGGATTTGATTCTCTCCCAGAAGAATGCTTTTGAGTTCAACAACG
GGAAGTTTGTCTCTCCTCCCATTACATCTTTTCTTCACCAGTTATCTCTCTAAAGATATC
ATATTAAATGGCTGTACATTGTTCTTTCTCTTTGTGGGTAAAAGAACCCTTCAAAGCGAT
TTAACTTGTTTAATAAGTATATTATGGTTTGAAAAACGTTATTATGCATCTTTGGATATT
TAATTATAAACAGCT

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL6128Contig1 644 2 2 U
GGAAAACAATCTCACACATCTCTCTCTCTCTATACCATGAAGAACACTCATTTTTGATCT
TTCAAGAGCTCATTAATTCTGTATAATCTGAATAGACTCTCTTTTGTTTTTGTGTGTGTT
CTTGTAATATAAGCTCATAATCTTATACTTGTATAACATGTGATGCGATCTCCTCACATC
ATCGTTTCACTTGCTCTCCTTTTCTTCCTCTCTCTAATACTCCAGGCACATCAAAGAACC
ATTGGTCAAACTCACCGGATTGGCTCCAATGTCCAACACGTCAATGATGCGGCGGTGACT
TCCCCGGAAGGGAGAAGACGAGAGACCTTTAGGGTTCGGCGGCCGATGACCTCATGGCGG
AAGGGGAAGATGCTCAATAACAGTGAACATGGAGTCCCAAGTGGTCCGAATCCCATCTCC
AATAGGTAGAATTATATACTATAAATATATATATTATTACAGGGCTTACTGTATGAATAC
TCTGCCTAGTAGTCTAGTATGTCTCTTTGCTTATGAGGTCGCACGTACAAAAGTCACCGA
ATGTTACCGGTTGTCTGTTGATTCAGAGTTGGAAACTTCAAAATTTGCAGGTGAATTGTT
TTATGGTAGTGACATGGAAAATAATAATATCTTACTGTAACTCC


BQ
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AF RS1GL24TF U 1
AF RS1GL24JQ C 107
BS 1 513 RS1GL24TF
BS 514 644 RS1GL24JQ

RD RS1GL24TF 513 0 0
GGAAAACAATCTCACACATCTCTCTCTCTCTATACCATGAAGAACACTCATTTTTGATCT
TTCAAGAGCTCATTAATTCTGTATAATCTGAATAGACTCTCTTTTGTTTTTGTGTGTGTT
CTTGTAATATAAGCTCATAATCTTATACTTGTATAACATGTGATGCGATCTCCTCACATC
ATCGTTTCACTTGCTCTCCTTTTCTTCCTCTCTCTAATACTCCAGGCACATCAAAGAACC
ATTGGTCAAACTCACCGGATTGGCTCCAATGTCCAACACGTCAATGATGCGGCGGTGACT
TCCCCGGAAGGGAGAAGACGAGAGACCTTTAGGGTTCGGCGGCCGATGACCTCATGGCGG
AAGGGGAAGATGCTCAATAACAGTGAACATGGAGTCCCAAGTGGTCCGAATCCCATCTCC
AATAGGTAGAATTATATACTATAAATATATATATTATTACAGGGCTTACTGTATGAATAC
TCTGCCTAGTAGTCTAGTATGTCTCTTTGCTTA

QA 1 513 1 513
DS 

RD RS1GL24JQ 538 0 0
TTTTTGTGTGTGTTCTTGTAATATAAGCTCATAATCTTATACTTGTATAACATGTGATGC
GATCTCCTCACATCATCGTTTCACTTGCTCTCCTTTTCTTCCTCTCTCTAATACTCCAGG
CACATCAAAGAACCATTGGTCAAACTCACCGGATTGGCTCCAATGTCCAACACGTCAATG
ATGCGGCGGTGACTTCCCCGGAAGGGAGAAGACGAGAGACCTTTAGGGTTCGGCGGCCGA
TGACCTCATGGCGGAAGGGGAAGATGCTCAATAACAGTGAACATGGAGTCCCAAGTGGTC
CGAATCCCATCTCCAATAGGTAGAATTATATACTATAAATATATATATTATTACAGGGCT
TACTGTATGAATACTCTGCCTAGTAGTCTAGTATGTCTCTTTGCTTATGAGGTCGCACGT
ACAAAAGTCACCGAATGTTACCGGTTGTCTGTTGATTCAGAGTTGGAAACTTCAAAATTT
GCAGGTGAATTGTTTTATGGTAGTGACATGGAAAATAATAATATCTTACTGTAACTCC

QA 1 538 1 538
DS 



AS 1 2

CO CL6129Contig1 887 2 6 U
GGGATTCCCACCTTCTCATCAGTCGCGAAGAAGCTCTCAGCTCAGGGATTTTTTTTTTCG
AATTCTTACAGCGATGGATCTAAATCTGGATGCGCCGCACTCTATGGGGACGACAATCAT
CGGCGTCACTTACAATGGAGGTGTCGTTCTCGGAGCTGACTCACGTACCAGCACCGGGAT
GTACGTAGCGAATCGGGCTTCAGACAAGATCACACAACTCACAGACAATGTCTACGTCTG
TCGTTCCGGTTCGGCTGCTGATTCTCAAGTTGTCTCTGACTATGTCCGGTACTTCCTTCA
CCAGCACACGATTCAGCTGGGGCAGCCTGCAACCGTGAAGGTTTCTGCCAACCTTATCAG
GATGCTCGCATACAATAACAAGAACATGCTCCAAACCGGTCTTATTGTAGGTGGCTGGGA
CAAATACGAAGGTGGGAAGATCTATGGGATTCCTCTCGGTGGAACGGTAGTGGAGCAACC
GTTTGCTATTGGAGGCTCTGGCTCGAGTTACTTTTACGGTTTCTTTGATCAAGCATGGAA
AGAAAACATGACCAAAGAAGAAGCCGAGCAACTTGTTGTGAAGGCGGTTTCACTAGCCAT
AGCCCGTGATGGAGCCAGTGGAGGGGTTGTGCGGACTGTCATAATAAACTCAGAGGGAGT
GACCAGAAACTTCTATCCTGGTGATAAGTTGCAGCTTTGGCACGAGGAGTTGGAGCCACA
GAACTCTTTGTTAGACATCTTGAACGCTGCTGGTCCTGAGCCAATGGCCATATGATGCGA
ACAAACGATCATTCTCTTACTCTGTTAAACAAACTTGTTTTAGATGTTTGATTACATTTA
CCGATGTTTTACTCTAAACCCTGTGTGAAGTTAGGTTGGATTGACTC


BQ
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20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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A
AAA

QA 1 781 1 781
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ACATGACCAAAGAAGAAGCCGAGCAACTTGTTGTGAAGGCGGTTTCACTAGCCATAGCCC
GTGATGGAGCCAGTGGAGGGGTTGTGCGGACTGTCATAATAAACTCAGAGGGAGTGACCA
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CTTTGTTAGACATCTTGAACGCTGCTGGTCCTGAGCCAATGGCCATATGATGCGAACAAA
CGATCATTCTCTTACTCTGTTAAACAAACTTGTTTTAGATGTTTGATTACATTTACCGAT
GTTTTACTCTAAACCCTGTGTGAAGTTAGGTTGGATTGACTC

QA 1 522 1 522
DS 



AS 1 2

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CGTTTCTTGTATCTTTAAGACTAATTATTGGTACATTAATAAAATATATTT


BQ
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AF RS1GB64JQ C 1
AF RS1GB64TF U 1
BS 1 411 RS1GB64TF

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CGTTTCTTGTATCTTTAAGACTAATTATTGGTACATTAATAAAATATATTT

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DS 

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TCGCCACCGCATTGGTCGGTGTCTTGTCTTTCGTCTTCTAAGATGTGCTTCTATTCATCA
TTTTATTGTTTTCTCTCGGAGTTTTTTTTTCTTTAACTTTGTTTTCTTCCATGTCTTCCT
CGTTTCTTGTATCTTTAAGACTAATTATTGGTACATTAATAAAATATATTT

QA 1 411 1 411
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TGAAGATAATGTGGCCATTGGTGTCTTGGAGGAAAAAGTAGAATCAAAGGCTCAAGAAGA
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CAACAAGAGAATGCGGAAAGCTTGCCGACGAAGGATCCAACAGTTGGTGGTTTAGACGAA
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GGAAGTAGCGAATCAGCTGACTTGGATTCAGAGGCACCCCCAGAACCAGTAAACTCGATT
CCTGCTGCTATTGAAGCGAGTTCAGAACCATCAAATTCCTTGGTATCCGAGGAGATCAAA
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ATTGACAACTTATAAATCTACT


BQ
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AF RS1F686TF U 1
AF RS1F686JQ C 383
BS 1 691 RS1F686TF
BS 692 693 RS1F686JQ
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RD RS1F686TF 803 0 0
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TGAAGATAATGTGGCCATTGGTGTCTTGGAGGAAAAAGTAGAATCAAAGGCTCAAGAAGA
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TCCACAAATCTAGATGAAACTACGGAGGCCACACAGATGGGGGAAGTTGGTAATGCAAGT
AACAGTTCCGAGGATAATGTGACTCTCGGCGTCTTGGTGGAGAAAGAAGAATCAAAGGAG
CAACAAGAGAATGCGGAAAGCTTGCCGACGA**GATCCAACAGTTGGTGGTTTAGACGAA
CCGGAGCC*AAGTGCTCTGTCTCAGAATCTGACACCACGGGAGATGGTAAGAACTGTGTT
GGAAGTAGCGAATCAGCTGACTT

QA 1 803 1 803
DS 

RD RS1F686JQ 720 0 0
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QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

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CAAGGATGGAGACTCGTCACTTGTATGTGGCTACACGCTGGTATCATTCATCTTCTTACC
AATATGTTGAGTTTGATCTTCATCGGTATCCCCCTTGAGCAGCAGTTTGGCTTCATAAGA
GTGGGGCTTATCTACTTAGTATCTGGTCTCGGTGGAAGCATACTATCGTCTCTTTTCCTT
CAAGAAAGTATCTCTGTTGGAGCTTCGGGTGCTCTCTTTGGACTTCTTGGTGCTATGTTA
TCTGAACTTCTCACCAATTGGACTATCTATGCCAACAAAGCGGCTGCACTTGTCACACTC
TTATTCATCATAGCAATCAACTTAGGACTAGGCTTGCTACCTCGGGTTGACAATTTCGCG
CACATTGGAGGCTTCTTAACAGAGTTGTGCCTCGGGTTTGTCCTCCTTGTCCGACCACAG
TACGGTTGGGAAGCTTCTCGCACCAACACTTCTGTTACCAAACGCAAGCATAGCATGTAC
CAGTACGCTCTGTTCGTAGTTGCAGCGGTTCTACTAGTGGTTGGTTTAACTGTTGGATTA
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AGCTTCTTATATGCGTTCTTGTAACATATAATCTGTTCGTTCCTTTTGCCTTTGACCTCT
CTAGCCTTTTATAACATACATGTATATTATTACATTTGAATATTATCCTTACTCAACTCT
CAACTGAATAAATAGTATTGTTC


BQ
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AF RS1A981JQ C 442
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QA 1 720 1 720
DS 

RD RS1A981JQ 722 0 0
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TCTGGTCTCGGTGGAAGCATACTATCGTCTCTTTTCCTTCAAGAAAGTATCTCTGTTGGA
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ACCTGTTAATCATCATCACCATCATCATCATCATCTCAAAGCTTCTTATATGCGTTCTTG
TAACATATAATCTGTTCGTTCCTTTTGCCTTTGACCTCTCTAGCCTTTTATAACATACAT
GTATATTATTACATTTGAATATTATCCTTACTCAACTCTCAACTGAATAAATAGTATTGT
TC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

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CAAACTATATTCAGAGTGTGACACCCCGTCTATCTTTGGGTGGGGAAGTTTTCTGGGTTG
GTGTCCCTCGGAAGTCGGGTATAGGTTACGCTGCAAGATACGAAACTGATAAGATGGTCG
CCTCTGGGCAAGTTGCTAGCACTGGTCTTATGGCTATGAACTATGTTCAGAAGGTTTCCG
ATAAGGTCTCACTTGCCACTGATTTTATGTACAACTACTTTTCAAGAGAAGCTGTAGCTA
GCGTTGGGTATGACTACATGCTCAGACAGTCTCGTGTGCGGGGAAAGATAGATTCGAACG
GTGTTGCATCCGCTCTTCTAGAAGAAAGATTGAGTATGGGACTCAATTTTCTTATGTCTG
CAGAGCTTGACCATAAGAAGAAGGACTACAAGTTTGGATTCGGTTTAACAGTCGGCTAAT
AAGCACAGCGACGCACGGAATAAGCCCTGGCAGCTGCAGCAGCTGTTTGCGCGGGGGAAT
CGTTTCAATTTTATTATATTTTCTCCCTTCAAGATTTCAGTTTAGGCTATTTTCGTTGGG
AAGTTGAACGAAAAACAAAGGAAATATGTGTTGTTTATTTTCGGTTTAGGTTTTCTCTCC
AAGAACATCCAATTAAAGGAGGTTTTTTTTTTGTGTTTTTT


BQ
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AF RS1DH39TF U 1
AF RS1DH39JQ C 419
BS 1 680 RS1DH39TF
BS 681 1241 RS1DH39JQ

RD RS1DH39TF 680 0 0
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CTCAAATCGACGACAAGCCTAAAGTCGACGAGAAAGTCGATTACTCGAATCTCCCTTGCC
CTGTTCCCTATGAAGAACTCCACCGCGAAGCTTACATGTCTTTAAAGCCAGACACTTTCG
AGGGTCTACGCTTCGACTTTACCAAGGGGTTGAATCAGAAGTCTGGTCTCTGCCACAGTG
TAATGATGGGGCCAACCGAAGTTCCTTCTCAGTCGCCTGACACGGTGATTAAAATTCCAA
CTGCTCACTATGAGTTTGGTGCCAATTATATTGACCCGAAGTTGATGCTTGTTGGAAGGG
TTATGACTGATGGTAGACAAAGTGCAAGAGTGAGGGCTGATTTAACTGATAAGCTGATGG
TGAAGGCGAATGCTCAGCTGGCAAATGAGCCTCATATGTCGCAAGCAATGTTCAACTTTG
ATTACATGGGATCAGATTACAGAGCCCAACTTCAATTTGGGAACAATGCTCTAGTTGGAG
CAAACTATATTCAGAGTGTGACACCCCGTCTATCTTTGGGTGGGGAAGTTTTCTGGGTTG
GTGTCCCTCGGAAGTCGGGT

QA 1 680 1 680
DS 

RD RS1DH39JQ 823 0 0
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TGATTACATGGGATCAGATTACAGAGCCCAACTTCAATTTGGGAACAATGCTCTAGTTGG
AGCAAACTATATTCAGAGTGTGACACCCCGTCTATCTTTGGGTGGGGAAGTTTTCTGGGT
TGGTGTCCCTCGGAAGTCGGGTATAGGTTACGCTGCAAGATACGAAACTGATAAGATGGT
CGCCTCTGGGCAAGTTGCTAGCACTGGTCTTATGGCTATGAACTATGTTCAGAAGGTTTC
CGATAAGGTCTCACTTGCCACTGATTTTATGTACAACTACTTTTCAAGAGAAGCTGTAGC
TAGCGTTGGGTATGACTACATGCTCAGACAGTCTCGTGTGCGGGGAAAGATAGATTCGAA
CGGTGTTGCATCCGCTCTTCTAGAAGAAAGATTGAGTATGGGACTCAATTTTCTTATGTC
TGCAGAGCTTGACCATAAGAAGAAGGACTACAAGTTTGGATTCGGTTTAACAGTCGGCTA
ATAAGCACAGCGACGCACGGAATAAGCCCTGGCAGCTGCAGCAGCTGTTTGCGCGGGGGA
ATCGTTTCAATTTTATTATATTTTCTCCCTTCAAGATTTCAGTTTAGGCTATTTTCGTTG
GGAAGTTGAACGAAAAACAAAGGAAATATGTGTTGTTTATTTTCGGTTTAGGTTTTCTCT
CCAAGAACATCCAATTAAAGGAGGTTTTTTTTTTGTGTTTTTT

QA 1 823 1 823
DS 



AS 1 2

CO CL6135Contig1 1083 2 10 U
CGAACGTGGTCCCAAGATTGATGAGAATGTGGCAAGAGAGATCATTAATCATAGATCACT
TCGCCATCCTAATATTATCCGATTTAAGGAGGTGGTGTTGACTCCAACTCATCTTGCTAT
TGCTATGGAATATGCTGCTGGTGGTGAACTTTTCGAGCGTATTTGCAGTGCTGGCAGATT
CAGTGAGGATGAGGCGAGATACTTCTTTCAGCAGCTTATATCAGGTGTTAGCTATTGCCA
TGCTATGCAAATATGCCATAGAGATCTGAAGCTCGAGAATACACTCTTGGATGGAAGTCC
TGCTCCACGTCTCAAAATCTGTGATTTTGGTTATTCCAAGTCCTCTCTACTGCACTCGAG
GCCCAAATCAACGGTTGGAACTCCAGCATATATTGCACCTGAGGTCCTTTCTTGGAGCAT
ACCCATTCGAAGACCAGGAAGACCCCAAAAACTTCAGGAAAACAATACAAAAAATCATGG
CTGTTCAGTACAAGATCCCGGACTACGTCCACATCTCACAGGATTGCAAGCATCTCCTTT
CCCGTATATTTGTTGCCAATTCACTCAAGAGGATAAGCATTGCAGAAATCAAGAAACATC
CATGGTTCTTGAAGAACTTGCCGAGGGAACTAACAGAGACGGCTCAAGCTGCATATTTCA
AGAAAGAAATCCAACCTTCTCCCCGCAGACGGCTGAAGAGATCATGAAGATAGTGGATGA
AGCCAAAACGCCTCCGCCTGTTTCGAGATCCATAGGAGGGTTTGGGTGGGGAGGAAAGGG
AGATGCAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGTGGATGAAGAGGAGGTGGTGGAGGAAGAGGA
AGAGGAAGAAGATGAATATGACAAGACTGTAAAGGAAGTACACGCAAGTGGAGAAGTGAG
AATCAGTTGAATTTCTTGGTCTTTTGTGTAAGAAATAAAGAAAAGTTGTCGTTGGTTTGC
TGAAAGTTAAAAGTCTTGGTTGTATTTTATTTTTGTGTTTGCCAAATACAATACTTTGGT
TTTTGGTTTTGAAGATTTGTAAAATTTGGTATAAGAAGAAGAAGAACAAACAGAGGTTGA
GTC


BQ
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10 10 10 

AF RS1F143TF U 1
AF RS1F143JQ C 304
BS 1 641 RS1F143TF
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RD RS1F143TF 733 0 0
CGAACGTGGTCCCAAGATTGATGAGAATGTGGCAAGAGAGATCATTAATCATAGATCACT
TCGCCATCCTAATATTATCCGATTTAAGGAGGTGGTGTTGACTCCAACTCATCTTGCTAT
TGCTATGGAATATGCTGCTGGTGGTGAACTTTTCGAGCGTATTTGCAGTGCTGGCAGATT
CAGTGAGGATGAGGCGAGATACTTCTTTCAGCAGCTTATATCAGGTGTTAGCTATTGCCA
TGCTATGCAAATATGCCATAGAGATCTGAAGCTCGAGAATACACTCTTGGATGGAAGTCC
TGCTCCACGTCTCAAAATCTGTGATTTTGGTTATTCCAAGTCCTCTCTACTGCACTCGAG
GCCCAAATCAACGGTTGGAACTCCAGCATATATTGCACCTGAGGTCCTTTCTTGGAGCAT
ACCCATTCGAAGACCAGGAAGACCCCAAAAACTTCAGGAAAACAATACAAAAAATCATGG
CTGTTCAGTACAAGATCCCGGACTACGTCCACATCTCACAGGATTGCAAGCATCTCCTTT
CCCGTATATTTGTTGCCAATTCACTCAAGAGGATAAGCATTGCAGAAATCAAGAAACATC
CATGGTTCTTGAAGAACTTGCCGAGGGAACTAACAGAGACG*CTCAAGCTGCATATTTCA
AGAAAGAAATCCAACCTTCTCCC*GCAGACG*CTGA*GAGATCATGAAGATAGTGGATGA
AGCCAAA
CGCCTC

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1F143JQ 780 0 0
TCCACGTCTCAAAATCTGTGATTTTGGTTATTCCAAGTCCTCTCTACTGCACTCGAGGCC
CAAATCAACGGTTGGAACTCCAGCATATATTGCACCTGAGGTCCTTTCTTGGAGCATACC
CATTCGAAGACCAGGAAGACCCCAAAAACTTCAGGAAAACAATACAAAAAATCATGGCTG
TTCAGTACAAGATCCCGGACTACGTCCACATCTCACAGGATTGCAAGCATCTCCTTTCCC
GTATATTTGTTGCCAATTCACTCAAGAGGATAAGCATTGCAGAAATCAAGAAACATCCAT
GGTTCTTGAAGAACTTGCCGAGGGAACTAACAGAGACGGCTCAAGCTGCATATTTCAAGA
AAGAAATCCAACCTTCTCCCCGCAGACGGCTGAAGAGATCATGAAGATAGTGGATGAAGC
CAAAACGCCTCCGCCTGTTTCGAGATCCATAGGAGGGTTTGGGTGGGGAGGAAAGGGAGA
TGCAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGTGGATGAAGAGGAGGTGGTGGAGGAAGAGGAAGA
GGAAGAAGATGAATATGACAAGACTGTAAAGGAAGTACACGCAAGTGGAGAAGTGAGAAT
CAGTTGAATTTCTTGGTCTTTTGTGTAAGAAATAAAGAAAAGTTGTCGTTGGTTTGCTGA
AAGTTAAAAGTCTTGGTTGTATTTTATTTTTGTGTTTGCCAAATACAATACTTTGGTTTT
TGGTTTTGAAGATTTGTAAAATTTGGTATAAGAAGAAGAAGAACAAACAGAGGTTGAGTC

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL6136Contig1 1043 2 8 U
AGGGAAGTTGGTGGTCGAGGAAGTGCGAGCCGAGAGCTTGGAGAAGGAAGGAAGAAGCCA
TGATGGACGTGGCTATCGCTTCTTCTAAAGCTTGTTCATCAGTCTTATATACTTTAATAA
CTCCATTCAATAGGTCGAAGTCAATGTGAGCTTGCTCCGGTTCGAGCCCTGACCGGAAAA
GAAGAAGCGTGATCTTCTTCGGTTCGAGTCTGGTGCTCGCGTCGACTCTGCTTGGCTCCT
CCAATCAACCGAAGTTCCCAGTTGAGTCTGCGATCGCACTAGAGCAAATGAAAGAAATAG
AAGAAGAGGAGCTCGAGGAAGAAGAAGAGAGAAATGTCAATCTCTTCCAGAAAACTTCGG
CGTCTGTTGTGTATATCGAAGACATTGAGCTTCCCAAAACTTCCTCTGATGAATCCAATG
TTGAGGATAATGCAAAGATCGAAGGGACGGGTTCTGGCTTCGTTTGGGACAAGCTTGGTC
ACATTGTGACAAATTACCATGTGATTGCCAAGTTAGCTACAGATCAGAGTGGATTACAAC
GTTGTAAGGTATCTCTAGTTGATGCCACGGGGACAAAGTTTACCAAGGAAGCGAAAATTG
TGGGTCTTGATCCAGACAATGATCTTGCCGTTTGGAAGATTGAAACCGAAGGACGTGAGT
TGAAACCTGTTGCTCTTGGTACCTCCAGTGATCTACGCGTAGGTCAGAGTTGCTTTGCTA
TTGGGAATCCATATGGATATGAAAACACTTTGACAATAGGGGTAGTGAGTGGGTTGGGAA
GAGAGATACCTTCACCAAACGGGAAGAGTATTCGAGAAGCTATCCAAACAGATGCTGACA
TTAACTCAGGCAATTCTGGAGGGCCATTGCTTGATTCTTATGGCCATACCATAGGCGTCA
ACACTGCCACATTCACCCGCAAAGGGACTGGAATGTCTTCGGGTGTGAACTTTGCCATTC
CCATTGACACAGTTGTTCGAACAGTACCCTATCTCATTGTGTATGGAACAGCTTATAGAG
ACAGATTCTAAAAGAAAACAAAC


BQ
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AF RS1H056TF U 1
AF RS1H056JQB C 330
BS 1 651 RS1H056TF
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RD RS1H056TF 751 0 0
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TGATGGACGTGGCTATCGCTTCTTCTAAAGCTTGTTCATCAGTCTTATATACTTTAATAA
CTCCATTCAATAGGTCGAAGTCAATGTGAGCTTGCTCCGGTTCGAGCCCTGACCGGAAAA
GAAGAAGCGTGATCTTCTTCGGTTCGAGTCTGGTGCTCGCGTCGACTCTGCTTGGCTCCT
CCAATCAACCGAAGTTCCCAGTTGAGTCTGCGATCGCACTAGAGCAAATGAAAGAAATAG
AAGAAGAGGAGCTCGAGGAAGAAGAAGAGAGAAATGTCAATCTCTTCCAGAAAACTTCGG
CGTCTGTTGTGTATATCGAAGACATTGAGCTTCCCAAAACTTCCTCTGATGAATCCAATG
TTGAGGATAATGCAAAGATCGAAGGGACGGGTTCTGGCTTCGTTTGGGACAAGCTTGGTC
ACATTGTGACAAATTACCATGTGATTGCCAAGTTAGCTACAGATCAGAGTGGATTACAAC
GTTGTAAGGTATCTCTAGTTGATGCCACGGGGACAAAGTTTACCAAGGAAGCGAAAATTG
TGGGTCTTGATCCAGACAATGATCTTGCCGTTTGGAAGATTGAAACCGAAG*ACGTGAGT
TGAAACCTGTTGCTCTTGGTACCTCCAGTGATCTACGCGTAG*TCAGAGTTGCTTTGCTA
TTGGGA*TCCATATGGATATGAAAACACTTT

QA 1 751 1 751
DS 

RD RS1H056JQB 714 0 0
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GGTTCTGGCTTCGTTTGGGACAAGCTTGGTCACATTGTGACAAATTACCATGTGATTGCC
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GGGACAAAGTTTACCAAGGAAGCGAAAATTGTGGGTCTTGATCCAGACAATGATCTTGCC
GTTTGGAAGATTGAAACCGAAGGACGTGAGTTGAAACCTGTTGCTCTTGGTACCTCCAGT
GATCTACGCGTAGGTCAGAGTTGCTTTGCTATTGGGAATCCATATGGATATGAAAACACT
TTGACAATAGGGGTAGTGAGTGGGTTGGGAAGAGAGATACCTTCACCAAACGGGAAGAGT
ATTCGAGAAGCTATCCAAACAGATGCTGACATTAACTCAGGCAATTCTGGAGGGCCATTG
CTTGATTCTTATGGCCATACCATAGGCGTCAACACTGCCACATTCACCCGCAAAGGGACT
GGAATGTCTTCGGGTGTGAACTTTGCCATTCCCATTGACACAGTTGTTCGAACAGTACCC
TATCTCATTGTGTATGGAACAGCTTATAGAGACAGATTCTAAAAGAAAACAAAC

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL6137Contig1 769 2 2 U
GCTCTTGAACACGAAGCTCTAAACGCAAAGCGGGGTAACCTTTTCACCACCTTCTAGGGT
TCTTCGTCGTTGTCAACTGAATCTGCGAAGATGTTCTCTTCTCAGAACAAGATCCATAAG
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GAGAACACAAACCAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAAGCTGTT
CAGATGGATGTTTCTGGCAACCGCAAGGCTATTGTGATCTATGTTCCATTCAGACTGAGG
AAGGCCTTCCGCAAGATTCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGC
AAAGAAGTTATCTTTGTTGCCACCAGAAGAATCGTGCGCCCACCAAAGAAGGGCTCTGCT
GTTCAGAGACCACGCAACAGAACTCTCACTTCCGTCCATGAAGCCATGCTTGAGGATGTC
GCTTACCCTGCTGAGATTGTTGGCAAACGCACCAGATACCGTGTTGATGGCACCAAGATC
ATGAAGGTGTATTTGGAGCCTAAGGAGAGGAATAACACTGAGTACAAGCTTGAGACAATG
GTCGGTGTCTACAGGAAGCTTACAGGGAGAGATGTTGTTTTCGAGTACCCAATCGTAGAA
GCTTGAGGAGATGAATGTTTGATTCTTTTTTTTTGTCAGGATAGAGAGCTTTTGATTATG
CTTTTGAGTAAAAACTCTTTGCAAAATATTTTCTTGTTTAAGTTGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1H784TF U 1
AF RS1H784JQB C 136
BS 1 543 RS1H784TF
BS 544 769 RS1H784JQB

RD RS1H784TF 543 0 0
GCTCTTGAACACGAAGCTCTAAACGCAAAGCGGGGTAACCTTTTCACCACCTTCTAGGGT
TCTTCGTCGTTGTCAACTGAATCTGCGAAGATGTTCTCTTCTCAGAACAAGATCCATAAG
GATAAGGGTGTTGCTCCAACAGACTTCGAACAGGAAGTTGCCCAGGCTTTCTTTGACCTG
GAGAACACAAACCAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAAGCTGTT
CAGATGGATGTTTCTGGCAACCGCAAGGCTATTGTGATCTATGTTCCATTCAGACTGAGG
AAGGCCTTCCGCAAGATTCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGC
AAAGAAGTTATCTTTGTTGCCACCAGAAGAATCGTGCGCCCACCAAAGAAGGGCTCTGCT
GTTCAGAGACCACGCAACAGAACTCTCACTTCCGTCCATGAAGCCATGCTTGAGGATGTC
GCTTACCCTGCTGAGATTGTTGGCAAACGCACCAGATACCGTGTTGATGGCACCAAGATC
ATG

QA 1 543 1 543
DS 

RD RS1H784JQB 634 0 0
CCAACAGACTTCGAACAGGAAGTTGCCCAGGCTTTCTTTGACCTGGAGAACACAAACCAG
GAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAAGCTGTTCAGATGGATGTTTCT
GGCAACCGCAAGGCTATTGTGATCTATGTTCCATTCAGACTGAGGAAGGCCTTCCGCAAG
ATTCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTTGAGAAGAAGTTCAGTGGCAAAGAAGTTATCTTT
GTTGCCACCAGAAGAATCGTGCGCCCACCAAAGAAGGGCTCTGCTGTTCAGAGACCACGC
AACAGAACTCTCACTTCCGTCCATGAAGCCATGCTTGAGGATGTCGCTTACCCTGCTGAG
ATTGTTGGCAAACGCACCAGATACCGTGTTGATGGCACCAAGATCATGAAGGTGTATTTG
GAGCCTAAGGAGAGGAATAACACTGAGTACAAGCTTGAGACAATGGTCGGTGTCTACAGG
AAGCTTACAGGGAGAGATGTTGTTTTCGAGTACCCAATCGTAGAAGCTTGAGGAGATGAA
TGTTTGATTCTTTTTTTTTGTCAGGATAGAGAGCTTTTGATTATGCTTTTGAGTAAAAAC
TCTTTGCAAAATATTTTCTTGTTTAAGTTGTTGC

QA 1 634 1 634
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6139Contig1 788 2 2 U
GCTAAAGAACCTGTCTTTATCCTCCAACAAGCTGTCGGGACCGATCCCTGACTCGATCTC
CTCGATTCCGGAACTTACTCACTTAGATCTGAGCGGAAACCAGCTAAACGGCACCGTTCC
GAGGTTCATTGCCAAGATGAAGAGTCTCAAGTACTTGAACTTAGCTAACAATGCCTTCCA
CGGAGTCCTTCCTTTCAATGCGAGCTTCTTGAAGAAGCTTGAGGTGTTCAAAGTGGGTGG
AAACAGTGATCTCTGTTACAACCACACTGTGTTGTCGTCGAAGATGAAGTTGGGTATCGC
TCCGTGTGATAAGCACGGTTTGCCTCTGTCTCCGCCGCAGAAGGGAGACTCCTCGAGTTC
GGATTACGATTACAGTGAAGATGATAGTAGTGAGAAGAAGAAGGAAGAGCATCATGGTCC
TAATAAGGTCGTGCTTGGTGTTGCCATTGGACTTTCTTCGCTTGTGTTCTTGATCATCTT
CATGATCCTTCTCGCAAAATGGTGTGGTTAATTCAAAAGGAGATGAGTTTGTTATCTTTG
TCTTTCTCATTTATTACTGATACAGAAAAAGTATAGTAAAAAAGATTTTACTCTCTGAGA
GTGATTCAGAGTTGGAAGAAGAAGAGGATAGTGATTCTTTGGAGAATAACCGATCCGGTT
CTCCAGCACCAATCCCGGTTTAGTTTAATCTATTCTTTTTTTTTTTTTTGCTATTTTACT
TTGATGTCACATTTTGAGTTGTATGATGTAAAAGGATTATTTTGTAACGAGTATTGAATT
ATTTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AL74TF U 1
AF RS1AL74JQ C 279
BS 1 699 RS1AL74TF
BS 700 788 RS1AL74JQ

RD RS1AL74TF 699 0 0
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CTCGATTCCGGAACTTACTCACTTAGATCTGAGCGGAAACCAGCTAAACGGCACCGTTCC
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AAACAGTGATCTCTGTTACAACCACACTGTGTTGTCGTCGAAGATGAAGTTGGGTATCGC
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GGATTACGATTACAGTGAAGATGATAGTAGTGAGAAGAAGAAGGAAGAGCATCATGGTCC
TAATAAGGTCGTGCTTGGTGTTGCCATTGGACTTTCTTCGCTTGTGTTCTTGATCATCTT
CATGATCCTTCTCGCAAAATGGTGTGGTTAATTCAAAAGGAGATGAGTTTGTTATCTTTG
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CTCCAGCACCAATCCCGGTTTAGTTTAATCTATTCTTTT

QA 1 699 1 699
DS 

RD RS1AL74JQ 510 0 0
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AGAAGGAAGAGCATCATGGTCCTAATAAGGTCGTGCTTGGTGTTGCCATTGGACTTTTTT
CGCTTGTGTTCTTGATCATCTTCATGATCCTTCTCGCAAAATGGTGTGGTTAATTCAAAA
GGAGATGAGTTTGTTATCTTTGTCTTTCTCATTTATTACTGATACAGAAAAAGTATAGTA
AAAAAGATTTTACTCTTTGAGAGTGATTCAGAGTTGGAAGAAGAAGAGGATAGTGATTCT
TTGGAGAATAACCGATCCGGTTCTCCAGCACCAATCCCGGTTTAGTTTAATCTATTCTTT
TTTTTTTTTTTGCTATTTTACTTTGATGTCACATTTTGAGTTGTATGATGTAAAAGGATT
ATTTTGTAACGAGTATTGAATTATTTCTTC

QA 1 510 1 510
DS 



AS 1 2

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AAGCTCATTCTTCTTCTGCGTCGCGTTGTCTCCGACTCATATTTGCTCAGTGTGTTAGGT
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AGCAGTCTGTTCCTCCACATTCTGATGCCAATGGGACATCTGACAGAGGAAAATTTCGAG
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TCCACAGCTGTCCAGGAACTGAGAATGTGGAGGGAGACCATGCCATTAACGAGCAAATGG
TGGTTCCCAGTAATTCCCTGCCTCTTGTGACAGTTCCAGCTCCATCATACATCAAAGAGA
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CCTGCTCAGATTCTCCTTGCGTATCTGACTCAGGCTCAGACATATTCAGCAAGCGAGAAG
TAATACAGAAGCTGAGGCAACAGCTAAAGAGACGAGACGACATGATACTTGAAATGCAGG
AACAGATTCTAGAGCTGCAAAACTCGCTTAACTCGCAAATGTCACACTCTAGCCATCTCC
AAGCTCAGCTTGACGCAACAAACAGGGATCTGTATGAATCAGAGAGAGAAGTGCTGAGAC
TGAGAAAGGCAATCGCTGATCACTGCGTGGGACAGGCTGGTGGCAACGGCTGGAACGGGG
AGGCAAACGGGTTTATGGACAGCGAAAGCAATTACGAGTCGCCGGAAAAGGGATCGAAGG
ATGGAGAGAGAGTAGAGATGCTGAGGAAGGAAGTGGGTGAGCTTAAAGAGGTGATAGATG
GGAAAGAGTATCTGCTTAGGAACTACAAAGAGCAGAAGATGGAGCTTTCAGAGAAGGTGC
AGGAGTTGCAGCGGAGATTGGACTCGCAGGTCCCAAACATTTTGTAGGTTGGAAAGTGAA
TATGACAATGTGCAAGTTCTACACTTTGGTGTCTTCAAGGCTTATAAAGTTGGTCAAGTT
TTGTTTTTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ER36TF U 1
AF RS1ER36JQ C 511
BS 1 629 RS1ER36TF
BS 630 1210 RS1ER36JQ

RD RS1ER36TF 629 0 0
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AAGCTCATTCTTCTTCTGCGTCGCGTTGTCTCCGACTCATATTTGCTCAGTGTGTTAGGT
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AGCAGTCTGTTCCTCCACATTCTGATGCCAATGGGACATCTGACAGAGGAAAATTTCGAG
GAGGATGCTGCTGCTTGCATTCTAGCTCATCTTCTTGTGGAAGGAATACGGATTGTTGCC
TCCACAGCTGTCCAGGAACTGAGAATGTGGAGGGAGACCATGCCATTAACGAGCAAATGG
TGGTTCCCAGTAATTCCCTGCCTCTTGTGACAGTTCCAGCTCCATCATACATCAAAGAGA
ATGGCCTCGGGTGGGCTGATCACCTGGAAGTACCCATGAAACCATACAATCCCCACTCTA
CCTGCTCAGATTCTCCTTGCGTATCTGAC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RS1ER36JQ 700 0 0
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TACCCATGAAACCATACAATCCCCACTCTACCTGCTCAGATTCTCCTTGCGTATCTGACT
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GACGAGACGACATGATACTTGAAATGCAGGAACAGATTCTAGAGCTGCAAAACTCGCTTA
ACTCGCAAATGTCACACTCTAGCCATCTCCAAGCTCAGCTTGACGCAACAAACAGGGATC
TGTATGAATCAGAGAGAGAAGTGCTGAGACTGAGAAAGGCAATCGCTGATCACTGCGTGG
GACAGGCTGGTGGCAACGGCTGGAACGGGGAGGCAAACGGGTTTATGGACAGCGAAAGCA
ATTACGAGTCGCCGGAAAAGGGATCGAAGGATGGAGAGAGAGTAGAGATGCTGAGGAAGG
AAGTGGGTGAGCTTAAAGAGGTGATAGATGGGAAAGAGTATCTGCTTAGGAACTACAAAG
AGCAGAAGATGGAGCTTTCAGAGAAGGTGCAGGAGTTGCAGCGGAGATTGGACTCGCAGG
TCCCAAACATTTTGTAGGTTGGAAAGTGAATATGACAATGTGCAAGTTCTACACTTTGGT
GTCTTCAAGGCTTATAAAGTTGGTCAAGTTTTGTTTTTCC

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

CO CL6141Contig1 1260 2 4 U
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ACCATCGGGTTCTCCGGCGTCGTTTCGTTTATCTAATTCTGTTTACTTGATTTGATTATC
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AGATTTCGTTTTGAAAGTCACTGCCTTCCGCGTCAATCAGTACGTTTGAAACACTACAAA
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BQ
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AA

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DS 

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CTTCTTGGAGAATCAGTCTGTGGTTTAGATGTGTTCTGGGTGAAATTTCAGGTTCCTATG
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QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 2

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GATACCAATTTATCGTCGTCCACCGTACAAGGTACGATAAAAGTCATTTCTGTGAAATTA
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AGTCTAATGTGCTGGCTGAGAGTGTCTGACGACTGCTTCCCTGCCTCGAATTTCAGTAGC
TCTTGGAGTTTGGGCTCAGCTCCATGCGGAGAGCTTGCTGGCTTGCAGGTTGATGTGAGA
AAGTACATGGCTAGAAAGTCAGGATGGAACAGGATAGCTGATGATGGAGTGCAAACACGT
GCACATTTGGAATCTCAATTTGCATCCTCTCTTGCGTTGGAGTCTCCTAACGAGTACCGC
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AAACTTGTCTTGGGATCCATATGTTCTGGGGGTGAAGAAGCATAAACTATTGAGAAACGA
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TCTGTTATCTGAATACGAAAACACAGAAGTAGCAGAAGCTGCAACTAAGGGGTCGGAACC
AACCATAAACTGTAGTGGAGTCCCATCTTCACTGGATCAAATGGATTCTGATCCTCCAGC
AGTGACAGCTACAACTCCTTTGACAATAGACAATGACAAACAGGTTTCTTTGGAGACGGG
TATTTTGTGTGAGAAACAGGGCTCTGAAGCCCAGGAAAGGCACGACCAGAATTTAAGAGA
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TGATGTTGAGATGTAGTAACACAGGGATATTGAATCGCTCCATTTACATTTTGAGTAAAG
CTTTTCCAAAAA


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CACTGCCTCCTCGCCTATGTTAGGTTTCTAGCTAGAGAGGCAGACGAGTCGAGACTAAGA
GAAGTGTGCGAGAGCTTTCTTGGACCTCCTACTTATGGCTGAAGCAACAACCTCAGACAC
AAACTTGTCTTGGGATCCATATGTTCTGGGGGTGAAGAAGCATAAACTATTGAGAAACGA
TATTCTTCCTGCAATGGCCTCAAACAGGAAGGTGCAGCGTCTACTCAGTGAGTTTATGGA
TCTGTTATCTGAATACGAAAACACAGAAGTAGC

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AGCTAGAGAGGCAGACGAGTCGAGATTAAGAGAAGTGTGCGAGAGCTTTTTTGGACCTCC
TACTTATGGCTGAAGCAACAACCTCAGACACAAACTTGTCTTGGGATCCATATGTTCTGG
GGGTGAAGAAGCATAAACTATTGAGAAACGATATTTTTCCTGCAATGGCCTCAAACAGGA
AGGTGCAGCGTTTACTCAGTGAGTTTATGGATCTGTTATCTGAATACGAAAACACAGAAG
TAGCAGAAGCTGCAACTAAGGGGTCGGAACCAACCATAAACTGTAGTGGAGTCCCATCTT
CACTGGATCAAATGGATTCTGATCCTCCAGCAGTGACAGCTACAACTCCTTTGACAATAG
ACAATGACAAACAGGTTTCTTTGGAGACGGGTATTTTGTGTGAGAAACAGGGCTCTGAAG
CCCAGGAAAGGCACGACCAGAATTTAAGAGACCCGGGTGCTTGAAACTTCTCATTGTTTC
TTGTATATCAACTATAGCTGTTGTTAAAAATTGATGTTGAGATGTAGTAACACAGGGATA
TTGAATCGCTCCATTTACATTTTGAGTAAAGCTTTTCCAAAAA

QA 1 763 1 763
DS 



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AACAGATACAGCGCACACGTATAGCGAATACGCACAACACAGTCGACAACTACATGCACT
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TCCCAGAAATCATCTCCGTCACCGATATTCGCCACGTCATCTCCTGTTTTAATGATCTTG
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BQ
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TGGCCGCTGCGACTTGGATATCTCTGGCCGTACACGTCGAGGGGCGAGGTAAATCGT

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QA 1 761 1 761
DS 



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GGAGGAGGCCGAGGAGCTGAAGACCGAAACGCTTGACCACCAATTCTTCCGCCGCTCTTA
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GCTAATTTCGCCAGCTGATTCTCATTTTTCCGAGAAGAATCAGTTTCGTCGTCGTGGTGT
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BQ
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AF RS1AP28JQ U 77
AF RS1AP28TFB C 1
BS 1 76 RS1AP28TFB
BS 77 491 RS1AP28JQ
BS 492 776 RS1AP28TFB

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TCTCTGATTTTATTCTTTCCCAGCCCTAATAGTCATCTTCGTCATCTTCTTCATTTCTTG
ATCGGAAAACGTTTCTGGCCACGGCTGAAGCGGCTCCAAAAAACATGAAGAGAACGAGGA
GGTCGAAGCCACCGCCGCCACCAACTGCCACCGCAGGACCGGGGGCAAAGTAAGAAAACG
GTGACCATCCCCAACCGCCGTAGCCATATCCATAGCCACCGATCAAAGGTGGTGCAACCT
GAGGATTCACGTAAACGTTGGTCCTCGATCGGTTGTTAATTCTAGGAGGAGGCCGAGGAG
CTGAAGACCGAAACGCTTGACCACCAATTCTTCCGCCGCTCTTAGCCGCAAACGC

QA 1 415 1 415
DS 

RD RS1AP28TFB 776 0 0
CGAGTTTAGCTATATAAGTTTTTCAGATTGTTCCTTAGTAACTTGTCTCAAGGTTTACAA
ATTACAAACCGTCTTTTCCATCATTAACTTTTAACACAAAATCGTATATTCGACTATGTT
TGTAATAAGACATGCCTCTCTGATTTTATTCTT*CCCAGCCCTAATAGTCATCTTCGTCA
TCTTCTTCATTTCTTGATCGGAAAACGTTTCTGGCCACGGCTGAAGCGGCTCCAAAAAAC
ATGAAGAGAACGAGGAGGTCGAAGCCACCGCCGCCACCAACTGCCACCGCAGGACCGGGG
GCAAAGTAAGAAAACGGTGACCATCCCCAACCGCCGTAGCCATATCCATAGCCACCGATC
AAAGGTGGTGCAACCTGAGGATTCACGTAGACGTTGGTCCTCGATCGGTTGTTAATTCTA
GGAGGAGGCCGAGGAGCTGAAGACCGAAACGCTTGACCACCAATTCTTCCGCCGCTCTTA
GCCGCAGACGCATCTCCAACGGATCCCAAAGCCAAAACGCCAACCGCTAACGTCGCAATT
GCTAATTTCGCCAGCTGATTCTCATTTTTCCGAGAAGAATCAGTTTCGTCGTCGTGGTGT
GGAGATTTGCAACATATTGAATTCGGACGTGTGTGCTTATTACTGTGTCTGGGTTTGAAG
CTGTGTCGGGAACTGAAAGAGTCTGACAAAAAGCTATGTCGTGAAGAAGCTATGGCTGCG
AAATACATTTTTGTGTGTCTCTCTGTTCTGTTCTGTTTCTGGTTCTAAAGAGATCC

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

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TATATCTCAACATTTTTTTCCTTAATATCTCTTTTTCTGAATCTTTTTTTTTTTAATGTT
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GGAAAGCCACAGGGTCGCTCACCGGAAAGAGACCAGGGAGGCCTTAACTTGACCACCACC
ACTGCAGCCACAAATGGCCAGAAAACCAAATATACACATGAGTGTTTTGTGTATGCAGAC
ATGTACCATTTTAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RS1GN26JQ U 1
AF RS1AO43JQ U 45
BS 1 317 RS1GN26JQ

RD RS1GN26JQ 317 0 0
ACAATAAGAATTTCAATACACTCCCTTTCCCAGCCACATTTTTTCCTACATACATATTTA
TATATCTCAACATTTTTTTCCTTAATATCTCTTTTTCTGAATCTTTTTTTTTTTAATGTT
CTGTAAAGAATCTGTCCTATAAAGACGAATAAAACAAAAAATAAATAAAAGAAAAAGAAA
GGAAAGCCACAGGGTCGCTCACCGGAAAGAGACCAGGGAGGCCTTAACTTGACCACCACC
ACTGCAGCCACAAATGGCCAGAAAACCAAATATACACATGAGTGTTTTGTGTATGCAGAC
ATGTACCATTTTAAAAA

QA 1 317 1 317
DS 

RD RS1AO43JQ 268 0 0
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TTTTTTTTTTAATGTTCTGTAAAGAATCTGTCTTATAAAGACGAATAAAACAAAAAATAA
ATAAAAGAAAAAGAAAGGAAAGCCACAGGGTCGCTCACCGGAAAGAGACCAGGGAGGCCT
TAACTTGACCACCACCACTGCAGCCACAAATGGCCAGAGAACCAAATATACACATGAGTG
TTTTGTGTATGCAGACATGTACCATTTT

QA 1 268 1 268
DS 



AS 1 2

CO CL6147Contig1 982 2 2 U
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CGATAACTCCAACATCACTGATGACACCAGGATTCGCGCCGCTGTTCCTACCATCAAGTA
CTTGATGGGAAACGGATCTAGGGTTGTTCTCTGCAGTCACTTGGGTCGCCCAAAAGGTGT
TACCCCTAAATTCAGCTTAAAGCCTCTCGTACCAAGATTGTCTGAGCTTCTTGGTGTTGA
GGTCGTGATGGCGAACGACTCCATCGGCGAGGAAGTCCAGAAACTTGTCGCGGGACTACC
CGAAGGCGGCGTCCTCCTCCTAGAGAACGTGAGGTTCTACAAGTCGCTTATGGAGAAGGC
CAAAGCCAAAGGTGTCTCTCTCTTGCCCCCAACCGATGTGGTTATTGCCGACAAGTTCGC
TCCAGATGCTAACAGCAAGACAGTGGCCGCCACGGCAATCCCAGATGGCTGGATGGGACT
TGATATTGGTCCGGACTCGATCAAGACCTTCAGTGATGCTCTGGACACAACCAAAACCAT
CATCTGGAATGGTCCCATGGGTGTTTTTGAATTCGAAAAGTTTGCAGCTGGAACTGAGGC
CGTGGCAAAGCAGCTAGCGGAGCTGAGTGGAAAGGGAGTGACGACGACCATAGGAGGAGG
TGACTCCGTGGCTGCGGTTGAGAAGGTTGGTTTGGCTGACAAGATGAGTCACATCTCTAC
CGGAGGAGGTGCGAGTTTGGAGCTTCTAGAGGGAAATCCACTTCCGGGAGTCCTCGCTCT
TGACGACGCCTGAATTTCATCTCTCTTGTGATATATAATAATGTATTACATGTCTTCTGG
TTTTCTTTATGACCAGATGAGCAAAAGCTATTATTATTGTCATGCTTGAGTTTTTCTGTC
TACGGCTCTTTTTTTTTGGAGCCTTTTTCTTAATAAAAGAGAGATGAGACTCTTATTAGT
AAACAGTTTATTTCAAATGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BP31TF U 1
AF RS1BP31JQ C 184
BS 1 594 RS1BP31TF
BS 595 982 RS1BP31JQ

RD RS1BP31TF 594 0 0
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CGATAACTCCAACATCACTGATGACACCAGGATTCGCGCCGCTGTTCCTACCATCAAGTA
CTTGATGGGAAACGGATCTAGGGTTGTTCTCTGCAGTCACTTGGGTCGCCCAAAAGGTGT
TACCCCTAAATTCAGCTTAAAGCCTCTCGTACCAAGATTGTCTGAGCTTCTTGGTGTTGA
GGTCGTGATGGCGAACGACTCCATCGGCGAGGAAGTCCAGAAACTTGTCGCGGGACTACC
CGAAGGCGGCGTCCTCCTCCTAGAGAACGTGAGGTTCTACAAGTCGCTTATGGAGAAGGC
CAAAGCCAAAGGTGTCTCTCTCTTGCCCCCAACCGATGTGGTTATTGCCGACAAGTTCGC
TCCAGATGCTAACAGCAAGACAGTGGCCGCCACGGCAATCCCAGATGGCTGGATGGGACT
TGATATTGGTCCGGACTCGATCAAGACCTTCAGTGATGCTCTGGACACAACCAAAACCAT
CATCTGGAATGGTCCCATGGGTGTTTTTGAATTCGAAAAGTTTGCAGCTGGAAC

QA 1 594 1 594
DS 

RD RS1BP31JQ 799 0 0
ACCCTAAA
TCAGCTTAAAGCCTCTCGTACCAAGATTGTCTGAGCTTCTTGGTGTTGAGGTCGTGATGG
CGAACGACTCCATCGGCGAGGAAGTCCAGAAACTTGTCGCGGGACTACCCGAAGGCGGCG
TCCTCCTCCTAGAGAACGTGAGGTTCTACAAGTCGCTTATGGAGAAGGCCAAAGCCAAAG
GTGTCTCTCTCTTGCCCCCAACCGATGTGGTTATTGCCGACAAGTTCGCTCCAGATGCTA
ACAGCAAGACAGTGGCCGCCACGGCAATCCCAGATGGCTGGATGGGACTTGATATTGGTC
CGGACTCGATCAAGACCTTCAGTGATGCTCTGGACACAACCAAAACCATCATCTGGAATG
GTCCCATGGGTGTTTTTGAATTCGAAAAGTTTGCAGCTGGAACTGAGGCCGTGGCAAAGC
AGCTAGCGGAGCTGAGTGGAAAGGGAGTGACGACGACCATAGGAGGAGGTGACTCCGTGG
CTGCGGTTGAGAAGGTTGGTTTGGCTGACAAGATGAGTCACATCTCTACCGGAGGAGGTG
CGAGTTTGGAGCTTCTAGAGGGAAATCCACTTCCGGGAGTCCTCGCTCTTGACGACGCCT
GAATTTCATCTCTCTTGTGATATATAATAATGTATTACATGTCTTCTGGTTTTCTTTATG
ACCAGATGAGCAAAAGCTATTATTATTGTCATGCTTGAGTTTTTCTGTCTACGGCTCTTT
TTTTTTGGAGCCTTTTTCTTAATAAAAGAGAGATGAGACTCTTATTAGTAAACAGTTTAT
TTCAAATGGTT

QA 9 799 9 799
DS 



AS 1 2

CO CL6148Contig1 1219 2 8 U
GGAAAAATAAAAAGGAAAATCACTCAAGAAACACTCTTTCTTAGATGGGATCTCTGGAGA
GATCAAAGAAGAAAACTCAAATATGGAAGAAAGCTGTGATCCATTTCTCTCTATGTTTTG
TAATGGGTTTCTTCACTGGCTTTGCTCCAGCTGGCAAGGCCTCACTTTTCTCTAATTTCG
AAACCACCGCCTCTACTACCTCCAAATCTCAGATTCCTCCCCAAACTTTTGAGAACTCTA
CCTATACACCCAATTCCCTCGTTGGTAAAGCTTTGGTCACTTCCCAAGGCCAAGCCCCTG
CTCCTTCAGAGTCACGAGAAGCTGAACCAGAAAACAGATCGCTCTCCGAGACAGAAGAGG
AAGTTACACCAAGAGGTCTAGTGATTGTTGTGACTCCAGTAATGACCAAAGATCGCTACA
AAAACGTTCTTCTAAGGAGAATGGCCAACACTCTGAGGCTAGTTCCGCCTCCTTTACTGT
GGATAGTCGTAGAAAAACACTCGGAAGCTGACGTGAACTCTTCATCTACGATGTTAAGAA
AGACTGGTTTAATGTATAGACGTATAGTCTTCAAGGAGAACTTCACGAGCTCGGAATCAG
AGCTTGATCATCAGAGAAACCTAGCGTTGAGACACATTGAGCATCACAAATTAAGCGGAA
TAGTTCATTTCGCGGGACTCAACAACATCTATGATCTTGAATTTTTCGATGAGATTAGAG
ATATCGAGGTATTTGGGACGTGGCCAATGGCGTTGCTATCAGCTAATAGGAAACGAGTGA
TAGTAGAGGGGCCGGTTTGTGAATCTTCACAAGTATTGGGGTGGCATTTGAGAAAAATTA
ATAACGAGACGGAGACAAAGCCTCCGGTTCATATATCAAGCTTTGCTTTCAATAGTTCTA
TACTTTGGGACCCTGAAAGATGGGGTCGTCCTTCTTCTGTTGAAGGGACCAAACAGGATT
CGATTAAATATGTGAAGCAAGTGGTTTTGGAGGACGATACAAAGTTGAAGGGACTTCCGG
CGCAAGACTGTTCCAAGGTTATGCTTTGGCGTCTCAATTTTCCCACAAGAACACGTTTTA
GCACCTGATTTGCTTTATTCTATTCTAATATCCTCCAAATTAGTCCCTTTCCTTTTTCAA
ATTAAAGTAGATAAATACAGTTCGGATTTTGAATGTGAATGAGTCGGAACATGATCGGTG
ATAAACATGCATGCATGCC


BQ
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AF RS1BT73JQ C 476
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CGGTGATAAACATGCATGCATGCC

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DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GTGGGGGCTGGAATAGCATGAGTTGAAGTAGACTGATCCATATTTTTATTGTCTTGTGTG
GCGATCCAATCCCGTGAGGCGGGGATGTTCTAAGAGCCACTTCTTCCTTTGGGAAGGCTT
TATTTCCGATGACAAGATTGTTTCTCGAGATTCAAAATTTCCAGCATACCCAAGGGAGGA
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ATTCAAAGTCTTGTACTGTAGCTAGGTGAACTGCATTGGATACATGTAACTGATGCATTG
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BQ
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AF RS1GN68TF U 1
AF RS1GN68JQ C 371
BS 1 489 RS1GN68TF
BS 490 1196 RS1GN68JQ

RD RS1GN68TF 489 0 0
GGAAAAAGGGAATACGGAAAGCCGACTTCGTCAAGAAGTCATCATCCAAGTTCTTTGATC
TAGAGACGAAAGAGAATGAGATAGATGAAAACAAAGCTGCGGGGGGTCTGATATCCGCTA
CGATACCAAAGATCTCTTTGTGAGCAAACTTGCTATTGATGGTGGTAATGAGCGTCTTGT
TGTCCAAGAAGACTGAGAGGCTTTCGATCCCGATGGCAATTGCATGTCTGAGACTTGATC
TGCAGGCAAGAGCTTCTGCGATGAGAGGGGAGCCAACATGTTCCTGAAACTCTGAGACAC
TACAGATCGTTGCTGTCTGTATGAAGAAGATCCAGACCGAACCTGATCGGAGGTTTTCTC
CATTAATTCCAGGAGGCGTCTGTGAAACATCGGGTATCCTCCAGGTGCCTTGCTACTTGA
GTGGGGGCTGGAATAGCATGAGTTGAAGTAGACTGATCCATATTTTTATTGTCTTGTGTG
GCGATCCAA

QA 1 489 1 489
DS 

RD RS1GN68JQ 826 0 0
AGGAGGCGTCTGTGAAACATCGGGTATCCTCCAGGTGCCTTGCTACTTGAGTGGGGGCTG
GAATAGCATGAGTTGAAGTAGACTGATCCATATTTTTATTGTCTTGTGTGGCGATCCAAT
CCCGTGAGGCGGGGATGTTCTAAGAGCCACTTCTTCCTTTGGGAAGGCTTTATTTCCGAT
GACAAGATTGTTTCTCGAGATTCAAAATTTCCAGCATACCCAAGGGAGGATATTAATTGG
AATACCTGAGGGCGGGAGGCATGGCATACGGCGAGATTCAGTCACTGCTGATTCAAAGTC
TTGTACTGTAGCTAGGTGAACTGCATTGGATACATGTAACTGATGCATTGATTTCCCATT
CTCTGGAGGTTCTCTCCTATAGGCAGAGCCTTTTGGAGGATTGACCATTGTAAAAATTTA
AGCTTTGGGGAGCACTTGGGGGTCCAGATGTCTTTGTACCAGTCAATCGTGCTAGTGAGG
GGTCTGTGAATCTAGAAGTCATGGATGAGTGGTATATCCAGATTTGGTTGAGTAAATACC
GGACTTTAATGGTTGCCAGATGAAGGCGTCCTCCACTCCCCCTTGACTTGGTTGCAAGCA
CTGGATTGCGGTTGAAAGCTCAGGTAATAGTTCTTCAATTCTTCTTGTATTCCATTTCAG
GTCAGAAGTTACTAAATCAGATACTCTGAGACTCAAAATCTCGTCGATCCTCTTTCAGAT
ACTTCAATCCTGTCTTTTTTCCACAACTTGATCTCGCTACTTTGTTTAATGTATGTAAAG
CACATTTTATATCTATTAGTTGTTTGAATCAAACCCATACACTCTC

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 2

CO CL6151Contig1 882 2 4 U
GCTACCTCTGAACAAAATCAGACTAGGGAAGCTAATCATCATGCCGTTGAAGAAACAGGA
GTTTTACACAGTAGATCTCGTGGAGTTGTTTTGGACATGACATTTATCTCCACACAAGGA
GTCAAGAAGACATCTGAAGATACAACCGCTCCGCAAAGTGGAACTGGTGTACATGACGAC
TTCATCCAACCTAGCTCGACTACTGGAGACACCACAAATGCTGTGTTGGCTCTTGGAGCA
ACTTCGAATCCAACTGGGAACTTTTGTATCCCAAAAGATGTGTTTGAAACATCGAAAGAA
GCTGATGAAGTACATGTTACTACTAACGGTTTCCCATCTTCATCACCTAGTGCACCAATG
GCTGCGGAAGGTGAACCAAAACCCAAACCAGATGAAACCGAGGCTTCTCAGCCTGTTGCT
GAAACTCCTGATGATGATATCACAGTAGGGAATCGCTCAGACGGCGGCACGATTGACAAC
AACGAAAACAATAACAGCGAGTCGAGTGGCGGCTCGCATGAAGAAGAGTGGCTCCCAGGA
GACCAATCTCTACCTAACTCAAACTCAAACTCAGCAAGTAGCAGCCCTGGTACTACCAAG
GTCCTTGCATACACGAGAAGAGGAAGGGGGCGAGGTAGGGGAAGAGGTCGAGGAGGAGTT
CGAGGCAAAGGACGGGGCAAATAAACTGTACACAACAACCAAATGGAGTAGGAGAGTAAT
ATGCAGGTAGGATTATGTGAAACATCTCTTATAGATTTCAATCCCAAACTGTTTTTGTCT
ACCAAAGTCTTTTGTCATTTTGTCATATCTCTTTAGGTTCTTTTTTGAAGTCAAACTGTG
TCTCTGTTTATTTTACTTCTTGATCTTTTATGTTTATGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G103TF U 1
AF RS1G103JQ C 409
BS 1 711 RS1G103TF
BS 712 712 RS1G103JQ
BS 713 724 RS1G103TF
BS 725 882 RS1G103JQ

RD RS1G103TF 724 0 0
GCTACCTCTGAACAAAATCAGACTAGGGAAGCTAATCATCATGCCGTTGAAGAAACAGGA
GTTTTACACAGTAGATCTCGTGGAGTTGTTTTGGACATGACATTTATCTCCACACAAGGA
GTCAAGAAGACATCTGAAGATACAACCGCTCCGCAAAGTGGAACTGGTGTACATGACGAC
TTCATCCAACCTAGCTCGACTACTGGAGACACCACAAATGCTGTGTTGGCTCTTGGAGCA
ACTTCGAATCCAACTGGGAACTTTTGTATCCCAAAAGATGTGTTTGAAACATCGAAAGAA
GCTGATGAAGTACATGTTACTACTAACGGTTTCCCATCTTCATCACCTAGTGCACCAATG
GCTGCGGAAGGTGAACCAAAACCCAAACCAGATGAAACCGAGGCTTCTCAGCCTGTTGCT
GAAACTCCTGATGATGATATCACAGTAGGGAATCGCTCAGACGGCGGCACGATTGACAAC
AACGAAAACAATAACAGCGAGTCGAGTGGCGGCTCGCATGAAGAAGAGTGGCTCCCAGGA
GACCAATCTCTACCTAACTCAAACTCAAACTCAGCAAGTAGCAGCCCTGGTACTACCAAG
GTCCTTGCATACACGAGAAGAGGAAGGGGGCGAGGTAGGGGAAGAGGTCGAGGAGGAGTT
CGAGGCAAAGGACGGGGCAAATAAACTGTACACAACAACCAAATGGAGTAG*AGAGTAAT
ATGC

QA 1 724 1 724
DS 

RD RS1G103JQ 474 0 0
CAGCCTGTTGCTGAAACTCCTGATGATGATATCACAGTAGGGAATCGCTCAGACGGCGGC
ACGATTGACAACAACGAAAACAATAACAGCGAGTCGAGTGGCGGCTCGCATGAAGAAGAG
TGGCTCCCAGGAGACCAATCTCTACCTAACTCAAACTCAAACTCAGCAAGTAGCAGCCCT
GGTACTACCAAGGTCCTTGCATACACGAGAAGAGGAAGGGGGCGAGGTAGGGGAAGAGGT
CGAGGAGGAGTTCGAGGCAAAGGACGGGGCAAATAAACTGTACACAACAACCAAATGGAG
TAGGAGAGTAATATGCAGGTAGGATTATGTGAAACATCTCTTATAGATTTCAATCCCAAA
CTGTTTTTGTCTACCAAAGTCTTTTGTCATTTTGTCATATCTCTTTAGGTTCTTTTTTGA
AGTCAAACTGTGTCTCTGTTTATTTTACTTCTTGATCTTTTATGTTTATGTTGC

QA 1 474 1 474
DS 



AS 1 2

CO CL6152Contig1 786 2 2 U
GATGGGGATTGAGATGGGGGATGAATCGGAGAAGTTTGGTGTTGGGTTGGAGATGGGGAA
GAGGAAGGTGAAGAAGATGATGTTCAGCGGTGAGGGAGGGCTTATTGGGATCAGTGGGAT
GGGTGGTGTCGGCAAAACGACTCTTGCTAGAGAGCTTGAACGGGACGGTGAAGTCCAATG
TCACTATGAGAACAGGATTTTGTTCCTGACTGTATCACAGTCTCCTTGAGCATAACAAAC
TGTCCACGCCTCAGCGAGTTGCCCAAGAACCTAAGTAAGCTACAAGCTCTTGAGATTCTG
AGACTGTACGCTTGTCTCGAGCTAAAGGCACTGCCCGTGGAGATCTGTGAGCTTCCTCAG
CTTAAGTACCTAGACATCTCGCAGTGTGTTAACCTGAGCTGTCTTCCGGAGGAGATAGGA
AAGCTAAAGACGCTTGAGAAGATAGACATTAGGGAATGTTTTTTTTCTGATAGGCTTAGT
TCTGCTGTTTCTTTAGAGTCTCTGCGCCATGTGATTTGCGATAAGGACGTTGCGTTTATA
TGGGAGGAAGTGGAGAAGGCTGTGCCAGGGTTGAAGATTGAAGCTGCTGAGAAATGTTTC
AGCTTAGATTGGCTCAACGAGTAAAGATCATAAACCCATAGAGGAGGCCTTGTATCAATT
GTAAATAGTTTTGAGGGGATTAGTGTAGGCTCTCTTCTTTGTTAGTTTATATCATGCTTT
GTACTTTTGTAGTAAAGATAAAAGATCTCTCTGTACAGTTTCTACAAACTCATTCGGTCA
AGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1D148TF U 1
AF RS1D148JQ C 209
BS 1 377 RS1D148TF
BS 378 786 RS1D148JQ

RD RS1D148TF 377 0 0
GATGGGGATTGAGATGGGGGATGAATCGGAGAAGTTTGGTGTTGGGTTGGAGATGGGGAA
GAGGAAGGTGAAGAAGATGATGTTCAGCGGTGAGGGAGGGCTTATTGGGATCAGTGGGAT
GGGTGGTGTCGGCAAAACGACTCTTGCTAGAGAGCTTGAACGGGACGGTGAAGTCCAATG
TCACTATGAGAACAGGATTTTGTTCCTGACTGTATCACAGTCTCCTTGAGCATAACAAAC
TGTCCACGCCTCAGCGAGTTGCCCAAGAACCTAAGTAAGCTACAAGCTCTTGAGATTCTG
AGACTGTACGCTTGTCTCGAGCTAAAGGCACTGCCCGTGGAGATCTGTGAGCTTCCTCAG
CTTAAGTACCTAGACAT

QA 1 377 1 377
DS 

RD RS1D148JQ 578 0 0
ACTGTATCACAGTCTCCTTGAGCATAACAAACTGTCCACGCCTCAGCGAGTTGCCCAAGA
ACCTAAGTAAGCTACAAGCTCTTGAGATTCTGAGACTGTACGCTTGTCTCGAGCTAAAGG
CACTGCCCGTGGAGATCTGTGAGCTTCCTCAGCTTAAGTACCTAGACATCTCGCAGTGTG
TTAACCTGAGCTGTCTTCCGGAGGAGATAGGAAAGCTAAAGACGCTTGAGAAGATAGACA
TTAGGGAATGTTTTTTTTCTGATAGGCTTAGTTCTGCTGTTTCTTTAGAGTCTCTGCGCC
ATGTGATTTGCGATAAGGACGTTGCGTTTATATGGGAGGAAGTGGAGAAGGCTGTGCCAG
GGTTGAAGATTGAAGCTGCTGAGAAATGTTTCAGCTTAGATTGGCTCAACGAGTAAAGAT
CATAAACCCATAGAGGAGGCCTTGTATCAATTGTAAATAGTTTTGAGGGGATTAGTGTAG
GCTCTCTTCTTTGTTAGTTTATATCATGCTTTGTACTTTTGTAGTAAAGATAAAAGATCT
CTCTGTACAGTTTCTACAAACTCATTCGGTCAAGTCCC

QA 1 578 1 578
DS 



AS 1 2

CO CL6153Contig1 628 2 1 U
GGACTACAATCACTGGCTGATAGTGATGGAGTTCCCCAAGGATCCAGCGCCAACGAGGGA
GCAGATGATCGATACTTACCTCAACACTCTTGCTACTGTTCTTGGAAGTATGGAAGAGGC
AAAGAAGAATATGTATGCATTCAGTACTACCACCTATACTGGATTCCAATGCACCATCGA
CGAAGAAACATCTGAGAAGTTCAAGGGTTTGCCAGGAGTTCTCTGGGTTTTGCCTGACTC
CTACATAGATGTCAAGAACAAGGACTATGGAGGCGACAAGTACATCAATGGAGAGATTAT
CCCCTGCACATACCCAACATACCAACCAAAGCAGCGCAATAACTCCAAGTATCAAAGTAA
GAGGTACGAGAGAAAAAGAGACGGCCCACCACCTCCTGAGCAGCAGAGGAAACCAAGACA
AGCGCCACCACCAGCCGCTTCTGATTCCTCTTGAACGTCAAAGCCCTTTTGTACTAGGAG
CGTGCGAGATTTTGATTGATTGATTTGGTTAGTAGTCCCTCATAGCTTATTCAAACCGGA
TGTAAAATCGTCGTTTGGAACAATATATAAGACATGCCATGTGGTTTAGTTTCCTGTTCT
GTCCGGTTAACCTGTAGCAAGGTATTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DQ49TF U 177
AF RS1EW95TF U 1
BS 1 628 RS1EW95TF

RD RS1DQ49TF 411 0 0
G
CGACGAAGAAACATCTGAGAAGTTCAAGGGTTTGCCAGGAGTTCTCTGGGTTTTGCCTGA
CTCCTACATAGATGTCAAGAACAAGGACTATGGAGGCGACAAGTACATCAATGGAGAGAT
TATCCCCTGCACATACCCAACATACCAACCAAAGCAGCGCAATAACTCCAAGTATCAAAG
TAAGAGGTACGAGAGAAAAAGAGACGGCCCACCACCTCCTGAGCAGCAGAGGAAACCAAG
ACAAGCGCCACCACCAGCCGCTTCTGATTCCTCTTGAACGTCAAAGCCCTTTTGTACTAG
GAGCGTGCGAGATTTTGATTGATTGATTTGGTTAGTAGTCCCTCCTAGCTTATTCAAACC
GGATGTAAAATCGTCGTTTGGAACAATATATAAGACATGCCATGTGGTTT

QA 2 411 2 411
DS 

RD RS1EW95TF 628 0 0
GGACTACAATCACTGGCTGATAGTGATGGAGTTCCCCAAGGATCCAGCGCCAACGAGGGA
GCAGATGATCGATACTTACCTCAACACTCTTGCTACTGTTCTTGGAAGTATGGAAGAGGC
AAAGAAGAATATGTATGCATTCAGTACTACCACCTATACTGGATTCCAATGCACCATCGA
CGAAGAAACATCTGAGAAGTTCAAGGGTTTGCCAGGAGTTCTCTGGGTTTTGCCTGACTC
CTACATAGATGTCAAGAACAAGGACTATGGAGGCGACAAGTACATCAATGGAGAGATTAT
CCCCTGCACATACCCAACATACCAACCAAAGCAGCGCAATAACTCCAAGTATCAAAGTAA
GAGGTACGAGAGAAAAAGAGACGGCCCACCACCTCCTGAGCAGCAGAGGAAACCAAGACA
AGCGCCACCACCAGCCGCTTCTGATTCCTCTTGAACGTCAAAGCCCTTTTGTACTAGGAG
CGTGCGAGATTTTGATTGATTGATTTGGTTAGTAGTCCCTCATAGCTTATTCAAACCGGA
TGTAAAATCGTCGTTTGGAACAATATATAAGACATGCCATGTGGTTTAGTTTCCTGTTCT
GTCCGGTTAACCTGTAGCAAGGTATTCA

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 2

CO CL6154Contig1 859 2 10 U
TACCAACCGCAGTAGTATAACAAACACTAAACACACGGGAACTGCTTCATCCGGGTCTGA
GGTTTCATCAAGTAAAGGAAGTACTCGGAAGGGCCTTCGTGGTGGTAGCCCTAGTTTAGC
AAGAAGATCCGCAACAACAAATACTACTGACACCGTGCCACCACCTTCCCCGGCTGCTTT
GAGATCTTCTATGTCTTTGCGGTTGCATTTTCTGCTAAGATTACTGCCTGTCATCTGCAG
GGAACCGTCGTTTAGGAACACGAGACACACACTTGCGTCTACTATAGTTCGTCTGCTTGG
AAGCAGGGTAGTATATGAAGATTCTGCTGTGTGTTCTCCTCGTAATGACTTATCAAAGTC
GGAGACAGAATCAACAACAGATCCATCTCTCATGGCAGATCTTTCTAATGAAATCTTATT
TGACCGTTTACTGTTTGTACTCCATGGACTGTTAAGCAATCACCAGCCAAATTGGCTAAA
GCCAAGGTCTTGTTCCTCTAATGAATCATCCAAAGACTTTACCTTTTTCGATCGTGATGC
AGCAGAGAGCCTACAGAGTGAGCTTGCGCGGATGCAGTTACCAGAAACCATTAGATGGCG
GATTCAAGCAGCGATGCCAACCCTCCTTCCGCCTCTGCGTTGCTCTCCCTCGTGTCAGCC
ACATTCGGTTCCGCCAACGGCTCTCACACTTGTTCAACCATCGGGATCTTCTGGTCTCAA
TCAAAGAAACTCCCCTGCCATACCAAAAACCGTAACAGCTGCAGCGCAAGGGAAGTTGAA
GCAGACGATGTTGTCACAGTCTCAGCAGCAAGAAGCAGAAAACACGGATGTGGTTGTTGA
CCCATGGACGCTTTTGGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CR82TF U 1
AF RS1AB89TF U 300
BS 1 366 RS1CR82TF
BS 367 367 RS1AB89TF
BS 368 394 RS1CR82TF
BS 395 395 RS1AB89TF
BS 396 619 RS1CR82TF
BS 620 620 RS1AB89TF
BS 621 647 RS1CR82TF
BS 648 648 RS1AB89TF
BS 649 746 RS1CR82TF
BS 747 859 RS1AB89TF

RD RS1CR82TF 746 0 0
TACCAACCGCAGTAGTATAACAAACACTAAACACACGGGAACTGCTTCATCCGGGTCTGA
GGTTTCATCAAGTAAAGGAAGTACTCGGAAGGGCCTTCGTGGTGGTAGCCCTAGTTTAGC
AAGAAGATCCGCAACAACAAATACTACTGACACCGTGCCACCACCTTCCCCGGCTGCTTT
GAGATCTTCTATGTCTTTGCGGTTGCATTTTCTGCTAAGATTACTGCCTGTCATCTGCAG
GGAACCGTCGTTTAGGAACACGAGACACACACTTGCGTCTACTATAGTTCGTCTGCTTGG
AAGCAGGGTAGTATATGAAGATTCTGCTGTGTGTTCTCCTCGTAATGACTTATCAAAGTC
GGAGACCGAATCAACAACAGATCCATCTCTCATGTCAGATCTTTCTAATGAAATCTTATT
TGACCGTTTACTGTTTGTACTCCATGGACTGTTAAGCAATCACCAGCCAAATTGGCTAAA
GCCAAGGTCTTGTTCCTCTAATGAATCATCCAAAGACTTTACCTTTTTCGATCGTGATGC
AGCAGAGAGCCTACAGAGTGAGCTTGCGCGGATGCAGTTACCAGAAACCATTAGATGGCG
GATTCAAGCAGCGATGCCA*CCCTCCTTCCGCCTCTGCGTTGCTCTCTCTCGTGTCAGCC
ACATTCGGTTCCGCCAACGGCTCTCACACTTGTTCAACCATCGGGATCTTCTGGTCTCAA
TCAAAGAAACTCCCCTGCCATACCAA

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1AB89TF 560 0 0
GAAGCAGGGTAGTATATGAAGATTCTGCTGTGTGTTCTCCTCGTAATGACTTATCAAAGT
CGGAGACAGAATCAACAACAGATCCATCTCTCATGGCAGATCTTTCTAATGAAATCTTAT
TTGACCGTTTACTGTTTGTACTCCATGGGCTGTTAAGCAATCACCAGCCAAATTGGCTAA
AGCCAAGGTCTTGTTCCTCTAATGAATCATCCAAAGACTTTACCTTTTTTGATCGTGATG
CAGCAGAGAGCCTACAGAGTGAGCTTGCGCGGATGCAGTTACCAGAAACCATTAGATGGC
GGATTCAAGCAGCGATGCCAACCCTCCTTCCGTCTCTGTGTTGCTCTCCCTCGTGTCAGC
CACATTCGGTTCCGCCAACGGCTCTCACACTTGTTCGACCATTGGGATCTTCTGGTCTCA
ATCAAAGAAACTCCCCTGCCATACCAAAAACCGTAACAGCTGCAGCGCAAGGGAAGTTGA
AGCAGACGATGTTGTCACAGTCTCAGCAGCAAGAAGCAGAAAACACGGATGTGGTTGTTG
ACCCATGGACGCTTTTGGAA

QA 1 560 1 560
DS 



AS 1 2

CO CL6155Contig1 1113 2 2 U
CCCCTCTAGAAAATATGTCTTCGGCTTATTGCCCCTCCCTCGTGGCGGTTTCCGCCGCAG
CCACCGTTTCCTCCGCCGCTACCTCTAACCCGTTATTCTCCTCCCACTCAAATTTCAAAC
TCTTGTATCGCATCACACCAAAACCCTTCAAACTCGTCGCCAAATGCCCTACTCCTCTGT
TCCTCCATCCAAATACCCGTCGCCACCGCCTCCTCTGCGCCGCCGAAGACGAAATCCCGC
CGTCATCCGAAGAAGAAGACGAAGAGGACGAAGAAGAAAACGAAGAAGAAGGCGAAGAAG
ACGCAGATGGGACACAGACTACTACGCAAGCGAGCGTTGAGGAAGGGAGGCTGTACGTTG
GGAACTTACCTTACACAATCACTTCTTCTGAGCTCTCCCAACTCTTCGGAGAAGCTGGTA
ACGTCGTCGATGTTCAGATTGTGTACGATAAAGTCACTGACAGAAGCAGAGGGTTTGGGT
TCGTGACCATGGGAACCATTGAAGAAGCTAAGGAAGCGATTCAGATGTTCAACAGCTCCC
AAATCGGTGGTCGGACGGTGAAAGTGAACTTTCCGGAGGTGCCTAGAGGCGGAGAGAGAG
AAGTGATGAGGACTAAGATTCGTGATAGTAACCGGAGTTATGTTGACAGTCCTCACAAGA
TCTATGCGGGAAACCTTGGTTGGAATCTAACCTCGCAAGGTCTTAAAGATGCGTTTGGGG
ATCAGACTGGTGTGCTTGGTGCTAAGGTTATCTACGAAAGGAACAGTGGGAGGTCTAGGG
GGTTTGGTTTCGTGTCTTGAGTCGGAAGAAGATCTTCAGTCTGCTCTGAGCGCTATGAAT
GGTGTGGAAGTTGAAGGACGAGCTCTGAGGCTAAACTTGGCTTCGGAGAGAGCCGCGGAG
CCTCCTCCTTCTGTAAGAGAAGGAGAGACTGAAGAGGGAAGTCTAGAGAGCAGCGAGGTG
CTTTCGAACATTAGCACATGAAGCAGCAGAAGCACAATAGATTCCAGACATGTAACCGGG
AGGGCTAGAATATGAAAATGTTACTGTCTTTTTTGACTATGTTATTGTATTCTACTTGCG
GCTAAAGATTAAGATAATATATGAGAATAACAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DY60TF U 1
AF RS1DY60JQ C 392
BS 1 650 RS1DY60TF
BS 651 1113 RS1DY60JQ

RD RS1DY60TF 650 0 0
CCCCTCTAGAAAATATGTCTTCGGCTTATTGCCCCTCCCTCGTGGCGGTTTCCGCCGCAG
CCACCGTTTCCTCCGCCGCTACCTCTAACCCGTTATTCTCCTCCCACTCAAATTTCAAAC
TCTTGTATCGCATCACACCAAAACCCTTCAAACTCGTCGCCAAATGCCCTACTCCTCTGT
TCCTCCATCCAAATACCCGTCGCCACCGCCTCCTCTGCGCCGCCGAAGACGAAATCCCGC
CGTCATCCGAAGAAGAAGACGAAGAGGACGAAGAAGAAAACGAAGAAGAAGGCGAAGAAG
ACGCAGATGGGACACAGACTACTACGCAAGCGAGCGTTGAGGAAGGGAGGCTGTACGTTG
GGAACTTACCTTACACAATCACTTCTTCTGAGCTCTCCCAACTCTTCGGAGAAGCTGGTA
ACGTCGTCGATGTTCAGATTGTGTACGATAAAGTCACTGACAGAAGCAGAGGGTTTGGGT
TCGTGACCATGGGAACCATTGAAGAAGCTAAGGAAGCGATTCAGATGTTCAACAGCTCCC
AAATCGGTGGTCGGACGGTGAAAGTGAACTTTCCGGAGGTGCCTAGAGGCGGAGAGAGAG
AAGTGATGAGGACTAAGATTCGTGATAGTAACCGGAGTTATGTTGACAGT

QA 1 650 1 650
DS 

RD RS1DY60JQ 722 0 0
GCTCTCCCAACTCTTCGGAGAAGCTGGTAACGTCGTCGATGTTCAGATTGTGTACGATAA
AGTCACTGACAGAAGCAGAGGGTTTGGGTTCGTGACCATGGGAACCATTGAAGAAGCTAA
GGAAGCGATTCAGATGTTCAACAGCTCCCAAATCGGTGGTCGGACGGTGAAAGTGAACTT
TCCGGAGGTGCCTAGAGGCGGAGAGAGAGAAGTGATGAGGACTAAGATTCGTGATAGTAA
CCGGAGTTATGTTGACAGTCCTCACAAGATCTATGCGGGAAACCTTGGTTGGAATCTAAC
CTCGCAAGGTCTTAAAGATGCGTTTGGGGATCAGACTGGTGTGCTTGGTGCTAAGGTTAT
CTACGAAAGGAACAGTGGGAGGTCTAGGGGGTTTGGTTTCGTGTCTTGAGTCGGAAGAAG
ATCTTCAGTCTGCTCTGAGCGCTATGAATGGTGTGGAAGTTGAAGGACGAGCTCTGAGGC
TAAACTTGGCTTCGGAGAGAGCCGCGGAGCCTCCTCCTTCTGTAAGAGAAGGAGAGACTG
AAGAGGGAAGTCTAGAGAGCAGCGAGGTGCTTTCGAACATTAGCACATGAAGCAGCAGAA
GCACAATAGATTCCAGACATGTAACCGGGAGGGCTAGAATATGAAAATGTTACTGTCTTT
TTTGACTATGTTATTGTATTCTACTTGCGGCTAAAGATTAAGATAATATATGAGAATAAC
AG

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL6156Contig1 901 2 6 U
GCAGGATCAAATGGACGGGTGACGACCATGGGTGTTTACGTACGTGATTTGCTGCTTGGA
CTGTATTACTTTGATACATTGTTTCCACGTATCCCGGTACCTGTGATGCGCCAGATTGTA
TCAAACCTTGAGAAGATGAATTTACCAACAAAACCATCTGGTTCAACCGGAGACATGTCT
CGTGGCTCTGAAGACACTGCGCGTCGTCCACCATCAGTAAAAGCATCCCTCTCTGTTTCA
TTTGGGCAACGTGCACCTCACCGTGCCTCCACCAGAGGCTCCTCTCCCGTTCGCCGTCCT
CCACCTTCTGGTTATGACAGAAATGAAAGGGATGAACCACAGCGTCGGTCCCCGCGAAGG
AGCCAGAGCCGAGACTATTATTCGGACAGAGACTCAGATAGACAGCGGGAGAGAGAGAGG
GAGAGGGAAAGAGATAGATACAGAGAAAGGTAGAGGGATTATGGTAATGATAGGAGATCA
AGGCGTGACTATGAAAGTAGTAGAAGCAGACGCGGTGATTATGAGGATGATAGAAGCAGA
CACGACCGTAGAAGCAGGAGCAGGAGTAGGAGCAGGAGTGTGAAAATTGAGCGTGAACCA
ACTCCTAAAAGAGACTATGGAAACAAGGAGAAAGCAGCTGCGACTGTTAACAGCAACCTC
GCAAAGCTAAAAGATCTATACGGAGACGCGAGTAATCAGAAAGGGGAAGAAGGGTATGGA
ACAAGGAGGGATTCAAGTTCAGAAGAAGTGATTAAGCTTGGTGGTTCCTCTTGGAGGTGA
AAACCAAAAAAAGAAAAAAAAAAAACACTCTGTGACTTGAAATGTTTATTCTATGTTGTA
GGATGATGCAATGTTGTTTTACTTTGCTGTTTTAAACTTCCAGCAAACTATTTGTTTACA
G


BQ
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10 

AF RS1CU72TF U 1
AF RS1BS03TF U 573
BS 1 582 RS1CU72TF
BS 583 583 RS1BS03TF
BS 584 643 RS1CU72TF
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BS 645 708 RS1CU72TF
BS 709 901 RS1BS03TF

RD RS1CU72TF 708 0 0
GCAGGATCAAATGGACGGGTGACGACCATGGGTGTTTACGTACGTGATTTGCTGCTTGGA
CTGTATTACTTTGATACATTGTTTCCACGTATCCCGGTACCTGTGATGCGCCAGATTGTA
TCAAACCTTGAGAAGATGAATTTACCAACAAAACCATCTGGTTCAACCGGAGACATGTCT
CGTGGCTCTGAAGACACTGCGCGTCGTCCACCATCAGTAAAAGCATCCCTCTCTGTTTCA
TTTGGGCAACGTGCACCTCACCGTGCCTCCACCAGAGGCTCCTCTCCCGTTCGCCGTCCT
CCACCTTCTGGTTATGACAGAAATGAAAGGGATGAACCACAGCGTCGGTCCCCGCGAAGG
AGCCAGAGCCGAGACTATTATTCGGACAGAGACTCAGATAGACAGCGGGAGAGAGAGAGG
GAGAGGGAAAGAGATAGATACAGAGAAAGGTAGAGGGATTATGGTAATGATAGGAGATCA
AGGCGTGACTATGAAAGTAGTAGAAGCAGACGCGGTGATTATGAGGATGATAGAAGCAGA
CACGACCGTAGAAGCAGGAGCAGGAGTAGGAGCAGGAGTGTGCAAATTGAGCGTGAACCA
ACTCCTAAAAGAGACTATGGAAACAAGGAGAAAGCAGCTGCGAGTGTTAACAGCAACCTC
GCAAAGCTAAAAGATCTATACGGAGACGCGAGTAATCAGAAAGGGGAA

QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1BS03TF 329 0 0
G
AGGAGTGTGAAAATTGAGCGTGAACCAACTCCTAAAAGAGACTATGGAAACAAGGAGAAA
GCAGCTGTGACTGTTAACAGCAACCTCGCAAAGCTAAAAGATCTATATGGAGACGCGAGT
AATCAGAAAGGGGAAGAAGGGTATGGAACAAGGAGGGATTCAAGTTCAGAAGAAGTGATT
AAGCTTGGTGGTTCCTCTTGGAGGTGAAAACCAAAAAAAGAAAAAAAAAAAACACTCTGT
GACTTGAAATGTTTATTCTATGTTGTAGGATGATGCAATGTTGTTTTACTTTGCTGTTTT
AAACTTCCAGCAAACTATTTGTTTACAG

QA 2 329 2 329
DS 



AS 1 2

CO CL6157Contig1 1214 2 4 U
GGATCACTGTACTACTGTGAAAGTTAGTTAGTTCAACATTACCAAAACAACCAACAATGG
CTAAAACCAGATGGTCTTGCCTCGCTATCGCCCTTTTGGCTATTACCCATTTCGTCAACT
GTGAAGAAGAAGCTGTCTTGTCTGAGAAAGAGCAGGACAAGGTCTCGAGATTGCCTGGTC
AGGATTTCGATATAGACTTTGCTCATTACTCCGGGTTCGTTACTACTAATGAGGAACTGG
GAAGAGCACTCTTCTACTGGTTCTTTGAAGCCGCTGAAGATGCTGCCTCTAAGCCTCTTG
TTCTCTGGCTCAATGGAGGACCAGGATGTTCATCAGTTGGATTTGGTGAAGCAGAAGAGA
TAGGACCGTTTCACATTAACCCAGATGGGAAGACTCTTTACCTTAATCAATATTCTTGGA
ACCAAGTTGCGAATATTTTGTTCCTTGATGCACCTGTTGGAGTTGGTTATTCATACTCAA
ACACTTCATCTGATTTGCTTACCAATGGTGATATGAGAACCGCGCAAGACTCACTGAAGT
TTCTTCTGAAATGGGTTGAGCGTTATCCGGAGTACAAAGGAAGAGAGTTTTATATAGTTG
GAGAGAGCTATGCAGGGCATTACATCCCTCAGCTGAGTCAAGCCATTGTAGAACATAACC
AAGCTTATGGCGATAACACCATTAATCTGATGGGTTACATGGTAGGTAATGGGCTGATGG
ATGATTTCCATGACAGCCTCGGTCTTTACCAGTATATTTGGACGTTGGGTTTCATCTCCG
ACCAAACGTACAGCTTACTAAAACTTCGTCCAGTGAGTCCCTATGGTCCTTGGTACATAG
ACGGACAGGTGGGAGGGTGGACTCAGGAGTATGATGGTCTAAACTTTGTGACTATGAGAG
GTGCAGGGCATGAAGTTCCTTTGCACAGACCGAAGGAGGCTCTTGCGCTCTTCAAGGCCT
TTATCTCTGGAACTTCATTGCCAACACTAGAGAACAGCATCAGCAGAGAGAATTCCGAAC
TCGTTAGTAACTCATGATGAGTTGTGTGATTCTCAGTCGGAAAGTTGCAGTCATTGTATG
TATGAACTAGTAAAGAGAATAATATAAGAACTGGTTCGTGAGTTCGTCTTCTGATTGTTT
TTGTTTTGAAAACATGCAATGTTGGATTCTGTTAAGTTTCTACCATTTGTGAGCCATACA
ATCTATCTATGTTT


BQ
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GAAGTTTCTTCTGAAATGGGTTGAGCGTTATCCGGAGTACAAAGGAAGAGAGTTTTATAT
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TAACCAAGCTTATGGCGATAACACCATTAATCTGATGGGTTACATGGTAGGTAATGGGCT
GATGGATGATTTCCATGACAGCCTCGGTCTTTACCAGTATATTTGGACGTTGGGTTTCAT
CTCCGACCAAACGTACAGCTTACTAAAACTTCGTCCAGTGAGTCCCTATGGTCCTTGGTA
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GAGAGGTGCAGGGCATGAAGTTCCTTTGCACAGACCGAAGGAGGCTCTTGCGCTCTTCAA
GGCCTTTATCTCTGGAACTTCATTGCCAACACTAGAGAACAGCATCAGCAGAGAGAATTC
CGAACTCGTTAGTAACTCATGATGAGTTGTGTGATTCTCAGTCGGAAAGTTGCAGTCATT
GTATGTATGAACTAGTAAAGAGAATAATATAAGAACTGGTTCGTGAGTTCGTCTTCTGAT
TGTTTTTGTTTTGAAAACATGCAATGTTGGATTCTGTTAAGTTTCTACCATTTGTGAGCC
ATACAATCTATCTATGTTT

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

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TGGCTGATCACGAGTGAAAAGAAATTGCTTTTGTCAGGAAGAAGATTGATCCTGTCAACA
AAGAATTCTCAACAAGCCAATCTGTAAAGCTACCACCAGCAGCAGAGAATCCTCAAGCTG
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TCTTTTTTTTTTGTCACAACTACTCTACTAGCTCTTCTTTTTTAATTCCGCAAAATGAAA
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ATATGAAGGGAAATAAACGT


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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F968TF U 1
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GCTCAGCTTGGTCGTGTCGAGGAAGAGACTAAAGGCATCGTCTTGATCCGTGAGAAGCTT
TGGCTGATCACGAGTGAAAAGAAATTGCTTTTGTCAGGAAGAAGATTGATCCTGTCAACA
AAGAATTCTCAACAAGCCAATCTGTAAAGCTACCACCAGCAGCAGAGAATCCTCAAGCTG
ATCTAGAGAAGGTGAAACGGGTATCACAGTTTAACAATCAAGCAAGAAGTCAGACATGGA
AATAAGATCAAAAGGAATGTTAGTTTAGAAGCGTAACCAGTGTTCCGTTCCTGTCGGAGC
GCCGCCACCGAGGACCATAGTCAGAATCAAGTATAGTTCTGTCTACCATGAGATCAATAT
CAGTCCTCAAGCTTCATTTGGACGCTGACGGAGTATATAATTAGACAGTCTGAGAGTCTT
CACATGCATTCATATGGTACTTCAATCATAGAACCCTAGATATCTCTCAGCACTCTCCAA
GAAGTGATTCATTTCTCTGAGCTAA

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DS 

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TTCCTGTCGGAGCGCCGCCACCGAGGACCATAGTCAGAATCAAGTATAGTTCTGTCTACC
ATGAGATCAATATCAGTCCTCAAGCTTCATTTGGACGCTGACGGAGTATATAATTAGACA
GTTTGAGAGTCTTCACATGCATTCATATGGTACTTCAATCATAGAACCCTAGATATCTTT
CAGCACTTTCCAAGAAGTGATTCATTTTTTTGAGCTAAAGGTTTTTGTATCATGATTTTG
AAGTACAATGGTGGAAAGCTGAGAGATGAGACCAAGCTTAAAAGTGCTGTCCAGATGCAA
GAATGTTAGGTCCCAAAACAAGGGCTGGGACCGTGTTTTGATAGTGTCCATGTTAGTATG
CCTGTCAACAGCACTGGACTCGGTGCTGACATTGAACCTCCTGTAACCAGTACCGGTCTC
CCTGGTGTGGCCATGGATGAAGGCATCCGATGCAATCACAGTTGAGGGAGGTAGCCCCTC
TGCAAAGAAGCCACTTAATGTCAAAAACTCAACCATCAGACATCATTACGCATAAGTGTA
GTGTCACAACTACTCTTTTTTTTTTGTCACAACTACTCTACTAGCTCTTCTTTTTTAATT
CCGCAAAATGAAATAAGTTTTCTTGCAGCACTGTGTTTCTGTGTTTTTCGATAATAAACG
GAATAATATTATTATATGAAGGGAAATAAACGT

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL6159Contig1 811 2 2 U
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TGGATTCAGATACGGAATTGGAGTCTCCATAGGAGTGCTCCTCCTCATCACCACAATCAC
CCTCACCTCCTATTTCTGCACACGTAGACAGCTCTCTTCTTCACCTTCACAAACAAGTCA
AGATTCAACACGCGTTCACCATCACCACCACCACCATGTCATCCTCGACGTCGTGTCAGG
CCTGGACGAGGACACCATTCAAAGCTACCCGAAGCTCCTCTACTCCGAAGCAAAGGGAAG
CTCAACGTCGTCGTGTTGTTCAATATGCTTAGGAGACTACAAAGGGAATCATCTGCTGCG
GCAACTCCCAGATTAACCATCTCTTTCACCTTAAATGTATAGACACGTGGCTTAGACTCA
ATCCTACATGTCCTGTCTGTCGGACTTCGCCGTTACCTACTCCTCTGCCCACTCCCCTCG
CCGAGGTTGTCCCCTTAGCCTCCACCGTTGCCACCACCAGGATGTCCTAATTATTCGCTT
TCATAGCTGGATAATCCTGAAACGAAGTCAAGCCTAATCTTCGGGGTATTATTCTTTGAA
TTCTTGTTTAGTTCCTTGTATATTTTGATTTTTTGGTCACTAACTGATCATTGTATATAT
TCGCTGGATCCAAATATCTCTAAATGAAAGGAAAATAAGGATAAATTTTACATTTTTGTT
CGATAAAATGCTTTGATTTTGTCTTTTTGCC


BQ
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AF RS1GD21TF U 1
AF RS1GD21JQ C 344
BS 1 750 RS1GD21TF
BS 751 811 RS1GD21JQ

RD RS1GD21TF 752 0 0
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CCTGGACGAGGACACCATTCAAAGCTACCCGAAGCTCCTCTACTCCGAAGCAAAGGGAAG
CTCAACGTCGTCGTGTTGTTCAATATGCTTAGGAGACTACAAAGGGAATCATCTGCTGCG
GCAACTCCCAGATTAACCATCTCTTTCACCTTAAATGTATAGACACGTGGCTTAGACTCA
ATCCTACATGTCCTGTCTGTCGGACTTCGCCGTTACCTACTCCTCTGCCCACTCCCCTCG
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TTCTTGTTTAGTTCCTTGTATATTTTGATTTTTTGGTCACTAACTGATCATTGTATATAT
TCGCTGGATCCAAATATCTCTAAATGAAAG
AA

QA 1 750 1 750
DS 

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GGGAATCATCTGCTGCGGCAACTCCCAGATTAACCATCTCTTTCACCTTAAATGTATAGA
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TCTGCCCACTCCCCTCGCCGAGGTTGTCCCCTTAGCCTCCACCGTTGCCACCACCAGGAT
GTCCTAATTATTCGCTTTCATAGCTGGATAATCCTGAAACGAAGTCAAGCCTAATCTTCG
GGGTATTATTCTTTGAATTCTTGTTTAGTTCCTTGTATATTTTGATTTTTTGGTCACTAA
CTGATCATTGTATATATTCGCTGGATCCAAATATCTCTAAATGAAAGGAAAATAAGGATA
AATTTTACATTTTTGTTCGATAAAATGCTTTGATTTTGTCTTTTTGCC

QA 1 468 1 468
DS 



AS 1 2

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TCTGTGAAAGATGGAACATGGTCGTGCACGACGTGATTAAAGGCCGTGACATTGATAAGC
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ATTTACTCTCAACAGTTGAGAAGCTTCTGAAGGGTACCATTCCGTCACTTTCGCATGAAG
CAGATGGCCTTATATTTCAGGGATGGGACGATCCTTATGTTCCACGAACGCATAAAGGTC
TACTGAAGTGGAAGTATGCGGAAATGAACTCAGTAGACTTTCTGTTCGAGATGGGTGAGG
AAGAGGAGGGTCGCAGGATGCTCTTCTTGTCTGAACGAGGGAAGAAAAAGCTTATGGACG
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AGTGTTCATGGGACAAGGAGAAGAAAGTATGGGTTAGCATGCGTATCAGAGTCGACAAAA
CTACACCAAACGATATCAACACCGCTCGTAAGGTGATAAAAAGCATAAACGACAACATAA
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GCATTCGAATGGACCTTCGAGCTGCTGGACGCTGAGAGTGTGATAATATAAGAGGTCTGC
AGACGCATACCAGTAATGTTTACCTAAGAAATCCAGAGTCAGAAGACAGACAGACTGTAA
AACTAGCATTGATCGATCATATAATCGTTTTGTCTTACAGAAACATGACCCACTCAGGTT
ACATCTTTTAAATA


BQ
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AF RS1E590TF U 1
AF RS1E387JQ C 242
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BS 529 529 RS1E387JQ
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RD RS1E590TF 661 0 0
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GGAGGTACCTCGTATATGACTTGGTAGCAATCAACGGCGAATCAGTCGTAGAGCGGACAT
TCTGTGAAAGATGGAACATGGTCGTGCACGACGTGATTAAAGGCCGTGACATTGATAAGC
AAAGGAATCATTGCTACAGATATGACCTGGAGCCTTTTGGGGTACGGATGAAGGGTTTTT
ATTTACTCTCAACAGTTGAGAAGCTTCTGAAGGGTACCATTCCGTCACTTTCGCATGAAG
CAGATGGCCTTATATTTCAGGGATGGGACGATCCTTATGTTCCACGAACGCATAAAGGTC
TACTGAAGTGGAAGTATGCGGAAATGAACTCAGTAGACTTTCTGTTCGAGATGGGTGAGG
AAGAGGAGGGTCGCAGGATGCTCTTCTTGTCTGAACGAGGGAAGAAAAAGCTTATGGACG
GATATACGGTTGAGTTTAGAGATGGTTCGGATCCGTCAAGTTACAACGGGAAGATTGTAG
AGTGTTCATGGGACAAGGATAAGAAAGTATGGGTTAGCATGCGTATCAGAGTCGACAAAA
CTACACCAAACGATATCAACACCGCTCGTAAGGTGATAAAA*GCATAAACGACAACATAA
C

QA 1 661 1 661
DS 

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AGATGGCCTTATATTTCAGGGATGGGACGATCCTTATGTTCCACGAACGCATAAAGGTCT
ACTGAAGTGGAAGTATGCGGAAATGAACTCAGTAGACTTTCTGTTCGAGATGGGTGAGGA
AGAGGAGGGTCGCAGGATGCTCTTCTTGTCTGAACGAGGGAAGAAAAAGCTTATGGACGG
ATATACGGTTGAGTTTAGAGATGGTTCGGATCCGTCAAGTTACAACGAGAAGATTGTAGA
GTGTTCATGGGACAAGGAGAAGAAAGTATGGGTTAGCATGCGTATCAGAGTCGACAAAAC
TACACCAAACGATATCAACACCGCTCGTAAGGTGATAAAAAGCATAAACGACAACATAAC
AGAGGAAGTGTTGCTTCAAGAAATGAGAGAGATCATACGTCTCCCAATGTACGCAGACCG
CATTCGAATGGACCTTCGAGCTGCTGGACGCTGAGAGTGTGATAATATAAGAGGTCTGCA
GACGCATACCAGTAATGTTTACCTAAGAAATCCAGAGTCAGAAGACAGACAGACTGTAAA
ACTAGCATTGATCGATCATATAATCGTTTTGTCTTACAGAAACATGACCCACTCAGGTTA
CATCTTTTAAATA

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

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TGCTGCTTTGGCATCTGGGTTTCTCTTCTAAACCAATCTCTACATACCATATAGAGTTAT
TGTTTGCTACTTCTTTTCTCTTTTCTTCTGTTTATTTTGTTATCGCATGAGCTTTTTGTT
ATTGTTTCTAATATTTGGACTACTATATATTATATATTTTTAATTT


BQ
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AF RS1DN29JQ C 1
AF RS1DN29TF U 1
BS 1 406 RS1DN29TF

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TGTTTGCTACTTCTTTTCTCTTTTCTTCTGTTTATTTTGTTATCGCATGAGCTTTTTGTT
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QA 1 406 1 406
DS 

RD RS1DN29TF 406 0 0
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TTCCAAGTGCAAAAGAGGAGGGATGGAGTCAATGAAGATGAAGCTTATGGTGGTGTTGAC
GGTGGCTATTGTGGCTTTCTCAGCCGTAGGAAATGTGGCGGCTCAGACAACAGAGTCTCC
AGCTCCAAGTCCTACTTCCGATGCTGCTGCTATGTTCGTCCCAGCATTGTTTGCATCTGT
TGCTGCTTTGGCATCTGGGTTTCTCTTCTAAACCAATCTCTACATACCATATAGAGTTAT
TGTTTGCTACTTCTTTTCTCTTTTCTTCTGTTTATTTTGTTATCGCATGAGCTTTTTGTT
ATTGTTTCTAATATTTGGACTACTATATATTATATATTTTTAATTT

QA 1 406 1 406
DS 



AS 1 2

CO CL6162Contig1 1103 2 2 U
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ATGGACTATGATAGGAAAATGGACTATCCATCTAATGGTGTATCCATACTGGCATGCCTT
AGGCCGGCTTTCCTTGACGAGGAATCCTATATAAGAAGATTGTTTCTCTCGGAAGATAGA
GATGACTATAGCTGGGAGGTTCAAGGTGATGATAATCAAAACACTAGTTCCAGACATGAC
GAGAACGATATGAGTTCTAGTCTATATAGATTAGAGATTGTGGGAATAGAGCTTCTCTCC
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TTAGTTCACTCAACGTCTGCAATCATAGAGCGTTTCAACAACAGAGGGACTAGTTCAGAC
ATTGCACTTAAAGCTCTCTGCAAAAAGAAAGGTCTTCATGCAGAGGAAGCTAACCTGATC
AGTGTTGATAGCCTTGGTATGGATGTGAGAGTTTTTGCAGGCGCACAATTCCAAACTCAC
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CTGCTGTTCCCTCGTTCACGCAGAAGGAAGTTGAAGTCTAACGACGAGAGTTTGAAGGAC
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TGCCACTGTGGAGTTCTTTGCTCTGACGTTTTATGTACATAAAGATGAGCTTTCAAGAGA
GACCGTACTAGGGCTGTGTGGAGATTGCCGCTTCTTACATCGTCTTAGTAAGTTAAATAA
AATAAAAAAGAAATGTAAGAATAAATAGAAGTTGATACATTTGAAGTAAACTTCTATGAT
AAGTCCAATGTTGTTCTGTTTTTTTTTTTTACAACTAACTTAAAGATCAAATAAAACCTT
TTTATTTCCTCTTTACAGTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AI84TF U 1
AF RS1AI84JQ C 338
BS 1 743 RS1AI84TF
BS 744 1103 RS1AI84JQ

RD RS1AI84TF 743 0 0
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AGGCCGGCTTTCCTTGACGAGGAATCCTATATAAGAAGATTGTTTCTCTCGGAAGATAGA
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QA 1 743 1 743
DS 

RD RS1AI84JQ 766 0 0
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CATTTGAAGTAAACTTCTATGATAAGTCCAATGTTGTTCTGTTTTTTTTTTTTACAACTA
ACTTAAAGATCAAATAAAACCTTTTTATTTCCTCTTTACAGTTACC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

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AATACACACCTTTATCAAAGGAAAAATAGTAATATTATTATTTTTGTTAGTTTTTGTTGC
ATAATAAAATGTATAATGTTACAAATATAAATAATAAATATTAATTAGACG


BQ
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BS 1 411 RS1CB17TF

RD RS1CB17JQ 411 0 0
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GAGGAATGGACTTGGTGCATGTGGGCGCAACTTTTGTTTTTGTTTCTATGAAAAGAATAA
AAAAAATTCTTGCTTACCCTAATTTTTTATCTACATTGGAACTCAAATAATACTTATAAT
AATACACACCTTTATCAAAGGAAAAATAGTAATATTATTATTTTTGTTAGTTTTTGTTGC
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QA 1 411 1 411
DS 

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AGTAATAGCGATTGCTCAGAAAAGAGGACCACCGCGAAAAGAACCTCCTTGTAAGGAAGA
CTACTTTAAGAGAAACGGATCATGTAACATGGAAGATTGTAAGGCTGAATGTTCTAAAAA
GAGGAATGGACTTGGTGCATGTGGGCGCAACTTTTGTTTTTGTTTCTATGAAAAGAATAA
AAAAAATTCTTGCTTACCCTAATTTTTTATCTACATTGGAACTCAAATAATACTTATAAT
AATACACACCTTTATCAAAGGAAAAATAGTAATATTATTATTTTTGTTAGTTTTTGTTGC
ATAATAAAATGTATAATGTTACAAATATAAATAATAAATATTAATTAGACG

QA 1 411 1 411
DS 



AS 1 2

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TAATGTCCATTACTTCAGTCACCACGATGTAGCCTTGAATGCATGCTTTGATTAGGAGTC
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AAAGATCGCCGGTGAAACATAATGATCCTGGAGGTGGATTTATATGATGTGAACCAGAGG
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ATGCGATAAGCACATTAGATCTGAATAATCCAAGGTTCATGTAGATATCAACACAAGAGT
CAGGGTCAGAGAAAAAAAAGAGAATCAACAGTGAAGCAAATAAGGTGTTCC


BQ
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AF RS1CC40JQ C 1
AF RS1CC40TF U 1
BS 1 411 RS1CC40TF

RD RS1CC40JQ 411 0 0
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QA 1 411 1 411
DS 

RD RS1CC40TF 411 0 0
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TAATGTCCATTACTTCAGTCACCACGATGTAGCCTTGAATGCATGCTTTGATTAGGAGTC
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AAAGATCGCCGGTGAAACATAATGATCCTGGAGGTGGATTTATATGATGTGAACCAGAGG
TGCTGAACTCAAGAAGAACCTTGCTCTCTCTCGCTAAAAAGCAAAGAAGAAAACTTGAAA
ATGCGATAAGCACATTAGATCTGAATAATCCAAGGTTCATGTAGATATCAACACAAGAGT
CAGGGTCAGAGAAAAAAAAGAGAATCAACAGTGAAGCAAATAAGGTGTTCC

QA 1 411 1 411
DS 



AS 1 2

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GAGTGTCTCTACTGATGTTGAATTGCTG


BQ
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AF RS1BF28TF U 1
AF RS1BF28JQ C 380
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BS 639 1168 RS1BF28JQ

RD RS1BF28TF 638 0 0
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GCCTGGATTGGGCCGTGCCGCTGGACGTGGAGTGCCGACTGGGCCGCTCGTTCAAGCTCA
GCCTGGGCTTTCTGGGCCTGTTCGTGGAGTCGGTGGGCCGTCTCCGGGGATGATGCAGCC
GCAGATCTCTCGTCCTCCGGTGATGCGGCCTCCGGGACAGATGCTTCCGCCGCCGCCTGC
TTTCGGTGGTCCTCCTCCTCCGATGGGGAGAGGTGTTC

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DS 

RD RS1BF28JQ 789 0 0
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GCTGGACGTGGAGTGCCGACTGGGCCGCTCGTTCAAGCTCAGCCTGGGCTTTCTGGGCCT
GTTCGTGGAGTCGGTGGGCCGTCTCCGGGGATGATGCAGCCGCAGATCTCTCGTCCTCCG
GTGATGCGGCCTCCGGGACAGATGCTTCCGCCGCCGCCTGCTTTCGGTGGTCCTCCTCCT
CCGATGGGGAGAGGTGTTCCTCAAGGTCCTCCTCCGAATTACGGTATGAGGCCTCCGCCG
CAGTTTGGTGGACCGCTGCCTCCGTATGGGCAGAGACCGATGGGACCTCCGCCTGGTGGG
ATGATGAGAGGTCCTCCTCCACCGCCTCATGGGATGCAGGGACCCCCGCCTGGGCCGCCT
CGCCCTGGAATGCAGCCTCCTCCTGGAGGGTTTGCTCCACAGCGTCCGGGGCCACCACCG
CCTAATCCACATAATCAGCAGCAGTGATTAGGTTTGCCATGAATGAATGTACCCTTTTTT
CTTAAGCTGAGATTGTGAAGGCATTGTTAAGTTTGTTTGGGTTGGACTTTACTCAGATTT
AAAGTGTCTTGCTTTTCATGTCTTTAGCTGGAATCTCCTGATCTATCTTTAGCTGGAATC
TCCTGATCTATCTTATTTGCGCATAATCGTTATATATTGCTATATGTTTTATGTCTGGAA
CTCTAATCATAATTCTATGATGACCTGAGTGAGCACATAGTGAGTGTCTCTACTGATGTT
GAATTGCTG

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 2

CO CL6166Contig1 1181 2 12 U
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GATGGTAGCAGATCGATCGACGCTTCTTCCCCATCCATGGCGATTGACGATTCAGAAATC
AATTGAAGGTTCAGAAATGAAAATCAAAACCAGTAAAAACTGTAACGATGGCTTGAAGAT
CTTCGACGATGACGGTAGCAAATCGGGTTTGGAAACAAAATCAAACCACGAAGTTTGAAA
CTCGTTAGATCCAGGAAAGACTTCTCCTATTCCTCACTCTTAAGATCCGAAGGCTTCAGT
GAGAAAAACGTTAAGTGATATTTGGGTTTCAATTTGGTGATTTCAGAAATCTTTGGCCGA
TTTGTGATCAGAACTGAAAGACAATTAAACGATAAATATAATTTAAAGTTTTTAATCATT
TGTTAAAAGTTAATCTCGGAGTTTTATTCACCAAATATATTCATGTAACATTTGTTCTGG
TTTTTGTTTCCGATGAGATTGGAATGGTTTCTAAGAATCCGACGAAGAATCCGATGAAGT
TCTGAAGCGGAACATGTCATTCTTCACTGTTAAAAGTTTAAAGACACATGTTTGTGCAGC
TGAAGGACCATGGGACAAATACATAACGCCAAAGCAATACGAACCAATAAATCTGATATC
ATGACATATAGTTGAGAGTAGGTGGTTACAACAAGACCAGCTCTTAGGAGTTAGGAGAGC
GAGACTCCAAAAATCTTCATGATCCGGAGCGTCTCTTTCCACTCTAACAGCGTGGAGTGA
ATTGTCGACTCAGTTTGATTGGGTCTGGCCCATATGGGCTATAAAGCTTAACAGCCCAAG
TTTAATTCTTCCAAACCTCAGAGTTATTGAAGTTTGCTATCTTGTGGAGCGGTCTGTACG
GGGCCTGAAGATGCAATCGAGATTACTCATGTTTTTCTCGTAGGTGAAAGCTGGCTCTCA
ACGTCACTTGTGACTATTTCTCAGCTGTCCGACTTTGTCGTGAAAGCTTTATTGACGCAG
TCAAGCTTTGTTTTGATTTCGCTGTCATCTTCTCCTAAAGAACTATTTATCTTAATTTAT
TTTGCTAGAGTTGTTTATGTTTTTAACCTAAGAGGATGGTTAATTCCCTCAGTTCAGTGT
AAGCGAACAAGTTAAGTATAAATGAAAATAAGTTGTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CM18TF U 1
AF RS1CM18JQ C 519
BS 1 681 RS1CM18TF
BS 682 682 RS1CM18JQ
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BS 760 780 RS1CM18TF
BS 781 781 RS1CM18JQ
BS 782 792 RS1CM18TF
BS 793 1181 RS1CM18JQ

RD RS1CM18TF 792 0 0
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GATGGTAGCAGATCGATCGACGCTTCTTCCCCATCCATGGCGATTGACGATTCAGAAATC
AATTGAAGGTTCAGAAATGAAAATCAAAACCAGTAAAAACTGTAACGATGGCTTGAAGAT
CTTCGACGATGACGGTAGCAAATCGGGTTTGGAAACAAAATCAAACCACGAAGTTTGAAA
CTCGTTAGATCCAGGAAAGACTTCTCCTATTCCTCACTCTTAAGATCCGAAGGCTTCAGT
GAGAAAAACGTTAAGTGATATTTGGGTTTCAATTTGGTGATTTCAGAAATCTTTGGCCGA
TTTGTGATCAGAACTGAAAGACAATTAAACGATAAATATAATTTAAAGTTTTTAATCATT
TGTTAAAAGTTAATCTCGGAGTTTTATTCACCAAATATATTCATGTAACATTTGTTCTGG
TTTTTGTTTCCGATGAGATTGGAATGGTTTCTAAGAATCCGACGAAGAATCCGATGAAGT
TCTGAAGCGGAACATGTCATTCTTCACTGTTAAAAGTTTAAAGACACATGTTTGTGCAGC
TGAAGGACCATGGGACAAATACATAACGCCAAAGCAATACGAACCAATAAATCTGATATC
ATGACATATAGTTGAGAGTAG*TGGTTACAACAAGACCAGCTCTTAG*AGTTAGGAGAGC
GAGACTCCAAAA*TCTTCATGATCCGGAGCGTCTCTT**CACTCTAACAGCGTGGAGTGA
*TTGTCGACTCA

QA 1 792 1 792
DS 

RD RS1CM18JQ 663 0 0
CCGACGAAGAATCCGATGAAGTTCTGAAGCGGAACATGTCATTCTTCACTGTTAAAAGTT
TAAAGACACATGTTTGTGCAGCTGAAGGACCATGGGACAAATACATAACGCCAAAGCAAT
ACGAACCAATAAATCTGATATCATGACATATAGTTGAGAGTAGGTGGTTACAACAAGACC
AGCTCTTAGGAGTTAGGAGAGCGAGACTCCAAAAATCTTCATGATCCGGAGCGTCTCTTT
CCACTCTAACAGCGTGGAGTGAATTGTCGACTCAGTTTGATTGGGTCTGGCCCATATGGG
CTATAAAGCTTAACAGCCCAAGTTTAATTCTTCCAAACCTCAGAGTTATTGAAGTTTGCT
ATCTTGTGGAGCGGTCTGTACGGGGCCTGAAGATGCAATCGAGATTACTCATGTTTTTCT
CGTAGGTGAAAGCTGGCTCTCAACGTCACTTGTGACTATTTCTCAGCTGTCCGACTTTGT
CGTGAAAGCTTTATTGACGCAGTCAAGCTTTGTTTTGATTTCGCTGTCATCTTCTCCTAA
AGAACTATTTATCTTAATTTATTTTGCTAGAGTTGTTTATGTTTTTAACCTAAGAGGATG
GTTAATTCCCTCAGTTCAGTGTAAGCGAACAAGTTAAGTATAAATGAAAATAAGTTGTGT
TCC

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

CO CL6167Contig1 897 2 6 U
GGGCTAACGATTGATTCTTAGCTTGTAGCCATATAATAATCCAAACAGGGAGAGAATATA
GCTTTTCATGGATTCTCTTCGATTCAACCTTCACCAATCTCCCTTTCAGCTGAGACCCAG
AAAAACTTTTCGACCAAGAATCACTAGCATTTCGAACCAAACCGAAGAAACCGATCCGCG
ACCAACATCTTCGCCCGGTAAGATCCAACGCTTAGTACTCAACAATGAAGGTCGTACGAA
ACTCAACTCCGGTCCTGACCGTGAATTCTATTCGTACCCACGGTTCGTAAACCACGTCGA
CGACGGCTTCATATCCTCCTTAACGGATCTCTACAGAAACCGGTTAAAATCCGGTTCGAT
TGTATTAGACATGATGAGCTCGTGGGTTAGCCATCTACCAGAAGAGGTGAAGTTCGAGAA
AGTAGTGGGACATGGTCTTAACGCACAGGAGCTTGCCAGAAACCCTAGACTCGATTACTT
CTTCATCAAGGATCTTAACGAGGATCAGAAACTCGAGTTCCAAGACAAATATTTCGATGC
GGTTTTATGTTCTGTCGGTGTACAGTATCTACAACAACCCGAAAAGGTGTTTGCGGAAGT
GTATAGAGTGTTAAAACCGGGAGGTGCGTTGATAGTGAGTTTTAGCAATCGCATGTTTTA
TGAGAAAGCAATCAGGGTTTGGAGAGATGGAACCGAGTACGGTCGGGTACAGCTGGTGGT
TCAGTACTTTCAGTCTGTCCAAGGGTTTACTCAGCCGGAGATCATCCGGCAACAGCCTCC
TCCTAATGGTGGTGGAGGAGCTGAGAAACCGGTTTTGAATTGGTTTATGGGTTTAATTGG
TTTAGCTTTTAGGCCGGACCCTTTTAATGCTGTGATTGCTTATAAGAATTTCAAACC


BQ
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CB64TF U 1
AF RS1CB64JQ C 336
BS 1 586 RS1CB64TF
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BS 599 612 RS1CB64TF
BS 613 897 RS1CB64JQ

RD RS1CB64TF 612 0 0
GGGCTAACGATTGATTCTTAGCTTGTAGCCATATAATAATCCAAACAGGGAGAGAATATA
GCTTTTCATGGATTCTCTTCGATTCAACCTTCACCAATCTCCCTTTCAGCTGAGACCCAG
AAAAACTTTTCGACCAAGAATCACTAGCATTTCGAACCAAACCGAAGAAACCGATCCGCG
ACCAACATCTTCGCCCGGTAAGATCCAACGCTTAGTACTCAACAATGAAGGTCGTACGAA
ACTCAACTCCGGTCCTGACCGTGAATTCTATTCGTACCCACGGTTCGTAAACCACGTCGA
CGACGGCTTCATATCCTCCTTAACGGATCTCTACAGAAACCGGTTAAAATCCGGTTCGAT
TGTATTAGACATGATGAGCTCGTGGGTTAGCCATCTACCAGAAGAGGTGAAGTTCGAGAA
AGTAGTGGGACATGGTCTTAACGCACAGGAGCTTGCCAGAAACCCTAGACTCGATTACTT
CTTCATCAAGGATCTTAACGAGGATCAGAAACTCGAGTTCCAAGACAAATATTTCGATGC
GGTTTTATGTTCTGTCGGTGTACAGTATCTACAACAACCCGAAAAG*TGTTTGCGGA*GT
GTATAGAGTGTT

QA 1 612 1 612
DS 

RD RS1CB64JQ 562 0 0
GAAACCGGTTAAAATCCGGTTCGATTGTATTAGACATGATGAGCTCGTGGGTTAGCCATC
TACCAGAAGAGGTGAAGTTCGAGAAAGTAGTGGGACATGGTCTTAACGCACAGGAGCTTG
CCAGAAACCCTAGACTCGATTACTTTTTCATCAAGGATTTTAACGAGGATCAGAAACTCG
AGTTCCAAGACAAATATTTCGATGCGGTTTTATGTTCTGTCGGTGTACAGTATTTACAAC
AACCCGAAAAGGTGTTTGCGGAAGTGTATAGAGTGTTAAAACCGGGAGGTGCGTTGATAG
TGAGTTTTAGCAATCGCATGTTTTATGAGAAAGCAATCAGGGTTTGGAGAGATGGAACCG
AGTACGGTCGGGTACAGCTGGTGGTTCAGTACTTTCAGTCTGTCCAAGGGTTTACTCAGC
CGGAGATCATCCGGCAACAGCCTCCTCCTAATGGTGGTGGAGGAGCTGAGAAACCGGTTT
TGAATTGGTTTATGGGTTTAATTGGTTTAGCTTTTAGGCCGGACCCTTTTAATGCTGTGA
TTGCTTATAAGAATTTCAAACC

QA 1 562 1 562
DS 



AS 1 2

CO CL6168Contig1 956 2 2 U
GGAGAACATATTTTCCTCTCTTCTCGTGTAGCTCTAGTCTTGTACTTCTAGTATTTCTTT
ATAACCTCCGTAAACCTCTGTATAGGTTATAGGTAATTGTAAAGATTTGATCTTTGTCTG
GGTTTTATTTGTAGTTTTGAATGCCGGTGATGGTATTAAATATACTTTGAGGGCTAAGTC
CCTAGGAAAAAAGAAACAACTCTGAGGCATTATTTATTTAATCTGTTTATTCTTGTTAGA
TATTTTCCTCTGCGTCAGCTTAGTGTTGTATTAGAGGATAGTATTCTTGTTTACGTAGAT
TATTGTTGAATATGATGCTTTGCTCTTGTTTGGTTTTCTAGTGTTTTATGGGTTGTATTG
TGCAAGTGACGATAAAAAGACAGGGACATCAGATTCTCCTTAGGGAGAAGTAGAATGATG
ATGAATGTCTAAATGGGAATCTCTCTGATGCACATACCCAAAAATAAAATATGTTTTTTT
GAAGCTTTCTTAATTGTGCCGATGATGTATATCTACTGATGTTTTTTCATCAGATTTTTA
TAGTGATGAATATAATCACAATTGTCACTACCTCTGAGGTACATTCTCTTTTCGTTTTGT
ATCTGATTTATTAGGCCTAGTAATTGCATCTAAGAACGGAGATATGAAGTGTTTTGTTTT
GTTGCTACCTAACATTTAGTTCGGCTAAGGCCCTCTTTGTTTAGATTTTGTTCTTGGTAA
ATGGTAATGGATGCAGGTTGCTCTCATACTTTTTCTTCAACGCGATGCTGTCTAGAGTTG
TAGGGTGTGTGCTCCCTTGATGCTTGAAGTTGAGACGAGCTCTTTCAAGCTCCTCAGAAC
TTTATTCGATTAAGCTCCGCAGAAGACGAGTTCTAATTCAAATTAACAAGTGTACCATTA
TTCGATTTTAGTAAAAATAGATACTTGTGTTAGATTTTAATAAAAATACACGATCC


BQ
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AF RS1DR56TF U 1
AF RS1DR56JQ C 200
BS 1 610 RS1DR56TF
BS 611 956 RS1DR56JQ

RD RS1DR56TF 610 0 0
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ATAACCTCCGTAAACCTCTGTATAGGTTATAGGTAATTGTAAAGATTTGATCTTTGTCTG
GGTTTTATTTGTAGTTTTGAATGCCGGTGATGGTATTAAATATACTTTGAGGGCTAAGTC
CCTAGGAAAAAAGAAACAACTCTGAGGCATTATTTATTTAATCTGTTTATTCTTGTTAGA
TATTTTCCTCTGCGTCAGCTTAGTGTTGTATTAGAGGATAGTATTCTTGTTTACGTAGAT
TATTGTTGAATATGATGCTTTGCTCTTGTTTGGTTTTCTAGTGTTTTATGGGTTGTATTG
TGCAAGTGACGATAAAAAGACAGGGACATCAGATTCTCCTTAGGGAGAAGTAGAATGATG
ATGAATGTCTAAATGGGAATCTCTCTGATGCACATACCCAAAAATAAAATATGTTTTTTT
GAAGCTTTCTTAATTGTGCCGATGATGTATATCTACTGATGTTTTTTCATCAGATTTTTA
TAGTGATGAATATAATCACAATTGTCACTACCTCTGAGGTACATTCTCTTTTCGTTTTGT
ATCTGATTTA

QA 1 610 1 610
DS 

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TTAGTGTTGTATTAGAGGATAGTATTCTTGTTTACGTAGATTATTGTTGAATATGATGCT
TTGCTCTTGTTTGGTTTTCTAGTGTTTTATGGGTTGTATTGTGCAAGTGACGATAAAAAG
ACAGGGACATCAGATTCTCCTTAGGGAGAAGTAGAATGATGATGAATGTCTAAATGGGAA
TCTCTCTGATGCACATACCCAAAAATAAAATATGTTTTTTTGAAGCTTTCTTAATTGTGC
CGATGATGTATATCTACTGATGTTTTTTCATCAGATTTTTATAGTGATGAATATAATCAC
AATTGTCACTACCTCTGAGGTACATTCTCTTTTCGTTTTGTATCTGATTTATTAGGCCTA
GTAATTGCATCTAAGAACGGAGATATGAAGTGTTTTGTTTTGTTGCTACCTAACATTTAG
TTCGGCTAAGGCCCTCTTTGTTTAGATTTTGTTCTTGGTAAATGGTAATGGATGCAGGTT
GCTCTCATACTTTTTCTTCAACGCGATGCTGTCTAGAGTTGTAGGGTGTGTGCTCCCTTG
ATGCTTGAAGTTGAGACGAGCTCTTTCAAGCTCCTCAGAACTTTATTCGATTAAGCTCCG
CAGAAGACGAGTTCTAATTCAAATTAACAAGTGTACCATTATTCGATTTTAGTAAAAATA
GATACTTGTGTTAGATTTTAATAAAAATACACGATCC

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

CO CL6169Contig1 673 2 4 U
GGAAAAAATATTGCGGGTTTTAAAAAGGACTTCGATCTTTTAACAACTCCACAAAGGTAA
CAAAACCTCCAGAGTCCATAATCATAATGCATAAATAAAATAAATAAGGACTACTAAGCC
AAGTTTATGACACATCCACTGACTGGCATATGATCTTGTAGCTTTTTCGTGGGACTTTCT
CATGTTGAAAAACCCACCAAGGGCAAGTTTGGCTCCATTGCCCACTCAGTCCAAGATCCA
TCATAAATTGGCACATCGGTTTTTCCCAGACGATGAAGTCCCAATGTCAAAATACAAGCT
GTCACACCGGTTCCACACGATGCCATGATAGGACTGTCCACAGAAATGTCTTCTTCTTCA
AACCGTTTCTTAAGCTCCTCAGCTGGTAACAGTGTTTGAGAGGAATCAAACATCTGGGGA
AAGGGGACACTTGCTACCGGGTATATGACCGCTTGGTATTCCTTTGCGAGGTTCTGGAGC
AGTACCATCAAATCTAGCTTTTGCACGTGCATCTATGTGCCGGTAGGTCTTATTCTCCAT
ATTTTCCTTGACCTGATCAAGTGTCCATACAAGATGTGGCTGGAACTTCGTCTTGAAAGT
TACCGGACTAATAGGTTGTCCTTGATAAACTTTCTCTACAACCTCACTTGCTGCATTGGC
TTTCAAAATGACA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EM34JQ U 1
AF RS1FC10JQ U 1
BS 1 189 RS1EM34JQ
BS 190 190 RS1FC10JQ
BS 191 267 RS1EM34JQ
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RD RS1EM34JQ 267 0 0
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CAAAACCTCCAGAGTCCATAATCATAATGCATAAATAAAATAAATAAGGACTACTAAGCC
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CATGTTGAAGAACCCACCAAGGGCAAGTTTGGCTCCATTGCCCACTCAGTCCAAGATCCA
TCATAAATTGGCACATCGGTTTTTCCC

QA 1 267 1 267
DS 

RD RS1FC10JQ 673 0 0
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CAAAACCTCCAGAGTCCATAATCATAATGCATAAATAAAATAGATAAGGACTACTAAGCC
AAGTTTATGACACATCCACTGACTGGCATATGATCTTGTAGCTTTTTCGTGGGACTTTCT
CATGTTGAAAAACCCACCAAGGGCAAGTTTGGCTCCATTGCCCACTCAGTCCAAGATCCA
TCATAGATTGGCACATCGGTTTTTCCCAGACGATGAAGTCCCAATGTCAAAATACAAGCT
GTCACACCGGTTCCACACGATGCCATGATAGGACTGTCCACAGAAATGTCTTCTTCTTCA
AACCGTTTCTTAAGCTCCTCAGCTGGTAACAGTGTTTGAGAGGAATCAAACATCTGGGGA
AAGGGGACACTTGCTACCGGGTATATGACCGCTTGGTATTCCTTTGCGAGGTTCTGGAGC
AGTACCATCAAATCTAGCTTTTGCACGTGCATCTATGTGCCGGTAGGTCTTATTCTCCAT
ATTTTCCTTGACCTGATCAAGTGTCCATACAAGATGTGGCTGGAACTTCGTCTTGAAAGT
TACCGGACTAATAGGTTGTCCTTGATAAACTTTCTCTACAACCTCACTTGCTGCATTGGC
TTTCAAAATGACA

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

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CTGATCGAAATCTCCACAAGCAGAACTCTGATCTGCAATCTCTTACAGAAAAGATGGGTT
CTTTCAAAGGCCATGCTTTGCCAGGTACATTGTTCTTTGTGGTCGGAGTGTGGCACATCT
GGAGCTCCGTGGTTCGATTCGTATCCAACCCCAACTCATTTCGTGTTCGAGTTTGGCACC
CTGTCCCTGGTTTCAACTGTAGGATCAAGTACTTGGAGCTTTACCTTGTCACCATTGGCT
CGTTCATTGACCTGTGCATCGAGTTCTTCTACTCCACTCATCTCAAGTTCTTTGTCAATG
GTGTCTTGAATCCTTCCCACATGAACGATTTCGAGCACTCTGGGATGCTTCTCATGTTCT
CCATCCTCGGTTTCATCACTTTGCTCTCCGAGAAAACCAGGTTGCTTCCTCTGCCACAAG
AAGCTCTGTGTCTAATCGCTGCAACAGCTTTTACAGCAGAAGGTCTTCTCTTCTTCTTCC
ACTCCACAAGCCACAAAGGTCTCGAAGGTTATTACCATCTCCTCCTCGTCTTTCTCATCG
CTCTCTGCGTCATCTCCTCAATCGCAGGGTCTATCTGCCCTACAAGCTTCCCTGTTGATC
TGTGCAATGGCATTGCAATGACTCTTCAGGGCCTCTGGTTTTATCAAACAGCTTTCACTC
TCTATGGCCCTATGATGCCTCAAGGCTGCGGTTTAAAAGGAAGCTCTGTCGTCTGCAGAT
CGGTTGACTCTGTAGTCTCTGGAGAGTTTCTGGCTAACTTTCAGCTCTTCTCTTTGGTTC
TTGCTGTTCTTGTCTGCGTTGTGGGTTCTTATGTTTTTGCAGCTTCAAGATTTGGATTAA
GTAAATGAGAGATTTTTGGGAAGTAGAAACTAGGTTCTCTTTTTTTTTTACCGAATCTTT
GCTACATGTCTTTTATATTATACAAATATGTTGACACATGAGTTATGATAATTTTGAGGC
GACCTTAGAGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EO57TF U 1
AF RS1EO57JQ C 330
BS 1 701 RS1EO57TF
BS 702 702 RS1EO57JQ
BS 703 746 RS1EO57TF
BS 747 1033 RS1EO57JQ

RD RS1EO57TF 746 0 0
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CTGATCGAAATCTCCACAAGCAGAACTCTGATCTGCAATCTCTTACAGAAAAGATGGGTT
CTTTCAAAGGCCATGCTTTGCCAGGTACATTGTTCTTTGTGGTCGGAGTGTGGCACATCT
GGAGCTCCGTGGTTCGATTCGTATCCAACCCCAACTCATTTCGTGTTCGAGTTTGGCACC
CTGTCCCTGGTTTCAACTGTAGGATCAAGTACTTGGAGCTTTACCTTGTCACCATTGGCT
CGTTCATTGACCTGTGCATCGAGTTCTTCTACTCCACTCATCTCAAGTTCTTTGTCAATG
GTGTCTTGAATCCTTCCCACATGAACGATTTCGAGCACTCTGGGATGCTTCTCATGTTCT
CCATCCTCGGTTTCATCACTTTGCTCTCCGAGAAAACCAGGTTGCTTCCTCTGCCACAAG
AAGCTCTGTGTCTAATCGCTGCAACAGCTTTTACAGCAGAAGGTCTTCTCTTCTTCTTCC
ACTCCACAAGCCACAAAGGTCTCGAAGGTTATTACCATCTCCTCCTCGTCTTTCTCATCG
CTCTCTGCGTCATCTCCTCAATCGCAGGGTCTATCTGCCCTACAAGCTTCCCTGTTGATC
TGTGCAATGGCATTGCAATGACTCTTCAGGGCCTCTGGTTT*ATCAAACAGCTTTCACTC
TCTATGGCCCTATGATGCCTCAAGGC

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1EO57JQ 704 0 0
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TTCGAGCACTCTGGGATGCTTCTCATGTTCTCCATCCTCGGTTTCATCACTTTGCTCTCC
GAGAAAACCAGGTTGCTTCCTCTGCCACAAGAAGCTCTGTGTCTAATCGCTGCAACAGCT
TTTACAGCAGAAGGTCTTCTCTTCTTCTTCCACTCCACAAGCCACAAAGGTCTCGAAGGT
TATTACCATCTCCTCCTCGTCTTTCTCATCGCTCTCTGCGTCATCTCCTCAATCGCAGGG
TCTATCTGCCCTACAAGCTTCCCTGTTGATCTGTGCAATGGCATTGCAATGACTCTTCAG
GGCCTCTGGTTTTATCAAACAGCTTTCACTCTCTATGGCCCTATGATGCCTCAAGGCTGC
GGTTTAAAAGGAAGCTCTGTCGTCTGCAGATCGGTTGACTCTGTAGTCTCTGGAGAGTTT
CTGGCTAACTTTCAGCTCTTCTCTTTGGTTCTTGCTGTTCTTGTCTGCGTTGTGGGTTCT
TATGTTTTTGCAGCTTCAAGATTTGGATTAAGTAAATGAGAGATTTTTGGGAAGTAGAAA
CTAGGTTCTCTTTTTTTTTTACCGAATCTTTGCTACATGTCTTTTATATTATACAAATAT
GTTGACACATGAGTTATGATAATTTTGAGGCGACCTTAGAGCTC

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

CO CL6171Contig1 416 2 1 U
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CGCCTTCCACCCTCTATCTTTTCGGTTGTTTTGGGTCTGGGAGAATTATTATGGTGTATG
CTTAAACCGTGTTTCTTGTCTTCAATAAATGTGGAGGATTTCTGTTTTGGTTCTAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1B335JQ C 1
AF RS1B335TF U 1
BS 1 416 RS1B335TF

RD RS1B335JQ 416 0 0
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TCAGCACAGAGGAAGCCCAAAATAGTTCAGCCTTGGAAGCAATTAACGGTTACTAGAAAA
AGACGGTGGGATAGGCTTTGGTGGAGTCCGGTGGCGTCTCAACGCGGTGGCTTATTCTGG
ATCCGAGGTGTTGGTTCTTTTTAGATTGGGATGTTTCAGAGAAGCAAAAGCCACAGTATC
CGGAGTGGACTTTACGGTGGTCTTGGGCGCCTATGGACTCTCGAGCTCTTGCGGTTTCAA
CGCCTTCCACCCTCTATCTTTTCGGTTGTTTTGGGTCTGGGAGAATTATTATGGTGTATG
CTTAAACCGTGTTTCTTGTCTTCAATAAATGTGGAGGATTTCTGTTTTGGTTCTAC

QA 1 416 1 416
DS 

RD RS1B335TF 416 0 0
GGCAGCACCTTGGCTTTTCTTCAGCGCCTCCATCTCTCTTCCGTGACTCCATGCTTCTCT
TCAGCACAGAGGAAGCCCAAAATAGTTCAGCCTTGGAAGCAATTAACGGTTACTAGAAAA
AGACGGTGGGATAGGCTTTGGTGGAGTCCGGTGGCGTCTCAACGCGGTGGCTTATTCTGG
ATCCGAGGTGTTGGTTCTTTTTAGATTGGGATGTTTCAGAGAAGCAAAAGCCACAGTATC
CGGAGTGGACTTTACGGTGGTCTTGGGCGCCTATGGACTCTCGAGCTCTTGCGGTTTCAA
CGCCTTCCACCCTCTATCTTTTCGGTTGTTTTGGGTCTGGGAGAATTATTATGGTGTATG
CTTAAACCGTGTTTCTTGTCTTCAATAAATGTGGAGGATTTCTGTTTTGGTTCTAC

QA 1 416 1 416
DS 



AS 1 2

CO CL6172Contig1 741 2 3 U
GGGCCCGATGTTCCTGGAAGTTTCAGTACCAAGTTGTCTGGCATATCTTTGGGTGCAAAG
AAGTGTGGCAATAACATCATTACATCTTCATCAGCCATGTCCATTAGATCATCGTTTCCT
GCAAGCGGATTCACCTCCATCCATTTCCTCTTCCTCTGTTGTGCAATATCCGCGTGAATA
GGAATTACATGCTGGTAGTCAACCATGCCATCGAAGCAATACGACTCAGACACACGAGCT
ACAATATCAGCACAGAGAGCTGAACAAGCATCGCTAGTGGAAAGAACAGGTTGAGTTTCA
CGCAGAAAAAAACCTCTCTTAACATCCTCCTTATAAATTTTCAACAGAAAACCATTACAA
GGTCATCTCTCTCCCCAGGCAGGATGTGCATAAGGGTCCTCAGGGCGGAAATGTAGCTCA
AGCTTGTTTGCCGTTGACTCTCTTGCCGTTGTGATCCCTTGGATTCCTCCAAGAGTCTCT
AGGGCTCGGGAGATAGAAGATGGATATCCAGGGTAGTGTACTACAAACGTCTCCTTGCTC
GGCAAGTTACCTGATACAGTTCCTGTTTCTATGATTCCCATCGCTTCTCTCCAAATCTCA
CCTCGCAGAAGTAGCGGTTACGATCGGAATGGATCTCGAAATTGGGACGGATCAGACGGA
TCGCCGGAGCGGGAAGAAGTTGGAGACCGCCGGGAGGAGAAGGAGTCACCGGAGCTTTTT
TGCCTCCTGCCTTTATGGCCC


BQ
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AF RS1FO42JQ U 234
AF RS1FO42TF C 1
BS 1 233 RS1FO42TF
BS 234 651 RS1FO42JQ
BS 652 741 RS1FO42TF

RD RS1FO42JQ 418 0 0
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AGTTTCACGCAGAAAAAAACCTCTCTTAACATCCTCCTTATAAATTTTCAACAGAAAACC
ATTACAAGGTCATCTCTCTCCCCAGGCAGGATGTGCATAAGGGTCCTCAGGGCGGAAATG
TAGCTCAAGCTTGTTTGCCGTTGACTCTCTTGCCGTTGTGATCCCTTGGATTCCTCCAAG
AGTCTCTAGGGCTCGGGAGATAGAAGATGGATATCCAGGGTAGTGTACTACAAACGTCTC
CTTGCTCGGCAAGTTACCTGATACAGTTCCTGTTTCTATGATTCCCATCGCTTCTCTCCA
AATCTCACCTCGCAGAAGTAGCGGTTACGATCGGAATGGATCTCGAAATTGGGACGGA

QA 1 418 1 418
DS 

RD RS1FO42TF 741 0 0
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AAGTGTGGCAATAACATCATTACATCTTCATCAGCCATGTCCATTAGATCATCGTTTCCT
GCAAGCGGATTCACCTCCATCCATTTCCTCTTCCTCTGTTGTGCAATATCCGCGTGAATA
GGAATTACATGCTGGTAGTCAACCATGCCATCGAAGCAATACGACTCAGACACACGAGCT
ACAATATCAGCACAGAGAGCTGAACAAGCATCGCTAGTGGAAAGAACAGGTTGAGTTTCA
CGCAGAGAAGAACCTCTCTTAACATCCTCCTTATAAATTTTCAACAGAAAACCATTACAA
GGTCATCTCTCTCCCCAGGCAGGATGTGCATAAGGGTCCTCAGGGCGGAAATGTAGCTCA
AGCTTGTTTGCCGTTGACTCTCTTGCCGTTGTGATCCCTTGGATTCCTCCAAGAGTCTCT
AGGGCTCGGGAGATAGAAGATGGATATCCAGGGTAGTGTACTACAAACGTCTCCTTGCTC
GGCAAGTTACCTGATACAGTTCCTGTTTCTATGATTCCCATCGCTTCTCTCCAAATCTCA
CCTCGCAGAAGTAGCGGTTACGATCGGAATGGATCTCGAAATTGGGACGGATCAGACGGA
TCGCCGGAGCGGGAAGAAGTTGGAGACCGCCGGGAGGAGAAGGAGTCACCGGAGCTTTTT
TGCCTCCTGCCTTTATGGCCC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL6173Contig1 896 2 8 U
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AAAGAAAACAGTCAACTAATATTTTTTTTTGTTTTCGTTGATTGGAAATCACTTCCGACT
TCAAGCAGAGATTTTATTTCGTTTATCGGATCGTCTGTTTCAGAATTTTGAATTTGTCTT
ATCCGTTTGTGGATTTCTACCTTTTGCGTGTTAAAAAATCAAGCCTTTAGTCCGACGATT
ACGAGGATTTTGATTTGCTAGATCTTGCTTGGTTCTCTTTTTAATCTAAGAGTAGTCCTT
CACTTTTCGATGTGTTTATCAGACTTTAGGTGTAAGTTTCCCTTTAGAGTAGAACCCGAG
ATGATAAGATTGTTTTTGATGGGTTTAGATCAGAAATATAGATTGGGCGTCTCAAAAAAA
TTATGGATTCTAATTCAATCAGTTCAATCTGGGTTTTAATTTTTCTGCTGAGTTTATAGA
TCATCTTATTATCGTCGGTATCTTTATGGCAAAAGGAGTAAGTAACGGACTAAGCAGTAG
CAGCAGTTTAATGGCGCTATGTCTTGCAGCTAAATCACAAAAAAAAAACCATGAAATTGG
AGATACATTGATGAATGCATTGAGGATAATTTTTTTTGGGTAAACTACACAGAGCAACAA
GAGGAAGGAGCATGTATTATTATATACATGGGTGGGAAGGATTAAACTGATAATAACTTA
CGATATTTTTAACGAAAAATAACTTACTAGATTTTTGTTGGATGTAATATGTTATGTCAG
AGGTGTATCTTTGTTTTTCTTTCATTTTGGATGGTTTGAGTAATGCCTTTTATATTCCTC
CATATCTATAACGCAGTGGCTGTTGTCAAAATTATAAATGTAAGTCTGATCATACG


BQ
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AF RS1F329TF U 1
AF RS1F329JQ C 288
BS 1 587 RS1F329TF
BS 588 588 RS1F329JQ
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RD RS1F329TF 656 0 0
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AAAGAAAACAGTCAACTAATATTTTTTTTTGTTTTCGTTGATTGGAAATCACTTCCGACT
TCAAGCAGAGATTTTATTTCGTTTATCGGATCGTCTGTTTCAGAATTTTGAATTTGTCTT
ATCCGTTTGTGGATTTCTACCTTTTGCGTGTTAAAAAATCAAGCCTTTAGTCCGACGATT
ACGAGGATTTTGATTTGCTAGATCTTGCTTGGTTCTCTTTTTAATCTAAGAGTAGTCCTT
CACTTTTCGATGTGTTTATCAGACTTTAGGTGTAAGTTTCCCTTTAGAGTAGAACCCGAG
ATGATAAGATTGTTTTTGATGGGTTTAGATCAGAAATATAGATTGGGCGTCTCAAAAAAA
TTATGGATTCTAATTCAATCAGTTCAATCTGGGTTTTAATTTTTCTGCTGAGTTTATAGA
TCATCTTATTATCGTCGGTATCTTTATGGCAAAAGGAGTAAGTAACGGACTAAGCAGTAG
CAGCAGTTTAATGGCGCTATGTCTTGCAGCTAAATCACAAAAAAAAA*CCATGAAATTGG
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QA 1 656 1 656
DS 

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AGTAGAACCCGAGATGATAAGATTGTTTTTGATGGGTTTAGATCAGAAATATAGATTGGG
CGTCTCAAAAAAATTATGGATTCTAATTCAATCAGTTCAATCTGGGTTTTAATTTTTCTG
CTGAGTTTATAGATCATCTTATTATCGTCGGTATCTTTATGGCAAAAGGAGTAAGTAACG
GACTAAGCAGTAGCAGCAGTTTAATGGCGCTATGTCTTGCAGCTAAATCACAAAAAAAAA
ACCATGAAATTGGAGATACATTGATGAATGCATTGAGGATAATTTTTTTTGGGTAAACTA
CACAGAGCAACAAGAGGAAGGAGCATGTATTATTATATACATGGGTGGGAAGGATTAAAC
TGATAATAACTTACGATATTTTTAACGAAAAATAACTTACTAGATTTTTGTTGGATGTAA
TATGTTATGTCAGAGGTGTATCTTTGTTTTTCTTTCATTTTGGATGGTTTGAGTAATGCC
TTTTATATTCCTCCATATCTATAACGCAGTGGCTGTTGTCAAAATTATAAATGTAAGTCT
GATCATACG

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 2

CO CL6174Contig1 960 2 2 U
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GGATACGTACTCCGCTGTTCTTTATCATCTGCAAGAAGAGATGAGGTTGGGCTATCTGGC
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GAATGAAAGATTCACATATGCACACACCCTCTGTGGGCACGAGCTTGCTGCATTGGAAGA
CTTTGAGGATGCAGAGAGATGCTACCGGAAGGCTCTGAGCATAGATACAAGACACTACAA
TGCATGGTATGGTCTTGGAATGACCTACATTCATCAGGAGAAATTCGAGTTTGCGCAGCA
TCAGTTTCAATTGGCTCTCCAAATAAACCCAAGATCGTCAGTCATCATGTGTTACTTTGG
AATCGCGTTGCATGAGTCAAAGAGGAACGATGAGGCGTTGAAGATGATGGAAAAAGCTAT
AGTTGCTGATGCTAGGAATCCGATCTCGAAGTACTTTAAGGCTAACATATTGGCCAACCT
CGGTGATTATCACGAAGCCCTGAAAGTTCTAGAAGAGCTCAAAGATTCTGCTCCTCAAGA
GAGCAGTGTCCATGCGTTGCTTGGCAAAATCTACAAACAAGTAAAGCTATACGACAAGGC
CGTGTTAAATTTCGGCATTGCGTTGGATTTAAACCCATCTACATCTGATGCTGTCAAAAT
CAAGGCTTGCATGGAGAGGTTAATAGTACCAGACGAGTTGGAGACAGAGGAGGATCTCTA
GAATCACTGTGCAGGTATACAATGCATATACGCACCCAGTTATTATGTTTCTTGTATAAC
CCCAAAGTCATCTTTATTCGATTTGTCTTGTGATAGGAATACTCCTAAAACTTTGCTAAT


BQ
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AF RS1D776TF U 1
AF RS1D776JQ C 273
BS 1 683 RS1D776TF
BS 684 960 RS1D776JQ

RD RS1D776TF 683 0 0
GAGCGCTGACTCTGTCTTTACTCTTGCGTATCAAAAATATCCTTATGCTTTGGAGGGAAT
GGATACGTACTCCGCTGTTCTTTATCATCTGCAAGAAGAGATGAGGTTGGGCTATCTGGC
GCAAGAGCTGATTGCAATTGACCGCCTATCTCCAGAATCATGGTGTGCTTCAGGGAACTA
CTACAGTTTGCGTAAAGATCACGAAGCTGCTCTTAAGATGTTTAGAAGAGCTATCCAACT
GAATGAAAGATTCACATATGCACACACCCTCTGTGGGCACGAGCTTGCTGCATTGGAAGA
CTTTGAGGATGCAGAGAGATGCTACCGGAAGGCTCTGAGCATAGATACAAGACACTACAA
TGCATGGTATGGTCTTGGAATGACCTACATTCATCAGGAGAAATTCGAGTTTGCGCAGCA
TCAGTTTCAATTGGCTCTCCAAATAAACCCAAGATCGTCAGTCATCATGTGTTACTTTGG
AATCGCGTTGCATGAGTCAAAGAGGAACGATGAGGCGTTGAAGATGATGGAAAAAGCTAT
AGTTGCTGATGCTAGGAATCCGATCTCGAAGTACTTTAAGGCTAACATATTGGCCAACCT
CGGTGATTATCACGAAGCCCTGAAAGTTCTAGAAGAGCTCAAAGATTCTGCTCCTCAAGA
GAGCAGTGTCCATGCGTTGCTTG

QA 1 683 1 683
DS 

RD RS1D776JQ 688 0 0
GTGGGCACGAGCTTGCTGCATTGGAAGACTTTGAGGATGCAGAGAGATGCTACCGGAAGG
CTCTGAGCATAGATACAAGACACTACAATGCATGGTATGGTCTTGGAATGACCTACATTC
ATCAGGAGAAATTCGAGTTTGCGCAGCATCAGTTTCAATTGGCTCTCCAAATAAACCCAA
GATCGTCAGTCATCATGTGTTACTTTGGAATCGCGTTGCATGAGTCAAAGAGGAACGATG
AGGCGTTGAAGATGATGGAAAAAGCTATAGTTGCTGATGCTAGGAATCCGATCTCGAAGT
ACTTTAAGGCTAACATATTGGCCAACCTCGGTGATTATCACGAAGCCCTGAAAGTTCTAG
AAGAGCTCAAAGATTCTGCTCCTCAAGAGAGCAGTGTCCATGCGTTGCTTGGCAAAATCT
ACAAACAAGTAAAGCTATACGACAAGGCCGTGTTAAATTTCGGCATTGCGTTGGATTTAA
ACCCATCTACATCTGATGCTGTCAAAATCAAGGCTTGCATGGAGAGGTTAATAGTACCAG
ACGAGTTGGAGACAGAGGAGGATCTCTAGAATCACTGTGCAGGTATACAATGCATATACG
CACCCAGTTATTATGTTTCTTGTATAACCCCAAAGTCATCTTTATTCGATTTGTCTTGTG
ATAGGAATACTCCTAAAACTTTGCTAAT

QA 1 688 1 688
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6176Contig1 1078 2 4 U
GTAACTTTAGAGTTAAGCGTGATTGGACTGGAGTAGTGGAAGGATGAGTGAACTATCGAG
AAGTGATTCGCAATATCGTGCGAGTAAAGTCAAAGCATGAAAAGATCATGTAGTGATTGC
AGGGTCAGTATGAATTTCGAGCCTTCAGAAAAATTAATAGACCGATATTTTGACGGGATG
GAGCCCACGGGCCGAGTGAGTGGATGTGGGAGGTCTATTAGCTGTGGACGGTCGGGGCAT
CACAAGTGGTATCAGAGCTGGTTAGTTATCTCGGTTCAGACCCAAGATGCATCTTGAGAC
CTAACGTGAGGTGCAATAAGGACTTTGCGTTCTTTGAGAGATGATGAATTTTAACATCAC
GAGTTGTGATATATGAAAAGACTTAAGAGCATTGATTTAGTTACCTATTTCACCAAGATG
TACTTACCTTTTCGGGAGCACATCTATTTAGAAATCTAAAGTTAAACGTGTTTGGAATCG
AATAGTAGAAAGATAGGTGAATTATTGGGAAGTAATTCGAGATATCGTACGAATGAGGAT
AAAGCACGGAGAAAAGTCATGCGGTCATTATAGGTCAGTAAACATGATTTTGAACTTTCA
AAAAATTAACTAGACCGACCGTTGGTTGAGATAAAACCCACCGATTAAATGAGGAGGCAT
GGAAAAGCCATTACCTGTGGACAGTCGGTGAATAGTAGAGCATTTGAACCGATTAAGTGG
AGCATTTGAACAAAATCCCAGGTGAAAGAGTTTCTTTAAATCGTTAATATGTACATGTAC
ATTTGTTGTTTCTGTAAACATAACGTTTTATATTGGTCATATATTGCATACACTCGTGAC
AATGTATTGTGACGTGGTCTTGCCGTGATTTATGAATGGACTTACAGTTTACATATTTAA
CCGGGGCTTCTAGCTCAGTTGGTAAAGGGTTCACAGCTGTGAGTTCCGCCATCTGGGTTC
GAATCCCGGCCACTGGGGAATTAACATTTCGGCATCGCCAGGGACAGAGGACCGACATGT
GGCAACACGTGACTAGTCTGGACCACTTCGGTGGGGCCAGGATACCTCTGTATAATTC


BQ
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AF RS1C429TF U 1
AF RS1C429JQ C 324
BS 1 665 RS1C429TF
BS 666 666 RS1C429JQ
BS 667 734 RS1C429TF
BS 735 1078 RS1C429JQ

RD RS1C429TF 742 0 0
GTAACTTTAGAGTTAAGCGTGATTGGACTGGAGTAGTGGAAGGATGAGTGAACTATCGAG
AAGTGATTCGCAATATCGTGCGAGTAAAGTCAAAGCATGAAAAGATCATGTAGTGATTGC
AGGGTCAGTATGAATTTCGAGCCTTCAGAAAAATTAATAGACCGATATTTTGACGGGATG
GAGCCCACGGGCCGAGTGAGTGGATGTGGGAGGTCTATTAGCTGTGGACGGTCGGGGCAT
CACAAGTGGTATCAGAGCTGGTTAGTTATCTCGGTTCAGACCCAAGATGCATCTTGAGAC
CTAACGTGAGGTGCAATAAGGACTTTGCGTTCTTTGAGAGATGATGAATTTTAACATCAC
GAGTTGTGATATATGAAAAGACTTAAGAGCATTGATTTAGTTACCTATTTCACCAAGATG
TACTTACCTTTTCGGGAGCACATCTATTTAGAAATCTAAAGTTAAACGTGTTTGGAATCG
AATAGTAGAAAGATAGGTGAATTATTGGGAAGTAATTCGAGATATCGTACGAATGAGGAT
AAAGCACGGAGAAAAGTCATGCGGTCATTATAGGTCAGTAAACATGATTTTGAACTTTCA
AAAAATTAACTAGACCGACCGTTGGTTGAGATAAAACCCACCGATTAAATGAGGAGGCAT
GGAAA*GCCATTACCTGTGGACAGTCGGTGAATAGTAGAGCATTTGAACCGATTAAGTGG
AGCATTTGAACAAA
TCCCAGGT

QA 1 734 1 734
DS 

RD RS1C429JQ 755 0 0
TTTGCGTTCTTTGAGAGATGATGAATTTTAACATCACGAGTTGTGATATATGAAAAGACT
TAAGAGCATTGATTTAGTTACCTATTTCACCAAGATGTACTTACCTTTTCGGGAGCACAT
CTATTTAGAAATCTAAAGTTAAACGTGTTTGGAATCGAATAGTAGAAAGATAGGTGAATT
ATTGGGAAGTAATTCGAGATATCGTACGAATGAGGATAAAGCACGGAGAAAAGTCATGCG
GTCATTATAGGTCAGTAAACATGATTTTGAACTTTCAAAAAATTAACTAGACCGACCGTT
GGTTGAGATAAAACCCACCGATTAAATGAGGAGGCATGGAAAAGCCATTACCTGTGGACA
GTCGGTGAATAGTAGAGCATTTGAACCGATTAAGTGGAGCATTTGAACAAAATCCCAGGT
GAAAGAGTTTCTTTAAATCGTTAATATGTACATGTACATTTGTTGTTTCTGTAAACATAA
CGTTTTATATTGGTCATATATTGCATACACTCGTGACAATGTATTGTGACGTGGTCTTGC
CGTGATTTATGAATGGACTTACAGTTTACATATTTAACCGGGGCTTCTAGCTCAGTTGGT
AAAGGGTTCACAGCTGTGAGTTCCGCCATCTGGGTTCGAATCCCGGCCACTGGGGAATTA
ACATTTCGGCATCGCCAGGGACAGAGGACCGACATGTGGCAACACGTGACTAGTCTGGAC
CACTTCGGTGGGGCCAGGATACCTCTGTATAATTC

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL6177Contig1 1042 2 2 U
GCAAGAGTGTACCCCAGTATTTCTACGGGCTCAATCCAGCTCAAATGGATATGTTCATGA
CAGAGGACAGCCCTGTCCGCAGGCAAGCTGAGAAAGTTACAGAGGAAAGCATCTCGTCTA
GAAGTAATTATCTAGACAACGGAGGAACATGGAGTATGTCTGGTATGAATGCTGCAGATC
CTAGGAGATACAGCATGAGCGTCCAAATGTACAGAGGTGGTGGAGGCGGCGGAGGAGGAT
CTGCGAGACCAAGAACTGCTCCTCCAGATTTGCCTTCTTTGCTCTTGGATGCTCGGATAT
GCTACCTTGGCATGCCTATCGTACCTGCAGTTACTGAGTTGCTCGTTGCTCAGTTTATGT
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TTTCTTATTGCAAATCAGATGTATACACTATCAACTGTGGCATGGCTTTTGGTCAAGCAG
CAATGCTTCTTTCTCTCGGTAAAAAGGGTTACCGTGCAGTTCAGCCACATTCATCAACAA
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CCAAGGAACTTGATGCAAATACTGAGTACTACATCGAGCTGTTAGCTAAGGGAACAGGCA
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CCATTGACTATGGAATCGCAGACAAGATAGCTAACTCGCAGGATAGTTCCTTCGAGAAAC
GGGATTATGATGGGTTTCTTGCCCAAAGAGCCATGGGAAGACCTGGAGGAGGCAGTCCAA
CATCTCCAGCCGGACTAAGATGATCAATTAACTCACCAGAAAAAAAAAAAAGAGTTTGAA
TCTCAATTTGCCTAGTCACTTTGGAATATGTAGCTGTTACAATCTGTAAGCAAACACAAA
GATAAAAGAAACATACAAAAGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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CTAGGAGATACAGCATGAGCGTCCAAATGTACAGAGGTGGTGGAGGCGGCGGAGGAGGAT
CTGCGAGACCAAGAACTGCTCCTCCAGATTTGCCTTCTTTGCTCTTGGATGCTCGGATAT
GCTACCTTGGCATGCCTATCGTACCTGCAGTTACTGAGTTGCTCGTTGCTCAGTTTATGT
GGTTAGACTATGACAACCCAGCAAAGCCCATCTACCTGTACATAAACTCACCCGGGACTC
AGAATGAGAAGATGGAGACTGTTGGGTCAGAAACAGAGGCTTATGCCATAGCTGACACCA
TTTCTTATTGCAAATCAGATGTATACACTATCAACTGTGGCATGGCTTTTGGTCAAGCAG
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DS 

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GCTCGTTGCTCAGTTTATGTGGTTAGACTATGACAACCCAGCAAAGCCCATCTACCTGTA
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TTATGCCATAGCTGACACCATTTTTTATTGCAAATCAGATGTATACACTATCAACTGTGG
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GGATAGTTCCTTCGAGAAACGGGATTATGATGGGTTTCTTGCCCAAAGAGCCATGGGAAG
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AAAAAAAAAAAGAGTTTGAATCTCAATTTGCCTAGTCACTTTGGAATATGTAGCTGTTAC
AATCTGTAAGCAAACACAAAGATAAAAGAAACATACAAAAGT

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

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TTAACCCAAGAATCCTAATAAGTGATTTCTGATACTATATTTACATATAGACAAAAATTA
TGCACTCTGTAATATGTTATTATTATTATCATTATCATAATCATATCGTTGT


BQ
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AF RS1AO89JQ C 1
AF RS1AO89TFB U 1
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QA 1 412 1 412
DS 

RD RS1AO89TFB 412 0 0
GGATTAAAAAAAAAACACTAGATTAAAATTTATTTTTGAATAAGAGGATAATCATGAAAA
CTTTGATGATTTGCTTATTGGTGATTTGTAGTGTCGTGATAATAGGAAATGCAGCAGAAG
TGTCGGGTAAGCATTTAGATCCAGGGGTGTTTAACCGTTGCTTGGGTCCTAACCCGCCAC
CCGGATGTCAGGTTCCCGATTCCAAGGAGAAAACTCCTACACCAGCTCACGACTATCGTC
GTGGTTGCCAGAAAAGTCAACACTGCCGTCAAGATTAAAACCTATGGTGTTAAACTAACA
TTAACCCAAGAATCCTAATAAGTGATTTCTGATACTATATTTACATATAGACAAAAATTA
TGCACTCTGTAATATGTTATTATTATTATCATTATCATAATCATATCGTTGT

QA 1 412 1 412
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CTCAATCAGGAAATGCAATCAATCTTTGGAGCTGAACCTCCTGCCACAATGGATTACCCT
GAGTTGAACTCCAGTATTGGATCTACAGAACCGGAGAGTTCTAGGCAATACGAACAACCT
GCAAAAGTGGTTACCGACGATATCTCTAAGCTGACACATGTTGGTGTCTCCGGGGAAGCT
CAGATGGTGGATGTTTCTTCAAAGGACAATACTAAGAGAACCGCATTGGCTTGCTGCAAA
GTGATTCTAGGCAAAAGAGTTTTCGATTTGGTCTTAGCCAATCAAATGGGGAAAGGAGAT
GTTCTCGGAGTGGCCAAAATCGCTGGCATCAACGGAGCGAAACAGACCAGCAGTTTGATA
CCTTTGTGTCATAACATTGCTCTCACGCATGTTCGTGTTGACTTGAGATTGAACCCTGAG
GATTTCAGTGTTGACATCGAAGGAGAAGCTTCTTGCACTGGAAAAACAGGAGTTGAGATG
GAAGCTATGACTGCTGTATCGGTTGCTGGTTTAACTGTTTACGACATGTGCAAGGCTGCT
TCCAAAGATATCAGCATTACGGATGTGAGGCTTGAACGTAGAACTGGTGGAAAGAGTGGC
TACTGGTCTAGAGGCGAGTGAAAACAGCCCAACACTTGTTATGGAGTCACAGATTACGCG
TAGACAAAGCCATAGCTAGCCTTGCCTGGACC


BQ
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AF RS1DX19TF U 1
AF RS1DX19JQ C 148
BS 1 558 RS1DX19TF
BS 559 812 RS1DX19JQ

RD RS1DX19TF 558 0 0
GGGTTTTCGACGCTCCGACGCGCCATGTATCTCCGTCGATTTCCGGCTGTTATCTCCCCG
GAGAAAAGGGCATTCAGCAGTAAAATTTCCGAAGAAATTGATCTCCGAGTATTGAATGAG
CTCAATCAGGAAATGCAATCAATCTTTGGAGCTGAACCTCCTGCCACAATGGATTACCCT
GAGTTGAACTCCAGTATTGGATCTACAGAACCGGAGAGTTCTAGGCAATACGAACAACCT
GCAAAAGTGGTTACCGACGATATCTCTAAGCTGACACATGTTGGTGTCTCCGGGGAAGCT
CAGATGGTGGATGTTTCTTCAAAGGACAATACTAAGAGAACCGCATTGGCTTGCTGCAAA
GTGATTCTAGGCAAAAGAGTTTTCGATTTGGTCTTAGCCAATCAAATGGGGAAAGGAGAT
GTTCTCGGAGTGGCCAAAATCGCTGGCATCAACGGAGCGAAACAGACCAGCAGTTTGATA
CCTTTGTGTCATAACATTGCTCTCACGCATGTTCGTGTTGACTTGAGATTGAACCCTGAG
GATTTCAGTGTTGACATC

QA 1 558 1 558
DS 

RD RS1DX19JQ 665 0 0
GGAGCTGAACCTCCTGCCACAATGGATTACCCTGAGTTGAACTCCAGTATTGGATCTACA
GAACCGGAGAGTTCTAGGCAATACGAACAACCTGCAAAAGTGGTTACCGACGATATCTCT
AAGCTGACACATGTTGGTGTCTCCGGGGAAGCTCAGATGGTGGATGTTTCTTCAAAGGAC
AATACTAAGAGAACCGCATTGGCTTGCTGCAAAGTGATTCTAGGCAAAAGAGTTTTCGAT
TTGGTTTTAGCCAATCAAATGGGGAAAGGAGATGTTCTCGGAGTGGCCAAAATCGCTGGC
ATCAACGGAGCGAAACAGACCAGCAGTTTGATACCTTTGTGTCATAACATTGCTCTCACG
CATGTTCGTGTTGACTTGAGATTGAACCCTGAGGATTTCAGTGTTGACATCGAAGGAGAA
GCTTCTTGCACTGGAAAAACAGGAGTTGAGATGGAAGCTATGACTGCTGTATCGGTTGCT
GGTTTAACTGTTTACGACATGTGCAAGGCTGCTTCCAAAGATATCAGCATTACGGATGTG
AGGCTTGAACGTAGAACTGGTGGAAAGAGTGGCTACTGGTCTAGAGGCGAGTGAAAACAG
CCCAACACTTGTTATGGAGTCACAGATTACGCGTAGACAAAGCCATAGCTAGCCTTGCCT
GGACC

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

CO CL6181Contig1 939 2 2 U
TTTTTCCATCTGGGAATTAGCCCAATTTCCCGGCCAAAATTTTGTCGTTGACCTCAACGG
AGCCGCACGGTCGTTGTTAAACCCGCCAAATCCGCCTCCTATCACCCCATCAAATGCGGC
TCCACAAGATGCAAATATACAAACCCTAACTTATCCAGTCCCAACAACACCAAGAAGTCC
ACATGTCGCTCCTTCGAACAATGCCAAGCTCTTCCGAAACACCGTCTACTTACCATACAC
ACCTAATGGAGTTATCGCTATGGCAGTGGAAATAGCTCTATGTTGACTTGCACTGATGAT
GCTATGGCATTAAAGACGATCCCCCTTTGATTTTATTGAGGTCGTCGGTCTAGCTAACAC
ATACTTATCGATACACTCGCAGCTCGTTTCCTCCAAAGATATCTCTATGTTTTCCATCTA
GTCAAGGAATGGGGCCTTATTCTGGTGACCTTTGGATCGGCGGAGGCCATTTGTTTTATC
CGCCTTTCCAAAAAGATGTCTCAACCATCTTTGCCTCCACGCCACTGGTCGGTAGTAAAA
GGTCCGGTGAATACTTAACCAATGTGAAGTCCATCCAGATCGGTGGAAAGACCATTCCTA
TACTCCATGAAGCCACAAAGTTATGTACTCTGACTCCTTACACTGTCCTCCACACTTCCA
TTTATAAGGCTTTGGTCAGTCTTCGTTGTAACAACGAAGATGGCTGCTGTGAAGCCTTTC
GGAGCTTGCTTCCGCTCCAACGGAGGATGTCGAGTTCCGGTGATCGACTTGTTTCTTAGT
GGATGGGCTAAGTAGAGGATCCACAGGTCAAATTCTTTTGTAAAGGTGAGCAAAAATGTG
GTTTGTTTAAGGTTTGTAGAAGGAGACTTGTATACGAAAAACCCAATAGTGCTAGGAGGT
TTTCATTTGGATGATAATTTGGTGGAGTTCGATCTCAAA


BQ
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AF RS1DE80TF U 1
AF RS1DE80JQ C 247
BS 1 663 RS1DE80TF
BS 664 939 RS1DE80JQ

RD RS1DE80TF 663 0 0
TTTTTCCATCTGGGAATTAGCCCAATTTCCCGGCCAAAATTTTGTCGTTGACCTCAACGG
AGCCGCACGGTCGTTGTTAAACCCGCCAAATCCGCCTCCTATCACCCCATCAAATGCGGC
TCCACAAGATGCAAATATACAAACCCTAACTTATCCAGTCCCAACAACACCAAGAAGTCC
ACATGTCGCTCCTTCGAACAATGCCAAGCTCTTCCGAAACACCGTCTACTTACCATACAC
ACCTAATGGAGTTATCGCTATGGCAGTGGAAATAGCTCTATGTTGACTTGCACTGATGAT
GCTATGGCATTAAAGACGATCCCCCTTTGATTTTATTGAGGTCGTCGGTCTAGCTAACAC
ATACTTATCGATACACTCGCAGCTCGTTTCCTCCAAAGATATCTCTATGTTTTCCATCTA
GTCAAGGAATGGGGCCTTATTCTGGTGACCTTTGGATCGGCGGAGGCCATTTGTTTTATC
CGCCTTTCCAAAAAGATGTCTCAACCATCTTTGCCTCCACGCCACTGGTCGGTAGTAAAA
GGTCCGGTGAATACTTAACCAATGTGAAGTCCATCCAGATCGGTGGAAAGACCATTCCTA
TACTCCATGAAGCCACAAAGTTATGTACTCTGACTCCTTACACTGTCCTCCACACTTCCA
TTT

QA 1 663 1 663
DS 

RD RS1DE80JQ 693 0 0
TGGAGTTATCGCTATGGCAGTGGAAATAGCTCTATGTTGACTTGCACTGATGATGCTATG
GCATTAAAGACGATCCCCCTTTGATTTTATTGAGGTCGTCGGTCTAGCTAACACATACTT
ATCGATACACTCGCAGCTCGTTTCCTCCAAAGATATCTCTATGTTTTCCATCTAGTCAAG
GAATGGGGCCTTATTCTGGTGACCTTTGGATCGGCGGAGGCCATTTGTTTTATCCGCCTT
TCCAAAAAGATGTTTCAACCATCTTTGCCTCCACGCCACTGGTCGGTAGTAAAAGGTCCG
GTGAATACTTAACCAATGTGAAGTCCATCCAGATCGGTGGAAAGACCATTCCTATACTCC
ATGAAGCCACAAAGTTATGTACTCTGACTCCTTACACTGTCCTCCACACTTCCATTTATA
AGGCTTTGGTCAGTCTTCGTTGTAACAACGAAGATGGCTGCTGTGAAGCCTTTCGGAGCT
TGCTTCCGCTCCAACGGAGGATGTCGAGTTCCGGTGATCGACTTGTTTCTTAGTGGATGG
GCTAAGTAGAGGATCCACAGGTCAAATTCTTTTGTAAAGGTGAGCAAAAATGTGGTTTGT
TTAAGGTTTGTAGAAGGAGACTTGTATACGAAAAACCCAATAGTGCTAGGAGGTTTTCAT
TTGGATGATAATTTGGTGGAGTTCGATCTCAAA

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

CO CL6182Contig1 1199 2 4 U
GAAGGTTTATAAAAAAGGGGTCGTATAGGAGAAATGTGATACCTTCATTTTCACCAACGG
TTGATATATACTTGATGATCTTTTCCACCAAAGAAAATGCGATAGCAAGATAACGTTGCT
TCAAGAGATGCTCTTCAACAGTTGAACTAGGAGCTTCATATTTCATGTATGCGAGTTCAT
TTGATAAAACAGAAATCTCAACATGTGATGACTCTAATACCAGCAGAAGACACCTACAAA
AAGAAATCAGAATGATAAAGTCATTTGGCTGCAAAACGTAGGTCATGTGTGAATCCTTAT
GATTACCTATCAGCCGGAAGATAGTCCTCAACACTGGGTAATTTTACTCTACCAATAAGC
CACTTCTCACCCAGAATTGACATCATATTCTCAGCCAGAATCAACGCATGAAGCTTTTCC
GAAGGTGCTGCACATTCAAACAAGAAAATTTTAAGTTTCTGGGAAGCCTCGATAGCATAA
ACGATGTAAGCAAGCATATCAATGACATGTAACAATTATTAGCAATGCTGGCATCAGTTT
CTTTCGTATGAGATAACCAGAGAAGGTATATTTCAGAAAACAAATAGGAAAAATTAAGGG
AGAATGCCATAAATGGGTAATGCCGTTTTCAGCAATCCAGTCAAACTGCTTAAAGATCTC
TTTAAACTCACCCACACGATTCTGCAGAATTGACACAACACCTGTGCGCATGTAGTCTGC
CCAATTGTTATCTGGCATGGAACGAAGAGGTTCATGAAGAAGTGCCTACACATAAGAAAT
TCTGTTAGAAGCATATAGACATATTTGGACGTAAAAAATAACAGAATATGTAGAGCTTCT
ACGACTACAAGAGAAACGCTATATGAATATGAAAGAGCATCAACATAGTGAAGCCATGGT
CATGAGGATGACAACTGCATCCAATCAAAAGAATGAAACGTATAGGAAAACTCAAAATTA
GACTGTCATTAGATTTACCTACACCATGCTAGTAACTACAGCTAAAAACATAACTCCATT
CAGATACAGCTAAGGTAAAGGAGTGAAAACTCACAGAATAATCGGAACAGAAGACTGCAG
ACAGTAGATGGAGTGCTTCAAACTTCAGAGCATTGTGCAAGACCGCAAACTGCCGTGCAA
CAGCAGCAACCTGAATAACATATAACATGACATTAAACTCCATCATACCACGGTAGCTT


BQ
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ACGAATTT


BQ
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AGCCAACATCAAGGCTGCTTTATGTAGGATGGTGGATAAAGCTCAAACCGGACCTGAAAA
CGTCTTGTTCTTCCACTATAGTGGCCATGGAACTCGGATTCCTTCGGTTAAACCTGCTCG
TCCTTTTAAACAAGACGAAGCTATAGTCCCTTGTGATTTCAATCTCATCACAGATGTTGA
TTTCAGAGAACTTGTTAATCAACTTCCCAAGGGGACGAGCTTTACCATGATCTCAGATTC
TTGCCACAGTGGTGGCCTCATTGACAAGGAGAAAGAACAAATTGGTCCCTTCTCTGGAGT
TAGATCTCCGGCCATGGAGACAACGTCGACAATAACATCACGTGCCTTACCCTACAAG*A
AGTTCTCGACCACTTGAGTTCTCGTACCGGAATCTCA*CTTCAGACATTGGTACACACCT
ACTCGAGCTCTT

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1BW68JQ 740 0 0
CACAGATGTTGATTTCAGAGAACTTGTTAATCAACTTCCCAAGGGGACGAGCTTTACCAT
GATCTCAGATTCTTGCCACAGTGGTGGCCTCATTGACAAGGAGAAAGAACAAATTGGTCC
CTTCTCTGGAGTTAGATCTCCGGCCATGGAGACAACGTCGACAATAACATCACGTGCCTT
ACCCTACAAGGAAGTTCTCGACCACTTGAGTTCTCGTACCGGAATCTCAACTTCAGACAT
TGGTACACACCTACTCGAGCTCTTTGGTGGCGACGCTGGTCTAAAGTTCCGGCTACCGGC
TATGGATTTGATGGATCTTTTGGAGAACATGAAGGCGCGTGAAAGACACGTTGACTCAGG
GATACTGTTGAGTGGGTGTCTGGCCGATGAAACGTCTGCTGGCGTTGTAAGTGGCGGTGG
GAAGGCGTATGGAGCGTTTAGCAACGCGATTCAGACGGTGCTGAAGGAAAACAGAGGTGC
CTTGAAGAACAAGGAACTAGTGATAATGGCAAGAGAAGTGCTTGAGAGACTAGGGTTTCA
GCAACACCCTTGTCTTTACTGCAGCGACCAGAACGCGGACGCAACGTTTCTGTCTCAACC
TTGATTCGATTATATTTAATGAATAAAAGCGTTGTCGTTGTGTTTCTTTTATTTGTGTTG
TCGTGTTTGATGTGTATTTTCACTCTTTCAAAGGTGTGTGTGTTCCATAATTAAAAGGAA
GAATAAATTGCTACGAATTT

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL6184Contig1 424 2 1 U
GGATAGCAAAGAAGAAGAATCAAGAAATGGCGGAGTGGATACCCGCAATTGTAGCGACGG
TGTTGTTCGTTGTTCTGACGCCGGGGTTGCTGTTTCAGGTTCCCGGCAACAATAACTTTG
TAGACTTTGGGAAGATGGAGACCAGCGGATACTCAATCCTTCTTCACTCCTTCATTTACT
TCGGCCTTGTCACTGTCTTCACCGTCGTCATTCACTTTCCTGGCACTTAAATTCTACACA
ATACGTACACATATATTTCTTTTTAATTGTTTTTATCTATGCTTTAAATTTATCTTTCAT
GTTTTATATATGTATCTATACTACTGTTTTGTACTTTGATAATTAGTTCTAAAGTAATTC
ACATAAGATGAACCAACAAGAAGAACGAACACTAGCATTGTAAAGTTCTATTGAAACTAT
TTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 

AF RS1BM86JQ C 1
AF RS1BM86TF U 1
BS 1 424 RS1BM86TF

RD RS1BM86JQ 424 0 0
GGATAGCAAAGAAGAAGAATCAAGAAATGGCGGAGTGGATACCCGCAATTGTAGCGACGG
TGTTGTTCGTTGTTCTGACGCCGGGGTTGCTGTTTCAGGTTCCCGGCAACAATAACTTTG
TAGACTTTGGGAAGATGGAGACCAGCGGATACTCAATCCTTTTTCACTCCTTCATTTACT
TCGGCCTTGTCACTGTTTTCCCCGTCGTCATTCACTTTCCTGGCACTTAAATTCTACACA
ATACGTACACATATATTTCTTTTTAATTGTTTTTATCTATGCTTTAAATTTATCTTTCAT
GTTTTATATATGTATCTATACTACTGTTTTGTACTTTGATAATTAGTTCTAAAGTAATTC
ACATAAGATGAACCAACAAGAAGAACGAACACTAGCATTGTAAAGTTCTATTGAAACTAT
TTTC

QA 1 424 1 424
DS 

RD RS1BM86TF 424 0 0
GGATAGCAAAGAAGAAGAATCAAGAAATGGCGGAGTGGATACCCGCAATTGTAGCGACGG
TGTTGTTCGTTGTTCTGACGCCGGGGTTGCTGTTTCAGGTTCCCGGCAACAATAACTTTG
TAGACTTTGGGAAGATGGAGACCAGCGGATACTCAATCCTTCTTCACTCCTTCATTTACT
TCGGCCTTGTCACTGTCTTCACCGTCGTCATTCACTTTCCTGGCACTTAAATTCTACACA
ATACGTACACATATATTTCTTTTTAATTGTTTTTATCTATGCTTTAAATTTATCTTTCAT
GTTTTATATATGTATCTATACTACTGTTTTGTACTTTGATAATTAGTTCTAAAGTAATTC
ACATAAGATGAACCAACAAGAAGAACGAACACTAGCATTGTAAAGTTCTATTGAAACTAT
TTTC

QA 1 424 1 424
DS 



AS 1 2

CO CL6185Contig1 575 2 3 U
CATTAACAGGTAAAATTGTTTTCCAATTTAACCGCTGGTCATCATCATCCTCACAAATTC
ATCATAATTGACTTGACCATCACCATCCAAATCTGCTTCCTTGATCATTTGAGCAACTTC
TTCATCTGTTAGCTTCTCCCCAAGATTAATCATCACATGCCTCAACTGCAACATTTATAT
TAAATCTCTTACAAAAAACATTTATATTAAATGATGTTTTAAAGTAAAACAAACTGCCCA
AAGTGTATTTTGTGTAGTTTCTTAATGTTCTTGATTTTGTTTTGTGAACTAATATCCGTG
TTGTAGCCATAACATCTTAAAATTGAAGAAAGTAGTAATCACGAGAAAAGATTATGGGTT
GCTAAAAAGAATATAAATATAATTTACACTAGGTGAGACATATGCTTTGCCCAACAAACC
AATATAAATATATAATCATACTCATCTAGTCATCTTACTAAAATGTTGTTAAGCTTTCTA
AAATATTTCTTTTGACCTCGTTATCCTCCAAAAAGTCATAATGCCAGCTAGCTCGATGCT
TAAAACAATTTACCTCACCTTTCTACGACGCAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AN92JQ U 277
AF RS1AN92TF C 1
BS 1 276 RS1AN92TF
BS 277 455 RS1AN92JQ
BS 456 575 RS1AN92TF

RD RS1AN92JQ 179 0 0
TTGTTTTGTGAACTAATATCCGTGTTGTAGCCATAACATCTTAAAATTGAAGAAAGTAGT
AATCACGAGAAAAGATTATGGGTTGCTAAAAAGAATATAAATATAATTTACACTAGGTGA
GACATATGCTTTGCCCAACAAACCAATATAAATATATAATCATACTCATCTAGTCATCT

QA 1 179 1 179
DS 

RD RS1AN92TF 575 0 0
CATTAACAGGTAAAATTGTTTTCCAATTTAACCGCTGGTCATCATCATCCTCACAAATTC
ATCATAATTGACTTGACCATCACCATCCAAATCTGCTTCCTTGATCATTTGAGCAACTTC
TTCATCTGTTAGCTTCTCCCCAAGATTAATCATCACATGCCTCAACTGCAACATTTATAT
TAAATCTCTTACAAAAAACATTTATATTAAATGATGTTTTAAAGTAAAACAAACTGCCCA
AAGTGTATTTTGTGTAGTTTCTTAATGTTCTTGATTTTGTTTTGTGAACTAATATCCGTG
TTGTAGCCATAACATCTTAAAATTGAAGAAAGTAGTAATCACGAGAAAAGATTATGGGTT
GCTAAAAAGAATATAAATATAATTTACACTAGGTGAGACATATGCTTTGCCCAACAAACC
AATATAAATATATAATCATACTCATCTAGTCATCTTACTAAAATGTTGTTAAGCTTTCTA
AAATATTTCTTTTGACCTCGTTATCCTCCAAAAAGTCATAATGCCAGCTAGCTCGATGCT
TAAAACAATTTACCTCACCTTTCTACGACGCAAGC

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 2

CO CL6186Contig1 337 2 2 U
GTAGAATCTTTAGTCTCTTGTATATGATTATATAGCTCCTTTCGCTTTGCTTGCTCTTCG
CTGTACTTCTGCTTGAGATCCTCACACTGTGAAACAAGTGCCTGAACTCCATCAACCATT
TTGTACAATTCAGGAATTGATCCCACACATTCGTGTGCTTCCTGGGATAGCTGGGATTGT
TCCCTTTTCATTATCTCTATTTTCTCCTGTAGACTAGCAATTGCAGTGGTCCAATGTCTC
TTGTCATTCTCATACTTGCTCGTGATACTGTTCAAACAATCTGCTTGCGTCTCCACAGTT
TGGTCTAGAGAGCGTGCCTCAAACATCTTATTGTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BV65TF C 1
AF RS1BV65JQ U 184
BS 1 183 RS1BV65TF
BS 184 337 RS1BV65JQ

RD RS1BV65TF 337 0 0
GTAGAATCTTTAGTCTCTTGTATATGATTATATAGCTCCTTTCGCTTTGCTTGCTCTTCG
CTGTACTTCTGCTTGAGATCCTCACACTGTGAAACAAGTGCCTGAACTCCATCAACCATT
TTGTACAATTCAGGAATTGATCCCACACATTCGTGTGCTTCCTGGGATAGCTGGGATTGT
TCCCTTTTCATTATCTCTATTTTCTCCTGTAGACTAGCAATTGCAGTGGTCCAATGTCTC
TTGTCATTCTCATACTTGCTCGTGATACTGTTCAAACAATCTGCTTGCGTCTCCACAGTT
TGGTCTAGAGAGCGTGCCTCAAACATCTTATTGTCGC

QA 1 337 1 337
DS 

RD RS1BV65JQ 154 0 0
CTTTTCATTATCTCTATTTTCTCCTGTAGACTAGCAATTGCAGTGGTCCAATGTCTCTTG
TCATTCTCATACTTGCTCGTGATACTGTTCAAACAATCTGCTTGCGTCTCCACAGTTTGG
TCTAGAGAGCGTGCCTCAAACATCTTATTGTCGC

QA 1 154 1 154
DS 



AS 1 2

CO CL6187Contig1 812 2 1 U
CATTTCATTTCATTTCATTTTATTATGTTACATTTTTTTTAGGGAGAAAATCACAAGAAA
CGCTTAAAACTTGCCATTCTTGGGATTCAAGAAAACGACTCACGGATTAAGACATGGTGG
TGGTGGAGAAAGAGCTGGTCACAGGTAAAAAGAAAGGAGAGGCTCCGATTTTTTTAGACC
CTAACACATTCCTCACCAGAAGTTTCCATCTAACCTCATCCTTCTTGCTCTGTTTCTCCA
TCTTCTCCTTAAAGTTCCTGCATAGTGGGACTCGACACTGATCAGAATCAGCGCAAACGC
GTGAATGTAACTCGAGGAGCTGCCACATTCTCTTGCAATGCACGCAACCTCCTGGAACCC
TAAGCTTACATCCAGCGAAATGCCTGATCAGCGATTCCAACCCTTTGCAAGATTCGTAGT
GACACGTGGCGTGGTTGGGTTTTAAATCTTTATCGTGCGGTCCTATTGTTTTGCACCCGT
CTCTGCATATATGAACAAGCGCTTCCATCGCTTCGTACAGCTCCGAGTATATCCTCTGTT
CATTGCGTTTTCTGATCCTCTCTTTCCGCATATTTTCTTCGATGAAGACAGAGTCTCTAA
GTTCTTTCTCGAGAAAGGGATGGCTTTTCTTCATAGCCGTCCACGCTTCTGTCGCGTAAA
GCTCCTTGAAGTGTTTAATGATCATACGGTGAGATAAGACGCTGAGCCGAGGGAAATCAC
AGAGCAGGCGAGCTGGAAGACATCGATTACGTTCTCAGTGGTAAGCAGACATGTTCTAGA
TGCCATTCACAGTCCCGTTTCAGCTGAGTACC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1GI88JQ U 1
AF RS1GG79JQ U 1
BS 1 812 RS1GG79JQ

RD RS1GI88JQ 412 0 0
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CGCTTAAAACTTGCCATTCTTGGGATTCAAGAAAACGACTCACGGATTAAGACATGGTGG
TGGTGGAGAAAGAGCTGGTCACAGGTAAAAAGAAAGGAGAGGCTCCGATTTTTTTAGACC
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QA 1 412 1 412
DS 

RD RS1GG79JQ 812 0 0
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CGCTTAAAACTTGCCATTCTTGGGATTCAAGAAAACGACTCACGGATTAAGACATGGTGG
TGGTGGAGAAAGAGCTGGTCACAGGTAAAAAGAAAGGAGAGGCTCCGATTTTTTTAGACC
CTAACACATTCCTCACCAGAAGTTTCCATCTAACCTCATCCTTCTTGCTCTGTTTCTCCA
TCTTCTCCTTAAAGTTCCTGCATAGTGGGACTCGACACTGATCAGAATCAGCGCAAACGC
GTGAATGTAACTCGAGGAGCTGCCACATTCTCTTGCAATGCACGCAACCTCCTGGAACCC
TAAGCTTACATCCAGCGAAATGCCTGATCAGCGATTCCAACCCTTTGCAAGATTCGTAGT
GACACGTGGCGTGGTTGGGTTTTAAATCTTTATCGTGCGGTCCTATTGTTTTGCACCCGT
CTCTGCATATATGAACAAGCGCTTCCATCGCTTCGTACAGCTCCGAGTATATCCTCTGTT
CATTGCGTTTTCTGATCCTCTCTTTCCGCATATTTTCTTCGATGAAGACAGAGTCTCTAA
GTTCTTTCTCGAGAAAGGGATGGCTTTTCTTCATAGCCGTCCACGCTTCTGTCGCGTAAA
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TGCCATTCACAGTCCCGTTTCAGCTGAGTACC

QA 1 812 1 812
DS 



AS 1 2

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TGAGGCAGTGTTTTGGGTAGTAGATTTGGCTTGTCGGCTTCTTTTTTTGTTTTGTTTTTT
GTTCTTGTAAATGTTAGAAAAGCCTTTTAATACAGTGGGCAGTGTAAGTAGATATCTCTA
CTTTATTCATCTAACTTGACAATGTTTGAATGCAGACTTATGTTGTTAT


BQ
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AF RS1EV08JQ C 1
AF RS1EV08TF U 1
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RD RS1EV08JQ 409 0 0
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CAACCCTTCTAGGAAAGTGAAGATATAATTTTTGGCTATTGGTTTTTCTGGTGATGACCA
TGAGGCAGTGTTTTGGGTAGTAGATTTGGCTTGTCGGCTTCTTTTTTTGTTTTGTTTTTT
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CTTTATTCATCTAACTTGACAATGTTTGAATGCAGACTTATGTTGTTAT

QA 1 409 1 409
DS 

RD RS1EV08TF 409 0 0
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GTTGTGGACTGCATGTCGAAACCCTTCAACGGCAAGAATATACTCTCAGTCGATTTATCG
GTTGATGCAAAATGTGCTCAGAACTGGTATGCTTCTAAATAGGGGTGTCTTCTAACAAGA
CAACCCTTCTAGGAAAGTGAAGATATAATTTTTGGCTATTGGTTTTTCTGGTGATGACCA
TGAGGCAGTGTTTTGGGTAGTAGATTTGGCTTGTCGGCTTCTTTTTTTGTTTTGTTTTTT
GTTCTTGTAAATGTTAGAAAAGCCTTTTAATACAGTGGGCAGTGTAAGTAGATATCTCTA
CTTTATTCATCTAACTTGACAATGTTTGAATGCAGACTTATGTTGTTAT

QA 1 409 1 409
DS 



AS 1 2

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CCCCGACATTGGAGCCAAAGATAACACTTGCTATTGTTGTCCCTACAAAAAGAAGAAGGA
GAACACATGTTATGCGACCAAAGAATTATGTACACGTTTGTGCAAAAAATCATAAGTTAT
CTCAAGAACCTACATCAGGGATTTATTAAATCCTAAAAACCTGTTTTATTTAATACTTCC
TAATATGTATTTTCGTTTTAAATGAATAAAACATGCTTATTTAGAGTCC


BQ
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AF RS1CM45JQ C 1
AF RS1CM45TF U 1
BS 1 409 RS1CM45TF

RD RS1CM45JQ 409 0 0
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GTCATCACAGTTTGCTATATTTTGCATAATCTTGATTGCTTTATTTCCTCTTCACGAATT
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CCCCGACATTGGAGCCAAAGATAACACTTGCTATTGTTGTCCCTACAAAAAGAAGAAGGA
GAACACATGTTATGCGACCAAAGAATTATGTACACGTTTGTGCAAAAAATCATAAGTTAT
CTCAAGAACCTACATCAGGGATTTATTAAATCCTAAAAACCTGTTTTATTTAATACTTCC
TAATATGTATTTTCGTTTTAAATGAATAAAACATGCTTATTTAGAGTCC

QA 1 409 1 409
DS 

RD RS1CM45TF 409 0 0
GGATCAAACTATCAAGTTTAAATTCAAAAGAAGTAACAATATCACGAATAACAATATGTC
GTCATCACAGTTTGCTATATTTTGCATAATCTTGATTGCTTTATTTCCTCTTCACGAATT
TGTCGATGGCCAAGGTCTTCAAGCGGGCAATGCTGCTACAACCTGTGCACCAGAAAAATG
CCCCGACATTGGAGCCAAAGATAACACTTGCTATTGTTGTCCCTACAAAAAGAAGAAGGA
GAACACATGTTATGCGACCAAAGAATTATGTACACGTTTGTGCAAAAAATCATAAGTTAT
CTCAAGAACCTACATCAGGGATTTATTAAATCCTAAAAACCTGTTTTATTTAATACTTCC
TAATATGTATTTTCGTTTTAAATGAATAAAACATGCTTATTTAGAGTCC

QA 1 409 1 409
DS 



AS 1 2

CO CL6190Contig1 487 2 6 U
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AGCCACCGCAGAGAGGGTCTCCTCTTCTTGTCCAGCTCTCTCCTCCTGGTCTCTTGGTCA
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TTTTATTCTCTCTTTTTTACAATAAGACGAAAGACCAATGAAATCATATGTTTCTTGGCC
AAATCGTCCATCAACTTTTCCAATGAGAACCTATTTGTAATCTCTCAGCATTAAGAGTTG
TTTGTTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FQ49TF U 1
AF RS1F563TF U 5
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DS 

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GG
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GAACATGTTGACCACAATCTTTGAGGAAGAGATGGCTTTTGACGAATTAGTCAGAGCCAC
CGCAGAGAGGGTCTCCTCTTCTTGTCCAGCTCTCTCCTCCTGGTCTCTTGGTCACTACGT
CAAGACCAACAGCCTCTCTGCTTCTTAGACCATTTAAACGACCCTAAAATTGCATTTTAT
TCTCTCTTTTTTACAATAAGACGAAAGACCAATGAAATCATATGTTTCTTGGCCAAATCG
TCCATCAACTTTTCCAATGAGAACCTATTTGTAATCTCTCAGCATTAAGAGTTGTTTGTT
C

QA 3 483 3 483
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TGAACCACCACCACCATGCAAACCCCCACAGCTTCACCTCCTCTCCGACCAAACCCGTTT
TCTTCCTTTCCCAAAAGCCTCACGTCTGCTCCTCTCGATGCTCTTTAGTTCTTGAAGAAG
ATGAAAAGAGGTCACAGACTGCATTCTCTGCGCGGTCGTGAACGAATTCTGTAAGCAGAG
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GCAAGTGACTTACGCGATAACGATCAACGCGTACTGTCGGCTGGAGGAGCACGACAAGGC
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GAACATAATGGATATGTACGGGAAGACGAGGAGGCTGAGCGACGCGGTGAAACTCATGGC
TAAGATGAAACAGAGAGGATGCAGACCCAACATTTGGATTTACAATGCGTTGATCGATAT
GCATGGAAGAGCTATGGACTTGAGGCGGGTGGAAAAGATATGGAAAGAGATGAAGAGGAT
GAAGGTGCTGCCGGATAAAGTGAGCTACACGAGCATGATCAGTGCGTATAACAGGGCAAA
AGAGTTTGAGACGTGCGTGGAGCTTTACCGGGAGTTTAGGATGAACAGAGGGAAGATCGA
TAGGGCCATGGCGGGGATTATGGTCGGTGTGTTCTCCAAAACCAGCAGGATTGATGAGCT
GATGAGGCTGTTGCAGGACATGAGAGTGGAAAAAACCAAGGTTGATGCGAGGCTGTATTC
CTCGGCTTTGAACGCTCTACGTGATGCCAGTCTTAACTCCCAGATCAGATGGTTGCAGGA
AAGCTTTGACATAGCACAAGAAACTAGTGCTTCAAGATATTCCAATATGAAGAAGAAAAG
AAGTTTGCAGGGTGGTTCTTGAGTTGAAAAGGAAACTGTACAAGTTCATGATTCTTTTGT
AAACTATATCTTGCAAATAGAAGATTTCAATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CR58TF U 1
AF RS1CR58JQ C 313
BS 1 419 RS1CR58TF
BS 420 420 RS1CR58JQ
BS 421 729 RS1CR58TF
BS 730 1053 RS1CR58JQ

RD RS1CR58TF 729 0 0
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TGAACCACCACCACCATGCAAACCCCCACAGCTTCACCTCCTCTCCGACCAAACCCGTTT
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AGGCTTTGCGGAAGCGGTCGAGGCTTACGAGTGGCTCATGAAGCAAGAATGCGAGGCGGG
GCAAGTGACTTACGCGATAACGATCAACGCGTACTGTCGGCTGGAGGAGCACGACAAGGC
TGAGATGCTGTTCGAAGAGATGGTGAAGAAAGGATTCGACAGATGCGTCGTGGCGTACTT
GAACATAATGGATATGTACGGGAAGACGAGGAGGCTGAGCGACGCGGTGAAACTCATGGC
TAAGATGAAACAGAGAGGATGCAGACCCAACATTTGGATTTACAATGCGTTGATCGATAT
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GAAGGTGCTGCCGGATAAAGTGAGCTACACGAGCATGATCAGTGCGTATAACAGGGCAAA
AGAGTTTGAGACGTGCGTGGAGCTTTACCGGGAGTTTAGGATGAACAGAGGGAAGATCGA
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DS 

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TATGGACTTGAGGCGGGTGGAAAAGATATGGAAAGAGATGAAGAGGATGAAGGTGCTGCC
GGATAAGGTGAGCTACACGAGCATGATCAGTGCGTATAACAGGGCAAAAGAGTTTGAGAC
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GGGGATTATGGTCGGTGTGTTCTCCAAAACCAGCAGGATTGATGAGCTGATGAGGCTGTT
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AGCACAAGAAACTAGTGCTTCAAGATATTCCAATATGAAGAAGAAAAGAAGTTTGCAGGG
TGGTTCTTGAGTTGAAAAGGAAACTGTACAAGTTCATGATTCTTTTGTAAACTATATCTT
GCAAATAGAAGATTTCAATCC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

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AGAGAACAAGAAGACGATGCGAAGGTACCGCCATGGGCGCCACCGTCTTCGATCTCCGTC
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TAGAGCAGCAGCCCAACATATACGATGTTGTTCATGTTAAATACCACGACGAGGATCCTC
TGAAGCTGGATATTGTTATTAGCTTTCCCGATCATGGTTTTCACCTTCGCTTTGATCCAT
GGTCTCAGAGGTTACGCCTTGTTGAGATATATGATGTCAAGCGGCTTCAGATGCGTTACG
CCACTTCTACCATCGGGGGTCCATCAACTCTGGCGACGTTTGTGGCTGTTTATGCACTTT
TTGGACCCACCTTTCCTGGGATTTATGATAAAGAAAGAGGGGTTTATTCTCTCTTCTACC
CGGGGCTATCCTTTCAGTTTCCAATTCCTAACCAGTACACGGACTGCTGCCATGATGGAG
AAGCGGCGCTACCATCGGAGTTTCCAGATGGCACCACGCCAGTAGCATGCCGGGTCTCTA
TCTATGACAACTCAAGCGACAAAAAGTTGGTGTAGGAAAGCTGATGGATAGAGCTTCTGT
CCCTCCTTTGCCTCCTGGCAGCCTTTATATGGAGGA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GY84TF U 3
AF RS1CK84TF U 1
BS 1 30 RS1CK84TF
BS 31 31 RS1GY84TF
BS 32 101 RS1CK84TF
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BS 255 261 RS1CK84TF
BS 262 263 RS1GY84TF
BS 264 433 RS1CK84TF
BS 434 434 RS1GY84TF
BS 435 460 RS1CK84TF
BS 461 461 RS1GY84TF
BS 462 756 RS1CK84TF

RD RS1GY84TF 474 0 0
GG
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TCCGTCCGAGAAACCGATCACAGTAGGAAGGATTACTCAAAGATCGGCGGTAATGCAGAG
AACAAGAAGACGATGCGAAGGTACCGCCATGGGCGCCACCGTCTTCGATCTCCGTCCCGG
CGTCGGCATCGGACCTTTCTCTATCGGAATGCCAATTTGTGATGCGTTTTCGCAAATAGA
GCAGCAGCCCAACATATACGATGTTGTTCATGTTAAATACCACGACGAGGATCCTCTGAA
GCTGGATATTGTTATTAGCTTTCCGGATCATGGTTTTCATCTTCGCTTTGATCCATGGTC
TCAGAGGTTACGCCTTGTTGAGATTTATGATGTCAAGCGGCTTCAGATGCGTTACGCCAC
TTCTACTATCGGGGGTCCATCAGCTCTGGCGACGTTTGTGGCTGTTTATGCA

QA 3 474 3 474
DS 

RD RS1CK84TF 756 0 0
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CTCATCCGTCCGAGAAACCGATCACAGTAGGAAGGATTACTGAAAGATCGGCGGTAATGC
AGAGAACAAGAAGACGATGCGAAGGTACCGCCATGGGCGCCACCGTCTTCGATCTCCGTC
CCGGCGTCGGCATCGGACCTTTCTCTATCGGAATGCCAATTTGTGATGCGTTTGCGCAAA
TAGAGCAGCAGCCTAACATAT**GATGTTGTTCATGTTAAATACCACGACGAGGATCCTC
TGAAGCTGGATATTGTTATTAGCTTTCCCGATCATGGTTTTCACCTTCGCTTTGATCCAT
GGTCTCAGAGGTTACGCCTTGTTGAGATATATGATGTCAAGCGGCTTCAGATGCGTTACG
CCACTTCTACCATTGGGGGTCCATCAACTCTGGCGACGTT*GTGGCTGTTTATGCACTTT
TTGGACCCACCTTTCCTGGGATTTATGATAAAGAAAGAGGGGTTTATTCTCTCTTCTACC
CGGGGCTATCCTTTCAGTTTCCAATTCCTAACCAGTACACGGACTGCTGCCATGATGGAG
AAGCGGCGCTACCATCGGAGTTTCCAGATGGCACCACGCCAGTAGCATGCCGGGTCTCTA
TCTATGACAACTCAAGCGACAAAAAGTTGGTGTAGGAAAGCTGATGGATAGAGCTTCTGT
CCCTCCTTTGCCTCCTGGCAGCCTTTATATGGAGGA

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL6194Contig1 662 2 15 U
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AGAAAAAGACGCAAACCAAAGCAACAGCCTTAAAAATATAAAAATGGCCATGTCTCATCT
CTTCCTTTCTTCGCCTCGACCTTCATTGGCTCCGCGACTCCACTCACCGACCCAGTTGTA
CTCTAACAAGAGTAAAAGTCTCAAGGGTGCAAATGAAGCCAAAGCATCAAAGAGATTATT
CCTCTGCCGCTCAATTCACATGGAATCTGATCATTCAGGGGACTCAAAGAGGCTTACTTT
CGACACCCTCTTGAGAAAAGCAAAACATGTTTGGAATGATTCTCCACAGCCGGTCAAGGA
CTTCCCTTGGAACAGAGCGTTCGAGAACTTCGTGCAGCTCGTTCTCGATCTCGCCATATC
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CTGTGCACATGAGAGGAAGTTTGCTTTAGTCCCGTTCCCGTTACTCATCGGTGTTGTTGT
TGGAGGCATTCTACAAGGAACCGCTTTGAACATCTCTCCTCGTCTTAAGGTCCGTGACTT
GTTGTGACAGTTTCGAAATCCCTTCTGGTCTTAAGAGATAAAGAGTGTTTTTTTTTGCAG
AA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1EI36TF U 3
AF RS1E063TF U 1
BS 1 50 RS1E063TF
BS 51 51 RS1EI36TF
BS 52 219 RS1E063TF
BS 220 220 RS1EI36TF
BS 221 231 RS1E063TF
BS 232 232 RS1EI36TF
BS 233 258 RS1E063TF
BS 259 259 RS1EI36TF
BS 260 309 RS1E063TF
BS 310 310 RS1EI36TF
BS 311 315 RS1E063TF
BS 316 316 RS1EI36TF
BS 317 447 RS1E063TF
BS 448 448 RS1EI36TF
BS 449 662 RS1E063TF

RD RS1EI36TF 487 0 0
GGACAGAACCTCCC
CCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCAATGGCCTCTCTGTGAGAAAAAGACGCAAAC
CAAAGCAACAGCCTTAAAA*TATAAAAATGGCCATGTCTCATCTCTTCCTTTCTTCGCCT
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CACATGGAATCTGATCATTCAGGGGATTCAAAGAGGCTTACTTTCGACACCCTCTTGAGA
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TTTGTTCCCGTCTTGGCGGTTTCCTCCGTTAGCGAGATGTCTTATTGTGC
GCA

QA 15 484 15 484
DS 

RD RS1E063TF 662 0 0
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AGAAAAAGACGCAAACCAAAGCAACAGCCTTAAAAATATAAAAATGGCCATGTCTCATCT
CTTCCTTTCTTCGCCTCGACCTTCATTGGCTCCGCGACTCCACTCACCGACCCAGTTGTA
CTCTAACAAGAGTAAAAGTCTCAAGGGTGCAAATGAAGCTAAAGCATCAAATAGATTATT
CCTCTGCCGCTCAATTCATATGGAATCTGATCATTCAGGGGACTCAAAGAGGCTTACTTT
CGACACCCTTTTGAGGAAAGCAAAACATGTTTGGAATGATTCTCCACAGCCGGTCAAGGA
CTTCCCTTGGAACAGAGCGTTCGAGAACTTCGTGCAGCTCGTTCTCGATCTCGCCATATC
AGTCGTTAAGCTTCTGTTTGTTCCCGTGTTGGCGGTTTCCTCCGTCAGCGAGATGTCTTA
CTGTGCACATGAGAGGAAGTTTGCTTTAGTCCCGTTCCCGTTACTCATCGGTGTTGTTGT
TGGAGGCATTCTACAAGGAACCGCTTTGAACATCTCTCCTCGTCTTAAGGTCCGTGACTT
GTTGTGACAGTTTCGAAATCCCTTCTGGTCTTAAGAGATAAAGAGTGTTTTTTTTTGCAG
AA

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

CO CL6195Contig1 805 2 2 U
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AATATATGTGACAAGTTAATACCTTTGCTTCTAGGGTGACAGGAGAGTATCTCTGGAGTT
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AGAAACAGTCTTTTGTAAGATAAGAACTTTCTATATACAACCTTTAGCTTAGCAATGGAT
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GCCTGATTATTTCAAATAGTTTCCCATAATCTCCGTTTACATCATATGGCACATAAGCAG
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CTTCCTCTTGCTAATATATACAAGAACAAAAACGAAATGGTGAGGTAACTTGTGTGGGTT
TTAGTACTTAAACTTATAGCGTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G624TF U 1
AF RS1G624JQ C 308
BS 1 724 RS1G624TF
BS 725 805 RS1G624JQ

RD RS1G624TF 724 0 0
GTGGACTTTTGTTGATCAGGAAGTAATCCCATTTAAGTTTGTCCAGGTCTGATGCATTGG
CATGCTCCTTAAGCCAATCTCTTAGAGCTGGATTGCTGTACCAAACCTGTTTTAGGATAA
CATACAACTTATTTAGTTTAGTTTTAAGTTCAGCCATGAGATCTCATGTTCATAAACAGA
ACAGCAAATTCAGACTAGAGATCTACAAAACCTGCTCATAGAAGATATCGTCAATGACTT
TTGCAGCCTTCACGATTAGTCTGAGCGCTTTCTGATCCGCCTCAGAGAGTTCTGTCAACT
GCATTGTCAAGAAAAAAAACTCAGTTTTGTGGTACATTTGAAACAAATAAATCAGAAAGT
AATATATGTGACAAGTTAATACCTTTGCTTCTAGGGTGACAGGAGAGTATCTCTGGAGTT
GCTTCTGCAGAGATAAACTACGAGCCTCAGCGTTGACTTGACACCTTCAACAAACTCAGA
AGAAACAGTCTTTTGTAAGATAAGAACTTTCTATATACAACCTTTAGCTTAGCAATGGAT
ATGTCACACAAAAATGGAAATAACTAAGAAAAGACCAGTGAGAGATGATAATGTACCTCT
GCCTGATTATTTCAAATAGTTTCCCATAATCTCCGTTTACATCATATGGCACATAAGCAG
GATCTTCCTTGGCCAGAAAGTTTCTGTATTCTTCATAAAGTACGTATTTCACAGCAGAGA
CTTC

QA 1 724 1 724
DS 

RD RS1G624JQ 498 0 0
CAAGAAAAAAAACTCAGTTTTGTGGTACATTTGAAACAAATAAATCAGAAAGTAATATAT
GTGACAAGTTAATACCTTTGCTTCTAGGGTGACAGGAGAGTATCTCTGGAGTTGCTTCTG
CAGAGATAAACTACGAGCCTCAGCGTTGACTTGACACCTTCAACAAACTCAGAAGAAACA
GTCTTTTGTAAGATAAGAACTTTCTATATACAACCTTTAGCTTAGCAATGGATATGTCAC
ACAAAAATGGAAATAACTAAGAAAAGACCAGTGAGAGATGATAATGTACCTCTGCCTGAT
TATTTCAAATAGTTTCCCATAATCTCCGTTTACATCATATGGCACATAAGCAGGATCTTC
CTTGGCCAGAAGGTTTCTGTATTCTTCATAAGGTACGTATTTCACAGCAGAGACTTCCTC
TTGCTAATATATACAAGAACAAAAACGAAATGGTGAGGTAACTTGTGTGGGTTTTAGTAC
TTAAACTTATAGCGTCGC

QA 1 498 1 498
DS 



AS 1 2

CO CL6196Contig1 774 2 4 U
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GCCAAAGAATACTCATACTTGGTGCCACTAACCGACCTTTTGATCTTGATGACGCTGTCA
TTCGCCGTCTACCAAGAAGAATATATGTGGATTTACCAGATGCTGAGAACCGGTTGAAGA
TCTTAAAGATCTTTCTGACTCCAGAAAATCTTGAAACTGGTTTTGAATTTGAGAAACTTG
CAAAAGAGACCGAAGGATACTCGGGAAGCGATCTAAAGAATCTATGCATCGCTGCTGCGT
ACAGACCAGTTCAAGAATTGTTACAGGAAGAAAACAAGGGTTCGGTAGCAAATAGTGGAG
CTCCTGATCTACGGCCTCTGAGTTTGGACGACTTCATTCAATCTAAAGCTAAGGTAGTTG
ATTGGATCATCATATGTGTTTATGCTTCTTCTTTTCTTTTTGTTGGATGTGCTTTATCAA
ATGTTGATATTGCATCAATTTTTAATGCAATTGCAGGTAAGTCCGTCAGTGTCATATGAT
GCAACGACCATGAACGAACTGAGAAAATGGAACGAGCAGTACGGTGAAGGTGGTAGCCGG
ACCAAGTCTCCTTTCGGCTTCTAATACAGTTTTGTTAGATTCATCAACTATTCAATGTTT
CTTCGACAATAATTTTTCCAATTTCACAGACAATAAATGTCTACTATTTGAAATTTAATC
CTAGTTTTTCATTCCAAAGGTAACTAATAAAAAGAAAGAATATCTTCAAATAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GK16TF U 1
AF RS1GK16JQ C 463
BS 1 692 RS1GK16TF
BS 693 693 RS1GK16JQ
BS 694 733 RS1GK16TF
BS 734 774 RS1GK16JQ

RD RS1GK16TF 733 0 0
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ATTGGATCATCATATGTGTTTATGCTTCTTCTTTTCTTTTTGTTGGATGTGCTTTATCAA
ATGTTGATATTGCATCAATTTTTAATGCAATTGCAGGTAAGTCCGTCAGTGTCATATGAT
GCAACGACCATGAACGAACTGAGAAAATGGAACGAGCAGTACGGTGAAGGTGGTAGCCGG
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CTTCGACAATAATTTTTCCAATTTCACAGACA*TAAATGTCTACTATTTGAAATTTAATC
CTAGTTTTTCATT

QA 1 733 1 733
DS 

RD RS1GK16JQ 312 0 0
G
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CGTCAGTGTCATATGATGCAACGACCATGAACGAACTGAGAAAATGGAACGAGCAGTACG
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TCAACTATTCAATGTTTCTTCGACAATAATTTTTCCAATTTCACAGACAATAAATGTCTA
CTATTTGAAATTTAATCCTAGTTTTTCATTCCAAAGGTAACTAATAAAAAGAAAGAATAT
CTTCAAATAGT

QA 2 312 2 312
DS 



AS 1 2

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ACCAGGGGTTGATGGATTTGCGGGAACATAGATTTGGACCAACACGGGAACAACTCGACA
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ATCAGCATCTTGTTCAATCACCACAGCTTTGTGCTCCATATCGGTCTTGTATGACCCACC
TATGGTTTCTTTTATGTTAGTCTTTAATTTATATAATAATAATACTTAGTTAACTTATGT
TAAATTTCGGAGTATCTTTGGGGATTTTCATTCACTATATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B289TF U 1
AF RS1B289JQ C 260
BS 1 668 RS1B289TF
BS 669 881 RS1B289JQ

RD RS1B289TF 668 0 0
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GGTTGAAATTGAAGAGGAGGCCAAGAGATCTGACGAAGAAGAAGAATAAGGTTGGAGGAA
TACTCTGCGACTTCTGCGGATTCTCCACGCGGTATTAACGAGATCACATGGAGAGCGAGC
TCAAGAGATTACGTGTTTTGACCAGGAGAATGACTGGCAAGGATCTGGACGGTCTGAGTT
TCACAGAGCTTGTGTTTCTTGAAAACCATCTCAGAGAAGTCGTCTTGCCCATTGTGAACA
AGAAGAATGAGCAGCTGGAGGAAGATTTGGAGAGTTTGCTCATACAGAGTGAAACAGTGG
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GAAAGGCTGAATCCATGGAGATGGAGTTCGAGAGGCTGTGGCTACTGAAGGAGAGACTGA
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ACCAGGGGTTGATGGATTTGCGGGAACATAGATTTGGACCAACACGGGAACAACTCGACA
AAGAGAAG

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1B289JQ 622 0 0
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GAGAGTGGCTCCCCGCAGATTCTCTAGCGGCAACAGCTCGGGAGAGGGACAAGTTGGTGA
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TATGACCTATGCCGAGATGGGTATTCTTCACCGTCAGATATACCAGGGGTTGATGGATTT
GCGGGAACATAGATTTGGACCAACACGGGAACAACTCGACAAAGAGAAGAAGAAGAAGTT
GCTCACTCGGAAGATGGTTCCCGGAGATGTTCATTAGGATCATCAGCATCTTGTTCAATC
ACCACAGCTTTGTGCTCCATATCGGTCTTGTATGACCCACCTATGGTTTCTTTTATGTTA
GTCTTTAATTTATATAATAATAATACTTAGTTAACTTATGTTAAATTTCGGAGTATCTTT
GGGGATTTTCATTCACTATATG

QA 1 622 1 622
DS 



AS 1 2

CO CL6198Contig1 988 2 6 U
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CCTTTCTCGCTCTTGTATTGTGTACGCTTCTAGAGAAAGATGAAGAAGAAGAAGAAGATG
AGTCATGTCTGGATTATACAACAACAACTCGTCTTACTTTTCTCCTGCTAGAGCTGCTTC
TCCTCAGATCAGAAGCACTCCTGAGATCGACAGCTCTCAGTACTTGACGGAGCTTCTCGT
TGAACATCAGAAGCTTACACCTTTTATGCAAGTCTTGCCCATATGCAGCCGCCTGTTGAA
TCAAGGGTATCTGGAATGATGCCTAACCAAGGAGGATTTGGCGGCGATTTTGATAGACTC
AGACACAGAAGTCCCAGTCCAATGGCTTCTTCTAATCTTATGTCTAATGTCTCTAACTCC
GGTTTAGCTGCTTGGAACAGAGCTTCTCTCTCAGGAGGTATTACCATCATCTGTTTTAAG
CTCTGTACTTGTGTTGTCTAAGATTGTGACTGCGTTGTGTTGCATCTGTTTGAGCATTGT
GGAACACCTGGAATGACAATGGATTGGCAAGGTGCACCTGGAAGTCCCAGCTCATACACT
GTCAAAAGGATATTGCGTCTGGAGATTCCAATATATAGCTATCCTAATATTCCATTGGAA
ATGAAGATCAGAGAAGGTTCTGATGAAGGTGTTCCTGTGATTGTTTCTTCACCTGGTTCT
GTAGTATTAAAAGCTTATGAAGATTCTAGCTCAAAACGTGGTGAATAGGCTCAAGGAGCT
ACGTGATAATCCTTAGAATGAGATTCAGACAAAACTTAACGTTCCACACTCATCATAGAA
CAAGCCATGAGAACAAGAGGCATTATAAAACCAAGTTTTGCAATTGCTGAGAGAATAATG
TATCTACATAGAACAAAAGAATAGAGACACTCTGTTTGAACAATGTGAATGTTTCCATTT
TATTTGCTATCATAACATTTTTTTAATC


BQ
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AF RS1CX44TF U 1
AF RS1CX44JQ C 298
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CCTTTCTCGCTCTTGTATTGTGTACGCTTCTAGAGAAAGATGAAGAAGAAGAAGAAGATG
AGTCATGTCTGGATTATACAACAACAACTCGTCTTACTTTTCTCCTGCTAGAGCTGCTTC
TCCTCAGATCAGAAGCACTCCTGAGATCGACAGCTCTCAGTACTTGACGGAGCTTCTCGT
TGAACATCAGAAGCTTACACCTTTTATGCAAGTCTTGCCCATATGCAGCCGCCTGTTGAA
TCAAGGGTATCTGGAATGATGCCTAACCAAGGAGGATTTGGCGGCGATTTTGATAGACTC
AGACACAGAAGTCCCAGTCCAATGGCTTCTTCTAATCTTATGTCTAATGTCTCTAACTCC
GGTTTAGCTGCTTGGAACAGAGCTTCTCTCTCAGGAGGTATTACCATCATCTGTTTTAAG
CTCTGTACTTGTGTTGTCTAAGATTGTGACTGCGTTGTGTTGCATCTGTTTGAGCATTGT
GGAACACCTGGAATGACAATGGATTGGCAAGGTGCACCTGGAAGTCCCAGCTCATACACT
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ATGAAGATCAGAGA*GGTTCTGATGAAG*TGTTCCTGTGATTGTTTCTTCACCTG

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DS 

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GAATCAAGGGTATCTGGAATGATGCCTAACCAAGGAGGATTTGGCGGCGATTTTGATAGA
CTCAGACACAGAAGTCCCAGTCCAATGGCTTCTTCTAATCTTATGTCTAATGTCTCTAAC
TCCGGTTTAGCTGCTTGGAACAGAGCTTCTCTCTCAGGAGGTATTACCATCATCTGTTTT
AAGCTCTGTACTTGTGTTGTCTAAGATTGTGACTGCGTTGTGTTGCATCTGTTTGAGCAT
TGTGGAACACCTGGAATGACAATGGATTGGCAAGGTGCACCTGGAAGTCCCAGCTCATAC
ACTGTCAAAAGGATATTGCGTCTGGAGATTCCAATATATAGCTATCCTAATATTCCATTG
GAAATGAAGATCAGAGAAGGTTCTGATGAAGGTGTTCCTGTGATTGTTTCTTCACCTGGT
TCTGTAGTATTAAAAGCTTATGAAGATTCTAGCTCAAAACGTGGTGAATAGGCTCAAGGA
GCTACGTGATAATCCTTAGAATGAGATTCAGACAAAACTTAACGTTCCACACTCATCATA
GAACAAGCCATGAGAACAAGAGGCATTATAAAACCAAGTTTTGCAATTGCTGAGAGAATA
ATGTATCTACATAGAACAAAAGAATAGAGACACTCTGTTTGAACAATGTGAATGTTTCCA
TTTTATTTGCTATCATAACATTTTTTTAATC

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

CO CL6199Contig1 1113 2 2 U
GGGGTGCTAGGGTTACATGGGGTTGTATTAACCGGATACTTGGACAGCCATCACTTATCC
GAGAATCCTCCATGAGTAGATTTCCGTGGGCAGGGTCAGTGTCTCAGTTTAAGACCAAAG
TCTCTAAGTTTGGTAAAGCTGCATCTGCAAAAGGAGAAAACCCACTTGATAATGTAGTTC
TCCATCCTTCTCTAAAGAAGAGAATTGAGCATCTTGCTAGAGCCACAGCGAATACTAAGT
CGCATCAAGCGCCATTCCGCAACATGATGTTTTATGGTCCTCCTGGTACCGGTAAAACTA
TGGTGGCCAGAGAGATTGCTCGGAAGTCGGGTCTTGATTATGCTATGATGACAGGAGGAG
ATGTTGCTCCTCTGGGTGCACAGGCTGTTACGAAAATCCATGAGATTTTTGATTGGGCTA
AGAAATCAAACAAAGGTTTACTTCTTTTCATCGATGAAGCTGATGCTTTCCTATGCGAGC
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CCGGTGATCAGTCACGGGACATAGTTCTGGTCCTGGCCACAAACAGACCCGGGGATCTTG
ACAGTGCGGTCACTGACAGGATTGACGAAGTTATCGAGTTTCCGCTCCCTGGTGAAGACG
AACGCTTCAAGCTCCTTAAACTTTATCTCAATAAGTACCTAACTGGTGAAGACCAGAAAG
GTGACAAAGACACGAAGACTAGATGGAGCCATTTGTTCAAGAAGCAGTCACAAAAGATAG
TAGTTGAAGGAGACCTAACCGACCAAGTGATCAGAGAGGCTGCGAAGAAGACAGAAGGAT
TCTCTGGTCGTGGGATCGCTAAGCTCGTGGCTGGTGTTCAAGCTGCGGTGTATGGACGAC
CAGATTGCGTCTTGGATGCACAGCTTTTTGAAGAGATTGTTGATTATAAAATCCAAGAAC
ACCACCAGAGAGCCAGACTTGCGACTGAAGGTGGTCAATCTTTTGCTTAGAAGCGGGTAG
TCACTCTTTCTGTATGTTTTGTTTCTTTAGCCGCACTTCTGACTTTATTATTATAGATGA
GAGACCGATTCAATGAGATCTGGTTCAGATTTG


BQ
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AF RS1D092TF U 1
AF RS1D092JQ C 299
BS 1 712 RS1D092TF
BS 713 1113 RS1D092JQ

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GGGGTGCTAGGGTTACATGGGGTTGTATTAACCGGATACTTGGACAGCCATCACTTATCC
GAGAATCCTCCATGAGTAGATTTCCGTGGGCAGGGTCAGTGTCTCAGTTTAAGACCAAAG
TCTCTAAGTTTGGTAAAGCTGCATCTGCAAAAGGAGAAAACCCACTTGATAATGTAGTTC
TCCATCCTTCTCTAAAGAAGAGAATTGAGCATCTTGCTAGAGCCACAGCGAATACTAAGT
CGCATCAAGCGCCATTCCGCAACATGATGTTTTATGGTCCTCCTGGTACCGGTAAAACTA
TGGTGGCCAGAGAGATTGCTCGGAAGTCGGGTCTTGATTATGCTATGATGACAGGAGGAG
ATGTTGCTCCTCTGGGTGCACAGGCTGTTACGAAAATCCATGAGATTTTTGATTGGGCTA
AGAAATCAAACAAAGGTTTACTTCTTTTCATCGATGAAGCTGATGCTTTCCTATGCGAGC
GTAACAGCACGTATATGAGCGAGGCCCAGCGTAGCGCTCTGAACGCTCTACTCTTTCGAA
CCGGTGATCAGTCACGGGACATAGTTCTGGTCCTGGCCACAAACAGACCCGGGGATCTTG
ACAGTGCGGTCACTGACAGGATTGACGAAGTTATCGAGTTTCCGCTCCCTGGTGAAGACG
AACGCTTCAAGCTCCTTAAACTTTATCTCAATAAGTACCTAACTGGTGAAGA

QA 1 712 1 712
DS 

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CTAT
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GTTGCTCCTCTGGGTGCACAGGCTGTTACGAAAATCCATGAGATTTTTGATTGGGCTAAG
AAATCAAACAAAGGTTTACTTCTTTTCATCGATGAAGCTGATGCTTTCCTATGCGAGCGT
AACAGCACGTATATGAGCGAGGCCCAGCGTAGCGCTCTGAACGCTCTACTCTTTCGAACC
GGTGATCAGTCACGGGACATAGTTCTGGTCCTGGCCACAAACAGACCCGGGGATCTTGAC
AGTGCGGTCACTGACAGGATTGACGAAGTTATCGAGTTTCCGCTCCCTGGTGAAGACGAA
CGCTTCAAGCTCCTTAAACTTTATCTCAATAAGTACCTAACTGGTGAAGACCAGAAAGGT
GACAAAGACACGAAGACTAGATGGAGCCATTTGTTCAAGAAGCAGTCACAAAAGATAGTA
GTTGAAGGAGACCTAACCGACCAAGTGATCAGAGAGGCTGCGAAGAAGACAGAAGGATTC
TCTGGTCGTGGGATCGCTAAGCTCGTGGCTGGTGTTCAAGCTGCGGTGTATGGACGACCA
GATTGCGTCTTGGATGCACAGCTTTTTGAAGAGATTGTTGATTATAAAATCCAAGAACAC
CACCAGAGAGCCAGACTTGCGACTGAAGGTGGTCAATCTTTTGCTTAGAAGCGGGTAGTC
ACTCTTTCTGTATGTTTTGTTTCTTTAGCCGCACTTCTGACTTTATTATTATAGATGAGA
GACCGATTCAATGAGATCTGGTTCAGATTTG

QA 5 815 5 815
DS 



AS 1 2

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TAATGTATTAGTGGAAGATCTCTCCTCTGTTTTGCTATATCCTCTCTAATATACAACTTC
AAATTGCTAATCCCATCAACTGATGATTAACACAGCAGAACCAAAACTGAATCAAATGTC
TCAAATCTCATTTCCAAGGAACACGGATGAACTTGTTTTAGCACGGAAGCTTTCTCTTCT
CATGAAGCCAAACCAATCATACCTCAGCATCTACCTTTCATCTGCACCGAGCAGACGCCA
GTCCAATGCGAACTGAGGAACTTTCTCCTTGGTTGAAGTGAGTGAACATCATAATTTCGT
CAAACTAGAATGGAACAACATAAGGAAGAGCTACAATGTCAGCAGAGTCTATACTAAGAG
CCTTGTTCCAGACTTGCAGAGACTCATCCAATGAAGAAGTAGAATCTGTTTTTGGCTTCT
TTGACAATTTCACACCAGTCTGACCAAAAAGCCACTCTTGCTCTTCACTTTCATCAACCT
CATGCAATTCCTCCTTTTCTGGTACATTCAGTATCTGGTCCAAATACTTTAAGTCAGAGT
GAGGTCGCTTTTTCGCTGATGCTTCACCGTTTTCCTTCGCTTTCACAGAAGTTATCTTTG
GATGGCTTTTGGGGTCTTGAGACTTGATGAAACCGTTAACTCTATGCTCCTTGGCCTCTG
GATTACGCATTGCTTCTTGCAACTCAGTAACAGGTTTTAGAGGAGTTTGGCATCCTTCCA
ACTTTCTTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A448JQ U 97
AF RS1A448TF C 1
BS 1 96 RS1A448TF
BS 97 122 RS1A448JQ
BS 123 123 RS1A448TF
BS 124 317 RS1A448JQ
BS 318 791 RS1A448TF

RD RS1A448JQ 221 0 0
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TTCATCTGCACCGAGCAGACGCCAGTCCAATGCGAACTGAG

QA 1 221 1 221
DS 

RD RS1A448TF 791 0 0
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AAATTGCTAATCCCATCAACTGATGATTAACACAGCAGAACCAAAACTGAATCAAATGTC
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CATGAAGCCAAACCAATCATACCTCAGCATCTACCTTTCATCTGCACCGAGCAGACGCCA
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TTGACAATTTCACACCAGTCTGACCAAAAAGCCACTCTTGCTCTTCACTTTCATCAACCT
CATGCAATTCCTCCTTTTCTGGTACATTCAGTATCTGGTCCAAATACTTTAAGTCAGAGT
GAGGTCGCTTTTTCGCTGATGCTTCACCGTTTTCCTTCGCTTTCACAGAAGTTATCTTTG
GATGGCTTTTGGGGTCTTGAGACTTGATGAAACCGTTAACTCTATGCTCCTTGGCCTCTG
GATTACGCATTGCTTCTTGCAACTCAGTAACAGGTTTTAGAGGAGTTTGGCATCCTTCCA
ACTTTCTTCCC

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 2

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CATCCTCGAAATTCAGAAACATCAGAACGGAGTGATGGATGCTTTCTTCTCAGGGCTTTC
GTGTGTTGTCTCTGTGCCCTTTTACACTGCTTTCTTGCCTCTGCTCTTCTGGAGCGGACA
TGGTAGATTGGCTAGGCAGATGACTCTATTGATAGCATTCTGTGATTACTTGGGAAATTG
CATAAAGGATGTTGTGTCAGCTCCTCGTCCGAGCTGCCCACCTGTTAGAAGGATTACTGC
CACAAAAGATGAGGAAGATAATGCAATGGAGTATGGCTTGCCTTCTTCACATACTTTAAA
CACTGTTTGCTTATCCGGATATCTGTTGCACTATGTGTTATCCTTTTTTGAACATGAAGA
TGCGTCTATCCGATACTATGGATTTGCCCTTGCTTGTCTGTTGGTAGCCTTAATTGCCTT
TGGAAGGATTTACTTGGGTATGCACAGTGTGGTTGATATCATCGCTGGTCTTGCCATAGG
AGTCCTTACTCTCGGTCTTTGGCTTACCGTCAATGAAAAAATAGATAATTTCATTACCTC
AAATCAGAATGTTAGCTCCTTCTGGACTGCTCTGAGTTTCCTGTTGCTCTTTGCCTATCC
AACCCCCGAGAACCCAACTCCAAGCTACGAGTATCACACCGCCTTCACCGGAGTTGCTCT
AGGAATTGTGACTGGAGTTCAACAAACATACAGCCAATTCCACCATGAAGGAGCTCCACG
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GACGATACTGCTGGTGAAAGTCTGCAGCAAATCTCTTGCTAAATGGATCTTGCCAACAGT
ATCCAACACACTTGGGATTCCAATAAGATCCACCACCTACATTACCCAGCTCAAGCTCGA
CAACAAGGGATATGGAAATGAGAAGAACACAGACACAACTAAGAACTCTGCTGGGTATTC
ACAGAAACTGTGCGAGTTCCTGAATCAGGACTCGTTTGATATTGACACCGGTATAAGGTT
CTTGCAATACGCAGGCCTTGCTTGGTCTGTTGTTGATCTTGTTCCTTCCCTATTCTCTTA
CTTTAACTTGTAGTAACAGTTTCTTGCCTGGTGTTATATAATCTTAGTATGCCACTG


BQ
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AF RS1BP07TF U 1
AF RS1BP07JQ C 485
BS 1 724 RS1BP07TF
BS 725 725 RS1BP07JQ
BS 726 741 RS1BP07TF
BS 742 1197 RS1BP07JQ

RD RS1BP07TF 752 0 0
GAAGTTTAGATCTCTTGTTCAACCATGGGTCGCTCGTCAAGTCGTCGGTGGCGTTCCCCT
CATCCTCGAAATTCAGAAACATCAGAACGGAGTGATGGATGCTTTCTTCTCAGGGCTTTC
GTGTGTTGTCTCTGTGCCCTTTTACACTGCTTTCTTGCCTCTGCTCTTCTGGAGCGGACA
TGGTAGATTGGCTAGGCAGATGACTCTATTGATAGCATTCTGTGATTACTTGGGAAATTG
CATAAAGGATGTTGTGTCAGCTCCTCGTCCGAGCTGCCCACCTGTTAGAAGGATTACTGC
CACAAAAGATGAGGAAGATAATGCAATGGAGTATGGCTTGCCTTCTTCACATACTTTAAA
CACTGTTTGCTTATCCGGATATCTGTTGCACTATGTGTTATCCTTTTTTGAACATGAAGA
TGCGTCTATCCGATACTATGGATTTGCCCTTGCTTGTCTGTTGGTAGCCTTAATTGCCTT
TGGAAGGATTTACTTGGGTATGCACAGTGTGGTTGATATCATCGCTGGTCTTGCCATAGG
AGTCCTTACTCTCGGTCTTTGGCTTACCGTCAATGAAAAAATAGATAATTTCATTACCTC
AAATCAGAATGTTAGCTCCTTCTGGACTGCTCTGAGTTTCCTGTTGCTCTTTGCCTATCC
AACCCCCGAGAACCCAACTCCAAGCTACGAGTATCACACCGCCTTCACCGGAGTTGCTCT
AGGA*TTGTGACTGGAGTTCA
CAACATACAGC

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1BP07JQ 713 0 0
AGGATTTACTTGGGTATGCACAGTGTGGTTGATATCATCGCTGGTCTTGCCATAGGAGTC
CTTACTCTCGGTCTTTGGCTTACCGTCAATGAAAAAATAGATAATTTCATTACCTCAAAT
CAGAATGTTAGCTCCTTCTGGACTGCTCTGAGTTTCCTGTTGCTCTTTGCCTATCCAACC
CCCGAGAACCCAACTCCAAGCTACGAGTATCACACCGCCTTCACCGGAGTTGCTCTAGGA
ATTGTGACTGGAGTTCAACAAACATACAGCCAATTCCACCATGAAGGAGCTCCACGAATC
TTCTCACCAGAGCTTCCTGTTACAGCCTACCTTGGGAGAGTCATGGTGGGGATACCGACG
ATACTGCTGGTGAAAGTCTGCAGCAAATCTCTTGCTAAATGGATCTTGCCAACAGTATCC
AACACACTTGGGATTCCAATAAGATCCACCACCTACATTACCCAGCTCAAGCTCGACAAC
AAGGGATATGGAAATGAGAAGAACACAGACACAACTAAGAACTCTGCTGGGTATTCACAG
AAACTGTGCGAGTTCCTGAATCAGGACTCGTTTGATATTGACACCGGTATAAGGTTCTTG
CAATACGCAGGCCTTGCTTGGTCTGTTGTTGATCTTGTTCCTTCCCTATTCTCTTACTTT
AACTTGTAGTAACAGTTTCTTGCCTGGTGTTATATAATCTTAGTATGCCACTG

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

CO CL6202Contig1 691 2 2 U
GAACCTGGAGCGTCACAAACCTCACTCCAACTGGCTCTTGACTATGCATGCGGGTTAGGT
GGAGCTGATTGCTCTCAGATACAGCAAGGAGGCAACTGTTATTCGCCTATCAGTCTCCAG
AACCATGCCTCGTTTGCCTTCAACAGCTATTACCAGAAGAATCCATCTCCACAAAGCTGT
GATTTTGGCGGTGCAGCCTCCGTTGTAAACACCAACCCAAGCACTGGTTCTTGCGTTTAC
CAGACTGGCTCATCAACGCCAACTCCATCAACACAAACAGTGAACCAGCCTCCTGTCACA
TCAACACCAATAATACCAACAGGAGGCGGGATAATCGGGGTTGGAACTCCACCAGCAGTT
TTTAACCCGGCGAATCCTTTACCAAACACTATGAACAATCCATTATCAGGAGGTCCTCCC
GCGGTTTACGGGTTTGATGGTTCGCCTAGTGGGAACAATCCAACATTATCAGACTCTACC
TACTTGCAGCTTCACTTTGGTCACACTGTGGTAGTGACAATGATTCTTCACGCAGTGCTG
TTTCATTAGAAAGTAGAATTATATAGGAGTTGAATTAGTTTTATGAGATAGTGTTCAACA
AGCTTAAGCTCTTAGAGTATCTTACGAAGAAGCTAGGGATGTAAGACATTATAAATTTGT
TTGATTCAACGCTCATGTTTCGGTTTTGTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1H083TF U 1
AF RS1H083JQB C 255
BS 1 668 RS1H083TF
BS 669 691 RS1H083JQB

RD RS1H083TF 668 0 0
GAACCTGGAGCGTCACAAACCTCACTCCAACTGGCTCTTGACTATGCATGCGGGTTAGGT
GGAGCTGATTGCTCTCAGATACAGCAAGGAGGCAACTGTTATTCGCCTATCAGTCTCCAG
AACCATGCCTCGTTTGCCTTCAACAGCTATTACCAGAAGAATCCATCTCCACAAAGCTGT
GATTTTGGCGGTGCAGCCTCCGTTGTAAACACCAACCCAAGCACTGGTTCTTGCGTTTAC
CAGACTGGCTCATCAACGCCAACTCCATCAACACAAACAGTGAACCAGCCTCCTGTCACA
TCAACACCAATAATACCAACAGGAGGCGGGATAATCGGGGTTGGAACTCCACCAGCAGTT
TTTAACCCGGCGAATCCTTTACCAAACACTATGAACAATCCATTATCAGGAGGTCCTCCC
GCGGTTTACGGGTTTGATGGTTCGCCTAGTGGGAACAATCCAACATTATCAGACTCTACC
TACTTGCAGCTTCACTTTGGTCACACTGTGGTAGTGACAATGATTCTTCACGCAGTGCTG
TTTCATTAGAAAGTAGAATTATATAGGAGTTGAATTAGTTTTATGAGATAGTGTTCAACA
AGCTTAAGCTCTTAGAGTATCTTACGAAGAAGCTAGGGATGTAAGACATTATAAATTTGT
TTGATTCA

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1H083JQB 437 0 0
AACGCCAACTCCATCAACACAAACAGTGAACCAGCCTCCTGTCACATCAACACCAATAAT
ACCAACAGGAGGCGGGATAATCGGGGTTGGAACTCCACCAGCAGTTTTTAACCCGGGGAA
TCCTTTACCAAACACTATGAACAATCCATTATCAGGAGGTCCTCCCGCGGTTTACGGGTT
TGATGGTTCGCCTAGTGGGAACAATCCAACATTATCAGACTCTACCTACTTGCAGCTTCA
CTTTGGTCACACTGTGGTAGTGACAATGATTCTTCACGCAGTGCTGTTTCATTAGAAAGT
AGAATTATATAGGAGTTGAATTAGTTTTATGAGATAGTGTTCAACAAGCTTAAGCTCTTA
GAGTATCTTACGAAGAAGCTAGGGATGTAAGACATTATAAATTTGTTTGATTCAACGCTC
ATGTTTCGGTTTTGTAC

QA 1 437 1 437
DS 



AS 1 2

CO CL6203Contig1 870 2 2 U
GGTGGCTCTTTTCGACTTTTCTTATCGCGATGATGATGATGATGATCGGGAGTAGTAATA
GAGCATTTCTGATGTCTTCCACGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGAGGAATACACGGAAAG
GAGACTTGTTCAATCTGAATCCGAACAGCAGCATCGGGAATAAGAAGCATGATCGGGCTT
CGGTTTCTTACGCTCCGAAAAGGAAGCTCCCGGTTCTCCTCTTCGACGTGATGGACACCA
TCGTCCGTGATCCATTCTACCAAGATATTCCAGCCTTCTTCGGAATGCCGATGAGGGAGC
TACTCGAGTGCAAGCATCCCACCGCCTGGATCGAATTCGAAAAGGGGTTGATCGATGAGG
AGGAGCTATCAAGAAAGTTCTTCATTGATAAGAGGGACTTTGATTTCGAAGGGCTGAAGG
ATTGCATTAGATCAGGATACTCTTACTTAGATGGAATGCAAGAGCTTCTCCAAACTTTGA
GTGCTGACAACTTCGAAATTCATGCTTTCACCAACTACCCCATCTGGTATAAAATGATCG
AAGACAAGTTGAAGCTTTCAGCCTACTTGTCATGGACTTTTTGTTCCTGTTATACAGGAA
AGAGAAAGCCTGATCCTGAGTTCTATCTCGAGGTTGTGCAACATCTCGGTGTTGAACCTT
GCGACTGTGTATTTATTGATGACAGGCCAAGCAACGTCAAGTGTGCAGTAGAGATTGGGA
TGCGTGGGTTAGTTTTTGAGAATGCAGATTCCCTCCTCAAGGATCTCTCACATCTAGGGA
TCAACGTCTCTCTACCCAATATTTGATTACGTGTGTCTTGGATGTAATTTGTAAAAATAC
ACTCGGAAAGAACAATACATTGGTTTCGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GI53TF U 1
AF RS1GI53JQ C 141
BS 1 550 RS1GI53TF
BS 551 870 RS1GI53JQ

RD RS1GI53TF 550 0 0
GGTGGCTCTTTTCGACTTTTCTTATCGCGATGATGATGATGATGATCGGGAGTAGTAATA
GAGCATTTCTGATGTCTTCCACGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGAGGAATACACGGAAAG
GAGACTTGTTCAATCTGAATCCGAACAGCAGCATCGGGAATAAGAAGCATGATCGGGCTT
CGGTTTCTTACGCTCCGAAAAGGAAGCTCCCGGTTCTCCTCTTCGACGTGATGGACACCA
TCGTCCGTGATCCATTCTACCAAGATATTCCAGCCTTCTTCGGAATGCCGATGAGGGAGC
TACTCGAGTGCAAGCATCCCACCGCCTGGATCGAATTCGAAAAGGGGTTGATCGATGAGG
AGGAGCTATCAAGAAAGTTCTTCATTGATAAGAGGGACTTTGATTTCGAAGGGCTGAAGG
ATTGCATTAGATCAGGATACTCTTACTTAGATGGAATGCAAGAGCTTCTCCAAACTTTGA
GTGCTGACAACTTCGAAATTCATGCTTTCACCAACTACCCCATCTGGTATAAAATGATCG
AAGACAAGTT

QA 1 550 1 550
DS 

RD RS1GI53JQ 730 0 0
CCGAACAGCAGCATCGGGAATAAGAAGCATGATCGGGCTTCGGTTTCTTACGCTCCGAAA
AGGAAGCTCCCGGTTCTCCTCTTCGACGTGATGGACACCATCGTCCGTGATCCATTCTAC
CAAGATATTCCAGCCTTCTTCGGAATGCCGATGAGGGAGCTACTCGAGTGCAAGCATCCC
ACCGCCTGGATCGAATTCGAAAAGGGGTTGATCGATGAGGAGGAGCTATCAAGAAAGTTC
TTCATTGATAAGAGGGACTTTGATTTCGAAGGGCTGAAGGATTGCATTAGATCAGGATAC
TCTTACTTAGATGGAATGCAAGAGCTTCTCCAAACTTTGAGTGCTGACAACTTCGAAATT
CATGCTTTCACCAACTACCCCATCTGGTATAAAATGATCGAAGACAAGTTGAAGCTTTCA
GCCTACTTGTCATGGACTTTTTGTTCCTGTTATACAGGAAAGAGAAAGCCTGATCCTGAG
TTCTATCTCGAGGTTGTGCAACATCTCGGTGTTGAACCTTGCGACTGTGTATTTATTGAT
GACAGGCCAAGCAACGTCAAGTGTGCAGTAGAGATTGGGATGCGTGGGTTAGTTTTTGAG
AATGCAGATTCCCTCCTCAAGGATCTCTCACATCTAGGGATCAACGTCTCTCTACCCAAT
ATTTGATTACGTGTGTCTTGGATGTAATTTGTAAAAATACACTCGGAAAGAACAATACAT
TGGTTTCGGG

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL6204Contig1 954 2 2 U
GGATTCATCATCGACACCGAACCTTAAAAACGCTCACGAGAAATCTCCGATCGGCTACGT
TCTGGTGAGAGATCCTCTCAAACGATTTGATTTTAGAAGGGAAGCAAAAGTTAGGTGAGG
ATTGGAGAAAGATGTCACAAGGATGGTTTTCGATGAGCAGCGGAGATCAGCAGCAGCAGC
AGAAGGAGCTGCAATCGGGATCGTCTCTGCTCGCGGATTGGAATTCTTACGCAGCCTCCA
GAGATGTCGAAGAAGGCGGCGGAAGCTTCGGTTTCGATATCGAATCCGCCGTTAGATCTG
CCAACGACACTGTTTCAGGCACCTTCAGTGTGGTTTCAAAGGGAGTTAGAGATATTCCGG
GGAGCCTGTCGTCAGCAACCAGCAGTATGCCTTCAGGGAAAGCTCTCATGTACTTCGGTT
TACTCCTCGCAAGCGGTGTATTCTTCATCTTCATTGCCTTCACTATGTTTCTTCCGGTCA
TGGTCCTTATGCCTCAGAAGTTTGCTATTTGTTTCACCCTTGGATGTGGTTTTATCATCG
GTTCTTTCTTCGCTCTTCGTGGCCCACAAAATCAGCTCGCACACATGACATCCATGGAGA
TACTTCCTTTAACCATAGGTTTCATTGCCACCATGGTTGGCACCATTTACGTGTCAATGG
TTCTCCACAGCTACATTCTCTCCGTGCTCTTCTCTGTCTTACAGGTGCTTGCGTTAGTTT
ACTACTGTATATCATACTTCCCTGGTGGATCATCAGGCATGAAATTCCTCGGTTCTGCTC
TTACCTCATCTGTTCTAAGAGTTTTTGGGAGATGAGCTTCCGTGGCCAATCTGGAAGAAA
GGACAGCACTGGTGTATACAGAGAGAATGTCAGAGCTTTTTTCGTGTTCTAGTTAACATA
GATTTGATGAAAATGTTTGTAAAGACAAAACTGTTCTGAAAACTATCTTGAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E596TF U 1
AF RS1E596JQ C 152
BS 1 561 RS1E596TF
BS 562 954 RS1E596JQ

RD RS1E596TF 561 0 0
GGATTCATCATCGACACCGAACCTTAAAAACGCTCACGAGAAATCTCCGATCGGCTACGT
TCTGGTGAGAGATCCTCTCAAACGATTTGATTTTAGAAGGGAAGCAAAAGTTAGGTGAGG
ATTGGAGAAAGATGTCACAAGGATGGTTTTCGATGAGCAGCGGAGATCAGCAGCAGCAGC
AGAAGGAGCTGCAATCGGGATCGTCTCTGCTCGCGGATTGGAATTCTTACGCAGCCTCCA
GAGATGTCGAAGAAGGCGGCGGAAGCTTCGGTTTCGATATCGAATCCGCCGTTAGATCTG
CCAACGACACTGTTTCAGGCACCTTCAGTGTGGTTTCAAAGGGAGTTAGAGATATTCCGG
GGAGCCTGTCGTCAGCAACCAGCAGTATGCCTTCAGGGAAAGCTCTCATGTACTTCGGTT
TACTCCTCGCAAGCGGTGTATTCTTCATCTTCATTGCCTTCACTATGTTTCTTCCGGTCA
TGGTCCTTATGCCTCAGAAGTTTGCTATTTGTTTCACCCTTGGATGTGGTTTTATCATCG
GTTCTTTCTTCGCTCTTCGTG

QA 1 561 1 561
DS 

RD RS1E596JQ 803 0 0
GATGAGCAGCGGAGATCAGCAGCAGCAGCAGAAGGAGCTGCAATCGGGATCGTCTCTGCT
CGCGGATTGGAATTCTTACGCAGCCTCCAGAGATGTCGAAGAAGGCGGCGGAAGCTTCGG
TTTCGATATCGAATCCGCCGTTAGATCTGCCAACGACACTGTTTCAGGCACCTTCAGTGT
GGTTTCAAAGGGAGTTAGAGATATTCCGGGGAGCCTGTCGTCAGCAACCAGCAGTATGCC
TTCAGGGAAAGCTCTCATGTACTTCGGTTTACTCCTCGCAAGCGGTGTATTCTTCATCTT
CATTGCCTTCACTATGTTTCTTCCGGTCATGGTCCTTATGCCTCAGAAGTTTGCTATTTG
TTTCACCCTTGGATGTGGTTTTATCATCGGTTCTTTCTTCGCTCTTCGTGGCCCACAAAA
TCAGCTCGCACACATGACATCCATGGAGATACTTCCTTTAACCATAGGTTTCATTGCCAC
CATGGTTGGCACCATTTACGTGTCAATGGTTCTCCACAGCTACATTCTCTCCGTGCTCTT
CTCTGTCTTACAGGTGCTTGCGTTAGTTTACTACTGTATATCATACTTCCCTGGTGGATC
ATCAGGCATGAAATTCCTCGGTTCTGCTCTTACCTCATCTGTTCTAAGAGTTTTTGGGAG
ATGAGCTTCCGTGGCCAATCTGGAAGAAAGGACAGCACTGGTGTATACAGAGAGAATGTC
AGAGCTTTTTTCGTGTTCTAGTTAACATAGATTTGATGAAAATGTTTGTAAAGACAAAAC
TGTTCTGAAAACTATCTTGAAGT

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

CO CL6205Contig1 775 2 7 U
CAACATTCTTTTAAAATTCGTTGCTTCTGTATCAAAAATCCTTTTTGCTTTCTCCTTAAC
ATGACATGCATGTGAATGTGATGACGTGAAACTGTAGTGTTTCCATATTAAATTCCACTT
TTTCAGGAAAAGAAGATGAACACAACTAAATATGAAAAATATCCCAATCGGAATGCAAAA
CTACTTGAAAGAAACAAGACAGATGATGCAGAGAGAGATTAGGCGTAGTAATTCAAGCTT
GCTTTCTTCTTGGCCTGGACTTGGATGATACCTTCATTAAAGTCCTCATGGTTCACCTCT
GAGGCATCACGACGAAAAGCCAACATGCCAGCCTCCACACAAACTGCTTTCAGTTGAGCA
CCATTGAAATCGTCTGTTGATCTTGCAAGCTCCTCAAAGTTGACGTCCGGGTGGACATTC
ATCTTCCTCGAGTGAATCTGCAAGATTCTGGCTCTTGCTTCTTCTGTAAGATGTGGGAAC
TCAATCTTCCTGTCCAGTCGACCAGAACGCATCAGTGCTGGGTCTAGAATATCTGCACGG
TTAGTGGCTGCAATCACCTTAATACGCTCATCGCTACTGAATCCATCAAGCTGATTAAGC
AGCTCCAACATAGTCCTCTGCACTTCCCTGTCTCCACTTACTTCACTGTCAAAACGCTTT
GTACCAATTGCATCGATTTCATCAATGAAGATGATGCATGGAGCTTTCTCTTTCGCTAGT
TGAAAGGCATCACGGACAAGTTTTGCTCCATCTCCAATGAACATCTGGACCAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1A112JQ U 242
AF RS1A112TR U 1
BS 1 335 RS1A112TR
BS 336 336 RS1A112JQ
BS 337 468 RS1A112TR
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BS 495 495 RS1A112JQ
BS 496 775 RS1A112TR

RD RS1A112JQ 272 0 0
CTTTCTTCTTGGCCTGGACTTGGATGATACCTTCATTAAAGTCCTCATGGTTCACCTCTG
AGGCATCACGACGAAGAGCCAACATGCCAGCCTCCACACAAACTGCTTTCAGTTGAGCAC
CATTGAAATCGTCTGTTGATCTTGCAAGCTCCTCAAAGTTGACGTCCGGGTGGACATTCA
TCTTCCTCGAGTGAATCTGCAAGATTCTGGCTCTTGCTTCTTCTGTAAGATGTGGGAACT
CAATCTTCCTGTCCAGTCGACCAGAACGCATC

QA 1 272 1 272
DS 

RD RS1A112TR 775 0 0
CAACATTCTTTTAAAATTCGTTGCTTCTGTATCAAAAATCCTTTTTGCTTTCTCCTTAAC
ATGACATGCATGTGAATGTGATGACGTGAAACTGTAGTGTTTCCATATTAAATTCCACTT
TTTCAGGAAAAGAAGATGAACACAACTAAATATGAAAAATATCCCAATCGGAATGCAAAA
CTACTTGAAAGAAACAAGACAGATGATGCAGAGAGAGATTAGGCGTAGTAATTCAAGCTT
GCTTTCTTCTTGGCCTGGACTTGGATGATACCTTCATTAAAGTCCTCATGGTTCACCTCT
GAGGCATCACGACGAAAAGCCAACATGCCAGCCTCTACACAAACTGCTTTCAGTTGAGCA
CCATTGAAATCGTCTGTTGATCTTGCAAGCTCCTCAAAGTTGACGTCCGGGTGGACATTC
ATCTTCCTCGAGTGAATCTGCAAGATTCTGGCTCTTGCTTCTTCTGTAGGATGTGGGAAC
TCAATCTTCCTGTCTAGTCGACCAGAACGCATCAGTGCTGGGTCTAGAATATCTGCACGG
TTAGTGGCTGCAATCACCTTAATACGCTCATCGCTACTGAATCCATCAAGCTGATTAAGC
AGCTCCAACATAGTCCTCTGCACTTCCCTGTCTCCACTTACTTCACTGTCAAAACGCTTT
GTACCAATTGCATCGATTTCATCAATGAAGATGATGCATGGAGCTTTCTCTTTCGCTAGT
TGAAAGGCATCACGGACAAGTTTTGCTCCATCTCCAATGAACATCTGGACCAATT

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

CO CL6206Contig1 1181 2 2 U
GGACCATTCGTCTGTCACAACTACCACCACCCCCTTCCTTTCTCCATTTGCTTTGTCTCC
GAGACACGATTCGATCTTCCTCCGTCAAAAAAGTAGCAAACCCATAACGAAAGTCTCGAA
CTTTCGTATTAGATCCAACATCGTTTTTGATTCTTCGATTCATTTCCCTCCCTTAGGGTT
TATTGAATGGGTTCTGGGCTCTCTCTCTTTACCAATGGCTCATCATCGTCTTCTCCGCCG
TCTCGTGAACGAGATCTGTTAAAGCCCGGTCTCGGTGATCTGCCCGAAAGCTGCGTGGCG
TTGATCCTCGAGAAGCTGGATCCGGTCGAGATCTGCAGGTTCTCGAAGCTGAACGGAGCG
TTTCGCAGCGCCTCCTGGGCCGATTTCGTCTGGGAATCGAAGCTTCCTCATGATTACAGG
TCGATTCTCGAGAAAATCCTCGGTGGGTTCCCGGAAAAGCTGCGTAAAAGAGACATCTAT
AACTTTCTCTCTCGCGTTAATTCCTTCGACGACGGCACAAAGAAAGCTTGGGTTGATAAA
CGAACCAGTGATCTCTGTTTATGCATATCGGTTAAGGGTTTGTCGGTAACCGGGATTGAT
GATCGGAGATACTGGAATCACATTCCTTCTGATGAATCTCGATTTGCTTCAGTAGCATAT
CTTCAGCAAGTCTGGTGGTTTCAAGTTGATGGAGAAATCGAGTTCCCGTTCCCAGCAGGA
ACCTACAGCGTCTTCTTCAGGCTTCATCTAGGCAAACCGGGAAAACGGTTTGGTTGGAGG
GTTTGCAATAACGAGCAGATTCATGGTTGGGACATTAACCCGGTTCAGTTTCAGATTTGG
ACTGAAGATGGTCAGCACTTTTCGTCTCAGTGCATGTTAACCGAACCAGGGACATGGAGT
CATTACCATGCTGGAGACTTTGTGGTTGGGAAGTCGAAAAGCTCGTTTACGAAGCTTAGG
TTCTCCATGACTCAGATTGATTGTACACATACCAAAGGAGGGTTATGTGTAGACTCTGTA
TTTGTGTATCCGAGCTCGTGTAAGGATCGGTTGAGACGGTTTTAAAAGTCTTTAAACCGA
AGTTTGGTGTTGTTTAGAGGTTGTAAAAGCTATATTTTTAATTAGCTTTTTTTACCTTTT
TGTAGAAATATTTGTGTGGTGATGAAAAAAAAACTACATTT


BQ
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CGAACCAGTGATCTCTGTTTATGCATATCGGTTAAGGGTTTGTCGGTAACCGGGATTGAT
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TAACCCGGTTCAGTTTCAGATTTGGACTGAAGATGGTCAGCACTTTTCGTCTCAGTGCAT
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ACATTT

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

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CAACAAGACAACCTCGAGACTCAGGTACCTCATTAACCGGCTTGTGACTTCTCTGCTCCA
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TCCTTTTACTGTACTTATCGGAGAACATTCTCATTGTATGAGTCTGGCAAGTTTATGTGA
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TGTTTCACACAATTCATTGATTCATATCT


BQ
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DS 

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TAGCTGAGAGAGAAGGTATATCTCTAGGCATTGGTTACCTCAGTCATATAAAGATCGTGG
ATAATCGAGGAGGCGAAGATTCGAGTTCTTGGAAACCAGATGGAAGAAACAGCAACGGTT
TCATCAGAGTTGAGGTTGTCACTGCTTCACTTGGGTTCTTGACGAACTTTGAAGATGTTT
ACAGATTATGGAGTTTCGTGGCGAAGTTCTTGAGTCCGGGTTTTGCTAAACAGGGGACAC
TCCCAACAGTTGTTGAAGAAGATGACTCTTCAGAAACTTAGAAGAAGAAGAAATTGAGCA
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ATTGTATGAGTCTGGCAAGTTTATGTGAACAGAGACGATCTCAGACAAGTTTACTGCATA
TTGTAACTGTTCATTTATTTTGTGTCTTTGTTTCACACAATTCATTGATTCATATCT

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 2

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ACGAAGTTATCGCCTTGGCTGAAATGAGTGTGAGAAACCATACCGAGAGGAGGAAGCTAG
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GCGGTCGCGACGGTCGTTTCTACGTAGTCACTGACCCAAGAGACGACAACCCGGTTAACC
CTAGACCGGGAACACTACGTCACGCCGTGGTCCAAGACCGACCACTATGGATCGTCTTCA
AACGTGATATGGTGATTCAGTTAAAACAAGAGCTAATCGTAAACAGTTTCAAAACGATCG
ACGGACGTGGCGCAAATGTCCACATCGCTAATGGCGGTTGCATCACGATTCAGTACGTGA
CGAACGTCATTGTCCATGGATTGCATATTCATGACTGTAGACCAACCGGTAACGCTATGG
TTAGAAGCTCAGAGACGCACTTTGGGTGGAGAACAATGGCTGATGGTGATGCCATTTCCA
TCTTTGGCTCGAGTCATGTTTGGATTGATCACAACTCGTTGTCTCATTGCGCTGATGGGC
TTGTGGATGCAATTATGGGCTCGACCGCGATTACAATCTCTAACAACCACATGACTCACC
ACAACGAGGTTATGTTGCTCGGACATAGTGATTCTTACACGAGGGACAAGGCTATGCAAG
TTACCATTGCTTATAACCATTTTGGGGTCGGACTTATTCAAAGAATGCCGAGGTGTCGGC
ACGGGTACTTCCATGTCGTGAACAACGACTATACTCACTGGGAAATGTATGCGATCGGTG
GAAGTGCAAACCCAACAATCAACAGTCAAGGAAACCGCTATGCCGCCCCTAAAAATCCTT
TTGCTAAAGAGGTAACGAAGAGAGTGAACACACCGACGGGTCATTGGAAAGGATGGAATT
GGAGAACCGAAGGAGATTTGCTACAGAACGGAGCTTACTTCACCGCTTCAGGAGTCGCTG
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CAATTACTTCGGACGCCGGAGCTCTACCATGCCGTAGAGGACGTCAATGTACCTCATAGT
TGTTTTTAACCTCCTCCCAACACCATAACCACCAAAATGCATAACCATCTTCTATTATAT
TTAGACAAAAGTGTACATCTTCACACATTTGTCATTTAAGAGGGCAATTATCTTTAG


BQ
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AF RS1EM94TF U 1
AF RS1EM94JQ C 679
BS 1 755 RS1EM94TF
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GTCTACTCTTCTTCGTTGGAGCAATGGAGAACAGTACACACGACAAGATCTCATCTCTCT
CCAGATCGGAAGAAATCGAATGGAACAAGCACGCAGTGACGAATCCAGATGAAGTAGCTG
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GGCACAAGAACCGCAAACGTCTAGCAGACTGTGGTATCGGATTTGGAAGAAATGCGATTG
GCGGTCGCGACGGTCGTTTCTACGTAGTCACTGACCCAAGAGACGACAACCCGGTTAACC
CTAGACCGGGAACACTACGTCACGCCGTGGTCCAAGACCGACCACTATGGATCGTCTTCA
AACGTGATATGGTGATTCAGTTAAAACAAGAGCTAATCGTAAACAGTTTCAAAACGATCG
ACGGACGTGGCGCAAATGTCCACATCGCTAATGGCGGTTGCATCACGATTCAGTACGTGA
CGAACGTCATTGTCCATGGATTGCATATTCATGACTGTAGACCAACCGGTAACGCTATGG
TTAGAAGCTCAGAGACGCACTTTGGGTGGAGAACA*TGGCTGATG

QA 1 765 1 765
DS 

RD RS1EM94JQ 819 0 0
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TTTGGATTGATCACAACTCGTTGTCTCATTGCGCTGATGGGCTTGTGGATGCAATTATGG
GCTCGACCGCGATTACAATCTCTAACAACCACATGACTCACCACAACGAGGTTATGTTGC
TCGGACATAGTGATTCTTACACGAGGGACAAGGCTATGCAAGTTACCATTGCTTATAACC
ATTTTGGGGTCGGACTTATTCAAAGAATGCCGAGGTGTCGGCACGGGTACTTCCATGTCG
TGAACAACGACTATACTCACTGGGAAATGTATGCGATCGGTGGAAGTGCAAACCCAACAA
TCAACAGTCAAGGAAACCGCTATGCCGCCCCTAAAAATCCTTTTGCTAAAGAGGTAACGA
AGAGAGTGAACACACCGACGGGTCATTGGAAAGGATGGAATTGGAGAACCGAAGGAGATT
TGCTACAGAACGGAGCTTACTTCACCGCTTCAGGAGTCGCTGCATTTGGTAGCTACGCAC
GTGCCTCTAGCCTCGCCGCTAAATTTTCTTCATTGGTCGATACAATTACTTCGGACGCCG
GAGCTCTACCATGCCGTAGAGGACGTCAATGTACCTCATAGTTGTTTTTAACCTCCTCCC
AACACCATAACCACCAAAATGCATAACCATCTTCTATTATATTTAGACAAAAGTGTACAT
CTTCACACATTTGTCATTTAAGAGGGCAATTATCTTTAG

QA 1 819 1 819
DS 



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GCTGTTGGTCATGGAGATATGCCGATTATAGTAGGAGAAGTTGGCTGGCCAACAGAGGGT
GACAAACACGCTAACACCCGGCGATGCTTATAGGTTCTACAACGGGTTGTTACCGAGGCT
AGGAACAAACAAAGGCACTCCGCTTAGACCGACCTACATCGAGGTGTACCTGTTCGGGTT
ACTAGACGAGGACGCTAAAAGCATAGCGCCAGGAGCGTTCGAGCGCCACTGGGGACTGTT
CAGATTTGACGGTCAGCCGAATTTCCCTCTAGACCTCTCTGGACAAGGACAGAACACGCT
GCTGGTCGGTGCGCGGAACTTGACGTATCTACCGAACAAGTGGTGCGAGTTTAATCCGGA
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TACCGCGCTTGGTTACGGGTCTTCTTGCAATGGTCTGGATGCGAACGGGAATGCTTCGTA
TGCGTTTAACATGTATTTTCAGGTGAAGAACCAGGATGAGATGGCTTGTGTGTTCCAAGG
TTTGGCCAGAGTTACAGATAAGAATATATCTCAGGGACAGTGTGAGTTCCCTGTTCAGAT
TGTTGCTTCTTCGTCTTCTTCTTCTTCTTCTGTGTCTCTTTTTGTTTGGTTGATCATCGC
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GGTCTTTGTGATAATATGTTGGATTTTTTTTTGAGTAACTATCATTTTTAGATTTTCC


BQ
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TGCGTTTAACATGTATTTT

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DS 

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GCGTTTAACATGTATTTTCAGGTGAAGAACCAGGATGAGATGGCTTGTGTGTTCCAAGGT
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QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 2

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TCGTAAGATATGGTCCTTTTTATATACACTTACTTCCATGCTTTTCCAGTTGTTAATGCA
ATGAAACACAAGTAATTACAAGTTTCAAACTCGTTAGAGAGCTTCTTATGTGTTTAAGTA
TTGCCGTATTAGAATAGCTCTCTAAAACAACTTCTGCATTCACTGCAAACTGTTCTTTTG
TGAGTAATTATTTTCAATCTCCTACAAGAATT


BQ
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AF RS1ES42TF U 1
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ACCACGTCAGAGACGCTTCTTCTGACCCCTCCCTTTTAAGTTCTCGCCGGAGATGAATAT
TCGTAAGATATGGTCCTTTTTATATACACTTACTTCCATGCTTTTCCAGTTGTTAATGCA
ATGAAACACAAGTAATTACAAGTTTCAAACTCGTTAGAGAGCTTCTTATGTGTTTAAGTA
TTGCCGTATTAGAATAGCTCTCTAAAACAACTTCTGCATTCACTGCAAACTGTTCTTTTG
TGAGTAATTATTTTCAATCTCCTACAAGAATT

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DS 

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TTT
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GGTTTCTTTTTGATGATCGGATTTGGTATCTTTGCTATTATCGCTTCTGTCCTTTGCTCC
GTCGTTTTCATCCACCACGTCAGAGACGCTTTTTTTGACCCCTCCCTTTTAAGTTCTCGC
CGGAGATGAATATTCGTAAGATATGGTCCTTTTTATATACACTTACTTCCATGCTTTTCC
AGTTGTTAATGCAATGAAACACAAGTAATTACAAGTTTCAAACTCGTTAGAGAGCTTTTT
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QA 4 468 4 468
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CTTTGTTTTCTTCTTCTTTGATTCACACTTGTAGTGGTAGTATGTGGACTTCTTATTTTC
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ATTAATATTGGTTGGTGGC


BQ
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AF RS1GW45TF U 1
AF RS1GW45JQ C 380
BS 1 632 RS1GW45TF
BS 633 739 RS1GW45JQ

RD RS1GW45TF 632 0 0
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TTTCACAAGCACTGCTCTGTTTCTCGCGACGGCTCGCCAGTTCTATGGGAACCAAACCTC
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AATGAAGAAACAGAGGAGTAAGAAGAAGAAAGTTAGATTCGCGGAGAATGTGAAAGATAC
TAAAGGGAACGGTAACGAGTACCGGAGGAGGATGACAATGAGTGGGAGAAACGTACCGGA
GCCAGTGACTAAACCGGGGAAGACCGGTTCAATTTGTGGAATATCCACTATGCCAGCGAA
CCGGATGGCTCTGTACCATGGGATTCTCAGAGACCGAGATCACAGAACTCAATGTTCGTA
TTGACTTTTTTTCTGGACCAAACAAGTCAATAGATTTAGGTTTGCAGATTGTGTAGTAGG
CTTTGTTTTCTTCTTCTTTGATTCACACTTGT

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1GW45JQ 360 0 0
TACCGGAGGAGGATGACAATGAGTGGGAGAAACGTACCGGAGCCAGTGACTAACCCGGGG
AAGACCGGTTCAATTTGTGGAATATCCACTATGCCAGCGAACCGGATGGCTCTGTACCAT
GGGATTTTCAGAGACCGAGATCACAGAACTCAATGTTCGTATTGACTTTTTTTTTGGACC
AAACAAGTCAATAGATTTAGGTTTGCAGATTGTGTAGTAGGCTTTGTTTTCTTCTTCTTT
GATTCACACTTGTAGTGGTAGTATGTGGACTTCTTATTTTCTGCTTTTTTCTAATTACTT
GTTATAAAATCAAAGTGACCATGTAAATAAGTAACTATAGAATTAATATTGGTTGGTGGC

QA 1 360 1 360
DS 



AS 1 2

CO CL6213Contig1 1050 2 8 U
CAGTTTTCATCACCACCATCTTCTTCACTTTCCTTCCCCAACACAGTACATAGTCTTGCG
GACGTGACTCCAGCGAGTCCCATAAAAACATCTGTATCAGGCACATCTTTTAGTCTCAAG
GAAAGATGTGCTGCAGTGGACACTGTTTCTCTTGTGGCTCGTATACTGCATAAATCAAAA
GCTCATCTCCAGTCTATGCTTATGTCAAGAAATGGCTCTCTGGTTGAAGACTTCTTTGGT
CAACTGGTTGGTTCCGTACCTGAACTAACAGAGCATTTACATAGGACAACTGCAAGGATA
CTGCTGCACGTTAATGGATATGTTGACCGGATTGCTAATTCTAAATGGGAAGTCAAGGAG
CTTGGAGTGGAGCATAATGGGTATGTTGATTTGATGCTGGGGGAATTTAAACACTACAAA
ACAAGGCTTGCTCATGGAGGCATCCAACAGGAGGTCCAGAATATCCTACTGCAATATGGA
GTTGAAATATTTGCGGAGATGCTGGTCGAAGGGTTCTCTCGAATAAAAAGATGTACTGAT
GAAGGACGTGCTCTCATGTCATTAGATATTCAGGTCCTAATAAACGGGCTACAGCACTTT
GTGCCAACAAAGGTGAAGCCAAAGTTACAGATAGTCGAAACATTTATCAAGGCGTACTAT
CTGCCAGAGACGGAATATGTCCACTGGGCAAGGGCTCATCCGGAATATACGAAAGCACAG
GTCATCGGACTGGTGAATTTAGTAGCCACCATGAAAAGCTGGAAGAGGAAAACGCGACTA
GAAGTTGTGGAGAAGATTGAATCAGCTGCTGCGTAGATCAAATCTAAAAGCAACAACAAA
GTAATATCTACTTCTTTTCTCTGGTCTTGTTTTGTCTTTTGCTTTTGTCTCTTTCTTTTG
CATTTAGAATCGAGTGGTGTAAATTTGAGGATAAGCCCTTCTTAGTTGCTGTCGTGCTTA
ATGGGGTTGTGTAAAAGATTCTCCTCAAGTTGTACAGTCCTGAAGAGATTGTACACACAT
TTTCCTACATTTAAATACTTCATTAATGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BO58TF U 1
AF RS1BO58JQ C 265
BS 1 651 RS1BO58TF
BS 652 652 RS1BO58JQ
BS 653 672 RS1BO58TF
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BS 674 690 RS1BO58TF
BS 691 691 RS1BO58JQ
BS 692 702 RS1BO58TF
BS 703 1050 RS1BO58JQ

RD RS1BO58TF 714 0 0
CAGTTTTCATCACCACCATCTTCTTCACTTTCCTTCCCCAACACAGTACATAGTCTTGCG
GACGTGACTCCAGCGAGTCCCATAAAAACATCTGTATCAGGCACATCTTTTAGTCTCAAG
GAAAGATGTGCTGCAGTGGACACTGTTTCTCTTGTGGCTCGTATACTGCATAAATCAAAA
GCTCATCTCCAGTCTATGCTTATGTCAAGAAATGGCTCTCTGGTTGAAGACTTCTTTGGT
CAACTGGTTGGTTCCGTACCTGAACTAACAGAGCATTTACATAGGACAACTGCAAGGATA
CTGCTGCACGTTAATGGATATGTTGACCGGATTGCTAATTCTAAATGGGAAGTCAAGGAG
CTTGGAGTGGAGCATAATGGGTATGTTGATTTGATGCTGGGGGAATTTAAACACTACAAA
ACAAGGCTTGCTCATGGAGGCATCCAACAGGAGGTCCAGAATATCCTACTGCAATATGGA
GTTGAAATATTTGCGGAGATGCTGGTCGAAGGGTTCTCTCGAATAAAAAGATGTACTGAT
GAAGGACGTGCTCTCATGTCATTAGATATTCAGGTCCTAATAAACGGGCTACAGCACTTT
GTGCCAACAAAGGTGAAGCCAAAGTTACAGATAGTCGAAACATTTATCAAG*CGTACTAT
CTGCCAGAGACG*AATATGTCCACTGGGCA*GGGCTCATCCG
ATATACGAAAGC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RS1BO58JQ 786 0 0
CTAACAGAGCATTTACATAGGACAACTGCAAGGATACTGCTGCACGTTAATGGATATGTT
GACCGGATTGCTAATTCTAAATGGGAAGTCAAGGAGCTTGGAGTGGAGCATAATGGGTAT
GTTGATTTGATGCTGGGGGAATTTAAACACTACAAAACAAGGCTTGCTCATGGAGGCATC
CAACAGGAGGTCCAGAATATCCTACTGCAATATGGAGTTGAAATATTTGCGGAGATGCTG
GTCGAAGGGTTCTCTCGAATAAAAAGATGTACTGATGAAGGACGTGCTCTCATGTCATTA
GATATTCAGGTCCTAATAAACGGGCTACAGCACTTTGTGCCAACAAAGGTGAAGCCAAAG
TTACAGATAGTCGAAACATTTATCAAGGCGTACTATCTGCCAGAGACGGAATATGTCCAC
TGGGCAAGGGCTCATCCGGAATATACGAAAGCACAGGTCATCGGACTGGTGAATTTAGTA
GCCACCATGAAAAGCTGGAAGAGGAAAACGCGACTAGAAGTTGTGGAGAAGATTGAATCA
GCTGCTGCGTAGATCAAATCTAAAAGCAACAACAAAGTAATATCTACTTCTTTTCTCTGG
TCTTGTTTTGTCTTTTGCTTTTGTCTCTTTCTTTTGCATTTAGAATCGAGTGGTGTAAAT
TTGAGGATAAGCCCTTCTTAGTTGCTGTCGTGCTTAATGGGGTTGTGTAAAAGATTCTCC
TCAAGTTGTACAGTCCTGAAGAGATTGTACACACATTTTCCTACATTTAAATACTTCATT
AATGCC

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

CO CL6214Contig1 1250 2 4 U
GGAGAGAAACCAACATCAACATCGCTGCCTTCTGATCATTTTGCTGCCACGCTTTGTTCT
TCCCCAGGATTTTGTCTGGAGAATGTTTGTTTGAGATTTTGCAATCGAACAAGAAGAAGA
AGACCAAAGTAACAAATGGCTCCTGGTAGTAAAGCAGACAAGAAAGCAACGGTAGATGCT
GCTGCTTGGATGTTCAATGTCGTTACTTCTGTCGGAATCATCATTGTCAATAAAGCTTTA
ATGGCTACGTACGGCTTTAGCTTTGCAACAACCTTGACCGGTCTACATTTCGCCACGACC
ACACTGATGACACTTGTTCTAAGATGTCTAGGCTACATTCAGCCTTCTCATCTTCCCTTC
ACAGAGCTTCTTAAGTTCATTATATTTGCAAACTTTTCGATCGTTGGGATGAACGTTAGT
CTGATGTGGAACTCTGTTGGATTTTATCAGATTGCAAAGCTTAGCATGATTCCTGTAGCT
TGCTTGTTGGAAGTAGTGTTCGATAAGATTCGTTACTCAAGAGACACCAAACTTAGCATA
GGACTTGTTCTTGTGGGGTGTTGGTGTTTGCACTGTTACTGATGTTAGTGTCAACACCAA
AGGTTTCGTTGCTGCTTTTGTTGCTGTCTGGAGTACTGCTTTGCAACAATACTATGTGCA
TTATCTCCAGCGAAAGTATTCACTTACATCATTCAACCTACTGGGTCATACGGCTCCAGC
TCAAGCTGCAACGTTGTTGATAGTCGGTCCATTTCTCGACTTTTGGCTGACAGAGAAACG
GGTAGACATGTATGACTACAACGTTGTCTCTCTGATGTTTATAACCCTCTCATGCACAAT
GGCGATCGGGACAAACCTCAGCCAATTCATCTGCATCGGGAGATTCACGGCGGTTTCCTT
CCAAGTCCTGGGCCATATGAAGACGATCTTGGTGCTGATAATGGGCTTCTTCTTCTTTGA
CCGGGACGGTCTAAACCTGCACGTGGTTCTCGGCATGATTATTGCAGTGCTGGGGATGAT
CTGGTACGGTAATGCCTCGTCCAAGCCAGGAGGTAAGGAGAAGAAAAGCTATTCTCTTCC
AACGACCCGTCAACAGAAACATGGAGATGATTCGGATTCTGATGAAAGACCAAGGTTGAA
AGCTTAGCTAGCGTTAAGCGAGTTAATGATGAGTTTCTTACTACAGACATGGCACCATTT
TTATACATCATATTGCTTATTCTTTCTTAGCAGAATATTGTAAAATCCTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AH02TF U 1
AF RS1AH02JQ C 398
BS 1 800 RS1AH02TF
BS 801 801 RS1AH02JQ
BS 802 835 RS1AH02TF
BS 836 1250 RS1AH02JQ

RD RS1AH02TF 835 0 0
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TCCCCAGGATTTTGTCTGGAGAATGTTTGTTTGAGATTTTGCAATCGAACAAGAAGAAGA
AGACCAAAGTAACAAATGGCTCCTGGTAGTAAAGCAGACAAGAAAGCAACGGTAGATGCT
GCTGCTTGGATGTTCAATGTCGTTACTTCTGTCGGAATCATCATTGTCAATAAAGCTTTA
ATGGCTACGTACGGCTTTAGCTTTGCAACAACCTTGACCGGTCTACATTTCGCCACGACC
ACACTGATGACACTTGTTCTAAGATGTCTAGGCTACATTCAGCCTTCTCATCTTCCCTTC
ACAGAGCTTCTTAAGTTCATTATATTTGCAAACTTTTCGATCGTTGGGATGAACGTTAGT
CTGATGTGGAACTCTGTTGGATTTTATCAGATTGCAAAGCTTAGCATGATTCCTGTAGCT
TGCTTGTTGGAAGTAGTGTTCGATAAGATTCGTTACTCAAGAGACACCAAACTTAGCATA
GGACTTGTTCTTGTGGGGTGTTGGTGTTTGCACTGTTACTGATGTTAGTGTCAACACCAA
AGGTTTCGTTGCTGCTTTTGTTGCTGTCTGGAGTACTGCTTTGCAACAATACTATGTGCA
TTATCTCCAGCGAAAGTATTCACTTACATCATTCAACCTACTGGGTCATACGGCTCCAGC
TCAAGCTGCAACGTTGTTGATAGTCGGTCCATTTCTCGACTTTTGGCTGACAGAGAAACG
GGTAGACATGTATGACTACA*CGTTGTCTCTCTGATGTTTATAACCCTCTCATGC

QA 1 835 1 835
DS 

RD RS1AH02JQ 853 0 0
CGATCGTTGGGATGAACGTTAGTCTGATGTGGAACTCTGTTGGATTTTATCAGATTGCAA
AGCTTAGCATGATTCCTGTAGCTTGCTTGTTGGAAGTAGTGTTCGATAAGATTCGTTACT
CAAGAGACACCAAACTTAGCATAGGACTTGTTCTTGTGGG*TGTTGGTGTTTGCACTGTT
ACTGATGTTAGTGTCAACACCAAAGGTTTCGTTGCTGCTTTTGTTGCTGTCTGGAGTACT
GCTTTGCAACAATACTATGTGCATTATCTCCAGCGAAAGTATTCACTTACATCATTCAAC
CTACTGGGTCATACGGCTCCAGCTCAAGCTGCAACGTTGTTGATAGTCGGTCCATTTCTC
GACTTTTGGCTGACAGAGAAACGGGTAGACATGTATGACTACAACGTTGTCTCTCTGATG
TTTATAACCCTCTCATGCACAATGGCGATCGGGACAAACCTCAGCCAATTCATCTGCATC
GGGAGATTCACGGCGGTTTCCTTCCAAGTCCTGGGCCATATGAAGACGATCTTGGTGCTG
ATAATGGGCTTCTTCTTCTTTGACCGGGACGGTCTAAACCTGCACGTGGTTCTCGGCATG
ATTATTGCAGTGCTGGGGATGATCTGGTACGGTAATGCCTCGTCCAAGCCAGGAGGTAAG
GAGAAGAAAAGCTATTCTCTTCCAACGACCCGTCAACAGAAACATGGAGATGATTCGGAT
TCTGATGAAAGACCAAGGTTGAAAGCTTAGCTAGCGTTAAGCGAGTTAATGATGAGTTTC
TTACTACAGACATGGCACCATTTTTATACATCATATTGCTTATTCTTTCTTAGCAGAATA
TTGTAAAATCCTA

QA 1 853 1 853
DS 



AS 1 2

CO CL6215Contig1 1231 2 2 U
GCGCTCCTTTTACGAAACATAGAGGGAGCTACCAATAACCTCGGATCAAATGCATCAACC
ACAGACTGTATAATCCACAGATATGACTCATCAATATTTGGTTATGATAGTTAGAGAATA
ACACCAAATACAATACAGACTACTATTTGCTGGTGTGTTGTAAACACATGTACCTGAGAA
AAATAACCTTGGTGTGCTGACCCAAAGAGAGGTGTCAAATCAACGCCACAATAGTTATCT
TGTTGCCGAAACAAAGCCTGCAATAGAGGAAGGAACTTAACATGCAATATATATGGTGTT
GCAGAGCGCAATATCCAACATATAGTCCCTTTGAACATATTGACATTCAGTTACCTTATT
TGCCTTTTCGATAAACAAAAGTTCATCTGCCATGTGAATCCTACAGTGACAGAACAAAAT
GAGAATCAACACATAACAAAACAGATATAAAGAAAAGCCTCTCAAAGGTTGACTTTACCT
TCCAACAGTGGGAAACATTTTGGCATTTGGAGACATAAAACGATCTCTAGCAATAACATA
TGATTCCAACATTCTCTCGTTGACCAATAGGGTGCTGATAGACCTTGGAGGGCGTATTAT
CACTGTGATCCGATCAGCGAACAATGGATTTCCAGCAATCAGCTTGCGTGCGTATTCAGC
CATTTCGGATGCTTCTACAGCATGCTTGGCACCAGCCTAATTCATTAAAAAAAAAAGAAG
CAAAAATGCACAAAAGTCATCAAACAAGTCATCTTAATCTATATTTGGTTTCAGCATAGC
AAAACCTTAGTTCTGTAATTAGAGGCCTGAATATTTAATTTAATACCTGGGCAGCAAACA
TTGACAAAATGCCACTCCCAGCACCCACATCGACCACCACGACACGACCAGCAAAATTAG
AACGGTTACCTGAAGACATGAAAGAGAGAGACAGCCATCCTGTGTCATACAGCGGTGCAA
AGCATACATAATATAATATTTGATAGATTTACATTCTATAACACAAACATAAGTGAAACA
GTTCAGAGGAAACCAAATACATATAAATGCCATAATTTTTTTACCTGTCCTGACATAACC
TTGTAGCATATATTTTTGCTGCCCATTGTAATGGAAATCCATTTTGGCCGAGACGCCTCG
TCGAACATGCTTTTACTAGCTGAAACTGTGGATGATGATCCACCTATAAACGGAGCATGA
CAAGACAGTCAAGGACTATGTATGCACAGAG


BQ
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AF RS1EU43TF U 1
AF RS1H562TF U 442
BS 1 565 RS1EU43TF
BS 566 1231 RS1H562TF

RD RS1EU43TF 565 0 0
GCGCTCCTTTTACGAAACATAGAGGGAGCTACCAATAACCTCGGATCAAATGCATCAACC
ACAGACTGTATAATCCACAGATATGACTCATCAATATTTGGTTATGATAGTTAGAGAATA
ACACCAAATACAATACAGACTACTATTTGCTGGTGTGTTGTAAACACATGTACCTGAGAA
AAATAACCTTGGTGTGCTGACCCAAAGAGAGGTGTCAAATCAACGCCACAATAGTTATCT
TGTTGCCGAAACAAAGCCTGCAATAGAGGAAGGAACTTAACATGCAATATATATGGTGTT
GCAGAGCGCAATATCCAACATATAGTCCCTTTGAACATATTGACATTCAGTTACCTTATT
TGCCTTTTCGATAAACAAAAGTTCATCTGCCATGTGAATCCTACAGTGACAGAACAAAAT
GAGAATCAACACATAACAAAACAGATATAAAGAAAAGCCTCTCAAAGGTTGACTTTACCT
TCCAACAGTGGGAAACATTTTGGCATTTGGAGACATAAAACGATCTCTAGCAATAACATA
TGATTCCAACATTCTCTCGTTGACC

QA 1 565 1 565
DS 

RD RS1H562TF 790 0 0
G
AGATATAAAGAAAAGCCTCTCAAAGGTTGACTTTACCTTCCAACAGTGGGAAACATTTTG
GCATTTGGAGACATAAAACGATCTCTAGCAATAACATATGATTCCAACATTCTCTCGTTG
ACCAATAGGGTGCTGATAGACCTTGGAGGGCGTATTATCACTGTGATCCGATCAGCGAAC
AATGGATTTCCAGCAATCAGCTTGCGTGCGTATTCAGCCATTTCGGATGCTTCTACAGCA
TGCTTGGCACCAGCCTAATTCATTAAAAAAAAAAGAAGCAAAAATGCACAAAAGTCATCA
AACAAGTCATCTTAATCTATATTTGGTTTCAGCATAGCAAAACCTTAGTTCTGTAATTAG
AGGCCTGAATATTTAATTTAATACCTGGGCAGCAAACATTGACAAAATGCCACTCCCAGC
ACCCACATCGACCACCACGACACGACCAGCAAAATTAGAACGGTTACCTGAAGACATGAA
AGAGAGAGACAGCCATCCTGTGTCATACAGCGGTGCAAAGCATACATAATATAATATTTG
ATAGATTTACATTCTATAACACAAACATAAGTGAAACAGTTCAGAGGAAACCAAATACAT
ATAAATGCCATAATTTTTTTACCTGTCCTGACATAACCTTGTAGCATATATTTTTGCTGC
CCATTGTAATGGAAATCCATTTTGGCCGAGACGCCTCGTCGAACATGCTTTTACTAGCTG
AAACTGTGGATGATGATCCACCTATAAACGGAGCATGACAAGACAGTCAAGGACTATGTA
TGCACAGAG

QA 2 790 2 790
DS 



AS 1 2

CO CL6216Contig1 1118 2 2 U
GAGATGGGCTGGCCAGGTTGAAAAGACCTAAAGGCAAGCGTATCATGGTCTAATCTAAGG
GTTAAGTGCATCAGGAAGCTGGGACTTGACCAGGATAAGAAGGAAAGAAGAAAATGGTAG
CTGGACGAGTGATCCGGAAGCTGGACATGGTCCGGAAGCAGTTCAATCAACTCGGTGAAG
CTGGTGGGGAGCTCAAACAGTCTTGGGCAGCTCACAGGAGCTGGAGGAGTAGCTCACTCA
GCTCAGGCAACTGTCACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGTGATGGAGGTG
GTGGTTTCGTTCATAGGCTCAATCCCATTTCTAACGCCTTGTTTAAAGGAGGCGGAAAGC
CCAATAGGTGGTTAACCTTAAGAAGCTGTTTTGATGATTCTCCTCCTCCTCCTCCTCATC
ACAAGAAGGCTCGAGCTTTATCTCTGCATCATCATCATCGCCGCCTCCTCCTCCATGGCT
CGAGGGAAGAACGTCTCGGCGGCGGAACCACGGACTTAGCGGATGGACGTGGAGTTGGTA
ACACGGCGAGGTTCCAAGGGAGTGATAAGATCGTTGTGGCTGTTGACATTGATGAGGTTT
TGGGAAACTTTGTCTCGGCCCTTAACAAGTTCATTGCCGACCGCTATTTGTCAAACCATT
CCGTCTCAGAGTACCATGTCTACGAGTTCTTCAGGATATGGAACTGCTCTCGGAATGAAG
CTGACCTACGTGTTCATGAATTCTTTAAGACATCATATTTCAAGAAAGGGATCCATCCTC
TTCCAGGTGCCCATAAGACTCTTCACAAGCTATCAAGATACTGCGAGCTCTCAGTTGTGA
CGTCCCGGCAGAATGCGGTAAAAGATCACACACTTGGGTGGATCGACATGCATTTTCCAG
GACTGTTTAAACAGATTCATTTCGGGAACCATTTTGCTCTTCATGGAGAGTCTAAACCCA
AGTCTGAAATCTGCAGATCGTTTGGAGCAGAGATATTGATCGACGATAACCCCAGATATG
CAGAGGAATGCGCTAACATAGGAATGAAGGTTCTCCTCTTTGACTATGAAAACTCATACC
CTTGGTCTAAACTGAGTCTGTGGACAGACATCCTTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1CJ32TF U 1
AF RS1GC86TF U 395
BS 1 637 RS1CJ32TF
BS 638 1118 RS1GC86TF

RD RS1CJ32TF 637 0 0
GAGATGGGCTGGCCAGGTTGAAAAGACCTAAAGGCAAGCGTATCATGGTCTAATCTAAGG
GTTAAGTGCATCAGGAAGCTGGGACTTGACCAGGATAAGAAGGAAAGAAGAAAATGGTAG
CTGGACGAGTGATCCGGAAGCTGGACATGGTCCGGAAGCAGTTCAATCAACTCGGTGAAG
CTGGTGGGGAGCTCAAACAGTCTTGGGCAGCTCACAGGAGCTGGAGGAGTAGCTCACTCA
GCTCAGGCAACTGTCACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGTGATGGAGGTG
GTGGTTTCGTTCATAGGCTCAATCCCATTTCTAACGCCTTGTTTAAAGGAGGCGGAAAGC
CCAATAGGTGGTTAACCTTAAGAAGCTGTTTTGATGATTCTCCTCCTCCTCCTCCTCATC
ACAAGAAGGCTCGAGCTTTATCTCTGCATCATCATCATCGCCGCCTCCTCCTCCATGGCT
CGAGGGAAGAACGTCTCGGCGGCGGAACCACGGACTTAGCGGATGGACGTGGAGTTGGTA
ACACGGCGAGGTTCCAAGGGAGTGATAAGATCGTTGTGGCTGTTGACATTGATGAGGTTT
TGGGAAACTTTGTCTCGGCCCTTAACAAGTTCATTGC

QA 1 637 1 637
DS 

RD RS1GC86TF 724 0 0
G
GATTCTCCTCCTCCTCCTCCTCATCACAAGAAGGCTCGAGCTTTATCTCTGCATCATCAT
CATCGCCGCCTCCTCCTCCATGGCTCGAGGGAAGAACGTCTCGGCGGCGGAACCACGGAC
TTAGCGGATGGACGTGGAGTTGGTAACACGGCGAGGTTCCAAGGGAGTGATAAGATCGTT
GTGGCTGTTGACATTGATGAGGTTTTGGGAAACTTTGTCTCGGCCCTTAACAAGTTCATT
GCCGACCGCTATTTGTCAAACCATTCCGTCTCAGAGTACCATGTCTACGAGTTCTTCAGG
ATATGGAACTGCTCTCGGAATGAAGCTGACCTACGTGTTCATGAATTCTTTAAGACATCA
TATTTCAAGAAAGGGATCCATCCTCTTCCAGGTGCCCATAAGACTCTTCACAAGCTATCA
AGATACTGCGAGCTCTCAGTTGTGACGTCCCGGCAGAATGCGGTAAAAGATCACACACTT
GGGTGGATCGACATGCATTTTCCAGGACTGTTTAAACAGATTCATTTCGGGAACCATTTT
GCTCTTCATGGAGAGTCTAAACCCAAGTCTGAAATCTGCAGATCGTTTGGAGCAGAGATA
TTGATCGACGATAACCCCAGATATGCAGAGGAATGCGCTAACATAGGAATGAAGGTTCTC
CTCTTTGACTATGAAAACTCATACCCTTGGTCTAAACTGAGTCTGTGGACAGACATCCTT
TGG

QA 2 724 2 724
DS 



AS 1 2

CO CL6217Contig1 646 2 3 U
AACACAAACGAGGCTGTAAGTGTCATATCATGAAAAGAGAACAAAAAGCTTGTTTATATT
GAACTCTTGGACAGTAAAAAAAAAGATGAGTAGTGGTCCGATGGTTCTACACTAATACTG
CATCATATACAATAGGGCTTATCATAAGAGCTGAAGACAAACCTAACCAACCATATACAA
AAAAAAAGAGGAGTGAAACGGAAGCAAAGGCCAGTTCTTCTTCTTCTGTCACTGTTCTTC
CTTATCAAAGAAACTCTGGGGCAGGGTAAAGTCTTCCTCGTGGTTAAGAATGTCAATGTC
CTCATCATCTGATTTCAGCATCTCTATGTTGTAGAAACGATCCAGTAGCTGCAGAACCTC
ATCCGCTGAGAACGGTCGGTCAAAGCTTCTGCCGAGATATTCCATCAGACCATAAAGAAC
AAAGTGGCGATGTATGCCTCGGAGTTTAACGGGAGGGTAGATTTCAAGAGCTTCTAATAA
CGTGAGCTCCAATTCAACCTGTGACTGCTCCTTGGAGAGAGAAGAAGCGGAGGAAGGTAA
GGCTTTACAGGGAGAGTGCACAGACATGTCATCCTGCTCTTCCTCTTTGTCTTTAATATC
TCCTCCGCCAGCTTCTTCGTCATTCCTTCCTCCCATCTTGTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AL78JQ U 106
AF RS1AL78TF C 1
BS 1 105 RS1AL78TF
BS 106 534 RS1AL78JQ
BS 535 646 RS1AL78TF

RD RS1AL78JQ 429 0 0
TCTACACTAATACTGCATCATATACAATAGGGCTTATCATAAGAGCTGAAGACAAACCTA
ACCAACCATATACAAAAAAAAAGAGGAGTGAAACGGAAGCAAAGGCCAGTTCTTCTTCTT
CTGTCACTGTTCTTCCTTATCAAAGAAACTCTGGGGCAGGGTAAAGTCTTCCTCGTGGTT
AAGAATGTCAATGTCCTCATCATCTGATTTCAGCATCTCTATGTTGTAGAAACGATCCAG
TAGCTGCAGAACCTCATCCGCTGAGAACGGTCGGTCAAAGCTTCTGCCGAGATATTCCAT
CAGACCATAAAGAACAAAGTGGCGATGTATGCCTCGGAGTTTAACGGGAGGGTAGATTTC
AAGAGCTTCTAATAACGTGAGCTCCAATTCAACCTGTGACTGCTCCTTGGAGAGAGAAGA
AGCGGAGGA

QA 1 429 1 429
DS 

RD RS1AL78TF 646 0 0
AACACAAACGAGGCTGTAAGTGTCATATCATGAAAAGAGAACAAAAAGCTTGTTTATATT
GAACTCTTGGACAGTAAAAAAAAAGATGAGTAGTGGTCCGATGGTTCTACACTAATACTG
CATCATATACAATAGGGCTTATCATAAGAGCTGAAGACAAACCTAACCAACCATATACAA
AAAAAAAGAGGAGTGAAACGGAAGCAAAGGCCAGTTCTTCTTCTTCTGTCACTGTTCTTC
CTTATCAAAGAAACTCTGGGGCAGGGTAAAGTCTTCCTCGTGGTTAAGAATGTCAATGTC
CTCATCATCTGATTTCAGCATCTCTATGTTGTAGAAACGATCCAGTAGCTGCAGAACCTC
ATCCGCTGAGAACGGTCGGTCAAAGCTTCTGCCGAGATATTCCATCAGACCATAAAGAAC
AAAGTGGCGATGTATGCCTCGGAGTTTAACGGGAGGGTAGATTTCAAGAGCTTCTAATAA
CGTGAGCTCCAATTCAACCTGTGACTGCTCCTTGGAGAGAGAAGAAGCGGAGGAAGGTAA
GGCTTTACAGGGAGAGTGCACAGACATGTCATCCTGCTCTTCCTCTTTGTCTTTAATATC
TCCTCCGCCAGCTTCTTCGTCATTCCTTCCTCCCATCTTGTTTTCC

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 2

CO CL6218Contig1 1094 2 2 U
GGTACCAGAGGAAACTGTCAAGAAGATTACTGAACCTCTTAGCTGCCAAGCGGATGATGA
ATCTGTCGGAAAATCTCAGAGGGGTGCTTCTTGTGAAGAAACTGAGGTTACGAATTTAGA
TGATGATGGCTCATCTGAAGAGGGTTCTGATAATGATGATGATGATGATGGTCTTTTTGA
CGAGGTTACAGGTGAGGGTAGTGTTTCGTCTAAAAAGGATGTCTATGGTGATGATGCTTC
ATCTCCTTTGTCAGATGATGGAGGTGTGGACATAAGTCTTTCGAACCAATCCAGTGCTTT
GGAAGAGGCTTCTCACACAGTAGGAAATCATGGTTTAAAGAGTAACAGTGTGGCAGTAGA
GACTGAAGTTTCCAATGATGATGCACCTAAAGAAGATGTCGGTGATGAGGCTTTTTCATC
TTTTGTTTTCAATGACAGTGGTGTTATAAACAGAACCTCTCTAGACCAAGTGAAGCCCTT
GGGGGATGCCTCTCAGACAGTGGAAAATGGTGTTATCACTGATACATCGGTTACTGAGGC
TGCTAAGGAAACAATGGATGTCAATGGGTTTGACGTTTTTTTCTCTCAGGTAGAATCAGT
GAGACATATATTCAGAAGACACCCGGACATAGCATTAGGCTTCCGTCCTAAGAACAGACA
GATCAAAAGAGCGTACATGAATGAACTCCTTAGCCTCATCCAGCTTCTGTGCCAGTCACC
AGAAAAGCTCTCAGAGGATGATCTGAGTAATGCTGATGACACGCTGGCTGATCTGATTGA
TATCGGCTTTAAACTGGATTGGCTGAAGACAAAGTTGAATGAGGTTTCTGAAAAGAAGAA
GAAAGAACAGAGTATTGGGGCACGGCTGCTATCAATGGAGGAACAGTTGCAGAAACTGAA
GCTAATGTTCTTGGATCTTGAGACTCAGTTGCAGATGGAAAAGGCTGAGGCGTTGGCCGC
AAGAGCTCCTCTCTCGTTCAGTGATGTTGTTTGCTGATTTGGGAGGATTCTTGTAGAATT
GTAGATGAATCTTTCTTTTTTCTTTTGATGTCTAGGAACAATTCTCAAGTTCATAGTGTC
ACTAGTCTTTCGCC


BQ
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AF RS1ES10TF U 1
AF RS1ES10JQ C 412
BS 1 634 RS1ES10TF
BS 635 1094 RS1ES10JQ

RD RS1ES10TF 634 0 0
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ATCTGTCGGAAAATCTCAGAGGGGTGCTTCTTGTGAAGAAACTGAGGTTACGAATTTAGA
TGATGATGGCTCATCTGAAGAGGGTTCTGATAATGATGATGATGATGATGGTCTTTTTGA
CGAGGTTACAGGTGAGGGTAGTGTTTCGTCTAAAAAGGATGTCTATGGTGATGATGCTTC
ATCTCCTTTGTCAGATGATGGAGGTGTGGACATAAGTCTTTCGAACCAATCCAGTGCTTT
GGAAGAGGCTTCTCACACAGTAGGAAATCATGGTTTAAAGAGTAACAGTGTGGCAGTAGA
GACTGAAGTTTCCAATGATGATGCACCTAAAGAAGATGTCGGTGATGAGGCTTTTTCATC
TTTTGTTTTCAATGACAGTGGTGTTATAAACAGAACCTCTCTAGACCAAGTGAAGCCCTT
GGGGGATGCCTCTCAGACAGTGGAAAATGGTGTTATCACTGATACATCGGTTACTGAGGC
TGCTAAGGAAACAATGGATGTCAATGGGTTTGACGTTTTTTTCTCTCAGGTAGAATCAGT
GAGACATATATTCAGAAGACACCCGGACATAGCA

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1ES10JQ 683 0 0
TTTTTCATCTTTTGTTTTCAATGACAGTGGTGTTATAAACAGAACCTCTCTAGACCAAGT
GAAGCCCTTGGGGGATGCCTCTCAGACAGTGGAAAATGGTGTTATCACTGATACATCGGT
TACTGAGGCTGCTAAGGAAACAATGGATGTCAATGGGTTTGACGTTTTTTTCTCTCAGGT
AGAATCAGTGAGACATATATTCAGAAGACACCCGGACATAGCATTAGGCTTCCGTCCTAA
GAACAGACAGATCAAAAGAGCGTACATGAATGAACTCCTTAGCCTCATCCAGCTTCTGTG
CCAGTCACCAGAAAAGCTCTCAGAGGATGATCTGAGTAATGCTGATGACACGCTGGCTGA
TCTGATTGATATCGGCTTTAAACTGGATTGGCTGAAGACAAAGTTGAATGAGGTTTCTGA
AAAGAAGAAGAAAGAACAGAGTATTGGGGCACGGCTGCTATCAATGGAGGAACAGTTGCA
GAAACTGAAGCTAATGTTCTTGGATCTTGAGACTCAGTTGCAGATGGAAAAGGCTGAGGC
GTTGGCCGCAAGAGCTCCTCTCTCGTTCAGTGATGTTGTTTGCTGATTTGGGAGGATTCT
TGTAGAATTGTAGATGAATCTTTCTTTTTTCTTTTGATGTCTAGGAACAATTCTCAAGTT
CATAGTGTCACTAGTCTTTCGCC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

CO CL6219Contig1 1052 2 2 U
GGTATTCATCTTTCTGTCACAATTCTGAAAAAAAAAATTGAAGCTTGATTTGGTTCAACA
GAGAGAGAGAGAGAGAGATAAAGCAGAGATGTGTAGTTTGTCAGCGAACATGTTGTTACC
AACAAAGCTGAAACCTGCTTATTCAGACAAACAGAGTTATTGTACCACCAACTCACTCCT
TGTCTCCAACACAAGACCCAAGAGGAAGAAGAACCAATCCACTGTTCCTATGGCAAGATT
GTTTGGACCAGCTATCTTCGAATCATCCAAGCTGAAAGTATTGTTTCTAGGGGTTGATGA
CAAGAAGCATCCACCAACGCTCCCAAGAACTTACACTCTGACTCACAGTGACATTACAGC
TAAACTAACTCTAGCTATTTCTCACTCCATTAACAATTCTCAGTTGCAAGGATGGGCAAA
TAGGATATACAGAGATGAAGTGGTAGCAGAATGGAAAAAAGTGAAAGGGAACATGTCTCT
TCACGTCCACTGTCACATTAGCGGTGCCCATTTCCTCTTAGATCTCTTCCCAAAGTTTAG
ATACTACATCTTTTCCAAAGAACTACCCGTTGTGTTGAATGCTATTGTTCACGGAGATGG
CAACCTGTTGAACAGCTATCCCGAGTTACAAGAAGCTCTTGTTTGGGTTTATTTCCATTC
TAATGTCGATGAGTTCAACAGAGTCGAATGTTGGGGTCCGCTTTGGGAAGCTACTTCGCA
CGATGGTCACAGGACTCAGACTCTCCCTGAGACTCTGTGCAAGGAGGAGTGCGGTTGTTG
TTTCCCAACTGTTAGCTCCATTCCTTGGTCTCATAGTCTTACTAACGAAGGTGTTACAGA
CTACCCTGGGACTCAGGCCGAGGGAATGTCTACTCCAAGTCCGGAGAAAATCTAGTGATT
CAACTAATATACAAGTTTCTTTTTAGTGAAATCTTTTGTAGATCTAATATTGGTCTGGTT
TGGTTTAGTGTACATGATGTGGTATAGGAAAATAATGATTACTAGATTTTTACCCGCACG
CCCGTGCGGATGTATATTTCAAAAATATATTG


BQ
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AF RS1DT82TF U 1
AF RS1DT82JQ C 518
BS 1 758 RS1DT82TF
BS 759 1052 RS1DT82JQ

RD RS1DT82TF 758 0 0
GGTATTCATCTTTCTGTCACAATTCTGAAAAAAAAAATTGAAGCTTGATTTGGTTCAACA
GAGAGAGAGAGAGAGAGATAAAGCAGAGATGTGTAGTTTGTCAGCGAACATGTTGTTACC
AACAAAGCTGAAACCTGCTTATTCAGACAAACAGAGTTATTGTACCACCAACTCACTCCT
TGTCTCCAACACAAGACCCAAGAGGAAGAAGAACCAATCCACTGTTCCTATGGCAAGATT
GTTTGGACCAGCTATCTTCGAATCATCCAAGCTGAAAGTATTGTTTCTAGGGGTTGATGA
CAAGAAGCATCCACCAACGCTCCCAAGAACTTACACTCTGACTCACAGTGACATTACAGC
TAAACTAACTCTAGCTATTTCTCACTCCATTAACAATTCTCAGTTGCAAGGATGGGCAAA
TAGGATATACAGAGATGAAGTGGTAGCAGAATGGAAAAAAGTGAAAGGGAACATGTCTCT
TCACGTCCACTGTCACATTAGCGGTGCCCATTTCCTCTTAGATCTCTTCCCAAAGTTTAG
ATACTACATCTTTTCCAAAGAACTACCCGTTGTGTTGAATGCTATTGTTCACGGAGATGG
CAACCTGTTGAACAGCTATCCCGAGTTACAAGAAGCTCTTGTTTGGGTTTATTTCCATTC
TAATGTCGATGAGTTCAACAGAGTCGAATGTTGGGGTCCGCTTTGGGAAGCTACTTCGCA
CGATGGTCACAGGACTCAGACTCTCCCTGAGACTCTGT

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1DT82JQ 535 0 0
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AATGCTATTGTTCACGGAGATGGCAACCTGTTGAACAGCTATCCCGAGTTACAAGAAGCT
CTTGTTTGGGTTTATTTCCATTCTAATGTCGATGAGTTCAACAGAGTCGAATGTTGGGGT
CCGCTTTGGGAAGCTACTTCGCACGATGGTCACAGGACTCAGACTCTCCCTGAGACTCTG
TGCAAGGAGGAGTGCGGTTGTTGTTTCCCAACTGTTAGCTCCATTCCTTGGTCTCATAGT
CTTACTAACGAAGGTGTTACAGACTACCCTGGGACTCAGGCCGAGGGAATGTCTACTCCA
AGTCCGGAGAAAATCTAGTGATTCAACTAATATACAAGTTTCTTTTTAGTGAAATCTTTT
GTAGATCTAATATTGGTCTGGTTTGGTTTAGTGTACATGATGTGGTATAGGAAAATAATG
ATTACTAGATTTTTACCCGCACGCCCGTGCGGATGTATATTTCAAAAATATATTG

QA 1 535 1 535
DS 



AS 1 2

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TAAAGGGATATATGTTATTATAATTCCAAAGCATTGAGAAATGAAAAAACAAAAATACTT
TTATTCTAACCAAGATCTCATGAATCTTGGTCAACTCAATCACAAACTAAAAAGAACAGA
AGAGATCGAAACATTGAGACGAAACCAAATCCTCAAGAACATATAGATCAAAGCTCATCT
CTCTTGGTAGCAGATGGACGGACACCTTGACTTAGGAACTCTTTGTAATACTTTCCCGAT
TCTTTGACAATACGCGTGAGATTATTTTTGAAATCGATGTAGTAGAGTCCGAATCTGCTC
TTGTAACCTTCATTCCATTCAAAGTTGTCCAACAATGACCATATAAAGTATCCTGTAACA
TTTACTTTGTCGATGCAAATAGCTTCATTCATACTCAAAAAATGCCTCTGAAGATAATAT
TTTCTGTTGTGATCAGCAGTACCAACTGCAACTGAATCGGTTTCCCCAAGGTCTTCTCCA
TATCCATTTTCCATGATCATAATTTCAGGGTTTGCATATTTATCCTTGATGTACTTCAAA
AGACTTCTAAAGCCTTTTGCGAAAACGGGTAGCTTACCGGTGGAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CE68JQ U 284
AF RS1ES28TF C 1
BS 1 285 RS1ES28TF
BS 286 412 RS1CE68JQ
BS 413 587 RS1ES28TF

RD RS1CE68JQ 134 0 0
AA
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AAGTATCCTGTAACATTTACTTTGTCGATGCAAATAGCTTCATTCATACTCAAAAAATGC
CTCTGAA
AAAAA

QA 3 129 3 129
DS 

RD RS1ES28TF 587 0 0
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TTATTCTAACCAAGATCTCATGAATCTTGGTCAACTCAATCACAAACTAAAAAGAACAGA
AGAGATCGAAACATTGAGACGAAACCAAATCCTCAAGAACATATAGATCAAAGCTCATCT
CTCTTGGTAGCAGATGGACGGACACCTTGACTTAGGAACTCTTTGTAATACTTTCCCGAT
TCTTTGACAATACGCGTGAGATTATTTTTGAAATCGATGTAGTAGAGTCCGAATCTGCTC
TTGTAACCTTCATTCCATTCAAAGTTGTCCAACAATGACCATATAAAGTATCCTGTAACA
TTTACTTTGTCGATGCAAATAGCTTCATTCATACTCAAAAGATGCCTCTGAAGATAATAT
TTTCTGTTGTGATCAGCAGTACCAACTGCAACTGAATCGGTTTCCCCAAGGTCTTCTCCA
TATCCATTTTCCATGATCATAATTTCAGGGTTTGCATATTTATCCTTGATGTACTTCAAA
AGACTTCTAAAGCCTTTTGCGAAAACGGGTAGCTTACCGGTGGAAGC

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 2

CO CL6221Contig1 1461 2 6 U
GGGAATCAACACGATCCTCTCCCTCAGTTACGTTCAGCTTTGCGATCTGGTTTTCGATCC
GACGATCTCTCTCTTTCCACTTTCCACTTGTTTACTACGTAACCATGGATGCTGTAACCG
CTGCTGTCACTACGGATGACCCCGTAGCGTTGGGGGTTGCTTTAGGAGCTTTACCTGATG
GTTTCAAAAAAAAGGGTGACGAGCTTAGAGAATTGCTGGTTGTTACCCTGAAGAACCATC
AAGTGGATTGCTTTGAGATTCTCCTGCAAAGTGGAGCTCTCAGAGGGCTCCTCAGACGAT
CTTCATATCAGATCAAGTTCCTACTCTTCTACACCTTGCCAGCAGGAAAAATAAATTTCT
GCCATTTGTCAAGCTCCTTACTTCACATGGAGCTCTTCTAGAGGAAAGGAATGGACGCTT
TGAAACTCCTCTCCATGTTTCTGCTTTTCACGGCAAGTTTCTGACTGCTAAGCATCTGGT
GGAAAGTGGCTCCAACGTCCACAGTAGAAACTTTGAGCAAGAAACGCCTCTTCATTTGGC
TTGTTTTGAAGGGAGTGTCGACACCGTTGGGCTTCTTATCAACTCCGGTTCTGATTTGGA
AGCTCGGAATGACTATGGAGATAGGCCACTCCACGTTGCATGTAAACAAACCCATTATGA
GTGTGCTAATCTTCTTTTGCTCAGTGGAGCACAAATTGATTCTTTGGACGGTAATGGAGA
TTCGCCTCTCTGGATTGCACTAGAAGAAGAGAGCCTACAATGTTTGAATCTGCTCCTTGA
AAGAGGTGCTAATCCAAATGAAGGAAACGACGTAAGCGGTTTCACACGTTTTCATTTGGC
ATGTAAGAACAAAGAGCTCCCATTTGTACAGAGTTTGGCCAAATTTGGAGCTGAGATTGA
TGCTGAAGACAATGAGGGAGTTACTCCTCTTTTTGTTGCTTGTGGATTTGGCTTATTGGA
CATCATCAAGTTTCTACTCAAGGAAGGAGCTAATCCAAACAGCTCCAAATTCAACGGTGA
CACACCTCTCCACCGTGTTGTCACAAGTGAGGACGTTGATCTCTATGTTCAACTTGATAT
AGTGGAGGAGTTGATTGGAGCTGGTGCTAATCCTCTAATAGGAAATGCTGCAGGACAGAG
ACCTCACTCGGTTGCAATCCATCCTCAAGTTAAAGCTCGTTTGATCGAAGCTATGCATAA
CACGTGATACTTTCAACAGCTAGCGACATTTGGAATCAGTTTGGAACCAGAATCAGATTT
AGTGAATGACAGAAGCTCTTGTGACTCTTGTGGTGCGAACCTTTGTAAAGTCTTGAACCA
GTTAAGTTTGTTGCGGATAATTTAGCGTCTAATCCCGTCTTTTTCTTTCCTTGGAATGAT
TTCTTGTGGTGGAAAATCGAATTTACATAGTTAACAATGTTATAAGCTTTGGAATGACTT
TTATCCATCTCTCGGTCTATC


BQ
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AF RS1AK89TF U 1
AF RS1AK89JQ C 631
BS 1 785 RS1AK89TF
BS 786 786 RS1AK89JQ
BS 787 848 RS1AK89TF
BS 849 849 RS1AK89JQ
BS 850 879 RS1AK89TF
BS 880 1461 RS1AK89JQ

RD RS1AK89TF 879 0 0
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GACGATCTCTCTCTTTCCACTTTCCACTTGTTTACTACGTAACCATGGATGCTGTAACCG
CTGCTGTCACTACGGATGACCCCGTAGCGTTGGGGGTTGCTTTAGGAGCTTTACCTGATG
GTTTCAAAAAAAAGGGTGACGAGCTTAGAGAATTGCTGGTTGTTACCCTGAAGAACCATC
AAGTGGATTGCTTTGAGATTCTCCTGCAAAGTGGAGCTCTCAGAGGGCTCCTCAGACGAT
CTTCATATCAGATCAAGTTCCTACTCTTCTACACCTTGCCAGCAGGAAAAATAAATTTCT
GCCATTTGTCAAGCTCCTTACTTCACATGGAGCTCTTCTAGAGGAAAGGAATGGACGCTT
TGAAACTCCTCTCCATGTTTCTGCTTTTCACGGCAAGTTTCTGACTGCTAAGCATCTGGT
GGAAAGTGGCTCCAACGTCCACAGTAGAAACTTTGAGCAAGAAACGCCTCTTCATTTGGC
TTGTTTTGAAGGGAGTGTCGACACCGTTGGGCTTCTTATCAACTCCGGTTCTGATTTGGA
AGCTCGGAATGACTATGGAGATAGGCCACTCCACGTTGCATGTAAACAAACCCATTATGA
GTGTGCTAATCTTCTTTTGCTCAGTGGAGCACAAATTGATTCTTTGGACGGTAATGGAGA
TTCGCCTCTCTGGATTGCACTAGAAGAAGAGAGCCTACAATGTTTGAATCTGCTCCTTGA
AAGAG*TGCTAATCCAAATGAAGGAAACGACGTAAGCGGTTTCACACGTTTTCATTTGGC
ATGTAAGA*CAAAGAGCTCCCATTTGTACAGAGTTTGGC

QA 1 879 1 879
DS 

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ACAAATTGATTCTTTGGACGGTAATGGAGATTCGCCTCTCTGGATTGCACTAGAAGAAGA
GAGCCTACAATGTTTGAATCTGCTCCTTGAAAGAGGTGCTAATCCAAATGAAGGAAACGA
CGTAAGCGGTTTCACACGTTTTCATTTGGCATGTAAGAACAAAGAGCTCCCATTTGTACA
GAGTTTGGCCAAATTTGGAGCTGAGATTGATGCTGAAGACAATGAGGGAGTTACTCCTCT
TTTTGTTGCTTGTGGATTTGGCTTATTGGACATCATCAAGTTTCTACTCAAGGAAGGAGC
TAATCCAAACAGCTCCAAATTCAACGGTGACACACCTCTCCACCGTGTTGTCACAAGTGA
GGACGTTGATCTCTATGTTCAACTTGATATAGTGGAGGAGTTGATTGGAGCTGGTGCTAA
TCCTCTAATAGGAAATGCTGCAGGACAGAGACCTCACTCGGTTGCAATCCATCCTCAAGT
TAAAGCTCGTTTGATCGAAGCTATGCATAACACGTGATACTTTCAACAGCTAGCGACATT
TGGAATCAGTTTGGAACCAGAATCAGATTTAGTGAATGACAGAAGCTCTTGTGACTCTTG
TGGTGCGAACCTTTGTAAAGTCTTGAACCAGTTAAGTTTGTTGCGGATAATTTAGCGTCT
AATCCCGTCTTTTTCTTTCCTTGGAATGATTTCTTGTGGTGGAAAATCGAATTTACATAG
TTAACAATGTTATAAGCTTTGGAATGACTTTTATCCATCTCTCGGTCTATC

QA 1 831 1 831
DS 



AS 1 2

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GACGCCGAGGAAACCGACGGAGCTCAATGACTACATCAGCGTCAGCCTAATCGGATGTAA
GCAAATCTCTCATCAAGCACACTTTAGAACAAATATCATTTTTCAATCTCGCATACTAAA
GCGCTAAATCACGATAGGATTGAATGAAATTGTGAAACTATCCTGATGACAAGAAAAAAA
CCATTTAACGGTTTATTCAGAATCAGAGAAAACTTCAGATTCATGGCCCATCTCATCTCA
AGGCCAAACATTTTAAAATCCAGTTTTACTTTATCATTAAATTGAAACATAAAACAATCC
AATTTCATTTTTCGACCATTCAACCAATATCCGAAAACCAGACAACATTTAAAATAAAAT
CCACTAAACCTCAAAAAAATAAATAATCATAAAACTATATAATTTTTTTAAAAAATTTCT
ACAGTTATTACTTTTTAACAAAAAATAGTTTCCTACAATTCTAATTTTCCAAAATAAAAT
TTAGGTAGAATAACCAAAAAATATTATTTAAAGTTCACATTATTTTAACTTTTAAGTTCA
AAATTTTAATTTCTTTTCCTTACACTATTTTAGTTGTATATTAACAACTACCTAAGTTTG
GTTACTTTAAAACATGCAACCGCATAAAACGCTAATTTTATGAGATATGAAAATATCAGC
GCATATAAATTCGCTGCTCATTTTTATACCAACTTAATCAAATTATGTCACTCCAAATCT
TCCGTTCATAAACCATTATAAACAACATTTTCAAACAAAAGTTAAAAGAAAAACAAACAA
TAAAATCCCATACGCAAAACAACATAATACATCACAAATGTACCGAGTCCTGCGCTTGCG
CGGAGGCTATGCCCCTAGTTAAGTAGAGTTCAACAG


BQ
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AF RS1E155TF U 1
AF RS1E155JQ C 300
BS 1 698 RS1E155TF
BS 699 699 RS1E155JQ
BS 700 712 RS1E155TF
BS 713 713 RS1E155JQ
BS 714 728 RS1E155TF
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BS 730 743 RS1E155TF
BS 744 936 RS1E155JQ

RD RS1E155TF 743 0 0
GGAAAACAAATTATATCACTCCAATTCCAAACCTTCTCTATCTTCTCTATCGCAGGTTCC
GACGCCGAGGAAACCGACGGAGCTCAATGACTACATCAGCGTCAGCCTAATCGGATGTAA
GCAAATCTCTCATCAAGCACACTTTAGAACAAATATCATTTTTCAATCTCGCATACTAAA
GCGCTAAATCACGATAGGATTGAATGAAATTGTGAAACTATCCTGATGACAAGAAAAAAA
CCATTTAACGGTTTATTCAGAATCAGAGAAAACTTCAGATTCATGGCCCATCTCATCTCA
AGGCCAAACATTTTAAAATCCAGTTTTACTTTATCATTAAATTGAAACATAAAACAATCC
AATTTCATTTTTCGACCATTCAACCAATATCCGAAAACCAGACAACATTTAAAATAAAAT
CCACTAAACCTCAAAAAAATAAATAATCATAAAACTATATAATTTTTTTAAAAAATTTCT
ACAGTTATTACTTTTTAACAAAAAATAGTTTCCTACAATTCTAATTTTCCAAAATAAAAT
TTAGGTAGAATAACCAAAAAATATTATTTAAAGTTCACATTATTTTAACTTTTAAGTTCA
AAATTTTAATTTCTTTTCCTTACACTATTTTAGTTGTATATTAACAACTACCTAAGTTTG
GTTACTTTAAAACATGCAACCGCATAAAACGCTAATTT*ATGAGATATGAAA*TATCAGC
GCATATAA*TTCGCTGCTCATTT

QA 1 743 1 743
DS 

RD RS1E155JQ 637 0 0
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CAATTTCATTTTTCGACCATTCAACCAATATCCGAAAACCAGACAACATTTAAAATAAAA
TCCACTAAACCTCAAAAAAATAAATAATCATAAAACTATATAATTTTTTTAAAAAATTTC
TACAGTTATTACTTTTTAACAAAAAATAGTTTCCTACAATTCTAATTTTCCAAAATAAAA
TTTAGGTAGAATAACCAAAAAATATTATTTAAAGTTCACATTATTTTAACTTTTAAGTTC
AAAATTTTAATTTCTTTTCCTTACACTATTTTAGTTGTATATTAACAACTACCTAAGTTT
GGTTACTTTAAAACATGCAACCGCATAAAACGCTAATTTTATGAGATATGAAAATATCAG
CGCATATAAATTCGCTGCTCATTTTTATACCAACTTAATCAAATTATGTCACTCCAAATC
TTCCGTTCATAAACCATTATAAACAACATTTTCAAACAAAAGTTAAAAGAAAAACAAACA
ATAAAATCCCATACGCAAAACAACATAATACATCACAAATGTACCGAGTCCTGCGCTTGC
GCGGAGGCTATGCCCCTAGTTAAGTAGAGTTCAACAG

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 2

CO CL6223Contig1 1121 2 2 U
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TATAGTACCACATTCTGTAGAGTATTAGAGAGAGAGACACACAAAAGTGAGTGAGAGAGT
GGGAGAAACAGAGTGAGTGACAGAGAGTGAGACAAGAAGAAAGAAAAGGAACGATTTTTG
AGATAACTTCGAGCAGTTTGCAGTGGTCTCTGAATGAATTTATGATCTGGGGATTTTGGC
AAACTGGAATGGAAAATCGGAATGGAGAACCGGGTTTACAACAACTTTCGAGGCTGATCA
TCAACCGAGGAGATCTTCTTCTTCCTCAAGAGCATCATCTGTTCATGATGATGTGAATTC
GTTGGTCATCTACATTTTAGATTTTAATGAATCCGATGATTATTTATAATGGTAGATTGA
CTTGGTAAAAGTTTATTAGATTAGTTTATATTCTTTCATTCTTTTATTTGAATATATATT
TGGGGTGGGGATTCATTTCATTTTTTTCTATTTATTTCTCTCAACACTGCATATTAAGTC
ACAGAAAAAAAACTTTCTTTTCATTTTGATTTCACAAAAAAACATTATTTAATCTTACAT
TTAGGACTATATTTTGTTTCATAAAGAAAACATAGGAACAGAAAAAAAACATTTGATTAT
ATTTCTTTTCCCATCGGATTCCATTTTTTAATCAACTGTTGTTTGTGCAAAACACACACA
CACTTAGACAATATCTCACATTCTTTTAAGAAACTTAGATATTTGGGCGGGTAGATATTT
TTTGTAGAGGATGTTGGCAGGTTATTCAAGTTTATCATTGTTGTCACCGACCCAAAGATT
AAGGAGTGAAGCAGTAGCAGCCACAGTGTCAGTACATTTTCCCATGAACACACAGAGACT
GGACTTACCCTGCAGCAGTAGCTTCTCCCGCAAGGAAACACCTTCACTTGGACGCAGCAT
CTCACTCGACAACAACAACAACAAACCGATTGAGCGCAAGACCGGTGGGTGTTTTCTTAA
GCAGAGCATAAAGCTTCCGCCTTTGGCAACAACAAGAGGAAATACACAAGGGTTTTCATG
GAACAACGACAAGAACAACAGAGGGAAGACGATAATTTAGC


BQ
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AF RS1FH19TF U 1
AF RS1FH19JQ C 568
BS 1 644 RS1FH19TF
BS 645 1121 RS1FH19JQ

RD RS1FH19TF 644 0 0
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TATAGTACCACATTCTGTAGAGTATTAGAGAGAGAGACACACAAAAGTGAGTGAGAGAGT
GGGAGAAACAGAGTGAGTGACAGAGAGTGAGACAAGAAGAAAGAAAAGGAACGATTTTTG
AGATAACTTCGAGCAGTTTGCAGTGGTCTCTGAATGAATTTATGATCTGGGGATTTTGGC
AAACTGGAATGGAAAATCGGAATGGAGAACCGGGTTTACAACAACTTTCGAGGCTGATCA
TCAACCGAGGAGATCTTCTTCTTCCTCAAGAGCATCATCTGTTCATGATGATGTGAATTC
GTTGGTCATCTACATTTTAGATTTTAATGAATCCGATGATTATTTATAATGGTAGATTGA
CTTGGTAAAAGTTTATTAGATTAGTTTATATTCTTTCATTCTTTTATTTGAATATATATT
TGGGGTGGGGATTCATTTCATTTTTTTCTATTTATTTCTCTCAACACTGCATATTAAGTC
ACAGAAAAAAAACTTTCTTTTCATTTTGATTTCACAAAAAAACATTATTTAATCTTACAT
TTAGGACTATATTTTGTTTCATAAAGAAAACATAGGAACAGAAA

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DS 

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AAACATAGGAACAGAAAAAAAACATTTGATTATATTTCTTTTCCCATCGGATTCCATTTT
TTAATCAACTGTTGTTTGTGCAAAACACACACACACTTAGACAATATCTCACATTCTTTT
AAGAAACTTAGATATTTGGGCGGGTAGATATTTTTTGTAGAGGATGTTGGCAGGTTATTC
AAGTTTATCATTGTTGTCACCGACCCAAAGATTAAGGAGTGAAGCAGTAGCAGCCACAGT
GTCAGTACATTTTCCCATGAACACACAGAGACTGGACTTACCCTGCAGCAGTAGCTTCTC
CCGCAAGGAAACACCTTCACTTGGACGCAGCATCTCACTCGACAACAACAACAACAAACC
GATTGAGCGCAAGACCGGTGGGTGTTTTCTTAAGCAGAGCATAAAGCTTCCGCCTTTGGC
AACAACAAGAGGAAATACACAAGGGTTTTCATGGAACAACGACAAGAACAACAGAGGGAA
GACGATAATTTAGC

QA 1 554 1 554
DS 



AS 1 2

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GGAAAACCAAAACCTCAACAGTTATATTTGGGGATCATCAGGGCTTCTTCTTCACCATGG
ATCCTTACAAGATATATTGTAAAGGTTGGTTCTTCCTGAAGCTTGACTACAATACTACTT
GCTGCTTCAATATCTTCCACTGCAACAAGAAAGAGAACTCAGTACACCCCAAAGTTAACA
TCAAGACCTGCAATTAGCGAAGCCTGTAAAAGAGAAGGAAAGTCCAAGGGAAGTACTAGA
GGCTCGGCTAAGAGCCGCACCACCAGTGAGACGACTAAGGTCAAGAGCAGGGTGTGCACT
TTTGGCCTTCCTAATGTGTGTGTTCCTTCTGTTGCTCTGTTTGTTACTGCTGCCACTTTG
GCTCGGTGATGACGGTGCTCTCACATGGTGCTTTCTCCCGTGGCTACTGCCGCCACCATT
ACTACTGAAATCAAGTGAACTAGACTTGAGAGCTTCTGATAGTGTCTCAGATTTGGCCTT
GACCAAGCCTGATGATGAGGTTCCCACTTCCATCTTGTTTCCCCACCAGTGTTTCTGCAC
GTTTGTCTGTTTTTGTACATATTAATAACAAAATCGATCTTAGTTC


BQ
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AF RS1FS46TF U 1
AF RS1FS46JQ C 117
BS 1 586 RS1FS46TF

RD RS1FS46TF 586 0 0
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GCTGCTTCAATATCTTCCACTGCAACAAGAAAGAGAACTCAGTACACCCCAAAGTTAACA
TCAAGACCTGCAATTAGCGAAGCCTGTAAAAGAGAAGGAAAGTCCAAGGGAAGTACTAGA
GGCTCGGCTAAGAGCCGCACCACCAGTGAGACGACTAAGGTCAAGAGCAGGGTGTGCACT
TTTGGCCTTCCTAATGTGTGTGTTCCTTCTGTTGCTCTGTTTGTTACTGCTGCCACTTTG
GCTCGGTGATGACGGTGCTCTCACATGGTGCTTTCTCCCGTGGCTACTGCCGCCACCATT
ACTACTGAAATCAAGTGAACTAGACTTGAGAGCTTCTGATAGTGTCTCAGATTTGGCCTT
GACCAAGCCTGATGATGAGGTTCCCACTTCCATCTTGTTTCCCCACCAGTGTTTCTGCAC
GTTTGTCTGTTTTTGTACATATTAATAACAAAATCGATCTTAGTTC

QA 1 586 1 586
DS 

RD RS1FS46JQ 470 0 0
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CACTTTTGGCCTTCCTAATGTGTGTGTTCCTTTTGTTGCTCTGTTTGTTACTGCTGCCAC
TTTGGCTCGGTGATGACGGTGCTTTCACATGGTGCTTTTTCCCGTGGCTACTGCCGCCCC
CATTACTACTGAAATCAAGTGAACTAGACTTGAGAGCTTTTGATAGTGTTTCAGATTTGG
CCTTGACCAAGCCTGATGATGAGGTTCCCACTTCCATCTTGTTTCCCCACCAGTGTTTTT
GCACGTTTGTCTGTTTTTGTACATATTAATAACAAAATCGATTTTAGTTC

QA 1 470 1 470
DS 



AS 1 2

CO CL6225Contig1 1177 2 12 U
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TGAAGCTTCTTTTGAGTGAGTCAGATACAACTCTGGACCAAGCCAATGGTCTGCACTACG
TAGTGGCGTACAGTGATCCAAAAGTTGTGGCGGAGGTTCTAGCTCTAGGCATGGCTGATG
TGAATTACAGAAACTCGAGGGGATACACGGTTCTTCATTACGCTGCCATGCGTAGAGAGC
CGTCGATTATCATATCGTTGCTTAAGAAAGGAGCTAATGCTTCGGACTTTACCTTTGATG
GACGCAGTGCGGTTAATATATGTAGGAGACTGACTAGGCCTAAAGATTACTATACGAAAA
CCGCAAAGGGGGATGAAGCTAGTAAAGATCGGTTGTGTATTGATATATTAGAGAGGGAGA
TTAGAAGGAATCCATTGGCTAGTGGTGGTGATACACCTACTCGTTCTCATTCTATGCCTG
AGGATCTTCAAATGAGGCTATTGTACTTAGAAAAGCGAGTGGGACTTGCTCAGCTGTTCT
TCCCGACAGAAGCTGATGTAGCTATGGACATTGCTAATGTTGAAGGGACTAGCGAGTTCA
CAGGTTTACCTGTTCCACCGCCGTCAAATGGTGCAACAGGAAACTTGACTCAGGTCGACC
TGAATGAAACGCCGTATATGCAAACCAAAAGACTGCTTACTCGTATGGAAGCACTCATGA
AAACAGTTGAGACAGGTAGGAGGTATTTTCCATCTTGTTCTGAGGTTCTAGACAAGTACA
TGGATGATTATATGGACGAGGACATACCTGATATGTCGCATTCGGAGAAAGGTTCGGTGA
AAGAGAGGAGATGGAAGAGGATGAGATATAAGGAGCTGAAGAATGATGTTAAAAAGGCTT
ATAATAAAGACAAACAGGCTAAGATTGCACGGTCTTGTCTTTCTGTTTCTTCACCTGATT
CTTTTCTTAGAGGTTCCTTAGAGAACCAAACATGATTATGTGCCATAAATTAATGCCAGT
AATGAGACTTCTTGGAGAATGTTGTTGGTTTAGCAATTTTATAGTAGAAAGTTTGGAGAT
CCCATTTTGGTTTTAGGACATGGTTTGTATGAAATGGAATCGATTTTTGAAATGTATATT
AGAATGCTCTCAAGATCTGAAGCCAAATCCTTCAGTC


BQ
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AF RS1EN68TF U 1
AF RS1EN68JQ C 542
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BS 776 805 RS1EN68TF
BS 806 1177 RS1EN68JQ

RD RS1EN68TF 805 0 0
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TGAAGCTTCTTTTGAGTGAGTCAGATACAACTCTGGACCAAGCCAATGGTCTGCACTACG
TAGTGGCGTACAGTGATCCAAAAGTTGTGGCGGAGGTTCTAGCTCTAGGCATGGCTGATG
TGAATTACAGAAACTCGAGGGGATACACGGTTCTTCATTACGCTGCCATGCGTAGAGAGC
CGTCGATTATCATATCGTTGCTTAAGAAAGGAGCTAATGCTTCGGACTTTACCTTTGATG
GACGCAGTGCGGTTAATATATGTAGGAGACTGACTAGGCCTAAAGATTACTATACGAAAA
CCGCAAAGGGGGATGAAGCTAGTAAAGATCGGTTGTGTATTGATATATTAGAGAGGGAGA
TTAGAAGGAATCCATTGGCTAGTGGTGGTGATACACCTACTCGTTCTCATTCTATGCCTG
AGGATCTTCAAATGAGGCTATTGTACTTAGAAAAGCGAGTGGGACTTGCTCAGCTGTTCT
TCCCGACAGAAGCTGATGTAGCTATGGACATTGCTAATGTTGAAGGGACTAGCGAGTTCA
CAGGTTTACCTGTTCCACCGCCGTCAAATGGTGCAACAGGAAACTTGACTCAG*TCGACC
TGAATGAAACGCCGTATATGCAAACCAAAAGACTGCTTACTCGTATGGAAGCACTCATGA
AA*CAGTTGAGACAGGTAGGAG*TATTTTCCATCTTGTTCTGAGGT*CTAGACA*GTACA
TGGATGATTATATGGACGAGGACAT

QA 1 805 1 805
DS 

RD RS1EN68JQ 636 0 0
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AGGTTTACCTGTTCCACCGCCGTCAAATGGTGCAACAGGAAACTTGACTCAGGTCGACCT
GAATGAAACGCCGTATATGCAAACCAAAAGACTGCTTACTCGTATGGAAGCACTCATGAA
AACAGTTGAGACAGGTAGGAGGTATTTTCCATCTTGTTCTGAGGTTCTAGACAAGTACAT
GGATGATTATATGGACGAGGACATACCTGATATGTCGCATTCGGAGAAAGGTTCGGTGAA
AGAGAGGAGATGGAAGAGGATGAGATATAAGGAGCTGAAGAATGATGTTAAAAAGGCTTA
TAATAAAGACAAACAGGCTAAGATTGCACGGTCTTGTCTTTCTGTTTCTTCACCTGATTC
TTTTCTTAGAGGTTCCTTAGAGAACCAAACATGATTATGTGCCATAAATTAATGCCAGTA
ATGAGACTTCTTGGAGAATGTTGTTGGTTTAGCAATTTTATAGTAGAAAGTTTGGAGATC
CCATTTTGGTTTTAGGACATGGTTTGTATGAAATGGAATCGATTTTTGAAATGTATATTA
GAATGCTCTCAAGATCTGAAGCCAAATCCTTCAGTC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

CO CL6226Contig1 1368 2 6 U
AAAACTTTTGTTATAGCTTCTGTCCATCGCATCTTTTACCCCACCAGTTATTCATCAACC
TTGTCGTCTTCCCTTCACATCCTCAGATTCGATCGTCGGACCTTCTCAGCAATGGCCGGA
GCTGGCGGCGAAGATTTCGTAAAAGTAAACGTTTATCCGAATGGCGTCGCTGTCATCACT
CTCGATCGAACCAAAGCTCTTAACGCCATGAATCTAGAAATGGATTTGAAGTATAAAAGC
TTCCTTGACGAATGGGAATCTGATCCAAGAGTCAAATGTGTCGTCATTCAAGGCAGCACA
CCTCGTGCCTTTTGTGCTGGGATGGATATTAAAGGAGTTGCCGCAGAAATCCAAAAGGAC
AAAAACACACCTCTTGTTCAAAAGGTATTTACAGCAGAATATAGCCTGATATGCGCAATT
GCTGGTTACAAGAAACCGTATATCTCATTAATGGATGGAATAACAATGGGATTTGGCCTT
GGCCTTTCTGTACATGGTCGCTACCGTGTGATAACAGAGAGGACGGTTCTTGCCATGCCG
GAAAATGGAATCGGGTTGTTCCCAGATGTCGGGTTTTTCATATATAGCAGCTCATAGCCC
TGGGGGGAGGATCTGTTGGTGCTTATCTTGGTTTAACTGGAAAAAGGATCTCCACGCCGT
CAGATGCATTGTTCGTTGGTCTTGGGACGCATTATGTGCCATCTGAAAATCTAGCTTCTT
TAAAAGAAGCCATTTTGTCAGCCAACCTGTCGGAGGATCCTAATCAAGACATCCAGGCAA
CTTTGTCGAAATACAGTGGGAATACTGAATCTGAGGCCCATCTCAAATCACTTTTGCCTC
AAATAGAGTCAGCGTTTAGCTCAAATAAGTCTGTTAAGGAAACGATAGAAGAGCTCAAAA
AGTATCAGGAAAGCACTGAGCCTTCAGTTGTAGAATGGGCTACAGAGGCACTCAAAGGTT
TGGAGAAAGGAGCACCGTTTTCTCTTTACCTGACACAGAAGTACTTCTCAAATGTTGCAT
GTGCCAAGGGTAAAGCTGAGAACGAATTAGCAACACTTAATGGTGTGATGAAGACTGAAT
ATCGCATCGCACTAAGATCGGCCTTGCGTGGTGATTTTGCTGAAGGCGTCAGAGCAGTAT
TGATCGACAAGGATCAGAATCCTAAATGGAACCCGGCAAGGGTTGAAGAGGTAGACGAGA
ACGAGGTGGAAGCTCTCTTTAAACCATTAAGTTCAGAAGTGGAAGAGTTAAATGTCTAGT
TCTCAATTTGCTTTCTTTTCAAAGTGTTTCCACAAAATAAAGAAATCTTTCTTTGCCCAT
GTGTGTTTCAAGATACTGTTACTGTATAAGCTTCAATAAGTTGACAGC


BQ
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AF RS1BN29TF U 1
AF RS1BN29JQ C 612
BS 1 815 RS1BN29TF
BS 816 816 RS1BN29JQ
BS 817 837 RS1BN29TF
BS 838 838 RS1BN29JQ
BS 839 861 RS1BN29TF
BS 862 1368 RS1BN29JQ

RD RS1BN29TF 861 0 0
AAAACTTTTGTTATAGCTTCTGTCCATCGCATCTTTTACCCCACCAGTTATTCATCAACC
TTGTCGTCTTCCCTTCACATCCTCAGATTCGATCGTCGGACCTTCTCAGCAATGGCCGGA
GCTGGCGGCGAAGATTTCGTAAAAGTAAACGTTTATCCGAATGGCGTCGCTGTCATCACT
CTCGATCGAACCAAAGCTCTTAACGCCATGAATCTAGAAATGGATTTGAAGTATAAAAGC
TTCCTTGACGAATGGGAATCTGATCCAAGAGTCAAATGTGTCGTCATTCAAGGCAGCACA
CCTCGTGCCTTTTGTGCTGGGATGGATATTAAAGGAGTTGCCGCAGAAATCCAAAAGGAC
AAAAACACACCTCTTGTTCAAAAGGTATTTACAGCAGAATATAGCCTGATATGCGCAATT
GCTGGTTACAAGAAACCGTATATCTCATTAATGGATGGAATAACAATGGGATTTGGCCTT
GGCCTTTCTGTACATGGTCGCTACCGTGTGATAACAGAGAGGACGGTTCTTGCCATGCCG
GAAAATGGAATCGGGTTGTTCCCAGATGTCGGGTTTTTCATATATAGCAGCTCATAGCCC
TGGGGGGAGGATCTGTTGGTGCTTATCTTGGTTTAACTGGAAAAAGGATCTCCACGCCGT
CAGATGCATTGTTCGTTGGTCTTGGGACGCATTATGTGCCATCTGAAAATCTAGCTTCTT
TAAAAGAAGCCATTTTGTCAGCCAACCTGTCGGAGGATCCTAATCAAGACATCCAGGCAA
CTTTGTCGAAATACAGTGGGAATACTGAATCTGAG*CCCATCTCAAATCACTTTTGC*TC
AAATAGAGTCAGCGTTTAGCT

QA 1 861 1 861
DS 

RD RS1BN29JQ 757 0 0
TCTGTTGGTGCTTATCTTGGTTTAACTGGAAAAAGGATCTCCACGCCGTCAGATGCATTG
TTCGTTGGTCTTGGGACGCATTATGTGCCATCTGAAAATCTAGCTTCTTTAAAAGAAGCC
ATTTTGTCAGCCAACCTGTCGGAGGATCCTAATCAAGACATCCAGGCAACTTTGTCGAAA
TACAGTGGGAATACTGAATCTGAGGCCCATCTCAAATCACTTTTGCCTCAAATAGAGTCA
GCGTTTAGCTCAAATAAGTCTGTTAAGGAAACGATAGAAGAGCTCAAAAAGTATCAGGAA
AGCACTGAGCCTTCAGTTGTAGAATGGGCTACAGAGGCACTCAAAGGTTTGGAGAAAGGA
GCACCGTTTTCTCTTTACCTGACACAGAAGTACTTCTCAAATGTTGCATGTGCCAAGGGT
AAAGCTGAGAACGAATTAGCAACACTTAATGGTGTGATGAAGACTGAATATCGCATCGCA
CTAAGATCGGCCTTGCGTGGTGATTTTGCTGAAGGCGTCAGAGCAGTATTGATCGACAAG
GATCAGAATCCTAAATGGAACCCGGCAAGGGTTGAAGAGGTAGACGAGAACGAGGTGGAA
GCTCTCTTTAAACCATTAAGTTCAGAAGTGGAAGAGTTAAATGTCTAGTTCTCAATTTGC
TTTCTTTTCAAAGTGTTTCCACAAAATAAAGAAATCTTTCTTTGCCCATGTGTGTTTCAA
GATACTGTTACTGTATAAGCTTCAATAAGTTGACAGC

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

CO CL6227Contig1 563 2 2 U
GGTTAAACTATAACAATAAGTGCATGCATTCATTAAAAAATCTTATAAACTAAAAGTAGC
AAATAAGAAATGCAAACAAAAAAAACCCAAAACACTTTCAGAAACATCTGTTTCCTGTTT
CTTTATTTCACCCTGAGACATAAACCCTTGAGAAGAAGAAGACAAATGAGATGATTTGGC
AAAACTCACTTGACCACACAGATCTTGATAACAGAAGCAGCTCCAATACGGTGCAGAGCC
ACCACAGCATCACCATGGTTACACAGTCCTTTCTCAGTCGCCGACTTCAAAGCAGACTCG
ATAATCTCCTCCGTAGACTCATTATCAGTCGCTTTCGCAGATCCTTCAGCCAGAAAGGAA
CCAAACCTCTGTATATCAAACTATGCCTCGCCGGCGACTCGTCGCTGCAGCTCCAGTTAA
ACGTATCGCTGGTGAAAACCGGAACAACCACGGAGAGAATCGGAACAGCCGGTCTATACT
TAGCCACCAGCTTAGCCGTCGTACCACCTCTCGTCAGCACGATGATGAGTTTGGCCCTCG
CTTTGTTCGCCGTTCTCACGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BV69TF C 1
AF RS1BV69JQ U 75
BS 1 74 RS1BV69TF
BS 75 563 RS1BV69JQ

RD RS1BV69TF 503 0 0
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AAATAAGAAATGCAAACAAAAAAAACCCAAAACACTTTCAGAAACATCTGTTTCCTGTTT
CTTTATTTCACCCTGAGACATAAACCCTTGAGAAGAAGAAGACAAATGAGATGATTTGGC
AAAACTCACTTGACCACACAGATCTTGATAACAGAAGCAGCTCCAATACGGTGCAGAGCC
ACCACAGCATCACCATGGTTACACAGTCCTTTCTCAGTCGCCGACTTCAAAGCAGACTCG
ATAATCTCCTCCGTAGACTCATTATCAGTCGCTTTCGCAGATCCTTCAGCCAGAAAGGAA
CCAAACCTCTGTATATCAAACTATGCCTCGCCGGCGACTCGTCGCTGCAGCTCCAGTTAA
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TAGCCACCAGCTTAGCCGTCGTA

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DS 

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CACACAGATCTTGATAACAGAAGCAGCTCCAATACGGTGCAGAGCCACCACAGCATCACC
ATGGTTACACAGTCCTTTCTCAGTCGCCGACTTCAAAGCAGACTCGATAATCTCCTCCGT
AGACTCATTATCAGTCGCTTTCGCAGATCCTTCAGCCAGAAAGGAACCAAACCTCTGTAT
ATCAAACTATGCCTCGCCGGCGACTCGTCGCTGCAGCTCCAGTTAAACGTATCGCTGGTG
AAAACCGGAACAACCACGGAGAGAATCGGAACAGCCGGTCTATACTTAGCCACCAGCTTA
GCCGTCGTACCACCTCTCGTCAGCACGATGATGAGTTTGGCCCTCGCTTTGTTCGCCGTT
CTCACGGCC

QA 1 489 1 489
DS 



AS 1 2

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ATGTCACGACCACTACCCCTTGATGAAATGATGGCAGCGTTAAAAGAAAAACACAAAACA
AGTCACTTCTGGAAGATAGAAAATTTCTCTTTAGTCAAAAAACACATCAACAGGGTCGAA
TCCTCTGTTTTTTATCTTGGTGGTTACAGATGGAAACTCACGATGCTCCCATATGGGTTG
GAGGGTAATGTCTTTCATAATGTCGCCTTGGTCTTAGAGAGGCAATTCCCCTCCTTAATT
ATTCAACTTACAGTTGAGTTATTTGTCGTTAATCAACTATCGCAAATATGGCATTCGTCA
GGAAACATAGTCTTACCAGTAGACCGGAACTGGGTTTGGGATCCAAATTTGATGTCACAT
GCCAATTCCGAGTACCTAGGGCAACTCGTTGGAGATTGTTGTATCTTTGGTGTCAGGCTT
TTGGGGTTGAAACTGCGGCTTCTGGAACAGCTGAATGTTTTAGCGTGATTGAGAAACCTC
TCAATCACAAAGTCACTTGGATGATGAACAGGTTCTCGTCTTTCGAGCCTGAAAAGGCTC
ATCATTCTAATGAATTCGTCGTTGGAAACCGGAAATGGAGAATTCAAGTGCACCCAAGAG
GGTTTAAAGAGTGAAAAGACAAATCATTTTCTGTGTATCTAGTAGGAGGTGAGTTTGTCA
ACAATGTGCCGCATGTGGCAAACACTTACGCCATGTTTAAGCTGCGTGTGTTGGATCAAG
TTAACCGCGATCATTTTGAGAGCCGTGTTTTTGGTTGGCTTGGTGGAAATTCTGATGTAA
TCCAAGGATATCCAGAATTTATGCCTCTCTCAAAACTAGGTGAACCTTATCTGGTGAACG
ATAAGTTATATGTGGGAGTTGAGTTTGAATTAATCTCTGTGACTAATTATTGTTAGCTTT
ATAAGAGGACATCACCACGTGCAAAAAGACCTGACCCGTCAAGTATGTTTGGACTAAAGT
CATTTGTCTTTTCTTTTCTTTGCTGTATGAATAAAAGGGAGCACTGCTCTTCTCTCATAC
ATCACTCCCTTAGTTGTGTTTTCTTTTTTTGAAAGAACCTTAGTTGTGTTTTCCTATGTC
CAAGTTTGTAGGAACTTATGGTTCCTTAGATTATTATGTAAGATATGTGTGGACAAAGGT
GAATTATGTAAGATATGTGTGGACAAAGGTGTAGAGAAAACCTTTATTAATCTTCTCGCT
TGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 

AF RS1AM14TF U 1
AF RS1AM14JQ C 466
BS 1 705 RS1AM14TF
BS 706 1263 RS1AM14JQ

RD RS1AM14TF 710 0 0
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ATGTCACGACCACTACCCCTTGATGAAATGATGGCAGCGTTAAAAGAAAAACACAAAACA
AGTCACTTCTGGAAGATAGAAAATTTCTCTTTAGTCAAAAAACACATCAACAGGGTCGAA
TCCTCTGTTTTTTATCTTGGTGGTTACAGATGGAAACTCACGATGCTCCCATATGGGTTG
GAGGGTAATGTCTTTCATAATGTCGCCTTGGTCTTAGAGAGGCAATTCCCCTCCTTAATT
ATTCAACTTACAGTTGAGTTATTTGTCGTTAATCAACTATCGCAAATATGGCATTCGTCA
GGAAACATAGTCTTACCAGTAGACCGGAACTGGGTTTGGGATCCAAATTTGATGTCACAT
GCCAATTCCGAGTACCTAGGGCAACTCGTTGGAGATTGTTGTATCTTTGGTGTCAGGCTT
TTGGGGTTGAAACTGCGGCTTCTGGAACAGCTGAATGTTTTAGCGTGATTGAGAAACCTC
TCAATCACAAAGTCACTTGGATGATGAACAGGTTCTCGTCTTTCGAGCCTGAAAAGGCTC
ATCATTCTAATGAATTCGTCGTTGGAAACCGGAAATGGAGAATTCAAGTGCACCCAAGAG
GGTTTAAAGAGTGAAAAGACAAATCATTTTCTGTGTATCTAGTAG
AGGTG

QA 1 705 1 705
DS 

RD RS1AM14JQ 798 0 0
TTTGGTGTCAGGCTTTTGGGGTTGAAACTGCGGCTTCTGGAACAGCTGAATGTTTTAGCG
TGATTGAGAAACCTCTCAATCACAAAGTCACTTGGATGATGAACAGGTTCTCGTCTTTCG
AGCCTGAAAAGGCTCATCATTCTAATGAATTCGTCGTTGGAAACCGGAAATGGAGAATTC
AAGTGCACCCAAGAGGGTTTAAAGAGTGAAAAGACAAATCATTTTCTGTGTATCTAGTAG
GAGGTGAGTTTGTCAACAATGTGCCGCATGTGGCAAACACTTACGCCATGTTTAAGCTGC
GTGTGTTGGATCAAGTTAACCGCGATCATTTTGAGAGCCGTGTTTTTGGTTGGCTTGGTG
GAAATTCTGATGTAATCCAAGGATATCCAGAATTTATGCCTCTCTCAAAACTAGGTGAAC
CTTATCTGGTGAACGATAAGTTATATGTGGGAGTTGAGTTTGAATTAATCTCTGTGACTA
ATTATTGTTAGCTTTATAAGAGGACATCACCACGTGCAAAAAGACCTGACCCGTCAAGTA
TGTTTGGACTAAAGTCATTTGTCTTTTCTTTTCTTTGCTGTATGAATAAAAGGGAGCACT
GCTCTTCTCTCATACATCACTCCCTTAGTTGTGTTTTCTTTTTTTGAAAGAACCTTAGTT
GTGTTTTCCTATGTCCAAGTTTGTAGGAACTTATGGTTCCTTAGATTATTATGTAAGATA
TGTGTGGACAAAGGTGAATTATGTAAGATATGTGTGGACAAAGGTGTAGAGAAAACCTTT
ATTAATCTTCTCGCTTGC

QA 1 798 1 798
DS 



AS 1 2

CO CL6229Contig1 1298 2 8 U
GGGTGGCAAAAGTGTTTCTCTTTTGGTTCTGTTTTTGGATTATCAGATTCAGGTACAATG
GCGTACGTGAGCGTGTTGTTGTACGGAATAGGAGGGATAGTGGTGGCGGGAGTGGCGCTG
CTGGTGGTGTTCCAGGAGAAGCTTGTGTACGTCCCGGTTCTTCCCGGTTTAACAAAGTCG
TACCCTATCACACCGGCAAGGCTTAATCTCATATACGAGGACGTTTGGCTTCGCTCCTCA
GATGGCGTACGCCTCCACTCTTGGTTCATCAAAATGCTCCCTCTTTCTCAAGGTCCAACC
ATTCTATTTTTCCAGGAGAATGCTGGAAATATTGCTCATCGTCTAGAGATGGTTCGCATC
ATGATACAAAACTTGAACTGCAACGTATTCATGCTTTCATATCGCGGCTATGGGGAAAGT
GATGGTTATCCGTCACAGCATGGAATCATTAAAGATGCTCAGGCTGCGTTGGATCACCTT
TCTCAAAGGACGGATATTGATACATCTAGAATAGTTGTGTTTGGAAGGTCCCTTGGAGGA
GCTGTTGGAGCTGTTCTTACCAAAAACAATCCCGAAAAGGTGTCTGCATTGATTCTGGAA
AACACTTTCACATCCATTCTTGACATGGCTGGTGTGTTGCTGCCCTTCCTGAAGTGGTTT
ATTGGAGGAAGTGGTACTAAAAGCCTGAAACTTCTTAATTTTGTTGTACGCTCCCCCTGG
AAATTGATACTATTGGTGAGGTCAAACAACCAGTACTTTTCCTCTCTGGACTGAAAGATG
AAATGGTCCCTCCATTTCACATGAAAATGCTGTATGCCAAAGCGGCTGCACGTAACTCTC
AGTGCACCTTTGTGGAATTTCCAAGTGGGATGCATATGGATACATGGCTGACTGGGGGTG
ACGTTTACTGGAGATCGGTCATGCAGTTCCTTGTAAAGCATGCACCCGAGGAAAAGAAAC
AACAATAAAAGGAAGGTAACTAGTTGAAGATGCTGCGTTTAGAGGAAGTTTGGACTCAGT
TGGATCCTACTGAAACCTGAAACATTAGTATCTTTATAAAGCAGATGTATATGCTTATAT
TGCATTTGCTGGAGAGGGACTCTGTAAGAAGAAACAACCACTGGGAGATGTCAAAGTGTA
CGTTCTGAGTTGTTTCGGTTTTCCTGTCGTTTTTGGTTTTTTTTTGAATTTTTTTTTCCA
ACTGTTGGTGCTTCTCTTTTGATGCTAACCACCATTCCTCTAAGGTGATTATTGCTTTGT
AGATGATTGAGAAAATGCAAAGAGACATGGTTATATGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A407TF U 1
AF RS1A407JQ C 456
BS 1 601 RS1A407TF
BS 602 602 RS1A407JQ
BS 603 820 RS1A407TF
BS 821 821 RS1A407JQ
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BS 849 899 RS1A407TF
BS 900 1298 RS1A407JQ

RD RS1A407TF 899 0 0
GGGTGGCAAAAGTGTTTCTCTTTTGGTTCTGTTTTTGGATTATCAGATTCAGGTACAATG
GCGTACGTGAGCGTGTTGTTGTACGGAATAGGAGGGATAGTGGTGGCGGGAGTGGCGCTG
CTGGTGGTGTTCCAGGAGAAGCTTGTGTACGTCCCGGTTCTTCCCGGTTTAACAAAGTCG
TACCCTATCACACCGGCAAGGCTTAATCTCATATACGAGGACGTTTGGCTTCGCTCCTCA
GATGGCGTACGCCTCCACTCTTGGTTCATCAAAATGCTCCCTCTTTCTCAAGGTCCAACC
ATTCTATTTTTCCAGGAGAATGCTGGAAATATTGCTCATCGTCTAGAGATGGTTCGCATC
ATGATACAAAACTTGAACTGCAACGTATTCATGCTTTCATATCGCGGCTATGGGGAAAGT
GATGGTTATCCGTCACAGCATGGAATCATTAAAGATGCTCAGGCTGCGTTGGATCACCTT
TCTCAAAGGACGGATATTGATACATCTAGAATAGTTGTGTTTGGAAGGTCCCTTGGAGGA
GCTGTTGGAGCTGTTCTTACCAAAAACAATCCCGAAAAGGTGTCTGCATTGATTCTGGAA
A*CACTTTCACATCCATTCTTGACATGGCTGGTGTGTTGCTGCCCTTCCTGAAGTGGTTT
ATTGGAGGAAGTGGTACTAAAAGCCTGAAACTTCTTAATTTTGTTGTACGCTCCCCCTGG
AAATTGATACTATTGGTGAGGTCAAACAACCAGTACTTTTCCTCTCTGGACTGAAAGATG
AAATGGTCCCTCCATTTCACATGAAAATGCTGTATGCCAA*GCGGCTGCACGTAACTCTC
AGTGCAC*TTTGTGGAATTTCCAAGTGGGATGCATATGGATACATGGCTGACTGGGGGT

QA 1 899 1 899
DS 

RD RS1A407JQ 843 0 0
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TGTGTTTGGAAGGTCCCTTGGAGGAGCTGTTGGAGCTGTTCTTACCAAAAACAATCCCGA
AAAGGTGTCTGCATTGATTCTGGAAAACACTTTCACATCCATTCTTGACATGGCTGGTGT
GTTGCTGCCCTTCCTGAAGTGGTTTATTGGAGGAAGTGGTACTAAAAGCCTGAAACTTCT
TAATTTTGTTGTACGCTCCCCCTGGAAATTGATACTATTGGTGAGGTCAAACAACCAGTA
CTTTTCCTCTCTGGACTGAAAGATGAAATGGTCCCTCCATTTCACATGAAAATGCTGTAT
GCCAAAGCGGCTGCACGTAACTCTCAGTGCACCTTTGTGGAATTTCCAAGTGGGATGCAT
ATGGATACATGGCTGACTGGGGGTGACGTTTACTGGAGATCGGTCATGCAGTTCCTTGTA
AAGCATGCACCCGAGGAAAAGAAACAACAATAAAAGGAAGGTAACTAGTTGAAGATGCTG
CGTTTAGAGGAAGTTTGGACTCAGTTGGATCCTACTGAAACCTGAAACATTAGTATCTTT
ATAAAGCAGATGTATATGCTTATATTGCATTTGCTGGAGAGGGACTCTGTAAGAAGAAAC
AACCACTGGGAGATGTCAAAGTGTACGTTCTGAGTTGTTTCGGTTTTCCTGTCGTTTTTG
GTTTTTTTTTGAATTTTTTTTTCCAACTGTTGGTGCTTCTCTTTTGATGCTAACCACCAT
TCCTCTAAGGTGATTATTGCTTTGTAGATGATTGAGAAAATGCAAAGAGACATGGTTATA
TGT

QA 1 843 1 843
DS 



AS 1 2

CO CL6230Contig1 651 2 3 U
GGAAACGCGTTTGTTGGATAATTTCACAAAGTCTAATCCGTGCAATCACTGTAGAATAGG
CAATGATACCCAAGTGTCTGATAAACGAAATAGCAAAACTAAGAAAACACGATTAACACA
CAGATTTATATGATTATAGATCCTTCTGTTTGAGAGGATGGTCTTAGCCAGTAATGTTCT
GAGACTTGTTGAGAATGACTCCTTCATACTTCACTTGGAACCATTTCATGGCATCATCTT
TGGTGACTCTGTGCTGGATACCAACACGAGCCTTGCACCTTCTGCGACGCGCCACACGGT
AACCAGGACGCTCAAGAACAACATAAAAGTCCATACCGTAAATTCCAGTCGACGGGTCAT
ACTTGATACCCAAATCAATATGCTCCTGAATACCGAAACCGAAGCAACCAGTGTCGCTGA
AGTTCCTTCTCAAGAGCTCATACTCTTTAACTTTGAGTCCACTTTCAAGGAGTTGCATAG
CCTTGTCTCCCCTGACAGTCACGTAGCAAGCAATCTTCTCGTTACGTCTGATACCGAAAG
AACGAACGGTGTATCTTGCCTTGGAGAAAACAGGAGTCTGACCACTCAACTGCTCCAGCA
CCTTGGAGGCTCTGGTGAGACGATCTCCACTCTCACCTACGGAGATGTTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1A458TF C 1
AF RS1A458JQ U 195
BS 1 194 RS1A458TF
BS 195 630 RS1A458JQ
BS 631 651 RS1A458TF

RD RS1A458TF 651 0 0
GGAAACGCGTTTGTTGGATAATTTCACAAAGTCTAATCCGTGCAATCACTGTAGAATAGG
CAATGATACCCAAGTGTCTGATAAACGAAATAGCAAAACTAAGAAAACACGATTAACACA
CAGATTTATATGATTATAGATCCTTCTGTTTGAGAGGATGGTCTTAGCCAGTAATGTTCT
GAGACTTGTTGAGAATGACTCCTTCATACTTCACTTGGAACCATTTCATGGCATCATCTT
TGGTGACTCTGTGCTGGATACCAACACGAGCCTTGCACCTTCTGCGACGCGCCACACGGT
AACCAGGACGCTCAAGAACAACATAGAAGTCCATACCGTAGATTCCAGTCGACGGGTCAT
ACTTGATACCCAAATCAATATGCTCCTGAATACCGAAACCGAAGCAACCAGTGTCGCTGA
AGTTCCTTCTCAAGAGCTCATACTCTTTAACTTTGAGTCCACTTTCAAGGAGTTGCATAG
CCTTGTCTCCCCTGACAGTCACGTAGCAAGCAATCTTCTCGTTACGTCTGATACCGAAAG
AACGAACGGTGTATCTTGCCTTGGAGAAAACAGGAGTCTGACCACTCAACTGCTCCAGCA
CCTTGGAGGCTCTGGTGAGACGATCTCCACTCTCACCTACGGAGATGTTGA

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1A458JQ 436 0 0
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TGGATACCAACACGAGCCTTGCACCTTCTGCGACGCGCCACACGGTAACCAGGACGCTCA
AGAACAACATAAAAGTCCATACCGTAAATTCCAGTCGACGGGTCATACTTGATACCCAAA
TCAATATGCTCCTGAATACCGAAACCGAAGCAACCAGTGTCGCTGAAGTTCCTTCTCAAG
AGCTCATACTCTTTAACTTTGAGTCCACTTTCAAGGAGTTGCATAGCCTTGTCTCCCCTG
ACAGTCACGTAGCAAGCAATCTTCTCGTTACGTCTGATACCGAAAGAACGAACGGTGTAT
CTTGCCTTGGAGAAAACAGGAGTCTGACCACTCAACTGCTCCAGCACCTTGGAGGCTCTG
GTGAGACGATCTCCAC

QA 1 436 1 436
DS 



AS 1 2

CO CL6231Contig1 1044 2 6 U
GCTAATCATGGGATTATGAACCCTGAGAACGGTTTCTCGAGTTACAGAATGATGTCTTCG
CCGAGGTTCAGCCCTATGTTCTTAAGCAGCGGTCTAAACCCTGGACGGTTCACCTCTTCT
GGTGTTGATGGATTGTATGAGAATGGAAGGTCCCGTCGAGTGGAGAACAGTTCGAGCCAG
GTTGAAAGCAGGAAGCAGTTCCAGCTTGATTTGGAGAAGATTATGAATGGAGAAGATTCT
AGGACTACCTTGATGATTAAGAACATTCCTAACAAATACACTTCAAAGATGTTGTTAGCG
GCGATTGATGAAAAGAACCAAGGCACTTACAACTTTCTCTACTTGCCCATTGATTTTAAG
AACAAATGCAATGTTGGCTATGCATTCATCAACATGCTCTCTCCTGATCTCATTATTCCA
TTTTACGAGGCGTTTAACGGGAAGAAGTGGGAGAAGTTCAACAGTGAGAAAGTGGCTTCG
TTGGCATACGCTAGGATACAAGGCAAAACTGCACTTATAGCCCATTTTCAGAACTCGAGC
TTGATGAATGAAGACATGCGTTGCCGTCCAATCATCTTCGACACACCTAACAGTTCAGAC
TCTGTTGAACAGGTTATTGTTAAAGAAACTAAGAACGGGGATTTATTTGACTCTGAGGTT
AATGATGATGGCGATGGTAGAGAGAAGAGCTGACCCAAGAGAGAGAGAGAGAAGACTCGG
TGTTGTGATCATGGCTTTGTTTTTTTCTTTTTCAAGTACTAATTATTAACCGTACATAAT
GGGTGAAAGGCAGAGTTATAACTGATGCAGGAGCCTTGCAAAAGTGTGTTTTGCGATTTG
CAGGTTTTAAATGCTGCAGCTGGAGAGTATCTATCTTATCTTACTCTACTCTGTTTCTTC
TTTTCTCTTCATGTTTTTTTTTTTTGGTTTGGTTCCATGGAGCACTGTATATTATAAAGA
AAAGCCATGAATACTCGGATTTTATGTGGGTAATGATGTTGTAACTCTCTCTGTGACTCT
TGTTGCTTTTATTTATTAAAAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
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AF RS1CX26TF U 1
AF RS1CX26JQ C 296
BS 1 657 RS1CX26TF
BS 658 658 RS1CX26JQ
BS 659 712 RS1CX26TF
BS 713 713 RS1CX26JQ
BS 714 740 RS1CX26TF
BS 741 1044 RS1CX26JQ

RD RS1CX26TF 740 0 0
GCTAATCATGGGATTATGAACCCTGAGAACGGTTTCTCGAGTTACAGAATGATGTCTTCG
CCGAGGTTCAGCCCTATGTTCTTAAGCAGCGGTCTAAACCCTGGACGGTTCACCTCTTCT
GGTGTTGATGGATTGTATGAGAATGGAAGGTCCCGTCGAGTGGAGAACAGTTCGAGCCAG
GTTGAAAGCAGGAAGCAGTTCCAGCTTGATTTGGAGAAGATTATGAATGGAGAAGATTCT
AGGACTACCTTGATGATTAAGAACATTCCTAACAAATACACTTCAAAGATGTTGTTAGCG
GCGATTGATGAAAAGAACCAAGGCACTTACAACTTTCTCTACTTGCCCATTGATTTTAAG
AACAAATGCAATGTTGGCTATGCATTCATCAACATGCTCTCTCCTGATCTCATTATTCCA
TTTTACGAGGCGTTTAACGGGAAGAAGTGGGAGAAGTTCAACAGTGAGAAAGTGGCTTCG
TTGGCATACGCTAGGATACAAGGCAAAACTGCACTTATAGCCCATTTTCAGAACTCGAGC
TTGATGAATGAAGACATGCGTTGCCGTCCAATCATCTTCGACACACCTAACAGTTCAGAC
TCTGTTGAACAGGTTATTGTTAAAGAAACTAAGAACGGGGATTTATTTGACTCTGAG*TT
AATGATGATGGCGATGGTAGAGAGAAGAGCTGACCCAAGAGAGAGAGAGAGA*GACTCGG
TGTTGTGATCATGGCTTTGT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RS1CX26JQ 749 0 0
TAGCGGCGATTGATGAAAAGAACCAAGGCACTTACAACTTTCTCTACTTGCCCATTGATT
TTAAGAACAAATGCAATGTTGGCTATGCATTCATCAACATGCTCTCTCCTGATCTCATTA
TTCCATTTTACGAGGCGTTTAACGGGAAGAAGTGGGAGAAGTTCAACAGTGAGAAAGTGG
CTTCGTTGGCATACGCTAGGATACAAGGCAAAACTGCACTTATAGCCCATTTTCAGAACT
CGAGCTTGATGAATGAAGACATGCGTTGCCGTCCAATCATTTTCGACACACCTAACAGTT
CAGACTCTGTTGAACAGGTTATTGTTAAGGAAACTAAGAACGGGGATTTATTTGACTCTG
AGGTTAATGATGATGGCGATGGTAGAGAGAAGAGCTGACCCAAGAGAGAGAGAGAGAAGA
CTCGGTGTTGTGATCATGGCTTTGTTTTTTTCTTTTTCAAGTACTAATTATTAACCGTAC
ATAATGGGTGAAAGGCAGAGTTATAACTGATGCAGGAGCCTTGCAAAAGTGTGTTTTGCG
ATTTGCAGGTTTTAAATGCTGCAGCTGGAGAGTATCTATCTTATCTTACTCTACTCTGTT
TCTTCTTTTCTCTTCATGTTTTTTTTTTTTGGTTTGGTTCCATGGAGCACTGTATATTAT
AAAGAAAAGCCATGAATACTCGGATTTTATGTGGGTAATGATGTTGTAACTCTCTCTGTG
ACTCTTGTTGCTTTTATTTATTAAAAGGC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

CO CL6232Contig1 1262 2 4 U
GGGGGGATGCTAGTGACCTTTTGTCTTTTCTTCAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTTTCA
TTCTGGTTCCAACAATATGTATGCAAAAGAAGAAGACTGTCTTCAAACGAATCACAACTT
ACAAGACTATCAAGACCAGTTTCTTCTTCAACACCGTCCACAAATCCTGCCTTGGTCATC
TCTACCTTCATTTGACCCGAGCTATTTCCCATCCAACCAGACCCGTCATCCTGATCCTGT
CCCCTATTTCAATAGAAGAGCTTCTTCGTCCTCTTTTTTTGACTATACCGATGGTTTCGT
CTCTCCTCCTTCCATGGATCGTCATCATCCCAATCATCTAAGGGTTTTATCGGAGGCTCT
TGGACCCATCATGCGACGTGGCTCATCCTTCGGGGTTGAAGATGAGATTATGGGAAAACT
GAGTGCACAAGAAGTCATGGATGCTAAGGCACTGGCTGCTTCGAAGAGTCATAGTGAAGC
TGAGAGAAGAAGACGAGAGAGAATCAACACTCATCTAGCTAACTTGCGAAGTATTTTACC
AAATACAACCAAAACGGACAAAGCTTCGCTGCTAGCGGAAGTGATCCAACACATGAAGGA
GTTAAAACGACAGACATCACTGATCACAGACACCGGTCAACTCCCAACAGAGTGCGATGA
TCTGACCGTTGACTCTACTTACAACGACGAAGAAGGAAACTTGATGATAAGAGTTTCCTT
TTGCTGCGAAGACAGGACTGAACTCATGCATGACATTATCACTGCCTTAAAGTCTCTTCA
TCTCCGAACTCTCAAAGCCGAGATCGCAACCGTAGGTGGTCGTATCAAGAACGTCTTTTT
CTTGAGCCGAGAAGACGATGATGAATATCGTAGAAACTTCGATGGTATTGAGTGGATAAT
GATGATGAAGAGAAGAGATGTAATCGCGTGAGTTCTATAGAAGAAGCGTTAAAAGCGGTT
ATAGAGAAATGTGTCAAAAACGATGATGATAACAATAACTTGGATAAATCATTTTCAGGG
AGTACTAAGAGGCAAAGGACTAGCAAGATGGTAAACCGAGGTTATAATTAGTTAATCCTC
CCACAATATTATTGTTTAGATCATCAAGTCTTTAATTAATGTGTTAATTAGACTTGCAAA
TTGGGATTATGTGATAATTTGTATTTTTGGAGGGGGGGGGGGGGATCACTAGTCCTTTTT
AATTGGATTTGGGTTTCTTCTTTTATGTTTTTAATCTACGGAGGACCCTTTATCTAGTGT
TT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RS1A519TF U 1
AF RS1A519JQ C 549
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BS 696 696 RS1A519JQ
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BS 816 1262 RS1A519JQ

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ACAAGACTATCAAGACCAGTTTCTTCTTCAACACCGTCCACAAATCCTGCCTTGGTCATC
TCTACCTTCATTTGACCCGAGCTATTTCCCATCCAACCAGACCCGTCATCCTGATCCTGT
CCCCTATTTCAATAGAAGAGCTTCTTCGTCCTCTTTTTTTGACTATACCGATGGTTTCGT
CTCTCCTCCTTCCATGGATCGTCATCATCCCAATCATCTAAGGGTTTTATCGGAGGCTCT
TGGACCCATCATGCGACGTGGCTCATCCTTCGGGGTTGAAGATGAGATTATGGGAAAACT
GAGTGCACAAGAAGTCATGGATGCTAAGGCACTGGCTGCTTCGAAGAGTCATAGTGAAGC
TGAGAGAAGAAGACGAGAGAGAATCAACACTCATCTAGCTAACTTGCGAAGTATTTTACC
AAATACAACCAAAACGGACAAAGCTTCGCTGCTAGCGGAAGTGATCCAACACATGAAGGA
GTTAAAACGACAGACATCACTGATCACAGACACCGGTCAACTCCCAACAGAGTGCGATGA
TCTGACCGTTGACTCTACTTACAACGACGAAGAAG*AAACTTGATGATAAGAGTTTCCTT
TTGCTGCGAAGACAGGACTGAACTCATGCATGACATTATCACTGCCTTAAAGTCTCTTCA
TCTCCGAACTCTCAAAGCCGAGATCGCAACCGTAG
TG

QA 1 815 1 815
DS 

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TTGACTCTACTTACAACGACGAAGAAGGAAACTTGATGATAAGAGTTTCCTTTTGCTGCG
AAGACAGGACTGAACTCATGCATGACATTATCACTGCCTTAAAGTTTTTTCATTTCCGAA
CTTTCAAAGCCGAGATCGCAACCGTAGGTGGTCGTATCAAGAACGTCTTTTTCTTGAGCC
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TTATTGTTTAGATCATCAAGTCTTTAATTAATGTGTTAATTAGACTTGCAAATTGGGATT
ATGTGATAATTTGTATTTTTGGAGGGGGGGGGGGGGATCACTAGTCCTTTTTAATTGGAT
TTGGGTTTCTTCTTTTATGTTTTTAATCTACGGAGGACCCTTTATCTAGTGTTT

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

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AAGAGGAAGAGGATGATAGACAGAGTACCTCTCTGGCAAGTCAAATGAGGCGACAAGGAC
GGGTTCTACTAGGACGATCGGGTAGGAGACGTAGAGATAGAGAAGCTAACCAGAGACCAG
GTCCCCCTCCTAGATAAGAAGAGATATCACTAAGTTTGGTTTTGGGTTTCAGGTAAGTTC
AAGAAAGCAATTGACCTGTGAACCCTTTTTTTCCGCTGAATTTGACTCAGATTTGCTTCT
GGTTGTCAAAGAAGCAGGTCTGTGTTTACGCATTTTAGTGTATCCTGATGTAACTTTTCT
TGTCAAAGTTTTACATATGTGAATAAGCATGGTGATTAGTGATGCTCAGTGATCACACTA
TTCTGCAATCATGAACAATTGGATACTCGTTTTTGTTTATAAGTTTTATATCCCCTTTTA
CTAAGGAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GY57TF U 1
AF RS1GY57JQ C 1
BS 1 432 RS1GY57TF
BS 433 608 RS1GY57JQ

RD RS1GY57TF 432 0 0
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GTCCCCCTCCTAGATAAGAAGAGATATCACTAAGTTTGGTTTTGGGTTTCAGGTAAGTTC
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GGTTGTCAAAGA

QA 1 432 1 432
DS 

RD RS1GY57JQ 608 0 0
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TCCTTATGATGCATGCTGTTGGGGCGTCGAGGAGTCAGACAAGACGCTCTGATTCTGATT
CGAGCGACTTGACGACGACGATCAACCGTGGAACAACAAATGAGATGACTTTCTCTGGAG
AAGAGGAAGAGGATGATAGACAGAGTACCTTTCTGGCAAGTCAAATGAGGCGACAAGGAC
GGGTTCTACTAGGACGATCGGGTAGGAGACGTAGAGATAGAGAAGCTAACCAGAGACCAG
GTCCCCCTCCTAGATAAGAAGAGATATCACTAAGTTTGGTTTTGGGTTTCAGGTAAGTTC
AAGAAAGCAATTGACCTGTGAACCCTTTTTTTCCGCTGAATTTGACTCAGATTTGCTTCT
GGTTGTCAAAGAAGCAGGTCTGTGTTTACGCATTTTAGTGTATCCTGATGTAACTTTTCT
TGTCAAAGTTTTACATATGTGAATAAGCATGGTGATTAGTGATGCTCAGTGATCACACTA
TTCTGCAATCATGAACAATTGGATACTCGTTTTTGTTTATAAGTTTTATATCCCCTTTTA
CTAAGGAT

QA 1 608 1 608
DS 



AS 1 2

CO CL6234Contig1 816 2 2 U
GGATGCAGATCCCTTGTCTTATTTCAGCATCTTCCTTCTCCGTCTGTAACTCCTATTTTA
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GGAACTGAGAAACCTGAGTTTGGGGAATGGTCTTGGGTGTCTCCTGATCAACTCGTTCAT
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ACGTGAAAATACAATCATTTTACCCTCTGTTTCCGT


BQ
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AF RS1E371TF U 1
AF RS1E371JQ C 181
BS 1 620 RS1E371TF
BS 621 816 RS1E371JQ

RD RS1E371TF 620 0 0
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CGAAACTACCCCTTCAAACCGCTGAAATTATCCAGCCTGCCCATCTCCCATCGCTGCCGT
CAGTCTCCAGCATCCTCCTCCTCCGCTCGGTGTTGTTATTATTCGTCGTCGTCGTCGTCG
TCGATGGAGTCTCCTCCGGAAGGTTACAGAAAAAACGTGGGTGCCTGTCTCATGAATCCT
TCCAAAAAGATCTTCGCTGCGTCGAGGTTGGATATTCCCAGTGCTTGGCAGATGCCTCAG
GGTGGAATCGACGAGGGTGAAGATCCAAGAGTTGCAGTCATGAGGGAACTTAAGGAAGAG
ACTGGTGTTCACTCTGCTGAGATCATCGCTGAGGCACCTCACTGGGCGACTTATGATTTC
CCTCCAGATGTTAGGGAGAAGCTTAAGGTCCGTTGGGGATCTGACTGGAAGGGCCAAGCT
CAGAAGTGGTTTCTTCTAAAATTTACCGGGGAAGATGAAGAAATCAATCTTCTTGGCGAT
GGAACTGAGAAACCTGAGTTTGGGGAATGGTCTTGGGTGTCTCCTGATCAACTCGTTCAT
CTTGCAGTGGATTTCAAGAA

QA 1 620 1 620
DS 

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TCGATGGAGTCTCCTCCGGAAGGTTACAGAAAAAACGTGGGTGCCTGTCTCATGAATCCT
TCCAAAAAGATCTTCGCTGCGTCGAGGTTGGATATTCCCAGTGCTTGGCAGATGCCTCAG
GGTGGAATCGACGAGGGTGAAGATCCAAGAGTTGCAGTCATGAGGGAACTTAAGGAAGAG
ACTGGTGTTCACTCTGCTGAGATCATCGCTGAGGCACCTCACTGGGCGACTTATGATTTC
CCTCCAGATGTTAGGGAGAAGCTTAAGGTCCGTTGGGGATCTGACTGGAAGGGCCAAGCT
CAGAAGTGGTTTTTTTTAAAATTTACCGGGGAAGATGAAGAAATCAATTTTCTTGGCGAT
GGAACTGAGAAACCTGAGTTTGGGGAATGGTCTTGGGTGTCTCCTGATCAACTCGTTCAT
CTTGCAGTGGATTTCAAGAAGCCAGTATACAAGGAAGCCATGTCAGCTTTCGCTTCTCAT
CTCCAGTAATACAACAAAACCATTTCTAACTCACTGCTTTTATGTTTTCTTTTGTGGTAT
CAAACTCGAGAAAAAATAAGCTCTTATTGAAATACATTTGCTTCTTGAATAATCCCATGA
ACGTGAAAATACAATCATTTTACCCTCTGTTTCCGT

QA 1 636 1 636
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL6237Contig1 451 2 2 U
GTAACAAAATCAAATAAACAATCCTTTACGTTTGTGATCAAATATTACATTGTAACGTTA
GTCAAGTGATCACAATTAACGAAGGTCATTCCTTTACGTTTGCATGCTATTTTTGAAACT
AGGAGTAGCAGTTGAAAAAGCCCAAAGAACAAAAGCACATAGAAAGAGAACCAGAGGGAT
TATGTGAACAGCTCTCTCTCTATTAACAGACTTGTAGCTATTGTTGTGAAGCATCAGCTC
CTTCTTGGCGACGTCATAGACCACGAGGTCGTCGGCACTTGAAGAATCCGGCGAGAGGTT
AATCAGAAACTCTTCGGATGGCCGAGAACTAATCTGTAACCTCTGCATCGTGTTGGTTTG
ATTTGGACTTGGAAACAAATGTTATACTATGCGATGTCTCTCTTTGTAAGGCTTCGTGAC
AACGTCTTTGCGGTTATGTAAGGTTCTCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DV87TF C 1
AF RS1DV87JQ U 25
BS 1 24 RS1DV87TF
BS 25 451 RS1DV87JQ

RD RS1DV87TF 451 0 0
GTAACAAAATCAAATAAACAATCCTTTACGTTTGTGATCAAATATTACATTGTAACGTTA
GTCAAGTGATCACAATTAACGAAGGTCATTCCTTTACGTTTGCATGCTATTTTTGAAACT
AGGAGTAGCAGTTGAAAAAGCCCAAAGAACAAAAGCACATAGAAAGAGAACCAGAGGGAT
TATGTGAACAGCTCTCTCTCTATTAACAGACTTGTAGCTATTGTTGTGAAGCATCAGCTC
CTTCTTGGCGACGTCATAGACCACGAGGTCGTCGGCACTTGAAGAATCCGGCGAGAGGTT
AATCAGAAACTCTTCGGATGGCCGAGAACTAATCTGTAACCTCTGCATCGTGTTGGTTTG
ATTTGGACTTGGAAACAAATGTTATACTATGCGATGTCTCTCTTTGTAAGGCTTCGTGAC
AACGTCTTTGCGGTTATGTAAGGTTCTCTCC

QA 1 451 1 451
DS 

RD RS1DV87JQ 427 0 0
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GTCATTCCTTTACGTTTGCATGCTATTTTTGAAACTAGGAGTAGCAGTTGAAAAAGCCCA
AAGAACAAAAGCACATAGAAAGAGAACCAGAGGGATTATGTGAACAGCTCTCTCTCTATT
AACAGACTTGTAGCTATTGTTGTGAAGCATCAGCTCCTTCTTGGCGACGTCATAGACCAC
GAGGTCGTCGGCACTTGAAGAATCCGGCGAGAGGTTAATCAGAAACTCTTCGGATGGCCG
AGAACTAATCTGTAACCTCTGCATCGTGTTGGTTTGATTTGGACTTGGAAACAAATGTTA
TACTATGCGATGTCTCTCTTTGTAAGGCTTCGTGACAACGTCTTTGCGGTTATGTAAGGT
TCTCTCC

QA 1 427 1 427
DS 



AS 1 2

CO CL6238Contig1 1483 2 2 U
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AATGGGCATTCGCTTCTCCACAATCTCGGTTTTGTTTCTGTTTCTCTTTTCTTGGACTAG
CTTCATCACAACAGAAGCTTATGATGCACTTGATCCAACTGGAAACATTACCATAAAATG
GGATATCTTGAGCTGGACTGGTGATGGCTATGTGGCTCGTGTATCAATCTTCAATTTCCA
ACAATACCGTCACATCCAGGCCCCGGGTTGGCAATTAGGCTGGAGTTGGTATAAGAAAGA
AGTGATATGGAGTATGGTTGGTGCGCAAGCCACCGACCAAGGAGATTGTTCTAAGTTCAA
AGGTAACATTCCTCATTGCTGCAAGAAAACCCCCACCGTCGTTGACTTGTTACCGGGAAC
TCCCTACAACCAGCAGATATCAAACTGTTGTCGAGGCGGTGTGATTAGCTCCTGGGCACA
AGACCCATCAACCGCTGTTTCTTCGTTTCAGATCAGTGTTGGCCAATCTGGTACCACTAA
TACGACCGTTAGAGCGCCTAGGAACGTTACTTTGAGAGCACCAGGGCCTGGTTACACTTG
CGGGCCTGCTAAAGTCGTTCCGCCTACAAACTTTATTTCTGATGATAAACGAAGAAAGAC
TCAGGCTATGTTGACATGGAACATGACGTGCACGTATTCACAGTTTCTAGCTGAGAGACT
CCCACTTGTTGTGTCTCACTCTCGGCTTTCTACAATAAGACTATCGTACCATGCCCAACA
TGTTCGTGTGGATGTCAAAACGGTACATGTGTCGACAACCCGAAAATAGCTTCGGTGGTA
TCAGCTGTCTCAGGGAAGAACAACCTCCAGCCGTTCTTGCAATGCACGCAGCATATGTGT
CCCATCAGAGTTCATTGGCATGTGAAAACTAACTACAAAGAGTACTGGCGTGTGAAGGTC
ACGATCACAAACTTCAACTACAATATGAATTACTCGCAGTGGAATTTGGTTGTTCAGCAT
CCTAACTTCGACAATATCACTCAGCTTTTCAGCTTTAACTACAAACCTCTTAGTCCTTAC
GCTGGCATAAATGACACGGCCATGTTGTGGGGGATCAAGTTCTATAACGATTTTTTGAGC
CAGGCCGGTCCAGTAGGCAACGTACAGTCAGAACTTCTCTTCCGAAAGGACCCGTCATCG
TTCACGCTCGAGAAAGGATGGGCGTTTCCAAGACGCATTTACTTCAACGGAGATAACTGC
GTTATGCCACCTCCAGACTCGTATCCATGGCTTCCTAACGCTGCTTCAAACCTTGCAACT
TCGTCACTCATCATACTTATCATTAATTTCTTCTCTGTTTTGATTCTTATGTAAAGTGAT
CACGTTGAAATATTGTGCTTTTGACCCGGTTCATACTTTTGGGATCAGACTGGATCCTCA
TTGGCTAATATATAAAAATGGCATGCGGCACTCTGTTCATGAC


BQ
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AF RS1CE22TF U 1
AF RS1CE22JQ C 732
BS 1 788 RS1CE22TF
BS 789 1483 RS1CE22JQ

RD RS1CE22TF 788 0 0
GGATCTTCGAGAAGTTTCCGCCGGCGGGAGATCAAAAAACTGTTTGTCAAAGATCAGAGA
AATGGGCATTCGCTTCTCCACAATCTCGGTTTTGTTTCTGTTTCTCTTTTCTTGGACTAG
CTTCATCACAACAGAAGCTTATGATGCACTTGATCCAACTGGAAACATTACCATAAAATG
GGATATCTTGAGCTGGACTGGTGATGGCTATGTGGCTCGTGTATCAATCTTCAATTTCCA
ACAATACCGTCACATCCAGGCCCCGGGTTGGCAATTAGGCTGGAGTTGGTATAAGAAAGA
AGTGATATGGAGTATGGTTGGTGCGCAAGCCACCGACCAAGGAGATTGTTCTAAGTTCAA
AGGTAACATTCCTCATTGCTGCAAGAAAACCCCCACCGTCGTTGACTTGTTACCGGGAAC
TCCCTACAACCAGCAGATATCAAACTGTTGTCGAGGCGGTGTGATTAGCTCCTGGGCACA
AGACCCATCAACCGCTGTTTCTTCGTTTCAGATCAGTGTTGGCCAATCTGGTACCACTAA
TACGACCGTTAGAGCGCCTAGGAACGTTACTTTGAGAGCACCAGGGCCTGGTTACACTTG
CGGGCCTGCTAAAGTCGTTCCGCCTACAAACTTTATTTCTGATGATAAACGAAGAAAGAC
TCAGGCTATGTTGACATGGAACATGACGTGCACGTATTCACAGTTTCTAGCTGAGAGACT
CCCACTTGTTGTGTCTCACTCTCGGCTTTCTACAATAAGACTATCGTACCATGCCCAACA
TGTTCGTG

QA 1 788 1 788
DS 

RD RS1CE22JQ 752 0 0
TGTCTCACTCTCGGCTTTCTACAATAAGACTATCGTACCATGCCCAACATGTTCGTGTGG
ATGTCAAAACGGTACATGTGTCGACAACCCGAAAATAGCTTCGGTGGTATCAGCTGTCTC
AGGGAAGAACAACCTCCAGCCGTTCTTGCAATGCACGCAGCATATGTGTCCCATCAGAGT
TCATTGGCATGTGAAAACTAACTACAAAGAGTACTGGCGTGTGAAGGTCACGATCACAAA
CTTCAACTACAATATGAATTACTCGCAGTGGAATTTGGTTGTTCAGCATCCTAACTTCGA
CAATATCACTCAGCTTTTCAGCTTTAACTACAAACCTCTTAGTCCTTACGCTGGCATAAA
TGACACGGCCATGTTGTGGGGGATCAAGTTCTATAACGATTTTTTGAGCCAGGCCGGTCC
AGTAGGCAACGTACAGTCAGAACTTCTCTTCCGAAAGGACCCGTCATCGTTCACGCTCGA
GAAAGGATGGGCGTTTCCAAGACGCATTTACTTCAACGGAGATAACTGCGTTATGCCACC
TCCAGACTCGTATCCATGGCTTCCTAACGCTGCTTCAAACCTTGCAACTTCGTCACTCAT
CATACTTATCATTAATTTCTTCTCTGTTTTGATTCTTATGTAAAGTGATCACGTTGAAAT
ATTGTGCTTTTGACCCGGTTCATACTTTTGGGATCAGACTGGATCCTCATTGGCTAATAT
ATAAAAATGGCATGCGGCACTCTGTTCATGAC

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

CO CL6239Contig1 684 2 2 U
GGATCCTTCATAAAAACCCTAAAGTTTCAACCTTTGCTGTCAACAAAAAAAACCATGGCT
TCGTACAGCGAACCTTACGTCTCGAATGGGACAGGAGTCTTCTGGGACATGGACCAGTGC
AAGATCCCTGCGGGACGCACTTCATCTGATCTCGTGCCGTTTCTTAGAGAGATGATGTTG
AGTGTTGGTCTACGTGGTCCTACTTCGATCCGGATCTACGGTGATTTGACCGGTCTTGAC
TTTCAAGCCTCGGCCTCGGAGGATGTTATGCTCAATCATTTTCACGCAGGAGAGAAACGT
GCGAAGATGACGAAGATCTTGGAGGACATAGTTTCGTGGTCAGCTGAGAACCCAGAACCA
TCGTTGGGAATAATGTTCTTGGGACACTTGGAAGAGGCAGATTATGCTGACATCACCGAG
GTTACTGAACTTCTCGAGACTCAGAAAAACTATCACTTTGTGATTGTCACTGCACCCCCA
CCTCCTCCTCCAATGGTGGTGTTTCTGAGGTCTATTCCTCGTGGTGGACTCTAGTTCTTT
TGGTTTAGTAAAAGTTTGAATAAAAAAAATGACAATTTCTTTGTTTTGTTAATTTTGGAT
AATCGGTTGACAAAAAAAAAGTTAATGTTGGATAATCAAAATCCTTTTTTGGAAACTTAT
GTTATGTCTCGGAAGATGATTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GH05TF U 1
AF RS1GH05JQ C 75
BS 1 501 RS1GH05TF
BS 502 684 RS1GH05JQ

RD RS1GH05TF 501 0 0
GGATCCTTCATAAAAACCCTAAAGTTTCAACCTTTGCTGTCAACAAAAAAAACCATGGCT
TCGTACAGCGAACCTTACGTCTCGAATGGGACAGGAGTCTTCTGGGACATGGACCAGTGC
AAGATCCCTGCGGGACGCACTTCATCTGATCTCGTGCCGTTTCTTAGAGAGATGATGTTG
AGTGTTGGTCTACGTGGTCCTACTTCGATCCGGATCTACGGTGATTTGACCGGTCTTGAC
TTTCAAGCCTCGGCCTCGGAGGATGTTATGCTCAATCATTTTCACGCAGGAGAGAAACGT
GCGAAGATGACGAAGATCTTGGAGGACATAGTTTCGTGGTCAGCTGAGAACCCAGAACCA
TCGTTGGGAATAATGTTCTTGGGACACTTGGAAGAGGCAGATTATGCTGACATCACCGAG
GTTACTGAACTTCTCGAGACTCAGAAAAACTATCACTTTGTGATTGTCACTGCACCCCCA
CCTCCTCCTCCAATGGTGGTG

QA 1 501 1 501
DS 

RD RS1GH05JQ 610 0 0
TTACGTCTCGAATGGGACAGGAGTCTTCTGGGACATGGACCAGTGCAAGATCCCTGCGGG
ACGCACTTCATCTGATCTCGTGCCGTTTCTTAGAGAGATGATGTTGAGTGTTGGTCTACG
TGGTCCTACTTCGATCCGGATCTACGGTGATTTGACCGGTCTTGACTTTCAAGCCTCGGC
CTCGGAGGATGTTATGCTCAATCATTTTCACGCAGGAGAGAAACGTGCGAAGATGACGAA
GATCTTGGAGGACATAGTTTCGTGGTCAGCTGAGAACCCAGAACCATCGTTGGGAATAAT
GTTCTTGGGACACTTGGAAGAGGCAGATTATGCTGACATCACCGAGGTTACTGAACTTCT
CGAGACTCAGAAAAACTATCACTTTGTGATTGTCACTGCACCCCCACCTCCTCCTCCAAT
GGTGGTGTTTCTGAGGTCTATTCCTCGTGGTGGACTCTAGTTCTTTTGGTTTAGTAAAAG
TTTGAATAAAAAAAATGACAATTTCTTTGTTTTGTTAATTTTGGATAATCGGTTGACAAA
AAAAAAGTTAATGTTGGATAATCAAAATCCTTTTTTGGAAACTTATGTTATGTCTCGGAA
GATGATTATC

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 2

CO CL6240Contig1 955 2 2 U
TTCATCATTCTTTTTTCTTTCTTGTCTGGATCCATCGCCGAGCTCAGCCATGGAGATTTC
ATCAAATTTGCCGTCTTCATCTGACGGTGCAGAAGCCAGAGATGGTCGAGTTCTACGAAA
CGGAAACGGTGGAATCCACGATTCGTCCGAGAGTCGACGGAGTGCGGGATCTCGATTTGG
AGGAAGAGATCATCGGTTCCTCCTCATGTGGTGGAGAACAGCGAGATGAGGCAGCAGTGG
TTCGTGGGGATATTGAGTTTCTGGATGTGTGATTCATGTTTATGCGCTTACGGGAGGCGT
TGCGCCACTTATGCCTTCAATTGATGTTACCCACTTAAAGCTACATCCTCCACCTGACGA
GAAGGTAGCTTGGCAATGGCTTCCCATCAAAAGTTCTGCTAGGAAAGATGATCTGCAGCT
TTACCATTGGATGTACAGAGGCCTTGATGTTGGATCAGCCAAGCCATCAGAAACTGATAG
CTAGAAAGGTATATGAAACATACGAGTTGATCTCTACAGATTTCAGATGTGAAGACATGC
TTTCAGGTGCGGAAGGAGTGTTGTCAGAAGCTAGATGGCTTCTTGATCTCGGTCTTCTTC
CAAACACAAGTTCTGATACTCGTGCCATTGGGTACAAACAGGCCATGGAATATCTATCGA
ATGTCGTTGACGAGTGGGTGTGAGCTCCCCTGGAGAGTCTTATGGGTTTTTGAACAAATT
TCAGCAAGCTTCCCGGTGATTTTCCGTGAGAGCCAGGCTCTTGAAGAATATCGAAGCAAG
AAAAAGCATATGGAGTTTGACTTACCTTGAGCCAATAAGGAGAAACTACACCTTTGGAGT
TTGAATTTAGTTATACAAACTCACTTATAAGAGTACACAATTATATGCAAAACTATTGAG
GATTAATAATTTATTTATAAAGATTTATAAATTACGTATAATAGTTTAAATTAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B217TF U 1
AF RS1B217JQ C 207
BS 1 634 RS1B217TF
BS 635 955 RS1B217JQ

RD RS1B217TF 634 0 0
TTCATCATTCTTTTTTCTTTCTTGTCTGGATCCATCGCCGAGCTCAGCCATGGAGATTTC
ATCAAATTTGCCGTCTTCATCTGACGGTGCAGAAGCCAGAGATGGTCGAGTTCTACGAAA
CGGAAACGGTGGAATCCACGATTCGTCCGAGAGTCGACGGAGTGCGGGATCTCGATTTGG
AGGAAGAGATCATCGGTTCCTCCTCATGTGGTGGAGAACAGCGAGATGAGGCAGCAGTGG
TTCGTGGGGATATTGAGTTTCTGGATGTGTGATTCATGTTTATGCGCTTACGGGAGGCGT
TGCGCCACTTATGCCTTCAATTGATGTTACCCACTTAAAGCTACATCCTCCACCTGACGA
GAAGGTAGCTTGGCAATGGCTTCCCATCAAAAGTTCTGCTAGGAAAGATGATCTGCAGCT
TTACCATTGGATGTACAGAGGCCTTGATGTTGGATCAGCCAAGCCATCAGAAACTGATAG
CTAGAAAGGTATATGAAACATACGAGTTGATCTCTACAGATTTCAGATGTGAAGACATGC
TTTCAGGTGCGGAAGGAGTGTTGTCAGAAGCTAGATGGCTTCTTGATCTCGGTCTTCTTC
CAAACACAAGTTCTGATACTCGTGCCATTGGGTA

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1B217JQ 749 0 0
TGTGGTGGAGAACAGCGAGATGAGGCAGCAGTGGTTCGTGGGGATATTGAGTTTCTGGAT
GTGTGATTCATGTTTATGCGCTTACGGGAGGCGTTGCGCCACTTATGCCTTCAATTGATG
TTACCCACTTAAAGCTACATCCTCCACCTGACGAGAAGGTAGCTTGGCAATGGCTTCCCA
TCAAAAGTTCTGCTAGGAAAGATGATCTGCAGCTTTACCATTGGATGTACAGAGGCCTTG
ATGTTGGATCAGCCAAGCCATCAGAAACTGATAGCTAGAAAGGTATATGAAACATACGAG
TTGATCTCTACAGATTTCAGATGTGAAGACATGCTTTCAGGTGCGGAAGGAGTGTTGTCA
GAAGCTAGATGGCTTCTTGATCTCGGTCTTCTTCCAAACACAAGTTCTGATACTCGTGCC
ATTGGGTACAAACAGGCCATGGAATATCTATCGAATGTCGTTGACGAGTGGGTGTGAGCT
CCCCTGGAGAGTCTTATGGGTTTTTGAACAAATTTCAGCAAGCTTCCCGGTGATTTTCCG
TGAGAGCCAGGCTCTTGAAGAATATCGAAGCAAGAAAAAGCATATGGAGTTTGACTTACC
TTGAGCCAATAAGGAGAAACTACACCTTTGGAGTTTGAATTTAGTTATACAAACTCACTT
ATAAGAGTACACAATTATATGCAAAACTATTGAGGATTAATAATTTATTTATAAAGATTT
ATAAATTACGTATAATAGTTTAAATTAAC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

CO CL6241Contig1 1107 2 4 U
GGGTCTTCCCTAAAACAACATTCATTGATTACTATTACTCTCTCTCCGACGCACAACCAT
GTCTCTGCTTTCAGATCTCGTTAACCTCAACCTCTCCGACACCACCAAGCAAATCATTGC
CGAATACATATGGATCGGTGGATCTGGAATGGACATTAGAAGCAAAGCCAGGACGCTCCC
AGGACCAGTGAGCGATCCATCAAAGCTTCCCAAGTGGAACTACGATGGGTCCAGCACCGG
TCAGGCCGCTGGAGATAACAGTGAAGTCATTCTATACCCTCAGGCGATATTCCGTGATCC
GTTCAGGAGAGGCGACAACATCCTGGTGATGTGTGACGCTTACACACCGGCCGGAGATCC
AATCCCGACCAACAAGAGGCACAATGCTTCTAAGATCTTCAGCCATCCCAACGTTGCCAA
GGAGGTGCCTTGGTATGGGATTGAGCAAGAATACACTTTGATGCAAAAGGGTGTGAACTG
GCCTATTGGTTGGCCTATTGGTGGCTTCCCTGGTCCTCAGGGACCGTACTACTGTGGTGT
GGGAGCTGACAAAGCCATTGGTCGTGACATTGTGGACGCACACTACAAGGCCTGTCTTTA
CGCCGGTATTAGCATCTCCCGTGTCAATGGAGAAGTCATGCCTGGACAGTGGGAGTTCCA
AGTCGGTCCAGTTGAGGGTATTAGTGCTGGTGATCAAGTCTGGGTCGCTAGATACCTTCT
CGAGAGGATCACTGAGATTTCTGGTGTGAATGTCAGCTTCGACCCAAAACCAGTCCCCGG
TGACTGGAACGGAGCTGGAGCTCACTGCAACTACAGTACGAAGACGATGAGGAACGACGG
AGGATTAGCAGTGATAAAGAAAGCAATAGAGAAGCTTCAGGTGAAGCACAAGGAGCACAT
TGCTGCTTACGGTGAAGGCAACGAGCGTCGTCTCACGGGGAAGCATGAAACAGCAGACAT
CAACACGTTCTCTTGGGGAGTGGCGAACCGTGGAGCCTCGGTGAGAGTGGGACGTGACAC
TGAGAAAGAAGGCAAAGGTTACTTCGAGGACCGGAGGCCAGCTTCTAACATGGATCCTTA
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BQ
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GGACGTGACACTGAGAAAGAAGGCAAAGGTTACTTCGAGGACCGGAGGCCAGCTTCTAAC
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DS 



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ATGCAATCTTCAGTCTCTTGCTAAGATAGCTGAGATATTTGCGGCGGAGGGGAACAAGAA
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TCTAATTAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCCACTGTCCCTGTCTACTATCC
AGCGAAACCACAGCCAAGGGAACGGGCTTGGCAGAATCAGCGGGGAAAGAAGACCCTGTT
GAGCTTGACTCTAGTCCGACTTTGTGAAATGACTTGAGAGGTGTAGAATAAGTGGGAGCC
CCGGCACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGAAGTCTCAGCATTAAAGTTGA
TTTTGCTCCTTTTTTATAATACACACATCTCCTCCTCTCTTTTAACATCTTCTTCTTGAA
TCCTCCATCTCCTTCATCTAACCCTAAAGAACTTCATCAAAGATCGATCAAGATTCTATA
AAACACAAGAACATGCTTGCCGTCCACCGCCCTTCATCCGCCGTATCAGACGGAGACTCC
CTCCAGATTCCAACGATGGTTCAAAAACGTTTCCCTTCACTCTCATGCGACGCAACAGCA
GCTCGTTTCCACACGCACGAGGTCGGTCCTAACCAGTGCTGCTCCGCCGTGATACAAGAG
ATCTCCGCACCTATCCCCACCGTATGGTCCGTCGTCAGACGCTTTGACAACCCGCAAGCC
TACAAACACTTCCTCAAAAGCTGCTAGCTCCACAGAGCGTCTTGACATACTAGACGACGA
GAG*CACGTCATTAGTTTCAGCGTCGTCG*TGGTGAC*ATAGGCTCTCTAACTACCGATC
CGTCACGA

QA 1 788 1 788
DS 

RD RS1F090JQ 729 0 0
CATCTTCTTCTTGAATCCTCCATCTCCTTCATCTAACCCTAAAGAACTTCATCAAAGATC
GATCAAGATTCTATAAAACACAAGAACATGCTTGCCGTCCACCGCCCTTCATCCGCCGTA
TCAGACGGAGACTCCCTCCAGATTCCAACGATGGTTCAAAAACGTTTCCCTTCACTCTCA
TGCGACGCAACAGCAGCTCGTTTCCACACGCACGAGGTCGGTCCTAACCAGTGCTGCTCC
GCCGTGATACAAGAGATCTCCGCACCTATCCCCACCGTATGGTCCGTCGTCAGACGCTTT
GACAACCCGCAAGCCTACAAACACTTCCTCAAAAGCTGCTAGCTCCACAGAGCGTCTTGA
CATACTAGACGACGAGAGGCACGTCATTAGTTTCAGCGTCGTCGGTGGTGACCATAGGCT
CTCTAACTACCGATCCGTCACGACTCTTCACTTTTTTCCGGTCTCGGGGACCGTCGTTGT
TGAGTCTTACGTCGTCGATGTGCCTCCGGGGAACACGAAGGAAGAGACATGCGACTTTGT
TGACGTTATAGTACGATGCAATCTTCAGTCTCTTGCTAAGATAGCTGAGATATTTGCGGC
GGAGGGGAACAAGAAGACGTCCATTTGATATGTGTTTACGTCGTCTGAATAGTTTCGTTG
GGATCCGACGTCGTTTCTTGATTTTTTTAGCCGTCGTGTGATCTATGTTTTTTACCGGCT
TATTGTGTG

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

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ACAGATCTTGAAGCTGAGAGAGAAAGGATATTGAAAGCTGGTGGGTTCATTCACGCTGGT
CGTGTCAATGGAAGCTTGAACCTAGCAAGAGCTATCGGTGACATGGAATTCAAGCAGAAT
AAGTTTTTGCCAACTGAAAAGCAAATCGTTACCGCCAGTCCTGATGTAAACACTGTTGAA
CTCTGCAATGATGATGATTTCCTCGTTCTTGTCTGCGATGGAATTTGGTAAAATCATTTT
GAACTTTTTTGTTGTTGTTGTTGTAATCTTGTTTTCCAGACAAGGTCATTACTAGTTGTG
AAACACCTTGTCTTGGTTCATCTCATATCTGCAGGGACTGCATGACAAGCCAACAACTCG
TTGATTTTATACATGAACAGATGAATACGGAAACCAAACTCTCAGTGGTATGTGAAAAAG
TTCTAGATATATGCTTGGCTCCAAACACAGCAGGTGGTGAAGGCTGTGATAACATGACCA
TGATCTTGGTTCAGTTCAAGAAGCCTGTTCAGTCCACGAAAGCAGAACCTAGCCCAAGCC
ACAATGAGCCTAGCTCATCAAACTAGCCCCATCCTCTGAGCCAAGGAAGATGATGACATA
TAGTAGTTCGATTCCACATTGTAAATTCTTTTGAAAGACATTAATTAGCACAATCTGACT
TTTCGGAGGTTTCAGTTCCTCTGCCTCTAGACTTTTGTCCCACGAGTTCCAATAATACAG
AAGGAATGATTGACTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CK80TF U 1
AF RS1CK80JQ C 111
BS 1 539 RS1CK80TF
BS 540 859 RS1CK80JQ

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QA 1 539 1 539
DS 

RD RS1CK80JQ 749 0 0
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CACTGTTGAACTCTGCAATGATGATGATTTCCTCGTTCTTGTCTGCGATGGAATTTGGTA
AAATCATTTTGAACTTTTTTGTTGTTGTTGTTGTAATCTTGTTTTCCAGACAAGGTCATT
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CAACAACTCGTTGATTTTATACATGAACAGATGAATACGGAAACCAAACTCTCAGTGGTA
TGTGAAAAAGTTCTAGATATATGCTTGGCTCCAAACACAGCAGGTGGTGAAGGCTGTGAT
AACATGACCATGATCTTGGTTCAGTTCAAGAAGCCTGTTCAGTCCACGAAAGCAGAACCT
AGCCCAAGCCACAATGAGCCTAGCTCATCAAACTAGCCCCATCCTCTGAGCCAAGGAAGA
TGATGACATATAGTAGTTCGATTCCACATTGTAAATTCTTTTGAAAGACATTAATTAGCA
CAATCTGACTTTTCGGAGGTTTCAGTTCCTCTGCCTCTAGACTTTTGTCCCACGAGTTCC
AATAATACAGAAGGAATGATTGACTTGTC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

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CTGACTAAACCTGACTCCATCTCTCGTGACCTCGAGTTAGACATCCACATTATCCGCAAC
GGCCTTCACCGTACATCGCGTTTCGAGATCGCTATGCAAGCCGTTAGAAGCATGGCTACT
TCTTCTTCTTCTGTTGGAGCTTCCAATCTCTGGATAACGGGCCATTCTATGGGTGCAGCG
ATGGCGCTTCTCGCTGGCAAAACGTTGGCCAAGACTGGAGTTTACCTCAAATCCTTCTTG
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CCGTTGAAGGCTTTGTCTTTGTGGCTGCCTGACATTCATGTGAATCCAGGGGACCATTTG
TGTTGTGAGTACATTGGGTTTTTCGAGCATAGGGGGAATATGGAACAGCTTGGGTATGGA
GCTGGAATCGTTGAGAGGATGGCGATGCAGCATTCCTTGGGAGGTTTGCTGATGGATGCC
ATGGGAGTTAGTAACGCTGTGGACGTGCAGGAGCCTGTTCACGTCATCCCATCTGCTAAG
CTGGTTGTAAACCGGACTGCTTCTGATGACTACAAGGAAGCTCATGGGATACACCAGTGG
TGGAGAGATGACCAAGATTTGGTTTCCAACATTTATTTGTTCAAATAGCTCGCCAAGGTT
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GTAGTAATCACGGTATCTCTTTAAATTCTTCGTTTATAGTATGTCCGAAAGGAAGTTTAT
GATAATTTTGGAGGATGTTCTTGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DL60TF U 1
AF RS1DL60JQ C 299
BS 1 727 RS1DL60TF
BS 728 986 RS1DL60JQ

RD RS1DL60TF 727 0 0
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CTGACTAAACCTGACTCCATCTCTCGTGACCTCGAGTTAGACATCCACATTATCCGCAAC
GGCCTTCACCGTACATCGCGTTTCGAGATCGCTATGCAAGCCGTTAGAAGCATGGCTACT
TCTTCTTCTTCTGTTGGAGCTTCCAATCTCTGGATAACGGGCCATTCTATGGGTGCAGCG
ATGGCGCTTCTCGCTGGCAAAACGTTGGCCAAGACTGGAGTTTACCTCAAATCCTTCTTG
TTCAACCCTCCCTTTGTCTCTCCTCCTATCGAGAGGATTGTATCTAACGAGCGTGTTAGG
AGCGGGCTTAGATTCGCGGGCAGCCTTGTTACCGCAGGGCTCGCTTTCTCAAGAACGCTT
AAGCAAGCACAGCAGCCTCAGCATCAGCAGCAGCTGCAAGAGCGGAACTTGTCTGAAGAT
CCGTTGAAGGCTTTGTCTTTGTGGCTGCCTGACATTCATGTGAATCCAGGGGACCATTTG
TGTTGTGAGTACATTGGGTTTTTCGAGCATAGGGGGAATATGGAACAGCTTGGGTATGGA
GCTGGAATCGTTGAGAGGATGGCGATGCAGCATTCCTTGGGAGGTTTGCTGATGGATGCC
ATGGGAGTTAGTAACGCTGTGGACGTGCAGGAGCCTGTTCACGTCATCCCATCTGCTAAG
CTGGTTG

QA 1 727 1 727
DS 

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GGAGCGGGCTTAGATTCGCGGGCAGCCTTGTTACCGCAGGGCTCGCTTTCTCAAGAACGC
TTAAGCAAGCACAGCAGCCTCAGCATCAGCAGCAGCTGCAAGAGCGGAACTTGTCTGAAG
ATCCGTTGAAGGCTTTGTCTTTGTGGCTGCCTGACATTCATGTGAATCCAGGGGACCATT
TGTGTTGTGAGTACATTGGGTTTTTCGAGCATAGGGGGAATATGGAACAGCTTGGGTATG
GAGCTGGAATCGTTGAGAGGATGGCGATGCAGCATTCCTTGGGAGGTTTGCTGATGGATG
CCATGGGAGTTAGTAACGCTGTGGACGTGCAGGAGCCTGTTCACGTCATCCCATCTGCTA
AGCTGGTTGTAAACCGGACTGCTTCTGATGACTACAAGGAAGCTCATGGGATACACCAGT
GGTGGAGAGATGACCAAGATTTGGTTTCCAACATTTATTTGTTCAAATAGCTCGCCAAGG
TTGATTTGTTTTTTTTTCTTCGATTGCAATGCCCTTTATTTTGTATGTTTGTGTAATGCT
ATGTAGTAATCACGGTATCTCTTTAAATTCTTCGTTTATAGTATGTCCGAAAGGAAGTTT
ATGATAATTTTGGAGGATGTTCTTGTGC

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

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TCGGAGATACTCGCCGGGCTTATCCGACAGTGGAGATTCCAACATGGCCATCCGTTTCTG
AAGATTTTACGGCGGCGGAGATTTTTTCTCCGGTGATGAACAGTCCAGACTCCGGCATGC
TCGAAGCTTTGGCGGCGTTGCAGCGTTACTTACCGTCAAACGAACCGGATCCGGATTCCG
ACCCGGATCTATTCGGTCCGGACTCTCCTATCGACGCGTACTCCTGCGACCATTTCCGCA
TGTACGACTTCAAAGTCCGGAGGTGTGCTCGCGGCCGGAGCCACGACTGGACGGAGTGTC
CCTACGCTCACCCCGGAGAGAAGGCTCGCCGGAGGGATCCGAGGAAGTACAGCTACTCCG
GGACGGCTTGTCCCGATTTCCGTAAAGGCGGCTGCGTCAGAGGAGACGCGTGCGAGTTCG
CTCACGGTGTTTTCGAGTGCTGGCTTCATCCGGCTCGTTACCGGACTCAGCCGTGTAAAG
ACGGCGGTAACTGTCGCCGGAGAGTCTGTTTCTTTGCTCACTCGCCGGATCAGCTTAGGT
ATCTCCCGAATCGTAGCCCTGATCGTGTCGATTCATTCGACGTTTCGTCTCCGATTCGTC
ACTCGTGCGCCAGAGCGTTTCAGCTTTCGATTTCGCCGGTTTCTGGTTCGCCGCCGGTGA
GTCCGAGAGCTGACTCGGGGAGTCAGTCGCTGAGTCGCTCACTCGGGTCTAACTCTGTAA
ACGACGTCGTCTCTTCGTTTAGGAACTTGCAGTTTGAGAAGGTGAAATCGTTCCCTCCGC
CTTACAACAATCCGTTACGATGCTACCAAACCGGATCCTGATCAGAATTCGGGTGAAGCT
CCTGATGTCGGGTGGGTATCTGAGCTGGTGATGTAGGATGGTAAGATCCGACCCGTACCC
GGATATCAGTATCGGCTTTTTTCTGGAATCTCTTCTAAGGAAAAGAGGAGGAGATCTAGA
AGTGTGTTCATATTATTATTTACTAATTTCGCATTATCCGATAATAATATAATTAAGTAT
TGATTTTTGGGGAGGTTTTTGTTGAGAAGACTTCGGAATCTCGTTTTGTATAGATGTGCC
TAGGGTTTTAATTACGGAACATTAATATATTATTAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BB77TF U 1
AF RS1BB77JQ C 445
BS 1 597 RS1BB77TF
BS 598 598 RS1BB77JQ
BS 599 679 RS1BB77TF
BS 680 680 RS1BB77JQ
BS 681 695 RS1BB77TF
BS 696 1178 RS1BB77JQ

RD RS1BB77TF 695 0 0
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AAGATTTTACGGCGGCGGAGATTTTTTCTCCGGTGATGAACAGTCCAGACTCCGGCATGC
TCGAAGCTTTGGCGGCGTTGCAGCGTTACTTACCGTCAAACGAACCGGATCCGGATTCCG
ACCCGGATCTATTCGGTCCGGACTCTCCTATCGACGCGTACTCCTGCGACCATTTCCGCA
TGTACGACTTCAAAGTCCGGAGGTGTGCTCGCGGCCGGAGCCACGACTGGACGGAGTGTC
CCTACGCTCACCCCGGAGAGAAGGCTCGCCGGAGGGATCCGAGGAAGTACAGCTACTCCG
GGACGGCTTGTCCCGATTTCCGTAAAGGCGGCTGCGTCAGAGGAGACGCGTGCGAGTTCG
CTCACGGTGTTTTCGAGTGCTGGCTTCATCCGGCTCGTTACCGGACTCAGCCGTGTAAAG
ACGGCGGTAACTGTCGCCGGAGAGTCTGTTTCTTTGCTCACTCGCCGGATCAGCTTATGT
ATCTCCCGAATCGTAGCCCTGATCGTGTCGATTCATTCGACGTTTCGTCTCCGATTCGTC
ACTCGTGCGCCAGAGCGTT*CAGCTTTCGATTTCG

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DS 

RD RS1BB77JQ 734 0 0
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TTCATCCGGCTCGTTACCGGACTCAGCCGTGTAAAGACGGCGGTAACTGTCGCCGGAGAG
TCTGTTTCTTTGCTCACTCGCCGGATCAGCTTAGGTATCTCCCGAATCGTAGCCCTGATC
GTGTCGATTCATTCGACGTTTCGTCTCCGATTCGTCACTCGTGCGCCAGAGCGTTTCAGC
TTTCGATTTCGCCGGTTTCTGGTTCGCCGCCGGTGAGTCCGAGAGCTGACTCGGGGAGTC
AGTCGCTGAGTCGCTCACTCGGGTCTAACTCTGTAAACGACGTCGTCTCTTCGTTTAGGA
ACTTGCAGTTTGAGAAGGTGAAATCGTTCCCTCCGCCTTACAACAATCCGTTACGATGCT
ACCAAACCGGATCCTGATCAGAATTCGGGTGAAGCTCCTGATGTCGGGTGGGTATCTGAG
CTGGTGATGTAGGATGGTAAGATCCGACCCGTACCCGGATATCAGTATCGGCTTTTTTCT
GGAATCTCTTCTAAGGAAAAGAGGAGGAGATCTAGAAGTGTGTTCATATTATTATTTACT
AATTTCGCATTATCCGATAATAATATAATTAAGTATTGATTTTTGGGGAGGTTTTTGTTG
AGAAGACTTCGGAATCTCGTTTTGTATAGATGTGCCTAGGGTTTTAATTACGGAACATTA
ATATATTATTAATG

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL6246Contig1 1102 2 4 U
GGTGCATCCGGACTGTATAAACGCCTCTAATCCTTACCACGAGTGTGTTGAGTATTGCTT
TAAGAAAATTGCTCAAGCAAAGGCTAAACTAGAGAAGCAAGGATTAGTTGAAGCTGTCAG
TGGGCAGTCAAGGGAGACACCTGCTGATAAAATTGTAGAGGAAGAGAGTTCTGAGGAAGA
AGATGAAGAAGAAGATAACCAAGAACCTGAAGTTGACGTCAGCCAACTTACAGGGAGGAA
GAAGAAGTTGTATGAGCTAAGACTTAAGATGAATGAAGCAAGAAAGTTCAATCAGACAGA
TGTCGGGTCTGAAAAGAAGAAAATGGAAGCACCAACTGAGCCAAAAGGAATCTCCAAACA
GAAATGGGTGGAGGCGAGGCACAAAAAGATCGGGAAGATTCTGGATGCTAATGGTTTAGA
TATGTCAAAGGCTTACATGCTCGATACTCAAGAAGCAGCAGAAACCAAATACAAGAAATG
GGAGAAGGAACCCACACCTTCTGGTTGGGATGTCTTCAACCAGAAGACGTTATACAACGC
ATACAAGAAACGGACAAAGAACATTCAGGTTGACATAGAGGAGTACAACCGAATGAGAGC
AGCTGATCCAGAGTTTTACCGTGAGGCCTCAAGCTTGCAATACGGCAAGGCCCCAAAAAT
TTCAAAAGATAAGATAGATAAGATGGCAAAGGAGCTCCATGACAGAGAAGAGAAGCGACA
GGAGTTTAGCAGGAGAAGAAAGTTCAGGGAAGAGAAGGATATCGATTCGATCAACGACAG
AAACGAGCATTTCAACAAGAAGATCGAGCGTGCGTTTGGGAAGTACACGCTGGAGATCAA
AAACAACTTGGAGCGAGGAACTGCATTACCTGACTAAGTTAATTGAGATCACATGTTGGA
AACATGAGAATGTATTATCTTGTCGAATTATAATGCTTTTGTCTGCTTATCGTCTTTAAT
ATCTTGTAGAATGTACCACCAAATTCTCTCGTTAGAGAGAAAAACGGTAAGAAGGATTTT
TTTTAACCCTTTGCCAAAATTACATACTACCGACTGGCAAAAGGTCTTAAATGTTAACTA
AATGGATTTTGAAGTCTTGCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GK66TF U 1
AF RS1GK66JQ C 255
BS 1 658 RS1GK66TF
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BS 660 687 RS1GK66TF
BS 688 1102 RS1GK66JQ

RD RS1GK66TF 687 0 0
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TAAGAAAATTGCTCAAGCAAAGGCTAAACTAGAGAAGCAAGGATTAGTTGAAGCTGTCAG
TGGGCAGTCAAGGGAGACACCTGCTGATAAAATTGTAGAGGAAGAGAGTTCTGAGGAAGA
AGATGAAGAAGAAGATAACCAAGAACCTGAAGTTGACGTCAGCCAACTTACAGGGAGGAA
GAAGAAGTTGTATGAGCTAAGACTTAAGATGAATGAAGCAAGAAAGTTCAATCAGACAGA
TGTCGGGTCTGAAAAGAAGAAAATGGAAGCACCAACTGAGCCAAAAGGAATCTCCAAACA
GAAATGGGTGGAGGCGAGGCACAAAAAGATCGGGAAGATTCTGGATGCTAATGGTTTAGA
TATGTCAAAGGCTTACATGCTCGATACTCAAGAAGCAGCAGAAACCAAATACAAGAAATG
GGAGAAGGAACCCACACCTTCTGGTTGGGATGTCTTCAACCAGAAGACGTTATACAACGC
ATACAAGAAACGGACAAAGAACATTCAGGTTGACATAGAGGAGTACAACCGAATGAGAGC
AGCTGATCCAGAGTTTTACCGTGAGGCCTCAAGCTTGCAATACGGCAAGGCCCCAAAA*T
TTCAAAAGATAAGATAGATAAGATGGC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1GK66JQ 848 0 0
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AGAAGAAAATGGAAGCACCAACTGAGCCAAAAGGAATCTCCAAACAGAAATGGGTGGAGG
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ACATGCTCGATACTCAAGAAGCAGCAGAAACCAAATACAAGAAATGGGAGAAGGAACCCA
CACCTTCTGGTTGGGATGTCTTCAACCAGAAGACGTTATACAACGCATACAAGAAACGGA
CAAAGAACATTCAGGTTGACATAGAGGAGTACAACCGAATGAGAGCAGCTGATCCAGAGT
TTTACCGTGAGGCCTCAAGCTTGCAATACGGCAAGGCCCCAAAAATTTCAAAAGATAAGA
TAGATAAGATGGCAAAGGAGCTCCATGACAGAGAAGAGAAGCGACAGGAGTTTAGCAGGA
GAAGAAAGTTCAGGGAAGAGAAGGATATCGATTCGATCAACGACAGAAACGAGCATTTCA
ACAAGAAGATCGAGCGTGCGTTTGGGAAGTACACGCTGGAGATCAAAAACAACTTGGAGC
GAGGAACTGCATTACCTGACTAAGTTAATTGAGATCACATGTTGGAAACATGAGAATGTA
TTATCTTGTCGAATTATAATGCTTTTGTCTGCTTATCGTCTTTAATATCTTGTAGAATGT
ACCACCAAATTCTCTCGTTAGAGAGAAAAACGGTAAGAAGGATTTTTTTTAACCCTTTGC
CAAAATTACATACTACCGACTGGCAAAAGGTCTTAAATGTTAACTAAATGGATTTTGAAG
TCTTGCTG

QA 1 848 1 848
DS 



AS 1 2

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AAAAAAAAATCTTAGCTAAAAATTGCCATTGTTTTTCTCATTCGGTCCTGCTGCTTTCAA
AAAAGAAAAGTCGGTTTCTTGGTTTATTTATGTTTGAATGGTTTTAATTGATTATTCATA
CGAAAATTCAAGCTTATGAAACTGTGTTTTTTTTTAATCTGCACATTTAATTGAAAGTTT
TTTCTTCTGAATTTTTCCTTTTATTTTTCGTAGAATTAGTGGAGGGTTATTTTTTGTTCC
CGCCTCTTGGATCTAAACAAGGTTGCTTATTTCAAACCTTTCCGATCCATTTTTATTTTC
TTGAATCTTCTTGAAAAAACCCTGTTCTTTACTTTTGATAAGAACCAGGTGTAATTTTCG
GATTCAGA


BQ
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AF RS1AD60JQ C 1
AF RS1AD60TF U 1
BS 1 428 RS1AD60TF

RD RS1AD60JQ 428 0 0
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AAAAAAAAATCTTAGCTAAAAATTGCCATTGTTTTTCTCATTCGGTCCTGCTGCTTTCAA
AAAAGAAAAGTCGGTTTCTTGGTTTATTTATGTTTGAATGGTTTTAATTGATTATTCATA
CGAAAATTCAAGCTTATGAAACTGTGTTTTTTTTTAATCTGCACATTTAATTGAAAGTTT
TTTCTTCTGAATTTTTCCTTTTATTTTTCGTAGAATTAGTGGAGGGTTATTTTTTGTTCC
CGCCTCTTGGATCTAAACAAGGTTGCTTATTTCAAACCTTTCCGATCCATTTTTATTTTC
TTGAATCTTCTTGAAAAAACCCTGTTCTTTACTTTTGATAAGAACCAGGTGTAATTTTCG
GATTCAGA

QA 1 428 1 428
DS 

RD RS1AD60TF 428 0 0
GGGATCCATCGGTGAGGCAGAGAGTAAATTCACTACAAAAAACTGAGTGTCCTCCCCACA
AAAAAAAAATCTTAGCTAAAAATTGCCATTGTTTTTCTCATTCGGTCCTGCTGCTTTCAA
AAAAGAAAAGTCGGTTTCTTGGTTTATTTATGTTTGAATGGTTTTAATTGATTATTCATA
CGAAAATTCAAGCTTATGAAACTGTGTTTTTTTTTAATCTGCACATTTAATTGAAAGTTT
TTTCTTCTGAATTTTTCCTTTTATTTTTCGTAGAATTAGTGGAGGGTTATTTTTTGTTCC
CGCCTCTTGGATCTAAACAAGGTTGCTTATTTCAAACCTTTCCGATCCATTTTTATTTTC
TTGAATCTTCTTGAAAAAACCCTGTTCTTTACTTTTGATAAGAACCAGGTGTAATTTTCG
GATTCAGA

QA 1 428 1 428
DS 



AS 1 2

CO CL6248Contig1 1412 2 2 U
GACACACTCAAACCTCCAAACCTCACGAAGAAACCATGTTATTAAACATCTCATCTTCTC
CAATCTCTCATCGAATACCTCACTCTCTCCCCAATCCAAACAACCAATCCAAAACCCATC
ATCCCCCAAAATCTCACCTTTCCTCCACTTTCTCAAACCACAGCCTCTTCTACACCAAGA
ACAGAGCTTTGTTCAGCAACAAAAGAAACCCATTCGATGGTGAAAGGATCAGTTACAATT
ACAAACCACGAGCTCTCGCTGGACTCGACATCGGAAGCTTCGAGTCAGTCCTCGAAGCTT
CAGCTGTTCTCACAGCGATCATCGTCGTCCACGAGACATGACACTTCTTAGCCGCTTATC
TCCAAGGTATCCATATAAGCAAGTTCGCGATAGGGTTCGGTCCGATTCTAGCTAAGTTCA
ACTCCAACAACGTCGAGTACTCTCTTAGAGCGTTTCCTCTAGGCGGGTTTGTCGGCTTTC
CCGACAACGATCCGAACAGTGGAATCCCTCTGGACGACAAGAACCTCCTCAAGAACCGAC
CGATTTGGGACAGAGTGGTTGTGGTCTTAGCTGGAATCGTAGCTAACGTGATCTTCGCTT
ACGCTATAATCTTTGCTCAAGTTGTGTTCGTTGGATTACCGGTTCAAGAAGCGTTTCCAG
GAGTTCTTGTTCCTGACGTCAAGTCCTCCTCTGCTGCTGCTCGTGATGGATTGCTTCCTG
GAGACGTTATCTTAGCCGTTGATGGGAGTGAGTTAACAAACTCCGGTTCTGACTCCGTTT
CCAAGGTTGCTGACGTCGTGAAAAGCAATCCGAATCACAGTGTTTTGCTCAGGGTTCAGA
GAGGTAAAGAAGGTTTCGACATCATGATCACGCCTGATAGGAGTTTCGACGGGACAGGGA
GACTCGGTGTTCAGCTATCACCGAACGTGAGATTCTCTAAGGTGAAACCGAAGAACGTAA
CGGAGACTTTTAGTTTCGTAGGAAGAGAGTTCTTTGGTCTCTCTTACAATGTTTTGGACA
GTTTGAAAAAGACTTTTCTCAACTTCTCTCAAACAGCTAGTCAAGTCGCCGGTCCGGTTG
CCATCATTGCGGTAGGAGCTGAAGTAGCGAAATCAAACGCGGACGGGCTATACCAGTTCG
CGGCATTGCTGAATCTAAACCTTGCTGTGGTCAACCTGTTGCCGTTACCGGCTCTAGATG
GTGGAACTTTGGCTTTGATCTTGTTGGAAGCGGCTAGAGGCGGGAGGAAGCTACCGTTAG
AGGTTGAGCAAGGGATCATGTCGTCTGGAATTTTGCTTGTGATATTTCTCGGTTTGTTTC
TCATTGTTAAGGACACACTTAACCTTGATTTCATCAGAGAAATGTTGTAATCTCTTGCAA
GGGAGTATCAAATCATAGATGAGTGCGTCATC


BQ
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AF RS1A890TF U 1
AF RS1A890JQ C 635
BS 1 781 RS1A890TF
BS 782 1412 RS1A890JQ

RD RS1A890TF 781 0 0
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CAATCTCTCATCGAATACCTCACTCTCTCCCCAATCCAAACAACCAATCCAAAACCCATC
ATCCCCCAAAATCTCACCTTTCCTCCACTTTCTCAAACCACAGCCTCTTCTACACCAAGA
ACAGAGCTTTGTTCAGCAACAAAAGAAACCCATTCGATGGTGAAAGGATCAGTTACAATT
ACAAACCACGAGCTCTCGCTGGACTCGACATCGGAAGCTTCGAGTCAGTCCTCGAAGCTT
CAGCTGTTCTCACAGCGATCATCGTCGTCCACGAGACATGACACTTCTTAGCCGCTTATC
TCCAAGGTATCCATATAAGCAAGTTCGCGATAGGGTTCGGTCCGATTCTAGCTAAGTTCA
ACTCCAACAACGTCGAGTACTCTCTTAGAGCGTTTCCTCTAGGCGGGTTTGTCGGCTTTC
CCGACAACGATCCGAACAGTGGAATCCCTCTGGACGACAAGAACCTCCTCAAGAACCGAC
CGATTTGGGACAGAGTGGTTGTGGTCTTAGCTGGAATCGTAGCTAACGTGATCTTCGCTT
ACGCTATAATCTTTGCTCAAGTTGTGTTCGTTGGATTACCGGTTCAAGAAGCGTTTCCAG
GAGTTCTTGTTCCTGACGTCAAGTCCTCCTCTGCTGCTGCTCGTGATGGATTGCTTCCTG
GAGACGTTATCTTAGCCGTTGATGGGAGTGAGTTAACAAACTCCGGTTCTGACTCCGTTT
C

QA 1 781 1 781
DS 

RD RS1A890JQ 778 0 0
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TGCTGCTCGTGATGGATTGCTTCCTGGAGACGTTATCTTAGCCGTTGATGGGAGTGAGTT
AACAAACTCCGGTTCTGACTCCGTTTCCAAGGTTGCTGACGTCGTGAAAAGCAATCCGAA
TCACAGTGTTTTGCTCAGGGTTCAGAGAGGTAAAGAAGGTTTCGACATCATGATCACGCC
TGATAGGAGTTTCGACGGGACAGGGAGACTCGGTGTTCAGCTATCACCGAACGTGAGATT
CTCTAAGGTGAAACCGAAGAACGTAACGGAGACTTTTAGTTTCGTAGGAAGAGAGTTCTT
TGGTCTCTCTTACAATGTTTTGGACAGTTTGAAAAAGACTTTTCTCAACTTCTCTCAAAC
AGCTAGTCAAGTCGCCGGTCCGGTTGCCATCATTGCGGTAGGAGCTGAAGTAGCGAAATC
AAACGCGGACGGGCTATACCAGTTCGCGGCATTGCTGAATCTAAACCTTGCTGTGGTCAA
CCTGTTGCCGTTACCGGCTCTAGATGGTGGAACTTTGGCTTTGATCTTGTTGGAAGCGGC
TAGAGGCGGGAGGAAGCTACCGTTAGAGGTTGAGCAAGGGATCATGTCGTCTGGAATTTT
GCTTGTGATATTTCTCGGTTTGTTTCTCATTGTTAAGGACACACTTAACCTTGATTTCAT
CAGAGAAATGTTGTAATCTCTTGCAAGGGAGTATCAAATCATAGATGAGTGCGTCATC

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 2

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GTGGTCTGAGAA


BQ
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AF RS1FJ52JQ C 1
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BS 1 432 RS1FJ52TF

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AAGTGGGAGTATTGATCATCTCTTTAAATCCTCTTTTTCTGGTCTTGTCTAAAATTCTGA
CAAATCTGAACTTAATAGTTTGCATCGGTTTTTGCATGGGTTTGTCTTCATTCTTGCGTT
GTGGTCTGAGAA

QA 1 432 1 432
DS 

RD RS1FJ52TF 432 0 0
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TAGATGGAGATGCAGCTATGAACAAGTTTTTCAGCGATATATACCAGAGTGCTGATGAGG
ACATGAGGCGAGCCATGAACAAATCATTTGCAGAGTCGAATGGGACGGTGCTGTCTACAA
ACTGGAAAGAGGTTGGGACTAAAAGTGGAAAGCACTCCACCAGATGGCATGGAGCTCAAG
AAGTGGGAGTATTGATCATCTCTTTAAATCCTCTTTTTCTGGTCTTGTCTAAAATTCTGA
CAAATCTGAACTTAATAGTTTGCATCGGTTTTTGCATGGGTTTGTCTTCATTCTTGCGTT
GTGGTCTGAGAA

QA 1 432 1 432
DS 



AS 1 2

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CGTACAGCGATCGGGTTTGTAGTAATGGGATTCGTGGGATTCTTTGTGAAGCTCATTTTT
ATCCCCATCAACAACATCATCGTCGGTGCCACTTAGATAACCAGCGAAGAAAAAGAAGAA
GGGTAGAAACAGCTTTCTTGTTTCAAGAAAACAATTTCACAGTTTTTTTTTTTGGTTCAG
ATACTCAGAAAGAGAAAACATATGTTAACCACACATTTGAGATCAGTTTCCAGTAATTGC
ATTTTATTTTAT


BQ
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AF RS1FY34JQ C 1
AF RS1FY34TF U 1
BS 1 432 RS1FY34TF

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ATCCCCATCAACAACATCATCGTCGGTGCCACTTAGATAACCAGCGAAGAAAAAGAAGAA
GGGTAGAAACAGCTTTCTTGTTTCAAGAAAACAATTTCACAGTTTTTTTTTTTGGTTCAG
ATACTCAGAAAGAGAAAACATATGTTAACCACACATTTGAGATCAGTTTCCAGTAATTGC
ATTTTATTTTAT

QA 1 432 1 432
DS 

RD RS1FY34TF 432 0 0
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AGAGCCATGGACGCCATCGATTCCGTCGTCGATCCTCTCAGAGACTTTGCAAAGGACAGC
ATTCGTCTCGTTAAGCGTTGTCACAAACCAGATCGCAAAGAATTCACGAAAGTGGCGGTC
CGTACAGCGATCGGGTTTGTAGTAATGGGATTCGTGGGATTCTTTGTGAAGCTCATTTTT
ATCCCCATCAACAACATCATCGTCGGTGCCACTTAGATAACCAGCGAAGAAAAAGAAGAA
GGGTAGAAACAGCTTTCTTGTTTCAAGAAAACAATTTCACAGTTTTTTTTTTTGGTTCAG
ATACTCAGAAAGAGAAAACATATGTTAACCACACATTTGAGATCAGTTTCCAGTAATTGC
ATTTTATTTTAT

QA 1 432 1 432
DS 



AS 1 2

CO CL6251Contig1 742 2 2 U
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AGCTCAAACCAGGCACGAGCGGTCACACTTTGACTGTTAAGGTCGTCGATCAGAATCCAG
TTCCTCAGAAGTCAGGCGCCGCTTCTTCTCACCTCCGACCTGTTAGGATCGCTGAGTGCC
TCGTCGGAGACGAGACTGCTTCCATCCTCTTCACCGCTCGCAATGATCAAGTGGACTTGA
TGAAGCCAGGAACTACTGTGAATCTCCGGAATGCGAAGATAGATATGTTCCAGGGATCCA
TGAGGCTTGCTGTTGACAAATGGGGTCGCATCGAGGTCACTGAACCGGCTGACATTGCTG
TGAAAGTGGACAACAATCTGTCCCTTGTGGAGTACGAGCTCGTCAATGTTGAAGAATGAT
CTCTGGTCCTTGGGTCTGAATAGCTTATGTATCAAGGGCCACAACGAGTTTTGGCCAAAT
GATTAAGGGTGGGAGCTTATGGTTTATCTTATGTTGTTGCAAGTTTGCTATCTATCCACC
GAAAAGGGTATTTTGCTGCATG


BQ
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AF RS1GA35TF U 1
AF RS1GA35JQ C 90
BS 1 523 RS1GA35TF
BS 524 742 RS1GA35JQ

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GACCGCCTCCACCGCGGAGACAGGGGAGAAACCCACCGCCTCAGACGCTTACTCGGTATC
AGCAGACGACGAATCAGGTCTCGCAGGAGAAGAAGAAGCCTGTGTTCGTCAAGGTGGATC
AGCTCAAACCAGGCACGAGCGGTCACACTTTGACTGTTAAGGTCGTCGATCAGAATCCAG
TTCCTCAGAAGTCAGGCGCCGCTTCTTCTCACCTCCGACCTGTTAGGATCGCTGAGTGCC
TCGTCGGAGACGAGACTGCTTCCATCCTCTTCACCGCTCGCAATGATCAAGTGGACTTGA
TGAAGCCAGGAACTACTGTGAATCTCCGGAATGCGAAGATAGATATGTTCCAGGGATCCA
TGAGGCTTGCTGTTGACAAATGGGGTCGCATCGAGGTCACTGA

QA 1 523 1 523
DS 

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AACCCACCGCCTCAGACGCTTACTCGGTATCAGCAGACGACGAATCAGGTCTCGCAGGAG
AAGAAGAAGCCTGTGTTCGTCAAGGTGGATCAGCTCAAACCAGGCACGAGCGGTCACACT
TTGACTGTTAAGGTCGTCGATCAGAATCCAGTTCCTCAGAAGTCAGGCGCCGCTTCTTCT
CACCTCCGACCTGTTAGGATCGCTGAGTGCCTCGTCGGAGACGAGACTGCTTCCATCCTC
TTCACCGCTCGCAATGATCAAGTGGACTTGATGAAGCCAGGAACTACTGTGAATTTCCGG
AATGCGAAGATAGATATGTTCCAGGGATCCATGAGGCTTGCTGTTGACAAATGGGGTCGC
ATCGAGGTCACTGAACCGGCTGACATTGCTGTGAAAGTGGACAACAATCTGTCCCTTGTG
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TATCAAGGGCCACAACGAGTTTTGGCCAAATGATTAAGGGTGGGAGCTTATGGTTTATCT
TATGTTGTTGCAAGTTTGCTATCTATCCACCGAAAAGGGTATTTTGCTGCATG

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 2

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AACATAAAAAAAAAGAACCAAAAGAGGTTTTTTAACTTTACACAAGAAACTAGACTTTGT
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AATCATCCAAGATTGACGTG


BQ
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AF RS1GA62JQ U 1
AF RS1E933JQ U 1
BS 1 196 RS1E933JQ
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BS 198 326 RS1E933JQ
BS 327 327 RS1GA62JQ
BS 328 620 RS1E933JQ

RD RS1GA62JQ 440 0 0
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AACATAAAAAAAAAGAACCAAAAGAGGTTTTTTAACTTTACACAAGAAACTAGACTTTGT
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AAAATCGAAAACATAAAAGTCTTTGCCAATTTCTTGTCTTTTACTTACTTACTTAACTAG
TTGGATTGACCACTACAGTTGCTGTAACTGCATCTGGAGATGAACTTGTCTTTCCTCCTG
CTTCATCCAACCGGACAACC

QA 1 440 1 440
DS 

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AGAGAAAAGGGTACATAACACTGAAAATGAGGGAAATGAATCAAATTTATAGCTAATGGG
AACATAAAAAAAAAGAGCCAAAAGAGGTTTTTTAACTTTACACAAGAAACTAGACTTTGT
CAGACGTGAAGTTCCATTTGAATACCCCCTTCTTAGAACCAAACAAGAGATCATTATGAG
AAAATCGAAAACATAAAAGTCTTTGCTAATTTCTTGTCTTTTACTTACTTACTTAACTAG
TTGGATTGACCACTACAGTTGCTGTAACTGCATCTGGAGATGAACTTGTCTTTCCTCCTG
CTTCATCCAACCGGACAACCTGAGCAAAACTTTTAGACATGTTCTTGATCAAGTCTGTCT
GCAACGCAGAAACAGAAGAGGGTTTATCTTCGCTTTCCACTACTCCAGTTGGCAACAAGC
TTGGTTGTCTTCTCGCCTTCCGTTCTTGAATTATTTTCTCCCTCTCTTCATAAAACTCAA
AATCATCCAAGATTGACGTG

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 2

CO CL6253Contig1 1604 2 6 U
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ATAGGACCATTCAGGATAAGCAGAGGTGGGTCCGGTTTGTATCTCAACAAGTTCGCGTGG
AACTCAATCGCCAATCTCTTGTTCCTCGAAGCTCCCGCCGGCGTTGGTTTCTCTTACACT
AACCGCTCCTCCGACCTCTTCAATACTGGCGACATCCGCACTGCCAAAGATTCACTTCAG
TTTCTTATTAAATGGCTTCACCGGTTTCCGAGATACAACCGCCGTGAGGTTTACATCACC
GGAGAGAGTTACGCCGGACATTACGTCCCTCAGCTCGCTAGAGAAATCATGCATTACAAC
AAACGCTCTAAGAATCCAATCAATCTCAAAGGAATCATGGTTGGAAATGCCGTGACTGAC
AATCACTATGATAATCTTGGAACGGTGACGTATTGGTGGAGCCATGCGATGATCTCTGAT
AGGACGTATCATCAGCTGGTAAACACGTGCGATTTTAGTCGACAGACGGAATCAGATCAA
TGCGAAACGGTTTACTCTTACGCGATGGAGAAAGAGTTTGGTAACATAGACCAGTACAAC
ATCTATGCACCCCCGTGCAACAAGTCAAGTGAAGTTGGCCGTGGAGTCAGTGGTTCATCT
GGTCGCCGGAGTATGCGTGTCCCTCATCTTCCTCACTCCGTGTTGAGGAAAATATCAGGG
TATGATCCATGTACCGAGAGATATGCAGAGATCTATTACAACCGGCCCGATGTTCAGAAA
GCTCTTCATGCCAACACCACCAAGATTCCTTACAAATGGACAGCTTGCAGTGAGGTACTA
AACCGGAACTGGAACGACTCAGATTTATCGGTTCTACCTATATACCGAGAAATGATTTTT
GGTGGGATTAGGGTTTGGGTTTTCAGTGGCGATGTGGATTCCGTTGTACCGGTGACGGCG
ACTAGGTACGCATTAGCAAGACTTTCTTTGAGTACCAAAGTCTCTTGGTATCCTTGGTAT
GTCAAGAAACAGGTCGGAGGGTGGACGGAAGTGTACGAGGGACTAACGTTCGTGACGGTC
AGAGGAGCAGGTCACGAGGTGCCATTGTTCAAGCCTCGTGCTGCTTTTGAGCTGTTCAAG
TATTTCTTGAGAGGCAAGCCACTTCCAAAGGCTTAAAAAAAATCCATATCAAGAGATGTA
ACATTCAAAATTATGGCGAGAAAAACAAACTAAATGTAAAGTTTGGGTTATGATTTATGA
GTTATGAGATCGAATTAGTTAAATCAAATTTTAGAGTTAATGTG


BQ
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DS 



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BQ
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AF RS1GY81TF U 1
AF RS1GY81JQ C 535
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BS 608 609 RS1GY81JQ
BS 610 667 RS1GY81TF
BS 668 1111 RS1GY81JQ

RD RS1GY81TF 667 0 0
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ATCTGTCAAGTAGCCAACAGTGTGATCCTGTCTCACAAAGCATAGCTCTTGGATCTTCAG
AAGTTCCTCTTTTTAGTTCCCAGGGGACTAATGCTCCAACTCAAGCTGAAGAGACAACTG
AAGACATAAGAGGCGGAAGGGATTGGTCACAGAAGGAAGATGTGGTGCTCATACGTGCTT
GGCTTAACACAAGCAAAGATCCGATCATAGGGTATGATCGAAGGCCTGGCTCCTTTTGGA
AAAGAGTTGGAGCTTACTTCAATGCAAGTCCTCATCTTGTCGGTATGCCAGATAGAGAGG
TTGGCAACTGTAAGCAAAGGTGGTCCAAGATCGATGACCAAGTCAACGAGTTTGTTGGCT
CGTTATGTGCTGCAACAAGAATGCAGTCAAGTGGGCAGAATGACAATGATGTAATGAAGC
TTGCTAATGAAATCTATCACAATGATTACGGTGCCAAGTTCACACTTGAGCATTGTTGGA
GGGAGCTCAAAAATGAACAGAAATGGCGGGTAAATTTTGGGACAGATAACAGCAAGTCAA
AAAGAAG**AAGGTGAAGATGGTTCTCAAGCTTCTTCTGTCCAGTCATCAAGCCTTGGAG
ATGAAGA

QA 1 667 1 667
DS 

RD RS1GY81JQ 577 0 0
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TTGGAGATGAAGAAGAGGCTCGTCCTGAAGGTGTGAAGAAGGCAAAGGCAAGGTTGAAGG
CTCAAAGGAGGGCCAAAGAGATGGAAGCAACCAGCAGAAAGCCTGTGGAGAAGTTCCAAG
AGATGTTTGAGATAAGGAAGCATTACTTTGAAATGAAGGAGAAGCTTACTAAGCAACATA
AGTTGGAGACTCTCCATAGAAAAAAAGAGCCTCTTAGTGAGATTGAACTGGCTTTAAAGA
ACAAACTAATAAAAGATATGTTGTCATAAGAATCTATGATGTCTATAGAGTCAGTCTGCT
TCTGCTTATGTATTTGTTTATGGAGTCAGTTTGTTTATGTTTTTCAGGTCAGTTTGTTGT
TGTTTGTTGAGTCAGTTTGCTTGTCTATGTCTTATGTTTTAAAAGTCGGATGAATGATGT
ATTTTCACTATCTATGAACTTGTTTTAGTAATGGTTT

QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 2

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TCATCAGATCTGACTCATAGGTGTTTTTGTTCATTAACTCAAAATGCAAGCACTATCTTC
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AGGACGCTGCTCAAGAGGCTGTGAAGAAGAGGAGACGTGCAACCAAGAAGCCTTACTCTA
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TTCGTGATGCAGCCAGAGAAGCTGCCTTGCGTGACATTAAGGAGAGAATCAAGAAGACCA
AGGACGAGAAGAAGGC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DO32JQ C 1
AF RS1DO32TF U 1
BS 1 436 RS1DO32TF

RD RS1DO32JQ 436 0 0
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TCAAGACTGAGCTTTGCCGATTCAGTGGACACAAGATTTACCCAGGCAGGGGTATCAGAT
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ATAATAAGCTGAAGCCTTCCAAGCTTGCATGGACCACCATGTACCGTAAACAACACAAGA
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AGGACGAGAAGAAGGC

QA 1 436 1 436
DS 

RD RS1DO32TF 436 0 0
TTTTTTTAGGGCTTCCATTGTAAAACAACTTTCAGCGCGGCGGCGGCGGAGCCATGGTTC
TCAAGACTGAGCTTTGCCGATTCAGTGGACACAAGATTTACCCAGGCAGGGGTATCAGAT
TCATCAGATCTGACTCATAGGTGTTTTTGTTCATTAACTCAAAATGCAAGCACTATCTTC
ATAATAAGCTGAAGCCTTCCAAGCTTGCATGGACCACCATGTACCGTAAACAACACAAGA
AGGACGCTGCTCAAGAGGCTGTGAAGAAGAGGAGACGTGCAACCAAGAAGCCTTACTCTA
GGTCAATCGTTGGTGCTACTTTGGAGGTCATTCAGAAGAAGCGTGCAGAGAAGCCTGAGG
TTCGTGATGCAGCCAGAGAAGCTGCCTTGCGTGACATTAAGGAGAGAATCAAGAAGACCA
AGGACGAGAAGAAGGC

QA 1 436 1 436
DS 



AS 1 2

CO CL6256Contig1 1127 2 4 U
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CCACTCTTTCTCGGGAGCCCTCTCCTCTTCTCCGAGCTGCTCACCACACCGTGGATAGTT
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GTTATTTGGGTCATCAACTTCGTTCTGGTTCTATACAAAATGTTGTTGGTGTACCAATGT
CTGCTCGAAGTGCGAGCGAAGCAGCAAAGTTTGGAGTCCCCTTGAAACATTTCCGGGATG
ATTTTCAGATTGATTTTGCATTCCATGACGCTGATGCTGTAGAAGAGGGTACGCTTATCT
CAGTTATCGGGAGACCGAGAACAACACAGGAAGGTGACTATATTCTGTGACAAAAGTCTA
TTGTGAAAGCAGCTGTTGAGGCAGTCTTCATGATAAAGGATGAGCAATACAAGTCTGGCC
TTGAAGGATCTATCCCTGTCTTAGTTCAATCTCTAAATTGGTTAGCTACAGCTGAGGAGA
TAGATGACTTGTACTTAGGAGACGCTGAGGTGTGGAGAAGAGCTTCTGTAGGAGATGCAG
GCCCTCTTGGAGGAGACTTTCCTATAGTCACCAGTGATGGTCACAACATTCTTGATGTTG
TCTTCACAACTCCTATTACAAACCTCGCTAACGTGGCTAAAAGCCTGGATACGATTGATG
GGGTTGTGGACCATGGAATTGTTATGAAAAACAGATGCAGGGTGGTGATCGCCGGAGAGA
CAGAAGTAAGAACTGTTAGTTTGCAGACAAGTGCAGTGGAAGGTGGTGTATGAAATTATG
GGGGAGACTTTGCAGAAGTTGTTGATTCCATAAGACAGCGAGAGGTTGGACTAAAACTGC
TGTTAGGATTGCCATTCAAACCCATGAGGGAACTGTTCTACACATAGTACCCTAAGTTAT
AGAGCAATAATGCAACTTTTATAACTATACTATTATAACATCAGTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BB68TF U 1
AF RS1BB68JQ C 329
BS 1 720 RS1BB68TF
BS 721 721 RS1BB68JQ
BS 722 766 RS1BB68TF
BS 767 1127 RS1BB68JQ

RD RS1BB68TF 766 0 0
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CGTCCGCCGTTTTCACGCGCCGTCGCAGCTTCAGACGTGTTTCAGTACCTCGAGTAAGCG
CCACTCTTTCTCGGGAGCCCTCTCCTCTTCTCCGAGCTGCTCACCACACCGTGGATAGTT
ACGTGAAGAGTGGTATGGTTATTGGTTTAGGATCCGGAGAAGCTTCGGGCTTGGCTATAC
GTTATTTGGGTCATCAACTTCGTTCTGGTTCTATACAAAATGTTGTTGGTGTACCAATGT
CTGCTCGAAGTGCGAGCGAAGCAGCAAAGTTTGGAGTCCCCTTGAAACATTTCCGGGATG
ATTTTCAGATTGATTTTGCATTCCATGACGCTGATGCTGTAGAAGAGGGTACGCTTATCT
CAGTTATCGGGAGACCGAGAACAACACAGGAAGGTGACTATATTCTGTGACAAAAGTCTA
TTGTGAAAGCAGCTGTTGAGGCAGTCTTCATGATAAAGGATGAGCAATACAAGTCTGGCC
TTGAAGGATCTATCCCTGTCTTAGTTCAATCTCTAAATTGGTTAGCTACAGCTGAGGAGA
TAGATGACTTGTACTTAGGAGACGCTGAGGTGTGGAGAAGAGCTTCTGTAGGAGATGCAG
*CCCTCTTGGAGGAGACTTTCCTATAGTCACCAGTGATGGTCACAA

QA 1 766 1 766
DS 

RD RS1BB68JQ 799 0 0
G
TCTATACAAAATGTTGTTGGTGTACCAATGTCTGCTCGAAGTGCGAGCGAAGCAGCAAAG
TTTGGAGTCCCCTTGAAACATTTCCGGGATGATTTTCAGATTGATTTTGCATTCCATGAC
GCTGATGCTGTAGAAGAGGGTACGCTTATCTCAGTTATCGGGAGACCGAGAACAACACAG
GAAGGTGACTATATTCTGTGACAAAAGTCTATTGTGAAAGCAGCTGTTGAGGCAGTCTTC
ATGATAAAGGATGAGCAATACAAGTCTGGCCTTGAAGGATCTATCCCTGTCTTAGTTCAA
TCTCTAAATTGGTTAGCTACAGCTGAGGAGATAGATGACTTGTACTTAGGAGACGCTGAG
GTGTGGAGAAGAGCTTCTGTAGGAGATGCAGGCCCTCTTGGAGGAGACTTTCCTATAGTC
ACCAGTGATGGTCACAACATTCTTGATGTTGTCTTCACAACTCCTATTACAAACCTCGCT
AACGTGGCTAAAAGCCTGGATACGATTGATGGGGTTGTGGACCATGGAATTGTTATGAAA
AACAGATGCAGGGTGGTGATCGCCGGAGAGACAGAAGTAAGAACTGTTAGTTTGCAGACA
AGTGCAGTGGAAGGTGGTGTATGAAATTATGGGGGAGACTTTGCAGAAGTTGTTGATTCC
ATAAGACAGCGAGAGGTTGGACTAAAACTGCTGTTAGGATTGCCATTCAAACCCATGAGG
GAACTGTTCTACACATAGTACCCTAAGTTATAGAGCAATAATGCAACTTTTATAACTATA
CTATTATAACATCAGTAA

QA 2 799 2 799
DS 



AS 1 2

CO CL6257Contig1 1060 2 6 U
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TCGAATCCTCAGTCCTCCCTCCATGGCTTCGTGTAGCCTAGGAGTTCCGAAGATTAAAAT
CTCAGGGGTAGAACTAAGTAGAGTAAGATCTGGAAGCTTACAGATTCCACACGGTCAAAG
ATCATTGTTTGCTCAAAGGCCGGTTAAGTACTTGAGTCTGAGGACAAGTGTTGGATCTTT
GAAAGCTGTCCAACTGTCTACTGTCACAGCTGCGGAAAACAGCTGCTACTGTGGAAGTAG
AAGATGCTGAGAAGACCAAGTCATCTCCGTTGAACGCTCAGCTTGTTCCCAAGCCCTCTG
AGGTGGAAGCTCTTGTCACTGAGATATGTGATTCCTCATCAATTGCAGAGTTTGAACTGA
AACTGGGAGGTTTCCGCCTATATGTAGCAAGGAACTTAGCTGACAACAACATTAGTCCAC
CACAACCTCAATTCCTGCTGCCTTTTCTGCAACTACAGAGAGTGCTGATTCTAATGGATC
AGCTTCCTCTACTTCATTAGCTATCACAAAACCAGCATCTTCAGCTGCTGATCAGGGTTT
GATTATCCTCCAATCTCCTAAAGTAGGATTCTTCAGGAGATCCAAAACCATAAAGGGTAA
ACGCACTCCTTCCTCCTGTAAAGAGAAAGACCAAGTGAAAGAAGGTCAAGTTCTTTGCTA
CATTGAACAACCCGGTGGCCAGTTCCCTATCGAGTCTGATGTTTCCGGTGAGGTTGTCAA
GATACTCCGAGAAGATGGAGAGCCTGTAGGATACAATGATGCTCTTATCTCGATCCTTCC
TTCCTTCCCTGGGATCAAGAAGCTTCAGTAAAAACCAAATCCGAGCTTGGTTTTTTGAGT
TGTGGAACTGTGCCTTGTGTGTATGCTTTTAGAACAAAATAAACTTCATTCATATCTTTG
TATTTCTGTTTGTCTGAAAGTTTTTCTTCAAGACATTGTTTTATTATGTTCTTTTATATA
TTAAAAACATTCTGATACTTTAATACATAGACGATTATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DK05TF U 1
AF RS1DK05JQ C 211
BS 1 278 RS1DK05TF
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RD RS1DK05TF 651 0 0
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TCGAATCCTCAGTCCTCCCTCCATGGCTTCGTGTAGCCTAGGAGTTCCGAAGATTAAAAT
CTCAGGGGTAGAACTAAGTAGAGTAAGATCTGGAAGCTTACAGATTCCACACGGTCAAAG
ATCATTGTTTGCTCAAAGGCCGGTTAAGTACTTGAGTCTGAGGACAAGTGTTGGATCTTT
GAAAGCTGTCCAACTGTCTACTGTCACAGCTGCGGAAA*CAGCTGCTACTGTGGAAGTAG
AAGATGCTGAGAAGACCAAGTCATCTCCGTTGAACGCTCAGCTTGTTCCCAAGCCCTCTG
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AACTGGGAGGTTTCCGCCTATATGTAGCAAGGAACTTAGCTGACAACAACATTAGTCCAC
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AGCTTCCTCTACTTCATTAGCTATCACAAAACCAGCATCTTCAGCTGCTGATCAGGGTTT
GATTATCCTCCAATCTCCTAAAGTAGGATTCTTCAG*AGATCCAAAACCAT

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1DK05JQ 850 0 0
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ATTCCTCATCAATTGCAGAGTTTGAACTGAAACTGGGAGGTTTCCGCCTATATGTAGCAA
GGAACTTAGCTGACAACAACATTAGTCCACCACAACCTCAATTCCTGCTGCCTTTTCTGC
AACTACAGAGAGTGCTGATTCTAATGGATCAGCTTCCTCTACTTCATTAGCTATCACAAA
ACCAGCATCTTCAGCTGCTGATCAGGGTTTGATTATCCTCCAATCTCCTAAAGTAGGATT
CTTCAGGAGATCCAAAACCATAAAGGGTAAACGCACTCCTTCCTCCTGTAAAGAGAAAGA
CCAAGTGAAAGAAGGTCAAGTTCTTTGCTACATTGAACAACCCGGTGGCCAGTTCCCTAT
CGAGTCTGATGTTTCCGGTGAGGTTGTCAAGATACTCCGAGAAGATGGAGAGCCTGTAGG
ATACAATGATGCTCTTATCTCGATCCTTCCTTCCTTCCCTGGGATCAAGAAGCTTCAGTA
AAAACCAAATCCGAGCTTGGTTTTTTGAGTTGTGGAACTGTGCCTTGTGTGTATGCTTTT
AGAACAAAATAAACTTCATTCATATCTTTGTATTTCTGTTTGTCTGAAAGTTTTTCTTCA
AGACATTGTTTTATTATGTTCTTTTATATATTAAAAACATTCTGATACTTTAATACATAG
ACGATTATAC

QA 1 850 1 850
DS 



AS 1 2

CO CL6258Contig1 910 2 2 U
GGGCCCGCTCTCTTCTTTGTCTTCTTCCCTCCTTCCTCCGTCCTCAAATTTGCTCGTTCA
CTTACAGATTCTCTCACCAGACACAAACTCCAGATTCACTCCGACAATGGAAACATTCCG
AACATTCCATCTCTTCTTTTTCTTCTCTCACTTTATCTTCTTGACGACACACACTACGCT
TACGTCCGCAAACTCTCAGATCGTTGACTGTACAATGTGCACGTCTTGCGACAATCCTTG
TCAGCCAAATCCCTCTCCTCCACCACCGACTCCATCTCCGCCACCTCCAACCACGACCAC
TGCCTGTCCTCCGCCTCCTAGCTCTGGCGGTGGTGGTAGTGGTGGTCCTTACTATTACTA
CCCACCTCCTTCTCAGTCTAGCTCAAACCGTCCACCACCGTCTTCCTCCGGCGATGGTGG
CTACGTTTATCCACCGCCTAAAAGTGGAGGAAACTATCCTTTTACGCCGCCGCCGAACCC
AATCGTTCCTTACTTTCCGTTTTACTACTACAACCCTCCGCCGCAATCTGTCGTGTTGTC
TGGATCCGTTGGGAAAACAAGTTTCTCTTACGGGTTTTCATTTGCGTTAGTTTTTGCTCT
TTGTTTCAGTACGTTGCTTCTAAATAATACAGGTTGAAGAAGATGATAGAGGTTACTTGT
AACAACAAGAAAAATCCTCATCTCTTTGCAGAGAAGATGACTTATGCATGAGAGATCTTT
ACGCTACAGATTCAAAACGGTGAATGTTGGTTCTTCATTTTCTCTTTTCTTTTTCTTTAC
TTGTCTTTGCTTGTATAAGTAAAAATATATTTGTAATTCCATATCTTTTAACAATCTTAT
GAATGTAGTTTCTTCCCCTTTTTCATAATATTAAAAATAAATAAATGGGGGTTGCCTCAT
TTTGGGTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DD58TF U 1
AF RS1DD58JQ C 175
BS 1 606 RS1DD58TF
BS 607 910 RS1DD58JQ

RD RS1DD58TF 606 0 0
GGGCCCGCTCTCTTCTTTGTCTTCTTCCCTCCTTCCTCCGTCCTCAAATTTGCTCGTTCA
CTTACAGATTCTCTCACCAGACACAAACTCCAGATTCACTCCGACAATGGAAACATTCCG
AACATTCCATCTCTTCTTTTTCTTCTCTCACTTTATCTTCTTGACGACACACACTACGCT
TACGTCCGCAAACTCTCAGATCGTTGACTGTACAATGTGCACGTCTTGCGACAATCCTTG
TCAGCCAAATCCCTCTCCTCCACCACCGACTCCATCTCCGCCACCTCCAACCACGACCAC
TGCCTGTCCTCCGCCTCCTAGCTCTGGCGGTGGTGGTAGTGGTGGTCCTTACTATTACTA
CCCACCTCCTTCTCAGTCTAGCTCAAACCGTCCACCACCGTCTTCCTCCGGCGATGGTGG
CTACGTTTATCCACCGCCTAAAAGTGGAGGAAACTATCCTTTTACGCCGCCGCCGAACCC
AATCGTTCCTTACTTTCCGTTTTACTACTACAACCCTCCGCCGCAATCTGTCGTGTTGTC
TGGATCCGTTGGGAAAACAAGTTTCTCTTACGGGTTTTCATTTGCGTTAGTTTTTGCTCT
TTGTTT

QA 1 606 1 606
DS 

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TACGCTTACGTCCGCAAACTCTCAGATCGTTGACTGTACAATGTGCACGTCTTGCGACAA
TCCTTGTCAGCCAAATCCCTCTCCTCCACCACCGACTCCATCTCCGCCACCTCCAACCAC
GACCACTGCCTGTCCTCCGCCTCCTAGCTCTGGCGGTGGTGGTAGTGGTGGTCCTTACTA
TTACTACCCACCTCCTTCTCAGTCTAGCTCAAACCGTCCACCACCGTCTTCCTCCGGCGA
TGGTGGCTACGTTTATCCACCGCCTAAAAGTGGAGGAAACTATCCTTTTACGCCGCCGCC
GAACCCAATCGTTCCTTACTTTCCGTTTTACTACTACAACCCTCCGCCGCAATCTGTCGT
GTTGTCTGGATCCGTTGGGAAAACAAGTTTCTCTTACGGGTTTTCATTTGCGTTAGTTTT
TGCTCTTTGTTTCAGTACGTTGCTTCTAAATAATACAGGTTGAAGAAGATGATAGAGGTT
ACTTGTAACAACAAGAAAAATCCTCATCTCTTTGCAGAGAAGATGACTTATGCATGAGAG
ATCTTTACGCTACAGATTCAAAACGGTGAATGTTGGTTCTTCATTTTCTCTTTTCTTTTT
CTTTACTTGTCTTTGCTTGTATAAGTAAAAATATATTTGTAATTCCATATCTTTTAACAA
TCTTATGAATGTAGTTTCTTCCCCTTTTTCATAATATTAAAAATAAATAAATGGGGGTTG
CCTCATTTTGGGTTCT

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

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ATAAAAAAAACATAAACTAATGTGTAATGTCAATAACCAATTATGTACAGACCTTCTTTA
CCATATGTAAAACAGTGTATATTGCAATAAACAGGTAATGTTTCCTAATATCACAATAAA
GAGATTCAGGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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AF RS1AA47TF U 1
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GAGATTCAGGCC

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DS 

RD RS1AA47TF 432 0 0
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TTTCATGTTCGAATCAGCCTTGATCCCTAGAGTCTGCCACTGGGCTCTGGAGTCTCCTTT
CCTCGATCACGATTACTACCAATGTTGGATTGGCCTCAAGTCTCATTTCTCACGTATAGC
CTTGAACGAGACTAACGTTGAACAAACAACAGAGACAACGAGAGAAGCTTCAGAGTAAAT
ATAAAAAAAACATAAACTAATGTGTAATGTCAATAACCAATTATGTACAGACCTTCTTTA
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GAGATTCAGGCC

QA 1 432 1 432
DS 



AS 1 2

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CTCCTGTCTGGAACAACAACTCTTCTCTCACTGCTGGAACCAGAGGTCCGATTCTTCTGG
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TTGTTCACGCCAGAGGTGCCAGTGCCAAAGGTTTCTTTGAAGTCACTCACGACATCACCC
ACCTCACTTGTGCTGATTTTCTCCGAGGACCCGGTGTCCAGACTCCCGTCATCGTTCGTT
TCTCCACCGTCATCCACGAGCGTGGCAGCCCCGAGACTCTCAGAGATCCTCGTGGTTTCG
CTGTCAAGTTCTACACCAGAGAAGGCAACTTTGATCTCGTTGGCAACAACTTCCCCGTCT
TCTTCGTCCGCGACGGGCACGAAGTTCCCCGACATGGTCCACGCCCTGAAACCCAATCCC
AAATCCCACATTCAGAGAACTGGAGGATACTTGACTTCTTCTCGCACCACCCTGAGAGTC
TCCACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GX82TF U 1
AF RS1CS82TF U 291
BS 1 556 RS1GX82TF
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RD RS1GX82TF 597 0 0
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AAGACTATCATCTGCTTGAGAAACTCGCCAACTTTGACAGGGAGCGGATCCCTGAGAGGG
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TCTTCGTCCGCGACGG*CATGAAGTTCCCCGACATGGTCCACGCCCTGAAACCCAAT

QA 1 597 1 597
DS 

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CGTGGTTTCGCTGTCAAGTTCTACACCAGAGAAGGCAACTTTGATCTCGTTGGCAACAAC
TTCCCCGTCTTCTTCGTCCGCGACGGGCACGAAGTTCCCCGACATGGTCCACGCCCTGAA
ACCCAATCCCAAATCCCACATTCAGAGAACTGGAGGATACTTGACTTCTTCTCGCACCAC
CCTGAGAGTCTCCACAT

QA 1 377 1 377
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GCTTGCTTCCGAAAAGAAACGTGAAGTATCTGATCTTTCACGAGAGAACGGTTTTGTTTG
GAGTCAGCTCAAAGTTATCGAGAGCGGGTTCACTGATAAGCTGAAGAAGAGAGAAGACGA
GGTTGCGCAAGCGAGTACCAAAATATCAAGTCTTTTGTCTCATCAAGAGCAGCTTCAGTC
ATCTAACCATGAGAAAGATGAGATCATCTCTAGCTTGAAGGCCAAGGTTGCTGAAATGGA
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TTATTTGTGAGGTTTCACCAGTGTAATGTAACAAAGATTTCAAGTGGCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CV42TF U 1
AF RS1CV42JQ C 74
BS 1 413 RS1CV42TF
BS 414 414 RS1CV42JQ
BS 415 509 RS1CV42TF
BS 510 831 RS1CV42JQ

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GAGTCAGCTCAAAGTTATCGAGAGCGGGTTCACTGATAAGCTGAAGAAGAGAGAAGACGA
GGTTGCGCAAGCGAGTACCAAAATATCAAGTCTTTTGTCTCATCAAGAGCAGCTTCAGTC
ATCTAACCATGAGAAAGATGAGATCATCTCTAGCTTGAAGGCCAAGGTTGCTGAAATGGA
GATGGATTCTAGGAAGAGAGATGAGGAGATCTCAAAGCTATCACGGGATATAGAGTCTTT
GAAGAAGTCTCGTAGCTTTACACCGGTTTTAACTCGATGCACAACACGTGACATAGGTAG
CAATGGTAACACCGTGGGATCTCACGTATCTACTAAGCAAGAGAAGCTAGCTGCTGCATC
AACACCTAATCAAGAGGAAATTAAAAGCT

QA 1 509 1 509
DS 

RD RS1CV42JQ 758 0 0
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GTTATCGAGAGCGGGTTCACTGATAAGCTGAAGAAGAGAGAAGACGAGGTTGCGCAAGCG
AGTACCAAAATATCAAGTCTTTTGTCTCATCAAGAGCAGCTTCAGTCATCTAACCATGAG
AAAGATGAGATCATCTCTAGCTTGAAGGCCAAGGTTGCTGAAATGGAGATGGATTCTAGG
AAGAGAGATGAGGAGATCTCAAAGCTATCACGGGATATAGAGTCTTTGAAGAAGTCTCGT
AGCTTTACACCGGTTTTAACTCGATGCACAACACGTGACAAAGGTAGCAATGGTAACACC
GTGGGATCTCACGTATCTACTAAGCAAGAGAAGCTAGCTGCTGCATCAACACCTAATCAA
GAGGAAATTAAAAGCTCAAAGAGGAAAAGAGGGAACAAGACCACGCCAGCCACAGTTTCA
GTTATCCCAAAGCTGTTCACTTCCACCTTTAGGCTTCCCAAGTTAAAGTCTCCTCCACCT
TCTGGAGCCATATAAGATTTTGATCTTATCTATCTCTCTGTATTTAGGATCATTCCTCTG
ATGTATATTAGTTTTTTTTCTATATAGTTCTAGACAGTTTCCACTTTATTTAGTTAGGAA
CCTTTGCATTGGCATTGCAACTAGAGCTGTTGCTCCTTTTTGATGTATTATTTGTGAGGT
TTCACCAGTGTAATGTAACAAAGATTTCAAGTGGCTTC

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL6263Contig1 612 2 2 U
TTTTTGTTTCTCTTTCTTTAGCTCTCTCCCAAATTCTGAATCTACAGAGAAAAAGAAAAT
GCTTTCAACAACTCTTAGTCAACTATGGCTTCCCCCTCTGCATCTCTGGGATCTCTCAGC
CGTTATCTCTCTCCAAAGAAATGGCAGATCATGACAAGAGAAGGAAGAAGATGAAGAAGA
AGATAAGGAGATCGGAAGGTGAGTCCATGAACCATGGTGCGGAAGAAGAAATGGGTGTGG
AGAGATTCCATGATCTATTATGGCTCCAAGAGATGGGAGAGAGTGAAGATGTTAGAGATC
TAGTTGCTTTATTCCAAGATCTAGGGTCATGGACCTTTTCTTCTCACACAGCTAAAGCTG
TCTAGAAAAAGAAGCCCAAAAACTCTCTTAGATCTCACTGAGATGTTTCTTCTTTGTAAA
ACTTCAGATCAAAAATCTATAAAATATTCCTCAATGTTTTTCACTGTTGTTGTTGACACG
TTTATTTGTCGCTGGTGTGATGATGTTTTGATGCTTGCTGCCTCTTTTGGCACCATCCCT
TTTTATTTTGGTTTCTAGTTATTTGCTGGATAACCGCTTTGAACTTTAATCATTTAGTCA
AAGGCTTTTATT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GG68TF U 1
AF RS1GG68JQ C 133
BS 1 578 RS1GG68TF
BS 579 612 RS1GG68JQ

RD RS1GG68TF 581 0 0
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GCTTTCAACAACTCTTAGTCAACTATGGCTTCCCCCTCTGCATCTCTGGGATCTCTCAGC
CGTTATCTCTCTCCAAAGAAATGGCAGATCATGACAAGAGAAGGAAGAAGATGAAGAAGA
AGATAAGGAGATCGGAAGGTGAGTCCATGAACCATGGTGCGGAAGAAGAAATGGGTGTGG
AGAGATTCCATGATCTATTATGGCTCCAAGAGATGGGAGAGAGTGAAGATGTTAGAGATC
TAGTTGCTTTATTCCAAGATCTAGGGTCATGGACCTTTTCTTCTCACACAGCTAAAGCTG
TCTAGAAAAAGAAGCCCAAAAACTCTCTTAGATCTCACTGAGATGTTTCTTCTTTGTAAA
ACTTCAGATCAAAAATCTATAAAATATTCCTCAATGTTTTTCACTGTTGTTGTTGACACG
TTTATTTGTCGCTGGTGTGATGATGTTTTGATGCTTGCTGCCTCTTTTGGCACCATCCCT
TTTTATTTTGGTTTCTAGTTATTTGCTGGATAACCGCT
CTG

QA 1 578 1 578
DS 

RD RS1GG68JQ 480 0 0
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ATTTATTATGGCTCCAAGAGATGGGAGAGAGTGAAGATGTTAGAGATTTAGTTGCTTTAT
TCCAAGATTTAGGGTCATGGACCTTTTTTTTTCACACAGCTAAAGCTGTTTAGAAAAAGA
AGCCCAAAAACTTTTTTAGATCTCACTGAGATGTTTTTTTTTTGTAAAACTTCAGATCAA
AAATCTATAAAATATTCCTCAATGTTTTTCACTGTTGTTGTTGACACGTTTATTTGTCGC
TGGTGTGATGATGTTTTGATGCTTGCTGCCTCTTTTGGCCCCATCCCTTTTTATTTTGGT
TTCTAGTTATTTGCTGGATAACCGCTTTGAACTTTAATCATTTAGTCAAAGGCTTTTATT

QA 1 480 1 480
DS 



AS 1 2

CO CL6264Contig1 1277 2 2 U
GAACTTCCATTTTCAAAGGCCCCTGAGGATGATAGGAACTTGCCAGACATGCATCTTGGT
CTATATGACGATGTTATTGTATTTGATCACGTGGAGAAGAAAGCATATGTTATTCACTGG
ATTAGACTAGATGGGAGCGTTCCCTATGAGAAGGCATACAGTAACGGAGTCCAACATTTG
GAGAAATTGGTGGCCAAGTTACAGGATATTGAGCGGCCAAAGCTGGCTGCAGGTAACGTG
AATCTTCAGACGCGACAATTTGGGCCAGCTTTGGAAAACTCAAACGTGACACGCGAAGAG
TACGAGGAGGCTGTGGTGAATGCTAAAGAACACATACTTGCAGGAGATATATTCCAGATT
GTGTTGAGTCAGCGTTTTGAAAGGAGAACATTTGCTGACCCCTTTGAAGTTTATAGAGCT
CTAAGAGTTGTGAATCCAAGTCCCTATATGGGTTATTTGCAGGCTAGAGGATGTATATTG
GTAGCATCAAGTCCAGAAATTCTCACCAAAGTAAAGCAGAACAAGATAGTGAATCGGCCA
TTAGCAGGAACAAGCAGGAGAGGGAAAACAGAGGTTGAAGATAAGAGATTAGAGAAGGAG
CTGCTATAGAATGAGAAGCAATGTGCTGAACACATCATGCTGGTCGATCTCGCCCGCAAT
GATGTTGGAAAGGTTGCCAAATACGGTTCAGTGAAAGTTGAGAAACTCATGAACATCAAA
CGTTATTCCCATGTTATGCATATAAGCTCCACGGTGACAGGAGAGTTACAAGATGATTTA
TCTTGCTGGGACACACTACGTGCGGCTCTACCAGTGGGCACAGTTAGTGGGGCACCAAAG
GTAAAAGCCATGGAGCTAATCGATGAACTCGAGCCTACACGGCGTGGACCATACAGTGGC
GGTTTTGGTGGAGTCTCGTACACTGGTGACATGGACATTGCTTTATCACTTAGGACAATT
GTTTTCCCGACAGCAAGTCAATACAATACAATGTACTCTTACAAAGATGCTAACAAACGC
CGGGAATGGGTGGCTTATCTTCAAGCTGGAGCAGGTGTGGTAGCTGATAGTGACCCTGAA
GACGAGCACCGCGAGTGTCAGAACAAAGCTGCTGGTCTTGCTCGAGCTATCGACTTGGCT
GAATCCGCATTTGTTAAGAAATGAGTTTGCACACTTGAGAAGAGAGGCTTTTTTGAGCTT
CGAGTCATGTGTATAATAACGGTTATAAGCAGAACAAGCTTTCTTTTCTTAATTTTGTGG
AACTTGCATTTAGAGTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C839TF U 1
AF RS1C839JQ C 416
BS 1 674 RS1C839TF
BS 675 1277 RS1C839JQ

RD RS1C839TF 680 0 0
GAACTTCCATTTTCAAAGGCCCCTGAGGATGATAGGAACTTGCCAGACATGCATCTTGGT
CTATATGACGATGTTATTGTATTTGATCACGTGGAGAAGAAAGCATATGTTATTCACTGG
ATTAGACTAGATGGGAGCGTTCCCTATGAGAAGGCATACAGTAACGGAGTCCAACATTTG
GAGAAATTGGTGGCCAAGTTACAGGATATTGAGCGGCCAAAGCTGGCTGCAGGTAACGTG
AATCTTCAGACGCGACAATTTGGGCCAGCTTTGGAAAACTCAAACGTGACACGCGAAGAG
TACGAGGAGGCTGTGGTGAATGCTAAAGAACACATACTTGCAGGAGATATATTCCAGATT
GTGTTGAGTCAGCGTTTTGAAAGGAGAACATTTGCTGACCCCTTTGAAGTTTATAGAGCT
CTAAGAGTTGTGAATCCAAGTCCCTATATGGGTTATTTGCAGGCTAGAGGATGTATATTG
GTAGCATCAAGTCCAGAAATTCTCACCAAAGTAAAGCAGAACAAGATAGTGAATCGGCCA
TTAGCAGGAACAAGCAGGAGAGGGAAAACAGAGGTTGAAGATAAGAGATTAGAGAAGGAG
CTGCTATAGAATGAGAAGCAATGTGCTGAACACATCATGCTGGTCGATCTCGCCCGCAAT
GATGTTGGAAAGGT
GCCAAA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1C839JQ 862 0 0
GAGCTCTAAGAGTTGTGA*TCCAAGTCCCTATATGGGTTATT*GCAGGCTAGAGGATGTA
TAT*GGTAGCATCAAGTCCAGAAAT*CTCACCAAAGTAAAGCAGAACAAGATAGTGAATC
GGCCATTAGCAGGAACAAGCAGGAGAGGGAAAACAGAGGTTGAAGATAAGAGATTAGAGA
AGGAGCTGCTATAGAATGAGAAGCAATGTGCTGAACACATCATGCTGGTCGATCTCGGCC
GCAATGATGTTGGAAAGGTTGCCAAATACGGTTCAGTGAAAGTTGAGAAACTCATGAACA
TCAAACGTTATTCCCATGTTATGCATATAAGCTCCACGGTGACAGGAGAGTTACAAGATG
ATTTATCTTGCTGGGACACACTACGTGCGGCTCTACCAGTGGGCACAGTTAGTGGGGCAC
CAAAGGTAAAAGCCATGGAGCTAATCGATGAACTCGAGCCTACACGGCGTGGACCATACA
GTGGCGGTTTTGGTGGAGTCTCGTACACTGGTGACATGGACATTGCTTTATCACTTAGGA
CAATTGTTTTCCCGACAGCAAGTCAATACAATACAATGTACTCTTACAAAGATGCTAACA
AACGCCGGGAATGGGTGGCTTATCTTCAAGCTGGAGCAGGTGTGGTAGCTGATAGTGACC
CTGAAGACGAGCACCGCGAGTGTCAGAACAAAGCTGCTGGTCTTGCTCGAGCTATCGACT
TGGCTGAATCCGCATTTGTTAAGAAATGAGTTTGCACACTTGAGAAGAGAGGCTTTTTTG
AGCTTCGAGTCATGTGTATAATAACGGTTATAAGCAGAACAAGCTTTCTTTTCTTAATTT
TGTGGAACTTGCATTTAGAGTT

QA 1 862 1 862
DS 



AS 1 2

CO CL6265Contig1 810 2 10 U
GGTAGCCTTTGCCACTTTAATCCATCAATGGATGAAGACAACAAGCAAAGCAGATTCAGA
AAAATCTGTGTCTTGTGGAAGCCACTCTGGTCACAGAGAAGTTTTCAGTGATGCTACTAT
CGAACTCGGCAATGAACTCGTGAAGAGGAAAATAGACTTGGTTTATGGAGGAGGAAGTGT
TGGGCTGATGGGTCTTATCTCCAGGAGAGTTTATGAAGGTGGCTTCCATGTACTCGGGAT
CATCCCCAAGGCTTTGATGCCAATTGAGATATCTGGTGAGACTGTTGGAGATGTAAGAGT
GGTTGCAGACATGCACGAACGCAAAGCTGCTATGGCACAAGAAGCTGAGGCCTTCATCGC
CCTCCCTGGAGGTTATGGAACCATGGAGGAACTGCTAGAGATGATAACATGGTCACAACT
TGGCATCCACAAGAAAACGGTTGGTCTATTGAATGTTGATGGGTACTATAACAGTTTGCT
TGCTTTGTTTGACACGGGCGTTGAAGAAGGTTTTATCAAACCAGGCGCACGTAATATTGT
GGTTTCTGCCCCAACAGCCAAAGAGCTTATGGAGAAGATGGAGGAATACACTCCTTCACA
CAAGCATGTTGCAGCGCACGAAAGCTGGAAAGTTGAAGAACTTTAGAGCTTACCCTGGAC
AACAAAGCAAGCCTCAATGAAGAAGTGAAATTACATTAGTATTGCTTAGCTTATGCTCTA
CTTCCATTTCAAGTTTAGCCTGCAGAATCCAACAATGTGTGTATATGAAAAACTCAAAAC
CTTGTTGCAATTTGAAACAGCACATTGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H574TF U 1
AF RS1DS81TF U 153
BS 1 198 RS1H574TF
BS 199 199 RS1DS81TF
BS 200 243 RS1H574TF
BS 244 244 RS1DS81TF
BS 245 390 RS1H574TF
BS 391 391 RS1DS81TF
BS 392 621 RS1H574TF
BS 622 622 RS1DS81TF
BS 623 630 RS1H574TF
BS 631 810 RS1DS81TF

RD RS1H574TF 630 0 0
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AAAATCTGTGTCTTGTGGAAGCCACTCTGGTCACAGAGAAGTTTTCAGTGATGCTACTAT
CGAACTCGGCAATGAACTCGTGAAGAGGAAAATAGACTTGGTTTATGGAGGAGGAAGTGT
TGGGCTGATGGGTCTTATTTCCAGGAGAGTTTATGAAGGTGGCTTCCATGTACTCGGGAT
CATTCCCAAGGCTTTGATGCCAATTGAGATATCTGGTGAGACTGTTGGAGATGTAAGAGT
GGTTGCAGACATGCACGAACGCAAAGCTGCTATGGCACAAGAAGCTGAGGCCTTCATCGC
CCTCCCTGGAGGTTATGGAACCATGGAGGAGCTGCTAGAGATGATAACATGGTCACAACT
TGGCATCCACAAGAAAACGGTTGGTCTATTGAATGTTGATGGGTACTATAACAGTTTGCT
TGCTTTGTTTGACACGGGCGTTGAAGAAGGTTTTATCAAACCAGGCGCACGTAATATTGT
GGTTTCTGCCCCAACAGCCAAAGAGCTTATGGAGAAGATGGAGGAATACACTCCTTCACA
CAAGCATGTTGCAGCGCACGAGAGCTGGAA

QA 1 630 1 630
DS 

RD RS1DS81TF 658 0 0
G
AGACTTGGTTTATGGAGTAGGAAGTGTTGGGCTGATGGGTCTTATCTCCAGGAGAGTTTA
TGAAGGTGGTTTCCATGTACTCGGGATCATCCCCAAGGCTTTGATGCCAATTGAGATATC
TGGTGAGACTGTTGGAGATGTAAGAGTGGTTGCAGACATGCACGAACGCAAAGCTGCTAT
GGCCCAAGAAGCTGAGGCCTTCATCGCCCTCCCTGGAGGTTATGGAACTATGGAGGAACT
GCTGGAGATGATAACATGGTCACAACTTGGTATCCACAAGAAAACGGTTGGTCTATTGAA
TGTTGATGGGTACTATAACAGTTTGCTTGCTTTGTTTGACACGGGCGTTGAAGAAGGTTT
TATCAAACCAGGCGCACGTAATATTGTGGTTTCTGCCCCAACAGCCAAAGAGCTTATGGA
GAAGATGGATGAATACACTCCTTCACACAAGCATGTTGCAGCGCACGAAAGCTGGAAAGT
TGAAGAACTTTAGAGCTTACCCTGGACAACAAAGCAAGCCTCAATGAAGAAGTGAAATTA
CATTAGTATTGCTTAGCTTATGCTCTACTTCCATTTCAAGTTTAGCCTGCAGAATCCAAC
AATGTGTGTATATGAAAAACTCAAAACCTTGTTGCAATTTGAAACAGCACATTGGTC

QA 2 658 2 658
DS 



AS 1 2

CO CL6266Contig1 1040 2 6 U
GGAACATTTCACCGACGACGAATCCAACTCTCATCTTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCCCCC
TAAGAGTTTCAGGTTTTTAGTTGCGTTCTTCAGAACATCAGATACTTCGGTTCTTGATAA
TTGTCAACAAAGATGGATGATTGGGAGGCTGACGATTTTCAACCACTTCCTGCAAAAGTT
GTACTCAAAAGTAACTGGGATGACGAGGATGTGGATGAGAATGATATCAAGGACTCCTGG
GAGGAGGATGATGAACCTGTTCCTCCTGCACCTGTAGTAAAGCCTGCTACTGAGAAGGCT
CCAAAGAAAGCAGCAGCAGCAAAGGGTGTGGAGAAGAATGCTGAAACTGTTGAAGCTTCA
TCAAAGGAAGAACCTTTAGATCCTGTTACTGAGAAACTTCGCATGCAGAGGCTAGTGGAG
GAAGCTGATTACCAGGCAACTGCTGAACTCCTTGGAGCAAAGACTGAAGAAAAAAGTATC
AATATTTTTATTCCCAAGTCTGAAAGCGATTTCTTGGAATATGCTGAAATGATTTCTCGT
AAACTTGTACCTTATGAGAAAAGCTTTCACTATATTGGGCTACTCAAAGCAGTGATGAGA
CTTTCTGTGGCTAATATGAAAGCAGCTGATGTTAAAGATGTTGCTTCCTCCGTTACTGCA
ATAGCAAACGAAAAACTCAAGGCAGAGAAAGAAGCTGCTGCTGGCAAAAAGAAGACAGGT
AAGAAGAAGCAACTTCATGTGGATAAGCCTGACGATGATCTTGTTTCGGGTCCTTATGGC
GCTATGGACGATGATGATTTCATGTAAAAATTGCATTTTGGAAGTTGCAGTTACCTCCTT
GGGAGAGATTTAAATCATCGGCGGTTTTTTATTACATCTATTGAAGTAACACTTTTTTAG
TAAAACTAAAACACTCTAGTCCATCTTTTTTTTTTGTCACAAACACTCTAGTCCATCTTT
TCTCAGTTTTCTTTGCTTGGTTTGTTTTCGAAATTATGTATTAATATTTCTTTTTTGAAG
AAATGATTTTTGGATGAGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BJ92TF U 1
AF RS1BJ92JQ C 277
BS 1 681 RS1BJ92TF
BS 682 682 RS1BJ92JQ
BS 683 709 RS1BJ92TF
BS 710 710 RS1BJ92JQ
BS 711 722 RS1BJ92TF
BS 723 1040 RS1BJ92JQ

RD RS1BJ92TF 722 0 0
GGAACATTTCACCGACGACGAATCCAACTCTCATCTTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCCCCC
TAAGAGTTTCAGGTTTTTAGTTGCGTTCTTCAGAACATCAGATACTTCGGTTCTTGATAA
TTGTCAACAAAGATGGATGATTGGGAGGCTGACGATTTTCAACCACTTCCTGCAAAAGTT
GTACTCAAAAGTAACTGGGATGACGAGGATGTGGATGAGAATGATATCAAGGACTCCTGG
GAGGAGGATGATGAACCTGTTCCTCCTGCACCTGTAGTAAAGCCTGCTACTGAGAAGGCT
CCAAAGAAAGCAGCAGCAGCAAAGGGTGTGGAGAAGAATGCTGAAACTGTTGAAGCTTCA
TCAAAGGAAGAACCTTTAGATCCTGTTACTGAGAAACTTCGCATGCAGAGGCTAGTGGAG
GAAGCTGATTACCAGGCAACTGCTGAACTCCTTGGAGCAAAGACTGAAGAAAAAAGTATC
AATATTTTTATTCCCAAGTCTGAAAGCGATTTCTTGGAATATGCTGAAATGATTTCTCGT
AAACTTGTACCTTATGAGAAAAGCTTTCACTATATTGGGCTACTCAAAGCAGTGATGAGA
CTTTCTGTGGCTAATATGAAAGCAGCTGATGTTAAAGATGTTGCTTCCTCCGTTACTGCA
ATAGCAAACGAAAAACTCAAG*CAGAGAAAGAAGCTGCTGCTGGCAAAA*GAAGACAGGT
AA

QA 1 722 1 722
DS 

RD RS1BJ92JQ 764 0 0
AGTAAAG
CTGCTACTGAGAAGGCTCCAAAGAAAGCAGCAGCAGCAAAGGGTGTGGAGAAGAATGCTG
AAACTGTTGAAGCTTCATCAAAGGAAGAACCTTTAGATCCTGTTACTGAGAAACTTCGCA
TGCAGAGGCTAGTGGAGGAAGCTGATTACCAGGCAACTGCTGAACTCCTTGGAGCAAAGA
CTGAAGAAAAAAGTATCAATATTTTTATTCCCAAGTCTGAAAGCGATTTCTTGGAATATG
CTGAAATGATTTCTCGTAAACTTGTACCTTATGAGAAAAGCTTTCACTATATTGGGCTAC
TCAAAGCAGTGATGAGACTTTCTGTGGCTAATATGAAAGCAGCTGATGTTAAAGATGTTG
CTTCCTCCGTTACTGCAATAGCAAACGAAAAACTCAAGGCAGAGAAAGAAGCTGCTGCTG
GCAAAAAGAAGACAGGTAAGAAGAAGCAACTTCATGTGGATAAGCCTGACGATGATCTTG
TTTCGGGTCCTTATGGCGCTATGGACGATGATGATTTCATGTAAAAATTGCATTTTGGAA
GTTGCAGTTACCTCCTTGGGAGAGATTTAAATCATCGGCGGTTTTTTATTACATCTATTG
AAGTAACACTTTTTTAGTAAAACTAAAACACTCTAGTCCATCTTTTTTTTTTGTCACAAA
CACTCTAGTCCATCTTTTCTCAGTTTTCTTTGCTTGGTTTGTTTTCGAAATTATGTATTA
ATATTTCTTTTTTGAAGAAATGATTTTTGGATGAGTG

QA 8 764 8 764
DS 



AS 1 2

CO CL6267Contig1 806 2 3 U
CCCCCGGGACTCTCGAAGACGGCGGAGTTCGTGATCTCGAAGGTCGACGATCTCATGAAC
TGGGCTCGTAGGGGATCGATCTGGCCTATGACCTTCGGCCTCGCCTGCTGCGCCGTGGAG
ATGATGCACACCGGTGCTGCTCGCTACGATCTGGACCGGTTCGGTATCATCTTCAGGCCG
AGTCCTCGCCAATCCGACTGTATGATCGTCGCAGGGACGCTTACTAACAAGATGGCTCCT
GCTCTTCGCAAGGTTTATGACCAAATGCCGGAGCCAAGGTGGGTGATATCGATGGGAAGC
TGCGCCAACGGAGGTGGATACTACCACTACTCCTACTCAGTTGTTCGAGGCTGTGACAGG
ATTTTGCCAGTCGACATTTACGTCCCTGGGTGCCCTCCAACCGCTAGGCTTTGCTCTATG
GACTCCTCCAGCTTCAGAAGAAAATCAACAGGCGCAAGGATTTCTTGCATTGGTGGAACA
AGTAAACAAGTTTCAGAATCCTATCCTTCTTCCCAATGTGAAAGGGAGAGTTCTTTTCAG
ACAATTTTTCAACAAAGTTTGGGGGATAATAAAACGTGGACACGTTTCAATGCAATGCTT
CTTTGTGGTGTGGATGGATGCCATTTAAAATTTGTGTGTTTTACAAGTTTGATGTGGAAA
CTTGAATAAATATAAGATTCTGTTATATTTCTTTTTAATTGGATCTATGCACTAAAGATT
CTGGGTTAGAATGTTTGTATCCATAACATCTTGGTTAAGACCAATGATTGAAAGGGAGAA
ACAATATGAATGTTCTTAGAATTTCA


BQ
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AF RS1F146TF U 31
AF RS1F146JQ C 1
BS 1 30 RS1F146JQ
BS 31 269 RS1F146TF
BS 270 806 RS1F146JQ

RD RS1F146TF 239 0 0
GTGATCTCGAAGGTCGACGATCTCATGAACTGGGCTCGTAGGGGATCGATCTGGCCTATG
ACCTTCGGCCTCGCCTGCTGCGCCGTGGAGATGATGCACACCGGTGCTGCTCGCTACGAT
CTGGACCGGTTCGGTATCATCTTCAGGCCGAGTCCTCGCCAATCCGACTGTATGATCGTC
GCAGGGACGCTTACTAACAAGATGGCTCCTGCTCTTCGCAAGGTTTATGACCAAATGCC

QA 1 239 1 239
DS 

RD RS1F146JQ 806 0 0
CCCCCGGGACTCTCGAAGACGGCGGAGTTCGTGATCTCGAAGGTCGACGATCTCATGAAC
TGGGCTCGTAGGGGATCGATCTGGCCTATGACCTTCGGCCTCGCCTGCTGCGCCGTGGAG
ATGATGCACACCGGTGCTGCTCGCTACGATCTGGACCGGTTCGGTATCATCTTCAGGCCG
AGTCCTCGCCAATCCGACTGTATGATCGTCGCAGGGACGCTTACTAACAAGATGGCTCCT
GCTCTTCGCAAGGTTTATGACCAAATGCCGGAGCCAAGGTGGGTGATATCGATGGGAAGC
TGCGCCAACGGAGGTGGATACTACCACTACTCCTACTCAGTTGTTCGAGGCTGTGACAGG
ATTTTGCCAGTCGACATTTACGTCCCTGGGTGCCCTCCAACCGCTAGGCTTTGCTCTATG
GACTCCTCCAGCTTCAGAAGAAAATCAACAGGCGCAAGGATTTCTTGCATTGGTGGAACA
AGTAAACAAGTTTCAGAATCCTATCCTTCTTCCCAATGTGAAAGGGAGAGTTCTTTTCAG
ACAATTTTTCAACAAAGTTTGGGGGATAATAAAACGTGGACACGTTTCAATGCAATGCTT
CTTTGTGGTGTGGATGGATGCCATTTAAAATTTGTGTGTTTTACAAGTTTGATGTGGAAA
CTTGAATAAATATAAGATTCTGTTATATTTCTTTTTAATTGGATCTATGCACTAAAGATT
CTGGGTTAGAATGTTTGTATCCATAACATCTTGGTTAAGACCAATGATTGAAAGGGAGAA
ACAATATGAATGTTCTTAGAATTTCA

QA 1 806 1 806
DS 



AS 1 2

CO CL6268Contig1 1170 2 2 U
TATTTCACCATTTCCAGCTCACCAGTATCAACCTGGATTCCCCTAGAAAGCCTCCGTACA
ACACCGTGAGTTTCTGCAATTCGTGGAAGGAAAGTGGACCCCGACACGGTGTGACTCGGC
GCCGTAGCCAAAGGTTCGACCCGGTGGTCCGCTTGTCAGCTTTTGGTGAAAATTCCGGAG
ACTCACCAACGGAAACCACACCAGGGGTTGGCTCTGCTCTTGAAGACAGACCAGCTGTGG
AAGATGCGTCCTTTGAGCAAGAAGACAAATCAAGTTCGATCTATTAGTCTCTTTATCCAG
ATAAAGAGGAGCTTCCCTGATGATAAAGAGATGACTATATTCGATCATCTTGAGGAGCTC
CGTGAGAGAATATTCGTCTCGGTTTTAGCTGTGGGAGCTGCAATCTTGGGATGCTTCGCC
TACTCCAAAGATCTAATCGTGTTTCTCGAAGCTCCCGTCAAAACACAGGGCGTACGGTTT
CTGCAGCTAGCTCCGGGGCGAGTTTTTCTTCACAACTTTAAAGGTCTCGGGTTATTGTGG
GCTTCTACTAGGGAGTCCAGTGATACTGTATGAGATTATAGCTTTTGTACTTCCTGGTTT
GATACGAGCTGAGAGAAGGTTTCTGGGGCCAATTGTGTTTGGTTCCTCCTTGTTGTTCTA
TGCTGGACTTGCCTTCTCCTACTGGGTTTTAACCCCTGCTGCCTTGAATTTCTTTGTCAA
CTACGCTGAAGGGGTGGTTGAATCTCTCTGGTCTATCGACCAGTACTTTGAGTTTGTACT
TGTGCTTATGTTCAGCACCGGCCTGTCTTTCCAGGTTCCTGTAATTCAGTTACTCTTGGG
ACAAGTAGGGGTGGTGTCGGGAGATCAAATGCTTTCAATATGGAGATATGTAGTTGTGGG
TGCGGTGGTTGTAGCAGCTGTGGTCACGCCCTCGACAGACCCTGTCACTCAGATGCTCCT
AGCAACACCGCTTCTGGGCCTCTACTTAGGTGGTGCTTGGATGGTCAAGCTCACAGGTCG
GTGAAGAACTTGGCTGTTCAAAGAAAGACAAAAAAAAATCATGTGTATCTTGTAGAGTAT
ATCACTTTTCCATGCAAGAAACCACAGTTTGGTATCTAAAGCGTTTATTTGAAACATAGT
CTTCTTTGAATGTACAAATTTAGCAACCAG


BQ
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AF RS1EI40JQ C 356
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ACACCGTGAGTTTCTGCAATTCGTGGAAGGAAAGTGGACCCCGACACGGTGTGACTCGGC
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ATAAAGAGGAGCTTCCCTGATGATAAAGAGATGACTATATTCGATCATCTTGAGGAGCTC
CGTGAGAGAATATTCGTCTCGGTTTTAGCTGTGGGAGCTGCAATCTTGGGATGCTTCGCC
TACTCCAAAGATCTAATCGTGTTTCTCGAAGCTCCCGTCAAAACACAGGGCGTACGGTTT
CTGCAGCTAGCTCCGGGGCGAGTTTTTCTTCACAACTTTAAAGGTCTCGGGTTATTGTGG
GCTTCTACTAGGGAGTCCAGTGATACTGTATGAGATTATAGCTTTTGTACTTCCTGGTTT
GATACGAGCTGAGAGAA
AGT

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TCGCCTACTCCAAAGATCTAATCGTGTTTCTCGAAGCTCCCGTCAAAACACAGGGCGTAC
GGTTTCTGCAGCTAGCTCCGGG*CGAGTTTTTCTTCACAACTTTAAAGGTCTCGGGTTAT
TGTGGGCTTCTACTAGGGAGTCCAGTGATACTGTATGAGATTATAGCTTTTGTACTTCCT
GGTTTGATACGAGCTGAGAGAAGGTTTCTGGGGCCAATTGTGTTTGGTTCCTCCTTGTTG
TTCTATGCTGGACTTGCCTTCTCCTACTGGGTTTTAACCCCTGCTGCCTTGAATTTCTTT
GTCAACTACGCTGAAGGGGTGGTTGAATCTCTCTGGTCTATCGACCAGTACTTTGAGTTT
GTACTTGTGCTTATGTTCAGCACCGGCCTGTCTTTCCAGGTTCCTGTAATTCAGTTACTC
TTGGGACAAGTAGGGGTGGTGTCGGGAGATCAAATGCTTTCAATATGGAGATATGTAGTT
GTGGGTGCGGTGGTTGTAGCAGCTGTGGTCACGCCCTCGACAGACCCTGTCACTCAGATG
CTCCTAGCAACACCGCTTCTGGGCCTCTACTTAGGTGGTGCTTGGATGGTCAAGCTCACA
GGTCGGTGAAGAACTTGGCTGTTCAAAGAAAGACAAAAAAAAATCATGTGTATCTTGTAG
AGTATATCACTTTTCCATGCAAGAAACCACAGTTTGGTATCTAAAGCGTTTATTTGAAAC
ATAGTCTTCTTTGAATGTACAAATTTAGCAACCAG

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DS 



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TTTCTTAAATGAGATCTATTGATATC


BQ
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AF RS1H442JQB C 1
AF RS1H442TF U 1
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TTGTGTTTTTCTCTCTTATAATCTTTTGGTTAGTGATTGTAATCGACTTCTTCTATTTGC
AAGAACAAGTTGTCAATTATAATAAGAATAATAATGTACTCTCTTTGATCTATTTGTTGG
TTTCTTAAATGAGATCTATTGATATC

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DS 

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TTGTGTTTTTCTCTCTTATAATCTTTTGGTTAGTGATTGTAATCGACTTCTTCTATTTGC
AAGAACAAGTTGTCAATTATAATAAGAATAATAATGTACTCTCTTTGATCTATTTGTTGG
TTTCTTAAATGAGATCTATTGATATC

QA 1 266 1 266
DS 



AS 1 2

CO CL6270Contig1 966 2 2 U
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ATGTCAAAGAGCGGGAAACTCCACATGTTGATTACAGAGCAGGAGACTAGATCATTTTCT
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GAGATTGAAGAAAATGTTTTTCCTCACATAACCCTTGAAGATTTTCCCGGGAGCTCAGAG
AGCTTCGAGATGGTGGCAAAGTTCTGCTACGGCGTCAAGATCGACCTCTCCGCCTCCTCC
GCCGTTCCCCTCCGCTGCGCTGCCGAGCATCTCGAGATGACGGAAGAGTATTCACCGGAT
AACCTCATCTCAAAGACGGAGAGGTTTCTCTCGCACTCAGTCTACAAGAGCTTGCGAGAA
TCGATCAAGGCTCTCCAAGCTTGTGAGCCGGTCTCGCCTCTAGCAGAATCGCTTGGCTTA
ACGGAACAGTGCGTAGAGTCCATCGTCTCCAGAGCTTCCTCAGCCGATCCTTCTCTCTTC
GGCTGGCCCGTAAACGACGGAGGCGGAGGAATCTCCGTCAATGATCTGTCGCTTATCCCC
GGTGGCGGCGCGGCGAAATCTACAGCTGATGCTCGACGAAAGAAACAGAGTAGGGATACG
AATACGGAGCTATGGTTCGAAGATCTGGCGCAGCTGAGCCTTCCCATCTTCAGAACTGTG
ATCCTCTCAATGAGATCTGAAGATCTAAGCTCAGACGTCATAGAGAGCTGTTTGATTTGT
TACGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1BG79TF U 1
AF RS1BG79JQ C 259
BS 1 694 RS1BG79TF
BS 695 966 RS1BG79JQ

RD RS1BG79TF 694 0 0
TTTTTGGTTTCTTCTGTGAGTGTTTCTTTTTCAGAGCTTTCTTCACCAGTGTGGTCTACA
ATGGCGTCGTCAGAGAAGTCTACCTCCAAGGGTCAAGCATGGTTCTGTACGACTGGATTA
CCTAGCGACATTGAAATCGAAGTTGATGATATGACATTTCATCTCCATAAGTTTCCTCTC
ATGTCAAAGAGCGGGAAACTCCACATGTTGATTACAGAGCAGGAGACTAGATCATTTTCT
TCTGTAAATCCCCAAACCTCAATGGCGCTAACTGTAGTAGCAACAGACAGTGACAACAAG
AAAGGAAAAGGCCATGAAATCGAGGATGATGAAGAAGAAGAACGACAACAACAAGAGCAG
GAGATTGAAGAAAATGTTTTTCCTCACATAACCCTTGAAGATTTTCCCGGGAGCTCAGAG
AGCTTCGAGATGGTGGCAAAGTTCTGCTACGGCGTCAAGATCGACCTCTCCGCCTCCTCC
GCCGTTCCCCTCCGCTGCGCTGCCGAGCATCTCGAGATGACGGAAGAGTATTCACCGGAT
AACCTCATCTCAAAGACGGAGAGGTTTCTCTCGCACTCAGTCTACAAGAGCTTGCGAGAA
TCGATCAAGGCTCTCCAAGCTTGTGAGCCGGTCTCGCCTCTAGCAGAATCGCTTGGCTTA
ACGGAACAGTGCGTAGAGTCCATCGTCTCCAGAG

QA 1 694 1 694
DS 

RD RS1BG79JQ 708 0 0
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ATCGAGGATGATGAAGAAGAAGAACGACAACAACAAGAGCAGGAGATTGAAGAAAATGTT
TTTCCTCACATAACCCTTGAAGATTTTCCCGGGAGCTCAGAGAGCTTCGAGATGGTGGCA
AAGTTCTGCTACGGCGTCAAGATCGACCTTTCCGCCTCCTCCGCCGTTCCCCTCCGCTGC
GCTGCCGAGCATCTCGAGATGACGGAAGAGTATTCACCGGATAACCTCATCTCAAAGACG
GAGAGGTTTCTCTCGCACTCAGTCTACAAGAGCTTGCGAGAATCGATCAAGGCTCTCCAA
GCTTGTGAGCCGGTCTCGCCTCTAGCAGAATCGCTTGGCTTAACGGAACAGTGCGTAGAG
TCCATCGTCTCCAGAGCTTCCTCAGCCGATCCTTCTCTCTTCGGCTGGCCCGTAAACGAC
GGAGGCGGAGGAATCTCCGTCAATGATCTGTCGCTTATCCCCGGTGGCGGCGCGGCGAAA
TCTACAGCTGATGCTCGACGAAAGAAACAGAGTAGGGATACGAATACGGAGCTATGGTTC
GAAGATCTGGCGCAGCTGAGCCTTCCCATCTTCAGAACTGTGATCCTCTCAATGAGATCT
GAAGATCTAAGCTCAGACGTCATAGAGAGCTGTTTGATTTGTTACGCC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6272Contig1 972 2 2 U
GGGTGCAGGTCTTGTTGGGTCAGTGCTTGCTAAAGATGGGGGCTTACCAGATATGTCCAG
TTTCGTCTCCGGTGCTTTTAAGATGGTATTTAGACAACTGAAACAAGGAGAACCTGCCAA
ATCAACTAGCAAGCCTTACAATGATGCACTTACAGCCCAGGTTAACAGTCTTCGGCATGA
ATTGCAGTTGCTGGCTTCAAACAGACCTATCACTATAATTTCCACTGGAGGATCAGGTAG
TAGAAAGTATGGTGTGGTCGTTATTATTGGGGTGATAGGCTACGGATATGTTTGGTGGAA
GGGCTTCAAACTTGAAGATTTTATGTTTGCAACAAGGCGCAGCTTGTCAGATGCATGCAA
TAATGTTGGCACCCAGATCGATGGTTTTTATTCGTCCCTCTCCGGTACAAAACGGGAGTT
AGGTTCAGAAATCGACAGGATGGATCGTACTTTGGATGCAAGTTCAGTAATTATTAAAGA
AACAGGAAGAGAGGTGACTGAGTTACGGGATGGTACCGCAAATATGAAGGATGAAGTTAG
GTCTGTTTTCGAGGCTGTTGAAACTCTGGCCAGCAAAGTCTCTCGCATTGAGGGAAATCA
GGATCTCACGCTTAGAGGAGTCGGAGCTCTGCATGCCCAGAGTCTCGAGCACAAAAGAAT
TCAAGAGTCCAATAAGGCTTTGCCTTCAACTTCATCAGTGCCAGCTCTTGAGCCAGCTCC
TGTGGCAGTGGCGGCACCATCATCAAGGACTCTGTCTTTGCCTCCTCCTTCTCCCCGTGA
ATCCCAATCTCCGTCAACCCCTAATGGAGCTCAACAGTCACATGGTCCACTTCACCACAC
TCAGTCTATGCCTGGTTTGAAGGATATAAGCGAAAGCCCTAGGAGCGGTGAGACTTTCTC
CAATGGAACACATTCTGGAGAAGCCAAGGGAAACACAACAACAAGTCAGGCCTGTTTAGT
ATGTTTTCAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E119TF U 1
AF RS1D125TF U 306
BS 1 743 RS1E119TF
BS 744 972 RS1D125TF

RD RS1E119TF 743 0 0
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TTTCGTCTCCGGTGCTTTTAAGATGGTATTTAGACAACTGAAACAAGGAGAACCTGCCAA
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ATTGCAGTTGCTGGCTTCAAACAGACCTATCACTATAATTTCCACTGGAGGATCAGGTAG
TAGAAAGTATGGTGTGGTCGTTATTATTGGGGTGATAGGCTACGGATATGTTTGGTGGAA
GGGCTTCAAACTTGAAGATTTTATGTTTGCAACAAGGCGCAGCTTGTCAGATGCATGCAA
TAATGTTGGCACCCAGATCGATGGTTTTTATTCGTCCCTCTCCGGTACAAAACGGGAGTT
AGGTTCAGAAATCGACAGGATGGATCGTACTTTGGATGCAAGTTCAGTAATTATTAAAGA
AACAGGAAGAGAGGTGACTGAGTTACGGGATGGTACCGCAAATATGAAGGATGAAGTTAG
GTCTGTTTTCGAGGCTGTTGAAACTCTGGCCAGCAAAGTCTCTCGCATTGAGGGAAATCA
GGATCTCACGCTTAGAGGAGTCGGAGCTCTGCATGCCCAGAGTCTCGAGCACAAAAGAAT
TCAAGAGTCCAATAAGGCTTTGCCTTCAACTTCATCAGTGCCAGCTCTTGAGCCAGCTCC
TGTGGCAGTGGCGGCACCATCAT

QA 1 743 1 743
DS 

RD RS1D125TF 667 0 0
G
CAAACTTGAAGATTTTATGTTTGCAACAAGGCGCAGCTTGTCAGATGCATGCAATAATGT
TGGCACCCAGATCGATGGTTTTTATTCGTCCCTCTCCGGTACAAAACGGGAGTTAGGTTC
AGAAATCGACAGGATGGATCGTACTTTGGATGCAAGTTCAGTAATTATTAAAGAAACAGG
AAGAGAGGTGACTGAGTTGCGGGATGGTACCGCAAATATGAAGGATGAAGTTAGGTCTGT
TTTCGAGGCTGTTGAAACTCTGGCCAGCAAAGTCTCTCGCATTGAGGGAAATCAGGATCT
CACGCTTAGAGGAGTCGGAGCTCTGCATGCCCAGAGTCTCGAGCACAAAAGAATTCAAGA
GTCCAATAAGGCTTTGCCTTCAACTTCATCAGTGCCAGCTCTTGAGCCAGCTCCTGTGGC
AGTGGCGGCACCATCATCAAGGACTCTGTCTTTGCCTCCTCCTTCTCCCCGTGAATCCCA
ATCTCCGTCAACCCCTAATGGAGCTCAACAGTCACATGGTCCACTTCACCACACTCAGTC
TATGCCTGGTTTGAAGGATATAAGCGAAAGCCCTAGGAGCGGTGAGACTTTCTCCAATGG
AACACATTCTGGAGAAGCCAAGGGAAACACAACAACAAGTCAGGCCTGTTTAGTATGTTT
TCAATG

QA 2 667 2 667
DS 



AS 1 2

CO CL6273Contig1 997 2 2 U
GGACGAGAAACGCGGTCGCCATTGATTCGCCATTTCGAAAGATGGAGAGCACAAGGTCAG
ACCCAGAGCTTGATGACGACGACTTTAGTGAAATCTACAAGGAGTACACAGGTCCTGTCA
CCACCACCACCACCAACGTCCAAGAAAAACCTAAACTTCCTGAAGATGGATGTGATGAAC
AAGAAGAAGAAGAAGAAGAGCAGCAACAGCTTCCTGACCCCAACTCTGTGCCAACCGATT
TCACAAGCCGAGAGGCTAAGGTCTGGGAGGCTAAATCCAAAGCTACTGAGAGGAACTGGA
AGAAGAGGAAAGAAGAAGAAATGATCTGTAAGATTTGTGGCGAGTCTGGTCATTTCACTC
AGGGGTGTCCATCGACGCTTGGTGCCAACAGAAAGTCTCAGGATTTCATCGAGAGGGTAC
CGGCTAGGGACAAGAACGTTAGAGCTCTGTTTACTGAGAAAGCTGTGGAGAGGATCGAGA
GCGAGACCGGATGCAAGATTAAAATGGATGACAAGTTCATTATCGTCAGTGGCAAGGACA
GATTGATCTTGAGGAAAGGTGTTGATGCTGTTCACAAGGTTAGAGAGGACGGCGAGGTTA
AACCTTCTTCTGCCGCTTCTCGCAGGAGCAGATCCAGGTCGCCTAGACGAACTTCTGTCG
GTCCAGGTCCACCTCCGCCGCCTGTTCCTCGGAACCCTGAACCTCAGAGACAGCAGCACA
TGCCATCATCACATGGTTCGTCGAGTTTCTCAGAGCGCTCTGGAAGGCAATAGAAGTTTG
TGGACAACCGTGTTCGTGAGAACCAGCGGAATGCTCCACGAGGATCTCCACAAGGTAGGG
CTAGGATACAAGATACCTTAGAGAATTAGTTATTGTCTGTTTTAGGAGAAGTTGATTGGT
CTTTTCGGTTATTTTTGGCCGAAAATGTACTCTTCTTGTCTTTGTTTTGCAGCCAAAAAG
GTAAGTCCTTATGTTCAAGCGTTTTGTACATTTCTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1H509TF U 1
AF RS1H509JQB C 608
BS 1 730 RS1H509TF
BS 731 997 RS1H509JQB

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AAGAAGAAGAAGAAGAAGAGCAGCAACAGCTTCCTGACCCCAACTCTGTGCCAACCGATT
TCACAAGCCGAGAGGCTAAGGTCTGGGAGGCTAAATCCAAAGCTACTGAGAGGAACTGGA
AGAAGAGGAAAGAAGAAGAAATGATCTGTAAGATTTGTGGCGAGTCTGGTCATTTCACTC
AGGGGTGTCCATCGACGCTTGGTGCCAACAGAAAGTCTCAGGATTTCATCGAGAGGGTAC
CGGCTAGGGACAAGAACGTTAGAGCTCTGTTTACTGAGAAAGCTGTGGAGAGGATCGAGA
GCGAGACCGGATGCAAGATTAAAATGGATGACAAGTTCATTATCGTCAGTGGCAAGGACA
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AACCTTCTTCTGCCGCTTCTCGCAGGAGCAGATCCAGGTCGCCTAGACGAACTTCTGTCG
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TGCCATCATC

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DS 

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TCCACCTCCGCCGCCTGTTCCTCGGAACCCTGAACCTCAGAGACAGCAGCACATGCCATC
ATCACATGGTTCGTCGAGTTTCTCAGAGCGCTCTGGAAGGCAATAGAAGTTTGTGGACAA
CCGTGTTCGTGAGAACCAGCGGAATGCTCCACGAGGATCTCCACAAGGTAGGGCTAGGAT
ACAAGATACCTTAGAGAATTAGTTATTGTCTGTTTTAGGAGAAGTTGATTGGTCTTTTCG
GTTATTTTTGGCCGAAAATGTACTCTTCTTGTCTTTGTTTTGCAGCCAAAAAGGTAAGTC
CTTATGTTCAAGCGTTTTGTACATTTCTGA

QA 1 390 1 390
DS 



AS 1 2

CO CL6274Contig1 1101 2 2 U
GAGCGCATACTACGTAGCACCTGAAGTACTACACAGATCCTACAGCACAGAAGCTGATAT
CTGGAGCGTTGGCGTGATAGTCTACATTCTCTTATGTGGAAGCAGACCGTTTTGGGCTAG
GACGGAGTCAGGAATCTTTCGTTCCGTTCTAAAAGCAGATCCTAGTTTCGACGACGCTCC
TTGGCCTTTGCTATCTTCAGAGGCGAGAGACTTTGTGAAGCGGTTGCTGAATAAAGACCC
GCGTAAAAGATTAACAGCTGCACAAGCCTTGAGTCATCCATGGATAAAGGACTCAAATGA
CGCAAAGATTCCGTTGGATATTCTTGTTTTCAAACTTATGAGAGCTTATTTAAGATCATC
TTCTCTCCGTAAATCTGCTTTAAGGGCCTTGTCTAAAACACTTACGGTTGATGAACTGTT
TTATCTGAGGGAGCAGTTTGCTTTACTAGAACCTAGCAAGAACGGAACAATAAGTCTTGA
AAACATCAAATCAGCTCTGGTGAAAATGGCAACAGACGCAATGAAGGACTCGCGTATACA
TGAATTTTTAGCACAACTGAGTGCTCTTCAATATAGAAGAATGGACTTTGAAGAGTTCTG
TGCAGCTGCATTGAGTGTTCACCAGCTAGAAGCTCTTGATAGATGGGAACAACACGCTCG
TTGTGCTTATGAGCTTTTCGAAAAGGAAGGGAACAGACCCATCATGATAGATGAACTCGC
TTCGGAACTTGGTCTTGGTCCTTCTGTACCGGTTCATGCAGTGCTTCACGATTGGTTTAG
GCATACAGATGGAAAGCTTAGTTTTCTTGGGTTTGTGAAGTTGTTACATGGTGTGTCTAG
CCGTACTGTCAAAGCTCATTAGAAGGGGTTTAGAAAATTCTGAATATGTATTGAGAGGTT
TGTCTGAGATCTCTTCTCTCCCAAGAGCTTTTGGACTAGTTGGGTTTATAATATGGTTTT
TTTGCCTTTTGTGATGAAAGCTGAGAAGAAGAAAAAAGATGAGTGTAGCTAAAAAGAGAA
GTGTGTGTTAGTTTGTAGAGGATGAAGACATTTTCTAAATTTGGTAACTTATGACGATTG
ATTGATGATGTTTCTGACATT


BQ
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AF RS1BW25TF U 1
AF RS1BW25JQ C 332
BS 1 762 RS1BW25TF
BS 763 1101 RS1BW25JQ

RD RS1BW25TF 762 0 0
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CTGGAGCGTTGGCGTGATAGTCTACATTCTCTTATGTGGAAGCAGACCGTTTTGGGCTAG
GACGGAGTCAGGAATCTTTCGTTCCGTTCTAAAAGCAGATCCTAGTTTCGACGACGCTCC
TTGGCCTTTGCTATCTTCAGAGGCGAGAGACTTTGTGAAGCGGTTGCTGAATAAAGACCC
GCGTAAAAGATTAACAGCTGCACAAGCCTTGAGTCATCCATGGATAAAGGACTCAAATGA
CGCAAAGATTCCGTTGGATATTCTTGTTTTCAAACTTATGAGAGCTTATTTAAGATCATC
TTCTCTCCGTAAATCTGCTTTAAGGGCCTTGTCTAAAACACTTACGGTTGATGAACTGTT
TTATCTGAGGGAGCAGTTTGCTTTACTAGAACCTAGCAAGAACGGAACAATAAGTCTTGA
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TGAATTTTTAGCACAACTGAGTGCTCTTCAATATAGAAGAATGGACTTTGAAGAGTTCTG
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TTGTGCTTATGAGCTTTTCGAAAAGGAAGGGAACAGACCCATCATGATAGATGAACTCGC
TTCGGAACTTGGTCTTGGTCCTTCTGTACCGGTTCATGCAGT

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1BW25JQ 770 0 0
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TCTAAAACACTTACGGTTGATGAACTGTTTTATCTGAGGGAGCAGTTTGCTTTACTAGAA
CCTAGCAAGAACGGAACAATAAGTCTTGAAAACATCAAATCAGCTCTGGTGAAAATGGCA
ACAGACGCAATGAAGGACTCGCGTATACATGAATTTTTAGCACAACTGAGTGCTCTTCAA
TATAGAAGAATGGACTTTGAAGAGTTCTGTGCAGCTGCATTGAGTGTTCACCAGCTAGAA
GCTCTTGATAGATGGGAACAACACGCTCGTTGTGCTTATGAGCTTTTCGAAAAGGAAGGG
AACAGACCCATCATGATAGATGAACTCGCTTCGGAACTTGGTCTTGGTCCTTCTGTACCG
GTTCATGCAGTGCTTCACGATTGGTTTAGGCATACAGATGGAAAGCTTAGTTTTCTTGGG
TTTGTGAAGTTGTTACATGGTGTGTCTAGCCGTACTGTCAAAGCTCATTAGAAGGGGTTT
AGAAAATTCTGAATATGTATTGAGAGGTTTGTCTGAGATCTCTTCTCTCCCAAGAGCTTT
TGGACTAGTTGGGTTTATAATATGGTTTTTTTGCCTTTTGTGATGAAAGCTGAGAAGAAG
AAAAAAGATGAGTGTAGCTAAAAAGAGAAGTGTGTGTTAGTTTGTAGAGGATGAAGACAT
TTTCTAAATTTGGTAACTTATGACGATTGATTGATGATGTTTCTGACATT

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 2

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GGGTAGCCCCAAAGGAAAAAAAAGGAAGACGCAACCAAATACTCAAAGGTGCTGAGATGT
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AGATTTTTGCTTTGTTACAATGGGTTATGCTCAGCTCGTTATCGGTCCAGCAGGCAGCGG
AAAGTCAACTTATTGCTCATCTTTGTATGAACACTGTGAAACCGTCGGCAGAACAATGAA
TGTTGTTAACTTGGATCCTGCTGCTGAAATCTTTAACTATCCTGTGGCTATGGATATCAG
AGAGCTTGTTTCTTTGGAAGATGTAATGGAGGAGCTTGGGCTTGGTCCTAATGGTGCCCT
CATGTACTGCATGGAATACCTTGAGGATAGCTTACATGATTGGGTGGATGAAGAGTTGGA
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ACATGTTCCTGTGCTCAAGAACTTTGTGGCGCATTTGCAACAGAAGAACTTCAACGTCTG
TGTTGTTTATCTGCTTGATTCACAGTTCATAACAGATGTCACCAAGTTTATCAGCGGTTG
CATGTCGTCTCTCTCTGCAATGATCCAGCTTGAATTACCACACATCAACATCCTCTCAAA
GATGGATCTCTTGCAGGATAAAAGCAACATTGATAACTACTTGGATCCGGAGCCTCGCAC
ATTGTTGGCAGAGTTAAACGAAAAGATGGGTCCACGATACGCGAAATTGAACAAAGCCCT
GATTGAGATGGTGGGAGAATATGGGATGGTGAATTTCATTCCGCTTGACATAAGGAAAGA
ACGAAGTATTCAGTATGTTCTGTCTCAGATTGATGTCTGCATCCAGTTTGGAGAAGACGC
TGACGTTAAGATCAAAGATGAGGATGAAGATTTTGGTGATGATCAGTGATTTGTTACTCT
GATTCACGGACGTTTCTCTCAAACTTTTGAACAATCTTAGTCTTATCAAAGGCCAATGAA
CTTGTGAAAACTATTTTATTTGCTGAATACCAAAACCTTAACTAGCG


BQ
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AF RS1B161TF U 1
AF RS1B161JQ C 352
BS 1 591 RS1B161TF
BS 592 1067 RS1B161JQ

RD RS1B161TF 591 0 0
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GTCTATTGATTGCTTCTGGTCTATGGGTTCCTGCGACATTCTGAGTGTGTTGTCCGGTTT
AGATTTTTGCTTTGTTACAATGGGTTATGCTCAGCTCGTTATCGGTCCAGCAGGCAGCGG
AAAGTCAACTTATTGCTCATCTTTGTATGAACACTGTGAAACCGTCGGCAGAACAATGAA
TGTTGTTAACTTGGATCCTGCTGCTGAAATCTTTAACTATCCTGTGGCTATGGATATCAG
AGAGCTTGTTTCTTTGGAAGATGTAATGGAGGAGCTTGGGCTTGGTCCTAATGGTGCCCT
CATGTACTGCATGGAATACCTTGAGGATAGCTTACATGATTGGGTGGATGAAGAGTTGGA
GAACTACAGGGATGATGATTGCCTTATATTCGATTGTCCAGGCCAGATAGAACTGTTTAC
ACATGTTCCTGTGCTCAAGAACTTTGTGGCGCATTTGCAACAGAAGAACTTCAACGTCTG
TGTTGTTTATCTGCTTGATTCACAGTTCATAACAGATGTCACCAAGTTTAT

QA 1 591 1 591
DS 

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AGAGTTGGAGAACTACAGGGATGATGATTGCCTTATATTCGATTGTCCAGGCCAGATAGA
ACTGTTTACACATGTTCCTGTGCTCAAGAACTTTGTGGCGCATTTGCAACAGAAGAACTT
CAACGTCTGTGTTGTTTATCTGCTTGATTCACAGTTCATAACAGATGTCACCAAGTTTAT
CAGCGGTTGCATGTCGTCTCTCTCTGCAATGATCCAGCTTGAATTACCACACATCAACAT
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GCCTCGCACATTGTTGGCAGAGTTAAACGAAAAGATGGGTCCACGATACGCGAAATTGAA
CAAAGCCCTGATTGAGATGGTGGGAGAATATGGGATGGTGAATTTCATTCCGCTTGACAT
AAGGAAAGAACGAAGTATTCAGTATGTTCTGTCTCAGATTGATGTCTGCATCCAGTTTGG
AGAAGACGCTGACGTTAAGATCAAAGATGAGGATGAAGATTTTGGTGATGATCAGTGATT
TGTTACTCTGATTCACGGACGTTTCTCTCAAACTTTTGAACAATCTTAGTCTTATCAAAG
GCCAATGAACTTGTGAAAACTATTTTATTTGCTGAATACCAAAACCTTAACTAGCG

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

CO CL6276Contig1 1047 2 2 U
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TGAATATCCACAAGCACAGGCTTATGGGTCATCAGGAATCAGAAGTTCTTCGGTGACTGT
TATTACAGGCGATGGAGAGATTATCACTGGCGGACATGTGGATGATAGCATCAAGCTAGT
CTCATCTGATGGAGCCAAGACATTAGAAACAGCTTTTGGTCATTGTGCTCCTGTAACATG
TCTGGCTCTCTCTCCAGACAGCAACTTCCTTGTCACAGGTTCAAGAGATACAACTCTTTT
GATGTGGAGGTTTCACAAGGGAGTCACTTCTCAGACAAGTGAGTCCCAACAGACTAAAAC
CTCTGAGGCACCTTCCTCCGCAAGCAACACCTTGGTTAACAAATCCAAAAAGCGACGCAT
TGAAGGTCCCATACAAGTGTTACATGGCCACTTAAGAGAAGTAACATGTTGCTGTGTTAG
CTCAGATCATGGAATAGTTGTTTCTTCCTCTGAATCACCGGATGTTCTAGTGCATTCCAT
AAGGAAAGGCCGACTAATAAGACGGCTTGTTGGCGTCAAAGCCAATGCTCTATGCATCTC
TTCTGGTGGAGTTATAGTGGTTTGGAGTAGATCAGATCGTACTATCAGCACGTTCACTAT
CAATGTGTCCTTATTTCGAAAGCGAAACTTCCTTCCTCTTGTACTATAAGCTGCATGGAA
CTATCCATGGATGGTCAAAACGTTGTGGTCGGCGTGAACTCGTTGTCCTACACTGGTGAA
GAAGATTCATCAAGTGGAGACAATGCAATTAACATACTGGACGTTCCATCTCCATCTATA
TGCTTCCTCAATTTATATACTCTCAAGGTATTCCATGTGATGAAGCTTGGTAAAGGGCAG
AATATAACAGCTATGGCTCTGAACATAGACAACACTAACCTCTTAGTTTCCACTGAAGAT
AATCAGTTGTTCATCTTCACCAGCCCATCTTTAAGGTCGAAGGTGGTGGTTCAGAATTGG
TGAAGCTTGGCTCTGAATAAACATGTA


BQ
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AF RS1AP65TFB U 1
AF RS1AP65JQ C 509
BS 1 748 RS1AP65TFB
BS 749 1047 RS1AP65JQ

RD RS1AP65TFB 748 0 0
GCATCACGCTAAGGAAGCTTCAGCTGGTGTGACGTTGATACGTATGTTCAAAGGTGATTC
TGAATATCCACAAGCACAGGCTTATGGGTCATCAGGAATCAGAAGTTCTTCGGTGACTGT
TATTACAGGCGATGGAGAGATTATCACTGGCGGACATGTGGATGATAGCATCAAGCTAGT
CTCATCTGATGGAGCCAAGACATTAGAAACAGCTTTTGGTCATTGTGCTCCTGTAACATG
TCTGGCTCTCTCTCCAGACAGCAACTTCCTTGTCACAGGTTCAAGAGATACAACTCTTTT
GATGTGGAGGTTTCACAAGGGAGTCACTTCTCAGACAAGTGAGTCCCAACAGACTAAAAC
CTCTGAGGCACCTTCCTCCGCAAGCAACACCTTGGTTAACAAATCCAAAAAGCGACGCAT
TGAAGGTCCCATACAAGTGTTACATGGCCACTTAAGAGAAGTAACATGTTGCTGTGTTAG
CTCAGATCATGGAATAGTTGTTTCTTCCTCTGAATCACCGGATGTTCTAGTGCATTCCAT
AAGGAAAGGCCGACTAATAAGACGGCTTGTTGGCGTCAAAGCCAATGCTCTATGCATCTC
TTCTGGTGGAGTTATAGTGGTTTGGAGTAGATCAGATCGTACTATCAGCACGTTCACTAT
CAATGTGTCCTTATTTCGAAAGCGAAACTTCCTTCCTCTTGTACTATAAGCTGCATGGAA
CTATCCATGGATGGTCAAAACGTTGTGG

QA 1 748 1 748
DS 

RD RS1AP65JQ 539 0 0
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GTTGGCGTCAAAGCCAATGCTCTATGCATCTCTTCTGGTGGAGTTATAGTGGTTTGGAGT
AGATCAGATCGTACTATCAGCACGTTCACTATCAATGTGTCCTTATTTCGAAAGCGAAAC
TTCCTTCCTCTTGTACTATAAGCTGCATGGAACTATCCATGGATGGTCAAAACGTTGTGG
TCGGCGTGAACTCGTTGTCCTACACTGGTGAAGAAGATTCATCAAGTGGAGACAATGCAA
TTAACATACTGGACGTTCCATCTCCATCTATATGCTTCCTCAATTTATATACTCTCAAGG
TATTCCATGTGATGAAGCTTGGTAAAGGGCAGAATATAACAGCTATGGCTCTGAACATAG
ACAACACTAACCTCTTAGTTTCCACTGAAGATAATCAGTTGTTCATCTTCACCAGCCCAT
CTTTAAGGTCGAAGGTGGTGGTTCAGAATTGGTGAAGCTTGGCTCTGAATAAACATGTA

QA 1 539 1 539
DS 



AS 1 2

CO CL6277Contig1 301 2 1 U
GGCCTCTTCGCAGTTGTCTGTCTTCAGATTCCCCCCGAACCTCTCACCAAACTATCGTCG
ATATCGCACGCGCCGCCGCAGGCTTTGCCGCCGGCAACTGCTTTTACCCTTGTCTCCTCC
CCTCTCATCCTCTAAAGTATCCATAAAACTTATTTAAAAAAAAAAAAGAAAACTAAGAAA
ACTCACCAAACTATTTTCTCTGCTTCAGTTTCTCTCAATTGCGCTCTTCTTTCGTTTCGA
TCTTTGATTGCTCTGAAATAAACGAGAGGGGAGAGAAGAAGAGCAAATAAAAAAACACTC
C


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RS1GI76TF U 1
AF RS1GI76JQ C 58
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RD RS1GI76TF 301 0 0
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ACTCACCAAACTATTTTCTCTGCTTCAGTTTCTCTCAATTGCGCTCTTCTTTCGTTTCGA
TCTTTGATTGCTCTGAAATAAACGAGAGGGGAGAGAAGAAGAGCAAATAAAAAAACACTC
C

QA 1 301 1 301
DS 

RD RS1GI76JQ 244 0 0
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TCCCCTCTCATCCTCTAAAGTATCCATAAAACTTATTTAAAAAAAAAAAAGAAAACTAAG
AAAACTCACCAAACTATTTTTTCTGCTTCAGTTTCTCTCAATTGCGCTCTTCTTTCGTTT
CGATCTTTGATTGCTCTGAAATAAACGAGAGGGGAGAGAAGAAGAGCAAATAAAAAAACA
CTCC

QA 1 244 1 244
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6279Contig1 989 2 8 U
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ACTTTTCCTCATCACGCTTACGCTCCTTCTCCTTTGCCTTTTCCTGTAAGCTCGCTATGT
ATTCCTCAAAAAGCCCTCTGCTAACATTATCATCTCCAATCGATCTGTACTCTTGACTTT
CTTCGACTAGTTGTTTGACATCTTCCCAATTTGATGCTGCGGTTATTTCCTTGAAAGTGC
GCAAGAGATTGGTAAATTCTTCAGCCAAACGCTGAAGCTTTCTGGCTTCTTTTTCTTCTT
TTTCCTTCATCCTCTCAACCATGTCATTATATATAAGCTTTAAATTCATGTCTGATATTG
GTTGAGAACTGAGATCTTCTGAAAGAGCAAATTTAAAATCTTCAAACATCCATGACGCTA
CCATGGAAACCTTCCTTGACTTAATCGCATCCTTTACGCGACTCTTGTCCTCGTGATACT
GCTTCTCTAATTCTTCCGCGATATCTTCGAATAAGTCTTTCGGAGTTGAGCCAGACAAAT
TAAATGCAACAGCTTGGTATTGAGGCAAGTCTCTTACCTCAATGCAATACTCCAACCAAT
ACGTCTTGGCTGTAAGGATGCCAGCAGCGACATGTTCTTCCAATAGTGTACGAAATGCAT
CACGGTTTTTTCTCTCAGCCCGCCTAACATGTTCTTTCTCTACCCTCTTCAGCTCCTCTT
CTTCCTTCTCCAGGTCATTAATGTAATCCTCAAAACCAATCAAACGATCTATCTTTTCAA
GAGATGCGCTTCTTTCATCATCCTCCAGTCTATCCTGAATTTTGCGCCATTGTGTACTGG
CTTTGATATAGTCACAGGTTTCAAGAAACTTCCGATATTCTGCCATCTTCTGCCGATGTT
CTGCCACTGCCTTCTCTCTTTCCTTCCTCTCAAGTTCCACAATATAATTGTCAAAAAGAT
CTTCACGATCCCTTGGGCGATCAACAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E043JQ U 1
AF RS1CA67JQ U 304
BS 1 389 RS1E043JQ
BS 390 390 RS1CA67JQ
BS 391 498 RS1E043JQ
BS 499 499 RS1CA67JQ
BS 500 542 RS1E043JQ
BS 543 543 RS1CA67JQ
BS 544 749 RS1E043JQ
BS 750 989 RS1CA67JQ

RD RS1E043JQ 749 0 0
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CTTCGACTAGTTGTTTGACATCTTCCCAATTTGATGCTGCGGTTATTTCCTTGAAAGTGC
GCAAGAGATTGGTAAATTCTTCAGCCAAACGCTGAAGCTTTCTGGCTTCTTTTTCTTCTT
TTTCCTTCATCCTCTCAACCATGTCATTATATATAAGCTTTAAATTCATGTCTGATATTG
GTTGAGAACTGAGATCTTCTGAAAGAGCAGATTTAAAATCTTCAAACATCCATGACGCTA
CCATGGAAACCTTCCTTGACTTAATCGCATCCTTTACGCGACTCTTGTCCTCGTGATACT
GCTTCTCTAATTCTTCCGTGATATCTTCGAATAAGTCTTTCGGAGTTGAGCCAGACAAAT
TAGATGCAACAGCTTGGTATTGAGGCAAGTCTCTTACCTCAATGCAATACTCCAACCAAT
ACGTCTTGGCTGTAAGGATGCCAGCAGCGACATGTTCTTCCAATAGTGTACGAAATGCAT
CACGGTTTTTTCTCTCAGCCCGCCTAACATGTTCTTTCTCTACCCTCTTCAGCTCCTCTT
CTTCCTTCTCCAGGTCATTAATGTAATCC

QA 1 749 1 749
DS 

RD RS1CA67JQ 686 0 0
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TGGAAACCTTCCTTGACTTCATCGCATCCTTTACGCGACTCTTGTCCTCGTGATACTGCT
TCTCTAATTCTTCCGCGATATCTTCGAATAAGTCTTTCGGAGTTGAGCCAGACAAATTAA
ATGCAACAGCTTGGTATTGAGGCAAGTCTCTTACCTCAATGCAATACTCCAACCAATACG
TCTTGGCTGTAAGGATGCCAGCAGCGACATGTTCTTCCAATAGTGTACGAAATGCATCAC
GGTTTTTTCTCTCAGCCCGCCTAACATGTTCTTTCTCTACCCTCTTCAGCTCCTCTTCTT
CCTTCTCCAGGTCATTAATGTAATCCTCAAAACCAATCAAACGATCTATCTTTTCAAGAG
ATGCGCTTCTTTCATCATCCTCCAGTCTATCCTGAATTTTGCGCCATTGTGTACTGGCTT
TGATATAGTCACAGGTTTCAAGAAACTTCCGATATTCTGCCATCTTCTGCCGATGTTCTG
CCACTGCCTTCTCTCTTTCCTTCCTCTCAAGTTCCACAATATAATTGTCAAAAAGATCTT
CACGATCCCTTGGGCGATCAACAGCT

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 2

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TAAATTTGAAGACCCACCGAGAAGTGAGGACTTTTAGAGTGTGTATATTTTGAGTTTTGT
TGCAAGTCAGATTTCTAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EX51TF U 1
AF RS1EX51JQ C 71
BS 1 500 RS1EX51TF

RD RS1EX51TF 500 0 0
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GGATCGATCACCAGCTGAGGTGATGCCTGTGGAGCGGATAAGTGGGGAAGCAGCAGAGGC
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AAGCAAAAGAAGACTAACAATGGTTGTTAGACTTTCCTGATGATTCTGTGTATTAGAAGA
AGCAAAAAAAAAAAAGGTTAAAGAGAGATTTAGAGGATTATTGAGTAAGTCACATGTGTT
ATATAAAAGCTGCCCAGGTTGGCTGTAGTAATGTTGCCTTCTCTAGTGGCAGTTTGCAAC
ATTTTTAACTCTCTTTACCTTTCTCTGTGTGTATCAAAAAAGCAAACTTTTTTATTTCTA
TAAATTTGAAGACCCACCGAGAAGTGAGGACTTTTAGAGTGTGTATATTTTGAGTTTTGT
TGCAAGTCAGATTTCTAACC

QA 1 500 1 500
DS 

RD RS1EX51JQ 430 0 0
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TCAACGATGGATGATCCGATGGTAATTTGAAATAACCAAAACTAGTAATAAAGCAAAAGA
AGACTAACAATGGTTGTTAGACTTTCCTGATGATTCTGTGTATTAGAAGAAGCAAAAAAA
AAAAAGGTTAAAGAGAGATTTAGAGGATTATTGAGTAAGTCACATGTGTTATATAAAAGC
TGCCCAGGTTGGCTGTAGTAATGTTGCCTTCTCTAGTGGCAGTTTGCAACATTTTTAACT
CTCTTTACCTTTCTCTGTGTGTATCAAAAAAGCAAACTTTTTTATTTCTATAAATTTGAA
GACCCACCGAGAAGTGAGGACTTTTAGAGTGTGTATATTTTGAGTTTTGTTGCAAGTCAG
ATTTCTAACC

QA 1 430 1 430
DS 



AS 1 2

CO CL6281Contig1 805 2 2 U
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ATTTTCATAAAACAACAGAGTAAAACATCTTAAACATATTCCATCCAATCTACCGATAAA
GAAAACAACAACTTCATTGATAAGATTGTAACACTCAGGACACCACCAGGAACATCCTTA
ACGATTGGCCTTGGCAACTCTTTCAATCTCATCCTTCTTCTTGATGGCATAGCTGTTGGA
GGAGCCCTTGGCAGCGTTGATCAATTCATCAGCAAGGCACTCGGCAATAGTCTTGATGTT
CCTGAAAGCAGCTTCACGAGAACCGGTGGTAAGCAAGAAGATAGCTTGGTTCACACGTCT
TAGAGGGGAGATATCAACCGCTTGTCTCCTCACAACACCAGCAGATCCAATTCTCGTGGC
ATCTTCACGTGGACCACTGTTGACAATGGCATCGATGATGACCTGGATAGGGTTCGCGTC
GGTCAAGAGGTGGATGATCTCCATGGCGTGCTTGATGATTCTCACAGCCATCAATTTCTT
TCCGTTGTTTTCCGGCGGTGTGGGGGACAAAGGTGGCGTGTTTTGGCTGCCTGGACTCCG
ATGTAGTCAACAAGACTGATGTCTGTCACCGAAACGTCATCGTAGGTCCAGCGGTTGAAG
AGCTTGACCTCGTTGGTAAGCTGCTGCTGAATCTCGGCGTCGATTTCTACGGTGGCGGCC
ATGATTGTAAGAGAAACAGAGAGTATGGGTCAAAGCTACAGAGAGTGAGAGAGAGACGGC
AGAGAGTGAGAACGAGACGCTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1A631TF C 1
AF RS1A631JQ U 370
BS 1 369 RS1A631TF
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RD RS1A631TF 805 0 0
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TCCGTTGTTTTCCGGCGGTGTGGGGGACAAAGGTGGCGTGTTT*GGCTGCCTGGACTCCG
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AGAGAGTGAGAACGAGACGCTTTCC

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GTGGATGATCTCCATGGCGTGCTTGATGATTCTCACAGCCATCAATTTCTTTCCGTTGTT
TTCCGGCGGTGTGGGGGACAAAGGTGGCGTGTTTTGGCTGCCTGGACTCCGATGTAGTCA
ACAAGACTGATGTCTGTCACCGAAACGTCATCGTAGGTCCAGCGGTTGAAGAGCTTGACC
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AGAGAAACAGAGAGTATGGGTCAAAGCTACAGAGAGTGAGAGAGAGACGGCAGAGAGTGA
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QA 1 436 1 436
DS 



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TGACATTCAG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CK47JQ C 1
AF RS1CK47TF U 1
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TGACATTCAG

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DS 

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ATGAGCATCGGTTTCATTGCTTTCGTCGCTGTCCTTCATGTCATGGGCAAGCTCTACTTT
GTCAAGTGATGATCAAATACTAGTAGAATGTGACTGCTAGTGATCAGAGAGCTTTTTTAG
AGAATGGTTTCATCAACTCATGTTTTTAATTTTGTGGAATATAAAACTATCTTGTTTCTT
TGACATTCAG

QA 1 430 1 430
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1BG47TF U 1
AF RS1A988TF U 1
BS 1 43 RS1A988TF
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RD RS1BG47TF 448 0 0
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AGGTTTTTT*ATGAAATTATTTGATGAT

QA 1 448 1 448
DS 

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GAGCGATTTAGGCACTACCTCGGCCCTTTCGATCAAGCTCAACCACTGTTAGGATAATCA
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ATTAAAAAGACCCAAATATACTTTTCGT

QA 1 508 1 508
DS 



AS 1 2

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CTACCGTTGATGAAGCCAACCTTGCGCTTCGCTCTCAGAGCATTCTCCAACTCTGATGAC
CACTCCGTGTAATTATCACCAGTCAACGTCACCGGACATATCGCCGTACCAGGATTATCA
GACGGCGCCAAGTAGTACGGTGACATCTTTGCATCTCCTGACGAACTCACTATTTCTCCA
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TAGGCTCTGATACCATGTAAATCAAGAGATATGAGGGAGAATACTTGTTACTTTACATCA
TCACCTTAACGTGATATATATACAACATGGCGGAGGAGATCTCGTATAACAACTCAAGCT
TATCACAATCTTACGTGATCTCCTTTTGTACTTATCTATACAATATATATATCTAACATA
TAAGACTATGTCGGTTCTAGAACCATCTAGAACCTTAACACGAGTCAATAAAGCTACAGC
TCGAGCTTTAACAATTCTAGGTGTGTTCTTGTGTGCTGCATCGTCGTTATTGTTCCATAC
TCTTAGCTTTGACTTTTCACACAACAAGCAAACACGTTTGGCTCAATTACAGAGAGATAG
CGGAGGTGATTACGGCCGAGATGATTACCTTGGAGATGAGAGACACCGGAGATGAGCGAC
GACAGAGACGATGATGGACGAGATGAGCAATGGCCGAGATCATCCACGCCGGAGATGATT
GGGGACAAGACGAGCTGTCGTACTCGTTTTAGTGATTTCAATTTTCAGAAGAAAAAAAAT
ATAATCAGAGAAGGAAAGGGACATAAGGGTAAGGGTAAATGAACCTATTATATTAAATGA
AACTTATTTTTGTGATTTTCTTCTCGAGTTAAATTCTGGGTTTTGGTCAAACCTTTTCCC
GCGAGAGAAGACTTCGATAGAA


BQ
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DS 

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GAAAAAATTTGCCTTTGATAGGCTCTGATACCATGTAAATCAAGAGATATGAGGGAGAAT
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CGTATAACAACTCAAGCTTATCACAATCTTACGTGATCTCCTTTTGTACTTATCTATACA
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ACCTATTATATTAAATGAAACTTATTTTTGTGATTTTCTTCTCGAGTTAAATTCTGGGTT
TTGGTCAAACCTTTTCCCGCGAGAGAAGACTTCGATAGAA

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DS 



AS 1 2

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TAACATAGTAAAACTGTCTGATGGGATTTATTATGGTGATGAGGATTCTTTCTACT


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AF RS1BA54TF U 1
AF RS1BA54JQ C 585
BS 1 661 RS1BA54TF
BS 662 1376 RS1BA54JQ

RD RS1BA54TF 661 0 0
GGGTTGCAAAGCTTTCACGACAAAACAAAAAAGAAAAAAACTTGAGGTGTCGTGCGAGAG
AATTCTATCTGAAGAAGAATAGAATGAAACGACTTCGTTTTGGGGTGGTAAAGTTCATTC
CTTTAGGTTTAATCATCTCTGGTTAACGAGTGGCTCTTTGGCGAGTCACTGAGTGTGGAG
TTGGATATTCAGAGACAAATCTCAAACCTTTCACGACAAAAAAGGTTTCAGATTTGGTCA
TCATGACGGAGTATAAGGAGGAACAAGAGATGGAGATTGAAGCTCTTGAATCTATACTTG
CTCATGACTTCAAAGAGATTCATTCTAGTGAAAGTGGGCTTAACACTTCGAACCGATGCT
TTCAGATAACCGTCACTCCTCAGGATGATGATCTGGAGGAGTCATCAATCCCACCAGTTC
AGCTGGGTTTGGTTTTCTCTCACACAGACAATTATCCTGATGAGGTTCCACTTTTGGATG
TTAAAAGTATTCGAGGAATCCATGTTAGTGATCTCACCATCTTGAAAGAGAAGCTTGAAC
AAGAGGCAACAGAAAATCTTGGAATGGCCATGATGTATACATTGGTCTCATCAGCAAAGG
ACTGGTTGTCTGAGCACTATGGGCAAGATGATGGATCTGACTATGCCGAAGAAGACACTG
C

QA 1 661 1 661
DS 

RD RS1BA54JQ 792 0 0
GTCTCATCAGCAAAGGACTGGTTGTCTGAGCACTATGGGCAAGATGATGGATCTGACTAT
GCCGAAGAAGACACTGCCAAAGAGGATGAGGTAATTATTCCACATGGAGAACCTGTTACG
CTGGAGACATTTGTGGCATGGAGAGAGAGATATGAGGCAGAGCTTGCACTTGAGCGAGCC
AAGCTGATGCCGGAGTCTGCTCTCACGGCACCTAAGGAGAAGAAGCTTACAGGAAGACAG
TGGTTTGAGAGTGGCAAAGCGAGAGGAACAGTGGTCGCTGCTGATCAAGAATCTGAGGAG
GAGGAAGATGATGAAGACATTGACTTTGAAGACGAAGACTTTGAAGATGATGAAGAAGAC
ATGCTTGAGCACTACTTGGCGGAGAAATCTGATGCTAGGGCCTGAAGCTAGGGAGCTTTA
CATAATGGATTTTTTTTTAAAGCCTTTTTCTGGAGAGAGATGAGGGTGACCATTTCTGGA
TAGAGATGAGGATGACCTTTCATTGAGCAGCATTCAATTCCAAGCTTTGATATGCTCAAG
AGTCAAGACTACCTTCACAGTCTGTCATTTATAAAAATGCCACTTAGATTTTGTAACTTT
TTTTTATGCTAGTATCAGCACAAAGCAGTTGTCTCAGATCAAATCTCAAAAGACTGAATA
GTTGAATCTTATTTAGAAACCCCTTTGTTGAAGCTGTGAGTCAGTCAATTCAGTTATGTT
CCTCATAACTTTTGACTAACATAGTAAAACTGTCTGATGGGATTTATTATGGTGATGAGG
ATTCTTTCTACT

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 2

CO CL6286Contig1 559 2 2 U
GGGAATCAATCTCTCTCTCGTCTTTTCTTACTCTCCAATTTCGCCGCCTAAGCAGTTTTA
TAGTTATTCAAGAAAACATGGAATCAACCAGTAACCATGGAGGTATCCAGCAACTGCTTG
CAGCTGAACACGAAGCTCAGCTGATTGTCAATGCCGCTAGAACCGCAGAAATGGCAAGAC
TGAAGCAAGCCAAAGAAAAGGCTGAAACGGAGATTGCTGAGCACAGAACTAGTACTGAAC
ATGGTTTCCAGAGGAAACTCGAAGAGACAAGTGGAGATTCAGGTGCAAACGTGAAGAGGC
TTGAGGAAGAGACTGATGCCAAGATCGAGCAGTTGAAGAACGAAGCTTCGAGGATTTCTA
CAGATGTTGTGGAGATGCTTCTGAAACATGTGACCACAGTGAAGAACTGAGATACATATT
ACACACAAATCAAAATTATTATTGACTGTAACATGGTGTCAAGTGTTGGATTTCTTCATT
CGTTTCTTTTATTTGTTTTTGTGGGTTCTTTGATTTGAACTGTTGCTTTTCGTTTTCCGA
TTTGGTCTCTTGAGTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1G094TF U 1
AF RS1G094JQ C 51
BS 1 481 RS1G094TF
BS 482 559 RS1G094JQ

RD RS1G094TF 481 0 0
GGGAATCAATCTCTCTCTCGTCTTTTCTTACTCTCCAATTTCGCCGCCTAAGCAGTTTTA
TAGTTATTCAAGAAAACATGGAATCAACCAGTAACCATGGAGGTATCCAGCAACTGCTTG
CAGCTGAACACGAAGCTCAGCTGATTGTCAATGCCGCTAGAACCGCAGAAATGGCAAGAC
TGAAGCAAGCCAAAGAAAAGGCTGAAACGGAGATTGCTGAGCACAGAACTAGTACTGAAC
ATGGTTTCCAGAGGAAACTCGAAGAGACAAGTGGAGATTCAGGTGCAAACGTGAAGAGGC
TTGAGGAAGAGACTGATGCCAAGATCGAGCAGTTGAAGAACGAAGCTTCGAGGATTTCTA
CAGATGTTGTGGAGATGCTTCTGAAACATGTGACCACAGTGAAGAACTGAGATACATATT
ACACACAAATCAAAATTATTATTGACTGTAACATGGTGTCAAGTGTTGGATTTCTTCATT
C

QA 1 481 1 481
DS 

RD RS1G094JQ 509 0 0
AGCAGTTTTATAGTTATTCAAGAAAACATGGAATCAACCAGTAACCATGGAGGTATCCAG
CAACTGCTTGCAGCTGAACACGAAGCTCAGCTGATTGTCAATGCCGCTAGAACCGCAGAA
ATGGCAAGACTGAAGCAAGCCAAAGAAAAGGCTGAAACGGAGATTGCTGAGCACAGAACT
AGTACTGAACATGGTTTCCAGAGGAAACTCGAAGAGACAAGTGGAGATTCAGGTGCAAAC
GTGAAGAGGCTTGAGGAAGAGACTGATGCCAAGATCGAGCAGTTGAAGAACGAAGCTTCG
AGGATTTCTACAGATGTTGTGGAGATGCTTCTGAAACATGTGACCACAGTGAAGAACTGA
GATACATATTACACACAAATCAAAATTATTATTGACTGTAACATGGTGTCAAGTGTTGGA
TTTCTTCATTCGTTTCTTTTATTTGTTTTTGTGGGTTCTTTGATTTGAACTGTTGCTTTT
CGTTTTCCGATTTGGTCTCTTGAGTTGTT

QA 1 509 1 509
DS 



AS 1 2

CO CL6287Contig1 505 2 7 U
GACTTTCTAAGCATCAGGCTCGAAGGCTACGGGAGCTTGTGGGGAAAAGATATGATTCAG
GGAAAGACGAGCTTACAATCACAAGCGAAAGGTTTGAACATCGAGAGGAAAACAGGAAAT
ACTGCTTGAGGACGCTTTACGGGTTGATACAGGAAGCTGCGAAGGCTAACAAGATCGCTG
AGGACATAAGAACTGCTTATGTGAAACAGAGGCTCCAAGCTAATCCAGCTTTTATGCAGA
AACTACAAGCCAAGATCATGAAGTCTAAAGAATCAAATCCCATCAACGCATGAAGAAACT
TCTTCCTGGTTTGTTCTTTTTGTTATCGTTTCACCAAAGAATAGAAGTTGATCGTTCTCT
TTTAGGACCATCAGTTGATCCGGTTATGGGATCCATAAAGAATTGATGGTAACTCCATAT
TTTGTTTTGGTTTTGCTGCTCCTCGTCTCTCATGAAACTTGGTCGTGTTGCTGGGGGCTA
TTAGGACCATGAGACAGTCAACGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CJ17JQ C 1
AF RS1CJ17TF U 59
BS 1 60 RS1CJ17JQ
BS 61 342 RS1CJ17TF
BS 343 343 RS1CJ17JQ
BS 344 456 RS1CJ17TF
BS 457 457 RS1CJ17JQ
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BS 484 505 RS1CJ17JQ

RD RS1CJ17JQ 505 0 0
GACTTTCTAAGCATCAGGCTCGAAGGCTACGGGAGCTTGTGGGGAAAAGATATGATTCAG
GGAAAGACGAGCTTACAATCACAAGCGAAAGGTTTGAACATCGAGAGGAAAACAGGAAAT
ACTGCTTGAGGACGCTTTACGGGTTGATAGAGGAAGCTGCGAAGGCTAACAAGATCGCTG
AGGACATAAGAACTGCTTATGTGAAACAGAGGCTCCAAGCTAATCCAGCTTTTATGCAGA
AACTACAAGCCAAGATCATGAAGTTTAAAGAATCAAATCCCATCAACGCATGAAGAAACT
TCTTCCTGGTTTGTTCTTTTTGTTATCGTTTCACCAAAGAATAGAAGTTGATCGTTCTCT
TTTAGGACCATCAGTTGATCCGGTTATGGGATCCATAAAGAATTGATGGTAACTCCATAT
TTTGTTTTGGTTTTGCTGCTCCTCGTCTCTCATGAAACTTGGTCGTGTTGCTGGGGGCTA
TTAGGACCATGAGACAGTCAACGTT

QA 1 505 1 505
DS 

RD RS1CJ17TF 425 0 0
AT
GGAAAGACGAGCTTACAATCACAAGCGAAAGGTTTGAACATCGAGAGGAAAACAGGAAAT
ACTGCTTGAGGACGCTTTACGGGTTGATACAGGAAGCTGCGAAGGCTAACAAGATCGCTG
AGGACATAAGAACTGCTTATGTGAAACAGAGGCTCCAAGCTAATCCAGCTTTTATGCAGA
AACTACAAGCCAAGATCATGAAGTCTAAAGAATCAAATCCCATCAACGCATGAAGAAACT
TCTTCCTGGTTTGTTCTTTTTGTTATCGTTTCACCAAAGAATCGAAGTTGATCGTTCTCT
TTTAGGACCATCAGTTGATCCGGTTATGGGATCCATAAAGAATTGATGGTAACTCCATAT
TTTGTTTTGGTTTTGCTGCTCCTCGTCTCTCATGAA*CTTGGTCGTGTTGCTGGGGGCTA
TTA

QA 3 425 3 425
DS 



AS 1 2

CO CL6288Contig1 710 2 4 U
CAGTCTCCCCAAGTGCGCTTCTACAGCAGCTCAGAGGCACCTCAAGAGCGGGCGTATGCC
TTACTACGAAGTGGGTAATCGTTACAACGATGGGAAGATCAGTGAGCTAGAGGCAGTAGT
TGTGGCACACAGCTCAGATTTTGAAAACGACAATAACCTTGGATTAGTTAAGCAAGCAGT
GGCATCACTTTACAAGCGGAACATACTGAGATTGACTCAGAAGTACTTGACCTTGTCGCT
TCAAGATATAGCCAACATGGTCCAACTTGCTTATGCTAAGGAGGCGGAAATGCATGTGCT
TCAGATGATCCAGGAGGGTCAGATACACGCCCTTATCAATCAGAAAGATGGAATGGTGAG
ATTCTTGGAGGACCCTGAGCAGTACAAAACCAGTGAGATGATAGAGGTCATGGATTCTGT
CATCCAAAGGACAATTGGGCTGTCGAAGAATCTATTTGCCATGGATGAAAGCTTGTCATG
TGATCCTTTATACTTGGGAAAGGTTGGAAGGGAAAGTCAAAGGTTCGACTTCGGAGACGA
TTTTGATACTGTCCCTCAGAAGTTCTCCATGTAAACATCAAAAAGACCTGAAGGAACAAA
ACTCGACTCAAAGACAACTCTGGTTGTTGTGACAATCTGGACAACCTTTCTTTTGCTTTC
ATTGTTCTTTTCCTTAGTTTATGACGTTTCATAATATATTTTTTTCTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BR96JQ C 1
AF RS1BR96TF U 271
BS 1 270 RS1BR96JQ
BS 271 553 RS1BR96TF
BS 554 554 RS1BR96JQ
BS 555 710 RS1BR96TF

RD RS1BR96JQ 710 0 0
CAGTCTCCCCAAGTGCGCTTCTACAGCAGCTCAGAGGCACCTCAAGAGCGGGCGTATGCC
TTACTACGAAGTGGGTAATCGTTACAACGATGGGAAGATCAGTGAGCTAGAGGCAGTAGT
TGTGGCACACAGCTCAGATTTTGAAAACGACAATAACCTTGGATTAGTTAAGCAAGCAGT
GGCATCACTTTACAAGCGGAACATACTGAGATTGACTCAGAAGTACTTGACCTTGTCGCT
TCAAGATATAGCCAACATGGTCCAACTTGCTTATGCTAAGGAGGCGGAAATGCATGTGCT
TCAGATGATCCAGGAGGGTCAGATACACGCCCTTATCAATCAGAAAGATGGAATGGTGAG
ATTCTTGGAGGACCCTGAGCAGTACAAAACCAGTGAGATGATAGAGGTCATGGATTCTGT
CATCCAAAGGACAATTGGGCTGTCGAAGAATCTATTTGCCATGGATGAAAGCTTGTCATG
TGATCCTTTATACTTGGGAAAGGTTGGAAGGGAAAGTCAAAGGTTCGACTTCGGAGACGA
TTTTGATACTGTCCCTCAGAAGTTCTCCATGTAAACATCAAAAAGACCTGAAGGAACAAA
ACTCGACTCAAAGACAACTCTGGTTGTTGTGACAATCTGGACAACCTTTCTTTTGCTTTC
ATTGTTCTTTTCCTTAGTTTATGACGTTTCATAATATATTTTTTTTTCAT

QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1BR96TF 440 0 0
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CCTTATCAATCAGAAAGATGGAATGGTGAGATTCTTGGAGGACCCTGAGCAGTACAAAAC
CAGTGAGATGATAGAGGTCATGGATTCTGTCATCCAAAGGACAATTGGGCTGTCGAAGAA
TCTATTTGCCATGGATGAAAGCTTGTCATGTGATCCTTTATACTTGGGAAAGGTTGGAAG
GGAAAGTCAAAGGTTCGACTTCGGAGACGATTTTGATACTGTCTCTCAGAAGTTCTCCAT
GTAAACATCAAAAAGACCTGAAGGAACAAAACTCGACTCAAAGACAACTCTGGTTGTTGT
GACAATCTGGACAACCTTTCTTTTGCTTTCATTGTTCTTTTCCTTAGTTTATGACGTTTC
ATAATATATTTTTTTCTCAT

QA 1 440 1 440
DS 



AS 1 2

CO CL6289Contig1 1265 2 2 U
GGGCTGAAATTGTGAAAATGTTCAAAGCAATCTCATCTCTGCGCAAAAGTCTTGTTCTAC
CTCTTCATACACATATTCGCACGCTACAAACTTTCTCCAAGTACAACGCACAAGCTGCCT
CAGCCTTGCTAGAGGAGCGTAAGAAGCCTCTTTATCAAGATGATGAGTATGCGGATGTGG
ACTGGGATAATCTCGGGTTTGGTCTAACTCCAGCTGATTACATGTACGTCATGAAATGCT
CGAAAGACGGTGAGTTCACAGAAGGTGAACTTAGTCGCTTTGGCAATATTCAGCTAAGTC
CTTCCGCTGGTGTCTTAAACTACGGGCAGGCGATATATGAAGGTACAAAAGCATACAGAA
AAGAAAACGGGAAGCTTCTTCTATTTCGCCCTGATCACAACGCTGTTAGAATGCAGCTTG
GTGCTGAAAGGATGCTCATGCCTTCTCCTTCCGTTGATCAGTTTGTTGATGCTGTTAAAC
AAACCGCTTATGCAAATAAACGTTGGGTTCCTCCTTCAGGGAAAGGGTCTCTGTACATTA
GGCCTCTGTTGATGGGAAGTGGTCCGATTCTTGGTTTAGGACCTGCACCTGAATACACAT
TCATTGTCTATGCATCACCTGTTGGTAACTACTTCAAGGAAGGTATTGCTGCTTTAAACC
TCTATGTTGAGGAAGAGTATGTCCGTGCAGCTCCTGGTGGAGCTGGAGGAGTCAAGAGCA
TCACAAACTACGCACCGGTTCTGAAGGCATTGAGTAGAGCCAAGAGTCGTGGGTTTTCAG
ACGTTCTTTATCTTGATTCTGTAAAGAAGAAGTATCTTGAGGAAGCTTCTTCTTGTAACG
TATTTGTTATAAAGGGTCGGACAATCTCTACTCCTGCAACCAATGGGACTATCCTCGAAG
GGATTACTCGGAAAAGTGTGATGGAGATTGCAAGTGATCAAGGTTATGAGGTAGTAGAGA
AGACAGTTCATGTGGATGAAGTAATGGAAGCAGATGAAGTTTTCTGCACCGGAACTGCTG
TGGGAGTTGCTCCTGTGGGCACCATAACATATCAGGACAAAAGAGTAGAGTATGAAACTG
GGGATGAATCAGTCTGCCAGAAACTGCGTTCGGTTCTTGTCGGTATCCAGACAGGACTGA
TTGAAGATACCAAAGGATGGGTCACATGTATCAACTGATAAACCAGATTAGTCTGCATTT
TAATGTATACACAACAATGAAGAACACTTATGTAAAACATATATAATATAGAAAGCTCTT
TTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RS1CK04TF U 1
AF RS1CK04JQ C 517
BS 1 639 RS1CK04TF
BS 640 1265 RS1CK04JQ

RD RS1CK04TF 639 0 0
GGGCTGAAATTGTGAAAATGTTCAAAGCAATCTCATCTCTGCGCAAAAGTCTTGTTCTAC
CTCTTCATACACATATTCGCACGCTACAAACTTTCTCCAAGTACAACGCACAAGCTGCCT
CAGCCTTGCTAGAGGAGCGTAAGAAGCCTCTTTATCAAGATGATGAGTATGCGGATGTGG
ACTGGGATAATCTCGGGTTTGGTCTAACTCCAGCTGATTACATGTACGTCATGAAATGCT
CGAAAGACGGTGAGTTCACAGAAGGTGAACTTAGTCGCTTTGGCAATATTCAGCTAAGTC
CTTCCGCTGGTGTCTTAAACTACGGGCAGGCGATATATGAAGGTACAAAAGCATACAGAA
AAGAAAACGGGAAGCTTCTTCTATTTCGCCCTGATCACAACGCTGTTAGAATGCAGCTTG
GTGCTGAAAGGATGCTCATGCCTTCTCCTTCCGTTGATCAGTTTGTTGATGCTGTTAAAC
AAACCGCTTATGCAAATAAACGTTGGGTTCCTCCTTCAGGGAAAGGGTCTCTGTACATTA
GGCCTCTGTTGATGGGAAGTGGTCCGATTCTTGGTTTAGGACCTGCACCTGAATACACAT
TCATTGTCTATGCATCACCTGTTGGTAACTACTTCAAGG

QA 1 639 1 639
DS 

RD RS1CK04JQ 749 0 0
CAGGGAAAGGGTCTCTGTACATTAGGCCTCTGTTGATGGGAAGTGGTCCGATTCTTGGTT
TAGGACCTGCACCTGAATACACATTCATTGTCTATGCATCACCTGTTGGTAACTACTTCA
AGGAAGGTATTGCTGCTTTAAACCTCTATGTTGAGGAAGAGTATGTCCGTGCAGCTCCTG
GTGGAGCTGGAGGAGTCAAGAGCATCACAAACTACGCACCGGTTCTGAAGGCATTGAGTA
GAGCCAAGAGTCGTGGGTTTTCAGACGTTCTTTATCTTGATTCTGTAAAGAAGAAGTATC
TTGAGGAAGCTTCTTCTTGTAACGTATTTGTTATAAAGGGTCGGACAATCTCTACTCCTG
CAACCAATGGGACTATCCTCGAAGGGATTACTCGGAAAAGTGTGATGGAGATTGCAAGTG
ATCAAGGTTATGAGGTAGTAGAGAAGACAGTTCATGTGGATGAAGTAATGGAAGCAGATG
AAGTTTTCTGCACCGGAACTGCTGTGGGAGTTGCTCCTGTGGGCACCATAACATATCAGG
ACAAAAGAGTAGAGTATGAAACTGGGGATGAATCAGTCTGCCAGAAACTGCGTTCGGTTC
TTGTCGGTATCCAGACAGGACTGATTGAAGATACCAAAGGATGGGTCACATGTATCAACT
GATAAACCAGATTAGTCTGCATTTTAATGTATACACAACAATGAAGAACACTTATGTAAA
ACATATATAATATAGAAAGCTCTTTTACC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

CO CL6290Contig1 370 2 2 U
GGAGAGATCGCCGGAGAAGACAACAAGAGAAGCTAAACGAAGAAGAAGATGATATACCGA
AAGTGGAGTCTGCTTTCCGGTCCACCGGTTATCCTCGGCGGAGCTGTAGTTGCCGGGATC
GCGGTCGGCATCGTCTTACAGAACGTTACGAAAGGAGAGCAGAAGAAGAATGTTGAAAAC
AAGTGAAATGGATGCTACGCTATACTGTGGTGTTTGTTAATCGTGTGAGTTGAAAACATT
TTAGTTCAATGGATTGTGTTGTAAGCTTAATATAATGCTTTTCTTTTTTGGAAGCTTTTG
AATACTACACTTGTGTTTTTTTTTTTTTCAGTTTCTTGTTGCTAATAATGATAAATTCAT
TTCTCACCCG


BQ
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AF RS1DE85JQ C 1
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BS 33 370 RS1DE85TF

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DS 

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CCTCGGCGGAGCTGTAGTTGCCGGGATCGCGGTCGGCATCGTCTTACAGAACGTTACGAA
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TTTGTTAATCGTGTGAGTTGAAAACATTTTAGTTCAATGGATTGTGTTGTAAGCTTAATA
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QA 1 338 1 338
DS 



AS 1 2

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ATGACGGCAGTTTCAGAGGTTTTGGCCATGTTGAGTTTGCAACTGCTGAACAAGCACAGA
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TCCCTGTGACCGTGAAACCGGATCTTCCAAAGGAATTGCTTTCCTTGATTTTCAAGAAGG
CGCAGACAAGGCGTTGGACCTTAATGGTAGTGACATGGGAGGATGGAGTCTTGTTGTTGA
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BQ
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AF RS1C049TF U 1
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BS 681 936 RS1C049JQ

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CGCAGACAAGGCGTTGGACCTTAATGGTAGTGACATGGGAGGATGGAGTCTTGTTGTTGA
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QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

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CGATCAAATCAAACAATGACGCTCCACGCCGCAGTAATCCAGAAGCTTCTCAACACCGGC
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TTCGACGAGATCGTCGAGCTCACTTCACGTCGCATCCAGGGCGACGCTTGCAACCACAAC
CGCTCGATGAACCTGTGGAAGATGGGAGGGTTTTTGACCAACAGTTACAGTCCTAAGAAG
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TTTACTCATTTGGATGATTTTGCTAGTATGATTGTTATAAAGCAACAGTTTTTTTTTTTT
TAAATGAAGATACAGCAAAGCCAATC


BQ
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AF RS1G861TF U 1
AF RS1G861JQ C 317
BS 1 668 RS1G861TF
BS 669 866 RS1G861JQ

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CGATCAAATCAAACAATGACGCTCCACGCCGCAGTAATCCAGAAGCTTCTCAACACCGGC
TCGCATCTCGGCCGTCGCGCCGCCGAGCACCATTTCAAACAGTACGCCTACGGAACCCGC
AACGGGATGACCATAATCGACTCGGACAAAACCCTGATCTGCCTCCGCAGCGCCGCCAGC
TTCGTGGCGAACCTCGCGCACATGAGAGGGAACATCTTCTTCGTCAACACCAACCCTCTC
TTCGACGAGATCGTCGAGCTCACTTCACGTCGCATCCAGGGCGACGCTTGCAACCACAAC
CGCTCGATGAACCTGTGGAAGATGGGAGGGTTTTTGACCAACAGTTACAGTCCTAAGAAG
TTTCGGTCGAGGCACAAGAAGCTTTGCTTTGGTCCGACCACGATGCCTGATTGTGTCGTT
GTGTTTGATACGGAGAGGAAGAGCTCGGTGATACTCGAGGCCGCCAAGCTTCAGATTCCG
GTTGTTGCGATTGTGGATCCGAATGTGCCGTTGGAGTTCTTTGAGAAGATCACGTATCCT
GTCCCCGCTCGTGATTCGGTTAATTTCGTTTATTTGTTCTGTAATGTGATCACCAAGTGC
TTTGTTGC

QA 1 668 1 668
DS 

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GGAAGATGGGAGGGTTTTTGACCAACAGTTACAGTCCTAAGAAGTTTCGGTCGAGGCACA
AGAAGCTTTGCTTTGGTCCGACCACGATGCCTGATTGTGTCGTTGTGTTTGATACGGAGA
GGAAGAGCTCGGTGATACTCGAGGCCGCCAAGCTTCAGATTCCGGTTGTTGCGATTGTGG
ATCCGAATGTGCCGTTGGAGTTCTTTGAGAAGATCACGTATCCTGTCCCCGCTCGTGATT
CGGTTAATTTCGTTTATTTGTTCTGTAATGTGATCACCAAGTGCTTTGTTGCGGAACAGA
TGAAGATGGGGATCAAGGATGGAAGCAGCAAGGAAGATATGATCAAAGATTTAGCCGCAT
GATTTGGATTTTCGAATCATTGTTTTTTCAGCCTTGTGGTTTTCTTTACTCATTTGGATG
ATTTTGCTAGTATGATTGTTATAAAGCAACAGTTTTTTTTTTTTTAAATGAAGATACAGC
AAAGCCAATC

QA 1 550 1 550
DS 



AS 1 2

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TTGGAGACAACGGATCCAATCAACGAGACTCGTATGAGTGTTCCTCAGATTTAGACGCAT
TCTTGATTCATCTTTGTCTTCAGGTAAACAAAGTTCACTTTTTTTTCCTTCTGGGTTTCT
TCTTGTCGACCTTATAGCTTCCGTCATTGTCTTAATCAAGTCCATCCGTGTTAAAAGTCC
TTAGCTTTACGCATTCTGCCCACCAACTGTTCGTTGAAACTCCGCAGAGAGAGTGGAATT
TGAAGTTTTATAGAGAGATGAAGGATTTTCCTTCTTGCTTCGGTGAAAACGGAGTCCAAG
TCGCGGATTCTTCGTCTTCGAACTCCGGGAAGAACGCTCAGAACCTGGTCACTTCTATCT
ACCAGTGCCGTATCCGAGGAAGGACTTGTTTGATCACCCTGACGTGGGCCAAGACTCTGA
TGGGTCAGAGTGTGACCGTTGGTGTTGATGATTCTCGTAACCAGAGCCTCTGTAAAGTCG
AGATCAAGCCCTGGCTGTTCACCAAACGAAAAGGGTCCAAGAGTTTGGAGGTTTATTCGT
GTTGTAGCGTCGATGTTTACTGGGATCTGGCGTCTGCGAAGTTCGGGTCAGGACCCGAAG
CTTTGGGAGGATTCTATTTGGGTGTTGTTGTTGACAGGGAGATGGTTCTGCTTCTCGGTG
ATATGAAGAAGGAAGCTTTCAAGAAGACGAACGCTTCGCCTTCGTCTCTGGGCGCCGTGT
TCATCGCCAAGAAAGAGCATGTTTTTGGTAAGAGAGAGTTTATAACGAAGGCTCAGCTCT
GTTCAGATGGGGTTAGAGTACATGATGTTGTGATTGAATGTGACACGAGCGTCACTGATC
CTTGTCTCGTTGTTCGTGTGGATGGGAAGACGTTGTTGCAGGTGAAGCGGCTTAAGTGGA
AGTTCCGTGGGAACGATACGATAGTTGTTAATAGAATGGCTGTGGAAGTTCTGTGGGATG
TTCATAGTTGGCTATTTGGGATGCCTTCTTCTACAGCAGGAAACGCAGTGTTTATGTTCA
GGACTTGTCAGTCTTCTTCGGATAAGAGCTTGTCTTCTTTCTCACAGGACATCATGGCAG
CAACAACAACAACAAACTCCAAGTCTCAAAGTTCTGGTTTTTCGCTAATTCTGTATGCTT
GGAAGAACGAGTAGAATGCGTTTAAAAGCGTTTGTTGATTCCTTGTTGACATTTGTTATT
TATAGCGTGATGATTAATGAATTGATTC


BQ
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AF RS1CN10TF U 1
AF RS1CN10JQ C 561
BS 1 647 RS1CN10TF
BS 648 1288 RS1CN10JQ

RD RS1CN10TF 647 0 0
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TTGGAGACAACGGATCCAATCAACGAGACTCGTATGAGTGTTCCTCAGATTTAGACGCAT
TCTTGATTCATCTTTGTCTTCAGGTAAACAAAGTTCACTTTTTTTTCCTTCTGGGTTTCT
TCTTGTCGACCTTATAGCTTCCGTCATTGTCTTAATCAAGTCCATCCGTGTTAAAAGTCC
TTAGCTTTACGCATTCTGCCCACCAACTGTTCGTTGAAACTCCGCAGAGAGAGTGGAATT
TGAAGTTTTATAGAGAGATGAAGGATTTTCCTTCTTGCTTCGGTGAAAACGGAGTCCAAG
TCGCGGATTCTTCGTCTTCGAACTCCGGGAAGAACGCTCAGAACCTGGTCACTTCTATCT
ACCAGTGCCGTATCCGAGGAAGGACTTGTTTGATCACCCTGACGTGGGCCAAGACTCTGA
TGGGTCAGAGTGTGACCGTTGGTGTTGATGATTCTCGTAACCAGAGCCTCTGTAAAGTCG
AGATCAAGCCCTGGCTGTTCACCAAACGAAAAGGGTCCAAGAGTTTGGAGGTTTATTCGT
GTTGTAGCGTCGATGTTTACTGGGATCTGGCGTCTGCGAAGTTCGGG

QA 1 647 1 647
DS 

RD RS1CN10JQ 728 0 0
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TGGGATCTGGCGTCTGCGAAGTTCGGGTCAGGACCCGAAGCTTTGGGAGGATTCTATTTG
GGTGTTGTTGTTGACAGGGAGATGGTTCTGCTTCTCGGTGATATGAAGAAGGAAGCTTTC
AAGAAGACGAACGCTTCGCCTTCGTCTCTGGGCGCCGTGTTCATCGCCAAGAAAGAGCAT
GTTTTTGGTAAGAGAGAGTTTATAACGAAGGCTCAGCTCTGTTCAGATGGGGTTAGAGTA
CATGATGTTGTGATTGAATGTGACACGAGCGTCACTGATCCTTGTCTCGTTGTTCGTGTG
GATGGGAAGACGTTGTTGCAGGTGAAGCGGCTTAAGTGGAAGTTCCGTGGGAACGATACG
ATAGTTGTTAATAGAATGGCTGTGGAAGTTCTGTGGGATGTTCATAGTTGGCTATTTGGG
ATGCCTTCTTCTACAGCAGGAAACGCAGTGTTTATGTTCAGGACTTGTCAGTCTTCTTCG
GATAAGAGCTTGTCTTCTTTCTCACAGGACATCATGGCAGCAACAACAACAACAAACTCC
AAGTCTCAAAGTTCTGGTTTTTCGCTAATTCTGTATGCTTGGAAGAACGAGTAGAATGCG
TTTAAAAGCGTTTGTTGATTCCTTGTTGACATTTGTTATTTATAGCGTGATGATTAATGA
ATTGATTC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL6294Contig1 358 2 6 U
AAGTCTGCAACCTCTATTTCTCAATCTTAGGGGAACTTATACATAACAGGAATACTAAAA
TTTTCTGCAACCATTTTTAACCTTGCTTTTCACGTCATTTAAAATCTGTCATTCATCATT
CATAGGTTATAAGCTTGAGAGCTTCCCCATCATAAATCTTCGTAGTCGTTCTAATATTCC
GTATCCCGTCGTGACTAATAGCCTTGTATAGACGGGGATGTTGGGCATCCACGAACTCAC
TAGGCGGCTCTAAATCTGTATCAATCGGTCCTAACAAAAAAAAAGCGATAGAAAACCTCT
TCGTCGCTTCGTTGCACTGCACTCTATGCTTCACGTTGCACAACCTCCCATTGCTCCA


BQ
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AF RS1AV23JQ U 1
AF RS1BS42JQ U 92
BS 1 153 RS1AV23JQ
BS 154 154 RS1BS42JQ
BS 155 169 RS1AV23JQ
BS 170 171 RS1BS42JQ
BS 172 354 RS1AV23JQ
BS 355 358 RS1BS42JQ

RD RS1AV23JQ 354 0 0
AAGTCTGCAACCTCTATTTCTCAATCTTAGGGGAACTTATACATAACAGGAATACTAAAA
TTTTCTGCAACCATTTTTAACCTTGCTTTTCACGTCATTTAAAATCTGTCATTCATCATT
CATAGGTTATAAGCTTGAGAGCTTCCCCATCATGAATCTTCGTAGTCGT**TAATATTCC
GTATCCCGTCGTGACTAATAGCCTTGTATAGACGGGGATGTTGGGCATCCACGAACTCAC
TAGGCGGCTCTAAATCTGTATCAATCGGTCCTAACAAAAAAAAAGCGATAGAAAACCTCT
TCGTCGCTTCGTTGCACTGCACTCTATGCTTCACGTTGCACAACCTCCCATTGC

QA 1 354 1 354
DS 

RD RS1BS42JQ 267 0 0
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ATAAATCTTCGTAGTCGTTCTAATATTCCGTATCCCGTCGTGACTAATAGCCTTGTATAG
ACGGGGATGTTGGGCATCCACGAACTCACTAGGCGGCTCTAAATCTGTATCAATCGGTCC
TAACAAAAAAGAAGCGATAGAAAACCTCTTCGTCGCTTCGTTGCACTGCACTCTATGCTT
CACGTTGCACAACCTCCCATTGCTCCA

QA 1 267 1 267
DS 



AS 1 2

CO CL6295Contig1 1468 2 2 U
GGAAGAAGGTACTACTAAATCATCATCTACACGCAGGTGGAGAGATGGGAGCTCGGAGGT
TGATTTGCCTATGATGCAGCTTAAGGAGCTCTTCAATGTCAATCATTTTATCGTGAGTCA
AGCTAATTCTCACATTGCTCCGTTATTGCGTCTAAAGGATTTAATTCGAGCTTATGGTGG
TAGATTCGCTGCCAAGCTTGCGCATCTAGTGGAGATGGAGGTGAAACATAGATGCAACCA
GGTGTTAGAGCTTGGTTTCCCACTCGGTGGACTCGCGAAGCTGTTTGCTCAGGAGTGGGA
AGGTGATGTAACGGTTGTGATGCCTGCTACACTTGCTCAGTACTCTAAGATCATACAGAA
CCCTACTCACGTGGAGCTTCAGAAAGCGGCTAACCAAGGAAGGAGATGCACTTGGGAGAA
GCTTTCGGCGATCAAAGCGAACTGTGGGATCGAGCTCGCGCTTGACGAGTGTGTAGCCAT
TCTAAACCATATGCGTAGGCTCAAGAGAAGCGCCGAGAGAGCAGCTTCTTCGTCTCATCA
TGGATTAGCTTCGACGACGAGGTTCAATGCTTCTAGGAGAATCCCGTCTTGGAACGTCAT
TGCTAGAGAGAACTCAACTGGCTCACTAGATGACCTAGTTACTGACAATAGTAATCTTCA
CGCGTCTTCGGGGAGGAACTTGAGTGATAGCGAGACAGAGAGCGGGGAGTTGAGTTCTTG
GACGAGGACTGGTGGACCGTTGATGAGAACAGCTTCTGCTAATCTGTTCACTGACTTCGT
TCACGGTCTTGATGTCGACATTGCGTTGGCAAGAGGGTTTACTAGCAGCAGCCCCAATTC
TCCAGCGGTTCCTGGCCCGGTTAGTCCAAGCTTTAGTCCGAGGTCGAGATCCATAGCGGC
TCAATCCGAGGGCGAAGCTGACAAGAGGGAATCTAGCAACGTTCTTGGAGGAGGGAACGG
TTCAAGGATAACGGTTACTGAAGGTGATCTTCTGCAGCCTGAGAGAACGAGTAATGGTTT
TGTGTTGAACGTTGTTAGAAGAGAGGACTTGGGAATGCCTGTAGGGAATGAGATGCCGGA
GAGTGTACAGCTTGATATACATGAGAGGGAGATGGATAATAGCTCTGTTTCAGAACATGA
CCAAGAAGAAGATGATGATGATGATGATGATGATGATGAAGAAGTAGAACATGAGGGCTC
AGTTCCGGTTACCGTTTCTTCAAAAGATTCCGGTTTACACGAACCGATGTCTGATACTGT
TATAGATGCTTAGACTGATTGATCCGAGTGAAGAGATTGTCAACTGATTGAAGTTAGATT
CTTGTTCAAGGAGAGTTTATAAAGTTATAATGCTTTGTAAATAGAATAACTATAAGCCAT
AAGTTTGTGTTGTGTGTATGTTTTGCATTGATTATTGTTTTAAATTTCACTTATTCATCT
GTGGAAAATATCTGTAAAATAATTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AJ44TF U 1
AF RS1AJ44JQ C 623
BS 1 724 RS1AJ44TF
BS 725 1468 RS1AJ44JQ

RD RS1AJ44TF 724 0 0
GGAAGAAGGTACTACTAAATCATCATCTACACGCAGGTGGAGAGATGGGAGCTCGGAGGT
TGATTTGCCTATGATGCAGCTTAAGGAGCTCTTCAATGTCAATCATTTTATCGTGAGTCA
AGCTAATTCTCACATTGCTCCGTTATTGCGTCTAAAGGATTTAATTCGAGCTTATGGTGG
TAGATTCGCTGCCAAGCTTGCGCATCTAGTGGAGATGGAGGTGAAACATAGATGCAACCA
GGTGTTAGAGCTTGGTTTCCCACTCGGTGGACTCGCGAAGCTGTTTGCTCAGGAGTGGGA
AGGTGATGTAACGGTTGTGATGCCTGCTACACTTGCTCAGTACTCTAAGATCATACAGAA
CCCTACTCACGTGGAGCTTCAGAAAGCGGCTAACCAAGGAAGGAGATGCACTTGGGAGAA
GCTTTCGGCGATCAAAGCGAACTGTGGGATCGAGCTCGCGCTTGACGAGTGTGTAGCCAT
TCTAAACCATATGCGTAGGCTCAAGAGAAGCGCCGAGAGAGCAGCTTCTTCGTCTCATCA
TGGATTAGCTTCGACGACGAGGTTCAATGCTTCTAGGAGAATCCCGTCTTGGAACGTCAT
TGCTAGAGAGAACTCAACTGGCTCACTAGATGACCTAGTTACTGACAATAGTAATCTTCA
CGCGTCTTCGGGGAGGAACTTGAGTGATAGCGAGACAGAGAGCGGGGAGTTGAGTTCTTG
GACG

QA 1 724 1 724
DS 

RD RS1AJ44JQ 846 0 0
TCACTAGATGAC*TAGTTACTGACAATAGTAATCTTCACGCGTCTTCGGGGAGGAACTTG
AGTGATAGCGAGACAGAGAGCGGGGAGTTGAGTTCTTGGACGAGGACTGGTGGACCGTTG
ATGAGAACAGCTTCTGCTAATCTGTTCACTGACTTCGTTCACGGTCTTGATGTCGACATT
GCGTTGGCAAGAGGGTTTACTAGCAGCAGCCCCAATTCTCCAGCGGTTCCTGGCCCGGTT
AGTCCAAGCTTTAGTCCGAGGTCGAGATCCATAGCGGCTCAATCCGAGGGCGAAGCTGAC
AAGAGGGAATCTAGCAACGTTCTTGGAGGAGGGAACGGTTCAAGGATAACGGTTACTGAA
GGTGATCTTCTGCAGCCTGAGAGAACGAGTAATGGTTTTGTGTTGAACGTTGTTAGAAGA
GAGGACTTGGGAATGCCTGTAGGGAATGAGATGCCGGAGAGTGTACAGCTTGATATACAT
GAGAGGGAGATGGATAATAGCTCTGTTTCAGAACATGACCAAGAAGAAGATGATGATGAT
GATGATGATGATGATGAAGAAGTAGAACATGAGGGCTCAGTTCCGGTTACCGTTTCTTCA
AAAGATTCCGGTTTACACGAACCGATGTCTGATACTGTTATAGATGCTTAGACTGATTGA
TCCGAGTGAAGAGATTGTCAACTGATTGAAGTTAGATTCTTGTTCAAGGAGAGTTTATAA
AGTTATAATGCTTTGTAAATAGAATAACTATAAGCCATAAGTTTGTGTTGTGTGTATGTT
TTGCATTGATTATTGTTTTAAATTTCACTTATTCATCTGTGGAAAATATCTGTAAAATAA
TTTATC

QA 1 846 1 846
DS 



AS 1 2

CO CL6296Contig1 889 2 2 U
GGAATCATCTCATTACTTGTTATTAACATGAGCTCTGACAACAGAGATGAGGATCATTTC
GACCGTTCGTTCTGGCAAAACTCGACTTCTTATGATAGCAGCAGCAAGATCTTACTCGTC
ACCATCGTTTCTTTCTCTATCATTATCCTCATCGCCTTTGTTTATCATCTATACGCAAGA
TTCGTTCTCTACCGCCGTAGACCCGCCTTCCAAGGCCTCTCCTTCTCTGTTGTGTCACAA
CCACCCATACGTGGGCTCGACAAACTTGTCATTGCTTCTCTCCCTACATTTATAGTTGGA
GTCAACGGTGATGACGTCTCGGCCGTGGAATGTGCGGTGTGTCTAAGCTTGTTTGAGGAG
AAAGATACGGTGAGGATGTTACCGAACTGCAAGCATGTTTTCCACGTGACATGCGTTGAC
ACATGGCTTACCTCGTGCTCCACTTGTCCCATTTGTCGGACTGAAGTCGAGCCGAGTCAA
AGTCTTGTGCCTGAGCCAAGAGAAGGGCCTAACGTTGACGGTGCATCGGCGTTGGATTTT
ACGGCGGCTTCTTCATCGGATAACAAAAGGGGCGGGTCAACGTTCAGGAGGAACGATCAT
TCTCGCGTTGACCAAGATCGTGTATTGGACATAGAAAGACAATGAACCGATTAGATACAC
ATACCACGATAGTTAATCTTTAATTCATGTACAATAGTACTCATGTTTCCTTATAATTTT
TGTTGTCTTACTAAACTATTTTGTAATGTGTAAATCTTTTGTATGTACCGTAGGAAATGC
ACATTAGTACAAAGACATTGTTGATTAACATGTGAAAAACAAGAAGAAAATGTGGTGAAC
TTGTAATACGTTTTCAAAGCGTGTCTACATAGAAGAATTTTTCAAGCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GB54TF U 1
AF RS1GB54JQ C 321
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BS 571 889 RS1GB54JQ

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TTCGTTCTCTACCGCCGTAGACCCGCCTTCCAAGGCCTCTCCTTCTCTGTTGTGTCACAA
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AAAGATACGGTGAGGATGTTACCGAACTGCAAGCATGTTTTCCACGTGACATGCGTTGAC
ACATGGCTTACCTCGTGCTCCACTTGTCCCATTTGTCGGACTGAAGTCGAGCCGAGTCAA
AGTCTTGTGCCTGAGCCAAGAGAAGGGCCTAACGTTGACGGTGCATCGGCGTTGGATTTT
ACGGCGGCTTCTTCATCGGATAACAAAAGG

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ACCGAACTGCAAGCATGTTTTCCACGTGACATGCGTTGACACATGGCTTACCTCGTGCTC
CACTTGTCCCATTTGTCGGACTGAAGTCGAGCCGAGTCAAAGTCTTGTGCCTGAGCCAAG
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TAACAAAAGGGGCGGGTCAACGTTCAGGAGGAACGATCATTCTCGCGTTGACCAAGATCG
TGTATTGGACATAGAAAGACAATGAACCGATTAGATACACATACCACGATAGTTAATCTT
TAATTCATGTACAATAGTACTCATGTTTCCTTATAATTTTTGTTGTCTTACTAAACTATT
TTGTAATGTGTAAATCTTTTGTATGTACCGTAGGAAATGCACATTAGTACAAAGACATTG
TTGATTAACATGTGAAAAACAAGAAGAAAATGTGGTGAACTTGTAATACGTTTTCAAAGC
GTGTCTACATAGAAGAATTTTTCAAGCCG

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DS 



AS 1 2

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AGACAATGCGAGTACTTTTTAATTAGTACTCTTGTTTTGTTTATTGTTTAGCTATTCCAC
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TG


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AF RS1G946JQ C 1
AF RS1G946TF U 1
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ACGTATTGATTGTAAAATTATGAGGGATTCTTGTTTTTACATGGCTTGTAAGAGATCATT
AGACAATGCGAGTACTTTTTAATTAGTACTCTTGTTTTGTTTATTGTTTAGCTATTCCAC
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TG

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DS 

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TGATACGGTACTTGATCGGATCGGCAGTGATGATGATCGGCGTGGTATTACCGGTTGGTT
ACATGATGTTCCGCAACAAGCGCGTCCCCTCCTCGTCTTCTTACTCTAAACAGACGAACA
AAGTTTTGATATAGAGAGAGGCGGTTGAATTCAACTGGATTGACAAGGATGATATTGATG
ACGTATTGATTGTAAAATTATGAGGGATTCTTGTTTTTACATGGCTTGTAAGAGATCATT
AGACAATGCGAGTACTTTTTAATTAGTACTCTTGTTTTGTTTATTGTTTAGCTATTCCAC
TGTCTATTATGTAACACAACTTCTTCTCTTCGGTGGAAAGATTATATAATATCGAGTTCG
TG

QA 1 422 1 422
DS 



AS 1 2

CO CL6298Contig1 922 2 2 U
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GAACTCTGATAATGATCTCAACCTCTGCCTGAAACTCTCTTTCTCATTGACCACTCCTAA
CTTTCAACTATTTGCTATGGTGGAGATGGAGGCTTTGGTGGTAGTGACGTAAGACATTAA
TTGACGGCGGTGTTGCGTTTTGTTACCGCCATTGTTCCTGTTGTTGTCCACCATAAGGTC
CTCTAACTGAAAACATAAGAGCATTCCAAATCTTAAAATTAGATTCTTCAATATTGCAAA
AGATTGAGATTTTGTAACAAGTTAATAACATTTCCACAAAAAGATTGAAACTTTCTTGTA
AGTTAATACTTTTGGGACCATGAGGGTGGTGGAGGAAGAGCATAGTAGGTACTTTTCATC
TTTTCTTCATTTCTTCTCATAGAAAAGACAAATTAAAGTCGCAAACCGACTCCTTCGATG
GCAATTCCGACCGCCACTCCTGTTGATAACCCATGTGAAGCAGGAGACTGCTAAGATAGA
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TGAAGAAGGTGTAGATTTTGAATAAAAAGATTCAAGAGGAATAATAGTTAATAGGTGCAG
AAGGAGATGCCTGAGAAAGAGGAGGGGAAGATCTCGGCGTAATTTGAATGGAAGGTGATG
AAGGAGGAAAAAAAAGACGAAAGATGAATGAGATCTAGTTTTTTTTTAACAACATGATGT
AACAAGTTAATTTTTTTTTTCTTAATAGTTGAAAGGAAAAAGGGTAAAATTATAATTTCA
GATTCATGTCTGTGTTGAAAGACAGAGACAAAGTGTTTCAGTAGCAATTTGTGACCTTTT
GTGATATTCTAAAGAGGAAAAA


BQ
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AF RS1DT23TF U 1
AF RS1DT23JQ C 207
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BS 629 922 RS1DT23JQ

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GAACTCTGATAATGATCTCAACCTCTGCCTGAAACTCTCTTTCTCATTGACCACTCCTAA
CTTTCAACTATTTGCTATGGTGGAGATGGAGGCTTTGGTGGTAGTGACGTAAGACATTAA
TTGACGGCGGTGTTGCGTTTTGTTACCGCCATTGTTCCTGTTGTTGTCCACCATAAGGTC
CTCTAACTGAAAACATAAGAGCATTCCAAATCTTAAAATTAGATTCTTCAATATTGCAAA
AGATTGAGATTTTGTAACAAGTTAATAACATTTCCACAAAAAGATTGAAACTTTCTTGTA
AGTTAATACTTTTGGGACCATGAGGGTGGTGGAGGAAGAGCATAGTAGGTACTTTTCATC
TTTTCTTCATTTCTTCTCATAGAAAAGACAAATTAAAGTCGCAAACCGACTCCTTCGATG
GCAATTCCGACCGCCACTCCTGTTGATAACCCATGTGAAGCAGGAGACTGCTAAGATAGA
GTTTGAGGAGATCGTCCTCTGCTACTGCCTGAAGGATTCAATGGTGGTCCAACCAGTGAC
TGAAGAAGGTGTAGATTTTGAATAAAAA

QA 1 628 1 628
DS 

RD RS1DT23JQ 716 0 0
CGCCATTGTTCCTGTTGTTGTCCACCATAAGGTCCTCTAACTGAAAACATAAGAGCATTC
CAAATCTTAAAATTAGATTCTTCAATATTGCAAAAGATTGAGATTTTGTAACAAGTTAAT
AACATTTCCACAAAAAGATTGAAACTTTCTTGTAAGTTAATACTTTTGGGACCATGAGGG
TGGTGGAGGAAGAGCATAGTAGGTACTTTTCATCTTTTCTTCATTTCTTCTCATAGAAAA
GACAAATTAAAGTCGCAAACCGACTCCTTCGATGGCAATTCCGACCGCCACTCCTGTTGA
TAACCCATGTGAAGCAGGAGACTGCTAAGATAGAGTTTGAGGAGATCGTCCTCTGCTACT
GCCTGAAGGATTCAATGGTGGTCCAACCAGTGACTGAAGAAGGTGTAGATTTTGAATAAA
AAGATTCAAGAGGAATAATAGTTAATAGGTGCAGAAGGAGATGCCTGAGAAAGAGGAGGG
GAAGATCTCGGCGTAATTTGAATGGAAGGTGATGAAGGAGGAAAAAAAAGACGAAAGATG
AATGAGATCTAGTTTTTTTTTAACAACATGATGTAACAAGTTAATTTTTTTTTTCTTAAT
AGTTGAAAGGAAAAAGGGTAAAATTATAATTTCAGATTCATGTCTGTGTTGAAAGACAGA
GACAAAGTGTTTCAGTAGCAATTTGTGACCTTTTGTGATATTCTAAAGAGGAAAAA

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

CO CL6299Contig1 1028 2 4 U
GGCCACGGCTTCCTCCTTCCGCCACCTTCCATGAATCCGACGATGACAAATCCGACGATC
CTCCTTCCGCCTGGCACCGTCCAACCTCTAGTCTCTCCGCATTGCCCTCTCAAGATCCTC
CACCACACCATTGGCGTAATCATTCTCTTAATCTCTCTCCAATCCTGGCCACACCTTCCC
GGTCTCTCCCTCCTCCCCATTCAATCCCTGAGCTAGAGACTTACGTTGTCCAGGTACCGA
GAGATCAAGTCTATTGGACTCCTCCTCCTGAACACGCAAAATACGTCCAAGAACGCCGTA
ACAACCCGGAGAAAAACAAAAGGAATGGGTGTTCCAAACGTCTTATGTGGTTCTTTATTA
TCTTGATCTTTTTTGGATTCATAATTGGTGCAATCACCGTTATCCTTCATTTCGTGTTCA
ACCCCACTCTTCCAGTTTTTGAAGTCGAGAGATTAACGGCAAAACCTAGTAATATCGAAA
TCACGTTGAGATCTGAGAATCCGACGTCTAACATGGGGGTAAGCTATACGATGGGAAGAA
ACAGTATGATTTCATTAACGTACAAGAACAAGAGCCTAGGACGCGGAAAATTCCCAAAGA
TGTCCCTGGCGGCGACTGGATCCAGCAACGTCAATGTAAAGCTCAGTGGGTCGACCAAGA
ACGCCGTTATGCCACCTCGGGGATCGAAACAACCGGTGAGTTTGGTGCTGATGATGGAGC
TAAAGGCGGACTATGAAGCAGGACCAGTGAAAAAGAACAGGGAAGTGGTGGTGACTTGTG
ATGTTAAGGTTAAGGGATTATTAGATGCCAAGAAGGTTGAGATGTGTCGGAGAATTGTGA
GAGTGAGTTCAAGAACTGACAGTTTATATTATATAAGGTGATTGTGTCGTTAGAGTTACA
GTGTGCTGTAATGATTTATACTTATGATGTAATGTTCAATTGTTTATTTTATATTTGTTT
CCCCAATGTTTTCGTTTTTAGACTATTGTTGAGCGAGAAAAGAAAACGTGAACAAGGACA
CAATAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AT22TF U 1
AF RS1AT22JQ C 503
BS 1 655 RS1AT22TF
BS 656 656 RS1AT22JQ
BS 657 676 RS1AT22TF
BS 677 1028 RS1AT22JQ

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CACCACACCATTGGCGTAATCATTCTCTTAATCTCTCTCCAATCCTGGCCACACCTTCCC
GGTCTCTCCCTCCTCCCCATTCAATCCCTGAGCTAGAGACTTACGTTGTCCAGGTACCGA
GAGATCAAGTCTATTGGACTCCTCCTCCTGAACACGCAAAATACGTCCAAGAACGCCGTA
ACAACCCGGAGAAAAACAAAAGGAATGGGTGTTCCAAACGTCTTATGTGGTTCTTTATTA
TCTTGATCTTTTTTGGATTCATAATTGGTGCAATCACCGTTATCCTTCATTTCGTGTTCA
ACCCCACTCTTCCAGTTTTTGAAGTCGAGAGATTAACGGCAAAACCTAGTAATATCGAAA
TCACGTTGAGATCTGAGAATCCGACGTCTAACATGGGGGTAAGCTATACGATGGGAAGAA
ACAGTATGATTTCATTAACGTACAAGAACAAGAGCCTAGGACGCGGAAAATTCCCAAAGA
TGTCCCTGGCGGCGACTGGATCCAGCAACGTCAATGTAAAGCTCAGTGGGTCGAC*AAGA
ACGCCGTTATGCCACC

QA 1 676 1 676
DS 

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CAAGAACAAGAGCCTAGGACGCGGAAAATTCCCAAAGATGTCCCTGGCGGCGACTGGATC
CAGCAACGTCAATGTAAAGCTCAGTGGGTCGACCAAGAACGCCGTTATGCCACCTCGGGG
ATCGAAACAACCGGTGAGTTTGGTGCTGATGATGGAGCTAAAGGCGGACTATGAAGCAGG
ACCAGTGAAAAAGAACAGGGAAGTGGTGGTGACTTGTGATGTTAAGGTTAAGGGATTATT
AGATGCCAAGAAGGTTGAGATGTGTCGGAGAATTGTGAGAGTGAGTTCAAGAACTGACAG
TTTATATTATATAAGGTGATTGTGTCGTTAGAGTTACAGTGTGCTGTAATGATTTATACT
TATGATGTAATGTTCAATTGTTTATTTTATATTTGTTTCCCCAATGTTTTCGTTTTTAGA
CTATTGTTGAGCGAGAAAAGAAAACGTGAACAAGGACACAATAGAC

QA 1 526 1 526
DS 



AS 1 2

CO CL6300Contig1 782 2 10 U
AGTATACATTTTAATCATACGGTAATCTTAGACAAATTAATTCAGAAACCTTCATGTTGC
CACACCTTTTTCGTGTATGTACTAAAAACCAAAACCTGAACAAGATGTAAATAAACTGCA
TCCATACAAAACTATACAAAGTCCATGTCTCTTTTTAAGACATGCGAATGAATCACAATG
TTTTCATTGATCCGTCTTGTGCAGGTGGAGTTCATGGGAGAAGGCTAGCAAAAGACTCAT
CTCCATGTTCTTCATCATCCACCTGCGACTCAAATGGAACTTCTAAAACTGGTCTTGTTT
CCTCTGGGATGAATCTCGCCCATCGTTTCTCCTTCACGAGTTTTAGGAACGGGTGCAAGC
AGAACCCAACAGCAATGATCACACCGCTGATTAAAAACGTCTTTGCGGTGGCCAAAACCA
TCACAAGGATAAGAAGCAGAAAAGGAGGCAGACAAAGCACTAGAGCTCCTAAGGTGTTTA
AGGGAACTCTATAAGGTCGGTTAAGTTCCGGTTTCTTGATCCTTAGCTTGACAAAGGCTG
TGAATTCAAGAAGCATTCCTAAGGCGTACAAGAAGTTGAGAAACTCTATGATCTCTTGAA
AGCTCATCCATGACAAGAATATGACTCCTGTTGCTGAGCACAAGATACTGATCGTTGGTG
TCCCATACTTTGACCTCTGGGCGAAAAAGGCAGGGAGCATCCCCATCTCACTCATACCAA
GAAGCTGAAAAGCATCACTACTCATCTCAGCTTCAAACAAACCAAGATTCGACATAGCAG
CA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RS1GO72JQ U 1
AF RS1FF71JQ U 104
BS 1 230 RS1GO72JQ
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BS 442 540 RS1GO72JQ
BS 541 782 RS1FF71JQ

RD RS1GO72JQ 542 0 0
AGTATACATTTTAATCATACGGTAATCTTAGACAAATTAATTCAGAAACCTTCATGTTGC
CACACCTTTTTCGTGTATGTACTAAAAACCAAAACCTGAACAAGATGTAAATAAACTGCA
TCCATACAAAACTATACAAAGTCCATGTCTCTTTTTAAGACATGCGAATGAATCACAATG
TTTTCATTGATCCGTCTTGTGCAGGTGGAGTTCATGGGAGAAGGCTAGCAGAAGACTCAT
CTCCATGTTCTTCATCATCCACCTGCGACTCAGATGGAACTTCTAAAACTGGTCTTGTTT
CCTCTGGGATGAATCTCGCCCATCGTTTCTCCTTCACGAGTTTTAGGAACGGGTGCAAGC
AGAACCCAACAGCAATGATCACACCGCTGATTAAAAACGTCTTTGCGGTGGCCAAAACCA
TCACAAGGATGAGAAGCAGAGAAGGAGGCAGACAAAGCACTAGAGCTCCTAAGGTGTTTA
AGGGAACTCTATAAGGTCGGTTAAGTTCCGGTTTCTTGATCCTTAGCTTGACAAAGGCTG
CG

QA 1 540 1 540
DS 

RD RS1FF71JQ 679 0 0
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GCGAATGAATCACAATGTTTTCATTGATCCGTCTTGTGCAGGTGGAGTTCATGGGAGAAG
GCTAGCAAAAGACTCATCTCCATGTTCTTCATCATCCACCTGCGACTCAAATGGAACTTC
TAAAACTGGTCTTGTTTCCTCTGGGATGAATCTCGCCCATCGTTTCTCCTTCACGAGTTT
TAGGAACGGGTGCAAGCAGAACCCAACAGCAATGATCACACCGCTGATTAAAAACGTCTT
TGCGGTGGCCAAAACCATCACAAGGATAAGAAGCAGAAAAGGAGGCAGACAAAGCACTAG
AGCTCCTAAGGTGTTTAAGGGAACTCTATAAGGTCGGTTAAGTTCCGGTTTCTTGATCCT
TAGCTTGACAAAGGCTGTGAATTCAAGAAGCATTCCTAAGGCGTACAAGAAGTTGAGAAA
CTCTATGATCTCTTGAAAGCTCATCCATGACAAGAATATGACTCCTGTTGCTGAGCACAA
GATACTGATCGTTGGTGTCCCATACTTTGACCTCTGGGCGAAAAAGGCAGGGAGCATCCC
CATCTCACTCATACCAAGAAGCTGAAAAGCATCACTACTCATCTCAGCTTCAAACAAACC
AAGATTCGACATAGCAGCA

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

CO CL6301Contig1 825 2 2 U
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GGGCAAACTCTTTTTTTTTTCCGACAAGACACAAGCTTCTTCTGGTTATTCGCCGAATTA
TAGAAACGATGTTCAATTTCTGGGGATCAAAAGACCAACAAGGGCAATCACGTCCTCCTC
CGGAAGTTTCTTCTTCTTCGCAGCAGCAGCAGCCATGGTACTCTCCTTCTCTAGTCAGCT
CGCCAAGCTCCTCATCTCGGCCTCAAACATCTGGTCACATTCCAGCACATGTTTCACCTG
GTGAAGCAGCTGGCATTATTACCTTCTTGAAAGACAAAAGTGTGGACGAGCTCAGGAAGC
TTCTATCTGACAAAGATGCGTATCAGCAGTTTCTGCTCTCTCTTGACCAGGTCAAGGTCC
AGAACAATATCAGAAACCAATGCAGAATCATCCGTACGACTGAGCTAGCAGCTGCGCAAG
AAAAGCTTAATGAGCTGGAAAGACAAAAAGAAGAGATCCTCAAGTTCTACTCCCCTGCTT
CTCTTCTTAATAAACTTCAAGAGGCTATGAATCAGGTTGATGAAGAATCTGAAGCTCTGC
AAGAGAAGTTCCTAGAGAAGGAAATCGATACAGCTGCTTTTGTTCAGAAATACAAGGAGC
TGCGCACTATCTATCATCGACGTGCATTGATTCATCTTGCTGCTAAAACCTCAACCATCG
GTTGAAACTATGATAACCAGTCCTTTTTTTTTTGTCTTGTGACTTATGATGTTGTAAAAG
AAATGATTTTGCTGTTTACGTTCATACTATATTGATTTGACATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DO42TF U 1
AF RS1DO42JQ C 79
BS 1 503 RS1DO42TF
BS 504 825 RS1DO42JQ

RD RS1DO42TF 503 0 0
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GGGCAAACTCTTTTTTTTTTCCGACAAGACACAAGCTTCTTCTGGTTATTCGCCGAATTA
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CGGAAGTTTCTTCTTCTTCGCAGCAGCAGCAGCCATGGTACTCTCCTTCTCTAGTCAGCT
CGCCAAGCTCCTCATCTCGGCCTCAAACATCTGGTCACATTCCAGCACATGTTTCACCTG
GTGAAGCAGCTGGCATTATTACCTTCTTGAAAGACAAAAGTGTGGACGAGCTCAGGAAGC
TTCTATCTGACAAAGATGCGTATCAGCAGTTTCTGCTCTCTCTTGACCAGGTCAAGGTCC
AGAACAATATCAGAAACCAATGCAGAATCATCCGTACGACTGAGCTAGCAGCTGCGCAAG
AAAAGCTTAATGAGCTGGAAAGA

QA 1 503 1 503
DS 

RD RS1DO42JQ 747 0 0
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TCTGGGGATCAAAAGACCAACAAGGGCAATCACGTCCTCCTCCGGAAGTTTCTTCTTCTT
CGCAGCAGCAGCAGCCATGGTACTCTCCTTCTCTAGTCAGCTCGCCAAGCTCCTCATCTC
GGCCTCAAACATCTGGTCACATTCCAGCACATGTTTCACCTGGTGAAGCAGCTGGCATTA
TTACCTTCTTGAAAGACAAAAGTGTGGACGAGCTCAGGAAGCTTCTATCTGACAAAGATG
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AAAGACAAAAAGAAGAGATCCTCAAGTTCTACTCCCCTGCTTCTCTTCTTAATAAACTTC
AAGAGGCTATGAATCAGGTTGATGAAGAATCTGAAGCTCTGCAAGAGAAGTTCCTAGAGA
AGGAAATCGATACAGCTGCTTTTGTTCAGAAATACAAGGAGCTGCGCACTATCTATCATC
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AGTCCTTTTTTTTTTGTCTTGTGACTTATGATGTTGTAAAAGAAATGATTTTGCTGTTTA
CGTTCATACTATATTGATTTGACATCG

QA 1 747 1 747
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6303Contig1 564 2 1 U
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CAACCACTTATTCTAAATCTTATGCATCAACCACATCTATTATTGTTGATTCCAAATTTT
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TTAGATTGGATTCAAAGTGGCTATTTTGCTATGTATCAGCCGGAGAAGATGGAAAGCTTC
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TCATAGGTTCACCCATAAATCTTTCTTGTACATGTGGATAATATATGTAACTTGTACATG
TGGATATCACAATCGTACATGTGAAAATTATTTACATCACTGTACATTTGGATCATGATA
AACAAGTACATCTACAAACTGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1G942TF U 1
AF RS1G942JQ C 139
BS 1 564 RS1G942TF

RD RS1G942TF 564 0 0
GGAACCACTTATTTCTCATCTCCTCCTCTGTCTCTTTTTTCAATTTTCTGCATCGACCGT
CAACCACTTATTCTAAATCTTATGCATCAACCACATCTATTATTGTTGATTCCAAATTTT
TTTTTCTTTTAAATCTCTAATCGACGTGAAGAATCAAAACCCTAGTTCTCGTGGTTCTTT
TTAGATTGGATTCAAAGTGGCTATTTTGCTATGTATCAGCCGGAGAAGATGGAAAGCTTC
AGAGTTTGAAGCTGATTCGCCGTCAAAATTATATAATTTGGCGGTCATGATCTCAGATGC
AGGTTTCACCTTTGGCTTCTGATTTTTATTCATGAAAGGAATGTATAAGTTATGTGGTGA
AGAAGCATGCTATGAAGAGATTAGAGCCTCCATTAAAATCTTTAATGATTTTGGCAAAGC
TCATAGGTTCACCCATAAATCTTTCTTGTACATGTGGATAATATATGTAACTTGTACATG
TGGATATCACAATCGTACATGTGAAAATTATTTACATCACTGTACATTTGGATCATGATA
AACAAGTACATCTACAAACTGCTT

QA 1 564 1 564
DS 

RD RS1G942JQ 426 0 0
AATCGACGTGAAGAATCAAAACCCTAGTTCTCGTGGTTCTTTTTAGATTGGATTCAAAGT
GGCTATTTTGCTATGTATCAGCCGGAGAAGATGGAAAGCTTCAGAGTTTGAAGCTGATTC
GCCGTCAAAATTATATAATTTGGCGGTCATGATTTCAGATGCAGGTTTCACCTTTGGCTT
CTGATTTTTATTCATGAAAGGAATGTATAAGTTATGTGGTGAAGAAGCATGCTATGAAGA
GATTAGAGCCTCCATTAAAATCTTTAATGATTTTGGCAAAGCTCATAGGTTCACCCATAA
ATCTTTCTTGTACATGTGGATAATATATGTAACTTGTACATGTGGATATCACAATCGTAC
ATGTGAAAATTATTTACATCACTGTACATTTGGATCATGATAAACAAGTACATCTACAAA
CTGCTT

QA 1 426 1 426
DS 



AS 1 2

CO CL6304Contig1 895 2 2 U
GTAGATATGTATTATGAAAGGTATACCTCAGGAGCCATCCAGTAAGGAGTTCCAACCACT
GAGTGAGTGTTAACATCAGCCTCGTTTAGTTTAGTGGCAACTCCAAAGTCAGCAAGCTTT
ACAAGTCCCTGAAGCATGAGATTCTCAAGTGTCAAAGAATGAACAGCCTCAAGAAGAATC
TCAAAGGTAGAAGAAAACACAGACAGACCTCTTTTGTTGTCAAAATATTTGCACCCTTAA
TATCACGGTGTATGACACCCTGCTCATGCAGATATACTAAACCCTCCAAGACCTGTAATT
CACTAGTTAGTACACAAATGTTTTTGCAGAAAACTTAACTAGAAAAACAAAACATATACC
TGCGCAATGTAAACAGTCACCAATGATTCTGGAAAAGGTCCAAATTTATTAGGTTTGATA
ATGTTTGCAAGAGAGCCATTCTCCACATACCTGCAAAACATATATTATTTGAACTTGAAT
CTCGCGTGGACCAAACTAACACAAAAGTAGTAGTAACTTACTCCAGGATAATGTGAAGGT
GAGTCCTTGTCTTCAAGGAGCCAAGGTACTTGACAATGTTTTTATGGTTCAGGTTCTGCA
TGCATTAGAAATATATATCATGTTAGAAGGACATAGAGATACAATAACCATTAATGGAAA
GAAGCCAAAGCTGAGAAGGTTTTGTAAAACAATTATGTCAACAAAGTTTAAACTCTACAT
GCATTGGCAGTTCCAGAGGATAAAGTTAGAATGTGTAATGAAACAATAGCTAAAGGAAAC
TACCTTCAACAAATCGATTTCTTGCTGGAGAAAACAATCATCCCCCAACATGTAAAAAAC
CAGGAAAGGAGATGAGAGACCGAACACATTATTAGTCCATAGAGGAGGACATAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1A795TF U 1
AF RS1A795JQ C 248
BS 1 673 RS1A795TF
BS 674 895 RS1A795JQ

RD RS1A795TF 673 0 0
GTAGATATGTATTATGAAAGGTATACCTCAGGAGCCATCCAGTAAGGAGTTCCAACCACT
GAGTGAGTGTTAACATCAGCCTCGTTTAGTTTAGTGGCAACTCCAAAGTCAGCAAGCTTT
ACAAGTCCCTGAAGCATGAGATTCTCAAGTGTCAAAGAATGAACAGCCTCAAGAAGAATC
TCAAAGGTAGAAGAAAACACAGACAGACCTCTTTTGTTGTCAAAATATTTGCACCCTTAA
TATCACGGTGTATGACACCCTGCTCATGCAGATATACTAAACCCTCCAAGACCTGTAATT
CACTAGTTAGTACACAAATGTTTTTGCAGAAAACTTAACTAGAAAAACAAAACATATACC
TGCGCAATGTAAACAGTCACCAATGATTCTGGAAAAGGTCCAAATTTATTAGGTTTGATA
ATGTTTGCAAGAGAGCCATTCTCCACATACCTGCAAAACATATATTATTTGAACTTGAAT
CTCGCGTGGACCAAACTAACACAAAAGTAGTAGTAACTTACTCCAGGATAATGTGAAGGT
GAGTCCTTGTCTTCAAGGAGCCAAGGTACTTGACAATGTTTTTATGGTTCAGGTTCTGCA
TGCATTAGAAATATATATCATGTTAGAAGGACATAGAGATACAATAACCATTAATGGAAA
GAAGCCAAAGCTG

QA 1 673 1 673
DS 

RD RS1A795JQ 648 0 0
GTGTATGACACCCTGCTCATGCAGATATACTAAACCCTCCAAGACCTGTAATTCACTAGT
TAGTACACAAATGTTTTTGCAGAAAACTTAACTAGAAAAACAAAACATATACCTGCGCAA
TGTAAACAGTCACCAATGATTCTGGAAAAGGTCCAAATTTATTAGGTTTGATAATGTTTG
CAAGAGAGCCATTCTCCACATACCTGCAAAACATATATTATTTGAACTTGAATCTCGCGT
GGACCAAACTAACACAAAAGTAGTAGTAACTTATTCCAGGATAATGTGAAGGTGAGTCCT
TGTCTTCAAGGAGCCAAGGTACTTGACAATGTTTTTATGGTTCAGGTTCTGCATGCATTA
GAAATATATATCATGTTAGAAGGACATAGAGATACAATAACCATTAATGGAAAGAAGCCA
AAGCTGAGAAGGTTTTGTAAAACAATTATGTCAACAAAGTTTAAACTCTACATGCATTGG
CAGTTCCAGAGGATAAAGTTAGAATGTGTAATGAAACAATAGCTAAAGGAAACTACCTTC
AACAAATCGATTTCTTGCTGGAGAAAACAATCATCCCCCAACATGTAAAAAACCAGGAAA
GGAGATGAGAGACCGAACACATTATTAGTCCATAGAGGAGGACATAAC

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 2

CO CL6305Contig1 1017 2 2 U
GGGACCAGAAATGCCAAGAGCGTTGTGGAGATGGATGAGCGTGTTAGCGATGATGGCTTG
TTACACCGTTACAACCACTTATGTCGCGAGGCCATTAAGTATGCTGAGGAAGGTGCAGTT
ACACCTGAGACTTATAATATTGCTTTAGGAGCACTCAGAGAAGGAAAAGAAGGTTTCAGC
TGTCAGGAAAAGCGTTGGCAGAGCTGCACCTCCTAGCTCACACGGTGGTGATGCAAAGAC
CTCACTATCAGCATCTGACTCAACCCCTCTGCTGTGGCCTCGTCATGATGAAATGACACG
CAGATTTAATCTTAACGATGGTGGGGCCAGAGCTCAGTCTGTTGCTGATTTGAATCTGCC
GCGTATGGCACCGATATCCCTTCACCGAGATGATGGTGCTCCTGAGAATATGGTAGCTCT
TCCTTGTCTTAAGTCAATAACTTGGGGGATGGAGAGTAAGAATACAATCCCGGGTGGTAG
AGTTGCAGTTATCAATTTAAAGTTGCACGATTACAGAAAGTTTCCCTCGGCAGATATGGA
GGTCAAGTTTCAGCTGTCTAGCGTTACACTTGAACCTATGTTAAGGTCTATGGCTTACAT
CAGCGAACAACTCTCAGCTCCAGCGAATAGAGTAGCTGTCATCAATTTGAAGCTGCAAGA
CACTGAGACAACAACAGGAGAATCAGAGGTCAAATTTCAGGTGTCCAGGGATACACTAGG
GGCAATGTTGAGATCAATGGCTTATATCCGTGAGCAGCTCTCTATTGTTGGAGAGCTACA
GACAGAACCACAAGGGAAGAAGCAACGCAAGTGAAAGAGAGAAGCAACCACGGAATTTTT
TTTAAAAAAAATTGTAAACGTAGGAAGGAAGATCCCTCATTAGGATTCGTGTGTTCAATC
TTTGTGATTGATGTTGTACGTTACAATGTGTAATATGTGCAAGTGTGGAGAAACAGGTGG
GGGCATTGAGTCTTGATTCAGGGCAGGCTTTGAATTGTATATATATCCTTTTTTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DT25TF U 1
AF RS1DT25JQ C 275
BS 1 696 RS1DT25TF
BS 697 1017 RS1DT25JQ

RD RS1DT25TF 696 0 0
GGGACCAGAAATGCCAAGAGCGTTGTGGAGATGGATGAGCGTGTTAGCGATGATGGCTTG
TTACACCGTTACAACCACTTATGTCGCGAGGCCATTAAGTATGCTGAGGAAGGTGCAGTT
ACACCTGAGACTTATAATATTGCTTTAGGAGCACTCAGAGAAGGAAAAGAAGGTTTCAGC
TGTCAGGAAAAGCGTTGGCAGAGCTGCACCTCCTAGCTCACACGGTGGTGATGCAAAGAC
CTCACTATCAGCATCTGACTCAACCCCTCTGCTGTGGCCTCGTCATGATGAAATGACACG
CAGATTTAATCTTAACGATGGTGGGGCCAGAGCTCAGTCTGTTGCTGATTTGAATCTGCC
GCGTATGGCACCGATATCCCTTCACCGAGATGATGGTGCTCCTGAGAATATGGTAGCTCT
TCCTTGTCTTAAGTCAATAACTTGGGGGATGGAGAGTAAGAATACAATCCCGGGTGGTAG
AGTTGCAGTTATCAATTTAAAGTTGCACGATTACAGAAAGTTTCCCTCGGCAGATATGGA
GGTCAAGTTTCAGCTGTCTAGCGTTACACTTGAACCTATGTTAAGGTCTATGGCTTACAT
CAGCGAACAACTCTCAGCTCCAGCGAATAGAGTAGCTGTCATCAATTTGAAGCTGCAAGA
CACTGAGACAACAACAGGAGAATCAGAGGTCAAATT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RS1DT25JQ 743 0 0
TGGCCTCGTCATGATGAAATGACACGCAGATTTAATCTTAACGATGGTGGGGCCAGAGCT
CAGTCTGTTGCTGATTTGAATCTGCCGCGTATGGCACCGATATCCCTTCACCGAGATGAT
GGTGCTCCTGAGAATATGGTAGCTCTTCCTTGTCTTAAGTCAATAACTTGGGGGATGGAG
AGTAAGAATACAATCCCGGGTGGTAGAGTTGCAGTTATCAATTTAAAGTTGCACGATTAC
AGAAAGTTTCCCTCGGCAGATATGGAGGTCAAGTTTCAGCTGTCTAGCGTTACACTTGAA
CCTATGTTAAGGTCTATGGCTTACATCAGCGAACAACTCTCAGCTCCAGCGAATAGAGTA
GCTGTCATCAATTTGAAGCTGCAAGACACTGAGACAACAACAGGAGAATCAGAGGTCAAA
TTTCAGGTGTCCAGGGATACACTAGGGGCAATGTTGAGATCAATGGCTTATATCCGTGAG
CAGCTCTCTATTGTTGGAGAGCTACAGACAGAACCACAAGGGAAGAAGCAACGCAAGTGA
AAGAGAGAAGCAACCACGGAATTTTTTTTAAAAAAAATTGTAAACGTAGGAAGGAAGATC
CCTCATTAGGATTCGTGTGTTCAATCTTTGTGATTGATGTTGTACGTTACAATGTGTAAT
ATGTGCAAGTGTGGAGAAACAGGTGGGGGCATTGAGTCTTGATTCAGGGCAGGCTTTGAA
TTGTATATATATCCTTTTTTCAG

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

CO CL6306Contig1 859 2 2 U
TTTTTTCTGGTTTCAATATTAGTCGGCTCCGGTGGCTTCCTTAGCACCGGAGCTGATTCT
CTTTTTCTGTGTTTAGTTCTCTGTATTTAGATCGTAGCTTTTGGCGGTGTTTCATTTTAT
CATGTGTTGAAGTCTTAAAACCAGATCTCATGTTCTGGTCGATCTCTGAGAAGTCTCTTT
ACTTCTCTCTGGTCTCGTTGGATGGTACTAGTGTCTTCAACATATGATCAGTTATGATTC
GTTGGATCCATACCTTGCATGCAAGTCGATTGCTTTATTCCGGTGTTCATCGTTTCGTCT
TCAAACTGACTCTCAGCCTTGATTGTTCCATTGGATCCGTTCTAGGCTCGATCCATTTCT
AGTCTCATCCTTGTGACTAGCTATGGCTGGTTCGGTTCGACTCGCTCTTTGTCTTTTACC
CTGAGATTTGATCGGGATCTCGTCACTTCCGTTGCTTCTCGGCGTTCTGTGGTCGTTCTT
AGTCGACTTCGCCTTGCCGGAATAATATTTCCGGTCTTTGAAGCCCTGTGCTACCTTTGC
TTGTGCTATTCACTATAAGGGGAGTCAGTCATCTTCAAGGATTTGATGACCTTCTGTCTT
TGGCTTTCAAGGTTTTGTCTGTTTTGAAGACTTTAATGATGATCTTGCTATGTTTTGTAA
GCGTTCTTGAGTTTTAGAATTGGATCCATCTTCCGCTTGTCTCTATTGTAATGTGTTGTT
TATGTCGTTTCCCTTTGTTAGGGCTTTACTTCTGGAAAACATGTAGTTTGTCCAGCTTTG
TTTCCAGAGTCACTTATGTGTGCTGCTGGCTTTGTATCACACCCTTGTAGTTTTCTTTGT
CTGAATGAATATAGTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GN11TF U 1
AF RS1GN11JQ C 134
BS 1 556 RS1GN11TF
BS 557 859 RS1GN11JQ

RD RS1GN11TF 556 0 0
TTTTTTCTGGTTTCAATATTAGTCGGCTCCGGTGGCTTCCTTAGCACCGGAGCTGATTCT
CTTTTTCTGTGTTTAGTTCTCTGTATTTAGATCGTAGCTTTTGGCGGTGTTTCATTTTAT
CATGTGTTGAAGTCTTAAAACCAGATCTCATGTTCTGGTCGATCTCTGAGAAGTCTCTTT
ACTTCTCTCTGGTCTCGTTGGATGGTACTAGTGTCTTCAACATATGATCAGTTATGATTC
GTTGGATCCATACCTTGCATGCAAGTCGATTGCTTTATTCCGGTGTTCATCGTTTCGTCT
TCAAACTGACTCTCAGCCTTGATTGTTCCATTGGATCCGTTCTAGGCTCGATCCATTTCT
AGTCTCATCCTTGTGACTAGCTATGGCTGGTTCGGTTCGACTCGCTCTTTGTCTTTTACC
CTGAGATTTGATCGGGATCTCGTCACTTCCGTTGCTTCTCGGCGTTCTGTGGTCGTTCTT
AGTCGACTTCGCCTTGCCGGAATAATATTTCCGGTCTTTGAAGCCCTGTGCTACCTTTGC
TTGTGCTATTCACTAT

QA 1 556 1 556
DS 

RD RS1GN11JQ 726 0 0
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CTCGTTGGATGGTACTAGTGTCTTCAACATATGATCAGTTATGATTCGTTGGATCCATAC
CTTGCATGCAAGTCGATTGCTTTATTCCGGTGTTCATCGTTTCGTCTTCAAACTGACTCT
CAGCCTTGATTGTTCCATTGGATCCGTTCTAGGCTCGATCCATTTCTAGTCTCATCCTTG
TGACTAGCTATGGCTGGTTCGGTTCGACTCGCTCTTTGTCTTTTACCCTGAGATTTGATC
GGGATCTCGTCACTTCCGTTGCTTCTCGGCGTTCTGTGGTCGTTCTTAGTCGACTTCGCC
TTGCCGGAATAATATTTCCGGTCTTTGAAGCCCTGTGCTACCTTTGCTTGTGCTATTCAC
TATAAGGGGAGTCAGTCATCTTCAAGGATTTGATGACCTTCTGTCTTTGGCTTTCAAGGT
TTTGTCTGTTTTGAAGACTTTAATGATGATCTTGCTATGTTTTGTAAGCGTTCTTGAGTT
TTAGAATTGGATCCATCTTCCGCTTGTCTCTATTGTAATGTGTTGTTTATGTCGTTTCCC
TTTGTTAGGGCTTTACTTCTGGAAAACATGTAGTTTGTCCAGCTTTGTTTCCAGAGTCAC
TTATGTGTGCTGCTGGCTTTGTATCACACCCTTGTAGTTTTCTTTGTCTGAATGAATATA
GTGTTT

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL6307Contig1 785 2 2 U
GCATTCATCGAAGGAGAGGCGATAACTTTAAATTCTTGACGAGGCGATGCCTGAAGCATT
TGAAGGCTGGAATCGGTGGGTCGAAGATCCGTGTTTGTTTTGGCGACCTGGGGATTATAA
CTATCAGACGCCTAAGCATGATCCCGAAAAGGCTATCTACACACCTGAACAAGAGTATGA
AAGAATGAGGGAAGAAGTCGATAATAGCGAGGGTTTCGACATCGATTTCGATAGCTTCCG
TTGCGTTTTCAACTACCATCGTGCATACTTCGACTCAAATGAGTTCGTGGATGAGCCAGA
AACCACTGGAGATTTACTCGTGAGGCTCTCCAAGGAGGCCCTCGATGATCACAATGGAAA
ATATGTTGTTAAAGCCAACTTTCACTACTCTGCTGGATTCATGTTTCTCATAACGTTTGA
AGTTCGTGATCCTTATGATGGTCTTATCAAACCATTCCAAGCAAGGGTGCGCCACCTTAA
ACATACCTTCACTGAGCATGTCTTCTGCAGGCCTAAACCCAACACCGGAGTGGAATACTT
TGGGAATGCCAAGACAGATATCGAGAAAGATGCCAAGAAACAAAGATTGGACTAGGAGCT
TTACTATGCGGCTACGAGTAGTGAGTAGTGAAGCCTTGAGATATCTCTCTTGTTTAGTTA
TCTATTTGCATCCTGAGAAATCTAGATCTCTCTCGTCTTGTTTTTGAATTTGCTTATTGA
ATAAACGAACTGCTGCTTTGTTCTCTTTTATTCGTGACTTGTTCACTATTATCTATCTAT
GTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RS1DY31TF U 1
AF RS1DY31JQ C 169
BS 1 591 RS1DY31TF
BS 592 785 RS1DY31JQ

RD RS1DY31TF 591 0 0
GCATTCATCGAAGGAGAGGCGATAACTTTAAATTCTTGACGAGGCGATGCCTGAAGCATT
TGAAGGCTGGAATCGGTGGGTCGAAGATCCGTGTTTGTTTTGGCGACCTGGGGATTATAA
CTATCAGACGCCTAAGCATGATCCCGAAAAGGCTATCTACACACCTGAACAAGAGTATGA
AAGAATGAGGGAAGAAGTCGATAATAGCGAGGGTTTCGACATCGATTTCGATAGCTTCCG
TTGCGTTTTCAACTACCATCGTGCATACTTCGACTCAAATGAGTTCGTGGATGAGCCAGA
AACCACTGGAGATTTACTCGTGAGGCTCTCCAAGGAGGCCCTCGATGATCACAATGGAAA
ATATGTTGTTAAAGCCAACTTTCACTACTCTGCTGGATTCATGTTTCTCATAACGTTTGA
AGTTCGTGATCCTTATGATGGTCTTATCAAACCATTCCAAGCAAGGGTGCGCCACCTTAA
ACATACCTTCACTGAGCATGTCTTCTGCAGGCCTAAACCCAACACCGGAGTGGAATACTT
TGGGAATGCCAAGACAGATATCGAGAAAGATGCCAAGAAACAAAGATTGGA

QA 1 591 1 591
DS 

RD RS1DY31JQ 617 0 0
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CGATAGCTTCCGTTGCGTTTTCAACTACCATCGTGCATACTTCGACTCAAATGAGTTCGT
GGATGAGCCAGAAACCACTGGAGATTTACTCGTGAGGCTCTCCAAGGAGGCCCTCGATGA
TCACAATGGAAAATATGTTGTTAAAGCCAACTTTCACTACTCTGCTGGATTCATGTTTCT
CATAACGTTTGAAGTTCGTGATCCTTATGATGGTCTTATCAAACCATTCCAAGCAAGGGT
GCGCCACCTTAAACATACCTTCACTGAGCATGTCTTCTGCAGGCCTAAACCCAACACCGG
AGTGGAATACTTTGGGAATGCCAAGACAGATATCGAGAAAGATGCCAAGAAACAAAGATT
GGACTAGGAGCTTTACTATGCGGCTACGAGTAGTGAGTAGTGAAGCCTTGAGATATCTCT
CTTGTTTAGTTATCTATTTGCATCCTGAGAAATCTAGATCTCTCTCGTCTTGTTTTTGAA
TTTGCTTATTGAATAAACGAACTGCTGCTTTGTTCTCTTTTATTCGTGACTTGTTCACTA
TTATCTATCTATGTAGC

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 2

CO CL6308Contig1 423 2 1 U
GGAGCCGTATGAGATGAAAATCTCACATACGGTTCTGAAACGGAGAATTCGTTAAAGCGA
ATGACGACCGTAACGGATGTCGGCTCAATCTGAAGGAAATTATGCGGAAGCATTACAGAA
TTATTATGAAGCTATGCGACTAGAAATTGACCCCTATGATCGAAGTTATATACTCTATAA
TATAGGCCTTATCCACACAAGTAATGGGGAACATACCAAAGCTTTAGAATATTATTTTCG
GGCATTAGAACGAAACCCCTTTTTACCACAAGCTTTTAATAATATGGCTGTGATCTGTCA
TTACGTGCGACTATCTCCACTATAGAAAAAAAGAACGAACAGCTAGTCAATGAAATACTA
GAAACAAAAAAAAAAGGCTTTCTACATAAGCATCGTCCAAAACGATTTTTTATCAGCTGT
AGC


BQ
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20 20 20 

AF RS1G652JQ C 1
AF RS1G652TF U 1
BS 1 423 RS1G652TF

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AGC

QA 1 423 1 423
DS 

RD RS1G652TF 423 0 0
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ATGACGACCGTAACGGATGTCGGCTCAATCTGAAGGAAATTATGCGGAAGCATTACAGAA
TTATTATGAAGCTATGCGACTAGAAATTGACCCCTATGATCGAAGTTATATACTCTATAA
TATAGGCCTTATCCACACAAGTAATGGGGAACATACCAAAGCTTTAGAATATTATTTTCG
GGCATTAGAACGAAACCCCTTTTTACCACAAGCTTTTAATAATATGGCTGTGATCTGTCA
TTACGTGCGACTATCTCCACTATAGAAAAAAAGAACGAACAGCTAGTCAATGAAATACTA
GAAACAAAAAAAAAAGGCTTTCTACATAAGCATCGTCCAAAACGATTTTTTATCAGCTGT
AGC

QA 1 423 1 423
DS 



AS 1 2

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AGGCATAGGATCTCCCATGAATCAAAGCTCCCGCCGCCCTAACCTTAACTTATGGAGCAA
TTCTAACACTCAGCAGCAGAATCCGTCAGCTGGCATGATGTGGCCGAACTCTCCATCTCA
CATCAGTAGCATTCCTAGTCAGCGCCCACCTGTTACTGTATTCTCTAGAGCACCTCCTGT
TATGGTGAATATGGCATCTTCTCCTGTGCACCACCACATTGGATCCGCGCCGGTATTAAA
CTCGCCTTTCTGGGATAGAGGACAAGCCTATGTAGCTGAATCTCTAGAACCGCCTGGCAT
CCACATAGGTTCTCATGGTAGCATGGGGTTTCCTGGCTCGTCACCCTCACATCCGATGGA
AATTGGTTCTCATAAGTCCTTTTCCCATATTGCGCGGAATCGCATGGATGTAAATGCCCA
AAATTCTGTGCTGCGATCTCCCCAACAGTTGTCTCATCTCTTCCCCGGAAGGAACCCGAT
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TATATTACGTGGGGATGATGGTAGGACAACACTGATGCTTAAAAACATTCCTAATAAGTA
TACTTTTAAGATGCTTCTATTTGCCATTGACGAGCATTGTAAAGGAACATATGATTTCCT
TTATTTGCCAATTGACTTTAAGAACAAATGCAATGTGGGATATGCTTTCATCAACCTTGT
CGAACCTGAAAAGATTGTACCATTTTATAAGGCGTTTAATGG


BQ
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AF RS1F762TF U 1
AF RS1F762JQ C 324
BS 1 758 RS1F762TF
BS 759 942 RS1F762JQ

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AAATTCTGTGCTGCGATCTCCCCAACAGTTGTCTCATCTCTTCCCCGGAAGGAACCCGAT
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DS 

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ATGCTGACAAGAAACTGTATGAGCTTGATGTTGAACGTATATTACGTGGGGATGATGGTA
GGACAACACTGATGCTTAAAAACATTCCTAATAAGTATACTTTTAAGATGCTTCTATTTG
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ACAAATGCAATGTGGGATATGCTTTCATCAACCTTGTCGAACCTGAAAAGATTGTACCAT
TTTATAAGGCGTTTAATGG

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 2

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TGTTTACTCGATGCTTTTCGCGGGGATTCTTGGTTTCGGTATGGCAATGTGCTTAAACCA
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ATTATGTGATACACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FW68TF U 1
AF RS1FW68JQ C 335
BS 1 758 RS1FW68TF
BS 759 759 RS1FW68JQ
BS 760 766 RS1FW68TF
BS 767 767 RS1FW68JQ
BS 768 778 RS1FW68TF
BS 779 855 RS1FW68JQ

RD RS1FW68TF 778 0 0
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AGGCAACACGCTGAAAATGGAATGCAGTTGCAAAGGTGACCTCAGGCTCGTTCATGAGCA
CTTTGCCATTAAGTGGTTTAGTACAAAAGGAACCAGAATCTGCGATGTTTGCAGACAAGA
AGTCAGAAACTTGCCAGTGATTCTGCTTCGTGTCCCGACAATCAATCAGCTTACCACTAG
ACGGGAACTCACGCAGCAGAATCCTCAGACACAAGCCATTAGTGTGGGGCAAGAGTTTGT
AGTGCTTGTACTCATCAGCACAGTCTGCTACTTCTTCTTCCTTGAACATTTACTGATTCG
TGATTTGAAATCACAAGCCATCTTTGTAGCAGCGCCATTTTCATTCACCTTAGCTCTCTT
AGCCTCAACTTTCGCCGTTGTCCTCGCTATCAGAGAATACATGTGGACATACGCAGCTCT
TGAGTTTGCACTAGTGGCCTTGCTTGTTCATCTGTTATATGTTACATTTGGTGTGCCGGT
TGTTTACTCGATGCTTTTCGCGGGGATTCTTGGTTTCGGTATGGCAATGTGCTTAAACCA
GCTGTACGTTTGCTACTCTTCTCGGCTCGTGCGAGTTCCACGGAACCGGAACTTAGTATA
AAGAAAGTCTCTTCCCTTTTTGTAGTTCTTTCTGTTCTCCCTTGAAAGCTTGTATATGAA
AGTGTATATTGCTTGCTGGATAGAAAGATTCATCTGCA*CAGTATA*GATCTGTAGAT

QA 1 778 1 778
DS 

RD RS1FW68JQ 521 0 0
TTCTTCCTTGAACATTTACTGATTCGTGATTTGAAATCACAAGCCATCTTTGTAGCAGCG
CCATTTTCATTCCCCTTAGCTTTTTTAGCCTCAACTTTCGCCGTTGTCCTCGCTATCAGA
GAATACATGTGGACATACGCAGCTCTTGAGTTTGCACTAGTGGCCTTGCTTGTTCATCTG
TTATATGTTACATTTGGTGTGCCGGTTGTTTACTCGATGCTTTTCGCGGGGATTCTTGGT
TTCGGTATGGCAATGTGCTTAAACCAGCTGTACGTTTGCTACTCTTCTCGGCTCGTGCGA
GTTCCACGGAACCGGAACTTAGTATAAAGAAAGTCTCTTCCCTTTTTGTAGTTCTTTCTG
TTCTCCCTTGAAAGCTTGTATATGAAAGTGTATATTGCTTGCTGGATAGAAAGATTCATC
TGCAACAGTATAAGATCTGTAGATGTATTTGGGTTCTCTGTACGTTTTGTATGAGGAGAC
GAGAGTTTTGTGGGATTACAATGAACATTATGTGATACACC

QA 1 521 1 521
DS 



AS 1 2

CO CL6311Contig1 1016 2 2 U
GTTACACCATAGTAACCAATTCAGGTTTCTAGACAAAGCGGCGGTGATAATAGAAGGTGA
CCTAACACCCGAGGGAGTTCCGGCGAACAAGTGGCGGCTATGCAGCATTCAAGAAGTGGA
GGAAGTAAAGTGTTTGATCCGAATAGTTCCTGTTTGGTCGGCCGGAATAATCTCGCTGGC
TGCAATGTCACAGCAAGGAACGTTCACCGTCTCTCAAGCGTTGAAAATGGACCGACATAT
GGGTCCCAACTTCGAGATTCCGGCAGGTTCACTCTCCGTCATCTCTCTCCTCACCATCGG
CGTCTTTCTTCCCCTATACGACCGCGTTTTAGTCCCGTTCTTCCGCCGTATCACCGGCCA
TAAATCAGGTATCACACTCCTCCAACGTATCGGGACAGGCATCGTTTTCGCTATCCTTTC
CATGATCGTCGCCGGGCTAGTGGAGCGCATGAGACGCATACGCTCCATCAACGCCGGAGA
TCCGGCAGGTATGACTCCGATGTCGGTGTTCTGGCTCTCTCCGCAGCTAATCTTGATGGG
ACTATGCGAAGCGTTTAACATCATTGGACAGATTGAGTTCTTCAACAGTCAGTTTCCCGG
AGCACATGAGAAGCATCGCTAACTCTCTCTTCTCTTTGTCCTTTGCCGGCTCGAACTACC
TTAGCAGTTTGATAGTGACGACGGTTCATAAATTCTCCGGTGGTCATGACCGTCCTGATT
GGCTGAACAAGAATCTCAACGCGGGAAAGTTGGACTACTTCTACTATCTGATTGCGGTTT
TGGGTGTGTTTAATCTGGTTTACTTTTGGTATTGTGCTCGAGGATACCGGTACAAGGTTG
GTTTACAGATGGGAGATTTCGAAGAGAACAAGAGTTTCTCTGATGTTGAGATGAGTTCCA
AAAAACAGCTGAAGTGATTTAATAATGTGGTTAGGAGCAATAAAAAGATGATCGATGTTG
TTTTATAATTATGACAATGTATCTATTGTGTAATATATAAGAACTAAATTCTAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D302TF U 1
AF RS1D302JQ C 228
BS 1 656 RS1D302TF
BS 657 1016 RS1D302JQ

RD RS1D302TF 656 0 0
GTTACACCATAGTAACCAATTCAGGTTTCTAGACAAAGCGGCGGTGATAATAGAAGGTGA
CCTAACACCCGAGGGAGTTCCGGCGAACAAGTGGCGGCTATGCAGCATTCAAGAAGTGGA
GGAAGTAAAGTGTTTGATCCGAATAGTTCCTGTTTGGTCGGCCGGAATAATCTCGCTGGC
TGCAATGTCACAGCAAGGAACGTTCACCGTCTCTCAAGCGTTGAAAATGGACCGACATAT
GGGTCCCAACTTCGAGATTCCGGCAGGTTCACTCTCCGTCATCTCTCTCCTCACCATCGG
CGTCTTTCTTCCCCTATACGACCGCGTTTTAGTCCCGTTCTTCCGCCGTATCACCGGCCA
TAAATCAGGTATCACACTCCTCCAACGTATCGGGACAGGCATCGTTTTCGCTATCCTTTC
CATGATCGTCGCCGGGCTAGTGGAGCGCATGAGACGCATACGCTCCATCAACGCCGGAGA
TCCGGCAGGTATGACTCCGATGTCGGTGTTCTGGCTCTCTCCGCAGCTAATCTTGATGGG
ACTATGCGAAGCGTTTAACATCATTGGACAGATTGAGTTCTTCAACAGTCAGTTTCCCGG
AGCACATGAGAAGCATCGCTAACTCTCTCTTCTCTTTGTCCTTTGCCGGCTCGAAC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RS1D302JQ 789 0 0
AT
GACCGACATATGGGTCCCAACTTCGAGATTCCGGCAGGTTCACTCTCCGTCATCTCTCTC
CTCACCATCGGCGTCTTTCTTCCCCTATACGACCGCGTTTTAGTCCCGTTCTTCCGCCGT
ATCACCGGCCATAAATCAGGTATCACACTCCTCCAACGTATCGGGACAGGCATCGTTTTC
GCTATCCTTTCCATGATCGTCGCCGGGCTAGTGGAGCGCATGAGACGCATACGCTCCATC
AACGCCGGAGATCCGGCAGGTATGACTCCGATGTCGGTGTTCTGGCTCTCTCCGCAGCTA
ATCTTGATGGGACTATGCGAAGCGTTTAACATCATTGGACAGATTGAGTTCTTCAACAGT
CAGTTTCC*GGAGCACATGAGAAGCATCGCTAACTCTCTCTTCTCTTTGTCCTTTGCCGG
CTCGAACTACCTTAGCAGTTTGATAGTGACGACGGTTCATAAATTCTCCGGTGGTCATGA
CCGTCCTGATTGGCTGAACAAGAATCTCAACGCGGGAAAGTTGGACTACTTCTACTATCT
GATTGCGGTTTTGGGTGTGTTTAATCTGGTTTACTTTTGGTATTGTGCTCGAGGATACCG
GTACAAGGTTGGTTTACAGATGGGAGATTTCGAAGAGAACAAGAGTTTCTCTGATGTTGA
GATGAGTTCCAAAAAACAGCTGAAGTGATTTAATAATGTGGTTAGGAGCAATAAAAAGAT
GATCGATGTTGTTTTATAATTATGACAATGTATCTATTGTGTAATATATAAGAACTAAAT
TCTAAGG

QA 3 789 3 789
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6313Contig1 1247 2 2 U
GCAGCGATACATAACGAGAGGCTAAACCGTCCACTCATTCGTCCTTTACCATCAGAGGAG
TCACCACGCAGTAGTGATGGCCATTCGCAGTCCTCCTCCTCCTCCTCGCCTGTTGTGATT
CCACCGCCACCTGCAAAAAAAAACGGATTTTCCTGTAAGAGAGAGGATATTTCTCCTTCT
TGATGCAACTCAAACCTCTCTTGGTGGCTCTTCAGGAAGATACCCTCAGTATTACACAGC
ATACTATGATTTAGTGCAAGCAGGAGTAAAGTTTCCTCAGAGGTCTAACTCCACACCACC
AGTTGTGGTCACCGCACAAGCGGTTCCTAGAAGTACGCTTAATGAACAGCTTGCATCCGC
TAGAAAAGAGAGGACTGCTCCTCCTCCTACTCAGCAGCGAGAAAGAGAATCTCAAACTAC
TACCTCCTCTCCTTCTAGCATTTTACAAAAGGCTAGTGCTGCGTTAGAAGTTTTGAAGGA
AGTGCTTGACGCAGTTGATTCTCAAAATCCTGAGGGAGCAAAAGATGAGTTTACTCTTGA
TCTTGTTGAACAATGCGCGTTTCAGAAAGAGCGTGTAATGCACCTCGTCATGACATCAAG
GGATGAAAGAGCAGTGTCTCAAGCAATAGAATTGAATGAGCAGCTTCAGAGGATTCTTAA
TAGACATGAAGATTTACTCTCTGGTGGAATCACGGTGCCAGGCAGGTCGTTTACTACAAC
TAACGGTTATCATTTTACTTCAAATGGTCACAAGAAACCAAGCAGCTCTATTTCCATTGA
AGATGAGGATGAAATAGAAGAGGAGCCTGAACAGTTATTCAGAAGATTGAGAAAAGGGAA
AGCTAGAGCAATGCCTGAAGATGATGAAGAAGAAGAGGCATCACCACCTCCTCCACAAGT
CCTGCTTGGATCAGCGATACATAACGAGAGGCAGAAGTTTTTCAAGGAGAAGAAGGTTGA
TGGTGGTGCCTCGGGTTTGCCAGGTCATATGAGAGGTCTTTCTGTGCACAGTGGTAGCAG
CTCACGCAGTGGAAGTGTGGACTTCAGTGAATGAAACACTCCCAAAAGCTATGTCACATC
TATAAGTATATGTATTCTTTTTTTTTTTTTACTCTTGCTCCTTTTAGGTTTTGGTTAAAC
TACAGAAAACGTGTCTTTTGTGTGTTGCTGTGTGTCTAGACGAGATTATAGCGCCATGAG
ATTAAAAGGTGTCTTGGTTTCACTTTGTTGAAGCATGAGGTTATGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EC46TF U 1
AF RS1EC46JQ C 517
BS 1 596 RS1EC46TF
BS 597 1247 RS1EC46JQ

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TCACCACGCAGTAGTGATGGCCATTCGCAGTCCTCCTCCTCCTCCTCGCCTGTTGTGATT
CCACCGCCACCTGCAAAAAAAAACGGATTTTCCTGTAAGAGAGAGGATATTTCTCCTTCT
TGATGCAACTCAAACCTCTCTTGGTGGCTCTTCAGGAAGATACCCTCAGTATTACACAGC
ATACTATGATTTAGTGCAAGCAGGAGTAAAGTTTCCTCAGAGGTCTAACTCCACACCACC
AGTTGTGGTCACCGCACAAGCGGTTCCTAGAAGTACGCTTAATGAACAGCTTGCATCCGC
TAGAAAAGAGAGGACTGCTCCTCCTCCTACTCAGCAGCGAGAAAGAGAATCTCAAACTAC
TACCTCCTCTCCTTCTAGCATTTTACAAAAGGCTAGTGCTGCGTTAGAAGTTTTGAAGGA
AGTGCTTGACGCAGTTGATTCTCAAAATCCTGAGGGAGCAAAAGATGAGTTTACTCTTGA
TCTTGTTGAACAATGCGCGTTTCAGAAAGAGCGTGTAATGCACCTCGTCATGACAT

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DS 

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TGAGCAGCTTCAGAGGATTCTTAATAGACATGAAGATTTACTCTCTGGTGGAATCACGGT
GCCAGGCAGGTCGTTTACTACAACTAACGGTTATCATTTTACTTCAAATGGTCACAAGAA
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ATTCAGAAGATTGAGAAAAGGGAAAGCTAGAGCAATGCCTGAAGATGATGAAGAAGAAGA
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GTTTTTCAAGGAGAAGAAGGTTGATGGTGGTGCCTCGGGTTTGCCAGGTCATATGAGAGG
TCTTTCTGTGCACAGTGGTAGCAGCTCACGCAGTGGAAGTGTGGACTTCAGTGAATGAAA
CACTCCCAAAAGCTATGTCACATCTATAAGTATATGTATTCTTTTTTTTTTTTTACTCTT
GCTCCTTTTAGGTTTTGGTTAAACTACAGAAAACGTGTCTTTTGTGTGTTGCTGTGTGTC
TAGACGAGATTATAGCGCCATGAGATTAAAAGGTGTCTTGGTTTCACTTTGTTGAAGCAT
GAGGTTATGCT

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

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ACAGATCATATCATACCAGAGGTTAAACAAAGAAAAAGGAAAGGTGATTTGGCTTAAGTA
GAATATTCCTCAATATTTTCAAAAAGGACTTTGTGAGGCTCGGAATATTCTTGAATAAGG
GAAGGGTCTCGTGGTAGCACCATGTGGACCAGCTCATCGAGTCAAGGTAAACACTAAACA
GTTAGAACTTTTGTCGTTGTTTTAGCACACTGACAAAGTAGCTGTGAAATGTGCAAATAA
TGCAATCACGCAGATCGTCGTTGCTTAATAAATTGATTAACATTTCCGATTTTTTTTCAA
CATTTGTAATATAGCTAAATCTATTGGAAATATGAATGTAACATTGATATCAGTTTACTA
TTT


BQ
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AF RS1FV23JQ C 1
AF RS1FV23TF U 1
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GAAGGGTCTCGTGGTAGCACCATGTGGACCAGCTCATCGAGTCAAGGTAAACACTAAACA
GTTAGAACTTTTGTCGTTGTTTTAGCACACTGACAAAGTAGCTGTGAAATGTGCAAATAA
TGCAATCACGCAGATCGTCGTTGCTTAATAAATTGATTAACATTTCCGATTTTTTTTCAA
CATTTGTAATATAGCTAAATCTATTGGAAATATGAATGTAACATTGATATCAGTTTACTA
TTT

QA 1 423 1 423
DS 

RD RS1FV23TF 423 0 0
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ACAGATCATATCATACCAGAGGTTAAACAAAGAAAAAGGAAAGGTGATTTGGCTTAAGTA
GAATATTCCTCAATATTTTCAAAAAGGACTTTGTGAGGCTCGGAATATTCTTGAATAAGG
GAAGGGTCTCGTGGTAGCACCATGTGGACCAGCTCATCGAGTCAAGGTAAACACTAAACA
GTTAGAACTTTTGTCGTTGTTTTAGCACACTGACAAAGTAGCTGTGAAATGTGCAAATAA
TGCAATCACGCAGATCGTCGTTGCTTAATAAATTGATTAACATTTCCGATTTTTTTTCAA
CATTTGTAATATAGCTAAATCTATTGGAAATATGAATGTAACATTGATATCAGTTTACTA
TTT

QA 1 423 1 423
DS 



AS 1 2

CO CL6315Contig1 1131 2 2 U
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ACGAATCGGAAAGCGCGAAAGATTCATTCCTCTGTTATTATTAATTTGTTTAGTGATAAA
CACAATTTAGAGAGAGTTTGCACCAGCAATATGAACTTGTAAGATTTCATGTTTTGTATT
TATTCATTGAGTTGGTGAGTGAACAACATGCATCAAAAGAAAATGGTTTCAATTTTTTTT
AAAAATTCAGGTGAAGAAGAGGACGGCAGGAACTGTTTCGACGCATGGTTCTCATGTGAT
GGAGTTTGGAGATATAGGACTACTAAGCAAAGAGAAGCCCGTCCTTTACTTGGGTACAAA
TCCAGACAATGATCATTATCACGCATGAACCCAGCTGGCTTCTTGATTGGTACTGGAGCA
GCGATACAGGGAAGAACGTGAGCTGAGTTTTTCCCTGATAAAACTGAAGTTCAATGCATG
TATCGGTGGCAGAAAGTTTTGGATCCAAACCTTACCAAGGGACCTTGGACACAGCAGGAG
GATGAGACAATCGTTGAGCTTGTTATTCTCATTCCTTCTCGTTTATCATGTGATTTCAGT
GTAAGCTAGCCCACATCTTACTAGGTGATTCGTTTGGTGGTCACCACGCTTTTTGTATAT
TGAAGAAAACGAAGCAAATTAAATCATATATAAACTTGCAGAGCAGCACTGCTTTAGCAG
AACTGATTGGATCCCGGATTTCCTCTTTCAGAAAGACAGGGAGATATAAGCTTGCAGAGC
AGCGATGCTCAAAGGTGATCATGATACTTGCTGCAAGGTAATACGATGTTAGGCGGTCGC
TTGTTTGGAAGATCATCTTTTCAGTCTGTTGGTCTCCAAAGACAAAGGGAAGGAGTTGCT
GCAAGTGCCCGACCATTCTTGATTCTTTCTTTCTTTTTCTATATACTTCTGTCCCTTCAA
GAAGTGTCCTATTGTAACATTTTTTTCATTAGGATAGTTTATTTATGTGGTTGGACTGTT
GTGGTATATTTTCACAGCCAGATCAATATGAATCAAAATAAAATTCTTCTC


BQ
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AF RS1F562TF U 1
AF RS1F562JQ C 349
BS 1 593 RS1F562TF
BS 594 1131 RS1F562JQ

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GCGAAGCAATCTTGGTATCGAGCTGATACTCTACGACATTGAGGAATCAGAGAGCGCGAA
GTTGGTTTCTTGCGATGAAGACTTTTGCTTCTAGATTAGTGGTGGTCCTCTCTCAGATTG
ACGAATCGGAAAGCGCGAAAGATTCATTCCTCTGTTATTATTAATTTGTTTAGTGATAAA
CACAATTTAGAGAGAGTTTGCACCAGCAATATGAACTTGTAAGATTTCATGTTTTGTATT
TATTCATTGAGTTGGTGAGTGAACAACATGCATCAAAAGAAAATGGTTTCAATTTTTTTT
AAAAATTCAGGTGAAGAAGAGGACGGCAGGAACTGTTTCGACGCATGGTTCTCATGTGAT
GGAGTTTGGAGATATAGGACTACTAAGCAAAGAGAAGCCCGTCCTTTACTTGGGTACAAA
TCCAGACAATGATCATTATCACGCATGAACCCAGCTGGCTTCTTGATTGGTACTGGAGCA
GCGATACAGGGAAGAACGTGAGCTGAGTTTTTCCCTGATAAAACTGAAGTTCAATGCATG
TATCGGTGGCAGAAAGTTTTGGATCCAAACCTTACCAAGGGACCTTGGACACA

QA 1 593 1 593
DS 

RD RS1F562JQ 783 0 0
TTCTCATGTGATGGAGTTTGGAGATATAGGACTACTAAGCAAAGAGAAGCCCGTCCTTTA
CTTGGGTACAAATCCAGACAATGATCATTATCACGCATGAACCCAGCTGGCTTCTTGATT
GGTACTGGAGCAGCGATACAGGGAAGAACGTGAGCTGAGTTTTTCCCTGATAAAACTGAA
GTTCAATGCATGTATCGGTGGCAGAAAGTTTTGGATCCAAACCTTACCAAGGGACCTTGG
ACACAGCAGGAGGATGAGACAATCGTTGAGCTTGTTATTCTCATTCCTTCTCGTTTATCA
TGTGATTTCAGTGTAAGCTAGCCCACATCTTACTAGGTGATTCGTTTGGTGGTCACCACG
CTTTTTGTATATTGAAGAAAACGAAGCAAATTAAATCATATATAAACTTGCAGAGCAGCA
CTGCTTTAGCAGAACTGATTGGATCCCGGATTTCCTCTTTCAGAAAGACAGGGAGATATA
AGCTTGCAGAGCAGCGATGCTCAAAGGTGATCATGATACTTGCTGCAAGGTAATACGATG
TTAGGCGGTCGCTTGTTTGGAAGATCATCTTTTCAGTCTGTTGGTCTCCAAAGACAAAGG
GAAGGAGTTGCTGCAAGTGCCCGACCATTCTTGATTCTTTCTTTCTTTTTCTATATACTT
CTGTCCCTTCAAGAAGTGTCCTATTGTAACATTTTTTTCATTAGGATAGTTTATTTATGT
GGTTGGACTGTTGTGGTATATTTTCACAGCCAGATCAATATGAATCAAAATAAAATTCTT
CTC

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 2

CO CL6316Contig1 1129 2 4 U
GGATCGCAACTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTCGAGGCCGTGCCCTAGAAG
AGCCCCCTTTCCTCATCTCTCATCTCTCCTCCGTGACTTCCTTCAATCCCTAGCCTCCGT
CTTCGGATTTCTCGTCCTTCGATCATCGAGACTTAGTGTTTTAACTTAATTTCCACCCCA
ATCGATTTCAGATTCTGTGGAAGCAAAGTTCTTCTGAGATCAGTGTTTGTTGGTTACTTC
TGTAGTTTTGTGGATTTTACACATGAAGGTCTGTCCATTGCAGTGTGCTATGAATCCAGA
AGTAGAATATGAAAGATTCTGGCAGTGAAATGATTGATAGAGATTGGGTCATGAAGCAGA
GACGACGAAAGCTTCCGTGTATTCTGGATTTGTTAGACCAAAAGGGGGATACTTCCGCGG
CTATTATTGATTCTCCGGACTGCACTTCTTCTGATAAACCAACTAAGCACCAGCTTAAGG
CTGGTTCGGCTCCTGAGCGGACTTCGAAAAGAAAGGGACAGTCTCTTGCTGAAAATAATT
CTCTGGCTGTTGGTTCTCCGGAATTCACTTCTTCTGAGAAGCTAACTAATCATCAGCCTA
GCATTGATGTGACTCCTCAAGGGACCTCCTCTAAAAGGAAGGGACATGACGGGAATTATT
TTGAATGTGTGATCTGTGACCTTGGTGGTGATTTGCTGTGCTGTGATAGTTGTCCTCGGA
CCTATCATACCGCATGCCTCACTCCTCCTCTCAAGCGGATTCCAAATGGCAAGTGGATCT
GCCCAAAGTGTTCCCAAGACAGAAGTGCGCTAAAGCCTACCACACGTCTAGATGCCATTT
CAAAGCGGGCAAGAACAAAAACCTCTAAAAGAAATTCACAAGACAGGCCAAAGAGCGAGA
GAGCTTCCCAGATATACTGCAGTTCTATTGTTTCTGGAGAACCATCTGCAGAGAAGGGGA
AAAATATCTCGGTTGGGGAGAGCAAATCCATAGGAAAAGAAGTGATGGATGGGTGTTTTG
CTGAGCTTGGTCATGTATCTGCGGATGACCAACCCGATTCATATGTCATACCCACTGCAA
ATCCGCCTTCCTGCGAAGATCTCCCAGAATCTAAACTGTCAAATACCGG


BQ
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AF RS1C553TF U 1
AF RS1C553JQ C 434
BS 1 654 RS1C553TF
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BS 656 710 RS1C553TF
BS 711 1129 RS1C553JQ

RD RS1C553TF 710 0 0
GGATCGCAACTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTCGAGGCCGTGCCCTAGAAG
AGCCCCCTTTCCTCATCTCTCATCTCTCCTCCGTGACTTCCTTCAATCCCTAGCCTCCGT
CTTCGGATTTCTCGTCCTTCGATCATCGAGACTTAGTGTTTTAACTTAATTTCCACCCCA
ATCGATTTCAGATTCTGTGGAAGCAAAGTTCTTCTGAGATCAGTGTTTGTTGGTTACTTC
TGTAGTTTTGTGGATTTTACACATGAAGGTCTGTCCATTGCAGTGTGCTATGAATCCAGA
AGTAGAATATGAAAGATTCTGGCAGTGAAATGATTGATAGAGATTGGGTCATGAAGCAGA
GACGACGAAAGCTTCCGTGTATTCTGGATTTGTTAGACCAAAAGGGGGATACTTCCGCGG
CTATTATTGATTCTCCGGACTGCACTTCTTCTGATAAACCAACTAAGCACCAGCTTAAGG
CTGGTTCGGCTCCTGAGCGGACTTCGAAAAGAAAGGGACAGTCTCTTGCTGAAAATAATT
CTCTGGCTGTTGGTTCTCCGGAATTCACTTCTTCTGAGAAGCTAACTAATCATCAGCCTA
GCATTGATGTGACTCCTCAAGGGACCTCCTCTAAAAGGAAGGGACATGACGGGA*TTATT
TTGAATGTGTGATCTGTGACCTTGGTGGTGATTTGCTGTGCTGTGATAGT

QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1C553JQ 696 0 0
TCCGGACTGCACTTCTTCTGATAAACCAACTAAGCACCAGCTTAAGGCTGGTTCGGCTCC
TGAGCGGACTTCGAAAAGAAAGGGACAGTCTCTTGCTGAAAATAATTCTCTGGCTGTTGG
TTCTCCGGAATTCACTTCTTCTGAGAAGCTAACTAATCATCAGCCTAGCATTGATGTGAC
TCCTCAAGGGACCTCCTTTAAAAGGAAGGGACATGACGGGAATTATTTTGAATGTGTGAT
CTGTGACCTTGGTGGTGATTTGCTGTGCTGTGATAGTTGTCCTCGGACCTATCATACCGC
ATGCCTCACTCCTCCTCTCAAGCGGATTCCAAATGGCAAGTGGATCTGCCCAAAGTGTTC
CCAAGACAGAAGTGCGCTAAAGCCTACCACACGTCTAGATGCCATTTCAAAGCGGGCAAG
AACAAAAACCTCTAAAAGAAATTCACAAGACAGGCCAAAGAGCGAGAGAGCTTCCCAGAT
ATACTGCAGTTCTATTGTTTCTGGAGAACCATCTGCAGAGAAGGGGAAAAATATCTCGGT
TGGGGAGAGCAAATCCATAGGAAAAGAAGTGATGGATGGGTGTTTTGCTGAGCTTGGTCA
TGTATCTGCGGATGACCAACCCGATTCATATGTCATACCCACTGCAAATCCGCCTTCCTG
CGAAGATCTCCCAGAATCTAAACTGTCAAATACCGG

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL6317Contig1 936 2 2 U
GCAAACCGCCGGCTTACACTCCGGCACAAGACGAGGCTTCAGCTCCAAAGGACAAAGCTT
TGTTCGATAAAAAAACAGAGGACGAGCTTGAGGATCTCGAGGACGACAAAGATCTCGACG
ACGATCGCTTCCTCGAAGAATACAGGTTTTGCCATTTCGTAATCTCCCGGATCTGTAAAT
GTCAAGTTCTGATTTTTATCGATTCGTTTGTGTTTTGGTTATGAAAAGATTAAGACTTTA
CTAAGATGTGCTTTTGATATAGGAAGAAGAGGTTGACTGAGCTGAGAGAAGCTGCTAAAG
TTAGGAGGTATGGATCGGTGATTCCCATCTCTAGCTCTGATTTCGTGAGGGAGGTTACGC
AAGCTTCTGCTGAAGTTTGGGTTGTTGTGTGTCTCTACAAAGATGGTTTTGCAGAGTGTG
GATTGTTATTGGGTTGTCTAGAGGAACTGGCTGGCAGATACCCGGGAACGAAGTTTGTTA
AGATTGTATCAACTGATTGTATTCCCAACTACCCTGATTGCAATCTCCCTACCTTGCTTG
TGTACCATCATGGTGCTGTTAAAGGAACTCATGTTGGCTTGAAGAGCGTTGGCCGTAGGT
GCACCCCTGAGAGTGTAGCCTTAGTTTTGTGTCAGTCAGAGCCAGTTCTTAACGATGGCA
AAAGTGGAGACGATGACTCCTCAAGGGAAGCTGTGATGGCTGGCGTCCGAAGACAGTTCA
TAGAACGAGTGGTCAAAGACCATGAAGACAAGGATAACGATGATGATGGTTACAATAGCG
ATTAAGTCTCTTAAAGCTTCTCTGTTTGTCTCTGTTGGTTATGTTTGTTGCCTTTGTGAC
TGGTAAGCAAGAGTGCTGTCTCTATTTGTGTTGTACTGCTTTTCCACAACTATTTCATTC
TCAAATTTCAAATACATTCATTGAAATCTCAAATTT


BQ
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AF RS1GU86TF U 1
AF RS1GU86JQ C 142
BS 1 560 RS1GU86TF
BS 561 936 RS1GU86JQ

RD RS1GU86TF 560 0 0
GCAAACCGCCGGCTTACACTCCGGCACAAGACGAGGCTTCAGCTCCAAAGGACAAAGCTT
TGTTCGATAAAAAAACAGAGGACGAGCTTGAGGATCTCGAGGACGACAAAGATCTCGACG
ACGATCGCTTCCTCGAAGAATACAGGTTTTGCCATTTCGTAATCTCCCGGATCTGTAAAT
GTCAAGTTCTGATTTTTATCGATTCGTTTGTGTTTTGGTTATGAAAAGATTAAGACTTTA
CTAAGATGTGCTTTTGATATAGGAAGAAGAGGTTGACTGAGCTGAGAGAAGCTGCTAAAG
TTAGGAGGTATGGATCGGTGATTCCCATCTCTAGCTCTGATTTCGTGAGGGAGGTTACGC
AAGCTTCTGCTGAAGTTTGGGTTGTTGTGTGTCTCTACAAAGATGGTTTTGCAGAGTGTG
GATTGTTATTGGGTTGTCTAGAGGAACTGGCTGGCAGATACCCGGGAACGAAGTTTGTTA
AGATTGTATCAACTGATTGTATTCCCAACTACCCTGATTGCAATCTCCCTACCTTGCTTG
TGTACCATCATGGTGCTGTT

QA 1 560 1 560
DS 

RD RS1GU86JQ 795 0 0
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ATTCGTTTGTGTTTTGGTTATGAAAAGATTAAGACTTTACTAAGATGTGCTTTTGATATA
GGAAGAAGAGGTTGACTGAGCTGAGAGAAGCTGCTAAAGTTAGGAGGTATGGATCGGTGA
TTCCCATCTCTAGCTCTGATTTCGTGAGGGAGGTTACGCAAGCTTCTGCTGAAGTTTGGG
TTGTTGTGTGTCTCTACAAAGATGGTTTTGCAGAGTGTGGATTGTTATTGGGTTGTCTAG
AGGAACTGGCTGGCAGATACCCGGGAACGAAGTTTGTTAAGATTGTATCAACTGATTGTA
TTCCCAACTACCCTGATTGCAATCTCCCTACCTTGCTTGTGTACCATCATGGTGCTGTTA
AAGGAACTCATGTTGGCTTGAAGAGCGTTGGCCGTAGGTGCACCCCTGAGAGTGTAGCCT
TAGTTTTGTGTCAGTCAGAGCCAGTTCTTAACGATGGCAAAAGTGGAGACGATGACTCCT
CAAGGGAAGCTGTGATGGCTGGCGTCCGAAGACAGTTCATAGAACGAGTGGTCAAAGACC
ATGAAGACAAGGATAACGATGATGATGGTTACAATAGCGATTAAGTCTCTTAAAGCTTCT
CTGTTTGTCTCTGTTGGTTATGTTTGTTGCCTTTGTGACTGGTAAGCAAGAGTGCTGTCT
CTATTTGTGTTGTACTGCTTTTCCACAACTATTTCATTCTCAAATTTCAAATACATTCAT
TGAAATCTCAAATTT

QA 1 795 1 795
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6319Contig1 812 2 10 U
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ATTTGTTATTTGTTTGTTAGGTTTATCAGCAAACGCTAAAGATTTCACAATCACTGCTCC
TCCAGGTTCTGATATCACCAACTTATTGTTGAAAACATTCAATGAGGCATGCCAGTTCCC
AACCAAAAGCAGCGTTTTGATCCCTAAAGGTGAATACAGGCTTCGTTCAATAGAGATGAT
GGGTCCATGCAAAGCTCCCATAAGGATTACTCTTCAAGGCACTGTGAAAGCTGACGGAAA
CGTTAACGGGAACGACTACTGGGTCGCTTTCCGCAGGATTAATGGGTTTAAGTTGAACGG
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GGCATTAACTAAGTACAAGAAACTCCCTATCAGCATACGTTTTGATTTCGTGACTGACGC
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AAGGAACATGACAATGGAAGCAGTCACGATCATAGCCCCTGACGAGAGTCCCAACACCGA
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CGGTCCGGGGCACGGAATCAGTATTGGAAGCC


BQ
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AF RS1FX66TF U 1
AF RS1EB82TF U 294
BS 1 494 RS1FX66TF
BS 495 495 RS1EB82TF
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BS 739 812 RS1EB82TF

RD RS1FX66TF 741 0 0
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ATTTGTTATTTGTTTGTTAGGTTTATCAGCAAACGCTAAAGATTTCACAATCACTGCTCC
TCCAGGTTCTGATATCACCAACTTATTGTTGAAAACATTCAATGAGGCATGCCAGTTCCC
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GGGTCCATGCAAAGCTCCCATAAGGATTACTCTTCAAGGCACTGTGAAAGCTGACGGAAA
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GGCATTAACTAAGTGCAAGAAACTCCCTATCAGCATACGTTTTGATTTCGTGACTGACGC
TAAGATAAGAGGCATAACCTCGTTGGATTCAAAGAACTTCCACATTAACGTGCTCGGGGC
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AGATGACTGCATCTCTAT
GGA

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1EB82TF 519 0 0
G
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GAACGGAGGTGGTATCTTTGACGGTGAAGGTAACGCTGCATGGAGGGTTAACAATTGCCA
CAAGATGGCATTAACTAAGTACAAGAAACTCCCTATCAGCATACGTTTTGATTTCGTGAC
TGACGCTAAGATAAGAGGCATAACCTCGTTGGATTCAAAGAACTTCCAAATTAACGTGCT
CGGGGCAAGGAACATGACAATGGAAGCAGTCACGATCATAGCCCCTGACGAGAGTCCCAA
CACCGATGGAATCCACATCGGAAGGAGTGATGGAGTCCAGATCGTCAACTCAATTATCAA
AACGGGAGATGACTGCATCTCTATTGGAGACGGGACGAAAAACCTTCTCGTTGAAGGAGT
TACATGCGGTCCGGGGCACGGAATCAGTATTGGAAGCC

QA 2 519 2 519
DS 



AS 1 2

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GATGACAGGGCTACTCAAACCTTCATCTGGAACAGCATTGGTTCAGGGTTTGGACATATG
CAAGGATATGAACAAAGTATACACTAGCATGGGCGTTTGCCCACAACACGACTTGCTTTG
GGAGACACTAACAGGGAGAGAACATCTTCTCTTCTACGGGCGACTCAAGAACTTTAAGGG
CTCTGCTCTAACGCATGCCGTGGAAGAATCTCTAAAGAGTGTAAGCCTTTTCGACGGAGG
AGTTGGCGACAAACCTGCTGGAAATTACAGTGGAGGTATGAAAAGGCGGCTTAGTGTCAC
TATATCACTTATTGGGAACCCCAAGGTAGTTTATTTGGATGAGCCAAGCACAGGACTTGA
TCCAGCCTCGAGGAAGAACTTATGGGATGTGATTCAGCGTGCAAAACAAAACACAGCAAT
TATCCTCACAACTCACTCGATGGAATAAGCAGAGTTTCTATGCGATCGATTGGGAATATT
CGTAGACGGGGCCTTGCAATGCATAGGAAACTCCAAGGAACTAAAGAGCAGATACGGTGG
ATCGTATGTGTTCACGATGACAACATCTTCAGAACATGAGGAAGTTGTTGAGAAATTGGT
ACCAACTGTGTCTCCCAACGCCAAGAAAGTATATCATCTCGCTGGTACACAGAAGTTCGA
GCTCCCAAAGAACGAAGTTAGGATTGCTGAGGTGTTTAGGGCTGTAGAAAAGGCTAAATC
CAACTTCACAGTCTTTGCTTGGGGACTTGCCGACACAACTCTCGAAGATGTCTTCATCAA
AGTCGCTAAATCTGCTCAAGCCTTCATTTCCTTGTCTTGATGAAGCCTGATTTTTCAAGT
TAGGGTTTCTATTTTTTTGAGTCAAAGATGTGTCTTCGGGCGCACGCAACCAACTTCCTA
ATACTTTTCATGCAATTTGTATATACTATTAGCTGTACACGTTTTTTACATAGAAGCTTC
AGCCTATGTTGAGATGTCCCATAATTATTCGTTGTTACATACTCTCTATGTATTACAAAT
TAATATGAACATG


BQ
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AF RS1F662TF U 1
AF RS1F662JQ C 371
BS 1 691 RS1F662TF
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BS 800 808 RS1F662TF
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BS 810 826 RS1F662TF
BS 827 1033 RS1F662JQ

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AGTTGGCGACAAACCTGCTGGAAATTACAGTGGAGGTATGAAAAGGCGGCTTAGTGTCAC
TATATCACTTATTGGGAACCCCAAGGTAGTTTATTTGGATGAGCCAAGCACAGGACTTGA
TCCAGCCTCGAGGAAGAACTTATGGGATGTGATTCAGCGTGCAAAACAAAACACAGCAAT
TATCCTCACAACTCACTCGATGGAATAAGCAGAGTTTCTATGCGATCGATTGGGAATATT
CGTAGACGGGGCCTTGCAATGCATAGGAAACTCCAAGGAACTAAAGAGCAGATACGGTGG
ATCGTATGTGTTCACGATGACAACATCTTCAGAACATGAGGAAGTTGTTGAGAAATTGGT
ACCAACTGTGTCTCCCAACGCCAAGAAAGTATATCATCTCGCTGGTACACAGAAGTTCGA
GCTCCCAAAGAACGAAGTTAGGATTGCTGAG*TGTTTAGGGCTGTAGAAAAG*CTAA*TC
CAACTTCACAGTCTTTGCTTGGGGACTTGCCGACACA*CTCTCGA*GATGTCTTCATCAA
AGTCGCTAA*TCTGCTCA*GCCTTCATT*CCTTGTCTTGATGAAGC
TGATTTTCAG

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DS 

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ACTCACTCGATGGAATAAGCAGAGTTTCTATGCGATCGATTGGGAATATTCGTAGACGGG
GCCTTGCAATGCATAGGAAACTCCAAGGAACTAAAGAGCAGATACGGTGGATCGTATGTG
TTCACGATGACAACATCTTCAGAACATGAGGAAGTTGTTGAGAAATTGGTACCAACTGTG
TCTCCCAACGCCAAGAAAGTATATCATCTCGCTGGTACACAGAAGTTCGAGCTCCCAAAG
AACGAAGTTAGGATTGCTGAGGTGTTTAGGGCTGTAGAAAAGGCTAAATCCAACTTCACA
GTCTTTGCTTGGGGACTTGCCGACACAACTCTCGAAGATGTTTTCATCAAAGTCGCTAAA
TCTGCTCAAGCCTTCATTTCCTTGTCTTGATGAAGCCTGATTTTTCAAGTTAGGGTTTCT
ATTTTTTTGAGTCAAAGATGTGTCTTCGGGCGCACGCAACCAACTTCCTAATACTTTTCA
TGCAATTTGTATATACTATTAGCTGTACACGTTTTTTACATAGAAGCTTCAGCCTATGTT
GAGATGTCCCATAATTATTCGTTGTTACATACTCTCTATGTATTACAAATTAATATGAAC
ATG

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

CO CL6321Contig1 1095 2 2 U
GGAGTCTCTGTAAACCCTAAACCCAATTCGAGCTCTCCGATGGCGAGCCTTCGATGCCTT
CGCGAGCTAAGCCGCCGCGCCACGACGGTCCTATCAATCAACCAGACGCGATTGATCTCT
TCACTTCGAAGCTTAGAGCCTTTCGGTACCAGCATTACTCATGGAACCCCAATTCCGAAT
CGATCTCTCACTAGAGATCTCCCGAGGTACACTCGCTCCCGAGGTCGCCTCTTGTCTACG
AAAACAAACGATACTGATGAAAGCAGCGAAGGAGAAGATGATGATGATGATGAGGAGTAC
GAGGATTCGGCGGAGATGGAAGTAGAAAGGGAGTATTCGCCGGCCGAGAAAGTGGAAGCA
GCGGCGGAGATAGGGTACAAGGTGATGGGTCCTCTCAAACCTTCGGAGAGACTATTCAAA
CCCTATGAGCCAGTGTTCGCCGTTGTTCAGATTGGCTCGCATCAGTTCAAAGTAAGCAAT
GGAGACTCCATCTTCACGGAGAAGTTGAAGTTCTGTGACATCAATGATAAGTTGGTACTG
ACTAAGGTGCTTCTACTGGGCTCGGCGAGCCAGACGATTATTGGTAGGCCTATCTTGCCT
GATGCTACTGTTCATGCTGTTGTGGAAGAGCATGCATTGGATGAAAAAGTGCTCATTTTC
AAAAAGAAACGAAGGAAGAATTATAGGAGAACCACAGGGCATCGACAGGAATTGACAAAG
TTGAGAATAACCGATATACAAGGAATTGAGAAACCAGAGACGCCGATTGTCCATAAGCCT
TTTAAGGCAGCTGATGCAGAGCAACCAGAGCCGGAGCTAGTTGGTTAGAGAGAAGAATCG
CTTCCTTTTTTCTTTTGTTGCTGATGCCAACACTTTAAAGTAAGTTCATCAAACAGTTGC
CGATTTGGGCTTCACCTTCTCTGAAGTTTTTTTACAACTAGTAGCTGAAAAGGCTTTCTT
TGTAGTTAGTGGCAATGTTGATACTAAGATATGAACTTGAGTACCTTTAGCTATCTAGTT
CATCCTCTTCTGTTTGATTTTGCTCTTCATTTATACTGGAACTGACCCACGCATTGACAC
TGTTTGTTTTTGTGT


BQ
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AF RS1A810TF U 1
AF RS1A810JQ C 242
BS 1 660 RS1A810TF
BS 661 1095 RS1A810JQ

RD RS1A810TF 660 0 0
GGAGTCTCTGTAAACCCTAAACCCAATTCGAGCTCTCCGATGGCGAGCCTTCGATGCCTT
CGCGAGCTAAGCCGCCGCGCCACGACGGTCCTATCAATCAACCAGACGCGATTGATCTCT
TCACTTCGAAGCTTAGAGCCTTTCGGTACCAGCATTACTCATGGAACCCCAATTCCGAAT
CGATCTCTCACTAGAGATCTCCCGAGGTACACTCGCTCCCGAGGTCGCCTCTTGTCTACG
AAAACAAACGATACTGATGAAAGCAGCGAAGGAGAAGATGATGATGATGATGAGGAGTAC
GAGGATTCGGCGGAGATGGAAGTAGAAAGGGAGTATTCGCCGGCCGAGAAAGTGGAAGCA
GCGGCGGAGATAGGGTACAAGGTGATGGGTCCTCTCAAACCTTCGGAGAGACTATTCAAA
CCCTATGAGCCAGTGTTCGCCGTTGTTCAGATTGGCTCGCATCAGTTCAAAGTAAGCAAT
GGAGACTCCATCTTCACGGAGAAGTTGAAGTTCTGTGACATCAATGATAAGTTGGTACTG
ACTAAGGTGCTTCTACTGGGCTCGGCGAGCCAGACGATTATTGGTAGGCCTATCTTGCCT
GATGCTACTGTTCATGCTGTTGTGGAAGAGCATGCATTGGATGAAAAAGTGCTCATTTTC

QA 1 660 1 660
DS 

RD RS1A810JQ 854 0 0
AAACAAACGATACTGATGAAAGCAGCGAAGGAGAAGATGATGATGATGATGAGGAGTACG
AGGATTCGGCGGAGATGGAAGTAGAAAGGGAGTATTCGCCGGCCGAGAAAGTGGAAGCAG
CGGCGGAGATAGGGTACAAGGTGATGGGTCCTCTCAAACCTTCGGAGAGACTATTCAAAC
CCTATGAGCCAGTGTTCGCCGTTGTTCAGATTGGCTCGCATCAGTTCAAAGTAAGCAATG
GAGACTCCATCTTCACGGAGAAGTTGAAGTTCTGTGACATCAATGATAAGTTGGTACTGA
CTAAGGTGCTTCTACTGGGCTCGGCGAGCCAGACGATTATTGGTAGGCCTATCTTGCCTG
ATGCTACTGTTCATGCTGTTGTGGAAGAGCATGCATTGGATGAAAAAGTGCTCATTTTCA
AAAAGAAACGAAGGAAGAATTATAGGAGAACCACAGGGCATCGACAGGAATTGACAAAGT
TGAGAATAACCGATATACAAGGAATTGAGAAACCAGAGACGCCGATTGTCCATAAGCCTT
TTAAGGCAGCTGATGCAGAGCAACCAGAGCCGGAGCTAGTTGGTTAGAGAGAAGAATCGC
TTCCTTTTTTCTTTTGTTGCTGATGCCAACACTTTAAAGTAAGTTCATCAAACAGTTGCC
GATTTGGGCTTCACCTTCTCTGAAGTTTTTTTACAACTAGTAGCTGAAAAGGCTTTCTTT
GTAGTTAGTGGCAATGTTGATACTAAGATATGAACTTGAGTACCTTTAGCTATCTAGTTC
ATCCTCTTCTGTTTGATTTTGCTCTTCATTTATACTGGAACTGACCCACGCATTGACACT
GTTTGTTTTTGTGT

QA 1 854 1 854
DS 



AS 1 2

CO CL6322Contig1 883 2 2 U
GGGCGAACAAGCACATTGACGAAACCGATCGTTCTCTTCTCGATCGCACTGTTGAGCACC
GTCCTCTTCTTCGCATTCTTCTTCGAAGACAGGCCTTACTCATCATCATCATCATATCCC
TCTTCTTCAGACTCCATGGCTCTAAGAACCTTCATCTTGTGGCTTCACGGGCTTGGAGAT
TCCGGACCTGCCAACGAACCCATCAAGTCACTTTTCAAGTCTCCGGAGTTTACAAACACC
AAATGGCTCTTCCCTTCTGCTCCTCCTAATCCTGTCTCCTGCAATCATGGTATGGTGATG
CCTTCCTGGTTTGACATCCGTGAGCTTCCTCTTACCGCGGGCTCTCCTAATGACGAAAGC
AGCGTGCTTGAAGCTGTTAAGAACGTTCATGCCATTATAGATAAGGAGATTGCTGGAGGA
GTGAGTCCTCAAAACGTGTATATCTGCGGATTTAGCCAAGGAGGGGCATTAACCTTGGCT
AGTGTTCTGCTTCACCCTAAAACTCTTGGAGGAGGTGCAGTCTTTAGCGGATGGGTTCCA
TTCAATTCTTCTGTCATCAATCAGTTTACCAAAGATGCTATAAAGACACCAATCTTGTGG
TCTCGTGGGATTGATGACAAGACGGTACTATTCGAAGCTGGTCAAGCAGCTCTTCCTTTC
CTTCAACAAGCTGGTGTCACTTGTGAATTTAAGGCATATCCAGATCTTGGACACTCAATC
AGTAATAATGAGCTTCAGTATCTGGAGTCATGGATCAAACAAAGGATGCTAAGTTCCTCT
TCTTCTTCTTAAAAGCTTTTGAGATCGAGTTTGTTTGTCCAACTACTAAAGTTATCTATA
TTTCCCAAGTAATAATATGCGAAAGCCTTGAACACACTTACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DG11TF U 1
AF RS1DG11JQ C 267
BS 1 689 RS1DG11TF
BS 690 883 RS1DG11JQ

RD RS1DG11TF 689 0 0
GGGCGAACAAGCACATTGACGAAACCGATCGTTCTCTTCTCGATCGCACTGTTGAGCACC
GTCCTCTTCTTCGCATTCTTCTTCGAAGACAGGCCTTACTCATCATCATCATCATATCCC
TCTTCTTCAGACTCCATGGCTCTAAGAACCTTCATCTTGTGGCTTCACGGGCTTGGAGAT
TCCGGACCTGCCAACGAACCCATCAAGTCACTTTTCAAGTCTCCGGAGTTTACAAACACC
AAATGGCTCTTCCCTTCTGCTCCTCCTAATCCTGTCTCCTGCAATCATGGTATGGTGATG
CCTTCCTGGTTTGACATCCGTGAGCTTCCTCTTACCGCGGGCTCTCCTAATGACGAAAGC
AGCGTGCTTGAAGCTGTTAAGAACGTTCATGCCATTATAGATAAGGAGATTGCTGGAGGA
GTGAGTCCTCAAAACGTGTATATCTGCGGATTTAGCCAAGGAGGGGCATTAACCTTGGCT
AGTGTTCTGCTTCACCCTAAAACTCTTGGAGGAGGTGCAGTCTTTAGCGGATGGGTTCCA
TTCAATTCTTCTGTCATCAATCAGTTTACCAAAGATGCTATAAAGACACCAATCTTGTGG
TCTCGTGGGATTGATGACAAGACGGTACTATTCGAAGCTGGTCAAGCAGCTCTTCCTTTC
CTTCAACAAGCTGGTGTCACTTGTGAATT

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1DG11JQ 617 0 0
TAATCCTGTCTCCTGCAATCATGGTATGGTGATGCCTTCCTGGTTTGACATCCGTGAGCT
TCCTCTTACCGCGGGCTCTCCTAATGACGAAAGCAGCGTGCTTGAAGCTGTTAAGAACGT
TCATGCCATTATAGATAAGGAGATTGCTGGAGGAGTGAGTCCTCAAAACGTGTATATCTG
CGGATTTAGCCAAGGAGGGGCATTACCCTTGGCTAGTGTTCTGCTTCACCCTAAAACTCT
TGGAGGAGGTGCAGTCTTTAGCGGATGGGTTCCATTCAATTCTTCTGTCATCAATCAGTT
TACCAAAGATGCTATAAAGACACCAATCTTGTGGTCTCGTGGGATTGATGACAAGACGGT
ACTATTCGAAGCTGGTCAAGCAGCTCTTCCTTTCCTTCAACAAGCTGGTGTCACTTGTGA
ATTTAAGGCATATCCAGATCTTGGACACTCAATCAGTAATAATGAGCTTCAGTATCTGGA
GTCATGGATCAAACAAAGGATGCTAAGTTCCTCTTCTTCTTCTTAAAAGCTTTTGAGATC
GAGTTTGTTTGTCCAACTACTAAAGTTATCTATATTTCCCAAGTAATAATATGCGAAAGC
CTTGAACACACTTACGC

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 2

CO CL6323Contig1 423 2 1 U
GGGGCGCAAGGTCTCGATTTCTCCGTCAACGTCGTCACATTACGTTGGGCTGAGCTTCAG
TCTGGTCCTCTTAAGCTAGCTCTTATGCAATCTCCCAGCGACCATGTGGTGAGTGAGAAG
GGGTACTCTTCGTTACTATCGTTCACTGTGACAGACATTAATACATCAATCTCTAAACTT
ATGGAGTTAGGAGCGGAGCTCGATGGCTCTATTAAATACGAAGTCCATGGCAAGGTTGCA
TCTGTGAGATGTCTCGACGGTCATGTGCTCGGCCTCTATGAACCTTCTTAGGTTTTTATC
AGTTCGTGAGTGTACTTTGTTACGGGTAATTCCTATTGGACCGCCGATCAATAAACTAGA
TGGCTGATATGTACTAGTAGCCCAGCAAAAATCAAAGTAGTGCATTTCTTATTTTGAAAT
ATG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RS1DP05JQ C 1
AF RS1DP05TF U 1
BS 1 423 RS1DP05TF

RD RS1DP05JQ 423 0 0
GGGGCGCAAGGTCTCGATTTCTCCGTCAACGTCGTCACATTACGTTGGGCTGAGCTTCAG
TCTGGTCCTCTTAAGCTAGCTCTTATGCAATCTCCCAGCGACCATGTGGTGAGTGAGAAG
GGGTACTTTTCGTTACTATCGTTCACTGTGACAGACATTAATACATCAATCTCTAAACTT
ATGGAGTTAGGAGCGGAGCTCGATGGCTCTATTAAATACGAAGTCCATGGCAAGGTTGCA
TCTGTGAGATGTCTCGACGGTCATGTGCTCGGCCTCTATGAACCTTCTTAGGTTTTTATC
AGTTCGTGAGTGTACTTTGTTACGGGTAATTCCTATTGGACCGCCGATCAATAAACTAGA
TGGCTGATATGTACTAGTAGCCCAGCAAAAATCAAAGTAGTGCATTTCTTATTTTGAAAT
ATG

QA 1 423 1 423
DS 

RD RS1DP05TF 423 0 0
GGGGCGCAAGGTCTCGATTTCTCCGTCAACGTCGTCACATTACGTTGGGCTGAGCTTCAG
TCTGGTCCTCTTAAGCTAGCTCTTATGCAATCTCCCAGCGACCATGTGGTGAGTGAGAAG
GGGTACTCTTCGTTACTATCGTTCACTGTGACAGACATTAATACATCAATCTCTAAACTT
ATGGAGTTAGGAGCGGAGCTCGATGGCTCTATTAAATACGAAGTCCATGGCAAGGTTGCA
TCTGTGAGATGTCTCGACGGTCATGTGCTCGGCCTCTATGAACCTTCTTAGGTTTTTATC
AGTTCGTGAGTGTACTTTGTTACGGGTAATTCCTATTGGACCGCCGATCAATAAACTAGA
TGGCTGATATGTACTAGTAGCCCAGCAAAAATCAAAGTAGTGCATTTCTTATTTTGAAAT
ATG

QA 1 423 1 423
DS 



AS 1 2

CO CL6324Contig1 1006 2 4 U
GGAAACGCATACTGCAACGGAAAGAAAGAAAAAAAGAAGCGTTTGAGTGCGGAGGGAGGG
AGCTAATCAAATCCCTAAACCCGAAATATAACCTAAGAGAGATCTTTTTGATCAAACGAA
GATCAGAAACGGTAGGAAAGAAGAAGACGAAGATGTTACCCACAACTTCCAGATCTCGCT
CTTCTTCTTCGTCATCCCGAGCTAACCCAATGTTCCTTCAGTATTTTCGTCGCATCGTCA
AGGTTCTTTTTCAATCGTGATCTCAGATATCGATCGATTTCAACATATATTACTGTTGAA
GTGGTAGATTGCTTGCTGGAAATTATGTTGGTGTGTGATATGATTAAGCTATTATATAAT
TTGGAGGATGTGAATAATCTTTAGAGGAATTGTGTATGTGGTGTGGTTATACACTGTGAG
ATCATGCTCGAGTTTGTGATAATAGTTTCTCCATTGCAGTGGCAACAAATGGATATTGAA
TATACTTTCTGGCAAATGCTTAACCTTTGTACATCTCCCAAAGTTGTGTAAGTCTTTTCA
TTTCGGTTCCTTTTTCTAAGCCACTTTTTTGAGGACATGTTTCTGTATATATGTTGGGGA
TGGATTTACATCCTTCCTCAAGGTCCATTAGACAATGAACCAAGCTCATTTCACTAGAAT
ACCCTAGACATCTTTTTTCTATATATAAGGAATCACTTCCTTCTCAGAGGACCTCTTCCA
CATTTTTAGACCTAGAACACTTCTTGTAGAGATCCATAGATTCACTTTACATTTCATATC
ATTTTGTAATGAATCTATGATCAATAAAATCTATTTGATGTTCTATTTCTATTTGATTTC
TTTGTTGATTTCTCTTAAGCCTCAAGGATTTAAGAATCTAATTCTTAAATCTTTTATTGT
TATGATTCTACAAATACACCATTTTTGGATCAAACAGTTGGCGCTAGAAGGAGAGGGCCA
AAGAGAACAATCTTCAAAGCATATCAAATTTGAGAGGCTCAAGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DQ04TF U 1
AF RS1DQ04JQ C 250
BS 1 622 RS1DQ04TF
BS 623 623 RS1DQ04JQ
BS 624 677 RS1DQ04TF
BS 678 1006 RS1DQ04JQ

RD RS1DQ04TF 677 0 0
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CTTCTTCTTCGTCATCCCGAGCTAACCCAATGTTCCTTCAGTATTTTCGTCGCATCGTCA
AGGTTCTTTTTCAATCGTGATCTCAGATATCGATCGATTTCAACATATATTACTGTTGAA
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TTGGAGGATGTGAATAATCTTTAGAGGAATTGTGTATGTGGTGTGGTTATACACTGTGAG
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TGGATTTACATCCTTCCTCAAG*TCCATTAGACAATGAACCAAGCTCATTTCACTAGAAT
ACCCTAGACATCTTTTT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RS1DQ04JQ 757 0 0
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GTGAATAATCTTTAGAGGAATTGTGTATGTGGTGTGGTTATACACTGTGAGATCATGCTC
GAGTTTGTGATAATAGTTTCTCCATTGCAGTGGCAACAAATGGATATTGAATATACTTTC
TGGCAAATGCTTAACCTTTGTACATCTCCCAAAGTTGTGTAAGTCTTTTCATTTCGGTTC
CTTTTTTTAAGCCACTTTTTTGAGGACATGTTTCTGTATATATGTTGGGGATGGATTTAC
ATCCTTCCTCAAGGTCCATTAGACAATGAACCAAGCTCATTTCACTAGAATACCCTAGAC
ATCTTTTTTCTATATATAAGGAATCACTTCCTTCTCAGAGGACCTCTTCCACATTTTTAG
ACCTAGAACACTTCTTGTAGAGATCCATAGATTCACTTTACATTTCATATCATTTTGTAA
TGAATCTATGATCAATAAAATCTATTTGATGTTCTATTTCTATTTGATTTCTTTGTTGAT
TTCTCTTAAGCCTCAAGGATTTAAGAATCTAATTCTTAAATCTTTTATTGTTATGATTCT
ACAAATACACCATTTTTGGATCAAACAGTTGGCGCTAGAAGGAGAGGGCCAAAGAGAACA
ATCTTCAAAGCATATCAAATTTGAGAGGCTCAAGATC

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1B117JQ C 1
AF RS1B117TF U 282
BS 1 281 RS1B117JQ
BS 282 658 RS1B117TF
BS 659 659 RS1B117JQ
BS 660 702 RS1B117TF
BS 703 714 RS1B117JQ

RD RS1B117JQ 714 0 0
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TGTGGACCGGCTGTCTTTGTATGTCCTTTTGACGAGGCGTTTTTGGTTCTTAGCTGATTG
GTTTGGGTTGTGGTCACTCGGGTCCTCTGGTTCTTTCTCCTAGAAGCTCTGTTTTGATTT
TGTATATTCTCTCTCTCGAAGATGCCTGAGTGGTCTTGTAATTGACGCTCTTGAGATTTC
TCACCTCAATCGACAGTTTTTTCGGTTCGTCTCTTACAGATCCCCTACCAGTCTACCTTG
ATCTGTTGTAACCGGTTCGGGAATCTTACTGCCGCTTTTCTTTTGGATGGCTCAATAATG
TCTACGGCTGTTCTGTTAAAGCGGGTTTTGATTGCTCTGGAGGGAACTCACGGCTTCGAC
AGCCCAATGACATGCTGTGGCGAGGGTGAAGGGAGAAGTCCGGTTTCAATCGTACTTATC
TTACCTTTTGTAGTTCCTGTTAAGCTTTCAGCTATTTTGATCCTTTATGTTTAACTTACC
AGTTTTGATTCGTTCTTGTGTGGTGTTTGTGATTATCGTTTTTAAATTATCTCCCATGTG
TGGGCTTTAGACTCCGGATACATTCATGTCGTCTGCCGGCTTAAGATTCACGGAGTTTTA
TAAACCGCCGTCTTTGTTTGTATGTTTCAGTTTCTAATCAAAATCTTTCCAAGG

QA 1 714 1 714
DS 

RD RS1B117TF 427 0 0
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TTTGGATGGCTCAATAATGTCTACGGCTGTTCTGTTAAAGCGGGTTTTGATTGCTCTGGA
GGGAACTCACGGCTTCGACAGCCCAATGACATGCTGTGGCGAGGGTGAAGGGAGAAGTCC
GGTTTCAATCGTACTTATCTTACCTTTTGTAGTTCCTGTTAAGCTTTCAGCTATTTTGAT
CCTTTATGTTTAACTTACCAGTTTTGATTCGTTCTTGTGTGGTGTTTGTGATTATCGTTT
TTAAATTATCTCCCATGTGTGGGCTTTAGACTCCGGATACATTCATGTCGTCTGCCGGCT
TAAGATTCACGGAGTTT*ATAAACCGCCGTCTTTGTTTGTATGTTTCAGTTTCTAATCAA
A
TCTTTC

QA 1 421 1 421
DS 



AS 1 2

CO CL6326Contig1 1433 2 2 U
GGATAATAACCGGATATTCAACCGGCGGCGCAGTGGCCGCACTCACCACACTTTGGCTCC
TCCACTACCTTCGCCTCCGTCACTCCCCCTCCTCTGCATCACCTTCGGATCTCCTTTGCT
AGGAAACCAATCTCTCTCTTCCTCAGTCTCCCGATCACATGCAGCCCAAAACTTCTGCCA
CGTGGTTTCCATCCACGACCTCGTTCCAAGAAGAAACGATGATCAACTCTGGCCCTTTGG
AACATATCTTTCTGTTCCGACTGTGGAGGTCTTTGCTTAGAAAATGCTGCTTCAGTTCGT
AGGATGTTTCATATACTCAACTCAACAGGAACTCCAAACCTTGAGGAACGCCAAAGGTAC
GAAAATTACGTGTCTACACTCTCTCACCAGTTTCTAATATCTAGAAGCTCTCGTAGTGAG
AATATCTCAGACAATAGCTACGAAGCTGGTGTCGCATTAGCCGTGGAATCTCTTGGATTC
TCTGATGGTCACCCAAGTGGTATATCAGCAAAAGAATGCATAGAAACAGCTACAAAAATG
AGTCGTGCTCCGATTGAGAGAGCGAGTGAGTTAGCTATTGAGCTTGGTGATGTCTTGCCA
TCAAGACTAGAGATTCAATGGTACAAAGACAGTTGCGACGCGTCACCAAAGAAGCTTGGT
TACTACGATAACTTCAAACTATACTCAAATCAAAGAAAGTTAAAGGTGAACATGAGCCGT
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TCTGATTTTGATTTCGAATTGAAATGGCTATTTGCATCACAGTTTTACCAGCTCTTAGCC
GAACCACTGGATATTGCTTACTTCTATAAGTACAAATATTCAAAGACTGGTAGTGGTCAT
TACATGGAGAATGGGAATAGACCCAAAAGGTATTTACTGTTGGATAAGTGGTGGAAAGAA
AGAGGAGAGTGTCATAGAGTGAAGACTGCGAGAACTCGGTATGCTAGCACTACTCAGGAT
ACTTGCTTTTGGGCTAAGCTTGAGGAGGCAAAAGATTGGTTGGATGATGTGAGAAGCAAA
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GCTGATACATTGGTGAAGATGAAGGACGTTTCCCCTGATGTTCTTGCGGATAACTCGAGT
TACCGAGTGTGGGTGAAGAAGCTGGGAGAGTTCAAAATGGATAATGGAATTGGAATGGTT
GTTGATGATGAGAGTGACGCAATGGAGACTTAATTAGCAAGCTTAATAGCAATCTAATTT
ATAACGATCTCTATCGAATGTTGTTCATCATGTTTTATGTAATACGTTCTGATGTATGCT
ACTATTCTGAAATAATCTTTATCGTTTATGTTCAATAAGTTTATGCAATTGAG


BQ
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CTGAAATAATCTTTATCGTTTATGTTCAATAAGTTTATGCAATTGAG

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DS 



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CAGATATGGATCTATGGAAACAGCTTCGAGTCTTTTTTGGTAGCAGTGGTTGTACCCGAG
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GAATCCTCTTATTATCAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DH87TF U 1
AF RS1DH87JQ C 183
BS 1 602 RS1DH87TF
BS 603 978 RS1DH87JQ

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AGCTCATATGTTGTTATCAGGTGCAGCACCTTTACCTCGTCACGTAGAGGAGTTCTTGAG
AATCATCCCTGCCTCTAATCTCTCTCAAGGTTATGGGTTGACTGAGAGCTGTGGAGGGAG
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GGTGGAGGCAAGGCTAGTTTCTGTACCGGAGATGGGCTATGAAGCTTTTTCCGGGGATGT
GGCTAGAGGAGAGATTTGTCTTAGAGGAAACTCAATGTTCTCTGGTTACCACAAAAGACA
AGACCTAACTGATCAAGTCGTGATCAATGGATGGTTCCACACAGGAGATATTGGGGAATG
GCAAGAAGATGGATCGATGAAGATCATAGATAGGAAGAAGAACATCTTCAAGTTGTCCAA
GGTGAATATGTTGCTGTCGAAAACCTCGAGAACACTTACTCAAGATGCCCTCTCATTGCT
CAGATATGGATCTATGGAAACAGCTTCGAGTCTTTTTTGGTAGCAGTGGTTGTACCCGAG
AG

QA 1 602 1 602
DS 

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TCACGACTTTAGCAGGAGTATTTTCTATGGTGGGGACAGTGGGTGTGCCAATGCCTACGG
TGGAGGCAAGGCTAGTTTCTGTACCGGAGATGGGCTATGAAGCTTTTTCCGGGGATGTGG
CTAGAGGAGAGATTTGTCTTAGAGGAAACTCAATGTTCTCTGGTTACCACAAAAGACAAG
ACCTAACTGATCAAGTCGTGATCAATGGATGGTTCCACACAGGAGATATTGGGGAATGGC
AAGAAGATGGATCGATGAAGATCATAGATAGGAAGAAGAACATCTTCAAGTTGTCCAAGG
TGAATATGTTGCTGTCGAAAACCTCGAGAACACTTACTCAAGATGCCCTCTCATTGCTCA
GATATGGATCTATGGAAACAGCTTCGAGTCTTTTTTGGTAGCAGTGGTTGTACCCGAGAG
AAAGGTTATTGAAGATTGGGCTAAACTTAATAACCAAACATCTCCCAATGATTTTGAATC
TTTATGTCAAAATCTCAAAGCTCAAAAATACTTCTTGGATGAGCTTAACTCTACCGCAAA
GCAATACCAACTTAAAGGGTTTGAAATGTTAAAAGCGGTTCATTTGGAACCAAACCTTTT
CGATATTGAAAGAGATCTTATAACTCCAACATTCAAGTTGAAAAGGCCACAGCTCCTCAA
ACATTACAAGGACATAATTGATCAACTTTACACTGAAGCAAATGCGTCCAGAGCATAGAA
CCGAGTGGCTATTCATTTTCCTATGTTCTTTTAGTTGTGATATGTCAAGATTGTATTCGA
ATCCTCTTATTATCAT

QA 1 796 1 796
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6329Contig1 1071 2 2 U
GATCTGTCAAGTGCCGGTTCTTGATCCAATGGTGACTGAGCAGTTTTTAAACGATGTCGT
TGAGCCAAAGATCGAGTTTCCTTTGATGAGAATAGATGACCAGGAGGACGAAGACAACGC
TGAAAGTTGTCCGAATGGTTTTTTCCCGACCGACATGGAGCTTGAGGAGTTTGCTGCTGA
CGTGGAGACTCTACTCGGCCACGGATTAGACGTCACAGAGTCTTATGCTATGGAGGGGCT
AGGGTTGTCTAATACAGAGATGTTCAAAATCGAAAAAGACGAGATAGAAGAAGATGAAGG
AGAAGAAACAAAAGCCATGAACATGGGAATAGGCTGCGGTGAGGATCGGGACGATGGGGA
TGGAACTGTGGCGTTTGAGCTGAGGTTTGATCACGAGTCACACAACACATACGAAGAAGA
GGCAATAAAGAATGTTGAATGTATTAAAGTGAAGGAGGAAGAGCAAAAGAATGTTCTAAT
GCTGAGCTTAAACTATGACTCGGTGATATCCACATGGGGAGGCCAAGGTCCACCGTGGAC
ATCGGGAGAGCCACCAGAACGAGACATAGACATCAGTGACAAGCCAGTTGTTTCCATGGA
AATAAATGGAGGAGAAAGTCATCATAAGCATTACGTTGGTGGATGTTTACCATCAACTGG
GTTTGGGGATGGAGGAAGAGAGGCTAGGGTTTCCAGGTACAGAGAGAAGAGGAGGACGAG
ATTGTTCTCGAAGAAGATAAGGTACGAGGTACGTAAACTGAATGCAGAGAAACGACCTCG
AATGAAAGGGAGATTCGTTAAGAGAGCTTCACTTGCTTTTTTTGCTGCAAATTCACCATT
AGGTGTGAATTACTGAATATCCTAGCTATTTGCCGGCTATATCTCACTTTACCTTTTAAA
TTGAACGTTTTTGTTGAACTTTTTTTTTTTGAACGCCAGGAGTTTTTTTTTTGCACTTAA
TTGTGCTTTGTGGGCTTGGTATGTGCATAGAAAAGCCAATAATGTGACTTGTATGGATTA
AGCTGATGTATATATTATTTGGTAATAAGAATGTGACAAGGCACTTTGACG


BQ
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AF RS1FH34TF U 1
AF RS1FH34JQ C 509
BS 1 759 RS1FH34TF
BS 760 1071 RS1FH34JQ

RD RS1FH34TF 759 0 0
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TGAGCCAAAGATCGAGTTTCCTTTGATGAGAATAGATGACCAGGAGGACGAAGACAACGC
TGAAAGTTGTCCGAATGGTTTTTTCCCGACCGACATGGAGCTTGAGGAGTTTGCTGCTGA
CGTGGAGACTCTACTCGGCCACGGATTAGACGTCACAGAGTCTTATGCTATGGAGGGGCT
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TGGAACTGTGGCGTTTGAGCTGAGGTTTGATCACGAGTCACACAACACATACGAAGAAGA
GGCAATAAAGAATGTTGAATGTATTAAAGTGAAGGAGGAAGAGCAAAAGAATGTTCTAAT
GCTGAGCTTAAACTATGACTCGGTGATATCCACATGGGGAGGCCAAGGTCCACCGTGGAC
ATCGGGAGAGCCACCAGAACGAGACATAGACATCAGTGACAAGCCAGTTGTTTCCATGGA
AATAAATGGAGGAGAAAGTCATCATAAGCATTACGTTGGTGGATGTTTACCATCAACTGG
GTTTGGGGATGGAGGAAGAGAGGCTAGGGTTTCCAGGTACAGAGAGAAGAGGAGGACGAG
ATTGTTCTCGAAGAAGATAAGGTACGAGGTACGTAAACT

QA 1 759 1 759
DS 

RD RS1FH34JQ 563 0 0
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GACATCAGTGACAAGCCAGTTGTTTCCATGGAAATAAATGGAGGAGAAAGTCATCATAAG
CATTACGTTGGTGGATGTTTACCATCAACTGGGTTTGGGGATGGAGGAAGAGAGGCTAGG
GTTTCCAGGTACAGAGAGAAGAGGAGGACGAGATTGTTTTCGAAGAAGATAAGGTACGAG
GTACGTAAACTGAATGCAGAGAAACGACCTCGAATGAAAGGGAGATTCGTTAAGAGAGCT
TCACTTGCTTTTTTTGCTGCAAATTCACCATTAGGTGTGAATTACTGAATATCCTAGCTA
TTTGCCGGCTATATCTCACTTTACCTTTTAAATTGAACGTTTTTGTTGAACTTTTTTTTT
TTGAACGCCAGGAGTTTTTTTTTTGCACTTAATTGTGCTTTGTGGGCTTGGTATGTGCAT
AGAAAAGCCAATAATGTGACTTGTATGGATTAAGCTGATGTATATATTATTTGGTAATAA
GAATGTGACAAGGCACTTTGACG

QA 1 563 1 563
DS 



AS 1 2

CO CL6330Contig1 1047 2 4 U
GCAGAAGACTTCCGAGAAAGTCTTCTAATATATTTTGTGCTAGAAGACTCCTCTGGAAAA
ATTCCGAAGAAATCTGCAAATACATTTTATGCTAGAAGACTTTCTTAGAAGATATTTCAT
GAAGTTTTCTAATGCATATTATGGTAGAATACTTCCATGGATTTTAATGTATTTTATGTT
AAAAGGCTTCTCTGCAAGAATTCCCTGGAAAGTCTTCTGAATAAAAAATGTCTCATTTAA
TTCAAATTTCACTCTTTAGATAAAGAAAATCTACACATTTTCTTTCTTTCTATTAAGTGG
CTGCAACAAAAATGTAATGTTTCTCACTCTAAAACTCTTCAACCTCTCTTTAATATCTTT
GAACTTGAAAAATCAAATTTATATCAGTTTCTCATTTTTTCTTATGTCGATCTAACTAAT
TTATCTTATTTCGGAAATTTTCTTTACATGTTCTCATTTTCTCTCCTTTAAAGATAGATC
TATAAATTTCGAATATGTATTTTTGGTGTATTTTATATGTTAGATCCTAAAAATTTGTAT
ATTCAACCTAATGTAATTTTTTATTTATTATTTAAGCACATAAAATTATTTGGATTTTTT
TTTTGATACTATTTAACGTTATTGAATATAGAGGTTTTCTTAGATCTGAATCAGATTTTG
AAAGATTTCTGAGAAGACTTATTGAAAACTTCCTCGAAAATCTCCTAATATATTTTATGT
TAGAAGACTTCCATGTAAAAAATTGTCATGAAATATTTTAATGCATTTTTATGCTGGAAG
TCTTTTAATGCATTTTATTCTAAAAGACTTCTATGTAAGATATTACTTGAAGTATTTTAA
TGCATTTTGTGCTAGAAGGAAGTTTACTGAACCAAAAATATCTCACTTAAATGGAGTCCA
AGCTTGTCTATGTCAATGAATGGTCTCAAACTCCATTTGTAATAGTTTTGTTTATGGTAT
GTTTCATGATTCTAATGTGTATTTTTTTAGCTGTGAATTGTTTTGTAAAATACTTGACAT
TATTAAAATTATTGATACTACATAGCG


BQ
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AF RS1EJ63TF U 1
AF RS1EJ63JQ C 465
BS 1 699 RS1EJ63TF
BS 700 700 RS1EJ63JQ
BS 701 715 RS1EJ63TF
BS 716 1047 RS1EJ63JQ

RD RS1EJ63TF 719 0 0
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ATTCCGAAGAAATCTGCAAATACATTTTATGCTAGAAGACTTTCTTAGAAGATATTTCAT
GAAGTTTTCTAATGCATATTATGGTAGAATACTTCCATGGATTTTAATGTATTTTATGTT
AAAAGGCTTCTCTGCAAGAATTCCCTGGAAAGTCTTCTGAATAAAAAATGTCTCATTTAA
TTCAAATTTCACTCTTTAGATAAAGAAAATCTACACATTTTCTTTCTTTCTATTAAGTGG
CTGCAACAAAAATGTAATGTTTCTCACTCTAAAACTCTTCAACCTCTCTTTAATATCTTT
GAACTTGAAAAATCAAATTTATATCAGTTTCTCATTTTTTCTTATGTCGATCTAACTAAT
TTATCTTATTTCGGAAATTTTCTTTACATGTTCTCATTTTCTCTCCTTTAAAGATAGATC
TATAAATTTCGAATATGTATTTTTGGTGTATTTTATATGTTAGATCCTAAAAATTTGTAT
ATTCAACCTAATGTAATTTTTTATTTATTATTTAAGCACATAAAATTATTTGGATTTTTT
TTTTGATACTATTTAACGTTATTGAATATAGAGGTTTTCTTAGATCTGAATCAGATTTTG
AAAGATTTCTGAGAAGACTTATTGAAAACTTCCTCGAAA*TCTCCTAATATATTT
ATGT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1EJ63JQ 583 0 0
CCTTTAAAGATAGATCTATAAATTTCGAATATGTATTTTTGGTGTATTTTATATGTTAGA
TCCTAAAAATTTGTATATTCAACCTAATGTAATTTTTTATTTATTATTTAAGCACATAAA
ATTATTTGGATTTTTTTTTTGATACTATTTAACGTTATTGAATATAGAGGTTTTCTTAGA
TCTGAATCAGATTTTGAAAGATTTCTGAGAAGACTTATTGAAAACTTCCTCGAAAATCTC
CTAATATATTTTATGTTAGAAGACTTCCATGTAAAAAATTGTCATGAAATATTTTAATGC
ATTTTTATGCTGGAAGTCTTTTAATGCATTTTATTCTAAAAGACTTCTATGTAAGATATT
ACTTGAAGTATTTTAATGCATTTTGTGCTAGAAGGAAGTTTACTGAACCAAAAATATCTC
ACTTAAATGGAGTCCAAGCTTGTCTATGTCAATGAATGGTCTCAAACTCCATTTGTAATA
GTTTTGTTTATGGTATGTTTCATGATTCTAATGTGTATTTTTTTAGCTGTGAATTGTTTT
GTAAAATACTTGACATTATTAAAATTATTGATACTACATAGCG

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 2

CO CL6331Contig1 1056 2 6 U
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AGTCTGATGTCCGTAAAGCGTTAGAAGACTACGGCTGTTTCCAAGCTTTCGTTGACAAAG
AGTCAAACATAGACCTTGACAAGTCTGTTTTTGAAGCCATGGAAGGGATATTCGATTTGC
CGGTTCAGACCAAACAGAGAAACGTGTCGCCTAAACCGTTTCATGGGTATTTAAGTCACA
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CGAAGCAGTTAGTGGAGTTGGATGTGATGGTGAGAAGAATGATAATGGAGAGTTTTGGAG
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AGGACGAAAAATGGATCAAAGTGAAGCCATCTCAACATTCTTTCATTATCATGGTTGGAG
ATTCTCTCTGTGCACTTTTGAATGGTAGATTGTATTCTCCATATCACAGAGTCTTGATGA
TGGCCAACAAAACAAGGTATTCGACAGCAATGTTCTCTATTCCAAATCCAGGAGTTATCA
TAGATTCACCTGAAGAACTTGTCGACGAAGAACATCCTCGTATGTTCAAACCCTTTGAGT
ATATTGATTTCCTCAACTTCTTTCACTCGGAAGCTGGTCGTAGAGTTGAATCTACTCTCC
ATGCTTTTTGTGCTCTCTGAAACATTTAAACTTTTATTCACAATAATTAATGTAATGACT
TCAAATTTTATGGTATAAGTTTTGCCCCTTTTTCCT


BQ
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AF RS1DY33TF U 1
AF RS1DY33JQ C 281
BS 1 662 RS1DY33TF
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RD RS1DY33TF 709 0 0
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CAGTCATCAATTTCTCCGATCAGAACTTAACACCAGGAACCTCAAAGTGGGATGAAGTGA
AGTCTGATGTCCGTAAAGCGTTAGAAGACTACGGCTGTTTCCAAGCTTTCGTTGACAAAG
AGTCAAACATAGACCTTGACAAGTCTGTTTTTGAAGCCATGGAAGGGATATTCGATTTGC
CGGTTCAGACCAAACAGAGAAACGTGTCGCCTAAACCGTTTCATGGGTATTTAAGTCACA
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CGAAGCAGTTAGTGGAGTTGGATGTGATGGTGAGAAGAATGATAATGGAGAGTTTTGGAG
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ACACAGCACCTCCTGATGACGATGTAGAAGAGACAAAGTTAGATTTACGTTCTCATACCG
ACAAGAACATCATCACCATACTTCATCAGTATGAAGTTGATGGTTTGGAAATTAAGACCA
AG*ACGAAAAATGGATCAAAGTGAAGCCATCTCA*CATTCTTTCATTAT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1DY33JQ 776 0 0
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GATAATGGAGAGTTTTGGAGTAGATAAGAACATTGACGAACATCTGAACTCTACAAACTA
TCTTTTCCGAATGATGAAGTACACAGCACCTCCTGATGACGATGTAGAAGAGACAAAGTT
AGATTTACGTTCTCATACCGACAAGAACATCATCACCATACTTCATCAGTATGAAGTTGA
TGGTTTGGAAATTAAGACCAAGGACGAAAAATGGATCAAAGTGAAGCCATCTCAACATTC
TTTCATTATCATGGTTGGAGATTCTCTCTGTGCACTTTTGAATGGTAGATTGTATTCTCC
ATATCACAGAGTCTTGATGATGGCCAACAAAACAAGGTATTCGACAGCAATGTTCTCTAT
TCCAAATCCAGGAGTTATCATAGATTCACCTGAAGAACTTGTCGACGAAGAACATCCTCG
TATGTTCAAACCCTTTGAGTATATTGATTTCCTCAACTTCTTTCACTCGGAAGCTGGTCG
TAGAGTTGAATCTACTCTCCATGCTTTTTGTGCTCTCTGAAACATTTAAACTTTTATTCA
CAATAATTAATGTAATGACTTCAAATTTTATGGTATAAGTTTTGCCCCTTTTTCCT

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

CO CL6332Contig1 784 2 1 U
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ATGTCTTCAGCCACTGGATGAAAAATGCCTTGTCAGGCAAGAGGGTTGGTGGTCGTATGA
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AGAGTTTTCCTTGGGTAAGTATGACGCAGAGGCAACTGCTGCATTTAATCAAAATGTGTC
TGATGTTTCTACAATGAAAGAGAGGTATCACTCTCATATATACACCAATGGGACCACCTG
TGATCTTACAGGAACTCCTCGTGAAGTTGAGGTGAGGTTTGTCTGCGCTGAAACGAGGGC
AATGGTCACATCGATCACTGAGCTATCTACTCGCAAGTACGCACTTACTGTTCAGTGCCC
GACCTTGTGCAAGCATCCGCTGTTTCAGCTAGAGAAACCAGTGTGCACACGATCCACTGC
AGTTTGATCCCGTTGGAAGAAGACGCAACAAGAAACGAGGAAGTAGTAGGCGAATCACCT
AATGATATTGATTCTTGAAAACCGCTTAACTGAAACACAGGAGTAACACAGTTAAACAGT
GACTGTATATAGAAGAGCTAGTACATCTCCAGTGTCGGTATTATGACTCGCTGAAGTGTT
CTTGGTAAGTACCGGTTTAGCTTACTGTTGGAATGATTATACTCTCTTTGTAGCCTTTAG
TTTGTTCAGTTTGAAGTTTGGAACCGGTGTCTTCTGTGAACTGATATGGATCACATGTTC
GTCT


BQ
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10 10 10 10 

AF RS1G519TF U 1
AF RS1FV41TF U 1
BS 1 784 RS1FV41TF

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QA 1 392 1 392
DS 

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TGATGTTTCTACAATGAAAGAGAGGTATCACTCTCATATATACACCAATGGGACCACCTG
TGATCTTACAGGAACTCCTCGTGAAGTTGAGGTGAGGTTTGTCTGCGCTGAAACGAGGGC
AATGGTCACATCGATCACTGAGCTATCTACTCGCAAGTACGCACTTACTGTTCAGTGCCC
GACCTTGTGCAAGCATCCGCTGTTTCAGCTAGAGAAACCAGTGTGCACACGATCCACTGC
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CTTGGTAAGTACCGGTTTAGCTTACTGTTGGAATGATTATACTCTCTTTGTAGCCTTTAG
TTTGTTCAGTTTGAAGTTTGGAACCGGTGTCTTCTGTGAACTGATATGGATCACATGTTC
GTCT

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1A641TF C 1
AF RS1A641JQ U 479
BS 1 478 RS1A641TF
BS 479 726 RS1A641JQ
BS 727 760 RS1A641TF

RD RS1A641TF 760 0 0
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CAAAATGGATAGAGGATAATACAACCAAGTTTCTTCAAAACCCCACTTAGTGATGATTGT
AAGAATAATATAATGTTGAGACATGAAAGGCCGAAGATCGGTGGCATAAGATTAACGAAG
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TGACGCTGCTGCTGCGGTGATAATGATCGGCGGTCTCGGTTTATTATGAACGCATTCGTT
ACAAACTAGCGGCTGCGGTGGTGGAAGCGGTAGTGGGCAGTGCGTACACGGCGGTGGTGG
TGATGGAGGTGGCGGAGGAGGAGAAGGCGGTGGTGGTGAGGGTGGTGGAGGACAGAGAAT
CTCTAGTGGAGGCGGTGGAGGTGGTGGAAGAGGTGGAGGACAGAGAATCTCTATCGGCGG
AGGTGGTGGAAGAGGTGGAGGACAGAGTATCTCTTGCGGAGGTGGTGGAGGTGGTGTCTG
ATCACATGGATTCTCACATTCTAAGCACATTTCACATGCAGTCTGCATTTCCTCTGTCAT
ATTCAATGCAACAGACTGTGATATCAAAAGCAGAGTGAAGAAACAGAGTAACTCCATTCT
TAGGGAGGAAGAGAGCATTTTTCTTTTTCTTTTACAGTCC

QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1A641JQ 248 0 0
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GGAGGTGGTGGAAGAGGTGGAGGACAGAGTATCTCTTGCGGAGGTGGTGGAGGTGGTGTC
TGATCACATGGATTCTCACATTCTAAGCACATTTCACATGCAGTCTGCATTTCCTCTGTC
ATATTCAATGCAACAGACTGTGATATCAAAAGCAGAGTGAAGAAACAGAGTAACTCCATT
CTTAGGGA

QA 1 248 1 248
DS 



AS 1 2

CO CL6334Contig1 815 2 8 U
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AGGCCGAGATTGAGGAAACTCAGAATGAAGTAAATGGTGGTACTGTGAGTCAATCTCTGA
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TTCCCTCCACATAGCATAACAAAGTTCACCATGAAAGTGGAAGAGACTCACTTTTAAACG
CCTCTTGTGTTGTGCCAATGCCTTTTTCCCTCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1E865TF U 1
AF RS1E865JQ C 327
BS 1 645 RS1E865TF
BS 646 646 RS1E865JQ
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BS 718 718 RS1E865JQ
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CGTCGTAGCTGCTCATGTGTAGAAGAGGAAGATGAGGAGAGGAGATCCAATGCGTCATTG
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GAGACT

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CTAGCTGCTGCTCACAAGCACTGTGCTGAGACTTGGTTCAAGCTCAAAGGAAACAAAATA
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GAAGTAAATGGTGGTACTGTGAGTCAATCTCTGAGAATGTCTAATCCTCCGTTGGTGGAA
GCTAGAAGCTTCTGGCAAGGTCACCGGTTCTTGAATTTCCTTTTAGCTTGTATGGTCTTT
GCCTTTGTGATTTCGTGGCTCTTCCATTTCAATGTTCCCTCCACATAGCATAACAAAGTT
CACCATGAAAGTGGAAGAGACTCACTTTTAAACGCCTCTTGTGTTGTGCCAATGCCTTTT
TCCCTCACT

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DS 



AS 1 2

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GAGGCGGAAGGGATTGATCCGCCTCACGATCTTGTGAACTCGGCCAAGGATTTAGCTGAT
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AAAGTCGCGTTGCAGTTCTTGGAGAGCTGTGCTCGTGGTGATTATGGTGCTTCTGCTTCT
CCTCCTAAGCAGGTATGGGTGTTAGACTCTGTCCCTGGGGAAGTCAAGGCTGAACACAGT
GATGGCGAAGTTGAGAAAGTTCTCAAGACGTTGCAGAGTTTGCCTTCACCAATCCCTTCA
CGCAAGTGGCTCGTGGATCATATGGTGGAGCTTGGGTTTTCAAGATCGTTATCTGAGTGG
ATCGGCAGTAATCTCAAGAGATCAGGAGACTCAGAGACATGGGCCTTTAACCTCGAGGGA
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GCCACTCATGTTTTACGTAACTCTGGTCATTGGGTCCACACAGACAATCCCAAGGGACTG
CTAGAGATTGTGAGTGCCAACTTTTTGTCCACGCACAAGTAGACCCTATGAAAATTGCCT
CAGTCTTTGGTTTGTTTATCTCTCTTCTTCTGTATTTAGATGCAGAAATAGCAAATTCAG
TCTCGTTACTATTTACAAAATGATTTGCGCTTCATTTTCGTCTATTTGTTATTCTATGCA
ATTGTGTTTATTGTTACAGTATGGATTGTATCTGATCCCTCTTATTTAGAGATGTGGTTT
TGTTACATGATATGAATGTAACATGAAGTGTGAATCAAGTCCATGCAAGCTCTTTTTTTT
TT


BQ
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10 10 

AF RS1FR71TF U 1
AF RS1FR71JQ C 434
BS 1 685 RS1FR71TF
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RD RS1FR71TF 777 0 0
GGGGGAGAGAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGCGATGGCGACGAGAACTCTAAGGAACCGA
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GTCCTCCACGGCCTCCTCGGCTCGGGACGTAACTGGCGATCGTTTTCCCGCTCTCTCGCA
TCGTCTCTCTCCGATTGGAAGATGATGCTCGTCGATCTGAGGAACCACAGGAGATCGACG
GAGGCGGAAGGGATTGATCCGCCTCACGATCTTGTGAACTCGGCCAAGGATTTAGCTGAT
TTGGTGAAGGCGAGTGGGTGGAACTGGCCTGATGTGGTGATTGGTCATTCTCTAGGAGGT
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CCTCCTAAGCAGGTATGGGTGTTAGACTCTGTCCCTGGGGAAGTCAAGGCTGAACACAGT
GATGGCGAAGTTGAGAAAGTTCTCAAGACGTTGCAGAGTTTGCCTTCACCAATCCCTTCA
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GCTGTTCAGATGTTCAACTCTTATAGAGAGACTTCGTATTGGTCTTTGCTAGAGAAT

QA 1 777 1 777
DS 

RD RS1FR71JQ 829 0 0
TGCAGTCT
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TATAGAGAGACTTCGTATTGGTCTTTGCTAGAGAATCCGCCAAAAGGGACCGAGATTTTT
TTTGTGATTGCTGAGAAGAGTGACAGATGGGACCATGATACAACCACGAGGCTCGAAAGA
ATTGCTAAACAGAGACAGAATGTATCAGAAGGGAAGGTGGCCACTCATGTTTTACGTAAC
TCTGGTCATTGGGTCCACACAGACAATCCCAAGGGACTGCTAGAGATTGTGAGTGCCAAC
TTTTTGTCCACGCACAAGTAGACCCTATGAAAATTGCCTCAGTCTTTGGTTTGTTTATCT
CTCTTCTTCTGTATTTAGATGCAGAAATAGCAAATTCAGTCTCGTTACTATTTACAAAAT
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TGGATTGTATCTGATCCCTCTTATTTAGAGATGTGGTTTTGTTACATGATATGAATGTAA
CATGAAGTGTGAATCAAGTCCATGCAAGCTCTTTTTTTTTT

QA 9 829 9 829
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6337Contig1 843 2 4 U
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CCGTACCTAAATCCACCGCGAGATTCGTCTGCTCCGATGACAAATCCGCAACGCCGCAGC
AACAGCAGTCCATGAAGGCTTTCTCCGCGGCCGTAGCTCTCTCTTCCATCCTCCTCTCAG
CTCCGATGCCAGCCGCCGCTGATATCTCGGGCTTAACCCCTTGCAAGGAGTCGAAACAGT
TCGCCAAGAGGGAGAAGCAACAGATCAAGAAGCTCGAATCATCTCTTAAGCTCTACGCTC
CTGAGAGCGCCCCTGCTCTTGCTCTTAACGCTCAGATCGAGAAGACCAAGCGCAGGTTTG
ACAACTACGGCAAGTACGGGCTCCTCTGCGGGGCAGACGGGCTACCACACTTCATAGTCA
ACGGAGACCAGCGGCATTGGGGGGAGTTCATAACTCCAGGACTTCTCTTCCTCTACATTG
CTGGATGGATCGGGTGGGTCGGAAGAAGCTACTTGATAGCGATCAGTGATGAGAAGAAAC
CAGCGATGAAAGAGATCATTATCGATGTTCCATTGGCTAGTCGTCTCATCTTCCGGGGTT
TCATTTGGCCCGTTGCTGCTTACAGAGCTTTACTCAATGGTGATCTCATCGCCAAGGATG
TCTAGAAACATATCTGCTTTTCATCTTTTGTTTGCTTCTTTCTCTATCGCTCTTGTGTTT
TCCATTGTATGTAATTCATTTTCTTTTTTCAAAAAAAAAAAAAATTATGTATTCAATCTC
TTGTTAACTCTTCTTGTCTTTGCAATATTGACAAAAATATATTTTGATTTTTGTTCCGAG
ATT


BQ
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10 10 10 

AF RS1DO53TF U 1
AF RS1DO53JQ C 390
BS 1 595 RS1DO53TF
BS 596 596 RS1DO53JQ
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BS 654 843 RS1DO53JQ

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TCGCCAAGAGGGAGAAGCAACAGATCAAGAAGCTCGAATCATCTCTTAAGCTCTACGCTC
CTGAGAGCGCCCCTGCTCTTGCTCTTAACGCTCAGATCGAGAAGACCAAGCGCAGGTTTG
ACAACTACGGCAAGTACGGGCTCCTCTGCGGGGCAGACGGGCTACCACACTTCATAGTCA
ACGGAGACCAGCGGCATTGGGGGGAGTTCATAACTCCAGGACTTCTCTTCCTCTACATTG
CTGGATGGATCGGGTGGGTCGGAAGAAGCTACTTGATAGCGATCAGTGATGAGAAGAAAC
CAGCGATGAAAGAGATCATTATCGATGTTCCATTGGCTAGTCGTCTCATCTTCCGTGGTT
TCATTTGGCCCGTTGCTGCTTACAGAGCTTTACTCAATGGTGATCTCATCGCC

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DS 

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ATAACTCCAGGACTTTTCTTCCTTTACATTGCTGGATGGATCGGGTGGGTCGGAAGAAGC
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CCATTGGCTAGTCGTTTCATCTTCCGGGGTTTCATTTGGCCCGTTGCTGCTTACAGAGCT
TTACTCAATGGTGATTTCATCGCCAAGGATGTCTAGAAACATATCTGCTTTTCATCTTTT
GTTTGCTTCTTTCTCTATCGCTCTTGTGTTTTCCATTGTATGTAATTCATTTTCTTTTTT
CAAAAAAAAAAAAAATTATGTATTCAATCTCTTGTTAACTCTTCTTGTCTTTGCAATATT
GACAAAAATATATTTTGATTTTTGTTCCGAGATT

QA 1 454 1 454
DS 



AS 1 2

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TAATTTAGAAAACCTGATTATGGGTTTAATTGCCCGTAAGGTGTGTGTGTTTATCTTTGT
ATTCGCCCTTGTGTCCGAATTTGCATTCGGAAATGTCGAGGTTAATGAGGACAAACATTT
TTTTCACAAGCCGCGTCCATACTTCCATAAACCTCGTCCTTACTTCCACAAGCATGGCAT
TTACAAGAAGGGTTTTAGAAAGGGTTTGGGAGGCGGTGGCGGTCTTGGAGGAGGTGGCGG
TCTAGGCGGTGGCGGTGGTTTGGGCGGAGGAGGTGGTCTAGGAGGCGGTGGTGGTTTGGG
CGGTGGCGGCGGTCTAGGCCACGGTGGCGGTTTGGGTGGAGGAGGCGGTCTAGGACATGG
TGGTGGTTTGGGCGGAGGTGGAGGTCTAGGAGGCGGTGGAGGTCTAGGTGGCGGTGGTGG
TGTGGGCGGAGGAGCTGGAGGAGGATACGGTGGTGGTGCCGGTGGAGGACTTGGAGGCGG
TGGAGGTGCTGGAGGAGGAGGAGGATTTGGTGGCGGAGGAGGATATGGAGGCGGAGGAGG
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AGGCGGTTATGGTGGCGGTGGCCATCACTGATGAGTGATGAGGCTCATGATCATACATTC
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AF RS1GT31TF U 1
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BS 1 574 RS1GT31TF
BS 575 786 RS1GT31JQ

RD RS1GT31TF 574 0 0
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TTTTCACAAGCCGCGTCCATACTTCCATAAACCTCGTCCTTACTTCCACAAGCATGGCAT
TTACAAGAAGGGTTTTAGAAAGGGTTTGGGAGGCGGTGGCGGTCTTGGAGGAGGTGGCGG
TCTAGGCGGTGGCGGTGGTTTGGGCGGAGGAGGTGGTCTAGGAGGCGGTGGTGGTTTGGG
CGGTGGCGGCGGTCTAGGCCACGGTGGCGGTTTGGGTGGAGGAGGCGGTCTAGGACATGG
TGGTGGTTTGGGCGGAGGTGGAGGTCTAGGAGGCGGTGGAGGTCTAGGTGGCGGTGGTGG
TGTGGGCGGAGGAGCTGGAGGAGGATACGGTGGTGGTGCCGGTGGAGGACTTGGAGGCGG
TGGAGGTGCTGGAGGAGGAGGAGGATTTGGTGGC

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CCATACTTCCATAAACCTCGTCCTTACTTCCACAAGCATGGCATTTACAAGAAGGGTTTT
AGAAAGGGTTTGGGAGGCGGTGGCGGTCTTGGAGGAGGTGGCGGTTTAGGCGGTGGCGGT
GGTTTGGGCGGAGGAGGTGGTCTAGGAGGCGGTGGTGGTTTGGGCGGTGGCGGCGGTTTA
GGCCACGGTGGCGGTTTGGGTGGAGGAGGCGGTTTAGGACATGGTGGTGGTTTGGGCGGA
GGTGGAGGTCTAGGAGGCGGTGGAGGTCTAGGTGGCGGTGGTGGTGTGGGCGGAGGAGCT
GGAGGAGGATACGGTGGTGGTGCCGGTGGAGGACTTGGAGGCGGTGGAGGTGCTGGAGGA
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TAATTATATGAAACAGTGATATTAATTATTCAATAAAATGATACATTAGC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

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ATTACGATATCTAATAACTACTTGACGCACCATAACAAAGTGATGCTTTTGGGACACAGT
GATTCGTTCACGAGAGACAAGAACATGCAAGTCACCATTGCCTTTAATCATTTTGGTGAA
GGGCTTGTTCAGAGAATGCCTAGATGTAGGCATGGATATTTTCGTGTGGTAAATAATGAT
TATACGCACTGGCAAATGTACGCAATTGGTGGGAGTGCAGCTCCAACGATTAACAGTCAA
GGCAATAGGTTTCTTGCTCCCAATGACCATGTCTTCAAAGAGGTGACTAAATACGAAGAT
GCACCACAAAGCAAATGGAAGAATTGGAATTGGAGATCAGAAGGTGACTTATTCCTGAAC
GGTGCGTTTTTTACGCCCTCTGGTGGAAGAGCCTCTTCGAGCTATGCAAAGGCTTCAAGT
TTGTCGGCTAGACCGTCCTCGTTAGTGGCTTCAGTCACGGAAAATGCTGGTGCTCTCTCT
TGTAGAAAAGGATCTCGATGCTAATCCGATCCATCTACTTAAGTTATAGTGCATCTAATT
AACACAAGAGGATGTGTTGGTCCTCCTATGTCAATTTTTTCGTTACCCTTTGGTTCTATT
GTGGGAAGGGTTAAAGTTGTAAGTTGAGTTTGATGTGTATATTAAAGTATTGTATGGATC
CTTTGGACCAATGAGTGTCATGTAACTTTTTGGAGTAGGGACCTATGTATGTTGCGGTGG
GGATATGTACAAGTGCTGCAAGACTGTTGATTCC


BQ
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AF RS1CN24TF U 1
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TATACGCACTGGCAAATGTACGCAATTGGTGGGAGTGCAGCTCCAACGATTAACAGTCAA
GGCAATAGGTTTCTTGCTCCCAATGACCATGTCTTCAAAGAGGTGACTAAATACGAAGAT
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TGA

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DS 

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AAAATGCTGGTGCTCTCTCTTGTAGAAAAGGATCTCGATGCTAATCCGATCCATCTACTT
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DS 



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TCTTCC


BQ
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AF RS1AJ76JQ C 1
AF RS1AJ76TF U 1
BS 1 426 RS1AJ76TF

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DS 

RD RS1AJ76TF 426 0 0
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TCTGACGAAGGAATCTGGAGTTCCCTAACTCAAATCTTAGTTCCATCTTATGGTGAGGTT
TGAGAGTTACTGCTACAGAGGTGTAACCTGAGACCATTTTCTGAAAAATTTAAAAGCTAG
AAAGGGTATTATGAACATGAGTGAGAGTTTTTACTTCTTTTAAAGCTAAATTTTACAATT
ACTACTATTGTTATTACCCTTTTGGATGCTTAGCCTGTTTCCGGCTCATTGGAGTTTGCT
GTTTAAATTGTTGAGGAAACACAATTTGTTCCTTAATCCTTGTCATAAAAGTACCCTATT
TCTTCC

QA 1 426 1 426
DS 



AS 1 2

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AATAATAGTTCAGTCGAAGCGTTACTCAACGAGTCACCTGCCATTGGTATGACTAGTGGC
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TCATCGGGGACTAGTCACCATAGAGGTCCACCACCTGCAGCAAAATCATCTATTGATTCA
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CATTCTGACTGCATTGTCCCTTGGCTGGTTCAGCATAACGCATGCCCGGTTTGTCGTAAG
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BQ
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AF RS1AO82TFB U 1
AF RS1AO82JQ C 514
BS 1 743 RS1AO82TFB
BS 744 1235 RS1AO82JQ

RD RS1AO82TFB 743 0 0
CTTCCACGCTCGCTCTCTCTCATTGTCTTCTTCTTCCAACATCAAATCTCATCACATCAT
CTCTAGGGTAATCTCGTCTTCCTTCTCGGATCCATGTGAGGCTAATAACTAGCACCTGAC
TCTATCTGAACCAGCCATTAGGAGATTGTCCTGAGGATGTCTAGTGGTCGAAACACTCAC
TGGTGTCACAGATGTCAACGTGGTGTCTTCCTTCGTGGTAGAGACTCTCTCTGTCCCTAT
TGTGGAGGAGGGTTTGTCGAAGAAATCGATGTAACGCCTCATAGTAGCACCTTAGATATG
CTTAGAGCTCACAGAGATGTTGAGCGTGATCCAACGTTTGATCTCGTTGAAGCTTTCTCA
GCTTTTATGAGAAGCCGTTTAGCTGACAGAGAACTAACCGGAAGACTTGGTGGATCTGGT
CGTTCTGAAAGCTTCTCAAGTATAGCTCCTTTCTTGATCTTTAGTGGCCAAGCTAATAAT
AATAATAGTTCAGTCGAAGCGTTACTCAACGAGTCACCTGCCATTGGTATGACTAGTGGC
AACACCAATGCTGGAGATTACTTCTACGGACCAGGTCTTGAAGAACTGATTGAGCAGCTT
TCATCGGGGACTAGTCACCATAGAGGTCCACCACCTGCAGCAAAATCATCTATTGATTCA
TTACCAACCATAAAGATCACACAGAAGCATCTCAAGTCGTCAGACTCTCACTGTCCGGTT
TGCAAAGACGAGTTTGAGTTGAA

QA 1 743 1 743
DS 

RD RS1AO82JQ 722 0 0
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GGTCTTGAAGAACTGATTGAGCAGCTTTCATCGGGGACTAGTCACCATAGAGGTCCACCA
CCTGCAGCAAAATCATCTATTGATTCATTACCAACCATAAAGATCACACAGAAGCATCTC
AAGTCGTCAGACTCTCACTGTCCGGTTTGCAAAGACGAGTTTGAGTTGAAGTCGGAAGCA
AAACAGATGCCGTGTAAACATGTATATCATTCTGACTGCATTGTCCCTTGGCTGGTTCAG
CATAACGCATGCCCGGTTTGTCGTAAGGAGTTACCATCAGGAGGATCGTCTTCAAGTGCA
CAGAGTGATCAGAACAGAAGCACGGATAGAAGAAGGAATATTTTCTCTAGTCTCTGGCCA
TTCCGCTCGTCTAGCTCAAGCTCTACACATAACCGCAGAGACACAAACAACACAGCCGTT
GCTGAAGAAGGCCAATATAATCATCATCACCAACAACATCATCAACAACAATCCAATAGG
GGTTATAGTGGTTGGCCTTTTGACTATTAAATCTTTGTTAAGGCTTTGTATCTCACTTTG
GTCTTTTGTATTTTGTTTCATTGTTTTGTCTTGTTCTGCATTCACTTACTGGTAGATCTT
ATCATTATGTAGCTTATGATTTATCAACTTTGTGTTTTAATTATTACTAGAATTTGATCC
GC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL6342Contig1 820 2 2 U
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ACCAGTTCCCAGCCGGAGCAATGTGTTCTTCCACGTAAGGTAACCCTTGAGAAGTAGTTC
CCCACGTCCGAGCAATCCTTTCTTCCTTGTTGTGTTTATATATCTCCACACTGCGGAGAG
AGCCGATGATGTGTCCTTGAGGGGTAGCGAGAGCAACGTTTTTAGACACACCGATGTGTT
CTTTGGTTTTGTCGTCGATGGCGAGAACGATGGGAAGAGACATGTTGACAAAGGTCCCAT
CTTTGAGCCTTAGAGAGTTGAAATGAAGGGTTTGGAGATACTCGTCTTCTCTCATGAACC
CTTTCAGAGGACCAGCCCAGCCTTCGCTGATCACGTGCACCCACTCCAGGTCGATCTTCG
TCAGCTTCGCTCTCGGCATGGACTCTGCTTCCTTCTTTTTTAGATCGATCTCCGATTCGG
GTACGAGAAGTTCCACTAGCTCCCCACCGTCTGGGTCGATCAAGGAGCTCTTAACGGTCG
TTGGAGAAGGAAAGGAGAGAGATTGCATCGTTGGGTTGCGTTTGTAGACCAAATTGATTA
GTGGGTTGTGGTTGAATGAAGAGAAAAAGGGTGATTTTGAGGGGATTTGATCGGAGAAAG
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GCATGGATCTTGGTGAAGAAGCGAGAGAAGTGGGGAGTATAGAGTGAACAGTGAAGGTGA
GATTTGGTGGAACATGTTTGGAGGAAGAAGAACGAGACGA


BQ
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AF RS1F721TF C 1
AF RS1DZ48JQ U 251
BS 1 259 RS1F721TF
BS 260 820 RS1DZ48JQ

RD RS1F721TF 693 0 0
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ACCAGTTCCCAGCCGGAGCAATGTGTTCTTCCACGTAAGGTAACCCTTGAGAAGTAGTTC
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CTTTGGTTTTGTCGTCGATGGCGAGAACGATGGGAAGAGACATGTTGACAAAGGTCCCAT
CTTTGAGCCTTAGAGAGTTGAAATGAAGGGTTTGGAGATACTCGTCTTCTCTCATGAACC
CTTTCAGAGGACTAGCCCAGCCTTCGCTGATCACGTGCACCCACTCCAGGTCGATCTTCG
TCAGCTTCGCTCTCGGCATGGACTCTGCTTCCTTCTTTTTTAGATCGATCTCCGATTCGG
GTACGAGAAGTTCCACTAGCTCCCCACCGTCTGGGTCGATCAAGGAGCTCTTAACGGTCG
TTGGAGAAGGAAAGGAGAGAGATTGCATCGTTGGGTTGCGTTTGTAGACCAAATTGATTA
GTGGGTTGTGGTTGAATGAAGAGAAGAAGGGTGATTTTGAGGGGATTTGATCGGAGAAAG
ACGATGGTTTTGAGTTTGTAGTGTGAAATTTA
C

QA 1 692 1 692
DS 

RD RS1DZ48JQ 570 0 0
GTCGTCCAC
GGCGAGAACGATGGGAAGAGACATGTTGACAAAGGTCCCATCTTTGAGCCTTAGAGAGTT
GAAATGAAGGGTTTGGAGATACTCGTCTTCTCTCATGAACCCTTTCAGAGGACCAGCCCA
GCCTTCGCTGATCACGTGCACCCACTCCAGGTCGATCTTCGTCAGCTTCGCTCTCGGCAT
GGACTCTGCTTCCTTCTTTTTTAGATCGATCTCCGATTCGGGTACGAGAAGTTCCACTAG
CTCCCCACCGTCTGGGTCGATCAAGGAGCTCTTAACGGTCGTTGGAGAAGGAAAGGAGAG
AGATTGCATCGTTGGGTTGCGTTTGTAGACCAAATTGATTAGTGGGTTGTGGTTGAATGA
AGAGAAAAAGGGTGATTTTGAGGGGATTTGATCGGAGAAAGACGATGGTTTTGAGTTTGT
AGTGTGAAATTTAGAGACGTAGGAGGATCTGATCAGAAGAGGCATGGATCTTGGTGAAGA
AGCGAGAGAAGTGGGGAGTATAGAGTGAACAGTGAAGGTGAGATTTGGTGGAACATGTTT
GGAGGAAGAAGAACGAGACGA

QA 10 570 10 570
DS 



AS 1 2

CO CL6343Contig1 449 2 1 U
GATCCAGTGAGAATCTTTCTCTTTAGCTTTTAAAAAAAATTATTATTACAAGTATCTACA
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TGTTCATTCACTGAGCATGTTGTGAGGAAGCAGAGAAGAAGAATCATTGTAATCATTTGC
ATTCGGATTTTGAATCACCGAGCTTGTTCATATGTTTGTGTTTCATGTACGTAAGGAATG
ATGCGTATACATAAGAAAATATCAAACTCAGATCTCTCTCTACAGTTCACTTGCAACACA
CTCAAAGGAAACTTAGAAACCCTCTGAACCGCAAAGAGGCTTTCGTTCCAAGGAAAAATA
ATCCAAACTTTGTGTGTTAAAACTTATGATGACGCCAATCATATAACTTAGGATCACACC
AGATTAACCTCGGAAAATCAATAAACCCG


BQ
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AF RS1EI96TF U 1
AF RS1EI96JQ C 16
BS 1 449 RS1EI96TF

RD RS1EI96TF 449 0 0
GATCCAGTGAGAATCTTTCTCTTTAGCTTTTAAAAAAAATTATTATTACAAGTATCTACA
GAGTTTGTAGATAAACCCCTAGTGTTGGTCAAGCGTGTTGTTGATGAAAGTTTGTGGAAG
TGTTCATTCACTGAGCATGTTGTGAGGAAGCAGAGAAGAAGAATCATTGTAATCATTTGC
ATTCGGATTTTGAATCACCGAGCTTGTTCATATGTTTGTGTTTCATGTACGTAAGGAATG
ATGCGTATACATAAGAAAATATCAAACTCAGATCTCTCTCTACAGTTCACTTGCAACACA
CTCAAAGGAAACTTAGAAACCCTCTGAACCGCAAAGAGGCTTTCGTTCCAAGGAAAAATA
ATCCAAACTTTGTGTGTTAAAACTTATGATGACGCCAATCATATAACTTAGGATCACACC
AGATTAACCTCGGAAAATCAATAAACCCG

QA 1 449 1 449
DS 

RD RS1EI96JQ 434 0 0
TTTT
TCTTTAGCTTTTAAAAAAAATTATTATTACAAGTATCTACAGAGTTTGTAGATAAACCCC
TAGTGTTGGTCAAGCGTGTTGTTGATGAAAGTTTGTGGAAGTGTTCATTCACTGAGCATG
TTGTGAGGAAGCAGAGAAGAAGAATCATTGTAATCATTTGCATTCGGATTTTGAATCACC
GAGCTTGTTCATATGTTTGTGTTTCATGTACGTAAGGAATGATGCGTATACATAAGAAAA
TATCAAACTCAGATCTCTCTTTACAGTTCACTTGCAACACACTCAAAGGAAACTTAGAAA
CCCTCTGAACCGCAAAGAGGCTTTCGTTCCAAGGAAAAATAATCCAAACTTTGTGTGTTA
AAACTTATGATGACGCCAATCATATAACTTAGGATCACACCAGATTAACCTCGGAAAATC
AATAAACCCG

QA 5 434 5 434
DS 



AS 1 2

CO CL6344Contig1 935 2 4 U
GGAACTCAAAAGTCTCCTCCGTCTCGCCCCTTCCTATACGGAGTGAGGACGCTTTTTTCT
CGAACGCCATAGCCAAAAAGGCTCACCGAGAGAGGTCCAACAGAGTGAAAACGGTACGTA
CTGTACATCTTTGTAGTTATACACTGGTCGAATAGGAATTCGTGATGTCAATCCGAATCC
CCTCGGCTTCTCAGGATTATACAGGTATCATATTATGTCTCATCTTCCTCGGGTCGTTAC
CAGGGACAATACTTACACAACAAGTTACACTAGATTCGATTCTGATTTTCAAGACGCACG
AGTGGTTCTCCACTAAACCTATAGTTTATTTCCAATGCAAAGGAGAGAATAAGACTGTCT
TTAACGACGTGAAGACAACAAACGTGTCTTATTCTTTCAATGGCCAAGAATCTTGGCAGC
CACTAACAGAACTTAAGGGAACACAATGCAAGAGATGTGGAATCTATGAGGAAGATACCT
TTAGATATGATGCATTTAACGAATGGGAGCTTTGTCCTTCTGATTTTACATCTGAGGGTA
TATACACACACGCCAAGGCTAAAGATTTCAATGCTACTTTTCTCTGCCATGGTTGCTCAC
AAGTACTAGGTGCTGGTTTGAATAAAGATTCTGGCACTGACAAGGAAGAAGAAACGCCCA
GAAAGGGTCCTGCAATCATTGTAGTACTTGTGCTAGGTGGAGTTGCGGTGGGTTTTGTGG
TAGGTTGTAAGAATTGGCGAAAGAAGAAGCAGCAACAAGAACAGGCCTGGTTTCTCAAGC
TGTTTGAAGATGGTGACGAAATGGAGGTCGAAATTTGCCTTGAAGATACCCTATGAAGTC
TTAGACACTGAACTCAATGTCACCTGTTACGTTATATATATACACAGCTTCTTGATCTCA
CAAACATTTTGTTTTAATCTGAAATAGAGAGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C403TF U 1
AF RS1C403JQ C 285
BS 1 696 RS1C403TF
BS 697 697 RS1C403JQ
BS 698 719 RS1C403TF
BS 720 935 RS1C403JQ

RD RS1C403TF 719 0 0
GGAACTCAAAAGTCTCCTCCGTCTCGCCCCTTCCTATACGGAGTGAGGACGCTTTTTTCT
CGAACGCCATAGCCAAAAAGGCTCACCGAGAGAGGTCCAACAGAGTGAAAACGGTACGTA
CTGTACATCTTTGTAGTTATACACTGGTCGAATAGGAATTCGTGATGTCAATCCGAATCC
CCTCGGCTTCTCAGGATTATACAGGTATCATATTATGTCTCATCTTCCTCGGGTCGTTAC
CAGGGACAATACTTACACAACAAGTTACACTAGATTCGATTCTGATTTTCAAGACGCACG
AGTGGTTCTCCACTAAACCTATAGTTTATTTCCAATGCAAAGGAGAGAATAAGACTGTCT
TTAACGACGTGAAGACAACAAACGTGTCTTATTCTTTCAATGGCCAAGAATCTTGGCAGC
CACTAACAGAACTTAAGGGAACACAATGCAAGAGATGTGGAATCTATGAGGAAGATACCT
TTAGATATGATGCATTTAACGAATGGGAGCTTTGTCCTTCTGATTTTACATCTGAGGGTA
TATACACACACGCCAAGGCTAAAGATTTCAATGCTACTTTTCTCTGCCATGGTTGCTCAC
AAGTACTAGGTGCTGGTTTGAATAAAGATTCTGGCACTGACAAGGAAGAAGAAACGCCCA
GAAAGGGTCCTGCAATCATTGTAGTACTTGTGCTAG*TGGAGTTGCGGTGGGTTTTGTG

QA 1 719 1 719
DS 

RD RS1C403JQ 651 0 0
ATTTTCAAGACGCACGAGTGGTTCTCCACTAAACCTATAGTTTATTTCCAATGCAAAGGA
GAGAATAAGACTGTCTTTAACGACGTGAAGACAACAAACGTGTCTTATTCTTTCAATGGC
CAAGAATCTTGGCAGCCACTAACAGAACTTAAGGGAACACAATGCAAGAGATGTGGAATC
TATGAGGAAGATACCTTTAGATATGATGCATTTAACGAATGGGAGCTTTGTCCTTCTGAT
TTTACATCTGAGGGTATATACACACACGCCAAGGCTAAAGATTTCAATGCTACTTTTTTC
TGCCATGGTTGCTCACAAGTACTAGGTGCTGGTTTGAATAAAGATTCTGGCACTGACAAG
GAAGAAGAAACGCCCAGAAAGGGTCCTGCAATCATTGTAGTACTTGTGCTAGGTGGAGTT
GCGGTGGGTTTTGTGGTAGGTTGTAAGAATTGGCGAAAGAAGAAGCAGCAACAAGAACAG
GCCTGGTTTCTCAAGCTGTTTGAAGATGGTGACGAAATGGAGGTCGAAATTTGCCTTGAA
GATACCCTATGAAGTCTTAGACACTGAACTCAATGTCACCTGTTACGTTATATATATACA
CAGCTTCTTGATCTCACAAACATTTTGTTTTAATCTGAAATAGAGAGTTTG

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 2

CO CL6345Contig1 385 2 2 U
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AACATAAAACAGCCTCTCAAAACCAAAGAACAACAACCCCTTATTGATACCAATATTTGA
TCAACTTCATAAGAAGACCAATATCTCATATTTCCCCAACCATACCAAACCCGAACCAAC
TCAAACAATAGCCATTTGGATTACAACCAAATGGTCTAATCATAAAACCATACGAAAAAC
CAAAAGCTTGATCCGTTTTTTCTTCTCAGTACCTGTAGCTAACAGGCTTGTAGGGACCTT
CAACGGGTATGCTAACGTAGTCAGATTGGTCCTTGGTGAGCTTGGTGAGTCTGGCACCTA
GCTTGCCTAAGTGAAGTGCAGCAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1F866TF C 1
AF RS1F866JQ U 135
BS 1 138 RS1F866TF
BS 139 385 RS1F866JQ

RD RS1F866TF 385 0 0
GTGTAAACAAAAATTAATTTATCTTGAGATACATAAAATTGAAAGGGAAAAACAAAACAA
AACATAAAACAGCCTCTCAAAACCAAAGAACAACAACCCCTTATTGATACCAATATTTGA
TCAACTTCATAAGAAGACCAATATCTCATATTTCCCCAACCATACCAAACCCGAACCAAC
TCAAACAATAGCCATTTGGATTACAACCAAATGGTCTAATCATAAAACCATACGAAGAAC
CAAAAGCTTGATCCGTTTTTTCTTCTCAGTACCTGTAGCTAACAGGCTTGTAGGGACCTT
CAACGGGTATGCTAACGTAGTCAGATTGGTCCTTGGTGAGCTTGGTGAGTCTGGCACCTA
GCTTGCCTAAGTGAAGTGCAGCAAC

QA 1 385 1 385
DS 

RD RS1F866JQ 251 0 0
AGAA
CAATATCTCATATTTCCCCAACCATACCAAACCCGAACCAACTCAAACAATAGCCATTTG
GATTACAACCAAATGGTCTAATCATAAAACCATACGAAAAACCAAAAGCTTGATCCGTTT
TTTCTTCTCAGTACCTGTAGCTAACAGGCTTGTAGGGACCTTCAACGGGTATGCTAACGT
AGTCAGATTGGTCCTTGGTGAGCTTGGTGAGTCTGGCACCTAGCTTGCCTAAGTGAAGTG
CAGCAAC

QA 5 251 5 251
DS 



AS 1 2

CO CL6346Contig1 643 2 1 U
TTTTTGCGCAGACACTGTTTTGAGGCTTTCGATTTGTAGGGTTTTCAACAATCTGAACAA
TGGCGGATGCAGCTGCTGCGACTGGGATCGTGAAAAAGAGAACGTTCAAGAAGTTCTCCT
ACAAAGGAGTCGATCTCGATGCTCTTCTCGACATGTCTACCGATGATCTTGTCAAGCTCT
TCAGTTCCCGTATTCGCAGAAGGTTCTCTAGAGGGTTGACGAGGAAGCCTATGGCTTTGA
TCAAAAAATTGCGGAAAGCGAAAAGGGATGCACCAGCTGGTGAGAAGCCAGAAGCAGTGA
GAACCCACCTAAGGAACATGATCATCGTGCCTGAAATGATTGGAAGTGTCATTGGTGTGT
ACAATGGAAAGACATTTAACCAAGTAGAGATCAAACCTGAGATGATTGGTCATTACTTGG
CTGAATTTTCAATCTCGTACAAGCCTGTTAAGCACGGAAGGCCTGGTGTTGGTGCCACTA
ACTCCTCCAGGTTTATCCCTCTCAAATAATTAATCTACTCTAGTCTATGTTATTCTCCAA
AATAAGATTTTCGTTGGTTTTTTTCATTCTTTATAACGTTTTGTTTTTGTTTCTCCGCTC
TCCTTTAGATTTTGTCTAAGAACATTTCTTCATGCTTTTAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DB06TF U 1
AF RS1DB06JQ C 401
BS 1 643 RS1DB06TF

RD RS1DB06TF 643 0 0
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TGGCGGATGCAGCTGCTGCGACTGGGATCGTGAAAAAGAGAACGTTCAAGAAGTTCTCCT
ACAAAGGAGTCGATCTCGATGCTCTTCTCGACATGTCTACCGATGATCTTGTCAAGCTCT
TCAGTTCCCGTATTCGCAGAAGGTTCTCTAGAGGGTTGACGAGGAAGCCTATGGCTTTGA
TCAAAAAATTGCGGAAAGCGAAAAGGGATGCACCAGCTGGTGAGAAGCCAGAAGCAGTGA
GAACCCACCTAAGGAACATGATCATCGTGCCTGAAATGATTGGAAGTGTCATTGGTGTGT
ACAATGGAAAGACATTTAACCAAGTAGAGATCAAACCTGAGATGATTGGTCATTACTTGG
CTGAATTTTCAATCTCGTACAAGCCTGTTAAGCACGGAAGGCCTGGTGTTGGTGCCACTA
ACTCCTCCAGGTTTATCCCTCTCAAATAATTAATCTACTCTAGTCTATGTTATTCTCCAA
AATAAGATTTTCGTTGGTTTTTTTCATTCTTTATAACGTTTTGTTTTTGTTTCTCCGCTC
TCCTTTAGATTTTGTCTAAGAACATTTCTTCATGCTTTTAAAT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RS1DB06JQ 243 0 0
GATGATTGGTCATTACTTGGCTGAATTTTCAATCTCGTACAAGCCTGTTAAGCACGGAAG
GCCTGGTGTTGGTGCCACTAACTCCTCCAGGTTTATCCCTCTCAAATAATTAATCTACTC
TAGTCTATGTTATTCTCCAAAATAAGATTTTCGTTGGTTTTTTTCATTCTTTATAACGTT
TTGTTTTTGTTTCTCCGCTCTCCTTTAGATTTTGTCTAAGAACATTTCTTCATGCTTTTA
AAT

QA 1 243 1 243
DS 



AS 1 2

CO CL6347Contig1 1072 2 4 U
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TTCGTCAAGGGAAGCGTCGAGTCCGGCCACGCCACTTCCGCTCTGGTCAGAGAATCCTCT
CTCTCCGATCCCGTTAAGGCCAAACTCGTCCAGAGTTTCCAAGACCTTGGTGTCACCATA
CTCTACGGAAGCGTAAATGAGAAAGAGAGCTTGGTGAAAGCGATCAAACAAGTAGATGTC
GTGATTTCTGCTCTTGGTCGAACTCAGATTCTAGATCAGGTCAACATCATCGACGCCATC
AAAGAAGCTGGAAATGTCAAGAGATTCTTACCTTCGGAATTTGGAAATGACGTAGACCGT
ACGGTGGCCATCGAGCCGACGTTATCGGGATTCATCATGAAAGCTCAGATACGTCGCGCC
ATAGAGGCCGCGGAGATACCTTATACGTATGTTGTCTCAGGTGGCTTTGCTGGCTATTTC
GTACCTAGTTTGGGTCAATGCCACTTGGGACTCAGAACTCCTCCTACAGACAGAGTTTCC
ATCTTCGACAGTGGCGATGCAAAAGCTATTATCAACACAGAAGAGGACATTGTTGCCACT
ACAATGAAAGCTGTTGATGACCCGAAAACACTTAACAAGATTCTCTACATCCATCCACCC
AAGAACATTGTCTCGCAGAACGATATGGTCAGTTTGTGGGAGAGAAAGATCGGTAAGACT
CTGGAGAAAATCTATGTTTCAGAGGAAGAACTTCTCAAAAGCATCCAAGAGGCTCAGGAT
CCAATGGATGTTGTGATGGGTTTGATCCATGCAATACTAGTGCAAGGTGAGCTTACCTCC
TTCACTATAGACCCTTCTGTTGGAGTGGAAGCTTCCGAGCTTTACCCTGATGTCAAGTAC
ACCAGTCTCGATGAGTTTCTCAACCAGTTTGTTTGAGAACAAACAACCTCTTTATGTTGC
ATGTATGTTTTAATAATCTGAGATCGATTACATTCTGTTATAATGTAAGTCTCCGTTGAG
AGTGTCATATATATATGATGTCCATCCTTATCTATAGGATTGGATATACACG


BQ
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AF RS1BW51TF U 1
AF RS1BW51JQ C 337
BS 1 759 RS1BW51TF
BS 760 760 RS1BW51JQ
BS 761 771 RS1BW51TF
BS 772 1072 RS1BW51JQ

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TTCGTCAAGGGAAGCGTCGAGTCCGGCCACGCCACTTCCGCTCTGGTCAGAGAATCCTCT
CTCTCCGATCCCGTTAAGGCCAAACTCGTCCAGAGTTTCCAAGACCTTGGTGTCACCATA
CTCTACGGAAGCGTAAATGAGAAAGAGAGCTTGGTGAAAGCGATCAAACAAGTAGATGTC
GTGATTTCTGCTCTTGGTCGAACTCAGATTCTAGATCAGGTCAACATCATCGACGCCATC
AAAGAAGCTGGAAATGTCAAGAGATTCTTACCTTCGGAATTTGGAAATGACGTAGACCGT
ACGGTGGCCATCGAGCCGACGTTATCGGGATTCATCATGAAAGCTCAGATACGTCGCGCC
ATAGAGGCCGCGGAGATACCTTATACGTATGTTGTCTCAGGTGGCTTTGCTGGCTATTTC
GTACCTAGTTTGGGTCAATGCCACTTGGGACTCAGAACTCCTCCTACAGACAGAGTTTCC
ATCTTCGACAGTGGCGATGCAAAAGCTATTATCAACACAGAAGAGGACATTGTTGCCACT
ACAATGAAAGCTGTTGATGACCCGAAAACACTTAACAAGATTCTCTACATCCATCCACCC
AAGAACATTGTCTCGCAGAACGATATGGTCAGTTTGTGGGAGAGAAAGATCGGTAAGACT
CTGGAGAAAATCTATGTTTCAGAGGAAGAACTTCTCAAA*GCATCCAAGAG
CTC

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DS 

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ATGAAAGCTCAGATACGTCGCGCCATAGAGGCCGCGGAGATACCTTATACGTATGTTGTC
TCAGGTGGCTTTGCTGGCTATTTCGTACCTAGTTTGGGTCAATGCCACTTGGGACTCAGA
ACTCCTCCTACAGACAGAGTTTCCATCTTCGACAGTGGCGATGCAAAAGCTATTATCAAC
ACAGAAGAGGACATTGTTGCCACTACAATGAAAGCTGTTGATGACCCGAAAACACTTAAC
AAGATTCTCTACATCCATCCACCCAAGAACATTGTCTCGCAGAACGATATGGTCAGTTTG
TGGGAGAGAAAGATCGGTAAGACTCTGGAGAAAATTTATGTTTCAGAGGAAGAACTTCTC
AAAAGCATCCAAGAGGCTCAGGATCCAATGGATGTTGTGATGGGTTTGATCCATGCAATA
CTAGTGCAAGGTGAGCTTACCTCCTTCACTATAGACCCTTCTGTTGGAGTGGAAGCTTCC
GAGCTTTACCCTGATGTCAAGTACACCAGTCTCGATGAGTTTCTCAACCAGTTTGTTTGA
GAACAAACAACCTCTTTATGTTGCATGTATGTTTTAATAATCTGAGATCGATTACATTCT
GTTATAATGTAAGTCTCCGTTGAGAGTGTCATATATATATGATGTCCATCCTTATCTATA
GGATTGGATATACACG

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

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GGACAACACAACACATACATCAACATATTAACCATGAAGCTTCTGGGGTTCGCTTTAGTT
TTACTATTAGCTGCTGCCAGTTGCAAAGCTGGTGAAGAAATTACTTGCGAAGAGAACGAA
CCATTCACATGTAGTAACACTGCTAAATTAAGCAGTAAAAGCTTTGAAAAGACTTCATCT
TCGGTGTTGCATCTTCTGCTTACCAGATCGAAGGAGGGAGAGGTCGTGGTGTTAACATTT
GGGATGGTTTCAGTCACCGATACCCAGAGAAATCTGGGTCAGATTTGTAGAAAGATTGTA
AACTGGAAAACCTGCTTGAAATTCCCTGATGAAGCTAAGCTCTCTGTCGAGGTAAAAGAT
CTCATCCGAAGACTTCTCTGCAATGTCGAACAGAGGCTCGGAACCAAAGGAGTTTCATGA
AATCAAAGCTCACCCTCGGTTTAAAGGAATAGAATGGGAAAGACTATATGAGTCAAACGC
TCCATATATACCGAAAGTGAAGCATGAACTTGATACTCAAAACTTTGAAAAGTTTGATGA
GGTACCATCTACTTGCCAAACCTCTGCAAAGTCTGGCCCTTGGAGAAAGATGATCTCATC
TAAAGATGTAAATTTCGTTGGTTATACATTCAAGAATCTTGAGATTGTTGATGAACACAA
TATCCCTGGCATGGCGGAACTGAAACGGAAGAGTAAGACACCAAGGAAACCATCTCTCAA
GACACTGTTCGAAACACCGTACCCTCCTACTGAGAGTCATGCTTTACAGGATTTGCTAGA
TTCACCTATTTACTCTGATGGGGGATCTACAGGTTCATCCGGATCGCCATTTTCACATCC
GAATCAATCTCACAATGTTTCCCGGAGATGATCAAAACGGAGAATCTTAAAGTGATAAGC
AAAAAGTAAAAGAAGGAAGTAATTTTTCTTCAGTTGCACAAGTTTTCATCTTTTCATTCA
TATACCCATGTTTTGTAAATCAATGAACAACACCAAAAGAGAATTTGAACCAAAATGATT
CATATAGAAAACTTTATAGGTTTGCGTACAAACATATTTACAATGTC


BQ
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AF RS1CF47TF U 1
AF RS1CF47JQ C 327
BS 1 708 RS1CF47TF
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RD RS1CF47TF 761 0 0
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TTACTATTAGCTGCTGCCAGTTGCAAAGCTGGTGAAGAAATTACTTGCGAAGAGAACGAA
CCATTCACATGTAGTAACACTGCTAAATTAAGCAGTAAAAGCTTTGAAAAGACTTCATCT
TCGGTGTTGCATCTTCTGCTTACCAGATCGAAGGAGGGAGAGGTCGTGGTGTTAACATTT
GGGATGGTTTCAGTCACCGATACCCAGAGAAATCTGGGTCAGATTTGTAGAAAGATTGTA
AACTGGAAAACCTGCTTGAAATTCCCTGATGAAGCTAAGCTCTCTGTCGAGGTAAAAGAT
CTCATCCGAAGACTTCTCTGCAATGTCGAACAGAGGCTCGGAACCAAAGGAGTTTCATGA
AATCAAAGCTCACCCTCGGTTTAAAGGAATAGAATGGGAAAGACTATATGAGTCAAACGC
TCCATATATACCGAAAGTGAAGCATGAACTTGATACTCAAAACTTTGAAAAGTTTGATGA
GGTACCATCTACTTGCCAAACCTCTGCAAAGTCTGGCCCTTGGAGAAAGATGATCTCATC
TAAAGATGTAAATTTCGTTGGTTATACATTCAAGAATCTTGAGATTGTTGATGAACACAA
TATCCCTGGCATGGCGGAACTGAAACGGAAGAGTAAGACACCAAGGAA*CCATCTCTCA*
GACACTGTTCGAAACACCGTACCCTCCTACTGAGAGTCATG

QA 1 761 1 761
DS 

RD RS1CF47JQ 741 0 0
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CGAACAGAGGCTCGGAACCAAAGGAGTTTCATGAAATCAAAGCTCACCCTCGGTTTAAAG
GAATAGAATGGGAAAGACTATATGAGTCAAACGCTCCATATATACCGAAAGTGAAGCATG
AACTTGATACTCAAAACTTTGAAAAGTTTGATGAGGTACCATCTACTTGCCAAACCTCTG
CAAAGTCTGGCCCTTGGAGAAAGATGATCTCATCTAAAGATGTAAATTTCGTTGGTTATA
CATTCAAGAATCTTGAGATTGTTGATGAACACAATATCCCTGGCATGGCGGAACTGAAAC
GGAAGAGTAAGACACCAAGGAAACCATCTCTCAAGACACTGTTCGAAACACCGTACCCTC
CTACTGAGAGTCATGCTTTACAGGATTTGCTAGATTCACCTATTTACTCTGATGGGGGAT
CTACAGGTTCATCCGGATCGCCATTTTCACATCCGAATCAATCTCACAATGTTTCCCGGA
GATGATCAAAACGGAGAATCTTAAAGTGATAAGCAAAAAGTAAAAGAAGGAAGTAATTTT
TCTTCAGTTGCACAAGTTTTCATCTTTTCATTCATATACCCATGTTTTGTAAATCAATGA
ACAACACCAAAAGAGAATTTGAACCAAAATGATTCATATAGAAAACTTTATAGGTTTGCG
TACAAACATATTTACAATGTC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6350Contig1 613 2 3 U
GCGTCGCTTTGCTCTGCAAGGTCTTTGTCGCCTGATGCTCTAGGGTTTATACCTCCGAAG
AAGATGGCCTCTTCGATCCACGACTCGCGTTCGCGTGTCCATGGTTCTTCATCTCGCTAT
AGGATGGGTCGAAGAGCGAATAATAATAATCAGCTGCAAGTTGTGGCTATGGCACCCGAG
GAAGAGAAGCTCACTCGTCGCAATCCTCTCGATTTCCCTATTGAATGGGAGAGGCCTAAA
CCTGGGAGGAGGCCTGATATTTTCCCAAAGTTTAGCCCAATGAAGACACCATTGCCACCT
CCCATGCCTTATGATCCTCCAGCAGAGGACGAAGAAGAAGAGGAAGAGAAGAAAGAAGAG
GAAGAAGAAAACCCTGACCAAGAAGAAGAGGACCAACCTGAGAAGCAGCAATAAGATTTT
TTTTATAGTTTGCGAGAGAAAAAAAAGAGGTTGTAAACGTCGAGATCTAAGAGGCTTTTT
GTTTTTGATTTTTGTAGTGTTTTTAGAGGAGGAAGAAAAAAGAAAAAAGAAACCCATCGT
TCTCGTTAGTTGCTAGTTTAAAATCTCACTCATGTACTATATTTATTTCGTGTAATAATG
TCAGTTTTGTCAG


BQ
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AF RS1EI73TF U 25
AF RS1EI73JQ C 1
BS 1 24 RS1EI73JQ
BS 25 146 RS1EI73TF
BS 147 613 RS1EI73JQ

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TCGCGTTCGCGTGTCCATGGTTCTTCATCTCGCTATAGGATGGGTCGAAGAGCGAATAAT
AA

QA 1 122 1 122
DS 

RD RS1EI73JQ 613 0 0
GCGTCGCTTTGCTCTGCAAGGTCTTTGTCGCCTGATGCTCTAGGGTTTATACCTCCGAAG
AAGATGGCCTCTTCGATCCACGACTCGCGTTCGCGTGTCCATGGTTCTTCATCTCGCTAT
AGGATGGGTCGAAGAGCGAATAATAATAATCAGCTGCAAGTTGTGGCTATGGCACCCGAG
GAAGAGAAGCTCACTCGTCGCAATCCTCTCGATTTCCCTATTGAATGGGAGAGGCCTAAA
CCTGGGAGGAGGCCTGATATTTTCCCAAAGTTTAGCCCAATGAAGACACCATTGCCACCT
CCCATGCCTTATGATCCTCCAGCAGAGGACGAAGAAGAAGAGGAAGAGAAGAAAGAAGAG
GAAGAAGAAAACCCTGACCAAGAAGAAGAGGACCAACCTGAGAAGCAGCAATAAGATTTT
TTTTATAGTTTGCGAGAGAAAAAAAAGAGGTTGTAAACGTCGAGATCTAAGAGGCTTTTT
GTTTTTGATTTTTGTAGTGTTTTTAGAGGAGGAAGAAAAAAGAAAAAAGAAACCCATCGT
TCTCGTTAGTTGCTAGTTTAAAATCTCACTCATGTACTATATTTATTTCGTGTAATAATG
TCAGTTTTGTCAG

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 2

CO CL6351Contig1 1276 2 4 U
GAGGCTGTGATAGTGATATTCCATCTCCGGTAGCAGATGGCAACGGCAATTTATTTTCCG
TTACAATAGACTCACTGCAAAAGATGAAAAGCGTGCATAAGAAACATGCCTAACCTCTTC
ATACGACACCTACAACTACACTCATCGTGTAAAACATTTGCATTGCTTCTAATTAATCAA
AATATTACATGAAAAATTGTTTAGTTATAAACTCAGATCATTCTGATCGCACCTGCAAAT
AAACTAGTAAAAGTAATTGTGAAACCTACAAGATAATATCAAACAAAATGATCGCAGAAT
TTCAATTTCATAACCTCTGAATTCTGATACACCACTTAATATGTATCTTACCAATACAAT
CATTAAAGTATTTAATTCAATTTCAATATGAAGGACACAAAACTCCCACTGATTTTTTTT
CAGTTGCTTCAACTATCAAACTGCAAAAGAAAGAGACCACTCAAGGGAAAACCTGTGTGG
TGTCTGCTGGTGGTTTGGCACTCCAGAGGCAGAAGACCAAGAGCTTGTGTAACCCTGAGT
TCCACTTTCTTTCTTGTGTGTAGATTTTCCCGGAAAGTTTCCAGAATCTGAACAAGAGAA
GCACATAAGCATGAATCCTATAGTTAACGCTTACATAAAATTTACCCATCCATCCAAGAG
AAGAGATCGTGTTTATACCAGTAGAGCTGAGACGGGTAGATGCACTTCGTCCAGCATAGC
GATCAGAACCACCTCTACCACCGCGGTTGTATGTGTTATTAGCACCACGCAGCCGGGAAT
CCGGTATATCCCTTGTCTGAATAGAAACAAAAGACTTCAAAAATAGCCAAAGTTCCACCA
AAACATCTAGCGTCAGGTGCTATTTGAAGGGCATATATATATCGTCACCACTAGGCATGT
ATATGTACAAAAACTGTGACTAGAAACAGCAGATAAAGGTGCTAATACAAAATAAAATAG
TGCTAATTAGTTTGCATTTAAAATGCCACAAAAGACAAAGTCTCTTGCGGTAAGAAAACG
GGGTTTCAGCACTGACTCACCTCTTTTTTTTTCTCTTTTTTGCTCTTCACCTCGTGAAAA
GGATCTGGATAGAGGAAAAAAAGAAGAGTATCACAAATAGACGCCAACTAAAAAAGACAA
AACCTAGACTTTGAGAACTAACTTCCACAAAGTAAGAAGAAAACAAAAACAAAACTTCCA
CCAAAGTATGAAAGAAGACGACTTTTAAACCATAAAGCTCGACCCTCTTGACAAAACCAG
AAGCTTTGATACATCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EW18TF U 1
AF RS1EW18JQ C 516
BS 1 711 RS1EW18TF
BS 712 712 RS1EW18JQ
BS 713 765 RS1EW18TF
BS 766 1276 RS1EW18JQ

RD RS1EW18TF 770 0 0
GAGGCTGTGATAGTGATATTCCATCTCCGGTAGCAGATGGCAACGGCAATTTATTTTCCG
TTACAATAGACTCACTGCAAAAGATGAAAAGCGTGCATAAGAAACATGCCTAACCTCTTC
ATACGACACCTACAACTACACTCATCGTGTAAAACATTTGCATTGCTTCTAATTAATCAA
AATATTACATGAAAAATTGTTTAGTTATAAACTCAGATCATTCTGATCGCACCTGCAAAT
AAACTAGTAAAAGTAATTGTGAAACCTACAAGATAATATCAAACAAAATGATCGCAGAAT
TTCAATTTCATAACCTCTGAATTCTGATACACCACTTAATATGTATCTTACCAATACAAT
CATTAAAGTATTTAATTCAATTTCAATATGAAGGACACAAAACTCCCACTGATTTTTTTT
CAGTTGCTTCAACTATCAAACTGCAAAAGAAAGAGACCACTCAAGGGAAAACCTGTGTGG
TGTCTGCTGGTGGTTTGGCACTCCAGAGGCAGAAGACCAAGAGCTTGTGTAACCCTGAGT
TCCACTTTCTTTCTTGTGTGTAGATTTTCCCGGAAAGTTTCCAGAATCTGAACAAGAGAA
GCACATAAGCATGAATCCTATAGTTAACGCTTACATAAAATTTACCCATCCATCCAAGAG
AAGAGATCGTGTTTATACCAGTAGAGCTGAGACGGGTAGATGCACTTCGTC*AGCATAGC
GATCAGAACCACCTCTACCACCGCGGTTGTATGTGTTATTAGCAC
ACGCA

QA 1 765 1 765
DS 

RD RS1EW18JQ 761 0 0
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AGTTTCCAGAATCTGAACAAGAGAAGCACATAAGCATGAATCCTATAGTTAACGCTTACA
TAAAATTTACCCATCCATCCAAGAGAAGAGATCGTGTTTATACCAGTAGAGCTGAGACGG
GTAGATGCACTTCGTCCAGCATAGCGATCAGAACCACCTCTACCACCGCGGTTGTATGTG
TTATTAGCACCACGCAGCCGGGAATCCGGTATATCCCTTGTCTGAATAGAAACAAAAGAC
TTCAAAAATAGCCAAAGTTCCACCAAAACATCTAGCGTCAGGTGCTATTTGAAGGGCATA
TATATATCGTCACCACTAGGCATGTATATGTACAAAAACTGTGACTAGAAACAGCAGATA
AAGGTGCTAATACAAAATAAAATAGTGCTAATTAGTTTGCATTTAAAATGCCACAAAAGA
CAAAGTCTCTTGCGGTAAGAAAACGGGGTTTCAGCACTGACTCACCTCTTTTTTTTTCTC
TTTTTTGCTCTTCACCTCGTGAAAAGGATCTGGATAGAGGAAAAAAAGAAGAGTATCACA
AATAGACGCCAACTAAAAAAGACAAAACCTAGACTTTGAGAACTAACTTCCACAAAGTAA
GAAGAAAACAAAAACAAAACTTCCACCAAAGTATGAAAGAAGACGACTTTTAAACCATAA
AGCTCGACCCTCTTGACAAAACCAGAAGCTTTGATACATCG

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL6352Contig1 890 2 4 U
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GTGATTCTTTCCCCGAGAGTAATCACAATCGGCTCCGGAAGAGGAGGAGATTGTTCAGTC
GTTGTCTTGCCATGGCCATGTATATTCGTGTGAAGCGCATGAAAGCTACTTACTTTATCC
AATGCGATCGCGCAGCGACTGTTTTGGATTTTAAGCAGAAACTCTTTACCCTCATCGAGC
AGCCAGTCAGCAATCAGCGTCTCATCTTAATGTCTACAGAAGAAGTATTAGAGGATTCCA
AATCTCCAGCAGAGCAGAAGGTTGAGAATGATGCAGTCGTGGCTCTGACTTTGAGGAAAG
ATGATGACGAGTTTGAGCATGTTGACATTGCACAGCCCACCGACCTTTCTGTTGCATGAA
GAATTATAACTGGGGCTGGCTGTATCAGGGGAACCTTTGCTTCAACAGGAGAGAGTATTG
ATGTTAACCCTGTGACTAGAATCACTATCTCGAAGATCAGGGAGAGTACTTGGTTTAGAA
GAGGTTTACACATGAAACAGAGAAAAATGGAGAAACGAGTCAAAGAGACCGAAGCTACTA
TTGCAGGTCCAAAGTTAGGGAAACCATACAGACCAGCCTATAAACATAAACGCGTTTGAT
GTAATTGCCTCGTCTGCTGGGTTGGGTTTGATCTAACAGGACTCTTTGGAGATGATGCGT
ATGACAGGAGAGAATCTAGATTCACTTCTCAGAAACCTGCTTCGGTGATTATATCTAAGC
TTGAGGAGGTGGCGGGGAGCGATTGAAACTGAGCATAAGAATTGTAGTTTTGAATTTTTG
CTAACTCTGATGTTAAAACGTATATGAGTAATCTTACATTTTCGTTCGTG


BQ
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AF RS1GF19TF U 1
AF RS1GF19JQ C 179
BS 1 543 RS1GF19TF
BS 544 544 RS1GF19JQ
BS 545 606 RS1GF19TF
BS 607 890 RS1GF19JQ

RD RS1GF19TF 613 0 0
GGGCCTTGTTCAGCTGAGTCTGAGAAGAAGAGGCCAAACTTTCTCAGATTTTCCATCCTC
GTGATTCTTTCCCCGAGAGTAATCACAATCGGCTCCGGAAGAGGAGGAGATTGTTCAGTC
GTTGTCTTGCCATGGCCATGTATATTCGTGTGAAGCGCATGAAAGCTACTTACTTTATCC
AATGCGATCGCGCAGCGACTGTTTTGGATTTTAAGCAGAAACTCTTTACCCTCATCGAGC
AGCCAGTCAGCAATCAGCGTCTCATCTTAATGTCTACAGAAGAAGTATTAGAGGATTCCA
AATCTCCAGCAGAGCAGAAGGTTGAGAATGATGCAGTCGTGGCTCTGACTTTGAGGAAAG
ATGATGACGAGTTTGAGCATGTTGACATTGCACAGCCCACCGACCTTTCTGTTGCATGAA
GAATTATAACTGGGGCTGGCTGTATCAGGGGAACCTTTGCTTCAACAGGAGAGAGTATTG
ATGTTAACCCTGTGACTAGAATCACTATCTCGAAGATCAGGGAGAGTACTTGGTTTAGAA
GAG*TTTACACATGAAACAGAGAAAAATGGAGAAACGAGTCAAAGAGACCGAAGCTACTA
TTGCAG
TCCAAAG

QA 1 606 1 606
DS 

RD RS1GF19JQ 712 0 0
CCAATGCGATCGCGCAGCGACTGTTTTGGATTTTAAGCAGAAACTCTTTACCCTCATCGA
GCAGCCAGTCAGCAATCAGCGTCTCATCTTAATGTCTACAGAAGAAGTATTAGAGGATTC
CAAATCTCCAGCAGAGCAGAAGGTTGAGAATGATGCAGTCGTGGCTCTGACTTTGAGGAA
AGATGATGACGAGTTTGAGCATGTTGACATTGCACAGCCCACCGACCTTTCTGTTGCATG
AAGAATTATAACTGGGGCTGGCTGTATCAGGGGAACCTTTGCTTCAACAGGAGAGAGTAT
TGATGTTAACCCTGTGACTAGAATCACTATCTCGAAGATCAGGGAGAGTACTTGGTTTAG
AAGAGGTTTACACATGAAACAGAGAAAAATGGAGAAACGAGTCAAAGAGACCGAAGCTAC
TATTGCAGGTCCAAAGTTAGGGAAACCATACAGACCAGCCTATAAACATAAACGCGTTTG
ATGTAATTGCCTCGTCTGCTGGGTTGGGTTTGATCTAACAGGACTCTTTGGAGATGATGC
GTATGACAGGAGAGAATCTAGATTCACTTCTCAGAAACCTGCTTCGGTGATTATATCTAA
GCTTGAGGAGGTGGCGGGGAGCGATTGAAACTGAGCATAAGAATTGTAGTTTTGAATTTT
TGCTAACTCTGATGTTAAAACGTATATGAGTAATCTTACATTTTCGTTCGTG

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 2

CO CL6353Contig1 691 2 1 U
GGGAAAGATAGAGGAGAAGAAATCAACGCAGGCATGGTAGGCGCAGCAGCAGCATCAGCG
AACCTCGCGAGCCTGAGATCGACAACGACGTCTCTGTTTACAAATCGGCCATTCTGTTTA
TCCATGTTAGGCGGAATCAAAAGCTCCCTCGCATTAAGGACATGTCTAAAGCCCACACCT
CTCCGATTCGCGACGTCGTGGCCAACACCTCCACACCACGTTCCTTCCGTTAGGGCCATG
TCATCATCGTCTCCCTCTCCCTCGCTAGAGGAGACGGTTAAAACGACAGTAGCAGAAAAC
CCTGTGGTTGTCTACTCCAAATCTTGGTGCTCATACTCGTCTGAAGTGAAGTCGTTGTTC
AATGGGCTTCAAGTTAAGCCTCTCGTTATTGGACTTGATGAACTTGGTGCAGAGGGGTCA
CAGCTGCAGAATGTCTTGGAGAAACTCACTGGACAATACACTGTTCCTAGTGTTTTCATC
GGAGGCAAGCACATTGGTGGCTGCTCAGATACGGTGCAGCTGTACAACAAAGGAGAGTTG
GAGCCAATGTTAGCTGAGGCCGATGCCAAAACCGGTCAGAGCTAGAGATGAAAGCTGCTT
ACGTTTCTGTTTTTGTTTAATCAGAACCTCTGAACTAAAATTCTTGAAGTCGACATGATT
TGCTGTCTACGTAGAGATTTCATAAGAACCT


BQ
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AF RS1FK51TF U 1
AF RS1FK51JQ C 253
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DS 

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AGAGATTTCATAAGAACCT

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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1GA78TF U 1
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DS 

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DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AAATAGTTCCGCAGTGAAAATTGACGGTTAATTCTTTTTCGGTTATGTTTTTTTTTCTTT
AACATTTTTTCACTAAGCAATATTCTTGGTACATTTTTTTTAGC


BQ
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DS 

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CATTTGGTGCTGAAGCTGGATACGACACCTCCTCCAAGACTTTCACCAAGTACAACGCTG
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CGATCAAAGCATCTTACCTTCACCACCTTGACGAATCCAAGAGAAGCGCAGCAGTTGGTG
AGGTTTACAGGAAGTTCTCAACCAATGAAAACACGATAACGGTTGGTGGACTGTATGCGA
TTGATCGTACGACTACAGTGAAAGCTAAGCTGAACAACAATGGCAAACTCGGTGCTCTGC
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TTTGGAATAAATAGTTCCGCAGTGAAAATTGACGGTTAATTCTTTTTCGGTTATGTTTTT
TTTTCTTTAACATTTTTTCACTAAGCAATATTCTTGGTACATTTTTTTTAGC

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 2

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CAGCACTGCGCTCTTGGAACACTGCCATATCCACTGCAAATCTCAGGGTTTCATTACAGC
ACAAAGCCGCAAAACGTCTCAAGAATCTACTGGTTACGTATTCCTAAGATGTGTGATCAC
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GGTCCTTGCATACACTTACATGGATGCATGTGTTAGAAATGTTGGTTAGCATAACTGGGG
TAACGCAGAGAATGAGAGAAGTGCTTGCTTTTATGAGTACAGGTGCTTTGGTCCGGGTAG
CTGCTCGTCAGGACGTGTTACATGGTCGAGAGAACTGATGGATGAAGAAGCTGGACACTT
TCTGCATCATAGTTTTGTGGATCCAAATCAGGACCGGCCTTGGTTGTGTCTGAGAATGGG
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GAGGCGTTGGTTGAATAACAAAGGATTATGGAGAACCACCTACCTGCTGTAAACCAATTA
CTTTTAACTTGGAATTATCTTTGTCCTAGTGAATAAGATGCCAATATTGTACCC


BQ
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GCCCAAGAGGAAAAACTTCATCACTTTCGCCGGAATCTCCCCGGAAATCACCCTTCTCAC
TTGGAACAACACCGCTTCCAAGATTGAGCATCACCAGGCGTCTAGAGTCATAGGGACGGG
AACGTTTGGGTGCGGGAGTGTTATTGTTGAAGGTGAAGACTTTATTGCTGAGAACGTTAC
TTTTGAAAACTCTTCTCCTGAGGGATCAGGGCAAGCTGTGGCGATAAGAGTCACTGCAGA
CCGTTGTGCCTTTTATAACTGTCGCTTCCTCGGCTGGCAGGATACATTGTATTTGCATCA
TGGAAAGCAATACTTGAAAGACTGCTACGTGGAGGGAAGCGTGGATTTCATATTTGGAAA
CAGCACTGCGCTCTTGGAACACTGCCATATCCACTGCAAATCTCAGG*TTTCATTACAGC
ACAAAGCCGCAAAACGTCTCA*GAATCTACTG

QA 1 692 1 692
DS 

RD RS1CL83JQ 753 0 0
GGGATCAGGGCAAGCTGTGGCGATAAGAGTCACTGCAGACCGTTGTGCCTTTTATAACTG
TCGCTTCCTCGGCTGGCAGGATACATTGTATTTGCATCATGGAAAGCAATACTTGAAAGA
CTGCTACGTGGAGGGAAGCGTGGATTTCATATTTGGAAACAGCACTGCGCTCTTGGAACA
CTGCCATATCCACTGCAAATCTCAGGGTTTCATTACAGCACAAAGCCGCAAAACGTCTCA
AGAATCTACTGGTTACGTATTCCTAAGATGTGTGATCACGGGGAATGGTCAGAGTGGGTA
TATGTATCTAGGAAGGCCATGGGGACCATTTGGGAGAGTGGTCCTTGCATACACTTACAT
GGATGCATGTGTTAGAAATGTTGGTTAGCATAACTGGGGTAACGCAGAGAATGAGAGAAG
TGCTTGCTTTTATGAGTACAGGTGCTTTGGTCCGGGTAGCTGCTCGTCAGGACGTGTTAC
ATGGTCGAGAGAACTGATGGATGAAGAAGCTGGACACTTTCTGCATCATAGTTTTGTGGA
TCCAAATCAGGACCGGCCTTGGTTGTGTCTGAGAATGGGAGTGAAGACACCATATTCTGC
GTAGAGACTACTTGGAAAAAATGGTTTGTGTTTGTCACTGAGGCGTTGGTTGAATAACAA
AGGATTATGGAGAACCACCTACCTGCTGTAAACCAATTACTTTTAACTTGGAATTATCTT
TGTCCTAGTGAATAAGATGCCAATATTGTACCC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL6358Contig1 880 2 2 U
GGCACTCAAACGAGCCCTAATGTAATGTCGGCGACGACGGCGACCATGAAAACCTCCACG
GCTCTTCTCCTCCGCACTCTTTCGAAAGCTCGCATTTTTCATCCTCATTATCCGTCTCCT
TCTTGGGCTCGATGCAATCCTCTGTTGCCAGCTCCCCGATCACTAGACATCGCTGCTTCG
CGGCGATCCTACTCAGCGATGATCGCGTCGGCGAACTCTCCCTTCCGGTCCAACCTCCTC
CGAATCATAAGAAACGAGATCGAGTATCAATCTGAATATGCTCCTCCGCATCAGCCAGCG
ACTGAGTTCAAGTCATTCTCTGTTGAGGATCGTCCCGGTGAGCAATGCGTTGTGATGAAA
GGGAAGTTTGGAGAAGAGGAAAGTATCAAAATGGAAGCAACTATGTTCGATGGGTTTATG
ACTGTTCCACGAACCGGTTTAGATGCTTCAGGCCGCGACGCCCGTCTTCACGTTAGCTTG
CTTGTCGACATTTCCAAGTCTGATGGGAGTGAGGACATGGAGTTTCTTTGCTCCGTCTGG
CCTAACCGTATCGAAATTCAAAACCTTTACATGCTTAAGCGCGATAAAATTACTGGTCAG
CCTTACATGGGACCAAAGTTCGGGAGTTTGAAGTATGATTTTCAGACAGCGGTTAAAGAG
TTTTTGCGAGTGAGAGGGATAGACTCGGAGCTTTGCTTTTTCTTGCATGATTATATGATG
AATAAAGATAGGATTGAGCTCATTCAATGGTTGAGAAAGCTAAATTCTTTCATCGCAAAG
TAAATTTCCCATCGTTTTGACATATCTTTTTGATGATTATGTTCTCAGTTTATACAATGC
TTGAAATGGAATAAATCATATACGATATAAAGTTGATCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BP12TF U 1
AF RS1BP12JQ C 214
BS 1 640 RS1BP12TF
BS 641 880 RS1BP12JQ

RD RS1BP12TF 640 0 0
GGCACTCAAACGAGCCCTAATGTAATGTCGGCGACGACGGCGACCATGAAAACCTCCACG
GCTCTTCTCCTCCGCACTCTTTCGAAAGCTCGCATTTTTCATCCTCATTATCCGTCTCCT
TCTTGGGCTCGATGCAATCCTCTGTTGCCAGCTCCCCGATCACTAGACATCGCTGCTTCG
CGGCGATCCTACTCAGCGATGATCGCGTCGGCGAACTCTCCCTTCCGGTCCAACCTCCTC
CGAATCATAAGAAACGAGATCGAGTATCAATCTGAATATGCTCCTCCGCATCAGCCAGCG
ACTGAGTTCAAGTCATTCTCTGTTGAGGATCGTCCCGGTGAGCAATGCGTTGTGATGAAA
GGGAAGTTTGGAGAAGAGGAAAGTATCAAAATGGAAGCAACTATGTTCGATGGGTTTATG
ACTGTTCCACGAACCGGTTTAGATGCTTCAGGCCGCGACGCCCGTCTTCACGTTAGCTTG
CTTGTCGACATTTCCAAGTCTGATGGGAGTGAGGACATGGAGTTTCTTTGCTCCGTCTGG
CCTAACCGTATCGAAATTCAAAACCTTTACATGCTTAAGCGCGATAAAATTACTGGTCAG
CCTTACATGGGACCAAAGTTCGGGAGTTTGAAGTATGATT

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1BP12JQ 667 0 0
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GAATATGCTCCTCCGCATCAGCCAGCGACTGAGTTCAAGTCATTCTCTGTTGAGGATCGT
CCCGGTGAGCAATGCGTTGTGATGAAAGGGAAGTTTGGAGAAGAGGAAAGTATCAAAATG
GAAGCAACTATGTTCGATGGGTTTATGACTGTTCCACGAACCGGTTTAGATGCTTCAGGC
CGCGACGCCCGTCTTCACGTTAGCTTGCTTGTCGACATTTCCAAGTCTGATGGGAGTGAG
GACATGGAGTTTCTTTGCTCCGTCTGGCCTAACCGTATCGAAATTCAAAACCTTTACATG
CTTAAGCGCGATAAAATTACTGGTCAGCCTTACATGGGACCAAAGTTCGGGAGTTTGAAG
TATGATTTTCAGACAGCGGTTAAAGAGTTTTTGCGAGTGAGAGGGATAGACTCGGAGCTT
TGCTTTTTCTTGCATGATTATATGATGAATAAAGATAGGATTGAGCTCATTCAATGGTTG
AGAAAGCTAAATTCTTTCATCGCAAAGTAAATTTCCCATCGTTTTGACATATCTTTTTGA
TGATTATGTTCTCAGTTTATACAATGCTTGAAATGGAATAAATCATATACGATATAAAGT
TGATCAT

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 2

CO CL6359Contig1 233 2 1 U
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AATGAAGCCGTAGCAGCTGGGGATTCGCCTCTATCTCCATGATTTATCTGATGCTCTCAT
CTTACAGCTAGACTTTCTTCAGTTGCCCATGTTAGTTTTGTGGCAGACATGTATGTAACA
TTGTTGAATACTTGAATCTACCAAACATAAATCTTAAAGTGACAACTTCATCC


BQ
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AF RS1FG86JQ C 1
AF RS1FG86TF U 1
BS 1 233 RS1FG86TF

RD RS1FG86JQ 233 0 0
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AATGAAGCCGTAGCAGCTGGGGATTCGCCTCTATCTCCATGATTTATCTGATGCTCTCAT
CTTACAGCTAGACTTTCTTCAGTTGCCCATGTTAGTTTTGTGGCAGACATGTATGTAACA
TTGTTGAATACTTGAATCTACCAAACATAAATCTTAAAGTGACAACTTCATCC

QA 1 233 1 233
DS 

RD RS1FG86TF 233 0 0
GTACGAGAACTACAGAAGTATCACCGATGAAAAAGTGAGTTCTGCGTTCAACAAACTAAC
AATGAAGCCGTAGCAGCTGGGGATTCGCCTCTATCTCCATGATTTATCTGATGCTCTCAT
CTTACAGCTAGACTTTCTTCAGTTGCCCATGTTAGTTTTGTGGCAGACATGTATGTAACA
TTGTTGAATACTTGAATCTACCAAACATAAATCTTAAAGTGACAACTTCATCC

QA 1 233 1 233
DS 



AS 1 2

CO CL6360Contig1 903 2 2 U
GGACAGCAATTATAAATACTCTGCTAATTGTCACGACTTATAACTCAAAACTGTATTCTG
CGAGAGATTTTACATTTAAAGTTTCAAAAGAAAACTTCAATATGGGAAGAGTTGATTATT
TGGCCATGAAGACTGGAGAGGAAACCGCGGCTAACCTGATCAATTCTGATCTGAATGAGT
TTGTCGATGCCGCGAAGAAGCTCGTGAAAGATGCAACGATGCTAGGCAGTTTAAGCTTTG
GCACGTCTTTCCTCCAATGGGCCGCCTCAATCTCAGCCATCTATCTGTTGATATTGGATC
GGACCAACTGGAAAACCAAAATGTTGACTACCCTTTTGGTGCCATACATCTTTCTCACAC
TTCCTTACGTTATCTTTAACTTCTTCAGAGGAGATTTTGGGAAATGGATTGCTCTCATTT
CGATCACAATAAGGCTCTTCTGCCCTAAACACTTTCCAGATTGGTTGGAGATTCCAGCAG
CTTTGATCCTTCTTCTGGTGGTTGCACCTAGTCTCACAGCTGGGACAGTAAGAGAAAGTT
GGGTTGGGGCAGTAATATGTCTTATCATAGCATGTTACCTTTTCCATGAACATATCAAAG
CTTCTGATGGATTCAGAAACGCTTTAACTCAGAAGCATGGACTCTCCAATACTATTGGGA
TCGTTGCTCTCCTCGTTTACCCGGTTTGGACCATCTTTTTTAACATCTTCTAACTCTATT
CTACTACCCATTGGCCTGGAAACACCTTCAACATTCTGTGTCTTGCTTTCATTTGATAAA
GTGCGAATTGTTTATGTGTTTTAGCAGCATTTGTGTTTGGGAAAATCTTCATTGAACAAA
AGAAGATTCACTTGTGATGTGTAAGATATATGGGTTTGTGTTGTATATCGCTTGGTGTGT
TAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 

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AF RS1CA61JQ C 256
BS 1 679 RS1CA61TF
BS 680 903 RS1CA61JQ

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CGAGAGATTTTACATTTAAAGTTTCAAAAGAAAACTTCAATATGGGAAGAGTTGATTATT
TGGCCATGAAGACTGGAGAGGAAACCGCGGCTAACCTGATCAATTCTGATCTGAATGAGT
TTGTCGATGCCGCGAAGAAGCTCGTGAAAGATGCAACGATGCTAGGCAGTTTAAGCTTTG
GCACGTCTTTCCTCCAATGGGCCGCCTCAATCTCAGCCATCTATCTGTTGATATTGGATC
GGACCAACTGGAAAACCAAAATGTTGACTACCCTTTTGGTGCCATACATCTTTCTCACAC
TTCCTTACGTTATCTTTAACTTCTTCAGAGGAGATTTTGGGAAATGGATTGCTCTCATTT
CGATCACAATAAGGCTCTTCTGCCCTAAACACTTTCCAGATTGGTTGGAGATTCCAGCAG
CTTTGATCCTTCTTCTGGTGGTTGCACCTAGTCTCACAGCTGGGACAGTAAGAGAAAGTT
GGGTTGGGGCAGTAATATGTCTTATCATAGCATGTTACCTTTTCCATGAACATATCAAAG
CTTCTGATGGATTCAGAAACGCTTTAACTCAGAAGCATGGACTCTCCAATACTATTGGGA
TCGTTGCTCTCCTCGTTTA

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DS 

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CCAAAATGTTGACTACCCTTTTGGTGCCATACATCTTTCTCACACTTCCTTACGTTATCT
TTAACTTCTTCAGAGGAGATTTTGGGAAATGGATTGCTCTCATTTCGATCACAATAAGGC
TCTTCTGCCCTAAACACTTTCCAGATTGGTTGGAGATTCCAGCAGCTTTGATCCTTCTTC
TGGTGGTTGCACCTAGTCTCACAGCTGGGACAGTAAGAGAAAGTTGGGTTGGGGCAGTAA
TATGTCTTATCATAGCATGTTACCTTTTCCATGAACATATCAAAGCTTCTGATGGATTCA
GAAACGCTTTAACTCAGAAGCATGGACTCTCCAATACTATTGGGATCGTTGCTCTCCTCG
TTTACCCGGTTTGGACCATCTTTTTTAACATCTTCTAACTCTATTCTACTACCCATTGGC
CTGGAAACACCTTCAACATTCTGTGTCTTGCTTTCATTTGATAAAGTGCGAATTGTTTAT
GTGTTTTAGCAGCATTTGTGTTTGGGAAAATCTTCATTGAACAAAAGAAGATTCACTTGT
GATGTGTAAGATATATGGGTTTGTGTTGTATATCGCTTGGTGTGTTAA

QA 1 648 1 648
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6362Contig1 1042 2 8 U
GCAAGAAGAGTAATGGATACAATGCTTGTTTCTTGAGTCAGGATATTGTACATAAGGTCC
TTACTTGCGCGATCACCTGAGCTTCAGTCGATCAAGGTTTCTCCTGTTGAACGCTTTTTG
GAGAAGCCTTACACTAGTCGAACTAGAAGCTCCAGCGGGAGTAGCAGCCCGGGTAGATCG
CCAGTTCGATACTATGAAGAGCCGATACATGGCTTCAAAGTAAATTTAAAGCCAGACAAG
AAAAGCAAGTTGGTATCAGTAGTTTCAAGAATCCGTGGACATGACCAGGATACTGGGAGG
CAACAAGTAACTGGAGGAAAGCTGAGGGAGATACAAGATGACGCCAAAAGTTTTGCGATT
GGAAACAAACCCTTGGCTGCTTTGTTTGTTCACACTCCTGCTGGTGAACTACAAAGGCAG
ATTAGGTCATGGCTTGCAGAAAGCTTTGAGTCTTCTTTCTGTTACAGCAGACGATACTTC
TGGAGGAACCACAGGCCAGTTAGAGCTTCTTTCCACAGCAATTATGGATGGCTGGATGGC
TGGAGTAGGAGCTGCAGTGCCACCTCACACAGATGCTTTGGGACAGCTTTTATCTGATTA
TGCAAAAAGAGTCTACACCTCTCAGATGCAGCATCTAAAGGACATTGCCGGTACTTTGGC
TTCGGAAGAAGCAGAAGATGCTGGTCAAGTAGCAAAGCTTAGATCAGCTCTTGAGTCTGT
TGACCACAAAAGAAAAAAGATTTTGCAACAAATGAGAAGTGATGCAGCTTTGTTTACCTT
GGAGGAAGGCACTTCTCCTGTTCAGAATCCTACCACAGCAGCCGAAGACTCGAGATTAGC
TTCTCTCATTTCTCTAGATGCCATACTGAAGCAAGTCAAGGAAATAACAAGACAAGCCTC
TGTCCACGTTTTGAGTAAAAGCAAGAAGAAAGCATTACTTGAGTCACTTGAGGACTCACT
GAACGAATGCCTTCCCTTCTTGACGTTGATCATCCATGTGCACAGAGAGAAATGCTACGC
TCACATTTGGTGGAGACATCCC


BQ
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AF RS1GV69TF U 1
AF RS1AM69TF U 198
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BS 217 278 RS1GV69TF
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CCAGTTCGATACTATGAAGAGCCGATACATGGCTTTAAAGTAAATTTAAAGCCAGACAAG
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GGAAACAAACCCTTGGCTGCTTTGTTTGTTCACACTCCTGCTGGTGAACTGCAAAGGCAG
ATTAGGTCATGGCTTGCAGAAAGCTTTGAGTCTTCTTTCTGTTACAGCAGACGATACTTC
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DS 

RD RS1AM69TF 845 0 0
G
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GTAGTTTCAAGAATCCGTGGACATGACCAGGATACTGGGAGGCAACAAGTAACTGGAGGA
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GCTTTGTTTGTTCACACTCCTGCTGGTGGACTACAAAGGCAGATTAGGTCATGGCTTGCA
GAAAGCTTTGAGT*TTCTTTCTGTTACAGCAGACGATACTTCTGGAGGAACCACAGGCCA
GTTAGAGCTTCTTTCCACAGCAATTATGGATGGCTGGATGGCTGGAGTAGGAGCTGCAGT
GCCACCTCACACAGATGCTTTGGGACAGCTTTTATCTGATTATGCAAAAAGAGTCTACAC
CTCTCAGATGCAGCATCTAAAGGACATTGCCGGTACTTTGGCTTCGGAAGAAGCAGAAGA
TGCTGGTCAAGTAGCAAAGCTTAGATCAGCTCTTGAGTCTGTTGACCACAAAAGAAAAAA
GATTTTGCAACAAATGAGAAGTGATGCAGCTTTGTTTACCTTGGAGGAAGGCACTTCTCC
TGTTCAGAATCCTACCACAGCAGCCGAAGACTCGAGATTAGCTTCTCTCATTTCTCTAGA
TGCCATACTGAAGCAAGTCAAGGAAATAACAAGACAAGCCTCTGTCCACGTTTTGAGTAA
AAGCAAGAAGAAAGCATTACTTGAGTCACTTGAGGACTCACTGAACGAATGCCTTCCCTT
CTTGACGTTGATCATCCATGTGCACAGAGAGAAATGCTACGCTCACATTTGGTGGAGACA
TCCC

QA 2 845 2 845
DS 



AS 1 2

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GGACTCACTCTCTGGTCTCTACGGACTCTTGTCTTGTCCGAAATCTAGATTTTCTTTAAA
GGTACCAATGAGTTATCTGGGGATCGGAATCAGTCCCGGAAGCGTCGCCATCTACCAAGG
AGGCAAGATGAAGCTGATTGATCAGAGAGTTAGGCTAACGGAGGTTCTCTTACGCTGCTC
CGTGAGTGTCTTCGCTCTCCTCGCACTTATTCTGATGGTTACAGACACTCAGGTCAAGCG
TATCTTCGTAGTTGAGAAGAGGGCCAAGTACACCGACATGAAGTCTCTTGTATTCTTGGT
GGTGGCTAATGGGATAGCTGCAGCTTATTCATCATTACAATCAGTTCGTTGCGCGGCGGG
TTCGATGAAAGGAAGTGTTTTGTTCAGCAAGCCACTTGCTTGGGCCATTTTCTCTGTTGA
CCAGGCTATGGCTTACGTGAGCGTTGCGGCTATAGCAGCTCATCAGAGTCTGGTGTGATT
GGAATAAGAGGTGAGGAAAGGTTGCAGTGGATGAAAGTGTGTAATATGTATGCCAAGTTC
TGCTACCAAGGGGCTGGAGTGGTTGCTAGCGCCTCTATTGCCTCAGTTGCTATGGTGTTC
GTGTCTTGCATTTCTGCTTTTAGTCTCTTCCGCTTGTATGGTGCCACTCAAAGGCGGCTC
AACCTCGCCTTGGTGAAGTGAAAATGCACCTTCTTTAGTATTTATGAAATGTTTTTTTTT
TTTTTTTTTGCTAAAATATTTATGAAATGTTGTTAAAATGATAATCTTCTCTCATTCTAT
GTAACAAACTATATGTAAAATTGGACCTAGTGTTATCC


BQ
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AF RS1EJ16TF U 1
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QA 1 522 1 522
DS 



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BQ
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CATTCCG

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RD RS1B833TF 247 0 0
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CATTCCG

QA 1 247 1 247
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1G444TF U 1
AF RS1G444JQ C 317
BS 1 743 RS1G444TF
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TCCACCGGAAACCTCATCAGAAA*GCCCTAACG

QA 1 753 1 753
DS 

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TCAGAAAAGCCCTAACGGTTATTATTTTTTTCCGGCGACCGATAATAGCTACGATCAGTC
ATATTCCTACGGAAACAACAACTACAACAGCGAGGAGGAGAAGACCTTCAAGGATCCGTA
CAATTCCAAGTGGGAGAAGAACATGATGAACGGACAGCCCGAGGGGTTTGTTGAGGAACA
AGGAGATCAGTTCAAGCCTTGATGAAAATTTGTAGTATTTGATTTCCTCTCGAGATCTAC
ACTCTTATTGGTGATTTTCGCTTATTTCAACTAAGTTTATTTTACTTATGGTTGATTAGT
CAAAGTAAATCTTTGTTATCATTACCATAAATCGAAAGAGAAAGGGGTTTTTGTGTGTGT
GTGTTTG

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

CO CL6366Contig1 1073 2 8 U
GGACAAACGATACTTGCTCAGCTTCATTGTGATATATTGATGAGTCAGAATGTTGGAAAC
ACATAGAGTCTTCATCCTCTGCTTTTTGCTCTGTCTCCTCACATCTCATTCTCTTGTCTC
CCCTCTTCAAACCTTCCAGAAGATCCCTCTGCCGCCAGGAGTCTCTGGTCCCGAAGCTTT
TGCTTTCGATTCTCACGGTGTAGGACCTTATACCGGAGTCTCCGGCGGCAAGATCTTAAA
ATACCAAGGACCAAAGCTTGGCTTTACAGAGTTCGCCTATATTTCACCAATAGCGAACAA
GTCACTATGTGATAAAGCAGTAGGGACTTTTCTTGGTAACATATGTGGTAGACCAGTCGG
TTTAGCTTTCAATGAGATAACCGAGATTTGTACATAGCCGATGCGTTCTTGGGGCTGTAC
GTGGTTTCACGCCGCGGTGGCCAAGCCAATCGCCTAGCCGACAGCGCAGTTGGTTTACCT
TTTAAATTCCTTGACGGTTTAGATGTAGATCCAGTGACTGGTTCGGTTTACTTCACATCT
TTCAGCACAAGATTTGGTCCCAGTCAACTTGTCTTGGCGGTTGCTGTTAATGATGCAACG
GGGAGGTTCTTTAGGTACGACCCAACGACGAAAAGCGTAACCGTTTTGTTAAGCGGTCTA
AGTGGCTCAGCCGGATGCGCCGTGAGCTCCGACGGAGAGTTTGTTCTGGTGGGAGAGTTC
TTGAGGAATCGTATCTTAAGGTATTGGATCAAGGGTCCAAAAGTCAACACGTGGGACGTT
TTCGTACCTTCGATCCCTGGTCCGGACAACATAAGGAGAACAGACGGTGGAGATTTCTGG
ATCGCCTCCAACTCCGTGAAGCTTATAGTGGTCCCCACCAAGCCGTCAGCGGTGGAATTC
AACGCCGGCGGTGAGATTATCCAGCGTATGTCTCTCGGAGAATATTATGGAGATACGTTA
GTAAGTGAAGTGAATGAATATAGAGGTGTTGTTTATGTCGGAACACTCACGACCAACTTT
GTTGGTAACATGTAACAAAAGATGTCAAAAATAATAGTTAATGCCTCCATACC


BQ
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AF RS1B991TF U 1
AF RS1B991JQ C 299
BS 1 689 RS1B991TF
BS 690 690 RS1B991JQ
BS 691 701 RS1B991TF
BS 702 702 RS1B991JQ
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BS 727 736 RS1B991TF
BS 737 1073 RS1B991JQ

RD RS1B991TF 736 0 0
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TGCTTTCGATTCTCACGGTGTAGGACCTTATACCGGAGTCTCCGGCGGCAAGATCTTAAA
ATACCAAGGACCAAAGCTTGGCTTTACAGAGTTCGCCTATATTTCACCAATAGCGAACAA
GTCACTATGTGATAAAGCAGTAGGGACTTTTCTTGGTAACATATGTGGTAGACCAGTCGG
TTTAGCTTTCAATGAGATAACCGAGATTTGTACATAGCCGATGCGTTCTTGGGGCTGTAC
GTGGTTTCACGCCGCGGTGGCCAAGCCAATCGCCTAGCCGACAGCGCAGTTGGTTTACCT
TTTAAATTCCTTGACGGTTTAGATGTAGATCCAGTGACTGGTTCGGTTTACTTCACATCT
TTCAGCACAAGATTTGGTCCCAGTCAACTTGTCTTGGCGGTTGCTGTTAATGATGCAACG
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TTGAG*AATCGTATCT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RS1B991JQ 775 0 0
AAGTCACTATGTGATAAAGCAGTAGGGACTTTTCTTGGTAACATATGTGGTAGACCAGTC
GGTTTAGCTTTCAATGAGATAACCGAGATTTGTACATAGCCGATGCGTTCTTGGGGCTGT
ACGTGGTTTCACGCCGCGGTGGCCAAGCCAATCGCCTAGCCGACAGCGCAGTTGGTTTAC
CTTTTAAATTCCTTGACGGTTTAGATGTAGATCCAGTGACTGGTTCGGTTTACTTCACAT
CTTTCAGCACAAGATTTGGTCCCAGTCAACTTGTCTTGGCGGTTGCTGTTAATGATGCAA
CGGGGAGGTTCTTTAGGTACGACCCAACGACGAAAAGCGTAACCGTTTTGTTAAGCGGTC
TAAGTGGCTCAGCCGGATGCGCCGTGAGCTCCGACGGAGAGTTTGTTCTGGTGGGAGAGT
TCTTGAGGAATCGTATCTTAAGGTATTGGATCAAGGGTCCAAAAGTCAACACGTGGGACG
TTTTCGTACCTTCGATCCCTGGTCCGGACAACATAAGGAGAACAGACGGTGGAGATTTCT
GGATCGCCTCCAACTCCGTGAAGCTTATAGTGGTCCCCACCAAGCCGTCAGCGGTGGAAT
TCAACGCCGGCGGTGAGATTATCCAGCGTATGTCTCTCGGAGAATATTATGGAGATACGT
TAGTAAGTGAAGTGAATGAATATAGAGGTGTTGTTTATGTCGGAACACTCACGACCAACT
TTGTTGGTAACATGTAACAAAAGATGTCAAAAATAATAGTTAATGCCTCCATACC

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

CO CL6367Contig1 1282 2 4 U
GGACACTTGAAAAGGAAAAGAAAAATGTATACCGAGGAAAAGAAGAAAAATACCAACTAT
GGATCTGTATTTGTCTACTGCTTCTTCTGTCTTGTTTTTGTTGTAGGAGTAGTAAGATTT
GCAAAACCTTATTATAACCTTCAAAACCTAACGGAGACAGGAGCAGTAATAGAAGAAAGA
TTGTTTGACATGGAGGAATTAGGGGTACTTCCATGTGACTTGAAGAGCTCTGTCTCTGTT
CCTGCTCGGAATCACCACACGCTCTCGACAACAGTAAGGGAAGAAACGAGAACTCGTCCT
CCACTTTCGTACTGTGTGAAGTTCGAATCTTTTGCCACTATGGCGAACCTGGTCAAAGAA
AACGGTGACAAGTACGAGTCACGTCCTTTCTCAGCCGGTGGATACAATTGGACGTTCCTC
ATCTACCCAAACGCGAACAAGCCAGAGGGCTCGGGTGGATACGTTTCGCTTTACGTAAAA
ATCGATAACTCAAGCCTCATCACCACTCATAACGAAGTGTATGCATGGATCAAATTCCTC
ACCTATAAAAGCACTACAGACACGTACCATGAGCTCCATGCGACGGAGGCGCAGAGATTT
CATTTGTTTAAACAACAATATGGAATGCTAACCTTTCTTGAGATTGGGTATTACCAAAAT
CCGGCATATGGATTCATTTTCAACGGCGGACAAAGTGTGTTTGGCGTTGACATTGTGGTT
TCTAAACCCTCTGCATGGGAAGATGTCTCTTATGAGCAAAACATTCGTGATCCTGTTCTC
GATTGGAGAATCATCAAATTCTCTGTCGGCGATCATGTCTCTTACACTTTTGATACGTTT
TCTTCCGGTGGAAGAAACTGGATATTGAAAGTGTATCCAAACGGAGTTGGGTCTGCAACG
GGTAATTCGTTGTCACTCTATTTGTTGAGTGCGTCAAACCAAAAGGGTTACGTGAAAGTC
AAGTTTAGAGTTATTAACCAGACCCCATCCAATAATGTAGAGAAACAAGTGGAGGGATGG
CCCAATGCACAAGAAAATGGATGGGGTGTCGACAAACTTATACCTCTTGCGGATATCAAA
GATACGTCCAAAGGTTTCCTCGTCAACGATGTCATCAGATTTGAAGTCGAGATCCTGGCC
TTCTTTAAGACTTAAGATAATCGTGACTCGTACGTGTGTTGTTTTTTCGTATCGTAACAG
GAGATACTTGGTAGTAACTCCATGTGAATTACTATATCACTTTGTATCGCTGTTTCTGTT
TCCGTCCAATAATAAAGAGTCC


BQ
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AF RS1FF80TF U 1
AF RS1FF80JQ C 547
BS 1 682 RS1FF80TF
BS 683 683 RS1FF80JQ
BS 684 789 RS1FF80TF
BS 790 1282 RS1FF80JQ

RD RS1FF80TF 797 0 0
GGACACTTGAAAAGGAAAAGAAAAATGTATACCGAGGAAAAGAAGAAAAATACCAACTAT
GGATCTGTATTTGTCTACTGCTTCTTCTGTCTTGTTTTTGTTGTAGGAGTAGTAAGATTT
GCAAAACCTTATTATAACCTTCAAAACCTAACGGAGACAGGAGCAGTAATAGAAGAAAGA
TTGTTTGACATGGAGGAATTAGGGGTACTTCCATGTGACTTGAAGAGCTCTGTCTCTGTT
CCTGCTCGGAATCACCACACGCTCTCGACAACAGTAAGGGAAGAAACGAGAACTCGTCCT
CCACTTTCGTACTGTGTGAAGTTCGAATCTTTTGCCACTATGGCGAACCTGGTCAAAGAA
AACGGTGACAAGTACGAGTCACGTCCTTTCTCAGCCGGTGGATACAATTGGACGTTCCTC
ATCTACCCAAACGCGAACAAGCCAGAGGGCTCGGGTGGATACGTTTCGCTTTACGTAAAA
ATCGATAACTCAAGCCTCATCACCACTCATAACGAAGTGTATGCATGGATCAAATTCCTC
ACCTATAAAAGCACTACAGACACGTACCATGAGCTCCATGCGACGGAGGCGCAGAGATTT
CATTTGTTTAAACAACAATATGGAATGCTAACCTTTCTTGAGATTGGGTATTACCAAAAT
CCGGCATATGGATTCATTTTCA*CGGCGGACAAAGTGTGTTTGGCGTTGACATTGTGGTT
TCTAAACCCTCTGCATGGGAAGATGTCTCTTATGAGCAAAACATTCGTGATCCTGTTCTC
GATTGGAGA
TCATCAAA

QA 1 789 1 789
DS 

RD RS1FF80JQ 736 0 0
AAAAGCACTACAGACACGTACCATGAGCTCCATGCGACGGAGGCGCAGAGATTTCATTTG
TTTAAACAACAATATGGAATGCTAACCTTTCTTGAGATTGGGTATTACCAAAATCCGGCA
TATGGATTCATTTTCAACGGCGGACAAAGTGTGTTTGGCGTTGACATTGTGGTTTCTAAA
CCCTCTGCATGGGAAGATGTCTCTTATGAGCAAAACATTCGTGATCCTGTTCTCGATTGG
AGAATCATCAAATTCTCTGTCGGCGATCATGTCTCTTACACTTTTGATACGTTTTCTTCC
GGTGGAAGAAACTGGATATTGAAAGTGTATCCAAACGGAGTTGGGTCTGCAACGGGTAAT
TCGTTGTCACTCTATTTGTTGAGTGCGTCAAACCAAAAGGGTTACGTGAAAGTCAAGTTT
AGAGTTATTAACCAGACCCCATCCAATAATGTAGAGAAACAAGTGGAGGGATGGCCCAAT
GCACAAGAAAATGGATGGGGTGTCGACAAACTTATACCTCTTGCGGATATCAAAGATACG
TCCAAAGGTTTCCTCGTCAACGATGTCATCAGATTTGAAGTCGAGATCCTGGCCTTCTTT
AAGACTTAAGATAATCGTGACTCGTACGTGTGTTGTTTTTTCGTATCGTAACAGGAGATA
CTTGGTAGTAACTCCATGTGAATTACTATATCACTTTGTATCGCTGTTTCTGTTTCCGTC
CAATAATAAAGAGTCC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

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ATTCTCGATTATCTTCGAATTCTTTGTACTCTTATATATAAACTTTAGTGGTTATATACG
TACTTTGACGTCATACAACATGGCCGAAGAAGAACCAAAGAAGGTGACGGATACCGTTAA
CAACGTGTCAGAACAATCTCCATCCCCGTCAGCTCCAGCGAAGGAAGCTGTTGTTACAGC
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GGTGTAGAAGAAGCTAGATGACCCCAAGGCTCTTATTTCCATCATCGCAAAAGAAGTACA
AGAAGAGAAAAAGGAAGGGTCGATTAATCGAGATGCTGTCCTGGCTAGAGTTGAGACAGA
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AGCTAGACGTGGAGAAGAGGTTCTCAAGGCCGAGGAATTAGCTGCCAAGTACCGTGCCAA
CGGAACTGCTCCAAAAAAAGCCATTTGGATTCATGTGATTCAATTATATCGATGGAAAAC
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BQ
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AF RS1BC95TF U 1
AF RS1BC95JQ C 155
BS 1 578 RS1BC95TF
BS 579 838 RS1BC95JQ

RD RS1BC95TF 578 0 0
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ATTCTCGATTATCTTCGAATTCTTTGTACTCTTATATATAAACTTTAGTGGTTATATACG
TACTTTGACGTCATACAACATGGCCGAAGAAGAACCAAAGAAGGTGACGGATACCGTTAA
CAACGTGTCAGAACAATCTCCATCCCCGTCAGCTCCAGCGAAGGAAGCTGTTGTTACAGC
GGTTGTTGCTCCACAAGAGAAGCCTGTGGCTCCACCTCCAGTTCTTCCATCTCCAGCGCC
GGTGTAGAAGAAGCTAGATGACCCCAAGGCTCTTATTTCCATCATCGCAAAAGAAGTACA
AGAAGAGAAAAAGGAAGGGTCGATTAATCGAGATGCTGTCCTGGCTAGAGTTGAGACAGA
GAAGAGGATGTCACTTATCAAAGCTTGGGAAGAAGCTGAGAAATGCAAAGTGGAGAACAA
AGCTGAGAAGAAGCTTTCTTCAATTGGGTCATGGGAGAACAACAAAAAAGCAGCTGTAGA
AGCTGAGCTCAAGAAAATAGAGGAACAATTGGAGAAGA

QA 1 578 1 578
DS 

RD RS1BC95JQ 684 0 0
CCAAAGAAGGTGACGGATACCGTTAACAACGTGTCAGAACAATCTCCATCCCCGTCAGCT
CCAGCGAAGGAAGCTGTTGTTACAGCGGTTGTTGCTCCACAAGAGAAGCCTGTGGCTCCA
CCTCCAGTTCTTCCATCTCCAGCGCCGGTGTAGAAGAAGCTAGATGACCCCAAGGCTCTT
ATTTCCATCATCGCAAAAGAAGTACAAGAAGAGAAAAAGGAAGGGTCGATTAATCGAGAT
GCTGTCCTGGCTAGAGTTGAGACAGAGAAGAGGATGTCACTTATCAAAGCTTGGGAAGAA
GCTGAGAAATGCAAAGTGGAGAACAAAGCTGAGAAGAAGCTTTCTTCAATTGGGTCATGG
GAGAACAACAAAAAAGCAGCTGTAGAAGCTGAGCTCAAGAAAATAGAGGAACAATTGGAG
AAGAAGAAGGCCGAGTATGTTGAGTTGATGAAGAACAAAATAGCTCAAATTCACAAACAG
GCAGAAGAGAAGAGAGCTATGATCGAAGCTAGACGTGGAGAAGAGGTTCTCAAGGCCGAG
GAATTAGCTGCCAAGTACCGTGCCAACGGAACTGCTCCAAAAAAAGCCATTTGGATTCAT
GTGATTCAATTATATCGATGGAAAACATGTATTTGATGTTTCTGAAATGTTTATTTTCAT
TTCTTATAAATTTGAAAATTATCC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL6369Contig1 893 2 2 U
GGCCAGTCAGCGTTGATCTCTTACCTCCACTTCCCACTTCACTCCTCAAGTCCATCCTCT
GTAAAACCCCACACAGCCGCAAATTCGAATCAAATCAAATATAACAGAAATAAACTAGAG
ATCTCGAAACGGAACAGAGTCGAATCGAAATCAAAACCAAATCTAACCGAACCGAACCGA
ACCGAACCGAACCGGGTGTGTGCTTGTCTTTTCTTCTTTGTTATTTCCAATGGTGAAGAA
GGCGATAAAGGAGGAGGAAGAGAATCGAAACTCGTCGACGCAGTCAAAATACAGAGGCGT
GAGGAAGAGGAAATGGGGCAAATGGGTGTCGGAGATCAGACTTCCACACAGCAGAGAACG
CATCTGGTTAGGCTCCTACGACACTCCCGAGAAGGCGGCGCATGCCTTCGACGCCGCTCA
GTTCTGTCTCCGCGGCTGCGATTCAGATTTCAATTTCCCCGATAATCCACCGTCCATCTC
CGGAGGAAGGTCGCTGTCGGCTCCAGAGATTCGAGAAGCTGCCATTCGATTCGCCAACGC
TCAAGACGATACTACTAGTGTCCGGGAAGAAGAATCGGGTTTGTCCGAAATCCGACCGGA
GTCTCCTTCAACATCCGTCGTGTCTGAAGTAGCTACGTCGTCGTCGGCGACAACGCTGGA
TTGCGATATGTTGTTCTTCCTAGATATGATTCCTACTGATTTCGAGATGTTTCCAGGGTT
TGATGACTTCTCCGACGGCTTCTCTGGTGATCGGTTTACTGAGATTTCACCCATTGAAGA
CTACGGAGGAGGAGGAGAAGAAATTTTTGATGGGTCTTTGTTTCTTTGGGACTTTTAAAT
ATCCAAAGACAGAAAAAATTGTAAAGAGCGACTTGTGGTTTCTTGGGGGATCT


BQ
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GTTCTGTCTCCGCGGCTGCGATTCAGATTTCAATTTCCCCGATAATCCACCGTCCATCTC
CGGAGGAAGGTCGCTGTCGGCTCCAGAGATTCGAG

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CTTTTCTTCTTTGTTATTTCCAATGGTGAAGAAGGCGATAAAGGAGGAGGAAGAGAATCG
AAACTCGTCGACGCAGTCAAAATACAGAGGCGTGAGGAAGAGGAAATGGGGCAAATGGGT
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GCGACTTGTGGTTTCTTGGGGGATCT

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DS 



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BQ
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AF RS1EM22JQ C 1
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TGAGATCCGGTGAGACCTGAAGAGGCGCTTGAAGATTAGGTTTAGTTTTTTTTTTCTGGG
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ATTTAATTTATAAAAGA

QA 1 437 1 437
DS 



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TGCGCTCTGATTAATCAGAAATGCCATGTGAAGAAGAAGGATATTAGGAAGTTTCTTGAT
GGTATCTATGTGAGCGAGAAGGGCAAGATCGCTGTTGAAGAATGAAGCTATTGAAGTGCT
TTATTAGATTCATATTGTGGAAGAGTGATTTAGTTGTAGCGTTTTTTATTTACCGTCTCT
TATGGATTTGTAGTTTTATGGATTTGTAGTTTTGTTTCCGTTGGACCGTTATTGATGATG
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GACACTATTTTCACTTTTACTTGTTCTTGGAGCTGGTTTGAGTTATATGATATGTTCTAT
TTTATTGATCGTG


BQ
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AF RS1D481TF U 1
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BS 1 718 RS1D481TF
BS 719 913 RS1D481JQ

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GAGAAAGTCAAGGATGAGATTACTCTTGAGGGTAATGATATCGAGCTTGTCTCGCGTTCT
TGCGCTCTGATTAATCAGAAATGCCATGTGAAGAAGAAGGATATTAGGAAGTTTCTTGAT
GGTATCTATGTGAGCGAGAAGGGCAAGATCGCTGTTGAAGAATGAAGCTATTGAAGTGCT
TTATTAGATTCATATTGTGGAAGAGTGATTTAGTTGTAGCGTTTTTTATTTACCGTCT

QA 1 718 1 718
DS 

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TCGTGTATGCTCATTTCCCCATCAACGCTTCCATCTCCGGGGACAACAAGTCCATCGAGA
TCCGTAACTTCCTCGGCGAGAAGAAGGTCAGGAAGGTTGATATGTTGGATGGTGTTACCA
TTGTTCGGTCTGAGAAAGTCAAGGATGAGATTACTCTTGAGGGTAATGATATCGAGCTTG
TCTCGCGTTCTTGCGCTCTGATTAATCAGAAATGCCATGTGAAGAAGAAGGATATTAGGA
AGTTTCTTGATGGTATCTATGTGAGCGAGAAGGGCAAGATCGCTGTTGAAGAATGAAGCT
ATTGAAGTGCTTTATTAGATTCATATTGTGGAAGAGTGATTTAGTTGTAGCGTTTTTTAT
TTACCGTCTCTTATGGATTTGTAGTTTTATGGATTTGTAGTTTTGTTTCCGTTGGACCGT
TATTGATGATGCAAACTCGCTGTCCCTTTATGTTTGGGTTTTTTATTTTCTCTGTTCTTG
CAAAAGTTTTTGACACTATTTTCACTTTTACTTGTTCTTGGAGCTGGTTTGAGTTATATG
ATATGTTCTATTTTATTGATCGTG

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

CO CL6372Contig1 1168 2 2 U
GTGTCATGTATAAACCATAAAGTGATTGTTATGGTTTTTACCGAATATTTTGCCATCACC
GATCTCTCCTGTCCTTGCTCCATCGATTATAGTGTTGATTACAGACTCCACCTGCAAAAC
AAGAAGAACATAAATGGTTATAGACTTATTGAAGTTTTGGTTTCTTTTAAATCATATACG
TACTTGTTCTTTCTTGACAACGATCTCCATTTTAACTTTAGCGACAAACTTGTCTTCAGA
GAACTCAGACCCTGCAAAACTCAAACAACTTTGTATCACATTTTTGACAGTAGTAAGAAT
CAGTGAACTTGTTGTTGAACTCAATAGCTTACCACCATGTCTCTCCTTGGATCCACCTTG
TGCACCAAACCCTCGGACATCAGAAACCGTAACACCTCTAATCCCGATTTTCAATAAAGC
CTTGAGTAATTACGAAAACAGAGAAATGATTTAGTTGGATTTTCTAAAGTAGTTAGTACT
AATTTTTTTATTTAGTTGTAATGTCTTTTCTGTTTGCAATGTTCATTATTATTTTTGTAA
TATTTTCAATTAGTATGAAATTTTAAATATCAAATTTAGAGTTCAAAAATGTTTTTTTGG
TCAATTATTACTAGTTTATTTGGTTAATTTACAAAAATTTAGATAATTATGATGGATTTT
TGGCTAACTTTCGATAGGGTTGAGATGTTTTTCGGGTCCTAAATACATGAACCAATGCCT
AGACCTAGTTTGAAAAGTATTTACAATAACTATGAGAGCCCTAAGCCGTTTTCACAAATG
CAAACACTAGAGGAACAAGACATGACCAGTCCTATCGAGTTCAGCTGCATATTTGGTTTG
ATCTTTTGCATGCATTGATATGAACTTTTACTCTATACTTATTTATTGCCAAAGTGTGAC
ATCTTTTTTATCCTAAGACTCTCCTAGGATCAAGTGATTATCAAAGCACAAAATATTCCT
TCACATATCCAAAAAAGCTGAGAACAGTGAGAATTTTTTTTACCGATGAAACATGCTGGA
TCCTCCATGGCCTTATAACATTCACACAAGACAATGAAGAGATGTATCAGTTATAAGCCT
TTTTCAGACATATAGACCACAAAAGACATAGAAGCTTACCTGACAATTGCTTCAACCTTG
TAAAACTTCGAGTCTGGAATATAATCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GH74TF U 1
AF RS1GH74JQ C 442
BS 1 563 RS1GH74TF
BS 564 1168 RS1GH74JQ

RD RS1GH74TF 563 0 0
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GATCTCTCCTGTCCTTGCTCCATCGATTATAGTGTTGATTACAGACTCCACCTGCAAAAC
AAGAAGAACATAAATGGTTATAGACTTATTGAAGTTTTGGTTTCTTTTAAATCATATACG
TACTTGTTCTTTCTTGACAACGATCTCCATTTTAACTTTAGCGACAAACTTGTCTTCAGA
GAACTCAGACCCTGCAAAACTCAAACAACTTTGTATCACATTTTTGACAGTAGTAAGAAT
CAGTGAACTTGTTGTTGAACTCAATAGCTTACCACCATGTCTCTCCTTGGATCCACCTTG
TGCACCAAACCCTCGGACATCAGAAACCGTAACACCTCTAATCCCGATTTTCAATAAAGC
CTTGAGTAATTACGAAAACAGAGAAATGATTTAGTTGGATTTTCTAAAGTAGTTAGTACT
AATTTTTTTATTTAGTTGTAATGTCTTTTCTGTTTGCAATGTTCATTATTATTTTTGTAA
TATTTTCAATTAGTATGAAATTT

QA 1 563 1 563
DS 

RD RS1GH74JQ 727 0 0
AGAAATGATTTAGTTGGATTTTCTAAAGTAGTTAGTACTAATTTTTTTATTTAGTTGTAA
TGTCTTTTCTGTTTGCAATGTTCATTATTATTTTTGTAATATTTTCAATTAGTATGAAAT
TTTAAATATCAAATTTAGAGTTCAAAAATGTTTTTTTGGTCAATTATTACTAGTTTATTT
GGTTAATTTACAAAAATTTAGATAATTATGATGGATTTTTGGCTAACTTTCGATAGGGTT
GAGATGTTTTTCGGGTCCTAAATACATGAACCAATGCCTAGACCTAGTTTGAAAAGTATT
TACAATAACTATGAGAGCCCTAAGCCGTTTTCACAAATGCAAACACTAGAGGAACAAGAC
ATGACCAGTCCTATCGAGTTCAGCTGCATATTTGGTTTGATCTTTTGCATGCATTGATAT
GAACTTTTACTCTATACTTATTTATTGCCAAAGTGTGACATCTTTTTTATCCTAAGACTC
TCCTAGGATCAAGTGATTATCAAAGCACAAAATATTCCTTCACATATCCAAAAAAGCTGA
GAACAGTGAGAATTTTTTTTACCGATGAAACATGCTGGATCCTCCATGGCCTTATAACAT
TCACACAAGACAATGAAGAGATGTATCAGTTATAAGCCTTTTTCAGACATATAGACCACA
AAAGACATAGAAGCTTACCTGACAATTGCTTCAACCTTGTAAAACTTCGAGTCTGGAATA
TAATCGT

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

CO CL6373Contig1 593 2 2 U
TCGGTGATGAGCGTAAAAGCACTAGGAATAGCGCTAAAGCTGACATTTTCTGGAACAAAT
CAGTTGTTTTATCCTCAGACTTGGGTGTTCACCTTGGTCGTACTTACCTGTGTGATAACC
CAGTTGAACTACTTAAACAAGGCTCTTGACACATTCAATACAGCTATAGTATCTCCTATA
TACTACGTAATGTTCACATCACTAACTATATTGGCCAGCGTTATCATGTTTAAGGACTGG
GATAGGCAAAACGGTACTCAAATAGTCACGGAAATGTGCGGATTCGTTACAATACTTTCA
GGCACTTTTCTTCTCCATAGAACGAAGGACATGGTTGAGGGTTCATCGGTGATATTACCG
TTGCGGATAAGCAAGCATGCCAATGAGGATGGGGTTTGAATCAGAAGGCATTCCACTTAG
ACGCCAAGAGTCCCATGTCAGTTTAAAAGCTGTTATTGCTTTTTGTTTTCCGCTCTAGTG
CAAGCCAGAGAGCCTCAACTTTTTTTTTCACCTTATCTCGATCTACGATGAACGCGTGGA
CCATGGTTCTTCTGTTCTAACAATCACATATGGTTCACGAAGTTCAAGAAGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AC55TF U 1
AF RS1AC55JQ C 331
BS 1 582 RS1AC55TF
BS 583 593 RS1AC55JQ

RD RS1AC55TF 586 0 0
TCGGTGATGAGCGTAAAAGCACTAGGAATAGCGCTAAAGCTGACATTTTCTGGAACAAAT
CAGTTGTTTTATCCTCAGACTTGGGTGTTCACCTTGGTCGTACTTACCTGTGTGATAACC
CAGTTGAACTACTTAAACAAGGCTCTTGACACATTCAATACAGCTATAGTATCTCCTATA
TACTACGTAATGTTCACATCACTAACTATATTGGCCAGCGTTATCATGTTTAAGGACTGG
GATAGGCAAAACGGTACTCAAATAGTCACGGAAATGTGCGGATTCGTTACAATACTTTCA
GGCACTTTTCTTCTCCATAGAACGAAGGACATGGTTGAGGGTTCATCGGTGATATTACCG
TTGCGGATAAGCAAGCATGCCAATGAGGATGGGGTTTGAATCAGAAGGCATTCCACTTAG
ACGCCAAGAGTCCCATGTCAGTTTAAAAGCTGTTATTGCTTTTTGTTTTCCGCTCTAGTG
CAAGCCAGAGAGCCTCAACTTTTTTTTTCACCTTATCTCGATCTACGATGAACGCGTGGA
CCATGGTTCTTCTGTTCTAACAATCACATATGGTTCACGAAG
ATCA

QA 1 582 1 582
DS 

RD RS1AC55JQ 263 0 0
ATGGTTGAGGGTTCATCGGTGATATTACCGTTGCGGATAAGCAAGCATGCCAATGAGGAT
GGG*TTTGAATCAGAAGGCATTCCACTTAGACGCCAAGAGTCC*ATGTCAGTTTAAAAGC
TGTTATTGCTTTTTGTTTTCCGCTCTAGTGCAAGCCAGAGAGCCTCAACTTTTTTTTTCA
CCTTATCTCGATCTACGATGAACGCGTGGACCATGGTTCTTCTGTTCTAACAATCACATA
TGGTTCACGAAGTTCAAGAAGGT

QA 1 263 1 263
DS 



AS 1 2

CO CL6374Contig1 703 2 2 U
GACATTACATTTTGTGTTTTGGAAAAAAATGTTTGTTTCTTTGCATAAAGAGCACAAAAA
AAAAAAAAAGAAAGGGAGAAAAGATTAGTCAGAAAATCTCATCATGGTCAACTTCTGGTT
GATGATTCAAACTCGCTTCTAGTGGCCATGGGGACATTGCCAATGTCTGAGTACTCCCAT
GGCCATGAGTCTTGCTCGTCATCTTTTAATTTTTCATTGTCCTTCTTCTTCTTCTTCTTT
TGACAAATGCAGGAGGTCGGGTCCTCATGGAACTCTCCTTCTCCTGCTTTCATTTCATCT
GGCTCCCCCATGAACCCTGTTTGGCATTTCCGGACCTTGGTTGAAAATTCATCCCATGTC
ATGTTGTGTCTGTTTGTGAAAATTTTATGGAGTTTCTTGGCGTTTGGACGGATGGTTACT
TTATGTCCCATGTATCTTCTTCTTCCGGCTACGATTCTAGCCATGTTGCCGTTGTTGTTG
GTGACAAATGCGTCGCTCTCATCACACACGATGAAGTCAAGAGCAGCCATGCGTGATGAG
AAGCGTGCAAACGGAGCTAGCTCTTTCTTAGAAGTCAATGTCTCTTTTGTATGGATATTT
GGAGACAGAGCTCTTAATGGTGCTAGTGTAGCATCCCCTCCGTATACCTCGCCTGATGCA
ACGTACAAGTGAAATTCTCTGCCAAAGCCTAAGCCCCTGAGCA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1FD41JQ U 1
AF RS1GR16JQ U 1
BS 1 445 RS1FD41JQ
BS 446 703 RS1GR16JQ

RD RS1FD41JQ 445 0 0
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AAAAAAAAAGAAAGGGAGAAAAGATTAGTCAGAAAATCTCATCATGGTCAACTTCTGGTT
GATGATTCAAACTCGCTTCTAGTGGCCATGGGGACATTGCCAATGTCTGAGTACTCCCAT
GGCCATGAGTCTTGCTCGTCATCTTTTAATTTTTCATTGTCCTTCTTCTTCTTCTTCTTT
TGACAAATGCAGGAGGTCGGGTCCTCATGGAACTCTCCTTCTCCTGCTTTCATTTCATCT
GGCTCCCCCATGAACCCTGTTTGGCATTTCCGGACCTTGGTTGAAAATTCATCCCATGTC
ATGTTGTGTCTGTTTGTGAAAATTTTATGGAGTTTCTTGGCGTTTGGACGGATGGTTACT
TTATGTCCCATGTATCTTCTTCTTC

QA 1 445 1 445
DS 

RD RS1GR16JQ 703 0 0
GACATTACATTTTGTGTTTTGGAAAAGAATGTTTGTTTCTTTGCATAAAGAGCACAAAAG
AAAAAAAAAGAAAGGGAGAAAAGATTAGTCAGAAGATCTCATCATGGTCAACTTCTGGTT
GATGATTCAAACTCGCTTCTAGTGGCCATGGGGACATTGCCAATGTCTGAGTACTCCCAT
GGCCATGAGTCTTGCTCGTCATCTTTTAGTTTTTCATTGTCCTTCTTCTTCTTCTTCTTT
TGACAAATGCAGGAGGTCGGGTCCTCATGGAACTCTCCTTCTCCTGCTTTCATTTCATCT
GGCTCCCCCATGAACCCTGTTTGGCATTTCCGGACCTTGGTTGAAAATTCATCCCATGTC
ATGTTGTGTCTGTTTGTGAAGATTTTATGGAGTTTCTTGGCGTTTGGACGGATGGTTACT
TTATGTCCCATGTATCTTCTTCTTCCGGCTACGATTCTAGCCATGTTGCCGTTGTTGTTG
GTGACAAATGCGTCGCTCTCATCACACACGATGAAGTCAAGAGCAGCCATGCGTGATGAG
AAGCGTGCAAACGGAGCTAGCTCTTTCTTAGAAGTCAATGTCTCTTTTGTATGGATATTT
GGAGACAGAGCTCTTAATGGTGCTAGTGTAGCATCCCCTCCGTATACCTCGCCTGATGCA
ACGTACAAGTGAAATTCTCTGCCAAAGCCTAAGCCCCTGAGCA

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 2

CO CL6375Contig1 913 2 2 U
GGACAACACATAGAGAGAGAGAGAAAGAAACCTTTTTGCCTTTCACATTCACTCATCTCT
CTAATATCACTTTACTCTGATTTAGGGTTTCTCTCATACAGACACTCCGCCATGAACATT
TTCAGGAAGAAGACTACTCCCAAAGATGCTCTTCGCACCAGTAAGAGAGAAATGTCTGTG
GCTACAAGAGGTATCGAACGAGAGATTTCATCTCTTCAGATGGAGGAGAAGAGACTAGTT
GCTGAGATCAAGAAAACTGCTAAAACTGGAAACGAGGCGGCGACGAAAATTTTAGCACGT
CAACTTGTTAGATTGAGGCAACAGATCACAAACTTACAGGGAAGCCGTGCTCAGATTAGA
GGTGTAACCACTCACACACAGGCTCTGTATGCGAGCACTTCGATTTCTTCTGGTATGAAA
GGTGCAACCAAAGCTATGGTTGCTATGAACAAGCAAATGGCACCAACGAAACAAGCCAAG
GTTATTAAGGACTTCCAGAAACAGTCTGCACAGCTAGACATGACGATAGAGATGATGTCA
GAGGCAATTGATGAAACACTTGACAAAGATGAGGCTGAAGAAGAAACAGAAGACCTCACT
AACCAAGTTCTCGATGAGATTGGTGTTGGAGTTGCATCTCAGTTATCTTCAGCTCCAAAA
GGTCGCATCGCTACAAAGACCGCAGCTCCTCCTGCATCTACTACTAGCAACAGCTTTGAA
TCAAGTGAAGTGGATGAGCTTGAAAAGAGGTTGGCTTCACTGCGAAGAATTTGAGAGTCA
GCTTTTATGCATGCTTCTGTATGATTAAATAAAAAACATAACAGCTTCCCTTTTTTTTTT
TTTGCTTGTTGTGATCTCTGTATAAATCTGCTGAAACTTATTATGGAGGAAGCTTAATTT
CCCCAAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CT04TF U 1
AF RS1CT04JQ C 279
BS 1 715 RS1CT04TF
BS 716 913 RS1CT04JQ

RD RS1CT04TF 718 0 0
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CTAATATCACTTTACTCTGATTTAGGGTTTCTCTCATACAGACACTCCGCCATGAACATT
TTCAGGAAGAAGACTACTCCCAAAGATGCTCTTCGCACCAGTAAGAGAGAAATGTCTGTG
GCTACAAGAGGTATCGAACGAGAGATTTCATCTCTTCAGATGGAGGAGAAGAGACTAGTT
GCTGAGATCAAGAAAACTGCTAAAACTGGAAACGAGGCGGCGACGAAAATTTTAGCACGT
CAACTTGTTAGATTGAGGCAACAGATCACAAACTTACAGGGAAGCCGTGCTCAGATTAGA
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GTTATTAAGGACTTCCAGAAACAGTCTGCACAGCTAGACATGACGATAGAGATGATGTCA
GAGGCAATTGATGAAACACTTGACAAAGATGAGGCTGAAGAAGAAACAGAAGACCTCACT
AACCAAGTTCTCGATGAGATTGGTGTTGGAGTTGCATCTCAGTTATCTTCAGCTCCAAAA
GGTCGCATCGCTACAAAGACCGCAGCTCCTCCTGCATCTACTACTAGCAACAGCT
CTG

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1CT04JQ 635 0 0
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TTCGATTTTTTTTGGTATGAAAGGTGCAACCAAAGCTATGGTTGCTATGAACAAGCAAAT
GGCACCAACGAAACAAGCCAAGGTTATTAAGGACTTCCAGAAACAGTCTGCACAGCTAGA
CATGACGATAGAGATGATGTCAGAGGCAATTGATGAAACACTTGACAAAGATGAGGCTGA
AGAAGAAACAGAAGACCTCACTAACCAAGTTCTCGATGAGATTGGTGTTGGAGTTGCATC
TCAGTTATCTTCAGCTCCAAAAGGTCGCATCGCTACAAAGACCGCAGCTCCTCCTGCATT
TACTACTAGCAACAGCTTTGAATCAAGTGAAGTGGATGAGCTTGAAAAGAGGTTGGCTTC
ACTGCGAAGAATTTGAGAGTCAGCTTTTATGCATGCTTCTGTATGATTAAATAAAAAACA
TAACAGCTTCCCTTTTTTTTTTTTTGCTTGTTGTGATCTCTGTATAAATCTGCTGAAACT
TATTATGGAGGAAGCTTAATTTCCCCAAAAAAAAA

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

CO CL6376Contig1 921 2 2 U
GGAGGCAGGTCCTGTTATTTATCGTAGCCGGACTGTTTTTGAGGATGCAACTCCAGACAT
TGTTAGGGATTTCTTCTGGGACGACGAGTTTCGACCTAAATGGGATCCTATGCTTGCTTA
TTTCAAAACTTTGGAAGAAGATTCTAATACAGGAACAACTATTGTTCACTGGATTAAAAA
GTTTCCGTTTTTCTGTAGTGACTGGGAATACATCATTGGCCGGAGAATATGGGGATCTGA
AAACAAGTATTATGCTGTGACTAAGGGAGTGCCGTATCCAGCTCTACCAAAGCATAAACC
GAGGCGAGTAGAGCTTTATTTCTCAAGTTGGATTATCAAAGCGGTTGAATCTAGGAAAGG
AGATGGACAGTTAACGGCTTGTGAGGTCTCTCTTGTCCACTGCGAAGACATGGGAATCCC
AAAAGACGTAGCAAAGTTAGGAGTCCGTCACGGCATGTGGGGAGCCGTCAAGAAGCTAAA
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GCAAATTGCGAGAATCACCGTAAAACTGAACGTGGATTTGGTGGAGACATCGAGAATAGA
GGAAGGAGAGAGAGGACAAGCCATGGATAACGTAAGGAGAGGGAAGGAGCAGTTCAGTGT
AGATTGGAAACTGGTCGTTGTAGGAGGAGTTGCCTTGGCGTGTGGGCTTCATTCAAGTGC
TATTGGCAAGGCCTTAATGGTTGGAGCTGGGCAGAGACTTGCTCGTAGGTGAAATCACTG
TTGTTATCTCTTCCTGCTGATAGATTGACATTGTAACGTGTGTCCATGGATAATTCTTTA
GCCTAGCACAGGAAGACAGTTTAGTTATATGTATCATGGATTGTGTTTTCTTCTTACAAC
AGTATATTTAATGTTGGAGGC


BQ
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AF RS1DD38TF U 1
AF RS1DD38JQ C 190
BS 1 614 RS1DD38TF
BS 615 921 RS1DD38JQ

RD RS1DD38TF 614 0 0
GGAGGCAGGTCCTGTTATTTATCGTAGCCGGACTGTTTTTGAGGATGCAACTCCAGACAT
TGTTAGGGATTTCTTCTGGGACGACGAGTTTCGACCTAAATGGGATCCTATGCTTGCTTA
TTTCAAAACTTTGGAAGAAGATTCTAATACAGGAACAACTATTGTTCACTGGATTAAAAA
GTTTCCGTTTTTCTGTAGTGACTGGGAATACATCATTGGCCGGAGAATATGGGGATCTGA
AAACAAGTATTATGCTGTGACTAAGGGAGTGCCGTATCCAGCTCTACCAAAGCATAAACC
GAGGCGAGTAGAGCTTTATTTCTCAAGTTGGATTATCAAAGCGGTTGAATCTAGGAAAGG
AGATGGACAGTTAACGGCTTGTGAGGTCTCTCTTGTCCACTGCGAAGACATGGGAATCCC
AAAAGACGTAGCAAAGTTAGGAGTCCGTCACGGCATGTGGGGAGCCGTCAAGAAGCTAAA
CTCCGGGTTAAGGGCATACCAGGCCGCTAGAAAATCAGGGGCGGCTCTGTCAGGGAGCGC
GCAAATTGCGAGAATCACCGTAAAACTGAACGTGGATTTGGTGGAGACATCGAGAATAGA
GGAAGGAGAGAGAG

QA 1 614 1 614
DS 

RD RS1DD38JQ 732 0 0
TTTCTGTAGTGACTGGGAATACATCATTGGCCGGAGAATATGGGGATCTGAAAACAAGTA
TTATGCTGTGACTAAGGGAGTGCCGTATCCAGCTCTACCAAAGCATAAACCGAGGCGAGT
AGAGCTTTATTTCTCAAGTTGGATTATCAAAGCGGTTGAATCTAGGAAAGGAGATGGACA
GTTAACGGCTTGTGAGGTCTCTCTTGTCCACTGCGAAGACATGGGAATCCCAAAAGACGT
AGCAAAGTTAGGAGTCCGTCACGGCATGTGGGGAGCCGTCAAGAAGCTAAACTCCGGGTT
AAGGGCATACCAGGCCGCTAGAAAATCAGGGGCGGCTCTGTCAGGGAGCGCGCAAATTGC
GAGAATCACCGTAAAACTGAACGTGGATTTGGTGGAGACATCGAGAATAGAGGAAGGAGA
GAGAGGACAAGCCATGGATAACGTAAGGAGAGGGAAGGAGCAGTTCAGTGTAGATTGGAA
ACTGGTCGTTGTAGGAGGAGTTGCCTTGGCGTGTGGGCTTCATTCAAGTGCTATTGGCAA
GGCCTTAATGGTTGGAGCTGGGCAGAGACTTGCTCGTAGGTGAAATCACTGTTGTTATCT
CTTCCTGCTGATAGATTGACATTGTAACGTGTGTCCATGGATAATTCTTTAGCCTAGCAC
AGGAAGACAGTTTAGTTATATGTATCATGGATTGTGTTTTCTTCTTACAACAGTATATTT
AATGTTGGAGGC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6378Contig1 1083 2 2 U
GACCATAGGTTCTGTAATTAAAATTGGGCACTTTACATCTAATTCGGAAGCTCTCTCCTC
AAGGACACGCATGGCTTCATCAGGTTGGGGTACTGTGAAAGCTGGCACTCCAAGCTGATG
ATATATAAAGAGTATTATATTACTACGTTAACAACAAAAAAAAGGAATGGTTCATTTAAA
ATTTAGATATACAAGAGTTATAGCCACCTTGAAAATCCCAGCCTTCTCACCAGCAATTTT
GCCAAGCGTATCACCTGTGATGCATCCCACCATAGAGTAGAAAGAAATCATGATACTAAT
ATCAAACCAAAGGAATGTAACTCAAAACTATGCTTGCTCATTTAAATAAAACATAGATCT
CATGATCTAAAGATATGGACAATGATCACATCTTCATAACAGAACTGAGAGGATTCTAGT
TACAAACCTAGAATCTCCATGTGGTCATATCCGAGCGAAGAAATACCACATACCACAGGT
TTATGAACCTGTAACAAGTCAGCAGTGAATCCCCATGAGAACTTATTTAGTGACAAAAAA
AAAAGATTACTTAAAAGAAAGTAATCAGTAATTCACTAATTGGAGTTTTATGTAGATAGT
ATTATGAGTTGCGTTTGCGTAATTACAGTCCTAATGAACCATAACCTTACATGTTATGTG
AAGGGATACATCCTATTTAGAGAAGAAAAAAAATAGACAACCCTAGATAAGAAAGTAAAA
AGAGGTTAAACTTACCGCATTAGTGGCATCAAACTTCCCGCCTAACCCTACCTCCAATAT
AGCAGCATCTACCTGCATAAAGAAGTAAGGAGGAATATCAATAAAGAGAAAAGGGTGTTT
TCACATCTATCATGGCACTGGGGTGGGTCAATAAAGGTAAAGATTGGCATATCAAACCTC
TCCTGCAGCAAAGATTTTAAAAGCTAGCAACGCAAGGAAGCGGAAATATGTAGGCATTGG
TATCTCCTCGTTAGTTCTCTCCTGCATTACAAATAGTCAGCAACCATGCATGAATTATAG
TCAAAAAAATGAAGCTTCATTTAAATCTATGCACACTAACAACCATTATAATTTCTTAGC
ATG


BQ
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10 10 10 

AF RS1CV52TF U 1
AF RS1CV52JQ C 432
BS 1 693 RS1CV52TF
BS 694 1083 RS1CV52JQ

RD RS1CV52TF 693 0 0
GACCATAGGTTCTGTAATTAAAATTGGGCACTTTACATCTAATTCGGAAGCTCTCTCCTC
AAGGACACGCATGGCTTCATCAGGTTGGGGTACTGTGAAAGCTGGCACTCCAAGCTGATG
ATATATAAAGAGTATTATATTACTACGTTAACAACAAAAAAAAGGAATGGTTCATTTAAA
ATTTAGATATACAAGAGTTATAGCCACCTTGAAAATCCCAGCCTTCTCACCAGCAATTTT
GCCAAGCGTATCACCTGTGATGCATCCCACCATAGAGTAGAAAGAAATCATGATACTAAT
ATCAAACCAAAGGAATGTAACTCAAAACTATGCTTGCTCATTTAAATAAAACATAGATCT
CATGATCTAAAGATATGGACAATGATCACATCTTCATAACAGAACTGAGAGGATTCTAGT
TACAAACCTAGAATCTCCATGTGGTCATATCCGAGCGAAGAAATACCACATACCACAGGT
TTATGAACCTGTAACAAGTCAGCAGTGAATCCCCATGAGAACTTATTTAGTGACAAAAAA
AAAAGATTACTTAAAAGAAAGTAATCAGTAATTCACTAATTGGAGTTTTATGTAGATAGT
ATTATGAGTTGCGTTTGCGTAATTACAGTCCTAATGAACCATAACCTTACATGTTATGTG
AAGGGATACATCCTATTTAGAGAAGAAAAAAAA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RS1CV52JQ 652 0 0
AATCTCCATGTGGTCATATCCGAGCGAAGAAATACCACATACCACAGGTTTATGAACCTG
TAACAAGTCAGCAGTGAATCCCCATGAGAACTTATTTAGTGACAAAAAAAAAAGATTACT
TAAAAGAAAGTAATCAGTAATTCACTAATTGGAGTTTTATGTAGATAGTATTATGAGTTG
CGTTTGCGTAATTACAGTCCTAATGAACCATAACCTTACATGTTATGTGAAGGGATACAT
CCTATTTAGAGAAGAAAAAAAATAGACAACCCTAGATAAGAAAGTAAAAAGAGGTTAAAC
TTACCGCATTAGTGGCATCAAACTTCCCGCCTAACCCTACCTCCAATATAGCAGCATCTA
CCTGCATAAAGAAGTAAGGAGGAATATCAATAAAGAGAAAAGGGTGTTTTCACATCTATC
ATGGCACTGGGGTGGGTCAATAAAGGTAAAGATTGGCATATCAAACCTCTCCTGCAGCAA
AGATTTTAAAAGCTAGCAACGCAAGGAAGCGGAAATATGTAGGCATTGGTATCTCCTCGT
TAGTTCTCTCCTGCATTACAAATAGTCAGCAACCATGCATGAATTATAGTCAAAAAAATG
AAGCTTCATTTAAATCTATGCACACTAACAACCATTATAATTTCTTAGCATG

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 2

CO CL6379Contig1 424 2 1 U
CCAACCCTAATCGAGAACCGCCGATACGTAAAGAGATCAAAGAAAAGGGTTTAATCATGG
CCAATCAGAAAGGCGCTCTCGAAGGCTTTTACAGACTGATCATGCGCCGTAACTCCGTCT
ACGTCTCCTTCATCATCGCCGGCGCTTTCTTCGGCGAACGGGCTGTGGATTACGGTGTTC
ATAAGCTCTGGGAAAGCAAGAATGTTGGGAAACGGTACGAAGACATCTCTGTGTTAGGTC
AAAGGCCTATTGAAGAATGAGATTTCTCCTTTACGAATCTTCTCAGACTAAAAGAAGGAA
ATGAAACTTTCCTTGTTGTTTTGCAAGTCGCTTCTCTTGTTCAATAAATCATTGGGATGA
TTTTAATACTTTCACCTAAAGCACGCTTACTGAACTGATTAATTGAATTTTCTGCATTGT
GGCG


BQ
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AF RS1AD87JQ C 1
AF RS1AD87TF U 1
BS 1 424 RS1AD87TF

RD RS1AD87JQ 424 0 0
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ACGTCTCCTTCATCATCGCCGGCGCTTTCTTCGGCGAACGGGCTGTGGATTACGGTGTTC
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TTTTAATACTTTCACCTAAAGCACGCTTACTGAACTGATTAATTGAATTTTCTGCATTGT
GGCG

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DS 

RD RS1AD87TF 424 0 0
CCAACCCTAATCGAGAACCGCCGATACGTAAAGAGATCAAAGAAAAGGGTTTAATCATGG
CCAATCAGAAAGGCGCTCTCGAAGGCTTTTACAGACTGATCATGCGCCGTAACTCCGTCT
ACGTCTCCTTCATCATCGCCGGCGCTTTCTTCGGCGAACGGGCTGTGGATTACGGTGTTC
ATAAGCTCTGGGAAAGCAAGAATGTTGGGAAACGGTACGAAGACATCTCTGTGTTAGGTC
AAAGGCCTATTGAAGAATGAGATTTCTCCTTTACGAATCTTCTCAGACTAAAAGAAGGAA
ATGAAACTTTCCTTGTTGTTTTGCAAGTCGCTTCTCTTGTTCAATAAATCATTGGGATGA
TTTTAATACTTTCACCTAAAGCACGCTTACTGAACTGATTAATTGAATTTTCTGCATTGT
GGCG

QA 1 424 1 424
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TTACCGATGAAACCTCCAAAACCAGTTCCACAAAGATTCTTCCTCGATGTGATTTTGTTC
TCTATCGTCTCACCTGCCGACAAGGTATCTCATGGTGCAGATTAAACCACCCTCTCGGCA
ACCTCATCTCTTGTGACCATTGATGCTCCGAAACTTCACCATTAAAGATAGTGGATCCCG
GATGTAATTTTAACTAGCCGTTACATCCTCCAATGTCAATCTCCGACACTGTTGGCTTCT
GCAACCTCAGATTTTTGGCTCTACACATGAATAACGCATCCGACTCCTTTGATTACTTGG
GGTACTCCACCTGAAACCATTGATCCAATTCCCTTCATGGCTGCACTTCCCAGAAGAGCA
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TCTTCAACTGTCTCCTTGACCTCAGAACCTGACACGAATACTCTTGACTCGTTCCTTTGG
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CCTGGAATCAAGTTTACCTCACCGTGGCTCCGGATGCCTAAAAGGTACAAGGCTTAAAGA
GAAACAATAACAAAATGAGAAGAACACTAAAGGTGGAGACTCGAACTCCCACTTTCTATG
GAGATCATCTTCTTCTCTCTTTGATATTCTCTTGTTCTCTATACTCTTTGAAGACTCCTT
AGCTCTCGTGCCATTACGGCACTATGCCGTGAACCTCAATTAAGTTACCTTGTTGTAAAC
GTTTTCCGCCTTCTTTTATACGTAACTGATGTCGGTTTGGACAAATAGATGGGCTCCATT
CTG


BQ
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BS 645 903 RS1FS12JQ

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GATGTAATTTTAACTAGCCGTTACATCCTCCAATGTCAATCTCCGACACTGTTGGCTTCT
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GGTACTCCACCTGAAACCATTGATCCAATTCCCTTCATGGCTGCACTTCCCAGAAGAGCA
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TCTTCAACTGTCTCCTTGACCTCAGAACCTGACACGAATACTCTTGACTCGTTCCTTTGG
ATTCAATAACACTGTGAAGCATTAACCTGCTTCAATTGAATCTTTTCATCAGCTGCTCCA
CCTGGAATCAAGTTTACCTCACCGTGGCTCCGGATGCCTAAAAG
T

QA 1 644 1 644
DS 

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CACGAATACTCTTGACTCGTTCCTTTGGATTCAATAACACTGTGAAGCATTAACCTGCTT
CAATTGAATCTTTTCATCAGCTGCTCCACCTGGAATCAAGTTTACCTCACCGTGGCTCCG
GATGCCTAAAAGGTACAAGGCTTAAAGAGAAACAATAACAAAATGAGAAGAACACTAAAG
GTGGAGACTCGAACTCCCACTTTCTATGGAGATCATCTTCTTCTCTCTTTGATATTCTCT
TGTTCTCTATACTCTTTGAAGACTCCTTAGCTCTCGTGCCATTACGGCACTATGCCGTGA
ACCTCAATTAAGTTACCTTGTTGTAAACGTTTTCCGCCTTCTTTTATACGTAACTGATGT
CGGTTTGGACAAATAGATGGGCTCCATTCTG

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

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TCCAATGGGGTTCTTCGACTTCAACACGTCGGATAAAACCGAAGAAGCTTTTGCAGAACA
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ATCGCTGTTGGAGAAGGATGTGGAGTTCGTGGGAGTGGAAGCAGAAGGGACAGAAAAAGC
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GAAATTTGGTTTAAAAGTCTTTCCTTTGAAAAAAAAATGTTTTTTACC


BQ
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AF RS1EL25TF U 1
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BS 1 748 RS1EL25TF
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AAATAAAATTGGTCAGTTGAGTAACAGCAATGACCAGCTAAAGGGATACCTTCAGGAAAA
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GGGTTGGGTGGAGCGAACCGTCATCCGATATGCAAGTGAGTGGCACTGGTCTGAACCCAT
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AAATGGAATCTGTGATACCAAACGGGTCGTCATCGTCACCAACAGAAAGATCGCTGTTGG
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CAATGAAAGAAGGGACAGTAGGGGAAGCTGGAGCGATGAAGAGGAAGATGGAGACGGTTG
AGAACCAAAAGGCGGAGGAGGAAAGTTCGGGAGTGAAGGAGTTCAACGATAACAATTTCT
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TATGATTTTGTATCGAGAGTGTTGTGTAAAAAAACTTTTACTTTTAGTTGAAATTTGGTT
TAAAAGTCTTTCCTTTGAAAAAAAAATGTTTTTTACC

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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1C253TF U 1
AF RS1C253JQ C 46
BS 1 703 RS1C253TF
BS 704 704 RS1C253JQ
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GTTCAATGATTTTGGCGAGAATGGAGGCCGAGCAGCTAAATCTTTAAGACCAAAGTTCAA
TGCTTTTGTTAGTCACGTAACAACTCATACTGGCCAGCGACTGCCACCAGTCGATATGAA
GCTTCTTGTTGCTGCTGCTATAGCCTTAAAGGGTATTGGTGGACTTTTGTTCATTTCTGG
CAGCTCCTTGGGAGCCTATCTCCTGCTTCTTCATCAAGCCGTTGCCACCCCAATTCTTTA
CGATTTCTACAACTACGATGCTGAGAGAAAGGAATTTAGCCAGCTGTTTACCAAATTTAC
TCAGAGCGTGGCACTTGTTGGGGCACTGCTCTTCTTTATTGGAATGAAGAACTCGAGGAG
ACATGGTAGACAACACCGGAAGAAGGCTCCAAAAGCTAAAGCAAACTGAAGAAAGATGAT
TCGTTTTCATCGCTTTTTTCATCTTTTGTAGCACAATCGGGTCTGTATTTTGAGATTTCT
GTTTTGGAATCCAGACATTGGTTTTGAAGATGTATGCTATAAG*CAAAAATCTTTCC

QA 1 717 1 717
DS 

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AGATTCAATGGAGTTGATTTCCTTCGTTGGTAGAGCTCTGTTCGTTTCCGTCTTTCTTCT
CTCCGCATGGCAAGAGTTCAATGATTTTGGCGAGAATGGAGGCCGAGCAGCTAAATCTTT
AAGACCAAAGTTCAATGCTTTTGTTAGTCACGTAACAACTCATACTGGCCAGCGACTGCC
ACCAGTCGATATGAAGCTTCTTGTTGCTGCTGCTATAGCCTTAAAGGGTATTGGTGGACT
TTTGTTCATTTCTGGCAGCTCCTTGGGAGCCTATCTCCTGCTTCTTCATCAAGCCGTTGC
CACCCCAATTCTTTACGATTTCTACAACTACGATGCTGAGAGAAAGGAATTTAGCCAGCT
GTTTACCAAATTTACTCAGAGCGTGGCACTTGTTGGGGCACTGCTCTTCTTTATTGGAAT
GAAGAACTCGAGGAGACATGGTAGACAACACCGGAAGAAGGCTCCAAAAGCTAAAGCAAA
CTGAAGAAAGATGATTCGTTTTCATCGCTTTTTTCATCTTTTGTAGCACAATCGGGTCTG
TATTTTGAGATTTCTGTTTTGGAATCCAGACATTGGTTTTGAAGATGTATGCTATAAGGC
AAAAATCTTTCC

QA 1 672 1 672
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GCGACCTGTTCCTTATTGGCACCCAACCTACGAAAGTCAAATAATAACTTTTTTTTTTTG
TTCAAAGTCAAATAATAACTTAGGATGCGTATTAACTGTAGAATATTCTTTTGATAGATC
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AATTATTTCAACCAGTGTTTCAATTTTCAACTATC


BQ
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AF RS1EN04TF U 1
AF RS1EN04JQ C 230
BS 1 635 RS1EN04TF

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TTTGGTTAATGCCGTCACCGATCATCATCACATACCTCTTGTACTTCGGAATCTCCACGT
ATTCCTCGTACAATCCCGCCGTTACATAGATCAAGAAATAACCGTTACTACCGTCGGTTT
TATTAGGCGCGGCTGCTACTGCTTCGTTTATGGTCGTGAAGTTTCCCGTCCCGTTCTGTA
TCACCGTCACCATATCGCTCACCTTAACAGCGCCTTCTTCAGTTTGAAGAAGCTTTCTCC
CAGACCTAGTCACGGCGTTATAAACAGCACGAGCTCTTTCCGACATCTTTATGGGTAATC
TACCGTTACGGAAACCACCGAAAAACTTTTTGAATCTGGCTTGTGGATTCCAAACAGGCC
GCGACCTGTTCCTTATTGGCACCCAACCTACGAAAGTCAAATAATAACTTTTTTTTTTTG
TTCAAAGTCAAATAATAACTTAGGATGCGTATTAACTGTAGAATATTCTTTTGATAGATC
AATGGAGTTTTTTTTTAAATAAAAAGCATGTGAAACGCCCGGTTATGTGTGTAGATTAAC
AATTATTTCAACCAGTGTTTCAATTTTCAACTATC

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DS 

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AAGCTTTCTCCCAGACCTAGTCACGGCGTTATAAACAGCACGAGCTCTTTCCGACATCTT
TATGGGTAATTTACCGTTACGGAAACCACCGAAAAACTTTTTGAATTTGGCTTGTGGATT
CCAAACAGGCCGCGACCTGTTCCTTATTGGCACCCAACCTACGAAAGTCAAATAATAACT
TTTTTTTTTTGTTCAAAGTCAAATAATAACTTAGGATGCGTATTAACTGTAGAATATTCT
TTTGATAGATCAATGGAGTTTTTTTTTAAATAAAAAGCATGTGAAACGCCCGGTTATGTG
TGTAGATTAACAATTATTTCAACCAGTGTTTCAATTTTCAACTATC

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DS 



AS 1 2

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GTAGAAGACACGTCAAGCTTCGAAGAGGATCAGCTCGCTTCCATGTCCACAGAAGATATC
ATCAGAGCTGCTCGCCTCCTCGAAAACGAGATTCGAATCCTCAAGGAAGACGCACAAAGA
ACGAATCTTGAATGCGATTCTTACAAGGAGAAGATAAAAGAGAATCAGGAGAAGATTAAA
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GAAGATGATGCTGAGGAAGACGGTGCTAATATTGACCTTGACTCTCAACGGAAGGGAAAG
TGTGTTGTGTTGAAAACCTCTACACGACAGACTATCTTTCTACCAGTTGTTGGTCTCGTG
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AAGGGAGTAC


BQ
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AF RS1A112TF U 1
AF RS1A112TV U 37
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BS 704 790 RS1A112TV

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GAAGATGATGCTGAGGAAGACGGTGCTAATATTGACCTTGACTCTCAACGGAAGGGAAAG
TGTGTTGTGTTGAAAACCTCTACACGACAGACTATCTTTCTACCAGTTGTTGGTCTCGTG
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GCTTCCATGTCCACAGAAGATATCATCAGAGCTGCTCGCCTCCTCGAAAACGAGATTCGA
ATCCTCAAGGAAGACGCACAAAGAACGAATCTTGAATGCGATTCTTACAAGGAGAAGATA
AAAGAGAATCAGGAGAAGATTAAACTCAACAAGCAGCTTCCTTACCTGGTTGGCAACATT
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CTTGACTCTCAACGGAAGGGAAAGTGTGTTGTGTTGAAAACCTCTACACGACAGACTATC
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AAAGCCATGGAGGTCGATGAGAAACCTACCGAAGATTACAATGACATTGGAGGACTAGAG
AAGCAGATCCAAGAGCTTGTAGAGGCTATTGTGCTCCCCATGACGCACAAGGAGCGTTTC
GAAAAGCTAGGTGTTCGTCCACCAAAGGGAGTAC

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DS 



AS 1 2

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GCTATTAATCTTACTAAGTCTCCATTGCGTCACTCTCATCAACAACTCCATTACTCATTT
TTAACTTGAACTCTCCAAGTTTCTCCACTTTCTCCACCCACACACTGTAACTCGAGTTCT
TCGCCAAGACATCCAAAGAAACTTCCTTCATCTGCACCAATGTATCAGCATAGCTCTTAA
ACCCAACAATCTTTTCCCTCAACAAAGTTCGCTTCTGCAAATCTATACTCTCACAGCTCA
AATCATCCAAACATTCTTTTGCTTCCTCAAGCTTAGCCCAAAAGCAAGTATCCTGCGTAG
TGCTAGCATACCGAGTTCTCGCACGCTTCTCTTTATGAGGCGCTCCTCTTTCTTTCCACC
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TCCTTGAATATTTGTACTTGTAGAAGTACGCAATGTCTAGTGGTTCGGCTAAGAGTTGGT
AAAACTGTGATGCGTATACCCATTTCTTCCCCAGATGAAAATCAAAAGGTAACTTATTCT
TCTCCACCATTTCAAACACACCATCCCAAAACTTAGCTAGCTTTGCGCGACTCATGTTCA
CCCTTATCTCTCTTGCATTTGAGAATTGTTTGAAGTTATCGTAGTAACCTAGCTGTTTTG
GTGACGCT


BQ
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TTAACTTGAACTCTCCAAGTTTCTCCACTTTCTCCACCCACACACTGTAGCTCGAGTTCT
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TCCTTGAATATTTGTACTTGTAGAAGTACGCAATGTCTAGTGGTTCGGCTAAGAGTTGGT
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BQ
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AF RS1FQ92JQ C 1
AF RS1FQ92TF U 1
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GGGTTTGGTTG

QA 1 671 1 671
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BQ
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AF RS1AO54TFB C 1
AF RS1AO54JQ U 167
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RD RS1AO54TFB 858 0 0
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ATGAGGAGGTGGCCTCGACTGTGACCTCGATATCGACATAGACCTCGACTTCGACCTCAC
GCGCATCTTCTTGTTCGAGTCTTGCTCATCATCCACATCCATTGCATCTTCTGAACGGTC
CCTCTTCCTCCCTCTCGACTTGCTTCTCGCACGGTCCACTGCAGCAGACGGATCAAGCCC
CAGAGAAGACAGCTCCCTACCCATTCTCTTAGTTGTGTACTTCTTGTCCTTGTCAAACTT
CCTTGGAACGGTTGATCTGTTCTGCGCAACGGTCTTCTTGAGCCTATGCTCTCTGATGAG
CACAGCTTTCTTGTTCCTAATCTTAGCAAGCTGCTCCTTCTGTTCCTCAGTGAGCTCTTC
CCCATCCATCTCGAAATCATCCTCTTCACCATTAGCCAGCCTGGTCTCTTCCTCACGCTC
CAACTCCTCGAGCCTCAACAAAATGTCCGGATCAAGGAAGTCAGCAACGTTGTGACCATC
GAGAATCTCAGGCAATCC

QA 1 858 1 858
DS 

RD RS1AO54JQ 676 0 0
TTTCATCAACGCCTATCTGTCTTTCCTTTACCCCTCTTCCCTGAGAACAAATGCTTCGGC
CTCAGAGTCGGTATAACTCTATCAGCTTCACCACGTCTTGCATTCTTGTCTCTCTTCTTG
TGAGAGCTATTGCTAATCTTAAGCGCCGCCTTCTTCTGAGTAGAGTCTTTGAACCCTTCA
CCAGGCACAACTTCATGAGGAGGTGGCCTCGACTGTGACCTCGATATCGACATAGACCTC
GACTTCGACCTCACGCGCATCTTCTTGTTCGAGTCTTGCTCATCATCCACATCCATTGCA
TCTTCTGAACGGTCCCTCTTCCTCCCTCTCGACTTGCTTCTCGCACGGTCCACTGCAGCA
GACGGATCAAGCCCCAGAGAAGACAGCTCCCTACCCATTCTCTTAGTTGTGTACTTCTTG
TCCTTGTCAAACTTCCTTGGAACGGTTGATCTGTTCTGCGCAACGGTCTTCTTGAGCCTA
TGCTCTCTGATGAGCACAGCTTTCTTGTTCCTAATCTTAGCAAGCTGCTCCTTCTGTTCC
TCAGTGAGCTCTTCCCCATCCATCTCGAAATCATCCTCTTCACCATTAGCCAGCCTGGTC
TCTTCCTCACGCTCCAACTCCTCGAGCCTCAACAAAATGTCCCGATCAAGGA*GTCAGCA
ACGTTGTGACCATCGA

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL6391Contig1 851 2 2 U
GGGTGCGAAGAGCGAAGAATCTGATCCTAAGTTCTGTTTTGAAAAAATGGAAGGGAGTGT
GTTTACGCCTTGTTTGGAAGGACTGAAGCATGCCAAGTCTGAACATGGCGAGATGCTTTC
TAAGCCTTTTCTGGACGTCTGCAAGACCATCTTGCCTGTTTTAGATAAGTTTGGACCCGC
TATGACTCTCGTGAAAGCCGACATTGGTGGCAACATATCGAGGTTGGAGAAGAATTACTT
GTCTGATCCCAACAAGTACAAGTACTTGTACACCTTTGTTCAAGGCGAAATTGAGTCTAA
GACTGCAAAAGGATCGTCTAGCTGTACCAACGGTCTTCTCTGGCTAACCAGAGCAATGGA
TTTCTTAGTGGAGCTGTTCCGCAACTTGGTAGCACATCAAGACTGGTCAATGTCACAAGC
TTGTGGAGACTCATACCAGAAAACACTCAAGAAATGGCACGGATGGATCGCTAGCTCTAG
CTTCACTATGGCCTTAAAGCTTGCTCCAGATAGGAAGAAGTTCATAGATGTGATATCTGG
TTCTGGTGACATCTACACTGATATGGCAAGCTTTTGCTCTGAGTTTGGTCCGTTGCTTCA
ATATAACCATAAGTTCCTGGCTAGCGTCCGTATGGATGACATGAAAGCTTCTTAAGCCAT
CACATATGGTCATTGTTATCGCCGGTATCCTAATCTGCTTAGCCGGAGACGTTTTAACTT
TCTCTTTGGGATTTTATAACTTTTAGACCCTCCAAAGAAACAGAATAATTTGTCAATTTC
TATCTGAATCTTAGTTCACTTTATGTTATAACTTTATAAGATACTAATCAATCTGATCAA
CTCTTTTCGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G014TF U 1
AF RS1G014JQ C 177
BS 1 677 RS1G014TF
BS 678 851 RS1G014JQ

RD RS1G014TF 677 0 0
GGGTGCGAAGAGCGAAGAATCTGATCCTAAGTTCTGTTTTGAAAAAATGGAAGGGAGTGT
GTTTACGCCTTGTTTGGAAGGACTGAAGCATGCCAAGTCTGAACATGGCGAGATGCTTTC
TAAGCCTTTTCTGGACGTCTGCAAGACCATCTTGCCTGTTTTAGATAAGTTTGGACCCGC
TATGACTCTCGTGAAAGCCGACATTGGTGGCAACATATCGAGGTTGGAGAAGAATTACTT
GTCTGATCCCAACAAGTACAAGTACTTGTACACCTTTGTTCAAGGCGAAATTGAGTCTAA
GACTGCAAAAGGATCGTCTAGCTGTACCAACGGTCTTCTCTGGCTAACCAGAGCAATGGA
TTTCTTAGTGGAGCTGTTCCGCAACTTGGTAGCACATCAAGACTGGTCAATGTCACAAGC
TTGTGGAGACTCATACCAGAAAACACTCAAGAAATGGCACGGATGGATCGCTAGCTCTAG
CTTCACTATGGCCTTAAAGCTTGCTCCAGATAGGAAGAAGTTCATAGATGTGATATCTGG
TTCTGGTGACATCTACACTGATATGGCAAGCTTTTGCTCTGAGTTTGGTCCGTTGCTTCA
ATATAACCATAAGTTCCTGGCTAGCGTCCGTATGGATGACATGAAAGCTTCTTAAGCCAT
CACATATGGTCATTGTT

QA 1 677 1 677
DS 

RD RS1G014JQ 675 0 0
CCGCTATGACTCTCGTGAAAGCCGACATTGGTGGCAACATATCGAGGTTGGAGAAGAATT
ACTTGTCTGATCCCAACAAGTACAAGTACTTGTACACCTTTGTTCAAGGCGAAATTGAGT
CTAAGACTGCAAAAGGATCGTCTAGCTGTACCAACGGTCTTCTCTGGCTAACCAGAGCAA
TGGATTTCTTAGTGGAGCTGTTCCGCAACTTGGTAGCACATCAAGACTGGTCAATGTCAC
AAGCTTGTGGAGACTCATACCAGAAAACACTCAAGAAATGGCACGGATGGATCGCTAGCT
CTAGCTTCACTATGGCCTTAAAGCTTGCTCCAGATAGGAAGAAGTTCATAGATGTGATAT
CTGGTTCTGGTGACATCTACACTGATATGGCAAGCTTTTGCTCTGAGTTTGGTCCGTTGC
TTCAATATAACCATAAGTTCCTGGCTAGCGTCCGTATGGATGACATGAAAGCTTCTTAAG
CCATCACATATGGTCATTGTTATCGCCGGTATCCTAATCTGCTTAGCCGGAGACGTTTTA
ACTTTCTCTTTGGGATTTTATAACTTTTAGACCCTCCAAAGAAACAGAATAATTTGTCAA
TTTCTATCTGAATCTTAGTTCACTTTATGTTATAACTTTATAAGATACTAATCAATCTGA
TCAACTCTTTTCGCC

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL6392Contig1 781 2 2 U
GGCACTGAACTTCCTCAGCATGCGCGTGAGCCTGAGCATGTTCAGTACAATCCTCCTGTG
AGAACCTTTACAGCTGAGCAGACGAAGGAAGCTTTCGATATAGCAAGAAACAGCATTGAA
CTTCTTTCCACGGTTCTGTCCTCTTCCCCTCAACACGATGCTTTACAGGATGACTTAACA
ACGACACTTGTACAGCAGTGTCGCCAGTCTCAAACCACTGTCCAAAGAATCATCGAAACA
GCAGGGGAAGACGAGGCTCTTCTGTTCGAAGCCTTGAATGTGAACGACGAGCTTGTGAAA
ACTCTGTCCAAGTACGAGGAGATGAACAAACCCTCTGCACCTTTAACCGCGCCTGAGCCA
GCCATGATTCCTGTTTCTGAGGAGTCTGATGACTCTCCGCTTCATGGAAAAGAAGAATCT
CTGGTCAGAAAATCGTCGAGTACACGAGCTTTGATCCATGGAGGTGGTGGGAGTGGGGAT
GACATGATGGATGATCTTGATGAGATGATATTTGGCAAGAAGAGCGGCGGTTCCTCGACA
GATGGTGGACATGACTCGAAGAAGTCGTCTAAAGATGATGATCTCATTCGATTCTGAGAT
GGTTTTAGTAATAAAACTATGTTTAACGGATTTGGTTTTTAATTGGTGATATGGAACAGT
TTCTATGTAAGTAATCTGTGTTTGATTGACTTATGTTGGGGTTTATAATGAAGAGAGCTG
TTATGAGACCAAATATTTCTACTTTTATATCTTTCTCAATAAATTGTTGTGTTTACTGTC
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1FV58TF U 1
AF RS1FV58JQ C 36
BS 1 707 RS1FV58TF
BS 708 781 RS1FV58JQ

RD RS1FV58TF 707 0 0
GGCACTGAACTTCCTCAGCATGCGCGTGAGCCTGAGCATGTTCAGTACAATCCTCCTGTG
AGAACCTTTACAGCTGAGCAGACGAAGGAAGCTTTCGATATAGCAAGAAACAGCATTGAA
CTTCTTTCCACGGTTCTGTCCTCTTCCCCTCAACACGATGCTTTACAGGATGACTTAACA
ACGACACTTGTACAGCAGTGTCGCCAGTCTCAAACCACTGTCCAAAGAATCATCGAAACA
GCAGGGGAAGACGAGGCTCTTCTGTTCGAAGCCTTGAATGTGAACGACGAGCTTGTGAAA
ACTCTGTCCAAGTACGAGGAGATGAACAAACCCTCTGCACCTTTAACCGCGCCTGAGCCA
GCCATGATTCCTGTTTCTGAGGAGTCTGATGACTCTCCGCTTCATGGAAAAGAAGAATCT
CTGGTCAGAAAATCGTCGAGTACACGAGCTTTGATCCATGGAGGTGGTGGGAGTGGGGAT
GACATGATGGATGATCTTGATGAGATGATATTTGGCAAGAAGAGCGGCGGTTCCTCGACA
GATGGTGGACATGACTCGAAGAAGTCGTCTAAAGATGATGATCTCATTCGATTCTGAGAT
GGTTTTAGTAATAAAACTATGTTTAACGGATTTGGTTTTTAATTGGTGATATGGAACAGT
TTCTATGTAAGTAATCTGTGTTTGATTGACTTATGTTGGGGTTTATA

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1FV58JQ 746 0 0
GCATGTTCAGTACAATCCTCCTGTGAGAACCTTTACAGCTGAGCAGACGAAGGAAGCTTT
CGATATAGCAAGAAACAGCATTGAACTTCTTTCCACGGTTCTGTCCTCTTCCCCTCAACA
CGATGCTTTACAGGATGACTTAACAACGACACTTGTACAGCAGTGTCGCCAGTCTCAAAC
CACTGTCCAAAGAATCATCGAAACAGCAGGGGAAGACGAGGCTCTTCTGTTCGAAGCCTT
GAATGTGAACGACGAGCTTGTGAAAACTCTGTCCAAGTACGAGGAGATGAACAAACCCTT
TGCACCTTTAACCGCGCCTGAGCCAGCCATGATTCCTGTTTCTGAGGAGTCTGATGACTC
TCCGCTTCATGGAAAAGAAGAATCTCTGGTCAGAAAATCGTCGAGTACACGAGCTTTGAT
CCATGGAGGTGGTGGGAGTGGGGATGACATGATGGATGATCTTGATGAGATGATATTTGG
CAAGAAGAGCGGCGGTTCCTCGACAGATGGTGGACATGACTCGAAGAAGTCGTCTAAAGA
TGATGATCTCATTCGATTCTGAGATGGTTTTAGTAATAAAACTATGTTTAACGGATTTGG
TTTTTAATTGGTGATATGGAACAGTTTCTATGTAAGTAATCTGTGTTTGATTGACTTATG
TTGGGGTTTATAATGAAGAGAGCTGTTATGAGACCAAATATTTCTACTTTTATATCTTTC
TCAATAAATTGTTGTGTTTACTGTCT

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 2

CO CL6393Contig1 668 2 1 U
GGAAAATAAAAAACCCTAGCGTTCACAGGTAAAGCTCCCCTCCCTCGCTCTGACCGCGTC
TTCTAGATTGCTCAGGTTTTATTTGTTGGCAGATCTCTCGGAGATGAAAGGTGGTGAAAC
CAAAGCTCAAGCGAAGGGCACTGATGACAGATTGAAGACGAGAGGTAAGAAAGCTGGAAA
GAAAGCCGCCAAGGATCCTAACAAGCCTAAGAGGCCTCCTAGTGCTTTCTTCGTCCTCCT
GGAGGGATTCCGTAAGGAGTTCAATCTAGCTAACCCTGACAACAAATCCGTCGGAGCTGT
TGGTAAAGCTGCTGGAGCTAAATGGAAATCCATGACTGATGAAGACAAAGCTCCTTTTGT
AGCCAAGGCAGAGACTAAAAAGAGTGAATATACCAAGACTATGCAAAAATACAACATGAA
ATTGGCTAATGGAACTAGCACAGCTGGAGATGATGACTCTGACAAGTCCAAGTCTGAAGT
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CTATGTTTCTTCTCCTTTTTTTTATGTTAACTGGGATTATTCGTACTATCTACTACAACT
TGATATGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AE11JQ C 1
AF RS1AE11TF U 1
BS 1 668 RS1AE11TF

RD RS1AE11JQ 668 0 0
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TGGTAAAGCTGCTGGAGCTAAATGGAAATCCATGACTGATGAAGACAAAGCTCCTTTTGT
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ATTGGCTAATGGAACTAGCACAGCTGGAGATGATGACTCTGACAAGTCCAAGTCTGAAGT
CAACGAAGGCGCAAGTGAAGAGGAAGAAGATGATGATTAGAAGATGTATCATCGATTTGT
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CTATGTTTCTTCTCCTTTTTTTTATGTTAACTGGGATTATTCGTACTATCTACTACAACT
TGATATGC

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DS 

RD RS1AE11TF 668 0 0
GGAAAATAAAAAACCCTAGCGTTCACAGGTAAAGCTCCCCTCCCTCGCTCTGACCGCGTC
TTCTAGATTGCTCAGGTTTTATTTGTTGGCAGATCTCTCGGAGATGAAAGGTGGTGAAAC
CAAAGCTCAAGCGAAGGGCACTGATGACAGATTGAAGACGAGAGGTAAGAAAGCTGGAAA
GAAAGCCGCCAAGGATCCTAACAAGCCTAAGAGGCCTCCTAGTGCTTTCTTCGTCCTCCT
GGAGGGATTCCGTAAGGAGTTCAATCTAGCTAACCCTGACAACAAATCCGTCGGAGCTGT
TGGTAAAGCTGCTGGAGCTAAATGGAAATCCATGACTGATGAAGACAAAGCTCCTTTTGT
AGCCAAGGCAGAGACTAAAAAGAGTGAATATACCAAGACTATGCAAAAATACAACATGAA
ATTGGCTAATGGAACTAGCACAGCTGGAGATGATGACTCTGACAAGTCCAAGTCTGAAGT
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CTATGTTTCTTCTCCTTTTTTTTATGTTAACTGGGATTATTCGTACTATCTACTACAACT
TGATATGC

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL6394Contig1 696 2 2 U
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TCCGGAAAAGTTTTGATGAAGGACCAATGCAGACCGTGGAGGTGAAGCAAGCTGCGGCCT
GGAAGTTCCTTTGGTAGGCTGGAATATTCCCTGTAAATCTAATTGTACAAGAAAACCGAA
AACATCTCACCGTAAGATACATTTATATTCTTCACAAGAATCATTATTAATGCCATAATG
GGAGGAGATATACGAATCGGAGAATGATGTAAATATTAATGTGATTTTAAATTTTCTTGA
TTTTAAATTTAAAATCTAGGCTTCTCCAATCCGGTGACCGAGGCGTATTCCGGCCGTAGG
CTGATACGTATACTCGCCGCTAATATGAATCCATTTCGATGGGTGTCAGGATACACTGAG
TTATTCAAAAAAAAAAAAAGCTCTTTACAAACTCATGATTCTATGTTTTGCTTAAACCCT
GGTTATGGTACCATATTTAATATTCTCTCCTTAGTTAGGTGTCACTTGCTTGTACGTTAA
GAACTCACAAGAATGGAGCTGCCAACATCATTGTTTTGCCGTATGTAAAGATTGTAATCC
TAATAAATCTGCGTACTTATTGTTGATTCAAGGATTGTACATAAAGAAATTGTTATCGCT
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BQ
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AF RS1GG32JQ C 1
AF RS1GG32TF U 1
BS 1 692 RS1GG32TF
BS 693 696 RS1GG32JQ

RD RS1GG32JQ 696 0 0
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QA 1 696 1 696
DS 

RD RS1GG32TF 692 0 0
GCATTTTCACTCATCCAGACAACAAACGATAGATACTTCAAGAACATCAAGGAATGCATA
TCCGGAAAAGTTTTGATGAAGGACCAATGCAGACCGTGGAGGTGAAGCAAGCTGCGGCCT
GGAAGTTCCTTTGGTAGGCTGGAATATTCCCTGTAAATCTAATTGTACAAGAAAACCGAA
AACATCTCACCGTAAGATACATTTATATTCTTCACAAGAATCATTATTAATGCCATAATG
GGAGGAGATATACGAATCGGAGAATGATGTAAATATTAATGTGATTTTAAATTTTCTTGA
TTTTAAATTTAAAATCTAGGCTTCTCCAATCCGGTGACCGAGGCGTATTCCGGCCGTAGG
CTGATACGTATACTCGCCGCTAATATGAATCCATTTCGATGGGTGTCAGGATACACTGAG
TTATTCAAAAAAAAAAAAAGCTCTTTACAAACTCATGATTCTATGTTTTGCTTAAACCCT
GGTTATGGTACCATATTTAATATTCTCTCCTTAGTTAGGTGTCACTTGCTTGTACGTTAA
GAACTCACAAGAATGGAGCTGCCAACATCATTGTTTTGCCGTATGTAAAGATTGTAATCC
TAATAAATCTGCGTACTTATTGTTGATTCAAGGATTGTACATAAAGAAATTGTTATCGCT
TGTACGACATGTAATTAACGAGTATTGAGCTC

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 2

CO CL6395Contig1 662 2 1 U
GGAATCGAAGCTGGGCTACTTGCGGAGCGAATTAGCGACTGCGATCGCCGTTCGGAGAAG
AAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAGGCCATGGGAATCTCCGGAGCTCTCTCAA
GCACTGTTTGTATTCTTCTGTTGCTCTCGCTGAGCTTATTATTTTCCTGTGCTTTCTCTA
AATCTCCTCGTCCTATATCCGATGCGGAGATCAGGGAGAAGAAGAACCAATGCTATGCTG
ATATTGAGAGTGGGCTATGGGGTTGGCAATGCAAAGCTTCTTCCATAGCAAAAGAGAATT
GTGCGCTGCGATGTCTTTCTCCGGTTTGTTATGAGCTCATATATGAGAGTGATCCCGTAA
GGAGATGATGACTATGAGTTTTTCTGTGAATGATTTATTTTCTTTTTGATGCATTTTGTG
TGTTCTTTTGTTGAGCAGCTTGAAGAAGGTGAAAAAGATTTGATTCGGAGCCAAGAATAC
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TTATAGAAACCAAAGCCAACAAGACTCTCTTTAATTGTGTAGCATTCTGCTCTTCCATGT
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20 20 

AF RS1BE62JQ C 1
AF RS1BE62TF U 1
BS 1 662 RS1BE62TF

RD RS1BE62JQ 662 0 0
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TTATAGAAACCAAAGCCAACAAGACTCTCTTTAATTGTGTAGCATTCTGCTCTTCCATGT
TTGTAAGACTTCGATTTTGTTTCAAACGCTCATCATGTGAAAATAAAATTGCTGTTCTGC
AG

QA 1 662 1 662
DS 

RD RS1BE62TF 662 0 0
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AAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAGGCCATGGGAATCTCCGGAGCTCTCTCAA
GCACTGTTTGTATTCTTCTGTTGCTCTCGCTGAGCTTATTATTTTCCTGTGCTTTCTCTA
AATCTCCTCGTCCTATATCCGATGCGGAGATCAGGGAGAAGAAGAACCAATGCTATGCTG
ATATTGAGAGTGGGCTATGGGGTTGGCAATGCAAAGCTTCTTCCATAGCAAAAGAGAATT
GTGCGCTGCGATGTCTTTCTCCGGTTTGTTATGAGCTCATATATGAGAGTGATCCCGTAA
GGAGATGATGACTATGAGTTTTTCTGTGAATGATTTATTTTCTTTTTGATGCATTTTGTG
TGTTCTTTTGTTGAGCAGCTTGAAGAAGGTGAAAAAGATTTGATTCGGAGCCAAGAATAC
AAATATTGTATGTACAAGTCTTCGCTCGGGGAGAGCTTAGATGGTGTTCGAGGCAGCTTT
TTATAGAAACCAAAGCCAACAAGACTCTCTTTAATTGTGTAGCATTCTGCTCTTCCATGT
TTGTAAGACTTCGATTTTGTTTCAAACGCTCATCATGTGAAAATAAAATTGCTGTTCTGC
AG

QA 1 662 1 662
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TGAATTTGAAGAGAAAATTAAAGAGATGTGAATTTGTGTGCATAATTAATGAGATATGAA
GAGTAAAATCAAAACTTTTGTGCATTAAGAACTTCAAATTGGTTGTTCATGGTGGTATAT
GTATTGGTGAAGATGAGTAAGATAAGGTAAAAAAATATTTTTGAAAAATGACATTTTCGT
GAATAACTCGAACTTTAAAGATGAATATAGAAAATAAAGTTTCATAAAAAACATAGGTTA
TTTTGTGTTAGACATAAAATTTTAGATCACATTTGAAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BI41TF U 1
AF RS1BI41JQ C 39
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TGAATTTGAAGAGAAAATTAAAGAGATGTGAATTTGTGTGCATAATTAATGAGATATGAA
GAGTAAAATCAAAACTTTTGTGCATTAAGAACTTCAAATTGGTTGTTCATGGTGGTATAT
GTATTGGTGAAGATGAGTAAGATAAGGTAAAAAAATATTTTTGAAAAATGACATTTTCGT
GAATAACTCGAACTTTAAAGATGAATATAGAAAATAAAGTTTCATAAAAAACATAGGTTA
TTTTGTGTTAGACATAAAATTTTAGATCACATTTG

QA 1 515 1 515
DS 

RD RS1BI41JQ 485 0 0
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TGCATAATTAATGAGATATGAAGAGTAAAATCAAAACTTTTGTGCATTAAGAACTTCAAA
TTGGTTGTTCATGGTGGTATATGTATTGGTGAAGATGAGTAAGATAAGGTAAAAAAATAT
TTTTGAAAAATGACATTTTCGTGAATAACTCGAACTTTAAAGATGAATATAGAAAATAAA
GTTTCATAAAAAACATAGGTTATTTTGTGTTAGACATAAAATTTTAGATCACATTTGAAA
AAAAA

QA 1 485 1 485
DS 



AS 1 2

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TTCAAATCATGGGCTTGTTTGTATTTGGTTCCATTGTTGGTGAAGAGCTAAAAACCTTAT
AATTTATTTGAATACTATTGGAACATGATTGAAATATTTCTATTCAGGTTAGATTTGGTT
TT


BQ
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10 10 

AF RS1GZ22TF U 1
AF RS1GZ22JQ C 1
BS 1 644 RS1GZ22TF
BS 645 662 RS1GZ22JQ

RD RS1GZ22TF 644 0 0
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AAGATACGGCACTAAGACTTGCTGAGAAGTGGGTCGCCAACATGACGACGCCTGCAGAGG
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TTCAAATCATGGGCTTGTTTGTATTTGGTTCCATTGTTGGTGAAGAGCTAAAAACCTTAT
AATTTATTTGAATACTATTGGAACATGATTGAAATATTTCTATT

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1GZ22JQ 662 0 0
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CTCTAGTTGCAATGACAACGGAAACGGCAAAGAAGAAGAGAGCTCCACAGATTCTCAAGA
AAGATACGGCACTAAGACTTGCTGAGAAGTGGGTCGCCAACATGACGACGCCTGCAGAGG
ATGATCCTATTGAGGCTCAGCAAGAAGCTCGACCACACAGGCTTGGACTTGGTGCTAAAG
TGTCAAAGCAAATGAAGCGTAGACCCTCAGACGACCCTCTTGACCAAAAACTACAGGCCA
AGTTTGATGCAGGGAGGAGAAAACATGCAAGAGCTGAGGCAGAGGCTGCTGGTTCTAGCA
AGAACGCTGGTGATGACAGCGAGGATGATGATGACGAATCAGATAGTAAAAGCAAAGCAT
TTGGAAAGAAAAGACCAAACGCAAGTACGCCTCGTTAGTATTTTCTGATGTGGTGTGTAC
TTCAAATCATGGGCTTGTTTGTATTTGGTTCCATTGTTGGTGAAGAGCTAAAAACCTTAT
AATTTATTTGAATACTATTGGAACATGATTGAAATATTTCTATTCAGGTTAGATTTGGTT
TT

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

CO CL6399Contig1 685 2 5 U
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ACACATTGCGTTGATGGAGCTTATGAAATGGAGAACCGAAGGGCTTGATCCTATGTATGC
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TCAAAGCAGTAGGCTTGTTTGGGAGACGTATCTTAGCGAGTTCAGGTCGCTAGGGAAAGT
TGCTGTAAGGCTCATTTTCCTCCATGCGACTACTTGTGGGTTCAAATGCAATTCCTCTCT
TTTGAAATGGGTTAACTCTCGTGGGAGGTCACATGCGGCCATAGATCGAGCTCAGAAGCT
GATCTTTATATCAGTTAATTCGAAGTTTGAAAGAAGGGATTTCTCTAATGAGGAGGATAG
GGATGCAGAGTTACTAGCCATGGCTAATGGTGATGACAATTTGCTTAACGATGTTCTTGT
GGACACATCCTCGGTGTGACATTTTTTTCTTCTAAATTTGAATCCTATGTTTTGATCCAT
TTGATTTCAGCTTAGTTTTTCATTAGATTTTGTCATTTTGTAGGATCGTCTGGATTCTAT
TCTTTCAATTACTATTTACCATTTACTATCATTAATATTAAATTTGTACTTGGTTCCAAA
ATGTTGATGGTGATTCAAAATTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1F756JQ C 1
AF RS1F756TF U 1
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RD RS1F756JQ 685 0 0
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DS 

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ACACATTGCGTTGATGGAGCTTATGAAATGGAGAACCGAAGGGCTTGATCCTATGTATGC
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TCAAAGCAGTAGGCTTGTTTGGGAGACGTATCTTAGCGAGTTCAGGTCGCTAGGGAAAGT
TGCTGTAAGGCTCATTTTCCTCCATGCGACTACTTGTGGGTTCAAATGCAATTCCTCTCT
TTTGAAATGGGTTAACTCTCGTGGGAGGTCACATGCGGCCATAGATCGAGCTCAGAAGCT
GATCTTTATATCAGTTAATTCGAAGTTTGAAAGAAGGGATTTCTCTAATGAGGAGGATAG
GGATGCAGAGTTACTAGCCATGGCTAATGGTGATGACAATTTGCTTAACGATGTTCTTGT
GGACACATCCTCGGTGTGACATTTTTTTCTTCTAAATTTGAATCCTATGTTTTGATCCAT
TTGATTTCAGCTTAGTTTTTCATTAGATTTTGTCATTTTGTAG*ATCGTCTGGATTCTAT
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QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1CJ84TF U 1
AF RS1CJ84JQ C 1
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BS 669 823 RS1CJ84JQ

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CAAGATAA

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DS 

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ATCCAAGATATGTGTGCCAAAGAGAATTCGCCTTGAAGCATCTACCTGATGACCCTCTTT
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TCAAGAACCCTTGGCCTAACGTTGATGCTCACAGCGGAGTGCTTCTCAACTATTATGGTC
TAACCGAAGCAAAATACTACACGGTTCTTTTTGGCGTCTCAAGGAGTCTTGGAATCTGCT
CACAGCTGATATGGGACCGAGCTCTTTGACTGCCACTTGAGAGACCGAAGAGTGTAAACA
TGGACTGGCTCGATAAGTTCATGAGCTTGAGCCGCTGAGTTAATAACCTGACGTGTTGGT
CAAGATAACCAGCCTTCTCTTCCATTTGATGGGTATCTTTTAGCGCATTTTTTCGTAACG
ATTATCCGTTTTTCTTAATTTGGAGTTGTCTTCTGAAAACGAAATAATGCCAACAATTGA
ATAAACGGTCTTTCTCGGATTGCAATACACTGAATTATTGTTC

QA 1 823 1 823
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1D995JQ U 1
AF RS1AL37JQ U 44
BS 1 153 RS1D995JQ
BS 154 154 RS1AL37JQ
BS 155 726 RS1D995JQ
BS 727 822 RS1AL37JQ

RD RS1D995JQ 726 0 0
CGAAGCCATGGTTAATACGGAGCTAGTAAAATATTGGGAAACTGTATAACCTTAGCTAAG
GTTGATGTTGTTCTCGTAAAAAAACAAAACATCAAATATTTGAAAACAGATGACTAAGGT
TGAGATCCAGACAAAAGCTCCATAAAAGTTTAGGGACATAAAAAAGGAGATCTCCTCCAG
AATGATTGATTCACACGACATTTGACTTCGTTCCTCAATCTAGTCGTTCCATCTTCCAAA
GACCGTCGTTGAGGTAATGCATGTTGTCCACTCCGATTCCTTTGTTGATGCTCTTAATGT
CCTTGGCTGACATTTTGGTGAAGCCTATTGCTAAGGCATGCTGCTTTCCTTCTGCATATA
TAGCCACAGGCCTTTCTGCCTCAACTTCTTCATCCAGAACACCTCCAGGAGATGTGAGAC
CAGGACACATTATGTTGGCACCAGAGAAAACAAACTTTATAGCACCTCTATCAACTTGAA
ACCTCTTCATTATATTTGGGTACTGATGAAGAAGACGCAAAGTTGGCATGTATGGCCCAT
CACGGATACAGAAGAAGAGAGGGACATTGTTGACAACAACTAGCGTCAGATGGTTTGGGC
ACTTGACTACAATGAGAGGAGACTTTTTGGGAAGTAGATCTTCCAACACCGTTTCAAGTC
CCGGGTACTCTTCTTGAATACTCTGGCGAATCCTACGTTGGACAGAAGCCTTTACTTGGT
TTTGCG

QA 1 726 1 726
DS 

RD RS1AL37JQ 779 0 0
GTATAACCTTTGCTAAGGTTGATGTTGTTCTCGTAAAAAAACAAAACATCAAATATTTGA
AAACAGATGACTAAGGTTGAGATCCAGACAAAAGCTCCATAAAAGTTTAGAGACATAAAA
AAGGAGATCTCCTCCAGAATGATTGATTCACACGACATTTGACTTCGTTCCTCAATCTAG
TCGTTCCATCTTCCAGAGACCGTCGTTGAGGTAATGCATGTTGTCCACTCCGATTCCTTT
GTTGATGCTCTTAATGTCCTTGGCTGACATTTTGGTGAAGCCTATTGCTAAGGCATGCTG
CTTTCCTTCTGCATATATAGCCACAGGCCTTTCTGCCTCAACTTCTTCATCCAGAACACC
TCCAGGAGATGTGAGACCAGGACACATTATGTTGGCACCAGAGAAAACAAACTTTATAGC
ACCTCTATCAACTTGAAACCTCTTCATTATATTTGGGTACTGATGAAGAAGACGCAGAGT
TGGCATGTATGGCCCATCACGGATACAGAAGAAGAGAGGGACATTGTTGACAACAACTAG
CGTCAGATGGTTTGGGCACTTGACTACAATGAGAGGAGACTTTTTGGGAAGTAGATCTTC
CAACACCGTTTCAAGTCCCGGGTACTCTTCTTGAATACTCTGGCGAATCCTACGTTGGAC
AGAAGCCTTTACTTGGTTTTGCGATGAAACCTCCTCCATTGAAAACTTCTTGAACATGTT
GGATGATGAGAGGTTATTTCTTTTGGTAAGTTTATGAGATTTGGTCGATGCAGCTGGAA

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

CO CL6402Contig1 753 2 3 U
TTTTTTTAGTTTCCTGAAGATGTAGTCGATCATATCATGATCCTTTTCGTTATCAACGTG
TCGTCCCGCGTTGTTCTTCTTGTAGATTCGACATAGCACCCAGTCATCAAGCCTTAGGGA
GTTTTTCTTGTTGCCGTAATCACATCCTGGTGGTCTATTGTTTGGTTTGTTGTCGATGAG
ACGGTACTCATGCATGATCCAGTCGCTTTTAACGCCTTTTGGAGGTTTGCCACTGTAGAA
GACGAGTGCCTTCTTCACACCGACCTTTTGGTTCCCGTCGGAAGCAAGCACCGGTTTATC
AGTACCCGTGGCTTTCCAGTAACCAGACGTCGCAGATCTGTTTGGCCTAGCTCCGTTCGG
ATACTTGCGATCTCTAGGACTGAAGAAGTACCATTCCTGCTCTCCAAACGATGCCTTAGC
TGGAAGTTCCCATGGATCGAACTTGTAGAGATCGACATCAGCGATGATGGAGACAGGTAA
AGGAGCTGAGGCGGATTTGCGTTTGAGGTAGTGAACGACAAGCTCTTCATCGGTTGGGTG
AAAACGGAATCCTGGAGGAAGGTTAGGCTGCGGCGGCGGCGGAGGACCACCGGAAGAATC
TGTACTCTCCATTACAAGAACCTTCTCCGTTGATGAAAATCTAATACAAGAGAATTTTCT
AGTTTATAGGATTGTAAGAGAAGCTCATATCAAAGATTATTCCCTCTCTTTCTTTTTTTT
TTTCGCTTAGATATTTGTTTTTTTTAGGTTTCC


BQ
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AF RS1D319JQ U 6
AF RS1D319TF C 1
BS 1 12 RS1D319TF
BS 13 336 RS1D319JQ
BS 337 753 RS1D319TF

RD RS1D319JQ 331 0 0
AGGTTTC
CCTGAAGATGTAGTCGATCATATCATGATCCTTTTCGTTATCAACGTGTCGTCCCGCGTT
GTTCTTCTTGTAGATTCGACATAGCACCCAGTCATCAAGCCTTAGGGAGTTTTTCTTGTT
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CATGATCCAGTCGCTTTTAACGCCTTTTGGAGGTTTGCCACTGTAGAAGACGAGTGCCTT
CTTCACACCGACCTTTTGGTTCCCGTCGGAAGCAAGCACCGGTTTATCAGTACCCGTGGC
TTTCCAGTAACCAGACGTCGCAGA

QA 8 331 8 331
DS 

RD RS1D319TF 753 0 0
TTTTTTTAGTTTCCTGAAGATGTAGTCGATCATATCATGA*CCTTTTCGT*ATCAACGTG
TCGTCCCGCGTTGTTCTTCTTGTAGATTCGACATAGCACCCAGTCATCAAGC*TTAGGGA
GTTTTTCTTGTTGCCGTAATCACATCCTGGTGGTCTATTGTTTGGTTTGTTGTCGATGAG
ACGGTACTCATGCATGATCCAGTCGCTTTTAACGCCTTTTGGAGGTTTGCCACTGTAGAA
GACGAGTGCCTTCTTCACACCGACCTTTTGGTTCCCGTCGGAAGCAAGCACCGGTTTATC
AGTACCCGTGGCTTTCCAGTAACCAGACGTCGCAGATCTGTTTGGCCTAGCTCCGTTCGG
ATACTTGCGATCTCTAGGACTGAAGAAGTACCATTCCTGCTCTCCAAACGATGCCTTAGC
TGGAAGTTCCCATGGATCGAACTTGTAGAGATCGACATCAGCGATGATGGAGACAGGTAA
AGGAGCTGAGGCGGATTTGCGTTTGAGGTAGTGAACGACAAGCTCTTCATCGGTTGGGTG
AAAACGGAATCCTGGAGGAAGGTTAGGCTGCGGCGGCGGCGGAGGACCACCGGAAGAATC
TGTACTCTCCATTACAAGAACCTTCTCCGTTGATGAAAATCTAATACAAGAGAATTTTCT
AGTTTATAGGATTGTAAGAGAAGCTCATATCAAAGATTATTCCCTCTCTTTCTTTTTTTT
TTTCGCTTAGATATTTGTTTTTTTTAGGTTTCC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL6403Contig1 813 2 4 U
TGAAAATCATCGGAGAGAGAGAGAGAGAGGAAGATGAGGTTTTGCTCAATTTCTCCGCCT
GTGTGTGTGTTATCGTCGATTGCTCTTGCGCCACCCAGTTCCAATCTCAGTCATCGGCTT
CTCCGAATTTGCGCCACTGCTGACGACGGAGTGGAAGCTCCCGAGGAGGTTCAAACCCAA
TCTCCTTCCTCTTCTTCTTCTTCTGCACTCGGTAAAGACTTGAAAAAGGTGGTTAACAAG
ACAGCAGCAACCTTTGCGCCTAGGGCCTCCACCGCCAGTAAAAACCCAGCTCTCCCTGGA
ACTACTCTTTACAAAGTTTTTGAGGTTCAAGGTTATGCATCCATGTTCCTTGGAGGTGTT
CTCTCTTTCAACCTCCTCTTTCCCTCCACCCAACCTGACTTATGGAGGCTGATGGGTATG
TGGTCCATTTGGATGTTCACTATTCCTTCTCTTCGAGCACGTGACTGCCCTCCTAAAGAG
AAAGAAGCTCTTAACTATCTTTTTCTCATCATCCCTTTACTCAATGTTGCTATTCCCTTC
TTCTGGAAATCTTTTCCTCTTGTCTGGTCTGCTGATACCCTTGCCTTCTTTGCCCTGTAT
GCCTGGAAGCTTGGATGGCTGGAAAGAGCCGAGTAGAGCTACTCCTGTTGGGATTAGAGT
CTGGAAGATTCTATGTCTGAAATGATTCTCCATTCAGCTTCTCTGTTACCAAGTACAGCA
TATCTAATATTCAATGGTACGTAGAGGCAAACGAATGTGTACATTGCTAAATATTGGCAA
GCCCCCCTTAAGTAATATTCATAGACTTCTGAG


BQ
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20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G334TF U 1
AF RS1G334JQ C 195
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BS 727 727 RS1G334JQ
BS 728 770 RS1G334TF
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RD RS1G334TF 783 0 0
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CTCCGAATTTGCGCCACTGCTGACGACGGAGTGGAAGCTCCCGAGGAGGTTCAAACCCAA
TCTCCTTCCTCTTCTTCTTCTTCTGCACTCGGTAAAGACTTGAAAAAGGTGGTTAACAAG
ACAGCAGCAACCTTTGCGCCTAGGGCCTCCACCGCCAGTAAAAACCCAGCTCTCCCTGGA
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CTCTCTTTCAACCTCCTCTTTCCCTCCACCCAACCTGACTTATGGAGGCTGATGGGTATG
TGGTCCATTTGGATGTTCACTATTCCTTCTCTTCGAGCACGTGACTGCCCTCCTAAAGAG
AAAGAAGCTCTTAACTATCTTTTTCTCATCATCCCTTTACTCAATGTTGCTATTCCCTTC
TTCTGGAAATCTTTTCCTCTTGTCTGGTCTGCTGATACCCTTGCCTTCTTTGCCCTGTAT
GCCTGGAAGCTTGGATGGCTGGAAAGAGCCGAGTAGAGCTACTCCTGTTGGGATTAGAGT
CTGGAAGATTCTATGTCTGAAATGATTCTCCATTCAGCTTCTCTGTTACCAAGTACAGCA
TATCTA*TATTCAATGGTACGTAGAGGCAAACGAATGTGTACATTGCTAA
TATTGGCAGCCCC

QA 1 770 1 770
DS 

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TGCGCCTAGGGCCTCCACCGCCAGTAAAAACCCAGCTCTCCCTGGAACTACTCTTTACAA
AGTTTTTGAGGTTCAAGGTTATGCATCCATGTTCCTTGGAGGTGTTCTCTCTTTCAACCT
CCTCTTTCCCTCCACCCAACCTGACTTATGGAGGCTGATGGGTATGTGGTCCATTTGGAT
GTTCACTATTCCTTCTCTTCGAGCACGTGACTGCCCTCCTAAAGAGAAAGAAGCTCTTAA
CTATCTTTTTCTCATCATCCCTTTACTCAATGTTGCTATTCCCTTCTTCTGGAAATCTTT
TCCTCTTGTCTGGTCTGCTGATACCCTTGCCTTCTTTGCCCTGTATGCCTGGAAGCTTGG
ATGGCTGGAAAGAGCCGAGTAGAGCTACTCCTGTTGGGATTAGAGTCTGGAAGATTCTAT
GTCTGAAATGATTCTCCATTCAGCTTCTCTGTTACCAAGTACAGCATATCTAATATTCAA
TGGTACGTAGAGGCAAACGAATGTGTACATTGCTAAATATTGGCAAGCCCCCCTTAAGTA
ATATTCATAGACTTCTGAG

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 2

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TGGTGCAGAGGATCCCGATGTTGATCATCGTCATTGCTTCTTCTCTGTTGTAATCTGTTC
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GTGGATGCTGAAGAGCAGAGGTCATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A580JQ U 78
AF RS1A580TF C 1
BS 1 77 RS1A580TF
BS 78 185 RS1A580JQ
BS 186 687 RS1A580TF

RD RS1A580JQ 108 0 0
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QA 1 108 1 108
DS 

RD RS1A580TF 687 0 0
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CAAGAAGGTGAAAGGTTTCGCCTTTGGATCGTGCGCTCGTGTTGCTTCTTCCGTGAACAA
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TGGCGTATTCAGGAGCCATGTATCCGTAGGTTCCAGCGACTCGTGTGCTCATGTGTGTGT
TTTCTTCTTCATCAAGCTTAGCGAGACCGAAATCCGAAATTTTTGCATTTAGTTCCTTGT
CCAGCAAGACATTAGTTGCTTTGATGTCTCTGTGTACAATCTTGAGTCTTGATTCCTCGT
GGAGATAAGCCAATCCTCTTGCTATACCGACGCAAATCCTCTGCCTCGTTGGCCAATCTA
GCCGTATCTGAGTCTCTGGAGGACCGAAAAGTGCCCTGGCGAGACTGTTGTTCTCCAAGT
ACTCGTAGACAAGCAAGAGCTGATCACCTTCGACGCAGCATCCGTATAGTTTAACCAAAT
GTGGATGCTGAAGAGCAGAGGTCATAG

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

CO CL6405Contig1 703 2 4 U
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TGGCTGCTTCAATCTCAAGAAGAATTGTCCGCACTTTTGGATCCTTCACTGCTCTAGGGC
GCAGCAGCAGCAGCAGCAGTATTATCTCAGTTTCTAATCTCTTTCTTTTGAACTTTTGAT
CTCTAATTGCTTCTCTCTGTCTCTTTCGAAATTAGCGAATGCATCTGGAAATGGTTTAAG
CTCTCTTCCTAGTCATCTCAAGTGTGGTGGAATAAGTTTGGTTTCCGACCGAAAGCACTC
CACTTCTATCTTGACTCCTGATGACAAATTTCCTTATGATTTACTTTCCAAGAAGACAGT
CATTACACCAGACCGAACCATAGGACAATATCAAGACTTGGTCATGCCAGTCACAAATTT
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TCGACTAAAACAATAAGTGAGTTAGCGGAACTGGTAGAAAGCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1F649TF U 1
AF RS1FB77TF U 1
BS 1 599 RS1F649TF
BS 600 600 RS1FB77TF
BS 601 669 RS1F649TF
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RD RS1F649TF 669 0 0
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GTAGGATTATCTACCGAGATTCTGGTTATGCGTTAATCGTGTTTCGACTAGATTGAGAAA
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TGGCTGCTTCAATCTCAAGAAGAATTGTCCGCACTTTTGGATCCTTCACTGCTCTAGGGC
GCAGCAGCAGCAGCAGCAGTATTATCTCAGTTTCTAATCTCTTTCTTTTGAACTTTTGAT
CTCTAATTGCTTCTCTCTGTCTCTTTCGAAATTAGCGAATGCATCTGGAAATGGTTTAAG
CTCTCTTCCTAGTCATCTCAAGTGTGGTGGAATAAGTTTGGTTTCCGACCGAAAGCACTC
CACTTCTATCTTGACTCCTGATGACAAATTTCCTTATGATTTACTTTCCAAGAAGACAGT
CATTACACCAGACCGAACCATAGGACAATATCAAGACTTGGTCATGCCAGTCACAAATTT
TCAGAACGAAGACAAGGGTTTCATGTTTTTAGCTGGTGATGTCTTTGATGTTCCTATCAG
GAAAGATATCATTCACCACGTCGTGAGATGGCAGCTTGCCAAACGCCAGCAGGTACTCAT
TCGACTAAA

QA 1 669 1 669
DS 

RD RS1FB77TF 703 0 0
TACCGTCAATCATCGTCGCTCGTTCGTGTGACCGGTTAGGTTTCTTCTTCTCTCATCAGC
GTAGGATTATCTACCGAGATTCTGGTTATGCGTTAATCGTGTTTCGACTAGATTGAGAAA
TTGGATTTGGTATTGTAGATGAGCAGTTAGAGGTTTCTTCATTTGACTAGAAAGAAGATA
TGGCTGCTTCAATCTCAAGAAGAATTGTCCGCACTTTTGGATCCTTCACTGCTCTAGGGC
GCAGCAGCAGCAGCAGCAGTATTATCTCAGTTTCTAATCTCTTTCTTTTGAACTTTTGAT
CTCTAATTGCTTCTCTCTGTCTCTTTCGAAATTAGCGAATGCATCTGGAAATGGTTTAAG
CTCTCTTCCTAGTCATCTCAAGTGTGGTGGAATAAGTTTGGTTTCCGACCGAAAGCACTC
CACTTCTATCTTGACTCCTGATGACAAATTTCCTTATGATTTACTTTCCAAGAAGACAGT
CATTACACCAGACCGAACCATAGGACAATATCAAGACTTGGTCATGCCAGTCACAAATTT
TCAGAACGAAGACAAGGGTTTCATGTTTTTAGCTGGTGATGTCTTTGATGTTCCTATCAC
GAAAGATATCATTCACCACGTCGTGAGATGGCAGCTTGCCAAACGCCAGCAGGTACTCAT
TCGACTAAAACAATAAGTGAGTTAGCGGAACTGGTAGAAAGCC

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 2

CO CL6406Contig1 776 2 4 U
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TTTTCCAAAGAAGAAGATGATGAAAATGACTTCTCTTCTGATGATCATTTTGTTATGCAT
TCAATGTGCCGTTATGGTAGCGTCGGAGGGTGGTCCTAGAGTTTTCAAGGTTGGAGACGA
GTTCCAGTGGAAAGTTCCACTCCAGAATGATACATCGGTTTACAGCCGCTGGGCGAGCAC
CAACCGCTTCCACATCGGCGATTCTCTCTCGTTTGTGTACGACAAGTACTCGGTGATGGA
AGTGGAGAAAGAGGGTTTCTACCACTGCAACGCCAGCGATCCCATCACAGCGTTTGACAA
TGGAAACAGTACGTTTATCCTTGATCGTCCTGGTCTCTTCTACTTCATCAGCGGCTCCGA
CTCCCACTGCACCAGCGGACAGCGTCTCATCGTCGAAGTGATGCATATCCACCACCACCA
CAGCAACCACCACGCTTCCTTGCCTCCATCCATGTCGCCTCTCTCACCTGCCAGCTCTCC
CTCTTCATCTGCATTTGACTCTCATGATGATCCTGCTTCTTCTTCTGCTGCCTCCTCCCT
GCTCGCTTCCTTCTTCCTTCCCTTTGCTGCACTTCTTGTTGCTCTTTTCTGCTTCCGACC
ATAGCGCTTTTAGTTTCATCTTCTTAATTAGTCTTCTTTCATTGCTATTTTTCAGTTACT
TTGTCATCCAACTTTTTAAGATATTGTTTTTTTATTACTACCCTTACGTTTTCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BF20TF U 1
AF RS1BF20JQ C 77
BS 1 711 RS1BF20TF
BS 712 712 RS1BF20JQ
BS 713 746 RS1BF20TF
BS 747 776 RS1BF20JQ

RD RS1BF20TF 746 0 0
GGCCACTCAAAAGCTAATCAAAGAACCCATCTCCTCTCAAACAAAGCATCATACCTTTTT
TTTTCCAAAGAAGAAGATGATGAAAATGACTTCTCTTCTGATGATCATTTTGTTATGCAT
TCAATGTGCCGTTATGGTAGCGTCGGAGGGTGGTCCTAGAGTTTTCAAGGTTGGAGACGA
GTTCCAGTGGAAAGTTCCACTCCAGAATGATACATCGGTTTACAGCCGCTGGGCGAGCAC
CAACCGCTTCCACATCGGCGATTCTCTCTCGTTTGTGTACGACAAGTACTCGGTGATGGA
AGTGGAGAAAGAGGGTTTCTACCACTGCAACGCCAGCGATCCCATCACAGCGTTTGACAA
TGGAAACAGTACGTTTATCCTTGATCGTCCTGGTCTCTTCTACTTCATCAGCGGCTCCGA
CTCCCACTGCACCAGCGGACAGCGTCTCATCGTCGAAGTGATGCATATCCACCACCACCA
CAGCAACCACCACGCTTCCTTGCCTCCATCCATGTCGCCTCTCTCACCTGCCAGCTCTCC
CTCTTCATCTGCATTTGACTCTCATGATGATCCTGCTTCTTCTTCTGCTGCCTCCTCCCT
GCTCGCTTCCTTCTTCCTTCCCTTTGCTGCACTTCTTGTTGCTCTTTTCTGCTTCCGACC
ATAGCGCTTTTAGTTTCATCTTCTTAATTAGTCTTCTTTCATTGCTATTTT*CAGTTACT
TTGTCATCCAACTTTTTAAGATATTG

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1BF20JQ 700 0 0
ATGATGAAAATGACTTCTCTTCTGATGATCATTTTGTTATGCATTCAATGTGCCGTTATG
GTAGCGTCGGAGGGTGGTCCTAGAGTTTTCAAGGTTGGAGACGAGTTCCAGTGGAAAGTT
CCACTCCAGAATGATACATCGGTTTACAGCCGCTGGGCGAGCACCAACCGCTTCCACATC
GGCGATTCTCTCTCGTTTGTGTACGACAAGTACTCGGTGATGGAAGTGGAGAAAGAGGGT
TTCTACCACTGCAACGCCAGCGATCCCATCACAGCGTTTGACAATGGAAACAGTACGTTT
ATCCTTGATCGTCCTGGTCTCTTCTACTTCATCAGCGGCTCCGACTCCCACTGCACCAGC
GGACAGCGTCTCATCGTCGAAGTGATGCATATCCACCACCACCACAGCAACCACCACGCT
TCCTTGCCTCCATCCATGTCGCCTCTCTCACCTGCCAGCTCTCCCTCTTCATCTGCATTT
GACTCTCATGATGATCCTGCTTCTTCTTCTGCTGCCTCCTCCCTGCTCGCTTCCTTCTTC
CTTCCCTTTGCTGCACTTCTTGTTGCTCTTTTCTGCTTCCGACCATAGCGCTTTTAGTTT
CATCTTCTTAATTAGTCTTCTTTCATTGCTATTTTTCAGTTACTTTGTCATCCAACTTTT
TAAGATATTGTTTTTTTATTACTACCCTTACGTTTTCTTC

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

CO CL6407Contig1 731 2 2 U
GGAGCATCGTTAAGAACAAAGCTCGAGAAAGTTACCAGCTTTGGTTTCGGGTGAGAATCT
GACTGGAAAAAGTTTGGCGGGGCTTTAAACTCAACAAACTGTTTGGCTCTGCACGGTATC
GAGGTGATATGGCTTCGACCCTTCTCTCAAGAACTTTATTGGTAGCTGGTCACTGCCTGA
TTAACCCCTCTCTATCTTCTACTCTTCTGCAGAAGTCTCGTGGTTTCGCAACTGTTTTGA
ATAAGAGAGCAGTCAGCTTGCAGTTACGCTCTGCTTATTCAGCTCCCTACGTTGGTCGAG
TTATGGCTTCTACTGGACTTGGACCAAAAGCTAGTTACGCGACATCATCCATATCTACCA
ATGAACCTGTTGTTTCTGTTGATTGGCTCCACTCCAATCTTAAAGAGGCTGATATAAAGG
TTTTGGATGCCTCATGGTACATGCCAAATGAGCAAAGAAATCCAATCCAAGAGTATCAAG
TTGCTCATATTCCAGGTGCTCTCTTCTTTGATTTGGATGGAATATCAGATAGAAGAACTA
ATTTACCACACATGCTGCCATCTGAGGAAGCTTTTGCTGCTGCTTGTTCTGCTCTTGGAA
TCGAGAACAAAGATGGAGTGGTTGTGTATGATGGAAAGGGCATCTTTAGTGCCTCTCGTG
TTTGGTGGATGTTTAGAGTCTTTGGACATGAAAATGTTTGGGTACTTGATGGAGCTTACC
TAGATGGCGTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B865TF U 1
AF RS1E153TF U 1
BS 1 644 RS1B865TF
BS 645 731 RS1E153TF

RD RS1B865TF 644 0 0
GGAGCATCGTTAAGAACAAAGCTCGAGAAAGTTACCAGCTTTGGTTTCGGGTGAGAATCT
GACTGGAAAAAGTTTGGCGGGGCTTTAAACTCAACAAACTGTTTGGCTCTGCACGGTATC
GAGGTGATATGGCTTCGACCCTTCTCTCAAGAACTTTATTGGTAGCTGGTCACTGCCTGA
TTAACCCCTCTCTATCTTCTACTCTTCTGCAGAAGTCTCGTGGTTTCGCAACTGTTTTGA
ATAAGAGAGCAGTCAGCTTGCAGTTACGCTCTGCTTATTCAGCTCCCTACGTTGGTCGAG
TTATGGCTTCTACTGGACTTGGACCAAAAGCTAGTTACGCGACATCATCCATATCTACCA
ATGAACCTGTTGTTTCTGTTGATTGGCTCCACTCCAATCTTAAAGAGGCTGATATAAAGG
TTTTGGATGCCTCATGGTACATGCCAAATGAGCAAAGAAATCCAATCCAAGAGTATCAAG
TTGCTCATATTCCAGGTGCTCTCTTCTTTGATTTGGATGGAATATCAGATAGAAGAACTA
ATTTACCACACATGCTGCCATCTGAGGAAGCTTTTGCTGCTGCTTGTTCTGCTCTTGGAA
TCGAGAACAAAGATGGAGTGGTTGTGTATGATGGAAAGGGCATC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1E153TF 731 0 0
GGAGCATCGTTAAGAACAAAGCTCGAGAAAGTTACCAGCTTTGGTTTCGGGTGAGAATCT
GACTGGAAAAAGTTTGGCGGGGCTTTAAACTCAACAAACTGTTTGGCTCTGCACGGTATC
GAGGTGATATGGCTTCGACCCTTCTCTCAAGAACTTTATTGGTAGCTGGTCACTGCCTGA
TTAACCCCTCTCTATCTTCTACTCTTCTGCAGAAGTCTCGTGGTTTCGCAACTGTTTTGA
ATAAGAGAGCAGTCAGCTTGCAGTTACGCTCTGCTTATTCAGCTCCCTACGTTGGTCGAG
TTATGGCTTCTACTGGACTTGGACCAAAAGCTAGTTACGCGACATCATCCATATCTACCA
ATGAACCTGTTGTTTCTGTTGATTGGCTCCACTCCAATCTTAAAGAGGCTGATATAAAGG
TTTTGGATGCCTCATGGTACATGCCAAATGAGCAAAGAAATCCAATCCAAGAGTATCAAG
TTGCTCATATTCCAGGTGCTCTCTTCTTTGATTTGGATGGAATATCAGATAGAAGAACTA
ATTTACCACACATGCTGCCATCTGAGGAAGCTTTTGCTGCTGCTTGTTCTGCTCTTGGAA
TCGAGAACAAAGATGGAGTGGTTGTGTATGATGGAAAGGGCATCTTTAGTGCCTCTCGTG
TTTGGTGGATGTTTAGAGTCTTTGGACATGAAAATGTTTGGGTACTTGATGGAGCTTACC
TAGATGGCGTG

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

CO CL6408Contig1 798 2 2 U
AGGGTTTCTAACCGATCTTTTTACAGGGATGGCAAAAATGGGTGAGAAAGAATGGTACTT
CTTCTGTTTGAGGGACAAGAAGTATCCAACCGGTTTGAGGACTAACCGGGCTACGGAAGC
CGGTTACTGAAGGCCACCGGGAAAGATAAGGAGATTTACCGGGGTAAAACCCTTGTTGGG
ATGAAGAAAACACTTGTATTCTATAGAGGAAGAGCTCCTAAAGGTCAGAAAACCAATTGG
GTGATCCATGAGTATAGGCTTGAAGGCGAACTCTCTGCCCATAATTTACCTAAAACCGCA
AAGGTTTTTTTTTCAATATAAAAGCTCTGTTTCTGCTCTGTTTTTTTTCTCTATTTCTTT
GGTTTAATAACTTTTGTTGGAGTTTTCAGAATGAATGGGTGATATGCAGAGTGTTCCGGA
AGACTGCTGGAGGGAAGAAGATCCCTATTTCAAGTCTAATCCGGATTGGTTCAGTCGGAA
CCGGCTTTAACCCTTCTTATTTGTCCCATTTAACCGATGATTCAAGTTACAATGATAAAA
CCAAAACAGAACCGGTTTACGTGCCCTGCTTCTCCAACAAAACTGATCAACTCCAAGGAA
ACACATTCAACTGCTTTAGCAATCCTGTTTTCAACTCGATCCAAGCCGACATTTTCAACA
GGCTTCCACTTTACCAAAGCTCGATGCTCGCTCAAGAGCATTCGGTTTTACAGGCTATGG
TTGATAATAACACAAGGCAGAGTTTCAAAGGGATGAGTGTTTCACAAGAAACCGCAGTTT
TTACTGACATAAACACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1A723TF U 1
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BS 658 798 RS1A723JQ

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DS 

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CTTTTTATTTGTCCCATTTAACCGATGATTCAAGTTACAATGATAAAACCAAAACAGAAC
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QA 1 366 1 366
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1GS67TF U 1
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TAACCGCACCTCGTGTAGCTGAGACTTAGTGTTCCTGACCCGTAGCTGCTATCAAG*TCC
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DS 

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TAACCGCACCTCGTGTAGCTGAGACTTAGTGTTCCTGACCCGTAGCTGCTATCAAGGTCC
GCTTTTTCGCTCCGAACGGTGTGCTCGGTTTCAGTACGGAGCGCTTCCGTGTTTTCGGCT
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CTTGATATCTTGGTCTGTGATTATCATAAATCAATACCATTAAATCAAAATCATTCCCAA
CTTATGCCTTTAATAAATATTTTAAAGTTTTCC

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

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AT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RS1AG62TF U 1
AF RS1AG62JQ C 432
BS 1 780 RS1AG62TF
BS 781 1322 RS1AG62JQ

RD RS1AG62TF 780 0 0
GGGGGTTGTTGATGTTGATGCAGAGCCCAAGATCTCCGTCGTCGTCGTCGTCGTCGTCGC
AGCTGTATTTGTCAGCCTCCGTCACCGATCCAGTCAAATCAGGCAATGGCGTTCAAGCTT
ACATCTCTTACAGAGTCGTCACCAAGACGAACTTGCCGGAGTATCAAGGAGGACCGGAGA
AGATTGTAATCAGACGGTACAGTGATTTCGTGTGGTTGAGGGATCGGCTCTTTGAGAAGT
ACATAGGCGTTTTCGTTCCTCCTCTCCCGGAGAAGAGTGCTGTTGAAAAATTCAGGTTTA
CTGCTGAGTTTATTGAAATGAGGAGAGCGGCATTGGATATATTTGTTAATCGGATAGCAT
TACACTCTGAGCTTCAGCATAGTGAGGATCTTAGAACCTTTTTGCAAGCTGATGAAGAGA
CAATGGAAAGATTCAGGTTTCAGGAAACTGGTATATTCAAGACCAAGCCTGCTGATCTTA
TGCAAATGTTTTGGGATGTGCAATCAAAAGTTAGTTATGCTGTCCTCGGAAAGGAAAAAC
CTGTCGAAGAAACTACTCCTGAATACGAGAAGCTTAAACACTACGTTTTCGAGCTTGAGA
ACCACTTAGCTGAAGCTCAGAAGCATGCATTTCGCCTCGTCAAGAGGCATAGAGAACTGG
GTCAGTCACTGTTGGATTTTGGCAAAGCTGTAAAACTTCTTGGGGCTTGTGAGGGTGAAC
CTACAGGAAAAGCATTTTCTGATCTTGGAACTAAATCTGAACTGGTATCGATTAAGCTCC

QA 1 780 1 780
DS 

RD RS1AG62JQ 891 0 0
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TGGGATGTGCAATCAAAAGTTAGTTATGCTGTCCTCGGAAAGGAAAAACCTGTCGAAGAA
ACTACTCCTGAATACGAGAAGCTTAAACACTACGTTTTCGAGCTTGAGAACCACTTAGCT
GAAGCTCAGAAGCATGCATTTCGCCTCGTCAAGAGGCATAGAGAACTGGGTCAGTCACTG
TTGGATTTTGGCAAAGCTGTAAAACTTCTTGGGGCTTGTGAGGGTGAACCTACAGGAAAA
GCATTTTCTGATCTTGGAACTAAATCTGAACTGGTATCGATTAAGCTCCAGAAAGAGGCT
CAACAAGTTTTGATGAACTTTGAGGAACCGTTGAAGGACTATGTTCGTTATGTGCAATCC
ATCAAGGCGACAATAGCAGAACGAGGCACTGCATTCAGGCAACATTGTGAATTGACAGAA
ACAACAAAGTTGAAGGAAATAAACCTTGACAAACTCATGCTCACACGTTCTGACAAAGTA
GGAGAATCTGAGAAGGAATACAGAGAGATAAAAGCAGAAAGCGAGGAAGCAACGATAAGG
TTTGAGAGGATAGTAAAGAGAATGAACGAGGAGATAGTGAGGTTCCAAGAAGAGAAGACA
GAAGAGATGGGAGTTGCGTTTCATCAGTTTGCTAAAGGACAAGCTCGCTTAGCAAACGGT
GTAGCTGATGGTTGGAGAGCTCTTCTTCCCAAACTTGAAGCTTCTTCTTCTGTTTAAAAG
AAAAACTTCTTTGTGTCTTTTTGTTGTTTTCTAACTGTTTTATTTTTGTTAACTTCAACT
TTAGTAACTTTGCTCGTTTTCTTCCACTTCTAAAGAACACTATTCATAAAT

QA 1 891 1 891
DS 



AS 1 2

CO CL6411Contig1 780 2 2 U
GGAGAAGAACTACAGCATGTTCTTGCAAGGTGTCTTTGATCACGAGATGAGATTCCTCAA
CATGGTCACCGGCTGGCCTGGCGGCATGACCGTCTCCAAGCTTCTTAACTTATCTGGTTT
CTTCAAACTCTGTGAGTCCGGTCAGATTTTAGACGGCAATCCCAAAACTCTATACCAAGG
AGCTGAGATTAGAGAGTATGTGGTTGGAGGTTTCAGCTACCCGCTTCTTCCTTGGCTTAT
AACTCCTCACGACACCACCGGGGATGATCCCCCCATGATGGCTTTCAACGACAGGCACGA
GAAGGTGAGGTCAGTGGCTGCCACGGCCTTTGCACAGCTAAAAGGAAGCTGGAGGATTCT
CAGCAAGGTGTGGAGACCAGACAGGAGAAAATTACCAAGTATAATATTGGTGTGTTGTTT
ATTGCATAACATCATAATAGATTGTGGAGATTATCTGGAAGAAGATGTTGCTTTATCGGG
TCATCACGACGTGGGATATTCAGAGCGGTACTGCAAGCAGAGCGAGCCGCTTGGTAGTGA
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TCAGTAGCCCAAGAAAATATCTAGGAGGGGAGAAAATGTTATGAAACTTTTTCTTGTAGT
ATAAAAATCGATCTGTCCTCTCTTATTTGATAAATTATCAAACAGAAGTGTTTATTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AE22TF U 1
AF RS1AE22JQ C 107
BS 1 779 RS1AE22TF
BS 780 780 RS1AE22JQ

RD RS1AE22TF 779 0 0
GGAGAAGAACTACAGCATGTTCTTGCAAGGTGTCTTTGATCACGAGATGAGATTCCTCAA
CATGGTCACCGGCTGGCCTGGCGGCATGACCGTCTCCAAGCTTCTTAACTTATCTGGTTT
CTTCAAACTCTGTGAGTCCGGTCAGATTTTAGACGGCAATCCCAAAACTCTATACCAAGG
AGCTGAGATTAGAGAGTATGTGGTTGGAGGTTTCAGCTACCCGCTTCTTCCTTGGCTTAT
AACTCCTCACGACACCACCGGGGATGATCCCCCCATGATGGCTTTCAACGACAGGCACGA
GAAGGTGAGGTCAGTGGCTGCCACGGCCTTTGCACAGCTAAAAGGAAGCTGGAGGATTCT
CAGCAAGGTGTGGAGACCAGACAGGAGAAAATTACCAAGTATAATATTGGTGTGTTGTTT
ATTGCATAACATCATAATAGATTGTGGAGATTATCTGGAAGAAGATGTTGCTTTATCGGG
TCATCACGACGTGGGATATTCAGAGCGGTACTGCAAGCAGAGCGAGCCGCTTGGTAGTGA
GCTCAGAGGATATCTGACTGGGTATTTACAGAGGTGAGAATAGACTTTCTTCAGTATTTG
AGAGAGCCTTAACGCTTCTCGAAAGCCCATCCCACCAAAAGTCCACTGAGCAATGCAGCA
TCAGTAGCCCAAGAAAATATCTAGGAGGGGAGAAAATGTTATGAAACTTTTTCTTGTAGT
ATAAAAATCGATCTGTCCTCTCTTATTTGATAAATTATCAAACAGAAGTGTTTATTTTA

QA 1 779 1 779
DS 

RD RS1AE22JQ 674 0 0
AACTTATCTGGTTTCTTCAAACTCTGTGAGTCCGGTCAGATTTTAGACGGCAATCCCAAA
ACTCTATACCAAGGAGCTGAGATTAGAGAGTATGTGGTTGGAGGTTTCAGCTACCCGCTT
CTTCCTTGGCTTATAACTCCTCACGACACCACCGGGGATGATCCCCCCATGATGGCTTTC
AACGACAGGCACGAGAAGGTGAGGTCAGTGGCTGCCACGGCCTTTGCACAGCTAAAAGGA
AGCTGGAGGATTTTCAGCAAGGTGTGGAGACCAGACAGGAGAAAATTACCAAGTATAATA
TTGGTGTGTTGTTTATTGCATAACATCATAATAGATTGTGGAGATTATCTGGAAGAAGAT
GTTGCTTTATCGGGTCATCACGACGTGGGATATTCAGAGCGGTACTGCAAGCAGAGCGAG
CCGCTTGGTAGTGAGCTCAGAGGATATCTGACTGGGTATTTACAGAGGTGAGAATAGACT
TTTTTCAGTATTTGAGAGAGCCTTAACGCTTCTCGAAAGCCCATCCCACCAAAAGTCCAC
TGAGCAATGCAGCATCAGTAGCCCAAGAAAATATCTAGGAGGGGAGAAAATGTTATGAAA
CTTTTTCTTGTAGTATAAAAATCGATCTGTCCTCTCTTATTTGATAAATTATCAAACAGA
AGTGTTTATTTTAC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6413Contig1 731 2 1 U
GTTTAACTAAAATAATAAAAGAAGAATTATTAGTCACCCGCCTTATTTGGATGTCGACTG
GTCCATGTAATGCCGAAGATTTCCAACTTAGCTATCTACTTCTTGATCTCGCATATCCAA
TTATGTAACTTGAAATTCTTCTGACAGCCTTTGGTAAGTTGAGGAACTTCACTGTTATCA
CCTTCAAATATAACATTGCGGTATCCTTTGGACCATGCGTGGTGTACTGTCATTAAGAGA
GCTTGTAGTTCAGTGTCTAAAGAAGATGTACAAATCGAGCCCCGGCAGGCCTTTAGCAGC
TTTAGAATATGTTCCATTATGATCTCTAAAGATCCAAGCAGCTTCTGATTCAGTATTCAT
TCCCATAAAACGACAATCATAGTTACACTTGATGTAGTTCATGTGGACGCTTCCATTTTG
GCATTTGAGTTAAGTTGGCTCTGGCTTTTGCTTGTTATTTAGGCGAAGCAACTGTTATCC
ATTCATTTGAGTTAAATTACCAGCAACCCATATCTCTCACATAGTCACATAGTCTTTACA
CTGACTTTATTGATATTTTCATTTTCAAGTGACATAATAAATTTTCATTTTGTAAATCTA
ATTGAGTCAATAGAAAATGGACAAGTGTGGAAATAGTCTCTACAGAACATTTCAAAATCT
CTTTGCAAGTTTGCAGAGAAATTGTGATATTTTCTACAATCTTTCTCCAGACTGTCTTGA
TAGATCATCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EJ06TF U 1
AF RS1EJ06JQ C 62
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TTATGTAACTTGAAATTCTTCTGACAGCCTTTGGTAAGTTGAGGAACTTCACTGTTATCA
CCTTCAAATATAACATTGCGGTATCCTTTGGACCATGCGTGGTGTACTGTCATTAAGAGA
GCTTGTAGTTCAGTGTCTAAAGAAGATGTACAAATCGAGCCCCGGCAGGCCTTTAGCAGC
TTTAGAATATGTTCCATTATGATCTCTAAAGATCCAAGCAGCTTCTGATTCAGTATTCAT
TCCCATAAAACGACAATCATAGTTACACTTGATGTAGTTCATGTGGACGCTTCCATTTTG
GCATTTGAGTTAAGTTGGCTCTGGCTTTTGCTTGTTATTTAGGCGAAGCAACTGTTATCC
ATTCATTTGAGTTAAATTACCAGCAACCCATATCTCTCACATAGTCACATAGTCTTTACA
CTGACTTTATTGATATTTTCATTTTCAAGTGACATAATAAATTTTCATTTTGTAAATCTA
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CTTTGCAAGTTTGCAGAGAAATTGTGATATTTTCTACAATCTTTCTCCAGACTGTCTTGA
TAGATCATCAC

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DS 

RD RS1EJ06JQ 670 0 0
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TATGTAACTTGAAATTCTTCTGACAGCCTTTGGTAAGTTGAGGAACTTCACTGTTATCAC
CTTCAAATATAACATTGCGGTATCCTTTGGACCATGCGTGGTGTACTGTCATTAAGAGAG
CTTGTAGTTCAGTGTCTAAAGAAGATGTACAAATCGAGCCCCGGCAGGCCTTTAGCAGCT
TTAGAATATGTTCCATTATGATCTCTAAAGATCCAAGCAGCTTCTGATTCAGTATTCATT
CCCATAAAACGACAATCATAGTTACACTTGATGTAGTTCATGTGGACGCTTCCATTTTGG
CATTTGAGTTAAGTTGGCTCTGGCTTTTGCTTGTTATTTAGGCGAAGCAACTGTTATCCA
TTCATTTGAGTTAAATTACCAGCAACCCATATCTCTCACATAGTCACATAGTCTTTACAC
TGACTTTATTGATATTTTCATTTTCAAGTGACATAATAAATTTTCATTTTGTAAATCTAA
TTGAGTCAATAGAAAATGGACAAGTGTGGAAATAGTCTTTACAGAACATTTCAAAATCTC
TTTGCAAGTTTGCAGAGAAATTGTGATATTTTCTACAATCTTTCTCCAGACTGTCTTGAT
AGATCATCAC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

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CTTTTTCTTTTTGTTTCTTTCTGTGTGTTCTTTAGTGGGAGTTTGATGGCATTTTCCAGA
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TTCCCC


BQ
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AF RS1GG43JQ U 1
AF RS1CS95JQ U 197
BS 1 463 RS1GG43JQ
BS 464 846 RS1CS95JQ

RD RS1GG43JQ 463 0 0
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CTTTTTCTTTTTGTTTCTTTCTGTGTGTTCTTTAGTGGGAGTTTGATGGCATTTTCCAGA
AAGGTTTGGTAGCAACAAGTATCTTCTCTCTTCCATGGGATTCAGGTTCTTTGTCATGTA
TGGAAGAAGACCATCTTACAGCATGAGCCATTCTTGCTACTTTGTCTAGCACCTCTGGAG
AGTCTCGGGTCAAAACCTTTCCTTCTGGACGCAATATTCTGTCCATCTCTACCATCAGAT
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QA 1 463 1 463
DS 

RD RS1CS95JQ 650 0 0
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TCTAGAAGGAACTTTAGTAAGCCTTTCCGGCCACTTGGGAATAGTTCCCC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

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GAATTCGATGATACAAAGAACAAACTCACCGTCTTCTTCTCTACACCATGTGAAGTCGCA
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AAACTGATGGGTGTTGAAGGGATGAAGACCAAAGTGTTGGTTTGGGTTAAAGTCACGACA
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CGATCTAAGAGTGTTTATGATATCCCTCATGACGCTATCAAAGTCGTTGGAGAGTTCTGA
TAAGAAAGGGTTATTTGATTCATGAATTTTATATTGGTTATTTGGTTATTATTTGCATCT
TGGGAAGAGGT


BQ
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20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DP41JQ C 1
AF RS1DP41TF U 1
BS 1 671 RS1DP41TF

RD RS1DP41JQ 671 0 0
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AAACTGATGGGTGTTGAAGGGATGAAGACCAAAGTGTTGGTTTGGGTTAAAGTCACGACA
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TGGGAAGAGGT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1DP41TF 671 0 0
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ATGGAGAAAGCGTTAACGAAAGTGACGAGCTTCAAAGTGGGAGGCTCATGGATCTCGAAG
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GAATTCGATGATACAAAGAACAAACTCACCGTCTTCTTCTCTACACCATGTGAAGTCGCA
TTCAAAGATGGATCAGCCATAAGATACGCGACACGCGTGAAAGGGATTTTGGTTAGAGGG
AAACTGATGGGTGTTGAAGGGATGAAGACCAAAGTGTTGGTTTGGGTTAAAGTCACGACA
ATCTCAGTCGAGAGCTCCAAGTCAGACAAGCTATGGTTCACTGCCGGTGTCAAGAAGTCT
CGATCTAAGAGTGTTTATGATATCCCTCATGACGCTATCAAAGTCGTTGGAGAGTTCTGA
TAAGAAAGGGTTATTTGATTCATGAATTTTATATTGGTTATTTGGTTATTATTTGCATCT
TGGGAAGAGGT

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 2

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TCTGATTCCGCTGAGTGAGTTCTCGGAAGCGGCTGTGATGAAGAAGTATGGAGTGAAGCC
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AAGATTTGTGTGTCGTTGTGTCGTTGTGTCTTAATATGTATTTATAACTCTTGTGTCACT
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TAATAATAATTACTCGTTTTGAGTTTTGGGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GX16TF U 1
AF RS1GX16JQ C 30
BS 1 695 RS1GX16TF
BS 696 753 RS1GX16JQ

RD RS1GX16TF 695 0 0
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AAGTGTAAGCAACCATGTTGTGAACAACGTGGCATGCCCTGTCACCGTCGTGAAGGCTCA
CCACTGAGCTCTGTGTTGATACTGCTCCGGAGAAGCTGATAGCCTACCGGTGTATATCCT
AAGATTTGTGTGTCGTTGTGTCGTTGTGTCTTAATATGTATTTATAACTCTTGTGTCACT
TGTATGTTGTTTATCTTGAGCATCTTTGTCTTTTC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1GX16JQ 724 0 0
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GCCTTGGTGGTCTTAAGAGGATGATAATGGGAAGTGTAAGCAACCATGTTGTGAACAACG
TGGCATGCCCTGTCACCGTCGTGAAGGCTCACCACTGAGCTCTGTGTTGATACTGCTCCG
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GACG

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BY52JQ C 1
AF RS1BY52TF U 1
BS 1 596 RS1BY52TF

RD RS1BY52JQ 596 0 0
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TTTTTTTCAAAGTACGATGAAGATTCCAAGTTAAGCACTAGACTTTACATGTGTCT

QA 1 596 1 596
DS 

RD RS1BY52TF 596 0 0
GGCCGAACCCTTATCTCACCAAGGAACATCATTAAAATTCACCAACTCAGGATTTGGCCA
AGCAGACTGCAATGGCGAAGAAGAAAGAGCTCTTATCCAAAGCCCCCTGGAGAGGCGACG
ACGATGACTCCGATAAATTCAGCGGCGCAAAGCTCAAGGTCACCAAGGAGTCTGACAGTA
TGTCGAAGATGCACGTCCCTAGCCGTGGAACCAATAAAGGTAGTCTCGCCGATGACGATG
ATTCCCTCGAAATCGATCCTCAGCTTCGATACAGCTTCAATCGAAACTATCAGTTCCTGC
AAAGAGTGTTCACTGTAGACACTTTGGTGAAGCCTCTTCCTCCTACCATGGCTTACAATG
TCTCTCGCAACTTGAGCTTCTTCAGCCGCATTTTCACTCAGTTCTTTGATCCTGAAGGCA
TTGCAAATGCACAGAAGTCTCTTGGGTTGGGACAGGAAGACAAAGCTCGTCGTGTTAGTT
GAGATTTGAATGGACGCTGCGTTCTTGTTATGTTATTTAAAATAAAGATAATTTGTGTCC
TTTTTTTCAAAGTACGATGAAGATTCCAAGTTAAGCACTAGACTTTACATGTGTCT

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 2

CO CL6418Contig1 833 2 4 U
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TGCGGAAGAACTAAAGAACGCTCTGAATGGTGAATCAGCTTCTTCCAGTAGAAATGCTAG
CCAGGGCTCTGGTTCTGGTGGTGGCTGGAGCTCCGCTGAGGATGATGAAGCAGATCCAAT
GGATCAAGATGGTTTGGAAGGTGAGAAAAATGAGAGGTTCAGTGAACACAGAAGAGTGCA
TTACAATGAGTTCCACAAGGTGAAGGAACTTAGGTCCTTGGGGTCCTTCTATGATGATGA
AGAAGAGGACGAGGATGATGATGGCTCCAAAGGAAGTGAAGCTGAGACAACAACCTCACC
ACACAGTAAAGGCGTTAACAAAGAGGGGAAGTCATCTTCATCCTCCAGTTGATGATATGA
TATGATACCTCTGTTCAATCAAGCGTGTACTCTTGTCCACGTTTTATAGATCTCTCTCTC
TCAATCTTTAAACCTTTTTGAAAGGAAGAGGAACAAGAAAACAAAAATCAAGATTCTGAA
ACTAAGTTATGCTGTTACGGCATTTTAATGCAATTGCTTACAATCACTACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DL73TF U 1
AF RS1DL73JQ C 78
BS 1 723 RS1DL73TF
BS 724 724 RS1DL73JQ
BS 725 746 RS1DL73TF
BS 747 833 RS1DL73JQ

RD RS1DL73TF 756 0 0
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ACAAAAACAAAAAAAAGTTGCTGGAGAGATGGCTGATCCAAAGAAGGGGCGTGTACAATG
GGATGAAGCTAATATAGTGGAAATTGGATCTAACAAACCTGTTAGGCAGAAGATCACTGA
ACCTAAGACTCCCTACCACCCCATGATTCATGATGATGATGATGATGTTGATGTTGGTGA
TGGTACTTTGTCTCCAAGAGGAGGAAGATCCTTCAACGAATGCGTTGATGATATGCAACG
TGCGGAAGAACTAAAGAACGCTCTGAATGGTGAATCAGCTTCTTCCAGTAGAAATGCTAG
CCAGGGCTCTGGTTCTGGTGGTGGCTGGAGCTCCGCTGAGGATGATGAAGCAGATCCAAT
GGATCAAGATGGTTTGGAAGGTGAGAAAAATGAGAGGTTCAGTGAACACAGAAGAGTGCA
TTACAATGAGTTCCACAAGGTGAAGGAACTTAGGTCCTTGGGGTCCTTCTATGATGATGA
AGAAGAGGACGAGGATGATGATGGCTCCAAAGGAAGTGAAGCTGAGACAACAACCTCACC
ACACAGTAAAGGCGTTAACAAAGAGGGGAAGTCATCTTCATCCTCCAGTTGATGATATGA
TATGATACCTCTGTTCAATCAAGCGTGTACTCTTGTCCACGTTTTATAGATCTCTCTCTC
TCA*TCTTTAAACCTTTTTGAAAGGA
GAGGACAGAA

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1DL73JQ 756 0 0
TTGCTGGAGAGATGGCTGATCCAAAGAAGGGGCGTGTACAATGGGATGAAGCTAATATAG
TGGAAATTGGATCTAACAAACCTGTTAGGCAGAAGATCACTGAACCTAAGACTCCCTACC
ACCCCATGATTCATGATGATGATGATGATGTTGATGTTGGTGATGGTACTTTGTCTCCAA
GAGGAGGAAGATCCTTCAACGAATGCGTTGATGATATGCAACGTGCGGAAGAACTAAAGA
ACGCTCTGAATGGTGAATCAGCTTCTTCCAGTAGAAATGCTAGCCAGGGCTCTGGTTCTG
GTGGTGGCTGGAGCTCCGCTGAGGATGATGAAGCAGATCCAATGGATCAAGATGGTTTGG
AAGGTGAGAAAAATGAGAGGTTCAGTGAACACAGAAGAGTGCATTACAATGAGTTCCACA
AGGTGAAGGAACTTAGGTCCTTGGGGTCCTTCTATGATGATGAAGAAGAGGACGAGGATG
ATGATGGCTCCAAAGGAAGTGAAGCTGAGACAACAACCTCACCACACAGTAAAGGCGTTA
ACAAAGAGGGGAAGTCATCTTCATCCTCCAGTTGATGATATGATATGATACCTCTGTTCA
ATCAAGCGTGTACTCTTGTCCACGTTTTATAGATCTCTCTCTCTCAATCTTTAAACCTTT
TTGAAAGGAAGAGGAACAAGAAAACAAAAATCAAGATTCTGAAACTAAGTTATGCTGTTA
CGGCATTTTAATGCAATTGCTTACAATCACTACTCC

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL6419Contig1 1077 2 2 U
ATTCGGTGCTGGGGGTCGCGATTGGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAATGATGAGCTCCATT
GGATCATCTCTTTCTCTGTTCTGTTGTTCTTATCCGAACCGTAAACAGAGGAGATGCTCT
GTCCTTTGCTCCTGCGTCAGAACCGCTGCGGCTAGGCGGCAGAGTCGGGATCTGTCCGCA
ACCGAAGCTAGAGTTTCTCTCGTTCTCGCTCTCGCCTCCCAGGCCTCCTCTGTTTCTCAG
CGCCTTTTGGCTGATTTGGCTGTGGAGACTGCGAAGTATGTGTTTCCGAAGAGATTCAAT
AGCTCGAACCTTGAAGAAACCTTCATGTCTGTTCCGGATCTCGAGACTATGAACTTCAGA
GTTCTAAGCAGGACAGATCGATACGAGATCAGAGAAGTCGAGCCTTATTATGTGGCCGAG
ACTACAATGCCAGGGGGAACTGGATTTGACTTCTATGGTGCTTCCAGGTCTTTTAATGTC
TTAGCTGAGTACCTCTTTGGTAAGAACACGGTAAATGAGAAAATGGAGATGACCACTCCT
GTTGTTACTCGTAAAGTCCAGTCTGTTGGAGAAAAGATGGATATGACTACTCCAGTAATA
ACTAGGAAGGGGAAAGATCAAACCCAATGGCAGATGTCTTTTGTCATGCCCTCGAAGTAT
GGCTCAGATTTGCCACTGCCTAAAGATCCTTCAGTCAAGATACAGGAGGTGCCACGGAAG
ATCGTTGCTGTTCTCGCCTTCTCAGGATACGTAACAGATGAAGAGATTGAGAAACGGGAG
CAAGAACTAAGGCGAGCTCTTCAGAATGACAAGAAGTTTCGAGTGAGATATGGTGTTTCA
GTCGAAGTTGCACAGTACAATCCACCATTCACTCTCCCGTTCACCCGCCGCAACGAGGTC
TCTTTAGAAGTGGAAAGCAAAGAGTATTAGCACCTTCGTTGGTACTACATACAGACGTAT
ATACACACATACACTTGTACACAGTGTTAAAATAGTTGTGGCTAAAAAAGACAAAACGCG
TTTACTTGAACAGTTGAATGTGAGTAAGTAAACTATTATGGATCTTTCACTTTAGCT


BQ
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AF RS1BY16TF U 1
AF RS1BY16JQ C 374
BS 1 701 RS1BY16TF
BS 702 1077 RS1BY16JQ

RD RS1BY16TF 701 0 0
ATTCGGTGCTGGGGGTCGCGATTGGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAATGATGAGCTCCATT
GGATCATCTCTTTCTCTGTTCTGTTGTTCTTATCCGAACCGTAAACAGAGGAGATGCTCT
GTCCTTTGCTCCTGCGTCAGAACCGCTGCGGCTAGGCGGCAGAGTCGGGATCTGTCCGCA
ACCGAAGCTAGAGTTTCTCTCGTTCTCGCTCTCGCCTCCCAGGCCTCCTCTGTTTCTCAG
CGCCTTTTGGCTGATTTGGCTGTGGAGACTGCGAAGTATGTGTTTCCGAAGAGATTCAAT
AGCTCGAACCTTGAAGAAACCTTCATGTCTGTTCCGGATCTCGAGACTATGAACTTCAGA
GTTCTAAGCAGGACAGATCGATACGAGATCAGAGAAGTCGAGCCTTATTATGTGGCCGAG
ACTACAATGCCAGGGGGAACTGGATTTGACTTCTATGGTGCTTCCAGGTCTTTTAATGTC
TTAGCTGAGTACCTCTTTGGTAAGAACACGGTAAATGAGAAAATGGAGATGACCACTCCT
GTTGTTACTCGTAAAGTCCAGTCTGTTGGAGAAAAGATGGATATGACTACTCCAGTAATA
ACTAGGAAGGGGAAAGATCAAACCCAATGGCAGATGTCTTTTGTCATGCCCTCGAAGTAT
GGCTCAGATTTGCCACTGCCTAAAGATCCTTCAGTCAAGAT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RS1BY16JQ 704 0 0
CAGATCGATACGAGATCAGAGAAGTCGAGCCTTATTATGTGGCCGAGACTACAATGCCAG
GGGGAACTGGATTTGACTTCTATGGTGCTTCCAGGTCTTTTAATGTCTTAGCTGAGTACC
TCTTTGGTAAGAACACGGTAAATGAGAAAATGGAGATGACCACTCCTGTTGTTACTCGTA
AAGTCCAGTCTGTTGGAGAAAAGATGGATATGACTACTCCAGTAATAACTAGGAAGGGGA
AAGATCAAACCCAATGGCAGATGTCTTTTGTCATGCCCTCGAAGTATGGTTCAGATTTGC
CACTGCCTAAAGATCCTTCAGTCAAGATACAGGAGGTGCCACGGAAGATCGTTGCTGTTC
TCGCCTTCTCAGGATACGTAACAGATGAAGAGATTGAGAAACGGGAGCAAGAACTAAGGC
GAGCTCTTCAGAATGACAAGAAGTTTCGAGTGAGATATGGTGTTTCAGTCGAAGTTGCAC
AGTACAATCCACCATTCACTCTCCCGTTCACCCGCCGCAACGAGGTCTCTTTAGAAGTGG
AAAGCAAAGAGTATTAGCACCTTCGTTGGTACTACATACAGACGTATATACACACATACA
CTTGTACACAGTGTTAAAATAGTTGTGGCTAAAAAAGACAAAACGCGTTTACTTGAACAG
TTGAATGTGAGTAAGTAAACTATTATGGATCTTTCACTTTAGCT

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

CO CL6420Contig1 666 2 1 U
GGGTTTTCAAACAGTCTGTTAGCACCCCCGCCGCAAAGATGCAGATCTTCGTGAAAACCC
TAACGGGTAAGACGATAACCCTCGAGGTTGAGTCCTCTGACACCATCGACAACGTCAAGG
CCAAGATCCAGGACAAGGAAGGAATCCCTCCGGACCAGCAGCGACTGATCTTCGCCGGGA
AGCAGCTGGAAGACGGCCGCACCCTCGCCGACTACAACATCCAGAAGGAGTCGACGCTTC
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ATCAGC


BQ
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CCAAGATCCAGGACAAGGAAGGAATCCCTCCGGACCAGCAGCGACTGATCTTCGCCGGGA
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ATCTCGTCCTCCGTCTCCGTGGTGGGGCCAAGAATAGGAAGAAGAAGACGTACACCAAGC
CGAAGAAGATCAAGCACAAGCACAAGAAGGTGAAGCTCGCCGTGCTCCAGTTCTACAAGG
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BQ
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AF RS1AL79TF U 1
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GTGAGACTTACCAAAGGAAGAGATTTGTGATACCTATATCATATTTAAACCATCCATTGT
TCCAAAGTTTGCTGAACCTCGCGGAAGAAGAGTTTGGGTTCGATCATCCCATGGGAGGTC
TAACAATCCCTTGCACTGAAGATTACTTTACTGCTCTAGCCTCTATTCTAAACGGTTCAT
GGTAAGGGAGCTCACTGATCATCCCAAGATTCATTAAGATTATTCATACAAATAAATTGT
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AGATTGAGATACTAAGTAGACTCTTTCAGTTTTGGATCTAAGAAGATCTTGAGAGTTCTT
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QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 

AF RS1CR92TF U 1
AF RS1CR92JQ C 70
BS 1 735 RS1CR92TF
BS 736 785 RS1CR92JQ

RD RS1CR92TF 735 0 0
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GCCTCATTTCTAGGGCGTCGATCAGTGTCTTGGAAGATCAATCCATCAACGGTTTTAAAA
TGCAACTTGGCAGCTCTGTTTCTCCTCCGCGTTTAATCAATCCATTAGGCAAGACGATGA
GTAGGAGCGATCAGGCGTTTCTTCTCTTCGCCTTCATTGCTTGCACGACTTCAGTTGCTT
TTACAAGTTTTGTGATTACAGCAGTTCCCACACTTCTGGCCATGGGTAGAGCTGCGTCTC
CCTTTGCTAAGTTAGCCGACACGGCCCGCCAGGAACTCCCTAGTACCTTGGCAGCCATTA
GGCTCTCCGGCATGGAAATAAGCGATCTTACTCTTGAATTAAGCGAGTTAAGCCATGAAG
TAAGTGATGGGGTAAACAAATCAACTAAAGCGGTTCAAGCAGCTGAGGCTGGAATCCGAC
AGATTGGAACGCTTGCACATCAGCAAACTCTCTCAATGATTGATGAGAGAGCAAGTTTAC
CAGAAATATCACTGCAACCTGTTGTGGCTGGTGCAGCGAAGAAGACTTCTCACGCAATAG
GCATAGCATCCAAGACACTAATGAACATTATAACCGGAGGAGGTGACAAGGACGAAGAAG
ACTCCTAAGACGTTTTTAAAAACCTTCTCACTTTAATTCTTTGCTCCTTTTTTTTTTGCA
AGCTATGAGATTATT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RS1CR92JQ 716 0 0
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TTGTGATTACAGCAGTTCCCACACTTCTGGCCATGGGTAGAGCTGCGTCTCCCTTTGCTA
AGTTAGCCGACACGGCCCGCCAGGAACTCCCTAGTACCTTGGCAGCCATTAGGCTCTCCG
GCATGGAAATAAGCGATCTTACTCTTGAATTAAGCGAGTTAAGCCATGAAGTAAGTGATG
GGGTAAACAAATCAACTAAAGCGGTTCAAGCAGCTGAGGCTGGAATCCGACAGATTGGAA
CGCTTGCACATCAGCAAACTCTCTCAATGATTGATGAGAGAGCAAGTTTACCAGAAATAT
CACTGCAACCTGTTGTGGCTGGTGCAGCGAAGAAGACTTCTCACGCAATAGGCATAGCAT
CCAAGACACTAATGAACATTATAACCGGAGGAGGTGACAAGGACGAAGAAGACTCCTAAG
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ATTATTAAAGGAATCACGGTTCAGTTGGTCTCACGGTTCAAACTTTCTGTCATATC

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

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TAAAATTACTGAACATGAACACATAGAAGGAGAAAACGAAGACGAATTGGGTAAATTGAT
TGAAGGAGGCGAAGAAGAAGATGAGGAGGGTAGGAGTGAAAAGGAGGATGGAAAAGTGCA
ACCTGATGATGATGATATGTTAACGCCTGCAGAAAGACGGTACATAGAGCAGAAGCAGAA
ACTGGATGTGCAGAAACTAGCCAAAGAAGCTAACAAGTCTCACCGTAACAGGATTGGGAT
TTCAATCAGTATCTGGCTAACATGAGTGAGCATTACGATATCCCTAAAGTCGGACCTGGT
TAAATCTACTTCTTCCTTGTCTCTCTCTCTGCTTATTTTCAATTTGGCATTGTCAAACAG
TTACTGTTGTTGGATCTCCCTCGTTTTATTACTTTGCTACTATATGGCCTCTGTTCTTTT
CTATGATGGATTCATTTTCGTGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GQ03TF U 1
AF RS1GQ03JQ C 203
BS 1 625 RS1GQ03TF

RD RS1GQ03TF 625 0 0
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TGCGTACGAAAATGTTATTGGTGGGAAGCTAAAGCTGAAAGGGAAGGCTTTAGATGTGAA
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TAAAATTACTGAACATGAACACATAGAAGGAGAAAACGAAGACGAATTGGGTAAATTGAT
TGAAGGAGGCGAAGAAGAAGATGAGGAGGGTAGGAGTGAAAAGGAGGATGGAAAAGTGCA
ACCTGATGATGATGATATGTTAACGCCTGCAGAAAGACGGTACATAGAGCAGAAGCAGAA
ACTGGATGTGCAGAAACTAGCCAAAGAAGCTAACAAGTCTCACCGTAACAGGATTGGGAT
TTCAATCAGTATCTGGCTAACATGAGTGAGCATTACGATATCCCTAAAGTCGGACCTGGT
TAAATCTACTTCTTCCTTGTCTCTCTCTCTGCTTATTTTCAATTTGGCATTGTCAAACAG
TTACTGTTGTTGGATCTCCCTCGTTTTATTACTTTGCTACTATATGGCCTCTGTTCTTTT
CTATGATGGATTCATTTTCGTGGAC

QA 1 625 1 625
DS 

RD RS1GQ03JQ 423 0 0
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GAGGAGGGTAGGAGTGAAAAGGAGGATGGAAAAGTGCAACCTGATGATGATGATATGTTA
ACGCCTGCAGAAAGACGGTACATAGAGCAGAAGCAGAAACTGGATGTGCAGAAACTAGCC
AAAGAAGCTAACAAGTCTCACCGTAACAGGATTGGGATTTCAATCAGTATCTGGCTAACA
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CTCTCTCTGCTTATTTTCAATTTGGCATTGTCAAACAGTTACTGTTGTTGGATCTCCCTC
GTTTTATTACTTTGCTACTATATGGCCTCTGTTCTTTTCTATGATGGATTCATTTTCGTG
GAC

QA 1 423 1 423
DS 



AS 1 2

CO CL6424Contig1 799 2 4 U
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TATAGTTGAAGCTTGTCTTGTTTATTATTAAGTTGGTGCCAATTTTTTAAAAAATATTTT
GGGTCAGCAGGAAACTAAAAATAATGTTAGTGTCGAGAATGTTTTGTTCTCATCTGCTGT
TGTTTATCGATTAATTGTAACGTTTTTGTTTAATTTTCTGATCAACAAAAATTTTAGTAA
ATCTGTTTTGGCATCTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1H003TF U 1
AF RS1H003JQB C 70
BS 1 670 RS1H003TF
BS 671 671 RS1H003JQB
BS 672 744 RS1H003TF
BS 745 799 RS1H003JQB

RD RS1H003TF 744 0 0
GGCACCACACGAACACAGGAACCTCTCGAATCTCCTCTCTCTCTCTCTATATATATATGG
CGCCGACAGTTCAAACGGCGGTAGTTAACACCAACCGCGGCGATGGAAGAATCAAAGAAA
CCCGTTACAGAGGAGTAAGAAAGAGGCCGTGGGGACGTTACGCCGCCGAGATCAGAGATC
CGTACAAGAAGACACGTGTATGGCTCGGAACCTTCGATACTCCAGAAGCAGCCGCTCGTG
CCTACGACAGAGCCGCTCTTCGCTTTCGCGGCGCTAAAGCCAAAACCAATTTCCCTTATA
CTTACGTAGTCGACAACAACGAGAGCCCGACGCAAAGCAGCACCGTCGAATCATCGTCGA
TTCTGGATCTCAATCTCGGATCCGTTGGTTCCATATTCCCTTTCCCGGAGGTTCAGGTCA
AGCATGGGATGATTTTGTTCGGTGAAGAGTCGACGAGGAGTGAATCGGACTCGTCGTCTG
TGGTGATGGATCTGAGTCCGGAGAGACGGTCACGTGTGTTCTTGGATTTGGATCTTAATC
TCCCTCCAAAGCCTGAGGACTAAGATGAATTATCAAATGGTCTGATTCGAGAGTGACTAC
TATAGTTGAAGCTTGTCTTGTTTATTATTAAGTTGGTGCCAATTTTTTAAAAAATATTTT
GGGTCAGCAG*AAACTAAAAATAATGTTAGTGTCGAGAATGTTTTGTTCTCATCTGCTGT
TGTTTATCGATTAATTGTAACGTT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1H003JQB 730 0 0
TTCAAACGGCGGTAGTTAACACCAACCGCGGCGATGGAAGAATCAAAGAAACCCGTTACA
GAGGAGTAAGAAAGAGGCCGTGGGGACGTTACGCCGCCGAGATCAGAGATCCGTACAAGA
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GAGCCGCTCTTCGCTTTCGCGGCGCTAAAGCCAAAACCAATTTCCCTTATACTTACGTAG
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BQ
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10 10 10 

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QA 1 762 1 762
DS 



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GTATGCAAAAAGTATGCAAAATTTCATCCCATTATCTTTGTGAAATTTCTCTCAACTACT
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BQ
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AF RS1B392JQ C 1
AF RS1B392TF U 1
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CCAAATACAGCCTTCACTTCTTCTCACAGATACTGGATATAGCACCAGCAGCAAAAGATA
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TGCTGTTAAAGTCTTCAAGATGACATGTGAAACAGCAATACAGCTGAGGGAGAAAGGAAA
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GGGGGAGAAGTACAATGAAGAAGTGGAAGGAGCTTGGTCTCAAGCTTATGATCACTTGGC
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GTATGCAAAAAGTATGCAAAATTTCATCCCATTATCTTTGTGAAATTTCTCTCAACTACT
TTTGTTCTTTCTTTAGAGCTACATGACAATCAATCAATGAAATAAATAAATAAACCTACT
GTTAACAGAAT

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1B847TF U 1
AF RS1B847JQ C 61
BS 1 736 RS1B847TF
BS 737 860 RS1B847JQ

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QA 1 736 1 736
DS 

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ACGGGTCCAGGGTCTGGGTTCATACCCAACGTTGTCTTCACTCGGACTCCTGCTCAAGTA
TCTGTCCCGTCGGCAAAATCATCCTCACCGTGTGAAAGCCAAAGCCAAGACATTGATTCG
CAATACCAGATTTAGTGTACGCTTATAATCAAACATAGGGGGATTTTGCTAGAAATGTGC
ATTATAGTCAGAAGTAACAAACTCAACTTAAGTGAAGCGACAACGACAAGAGACCAACGC
GAGTAATGGACGCGTGTCAGAACAAGAACTTTGATTGCATAACCAGGTTCTATGTAATAT
TGACATGTGTGTTTGCTACTATCCAGACGTAAAAGAGCATGACCAAGATTTCGGAGCAAC
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QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GB21TF U 1
AF RS1GB21JQ C 351
BS 1 596 RS1GB21TF
BS 597 1070 RS1GB21JQ

RD RS1GB21TF 596 0 0
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ACCTCGAATACACGCCTCCCCCACCATTTACAGGTGTGAGAAGTGAAAGAACGGATCTGG
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TGCAAGCTCATCCTGCTTTTAAACGTCTAAGCGGGATAAGTGAGCCTGTCGTCAGCAAAA
GCCAAGAGATTGCAGAAGATGTTGTGGAAAGATGGGAAACTAGTGACAACCCCATTGTTC
ACAAAATTCAGGACTTAAATGAGGCAGTGTTTAATGAGACAGATTCTGGATCAACTTACA
AGGAGATACGCCGCCGAGATCCAACGTTCTCCTTGACGGACTTTGCTGCAGAAGTTCACG
AAGCCATCAAACCAGTCTTGAGTGCATATAGCAAGGGAGATGCTGAGACGTTGAAGAAGT
ATTGCAGCGGGGAAGTGATTGAACGGTGCACGGCAGAGCTCGCAGCTTTAAAAGGCCATG
ATCTTTTCTTCGATCACAAGATTCTGCATATATCGGAAGTAGAAGTTGAAGAGACA

QA 1 596 1 596
DS 

RD RS1GB21JQ 720 0 0
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TTGAAGAAGTATTGCAGCGGGGAAGTGATTGAACGGTGCACGGCAGAGCTCGCAGCTTTA
AAAGGCCATGATCTTTTCTTCGATCACAAGATTCTGCATATATCGGAAGTAGAAGTTGAA
GAGACAAAGATGATGGGAACTACGCCCACAATCATCGTCAGGTTCCAAACGCAAGAAATA
TTCTGTGTGCGCGACAAGAATGGCAACATCAAAGAAGGAGGCCAGGACACAATACACTCG
GTGTACTACAAGTGGGCAATGCAACAAGTGGAGGCAGGGGAGGAATCTATGTATCCCATT
TGGAGGCTCAGAGATGTCTGTAAACTTGGTGCTGCCCAGGCTCTTATTTAATATCGTTCG
TTGGTTTATTACCACCGTTAAGCAAAGCCTCTTTATATAATTTTCTCTGCAACGTATCAG
TAGAGTATTATTTACTCAAAATCTTTGTTCACTCTTTACCCTCATTTTTCGTTTTCTTCT
TCTCTCGGGAAGAATTGGGTTCACATGTTTCCGGGGTATAAGTTTTGACATGTATTTGAT
TAGTCCCCTATGTCTCTTTTTCTGGAGGTTCTTACTTCTGTTGGTCAGTCCTAAGGGGAT

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL6429Contig1 1012 2 10 U
GGTCAGGCGTAACTCTTGGCTATCTCGATTTCTTTGAACCCACTTTCTCCTCCAATGAAA
CACCTCATGTTCCTGTAACTACTTCCCGAGCATCCTATATATATAGAGGTCGTCTATGCC
ACTAGGTCTCTCCCGCACACGGTCTCAATCATTCCATGTCATCCACAAGGTTCCCATCGG
AGACAGTCCTTACATCAGAGCCAAAAACGTTCAGATGATAGAGAAGGATCTCGAGAGAGC
AATTCCGCTGTTCTCTTTGCCATTAACGACAGAGACAGAGTTGACAGTGCTCTGAGAGAT
ATGGCTATCATGATGAAGCAGCAAGATTGGGCAGAAGAAGCTATCAAAGCTATTAAGTAT
CTTAGTGTCAGGTGTTCAGATCAAGCTCAGGAATGGCTTGACAACATCCTCTTAGATCTC
TTCGACGTTAATTAGTTGAAGTTCTTCTCAACGAGTATCAGAATCGGCAACGTTACGGAA
TTTGATTTCATTCAATTATTTTCATTTATACTCTAATTAACTTCATTTTCGCACTCCTCA
CACGATCTGTCATTCAATACATCATCTCCTTTCTTCCATTTATGAGAATCTGCAGCTATA
AATATGTACTTAAAAAAAAGTTACAAGATTCTTATCATGAAAAGTGTTTGATCTCTCAAG
AGTGAAATCCAGTTAATTTGTACGATACAGGTTGGTGTGTTTGGAGATGTTTGTAATGAA
AGGAGATGAATGCGCTAGAGAATGCAGAGAACAGATGCGCGTTATGAGAAAAAAGAAGTT
AGTGGCAGTGACGGTGATGATAGGTGGAAGGTGATCATGGTACATTTGTCTTGAGAAACA
CCTAGCATGGTATGATGCTCTCGATTTGATTAAAAAAAGAAGGCACGATGCTCTTGATAC
ACACAACATTGATGCTATGTAATCTCTCTTTTTTTTTTCTAAAATGGCTTTCTCCTATGT
AATCTCTAAAAATTATTCAATCCAAATTCTAATAAAACATCTTCTCATATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FB26TF U 1
AF RS1FB26JQ C 173
BS 1 690 RS1FB26TF
BS 691 691 RS1FB26JQ
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RD RS1FB26TF 773 0 0
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CACCTCATGTTCCTGTAACTACTTCCCGAGCATCCTATATATATAGAGGTCGTCTATGCC
ACTAGGTCTCTCCCGCACACGGTCTCAATCATTCCATGTCATCCACAAGGTTCCCATCGG
AGACAGTCCTTACATCAGAGCCAAAAACGTTCAGATGATAGAGAAGGATCTCGAGAGAGC
AATTCCGCTGTTCTCTTTGCCATTAACGACAGAGACAGAGTTGACAGTGCTCTGAGAGAT
ATGGCTATCATGATGAAGCAGCAAGATTGGGCAGAAGAAGCTATCAAAGCTATTAAGTAT
CTTAGTGTCAGGTGTTCAGATCAAGCTCAGGAATGGCTTGACAACATCCTCTTAGATCTC
TTCGACGTTAATTAGTTGAAGTTCTTCTCAACGAGTATCAGAATCGGCAACGTTACGGAA
TTTGATTTCATTCAATTATTTTCATTTATACTCTAATTAACTTCATTTTCGCACTCCTCA
CACGATCTGTCATTCAATACATCATCTCCTTTCTTCCATTTATGAGAATCTGCAGCTATA
AATATGTACTTAAAAAAAAGTTACAAGATTCTTATCATGAAAAGTGTTTGATCTCTCAAG
AGTGAAATCCAGTTAATTTGTACGATACAG*TTGGTGTGTTTGGAGATGTTTGTAATGAA
AGGAGATGA*TGCGCTAGAGA*TGCAGAGA*CAGATGCGCGTTATGAGAAAAA

QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1FB26JQ 840 0 0
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GAGAGAGCAATTCCGCTGTTCTCTTTGCCATTAACGACAGAGACAGAGTTGACAGTGCTC
TGAGAGATATGGCTATCATGATGAAGCAGCAAGATTGGGCAGAAGAAGCTATCAAAGCTA
TTAAGTATCTTAGTGTCAGGTGTTCAGATCAAGCTCAGGAATGGCTTGACAACATCCTCT
TAGATCTCTTCGACGTTAATTAGTTGAAGTTCTTCTCAACGAGTATCAGAATCGGCAACG
TTACGGAATTTGATTTCATTCAATTATTTTCATTTATACTCTAATTAACTTCATTTTCGC
ACTCCTCACACGATCTGTCATTCAATACATCATCTCCTTTCTTCCATTTATGAGAATCTG
CAGCTATAAATATGTACTTAAAAAAAAGTTACAAGATTCTTATCATGAAAAGTGTTTGAT
CTCTCAAGAGTGAAATCCAGTTAATTTGTACGATACAGGTTGGTGTGTTTGGAGATGTTT
GTAATGAAAGGAGATGAATGCGCTAGAGAATGCAGAGAACAGATGCGCGTTATGAGAAAA
AAGAAGTTAGTGGCAGTGACGGTGATGATAGGTGGAAGGTGATCATGGTACATTTGTCTT
GAGAAACACCTAGCATGGTATGATGCTCTCGATTTGATTAAAAAAAGAAGGCACGATGCT
CTTGATACACACAACATTGATGCTATGTAATCTCTCTTTTTTTTTTCTAAAATGGCTTTC
TCCTATGTAATCTCTAAAAATTATTCAATCCAAATTCTAATAAAACATCTTCTCATATTT

QA 1 840 1 840
DS 



AS 1 2

CO CL6430Contig1 756 2 7 U
GGGGAAATTATTTAATTAGGGTTAAGAAATTGGGGAGACTTGTCGCCAGCGATACTCTCA
TCGTTTCTAGTCTGTGCTTTTTGTATATGTTAGGGTTTCGCTTCAAATCGGAGAGAGGCA
ACTAATTTCATCGGAACATGTCGAACAATCTTCCTCAATCCTCTGGTGCCCAGTTTCGGC
CGATGGTTCCTGGGCAGCAATTTGTTCCTGCAGCTTCACAGCCGTTTCATCACCCTTATG
GACATGTACCACCAAATGTTCAAAGCCAGCAGCTTTTTCCAGTGAGACCAGGTCAGCCTG
GACAATCACAGCCCAATGCACCTCCACTTGTAGGCTTTGGTACATCTGGACCTCCCTTTT
CTTCTTCATACACATTTGCACCAGCATCTTATGGCCAGCAACAACCACCGTCCTTAGTAC
AACCAACTCCGCAGATGCATGCATCTGGTAGTGTCCCACCACCAGCGAACTCTCGGCCTG
CTCCTGTTGTAAGTCAAAGTACAACACTTGTTTCCCCTGTTCAGCAGACTAGTCAACAAA
CACCAGCCACTCCCACAGACCCAGGAAGTCTGACTCCGCAATCCGCATCTGACTGGATGG
AGCATACATCTGCTGATGGTAGAAAGTATTATTATAACAAGCAGACTAAGCAATCAAGTT
GGGAAAAACCTCTTGAACTGATGACACCACTTGAGAGGCAGATGCATCCACTGTATGGAA
GAATTTACAACAGCTGAAGAAGGAAATATTATTATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CA67TF U 12
AF RS1E043TF U 1
BS 1 254 RS1E043TF
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BS 256 583 RS1E043TF
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BS 669 756 RS1E043TF

RD RS1CA67TF 703 0 0
GGG
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AATGTTCAAAGCCAGCAGCTTTTTCCAGTGAGACCAGGTCAGCCTGGACAATCACAGCCC
AATGCACCTCCACTTGTAGGCTTTGGTACATCTGGACCTCCCTTTTCTTCTTCATATACA
TTTGCACCAGCATCTTATGGCCAGCAACAACCACCGTCCTTAGTACAACCAACTCCGCAG
ATGCATGCATCTGGTAGTGTCCCACCACCAGCGAACTCTTGGCCTGCTCCTGTTGTAAGT
CAAAGTACAACACTTGTTTCCCCTGTTCAGCAGACTAGTCAACAAACACCAGCCACTCCC
ACAGACC*AGGAAGTCTGACTCCGCAATCCGCATCTGACTGGATGGAGCATACATCTGCT
GATGGTAGAAAGTATTATTATAACAAGCAGACTAAGCAATCAAGTTGGGAAAAACCTCTT
GAACTGATGACACCACTTGAGAGGCAGATGCATCCACTGT

QA 4 703 4 703
DS 

RD RS1E043TF 756 0 0
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ACTAATTTCATCGGAACATGTCGAACAATCTTCCTCAATCCTCTGGTGCCCAGTTTCGGC
CGATGGTTCCTGGGCAGCAATTTGTTCCTGCAGCTTCACAGCCGTTTCATCACCCTTATG
GACATGTACCACCAGATGTTCAAAGCCAGCAGCTTTTTCCAGTGAGACCAGGTCAGCCTG
GACAATCACAGCCCAATGCACCTCCACTTGTAGGCTTTGGTACATCTGGACCTCCCTTTT
CTTCTTCATACACATTTGCACCAGCATCTTATGGCCAGCAACAACCACCGTCCTTAGTAC
AACCAACTCCGCAGATGCATGCATCTGGTAGTGTCCCACCACCAGCGAACTCTCGGCCTG
CTCCTGTTGTAAGTCAAAGTACAACACTTGTTTCCCCTGTTCAGCAGACTAGTCAACAAA
CACCAGCCACTCCCACAGACCCAGGAAGTCTGACTCCGCAATCTGCATCTGACTGGATGG
AGCATACATCTGCTGATGGTAGAAAGTATTATTATAACAAGCAGACTAAGCAATCAAGTT
GGGAAAA*CCTCTTGAACTGATGACACCACTTGAGAGGCAGATGCATCCACTGTATGGAA
GAATTTACAACAGCTGAAGAAGGAAATATTATTATA

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

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TTTTTCGGATCTCCAGTTCCAGTGTTTCCACTCTTCTTCGGGAGCATAGTCTCTCTTTGT
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GTTAGACGAACCGTATATAGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1G320JQ U 1
AF RS1FX72JQ U 1
BS 1 801 RS1FX72JQ

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QA 1 670 1 670
DS 

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ATCAGTTTCGTAATTAGGATCTCCAGATTGTCTGAAATAAGCTCCATTCATGAATATATC
TTTTTCGGATCTCCAGTTCCAGTGTTTCCACTCTTCTTCGGGAGCATAGTCTCTCTTTGT
CACCTCTCTGTAATGAGGCAAGTGTGGAGGAGCTATGAATCGGTTTCCTTGGCTGAGAAT
TGTCGGACTTTGACTGCCTCCGATAGCGTAAAGCTCCCAATGAGTGTAGTCATTGTTCAC
AACATGAACAAATCCCCACCTGATCCTTGGCATCCTCTGCACAAGTCCTTTACCGAAATG
GTTATAAGCTACTGTCACTTGCATCTTCTTGTCCAAATCATAAGTGTTTTGAGCACCAAG
CAACATCACATCGTTGTGGTGAGTGAAGTGAGAGTTGGAGATTGTAATGGCAGTGGATCC
AACAATGGCATCAATGAGTCCATCTTGACATTGCGACATGGAGACATGGTCAATCCAAAT
GTTAGACGAACCGTATATAGG

QA 1 801 1 801
DS 



AS 1 2

CO CL6432Contig1 921 2 2 U
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TTAAACATCACTGCTTGTGTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E288TF U 1
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TTAAAAATCCATAGTAAAGCGTTTTAAAATTACTGAATATTTTATCGATTAAACATCACT
GCTTGTGTG

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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1GO38TF U 1
AF RS1GO38JQ C 466
BS 1 654 RS1GO38TF
BS 655 834 RS1GO38JQ

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TTTTAATTG

QA 1 369 1 369
DS 



AS 1 2

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CAAAGATCTCTCTTTGAAGAATGTGATGCATT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1B867TF U 1
AF RS1FB16TF U 1
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BS 87 87 RS1FB16TF
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BS 475 692 RS1B867TF

RD RS1B867TF 692 0 0
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AGATCTCCACCTCAACTCTGCTCATCTCAGCTTGTAGAATTTGTGCCAAACTATGGGAGA
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CATGGATGTTATCTGCCAAGCAAAGTCTGGTATGGGGAAGACTGCTGTCTTTGTTCTTTC
GACTCTGCAACAGATCGAGCCAACTCCTGGCCAGGTGTCTGCACTTATCCTGTTCCATAC
TAGAGAGTTAGCTTACCAGATCTGCAATGAGTTCGTGCGATTCAGTACATATCTACCTGA
TACTAAGGTTTCAGTGTTCTACGGAGGAGTCAACAATAAAATTCACAAAGAATTGCTTAA
GAATGAATGTCCTCACATTGTTGTTGGAACACCTGGTCGTGTGCTTGGACTCGCCAGGGA
CAAAGATCTCTCTTTGAAGAATGTGATGCATT

QA 1 692 1 692
DS 

RD RS1FB16TF 682 0 0
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AGATCTCCACCTCAACTCTGCTCATCCCAGCTTGTAGAATTTGTGCCAAACTATGGGAGA
CGCTAGGGACAACGAAGCTTATGAGGAGGAGCTCCTAGACTACGAGGAAGAGGACGAGAA
GGTCTTAGATTCTGGGAATAAAGTTAACGGCGATGCCGTGAAGAAAGGTTACGTGGGGAT
ACACAGTTCAGGATTCAGAGACTTCCTTTTGAAACCTGAGCTTCTCCGAGCTATTGTTGA
CTCTGGTTTTGAACATCCATCCGAAGTGCAACACGAATGTATCCCTCAAGCTATCTTGGG
CATGGATGTTATCTGCCAAGCAAAGTCTGGTATGGGGAAGACTGCTGTCTTTGTTCTTTC
GACTCTGCAACAGATCGAGCCAACTCCTGGCCAGGTGTCTGCACTTATCCTGTGCCATAC
TAGAGAGTTAGCTTACCAGATCTGCAATGAGTTCGTGCGATTCAGTACATATCTACCTGA
TACTAAGGTTTCAGTGTTCTACGGAGGAGTCAACAATAAAATTCACAAAGAATTGCTTAA
GAATGAATGTCCTCACATTGTTGTTGGAACACCTGGTCGTGTGCTTGGACTCGCCAGGGA
CAAAGATCTCTCTTTGAAGA
TG

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL6435Contig1 743 2 4 U
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AGACAAGTTGATCCATTTCTCTGGTGTAGAGATGGGCCAGGCGTGTTCAATTGTCCTAAG
GGGTGCTAGTCACCATGTTCTAGACGAGGCTGAAAGATCACTCCATGATGCGCTGTGTGT
ACTCTCACAAACAGTGAATGACAGCAGAGTGTTGCTCGGAGGTGGATGGCCAGAGATGGT
GATGGCAAAGGAAGTAGACGAGCTTGCAAGGAAAACTGCTGGCAAGAAATCGCATGCCAT
TGAAGCTTTCTCACGGGCTCTAGTGGCTATACCGACAACAATCGCTGACAATGCTGGTTT
AGACAGTGCAGAATTGGTGGCTCAGCTTCGCGCAGAGCACCACAACGAAGGGTGTAACGC
CGGGATCGATGTCATCTCCGGAGCTGTAGGGGATATGGAGGAGAGAGGAATCTATGAAGC
ATTCAAAGTGAAGCATGCCGTTCTGCTTTCAGCGACAGAAGCAGCTGAGATGATACTGAG
AGTGGATGAGATCATTACATGTGCTCCTAGGAGGAGAGAAGACAGGATGTGAAGCCCAAC
ACATGCACCTGGTGGGAGAGAGATTTCATGATGATTTACACGATCACACCCTCCCCAGTG
ACATTGTTCTGTTCTGTTATTAGATTTGTGTTTTGTATTTGGATCACAAAACAGCCTTTA
AATGTTTTAGTGTTTTGCTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D957TF U 1
AF RS1D957JQ C 44
BS 1 710 RS1D957TF
BS 711 711 RS1D957JQ
BS 712 732 RS1D957TF
BS 733 743 RS1D957JQ

RD RS1D957TF 732 0 0
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GATGGCAAAGGAAGTAGACGAGCTTGCAAGGAAAACTGCTGGCAAGAAATCGCATGCCAT
TGAAGCTTTCTCACGGGCTCTAGTGGCTATACCGACAACAATCGCTGACAATGCTGGTTT
AGACAGTGCAGAATTGGTGGCTCAGCTTCGCGCAGAGCACCACAACGAAGGGTGTAACGC
CGGGATCGATGTCATCTCCGGAGCTGTAGGGGATATGGAGGAGAGAGGAATCTATGAAGC
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ACATGCACCTGGTGGGAGAGAGATTTCATGATGATTTACACGATCACACCCTCCCCAGTG
ACATTGTTCTGTTCTGTTATTAGATTTGTGTTTTGTATTTGGATCACAAA*CAGCCTTTA
AATGTTTTAGTG

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1D957JQ 700 0 0
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TGTTCAATTGTCCTAAGGGGTGCTAGTCACCATGTTCTAGACGAGGCTGAAAGATCACTC
CATGATGCGCTGTGTGTACTCTCACAAACAGTGAATGACAGCAGAGTGTTGCTCGGAGGT
GGATGGCCAGAGATGGTGATGGCAAAGGAAGTAGACGAGCTTGCAAGGAAAACTGCTGGC
AAGAAATCGCATGCCATTGAAGCTTTCTCACGGGCTCTAGTGGCTATACCGACAACAATC
GCTGACAATGCTGGTTTAGACAGTGCAGAATTGGTGGTTCAGCTTCGCGCAGAGCACCAC
AACGAAGGGTGTAACGCCGGGATCGATGTCATTTCCGGAGCTGTAGGGGATATGGAGGAG
AGAGGAATTTATGAAGCATTCAAAGTGAAGCATGCCGTTCTGCTTTCAGCGACAGAAGCA
GCTGAGATGATACTGAGAGTGGATGAGATCATTACATGTGCTCCTAGGAGGAGAGAAGAC
AGGATGTGAAGCCCAACACATGCACCTGGTGGGAGAGAGATTTCATGATGATTTACACGA
TCACACCCTCCCCAGTGACATTGTTCTGTTCTGTTATTAGATTTGTGTTTTGTATTTGGA
TCACAAAACAGCCTTTAAATGTTTTAGTGTTTTGCTCCCC

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

CO CL6436Contig1 753 2 4 U
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GGTGGAAGTGATGAGAACAGCAGACCATCTTTCTATGATATAACTAAAGATGCCAATGCT
CTCGATAGAGAACTAGAAGCTAGTGGTTTCACCAAAAAGGAGCAGAATGACCCCGATAAA
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AATGAAAAAGGCAAAAGCAGTGGAGATGAAGATGAAGATGAAGATGAAGATGAAGCTGGA
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AGGGGAGGTAGAAAGTCGCAGTCATCGAGAAACACATACAAGGACAAAGGAGGCCGTTCC
CAAAACTCCAAGATCCACAACAACATGAGCGGCTGGTGATGATAATAAAACTCTTTTTGC
AGCAATTTTGGATACACAACAAAACTAAACTACGCTTAATGGGCCTCATTCAATGTTGTA
AACGGGCTTAGTTTCAAACTTTGAAAATCTAAGATTATATGGATAATGTTTCAAACTTTC
TATATAAAACATTATCATAATGATATTTTGGGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E750TF U 1
AF RS1E750JQ C 1
BS 1 661 RS1E750TF
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BS 663 677 RS1E750TF
BS 678 753 RS1E750JQ

RD RS1E750TF 677 0 0
TTTTTCAAAAAGGTTTAATATGACTTTCCAAGAAGATAGGGATGAGTCAGATGAGACAGA
GGTGGAAGTGATGAGAACAGCAGACCATCTTTCTATGATATAACTAAAGATGCCAATGCT
CTCGATAGAGAACTAGAAGCTAGTGGTTTCACCAAAAAGGAGCAGAATGACCCCGATAAA
TTTATTGAAAGTGGGTTGGAGAAGAGTAAAGATTCTGACGAGGATGAGGAGTCTGATGAT
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AATGAAAAAGGCAAAAGCAGTGGAGATGAAGATGAAGATGAAGATGAAGATGAAGCTGGA
AGAGATGAGGAGCTGGACAAAAAACTGGGAAAGCAAAGACGCAGAGCCATGGCAGCAGCC
AGGGGAGGTAGAAAGTCGCAGTCATCGAGAAACACATACAAGGACAAAGGAGGCCGTTCC
CAAAACTCCAAGATCCACAACAACATGAGCGGCTGGTGATGATAATAAAACTCTTTTTGC
AGCAATTTTGGATACACAACAAAACTAAACTACGCTTAATGGGCCTCATTCAATGTTGTA
A*CGGGCTTAGTTTCAA

QA 1 677 1 677
DS 

RD RS1E750JQ 753 0 0
TTTTTCAAAAAGGTTTAATATGACTTTCCAAGAAGATAGGGATGAGTCAGATGAGACAGA
GGTGGAAGTGATGAGAACAGCAGACCATCTTTCTATGATATAACTAAAGATGCCAATGCT
CTCGATAGAGAACTAGAAGCTAGTGGTTTCACCAAAAAGGAGCAGAATGACCCCGATAAA
TTTATTGAAAGTGGGTTGGAGAAGAGTAAAGATTCTGACGAGGATGAGGAGTCTGATGAT
GAAGAGGAGACCTCCGAGTCCAATGAAGAAGAAAACCTAAATGAAATGAAATCATTGAAG
TTGCAAGACGAGGAGCAGAAAAGTGCAGATGGAGTTGATGCAGAAGTTGAATTGGATGAT
AATGAAAAAGGCAAAAGCAGTGGAGATGAAGATGAAGATGAAGATGAAGATGAAGCTGGA
AGAGATGAGGAGCTGGACAAAAAACTGGGAAAGCAAAGACGCAGAGCCATGGCAGCAGCC
AGGGGAGGTAGAAAGTCGCAGTCATCGAGAAACACATACAAGGACAAAGGAGGCCGTTCC
CAAAACTCCAAGATCCACAACAACATGAGCGGCTGGTGATGATAATAAAACTCTTTTTGC
AGCAATTTTGGATACACAACAAAACTAAACTACGCTTAATGGGCCTCATTCAATGTTGTA
AACGGGCTTAGTTTCAAACTTTGAAAATCTAAGATTATATGGATAATGTTTCAAACTTTC
TATATAAAACATTATCATAATGATATTTTGGGG

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL6437Contig1 778 2 2 U
GGGGACAAAAATAAATTAAAAAAAGTTCAGCTGGTTTGCGAATCTGAGTTGACGCTAATC
CAATCTCTCCGTCGACGAGCTCAGCCCTTTCTTGAAATCTAGGATGAAAGAGAAGGGATA
TTACGTGCCGCCGCGTTACATTCCGTTAAAAGAGTCTGAGGAAGCTGATACTGCAGAAGA
AGTAACCACCACACCAAGTCTTGAAGTTGCTGTCTCTGGAGACACAAGAGATGGTCCGAA
ACAGTGGTCGTCTGGCATATGCGCTTGCTTCGACGACATACAGAGCTGTTTCATAGGTTT
GTTCTGTCCATGTTACGTCTTTGGCAAAAACGCAGAGCTGTTGGGGTCTGGAACATTTGC
AGGACCTTGCTTAACACACTGCGTTTCATGGGCGTTAGTCAACACCATTTGCTGCTTTGC
AACCAATGGCGTGTTGCTCGGTCTACCTGGATGTTTTGTGTCGTGTTATGCTTGTGGATA
CCGGAGATCGTTAAGAACCAAGTATAACTTACAGGAGGCTCCATGTGGGGATTTTGTAAC
ACACTTCTTCTGTCACTTATGTGCCATTTGCCAAGAATATAGAGAGATCCGAGAACGTAG
CAGCGGCTCAAATCCTCCTGACATCAAGATGGCTATTACTAACGCCCCCTTAGCTCAAAC
CATGGAATCAGCTAACTGATCACTTTCAGTTTCTTTTGTTTCGGGACATGTTTCTTGTAA
TATTGCAATGTATCAAGGTTCTATATAAGTTTACTAAAGATATATTAAAAAGTTACAG


BQ
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AF RS1AG35JQ C 1
AF RS1AG35TF U 107
BS 1 106 RS1AG35JQ
BS 107 778 RS1AG35TF

RD RS1AG35JQ 778 0 0
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CAATCTCTCCGTCGACGAGCTCAGCCCTTTCTTGAAATCTAGGATGAAAGAGAAGGGATA
TTACGTGCCGCCGCGTTACATTCCGTTAAAAGAGTCTGAGGAAGCTGATACTGCAGAAGA
AGTAACCACCACACCAAGTCTTGAAGTTGCTGTCTCTGGAGACACAAGAGATGGTCCGAA
ACAGTGGTCGTCTGGCATATGCGCTTGCTTCGACGACATACAGAGCTGTTTCATAGGTTT
GTTCTGTCCATGTTACGTCTTTGGCAAAAACGCAGAGCTGTTGGGGTCTGGAACATTTGC
AGGACCTTGCTTAACACACTGCGTTTCATGGGCGTTAGTCAACACCATTTGCTGCTTTGC
AACCAATGGCGTGTTGCTCGGTCTACCTGGATGTTTTGTGTCGTGTTATGCTTGTGGATA
CCGGAGATCGTTAAGAACCAAGTATAACTTACAGGAGGCTCCATGTGGGGATTTTGTAAC
ACACTTCTTCTGTCACTTATGTGCCATTTGCCAAGAATATAGAGAGATCCGAGAACGTAG
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CATGGAATCAGCTAACTGATCACTTTCAGTTTCTTTTGTTTCGGGACATGTTTCTTGTAA
TATTGCAATGTATCAAGGTTCTATATAAGTTTACTAAAGATATATTAAAAAGTTACAG

QA 1 778 1 778
DS 

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AGAGATGGTCCGAAACAGTGGTCGTCTGGCATATGCGCTTGCTTCGACGACATACAGAGC
TGTTTCATAGGTTTGTTCTGTCCATGTTACGTCTTTGGCAAAAACGCAGAGCTGTTGGGG
TCTGGAACATTTGCAGGACCTTGCTTAACACACTGCGTTTCATGGGCGTTAGTCAACACC
ATTTGCTGCTTTGCAACCAATGGCGTGTTGCTCGGTCTACCTGGATGTTTTGTGTCGTGT
TATGCTTGTGGATACCGGAGATCGTTAAGAACCAAGTATAACTTACAGGAGGCTCCATGT
GGGGATTTTGTAACACACTTCTTCTGTCACTTATGTGCCATTTGCCAAGAATATAGAGAG
ATCCGAGAACGTAGCAGCGGCTCAAATCCTCCTGACATCAAGATGGCTATTACTAACGCC
CCCTTAGCTCAAACCATGGAATCAGCTAACTGATCACTTTCAGTTTCTTTTGTTTCGGGA
CATGTTTCTTGTAATATTGCAATGTATCAAGGTTCTATATAAGTTTACTAAAGATATATT
AAAAAGTTACAG

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

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ACGCAAATGCCCCTTCTGGCCCGACAGGATCTACTCCTAACGACAACAACAACGCCGCTG
CACTCTCCGCCGGATCTTTCCTAGGATTCCTGTTCGTCGCCGCTTTGTTACTTTAATTTG
GTGTTTAGATTATGTAATAATAATTCGAGAGTTTAGCGATGGACGGTAGATATTCGATCT
GTTGTTTTGTTTAGAGATTTATTTGTGGTCTTGCGATGATCTCTATTACCTTAGAAAACC
TATATGTTACTTATATCGTTTGTTATTGTTACTCATGGTTTTAATTAGCACATTTATCTG
GTTTTTGATTATTGC


BQ
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AF RS1AQ54TFB U 1
AF RS1G565TF U 275
BS 1 376 RS1AQ54TFB
BS 377 377 RS1G565TF
BS 378 449 RS1AQ54TFB
BS 450 450 RS1G565TF
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BS 455 474 RS1AQ54TFB
BS 475 475 RS1G565TF
BS 476 541 RS1AQ54TFB
BS 542 555 RS1G565TF

RD RS1AQ54TFB 541 0 0
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CTCCTCCGCCGTCCGTCACTCCCACGGCAGCTCCTACTTCTCCTCCGGCTGGCTCACCGA
CCTCCACCGTCGCTTCCCCACCGGCTCCTCCGACATCCCTTACACCCGATGGAGCTCCTG
ACGCAAATGCCCCTTCTGGCCCGACAGGATCTACTCCTAACGACAACAACAACGCCGCTG
CACTCTCCGCCGGATCTTTCCTAGGATTCCTGTTCGTCGCCGCTTTGTTACTTTAATTTG
GTGTTTAGATTATGTATTAATAATTCGAGAGTTTAGCGATGGACGGTAGATATTCGATCT
GTTGTTTTGTTTAGAGATTTATTTGTGGTTTTGTGATGATCTCTATTACCTTAGGAAACC
TATATGTTACTTATATCGTTTGTTATTGTTACTCATGGTTTTAATTAGCACATTTATCTG
G

QA 1 541 1 541
DS 

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G
CCTAACGACAACAACAACGCCGCTGCACTCTCCGCCGGATCTTTCCTAGGATTCCTGTTC
GTCGCCGCTTTGTTACTTTAATTTGGTGTTTAGATTATGTAATAATAATTCGAGAGTTTA
GCGATGGACGGTAGATATTCGATCTGTTGTTTTGTTTAGAGATTTATTTGTGGTCTTGCG
ATGATCTCTATTACCTTAGAAAACCTATATGTTACTTATATCGTTTGTTATTGTTACTCA
TGGTTTTAATTAGCACATTTATCTGGTTTTTGATTATTGC

QA 2 281 2 281
DS 



AS 1 2

CO CL6439Contig1 691 2 1 U
GGGACAGCTAAAATCACAAATGACTCATCTTCTCCGCCAAGAGAGAATCTAGGGTTCCAG
ATTTACTCTTTTCTCTTCCCTATCCTCTCTTCGATTTACACACATCCCTCAATCTCTGTA
CATTTCAGAGAACCTTTTAGCTTTCTCTACCGCTTTTACCTGTTTTTAGCTTCTTTCCCA
TGGCGAAAACTCGACCTGGTGTCCCCTCCAAAATCAAAACCGGAAGGAAGGAGCTTGACT
CTTATACCATCAAAGGAACCAACAAAGTCGTCAGAGCTGGAGAGTGTGTGTTGATGCGCC
CATCGGATGCTGGCAAGCCGCCATACGTGGCACGTGTCGAGAAGATAGAAGCTGATGCTA
GGAACAATGTGAAGGTGCACTGTCGTTGGTATTACCGCCCTGAGGAGTCCCTCGGTGGTA
GGAGGCAGTTCCATGGAGCGAAAGAACTTTTCTTGTCCGACCATTTCGACGTTCAGAGCG
GACACACCATCGAAGGGAAATGCATTGTTCACACCTTCAAGAACTACACCAGGCTCGAAA
ACGTTGGGGCTGAGGATTATTATTGTAGGTTTGAGTACAAGGCTGCCACTGGCGCCTTCA
CCCCTGATCGAGTTGCTGTGTACTGCAAGTGTGAAATGCCTTATAACCCAGATGATCTCA
TGGTTCAATGTGAAGGCTGCAAAGACTGGTA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ET19TF U 1
AF RS1H469TF U 1
BS 1 691 RS1ET19TF

RD RS1ET19TF 691 0 0
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ACGTTGGGGCTGAGGATTATTATTGTAGGTTTGAGTACAAGGCTGCCACTGGCGCCTTCA
CCCCTGATCGAGTTGCTGTGTACTGCAAGTGTGAAATGCCTTATAACCCAGATGATCTCA
TGGTTCAATGTGAAGGCTGCAAAGACTGGTA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1H469TF 671 0 0
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ATTTACTCTTTTCTCTTCCCTATCCTCTCTTCGATTTACACACATCCCTCAATCTCTGTA
CATTTCAGAGAACCTTTTAGCTTTCTCTACCGCTTTTACCTGTTTTTAGCTTCTTTCCCA
TGGCGAAAACTCGACCTGGTGTCCCCTCCAAAATCAAAACCGGAAGGAAGGAGCTTGACT
CTTATACCATCAAAGGAACCAACAAAGTCGTCAGAGCTGGAGAGTGTGTGTTGATGCGCC
CATCGGATGCTGGCAAGCCGCCATACGTGGCACGTGTCGAGAAGATAGAAGCTGATGCTA
GGAACAATGTGAAGGTGCACTGTCGTTGGTATTACCGCCCTGAGGAGTCCCTCGGTGGTA
GGAGGCAGTTCCATGGAGCGAAAGAACTTTTCTTGTCCGACCATTTCGACGTTCAGAGCG
GACACACCATCGAAGGGAAATGCATTGTTCACACCTTCAAGAACTACACCAGGCTCGAAA
ACGTTGGGGCTGAGGATTATTATTGTAGGTTTGAGTACAAGGCTGCCACTGGCGCCTTCA
CCCCTGATCGAGTTGCTGTGTACTGCAAGTGTGAAATGCCTTATAACCCAGATGATCTCA
TGGTTCAATGT

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 2

CO CL6440Contig1 804 2 6 U
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ATCGACGAGTGTTGTTGTTTCTCGCTACGAGAGACGTACAAGAAGCTCGATAAGCTTGAT
TTCGTGACAGCTGCCAAGATCTTGTTCACTGAACCACCCAAGAAGAACAAATTTGGGCTT
GACTGGCATATTGTGCAATTCATTATTGTCTGCTTGCCGTCTCTAGCTGTGTATCTGGTT
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AAAGAAGAAGAAAAGAAAGAGAAAGAAGAGGCTGAAAAGAAGGCATTAGAAGAAGAAGCA
GCAACAAAGTCTCAGGACGAGCTAACGGAGATGAAACAGAGACTGGGAAAAATCGAAGAC
ACAATCAAAGAGATTGTTTTGGTAACAAAGAAACCTTCAGGGAATGCTCCAGCCAATACA
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ACAGAAGCCAGGTGAGGATCAAACAAATGTGGATTCTCCTAGGCCTCATTGAGAGATTAT
TGGAAAGGAAACTTAGGTGGTAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BI40TF U 1
AF RS1BI40JQ C 97
BS 1 754 RS1BI40TF
BS 755 755 RS1BI40JQ
BS 756 762 RS1BI40TF
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BS 764 790 RS1BI40TF
BS 791 804 RS1BI40JQ

RD RS1BI40TF 791 0 0
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TGGAAAGGAA
C

QA 1 790 1 790
DS 

RD RS1BI40JQ 708 0 0
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TACAAGAAGCTCGATAAGCTTGATTTCGTGACAGCTGCCAAGATCTTGTTCACTGAACCA
CCCAAGAAGAACAAATTTGGGCTTGACTGGCATATTGTGCAATTCATTATTGTCTGCTTG
CCGTCTCTAGCTGTGTATCTGGTTGCTCAATATGCTCGCCGTAAAATGAAGATCATGGAC
GCTGAACTTGGGGAGAAGAAGAGGAAAGAAGAAGAAAAGAAAGAGAAAGAAGAGGCTGAA
AAGAAGGCATTAGAAGAAGAAGCAGCAACAAAGTCTCAGGACGAGCTAACGGAGATGAAA
CAGAGACTGGGAAAAATCGAAGACACAATCAAAGAGATTGTTTTGGTAACAAAGAAACCT
TCAGGGAATGCTCCAGCCAATACACAA*GGGGATCAATCTACTAAACCCCCACCAAAACA
AGAATCTAGACCGATCAATGTGGAACAGAAGCCAGGTGAGGATCAAACAAATGTGGATTC
TCCTAGGCCTCATTGAGAGATTATTGGAAAGGAAACTTAGGTGGTAGA

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

CO CL6441Contig1 730 2 2 U
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AGGTCGGAGCAGGTGGAATCGGCATTCAATACGTCAAGTTTGATTATGTGAAGAACGGAC
AAACCGAAGAAGTCCCTCTTCGCGGAGTCAAAGGCCGTAGTATCGCAGCTGATCCGGTTC
CTTTACTTCTTCCTCTCCCTTTGACTTTTATATATATAAATATAACTATATACAAGTTTA
CTTTTTTCAGTGTGTCACATTTTTATCTCGATCTTTGTAGTTTGTTATTAACCATCCAGA
GGAGCATCTAGTTTCTGTAGAAGGTTGGTATAACCCTGATGGTTTCATTCAAGGGCTTAA
GTTCATATCCAACAAGAAAGCCTCTGATGTCATTGGATACGATGACGGTACTCATTTCAC
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GAACGTGTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A023TF U 1
AF RS1A023TV U 11
BS 1 682 RS1A023TF
BS 683 730 RS1A023TV

RD RS1A023TF 685 0 0
GGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGATAGCACCTGTAACAATCTACTCTCCCTTTGAA
GGTAACTTTTAATATTGATCGTAAAGCAAACAAAGATGGCCCAAAAGGTGGAAGCACAAG
GAGGGAAAGGAGGTATTCAATGGGACGATGGATCCGAACACGATGCCGTAACCAAGATTC
AGGTCGGAGCAGGTGGAATCGGCATTCAATACGTCAAGTTTGATTATGTGAAGAACGGAC
AAACCGAAGAAGTCCCTCTTCGCGGAGTCAAAGGCCGTAGTATCGCAGCTGATCCGGTTC
CTTTACTTCTTCCTCTCCCTTTGACTTTTATATATATAAATATAACTATATACAAGTTTA
CTTTTTTCAGTGTGTCACATTTTTATCTCGATCTTTGTAGTTTGTTATTAACCATCCAGA
GGAGCATCTAGTTTCTGTAGAAGGTTGGTATAACCCTGATGGTTTCATTCAAGGGCTTAA
GTTCATATCCAACAAGAAAGCCTCTGATGTCATTGGATACGATGACGGTACTCATTTCAC
TCTCCAAGTTCAAGACAAGAAGATCATTGGCTTTCATGGGTTTGCCGGAGACTGTGTCAA
CTCTCTTGGAGCTTACTTTGCTCCGTTGACTTCAACCCCGTTGACCCCTACCAAGAAGCT
GCCGGCACTTGGTGCTGATGCA
CGA

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1A023TV 720 0 0
CCATTACGGCCGGGGGGATAGCACCTGTAACAATCTACTCTCCCTTTGAAGGTAACTTTT
AATATTGATCGTAAAGCAAACAAAGATGGCCCAAAAGGTGGAAGCACAAGGAGGGAAAGG
AGGTATTCAATGGGACGATGGATCCGAACACGATGCCGTAACCAAGATTCAGGTCGGAGC
AGGTGGAATCGGCATTCAATACGTCAAGTTTGATTATGTGAAGAACGGACAAACCGAAGA
AGTCCCTCTTCGCGGAGTCAAAGGCCGTAGTATCGCAGCTGATCCGGTTCCTTTACTTCT
TCCTCTCCCTTTGACTTTTATATATATAAATATAACTATATACAAGTTTACTTTTTTCAG
TGTGTCACATTTTTATCTCGATCTTTGTAGTTTGTTATTAACCATCCAGAGGAGCATCTA
GTTTCTGTAGAAGGTTGGTATAACCCTGATGGTTTCATTCAAGGGCTTAAGTTCATATCC
AACAAGAAAGCCTCTGATGTCATTGGATACGATGACGGTACTCATTTCACTCTCCAAGTT
CAAGACAAGAAGATCATTGGCTTTCATGGGTTTGCCGGAGACTGTGTCAACTCTCTTGGA
GCTTACTTTGCTCCGTTGACTTCAACCCCGTTGACCCCTACCAAGAAGCTGCCGGCACTT
GGTGCTGATGCAGGAACTGCATGGGATGATGGTGCTTACGATGGTGTTAAGAACGTGTAC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

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AAGAAGGCGAGGCTTGTGAGAAACCGCGAAAGCGCGCAGCTTTCGAGGCGAGGAAGAAGC
ATTACGTGGAGGAGCTCGAGGAGAAGGTTAGGCATATGCATTCCACTATCACCGATTTGA
ACGGGAAGATATCTTTTTTCATGTCTGAGAATGCTGCGTTAAGACAGCAGTTAGGCGGGA
GTGGGATGATGTGCTCTCCTCCTCCTCCGCTGCCTCCGATGGGAATGTACCCGCCGATGG
GTTACCAGTGGATGCCTTGTCCTCCTCCTTACATGTTGAAGCAGCAAGGGTCTCAAGTGC
CTTTGGTTCCTATCCCTAGGTTGAAACCACAGAGTGCTCTTGGATCATCCAAGGGGAAGA
GTAAGAAGAGTGAAACCAAGACTAAGAAGGTCGCTAGTATTAGTTTTTTGGGTCTTCTGT
TTTGTCTGTTTTTGTTTGGTGCTTTGGCTCCGGTTATGAACGTTAGTTATGGAGGAATTA
GTGGTGCTTTTTATGGGAACTATAGGTCTAATTATGTTACTGATCAGATTTATAGCCACC
GTAGGAGTAGGGTTTTGGAGACATCTGGTAGTGGTGCTGGTTCTGGGGGTTTTAATGGTA
ATGGGATGCATTGCGGGAGAGATTCTAATATATCTGCAACAGAGAGCTCTGTATCTCCTG
GGAATGGTAGCGAGCCTCTGGTTGCATCACTCTTTGTTCCGAGGAATGATAAGCTTGTGA
AGATTGATGGGAATTTGATTATTAATTCTATACTGGCGAGTGAGAAAGCGGTGGTGGCTT
CACGAAAGGCTTTTGAATCAAATGAGATGATTGGTGGACCAAAATCACTGTCCCGAGTTT
TTGTTGTCGTGCCTGTGGACAGTGCAAAGTATGTAACATACTCTTGTGTCCTACCTCGAT
CAGGAGCTCCTCATCTTGTGACCACTTAAAAGGACTTTTCAGCAGTCTCTATCCTTCAGC
TATGTATGTAGAAGAATAAAAAGCTGCCTGTGCCTGCTTTATGGAATCAAGTAGTATCCT
TAGCTATTACCGGTTTTGTTTACAGATGTAGAATCCAAACACTGTAACTTTTTTTTATAT
ATATACTTTACTCATCAATCTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GK68TF U 1
AF RS1GK68JQ C 380
BS 1 604 RS1GK68TF
BS 605 605 RS1GK68JQ
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RD RS1GK68TF 763 0 0
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GTGGGATGATGTGCTCTCCTCCTCCTCCGCTGCCTCCGATGGGAATGTACCCGCCGATGG
GTTACCAGTGGATGCCTTGTCCTCCTCCTTACATGTTGAAGCAGCAAGGGTCTCAAGTGC
CTTTGGTTCCTATCCCTAGGTTGAAACCACAGAGTGCTCTTGGATCATCCAAGGGGAAGA
GTAAGAAGAGTGAAACCAAGACTAAGAAGGTCGCTAGTATTAGTTTTTTGGGTCTTCTGT
TTTGTCTGTTTTTGTTTGGTGCTTTGGCTCCGGTTATGAACGTTAGTTATGGAGGAATTA
GTGGTGCTTTTTATGGGAACTATAGGTCTAATTATGTTACTGATCAGATTTATAGCCACC
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ATGGGATGCATTGCGGGAGAGATTCTAATATATCTGCA*CAGAGAGCTCTGTATCTCCTG
GGAATGGTAGCGAGCCTCTGGTTGCATCACTCTTTGTTCCGAG

QA 1 763 1 763
DS 

RD RS1GK68JQ 786 0 0
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GACTAAGAAGGTCGCTAGTATTAGTTTTTTGGGTCTTCTGTTTTGTCTGTTTTTGTTTGG
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CTATAGGTCTAATTATGTTACTGATCAGATTTATAGCCACCGTAGGAGTAGGGTTTTGGA
GACATCTGGTAGTGGTGCTGGTTCTGGGGGTTTTAATGGTAATGGGATGCATTGCGGGAG
AGATTCTAATATATCTGCAACAGAGAGCTCTGTATCTCCTGGGAATGGTAGCGAGCCTCT
GGTTGCATCACTCTTTGTTCCGAGGAATGATAAGCTTGTGAAGATTGATGGGAATTTGAT
TATTAATTCTATACTGGCGAGTGAGAAAGCGGTGGTGGCTTCACGAAAGGCTTTTGAATC
AAATGAGATGATTGGTGGACCAAAATCACTGTCCCGAGTTTTTGTTGTCGTGCCTGTGGA
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AAAGCTGCCTGTGCCTGCTTTATGGAATCAAGTAGTATCCTTAGCTATTACCGGTTTTGT
TTACAGATGTAGAATCCAAACACTGTAACTTTTTTTTATATATATACTTTACTCATCAAT
CTTCTC

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

CO CL6443Contig1 734 2 2 U
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CTCTTTTGGTTTTAAAAAAAAATTCTATTCCAATGTAACACAAAATGTAAAACAGTTTTT
TTTGTTTGAATTAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AZ02TF U 1
AF RS1AZ02JQ C 1
BS 1 672 RS1AZ02TF
BS 673 734 RS1AZ02JQ

RD RS1AZ02TF 672 0 0
AATAAGATCGAGGATCACATTCTGCGTTTGAAAGAGAAAGGACTGGTTGATCGGGAAGAT
ATTAAACTGTGGAGGCGAGGGGACAAATATAAATCTGTTTTCAGTTCCAAGGAAACATGG
AAACTGACACGAGTACCTCGACCAAAAGTGAATTGGAGCCCTGGGATCTGGTTTGCTTGC
AATACACCAAAATATTCATTCATGACTTGGCTTGCAATCCTCAACAGACTTGCAACAGGT
GATCGAATTAAGCAATGGAACACTCAACACCCCAGCTCTTGTGTGTTCTGCAATGATCCG
ACTGAGTCAAGAGATCATATTTTCTTTGTCTGTAAATTTTCAGAGGAGGTTTGGAAAGGT
TTAACCCAGAAACTGCTGGCTTCGCGCTACACAAACCAGTGGGATCAGATTATACAACTG
TTGCTTGCTCAAAACAGAGACAAAACAGAGCTTTACATAGTGAGATATGTGTTCCAAGCA
ACTCTGTATGCTGTATGGAGGGAACGTAACCAAGGCAAGCATGGAGAAAGTCCACTGTCC
CCGAGTCAGCTGATCCAGATGGTGGAAAAGAACGTTCGTAACAGGCTGTCTTCTATCTGC
GCCCACTCGCACATGGGAGGTTTAACTCAGTGGTTTGCAACAAGATAGTCTCTTGAAGCT
CTCTTTTGGTTT

QA 1 672 1 672
DS 

RD RS1AZ02JQ 734 0 0
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ATTAAACTGTGGAGGCGAGGGGACAAATATAAATCTGTTTTCAGTTCCAAGGAAACATGG
AAACTGACACGAGTACCTCGACCAAAAGTGAATTGGAGCCCTGGGATCTGGTTTGCTTGC
AATACACCAAAATATTCATTCATGACTTGGCTTGCAATCCTCAACAGACTTGCAACAGGT
GATCGAATTAAGCAATGGAACACTCAACACCCCAGCTCTTGTGTGTTCTGCAATGATCCG
ACTGAGTCAAGAGATCATATTTTCTTTGTCTGTAAATTTTCAGAGGAGGTTTGGAAAGGT
TTAACCCAGAAACTGCTGGCTTCGCGCTACACAAACCAGTGGGATCAGATTATACAACTG
TTGCTTGCTCAAAACAGAGACAAAACAGAGCTTTACATAGTGAGATATGTGTTCCAAGCA
ACTCTGTATGCTGTATGGAGGGAACGTAACCAAGGCAAGCATGGAGAAAGTCCACTGTCC
CCGAGTCAGCTGATCCAGATGGTGGAAAAGAACGTTCGTAACAGGCTGTCTTCTATCTGC
GCCCACTCGCACATGGGAGGTTTAACTCAGTGGTTTGCAACAAGATAGTCTCTTGAAGCT
CTCTTTTGGTTTTAAAAAAAAATTCTATTCCAATGTAACACAAAATGTAAAACAGTTTTT
TTTGTTTGAATTAA

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL6444Contig1 760 2 10 U
GGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAGGGATGGTGGAGTATGAGAG
CTACGTGGTTGTTCACAACATAGCGAAGTGACACAACGTGGGGAACACTAGCTCGAAGCG
CCACGGCGTTCGGCGTGACGGAGCTGATACTCGTGGGGCCGCCGTGACTTCAACGCCTTT
CGGAAGCCATGGTTCCGCTTCTCACGTCCGTTTCCGACGCTTTCACTCTTTAATCGAAGC
TCGCGACTACCTCAAGGAGGAGAAAGAATGCGATATATGCGGCGTTGAGATCGCAGATGG
AGCTGCTCAGGTCAATGAACATCCTTTCAAAAGAAACACTGCTTTTCTTCTGGGTAATGA
GGAATCGGGGTTATCTGCCAAAGAGTATGAGATATGTGACTTCTTTGTTTACATTCCTCA
GTATGGCTGTGGCACTGCCTCTCTCAATGTCACTGTTGCAGCTTCTATTGTCTTGCATCA
TTTTGGAGTGTGGGCGGGATTTTCTGAACGTGTCCGAGATGGAAGCAAATTCATAGTGGC
TGATAAACCAGTTAGGCAAGGAAGACGGAATTTCTGTGCTGGTACAGAAGAATCCATCGT
TGAAGAGCGGAAGCTGAGGAAAGAAAGTGCTGAAAAGGGCTTCTTTGATGAAAACGGAAA
CGAGAGTTCATCCACCGAGCTTCTCAACGGTTTGTTCCTTAACGATTAGTTGTCTTTAAA
ATTAAGGAACAAAGTCTTGGTTTTGGGTTTTAAATTCTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AO41TFB U 1
AF RS1AO41JQ C 33
BS 1 102 RS1AO41TFB
BS 103 103 RS1AO41JQ
BS 104 157 RS1AO41TFB
BS 158 158 RS1AO41JQ
BS 159 179 RS1AO41TFB
BS 180 180 RS1AO41JQ
BS 181 362 RS1AO41TFB
BS 363 363 RS1AO41JQ
BS 364 723 RS1AO41TFB
BS 724 760 RS1AO41JQ

RD RS1AO41TFB 723 0 0
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CTACGTGGTTGTTCACAACATAGCGAAGTGACACAACGTGGG*AACACTAGCTCGAAGCG
CCACGGCGTTCGGCGTGACGGAGCTGATACTCGTGGG*CCGCCGTGACTTCAACGCCTT*
CGGAAGCCATGGTTCCGCTTCTCACGTCCGTTTCCGACGCTTTCACTCTTTAATCGAAGC
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AGCTGCTCAGGTCAATGAACATCCTTTCAAAAGAAACACTGCTTTTCTTCTGGGTAATGA
GGGATCGGGGTTATCTGCCAAAGAGTATGAGATATGTGACTTCTTTGTTTACATTCCTCA
GTATGGCTGTGGCACTGCCTCTCTCAATGTCACTGTTGCAGCTTCTATTGTCTTGCATCA
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TGATAAACCAGTTAGGCAAGGAAGACGGAATTTCTGTGCTGGTACAGAAGAATCCATCGT
TGAAGAGCGGAAGCTGAGGAAAGAAAGTGCTGAAAAGGGCTTCTTTGATGAAAACGGAAA
CGAGAGTTCATCCACCGAGCTTCTCAACGGTTTGTTCCTTAACGATTAGTTGTCTTTAAA
ATT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1AO41JQ 728 0 0
AGA
GAAGAGGGATGGTGGAGTATGAGAGCTACGTGGTTGTTCACAACATAGCGAAGTGACACA
ACGTGGGGAACACTAGCTCGAAGCGCCACGGCGTTCGGCGTGACGGAGCTGATACTCGTG
GGGCCGCCGTGACTTCAACGCCTTTCGGAAGCCATGGTTCCGCTTCTCACGTCCGTTTCC
GACGCTTTCACTCTTTAATCGAAGCTCGCGACTACCTCAAGGAGGAGAAAGAATGCGATA
TATGCGGCGTTGAGATCGCAGATGGAGCTGCTCAGGTCAATGAACATCCTTTCAAAAGAA
ACACTGCTTTTCTTCTGGGTAATGAGGAATCGGGGTTATCTGCCAAAGAGTATGAGATAT
GTGACTTCTTTGTTTACATTCCTCAGTATGGCTGTGGCACTGCCTCTCTCAATGTCACTG
TTGCAGCTTCTATTGTCTTGCATCATTTTGGAGTGTGGGCGGGATTTTCTGAACGTGTCC
GAGATGGAAGCAAATTCATAGTGGCTGATAAACCAGTTAGGCAAGGAAGACGGAATTTCT
GTGCTGGTACAGAAGAATCCATCGTTGAAGAGCGGAAGCTGAGGAAAGAAAGTGCTGAAA
AGGGCTTCTTTGATGAAAACGGAAACGAGAGTTCATCCACCGAGCTTCTCAACGGTTTGT
TCCTTAACGATTAGTTGTCTTTAAAATTAAGGAACAAAGTCTTGGTTTTGGGTTTTAAAT
TCTGG

QA 4 728 4 728
DS 



AS 1 2

CO CL6445Contig1 677 2 1 U
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AAATGCTCGAGAACGAGGACATGCAACAGTTCCTCCGCCTATTCAGCATGGGAGGAGGAG
GTAATGGCTCTGCTTCACATTTGCCCGAAGATGGGTATACTTTCCCGTCGTTTCTGCACA
CGCCTATGCAAGGTTATGATGAAGACCGTGGTCGATCAGGCAGAGCTGTTGTTGGGTGGC
TTAAGATAAAGGCAGCAATGAGATGGGGTTTCTTCATCAGAAGGAAAGCTGCTGAGAGGC
GAGCACAGATTGTAGAGCTGGATGATGATGACGAAGAATAGTCTGGTCTTTATTCATCAT
GATTGTACCCCATATACCCTCATGATGATGGTAACAACACTAATGACTCAAAACAGTGTC
TACCAAATGGAAACTGAATCTTGAGGGCAACGAGGCAGCAGCAGCAGCGCGAATGGAGGT
GAGTGGCCCTGGTATTGTATAAAAGGAGTGTACAGATAGATTCAGTGGATGTGTTGTGTT
TATGAAGCAGGAGACTTCTAATATGTTTGGTTGACTCATTCAGACATTAGCATTCTTAAG
AACTGATTTTGCAGTCTTAACAAGTAGAATGTATGTCTTGTGACTTTGTCCTTTTTTCTT
CTTCTATTTGATTTTCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1F765TF U 1
AF RS1F765JQ C 5
BS 1 677 RS1F765TF

RD RS1F765TF 677 0 0
GCCGCGAGAGAGGAGCAGAAGATTTCTTCTCAGAGGAAGAGATCCGTATGAGAAGCCATG
AAATGCTCGAGAACGAGGACATGCAACAGTTCCTCCGCCTATTCAGCATGGGAGGAGGAG
GTAATGGCTCTGCTTCACATTTGCCCGAAGATGGGTATACTTTCCCGTCGTTTCTGCACA
CGCCTATGCAAGGTTATGATGAAGACCGTGGTCGATCAGGCAGAGCTGTTGTTGGGTGGC
TTAAGATAAAGGCAGCAATGAGATGGGGTTTCTTCATCAGAAGGAAAGCTGCTGAGAGGC
GAGCACAGATTGTAGAGCTGGATGATGATGACGAAGAATAGTCTGGTCTTTATTCATCAT
GATTGTACCCCATATACCCTCATGATGATGGTAACAACACTAATGACTCAAAACAGTGTC
TACCAAATGGAAACTGAATCTTGAGGGCAACGAGGCAGCAGCAGCAGCGCGAATGGAGGT
GAGTGGCCCTGGTATTGTATAAAAGGAGTGTACAGATAGATTCAGTGGATGTGTTGTGTT
TATGAAGCAGGAGACTTCTAATATGTTTGGTTGACTCATTCAGACATTAGCATTCTTAAG
AACTGATTTTGCAGTCTTAACAAGTAGAATGTATGTCTTGTGACTTTGTCCTTTTTTCTT
CTTCTATTTGATTTTCC

QA 1 677 1 677
DS 

RD RS1F765JQ 673 0 0
CGAGAGAGGAGCAGAAGATTTCTTCTCAGAGGAAGAGATCCGTATGAGAAGCCATGAAAT
GCTCGAGAACGAGGACATGCAACAGTTCCTCCGCCTATTCAGCATGGGAGGAGGAGGTAA
TGGCTCTGCTTCACATTTGCCCGAAGATGGGTATACTTTCCCGTCGTTTCTGCACACGCC
TATGCAAGGTTATGATGAAGACCGTGGTCGATCAGGCAGAGCTGTTGTTGGGTGGCTTAA
GATAAAGGCAGCAATGAGATGGGGTTTCTTCATCAGAAGGAAAGCTGCTGAGAGGCGAGC
ACAGATTGTAGAGCTGGATGATGATGACGAAGAATAGTCTGGTCTTTATTCATCATGATT
GTACCCCATATACCCTCATGATGATGGTAACAACACTAATGACTCAAAACAGTGTCTACC
AAATGGAAACTGAATCTTGAGGGCAACGAGGCAGCAGCAGCAGCGCGAATGGAGGTGAGT
GGCCCTGGTATTGTATAAAAGGAGTGTACAGATAGATTCAGTGGATGTGTTGTGTTTATG
AAGCAGGAGACTTTTAATATGTTTGGTTGACTCATTCAGACATTAGCATTCTTAAGAACT
GATTTTGCAGTCTTAACAAGTAGAATGTATGTCTTGTGACTTTGTCCTTTTTTCTTCTTC
TATTTGATTTTCC

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

CO CL6446Contig1 739 2 2 U
GGATCAGATAAGTTATCCAATCAATATACACTTCTACAATCTATATATACAGCCACAGCT
ACTTATATAGCATTCTGCAAGGCGGCGTTGCAATTTTTTCTGTCCTTATGAGTTTTGTTG
GTAAAATGAAGGAAAACGCAGTCAACCCTCTCCGTCTCACATCACTGAACCATGTGTCTC
TCTTGTGCCGATCCCTTGAAGAGTCGATGAATTTTTACCAAAGGGTGTTAGGGTTCTTCC
CAGTTCGAAGACCTGAATCTTTAGATTTTGAAGGCGCTTGGTTGTTTGGACATGGAATCG
GAATACATCTCTTGCCTTCCACAGAGCCTCAAAAACTCCCCAAGAAAACTGTGATTGACT
CCAGAGATAACCATATCTCTTTTCAGTGCGAGAGTATGGCAGCAGTGGAGAAGAAGCTTG
ATGAAATGGGAATAGAGTATGTGAGGGAGATGGTCGAAGGAAGAGGGATCAAAGTGGACC
AGCTCTTCTTCCACGACCCTGATGGCTTCATGATAGAGATCTGCAATTGTGATAGCCTCC
CTGTTGTCCCTCTCGTAGGAGGACTGGCCCAGTACTGCGCAAGAGTTAAACTTCATCAGA
TGGGGCAACCACAACCGCAGACTAATTAAGATCAATCCTTAACTATCTCTGTTTTGTGTT
TGTGTGTGTGCTTTGGGTGTGTTTGCTTTGTGTGTGATGAATAAGAGACCGATCAACGGG
GATCAGTGAATGTGATCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1CB66TF U 1
AF RS1DU46TF U 1
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BS 670 739 RS1DU46TF

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TGTGTGTGT

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DS 

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TCTTGTGCCGATCCCTTGAAGAGTCGATGAATTTTTACCAAAGGGTGTTAGGGTTCTTCC
CAGTTCGAAGACCTGAATCTTTAGATTTTGAAGGCGCTTGGTTGTTTGGACATGGAATCG
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CCAGAGATAACCATATCTCTTTTCAGTGCGAGAGTATGGCAGCAGTGGAGAAGAAGCTTG
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GATCAGTGAATGTGATCCC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1FR45TF U 1
AF RS1FR45JQ C 241
BS 1 561 RS1FR45TF
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RD RS1FR45TF 561 0 0
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DS 

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GAGGCAGTTACGGATCTCTTGAACAATGAAAGTGTGTCTGACATCGACCGGCTACGTTTG
GTGATGCTGTATGCTTTGCGCTATGAGAAAGAGAATCCCGTTCAGTTGATGCAACTGTTC
AACAAATTGGCTTCACGGTCTCCCAAGTACAAACAAGGGCTTGTTCAATTTCTCCTGAAA
CAAGCCGGAGTAGAGAAGCGAACTGGTGATCTGTTTGGGAATAGAGATCTTCTGAATATA
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CGGTTTATCCTCGGCGGCACTGCAGTGCTTAATTCCAAGAGGTTTCTCATGGACTTGGAA
GAAGCCCAAAGGATATCAAGATCAGGTAGCCATATGGTGTGAACTGTGAAGAGGGATATA
ACAAACGAGATTGTGCATTAGTAGTCTATATATATAAGATTCTTCCTTATTATAAATATT
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AGATTGTGGTTAGGTTCTTCGAATCATTCCTAC

QA 1 813 1 813
DS 



AS 1 2

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TCTGGTTTGGTTTCTGGGTTGTAGAATGTTTAGGGCATGTGTGCGTTTTGTGTAAACCAT
GAACAAAATAAGAGCTAATAAGAGTTTCTGATTCTG


BQ
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AF RS1A363TV U 1
AF RS1A363TF U 27
BS 1 695 RS1A363TV
BS 696 696 RS1A363TF

RD RS1A363TV 695 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGTTCTTACATC
TTTTTTCCTTCTGGTTTGATAAGAATCATGAAGATAATTCCATATGTCCGAACAGGCCAA
TCTGGAATCACCTGAATAAAAAGTCGGATAGCTTCTTCCTCATAACTCCTATGAGATTTA
TTCAACTTCCTGGTGATTCTAAACTGATTAATGGTTTCAAATCAGGCTTCTTACATCTTT
CTTCCTTCTGGTTTGATAAGAATCATGAAGATATTGCCATATGTCCGAACAGGCCAATCT
GGAATCAACTGAATAGAAAGTGGGATAGCTTCTTCCTCATAACTCCTATGAGATTTATTC
AACTTCCTAGTGATTCTAAACTGATTAATGGTTTCAAATCAAGCTTCTTACATCCTTGTT
CCTTCTGGTTTGATAAGAATCATGAAGATATTGCCATATGTCCGAACATGCCAATCTGGA
ATCACCTGAATAAAAAGTCGAATAGATTCTTCCTCATAACTCCTATGAGATTTATTCAAC
TTCCTGGTGATTCTAAACTGATTAATGGTCTCAAATCATGCTTCTTACATCTTGGTGCCT
TCTGGTTTGGTTTCTGGGTTGTAGAATGTTTAGGGCATGTGTGCGTTTTGTGTAAACCAT
GAACAAAATAAGAGCTAATAAGAGTTTCTGATTCT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1A363TF 670 0 0
GGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGTTCTTACATCTTTTTTCCTTCTGGTTTGATAAGAAT
CATGAAGATAATTCCATATGTCCGAACAGGCCAATCTGGAATCACCTGAATAAAAAGTCG
GATAGCTTCTTCCTCATAACTCCTATGAGATTTATTCAACTTCCTGGTGATTCTAAACTG
ATTAATGGTTTCAAATCAGGCTTCTTACATCTTTCTTCCTTCTGGTTTGATAAGAATCAT
GAAGATATTGCCATATGTCCGAACAGGCCAATCTGGAATCAACTGAATAGAAAGTGGGAT
AGCTTCTTCCTCATAACTCCTATGAGATTTATTCAACTTCCTAGTGATTCTAAACTGATT
AATGGTTTCAAATCAAGCTTCTTACATCCTTGTTCCTTCTGGTTTGATAAGAATCATGAA
GATATTGCCATATGTCCGAACATGCCAATCTGGAATCACCTGAATAAAAAGTCGAATAGA
TTCTTCCTCATAACTCCTATGAGATTTATTCAACTTCCTGGTGATTCTAAACTGATTAAT
GGTCTCAAATCATGCTTCTTACATCTTGGTGCCTTCTGGTTTGGTTTCTGGGTTGTAGAA
TGTTTAGGGCATGTGTGCGTTTTGTGTAAACCATGAACAAAATAAGAGCTAATAAGAGTT
TCTGATTCTG

QA 1 670 1 670
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TTTTTAGATCTGCAAGACTTGAAATTTTATTTGAAAAGTAGAGCAAAAGAACCAAAAATT
TGAGTTACAGTGAATGAATATGTTCAGCATCATCTTGCAGCTCTCACACTCACAATGATG
GAAATCACAATGCTTTATCAGTTCAGCCTAAAGCATTGCTTTTGTTTTCTGTTTTCGTTA
TTGTCAACAAAAAAGAAGAAGAAACGTACTAAGCATCTGATACAACAAGCCCTTAAGCAG
CTGCCTCCTTGGAGATCTTCTCTGCTTTCGCAACCACCTCGTCGATGCCACCAACCATGT
AAAACGATTGTTCAGGAAGATCATCGTACTTACCATCGAGCAAACCCTGGAAACTGTTGA
TGTTTTCCTTAAGGTCAACGTATTTGCCAGGAGCACCCGTGAAGATCTCAGCAACATGGA
ACGGCTGACTCAAGAATCTCTGGATCTTACGTGCACGGGCAACAGTCAGTTTGTCATCTT
CACTTAACTCATCCATTCCCAAAATGGCAATAATATCTTGCAAGTTATTGTAGTTCTGTA
GCACTTTCTGCACACCACGAGCCGTGTTGTAGTGCTCCTCACCCAGAATGTGAGGCGAGA
GCATACGGGATGTTGAGTCCAGAGGATCCACAGCAGGATAGATACCTAGCTCAGAAATCT
GTCTGGAAAGCACGGTTGTGGCATCCAAGTGAGCAAAAGTTGTGGCAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CS41TF C 1
AF RS1CS41JQ U 38
BS 1 37 RS1CS41TF
BS 38 710 RS1CS41JQ

RD RS1CS41TF 710 0 0
TTTTTAGATCTGCAAGACTTGAAATTTTATTTGAAAAGTAGAGCAAAAGAACCAAAAATT
TGAGTTACAGTGAATGAATATGTTCAGCATCATCTTGCAGCTCTCACACTCACAATGATG
GAAATCACAATGCTTTATCAGTTCAGCCTAAAGCATTGCTTTTGTTTTCTGTTTTCGTTA
TTGTCAACAAAAAAGAAGAAGAGACGTACTAAGCATCTGATACAACAAGCCCTTAAGCAG
CTGCCTCCTTGGAGATCTTCTCTGCTTTCGCAACCACCTCGTCGATGCCACCAACCATGT
AAAACGATTGTTCAGGAAGATCATCGTACTTACCATCGAGCAAACCCTGGAAACTGTTGA
TGTTTTCCTTAAGGTCAACGTATTTGCCAGGAGCACCCGTGAAGATCTCAGCAACATGGA
ACGGCTGACTCAAGAATCTCTGGATCTTACGTGCACGGGCAACAGTCAGTTTGTCATCTT
CACTTAACTCATCCATTCCCAAAATGGCAATAATATCTTGCAAGTTATTGTAGTTCTGTA
GCACTTTCTGCACACCACGAGCCGTGTTGTAGTGCTCCTCACCCAGAATGTGAGGCGAGA
GCATACGGGATGTTGAGTCCAGAGGATCCACAGCAGGATAGATACCTAGCTCAGAAATCT
GTCTGGAAAGCACGGTTGTGGCATCCAAGTGAGCAAAAGTTGTGGCAGGC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1CS41JQ 673 0 0
GTAGAGCAAAAGAACCAAAAATTTGAGTTACAGTGAATGAATATGTTCAGCATCATCTTG
CAGCTCTCACACTCACAATGATGGAAATCACAATGCTTTATCAGTTCAGCCTAAAGCATT
GCTTTTGTTTTCTGTTTTCGTTATTGTCAACAAAAAAGAAGAAGAAACGTACTAAGCATC
TGATACAACAAGCCCTTAAGCAGCTGCCTCCTTGGAGATCTTCTCTGCTTTCGCAACCAC
CTCGTCGATGCCACCAACCATGTAAAACGATTGTTCAGGAAGATCATCGTACTTACCATC
GAGCAAACCCTGGAAACTGTTGATGTTTTCCTTAAGGTCAACGTATTTGCCAGGAGCACC
CGTGAAGATCTCAGCAACATGGAACGGCTGACTCAAGAATCTCTGGATCTTACGTGCACG
GGCAACAGTCAGTTTGTCATCTTCACTTAACTCATCCATTCCCAAAATGGCAATAATATC
TTGCAAGTTATTGTAGTTCTGTAGCACTTTCTGCACACCACGAGCCGTGTTGTAGTGCTC
CTCACCCAGAATGTGAGGCGAGAGCATACGGGATGTTGAGTCCAGAGGATCCACAGCAGG
ATAGATACCTAGCTCAGAAATCTGTCTGGAAAGCACGGTTGTGGCATCCAAGTGAGCAAA
AGTTGTGGCAGGC

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

CO CL6451Contig1 1253 2 2 U
GGAAAAGTAAAAGAGAGTGTTCTGTTTCCTTCTTGGTCTTGTATTTACCGTCCGTGGGAC
GTGGACAAAGGATCACCATCAGACATGAGAACCCTCCACGTAGTCTCTTTTCCCCTTCTT
CGATAGCTTTCATGTGACCCTCACCTGACTCTGGGTTTGCTTTGCTGGAGAAACGCCAAA
GAACAGCTTTTTTTTTGTAGAAGATGACAAGTGTCAAGAGGAAACTTGACGATGAACTTT
CGTCTCCTTGGTTCTACGCCGTTTGTACCATGGGAGGAATGATCAGTGCCGGAACAACAC
ATCTGGCTATAACCCCTCTTGATGTCCTCAAAGTCAATATGCATGTGAATCCTGTGAAGT
ACAGTAGCATTCCCACAGGTTTCTCAACTCTCTTGAGAGAGCATGGACATTCCTATCTAT
GGAGAGGTTGGTCAGGGAAGCTTTTAGGCTATGGTGTTCAAGGCGGGTGCAGATTTGGAC
TCTATGAGTACTTCAAGACACTCTACAGCAATGTGTTGCCTAACAACAAGAAAACTTCCA
TATATTTTCTTAGCAGTGCTTCTGCTCAGATATTCGCAGATATGGCCTTATGTCCATTTG
AAGCTATAAAAGTTAGAGTTCAGACGCAGCCCAGGTTTGCAAAAGGGTTGCTTGATGGGT
TTCCAAGAGTGTATAGAAATGAGGGTCTTGCTGGCTTCCACAGGGGACTTTTCCCGCTCT
GGTGTCGCAATCTTCCATTTTCTATGGTGATGTTCTCAACGTTTGAGCAGTCAGTTGAGT
TTATATATGGAAACATTATCCATAAAAGGAAGCAAGATTGCTCTAAAGCTCAACAACTTG
GTGTCACATGTCTTGCTGGCTATACTGCTGGAGCCGTAGGTACAGTCACCTCTAACCCTG
CAGATGTGGTTGTTTCGTCTCTTTACAACAACAAAGCCAAGAATGTGTTGCAGGCTGTGA
GAAACATTGGGTTTGTTGGTCTTTTCACCAGAAGTCTTCCTGTTCGAATAACGATTGTTG
GACCTGTCATAACCTTGCAGTGGTTCTTTTATGACGCTATCAAAGTCTTAAGTGGATTCC
CTACCAGTGGAGGTGTGCCGAAACCAGTGGATGCAACTAAGGTGTCAGTGTAAAGCTTAG
AAGAGTAGATTTTATCTTTTTCAACATCAGAATCTGAAACTTCAAACGTATTATGGTATT
ATGTAAGATTCTCTTACGTTTCCCAATTGTATAACAACTTCAGCTGATAACAC


BQ
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AF RS1GN37TF U 1
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RD RS1GN37TF 630 0 0
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CGATAGCTTTCATGTGACCCTCACCTGACTCTGGGTTTGCTTTGCTGGAGAAACGCCAAA
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CGTCTCCTTGGTTCTACGCCGTTTGTACCATGGGAGGAATGATCAGTGCCGGAACAACAC
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TCTATGAGTACTTCAAGACACTCTACAGCAATGTGTTGCCTAACAACAAGAAAACTTCCA
TATATTTTCTTAGCAGTGCTTCTGCTCAGATATTCGCAGATATGGCCTTATGTCCATTTG
AAGCTATAAAAGTTAGAGTTCAGACGCAGC

QA 1 630 1 630
DS 

RD RS1GN37JQ 694 0 0
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CCATAAAAGGAAGCAAGATTGCTCTAAAGCTCAACAACTTGGTGTCACATGTCTTGCTGG
CTATACTGCTGGAGCCGTAGGTACAGTCACCTCTAACCCTGCAGATGTGGTTGTTTCGTC
TCTTTACAACAACAAAGCCAAGAATGTGTTGCAGGCTGTGAGAAACATTGGGTTTGTTGG
TCTTTTCACCAGAAGTCTTCCTGTTCGAATAACGATTGTTGGACCTGTCATAACCTTGCA
GTGGTTCTTTTATGACGCTATCAAAGTCTTAAGTGGATTCCCTACCAGTGGAGGTGTGCC
GAAACCAGTGGATGCAACTAAGGTGTCAGTGTAAAGCTTAGAAGAGTAGATTTTATCTTT
TTCAACATCAGAATCTGAAACTTCAAACGTATTATGGTATTATGTAAGATTCTCTTACGT
TTCCCAATTGTATAACAACTTCAGCTGATAACAC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

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ATGGATTCTTCAAGAACTCGAACTTTAGGCAGAAGATCTGATCCGGTCAACTTTCCGGCG
AAGACAAACACTTCATCCCGGCGATCTTTATCTTCTTCCTCCTTCTCATCCTTCTCCTCT
TGCTCCTCTAGCTCCCTCGTGTTTCAAGGCGACTCTCCTTTAAATTCTCCCGCGACTCCT
CTTCGTCTCCTCGGTGTTCCATTCTCTTGGGAACATCTTCCAGGGAAACCCAAAGATTAC
TCTCACAGACTCAACCACCGCCTAAGTAAAGAATCTTCACTTATACTACCCCTCCCTCCT
CACCGGAGTACACATTTTCCGGTGTCCGGAAAAAATAAAAAACCTAACAGTTTAAGTAAG
AAGAACAGCTTCCCGGTGATTGAGAAAGATCCATTCGCGGCCGCGTTGTTGGAGTGTTCC
AGAGACGACGTTGACGATGAAGACGACAGGGAAGACGAGAGGTTCCGAGGAAACTCCAGT
GGATCAAGCAAGGCGCTATCTAAGAGCAGCATTGGCGACAGGCTTGGGTTAGTGAGTCTT
TACGGTTCTTGTCGGAGAACTTGTACCGTTGCAGAGTCCATTGTTTATCTCCCAAGACCG
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CACAATTTACTATATATTTTCTCTTGATCTTTGTATACTTTTTATATATTTTCTCTGATG
TATATTGTGGG


BQ
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AF RS1DZ96TF U 22
AF RS1CG50TF U 1
BS 1 42 RS1CG50TF
BS 43 43 RS1DZ96TF
BS 44 319 RS1CG50TF
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RD RS1DZ96TF 734 0 0
GAC
TGTCTCTCTCTCTCACTCCTCATCTTCTTGTTCTTCATGGATTCTTCGAGAACTCGAACT
TTAGGCAGAAGATCTGATCCGGTCAACTTTCCGGCGAAGACAAACACTTCATCCCGGCGA
TCTTTATCTTCTTCCTCCTTCTCATCCTTCTCCTCTTGCTCCTCTAGCTCCCTCGTGTTT
CAAGGCGACTCTCCTTTAAATTCTCCCGCGACTCCTCTTCGTCTCCTCGGTGTTCCATTC
TCTTGGGAACATCTTCCAGGGAAACCCAAAGATTACTCTCACAGACTCAACCACCGCCTA
AGTAAAGAATCTTCACTTATACTACCCCTCCCTCCTCACCGGAGTACACATTTTCCGGTG
TCCGGAAAAAATAAAAAACCTAACAGTTTAAGTAAGAAGAATAGCTTCCCGGTGATTGAG
AAAGATCCATTCGCGGCGGCGTTGTTGGAGTGTTCCAGAGACGACGTTGACGATGAAGAC
GACAGGGAAGACGAGAGGTTCCGAGGAAACTCCAGTGGATCAAGCAAGGCGCTATCTAAG
AGCAGCATTGGCGACAGGTTTGGGTTAGTGAGTCTTTACGGTTCTTGTCGGAGAACTTGT
ACCGTTTCAGAGTCCATTGTTTATCTCCCAAGACCGA*AAAAGCTTCTTCTTATGATCAT
CTGATTCCACGCCGTCGCAGTTAATTCGTTGCCTTTCACGATTTACTATATAT
ATTTTCTGTGATCTTTGT

QA 4 716 4 716
DS 

RD RS1CG50TF 791 0 0
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ATGGATTCTTCAAGAACTCGAACTTTAGGCAGAAGATCTGATCCGGTCAACTTTCCGGCG
AAGACAAACACTTCATCCCGGCGATCTTTATCTTCTTCCTCCTTCTCATCCTTCTCCTCT
TGCTCCTCTAGCTCCCTCGTGTTTCAAGGCGACTCTCCTTTAAATTCTCCCGCGACTCCT
CTTCGTCTCCTCGGTGTTCCATTCTCTTGGGAACATCTTCCAGGGAAACCCAAAGATTAC
TCTCACAGACTCAACCACCTCCTAAGTAAAGAATCTTCACTTATACTACCCCTCCCTCCT
CACCGGAGTACACATTTTCCGGTGTCCGGAAAAAATAAAAAACCTAACAGTTTAAGTAAG
AAGAACAGCTTCCCGGTGATTGAGAAAGATCCATTCGCGGCCGCGTTGTTGGAGTGTTCC
AGAGACGACGTTGACGATGAAGACGACAGGGAAGACGAGAGGTTCCGAGGAAACTCCAGT
GGATCAAGCAAGGCGCTATCTAAGAGCAGCATTGGCGACAGGCTTGGGTTAGTGAGTCTT
TACGGTTCTTGTCGGAGAACTTGTACCGTTGCAGAGTCCATTGTTTATCTCCCAAGACTG
AGAAAAGCTTCTTCTTATGATCA*CTGATTCCACGCCGTCGCAGTTAATTCGTTGTCTTT
CACAATTTACTATATATTTTCTCTTGATCTTTGTATACTTTTTATATATTTTCTCTGATG
TATATTGTGGG

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 2

CO CL6453Contig1 578 2 1 U
GCAAACCCACACCTATGTTTCTTCTTCATGGTCGTCGTCTTCGTGTTCTCCTTCACATGG
TACTTGAACTACGAGTCCATCTTCGAAGACACCATGAATAATCTAAAGTTCTTCATCATC
CTCTCCCCTCTCTTACTCCTTCTCATCGTCCATTTCTTCTCCGGGGGCCTCTCCTTGTAC
GTCCCCTTGCCTGAACAAGACTCCATCCACCATGCCGGTTCATCCCCTTGGGGCGTAGCA
GCTGTGCTCGTTGTCATCTTGTTCATGGTCTCCTACCAGTCAGACATCCACGAGATGTGG
TTCCCCTTTGGGGCTAAGTAGATGAGATCAGCCTGATTTTTCCTTATTACCAGCTCTATC
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ATGAAGATTTTAGTCTCGCATGTGTGTAGGAGTGAAACTTTTTTCGAAGGTCTCTTAAGT
CATATCAGAGTGTCCATATATGTAGATGAAGTTGTCTCTGCTTGTATGTTCTGCTTGTAT
TCGTAAATATCATATGGAAAAATGAGATGAAGACAACC


BQ
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QA 1 578 1 578
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1F320TF C 1
AF RS1F320JQ U 88
BS 1 87 RS1F320TF
BS 88 524 RS1F320JQ

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DS 



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ATGTTGAGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GT92TF U 1
AF RS1GT92JQ C 1
BS 1 685 RS1GT92TF
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QA 1 685 1 685
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ATGTTGAGC

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

CO CL6456Contig1 865 2 2 U
GGACTCACTCTAGAACTGATTCATTGAAGAAGATGGAGAGACAACAGAATTATCTACTTA
GCTGTGTTCCCCAAAACCAGTGTGGTATAAAGACAATAGAAGAGTTAAGACATTCGCTTC
TCCACACAAGAGTGGAGTTAGAGCAAACAATAAGGGTAGCCCAAGAAGAACTCAATACCA
AAGACAACCACATAATGCAGCTGAAAGATCTCCTCAACAAAACTATTAAAGAGAAAGATG
AAGCGCAAGAGAGATACAAGAAGCTTCTTCTCGACAAAAACTTCATCCTTCAACACCAAA
CTCTAGATGAACAAGACCCACACATCAGTGGGTTTCCTTCATCCGACGGTGAGGAAAGCA
TCGTCTCATCATCTTTCGAACCGCCGATGCAAATTGAGTTAGATTTTCCTGAGAGGACAT
TACCGGAGAGAGGGAAGCTTAAATGCGGTTTTGAAGGCAGGGCCTCTGCTTCAGACTCTG
CTTTTGGCTGGACAGCTTCCACAGTGGCGTTATCCACCACCGCAGCTAGAGTCATTCGAA
ATTCCACCGGTGATTATTCCTGAAGCAACAACACCATCGTCCCAAAATAGCTGTGGGAGT
AATCTAAACCGGAAGAGGGTTCACTGCGACGATTCTAGTTCCAAAAGAGAGACCAAGTAC
CAAAGACTTCTCTTTCCTTGATTGTTCATGTAATCATATTTTTCATTCAAGCATCAACTA
TGTTTTTAAAGAGTTCATTTTTCTTTGTTTCTTTCCGCTGCAAAAAGCATTGGAGCTTGA
ATCGTTTTCTCCCATGTGGAGGTTGTAATATTAGATCCATGGACTGTTCCGGTCCGGTTT
TTAACAGGTCGGCCCTTAGAGCTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DK20TF U 1
AF RS1DK20JQ C 269
BS 1 652 RS1DK20TF
BS 653 865 RS1DK20JQ

RD RS1DK20TF 652 0 0
GGACTCACTCTAGAACTGATTCATTGAAGAAGATGGAGAGACAACAGAATTATCTACTTA
GCTGTGTTCCCCAAAACCAGTGTGGTATAAAGACAATAGAAGAGTTAAGACATTCGCTTC
TCCACACAAGAGTGGAGTTAGAGCAAACAATAAGGGTAGCCCAAGAAGAACTCAATACCA
AAGACAACCACATAATGCAGCTGAAAGATCTCCTCAACAAAACTATTAAAGAGAAAGATG
AAGCGCAAGAGAGATACAAGAAGCTTCTTCTCGACAAAAACTTCATCCTTCAACACCAAA
CTCTAGATGAACAAGACCCACACATCAGTGGGTTTCCTTCATCCGACGGTGAGGAAAGCA
TCGTCTCATCATCTTTCGAACCGCCGATGCAAATTGAGTTAGATTTTCCTGAGAGGACAT
TACCGGAGAGAGGGAAGCTTAAATGCGGTTTTGAAGGCAGGGCCTCTGCTTCAGACTCTG
CTTTTGGCTGGACAGCTTCCACAGTGGCGTTATCCACCACCGCAGCTAGAGTCATTCGAA
ATTCCACCGGTGATTATTCCTGAAGCAACAACACCATCGTCCCAAAATAGCTGTGGGAGT
AATCTAAACCGGAAGAGGGTTCACTGCGACGATTCTAGTTCCAAAAGAGAGA

QA 1 652 1 652
DS 

RD RS1DK20JQ 597 0 0
TCTCGACAAAAACTTCATCCTTCAACACCAAACTCTAGATGAACAAGACCCACACATCAG
TGGGTTTCCTTCATCCGACGGTGAGGAAAGCATCGTCTCATCATCTTTCGAACCGCCGAT
GCAAATTGAGTTAGATTTTCCTGAGAGGACATTACCGGAGAGAGGGAAGCTTAAATGCGG
TTTTGAAGGCAGGGCCTTTGCTTCAGACTTTGCTTTTGGCTGGACAGCTTCCACAGTGGC
GTTATCCACCACCGCAGCTAGAGTCATTCGAAATTCCACCGGTGATTATTCCTGAAGCAA
CAACACCATCGTCCCAAAATAGCTGTGGGAGTAATCTAAACCGGAAGAGGGTTCACTGCG
ACGATTCTAGTTCCAAAAGAGAGACCAAGTACCAAAGACTTCTCTTTCCTTGATTGTTCA
TGTAATCATATTTTTCATTCAAGCATCAACTATGTTTTTAAAGAGTTCATTTTTCTTTGT
TTCTTTCCGCTGCAAAAAGCATTGGAGCTTGAATCGTTTTCTCCCATGTGGAGGTTGTAA
TATTAGATCCATGGACTGTTCCGGTCCGGTTTTTAACAGGTCGGCCCTTAGAGCTTG

QA 1 597 1 597
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6458Contig1 871 2 2 U
GGGTCTCTCTGATGAAGACCATGGAGCTTTTCTCTCTCTCATCCATCCTCCTTCTCCTTG
GGCTCTCCTTCACTAGTCCCATTTTCTCCAACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCG
GGGGATTAAACATATTTTTCGTTATAAAAGTTAATATCCTCCTCTCTGTCAGTCTCTCTC
TTTCGTGATGGAAGCTCAACATCTTCATGGCAAGCCTCAAGCTGAAGGAGAATGGTCCAC
AGGCTTCTGTGATTGCTTCTCCGACTGCGGAAACTGCTGTATCACATGCTGGTGTCCATG
TATTACATTTGGCCAAGTGGCGGATATTGTAGACCAAGGATCAACCACGTGTGGTACGGC
TGGAGCACTATACACGTTAATAAGTGCAGTAACGGGTTGCGGATGTCTCTACTCGTGTTT
CTATCGTGGAAAGATGAGAGCTCAATACAACATTGGAGGCAATGATTGTGGAGATTGCCT
TAAACATTTCTTCTGCGAGCTCTGTGCTCTCACTCAACAATACCGTGAACTCAAGAACCG
TGGCTACAATATGAAACTTGGATGGGCCGGGAACGCACAGATACAACAGAACCAAGGCGT
GGCGATGGGTGCTCCAGTCTTCCAAGGCGGCATGACCCGCTAAGATTCGTTCCTTTGTAT
GTAATTTATTTATTTATATAATAAAGTGAGGTTTAATCCTCTGTGTGGATTTGTGTAATA
TGCTTGTTATGATTTATGAAAGTGAATGTATATATTTTTATAATACCCAGTCAAGGATAT
GACACTTTTACTAACATGTCATTATACGTCTTTGATTTGGTTTGGTCGAGATTGTAACTG
CAAGGTTGAATAGTCTATAAATATTTCAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1A694TF U 1
AF RS1A694JQ C 114
BS 1 791 RS1A694TF
BS 792 871 RS1A694JQ

RD RS1A694TF 791 0 0
GGGTCTCTCTGATGAAGACCATGGAGCTTTTCTCTCTCTCATCCATCCTCCTTCTCCTTG
GGCTCTCCTTCACTAGTCCCATTTTCTCCAACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCG
GGGGATTAAACATATTTTTCGTTATAAAAGTTAATATCCTCCTCTCTGTCAGTCTCTCTC
TTTCGTGATGGAAGCTCAACATCTTCATGGCAAGCCTCAAGCTGAAGGAGAATGGTCCAC
AGGCTTCTGTGATTGCTTCTCCGACTGCGGAAACTGCTGTATCACATGCTGGTGTCCATG
TATTACATTTGGCCAAGTGGCGGATATTGTAGACCAAGGATCAACCACGTGTGGTACGGC
TGGAGCACTATACACGTTAATAAGTGCAGTAACGGGTTGCGGATGTCTCTACTCGTGTTT
CTATCGTGGAAAGATGAGAGCTCAATACAACATTGGAGGCAATGATTGTGGAGATTGCCT
TAAACATTTCTTCTGCGAGCTCTGTGCTCTCACTCAACAATACCGTGAACTCAAGAACCG
TGGCTACAATATGAAACTTGGATGGGCCGGGAACGCACAGATACAACAGAACCAAGGCGT
GGCGATGGGTGCTCCAGTCTTCCAAGGCGGCATGACCCGCTAAGATTCGTTCCTTTGTAT
GTAATTTATTTATTTATATAATAAAGTGAGGTTTAATCCTCTGTGTGGATTTGTGTAATA
TGCTTGTTATGATTTATGAAAGTGAATGTATATATTTTTATAATACCCAGTCAAGGATAT
GACACTTTTAC

QA 1 791 1 791
DS 

RD RS1A694JQ 758 0 0
ACGGCCGGGGGATTAAACATATTTTTCGTTATAAAAGTTAATATCCTCCTCTCTGTCAGT
CTCTCTCTTTCGTGATGGAAGCTCAACATCTTCATGGCAAGCCTCAAGCTGAAGGAGAAT
GGTCCACAGGCTTCTGTGATTGCTTCTCCGACTGCGGAAACTGCTGTATCACATGCTGGT
GTCCATGTATTACATTTGGCCAAGTGGCGGATATTGTAGACCAAGGATCAACCACGTGTG
GTACGGCTGGAGCACTATACACGTTAATAAGTGCAGTAACGGGTTGCGGATGTCTCTACT
CGTGTTTCTATCGTGGAAAGATGAGAGCTCAATACAACATTGGAGGCAATGATTGTGGAG
ATTGCCTTAAACATTTTTTTTGCGAGCTCTGTGCTCTCACTCAACAATACCGTGAACTCA
AGAACCGTGGCTACAATATGAAACTTGGATGGGCCGGGAACGCACAGATACAACAGAACC
AAGGCGTGGCGATGGGTGCTCCAGTCTTCCAAGGCGGCATGACCCGCTAAGATTCGTTCC
TTTGTATGTAATTTATTTATTTATATAATAAAGTGAGGTTTAATCCTCTGTGTGGATTTG
TGTAATATGCTTGTTATGATTTATGAAAGTGAATGTATATATTTTTATAATACCCAGTCA
AGGATATGACACTTTTACTAACATGTCATTATACGTCTTTGATTTGGTTTGGTCGAGATT
GTAACTGCAAGGTTGAATAGTCTATAAATATTTCAATT

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL6459Contig1 748 2 4 U
GCTGTAAAAGGTCGAGATGGGAAGCGTTTTGCAAAGGCCTTTTCAGCTGAGCTTACTGCC
ATTAGAGCTGAGAAGGAGAAAGAAAGAGAGTTCTTGAAAAAGGAGAACAAGGGCCTTAAG
ATTCAGCTGCGAGATACCGCTGAAGCTGTCCAAGCTGCTGGAGAGTTACTGATCAGACTC
CGAGAAGCTGAGCAATACGTACAATCCTCCGAGGAACGTTTCAGCTTACTTGAAGACGAG
AATGCAAAGTTGAAGATGCAGATGGAGAAGTTAAAGGATAAGCACAAGACAGAGATGGGC
ACAATGAAGTAGTATCTTGCGTAAAGCAAATTGCCAGGGTCTGCATTACAGCCATGGTTC
AAGGAGAATGGAGAAGATGAAACAGAACACAGAACCGGTTTGGTCAAGGAGAATGAAGAA
TATGAAACAGAACGCAGAACCGGTGGTGTGGTCAGCTATGATGATTATGCAGACGATCAG
GCATGGAGAGCTGAGTTTGGTGCCATATATCAAGACCATCAGTACTGATGATGGTTCGAT
CATTTCATTTCAAGAGCAAAAACTTTGTTGAATCAGTGTCCTTTTGTCTCAGACAAGACC
CATCTTGGGTCATCTCATTCTCTTATGTTGCTTAAAAATTCTTAATCTGTCTTGTTATTG
TTGTTGTTGTCTTTACATTTTCTATTGTTGTATTGGTCATTAACTGATGAATCAGGTTTT
CTTGTAATCTGAATATTATTGATTCGCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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CTTGTAATCTGAATATTATTGATTC

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GCAGATGGAGAAGTTAAAGGATAAGCACAAGACAGAGATGGGCACAATGAAGTAGTATCT
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AACCGGTGGTGTGGTCAGCTATGATGATTATGCAGACGATCAGGCATGGAGAGCTGAGTT
TGGTGCCATATATCAAGACCATCAGTACTGATGATGGTTCGATCATTTCATTTCAAGAGC
AAAAACTTTGTTGAATCAGTGTCCTTTTGTCTCAGACAAGACCCATCTTGGGTCATCTCA
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ATTGATTCGCC

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AS 0 0

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BQ
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AF RS1DT34TF C 1
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TGGCGTCACTAGTGTTAGAAACACCGATAGCTTTCCATCCATCAGCTATTAGTTGCATAG
TTTTCCTCGTGGGAACGACCTTCTTCTTCTCCATATCTTTCAGAAGCTCCTCAGCTTTCC
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ACAGACCAACCGTTCCACACATTTTGCTATACACCTGCATCGCTTTCTTCATCTCGCCTG
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TCTTCATCTGATTCC

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CATAGCTTTGGTTTCTCAGGCATTCCCTTTAAAAACACCGGACTTCTCGTCTGGACGATA
TGATTAGGGATACTGAGCTTGTTGGAGGAAGCTGAAAAAGAAGAGCCTAACGTATTATTG
GCGTCACTAGTGTTAGAAACACCGATAGCTTTCCATCCATCAGCTATTAGTTGCATAGTT
TTCCTCGTGGGAACGACCTTCTTCTTCTCCATATCTTTCAGAAGCTCCTCAGCTTTCCAC
GGCTGCTTCGCTTCTCCAAACCCCCACATGAGAGTCTCGTAAGTAGTCAAGTTTGGGGAC
AGACCAACCGTTCCACACATTTTGCTATACACCTGCATCGCTTTCTTCATCTCGCCTGCG
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TTCATCTGATTCC

QA 1 673 1 673
DS 



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TCTTTAGTTTCCTTTGTTAGTGTGTTGTGCTCTTTTGAACATCATCAGGTGTACATTAGT
TAATCTGAACTCTTAGGTTTCTCGTTTGAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1F605TF U 1
AF RS1F605JQ C 20
BS 1 692 RS1F605TF

RD RS1F605TF 692 0 0
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CATCACTCGCTCTGCTCGTGCTGGTATTCAGTTTCCGGTGGGTCGTATCCATAGGCAACT
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GAAAGTGAAGAGGATCACTCCAAGGCATTTGCAGCTGGCTATCAGAGGAGACGAGGAGCT
CGACACCCTCATCAAGGGAACCATTGCTGGAGGAGGTGTGATCCCTCACATCCACAAGTC
TCTCATCAACAAAACCATCAAGGAGTGATTTGTTTTCATAGGCACTGTGGGTTATGTGAT
ATGCTAATTTAGTAGCTTATGGGTGTTTGTGTTTGTTTAGTCTTGGACTGCTTATCTTTT
TCTTTAGTTTCCTTTGTTAGTGTGTTGTGCTCTTTTGAACATCATCAGGTGTACATTAGT
TAATCTGAACTCTTAGGTTTCTCGTTTGAGCC

QA 1 692 1 692
DS 

RD RS1F605JQ 673 0 0
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GCTGGTATTCAGTTTCCGGTGGGTCGTATCCATAGGCAACTCAAGACGAGAGTTTCAGCA
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TGGGTGTTTGTGTTTGTTTAGTCTTGGACTGCTTATCTTTTTCTTTAGTTTCCTTTGTTA
GTGTGTTGTGCTCTTTTGAACATCATCAGGTGTACATTAGTTAATCTGAACTCTTAGGTT
TCTCGTTTGAGCC

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

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CTTTTTTG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G996TF U 1
AF RS1G048TF U 1
BS 1 548 RS1G048TF

RD RS1G996TF 379 0 0
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DS 

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GAAGGAATCCCTCCGGATCAGCAGAGGTTGATTTTCGCTGGAAAACAGCTTGAAGACGGT
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AGGGGAGGTATCATCGAGCCGTCTTTGATGGCTTTGGCTCGTAAGTACAACCAAGACAAG
ATGATCTGTCGCAAGTGTTACGCGCGTCTGCACCCGAGGGCTGTCAACTGCAGGAAGAAG
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ACAAACTTATTTTTTTATGTTGTTTCCCTGAAAGACTTCTCTAGTGTTTTTTTGATACAA
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CTTTTTTG

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DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EK51TF U 1
AF RS1EK51JQ C 84
BS 1 713 RS1EK51TF
BS 714 714 RS1EK51JQ
BS 715 727 RS1EK51TF
BS 728 728 RS1EK51JQ
BS 729 765 RS1EK51TF

RD RS1EK51TF 765 0 0
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GAAGACACAAATGCAAACGTGAATGCGGAAAGTGAGCAGATTGCAAGGGAGGCTGCTCTA
GCTTCTCAGGTTCATTTCTTGGAGCAGAGGGTGCAGGAGCTTGAAGAGGAGATTGAGACT
CAGAAGAAACTAAACGCTGAGCTAGAAGAACAGCTTAAGAGCTTGACGAACAGCAGTGAT
CCATAAAGGCAGGATTTGACTTTGCGCTCCATCTTGAAGGAGGCATATGCACCACTCTCT
TTGCATTACATCTTTTTTTTCTCTCTCTCTTAGAAAACGTTATGGACAGATAAACTGCTG
TGGTTGGTCCATTGATTGATTGAACAGTTACGAGTTTCCTCTAGTCATATAAA*TGACTC
CCTGTTT*GTATATATAAATAATACTGATACTCTATCAGAGTTTG

QA 1 765 1 765
DS 

RD RS1EK51JQ 682 0 0
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GCTAACCGGATTGGTTCAACTCTATGCTCCAGCTGTTGAAGACACAAATGCAAACGTGAA
TGCGGAAAGTGAGCAGATTGCAAGGGAGGCTGCTCTAGCTTTTCAGGTTCATTTCTTGGA
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GCGCTCCATCTTGAAGGAGGCATATGCACCACTCTCTTTGCATTACATCTTTTTTTTCTC
TCTCTCTTAGAAAACGTTATGGACAGATAAACTGCTGTGGTTGGTCCATTGATTGATTGA
ACAGTTACGAGTTTCCTCTAGTCATATAAAATGACTCCCTGTTTTGTATATATAAATAAT
ACTGATACTCTATCAGAGTTTG

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 2

CO CL6465Contig1 411 2 1 U
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TGCTCCAGCTGCCGGTGGTGGTGGTGCTGCTGCTGCACCTGCCGCTGAAGAGAAGAAGAA
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CGCATTGAACTACTACTTGGATTGGTCCACTGCTCTAAACAAGTTTTAGTTATTTTATTT
TCTTATGTTAAAATTGATTACAATATTTTAGGAATGGTTTGCTCTTATGAGGCTTGTAAA
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BQ
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QA 1 411 1 411
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1FR23TF U 1
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AGCAGAATTGCTGTCAGATTCGAGGAGAAAATTTTCAGCCGTGCTGTTAACCCGGTGATA
TAATTATACACCCCTCCTGTCTAAAACTATATTTGTTTCTTTAAGTGAGATTTTACATGG
TGATTTTTTGTGTGCCAATGGACTTTACAACATGAAAAAAAAAACCGACTTCCATGTCTT
ATTCTTATTCCTTTTTTTTTGTTTCGACTTTCAGAGTGATTACCTTCGGATAATATCCCT
CAAGATGCTGACCGTGGAGGGTAGACAGTACAACGCAGCTGGCTCTTCCTCGTCTATCAC
TGCTGATAATGACATCCGACGCTTGGAAGTGGATTTAGGCCATCTTGTGATCGGTGACAA
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BQ
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C
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A135JQ U 1
AF RS1A135TR U 30
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BS 691 761 RS1A135TR

RD RS1A135JQ 690 0 0
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GACATTTTATGTTATATCATATTTCTCGTGAGAAAATAAATCGTCGATCCTATTCTAAAA
CATAATTGTGAATATTGTCATTGAAATATGTATATATTTAGTTAAGAAAAGGTAAAACAG
TTATGATCATCGTTGATTTGAGTTGTTAATTTCCGTAGCAATATGGACAAAGAATAGTCA
AACTCCATGCACGTCAATGTTTTAGAGGAAACACTTGAATCAAACTCAAACGATTGTTAA
AAGAATTAAACAAATTTAAATAAAATGACTCATTTGCTTCTAGGTGGTGATCCATTATCT
TGATTTGGAGATGAATCCATTTGTTAATAAGAAAAAAGTCGAAGGAGAGACGCCGAATCA
GTCAAGTGATCAAATACATGTATAAGTCTAGTCCAATAAAACAAATTAAATTGTTAAAAC
GACATTGTTATCAGAAATAGTTTTGAGAACAACTAATCAAACCAAGTAATCAAGAGTTTA
ACTGTAAGGTTTACTATCATTTTAAAATAATCAATTTAATCAATTAAAAGACAAAAAATT
ATATTGAAAGATACAAAAAATAGAATTTAGCTTTTGTTCTTCTTCGAAGACGTATATAGA
GAGGAGACAATAAGAGTTGGATTTGTAAGG

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1A135TR 732 0 0
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GAGAAAATAAATCGTCGATCCTATTCTAAAACATAATTGTGAATATTGTCATTGAAATAT
GTATATATTTAGTTAAGAAAAGGTAAAACAGTTATGATCATCGTTGATTTGAGTTGTTAA
TTTCCGTAGCAATATGGACAAAGAATAGTCAAACTCCATGCACGTCAATGTTTTAGAGGA
AACACTTGAATCAAACTCAAACGATTGTTAAAAGAATTAAACAAATTTAAATAAAATGAC
TCATTTGCTTCTAGGTGGTGATCCATTATCTTGATTTGGAGATGAATCCATTTGTTAATA
AGAAAAAAGTCGAAGGAGAGACGCCGAATCAGTCAAGTGATCAAATACATGTATAAGTCT
AGTCCAATAAAACAAATTAAATTGTTAAAACGACATTGTTATCAGAAATAGTTTTGAGAA
CAACTAATCAAACCAAGTAATCAAGAGTTTAACTGTAAGGTTTACTATCATTTTAAAATA
ATCAATTTAATCAATTAAAAGACAAAAAATTATATTGAAAGATACAAAAAATAGAATTTA
GCTTTTGTTCTTCTTCGAAGACGTATATAGAGAGGAGACAATAAGAGTTGGATTTGTAAG
GTTTGGAGTTAGATTAAATGAAATTTGATAATCTTCAAAATCGTAAATTTCATGAATTAT
AAAACTAGCAAG

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

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AGACAGATGTGTTTGAGGTTCCTGTTGCGGTAGTGAAAGAAGAAGATGGGAAACTTGTTG
TGAAGGAAGATGAGATCAAGATGTTGAAAGCTAGACTATATGATATGGAGAAAGAACAGG
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BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AY39TF U 1
AF RS1A693TF U 1
BS 1 779 RS1A693TF

RD RS1AY39TF 663 0 0
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AGCTTCATCATGATAACAACAACAATTCTACAAAACCAAACCCTCTGGATGGAGTGGAGG
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TGTCTAAAGTGAAAGGTAACGAAGATGAGATGGCTTCAAAGGTGAGTCAGATAGGAGAAG
AGTTGGAACAAAGCAGAGCAAAGACAGCTCACCTAAAGGAGAAGCTTGAGTCCGTGGAAG
A
GC

QA 1 661 1 661
DS 

RD RS1A693TF 779 0 0
GCTCTACGTCTAACTCGAATCATCCCAACCGTCTGCTCAATACCGACCGGAGTTCTAAGC
TTGGTGCTGACCGTAAATCTCCTAGAAGCGGTGGTGGTGGGCCTCCTCCGCTTGGTCAGA
AGAAACTTGGGGGCCGAATATCGGATCTAGAGTCGCAGTTAGGGCAAGCGCAAGAGGAGC
TGAGACTGCTCAAAGAGCAGCTGGCTAATGCTGAAGCCGTGAAGAACCAAGCTCAAGATG
AGCTTCATCATGATAACAACAACAATTCTACAAAACCAAACCCTCTGGATGGAGTGGAGG
GTTCCGCTTCCGAGGCAGAAGCAGTTGATAGAGATGAAATCCCCGGTGATGTGGAGAACG
AGACAGATGTGTTTGAGGTTCCTGTTGCGGTAGTGAAAGAAGAAGATGGGAAACTTGTTG
TGAAGGAAGATGAGATCAAGATGTTGAAAGCTAGACTATATGATATGGAGAAAGAACAGG
AGTCACTAGGCAAAGAAAACGAGAGCTTAAAGAATCAGTTAAGTGATGCAGCTTCTGAGA
TGTCTAAAGTGAAAGGTAACGAAGATGAGATGGCTTCAAAGGTGAGTCAGATAGGAGAAG
AGTTGGAACAAAGCAGAGCAAAGACAGCTCACCTAAAGGAGAAGCTTGAGTCCGTGGAAG
AAGCAAAGGAAGCTTTAGAAGATGAGATGAAGAAGCTCAGAGTTCAAACCGAGCAGTGGA
GGAAGGCGGCAGATGCTGCAGCAGCTGTTCTCTCTGGAGAGTCGGAGATGAACAGTCAA

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

CO CL6472Contig1 607 2 4 U
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GTACTAAGTCTTATTCATAAAAATTTCACTACATTATCTATTAGTACCATCAAATAACTC
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TTCTTAGTAGCTCATGAAATACAGTATCCAAGACACACATCTCCCTTCTCTATGCATGAG
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GAGAAGTAGAACCAGCAACGGAGGCTGAGGAAGTTGAAGCCATAGCAGCGGCTGCGGCTT
GAGGAGAATAGATGCGAGCTTTGTTAATGATCTCAGCAACAACCCAATGCTTATTCTTGC
TCAACGGTCTCGAAGGACCTAACTTTACTCGATCGCCAATGTTGCAGGAGTCTTTCTCGT
CGTGAGCCATGAACTTGGAAGTGCGCTTGATGTAGCGGTTGTAGAGCTTGTTGTGGAACA
GTCTGTCCACGGCTACGACCACTGATTTCTGCATCTTGTTCGAGACCACTGTGCCTATCA
CTGGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 0 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FZ01JQ U 1
AF RS1DO17TF C 76
BS 1 303 RS1FZ01JQ
BS 304 304 RS1DO17TF
BS 305 308 RS1FZ01JQ
BS 309 607 RS1DO17TF

RD RS1FZ01JQ 313 0 0
GCAGAATAAAGAAGCATTACATCATCAAGGTTCACTCACTGTTTCATTCATGCACATATG
GTACTAAGTCTTATTCATAAAAATTTCACTACATTATCTATTAGTACCATCAAATAACTC
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TTCTTAGTAGCTCATGAAATACAGTATCCAAGACACACATCTCCCTTCTCTATGCATGAG
GACTCCTAACAAAAGTATCTCAATCATCTTAAGAAGAAAAGGATGGAGGAGCCTGAAACT
GAGCAGTA
AAATC

QA 1 308 1 308
DS 

RD RS1DO17TF 532 0 0
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AATAAACTTAGATCGAGAATAATGTTGATCGGTACAAAGCTGTCTTTCTTAGTAGCTCAT
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GACCTAACTTTACTCGATCGCCAATGTTGCAGGAGTCTTTCTCGTCGTGAGCCATGAACT
TGGAAGTGCGCTTGATGTAGCGGTTGTAGAGCTTGTTGTGGAACAGTCTGTCCACGGCTA
CGACCACTGATTTCTGCATCTTGTTCGAGACCACTGTGCCTATCACTGGCCC

QA 1 532 1 532
DS 



AS 1 2

CO CL6473Contig1 757 2 17 U
GGGTCTTCTCCATCACACTCCTCGTGCCTTCCTCCTCCAATGGAGTCACTCCTGCACGCG
TCCTCGTCTCTACTATCTCTCAGGCCCAGAATAGACGGCCGAGATTCGTTCATCAACTCT
CCCCGCGTGTGCCTCATACCTAGTCTCGCCCCCAGAGGATCAAAGTCTCTTCCTTTGGTC
ATCGCCGCCGCTAAGAAGAAGAAAAGCAAGAAAGACGACAGCCACAGCTTCTCCGCTAGA
CCTGACGAAGCCACCGGCCCGTTTCCTGAATCCATTCTTCTCAAAGAGAAGAAGATTGAT
GAGGAAGGTGATCTTCTTCCTGAGTTCGCTGATGATGAAGAAAAGGAGCTATACGAGTTT
CTTGATCTTCAGCTTCAGAGTGACTTGAATGAAGAAAGGATGAGGCACTATGAGGTGGTG
TACTTGATTCATGAGAAACATGCAGAGGAGGTTGAAAGCGTCAATGAGAAAGTTCAAGAG
TTCTTGAAGGAGAAGAAGGGGAAAGTGTGGAGGTTTAGTGACTGGGGGATGCGTAGACTG
GCGTATAAGATACAGAAGGCAGAGAACGCACACTATATACTGATGAACTTTGAGATGGAA
GCGAAACACTTGAACGAGTTCAAAGGAATATTGGATAGTGATGAGAGGGTGATCAGGCAT
CTCGTGATGAAACGTGATGAGGCCATTACGGAAGACTGCCCTCCCCCTCCCGAGTTTCAC
TCTGTTCGTGCAAGTATGGACGGGGATGATGACTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1DO63TF U 1
AF RS1EH23TF U 37
BS 1 419 RS1DO63TF
BS 420 420 RS1EH23TF
BS 421 629 RS1DO63TF
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BS 745 745 RS1EH23TF
BS 746 757 RS1DO63TF

RD RS1DO63TF 757 0 0
GGGTCTTCTCCATCACACTCCTCGTGCCTTCCTCCTCCAATGGAGTCACTCCTGCACGCG
TCCTCGTCTCTACTATCTCTCAGGCCCAGAATAGACGGCCGAGATTCGTTCATCAACTCT
CCCCGCGTGTGCCTCATACCTAGTCTCGCCCCCAGAGGATCAAAGTCTCTTCCTTTGGTC
ATCGCCGCCGCTAAGAAGAAGAAAAGCAAGAAAGACGACAGCCACAGCTTCTCCGCTAGA
CCTGACGAAGCCACCGGCCCGTTTCCTGAATCCATTCTTCTCAAAGAGAAGAAGATTGAT
GAGGAAGGTGATCTTCTTCCTGAGTTCGCTGATGATGAAGAAAAGGAGCTATACGAGTTT
CTTGATCTTCAGCTTCAGAGTGACTTGAATGAAGAAAGGATGAGGCACTATGAGGTGGTT
TACTTGATTCATGAGAAACATGCAGAGGAGGTTGAAAGCGTCAATGAGAAAGTTCAAGAG
TTCTTGAAGGAGAAGAAGGGGAAAGTGTGGAGGTTTAGTGACTGGGGGATGCGTAGACTG
GCGTATAAGATACAGAAGGCAGAGAACGCACACTATATACTGATGAACTTTGAGATGGAA
GCGAAACACTTGAACGAGTTCAAAGGAATGTTGGATAGTGATGAGAGGGTGATTAG*CAT
CTCGTGATGAAACGTGATGAGGC*ATTACGGA*GACTGCCCTCCCC*TCCCGAGTTTCAC
TCTGTTCGTGCAAGTATGGACGGG*ATGATGACTTTT

QA 1 757 1 757
DS 

RD RS1EH23TF 721 0 0
GG
AATGGAGTCACTCCTGCACGCGTCTTCGTCTCTACTATCTCTCAGGCCCAGAATAGACGG
CCGAGATTCGTTCATCAACTCTCCCCGCGTGTGCCTCATACCTAGTCTCGCCCCCAGAGG
ATCAAAGTCTCTTCCTTTGGTCGTCGCCGCCGCTAAGAAGAAGAAAAGCAAGAAAGACGA
CAGCCACAGCTTCTCCGCTAGACCTGACGAAGCCACCGGCCCGTTTCCTGAATCCATTCT
TCTCAAAGAGAAGAAGATTGATGAGGAAGGTGATCTTCTTCCTGAGTTCGCTGATGATGA
AGAAAAGGAGCTATACGAGTTTCTTGATCTTCAGCTTCAGAGTGACTTGAATGAAGAAAT
GATGAGGCACTATGAGGTGGTGTACTTGATTCATGAGAAATATGCAGAGGAGGTTGAAAG
CGTCAATGAGAAAGTTCAAGAGTTCTTGAAGGAGAAGAAGGGGAGAGTGTGGAGGTTTAG
TGACTGGGGGATGCGTAGACTGGCGTATAAGATACAGAAGGCAGAGAACGCACACTATAT
ACTGATGAACTTTGAGATGGAAGCGAAACACTTGAACGAGTTCAAAGGAATATTGGATAG
TGATGAGAGGGTGATCAGGCATCTCGTGATGAAACGTGATGAGGCCATTACGGAAGACTG
CCCTCCCCCTCCCGAGTTTCACTCTGTTCGTGCAAGTATGGATGGGGATGATGACTTTT

QA 3 721 3 721
DS 



AS 1 2

CO CL6474Contig1 778 2 7 U
GGACAGGGCGTAAATAAATAACCTCCATTTGCAGTCAAGTATACAAATATGAAAAGAGTG
TCTATGCAAAATCGCAAATGATTATCCATCAAATGGAAAAAGCTAAATATATTGTAGGAA
CAATCCTCTGTGTGTCCTCGAAACAAATAAAAACGAGAATTTGCAACAGTTTGAAGCTTT
CTAGAGGAGAGCTTCGATGTCAATCTCCACGAAAGCGCATGGATCAGTGATGTCAAAGTT
GATCAAAACCTCAGGATGCACGATTCCAAAGTTACCAACATGTTTCCCTTCGCAAATGAT
ACTGGCTTGTCTACCAGTTAAAAACTCAGGTTCTTCAAAGCGGTTTATATGGTATCCTAT
ATGGTATTCTATATCGGCACAGTCGGGTTTAAATGGGACTCCCATTACTTCCATGATTCT
ATCGACGAGGCCATGTATAAGCTCAAATCCAGAAGTAGCACCACAGTGTAGTGCAGCGAG
ATGGCGGCGATTGGATGCACCGACGTCTTTTGTTTCATCCAATAAGTTGACGTCACCTAC
TTCAAAAATCTTGATAGGTTTAGGGTGCTTATTGTTAGAACCAACTGTCTTCAGTATTCC
AGGCATTAGCCTCGTTCTTACAGCCTCGAAATCAGCACCCCGTGGGTTCCCAATAATAAC
ACCTGAATTGTCATCTTCTCTATTCAGTAATGCGAAGTTTTCCTTGTGTGAGCACAGTAT
CCATGTCAGAACCTCGGTGTACACATTCATCGCAATCTCTAATCTGAGAAGATCGCTG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EG24JQ U 1
AF RS1D189JQ U 1
BS 1 290 RS1D189JQ
BS 291 291 RS1EG24JQ
BS 292 321 RS1D189JQ
BS 322 322 RS1EG24JQ
BS 323 337 RS1D189JQ
BS 338 338 RS1EG24JQ
BS 339 778 RS1D189JQ

RD RS1EG24JQ 682 0 0
A
GACAGGGCGTAAATAAATAACCTCCATTTGCAGTCAAGTATACAAATATGAAAAGAGTGT
CTATGCAAAATCGCAAATGATTATCCATCAAATGGAAAAAGCTAAATATATTGTAGGAAC
AATCCTCTGTGTGTCCTCGAAACAAATAAAA*CGAGAATTTGCAACAGTTTGAAGCTTTC
TAGAGGAGAGCTTCGATGTCAATCTCCACGAAAGCGCATGGATCAGTGATGTCAAAGTTG
ATCAAAACCTCAGGATGCACGATTCCAAAGTTACCAACATGTTTCCCTTCGCAAATGATA
CTGGCTTGTCTACCAGTTAAAAACTCAGGTTCTTCAAAGCGGTTTATATGGTATCCTATA
TGGTATTCTATATCGGCACAGTCGGGTTTAAATGGGACTCCCATTACTTCCATGATTCTA
TCGACGAGGCCATGTATAAGCTCAAATCCAGAAGTAGCACCACAGTGTAGTGCAGCGAGG
TGGCGGCGATTGGATGCACCGACGTCTTTTGTTTCATCCAATAAGTTGACGTCACCTACT
TCAAAAATCTTGATAGGTTTAGGGTGCTTATTGTTAGAACCAACTGTCTTCAGTATTCCA
GGCATTAGCCTCGTTCTTACAGCCTCGAAATCAGCACCCCGTGGGTTCCCAATAATAACA
CCTGAATTGTCATCTTCTCTA

QA 2 682 2 682
DS 

RD RS1D189JQ 778 0 0
GGACAGGGCGTAAATAAATAACCTCCATTTGCAGTCAAGTATACAAATATGAAAAGAGTG
TCTATGCAAAATCGCAAATGATTATCCATCAAATGGAAAAAGCTAAATATATTGTAGGAA
CAATCCTCTGTGTGTCCTCGAAACAAATAAAAACGAGAATTTGCAACAGTTTGAAGCTTT
CTAGAGGAGAGCTTCGATGTCAATCTCCACGAAAGCGCATGGATCAGTGATGTCAAAGTT
GATCAAAACCTCAGGATGCACGATTCCAAAGTTACCAACATGTTTCCCTTTGCAAATGAT
ACTGGCTTGTCTACCAGTTAAGAACTCAGGTTCTTCAGAGCGGTTTATATGGTATCCTAT
ATGGTATTCTATATCGGCACAGTCGGGTTTAAATGGGACTCCCATTACTTCCATGATTCT
ATCGACGAGGCCATGTATAAGCTCAAATCCAGAAGTAGCACCACAGTGTAGTGCAGCGAG
ATGGCGGCGATTGGATGCACCGACGTCTTTTGTTTCATCCAATAAGTTGACGTCACCTAC
TTCAAAAATCTTGATAGGTTTAGGGTGCTTATTGTTAGAACCAACTGTCTTCAGTATTCC
AGGCATTAGCCTCGTTCTTACAGCCTCGAAATCAGCACCCCGTGGGTTCCCAATAATAAC
ACCTGAATTGTCATCTTCTCTATTCAGTAATGCGAAGTTTTCCTTGTGTGAGCACAGTAT
CCATGTCAGAACCTCGGTGTACACATTCATCGCAATCTCTAATCTGAGAAGATCGCTG

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 2

CO CL6475Contig1 798 2 1 U
GAAGTCTTCTTAATAGCCTCCTCTCTCTCTAGTTCTCTCTATATCTGAAAAAGAGTATCG
CTTATAGAACGATATGCGGAATAACGAAACCTCAGCGAGTGAGATTGCTGCTGCGAAGCA
GAAGAAAGTCGACGATTGGTTACCGATCACATCCTCAAGAAACGCCAAGTGGTGGTACTC
TGCGTTTCACAATGTCACTGCCATGGTTGGTGCTGGTGTACTCAGCTTGCCCTACGCCAT
GTCCAATCTCGGATGGGGACCTGGCGTGACGTTGATGATAATGTCATGGCTCATAACTTT
GTACACACTGTGGCAAATGGTGGAGATGCACGAGATGGTACCTGGGAAGAGGTTTGATAG
ATATCACGAGCTAGGCCAAGAAGCTTTTGGCGAAAAGCTTGGCCTTTGGATCATTGTGCC
TCAACAACTAATCGTGGAGGTCGGTGTAGACATCGTTTATATGGCCACCGGAGGTCAATC
TCTCAAGAAAGTCCATGAACTCCTCTGCTCTGATTGCAAAGACATCAAAACTACGTATTG
GATCATGATCTTTGCTTCTATCCACTTCGTTATCTCTCACCTACCAAACTTTAACTCCAT
CTCCGTCATCTCACTCGCAGCTGCCGTTATGTCCCTATCTTACTCAACTATTGCATGGAC
TGCATCAGTGCACAAAGGAGTTCGTCCAGATGTAGACTACTCGCCTAGAGCCTCGACACG
CCTGGAAATGTATTCAACTTCTTGAACGCGTTGGGAGATGTGGCTTTGCATACGCAGTCA
CAACGTTGTGCTGGAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CZ47TF U 10
AF RS1EJ90TF U 1
BS 1 798 RS1EJ90TF

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GCAC

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CTTATAGAACGATATGCGGAATAACGAAACCTCAGCGAGTGAGATTGCTGCTGCGAAGCA
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GTACACACTGTGGCAAATGGTGGAGATGCACGAGATGGTACCTGGGAAGAGGTTTGATAG
ATATCACGAGCTAGGCCAAGAAGCTTTTGGCGAAAAGCTTGGCCTTTGGATCATTGTGCC
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CTCCGTCATCTCACTCGCAGCTGCCGTTATGTCCCTATCTTACTCAACTATTGCATGGAC
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CCTGGAAATGTATTCAACTTCTTGAACGCGTTGGGAGATGTGGCTTTGCATACGCAGTCA
CAACGTTGTGCTGGAGAT

QA 1 798 1 798
DS 



AS 1 2

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TATGAACCTGGTGAATGTCATTATTTGAAAACGGGGAAAACTGTTTATATCTCGGATTTG
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TATTCTATTCAATAATATAGTAGTACAACATCCATATAACCTTGTTACTAAAGTCCTCCG
AATTATTGAACGAGAACTAAAGTTTAGTTCCCCGTACCACTAAAAGTAGTATACTATATC
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AAGGGGTTTAAGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ER65TF U 1
AF RS1ER65JQ C 49
BS 1 712 RS1ER65TF
BS 713 793 RS1ER65JQ

RD RS1ER65TF 712 0 0
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ATTTTCGGGTTAGGGTATAGTTTTATCATCTAAGTTGAGTTTCACTAACTCATCCTGAAT
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TATGAACCTGGTGAATGTCATTATTTGAAAACGGGGAAAACTGTTTATATCTCGGATTTG
GGTTGACATTTACAAGTTAGGGTTTAGTGTTATCATCTGGGTGAGAGTTTTACTAACTCA
CCCTCATTACTCTATTACTTGTATTAGTGATATGAACTCATCTATGTCGTAATGTCAGTC
TATTCTATTCAATAATATAGTAGTACAACATCCATATAACCTTGTTACTAAAGTCCTCCG
AATTATTGAACGAGAACTAAAGTTTAGTTCCCCGTACCACTAAAAGTAGTATACTATATC
TACTATGTAGTATAGTATTATGAACCTGGTGAATGTCATTATTTGAAAACGAAGAAAACT
GTTTATATCTCGGATGTGGGTTGACATTTCCAGGTTAGGGTTTAGTGTTATCATCTGGGT
GGGATTTCACTAACTCACTCTTGTATACTATTTTGTTTATATGGAATAGAACACTCTGAT
TTGACTGTGTGAAATATGAATAGTGTACAATAAATATTGGCCACATTTTATT

QA 1 712 1 712
DS 

RD RS1ER65JQ 745 0 0
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GTAGTATAGTATTATGAACCTGGTGAATGTCATTATTTGAAAACGGGGAAAACTGTTTAT
ATCTCGGATTTGGGTTGACATTTACAAGTTAGGGTTTAGTGTTATCATCTGGGTGAGAGT
TTTACTAACTCACCCTCATTACTCTATTACTTGTATTAGTGATATGAACTCATCTATGTC
GTAATGTCAGTCTATTCTATTCAATAATATAGTAGTACAACATCCATATAACCTTGTTAC
TAAAGTCCTCCGAATTATTGAACGAGAACTAAAGTTTAGTTCCCCGTACCACTAAAAGTA
GTATACTATATCTACTATGTAGTATAGTATTATGAACCTGGTGAATGTCATTATTTGAAA
ACGAAGAAAACTGTTTATATTTCGGATGTGGGTTGACATTTCCAGGTTAGGGTTTAGTGT
TATCATCTGGGTGGGATTTCACTAACTCACTCTTGTATACTATTTTGTTTATATGGAATA
GAACACTCTGATTTGACTGTGTGAAATATGAATAGTGTACAATAAATATTGGCCACATTT
TATTTTGATGACATCATACGTATGTGCTTAATTTACCATATATTATTTTGCTACATCATC
TCCAATAACACAAAGGGGTTTAAGC

QA 1 745 1 745
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6478Contig1 723 2 2 U
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TGGCGACGTCAGGAACATACGTGACGGAGGTTCCGTTGAAAGGGACGGTGGTGAAACATT
ACAAGAGGTGGAGGAGCGAGAACCATGCCTTCCCGGAAGCCATCGGCCACCACATCCAAA
ATGTCACCATTCACGACGACGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTTGGAACTACA
CATGCGATGGGAGGCCAGAGGTCTTCAAAGAAAGGAGAGAGATAGACGATGAGAAGAAAA
CAGTGACGTTTAGAGGACTTGAAGGTCACGTGATGGAACAGCTTAAGGTGTATGACGTCA
TCTTCGAGTTTATTCCCAAGTCGGAGGATGGCTGCGCCTACAAAGTTACTATGATATGGG
AGAAGCGCAAGGATGAGTGCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAATTCGTCAAGAGCATGA
TTGCTGACATGGACGACCACGTTCTCAAAGCTTAATCATCATCATTCATCATCATCATCA
TCATCATCATCACCACCATCATCATCACCGCCATTACGAAATACTTATTAAGATGCTTTT
CAATTCAATAAATGTGGTCTTGTGAAGTTTCATTTCTTTATAGGATCATGCTTTGATATG
TTCTTGTGGTCATAGACCGGTTTGATATGTTATCTTTTACTTATATGTTCTTGTTCACTT
ATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 

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TTCTTGT

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DS 

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ATGGACGACCACGTTCTCAAAGCTTAATCATCATCATTCATCATCATCATCATCATCATC
ATCACCACCATCATCATCACCGCCATTACGAAATACTTATTAAGATGCTTTTCAATTCAA
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AS 0 0

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BQ
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AF RS1DB02TF U 1
AF RS1DB02JQ C 78
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GTTTTGGGACACTGCTCCTCACTATGGTGGTACCAAAGAGATATGGGATGCACTTCGTGC
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GAAGGAGAACATGGAGAGACGGAGGAAAGAGGTAAGCCCGAACCAGGCATGTGGTACCCT
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DW45TF U 1
AF RS1DW45JQ C 110
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BS 584 770 RS1DW45JQ

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ATTTCTGATTTTAATTTCTAGGGATTTCAATTTGACAAAACTCTCATTTTGATTTTGTTT
CTCCAGAATAAGTTTTCCGAATTGGATGAGGTTAACAGGGAAACAGGAAGAGAAGTTACT
TACCTTTGTTTCAGCCTCAGAGACGTTGACACAGCATTTGAAAAGTGGAAACCAGAATAT
GAAGGAGAACATGGAGAGACGGAGGAAAGAGGTAAGCCCGAACCAGGCATGTGGTACCCT
ATATTAATGTGTTAATCTTCTTCCCCTGGACTTGCTTCTGACTTCTTGTGAAGTGTAAAA
TCATGGCTGTCTTGGTTCACATATATACCTGGGACTAGAGCGTCTGGAGTCTCAAAAGTG
CCTTGTGGAAGAAGAACAAAAGAGTAACTTCTTACGGTATAAGAAACGAGCCAACGAGAT
ATACAATATGGCAGAAGGATCGGAAGTCAACCAGTGGAAGGAA

QA 1 583 1 583
DS 

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AACCAGAATATGAAGGAGAACATGGAGAGACGGAGGAAAGAGGTAAGCCCGAACCAGGCA
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TCTCAAAAGTGCCTTGTGGAAGAAGAACAAAAGAGTAACTTCTTACGGTATAAGAAACGA
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TGCTCTTTGGCTGCTTAATTAACCATTACTTTCCGGCAAGAGGACAAGCCACGAACCATC
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CTTACACAGAGCCTTTGGTTGCAAGAGGAGTCAGATATCGATTGCAGCAGCAGTTATATA
C

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 2

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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AV18TF U 1
AF RS1FV33TF U 276
BS 1 489 RS1AV18TF
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RD RS1AV18TF 676 0 0
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GTTCACTCTGCGTTGATACCACTGTTATGGCCGGGGGAACCTAAGAAAATCGACTCCTCT
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CTCATGGCAACTGGTG

QA 1 676 1 676
DS 

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QA 1 476 1 476
DS 



AS 1 2

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C


BQ
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20 

AF RS1E220JQ C 1
AF RS1E220TF U 1
BS 1 661 RS1E220TF

RD RS1E220JQ 661 0 0
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TCTTCTTGTTGCTTTACTTTATACTACTATATTAATCTAAGAGATACTTATTATTATGAT
C

QA 1 661 1 661
DS 

RD RS1E220TF 661 0 0
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AATGGAGAGGAAAAAAGGAGGAGGAGGAGGGAGGGGGTTCAGGTGTCCCTCAGAGGAGGC
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CAGTATGTGGTGGGGGCATGCACGGTGACCATTCTCTACTTCCTGGTCCACCTCTGTCTA
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ACCCTTTCTTCTTTCTGCAATCACGTCGCCCTCTCCCTCCTCCTAGTCTTGCTCTCCTTC
ATCTTTCTCGCCTCCTCTTCCCTCTTTAATGTCCTTGTGCTCTCCACTCCCTAGTCTTTC
TCTTCTTGTTGCTTTACTTTATACTACTATATTAATCTAAGAGATACTTATTATTATGAT
C

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 2

CO CL6484Contig1 795 2 4 U
TGTCAATGGATAGACCATACCTAGATTTGAAGAGCAGAAACGAGAGTTTCAAGTCGTTTA
AGGAAGAAAGGACTTCTCATGTGCCCCAAGTTCCTGATTATCCAAATATGCAAACAAGAA
ACAATCAAAGCAATGAGAGAGTTTCATACTCGGGTCCGTTGGTGAGCAACGGGAAGATGG
GTAAGTCAACAATGTATGTGAAGGAGAATGCACCTCCTCCTAGATATCCTCCATCTAGAG
TAAACCCGAGGGTTTTGTCAGGCTCAGTCTCCTCCAAGGCGTTATTAGATCAGCCAGTTA
CTAATCAAAGAAGAAGGGATAGACGAGCGTACAATAGAGCTGATACTATGGATAGTAGAC
ATATGACGATACCAATCGACCCATCTTGGTATGATCCTAGTGATAGCAAGATTTACACGT
CCGGAAGACCGTTGTTGGAACAGCCAAGCAGAGTGGATCAGATGCTTGAGGAACATGACA
GACAGATCCAGTAATTTAATAGACAAACACAGAAGGCGCGAGAAGGCAAAACTGGCACAT
GATGTAAACGAATCATCAAACTAGACACTGGACTTTGTACTTGGAAGCTACAGTTGAGTA
AGGTTTAAGATCTGTCATTAGAATTTCTGTTGGTTCATATATTTGTGACTATACCATATG
TTAGTCACACTTGGCTTAAGCTGCCGATTGTTTGATTAGTTTTTTGTATTTAAGATGTGT
AATTATAGAGACTGATCTGTGTAAATTACATAGTGAGATTGTCCTTCACATATGATAAAA
AGATTTCCGAGTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AJ95TF U 1
AF RS1AJ95JQ C 28
BS 1 266 RS1AJ95TF
BS 267 267 RS1AJ95JQ
BS 268 692 RS1AJ95TF
BS 693 795 RS1AJ95JQ

RD RS1AJ95TF 692 0 0
TGTCAATGGATAGACCATACCTAGATTTGAAGAGCAGAAACGAGAGTTTCAAGTCGTTTA
AGGAAGAAAGGACTTCTCATGTGCCCCAAGTTCCTGATTATCCAAATATGCAAACAAGAA
ACAATCAAAGCAATGAGAGAGTTTCATACTCGGGTCCGTTGGTGAGCAACGGGAAGATGG
GTAAGTCAACAATGTATGTGAAGGAGAATGCACCTCCTCCTAGATATCCTCCATCTAGAG
TAAACCCGAGGGTTTTGTCAGGCTCATTCTCCTCCAAGGCGTTATTAGATCAGCCAGTTA
CTAATCAAAGAAGAAGGGATAGACGAGCGTACAATAGAGCTGATACTATGGATAGTAGAC
ATATGACGATACCAATCGACCCATCTTGGTATGATCCTAGTGATAGCAAGATTTACACGT
CCGGAAGACCGTTGTTGGAACAGCCAAGCAGAGTGGATCAGATGCTTGAGGAACATGACA
GACAGATCCAGTAATTTAATAGACAAACACAGAAGGCGCGAGAAGGCAAAACTGGCACAT
GATGTAAACGAATCATCAAACTAGACACTGGACTTTGTACTTGGAAGCTACAGTTGAGTA
AGGTTTAAGATCTGTCATTAGAATTTCTGTTGGTTCATATATTTGTGACTATACCATATG
TTAGTCACACTTGGCTTAAGCTGCCGATTGTT

QA 1 692 1 692
DS 

RD RS1AJ95JQ 768 0 0
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AAGTTCCTGATTATCCAAATATGCAAACAAGAAACAATCAAAGCAATGAGAGAGTTTCAT
ACTCGGGTCCGTTGGTGAGCAACGGGAAGATGGGTAAGTCAACAATGTATGTGAAGGAGA
ATGCACCTCCTCCTAGATATCCTCCATCTAGAGTAAACCCGAGGGTTTTGTCAGGCTCAG
TCTCCTCCAAGGCGTTATTAGATCAGCCAGTTACTAATCAAAGAAGAAGGGATAGACGAG
CGTACAATAGAGCTGATACTATGGATAGTAGACATATGACGATACCAATCGACCCATCTT
GGTATGATCCTAGTGATAGCAAGATTTACACGTCCGGAAGACCGTTGTTGGAACAGCCAA
GCAGAGTGGATCAGATGCTTGAGGAACATGACAGACAGATCCAGTAATTTAATAGACAAA
CACAGAAGGCGCGAGAAGGCAAAACTGGCACATGATGTAAACGAATCATCAAACTAGACA
CTGGACTTTGTACTTGGAAGCTACAGTTGAGTAAGGTTTAAGATCTGTCATTAGAATTTC
TGTTGGTTCATATATTTGTGACTATACCATATGTTAGTCACACTTGGCTTAAGCTGCCGA
TTGTTTGATTAGTTTTTTGTATTTAAGATGTGTAATTATAGAGACTGATCTGTGTAAATT
ACATAGTGAGATTGTCCTTCACATATGATAAAAAGATTTCCGAGTGCC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL6485Contig1 768 2 2 U
GACCGTAAACCATAACAGAGCTACCTAAATCCTAAACCCAAACTCTAAATCCTAAACCCA
AACTCTAAATATAAATTCTTAACCCAAACCGTAGACCCAAACGAAGCTACCTAAACCCTA
AATCTCCTTAAATTCAAATTCTAAACCCTAAACCCAAACTGTAAACCCCTTAACCCAAAC
CCTAAACCCAAATTGTAAAACCAAACCATCGCCCATAACGGAGCTATCTAAACCCTAATC
CTGAAGGTCTAAACCCAAATTGTAGACCCTAAACCTAAACCCAAACCGTACGTAGTTACT
ATATTGGTGAATGGGAAAAGGAGTAAAATGGAGAGATCAGGAGCTGCAAGGGAGGAGGAA
TGAGAAAAGATAAAAGTATGAAGTAAATGAAGGAGGAATGGAGAGAGAGGCAGAGAGAGA
CCGAGGAAGGGAGGGGAGGAGTTAAAGAATAGGAGGGAGTGTAAATGTGAAAGCGACATA
GGAAAAAGCTATACTATTTTGATAAATAGATTAGTATAATATAATGTAATGTTTATTCAA
ATATTGTATGAAAGTTACATAAACTGTTAATACAAACATGTATGTGAATTTTCATTAACT
TAGAGCATTCATTCAACACAATAGCAAAATAATATTCTTTATAAAACATGAAAGAAAGAG
AGAGAAGGAGAGAAGGAGGGAGGGAGGATGTATAATAACAAATCTATTCTATATTTCTTA
AATAGAATAGAATACATCAATCTATTATTTGAATAGAAAGTGTGAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DN01TF U 1
AF RS1DN01JQ C 8
BS 1 667 RS1DN01TF
BS 668 768 RS1DN01JQ

RD RS1DN01TF 672 0 0
GACCGTAAACCATAACAGAGCTACCTAAATCCTAAACCCAAACTCTAAATCCTAAACCCA
AACTCTAAATATAAATTCTTAACCCAAACCGTAGACCCAAACGAAGCTACCTAAACCCTA
AATCTCCTTAAATTCAAATTCTAAACCCTAAACCCAAACTGTAAACCCCTTAACCCAAAC
CCTAAACCCAAATTGTAAAACCAAACCATCGCCCATAACGGAGCTATCTAAACCCTAATC
CTGAAGGTCTAAACCCAAATTGTAGACCCTAAACCTAAACCCAAACCGTACGTAGTTACT
ATATTGGTGAATGGGAAAAGGAGTAAAATGGAGAGATCAGGAGCTGCAAGGGAGGAGGAA
TGAGAAAAGATAAAAGTATGAAGTAAATGAAGGAGGAATGGAGAGAGAGGCAGAGAGAGA
CCGAGGAAGGGAGGGGAGGAGTTAAAGAATAGGAGGGAGTGTAAATGTGAAAGCGACATA
GGAAAAAGCTATACTATTTTGATAAATAGATTAGTATAATATAATGTAATGTTTATTCAA
ATATTGTATGAAAGTTACATAAACTGTTAATACAAACATGTATGTGAATTTTCATTAACT
TAGAGCATTCATTCAACACAATAGCAAAATAATATTCTTTATAAAACATGAAAGAAAGAG
AGAGAAG
AGAGA

QA 1 667 1 667
DS 

RD RS1DN01JQ 761 0 0
AACCATAACAGAGCTACCTAAATCCTAAACCCAAACTCTAAATCCTAAACCCAAACTCTA
AATATAAATTCTTAACCCAAACCGTAGACCCAAACGAAGCTACCTAAACCCTAAATCTCC
TTAAATTCAAATTCTAAACCCTAAACCCAAACTGTAAACCCCTTAACCCAAACCCTAAAC
CCAAATTGTAAAACCAAACCATCGCCCATAACGGAGCTATCTAAACCCTAATCCTGAAGG
TCTAAACCCAAATTGTAGACCCTAAACCTAAACCCAAACCGTACGTAGTTACTATATTGG
TGAATGGGAAAAGGAGTAAAATGGAGAGATCAGGAGCTGCAAGGGAGGAGGAATGAGAAA
AGATAAAAGTATGAAGTAAATGAAGGAGGAATGGAGAGAGAGGCAGAGAGAGACCGAGGA
AGGGAGGGGAGGAGTTAAAGAATAGGAGGGAGTGTAAATGTGAAAGCGACATAGGAAAAA
GCTATACTATTTTGATAAATAGATTAGTATAATATAATGTAATGTTTATTCAAATATTGT
ATGAAAGTTACATAAACTGTTAATACAAACATGTATGTGAATTTTCATTAACTTAGAGCA
TTCATTCAACACAATAGCAAAATAATATTCTTTATAAAACATGAAAGAAAGAGAGAGAAG
GAGAGAAGGAGGGAGGGAGGATGTATAATAACAAATCTATTCTATATTTCTTAAATAGAA
TAGAATACATCAATCTATTATTTGAATAGAAAGTGTGAGAG

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL6486Contig1 719 2 4 U
TTTTTATTCGACCCGTAAGCTCGCCGGAGGAGGTGAAATCTTGTATAGATGGCGCAGAGA
ACGGAGAAGGAAGATACGGAGTTCAAGGTCCTCGAAACCTTGACGACCACCACCACGACG
CTCTGCTCCAATAACTGCGGCGTTACGGCCAATCCAGCGACCAACAACATGTGTCAGAAA
TGTTTCAACGCCTCCATCGCCGCCGCCGGTGTAGATTCCCCTTCGATCTCGAAGAGAACG
CCGAGATCCGTCAATCTTAGGCCCACCACACCAGCCAGAGTCGTGATCCGTCCCAGGGAG
ATCGATCCGGTTAAAAGAGATCAGCAGACGGTAAACCGATGTTCTGGCTGTCGGAAGAAG
GTGGGGTTGACCGGATTCAGGTGCCGGTGCGGCGACCTTTTCTGCTCCGAGCACCGTTAC
TCGGATCGACACGATTGCAGCTACGACTATAAAACAGCAGGTCGCGAGGCGATCGCTAGA
GAAAACCCGGTCGTCAAGGCGGCGAAGATGGTTAAAGTTTAAAAAAGTTAAAAAAAATTC
AAATTTGAAAAAAACAAAAAACAATCTTCAATCGTGGTTCAAAGCTTCCGATCTGTAAAA
TTCGGACAGGGATAGATGCTCGCAGACATTGATTTGATGCAGTCTGTTTTGTAATGAAAA
ATATCAGAGAGATTCTCTTCTCGATTTGAATTTGGAACTAAATTTAATTATTTTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GL01TF U 1
AF RS1GL01JQ C 29
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AAATTTGAAAAAA*CAAAAAACAATCTTCAATCGTGGTTCAAAGCTTCCGATCTGTAAAA
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ATATCAGAGAGATTCTCTTCTCGATTTGAATTTG

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DS 

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AATTTGGAACTAAATTTAATTATTTTTTACC

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

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T


BQ
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10 

AF RS1DV42TF U 1
AF RS1DV42JQ C 98
BS 1 728 RS1DV42TF
BS 729 729 RS1DV42JQ
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BS 758 781 RS1DV42JQ

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GCAAACATACACATTCCTGGTCTCATCACCTATGTCCTTAAACAATAAATTTATAATAAC
TATGTGCTTGAATACTAGTAAAATCGTATTGTGATGAAGTATTGAAAGGAGTTCGAAACT
CGTGTGTA*TATGTTTATAGACCAACGCATTGTATGA
TATGATATATGTC

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DS 

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AAGGAGATAAATACAACGACCTTAGCCGCAAACTCAAGCTAGCTATGCGTCTCGTTGAGC
TTTACGAGCCTTACTTACTCTTCAAGGGCATATTTGATGATTTAAATACCGAAAGACTGC
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CCATCAACTGGGACGATTATATCGCAAACATACACATTCCTGGTCTCATCACCTATGTCC
TTAAACAATAAATTTATAATAACTATGTGCTTGAATACTAGTAAAATCGTATTGTGATGA
AGTATTGAAAGGAGTTCGAAACTCGTGTGTAATATGTTTATAGACCAACGCATTGTATGA
ATATGATTATATGTCACTATAACT

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

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ATCGTCTTCTCAACAACAAAGAAGAGATCTGCCTCCTCCATTTCTCCGCCGCAGCCGTAA
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BQ
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AF RS1GB60TF U 36
AF RS1GQ52TF U 1
BS 1 237 RS1GQ52TF
BS 238 238 RS1GB60TF
BS 239 389 RS1GQ52TF
BS 390 390 RS1GB60TF
BS 391 452 RS1GQ52TF
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BS 454 515 RS1GQ52TF
BS 516 516 RS1GB60TF
BS 517 768 RS1GQ52TF

RD RS1GB60TF 487 0 0
GGACCAATGAGAG
CTTCCTCCCCTCATCGTCTTCTCAACAACAAAGAAGAGATCTGCCTCCTCCATTTCTCCG
CCGCAGCCGTAACTAACCGATAAACACATGGGAGAAAACACTAACCGCTCCGAAGCCGAG
CGCCTCCTCGGAATCTCCGAAAAGCTCCTCGAATCCCGAGATCTAAACGGCTCAAAAGAG
TTCGCCATCCTAGCACAGGAGACCGAGCCTCTCCTCGAAGGCACCGACCAAATCCTCGCC
GTCGTCGACGTCCTCCTCGCCTCCTCCTCGGAGAATCGCATCAACAGCAACCAGCCGAAC
TGGTACAAGATCCTCCAGATCGAGGACCCGAACCAGTCCCCCGCCGACTCCGATCTGATC
AAGAAACAGTACCGCCGCCTCGCGCTCCTCCTCCACCCGGACAAAAACCGCCTCCCTTAC
GCCGATCAGGCGTTCCGCCTCGTGGCCGACGCGTGGGAGGTGCTGTCGACGGCG

QA 14 487 14 487
DS 

RD RS1GQ52TF 768 0 0
GGATTTAACCCACAAGAACCAATCCACCAATGAGAGCTTCCTTCCTTCCTTCCTCCCCTC
ATCGTCTTCTCAACAACAAAGAAGAGATCTGCCTCCTCCATTTCTCCGCCGCAGCCGTAA
CTAACCGATAAACACATGGGAGAAAACACTAACCGCTCCGAAGCCGAGCGCCTCCTCGGA
ATCTCCGAAAAGCTCCTCGAATCCCGAGATCTAAACGGCTCAAAAGAGTTCGCCATCTTA
GCACAAGAAACCGAACCCCTCCTCGAAGGCACCGACCAAATCCTCGCCGTCGTCGACGTC
CTCCTCGCCTCCTCCTCGGAGAATCGCATCAACAGCAACCAGCCGAACTGGTACAAGATC
CTCCAGATCGAGGACCCGAACCAGTCCCCGGCCGACTCCGATCTGATCAAGAAACAGTAC
CGCCGCCTCGCGCTCCTCCTCCACCCGGACAAGAACCGCCTCCCTTACGCCGACCAGGCG
TTCCGCCTCGTGGCCGACGCGTGGGAGGTGCTGTCTACGGCGTCGAAGAAGTCGCAGTTC
GATAGTCTCGTCTTCACGAAGGTGGATCTGAATAAGAACAAGAAAGGAGGGACGAGGACG
AGCGAGAGGATGAGCACGTTTTGGACGGTGTGTCCTTACTGCTACGCGCTTCACGAGTAC
CCTAGGGTTATCAGAGTATTGTATTCGTTGCCAGAACTGCCACGCGCGTTCACGCCGCGA
GTGTCCTCAGTTGCTCCTTTGGTGCTGGGAGGACGAGTATATGCTGTT

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL6489Contig1 322 2 1 U
GGGCAACGAGCTGATAAATAATCTCACTGCAAGATCACTGCAAGATCACGAGTCGAAGCA
TCCCAAATTGCCTTACGAGGAGCCGAAGAATCTCCACGAGGCTCTTGCTGCTCCTGCCGA
ATCGTCCAAACCTAAACCTGGAATCAGAGGAAGCCTCAAGAAGTGATCATGATGTGATTG
TTTTCTATCGAATTCTCCCTTTTTATAATATAAAGTTTATCATCTTTTATGATGGGGTTT
TCTTCAAGTTGTTGCTCTGATAAAGTATGAAAAAACTGCAATGATGTTTTGCTATTATAT
AAAAGAAAATGGTATCTATTAT


BQ
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AF RS1CC84JQ C 1
AF RS1CC84TF U 1
BS 1 322 RS1CC84TF

RD RS1CC84JQ 322 0 0
GGGCAACGAGCTGATAAATAATCTCACTGCAAGATCACTGCAAGATCACGAGTCGAAGCA
TCCCAAATTGCCTTACGAGGAGCCGAAGAATCTCCACGAGGCTCTTGCTGCTCCTGCCGA
ATCGTCCAAACCTAAACCTGGAATCAGAGGAAGCCTCAAGAAGTGATCATGATGTGATTG
TTTTCTATCGAATTCTCCCTTTTTATAATATAAAGTTTATCATCTTTTATGATGGGGTTT
TCTTCAAGTTGTTGCTCTGATAAAGTATGAAAAAACTGCAATGATGTTTTGCTATTATAT
AAAAGAAAATGGTATCTATTAT

QA 1 322 1 322
DS 

RD RS1CC84TF 322 0 0
GGGCAACGAGCTGATAAATAATCTCACTGCAAGATCACTGCAAGATCACGAGTCGAAGCA
TCCCAAATTGCCTTACGAGGAGCCGAAGAATCTCCACGAGGCTCTTGCTGCTCCTGCCGA
ATCGTCCAAACCTAAACCTGGAATCAGAGGAAGCCTCAAGAAGTGATCATGATGTGATTG
TTTTCTATCGAATTCTCCCTTTTTATAATATAAAGTTTATCATCTTTTATGATGGGGTTT
TCTTCAAGTTGTTGCTCTGATAAAGTATGAAAAAACTGCAATGATGTTTTGCTATTATAT
AAAAGAAAATGGTATCTATTAT

QA 1 322 1 322
DS 



AS 1 2

CO CL6490Contig1 758 2 2 U
GATATGGGTAAACCAATGTTCAAATAAGAAGGCTTCACATCATCATATCTACACAATATT
ACACAAACACATCACTGAAACAGAGGAGCTCTGTTTTCACAAAGCCATGTTAAGCTCAAC
CAAAACCTTTCTTTCTTCAACACATCTCATCTCCCTCCCAGTTATCCTTCTCCTTTGGCC
CCGTAGGACCTTCCTCTCCATAAAGCGCAATAGGAAACAGATTCTCAATAGAGTACCTCA
CAATCAAAGGCAAAAGATTAATGATCTTATCAATCTCAGCTGCAGAATCATACACTATAG
TTGGTCCCCACTCTCTCATATACTGCAGCCAGCACGGCTCCGAAACCACTCCTTCCCCTA
AATACTCAGCCGCCACGACTCTATACCTCTCACTAGAATCCACCACAAACTCGCTCTTCC
CAACATCGTTTCTCACTCCAATCCCAAGCTTGGACGAGCCTTGAAGATACATCCCCGGGT
GTGGGAAACTCGCGTGTCCGTGTTTAGACGAGTACACAACCGGTTTATTACTTCCTTTGA
CAAACTCAAGATCAGACACATCAACCCACCCGCCACCGCTATGCTGCGAGAAGAACATCT
GAGTCAGCTCGCCGTTGAAGTTGCTTATCCGGAACGTGAAATGCTCCCAGTCACCAACAT
GTTCTCCTATACGGTTCATTGGTACGGTGAGAAGACCGATCTTGAGCGTGGCGGGACCGT
TGAAGGGACAGAAGATCCACATGACAACGTCTGTGAAG


BQ
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AF RS1DE26JQ U 1
AF RS1BM07JQ U 18
BS 1 682 RS1DE26JQ
BS 683 758 RS1BM07JQ

RD RS1DE26JQ 682 0 0
GATATGGGTAAACCAATGTTCAAATAAGAAGGCTTCACATCATCATATCTACACAATATT
ACACAAACACATCACTGAAACAGAGGAGCTCTGTTTTCACAAAGCCATGTTAAGCTCAAC
CAAAACCTTTCTTTCTTCAACACATCTCATCTCCCTCCCAGTTATCCTTCTCCTTTGGCC
CCGTAGGACCTTCCTCTCCATAAAGCGCAATAGGAAACAGATTCTCAATAGAGTACCTCA
CAATCAAAGGCAAAAGATTAATGATCTTATCAATCTCAGCTGCAGAATCATACACTATAG
TTGGTCCCCACTCTCTCATATACTGCAGCCAGCACGGCTCCGAAACCACTCCTTCCCCTA
AATACTCAGCCGCCACGACTCTATACCTCTCACTAGAATCCACCACAAACTCGCTCTTCC
CAACATCGTTTCTCACTCCAATCCCAAGCTTGGACGAGCCTTGAAGATACATCCCCGGGT
GTGGGAAACTCGCGTGTCCGTGTTTAGACGAGTACACAACCGGTTTATTACTTCCTTTGA
CAAACTCAAGATCAGACACATCAACCCACCCGCCACCGCTATGCTGCGAGAAGAACATCT
GAGTCAGCTCGCCGTTGAAGTTGCTTATCCGGAACGTGAAATGCTCCCAGTCACCAACAT
GTTCTCCTATACGGTTCATTGG

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1BM07JQ 741 0 0
GC
TCAAATAAGAAGGCTTCACATCATCATATCTACACAATATTACACAAACACATCACTGAA
ACAGAGGAGCTCTGTTTTCACAAAGCCATGTTAAGCTCAACCAAAACCTTTCTTTCTTCA
ACACATCTCATCTCCCTCCCAGTTATCCTTCTCCTTTGGCCCCGTAGGACCTTCCTCTCC
ATAAAGCGCAATAGGAAACAGATTCTCAATAGAGTACCTCACAATCAAAGGCAAAAGATT
AATGATCTTATCAATCTCAGCTGCAGAATCATACACTATAGTTGGTCCCCACTCTCTCAT
ATACTGCAGCCAGCACGGCTCCGAAACCACTCCTTCCCCTAAATACTCAGCCGCCACGAC
TCTATACCTCTCACTAGAATCCACCACAAACTCGCTCTTCCCAACATCGTTTCTCACTCC
AATCCCAAGCTTGGACGAGCCTTGAAGATACATCCCCGGGTGTGGGAAACTCGCGTGTCC
GTGTTTAGACGAGTACACAACCGGTTTATTACTTCCTTTGACAAACTCAAGATCAGACAC
ATCAACCCACCCGCCACCGCTATGCTGCGAGAAGAACATCTGAGTCAGCTCGCCGTTGAA
GTTGCTTATCCGGAACGTGAAATGTTCCCAGTCACCAACATGTTCTCCTATACGGTTCAT
TGGTACGGTGAGAAGACCGATCTTGAGCGTGGCGGGACCGTTGAAGGGACAGAAGATCCA
CATGACAACGTCTGTGAAG

QA 3 741 3 741
DS 



AS 1 2

CO CL6491Contig1 805 2 2 U
GGAACCTCAGACACAGTTCTCATCTTCTCAGAGCGAGCAAAAAAATGGAAGTCGCTCTTC
TTTCATTTTCGTCTTCCTTGTCTCCCCTCTGCCACAACCGAGCCTCAACCACACTAACCC
CCAAACCCTCGAACCACCCTCGCCTCCCGGTCATCAGATCCGCCGTGTCACGCTCCAAGA
AGGAAGAAACCGTGGAGACAGTCAAGTCCCATCTCGAGAACTGCCACCTCCTCGCAGCCA
TCAACTACAAAGGCCTAACCGTCAAGCAGTTCCAAGACCTCCGGAGAACCCTCCCTGACA
CCACGAAGCTCGTCGTCGCCAAGAACACCCTCGTCTTCAAGGCCATCGAAGGCACCAAGT
GGGAAGCCCTCAAGCCCTGTATGAAAGGCATGAACGCCTGGCTCTTCGTCCAGACCGGCG
AGATCCCTTCCGCCATCCAACCGTACCGGAGTTTCCAGAAGGAGCGCAAGCTCGAGGACA
ATGACTTCGCTGGCGCTGTGTTTGAAGGTAAGTTCTACGCTCCTGGTGATTTCAAGTCCC
TCGAGACGATGCCTACGAGAGCTGAGGTTTACGCTAAGTTGCTCGGAGCTCTGCAGAGTC
CGGCGATTAATCTCGTATCTACTTTGCAAGCGCCGGCGATTGGGTTATCATGGTGCTTAA
GGCTTATGTCAAGAAGCTTGAAGATGAGAGTAACAATGTGTAATTAGTTTTTAAAGGAAG
CTGTACTCAAAGCACTTGTTTATGACTCGAACAGAGCAATTGTTTATTACAGTCATTTGG
TTTTTTATTGAAATGTTTTTTTTTT


BQ
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AF RS1AR50TFB U 1
AF RS1AR50JQ C 1
BS 1 659 RS1AR50TFB
BS 660 805 RS1AR50JQ

RD RS1AR50TFB 659 0 0
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QA 1 659 1 659
DS 

RD RS1AR50JQ 805 0 0
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CCAAACCCTCGAACCACCCTCGCCTCCCGGTCATCAGATCCGCCGTGTCACGCTCCAAGA
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TCAACTACAAAGGCCTAACCGTCAAGCAGTTCCAAGACCTCCGGAGAACCCTCCCTGACA
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GGGAAGCCCTCAAGCCCTGTATGAAAGGCATGAACGCCTGGCTCTTCGTCCAGACCGGCG
AGATCCCTTCCGCCATCCAACCGTACCGGAGTTTCCAGAAGGAGCGCAAGCTCGAGGACA
ATGACTTCGCTGGCGCTGTGTTTGAAGGTAAGTTCTACGCTCCTGGTGATTTCAAGTCCC
TCGAGACGATGCCTACGAGAGCTGAGGTTTACGCTAAGTTGCTCGGAGCTCTGCAGAGTC
CGGCGATTAATCTCGTATCTACTTTGCAAGCGCCGGCGATTGGGTTATCATGGTGCTTAA
GGCTTATGTCAAGAAGCTTGAAGATGAGAGTAACAATGTGTAATTAGTTTTTAAAGGAAG
CTGTACTCAAAGCACTTGTTTATGACTCGAACAGAGCAATTGTTTATTACAGTCATTTGG
TTTTTTATTGAAATGTTTTTTTTTT

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 2

CO CL6492Contig1 886 2 2 U
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CCATTTATTCAACGTACCATAAGCATCAATGGAAGCCCCATGGTAGATGACAGAGAAGAG
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TTTCATGTATTGTGACAATGTTCCACAAAAATATGCTCATTTATTC


BQ
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AF RS1AS71TF U 1
AF RS1AS71JQ C 70
BS 1 728 RS1AS71TF
BS 729 886 RS1AS71JQ

RD RS1AS71TF 728 0 0
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TGCGTAAGGAGGTTTCCGCGATAAGGAAAAGAGTCGATGCTATTAATCGAGAACTCAAGC
CATTAGGACAGAGTTGTCAAAGGAAGGTAATGAATGCATGTGTGTTTAAGATGTTCATCA
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TTCAAAGAAGCACTTGAAGCATACAACGAAAAGAACAAAGAGAAAGCTATGTACATTAGC
AAGCTAGTTGAGCTTGTTACTGAAAGCGAAAAACTGCGAATGACAAAGCTTGATGAACTC
AGCAAAGGCATTGACGTTTCCTTACGCTAACACAAGATGATCATCAGCCAGCTTTGCTTA
TTTCATTT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1AS71JQ 817 0 0
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GAGATTCGGGAAGTGAGTTTGGTTTTAACATTTTCAAGAACTTAGCCATCAGTTTTAGAG
AGCTGTGGTTGTCAGAAAAATTTCAGGAGCTGGAAGCTCTTACCGATCCAATGCGTAAGG
AGGTTTCCGCGATAAGGAAAAGAGTCGATGCTATTAATCGAGAACTCAAGCCATTAGGAC
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GCACTTGAAGCATACAACGAAAAGAACAAAGAGAAAGCTATGTACATTAGCAAGCTAGTT
GAGCTTGTTACTGAAAGCGAAAAACTGCGAATGACAAAGCTTGATGAACTCAGCAAAGGC
ATTGACGTTTCCTTACGCTAACACAAGATGATCATCAGCCAGCTTTGCTTATTTCATTTG
CACCTCTTTTTAATTGTTTGATTTCGATATTGCTTGTCTTTGTGATCAAATCTGATTTCC
TGATTTAGTTGAAATGTGTTAAGGCTTCGGTATGAATTTACATTCTTATGTTTTCATGTA
TTGTGACAATGTTCCACAAAAATATGCTCATTTATTC

QA 1 817 1 817
DS 



AS 1 2

CO CL6493Contig1 698 2 2 U
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AAAAATAGTTAAAGTTCAAAGCTCATACATGTTTCTCCTCGTTAAACAAGCGATGTTGCT
TCACATCATGAAGTAGAATCACTGGCTGGTAATGATGTTTCTACGTGCTCAGATACATCT
TAAGAGTTCCATATCTTTAGAACCGAGAATTTGGGACCGAAGCTAGTAGCATATTTTTGT
TGTGCTTCATTTCATTACAAGGGGTAGTTATCCTAATTTACAGAGGTCAAACATTCTCAA
TTTTATTTGTTTAGCCCAATTTCACCTTTTTAATCTTT


BQ
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AF RS1A438JQ C 1
AF RS1A438TF U 31
BS 1 30 RS1A438JQ
BS 31 698 RS1A438TF

RD RS1A438JQ 698 0 0
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TTT*ATTTGTTTAGCCCAATTTCACCTTTTTAATCTTT

QA 1 698 1 698
DS 

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AATGATGTTTCTACGTGCTCAGATACATCTTAAGAGTTCCATATCTTTAGAACCGAGAAT
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TAATCTTT

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1EF25JQ C 1
AF RS1AJ41TF U 131
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RD RS1EF25JQ 809 0 0
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QA 1 809 1 809
DS 

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G
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C

QA 2 676 2 676
DS 



AS 1 2

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ATACTATCATTTAATTCC


BQ
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AF RS1H384TF U 1
AF RS1H384JQB C 425
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BS 600 978 RS1H384JQB

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QA 1 554 1 554
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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AF RS1AH83JQ C 1
AF RS1AH83TF U 1
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BS 667 690 RS1AH83JQ

RD RS1AH83JQ 690 0 0
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TCTATGTTAAAAAATGTGTTCTTACTTTTTAATCTAAACATATAATTCAATAAGAAACAA
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TATTGTTTGTTTGTAATTTTATTGAAGTGATCCCTATAATAATTGACTAGTTTAAGCTTT
TATTGTAAAATTTCAAGGAAGTAAAAGGAT

QA 1 690 1 690
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RD RS1AH83TF 666 0 0
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AATTTTGTTTCTTCTTCTCCAAGAAACGAACCACAGATTGATTGAGACTTCCTTTAAGAC
ACCATGGACAAAGTTGTGAGAATGTCTTCGGAGAAAGGAGTTGTTATATTCAGCAAGAGC
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GTCCATGAGATAGACAAGGACCCTGATTCGTGAGATAGAGAAATCCCTAATGAGGCTCGG
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TCTATGTTAAAAAATGTGTTCTTACTTTTTAATCTAAACATATAATTCAATAAGAAACAA
TCTAAAACACAATCTTATAGCCGATGCAAGCATGCAACCTTTGTAATATAACTTTATAAA
TATTGTTTGTTTGTAATTTTATTGAAGTGATCCCTATAATAATTGACTAGTTTAAGCTTT
TATTGT

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

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ATGTTTAGCATATGCATTATATCTTTACTACTACGTTAATAAACCTCATTCTGTGTCACA
AACTATTACATTGGAGGATGTATAAAACTTGAGATCAACAAACGTCGCGCATGGTTTGCA
AATAATCAAAGGCTTACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FY19TF U 1
AF RS1FY19JQ C 1
BS 1 658 RS1FY19TF
BS 659 678 RS1FY19JQ

RD RS1FY19TF 658 0 0
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CATGGCTTCCCTCCCAACTATGCTTCAAGAAGAGGTATTGCATCTTAGACGCCAACTTCA
GCTGCTAAAAAGATGCCAAGAGAACAAGGAGGAAGAGGATTTCGCTGCACCTGCCTTTTG
ATTCAGCTACCCAGATCTTAACGCCTCTCTCTTCACCAATTGAATCCCAGTTTCTCAAAC
CTAAAATACCCTATAATTAATTATTAGAGTGTCTTTTATTCTATTTATGATGCCAGCTCT
ATGTTTAGCATATGCATTATATCTTTACTACTACGTTAATAAACCTCATTCTGTGTCACA
AACTATTACATTGGAGGATGTATAAAACTTGAGATCAACAAACGTCGCGCATGGTTTG

QA 1 658 1 658
DS 

RD RS1FY19JQ 678 0 0
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TGTCAAAGGTCCTGGCGAGGCAGCAGGCACCGTTGTGACTGGAGTTGTGGTGCGTGACGG
GAGCGAACAAAATGTTGATCTGCTGGTGCCATCAACCCAAACTGACTGTGAATGTGGTCC
AGAGGCAAATTATCCTGCAGGAAACGATGTTTTCACTGTACTTCTGTTGGCATTACCTCC
ACAGACATGGTCAGGGGTCAAAGACCAAGCTCTTATGCAAGAAATGAAGCAGCTCATTTC
CATGGCTTCCCTCCCAACTATGCTTCAAGAAGAGGTATTGCATCTTAGACGCCAACTTCA
GCTGCTAAAAAGATGCCAAGAGAACAAGGAGGAAGAGGATTTCGCTGCACCTGCCTTTTG
ATTCAGCTACCCAGATCTTAACGCCTCTCTCTTCACCAATTGAATCCCAGTTTCTCAAAC
CTAAAATACCCTATAATTAATTATTAGAGTGTCTTTTATTCTATTTATGATGCCAGCTCT
ATGTTTAGCATATGCATTATATCTTTACTACTACGTTAATAAACCTCATTCTGTGTCACA
AACTATTACATTGGAGGATGTATAAAACTTGAGATCAACAAACGTCGCGCATGGTTTGCA
AATAATCAAAGGCTTACC

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 2

CO CL6499Contig1 748 2 4 U
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CATATCATGTTGGAATCCATCATCTGTTTCTTATCATCAATCTTCCTTCTTACCGACAAC
AGAAATCTGAAGACGTTACGGAATTTGGCTGATTTCAAGCGTCATCTTGGAACCGTCATC
TTTAAAGCACTCATTAACAATCCCTCCTCAATTACTTCCTTTCTGTGCATCCTTGACTAT
AAATAGGCGACCCTTATGCAAGCCATTGTCACCGTCACCGTCAAGCGGACAGTTCAGAAT
CGTCAGCTGCAGATTTGGTCATTAAGGCGTTGAAAGAGCCGAAGAGAGACCGTAAAAATA
GTTAAGAACGTTACGCACAAGACTACTAGAGATATTCAAGAAGGTGAGATCAGTATTCAT
GGTTACCAAGGTGAAAAACGCACCCAGAAAAAAAGATTTTATGGGAGTTGAAAAGATGAT
ATCTTCTCTTCTTTCATTTTTATATAGGGTGAGCTGTTAAGTTTCTTCACTCACAATGAC
TCAATTTTTTATTACGGTTGTATTGCGTTCCTTCTGCTTAACAATACCGATCGAAAGTTA
TATAGATTTCTTTTATAGCATTGTTTTTCTCTTGCTCTCACATTTAAGCCTTCTCCCGTA
ATGATGCTACTAATTTCTTTCTCCAGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CG14TF U 1
AF RS1AW63TF U 86
BS 1 405 RS1CG14TF
BS 406 406 RS1AW63TF
BS 407 614 RS1CG14TF
BS 615 748 RS1AW63TF

RD RS1CG14TF 614 0 0
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CATATCATGTTGGAATCCATCATCTGTTTCTTATCATCAATCTTCCTTCTTACCGACAAC
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TTTAAAGCACTCATTAACAATCCCTCCTCAATTACTTCCTTTCTGTGCATCCTTGACTAT
AAATAGGCGACCCTTATGCAAGCCATTGTCACCGTCACCGTCAAGCGGACAGTTCAGAAT
CGTCAGCTGCAGATTTGGTCATTAAGGCGTTGAAAGAGCCGAAGATAGACCGTAAAAATA
GTTAAGAACGTTACGCACAAGACTACTAGAGATATTCAAGAAGGTGAGATCAGTATTCAT
GGTTACCAAGGTGAAAAACGCACCCAGAAAAAAAGATTTTATGGGAGTTGAAAAGATGAT
ATCTTCTCTTCTTTCATTTTTATATAGGGTGAGCTGTTAAGTTTCTTCACTCACAATGAC
TCAATTTTTTATTA

QA 1 614 1 614
DS 

RD RS1AW63TF 663 0 0
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GTTTCTTATCATCAATCTTCCTTCTTACCGACAACAGAAATCTGAAGACGTTACGGAATT
TGGCTGATTTCAAGCGTCATCTTGGAACCGTCATCTTTAAAGCACTCATTAACAATCCCT
CCTCAATTACTTCCTTTCTGTGCATCCTTGACTATAAATATGCGACCCTTATGCAAGCCA
TTGTCACCGTCACCGTCAAGCGGACAGTTCAGAATCGTCAGCTGCAGATTTGGTCATTAA
GGCGTTGAAAGAGCCGAAGAGAGACCGTAAAAATAGTTAAGAACGTTACGCACAAGACTA
CTAGAGATATTCAAGAAGGTGAGATCAGTATTCATGGTTACCAAGGTGAAAAACGCACCC
AGAAAAAAAGATTTTATGGGAGTTGAAAAGATGATATCTTCTCTTCTTTCATTTTTATAT
AGGGTGAGCTGTTAAGTTTCTTCACTCAGAATGACTCAATTTTTTATTACGGTTGTATTG
CGTTCCTTCTGCTTAACAATACCGATCGAAAGTTATATAGATTTCTTTTATAGCATTGTT
TTTCTCTTGCTCTCACATTTAAGCCTTCTCCCGTAATGATGCTACTAATTTCTTTCTCCA
GTG

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

CO CL6500Contig1 659 2 1 U
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ATATACGGAAGATTATATATACAGTAAAGTCAGAGATTTATGTTTCTTTTTAAGTGTTTT
TATTTGATATGACAGGGCAACTTCTTTAATGAAATAAAGATATTATGATTTGAATATTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AO12JQ C 1
AF RS1AO12TFB U 1
BS 1 659 RS1AO12TFB

RD RS1AO12JQ 659 0 0
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TCTTGAAGTCTCAAAAGGTAGTTATCCGACGTACCTCGGCCGTCCATGGAAGTTATACTC
TAGAGTTGTGTACATGATGTCGTATATGGGGGACCATATTAACCCGAGAGGATGGTTGGA
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GGGAGCAGGTTTGGGTCAACGGGTCAAGTGGCCTGGTTATCACGTTATTACTTCAACAAT
CGAGGCAAGTAAGTTCACGGTGGGTCAGTTCATTGGAGGTTCATCGTGGTTACCATCCAC
TGGCGTGGCCTTCTTCTCTGGGTTGTCACAGTAAGGCTGGCTCGGCCTTGTATGTAACTA
ATATACGGAAGATTATATATACAGTAAAGTCAGAGATTTATGTTTCTTTTTAAGTGTTTT
TATTTGATATGACAGGGCAACTTCTTTAATGAAATAAAGATATTATGATTTGAATATTC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RS1AO12TFB 659 0 0
GATTTATGGAACGGTCGATTTTATATTCGGAAACGCAGCTGTGATCTTACAGAGCTGTAA
CATCTACGCGCGTAAGCCAATGCCTCAGCAGAAGATCACCATCACGGCTCAGAACCGGAA
AGACCCGAACCAGAACACGGGGATCTCGATCCACGCTTGTAAGCTACTGGCCACGGCTGA
TCTTGAAGTCTCAAAAGGTAGTTATCCGACGTACCTCGGCCGTCCATGGAAGTTATACTC
TAGAGTTGTGTACATGATGTCGTATATGGGGGACCATATTAACCCGAGAGGATGGTTGGA
GTGGAACGGTCCGTTTGCGTTGGACTCTTTGTACTACGGTGAGTATATGAACCGAGGGCC
GGGAGCAGGTTTGGGTCAACGGGTCAAGTGGCCTGGTTATCACGTTATTACTTCAACAAT
CGAGGCAAGTAAGTTCACGGTGGGTCAGTTCATTGGAGGTTCATCGTGGTTACCATCCAC
TGGCGTGGCCTTCTTCTCTGGGTTGTCACAGTAAGGCTGGCTCGGCCTTGTATGTAACTA
ATATACGGAAGATTATATATACAGTAAAGTCAGAGATTTATGTTTCTTTTTAAGTGTTTT
TATTTGATATGACAGGGCAACTTCTTTAATGAAATAAAGATATTATGATTTGAATATTC

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

CO CL6501Contig1 605 2 1 U
GGATTCCCCACGAATTTTATACTCTTTGAAAAAAGGACATCAAACTCTTTACTTTCCCGA
TCTCATCTCTTCTTTACTTCATCAAGATCCCAGACGAAATGGCTCAGAAGGTGGTGCTGA
AGGTTTTAACCATGACGGATGATAAGACCAAGCAGAAAGCCATAGAAGCTGCAGCTGATA
TTTTCGGAGTTGATTCGATAGCAGCGGATATGAAGGAGCAAAAGTTGACTGTGATCGGTA
TGATGGATGCGGTTGCGGTGGTAAAGAAACTGAAGAAAGTCGGTAAAGTAGATTTGATAT
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AAAATGCCAATATGAGCCAAACCAGGACGTGCTGATGAGCAACATATGCTGGCAGAGTGT
CGGTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1AF69TF U 362
AF RS1DR57TF U 1
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GCC

QA 5 187 5 187
DS 

RD RS1DR57TF 605 0 0
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TGATGGATGCGGTTGCGGTGGTAAAGAAACTGAAGAAAGTCGGTAAAGTAGATTTGATAT
CTGTCGGACCGGCAAAAGAGGAGAAGAAAGAAGAGAAGAAGGAAGAGAAAAAAGAGGAAA
AGAAAGAGGAGAAGAAGGAAGAGAAGAAGCCAGAAGAACCTAAGAAATAAGTAACTTAGT
TGATATTATAAATTCTGCATTTTTTTTTTTTTTTGAAACTTATAAATTCTGCATTTTGCC
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CGGTG

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DS 



AS 1 2

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TTC


BQ
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20 20 20 

AF RS1F731JQ C 1
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TTC

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RD RS1F731TF 663 0 0
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TTAGTATACAGGTAATCATTTATGTCGGATTAGATTACGTAACAAAATATTTTTTTCAGT
TTC

QA 1 663 1 663
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TG


BQ
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10 10 

AF RS1DG72TF U 1
AF RS1DG72JQ C 1
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BS 627 662 RS1DG72JQ

RD RS1DG72TF 626 0 0
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CCACCAAATGATCCTGTCGCTTCAAGGATTGCTGCATCTGACGGTTCTTCTAAGGAACCA
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CTTCCTTCAACAAAGGGATCATCAGGACCGACAGGAGCTGCAGGTTGGGCAGCTTTCTGA
TCCACAAAGGAGTGTGAAATCTAAGGTCTTGGACCCGTCCGGCTTCATCTTCTTGTGACT
TGAGAGCAAGAGACATTAGAGGCAAGACACTAGACACCAAGACAAACAGCAACCTTGAGT
TTTTTTCAAATATTATGTATGTTTATTGGTAAATTTGATGTGTGTTTTCGTTGTTATCCC
AACACTCCCTGTTGTAATATCTTTTT

QA 1 626 1 626
DS 

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CCCGCTGTTAATCACAGATTGAAGGAAGGTGAAACCATAAGAATCAACGTGAAGGCCAAA
TCAACAACAAGTGGAACTGGGATGCTCTCAGCTGCTCTCTCAGGGAACGGGAAGCCTAAA
CCTCTAGCACTTGCTCCACCACCAAATGCTGCTATAAAACTCAGGTCTCCTTTACCGCCT
CCACCAAATGATCCTGTCGCTTCAAGGATTGCTGCATCTGACGGTTCTTCTAAGGAACCA
ACGGATAACACAAGACGCAGGAACGATCCTCTGTTTGATCTATTTCAGCTAAAGAAGAAT
CTTCCTTCAACAAAGGGATCATCAGGACCGACAGGAGCTGCAGGTTGGGCAGCTTTTTGA
TCCACAAAGGAGTGTGAAATTTAAGGTCTTGGACCCGTCCGGCTTCATCTTCTTGTGACT
TGAGAGCAAGAGACATTAGAGGCAAGACACTAGACACCAAGACAAACAGCAACCTTGAGT
TTTTTTCAAATATTATGTATGTTTATTGGTAAATTTGATGTGTGTTTTCGTTGTTATCCC
AACACTCCCTGTTGTAATATCTTTTTTTTTTCTTTTTCAAACCATCTTTGTTACATTTGC
TG

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

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TACAACTTTGTGATCGGAGCTTACTCATATTGGGGACCAAAAGCTGGTTTTGGTATCTAC
CATATGAAAAACGCAGACATGGTTTTTGGAGGCCTTACTATCATCTGTGGGATCATTGGA
ACGTTAGGCGGAAGCTATGTGCTTGATCGCATCAACGCTACACTTCCAAACACCTTCAAG
TTACTAGCGGCATCAACTTTATTCGGCGCAGCGTTTTGTTTTGTTGCTTTCTGCATGAAG
AATATGTATGCATTCATCGGTCTGTTCGCAGTGGGAGGGATTTTAATCTTTGATCCACAG
GCTCCGGTTAACTTTGTGTGTCTGCATTGCGTTAGACCAAACTTGAGACCACTATCAATG
GCTTCTTCAACTGTTTTGATCCATATCTTAGGAGATGTTCCTTCTTCCCCTCTGTATGGA
AAAATGCAGGACCGTCTCAAAAACTGGAGGACATCAACTCTTATTATTACTTCAATCCTC
TTCCTCGCTGCTATTATATGGGGCATTGGGATATTTATGAATAGTGTGGACCGTTCTAAT
GAAAAGAGTGAAGATGAGGTCGAGGAGGAAGAGAAATTGGAAACCAAAGCAGACAACAAC
AACTCTGTTCCCGTCTAAATTTTGAAGACGTTCATCAATTTTGCTTCCACCACAAAATAA
TTTTTTAAATTTTTTTCTTTCACATATGTTCAGTTCAACTACAATTCATTTGATTCAATT
TCTTTCTCCTTGCTTCTTAATTTCTTTGGTGTACATAAACTAATTTTTTTAGGATAAAAA
TTTGCTGTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B869TF U 1
AF RS1B869JQ C 49
BS 1 678 RS1B869TF
BS 679 679 RS1B869JQ
BS 680 716 RS1B869TF
BS 717 852 RS1B869JQ

RD RS1B869TF 720 0 0
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GCTCCGGTTAACTTTGTGTGTCTGCATTGCGTTAGACCAAACTTGAGACCACTATCAATG
GCTTCTTCAACTGTTTTGATCCATATCTTAGGAGATGTTCCTTCTTCCCCTCTGTATGGA
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GAAAAGAGTGAAGATGAGGTCGAGGAGGAAGAGAAATTGGAAACCAAAGCAGACAACAAC
AACTCTGTTCCCGTCTAA*TTTTGAAGACGTTCATCAATTTTGCTTCCACCACAAA
TAAT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RS1B869JQ 804 0 0
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GGGATCATTGGAACGTTAGGCGGAAGCTATGTGCTTGATCGCATCAACGCTACACTTCCA
AACACCTTCAAGTTACTAGCGGCATCAACTTTATTCGGCGCAGCGTTTTGTTTTGTTGCT
TTCTGCATGAAGAATATGTATGCATTCATCGGTCTGTTCGCAGTGGGAGGGATTTTAATC
TTTGATCCACAGGCTCCGGTTAACTTTGTGTGTCTGCATTGCGTTAGACCAAACTTGAGA
CCACTATCAATGGCTTCTTCAACTGTTTTGATCCATATCTTAGGAGATGTTCCTTCTTCC
CCTCTGTATGGAAAAATGCAGGACCGTCTCAAAAACTGGAGGACATCAACTCTTATTATT
ACTTCAATCCTCTTCCTCGCTGCTATTATATGGGGCATTGGGATATTTATGAATAGTGTG
GACCGTTCTAATGAAAAGAGTGAAGATGAGGTCGAGGAGGAAGAGAAATTGGAAACCAAA
GCAGACAACAACAACTCTGTTCCCGTCTAAATTTTGAAGACGTTCATCAATTTTGCTTCC
ACCACAAAATAATTTTTTAAATTTTTTTCTTTCACATATGTTCAGTTCAACTACAATTCA
TTTGATTCAATTTCTTTCTCCTTGCTTCTTAATTTCTTTGGTGTACATAAACTAATTTTT
TTAGGATAAAAATTTGCTGTTATC

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 2

CO CL6506Contig1 840 2 10 U
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ATTCGTTAGAAGTGACAGCGTGAATGGCGGATCGCGCGGCGGAGACGATCTCCGACAAGA
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AAGAGATGGAGTACGAGGAAGAGAAGAAGGCTTTGGAATCTATTTCCACAAGAGCTGATG
TTGAGAGGAAGGTTAGAGAGTTGGAGAGGAAGATTGGGGTTTTTGAAGTGAGGGTAGTGG
AGGAGAAGAGCAAGAAGGTTAGGTTAGAAGAGGAGATTAGGGAGAAAGGTGATGCGAAAG
AGAAGGAGATCAAGGATTTGCAGAAGAAATTTGGGGACTTGAATCTGGAGCTGGTGAAGA
ATGGAGAGGAGTTGAAGAAATGCAAGTCTGAGCAGAAGAAGGGGGCAGGGAGTGAAGCTG
AGGAAAGAGAGAAGGAAATGGAGTTGAGGAAGGAAGAGTTGCTGAAGAAAGTTGAGGAAG
CGCAGGAGATGATAGTTGAGTTGAAAGAGAGAGCCATGAAGCCTGGTATCAGAGAGAGAA
ACACATGAAAGTAGAGTTGTGGTGGCCAGTGGTTGGTGCTGGTTTGGTTGCAGCGACCGC
GTTTGTCTGCTATTCCAAGCTAAGGTGAATTTTTTTAATTGATGTGTAACGGATGAGGGG
AATAATAACTGATGACCAAGTTCTTAAGATTGATATCAGGAAATTGATGATTTGGAGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ED49TF U 1
AF RS1ED49JQ C 111
BS 1 605 RS1ED49TF
BS 606 606 RS1ED49JQ
BS 607 744 RS1ED49TF
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BS 746 755 RS1ED49TF
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BS 792 840 RS1ED49JQ

RD RS1ED49TF 791 0 0
GGAACCTATGCATCTCTGATTGGAAAATCTCGTCGTTTTCTCTTTAACTTTCCCAGGAAA
ATTCGTTAGAAGTGACAGCGTGAATGGCGGATCGCGCGGCGGAGACGATCTCCGACAAGA
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AAATGGAGGAGATGAAACACGTGGAAGCGGAGATGAATCAGAGCATGGGAGAGATGGAGA
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AGGAAAGAGAGAAGGAAATGGAGTTGAGGAAGGAAGAGTTGCTGAAGAAAGTTGAGGAAG
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ACACATGAAAGTAGAGTTGTGGTGGCCAGTGGTTGGTGCTGGTTTGGTTGCAGCGACCGC
GTTTGTCTGCTATTCCAAGCTAAG*TGAATTTTTT*AATTGATGTGTAACGGATGAGGGG
A*TAATAACTG

QA 1 791 1 791
DS 

RD RS1ED49JQ 730 0 0
TCCGACAAGAATCAGGAGCTAACGAGGGAGAATCTGGAGATGAAGGAGAGGTTAAAGAAG
CTAACGGGAGAAATGGAGGAGATGAAACACGTGGAAGCGGAGATGAATCAGAGCATGGGA
GAGATGGAGAAAGAGATGGAGTACGAGGAAGAGAAGAAGGCTTTGGAATCTATTTCCACA
AGAGCTGATGTTGAGAGGAAGGTTAGAGAGTTGGAGAGGAAGATTGGGGTTTTTGAAGTG
AGGGTAGTGGAGGAGAAGAGCAAGAAGGTTAGGTTAGAAGAGGAGATTAGGGAGAAAGGT
GATGCGAAAGAGAAGGAGATCAAGGATTTGCAGAAGAAATTTGGGGACTTGAATCTGGAG
CTGGTGAAGAATGGAGAGGAGTTGAAGAAATGCAAGTCTGAGCAGAAGAAGGGGGCAGGG
AGTGAAGCTGAGGAAAGAGAGAAGGAAATGGAGTTGAGGAAGGAAGAGTTGCTGAAGAAG
GTTGAGGAAGCGCAGGAGATGATAGTTGAGTTGAAAGAGAGAGCCATGAAGCCTGGTATC
AGAGAGAGAAACACATGAAAGTAGAGTTGTGGTGGCCAGTGGTTGGTGCTGGTTTGGTTG
CAGCGACCGCGTTTGTCTGCTATTCCAAGCTAAGGTGAATTTTTTTAATTGATGTGTAAC
GGATGAGGGGAATAATAACTGATGACCAAGTTCTTAAGATTGATATCAGGAAATTGATGA
TTTGGAGTCG

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL6507Contig1 877 2 14 U
GTGGAAAAATATGCGACTGGTTCTTAAAAGATAAGCTGAAGAGAGAGCAGAACATGGAAT
CCGTTCTTCAATGGGATGATCCTGATTTTCCATTTTAATATTTTCTTATCATTAAATTTT
AAGACACAAAAGAGTATGTATGATCATCCATTAATTGGAAAATATTAAGTCGAAATATTA
AAGGTTCTTCATTAATAGGTAAGTCTTATTGTAATTTGGTCTACATCATCCTAAACAATA
TATGCATCCGTGGATTAGTTGAAAGACTTGGTTTAGACTAACAAACTCTTCTATTCGTCT
CCATGCCTTGTATTAAACCAGGTTCAATACAAATCTACTATGGATAAGATAATGAGTATA
TGTCATCAGTCCCCAGCCGTACGACATGTCTACTATGCATCAAAACCCTTCCAGGTTGAT
TCGACTTTTGAAAGATCAGGGAAAATGAAGATGAAAGAGTGGATTTGGAGGCTATCTAAG
ATGGGATCTCACTGAGAAGCAGGCTTATAATGATGGCTTTTATGATAATTTGGTTCAAGA
CTATGTGATGTGCTACATTCGCTAAATGAATTTTGTGTAGACAAAACCCAAACGGAAAAG
GGTTTCTTTTCTTGTCTAAAAATCATGCCAAGCCAGAAAATTGGCTCTCCTTCTGGTGGT
TAAAACATGATGAAGTTTGACTTCCGAGTCCTTACGGGGCATGTACCCTAGGATTCGGTC
GGAAGAATCTTTGTCGGATGACATATGCAGCAGGAGATCGTTTGCCTCTTTTCTTCTAGG
TTTTTCTGATTGTGTTTGGAACTAAACAAGATATGATGATGATGATGTTCTCAAAAAAAA
AGATATGATGATAACCTAACATGCAATGTAAATATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DM83TF U 1
AF RS1DM83JQ C 67
BS 1 664 RS1DM83TF
BS 665 665 RS1DM83JQ
BS 666 698 RS1DM83TF
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BS 700 711 RS1DM83TF
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BS 713 717 RS1DM83TF
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BS 755 765 RS1DM83TF
BS 766 877 RS1DM83JQ

RD RS1DM83TF 769 0 0
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CCGTTCTTCAATGGGATGATCCTGATTTTCCATTTTAATATTTTCTTATCATTAAATTTT
AAGACACAAAAGAGTATGTATGATCATCCATTAATTGGAAAATATTAAGTCGAAATATTA
AAGGTTCTTCATTAATAGGTAAGTCTTATTGTAATTTGGTCTACATCATCCTAAACAATA
TATGCATCCGTGGATTAGTTGAAAGACTTGGTTTAGACTAACAAACTCTTCTATTCGTCT
CCATGCCTTGTATTAAACCAGGTTCAATACAAATCTACTATGGATAAGATAATGAGTATA
TGTCATCAGTCCCCAGCCGTACGACATGTCTACTATGCATCAAAACCCTTCCAGGTTGAT
TCGACTTTTGAAAGATCAGGGAAAATGAAGATGAAAGAGTGGATTTGGAGGCTATCTAAG
ATGGGATCTCACTGAGAAGCAGGCTTATAATGATGGCTTTTATGATAATTTGGTTCAAGA
CTATGTGATGTGCTACATTCGCTAAATGAATTTTGTGTAGACAAAACCCAAACGGAAAAG
GGTTTCTTTTCTTGTCTAAAAATCATGCCAAGCCAGAAAATTGGCTCTCCTTCTGGTGGT
TAAA*CATGATGAAGTTTGACTTCCGAGTCCTTACGGG*CATGTACCCTAG*ATTCG*TC
GGAG**ATCTTTGTCGGATGACATATGCAGCAG*AGATCGTTTGC
TCTT

QA 1 765 1 765
DS 

RD RS1DM83JQ 811 0 0
TTCAATGGGATGATC*TGATTTTCCATTTTAATATTTTCTTATCATTAAATTTTAAGACA
CAAAAGAGTATGTATGATCATCCATTAATTGGAAAATATTAAGTCGAAATATTAAAGGTT
CTTCATTAATAGGTAAGTCTTATTGTAATTTGGTCTACATCATCCTAAACAATATATGCA
TCCGTGGATTAGTTGAAAGACTTGGTTTAGACTAACAAACTCTTCTATTCGTCTCCATGC
CTTGTATTAAACCAGGTTCAATACAAATCTACTATGGATAAGATAATGAGTATATGTCAT
CAGTCCCCAGCCGTACGACATGTCTACTATGCATCAAAACCCTTCCAGGTTGATTCGACT
TTTGAAAGATCAGGGAAAATGAAGATGAAAGAGTGGATTTGGAGGCTATTTAAGATGGGA
TCTCACTGAGAAGCAGGCTTATAATGATGGCTTTTATGATAATTTGGTTCAAGACTATGT
GATGTGCTACATTCGCTAAATGAATTTTGTGTAGACAAAACCCAAACGGAAAAGGGTTTC
TTTTCTTGTCTAAAAATCATGCCAAGCCAGAAAATTGGCTCTCCTTCTGGTGGTTAAAAC
ATGATGAAGTTTGACTTCCGAGTCCTTACGGGGCATGTACCCTAGGATTCGGTCGGAAGA
ATCTTTGTCGGATGACATATGCAGCAGGAGATCGTTTGCCTCTTTTCTTCTAGGTTTTTC
TGATTGTGTTTGGAACTAAACAAGATATGATGATGATGATGTTCTCAAAAAAAAAGATAT
GATGATAACCTAACATGCAATGTAAATATCG

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 2

CO CL6508Contig1 667 2 2 U
TTTTTTCTTCGCTTATGACATACCTCACATAAAACATTATTGTGGCATCCATACAAGTTA
ATAACCATCAAAACCCATAAAATTGTACAATAACATTATAGCAATGCAAATGCATCCAAA
ACAAATATATTACAACATATCATATCACCCATTAATATAAATTATTTAAATTAAACAGAG
GTCGTAGGAGCACCGGAAGGTGAAGGAGATCTAGGCTCAACTTTCCTCAGCTGGATGGCT
TTGTGAGACTCATCATCATCATAGTACATAAACGCAAAGCCACCATGCCGGGTCATATCC
ATGCCAGCCATCTCATCCTCCGCTGATATCCGAAACAGTTTCATTTTCTTGAGGATGAAG
AAAAGTGTTCCCATGGTCGCACTCACCCAACCCGTGATCACAAGTATTTGAATCAGCTGA
GCTCCAAGTAGTTTCCCTCCACCGCCCATGAACAAACCATGCGGCCTTCCGGGCTTGTCG
CCGTATATCTGGTTCAAGTACTTTTCTCTAGCGAAAAGTGCGGTAAATATTAGACCCCAC
GCTCCGCACCCACCGTGTAATTGTGCTGCTTCGAGCGGGTCGTCATATTTGAGTTTCTCT
GCGGGCTTGTTGCATCCGATGAGGACGAGAGCTGCCACGAAACCGCATATGATTGCTGCC
CACGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FV52TF C 1
AF RS1FV52JQ U 10
BS 1 9 RS1FV52TF
BS 10 667 RS1FV52JQ

RD RS1FV52TF 667 0 0
TTTTTTCTTCGCTTATGACATACCTCACATAAAACATTATTGTGGCATCCATACAAGTTA
ATAACCATCAAAACCCATAAAATTGTACAATAACATTATAGCAATGCAAATGCATCCAAA
ACAAATATATTACAACATATCATATCACCCATTAATATAAATTATTTAAATTAAACAGAG
GTCGTAGGAGCACCGGAAGGTGAAGGAGATCTAGGCTCAACTTTCCTCAGCTGGATGGCT
TTGTGAGACTCATCATCATCATAGTACATAAACGCAAAGCCACCATGCCGGGTCATATCC
ATGCCAGCCATCTCATCCTCCGCTGATATCCGAAACAGTTTCATTTTCTTGAGGATGAAG
AAAAGTGTTCCCATGGTCGCACTCACCCAACCCGTGATCACAAGTATTTGAATCAGCTGA
GCTCCAAGTAGTTTCCCTCCACCGCCCATGAACAAACCATGCGGCCTTCCGGGCTTGTCG
CCGTATATCTGGTTCAAGTACTTTTCTCTAGCGAAAAGTGCGGTAAATATTAGACCCCAC
GCTCCGCACCCACCGTGTAATTGTGCTGCTTCGAGCGGGTCGTCATATTTGAGTTTCTCT
GCGGGCTTGTTGCATCCGATGAGGACGAGAGCTGCCACGAAACCGCATATGATTGCTGCC
CACGGCC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RS1FV52JQ 658 0 0
CGCTTATGACATACCTCACATAAAACATTATTGTGGCATCCATACAAGTTAATAACCATC
AAAACCCATAAAATTGTACAATAACATTATAGCAATGCAAATGCATCCAAAACAAATATA
TTACAACATATCATATCACCCATTAATATAAATTATTTAAATTAAACAGAGGTCGTAGGA
GCACCGGAAGGTGAAGGAGATCTAGGCTCAACTTTCCTCAGCTGGATGGCTTTGTGAGAC
TCATCATCATCATAGTACATAAACGCAAAGCCACCATGCCGGGTCATATCCATGCCAGCC
ATCTCATCCTCCGCTGATATCCGAAACAGTTTCATTTTCTTGAGGATGAAGAAAAGTGTT
CCCATGGTCGCACTCACCCAACCCGTGATCACAAGTATTTGAATCAGCTGAGCTCCAAGT
AGTTTCCCTCCACCGCCCATGAACAAACCATGCGGCCTTCCGGGCTTGTCGCCGTATATC
TGGTTCAAGTACTTTTCTCTAGCGAAAAGTGCGGTAAATATTAGACCCCACGCTCCGCAC
CCACCGTGTAATTGTGCTGCTTCGAGCGGGTCGTCATATTTGAGTTTCTCTGCGGGCTTG
TTGCATCCGATGAGGACGAGAGCTGCCACGAAACCGCATATGATTGCTGCCCACGGCC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

CO CL6509Contig1 788 2 2 U
GGTTCTCTTACTGTTTAGTCGACAGATCCGCTTCCTCTAAGCCTTCCACTGTCGTTTTCG
GAAACGCCGCCGTTTCGCGTACAGCGAAGTTCACTCCGCTTTTATCCAATCCGAAGCTTG
ATACTTTCTACTACGTCGAGCTGCTTGGAATTAGCGTGGGAGGGACGCGCGTCCCCGGCG
TAGCCGCTTCTCTTTTCAAACTCGACCAGATCGGCAACGGTGGAGTCATTATCGACTCGG
GTACCTCTGTGACCCGGCTGGTCCGACCCGCTTACATCGCTATGAGAGACGCCTTCCGGA
TCGGAGCCAAGAGCCTGAAACGAGCGCCTGATTACTCTCTCTTCGATACCTGTTTCGATC
TCTCCATCAAAACGAGGTTAAAGTCCCGACGGTGGTTTTGCACTTCCGTGGGGCTGACGT
GTCACTTCCGGCGACGAATTATCTGATTCCGGTGGATACTAACGGCAAGTTCTGCTTTGC
ATTCGCCGGTACCATGAGCGGGCTATCCATTATTGGGAACATCCAGCAACAGGGTTTCCG
GGTCGTTTACGATTTGATGGGTTCACGAGTCGGGTTTGCTCCACGAGGATGTGCTTAATC
TTGACCCGACCCGAGCCGGTACGGATAATGTACTTTGTTTCCATTTTCTCAATTTATGTT
TTAGACGAGAGACCTTTGTTTCTCGGACAAGTGAATCTTTAGCGGTTGAGTTTAAATACG
TGTTGATAAAACTTCACGTGTTGTCGGCTGTATTATTAGCGTCTTTATATGTTTTTAACT
CTGGGATC


BQ
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AF RS1E912TF U 1
AF RS1E912JQ C 68
BS 1 726 RS1E912TF
BS 727 788 RS1E912JQ

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GTCACTTCCGGCGACGAATTATCTGATTCCGGTGGATACTAACGGCAAGTTCTGCTTTGC
ATTCGCCGGTACCATGAGCGGGCTATCCATTATTGGGAACATCCAGCAACAGGGTTTCCG
GGTCGTTTACGATTTGATGGGTTCACGAGTCGGGTTTGCTCCACGAGGATGTGCTTAATC
TTGACCCGACCCGAGCCGGTACGGATAATGTACTTTGTTTCCATTTTCTCAATTTATGTT
TTAGACGAGAGACCTTTGTTTCTCGGACAAGTGAATCTTTAGCGGTTGAGTTTAAATACG
TGTTGA

QA 1 726 1 726
DS 

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CTACTACGTCGAGCTGCTTGGAATTAGCGTGGGAGGGACGCGCGTCCCCGGCGTAGCCGC
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TGTGACCCGGCTGGTCCGACCCGCTTACATCGCTATGAGAGACGCCTTCCGGATCGGAGC
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CCGGCGACGAATTATCTGATTCCGGTGGATACTAACGGCAAGTTCTGCTTTGCATTCGCC
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AGAGACCTTTGTTTCTCGGACAAGTGAATCTTTAGCGGTTGAGTTTAAATACGTGTTGAT
AAAACTTCACGTGTTGTCGGCTGTATTATTAGCGTCTTTATATGTTTTTAACTCTGGGAT
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1D472JQ C 1
AF RS1D472TF U 1
BS 1 642 RS1D472TF
BS 643 649 RS1D472JQ

RD RS1D472JQ 649 0 0
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ATGCTGGTGTCATCGATGAGTATCTTGAGAAGAGCAAAGCCAACAAAGAACTGAATGATA
AGAAGAGGTTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGAGCGTTTACTGTCCAGTTCGGAA
GCTGCAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGATCTTGCCAAGCAAAAGAAAGTAC
CATTCATCTCAGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCAGAGACAAGTTCAAGTGTGGTT
CCAATGTTTTCTGGAAATGGTGATCATGTTTTGTTGTCTTTTTTAAATCCATTCTTTGTA
TAAACTCAACAGTGTATCTCTCTCTCTCTTTATTCATCAAAGTTCTCAC

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1D472TF 642 0 0
GGAACCAATCAAAAGACCTTACTAGTTACTACTCTTGAATTTTCTGAACAAAGCAAAAGA
GAAACAAAATGGTGGCCATGAACTCGAGTGTTCTCACATGCAGCTACGCAATCTCTGGTG
GTAGCTCGGCAGAGCTGAACCAGAGAGTGGGTTTAGTGAATTCATCAGTTGGGTTTGGTC
AAAAGAAACAAACGCTTCCTGTGATCAAAGCTCAACAACGAGTTGGTGGTGATGATGTTA
ATGGAAGAAGATCCGCAATGGTGATCTTAGCTGCTACACTCTTCTCCTCTGCTTCTGCTA
ATGCTGGTGTCATCGATGAGTATCTTGAGAAGAGCAAAGCCAACAAAGAACTGAATGATA
AGAAGAGGTTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCGAGAGCGTTTACTGTCCAGTTCGGAA
GCTGCAAGTTCCCTGAGAATTTCACTGGTTGCCAAGATCTTGCCAAGCAAAAGAAAGTAC
CATTCATCTCAGAAGATTTGGCGTTGGAATGCGAAGGCAGAGACAAGTTCAAGTGTGGTT
CCAATGTTTTCTGGAAATGGTGATCATGTTTTGTTGTCTTTTTTAAATCCATTCTTTGTA
TAAACTCAACAGTGTATCTCTCTCTCTCTTTATTCATCAAAG

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 2

CO CL6511Contig1 1182 2 2 U
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CACATCGGGTTTCACTTTGGTAACAAGGAAGCCTCGCTTTGGTCTCCCAACAGCTTGCCC
TAACTGCCTCCCCGCTTACATATACCTGAAACTAGCCCAGCTTCCTTTTCAACTCGCCTT
CAATTCCATCTTCCCTGATTCAGATGAGCTTCCCTACTTTGAAACGGGTACATATGTTGC
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GCTGGAAGAAGCGCTTGCGTATGAACTGTGGGTTGGTACTGATAGAGTATCTGCGTGGAA
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CATGGCCAAGACCCGTTTAGGACTCACCAAAGAAAACTCAGAGGAAAGAAAGAAACAGAT
ATACAAGAGGGCTAGTGATGCGTATGAAGCTTTGTCGACTAGGTTAGGCGAGCAGAAGTT
TCTTTTTGAAGACAGGCCATCTAGTTTGGATGCTTTCTTTCTCTCACACATACTTTTTAC
AATCCAAGTTCTACCGGAAACATCAGTGCTTCAGCGCAAACTTCTAGAACATGGTAATCT
TGTCAGATATTCTGAGAAACTCAGGTTAGAGTTCCTTAAAGCCTCTTCTTCATCTTCTTC
GCCTCCACTTCACTCATTCCCTTCCTCTTTTTCCAGAAAGGGTTCAAAGCCAAAGAGCAA
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AGCTGCTCAGTTTCTAGCGGTGGTTATTTACTTATCCGTGATGGGAGGAGTTAGTAACGA
TGAACTGGAGTATGAAGATGATGATTAGTACAACTAAAGCTTCTCTTGTTACATGAACCA
GTAACTCTCTTCTTCCTAGACACAATAATCTTTCTGCTTTTTCTTAAATTTTTAGTTAAA
GAGAGAGAGGCTAATGATGTGAGGTTAGTCACACATTATAATCATTTTTTCATTCCGAAG
GAGATTCGTTGGCTTTTATATAATTTTCATTGGTTTTAAGAC


BQ
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TCTTTT

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DS 



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BQ
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QA 1 642 1 642
DS 

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AAGCTCTTCTTTCCAATTGCCCTGGCGTTAATGAGGATGATCATTAGATAAGTCACACAG
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QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

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CT


BQ
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10 10 

AF RS1G893TF U 1
AF RS1G893JQ C 36
BS 1 681 RS1G893TF
BS 682 782 RS1G893JQ

RD RS1G893TF 681 0 0
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TCATCATCTTCTCCAATGGCTACTCCGACGCAGAACAGCGAGACCAAACCTTTCTCCGTC
CTTTTCGTCTGTCTGGGTAACATCTGTCGGAGCCCCGCAGCTGAAGGCGTCTTCAGAGAT
ATCGTCAAAAAGAGAGGCCTTGACTCCAATTTCGTCATTGATTCCACCGGCACCATCGAT
TATCACGAGGGGAACATGGCAGATCCAAGGATGAGAAGTGCGGCGAAACGTCGTGGAGTT
GAGATAACGTCATTATCTAGACCGATAAAGGCATCTGATTTCAGGGAGTTTGATCTCATT
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DS 

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CGCAGCTGAAGGCGTCTTCAGAGATATCGTCAAAAAGAGAGGCCTTGACTCCAATTTCGT
CATTGATTCCACCGGCACCATCGATTATCACGAGGGGAACATGGCAGATCCAAGGATGAG
AAGTGCGGCGAAACGTCGTGGAGTTGAGATAACGTCATTATCTAGACCGATAAAGGCATC
TGATTTCAGGGAGTTTGATTTCATTCTCGCCATGGATGAGCAGAACAAAAAGGACATATT
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GAAGCTCATGTGTTCGTATTGCAAGAAACACAATGACAAGGTAGTGCCGGACCCGTATTA
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GCTGGACAGTATCACGGCTGAAAATTGAAACATCGCAAAGCTCAAAGTCATGTTTCCTGA
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ATGCCAAACAGCGTGAGATATGGTGTGAAGCTCGAATCTTGTTGAATATTTTCTTTAAGA
AAACATTGTTAACCAGCTTAATACCCT

QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1BJ73TF U 1
AF RS1C533TF U 5
BS 1 47 RS1BJ73TF
BS 48 48 RS1C533TF
BS 49 151 RS1BJ73TF
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BS 153 309 RS1BJ73TF
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RD RS1BJ73TF 673 0 0
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AAGATACCACTAAGAACCTGGAGGCTCCTTGTAGTTGTAATGGCAGTTTGAAGTATGCCC
ATCGCAAGTGTGTTCAGCGTTGGTGTAATGAGAAAGGCGACATAACTTGCGAAATATGCC
ACCAGGCTTATCAACCTGGATATACAGCACCTCCTCCTCCTCCTCCTGATGAAACAATAA
TTCACATTGGTGACAACTGGGAGAATGGAGTTCCCTTGGACTTGAGTGACCCACGCATCC
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QA 1 673 1 673
DS 

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GG
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AGTGTGTTCAGCGTTGGTGTAATGAGAAAGGCGACATAACTTGCGAAATATGCCACCAGG
CTTATCAACCTGGATATACAGCACCTCCTCCTCCTCCTCCTGATGAAACAATAATTCACA
TTGGTGACAACTGGGAGAATGGAGTTCCCTTGGACTTGAGTGACCCACGCATCCTGGCAA
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CTAGCGGAGCTGCTTTTTGCCGCTCTGCTGCTCTCATCCTAATGGCACTTTTACTGCTAC
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QA 3 773 3 773
DS 



AS 1 2

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GATGGAATCAGAATCATCTTCTTCTCACGTGATCGCATTCACCGTTAAACCTAGAGCATC
AGATGCTGGCGGCTTAAAGCTTCAAGCTACTAGCTGAATCACTTTAATGATCATGAATTC
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TTCTG


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RS1CB76TF U 1
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TTCTG

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1EW30TF U 1
AF RS1E646TF U 1
BS 1 719 RS1E646TF

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QA 1 641 1 641
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QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

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TAACTAGATGGACACCATTGATAATGGCTCATGGCACCGGAACTGGCTCTAGGAAATCTT
GAACATAACCACTGATCAGCCACAAGGCCATCAACTAAAACTCCCTTATCCTTTCATCTG
TAGTCCTAGTATGCGGCTGGTGAGGAAATGATTGTTTAACTCCATGTTGTGACCCTTTTC
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ACACCATAAATCAAAGACACCACAAGCGACACCAGGATCATACACGTGTGGCACGACACT
GTCTCTTTCACCAAACTTCCA
TGCACAAGACC

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CTACATGTTATGAGAAAGTTAATATCAGTGTCTTCCGGGTATATGTCGTATATCCTTTGC
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TGAACATAACCACTGATCAGCCACAAGGCCATCAACTAAAACTCCCTTATCCTTTCATCT
GTAGTCCTAGTATGCGGCTGGTGAGGAAATGATTGTTTAACTCCATGTTGTGACCCTTTT
CCTGTCTGTATGGAAAGAAATGCATTGTACCTTCTGGATGTGGTCATGAGTTCTGACCTA
AACACCATAAATCAAAGACACCACAAGCGACACCAGGATCATACACGTGTGGCACGACAC
TGTCTCTTTCACCAAACTTCCAATGCAACAAGACCAGCAAGATCTCAAGAACAAATATGC
AGAGTGAAGGAAAGGCTCTGTACCACAAGTGGTTACTAATAAATAGGATAAGCAGTCAAC
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TCATGTAAATCATGTAAATTTTGACATAAACCTTGACATAAATTGTATATATACATCTTA
TAGTAACAG

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DS 



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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1C927TF C 1
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DS 

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QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 2

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TATC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 

AF RS1AN28TF U 1
AF RS1AN28JQ C 95
BS 1 152 RS1AN28TF
BS 153 153 RS1AN28JQ
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BS 754 964 RS1AN28JQ

RD RS1AN28TF 753 0 0
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TTTGCCGCCTTGGAGGTCCTGCTTTTGCTGATTCAGCTGCTGAGCAAGTAAACGAGATTT
TGGCTGAACTTTCTTTTGTGGGAGAAGATAAA*GAGGCAACGTTTGGTGAACTGTTTCAA
GGGAAGTGCAAGAAAGCTCTCATCATAGGAGGAGGTCTGGTCTTGTTTCAGCAGATAACT
GGGCAACCAAGTGTTCTTTATTATGCACCATCGATACTGCAGACCGCTGGATTCTCTGCC
GCAGGTGATGCAACAAGGGTCTCAATTCTACTTGGACTATTGAAGTTGATTATGACAGGA
GTAGCTGTTGTAGTTATCGACAGACTTGGAAGAAGACCTTTACTTCTTGGTGGTGTTGGT
GGCATGGTTGTCTCATTATTCCTGCTGGGGTCATACTACATCATTTTCAGCGCCGCACCA
GCTGTTGCTGTGGTTGCTCTGCTGCTCTATGTGGGCTGTTACCAGCTATCCTTTGGTCCG
ATTGGTTGGCTGATGATCTCAGAGATATTTCCCCTCAAGTTAAGAGGTCGAGGGCTCAGT
CTAGCAGTTCTTGTGAATTTCGGTGCAAACGCGCTAGTCACATTTGCATTTTCGCCTCTA
AAGGAATTGTTTGGAGCTGGGATACTGTTTATGGGGGTTTGGTGTGAAATGTGTCTTGTC
TCTGCTCTTCATATACTTCATTGTGCCAGAAAC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1AN28JQ 870 0 0
AGCTGCTGAGCAAGTAAACGAGATTTTGGCTGAACTTTCTTTTGTGGGAGAAGATAAAAG
AGGCAACGTTTGGTGAACTGTTTCAAGGGAAGTGCAAGAAAGCTCTCATCATAGGAGGAG
GTCTGGTCTTGTTTCAGCAGATAACTGGGCAACCAAGTGTTCTTTATTATGCACCATCGA
TACTGCAGACCGCTGGATTCTCTGCCGCAGGTGATGCAACAAGGGTCTCAATTCTACTTG
GACTATTGAAGTTGATTATGACAGGAGTAGCTGTTGTAGTTATCGACAGACTTGGAAGAA
GACCTTTACTTCTTGGTGGTGTTGGTGGCATGGTTGTCTCATTATTCCTGCTGGGGTCAT
ACTACATCATTTTCAGCGCCGCACCAGCTGTTGCTGTGGTTGCTCTGCTGCTCTATGTGG
GCTGTTACCAGCTATCCTTTGGTCCGATTGGTTGGCTGATGATTTCAGAGATATTTCCCC
TCAAGTTAAGAGGTCGAGGGCTCAGTCTAGCAGTTCTTGTGAATTTCGGTGCAAACGCGC
TAGTCACATTTGCATTTTCGCCTCTAAAGGAATTGTTTGGAGCTGGGATACTGTTTATGG
GG*TTTGGTGTGATATGTGTCTTGTCTCTGCTCTTCATATACTTCATTGTGCCAGAAACA
AAGGGTCTCACTCTTGAGGAAATTGAAGCCAAATGTCTCTAAACTTTCTGCACATCAAGC
GAAATAGATATTCATACTTCCTTTGTGTTTCAGACGCTCGAGATTATCATCACATTTACA
AAACAAGAGTGTTTAAAGTCTCTGTAATAATTATTATTATCACCACAGTCACAGTGAATG
TTGTTAAAATAAAGTTTTTAAAAGTTTATC

QA 1 870 1 870
DS 



AS 1 2

CO CL6520Contig1 593 2 3 U
GGATGATTGAACGTAGCTCATAAACTAAAGCACCTGTCTGGGAAACCCCATCTTATGTAT
TTCCACATACATATCATGAGTGCGTGTTTCTGTCTGTCCTTTTAACATGAGGTTACTGGA
ACAGTTGCTTGGGCGTTTGTCCAAAATGATTACTCTGCGCTAGTATGGAAGCTTCAATCT
ACATCTACAGATCTGGCTTGTCATGGCCGTGGTGGTTTGTCACCTCTTTTCGCTTTGGAT
TGGCGTCGACTAGGTATCGGCAGTTGAGATTCTCTCTTCGTTGGTCTCCGTCTTGTCTAG
CCGTCAGTGATCCATGGGTTCTATGTGGGCTTTTAGCCTCATCTGTTCTTATCTTTGTTG
ACCCTTTCGACCGTGTCAAGCAGATGAGGCTATTCTTCATCGATTTGTTCTATCCGGGTT
GTACACTTCTCTGTTTTATTGTCGTAAGATTGTTGTGTGGTCAGATGGTGTTTGTTCTGG
TTCCGTTCTGCCTCTTCTTTCTAATTTTACACTGTCATTAGCATATAGATGTGATGGACA
CGAGCATACCTATATGGTGTATCTGAATTCCAGCAACAAGTGGAGGTTCTTGC


BQ
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AF RS1CQ05TF U 1
AF RS1CQ05JQ C 157
BS 1 361 RS1CQ05TF
BS 362 362 RS1CQ05JQ
BS 363 593 RS1CQ05TF

RD RS1CQ05TF 593 0 0
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TTCCACATACATATCATGAGTGCGTGTTTCTGTCTGTCCTTTTAACATGAGGTTACTGGA
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ACATCTACAGATCTGGCTTGTCATGGCCGTGGTGGTTTGTCACCTCTTTTCGCTTTGGAT
TGGCGTCGACTAGGTATCGGCAGTTGAGATTCTCTCTTCGTTGGTCTCCGTCTTGTCTAG
CCGTCAGTGATCCATGGGTTCTATGTGGGCTTTTAGCCTCATCTGTTCTTATCTTTGTTG
AGCCTTTCGACCGTGTCAAGCAGATGAGGCTATTCTTCATCGATTTGTTCTATCCGGGTT
GTACACTTCTCTGTTTTATTGTCGTAAGATTGTTGTGTGGTCAGATGGTGTTTGTTCTGG
TTCCGTTCTGCCTCTTCTTTCTAATTTTACACTGTCATTAGCATATAGATGTGATGGACA
CGAGCATACCTATATGGTGTATCTGAATTCCAGCAACAAGTGGAGGTTCTTGC

QA 1 593 1 593
DS 

RD RS1CQ05JQ 437 0 0
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TTGTCACCTCTTTTCGCTTTGGATTGGCGTCGACTAGGTATCGGCAGTTGAGATTCTCTT
TTCGTTGGTCTCCGTCTTGTCTAGCCGTCAGTGATCCATGGGTTCTATGTGGGCTTTTAG
CCTCATCTGTTCTTATCTTTGTTGACCCTTTCGACCGTGTCAAGCAGATGAGGCTATTCT
TCATCGATTTGTTCTATCCGGGTTGTACACTTCTCTGTTTTATTGTCGTAAGATTGTTGT
GTGGTCAGATGGTGTTTGTTCTGGTTCCGTTCTGCCTCTTCTTTCTAATTTTACACTGTC
ATTAGCATATAGATGTGATGGACACGAGCATACCTATATGGTGTATCTGAATTCCAGCAA
CAAGTGGAGGTTCTTGC

QA 1 437 1 437
DS 



AS 1 2

CO CL6521Contig1 1396 2 6 U
GGGTAGGAATTGTGGAAGAGCAAAAGCTAATCAGTTGTTTGTTATGTACCCCCATGTTCG
CGAGTTTCTCTAAGGTTATGACCTCATTATCTCCGCCATGAAAACAAGCCTGCGTAAGCC
TCACCTCTCCGGAGAACTTTCCTCAACTACTGGACGTAATACGCGACCGAAGACCTCAGA
GGATGGAATAGGCAACGCATTACCGTTCCCAACTGATCTCATCATCGAGATATTCACGAG
GTTGCCATTGAAGTCAATAGCTATATGTCGGTGTGTTTCGAAGACATGGTCCTCCCTACT
TCGCCGTTCAGATTTCACGGAGTTGTTCTTGAGCTTGAGCAAGTCCTGTACTCTCCCCAG
GCTCTTGCTCGCCTACCAAAAAGGCCGTGACTTGCTCTTCTTTTCGGCACCTCAGCCGCA
AAACCCGGATGAGAACTCGTCTCCTGTAGTGGCTACTTATCATATGAAGTTTTCCTTTCA
TGCTTGCCTCCTTGGTTCGTTTAAATTAAGTGGGCTTGATCATGGCTTGGTGGGTCTTAC
AAGTACGTGGATCGGAAAGGGAAGGGAGCCGCCTTTGGTGCCAGTGATGTGTAACCCTAG
CACAGGACAATCATTACTATTACCTAGAGTGAAGACGAAGAGAGTTAAGGCAATGAGTTT
GTTTGGGTATGATCCTATTGATAAACAAGTCAAAGTATTGTCCATGTCAGTAAGTCAGGG
AAGTGTCCTTCCTGTGGCGGAGGAGTATCAAGTGGTGACATTAGGAACGGGAAAACTGTC
ACAGAGAATGATCAACTGCGGCCGCGAACTCCGTTATTATCCACATTTGCGAGGGAAGTG
CATTAATGGTGTTTTGTACTATCCATCTATTGATATGTCTACGGAGAGTCATGTGTTAGT
TTGCTTTGACGTTAGATCTGAAAAGTTCAGCTTTATTAAAGTTGATAAATTCTTCACTGA
GGGAACTATGATAAACTACAATGGTAAATTAGTTTTAGTTTGGTCTGAAGGATGGCTTTC
TAGAAATAGCAGAAGTGTTAACCTGTGTGTGTTAGAAGATATTGAAAAGCAGGAGTGGTC
TAAACATGTGTATGTATTGCCCGCTTTGTGGGAGGATATTGTTGGGAGAGCCTTGTTAAG
CTTTGTTGGAATGACGCGGACAAATGAGATTGTGATGAGGTCGCTGAGTCCTTTGTACCT
ATTCTACTTCAATACCGAGAAGAATACTGTCGTTAGAGTTGAAATCGAAGGGCTCGATTT
GTCTGAGTATACTAGAGTTCACATTTTTCTAGACCATGTAGAGAATGTGACACTTATGTA
AGTGTTTAAGTACTTCATAGCTTGAGACTCTGTTTGGCTATCTGTTCTAAGTTACGTTAT
ATGCTACTTGGTTACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GS75TF U 1
AF RS1GS75JQ C 582
BS 1 649 RS1GS75TF
BS 650 650 RS1GS75JQ
BS 651 719 RS1GS75TF
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BS 721 761 RS1GS75TF
BS 762 1396 RS1GS75JQ

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GGATGGAATAGGCAACGCATTACCGTTCCCAACTGATCTCATCATCGAGATATTCACGAG
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TGCTTGCCTCCTTGGTTCGTTTAAATTAAGTGGGCTTGATCATGGCTTGGTGGGTCTTAC
AAGTACGTGGATCGGAAAGGGAAGGGAGCCGCCTTTGGTGCCAGTGATGTGTAACCCTAG
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GTTTGGGTATGATCCTATTGATAAACAAGTCAAAGTATTGTCCATGTCAGTAAGTCAGG*
AAGTGTCCTTCCTGTGGCGGAGGAGTATCAAGTGGTGACAT
AG

QA 1 761 1 761
DS 

RD RS1GS75JQ 815 0 0
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TAGGAACGGGAAAACTGTCACAGAGAATGATCAACTGCGGCCGCGAACTCCGTTATTATC
CACATTTGCGAGGGAAGTGCATTAATGGTGTTTTGTACTATCCATCTATTGATATGTCTA
CGGAGAGTCATGTGTTAGTTTGCTTTGACGTTAGATCTGAAAAGTTCAGCTTTATTAAAG
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GGTCTGAAGGATGGCTTTCTAGAAATAGCAGAAGTGTTAACCTGTGTGTGTTAGAAGATA
TTGAAAAGCAGGAGTGGTCTAAACATGTGTATGTATTGCCCGCTTTGTGGGAGGATATTG
TTGGGAGAGCCTTGTTAAGCTTTGTTGGAATGACGCGGACAAATGAGATTGTGATGAGGT
CGCTGAGTCCTTTGTACCTATTCTACTTCAATACCGAGAAGAATACTGTCGTTAGAGTTG
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AGAATGTGACACTTATGTAAGTGTTTAAGTACTTCATAGCTTGAGACTCTGTTTGGCTAT
CTGTTCTAAGTTACGTTATATGCTACTTGGTTACC

QA 1 815 1 815
DS 



AS 1 2

CO CL6522Contig1 593 2 1 U
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FJ91TF U 1
AF RS1FJ91JQ C 166
BS 1 593 RS1FJ91TF

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ACACCATCGACCTTAAGATCCATGGTGGAACCCGTCAACTGGTTCTTCGTCTGAGTCCGG
AACCAGACTCGGATTTGGATCATTTGGAAGTGATGCGGATTTTTGTATCGACACTCGGGG
GAAAAACATTCAACCTAGAGGTGGAGGAGACCGAGACCACTGAACTCATGCTTAAGATCC
GTGGTCTAGGGGGCCCACCAGTGGACCAGCAGAGGCTGATCTTTCAAGGCAAGCAACTCG
AACACGGACGCACCATAGGTGACTACAAAATCAAGACGGGGTCGACCCTTGTGATGATGT
CGCGTCTCTGCGGTTGCTAAAATGTCTCTTTCTGTTTTCCAAAATTTTATGTACGTGTGT
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DS 

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AAGGCAAGCAACTCGAACACGGACGCACCATAGGTGACTACAAAATCAAGACGGGGTCGA
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TTTATGTACGTGTGTGATGATATATGACTAAAGAATAATACCTTTCATGTGATATTTATG
TCACGTGCATTATGTTAAGGTTATGGATCAGTATAAAACCGCTATGATAATAGCATTTAT
TTCATTAC

QA 1 428 1 428
DS 



AS 1 2

CO CL6523Contig1 634 2 1 U
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TTTTTGGGTCAAGATTTGCATTTCTGTTTAAAAC


BQ
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AF RS1B520JQ C 1
AF RS1B520TF U 1
BS 1 634 RS1B520TF

RD RS1B520JQ 634 0 0
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GCAGAAGATTTTTCATCCCCAATGGAGTAACTGAATCGTCTTTTTAGAGTAAAAGTGACG
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TTTTTGGGTCAAGATTTGCATTTCTGTTTAAAAC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1B520TF 634 0 0
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TTAAGCATCCAGGGCCGATGGACAGCTATAAAGGCTTTCGAGGTGTTTGCATGGACGAGC
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CAAGACGACTGGGACAGGCTCCATCAAGCCTCTGCTAACGAAGGTTGGAGCGAGAAAGAA
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GCGGGTAAACTAATGCTAACTGCAATCATGCTGGGTTGTGTAGAAGAAGAGGGTATCGAA
GCAGAAGATTTTTCATCCCCAATGGAGTAACTGAATCGTCTTTTTAGAGTAAAAGTGACG
GTGTAAATGATGTTGAGGGGATGCCATTGTTTTGAGGATGGTTTGCATTTCTGTTTGTTT
TTTTTGGGTCAAGATTTGCATTTCTGTTTAAAAC

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 2

CO CL6524Contig1 761 2 4 U
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ATGCAGGGGATTCTGTTTTTTATGAGTAGGTGTTTGCAGGCTGGTTTCCAAAGACCTGGG
AACACCCATGTTCATATTTTCTTAGAGGCTATGCAAAGGTTGAACCTCTTACTTCAGCTG
AGATCAATGATTTCGTCATCATTTCGAAGCCTCAGGTTGAACAGTCCGTTTTTACTGCTC
TAATATTTTAAAAGTTTATATTCCGTATATGTTTCTGCAAAGTTCAAAATGTAGAACATT
GAATTTGTCTGCACTGGAATGGTGACTGATATCAAAATGTAGATAGGCTGGTGTTATGTC
TCTTGCCTTAGATGGACAAAGAACTTCCAACGAACGGTCTCATCCTTTACTTGCGTGACC
TGCAATAACTTGGTTTGCTCAGGTACCGTGTGGAGGGTGTCTTTGTTGGATTCGATGGTG
AGATGACAAAACTACATACCTGTGAGGCTGGTAATTTAAGTGTAGGAACATCTCCAAGTG
GTGTCGCCATCAAGAAACCTCAGGCATCAAATTCTTTAAAGGTGGTGAAGATGCCACGTA
AGGAATAGGTGAAGCTGAGATTGTGATGCGGATGGAGTACTTATATTTCAAAAATGAGTA
TGTATTGGTTTTTATTTTAGAATATGTTCTCTAATGTAGTTTTTGGTATGGTTTATTAAA
ATCTAAAACAATATAAAAAAGGCCTTTGGAGTTTTTCATCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C688TF U 1
AF RS1C688JQ C 1
BS 1 570 RS1C688TF
BS 571 571 RS1C688JQ
BS 572 648 RS1C688TF
BS 649 761 RS1C688JQ

RD RS1C688TF 648 0 0
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GAATTTGTCTGCACTGGAATGGTGACTGATATCAAAATGTAGATAGGCTGGTGTTATGTC
TCTTGCCTTAGATGGACAAAGAACTTCCAACGAACGGTCTCATCCTTTACTTGCGTGACC
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QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1C688JQ 761 0 0
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TAATATTTTAAAAGTTTATATTCCGTATATGTTTCTGCAAAGTTCAAAATGTAGAACATT
GAATTTGTCTGCACTGGAATGGTGACTGATATCAAAATGTAGATAGGCTGGTGTTATGTC
TCTTGCCTTAGATGGACAAAGAACTTCCAACGAACGGTCTCATCCTTTACTTGCGTGACC
TGCAATAACTTGGTTTGCTCAGGTACCGTGTGGAGGGTGTCTTTGTTGGATTCGATGGTG
AGATGACAAAACTACATACCTGTGAGGCTGGTAATTTAAGTGTAGGAACATCTCCAAGTG
GTGTCGCCATCAAGAAACCTCAGGCATCAAATTCTTTAAAGGTGGTGAAGATGCCACGTA
AGGAATAGGTGAAGCTGAGATTGTGATGCGGATGGAGTACTTATATTTCAAAAATGAGTA
TGTATTGGTTTTTATTTTAGAATATGTTCTCTAATGTAGTTTTTGGTATGGTTTATTAAA
ATCTAAAACAATATAAAAAAGGCCTTTGGAGTTTTTCATCG

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL6525Contig1 802 2 4 U
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GGTTCAGTGCCTTTGTCTTAGACATGAGATGGCTGAGATATCTAAACCAATGGCGTGGAA
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TCACCGATCGTTACATAATCTCATCCACTCACGTTCAAGGTCCTAGCATGCTTCCGACGC
TTAACCTCACGGGGGATGTCATTTTAGCGGAACATTTATCGCACCGGTTCGGTAAGATTG
GTCTCGGTGACATTGTGTTGGTTCGATCTCCGACTGACCCGACTAGGATGGTGACGAAGA
GGATCTTGGGTTTAGAAGGGCATAGACTCTCTTTCTCTGCTGACCCATTGCTTGGTGATA
GCTCCGTCAGCGTTGTGGTTCCAAAAGGCCATGTTTGGATTCAGGGAGATAACTTGTATG
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AGTGGGATAAATATTAGAGGAAGCCATGGACCTGACTTTGTTTTATACCTGAAGCTACGT
TAAGATTCATTTTGTAAGATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GT40TF U 1
AF RS1GT40JQ C 75
BS 1 652 RS1GT40TF
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BS 654 726 RS1GT40TF
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RD RS1GT40TF 726 0 0
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GGTTCAGTGCCTTTGTCTTAGACATGAGATGGCTGAGATATCTAAACCAATGGCGTGGAA
CCGCGAAGGAGGCATTCGAGCAAGTATCAATCGTAGCCAAGCTTCTCTGTTTGATCCACG
TCACCGATCGTTACATAATCTCATCCACTCACGTTCAAGGTCCTAGCATGCTTCCGACGC
TTAACCTCACGGGGGATGTCATTTTAGCGGAACATTTATCGCACCGGTTCGGTAAGATTG
GTCTCGGTGACATTGTGTTGGTTCGATCTCCGACTGACCCGACTAGGATGGTGACGAAGA
GGATCTTGGGTTTAGAAGGGCATAGACTCTCTTTCTCTGCTGACCCATTGCTTGGTGATA
GCTCCGTCAGCGTTGTGGTTCCAAAAGGCCATGTTTGGATTCAGGGAGATAACTTGTATG
CTTCAACTGATTCGCGTAATTTCGGACCTGTACCTTACAATCTCATCGAAGGCAAAGCTC
TTCTTCGTGTCTGGCCACCACGGTTCTTTGGGTCATTGAGGTGACGATCACAATCCGGCT
TGTTTCCCTTTCAGTTGTTTTTGCAGTAGGATGTGTGTAACTCCAGCGGTTT*ATTGCAA
TGTTGATCATACTCATTAGAGTAATGTTATGTATCAATCGGATTTAGATAAAGCCACAGA
AGTGGG

QA 1 726 1 726
DS 

RD RS1GT40JQ 728 0 0
GTCTTAGACATGAGATGGCTGAGATATCTAAACCAATGGCGTGGAACCGCGAAGGAGGCA
TTCGAGCAAGTATCAATCGTAGCCAAGCTTCTCTGTTTGATCCACGTCACCGATCGTTAC
ATAATCTCATCCACTCACGTTCAAGGTCCTAGCATGCTTCCGACGCTTAACCTCACGGGG
GATGTCATTTTAGCGGAACATTTATCGCACCGGTTCGGTAAGATTGGTCTCGGTGACATT
GTGTTGGTTCGATCTCCGACTGACCCGACTAGGATGGTGACGAAGAGGATCTTGGGTTTA
GAAGGGCATAGACTCTCTTTTTCTGCTGACCCATTGCTTGGTGATAGCTCCGTCAGCGTT
GTGGTTCCAAAAGGCCATGTTTGGATTCAGGGAGATAACTTGTATGCTTCAACTGATTCG
CGTAATTTCGGACCTGTACCTTACAATCTCATCGAAGGCAAAGCTCTTCTTCGTGTCTGG
CCACCACGGTTCTTTGGGTCATTGAGGTGACGATCACAATCCGGCTTGTTTCCCTTTCAG
TTGTTTTTGCAGTAGGATGTGTGTAACTCCAGCGGTTTTATTGCAATGTTGATCATACTC
ATTAGAGTAATGTTATGTATCAATCGGATTTAGATAAAGCCACAGAAGTGGGATAAATAT
TAGAGGAAGCCATGGACCTGACTTTGTTTTATACCTGAAGCTACGTTAAGATTCATTTTG
TAAGATCT

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL6526Contig1 724 2 2 U
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TCATCGCGATCGCTTTCTCTCTCTTCTAGTAGTCACCGCGAGATATCATCACGTCTGATC
AAAGTCACCGCCATGGAGACGACGGCGGAGACAATTTCCGGTGGTGTTCCCAACAACACG
ATGAAGCTACTGTTCGTCGAGATGGGTGTGGGTTACGATCAGCACGGGCAGGACGTGACA
TCTGCGGCGATGAAGGCTTGTAAGAATGCAATTTCTTCCAATTCGATTCCTGCTTTTAGA
AGAGGTTCGATTCCTGGAGTTTCATTTGGAGAAATGAAGTTACAGATCAAGCTTGGAGTG
CCTCGTTGTCTCCACCACCAACTGGATCTCGACAAGGTCAAGTCTATCTTCCCCTATGGG
AAGATTGTAAACGTGGAGGTGGTGGATGGAGGACTGATCTGCTCGAGTGGCGTTCTAGTT
GGAGAAATGGGTGATAAAAACGAGGACTGCTACATTGTGAACGTCGCCGTTTACGTTGGC
TACTAGTGTCTCTTGTTCTTTGGGTAATTGACGCCCAAGTTAAGAAATGAGAAGAAGAAG
AAGAAGAAGACAACATTATAGTCACTTTTAGTTGTATGTTTTGGTTACAGAACAAAGCTT
TCTGTTTGTAGACTATGCAGCAATAACTCAATGTTTAGTTTAAGGGAAAATTTGCTTCTA
TGCC


BQ
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10 10 10 10 

AF RS1BJ51TF U 1
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BS 1 701 RS1BJ51TF
BS 702 724 RS1BJ51JQ

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AAGATTGTAAACGTGGAGGTGGTGGATGGAGGACTGATCTGCTCGAGTGGCGTTCTAGTT
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AAGAAGAAGACAACATTATAGTCACTTTTAGTTGTATGTTTTGGTTACAGAACAAAGCTT
TCTGTTTGTAGACTATGCAGCAATAACTCAATGTTTAGTTT

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GGAAGATTGTAAACGTGGAGGTGGTGGATGGAGGACTGATCTGCTCGAGTGGCGTTCTAG
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AGAAGAAGAAGACAACATTATAGTCACTTTTAGTTGTATGTTTTGGTTACAGAACAAAGC
TTTCTGTTTGTAGACTATGCAGCAATAACTCAATGTTTAGTTTAAGGGAAAATTTGCTTC
TATGCC

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

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AGTTTGACAAGGAGCAACAGCGAGCCTTTCTGCAATTTGTAACAGGATGTCCTCGTCTAC
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BQ
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AF RS1DJ67TF U 1
AF RS1DJ67JQ C 15
BS 1 637 RS1DJ67TF
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AGTTTGACAAGGAGCAACAGCGAGCCTTTCTGCAATTTGTAACAGGATGTCCTCGTCTAC
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TGGTTTAAAGTTTTTTTTTTT

QA 1 681 1 681
DS 

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GCGTCTCTCAATCCCAAACTTACAATTGTCCGCAAGCATGGTAGCGATTTTTCAGAAACA
GACCTGCCGAGTGTGATGACATGCGCAAATTATCTCAAGCTTCCACCTTACTTTTCCAAA
GAAAACATGAAGGAGAAGCTAATTTATGCTATAACTGAAGGTCAAGGTTCCTTCCATCTC
TCTTAGATTAGCATCTTGTGACAAAAGATTAGCAGAAGCGGTAGGAGGTGAGGGAAGGAG
AAGAGTGCAACTGTTGGAAGAAAACAAGAGGAAGCTTTTCTTCGCATGGTTTAAAGTTTT
TTTTTTTTAAATTTTTTAGGCTAATCAATAGATGTAGAAATACATTTTAAAAGGAAACTC
TTGATGGAAAAGAGTTGTATATTTAAAAAAATTCACCT

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

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AACCGATATTAACCAACAAACTTTCAAAGTTCGATACAAGCCAGATGATTATTATAAATG
CTGACCTCTCCAACACATTCTATAACTCGGTCTTAACCTCATCTTCATGGCTATCATGAC
CATGTTTATCCAAATAAGAGACCGCCATGGCTGCGTGAAGAGCTGCGCCAAGAGGAAGAG
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TCTTTATCCCCAGCACGAAGATAGAAGCCTTAGTCCTCTGAGTGAAGAAGCTGAAGTCCT
CTGCTCCCATCGTCACCGGAAAATCATGGAAGTTGTTCTTTCCGATCATCGCTTCCGCTA
CTTCTTTTCCCTGATCGTACAACCCCTCGTCGTTCTTCATCACCGGGTGAAGCGACGGCT
CTTTCTCTCCGAAATCTACTTCTGCTTTGCATTGGTACACCGAGGCTTGTGCCTCTGAGA
TCTCTTTGATTCGTCTTTGGATAAATAGAAGCCCATCGTTGCTTAGGCTTCTGAAAGTTC
CTCCAAATTTCGCAAACTGCGGTATAACATTTTGAGCATGGCCTCCTTGAATGTATCCAA
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CTAGATGTCGTCTTTA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1DY41JQ U 46
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CTTTCTCTCCGAAATCTACTTCTGCTTTGCATTGGTACACCGAGGCTTGTGCCTCTGCTA
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CG
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AAGCTGAAGTCCTCTGCTCCCATCGTCACCGGAAAATCATGGAAGTTGTTCTTTCCGATC
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TGAAGCGACGGCTCTTTCTCTCCGAAATCTACTTCTGCTTTGCATTGGTACACCGAGGCT
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CTTCTGAAAGTTCCTCCAAATTTCGCAGACTGCGGTATAACATTTTGAGCATGGCCTCCT
TGAATGTATCCAACTGTAACCACACCAGCTTCGAGAGGATCCATTTCCCGCGAAACAATC
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DS 



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BQ
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AF RS1FA11TF U 1
AF RS1FA11JQ C 44
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CAGAAGATGTCGTTGACGCTTTTTATGAAGAACGGGCTTATGGTTAATCTGCATAAGAGG
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GAATGTGACGGTGTAGCCGTTTGATGGCTGATGGAAGCAATGGAAGTTACGATGGCTTAA
AGCCGATAACTTTTCTGATCTTAAATACGTTTTTTATTCCCAAAAAAAACATGTTGGACA
GAAAATACGACCAATGGTTTTTCATTTGTTCAATATGAAACTGTAAGAAATGATAAATAT
TTCATAAGAATATCTAAAGAAATTTTTTTTTTTTTTTGAAAAGGTAAAGAAAAGGTGAAA
GATCTCATAAGC

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DS 

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TTAATCTGCATAAGAGGGATCTCGAAGGAACCGTCAAGAGTCTAGTGGTGGCGAAGAGTG
ACGGTGTTGTCAACGGCGAATGTGACGGTGTAGCCGTTTGATGGCTGATGGAAGCAATGG
AAGTTACGATGGCTTAAAGCCGATAACTTTTCTGATCTTAAATACGTTTTTTATTCCCAA
AAAAAACATGTTGGACAGAAAATACGACCAATGGTTTTTCATTTGTTCAATATGAAACTG
TAAGAAATGATAAATATTTCATAAGAATATCTAAAGAAATTTTTTTTTTTTTTTGAAAAG
GTAAAGAAAAGGTGAAAGATCTCATAAGC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 2

CO CL6530Contig1 445 2 2 U
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GAAAACGTTCCATCTCAATTTCATATTTTTCCGTGTCAATGTACGAATTTCGCTTGATCT
TTAAGATCTTCGACATTTCCCAACCAAATTGAAGCACATATCCAACAGTAGACCAGACGG
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CGGCTATTGTTCATAATGTTCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1F796TF C 1
AF RS1F796JQ U 28
BS 1 27 RS1F796TF
BS 28 445 RS1F796JQ

RD RS1F796TF 445 0 0
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GAAAACGTTCCATCTCAATTTCATATTTTTCCGTGTCAATGTACGAATTTCGCTTGATCT
TTAAGATCTTCGACATTTCCCAACCAAATTGAAGCACATATCCAACAGTAGACCAGACGG
CAATAGTACTAGCAACATCCAAGAATGGCGTAAAGTTCAATCCTTTTCCTTTGTCGCCGA
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CGGCTATTGTTCATAATGTTCCTCC

QA 1 445 1 445
DS 

RD RS1F796JQ 418 0 0
TAACAAAGTCGGAAATTACAAACACCAGACAAACAAGTAAGATATTGCAAATAAATACAT
TTCATTCACTGATGCGACGGAGCAGTTGCTCACGAAAACGTTCCATCTCAATTTCATATT
TTTCCGTGTCAATGTACGAATTTCGCTTGATCTTTAAGATCTTCGACATTTCCCAACCAA
ATTGAAGCACATATCCAACAGTAGACCAGACGGCAATAGTACTAGCAACATCCAAGAATG
GCGTAAAGTTCAATCCTTTTCCTTTGTCGCCGATAGGATTAGGAGCTGAGGAGGATGCGG
AGGAGGAACAGAAAGCACGTCCTTGACGAACGCGGTAAGCCTTCGCAACCAAAGATCTCA
GGTTCGGCATCATGGTCGTCGGCAATTAGGTTTCGGCTATTGTTCATAATGTTCCTCC

QA 1 418 1 418
DS 



AS 1 2

CO CL6531Contig1 749 2 4 U
GGACCACGATCACTTGATCCGGATGAGAAGAGAAAAACTCTCGAGAGAACTCCACGGAGC
CAACGGAGTAGCTTACTTTAGCTAGTGCTGTTTCCAAGTCGAGTTCACGGCGGTAAGAGT
CTTGAGTGTACTTGCGATGCGAGCTGTCGAACTGTAGATTCAAATCTCCCACTATCTGAT
AGACCTGTGTAGAGAAGAAACCAATAACAGAGGATTAGTCTTTTAAACAAGAACTCAAAG
GAAAAGAAAACATTAAGACACATTACATCAGAAGGATGGCCTGATAACTTGACAGCTTCT
GAAGTAGCTTCAGCGTATTTTCTTTCGTCGACAAGCTTCCTAACTTGCGCTAATGCTTCT
GGAGCATTCGGGTTTGTGTAATCAGCGGGTACTCCAGTCCAGATTGTGTCCTCTGTCAAA
TAAAGTTTAACACTTCAGATCCACAGCTATTTAAAGAACACAACAGAGCAGCAAAAAAAC
AAGAATCAAGAACGTTTTTTTAAGCATTTTATTACACAGAGACAAATAAGAGATCCAGTT
TCATTAAAAGTTGGTTATGATCTATAAGACTATGTCCCAAAGCATAATCCCATGTTCTGT
CATTTCAATAAATGTATCCGAGAAACACGAGTCATGAAACCAACAATCTGACATTAGCAG
AGACTGTAGAGCTTCATTTATTACCAACCTCCCCAGAATATATATTTTTTTTTAAACTTC
AAAAGAAGACTGCACAACACAAACAATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FG07TF U 1
AF RS1FG07JQ C 85
BS 1 712 RS1FG07TF
BS 713 713 RS1FG07JQ
BS 714 723 RS1FG07TF
BS 724 749 RS1FG07JQ

RD RS1FG07TF 740 0 0
GGACCACGATCACTTGATCCGGATGAGAAGAGAAAAACTCTCGAGAGAACTCCACGGAGC
CAACGGAGTAGCTTACTTTAGCTAGTGCTGTTTCCAAGTCGAGTTCACGGCGGTAAGAGT
CTTGAGTGTACTTGCGATGCGAGCTGTCGAACTGTAGATTCAAATCTCCCACTATCTGAT
AGACCTGTGTAGAGAAGAAACCAATAACAGAGGATTAGTCTTTTAAACAAGAACTCAAAG
GAAAAGAAAACATTAAGACACATTACATCAGAAGGATGGCCTGATAACTTGACAGCTTCT
GAAGTAGCTTCAGCGTATTTTCTTTCGTCGACAAGCTTCCTAACTTGCGCTAATGCTTCT
GGAGCATTCGGGTTTGTGTAATCAGCGGGTACTCCAGTCCAGATTGTGTCCTCTGTCAAA
TAAAGTTTAACACTTCAGATCCACAGCTATTTAAAGAACACAACAGAGCAGCAAAAAAAC
AAGAATCAAGAACGTTTTTTTAAGCATTTTATTACACAGAGACAAATAAGAGATCCAGTT
TCATTAAAAGTTGGTTATGATCTATAAGACTATGTCCCAAAGCATAATCCCATGTTCTGT
CATTTCAATAAATGTATCCGAGAAACACGAGTCATGAAACCAACAATCTGACATTAGCAG
AGACTGTAGAGCTTCATTTATTACCAACCTCCCCAGAATATATATTTTTTTT*AAACTTC
AAA
GAGACTGCACACACAAA

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1FG07JQ 665 0 0
GTGCTGTTTCCAAGTCGAGTTCACGGCGGTAAGAGTCTTGAGTGTACTTGCGATGCGAGC
TGTCGAACTGTAGATTCAAATCTCCCACTATCTGATAGACCTGTGTAGAGAAGAAACCAA
TAACAGAGGATTAGTCTTTTAAACAAGAACTCAAAGGAAAAGAAAACATTAAGACACATT
ACATCAGAAGGATGGCCTGATAACTTGACAGCTTCTGAAGTAGCTTCAGCGTATTTTCTT
TCGTCGACAAGCTTCCTAACTTGCGCTAATGCTTCTGGAGCATTCGGGTTTGTGTAATCA
GCGGGTACTCCAGTCCAGATTGTGTCCTCTGTCAAATAAAGTTTAACACTTCAGATCCAC
AGCTATTTAAAGAACACAACAGAGCAGCAAAAAAACAAGAATCAAGAACGTTTTTTTAAG
CATTTTATTACACAGAGACAAATAAGAGATCCAGTTTCATTAAAAGTTGGTTATGATCTA
TAAGACTATGTCCCAAAGCATAATCCCATGTTCTGTCATTTCAATAAATGTATCCGAGAA
ACACGAGTCATGAAACCAACAATCTGACATTAGCAGAGACTGTAGAGCTTCATTTATTAC
CAACCTCCCCAGAATATATATTTTTTTTTAAACTTCAAAAGAAGACTGCACAACACAAAC
AATGG

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

CO CL6532Contig1 780 2 4 U
GGGACCGACCTCAGAGGATCACACTATACGCAAAACACGCATATACATACATATATGTAT
ATATATCTCTGCCGTCTTGTCTTCCTCCTCCACATTTCTCTCTTTACACAACTTTCATGG
TGTCGAGAAATATGAATCCTGCAGACGGATCTTTCTTGGATCCGAAGGGTACTATGACCG
TCCCCGCAATTGGACCCTTCTCCACCTCCTCCTCCTCGACCGCTGTGGATGCGACGACGT
CGGAGGAAGATCTTAGCAAGAAGATAAGGAAGCCTTATACCATTACCAAGTCCAGGGAGA
GCTGGACGGAGCCTGAGCACGACAAGTTCCTCGAAGCTCTTCACCTGTTTGACAGAGACT
GGAAAAAGATTGAAGCTTTCATTGGCTCAAAGACTGTGATTCAGATAAGAAGTCATGCTC
AGAAGTACTTTCTCAAGGTACAAAAGAGTGGAACGGGTGAACATCTCCCTCCTCCTCGAC
CTAAAAGGAAAGCCGCTCATCCCTATCCTCAGAATGCTCACAAGAACGTTCAACCTCAAG
TACCGGGGTCCCTTAAATCTACAGCTGAACCAAATGACTCTAGTTATATGTTTAGGCCCG
AGTCTTCTTCCATGCTGATGACTTCTCCACCCGCTGCTGCTGCTGCCGCAGCTCCCTGGA
CTAATAATGTGCCAACAATTAGCTTCAGACCCCTGCCCAAAGGTGGTTTTATTATTATTG
TTATCTGCAAGCAGTCACTGTTACTCTCTAAATTTTTCTAAATGAACCATATTGCTATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G063TF U 1
AF RS1G063JQ C 341
BS 1 573 RS1G063TF
BS 574 574 RS1G063JQ
BS 575 702 RS1G063TF
BS 703 780 RS1G063JQ

RD RS1G063TF 704 0 0
GGGACCGACCTCAGAGGATCACACTATACGCAAAACACGCATATACATACATATATGTAT
ATATATCTCTGCCGTCTTGTCTTCCTCCTCCACATTTCTCTCTTTACACAACTTTCATGG
TGTCGAGAAATATGAATCCTGCAGACGGATCTTTCTTGGATCCGAAGGGTACTATGACCG
TCCCCGCAATTGGACCCTTCTCCACCTCCTCCTCCTCGACCGCTGTGGATGCGACGACGT
CGGAGGAAGATCTTAGCAAGAAGATAAGGAAGCCTTATACCATTACCAAGTCCAGGGAGA
GCTGGACGGAGCCTGAGCACGACAAGTTCCTCGAAGCTCTTCACCTGTTTGACAGAGACT
GGAAAAAGATTGAAGCTTTCATTGGCTCAAAGACTGTGATTCAGATAAGAAGTCATGCTC
AGAAGTACTTTCTCAAGGTACAAAAGAGTGGAACGGGTGAACATCTCCCTCCTCCTCGAC
CTAAAAGGAAAGCCGCTCATCCCTATCCTCAGAATGCTCACAAGAACGTTCAACCTCAAG
TACCGGGGTCCCTTAAATCTACAGCTGAACCAA*TGACTCTAGTTATATGTTTAGGCCCG
AGTCTTCTTCCATGCTGATGACTTCTCCACCCGCTGCTGCTGCTGCCGCAGCTCCCTGGA
CTAATAATGTGCCAACAATTAGCTTCAGACCCCTGCCCAAAG
TG

QA 1 702 1 702
DS 

RD RS1G063JQ 440 0 0
TCACCTGTTTGACAGAGACTGGAAAAAGATTGAAGCTTTCATTGGCTCAAAGACTGTGAT
TCAGATAAGAAGTCATGCTCAGAAGTACTTTCTCAAGGTACAAAAGAGTGGAACGGGTGA
ACATCTCCCTCCTCCTCGACCTAAAAGGAAAGCCGCTCATCCCTATCCTCAGAATGCTCA
CAAGAACGTTCAACCTCAAGTACCGGGGTCCCTTAAATCTACAGCTGAACCAAATGACTC
TAGTTATATGTTTAGGCCCGAGTCTTCTTCCATGCTGATGACTTCTCCACCCGCTGCTGC
TGCTGCCGCAGCTCCCTGGACTAATAATGTGCCAACAATTAGCTTCAGACCCCTGCCCAA
AGGTGGTTTTATTATTATTGTTATCTGCAAGCAGTCACTGTTACTCTCTAAATTTTTCTA
AATGAACCATATTGCTATTC

QA 1 440 1 440
DS 



AS 1 2

CO CL6533Contig1 1016 2 4 U
AAAGTGAACATGGATGCTTGTTTTCTTACTTCAAGATCAATCTCTGGTGTTAAAGGGATA
GTCCCTTTCATCAAAACCAGAGTCTTTTCTTGTCCCAAGAGAAACTCCAGCCAGTTTCTC
ACCAGGAAGGTTGCTGCTCCGATCTCTATAAAATGTTCTCTTTCGGATTCATGGAAGCCA
CTGGAGGATAATACTGAGCTCTTCAAGGATTGTGTCAACAAATCTAAAGCAGAAGATGAC
TGGAAAGAGTTCAGGGCAAGGCTCGTAGCTGGGGAACAAGCTGCAACCACCTCTGACAAG
GTGGTGGACTGTTCTTCATCATCTTCCTCACTGATCACACTTGGAGACAAATGGGCACAC
AAGATCAGCGAGCCAGAGACAGGATGTCTCTGATAGCCACAGAGAAGCAAGACGAGTCCA
CATCTTCGAAAAGACAGTGGTCCTCATCCTCTCTGTTGGAGGACCCTCAGGTCCTGTAGG
AGTCATCCTCAACCGTCCATCGATTATGTCAATCAAGGAGACAACAGCAGCGGTCTTAGA
CATGGCGGGAACGTTTGCAGACAAGAGACTCTTCTTTGGTGGACCTTTGGAAGAAGGATT
GTTCCTCGTGAGTCCTAGGAACGGTGGGGACAACGAGGTTGAGAAGAGTGGAGTGTTCAG
ACAAGTGATGGGAAGGATTGTACTACGGGACGAGTGAGAGTGTGGGATTGGCTGCAGAGA
TGGTGAAGAGGAAGTTGGTGGGAAGAAGTGAGGTGAGGTTCTTTGATGGGTATTGTGGTT
GGGAAACAGAGCAGTTGAAAGCAGATATCTTGAGAGGGTATTGGACTGTGGCTGCTTGTA
GCTCAAGTGTTGTTGAGATTGGTTCAGATGTCCAAAGTCATGGTCTTTGGGATGAGGTTG
TTGGGCTTATTGGTCCTCAAACTGGCTCTGTTTTCATGTAATGAGTTTCTTAACTAGTGG
TTTATATCAGTGAGTCATGACTATACTGTGTATGTTTAATCAACTAATTTTTGAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CP52TF U 1
AF RS1CP52JQ C 249
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TGGTGAAGAGGAAGTTGGTGGGAAGAAG

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DS 

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AAAAGACAGTGGTCCTCATCCTCTCTGTTGGAGGACCCTCAGGTCCTGTAGGAGTCATCC
TCAACCGTCCATCGATTATGTCAATCAAGGAGACAACAGCAGCGGTTTTAGACATGGCGG
GAACGTTTGCAGACAAGAGACTTTTCTTTGGTGGACCTTTGGAAGAAGGATTGTTCCTCG
TGAGTCCTAGGAACGGTGGGGACAACGAGGTTGAGAAGAGTGGAGTGTTCAGACAAGTGA
TGG*AAGGATTGTACTACGGGACGAGTGAGAGTGTGGGATTGGCTGCAGAGATGGTGAAG
AGGAAGTTGGTGGGAAGAAGTGAGGTGAGGTTCTTTGATGGGTATTGTGGTTGGGAAACA
GAGCAGTTGAAAGCAGATATCTTGAGAGGGTATTGGACTGTGGCTGCTTGTAGCTCAAGT
GTTGTTGAGATTGGTTCAGATGTCCAAAGTCATGGTCTTTGGGATGAGGTTGTTGGGCTT
ATTGGTCCTCAAACTGGCTCTGTTTTCATGTAATGAGTTTCTTAACTAGTGGTTTATATC
AGTGAGTCATGACTATACTGTGTATGTTTAATCAACTAATTTTTGAGG

QA 1 768 1 768
DS 



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GTGTTTGACTTAAATATTAAATTAACCGTGCTCAATC


BQ
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AF RS1GV44JQ C 1
AF RS1GV44TF U 1
BS 1 457 RS1GV44TF

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GCCGACAACAATTTCTTTGGAATGTTTCCGGCAAACTACAGCGTCGTCTTCCGCGTCCGC
GATATGGGGTAGCTTAGCTCCTACGTATAATATTTAAGGCCGTCGTTGTTGTTGGAGACC
GATAAAATTGATAGTTATTTGGTCATGTTTCCTTTCCTACTTTTAAATTGTTTTAAATGT
GTGTTTGACTTAAATATTAAATTAACCGTGCTCAATC

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DS 

RD RS1GV44TF 457 0 0
TTTTTGGAAGAAAAATATTAATATCTTAACTTTTTTTCACAGGTTCCATTTGCTGTCGGA
ATTCGACAACGGGAAACGGAGCTGCCGTAAGCGACTTGCCGACCATAACCGCCGCCGCCG
TAAATGTCACCAGGCAGCCTCCGCCAGCGGCAAACACACTACGGATATTATCAACACTTC
AAAGTCAGCAAACGATTCGGGTCTGAAGTCGTCGTCAGCGTCTCCATCTCCATCCAACGC
GCCGACAACAATTTCTTTGGAATGTTTCCGGCAAACTACAGCGTCGTCTTCCGCGTCCGC
GATATGGGGTAGCTTAGCTCCTACGTATAATATTTAAGGCCGTCGTTGTTGTTGGAGACC
GATAAAATTGATAGTTATTTGGTCATGTTTCCTTTCCTACTTTTAAATTGTTTTAAATGT
GTGTTTGACTTAAATATTAAATTAACCGTGCTCAATC

QA 1 457 1 457
DS 



AS 1 2

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TTAGCACCGCTGCCATGGGTTGCAAGCTTTTCATTCTCGGTGAAGATGGCAATCCTCTCC
CTCCAGACGCAGAAGGAGTAGGAGAATTGGCTCTATGTCCTCACATGCTTGGAGCTTCTA
GCACTCTCCTGAATGGGAATCACTACAAAGTTTACTTCCAAGGAATGCCCACCTTCCAAG
GACATGTTTTACGAAGACATGGAGATTTATTTGAACGGACTTCAAAAGGATACTACCGTG
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TCGAACGAGTCTGTAACTCCGTTGATGACAGCGTCCTGGAGACAGCAGCGATCGGTGTTC
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TACGGAACCATAACTTGAACCTCCTGAAGAAGTCCTTCAACTCTGAGATACAAAAGAAAC
TTAACCCATTGTTCAAGGTATCATCTGTTGCGACTCTGCCTTCCTTACCTAGGACGGCCA
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AGCTATGAGAGACTATTGTTTGCCATTAACACACAAAACATTTGGTCTTTTGTTGTATCA
ATCTACATCCATGTCTACATCAATAAATGATTTCTCAATTCACATACAGCATGTGGAATT
GGTCTTCTGTGAGTGTATCAAGAGATCCATAAATGTAGAGCCATCCTTGATGTGAATAAT
GTACTTGTCCTGTAATGTAACGTAATTTGTC


BQ
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AF RS1A504TF U 1
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CTCA

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TG


BQ
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AF RS1B879JQ C 1
AF RS1B879TF U 1
BS 1 662 RS1B879TF

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TG

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ATCATGCTCTGGGATCTTAGAACCGCTTGGCCTTTGTCAATTATCGACTCACACAAGGAT
AAGGTTTTATGTGCGGACTGGTGGAAAGGAGACAGCGTAGTCAGCGGAGGAGCAGACTCT
AACCTTCGAGTATCATCCGGAATCTCAATTTAAACGGTCTAAAATCTCTCGACCATTTTT
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TG

QA 1 662 1 662
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AS 0 0

AS 1 2

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GACCC


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RS1FG66JQ U 4
AF RS1FG66TF C 1
BS 1 3 RS1FG66TF
BS 4 692 RS1FG66JQ
BS 693 785 RS1FG66TF

RD RS1FG66JQ 689 0 0
CCGAAGATCAACTTTGTAAGCAATTTAAATCGACGAGAAAGTCTACAACTTTGTAGGACA
AAAAAAAGAGAAGGCTTTAATTTGAATGCTTTTTTTTTTTGTAGCGAAGGAAGGCTAAAT
CATCACATGCCCATGCCAGCCATATCAGGGACATGCTTTTGAGTTTTCTCCTCTCCCTTC
ACAAGCACTGAGGCCTCTGTTGTTGTCAACAGCAAAAAAACGCTAGCAGCATCGGTTAAT
GCGGTTTTGATAACCTTGACCGGGTCTATGATTCCAGCTTTCACCATATCAACATACGAA
CCTTTGGCAGCATCGAAACCGAAATTGCAATCGTTTTGCTCTAGTAACTTGCCAACCACT
AAAGAACCATCTCCAGCAACCTTGTTAGTGGCATTAGCGACCTGTTTAACGAGCTCAGCA
CCCATATTCTTAGCGTTCGACTCAAACGAAATACTTTTGGCCACGGTGACACCATCTTTT
GTGATCTTCGGTGCGCCATAACTGCTCTCAATTATCACATTTCTTCCCTTTGGTCCCATA
GTGACTTTGACGGCTTCAGCAACCTCGGAAACACCTTGCAACATAGCAGCACGAGCACCA
ATCCCAAAACTGATATCCTTAGCCACATAGTTTCTGCTGCTTATAATCCTTCCCGAAACT
AGTTTCCGGGAAGTAGAGGAGCCAATTGA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1FG66TF 785 0 0
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ACAAAAAAA*GAGAAGGCTTTAATTTGAATGCTTTTTTTTT**GTAGCGAAGGAAGGCTA
AATCATCACATGCCCATGCCAGCCATATCAGGGACATGCTTTTGAGTTTTCTCCTCTCCC
TTCACAAGCACTGAGGCCTCTGTTGTTGTCAACAGCAAAGAAACGCTAGCAGCATCGGTT
AATGCGGTTTTGATAACCTTGACCGGGTCTATGATTCCAGCTTTCACCATATCAACATAC
GAACCTTTGGCAGCATCGAAACCGAAATTGCAATCGTTTTGCTCTAGTAACTTGCCAACC
ACTAAAGAACCATCTCCAGCAACCTTGTTAGTGGCATTAGCGACCTGTTTAACGAGCTCA
GCACCCATATTCTTAGCGTTCGACTCAAACGAAATACTTTTGGCCACGGTGACACCATCT
TTTGTGATCTTCGGTGCGCCATAACTGCTCTCAATTATCACATTTCTTCCCTTTGGTCCC
ATAGTGACTTTGACGGCTTCAGCAACCTCGGAAACACCTTGCAACATAGCAGCACGAGCA
CCAATCCCAAAACTGATATCCTTAGCCACATAGTTTCTGCTGCTTATAATCCTTCCCGAA
ACTAGTTTCCGGGAAGTAGAGGAGCCAATTGAAGAAGATAACTTCGACAGCACTCTGTAC
ATTTTCGCTTGCGGACAAAGTAGAGAGACAGAGAGGGGGCTTCGAAGGGTTTAGGGTTTA
GACCC

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

CO CL6540Contig1 686 2 1 U
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GTTCCGGTTGATAAAGGGGCTAATATTCATGACATTTATTGCAATCATTGTGATATTGAT
CACACTTGCTCACATGACGATTCAAGATATTATTGTGTGCATCCTTGCGTTTATGCCTAC
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CTGGGGATCAGTGAGGACACTAGCTCGTGGATATGAGATAGTGATGGGACTGTTGCTGTT
CACACCAGTGGCGTTCTTGGCTTGGTTTCCTTTTGTGTCGGAGTTTCAGACGCGTATGCT
CTTCAATCAAGCGTTCAGTAGAGGTCTTCAGATCTCTCGTATCCTTAGAGGACATAGGAA
GGATCGTTCTTCTCGAAACAAGGAGTGAAACATCATCGTCGTCATCACTTGTTCTCCACT
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ATGTTGAATGTAGTATGTTTTAACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1H134TF U 1
AF RS1H134JQB C 27
BS 1 686 RS1H134TF

RD RS1H134TF 686 0 0
GGAGAGGACTAAAAACTTTCTGGTTTATGGAGTGTCGTGGCTGGTGATTTTCTTGATATT
GTTTGTGATGAAGACTATCTCGGTGGGAAGGAGGAAGTTCAGTGCGAGTTTCCAGCTGAT
GTTCCGGTTGATAAAGGGGCTAATATTCATGACATTTATTGCAATCATTGTGATATTGAT
CACACTTGCTCACATGACGATTCAAGATATTATTGTGTGCATCCTTGCGTTTATGCCTAC
AGGCTGGGGTATGCTCTTGATTGCGCAAGCGTGTAAGCCAGTGGTGCATAGAGCAGGGTT
CTGGGGATCAGTGAGGACACTAGCTCGTGGATATGAGATAGTGATGGGACTGTTGCTGTT
CACACCAGTGGCGTTCTTGGCTTGGTTTCCTTTTGTGTCGGAGTTTCAGACGCGTATGCT
CTTCAATCAAGCGTTCAGTAGAGGTCTTCAGATCTCTCGTATCCTTAGAGGACATAGGAA
GGATCGTTCTTCTCGAAACAAGGAGTGAAACATCATCGTCGTCATCACTTGTTCTCCACT
TCACTGTAATGCAGAGGGATGTCTAGTCAGTAAAACATATCTAGTTCTTTTATCTTTAGC
TATTGTTGTTGTTGTTGGTACAAGTAGTGAATCGTATGAGTTGGGTTAAAAAACAATACA
ATGTTGAATGTAGTATGTTTTAACTG

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1H134JQB 660 0 0
ATGGAGTGTCGTGGCTGGTGATTTTCTTGATATTGTTTGTGATGAAGACTATCTCGGTGG
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TCATGACATTTATTGCAATCATTGTGATATTGATCACACTTGCTCACATGACGATTCAAG
ATATTATTGTGTGCATCCTTGCGTTTATGCCTACAGGCTGGGGTATGCTCTTGATTGCGC
AAGCGTGTAAGCCAGTGGTGCATAGAGCAGGGTTCTGGGGATCAGTGAGGACACTAGCTC
GTGGATATGAGATAGTGATGGGACTGTTGCTGTTCACACCAGTGGCGTTCTTGGCTTGGT
TTCCTTTTGTGTCGGAGTTTCAGACGCGTATGCTCTTCAATCAAGCGTTCAGTAGAGGTC
TTCAGATCTCTCGTATCCTTAGAGGACATAGGAAGGATCGTTCTTCTCGAAACAAGGAGT
GAAACATCATCGTCGTCATCACTTGTTCTCCACTTCACTGTAATGCAGAGGGATGTCTAG
TCAGTAAAACATATCTAGTTCTTTTATCTTTAGCTATTGTTGTTGTTGTTGGTACAAGTA
GTGAATCGTATGAGTTGGGTTAAAAAACAATACAATGTTGAATGTAGTATGTTTTAACTG

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL6541Contig1 804 2 10 U
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TGGATCTGGATTTGAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAGCGAATAGATTTAAAATCTCCGATC
GAGAATTTGAATTGGGAAGCTTTTTGAAAATTCTTAACTTTGAAATCTCCGTTTCTTTTT
TTGAATCACGGATTAAAACCCTAATTTCAGTTATTGAGATCGTATTCGAATGGGGAAAGA
TGAGGATTTGATTGTGTTGGCGGCGGGTGTAGAGGATGGAAAGATCGGTGGTGCTGCTTC
TGGTAACGCTTCGATTGAAGAAGTTAAGGGAGACGGCGGAGACGTCGATGGTGGTGGCGC
TGTGACCGGAGGAAGAGGAGGAGGATTTGACGGCAATTCTAGGGTTTGGACAATGAGTGA
TTTGGTGAATAAGTATCCAGGGTACCGTGGATACGCGAACTCGGGATTGTCGAATTTCGC
ATGGGCGCAGGCTGTGCAGAACAAACCGCTGAGTGAAGGTTTGGGGAGGGAGTATGAAAC
GAGAGAGAGTGATAAGATTGTGATTGAAGACAGTGATGATGAGAAAGAGGAAGGAGAGTT
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TCTTGTTGTTGTTGCTGATAAAGTGGAAGATGATGATAGGGTTCAGAAGGAGAGGGATTT
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GATGTAAGTCGTGACGATGATGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G277TF U 1
AF RS1G277JQ C 84
BS 1 702 RS1G277TF
BS 703 703 RS1G277JQ
BS 704 709 RS1G277TF
BS 710 710 RS1G277JQ
BS 711 726 RS1G277TF
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BS 728 752 RS1G277TF
BS 753 753 RS1G277JQ
BS 754 767 RS1G277TF
BS 768 804 RS1G277JQ

RD RS1G277TF 767 0 0
TTTTTTTGTTCACAATCTCTCAAGCTCGTCGGCGTCGGGAGAAAAAAAAAATCTCAAAAT
TGGATCTGGATTTGAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAGCGAATAGATTTAAAATCTCCGATC
GAGAATTTGAATTGGGAAGCTTTTTGAAAATTCTTAACTTTGAAATCTCCGTTTCTTTTT
TTGAATCACGGATTAAAACCCTAATTTCAGTTATTGAGATCGTATTCGAATGGGGAAAGA
TGAGGATTTGATTGTGTTGGCGGCGGGTGTAGAGGATGGAAAGATCGGTGGTGCTGCTTC
TGGTAACGCTTCGATTGAAGAAGTTAAGGGAGACGGCGGAGACGTCGATGGTGGTGGCGC
TGTGACCGGAGGAAGAGGAGGAGGATTTGACGGCAATTCTAGGGTTTGGACAATGAGTGA
TTTGGTGAATAAGTATCCAGGGTACCGTGGATACGCGAACTCGGGATTGTCGAATTTCGC
ATGGGCGCAGGCTGTGCAGAACAAACCGCTGAGTGAAGGTTTGGGGAGGGAGTATGAAAC
GAGAGAGAGTGATAAGATTGTGATTGAAGACAGTGATGATGAGAAAGAGGAAGGAGAGTT
GGAGGAAGGGGAGATTGATTTGGACTCTACTGCTACAAGAGTTGAGATGGATACTGAATC
TCTTGTTGTTGTTGCTGATAAAGTGGAAGATGATGATAGGGT*CAGAAG*AGAGGGATTT
GGAGAC*AAAGTGAAACTCATCCGTGATGTGT*GGAGAGTACCTCGT

QA 1 767 1 767
DS 

RD RS1G277JQ 721 0 0
AGAAAAGAAAAAGCGAATAGATTTAAAATCTCCGATCGAGAATTTGAATTGGGAAGCTTT
TTGAAAATTCTTAACTTTGAAATCTCCGTTTCTTTTTTTGAATCACGGATTAAAACCCTA
ATTTCAGTTATTGAGATCGTATTCGAATGGGGAAAGATGAGGATTTGATTGTGTTGGCGG
CGGGTGTAGAGGATGGAAAGATCGGTGGTGCTGCTTCTGGTAACGCTTCGATTGAAGAAG
TTAAGGGAGACGGCGGAGACGTCGATGGTGGTGGCGCTGTGACCGGAGGAAGAGGAGGAG
GATTTGACGGCAATTCTAGGGTTTGGACAATGAGTGATTTGGTGAATAAGTATCCAGGGT
ACCGTGGATACGCGAACTCGGGATTGTCGAATTTCGCATGGGCGCAGGCTGTGCAGAACA
AACCGCTGAGTGAAGGTTTGGGGAGGGAGTATGAAACGAGAGAGAGTGATAAGATTGTGA
TTGAAGCCAGTGATGATGAGAAAGAGGAAGGAGAGTTGGAGGAAGGGGAGATTGATTTGG
ACTCTACTGCTACAAGAGTTGAGATGGATACTGAATCTCTTGTTGTTGTTGCTGATAAAG
TGGAAGATGATGATAGGGTTCAGAAGGAGAGGGATTTGGAGACCAAAGTGAAACTCATCC
GTGATGTGTTGGAGAGTACCTCGTTGGTCCAAGCACAGATGTAAGTCGTGACGATGATGA
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL6542Contig1 739 2 4 U
GGGTCTTGGTGGTGGTTATCTGCAAAAAAAGAAGAAGATGGACATGGGATTCGCAGACCG
TCGAAATACTAGCAGGAACCATCTGGTGACCCATGTCTCAAAGTCAACGCAAAAGGGAAG
CTCTTCTTTGCTTTGTTACTGATCTGATCTGCTATTTTATTCATTCAATTCAATTCAATT
TGGGGGGTGATTGACAGGAGGAGCCCTTCAATGCCTCGCTCTGCCTTAGTGTCATCTTAT
GTCACTTCCAGTATCCATCTTTTCTACAAGCGAAATCATGGTCGAAAAGTGAACCCTCTT
AGCCAAGCCACAAATCCTTGGAGAGGTTTGATATCTTTCTCTTTTGCCTCCTCAGCAGCA
AAACTAGTCTCATCATCAACAAAAAAGAGTGCCATGTCTATCTCAGCAAAAGTGTCATAC
CAAAAAAGATTTTCCCTGTTCAGAGTTGTGGGAATGGGCAGTTGCCGGAAAACGTGGAGT
CAGTGTGGAACCTAAGAGGGGTGCTCAACGCCGTTGCACCGTGTCCTGAACCCACTCAAC
TTGTGGATCAATGTCCTCTTCTTTGACCTCTTCTCGGTTTCAAAACACAAGACTCTTTAA
AAAAGAATGTATCCACCTGTGATTATTCTTTTAGCTTTTCGTCCTAGTTTGGTGCGTTAT
TTTAATATCCAACCACTGTTTACCGATTTTGATGCATTATTATTTTTATAACAAATGTGC
TTGCAATATCGTATGGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CT20TF U 1
AF RS1CT20JQ C 31
BS 1 698 RS1CT20TF
BS 699 699 RS1CT20JQ
BS 700 717 RS1CT20TF
BS 718 739 RS1CT20JQ

RD RS1CT20TF 717 0 0
GGGTCTTGGTGGTGGTTATCTGCAAAAAAAGAAGAAGATGGACATGGGATTCGCAGACCG
TCGAAATACTAGCAGGAACCATCTGGTGACCCATGTCTCAAAGTCAACGCAAAAGGGAAG
CTCTTCTTTGCTTTGTTACTGATCTGATCTGCTATTTTATTCATTCAATTCAATTCAATT
TGGGGGGTGATTGACAGGAGGAGCCCTTCAATGCCTCGCTCTGCCTTAGTGTCATCTTAT
GTCACTTCCAGTATCCATCTTTTCTACAAGCGAAATCATGGTCGAAAAGTGAACCCTCTT
AGCCAAGCCACAAATCCTTGGAGAGGTTTGATATCTTTCTCTTTTGCCTCCTCAGCAGCA
AAACTAGTCTCATCATCAACAAAAAAGAGTGCCATGTCTATCTCAGCAAAAGTGTCATAC
CAAAAAAGATTTTCCCTGTTCAGAGTTGTGGGAATGGGCAGTTGCCGGAAAACGTGGAGT
CAGTGTGGAACCTAAGAGGGGTGCTCAACGCCGTTGCACCGTGTCCTGAACCCACTCAAC
TTGTGGATCAATGTCCTCTTCTTTGACCTCTTCTCGGTTTCAAAACACAAGACTCTTTAA
AAAAGAATGTATCCACCTGTGATTATTCTTTTAGCTTTTCGTCCTAGTTTGGTGCGTTAT
TTTAATATCCAACCACTGTTTACCGATTTTGATGCATT*TTATTTTTATAACAAATG

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1CT20JQ 709 0 0
GAAGAAGATGGACATGGGATTCGCAGACCGTCGAAATACTAGCAGGAACCATCTGGTGAC
CCATGTCTCAAAGTCAACGCAAAAGGGAAGCTCTTCTTTGCTTTGTTACTGATCTGATCT
GCTATTTTATTCATTCAATTCAATTCAATTTGGGGGGTGATTGACAGGAGGAGCCCTTCA
ATGCCTCGCTCTGCCTTAGTGTCATCTTATGTCACTTCCAGTATCCATCTTTTTTACAAG
CGAAATCATGGTCGAAAAGTGAACCCTTTTAGCCAAGCCACAAATCCTTGGAGAGGTTTG
ATATCTTTTTCTTTTGCCTCCTCAGCAGCAAAACTAGTCTCATCATCAACAAAAAAGAGT
GCCATGTCTATTTCAGCAAAAGTGTCATACCAAAAAAGATTTTCCCTGTTCAGAGTTGTG
GGAATGGGCAGTTGCCGGAAAACGTGGAGTCAGTGTGGAACCTAAGAGGGGTGCTCAACG
CCGTTGCACCGTGTCCTGAACCCACTCAACTTGTGGATCAATGTCCTCTTCTTTGACCTC
TTCTCGGTTTCAAAACACAAGACTCTTTAAAAAAGAATGTATCCCCCTGTGATTATTCTT
TTAGCTTTTCGTCCTAGTTTGGTGCGTTATTTTAATATCCAACCACTGTTTACCGATTTT
GATGCATTATTATTTTTATAACAAATGTGCTTGCAATATCGTATGGTTG

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 2

CO CL6543Contig1 847 2 4 U
GGAGATCATCCAAACATCATGAAACTAAGGGATCATCGCGTCACGTAATTCAGGCAGCAT
GTACTTTGTGTTCGATTACATGGAGCACGATCTCGAAGGCTTATGTACATCTCCTGACAT
CAAATTCACCGAGGCACAGATAAAATGCTACATGCAGCAGCTTATATGGGGAGTAGAACA
TTGTCATGTACGAGGGATCATGCATAGAGACATTAAAGCCGCAAACATTCTGGTGAATAA
CAAAGGAGTTTTGAAGCTAGCTGATTTTGGACTAGCTAACATTGTAACGCCAAGAAACAA
GAATCAGCTAACAAGTAGGGTTGTGACGCTATGGTACCGTGCACCTGAACTTCTAATGGG
TTCCACGAGTTATAATGTATCCGTGGATCTTTGGAGCGTTGGATGTGTTTCCGCTGAGAT
TCTTACCGGAAGACCACTGCTTAAGGGAAGAACAGAGATTGAACAACTTCACAAAATTTA
TAAACTATGTGGATCACCAAATGAAGAGCTTTGGGAAAAGAACAAGCTTCATCCTCAAAC
TAAGATGTTTAAAACACAACATCAATATGAAGGTTGTCTGAGAGAAAGATTTGAGGAGTT
TCCCAAAACAGCAATTGATCTTCTTGAGAATCTATTATCTATGGATCCAGAGAAACGAGG
AACTGCCTCTTCTGCTCTCATGTCCGAGTACTTTAACACAAAGCCTTACGCTTGTGATCC
ATCGACATTACCTAAGTATCCTCCTAACAAAGAAATGGATGCTAAGTACCGTGAAGACTT
CAACGAAGAAGAAGATTTACTATAAATAAAAGAGATAACTTGTCATCAAAGAAGCAGTGA
AGTCACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GO11TF U 1
AF RS1DN28TF U 122
BS 1 410 RS1GO11TF
BS 411 411 RS1DN28TF
BS 412 546 RS1GO11TF
BS 547 847 RS1DN28TF

RD RS1GO11TF 546 0 0
GGAGATCATCCAAACATCATGAAACTAAGGGATCATCGCGTCACGTAATTCAGGCAGCAT
GTACTTTGTGTTCGATTACATGGAGCACGATCTCGAAGGCTTATGTACATCTCCTGACAT
CAAATTCACCGAGGCACAGATAAAATGCTACATGCAGCAGCTTATATGGGGAGTAGAACA
TTGTCATGTACGAGGGATCATGCATAGAGACATTAAAGCCGCAAACATTCTGGTGAATAA
CAAAGGAGTTTTGAAGCTAGCTGATTTTGGACTAGCTAACATTGTAACGCCAAGAAACAA
GAATCAGCTAACAAGTAGGGTTGTGACGCTATGGTACCGTGCACCTGAACTTCTAATGGG
TTCCACGAGTTATAATGTATCCGTGGATCTTTGGAGCGTTGGATGTGTTTTCGCTGAGAT
TCTTACCGGAAGACCACTGCTTAAGGGAAGAACAGAGATTGAACAACTTCACAAAATTTA
TAAACTATGTGGATCACCAAATGAAGAGCTTTGGGAAAAGAACAAGCTTCATCCTCAAAC
TAAGAT

QA 1 546 1 546
DS 

RD RS1DN28TF 726 0 0
G
AATTCACCGAGGCACAGATAAAATGCTACATGCAGCAGCTTATATGGGGAGTAGAACATT
GTCATGTACGAGGGATCATGCATAGAGACATTAAAGCCGCAAACATTCTGGTGAATAACA
AAGGAGTTTTGAAGCTAGCTGATTTTGGACTAGCTAACATTGTAACGCCAAGAAACAAGA
ATCAGCTAACAAGTAGGGTTGTGACGCTATGGTACCGTGCACCTGAACTTCTAATGGGTT
CCACGAGTTATAATGTATCCGTGGATCTTTGGAGCGTTGGATGTGTTTCCGCTGAGATTC
TTACCGGAAGACCACTGCTTAAGGGAAGAACAGAGATTGAACAACTTCACAAAATTTATA
AACTATGTGGATCACCAAATGAAGAGCTTTGGGAAAAGAACAAGCTTCATCCTCAAACTA
AGATGTTTAAAACACAACATCAATATGAAGGTTGTCTGAGAGAAAGATTTGAGGAGTTTC
CCAAAACAGCAATTGATCTTCTTGAGAATCTATTATCTATGGATCCAGAGAAACGAGGAA
CTGCCTCTTCTGCTCTCATGTCCGAGTACTTTAACACAAAGCCTTACGCTTGTGATCCAT
CGACATTACCTAAGTATCCTCCTAACAAAGAAATGGATGCTAAGTACCGTGAAGACTTCA
ACGAAGAAGAAGATTTACTATAAATAAAAGAGATAACTTGTCATCAAAGAAGCAGTGAAG
TCACG

QA 2 726 2 726
DS 



AS 1 2

CO CL6544Contig1 882 2 6 U
GGATTAGCATCCCGAAAGACAAAAAAAATCTCAAGAAAAATACAAAGGATGATGATCTCA
TCCTATTTACGTGTAATATTACTCTTATTATGCGCCACTGATCTCTACGCTTCAACATCA
ATAACCAGAACTAGAACCAGAACAATAACCAAAAGCAGCAGATCTAGAAGCAGATCGAGG
ACTGTATCATTACATCATGTGTTCCAAACCAGTAGGTCCAAGTGTCTGGGATGTTACCAC
GACTCGTTACAGTTCTTGTTCCGACAAAATTTGGTTCGTGCCCAAAGACTCGAAGCTCCT
TTGATTTGGGACCGCAGACTCGAGCACTACGCTCAAAACTGGGCTAATCAAAGAAAAGGA
GATTGTGCTTTAAGACATTCTTTCCAAAACGGTGAGTTTACTCTCGGCGAAAACGTTTTC
CAAGGTTACGGCAAAGACTGGTCCCCGGCCGACGCAGTGGTCGCGTGGCCAGCGAGAAGA
GGTATTATAATTACGGTTCTAATACGTGCGACCCTGGGAAGGTGTGTGGGCATTACACAC
AGATGGTGTGGAAGAACACGAGGAGGGTCGGGTGTGCACGTGTAAAGTGCGACAGTGGTG
CGATTTTCATGACTTGTAACTATGATCCTCCCGGTAACTACGTCGGCCAGAAACCCTATT
GAGCGATCATTCATCTACTCTTTGATCTTAATTTAGAAATTGTTATATGACTTTTTGAAG
GAAGTTAAGTGGATGTATATAATTTATTTGGATATTTTACTAGAAAATAGACGCCTTTTG
TGTGGCTCGTGATACTGGTTATGTTTGTATCTCTAAAAGTGATTATTTCAGTTGATGGTT
GTAATTGCATTTACGATTATTCATATATATCCGTCCAATTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1B986TF U 1
AF RS1B986JQ C 83
BS 1 698 RS1B986TF
BS 699 699 RS1B986JQ
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GATTGTGCTTTAAGACATTCTTTCCAAAACGGTGAGTTTACTCTCGGCGAAAACGTTTTC
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QA 1 745 1 745
DS 

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CAATAACCAAAAGCAGCAGATCTAGAAGCAGATCGAGGACTGTATCATTACATCATGTGT
TCCAAACCAGTAGGTCCAAGTGTCTGGGATGTTACCACGACTCGTTACAGTTCTTGTTCC
GACAAAATTTGGTTCGTGCCCAAAGACTCGAAGCTCCTTTGATTTGGGACCGCAGACTCG
AGCACTACGCTCAAAACTGGGCTAATCAAAGAAAAGGAGATTGTGCTTTAAGACATTCTT
TCCAAAACGGTGAGTTTACTTTCGGCGAAAACGTTTTCCAAGGTTACGGCAAAGACTGGT
CCCCGGCCGACGCAGTGGTCGCGTGGCCAGCGAGAAGAGGTATTATAATTACGGTTTTAA
TACGTGCGACCCTGGGAAGGTGTGTGGGCATTACACACAGATGGTGTGGAAGAACACGAG
GAGGGTCGGGTGTGCACGTGTAAAGTGCGACAGTGGTGCGATTTTCATGACTTGTAACTA
TGATCCTCCCGGTAACTACGTCGGCCAGAAACCCTATTGAGCGATCATTCATCTACTCTT
TGATCTTAATTTAGAAATTGTTATATGACTTTTTGAAGGAAGTTAAGTGGATGTATATAA
TTTATTTGGATATTTTACTAGAAAATAGACGCCTTTTGTGTGGCTCGTGATACTGGTTAT
GTTTGTATCTCTAAAAGTGATTATTTCAGTTGATGGTTGTAATTGCATTTACGATTATTC
ATATATATCCGTCCAATTAT

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 2

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CCAGACGTTATGAGTTGTCTTCATTCATTGGCTTTAAGAGATGTCTTAACTCCACCGACG
AGAATCAAGCACGACGTCTCATACAATGATATCATCCAATTCCAAGGCGGTTTCTTCAAC
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GCTTTCGAAGAAGCTTGAGATTACATAGGATGCAGTAGAAGAGAACGAAGAAGACGCAGA
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GGCTGCCGAAGTTCATCGCCAGGTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CJ66TF U 1
AF RS1CJ66JQ C 46
BS 1 686 RS1CJ66TF

RD RS1CJ66TF 686 0 0
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CCAGACGTTATGAGTTGTCTTCATTCATTGGCTTTAAGAGATGTCTTAACTCCACCGACG
AGAATCAAGCACGACGTCTCATACAATGATATCATCCAATTCCAAGGCGGTTTCTTCAAC
TATAAAAAGGGCTCTTCGAATACAATAAGCTTTCTCCGATCCTCTTATTCGTTGTACGAC
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TGGTGGCGCTGAGTCCTCCTCCTCCTCCAAAGGGAAAGAGGAGGAACAGTTAGAGTCGGA
GCTTTCGAAGAAGCTTGAGATTACATAGGATGCAGTAGAAGAGAACGAAGAAGACGCAGA
AGAAGATGGTAGCAAAGGTGAGACATCAACGAAGAAGAAGAAGAAAAAGAAGAGTAAAAG
CAAGAAGAAGCCTCACCAGACTGATCCACCTACAATCCCTGTCGTTAAGCTTTTTCCATC
TGGAGAGTTTCCTGAAGGTGAAATCCAACAGTACAAGGATGACAATTTGTGGAGAACAAC
ATCTGAAGAGAAGAGAGAGTTGGAGCGTTTGGAGAAGCCTATATACAACTCTGTACGCAA
GGCTGCCGAAGTTCATCGCCAGGTAG

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1CJ66JQ 641 0 0
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TTAACTCCACCGACGAGAATCAAGCACGACGTCTCATACAATGATATCATCCAATTCCAA
GGCGGTTTCTTCAACTATAAAAAGGGCTCTTCGAATACAATAAGCTTTCTCCGATCCTCT
TATTCGTTGTACGACAAATCGATTAAAGATGGCGAGCGAAAGCCCTGAAGTCTTTGTTGC
TCCCGTTGTGGAGAATGGTGGCGCTGAGTCCTCCTCCTCCTCCAAAGGGAAAGAGGAGGA
ACAGTTAGAGTCGGAGCTTTCGAAGAAGCTTGAGATTACATAGGATGCAGTAGAAGAGAA
CGAAGAAGACGCAGAAGAAGATGGTAGCAAAGGTGAGACATCAACGAAGAAGAAGAAGAA
AAAGAAGAGTAAAAGCAAGAAGAAGCCTCACCAGACTGATCCACCTACAATCCCTGTCGT
TAAGCTTTTTCCATCTGGAGAGTTTCCTGAAGGTGAAATCCAACAGTACAAGGATGACAA
TTTGTGGAGAACAACATCTGAAGAGAAGAGAGAGTTGGAGCGTTTGGAGAAGCCTATATA
CAACTCTGTACGCAAGGCTGCCGAAGTTCATCGCCAGGTAG

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

CO CL6546Contig1 661 2 1 U
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ATAGAGAAACTGAAGCCATTGAAGAGTTATCAAAAGCTATAGCCTTTAAACCTGACCTCC
AGCTGTTACATCTCCGAGCAGCATTCTTCGCTTCAATGCGTGAAACCACAAACGCTATCA
GAGACTGTGAAGCAGCTCTGAGTCTTGATCCATGCCACAAAGATACCATCAACCTCTATC
ACAATGTACGTGAACCACAATCATAGACAAACCCATCTGCCATCTTATTTATATCCTAAA
CTATGGCGAGAGCTTCTTTCGTCTAAAACCACATATACATGTACCGTTCCATATCTATTA
TGGAACATTCCAATGAGAAACTAAGCTTGGTTCTTTTTGTGATCAATAAGTTTTGATAGA
AAGATCTGGGAACAAACCAAAAGGAGCAGCAACATAGAATGTAAATATAACTTCATACTT
TGGGTTTTGGGATTGATTCTGGTTTGATGACTGGATAAGGTTAATATATGATTAGTGCAG
AGTGTGTTCCGGACAAAACAGAACACTAAAAATATTGATATGTCATGTTTTGTTTTTAGA
T


BQ
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20 

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T

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T

QA 1 661 1 661
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BQ
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AF RS1GC18JQ C 1
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TTGTGAGTTTCCATTAGTAATGAATCAGATTGCTATTTTAT

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

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CGG


BQ
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20 20 20 

AF RS1AX71JQ C 1
AF RS1AX71TF U 1
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CGG

QA 1 663 1 663
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CCGAGTGGGAGACTCCACGCCATTTGCCCAAGTTATAGAGAGAGCCAAAGAAAAAAAAAA
AAGAAAAACAATAAACCAGAGAACAGCAACAACACAGAGCTACACAATGGATTAAAGACC
TATTGATATTCTTCTGATTGATCACTTTGGCTATTTATTTCAAAAGAATGGTTTCTCTGT
TGTATCCAAAACTCACAAAACAATAGAGATTCCCTTGTAATGCTATTTGCCTACTTCTAC
CGG

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

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AAGAAGAGGTTGAAAATGCAACGGTTGCGTCTGTAAAAGTGGCCGAACTAACCTCAAAGC
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AAAAGGCAGTCACTGAATTTGAATCGATGGTCAAAGATCTTGAACAGAAAGTGCAGCTCG
CGGATGCTAAAGCTAAGGAAACGGAGGCAGAGGATGTAGTTATCAAATCTCGAGACGTTG
ACTTGTCCTTTTCATCTCCAACGAAACGTACGAGCAAGAAGAAGTCAGAGGCATCTCCTT
CATCTTCTTCTTCGAGCAACGTTACTGCTACTCAGACGGCTACAACTTCTCATCTCATGA
CAGTGAAGATTATCGCTGGAGTAGCTCTGATCTCCGTTATCATCGGTATAATTCTTGGGA
AAAAGTACTAGTGTTCTTGTTTGGGTGTGATGTTCATATGTGAAGATCTCTCCCTTTATT
TGTTTTTTTTTTAATTTTGATAAAAAAATCTCTCAGAAGCTTCATGAGAGATGTAATGTT
TAGCAGAATTTGGGAAGCTTTGCTTCTCTCTGCAGATTGTTTGTGGTTCTTTTTTTTGGT
GGCTTGTTGGTCAAGCAATGTTTTGATACTCTTAAAATTAAATGAAGGTGAAGTTATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AH72TF U 1
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BS 726 840 RS1AH72JQ

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AAAAGTACTAGTGTTCTTGTTTGGGTGTGATGTTCATATGTGAAGATCTCTCCCTTTATT
TGTTTTTTTTTTAATTTTGATAAAAAAATCTCTCAGAAGCTTCATGAGAGATGTAATGTT
TAGCA

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1AH72JQ 724 0 0
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AAGAAAAAGGCAGTCACTGAATTTGAATCGATGGTCAAAGATCTTGAACAGAAAGTGCAG
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GTTGACTTGTCCTTTTCATCTCCAACGAAACGTACGAGCAAGAAGAAGTCAGAGGCATTT
CCTTCATTTTTTTTTTCGAGCAACGTTACTGCTACTCAGACGGCTACAACTTCTCATCTC
ATGACAGTGAAGATTATCGCTGGAGTAGCTCTGATCTCCGTTATCATCGGTATAATTCTT
GGGAAAAAGTACTAGTGTTCTTGTTTGG*TGTGATGTTCATATGTGAAGATCTCTCCCTT
TATTTGTTTTTTTTTTAATTTTGATAAAAAAATCTCTCAGAAGCTTCATGAGAGATGTAA
TGTTTAGCAGAATTTGGGAAGCTTTGCTTCTCTCTGCAGATTGTTTGTGGTTCTTTTTTT
TGGTGGCTTGTTGGTCAAGCAATGTTTTGATACTCTTAAAATTAAATGAAGGTGAAGTTA
TTTG

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1F315TF U 1
AF RS1F315JQ C 87
BS 1 569 RS1F315TF
BS 570 571 RS1F315JQ

RD RS1F315TF 569 0 0
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TAAAAAATAATGCGAAAATGATGAAAAAGGAAGTTAGAAAAATGCAAAAACTTGAACAAG
ATACGAGAGCTGTTGAGTGCAAGATTCTCGAGCTGCAGATCCAAAGAGAAGTCTTAGAAC
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TAATGAGCTCGAACTCGGCTCTGTTTTGCAAAATGAAAGGTAGACTAGATGTAAGTTAAA
AAAGACGTTTGGTTGTGGTAGATGGCAAGGTTAGTTTAACTAATCCTTCTAAGATAATTA
GGAAAAAATCATGTCACTTGTAGATATGAAGACTGCTTGTTTAGTGGTGTTTTGGTAATC
ATGAAATGATAATGGTAATGAAGTTTTTG

QA 1 569 1 569
DS 

RD RS1F315JQ 485 0 0
T
TCATAGAAAAACAAGTGAAAACAGAGAAGAGACTAAAAAATAATGCGAAAATGATGAAAA
AGGAAGTTAGAAAAATGCAAAAACTTGAACAAGATACGAGAGCTGTTGAGTGCAAGATTC
TCGAGCTGCAGATCCAAAGAGAAGTTTTAGAACAGAAGAAGAAAGATGTTTCAGAGATAC
AGCTTTGTGCAGAAGATCTTGACAAAGAGATTCAAGGTGTGGATTTTGGAACGACCGTAT
CAGGTGCTTGGTGATATTAAAAAAAAAATACTATAATGAGCTCGAACTCGGCTTTGTTTT
GCAAAATGAAAGGTAGACTAGATGTAAGTTAAAAAAGACGTTTGGTTGTGGTAGATGGCA
AGGTTAGTTTAACTAATCCTTTTAAGATAATTAGGAAAAAATCATGTCACTTGTAGATAT
GAAGACTGCTTGTTTAGTGGTGTTTTGGTAATCATGAAATGATAATGGTAATGAAGTTTT
TGGT

QA 2 485 2 485
DS 



AS 1 2

CO CL6551Contig1 653 2 1 U
GGATCGTCCCAGATTTAAGCAAATATCGAATTGTATTCCGAGCTTGCTGGAGGAGGAAGA
AAGAGCAGCGATTTCCGTTCATTAGTTATCGTAGTTAACTCTATTTTCACGGTTGTTTAG
AGCTTTGTATTCGAGAATGGCTGAGGAAGCGCACAAGGTTACGTTGGATGTCTACGACCT
AAGCCGAGGCTTGGCTCGCCAGCTCTCTGCTTCATTTTTGGTGCTTTTGGCAAGGATGAA
GGTCCAAAACTACCGAGCAAGCCCAAGGAGAATAACTCGAAGTCTGAGGATGCCAAAACC
TCGGTTCCAGCTGAAAAAGTGGCACCTGCTGTTGCTCAAACTTCTTCTAGTAAAGAGAAG
GTGAAGGAGGATCCATTGGGTGATGCTAGGACCAAGATTCAGGAAGAGATTACCCGTGAG
TTTGCAGCTCTCATGGCGCAAGGCACACTAAGAGCAAGTGAAGCAGCTGCCATGGCCACC
AAAAGAGTGATGCAAAAGTATGGACATCTCAATATATCTGCCTAGTCTATAATAAAACCA
GATTAAACCGTTTATCTTGCTGTTGTATTGAAACCGAGTCCATGATTTTGAACGATTTTT
ATTACTATTTTTTCCAACTACATTCGTATATATCAAAAAATCAGGAAACAAGC


BQ
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AF RS1H306JQB C 1
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ATTACTATTTTTTCCAACTACATTCGTATATATCAAAAAATCAGGAAACAAGC

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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1D218TF U 1
AF RS1D218JQ C 27
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BQ
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AF RS1BU17JQ U 1
AF RS1FU82JQ U 7
BS 1 521 RS1BU17JQ
BS 522 734 RS1FU82JQ

RD RS1BU17JQ 521 0 0
TTTATTAATAATCATAACGACTGAATAACTAGAAAATATTTTATTACTAAAAAAAAAACT
CAAATGAGTGGAAACAAAAGAGAAGGAAATGTTGTTCTTCTGTGGAATTCTTTAACTCTG
GACTTGATTAACGTTGAAGAATTTGCTGATCCCCTCTATCTTTTCCCCTAGAGCATCAAT
TTCCAGCAGCGAAGTTTCTAGATTTTGTTCCTTCGTCTCGAGCTCTGACCGAAACCGTCT
TACATCGGTTAAAGTTTGCACAATACTCTGTCTCACCTTACTCACTTGATCAGAAATTGA
GCAAGGTTCAGGGGCTTTCTTGTGCTGCAAGTTTGATGGACCAACACTGAATTTGTTTGA
TGCCCTGGTACGGCGAGATGATCCTCCTTCTGCAGAAACTCGAGCTTTCTTTTGGATACA
AGTCTCCATCTCTTCTTCAGCTCGTGATGCTTCAATCATCCTTGACTTTCTTCTGTTCAT
ACTAGGATTACCATCGAATAATGCTTCCTTCATCTTGGAGC

QA 1 521 1 521
DS 

RD RS1FU82JQ 728 0 0
AATAATCATAACGACTGAATAACTAGAAAATATTTTATTACTAAAAAAAAAACTCAAATG
AGTGGAAACAAAAGAGAAGGAAATGTTGTTCTTCTGTGGAATTCTTTAACTCTGGACTTG
ATTAACGTTGAAGAATTTGCTGATCCCCTCTATCTTTTCCCCTAGAGCATCAATTTCCAG
CAGCGAAGTTTCTAGATTTTGTTCCTTCGTCTCGAGCTCTGACCGAAACCGTCTTACATC
GGTTAAAGTTTGCACAATACTCTGTCTCACCTTACTCACTTGATCGGAAATTGAGCAAGG
TTCAGGTGCTTTCTTGTGCTGCAAGTTTGATGGACCAACACTGAATTTGTTTGATGCCCT
GGTACGGCGAGATGATCCTCCTTCTGCAGAAACTCGAGCTTTCTTTTGGATACAAGTCTC
CATCTCTTCTTCAGCTCGTGATGCTTCAATCATCCTTGACTTTCTTCTGTTCATACTAGG
ATTACCATCGAATAATGCTTCCTTCATCTTGGAGCAGATCTTGAGAATAGGACTAGTTCC
TCCTCGAATTATGTCAAGTGTGAAGGAATCACCAACTTTCTTTACGCCATTGGCTACAAG
GCAATCTTTAAAACCTTTAATGTAAAACTGTCCACGTCCTTTGACGCTAACTAGATGCAA
CTTCCACTCTACGCCGTCTTTGTTCACTAGAGTTACCTCTCCTGGTTCATTGATCCCGTT
CTCTCTTG

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL6554Contig1 570 2 4 U
TGAGAACCTCTCTTTTGCAATGGTGCTACACCAGCTATGGAGAGGTTTTCAGCTCCTGGA
TGCATTTCTGTGCTGCGCGCATATTCGCTGAGAGCATTATGAGATATGGTTTACCTCCTG
CGTTCTTGGCATGCGTCTTATCTCCGGCTGTGAAGAGCGAAAAGAAAGTGCGCTCCCTTC
TTGAACGCTTGTGTGATTCTACCAACAGTTTATACTGGAAAAGCGAGGAGGATGGAGGAG
CTGCCATGGCTGGTTTAGCAGGTGACTCAGAGACACATCCTTATGTCTCCTTCACGATCA
ACCTTGCTTGAAATTGATGAGAGATTGGTTTGATGCTTCTTCTTCATCTCAGTCTCCATC
TGTTATGTTTGTTTGTGTTCTATATATTTCATTTTTTATTTTTCGTAATATATTTTGAAA
ATAAAAGAAGGAAATATTAAGGTGGCACTCAAGATACTGTAATTTATTTGGCCGGAGCCT
TTTTAGATTCCGGTGAGTTTCTGTTCTGGAGGAGATGTTATACAGTTTGTTACCTTCTTG
AATAATAATATTTTCTTATTTCATTGTAAC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RS1FI81TF U 1
AF RS1AH92JQ C 6
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BS 78 79 RS1AH92JQ
BS 80 567 RS1FI81TF
BS 568 570 RS1AH92JQ

RD RS1FI81TF 567 0 0
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TGCATTTCTGTGCTGCG**CATATTCGCTGAGAGCATTATGAGATATGGTTTACCTCCTG
CGTTCTTGGCATGCGTCTTATCTCCGGCTGTGAAGAGCGAAAAGAAAGTGCGCTCCCTTC
TTGAACGCTTGTGTGATTCTACCAACAGTTTATACTGGAAAAGCGAGGAGGATGGAGGAG
CTGCCATGGCTGGTTTAGCAGGTGACTCAGAGACACATCCTTATGTCTCCTTCACGATCA
ACCTTGCTTGAAATTGATGAGAGATTGGTTTGATGCTTCTTCTTCATCTCAGTCTCCATC
TGTTATGTTTGTTTGTGTTCTATATATTTCATTTTTTATTTTTCGTAATATATTTTGAAA
ATAAAAGAAGGAAATATTAAGGTGGCACTCAAGATACTGTAATTTATTTGGCCGGAGCCT
TTTTAGATTCCGGTGAGTTTCTGTTCTGGAGGAGATGTTATACAGTTTGTTACCTTCTTG
AATAATAATATTTTCTTATTTCATTGT

QA 1 567 1 567
DS 

RD RS1AH92JQ 565 0 0
ACCTCTCTTTTGCAATGGTGTTACACCAGCTATGGAGAGGTTTTCAGCTCCTGGATGCAT
TTCTGTGCTGCGCGCATATTCGCTGAGAGCATTATGAGATATGGTTTACCTCCTGCGTTC
TTGGCATGCGTCTTATCTCCGGCTGTGAAGAGTGAAAAGAAAGTGCGCTCCCTTCTTGAA
CGCTTGTGTGATTCTACCAACAGTTTATACTGGAAAAGCGAGGAGGATGGAGGAGCTGCC
ATGGCTGGTTTAGCAGGTGACTCAGAGACACATCCTTATGTCTCCTTCACGATCAACCTT
GCTTGAAATTGATGAGAGATTGGTTTGATGCTTCTTCTTCATCTCAGTCTCCATCTGTTA
TGTTTGTTTGTGTTCTATATATTTCATTTTTTATTTTTCGTAATATATTTTGAAAATAAA
AGAAGGAAATATTAAGGTGGCACTCAAGATACTGTAATTTATTTGGCCGGAGTCTTTTTA
GATTCCGGTGAGTTTCTGTTCTGGAGGAGATGTTATACAGTTTGTTACCTTCTTGAATAA
TAATATTTTCTTATTTCATTGTAAC

QA 1 565 1 565
DS 



AS 1 2

CO CL6555Contig1 294 2 1 U
GGACAACCATCCGAACAAAAATTTGGAGCCAAGTATTACTTCAAAACTTTTAACCAAAAT
AAAATAAGATATAGAACCCATTCAAACCAAATTTCAGCCGTTGTAATCTAAATATAATCC
AAAAAGATCAAAAGTGTTCAATGATATGAAGCTATTAACAATGGTTTAATAGTTGGTTTT
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TTGTTAGAATATATAATGCTAAATTTGTTCAATCCAAAAAACTATTTTTACACC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1D419JQ C 1
AF RS1D419TF U 1
BS 1 294 RS1D419TF

RD RS1D419JQ 294 0 0
GGACAACCATCCGAACAAAAATTTGGAGCCAAGTATTACTTCAAAACTTTTAACCAAAAT
AAAATAAGATATAGAACCCATTCAAACCAAATTTCAGCCGTTGTAATCTAAATATAATCC
AAAAAGATCAAAAGTGTTCAATGATATGAAGCTATTAACAATGGTTTAATAGTTGGTTTT
GTAATGTTTCACGTTGTTCATAATGAAGACAAAAGATGTTGTGAAGATGTGATGAGAGAC
TTGTTAGAATATATAATGCTAAATTTGTTCAATCCAAAAAACTATTTTTACACC

QA 1 294 1 294
DS 

RD RS1D419TF 294 0 0
GGACAACCATCCGAACAAAAATTTGGAGCCAAGTATTACTTCAAAACTTTTAACCAAAAT
AAAATAAGATATAGAACCCATTCAAACCAAATTTCAGCCGTTGTAATCTAAATATAATCC
AAAAAGATCAAAAGTGTTCAATGATATGAAGCTATTAACAATGGTTTAATAGTTGGTTTT
GTAATGTTTCACGTTGTTCATAATGAAGACAAAAGATGTTGTGAAGATGTGATGAGAGAC
TTGTTAGAATATATAATGCTAAATTTGTTCAATCCAAAAAACTATTTTTACACC

QA 1 294 1 294
DS 



AS 1 2

CO CL6556Contig1 1045 2 2 U
GGATTTCGGCGTTGTTTTCTCTCTATAGTAATGTGTAGTATTGATCTATAAATCATTCTC
TTTCTCTCTACCCGTTTCACCCCTTATAGGAAAAAAAAACCAGTGAATCATCATCATCAT
CTTCTTCTTCCTTCTCCAAAAACAGATTTTCCGACCAAACTTGATCTGTTTTGTCTAAAG
CTTAATTAATAATAAATTAATGGCGGAAGAACATCGATGCCAAACACCGGAAGGCCACCG
TCTCTGCGTTAACAACTGTGGTTTCCTCGGCAGCTCAGCCACCATGAATCTCTGCTCCAA
TTGCTACGGCGATCTCTGCCTCAACGAACAGCAAGCCTCCGCCAAACCGACCGTCGAATC
CCCTCTCCCCGCCGCATCTTCTCCGTCGTCGTCGTCGTCGGAGATCATCGAATCCTTTTC
ACCCTCGTCTCCGACTGCGGAGAAACAAATCAAGCTGATCCCGACGACGGAGCAGAAGCA
GGAGCCGCCGCAACGGCCTAACCGGTGCACAGTGTGCAGGAAACGGGTCGGGTTGACCGG
ATTCATGTGCCGGTGCAGGACTACTTTCTGCGGGACCCACAGGTATCCGGAGGTTCACGG
GTGCACGTTCGATTTCAAATCGGCGGGGCGCGAAGAGATCGCAAAGGCTAATCCTTTGGT
CATAGCCGCGAAGCTCCAGAAGATATGATTTCAGCCGTTGGTTTTGCGTTGACCTTCCTT
CTTCTCTTTCCCGCGTTTACCGAGACAAGGGGTGTATTTCAGCCGTTTGTTATGTCGAAA
ACATAAACTTTGTTGTTGCGGAAACGTGTTACGTTATTAAAGGTTGAGATGGTTGTTACA
ATACTCACCTTTCATATTATTTTCCTTTTCTTCCGAAAGAATTTAAGTTTTTAAAAAAAA
ATTGTGTGGCTTCTTGCTTGTGGAAAAAAAAAGATTTTCTTTTGGGGGAAAAATATAATA
AAGTTGTGTCTCTTGTTTTTTTTTCAATTTTATTTTTGTTTGGGAATGTTTTATATACTG
ACGACATAAAGACGGTTTGATTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TACCGAGACAAGGGGTGTATTTCAGCCGTTTGTTATGTCGAAAACATAAACTTTGTTGTT
GCGGAAACGTGTTACGTTATTAAAGGTTGAGATGGTTGTTACAATACTCACCTTTCATAT
TATTTTCCTTTTCTTCCGAAAGAATTTAAGTTTTTAAAAAAAAATTGTGTGGCTTCTTGC
TTGTGGAAAAAAAAAGATTTTCTTTTGGGGGAAAAATATAATAAAGTTGTGTCTCTTGTT
TTTTTTTCAATTTTATTTTTGTTTGGGAATGTTTTATATACTGACGACATAAAGACGGTT
TGATTGTC

QA 1 608 1 608
DS 



AS 1 2

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ATGATGATGATGATGGTGATGATCTACGGCCGCTTGGCGAGATTGATCCCAAAAAGCTGA
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BQ
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TCACG

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AATTCTTGAACCAGTAGAAAAAAAACTATACATATTTATATTATCTTTGAGTTGTTCTCT
TTTC

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 2

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CTCACGTTTAACTTTGGTGTTCCTCAATTAGCAGAGAGAAGAAAATAAAGGCTGCGTTGG
AACCTAGTGACATGTAGTATCTAATTTCTTGCTTGGTGAAGTGAGGGTTTGAATGTGACT
TGTGGGCCAACTTTGAAATGGTACTTTCGGTTACATCTATGTTTACTTCTCAACTTTATA
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CATG


BQ
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AF RS1DK36JQ C 1
AF RS1DK36TF U 1
BS 1 664 RS1DK36TF

RD RS1DK36JQ 664 0 0
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CTGGCATTAACCCTGCAAGAAGTCTTGGAGCTGCAATTATCTACAACAAGGACCAAACTT
GGGACCATCATTGGATATTTTGGGTTGGTCCGTTTGCGGGTGCAGCCCTTGCGGCTTTCT
ACCATCAGTTTGTGTTGAGGGCTGGTGCGGTAAAGGCGCTCGGGTCCTTCAGGAGCCAGT
CTCACGTTTAACTTTGGTGTTCCTCAATTAGCAGAGAGAAGAAAATAAAGGCTGCGTTGG
AACCTAGTGACATGTAGTATCTAATTTCTTGCTTGGTGAAGTGAGGGTTTGAATGTGACT
TGTGGGCCAACTTTGAAATGGTACTTTCGGTTACATCTATGTTTACTTCTCAACTTTATA
TTTGCTCTATTGCGCTAGCTTGCTGAATTCCGTATGATCGACTTTCCACGTGAGAGTATA
AAAGTCCCCTAAACCTACACGTGGAAGATTATGCTTACTTTAAGAAAATACAATATTTTA
TGAAGTAGTCCTTTTATCAAAATTTTAAATTACGTTTTATATGTGTATGATTTTCTAATG
ACGTTTGATTGTTATTATTTTATATTAAAGATGAAAAAACACAAACTGGCAGTATCCATG
CATG

QA 1 664 1 664
DS 

RD RS1DK36TF 664 0 0
GATTACCAATTGGATTTGCGGTATTCATTGTTCACTTGGCTACAATCCCAATCACGGGCA
CTGGCATTAACCCTGCAAGAAGTCTTGGAGCTGCAATTATCTACAACAAGGACCAAACTT
GGGACCATCATTGGATATTTTGGGTTGGTCCGTTTGCGGGTGCAGCCCTTGCGGCTTTCT
ACCATCAGTTTGTGTTGAGGGCTGGTGCGGTAAAGGCGCTCGGGTCCTTCAGGAGCCAGT
CTCACGTTTAACTTTGGTGTTCCTCAATTAGCAGAGAGAAGAAAATAAAGGCTGCGTTGG
AACCTAGTGACATGTAGTATCTAATTTCTTGCTTGGTGAAGTGAGGGTTTGAATGTGACT
TGTGGGCCAACTTTGAAATGGTACTTTCGGTTACATCTATGTTTACTTCTCAACTTTATA
TTTGCTCTATTGCGCTAGCTTGCTGAATTCCGTATGATCGACTTTCCACGTGAGAGTATA
AAAGTCCCCTAAACCTACACGTGGAAGATTATGCTTACTTTAAGAAAATACAATATTTTA
TGAAGTAGTCCTTTTATCAAAATTTTAAATTACGTTTTATATGTGTATGATTTTCTAATG
ACGTTTGATTGTTATTATTTTATATTAAAGATGAAAAAACACAAACTGGCAGTATCCATG
CATG

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

CO CL6559Contig1 712 2 2 U
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CTTCACGGATCAGATACTCGGGGTACCACGACCAGGACGTTCTTAACTTCATCAAGAGGG
AGCCTTTTCTTGTCCGGATTGGGCTTAGGATTAGGTTCTTGAACACTGCGTATTTCGGTG
GACTCTGTGAACCAAGCAAAGATATGAATCTTGTTCGGACGATGCATGCGAACTGCTGCT
TTGGTTTGGATAGTAAGCTTCATGATCTTAGAATTATGCTTCAGGATTGGAGAGACTTTA
TGGCTTTGCCACTTCATCTTAAGCAGGAGTCTGGTTTCTCTTGGAAAGTCCCACAGAATT
GCAGTCTTGATTCACTTCGGAGATATGATGAATCTATGTATGAAGAAGAGAGCGAGCCAC
CTGGAGAATCCCAAGAGTGAAGTGTGAATGTGTTTACTAATGTATATAGAGATTTGTTTT
TGTTACATGGCAGAAGAAGAAAGATGGAATCAAGTTTTGTAAAAAAGTCATCGATTGCTC
TCAAAGAGGAGGAACCCATAACGCAAATGTCTTGTTTGTTTGTTGTGCCAAAAGAGCCCA
TTTTTCCTACTAATGAAGAGTACTTGTTCATTAATATTTACAATTTCTAACAAATACTTT
CTAGCCCCATTTATGTGTTCAGATTGTAATCTCAACATGCAAGATTTAAATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G278JQ C 1
AF RS1G278TF U 1
BS 1 667 RS1G278TF
BS 668 712 RS1G278JQ

RD RS1G278JQ 712 0 0
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GCAGTCTTGATTCACTTCGGAGATATGATGAATCTATGTATGAAGAAGAGAGCGAGCCAC
CTGGAGAATCCCAAGAGTGAAGTGTGAATGTGTTTACTAATGTATATAGAGATTTGTTTT
TGTTACATGGCAGAAGAAGAAAGATGGAATCAAGTTTTGTAAAAAAGTCATCGATTGCTC
TCAAAGAGGAGGAACCCATAACGCAAATGTCTTGTTTGTTTGTTGTGCCAAAAGAGCCCA
TTTTTCCTACTAATGAAGAGTACTTGTTCATTAATATTTACAATTTCTAACAAATACTTT
CTAGCCCCATTTATGTGTTCAGATTGTAATCTCAACATGCAAGATTTAAATT

QA 1 712 1 712
DS 

RD RS1G278TF 667 0 0
GAGGGTTTAGCTTTGTGAGGTCTAACAACAGGACTATACTCTTCTACAAGTACTGGTACG
CTTCACGGATCAGATACTCGGGGTACCACGACCAGGACGTTCTTAACTTCATCAAGAGGG
AGCCTTTTCTTGTCCGGATTGGGCTTAGGATTAGGTTCTTGAACACTGCGTATTTCGGTG
GACTCTGTGAACCAAGCAAAGATATGAATCTTGTTCGGACGATGCATGCGAACTGCTGCT
TTGGTTTGGATAGTAAGCTTCATGATCTTAGAATTATGCTTCAGGATTGGAGAGACTTTA
TGGCTTTGCCACTTCATCTTAAGCAGGAGTCTGGTTTCTCTTGGAAAGTCCCACAGAATT
GCAGTCTTGATTCACTTCGGAGATATGATGAATCTATGTATGAAGAAGAGAGCGAGCCAC
CTGGAGAATCCCAAGAGTGAAGTGTGAATGTGTTTACTAATGTATATAGAGATTTGTTTT
TGTTACATGGCAGAAGAAGAAAGATGGAATCAAGTTTTGTAAAAAAGTCATCGATTGCTC
TCAAAGAGGAGGAACCCATAACGCAAATGTCTTGTTTGTTTGTTGTGCCAAAAGAGCCCA
TTTTTCCTACTAATGAAGAGTACTTGTTCATTAATATTTACAATTTCTAACAAATACTTT
CTAGCCC

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 2

CO CL6560Contig1 1022 2 4 U
GAAGGTCGATGGTTATGGAATAGATTCTCTGTCGAGCTTTCTCATGGATTATGGATATCA
AGTTGGAGGCAGACTTGATTTTCCAAAGAAGCATGTACACGTTCTCTGGCTTTCTCCTCC
GGATATTAACGTCCCTGTTGAAGGATGCGGTCTAGGCAACGGCCCCTTGCCACGAATTGT
TATAGCTGAGCTTCTCGTGGACGAACTAAGCCAAGAATCACAGGAGATAATAAGGAAGTA
TTTGAAACCAGAAGGTGGTAAGTAAGCCATTCTTTCAAGTACGTTGGGGTCTTTAATTTG
GGAGAAGCCAACATCAGCCGACTTTAATCAACTTGCCAAAGAGAGTGAATATGGGGCATG
GGCGCTTTTCCATGGCTACACAATGAACCATCTTGCTATTGCGGTCCATCGACTTAAACA
TCGTTTCAGTGACATTAAATGTGTCGAAGAGTACTTCAAAGAAAAGGGATTCGAACTCAA
CAAAGACGGAGGAGATGTTCTCAAAGTGAGTGAAGATGGTTTACTATTACAAGTGTCGTT
GATGTCGGAGAAACACGAGGTTGAGTTTGCAGATGGGGGTAACTGAAACCATCACGGCTT
CATACATTGAGTTCGTCCAACGTCTAGTTCTTCCAGAGTTCAAAGATGTACCCGGTGATG
AGATCAAAGAATTTCATAGACGCGAGGGCCTCGAGCAAGCTAGCGCTTACCACATAATGG
AAAGCACCCGTTTCACAGCGCAAGATTAAAACCAGCTAGGCTTGTCTTGTTCTGCTCACT
ATGCCAGTGTTGTGTATCTTTAATTTTCCGTATGCTATTTTTAGACCATCTGCATGTTAA
ATCTATATGTTGTACTACTTCTCTTGTGAAGTGACGATAACTTATATTACCTCTCATGAT
AGTTATAGTTACCGATGAATAATTGAAAACAGTGGTGATGTTTTGGTGTGCAATTTGTGG
TGTATTTGTGGTTCCAAATTTTAAATATAATAATTTATGTGAATGGGTATCGTTCGCTTA
GC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1FP52TF U 1
AF RS1FP52JQ C 174
BS 1 689 RS1FP52TF
BS 690 690 RS1FP52JQ
BS 691 710 RS1FP52TF
BS 711 1022 RS1FP52JQ

RD RS1FP52TF 713 0 0
GAAGGTCGATGGTTATGGAATAGATTCTCTGTCGAGCTTTCTCATGGATTATGGATATCA
AGTTGGAGGCAGACTTGATTTTCCAAAGAAGCATGTACACGTTCTCTGGCTTTCTCCTCC
GGATATTAACGTCCCTGTTGAAGGATGCGGTCTAGGCAACGGCCCCTTGCCACGAATTGT
TATAGCTGAGCTTCTCGTGGACGAACTAAGCCAAGAATCACAGGAGATAATAAGGAAGTA
TTTGAAACCAGAAGGTGGTAAGTAAGCCATTCTTTCAAGTACGTTGGGGTCTTTAATTTG
GGAGAAGCCAACATCAGCCGACTTTAATCAACTTGCCAAAGAGAGTGAATATGGGGCATG
GGCGCTTTTCCATGGCTACACAATGAACCATCTTGCTATTGCGGTCCATCGACTTAAACA
TCGTTTCAGTGACATTAAATGTGTCGAAGAGTACTTCAAAGAAAAGGGATTCGAACTCAA
CAAAGACGGAGGAGATGTTCTCAAAGTGAGTGAAGATGGTTTACTATTACAAGTGTCGTT
GATGTCGGAGAAACACGAGGTTGAGTTTGCAGATGGGGGTAACTGAAACCATCACGGCTT
CATACATTGAGTTCGTCCAACGTCTAGTTCTTCCAGAGTTCAAAGATGTACCCGGTGATG
AGATCAAAGAATTTCATAGACGCGAGGGC*TCGAGCAAGCTAGCGCTTAC
ACA

QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1FP52JQ 849 0 0
CGAATT
TTATAGCTGAGCTTCTCGTGGACGAACTAAGCCAAGAATCACAGGAGATAATAAGGAAGT
ATTTGAAACCAGAAGGTGGTAAGTAAGCCATTCTTTCAAGTACGTTGGGGTCTTTAATTT
GGGAGAAGCCAACATCAGCCGACTTTAATCAACTTGCCAAAGAGAGTGAATATGGGGCAT
GGGCGCTTTTCCATGGCTACACAATGAACCATCTTGCTATTGCGGTCCATCGACTTAAAC
ATCGTTTCAGTGACATTAAATGTGTCGAAGAGTACTTCAAAGAAAAGGGATTCGAACTCA
ACAAAGACGGAGGAGATGTTCTCAAAGTGAGTGAAGATGGTTTACTATTACAAGTGTCGT
TGATGTCGGAGAAACACGAGGTTGAGTTTGCAGATGGGG*TAACTGAAACCATCACGGCT
TCATACATTGAGTTCGTCCAACGTCTAGTTCTTCCAGAGTTCAAAGATGTACCCGGTGAT
GAGATCAAAGAATTTCATAGACGCGAGGGCCTCGAGCAAGCTAGCGCTTACCACATAATG
GAAAGCACCCGTTTCACAGCGCAAGATTAAAACCAGCTAGGCTTGTCTTGTTCTGCTCAC
TATGCCAGTGTTGTGTATCTTTAATTTTCCGTATGCTATTTTTAGACCATCTGCATGTTA
AATCTATATGTTGTACTACTTCTCTTGTGAAGTGACGATAACTTATATTACCTCTCATGA
TAGTTATAGTTACCGATGAATAATTGAAAACAGTGGTGATGTTTTGGTGTGCAATTTGTG
GTGTATTTGTGGTTCCAAATTTTAAATATAATAATTTATGTGAATGGGTATCGTTCGCTT
AGC

QA 7 849 7 849
DS 



AS 1 2

CO CL6561Contig1 1057 2 4 U
GGACCTTTCGATATAATATAGATTAGGACAGAGAGTGTATAGAGACAAGAATCAAAAAAA
AAAATGAGTGATACAGAGGAGATACTATTTCCCACTTTTGGTTGGTATAGGGTTGCTTGT
ACTTCAACAACTCGGTGGGATTAACGGCGTCTTATTCTATTCCAGTACAATCTTTGAATC
TGCAGGAGTTACATCGAGTAATGCAGCGACATTTGGGGTAGGTGCTATTCAAGTAGTGGC
GACCGCAATATCAACATGGTTGGTGGACAAAGCAGGTCGTCGGCTTCTGCTTACCATCTC
TTCGGTTGGGATGACGATCAGCTTAGTGATTGTTGCAGCTGCTTTCTACCTTAAGGGATT
TGTGTCTCATGATTCAGACATGTACAGTATGCTGAGCATCCTGTCTGTAGTTGGAGTAGT
GGCAATGGTTGTTTCTTTCTCATTAGGAATGGGACCGATTCCGTGGCTCATTATGTCTGA
GATCCTTCCTGTGAACATAAAGGGTTTAGCAGGAAGCATAGCAACTTTAGCCAATTGGTT
CTTTTCTTGGTTGATCGCCATGACTGCAAACTTGCTCTTAGCCTGGAGCAGTGGAGGAAC
TTTCACACTGTACGCGGTGGTTTGTGCATTCACGGTGGTGTTTGTGACTCTATGGGTTCC
TGAGACCAAAGGGAAAACGCTTGAAGAGCTTCAAGCCTTGTTCAGATGAGAAAACTGTAA
ACGGAGATATCATTTTCTGTCCCCCCTCTCACCACACATTTCTGTTTTTGGCCAAAGAAG
AAGAAGAAACAAAGTAATGTCAGAGATTTTCCAGCTGTTGTTGAGAAGTTACCAACATTT
GTTTGTTTGTTTGTCAATAATCTTCTGTTATGTGTATATGAACACACCTTCAAGTTTTTT
TTTTGTAATTTGATCAAACTCTTTTTTTATAGAGTAAAAATTAGGCCAACGCAGATGTTA
CCGCTTAAAGCGTGTGAATAACTTTAGCAAGACAAACAACAACTTGATGTGACTTGTTAG
TATGCTTTGGACTAAACAGATTCAAAATTAGGATTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FV15TF U 1
AF RS1FV15JQ C 483
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RD RS1FV15TF 757 0 0
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AAAATGAGTGATACAGAGGAGATACTATTTCCCACTTTTGGTTGGTATAGGGTTGCTTGT
ACTTCAACAACTCGGTGGGATTAACGGCGTCTTATTCTATTCCAGTACAATCTTTGAATC
TGCAGGAGTTACATCGAGTAATGCAGCGACATTTGGGGTAGGTGCTATTCAAGTAGTGGC
GACCGCAATATCAACATGGTTGGTGGACAAAGCAGGTCGTCGGCTTCTGCTTACCATCTC
TTCGGTTGGGATGACGATCAGCTTAGTGATTGTTGCAGCTGCTTTCTACCTTAAGGGATT
TGTGTCTCATGATTCAGACATGTACAGTATGCTGAGCATCCTGTCTGTAGTTGGAGTAGT
GGCAATGGTTGTTTCTTTCTCATTAGGAATGGGACCGATTCCGTGGCTCATTATGTCTGA
GATCCTTCCTGTGAACATAAAGGGTTTAGCAGGAAGCATAGCAACTTTAGCCAATTGGTT
CTTTTCTTGGTTGATCGCCATGACTGCAAACTTGCTCTTAGCCTGGAGCAGTGGAGGAAC
TTTCACACTGTACGCGGTGGTTTGTGCATTCACGGTGGTGTTTGTGACTCTATGGGTTCC
TGAGACCAAAGGGAAAACGCTTGAAGAGCTTCAAGCCTTGTTCAGATGAGAAA*CTGTAA
ACGGAGATATCATTTTCTGTCCCCC
TCTCACACACAT

QA 1 745 1 745
DS 

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TTTCTTGGTTGATCGCCATGACTGCAAACTTGTTTTTAGCCTGGAGCAGTGGAGGAACTT
TCACACTGTACGCGGTGGTTTGTGCATTCACGGTGGTGTTTGTGACTTTATGGGTTCCTG
AGACCAAAGGGAAAACGCTTGAAGAGCTTCAAGCCTTGTTCAGATGAGAAAACTGTAAAC
GGAGATATCATTTTCTGTCCCCCCTCTCACCACACATTTCTGTTTTTGGCCAAAGAAGAA
GAAGAAACAAAGTAATGTCAGAGATTTTCCAGCTGTTGTTGAGAAGTTACCAACATTTGT
TTGTTTGTTTGTCAATAATCTTCTGTTATGTGTATATGAACACACCTTCAAGTTTTTTTT
TTGTAATTTGATCAAACTCTTTTTTTATAGAGTAAAAATTAGGCCAACGCAGATGTTACC
GCTTAAAGCGTGTGAATAACTTTAGCAAGACAAACAACAACTTGATGTGACTTGTTAGTA
TGCTTTGGACTAAACAGATTCAAAATTAGGATTAC

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 2

CO CL6562Contig1 760 2 3 U
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TACAAAAGCAAAATTCAAAGCTGAAACAACAACAAACTCCACGGTCTCTTACGTTCAACT
AAAAAACCCTTTCCTCTTTCAAGGTAAACCAAAACCAGATGGTGCAGCCGCGCTGTAACC
TCCAGCACCACGACCAAAACCAGGCCTACCACCACTTCCCTGGAAAGAAGGCTGGTAATC
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GTCACCATACCTAGGACGGTCTCCACCTTCAAACCGAGCTCCTCTTGGGCGATCGCCAGG
TGGGCCACCACCAAAGGGACGACCAATGGGCTTAGCAAACTTCTTCAAAGTCGCGGGAAC
GACATCAAAAGGGAGGTTGAGATAAGTCCTCAAGAACTCGATCCCTTCGTTGGTGAGAAA
CCAGTAGTAATGCATCCAGGCGAATGTCTTCCTGACATACTCCTTGGACTTGAAGGATTG
CATCAGCTTGATCACTTGCAGGTTCGGTACTGACTCGATCAAAGGGTGCTTCGCGAGGTT
GAAGTCTTTCTTGGCAAACAAAACTCCTTCTTTGAAAAGGTACTTGCAGATTTCTCTGCG
GTTTTCCTCTGACATAATCATTTTCGGAGCTGTGGGGGCGAGCTTTCTTCGAGTAGAGAC
GCAGAGGTGAGGAAACGAGAGAGAGTGTAAGAAGCTAGCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1EH33JQ U 6
AF RS1EH33TF C 1
BS 1 5 RS1EH33TF
BS 6 686 RS1EH33JQ
BS 687 760 RS1EH33TF

RD RS1EH33JQ 681 0 0
CGACAACGACACTTAAACTCAAGATAAAAACATGACAATACTCCAGAATCCGAATTACAA
AAGCAAAATTCAAAGCTGAAACAACAACAAACTCCACGGTCTCTTACGTTCAACTAAAAA
ACCCTTTCCTCTTTCAAGGTAAACCAAAACCAGATGGTGCAGCCGCGCTGTAACCTCCAG
CACCACGACCAAAACCAGGCCTACCACCACTTCCCTGGAAAGAAGGCTGGTAATCAGCAG
GAGCTCCACCCTTCTCGCCTTCACCACCACGAGGACCTGCACGGTACCCATCACGGTCAC
CATACCTAGGACGGTCTCCACCTTCAAACCGAGCTCCTCTTGGGCGATCGCCAGGTGGGC
CACCACCAAAGGGACGACCAATGGGCTTAGCAAACTTCTTCAAAGTCGCGGGAACGACAT
CAAAAGGGAGGTTGAGATAAGTCCTCAAGAACTCGATCCCTTCGTTGGTGAGAAACCAGT
AGTAATGCATCCAGGCGAATGTCTTCCTGACATACTCCTTGGACTTGAAGGATTGCATCA
GCTTGATCACTTGCAGGTTCGGTACTGACTCGATCAAAGGGTGCTTCGCGAGGTTGAAGT
CTTTCTTGGCAAACAAAACTCCTTCTTTGAAAAGGTACTTGCAGATTTCTCTGCGGTTTT
CCTCTGACATAATCATTTTCG

QA 1 681 1 681
DS 

RD RS1EH33TF 760 0 0
TTTTTCGACAACGACACTTAAACTCAAGATAAAA*CATGACAATACTCCAGAATCCGAAT
TACAAAAGCAAAATTCAAAGCTGAAACAACAACAAACTCCACGGTCTCTTACGTTCAACT
AAAAAACCCTTTCCTCTTTCAAGGTAAACCAGAACCAGATGGTGCAGCCGCGCTGTAACC
TCCAGCACCACGACCAAAACCAGGCCTACCACCACTTCCCTGGAAAGAAGGCTGGTAATC
AGCAGGAGCTCCACCCTTCTCGCCTTCACCACCACGAGGACCTGCACGGTACCCATCACG
GTCACCATACCTAGGACGGTCTCCACCTTCAAACCGAGCTCCTCTTGGGCGATCGCCAGG
TGGGCCACCACCAAAGGGACGACCAATGGGCTTAGCAGACTTCTTCAAAGTCGCGGGAAC
GACATCAGAAGGGAGGTTGAGATAAGTCCTCAAGAACTCGATCCCTTCGTTGGTGAGAAA
CCAGTAGTAATGCATCCAGGCGAATGTCTTCCTGACATACTCCTTGGACTTGAAGGATTG
CATCAGCTTGATCACTTGCAGGTTCGGTACTGACTCGATCAAAGGGTGCTTCGCGAGGTT
GAAGTCTTTCTTGGCAAACAAAACTCCTTCTTTGAAAAGGTACTTGCAGATTTCTCTGCG
GTTTTCCTCTGACATAATCATTTTCGGAGCTGTGGGGGCGAGCTTTCTTCGAGTAGAGAC
GCAGAGGTGAGGAAACGAGAGAGAGTGTAAGAAGCTAGCC

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

CO CL6563Contig1 215 2 1 U
GGAGGAGGCACCGGGTTTACACCAAAGACTACAATGCTATGCATTCTGAAGCTCCACGGG
ACAGGGGCCCGCAGTGAGATTTTCTGTACTTTTGCCCGTTTTATGTAAATTATGTTTGTG
ACATGTCGGGTGATCTTGTGTATTGGAAGGAATCTATGGTTGTGTGGTTGTTGTGATTAA
TGTTCTTTATAATTGATATGTTGAGAACTACTTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1G666JQ C 1
AF RS1G666TF U 1
BS 1 215 RS1G666TF

RD RS1G666JQ 215 0 0
GGAGGAGGCACCGGGTTTACACCAAAGACTACAATGCTATGCATTCTGAAGCTCCACGGG
ACAGGGGCCCGCAGTGAGATTTTCTGTACTTTTGCCCGTTTTATGTAAATTATGTTTGTG
ACATGTCGGGTGATCTTGTGTATTGGAAGGAATCTATGGTTGTGTGGTTGTTGTGATTAA
TGTTCTTTATAATTGATATGTTGAGAACTACTTCG

QA 1 215 1 215
DS 

RD RS1G666TF 215 0 0
GGAGGAGGCACCGGGTTTACACCAAAGACTACAATGCTATGCATTCTGAAGCTCCACGGG
ACAGGGGCCCGCAGTGAGATTTTCTGTACTTTTGCCCGTTTTATGTAAATTATGTTTGTG
ACATGTCGGGTGATCTTGTGTATTGGAAGGAATCTATGGTTGTGTGGTTGTTGTGATTAA
TGTTCTTTATAATTGATATGTTGAGAACTACTTCG

QA 1 215 1 215
DS 



AS 1 2

CO CL6564Contig1 818 2 6 U
GGCGTCTCGACAAGCGTTTGGCTTGACGATAGTTAAATGGGCTTATGGATTACTAATGTG
AGAATGTTATTATTGATATCTCTTTGGAACTCAAAAAGCTACAAACTGACCCAATAAGAA
AGTCTGCGTTTGGACTAAAAAAAAAAAAACCACGTTCTCTCCCAAAAAGAGGCGAAAGAG
AGAGAAACCCTAGATCTGATAGCTTGAGCTCCGGCCGCCGCTCCGTCGGTTCGCCGGAAG
CGACCTCTTCCCCCTTCCTTTTTTCTTTTTTCTCCTTTGCTCCCTTTCTTCCCATCTCCC
CTTAGTTGATATGCAATCTGCTCTGTAAAGGCCGAGAAACTCCGGAATAGTTGCGGGCTT
GACGGAGGCGGTTCCCGAGTCCTTGCGGAGAGACGGCGAGACCCAAGGTGAGGTGGTGAA
GAAGGGAGTCGGCGTTTTAGGGCTGAAGATTCATCTGGATCTGGTTTTCTTTTCCTTCAG
CTCTTCGGTGTATCTTCACAGCAACAGTGCGTGGTTCCGGTGAGTCGCCTTCTCCACCTT
AGATCTGCTCATTTGTGTGGTGGTGTGGTGGTTGGAGGAGAGATATGACAGATGGTGAAA
AGGATTTTGCTCCCTGGCTCTCAAGGACATCACGCGCCAAGCTTCATGACGACGGAGCTG
TCATCTGGAGTTGTGGGGTTGGTTGGAAACGCGTGGTGAAGCTCGGCTTTCCAACACCGG
CGCGGGTCGCGACTCGTTCCGGTAGTCGAGCTCACATTTCTTCTAGCCGTAATTCGGTAT
ACTGGACGCGTGAGCTGGTGCCAAGGTCCGTTTTTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GK59TF U 1
AF RS1D665TF U 131
BS 1 273 RS1GK59TF
BS 274 274 RS1D665TF
BS 275 560 RS1GK59TF
BS 561 563 RS1D665TF
BS 564 599 RS1GK59TF
BS 600 818 RS1D665TF

RD RS1GK59TF 599 0 0
GGCGTCTCGACAAGCGTTTGGCTTGACGATAGTTAAATGGGCTTATGGATTACTAATGTG
AGAATGTTATTATTGATATCTCTTTGGAACTCAAAAAGCTACAAACTGACCCAATAAGAA
AGTCTGCGTTTGGACTAAAAAAAAAAAAACCACGTTCTCTCCCAAAAAGAGGCGAAAGAG
AGAGAAACCCTAGATCTGATAGCTTGAGCTCCGGCCGCCGCTCCGTCGGTTCGCCGGAAG
CGACCTCTTCCCCCTTCCTTTTTTCTTTTTTCTTCTTTGCTCCCTTTCTTCCCATCTCCC
CTTAGTTGATATGCAATCTGCTCTGTAAAGGCCGAGAAACTCCGGAATAGTTGCGGGCTT
GACGGAGGCGGTTCCCGAGTCCTTGCGGAGAGACGGCGAGACCCAAGGTGAGGTGGTGAA
GAAGGGAGTCGGCGTTTTAGGGCTGAAGATTCATCTGGATCTGGTTTTCTTTTCCTTCAG
CTCTTCGGTGTATCTTCACAGCAACAGTGCGTGGTTCCGGTGAGTCGCCTTCTCCACCTT
AGATCTGCTCATTTGTGTGG***TGTGGTGGTTGGAGGAGAGATATGACAGATGGTGAA

QA 1 599 1 599
DS 

RD RS1D665TF 688 0 0
GGACAAAGGC
AAAAAAAAACCACGTTCTCTCCCAAAAAGAGGCGAAAGAGAGAGAAACCCTAGATCTGAT
AGCTTGAGCTCCGGCCGCCGCTCCGTCGGTTCGCCGGAAGCGACCTCTTCCCCCTTCCTT
TTTTCTTTTTTCTCCTTTGCTCCCTTTCTTCCCATCTCCCCTTAGTTGATATGCAATCTG
CTCTGTAAAGGCCGAGAAACTCCGGAATAGTTGCGGGCTTGACGGAGGCGGTTCCCGAGT
CCTTGCGGAGAGACGGCGAGACCCAAGGTGAGGTGGTGAAGAAGGGAGTCGGCGTTTTAG
GGCTGAAGATTTATCTGGATCTGGTTTTCTTTTCCTTCAGCTCTTCGGTGTATCTTCACA
GCAACAGTGCGTGGTTCCGGTGAGTCGCCTTCTCCACCTTAGATCTGCTCATTTGTGTGG
TGGTGTGGTGGTTGGAGGAGAGATATGACAGATGGTGAAAAGGATTTTGCTCCCTGGCTC
TCAAGGACATCACGCGCCAAGCTTCATGACGACGGAGCTGTCATCTGGAGTTGTGGGGTT
GGTTGGAAACGCGTGGTGAAGCTCGGCTTTCCAACACCGGCGCGGGTCGCGACTCGTTCC
GGTAGTCGAGCTCACATTTCTTCTAGCCGTAATTCGGTATACTGGACGCGTGAGCTGGTG
CCAAGGTCCGTTTTTCAG

QA 11 688 11 688
DS 



AS 1 2

CO CL6565Contig1 759 2 6 U
GGATGGCATATTTACTCAACTGAACCGGTTGTGTTGCTTTTGATACCCGATAAAAACCGA
ACCAAGACCTAAATTACGCCTCGAAACCCCTTGTCCCCTCCTATCTCTTCTTCCTCCGCT
TCTCCGGCGAAGGTGGTCTTTCACCAATGGCGGCGAGGCTGAACTCTTCGTTTCACAACG
CCCTCTCCTTCTTAAACCCGTTCAACACTCCGCTCAGCAAAAAACCATTCTCCTCTAGAA
ACAGCAGTTTCAGATTCTCCAAAAAGCTCGCTTCTTCCCCGACGAGGAGAGCTCTCTACT
CTACTTCCACCCTCGGAAGCCATGAAAACGCCGACACTTTCGTCCTCACCACTCCTCTCT
ATTACGTAAACGCCCCTCCCCACATGGGCAGTGCCTACACCACCATAGCCGCCGATTCAA
TCGCTCGTTTCCAGAGGCTGCTTGGGAAGAAGGTTATCTTTATCACGGGAACAGATGAGC
ACGGTGAGAAGATAGCTACTTCAGCAGCTGCGAACGGACGCAACCCTGCTGAGCATTGTG
ATCTCATTTCTCAATCTTATCGAACTCTTTGGAAAGAACTCGATATTGCTTATGATAAGT
TCGTTAGAACCACTGATCCTAAGCATGAAGCTATCGTGAAAGAGTTCTATGAACGTGTTT
TCGCCAACGGTGATATATACAGAGCTGATTATGAAAGGGCTTTACTGTGTTAACTGTGAG
GAATATAAAGATGAGAAAGAGCTGCTTGAAAACAATTGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AZ54TF U 1
AF RS1CO23TF U 1
BS 1 640 RS1AZ54TF
BS 641 641 RS1CO23TF
BS 642 645 RS1AZ54TF
BS 646 646 RS1CO23TF
BS 647 691 RS1AZ54TF
BS 692 759 RS1CO23TF

RD RS1AZ54TF 691 0 0
GGATGGCATATTTACTCAACTGAACCGGTTGTGTTGCTTTTGATACCCGATAAAAACCGA
ACCAAGACCTAAATTACGCCTCGAAACCCCTTGTCCCCTCCTATCTCTTCTTCCTCCGCT
TCTCCGGCGAAGGTGGTCTTTCACCAATGGCGGCGAGGCTGAACTCTTCGTTTCACAACG
CCCTCTCCTTCTTAAACCCGTTCAACACTCCGCTCAGCAAAAAACCATTCTCCTCTAGAA
ACAGCAGTTTCAGATTCTCCAAAAAGCTCGCTTCTTCCCCGACGAGGAGAGCTCTCTACT
CTACTTCCACCCTCGGAAGCCATGAAAACGCCGACACTTTCGTCCTCACCACTCCTCTCT
ATTACGTAAACGCCCCTCCCCACATGGGCAGTGCCTACACCACCATAGCCGCCGATTCAA
TCGCTCGTTTCCAGAGGCTGCTTGGGAAGAAGGTTATCTTTATCACGGGAACAGATGAGC
ACGGTGAGAAGATAGCTACTTCAGCAGCTGCGAACGGACGCAACCCTGCTGAGCATTGTG
ATCTCATTTCTCAATCTTATCGAACTCTTTGGAAAGAACTCGATATTGCTTATGATAAGT
TCGTTAGAACCACTGATCCTAAGCATGAAGCTATCGTGAA*GAGT*CTATGAACGTGTTT
TCGCCAACGGTGATATATACAGAGCTGATTA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1CO23TF 759 0 0
GGATGGCATATTTACTCAACTGAACCGGTTGTGTTGCTTTTGATACCCGATAAAAACCGA
ACCAAGACCTAAATTACGCCTCGAAACCCCTTGTCCCCTCCTATCTCTTCTTCCTCCGCT
TCTCCGGCGAAGGTGGTCTTTCACCAATGGCGGCGAGGCTGAACTCTTCGTTTCACAACG
CCCTCTCCTTCTTAAACCCGTTCAACACTCCGCTCAGCAAAAAACCATTCTCCTCTAGAA
ACAGCAGTTTCAGATTCTCCAAAAAGCTCGCTTCTTCCCCGACGAGGAGAGCTCTCTACT
CTACTTCCACCCTCGGAAGCCATGAAAACGCCGACACTTTCGTCCTCACCACTCCTCTCT
ATTACGTAAACGCCCCTCCCCACATGGGCAGTGCCTACACCACCATAGCCGCCGATTCAA
TCGCTCGTTTCCAGAGGCTGCTTGGGAAGAAGGTTATCTTTATCACGGGAACAGATGAGC
ACGGTGAGAAGATAGCTACTTCAGCAGCTGCGAACGGACGCAACCCTGCTGAGCATTGTG
ATCTCATTTCTCAATCTTATCGAACTCTTTGGAAAGAACTCGATATTGCTTATGATAAGT
TCGTTAGAACCACTGATCCTAAGCATGAAGCTATCGTGAAAGAGTTCTATGAACGTGTTT
TCGCCAACGGTGATATATACAGAGCTGATTATGAAAGGGCTTTACTGTGTTAACTGTGAG
GAATATAAAGATGAGAAAGAGCTGCTTGAAAACAATTGT

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 2

CO CL6566Contig1 683 2 2 U
TCATCAACCAATCTTTATTGAAACTCGAAAAGACATTCGAAAAAGAAAACGAAAAGAATA
TACACACGTTTCTTCCTAAAACACTTAAAACCTAAGCCTCTGTTCCATCTCGAGAGTTCG
AATCACCATCGCTTCTTCTTCCCCCGTCTCCTTCGCTTCTCCTCTCACCAGAACCAACAG
CGAACCCAATCCAAACCCCAACTTTCTTCTCTCCCTCCACTTCTTCAACAGGCATCTCGT
ACCTACACAACGGACACGTGGCGTGCCTCCCCAACCACTCCTCCACACACTTCGAGTGGA
ACCTATGCTTACACGGCATCTCCGACGCCACGTCACCTTCCGACCACTCCTCTAGGCAAA
CCGGACACGATCCTCCTCCTCCTCCTGCTCTCTCCTCATCTTTCCCGATCACGACACGTG
GCATACTCTCCACCGACGATTTCGACGCCGGCGACCTCCCTTGTTTCTCCGAAAATTCGT
CGCCGTTCAAGAACTCCCCCAGAGCCGATCTGATCATCACGACTCTCCGGCCGTCTGATC
ATCCTCTCGAATAAAGCCGAAAACTCTGCAAACTCCGCTTCCGAAGACATAACGTTAACA
CTTAAAACAAAGATCGTAAGAGTGAAAGGAAAGGAAACTGAGAAGAAGACGAAGGAGAAG
GAAACTGTAAGAATTAGAGATCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EH70TF C 1
AF RS1EH70JQ U 2
BS 1 1 RS1EH70TF
BS 2 683 RS1EH70JQ

RD RS1EH70TF 683 0 0
TCATCAACCAATCTTTATTGAAACTCGAAAAGACATTCGAAAAAGAAAACGAAAAGAATA
TACACACGTTTCTTCCTAAAACACTTAAAACCTAAGCCTCTGTTCCATCTCGAGAGTTCG
AATCACCATCGCTTCTTCTTCCCCCGTCTCCTTCGCTTCTCCTCTCACCAGAACCAACAG
CGAACCCAATCCAAACCCCAACTTTCTTCTCTCCCTCCACTTCTTCAACAGGCATCTCGT
ACCTACACAACGGACACGTGGCGTGCCTCCCCAACCACTCCTCCACACACTTCGAGTGGA
ACCTATGCTTACACGGCATCTCCGACGCCACGTCACCTTCCGACCACTCCTCTAGGCAAA
CCGGACACGATCCTCCTCCTCCTCCTGCTCTCTCCTCATCTTTCCCGATCACGACACGTG
GCATACTCTCCACCGACGATTTCGACGCCGGCGACCTCCCTTGTTTCTCCGAAAATTCGT
CGCCGTTCAAGAACTCCCCCAGAGCCGATCTGATCATCACGACTCTCCGGCCGTCTGATC
ATCCTCTCGAATAAAGCCGAAAACTCTGCAAACTCCGCTTCCGAAGACATAACGTTAACA
CTTAAAACAAAGATCGTAAGAGTGAAAGGAAAGGAAACTGAGAAGAAGACGAAGGAGAAG
GAAACTGTAAGAATTAGAGATCC

QA 1 683 1 683
DS 

RD RS1EH70JQ 682 0 0
CATCAACCAATCTTTATTGAAACTCGAAAAGACATTCGAAAAAGAAAACGAAAAGAATAT
ACACACGTTTCTTCCTAAAACACTTAAAACCTAAGCCTCTGTTCCATCTCGAGAGTTCGA
ATCACCATCGCTTCTTCTTCCCCCGTCTCCTTCGCTTCTCCTCTCACCAGAACCAACAGC
GAACCCAATCCAAACCCCAACTTTCTTCTCTCCCTCCACTTCTTCAACAGGCATCTCGTA
CCTACACAACGGACACGTGGCGTGCCTCCCCAACCACTCCTCCACACACTTCGAGTGGAA
CCTATGCTTACACGGCATCTCCGACGCCACGTCACCTTCCGACCACTCCTCTAGGCAAAC
CGGACACGATCCTCCTCCTCCTCCTGCTCTCTCCTCATCTTTCCCGATCACGACACGTGG
CATACTCTCCACCGACGATTTCGACGCCGGCGACCTCCCTTGTTTCTCCGAAAATTCGTC
GCCGTTCAAGAACTCCCCCAGAGCCGATCTGATCATCACGACTCTCCGGCCGTCTGATCA
TCCTCTCGAATAAAGCCGAAAACTCTGCAAACTCCGCTTCCGAAGACATAACGTTAACAC
TTAAAACAAAGATCGTAAGAGTGAAAGGAAAGGAAACTGAGAAGAAGACGAAGGAGAAGG
AAACTGTAAGAATTAGAGATCC

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 2

CO CL6567Contig1 733 2 2 U
GACAGCATATCTATGTTCGTTTAACTTTGTATATTTATGAATAACAAAGGATTTTAATGT
AATTTAATAGGCTTCAAACCAATAACAATGAATTTTGGTAAGATTTTAAAAATCCATAAA
CCAATAACATGGATTCTCAAAGTTTTATAATTCCTTTGTAATTCTTAAACCAATATAATA
ACCCCCTTAGTAAAAATATAAAAATAAGTGTTGGAAATCTTCTTTAAATAATTCAGACAA
TATTTATTTGAGAAACGTGAAAGGTGGAATAGAATGAGAATTTAATATTGTAACTAAAAG
GATTATGGCAGTCTTCTCAATCACATGATTTATGTTTGTGCTTTTGTTATTACTAAGTAG
ATCCTACAAGGCCTGAAGCATTGTTTACAGATAATTAAATTGGTACTTCCTTCCGTCAGC
GTGACTAGACGTAATCATCATCACGCCAAGTCGCCAACCCATACGGGTTAGGAAAACAAA
ACTTGTCAAGTATTTGATCATAGCGTGTAACTGAAACCAATTATGAGCATTCCATAAATG
TTAGGTTCTGTTGTAAAACTAGGTTTGTTATGAACCAAGTGCTCGTAGCTTGGTGGTAAA
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TCCTTTCCGTTGGGGCGCTGAACCCCATTCGGAGGATAGTTGGGAATGTGGCTGCCGAGA
TACCAGAGTTACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DT74TF U 1
AF RS1DT74JQ C 1
BS 1 681 RS1DT74TF
BS 682 733 RS1DT74JQ

RD RS1DT74TF 686 0 0
GACAGCATATCTATGTTCGTTTAACTTTGTATATTTATGAATAACAAAGGATTTTAATGT
AATTTAATAGGCTTCAAACCAATAACAATGAATTTTGGTAAGATTTTAAAAATCCATAAA
CCAATAACATGGATTCTCAAAGTTTTATAATTCCTTTGTAATTCTTAAACCAATATAATA
ACCCCCTTAGTAAAAATATAAAAATAAGTGTTGGAAATCTTCTTTAAATAATTCAGACAA
TATTTATTTGAGAAACGTGAAAGGTGGAATAGAATGAGAATTTAATATTGTAACTAAAAG
GATTATGGCAGTCTTCTCAATCACATGATTTATGTTTGTGCTTTTGTTATTACTAAGTAG
ATCCTACAAGGCCTGAAGCATTGTTTACAGATAATTAAATTGGTACTTCCTTCCGTCAGC
GTGACTAGACGTAATCATCATCACGCCAAGTCGCCAACCCATACGGGTTAGGAAAACAAA
ACTTGTCAAGTATTTGATCATAGCGTGTAACTGAAACCAATTATGAGCATTCCATAAATG
TTAGGTTCTGTTGTAAAACTAGGTTTGTTATGAACCAAGTGCTCGTAGCTTGGTGGTAAA
GGAGGTACAGCTGTACTGTCCGCCACCCGGGTTCGAACTTTGGCCACAACGGATTTAACA
TCCTTTCCGTTGGGGCGCTGA
CCCCA

QA 1 681 1 681
DS 

RD RS1DT74JQ 733 0 0
GACAGCATATCTATGTTCGTTTAACTTTGTATATTTATGAATAACAAAGGATTTTAATGT
AATTTAATAGGCTTCAAACCAATAACAATGAATTTTGGTAAGATTTTAAAAATCCATAAA
CCAATAACATGGATTCTCAAAGTTTTATAATTCCTTTGTAATTCTTAAACCAATATAATA
ACCCCCTTAGTAAAAATATAAAAATAAGTGTTGGAAATCTTCTTTAAATAATTCAGACAA
TATTTATTTGAGAAACGTGAAAGGTGGAATAGAATGAGAATTTAATATTGTAACTAAAAG
GATTATGGCAGTCTTCTCAATCACATGATTTATGTTTGTGCTTTTGTTATTACTAAGTAG
ATCCTACAAGGCCTGAAGCATTGTTTACAGATAATTAAATTGGTACTTCCTTCCGTCAGC
GTGACTAGACGTAATCATCATCACGCCAAGTCGCCAACCCATACGGGTTAGGAAAACAAA
ACTTGTCAAGTATTTGATCATAGCGTGTAACTGAAACCAATTATGAGCATTCCATAAATG
TTAGGTTCTGTTGTAAAACTAGGTTTGTTATGAACCAAGTGCTCGTAGCTTGGTGGTAAA
GGAGGTACAGCTGTACTGTCCGCCACCCGGGTTCGAACTTTGGCCACAACGGATTTAACA
TCCTTTCCGTTGGGGCGCTGAACCCCATTCGGAGGATAGTTGGGAATGTGGCTGCCGAGA
TACCAGAGTTACC

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 2

CO CL6568Contig1 1108 2 4 U
GGAACGACATCGTTTTGGGGATCCTCGAGCTGCTTAAGATGTTTAGGCGGGTTCTCTACA
TTGATATCGATGTTCACCATGGAGATGGAGTGGAAGAGGCGTTTTACACGACTGATAGAG
TTATGACCGTTTCTTTTCACAAGTTTGGGGACTTCTACCCAGGAACTGGTCACATCAGAG
ACGTTGGCGCTGAGAAAGGGAAGTACTATGCTCTAAATGTCCCGTTGAACGATGGTATGG
ACGACGAGAGTTTCCGCAGCTTGTTTAGACCTCTTATTCAGAAGGTTATGGAGGTTTATA
GGCCGGAAGCAGTTGTTCTTCAGTGTGGGGCTGACTCCTTAAGCGGTGGTCGGTTGGGTT
GTTTTAACTTGTCGGTCAAGGGTCATGCTGATTGCCTCCGGTTCTTGAGATCTTACAATG
TTCCTCTCATGGTCTTGGGTGGTGGAGGGTATACTATTCGGAATGTTGCTCGTTGCTGGT
GTTATGAGACTGCAGTTGCGGTTGGAGTAGAGCCGGACAACAAGCTCCCGTACAATGAGT
ACTTTGAGTACTTCGGACCAGACTATACACTTCATGTCGAGCCAGGTCCAATGGAGAATT
TGAACACGCCTAAAGATATGGAGAAGATAAGGAACACATTGCTAGAACAACTTTCTGGAC
TAATACACGCACCTAGTGTGCCGTTTCAGCACACACCTCCAGTTAATAGAGTCTTGGATG
AGCCGGAAGAAGACATGGAGAAGAGACCAAGGCCTCGCATTTGGAGTGGAACTGCGAATT
ATGAATCAGACAGTGACGATGACGAGAAACCTCTTGTTGGTTTTTCAGGTATTGATGGCC
CAACAAATATGGACAGGGACTTTACAGGGGAAGATGAAATGGAAGATGATAACGCAGAGC
CGGAGGTGGATCCTCCATCGTCTTGAAACCAGCTTGATGTAGTGTCAAAAGTTAGAGAAA
TGATTTTTGGAGATGCTTTTTTTTACTATGTGATTTTTTTTTTTTTGCAAAGAAACCTTT
TGTTTTTGCCTCAAGACTTTTACTTAATAGGAATGTATTTGTATTACCATTCAATCAAAA
CAAGAGTAAATTCATTCCTTTTATAGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FE71TF U 1
AF RS1FE71JQ C 657
BS 1 730 RS1FE71TF
BS 731 731 RS1FE71JQ
BS 732 753 RS1FE71TF
BS 754 1108 RS1FE71JQ

RD RS1FE71TF 755 0 0
GGAACGACATCGTTTTGGGGATCCTCGAGCTGCTTAAGATGTTTAGGCGGGTTCTCTACA
TTGATATCGATGTTCACCATGGAGATGGAGTGGAAGAGGCGTTTTACACGACTGATAGAG
TTATGACCGTTTCTTTTCACAAGTTTGGGGACTTCTACCCAGGAACTGGTCACATCAGAG
ACGTTGGCGCTGAGAAAGGGAAGTACTATGCTCTAAATGTCCCGTTGAACGATGGTATGG
ACGACGAGAGTTTCCGCAGCTTGTTTAGACCTCTTATTCAGAAGGTTATGGAGGTTTATA
GGCCGGAAGCAGTTGTTCTTCAGTGTGGGGCTGACTCCTTAAGCGGTGGTCGGTTGGGTT
GTTTTAACTTGTCGGTCAAGGGTCATGCTGATTGCCTCCGGTTCTTGAGATCTTACAATG
TTCCTCTCATGGTCTTGGGTGGTGGAGGGTATACTATTCGGAATGTTGCTCGTTGCTGGT
GTTATGAGACTGCAGTTGCGGTTGGAGTAGAGCCGGACAACAAGCTCCCGTACAATGAGT
ACTTTGAGTACTTCGGACCAGACTATACACTTCATGTCGAGCCAGGTCCAATGGAGAATT
TGAACACGCCTAAAGATATGGAGAAGATAAGGAACACATTGCTAGAACAACTTTCTGGAC
TAATACACGCACCTAGTGTGCCGTTTCAGCACACACCTCCAGTTAATAGAGTCTTGGATG
AGCCGGAAGA*GACATGGAGAAGAGACCAAGGC
TC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1FE71JQ 452 0 0
GGACTAATACACGCACCTAGTGTGCCGTTTCAGCACACACCTCCAGTTAATAGAGTTTTG
GATGAGCCGGAAGAAGACATGGAGAAGAGACCAAGGCCTCGCATTTGGAGTGGAACTGCG
AATTATGAATCAGACAGTGACGATGACGAGAAACCTCTTGTTGGTTTTTCAGGTATTGAT
GGCCCAACAAATATGGACAGGGACTTTACAGGGGAAGATGAAATGGAAGATGATAACGCA
GAGCCGGAGGTGGATCCTCCATCGTCTTGAAACCAGCTTGATGTAGTGTCAAAAGTTAGA
GAAATGATTTTTGGAGATGCTTTTTTTTACTATGTGATTTTTTTTTTTTTGCAAAGAAAC
CTTTTGTTTTTGCCTCAAGACTTTTACTTAATAGGAATGTATTTGTATTACCATTCAATC
AAAACAAGAGTAAATTCATTCCTTTTATAGGT

QA 1 452 1 452
DS 



AS 1 2

CO CL6569Contig1 919 2 4 U
TTCAGCCTCTCAGTACACATACACTTCGAATTCGTACTACTCCGCTCCCTACCAGCCTCC
ACAGCCCTTCGTGGCGCCGTCGCCTGCTCACCACCACCTCCAGTTGCTACCATTCCCGGA
GCCACGGTCTATCCTCAGCCTATTGGTCCCGTTCCCGCCGTATACTCTTACCCTCAGTAC
CAGGCGCATCAGTTGTTCCAGAGAGACGCACAAACTATCACACCAGAAGCGCTTGAGAAT
GTAAAAGCTGCTTTGGCTAGTAGCGAAACTGAACACAAAGCGGAAACTAAGAAGAGAGCT
ATTCCTCGTAAAGCTGCTGGGCAGTCTTGGGAGGATCCTACTCTTGCAGAGTGGCCTGAA
AATGACTATCGCTTGTTTTGTGGGGATCTTGGGAATGAAGTAAATGATGATGTTCTTTCC
AAGGCATTTGCTCGATTCCCCACCTTCAATATGGCCAAGGTCATCAGAGATAAGCGGACT
GGTAAAACCAAGGGTTATGGGTTTGTGAGTTTCTTAAATCCTGCGGATCTTGCTGCAGCC
CTAAAAGAAATGAATGGCAAGTATGTTGGGAACCGTCCAATAAAATTAAGAAAGAGCAGC
TGGAAAGAGAGAACAGATCAGGAAGCTGCAGAAAGACAAAAGCATCACAGCAATAAGAAG
CAAAAGACAGTGAAGAAGAAGAGCGTACTCCACAAGTGAACAATCAAATCGCATTCTGTT
TACATGCCAAGAAAAAAGAACAGGGTGTCTTTGAATTTTATCTTTGATATTAACAACCAA
TTGAGTTGGAATTCAGACTATCAGAAATAAAATTACTTGAACTTGAATTTATTTCTCTAG
TTATTTGAGTATTTGTATGTTGTAAATCTTTGAGCAACTGTTATTTTTGGTCTGTTTTAC
AATTTGGTTTTGTTCAACC


BQ
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AF RS1EQ56TF U 1
AF RS1EQ56JQ C 163
BS 1 620 RS1EQ56TF
BS 621 621 RS1EQ56JQ
BS 622 628 RS1EQ56TF
BS 629 919 RS1EQ56JQ

RD RS1EQ56TF 628 0 0
TTCAGCCTCTCAGTACACATACACTTCGAATTCGTACTACTCCGCTCCCTACCAGCCTCC
ACAGCCCTTCGTGGCGCCGTCGCCTGCTCACCACCACCTCCAGTTGCTACCATTCCCGGA
GCCACGGTCTATCCTCAGCCTATTGGTCCCGTTCCCGCCGTATACTCTTACCCTCAGTAC
CAGGCGCATCAGTTGTTCCAGAGAGACGCACAAACTATCACACCAGAAGCGCTTGAGAAT
GTAAAAGCTGCTTTGGCTAGTAGCGAAACTGAACACAAAGCGGAAACTAAGAAGAGAGCT
ATTCCTCGTAAAGCTGCTGGGCAGTCTTGGGAGGATCCTACTCTTGCAGAGTGGCCTGAA
AATGACTATCGCTTGTTTTGTGGGGATCTTGGGAATGAAGTAAATGATGATGTTCTTTCC
AAGGCATTTGCTCGATTCCCCACCTTCAATATGGCCAAGGTCATCAGAGATAAGCGGACT
GGTAAAACCAAGGGTTATGGGTTTGTGAGTTTCTTAAATCCTGCGGATCTTGCTGCAGCC
CTAAAAGAAATGAATGGCAAGTATGTTGGGAACCGTCCAATAAAATTAAGAAAGAGCAGC
TGGAAAGAGAGAACAGATCATGAAGCTG

QA 1 628 1 628
DS 

RD RS1EQ56JQ 757 0 0
TACTCTTACCCTCAGTACCAGGCGCATCAGTTGTTCCAGAGAGACGCACAAACTATCACA
CCAGAAGCGCTTGAGAATGTAAAAGCTGCTTTGGCTAGTAGCGAAACTGAACACAAAGCG
GAAACTAAGAAGAGAGCTATTCCTCGTAAAGCTGCTGGGCAGTCTTGGGAGGATCCTACT
CTTGCAGAGTGGCCTGAAAATGACTATCGCTTGTTTTGTGGGGATCTTGGGAATGAAGTA
AATGATGATGTTCTTTCCAAGGCATTTGCTCGATTCCCCACCTTCAATATGGCCAAGGTC
ATCAGAGATAAGCGGACTGGTAAAACCAAGGGTTATGGGTTTGTGAGTTTTTTAAATCCT
GCGGATCTTGCTGCAGCCCTAAAAGAAATGAATGGCAAGTATGTTGGGAACCGTCCAATA
AAATTAAGAAAGAGCAGCTGGAAAGAGAGAACAGATCAGGAAGCTGCAGAAAGACAAAAG
CATCACAGCAATAAGAAGCAAAAGACAGTGAAGAAGAAGAGCGTACTCCACAAGTGAACA
ATCAAATCGCATTCTGTTTACATGCCAAGAAAAAAGAACAGGGTGTCTTTGAATTTTATC
TTTGATATTAACAACCAATTGAGTTGGAATTCAGACTATCAGAAATAAAATTACTTGAAC
TTGAATTTATTTCTCTAGTTATTTGAGTATTTGTATGTTGTAAATCTTTGAGCAACTGTT
ATTTTTGGTCTGTTTTACAATTTGGTTTTGTTCAACC

QA 1 757 1 757
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6571Contig1 665 2 1 U
AGGGACACCAACATAATAATTTTCTCAAAAAAAAAACATAATAATTTTCTTCTCCCAATT
ACAATGGCGTCAATAACAATGCAAACATCTATTCTCATGATCTTCACGGTGGTCGCATTA
ATGTCCGGCGAGAGAGCCATCGCAGTGGACTGCTCCTCGTTGATACTAAACATGGCTGAT
TGTTTGTCGTTCGTCACGAGTGGTAGTACGGTGGAGAAGCCTGAAGGAACATGTCGCTCA
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GCCTCTCTTGGTGTTACTCTTGATCTTTCTAAAGCTGCTTCACTTCCTTCAGTTTGTAAA
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ATTAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 

AF RS1BA17JQ C 1
AF RS1BA17TF U 1
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RD RS1BA17JQ 665 0 0
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ATTAC

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AS 0 0

AS 1 2

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TCCATCTGATTAAACACCCATGGTCGAGGACATGAAATGAACAAAGTGTTTGTTGTTGTT
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TTTCTTTTTAGAAACATTTTTTTCAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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CTTGTCGGAATCATCGTCTATCAGCTTGTTTGCTTAGCGGATCTTGAGTTTGATTACATA
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CCTTATCTCTACTACAACTTCCAACCCTACTCGAAGCGACAACACTTGGTAGATGTGACA
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TTTTTCAGAC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

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AT


BQ
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10 10 

AF RS1BP40TF U 1
AF RS1BP40JQ C 1
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BS 610 610 RS1BP40JQ
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CTTTTTGTTTGTTTTGCATTTCTT
GATG

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DS 

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GCTGAGATTGATTGCTTCAAGAACCAGACACCACATAAGAAGCTAGATGAAAATGTGATG
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GAAATTTGATGCCGCTTCTACCTGTAAAGAACCTTCACAAAGATAACTTTGTGGAGAAGA
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CATTTTCTCCATGGCCTTTTCGCACTTTATATACATAATAAACTTAGTATTTTACAGTTT
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CTTTTTGTTTGTTTTGCATTTCTTTGATTGAAGAGTGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTG
GGGGGGGGGGGGGGAGTTGTGCTGAAGTTCTCATTTGATATTATTCAATTAATTAGATTG
AT

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1CT60JQ C 1
AF RS1CT60TF U 1
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BS 681 720 RS1CT60JQ

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DS 

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TGCACATTGGGGAACTCAATTTCTTCCGACAGTAGCGGAACCACAAGCATAGCTCTCAAG
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TCTGCCACTGCTGTGTTGGAGCCGTTCAAGGCTTTGGTTGTGACTTGTGTTGTTGTATTA
TTATATGCTTTGGTTCTTTCTTAGTTTTCTTTAATTTCTTTTGGTTTGGTTTGGCTCCTT
TGAAAGTCCAGGCTAGAGGCAGTGCTATGAACCCCATTACACTGTATGCTTCTTGTTGTG
GTTAATTATTCTATGATATT
A

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

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BQ
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BS 244 592 RS1G446TF
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TA*ATTGACAGTTACATAAGCACCATTGGTGTTGACTTCAAAATTAGGACGATTGAGCAG
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ATGGAAAGCTTCAATAACGTGAAGCAGTGGTTGAGTGAGATCGACAGATATGCTAATGAC
AGTGTATGCAAGCTTCTTATTGGTAACAAGAATGATATGGTTGACAGTAAAGTTGTTTCC
ACCGAAACTGGAAAGGCCTTAGCAGACGAGCTCGGAATACCCTTTCTGGAGA*CAGTGCT
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ATGGGAAGCCAGACGAATGCAAACAAGACATCTGGAAGTGGAACTGTCCAAATGAAAG*T
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QA 1 769 1 769
DS 

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GG
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GGAAAAACTTCACGAATCAATCGGGAAACTCACCAAGAGCTCGAGAAAACCATGAGCAAC
GAGTACGATTATCTGTTCAAGCTTCTGTTGATCGGTGACTCATCTGTTGGAAAATCATGC
CTCCTTCTTCGATTCGCTGATGATGCGTACATTGACAGTTACATAAGCACCATTGGTGTT
GACTTCAAAATTAGGACGATTGAGCAGGATGGGAAGACGATTAAGCTCCAAATCTGGGAT
ACTGCTGGGCAGGAGCGTTTCAGGACCATCACTAGCAGCTACTACAGAGGAGCTCATGGA
ATCATCATTGTGTATGATTGTACTGAGATGGAAAGCTTCAATAACGTGAAGCAGTGGTTG
AGTGAGATCGACAGATATGCTAATGACAGTTTATGCAAGCTTCTTATTGGTAACAAGAAT
GATATGGTTGACAGTAAAGTTGTTTCCACCGAAACTGGAAAGGCCTTAGCAGACGAGCTC
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ACTATTGCTGGCGAGATCAAGAAGAAAATGGGAAGCCAGACGAATGCAAACAAGACATCT
GGAAGTGGAACTGTCCAAATGAAAGGTCAGCCAATCCA
A

QA 3 700 3 700
DS 



AS 1 2

CO CL6577Contig1 1216 2 2 U
GGGTTGACAAAGCCAACCTCTCCTTTACTCTCTTTCTCTCTCTTTTAGCTCTCTATCTCT
CTCTCTCAATGGATGCTCTTAGCTTTGTGAAATTCTGGCTAACCAATAACACCAACGGCA
ATAAACCCCGCCGTGAAATCAGAATCTCAGAATCCGCCGTCGAACCCTCCACCGCATTGG
GAGACTCCGAAGTTGACCTCTTCGAAGAAGATGATTCCTTCTTCGAGCTCGAGATCTCTC
TCTCCGACTTCTCCTTAAAGAAAAACAAAACCCATGAAGAAGAAAAACAGAACACGTTCT
CTGTCTCCAAAAGCAAAGTCCTCCCTTTCGTCGAAACCACCTCGAAACCTCAATCTCCGA
TCACTCTCCTGAAACCCAGTCAAAAGCTTCGTGCTTTCTCCTTCAAGAAGAAAGAACCCA
GCAGCAGAAGCCTCAACGTAAGGTTCAGATTCGAAGACGAGACAACAACGAGGTGTGAAG
ACTCTGTTTCTTCCTCTTCAAAGAGATTCTTCGATCTCATTAAGCCACTGTACAATAAAA
CAACGAAGAGACAGAGCGTCAACAGTGTATCCACTTCTCCGGCGTCTTCACCGGCGGCGA
GAGAGAAACAGAGGAGTAATGTTACTCGAACTGGGAGGAGACAGCTTGGGAAGAGCCGGT
CGGCGTCTGCGGCTGTCGGAGCCATGTCTCCGGGGAAGAGGCTCGACGAGTCTTTGCAGG
TTCAACAAGATGGGATTCAAAGTGCCATTCTCCATTGCAAGAAATCGTTTCACGGGTCGA
GAGAATCTTCTATGTTATCCCGATCTACTAGTGAATCTTCCTCACAAGAGAAACTCAGTA
CTTCATCTTCTGAAGATTCGTATTTGTTTTCAAGAATGTCAAGCGATTCATCAGTGTCGG
AGAAATCAATGGATAGTCTGACTTCAATCAAGGAACAGAGGGAGAAGATTTGCGATTAGG
TTTACTTTTGTCAAAAGAAAGAAAAAGAAAATTAAATAGCAGGAAGGAGCTTTAGTCTTT
TGAAAAATTAGTGCAAAAAATACTTAGTTTGAAGTGGTGATGATGATGGCAAAACAGACA
AATCTTGTTGCAGCATCAGCAGAGACTCACAGATTACTGATGGCTCTTTCTTTTGCCTTT
GTATTGTGATGGATCATTATGTGAATCCTGACACCTAGAAATTTGAAAAAAATAAGTAAA
TATATAATTATTACAT


BQ
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AF RS1BW07TF U 1
AF RS1BW07JQ C 436
BS 1 715 RS1BW07TF
BS 716 1216 RS1BW07JQ

RD RS1BW07TF 715 0 0
GGGTTGACAAAGCCAACCTCTCCTTTACTCTCTTTCTCTCTCTTTTAGCTCTCTATCTCT
CTCTCTCAATGGATGCTCTTAGCTTTGTGAAATTCTGGCTAACCAATAACACCAACGGCA
ATAAACCCCGCCGTGAAATCAGAATCTCAGAATCCGCCGTCGAACCCTCCACCGCATTGG
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TCTCCGACTTCTCCTTAAAGAAAAACAAAACCCATGAAGAAGAAAAACAGAACACGTTCT
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GAGAGAAACAGAGGAGTAATGTTACTCGAACTGGGAGGAGACAGCTTGGGAAGAGCCGGT
CGGCGTCTGCGGCTGTCGGAGCCATGTCTCCGGGGAAGAGGCTCGACGAGTCTTT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1BW07JQ 781 0 0
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CTTCAAAGAGATTCTTCGATCTCATTAAGCCACTGTACAATAAAACAACGAAGAGACAGA
GCGTCAACAGTGTATCCACTTCTCCGGCGTCTTCACCGGCGGCGAGAGAGAAACAGAGGA
GTAATGTTACTCGAACTGGGAGGAGACAGCTTGGGAAGAGCCGGTCGGCGTCTGCGGCTG
TCGGAGCCATGTCTCCGGGGAAGAGGCTCGACGAGTCTTTGCAGGTTCAACAAGATGGGA
TTCAAAGTGCCATTCTCCATTGCAAGAAATCGTTTCACGGGTCGAGAGAATCTTCTATGT
TATCCCGATCTACTAGTGAATCTTCCTCACAAGAGAAACTCAGTACTTCATCTTCTGAAG
ATTCGTATTTGTTTTCAAGAATGTCAAGCGATTCATCAGTGTCGGAGAAATCAATGGATA
GTCTGACTTCAATCAAGGAACAGAGGGAGAAGATTTGCGATTAGGTTTACTTTTGTCAAA
AGAAAGAAAAAGAAAATTAAATAGCAGGAAGGAGCTTTAGTCTTTTGAAAAATTAGTGCA
AAAAATACTTAGTTTGAAGTGGTGATGATGATGGCAAAACAGACAAATCTTGTTGCAGCA
TCAGCAGAGACTCACAGATTACTGATGGCTCTTTCTTTTGCCTTTGTATTGTGATGGATC
ATTATGTGAATCCTGACACCTAGAAATTTGAAAAAAATAAGTAAATATATAATTATTACA
T

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 2

CO CL6578Contig1 924 2 2 U
GGCCAGGAGAAAAAAAGATTAAAAAAAAAAAAAATCCAAAATCTTCTCACCTTATCGAAC
TTCAAGAGACTTCCAAGATCTGGTGAATAACCATGGAAGAAGGAGACGTTTTCAATTGCT
GTTTCAGAGAAATTAATAGTGACATATCCATGAGTAAGAAGAAGATGAAGAAGAGCAATA
CTCAGAAGAGGTTTAGTGAGGAACAGATCAAATCACTTGAGGTTATATTCGAGTCTGAGA
CGAGGCTCGAGCCGCGAAAGAAGGTGCAGGTTGCTCGAGAACTAGGGCTGCAACCAAGAC
AAGTGGCTATATGGTTTCAGAACAAGAGGGCTCGTTGGAAGACTAAGCAGCTTGAGAAAG
AATATAACATTCTTAGAGCCAATTACAATAATCTGGCATCACAATTTGACATCATGAAGA
AAGAAAAGCAAGCTCTGGTCTCCGAGTTGCAGAGACTAAATGAAGAGATGCAAAAGTCAA
AAGAAGAAAGACGTGATGAGTGTTGTGGTGAACAAAGAATAGCTCTCAGCAGTACCACAT
GGTCAGAAAATGGAAAGTGTGATCCAGAAGTTAGGATAAATCAAGAGATTGTTCTGTGTA
ATGATGACATTAAGACAGAGTATTTTGGATTTGAGGAGGAGTCTAATCACGAGCCCACGA
ACATTGTGGAGCAAGCTGATGATAGTTGCTTGACTTCATCTGATAATTGGGGAGGCTTCA
ACTCTGATTCTATCTTAGACCAATCTAGCAGCAATTACCCTTGGTGGGACTTTGGTCATA
ATTCATAAACAAAACAACTAAGTGCAGAGAACGAGTGTGTATATACTTCTGTAGAATGTG
TTAATAGTGTGTTAAGATAAATAATTAATGTTCATTTTGCATCGTTATGCATACGTTGTG
TTATATTTGATTTTACAAAATTAG


BQ
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AF RS1GB62TF U 1
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DS 



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TCAGCATCAAAGGAACTACATTGGCATGTACATGTAAGAATGGAAATATATTCATTCATC
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ATTACAAGTTTTGTTATTAAGTATGATTTATAGTATCACAAGTATCATGCAAGAGCC


BQ
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AF RS1FC71TF U 1
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BS 1 597 RS1FC71TF

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ACTATGGATTCCATGCGATGAGAGCACTTTCATCGATGTTGTTCGTTGCAGTGGCGCTCC
TCAGCATCAAAGGAACTACATTGGCATGTACATGTAAGAATGGAAATATATTCATTCATC
ATCTGTGGATCCATGTGTTCTTGAGATGGTTGTTTAGATCATGTTGTTGTACGCTAATTA
ATTACAAGTTTTGTTATTAAGTATGATTTATAGTATCACAAGTATCATGCAAGAGCC

QA 1 597 1 597
DS 

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GACATCTGGTAGTGTATGTAGGCGATAGTTACAAGAGGTTTGTGATAAAGATGAGTTTGC
TTAAGCATCCAATCTTCAAGGGACTACTTGATCAAGCTCAAGATGCTTATGACTTCAGTT
TTGATTCATCGAAACTATGGATTCCATGCGATGAGAGCACTTTCATCGATGTTGTTCGTT
GCAGTGGCGCTCCTCAGCATCAAAGGAACTACATTGGCATGTACATGTAAGAATGGAAAT
ATATTCATTCATCATCTGTGGATCCATGTGTTCTTGAGATGGTTGTTTAGATCATGTTGT
TGTACGCTAATTAATTACAAGTTTTGTTATTAAGTATGATTTATAGTATCACAAGTATCA
TGCAAGAGCC

QA 1 550 1 550
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6581Contig1 747 2 6 U
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AGGTTTCCTTGAAGATTAACCAAATCCAGAAATGGTCAGAGCCTCACATTGAAACCATGA
ACTCAAAATGGATTCCAAGCATCAAAGAAACTTATGTAACATTAACCATTTATCTAGAAC
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TCACGCCACATCTCATCCAAGGCTTTGATGTCTCACGCTACTATCTTGAGGTAATCAAGA
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TACAAGTCGCCTTGGAGCCATATACCAAAAACGCAAGGCATGGCTTTGAAAAGTTGGTTG
AGTCCACCAAAATCTACCATCAGCAGGCTCAAGAAATGCTGAAGAACAATGAGATTACCA
AACCGGTTGCTACCATGGATTTAGCTTGGGTTGGGGCCACAGCTTTGATTGGTTTCCCTC
TCATATTCATCATCAAATTTCTTTCTGCAGTCTCCAATCCTAAGGGGAAGAAGAGGTACA
GCCATAAGCAAGAACCAAGCACTGGATTTCGCCGAGCCAAACGCCGTCATCCTCACCATT
GAAACAATGTAAAATATAACTTCAGAGATTAAAAAGGTGGTTTGTATTTACCTTTTTGGA
CTTTCAGACTTATTACAGTTATTAGTT


BQ
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AF RS1EY93TF U 1
AF RS1EY93JQ C 34
BS 1 673 RS1EY93TF
BS 674 674 RS1EY93JQ
BS 675 694 RS1EY93TF
BS 695 695 RS1EY93JQ
BS 696 721 RS1EY93TF
BS 722 747 RS1EY93JQ

RD RS1EY93TF 721 0 0
GATATTTAATGACTCTGTGGCACCAACACCTTAGCCCAAATCTTCATATCACTCTTCAAC
AGGTTTCCTTGAAGATTAACCAAATCCAGAAATGGTCAGAGCCTCACATTGAAACCATGA
ACTCAAAATGGATTCCAAGCATCAAAGAAACTTATGTAACATTAACCATTTATCTAGAAC
CAAAGGTTCACTATTTAACAGAGAAGTCCATCGAGGTGTTATCTATGTCTAAACAGGCTT
TCACGCCACATCTCATCCAAGGCTTTGATGTCTCACGCTACTATCTTGAGGTAATCAAGA
CACATACAGCCCCATACACAAGCCAGATTATAACCATAGCGAAACCACACTTGGAGAAAG
TACAAGTCGCCTTGGAGCCATATACCAAAAACGCAAGGCATGGCTTTGAAAAGTTGGTTG
AGTCCACCAAAATCTACCATCAGCAGGCTCAAGAAATGCTGAAGAACAATGAGATTACCA
AACCGGTTGCTACCATGGATTTAGCTTGGGTTGGGGCCACAGCTTTGATTGGTTTCCCTC
TCATATTCATCATCAAATTTCTTTCTGCAGTCTCCAATCCTAAGGGGAAGAAGAGGTACA
GCCATAAGCAAGAACCAAGCACTGGATTTCGCCGAGCCAAACGCCGTCATCCTCACCATT
GAAACAATGTAAACTATAACTTCAGAGATTAAAA*GGTGGTTTGTATTTACCTTTTTGGA
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RS1EY93JQ 714 0 0
GCCCAAATCTTCATATCACTCTTCAACAGGTTTCCTTGAAGATTAACCAAATCCAGAAAT
GGTCAGAGCCTCACATTGAAACCATGAACTCAAAATGGATTCCAAGCATCAAAGAAACTT
ATGTAACATTAACCATTTATCTAGAACCAAAGGTTCACTATTTAACAGAGAAGTCCATCG
AGGTGTTATCTATGTCTAAACAGGCTTTCACGCCACATCTCATCCAAGGCTTTGATGTCT
CACGCTACTATCTTGAGGTAATCAAGACACATACAGCCCCATACACAAGCCAGATTATAA
CCATAGCGAAACCACACTTGGAGAAAGTACAAGTCGCCTTGGAGCCATATACCAAAAACG
CAAGGCATGGCTTTGAAAAGTTGGTTGAGTCCACCAAAATCTACCATCAGCAGGCTCAAG
AAATGCTGAAGAACAATGAGATTACCAAACCGGTTGCTACCATGGATTTAGCTTGGGTTG
GGGCCACAGCTTTGATTGGTTTCCCTCTCATATTCATCATCAAATTTCTTTCTGCAGTCT
CCAATCCTAAGGGGAAGAAGAGGTACAGCCATAAGCAAGAACCAAGCACTGGATTTCGCC
GAGCCAAACGCCGTCATCCTCACCATTGAAACAATGTAAAATATAACTTCAGAGATTAAA
AAGGTGGTTTGTATTTACCTTTTTGGACTTTCAGACTTATTACAGTTATTAGTT

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL6582Contig1 632 2 1 U
GAGAAATAATAAAAATACAAGATATTCTAAGATATCTTTAGAATTCAGAATATAACAATA
ACAGGTACAAATATTAAATTGAGGTACCCCATTTTATGACAACTTTCAACAACTTACCCT
CTATTTTTGTGCCTTTAGTAGGCCTAGTCTTTCCGGCACTTGCAATGGCTTCTTTATTTC
TTCATATTCAAAAAAATAAGATTTTTTAGATCGGATGAGACCGAATCGTATAAATCCCTT
TTTTATTTTAAAAACTTCGATTTGATAAGACCCATTTGGTAGAATATTGTATAACACATA
GATTCCTACAAACATAACTAAAAGAAGCTTTTATGCATGTGTAAACGTATTATATGGGGT
AACTCAATTTGCGCTCTTTTGAAAAAATGGATCATCATTGGACCGCTGTATGAAATTCAA
GTCAATGTATTTAATTGTATGTATATAGTTATCAATGTATTTATTTGTATGTATATAGTT
ATAGGGGATCATATAAAGGAAGGAGATGTTATTATTTTAGATATAAACAATTATATAAAT
TACTCCTAAAGTAAAGGTTCACAATAAAATAGTTATAGTTGATGAGAGTTACTTTGAAAA
CAAAAAAAGGAAAGTCATATTTTCTCAATTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DT26JQ C 1
AF RS1DT26TF U 1
BS 1 632 RS1DT26TF

RD RS1DT26JQ 632 0 0
GAGAAATAATAAAAATACAAGATATTCTAAGATATCTTTAGAATTCAGAATATAACAATA
ACAGGTACAAATATTAAATTGAGGTACCCCATTTTATGACAACTTTCAACAACTTACCCT
CTATTTTTGTGCCTTTAGTAGGCCTAGTCTTTCCGGCACTTGCAATGGCTTCTTTATTTC
TTCATATTCAAAAAAATAAGATTTTTTAGATCGGATGAGACCGAATCGTATAAATCCCTT
TTTTATTTTAAAAACTTCGATTTGATAAGACCCATTTGGTAGAATATTGTATAACACATA
GATTCCTACAAACATAACTAAAAGAAGCTTTTATGCATGTGTAAACGTATTATATGGGGT
AACTCAATTTGCGCTCTTTTGAAAAAATGGATCATCATTGGACCGCTGTATGAAATTCAA
GTCAATGTATTTAATTGTATGTATATAGTTATCAATGTATTTATTTGTATGTATATAGTT
ATAGGGGATCATATAAAGGAAGGAGATGTTATTATTTTAGATATAAACAATTATATAAAT
TACTCCTAAAGTAAAGGTTCACAATAAAATAGTTATAGTTGATGAGAGTTACTTTGAAAA
CAAAAAAAGGAAAGTCATATTTTCTCAATTCC

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1DT26TF 632 0 0
GAGAAATAATAAAAATACAAGATATTCTAAGATATCTTTAGAATTCAGAATATAACAATA
ACAGGTACAAATATTAAATTGAGGTACCCCATTTTATGACAACTTTCAACAACTTACCCT
CTATTTTTGTGCCTTTAGTAGGCCTAGTCTTTCCGGCACTTGCAATGGCTTCTTTATTTC
TTCATATTCAAAAAAATAAGATTTTTTAGATCGGATGAGACCGAATCGTATAAATCCCTT
TTTTATTTTAAAAACTTCGATTTGATAAGACCCATTTGGTAGAATATTGTATAACACATA
GATTCCTACAAACATAACTAAAAGAAGCTTTTATGCATGTGTAAACGTATTATATGGGGT
AACTCAATTTGCGCTCTTTTGAAAAAATGGATCATCATTGGACCGCTGTATGAAATTCAA
GTCAATGTATTTAATTGTATGTATATAGTTATCAATGTATTTATTTGTATGTATATAGTT
ATAGGGGATCATATAAAGGAAGGAGATGTTATTATTTTAGATATAAACAATTATATAAAT
TACTCCTAAAGTAAAGGTTCACAATAAAATAGTTATAGTTGATGAGAGTTACTTTGAAAA
CAAAAAAAGGAAAGTCATATTTTCTCAATTCC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 2

CO CL6583Contig1 817 2 4 U
GGAAGTTCCTTTTCATCACTCACGCTCACCTCGATCACATCGGAGGTTTACCGATGTATG
TAGCTAGTCGTGGGTTATACAATCTAGAGCCACCTAAAATATTCGTGCCACCGTCCATTA
AAGAAGATGTTGAGAAACTCCTTGACATTCACAGGTCTATGGGTCAAGTTGACCTCAATG
TTGAAATCATTCCACTCCACGTTGGTGAAACATATGAGTTGCGGAATGACATTGTCGTTA
GACCTTTTGCAACTAACCACGTCATACCCAGCCAGGGTTATGTTATCTACTCGGTTAGGA
ACAAGTTGAAGAAGCAGTATGTTCATCTTAAAGGCAAACAAATCGAAAAGATTAAAAAAT
CTGGCGAACAGATTACAGACACGATATTATCCCCTGAGATAGCCTTCACTGGAGATACAA
CTGCTGAGTATATGCTTGACCCTCGTAACGCTGATGCTTTGAGGGCTAAAGTTCTTATTA
CCGAGGCTACTTTCTTGGATGAAAGTTTTAGCAATGAGCATGCGCAGTCACTCGGTCACA
CTCATATATCTCAGATAATTGAGAATGCAAAATGGATCCGGAGCAAAACTGTGTTGTTAA
CGCATTTCTCATCACGTTACAATATAGAGGAAATTCGCGAAGCTGTGCTCAAGTTGCAAT
CAAAAGTGTCCGCAAAAGTCATTCCTCTTACAGAAGGATTCAGGTCAAAATATTCTTGAA
AGAGTGCAAGCTATTAGTGTGATTTGAAACCATTTTTATCAACTAATGTAAGTTAACAAG
GAGAAATGAAAAGAAATATATTCATTCGTTGCAACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C167TF U 1
AF RS1C167JQ C 15
BS 1 664 RS1C167TF
BS 665 665 RS1C167JQ
BS 666 699 RS1C167TF
BS 700 817 RS1C167JQ

RD RS1C167TF 700 0 0
GGAAGTTCCTTTTCATCACTCACGCTCACCTCGATCACATCGGAGGTTTACCGATGTATG
TAGCTAGTCGTGGGTTATACAATCTAGAGCCACCTAAAATATTCGTGCCACCGTCCATTA
AAGAAGATGTTGAGAAACTCCTTGACATTCACAGGTCTATGGGTCAAGTTGACCTCAATG
TTGAAATCATTCCACTCCACGTTGGTGAAACATATGAGTTGCGGAATGACATTGTCGTTA
GACCTTTTGCAACTAACCACGTCATACCCAGCCAGGGTTATGTTATCTACTCGGTTAGGA
ACAAGTTGAAGAAGCAGTATGTTCATCTTAAAGGCAAACAAATCGAAAAGATTAAAAAAT
CTGGCGAACAGATTACAGACACGATATTATCCCCTGAGATAGCCTTCACTGGAGATACAA
CTGCTGAGTATATGCTTGACCCTCGTAACGCTGATGCTTTGAGGGCTAAAGTTCTTATTA
CCGAGGCTACTTTCTTGGATGAAAGTTTTAGCAATGAGCATGCGCAGTCACTCGGTCACA
CTCATATATCTCAGATAATTGAGAATGCAAAATGGATCCGGAGCAAAACTGTGTTGTTAA
CGCATTTCTCATCACGTTACAATATAGAGGAAATTCGCGAAGCTGTGCTCAAGTTGCAAT
CAAA*GTGTCCGCAAAAGTCATTCCTCTTACAGAAGGAT
C

QA 1 699 1 699
DS 

RD RS1C167JQ 803 0 0
ATCACTCACGCTCACCTCGATCACATCGGAGGTTTACCGATGTATGTAGCTAGTCGTGGG
TTATACAATCTAGAGCCACCTAAAATATTCGTGCCACCGTCCATTAAAGAAGATGTTGAG
AAACTCCTTGACATTCACAGGTCTATGGGTCAAGTTGACCTCAATGTTGAAATCATTCCA
CTCCACGTTGGTGAAACATATGAGTTGCGGAATGACATTGTCGTTAGACCTTTTGCAACT
AACCACGTCATACCCAGCCAGGGTTATGTTATCTACTCGGTTAGGAACAAGTTGAAGAAG
CAGTATGTTCATCTTAAAGGCAAACAAATCGAAAAGATTAAAAAATCTGGCGAACAGATT
ACAGACACGATATTATCCCCTGAGATAGCCTTCACTGGAGATACAACTGCTGAGTATATG
CTTGACCCTCGTAACGCTGATGCTTTGAGGGCTAAAGTTCTTATTACCGAGGCTACTTTC
TTGGATGAAAGTTTTAGCAATGAGCATGCGCAGTCACTCGGTCACACTCATATATCTCAG
ATAATTGAGAATGCAAAATGGATCCGGAGCAAAACTGTGTTGTTAACGCATTTCTCATCA
CGTTACAATATAGAGGAAATTCGCGAAGCTGTGCTCAAGTTGCAATCAAAAGTGTCCGCA
AAAGTCATTCCTCTTACAGAAGGATTCAGGTCAAAATATTCTTGAAAGAGTGCAAGCTAT
TAGTGTGATTTGAAACCATTTTTATCAACTAATGTAAGTTAACAAGGAGAAATGAAAAGA
AATATATTCATTCGTTGCAACTG

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

CO CL6584Contig1 600 2 5 U
CGTAGAAATTCACGCTTATTCAATAATAGGATACATGATCAAGTTCACTGATACACACAC
ATAGTCAAGCGTACATTATAATCAAACTCGCCTTGAGTCGACACATAAACTCGCCTTTTT
GGCTTTATTGGTGATGCCACGACAAATAAAATACGAAGATTCAGACAAACAAACATGACA
CAACAAAAAAAAGGAAAGAAACAACAATACATTGAAGGCGGATAAGTTATCACATTCCTC
CAAGTTCATTCTCCGTTAATTAACGTGCCGCCTCGGCCGAGTAAATACAAACCGCCTTTA
CGTAGTGGAGTTTCATGGCTAGGTCTAAACCGGTACGTTCGTGGGTTGTACCCGTTTCAG
TCGGTTGGGTTGAACTCACGGTTGACAACAAGAAGCCATGAACTGGACCGCTTCCCTCTT
CTTGAAGTTGAGACATGTGTATGAAAAAAGAGGATGAATGTACGAGAAGTATTGGTAAAA
TGATTATGAGTAATCTCTCGCTCTAGACTCTAGCCTATATATATAAGTTTATATAGGAAG
AATTATGTATTTTCTTACAGATTTTTTTTGCTCTAGTTTCAAAATGCTTTGCGACTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1F736JQ U 168
AF RS1F736TF C 1
BS 1 167 RS1F736TF
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RD RS1F736JQ 282 0 0
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TATCACATTCCTCCAAGTTCATTCTCCGTTAATTAACGTGCCGCCTCGGCCGAGTAAATA
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GTACCCGTTTCAGTCGGTTGGGTTGAACTCACGGTTGACAACAAGAAGCCATGAACTGGA
CCGCTTCCCTCTTCTTGAAGTTGAGACATGTGTATGAAAAAA

QA 1 282 1 282
DS 

RD RS1F736TF 600 0 0
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ATAGTCAAGCGTACATTATAATCAAACTCGCCTTGAGTCGACACATAAACTCGCCTTTTT
GGCTTTATTGGTGATGCCACGACAAATAAAATACGAAGATTCAGACAAACAAACATGACA
CAACAAAGAAAAGGAAAGAAACAACAATACATTGAAGGCGGATAAGTTATCACATTCCTC
CAAGTTCATTCTCCGTTAATTAACGTGCCGCCTCGGCCGAGTAAATACAAACCGCCTTTA
CGTAGTGGAGTTTCATGGCTAGGTCTAAACCGGTACGTTCGTGGGTTGTACCCGTTTCAG
TCGGTTGGGTTGAACTCACGGTTGACAACAAGAAGCCATGAACTGGACCGCTTCCCTCTT
CTTGAAGTTGAGACATGTGTATGAGAAAAGAGGATGAATGTACGAGAAGTATTGGTAAAA
TGATTATGAGTAATCTCTCGCTCTAGACTCTAGCCTATATATATAAGTTTATATAGGAAG
AATTATGTATTTTCTTACAGATTTTTTTTGCTCTAGTTTCAAAATGCTTTGCGACTGTCC

QA 1 600 1 600
DS 



AS 1 2

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AGCCTGCTTAAGCATAGGGAACAATGAACCGTTAAGGGGAAAACTCATGACCTCGTTAGC
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TATATGGTGTCACAACTAAAATCCAGTTGCTTAGTTTTTGTTTCTTTATTTAACGTTTGG
AATAGGTTTCCTAATCAATATGATATATTTGTTAAGGTTGTGAGAATGTTGTGTC


BQ
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AF RS1AQ32JQ U 100
AF RS1AQ32TFB C 1
BS 1 99 RS1AQ32TFB
BS 100 317 RS1AQ32JQ
BS 318 595 RS1AQ32TFB

RD RS1AQ32JQ 218 0 0
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AAGTCAAACCCACAATGCACCAGCCTGCTTAAGCATAGGGAACAATGAACCGTTAAGGGG
AAAACTCATGACCTCGTTAGCCCCACCAACCAACTCCCCTCCAATAAAAATGGCTGGAAC
CGCAGGGCTACAACCAAAACGCAACAACGCCTGCTCAA

QA 1 218 1 218
DS 

RD RS1AQ32TFB 595 0 0
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CTTAACTTAGTGTTAAGTAACTAGTTAGATAAAGTAGATAAGTCAAACCCACAATGCACC
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CAACAACGCCTGCTCAATCTCCCTGCCTCTAGGTACTTCATCAAGCTCGTGAACCGCTGG
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GCTGTATATCACCACTGGTCTCTCCATCACCATCTTCGTTATCATCTCCATTACTAGTTT
TATATGGTGTCACAACTAAAATCCAGTTGCTTAGTTTTTGTTTCTTTATTTAACGTTTGG
AATAGGTTTCCTAATCAATATGATATATTTGTTAAGGTTGTGAGAATGTTGTGTC

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 2

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AAGACGACAACATTTCTCTGTCTTCATGGCCACGGATCAAGAAGATTTACTCTCAGATGA
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AAGAGGAGATGGTGGCTGGAGCGGTAACTTGCAGGAAGAGAAAGGAGAAAGTTGGTGGAG
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CTTCATAAGAAGTTTTAGCAGTGGAAAGAAGAAGATCAGAAGAGATGTGGATTTCACGTA
CGATCTCAAAAACTACAGTCTTAATTTTGACGACGGCGGCGCCGGCGAAAGTCCTTCACC
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GTATTATTTTTATTGATCGTGTTATAAATGTTAATACC


BQ
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AF RS1BZ91JQ C 1
AF RS1BZ91TF U 6
BS 1 5 RS1BZ91JQ
BS 6 518 RS1BZ91TF

RD RS1BZ91JQ 518 0 0
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AAGACGACAACATTTCTCTGTCTTCATGGCCACGGATCAAGAAGATTTACTCTCAGATGA
TTACCAAGAAACGGCGGCGTTTTGCGGGTGTGGGTATCTCTGTAACTTCTGGTGGAAAAG
AAGAGGAGATGGTGGCTGGAGCGGTAACTTGCAGGAAGAGAAAGGAGAAAGTTGGTGGAG
CAGGACACTGAAGGGGCCAAAAGAGATTTCTGAGAAACTTGCGGGGCCAAAATGGAAAAA
CTTCATAAGAAGTTTTAGCAGTGGAAAGAAGAAGATCAGAAGAGATGTGGATTTCACGTA
CGATCTCAAAAACTACAGTCTTAATTTTGACGACGGCGGCGCCGGCGAAAGTCCTTCACC
GGAGAGATATATAGCTCCTCCGGCTGTTGTAAAAGTTTGATATATTTATCTCTCCTTTTT
GTATTATTTTTATTGATCGTGTTATAAATGTTAATACC

QA 1 518 1 518
DS 

RD RS1BZ91TF 513 0 0
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AAGAAACGGCGGCGTTTTGCGGGTGTGGGTATCTCTGTAACTTCTGGTGGAAAAGAAGAG
GAGATGGTGGCTGGAGCGGTAACTTGCAGGAAGAGAAAGGAGAAAGTTGGTGGAGCAGGA
CACTGAAGGGGCCAAAAGAGATTTCTGAGAAACTTGCGGGGCCAAAATGGAAAAACTTCA
TAAGAAGTTTTAGCAGTGGAAAGAAGAAGATCAGAAGAGATGTGGATTTCACGTACGATC
TCAAAAACTACAGTCTTAATTTTGACGACGGCGGCGCCGGCGAAAGTCCTTCACCGGAGA
GATATATAGCTCCTCCGGCTGTTGTAAAAGTTTGATATATTTATCTCTCCTTTTTGTATT
ATTTTTATTGATCGTGTTATAAATGTTAATACC

QA 1 513 1 513
DS 



AS 1 2

CO CL6587Contig1 668 2 2 U
GTATGGGATCTGCGTTCTCCATCTGCTAAACCGATACAGTCTGTGGTTGCTCACTCCATG
GAGGTTAACTGCTCAGCCTTCAATCCAATCAATGAGTGGGTTGTGGCAACAGGGTCGACT
GATAAGACTGTTAAATTGTTCGATCTACGGAAGCTAACCAGCGCTCTTCACACATTTGAT
AGCCATAAAGAGGAGGTTTTCCAAGTTGGTTGGAACCCGAAGAACGAGACTATCTTAGCC
TCATGTTGCCTTGGTAGAAGGCTTATGGTTTGGGACCTTAGCAGGATCGACGAGGAACAG
ACAGCAGAGGATGCAGAGGACGGTCCACCAGAGCTGCTGTTCATCCATGGTGGTCACACC
AGCAAAATATCAGATTTCTCGTGGAATCCTTGTGAAGACTGGGTTATTTCAAGTGTAGCT
GAGGACAACATACTCCAAATATGGCAAATGGCTGAGAACATTTATCATGACGAAGATGAT
GCTCCAGGGGAAGAACCAATAAAAGGTTCTTAAGCTTATTGTTAGGTTCCTTATCTTATG
TGACATTAATTTTCTGTTATACATCTCTCTGCTTTGATCTGTTCCAACTTCCAAGTATTT
AGTGTAAGTTATGTAAAGCTAGACATGAAATGAGTTTGCTTTCTCAATCCATATCTTGCT
TCTGTATA


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AF RS1CV09JQ C 1
AF RS1CV09TF U 1
BS 1 667 RS1CV09TF
BS 668 668 RS1CV09JQ

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TCATGTTGCCTTGGTAGAAGGCTTATGGTTTGGGACCTTAGCAGGATCGACGAGGAACAG
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GAGGACAACATACTCCAAATATGGCAAATGGCTGAGAACATTTATCATGACGAAGATGAT
GCTCCAGGGGAAGAACCAATAAAAGGTTCTTAAGCTTATTGTTAGGTTCCTTATCTTATG
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TCTGTATA

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1CV09TF 667 0 0
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GAGGTTAACTGCTCAGCCTTCAATCCAATCAATGAGTGGGTTGTGGCAACAGGGTCGACT
GATAAGACTGTTAAATTGTTCGATCTACGGAAGCTAACCAGCGCTCTTCACACATTTGAT
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TCATGTTGCCTTGGTAGAAGGCTTATGGTTTGGGACCTTAGCAGGATCGACGAGGAACAG
ACAGCAGAGGATGCAGAGGACGGTCCACCAGAGCTGCTGTTCATCCATGGTGGTCACACC
AGCAAAATATCAGATTTCTCGTGGAATCCTTGTGAAGACTGGGTTATTTCAAGTGTAGCT
GAGGACAACATACTCCAAATATGGCAAATGGCTGAGAACATTTATCATGACGAAGATGAT
GCTCCAGGGGAAGAACCAATAAAAGGTTCTTAAGCTTATTGTTAGGTTCCTTATCTTATG
TGACATTAATTTTCTGTTATACATCTCTCTGCTTTGATCTGTTCCAACTTCCAAGTATTT
AGTGTAAGTTATGTAAAGCTAGACATGAAATGAGTTTGCTTTCTCAATCCATATCTTGCT
TCTGTAT

QA 1 667 1 667
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6589Contig1 961 2 2 U
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TATAAAATCTGCGTTGGAGAAGAAGATTGGTCGTCCTTCTGTAGTCAGCATCTATGCCCT
GGGCAACCTAGAATACATCCCAAGGGACCTCTTGGAAATGATCTCTTCCTCTGGAATCAC
TCTTATTCATGGCCTCCGCAATATGATGGACTTTAACGGGTTTCTGGAAGAATGGTCTGA
CAACAGCATGGACACCACTTACACAATGGTGATAACCGATGATTATGGGATTGCTTATCC
TCCTCTTCTTGGGCTTTTTGAATTCTCTAAGCTTTGTGCATATCCAAAAGATGGTCGGCT
CATTGCCCTTGCCAATCAAAGCAATCCCAGACATAGAGTGTTGCCCTGTGACTTTGTCTG
GGAAGCTTTATTGTCTGATAATTACGCAGATACAACAGATGAGATGAATTCGACCGGGAG
TAAACCTCTCTACGGGAGTAAACCTCTCTACGTGTGCAACATATGCGATACTTATTTCGA
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AAAGTTGTTTGATATAGCGCCTAGAGACTCCAGCAACGGTGAGCTTAAACATTTTTGCCA
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GAAGATCATTGATCATTGTTGTGTTTAAGTTTACTACATAATACTTATCTTATTATGTTT
AATAGTTTGTTCGTCCGCCACTAAAATATTTCTAAGTCTTGTTTGTTTGCTTTTTTTTGC
C


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10 

AF RS1GV92TF U 1
AF RS1GV92JQ C 315
BS 1 741 RS1GV92TF
BS 742 961 RS1GV92JQ

RD RS1GV92TF 741 0 0
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GGGCAACCTAGAATACATCCCAAGGGACCTCTTGGAAATGATCTCTTCCTCTGGAATCAC
TCTTATTCATGGCCTCCGCAATATGATGGACTTTAACGGGTTTCTGGAAGAATGGTCTGA
CAACAGCATGGACACCACTTACACAATGGTGATAACCGATGATTATGGGATTGCTTATCC
TCCTCTTCTTGGGCTTTTTGAATTCTCTAAGCTTTGTGCATATCCAAAAGATGGTCGGCT
CATTGCCCTTGCCAATCAAAGCAATCCCAGACATAGAGTGTTGCCCTGTGACTTTGTCTG
GGAAGCTTTATTGTCTGATAATTACGCAGATACAACAGATGAGATGAATTCGACCGGGAG
TAAACCTCTCTACGGGAGTAAACCTCTCTACGTGTGCAACATATGCGATACTTATTTCGA
AGAAGAATTCAGCCCTCATCTCAAATTCAGCACTCATCTCAAGGGTGAAGAACACAGAAC
AAAGTTGTTTGATATAGCGCCTAGAGACTCCAGCAACGGTGAGCTTAAACATTTTTGCCA
AGTTTGCAATTATCCCGCCGACGTCGATTTTAACTTACGCCTCCATAACCAAAGTGAAGA
ACATAAGCTGGCTGCGAAAAA

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1GV92JQ 647 0 0
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ATCAAAGCAATCCCAGACATAGAGTGTTGCCCTGTGACTTTGTCTGGGAAGCTTTATTGT
CTGATAATTACGCAGATACAACAGATGAGATGAATTCGACCGGGAGTAAACCTCTCTACG
GGAGTAAACCTCTCTACGTGTGCAACATATGCGATACTTATTTCGAAGAAGAATTCAGCC
CTCATCTCAAATTCAGCACTCATCTCAAGGGTGAAGAACACAGAACAAAGTTGTTTGATA
TAGCGCCTAGAGACTCCAGCAACGGTGAGCTTAAACATTTTTGCCAAGTTTGCAATTATC
CCGCCGACGTCGATTTTAACTTACGCCTCCATAACCAAAGTGAAGAACATAAGCTGGCTG
CGAAAAAGGCTCAAGAAGAGGACAATTGCGAGAGCAGGAACAGAGGTCCAGAGTGGGATT
CGGTTGGCGAGATAAGAAGCAATCTCTCTTGAACGAGGCAAACAGTGAAGATCATTGATC
ATTGTTGTGTTTAAGTTTACTACATAATACTTATCTTATTATGTTTAATAGTTTGTTCGT
CCGCCACTAAAATATTTCTAAGTCTTGTTTGTTTGCTTTTTTTTGCC

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 2

CO CL6590Contig1 479 2 1 U
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ATCAAGATAGTGCCGAAGCTGAGGGTCTTGAAAAAGACTACGTCCCCTAAGAAGCTTTTA
ACGCGGCTTCGAGATTCTTACGTCAATATGATGCTGCGCCTCGCCAGCTCTGGGGCCATA
GGGTCGTCCTACGGGTACGGGTCGGGTCGTCCTACGGGTACGGAGTATGATGAGAAGAAG
CTGGTGGAGATTTACAAATCCATGTTGATGGCGCAGGGGACTCTCGTTCACCGCAATGTA
CCTAAACCTTGCTCTGGTTCTAATATTGTACTCTCATCGCTTGGTTAATTACATATGTGG
ATCGTTGGTGCTAAGCGTTGTGATTGTAATCTGTGTTAAAGTTACATTTCAGAAAGTAT


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AF RS1G355JQ C 1
AF RS1G355TF U 1
BS 1 479 RS1G355TF

RD RS1G355JQ 479 0 0
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CCTAAACCTTGCTCTGGTTCTAATATTGTACTCTCATCGCTTGGTTAATTACATATGTGG
ATCGTTGGTGCTAAGCGTTGTGATTGTAATCTGTGTTAAAGTTACATTTCAGAAAGTAT

QA 1 479 1 479
DS 

RD RS1G355TF 479 0 0
GTAAGAGAGAGAGTGATGAAGATAAGGTATTGGCGGAGGTCAAGAGGATACGAAAGGCTA
GATGTCTCGGCAAAGAAGTCGAACTCGGATCCGACCCGGAAGAGACGGTTTTGGAGGAGG
ATCAAGATAGTGCCGAAGCTGAGGGTCTTGAAAAAGACTACGTCCCCTAAGAAGCTTTTA
ACGCGGCTTCGAGATTCTTACGTCAATATGATGCTGCGCCTCGCCAGCTCTGGGGCCATA
GGGTCGTCCTACGGGTACGGGTCGGGTCGTCCTACGGGTACGGAGTATGATGAGAAGAAG
CTGGTGGAGATTTACAAATCCATGTTGATGGCGCAGGGGACTCTCGTTCACCGCAATGTA
CCTAAACCTTGCTCTGGTTCTAATATTGTACTCTCATCGCTTGGTTAATTACATATGTGG
ATCGTTGGTGCTAAGCGTTGTGATTGTAATCTGTGTTAAAGTTACATTTCAGAAAGTAT

QA 1 479 1 479
DS 



AS 1 2

CO CL6591Contig1 808 2 2 U
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CATGTCCTCTGGAACTGGAAATTAGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1H123TF U 1
AF RS1H123JQB C 85
BS 1 600 RS1H123TF
BS 601 808 RS1H123JQB

RD RS1H123TF 600 0 0
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TAAGGGTGACATCGAGTTACGGGAACGCGTTTCATCACGCGGAAGATGTAGACTCGGGAC
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AGATGCAGAATCTGAACAGGGCTACAATCTCTAAAATGGCTTGGTTGAGTTTCCTCTCTC

QA 1 600 1 600
DS 

RD RS1H123JQB 724 0 0
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CAATCTCTAAAATGGCTTGGTTGAGTTTCCTCTCTCTTTTTGTATGCTTAGGAGTCGCTG
GAATGCAGTTTATGCACTTGAAGACGTTTCTGGAGAAGAAGAAAGTTATCTAAGATGGTT
TAGTTAGATAGAACAATCCCACTTGCTTTTTTTCTCATCTCTCAAGGAATCTTTTATTCC
TTGGGTTTTTGTACATTTAGATCTTTGTGGCTTGAGCATGTCCTCTGGAACTGGAAATTA
GATG

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL6592Contig1 707 2 3 U
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CCAATGGCGTTCTCAACGACTCTGTCTCAGCTTTCTTCCCTTTCGAGGATCTCCTCTTCA
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GCTTCAACCAAAACCCCTAAAACTCTTCCCAAGAAGCCAGTTTACTCGATGAAGAAGGGT
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BQ
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AF RS1AG77TF U 1
AF RS1FW40TF U 1
BS 1 98 RS1AG77TF
BS 99 99 RS1FW40TF
BS 100 707 RS1AG77TF

RD RS1AG77TF 707 0 0
GGATTGCGGTCTTATCCCAAAATCCCAACAAAACACAGAGAAATTTTCTTGGTGGTCTCT
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GCTTCAACCAAAACCCCTAAAACTCTTCCCAAGAAGCCAGTTTACTCGATGAAGAAGGGT
CAAATCGTTCGTGTAGACAAGGAGAAGTACCTCAACAGCATCAATTACTTATCAGTTGGT
CATCCACCTTTCTACAAAGGACTAGATTACATCTATGAAGATCGCGGCGAGGTCCTGGAC
ATTCGTGTTTTTGAGACAGGAGAGTATGCCCTTGTTGGATGGGTTGGTATCCCAACTGCA
CCGGCTTGGCTACCAACAGATATGCTCATCAAGTCCGAGAAACTTGTTTACGAGAGACTA
TAGAGTCTTCAAGAAGAATCCTGCGGGTTGTCTATTAAGCTGAGATGAATGGTAACAGTG
AACCACCATAATCATGTATTCAAGAGTTTGACAAGCATCATAATGTTACCATAGTCATAA
AACTGTTGTGGTATGTAAAAAAAAAATGTGATGAGACCGAATCTTAC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1FW40TF 675 0 0
GGATTGCGGTCTTATCCCAAAATCCCAACAAAACACAGAGAAATTTTCTTGGTGGTCTCT
CCAATGGCGTTCTCAACGACTCTGTCTCAGCTTTCTTCCCTTTCGAGGATCTCCTCTTCA
CTGCCACTTTCTTCTAGAAGATTCTCTCTTCTATCCCAGACTCAGTTCAGAGTCAAAGCA
GGGGCAGAGAATGAGAAACAGAGCACACAGACTAAATCCGAAGGGGAAGCAGCTTCACCA
GCTTCAACCAAAACCCCTAAAACTCTTCCCAAGAAGCCAGTTTACTCGATGAAGAAGGGT
CAAATCGTTCGTGTAGACAAGGAGAAGTACCTCAACAGCATCAATTACTTATCAGTTGGT
CATCCACCTTTCTACAAAGGACTAGATTACATCTATGAAGATCGCGGCGAGGTCCTGGAC
ATTCGTGTTTTTGAGACAGGAGAGTATGCCCTTGTTGGATGGGTTGGTATCCCAACTGCA
CCGGCTTGGCTACCAACAGATATGCTCATCAAGTCCGAGAAACTTGTTTACGAGAGACTA
TAGAGTCTTCAAGAAGAATCCTGCGGGTTGTCTATTAAGCTGAGATGAATGGTAACAGTG
AACCACCATAATCATGTATTCAAGAGTTTGACAAGCATCATAATGTTACCATAGTCATAA
AACTGTTGTGGTATG

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL6593Contig1 904 2 12 U
GGATTTTATAGGAGGAGGAACTCTCTTCGCTTTCTCCTTTTCTCAGTTCCTCAAAGCGAA
GCGACGACGCCATTTCTCTCACTCCAATCTCACCTCAAAATTCCCTTCTCCTTCGTCGCT
CGCTCCTACCTTCAGATCTCCCACTGGTGATGCAGGGGTTTCTTACATGATGTGGTTTCT
AGTGTAATAACTAGTAAATATGTCGTCTTCTTCTTCACGGCTCATAGAGATACTGGAATC
TGTTACTTCGTCGGAGGATATATCTACAAAGACCAAGAGTGTAATAGAACTGAAAAAGCT
TCAGCTGTTAAATCTGCAACGTCGTTTGAGAAGTGAGTTTCTTTACAACTTCTTCAAACC
TATTGGAAACGATGTTGAGAACCTAAAGTCATATAAAAACATAAGCATGGCCGGCGGATT
AGACAGCTTGAGAAGTATGAGCAGAAGATGAAGGAAGAGCGACAGAGGAGAATTCGTGAG
AGGCAGAAGGAGTTCTTTGGGGAGACAGAAGTTCACAAGGAAAGGCTTGATGACTTATCC
AAAGCTAGGAGAGAAAGGTGGAAGGGCTTCAATAGATATGTAAAGGAGTTCCACAAAAGA
AAGGAACGTTTTCATCGTGAAAAGGTTGACAAAATTCAGCGGGAGAAGATTAATTTGTTA
AAGATTAATGATGTGGAGGGTTATCTTCGTATGGTGAAGGATGCAAAGTCAGACAGAGTA
ATGCAACTACTCGAAGAGACAGAAAAGTACCTTCAAAAGCTTGGATCCAAGTTAAAGGAG
GCAAAATCTTTGGCCAGTCGATTTGAGAATGAGGCAGATGAGGCACCTGTTGAGGATAAA
ATTGAAAATGATGATGAGAGTGACCAGGCAAAGCACTACCTGGAAAGCAATGAAAAATAC
TACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1CE14TF U 1
AF RS1CE14JQ C 253
BS 1 699 RS1CE14TF
BS 700 700 RS1CE14JQ
BS 701 725 RS1CE14TF
BS 726 726 RS1CE14JQ
BS 727 734 RS1CE14TF
BS 735 735 RS1CE14JQ
BS 736 745 RS1CE14TF
BS 746 746 RS1CE14JQ
BS 747 757 RS1CE14TF
BS 758 758 RS1CE14JQ
BS 759 772 RS1CE14TF
BS 773 904 RS1CE14JQ

RD RS1CE14TF 772 0 0
GGATTTTATAGGAGGAGGAACTCTCTTCGCTTTCTCCTTTTCTCAGTTCCTCAAAGCGAA
GCGACGACGCCATTTCTCTCACTCCAATCTCACCTCAAAATTCCCTTCTCCTTCGTCGCT
CGCTCCTACCTTCAGATCTCCCACTGGTGATGCAGGGGTTTCTTACATGATGTGGTTTCT
AGTGTAATAACTAGTAAATATGTCGTCTTCTTCTTCACGGCTCATAGAGATACTGGAATC
TGTTACTTCGTCGGAGGATATATCTACAAAGACCAAGAGTGTAATAGAACTGAAAAAGCT
TCAGCTGTTAAATCTGCAACGTCGTTTGAGAAGTGAGTTTCTTTACAACTTCTTCAAACC
TATTGGAAACGATGTTGAGAACCTAAAGTCATATAAAAACATAAGCATGGCCGGCGGATT
AGACAGCTTGAGAAGTATGAGCAGAAGATGAAGGAAGAGCGACAGAGGAGAATTCGTGAG
AGGCAGAAGGAGTTCTTTGGGGAGACAGAAGTTCACAAGGAAAGGCTTGATGACTTATCC
AAAGCTAGGAGAGAAAGGTGGAAGGGCTTCAATAGATATGTAAAGGAGTTCCACAAAAGA
AAGGAACGTTTTCATCGTGAAAAGGTTGACAAAATTCAGCGGGAGAAGATTAATTTGTTA
AAGATTAATGATGTGGAGGGTTATCTTCGTATGGTGAAG*ATGCAAAGTCAGACAGAGTA
ATGCA*CTACTCGA*GAGACAGAAA*GTACCTTCAAA*GCTTGGATCCAAGT

QA 1 772 1 772
DS 

RD RS1CE14JQ 652 0 0
GGAGGATATATCTACAAAGACCAAGAGTGTAATAGAACTGAAAAAGCTTCAGCTGTTAAA
TCTGCAACGTCGTTTGAGAAGTGAGTTTCTTTACAACTTCTTCAAACCTATTGGAAACGA
TGTTGAGAACCTAAAGTCATATAAAAACATAAGCATGGCCGGCGGATTAGACAGCTTGAG
AAGTATGAGCAGAAGATGAAGGAAGAGCGACAGAGGAGAATTCGTGAGAGGCAGAAGGAG
TTCTTTGGGGAGACAGAAGTTCACAAGGAAAGGCTTGATGACTTATCCAAAGCTAGGAGA
GAAAGGTGGAAGGGCTTCAATAGATATGTAAAGGAGTTCCACAAAAGAAAGGAACGTTTT
CATCGTGAAAAGGTTGACAAAATTCAGCGGGAGAAGATTAATTTGTTAAAGATTAATGAT
GTGGAGGGTTATCTTCGTATGGTGAAGGATGCAAAGTCAGACAGAGTAATGCAACTACTC
GAAGAGACAGAAAAGTACCTTCAAAAGCTTGGATCCAAGTTAAAGGAGGCAAAATCTTTG
GCCAGTCGATTTGAGAATGAGGCAGATGAGGCACCTGTTGAGGATAAAATTGAAAATGAT
GATGAGAGTGACCAGGCAAAGCACTACCTGGAAAGCAATGAAAAATACTACT

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 2

CO CL6594Contig1 686 2 2 U
GGGCAATTCGCAACCAAACTGTTGATTTGAATTTTCTGAGTCTCAAATCTTTTCAGCAGA
TCCGAATACACGGTTGTTTTCTCCTTTTGATTTCGGCGTCGATGGCTCACAGAGGCGGTG
CGGGTGGTTCCCTCTACGGCGGCGCCGCGCCGTACAGATCAGGAGATGGGCTTAGCACTA
GAACGGGTGCAGGTTCAGAGAAAATCCAGCTAAGGATCGATCCCATGCACTCTGACCTTG
ATGATGAGATCTCTGGTCTCCACGGCCAAGTTAGGCAATTGAAAAATATTGCTAAAGAAA
TTGGGTCAGAAGCCCAGTTTCAGAAGAACTTCTTAGATGAGCTGCAAGTGACGTTGATGA
GAGCGCAAGCTGGGGTGAAGAACAACATAAGGAAACTGAACTTGAGCATCATACGCAGTG
AAAACAACCACGTCATGCACGTGGTTTTGTTCGCTCTCCTCTGCTTCTTTATTCTCTACA
TGTGGTCCAAGATGTTCAAAATATGAGAGAGACTCATGATAGCGTCGCGTATTATACGCT
TGATGACTGACTAATAGTGGAAAATTGTAGAAATTATCTTTTAGTTACGACATTATGTGG
ATTGTGGTTCTTCTCGTTCCCTGTTATGTAGAGTGCTTAGTTTGAACTTTGAACAAGTAC
ATTAATATACGGTCTTATTTAACCAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DW56JQ C 1
AF RS1DW56TF U 1
BS 1 663 RS1DW56TF
BS 664 686 RS1DW56JQ

RD RS1DW56JQ 686 0 0
GGGCAATTCGCAACCAAACTGTTGATTTGAATTTTCTGAGTCTCAAATCTTTTCAGCAGA
TCCGAATACACGGTTGTTTTCTCCTTTTGATTTCGGCGTCGATGGCTCACAGAGGCGGTG
CGGGTGGTTCCCTCTACGGCGGCGCCGCGCCGTACAGATCAGGAGATGGGCTTAGCACTA
GAACGGGTGCAGGTTCAGAGAAAATCCAGCTAAGGATCGATCCCATGCACTCTGACCTTG
ATGATGAGATCTCTGGTCTCCACGGCCAAGTTAGGCAATTGAAAAATATTGCTAAAGAAA
TTGGGTCAGAAGCCCAGTTTCAGAAGAACTTCTTAGATGAGCTGCAAGTGACGTTGATGA
GAGCGCAAGCTGGGGTGAAGAACAACATAAGGAAACTGAACTTGAGCATCATACGCAGTG
AAAACAACCACGTCATGCACGTGGTTTTGTTCGCTCTCCTCTGCTTCTTTATTCTCTACA
TGTGGTCCAAGATGTTCAAAATATGAGAGAGACTCATGATAGCGTCGCGTATTATACGCT
TGATGACTGACTAATAGTGGAAAATTGTAGAAATTATCTTTTAGTTACGACATTATGTGG
ATTGTGGTTCTTCTCGTTCCCTGTTATGTAGAGTGCTTAGTTTGAACTTTGAACAAGTAC
ATTAATATACGGTCTTATTTAACCAT

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1DW56TF 663 0 0
GGGCAATTCGCAACCAAACTGTTGATTTGAATTTTCTGAGTCTCAAATCTTTTCAGCAGA
TCCGAATACACGGTTGTTTTCTCCTTTTGATTTCGGCGTCGATGGCTCACAGAGGCGGTG
CGGGTGGTTCCCTCTACGGCGGCGCCGCGCCGTACAGATCAGGAGATGGGCTTAGCACTA
GAACGGGTGCAGGTTCAGAGAAAATCCAGCTAAGGATCGATCCCATGCACTCTGACCTTG
ATGATGAGATCTCTGGTCTCCACGGCCAAGTTAGGCAATTGAAAAATATTGCTAAAGAAA
TTGGGTCAGAAGCCCAGTTTCAGAAGAACTTCTTAGATGAGCTGCAAGTGACGTTGATGA
GAGCGCAAGCTGGGGTGAAGAACAACATAAGGAAACTGAACTTGAGCATCATACGCAGTG
AAAACAACCACGTCATGCACGTGGTTTTGTTCGCTCTCCTCTGCTTCTTTATTCTCTACA
TGTGGTCCAAGATGTTCAAAATATGAGAGAGACTCATGATAGCGTCGCGTATTATACGCT
TGATGACTGACTAATAGTGGAAAATTGTAGAAATTATCTTTTAGTTACGACATTATGTGG
ATTGTGGTTCTTCTCGTTCCCTGTTATGTAGAGTGCTTAGTTTGAACTTTGAACAAGTAC
ATT

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

CO CL6595Contig1 725 2 4 U
TTTTTGGTTGCTGATGGTTTCATGGGAGATTTCGACTTTAATGCTTCTTTTGTCTCAGGA
CTCTGGTGTATAGAACCTGTGATGAATCAAGTTCCTAAACAAGAACCCGATTCTCCGGTT
CTTGATCCGGACTCGTTCGTCAAAGAGTTTTTACAAGTGGAAGTGGAATCATCTACATCA
ACGGGAATTTCAGAGCAGAATTCATCACCACATGAGACTGATCAGAGTGTCTCAGCCAGG
AAAAAAACAGAGAGGTTCGAAGAACAAGAAGAAGAAGAAGAACAGAGGCACTACCGAGGA
GTGAGAAGAAGGCCGTGGGGGAAATTTGCAGCAGAGATTCGGGATCCAGCAAAGAAAGGA
TCTCGGATTTGGCTAGGGACGTTTGAAAGTAATGTTGATGCCGCAAGAGCATATGACTGT
GCAGCTTTCAAGCTCAGGGGAAGAAAAGCTGTGCTCAACTTTCCTCTCGACGCTGGCAAA
TATGAAGCTCCCGTGAATTCAGGACGGAAAAGGAAGAGAAGTGATGTGCAGGAGGAGCTC
CAAAGAAGTCAGAGCAATTCATCTTCGTCGTCAAGTGATGGAGGAACGACCTGTGAATGA
TATAATTTAACATTTTAAAGTGTGAGCAGTTTCGTTGTACAAGTTAATTGTACAGAAGAA
GTGAAGTATAGGTTAGTGTGCTAGGAACTCTTAGGCAACAAATTTGTATGAATGTTCTGT
TTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 

AF RS1BK19TF U 1
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CTTGATCCGGACTCGTTCGTCAAAGAGTTTTTACAAGTGGAAGTGGAATCATCTACATCA
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TATAATTTAACATTTTAAAGTGTGAGCAGTTTCGTTGTACAAGTTAATTGTACAGAAGAA
GTGAAGTATAG*TTAGTGTGCTAG
AACTCTT

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DS 

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CTGTGATGAATCAAGTTCCTAAACAAGAACCCGATTCTCCGGTTCTTGATCCGGACTCGT
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GGGGAAGAAAAGCTGTGCTCAACTTTCCTCTCGACGCTGGCAAATATGAAGCTCCCGTGA
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AAAGTGTGAGCAGTTTCGTTGTACAAGTTAATTGTACAGAAGAAGTGAAGTATAGGTTAG
TGTGCTAGGAACTCTTAGGCAACAAATTTGTATGAATGTTCTGTTTCCT

QA 1 709 1 709
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AAGGACAACACGATGAGGACAACATGTCACGTCTTCCATGGAAGAGGGTCAGAGACGAGG
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ATCTTCGTATGACGCCACTAAATGATTCTTCTACTCATCACCATCATTCTCAGCCGCTAG
ATCAGCCATCTCTAGATCTCAACTTAGCTTGCGTTGATCCAACGGTCATGAGCGTAGGGA
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TAATGGATTTTATTATATTAATATACGCTTCACGTTTCAGAGAGCCTAGTTTATTTAGGG
GATGTTAGAACTTTGACATTGTTGG


BQ
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AF RS1GZ75TF U 1
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BS 766 925 RS1GZ75JQ

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AGGAATACAAAGTGGACGACGACGATGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGACAAGCCTC
ACATCATCACCAGAAAGAAAACTAACGCTCACGAATGCACGATCTGCCATCGCGTATTCT
CATCAGGACAAGCCTTGGGAGGTCACAAGAGATGTCATTGGTTAACACCTTCCACTAATT
ATCTTCGTATGACGCCACTAAATGATTCTTCTACTCATCACCATCATTCTCAGCCGCTAG
ATCAGCCATCTCTAGATCTCAACTTAGCTTGCGTTGATCCAACGGTCATGAGCGTAGGGA
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GTGGCGACTGGTCGTGATGACTGACTAATAAATTGAGTTGATGAT

QA 1 765 1 765
DS 

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ACCTTCCACTAATTATCTTCGTATGACGCCACTAAATGATTCTTCTACTCATCACCATCA
TTTTCAGCCGCTAGATCAGCCATCTCTAGATCTCAACTTAGCTTGCGTTGATCCAACGGT
CATGAGCGTAGGGAGAGATGGTGGTGGCAACAATCTCAATGCTACTTCATTTAATTCATG
GTTAAAACTCGCTAGTGGCGACTGGTCGTGATGACTGACTAATAAATTGAGTTGATGATT
TTATATTCATTCGCTTATATACACATAAATATACTCACATACAATTAAAGTACATTAATC
AATTTATAAATTTGTAATGGATTTTATTATATTAATATACGCTTCACGTTTCAGAGAGCC
TAGTTTATTTAGGGGATGTTAGAACTTTGACATTGTTGG

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 2

CO CL6598Contig1 754 2 6 U
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ATCTGCCGGCCAGAAGCTACTCCACATCTGTTCATCTCCGAGGGAAAATGGCGTTGAGGC
AGATGTTAGGATGGTCAGAAGGAGATCTAATGAGGTCAGATGCAAAGCCATGTTCAAGGC
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TCAGACTTCACTATGGTCCGAGGGTTACAGTACCAAGAAGTCTACGATGGGCTGGTTGTG
GAGCTGTGTCCATGAGTGCTTCTACTGCAACACTTGTCCGTCTCCTGAGCCCTGAATGTG
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CCACCAGTTTCTGACTTGATCTGTTATGTGTATGTACCTCAGGAGTGTTCAAGATGAGCT
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TTTTGGTAAAAACGTAAATCAATGTTCGTTTCTTTTTATGTATTAAAATGTAACATTCAG
ACACATTACCTAATTACATTTTCGAAAATTCACC


BQ
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AF RS1DL50TF U 1
AF RS1DL50JQ C 48
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ACACATTACCTAATTACATTT

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1DL50JQ 707 0 0
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TGGGCTGGTTGTGGAGCTGTGTCCATGAGTGCTTCTACTGCAACACTTGTCCGTCTCCTG
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TTGGACTATTTTGATCATAAGCTAAATGAATTAGCTCGCGAGTGTTAATTCGTTTGCTCA
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ATGTAACATTCAGACACATTACCTAATTACATTTTCGAAAATTCACC

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 2

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TTATACATTCCGATCGTGATTGAAATGAGTGAGATAATGAATCTGCGGAGAATCAATCGT
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ATTTTTTTTAGGGTTTGAGAATGAATATAAATGATCC


BQ
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AF RS1AK32JQ U 3
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TATGTCGC

QA 1 128 1 128
DS 

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ATTTTTTTTAGGGTTTGAGAATGAATATAAATGATCC

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 2

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CTTTGAACTCTTAAAGTCTGCTCTCTAATAAAAATTGTCACACTGTGAGTTTAATATAC


BQ
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AF RS1G954TF U 1
AF RS1G954JQ C 185
BS 1 618 RS1G954TF
BS 619 659 RS1G954JQ

RD RS1G954TF 618 0 0
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TTCAGGCTATGGAAGTATCGTCTTCATTTCATCTGTTGCTGGGGTTGTATTCTTTGAATC
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TGAATGGGCAAAAGATGGTATAAGAACCAACGCTGTTGCTCCTAATGTTATCAAGACTCC
TCTGTCTCAGCCATATCTTGATGACGTCGGTTTCAAGGAGGGGTTTATGGGTAGAACTCC
ACTTGGTCGCGCTGGAGAACCAAATGAAGTTGCATCAATGGTGGTCTTCTTGTGTCTACC
TGCAGCGTCTTATATAACAGGTCAAACCATTTGTGTTGATGGAGGCCTCACCGTTAACGG
TTTCTCCTACCAATCACATGCTTGAGAATGGCCTTGTCGCGTTTTATTTTCTGGCACTGT
CTTTGAACTCTTAAAGTC

QA 1 618 1 618
DS 

RD RS1G954JQ 475 0 0
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TCCCTTTATAGTCTAGCCAAAGGAGCTCTGAATCAGCTAGCAAGAAATTTGGCATGTGAA
TGGGCAAAAGATGGTATAAGAACCAACGCTGTTGCTCCTAATGTTATCAAGACTCCTCTG
TTTCAGCCATATCTTGATGACGTCGGTTTCAAGGAGGGGTTTATGGGTAGAACTCCACTT
GGTCGCGCTGGAGAACCAAATGAAGTTGCATCAATGGTGGTCTTCTTGTGTCTACCTGCA
GCGTCTTATATAACAGGTCAAACCATTTGTGTTGATGGAGGCCTCACCGTTAACGGTTTC
TCCTACCAATCACATGCTTGAGAATGGCCTTGTCGCGTTTTATTTTCTGGCACTGTCTTT
GAACTCTTAAAGTCTGCTCTCTAATAAAAATTGTCACACTGTGAGTTTAATATAC

QA 1 475 1 475
DS 



AS 1 2

CO CL6601Contig1 684 2 1 U
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CTACTCAACTGATTCCACCAAACAGTGGTGGGATGTCTGAGATGGCGGTGAGTCCAGCTT
CAGTGGCATCAAGTGGACACTTTCCATTTGATGCTTCGGAAATGGTAATGGAGGCTTCAG
TGCTTGATTCCACGTTCACTTCTGAGGTTGGAGGAGAAGGAGGAGGAGGAGCTGAGAATG
CTAGAGATTCACTCAGGTCATTTGATCAGATTCCTTGGAACTTCAGCCTTTCTGATCTCA
CCGCTGATCTGTCAAATTTGGGAGAGTTAGGAGGTTTGGGAAACTATCCAGGCTCTCCAT
TTCTTCCATCTGATTCAGAGATTTTGCTGGATTCTCCTGACCATGAGGACATAGAGGAGT
TTTTCGTGGATGTCCCTGGACCTCCTTGTTCTAATTCAGATGAAGAGAAGCCTTGAATTG
AAAGGGGAACGAACGGCTCTATATAATAATAATCTTCTTCAGAGAAACATCAAGCATTTT
TTTTCCTTATTTAAATAACAAATATAACTACTATTGTTATTATAAATCAAAGTATTTTAT
GAATAAAGAGGGTTAAAATGAACCTAAAAAGAGGCTGTAACGACAAATGCTTCACACGGC
GTCACTGATTTCATTTTGTATCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1B525JQ C 1
AF RS1B525TF U 1
BS 1 684 RS1B525TF

RD RS1B525JQ 684 0 0
GTAATTTCCAGCCATTGAAGATGAACGACATGGTGATTGATACAAACGTGGAAGATGCAA
CTACTCAACTGATTCCACCAAACAGTGGTGGGATGTCTGAGATGGCGGTGAGTCCAGCTT
CAGTGGCATCAAGTGGACACTTTCCATTTGATGCTTCGGAAATGGTAATGGAGGCTTCAG
TGCTTGATTCCACGTTCACTTCTGAGGTTGGAGGAGAAGGAGGAGGAGGAGCTGAGAATG
CTAGAGATTCACTCAGGTCATTTGATCAGATTCCTTGGAACTTCAGCCTTTCTGATCTCA
CCGCTGATCTGTCAAATTTGGGAGAGTTAGGAGGTTTGGGAAACTATCCAGGCTCTCCAT
TTCTTCCATCTGATTCAGAGATTTTGCTGGATTCTCCTGACCATGAGGACATAGAGGAGT
TTTTCGTGGATGTCCCTGGACCTCCTTGTTCTAATTCAGATGAAGAGAAGCCTTGAATTG
AAAGGGGAACGAACGGCTCTATATAATAATAATCTTCTTCAGAGAAACATCAAGCATTTT
TTTTCCTTATTTAAATAACAAATATAACTACTATTGTTATTATAAATCAAAGTATTTTAT
GAATAAAGAGGGTTAAAATGAACCTAAAAAGAGGCTGTAACGACAAATGCTTCACACGGC
GTCACTGATTTCATTTTGTATCCC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1B525TF 684 0 0
GTAATTTCCAGCCATTGAAGATGAACGACATGGTGATTGATACAAACGTGGAAGATGCAA
CTACTCAACTGATTCCACCAAACAGTGGTGGGATGTCTGAGATGGCGGTGAGTCCAGCTT
CAGTGGCATCAAGTGGACACTTTCCATTTGATGCTTCGGAAATGGTAATGGAGGCTTCAG
TGCTTGATTCCACGTTCACTTCTGAGGTTGGAGGAGAAGGAGGAGGAGGAGCTGAGAATG
CTAGAGATTCACTCAGGTCATTTGATCAGATTCCTTGGAACTTCAGCCTTTCTGATCTCA
CCGCTGATCTGTCAAATTTGGGAGAGTTAGGAGGTTTGGGAAACTATCCAGGCTCTCCAT
TTCTTCCATCTGATTCAGAGATTTTGCTGGATTCTCCTGACCATGAGGACATAGAGGAGT
TTTTCGTGGATGTCCCTGGACCTCCTTGTTCTAATTCAGATGAAGAGAAGCCTTGAATTG
AAAGGGGAACGAACGGCTCTATATAATAATAATCTTCTTCAGAGAAACATCAAGCATTTT
TTTTCCTTATTTAAATAACAAATATAACTACTATTGTTATTATAAATCAAAGTATTTTAT
GAATAAAGAGGGTTAAAATGAACCTAAAAAGAGGCTGTAACGACAAATGCTTCACACGGC
GTCACTGATTTCATTTTGTATCCC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL6602Contig1 725 2 2 U
GGATCGGAGAGATTAGAAGAAAGAATGATAGATAACTGGATCACGAGGGCGACGAATCAC
AAAGACGAAGAAGAAGAACTAATAAAACCTAAAAAGGGAATTTTTTTTTCCTGTGAAGTC
AACAGACAATGAAGGAAGGAAGGAGAATCTGACCTCAAAATCGCATAAAGTTTCGTACTT
TTGGCTCCGAGTTGCAACATAAGGGTTTTTTTTAGGGATCTCTCTATATTTCAGGTTTTT
TTTTTTAGAGTTATGTGGAAACAGATCATAAGTAAGCTTCCTAAGAAGTCTTCTTCTTCT
AATAACCACTCTTCATCTAACAACGCAACTGCATCTACTTCCAAGACTAGTAGTAGTCAT
GACAATGCTACAGGAAAATCTCACTCCAAGAACGCTCCTCCTCCAGCTGCTGCAAAGCCT
CCTGCTTTTGCTTCCTCTCCTCCTAAAGATGGCAACTTTAACCGTAACGGGATCTACATG
GAAACGTTTGGAAGAGATTGGGATGCAAAAGCAAAAGAGTTCTTCTTCTTAAGGTTGCTG
CTTTAGTTGTAGAGAGAGAGAGGTTTTGGTTTTTGTAATTTCGTTTTTTTACTACATTGG
AATATTGGTTTTTTTGTTTTTGTGGTATTCTCTCCAAGAAAACTTAGTGAGAACAAGTTC
CCATCTTCTTTGAAGAGATGCAAAGATGTAAGATCTTTTTCTTGTTTTAATTTTCTTTAT
TTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1D953TF U 1
AF RS1D953JQ C 153
BS 1 212 RS1D953TF
BS 213 725 RS1D953JQ

RD RS1D953TF 212 0 0
GGATCGGAGAGATTAGAAGAAAGAATGATAGATAACTGGATCACGAGGGCGACGAATCAC
AAAGACGAAGAAGAAGAACTAATAAAACCTAAAAAGGGAATTTTTTTTTCCTGTGAAGTC
AACAGACAATGAAGGAAGGAAGGAGAATCTGACCTCAAAATCGCATAAAGTTTCGTACTT
TTGGCTCCGAGTTGCAACATAAGGGTTTTTTT

QA 1 212 1 212
DS 

RD RS1D953JQ 573 0 0
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TAGGGATCTCTCTATATTTCAGGTTTTTTTTTTTAGAGTTATGTGGAAACAGATCATAAG
TAAGCTTCCTAAGAAGTCTTCTTCTTCTAATAACCACTCTTCATCTAACAACGCAACTGC
ATCTACTTCCAAGACTAGTAGTAGTCATGACAATGCTACAGGAAAATCTCACTCCAAGAA
CGCTCCTCCTCCAGCTGCTGCAAAGCCTCCTGCTTTTGCTTCCTCTCCTCCTAAAGATGG
CAACTTTAACCGTAACGGGATCTACATGGAAACGTTTGGAAGAGATTGGGATGCAAAAGC
AAAAGAGTTCTTCTTCTTAAGGTTGCTGCTTTAGTTGTAGAGAGAGAGAGGTTTTGGTTT
TTGTAATTTCGTTTTTTTACTACATTGGAATATTGGTTTTTTTGTTTTTGTGGTATTCTC
TCCAAGAAAACTTAGTGAGAACAAGTTCCCATCTTCTTTGAAGAGATGCAAAGATGTAAG
ATCTTTTTCTTGTTTTAATTTTCTTTATTTATG

QA 1 573 1 573
DS 



AS 1 2

CO CL6603Contig1 731 2 1 U
GGAACTTTGGTTGCTTTGAATGCAGCCTCTCCTTTCACATTTATAAATCATTTGCAATCT
TACTTATCTTGGTGACAAACACAAAGCTTCTCCCTTTCTATTTATGCACCTAAATAAAGC
TCTCCGAGCTATTTTATATTTCAATAATTCTCTGTTTTACCTTTGTTCTCATGGTATCAG
AGCTCAGCAAGTAGATCTTGGTTTCTTTATTTATTCTGTTCGGCTAGCTCCACGCTTCTG
ACAAACAGACCTTCTCCCCAGACAACTCCAGCACTCGTGACTTCTTTCTTCTCTGCTTAC
CAAATTTTTTTTTTCTTTAAAGAAAAAAAGGAAAACAAAAAGAAAGCTTTGGACACTGAG
GATCGTTGTGTTCCACGTCCCAAGATCAACAAGCGCCCAGAAGGCAATGGAGTTCTCAAG
CTGACTTTCAGAACGAAGTGAAGACCACGAGATGGCTGCGGGTTTGTGTGTTGATGAAGA
TACACCGAGCCAACAAAAGTTCCTTTCTGATTTGGTGTCTCTGAGCTGCGAATATTGACA
AGATCGTTGCAGATGTATACAAATCTGCAAAGTGAACAGCCAAGAGATTACATTCAAGGA
ACCGTTATGATTTTCCAAGGTAACCACCTGTCTGTTCCTTCTTCTCAGACAGAGCACAAG
ATAAAGTTAGTGGTTGCTTGTTCGTTTGGTGGTCTTGATGGTCAATTAGAATGGTTATGC
TAGTTGCTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CD70TF U 1
AF RS1CD70JQ C 36
BS 1 731 RS1CD70TF

RD RS1CD70TF 731 0 0
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TACTTATCTTGGTGACAAACACAAAGCTTCTCCCTTTCTATTTATGCACCTAAATAAAGC
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AGCTCAGCAAGTAGATCTTGGTTTCTTTATTTATTCTGTTCGGCTAGCTCCACGCTTCTG
ACAAACAGACCTTCTCCCCAGACAACTCCAGCACTCGTGACTTCTTTCTTCTCTGCTTAC
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TAGTTGCTGTG

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DS 

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TTTACCTTTGTTCTCATGGTATCAGAGCTCAGCAAGTAGATCTTGGTTTCTTTATTTATT
CTGTTCGGCTAGCTCCACGCTTCTGACAAACAGACCTTCTCCCCAGACAACTCCAGCACT
CGTGACTTCTTTCTTCTCTGCTTACCAAATTTTTTTTTTCTTTAAAGAAAAAAAGGAAAA
CAAAAAGAAAGCTTTGGACACTGAGGATCGTTGTGTTCCACGTCCCAAGATCAACAAGCG
CCCAGAAGGCAATGGAGTTCTCAAGCTGACTTTCAGAACGAAGTGAAGACCACGAGATGG
CTGCGGGTTTGTGTGTTGATGAAGATACACCGAGCCAACAAAAGTTCCTTTTTGATTTGG
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TGATGGTCAATTAGAATGGTTATGCTAGTTGCTGTG

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DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CGCTCTTATCCGATTATCGATTTAGAAATACAGGGAATTTGATCGAACAATAGAATGGAT
TTCGTTAAGAATCTTGATACCGACATGTCTCTAGCCATTCTTTCGTGTCTTGATGACCCA
TCAGATCTTGTCCGTGCCAGTGCTGTCTCACGCTCCTGGCGTGCCTTTGTGATTAAATAC
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ATAGACACAAGCAATGATATGAAGGAATCCTTTGAAGCCACCGGGTCAAGCAGCAGTCTC
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AGTACTGATAATTTCCCAGCAGAGAGCATCTTGAACACACTCGACGAAAGAGATAGAATT
GGTGGCACCCCTTCGTATTGGTCTAGTACAGGACACCACAGGACTTCCGTGCCCGAAACA
CTTCTTTACCAGCTGAAGGGTGATTTGTGTGTCGTTACTGAACTCAGCGTCCAGCCTTTC
CAAGCTTATTTCCAGCCTGGTACTCCGATATACTCTTCACATTATGTTCGTTTCCGGTTG
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TTTAAGCTTCCAGAACCGGTTCTTTGCATTGGTGGGTATATGCTAGTGGAGTTTTTAGGT
CGGGTTCAGACACAAGAAATGGATGGCTTATACTACATATGTGTGTCGCATGTGAAAGTG
ATGGGAAGATCACTAGCAAAATCGTTTCAAGTGGTAGATCCGGATGAGTCAGGGAAGTTT
GGGTTGAAGGTGTTGAGTTACAGTGATCCACAAGAAATGGATGAGAACGAAGAAGAGGCA
GAGGGGCAAGGTCCGTTTAGGCCAATGAGAAACCTTGAACAGCTCTTGAATTTCCTACAT
AGACATCCTCTTGACGTCGAGTATGTTTGGCCTGAATCTGACGATGATGAAGATGCTGCT
GTATCAGACGGTGAGGTTTAGTGTATGAATCACTACGGGTGGGGATGCTGAATTGTCTCT
TTTTCTTTCTTTCTTTCTTTGATTTTAGTTTGTATTTGCTTCTATTGTTGAAGAATCTTA
TAGGTTTTTTTCCATC


BQ
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AF RS1BU73TF U 1
AF RS1BU73JQ C 516
BS 1 712 RS1BU73TF
BS 713 1336 RS1BU73JQ

RD RS1BU73TF 712 0 0
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CGCTCTTATCCGATTATCGATTTAGAAATACAGGGAATTTGATCGAACAATAGAATGGAT
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TCAGATCTTGTCCGTGCCAGTGCTGTCTCACGCTCCTGGCGTGCCTTTGTGATTAAATAC
AGTCTCTCGAAGAACCTGTGCTTGAAGTTGTTCCATCAGCTAACTAGTGTGGATCGTATA
ATAGACACAAGCAATGATATGAAGGAATCCTTTGAAGCCACCGGGTCAAGCAGCAGTCTC
ATGGATGATGATGATGATACAAGGGTACTAGAAAGAGAGCACAGGGTTTATGCCTTATTG
ACTAAAGGATGCACATCTTCCCCTATCAGAAGCTGTATTGCTGATGCCATTGTAGCCTCC
AGTACTGATAATTTCCCAGCAGAGAGCATCTTGAACACACTCGACGAAAGAGATAGAATT
GGTGGCACCCCTTCGTATTGGTCTAGTACAGGACACCACAGGACTTCCGTGCCCGAAACA
CTTCTTTACCAGCTGAAGGGTGATTTGTGTGTCGTTACTGAACTCAGCGTCCAGCCTTTC
CAAGCTTATTTCCAGCCTGGTACTCCGATATACTCTTCACATTATGTTCGTT

QA 1 712 1 712
DS 

RD RS1BU73JQ 821 0 0
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TTCACATTATGTTCGTTTCCGGTTGGGTCACCTCGATAACAATCAAGCTGAGTCAGGAGG
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GGCTCAGGAGAATCGGTTGCAGAACTTTAAGCTTCCAGAACCGGTTCTTTGCATTGGTGG
GTATATGCTAGTGGAGTTTTTAGGTCGGGTTCAGACACAAGAAATGGATGGCTTATACTA
CATATGTGTGTCGCATGTGAAAGTGATGGGAAGATCACTAGCAAAATCGTTTCAAGTGGT
AGATCCGGATGAGTCAGGGAAGTTTGGGTTGAAGGTGTTGAGTTACAGTGATCCACAAGA
AATGGATGAGAACGAAGAAGAGGCAGAGGGGCAAGGTCCGTTTAGGCCAATGAGAAACCT
TGAACAGCTCTTGAATTTCCTACATAGACATCCTCTTGACGTCGAGTATGTTTGGCCTGA
ATCTGACGATGATGAAGATGCTGCTGTATCAGACGGTGAGGTTTAGTGTATGAATCACTA
CGGGTGGGGATGCTGAATTGTCTCTTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTGATTTTAGTTTGTAT
TTGCTTCTATTGTTGAAGAATCTTATAGGTTTTTTTCCATC

QA 1 821 1 821
DS 



AS 1 2

CO CL6606Contig1 743 2 5 U
AGTATTACAATTCCATTACAAAGATTCATTTATACAATGTGGAATCATCATCTTGGGACA
TATAATCAAATAATACAATAACAATACAAAAAAGTTTACATTATGATTTAAACATAACCA
ATTTCTTTAGGCTGTTGTTGTTACACACACACATTGCATTATAATGAGTATCAAGCTTTG
GCTGACACTCTTAAAAGAATTTAAGTTTCCTCACTTTAGAGAAACTGGCATGGACGTGTT
CCATCTGACAGATTGCCTTCTCTTTCCCGGTCATGTCCGAACACGACAAGTGCCTAGCGC
CTAAAGTGACGGCGAAGTAGATATAGATGGTGCATAGGAAGGCCAAAAGGAGCATAGCGG
TTAAAAGGAAACGATGCCTCCGGAAAACAGTAAAGAAGCTACCCAAGTCCTCCCATTGCT
TCTTCAGCGCATGTGGCCTTCGTAATGGTGATGTTACAATCCCATCAAGAACCATAGTTT
AAGCCCACCAACCGATTCGAGATCTGGAGATGAAGGAGATCTCCGTCAGACAATAAGACA
CTAGATTCCGAGAGATCCTCCTTCAGCTCCCAATAGCAAACGTTCGCCTAGAGCAAGAGA
CGATTCGCCGGTAAACGCGGTATGTCAAAAGCTCAAAAAGAACAGAGTCCGTTACAAATA
CCGACAATTAAGGAAAATAGATTTTGAAAAAAAAAATTATAAAAAGAGAGAAAGCGTGTT
AGGTTGTGTTGGGATGGAATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A459TF C 1
AF RS1A459JQ U 42
BS 1 41 RS1A459TF
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BS 93 93 RS1A459TF
BS 94 736 RS1A459JQ
BS 737 743 RS1A459TF

RD RS1A459TF 743 0 0
AGTATTACAATTCCATTACAAAGATTCATTTATACAATGTGGAATCATCATCTTGGGACA
TATAATCAAATAATACAATAACAATACAAAAAAGTTTACATTATGATTTAAACATAACCA
ATTTCTTTAGGCTGTTGTTGTTACACACACACATTGCATTATAATGAGTATCAAGCTTTG
GCTGACACTCTTAAAAGAATTTAAGTTTCCTCACTTTAGAGAAACTGGCATGGACGTGTT
CCATCTGACAGATTGCCTTCTCTTTCCCGGTCATGTCCGAACACGACAAGTGCCTAGCGC
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TTAAAAGGAAACGATGCCTCCGGAAAACAGTAGAGAAGCTACCCAAGTCCTCCCATTGCT
TCTTCAGCGCATGTGGCCTTCGTAATGGTGATGTTACAATCCCATCAAGAACCATAGTTT
AAGCCCACCAACCGATTCGAGATCTGGAGATGAAGGAGATCTCCGTCAGACAATAAGACA
CTAGATTCCGAGAGATCCTCCTTCAGCTCCCAATAGCAAACGTTCGCCTAGAGCAAGAGA
CGATTCGCCGGTAAACGCGGTATGTCAAAAGCTCAAAAAGAACAGAGTCCGTTACAAATA
CCGACAATTAAGGAAAATAGATTTTGAAAAAAAAAATTATAAAAAGAGAGAAAGCGTGTT
AGGTTGTGTTGGGATGGAATCCC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RS1A459JQ 695 0 0
GAATCATCATCTTGGGACATATAATCAAATAATACAATAACAATACAAAAA*GTTTACAT
TATGATTTAAACATAACCAATTTCTTTAGGCTGTTGTTGTTACACACACACATTGCATTA
TAATGAGTATCAAGCTTTGGCTGACACTCTTAAAAGAATTTAAGTTTCCTCACTTTAGAG
AAACTGGCATGGACGTGTTCCATCTGACAGATTGCCTTCTCTTTCCCGGTCATGTCCGAA
CACGACAAGTGCCTAGCGCCTAAAGTGACGGCGAAGTAGATATAGATGGTGCATAGGAAG
GCCAAAAGGAGCATAGCGGTTAAAAGGAAACGATGCCTCCGGAAAACAGTAAAGAAGCTA
CCCAAGTCCTCCCATTGCTTCTTCAGCGCATGTGGCCTTCGTAATGGTGATGTTACAATC
CCATCAAGAACCATAGTTTAAGCCCACCAACCGATTCGAGATCTGGAGATGAAGGAGATC
TCCGTCAGACAATAAGACACTAGATTCCGAGAGATCCTCCTTCAGCTCCCAATAGCAAAC
GTTCGCCTAGAGCAAGAGACGATTCGCCGGTAAACGCGGTATGTCAAAAGCTCAAAAAGA
ACAGAGTCCGTTACAAATACCGACAATTAAGGAAAATAGATTTTGAAAAAAAAAATTATA
AAAAGAGAGAAAGCGTGTTAGGTTGTGTTGGGATG

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

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GGTTTGAAGACAGAGAGATTATCTCCAACGAACCAAAGTGAAGATGATCCCACGGTGGAG
AAGGGACTGAAGATGCCAACAGCTCTTTTAACTGACCCGTGGGATACAGATAATAGTCTC
CCACAGCCTGTGGAATCCATAAAAGAGGAGAAAATGGATTCTCCGAAGGAAACTGAAGGA
AATGTCATTCAGAGTTTGGATGGTAGTACAAGTGCTGAGTCTATGCAAGAACAGACACTT
GATGCTCCAAAAGAAACTAATGGCAATGACAATAAGAGTTCAAATGGTGGTGCTGTGTGG
GATATCTTTCGAAGAGAGGATGTTCCAAAACTTATCGAGTATTTGAATAGACACAAGCAT
GAGTTTCGTCATTTCTTTAACGAACCTGTGGAATCTGTTACTCACCCAATTCATGACCAG
ACCTTGCTCTTGACTGAAAGGCAAAAGAAACAGCTGAAAGAGGAGTTCGATATTGAGCCA
TGGACGTTTGTGCAACATCTCGGTGAAGCTGTTTTCATCCCTGCAGGTTGTCCTCACCAA
GTGAGGAATATACAGTCTTGCATAAAGGTGGCACTTGATTTTGTTGCTCCTGAAAGCGTA
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TAAACTAGAGCTAAGAAAATAGTGCTGCATGCTGCAGCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1FP84TF U 1
AF RS1FS78TF U 1
BS 1 686 RS1FP84TF
BS 687 759 RS1FS78TF

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QA 1 686 1 686
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CCACAGCCTGTGGAATCCATAAAAGAGGAGAAAATGGATTCTCCGAAGGAAACTGAAGGA
AATGTCATTCAGAGTTTGGATGGTAGTACAAGTGCTGAGTCTATGCAAGAACAGACACTT
GATGCTCCAAAAGAAACTAATGGCAATGACAATAAGAGTTCAAATGGTGGTGCTGTGTGG
GATATCTTTCGAAGAGAGGATGTTCCAAAACTTATCGAGTATTTGAATAGACACAAGCAT
GAGTTTCGTCATTTCTTTAACGAACCTGTGGAATCTGTTACTCACCCAATTCATGACCAG
ACCTTGCTCTTGACTGAAAGGCAAAAGAAACAGCTGAAAGAGGAGTTCGATATTGAGCCA
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GTGAGGAATATACAGTCTTGCATAAAGGTGGCACTTGATTTTGTTGCTCCTGAAAGCGTA
GAGGAATGCCTTAGCTAACACAGAGTTCCGAGCTACCAAAGACCACAGATCCAATGAAGA
TAAACTAGAGCTAAGAAAATAGTGCTGCATGCTGCAGCT

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 2

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AGTCTCTTCCGAAGCCTCAAGCCATGTACAGGTGTAAGAAATGCAGAAGAATAGTGGCTA
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AGAGAAGCGGTAACTATGCTGAACAAGTGCAATGCTCTTCCATCTTTGTCGAGCCTATGA
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BQ
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AF RS1EL49JQ C 1
AF RS1EL49TF U 1
BS 1 694 RS1EL49TF

RD RS1EL49JQ 694 0 0
GGGAAAAGGACAAAAACCTAACAGATTTGGTGAGGAAGCAGAGAAAATCAGTGTAAGCTC
AGCAGCAGCCTTGGCAAGGTAGAAGAGTAGAAGTTATGACTGAATTGAAAATGGAGGTAG
AGAGCAAGAAGGCTATGAGTGAGTTGCAAATGGAGGTAGAGACCAATCCCTCTTCGCAAG
AGTTTCTTCCGAAGCCTCAAGCCATGTACAGGTGTAAGAAATGCAGAAGAATAGTGGCTA
TTGAGGAAAACATTGTTCCTCATGAGCCAGGGAAAGGTGAAGAATGCTTTGCTTGGAAAA
AGAGAAGCGGTAACTATGCTGAACAAGTGCAATGTTCTTCCATCTTTGTCGAGCCTATGA
AATGGATGCAAACTATACATGATGGAACTGTTGAAGAGAAGCTTCTTTGTTTGGGATGTA
ACGCCCGGTTAGGTTATTTCAACTGGGCTGGCATGCAATGTAGCTGTGGCGCCTGGGTTA
ATCCCGCTTTCCAGCTCCATAAAAGCCGATTAGACGAGTGTAAGTCCGAGGAGCCAAACC
CAAATCAGGCAACTGTATGAAACCAAAGTTTCTTGGATAACTAAGGGTTATAGTAAGATC
AAATTAAGCTTTATTGTATTTGATCATCTTAATGTGTGTTTTCATTTGATAAAATCCAAC
AAAGTTCATTAGCTTAATGTTTTTCTACAAGTAC

QA 1 694 1 694
DS 

RD RS1EL49TF 694 0 0
GGGAAAAGGACAAAAACCTAACAGATTTGGTGAGGAAGCAGAGAAAATCAGTGTAAGCTC
AGCAGCAGCCTTGGCAAGGTAGAAGAGTAGAAGTTATGACTGAATTGAAAATGGAGGTAG
AGAGCAAGAAGGCTATGAGTGAGTTGCAAATGGAGGTAGAGACCAATCCCTCTTCGCAAG
AGTCTCTTCCGAAGCCTCAAGCCATGTACAGGTGTAAGAAATGCAGAAGAATAGTGGCTA
TTGAGGAAAACATTGTTCCTCATGAGCCAGGGAAAGGTGAAGAATGCTTTGCTTGGAAAA
AGAGAAGCGGTAACTATGCTGAACAAGTGCAATGCTCTTCCATCTTTGTCGAGCCTATGA
AATGGATGCAAACTATACATGATGGAACTGTTGAAGAGAAGCTTCTTTGTTTGGGATGTA
ACGCCCGGTTAGGTTATTTCAACTGGGCTGGCATGCAATGTAGCTGTGGCGCCTGGGTTA
ATCCCGCTTTCCAGCTCCATAAAAGCCGATTAGACGAGTGTAAGTCCGAGGAGCCAAACC
CAAATCAGGCAACTGTATGAAACCAAAGTTTCTTGGATAACTAAGGGTTATAGTAAGATC
AAATTAAGCTTTATTGTATTTGATCATCTTAATGTGTGTTTTCATTTGATAAAATCCAAC
AAAGTTCATTAGCTTAATGTTTTTCTACAAGTAC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL6609Contig1 756 2 5 U
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CTCAAGAACCTGAGGATGGATTGGTGCTTGAATGTGTCTGACTCTTCCCTCACCTGCGTT
CTGAGGAAGTGCAAGAACTTGGAGGCTCTTGATATCGGTTGCTGCGAAGAGGTGACAGAC
AGTGCTTTCCGGGAATTAGGGAGCGAAGATGTTTTGGGATTGAAGGTTTTGAAGGTGAGC
AACTGTCCTAAGATCACAGTTGCAGGGATAGGCAAGCTGTTGGAGAAATGCAGCTCTTTG
GAGTATTTGGATGTAAGGTCTCTTCCGCATGTGACTGAAGTAAGATGCAGGGAAGCTGGT
CTTGAGTTCCCATCATGTTGTAAAGTTAACTATTCTGGAAGTTTAACCGAGCCAGATGTT
CTGCTTTGACTGTTGCTGTTGGGAAGATTGTCTGTGGTGTGCCCTAAACCCTCTGTGATC
TCTCTCTCTCTATCTATCTCTGTCTCGTGTATGAGTGCACTCATGGCTTATGGCCCATTA
GTGAGTCCTTCTCTGAAGCTTTTGTACATTATTGTGCATTGTATAATTGGTTGTGACCGC
TCCTTTATTGTTGTTATTCAGTTGCTTTGCAAAGTGTGTGTATTTCTCGTTGGATCTGAT
ATTTGAAGACTGATTCTCTATTTAATACAATGGAGCAAAGTGTGTTTGTCCTAAAGCTTT
TGTTGTGATCAATTTGATGTGCATTTTGTTGAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BQ20JQ C 1
AF RS1BQ20TF U 38
BS 1 37 RS1BQ20JQ
BS 38 689 RS1BQ20TF
BS 690 690 RS1BQ20JQ
BS 691 729 RS1BQ20TF
BS 730 756 RS1BQ20JQ

RD RS1BQ20JQ 756 0 0
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AACTGTCCTAAGATCACAGTTGCAGGGATAGGCAAGCTGTTGGAGAAATGCAGCTCTTTG
GAGTATTTGGATGTAAGGTCTCTTCCGCATGTGACTGAAGTAAGATGCAGGGAAGCTGGT
CTTGAGTTCCCATCATGTTGTAAAGTTAACTATTCTGGAAGTTTAACCGAGCCAGATGTT
CTGCTTTGACTGTTGCTGTTGGGAAGATTGTCTGTGGTGTGCCCTAAACCCTCTGTGATC
TCTCTCTCTCTATCTATCTCTGTCTCGTGTATGAGTGCACTCATGGCTTATGGCCCATTA
GTGAGTCCTTCTCTGAAGCTTTTGTACATTATTGTGCATTGTATAATTGGTTGTGACCGC
TCCTTTATTGTTGTTATTCAGTTGCTTTGCAAAGTGTGTGTATTTCTCGTTGGATCTGAT
ATTTGAAGACTGATTCTCTATTTAATACAATGGAGCAAAGTGTGTTTGTCCTAAAGCTTT
TGTTGTGATCAATTTGATGTGCATTTTGTTGAAACC

QA 1 756 1 756
DS 

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CTGACTCTTCCCTCACCTGCGTTCTGAGGAAGTGCAAGAACTTGGAGGCTCTTGATATCG
GTTGCTGCGAAGAGGTGACAGACAGTGCTTTCCGGGAATTAGGGAGCGAAGATGTTTTGG
GATTGAAGGTTTTGAAGGTGAGCAACTGTCCTAAGATCACAGTTGCAGGGATAGGCAAGC
TGTTGGAGAAATGCAGCTCTTTGGAGTATTTGGATGTAAGGTCTCTTCCGCATGTGACTG
AAGTAAGATGCAGGGAAGCTGGTCTTGAGTTCCCATCATGTTGTAAAGTTAACTATTCTG
GAAGTTTAACCGAGCCAGATGTTCTGCTTTGACTGTTGCTGTTGGGAAGATTGTCTGTGG
TGTGCCCTAAACCCTCTGTGATCTCTCTCTCTCTATCTATCTCTGTCTCGTGTATGAGTG
CACTCATGGCTTATGGCCCATTAGTGAGTCCTTCTCTGAAGCTTTTGTACATTATTGTGC
ATTGTATAATTGGTTGTGACCGCTCCTTTATTGTTGTTATTCAGTTGCTTTGCAAAGTGT
GTGTATTTCTCGTTGGATCTGATATTTGAAGACTGATTCTCTATTTAATACA*TGGAGCA
AAGTGTGTTTGTCCTAAAGCTTTTGTTGTGAT

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 2

CO CL6610Contig1 759 2 2 U
GTTTCCGAGTACATTGAGATGTCCTGTTCCACTATTGAGTCAGATACTTCAGACAGCTTG
GTTACTTCTGACGCTGAGAAACATGTAACCAGTTCTGTCACTTCTGTAATGAAGCAAGAT
TCACCTGAGAGCAGCAGCAATGCAGCAAATGGAGCCGCTTCTCCTCACGCTTCAGCATAC
TCCGCCACAGAAACACCAAACCGTGATCATCTCTCTCTGGTGAACTCCAAAGCGGATTCT
CAGGAGTCAGAGAGTGAGGCTTCAGCTGAGACATCAACCGAGGAGAAGACTGTTGTGAAA
CCAGTCATCAGTGTGAGGAGGGTTGAGACAGAGTCAAAGGTGGTGCAGCAGGATATAGTC
GACATGTACATGAAAAGCATGCAGCAGTTTACTGATTCACTTGCTAAGATGAAGCTTCCT
CTGGAAATTGATAGCCCAACAGTGTCCGAGGATTCAAGCTCTGGTGATTCTCAGAAGCTG
CCAACACCAAAGAGCAGCAACAAAGGATCTCGTGTGTTCTATGGGAGCAGGGCTTTCTTT
TGAGCGTATGTTTTCACTAAGTTCACTCCTGGACTTTTTCTAATGAAGAAAGACTAATCT
CCTAATAATGTAATTTGATAATGTACTACTACTATCTGATGTTGTATCTTCTATTAGGTC
TGCTTGATGCTTTAGTTGATGTGAAGTTATTAGTAGGTATCCACTATACCCTTTTGTACT
ATTAGAACCATGCTCGCATTACATTAACTTATGTTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FE60TF U 1
AF RS1FE60JQ C 407
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TCCGCCACAGAAACACCAAACCGTGATCATCTCTCTCTGGTGAACTCCAAAGCGGATTCT
CAGGAGTCAGAGAGTGAGGCTTCAGCTGAGACATCAACCGAGGAGAAGACTGTTGTGAAA
CCAGTCATCAGTGTGAGGAGGGTTGAGACAGAGTCAAAGGTGGTGCAGCAGGATATAGTC
GACATGTACATGAAAAGCATGCAGCAGTTTACTGATTCACTTGCTAAGATGAAGCTTCCT
CTGGAAATTGATAGCCCAACAGTGTCCGAGGATTCAAGCTCTGGTGATTCTCAGAAGCTG
CCAACACCAAAGAGCAGCAACAAAGGATCTCGTGTGTTCTATGGGA

QA 1 526 1 526
DS 

RD RS1FE60JQ 353 0 0
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ATTCTCAGAAGCTGCCAACACCAAAGAGCAGCAACAAAGGATCTGGTGTGTTCTATGGGA
GCAGGGCTTTCTTTTGAGCGTATGTTTTCACTAAGTTCACTCCTGGACTTTTTCTAATGA
AGAAAGACTAATCTCCTAATAATGTAATTTGATAATGTACTACTACTATCTGATGTTGTA
TCTTCTATTAGGTCTGCTTGATGCTTTAGTTGATGTGAAGTTATTAGTAGGTATCCACTA
TACCCTTTTGTACTATTAGAACCATGCTCGCATTACATTAACTTATGTTGCCC

QA 1 353 1 353
DS 



AS 1 2

CO CL6611Contig1 706 2 4 U
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ATCAGACTTTCTGCTTAGAACCTCGTTTAATTTTTAAGTTATGTGGTTTATCTTTCTTTC
TGTACAAGAACAAAGTATATTTGTTGGGAGGGATTATAAGTTTTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AY87JQ C 1
AF RS1AY87TF U 1
BS 1 673 RS1AY87TF
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BS 675 692 RS1AY87TF
BS 693 706 RS1AY87JQ

RD RS1AY87JQ 706 0 0
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QA 1 706 1 706
DS 

RD RS1AY87TF 692 0 0
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CGCCTTCATTGACAGCTCAGAGGTTGATACGTGAACAGCAGGATGATGAGTATCTTGCAT
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CTCAGAGAAAACTTGAGGAGGAACAGGAGCTAGAGAGGGAACTAAATGCAAAAGAAGCTT
CTCTGCCTAAGGAACCACAAGCAGACGAAGAGAATGCTATTACCCTTCTAGTCAGGATGC
CTGATGGAACTCGACATGGCCGACGATTCCTCAGATCCGACAAACTCCAATCTCTTTTCG
ATTTCATAGACATTGCAAGAGTGGTGAAACCCAGGACTTACCGACTGGTGAGGCCTTACC
CTCGGCATGCGTTTGGGGATGGAGAAAGCGAGTCGACTCTGAAGGATCTTGGATTGAGCA
GCAAGCAAGAAGCATTGTTTCTTGAGCTTATCTGAGCAAAATGTTTAATTTCTTAAATAT
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TGTACAAGAACAA*GTATATTTGTTGGGAGGG

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 2

CO CL6612Contig1 779 2 1 U
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BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1FI96JQ U 1
AF RS1ER33JQ U 1
BS 1 779 RS1ER33JQ

RD RS1FI96JQ 695 0 0
AATTGGAAAAAAGGAGGTTCATTCATTTCCTCTAACGATCACAAACTTCATGATCATCAT
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GAGATCATGTTCCAGATATCAAAAGCCTTGTCCATCATCTTGTGCTGTACATATTCTTTG
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CTGAAAGGAGCCAATCCAGTCCCTGGACCGATCATGATGATCGGTACCTTGGAATCAGAA
GGAAGCTTGAAGTTGGATTGCCTAACAAATATCGGTGCTGAGCAACAGTTTTCACTCTTC
TCATAAGGCACAGCACTCTTCATCCAAGTCGAGCA

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1ER33JQ 779 0 0
AATTGGAAAAAAGGAGGTTCATTCATTTCCTCTAACGATCACAAACTTCATGATCATCAT
AATATGGCATTTCTGTAACGTATATATATAAAATAAAGTACACAGAGTGTGTAGGGACTA
CAACAGCTTCATTACCATACATCTCTTAAATATCTTCCACTCATTTGCAGATTCTTCACA
AAGCTCTCTGCTTTCGTTGAATTCATCAATCCCTGTTCTTGAGCTATTGTGTGGAGAGAT
CTGTGAACGTCTCTTGCCATGCCTTTAGCGTCACCGCAAACATATAAATAAGCTCCTTGA
GAGATCATGTTCCAAATATCAAAAGCCTTGTCCATCATCTTGTGCTGTACATATTCTTTG
GTTGGTCCTTCACGAAAGAAGGCTACACTTAGCTCTGAAAGTGCACCACTCTCTAAAAAC
CTCTGCAGCTCTTCCTCGTAAATGAAATCCATTCTACGGTTTCTGCATCCAAAGAACAAC
ACTGATGGACCTTGTTCAGCACCAGATTCAACCAACGCAAGTCTTTCCTGAAGGAAACCT
CTGAAAGGAGCCAATCCAGTCCCTGGACCGATCATGATGATCGGTACCTTGGAATCAGAA
GGAAGCTTGAAGTTGGATTGCCTAACAAATATCGGTGCTGAGCAACAGTTTTCACTCTTC
TCATAAGGCACAGCACTCTTCATCCAAGTCGAGCACACTCCCTTATGAATCCTTCCTGTT
GGCATCTTCTCATAGACAAGTGCACATGTAACATGAATTCTAGTTTCAGCATCTTGGGA

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

CO CL6613Contig1 911 2 2 U
AAAGCAGCGTCATCCTTACGTTTTTCTTTTCATATAAGCTTCACAGAGAAAAAGAACAAA
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TCAACAAACCAACACTTGTTGCTGTTGTTGTTGTTGTTGGTTGGCTCTTTCTTTCTTTCT
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BQ
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QA 1 684 1 684
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BQ
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AF RS1AZ83TF U 1
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TACACTGCCTTTGAGAATATCTACCCAGTTCTTACAGAGTTCAGGAAAATCCAGCAGTGA
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QA 1 767 1 767
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AS 1 2

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BQ
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AF RS1CI91TF U 1
AF RS1CI91JQ C 245
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AACTCAAACAAACCCCAAAAATGGCTTCTTGGTTATCATTTCTTGTCATTGCAGTGACAT
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CTCAGCCACCGGTTACAACAACATTCCCACCTCTTCCCAAACCCACAATGCCACCACCAA
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CAGTTTCTTCGT

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DS 

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TTT
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GATACCTTCATTGCCTAACCCAACACAGCCCATTAATATCCCAAACTTTCCCCAAATCAA
TATTCCTAATTTCCCATTTAACATTCCAAACAGCTTCCCCTTTAATATTCCCACCAGCAT
TCCTACCATCCCTTTTTTCACTCCCCCCCCTTCCAAATGAGAAGCTACGCTTTTCAGCTG
CTGTCACACAACACTTTACGGTTTTTTTTTCACACACTTTGTTTGCACATGTTTGTAATG
TTTCTTATTCTTTTGCTGTTGCTTGATGAATGTACTCCTTGTTGTTGGTGTTGTGTGTTT
CTGGCGTGATTTAGTTGCTTTTGTAATATCTATAAAGTCGCCTAAGGATCGAATGTGTGA
ATGTGCAAAGCTTGTTAATAAAACAGTTTTTTCGTTT

QA 4 460 4 460
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1G488TF C 1
AF RS1G488JQ U 8
BS 1 7 RS1G488TF
BS 8 693 RS1G488JQ
BS 694 714 RS1G488TF

RD RS1G488TF 714 0 0
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GCCTGATCGATCTTCATGAACTCGCCGTCCCACGCCTTGAGGTCATCGTCGGAGGAAGCG
CCACCGTCGACGGCCTCGGTCTTGGAAGCGGCGGCGTCGACGTGCTTCTTGCAGTACTCA
ATCACCTTGGCGAGGATCTTGCTCGTGACGTTGGGGAGAGGGATCCCGTTGTCGACGCAG
TCGTCTTCGACCATGTGGGCTATGGTCTGAGACTCGAGAGCCACGGCCTCGTCCACCTCG
AAGGACTCGCCGTCGGAGCTTTTCAACACGATCTTCTTCGTCGACATCTTTTGTGAGATG
GTTTTGATTTCTAGAAGAGATCTGAGAGAAGCGTTCAAGGTTAGGGTAAGGACC

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DS 

RD RS1G488JQ 686 0 0
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CTCTGCGCACCTCCTCCTCTTCCTCGGGTGTAAAGTCGTTCTTGATGTTGAAGGTCTGGC
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GAAGGTTCTTGATGTTCAAGTAGTTAGCAGCCAGGATGAGCTCGAAGAGGGTGGCCTGAT
CGATCTTCATGAACTCGCCGTCCCACGCCTTGAGGTCATCGTCGGAGGAAGCGCCACCGT
CGACGGCCTCGGTCTTGGAAGCGGCGGCGTCGACGTGCTTCTTGCAGTACTCAATCACCT
TGGCGAGGATCTTGCTCGTGACGTTGGGGAGAGGGATCCCGTTGTCGACGCAGTCGTCTT
CGACCATGTGGGCTATGGTCTGAGACTCGAGAGCCACGGCCTCGTCCACCTCGAAGGACT
CGCCGTCGGAGCTTTTCAACACGATCTTCTTCGTCGACATCTTTTGTGAGATGGTTTTGA
TTTCTAGAAGAGATCTGAGAGAAGCG

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 2

CO CL6617Contig1 1219 2 2 U
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GCTGATCTCATCTTTGAAGAATACATTGGTATTGATCTCCATGAAACGCTTCTACTTAAG
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GAGAAAGAGCCTTATGTGACGATGGAAGAAGACTACTGCGTCATTCTCAATGAACATACA
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GAACTCGAACCTCTGTTTCAGTATAATACTGTGTTTGGCTCACCTACAAATACTAACGAC
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TCAGATGAAACAGTATTCAACTACATAAGGAAACGGTCCAAGAACTCTCCCATACTCGCC
ACGTCAAAACTGGAGGATCCTATAACCAACTCTCCTCAGGAAGGAGGAAAAGCAGAGACA
AGTTCGTATATATCATACGGGTTATTATTGCCTAGTCCTTCTGCTAAAATACCAAGCATC
AAATCTGATGCACCTGCAGAAATGCTGTCGTTTGATATCTCGATGGCAAAGAGAAGCAAC
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TCTGATTCTTTTCTTGGATTTAAAAGCATCTTCTCTTTTCTGTGACATTCTCATTTGTAT
GTCAACACAAAACTGAGTGTTATTGAGTATCTAGTCTCCTCATGCTGATATGATACTACT
AGTAGCGTGAGTGATAAAACTGCATTACATTAAAAGAAACTGAAGAATAACCAAAATAAA
AAAAAGAGTCCTGTTGTGC


BQ
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AF RS1B906TF U 1
AF RS1B906JQ C 537
BS 1 689 RS1B906TF
BS 690 1219 RS1B906JQ

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AGTCCGTACAGCGTCACCATACTCCTGGAAAGACCCCAACAGGGTAAGGTGACTGTGAAG
GCTGATCTCATCTTTGAAGAATACATTGGTATTGATCTCCATGAAACGCTTCTACTTAAG
AAGGCAAACAACAACACAGTAAATTTCAAAAGCGAAAACAGGATGCCACACTATTATCCT
CCTATGGTGGATGTATGCATTGTAGATGATGACACTCCAGTAAAATCTGCACCCCCAAAC
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GAGAAAGAGCCTTATGTGACGATGGAAGAAGACTACTGCGTCATTCTCAATGAACATACA
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ATCAAACAAAGCGCACAGCAAACCACAAG

QA 1 689 1 689
DS 

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TGGTTCTGATTCTTTTCTTGGATTTAAAAGCATCTTCTCTTTTCTGTGACATTCTCATTT
GTATGTCAACACAAAACTGAGTGTTATTGAGTATCTAGTCTCCTCATGCTGATATGATAC
TACTAGTAGCGTGAGTGATAAAACTGCATTACATTAAAAGAAACTGAAGAATAACCAAAA
TAAAAAAAAGAGTCCTGTTGTGC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1D458TF U 1
AF RS1D458JQ C 1
BS 1 678 RS1D458TF
BS 679 679 RS1D458JQ
BS 680 688 RS1D458TF
BS 689 761 RS1D458JQ

RD RS1D458TF 688 0 0
GATGACACATAACTCACAATTCTTAGTTTCAGTGACGGTTACATCGGCGACCTTTCTGCA
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AGAAGCGGACATTTCTGGTGCTTCTGATTCGAAGGTAAGACTTCAGGGAACATGTTACCT
CTAAGATGACTGAACCCATATTAAAGGCTGCTAGGTATTGATTCAATAGGAATGGTGAAG
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ATTGCGTTAGTCTCAAAGCAACTTCCCATTAGATGAAGACCACAAAGACTTGCATTCACT
TCAAAGGATGATTTAGGTTTTTGATTTTGATATGTTAAAGTTTGTTGAGGCATTGGTTCG
TAGATTTAGCAATCTTAG*AATTGTTTT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RS1D458JQ 761 0 0
GATGACACATAACTCACAATTCTTAGTTTCAGTGACGGTTACATCGGCGACCTTTCTGCA
AGCCTGGTAACGTCTCTTGTATGTTTATAAGCTAAAGCTTGTACCTTTGAGGCTTTGCTT
AGTTTTTCTCCCTTAGATTTGGTCTCACCTTTTCTTTTAGTTACTCTGTTTCTTTTGAGA
AGAAGCGGACATTTCTGGTGCTTCTGATTCGAAGGTAAGACTTCAGGGAACATGTTACCT
CTAAGATGACTGAACCCATATTAAAGGCTGCTAGGTATTGATTCAATAGGAATGGTGAAG
AGCCTGATGAGTGACGAAGCTTCAAGGGTCTGGTACCAGAAAACAGAATCCTTGCTCCGG
AGCATCTTCGTTGCCGGGTCTCGGCGTCGGGTTTAGATTATGAAGGCTGCGACTGTGGAT
TCGGATTCTCATCATCATCCTCTCAGTTTGTACTGACTTCAAGTGTACTTGAAAAGAAGA
ACATGTTGGGGATTGTATGATCACTTTCTTCTTTGTGCTTGCTTCTGTTGTTGTATTGGC
ATTGCGTTAGTCTCAAAGCAACTTCCCATTAGATGAAGACCACAAAGACTTGCATTCACT
TCAAAGGATGATTTAGGTTTTTGATTTTGATATGTTAAAGTTTGTTGAGGCATTGGTTCG
TAGATTTAGCAATCTTAGGAATTGTTTTGGTTTATGTGTATTTTGGATGATATATGAAAT
AGTCTATATTTTGGAAATTTAATGAAATTTAAATTTTTATA

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL6619Contig1 962 2 2 U
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TCCGGTTGTGTATTTATTCGGCACAGATCACATTGAAGAAGCAATCTACAACCTCTCAAC
CAAGTCTCTCCGCATCTTCAAAGTTCTAGTACAAAGGAATGGTGCCACTGAGAAAGACTC
TCTTTTAGAAGAGCTAACAAGTTTTTCGGTGCCATATGATCTGAGTATGGGAGGAAGCAA
GGAAGTGTGGGCTGAAGCATTTCTGGAGAGGATGAGTTCAAGGTGGGAAGAATGCAAACA
CATTTGGAGTTCTTCGGATTTGCAAGTTTCTGAATGTTATCCTCAAGCTATTGTTCTTTA
AGGCTTTCACTAAAAACAATCGTTACAATCGTTCAGTAAACTCTGGTAATGAGTTCTTAT
TT


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10 10 

AF RS1A885TF U 1
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TCTTTTA

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DS 



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BQ
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AF RS1B888TF U 1
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DS 

RD RS1B888TF 683 0 0
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CCAACACCGTGCACTCAACAATGACGAGACACTGGGAGTGCCAAGCGCCAACTCCGGTGC
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CTTCACTTATTGGTTCTTCATCC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1E346TF C 1
AF RS1E346JQ U 8
BS 1 7 RS1E346TF
BS 8 698 RS1E346JQ

RD RS1E346TF 698 0 0
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CCATTCCCTTGTCTCTCAGACAATGGAGCAGGGACCACGTTTTCAGAAGCAGCAGCTCCT
ACAGTGTCCGGATTCACGACAGACTCAGCTGGTGGTTTGATATCAAACCCAGAAACACGC
TGTCGCCTATCCCGTCTTTCATAAACCGGACTAGGACTACGGCTATAGCTTCTACTCCGT
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AACCGACCAAATCCGCCTCTACCCACATTCATACGACC

QA 1 698 1 698
DS 

RD RS1E346JQ 691 0 0
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ATGAATAAAGAAACTCCAGCCAACAAATCCAGGAAAACCTCCAATTCAATAACCAAACAT
ATTGGGATGAATAGTGATTTCTTCATTTTGAGGTGTTGAAATCATTCTCTGTTTCGAGTC
TTGGCTTTTAGGGTTCATGAACTAAAGCTGGTTTTAGTTCAAACTCGACAACACCATTCC
CTTGTCTCTCAAACAATGGAGCAGGGACCACGTTTTCAGAAGCAGCAGCTCCTACAGTGT
CCGGATTCACGACAGACTCAGCTGGTGGTTTGATATCAAACCCAGAAACACGCTGTCGCC
TATCCCGTCTTTCATAAACCGGACTAGGACTACGGCTATAGCTTCTACTCCGTTTATGAC
CACTACGCCTAGGGCTACGACTCCTTGAGCGTGACCAGCTCCTACTACGGCTAAGACTAT
AGCTCCTGCTGCGGCTCCTGCTATAGCTCGGGCTACGACGTGGCCTAAACAAATCAGGAC
TTCTGCTACGGCTTCTACCCCTTCTGTTATCAAATCGCCCACCACCACCACCACGACTAA
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CAAATCCGCCTCTACCCACATTCATACGACC

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1EG21TF U 1
AF RS1DG78TF U 1
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QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

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TAACATTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D644JQ U 1
AF RS1EF85JQ U 2
BS 1 445 RS1D644JQ
BS 446 789 RS1EF85JQ

RD RS1D644JQ 445 0 0
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GTCCCCGATGCTAAGCCGGCGGAAACAAGTTTCCCCGGAGACTAAGCCTAACGTAGGGAA
CAAGAACAACATAAACGAAACTCCAAACCGACCTAACACATTTATGTACATTAAAAATAC
CATAATTTATCATCGAATCAAGTCCAAAGAAATGCAACTTAGGTGAAATTTTACAAAGCC
TATTTACAATAAACATAGCCGATGATCTTTCTCACCAGAAAGGGCACCACCCAACATAGT
TTTGACAGAAATTTTCATGGGAAGTGGCTTGATCAATTAGCTTTTGAACCTGAACTTTCA
CAGACAAACCATGTTCGACTTCATGAAAATCTCCTCCGAGCAAGTTATTGTGATCAGCGA
TTGGATTGCTTGGAATTGCAGACGT

QA 1 445 1 445
DS 

RD RS1EF85JQ 788 0 0
G
CTACAAAATAGTTTGATTGAAACATGAAAAAGATACAAAGACGACGTTGATAAAGGATGT
CCCCGATGCTAAGCCGGCGGAAACAAGTTTCCCCGGAGACTAAGCCTAACGTAGGGAACA
AGAACAACATAAACGAAACTCCAAACCGACCTAACACATTTATGTACATTAAAAATACCA
TAATTTATCATCGAATCAAGTCCAAAGAAATGCAACTTAGGTGAAATTTTACAAAGCCTA
TTTACAATAAACATAGCCGATGATCTTTCTCACCAGAAAGGGCACCACCCAACATAGTTT
TGACAGAGATTTTCATGGGAAGTGGCTTGATCAATTAGCTTTTGAACCTGAACTTTCACA
GACAAACCATGTTCGACTTCATGAGAATCTCCTCCGAGCAAGTTATTGTGATCAGCGATT
GGATTGCTTGGAATTGCAGACGTAAAGAAATCACGGCCCGTAAGCTTATGACTCATACGA
GCCATTACAACTACTGCACGCTCGTTCAATACCTCATTTGCATCTCCAAGCATATTCACA
GCCTGAAGAATTTCCTTCTCTCGAGCACTCCTTTGAGGCTGAGGAAGGTCTGCGTCAGCG
GGATCTTCATCTACTTCCTCAGGCTCAACATTAGCAGGACCGTTGGGATTGTTGTTACCG
AGTAGAGCTAGCTGAGGGACTTCGTTGAAATTGAAAAGACGCCAATTGATCAAAGGATCG
TGCACAAACGCCTCCATCATTGCCATAACGCTGTCTTTGTTGGTTCTGAGAACTTGCATA
ACATTTT

QA 2 788 2 788
DS 



AS 1 2

CO CL6624Contig1 777 2 4 U
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CTGTATCGTCGATTCCTCCATAAATATCCGATCTCGCGACTTAGAGAGTAAAGGGCGATC
GATCGATCATGTCATCTCCGGATCCGACGAAGACAGCGAATTCCGATTCCCAATCTCCAA
AGGAAGCTCCTACTCCGTCGGAGGAGCTAGGAGATTCGTCAACTGTTTGGAGAGATCCAG
TAGAATCCGGATCTCCAAACGAAGAAGAAGAGTCGAATCAAGGAGGAGAGGGAGAAGAGG
AGGAAGAGGAAGGAGAGTGCGGGTTTTGCTTGTTCATGAAAGGAGGGGGATGCAAAGAGT
CGTTCACGGCTTGGGAAGTGTGTGTGGAGGAAGCTGAGAAGAACAAGGAAGACATCGTCA
CCAAGTGCATGGAGATCACTAGTACCTTGAAGAAGTGTATGGATGAGCATTCCGATTACT
ACCAGCCGATCCTCGCTGCGGAGAGAACTGCTGAGCAGCAGGTGAAGAAGGAGCTCGAGG
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ATGGTCGAGTTTCTTTACCTAATTATTATAACCTGTTACTTCTTTGTGTGGGGGAAGAAT
AAGTGGATTGATTGAGATCAGTTGAACCTTTTCTATCTGATTGAATACTTTGTTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DN86TF U 1
AF RS1DN86JQ C 90
BS 1 621 RS1DN86TF
BS 622 622 RS1DN86JQ
BS 623 776 RS1DN86TF
BS 777 777 RS1DN86JQ

RD RS1DN86TF 776 0 0
GGAAGCTTCGTTTTACAAATCTACGAGTCGGCGGCGGCAGAAACAACGAACTTTCTTCAT
CTGTATCGTCGATTCCTCCATAAATATCCGATCTCGCGACTTAGAGAGTAAAGGGCGATC
GATCGATCATGTCATCTCCGGATCCGACGAAGACAGCGAATTCCGATTCCCAATCTCCAA
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TAGAATCCGGATCTCCAAACGAAGAAGAAGAGTCGAATCAAGGAGGAGAGGGAGAAGAGG
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CGTTCACGGCTTGGGAAGTGTGTGTGGAGGAAGCTGAGAAGAACAAGGAAGACATCGTCA
CCAAGTGCATGGAGATCACTAGTACCTTGAAGAAGTGTATGGATGAGCATTCCGATTACT
ACCAGCCGATCCTCGCTGCGGAGAGAACTGCTGAGCAGCAGGTGAAGAAGGAGCTCGAGG
CCGACAAGGAGAAGATCTCTGAAGAAGAAGCGGCGGCGATGAAGCTAGCTCAGGGTTAAA
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ATGGTCGAGTTTCTTTACCTAATTATTATAACCTGTTACTTCTTTGTGTGGGGGAAGAAT
AAGTGGATTGATTGAGATCAGTTGAACCTTTTCTATCTGATTGAATACTTTGTTTT

QA 1 776 1 776
DS 

RD RS1DN86JQ 688 0 0
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AAGACAGCGAATTCCGATTCCCAATCTCCAAAGGAAGCTCCTACTCCGTCGGAGGAGCTA
GGAGATTCGTCAACTGTTTGGAGAGATCCAGTAGAATCCGGATCTCCAAACGAAGAAGAA
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TTGTTCATGAAAGGAGGGGGATGCAAAGAGTCGTTCACGGCTTGGGAAGTGTGTGTGGAG
GAAGCTGAGAAGAACAAGGAAGACATCGTCACCAAGTGCATGGAGATCACTAGTACCTTG
AAGAAGTGTATGGATGAGCATTCCGATTACTACCAGCCGATCCTCGCTGCGGAGAGAACT
GCTGAGCAGCAGGTGAAGAAGGAGCTCGAGGCCGACAAGGAGAAGATCTCTGAAGAAGAA
GCGGCGGCGATGAAGCTAGCTCAGGGTTAAAACTGAGAGGGAGGAGATTTAGGTAATTTT
ACCAGAGAATGTTGTTTAGATACCATTGATGATGGTCGAGTTTCTTTACCTAATTATTAT
AACCTGTTACTTCTTTGTGTGGGGGAAGAATAAGTGGATTGATTGAGATCAGTTGAACCT
TTTCTATCTGATTGAATACTTTGTTTTT

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

CO CL6625Contig1 688 2 2 U
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GGTCTGTTACTGACTTATCTAGGTCTATATCTAATGGACGGACATGGCCAGCCTGCGCTA
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CTTAAAGAACTATGGAACTACGGTATCGAAGAATCGGAGTCTCACACGCCGGAGGATCCT
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CATGTCGACATGTTTGTACAGAGTCCATATAATCTTCTTGAATTCAGACACACAGTAACC
ACTACTCCGTAGTATTTCAAGTTTTTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EP26JQ C 1
AF RS1EP26TF U 1
BS 1 682 RS1EP26TF
BS 683 688 RS1EP26JQ

RD RS1EP26JQ 688 0 0
GCTGTACTTCTTTGCTGCGCGTTTGTCTATGACATCTTCTGGGTCTTCATATCACCATTG
ATATTCCACGAGAGTGTTATGATTGTGGTTGCCCAAGGAGACAGCAGTAGTGGGGAGTCC
ATTCCTATGTTACTGAGGATTCCTCGGTTTTTCGATCCTTGGGGTGGCTATGACATGATT
GGTTTTGGGGACATCTTCTTCCCCGGTTTGCTCATTTCCTTTGTTTCCAGATATGACAAG
GTCAAAAAGAGAGTAATCTCAAGTGGATACTTCCTTTGGTTGACTATAGGCTATGGAGTT
GGTCTGTTACTGACTTATCTAGGTCTATATCTAATGGACGGACATGGCCAGCCTGCGCTA
CTCTACATCGTACCATGCACACTCGGTTTGGCCGTCGTTCTGGGGTTGGTAAGAGGAGAG
CTTAAAGAACTATGGAACTACGGTATCGAAGAATCGGAGTCTCACACGCCGGAGGATCCT
CTGCCTGTGGCATAAGAAACATGATGCAACAAATCTAATGGCGTGCGACCAAACAAATTA
GATCAGCTTTCCCCTGATCATCGAGCACAACTTGAAAAGGAAAGGTTCTGTAGTAAGACT
CATGTCGACATGTTTGTACAGAGTCCATATAATCTTCTTGAATTCAGACACACAGTAACC
ACTACTCCGTAGTATTTCAAGTTTTTTC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RS1EP26TF 682 0 0
GCTGTACTTCTTTGCTGCGCGTTTGTCTATGACATCTTCTGGGTCTTCATATCACCATTG
ATATTCCACGAGAGTGTTATGATTGTGGTTGCCCAAGGAGACAGCAGTAGTGGGGAGTCC
ATTCCTATGTTACTGAGGATTCCTCGGTTTTTCGATCCTTGGGGTGGCTATGACATGATT
GGTTTTGGGGACATCTTCTTCCCCGGTTTGCTCATTTCCTTTGTTTCCAGATATGACAAG
GTCAAAAAGAGAGTAATCTCAAGTGGATACTTCCTTTGGTTGACTATAGGCTATGGAGTT
GGTCTGTTACTGACTTATCTAGGTCTATATCTAATGGACGGACATGGCCAGCCTGCGCTA
CTCTACATCGTACCATGCACACTCGGTTTGGCCGTCGTTCTGGGGTTGGTAAGAGGAGAG
CTTAAAGAACTATGGAACTACGGTATCGAAGAATCGGAGTCTCACACGCCGGAGGATCCT
CTGCCTGTGGCATAAGAAACATGATGCAACAAATCTAATGGCGTGCGACCAAACAAATTA
GATCAGCTTTCCCCTGATCATCGAGCACAACTTGAAAAGGAAAGGTTCTGTAGTAAGACT
CATGTCGACATGTTTGTACAGAGTCCATATAATCTTCTTGAATTCAGACACACAGTAACC
ACTACTCCGTAGTATTTCAAGT

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 2

CO CL6626Contig1 838 2 2 U
GGATTCACCATTCTTCAACTCAATTTAAATCAGGGGGGGAGAGAGAGAAAGGATGGAATA
TCAGAAACAAGAAAGTGGGGTGAAGAAGATGAAGAGAGTCACTAAGATCATAGCATTGGC
ATCTATTTTCTCTCTCGTTCTGTCTTACTCGTCTTCAGTCTCCTCCCTACAACAAAGACT
CCATTTATTTTCCATGTATATCAGCCTTGTGGACAAGAAATACATGTTCTTGTTATGCAA
TGGTATTGTAGGTTTTATCATGGGGAATTTCAAAACCCTTCTGCGTGGTCATGCCATCAA
CATCGTTGAAGAAACGGAAGAACTAAGGATCAACCATATTCAAAAATCAGAAATGAAGAA
TGTAGTGATGCTACTTGAAGAACAATGTGTATCCAAAGAAGAAAAAGAAGAAGAAGGAGT
GGCGCTACTCGAAGAACAGTGTGTATCCAAAGAAGAAGGAGAAGAAGCAGTGGCACTACT
TGAAGAACAATGTGCATCCAAAGAAGAAGATATGACAAGTTTATTGAGAGAATAAGTTTC
AATGGTCGTTGAGGATGACGATGGAGGTAAAGACCTCACTCTCGTTAGAATAGATGATGA
TGATGAGATATATGATAACTTCCTAAGTTCGGAAGAGTTGAACAAGAAATGCGAGGAGTT
CATCAGAAAGATGAAGGCGGGGATTCGATCGGAGTCCCAGAGTTTATTTACTTCTTAGAT
ATGTGATTGTTTTTTGAGTAATATTTATCAACTTATCATTAGCATATTCACATTCTTCTA
GAGAATGTTAAAAGTTTTTTATTTGTTTGCTGTTGAATAGATTATTTACTTTGGTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GI64TF U 1
AF RS1GI64JQ C 176
BS 1 378 RS1GI64TF
BS 379 838 RS1GI64JQ

RD RS1GI64TF 378 0 0
GGATTCACCATTCTTCAACTCAATTTAAATCAGGGGGGGAGAGAGAGAAAGGATGGAATA
TCAGAAACAAGAAAGTGGGGTGAAGAAGATGAAGAGAGTCACTAAGATCATAGCATTGGC
ATCTATTTTCTCTCTCGTTCTGTCTTACTCGTCTTCAGTCTCCTCCCTACAACAAAGACT
CCATTTATTTTCCATGTATATCAGCCTTGTGGACAAGAAATACATGTTCTTGTTATGCAA
TGGTATTGTAGGTTTTATCATGGGGAATTTCAAAACCCTTCTGCGTGGTCATGCCATCAA
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TGTAGTGATGCTACTTGA

QA 1 378 1 378
DS 

RD RS1GI64JQ 663 0 0
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TGCAATGGTATTGTAGGTTTTATCATGGGGAATTTCAAAACCCTTCTGCGTGGTCATGCC
ATCAACATCGTTGAAGAAACGGAAGAACTAAGGATCAACCATATTCAAAAATCAGAAATG
AAGAATGTAGTGATGCTACTTGAAGAACAATGTGTATCCAAAGAAGAAAAAGAAGAAGAA
GGAGTGGCGCTACTCGAAGAACAGTGTGTATCCAAAGAAGAAGGAGAAGAAGCAGTGGCA
CTACTTGAAGAACAATGTGCATCCAAAGAAGAAGATATGACAAGTTTATTGAGAGAATAA
GTTTCAATGGTCGTTGAGGATGACGATGGAGGTAAAGACCTCACTCTCGTTAGAATAGAT
GATGATGATGAGATATATGATAACTTCCTAAGTTCGGAAGAGTTGAACAAGAAATGCGAG
GAGTTCATCAGAAAGATGAAGGCGGGGATTCGATCGGAGTCCCAGAGTTTATTTACTTCT
TAGATATGTGATTGTTTTTTGAGTAATATTTATCAACTTATCATTAGCATATTCACATTC
TTCTAGAGAATGTTAAAAGTTTTTTATTTGTTTGCTGTTGAATAGATTATTTACTTTGGT
GCC

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

CO CL6627Contig1 931 2 2 U
GGGTTGATGTTTCTTGCTGACAACAACAGCAGATTTTGTTTTGTTTTGCTTCAAAGCATA
GAAGCTGCATTTTTCTTCGTTTTATCAAAAAAAATGTCGAATCTTTCAGCACGAACAGGA
AGAGACCGTCAACGTTATGACAACAACTTCCGTCTCGTTTCTGGGTGCATTCCGTATAGG
GTGGTGAAAGATGAAGAGGAGTCGGATGTTGTTGACCTTGAAAACAAGCTTCAAGTGCTT
ATGGTTTCATCTCCTAACCGACACGATCTTGTCTTCCCAAAGGGAGGATGGGAAGATGAT
GAAACTGTTCTTGAAGCTGCTTCTCGTGAAGCTATGGAAGAAGCAGGAGTTAAAGGAATA
CTAAGAGAAGATCCATTAGGAGTTTGGGAATTTAGAAGCAAGAGTAGTTGTGAAGAAGCT
GAATGTTGTGGTGGCTGCAAAGGTTATATGTTTGCATTAGAGGTTAAGGAAGAACTTAAG
GCATGGCCAGAGCAAGAAAACCGAGAGAGGAGATGGCTGAATGTTAAAGAAGCTTTGGAA
CTGTGTCGGTATGAGTGGATGCAGAGTGCTCTTGAAGAGTTTTTAAGAGTGATGACAGAA
GATGGAAGGACAAAAGAAGAGACCCTTTCCCCTTCCAGCATTTCAAATCAAGGAGAACGT
CAAATAGATTCTCGGTACTGCTTTGTAGTAAATTAGTTGTCAGTTGTTATGTAGTATGGA
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TGTTCCAAGGTTACCCTGTGACTTGAATGTGATGAATAGAAAAACGTATAGTCGCGTATA
TAGAGAGGCTGTTATTAACTAAATAAAGAGAAGTAAATGTAACATACAGAAAATTTTGTT
TCTCTGAAATCTTTTCTTTACCGTCATAAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AM50TF U 1
AF RS1AM50JQ C 94
BS 1 776 RS1AM50TF
BS 777 931 RS1AM50JQ

RD RS1AM50TF 776 0 0
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GAAGCTGCATTTTTCTTCGTTTTATCAAAAAAAATGTCGAATCTTTCAGCACGAACAGGA
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GTGGTGAAAGATGAAGAGGAGTCGGATGTTGTTGACCTTGAAAACAAGCTTCAAGTGCTT
ATGGTTTCATCTCCTAACCGACACGATCTTGTCTTCCCAAAGGGAGGATGGGAAGATGAT
GAAACTGTTCTTGAAGCTGCTTCTCGTGAAGCTATGGAAGAAGCAGGAGTTAAAGGAATA
CTAAGAGAAGATCCATTAGGAGTTTGGGAATTTAGAAGCAAGAGTAGTTGTGAAGAAGCT
GAATGTTGTGGTGGCTGCAAAGGTTATATGTTTGCATTAGAGGTTAAGGAAGAACTTAAG
GCATGGCCAGAGCAAGAAAACCGAGAGAGGAGATGGCTGAATGTTAAAGAAGCTTTGGAA
CTGTGTCGGTATGAGTGGATGCAGAGTGCTCTTGAAGAGTTTTTAAGAGTGATGACAGAA
GATGGAAGGACAAAAGAAGAGACCCTTTCCCCTTCCAGCATTTCAAATCAAGGAGAACGT
CAAATAGATTCTCGGTACTGCTTTGTAGTAAATTAGTTGTCAGTTGTTATGTAGTATGGA
TATTATTGAGAAGCTTCTTCTGTAAACGAAGTTATAACATGAGAAGCTAATGACTA

QA 1 776 1 776
DS 

RD RS1AM50JQ 838 0 0
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CTCGTTTCTGGGTGCATTCCGTATAGGGTGGTGAAAGATGAAGAGGAGTCGGATGTTGTT
GACCTTGAAAACAAGCTTCAAGTGCTTATGGTTTCATCTCCTAACCGACACGATCTTGTC
TTCCCAAAGGGAGGATGGGAAGATGATGAAACTGTTCTTGAAGCTGCTTCTCGTGAAGCT
ATGGAAGAAGCAGGAGTTAAAGGAATACTAAGAGAAGATCCATTAGGAGTTTGGGAATTT
AGAAGCAAGAGTAGTTGTGAAGAAGCTGAATGTTGTGGTGGCTGCAAAGGTTATATGTTT
GCATTAGAGGTTAAGGAAGAACTTAAGGCATGGCCAGAGCAAGAAAACCGAGAGAGGAGA
TGGCTGAATGTTAAAGAAGCTTTGGAACTGTGTCGGTATGAGTGGATGCAGAGTGCTCTT
GAAGAGTTTTTAAGAGTGATGACAGAAGATGGAAGGACAAAAGAAGAGACCCTTTCCCCT
TCCAGCATTTCAAATCAAGGAGAACGTCAAATAGATTCTCGGTACTGCTTTGTAGTAAAT
TAGTTGTCAGTTGTTATGTAGTATGGATATTATTGAGAAGCTTCTTCTGTAAACGAAGTT
ATAACATGAGAAGCTAATGACTAAACTTGTTCCAAGGTTACCCTGTGACTTGAATGTGAT
GAATAGAAAAACGTATAGTCGCGTATATAGAGAGGCTGTTATTAACTAAATAAAGAGAAG
TAAATGTAACATACAGAAAATTTTGTTTCTCTGAAATCTTTTCTTTACCGTCATAAAG

QA 1 838 1 838
DS 



AS 1 2

CO CL6628Contig1 733 2 2 U
GGATTGTTTCTTCATCGCTTCGATCATCCTCCAATGGCTGTCAACGCTCCCTTATCGTCT
CCGGCAGCTCACCCGCGAACACAGTTTCTCTCCAACCCCGTTCTCCCCCGCTTTCAACGG
TCATACTCCGCCGTAAAAGCACCAGCAGCAGCCTTCTCCGTCGTCTCTATGGCTCCTCAG
AAGAAGGTGAACAAATATGATGCCAAGTGGAAGAAACAATGGTACGGAGCGGACTATTCT
TCGAAGGAAGCGAAGAAGTAAACGTCGACGTTTTCAAGAAGCTTGAGAAGCGGAAAGTGC
TGAGCAACGTTGAGAAATCTGGTCTTCTCTCAAAAGCAGAGGACTTGGGAGTCACATTGT
CATCTCTTGAGAAGCTTGGTGTTTTCTCCAAAGCAGAGGAGCTCGGTCTTCTCAGTCTCC
TTGAAACTTTAGCCGGTACATCCCCTGCAGTCTTGGCCTCGGCTGCACTCCCGGCTCTGA
CGGCTGCAATTGTTGCTGTCGTGCTGATTCCTGATGACTCAGCTACTCTGGTGGTTGCTC
AATCGGTTTTGGCAGGTGCTCTTGCGCTTGGAGCCCTTGTTTTGTTGGTTGGCTCTGTTG
TTTTGGATGGACTTCAAGAAGCTGACTGATTCTTTGCTATGTAAAAGTTGTAAACCAAAC
ATAAATGAACCTTTTGTCCAATTGATTTATGTTAGTTTGCTGATACCATAAATGTAAGGT
TGAGTGAACGGCC


BQ
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AF RS1BN36TF U 1
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BS 716 733 RS1BN36JQ

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TCGAAGGAAGCGAAGAAGTAAACGTCGACGTTTTCAAGAAGCTTGAGAAGCGGAAAGTGC
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TTGAAACTTTAGCCGGTACATCCCCTGCAGTCTTGGCCTCGGCTGCACTCCCGGCTCTGA
CGGCTGCAATTGTTGCTGTCGTGCTGATTCCTGATGACTCAGCTACTCTGGTGGTTGCTC
AATCGGTTTTGGCAGGTGCTCTTGCGCTTGGAGCCCTTGTTTTGTTGGTTGGCTCTGTTG
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CTTCTCCGTCGTCTCTATGGCTCCTCAGAAGAAGGTGAACAAATATGATGCCAAGTGGAA
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TTGGCCTCGGCTGCACTCCCGGCTCTGACGGCTGCAATTGTTGCTGTCGTGCTGATTCCT
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TTTGCTATGTAAAAGTTGTAAACCAAACATAAATGAACCTTTTGTCCAATTGATTTATGT
TAGTTTGCTGATACCATAAATGTAAGGTTGAGTGAACGGCC

QA 1 701 1 701
DS 



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BQ
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BS 1 5 RS1EA44TF
BS 6 696 RS1EA44JQ

RD RS1EA44TF 696 0 0
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ATGAGAACTGATATACTCACCCTCCTCTCTCTCTCTTTCGAATATCTTCTTGATTGCCTC
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GTTGTTCCATAGAAACAATGCTCTCTCAGCAACCCC

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DS 

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ACAAGCAACCAACAAGTAGAACCCATACAAAAAAAAAGTTGTCAAGTATTCAGTGATGAG
AACTGATATACTCACCCTCCTCTCTCTCTCTTTCGAATATCTTCTTGATTGCCTCAAGAA
AACCGTTTCAAACCCGAATCTGTATCCGTTACCATTAAAAGTATAAGCTGACATAACAGA
GAAGAGACCACAGTACCTACCCTTAGGACTCAGAGCTGCTTGCAAGATTCACCGAGGACA
CAAATCTTGGGACCAGCTCTGCCTCGTTGGTCTTCGAAGCCGCCAAATCTTCTAACCTCT
TCCATGTTTTTTCCCGGTTTGCTTTAACCTCTGTCTTATTCTCTTCTTCCACTTGGTATT
TGGCTAAACACTCATCGAAGAAAGCTTGGTCAATGTCGGAAAACACTTTCCTCACGTTTA
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AGACTATAGGCAAGATCACTTTGTAGTTGTGAGTGATCAGGTTTCTTATGTGATCGTTGT
TCCATAGAAACAATGCTCTCTCAGCAACCCC

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

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ATAACGTGAACCTTTAAGTAGGGTTATAACCTCCATCTACTCTGCAAAAAAATATATATC
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AACAATGCTTGCTTTATATCTTCGGAGTTGATGAAATCTCTCTGCTGAGCTACCTCGGAA
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AAATGTTCCTTTGTAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FI24JQ U 283
AF RS1EC42JQ U 1
BS 1 556 RS1EC42JQ

RD RS1FI24JQ 132 0 0
CCT
TAACCTGCGTTTCTAAACAATGCTTGCTTTATATCTTCGGAGTTGATGAAATCTCTCTGC
TGAGCTACCTCGGAACAAGAAGCATGCAAGGAGAAATCACTAAAGCAGCTAATAACACAT
TGTTCAATC

QA 4 132 4 132
DS 

RD RS1EC42JQ 556 0 0
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ATAACGTGAACCTTTAAGTAGGGTTATAACCTCCATCTACTCTGCAAAAAAATATATATC
TTTCTTATTTCCTTTTTGAAACAACAACTCATAATGTCTTCCCCCAAAAAATTTAAGCTC
GCAATGGAAATAAACACCAAACATCTAACCTTTTAAATCATTAAATAAATAGTATTTTGA
TTCATTAATTTCATCATAAAAACTCCTTACAAGCATTTTCCTCCATAACCTGCGTTTCTA
AACAATGCTTGCTTTATATCTTCGGAGTTGATGAAATCTCTCTGCTGAGCTACCTCGGAA
CAAGAAGCATGCAAAGAAAAATCACTAAAGCAGCTAATAACACATTGTTCAATCTCCAAG
CCTAAAGTCTCAAGTGTATTAACAGTTGATAAAAGCAATCCCGGTTTGGGTGAGCAACAT
ATCTCAACCCGAGTATCTTGGTCTCTCCGGTCCACTTCAAACTTTGGTGAGTTTCTGACC
AAATGTTCCTTTGTAT

QA 1 556 1 556
DS 



AS 1 2

CO CL6631Contig1 1016 2 2 U
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GCAAAGAGGAGCAAGAAGAACTGAAACTGAAGAAGAAAGAAATGGGTGTTGTGAAGTCAG
CGATTGGGGATATGCTGATGACCTTCTCGTGGGTTGTCCTCTCCGCGACGTTCGGTTTAC
AGACGACGGAGATCATCTCCGCCGCTGGGTTTCAGGGGATCGCTTGGGCTCCGCTGGCCA
TCACCACGTTTCTTATTTTCGTCTACGTCTCCATCTTCACCATTGTATTCGGTAGCGCTA
GCTTTAATCCCACCGGAAACGCCGCCTTCTATGCCGCCGGTATCCCCGGAGATACCCTTT
TCACCTTGGCCATCAGGTTACCTGCTCAGGCAGCTGGTGCGGCAGGAGGTGCATTGGCCA
TCATGGAGTTCATACCAGAGAAGTACAAGCACATGATTTCTGGACCTTCCCTTCAGGTTG
ATGTGCACACTGGAGCTATTGCTGAAACCATCTTAAGTTTCGGTATCACCTTTGCGGCTT
TGCTTATTATCATCAGGGGTCCACGAAGATTACTCGCCAAGACCTTCTTGCTCGCTCTTG
CAACCATTTGCTTCGTTGTCGCTGGCTCTAAATACACCGGACCAGCCATGAATCCCGCCA
TTGCGTTTTGGGTGGGCATACATGTACAGCTCTCACAACACTTGGGACCATTTCTACGTG
TACTGGATCAGTTCTTTTGTTGGTGCTTTATCTGCTGCACTGGTCTTCCGTACTATCTTC
CCGCCACCTAAACCCCAGAAGAAGAAACAGAAGAAAGCCTGAGAGGATAAAAACTAATCC
GAGACAACACCGGTTCAATTCTTTACCGGTTTGGGATATAGAAAGATTCAGAAGGTTTTC
CATTCTAAAATAAGGAGAAAACCTTATATCATTGTTTACATTCACGCTTTATATTATGAA
TTTGTGCGGACGGCAACAATTCTCCAGTTCGTGCATATATATATATATCTTCACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AN40TF U 1
AF RS1AN40JQ C 352
BS 1 796 RS1AN40TF
BS 797 1016 RS1AN40JQ

RD RS1AN40TF 796 0 0
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GCAAAGAGGAGCAAGAAGAACTGAAACTGAAGAAGAAAGAAATGGGTGTTGTGAAGTCAG
CGATTGGGGATATGCTGATGACCTTCTCGTGGGTTGTCCTCTCCGCGACGTTCGGTTTAC
AGACGACGGAGATCATCTCCGCCGCTGGGTTTCAGGGGATCGCTTGGGCTCCGCTGGCCA
TCACCACGTTTCTTATTTTCGTCTACGTCTCCATCTTCACCATTGTATTCGGTAGCGCTA
GCTTTAATCCCACCGGAAACGCCGCCTTCTATGCCGCCGGTATCCCCGGAGATACCCTTT
TCACCTTGGCCATCAGGTTACCTGCTCAGGCAGCTGGTGCGGCAGGAGGTGCATTGGCCA
TCATGGAGTTCATACCAGAGAAGTACAAGCACATGATTTCTGGACCTTCCCTTCAGGTTG
ATGTGCACACTGGAGCTATTGCTGAAACCATCTTAAGTTTCGGTATCACCTTTGCGGCTT
TGCTTATTATCATCAGGGGTCCACGAAGATTACTCGCCAAGACCTTCTTGCTCGCTCTTG
CAACCATTTGCTTCGTTGTCGCTGGCTCTAAATACACCGGACCAGCCATGAATCCCGCCA
TTGCGTTTTGGGTGGGCATACATGTACAGCTCTCACAACACTTGGGACCATTTCTACGTG
TACTGGATCAGTTCTTTTGTTGGTGCTTTATCTGCTGCACTGGTCTTCCGTACTATCTTC
CCGCCACCTAAACCCC

QA 1 796 1 796
DS 

RD RS1AN40JQ 665 0 0
ATACCCTTTTCACCTTGGCCATCAGGTTACCTGCTCAGGCAGCTGGTGCGGCAGGAGGTG
CATTGGCCATCATGGAGTTCATACCAGAGAAGTACAAGCACATGATTTCTGGACCTTCCC
TTCAGGTTGATGTGCACACTGGAGCTATTGCTGAAACCATCTTAAGTTTCGGTATCACCT
TTGCGGCTTTGCTTATTATCATCAGGGGTCCACGAAGATTACTCGCCAAGACCTTCTTGC
TCGCTCTTGCAACCATTTGCTTCGTTGTCGCTGGCTCTAAATACACCGGACCAGCCATGA
ATCCCGCCATTGCGTTT*GGGTGGGCATACATGTACAGCTCTCACAACACTTGGGACCAT
TTCTACGTGTACTGGATCAGTTCTTTTGTTGGTGCTTTATCTGCTGCACTGGTCTTCCGT
ACTATCTTCCCGCCACCTAAACCCCAGAAGAAGAAACAGAAGAAAGCCTGAGAGGATAAA
AACTAATCCGAGACAACACCGGTTCAATTCTTTACCGGTTTGGGATATAGAAAGATTCAG
AAGGTTTTCCATTCTAAAATAAGGAGAAAACCTTATATCATTGTTTACATTCACGCTTTA
TATTATGAATTTGTGCGGACGGCAACAATTCTCCAGTTCGTGCATATATATATATATCTT
CACTC

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

CO CL6632Contig1 896 2 2 U
GGGGGAAAGGAAGGAATCAGATGTTGGTGCGCTTACCAGTAGCAGCAGCAGGCTCCGTCG
TTGTCTATCTCCACCGGCGAATCACCACCGCTTGTCTGCTATCCACGAAGAGCTCGATGA
CTTCGGATTCCTTCACGACCATCAAAGAAACCGTATCCTTAGAGAAAGAGATTAAGAAGA
GCAAATTCATCGCGATCGCCGGTCATATCTCCTCCGAGCAGTCGGCACAACTGTTCCTCT
CCGAGGTCCGAGATCCTCGCGCTACGCACAACTGCTGGGCTTATAAGGTTGGTGATCAGC
ATCGATCTAGTGATGACGGTGAGCCATCGGGCACAGCAGGAAAGCCGATGCTGTCTGCAA
TTTGTTCCTCTGGATTAGACAGAGTTATGGTTGTTGTCATTAGGTATTTTGGGGGCATCA
AACTCGGAACCGGAGGTCTTGTTAGAGCATATGGTGGGGTTACCTCTGATTGCTTGAAAA
CTGCTTCAACTCGCCTTTTCAAGTCTAAAGTTCAAATGGGAGTCGAGGTGACATTTGATC
TTCTAGGTGTTGTTTACAATCAGCTGCAGTCATGCCAGGCTGAAGACATCAAGGAAGACT
ATGATACTGGTAAAGATGGTACCACCATGGTTTCCTTCAAGGTTGATTTTGACCAGGTTG
ATAAACTAAAGGATGCTATCAAATCAAACTGCAAACGAGACCTTGTTTTTTTCAAAAACC
TAGCAAATGGTGGCCAACTCGGCAAAAACATTATCCAGTAATTGTTACAGAATACTGCCA
AAAAGTAAAGCTATTTTTGTTTTTAGCAACATAGTGAAGAATGCCTCGTCCAAGATTATG
ACTTGTTTCAACTATAGCGTTACGTTATGTATGTTGATAGCCTACTAGTTTAGTCC


BQ
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AF RS1EX27TF U 1
AF RS1EX27JQ C 374
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GCAAATTCATCGCGATCGCCGGTCATATCTCCTCCGAGCAGTCGGCACAACTGTTCCTCT
CCGAGGTCCGAGATCCTCGCGCTACGCACAACTGCTGGGCTTATAAGGTTGGTGATCAGC
ATCGATCTAGTGATGACGGTGAGCCATCGGGCACAGCAGGAAAGCCGATGCTGTCTGCAA
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AACTCGGAACCGGAGGTCTTGTTAGAGCATATGGTGGGGTTACCTCTGATTGCTTGAAAA
CTGCTTCAACTCGCCTTTTCAAGTCTAAAGTTCAAATGGGAGTCGAGGTGACATTTGATC
TTCTAGGTGTTGTTTACAATCAGCTGCAGTCATGCCAGGCTGAAGACATCAAGGAAGACT
ATGATACTGGTAAAGATGGTACCACCATGGTTTCC

QA 1 635 1 635
DS 

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AGGTCTTGTTAGAGCATATGGTGGGGTTACCTCTGATTGCTTGAAAACTGCTTCAACTCG
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AGATGGTACCACCATGGTTTCCTTCAAGGTTGATTTTGACCAGGTTGATAAACTAAAGGA
TGCTATCAAATCAAACTGCAAACGAGACCTTGTTTTTTTCAAAAACCTAGCAAATGGTGG
CCAACTCGGCAAAAACATTATCCAGTAATTGTTACAGAATACTGCCAAAAAGTAAAGCTA
TTTTTGTTTTTAGCAACATAGTGAAGAATGCCTCGTCCAAGATTATGACTTGTTTCAACT
ATAGCGTTACGTTATGTATGTTGATAGCCTACTAGTTTAGTCC

QA 1 523 1 523
DS 



AS 1 2

CO CL6633Contig1 730 2 2 U
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CTTGACCACCATGTCTGCTCCTCTTCACTACCCTAAGCCCAATCCATTGACGAAGATTGA
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TCTTGATCCTGTTCTTGTTCGAGCTGAAGAGAAAGTTGTGGGGCCGAAACTAGATGTGGG
CATTAAGAGTACCTCGGTGGATAGTAGCTCCGGTAGCCCTAGTCCGGCAGAGACGCCTCC
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TCTCAATATGGAAGGTCAACCAGAGGATTTAAAGTTGGCAGAGGATGAAAAGGAAGAAGA
AAAGCACGAAATGCCTAAAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAAGAGAAGCAAGG
GATGAGTAAAAAAGAAGAAGAGAAGCAAGAGATGATAAAAGGAAAAGTAGAAAAAGAGCA
AGAGACGAGTGAAGAAGGAGAAAAACAAATGGAGAAAAATAAGAAGAGAGGAAGTGGATG
CTTCCCATGGATGAGATCAAGACAAGGACAAGCAAGAAAATCAAAGTACATTTTCCCGAT
TTGTATTCCTCATCTTGTCAAAGTTGTTAAAAATCACCTTAAAACACACAAGAGAATCAA
CAAAAAAACA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ER26TF U 1
AF RS1FE69TF U 1
BS 1 683 RS1ER26TF
BS 684 730 RS1FE69TF

RD RS1ER26TF 688 0 0
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TCTTGATCCTGTTCTTGTTCGAGCTGAAGAGAAAGTTGTGGGGCCGAAACTAGATGTGGG
CATTAAGAGTACCTCGGTGGATAGTAGCTCCGGTAGCCCTAGTCCGGCAGAGACGCCTCC
GATCATGGAACGGTCGCTGAAAAGATATGCGGAACCTTATGATTCGCCGGTGGACTTCAA
TCTCAATATGGAAGGTCAACCAGAGGATTTAAAGTTGGCAGAGGATGAAAAGGAAGAAGA
AAAGCACGAAATGCCTAAAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAAGAGAAGCAAGG
GATGAGTAAAAAAGAAGAAGAGAAGCAAGAGATGATAAAAGGAAAAGTAGAAAAAGAGCA
AGAGACGAGTGAAGAAGGAGAAAAACAAATGGAGAAAAATAAGAAGAGAGGAAGTGGATG
CTTCCCATGGATGAGATCAAGACAAGGACAAGCAAGAAAATCAAAGTACATTTTCCCGAT
TTGTATTCCTCATCTTGTCAAAG
GTTGT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RS1FE69TF 730 0 0
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TCAAAATAAAACCAATAATAATAATCATAACGTCAGAGTCATTCACGAGGATCTTTATGT
TCTTGATCCTGTTCTTGTTCGAGCTGAAGAGAAAGTTGTGGGGCCGAAACTAGATGTGGG
CATTAAGAGTACCTCGGTGGATAGTAGCTCCGGTAGCCCTAGTCCGGCAGAGACGCCTCC
GATCATGGAACGGTCGCTGAAAAGATATGCGGAACCTTATGATTCGCCGGTGGACTTCAA
TCTCAATATGGAAGGTCAACCAGAGGATTTAAAGTTGGCAGAGGATGAAAAGGAAGAAGA
AAAGCACGAAATGCCTAAAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAAGAGAAGCAAGG
GATGAGTAAAAAAGAAGAAGAGAAGCAAGAGATGATAAAAGGAAAAGTAGAAAAAGAGCA
AGAGACGAGTGAAGAAGGAGAAAAACAAATGGAGAAAAATAAGAAGAGAGGAAGTGGATG
CTTCCCATGGATGAGATCAAGACAAGGACAAGCAAGAAAATCAAAGTACATTTTCCCGAT
TTGTATTCCTCATCTTGTCAAAGTTGTTAAAAATCACCTTAAAACACACAAGAGAATCAA
CAAAAAAACA

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL6634Contig1 1080 2 6 U
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CCAACTGAGAAGTTGCTTGTCCTTGGTGGAAATGGATTTGTGGGATCGCATGTCTGTAAA
GAAGCTCTAGAACGCGGCTTATCTGTCTCTAGCCTTAGCAGATCAGGTAAGTCGTCTTTA
CAAGAGTCATGGGCTACTAGAGTAACATGGCATCAAGGAAACCTTCTGTCATCTGATTCA
TTGAAAGATGCTCTCGATGGGGTGACTTCTGTGATATCTTGTGTTGGAGGTTTTGGTTCA
AACTCGTATATGTATAAGATTAACGGGACTGCAAATATCAATGCAATTAGAGCTGCCTCA
GAGAAAGGTGTGAAAAGATTTGTCTATATATCTGCTGCTGATTTCGGACTAGCCAACTAC
TTGTTGAGCGGATACTATGAGGGAAAGCGAGCTGCTGAGACCGAGCTGCTCACAAGATTT
GCTTATGGAGGGATAATCTTGCGACCTGGTTTTATATATGGAACCCGCAGCGTTGGAAGC
ATGAAGATCCCATTGGGAGTCTTTGGTTCACCCATGGAGATGGTTTTTCAACAAGCAAAA
CCGCTGAACCAGCTCCCGTTAGTCGGACCTTTGTTCACACCTCCAGTGAATGTTGAATCG
GTTGCCAAAGTTGCGGTTAGAGCAGCTACTGTTCCCGTCTTCCCTCCCGGGATTGTTGAT
GTTCATGGAATACAACGTTACAGCCAACAGAAATCGAGATAAGCATCTTCTTGATTATAT
GCTCTCTTGTCGTTTTTGTAGAGTTTGGCTGCTTTACTCTTGTTAGATTTCGACAATGAG
AATAAAACCGTTCTGTTTCTCTCACCATGAATAAATAAAGAAGACAAGCTTTTTATTGAT


BQ
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AF RS1CE21TF U 1
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DS 

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TTTGCTTATGGAGGGATAATCTTGCGACCTGGTTTTATATATGGAACCCGCAGCGTTGGA
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AAACCGCTGAACCAGCTCCCGTTAGTCGGACCTTTGTTCACACCTCCAGTGAATGTTGAA
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TATGCTCTCTTGTCGTTTTTGTAGAGTTTGGCTGCTTTACTCTTGTTAGATTTCGACAAT
GAGAATAAAACCGTTCTGTTTCTCTCACCATGAATAAATAAAGAAGACAAGCTTTTTATT
GAT

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AD38JQ U 77
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BS 601 884 RS1AD38TF

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QA 1 524 1 524
DS 

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CACCATCCCCGAAACTGATAGGCTCTTCACCTTCCTTT*ACGGCTTCGATGTAAAGTGCT
TT*GGATTT*GGACGAACCAACAAGTTT*GCGATT*GATGACGGAGACAGCAAACTCGGC
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ATTGGAAAATTAAATTTTAGGAGAGTGGAATCATAGAAATTTAGGAGTAAGAAGAATCTC
CAGGAAAAGAGAAAGATTCAACAACTTACAAGAGATCTCGAGCTGGGGAATTCTATGTGC
GTGTCTGGGTCTGGGAGACGGATTAAGCCAAATCTCCAATCCCG

QA 1 884 1 884
DS 



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BQ
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AF RS1AD26TF C 1
AF RS1AD26JQ U 13
BS 1 12 RS1AD26TF
BS 13 699 RS1AD26JQ
BS 700 718 RS1AD26TF

RD RS1AD26TF 718 0 0
TAATTCATTTGAAAAATCTGACTATAAAAATGCGTTAACATGTTGAAACACTTAGTATAG
AGAAAAAGAAACTGTTATCTCTTCCGGTAGTCTTCTCACAGGATCCTGCAATTAGGTTCG
TGGTTGTAGACTGGTTCCCCGATATAGTCCCTAGAATTATACCCGTAGGGATCACATGGG
TGATGATAGGATGATGGCGCACCATATCCATAAGGCCATGGTTGTGGATGACATGGTTGA
TGACATGGTGGATGGCAATGACATGGCTCTTGTTTTTCCTCAGGCTTTTTCTCATCTGTT
TTTTTCTCTTCGGGCTTTGCCTCTTCTGGTTTTTTCTCCTCGGGTTTCTTCTCATCTGGC
TTCTTGTCTCCATCGGGCTTGGGTGGTTCGACTTTGTTTACGCTTACAAGCTCCGCACAG
GCTACCTTCCTCCTCAGCGTGTTGGTTAGACCAATCATATCGACTTCAAAACCGGTTACC
TCAATCTGGTTCCTGTGATCTCCCTTTATTTCCACAGCCGACACACCTTTAAACTTAACC
GCAGTTTTCATTGCTTTTGCTCGGGTTTTGTCATCAGTCATAGTAACTCTTATCAATATC
TTTTGCTTCATGTTCTTGTTATCTTTTTCACGGCCGATTATTAGAAATGATCTGCTTGAA
AACTATCTTTAATGTTTTGATGGGTTTTTGTCTAGCCTCAGAGATTTGCGGGTCTTCC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1AD26JQ 687 0 0
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TGTTATCTCTTCCGGTAGTCTTCTCACAGGATCCTGCAATTAGGTTCGTGGTTGTAGACT
GGTTCCCCGATATAGTCCCTAGAATTATACCCGTAGGGATCACATGGGTGATGATAGGAT
GATGGCGCACCATATCCATAAGGCCATGGTTGTGGATGACATGGTTGATGACATGGTGGA
TGGCAATGACATGGCTCTTGTTTTTCCTCAGGCTTTTTCTCATCTGTTTTTTTCTCTTCG
GGCTTTGCCTCTTCTGGTTTTTTCTCCTCGGGTTTCTTCTCATCTGGCTTCTTGTCTCCA
TCGGGCTTGGGTGGTTCGACTTTGTTTACGCTTACAAGCTCCGCACAGGCTACCTTCCTC
CTCAGCGTGTTGGTTAGACCAATCATATCGACTTCAAAACCGGTTACCTCAATCTGGTTC
CTGTGATCTCCCTTTATTTCCACAGCCGACACACCTTTAAACTTAACCGCAGTTTTCATT
GCTTTTGCTCGGGTTTTGTCATCAGTCATAGTAACTCTTATCAATATCTTTTGCTTCATG
TTCTTGTTATCTTTTTCACGGCCGATTATTAAAAATGATCTGCTTGAAAACTATCTTTAA
TGTTTTGATGGGTTTTTGTCTAGCCTC

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

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GTTGGCGGAAGAACTCGACGCGTGATTCCTTCTCCTAGATTATTCGGTTCCCGCGTAAGA
GTGTGCTCTCTTCCTCCTCCTTCTTCATCTCTCAAGGCTGAGTCATGTTTAAAAAGAGAT
GTGAACTGACAATTAAGCAGTCTCGAGTCGATGTCCTGTTACGACAAGCCAATACCTGAG
GAGATCATCGATGAGCCTGTCGGATTATCCATGTCCGAGAGAGAGATTGGTGATAACAGG
CGTTGCACTTGCTGCGAAGCTAAAGGTGCATTGCTTTGTGCCACTTGCTCTGGAACTGGT
CTTTACGTTGACTCCATTATGGAGAGCCAAGGCATCATTGTTAAAGTCCGTTGCTTAGGT
TGTGGTGGAAGTGGTAACATTATGTGTAACAGCTGTGGCGGGCGTGGTCACGTAGGCCAT
TGATGACCCCCATGTTTCACTCTGTTTTTAGTCATGTTTTTGCCACTTTACGTGTTGTGA
CTTTCTCTGTTCTTATTGCAGAATCCTACCTTTGTCAGTTCCATATATAGATTTGTGTTC
TTGTACTGATGTAATCCACAGTTTTGTAAAAGGCTCGATTCATCTTCTGTGGTTAAATAT
AAAATGACTAAATTAGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1H142JQB C 1
AF RS1H142TF U 1
BS 1 632 RS1H142TF
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BS 634 676 RS1H142TF
BS 677 677 RS1H142JQB

RD RS1H142JQB 677 0 0
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AAAATGACTAAATTAGG

QA 1 677 1 677
DS 

RD RS1H142TF 676 0 0
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CGTTGCACTTGCTGCGAAGCTAAAGGTGCATTGCTTTGTGCCACTTGCTCTGGAACTGGT
CTTTACGTTGACTCCATTATGGAGAGCCAAGGCATCATTGTTAAAGTCCGTTGCTTAGGT
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TGATGACCCCCATGTTTCACTCTGTTTTTAGTCATGTTTTTGCCACTTTACGTGTTGTGA
CTTTCTCTGTTCTTATTGCAGAATCCTACCTTTGTCAGTTCCATATATAGATTTGTGTTC
TTGTACTGATGTAATCCACAGTTTTGTAAAAG*CTCGATTCATCTTCTGTGGTTAAATAT
AAAATGACTAAATTAG

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL6638Contig1 683 2 1 U
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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1H428JQB C 1
AF RS1H428TF U 1
BS 1 683 RS1H428TF

RD RS1H428JQB 683 0 0
GGAATTTAAAGAATAACATTGTCTTAAAAGTTTTCATGACGACCATCATGTCGGGATTAC
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ACAGTAGCCTCTTTGGGTTGCGTCATCTTAGCCACCTAAATCTCTCTCACAACAACTTCA
CTTCCTCTTCACTCCCTTCCGAGTTCAGCAACCTCAGCAGATTAGAGGTTTTGTCTCTTT
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GCAAGAAAAAGAAGAGGAAGAAGTGTTGAACTGGAAAGCAGTGGCAATAGGATATGGTAC
TGGACTGTTGTTTGGATTGTCAATAGCACAAGTCATCGCTTCATACAAGCCGGAGTGGCT
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CTTTATACTGTTTCCTCTTTCAT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RS1H428TF 683 0 0
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TTGATTCCAGCAACTGTAACCAAACTGATTACTTAGATGGAGTTCAGTGCAACAACGCCA
CTGGTGCGGTCACAGAGCTACAACTCCCAAGTGGCTGCCTCACCGGAGTACTCAAGCCCA
ACAGTAGCCTCTTTGGGTTGCGTCATCTTAGCCACCTAAATCTCTCTCACAACAACTTCA
CTTCCTCTTCACTCCCTTCCGAGTTCAGCAACCTCAGCAGATTAGAGGTTTTGTCTCTTT
CCTCTAATAGCTTCATAGTTGTTTTGGGACTAACGCGCCACCAATGCAACAACAGCAAGA
GCAAGAAAAAGAAGAGGAAGAAGTGTTGAACTGGAAAGCAGTGGCAATAGGATATGGTAC
TGGACTGTTGTTTGGATTGTCAATAGCACAAGTCATCGCTTCATACAAGCCGGAGTGGCT
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QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

CO CL6639Contig1 186 2 1 U
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TCCAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 

AF RS1DX28JQ C 1
AF RS1DX28TF U 1
BS 1 186 RS1DX28TF

RD RS1DX28JQ 186 0 0
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TCCAGC

QA 1 186 1 186
DS 

RD RS1DX28TF 186 0 0
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TCCAGC

QA 1 186 1 186
DS 



AS 1 2

CO CL6640Contig1 772 2 4 U
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TGCCAAGTCTAACATGCGTTTCCCACATTCTGAAGAAGTGACTTGTGGGGGAAACGCATT
GCGGTTTCAGGCAGCTATACGTCTCAAAATGATAAGAACGGGCTTGATTAAGACTGACAA
TGAGGTAAGTGGTCTGAACGTGTGCGTGGAAGTGGTGAAAAACAAACTGACGCCAGGGAA
TAAGAAATCTGAATTGGGGATTCACTTTGGTCGTGGCTTCTACGTGGAGCGTGAGGTGTT
AGAATTGGGTTGTGAGCATGGAGTTATTGCAAGAGAAGGTAATAGCCATTTGATTGAAGG
CGAGGTTGTTGATGGCAAAGAAGCAGCTGAAAAGTACCTGCTGGAAAATAAGGAGGTTCT
TGATACCGTTATCAATACCCTGAGGAAGCAGCTCTTCTAGATGTCCAATTTAAGCAAAAG
TGGAAGGAGCATTAGGTACGTTAACTAGGAGCATAGAAAGCATGTCAAAGCCTAGTTGTT
GTTAGATGATGTCTTAGGCACTGTTATTGCAGAACTCTGCAGATCTGTGGGGTGTAATGA
AACGTTCTTCTCTTCAGTGTTATAACCAATCTTTCAGTAACTTGGCTTTTCTACTTAACC
ATTGAGGAGAGGGTTTCAGTTATATGAACAGTTAAGCTCATGTAACAATCATTTGTGGAA
TGTTGGGGAGATATTTTAGGAAACAATGTATAAGAAACAAATTAATTTACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CM74TF U 1
AF RS1CM74JQ C 248
BS 1 557 RS1CM74TF
BS 558 558 RS1CM74JQ
BS 559 745 RS1CM74TF
BS 746 772 RS1CM74JQ

RD RS1CM74TF 745 0 0
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GCGGTTTCAGGCAGCTATACGTCTCAAAATGATAAGAACGGGCTTGATTAAGACTGACAA
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TGTTGGGGAGATATTTTAGGAAACA

QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1CM74JQ 525 0 0
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GGTTGTGAGCATGGAGTTATTGCAAGAGAAGGTAATAGCCATTTGATTGAAGGCGAGGTT
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GTTATCAATACCCTGAGGAAGCAGCTTTTCTAGATGTCCAATTTAAGCAAAAGTGGAAGG
AGCATTAGGTACGTTAACTAGGAGCATAGAAAGCATGTCAAAGCCTAGTTGTTGTTAGAT
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TTCTCTTCAGTGTTATAACCAATCTTTCAGTAACTTGGCTTTTCTACTTAACCATTGAGG
AGAGGGTTTCAGTTATATGAACAGTTAAGCTCATGTAACAATCATTTGTGGAATGTTGGG
GAGATATTTTAGGAAACAATGTATAAGAAACAAATTAATTTACTC

QA 1 525 1 525
DS 



AS 1 2

CO CL6641Contig1 707 2 2 U
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GAGAGATTGAAATGCTTGCAAGATATAGTCCCCGGATGTTATAAGGCAATGGGAATGGCT
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AGCAGTGTCTTCCATCCATCATCATGGACCCTTTGACTTTTGTTTTTTCCTCCCTTTTTG
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BQ
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AF RS1EB72JQ C 1
AF RS1EB72TF U 1
BS 1 674 RS1EB72TF
BS 675 707 RS1EB72JQ

RD RS1EB72JQ 707 0 0
GTGATTCACGACAGCGACGAGTCTTCTTCAAGAAACGATACCAAGAAGAGAAAAACATTA
ACGTCGTCCGTGTCTACGTCGGAAAACAGTGGAACCAAAAATAGTTATGCAAGGAAAGGG
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GAGAGATTGAAATGCTTGCAAGATATAGTCCCCGGATGTTATAAGGCAATGGGAATGGCT
ACGATGCTGGACGAAATAATCAATTACGTTCAGTCATTACAAAATCAAGTCGAGTTTTTA
TCTATGGAGCTTTCGGCAGCAAGTTCGTATTATGACTTTAACTCGGAGGCTGATGCTGTT
GATTCCATGCAGAAGGCAAAGGCACGTGAGGCAGTGGAGATGGGGCAAGGGAGGGATGGG
AGCAGTGTCTTCCATCCATCATCATGGACCCTTTGACTTTTGTTTTTTCCTCCCTTTTTG
TCGTCTTTCTATGTGCTCTTTTTGGAACAATAATGTGCTCTTTCTAATGTGCTCTTATTT
GAATAAAAATACTTAATAGAATGTATCAATAATTTGGATACCAAATGATTATATGTACTG
TGTAATGTCAAAATTACAAATTTATTAATGCCTAGAGATTGCAATTC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1EB72TF 674 0 0
GTGATTCACGACAGCGACGAGTCTTCTTCAAGAAACGATACCAAGAAGAGAAAAACATTA
ACGTCGTCCGTGTCTACGTCGGAAAACAGTGGAACCAAAAATAGTTATGCAAGGAAAGGG
AAAAGGTCGAAGAGTAGAGAAGAAGAGAAAGAGAGAGAAGATGTTCATGTTAGAGTCAAA
AGAGGTCAAGCCACTGATAGCCACAGCTTAGCAGAGCGGGTTCGACGAGGGAAAATAAAC
GAGAGATTGAAATGCTTGCAAGATATAGTCCCCGGATGTTATAAGGCAATGGGAATGGCT
ACGATGCTGGACGAAATAATCAATTACGTTCAGTCATTACAAAATCAAGTCGAGTTTTTA
TCTATGGAGCTTTCGGCAGCAAGTTCGTATTATGACTTTAACTCGGAGGCTGATGCTGTT
GATTCCATGCAGAAGGCAAAGGCACGTGAGGCAGTGGAGATGGGGCAAGGGAGGGATGGG
AGCAGTGTCTTCCATCCATCATCATGGACCCTTTGACTTTTGTTTTTTCCTCCCTTTTTG
TCGTCTTTCTATGTGCTCTTTTTGGAACAATAATGTGCTCTTTCTAATGTGCTCTTATTT
GAATAAAAATACTTAATAGAATGTATCAATAATTTGGATACCAAATGATTATATGTACTG
TGTAATGTCAAAAT

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

CO CL6642Contig1 1408 2 2 U
GGGCGTCTGAAACCTTTAGATCCCCACATTGAAGCCTCTCTGCAAGGGATCCCAACAACG
CGTTTAAGGTTTCTCAGGCGAGAAGAAACCTCTCTCTCTCTCCTTCGCATTCTCTCTCAT
CTCTCCTCCCCTCTCTCTCTCGTTGTTCAACATTCTCAAGCACGAGGCTTTGGCGTTACA
TATTATCAAAAAGGAACTCTCTTTCTGATCATGGACACTCTTTTGCATCTGCTAGAGCCT
GCTCCAGCCACTCTGATTCTGACAGCTGTCACCGTGACATTCGCATCTGCTTTCCGTGCA
CTCAACTACGGCAAAGAGATGGAGAGGAACCGCGACTTCTCCGAAGCTTCCATCACGCTA
GACACCTCTCAGGCCTTGATGATCCCAGTCATGAGCTCCTGCAGTTTGCTTCTCATGTTC
TATCTCTTCTCCTCCGTCTCTCAGCTCCTCACCGCCTTCACAGCCGTTGCATCAGTCTCC
TCTCTCTTCTTTTGGCTTTCACCGTATGTTTTGTACGTCAAGTCTCAGCTCGGTCTCTCT
GATCCTTTCCTCTCCCGCTGCTGCTCCAAGTCTTTCACGAGGATGCAAGGGTTGTTGCTG
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CTGCTTGGGATCTCTATCTGTATTGCCTTCGTCAGCCATGTTCGTCTTCCTAATATCAAA
ACGTGTGCTATGCTCCTCGTGTGTCTCTTTGTGTATGACATCTTCTGGGTTTTCTTCTCT
GAGAGGTTCTTTGGTGCTAACGTGATGGTCTCCGTGGCTACTCAAAAAGCGTCTAACCCG
GTTCATACGGTAGCCAACAGTTTGAATCTTCCTGGACTGGAGTTGATAACAAAGAAACTG
GAGCTGCCGGTTAAGATAGTGTTTCCGAGGAACTTACTGGGCGGTGTGGTGCCTGGTGTG
AGTGCCTCGGAGTTCATGATGCTTGGTCTTGGTGACATGGCTATTCCTGCGATGCTTTTG
GCTTTGGTTTTTTGCTTTGACTATCGGAAAAGTAGAGATGTGGTGAATCTTTATGATCTA
AAATCTTCAAAGGGACACAAATACATATGGTATGCTCTTCCTGGGTACGCCATTGGCTTG
GTCTCGGCTCTAGCTGCAGGTGTCCTGACCCACTCACCTCAACCGGCTTTACTTTATCTG
GTACCATCTACATTAGGACCGGTGATCTTCATGTCATGGCGTAGAAAGGATCTTGCGGAG
CTGTGGGATGGTCCAGCATTATCCAATCCCACTGAGAAACCTCATGAAGTAGAGATCTGA
GTTTATATAAATCAAAAGATTGCTCAGAAACATTAAAAAAGAAACACAGAGACGTTTAGT
AGAACGATAACAGATCAGGTGTTCTTGG


BQ
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AF RS1FV73TF U 1
AF RS1FV73JQ C 599
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CTGCTTGGGATC

QA 1 672 1 672
DS 

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GTAGAACGATAACAGATCAGGTGTTCTTGG

QA 1 810 1 810
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1EF03JQ C 1
AF RS1EF03TF U 1
BS 1 669 RS1EF03TF
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QA 1 687 1 687
DS 

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QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

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TAATATACGATGAATATCTATCTATATATATAATTCTTCATGTATATTATGTTTGTTTAA
ACATTTCTGATGTTATTTTCGTTTTTGTTTATATGAAAACATCATTTACTAAAATGTTTC
AAAAGGTAAAACATAACATACTATAAAAGTAATTTTTTCTTTTGGTGGACATTTGTGAAT
TATTTGTGAGGTGAGTGCTAAACAAGGTAACTCGGGGTTTGGGGTTTTGCCATTAATGAA
TAAATATTTTTTAATTAAATAAATTTTCCCTCCTATTTTCTATTTTGAGCTACACTCTAC
TCTGCATCTCTCTCTCCCTCTGTTTCTCTTCGCATTGATTCCTCTCAGCAAATTGGTAAA
GTGAAATTCAAAGTTTCTTATTCTGTTTCTCGACTTTGTTTCTTCGCTCGATCGACGATT
AAAAACCCTCGATCAAACATATTGTGTTTGTTCCCTGAAATGGAGGCCAAAAATCTCGAG
CAGCTAGAGTTCTCTCTAGATTCCGTCATTGATCTATCCTCCACTTCCCCTTCGTCGTCC
TCCCCTGTGGAGCTCCGGTTTCAGCAATCGGACTCGACCCATTGTTTCACTTTTGATCTC
GCTTCAGCTCAGTGAACAATTAATTAATTTGAGCTTTGGAAGATTGAATTTTGGTGTAGA
AATTCATTTGCATTTGACCGTTTG


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EU43JQ U 1
AF RS1H562JQB U 2
BS 1 692 RS1EU43JQ
BS 693 804 RS1H562JQB

RD RS1EU43JQ 692 0 0
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ATGATGAAATATGTATTAACAATTTTCTCTTTACATTTTAGGGAGTACGTATAATTATTT
TAATATACGATGAATATCTATCTATATATATAATTCTTCATGTATATTATGTTTGTTTAA
ACATTTCTGATGTTATTTTCGTTTTTGTTTATATGAAAACATCATTTACTAAAATGTTTC
AAAAGGTAAAACATAACATACTATAAAAGTAATTTTTTCTTTTGGTGGACATTTGTGAAT
TATTTGTGAGGTGAGTGCTAAACAAGGTAACTCGGGGTTTGGGGTTTTGCCATTAATGAA
TAAATATTTTTTAATTAAATAAATTTTCCCTCCTATTTTCTATTTTGAGCTACACTCTAC
TCTGCATCTCTCTCTCCCTCTGTTTCTCTTCGCATTGATTCCTCTCAGCAAATTGGTAAA
GTGAAATTCAAAGTTTCTTATTCTGTTTCTCGACTTTGTTTCTTCGCTCGATCGACGATT
AAAAACCCTCGATCAAACATATTGTGTTTGTTCCCTGAAATGGAGGCCAAAAATCTCGAG
CAGCTAGAGTTCTCTCTAGATTCCGTCATTGATCTATCCTCCACTTCCCCTTCGTCGTCC
TCCCCTGTGGAGCTCCGGTTTCAGCAATCGGA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RS1H562JQB 803 0 0
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TGATGAAATATGTATTAACAATTTTCTCTTTGCATTTTAGGGAGTACGTATAATTATTTT
AATATACGATGAATATCTATCTATATATATAATTCTTCATGTATATTATGTTTGTTTAAA
CATTTCTGATGTTATTTTCGTTTTTGTTTATATGAAAACATCATTTACTAAAATGTTTCA
AAAGGTAAAACATAACATACTATAAAAGTAATTTTTTCTTTTGGTGGACATTTGTGAATT
ATTTGTGAGGTGAGTGCTAAACAAGGTAACTCGTGGTTTGGGGTTTTGCCATTAATGAAT
AAATATTTTTTAATTAAATAAATTTTCCCTCCTATTTTCTATTTTGAGCTACACTCTACT
CTGCATCTCTCTCTCCCTCTGTTTCTCTTCGCATTGATTCCTCTCAGCAGATTGGTAAAG
TGAAATTCAAAGTTTCTTATTCTGTTTCTCGACTTTGTTTCTTCGCTCGATCGACGATTA
AAA*CCCTCGATCAAACATATTGTGTTTGTTCCCTGAAATGGAGGCCAAAAATCTCGAGC
AGCTAGAGTTCTCTCTAGATTCCGTCATTGATCTATCCTCCACTTCCCCTTCGTCGTCCT
CCCCTGTGGAGCTCCGGTTTCAGCAATCGGACTCGACCCATTGTTTCACTTTTGATCTCG
CTTCAGCTCAGTGAACAATTAATTAATTTGAGCTTTGGAAGATTGAATTTTGGTGTAGAA
ATTCATTTGCATTTGACCGTTTG

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

CO CL6645Contig1 754 2 2 U
GGGGTATTATTATTAACGATAGAGATAAAAACGCGTGTTACTTAAAACACTCTCCTCCTC
GTTTCCATCTCCTTCACTTTCTCTAACGCCTCCTATAACTACTCTCACTTTTGTGGATCC
AGGGGGTGTGCACTGTGCTTCATCTCCTCCTCCTCCTTTCGTCTAAATTGTTTCTTGACG
TACACGTTTCTACAGGTTATCAGAAGAAACCTAACAATGAGTCAACCTCCTGTCGGTGTT
CCTCCTCCTCAAGGCTATCCGCCGGAGGGATATTCAAAAGATGCCTATCCACCACAAGGC
TATCCACCACAGCAAGGCTATCCACCACAGCAGGGCTATCCTCCTCAAGGTTATCCTCCT
CCTTATGCGCCTCAATATCCTCCGCCACCACCGCATCATCAGCAGCCACAAAAGTCCGGT
CCTGGATGTCTAGAAGGATGTCTTGCTGCTCTCTGCTGTTGTTGTCTCTTGGATGCTTGC
TTCTGATTAAAGTATCTGCTCTCAGAGGCTGCTGATTTCATTTGCAAGAGAAGTGTTTGG
CAAAACACAAGAACCTTAAATTGATTTATGGGATATAAAATGAATGGATTGCTGATAATA
TAATCTCTCGTCTATTCGCTTTCTTTTACGTTTTGTCTTCTTTGGGCTCATAAATTATGT
TTCTATCGACGTTCTAGCTAGCTCACGTTTGGATTTGAGATAATGGGAATGTAAATTGGT
TGGTATGATATGAATACACTATTCCTTTTGCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1CD26TF U 1
AF RS1CD26JQ C 76
BS 1 753 RS1CD26TF
BS 754 754 RS1CD26JQ

RD RS1CD26TF 753 0 0
GGGGTATTATTATTAACGATAGAGATAAAAACGCGTGTTACTTAAAACACTCTCCTCCTC
GTTTCCATCTCCTTCACTTTCTCTAACGCCTCCTATAACTACTCTCACTTTTGTGGATCC
AGGGGGTGTGCACTGTGCTTCATCTCCTCCTCCTCCTTTCGTCTAAATTGTTTCTTGACG
TACACGTTTCTACAGGTTATCAGAAGAAACCTAACAATGAGTCAACCTCCTGTCGGTGTT
CCTCCTCCTCAAGGCTATCCGCCGGAGGGATATTCAAAAGATGCCTATCCACCACAAGGC
TATCCACCACAGCAAGGCTATCCACCACAGCAGGGCTATCCTCCTCAAGGTTATCCTCCT
CCTTATGCGCCTCAATATCCTCCGCCACCACCGCATCATCAGCAGCCACAAAAGTCCGGT
CCTGGATGTCTAGAAGGATGTCTTGCTGCTCTCTGCTGTTGTTGTCTCTTGGATGCTTGC
TTCTGATTAAAGTATCTGCTCTCAGAGGCTGCTGATTTCATTTGCAAGAGAAGTGTTTGG
CAAAACACAAGAACCTTAAATTGATTTATGGGATATAAAATGAATGGATTGCTGATAATA
TAATCTCTCGTCTATTCGCTTTCTTTTACGTTTTGTCTTCTTTGGGCTCATAAATTATGT
TTCTATCGACGTTCTAGCTAGCTCACGTTTGGATTTGAGATAATGGGAATGTAAATTGGT
TGGTATGATATGAATACACTATTCCTTTTGCCC

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1CD26JQ 679 0 0
ACTTTCTCTAACGCCTCCTATAACTACTCTCACTTTTGTGGATCCAGGGGGTGTGCACTG
TGCTTCATCTCCTCCTCCTCCTTTCGTCTAAATTGTTTCTTGACGTACACGTTTCTACAG
GTTATCAGAAGAAACCTAACAATGAGTCAACCTCCTGTCGGTGTTCCTCCTCCTCAAGGC
TATCCGCCGGAGGGATATTCAAAAGATGCCTATCCACCACAAGGCTATCCACCACAGCAA
GGCTATCCACCACAGCAGGGCTATCCTCCTCAAGGTTATCCTCCTCCTTATGCGCCTCAA
TATCCTCCGCCACCACCGCATCATCAGCAGCCACAAAAGTCCGGTCCTGGATGTCTAGAA
GGATGTCTTGCTGCTCTCTGCTGTTGTTGTCTCTTGGATGCTTGCTTCTGATTAAAGTAT
CTGCTCTCAGAGGCTGCTGATTTCATTTGCAAGAGAAGTGTTTGGCAAAACACAAGAACC
TTAAATTGATTTATGGGATATAAAATGAATGGATTGCTGATAATATAATCTCTCGTCTAT
TCGCTTTCTTTTACGTTTTGTCTTCTTTGGGCTCATAAATTATGTTTCTATCGACGTTCT
AGCTAGCTCAGGTTTGGATTTGAGATAATGGGAATGTAAATTGGTTGGTATGATATGAAT
ACACTATTCCTTTTGCCCC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

CO CL6646Contig1 901 2 2 U
GGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAAAGATGATGTGTGGCATGCACTGATTGTTGTCA
TAAGCAATGCATCAGAGCTTCACGGATATACAGTCAGAGCATTATACAAAGCAGTCATGA
CATATTCAGAACAGGAGACCCTTGTCCGAGTGGCGGTTTGGTGCATTGGGGAATATGGTG
ATTTACTGGTTAACAATGTGGGGATGCTTGGTATTGAAGATCCAATAACGGTAACGGAAA
GTGATGCAGTGGACGTAATCGTAAGCCATTACTCGCCATAACTCAGATATGACTACAAAA
GCGATGGCATTGGTTGCTCTACTGAAGCTTTCATCCCGCTTTCCTACTATCTCAGAGAGG
ATTAAAGATATAATTGTGAAGCAGAAAGGGAGCCTTCTCCTTGAAATGCAGCAGAGAGCT
ATTGAATTCAATTCTATTGTTGACAGGCATAAAAATATCAGGTCTTCTCTAGTTGAGAGA
ATGCCGGTGCTAGATGAGGCTACCTTCAATGTGAGGAGGGCTGGCTCTTTGCCTGCGTCA
GTTTCAACAATGGCCAAACCTTCAGTTAGTATTCCAAATGGTGTTGCTGCAGCTCCACTA
GTGGATTTGCTGGACCTGGGTTCTGACGATATCATGGCTGCACCTAGTTCATCTGGTGCA
GATTTCCTTCAGGATCTTCTTGGTGTTGACCTAGGATCATCGCCGGCACATCTGGTGCAG
CCCCGGGTCCAAAAGCCGGCGCAGATCTGTTGATGGATATTTTATCAATTGGAACACCTT
CTCCGGCACAAAACAACACGTCATCAATTGATTTGTTATCGACAGCTGCCATTAACAATA
GTCCTTCTACTGCGCTAGACACACTCTCTTCACCAGCTCCACCTCACGTAGCAACGACTG
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 

AF RS1A227TF U 1
AF RS1A227TV U 71
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BS 669 901 RS1A227TV

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GATTTCCT

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DS 

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ACAGGAGACCCTTGTCCGAGTGGCGGTTTGGTGCATTGGGGAATATGGTGATTTACTGGT
TAACAATGTGGGGATGCTTGGTATTGAAGATCCAATAACGGTAACGGAAAGTGATGCAGT
GGACGTAATCGTAAGCCATTACTCGCCATAACTCAGATATGACTACAAAAGCGATGGCAT
TGGTTGCTCTACTGAAGCTTTCATCCCGCTTTCCTACTATCTCAGAGAGGATTAAAGATA
TAATTGTGAAGCAGAAAGGGAGCCTTCTCCTTGAAATGCAGCAGAGAGCTATTGAATTCA
ATTCTATTGTTGACAGGCATAAAAATATCAGGTCTTCTCTAGTTGAGAGAATGCCGGTGC
TAGATGAGGCTACCTTCAATGTGAGGAGGGCTGGCTCTTTGCCTGCGTCAGTTTCAACAA
TGGCCAAACCTTCAGTTAGTATTCCAAATGGTGTTGCTGCAGCTCCACTAGTGGATTTGC
TGGACCTGGGTTCTGACGATATCATGGCTGCACCTAGTTCATCTGGTGCAGATTTCCTTC
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AAACAACACGTCATCAATTGATTTGTTATCGACAGCTGCCATTAACAATAGTCCTTCTAC
TGCGCTAGACACACTCTCTTCACCAGCTCCACCTCACGTAGCAACGACTGC

QA 1 831 1 831
DS 



AS 1 2

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ATTTTCCAGTCTCTCTCTCTCTCTGTGTCTTCGTTCAATCTTATCTCAGTGATTTACTTG
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CGGCCAAAACGCGCGTTTGAATGTGGTCCCCACTGTCACAATGCTCGGTGTGATGAAAGC
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CGTTCAGTTCAGAGCCCTTCTCAAGAAAATCGTGACGGCCAAGGAATCGATGGGAGATAT
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ACACGTCGTCCTCGAGAACGTCAAAGAAGCCACGCTCAAAGTCCGGTCAAGGCAAGAGAA
CATCGCCGGGGTGAAGCTCCCCAAGTTCGATCATTTCTCCGAAGGAGAGACCAAGAACGA
CTTGACCGGTTTAGCTAGAGGTGGGCAGCAAGTCCAAGCTTGCCGTGTGGCTTACGTGAA
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TGAGAATACGATCAGTTACATCAAAGGAGAGCTTGATGAGCTCGAGAGGGAAGATTTCTT
CAAGCTGAAGAAGATTCAGGGGTACAAGAGGAGGGAAGTCGAGAGACAGGCTGCTAATGC
TAAGGCCTTTGCTGAGGAAATGGTTCTTGAAGGGATCTCTATGCAGAGAGGGATTTCGAT
AAACGCTGCTCGTGATATACTTGCTGGTGGTGCGGAGAAGGATGCAGACATTATTTTTTG
AGGTGTGCGTGTGTGTGTCTGAGAGGCTCTCTATTTATATTTTTGTTTGTGATTGTTTGG
TTTATTAATCGGTTCATCGGAGTTTATGTTTCCTCAAATAAAATGGATTTGATGTAGATG
AAGGATTGTTGTATCATCTTGAGTTGTGATTTGCTATGATTTTCCTGAAGAGGTTTGTGA
TTGTTACTCTTGTGTAATGATTAATTACCTTGTTTC


BQ
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AF RS1F484TF U 1
AF RS1F484JQ C 381
BS 1 716 RS1F484TF
BS 717 717 RS1F484JQ
BS 718 727 RS1F484TF
BS 728 1176 RS1F484JQ

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CGTTCAGTTCAGAGCCCTTCTCAAGAAAATCGTGACGGCCAAGGAATCGATGGGAGATAT
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ACACGTCGTCCTCGAGAACGTCAAAGAAGCCACGCTCAAAGTCCGGTCAAGGCAAGAGAA
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TGAGAAT

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DS 

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CTCTCACCGAAGTCAAGTACGTCGCCGGCGAGAACGTCAAACACGTCGTCCTCGAGAACG
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CCAAGTTCGATCATTTCTCCGAAGGAGAGACCAAGAACGACTTGACCGGTTTAGCTAGAG
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AGCTTGCTTCTCTCCAGACTTCGTTCTTGACGCTTGACGAAGCGATCAAGACGACTAATC
GGAGGGTGAACGCTCTGGAGAACGTGGTGAAACCGAAGATTGAGAATACGATCAGTTACA
TCAAAGGAGAGCTTGATGAGCTCGAGAGGGAAGATTTCTTCAAGCTGAAGAAGATTCAGG
GGTACAAGAGGAGGGAAGTCGAGAGACAGGCTGCTAATGCTAAGGCCTTTGCTGAGGAAA
TGGTTCTTGAAGGGATCTCTATGCAGAGAGGGATTTCGATAAACGCTGCTCGTGATATAC
TTGCTGGTGGTGCGGAGAAGGATGCAGACATTATTTTTTGAGGTGTGCGTGTGTGTGTCT
GAGAGGCTCTCTATTTATATTTTTGTTTGTGATTGTTTGGTTTATTAATCGGTTCATCGG
AGTTTATGTTTCCTCAAATAAAATGGATTTGATGTAGATGAAGGATTGTTGTATCATCTT
GAGTTGTGATTTGCTATGATTTTCCTGAAGAGGTTTGTGATTGTTACTCTTGTGTAATGA
TTAATTACCTTGTTTC

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 2

CO CL6648Contig1 777 2 4 U
CGTAGGAATTAACAAATTTATAGATGTTTTAGTGTGATTCAGCTCAAGTAATAATGTGGC
ACTAAATAGGCGTTTTATGTAGGAACTTGGGACAGATTACAAATAACATTAACATAAATA
ATACATATGGCTTGGTCCTTGATACAAACAAGTAATCCCTCCCTATGTGCTTGCTTGCTT
GCTTTGAAGCAAACAGTGCGTTTAAGCTCTTTCAGTTATGATCCAAAAACCAGTTCCTTC
AGTGATCTAAACGGCGAGTTGTGACCATGAGCTGCTGAATCTCTCCATAAAGCAAGTCCT
ATCCATGAAATCAAACCAATTGTGGATGCTGCAAAGAATGACTTGCTGGTGCAGTTAGAC
AGGTATAAGCACAGAATGTTTCCATATCCATAAAAGAGAGTTGCCCATACTGAACCAGTG
AACCACATCAAGTCACGGATAAATAATGCTCTAGGCAGCATAAGCCCGTTCCCCAGCATC
GAAAGCAACATTGTGATTGGTGATAAGCCTTTTAGGTTGTCTGGACTTAGGAAATTAGTC
CACATTTGGGAAACTGGCATCCACATGAACATAAGTGTCGCTGTCCATCCAGATAAAGAC
TCGACAAACTTAACACCTTCCTCTGGGAGTTTCCCCGTTCGAGACATAAATACAGCGGCT
ACAGCAATCACAAAAGCAGTAGTCCCAGGCAAGATACTGTTTGGTACAAGAGGGACAAAA
GTTGACCACATGACTTGAGGAAGAACGGAGAGTCCACCGACAGTGATAAAGTCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1FD07JQ U 1
AF RS1GK93JQ U 58
BS 1 476 RS1FD07JQ
BS 477 477 RS1GK93JQ
BS 478 717 RS1FD07JQ
BS 718 777 RS1GK93JQ

RD RS1FD07JQ 717 0 0
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ACTAAATAGGCGTTTTATGTAGGAACTTGGGACAGATTACAAATAACATTAACATAAATA
ATACATATGGCTTGGTCCTTGATACAAACAAGTAATCCCTCCCTATGTGCTTGCTTGCTT
GCTTTGAAGCAAACAGTGCGTTTAAGCTCTTTCAGTTATGATCCAAAAACCAGTTCCTTC
AGTGATCTAAACGGCGAGTTGTGACCATGAGCTGCTGAATCTCTCCATAAAGCAAGTCCT
ATCCATGAAATCAAACCAATTGTGGATGCTGCAAAGAATGACTTGCTGGTGCAGTTAGAC
AGGTATAAGCACAGAATGTTTCCATATCCATAAAAGAGAGTTGCCCATACTGAACCAGTG
AACCACATCAAGTCACGGATAAATAATGCTCTAGGCAGCATAAGCCCGTTCCCCAGTATC
GAAAGCAACATTGTGATTGGTGATAAGCCTTTTAGGTTGTCTGGACTTAGGAAATTAGTC
CACATTTGGGAAACTGGCATCCACATGAACATAAGTGTCGCTGTCCATCCAGATAAAGAC
TCGACAAACTTAACACCTTCCTCTGGGAGTTTCCCCGTTCGAGACATAAATACAGCGGCT
ACAGCAATCACAAAAGCAGTAGTCCCAGGCAAGATACTGTTTGGTACAAGAGGGACA

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1GK93JQ 720 0 0
GGCACTAAATAGGCGTTTTATGTAGGAACTTGGGACAGATTACAAATAACATTAACATAA
ATAATACATATGGCTTGGTCCTTGATACAAACAAGTAATCCCTCCCTATGTGCTTGCTTG
CTTGCTTTGAAGCAAACAGTGCGTTTAAGCTCTTTCAGTTATGATCCAAAAACCAGTTCC
TTCAGTGATCTAAACGGCGAGTTGTGACCATGAGCTGCTGAATCTCTCCATAAAGCAAGT
CCTATCCATGAGATCAAACCAATTGTGGATGCTGCAAAGAATGACTTGCTGGTGCAGTTA
GACAGGTATAAGCACAGAATGTTTCCATATCCATAAAAGAGAGTTGCCCATATTGAACCA
GTGAACCACATCAAGTCACGGATAAATAATGCTCTAGGCAGCATAAGCCCGTTCCCCAGC
ATCGAAAGCAACATTGTGATTGGTGATAAGCCTTTTAGGTTGTCTGGACTTAGGAAATTA
GTCCACATTTGGGAAACTGGCATCCACATGAACATAAGTGTCGCTGTCCATCCAGATAAA
GACTCGACAAACTTAACACCTTCCTCTGGGAGTTTCCCCGTTCGAGACATAAATACAGCG
GCTACAGCAATCACAAAAGCAGTAGTCCCAGGCAAGATACTGTTTGGTACAAGAGGGACA
AAAGTTGACCACATGACTTGAGGAAGAACGGAGAGTCCACCGACAGTGATAAAGTCCTCC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL6649Contig1 674 2 1 U
GAGAGCAATGCTTGGTAGAATAAAAGAGAAATATATGAGCAGGTTAAAATTACCTTGACA
TCAGAAGAAAAATTGGTGACCTGCTTTTCATAACCAGCTTTCTTGAGATGAAAATTCATC
CATTTTAGCAATACTTTTTCAGGAGCCAATCCCATGAGCTCCTCCGCATCCTGCAACGTC
ATGAAGATATTAATGCATTTTCATTATTCTCCTAGAAAGCATTGCATATATATATTACCT
GAGTGTCATCCACCAATTGGAAAAGTGAAGGAGTTTTCTTAAAATTGAGATCAGCCAGCA
TTTGGATCTGATAACAACAACAACAACAAGAGGAGTTAGTAAGTCTTATAACAAGTCCAA
TAGATTCCTATAACCTAGAAAAGGAGTACCTTAATAATCTGAGATATCAACCCAAGTACG
AGATATGGCTGCAAAGGAGAAAAAAAAGTCATGAAAATAAATAGATAAATCTTGCAATGT
TGGGAATGTATAACTCACTCTTCCTTCAGCAATGTCCTGTGTTCCAATGTTGACCACAGT
GCGTCCAATAGCTTTGGCAGAATTGAGACCTAGAGTAAGATTCTCATTCCTCTCCCATGG
GTTGAGTATTTTCTTTGTGTTGATAGCTCGTTCATCAATGGTCCCAGGAACAGCAAGATT
TATAAGCTTACTGC


BQ
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AF RS1C166JQ C 1
AF RS1C166TF U 1
BS 1 674 RS1C166TF

RD RS1C166JQ 674 0 0
GAGAGCAATGCTTGGTAGAATAAAAGAGAAATATATGAGCAGGTTAAAATTACCTTGACA
TCAGAAGAAAAATTGGTGACCTGCTTTTCATAACCAGCTTTCTTGAGATGAAAATTCATC
CATTTTAGCAATACTTTTTCAGGAGCCAATCCCATGAGCTCCTCCGCATCCTGCAACGTC
ATGAAGATATTAATGCATTTTCATTATTCTCCTAGAAAGCATTGCATATATATATTACCT
GAGTGTCATCCACCAATTGGAAAAGTGAAGGAGTTTTCTTAAAATTGAGATCAGCCAGCA
TTTGGATCTGATAACAACAACAACAACAAGAGGAGTTAGTAAGTCTTATAACAAGTCCAA
TAGATTCCTATAACCTAGAAAAGGAGTACCTTAATAATCTGAGATATCAACCCAAGTACG
AGATATGGCTGCAAAGGAGAAAAAAAAGTCATGAAAATAAATAGATAAATCTTGCAATGT
TGGGAATGTATAACTCACTCTTCCTTCAGCAATGTCCTGTGTTCCAATGTTGACCACAGT
GCGTCCAATAGCTTTGGCAGAATTGAGACCTAGAGTAAGATTCTCATTCCTCTCCCATGG
GTTGAGTATTTTCTTTGTGTTGATAGCTCGTTCATCAATGGTCCCAGGAACAGCAAGATT
TATAAGCTTACTGC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1C166TF 674 0 0
GAGAGCAATGCTTGGTAGAATAAAAGAGAAATATATGAGCAGGTTAAAATTACCTTGACA
TCAGAAGAAAAATTGGTGACCTGCTTTTCATAACCAGCTTTCTTGAGATGAAAATTCATC
CATTTTAGCAATACTTTTTCAGGAGCCAATCCCATGAGCTCCTCCGCATCCTGCAACGTC
ATGAAGATATTAATGCATTTTCATTATTCTCCTAGAAAGCATTGCATATATATATTACCT
GAGTGTCATCCACCAATTGGAAAAGTGAAGGAGTTTTCTTAAAATTGAGATCAGCCAGCA
TTTGGATCTGATAACAACAACAACAACAAGAGGAGTTAGTAAGTCTTATAACAAGTCCAA
TAGATTCCTATAACCTAGAAAAGGAGTACCTTAATAATCTGAGATATCAACCCAAGTACG
AGATATGGCTGCAAAGGAGAAAAAAAAGTCATGAAAATAAATAGATAAATCTTGCAATGT
TGGGAATGTATAACTCACTCTTCCTTCAGCAATGTCCTGTGTTCCAATGTTGACCACAGT
GCGTCCAATAGCTTTGGCAGAATTGAGACCTAGAGTAAGATTCTCATTCCTCTCCCATGG
GTTGAGTATTTTCTTTGTGTTGATAGCTCGTTCATCAATGGTCCCAGGAACAGCAAGATT
TATAAGCTTACTGC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

CO CL6650Contig1 929 2 4 U
GGGAGAGTACTCCAGATATAATCATCCTTCACTACCATCTCATCGAAACATCTTTTAGCA
CTCTCCATCTCACCACATTTAGCATAAGCATCGATGATAGAACAAGAAAGCACCACATTC
GAGAGAAACCCAGCGACAAGAACCTGCCCGTGAGCTTGTCTGCTGAGCTGGATCTCTCTC
GACTTCACACAAGCGGTCAAAACCCCCGCGAAGCTGAACTCGTTGCAGTTAATCCCAGAT
CTCCTCAGCTCTCTATAAAACCACAGAGCCTCGTTCAGATCCCCGCTCTTAGCGTAGCCG
ATGACCATCGTGTTCCACGAGACGACATCCCTCTCAGGCATACCGTCGAACACGTGACGC
GCACGAGCCAGCATCCCGGATTTGACGTACCCGGAGATCATACTGTTCCACGAGTACAAG
TTCTTGAAATGCATTTTGTCGAACACTTTGCAGGCGTCGACGTGTTTACCGCATTTCATG
TACATTCCGATCAGATGATTGGAGAGAAGCGTGTTGGGCTGGGTCTTGAATCCGGTGATC
TTCAGGTGGCGATGGATCCATCTGCCTTGTTTTAAGGAGCCGGTGTCTCCGCAGCGCTGG
AGGAGGGACGCGAGGACTTGGAAGGGTAAGCGAATCCCTTGTTTGGTCAGGGACTCGAGG
CGAGAGACCGCTTGGGAGAGCTCTTCTTTGAGAAACGATCGAGGGACGGTGATTATTGGG
GGACGTTTCGTAGGGTTACTGATGGGCATTGAAGGGAGAAACCACCATGGGAGGAGGAGA
TTTGACTCCTTGAAATCTCCACCGGCGAATACAGGTCTGAAGAAGGGTTTAACGGCGGCG
AGATTCGCCGGTACGAAATCATATGACAAATGTGGATTAGAAAACCGGATCTGGTTTTTG
GTATTGGACCCTTACAAACAAACAAACAA


BQ
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AF RS1C077TF U 1
AF RS1C077JQ C 222
BS 1 651 RS1C077TF
BS 652 652 RS1C077JQ
BS 653 704 RS1C077TF
BS 705 929 RS1C077JQ

RD RS1C077TF 704 0 0
GGGAGAGTACTCCAGATATAATCATCCTTCACTACCATCTCATCGAAACATCTTTTAGCA
CTCTCCATCTCACCACATTTAGCATAAGCATCGATGATAGAACAAGAAAGCACCACATTC
GAGAGAAACCCAGCGACAAGAACCTGCCCGTGAGCTTGTCTGCTGAGCTGGATCTCTCTC
GACTTCACACAAGCGGTCAAAACCCCCGCGAAGCTGAACTCGTTGCAGTTAATCCCAGAT
CTCCTCAGCTCTCTATAAAACCACAGAGCCTCGTTCAGATCCCCGCTCTTAGCGTAGCCG
ATGACCATCGTGTTCCACGAGACGACATCCCTCTCAGGCATACCGTCGAACACGTGACGC
GCACGAGCCAGCATCCCGGATTTGACGTACCCGGAGATCATACTGTTCCACGAGTACAAG
TTCTTGAAATGCATTTTGTCGAACACTTTGCAGGCGTCGACGTGTTTACCGCATTTCATG
TACATTCCGATCAGATGATTGGAGAGAAGCGTGTTGGGCTGGGTCTTGAATCCGGTGATC
TTCAGGTGGCGATGGATCCATCTGCCTTGTTTTAAGGAGCCGGTGTCTCCGCAGCGCTGG
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QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1C077JQ 708 0 0
GTTGCAGTTAATCCCAGATCTCCTCAGCTCTCTATAAAACCACAGAGCCTCGTTCAGATC
CCCGCTCTTAGCGTAGCCGATGACCATCGTGTTCCACGAGACGACATCCCTTTCAGGCAT
ACCGTCGAACACGTGACGCGCACGAGCCAGCATCCCGGATTTGACGTACCCGGAGATCAT
ACTGTTCCACGAGTACAAGTTCTTGAAATGCATTTTGTCGAACACTTTGCAGGCGTCGAC
GTGTTTACCGCATTTCATGTACATTCCGATCAGATGATTGGAGAGAAGCGTGTTGGGCTG
GGTCTTGAATCCGGTGATCTTCAGGTGGCGATGGATCCATCTGCCTTGTTTTAAGGAGCC
GGTGTCTCCGCAGCGCTGGAGGAGGGACGCGAGGACTTGGAAGGGTAAGCGAATCCCTTG
TTTGGTCAGGGACTCGAGGCGAGAGACCGCTTGGGAGAGCTCTTCTTTGAGAAACGATCG
AGGGACGGTGATTATTGGGGGACGTTTCGTAGGGTTACTGATGGGCATTGAAGGGAGAAA
CCACCATGGGAGGAGGAGATTTGACTCCTTGAAATCTCCACCGGCGAATACAGGTCTGAA
GAAGGGTTTAACGGCGGCGAGATTCGCCGGTACGAAATCATATGACAAATGTGGATTAGA
AAACCGGATCTGGTTTTTGGTATTGGACCCTTACAAACAAACAAACAA

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

CO CL6651Contig1 905 2 6 U
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TCTAGCTAAGGAGGTGGCTCGTCCTAACGCTGATGCAATGGACAACTTAGCGGGCCAGAG
GAAGAACAGCCATGGCGCTGAAGAGTTTACTACAATGCGCAACATGAGTTACAACACCGT
ACCTTTCACTGTTCATCCACAGAAACCCGTCACTGGTTTACCTTACTCCGCAAAAGAGTC
TGGACAACATGCAGCAGCTACAAGTCTAACACAGCTTACTGCTAATGCTGGGAATAATCT
CCCAGTTATGTTCGGATACTCACCGGTTCAGCTCCCTATGCTGGATAAGGATGGCTCAGG
CGGCATTGCTGGCCTATCTCAATCTCCATTCGCTGCAAGAGGCCCATCAAACTCAGCTAC
GGCGAAAGGCGAGGGAAAACAGCCCGTTGCAGAAGAAGGCTCATCAGAGGATGCATCAGA
ACGACCATCCGGAGACAACAACAACAGTACTGCTTTCTCTTTCGACTTTTCCGCCATAAA
ACCTGGAATGGCAGCGGATGTGAAGTTTGGAGGATCTGGTGCACGTCCTAACCTGCCCTG
GGTCTCAACCACTGGCTCAGGCCCGCACGGTCGAACAATCTCGGGTGTTACATACCGGTA
CAATGCAAACCAGATCAAAATGGTTTGCGCTTGTCACGGCTCACACATGTCGCCGGAGGA
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GAACAAGTGGTTTGTAATGAGTTTCTTATGGGAAGGTGTACTCTTTTAAGGCCAAAGTTT
TATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 

AF RS1AN13TF U 1
AF RS1AN13JQ C 110
BS 1 770 RS1AN13TF
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RD RS1AN13TF 804 0 0
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TCTAGCTAAGGAGGTGGCTCGTCCTAACGCTGATGCAATGGACAACTTAGCGGGCCAGAG
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ACCTTTCACTGTTCATCCACAGAAACCCGTCACTGGTTTACCTTACTCCGCAAAAGAGTC
TGGACAACATGCAGCAGCTACAAGTCTAACACAGCTTACTGCTAATGCTGGGAATAATCT
CCCAGTTATGTTCGGATACTCACCGGTTCAGCTCCCTATGCTGGATAAGGATGGCTCAGG
CGGCATTGCTGGCCTATCTCAATCTCCATTCGCTGCAAGAGGCCCATCAAACTCAGCTAC
GGCGAAAGGCGAGGGAAAACAGCCCGTTGCAGAAGAAGGCTCATCAGAGGATGCATCAGA
ACGACCATCCGGAGACAACAACAACAGTACTGCTTTCTCTTTCGACTTTTCCGCCATAAA
ACCTGGAATGGCAGCGGATGTGAAGTTTGGAGGATCTGGTGCACGTCCTAACCTGCCCTG
GGTCTCAACCACTGGCTCAGGCCCGCACGGTCGAACAATCTCGGGTGTTACATACCGGTA
CAATGCAAACCAGATCAAAATGGTTTGCGCTTGTCACGGCTCACACATGTCGCCGGAGGA
GTTTGTCACGCATGCAAGCGAGGAGTATGTTAGCCCTGAGTCATCTGTAG*AATGACG*C
TGCCTCGGCTCATACCTGAAA
GTC

QA 1 801 1 801
DS 

RD RS1AN13JQ 796 0 0
GCGGGCCAGAGGAAGAACAGCCATGGCGCTGAAGAGTTTACTACAATGCGCAACATGAGT
TACAACACCGTACCTTTCACTGTTCATCCACAGAAACCCGTCACTGGTTTACCTTACTCC
GCAAAAGAGTCTGGACAACATGCAGCAGCTACAAGTCTAACACAGCTTACTGCTAATGCT
GGGAATAATCTCCCAGTTATGTTCGGATACTCACCGGTTCAGCTCCCTATGCTGGATAAG
GATGGCTCAGGCGGCATTGCTGGCCTATCTCAATCTCCATTCGCTGCAAGAGGCCCATCA
AACTCAGCTACGGCGAAAGGCGAGGGAAAACAGCCCGTTGCAGAAGAAGGCTCATCAGAG
GATGCATCAGAACGACCATCCGGAGACAACAACAACAGTACTGCTTTCTCTTTCGACTTT
TCCGCCATAAAACCTGGAATGGCAGCGGATGTGAAGTTTGGAGGATTTGGTGCACGTCCT
AACCTGCCCTGGGTCTCAACCACTGGCTCAGGCCCGCACGGTCGAACAATCTCGGGTGTT
ACATACCGGTACAATGCAAACCAGATCAAAATGGTTTGCGCTTGTCACGGCTCACACATG
TCGCCGGAGGAGTTTGTCAGGCATGCAAGCGAGGAGTATGTTAGCCCTGAGTCATCTGTA
GGAATGACGGCTGCCTCGGCTCATACCTGAAAAGTCGCCGGAGAAGTGTCTTATATCGTT
GTAAACAAATGGAACAAGTGGTTTGTAATGAGTTTCTTATGGGAAGGTGTACTCTTTTAA
GGCCAAAGTTTTATTG

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 2

CO CL6652Contig1 842 2 6 U
GGAGATCGCTCAATTAACTCTGAATCTTCCTCGAAGCAACCGCAAGTCTTTGTAGGTCTC
TAGGGCGATTGATTGATTCATATATCTATGGCGGACGTTGAGAATCAACAAGACTCTTCG
TTTCCAGTGAAGAGGAAATCGGATCTCTGTTGCCAAGACCAGGATAATGTGGCGAACAAG
GCTCAGAAGCTTAATCCTTCGTCGAGTTCTGATGATTCTGAGTTCAAAGACGGACAAGTT
AATGGAAGCGGCGCCGAGAATCTGAACTCCTCAACTGATGAAAAACTAGGGACAGAATCA
TCGCTTGAGAAGGCAGCTGAAGATAAGCAAGAAGTGGAAGACGAAGAGGAAGAGGAAGAG
GAGGAGGAGGATTTGATTGAAGCTGAGATTGACAGGAAAGGTAAAGGCATAGCGAGAGAG
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GATGAAGACGACGAAGATGGTGATGAGTACGACGAAAGCGATTTGTCTGACGATCCATTG
GCGGAGGTGGATTTGGATAACATCCTTCCCTCGAGGACTAGGAGACGATCGATCCAGCCT
GTAGTCTTCATCTCCAATGACCGTATCGGAAACCACGAGGATGATGATGATGATAGCAGT
GACGATAGTGATGCTTAAACGTTTAGCTATATCGAAGGTTAGTGCTAAGAAATCAAGATG
TAGTTCCTTTGATTCTAAACTATGTTCAATGATTGTTGGTTATAATCTAAATGTTTCCAA
CGCTTGGACCAAAAGTTAGCTACTATACCTATCATGTTATTGCAATTTCAACTCATTTTG
CG


BQ
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10 10 

AF RS1AU81TF U 1
AF RS1AU81JQ C 56
BS 1 683 RS1AU81TF
BS 684 684 RS1AU81JQ
BS 685 697 RS1AU81TF
BS 698 698 RS1AU81JQ
BS 699 733 RS1AU81TF
BS 734 842 RS1AU81JQ

RD RS1AU81TF 749 0 0
GGAGATCGCTCAATTAACTCTGAATCTTCCTCGAAGCAACCGCAAGTCTTTGTAGGTCTC
TAGGGCGATTGATTGATTCATATATCTATGGCGGACGTTGAGAATCAACAAGACTCTTCG
TTTCCAGTGAAGAGGAAATCGGATCTCTGTTGCCAAGACCAGGATAATGTGGCGAACAAG
GCTCAGAAGCTTAATCCTTCGTCGAGTTCTGATGATTCTGAGTTCAAAGACGGACAAGTT
AATGGAAGCGGCGCCGAGAATCTGAACTCCTCAACTGATGAAAAACTAGGGACAGAATCA
TCGCTTGAGAAGGCAGCTGAAGATAAGCAAGAAGTGGAAGACGAAGAGGAAGAGGAAGAG
GAGGAGGAGGATTTGATTGAAGCTGAGATTGACAGGAAAGGTAAAGGCATAGCGAGAGAG
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GATGAAGACGACGAAGATGGTGATGAGTACGACGAAAGCGATTTGTCTGACGATCCATTG
GCGGAGGTGGATTTGGATAACATCCTTCCCTCGAGGACTAGGAGACGATCGATCCAGCCT
GTAGTCTTCATCTCCAATGACCGTATCGGAAACCACGAGGATGATGATGATGATAGCAGT
GACGATAGTGATGCTTAAACGTT*AGCTATATCGAAG*TTAGTGCTAAGAAATCAAGATG
TAGTTCCTTTGAT
CTAACTATGTTCATGA

QA 1 733 1 733
DS 

RD RS1AU81JQ 787 0 0
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CTTCGTTTCCAGTGAAGAGGAAATCGGATCTCTGTTGCCAAGACCAGGATAATGTGGCGA
ACAAGGCTCAGAAGCTTAATCCTTCGTCGAGTTCTGATGATTCTGAGTTCAAAGACGGAC
AAGTTAATGGAAGCGGCGCCGAGAATCTGAACTCCTCAACTGATGAAAAACTAGGGACAG
AATCATCGCTTGAGAAGGCAGCTGAAGATAAGCAAGAAGTGGAAGACGAAGAGGAAGAGG
AAGAGGAGGAGGAGGATTTGATTGAAGCTGAGATTGACAGGAAAGGTAAAGGCATAGCGA
GAGAGGACAAAGGAAAAGGAAAACTGATCGAATTTGATGAAAGTGACGATAGCGATGATG
ATGATGATGAAGACGACGAAGATGGTGATGAGTACGACGAAAGCGATTTGTCTGACGATC
CATTGGCGGAGGTGGATTTGGATAACATCCTTCCCTCGAGGACTAGGAGACGATCGATCC
AGCCTGTAGTCTTCATCTCCAATGACCGTATCGGAAACCACGAGGATGATGATGATGATA
GCAGTGACGATAGTGATGCTTAAACGTTTAGCTATATCGAAGGTTAGTGCTAAGAAATCA
AGATGTAGTTCCTTTGATTCTAAACTATGTTCAATGATTGTTGGTTATAATCTAAATGTT
TCCAACGCTTGGACCAAAAGTTAGCTACTATACCTATCATGTTATTGCAATTTCAACTCA
TTTTGCG

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

CO CL6653Contig1 784 2 3 U
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AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGAAGATGGCCTCTTCTCTTTTCTTCCCAGT
GAGCACCGGCTCATTTCTCAAATGCGGTTTCTCCCCTCCCACACTCACACAGCTTTCATC
ATCCCAGAAAAACAACAGCATGAGATGCAGCTTTTCTCCCGAGGACTACTACATTCCTGC
TGTTGATTTTGTTGGCCACTCTCTCTCTGCATTGAATGATACACAGAAGTGGGCATCCTT
TGCATCAGCCGGACTTGTGTGGTTTTACCTGACGGCGAGACCTGGTGTTCTCGTCGGCGC
CATTGACGCATATCTCCTGGCTCCACTCCAGCTTGGCATTGACACTCTGATTGGGACAAG
GAGGTTTAAGAGGTCTGATTTCTTGGTGGCAGAGAAGCTTGGAGAAGGCTCATTCGGAGT
GGTGTATTCAGGGGTCCTTCTCCCAAAGAATTCTTCAAGTGAGCAGCGGATTATGAACAA
GGCTACACTTAAATCTTCTTTGGGGGATTTTAAGGAGAGGGTTATTCTCAAGAAGGTTAA
GCTTGGGGTTCGAGGTGCTCACGACTTGGGCGAGTACGAAGAGTGGTTCAACTACAGACT
CTCTAGGGCTGCTCCTGACACCTGCGCTGAGTTTCTCGGTAGCTTTGTCGCCGACAAGAC
CAATACTGTCTTTACAAAAGCGGCAAATGGCTCGTCTGGAGGTTCGAGGGAGACCGTGAT
CTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 

AF RS1EA96TF U 38
AF RS1CQ67TF U 1
BS 1 84 RS1CQ67TF
BS 85 85 RS1EA96TF
BS 86 784 RS1CQ67TF

RD RS1EA96TF 697 0 0
GGACTTGGGGAAGAAGAA
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGAAGATGGCCTCTTCTCTTTTCTTC
CCAGTGAGCACCGGCTCATTTCTCAAATGCGGTTTCTCCCCTCCCACACTCACACAGCTT
TCATCATCCCAGAAAAACAACAGCATGAGATGCAGCTTTTCTCCCGAGGACTACTACATT
CCTGCTGTTGATTTTGTTGGCCACTCTCTCTCTGCATTGAATGATACACAGAAGTGGGCA
TCCTTTGCATCAGCCGGACTTGTGTGGTTTTACCTGACGGCGAGACCTGGTGTTCTCGTC
GGCGCCATTGACGCATATCTCCTGGCTCCACTCCAGCTTGGCATTGACACTCTGATTGGG
ACAAGGAGGTTTAAGAGGTCTGATTTCTTGGTGGCAGAGAAGCTTGGAGAAGGCTCATTC
GGAGTGGTGTATTCAGGGGTCCTTCTCCCAAAGAATTCTTCAAGTGAGCAGCGGATTATG
AACAAGGCTACACTTAAATCTTCTTTGGGGGATTTTAAGGAGAGGGTTATTCTCAAGAAG
GTTAAGCTTGGGGTTCGAGGTGCTCACGACTTGGGCGAGTACGAAGAGTGGTTCAACTAC
AGACTCTCTAGGGCTGCTCCTGACACCTGCGCTGAGTTTCTCGGTAGCTTTGTCGCCGAC
AAGACCAATACTGTCTTTA

QA 19 697 19 697
DS 

RD RS1CQ67TF 784 0 0
GGAGTCTCACCATCACCACATACACAAAGGGGATGGAGATAAGATTGTACTTGGGGAAGA
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATGAAGAGAAGATGGCCTCTTCTCTTTTCTTCCCAGT
GAGCACCGGCTCATTTCTCAAATGCGGTTTCTCCCCTCCCACACTCACACAGCTTTCATC
ATCCCAGAAAAACAACAGCATGAGATGCAGCTTTTCTCCCGAGGACTACTACATTCCTGC
TGTTGATTTTGTTGGCCACTCTCTCTCTGCATTGAATGATACACAGAAGTGGGCATCCTT
TGCATCAGCCGGACTTGTGTGGTTTTACCTGACGGCGAGACCTGGTGTTCTCGTCGGCGC
CATTGACGCATATCTCCTGGCTCCACTCCAGCTTGGCATTGACACTCTGATTGGGACAAG
GAGGTTTAAGAGGTCTGATTTCTTGGTGGCAGAGAAGCTTGGAGAAGGCTCATTCGGAGT
GGTGTATTCAGGGGTCCTTCTCCCAAAGAATTCTTCAAGTGAGCAGCGGATTATGAACAA
GGCTACACTTAAATCTTCTTTGGGGGATTTTAAGGAGAGGGTTATTCTCAAGAAGGTTAA
GCTTGGGGTTCGAGGTGCTCACGACTTGGGCGAGTACGAAGAGTGGTTCAACTACAGACT
CTCTAGGGCTGCTCCTGACACCTGCGCTGAGTTTCTCGGTAGCTTTGTCGCCGACAAGAC
CAATACTGTCTTTACAAAAGCGGCAAATGGCTCGTCTGGAGGTTCGAGGGAGACCGTGAT
CTGG

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 2

CO CL6654Contig1 854 2 10 U
GGGAAATCAATGGTGCTTCTAAAGAACGGGAAGACAGACAACGATAAAATTATTCCGCTC
CCGAAGAAGGTGAAAAAGATAGTTGTTGCGGGCGCACACGCTAACAACATGGGTTGGCAA
TGTGGTGGCTTCACTCTCACTTGGCAAGGATTCAACGGAACCGGAGAAAACATCGGTCGT
AACAAAGCCTTGCATCTCCCTACCGGTAAAACCAGAGGAACAACAATCTTGGAAGGAATC
ATGAAAACAGTAGACGCCACCACTGAAGTTGTCTACGTGGAGGAACCAAACAAAGATACA
GCTAAGCTTCATGCCGACGCAGCATACACAATTGTGGTTGTAGGTGAAGCTCCATATGCT
GAGTCACAAGGGGACAGCACCACACTAAACATGGCTGCACCAGGTCCAGACACGATCAGC
CACACGTGTGCTAGTGGTATGAAGTGTGCAGTGGTTCTAGTCACAGGACGTCCTCTCATG
ATCGAAGCGTACATTGACCACATCGACGCTGTTGCGGTAGCTTGGCTTCCAGGAACCGAA
GGACAAGGAGTCGCTGATGTTTTGTTTGGTGATCATCCATTCACCGGCACTTTGCCTCGC
ACGTGGATGAAGAGTGTGGCTCAACTTCCAATGAACGTTGGCGACTCGGCCTACGACCCT
CTCTTCCCCTTCGGATTCGGAATTACAAATTAAATGAAGAATCAAATCATCTATCATGTA
TGTTAAATATGTGAAAAAATGTTAAATGTAACGCTTCTTCAATGAATATTGGATCACTTT
ATACTCTGCCATATACGTACGATGCAACTTGTTCAAAGATCAAAACAAACTTGTTCATGA
CTTGATGATTGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DQ64TF U 1
AF RS1DM31JQ C 86
BS 1 448 RS1DQ64TF
BS 449 449 RS1DM31JQ
BS 450 681 RS1DQ64TF
BS 682 682 RS1DM31JQ
BS 683 738 RS1DQ64TF
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BS 763 782 RS1DQ64TF
BS 783 854 RS1DM31JQ

RD RS1DQ64TF 782 0 0
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TGTGGTGGCTTCACTCTCACTTGGCAAGGATTCAACGGAACCGGAGAAAACATCGGTCGT
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ATGAAAACAGTAGACGCCACCACTGAAGTTGTCTACGTGGAGGAACCAAACAAAGATACA
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ATCGAAGCGTACATTGACCACATCGACGCTGTTGCGGTAGCTTGGCTTCCAGGAACCGAA
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ACGTGGATGAAGAGTGTGGCTCAACTTCCAATGAACGTTGGCGACTCGGCCTACGACCCT
CTCTTCCCCTTCGGATTCGGA*TTACAAATTAAATGAAGAATCAAATCATCTATCATGTA
TGTTAAATATGTGAAAAA*TGTTAAATGTAACGCTTCTTCA*TGAATATTGGATCACTTT
AT

QA 1 782 1 782
DS 

RD RS1DM31JQ 769 0 0
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GTAAAACCAGAGGAACAACAATCTTGGAAGGAATCATGAAAACAGTAGATGCCACCACTG
AAGTTGTCTACGTGGAGGAACCAAACAAAGATACAGCTAAGCTTCATGCCGACGCAGCAT
ACACAATTGTGGTTGTAGGTGAAGCTCCATATGCTGAGTCACAAGGGGACAGCACCACAC
TAAACATGGCTGCACCAGGTCCAGACACGATCAGCCACACGTGTGCTAGTGGTATGAAGT
GTGCAGTGGTTCTAGTCACAGGACGTCCTCTCATGATCGAAGCGTACATTGACCACATCG
ACGCTGTTGCGGTAGCTTGGCTTCCAGGAACCGAAGGACAAGGAGTCGCTGATGTTTTGT
TTGGTGATCATCCATTCACCGGCACTTTGCCTCGCACGTGGATGAAGAGTGTGGCTCAAC
TTCCAATGAACGTTGGCGACTCGGCCTACGACCCTCTCTTCCCCTTCGGATTCGGAATTA
CAAATTAAATGAAGAATCAAATCATCTATCATGTATGTTAAATATGTGAAAAAATGTTAA
ATGTAACGCTTCTTCAATGAATATTGGATCACTTTATACTCTGCCATATACGTACGATGC
AACTTGTTCAAAGATCAAAACAAACTTGTTCATGACTTGATGATTGAGC

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1BE32TF U 1
AF RS1FT71TF U 40
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RD RS1BE32TF 733 0 0
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TCCATTCAACTACCCTGTCAATCTCGCTGTATCAAAGATCGCTCCTGCTTTGATAGCTGG
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TTGCTTTCACTTAGCTGGTTTCCCAAAAGGTCTCATTAGCTGCATCACTGGAAAAGGCTC
TGAGATTGGCGATTTCCTCACCATGCACCCTTCTGTTAACTGCATTAGTTTCACTGGCGG
TGATACCGGAATCTCAATCTCCAAGAAAGCTGGCATGATCCCTCTCCAGATGGAACTTGG
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TAAAAGAGAAGTAACTTGATTTGGCCGTTGCTTTTGGACA*TGTCAGAC*GGACATGAG*
ATTGCTTGGGAGG

QA 1 733 1 733
DS 

RD RS1FT71TF 772 0 0
G
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GCTCCTGCTTTGATAGCTGGAAACTCCCTTGTCCTGAAACCTCCAACTCAAGGAGCTGTT
TCTTGCCTTCATATGGTGCATTGCTTTCACTTAGCTGGTTTCCCAAAAGGTCTCATTAGC
TGCATCACTGGAAAAGGCTCTGAGATTGGCGATTTCCTCACCATGCACCCTTCTGTTAAC
TGCATTAGTTTCACTGGCGGTGATACCGGAATCTCAATCTCCAAGAAAGCTGGCATGATC
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GCAACGTTCTGTCAAGAGTATAAAAGAGAAGTAACTTGATTTGGCCGTTGCTTTTGGACA
ATGTCAGACCGGACATGAGGATTGCTTGGGAGGAACCTTTCGGTCCTGTCTTGCCTGTCT
TGAGATCAGTTCGGTTGAGAAGCATTAATCATTGCAATGCTAGTAACTTTG

QA 2 772 2 772
DS 



AS 1 2

CO CL6656Contig1 769 2 2 U
GACGAGAATGAAGAAAACATCAAGATTGTGGAAATGGACACTCAGTCTAGATTTTACTCT
CCAGCTCCTTCGGCTATAACAGACATGAGTCCTCGAGCGTACAGTAGCCATTTCGAGGAT
TGTAACTCGTTCAACACAGCACAAAGCAGTCCTCAGTGTTCCAGATTCAAAGAGTATTAC
AATGGAGATTCTTTGTCTTCTTACGATTACCCTCTCTTCCCAAACTACATGGCCAATACT
CAGTCTTCTAAAGCCAAGGCTCGTTCTCAGAGTGCGCCTAAGCAGAGACCTCCTGAGATC
TATGAGAAGCAGCCAAGCGGGAGGAGAAGATCTTCCATGGAAGCACCGAGGAACGGTGTC
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AGTCATCACCATCATCATCCGTGGATGGCAATTAAGCTCGATAGATCTAACATTTCTCTT
ATGGAGAGTGAATGTGGATCTACCAGTACAATTATGACCAATAGCAACTACGGTAGACAT
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TTTGGTTGTGTTATTGAAGGTTCAGGGGAACCATGTACTATAAAGTGTGATTACAAACTA
GTAAGTGATTTGATTGCTGGAAGAAAATAGACAAGCTTAGTAACTGAAG


BQ
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AF RS1BD31TF U 1
AF RS1BD31JQ C 1
BS 1 678 RS1BD31TF
BS 679 769 RS1BD31JQ

RD RS1BD31TF 678 0 0
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CAGTCTTCTAAAGCCAAGGCTCGTTCTCAGAGTGCGCCTAAGCAGAGACCTCCTGAGATC
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AGTCATCACCATCATCATCCGTGGATGGCAATTAAGCTCGATAGATCTAACATTTCTCTT
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GTTGATGTGGGTTTGTGAAAAATTACTTGTTTCCCAAGAAATAATTACCTGAGGTAAATC
TTCATGTTTATTGCTCTCTTGTTCCTGGCTAGGTGTTGTTTTGTTTATTTCTTTCTTGTT
TTTGGTTGTGTTATTGAA

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1BD31JQ 769 0 0
GACGAGAATGAAGAAAACATCAAGATTGTGGAAATGGACACTCAGTCTAGATTTTACTCT
CCAGCTCCTTCGGCTATAACAGACATGAGTCCTCGAGCGTACAGTAGCCATTTCGAGGAT
TGTAACTCGTTCAACACAGCACAAAGCAGTCCTCAGTGTTCCAGATTCAAAGAGTATTAC
AATGGAGATTCTTTGTCTTCTTACGATTACCCTCTCTTCCCAAACTACATGGCCAATACT
CAGTCTTCTAAAGCCAAGGCTCGTTCTCAGAGTGCGCCTAAGCAGAGACCTCCTGAGATT
TATGAGAAGCAGCCAAGCGGGAGGAGAAGATCTTCCATGGAAGCACCGAGGAACGGTGTC
CCCAGAGCTGTAAGGATGCAGAGATCTTCATCTCAGTTAGGCAAGGAAAGTCAAAGTCAA
AGTCATCACCATCATCATCCGTGGATGGCAATTAAGCTCGATAGATCTAACATTTCTCTT
ATGGAGAGTGAATGTGGATCTACCAGTACAATTATGACCAATAGCAACTACGGTAGACAT
GTTGATGTGGGTTTGTGAAAAATTACTTGTTTCCCAAGAAATAATTACCTGAGGTAAATC
TTCATGTTTATTGCTCTCTTGTTCCTGGCTAGGTGTTGTTTTGTTTATTTCTTTCTTGTT
TTTGGTTGTGTTATTGAAGGTTCAGGGGAACCATGTACTATAAAGTGTGATTACAAACTA
GTAAGTGATTTGATTGCTGGAAGAAAATAGACAAGCTTAGTAACTGAAG

QA 1 769 1 769
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6658Contig1 1042 2 2 U
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TGAGTAGTGGAAGAGTAGAGAAGAGGTCTGATTTATCTATGGAGGGGTTTCTGCGTGATT
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CCAAGTGGAACCACTTGGACTATCTCAACGCTGTCGCTGGTAACCGTACCGTTCCCGTCG
AGGTGGGGAAAAACGATTTGTGTTCTGATTGGAAGCAAGAGCTTGTGACTTTCTCCAAGT
TCCTTGAACGGATGAGGACCAATAGATCCACGTCGTCCGTGGAGCCTACTTATCTTGCTC
AGCATCCCTTGTTTGACCAGATAAATGAACTGAGAGATGATATATGTATTCCTGATTACT
GTTTTGTCGGTGGAGGGGAACTCCAATCTCTTAACGCTTGGTTTGGCCCGGCTGGGACAG
TCACCCCATTACACCATGATCCACATCATAATATACTTGCTCAGGTTGTTGGTAAGAAGT
ATATAAGGCTTTACCCATCCTCATTGCAAGACGAACTTTACCCTTATTCTGAGACAATGC
TTTGCAACTCTAGCCAGGTTGATCTTGACAACATTGACAAGAACGAGTTCCCAAAGGCGG
TGGAGCTGGAGTTTATGGATTGTATCCTAGAGGAAGGCGAGATGCTGTACATCCCTCCCA
AATGGTGGCACTATGTCAGGTCTTTAACAATGAGTTTCTCGGTTAGCTTCTGGTGGAGCA
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CACTCTCTTTTACACCAATTATGTTAGACCCTAAAAGTAAGTAGAGAAGAAAACAATTGC
TCTGAGACTGAGCATGAAGATCGTTTGTTTTGTCTAAGCCTATGTTGTAAAAGACAATCG
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AATCAAGAAAAGGTTTTATGAG


BQ
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AF RS1EP19TF U 1
AF RS1EP19JQ C 377
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BS 649 1042 RS1EP19JQ

RD RS1EP19TF 648 0 0
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TGAGTAGTGGAAGAGTAGAGAAGAGGTCTGATTTATCTATGGAGGGGTTTCTGCGTGATT
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AGCATCCCTTGTTTGACCAGATAAATGAACTGAGAGATGATATATGTATTCCTGATTACT
GTTTTGTCGGTGGAGGGGAACTCCAATCTCTTAACGCTTGGTTTGGCCCGGCTGGGACAG
TCACCCCATTACACCATGATCCACATCATAATATACTTGCTCAGGTTGTTGGTAAGAAGT
ATATAAGGCTTTACCCATCCTCATTGCAAGACGAACTTTACCCTTATTCTGAGACAATGC
TTTGCAACTCTAGCCAGGTTGATCTTGACAACATTGACAAGAACGAGT

QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1EP19JQ 666 0 0
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GGAACTCCAATCTCTTAACGCTTGGTTTGGCCCGGCTGGGACAGTCACCCCATTACACCA
TGATCCACATCATAATATACTTGCTCAGGTTGTTGGTAAGAAGTATATAAGGCTTTACCC
ATCCTCATTGCAAGACGAACTTTACCCTTATTCTGAGACAATGCTTTGCAACTCTAGCCA
GGTTGATCTTGACAACATTGACAAGAACGAGTTCCCAAAGGCGGTGGAGCTGGAGTTTAT
GGATTGTATCCTAGAGGAAGGCGAGATGCTGTACATCCCTCCCAAATGGTGGCACTATGT
CAGGTCTTTAACAATGAGTTTCTCGGTTAGCTTCTGGTGGAGCAACGAAACAGAGTCCTC
TGATTCTTAGCAAATGGAGTATTTTTAATCTCTGTTTCTTTGTTCACTCTCTTTTACACC
AATTATGTTAGACCCTAAAAGTAAGTAGAGAAGAAAACAATTGCTCTGAGACTGAGCATG
AAGATCGTTTGTTTTGTCTAAGCCTATGTTGTAAAAGACAATCGGGAGCTTTTAAGTCTT
ATCACAGACATTTTTGTGTGTATCCTCCTGGTTTTTGTTGCATTAATCAAGAAAAGGTTT
TATGAG

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

CO CL6659Contig1 869 2 2 U
GGACCATCGAACTTATTAGAGCATTTATCTGTGTCTTCATGTACGATCCTCTGCTCCCCC
CCCCACAATAATTATTGCAATAGTGGATCTTCTGAGATATTGAGTCTACCTCCGCCAAGA
TTCTCTTTTTTGGCCCCAGATCCAGAACTCAAGCGGCCTACTGGCTCATGGCCTCGCTTC
TCACGGCGGCGACCAAGATAATTTAGTAGTTAGGATTGTTGATCTGGAATTTCTTCTTCG
CGGTGGTGATCTAGAGAAAGAGAGGATTAGGTTTTTGATTTGGTTTTTAAATATTGATTT
TGATTTTTAGGTTTGTATTTCCTCTCTCTCTTTATTGAATCAGAGGTTAGAGATGTTGTT
GGGTTTTTGGAATATCTCAAAGACAAAGATAAATCTAGGGTGCGTAAAGATGAATCAGAG
GTTAAAGATGTTGTTGGGTTTTTGATTTTTAGGTTTGTTGGTTTTGACAAAATCTCTCAA
AGATGTTGTTGGATGTGTATGTATACAGTATAACACGAATTGACTCTTGTGGTTATGCTT
GGTGGTTTCTTCACTTCAGAATCATGGCCTTACAAATCTCTCATTTACAGATTGTATCTT
AATAAAGATCTTCATTTTCATTTTTGTGTAACTGATGTGCATGTGATGCTATGGAAATCA
ACTCGGAAACTAGGTGGTCTTGCTCCCGCTGTAAATTTACTTGTTTGGACACTCCAAACC
ACCGTGTCCATGTTGATACCTTTTATCTCTTGTGCTTTTTAATGTTTTTGTTCTGCTTTT
CTTTTTTTTTCTGAAAGCTTTAAGATGTTATGCGTATATGAATGCTTTGTACATGTACAT
TATTATATTTGCAGGTTTTAAAAAAAATT


BQ
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AF RS1DV05TF U 1
AF RS1DV05JQ C 190
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BS 670 869 RS1DV05JQ

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GGTGGTTTCTTCACTTCAGAATCATGGCCTTACAAATCTCTCATTTACAGATTGTATCTT
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ACTCGGAAA

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TGGATGTGTATGTATACAGTATAACACGAATTGACTCTTGTGGTTATGCTTGGTGGTTTC
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TCTGAAAGCTTTAAGATGTTATGCGTATATGAATGCTTTGTACATGTACATTATTATATT
TGCAGGTTTTAAAAAAAATT

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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1GG50TF C 1
AF RS1GG50JQ U 14
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BS 14 611 RS1GG50JQ
BS 612 625 RS1GG50TF

RD RS1GG50TF 625 0 0
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TCTGAGTCTTTTGTTGTGCCTAGCTTTCAAATCCATCTCCACTCTCAACGCTTTCTCCGA
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DS 

RD RS1GG50JQ 598 0 0
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GAGACCAGTTTAGGGCTCTTCCCTGCTGCTGCTGCCTCTACCCTGTGGTTGTCATCATCA
AACATTGCAAGATCATCGCAATCAAAACCACTGTCCAAAACCCGGTTTCTGAGTCTTTTG
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TTCTCACCCAGAGTGCAGATTGGGCATGAAGGGTCGAATTTATCGATTTCTGGCGTCATC
TGCTCTAAACACTCACCGTGATAGACATGCCCACAAGCTAAAATTGCAGACACAGAGAGC
TCGTTGGTCATAAAGATCTTCTGGCTGCTCCACAAGGATTTCTCTGACAAGGGTCAGA

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 2

CO CL6661Contig1 868 2 8 U
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CGGGTGGGGTCGTTTATCCATGTTGCCTCTTAATGAGCTCCACGCCAAAGATTCCGGATT
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CC09TF U 1
AF RS1CC09JQ C 108
BS 1 734 RS1CC09TF
BS 735 735 RS1CC09JQ
BS 736 754 RS1CC09TF
BS 755 755 RS1CC09JQ
BS 756 784 RS1CC09TF
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BS 786 799 RS1CC09TF
BS 800 868 RS1CC09JQ

RD RS1CC09TF 802 0 0
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TCTCATCACGATCGTCTCTAACTCATAAGAATTACAACAGTGGTTTGAGCAGAAGAGTCC
CGGGTGGGGTCGTTTATCCATGTTGCCTCTTAATGAGCTCCACGCCAAAGATTCCGGATT
TCTTGTAAATGGGGATCTCAAAATTTTGGTTGAGATAGATGTTCTTGAAGTTATTGGCAA
ATTAGATGTGTCAGAGGAAACTTCAACAATAATAGAAACAATAGATGTTAATGGGTTTCA
GATTCTTCCTTCACATGTACGCAGAATCTGTGAGCCGTATGTTTGAAAGACACTCGGAGC
TTGCATCTGAGTTCCGTCCAAAGAACCCAAATCTAAGGACCGCTTACATAAGTTTTCTAC
TCAGTCTGATTGAGACTATGTGCCAGTCACCGCAGGAGCTCTCCCAGGATGATTTGTCTG
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TTTA*TGTTCTTGAGATCT
GAG

QA 1 799 1 799
DS 

RD RS1CC09JQ 761 0 0
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AAGATTCCGGATTTCTTGTAAATGGGGATCTCAAAATTTTGGTTGAGATAGATGTTCTTG
AAGTTATTGGCAAATTAGATGTGTCAGAGGAAACTTCAACAATAATAGAAACAATAGATG
TTAATGGGTTTCAGATTCTTCCTTCACATGTACGCAGAATCTGTGAGCCGTATGTTTGAA
AGACACTCGGAGCTTGCATTTGAGTTCCGTCCAAAGAACCCAAATCTAAGGACCGCTTAC
ATAAGTTTTCTACTCAGTCTGATTGAGACTATGTGCCAGTCACCGCAGGAGCTCTCCCAG
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GATTGGTTGGAGAAGAAGCTTGATGAGGTGTCAGAGAAAAAGAAGAATGAGAAATCTTCT
GAGGCTGGGCTACAAGAAATGGAGGAAGATTTGAGGGACTTGAAGCGGAAGTGTTCAGAC
ATGGAAGATCTAGTTCAGAAAGAGAAGGTGAAGATGTCGGCTGCAAAAGCTCCTCTCTCA
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TGTTCCTGAGAGAACTCTTAATAGAGACTCATCATCACTCG

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL6662Contig1 770 2 1 U
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GTTTGTGGTGGATGTCCCTTCTTTGAAGTACCTTGAAATCGTAGATTCTGTAGTTTACGA
CTTCCGTCAGATGGAGAATATGCCTGCGTTGGAGGAGGCATGCGTTTGGATTACTAGTGG
AGTGACCCAAAAGTTTCTAAAGCCTCTTACTTCTGTCCACCGCCTCTCTCTATGGTTATC
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CAAGATTCCCCTAAACTGCGATCTCTCGAACTCACCAATGTATGTTCTCTCTAGAATCTG
CCTGCTTTTATCCGTTTTAGTTTTCGGATATTGTGTATTGATATTGACTGATAATAATTG
TATCTTTGGTCTTAGAGAAAATAAGAAGTGAATCAAAGAGACCCCAATTGGTTGGAGGCG
TCAAGTCTGTCCTGAGTGTTGTTGTCTAGTCTAGAGCTTTTGTGTGATGG


BQ
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AF RS1D049TF U 1
AF RS1B568TF U 1
BS 1 770 RS1B568TF

RD RS1D049TF 673 0 0
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TCCGTCTCTGCTCACAGAGGTGTCTCTGCATTGCTGACGATCTGTTCTTACACGTAGTTG
GTTTGTGGTGGATGTCCCTTCTTTGAAGTACCTTGAAATCGTAGATTCTGTAGTTTACGA
CTTCCGTCAGATGGAGAATATGCCTGCGTTGGAGGAGGCATGCGTTTGGATTACTAGTGG
AGTGACCCAAAAGTTTCTAAAGCCTCTTACTTCTGTCCACCGCCTCTCTCTATGGTTATC
ACTTTCAGAGGTAATAACTAATCAGTTGAATCTTGTAAATTCATATTATTGTTATTCTCT
CTTGTATATGAAAAAAAAATACAGGTTATGCATCCTTCTGGTATGATCTTCAATCAGCTT
GTTCATCTTGACTTGTACACTTTAGCTGAAGGCTAGTGGGATCTTCTTACATGTATGCTC
CAAGATTCCCCTAAACTGCGATCTCTCGAACTCACCAATGTATGTTCTCTCTAGAATCTG
CCTGCTTTTATCCGTTTTAGTTTTCGGATATTGTGTATTGATATTGACTGATAATAATTG
TATCTTTGGTCTT

QA 1 673 1 673
DS 

RD RS1B568TF 770 0 0
GGGGTTCGGTCGGGTGTTATTGGGCCTTTGGTTAGGGTTTTTGAGAACGGGAGCCCTGTT
GGTAGAGAAGCGTCTGCAAAGTGTTTAATGAAATTAACAGAGAACTTGGAGAATGTTTGG
TCCGTCTCTGCTCACAGAGGTGTCTCTGCATTGCTGACGATCTGTTCTTACACGTAGTTG
GTTTGTGGTGGATGTCCCTTCTTTGAAGTACCTTGAAATCGTAGATTCTGTAGTTTACGA
CTTCCGTCAGATGGAGAATATGCCTGCGTTGGAGGAGGCATGCGTTTGGATTACTAGTGG
AGTGACCCAAAAGTTTCTAAAGCCTCTTACTTCTGTCCACCGCCTCTCTCTATGGTTATC
ACTTTCAGAGGTAATAACTAATCAGTTGAATCTTGTAAATTCATATTATTGTTATTCTCT
CTTGTATATGAAAAAAAAATACAGGTTATGCATCCTTCTGGTATGATCTTCAATCAGCTT
GTTCATCTTGACTTGTACACTTTAGCTGAAGGCTAGTGGGATCTTCTTACATGTATGCTC
CAAGATTCCCCTAAACTGCGATCTCTCGAACTCACCAATGTATGTTCTCTCTAGAATCTG
CCTGCTTTTATCCGTTTTAGTTTTCGGATATTGTGTATTGATATTGACTGATAATAATTG
TATCTTTGGTCTTAGAGAAAATAAGAAGTGAATCAAAGAGACCCCAATTGGTTGGAGGCG
TCAAGTCTGTCCTGAGTGTTGTTGTCTAGTCTAGAGCTTTTGTGTGATGG

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 2

CO CL6663Contig1 794 2 6 U
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CATGGTCACCGCCTTCGAAACAATCACCACCACCTCCGACGGAGATGCGCTGGAGTGGTA
TAAGATTCTAAAGGTAGAACCTTTCTCTCACATCGATAGGATAAAGCAAAAGTATAGGGA
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GCTTGTGAATGAGGCTTTTGAGGTTTTGTCTGATGAGGTTAGGAGGAGTGAGTATGATGC
GAAGTTGAGGATTAGGATTCAGGGCGAGATTGGTGCTTGTGATGGTGAAACGTTGACGTT
TTCGACGGTTTGCTCTGGTTGTGGGTTGGTGCATAAGTATTTGGGGGAGAGTTTGATGTG
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TTCTTCCAAGATTATAACTTATACTAGGAGGAAGAAGCGTGTTGGTGAGGGTGGTGAAAG
TGTGAGAAGAGTGAGTGAGATGAGAGAGGAAGAAGCAGAGGCTTTAATTGTACCTGTGAC
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GAGAAAGAAATCGAAGGTGAGGATCACTGAGAAAAGTAGCACTAGAGAAGAACAGATATA
TCTTCAGGTGATGAAACGTTGATGGAGATGAGCACTAACAAGGAGAAAGAAGCTTTGAAG
AATAAGAGTAATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CI19TF U 1
AF RS1CI19JQ C 78
BS 1 727 RS1CI19TF
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BS 737 758 RS1CI19TF
BS 759 794 RS1CI19JQ

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CATGGTCACCGCCTTCGAAACAATCACCACCACCTCCGACGGAGATGCGCTGGAGTGGTA
TAAGATTCTAAAGGTAGAACCTTTCTCTCACATCGATAGGATAAAGCAAAAGTATAGGGA
GCTAGCTTCGGTGTTGGATCCTGATAAGAATCCTTATGTGGGGTGTGAGGAAGGGTTCAA
GCTTGTGAATGAGGCTTTTGAGGTTTTGTCTGATGAGGTTAGGAGGAGTGAGTATGATGC
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TTCGACGGTTTGCTCTGGTTGTGGGTTGGTGCATAAGTATTTGGGGGAGAGTTTGATGTG
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TTCTTCCAAGATTATAACTTATACTAGGAGGAAGAAGCGTGTTGGTGAGGGTGGTGAAAG
TGTGAGAAGAGTGAGTGAGATGAGAGAGGAAGAAGCAGAGGCTTTAATTGTACCTGTGAC
TAGTTTGGATGAAGAAGATGAAGGGATGATGACTTTAGCAGAGATGCAATCAGTTTTGAA
GAGAAAGAAATCGAAGGTGAGGATCACTGAGAAAAGTAGCACTAGAGAAGAACAGATATA
TCTTCAG*TGATGAA*CGTTGATGGAGATGAGCACTAA

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1CI19JQ 717 0 0
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AACCTTTCTCTCACATCGATAGGATAAAGCAAAAGTATAGGGAGCTAGCTTCGGTGTTGG
ATCCTGATAAGAATCCTTATGTGGGGTGTGAGGAAGGGTTCAAGCTTGTGAATGAGGCTT
TTGAGGTTTTGTCTGATGAGGTTAGGAGGAGTGAGTATGATGCGAAGTTGAGGATTAGGA
TTCAGGGCGAGATTGGTGCTTGTGATGGTGAAACGTTGACGTTTTCGACGGTTTGCTCTG
GTTGTGGGTTGGTGCATAAGTATTTGGGGGAGAGTTTGATGTGTAGTAGTTGCAAGAAGA
GTATTGAGGCAAAGGAAGAAGAGGGTAGTGAGAGTAGAGCTTGTTCTTCCAAGATTATAA
CTTATACTAGGAGGAAGAAGCGTGTTGGTGAGGGTGGTGAAAGTGTGAGAAGAGTGAGTG
AGATGAGAGAGGAAGAAGCAGAGGCTTTAATTGTACCTGTGACTAGTTTGGATGAAGAAG
ATGAAGGGATGATGACTTTAGCAGAGATGCAATCAGTTTTGAAGAGAAAGAAATCGAAGG
TGAGGATCACTGAGAAAAGTAGCACTAGAGAAGAACAGATATATCTTCAGGTGATGAAAC
GTTGATGGAGATGAGCACTAACAAGGAGAAAGAAGCTTTGAAGAATAAGAGTAATAC

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 2

CO CL6664Contig1 1022 2 2 U
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CCTTTTCTTCTTCTTCTCTTCTATGCTCAAAGATGGGTCGTGGATAAATTGAGATAAAGA
GGATCGAGAATGCGAACAGCAGGCAAGTTACCTTCTCCAAGAGGCGTGCTGGTTTGCTCA
ATAAAGCTCATGAGCTCTCTGTTCTTTGTGACGCCGAGGTTGCCGTTATCGTCTTCTCCA
AGTCTGGCAAGCTCTTCGAGTTCTCAAGTAGTAGCATGAAGAAAACGCTTTTGAGATACG
GCAATTACCAGATCCCTTCAGATGTTGCTGGTATTAACTGTAAAACAGAGAACCAGGAGG
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AACTGAAGGGTAAGCGCTTGAATACTCTGAGCTTGAAACAGCTGCAACACCTTGAGCAGC
AACTAAATGTCTCATTAATATCTGTGAGAGAGCGAAAGGAACTATTGTTGACTAAACAAC
TTGAAGAATCACGGTTGAAGCAACAGCGAGCAGAGCTGGAAAACGAGACCTTACGTAGAC
AGGTTCAAGAACTCAGGAGTTTTCTCCCTTCGATCAACCAACAACACTATGCTCCATTTT
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CGGGGGAAGCACATTATACAAGGAAGAACGAAGGAGACAGAGAGAGCCCATCAAGTGATT
CAGTGACAACGAGCACAACTAGAGCAAGTGCTCAAAGGATTAGTCTAGTTTAGAAATTAA
TATTCCATCTGAAAAAACAAAAGCCAAAATGTTCTCTGTTTAACCTCGCTCTTTGTACTT
TTATCTTTTGATTAACTAGTTTGTGGAGTTTTAATATTCCATAATCTGTACAATTAACTC
TA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RS1CZ52TF U 1
AF RS1CZ52JQ C 509
BS 1 612 RS1CZ52TF
BS 613 1022 RS1CZ52JQ

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CCTTTTCTTCTTCTTCTCTTCTATGCTCAAAGATGGGTCGTGGATAAATTGAGATAAAGA
GGATCGAGAATGCGAACAGCAGGCAAGTTACCTTCTCCAAGAGGCGTGCTGGTTTGCTCA
ATAAAGCTCATGAGCTCTCTGTTCTTTGTGACGCCGAGGTTGCCGTTATCGTCTTCTCCA
AGTCTGGCAAGCTCTTCGAGTTCTCAAGTAGTAGCATGAAGAAAACGCTTTTGAGATACG
GCAATTACCAGATCCCTTCAGATGTTGCTGGTATTAACTGTAAAACAGAGAACCAGGAGG
AGAGTACAGAGGTGGATCTTTTAAAGGATGAGATCTCAAAGCTTCAAGAGAAACACTTAC
AACTGAAGGGTAAGCGCTTGAATACTCTGAGCTTGAAACAGCTGCAACACCTTGAGCAGC
AACTAAATGTCTCATTAATATCTGTGAGAGAGCGAAAGGAACTATTGTTGACTAAACAAC
TTGAAGAATCACGGTTGAAGCAACAGCGAGCAGAGCTGGAAAACGAGACCTTACGTAGAC
AGGTTCAAGAAC

QA 1 612 1 612
DS 

RD RS1CZ52JQ 514 0 0
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AGCAGAGCTGGAAAACGAGACCTTACGTAGACAGGTTCAAGAACTCAGGAGTTTTCTCCC
TTCGATCAACCAACAACACTATGCTCCATTTTACATCAGATGCTTCACTATAGATCCTAA
GAGCTCACTTTTAAACAACACTTGCTATCGCGACATTAACTGCAGCCTCCTCCAGAACAC
TAACTCAGATACAACTTTGCAACTAGGGTTGCCGGGGGAAGCACATTATACAAGGAAGAA
CGAAGGAGACAGAGAGAGCCCATCAAGTGATTCAGTGACAACGAGCACAACTAGAGCAAG
TGCTCAAAGGATTAGTCTAGTTTAGAAATTAATATTCCATCTGAAAAAACAAAAGCCAAA
ATGTTCTCTGTTTAACCTCGCTCTTTGTACTTTTATCTTTTGATTAACTAGTTTGTGGAG
TTTTAATATTCCATAATCTGTACAATTAACTCTA

QA 1 514 1 514
DS 



AS 1 2

CO CL6665Contig1 972 2 2 U
GGACATTCCAACATTCAACAATTCAGAGAAATTATACTTTCAACCCAAAACTACTAAAAA
CTTTTATTAAAAAATCTTGGCAAAAATGTGTGGAGGAGCAGTGATTTCCGATTACACAGC
GCCGCCGCGATCCTGGAGACGCGACGACGTTGTTGACCTGACACTCGACTACTTGGAGGG
AGAGTCTCAGTATTGTTATCCATGGCTAGGTATGAAAAGAGAAGATGGGAAGAGGAGGAG
GAGGAAGAAGAGTATTAGTAGTGAGTACAAAGGAATCAGGAGACGTCCATGGGGAAGATG
GGCGGCTGAGATACGTGACCCGATCAAAGGAGTTAGAGTTTGGCTAGGGACGTTCGATAC
TGCAGAGGATGCTGCAATAGCTTACGACCTTGAGGCTAAGAGACTCCGAGGAGCTAAAGC
TAAACTCAACTTCCCTAACGAATCATCCTCTAGAAAGCGTAAAGCTTCTTCTTCTGCACA
GCCACCACAACAACAACCTCAGCTTCAGAAGGTAGAAGAGGAGGAGGATCTCGGTGGCTG
TCTTGATTTCTTGTGGGAGGAAAATAATAACGAGGACACGGCTCAGGTCGATACTCAGTG
GCTTGAAGATGTTATATTGGGTGATGCGGCGGAGAAGAGACAGAAAGGTTGTTATGATGA
CTGCGGAGAGAACGTGAATGCTCTGCTTTCGGATGAGCTTCTGGCTTTCGAGAACCAGAC
GGAGTGTTTCTCCCAGATGCCGTTTATGGAGAGGAGAAACTGTGGTTCATCGACGTCTCT
GAGTAGTCTCTTAGATGAAGTCAATGTCATGGATCTTTGGTCCTGAATGGGTTTTTTTTT
TAGGAATGACATTAGTGTTTGTTGTTCTGTTTTGTACAAATGAGTTCTTGTGTTTGTTTG
TGTGTCCCTACTCTCAAACTGTTTTGTTCTTCTCTCTTGTCAATAGCAAAAGTAATATTG
TACAGTTTTGTT


BQ
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AF RS1G747TF U 1
AF RS1G747JQ C 473
BS 1 556 RS1G747TF
BS 557 972 RS1G747JQ

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CTTTTATTAAAAAATCTTGGCAAAAATGTGTGGAGGAGCAGTGATTTCCGATTACACAGC
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DS 



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BQ
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AF RS1AE57JQ U 12
AF RS1AE57TF C 1
BS 1 11 RS1AE57TF
BS 12 684 RS1AE57JQ
BS 685 772 RS1AE57TF

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CAATCTCCGGCACAGGAGGATCGTCTGGGTTCGGGTCAGTCAACAAGGAGCAAATCGACA
GCAAAACCTTGGATATGGTAAGAGCAGGACTCCACTGTTCTTTCAGGATATCAAGGCAAA
TGCTTCCATTGCTGTTGATGTTTGGGTGATAAACCCTTGTCTTAAAAGACACCTTTGGTG
GCTTGAAGGGGTAATCAGGAGGGAAGTGAATGGAAACCAAAAAGACTCCTCCGGCATAAG
GACTGTCAGGAGGTCCCATGATAGTTGCTTGCCAATGGAACATGTCCTCAGCCACAGGTC
CTGCGCTGCAGTTAGAAGGAGGATCCTTCTGCAAATCCTTGAGCTCTTTCAAAATCCTCT
TCGAAGCCATGTGCTCAACCGAGAAAAAAAGAAGCGATCAGAAAGCGAGAAGACGGATGC
GGTGCAAAAGAGAGGAAACGAATGAGATCCTCGCTCCTCTCCTACTTACCTTTTTCTTTA
TAGAGTCAGAGAGAATGTATTCGAGACGGCAAGTCGAAAGCTTCTGATTCCC

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

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ATCCTCACCATTACCATGTTCGTCATGCTCGGACAAATGCTTCACAGAGATTACTTTGAT
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BQ
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1C986TF U 1
AF RS1CZ62TF U 57
BS 1 541 RS1C986TF
BS 542 542 RS1CZ62TF
BS 543 743 RS1C986TF
BS 744 764 RS1CZ62TF

RD RS1C986TF 743 0 0
GGGGTGGCTGTGTTGTGGGTCTGTAGATAGAGAGCGTAAGGCAAAGACTTTAACACTCAC
TCATAAAGAAACAAAATATATTTTCGACACAATCATCAAAAGGGACTCAGATTCGTGAAA
TCTTGTCTCTTTTTTTCTATCTCTTTTGTCTTCTAAAACCATCCCCTAATCTCTCCTCAA
TCGAAGGAGAGTGTAAGAAGAACCACAATGGGTGTGGATTTGAGACAAGTGGTGGCTGGA
ATCCTCACCATTACCATGTTCGTCATGCTCGGACAAATGCTTCACAGAGATTACTTTGAT
GCTCAGGTTCAAGGGGATGCACATGATATTGAGTTCCATGGATCAAAAGTATCTCTGGAA
GATGGACTTGTTAGATCCAGGAAAGGGAATCATGGGCCTTGGATGGAAGATAGCCATGAT
CTTAAACCTTGTTGGTCAATATCTGAATCTGATGAAGCTGTATCTTCAAAGGGTTATGTT
ACATTCTCCTTAACCAATGGTCCTGAGTACCATGTCTCTCAGATAACTGATGCTGTGATG
GTGGCTAAGCATCTTGGAGCAACGCTTGTGCTCCCTGACATAAGAGGAAGCAAACCTGGT
GATGAAATGAACTTTGAAGACATCTATGATGCAGATAAACTCGTTAAAAGCCTTGAAAGC
GTTCTCAAAGTTGTGAAGAAGTTGCCAAGCCACGTTTCTCTAAGAGACATCGCCATTGTT
AAGGTTCCCACCAGAGTTGCGGA

QA 1 743 1 743
DS 

RD RS1CZ62TF 708 0 0
GG
ACTCATAAAGAAACAAAATATATTTTCGACACAATCATCAAAAGGGACTCAGATTCGTGA
AATCTTGTCTCTTTTTTTCTATCTCTTTTGTCTTCTAAAACCATCCCCTAATCTCTCCTC
AATCGAAGGAGAGTGTAAGAAGAACCACAATGGGTGTGGATTTGAGACAAGTGGTGGCTG
GAATCCTCACCATTACCATGTTCGTCATGCTCGGACAAATGCTTCACAGAGATTACTTTG
ATGCTCAGGTTCAAGGGGATGCACATGATATTGAGTTCCATGGATCAAAAGTATCTCTGG
AAGATGGACTTGTTAGATCCAGGGAAGGGAATCATGGGCCTTGGATGGAAGATAGCCATG
ATCTTAAACCTTGTTGGTCAATATCTGAATCTGATGAAGCTGTATCTTCAAAGGGTTATG
TTACATTCTCCTTAACCAATGGTCCTGAGTACCATGTCTCTCAGATAACTGATGCTGTGA
TGGCGGCTAAGCATCTTGGAGCAACGCTTGTGCTCCCTGACATAAGAGGAAGCAAACCTG
GTGATGAAATGAACTTTGAAGACATCTATGATGCAGATAAACTCGTTAAAAGCCTTGAAA
GCGTTCTCAAAGTTGTGAAGAAGTTGCCAAGCCACGTTTCTCTAAGAGACATCGCCATTG
TTAAG*TTCCCACCAGAGTTGCGGAGACTACATCAAGAACATATCA

QA 3 708 3 708
DS 



AS 1 2

CO CL6668Contig1 821 2 7 U
GGAAGCGAAAACAGCGCAACACAAACACAATGTCTTCTCCTCCTCTCCTCTCCTTCCTTA
TCTTCCTCTCCGTCGCCTCCGCCATCAAACTACCCCTCTCTCCTCTCTCCCACCACACAG
ACCAACTACCCAGCAACGATCCTTACCTCTCTCTCCGCCGTCTCGCCGACTCCTCCATCG
CAAGAGCCCAACAGCTCAAACAACCCAGCTCCATTAAACCCGACGAAAATGCTCTCTCCG
CCCCCTCCACATCCGCCGCCGTCGTGAAATCACCTCTTTCCGCCAAAAGCTACGGCGGAT
ACTCCGTCTCGCTCAGCTTCGGCACACCGTCTCAGACAATCCCTTTCGTGTTCGATACCG
GAAGCAGTCTTGTCTGGTTCCCTTGCACCTCACGGTATCTCTGCACCGGCTGCGATTTTT
CCGGGTTAGACCCGACCCGGATCCCAAGATTCGTCCCCAAGAACTCCACCTCGTCGCGGG
TCATCGGGTGTCAGAATCCGAAATGCCAGCTTCTGTTCGGACCCAACGTTAAATGCAGAG
GATGTGACCCGAATACCCAAAACTGCACCGTCGCTTGCCCACCGTACATTCTCCAATACG
GATTAGGATCAACGGCTGGGATTTTACTATCAGAAAAGCTCGATTTCCCGGATCTAACCG
TACCCAATTTCGTCGTCGGTTGCTCCATTATCTCGACCCGACAACCCGCTGGGTATCGCC
GGGTTCGGACGCGGACCCGAGTCTCTCCCCGTGCAGATGAAACTCAAGAGTTCTCGCATT
GCTTGGTCTCCCGCCCGTTCGACGATACCGACGTCAGCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1DM21TF U 14
AF RS1BL68TF U 1
BS 1 51 RS1BL68TF
BS 52 52 RS1DM21TF
BS 53 248 RS1BL68TF
BS 249 249 RS1DM21TF
BS 250 443 RS1BL68TF
BS 444 444 RS1DM21TF
BS 445 821 RS1BL68TF

RD RS1DM21TF 702 0 0
GG
GCAACACAAACACAATGTCTTCTCCTCCTCTCCTCTCCTTCCTTATCTTCCTCTCCGTCG
CCTCCGCCATCAAACTACCCCTCTCTCCTCTCTCCCACCACACAGACCAACTACCCAGCA
ACGATCCTTACCTCTCTCTCCGCCGTCTCGCCGACTCCTCCATCGCAAGAGCCCAACAGC
TCAAACAACCCAGCTCCATTAAACCCGACGAAAATGCTCTCTCCGCCCCCTCCACATCCG
CCGCCGTCGTGAAATCACCTCTTTCCGCCAAAAGCTACGGCGGATACTCCGTCTCGCTCA
GCTTCGGCACACCGTCTCAGACAATCCCTTTCGTGTTCGATACCGGAAGCAGTCTTGTCT
GGTTCCCTTGCACCTCACGGTATCTTTGCACCGGCTGCGATTTTTCCGGGTTAGACCCGA
CCCGGATCCCAAGATTCGTCCCCAAGAACTCCACCTCGTCGCGGGTCATCGGGTGTCAGA
ATCCGAAATGCCAGCTTCTGTTCGGACCCAACGTTAAATGCAGAGGATGTGACCCGAATA
CCCAAAACTGCACCGTCGCTTGCCCACCGTACATTCTCCAATACGGATTAGGATCAACGG
CTGGGATTTTACTATCAGAAAAGCTCGATTTCCCGGATCTAACCGTACCCAATTTCGTCG
TCG*TTGCTCCATTATCTCGACCCGACAACC
GCTGGTATC

QA 3 693 3 693
DS 

RD RS1BL68TF 821 0 0
GGAAGCGAAAACAGCGCAACACAAACACAATGTCTTCTCCTCCTCTCCTCTTCTTCCTTA
TCTTCCTCTCCGTCGCCTCCGCCATCAAACTACCCCTCTCTCCTCTCTCCCACCACACAG
ACCAACTACCCAGCAACGATCCTTACCTCTCTCTCCGCCGTCTCGCCGACTCCTCCATCG
CAAGAGCCCAACAGCTCAAACAACCCAGCTCCATTAAACCCGACGAAAATGCTCTCTCCG
CCCCCTCCGCATCCGCCGCCGTCGTGAAATCACCTCTTTCCGCCAAAAGCTACGGCGGAT
ACTCCGTCTCGCTCAGCTTCGGCACACCGTCTCAGACAATCCCTTTCGTGTTCGATACCG
GAAGCAGTCTTGTCTGGTTCCCTTGCACCTCACGGTATCTCTGCACCGGCTGCGATTTTT
CCGGGTTAGACCCGACCCGGATCTCAAGATTCGTCCCCAAGAACTCCACCTCGTCGCGGG
TCATCGGGTGTCAGAATCCGAAATGCCAGCTTCTGTTCGGACCCAACGTTAAATGCAGAG
GATGTGACCCGAATACCCAAAACTGCACCGTCGCTTGCCCACCGTACATTCTCCAATACG
GATTAGGATCAACGGCTGGGATTTTACTATCAGAAAAGCTCGATTTCCCGGATCTAACCG
TACCCAATTTCGTCGTCGGTTGCTCCATTATCTCGACCCGACAACCCGCTGGGTATCGCC
GGGTTCGGACGCGGACCCGAGTCTCTCCCCGTGCAGATGAAACTCAAGAGTTCTCGCATT
GCTTGGTCTCCCGCCCGTTCGACGATACCGACGTCAGCACC

QA 1 821 1 821
DS 



AS 1 2

CO CL6669Contig1 1135 2 4 U
GGAAGCTTCTTTGTCCTTTTAAGTTCTTGCCTTTTTTCCGATCAATCAGACCAATCTCTC
TCCTTTTTGGCATCTTCGTGTTTCTTATATTTCTCTTGGGATTCTTCAAATCAATTCCTC
GTTGCATCAGAGAGAGAGAAAGAGAGATGTATAATCAGTTAGCTATATCTTCTTCTTCTT
CTTCTTCGTACTATGAATCTTTGAAGATTTTGGAAGCTGATGTCCAACACGCAAATACTT
TGGCAGAGGCAATTCCTATGGGGAAGAACAATGTGCGGCTCCAGATGAAACTGGTTCATA
CCAACTTTGCTTCATTATTACTCTTCTTGCTTCGGTGGATGGATCTTTCTTGCTCATGTC
TGCTTCCTCGCTACTTTAACCTCTTTCATGTTCTTGTCTACAAGGTTCATTCTGATGGGC
AACCGAAGCTCACCACTCACGGGAGGAAAGCTACTGTCAGTGAGTTCTATGGTGTGATAC
TACCATCCCTTCAGCTATTACACAGCAACTTAGACGAGCTGGCAAACGCAGACCTGGGGT
TTGACCTTAAAAGACTCAGCAAGAAGATAACAAAAGAGGCTCGCAGCAGTAGATTCAGCA
GTGCCGGGTTTGACCGCGAGGAAGAATGTGGAATCTGTTTAGAAACCTGCACCAAAATGG
TTTTGCCAAATTGCTGCCACTCAATGTGCATCAAATGCTACCGCAACTGGAACTTGAAGT
CACAGTCATGCCCGTTTTGCCGGGGGAGCATGAAGAGAGTGAACTCAGGGGATTTGTGGG
TGCTTGCTGGTGGCAACGACGTGGTGGATACGAGGACGGCTTCAAGGGAAGATTTGTTCA
GATTCTACCTCTACATCAATAGCCTCCCCAAGGATTACCCTGAAGCTTTCTTCTTGGTTT
ACTACGAGTACTCAAACCTGATTTAGAATCTGGACAAACAAAGTATATGTACAGATTTTT
AGAAACGTAAAAATTGTATTGTATAGAATGTAAAAACTGTGTTCAGGCTTTGGGATGATT
TGATCCAACATGCCAAAGCTCTCAGGTTTTACATCCTTTATTTTAAATAACTGTGAAATG
CTTCCAAAAATAAGCTTGAATAAAAGCAATGAATAAAAGATCTCTTTTTCATCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EI59TF U 1
AF RS1EI59JQ C 493
BS 1 745 RS1EI59TF
BS 746 746 RS1EI59JQ
BS 747 755 RS1EI59TF
BS 756 1135 RS1EI59JQ

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TCCTTTTTGGCATCTTCGTGTTTCTTATATTTCTCTTGGGATTCTTCAAATCAATTCCTC
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CTTCTTCGTACTATGAATCTTTGAAGATTTTGGAAGCTGATGTCCAACACGCAAATACTT
TGGCAGAGGCAATTCCTATGGGGAAGAACAATGTGCGGCTCCAGATGAAACTGGTTCATA
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TGCTTCCTCGCTACTTTAACCTCTTTCATGTTCTTGTCTACAAGGTTCATTCTGATGGGC
AACCGAAGCTCACCACTCACGGGAGGAAAGCTACTGTCAGTGAGTTCTATGGTGTGATAC
TACCATCCCTTCAGCTATTACACAGCAACTTAGACGAGCTGGCAAACGCAGACCTGGGGT
TTGACCTTAAAAGACTCAGCAAGAAGATAACAAAAGAGGCTCGCAGCAGTAGATTCAGCA
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TTTTGCCAAATTGCTGCCACTCAATGTGCATCAAATGCTACCGCAACTGGAACTTGAAGT
CACAGTCATGCCCGTTTTGCCGGGG*AGCATGAAG

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DS 

RD RS1EI59JQ 643 0 0
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GCTGCCACTCAATGTGCATCAAATGCTACCGCAACTGGAACTTGAAGTCACAGTCATGCC
CGTTTTGCCGGGGGAGCATGAAGAGAGTGAACTCAGGGGATTTGTGGGTGCTTGCTGGTG
GCAACGACGTGGTGGATACGAGGACGGCTTCAAGGGAAGATTTGTTCAGATTCTACCTCT
ACATCAATAGCCTCCCCAAGGATTACCCTGAAGCTTTCTTCTTGGTTTACTACGAGTACT
CAAACCTGATTTAGAATCTGGACAAACAAAGTATATGTACAGATTTTTAGAAACGTAAAA
ATTGTATTGTATAGAATGTAAAAACTGTGTTCAGGCTTTGGGATGATTTGATCCAACATG
CCAAAGCTCTCAGGTTTTACATCCTTTATTTTAAATAACTGTGAAATGCTTCCAAAAATA
AGCTTGAATAAAAGCAATGAATAAAAGATCTCTTTTTCATCGC

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1FP64JQ C 1
AF RS1FP64TF U 1
BS 1 664 RS1FP64TF
BS 665 665 RS1FP64JQ
BS 666 689 RS1FP64TF

RD RS1FP64JQ 689 0 0
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CTTCCTTATCGCCGTCGTCTTAAGTTTTACAGATTTGGAATATGCCTCGATTTGATGATC
GTTATGGAAACACTCGCCTCTACGTTGGCCGTTTGTCATCTAGAACTCGCAGCAGGGATT
TTGAGCGTCTTTTCAGCCGTTCACGATCGCCAGTGAGAAGAGAGAGAAGCGTGGAGGATA
GATCACTCAGTCCTAAGGCAATGGAGCGATCCGTATTTCCCATAGGCAAAGACCAAAGCC
TTAGTCCAGAGCGAAGAGCCGTAGATGCAAGCCCAAAACTAGAAAAGCAAGTTGGGTCGG
ACTATGAAGCCAGCCCAAGGGAGAATGGTAATGGCAAGAACTTTGCGAGTCCTATTGCGG
GAGGTGAAGAAAGTCCTGCTCAAGACAGGAGCCCCATTGATGATGAGCCTGAGCTTAACC
GTTCTTCCCCTAAAGGCAGCGAGTCACCGTGATGGCTCGTTACCCCCAAACAGGGTAAGA
AGCTCAATGTATCATTGTGTGTCAATTGGGTGTTGTTCCTTAAACTTTTTCGTTGTGGAC
TCGTTTGTTTGTCTTGAGACAACTTTTAAACTTTGTTATGTTTCATAAACTTGTTTTTAG
CAAAACATATTTATAATATTCTCGTTTGG

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1FP64TF 689 0 0
GGGCAGACAGAAAAAAAAGATATCCGCGGTTCAGTTTCTTCTTAATTAGGGTTAACTCTC
CTTCCTTATCGCCGTCGTCTTAAGTTTTACAGATTTGGAATATGCCTCGATTTGATGATC
GTTATGGAAACACTCGCCTCTACGTTGGCCGTTTGTCATCTAGAACTCGCAGCAGGGATC
TTGAGCGTCTTTTCAGCCGTTCACGATCGCCAGTGAGAAGAGAGAGAAGCGTGGAGGATA
GATCACTCAGTCCTAAGGCAATGGAGCGATCCGTATCTCCCATAGGCAAAGACCAAAGCC
TTAGTCCAGAGCGAAGAGCCGTAGATGCAAGCCCAAAACTAGAAAAGCAAGTTGGGTCGG
ACTATGAAGCCAGCCCAAGGGAGAATGGTAATGGCAAGAACTCTGCGAGTCCTATTGCGG
GAGGTGAAGAAAGTCCTGCTCAAGACAGGAGCCCCATTGATGATGAGCCTGAGCTTAACC
GTTCTTCCCCTAAAGGCAGCGAGTCACCGTGATGGCTCGTTACCCCCAAACAGGGTAAGA
AGCTCAATGTATCATTGTGTGTCAATTGGGTGTTGTTCCTTAAACTTTTTCGTTGTGGAC
TCGTTTGTTTGTCTTGAGACAACTTTTAAACTTTGTTATGTTTCATAAACTTGTTTTTAG
CAAA*CATATTTATAATATTCTCGTTTGG

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 2

CO CL6671Contig1 1137 2 2 U
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TCATCAAGTAAAGAAGATGAAGAAGGGACTATGGTCTCCAGAGGAAGACTCAAAGCTGAT
GCAGTATATGATAAACAATGGGCAAGGATGTTGGAGTGATGTCGCCAAAAACGCAGGCCT
GCAACGATGTGGCAAAAGCTGCCGTCTTCGTTGGATCAATTATCTTCGTCCTGACCTTAA
GCGTGGTGCTTTCTCTCCTCAAGAAGAGGAACTCATTATTCGCTTTCATTCCATTCTCGG
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CTTCTGGAACTCAACAATAAAGAAAAGGCTAAAGAAGATGTCCGATGCATCCAGCCTCGT
CAACAATTCATCCTCATCACCCAACGCTAGTGATTCATCTTCTAATAATACCTCCTCTTC
ATTGGACCTTAAAGACATTATAGGAAGCTTCATGTCCTTACAAGAACAAGGATTTGTCAA
CCCCTCTTTGGCCAACATACCAACCAGCAACAATCCATTCCAAGCGCCACACGTGATCAG
CCACCCTTGTCATGACGATTATACCCCTTATGCAGATGGTTTCTATGGAGTAAACACAGG
GCTACAAGGGGGAATCTACTTTCCACCTTTGGAGTGCGAAGAAGGTGATTGGTACAAGGC
AGATATTAACAACCACGTCGTCGAGATGAACACTAATGGAGCTGGAAATGTACCTGAGGG
TATGAGAATGGAAGAATATTGGGACCTTGACCAGTTGATGAGCACTGAGGTTCCTTCATT
TCACTTCAACTTCAAACAAAACACATGATTGATTTTCACGTCATTTTTTTCTGTTGCGGA
ATTATACCAAAGAGATTCATAGCCACACGTAAATGCAAATACTGATATATATTACATTTT
CATAGATAGATATTGAAAAGTTAGAGAGTCTTTTGTATTTCGAATAATTGTCTCGTACAA
GGGCTTGACGTGCCAAGTGTAATGATTAGTCAATGTAAGCTAAATCTCTTAATGAAATAA
ACACATACATTTGTAAACATTTGAAGTATTTTGTATTGAAATTTAAGTTGAAATTGT


BQ
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AF RS1F672TF U 1
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BS 665 1137 RS1F672JQ

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BQ
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AF RS1D017TF U 1
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BS 1 673 RS1D017TF
BS 674 733 RS1D017JQ

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QA 1 673 1 673
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QA 1 733 1 733
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GTTTTTTCCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BS01TF U 1
AF RS1BS01JQ C 268
BS 1 387 RS1BS01TF
BS 388 790 RS1BS01JQ

RD RS1BS01TF 387 0 0
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GGAAAGTCATTGAAGATCTCAAGCGTCTTCTTGAAAAGGCTGTTTTTCTTGTTGAGGCTT
ATGCAGAACTCAGACACAGAAACCTACGCAAGAAGTATAGGTTTGTATAGTTTATATAAT
ACATGAAATGCTTGAAAAGTCATTGTGATTTCTTTTTTTTTGGTCAAAGTCTTTGTGATT
TCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAACACTAAGTCCTTGTGATTTCTTAAAATGTT
TTTTTTGGTTTATATAATATATGTGTTGTTGATATCTAGGTACAAGAGTAAAATCAAAGA
GTTAGAAGCTTCATTAAAATGGATGGT

QA 1 387 1 387
DS 

RD RS1BS01JQ 523 0 0
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GTTGATATCTAGGTACAAGAGTAGAATCAAAGAGTTAGAAGCTTCATTAAGATGGATGGT
AGATGTGGAAATTCAAGTCGACCAATGGCTAGATATCAAAGAACTCATGGCCAAGATGTC
TGAAATGAACACTAAACTCGACAAGATCACGTGTCAACCAACTGATGATTGTAACTGTTT
CAAGAGCAATGATAGCACATCACCAGTGATATCACAAAGTAGTAATCAAAATATACTCGA
AGCAACAGACGGATCTTCAGAGGAAAATGAAGAAGAAAGCCCAAGGAGTTCAAGAAAAGG
AGCTAAAGATCCGATTCATGGTCAAGTGATGTCTTAAGCAACAAGTAAAATGAATGGTCA
AATGTGAAATAGGATTATCTTTTTTTTTTAATGTTGTTGTGAGTAATGGAAATGGAATCA
TGTACACAAATAATGTTTAGAAATGTAGAATTCGTTTTTTCCC

QA 1 523 1 523
DS 



AS 1 2

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TCTTGGAGAAAAGAAAATCCAAAAGTAAAACATGATGTCAGTTTATGGTAGATATAAAGC
AAAACAAAGCACGATGAAGAGGAATTGTAGGAAGAAACAGAAGAACTACTGTCCGCAGCA
GGAGTGTAAGTTATATGTGTTGCCAGATGATATCGTAATGAATTGCCTGACCTTTGTCTC
AAGGCTGGACCACGGATCCCTATATCTGGTCTCGAAGCTGCACCGCTCTCTAATGCTTTC
CCCGGAGTTATACCAAGCCCGATCCCTAACTGGTCGTACCGAACCCTGCATCTATTTATG
TTTAAGCATCCCTTCAGATCCGTTTGCACGCTGGTTCGCCTTCTACCCAAAAGCCCTAGA
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GTCCAGGGTCTTTTTCCTGGATTGCCGATCTCATACATGGACCAATCTCCCCTCCATGGG
GTTTGCTCGAGCTTCTGCTGCAGCTGGCGTGGTGGACGGGAAGATATACGTTTTTGGAGG
TGCGAGATCCAAATTGGGTAGTAGAGG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
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AF RS1EL56TF U 1
AF RS1FR04TF U 4
BS 1 456 RS1EL56TF
BS 457 457 RS1FR04TF
BS 458 695 RS1EL56TF
BS 696 747 RS1FR04TF

RD RS1EL56TF 695 0 0
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TATAGTTTTGTTCCTTGTTCGGATCGAATTAGTAATTCAGAGTACCCTTTATATACATTC
TCTTGGAGAAAAGAAAATCCAAAAGTAAAACATGATGTCAGTTTATGGTAGATATAAAGC
AAAACAAAGCACGATGAAGAGGAATTGTAGGAAGAAACAGAAGAACTACTGTCCGCAGCA
GGAGTGTAAGTTATATGTGTTGCCAGATGATATCGTAATGAATTGCCTGACCTTTGTCTC
AAGGCTGGACCACGGATCCCTATATCTGGTCTCGAAGCTGCACCGCTCTCTAATGCTTTC
CCCGGAGTTATACCAAGCCCGATCCCTAACTGGTCGTACCGAACCCTGCATCTATTTATG
TTTAAGCATCCCTTCAGATCCGTTTGCACGCTGGTTTGCCTTCTACCCAAAAGCCCTAGA
TCATCCTAGTCGGCTGCTTCCGATCCGGCCACACTTGTATCAGCCTCCGGAAGCATCTTC
CGTGGTGGCACATGGTTGGGGTATCTATGTGATTGGTGGGATGATTGGCAGGAAGCGATC
GTCCAGGGTCTTTTTCCTGGATTGCCGATCTCATACATGGACCAATCTCCCCTCCATGGG
GTTTGCTCGAGCTTCTGCTGCAGCTGGCGTGGTGG

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1FR04TF 744 0 0
GG
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GAGAAAAGAAAATCCAAAAGTAAAACATGATGTCAGTTTATGGTAGATATAAAGCAAAAC
AAAGCACGATGAAGAGGAATTGTAGGAAGAAACAGAAGAACTACTGTCCGCAGCAGGAGT
GTAAGTTATATGTGTTGCCAGATGATATCGTAATGAATTGCCTGACCTTTGTCTCAAGGC
TGGACCACGGATCCCTATATCTGGTCTCGAAGCTGCACCGCTCTCTAATGCTTTCCCCGG
AGTTATACCAAGCCCGATCCCTAACTGGTCGTACCGAACGCTGCATCTATTTGTGTTTAA
GCATCCCTTCAGATCCGTTTGCACGCTGGTTCGCCTTCTACCCAAAAGCCCTAGATCATC
CTAGTCGGCTGCTTCCGATCCGGCCACACTTGTATCAGCCTCCGGAAGCATCTTCCGTGG
TGGCACATGGTTGGGGTATCTATGTGATTGGTGGGATGATTGGCAGGAAGCGATCGTCCA
GGGTCTTTTTCCTGGATTGCCGATCTCATACATGGACCAATCTCCCCTCCATGGGGTTTG
CTCGAGCTTCTGCTGCAGCTGGCGTGGTGGACGGGAAGATATACGTTTTTGGAGGTGCGA
GATCCAAATTGGGTAGTAGAGG

QA 3 744 3 744
DS 



AS 1 2

CO CL6675Contig1 866 2 7 U
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CACACAAACACACACACTAAATCCAGCTATTACACTCGACACATCCCACATCTCATGCAT
TCCTCTGCTTTTATTATCCAACTACTAATTTTAAAAAACAAGAAAAACGAGTATTCTGAT
TGACGTTGGAGATCAAATCACACGTTTTAGTCACTGAGAAATTAACATAATGGTTATGAA
AAGTACTATTCCGCTAACGCAAGTCTTATGTTCTTCACAACATCTTCAATAGGTCGAGAA
AATTTGTTGTCCATCTTAGAGAGAATGGTGATAACGAGAGTTGAACTTCCAAAGGGTAAA
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CACCCCCTGTTCTTCTCACAATGAATCCTGATCAGCAAATCTCTGTCTGAAACTCGTGCT
TCGATCATAGGCATTGTCTGCTTCAAGATCGAAACTTCGTCTAAAGAAGAAGCTGGAGGA
GAAGCGGCAGAGCAAGTAGAAGAGTAAGATGAAGAATCATCGTCCACATACACTTGAGAT
CTCTTCACCAATATAACTGACTGATCCATTTTCATGGCTCCTCCTCGCTCTTCCTCCAAC
TTCTTTACACGTTCTTGAAGTTTCTTCAAATGTTTGATCGCGTCTTCAAGAACACTTGCC
TTGTCCGCCTTTTTGAGGACAGGAAGAAGAGCAGAGAGAGCAATTAAACGTTCGTTGAGC
TTTTGTCTACGTTTACGTCAGCCAAAAATGTTCTTTCATAGATGTGGCTCTCTTTTCTCA
TATACACACTCTTTTCTTTGGACCTC


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1EA82JQ U 1
AF RS1AS78JQ U 1
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BS 65 157 RS1AS78JQ
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BS 159 223 RS1AS78JQ
BS 224 224 RS1EA82JQ
BS 225 866 RS1AS78JQ

RD RS1EA82JQ 697 0 0
CA
TTACTAAATAATTCATAGATATTAGAAAAAAATCAAACCAATGATACAGCCATCATTACA
CACAAACACACACACTAAATCCAGCTATTACACTCGACACATCCCACATCTCATGCATTC
CTCTGCTTTTATTATCCAACTACTAATTTTAAAAAACAAGAAAAACGAGTATTCTGATTG
ACGTTGGAGATCAAATCACACGTTTTAGTCACTGAGAAATTAACATAATGGTTATGAAAA
GTACTATTCCGCTAACGCAAGTCTTATGTTCTTCACAACATCTTCAATAGGTCGAGAAAA
TTTGTTGTCCATCTTAGAGAGAATGGTGATAACGAGAGTTGAACTTCCAAAGGGTAAAGT
AAAACTATTGACTACTTCAAGATGAAACTTCTCCAATGAGCTCAAGATCTTAATCAAACA
CCCTCTGTTCTTCTCACAATGAATCCTGATCAGCAAATCTCTGTCTGAAACTCGTGCTTC
GATCATAGGCATTGTCTGCTTCAAGATCGAAACTTCGTCTAAAGAAGAAGCTGGAGGAGA
CGCGGCAGAGCAAGTAGAAGAGTAAGATGAAGAATCATCGTCCACATACACTTGAGATCT
CTTCACCAATATAACTGACTGATCCATTTTCATGGCTCCTCCTCGCTCTTCCTCCAACTT
CTTTACACGTTCTTGAAGTTTCTTCAAATGTTTGA

QA 3 697 3 697
DS 

RD RS1AS78JQ 866 0 0
CGTTACTAAATAATTCATAGATATTAGAAAAAAATCAAACCAATGATACAGCCATCATTA
CACGCAAACACACACACTAAATCCAGCTATTACACTCGACACATCCCACATCTCATGCAT
TCCTCTGCTTTTATTATCCAACTACTAATTTTAAAAA*CAAGAAAAACGAGTATTCTGAT
TGACGTTGGAGATCAAATCACACGTTTTAGTCACTGAGAAATTCACATAATGGTTATGAA
AAGTACTATTCCGCTAACGCAAGTCTTATGTTCTTCACAACATCTTCAATAGGTCGAGAA
AATTTGTTGTCCATCTTAGAGAGAATGGTGATAACGAGAGTTGAACTTCCAAAGGGTAAA
GTAAAACTATTGACTACTTCAAGATGAAACTTCTCCAATGAGCTCAAGATCTTAATCAAA
CACCCCCTGTTCTTCTCACAATGAATCCTGATCAGCAAATCTCTGTCTGAAACTCGTGCT
TCGATCATAGGCATTGTCTGCTTCAAGATCGAAACTTCGTCTAAAGAAGAAGCTGGAGGA
GAAGCGGCAGAGCAAGTAGAAGAGTAAGATGAAGAATCATCGTCCACATACACTTGAGAT
CTCTTCACCAATATAACTGACTGATCCATTTTCATGGCTCCTCCTCGCTCTTCCTCCAAC
TTCTTTACACGTTCTTGAAGTTTCTTCAAATGTTTGATCGCGTCTTCAAGAACACTTGCC
TTGTCCGCCTTTTTGAGGACAGGAAGAAGAGCAGAGAGAGCAATTAAACGTTCGTTGAGC
TTTTGTCTACGTTTACGTCAGCCAAAAATGTTCTTTCATAGATGTGGCTCTCTTTTCTCA
TATACACACTCTTTTCTTTGGACCTC

QA 1 866 1 866
DS 



AS 1 2

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CGACTTATCAATTTATCTGGTAAACTATTGGGAGCTCATGTAGCCCATGCCGGATTAATC
GTATTCTGGGCCGGAGCAATGAACTTATTTGAAGTGGCTCATTTTGTACCTGAAAAGCCC
ATGTATGAACAAGGATTGATTTTACTTCCCCACCTAGCCACTTTAGGCTGGGGGGTAGGT
CCTGGGGGAGAAGTTATAGACACCTTTCCATACTTTGTATCTGGAGTACTTCACTTAATT
TCTTCTGCAGTTTTGGGCTTTGGCGGTATTTATCATGCACTTCTGGGACCCGAAACTCTT
AAAGAATCTTTTCCATTTTTCGGTTATGTATGGAAAGATAGAAATAAAATGACCACCATT
TTGGGTATTCACTTAATTTTGTTAGGTGTAGGTGCTTTTCTTCTAGTATTCAAGGCTCTC
TATTTTGGGGGCGTATATGATACCTGGGCTCCAGGAGGGGGGGATGTAAGAAAAATTACA
AACTTGACTCTTAGCCCAAGTGTTATATTTGGTTATTTACTAAAATCTCCCTTTGGGGGA
GAAGGATGGATTGTTAGTGTGGACGATTTGGAAGATATAATTGGAGGGCATGTATGGTTA
GGTTCCATTTGTATATTTGGTGGAATCTGGCATATCTTAACCAAACCTTTTGCATGGGCT
CGCCGCGCACTTGTATGGTCTGGGGAGGCTTACTTGTCTTATAGTTTAGCTGCTTTATCT
GTTTGTGGTTTCATTGCTTGTTGTTTTGTCTGGTTTAATAATACCTCTTACCCTAGTGAG
TTTTACGGACCTACAGGGCCAGAAGCTTCTCAAGCTCAAGCATTTACTTTTCTAGTTAGA
GACCAACGTCTTGGAGCTAACGTGGGGTCTGCTCAAGGACCTACAGGTTTAGGTAAATAC
TTAATGCGTTCCCCGACTGGAGAAGTTATTTTTGGAGGAGAAACAATGCGTTTTTGGGAT
CTGCGTGCTCCCTGGTTAGAACCTTTAAGGGGTCCTAATGGTCTGGACTTAAGTAGGTTG


BQ
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AF RS1E018TF U 1
AF RS1E018JQ C 266
BS 1 600 RS1E018TF
BS 601 1080 RS1E018JQ

RD RS1E018TF 600 0 0
GTAGCTTTAGCTGGTCGTGACCAAGAAACCACTGGTTTCGCTTGGTGGGCCGGGAATGCC
CGACTTATCAATTTATCTGGTAAACTATTGGGAGCTCATGTAGCCCATGCCGGATTAATC
GTATTCTGGGCCGGAGCAATGAACTTATTTGAAGTGGCTCATTTTGTACCTGAAAAGCCC
ATGTATGAACAAGGATTGATTTTACTTCCCCACCTAGCCACTTTAGGCTGGGGGGTAGGT
CCTGGGGGAGAAGTTATAGACACCTTTCCATACTTTGTATCTGGAGTACTTCACTTAATT
TCTTCTGCAGTTTTGGGCTTTGGCGGTATTTATCATGCACTTCTGGGACCCGAAACTCTT
AAAGAATCTTTTCCATTTTTCGGTTATGTATGGAAAGATAGAAATAAAATGACCACCATT
TTGGGTATTCACTTAATTTTGTTAGGTGTAGGTGCTTTTCTTCTAGTATTCAAGGCTCTC
TATTTTGGGGGCGTATATGATACCTGGGCTCCAGGAGGGGGGGATGTAAGAAAAATTACA
AACTTGACTCTTAGCCCAAGTGTTATATTTGGTTATTTACTAAAATCTCCCTTTGGGGGA

QA 1 600 1 600
DS 

RD RS1E018JQ 815 0 0
TTCCATACTTTGTATCTG*AGTACTTCACTTAATTTCTTCTGCAGTTTTGGGCTTTGGCG
GTATTTATCATGCACTTCTGGGACCCGAAACTCTTAAAGAATCTTTTCCATTTTTCGGTT
ATGTATGGAAAGATAGAAATAAAATGACCACCATTTTGGGTATTCACTTAATTTTGTTAG
GTGTAGGTGCTTTTCTTCTAGTATTCAAGGCTCTCTATTTTGGGGGCGTATATGATACCT
GGGCTCCAGGAGGGGGGGATGTAAGAAAAATTACAAACTTGACTCTTAGCCCAAGTGTTA
TATTTGGTTATTTACTAAAATCTCCCTTTGGGGGAGAAGGATGGATTGTTAGTGTGGACG
ATTTGGAAGATATAATTGGAGGGCATGTATGGTTAGGTTCCATTTGTATATTTGGTGGAA
TCTGGCATATCTTAACCAAACCTTTTGCATGGGCTCGCCGCGCACTTGTATGGTCTGGGG
AGGCTTACTTGTCTTATAGTTTAGCTGCTTTATCTGTTTGTGGTTTCATTGCTTGTTGTT
TTGTCTGGTTTAATAATACCTCTTACCCTAGTGAGTTTTACGGACCTACAGGGCCAGAAG
CTTCTCAAGCTCAAGCATTTACTTTTCTAGTTAGAGACCAACGTCTTGGAGCTAACGTGG
GGTCTGCTCAAGGACCTACAGGTTTAGGTAAATACTTAATGCGTTCCCCGACTGGAGAAG
TTATTTTTGGAGGAGAAACAATGCGTTTTTGGGATCTGCGTGCTCCCTGGTTAGAACCTT
TAAGGGGTCCTAATGGTCTGGACTTAAGTAGGTTG

QA 1 815 1 815
DS 



AS 1 2

CO CL6677Contig1 999 2 2 U
GGAGCCTCCCCAGGCACAAAGTATCTTCTCTCCGTTCACCGTCGCTTCTCATTCAGTCCC
AACGGCCATCCTCAGCCTTAATGACGACGATGAGGACGGCATCACGTGGAAGCGTGGCTG
TGACGGCTGCTGCCACCTCCTCCGTCGAGGCGCTGCGAGAAGGAATAGCTGAATTCTACA
ACGAGACGTCGGGATTATGGGAGGAGATTTGGGGAGATCATATGCATCACGGCTTCTACG
ATCCTGATTCCTCTGTTCAACTTTCAGATTCCGGTCACCGGGAAGCTCAGATCCGGATGA
TTGAAGAGTCTCTACGTTTCGCTGGTGTTACTGAAGGGGAGAAAAAGATAAAGAGAGTAG
TGGATGTTGGTTGTGGGATCGGAGGAAGCTCAAGATATATTGCCTCTAAATTTGGTGCCG
AATGCGTTGGCATCACACACAGTCCTGTTCAAGCCAAGAGAGCCAATGATCTCGCGGCCG
CTCAATCACTCTCTCATAAGGTTTCCTTCCAGGTTGCAGATGCACTGGAGCAACCATTTG
AAGATGGAATGTTCGATCTTGTATGGTCAATGGAAAGCGGTGAGCATATGCCTGACAAGG
CCAAGTTCGTGAAGGAATTGGTAAGTGTGCAGATTGGTCAGAGAACGTAGCTCCTTTCTG
GCCGGCGGTTATACGAACCGCATTAACATGGAAAGGGCCTTGTGTCTCTGCTTCGTAGTG
GTATGAAGAGTATAGAATGAGCATTGACAATGCCATTGATGATCGAAGGGTACAAGAAAG
GTATCATTAAGTTTGGCATCATCACTTGCCAGAAGCCTCTTTAAGTTTAAGATAAACAAT
AAAATTGTTGTATAAGTGCTTTTCAGTGAATTGGTTTTTATTTATGATATAGGGGATTGA
ATAAGAGACGTGAGAAATGTGGATGCATGAGATCCCTTAACGTCATTAATGTTCATTCTT
GCTCCGTTGTTTATTTTAGATAAATATAATTGATTTAAG


BQ
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BS 784 999 RS1A404JQ

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AACGGCCATCCTCAGCCTTAATGACGACGATGAGGACGGCATCACGTGGAAGCGTGGCTG
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ACGAGACGTCGGGATTATGGGAGGAGATTTGGGGAGATCATATGCATCACGGCTTCTACG
ATCCTGATTCCTCTGTTCAACTTTCAGATTCCGGTCACCGGGAAGCTCAGATCCGGATGA
TTGAAGAGTCTCTACGTTTCGCTGGTGTTACTGAAGGGGAGAAAAAGATAAAGAGAGTAG
TGGATGTTGGTTGTGGGATCGGAGGAAGCTCAAGATATATTGCCTCTAAATTTGGTGCCG
AATGCGTTGGCATCACACACAGTCCTGTTCAAGCCAAGAGAGCCAATGATCTCGCGGCCG
CTCAATCACTCTCTCATAAGGTTTCCTTCCAGGTTGCAGATGCACTGGAGCAACCATTTG
AAGATGGAATGTTCGATCTTGTATGGTCAATGGAAAGCGGTGAGCATATGCCTGACAAGG
CCAAGTTCGTGAAGGAATTGGTAAGTGTGCAGATTGGTCAGAGAACGTAGCTCCTTTCTG
GCCGGCGGTTATACGAACCGCATTAACATGGAAAGGGCCTTGTGTCTCTGCTTCGTAGTG
GTATGAAGAGTATAGAATGAGCATTGACAATGCCATTGATGATCGAAGGGTACAAGAAAG
GTA

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DS 

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ATGGAAAGCGGTGAGCATATGCCTGACAAGGCCAAGTTTGTGAAGGAATTGGTAAGTGTG
CAGATTGGTCAGAGAACGTAGCTCCTTTTTGGCCGGGGGTTATACGAACCGCATTAACAT
GGAA*GGGCCTTGTGTTTTTGCTTTGTAGTGGTATGAAGAGTATAGAATGAGCATTGACA
ATGCCATTGATGATCGAAGGGTACAAGAAAGGTATCATTAAGTTTGGCATCATCACTTGC
CAGAAGCCTCTTTAAGTTTAAGATAAACAATAAAATTGTTGTATAAGTGCTTTTCAGTGA
ATTGGTTTTTATTTATGATATAGGGGATTGAATAAGAGACGTGAGAAATGTGGATGCATG
AGATCCCTTAACGTCATTAATGTTCATTCTTGCTCCGTTGTTTATTTTAGATAAATATAA
TTGATTTAAG

QA 1 490 1 490
DS 



AS 1 2

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AAATAAAAAGTCAGAGAAACCAAGAAAGAACTAGAAGAATGGGAAGTGTAGAAGTTGGAG
AAAAGAAAGCTTTAGGATGGGCTGCAAGAGATCCTTCTGGTGTTCTCTCTCCTTATTCCT
ATACTCTGAGGAGCACAGGGCCAGCTGATGTGTACATAAAGGTTATATGCTGTGGAATCT
GCCGTACTGATATTCACCAGATTAAAAATGATCTTGGAATGTCCAACTATCCTATGGTTC
CTGGACACGAGGTGGTAGGTGAAGTGGTTGAAGTGGGATCAGATGTGAGCAAGTTCACCG
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GCTCAGATCTTGAACAGTACTGTAACAAGAGGATCTGGAGTTACAACGATGTGTACACCG
ACGGCAAACCAACTCAAGGTGGCTTCGCAGACACTATGATCGTCAATCAGAAGTTTGTCG
TGAAGATTCCCGAAGGTATGCCAGTGGAACAGGCTGCCCCGCTGCTCTGCGCTGGAGTAA
CTGTGTACAGCCCGTTGAGCCACTTCGGTCTAATGTCAAGCGGGCTCAAAGGAGGGATCC
TAGGGCTAGGAGGAGTAGGGCACATGGGTGTGAAGATAGCTAAAGCAATGGGACATCACG
TGACAGTGATAAGCTCGTCAGAGAAGAAAAGAGAAGAAGCAATGGATCATCTAGGAGCTG
ACGACTACGTAGTGAGTTCTGATCAAGCAGAGATGCAAAGAATCGCAGATTCTCTTGACT
ATATCATCGATACCGTACCGGTGTTTCACCCACTGGAGCCTTACTTGGCTTGTCTTAAAC
TCGACGGGAAGTTGATTCTCATGGGTGTTATTAACACTCCTCTTCAGTTCCTCACCCCTC
TCATCATTCTTGGGAGGAAAGTGATATCAGGAAGCTTTATTGGGAGCATTAAAGAGACAG
AAGAAGTGTTGGCTTTCTGCAAAGAGAAAGGTCTTACGTCGACAATTGAAGTGGTGAAGA
TTGGTGAGCTCAACACTGCGTTTGAGAGGCTTCACAAGAACGATGTGCGTTACAGATTTG
TGGTTGATGTTGCCGGAAGCAATCTGGTCGAGGAGGCTGTAACCGCTGCAAAATGAAACA
GAGTAACTTAAGTAATGTGATATGGGTGTCCTATGTATGTTTTGTGGTGACTTATTCAGT
GGTTCAGAAGTGAATGCTTTGGTGTATCATTTGATGTCGTTTACTTTTGTTTTAAATGTG
GATTTTATGTCATTGTCTTTTTCACCTAAAGATAAAGAATAAATATTAATATGAGCATTT
ATATGTTAC


BQ
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AF RS1D618JQ C 555
BS 1 659 RS1D618TF
BS 660 1389 RS1D618JQ

RD RS1D618TF 659 0 0
GGCCGTAGAGACATCTCTCGAAACAGTTTTCTCTGCAAGACTAATATAAACAACCACACA
AAATAAAAAGTCAGAGAAACCAAGAAAGAACTAGAAGAATGGGAAGTGTAGAAGTTGGAG
AAAAGAAAGCTTTAGGATGGGCTGCAAGAGATCCTTCTGGTGTTCTCTCTCCTTATTCCT
ATACTCTGAGGAGCACAGGGCCAGCTGATGTGTACATAAAGGTTATATGCTGTGGAATCT
GCCGTACTGATATTCACCAGATTAAAAATGATCTTGGAATGTCCAACTATCCTATGGTTC
CTGGACACGAGGTGGTAGGTGAAGTGGTTGAAGTGGGATCAGATGTGAGCAAGTTCACCG
TAGGTGATGTGGTCGGAGTCGGCGTCATCGTCGGCTGCTGCGGTAGCTGCAACCCCTGCA
GCTCAGATCTTGAACAGTACTGTAACAAGAGGATCTGGAGTTACAACGATGTGTACACCG
ACGGCAAACCAACTCAAGGTGGCTTCGCAGACACTATGATCGTCAATCAGAAGTTTGTCG
TGAAGATTCCCGAAGGTATGCCAGTGGAACAGGCTGCCCCGCTGCTCTGCGCTGGAGTAA
CTGTGTACAGCCCGTTGAGCCACTTCGGTCTAATGTCAAGCGGGCTCAAAGGAGGGATC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RS1D618JQ 835 0 0
GGTATGCCAGTGGAACAGGCTGCCCCGCTGCTCTGCGCTGGAGTAACTGTGTACAGCCCG
TTGAGCCACTTCGGTCTAATGTCAAGCGGGCTCAAAGGAGGGATCCTAGGGCTAGGAGGA
GTAGGGCACATGGGTGTGAAGATAGCTAAAGCAATGGGACATCACGTGACAGTGATAAGC
TCGTCAGAGAAGAAAAGAGAAGAAGCAATGGATCATCTAGGAGCTGACGACTACGTAGTG
AGTTCTGATCAAGCAGAGATGCAAAGAATCGCAGATTCTCTTGACTATATCATCGATACC
GTACCGGTGTTTCACCCACTGGAGCCTTACTTGGCTTGTCTTAAACTCGACGGGAAGTTG
ATTCTCATGGGTGTTATTAACACTCCTCTTCAGTTCCTCACCCCTCTCATCATTCTTGGG
AGGAAAGTGATATCAGGAAGCTTTATTGGGAGCATTAAAGAGACAGAAGAAGTGTTGGCT
TTCTGCAAAGAGAAAGGTCTTACGTCGACAATTGAAGTGGTGAAGATTGGTGAGCTCAAC
ACTGCGTTTGAGAGGCTTCACAAGAACGATGTGCGTTACAGATTTGTGGTTGATGTTGCC
GGAAGCAATCTGGTCGAGGAGGCTGTAACCGCTGCAAAATGAAACAGAGTAACTTAAGTA
ATGTGATATGGGTGTCCTATGTATGTTTTGTGGTGACTTATTCAGTGGTTCAGAAGTGAA
TGCTTTGGTGTATCATTTGATGTCGTTTACTTTTGTTTTAAATGTGGATTTTATGTCATT
GTCTTTTTCACCTAAAGATAAAGAATAAATATTAATATGAGCATTTATATGTTAC

QA 1 835 1 835
DS 



AS 1 2

CO CL6679Contig1 760 2 3 U
TTCAGACGAAAGAACAAGTTTCCCGAGCAAAGCAACAGTTGAGCCAATAATAAACACACA
ACACAAAGGGAAGCCGATACTTGTCGCCAGTCTCTCTGTTCGTCATCACGACCGTTCCGC
GAAGATCTGAGGACAAAAGCAATCTCCTTCAACCTCAATTAATCAAAAGCATTCCAGCAA
ATCAATACATATATAAATAAAATTAGAGTAAATCCCCCTTCCTTTACTTTCTTCGTTGCA
TCGTTTCCTCCGTCGTTTCTCCCGAAATTTTCTCTTGTCTTATTATCGAATACCCATTGT
TGCAAAGTTTCAATCTTTTGCGGCTGATTAGCTCAGAACTTGATTTCTAGGGCTTTCCGT
GAGGTTTGATGTTCTTCTCTTTGTTTCTTTGTATTCTCATTTTGATTTCCGTAAAGGTGA
GTTCTTTATTCCGAATAATTTAATCCCTTAGCCTCTGTTTTTGTAATGATCTGTGTGCTA
AGTTTGTCTTGTGTGTTCATCAGACTGGTTCAGTTTATTTCTATTGCTTGGTTTCATCCT
CTGGGTTTAGGACTTTTAGGGCCTTACTATCTTGAAAGGCTATTACGTCTTTGTATCTTT
AGTTTTGTTTATTGGTTTAAGAGCCCTTGACTAGACCTTTACCAACCAATTAGACCAAGT
CTTACATTGCACACAGATTAAGAGTTTGCATCATTGTATTATTATGCTAACTTTGCTTTT
ATTCACAGTTATAATTTATGATTGTTTTTGTTTCACGCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A249TV U 1
AF RS1A249TF U 128
BS 1 366 RS1A249TV
BS 367 367 RS1A249TF
BS 368 760 RS1A249TV

RD RS1A249TV 760 0 0
TTCAGACGAAAGAACAAGTTTCCCGAGCAAAGCAACAGTTGAGCCAATAATAAACACACA
ACACAAAGGGAAGCCGATACTTGTCGCCAGTCTCTCTGTTCGTCATCACGACCGTTCCGC
GAAGATCTGAGGACAAAAGCAATCTCCTTCAACCTCAATTAATCAAAAGCATTCCAGCAA
ATCAATACATATATAAATAAAATTAGAGTAAATCCCCCTTCCTTTACTTTCTTCGTTGCA
TCGTTTCCTCCGTCGTTTCTCCCGAAATTTTCTCTTGTCTTATTATCGAATACCCATTGT
TGCAAAGTTTCAATCTTTTGCGGCTGATTAGCTCAGAACTTGATTTCTAGGGCTTTCCGT
GAGGTT*GATGTTCTTCTCTTTGTTTCTTTGTATTCTCATTTTGATTTCCGTAAAGGTGA
GTTCTTTATTCCGAATAATTTAATCCCTTAGCCTCTGTTTTTGTAATGATCTGTGTGCTA
AGTTTGTCTTGTGTGTTCATCAGACTGGTTCAGTTTATTTCTATTGCTTGGTTTCATCCT
CTGGGTTTAGGACTTTTAGGGCCTTACTATCTTGAAAGGCTATTACGTCTTTGTATCTTT
AGTTTTGTTTATTGGTTTAAGAGCCCTTGACTAGACCTTTACCAACCAATTAGACCAAGT
CTTACATTGCACACAGATTAAGAGTTTGCATCATTGTATTATTATGCTAACTTTGCTTTT
ATTCACAGTTATAATTTATGATTGTTTTTGTTTCACGCAC

QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1A249TF 625 0 0
TGAGGACAAAAGCAATCTCCTTCAACCTCAATTAATCAAAAGCATTCCAGCAAATCAATA
CATATATAAATAAAATTAGAGTAAATCCCCCTTCCTTTACTTTCTTCGTTGCATCGTTTC
CTCCGTCGTTTCTCCCGAAATTTTCTCTTGTCTTATTATCGAATACCCATTGTTGCAAAG
TTTCAATCTTTTGCGGCTGATTAGCTCAGAACTTGATTTCTAGGGCTTTCCGTGAGGTTT
GATGTTCTTCTCTTTGTTTCTTTGTATTCTCATTTTGATTTCCGTAAAGGTGAGTTCTTT
ATTCCGAATAATTTAATCCCTTAGCCTCTGTTTTTGTAATGATCTGTGTGCTAAGTTTGT
CTTGTGTGTTCATCAGACTGGTTCAGTTTATTTCTATTGCTTGGTTTCATCCTCTGGGTT
TAGGACTTTTAGGGCCTTACTATCTTGAAAGGCTATTACGTCTTTGTATCTTTAGTTTTG
TTTATTGGTTTAAGAGCCCTTGACTAGACCTTTACCAACCAATTAGACCAAGTCTTACAT
TGCACACAGATTAAGAGTTTGCATCATTGTATTATTATGCTAACTTTGCTTTTATTCACA
GTTATAATTTATGATTGTTTTTGTT

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 2

CO CL6680Contig1 728 2 2 U
GCCCGCCTGGTGATCTTTAACCTCCTAGTTTGATAGGTTAAAAAAAAGAATCTCATTTGT
CTTTTTATATTTCCCTAAGAAAGAAATCTCAGAACAATCAAATCTCTTTGTCATTGTAGC
TGATGAGGACTCACCGCAGCAGAGAGCAGCTCTACGTAATGGTAACCGTCAACAGGTTCC
TGATTTTGGGTATTCACCGGTTCCTCAGTCTCAGAATGGGTATTCAAGTTCAAGCAGGAA
CAGTAACGTTAGTAGCGAGCCAGAGAGGAAGCCAAGACCTGTTGCTCCTCCTCCTAGGAG
AGAGTCTCCTTCTCAAGCTAACCTTCTCGTCCCATTCAGAGGGAGAAGGAGCACAAAGAA
ATTGATTTTGACTCAGCTAGGAAAAGACTGCAACAAAACTACCGACAAGCTGAGAATGCT
AAAAAGCAAAGGACTATACAGGTGATGGACATTCATGAGATACCTAAACCTAAGAAAGGT
GGATTTTTTCCAAGAAGAGGCGGCAGTTCTCAAGGAGGTGGTAGACACTGGTAAAATTGA
GTATGAGAGAGAACAGAGAACAAAGCTCTGTTTTTGAGACACAAGAAGAAAGTGAAATCT
TAATATGTTTCAAGAGTTTGGAGTTAAGTTGGTCGGTACACTTTTTCCATTTTGTTGTTA
CTTTTTCTTTAAAAAAAAACATCTGATTAAGAACATAATTTTCTTGGATTTTATGAATAA
TAGTTTCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DS22TF U 1
AF RS1DS22JQ C 1
BS 1 673 RS1DS22TF
BS 674 728 RS1DS22JQ

RD RS1DS22TF 673 0 0
GCCCGCCTGGTGATCTTTAACCTCCTAGTTTGATAGGTTAAAAAAAAGAATCTCATTTGT
CTTTTTATATTTCCCTAAGAAAGAAATCTCAGAACAATCAAATCTCTTTGTCATTGTAGC
TGATGAGGACTCACCGCAGCAGAGAGCAGCTCTACGTAATGGTAACCGTCAACAGGTTCC
TGATTTTGGGTATTCACCGGTTCCTCAGTCTCAGAATGGGTATTCAAGTTCAAGCAGGAA
CAGTAACGTTAGTAGCGAGCCAGAGAGGAAGCCAAGACCTGTTGCTCCTCCTCCTAGGAG
AGAGTCTCCTTCTCAAGCTAACCTTCTCGTCCCATTCAGAGGGAGAAGGAGCACAAAGAA
ATTGATTTTGACTCAGCTAGGAAAAGACTGCAACAAAACTACCGACAAGCTGAGAATGCT
AAAAAGCAAAGGACTATACAGGTGATGGACATTCATGAGATACCTAAACCTAAGAAAGGT
GGATTTTTTCCAAGAAGAGGCGGCAGTTCTCAAGGAGGTGGTAGACACTGGTAAAATTGA
GTATGAGAGAGAACAGAGAACAAAGCTCTGTTTTTGAGACACAAGAAGAAAGTGAAATCT
TAATATGTTTCAAGAGTTTGGAGTTAAGTTGGTCGGTACACTTTTTCCATTTTGTTGTTA
CTTTTTCTTTAAA

QA 1 673 1 673
DS 

RD RS1DS22JQ 728 0 0
GCCCGCCTGGTGATCTTTAACCTCCTAGTTTGATAGGTTAAAAAAAAGAATCTCATTTGT
CTTTTTATATTTCCCTAAGAAAGAAATCTCAGAACAATCAAATCTCTTTGTCATTGTAGC
TGATGAGGACTCACCGCAGCAGAGAGCAGCTCTACGTAATGGTAACCGTCAACAGGTTCC
TGATTTTGGGTATTCACCGGTTCCTCAGTCTCAGAATGGGTATTCAAGTTCAAGCAGGAA
CAGTAACGTTAGTAGCGAGCCAGAGAGGAAGCCAAGACCTGTTGCTCCTCCTCCTAGGAG
AGAGTCTCCTTCTCAAGCTAACCTTCTCGTCCCATTCAGAGGGAGAAGGAGCACAAAGAA
ATTGATTTTGACTCAGCTAGGAAAAGACTGCAACAAAACTACCGACAAGCTGAGAATGCT
AAAAAGCAAAGGACTATACAGGTGATGGACATTCATGAGATACCTAAACCTAAGAAAGGT
GGATTTTTTCCAAGAAGAGGCGGCAGTTCTCAAGGAGGTGGTAGACACTGGTAAAATTGA
GTATGAGAGAGAACAGAGAACAAAGCTCTGTTTTTGAGACACAAGAAGAAAGTGAAATCT
TAATATGTTTCAAGAGTTTGGAGTTAAGTTGGTCGGTACACTTTTTCCATTTTGTTGTTA
CTTTTTCTTTAAAAAAAAACATCTGATTAAGAACATAATTTTCTTGGATTTTATGAATAA
TAGTTTCG

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL6681Contig1 1024 2 4 U
GATTCATTCAATTCATTATTATAGAGACACTCTTTCTCTCTGCATGCATCTCTCTCTCTC
TCCCTTAATCTCCCGTGGTTGTCAGGATTTGGGATTCTTTTTTCGTAATAAAAAAGATCA
GTGTCCAATCTCTCTTATCATCTTCAAAAGTTTCCTATTATTTCATTCCTCTTCTCATCC
TCAGTTTTCTCTAACTCAGAGACAATCTTCTTTCGCATTTCTCTCTCTCCAAACAAAAGT
ACAATCCGAGAAAAAAAAAAGAAAACAGAGCAATGAAGAAAATCGTGTTAAAGCTGGATC
TGCATGATGATAAGGCCAAACAAAAGGCCCTTAAAACAGTTTCTACTCTCCCAGGTATCG
ATTCGATTGCAATGGACATGAAGGAGAAGAAGTTAACGGTGATTGGAACTGTTGATCCGG
TGAATGTAGTCAGTAAGCTAAGGAAGTATTGGCCGACGACGGATATCATACTGGTAGGAC
CTGCAAAGGAGCCGGAAAAAGAGAAGAAGGAGGAGCCAAAAAAGGAGGGTGGAGGCGAGC
CGCCGAAGAAAGAAGGGGAAGCTCCAAAGGAAGAAGGTAAAAAGGAAGGAGAGGCTCCCA
AGAAGGAAGGTGGGGACAAGAAGGAAGGAGAAAAGAAAGATCAACCACAACCGCAGCAAC
AGCCTCAATTACCACCACCAGATCATGTGTTGGAGCTTGTAAAGGCGTATAAAGCATATA
ATCCTCATCTAACAACGTATTACTACGCCCAAAGCATTGAAGAAAACCCTAACGCTTGCG
TTATATGTTGAAAAACATGTATAATATAATACAATTTGGGTGAAAAAAATGTGAAAAGAT
GGACCGATCTATACCGAGGAAGAAGAATAAGAAATAGAGGATATATCTTAGACTAAGATC
GGATATGTTATTTTCCCTGCATAATGGTGCGGAGGGGGGGGGGGATTTAGGTTCATGTTT
CGGAAATTTTTTTTTATTTCGATGATGTGGTTTGTGTATATATCGTTGGAGTTGGAGATT
ACTG


BQ
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10 10 10 10 

AF RS1B969TF U 1
AF RS1B969JQ C 259
BS 1 557 RS1B969TF
BS 558 558 RS1B969JQ
BS 559 578 RS1B969TF
BS 579 1024 RS1B969JQ

RD RS1B969TF 578 0 0
GATTCATTCAATTCATTATTATAGAGACACTCTTTCTCTCTGCATGCATCTCTCTCTCTC
TCCCTTAATCTCCCGTGGTTGTCAGGATTTGGGATTCTTTTTTCGTAATAAAAAAGATCA
GTGTCCAATCTCTCTTATCATCTTCAAAAGTTTCCTATTATTTCATTCCTCTTCTCATCC
TCAGTTTTCTCTAACTCAGAGACAATCTTCTTTCGCATTTCTCTCTCTCCAAACAAAAGT
ACAATCCGAGAAAAAAAAAAGAAAACAGAGCAATGAAGAAAATCGTGTTAAAGCTGGATC
TGCATGATGATAAGGCCAAACAAAAGGCCCTTAAAACAGTTTCTACTCTCCCAGGTATCG
ATTCGATTGCAATGGACATGAAGGAGAAGAAGTTAACGGTGATTGGAACTGTTGATCCGG
TGAATGTAGTCAGTAAGCTAAGGAAGTATTGGCCGACGACGGATATCATACTGGTAGGAC
CTGCAAAGGAGCCGGAAAAAGAGAAGAAGGAGGAGCCAAAAAAGGAGGGTGGAGGCGAGC
CGCCGAAGAAAGAAGGG*AAGCTCCAAAGGAAGAAGGT

QA 1 578 1 578
DS 

RD RS1B969JQ 766 0 0
AAGAAAACAGAGCAATGAAGAAAATCGTGTTAAAGCTGGATCTGCATGATGATAAGGCCA
AACAAAAGGCCCTTAAAACAGTTTCTACTCTCCCAGGTATCGATTCGATTGCAATGGACA
TGAAGGAGAAGAAGTTAACGGTGATTGGAACTGTTGATCCGGTGAATGTAGTCAGTAAGC
TAAGGAAGTATTGGCCGACGACGGATATCATACTGGTAGGACCTGCAAAGGAGCCGGAAA
AAGAGAAGAAGGAGGAGCCAAAAAAGGAGGGTGGAGGCGAGCCGCCGAAGAAAGAAGGGG
AAGCTCCAAAGGAAGAAGGTAAAAAGGAAGGAGAGGCTCCCAAGAAGGAAGGTGGGGACA
AGAAGGAAGGAGAAAAGAAAGATCAACCACAACCGCAGCAACAGCCTCAATTACCACCAC
CAGATCATGTGTTGGAGCTTGTAAAGGCGTATAAAGCATATAATCCTCATCTAACAACGT
ATTACTACGCCCAAAGCATTGAAGAAAACCCTAACGCTTGCGTTATATGTTGAAAAACAT
GTATAATATAATACAATTTGGGTGAAAAAAATGTGAAAAGATGGACCGATCTATACCGAG
GAAGAAGAATAAGAAATAGAGGATATATCTTAGACTAAGATCGGATATGTTATTTTCCCT
GCATAATGGTGCGGAGGGGGGGGGGGATTTAGGTTCATGTTTCGGAAATTTTTTTTTATT
TCGATGATGTGGTTTGTGTATATATCGTTGGAGTTGGAGATTACTG

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

CO CL6682Contig1 919 2 2 U
GGGAGCTGCTAAAGGCTTATCTTATCTTCATGAGGATTGTAGTCCAACTATAATTCACCG
TGATATCAAAGCAGCTAATATCCTTCTAGATTCCAAATATGAAGCAAAGGTCTCTGACTT
TGGACTAGCCAAGTTCTTTTCAGACACCAATTCATCAATCACTCATATCTCTACTCGAGT
GGTAGGAACTTTCGGATACATGGCTCCAGAGTATGCGTCTAGTGGTAAAGTAACTGATGA
ATCAGATGTATATTCCTTTGGAGTAGTGCTTCTGGAACTCATCACTGGACGTCCACCAAT
CTTCGCCAAAGATCCTACCAGAAACCTCAGTTTAGTTGACTGGGCGAGGCCATTGCTTGC
AAAAGCTATCTCTGGAGAAAGTTTTGACCTTCTTGTAGACCCTAGACTGGAGAAGAACTA
CGATACAGCTCAAATGGCAGACATGGCTGCTTGTGCTGCTTCTTGCATACGCCAATCAGC
TTGGCTTCGTCCCCGAATGAGCCAGGTAATCCGTGCTCTTGAAGGCGAGGTGACCCTAAG
AAACGTGGAAGAGACGTATAGCTCTTCTGGGAACCCTCTAACGTATGGAACAAGTAAGAG
GATATTCAACACGGATTCAAGCGATGGTTCCACTTCGGAGTATGGAATCAATCCTTCTCA
GTCGAGCAGTGAACAACATCAGTTTACTGGTTCTAAAGTGTAGTAAGTGTCACCCACGTA
CCACTATTGAGCTTATTGGCAATGATTAGTCTTACTTCATTCATTTGTAGCTATTTGATT
GACATCTGTGAAGGGGTTTCCAAAGAACACTGCTTGTGTTCTAGCTTTCACCGTGTACAA
CTATAAATATATGCTGTAATCTTGATTATTATGTTTTTCTTGAACAATGACTTAAAAGTC
CCTCTCTTTTGCAACCCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AP45TFB U 1
AF RS1AP45JQ C 63
BS 1 744 RS1AP45TFB
BS 745 919 RS1AP45JQ

RD RS1AP45TFB 744 0 0
GGGAGCTGCTAAAGGCTTATCTTATCTTCATGAGGATTGTAGTCCAACTATAATTCACCG
TGATATCAAAGCAGCTAATATCCTTCTAGATTCCAAATATGAAGCAAAGGTCTCTGACTT
TGGACTAGCCAAGTTCTTTTCAGACACCAATTCATCAATCACTCATATCTCTACTCGAGT
GGTAGGAACTTTCGGATACATGGCTCCAGAGTATGCGTCTAGTGGTAAAGTAACTGATGA
ATCAGATGTATATTCCTTTGGAGTAGTGCTTCTGGAACTCATCACTGGACGTCCACCAAT
CTTCGCCAAAGATCCTACCAGAAACCTCAGTTTAGTTGACTGGGCGAGGCCATTGCTTGC
AAAAGCTATCTCTGGAGAAAGTTTTGACCTTCTTGTAGACCCTAGACTGGAGAAGAACTA
CGATACAGCTCAAATGGCAGACATGGCTGCTTGTGCTGCTTCTTGCATACGCCAATCAGC
TTGGCTTCGTCCCCGAATGAGCCAGGTAATCCGTGCTCTTGAAGGCGAGGTGACCCTAAG
AAACGTGGAAGAGACGTATAGCTCTTCTGGGAACCCTCTAACGTATGGAACAAGTAAGAG
GATATTCAACACGGATTCAAGCGATGGTTCCACTTCGGAGTATGGAATCAATCCTTCTCA
GTCGAGCAGTGAACAACATCAGTTTACTGGTTCTAAAGTGTAGTAAGTGTCACCCACGTA
CCACTATTGAGCTTATTGGCAATG

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1AP45JQ 857 0 0
ATATCAAAGCAGCTAATATCGTTCTAGATTCCAAATATGAAGCAAAGGTCTCTGACTTTG
GACTAGCCAAGTTCTTTTCAGACACCAATTCATCAATCACTCATATCTCTACTCGAGTGG
TAGGAACTTTCGGATACATGGCTCCAGAGTATGCGTCTAGTGGTAAAGTAACTGATGAAT
CAGATGTATATTCCTTTGGAGTAGTGCTTCTGGAACTCATCACTGGACGTCCACCAATCT
TCGCCAAAGATCCTACCAGAAACCTCAGTTTAGTTGACTGGGCGAGGCCATTGCTTGCAA
AAGCTATCTCTGGAGAAAGTTTTGACCTTCTTGTAGACCCTAGACTGGAGAAGAACTACG
ATACAGCTCAAATGGCAGACATGGCTGCTTGTGCTGCTTCTTGCATACGCCAATCAGCTT
GGCTTCGTCCCCGAATGAGCCAGGTAATCCGTGCTCTTGAAGGCGAGGTGACCCTAAGAA
ACGTGGAAGAGACGTATAGCTCTTCTGGGAACCCTCTAACGTATGGAACAAGTAAGAGGA
TATTCAACACGGATTCAAGCGATGGTTCCACTTCGGAGTATGGAATCAATCCTTCTCAGT
CGAGCAGTGAACAACATCAGTTTACTGGTTCTAAAGTGTAGTAAGTGTCACC*ACGTACC
ACTATTGAGCTTATTGGCAATGATTAGTCTTACTTCATTCATTTGTAGCTATTTGATTGA
CATCTGTGAAGGGGTTTCCAAAGAACACTGCTTGTGTTCTAGCTTTCACCGTGTACAACT
ATAAATATATGCTGTAATCTTGATTATTATGTTTTTCTTGAACAATGACTTAAAAGTCCC
TCTCTTTTGCAACCCCG

QA 1 857 1 857
DS 



AS 1 2

CO CL6683Contig1 684 2 2 U
TTATAAAACCATGTCCCTTTGTTCCGTTTGATTTTTAACAACCAATTCTACTACTAAGTG
TTCTTAGATACTTTTCGAGCTTATGGAAATTCAGTGCGCTTCAATAGCAAATGAAGTACT
ACTACGTACAATTCATCTTCACCCAACAAAACAAAACATAAACTTAAGACGGCGCCTTGA
CCGTGGGGATTCGCCACGTTCTTGTGTAAAGCGCACCGGAACGAACCGGGGTGAGTCGTC
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BB94TF C 1
AF RS1BB94JQ U 3
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RD RS1BB94TF 684 0 0
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CCTGAGGGTTAGTTGGTTCGGCCC

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DS 

RD RS1BB94JQ 682 0 0
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GTGGGGATTCGCCACGTTCTTGTGTAAAGCGCACCGGAACGAACCGGGGTGAGTCGTCGG
CGAGCACATGCATCTCCTCCTCGAATCGGGGATCTTACTACCACTGCTTGGCTTCGAAAC
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TTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGGTTGCTGAAGAAAGCTGAAGAACGGGACGAGAAGGT
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QA 1 682 1 682
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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ATTAATCTTCTGTCAAACCCAGGCAAGGGGATAAAATATCCAACACGGCTGAGCACAAGC
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TCTGTGCTTATCGGAGTAACTGATAGAAAAACTCTTCCTTTCTTTTGTAAAGAGATGTTT
TCTGTTCATCTGTGTAAAAGAGGTTTCTCTCGTTCTTGACAAACCCAAACTCGTAGTAAG
GTAGCTTTTTGATCGAAATGGTTGATAGCAAGCAAAGAGATGGGTCCCCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GT30TF U 1
AF RS1GT30JQ C 99
BS 1 724 RS1GT30TF
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RD RS1GT30TF 810 0 0
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CGGTATTGAGCACTGAACTTATCCGGGACAAAATCAAGAAACCTCTTCCTAAAAGACTTT
GGCCTGCTTTCCTGAAGTGTATTTGGACACACCAGAGTTCTGAGAACTCTGTGACTCTAG
AGGA*TAGTCTCTACATCCAAAGCATCTGTGTGCATT*CATCACTGCCCGTAGAT*CATC
TCTGTGCTTATCGGAGTA*CTGATAGAAAA

QA 1 810 1 810
DS 

RD RS1GT30JQ 854 0 0
ACATATAT
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AACGTGACAAAGACACATTTTAATCATCACTTGGTTTCATCAATCACAATC*TAATACAT
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AATTTGTGGACTGAGTCCAAGCTGGAAGAGGGAAAGCTTGATCTCTGCTCCAAACTCACC
AAGCTCCTCTACCAAAAAATTGTAAACCACAAACTCAGATGTGCCATACGAACAAGAGAG
ACTAAACAGGACACAAAATGGCATGAGAAAACTCACCAACAGAACCTGAGACAAAGCTAA
GGTAATCTTGAGGTATTAATCTTCTGTCAAACCCAGGCAAGGGGATAAAATATCCAACAC
GGCTGAGCACAAGCAAGACAGCCGTCACAAAAACAACCTCCTCCTTATCTCACTCTTGAA
GAACCTTTCCGCTGCGGTATTGAGCACTGAACTTATCCGGGACAAAATCAAGAAACCTCT
TCCTAAAAGACTTTGGCCTGCTTTCCTGAAGTGTATTTGGACACACCAGAGTTCTGAGAA
CTCTGTGACTCTAGAGGAATAGTCTCTACATCCAAAGCATCTGTGTGCATTTCATCACTG
CCCGTAGATTCATCTCTGTGCTTATCGGAGTAACTGATAGAAAAACTCTTCCTTTCTTTT
GTAAAGAGATGTTTTCTGTTCATCTGTGTAAAAGAGGTTTCTCTCGTTCTTGACAAACCC
AAACTCGTAGTAAGGTAGCTTTTTGATCGAAATGGTTGATAGCAAGCAAAGAGATGGGTC
CCCTGC

QA 9 854 9 854
DS 



AS 1 2

CO CL6686Contig1 703 2 5 U
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CTGAATTAAGTATAGACTTCTAGTGATGTTTTAAAAAGACTAAAGTTGCTTATATTTCCA
ACTTTATCGTGAAAGTAAAAGGCACACTTAGAAGCTTTTTGACCAGTAATATTGAGTTAT
CGACTGTTAGAATAAATGCATGAACAAAAAGAAGAAGAATAAATGCATGATTTATTTGAC
ACATTTTGTTATCAATATCTCGAGAAAAAAACACATTATTTTCATTTACTATTAACAGTG
ATCGACTAAGATCCATAACCTATCTCATATGAACCTGGCACATATGTGCATATTTTGTAT
GCACTCAACCACTGAAATAATTACACCAAACTTTTAAGAAGTAGAGATCTTTAAAAATTT
AAATTATAGGAAACCTGTCGTAAAACCCTTTTTAATACATATTAGACACATCTCTCTGCT
CACACAATTAGCATGGATCCAGGTAAGAACTAATAAGACAGTTTACCGAAAAGAAATCAT
ATAAGCTACATCTCTCTGCTCATATTTTAGATGGAGTATTGTTAATTATCGTGATGTAAC
ACCACTCACTTCACAAATATTTCACATGTTTTTATATTAAGTG


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1D194JQ U 3
AF RS1D194TF C 1
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RD RS1D194JQ 561 0 0
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CACAATTAGCATGGATCCAGG

QA 1 561 1 561
DS 

RD RS1D194TF 703 0 0
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GCAGAAAGGCCACACGAGCCACACGTATGCATCATTCATGATAACTGGCAAGCGGGTATG
CTGAATTAAGTATAGACTTCTAGTGATGTTTTAAAAAGACTAAAGTTGCTTATATTTCCA
ACTTTATCGTGAAAGTAAAAGGCACACTTAGAAGCTTTTTGACCAGTAATATTGAGTTAT
CGACTGTTAGAATAAATGCATGAACAAAAAGAAGAAGAATAAATGCATGATTTATTTGAC
ACATTTTGTTATCAATATCTCGAGAAAAAAACACATTATTTTCATTTACTATTAACAGTG
ATCGACTAAGATCCATAACCTATCTCATATGAACCTGGCACATATGTGCATATTTTGTAT
GCACTCAACCACTGAAATAATTACACCAAACTTTTAAGAAGTAGAGATCTTTAAAAATTT
AAATTATAGGAAACCTGTCGTAAAACCCTTTTTAATACATATTAGACACATCTCTCTGCT
CACACAATTAGCATGGATCCAGGTAAGAACTAATAAGACAGTTTACCGAAAAGAAATCAT
ATAAGCTACATCTCTCTGCTCATATTTTAGATGGAGTATTGTTAATTATCGTGATGTAAC
ACCACTCACTTCACAAATATTTCACATGTTTTTATATTAAGTG

QA 1 703 1 703
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CACATCTCGTTTTAACTGTTCAGGCGACAACTATCACTATGGCGGAAGAGTACAAGAACG
CTTCGGAGGAGTTCAAGAACGAGACCCCAAAGGTTGCCACCACCGAGGAATCATCTGCGA
CGACGACGACGACGGGAGAGGTTAAGGATCGTGGATTGTTTGACTTCCTCAAGAAAAAAG
AGGAAGTGAAGCCTCAAGAAACGTCGACGACGCTGGAGTCAGAGTTCGAGCACAAGGCTC
AGGTCTCGGAACCGCCGGCGTTTGTGGCGAAGCACGAAGAAGAGGAAGAGAAGGAGCATA
AGCCTACTCTCCTCGAGAAGCTCCACCAGAAGCACGAGGAAGAAGAAGAAGAGAACAAAC
CTAGTCTCCTCCAAAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTGTAAGTAACTTAT
TCAATCCGCACGTAACAGTTATTTATTTAAAACTTAGATTTAGTTTTATAATATGTTTAA
GTAATTTATCAGTCAAGCGAGGAAGAAGGTGAAGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAAAAG
AAGAAGAAGATGGCCGAAGAAGATGAAAAAATAAAGGAAGATAGAAAGGATGTAATGGAG
CAGATCAGGGAGAAGTTTCCACACGGAACAAAGACAGAGGAGGATGCTCCAGTCATCGCC
ACCCTGCCGGTGAAGGAGGAAACGGTAGAGCATCCGGAGGAGAAGAAAGGACTGATGGAG
AAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTCACAGCGAGAAACCAGAGGATTCTCAAGTGGTCGAC
ACGGGGGCTGCGGTACCAGTGACTGAGGAAACGGCTGAGCATCCGGAAGAGAAGAAAGGG
CTTCTTGAGAAGATCAAAGAGAAGCTTCCAGGTTATCACGCCAAGGGTACTGAAGAGGAG
GAGAAGAAGAAAGAAAAGAAGTCCGATGATTAAGAAGAAAATATGAAAAAAATAATGATG
TGGGAGTGGGACATTTGCTGTGTTTCTTTGATGGTTTTCTCTTTTTATCTTTATGATGTT
CTTGTAAGATTTGTGTCTTTCGTTGATTTGCATTTGCATCTTTATATTATGTAATAATTT
CATTATCTCTTTTATAAAGTTTGTGTTGTGTTTTTG


BQ
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AF RS1DR10TF U 1
AF RS1DR10JQ C 453
BS 1 601 RS1DR10TF
BS 602 1176 RS1DR10JQ

RD RS1DR10TF 601 0 0
GGACTCATCACAGCTCTACATAATCAATCACCTTTAAAGCTCTCATATTTTTCTGTTTAT
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CTTCGGAGGAGTTCAAGAACGAGACCCCAAAGGTTGCCACCACCGAGGAATCATCTGCGA
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AGGAAGTGAAGCCTCAAGAAACGTCGACGACGCTGGAGTCAGAGTTCGAGCACAAGGCTC
AGGTCTCGGAACCGCCGGCGTTTGTGGCGAAGCACGAAGAAGAGGAAGAGAAGGAGCATA
AGCCTACTCTCCTCGAGAAGCTCCACCAGAAGCACGAGGAAGAAGAAGAAGAGAACAAAC
CTAGTCTCCTCCAAAAGCTTCACCGATCCAACAGCTCTTCTTCCTCTGTAAGTAACTTAT
TCAATCCGCACGTAACAGTTATTTATTTAAAACTTAGATTTAGTTTTATAATATGTTTAA
GTAATTTATCAGTCAAGCGAGGAAGAAGGTGAAGACGGTGAGAAGAGGAAGAAGGAAAAG
A

QA 1 601 1 601
DS 

RD RS1DR10JQ 724 0 0
AGCTCTTCTTCCTCTGTAAGTAACTTATTCAATCCGCACGTAACAGTTATTTATTTAAAA
CTTAGATTTAGTTTTATAATATGTTTAAGTAATTTATCAGTCAAGCGAGGAAGAAGGTGA
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AAAGGAAGATAGAAAGGATGTAATGGAGCAGATCAGGGAGAAGTTTCCACACGGAACAAA
GACAGAGGAGGATGCTCCAGTCATCGCCACCCTGCCGGTGAAGGAGGAAACGGTAGAGCA
TCCGGAGGAGAAGAAAGGACTGATGGAGAAGATCAAGGAGAAGCTTCCAGGTCACAGCGA
GAAACCAGAGGATTCTCAAGTGGTCGACACGGGGGCTGCGGTACCAGTGACTGAGGAAAC
GGCTGAGCATCCGGAAGAGAAGAAAGGGCTTCTTGAGAAGATCAAAGAGAAGCTTCCAGG
TTATCACGCCAAGGGTACTGAAGAGGAGGAGAAGAAGAAAGAAAAGAAGTCCGATGATTA
AGAAGAAAATATGAAAAAAATAATGATGTGGGAGTGGGACATTTGCTGTGTTTCTTTGAT
GGTTTTCTCTTTTTATCTTTATGATGTTCTTGTAAGATTTGTGTCTTTCGTTGATTTGCA
TTTGCATCTTTATATTATGTAATAATTTCATTATCTCTTTTATAAAGTTTGTGTTGTGTT
TTTG

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL6689Contig1 1091 2 12 U
GAAACTTCTTCGTTCTCCCCCTATTCTCAATTTCTCATCATCATCTCTCTGACATCTCTT
TTCATGGCCGTCGATGCTCACCATCTCCATTTCTCTCCTCTTCAACTCTTCTCCAACAGA
GACTTAGTGATGAATAATAGCAACCACAACACAACCATGGAACCGACTAATGGCGGTTTC
TTCACGAATAACCAAACCGGATACGGCGTCGTTTCACCTTTCTCCGTGACAGACGATTCG
CCTCCTCTTCTTAACATGTACGGCGGCTCCTCCACCGCTGATACTATTCCGACAACAACT
GATTCATTCACTTATTACCCCGATGGTGGTAATCTCAACTCTGATTTGTTATCTTTACAC
TCGAGAAAACGCTCCAGAGATTCAGCATCGGGTTATAATCCTAGATCATGGTCACCGTGT
GTTACTCCTTTTTCGTTTCTCGGCCAAGACATTGATATCTCCTCTCACATCAATCAGCAA
CAGCACGACATCGATCGGTTCGTCTCCCTTCATATGGAGAGAGTGAGACTCGAGATTCAA
GAGAAGAGGAAGAGGCGAGCGAGGACGATTATGGAGGCTATAGAGCATAGGCTTCGTGCC
AAAGAAGAAGAGAGAGACAGAATCGGGAAGATAAACCACGCGCTCGAGGAGCGCGTGAGG
TCACTCTCCACCGAGAACCAAATCTGGCGGGATCTCGCTCAGACCAACGAAGCGACCGCC
AACGACCTCCGCAACAGCCTCGAGCAGGTGCTGGCGCAGGTTAACGACTCTGGCGCAGGG
TTAGATAACGGAAACGGCGATAACGACGACGATGACGCGGAGTCGTGTTGCGGGAGTAGC
GCGGGTGAAGAAACGGTTAGGAGGCGTAGGGTAGCGATTGAGGCGCATGATAAGGCGGCG
AAAGGTCGGATGTGCAGAAACTGTGGGGAGGAGGAATCGTGTGTGTTGCTTTTACCGTGC
AGACACTTGTGCTTGTGTGGAGTGTGTGGGTCCAGTGTGCACACGTGCCCGATATGTAGT
TCTCCCAAAAACGCTAGCGTTCATGTCAACATGTCATCTTGACCCCGTTTATGGAAACTC
CCTCTTCATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FH31TF U 1
AF RS1FH31JQ C 331
BS 1 716 RS1FH31TF
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RD RS1FH31TF 774 0 0
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TTCACGAATAACCAAACCGGATACGGCGTCGTTTCACCTTTCTCCGTGACAGACGATTCG
CCTCCTCTTCTTAACATGTACGGCGGCTCCTCCACCGCTGATACTATTCCGACAACAACT
GATTCATTCACTTATTACCCCGATGGTGGTAATCTCAACTCTGATTTGTTATCTTTACAC
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GTTACTCCTTTTTCGTTTCTCGGCCAAGACATTGATATCTCCTCTCACATCAATCAGCAA
CAGCACGACATCGATCGGTTCGTCTCCCTTCATATGGAGAGAGTGAGACTCGAGATTCAA
GAGAAGAGGAAGAGGCGAGCGAGGACGATTATGGAGGCTATAGAGCATAGGCTTCGTGCC
AAAGAAGAAGAGAGAGACAGAATCGGGAAGATAAACCACGCGCTCGAGGAGCGCGTGAGG
TCACTCTCCACCGAGAACCAAATCTGGCGGGATCTCGCTCAGACCAACGAAGCGAC*GCC
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QA 1 774 1 774
DS 

RD RS1FH31JQ 761 0 0
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GGTTATAATCCTAGATCATGGTCACCGTGTGTTACTCCTTTTTCGTTTCTCGGCCAAGAC
ATTGATATCTCCTCTCACATCAATCAGCAACAGCACGACATCGATCGGTTCGTCTCCCTT
CATATGGAGAGAGTGAGACTCGAGATTCAAGAGAAGAGGAAGAGGCGAGCGAGGACGATT
ATGGAGGCTATAGAGCATAGGCTTCGTGCCAAAGAAGAAGAGAGAGACAGAATCGGGAAG
ATAAACCACGCGCTCGAGGAGCGCGTGAGGTCACTCTCCACCGAGAACCAAATCTGGCGG
GATCTCGCTCAGACCAACGAAGCGACCGCCAACGACCTCCGCAACAGCCTCGAGCAGGTG
CTGGCGCAGGTTAACGACTCTGGCGCAGGGTTAGATAACGGAAACGGCGATAACGACGAC
GATGACGCGGAGTCGTGTTGCGGGAGTAGCGCGGGTGAAGAAACGGTTAGGAGGCGTAGG
GTAGCGATTGAGGCGCATGATAAGGCGGCGAAAGGTCGGATGTGCAGAAACTGTGGGGAG
GAGGAATCGTGTGTGTTGCTTTTACCGTGCAGACACTTGTGCTTGTGTGGAGTGTGTGGG
TCCAGTGTGCACACGTGCCCGATATGTAGTTCTCCCAAAAACGCTAGCGTTCATGTCAAC
ATGTCATCTTGACCCCGTTTATGGAAACTCCCTCTTCATTT

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

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TCCAGCTCCAAGTCCGACTTCTGATGCCGCTATGTTCGTCCCGGCATTGTTTGCATCTGT
TGTTGCTTTGGCATCTGGGTTTCTCTTTTAAACCAATCTCTACATATCATATAGAGTTAG
GGTTTGTTACTTTGTTTTCCCTTTACTTCCTGTCTATTTTCATCATTTGAGCCTTTTTGT
TATTGTTTCTAATATTTGTTCTACTGTATACTATTTCTTATTAATATAACCTTCGGGTTT
TGATGTAATTGCATGAGATTGTTTGTGTTTATATGTTATATAATTATTACC


BQ
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AF RS1E896JQ C 1
AF RS1E896TF U 1
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GATGGTTGCTATTGTGGCTTTTTCAGCCGTAGGAAAGGCGGCAGCTCAGACGGCAGAGGC
TCCAGCTCCAAGTCCGACTTCTGATGCCGCTATGTTCGTCCCGGCATTGTTTGCATCTGT
TGTTGCTTTGGCATCTGGGTTTCTCTTTTAAACCAATCTCTACATATCATATAGAGTTAG
GGTTTGTTACTTTGTTTTCCCTTTACTTCCTGTCTATTTTCATCATTTGAGCCTTTTTGT
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TGATGTAATTGCATGAGATTGTTTGTGTTTATATGTTATATAATTATTACC

QA 1 471 1 471
DS 

RD RS1E896TF 471 0 0
GGACCACAACTCATTATCGCATCAAAAACAAAACCTCAGAAACAAATCTATTGACTAAGT
TTCTTTGAAGTGTAAAAGAGCAGAGATGGAGTCAATGAAGATGAGGCTTATGGTGTTTTT
GATGGTTGCTATTGTGGCTTTCTCAGCCGTAGGAAAGGCGGCAGCTCAGACGGCAGAGGC
TCCAGCTCCAAGTCCGACTTCTGATGCCGCTATGTTCGTCCCGGCATTGTTTGCATCTGT
TGTTGCTTTGGCATCTGGGTTTCTCTTTTAAACCAATCTCTACATATCATATAGAGTTAG
GGTTTGTTACTTTGTTTTCCCTTTACTTCCTGTCTATTTTCATCATTTGAGCCTTTTTGT
TATTGTTTCTAATATTTGTTCTACTGTATACTATTTCTTATTAATATAACCTTCGGGTTT
TGATGTAATTGCATGAGATTGTTTGTGTTTATATGTTATATAATTATTACC

QA 1 471 1 471
DS 



AS 1 2

CO CL6691Contig1 832 2 7 U
CTCGTAAATTATAACTCATTTTGACACCATCGTAACTATACAACAAACACATTTATTCAT
TTGTATTTGGTAACCACAAATACATCAGTATATATATAACTGATACAGCAAAAGGTTATC
GGTTCCGAACCCCGTCGGGGGTAAGTACCCCGTAAGACACCGCAAAAGAAGCTTGAGTTT
CTTGATCCAGTTTAACACGGTTTGGATTCTTACCACAAGGGATCTGAAACATAGTCTTGA
GATCAGGACAAGTCTGCCTCCGCATGAAGAACTCAGCACATTCCGGTGCAGTTTTCTGGT
TAGGAAGATCAAGTATAAAATTCATACGAACGTCAAGAATATGGTTCTTGATGAGTTCTC
TACATTTTGGACCGGCCTGAGTGAAGTAATTATAGGAGAGAGAAAAGTTTTTGAGACTAG
GAAGCTCGCATACAATCTCTGGTATGGTTCCATAAAATTTGTTTCTGGCTAAGTTGAGTT
GTTCCATATTGGCTAAGCAACCGAAAGAGTATGGTATTGGACCGGTTAGCTGGTTAAACC
CAACATCGAAAACGGTGGCTCGGTTTAGCTTTCCAATTTGGTATGGTAAGCACCCGGTTA
GAGTGTTATTCAAGAAAAGGACTTCTTGTAGGTTCTTGATGTTGCCTATGCTGGCGGGAA
TTTTACCCGTGAACCTGTTGTTGGCGAATGTGAGATAAAGAGCAGTGATGGAGCCAAGAT
TGGATGGAAGTGTCTGAACAAGATTGTTGTTGTTGATGAACAGACGTCAAGATCAGATTA
AAGACCTGAGGAGGAACACAGCCTGAGAAAGTATTGAACCTGAGATCAAGAA


BQ
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AF RS1E045JQ U 38
AF RS1E311JQ U 1
BS 1 164 RS1E311JQ
BS 165 165 RS1E045JQ
BS 166 454 RS1E311JQ
BS 455 455 RS1E045JQ
BS 456 617 RS1E311JQ
BS 618 618 RS1E045JQ
BS 619 832 RS1E311JQ

RD RS1E045JQ 698 0 0
ATACAACAAACACATTTATTCATTTGTATTTGGTAACCACAAATACATCAGTATATATAT
AACTGATACAGCAAAAGGTTATCGGTTCCGAACCCCGTCGGGGGTAAGTACCCCGTAAGA
CACCGCAAAAGAAGCTTGAGTTTCTTGATCCAGTTTAACACGGTTTGGATTCTTACCACA
AGGGATCTGAAACATAGTCTTGAGATCAGGACAAGTCTGCCTCCGCATGAAGAACTCAGC
ACATTCCGGTGCAGTTTTCTGGTTAGGAAGATCAAGTATACAATTCATACGAACGTCAAG
AATATGGTTCTTGATGAGTTCTCTACATTTTGGACCGGCCTGAGTGAAGTAATTATAGGA
GAGAGAAAAGTTTTTGAGACTAGGAAGCTCGCATACAATCTCTGGTATGGTTCCATAAAA
TTTGTTTCTGGCTAAGTTGAGTTGTTCCATCTTGGCTAAGCAACCGAAAGAGTATGGTAT
TGGACCGGTTAGCTGGTTAAACCCAACATCGAAAACGGTGGCTCGGTTTAGCTTTCCAAT
TTGGTATGGTAAGCACCCGGTTAGAGTGTTATTCAAGAAAAGGACTTCTTGTAGGTTCTT
GATGTTGCCTATGCTGGCGGGAATTTTACCCGTGAACCTGTTGTTGGCGAATGTGAGATA
AAGAGCAGTGATGGAGCCAAGATTGGATGGAAGTGTCT

QA 1 698 1 698
DS 

RD RS1E311JQ 832 0 0
CTCGTAAATTATAACTCATTTTGACACCATCGTAACTATACAACAAACACATTTATTCAT
TTGTATTTGGTAACCACAAATACATCAGTATATATATAACTGATACAGCAAAAGGTTATC
GGTTCCGAACCCCGTCGGGGGTAAGTACCCCGTAAGACACCGCAGAAGAAGCTTGAGTTT
CTTGATCCAGTTTAACACGGTTTGGATTCTTACCACAAGGGATCTGAAACATAGTCTTGA
GATCAGGACAAGTCTGCCTCCGCATGAAGAACTCAGCACATTCCGGTGCAGTTTTCTGGT
TAGGAAGATCAAGTATAAAATTCATACGAACGTCAAGAATATGGTTCTTGATGAGTTCTC
TACATTTTGGACCGGCCTGAGTGAAGTAATTATAGGAGAGAGAAAAGTTTTTGAGACTAG
GAAGCTCGCATACAATCTCTGGTATGGTTCCATAGAATTTGTTTCTGGCTAAGTTGAGTT
GTTCCATATTGGCTAAGCAACCGAAAGAGTATGGTATTGGACCGGTTAGCTGGTTAAACC
CAACATCGAAAACGGTGGCTCGGTTTAGCTTTCCAATTTGGTATGGTAAGCACCCGGTTA
GAGTGTTATTCAAGAAA*GGACTTCTTGTAGGTTCTTGATGTTGCCTATGCTGGCGGGAA
TTTTACCCGTGAACCTGTTGTTGGCGAATGTGAGATAAAGAGCAGTGATGGAGCCAAGAT
TGGATGGAAGTGTCTGAACAAGATTGTTGTTGTTGATGAACAGACGTCAAGATCAGATTA
AAGACCTGAGGAGGAACACAGCCTGAGAAAGTATTGAACCTGAGATCAAGAA

QA 1 832 1 832
DS 



AS 1 2

CO CL6692Contig1 753 2 2 U
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CGGTCACATTTTTTTTTTTCTAATGAATAGTGATCACACTCTATTCAAACTATGAAGCTA
GAAGGATGTAATACGATCAACCAGATCATTTAGATTCCGAGATGACGACCCTCCTCGTTG
AACCGATCTTCTTACTTCATCTCGCAGCACTTTAACTCTCCCTCGAATCTCTTCTCCTTC
TGGTTCAACCATTAGTCTTGTCACGGCTCTCTCGATTACTCTTCTCTCTATGCGACATTC
CAAGTGAATCCCTATCCTCCATACATCACTAACGAATCTCGCGTTAAGCCACTGGTCCCA
CACAAAAGGCAAGCTGATCATAGGAACCCCTTCGCATATACTCTCTAGCGTCGAGTTCCA
TCCATTGTGTGTCAAAAACCCACCCGTGGCTCTATGCGCGAGAACGTCTATCTGCGGTGC
CCATTTCACTATCTTTCCCTTCCCGTTAAGACCTTCCATGAACCCTAACGGTAACGACTC
GATCCACTCTCTGCCTTGGACAGAACCTGGCCTGACAACCCACAAGAAAGACAGGTTTGT
TTGGCTTAACCCACAAGCAACCTCCAAGAACTGAGACTCGGTTACACTCACAATGCTCCC
TAAGCTCACGTAGATCACCGATCTCGTTTCTTGCTTATCCAACCATGGAATGCAGCTTTG
GTCCGGCTCGAACAAGCTGCTAGACGAGGCTGG


BQ
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AF RS1DV14JQ U 1
AF RS1D611JQ U 5
BS 1 686 RS1DV14JQ
BS 687 753 RS1D611JQ

RD RS1DV14JQ 686 0 0
GGTAGGAACAGAGCAAATAGTTTTATTAAGAAGTTCATGAGTCACATATACAACATATAA
CGGTCACATTTTTTTTTTTCTAATGAATAGTGATCACACTCTATTCAAACTATGAAGCTA
GAAGGATGTAATACGATCAACCAGATCATTTAGATTCCGAGATGACGACCCTCCTCGTTG
AACCGATCTTCTTACTTCATCTCGCAGCACTTTAACTCTCCCTCGAATCTCTTCTCCTTC
TGGTTCAACCATTAGTCTTGTCACGGCTCTCTCGATTACTCTTCTCTCTATGCGACATTC
CAAGTGAATCCCTATCCTCCATACATCACTAACGAATCTCGCGTTAAGCCACTGGTCCCA
CACAAAAGGCAAGCTGATCATAGGAACCCCTTCGCATATACTCTCTAGCGTCGAGTTCCA
TCCATTGTGTGTCAAAAACCCACCCGTGGCTCTATGCGCGAGAACGTCTATCTGCGGTGC
CCATTTCACTATCTTTCCCTTCCCGTTAAGACCTTCCATGAACCCTAACGGTAACGACTC
GATCCACTCTCTGCCTTGGACAGAACCTGGCCTGACAACCCACAAGAAAGACAGGTTTGT
TTGGCTTAACCCACAAGCAACCTCCAAGAACTGAGACTCGGTTACACTCACAATGCTCCC
TAAGCTCACGTAGATCACCGATCTCG

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1D611JQ 749 0 0
GGAACAGAGCAAATAGTTTTATTAAGAAGTTCATGAGTCACATATACAACATATAACGGT
CACATTTTTTTTTT*CTAATGAATAGTGATCACACTCTATTCAAACTATGAAGCTAGAAG
GATGTAATACGATCAACCAGATCATTTAGATTCCGAGATGACGACCCTCCTCGTTGAACC
GATCTTCTTACTTCATCTCGCAGCACTTTAACTCTCCCTCGAATCTCTTCTCCTTCTGGT
TCAACCATTAGTCTTGTCACGGCTCTCTCGATTACTCTTCTCTCTATGCGACATTCCAAG
TGAATCCCTATCCTCCATACATCACTAACGAATCTCGCGTTAAGCCACTGGTCCCACACA
AAAGGCAAGCTGATCATAGGAACCCCTTCGCATATACTCTCTAGCGTCGAGTTCCATCCA
TTGTGTGTCAAAAACCCACCCGTGGCTCTATGCGCGAGAACGTCTATCTGCGGTGCCCAT
TTCACTATCTTTCCCTTCCCGTTAAGACCTTCCATGAACCCTAACGGTAACGACTCGATC
CACTCTCTGCCTTGGACAGAACCTGGCCTGACAACCCACAAGAAAGACAGGTTTGTTTGG
CTTAACCCACAAGCAACCTCCAAGAACTGAGACTCGGTTACACTCACAATGCTCCCTAAG
CTCACGTAGATCACCGATCTCGTTTCTTGCTTATCCAACCATGGAATGCAGCTTTGGTCC
GGCTCGAACAAGCTGCTAGACGAGGCTGG

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

CO CL6693Contig1 722 2 6 U
TCCCATTCTTCTTGCCCAATCTGATAATCATCAACATTTAAGTAGAAGCATTCTGCTCTT
TTACTGGTTTTATGAACAAGAATTCAGGTTGTGAAGATTAGACTTCAGCAACAGAAAGGA
TTAAGCCCCGATCTTTTCAAGTACAAAGGTCCCATTCACTGTGCTCAAACCATCGTCAGA
GAAGAATCCATTTTGGATCTTTGGTCTGGTGCTGCCCCCACCGTTATGCGTAACGGCACC
AACCAAGCTGTCATGTTCACTGCCAAAAACTCCTTTGACGTCCTCTTGTGGAACAAACAC
GAAGGCGATGGTAAATCCTTGCACCCTTGGCAATCCATGATCTCAGGTTTCTTAGCTGGA
ACCGCTGGTCCCTTCTGCACTGGGCCGTTTGATGTTGTCAAGACCAGGTTGATGGCTCAG
ACCAGAGACGGTGAAGGTGGGCTGAAATACAAAGGGATGGTGCATGCCATTAGGACGATT
TATGCGGAGGAAGGATTAGTGGCTCTATGGAGAGGATTGTTACCGAGGCTGATGAGGATC
CCTCCAGGACAAGCCATTATGTGGGCTGTTGCAGATCAGGTCACTGGTCTTTATGAGAAG
AGATATCTCCTTAACGCACCTTTATAGAGAGAGAGTGACAGACTTTTGTTTCTTTTCATG
TCATGGTTTCTTGTTGGTTTATTTTTGCGAGGAATGGGAAAATCCAAATTCAATTCTCCC
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 

AF RS1D863TF U 1
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CTGGTGCTGCCCCCACCGTTATGCGTAACGGCACCAACCAAGCTGTCATGTTCACTGCCA
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CGTTTGATGTTGTCAAGACCAGGTTGATGGCTCAGACCAGAGACGGTGAAGGTGGGCTGA
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TGCGAGGAATGGGAAAATCCAAATTCAATTCTCCCCC

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DS 



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GCCCATGGGTGCTGGTGGATATGGGGGTATGAACCAAAACCAACACATGGGTATGGGAAT
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BQ
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AF RS1AP78TFB U 1
AF RS1AP78JQ C 198
BS 1 834 RS1AP78TFB
BS 835 1048 RS1AP78JQ

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GGGAATGGGACCAGGCATGAACATGGGAGGAGGATATGGCCAAGGTTATCCGATGCAACC
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CGATAAATA

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DS 

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TGAACATGGGAGGAGGATATGGCCAAGGTTATCCGATGCAACCACAAAACCAAGGAATGG
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GAGGATTTCACGTATTGAATGTGTAAACTTTTTTTCATACACGGAACAAATAAGATATGT
TCTCTCTTTTT

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DS 



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TTTGTATTTAGGAAAGTAGGGAGAATTGTGAGTCC


BQ
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GCCATTGGGAGACTCTGA

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DS 



AS 1 2

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BQ
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QA 1 748 1 748
DS 

RD RS1CY59JQ 854 0 0
TCATGTGCATCTTACCACTACTCAGCTCAATGACAATGCCGACTATTACGAATGGGAGAT
AGATGGCAGAATCAGTGATCGCTACAGCACGGGTACTATCTATGCGAAGCTATGTGAGGA
AGGAGCAACTGTACCTTGGTTCAACACGGTCTGGAATAAGAGCGGCATTCCGAGACACAA
CTTCCTTGCTTGGTTGTTTGTCTTGAACCGCTGCCCTACTGAGGACAGGACAATGCGATG
GGGGCATCAGACGAGTCCCTTGTGCCTCCTTTGCAACTTGTCTAACGAAAATCGTGATCA
TCTGTTCTTCTCCTGTCACTACTCCTGGAGTGTGTGGGGTTTGCTATCCCGACGCTGTGG
AATTCTCCCGGAGAGGAATTGGGATCGAGTGCTGTCACAGATTCAGTCAACCAGCCCACA
GACTACTCAAGGAATACTGCTTCGCATCTGCTGGCAAGGATGTATCTATTGGATTTGGCA
GGAACGAAACGCTAGGCTTCATCGGCAGAGCTTCCGTTCGGCTGAGTTGGTCGCAAGGCA
CTTGGAAAGGCAGGTTAGAGACAGGATCTCCTCTCTACGCTCCAAAAATCCGCTGGCCTC
TTCAAAATTGATGCAACAGTGGCTTGCATGATCTATCGCTCTCTGTTCTCCGTCGATTCA
ACTTTTCTCCTCCTCCATCGTTATCATCAAACCATCCTTCTCTTTTCATCTTTAACTCTT
GGGCCTGCTGACCCATTTGATCTAAAATATGTGTTCCTTCTAATTGGGCTTTTGGGCTCT
ACAAAACAAAACCTTGGCTTATGGGCTTGTATATTTTTCTTTCTTTCTGCATTTTAATTT
GAAAGCTTAAGTTC

QA 1 854 1 854
DS 



AS 1 2

CO CL6697Contig1 709 2 2 U
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ATGGAGAAGCAGAGGACTGCTTCTGTAGCTTACATTAGCTTTGGTACAGTCATGATGCCG
CCTCCCGGAGAGCTTGTGGCGATAGCGGAAGGGTTGGAGTCGAGCAAAGTGCCGTTTGTT
TGGTCGCTTAAGGAGAAGAACATGGTTTACCGGAAGGGTTTTTGGAACGGACAAGAGAGC
AAGGGATGGTGGTTCCATGGGCTCCACAAGTGGAACTGCTGAAACACGAAGCAACGGGTG
TATTTGTGACGCATTGTGGATGGAACTCCGTGTTGGAGAGTGTTTCCGGAGGTGTGTCGA
TGATTTGCAGACCGTTTTTTGGGGACCAGAGACTCAACGGAAGAGCTGTTGAGGCTGTGT
GGGAGATTGGAATGACGATTATCGAAGGAGTCTTCACGAGAGATGGATTCGAGAAGTGTT
TGGATCAAGTTTTGGTTCAAGATGATGGTAAGAAGATGAAGGGGAATGCTAAGAAGCTTA
GAGAACAAGCCCACCAAGCTGTCTCTGCAAAAGGAAGCTCTATTGAAAACTTCAAAGGAT
TGTTGGAAGCAGTTGTGGGCACTTTAAATTAAAAAAACACATTTTGTATTACTGGTAACA
ATAGCAGAGTCAAAACAATGTCTTGTGCACCTAAAACACGAATCGCTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1C309JQ C 1
AF RS1C309TF U 1
BS 1 679 RS1C309TF
BS 680 709 RS1C309JQ

RD RS1C309JQ 709 0 0
GCATCCGCATCTCAATCAGATACTACACCAGTGGACGATCCTCACGGCTGTTTGGCTTGG
ATGGAGAAGCAGAGGACTGCTTCTGTAGCTTACATTAGCTTTGGTACAGTCATGATGCCG
CCTCCCGGAGAGCTTGTGGCGATAGCGGAAGGGTTGGAGTCGAGCAAAGTGCCGTTTGTT
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AAGGGATGGTGGTTCCATGGGCTCCACAAGTGGAACTGCTGAAACACGAAGCAACGGGTG
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TGGATCAAGTTTTGGTTCAAGATGATGGTAAGAAGATGAAGGGGAATGCTAAGAAGCTTA
GAGAACAAGCCCACCAAGCTGTCTCTGCAAAAGGAAGCTCTATTGAAAACTTCAAAGGAT
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ATAGCAGAGTCAAAACAATGTCTTGTGCACCTAAAACACGAATCGCTTT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1C309TF 679 0 0
GCATCCGCATCTCAATCAGATACTACACCAGTGGACGATCCTCACGGCTGTTTGGCTTGG
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CCTCCCGGAGAGCTTGTGGCGATAGCGGAAGGGTTGGAGTCGAGCAAAGTGCCGTTTGTT
TGGTCGCTTAAGGAGAAGAACATGGTTTACCGGAAGGGTTTTTGGAACGGACAAGAGAGC
AAGGGATGGTGGTTCCATGGGCTCCACAAGTGGAACTGCTGAAACACGAAGCAACGGGTG
TATTTGTGACGCATTGTGGATGGAACTCCGTGTTGGAGAGTGTTTCCGGAGGTGTGTCGA
TGATTTGCAGACCGTTTTTTGGGGACCAGAGACTCAACGGAAGAGCTGTTGAGGCTGTGT
GGGAGATTGGAATGACGATTATCGAAGGAGTCTTCACGAGAGATGGATTCGAGAAGTGTT
TGGATCAAGTTTTGGTTCAAGATGATGGTAAGAAGATGAAGGGGAATGCTAAGAAGCTTA
GAGAACAAGCCCACCAAGCTGTCTCTGCAAAAGGAAGCTCTATTGAAAACTTCAAAGGAT
TGTTGGAAGCAGTTGTGGGCACTTTAAATTAAAAAAACACATTTTGTATTACTGGTAACA
ATAGCAGAGTCAAAACAAT

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

CO CL6698Contig1 650 2 1 U
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CTTTAACCGGCGAGAATAAATAGTACTCCGTATAATTCATTCGCCATGAATGAGAATTTA
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GAGTTAGGAGGACTCTTCTGTAAGCCTCTTCCTTGCTTCGGTTTTGGAATCGGATGGTTC
TCGTTTCTTGTTGGATTCGTCTTCCCGTTTGCGTGGTACTTTGCCACATTTCTTTATCTC
TCCAACTATTACCGTAGAGATCCTCGGGAAAGATCTGGTCTTGCTGCCTCTGCTATTGCT
GCGTTGATATTCACTGTCGCACTTGTGATTACCGTTCTTGTACTCGTTTTCTCGGGTCGC
TAGAGTCCGATTGCATATTCTTTCCGGGGGAGTAAAAGTGTTCTGTTTTGCTGAAGAAGA
GAAGATATACTGCTTGTCCTTTTAGATTCAAAGTTTGGTTTGGTTCTTCTTGTGCATAAA
AATGTCAAATTCTTAAAATATCAAAAATGTGATACCTAACTGACTGTTGG


BQ
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AF RS1BF48JQ C 1
AF RS1BF48TF U 1
BS 1 650 RS1BF48TF

RD RS1BF48JQ 650 0 0
GGGAACAAGAAGAAGAAGAAGCAAGAATCTCTCCTTCTGAAGATCACGGTCACGAATCTC
GCAGGCAATCTCTCTCGATCGTTCGTCCCTTTAAGAGATTTTAAATTTTCTGGGGAGTTT
CTTTAACCGGCGAGAATAAATAGTACTCCGTATAATTCATTCGCCATGAATGAGAATTTA
GAGGAAAAGAAGAAGGGCAAGTATATTCTGATCCGTGACGGTGAAGAGGAGGACACCACT
GAGTTAGGAGGACTCTTCTGTAAGCCTCTTCCTTGCTTCGGTTTTGGAATCGGATGGTTC
TCGTTTCTTGTTGGATTCGTCTTCCCGTTTGCGTGGTACTTTGCCACATTTCTTTATCTC
TCCAACTATTACCGTAGAGATCCTCGGGAAAGATCTGGTCTTGCTGCCTCTGCTATTGCT
GCGTTGATATTCACTGTCGCACTTGTGATTACCGTTCTTGTACTCGTTTTCTCGGGTCGC
TAGAGTCCGATTGCATATTCTTTCCGGGGGAGTAAAAGTGTTCTGTTTTGCTGAAGAAGA
GAAGATATACTGCTTGTCCTTTTAGATTCAAAGTTTGGTTTGGTTCTTCTTGTGCATAAA
AATGTCAAATTCTTAAAATATCAAAAATGTGATACCTAACTGACTGTTGG

QA 1 650 1 650
DS 

RD RS1BF48TF 650 0 0
GGGAACAAGAAGAAGAAGAAGCAAGAATCTCTCCTTCTGAAGATCACGGTCACGAATCTC
GCAGGCAATCTCTCTCGATCGTTCGTCCCTTTAAGAGATTTTAAATTTTCTGGGGAGTTT
CTTTAACCGGCGAGAATAAATAGTACTCCGTATAATTCATTCGCCATGAATGAGAATTTA
GAGGAAAAGAAGAAGGGCAAGTATATTCTGATCCGTGACGGTGAAGAGGAGGACACCACT
GAGTTAGGAGGACTCTTCTGTAAGCCTCTTCCTTGCTTCGGTTTTGGAATCGGATGGTTC
TCGTTTCTTGTTGGATTCGTCTTCCCGTTTGCGTGGTACTTTGCCACATTTCTTTATCTC
TCCAACTATTACCGTAGAGATCCTCGGGAAAGATCTGGTCTTGCTGCCTCTGCTATTGCT
GCGTTGATATTCACTGTCGCACTTGTGATTACCGTTCTTGTACTCGTTTTCTCGGGTCGC
TAGAGTCCGATTGCATATTCTTTCCGGGGGAGTAAAAGTGTTCTGTTTTGCTGAAGAAGA
GAAGATATACTGCTTGTCCTTTTAGATTCAAAGTTTGGTTTGGTTCTTCTTGTGCATAAA
AATGTCAAATTCTTAAAATATCAAAAATGTGATACCTAACTGACTGTTGG

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL6699Contig1 685 2 2 U
TTTTTTTATAGCAACAACTAAAATTTTATATGGCAGTAAAGAAAATTGTGTGTTTTCTTC
TTACCATCTCAATGAACAATGTAATATGTATGCAGAATCCTTATTGCACTCTTGCTTAAT
TAGGATAAATATTCGAAACATATAGATATCAGCAGATAGGCATATAAATCCAGGCCAATC
AATCTGTTTTACCATTTCCATCTAAGTTCTTGAGCCCTTCTTGGATTCTTCAACTTCTCC
TTTCTTGTTTTACCTTCACCAGCTTCACACTTCTCTCTGTTAACCAGATTCTCTGCTTTT
TTCATCTTGTCATTGTCTACTTCCTTCTTCCTCTCATTGATTTCAATCTTGGTATCTCCT
TCCATCTTTATGCTTATGTTCACTTCCAATACTCTCTTGCTCTTTCTCATGGAAACATCC
AACGACTCTTCTCTTTCCCTTCTTTGTTCATACAGCCTGCGCAGCTTGAGTGCCAGATTG
TAGATCCCATCCTTGAACTCTCCTTCCAAATTTCTTTCTATTTCCATTTCAAGCTCATCA
CGAATCCTCTCTTCTTCTTTGGACAATAAGAGTCTTCTGTCCTCCTTCTCTTGGTCCATG
ACTTTCAATTTTATGTCTCTCTTTCTTTTATGATGCGGTCCCCTAGCTTGTGTCTAGTTC
TTTTTTTTTCTCACTTGATTCGTCC


BQ
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AF RS1DX18TF C 1
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AACGACTCTTCTCTTTCCCTTCTTTGTTCATACAGCCTGCGCAGCTTGAGTGCCAGATTG
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QA 1 685 1 685
DS 

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AATATTCGAAACATATAGATATCAGCAGATAGGCATATAAATCCAGGCCAATCAATCTGT
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TTATGCTTATGTTCACTTCCAATACTCTCTTGCTCTTTCTCATGGAAACATCCAACGACT
CTTCTCTTTCCCTTCTTTGTTCATACAGCCTGCGCAGCTTGAGTGCCAGATTGTAGATCC
CATCCTTGAACTCTCCTTCCAAATTTCTTTCTATTTCCATTTCAAGCTCATCACGAATCC
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QA 1 678 1 678
DS 



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BQ
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QA 1 690 1 690
DS 



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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CA10JQ U 80
AF RS1D291JQ U 1
BS 1 591 RS1D291JQ
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RD RS1CA10JQ 696 0 0
GG
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AAAATCAGAAAACTCTTTTTCTTTCTAGCGCATTTCATATTATATTACTGATTCATCTCT
TCTAGAAGTGGAATAGGTTTGGTTGTGTCATAGCAAAAACACTATCAATGGAAGCCATGA
GAAGCACAAGACAAGAATGGTGTTTGGTGAATAGGCGACAGCAGCTAAGGATCTCGAGAA
CTGAACTGAACCTGAGTAGGTCCCAGCCGTTGATTCCATGTCTGGTGTTCTCGTCTGAAG
AGTAACATTTTTGCAAGAACCAAAAGCTGCTTCTGGCTGGCAGGCAGCAAGGGTTTCACA
ACCGCAAATAACAGGTCCATTCATTCTGTCTAGAACTTCGAAAACGCCTCCTCCATCACT
TCTCATGTAGAAGTTAACGGCGAGAAAGTTTGGCATTCTATTCCCAGCTGACTTGAGACA
AGTCCCAACCATCTCAGCAAGCGGAGCTGAATGCTCCTTGCAAGCATCTTTCTCTACCGG
AGACGTAGGGAAGTAATTCATCAAGAAAAGAGATGAACCTTTTGAATTCAAAGGTTGTGA
TTCTTTTCTGTTCGGACAAGAACCTCGCTTCACACCTGGATCTCCAGATTCATTTTCGAC
AATGTATCTCCATTGATAAGCAACGCCTTCTTCC

QA 3 696 3 696
DS 

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AGTCTACAAATAACAAGAATCAAAATCAGAAAACTCTTTTTCTTTCTAACGCATTTCATA
TTATATTACTGATTCATCTCTTCTAGAAGTGGAATAGGTTTGGTTGTGTCATAGCAAAAA
CACTATCAATGGAAGCCATGAGAAGCACAAGACAAGAATGGTGTTTGGTGAATAGGCGAC
AGCAGCTAAGGATCTCGAGAACTGAACTGAACCTGAGTAGGTCCCAGCCGTTGATTCCAT
GTCTAGTGTTCTCGTCTGAAGAGTAACATTTTTGCAAGAACCAAAAGCTGCTTCTGGCTG
GCAGGCAGCAAGGGTTTCACAACCGCAAATAACAGGTCCATTCATTCTGTCTAGAACTTC
GAAAACGCCTCCTCCATCACTTCTCATGTAGAAGTTAACGGCGAGAAAGTTTGGCATTCT
ATTCCCAGCTGACTTGAGACAAGTCCCAACCATCTCAGCAAGCGGAGCTGAGTGCTCCTT
GCAAGCATCTTTCTCTACCGGAAACGTAGGGAAGTAATTCATCAAGAAAAGAGATGAACC
TTTTGAATTCAAAGGTTGTGATTCTTTTCTGTTCGGACAAGAACCTCGCTTCACACCTGG
ATCTCCAGATTCATTTTCGACAATGTATCTCCATTGATAAGCAACGCCTTCTTCCTCTTC
TTTAGCAGCAACAGAAGTGAAACCAAGAGCCTGTGATTCTCTTGCACCATGTCAGTCACA

QA 1 840 1 840
DS 



AS 1 2

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AAATTGTTCCCATTTCCACTGAGTTTGTTATTCCAGATGTGAGCCGTGATCTTTACCAGT
TGACGGGTATCTCCTACAAGGATGATTCTGTTACCCTTATGCATCGTAGCGGCGCCTACA
CTAGGACGATATCTTTCTTCCCGAGAACGAGAACCTCAGGACCATGATGGTTGATGGATT
CAACAATGGTAACAGCGTTGTTGTGGGTATCGTCACTTCATTGGGGCAGGATGCTGTTTA
TGCCGTCGATGTCTACCAGGCCGGTACAGCTATTACGTTCAATCCCAATGATGATCTTTT
GAACCAAAGCAAAACAAATGACAATAGTGATGTTGTTTTGGTCAGAAATGTTGGCTTCTA
AGAAATAAGTAGTCCCTAATTGTCTTGCCATGGGCATAATGCCAGGCAATTACTGAACCC
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AAACATTATGTAGTTGTTTTTTTTTTAAATAAAAATTATGTAGTTGTTTTTGTGTGTTGT
TGTTTTATTTCTCCTCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EJ83TF U 1
AF RS1EJ83JQ C 182
BS 1 719 RS1EJ83TF
BS 720 798 RS1EJ83JQ

RD RS1EJ83TF 719 0 0
GGAAGTGACGGCGTTTTGGTTTACAATCTCTCTCTCTCTCGTGCTAAATCATGACGGAGT
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CAACAATGGTAACAGCGTTGTTGTGGGTATCGTCACTTCATTGGGGCAGGATGCTGTTTA
TGCCGTCGATGTCTACCAGGCCGGTACAGCTATTACGTTCAATCCCAATGATGATCTTTT
GAACCAAAGCAAAACAAATGACAATAGTGATGTTGTTTTGGTCAGAAATGTTGGCTTCTA
AGAAATAAGTAGTCCCTAATTGTCTTGCCATGGGCATAATGCCAGGCAATTACTGAACCC
GAACCCTGATATTAAGTCTTTGGTTATCCTAGTATTGTAACAACAACACTCAGGAAGAT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RS1EJ83JQ 617 0 0
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AATTGTTCCCATTTCCACTGAGTTTGTTATTCCAGATGTGAGCCGTGATCTTTACCAGTT
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AACAATGGTAACAGCGTTGTTGTGGGTATCGTCACTTCATTGGGGCAGGATGCTGTTTAT
GCCGTCGATGTCTACCAGGCCGGTACAGCTATTACGTTCAATCCCAATGATGATCTTTTG
AACCAAAGCAAAACAAATGACAATAGTGATGTTGTTTTGGTCAGAAATGTTGGCTTTTAA
GAAATAAGTAGTCCCTAATTGTCTTGCCATGGGCATAATGCCAGGCAATTACTGAACCCG
AACCCTGATATTAAGTCTTTGGTTATCCTAGTATTGTAACAACAACACTCAGGAAGATAA
AACATTATGTAGTTGTTTTTTTTTTAAATAAAAATTATGTAGTTGTTTTTGTGTGTTGTT
GTTTTATTTCTCCTCAA

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 2

CO CL6703Contig1 683 2 1 U
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ATATGTTTGACGACACATAAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RS1G258TF U 1
AF RS1GF37TF U 1
BS 1 683 RS1G258TF

RD RS1G258TF 683 0 0
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TTATACTGCGTCTGATAACTCAAAGCCAAGTGAAAGACGAGTGTCGTCACTGCATGCAAA
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TACTTTGCGGCGCCATTCTCTGCCTTCTCCAGCCAATGGTAAGCCAGGTACTACTACTAC
TATGTCTCCAAGGGCTCACAAGCTTCTCCTAGCCTCGGCCAAAGCATCTATGAACGGCGA
CAGATCTGTTTCTTCTTCAAAGAACAAAACTGATAAGTCAAACAAAACCGAGTGGAAACG
TTAAAGGTTCGGGCAAAAGAGATTTCATCTCATTGTCTTATACAATCGACCTTAACTACT
TAGTGTGCTCTTTCTCTTTCTCTTGCGTTTTGGTTTGGTTTGGTTTGGTGAGTTTAGAGA
GTGTTTAGTCAGAGTTGTTCATTTCATCCTTTTTCATTTGTTGCTTCTGTTTACTCTGAT
ATATGTTTGACGACACATAAAAA

QA 1 683 1 683
DS 

RD RS1GF37TF 678 0 0
AGGACACGGTGCTGAGTCTGCTGAAAAGGAGAAAGATACCACAGATGTAGTTCCTACAGA
GCTTGATGTCGAAGAAAAAGAGAACTCACAGGAGGAGGAAGAGGAAATCAGAGCTTCAGA
GACCAATGATAAAGGTGAAGACCTCAAATGCTCAGATGTGAAGGTAAGCTCTGACAATGG
TTATACTGCGTCTGATAACTCAAAGCCAAGTGAAAGACGAGTGTCGTCACTGCATGCAAA
TGATGAAGGGCGTACACATAGCGGGAGGAAAGTCCCCAGCTACATGGCCCCGACTGCGTC
TACTTTGCGGCGCCATTCTCTGCCTTCTCCAGCCAATGGTAAGCCAGGTACTACTACTAC
TATGTCTCCAAGGGCTCACAAGCTTCTCCTAGCCTCGGCCAAAGCATCTATGAACGGCGA
CAGATCTGTTTCTTCTTCAAAGAACAAAACTGATAAGTCAAACAAAACCGAGTGGAAACG
TTAAAGGTTCGGGCAAAAGAGATTTCATCTCATTGTCTTATACAATCGACCTTAACTACT
TAGTGTGCTCTTTCTCTTTCTCTTGCGTTTTGGTTTGGTTTGGTTTGGTGAGTTTAGAGA
GTGTTTAGTCAGAGTTGTTCATTTCATCCTTTTTCATTTGTTGCTTCTGTTTACTCTGAT
ATATGTTTGACGACACAT

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 2

CO CL6704Contig1 707 2 2 U
GACTTGTAATCTTTGGACTTTCAAGTCTGTGTTTATTTTTATGGTATCAATTTGGGAAAA
AAAAATGTATCTGCAGGGATTGAGAGGCATATCGGATGAAAGTTTGACGGTCAGAGTGAA
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GCAAAGCCATTACGTTGCAACACGACAGGCTTTTCTCTAAATGGCAGGAGAGGGTCTGTG
ATTCAAGATGGGAACCATTCAAAATTCAGAGATCTGGAGATAAAATTTTGGGAGTTGTGG
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CTGTACTGTGGAATTTTGAACGTGGGAGAAAAGCAACAGTCAAGGAAGGGATTATTGCCA
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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1D122JQ C 1
AF RS1D122TF U 1
BS 1 685 RS1D122TF
BS 686 707 RS1D122JQ

RD RS1D122JQ 707 0 0
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QA 1 707 1 707
DS 

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CTTGTGTATTCCTATGAATATAAAT

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL6705Contig1 795 2 2 U
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CGTTACCTGTGTGGTTTCCTATACAAATTCTCGACGAAGAAACCCTTGCTAATAAGAAAG
CCAAGGAACAGAAACTCTTCACAAGATTGAACAAAGAAGAATCTTGACATCCGATCAAAA
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ACTTCAACACCCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DT24TF U 1
AF RS1DT24JQ C 56
BS 1 730 RS1DT24TF
BS 731 795 RS1DT24JQ

RD RS1DT24TF 730 0 0
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AACGTAGGAAAGCTCATCCCAATATACCAGCTACCTATGCTACTAATTCTGCCATCGTTG
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GAGGGCCTCGCGGTGCATTTCGATACTCTATAGCTTTTGCTACGGTTGGCACAGCATTTG
ATTATGCTAGCCTTAAATCCGAACCTTTATTAGAGAGAGTGCGTAACATGGATTCAATCA
CGTTACCTGTGTGGTTTCCTATACAAATTCTCGACGAAGAAACCCTTGCTAATAAGAAAG
CCAAGGAACAGAAACTCTTCACAAGATTGAACAAAGAAGAATCTTGACATCCGATCAAAA
CAGTTTATTTCGGCGTCGTAATTCCGTTTTTTTAGATGACTTTGAGGAGGAACCTTGATA
TTTTTGTTTCTTATTTGTTACACTATAAAAGTAGTTGTAAACACCTACGAAGTGTTCACT
TCTCGGGTTG

QA 1 730 1 730
DS 

RD RS1DT24JQ 740 0 0
ACTCTCAGAAGAGGCGATTCAGCTTCCAACGTCAACGATTGAGCAGCCGCCTTCGTTATC
GGAGCGTTTATTGATCCCCACTCTTCTCGCAGGAGTAACAGGGGGAGGAGTTGGTTTACT
GTCAAAACGTAGGAAAGCTCATCCCAATATACCAGCTACCTATGCTACTAATTCTGCCAT
CGTTGCTGCTTGCTATTGCGGGGTTCGTGAATTGGTTAGAGTAACTAGAAAATCACAAGA
CGATGACTTAATGAATTCAGCCATTGGTGGTCTTTTCAGTGGTGCTTTATTAGGACGACT
TCAAGGAGGGCCTCGCGGTGCATTTCGATACTCTATAGCTTTTGCTACGGTTGGCACAGC
ATTTGATTATGCTAGCCTTAAATCCGAACCTTTATTAGAGAGAGTGCGTAACATGGATTC
AATCACGTTACCTGTGTGGTTTCCTATACAAATTCTCGACGAAGAAACCCTTGCTAATAA
GAAAGCCAAGGAACAGAAACTCTTCACAAGATTGAACAAAGAAGAATCTTGACATCCGAT
CAAAACAGTTTATTTCGGCGTCGTAATTCCGTTTTTTTAGATGACTTTGAGGAGGAACCT
TGATATTTTTGTTTCTTATTTGTTACACTATAAAAGTAGTTGTAAACACCTACGAAGTGT
TCACTTCTCGGGTTGCTTTTACTTGTTTGTGGTTGTGGTTTTTGAATTAAGGGTCGCTAT
AGTCAACTTCAACACCCTTC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6707Contig1 731 2 2 U
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CTAGACTTAAGTAGCGAACTAGCGTCTACTTCAAACGTAAATTTATGCATTTCTCTAAAG
ATTAAAGGTTAGAACATGTCCAATTCAACTGCATAATTTACTGCATTTTTCACTTCATTT
TATAGTAAATTATACAGTGGTGTTGTAGATGTTCTTTGTGGTATTATTTGAAAGAAAAAA
ATGCTCTACTAAATAAGGTAAAAGCTTTCAAAAGTAAATGCAAATAACCAATCAAAAGCA
TAGTTAAGATATGTTTATTTGTTGCGTTTGCATATGCATATTGAAACCACAAATCTTTAT
ATTTCAAGTTAGCAAAAAAATAATCTTTATATTTCAAATCTTTTTTTAATTCTTTTACAG
TAATCCAAATATTCTTATGGAAACCGCACAAAGATTTACTAACTTAAGAATGTGATTTAT
TTAAATAAAAAAGTTTTCACATGTAAACGTAACTGCATGCACATAATTACAATTGATTTT
ATTTTGTTGAGAATGTTCTTAGCGTTCACCAATGCCACTACATAACGGGTTAGAAAAAAA
AAACTTAACTTAGGCATGAAAACATTCGCGATCTTCAGTGATTCTTGATATGTATAGAAT
TTCTTTTTTGAAAAAATATGTATGTATAGGTATGTATAGGTTCAAAAAAAAATATGTATG
TATAAAGTTAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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ATGCTCTACTAAATAAGGTAAAAGCTTTCAAAAGTAAATGCAAATAACCAATCAAAAGCA
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ATTTCAAGTTAGCAAAAAAATAATCTTTATATTTCAAATCTTTTTTTAATTCTTTTACAG
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TTAAATAAAAAAGTTTTCACATGTAAACGTAACTGCATGCACATAATTACAATTGATTTT
ATTTTGTTGAGAATGTTCTTAGCGTTCACCAATGCCACTACATAACGGGTTAGAAAAAAA
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BQ
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AF RS1FS43TF U 1
AF RS1FS43JQ C 57
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QA 1 771 1 771
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BQ
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DS 



AS 1 2

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CATCCATCTCTACTTTTATCCATCCATCCATCTCCATCCATCAACAACCATCCATCTATC
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GATGTTTTGGTGTGTTATGTCGTGTTC


BQ
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GGATTTGCATTTCCGGAGGTTTCTCTATTTTCTTTGGTTCCTTGGCGAGAAGGTGGAGCT
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TGTTCTGTTTCTTCTGCTCGCGAGGAGGAGGTTCAGTTTCATTCTCCTGTTCTTCCTCTT
CACTTTGAATTCTCTTTTCCTGATTCTCTGGCTTGTCCGTTCTATGAAGACGTGTGTTCT
TTG

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GCTTGGGGCTACTGGTCAGGGAGTGCGGAGGTTGTTACAATCTGTTTCGCTTGGTCCGGC
ATTGTGTACATGATGGTTCCAAGTCGAATAATTGCTTGTTTTTGCTGGTGTCGGTGTGCT
TGGCCTTTAATGTTACAGCTTGTTCTTGTGGGCATGTGCTAGCTAGGAGGTACTCCGCGA
GCTGTTTTCGGCTGAGCCAATATCTTTAAGATATATTGCATCAGGGAGGCCAAAATTATC
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TGGCCGTGCTTCTGGATTGATGTTTTGGTGTGTTATGTCGTGTTC

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DS 



AS 1 2

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ACTGGAGAACCTTCTTCATCGCGGTTGCCGAGCTTTTTGGATACAACAATGGAGAAGAGT
GGATGGTCTCACACTTCTTGTTCAAGAAGAAGTGATTTACATATCTTTCTTCTCTTATTT
ATCAGTTCTTGAAATTTCGTGTGCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D541TF U 1
AF RS1D541JQ C 511
BS 1 710 RS1D541TF
BS 711 1105 RS1D541JQ

RD RS1D541TF 711 0 0
TTAAGGTAGCTTATGACGCATCCGTGAAGACAGTTTTAACACTGTTGGAGAAGAATCTTT
TACCAAATGTTGTCATAAGGCGGTTGACGCGTCTGCTTCTCGCCGGTCGACTTCGTTCCG
GTTACAAACCCACGGCGGATCTGCAACTTTCCGATCTCCTCCGTTTCGTCAACGCTATAA
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CAGCTTTCTTCGAGCTTGTTCTTGGAAGAAACGTGAAATACAGCTCTTGCTACTTCTCTA
ACGATTCAAGTAGCCTAGAAGATGCAGAGGAAGCAATGCTAGCTCTATATTGCCAGAGGG
CTAAAGTGGAAGATGGACAGAGTGTTCTTGATGTCGGATGTGGCTGGGGATCTTTGTCCT
TGTACATTGCCCGCAAGTACAGCAACTGCAAGATAACAGGTCTCTGCAACTCAAAAACAC
AGAAAGCATTCATCGAGGAGCAATGCTGGAAACGTGGGATTCAAAATATCGAAATAATGG
TTGGAGATATTAGCACATTTGAGCATGAAGGGACATACGACCGAGTATTCTCCATCGAAA
TGTTCGAGCATATGAAAAACTATGGGGAGCTTCTGAAGAAAATTGGAAAGTGGATGAAAG
AAGATGGTCTTCTGTTTGTTCACTATTTCTGCCATAAGACATTTGCTTAC
A

QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1D541JQ 595 0 0
AACGTGGGATTCAAAATATCGAAATAATGGTTGGAGATATTAGCACATTTGAGCATGAAG
GGACATACGACCGAGTATTCTCCATCGAAATGTTCGAGCATATGAAAAACTATGGGGAGC
TTCTGAAGAAAATTGGAAAGTGGATGAAGGAAGATGGTCTTCTGTTTGTTCACTATTTCT
GCCATAAGACATTTGCTTACCACTTTGAGGATGTGAATGACGATGACTGGATCACAAGAC
ACTTCTTCAGTGGAGGAACAATGCCATCAGCAAATCTTCTCCTCTACTTCCAAGAAGATG
TTGCGATTGTGGATCATTGGCTACTAAATGGGAAGCATTATGCAAATACCAGTGAAGAGT
GGCTGAAAAGAATGGACAAGGAGATAGTTGCAATAAAGGAGATAATGGAAATGACTTATG
GGAAAGAGGAGGCAGTGAAGTGGACGGTTTACTGGAGAACCTTCTTCATCGCGGTTGCCG
AGCTTTTTGGATACAACAATGGAGAAGAGTGGATGGTCTCACACTTCTTGTTCAAGAAGA
AGTGATTTACATATCTTTCTTCTCTTATTTATCAGTTCTTGAAATTTCGTGTGCC

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 2

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GAGACACGACTCGCTCTAAAGATTAGACTCTAGTCTCAAGGCGAAAAGTGGGCTGAACTT
GGATTGGAGAACCATGGAATCGAATAAAGTGTTGGAAGAGGAAGAAGAAGAGATGTGGAG
GAGAGAGATAGTAACAAGCGTGATGAGGATAGTGAGCACGAGATTGCCACAGAAAGATTT
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CGACACTCATCTTCAACTTGTGCAAAGCCAGTGTCATGATGCGCTTTCAAGCTTAGAATG
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BQ
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AF RS1F751TF U 1
AF RS1F751JQ C 44
BS 1 674 RS1F751TF
BS 675 675 RS1F751JQ
BS 676 702 RS1F751TF
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RD RS1F751TF 741 0 0
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GAGACACGACTCGCTCTAAAGATTAGACTCTAGTCTCAAGGCGAAAAGTGGGCTGAACTT
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GGTTTCTCTCCTTCTCGTTAGCCCCTGGCTCTATCGCACACTCGTCTCTTACCCTTCCAT
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GTCCTTGCAAAGATATTGTCAAGTGAAGCATATCAATCTTGAATTTTCCCAGGGTGTTGA
CGACACTCATCTTCAACTTGTGCAAAGCCAGTGTCATGATGCGCTTTCAAGCTTAGAATG
CTTGAATCTGAATGGGTGCCAAAAGATATCAGACAGTGGAATCGAAGCTATAACAAGCGT
ATGTCCCAAGCTAAAAATTATCTCTATCTACTGGAACGTGAGGGTGACTGATGATTGTAT
TAGACATCTAGTCAAGAATTGCAGAAACATCATTGATTTGAACATAAGTGGCTGCAAGAG
CATAACCGACAAAG*TATGGAACTAGTAGCTGAAAGTTATCA*GACTTAGAGTCGCTGA*
CATCACTAG
TGTGTTAGATCA

QA 1 729 1 729
DS 

RD RS1F751JQ 844 0 0
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TTTTCCCAGGGTGTTGACGACACTCATTTTCAACTTGTGCAAAGCCAGTGTCATGATGCG
CTTTCAAGCTTAGAATGCTTGAATCTGAATGGGTGCCAAAAGATATCAGACAGTGGAATC
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GTGACTGATGATTGTATTAGACATCTAGTCAAGAATTGCAGAAACATCATTGATTTGAAC
ATAAGTGGCTGCAAGAGCATAACCGACAAAGGTATGGAACTAGTAGCTGAAAGTTATCAA
GACTTAGAGTCGCTGAACATCACTAGGTGTGTTAAGATCACAGATGATGGATTACTTCAA
GTGCTACACAAGTGTTCCTCTTTGCAAACCTTAAACCTCTATGCCCTTTCAAGCTTCACA
GACAAAGCTTACAAAAAGATATCAGACAGTGGAATCGAAGCTATAACAAGCGTATGTCCC
AAGG

QA 1 844 1 844
DS 



AS 1 2

CO CL6713Contig1 791 2 7 U
GGCCGGTGAAACTAAACAGAACAACAAGGTTTTGTCTCGAAACACCAGCTCCGAGTTTTA
CTTAGATCTTGTTTCTCTCTCTCTACTGATTTTGAAAAAAAAAGGTGAAAGAAACTTTTA
AGGGAATGCAGAGAGATGGTCGGAGTATCGCCGGTGAAGACTAAGCTGTGTGATCGTTTT
AACCGATCTGTCACCGGCAGAAACAGCCACCGGAAACACGTTGAGGACGGGTGATTAGTT
CAAAAACCACCAGATATCGAAATCCTAAATCTTCTTTTTTTTCTTTTTTTAATATTTGTA
AGAAAAAAACTATGGACGGATCTAAACCGGTGAAAGCGATGGAGAAAGGATCTGACGCTA
AGGCAAGTACTACAGGGCTTCTCCACGGGCGTTACGAGCTAGGTCGTCTCCTAGGACACG
GTACATTCGCGAAAGTGTACCACGCACGTAACGTAACAACCGGAAAAAGCATGGCGATGA
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TCTCGGTGATGAGCATGGTGAAGCATCCCAACATCGTCGAGCTCCACGAGGTCATGGCAA
GCAAATCCAAGATCTACTTCGCCATGGAGCTGGTCCGAGGCGGCGAGCTGTTCGCCAAAA
TCTCCAAAGGAAGACTACGCGAGGACGTGGCGCGCGTGTACTTCCAACAGCTGATCTCCG
CCGTCGATTTCTGCCATAGCCGGGGAGTTTACCACCGTGATCTCAAACCGGAGAATCTGT
TGCTTGACGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FR68TF U 6
AF RS1BL07TF U 1
BS 1 102 RS1BL07TF
BS 103 103 RS1FR68TF
BS 104 550 RS1BL07TF
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BS 591 591 RS1FR68TF
BS 592 791 RS1BL07TF

RD RS1FR68TF 698 0 0
GG
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CTTGTTTCTCTCTCTCTACTGATTTTGAAAAAAAAAGGTGAAAGAAACTTTTAAGGGAAT
GCAGAGAGATGGTCGGATTATCGCCGGTGGAGACTAAGCTGTGTGATCGTTTTAACCGAT
CTGTCACCGGCAGAAACAGCCACCGGAAACACGTTGAGGACGGGTGATTAGTTCAAAAAC
CACCAGATATCGAAATCCTAAATCTTCTTTTTTTTCTTTTTTTAATATTTGTAAGAAAAA
AACTATGGACGGATCTAAACCGGTGAAAGCGATGGAGAAAGGATCTGACGCTAAGGCAAG
TACTACAGGGCTTCTCCACGGGCGTTACGAGCTAGGTCGTCTCCTAGGACACGGTACATT
CGCGAAAGTGTACCACGCACGTAACGTAACAACCGGAAAAAGCATGGCGATGAAAGTCGT
GGCCAAAGAGAAAGTCATAAAGGTTGGCATGGTGGAGCAGATCAAGCGAGAGATCTCGGT
GATGAGCATGGTGAAGCATCCCAACATCGTCGAGCTCCACGAGGTCATGGCAAGCAAATC
CAAGATCTACTTCGCCATGGAGCTGGTCCGAGGCGGCGAGCTGTTCGCCAAAATCTCCAA
AGGAAGACTACGCGAGGACGTGGCGCGCGTGTACTT

QA 3 698 3 698
DS 

RD RS1BL07TF 791 0 0
GGCCGGTGAAACTAAACAGAACAACAAGGTTTTGTCTCGAAACACCAGCTCCGAGTTTTA
CTTAGATCTTGTTTCTCTCTCTCTACTGATTTTGAAAAAAAA*GGTGAAAGAAACTTTTA
AGGGAATGCAGAGAGATGGTCGGAGTATCGCCGGTGAAGACTAAGCTGTGTGATCGTTTT
AACCGATCTGTCACCGGCAGAAACAGCCACCGGAAACACGTTGAGGACGGGTGATTAGTT
CAAAAACCACCAGATATCGAAATCCTAAATCTTCTTTTTTTTCTTTTTTTAATATTTGTA
AGAAAAAAACTATGGACGGATCTAAACCGGTGAAAGCGATGGAGAAAGGATCTGACGCTA
AGGCAAGTACTACAGGGCTTCTCCACGGGCGTTACGAGCTAGGTCGTCTCCTAGGACACG
GTACATTCGCGAAAGTGTACCACGCACGTAACGTAACAACCGGAAAAAGCATGGCGATGA
AAGTCGTGGCCAAAGAGAAAGTCATAAAGGTTGGCATGGTGGAGCAGATCAAGCGAGAGA
TCTCGGTGATTAGCATGGTGAAGCATCCCAACATCGTCGAGCTCCACGAGTTCATGGCAA
GCAAATCCAAGATCTACTTCGCCATGGAGCTGGTCCGAGGCGGCGAGCTGTTCGCCAAAA
TCTCCAAAGGAAGACTACGCGAGGACGTGGCGCGCGTGTACTTCCAACAGCTGATCTCCG
CCGTCGATTTCTGCCATAGCCGGGGAGTTTACCACCGTGATCTCAAACCGGAGAATCTGT
TGCTTGACGAA

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 2

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GCAAGGAGTGATTGTATTGGGAGATGCATTCAACATGCGTCACCCAGCAATTGCATCTGG
AATGATGGTTTTATTGTCTGACATTCTCATCCTACGTCGCCTTCTCCAGCCATTGCGAAA
CCTTGGTGATGCAAACAAAATCTCAGAAGTTATTAAGTCATTTTATATCATCCGAAAGCC
AATGTCAGCGACGGTGAACACACTAGGAAATGCATTTTCTCAAGTGCTAGTTGCATCGAC
GGACGAAGCAAAAGAAGCGATGCGACAAGGCTGTTTTGATTACCTCTCTAGTGGCGGCTT
TCGCACGTCAGGCATGATGGCTCTGTTCGGAGGCATGAACCCTCAGCCACTCTCTCTCAT
CTTTCATCTTTGTGGTATTACTTTATCCTCCATTGGTCAACTGCTCTCTCCATTCCCATC
TCCTCTTGGCATTTGGCATAGCCTCAGACTTTTTGGTTTGTCTATGAAAATGTTGGTTCC
TCATCTTAAGGCGGAAGGGGTTAGCCAAATGTTGTATCCAGCATACGCAGCTGCGTATCG
CAAAAGCTATATGGCTGCAACAGCTCTCTAAGCAGCGATGATATGAACCGCGAATAATAC
TATGACATATTTGGAGCGCTAGTATTTGTGGTTGTGCATTTGTTATTTGTTAAATATGTA
CTGCAGTGTGCTTACTATTATTAGTTTATACCCGTCGCTATTGTAATAATAAAACGGCCC
CCTGTTTTGTTGAATGTGCCAAATTTGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1ED58TF U 1
AF RS1ED58JQ C 70
BS 1 756 RS1ED58TF
BS 757 810 RS1ED58JQ

RD RS1ED58TF 756 0 0
TGAGGGAGCACAAATAAAAACAATGCCAACAAAGAGAATGGAAGCTACTTTGAGCGAGAA
GCAAGGAGTGATTGTATTGGGAGATGCATTCAACATGCGTCACCCAGCAATTGCATCTGG
AATGATGGTTTTATTGTCTGACATTCTCATCCTACGTCGCCTTCTCCAGCCATTGCGAAA
CCTTGGTGATGCAAACAAAATCTCAGAAGTTATTAAGTCATTTTATATCATCCGAAAGCC
AATGTCAGCGACGGTGAACACACTAGGAAATGCATTTTCTCAAGTGCTAGTTGCATCGAC
GGACGAAGCAAAAGAAGCGATGCGACAAGGCTGTTTTGATTACCTCTCTAGTGGCGGCTT
TCGCACGTCAGGCATGATGGCTCTGTTCGGAGGCATGAACCCTCAGCCACTCTCTCTCAT
CTTTCATCTTTGTGGTATTACTTTATCCTCCATTGGTCAACTGCTCTCTCCATTCCCATC
TCCTCTTGGCATTTGGCATAGCCTCAGACTTTTTGGTTTGTCTATGAAAATGTTGGTTCC
TCATCTTAAGGCGGAAGGGGTTAGCCAAATGTTGTATCCAGCATACGCAGCTGCGTATCG
CAAAAGCTATATGGCTGCAACAGCTCTCTAAGCAGCGATGATATGAACCGCGAATAATAC
TATGACATATTTGGAGCGCTAGTATTTGTGGTTGTGCATTTGTTATTTGTTAAATATGTA
CTGCAGTGTGCTTACTATTATTAGTTTATACCCGTC

QA 1 756 1 756
DS 

RD RS1ED58JQ 741 0 0
GATTGTATTGGGAGATGCATTCAACATGCGTCACCCAGCAATTGCATCTGGAATGATGGT
TTTATTGTCTGACATTCTCATCCTACGTCGCCTTCTCCAGCCATTGCGAAACCTTGGTGA
TGCAAACAAAATCTCAGAAGTTATTAAGTCATTTTATATCATCCGAAAGCCAATGTCAGC
GACGGTGAACACACTAGGAAATGCATTTTTTCAAGTGCTAGTTGCATCGACGGACGAAGC
AAAAGAAGCGATGCGACAAGGCTGTTTTGATTACCTCTTTAGTGGCGGCTTTCGCACGTC
AGGCATGATGGCTCTGTTCGGAGGCATGAACCCTCAGCCACTCTCTCTCATCTTTCATCT
TTGTGGTATTACTTTATCCTCCATTGGTCAACTGCTCTCTCCATTCCCATCTCCTCTTGG
CATTTGGCATAGCCTCAGACTTTTTGGTTTGTCTATGAAAATGTTGGTTCCTCATCTTAA
GGCGGAAGGGGTTAGCCAAATGTTGTATCCAGCATACGCAGCTGCGTATCGCAAAAGCTA
TATGGCTGCAACAGCTCTTTAAGCAGCGATGATATGAACCGCGAATAATACTATGACATA
TTTGGAGCGCTAGTATTTGTGGTTGTGCATTTGTTATTTGTTAAATATGTACTGCAGTGT
GCTTACTATTATTAGTTTATACCCGTCGCTATTGTAATAATAAAACGGCCCCCTGTTTTG
TTGAATGTGCCAAATTTGCTT

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL6715Contig1 675 2 1 U
GGGCCTTCTCTTAGTGAGGATTTGGACTCTCCGACGACGGAGAAGACTTCATTTCACCGG
AATGGTCTAGTGCAAGAAAGTAGAAAAACAAATTGATTCCAAATATGGATATGTCTGAAG
AAGAGTTAAGTGGTGTAACTGGAGCAGAAGAATGGAGCGCAGAATCTGATGATTCTGTTG
ACATTGATATGCCAATGATAGAAACGCGAAGCAGGTTTGGATGTTCAAGGGCAAAAAGAA
AGCGTAAGGAAGCTGATCCATATGAAGAGATTTATGTTGCACGCAATGCAATTCTTAAAA
GACAGAATAAGCTATTAGAAGAGAGGCTCCAGATGATGGAACGGGATCAGAGATGCAGTG
TCGAGCGTGTGGTGAAGATACTTAATGAGCTGCCTGGAGTGATAAAGTGGACACCATTTC
ACACTGATGCACTTGACCATCTCATAGCTGATGTAGCTAACAGACAGGCGTTTATGGCTT
TCTCTAGTGTTGATTATAAGATTAGCTATCTTAAGCATATGATATGAACGGAGTCAAGCT
TGGTTGTGGGTTGTAATGTTTTTTCTTTGATAATCTTAACCTTCCTGTATATTACTTCTG
TTTATGACTTTGTTTCAGTTCTCTCTTTTGTTATGACTACTTATGATTATGGAATCAATT
GTGTGCTTATGGTAC


BQ
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TTTATGACTTTGTTTCAGTTCTCTCTTTTGTTATGACTACTTATGATTATGGAATCAATT
GTGTGCTTATGGTAC

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL6716Contig1 1440 2 2 U
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TGAAGATGGTATTTTAGATAATGAAGCTTTTGTCTTATGGCTATTAAAGAAATCCAAATC
TTTGACTAACGTTTCTTGTATTATTAAACTCGGTATTGTATTGTGTGTGTTGGTTGCTTC


BQ
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AF RS1F648TF U 1
AF RS1F648JQ C 675
BS 1 747 RS1F648TF
BS 748 1440 RS1F648JQ

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GCTGCTGCTGGAGCAGGAGGGATGCTGGGTCCCTATTCTGGTGGAGCCAGACGTCTTTAT
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GAGTGTTGAGCTGGTACAAGTACCTCGTGACGAAACTGGCCATTGCAAAGGATTTGGTTT
TGTTCAGTTTGCTCGCCTGGAGGATGCTAGGAATGCAGTGAATCTGAATGGGCAGTTGGA
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TGCACAATCGCGGGCTGCACTCATGAT

QA 1 747 1 747
DS 

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CTGCACTCATGATGAAGCTCGATCGCAGTGGAACTGCATCAAGCACTGGCCTTACTGCAG
TTCCTTCTATTCTCGGTGCAACTTCGACCGTCTCTCCGCTTGTGGCTCCTCTTGTACAAG
GGGGTTTCCCTGCTGTTGCTGGACTCGCAGGGCTCGGTGTAAATGTTCCAGCTGTTGTCG
ACCCAGTTGGTGTCCCCAGCGAATGTCTACTGCTTAAAAACATGTTTGATCCATCCACAG
AGACTGAACTTAATTTTGACGAGGACATCGAGGAAGATGTTCGAGATGAATGCTCCAAGT
TCGGAAAACTGAATCATATCTTTGTTGACAAGAACAGCATGGGTTTTGTTTACTTGAGAT
TTGAGAATGCACAAGCAGCAATGGGAGCGCAACGTGCTCTCCATGGGATGGTTTGCCGGG
AAGATGATTACAGCTACTTACATGACTACAGAGACTTACGAGGCCAAGTTCCCTCAGAGT
AAGTAGAGAGCTTCATGAGAACGTAAGCCTGGGAAAAAAAATTAAGGTTTGTATTTTGGT
GGAGCAGAGAAACAGTTTTTTTTTAGTATGGACTTTCTAGCATCAGTGAAGATGGTATTT
TAGATAATGAAGCTTTTGTCTTATGGCTATTAAAGAAATCCAAATCTTTGACTAACGTTT
CTTGTATTATTAAACTCGGTATTGTATTGTGTGTGTTGGTTGCTTC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

CO CL6717Contig1 676 2 1 U
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AATCAATCTTCCCGCAGTTTCTCACCGATCTGAAAACCAGCTACATCGCCGAGTTCGGAG
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TCTTGTGGCCGCTCTCGATCGCTAACGTCTACGCGATTCTCGCGGGAAAATCGTGGTTCG
GTACCACCTGCTTGCTTTACGGAGCTTCCCTCGTCGCTTCCATGGCTGCAATCCTTGGAG
AGATGATAGGTTCGGGGAAGGCATCTGAGAGGTTGCTGTTGATGTATGTTCCTTTCATGG
GTATTGGGATTCATGCGGTTCTTCGTGGTTTGGTCTTTAGTTCAAGCAAGAGCTACGGAT
CTGTTGGAAAGAGATATACTATTATGCCTAGGAGAAAGCTTGCTTGAGGGTGATTTTCTC
ATTTGATAAGTTTTTATTCTTTTATCTCTTTTTTTATCACATTGTGTTGATTATTTTGGG
ATTCTGTTCAAAGCTATTTTTCTCTCAGCAACAGTTAATGATAGTGTTTCATTGGTTGGA
ATCAAATTCATGCTCG


BQ
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AF RS1DX17JQ C 1
AF RS1DX17TF U 1
BS 1 676 RS1DX17TF

RD RS1DX17JQ 676 0 0
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GTATTGGGATTCATGCGGTTCTTCGTGGTTTGGTCTTTAGTTCAAGCAAGAGCTACGGAT
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QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1DX17TF 676 0 0
GGGAATCAAATCGGAGAAAGATGGGAGCAATCGGGAAGCTGATCGATGCGATCCTATTCG
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TCTTGTGGCCGCTCTCGATCGCTAACGTCTACGCGATTCTCGCGGGAAAATCGTGGTTCG
GTACCACCTGCTTGCTTTACGGAGCTTCCCTCGTCGCTTCCATGGCTGCAATCCTTGGAG
AGATGATAGGTTCGGGGAAGGCATCTGAGAGGTTGCTGTTGATGTATGTTCCTTTCATGG
GTATTGGGATTCATGCGGTTCTTCGTGGTTTGGTCTTTAGTTCAAGCAAGAGCTACGGAT
CTGTTGGAAAGAGATATACTATTATGCCTAGGAGAAAGCTTGCTTGAGGGTGATTTTCTC
ATTTGATAAGTTTTTATTCTTTTATCTCTTTTTTTATCACATTGTGTTGATTATTTTGGG
ATTCTGTTCAAAGCTATTTTTCTCTCAGCAACAGTTAATGATAGTGTTTCATTGGTTGGA
ATCAAATTCATGCTCG

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL6718Contig1 761 2 2 U
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CAAATAAGGAACTTGGACTTGATGGTGATGATATGGACATTCCATGGTGTGATCTTAATG
TAAAAGAGAGGATTGGAGCAGGTTCCTTCGGTACTGTTCACCGTGCTGAGTGGCATGGCT
CGGATGTTGCTGTGAAAATTCTCATGGAGCAGGACTTCCATGCTGAGCGTGTCAATGAGT
TCTTAAGAGAGGTTGCAATAATGAAACGCCTTCGCCACCCAAATATTGTTCTCTTCATGG
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CATAGAGATCTTAAATCTCCAAACTTGTTGGTTGACAAAAA


BQ
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AF RS1CF77TF U 1
AF RS1CI44TF U 1
BS 1 676 RS1CF77TF
BS 677 761 RS1CI44TF

RD RS1CF77TF 676 0 0
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GTATGGCATATGATGT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1CI44TF 761 0 0
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AAGTCCAAGAAGCAATACCTATAAGTGCCCCACCGACCAATCAGCCGGTTATGAACAGGG
CAAATAAGGAACTTGGACTTGATGGTGATGATATGGACATTCCATGGTGTGATCTTAATG
TAAAAGAGAGGATTGGAGCAGGTTCCTTCGGTACTGTTCACCGTGCTGAGTGGCATGGCT
CGGATGTTGCTGTGAAAATTCTCATGGAGCAGGACTTCCATGCTGAGCGTGTCAATGAGT
TCTTAAGAGAGGTTGCAATAATGAAACGCCTTCGCCACCCAAATATTGTTCTCTTCATGG
GCGCTGTCACTCAACCTCCAAATTTGTCAATAGTGACAGAATATTTGTCAAGAGGTAGTT
TATACAGACTTTTGCATAAAAGTGGAGCAAGGGAGCAATTGGATGAGAGACGCCGCTTGA
GTATGGCATATGATGTGGCCAAAGGGATGAACTATCTTCACATCGCATCCTCCGATTGTA
CATAGAGATCTTAAATCTCCAAACTTGTTGGTTGACAAAAA

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

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AAGTTTTCAAAGTTTTATCGATCTCTTTGCCCCGGCGAATGGGTTGATAGGTGGAACGAG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AU07TF U 1
AF RS1AU07JQ C 35
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AAGTTTTCAAAGTTTTATCGATCTCTTTGCCCCGGCGAATGGGTTGATAGGTGGAACGAG
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DS 

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CAAACCAAACCAGGCATTGTTTCACACGTTACATTGAATATCACAGATGTGTAGCTGCCA
AGGGTGACGATGCTCCCGAGTGCGATAAGTTTTCAAAGTTTTATCGATCTCTTTGCCCCG
GCGAATGGGTTGATAGGTGGAACGAGCAAAGAGAGAATGGAACTTTCCCTGGTCCTCTTT
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TAATGTCACCCGAATTACGCTGATAAGATTTTTACAGAGCCAGCATATCTGGTTGGTTCC
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TATGTTCAACTCAAGTTTTGAGGATC

QA 1 686 1 686
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TTTTCACTTGGTAACC


BQ
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AF RS1CP58JQ C 1
AF RS1CP58TF U 1
BS 1 676 RS1CP58TF

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CGATGGACGAAGGCGACCCGAACTACGACGAGGAGCAGACGAAGAAGGACACCAGCGCTG
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TTTTCACTTGGTAACC

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DS 

RD RS1CP58TF 676 0 0
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CCAACAAAAAGATGCAGACGGTATCCGTTGACGAAACCAAAAACACGGTGGTGCTACGTG
CTGAGCACCGGGACGAGGAAGGTCGAAAAGTCGCCGACAAGCTCGAGCTGAAGACGCGAA
ACCCGGAGACGATCAAGCAAGTCGAGAAGAAGCTGATGGATAAAGGCGTGCAACGTATGG
AGAGGCACCCGGCCGACGGGATCCCGCTCAAGCGGCAGCCGAAGTCCGGTCACGGCGGGA
AGTACACGTGGGAGGGGCCTGATCGGGTGGAGGATTACGAGATGCAGCCAGATCCGCCGG
CGATGGACGAAGGCGACCCGAACTACGACGAGGAGCAGACGAAGAAGGACACCAGCGCTG
ATGATGACGTGGCGGTGGAGGTTGTGAAAGGAGAGGTTGAGGTGGCGAAGAAAGCGCCGA
CGGGTGTGGCTAGAGTCGAGGTTGATCCTCGCTTGATCAGCTCTACTTGAGTTACGAAGG
ACGAAAGTGTTGGGGCAAATGTGAGAAGGGGATGGACTTTTGGGGTTGGATTTCTAATTT
CGAGTTGTTATGTTTTAATGTATTAGCGACGTGGAACGCTATTTGTGTGAAGAAATAATA
TTTTCACTTGGTAACC

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL6722Contig1 841 2 4 U
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CTGTTATAGGGTAGAGTTCACCAAGCAGTAAATAGTTAAACCAAGAACCGTAAGATTTAC
CAAGTATTAAATAGCAAACTGATAACAAATCTCCTTTTTTTTGTCAAAGATAACAAATCT
CCATGTTACAAGTAAACGGGGGGATATTTACAAACCGTAAGAGTTTACGAGAAGGAGAGG
AGCCCAAAGGATAAAATCAACAAACAGGATGCCAGAACCTGTTGTAAACCCACATGGTGT
CGGCCCCCACGGCGTAACCATCCTGGTTCCTGTGCCATCCATAGTGAGCATGCGTCCTGT
TCTTTATAGAGAACATAGCATGTCCGAAGCTCGCTTCTCTGAAGGCAGAGTACTTAGGCT
GAGGTTCAGTCATCTTGGTAGACAATCCTTCAAGATTGCCTCCATCACCAATGGTGATGT
AGATGGGAGCAGATTGATCTTTTACTGGAGTGCAAATTCCATTAACCACATTGTACGCAA
TGTTGGATATGCGTTCTGATCTTTCATAGCCATGGACATGCCCCGCAAAAACAACATCTA
CTTTGTTCTCGACGAACCACGGCTCATACATCACTCTCATTGTTTCGCCTTCCATGTAAT
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A


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10 

AF RS1AB08JQ U 1
AF RS1CQ34JQ U 112
BS 1 174 RS1AB08JQ
BS 175 175 RS1CQ34JQ
BS 176 210 RS1AB08JQ
BS 211 841 RS1CQ34JQ

RD RS1AB08JQ 210 0 0
TAGGGAGAGATTACACACGTAAAGCTTCAAATAATTTAACTAGAATGTTTTAGCTCCGCT
CTGTTATAGGGTAGAGTTCACCAAGCAGTAAATAGTTAAACCAAGAACCGTAAGATTTAC
CAAGTATTAAATAGCAAACTGATAACAAATCTCCTTTTTTTTGTCAAAGATAACCAATCT
CCATGTTACAAGTAAACGGGGGGATATTTA

QA 1 210 1 210
DS 

RD RS1CQ34JQ 730 0 0
AG
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CAAATCTCCATGTTACAAGTAAACGGGGGGATATTTACAAACCGTAAGAGTTTACGAGAA
GGAGAGGAGCCCAAAGGATAAAATCAACAAACAGGATGCCAGAACCTGTTGTAAACCCAC
ATGGTGTCGGCCCCCACGGCGTAACCATCCTGGTTCCTGTGCCATCCATAGTGAGCATGC
GTCCTGTTCTTTATAGAGAACATAGCATGTCCGAAGCTCGCTTCTCTGAAGGCAGAGTAC
TTAGGCTGAGGTTCAGTCATCTTGGTAGACAATCCTTCAAGATTGCCTCCATCACCAATG
GTGATGTAGATGGGAGCAGATTGATCTTTTACTGGAGTGCAAATTCCATTAACCACATTG
TACGCAATGTTGGATATGCGTTCTGATCTTTCATAGCCATGGACATGCCCCGCAAAAACA
ACATCTACTTTGTTCTCGACGAACCACGGCTCATACATCACTCTCATTGTTTCGCCTTCC
ATGTAATGGTAATCGTAGCTGTTGTACCATGGTGAATGCATCAGAACAATCAACCACGGC
GTTTCTGTCCTGTTAACCTTTGGGAACTCCTCTTCGAGCCACATGTATTGCGGCGTATAT
TTACCGTATGCTGAATATGAAGCTAGCACGATTATGTAAGCAGGACCTCTCTTTATTGAG
TACCAGAA

QA 3 730 3 730
DS 



AS 1 2

CO CL6723Contig1 824 2 3 U
GGGAATCTCAAAAAAAAGAAAAAAAACGTTCACTCTCATTCAACAGATTCCATCTTCTCT
GATCATCTCTCTCTGTTTCTTCTGTCTTACGGAGAAATGGCAGTAATCAACAGCCTCCGA
AGGTTGGCTCGTTCCTCTCAGGTTACTTTGCAGAGCAAGTATGCTGCTTCACAATATACG
TCTGGTTCGAGGATCTTTACTACAGAGGCTTCACCCCAGAAGCAAACCATAGTTGGGTCT
AAGGGGCATGATATGCTGGCACCTTTTACAGCTGGGTGGCAGAGTGCTGATTTACATCCC
TTGATCATTGCTAAATCCGAGGGAAGTTATGTGTATGATGACCATGGCAAAAAGTATCTT
GATTCTCTCGCTGGTCTTTGGTGTACTGCCTTAGGAGGAAATGAGCCACGGCTTGTTTCT
GCTGCCGTGGAGCAGTTGAAAACTTTGCCCTTTTATCACTCCTTCTGGAACCGTACTACT
AAGCCTTCTCTGGATCTTGCCAAGGATCTTCTAGACATGTTCACGGCTAATAAAATGGCT
AAAGCTTTTTTTACAAACAGTGGATCAGAGGCCAATGATACCCAGGTCAAGCTTGTTTGG
TACTACAATAACGCACTTGGGAGGCCTGAGAAGAAAAAGTTTATCGCAAGAAAGAAATCG
TACCATGGCTCCACTCTAATATCAGCAAGTTTGTCCCGGCCTTCCAGCTCTGCACCAAAA
CTTTGATTTACCAGCACCATTTGTGCTACACACAGATTGCCCTCACTATTGGCGTTTTCA
TCTTCCAGGTGAAACGGAAGAGGAGTTCTCAACCAGATAGCCAG


BQ
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AF RS1FZ96TF U 26
AF RS1BK92TF U 1
BS 1 457 RS1BK92TF
BS 458 458 RS1FZ96TF
BS 459 824 RS1BK92TF

RD RS1FZ96TF 687 0 0
GG
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TACGGAGAAATGGCAGTAATCAACAGCCTCCGAAGGTTGGCTCGTTCCTCTCAGGTTACT
TTGCAGAGCAAGTATGCTGCTTCACAATATACGTCTGGTTCGAGGATCTTTACTACAGAG
GCTTCACCCCAGAAGCAAACCATAGTTGGGTCTAAGGGGCATGATATGCTGGCACCTTTT
ACAGCTGGGTGGCAGAGTGCTGATTTACATCCCTTGATCATTGCTAAATCCGAGGGAAGT
TATGTGTATGATGACCATGGCAAAAAGTATCTTGATTCTCTCGCTGGTCTTTGGTGTACT
GCCTTAGGAGGAAATGAGCCACGGCTTGTTTCTGCTGCCGTGGAGCAGTTGAAAACTTTG
CCCTTTTATCACTCCTTCTGGAACCGTACTACTAAGCCTTCTCTGGATCTTGCCAAGGAT
CTTCTAGACATGTTCACGGCTAATAAAATGGCTAAAGCTTTTTTTACAAACAGTGGATCA
GAGGCCAATGATACCCAGGTCAAGCTTGTTTGGTACTACAATAACGCACTTGGGAGGCCT
GAGAAGAAAAAGTTTATCGCAAGAAAGAAATCGTACCATGGCTCCACTCTAATATCAGCA
AGTTTGTCC*GGCCTTCCAGCTCTG

QA 3 687 3 687
DS 

RD RS1BK92TF 824 0 0
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GATCATCTCTCTCTGTTTCTTCTGTCTTACGGAGAAATGGCAGTAATCAACAGCCTCCGA
AGGTTGGCTCGTTCCTCTCAGGTTACTTTGCAGAGCAAGTATGCTGCTTCACAATATACG
TCTGGTTCGAGGATCTTTACTACAGAGGCTTCACCCCAGAAGCAAACCATAGTTGGGTCT
AAGGGGCATGATATGCTGGCACCTTTTACAGCTGGGTGGCAGAGTGCTGATTTACATCCC
TTGATCATTGCTAAATCCGAGGGAAGTTATGTGTATGATGACCATGGCAAAAAGTATCTT
GATTCTCTCGCTGGTCTTTGGTGTACTGCCTTAGGAGGAAATGAGCCACGGCTTGTTTCT
GCTGCCGTGGAGCAGTTGAAAACTTTGCCCTTTTATCCCTCCTTCTGGAACCGTACTACT
AAGCCTTCTCTGGATCTTGCCAAGGATCTTCTAGACATGTTCACGGCTAATAAAATGGCT
AAAGCTTTTTTTACAAACAGTGGATCAGAGGCCAATGATACCCAGGTCAAGCTTGTTTGG
TACTACAATAACGCACTTGGGAGGCCTGAGAAGAAAAAGTTTATCGCAAGAAAGAAATCG
TACCATGGCTCCACTCTAATATCAGCAAGTTTGTCCCGGCCTTCCAGCTCTGCACCAAAA
CTTTGATTTACCAGCACCATTTGTGCTACACACAGATTGCCCTCACTATTGGCGTTTTCA
TCTTCCAGGTGAAACGGAAGAGGAGTTCTCAACCAGATAGCCAG

QA 1 824 1 824
DS 



AS 1 2

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GTGCGCTAAGGAGTAGTCCCTGAAGAGCCTGCAGTTGCAGTTGATACCGAAGAAGCTGAA
ATTGTGACCAAACTTGACGTGGAATCCACTGAGAACAACTCTGTCCCCGTTACTAAAGAA
CCAAAGGAAGAGGCTCAAAACGAGACGACGTCAGTTGAAAAGGTTATGATTGATGAATCA
AACCTTGCAGATTATGTAGGCAAACCTGTGTTCCATGCAGAAAAGATCTATGAGCCCACA
TCGGTAGGAGTTGTGATGGGTCTAGCCTGGACATCAATGGGCGGTTCAACGTTGTACATA
GAGACAACTGTTGTGGAGGAAGGTGAAGGTAAAGGTTGCTTGAACGTAACTGGTCAGCTC
GGCGATGTAATGAAAGAAAGCGCACTGATCGCTCACACGGTCGCTAGAAAGATCATGCTA
GAGAAAGAACCGGAGAACCAGTTCTTTGCAAACTCCAAGCTTCATCTCCATGTTCCCGCA
GGAGCTACACCCAAAGACGGTCCAAGTGCAGGCTGCACTATGATCACATCGCTGCTATCG
CTTGCCATGAAGAAACCTGTTCAGAAAGATCTTGCAATGACTGGAGAAGTCACTCTAACT
GGTAGAATCCTTCCTATTGGAGGGGTGAAGGAGAAAACCATAGCGGCGAGGCGGAGTCAG
GTGAAGACCATCATATTTCCGGAGGCAAACAGGAGAGACTTTGAAGAGCTTGCGGAGAAT
GTTAAAGAAGGGCTTGATGTTCACTTTGTGGATGACTATAAAAAGATCTTCGACCTTGCC
TTTGTCTCTGACAACAACCAACAAGACTGAGAGAAGTCACTTTGACCTTCTTCCTCTGTC
GTTGTCTCCATCTATAAACAAGAAAACCATTCTTGATTCTTTCTTTGCTTTTTCTTTATA
CTTTTGTCCCTTCAAGAAGGGTGTCATGCTGTAACAATTTTTTTTCATAATTAGGATAGT
TTATTTATGTGGTTGGGACCTCTTTCGTACATTCCCACAGCCAGATCATTATGCATCAAA
ATAAAAATGTCTATCTGCTTGTTATACTATG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1E428TF U 1
AF RS1E428JQ C 483
BS 1 568 RS1E428TF
BS 569 1111 RS1E428JQ

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ATTGTGACCAAACTTGACGTGGAATCCACTGAGAACAACTCTGTCCCCGTTACTAAAGAA
CCAAAGGAAGAGGCTCAAAACGAGACGACGTCAGTTGAAAAGGTTATGATTGATGAATCA
AACCTTGCAGATTATGTAGGCAAACCTGTGTTCCATGCAGAAAAGATCTATGAGCCCACA
TCGGTAGGAGTTGTGATGGGTCTAGCCTGGACATCAATGGGCGGTTCAACGTTGTACATA
GAGACAACTGTTGTGGAGGAAGGTGAAGGTAAAGGTTGCTTGAACGTAACTGGTCAGCTC
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GAGAAAGAACCGGAGAACCAGTTCTTTGCAAACTCCAAGCTTCATCTCCATGTTCCCGCA
GGAGCTACACCCAAAGACGGTCCAAGTG

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DS 

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AGCTACACCCAAGGACGGTCCAAGTGCAGGCTGCACTATGATCACATCGCTGCTATCGCT
TGCCATGAAGAAACCTGTTCAGAAAGATCTTGCAATGACTGGAGAAGTCACTCTAACTGG
TAGAATCCTTCCTATTGGAGGGGTGAAGGAGAAAACCATAGCGGCGAGGCGGAGTCAGGT
GAAGACCATCATATTTCCGGAGGCAAACAGGAGAGACTTTGAAGAGCTTGCGGAGAATGT
TAAAGAAGGGCTTGATGTTCACTTTGTGGATGACTATAAAAAGATCTTCGACCTTGCCTT
TGTCTCTGACAACAACCAACAAGACTGAGAGAAGTCACTTTGACCTTCTTCCTCTGTCGT
TGTCTCCATCTATAAACAAGAAAACCATTCTTGATTCTTTCTTTGCTTTTTCTTTATACT
TTTGTCCCTTCAAGAAGGGTGTCATGCTGTAACAATTTTTTTTCATAATTAGGATAGTTT
ATTTATGTGGTTGGGACCTCTTTCGTACATTCCCACAGCCAGATCATTATGCATCAAAAT
AAAAATGTCTATCTGCTTGTTATACTATG

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BZ46TF U 1
AF RS1BZ46JQ C 65
BS 1 744 RS1BZ46TF
BS 745 745 RS1BZ46JQ

RD RS1BZ46TF 744 0 0
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TTCCTCCAAACTCTACTCTCAGTCTCACCAGTTAAATCTCCCCACCTGGGTGGCACCAAA
CCAATGAATGGAAAAACAGAGGAACAGAGCTGCTGCGCGACGAGAAAACTGTCAACGCCG
CTCGTCGTGCCGGCGCCGATATCGAAACCGTCAGAAAATACAATGCTGCATCAAGCAGCA
CTTCTCTCAACACCAAGACGCTTGATGACGACACTGAGAACCTTACTCATGAGCGTGTGC
CTACTGAGCTTAAGAAAGCCATTATGCAAGCCCGCACTGAGAAGAAGCTTACCCAGTCCC
AACTTGCTCAGCTCATCAATGAGAAGCCACAAGTGATCCAAGAGTACGAGTCTGGCAAAG
CTATCCCCAACCAGCAGATCCTTTCTAAGCTCGAGAGAGCTCTTGGTGCTAAACTTCGTG
GTAAGAAGTGATCATCCTCATCAAGTCCTCAAGATGAACTAAACTTTTAATCGCAGTTTC
ACTTTTCTTAATGACACACCATGTAGTAACAACAACAATCAGTGCTTTCATGTAATGTCG
TAAACTCTGTCAAGAGTAATCCCCTTTCCTCATGTCAGAAAGAAAAGACCGTTTGAACGT
TTACTTGATGAATTGCTCTTTTCA

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1BZ46JQ 681 0 0
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TCCAAACTCTACTCTCAGTCTCACCAGTTAAATCTCCCCACCTGGGTGGCACCAAACCAA
TGAATGGAAAAACAGAGGAACAGAGCTGCTGCGCGACGAGAAAACTGTCAACGCCGCTCG
TCGTGCCGGCGCCGATATCGAAACCGTCAGAAAATACAATGCTGCATCAAGCAGCACTTC
TCTCAACACCAAGACGCTTGATGACGACACTGAGAACCTTACTCATGAGCGTGTGCCTAC
TGAGCTTAAGAAAGCCATTATGCAAGCCCGCACTGAGAAGAAGCTTACCCAGTCCCAACT
TGCTCAGCTCATCAATGAGAAGCCACAAGTGATCCAAGAGTACGAGTCTGGCAAAGCTAT
CCCCAACCAGCAGATCCTTTTTAAGCTCGAGAGAGCTCTTGGTGCTAAACTTCGTGGTAA
GAAGTGATCATCCTCATCAAGTCCTCAAGATGAACTAAACTTTTAATCGCAGTTTCACTT
TTCTTAATGACACACCATGTAGTAACAACAACAATCAGTGCTTTCATGTAATGTCGTAAA
CTCTGTCAAGAGTAATCCCCTTTCCTCATGTCAGAAAGAAAAGACCGTTTGAACGTTTAC
TTGATGAATTGCTCTTTTCAC

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

CO CL6726Contig1 851 2 6 U
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TAATCCTATCAATTCCTCCTCTGCCTCCCGTATTTCTCATCTTAACGGCAATAACAAGCT
TACACTTCCTCCACCGCAGCTTCTGAACGCCGCCGCCACGAGCCTCCGCGTCTTCTCGGT
CCCGGGCAAGTTTCCTAGTGCAAGACTTAGGGTTTCAACAAAGTGCGAGAAAGAAGATGC
ACAGAAAGGTGAAACAGAGGATGCGGCGGAGCGATTCGCGAGGCGAGAGAGCACTATGCC
TGATAGATTCAGACACTTGACCAAAGAAGCGGTTGCTCCGAACGCGATCAGCAAGCAGCC
TTACGTGGTGACTCTTGCTGGTGTTTTGGGGTATGCGGCTGTACAGGGGTACATCTCGGA
GCCGTTCTTCTGGACTGTTTTGGTGTGTATGTATGGGTATTCGAGGTTGGTGAAGAAGAG
AGATGATGTGACTTCGGCGTTACCTTCTGCGGCTGTTCTGGCGGGGGTAGGGGAACCGTG
GGTGAGAGTGGTGGCTATCACAGGGTATTTGGCTCTAGCTATGTATCAGAATTCAATTAA
GAAGGCATCTTCTGAAGAAGAAGAAAAAGAGGGACAGAGCTTGAGGAAGGGGCCACCAAT
GCCGTTGTTGGCTGCAGCTTTGGCTATTGGGGTTCGGCTTGCTGCAAAATGGGCTGGTTA
CAGGCACTTGACTTGGATGATTGTTTAAATTCTCTGTTAGCAACGAAAATTAAAAGACCA
AACTAAACTAGCTTGTGTTGTGCTTTGTAACCTCTACCCACTGGTTAGTTATGTTTCTTT
TTTTATGGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CK56TF U 1
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CCCGGGCAAGTTTCCTAGTGCAAGACTTAGGGTTTCAACAAAGTGCGAGAAAGAAGATGC
ACAGAAAGGTGAAACAGAGGATGCGGCGGAGCGATTCGCGAGGCGAGAGAGCACTATGCC
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AGATGATGTGACTTCGGCGTTACCTTCTGCGGCTGTTCTGGCGGGGGTAGGGGAACCGTG
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GCCGTTGTTGGCTGCAGCTTTGGCTATTGGGGTTCGGCTTGCTGCAAA*TGGGCTGGTTA
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GCCACGAGCCTCCGCGTCTTCTCGGTCCCGGGCAAGTTTCCTAGTGCAAGACTTAGGGTT
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TTCGCGAGGCGAGAGAGCACTATGCCTGATAGATTCAGACACTTGACCAAAGAAGCGGTT
GCTCCGAACGCGATCAGCAAGCAGCCTTACGTGGTGACTCTTGCTGGTGTTTTGGGGTAT
GCGGCTGTACAGGGGTACATTTCGGAGCCGTTCTTCTGGACTGTTTTGGTGTGTATGTAT
GGGTATTCGAGGTTGGTGAAGAAGAGAGATGATGTGACTTCGGCGTTACCTTCTGCGGCT
GTTCTGGCGGGGGTAGGGGAACCGTGGGTGAGAGTGGTGGCTATCACAGGGTATTTGGCT
CTAGCTATGTATCAGAATTCAATTAAGAAGGCATCTTCTGAAGAAGAAGAAAAAGAGGGA
CAGAGCTTGAGGAAGGGGCCACCAATGCCGTTGTTGGCTGCAGCTTTGGCTATTGGGGTT
CGGCTTGCTGCAAAATGGGCTGGTTACAGGCACTTGACTTGGATGATTGTTTAAATTCTC
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TACCCACTGGTTAGTTATGTTTCTTTTTTTATGGCCC

QA 1 757 1 757
DS 



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AC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RS1FU77TF U 1
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GAGTGGTGTCAATCTACGCTTACAGTGAGAAGAAACCGGACGATCTGGATGATGGAATCA
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ATATTCTCTTCGTTCTGCCTGATGACTACAACGAGAGGAATGTGAAACTTCCGTATACAA
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TATTTGAATTGCGTAAGAAGTTTCACACTGACGAAGATGATGCCTAGCCCAGATGATGTG
GTACAATACCTCACTCTTTCTTTCCTGTCAG*AATAATGTATCTAAACTAATGTTTTATC
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GTTTACTCTCTGTTTGT

QA 1 737 1 737
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CAGTTAACATCAAAGAAGAAATCACTATAACCCCAGTTTTTCAAGGTCTGTATGGTACTT
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CAAATTTTATATGGACTTGGGAGAGTCTGATTAATGAAGGAAAGCCTATGGACCAAAGCC
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GTGGTACAATACCTCACTCTTTCTTTCCTGTCAGGAATAATGTATCTAAACTAATGTTTT
ATCATTCTCCCTTTGTATGTCCGTTTTTGTGTGTTAGAGACACCATGAGTGTCTCTTTCT
GCAGTTTACTCTCTGTTTGTGTTTTAGAAACAAAGCAGAGTTCTAAAGAAGAACGGTGAA
GGGAC

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

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TGACTTTTTCCCTGTATATGAGAAGTTAATGTCAAGTGGATCCACTCCTTCCACCGTACT
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TTT


BQ
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10 10 10 

AF RS1FL56TF U 1
AF RS1FL56JQ C 312
BS 1 561 RS1FL56TF
BS 562 1083 RS1FL56JQ

RD RS1FL56TF 561 0 0
GGACGATTGTATGTTGGATGAGGCCAAGCTGTGTCATAGTGAGAGGAAGCTCGAAGCTCC
GCCACCGATCGTACACTATTCATTAACCACAACATTTTCAGATTCCGACGAGGAAGAGAT
TGATCCCGTGGAGCGCGAGAAGTTTCGAAAACAAGTCGTCGAGTCCGGCGGATTCGATGT
TGACTTTTTCCCTGTATATGAGAAGTTAATGTCAAGTGGATCCACTCCTTCCACCGTACT
GTTGAGCAAGGTGGACGAATTTACAGTTCAGGAGTGTACAGAAAGCAAACGAAGAATTTG
TTTCATTTACATTTTACTATATAACGGTTGAAGCGATGGATCCGTTCAATGATGATTCAA
CTGTTACTTTCCAAACCTCTGTCTGGGATGCTGCTACAAAGAACAACGAGAGCTTGAGAC
TGGTCACTAAAGTGTGCAGAATCAAAGGAAGTAAAGAAGAAACTTCTCTGTGGGACCACG
ATGCTGTAGACGAGTTCTATAAAGATGATATCTTAGTTAGAGGATGATGCTCTTACAGGA
AGTCATAAGCTACAATACTAT

QA 1 561 1 561
DS 

RD RS1FL56JQ 772 0 0
TTTTACTATATAACGGTTGAAGCGATGGATCCGTTCAATGATGATTCAACTGTTACTTTC
CAAACCTCTGTCTGGGATGCTGCTACAAAGAACAACGAGAGCTTGAGACTGGTCACTAAA
GTGTGCAGAATCAAAGGAAGTAAAGAAGAAACTTCTCTGTGGGACCACGATGCTGTAGAC
GAGTTCTATAAAGATGATATCTTAGTTAGAGGATGATGCTCTTACAGGAAGTCATAAGCT
ACAATACTATGAGGTGAAGGAATCGGATCTGCGAGACAACGAATGGCTTCATCTGTATGC
TGAAGTTGTATTGTTCTCCAAGTGGGAAATTGACCTTAGCGCTTATTTGCCGGTGAAGAT
GAAGAAAGTAGTGGTACGAACGAGGGAAGATGTAGAGACGAGTACGAAGCTCAGGTCAAA
GAATGCAATTTTCTACATGAGTTTCACGGCCTGTGGGGGTCTTGAGTACAGAGGGCCAGA
GGCATAATAACGCGGACGACTGATGGAAGACCACAAACACATGAGCTTTCAAGTTAACTG
TTGGATCGACAATTAGAGAGATAGATAGACGTATGACCATAATACATCGTCGTATGGTCT
GCTTTATTTTGTATATTTTCCAGCTACTTGATCCCCAAGTAATCATCTTTTTTTGTTGGA
TCTCTGTTTTTTTGTTTTGTTTTCATTTAATGTCAATTTTGTTATTAGAAACTGTGTGTA
ATCTTTCAGACTTTGTTATGCATTGCGCATTCGTTTTCAATTTGGAATATTT

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

CO CL6729Contig1 844 2 2 U
GATCTCCGGGTCGACGTTGCTTGCAGTGGAGACGCTTACGGAGAATCCCAACGTGAAGAG
AGGGGATAACAAGTGGGTGGATAAGATCTACGAGCTTATGGATGCTGTTGATAGTTATAT
ACCGATCCCTCAGAGACAGACCGAGCTGCCTTTCTTGTTAGCTGTTGAGGATGTTTTCTC
TATAACAGGGCGTGGGACTGTGGCCACGGGGAGGGTGGAGAGAGGGACTGTGAAGGTTGG
GGAGACTGTGGATTTAGTTGGGTTGAGGGAGACGAGGAACTATACGGTTACTGGTGTTGA
GATGTTTCAGAAGATTCTTGATGAGGCTTTAGCTGGGGATAATGTTGGTTTGTTGCTTAG
GGGTATTCAGAAGGCTGATATTCAGAGAGGGATGGTGTTGGCTAAGCCTGGGAGTATCAC
TCCGCATACTAAGTTCGAGGCGATTGTGTATGTGTTGAAGAAGGAAGAAGGCGGGAGGCA
TTCGCCGTTTTTCGCGGGGTACGGGCCTCAGTTTTACATGAGGACGACGGATGTGACGGG
GAAAGTGACGAAGATTATGAATGATAAAGATGAGGAGTCGAAGATGGTTATGCCTGGTGA
TAGGGTGAAGATTGTGGTTGAGCTTATTGTGCCTGTGGCTTGTTAGCAAAGGGATGAGGT
TTGCTATTAGAGAAAGTGGGAAGACCGTTGGTGCTGGTGTTATTCAGTCTATCATCGAAT
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TTTTACCTTGTCGTGTTGTTTTCTATAAGAAGTTGAAAATCGAAATGTGTCATATATTTC
CTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RS1H013TF U 1
AF RS1H013JQB C 65
BS 1 688 RS1H013TF
BS 689 844 RS1H013JQB

RD RS1H013TF 688 0 0
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AGGGGATAACAAGTGGGTGGATAAGATCTACGAGCTTATGGATGCTGTTGATAGTTATAT
ACCGATCCCTCAGAGACAGACCGAGCTGCCTTTCTTGTTAGCTGTTGAGGATGTTTTCTC
TATAACAGGGCGTGGGACTGTGGCCACGGGGAGGGTGGAGAGAGGGACTGTGAAGGTTGG
GGAGACTGTGGATTTAGTTGGGTTGAGGGAGACGAGGAACTATACGGTTACTGGTGTTGA
GATGTTTCAGAAGATTCTTGATGAGGCTTTAGCTGGGGATAATGTTGGTTTGTTGCTTAG
GGGTATTCAGAAGGCTGATATTCAGAGAGGGATGGTGTTGGCTAAGCCTGGGAGTATCAC
TCCGCATACTAAGTTCGAGGCGATTGTGTATGTGTTGAAGAAGGAAGAAGGCGGGAGGCA
TTCGCCGTTTTTCGCGGGGTACGGGCCTCAGTTTTACATGAGGACGACGGATGTGACGGG
GAAAGTGACGAAGATTATGAATGATAAAGATGAGGAGTCGAAGATGGTTATGCCTGGTGA
TAGGGTGAAGATTGTGGTTGAGCTTATTGTGCCTGTGGCTTGTTAGCAAAGGGATGAGGT
TTGCTATTAGAGAAAGTGGGAAGACCGT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RS1H013JQB 780 0 0
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ATCCCTCAGAGACAGACCGAGCTGCCTTTCTTGTTAGCTGTTGAGGATGTTTTCTCTATA
ACAGGGCGTGGGACTGTGGCCACGGGGAGGGTGGAGAGAGGGACTGTGAAGGTTGGGGAG
ACTGTGGATTTAGTTGGGTTGAGGGAGACGAGGAACTATACGGTTACTGGTGTTGAGATG
TTTCAGAAGATTCTTGATGAGGCTTTAGCTGGGGATAATGTTGGTTTGTTGCTTAGGGGT
ATTCAGAAGGCTGATATTCAGAGAGGGATGGTGTTGGCTAAGCCTGGGAGTATCACTCCG
CATACTAAGTTCGAGGCGATTGTGTATGTGTTGAAGAAGGAAGAAGGCGGGAGGCATTCG
CCGTTTTTCGCGGGGTACGGGCCTCAGTTTTACATGAGGACGACGGATGTGACGGGGAAA
GTGACGAAGATTATGAATGATAAAGATGAGGAGTCGAAGATGGTTATGCCTGGTGATAGG
GTGAAGATTGTGGTTGAGCTTATTGTGCCTGTGGCTTGTTAGCAA*GGGATGAGGTTTGC
TATTAGAGAAGGTGGGAAGACCGTTGGTGCTGGTGTTATTCAGTCTATCATCGAATGATT
TCATTAGAGTTTATCTTTATCTACTTTGCTTTCTTTATTTTTTGTTTAAAAAACTCTTTT
ACCTTGTCGTGTTGTTTTCTATAAGAAGTTGAAAATCGAAATGTGTCATATATTTCCTCG

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL6730Contig1 725 2 2 U
GGGTTGTCTTCTTCTCAAACATATCTAAACTTATCGTTTGAAACTAAAAAAGAAGAGACC
ACCAAACAAAAACAAAAATGGCGTCCAAAACCATCTTCTTCTCTTTCTTAGTCGTCTCCG
CCGTGTGTTTGTCCACTCTCGCCGGTTTTGTCGCCGCCGATGCTGACGATTTTGACCTTT
TCCAGATTCAGGGATCTGTTTACTGTGACACCTGCCGTGTCCAATTCGTTACCCGTCTCA
GCAAATTCCTCGAAGGTGCGAAAGTAAAGTTGGAGTGCAGGAGCAGAACAAACGGAACCC
TAACGTTGACTAAAGAAGCCATTACCGACAAATCAGGAAGCTACAAGATTGAAGTAACCG
GTGATCACGAAGAAGAACTTTGCGAGCTCATGTTGGTCCAATCACCAGACAGTGGTTGCA
GTGACGTAAGCAGAGACGCCTACTTACGTAACGCCGCTAAGATCAGTTTAACAGCGAATG
ACGGAATCGTCTCTCACGAGACACGTATCGTTAACCCTCTTGGTTTCATGGTTAAGACGC
CATTAGCCGATTGTCCCGCTGCTTTCAAGGAGCTCGGTATTGTACCTGACGTCATCTTTT
AAGCGAAGAAGAAGATATATTACGTCAGAGATATAAATTTCTACATGCTTAATCTTGAAG
GGTTTTCCGTCAAATTTGTCAATGATTTATTGTTATGAATTAATATCTACATCATTTATT
GAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 10 10 

AF RS1GD40TF U 1
AF RS1GD40JQ C 109
BS 1 723 RS1GD40TF
BS 724 725 RS1GD40JQ

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CCGTGTGTTTGTCCACTCTCGCCGGTTTTGTCGCCGCCGATGCTGACGATTTTGACCTTT
TCCAGATTCAGGGATCTGTTTACTGTGACACCTGCCGTGTCCAATTCGTTACCCGTCTCA
GCAAATTCCTCGAAGGTGCGAAAGTAAAGTTGGAGTGCAGGAGCAGAACAAACGGAACCC
TAACGTTGACTAAAGAAGCCATTACCGACAAATCAGGAAGCTACAAGATTGAAGTAACCG
GTGATCACGAAGAAGAACTTTGCGAGCTCATGTTGGTCCAATCACCAGACAGTGGTTGCA
GTGACGTAAGCAGAGACGCCTACTTACGTAACGCCGCTAAGATCAGTTTAACAGCGAATG
ACGGAATCGTCTCTCACGAGACACGTATCGTTAACCCTCTTGGTTTCATGGTTAAGACGC
CATTAGCCGATTGTCCCGCTGCTTTCAAGGAGCTCGGTATTGTACCTGACGTCATCTTTT
AAGCGAAGAAGAAGATATATTACGTCAGAGATATAAATTTCTACATGCTTAATCTTGAAG
GGTTTTCCGTCAAATTTGTCAATGATTTATTGTTATGAATTAATATCTACATCATTTATT
GAG
C

QA 1 723 1 723
DS 

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ATTTTGACCTTTTCCAGATTCAGGGATCTGTTTACTGTGACACCTGCCGTGTCCAATTCG
TTACCCGTCTCAGCAAATTCCTCGAAGGTGCGAAAGTAAAGTTGGAGTGCAGGAGCAGAA
CAAACGGAACCCTAACGTTGACTAAAGAAGCCATTACCGACAAATCAGGAAGCTACAAGA
TTGAAGTAACCGGTGATCACGAAGAAGAACTTTGCGAGCTCATGTTGGTCCAATCACCAG
ACAGTGGTTGCAGTGACGTAAGCAGAGACGCCTACTTACGTAACGCCGCTAAGATCAGTT
TAACAGCGAATGACGGAATCGTCTCTCACGAGACACGTATCGTTAACCCTCTTGGTTTCA
TGGTTAAGACGCCATTAGCCGATTGTCCCGCTGCTTTCAAGGAGCTCGGTATTGTACCTG
ACGTCATCTTTTAAGCGAAGAAGAAGATATATTACGTCAGAGATATAAATTTCTACATGC
TTAATCTTGAAGGGTTTTCCGTCAAATTTGTCAATGATTTATTGTTATGAATTAATATCT
ACATCATTTATTGAGGC

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 2

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TAAGTAATATATACCATTGAACTGACTATAGTAGTACTATTATGGTATGATTTTTGAAAT
AATGGAGCGGTTTGTCTAAGATATATTGTAAAATAAAGCTAGTTCAGTGGACAAAAGAAG
CATATATATATTACAAGAAATGTTTGTGGAG


BQ
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AF RS1E078JQ C 1
AF RS1E078TF U 1
BS 1 631 RS1E078TF

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AGCAGGACAATGATTCTCTTCAGAGACATTATTCACAAGGGTGAGAAAAGAGCTGCAAGA
CAGAAGAAAAACCGGTTTTGCGGGTTTATAAGATCTTCTAAAGAACAACAGGATGGTTTA
TAAGTAATATATACCATTGAACTGACTATAGTAGTACTATTATGGTATGATTTTTGAAAT
AATGGAGCGGTTTGTTTAAGATATATTGTAAAATAAAGCTAGTTCAGTGGACAAAAGAAG
CATATATATATTACAAGAAATGTTTGTGGAG

QA 1 631 1 631
DS 

RD RS1E078TF 631 0 0
GAGATCATGGAGAGACTGTTGTCTGACTCAAGAAGACTCTTAAATCTCCGGATTAGCCTA
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ATAGTTATAGTGAAGAGACAGTTGAAAGAGATGGAAGAAGCTGTCTTGCAGATGACAAAC
ACAAACGAGATTCTCTCAAAGGAAGCCGAGGAGACTTCCGGAGATTCCAGAGATATATAC
AGAAAAGTGGTTATGGAGAAGTCGAGAAACGGTTCTGAGAAGATTGAGCAGTTGCAGAGT
AAAATGCAGAGCATTGAGCAAGCGGTTCTGAAGCTTGAAGACGGAGCTACAAGCAAACGA
AGCAGGACAATGATTCTCTTCAGAGACATTATTCACAAGGGTGAGAAAAGAGCTGCAAGA
CAGAAGAAAAACCGGTTCTGCGGGTTTATAAGATCTTCTAAAGAACAACAGGATGGTTTA
TAAGTAATATATACCATTGAACTGACTATAGTAGTACTATTATGGTATGATTTTTGAAAT
AATGGAGCGGTTTGTCTAAGATATATTGTAAAATAAAGCTAGTTCAGTGGACAAAAGAAG
CATATATATATTACAAGAAATGTTTGTGGAG

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 2

CO CL6732Contig1 1191 2 4 U
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GAGTTTGTAACATAATGTGACCGAGATAAATAAATGTACTAGATAGGATATATATTTAAG
AAAAAACCAGCTTGAACTTAAATGTTGAAGCTAAAAGAAAAACAAAAGCGACAATGCAAA
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ATGGCACAAAAACAAGAATTGAACTGGCTGTTTGTTATACGAGATGAAAAGTTTGCCAGG
AAAAACCACAAAAAATTGATGGTGTGCTTAAATGTTTACGCAGTATATTACGATTATTTT
TCTTTTTTATAGTTTAGTTTGGTAGTATTGGATTTTCCGGATTACGTTGTAATATCCGAC
TAAGCATGGACATGAGCACATTCCTTTGGTAAAATTAGTTTCCAATTGAATGTACAAAAA
GATGTTTTTGACGAATAGTATAGGTTCAAAATAGACCGGAAAAAGAAAATTCACATATTT
TGGTCTATATAACATTCTTAGAACTTAATAACTAACGGTTCATTTTATTAAATTTTAAAA
TCTAAACCAAACAATGAAAACACCGCGTAGGATATAAAGTAGTATAAACTTTGACAAACT
AAAGGAGTATCCTTCGATTATGTCATATAGTTGGGCAGCTGATTTGATTTTTAATTTATT
TTTCACCGATTGTCGTTACGTACGTACGAACTCTAGTTGTGTTTATTTAGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A555TF U 1
AF RS1A555JQ C 541
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BS 736 818 RS1A555TF
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TCCTCCTCCCTGTTTTTAAGGAATATTGACATTCTAGGAATTGGCTGGCCATTTTCTAGG
ATATTTTGGACCGTTTCCATTACTAGTCTTTCCAAGTTCCGTGTGTTCCAAAGGAAAAGG
TCTTGCCATTTTTCTTGGAACATGCAAATGATACAAATAAACTAAACTACAAATGGTACT
TCGATGGGCAGTACCGCCATTACCTACTGCATTTACTAGCGTAATCTTAATAACAAAAAA
AAATCAACTACGTTATGATGAATATTACATTGGTTACTAGTTAGTAGTAATTAAAAGCTT
GAGTTTGTAACATAATGTGACCGAGATAAATAAATGTACTAGATAGGATATATATTTAAG
AAAAAACCAGCTTGAACTTAAATGTTGAAGCTAAAAGAAAAACAAAAGCGACAATGCAAA
ATTTCAGAACTATTTTATTATAGGGATACTGTTGTTTTTGCCGTTTCCATGGACGAGTCT
GATTTAAAGGGCAGTATAAACTTGAATTAGATAGAGTAGATTAGTTTTTGGTCTATTATG
CCGTCTTCCTATATTCTAGGATGGCTGGAATGTGTCCTATAAAGGATACAATCAATCCGT
ATGGCACAAAAACAAGAATTGAACTGGCTGTTTGTTATACGAGATGAAAAGTTTGCCAGG
AAAAACCACAAAAA*TTGATGGTGTGCTTAAATGTTTACGCAGTATATTACGATTATTTT
TCTTTTTTATAGTTTAGTTTGGTAGTATTGGATTTTCC
CGG

QA 1 818 1 818
DS 

RD RS1A555JQ 651 0 0
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CCGTCTTCCTATATTCTAGGATGGCTGGAATGTGTCCTATAAAGGATACAATCAATCCGT
ATGGCACAAAAACAAGAATTGAACTGGCTGTTTGTTATACGAGATGAAAAGTTTGCCAGG
AAAAACCACAAAAAATTGATGGTGTGCTTAAATGTTTACGCAGTATATTACGATTATTTT
TCTTTTTTATAGTTTAGTTTGGTAGTATTGGATTTTCCGGATTACGTTGTAATATCCGAC
TAAGCATGGACATGAGCACATTCCTTTGGTAAAATTAGTTTCCAATTGAATGTACAAAAA
GATGTTTTTGACGAATAGTATAGGTTCAAAATAGACCGGAAAAAGAAAATTCACATATTT
TGGTCTATATAACATTCTTAGAACTTAATAACTAACGGTTCATTTTATTAAATTTTAAAA
TCTAAACCAAACAATGAAAACACCGCGTAGGATATAAAGTAGTATAAACTTTGACAAACT
AAAGGAGTATCCTTCGATTATGTCATATAGTTGGGCAGCTGATTTGATTTTTAATTTATT
TTTCACCGATTGTCGTTACGTACGTACGAACTCTAGTTGTGTTTATTTAGC

QA 1 651 1 651
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AAAAAAAAAGAAAAGAAGAAGACATGTCGGCAGTTTCTAGGGTTTTCGGAGGATGCAGGA
CACTGATGGCAAAGGCGGCGAATAATGCGGCGGCGGCGGCAGCAAGCGGCGGAGCTGGTA
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TCTTCGGTGACAAAGACACAGTTGGATTCACAGAGATCGCAAAGCTCTTGTCCCCACATT
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GGTCGTTTTTGATGTATATGAAAAAGAAGCAGAACTATGCTTGATCCATCAGTAAGTGGA
ATATTTATGTATTCTGACAAATTTTTTTTTTTATCATGATCTTGTTTTGTTTGGGGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FO64TF U 1
AF RS1AH18TF U 87
BS 1 571 RS1FO64TF
BS 572 572 RS1AH18TF
BS 573 595 RS1FO64TF
BS 596 598 RS1AH18TF

RD RS1FO64TF 597 0 0
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AAAAAAAAAGAAAAGAAGAAGACATGTCGGCAGTTTCTAGGGTTTTCGGAGGATGCAGGA
CACTGATGGCAAAGGCGGCGAATAATGCGGCGGCGGCGGCAGCAAGCGGCGGAGCTGGTA
AAGAAGGAAAAGGGATACTCAAGACAGTTCCGGTCTCACAGACGCTGGCTAGCTTCGCCG
GAGAAAGCGAGCTCTCTCGTGCCACCGCCGTGAAGAAAGTGTGGGAGCATATCAAGGGAA
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TCTTCGGTGACAAAGACACAGTTGGATTCACAGAGATCGCAAAGCTCTTGTCCCCACATT
TTCCCAAGTCTGTCTAATTTGGTGATGTAGTCCCATTATCATATTAGTTTGCTATCTTTT
GGTCGTTTTTGATGTATATGAAAAAGAAGCAGAACTATGCTTGATCCATCAGTAAGTGGA
ATATTTATGTATTCTGACAAATTTTTTTTTT*ATCATGATCTTGTTTTGTTTGGG
AT

QA 1 595 1 595
DS 

RD RS1AH18TF 512 0 0
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GTTCCGGTCTCACAGACGCTGGCTAGCTTCGCCGGAGAAAGCGAGCTCTCTCGTGCCACC
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AAGCAGATCATATGCGACGATAAGTTGAAGACAATCTTCGGTGACAAAGACACAGTTGGA
TTCACAGAGATCGCAAAGCTCTTGTCCCCACATTTTCCCAAGTCTGTCTAATTTGGTGAT
GTAGTCCCATTATCATATTAGTTTGCTATCTTTTGGTCGTTTTTGATGTATATGAAAAAG
AAGCAGAACTATGCTTGATCCATCAGTAAGTGGAATATTTATGTATTCTGACAAATTTTT
TTTTTTATCATGATCTTGTTTTGTTTGGGGAT

QA 1 512 1 512
DS 



AS 1 2

CO CL6735Contig1 764 2 4 U
AGGAAGCTGAAGAACTTGTGAACAAGGTTCCACCTGATGAGGCTTCGGTTCTATTGGAAT
CTCTTCTTGGTGCATGTAATGTTTGGTTGCACGGAACAAGCAGAGAGTATAGCGAATCGG
TTATTGGAATTGAATCCAGGGGAGACTTCTGGTTATGTTCAGATGTCAAACTTGCATGCT
TCTAATGGAAGATGGGAGGAGGTTACGGAGGTGAGAAGAAAGATGAGAGCAGAAAGAGTA
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GGTGAAGGACTAATAAACGACTAGCACTCTGGTTTCAAGTCAGAAGAACCACTCAACTTT
GAAAACCAAGAAGAAGAAACAGGTTTCTTTCGTCCCCATCTCATCATTCCAAAGAATCTG
AAAAAGTTTTGTGGTCTCTTTTTCTACCGGGGGTTTCTTAGGATGGACTATAAAACAATA
TGATTAAAAAAAGTAAGGGATGTATCTAGAGGTTACTGTTGTAATATGGTTAGGTCGTTG
TGTTTAATAGGGAGATGGAAGATGTTGTCTTAACGTGTAAAAAGCTAGTTGCAGTTTGAA
AAAAAAGAAAGAGCGAACTAAACCCGCCTGAAGAATCCTGTGACCACTTTTGGCCTTAGA
AAACTTTTTGTTTTTTTAATTGGTTTTGTAATCTCTGGGTATGTATTGGAATTTATACCG
AAGTAGGGGACCAGCTTTATCAATCAAAAACCAAACTTCATTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DZ90TF U 1
AF RS1DZ90JQ C 38
BS 1 605 RS1DZ90TF
BS 606 606 RS1DZ90JQ
BS 607 657 RS1DZ90TF
BS 658 764 RS1DZ90JQ

RD RS1DZ90TF 657 0 0
AGGAAGCTGAAGAACTTGTGAACAAGGTTCCACCTGATGAGGCTTCGGTTCTATTGGAAT
CTCTTCTTGGTGCATGTAATGTTTGGTTGCACGGAACAAGCAGAGAGTATAGCGAATCGG
TTATTGGAATTGAATCCAGGGGAGACTTCTGGTTATGTTCAGATGTCAAACTTGCATGCT
TCTAATGGAAGATGGGAGGAGGTTACGGAGGTGAGAAGAAAGATGAGAGCAGAAAGAGTA
AGCAAGAAGCCTGGATGTAGCATGATTGAGGTCAACGGGGTCGTCCATGAGTTCTCAGCT
GGTGAAGGACTAATAAACGACTAGCACTCTGGTTTCAAGTCAGAAGAACCACTCAACTTT
GAAAACCAAGAAGAAGAAACAGGTTTCTTTCGTCCCCATCTCATCATTCCAAAGAATCTG
AAAAAGTTTTGTGGTCTCTTTTTCTACCGGGGGTTTCTTAGGATGGACTATAAAACAATA
TGATTAAAAAAAGTAAGGGATGTATCTAGAGGTTACTGTTGTAATATGGTTAGGTCGTTG
TGTTTAATAGGGAGATGGAAGATGTTGTCTTAACGTGTAAAAAGCTAGTTGCAGTTTGAA
AAAAA*GAAAGAGCGAACTAAACCCGCCTGAAGAATCCTGTGACCACTTTTGGCCTT

QA 1 657 1 657
DS 

RD RS1DZ90JQ 727 0 0
TGAGGCTTCGGTTCTATTGGAATCTCTTCTTGGTGCATGTAATGTTTGGTTGCACGGAAC
AAGCAGAGAGTATAGCGAATCGGTTATTGGAATTGAATCCAGGGGAGACTTCTGGTTATG
TTCAGATGTCAAACTTGCATGCTTCTAATGGAAGATGGGAGGAGGTTACGGAGGTGAGAA
GAAAGATGAGAGCAGAAAGAGTAAGCAAGAAGCCTGGATGTAGCATGATTGAGGTCAACG
GGGTCGTCCATGAGTTCTCAGCTGGTGAAGGACTAATAAACGACTAGCACTCTGGTTTCA
AGTCAGAAGAACCACTCAACTTTGAAAACCAAGAAGAAGAAACAGGTTTCTTTCGTCCCC
ATCTCATCATTCCAAAGAATCTGAAAAAGTTTTGTGGTCTCTTTTTCTACCGGGGGTTTC
TTAGGATGGACTATAAAACAATATGATTAAAAAAAGTAAGGGATGTATCTAGAGGTTACT
GTTGTAATATGGTTAGGTCGTTGTGTTTAATAGGGAGATGGAAGATGTTGTCTTAACGTG
TAAAAAGCTAGTTGCAGTTTGAAAAAAAAGAAAGAGCGAACTAAACCCGCCTGAAGAATC
CTGTGACCACTTTTGGCCTTAGAAAACTTTTTGTTTTTTTAATTGGTTTTGTAATCTCTG
GGTATGTATTGGAATTTATACCGAAGTAGGGGACCAGCTTTATCAATCAAAAACCAAACT
TCATTGG

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

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TTCATGTTCGTCGGCGTTTATGTCTGCTTCCCCGCCGTCGGCAACGTGCTGCGCCAAGCT
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TAACTCTCCAAACGCCAAAAAAGTCGCCAGCAGTTGCAATGTTGCAACCCCAAACTGTTA
ATCATGATTATTTAGTGACAAGTTTCGCTGATCATGAGTGTTTAATTACTAGTTAAAATG
GGTCAGGTCCTCGACACTACTGTTTAGAATAATAGTGTGTGGTGATTATGATGATCATCA
TCATGCTTTAATGTTATGTCATGTTATGCTACGTATATTATGTTATGTATGTTTCTATCT
TTTGAAACATTTTCCAAATATGTTTACTCTGTCTCTGTGCTAATCCTACATTTCAATTCC
TAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 

AF RS1DH47JQ C 1
AF RS1DH47TF U 1
BS 1 604 RS1DH47TF

RD RS1DH47JQ 604 0 0
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TAGC

QA 1 604 1 604
DS 

RD RS1DH47TF 604 0 0
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TAACTCTCCAAACGCCAAAAAAGTCGCCAGCAGTTGCAATGTTGCAACCCCAAACTGTTA
ATCATGATTATTTAGTGACAAGTTTCGCTGATCATGAGTGTTTAATTACTAGTTAAAATG
GGTCAGGTCCTCGACACTACTGTTTAGAATAATAGTGTGTGGTGATTATGATGATCATCA
TCATGCTTTAATGTTATGTCATGTTATGCTACGTATATTATGTTATGTATGTTTCTATCT
TTTGAAACATTTTCCAAATATGTTTACTCTGTCTCTGTGCTAATCCTACATTTCAATTCC
TAGC

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 2

CO CL6737Contig1 766 2 2 U
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CAATTGATCCGACTTTCGTACCATTGGTTCAGGCTCGATGCCCTCAAGCCGGAGACGCAT
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CCCGAACCATCATAGAACGTTTATTAGGCTTACGCCGACCATCCTTGAGGTTCGGAGCAG
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AGATTCGTAGGGTTTGCTCTGCGATCAACTAAGAAAGTGAATGAAAGCACAACACTGTGG
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GATTAGCATTTTGTTGTTGATGGTTACGTGATGTCAAGTGTAAGATTGTACTATGTAACA
TGAATGTATTATGTAATAAATGAAATTGTCATTTGTTTTTTTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RS1GD70TF U 1
AF RS1GD70JQ C 145
BS 1 763 RS1GD70TF
BS 764 766 RS1GD70JQ

RD RS1GD70TF 765 0 0
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AAACTCTTAACACATTAGACCTCGTAACTCTTATTGGCGGACACACAATAGGAACAGCTG
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CAATTGATCCGACTTTCGTACCATTGGTTCAGGCTCGATGCCCTCAAGCCGGAGACGCAT
CAGCCCGAGTCGACTTAGACGAAGGTAGTGCTGGCAGGTTTGACACATCGTTCCTAAGTA
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CCCGAACCATCATAGAACGTTTATTAGGCTTACGCCGACCATCCTTGAGGTTCGGAGCAG
AGTTCGGGAATTCGATGGTCAAGATGAGTCTTATAGAAGTCAAGACAGGATCAGATGGGG
AGATTCGTAGGGTTTGCTCTGCGATCAACTAAGAAAGTGAATGAAAGCACAACACTGTGG
TTTGGTCTAAATTTATGATTTGGTTTACTAATAATAATTTGTTTGATACAATAAGCTTGT
GATTAGCATTTTGTTGTTGATGGTTACGTGATGTCAAGTGTAAGATTGTACTATGTAACA
TGAATGTATTATGTAATAAATGAAATTGTCATTTGTTTTTTTT
CG

QA 1 763 1 763
DS 

RD RS1GD70JQ 622 0 0
TAACTCTTATTGGCGGACACACAATAGGAACAGCTGGTTGCGGTTTGGTGAGAGGCAGAT
TCTTTAACTTCAACGGCACAGGACAACCCGACCCATCAATTGATCCGACTTTCGTACCAT
TGGTTCAGGCTCGATGCCCTCAAGCCGGAGACGCATCAGCCCGAGTCGACTTAGACGAAG
GTAGTGCTGGCAGGTTTGACACATCGTTCCTAAGTAAAGTGAGGTCAAACCGCGTGGTTT
TACAGTCCGATCTAGTCTTGTGGAATGACCCCGAGACCCGAACCATCATAGAACGTTTAT
TAGGCTTACGCCGACCATCCTTGAGGTTCGGAGCAGAGTTCGGGAATTCGATGGTCAAGA
TGAGTCTTATAGAAGTCAAGACAGGATCAGATGGGGAGATTCGTAGGGTTTGCTCTGCGA
TCAACTAAGAAAGTGAATGAAAGCACAACACTGTGGTTTGGTCTAAATTTATGATTTGGT
TTACTAATAATAATTTGTTTGATACAATAAGCTTGTGATTAGCATTTTGTTGTTGATGGT
TACGTGATGTCAAGTGTAAGATTGTACTATGTAACATGAATGTATTATGTAATAAATGAA
ATTGTCATTTGTTTTTTTTTCG

QA 1 622 1 622
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6739Contig1 982 2 36 U
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TGAAACAAACAGAAAAGCCTTTTTGCGTTTTCAAAAATCCAAACTTAAAACTCTGGCAAT
GTCAATAACAATGAAACTCAGGTTCCCTCAAACTCATGATTTCAATTTGTATTCTATACC
TTTTTTTAGCCAAACTTAAATCCACCAGGGGGAGCAGCTGGCTGGTTATTCCCGAAACTG
AAGCCTTGCTGTGGATTCTAGCTCACACCGTCTGGCAAAATCTGCTCTTCACCTTCTTCT
TCAGCCCAATATCTCTCCAAGATCTTAACAGCCTTCTCATAAATCTCGTTGTTGTCATGG
GACTGAAGGTTTTCGATTTTGTCCAATCCATCAGACTCTTCTATTATCTGAGCATAGAGA
TTCACCCCACCGTTTAATCCCATCTCCTTGTCAGCCTCACTAATCTTGAGGATGTTTTCA
AGCCCTTCGAGGCACACTGTCACAATCCTCGGATCAGAGCAGATTAGTAGATCACAAAGA
GGTTTGATACAGCCTTGGTTGACCAAATATTGAATCTGCTCGCGAGACCCTCCTGATGTG
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TGCACAAGAGGAAGGACTAATCCAGCACCAACCACAGCCTCTATCTGAGCTTGGTTCCCA
GCAGTGATATTTGAGATAGTCCAACAAGCTTCTTTTTTTATACTTTTCTTGTGATTTTGC
GTAAGCAAATTATAAAGGGTGTGGAAGTACACCACTGTCAATTATAAACTGTGTCTGAGA
GTCATCACCAGTTACAATGTTC


BQ
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15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EC03JQ U 1
AF RS1AE68JQ U 89
BS 1 115 RS1EC03JQ
BS 116 116 RS1AE68JQ
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RD RS1EC03JQ 827 0 0
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TTTT**TAGCCAAACTTAAATCCACCAGGGGGAGCAGCTGGCTGGTTATTCCCGAAACTG
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TGCACAAGAGGAAGTACTAATCCAGCACCGACCACAGCCTCTATCTG

QA 1 827 1 827
DS 

RD RS1AE68JQ 894 0 0
GAGAT
AAGATTTATCCCAAAGTTTTAAAGATATTAAAATACAGACTCAGAGAATGATTCAAACGA
ATAAAGACAACAACAAAAGAAAGTAAATGAAACAAACAGAAAAGCTTTTTTGCGTTTTCA
AAAATCCAAACTTGAACCTCTGGCAATGTCAATAACAATGAAACTCAGGTTCCCTCAAAC
TCATGATTTCAATTTGTATTCTATACCTTTTTTTAGCCAAACTTAAATCCACCAGGGGGA
GCAGCTGGCTGGTTATTCCCGAAACTGAAGCCTTGCTGTGGATTCTCGCTCACACCGTCT
GGCAGAATCTGCTCTTCATCTTCTTCTTCAGCCCAATATCTCTCCAAGATCTTAACAGCC
TTCTCATAAATCTCGTTGTTGTCATGGGACTGAAGGTTTTCGATTTTGTCCAATCCATCA
GACTCTTCTATTATCTGAGCATAGAGATTCACCCCACCGTTTAGTCCCATCTCCTTGTCA
GCCTCGCTAATCTTGAGGATGTTTTCAAGCCCTTCGAGGCACACTGTCACAATCCTCGGA
TCAGAGCAGATTAGTAGATCACAGAGAGGTTTGATACAGCCTTGGTTGACCAAATATTGA
ATCTGCTCGCGAGACCCTCCTGATGTGGCATTGGAAATGGCCCATGCAGCTTCCTTCTTT
ATATCGAACTTAGCGTTCTAGAGCAGGTGCACAAGAGGAAGGACTAATCCAGCACCAACC
ACAGCCTCTATCTGAGCTTGGTTCCCAGCAGTGATATTTGAGATAGTCCAACAAGCTTCT
TTTTTTATACTTTTCTTGTGATTTTGCGTAAGCAAATTATAAAGGGTGTGGAAGTACACC
ACTGTCAATTATAAACTGTGTCTGAGAGTCATCACCAGTTACAATGTTC

QA 6 894 6 894
DS 



AS 1 2

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AGCTTATGCTTCTTTTGATATTTAACATAAGATTTTAATG


BQ
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AF RS1E166TF U 1
AF RS1E166JQ C 1
BS 1 616 RS1E166TF
BS 617 700 RS1E166JQ

RD RS1E166TF 616 0 0
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CTCGAGAAGAAACGACAAGAGGCTATGAGGAATGCTTTGGGTCACTCTGCAAAAATTGAA
GATTTAACGGAGAAGATGTGGTCTGATGTTAAGTTGATAAAGATGTTTTCTGATCTCGAG
AAGAAGATGCTGTCTCAACTTAGTGGTTTAAGTTTCGAGAGGATGTGGTCTGATCTGATG
GAGAAGATTGGTTCCGGTCGATCACCCTAATTATTGTCAAGCTTGTCTTTGTGGAGTAGC
AGTCAATCTTAATAAATTATTATGTAAACGTCTGTGCTTTTTGTTTAAATGTATGGTGTG
AGCATCTTATCTTATT

QA 1 616 1 616
DS 

RD RS1E166JQ 700 0 0
GGAAGCTCGCCCGCCCGACCATCGTCTCTCGAAGAAAATCACAAACTTGAGAAGGAGAGC
GAGCGTACCCTAGTTTCCTTGACGATGCCGCCGATTCTGAGATCCGTCAATTTCGCGCAG
GTAACTCGCGGGGGGAGATCTGTTGCCCGCAATTTCTCTTCGTACCGCAGAAGAAGAAGA
ATAAGCTATGAAGAGTCTAAGGGACGAGGAATAAGAATAGGAAATGTCATAACTGGAGGT
GCAGGAGCCACTCTGGGTTGTTACTTTGGTTATTTGCTCACTGGAGACTGGATACAAGAT
CTCGAGAAGAAACGACAAGAGGCTATGAGGAATGCTTTGGGTCACTCTGCAAAAATTGAA
GATTTAACGGAGAAGATGTGGTCTGATGTTAAGTTGATAAAGATGTTTTCTGATCTCGAG
AAGAAGATGCTGTCTCAACTTAGTGGTTTAAGTTTCGAGAGGATGTGGTCTGATCTGATG
GAGAAGATTGGTTCCGGTCGATCACCCTAATTATTGTCAAGCTTGTCTTTGTGGAGTAGC
AGTCAATCTTAATAAATTATTATGTAAACGTCTGTGCTTTTTGTTTAAATGTATGGTGTG
AGCATCTTATCTTATTGTAGGAAAACGTGTTAGCTTAAATGTGAACAAACATGGAAGCCT
AGCTTATGCTTCTTTTGATATTTAACATAAGATTTTAATG

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

CO CL6741Contig1 715 2 2 U
ACGTGGCGGTTCTGCGTTGTCGACGTATTTTTGTGGCTTGCTACGCACAGCATTTTAATC
TCTCCCAAGAATTTCTTGAGAAGAATGCAAGTTCTGTGGAACAAGAAAAGAAATCTTAAA
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TTCATCAAGATCGTGACTTTAGTAAAACAAATATTATTCTATGGTCTGTGGACAACAAGA
AGAACAAGGGATTGCTTATATGAGGATATGGAGAAGAAGACAATGAGGTTACGTAATTAT
CAATGTCAATCCGAGGAATTATGTATAGTATGGATATGGACTACAACAAAGCATGTTATC
TCCTGCAGCGGGGTGTATGGAATGGGCAACGATGTAACAGATGGATCGTGTCTCCTGATC
TATTAAGTGGTAAAAGGCGTTGGATCACAATGGATGATAGCCAAACACAAGATCATATAA
GACCGAGAACAACAATAGAAAGATTAGCGAATCAGTCTATCCTGCAAAGTGAGTTAGGAA
GCATCGTGTTATTATTTTTCTATTATCATGTTCAGCTTAAAAATGTATTTGTTGTAATTT
CCGATTCTAATATTTTGTTAAACTTCGGTTGATATTAATAAAAATAAGGTGTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BY92TF U 1
AF RS1BY92JQ C 28
BS 1 643 RS1BY92TF
BS 644 715 RS1BY92JQ

RD RS1BY92TF 643 0 0
ACGTGGCGGTTCTGCGTTGTCGACGTATTTTTGTGGCTTGCTACGCACAGCATTTTAATC
TCTCCCAAGAATTTCTTGAGAAGAATGCAAGTTCTGTGGAACAAGAAAAGAAATCTTAAA
CCGCCATGGATATGGAGAAGATTGCAGACATCGTGTTCTTTTACCATGGTAACTCCACTA
TTTCAAAAGAATATGTTTTATTTGGTCTACGGTGTGATGAAGGCAACACTGGTATTTACT
TTCATCAAGATCGTGACTTTAGTAAAACAAATATTATTCTATGGTCTGTGGACAACAAGA
AGAACAAGGGATTGCTTATATGAGGATATGGAGAAGAAGACAATGAGGTTACGTAATTAT
CAATGTCAATCCGAGGAATTATGTATAGTATGGATATGGACTACAACAAAGCATGTTATC
TCCTGCAGCGGGGTGTATGGAATGGGCAACGATGTAACAGATGGATCGTGTCTCCTGATC
TATTAAGTGGTAAAAGGCGTTGGATCACAATGGATGATAGCCAAACACAAGATCATATAA
GACCGAGAACAACAATAGAAAGATTAGCGAATCAGTCTATCCTGCAAAGTGAGTTAGGAA
GCATCGTGTTATTATTTTTCTATTATCATGTTCAGCTTAAAAA

QA 1 643 1 643
DS 

RD RS1BY92JQ 688 0 0
TTTTTGTGGCTTGCTACGCACAGCATTTTAATCTCTCCCAAGAATTTCTTGAGAAGAATG
CAAGTTCTGTGGAACAAGAAAAGAAATCTTAAACCGCCATGGATATGGAGAAGATTGCAG
ACATCGTGTTCTTTTACCATGGTAACTCCACTATTTCAAAAGAATATGTTTTATTTGGTC
TACGGTGTGATGAAGGCAACACTGGTATTTACTTTCATCAAGATCGTGACTTTAGTAAAA
CAAATATTATTCTATGGTCTGTGGACAACAAGAAGAACAAGGGATTGCTTATATGAGGAT
ATGGAGAAGAAGACAATGAGGTTACGTAATTATCAATGTCAATCCGAGGAATTATGTATA
GTATGGATATGGACTACAACAAAGCATGTTATCTCCTGCAGCGGGGTGTATGGAATGGGC
AACGATGTAACAGATGGATCGTGTCTCCTGATCTATTAAGTGGTAAAAGGCGTTGGATCA
CAATGGATGATAGCCAAACACAAGATCATATAAGACCGAGAACAACAATAGAAAGATTAG
CGAATCAGTCTATCCTGCAAAGTGAGTTAGGAAGCATCGTGTTATTATTTTTCTATTATC
ATGTTCAGCTTAAAAATGTATTTGTTGTAATTTCCGATTCTAATATTTTGTTAAACTTCG
GTTGATATTAATAAAAATAAGGTGTTAT

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

CO CL6742Contig1 722 2 14 U
AACTTTAGAATGACCTTTTTGCCTTAATTTTACAAACGTTTAGGTATTGCAGGACTTTGG
TATATGCAAAAATATATCAAAGATCAAACTAAAGGACAGACTCCAAACCTCCCTCACAAT
TGTCTATTGCTTTGTTTTAAGTTTTCTATACAGTACGTTTTCGCTTCGATCTTTTGCTTC
TCCTTTGGCCAACGTCAGGCAATGGCTTGCTTGTGCTCGAAGCTAACGCTCCTTCACGAA
CCTCTTCTTCCTCATCGTCGGACCCTTCTTCTGATTCAGACTGAGATTCTAGGAGTTCAA
CTGTATCTTTCGCAACGGCCTTGTTCTTCTTGCTACGCTTCTCTTGCTCTTTTAATTGTC
TAAATCTGTCGCCAGCATCATCAGGCTGAGCAATAGATCTCTTTGCCCGTCCCGCAGTTA
TTATTCCGCTTGCGTTTTCATTGACTGCAGGCGCTGCGCCACCTAGTTTACGCAGCCAAA
CTTGTTGGGCGGTGCTAAGCACATTGTTTGTGAACCAGTATATAGATAATCCTGATGGGA
CAGACAATGCAAAGTAGCCAATCATGAGTGGAAGAAACTTGAAAACGAGAAGTGTGTTCT
TCTGCGCAGGATCATCTGTTTGAGGAGGCTTCATAATCTCCATTGACACATACTGGGAGA
CAATAAGGAGAACAGGCAAGACAAGATACGCGGCGGTATCACCCCATCCCAATGGTGGAT
GC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
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10 10 

AF RS1DU72JQ U 1
AF RS1DM86TF C 19
BS 1 57 RS1DU72JQ
BS 58 58 RS1DM86TF
BS 59 129 RS1DU72JQ
BS 130 130 RS1DM86TF
BS 131 277 RS1DU72JQ
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BS 279 334 RS1DU72JQ
BS 335 335 RS1DM86TF
BS 336 613 RS1DU72JQ
BS 614 614 RS1DM86TF
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BS 650 650 RS1DM86TF
BS 651 681 RS1DU72JQ
BS 682 722 RS1DM86TF

RD RS1DU72JQ 681 0 0
AACTTTAGAATGACCTTTTTGCCTTAATTTTACAAACGTTTAGGTATTGCAGGACTT*GG
TATATGCAAAAATATATCAAAGATCAAACTAAAGGACAGACTCCAAACCTCCCTCACAAT
TGTCTATTGTTTTGTTTTAAGTTTTCTATACAGTACGTTTTCGCTTCGATCTTTTGCTTC
TCCTTTGGCCAACGTCAGGCAATGGCTTGCTTGTGCTCGAAGCTAACGCTCCTTCACGAA
CCTCTTCTTCCTCATCGTCGGACCCTTCTTCTGATTCTGACTGAGATTCTAGGAGTTCAA
CTGTATCTTTCGCAACGGCCTTGTTCTTCTTGCTGCGCTTCTCTTGCTCTTTTAATTGTC
TAAATCTGTCGCCAGCATCATCAGGCTGAGCAATAGATCTCTTTGCCCGTCCCGCAGTTA
TTATTCCGCTTGCGTTTTCATTGACTGCAGGCGCTGCGCCACCTAGTTTACGCAGCCAAA
CTTGTTGGGCGGTGCTAAGCACATTGTTTGTGAACCAGTATATAGATAATCCTGATGGGA
CAGACAATGCAAAGTAGCCAATCATGAGTGGAAGAAACTTGAAAACGAGAAGTGTGTTCT
TCTGCGCAGGATCGTCTGTTTGAGGAGGCTTCATAATCTCCATTGACACGTACTGGGAGA
CAATAAGGAGAACAGGCAAGA

QA 1 681 1 681
DS 

RD RS1DM86TF 704 0 0
TTTTTGCTTA
TTTACAAACGTTTAGGTATTGCAGGACTTTGGTATATGCAAAAATATATCAAAGATCAAA
CTAAAGGACAGACTCCAAACCTCCCTCACAATTGTCTATTGCTTTGTTTTAAGTTTTCTA
TACAGTGCGTTTTCGCTTCGATCTTTTGCTTCTCCTTTGGCCAACGTCAGGCAATGGCTT
GCTTGTGCTCGAAGCTAACGCTCCTTCACGAACCTCTTCTTCCTCATCGTCGGACCCTTC
TTCTGATTCAGACTGAGATTCTAGGAGTTCAACTGTATCTTTCGCAACGGCCTTGTTCTT
CTTGCTACGCTTCTCTTGCTCTTTTAATTGTCTAAATCTTTCGCCAGCATCATCAGGCTG
AGCAATAGATCTCTTTGCCCGTCCCGCAGTTATTATTCCGCTTGCGTTTTCATTGACTGC
AGGCGCTGCGCCACCTAGTTTACGCAGCCAAACTTGTTGTGCGGTGCTAAGCACATTGTT
TGTGAACCAGTATATAGATAATCCTGATGGGACAGACAATGCAAAGTAGCCAATCATGAG
TGGAAGAAACTTGAAAACGAGAAGTGTGTTCTTCTGCGCAGGATCATCTGTTTGAGGAGG
CTTCATAATCTCCATTGACACATACTGGGAGACAATAAGGAGAACAGGCAAGACAAGATA
CGCGGCGGTATCACCCCATCCCAATGGTGGATGC

QA 11 704 11 704
DS 



AS 1 2

CO CL6743Contig1 731 2 1 U
GGAAGAGCTCTCTCTCTTGATAATAACTAGACCTGTAGATAATACCGAAACCACACATAT
ACCCCTGAGGCCTCTTCTCTCCTTCTGCAACTTTATCATCCATGTGCTTGATAAGATAGG
ACCAACAATGGCTGTTCTTAGACAAGACATCGATCAGAATATACAGAGATTAGAGAAAGT
TTGTGAAACAGATCCTTGTGTTTACTCAAATTTAGTTGAGATTCTGAAAAAAGAGAGGAA
CGAGGGGACATACAAGATGGTTGCTAGTTGCAGCAGAGCTCTTCTTTGGCACACTAGGAC
AATGGATTTTACGGCGGGTTTATTACGAATGTTGTCCAAAGAGGTGTCGTCAAAAATGGA
AGAACTTATAGAAGAATGCTACTTGACGACTTTAAAACCGCATCATGGATGGATAGCGTC
TGCTGCTTTCAAAGTATGCTTGAAGCTAGTGCCTGACAATAAAACGTTTATGGACGCGAT
CGGCGGAAGAGACGACAGCTATGATACCCTTAGAGAAGACATTGAAACATTAAGCTCATT
ATTGACACCTATTCTCAAAGAGATTTCCATTGTGCTGGAACAATTTGGTTTGAACAGGTT
AAGATCGATGTAAAAATGAACTCAGAAGTGATACTATATTTGTTAATGTTATAAATTTTA
TATAAGATACATGTATATACCTTTTTATGTACATATCAGTTTTATACACTGTTTATTTAA
TAATGTGGACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AS38TF U 1
AF RS1AS38JQ C 88
BS 1 731 RS1AS38TF

RD RS1AS38TF 731 0 0
GGAAGAGCTCTCTCTCTTGATAATAACTAGACCTGTAGATAATACCGAAACCACACATAT
ACCCCTGAGGCCTCTTCTCTCCTTCTGCAACTTTATCATCCATGTGCTTGATAAGATAGG
ACCAACAATGGCTGTTCTTAGACAAGACATCGATCAGAATATACAGAGATTAGAGAAAGT
TTGTGAAACAGATCCTTGTGTTTACTCAAATTTAGTTGAGATTCTGAAAAAAGAGAGGAA
CGAGGGGACATACAAGATGGTTGCTAGTTGCAGCAGAGCTCTTCTTTGGCACACTAGGAC
AATGGATTTTACGGCGGGTTTATTACGAATGTTGTCCAAAGAGGTGTCGTCAAAAATGGA
AGAACTTATAGAAGAATGCTACTTGACGACTTTAAAACCGCATCATGGATGGATAGCGTC
TGCTGCTTTCAAAGTATGCTTGAAGCTAGTGCCTGACAATAAAACGTTTATGGACGCGAT
CGGCGGAAGAGACGACAGCTATGATACCCTTAGAGAAGACATTGAAACATTAAGCTCATT
ATTGACACCTATTCTCAAAGAGATTTCCATTGTGCTGGAACAATTTGGTTTGAACAGGTT
AAGATCGATGTAAAAATGAACTCAGAAGTGATACTATATTTGTTAATGTTATAAATTTTA
TATAAGATACATGTATATACCTTTTTATGTACATATCAGTTTTATACACTGTTTATTTAA
TAATGTGGACT

QA 1 731 1 731
DS 

RD RS1AS38JQ 644 0 0
CAACTTTATCATCCATGTGCTTGATAAGATAGGACCAACAATGGCTGTTTTTAGACAAGA
CATCGATCAGAATATACAGAGATTAGAGAAAGTTTGTGAAACAGATCCTTGTGTTTACTC
AAATTTAGTTGAGATTTTGAAAAAAGAGAGGAACGAGGGGACATACAAGATGGTTGCTAG
TTGCAGCAGAGTTTTTTTTTGGCACACTAGGACAATGGATTTTACGGCGGGTTTATTACG
AATGTTGTCCAAAGAGGTGTCGTCAAAAATGGAAGAACTTATAGAAGAATGCTACTTGAC
GACTTTAAAACCGCATCATGGATGGATAGCGTTTGCTGCTTTCAAAGTATGCTTGAAGCT
AGTGCCTGACAATAAAACGTTTATGGACGCGATCGGCGGAAGAGACGACAGCTATGATAC
CCTTAGAGAAGACATTGAAACATTAAGCTCATTATTGACACCTATTTTCAAAGAGATTTC
CATTGTGCTGGAACAATTTGGTTTGAACAGGTTAAGATCGATGTAAAAATGAACTCAGAA
GTGATACTATATTTGTTAATGTTATAAATTTTATATAAGATACATGTATATACCTTTTTA
TGTACATATCAGTTTTATACACTGTTTATTTAATAATGTGGACT

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 2

CO CL6744Contig1 798 2 2 U
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GGCACTATCCTCAGCGTACATGCCAATTGGGGCCATTCTTATGAGTCAAGAAGTAGCAGA
TGTCATATATTCTCAAAGCAACAAGCTAGGTGCTTTCTCCCATGGATTTACTTACTCTGG
TCATCCAGTTTCATGTGCTGTAGCAATTGAAGCGTTAAAGATATACAAAGAGAGGAACAT
ACCAGAACATGTCGCCAGAGTTGCCCCAAGGTTTCAAGATGGTCTTAAAGCTTTTGCCAA
GAGTAGTCCTATTATTGGAGAGATAAGAGGAACGGGTTTAATTCTGGGGACTGAGTTTAC
AGACAGCAAATCTCCAAACGAACTGTTTCCAACAGAATGGGGTGTTGGCGCATATTTTGG
AGCCGAGTGCCAGAAGCGTGGTATGCTAGTCCGTGTTGCAGGTGATGGCATTATGATGTC
TCCACCGCTCATTATCTCACCTGAAGAGATCGATGAGTTGATTGATATCTACGGGAAAGC
ATTGAAAGCTACGGAAGAGAGAGTAAAAGAACTCAAGGCTCAACACAAGAAGTGAGAAGC
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CCATTTGCTTTGCGTACAGTTCCCGAATTCAGTTTATATATACATAATAAAGCATCCATG
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AACCATCTAACTTAAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1H615TF U 1
AF RS1H615JQB C 104
BS 1 718 RS1H615TF
BS 719 798 RS1H615JQB

RD RS1H615TF 718 0 0
GGGGACAATGTTTGGCTGTGACAAATACAACATCAAGCCAGATCTTGTGTCCTTAGCCAA
GGCACTATCCTCAGCGTACATGCCAATTGGGGCCATTCTTATGAGTCAAGAAGTAGCAGA
TGTCATATATTCTCAAAGCAACAAGCTAGGTGCTTTCTCCCATGGATTTACTTACTCTGG
TCATCCAGTTTCATGTGCTGTAGCAATTGAAGCGTTAAAGATATACAAAGAGAGGAACAT
ACCAGAACATGTCGCCAGAGTTGCCCCAAGGTTTCAAGATGGTCTTAAAGCTTTTGCCAA
GAGTAGTCCTATTATTGGAGAGATAAGAGGAACGGGTTTAATTCTGGGGACTGAGTTTAC
AGACAGCAAATCTCCAAACGAACTGTTTCCAACAGAATGGGGTGTTGGCGCATATTTTGG
AGCCGAGTGCCAGAAGCGTGGTATGCTAGTCCGTGTTGCAGGTGATGGCATTATGATGTC
TCCACCGCTCATTATCTCACCTGAAGAGATCGATGAGTTGATTGATATCTACGGGAAAGC
ATTGAAAGCTACGGAAGAGAGAGTAAAAGAACTCAAGGCTCAACACAAGAAGTGAGAAGC
AAAGGGGTTCTGATGCTGTCCAGGAAATAGTGGTTTATATCTCTCTCCTCGAATTGTTTG
CCATTTGCTTTGCGTACAGTTCCCGAATTCAGTTTATATATACATAATAAAGCATCCA

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1H615JQB 695 0 0
AGTCAAGAAGTAGCAGATGTCATATATTCTCAAAGCAACAAGCTAGGTGCTTTCTCCCAT
GGATTTACTTACTCTGGTCATCCAGTTTCATGTGCTGTAGCAATTGAAGCGTTAAAGATA
TACAAAGAGAGGAACATACCAGAACATGTCGCCAGAGTTGCCCCAAGGTTTCAAGATGGT
CTTAAAGCTTTTGCCAAGAGTAGTCCTATTATTGGAGAGATAAGAGGAACGGGTTTAATT
CTGGGGACTGAGTTTACAGACAGCAAATCTCCAAACGAACTGTTTCCAACAGAATGGGGT
GTTGGCGCATATTTTGGAGCCGAGTGCCAGAAGCGTGGTATGCTAGTCCGTGTTGCAGGT
GATGGCATTATGATGTCTCCACCGCTCATTATCTCACCTGAAGAGATCGATGAGTTGATT
GATATCTACGGGAAAGCATTGAAAGCTACGGAAGAGAGAGTAAAAGAACTCAAGGCTCAA
CACAAGAAGTGAGAAGCAAAGGGGTTCTGATGCTGTCCAGGAAATAGTGGTTTATATCTC
TCTCCTCGAATTGTTTGCCATTTGCTTTGCGTACAGTTCCCGAATTCAGTTTATATATAC
ATAATAAAGCATCCATGCAACATAATAAACCATCCAACTTAAGCCTCCTTTTTTTGCGAG
CTTTTCACCACATAATAAACCATCTAACTTAAGCC

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

CO CL6745Contig1 726 2 2 U
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AGCTTAGCAAGCATGCGGTTGATTTGGAGAAGAGGTCTATTCAGCTCTCTCTCGAGGAAG
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AGTCTACATCCAATGAAGAGTGAGAATGATGGGTGGGGCAGCCGCTTGTGGCCTTGTTTG
TTATTGTTTTAAGATTTTTGTAATAGCCTTCCAAGCCATTTGGGGCTTAAACATCCCATT
GTATCCGTGTATATACTACTTATAACATGTGTTTACTCATTTCAGCTCTCAAATTTCCAA
GTCCATGTATTTATCCCTGTAGATGAAGATGTTGTTTTTTAAATTTGAGATAAAAATTTG
TTAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1GK94TF U 1
AF RS1GK94JQ C 415
BS 1 581 RS1GK94TF
BS 582 726 RS1GK94JQ

RD RS1GK94TF 581 0 0
CTCAGAGCTGGCTGATGGTGAAAGGGGATTCTGAGTCTGATCTTGAGACAAAAATGGAGA
CAGACCAACGAACAAGCAACACTCCACCAAAAGAACAAACGCCCCAGGCCGTGGAGAAGA
AAGTGAATCCGTCTCAGTCTCCGGCCACCACCAACGCGTATGTGCGCAGAAAAGTCGAGA
TTGACACATCCAAAGACACTGTGGCTAAGCAGCAGCCCAAGGTTATCTCATCATCCACAG
TGCCACTACCTCCGGACTGGGAAGAGCGTTACCACCACCTTCAAATTCTCCTAAACAAGC
TTAACGATTCTGATCAGACGGACCATCATCTACACATGCTTTGGTCACTTTCCTCGGCGG
AGCTTAGCAAGCATGCGGTTGATTTGGAGAAGAGGTCTATTCAGCTCTCTCTCGAGGAAG
CAAGGGAGATGCAGCGTGTAGCGGCTTTAAACGTGATAGGAAGGTCTGTGAATACTCTAA
AGTCTACATCCAATGAAGAGTGAGAATGATGGGTGGGGCAGCCGCTTGTGGCCTTGTTTG
TTATTGTTTTAAGATTTTTGTAATAGCCTTCCAAGCCATTT

QA 1 581 1 581
DS 

RD RS1GK94JQ 312 0 0
AGGAAGCAAGGGAGATGCAGCGTGTAGCGGCTTTAAACGTGATAGGAAGGTCTGTGAATA
CTTTAAAGTCTACATCCAATGAAGAGTGAGAATGATGGGTGGGGCAGCCGCTTGTGGCCT
TGTTTGTTATTGTTTTAAGATTTTTGTAATAGCCTTCCAAGCCATTTGGGGCTTAAACAT
CCCATTGTATCCGTGTATATACTACTTATAACATGTGTTTACTCATTTCAGCTCTCAAAT
TTCCAAGTCCATGTATTTATCCCTGTAGATGAAGATGTTGTTTTTTAAATTTGAGATAAA
AATTTGTTAAGG

QA 1 312 1 312
DS 



AS 1 2

CO CL6746Contig1 649 2 6 U
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AGGTTTTCTTCTCAGCTTTATCTCAGATCGCTTCTTAGCTGTTACCATGCCGAAGAACAA
GGGAAAGGGAGGAAAGAACAGGAAGAGAGGAAAGAACGAAGCCGATGACGAGAAGCGTGA
GCTTATACTCAAAGAAGACGGACAAGAGTACGCGCAAGTCCTTCGTATGCTCGGCAACGG
GAGATGCGAGTGCATGTGCATCGACGGCACCAAACGTCTCTGCCATATCCGCGGCAAGAT
GCACAAGAAGGTTTGGATCGCGGCAGGTGATATCATACTTGTTGGTCTGAGAGACTACCA
GGATGACAAGGCTGATGTCATCCTCAAGTACATGTCTGATGAGGCAAGGCTTCTCAAGGC
CTATGGTGAGCTTCCCGAGAACACTCGTCTCAACGAAGGTATTGCTGGTGATCTTGACGA
TGATGAGGAGAATGGCGCTGATGATGTTATTGATTTTGAGGACGAGGATATCGATAGGAT
CTAAGGTGTTTGTTTGGTTTTTGTTTTTGCTTTGAACCTTTTCTGGCAGCTTTATATTGA
CCTCTGAGTTTACAGAAGAGTATACTTTACAACTATTATGTTCTTTAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F888TF U 1
AF RS1B557TF U 8
BS 1 187 RS1F888TF
BS 188 188 RS1B557TF
BS 189 601 RS1F888TF
BS 602 602 RS1B557TF
BS 603 633 RS1F888TF
BS 634 649 RS1B557TF

RD RS1F888TF 633 0 0
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AGGTTTTCTTCTCAGCTTTATCTCAGATCGCTTCTTAGCTGTTACCATGCCGAAGAACAA
GGGAAAGGGAGGAAAGAACAGGAAGAGAGGAAAGAACGAAGCCGATGACGAGAAGCGTGA
GCTTATATTCAAAGAAGACGGACAAGAGTACGCGCAAGTCCTTCGTATGCTCGGCAACGG
GAGATGCGAGTGCATGTGCATCGACGGCACCAAACGTCTCTGCCATATCCGCGGCAAGAT
GCACAAGAAGGTTTGGATCGCGGCAGGTGATATCATACTTGTTGGTCTGAGAGACTACCA
GGATGACAAGGCTGATGTCATCCTCAAGTACATGTCTGATGAGGCAAGGCTTCTCAAGGC
CTATGGTGAGCTTCCCGAGAACACTCGTCTCAACGAAGGTATTGCTGGTGATCTTGACGA
TGATGAGGAGAATGGCGCTGATGATGTTATTGATTTTGAGGACGAGGATATCGATAGGAT
CTAAGGTGTTTGTTTGGTTTTTGTTTTTGCTTTGAACCTTTTCTGGCAGCTTTATATTGA
CTTCTGAGTTTACAGAAGAGTATACTTTACAAC

QA 1 633 1 633
DS 

RD RS1B557TF 642 0 0
GG
GTTGTTGATCCAAATTCAAAGAGAATCTCCGAATCTCTCATCTCATCCAAGAGGTTTTCT
TCTCAGCTTTATCTCAGATCGCTTCTTAGCTGTTACCATGCCGAAGAACAAGGGAAAGGG
AGGAAAGAACAGGAAGAGAGGAAAGAACGAAGCCGATGACGAGAAGCGTGAGCTTATACT
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GTGCATGTGCATCGACGGCACCAAACGTCTCTGCCATATCCGCGGCAAGATGCACAAGAA
GGTTTGGATCGCGGCAGGTGATATCATACTTGTTGGTCTGAGAGACTACCAGGATGACAA
GGCTGATGTCATCCTCAAGTACATGTCTGATGAGGCAAGGCTTCTCAAGGCCTATGGTGA
GCTTCCCGAGAACACTCGTCTCAACGAAGGTATTGCTGGTGATCTTGACGATGATGAGGA
GAATGGCGCTGATGATGTTATTGATTTTGAGGACGAGGATATCGATAGGATCTAAGGTGT
TTGTTTGGTTTTTGTTTTTGCTTTGAACCTTTTCTGGCAGCTTTATATTGACCTCTGAGT
TTACAGAAGAGTATACTTTACAACTATTATGTTCTTTAGT

QA 3 642 3 642
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6748Contig1 668 2 2 U
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AGATGGCAAAGAGGGAGGAGAAGGTGTGAAGGGGAGTGCTGCTGGACCGGCTAAAGCTGG
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CAACAATGTTGTTGTCGTGGCCTTTTTAAAAAATTTCATTGATTTTAAATATATATTTCC
ATTGTACTTGTACATAAAGGTCCTGAATGAAAATGCAGAGTATATTGATCAGAGAACATT
GGAGTCCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DQ38TF U 1
AF RS1DQ38JQ C 1
BS 1 615 RS1DQ38TF
BS 616 668 RS1DQ38JQ

RD RS1DQ38TF 615 0 0
GGAACCTAATCCAACCTCCGTCGCTAGGGTTTCCGACGCAACCGCCTCCAAACCATCCAC
CACTCCCTCCCACGGCGCAATCGGCGACGACGACAAGGACATGATGGACTTCGACATCGA
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GATCGAGCAGGTCGGGGATGTTGGAGCCTACGGAGATGATTGGGATAGCGACAGTGAAGA
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AAGAGCAAGGATTGGAGACGATGAAGATGATGAAGAGCCGCTTGTGATAGTGACAGACGC
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GTATAATAGCACTCATGGGTATCATCCGTTTCATTCTCAGTTTAAGGTCAGTGTCAACGG
CAACAATGTTGTTGTCGTGGCCTTTTTAAAAAATTTCATTGATTTTAAATATATATTTCC
ATTGTACTTGTACAT

QA 1 615 1 615
DS 

RD RS1DQ38JQ 668 0 0
GGAACCTAATCCAACCTCCGTCGCTAGGGTTTCCGACGCAACCGCCTCCAAACCATCCAC
CACTCCCTCCCACGGCGCAATCGGCGACGACGACAAGGACATGATGGACTTCGACATCGA
AGAGCCCGGCGATTCCACTCCTGCGATTCCCGGTTTGGCTTCAGATCAAGGTACGGCGAT
GATCGAGCAGGTCGGGGATGTTGGAGCCTACGGAGATGATTGGGATAGCGACAGTGAAGA
CGATCTGCAGATAGTGTTGAACGACAACAACAACGCCGTCATGATGATGGGAGCTGAGAG
AAGAGCAAGGATTGGAGACGATGAAGATGATGAAGAGCCGCTTGTGATAGTGACAGACGC
GGATCAGAATCAACCTATGGAGGAGCAGCAGCTCTGGGGAGAAGGAGAAGCTGTGGAAGG
AGATGGCAAAGAGGGAGGAGAAGGTGTGAAGGGGAGTGCTGCTGGACCGGCTAAAGCTGG
GTATAATAGCACTCATGGGTATCATCCGTTTCATTCTCAGTTTAAGGTCAGTGTCAACGG
CAACAATGTTGTTGTCGTGGCCTTTTTAAAAAATTTCATTGATTTTAAATATATATTTCC
ATTGTACTTGTACATAAAGGTCCTGAATGAAAATGCAGAGTATATTGATCAGAGAACATT
GGAGTCCG

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL6749Contig1 854 2 3 U
CATGGATGGTACATGGAGCTCTAACAAAGGGTAGATACCCAGATATCATGAGGCAGATTG
TGGGTAGTCGGCTTCCCAACTTTACCGAGGAAGAAGCCGCACTCGTTGCCCGTTCATATG
ATTTTCTTGGTCTCAACTATTACGTCACTCAGTACGCTCAGCCGAAACCTAACACCTATC
CTTCACCGAAACACACTGCCCAGGATGACGCTGGCGTAAAGCTCTCATATAAAAATTCAC
GTGGTGAATTTATTGGTCCACTGTTCGTTGAAGACAAAGACAACGGCAACAGCTATTACT
ACCCAAAAGGAATTTATTACGTAATGGACTACTTCAAAACCAAATACGGCAACCCTTTAA
TCTATGTCACCGAGAACGGATTTAGTACGCCCGATTCAGAAAACCGTGAGCAGGCTATTG
CGGATTACAGGCGAATTGATTATCTCTGTAGTCATCTATGTTTTCTTCGTAAGGTCATCA
ACGAGAAGGGTATTAACGTGAGAGGATACTTTGCATGGACCCTTGGTGATAATTATGAAT
TCTGTAAAGGCTTTACCGTCAGATTTGGGACTTAGTTATGTTAATTGGGCTGATCTCAAC
GACAGAAACCTCAAAGAATCTGGCAAATGGTACCAGAGATTCATTAGTGGGACTGTCAAG
AACCCTGCGAAACAAGATTTCCTCCGCTCAAGCCTCTCCTCTCAGAGTCAGAAGAAGAGA
CTTGCTGATGCATGAAACACTTTTTCCTCTTCGGGATCATCTCTATGTCTCTCACACTTC
CTAGTTGCTCTATAGATAAGGAGCTTCTTCTATACCTGCAGTGTACTAAATAAAAAGATG
ATCAATTACTAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AG19TF U 64
AF RS1AG19JQ C 1
BS 1 63 RS1AG19JQ
BS 64 709 RS1AG19TF
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GTGAATTTATTGGTCCACTGTTCGTTGAAGACAAAGACAACGGCAACAGCTATTACTACC
CAAAAGGAATTTATTACGTAATGGACTACTTCAAAACCAAATACGGCAACCCTTTAATCT
ATGTCACCGAGAACGGATTTAGTACGCCCGATTCAGAAAACCGTGAGCAGGCTATTGCGG
ATTACAGGCGAATTGATTATCTCTGTAGTCATCTATGTTTTCTTCGTAAGGTCATCAACG
AGAAGGGTATTAACGTGAGAGGATACTTTGCATGGACCCTTGGTGATAATTATGAATTCT
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AGAAACCTCAAAGAATCTGGCAAATGGTACCAGAGATTCATTAGTGGGACTGTCAAGAAC
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DS 

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GTGGTGAATTTATTGGTCCACTGTTCGTTGAAGACAAAGACAACGGCAACAGCTATTACT
ACCCAAAAGGAATTTATTACGTAATGGACTACTTCAAAACCAAATACGGCAACCCTTTAA
TCTATGTCACCGAGAACGGATTTAGTACGCCCGATTCAGAAAACCGTGAGCAGGCTATTG
CGGATTACAGGCGAATTGATTATCTCTGTAGTCATCTATGTTTTCTTCGTAAGGTCATCA
ACGAGAAGGGTATTAACGTGAGAGGATACTTTGCATGGACCCTTGGTGATAATTATGAAT
TCTGTAAAGGCTTTACCGTCAGATTTGG*ACTTAGTTATGTTAATTGGGCTGATCTCAAC
GACAGAAACCTCAAAGAATCTGGCAAATGGTACCAGAGATTCATTAGTGGGACTGTCAAG
AACCCTGCGAAACAAGATTTCCTCCGCTCAAGCCTCTCCTCTCAGAGTCAGAAGAAGAGA
CTTGCTGATGCATGAAACACTTTTTCCTCTTCGGGATCATCTCTATGTCTCTCACACTTC
CTAGTTGCTCTATAGATAAGGAGCTTCTTCTATACCTGCAGTGTACTAAATAAAAAGATG
ATCAATTACTAATG

QA 1 854 1 854
DS 



AS 1 2

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TACCTGGCAGGTATTCAACATTGGTAGCACGTGGCTTATCTTCGAGATTTCCTCTCTATT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1A665TF U 1
AF RS1A665JQ C 39
BS 1 687 RS1A665TF
BS 688 823 RS1A665JQ

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TACCTGGCAGGTATTCAACATTGGTAGCACGTGGCTTATCTTCGAGATTTCCTCTCTATT
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CCATGACAAAATGAATGGGTTGAAGGTGATTTCTATGATCTTGGCTATTTGGGGTTTCAT
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AACAACCGGATCCTCTGACTCACCAGAAGCAAAAGGGTCAAGTGGGCAAAAGATATATAC
TTCAGCGAGTTGAAAGCTGCCTACAAT

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1A665JQ 785 0 0
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TGAACCTAGTGTGGACAGCTATTACCTGGCAGGTATTCAACATTGGTAGCACGTGGCTTA
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CTGTACTGGCTGTCATCATTTTCCATGACAAAATGAATGGGTTGAAGGTGATTTCTATGA
TCTTGGCTATTTGGGGTTTCATGTCCTATGTCTACCAACACTATCTTGATGACAAAAACT
TGAAGAAAAGTCTTGGAATCCCAACAACCGGATCCTCTGACTCACCAGAAGCAAAAGGGT
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ATAATATATTTGTGATGCAATTCAAGTGAAGTCTGAGTGTGATCTATTTTTCCTATTTGC
ATCATTGTAACTAACAGCTAGTAGATTTGTCTTAAACAAATAATGAAATATTGTGATCTA
GTTTT

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

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TGAAGGATCTGATGCTTATGAGTCTTTCTTTTGCAGTTTATGTCTATATATCTCAACTAA
TGGTATGTGCTTACTTCTCCTGGACCCATGTCGCTCTCCCCAATCCCTCATGGTAGTTTA
GCTAAGATAGATCATTTCTTCTGCCCCCTCAAGTCACAATTATGTTATGTATATATTTTG
CACATCATTTATAAGATTACCAAGCTCTCTCAAAGTGATTGCAAACATTGAAGGACTGAG
AGTTGCCCTTTT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BJ85JQ C 1
AF RS1BJ85TF U 1
BS 1 492 RS1BJ85TF

RD RS1BJ85JQ 492 0 0
GGGATTGTTTATTCATAATCTTTCTCATGACGGCTCTCTCCACCATCTACCACCCACTCT
GTGCACACCACAACCACCGTACAACAAGACACAGCGTCAGATCTCTGACTGTGATGTCTT
GTCGGAAGCAGAAATCACCGGAAGAGAGTGGAGGAGTGATGAAGAGAACAGTGGTAAGGA
TGATTTCAGAGGCTGAGAAGATTGGGAAGAATCTGAAGCCAGAGAAGAAAGGAGGAGACA
TGAAGGATCTGATGCTTATGAGTCTTTCTTTTGCAGTTTATGTCTATATATCTCAACTAA
TGGTATGTGCTTACTTCTCCTGGACCCATGTCGCTCTCCCCAATCCCTCATGGTAGTTTA
GCTAAGATAGATCATTTCTTCTGCCCCCTCAAGTCACAATTATGTTATGTATATATTTTG
CACATCATTTATAAGATTACCAAGCTCTCTCAAAGTGATTGCAAACATTGAAGGACTGAG
AGTTGCCCTTTT

QA 1 492 1 492
DS 

RD RS1BJ85TF 492 0 0
GGGATTGTTTATTCATAATCTTTCTCATGACGGCTCTCTCCACCATCTACCACCCACTCT
GTGCACACCACAACCACCGTACAACAAGACACAGCGTCAGATCTCTGACTGTGATGTCTT
GTCGGAAGCAGAAATCACCGGAAGAGAGTGGAGGAGTGATGAAGAGAACAGTGGTAAGGA
TGATTTCAGAGGCTGAGAAGATTGGGAAGAATCTGAAGCCAGAGAAGAAAGGAGGAGACA
TGAAGGATCTGATGCTTATGAGTCTTTCTTTTGCAGTTTATGTCTATATATCTCAACTAA
TGGTATGTGCTTACTTCTCCTGGACCCATGTCGCTCTCCCCAATCCCTCATGGTAGTTTA
GCTAAGATAGATCATTTCTTCTGCCCCCTCAAGTCACAATTATGTTATGTATATATTTTG
CACATCATTTATAAGATTACCAAGCTCTCTCAAAGTGATTGCAAACATTGAAGGACTGAG
AGTTGCCCTTTT

QA 1 492 1 492
DS 



AS 1 2

CO CL6752Contig1 654 2 2 U
TTTTTTTTATCTCGAACAATATGTCCATAATTAACAACATCCGAAAATCTAATACACTTT
GTTTCCTAACTCAACGAGAAACACTACGAATGTCTTTAAGCAGACCCAACGCTTGTTGCA
TTGTTGGCCGTTTCCCTGGCGTCTCCGCCGTACAGAAATAACCAATTCTAAGACTCTCGA
CCATCTCATTAACCGATTCTCCAGAAGCTAACCGCAATCTCGAGTCAAGAGCTTACTCTC
CTCTCCTCTCCTTAAACAACCGTCGAACTGATTTCACATGTTCCTCACTCCCTTGCTTAC
CGGTCAAAAGCTCAAACAAAATCACTCCAAAACAATACACATCGAAGTCTAAATTGTTAT
TATCAGCATCGTTTCCTGTTTTTGCGATGTTGTTGATACCAAAATCAGATATTCGTGGCT
CTAGGGTTTCGGTTAGGAGGATGTTGGTAGCAACTAAGTGACCATGAGTAGTACCAACAT
GATGTAGATAGGCTAGACCACGCGCAACTCCAATAGCGATACGGTGACGTATTAACCAGT
TTGTTTTCTCTGGTGATGAATCTCCGACGTGACTCTCCCATGTATCGGCGCTCCAATCTT
CGACGTTGGTTTCTCCTGTTGGGAGCTCGTGAAGCCATCGGTGGAGGTCTCCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CZ51TF C 1
AF RS1CZ51JQ U 9
BS 1 8 RS1CZ51TF
BS 9 654 RS1CZ51JQ

RD RS1CZ51TF 654 0 0
TTTTTTTTATCTCGAACAATATGTCCATAATTAACAACATCCGAAAATCTAATACACTTT
GTTTC*TAACTCAACGAGAAACACTACGAATGTCTTTAAGCAGACCCAACGCTTGTTGCA
TTGTTGGCCGTTTCCCTGGCGTCTCCGCCGTACAGAAATAACCAATTCTAAGACTCTCGA
CCATCTCATTAACCGATTCTCCAGAAGCTAACCGCAATCTCGAGTCAAGAGCTTACTCTC
CTCTCCTCTCCTTAAACAACCGTCGAACTGATTTCACATGTTCCTCACTCCCTTGCTTAC
CGGTCAAAAGCTCAAACAAAATCACTCCAAAACAATACACATCGAAGTCTAAATTGTTAT
TATCAGCATCGTTTCCTGTTTTTGCGATGTTGTTGATACCAAAATCAGATATTCGTGGCT
CTAGGGTTTCGGTTAGGAGGATGTTGGTAGCAACTAAGTGACCATGAGTAGTACCAACAT
GATGTAGATAGGCTAGACCACGCGCAACTCCAATAGCGATACGGTGACGTATTAACCAGT
TTGTTTTCTCTGGTGATGAATCTCCGACGTGACTCTCCCATGTATCGGCGCTCCAATCTT
CGACGTTGGTTTCTCCTGTTGGGAGCTCGTGAAGCCATCGGTGGAGGTCTCCAG

QA 1 654 1 654
DS 

RD RS1CZ51JQ 646 0 0
ATCTCGAACAATATGTCCATAATTAACAACATCCGAAAATCTAATACACTTTGTTTCCTA
ACTCAACGAGAAACACTACGAATGTCTTTAAGCAGACCCAACGCTTGTTGCATTGTTGGC
CGTTTCCCTGGCGTCTCCGCCGTACAGAAATAACCAATTCTAAGACTCTCGACCATCTCA
TTAACCGATTCTCCAGAAGCTAACCGCAATCTCGAGTCAAGAGCTTACTCTCCTCTCCTC
TCCTTAAACAACCGTCGAACTGATTTCACATGTTCCTCACTCCCTTGCTTACCGGTCAAA
AGCTCAAACAAAATCACTCCAAAACAATACACATCGAAGTCTAAATTGTTATTATCAGCA
TCGTTTCCTGTTTTTGCGATGTTGTTGATACCAAAATCAGATATTCGTGGCTCTAGGGTT
TCGGTTAGGAGGATGTTGGTAGCAACTAAGTGACCATGAGTAGTACCAACATGATGTAGA
TAGGCTAGACCACGCGCAACTCCAATAGCGATACGGTGACGTATTAACCAGTTTGTTTTC
TCTGGTGATGAATCTCCGACGTGACTCTCCCATGTATCGGCGCTCCAATCTTCGACGTTG
GTTTCTCCTGTTGGGAGCTCGTGAAGCCATCGGTGGAGGTCTCCAG

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 2

CO CL6753Contig1 959 2 8 U
GGCATCTACGCTCTGTGAGCTACTAAGGAGGAAATCTATAGTCAGGCTGGCTAGGAATTT
GCAGTCTTCGAGTGCCCCCACGGTAGATTTAGCAACCACTTTGCCTTTCCGGTTTAGTTG
ATAGTCGATCAGTGAGATGAACCGCCTGGCACGTGAGATGGACCGTCTAAGAGAAAAACG
ACCGTAGGAGTAAACATCTCCGGGTGGGTTTGGGAGAATCGATCTACAGTAAGATGGATC
CGGTGCGTAGCGACATACATTTGATGGGGACGTGGCGTTTCCGGTGGCCTGAGGCCCTGC
GGCGAGAGAAAGAGATGACAATAAGGAGAGGGAGCTAAGGGTGACCAAGAACATGAGAAT
TTGAGACATCTTTTGATTTTTGTTTAGAGCTTTATTGTGTGTTCGGTTTGAGAAACTGTG
TTAAGTGTGTTGGATTATTTATAGGGTTTTGAAGAACGTTGATTTTTGAATACATACTAG
TTCAAGTCAATAATTGTGTGTGTACATAATTTGACGGTGCCACAAAGACACAAAGTTCAA
ACTAAACATATATATATCATATTACAGAATAATATTCACACGTATATATATATATCTGTT
TCTCACTAAAACAATTAGACAAATAATTACCGTAACTAAAGCGTAATTAAACTACGTCCT
CGACAATCATGAATTGGTGTTCAAGTTGAAGATTGATTGATCTTTAATGACTTTACTTGT
ATAATAAAATTTTGACCAACTTCTGTTTCCGCAATTTATAATTGTCAACCGACGTTAGGC
ATTTCAAGAAATTTTCGACTATATAAAACATGTTGGTAAAATAGCACATTACACATCAAC
TAAAGTCAAGATCTTGACATTGCAAACTTTGATAGACTATAGACTATTGCAAATAGAATT
CGTTTTACGACTTTACCTTATGCTGGCTGGGAAGTTTCCATGCCTGTGAAGGTTTAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BD88TF U 1
AF RS1BD88JQ C 246
BS 1 728 RS1BD88TF
BS 729 729 RS1BD88JQ
BS 730 736 RS1BD88TF
BS 737 737 RS1BD88JQ
BS 738 767 RS1BD88TF
BS 768 768 RS1BD88JQ
BS 769 778 RS1BD88TF
BS 779 959 RS1BD88JQ

RD RS1BD88TF 797 0 0
GGCATCTACGCTCTGTGAGCTACTAAGGAGGAAATCTATAGTCAGGCTGGCTAGGAATTT
GCAGTCTTCGAGTGCCCCCACGGTAGATTTAGCAACCACTTTGCCTTTCCGGTTTAGTTG
ATAGTCGATCAGTGAGATGAACCGCCTGGCACGTGAGATGGACCGTCTAAGAGAAAAACG
ACCGTAGGAGTAAACATCTCCGGGTGGGTTTGGGAGAATCGATCTACAGTAAGATGGATC
CGGTGCGTAGCGACATACATTTGATGGGGACGTGGCGTTTCCGGTGGCCTGAGGCCCTGC
GGCGAGAGAAAGAGATGACAATAAGGAGAGGGAGCTAAGGGTGACCAAGAACATGAGAAT
TTGAGACATCTTTTGATTTTTGTTTAGAGCTTTATTGTGTGTTCGGTTTGAGAAACTGTG
TTAAGTGTGTTGGATTATTTATAGGGTTTTGAAGAACGTTGATTTTTGAATACATACTAG
TTCAAGTCAATAATTGTGTGTGTACATAATTTGACGGTGCCACAAAGACACAAAGTTCAA
ACTAAACATATATATATCATATTACAGAATAATATTCACACGTATATATATATATCTGTT
TCTCACTAAAACAATTAGACAAATAATTACCGTAACTAAAGCGTAATTAAACTACGTCCT
CGACAATCATGAATTGGTGTTCAAGTTGAAGATTGATTGATCTTTAATGACTTTACTTGT
ATAATAAA*TTTTGAC*AACTTCTGTTTCCGCAATTTATAATTGTCA*CCGACGTTAG
CATTTCAGAAATTTCGACT

QA 1 778 1 778
DS 

RD RS1BD88JQ 714 0 0
CGTAGCGACATACATTTGATGGGGACGTGGCGTTTCCGGTGGCCTGAGGCCCTGCGGCGA
GAGAAAGAGATGACAATAAGGAGAGGGAGCTAAGGGTGACCAAGAACATGAGAATTTGAG
ACATCTTTTGATTTTTGTTTAGAGCTTTATTGTGTGTTCGGTTTGAGAAACTGTGTTAAG
TGTGTTGGATTATTTATAGGGTTTTGAAGAACGTTGATTTTTGAATACATACTAGTTCAA
GTCAATAATTGTGTGTGTACATAATTTGACGGTGCCACAAAGACACAAAGTTCAAACTAA
ACATATATATATCATATTACAGAATAATATTCACACGTATATATATATATCTGTTTCTCA
CTAAAACAATTAGACAAATAATTACCGTAACTAAAGCGTAATTAAACTACGTCCTCGACA
ATCATGAATTGGTGTTCAAGTTGAAGATTGATTGATCTTTAATGACTTTACTTGTATAAT
AAAATTTTGACCAACTTCTGTTTCCGCAATTTATAATTGTCAACCGACGTTAGGCATTTC
AAGAAATTTTCGACTATATAAAACATGTTGGTAAAATAGCACATTACACATCAACTAAAG
TCAAGATCTTGACATTGCAAACTTTGATAGACTATAGACTATTGCAAATAGAATTCGTTT
TACGACTTTACCTTATGCTGGCTGGGAAGTTTCCATGCCTGTGAAGGTTTAAGG

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL6754Contig1 747 2 2 U
GGTCAACAAAATCTGAACCAGAGAGTTTTCGAAAAGCACCATCACCGAGAACACTCTCTC
CTTACTCTCTCCCACCTCCTCAGTTACATTTCGAACGTGAAACCACTCAGAAAAACATTC
TCACGGCCGAGAAAACAAGCCAACTCCAAGAACCAAATCATCATAACCAGAGCCATAACC
ATAATAATCAAGGCAACAACACCAAGAGGACTCATCGTCAACAACCTTTTTCTGGTTCCG
AAAACATAATGGGCACACGAGCCATCACCATTGCAGGTGAAAACAAAGGTGCTGTAATGG
AGATTCTACGCTCACCATCAGGCAACAGAACCGGAGGAGCAGGACCACATCCCTCTGTGG
GGTTTAGCGGCACTGGAGAGAAAGGACGGCGACTTCAAAGCAGTAGTAGCAGCAGCAGCA
GCAGTGATGAAGGAGAAGGGAAGAAGAAAACCACCAAGAACCCTAATAATAATGCCAATA
ATAGTCATCATCTTCCGATGAAAGCATTTATGAACAGTAACGTTCAGATGATAAACAACT
CTCTTGTTTACAACTCGATGGCGACTCATCATGATCCTGGTGTTCATCTTAAAATCTCTC
GGAAACCTGGCTCTGGCAATGGTTTCCACGTCAAGGATTACGGTAATAATGACGGCGGAT
ACACCAACTGAGAAAGTAACATTTATTCCGAAAAGGAAAAGAAAACCAAAAACAAAGTTA
AGGGTTTTGGGTTCTATTTACAATAAA


BQ
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ATAATGCCAATAATAGTCATCATCTTCCGATGAAAGCATTTATGAACAGTAACGTTCAGA
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AAAACAAAGTTAAGGGTTTTGGGTTCTATTTACAATAAA

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BQ
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AF RS1C169JQ U 6
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QA 1 741 1 741
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TTCTCTTTTTTTCTTTTATCTTGAAACCTATATGTCTCCATCTT

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 2

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GTATATTTCTTATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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A

QA 1 691 1 691
DS 

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CTTGTCACCCATCCAAGACATCGATGCTCGTTTTGCGTTTGGCTTCTCCTCAATCTTTTG
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AAATGTTTATGATTTCTAATGTACATTGACGCTATGCGCTATGGTATAAGTATATTTCTT
ATAT

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1AX84JQ C 1
AF RS1AX84TF U 1
BS 1 593 RS1AX84TF

RD RS1AX84JQ 593 0 0
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AGAATCTAGAAGCTAGTGTTGCTCTTCTTAAAGAGCTTGTTGGCGGAAGGTGGGTTTTCC
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GGCGTAAGAACAAAAGAGCCATCGCTGAAGGAGGGGCCAGTGCTTCTCTTTACAAAGAAG
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DS 

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GGCGTAAGAACAAAAGAGCCATCGCTGAAGGAGGGGCCAGTGCTTCTCTTTACAAAGAAG
CTGACAAGTACTGCACGCTGATCTCTGGGAGTCTCTCCCGTGAAAGTGGAGGTTTCGAAT
TGTCACCTATTACTGTGGTTCTAGCCGCTGCCGGAGCCGCTGCCGGAGCTGCTGCTGCAC
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TATTTGTAAGCTAGTATACAATCCTAAGTTATTCCAAACAAATCTGCTCCCTTTAAATAT
TTGATAGATTGTCTGAATCATCATATATATATATGGCTCTGTCTTTCTTAAAT

QA 1 593 1 593
DS 



AS 1 2

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TTAATTCCGAAGTGTTTGCTAATGATTGCTAATGATTCGCGTTGCATGCTGATTGAAGAA
TTGAGCTAGCATACGATTTAATTGTTAACTAGATTTTGATCCGCGCTTTCAAAGCGCGGG
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TATATAATCCGTCTCATATATGTATTTTATATCCAGATTTATGTTCGGTAAAACTATATT
ATACATGTATTTTTAGGTTTTTAATTTTGAATTAGATATTTTAAATATAAATCAATATAA
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ACCGGTTGATCAAAAATAAATTCAGTTCGGGTTTGAAAAAAAAAAAATATTTAAAAATCC
AATTAAAACTACTAAAATCAAAATCCAGTTACCGGTTGAACCACTGGTTGAACCAATAAA
CAGTTTTTATTTTTAATAAATAATTTTTGTTAGATAGTTGGGATTATATTTAGGAAAAAA
CGGTTTAAAACCAAACCATTAAATAGTTTGAGAAAAACGATGCAGTTTCAAACATGTCCG
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ATTAGGAAACCGGTGGTTAATGACAAACCAAAAACAATTAAAAAAGAAATCAATGCAAAA
TGTCCAAAATGTCATTAATGAAAACAAAAGAAAGCCTCTTTAATAAGGGTAAACAGAGTA
AAAATCCAAATGTGTTTGTACTTTAATAGTATAGATTGTCTAAGAAGTAAAATAAGTTCT
CCGAATAATTAAGATGAAAAACTAGAATAACCTACCTGTACAGGCCTTTACCCATTTGTG
TTTGTACAAAATTATATTAAGAAATTAAAATAGGAAAATAGGATAGTTATTAAAGAGGAA
CAAACTTGTGTCCTTGACTGTGTTATGCTATACCACAATTTGCTTGCATCCAAATGTACC
AAGAATCATTAGTCATCAGCAAACTCTTAGCAGTAGACCCAATGCATTTATGTAGTGACC
CACCGCACGTCGTCGTGCCAACTTAAAAAGAACCAAACCTTGACACAAATGAATGTGGCC
TGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

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AF RS1BQ96JQ C 526
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BS 604 1264 RS1BQ96JQ

RD RS1BQ96TF 603 0 0
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TTGAGCTAGCATACGATTTAATTGTTAACTAGATTTTGATCCGCGCTTTCAAAGCGCGGG
TTTATATTTGGTGAAAATTTTATATAATCACATTTATATAATCCGTCTTGTATATGTATT
TATATAATCCGTCTCATATATGTATTTTATATCCAGATTTATGTTCGGTAAAACTATATT
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AATTAAAACTACTAAAATCAAAATCCAGTTACCGGTTGAACCACTGGTTGAACCAATAAA
CAG

QA 1 603 1 603
DS 

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GGTTGAACCAATAAACAGTTTTTATTTTTAATAAATAATTTTTGTTAGATAGTTGGGATT
ATATTTAGGAAAAAACGGTTTAAAACCAAACCATTAAATAGTTTGAGAAAAACGATGCAG
TTTCAAACATGTCCGGTTGGAAAAATATTAAAATGATGCAGTATCAAACACAGAATAATC
ATATACCAAAATTGAATTAGGAAACCGGTGGTTAATGACAAACCAAAAACAATTAAAAAA
GAAATCAATGCAAAATGTCCAAAATGTCATTAATGAAAACAAAAGAAAGCCTCTTTAATA
AGGGTAAACAGAGTAAAAATCCAAATGTGTTTGTACTTTAATAGTATAGATTGTCTAAGA
AGTAAAATAAGTTCTCCGAATAATTAAGATGAAAAACTAGAATAACCTACCTGTACAGGC
CTTTACCCATTTGTGTTTGTACAAAATTATATTAAGAAATTAAAATAGGAAAATAGGATA
GTTATTAAAGAGGAACAAACTTGTGTCCTTGACTGTGTTATGCTATACCACAATTTGCTT
GCATCCAAATGTACCAAGAATCATTAGTCATCAGCAAACTCTTAGCAGTAGACCCAATGC
ATTTATGTAGTGACCCACCGCACGTCGTCGTGCCAACTTAAAAAGAACCAAACCTTGACA
CAAATGAATGTGGCCTGAG

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

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CCGGCAAGTCAATTATCTCTTTGTCCCATTATCTATATCTCAGACACTCTTACGGTCGTC
ATATTTCTTTGGGGCCTAAATTTTCAGTGTGTAAATGGGTATTTTTCCTGAGTTTGGTGG
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GAGAGAGAAAAAAACTCACGATGAGAGAGATGAGACGAAGGAGCAATTAAAACTGTGGAG
AGATGCAAATAAGAAGAAACAATATAATGAACCTTCTCCTACGGTGAAGGTGCATACAGA
CCATAATATTGATAGCTTTTCCAGTGTGGACATGGACTTTACATTAGGATTGCCACCTCA
AGCAGCTTACGACCTTTTAATTAATCAAGACAACAAAACATACTCCAGAGAAATCAATGG
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CCCAATACGTCTAAATGTCCTCGAAGAGCCAAAAGAACTTGCTGCATATAACTGGAAAAT
GAGAAAAGGAATGGACTACATGGAAACGTTTAAAGTTAACTATAGAGTGGAGCCAATGTT
TGTTGATGCAGAACGCTTGTGCAAGCACAAGAAGCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BZ16TF U 1
AF RS1FX59TF U 49
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GAGAAAAGGAATGGACTACATGGAAACGT

QA 1 689 1 689
DS 

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G
GACCTTTCCCCCCGGCAAGTCAATTATCTCTTTGTCCCATTATCTATATCTCAGACACTC
TTACGGTCGTCATATTTCTTTGGGGCCTAAATTTTCAGTGTGTAAATGGGTATTTTTCCT
GAGTTTGGTGGCTGGATCAGTCAGAACACTCAACAGCCTAAAAAATCTGAAAATGTTAAA
TCCAAGCCTGTGAGAGAGAAAAAAACTCACGATGAGAGAGATGAGACGAAGGAGCAATTA
AAACTGTGGAGAGATGCAAATAAGAAGAAACAATATAATGAACCTTCTCCTACGGTGAAG
GTGCATACAGGCCATAATATTGATCGCTTTTCCAGTGTGGACATGGACTTTACATTAGGA
TTGCCACCTTAAGCAGCTTACGACCTTTTAATTAATCAAGACAACAAAACATACTCCAGA
GAAATCAATGGCCGCCCACTTCTGAAAGCCATATCAAGAAAAGTTACATCAGAGATAGGT
ATGGGGAATAGGCCGGTCCTGGAGGTTGAGAAAGAGTTGTCATGGAACTTCCTTTTCTTT
TCTGGAACTATCCCAATACGTCTAAATGTCCTCGAAGAGCCAAAAGAACTTGCTGCATAT
AACTGGAAAATGAGAAAAGGAATGGACTACATGGAAACGTTTAAAGTTAACTATAGAGTG
GAGCCAATGTTTGTTGATGCAGAACGCTTGTGCAAGCACAAGAAGCCG

QA 2 709 2 709
DS 



AS 1 2

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TTAGTGTGGTGGTCGTTTGGCTTTTGTCTCCGACGTCCTGGCGTTCTTCTCCGGCGAAGG
GCGGTCGGCTTCCCTCCGCGTTTACACCTCTGTAGGTGAGAACGGCGGTTCTGTTTAGCT
AGCTTCCGACTATAATAATAATTTTTTTCTCGGTTTTTACGATTGGGAGAAATCTTTGGT
TCGTTTGGTAACGACGAGTTGGTGTGCGGAAGAGATCTCGACACTCTGGTCGTTTGATGC
TCTCCGCCATGAATAGTTCCGAAGCATGTGCTGCTTCTTTGGTGTGGGTGTGACTTGAAG
AATCTGGATGAGATTTCGAATTGGCTTCGATTAATGCTCTCCAGTGGATAAGAATCAAGT
GATGAGGGTGATTTGGCTTAACTCTGGTGGATTCGGTGGAAGTGGTACTGTTCCCGGCAG
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1C414TF U 1
AF RS1C414JQ C 146
BS 1 699 RS1C414TF
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BS 761 774 RS1C414TF
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RD RS1C414TF 774 0 0
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DS 

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GTCTCCGACGTCCTGGCGTTCTTCTCCGGCGAAGGGCGGTCGGCTTCCCTCCGCGTTTAC
ACCTCTGTAGGTGAGAACGGCGGTTCTGTTTAGCTAGCTTCCGACTATAATAATAATTTT
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GCGGAAGAGATCTCGACACTCTGGTCGTTTGATGCTCTCCGCCATGAATAGTTCCGAAGC
ATGTGCTGCTTCTTTGGTGTGGGTGTGACTTGAAGAATCTGGATGAGATTTCGAATTGGC
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GGTGGATTCGGTGGAAGTGGTACTGTTCCCGGCAGGTTCCGGAGGTTGCTGTGTTTTTTC
CGGCGACGAACTCAAAGTTGGTCAAGGTGGTGGGACTCTGCGCACCACGTGGCTGTTGGC
TTTCTTGCGGTTGAACACGTGGGGAAGACGTGTTCCGTCTATTCTCCTTTGTTTGTGGGA
TGGTTCTGGGCCATTAGTGGGCTCTTGTATGGTTTGGTTGATGTAGTGGGTTTGATTGCT
TTTTTTCTTATGCTCTGGTGTTGTGGGCTTTTTGTATTCTGTAAAATATTTTGGTTATTA
AATAATATGAGATGAC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

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CTCTCGCCCGCCGGCCGCTCCGATAGTTGGAAATGGCTGTCTCGGTAGCATGCTGCTGTT
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CGTCTCCCCGAGCTAAACTAAACCCAGAGAAGAAGAAGAACCAGAAGAGATTAACAGTGA
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GCACTGGAAGTGCTTTTATGATTGGAGATGGCAAGCTCTTGACCAATGCCCACTGTGTCG
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TAGAGGTTACATCATATGCTCATGGATCATCTGACTTGCTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AGAGATTAACAGTGAGAGTGAAAGAAGAGCAAGATTGTAATAATGATGGAGGAGGCACCC
AAACAATGTCGGCTTTCAAGTCGTCTTTTGGGTCGAAAAAGGATAAAAAAGACTCCTCTC
ACCCTTCTACTGATTTGAGGAACGATCCTGCCAAGATTCATGATGCTTCCTTTCTCGACG
CCGTTGTAAAGGTGTACCCCACCCATACAGCGCCTGATTACTCCCTCCCTTGGCAGAAGC
AAAGACAGTTTACCAGCACTGGAAGTGCTTTTATGATTGGAGATGGCAAGCTCTTGACCA
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AAAGCGAGGATTTCT

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DS 

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CGTCTCCCCGAGCTAAACTAAACCCAGAGAAGAAGAAGAACCAGAAGAGATTAACAGTGA
GAGTGAAAGAAGAGCAAGATTGTAATAATGATGGAGGAGGCACCCAAACAATGTCGGCTT
TCAAGTCGTCTTTTGGGTCGAAAAAGGATAAAAAAGACTCCTCTCACCCTTCTACTGATT
TGAGGAACGATCCTGCCAAGATTCATGATGCTTCCTTTCTCGACGCCGTTGTAAAGGTGT
ACCCCACCCATACAGCGCCTGATTACTCCCTCCCTTGGCAGAAGCAAAGACAGTTTACCA
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QA 1 821 1 821
DS 



AS 0 0

AS 0 0

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TCTGGAATGTATGGATTAGGGTTTGTAGAATTTCATTTCTTGCGATTGTAATCTCATCTT
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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CI27JQ C 1
AF RS1CI27TF U 1
BS 1 641 RS1CI27TF

RD RS1CI27JQ 641 0 0
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QA 1 641 1 641
DS 

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GGTGACTAAGTTCACGAGCTCCTGAACTTTGACTTAGTTTTCCTTTTCTTTAAAAAAAAA
TCTGGAATGTATGGATTAGGGTTTGTAGAATTTCATTTCTTGCGATTGTAATCTCATCTT
TTTTTGTAAGTACGTTTGAAATCTGCGTTGAATCATTGTGTGTCCTAATCATATGCTTTG
AGATTGAAATATCCTCTACTCTTAATGAAGTTTTTTTATTC

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

CO CL6766Contig1 836 2 6 U
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TTTTTCTTCTTTTATTTCAACAAGAAGAGACATTAATCTAGGTAATGATTAAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AZ67TF U 1
AF RS1AZ67JQ C 50
BS 1 579 RS1AZ67TF
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RD RS1AZ67TF 704 0 0
GGGCCGTTAGGGTTTTCTATTCTTGTGCTCGTTTCCAGATTCCACCTCTATCGGGTAACT
GTGGAAGGAATCAATCATGAGGAGGAGGAATGTAAAGCGAGAATCTGAAGCATCACCCGG
CGAGGGGAGAGATGTCGACGAGTCGGGGCGGTTTAGGTTTGTGAAGAAGGAGAAACGGAG
GAACAAGGGCGGCGTAGAAGTAGATGACTCCGTCCCAATCGACGAGCCTCCGACTCAGCA
AGAAGAGCAAGGGATTTCTGATCGGAGGATTCTCAGATCTCAGTATCTCTCTCTTATCCA
CAAAATCACCGATTCTAAAGATGATTTGACGAGAGTTGATTCTGACAAGTTCTCCAGAAT
TTTCACTGAATTTGAGACTCTGCACCAGAAAGTTCAGAAGCCAAGAGAGCAAGTTGCAGA
TGCAGAGGCGTTTCTGGATATAGCAAACACCATCATGTCTTCACACAAGATTCTCAGACA
ACGCCAATACGAAAACTCTCGAGAAACCGAGGGTTGGTTGTACAAGAAGACACTGTTGTT
GAAGATTCTCCTGACGTCGAGGGGGGATGGAACACGCAG*AGAATTAAGCGGAGACTCGC
TTGAGAAGATGAGTCTCGTTGTATGTAGTATATAAGAGTAGAGTGTTGAAA*CTCCTGAT
GCTGTATGATTTTGTGACATGTAACTTTATGTGATTGTTTTGTT

QA 1 704 1 704
DS 

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ATCGGGTAACTGTGGAAGGAATCAATCATGAGGAGGAGGAATGTAAAGCGAGAATCTGAA
GCATCACCCGGCGAGGGGAGAGATGTCGACGAGTCGGGGCGGTTTAGGTTTGTGAAGAAG
GAGAAACGGAGGAACAAGGGCGGCGTAGAAGTAGATGACTCCGTCCCAATCGACGAGCCT
CCGACTCAGCAAGAAGAGCAAGGGATTTCTGATCGGAGGATTCTCAGATCTCAGTATCTC
TCTCTTATCCACAAAATCACCGATTCTAAAGATGATTTGACGAGAGTTGATTCTGACAAG
TTCTCCAGAATTTTCACTGAATTTGAGACTCTGCACCAGAAAGTTCAGAAGCCAAGAGAG
CAAGTTGCAGATGCAGAGGCGTTTCTGGATATAGCAAACACCATCATGTCTTCACACAAG
ATTCTCAGACAACGCCAATACGAAAACTCTCGAGAAACCGAGGGTTGGTTGTACAAGAAG
ACACTGTTGTTGAAGATTCTCCTGACGTCGAGGGGG*ATGGAACACGCAGGAGAATTAAG
CGGAGACTCGCTTGAGAAGATGAGTCTCGTTGTATGTAGTATATAAGAGTAGAGTGTTGA
AAACTCCTGATGCTGTATGATTTTGTGACATGTAACTTTATGTGATTGTTTTGTTCATGG
TAGGAGAGTGTTAGCATCTAAGTGGCTATCTCTTGTTTAACTTTAAATACAGCCACTAAA
GCTGGTTTGTTTTTTTCTTCTTTTATTTCAACAAGAAGAGACATTAATCTAGGTAATGAT
TAAAACC

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

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TGACACAAACAACTTTTGACTTTCCCAGATTTCCTTATATATGCTTCAGTTTTCTTATTG
TTTGTTTGCAATTTTTAGTTTTTTAGTGTTATCTAAATTTATAGATCTCATCGGTTGTTT
GCAACTTTTAGTTTTATTGTTCTTGGGTTTTGATTCACTGATTTTCTTTATGCAGAAAAA
GAGCTCTGGAAATGGTGAATTCACATGTGAAGAATGAAGATACTGAAGAACAAAAAAAAA
TCAAATTAAACAACCGCCACAAGAATTAGATCAATTGCTTGAAGCTGGGCATACCTCCTA
TTGCTATAATTCAGTTCTTCCCGGAGCTGTAATCTATAGTCGAAAACAACTGTGTTGGAG
ATGGACGTGGTGGTGTCGGGTTGGGCTTTCCTGAGACTCACAGGTTTGGTGTAAAGTTTT
GTCAGTCTGATGGAATGACCGGATCATCGGCGGTAAAGTCGCCACTATGGTGGAGCCGTT
GAATAATTGCCGATGTCGACCACGTTCAAGGAATTCTTAGAGAGATAAGGAGGATTTCCA
GTTTCTTTGCTCTTGATAGATATGTGAATGGTAGTGGATTTAGGTCGCTTGCTAGCCGAC
AAGTGGAAAGCTTGATTTCAACGGACGGTCAATGATGCAAGCACAGGATTCTCAAGCCAC
GTTGAAACCCTCTAAAAATAGTTGAGCTAGCAACACACTACTGGGTGTTTGTTAGAGGGT
AAGGATCTCTGTAAGATACTGTCTAGGTAAGGTTCATGGTTTATTGATTCTATGAATTGT
CATATTACATTACTGTTTCCACTGCAAGTGTAGAGTACTTCCAACAGTTCAATACCATAT
TCTCATATGGTAACTAGCCAAGCGGCTCTGTAACCATGAAATAAAAAAGCGCCTTCTAGC
TAAGGTTGTACCGGTTGCTCAGATGGGAGTTGTTACATGGGGGGTCATTCCTTATCCCTT
CTTTCACATTAAGTAGTTTCAAACGAACAGAAACACAAAACTTTTCTTCCTTTCCGGAAG
ATCCTTGCATCTGATCCTCTCCAGCAGCTATTTTCATCGCTTAGCTCCCTCCATCATCCT
AGCACAAGAGAAGCCAAAAAGGAAGAAGCATCAATGTCATACATATATAAAGGAAGAGAA
AGAATTATGACTTATGAGACAGCTCAGCCATTGTATACTATTTTCTTTTACCGGTGAGCA
AGAAGATGGGAATCTCATATGTGGTAATTTAACTACTGTAGAAATATTTTATCGCATCGA
TCAATCGTAGTTGGACATATTAGTTTAAGAACTTTTGGTTTATTCCTTGTGTTTCTCTG


BQ
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AF RS1GM67TF U 1
AF RS1GM67JQ C 580
BS 1 643 RS1GM67TF
BS 644 644 RS1GM67JQ
BS 645 678 RS1GM67TF
BS 679 1379 RS1GM67JQ

RD RS1GM67TF 678 0 0
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TGACACAAACAACTTTTGACTTTCCCAGATTTCCTTATATATGCTTCAGTTTTCTTATTG
TTTGTTTGCAATTTTTAGTTTTTTAGTGTTATCTAAATTTATAGATCTCATCGGTTGTTT
GCAACTTTTAGTTTTATTGTTCTTGGGTTTTGATTCACTGATTTTCTTTATGCAGAAAAA
GAGCTCTGGAAATGGTGAATTCACATGTGAAGAATGAAGATACTGAAGAACAAAAAAAAA
TCAAATTAAACAACCGCCACAAGAATTAGATCAATTGCTTGAAGCTGGGCATACCTCCTA
TTGCTATAATTCAGTTCTTCCCGGAGCTGTAATCTATAGTCGAAAACAACTGTGTTGGAG
ATGGACGTGGTGGTGTCGGGTTGGGCTTTCCTGAGACTCACAGGTTTGGTGTAAAGTTTT
GTCAGTCTGATGGAATGACCGGATCATCGGCGGTAAAGTCGCCACTATGGTGGAGCCGTT
GAATAATTGCCGATGTCGACCACGTTCAAGGAATTCTTAGAGAGATAAGGAGGATTTCCA
GTTTCTTTGCTCTTGATAGATATGTGAATGGTAGTGGATTTAG*TCGCTTGCTAGCCGAC
AAGTGGAAAGCTTGATTT

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1GM67JQ 800 0 0
GAGAGATAAGGAGGATTTCCAGTTTCTTTGCTCTTGATAGATATGTGAATGGTAGTGGAT
TTAGGTCGCTTGCTAGCCGACAAGTGGAAAGCTTGATTTCAACGGACGGTCAATGATGCA
AGCACAGGATTCTCAAGCCACGTTGAAACCCTCTAAAAATAGTTGAGCTAGCAACACACT
ACTGGGTGTTTGTTAGAGGGTAAGGATCTCTGTAAGATACTGTCTAGGTAAGGTTCATGG
TTTATTGATTCTATGAATTGTCATATTACATTACTGTTTCCACTGCAAGTGTAGAGTACT
TCCAACAGTTCAATACCATATTCTCATATGGTAACTAGCCAAGCGGCTCTGTAACCATGA
AATAAAAAAGCGCCTTCTAGCTAAGGTTGTACCGGTTGCTCAGATGGGAGTTGTTACATG
GGGGGTCATTCCTTATCCCTTCTTTCACATTAAGTAGTTTCAAACGAACAGAAACACAAA
ACTTTTCTTCCTTTCCGGAAGATCCTTGCATCTGATCCTCTCCAGCAGCTATTTTCATCG
CTTAGCTCCCTCCATCATCCTAGCACAAGAGAAGCCAAAAAGGAAGAAGCATCAATGTCA
TACATATATAAAGGAAGAGAAAGAATTATGACTTATGAGACAGCTCAGCCATTGTATACT
ATTTTCTTTTACCGGTGAGCAAGAAGATGGGAATCTCATATGTGGTAATTTAACTACTGT
AGAAATATTTTATCGCATCGATCAATCGTAGTTGGACATATTAGTTTAAGAACTTTTGGT
TTATTCCTTGTGTTTCTCTG

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 2

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GGAGCTGAATCACAAAGTTGCTTTCACCAACATATAAGATAATCAGAAGGCACAGAGCAC
GAACCTGACTGGTGTAGCGTATCAAAAGACACTGAGCCAAGGGAGAGCGAACAGATCTCC
TGGTCAAGCTACCAACCAACTTGCTAACAGCCAAGCGATCATTTTGGCGTATCTGAACAT
GATGATTGATTGTCAATATCTATTAGATCAGTTCTCACTACTTTAATAAATCAAAAAACG
AAAGCACATTTAGTTATGTTGGGAGCCTTTTCAAATCAATGTAATAGATATCATTTGCTA
ACTCCTACAAGCCTTAGGCTGTGCTTCCAACCTAACATGTATATATGTCCGAGACTGATT
CTAAATGACCATAGTAAAGAGCTATGATTGGCGACAGAAAACCTATTGTTACGTTTCTAG
TCAATACTCATAGTAACACACCTATTATCAACATGCTTCTTTCCAGTGGCTGTTTAATTA
AACAAAGAACAGAAACATAGACCAATTTACTTGGGTAACAGCAATGCAATAGCCTTACCT
GATGGAGCAAAGCTAGGGCATGAAACTGAACGAGAGCTGACCTAGACTGAACACCTTCTT
GGACCTCATTGCTCCATCTCTTAACAATTTCAGGGTTCGTCTGAAAACAACAATACATAA
GAAGAATACAAGCATAACCTAATAAATACGAAGCAACCAAACAGTTTAGGTTTCTAAAAA
GGTTTACCCTTAGCAAGTGAAGCCCACTGACCAAAGCAGCACTCGAAACAACAGGATTCT
TATCCACAATAGCTTGCTTCAAGTACCGCTCAATCTGAGTGAGAAGAGTTCCGTCGATAA
TCCGGCAGAGGACACGGATAGCATTAGCACGATACATATCAATCTTACTGTTCATGTCCT
TCATAAGTGAGCTGGTTACAATAATAACCTACGAGAGAAACACCAAAACAACAACTTATC
AGTGAAATACACCTACAAATGATTGTCATATTGAGTAAGAAGGC


BQ
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AF RS1GG47TF U 1
AF RS1GG47JQ C 410
BS 1 559 RS1GG47TF
BS 560 1004 RS1GG47JQ

RD RS1GG47TF 559 0 0
GGAGCTGAATCACAAAGTTGCTTTCACCAACATATAAGATAATCAGAAGGCACAGAGCAC
GAACCTGACTGGTGTAGCGTATCAAAAGACACTGAGCCAAGGGAGAGCGAACAGATCTCC
TGGTCAAGCTACCAACCAACTTGCTAACAGCCAAGCGATCATTTTGGCGTATCTGAACAT
GATGATTGATTGTCAATATCTATTAGATCAGTTCTCACTACTTTAATAAATCAAAAAACG
AAAGCACATTTAGTTATGTTGGGAGCCTTTTCAAATCAATGTAATAGATATCATTTGCTA
ACTCCTACAAGCCTTAGGCTGTGCTTCCAACCTAACATGTATATATGTCCGAGACTGATT
CTAAATGACCATAGTAAAGAGCTATGATTGGCGACAGAAAACCTATTGTTACGTTTCTAG
TCAATACTCATAGTAACACACCTATTATCAACATGCTTCTTTCCAGTGGCTGTTTAATTA
AACAAAGAACAGAAACATAGACCAATTTACTTGGGTAACAGCAATGCAATAGCCTTACCT
GATGGAGCAAAGCTAGGGC

QA 1 559 1 559
DS 

RD RS1GG47JQ 595 0 0
TACGTTTCTAGTCAATACTCATAGTAACACACCTATTATCAACATGCTTCTTTCCAGTGG
CTGTTTAATTAAACAAAGAACAGAAACATAGACCAATTTACTTGGGTAACAGCAATGCAA
TAGCCTTACCTGATGGAGCAAAGCTAGGGCATGAAACTGAACGAGAGCTGACCTAGACTG
AACACCTTCTTGGACCTCATTGCTCCATCTCTTAACAATTTCAGGGTTCGTCTGAAAACA
ACAATACATAAGAAGAATACAAGCATAACCTAATAAATACGAAGCAACCAAACAGTTTAG
GTTTCTAAAAAGGTTTACCCTTAGCAAGTGAAGCCCACTGACCAAAGCAGCACTCGAAAC
AACAGGATTCTTATCCACAATAGCTTGCTTCAAGTACCGCTCAATCTGAGTGAGAAGAGT
TCCGTCGATAATCCGGCAGAGGACACGGATAGCATTAGCACGATACATATCAATCTTACT
GTTCATGTCCTTCATAAGTGAGCTGGTTACAATAATAACCTACGAGAGAAACACCAAAAC
AACAACTTATCAGTGAAATACACCTACAAATGATTGTCATATTGAGTAAGAAGGC

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 2

CO CL6769Contig1 838 2 6 U
GGACACCATCAAACAACAACAATCAACATGGCTCCATTTCTCTCCATCTCCCTCGCCCTT
GTCGCCATTTTCTTCATTACAGTCTCCGCAGATCCCGACATGCTCCAAGACCTCTGTGTC
GCTGATCTCTCCTCCGGAATCAAAGTCAATGGCTTCCCTTGCAAAGACGCAGCCAACGTC
ACACCACTCGATTTCTTCTCCCAAGGAATAGCCAATCCAGGTCTCACCAACAACACATTC
GGCTCCTTAGTCACAGGCGCAAACGTGATGACCATCCCAGGTCTCAACACGCTCGGCGTC
TCCCTCGCACGAATCGACTACGCGCCAGGCGGCTTAAACCCGCCTCACACTCACCCTCGC
GCCACCGAAGTCGTCTACGTCCTCGAAGGAGCCCTCGACGTCGGGTTCCTCACCACGGCC
AACAAGCTCATCTCTCAGTCTCTCAAGAAAGGCGACGTCTTCGCTTTCCCCAAGGGGCTT
GTCCATTTCCAGAAGAACAACGGTCGTGTCCCTGCTTCTGTCATCGCTGCTTTCAATAGC
CAGCTTCCTGGGACTCAGTCTCTTGGTGCTACTCTGTTCGGTTCTACGCCTCCTGTTCCT
AATGAGATCTTGGCTCAAGCGTTTCAGACATCTCCCGGGAACTGTTAAACACATCAAAAC
CAAGTTCCAACCCAAGGTGTAATAATGATCTTTTGGTTCTGTTTTTTCTAACGGAATGAT
ATTTTCCTCCTTTATTTGTCTTGTGTAATAAAACCCATAACTGATGTTTTGAGTGTGCAT
TTGAGCTTTCATTGTCTCATGTATCATCTTCTATATAATACAAGTTGTTTTTTTTAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1H144TF U 1
AF RS1H144JQB C 143
BS 1 676 RS1H144TF
BS 677 677 RS1H144JQB
BS 678 706 RS1H144TF
BS 707 707 RS1H144JQB
BS 708 723 RS1H144TF
BS 724 838 RS1H144JQB

RD RS1H144TF 723 0 0
GGACACCATCAAACAACAACAATCAACATGGCTCCATTTCTCTCCATCTCCCTCGCCCTT
GTCGCCATTTTCTTCATTACAGTCTCCGCAGATCCCGACATGCTCCAAGACCTCTGTGTC
GCTGATCTCTCCTCCGGAATCAAAGTCAATGGCTTCCCTTGCAAAGACGCAGCCAACGTC
ACACCACTCGATTTCTTCTCCCAAGGAATAGCCAATCCAGGTCTCACCAACAACACATTC
GGCTCCTTAGTCACAGGCGCAAACGTGATGACCATCCCAGGTCTCAACACGCTCGGCGTC
TCCCTCGCACGAATCGACTACGCGCCAGGCGGCTTAAACCCGCCTCACACTCACCCTCGC
GCCACCGAAGTCGTCTACGTCCTCGAAGGAGCCCTCGACGTCGGGTTCCTCACCACGGCC
AACAAGCTCATCTCTCAGTCTCTCAAGAAAGGCGACGTCTTCGCTTTCCCCAAGGGGCTT
GTCCATTTCCAGAAGAACAACGGTCGTGTCCCTGCTTCTGTCATCGCTGCTTTCAATAGC
CAGCTTCCTGGGACTCAGTCTCTTGGTGCTACTCTGTTCGGTTCTACGCCTCCTGTTCCT
AATGAGATCTTGGCTCAAGCGTTTCAGACATCTCCCGGGAACTGTTAAACACATCAAAAC
CAAGTTCCAACCCAAG*TGTAATAATGATCTTTTGGTTCTGTTTTT*CTAACGGAATGAT
ATT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1H144JQB 696 0 0
AAGTCAATGGCTTCCCTTGCAAAGACGCAGCCAACGTCACACCACTCGATTTCTTCTCCC
AAGGAATAGCCAATCCAGGTCTCACCAACAACACATTCGGCTCCTTAGTCACAGGCGCAA
ACGTGATGACCATCCCAGGTCTCAACACGCTCGGCGTCTCCCTCGCACGAATCGACTACG
CGCCAGGCGGCTTAAACCCGCCTCACACTCACCCTCGCGCCACCGAAGTTGTTTACGTCC
TCGAAGGAGCCCTCGACGTCGGGTTCCTCACCACGGCCAACAAGCTCATCTTTCAGTCTC
TCAAGAAAGGCGACGTTTTCGCTTTCCCCAAGGGGCTTGTCCATTTCCAGAAGAACAACG
GTCGTGTCCCTGCTTCTGTCATCGCTGCTTTCAATAGCCAGCTTCCTGGGACTCAGTCTC
TTGGTGCTACTCTGTTCGGTTTTACGCCTCCTGTTCCTAATGAGATCTTGGCTCAAGCGT
TTCAGACATCTCC*GGGAACTGTTAAACACATCAAAACCAAGTTCCAACCCAAGGTGTAA
TAATGATCTTTTGGTTCTGTTTTTTCTAACGGAATGATATTTTCCTCCTTTATTTGTCTT
GTGTAATAAAACCCATAACTGATGTTTTGAGTGTGCATTTGAGCTTTCATTGTCTCATGT
ATCATCTTCTATATAATACAAGTTGTTTTTTTTAGG

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL6770Contig1 1228 2 2 U
GGGTGGAGAACAACGTCCTCGAGCTCTTGGTTCAGAACATGAACCGGTTATCGGAGGCGG
ATCCGGACGAAGCGGCGGCTGTATACGCCACCTTGACGGTTATCGAGAATCTCGTGGAGG
TTAAGCCGGCCGTAGCCGAGACTGTGTGCGAGCGGACGAAGCTGTTACGGTGGCTCGTTC
TGAAGATCAAGGTTAGGGACTTCGAAGGGATCAAGCAGTACGCGTCCGAGATTCTTGCGA
TTCTGCTGCAGAATAGCACGGCGAATCAGAAACGGTTAGGGCAGATGAACGGTGTGGATG
CTGTGCTGGAAGGCGTGGCGATGTATAAGTCGAAGGATCCTAAGACTCCTGATGAGGAGG
AGATGTTGGAGAATCTGTTTGATTCCCTTTGCTGTCTCTTGATGCCGTTGGAGAATAAGG
AGAGGTTTGTGAACGCGGAGGGTGTGGAGCTGATGATCATTATAATGAAGCAGAAGAAGT
TTGCTTATGGTTCCGCGATTCGGGCGCTTGACTTCGCCATGACTAACTATCCCCCGGCTT
GTGAGAGGTTTGTGGATGTTATGGGGTTGAAAACAGCGTTTGCTGCCTTCATGGGTAAGA
TTCCGCTAAACAAGAGGATTAAGAGGGAGCGGTATAAGGAGGAGCTAGAGGAGCGGGTTA
TTTCGCTGGTTGCTTCATTGTTTGCTGGGATTTTAAGGGGTTCTAGAAGAGACCGTTTGT
TGAGCAAGTTCGTTAAGAATGAATATGAGAAGATTGACCGCCTTATGGAACTATACATTA
GATACTCTGATAGGGTTAGATCAGAGGCTGAGAGGTTAGACCAACTTGAGCTTGATGACC
TTGAGTTGGATGAAGATGAAAAATATAACCGGAAGCTAGAATCAGGCCTCTACAGTCTTC
AGCTTGTTGCTGTCATTCTGGGCCATATTTGGTGTTCTGAGCATTCTGGAATGAGAGCGC
GGATCGAGCTGCTGTTGAAGCAACAAAAGCTAAGTAAAAACAACGTCAAGGAGATACTTC
AGGAATATCATGACAACATTGGAGATGTTGAAGGAGCAGAGGAGAAGGAACGAGGACAGG
CGAGAATCCAGTTGTTCATATCTGCAATGTGATGTTAGAGGAAGAAAGGAGATAAGAAAA
ATCCCAAGTGGCTTCGTATCAAATTCCAATATTTCTGGGACCAGAGAGACTTCTGTTTTT
ATTTCAATAGGATTTAAATTGGATGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GS66TF U 1
AF RS1GS66JQ C 415
BS 1 638 RS1GS66TF
BS 639 1228 RS1GS66JQ

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TGAAGATCAAGGTTAGGGACTTCGAAGGGATCAAGCAGTACGCGTCCGAGATTCTTGCGA
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AGATGTTGGAGAATCTGTTTGATTCCCTTTGCTGTCTCTTGATGCCGTTGGAGAATAAGG
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GTGAGAGGTTTGTGGATGTTATGGGGTTGAAAACAGCGTTTGCTGCCTTCATGGGTAAGA
TTCCGCTAAACAAGAGGATTAAGAGGGAGCGGTATAAG
A

QA 1 638 1 638
DS 

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AGAAGTTTGCTTATGGTTCCGCGATTCGGGCGCTTGACTTCGCCATGACTAACTATCCCC
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ATGACCTTGAGTTGGATGAAGATGAAAAATATAACCGGAAGCTAGAATCAGGCCTCTACA
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GACAGGCGAGAATCCAGTTGTTCATATCTGCAATGTGATGTTAGAGGAAGAAAGGAGATA
AGAAAAATCCCAAGTGGCTTCGTATCAAATTCCAATATTTCTGGGACCAGAGAGACTTCT
GTTTTTATTTCAATAGGATTTAAATTGGATGAGC

QA 1 814 1 814
DS 



AS 1 2

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CTCCTCTGCGGCGGCGGCGGAATCCGGCGAGGACTCACCGAAGTCTCCTGCTCCGCCAAA
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ATTCTTTCTTCTTCTTAGTTGTCC


BQ
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AF RS1BT72TF C 1
AF RS1BT72JQ U 75
BS 1 74 RS1BT72TF
BS 75 726 RS1BT72JQ
BS 727 744 RS1BT72TF

RD RS1BT72TF 744 0 0
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ATCTATCTGAAATTTGAAATTACACGACATAAATCCAATTGAGAAAATGAAAAGAAAAAA
AATAGACTTGGTTAATGAAAATCAAGAAGGGACGACAACGGTGCGCATCATGTTCTTGAA
CTCGAAAAAGTCAACGCGGCCGTCTTGGTTCCGGTCAACGGAGTCGATCATCTTCTCCAC
TCTCTCCATCTCACTTCCTTCGGGCAACCCGAGCTTCTTCAAAACCGCCTGCAACTCCCT
AGCGGAGATAAAACCGTCGCCATTCTCGTCGAACACCTTAAACGCCTCCGCGAGATCCGC
CTCCTCTGCGGCGGCGGCGGAATCCGGCGAGGACTCACCGAAGTCTCCTGCTCCGCCAAA
GAAGGACTCGTCGAGGGTCTTGTGGAGGGAGGAGAAGTCGTCGAAGTCGAGACCGGTGTT
TCCGGGCTGGATGTAGGACTCGACGGTGGATTTGAGGTCGGAGACTGAGAGATCGGCGTC
GAGACCGAGACGGGAGAGAGCTTGGTTTAGCTCGTCGACGGTGATGAAACCGTCGCCGTT
TTTGTAGAATAAGTCGAAAATGCGCTGGAGACGGAGAGCGTTTAGGCTTGGGCTTCGAAG
CCTGAAGGATGATGATTATCTCTCTACTTTCTTGTCGTTCTCTCCGTTGCTCTCCATTGT
ATTCTTTCTTCTTCTTAGTTGTCC

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1BT72JQ 652 0 0
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ATGAAAATCAAGAAGGGACGACAACGGTGCGCATCATGTTCTTGAACTCGAAAAAGTCAA
CGCGGCCGTCTTGGTTCCGGTCAACGGAGTCGATCATCTTCTCCACTCTCTCCATCTCAC
TTCCTTCGGGCAACCCGAGCTTCTTCAAAACCGCCTGCAACTCCCTAGCGGAAATAAAAC
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CGGCGGAATCCGGCGAGGACTCACCGAAGTCTCCTGCTCCGCCAAAGAAGGACTCGTCGA
GGGTCTTGTGGAGGGAGGAGAAGTCGTCGAAGTCGAGACCGGTGTTTCCGGGCTGGATGT
AGGACTCGACGGTGGATTTGAGGTCGGAAACTGAGAGATCGGCGTCGAGACCGAGACGGG
AGAGAGCTTGGTTTAGCTCGTCGACGGTGATGAAACCGTCGCCGTTTTTGTAGAATAAGT
CGAAAATGCGCTGGAGACGGAGAGCGTTTAGGCTTGGGCTTCGAAGCCTGAAGGATGATG
ATTATCTCTCTACTTTCTTGTCGTTCTCTCCGTTGCTCTCCATTGTATTCTT

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 2

CO CL6772Contig1 649 2 3 U
GATAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAAT
GCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGC
GCCCCAAGGCCGGTGAGAAGATCTTCAGGACCAAGTGCGCTCAGTGTCACACCGTCGACA
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AGGCCTTGTACGATTACTTGCTCAACCCAAAGAAGTACATTCCTGGAACTAAGATGGTCT
TCCCTGGGCTTAAGAAGCCACAAGAACGCGCTGATCTCATCGCCTACTTGAAGGAAGCTA
CTGCTTAGTGAAATCAACCAACCAACCAACCAATGGTGGTGTGGGACATCATGAATTATT
ATTCTTTTGACAAATAAAATCTCCAAACTCTTTTTTTGTTTTGCTTTTGGAAATTTTCTC
ATCTTTATTTATATACGTTTTGGCTGGAACTTGGCTGTTTGAGTACCCAAATGTACTCCG
AATACTTTCATTTTCTAAGGTTCACTTATATAAGTAAGTGCATCTATCG


BQ
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AF RS1BE05JQ C 1
AF RS1BE05TF U 1
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RD RS1BE05JQ 649 0 0
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QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1BE05TF 649 0 0
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GCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGC
GCCCCAAGGCCGGTGAGAAGATCTTCAGGACCAAGTGCGCTCAGTGTCACACCGTCGACA
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CAACAGCTGGTTACTCTTACTCTGCTGCTAACAAGAACAAAGCTGTTGAATGGGAAGAGA
AGGCCTTGTACGATTACTTGCTCAACCCAAAGAAGTACATTCCTGGAACTAAGATGGTCT
TCCCTGGGCTTAAGAAGCCACAAGAACGCGCTGATCTCATCGCCTACTTGAAGGAAGCTA
CTGCTTAGTGAAATCAACCAACCAACCAACCAATGGTGGTGTGGGACATCATGAATTATT
ATTCTTTTGACAAATAAAATCTCCAAACTCTTTTTTTGTTTTGCTTTTGGAA*TTTTCTC
ATCTTTATTTATATACGTTTTGGCTGGAACTTGGCTGTTTGAGTACCCAAATGTACTCCG
AATACTTTCATTTTCTAAGGTTCACTTATATAAGTAAGTGCATCTATCG

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1E168TF U 1
AF RS1E168JQ C 115
BS 1 659 RS1E168TF
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BS 764 833 RS1E168JQ

RD RS1E168TF 763 0 0
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TTTATTCTCATAATTAGATTACAAAACGGGGAATAACCAAAACAGAGGGCAGCTTATAAG
AGAACTGGATATCCCTCTTGGAAGGAGAGAAAAGAGATGGTGAGGTTGAGAGAAACAGAA
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GCTCTGGAGGTTGAGTTGTACATAAATGCTGTGGTTGCTGCATATAATATCGTTCAGTTA
GGATTTGGTTGGTACGGTGTTGCACAAAAAAACTCCAATTCTAAATGGCTCTCTACCTCT
TGGATCAGACGGCGGTGTACGTGGTGTTCGCCGGGACATCTGCGGCGGCACAACACTCAT
TGCTTGTTGACTGGTTCGAAGGAGCTTCAGTGGATGAAGTGGTGCTACAAGTTCACAAG*
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QA 1 763 1 763
DS 

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CAGTTAGGATTTGGTTGGTACGGTGTTGCACAAAAAAACTCCAATTCTAAATGGCTCTCT
ACCTCTTGGATCAGACGGCGGTGTACGTGGTGTTCGCCGGGACATCTGCGGCGGCACAAC
ACTCATTGCTTGTTGACTGGTTCGAAGGAGCTTCAGTGGATGAAGTGGTGCTACAAGTTC
ACAAGGTTCTGCTTTCAGATCGGAAGTGCCATTATCTTAAACTACATCGCAGCGGTGCTC
ATGATCATCCTCTCCTTCATCTCCTCCTTCAGTCTCTTCCGCCTCTATTCCCCTAAACGT
TATTTTCAGTTTAAGTCCTCCTCTTAATTATTTACTAGGTTAAATCCTTTTCTTGATCT

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CF79TF U 1
AF RS1CF79JQ C 255
BS 1 744 RS1CF79TF
BS 745 745 RS1CF79JQ
BS 746 755 RS1CF79TF
BS 756 1014 RS1CF79JQ

RD RS1CF79TF 767 0 0
TTTTTTTATTTTGCGATGGAGACACTTCCAATCTCCGCGGAGAGCTTCAAGGTAGGGTTC
ATCGGAGCTGGAAAGATGGCGGAGAGTATAGCCAGAGGCGTGGTCGCCTCCGGGATGCTT
CCTCCGAATCGTATCTCCACCGCCGTCCACTCGAACCTGAATCGCCGTCAAGTCTTCGAG
TCCTTTGGCGTCAATGTCTTCTCCAGTAGCGAAGAAGTCGTTAAAGAAAGTGACGTTGTG
ATCTTCTCTGTGAAACCTCAAGTTGTTAAGAAGGCCATCACGGAAGTAAGGTCAACGCTG
ACCAAGGATAAGGTTCTTGTTTCGGTTGCAGCGGGGATCAAGTTGAAAGATCTTCAGGAA
TGGTCTGGTCAAGATCGATTCATAAGGGTGATGCCTAATACACCAGCTGCAGTTGGTGAG
GCAGCTTCAGTAATGAGCCTCGGAACAGCAGCTACAGAAGAAGATGGAGCACTTGTTGCT
AAGTTGTTTGTCTCGGTGGGGAAGATATTAAGGGCCGATGAGAAAATGTTTGATGCTGTC
ACTGGTCTTAGTGGAAGTGGACCAGCGTACATATTCTTAGCAATTGAAGCTTTAGCTGAT
GGAGGAGTAGCTGCTGGTTTACCCCGAGAACTCGCATTGGGTTTAGCTTCACAGACGGTT
CTTGGAGCTGCAACAATGGTAAGCAAAACCGGGAAGCATCCTGGTGTGTTGAAAGATGAT
GTTACTTCACCAGGCGGGACTACA*TAGCTGGAGT
CATGACTGGAGA

QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1CF79JQ 760 0 0
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TCTTGTTTCGGTTGCAGCGGGGATCAAGTTGAAAGATCTTCAGGAATGGTCTGGTCAAGA
TCGATTCATAAGGGTGATGCCTAATACACCAGCTGCAGTTGGTGAGGCAGCTTCAGTAAT
GAGCCTCGGAACAGCAGCTACAGAAGAAGATGGAGCACTTGTTGCTAAGTTGTTTGTCTC
GGTGGGGAAGATATTAAGGGCCGATGAGAAAATGTTTGATGCTGTCACTGGTCTTAGTGG
AAGTGGACCAGCGTACATATTCTTAGCAATTGAAGCTTTAGCTGATGGAGGAGTAGCTGC
TGGTTTACCCCGAGAACTCGCATTGGGTTTAGCTTCACAGACGGTTCTTGGAGCTGCAAC
AATGGTAAGCAAAACCGGGAAGCATCCTGGTGTGTTGAAAGATGATGTTACTTCACCAGG
CGGGACTACAATAGCTGGAGTTCATGAACTGGAGAAAGGTTCTTTCCGTGCAACGCTTAT
GAGTGCTGTTGTTGCAGCAGCTAATCGAAGCCGCGAGCTCTCACAGAGCTAAATGACATA
AAAAGAGAGTTGCTACTATTATTTCACCTCACAGATTCTTTCATCACAATAAGGGGTTAT
GATATTACTTTGGTAGGTGTGGAGACTATTTATCTTGACTCTGTATTGGTTCAGATCTCA
GCTACGTTGTTATCATTCTTATATCTAATAAAAACTTCAT

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

CO CL6775Contig1 827 2 8 U
GGGTGGAAGGTAGCAAGCAGAGAGCACTAAGCACATATCTCGAGAGAGAACACAAAGAGC
TCTTCGTGGGATTGGCAAATGGAGAACTATGATCACCAGCCTCAGTCTACTTTCTCTGAT
GATGTGACCATGACTGAAGTCACTTTAAACCAAGAAGACCACTCTTACATGTTTGATGAT
GACTCCACCCCTGTTAAGGCCTGTAGCGAGCTCGGTTATCATGTCACAACAGATGAAACG
ATCAAGAAGCTGGAAGTGCAAAGTGAGACACGCTCTGCTGTGAAGAGGCGTCGGATGTTA
CATTTCGATGACCACCAGCCTATGGAAACTTCCCTTTTCAGCTCTGAGTGTTTCTCTTCA
ATCCTTAAATCAAGCGCTAGAGAGGAAGCATATGATGATCTTTTACCCGAAGGATCTCAG
CTTATACAAGGGTTTTCAGAAGATGCTTCTGCCTCAAGCTTGGAGGGTCTTGATCTGTAT
GCAGAAGAGTGGTACGCTGATTGCTTAAATGATCCTGACACTCCAACCCTACCTGATGAC
TTAAACCAGTTGTTGGGAAGACTAAAATCCGCACAGAACGAGGCAAAGGAAGCATCACAA
TAATGAGGACGAGAGGCTAAAGCTATAAAGTTAAAAGTTAAAGAAAATCTAAACTTTTTT
GCCTTATTCTCAGAGGCCCTTCAGTTACAGTCATCAAGAAGGGTCTTTAAGCAAAAGTAC
AGCGGCTAATATTATGAATCAAGTTCTTTTTTTCATTTTGGTATCTGTAAAGCCACAATG
TGGTTAGGATATTTTTTGGTTTGTATAAAAAGTTTCTTTGTTCTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1FG08TF U 1
AF RS1FG08JQ C 105
BS 1 702 RS1FG08TF
BS 703 703 RS1FG08JQ
BS 704 715 RS1FG08TF
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BS 717 752 RS1FG08TF
BS 753 753 RS1FG08JQ
BS 754 777 RS1FG08TF
BS 778 827 RS1FG08JQ

RD RS1FG08TF 781 0 0
GGGTGGAAGGTAGCAAGCAGAGAGCACTAAGCACATATCTCGAGAGAGAACACAAAGAGC
TCTTCGTGGGATTGGCAAATGGAGAACTATGATCACCAGCCTCAGTCTACTTTCTCTGAT
GATGTGACCATGACTGAAGTCACTTTAAACCAAGAAGACCACTCTTACATGTTTGATGAT
GACTCCACCCCTGTTAAGGCCTGTAGCGAGCTCGGTTATCATGTCACAACAGATGAAACG
ATCAAGAAGCTGGAAGTGCAAAGTGAGACACGCTCTGCTGTGAAGAGGCGTCGGATGTTA
CATTTCGATGACCACCAGCCTATGGAAACTTCCCTTTTCAGCTCTGAGTGTTTCTCTTCA
ATCCTTAAATCAAGCGCTAGAGAGGAAGCATATGATGATCTTTTACCCGAAGGATCTCAG
CTTATACAAGGGTTTTCAGAAGATGCTTCTGCCTCAAGCTTGGAGGGTCTTGATCTGTAT
GCAGAAGAGTGGTACGCTGATTGCTTAAATGATCCTGACACTCCAACCCTACCTGATGAC
TTAAACCAGTTGTTGGGAAGACTAAAATCCGCACAGAACGAGGCAAAGGAAGCATCACAA
TAATGAGGACGAGAGGCTAAAGCTATAAAGTTAAAAGTTAAAGAAAATCTAAACTTTTTT
GCCTTATTCTCAGAGGCCCTTCAGTTACAGTCATCAAGAAGG*TCTTTAAGCAAA*GTAC
AGCGGCTAATATTATGAATCAAGTTCTTTTTT*CATTTTGGTATCTGTAAAGCCACA
TGTG

QA 1 777 1 777
DS 

RD RS1FG08JQ 723 0 0
GTCTACTTTCTCTGATGATGTGACCATGACTGAAGTCACTTTAAACCAAGAAGACCACTC
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CACAACAGATGAAACGATCAAGAAGCTGGAAGTGCAAAGTGAGACACGCTCTGCTGTGAA
GAGGCGTCGGATGTTACATTTCGATGACCACCAGCCTATGGAAACTTCCCTTTTCAGCTC
TGAGTGTTTCTCTTCAATCCTTAAATCAAGCGCTAGAGAGGAAGCATATGATGATCTTTT
ACCCGAAGGATTTCAGCTTATACAAGGGTTTTCAGAAGATGCTTTTGCCTCAAGCTTGGA
GGGTCTTGATCTGTATGCAGAAGAGTGGTACGCTGATTGCTTAAATGATCCTGACACTCC
AACCCTACCTGATGACTTAAACCAGTTGTTGGGAAGACTAAAATCCGCACAGAACGAGGC
AAAGGAAGCATCACAATAATGAGGACGAGAGGCTAAAGCTATAAAGTTAAAAGTTAAAGA
AAATTTAAACTTTTTTGCCTTATTTTCAGAGGCCCTTCAGTTACAGTCATCAAGAAGGGT
CTTTAAGCAAAAGTACAGCGGCTAATATTATGAATCAAGTTCTTTTTTTCATTTTGGTAT
CTGTAAAGCCACAATGTGGTTAGGATATTTTTTGGTTTGTATAAAAAGTTTCTTTGTTCT
TAT

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

CO CL6776Contig1 787 2 3 U
GGAAATTAAATAGACACAAGTGCGTGCGTGAACTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA
GCTAAGCAGTAGAGATAAACAAACATCAATGGCGATTCCAATGCCAACTCGACAGCTATT
CATCGACGGCGAGTGGAGAGAGCCAATCTTGAAGAATCGCATCCCCATCGTCAATCCAGC
TACCCAAGATGTCATTGGTGATATCCCGGGGGCAACAAAGGAGGATGTGGAAGTAGCAGT
CAACGCTGCTCGAAGAGCTTTCTCAAGGAACAAAGGTAAAGACTGGTCCAAAGCATCAGG
AGCTCTTCGCGCCAAGTATCTACGCGCTATTGCTGCTAAGGTGACTGAAAGGAAGTCGCA
TCTGGCAACGCTTGAGTCGCTTGACTCTGGTAAACCTTTGGATGAAACTCTTTGGGATAT
GGAGGATGTTGCTGGATGTTTTGAGTTTTATGCTGACCTTGCTGAAGGATTAGATGCTAA
GCAGAAAGCTCCTGTTTCTCTTCCCATGGAGAGTTTTAAGAGTTATGTTCTCAAGCAACC
TCTTGGAGTTGTGGGACTCATCACACCTTGGAATTACCCTCTTCTGATGGCTGTTTGGAA
GGTGGCTCCTTCGCTTGCTGCTGGATGTACTGCCGTTCTCAAGCCATCAGAGCTCGCTTC
TGTCACTTGTTTGGAGCTTGCTGATATTTGTCGAGAAGTTGGTCTTCCTCCTGGTGTTCT
CAACGTTCTTACTGGATATGGTTCGGAAGCTGGTGCTCCTTTGGCTTCACATCCCAATGT
CGACAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D354TF U 28
AF RS1C413TF U 1
BS 1 416 RS1C413TF
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BS 418 787 RS1C413TF

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GGAGAGAG
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CTTTGGATGAAACTCTTTGGGATATGGAGGATGTTGCTGGATGTTTTGAGTTTTATGCTG
ACCTTGCTGAAGGATTAGATGCTAAGCAGAAAGCTCCTGTTTCTCTTTCCATGGAGAGTT
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ACCCTCTTCTGATGGCTGTTTGGAAGGTGGCT

QA 9 580 9 580
DS 

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CATCGACGGCGAGTGGAGAGAGCCAATCTTGAAGAATCGCATCCCCATCGTCAATCCAGC
TACCCAAGATGTCATTGGTGATATCCCGGGGGCAACAAAGGAGGATGTGGAAGTAGCAGT
CAACGCTGCTCGAAGAGCTTTCTCAAGGAACAAAGGTAAAGACTGGTCCAAAGCATCAGG
AGCTCTTCGCGCCAAGTATCTACGCGCTATTGCTGCTAAGGTGACTGAAAGGAAGTCGCA
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TCTTGGAGTTGTGGGACTCATCACACCTTGGAATTACCCTCTTCTGATGGCTGTTTGGAA
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CAACGTTCTTACTGGATATGGTTCGGAAGCTGGTGCTCCTTTGGCTTCACATCCCAATGT
CGACAAG

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

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CACGAAAGACGAAGAGGAGGGTGTGTGAATATGGAGAATAAGGGTTTTCTCTGTAAAATA
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CATGGTATGTATATAACTACGTACTTTTCAATGTAATATATGCAATAATTTGTGGCTGTA
TAGCCCTACGACTGCGGAGAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1B987TF U 1
AF RS1B987JQ C 87
BS 1 650 RS1B987TF
BS 651 651 RS1B987JQ
BS 652 743 RS1B987TF
BS 744 744 RS1B987JQ

RD RS1B987TF 743 0 0
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TAAACGAATCTCCAACGGTGAAGAAAACTCCTATGGCATCAAAAGAGAAACCAAAGAAGC
TTAGAAAACCCAAAACCGCCACTCATCCTCCATACTTTCAGATGATAAAAGAGGCTGTGA
TGAATCTGAAAGAGAAGAACGGGTCGAGCCCTTACGCTATAGCAAAGCAGATAGAGGAGA
AATACAAACCTGTACTCCCTGAGAATTACCGTAAAACACTTTCTCTGCAGCTTAAAAACT
CTGTTGCTAAAGGTAAGCTCGCGAAGATCAGCGCCTCTTACAAGCTCTCAGAGACCACCA
CGAGGACGACGAGGCAGCAGCAGCAGAAGAAGAAGATGGAGACTCGGTCGAAGAAGACTG
TGAGCAAGCCGCCAGAGATGGTGACGAAGAAGAAGAGGACAGCAAAGAAGCCAAGACAGC
TTAAGTCGATCAAGTCTCCAGGTTCTAAGAAGGTCTTGAGAGCTTCCGCTTCTTGATGGA
CACGAAAGACGAAGAGGAGGGTGTGTGAATATGGAGAATAAGGGTTTTCTCTGTAAAATA
GTTGACTCTGTTTTTGGTTTCGGGGTTACTCCTTCTTTAGGGCTTATAAG*ATAATGAGT
CATGGTATGTATATAACTACGTACTTTTCAATGTAATATATGCAATAATTTGTGGCTGTA
TAGCCCTACGACTGCGGAGAGAC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RS1B987JQ 658 0 0
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AGCCCTTACGCTATAGCAAAGCAGATAGAGGAGAAATACAAACCTGTACTCCCTGAGAAT
TACCGTAAAACACTTTTTCTGCAGCTTAAAAACTCTGTTGCTAAAGGTAAGCTCGCGAAG
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AAGAAGAAGATGGAGACTCGGTCGAAGAAGACTGTGAGCAAGCCGCCAGAGATGGTGACG
AAGAAGAAGAGGACAGCAAAGAAGCCAAGACAGCTTAAGTCGATCAAGTCTCCAGGTTCT
AAGAAGGTCTTGAGAGCTTCCGCTTCTTGATGGACACGAAAGACGAAGAGGAGGGTGTGT
GAATATGGAGAATAAGGGTTTTCTCTGTAAAATAGTTGACTCTGTTTTTGGTTTCGGGGT
TACTCCTTCTTTAGGGCTTATAAGGATAATGAGTCATGGTATGTATATAACTACGTACTT
TTCAATGTAATATATGCAATAATTTGTGGCTGTATAGCCCTACGACTGCGGAGAGACC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

CO CL6778Contig1 740 2 3 U
TAATCCAACATATATTGCTTATTTCCATCAAAATCAACCCTAATGTAAAACCTCTTCAGG
ATTATCCACTCGCTAATCAAGAAAGTGTGAAGAATATATATATGTATAACAAACAAACTC
AGTTGAATTTACCAATCTCCATTTTCTTCTTAATCGCTCGTTGCCCATGGTATATGAATG
AATCAACTATTCCTGATACCGTGAATATACCTCCTACTATAGCACAAACATTTGTTAGGA
AGTGCAAGGACTCCACATGCTGCTCCTCAAATATCACCTTAATTGGGGACAGATCATAGT
AGAAGAAAACACCAGGAGGTGATTGCATTCGACCTGCTTCCATTTTCTGGAAATGTTCCG
TCACAGAAAACTGGTTTGATTGAATAGTATGCCCGTGAACATCAGTGTATATGCTTGGTA
CCACCTTGATGAAATATTGATACACGCCATTCTGCTTCTCCTGGTTCCACTGAACACCAT
CTAGAGGGTTCACTACACCGGGGAAAAAGTCTCCAAAGGCCAGCCTGTTAACCTTGTGGG
TAATATTGTAGTTGCCCTGCTGGAAGAACATGAGATCACCAAACTGAAAACCGGATTGAT
GAAAGCTTTGTCCCGGAAGAAAATGAAAATTGCCAGCGACTTTGTTCACTTCCAAGAAAC
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TACACTGGTCGATAGATTCC


BQ
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AF RS1DI39JQ U 2
AF RS1DI39TF C 1
BS 1 1 RS1DI39TF
BS 2 654 RS1DI39JQ
BS 655 740 RS1DI39TF

RD RS1DI39JQ 653 0 0
AATCCAACATATATTGCTTATTTCCATCAAAATCAACCCTAATGTAAAACCTCTTCAGGA
TTATCCACTCGCTAATCAAGAAAGTGTGAAGAATATATATATGTATAACAAACAAACTCA
GTTGAATTTACCAATCTCCATTTTCTTCTTAATCGCTCGTTGCCCATGGTATATGAATGA
ATCAACTATTCCTGATACCGTGAATATACCTCCTACTATAGCACAAACATTTGTTAGGAA
GTGCAAGGACTCCACATGCTGCTCCTCAAATATCACCTTAATTGGGGACAGATCATAGTA
GAAGAAAACACCAGGAGGTGATTGCATTCGACCTGCTTCCATTTTCTGGAAATGTTCCGT
CACAGAAAACTGGTTTGATTGAATAGTATGCCCGTGAACATCAGTGTATATGCTTGGTAC
CACCTTGATGAAATATTGATACACGCCATTCTGCTTCTCCTGGTTCCACTGAACACCATC
TAGAGGGTTCACTACACCGGGGAAAAAGTCTCCAAAGGCCAGCCTGTTAACCTTGTGGGT
AATATTGTAGTTGCCCTGCTGGAAGAACATGAGATCACCAAACTGAAAACCGGATTGATG
AAAGCTTTGTCCCGGAAGAAAATGAAAATTGCCAGCGACTTTGTTCACTTCCA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RS1DI39TF 740 0 0
TAATCCAACATATATTGCTTATTTCCATCAAAATCA*CCCTAATGTAAAAC*TCTTCAGG
ATTATCCACTCGCTAATCAAGAAAGTGTGAAGAATATATATATGTATAACAAACAAACTC
AGTTGAATTTACCAATCTCCATTTTCTTCTTAATCGCTCGTTGCCCATGGTATATGAATG
AATCAACTATTCCTGATACCGTGAATATACCTCCTACTATAGCACAAACATTTGTTAGGA
AGTGCAAGGACTCCACATGCTGCTCCTCAAATATCACCTTAATTGGGGACAGATCATAGT
AGAAGAAAACACCAGGAGGTGATTGCATTCGACCTGCTTCCATTTTCTGGAAATGTTCCG
TCACAGAAAACTGGTTTGATTGAATAGTATGCCCGTGAACATCAGTGTATATGCTTGGTA
CCACCTTGATGAAATATTGATACACGCCATTCTGCTTCTCCTGGTTCCACTGAACACCAT
CTAGAGGGTTCACTACACCGGGGAAAAAGTCTCCAAAGGCCAGCCTGTTAACCTTGTGGG
TAATATTGTAGTTGCCCTGCTGGAAGAACATGAGATCACCAAACTGAAAACCGGATTGAT
GAAAGCTTTGTCCCGGAAGAAAATGAAAATTGCCAGCGACTTTGTTCACTTCCAAGAAAC
CGTGAACATTACAACCTTCACCTTCTTCGTCTTTCACCTTTTGCACATAGCCTTCTCTTT
TACACTGGTCGATAGATTCC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL6779Contig1 1021 2 4 U
GGTACACAAACTGAGTGAGCAGTGGGATAAGGATAGCTCCAAGAACAGCTACTTTTCTCC
AATCCGGTGAAGAAACAAACGAATCAGCGATTGCTAGAGCCACGATCCCAATCAAACCGA
GGTAAACGTTCCTTCTTGACTCTGATCCTGCACTTTCTTTGGTGACCTCTTGTATTCTCT
CAGTCTCCTCTTTAGCTTTCTCTGCATCCACAGGCTTCTTATCACGTAAGCTCTTGAAGA
ACAATCCTTCGTTCCTCTCTTCCACAATCTTCTCTTCAAACTCGGCCAACTTGTTATCGT
TCTCCTCTATCTCCAATCTGTTTAATCCTACAGATTCCTCAAAAGCTTGCATCTTGCTCT
CGATGTTCTCTAGTATCTGCTCAATCACCAAGAAACAAAAGCAAACAATGTCAGCTTATG
TATCTCTCTGTTCATGCAAGATCATCGAGCAAATCAATGTCTCTGGAGCTTAAGCCATGA
AAAAAGGCAAAAGTGAGGATCTTTTAGAACTGATACAATACCCTTGAGCTTGCTTCGTCG
AGGTCTTTCATGGCGTCTTCTCCAACTTTGTCAAACTCAGCGTTGGCTTCTTCAGCAAAC
TTGGTGAGATAATCTGATCGTTCGTCCAAGAAATCAGTTAAACGGACCTTCGATGTCTGA
AGCATGGCGATCCTGGCTAAGAGCTCTTGTCTCTGTGTATCTCCTTCTGGTTTCGGAGGA
TCCGGACCAGACTCTGAGTCAGAGTTTCCATCTCTGGATTTCGAGAGACAGAGGAATTGG
GTTCGAGAAATGAAATGTCTTGGGGGATTGAACAGAACATGAAAGTTTGGTGTTAGAGTT
GTCTGAAATGTTTGGAGTGTGTTCATCATCTTGTTTGTTTCTGAAGAAGAAGAAGGTCGA
GAGTAACCGCTCGTTCTTTAATTTGGTTTGTGCATTATCCAAAACCAGTTCTGTGTTTTA
ATGTATTTACACAAAATACCCTGTTTTCACGGATTATTATACTTAAGAGTCTCTTACTTT
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RS1E322TF U 1
AF RS1E322JQ C 317
BS 1 628 RS1E322TF
BS 629 629 RS1E322JQ
BS 630 647 RS1E322TF
BS 648 1021 RS1E322JQ

RD RS1E322TF 647 0 0
GGTACACAAACTGAGTGAGCAGTGGGATAAGGATAGCTCCAAGAACAGCTACTTTTCTCC
AATCCGGTGAAGAAACAAACGAATCAGCGATTGCTAGAGCCACGATCCCAATCAAACCGA
GGTAAACGTTCCTTCTTGACTCTGATCCTGCACTTTCTTTGGTGACCTCTTGTATTCTCT
CAGTCTCCTCTTTAGCTTTCTCTGCATCCACAGGCTTCTTATCACGTAAGCTCTTGAAGA
ACAATCCTTCGTTCCTCTCTTCCACAATCTTCTCTTCAAACTCGGCCAACTTGTTATCGT
TCTCCTCTATCTCCAATCTGTTTAATCCTACAGATTCCTCAAAAGCTTGCATCTTGCTCT
CGATGTTCTCTAGTATCTGCTCAATCACCAAGAAACAAAAGCAAACAATGTCAGCTTATG
TATCTCTCTGTTCATGCAAGATCATCGAGCAAATCAATGTCTCTGGAGCTTAAGCCATGA
AAAAAGGCAAAAGTGAGGATCTTTTAGAACTGATACAATACCCTTGAGCTTGCTTCGTCG
AGGTCTTTCATGGCGTCTTCTCCAACTTTGTCAAACTCAGCGTTGGCTTCTTCAGCAAAC
TTGGTGAGATAATCTGATCGTTCGTCCA*GAAATCAGTTAAACGGAC

QA 1 647 1 647
DS 

RD RS1E322JQ 705 0 0
TCTGTTTAATCCTACAGATTCCTCAAAAGCTTGCATCTTGCTCTCGATGTTCTCTAGTAT
CTGCTCAATCACCAAGAAACAAAAGCAAACAATGTCAGCTTATGTATCTCTCTGTTCATG
CAAGATCATCGAGCAAATCAATGTCTCTGGAGCTTAAGCCATGAAAAAAGGCAAAAGTGA
GGATCTTTTAGAACTGATACAATACCCTTGAGCTTGCTTCGTCGAGGTCTTTCATGGCGT
CTTCTCCAACTTTGTCAAACTCAGCGTTGGCTTCTTCAGCAAACTTGGTGAGATAATCTG
ATCGTTCGTCCAAGAAATCAGTTAAACGGACCTTCGATGTCTGAAGCATGGCGATCCTGG
CTAAGAGCTCTTGTCTCTGTGTATCTCCTTCTGGTTTCGGAGGATCCGGACCAGACTCTG
AGTCAGAGTTTCCATCTCTGGATTTCGAGAGACAGAGGAATTGGGTTCGAGAAATGAAAT
GTCTTGGGGGATTGAACAGAACATGAAAGTTTGGTGTTAGAGTTGTCTGAAATGTTTGGA
GTGTGTTCATCATCTTGTTTGTTTCTGAAGAAGAAGAAGGTCGAGAGTAACCGCTCGTTC
TTTAATTTGGTTTGTGCATTATCCAAAACCAGTTCTGTGTTTTAATGTATTTACACAAAA
TACCCTGTTTTCACGGATTATTATACTTAAGAGTCTCTTACTTTC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL6780Contig1 770 2 3 U
GGCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTCCTCTTCCTCTTT
CTCTTCCGAAAATAAACCTGGTTAAGCTTATTACAGCTTATCCAGATTTTTCTTGTATTA
TATTTTTTTCTGAGTCTAGCTTTCAAAATAAAGAATCTCAACTTAAAAGCTAGACGGACT
CATTTTGTAAAGCAGGAAGCTTTGGTGAAAACAGTTAATCTTTTAGACGTACCATTCTAG
AACATTTACAGTATTGTACTTTTCCAATCTTCAGAGATAAGCTTAGCTTGTCATCCGATT
CTAGATCTCTTCTTTTTTTGAATAATCCGGTGTATCCTGGCATCCACCGAAGTGAATTCA
GACTAGCGGCGAGTGTCCGTATCAGCCTACATTATCGGCCGGAGTACGCCTCGGTCACGG
ACGCTGGGGGAGCCCAGATTTTAAATTTAACCCCCAGTGGCCAGCGGGATTGAACCCGGG
TTCGTATTGGGGCCGAAGCTCCCTCAAGACCACTAGACCGTCCTCGCTTGGTTGATTCTA
GATCTCTTCAGTTACAGTTCATCAAGATTATTGAGCTAATATGTGTCTCAAGTTAGAAAA
CTCCAAACTTTGAAGCTAGCAATTGTTAAGTTTAGGAGACTTTGGCTTTCTTTTGAGTTA
ATCAATATCTATACTATAAAACGTAATGTCATTTTGTGAGGTGTCCTTATATTTCAACAA
TATTTGCAAATCTCTGCCATTGAAATATTTAAAATCTATGGTTTTTATTC


BQ
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AF RS1CF59TF U 1
AF RS1CF59JQ C 122
BS 1 700 RS1CF59TF
BS 701 701 RS1CF59JQ
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TATTTTTTTCTGAGTCTAGCTTTCAAAATAAAGAATCTCAACTTAAAAGCTAGACGGACT
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CTAGATCTCTTCTTTTTTTGAATAATCCGGTGTATCCTGGCATCCACCGAAGTGAATTCA
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TTCGTATTGGGGCCGAAGCTCCCTCAAGACCACTAGACCGTCCTCGCTTGGTTGATTCTA
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DS 

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ACATTTACAGTATTGTACTTTTCCAATCTTCAGAGATAAGCTTAGCTTGTCATCCGATTC
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ACTAGCGGCGAGTGTCCGTATCAGCCTACATTATCGGCCGGAGTACGCCTCGGTCACGGA
CGCTGGGGGAGCCCAGATTTTAAATTTAACCCCCAGTGGCCAGCGGGATTGAACCCGGGT
TCGTATTGGGGCCGAAGCTCCCTCAAGACCACTAGACCGTCCTCGCTTGGTTGATTCTAG
ATCTCTTCAGTTACAGTTCATCAAGATTATTGAGCTAATATGTGTCTCAAGTTAGAAAAC
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TCAATATCTATACTATAAAACGTAATGTCATTTTGTGAGGTGTCCTTATATTTCAACAAT
ATTTGCAAATCTCTGCCATTGAAATATTTAAAATCTATGGTTTTTATTC

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DS74TF U 1
AF RS1DS74JQ C 166
BS 1 665 RS1DS74TF
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GAGTAGCATCTGATGAGGACGTATTTGGCAACGAAGTCTTTACTCTGGAAGGGTTTTTAT
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DS 

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TTGTTTTCTTATTTGTTTTCGGAGTGTGGGAATCATCTTATCTAACATGAAC

QA 1 592 1 592
DS 



AS 1 2

CO CL6782Contig1 779 2 8 U
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CT85TF U 1
AF RS1CB16TF U 42
BS 1 170 RS1CT85TF
BS 171 171 RS1CB16TF
BS 172 297 RS1CT85TF
BS 298 298 RS1CB16TF
BS 299 488 RS1CT85TF
BS 489 489 RS1CB16TF
BS 490 714 RS1CT85TF
BS 715 779 RS1CB16TF

RD RS1CT85TF 714 0 0
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AAACAATAGCGGGAGGAAGAGCGGGTGAGAAAGAGGAAGGACTCGAAAAACACATTGGTT
AGAGTCTAAAACTAGCTCAAACGCTGTCGTTTCTGCTCATATTCATCTCCGGAATCATCA
TCCGCCTCGCCGCTAGCTCCCACATCGATCGCTACTTCAATTCTCTACCCACCATGTTCT
TCTCATCAGAAACGATTCCTTTCACGTCCTCTGATTACTCCAACTGCACGTTCATCCGCC
GTGACTGCAAAGGCGAGGACGGCGACGGCAAGGCGGAGAAACCAAAGTTCCGAGATTGCT
GGAGCGTCGATGGGTTTGTCCGTCCTGAGAATCTGAGCCATGGAATGAGTGACGATGAGC
TGTTCTGGAGAGCGTCGATGGTTCCAGGTAAATGAGGAGTATCCGTAGCCTTCTTGTTTC
TGACGAGAGGGCCTTTGCCTCTGCTTCCGCTGTGGGAGAGGTTTTTCAAAAGGCAACGAG
AAGTACTTGTCGGTTTATGTTCATACTCCTCCGGGGGTGCGACATGAATGTCTCGAGTGA
TTCACCTTTTTACCACCGGCAGATTCCTAGCCAGAAAGTTGCATGGGGATCCCCAACCTA
CTGACCGATGCAGAGAAGCGTCTACTAGCCAACGCATTACTCGACTTCTCAAAC

QA 1 714 1 714
DS 

RD RS1CB16TF 738 0 0
GGG
ATTTGAGTTATCTCTGAAACAATAGCGGGAGGAAGAGCGGGTGAGAAAGAGGAAGGACTC
GAAAAACACATTGGTTAG**TCTAAAACTAGCTCAAACGCTGTCGTTTCTGCTCATATTC
ATCTCCAGAATCATCATCCGCCTCGCCGCTAGCTCCCACATCGATCGCTACTTCAATTCT
CTACCCACCATGTTCTTCTCATCAGAAACGATTCCTTTCACGTCCTCTGATTACTCCAAC
TGCACGTTCATCCACCGTGACTGCAAAGGCGAGGACGGCGACGGCAAGGCGGAGAAACCA
AAGTTCCGAGATTGCTGGAGCGTCGATGGGTTTGTCCGTCCTGAGAATCTGAGCCATGGA
ATGAGTGGCGATGAGCTGTTCTGGAGAGCGTCGATGGTTCCAGGTAAATGAGGAGTATCC
GTAGCCTTCTTGTTTCTGACGAGAAGGCCTTTGCCTCTGCTTCCGCTGTGGGAGAGGTTT
TTCAAAAGGCAACGAGAAGTACTTGTCGGTTTATGTTCATACTCCTCCGGGGGTGCGACA
TGAATGTCTCGAGTGATTCACCTTTTTACCACCGGCAGATTCCTAGCCAGAAAGTTGCAT
GGGGATCCCCAACCTACTGACCGATGCAGAGAAGCGTCTACTAGCCAACGCATTACTCGA
CTTCTCAAACGAGCGTTTTGTTCTTCTCTCAGAAAAGCTGTGTCCCGTCCACAACTTTCA
CAACCGTCTACTCTT

QA 4 738 4 738
DS 



AS 1 2

CO CL6783Contig1 747 2 2 U
GGATCTTGGAACCGTATCTCTTTTCATCGTTCTCCTAATTTTAGGGTAATCATCATCAGC
GTCCATGTCGGGGAACACCAATTGCACCGTCTACATAGGGAACTTGGACGAGAGAGTGAG
CGATAGGGTGCTGTATGACATCTTGATCCAAGCTGGGAGAGTAATCGATCTACACATCCC
TCGCGATAAAGAAACCGATAAACCAAAAGGCTTCGCGTTCGCAGAGTATGAGACTGAAGA
GATCGCCGATTACGCCGTCAAGCTCTTCTCCGGTCTTGTCTCTCTCTACAATCGAACTCT
CAAATTCGCCATATCTGGACAAGACAAAGCACAGTCAGGTTCCGGTCACAGGACAAGACC
TCAGTCTCTGAGTTTCGATCATCACCATTCGGAGAGATTCTCATCACAGTTGATGTCTTC
ACCTTCTCCTATGCCTCTTGATTACACTCAAGAGCCACCTCCGCCAGGGGTTTCGAATGG
AGCCGGTTTGGAGTACAGTAGAAGGGTTCTGAGTTCGGCACTAGATATTAACCCGTCAAG
ACCGGGCCGCTACTGAACTAGTGTGAGAACACTACTTTTCTTTGCTTTTTGTTGTTGTGA
TAAATTAATATGATAATCAGTGTGTCTCTTGATTCATCCTGAAAAGAAAGAAAGAAAGAA
CTCGTGATTGTAATCATCCAAGGAAGTTTAGTAGAACTGATGTAACCTTGTTTTTTTATT
AAAAAGACAGATCTTTCTGTGTTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CU87TF U 1
AF RS1CU87JQ C 30
BS 1 678 RS1CU87TF
BS 679 747 RS1CU87JQ

RD RS1CU87TF 678 0 0
GGATCTTGGAACCGTATCTCTTTTCATCGTTCTCCTAATTTTAGGGTAATCATCATCAGC
GTCCATGTCGGGGAACACCAATTGCACCGTCTACATAGGGAACTTGGACGAGAGAGTGAG
CGATAGGGTGCTGTATGACATCTTGATCCAAGCTGGGAGAGTAATCGATCTACACATCCC
TCGCGATAAAGAAACCGATAAACCAAAAGGCTTCGCGTTCGCAGAGTATGAGACTGAAGA
GATCGCCGATTACGCCGTCAAGCTCTTCTCCGGTCTTGTCTCTCTCTACAATCGAACTCT
CAAATTCGCCATATCTGGACAAGACAAAGCACAGTCAGGTTCCGGTCACAGGACAAGACC
TCAGTCTCTGAGTTTCGATCATCACCATTCGGAGAGATTCTCATCACAGTTGATGTCTTC
ACCTTCTCCTATGCCTCTTGATTACACTCAAGAGCCACCTCCGCCAGGGGTTTCGAATGG
AGCCGGTTTGGAGTACAGTAGAAGGGTTCTGAGTTCGGCACTAGATATTAACCCGTCAAG
ACCGGGCCGCTACTGAACTAGTGTGAGAACACTACTTTTCTTTGCTTTTTGTTGTTGTGA
TAAATTAATATGATAATCAGTGTGTCTCTTGATTCATCCTGAAAAGAAAGAAAGAAAGAA
CTCGTGATTGTAATCATC

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1CU87JQ 718 0 0
GTTCT
CTAATTTTAGGGTAATCATCATCAGCGTCCATGTCGGGGAACACCAATTGCACCGTCTAC
ATAGGGAACTTGGACGAGAGAGTGAGCGATAGGGTGCTGTATGACATCTTGATCCAAGCT
GGGAGAGTAATCGATCTACACATCCCTCGCGATAAAGAAACCGATAAACCAAAAGGCTTC
GCGTTCGCAGAGTATGAGACTGAAGAGATCGCCGATTACGCCGTCAAGCTCTTCTCCGGT
CTTGTCTCTCTCTACAATCGAACTCTCAAATTCGCCATATCTGGACAAGACAAAGCACAG
TCAGGTTCCGGTCACAGGACAAGACCTCAGTCTCTGAGTTTCGATCATCACCATTCGGAG
AGATTCTCATCACAGTTGATGTCTTCACCTTCTCCTATGCCTCTTGATTACACTCAAGAG
CCACCTCCGCCAGGGGTTTCGAATGGAGCCGGTTTGGAGTACAGTAGAAGGGTTCTGAGT
TCGGCACTAGATATTAACCCGTCAAGACCGGGCCGCTACTGAACTAGTGTGAGAACACTA
CTTTTCTTTGCTTTTTGTTGTTGTGATAAATTAATATGATAATCAGTGTGTCTCTTGATT
CATCCTGAAAAGAAAGAAAGAAAGAACTCGTGATTGTAATCATCCAAGGAAGTTTAGTAG
AACTGATGTAACCTTGTTTTTTTATTAAAAAGACAGATCTTTCTGTGTTGTTC

QA 6 718 6 718
DS 



AS 1 2

CO CL6784Contig1 647 2 2 U
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ACGCGTCACCGCCATGGCTACATACAAGGTCAAGTTCGTCACTCCAGAAGGTGAGCAAGA
GGTCGAGTGCGACGACGACGTTTACGTCCTCGACGCTGCGGAGGAAGCCGGGATCGACTT
GCCTTACTCTTGCCGTGCTGGTTCTTGCTCGAGCTGTGCAGGTAAAGTTGTGTCTGGTTC
CGTTGACCAGTCTGACCAGAGTTTCCTCGATGATGACCAGATCGCTGAAGGGTTTGTTCT
CACTTGTGCGGCTTATCCTACTTCTGATGTTACCATTGAGACCCACAGAGAAGAAGACGT
TGTTTAAAACAAAAGCTCCATAAACATGCTTTTGATGCTCTCATAATCATTCATGTCTTT
ACATTTTGGGTTGAGTTTGTTGCTACTTGGTAAAATACATTGTTGTCTGTTGTAATCATT
CTTGGTTTGGCCCACCCTTTTGGTAAGATCAATGGATAACAGTTTAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1C027JQ C 1
AF RS1C027TF U 1
BS 1 645 RS1C027TF
BS 646 647 RS1C027JQ

RD RS1C027JQ 647 0 0
GGCACGCCATTTCCACAAGCCACAAAGAAACCAACTCAAAAATGGCCTCAACAGCTCTCT
CAAGCGCCATCGTCGGACATCCTTCCTCCGCCGTCAAACATCTCCCATCAGCCTCCGTTC
CCTCCCCTTAGCCAACACTCAATCCCTCTTCGGTCTCAAATCAGGCACCGCACGCGGCGG
ACGCGTCACCGCCATGGCTACATACAAGGTCAAGTTCGTCACTCCAGAAGGTGAGCAAGA
GGTCGAGTGCGACGACGACGTTTACGTCCTCGACGCTGCGGAGGAAGCCGGGATCGACTT
GCCTTACTCTTGCCGTGCTGGTTCTTGCTCGAGCTGTGCAGGTAAAGTTGTGTCTGGTTC
CGTTGACCAGTCTGACCAGAGTTTCCTCGATGATGACCAGATCGCTGAAGGGTTTGTTCT
CACTTGTGCGGCTTATCCTACTTCTGATGTTACCATTGAGACCCACAGAGAAGAAGACGT
TGTTTAAAACAAAAGCTCCATAAACATGCTTTTGATGCTCTCATAATCATTCATGTCTTT
ACATTTTGGGTTGAGTTTGTTGCTACTTGGTAAAATACATTGTTGTCTGTTGTAATCATT
CTTGGTTTGGCCCACCCTTTTGGTAAGATCAATGGATAACAGTTTAA

QA 1 647 1 647
DS 

RD RS1C027TF 645 0 0
GGCACGCCATTTCCACAAGCCACAAAGAAACCAACTCAAAAATGGCCTCAACAGCTCTCT
CAAGCGCCATCGTCGGACATCCTTCCTCCGCCGTCAAACATCTCCCATCAGCCTCCGTTC
CCTCCCCTTAGCCAACACTCAATCCCTCTTCGGTCTCAAATCAGGCACCGCACGCGGCGG
ACGCGTCACCGCCATGGCTACATACAAGGTCAAGTTCGTCACTCCAGAAGGTGAGCAAGA
GGTCGAGTGCGACGACGACGTTTACGTCCTCGACGCTGCGGAGGAAGCCGGGATCGACTT
GCCTTACTCTTGCCGTGCTGGTTCTTGCTCGAGCTGTGCAGGTAAAGTTGTGTCTGGTTC
CGTTGACCAGTCTGACCAGAGTTTCCTCGATGATGACCAGATCGCTGAAGGGTTTGTTCT
CACTTGTGCGGCTTATCCTACTTCTGATGTTACCATTGAGACCCACAGAGAAGAAGACGT
TGTTTAAAACAAAAGCTCCATAAACATGCTTTTGATGCTCTCATAATCATTCATGTCTTT
ACATTTTGGGTTGAGTTTGTTGCTACTTGGTAAAATACATTGTTGTCTGTTGTAATCATT
CTTGGTTTGGCCCACCCTTTTGGTAAGATCAATGGATAACAGTTT

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 2

CO CL6785Contig1 871 2 6 U
GCATCCAGGTACTGATTATGTCAAACTGTTAGTTTTTGCATTACCATTTTATCTTCAGAA
TCGGCTGGTTGCTAACTGTTTCGTGAAACAGATATTTTCCTAGTGTTATATTTGTTATTT
TTCAAAGGATATACCATAATTGGTGTTGTTAAAACGTTATTATTTTACTGCAAATGGTAT
TTAACTTATTTATCCTTCATAGAGCTGGAAACTTGGTTGTACCAAATGTGTCTACAGAGG
TGAGTGATGTGTCATCTTCGTCTGGACCAGTTAAGCTGGCAGACTTGCAAAGAATTCTGA
ACAACCTCTCTTCTGGTCCTGTAGGTATCCCTGGAGATGAAGAGGAAGGTGAATATTTTC
AAGTTTAGGTATTCTGTTTATTCATTATTTACCTCATCGTCTTCATGTTTTATCTTCCGA
AGGCCTAATATTAGGGGATATCCTGAAGCCTGAGTTGATTATGCCATTGCTTGAGATGTT
ACCGGTACAAGAACGATTGTCTTCCCATTTACCTGAGGGTCACTGTAGGGATGAAGATAT
ACTGGAGTTGTTACAGAGCCCTCCTTTTCGTCAGCAAGTAGATGCATTTACCTACGTACT
TCGCACAGGACAGATAGATTTGACTCAGTTCGGTATCAACCCAAGTAAATATAAGTTCAC
AGTTGTCTCATTCCTTGAGGCACTTGAGGACTCGGTTGCAACGCAATCAAACGACGCAAT
GGATGAGAGTTGATCTTTTCATAATGATTTTGTTTGAAGTTCGACCTTTCAACTAAGAAA
ATCATTTCCGCTGTTCGATGAATTTGGGTTTATGAATTTTGTTGAAGTTTATGTGTTGGG
ATTTTATTTTGTCGAACACGGGTTTTCAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CZ13TF U 1
AF RS1CZ13JQ C 118
BS 1 679 RS1CZ13TF
BS 680 680 RS1CZ13JQ
BS 681 738 RS1CZ13TF
BS 739 739 RS1CZ13JQ
BS 740 771 RS1CZ13TF
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RD RS1CZ13TF 775 0 0
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TTCAAAGGATATACCATAATTGGTGTTGTTAAAACGTTATTATTTTACTGCAAATGGTAT
TTAACTTATTTATCCTTCATAGAGCTGGAAACTTGGTTGTACCAAATGTGTCTACAGAGG
TGAGTGATGTGTCATCTTCGTCTGGACCAGTTAAGCTGGCAGACTTGCAAAGAATTCTGA
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AAGTTTAGGTATTCTGTTTATTCATTATTTACCTCATCGTCTTCATGTTTTATCTTCCGA
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ACCGGTACAAGAACGATTGTCTTCCCATTTACCTGAGGGTCACTGTAGGGATGAAGATAT
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TCGCACAGGACAGATAGATTTGACTCAGTTCGGTATCAACCCAAGTAAATATAAGTTCAC
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GGATGAGAGTTGATCTTT*CATAATGATTTTGTTTGAAGTTCGACCTTTCA
CTAA

QA 1 771 1 771
DS 

RD RS1CZ13JQ 754 0 0
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TATTTAACTTATTTATCCTTCATAGAGCTGGAAACTTGGTTGTACCAAATGTGTCTACAG
AGGTGAGTGATGTGTCATCTTCGTCTGGACCAGTTAAGCTGGCAGACTTGCAAAGAATTC
TGAACAACCTCTCTTCTGGTCCTGTAGGTATCCCTGGAGATGAAGAGGAAGGTGAATATT
TTCAAGTTTAGGTATTCTGTTTATTCATTATTTACCTCATCGTCTTCATGTTTTATCTTC
CGAAGGCCTAATATTAGGGGATATCCTGAAGCCTGAGTTGATTATGCCATTGCTTGAGAT
GTTACCGGTACAAGAACGATTGTCTTCCCATTTACCTGAGGGTCACTGTAGGGATGAAGA
TATACTGGAGTTGTTACAGAGCCCTCCTTTTCGTCAGCAAGTAGATGCATTTACCTACGT
ACTTCGCACAGGACAGATAGATTTGACTCAGTTCGGTATCAACCCAAGTAAATATAAGTT
CACAGTTGTCTCATTCCTTGAGGCACTTGAGGACTCGGTTGCAACGCAATCAAACGACGC
AATGGATGAGAGTTGATCTTTTCATAATGATTTTGTTTGAAGTTCGACCTTTCAACTAAG
AAAATCATTTCCGCTGTTCGATGAATTTGGGTTTATGAATTTTGTTGAAGTTTATGTGTT
GGGATTTTATTTTGTCGAACACGGGTTTTCAAGC

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

CO CL6786Contig1 736 2 2 U
TCAAACCCTAATCCAATCCCGCGACGCCAATCTCCCGAAACCAATGTCCAATCTCCGAGG
AGTCCTGACCAACGTATCTTCCTACTGTCAACGTTCCTTCTCTCAATCGGTTCTGCTATG
GCGGCGATCCGTAGTCAACCCTACTCCCAACAACAACATCGCTCAAACCCAACACAGACA
CATCTCCACGACGCTTACGAAACCGGCGTCGTCGAAACACAGCGGTACGGAGCAAGGCGT
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GAAGCTGTACAAGGCCTTCTGCAAAGATCCGGAGCTTCCTAGCGAGATGAGAGAGAAGAA
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TGTGTTCACTGGTCGGTCTCGGTCCGTGACGGAGCTGTTTCGGATGTCTAGGATCTGTTT
CCGTGGGTTAGCGAATAAAGGGGAGTTGATGGGTATAAAGAAATCGTCTTGGTAAGGGGG
CTTTTTTTTTTGCAAGGGAAGTGACCGAACCATACAAGAATCAAACAACTTTTGGCGGCT
ACTGTGTAATGATTCATTACAGACACTTTAGTTTTGCTTATAACACAAAGGGCTGCTTCC
TTTTGTTATGATCTCGTTTTAAAGATTGTGGAAGTTATTCTAGCGATTCTCGTTGAATAA
GATTTAACACTTGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GC92TF U 1
AF RS1GC92JQ C 69
BS 1 716 RS1GC92TF
BS 717 736 RS1GC92JQ

RD RS1GC92TF 721 0 0
TCAAACCCTAATCCAATCCCGCGACGCCAATCTCCCGAAACCAATGTCCAATCTCCGAGG
AGTCCTGACCAACGTATCTTCCTACTGTCAACGTTCCTTCTCTCAATCGGTTCTGCTATG
GCGGCGATCCGTAGTCAACCCTACTCCCAACAACAACATCGCTCAAACCCAACACAGACA
CATCTCCACGACGCTTACGAAACCGGCGTCGTCGAAACACAGCGGTACGGAGCAAGGCGT
GAAGCGAAACAGCGCGGATCACAGACGCAGACTTCTCGCGGCGAGATTCGAGCTGAGAAG
GAAGCTGTACAAGGCCTTCTGCAAAGATCCGGAGCTTCCTAGCGAGATGAGAGAGAAGAA
CCGTTACAAGCTGTCGAAACTGCCGAGGAACAGTGCGTTCACGAGAATTAGGAACAGGTG
TGTGTTCACTGGTCGGTCTCGGTCCGTGACGGAGCTGTTTCGGATGTCTAGGATCTGTTT
CCGTGGGTTAGCGAATAAAGGGGAGTTGATGGGTATAAAGAAATCGTCTTGGTAAGGGGG
CTTTTTTTTTTGCAAGGGAAGTGACCGAACCATACAAGAATCAAACAACTTTTGGCGGCT
ACTGTGTAATGATTCATTACAGACACTTTAGTTTTGCTTATAACACAAAGGGCTGCTTCC
TTTTGTTATGATCTCGTTTTAAAGATTGTGGAAGTTATTCTAGCGATTCTCGTTGA
TAGAT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RS1GC92JQ 668 0 0
CCAACGTATCTTCCTACTGTCAACGTTCCTTCTCTCAATCGGTTCTGCTATGGCGGCGAT
CCGTAGTCAACCCTACTCCCAACAACAACATCGCTCAAACCCAACACAGACACATCTCCA
CGACGCTTACGAAACCGGCGTCGTCGAAACACAGCGGTACGGAGCAAGGCGTGAAGCGAA
ACAGCGCGGATCACAGACGCAGACTTCTCGCGGCGAGATTCGAGCTGAGAAGGAAGCTGT
ACAAGGCCTTTTGCAAAGATCCGGAGCTTCCTAGCGAGATGAGAGAGAAGAACCGTTACA
AGCTGTCGAAACTGCCGAGGAACAGTGCGTTCACGAGAATTAGGAACAGGTGTGTGTTCA
CTGGTCGGTCTCGGTCCGTGACGGAGCTGTTTCGGATGTCTAGGATCTGTTTCCGTGGGT
TAGCGAATAAAGGGGAGTTGATGGGTATAAAGAAATCGTCTTGGTAAGGGGGCTTTTTTT
TTTGCAAGGGAAGTGACCGAACCATACAAGAATCAAACAACTTTTGGCGGCTACTGTGTA
ATGATTCATTACAGACACTTTAGTTTTGCTTATAACACAAAGGGCTGCTTCCTTTTGTTA
TGATCTCGTTTTAAAGATTGTGGAAGTTATTCTAGCGATTCTCGTTGAATAAGATTTAAC
ACTTGTCG

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL6787Contig1 1080 2 6 U
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GCATCAATTCATGGGTGGTATATGCAAGAAGCTTAAGGGAAAGGTAACAGGAGAGGTTGA
GGCTATATCTCTTGTTAAAGGGATGGAAGTCAAGAAGGAAGGTCCCTGCATGATCTCTAC
TCTCATCTCCAAGGAACTTGGTATCAACTGTTGTGTTCTTATGGGCGCTAACATCGCCAA
CGAGATTGCTGTGGATAAGTTTAGCGAAGCAACGGTTGGATACAGAGAGAGTAAAGAAAT
AGCTGACACTTGGGTTCAGTTGTTTAGTACTCCCTATTTTATGGTTACACCGGTTCATGA
TGTTGAAGGAGTAGAGTTGTGTGGGACCTTGAAGAATGTTGTGGCTATTGCAGCGGGTTT
CGTTGATGGTTTGGATATGGGTAATAACACAAAGGCTGCAATCATGAGGATTGGTTTGAG
AGAGATGAGAGCACTCTCGAAGCTTCTGTTTCCACCTGTTAAAGACAGTACTTTCTTCGA
GAGCTGTGGTGTAGCAGATGTCATAACAACTTGCTTAGGAGGAAGAAACAGAAGAGTAGC
AGAAGCATTTGCCCAAAGTGGAGGAAAAAGGTCTTTTGATGAGCTTGAAGCAGAGATGCT
ACAAGGGCAAAAGCTACAGGGTGTTTCCACGGCAAGAGAGGTCTACGAGGTCTTGAACCA
CTGTGGATGGATGGAGATGTTTCCGCTGTTTTCAACGGTTCACCAAATCTGCACAGGTCG
TCTTAAACCTGAAGCCATTGTTCATTACCGTGACCACAAAGCCTGATGATCACTCTTGAT
GGTCCCATTCATCTGCAATGAATATTTCTGTGTTGATGTAGAAGTTTAACGTTTTTGTTT
CTTTGAGAATGTTTTCTGGTGAGATGGACCTTCTAGCTGGTTTAGAGGATCCTGTTCATT
CAAAGTTTTTGGTCCAATTGAAATTTAATTTGCTTGGATCGAACACGAATACAATCATGT
GCTCAATGTTGTAATCACTGAGTACTGAATTCGTTTATTCAATTTGAAAGATTCACGAAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AO53TFB U 1
AF RS1AO53JQ C 217
BS 1 709 RS1AO53TFB
BS 710 710 RS1AO53JQ
BS 711 857 RS1AO53TFB
BS 858 858 RS1AO53JQ
BS 859 873 RS1AO53TFB
BS 874 1080 RS1AO53JQ

RD RS1AO53TFB 873 0 0
GGCAGGTCCTGACCTTGAAAACGCAGTGAAGGAAGCAAACATGTTGGTTTTTGTTACACC
GCATCAATTCATGGGTGGTATATGCAAGAAGCTTAAGGGAAAGGTAACAGGAGAGGTTGA
GGCTATATCTCTTGTTAAAGGGATGGAAGTCAAGAAGGAAGGTCCCTGCATGATCTCTAC
TCTCATCTCCAAGGAACTTGGTATCAACTGTTGTGTTCTTATGGGCGCTAACATCGCCAA
CGAGATTGCTGTGGATAAGTTTAGCGAAGCAACGGTTGGATACAGAGAGAGTAAAGAAAT
AGCTGACACTTGGGTTCAGTTGTTTAGTACTCCCTATTTTATGGTTACACCGGTTCATGA
TGTTGAAGGAGTAGAGTTGTGTGGGACCTTGAAGAATGTTGTGGCTATTGCAGCGGGTTT
CGTTGATGGTTTGGATATGGGTAATAACACAAAGGCTGCAATCATGAGGATTGGTTTGAG
AGAGATGAGAGCACTCTCGAAGCTTCTGTTTCCACCTGTTAAAGACAGTACTTTCTTCGA
GAGCTGTGGTGTAGCAGATGTCATAACAACTTGCTTAGGAGGAAGAAACAGAAGAGTAGC
AGAAGCATTTGCCCAAAGTGGAGGAAAAAGGTCTTTTGATGAGCTTGAAGCAGAGATGCT
ACAAGGGCAAAAGCTACAGGGTGTTTCCACGGCAAGAGAGGTCTACGAG*TCTTGAACCA
CTGTGGATGGATGGAGATGTTTCCGCTGTTTTCAACGGTTCACCAAATCTGCACAGGTCG
TCTTAAACCTGAAGCCATTGTTCATTACCGTGACCACAAAGCCTGATGATCACTCTTGAT
GGTCCCATTCATCTGCA*TGAATATTTCTGTGT

QA 1 873 1 873
DS 

RD RS1AO53JQ 864 0 0
TCTTATGGGCGCTAACATCGCCAACGAGATTGCTGTGGATAAGTTTAGCGAAGCAACGGT
TGGATACAGAGAGAGTAAAGAAATAGCTGACACTTGGGTTCAGTTGTTTAGTACTCCCTA
TTTTATGGTTACACCGGTTCATGATGTTGAAGGAGTAGAGTTGTGTGGGACCTTGAAGAA
TGTTGTGGCTATTGCAGCGGGTTTCGTTGATGGTTTGGATATGGGTAATAACACAAAGGC
TGCAATCATGAGGATTGGTTTGAGAGAGATGAGAGCACTCTCGAAGCTTCTGTTTCCACC
TGTTAAAGACAGTACTTTCTTCGAGAGCTGTGGTGTAGCAGATGTCATAACAACTTGCTT
AGGAGGAAGAAACAGAAGAGTAGCAGAAGCATTTGCCCAAAGTGGAGGAAAAAGGTCTTT
TGATGAGCTTGAAGCAGAGATGCTACAAGGGCAAAAGCTACAGGGTGTTTCCACGGCAAG
AGAGGTTTACGAGGTCTTGAACCACTGTGGATGGATGGAGATGTTTCCGCTGTTTTCAAC
GGTTCACCAAATCTGCACAGGTCGTCTTAAACCTGAAGCCATTGTTCATTACCGTGACCA
CAAAGCCTGATGATCACTCTTGATGGTCCCATTCATCTGCAATGAATATTTCTGTGTTGA
TGTAGAAGTTTAACGTTTTTGTTTCTTTGAGAATGTTTTCTGGTGAGATGGACCTTCTAG
CTGGTTTAGAGGATCCTGTTCATTCAAAGTTTTTGGTCCAATTGAAATTTAATTTGCTTG
GATCGAACACGAATACAATCATGTGCTCAATGTTGTAATCACTGAGTACTGAATTCGTTT
ATTCAATTTGAAAGATTCACGAAC

QA 1 864 1 864
DS 



AS 1 2

CO CL6788Contig1 702 2 16 U
GGGACCAAACATGAAGAAGAGGATCGATCCCCCTCTCTCTAATTAGAATATTCCTCCTAA
CGCCGGATCTCTCTTTCTTGGGGGAAGCGCAAAAATCAATGGAGGAAGATCCGATACCAT
CTCCGTACGATCTTCTCTTTGAAGCTCTCTGGCTAATCCCAATTCGTCACTATCTCTACG
CTCTCTTCATTATCTGGACCGTCTTCTTCTACAACTACGTGGAGTTCCATTTCCCTGGTG
ATGTGGCTCTTCAGTATTTCAGATGTCGAGTCAATCTCATCTACAACCCTGATTCTCCTA
TTTACCACGGTGTTGTCTCTCGCTGCCCGACTCTCCACGGCCGATATGTGGCGACGCCAT
GGTTAGCGAGTCCCCATCTTCAGACTTGTTTCCTTAATTTCCATGGATTGCCTCCCGTTT
TCACCTACACAAGAAAGCTCTTTCGTCCTTCTGATGGTGGAACCATTGCTTTGGATTGGC
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TTATTCCAGGCCTAACTAGTGATTCTTCTTCTGCATATCTTAAGCACCTTGCCTACAACA
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TTACTTCCGATTGCTTCTATAATGCTGGATGGACAGAGGATG


BQ
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15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1FS04TF U 1
AF RS1B147TF U 9
BS 1 59 RS1FS04TF
BS 60 60 RS1B147TF
BS 61 111 RS1FS04TF
BS 112 112 RS1B147TF
BS 113 148 RS1FS04TF
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BS 150 214 RS1FS04TF
BS 215 215 RS1B147TF
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BS 235 235 RS1B147TF
BS 236 267 RS1FS04TF
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BS 673 673 RS1B147TF
BS 674 701 RS1FS04TF
BS 702 702 RS1B147TF

RD RS1FS04TF 701 0 0
GGGACCAAACATGAAGAAGAGGATCGATCCCCCTCTCTCTAATTAGAATATTCCTCCTAT
CGCCGGATCTCTCTTTCTTGGGGGAAGCGCAAAAATCAATGGAGGAAGATCTGATACCAT
CTCCGTACGATCTTCTCTTTGAAGCTCTTTGGCTAATCCCAATTCGTCACTATCTCTACG
CTCTCTTCATTATCTGGACCGTCTTCTTCTACAATTACGTGGAGTTCCATTTCCTTGGTG
ATGTGGCTCTTCAGTATTTCAGATGTCTAGTCAATCTCATCTACAACCCTGATTCTCCTA
TTTACCACGGTGTTGTCTCTCGCTGCCCGACTCTCCACGGCCGATATGTGGCGACGCCAT
GGTTAGCGAGTCCCCATCTTCAGACTTGTTTCCTTAATTTCCATGGATTGCCTCCCGTTT
TCACCTACACAAGAAAGCTCTTTCGTCCTTCTGATGGTGGAACCATTGCTTTGGATTGGC
TTACCAACTCTCATGTTCTTGATGAAATCAGTAAAGAAGACACAACTCCCATTGCTGTTG
TTATTCCAGGCCTAACTAGTGATTCTTCTTCTGCATATCTTAAGCACCTTGCCTACAACA
CTGCAAAGTCCGGTTGGAATGTTGTTATTAGTAACCATAGAGGATTGGGTGGTGTTTCTG
TTACTTCCGATTTCTTCTATAATGCTGGATGGACAGAGGAT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RS1B147TF 694 0 0
GG
ATGAAGAAGAGGATCGATCCCTCTCTCTCTAATTAGAATATTCCTCCTAACGCCGGATCT
CTCTTTCTTGGGGGAAGCGCAAAAATCAATGGAGGAAGATCCGATCCCATCTCCGTACGA
TCTTCTCTTTGAAGCTCTCTGGCTAATCCCAATTCGTCACTATCTCTACGCTCTCTTCAT
TATCTGGACCGTCTTCTTCTACAACTTCGTGGAGTTCCATTTCCCTGGTGATGTGGTTCT
TCAGTATTTCAGATGTGGAGTCAATCTCATCTACAACCCTGATTCTCCTATTTTCCACGG
TGTTGTCTCTCGCTGCCCGACTCTCCACGGCCGATATGTGGCGACGCCATGGTTAGCGAG
TCCTCATCTTCAGACTTGTTTCCTTAATTTCCATGGATTGCCTCCCGTTTTCACCTACAC
AAGAAAGCTCTTTCGTCCTTCTGATGGTGGAACCATTGCTTTGGATTGGCTTACCAACTC
TCATGTTCTTGATGAAATCAGTAAAGAAGACACAACTCCCATTGCTGTTGTTATTCCAGG
CCTAACTAGTGATTCTTCTTCTGCATATCTTAAGCACCTTGCTTACAACACTGCAAAGTC
CGGTTGGAATGTTGTTATTAGTAACCATAGAGGATTGGGTGGTGTTTCTTTTACTTCCGA
TTGCTTCTATAATGCTGGATGGACAGAGGATG

QA 3 694 3 694
DS 



AS 1 2

CO CL6789Contig1 1042 2 6 U
GGGGGAATCACGAATTGAACTCGTCCAATCTCCCCATGTAATAAAAGGAAAACCGTATTA
TAACTAAGTCAATCAAAAGAGTAAGTTTGATATACCTCATCAAATAGGTAAACAAAAGAT
CAAGTCTCTGTGAATTAGGGTTTGCTTGGCCGTCAAACAGAAGGAAGGTCTGATACGAAA
CTCTATTTGATTTTCAAACAGTAAAACGTTGATAACATTAGTCTCCTTGGATTTGGGAGG
TTTCGGGGAGGTCTGGTAAGAAACTTGATTTGATTACTTGGGTCTATTTTCTTGTTTTTT
TTTCATCTAGAGAGAGGATCTTAATTTGTTGTAACTAAACTTTGTTTGATGTTTCATCTT
CAGCAGGAGAAATATCAAAAGGATCATATGAAAAACCTAAGTAAATTGCCTGATGATCTA
TTGATAAAGATTTTGTCATTGCTTCCAACAAAAGAGTCTGCGGCTACCAGCGTTTTGTCA
AAACAATGGCGTTGTCTTTGGAAACAACAAGATGTTGACTATGTAGAGCTTTGTAAAGAA
TGCTCACCCTACTGGAATTTTTTTATATCTGTAAAACCTGTACAGTATTGTCGTCGGGGG
GAGCGTCCGTATAAATTTGAGAGGTATCGCCCCTGTCCGCTTATGAAAGTGAGGTTTGCT
TTGTTGATGTCATATCTCAATGGTGAAGCCAATTGCAAAGGGTGTGCCGAGTGCAAAGAA
AGAATACATGCACCTCGAAAAGCAACCATTTTCATTTTAGGTAAAAAGTCGGGAAAGACG
CACGCTATTATATGGACCTGCAGGCTGGAAGAAAAACATGCGATGCAAATTGAGTTCGTT
GTCAGGCGGAAGACAAGGTTAAACTATAGCCGCTGCCTCTCACTTTAGTTTTGATATCAA
CTTTGTCTCTCTTCTTTTCTCCTTTTTTTTTTTTGTAGATTTAGAAACATGGGTAGGTTT
ATATCCTTGGACAACAAAGTCCCTTTTAATTTTTGCATGGTCTTGATTGAATTTAAATAT
ATTGCAAATTTCTTTTGATGGC


BQ
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AGA*TACATGCACCTCG

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DS 

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TTGTCAAAACAATGGCGTTGTCTTTGGAAACAACAAGATGTTGACTATGTAGAGCTTTGT
AAAGAATGCTCACCCTACTGGAATTTTTTTATATCTGTAAAACCTGTACAGTATTGTCGT
CGGGGGGAGCGTCCGTATAAATTTGAGAGGTATCGCCCCTGTCCGCTTATGAAAGTGAGG
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AAAGAAAGAATACATGCACCTCGAAAAGCAACCATTTTCATTTTAGGTAAAAAGTCGGGA
AAGACGCACGCTATTATATGGACCTGCAGGCTGGAAGAAAAACATGCGATGCAAATTGAG
TTCGTTGTCAGGCGGAAGACAAGGTTAAACTATAGCCGCTGCCTCTCACTTTAGTTTTGA
TATCAACTTTGTCTCTCTTCTTTTCTCCTTTTTTTTTTTTGTAGATTTAGAAACATGGGT
AGGTTTATATCCTTGGACAACAAAGTCCCTTTTAATTTTTGCATGGTCTTGATTGAATTT
AAATATATTGCAAATTTCTTTTGATGGC

QA 1 808 1 808
DS 



AS 1 2

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GGATGGGTCAGAAAGATGCTTACGTTGGCGATGAAGCTCAGTCCAAGAGAGGTATTCTCA
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CTTTCAATGTCCCTGTCATGTATGTTGCTATCCAGGCCGTTCTTTCTCTCTACGCTAGTG
GGCGTACTACTGGTATTGTGCTCGACTCTGGTGATGGTGTGTCTCACACCGTGCCGATCT
ACGAGGGTTATGCTCTTCCTCACGCTATCCTCCGTCTGGATCTCGCGGGTAGGGATCTCA
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TCCCAGGAATCGCTGACCGTATGAGCAAGGAGATCACCGCACTGGCACCAAGCAGCATGA
AGATCAAGGTGGTGGCACCGCCTGAGAGGAAATACAGTGTCTGGATTGGAGGATCTATCC
TTGCATCCCTCAGCACTTTCCAACAGATGTGGATCTCGAAGGGAGAGTACGATGAGTCGG
GTCCATCCATTGTCCCCAGGAAATGCTTTTAAGGTGTTTCTTCTCTTGTTCGTGGTGGTA
TGAGTTTGGTACGATCTCCCTTGTTGAGATGGGACTCAAATTATATGTTGTTATTGTGGT
TGTTTCTTTTTATTTTTTTTGGTCTCTTTAGAACCTTTTGGATGTTTCTCGAGTCTTTCT
ATGTACTTTAGTTTTATCTTTGTTTCCT


BQ
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AF RS1H263TF U 1
AF RS1H263JQB C 637
BS 1 689 RS1H263TF
BS 690 1408 RS1H263JQB

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TCTATCATCTTCTTCTTCTTCCCTAAGCTTAGCGAAAGATGGCCGACGGTGAGGACATTC
AACCCCTTGTCTGTGACAATGGAACTGGAATGGTGAAGGCTGGGTTTGCAGGTGACGATG
CCCCCAGGGCTGTGTTCCCAAGTATCGTTGGTCGTCCCAGACACATTGGTGTCATGGTTG
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CCGAGGCACCTCTCAACCCTAAAGCTAACAGGGAGAAAATGACTCAGATCATGTTCGAGA
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GGCGTACTACTGGTATTGTGCTCGACTCTGGTGATGGTGTGTCTCACACCGTGCCGATCT
ACGAGGGTTATGCTCTTCCTCACGCTATCCTCCGTCTGGATCTCGCGGGTAGGGATCTCA
CTGATTCTCTGATGAAGATTCTCACGGAG

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1H263JQB 772 0 0
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ACATGTTCACCACCACCGCCGAGCGAGAAATTGTCCGTGACATTAAAGAGAAACTTGCTT
ACGTGGCTCTCGACTACGAGCAAGAGCTTGAGACAGCCAAGAGCAGTTCTTCGGTGGAGA
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TGCTCAGTGGTGGTTCGACCATGTTCCCAGGAATCGCTGACCGTATGAGCAAGGAGATCA
CCGCACTGGCACCAAGCAGCATGAAGATCAAGGTGGTGGCACCGCCTGAGAGGAAATACA
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CGAAGGGAGAGTACGATGAGTCGGGTCCATCCATTGTCCCCAGGAAATGCTTTTAAGGTG
TTTCTTCTCTTGTTCGTGGTGGTATGAGTTTGGTACGATCTCCCTTGTTGAGATGGGACT
CAAATTATATGTTGTTATTGTGGTTGTTTCTTTTTATTTTTTTTGGTCTCTTTAGAACCT
TTTGGATGTTTCTCGAGTCTTTCTATGTACTTTAGTTTTATCTTTGTTTCCT

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

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GGAGCATTCGAGGAAAAGGTGAAGATGAGGGCGATAGAGCTGAAGCGTTTGCTGACGAAA
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TTTCTTTCTTTCTTCCCCTCTAAAAAAAAGATAAGATGCCCTAAGTTTTGTCTTCTGTTT
TTTTCTAATGGTGTGATTGATTTTATATTGATGTAAGTCTTTTCTTAATGGTGTCTTGTC
TTCATTCTTTTCTTCTTCGTCCTAATTACTTACGATATGGTTGGATGTCAACAATACCTT
CTTCAATGGATATGATGAGATCC


BQ
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AF RS1CX82JQ C 1
AF RS1CX82TF U 1
BS 1 443 RS1CX82TF

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CGCTAATGATTCCCTCCATCCTTCCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCATCTTTATCTCTGTGT
TTTCTTTCTTTCTTCCCCTCTAAAAAAAAGATAAGATGCCCTAAGTTTTGTCTTCTGTTT
TTTTCTAATGGTGTGATTGATTTTATATTGATGTAAGTCTTTTCTTAATGGTGTCTTGTC
TTCATTCTTTTCTTCTTCGTCCTAATTACTTACGATATGGTTGGATGTCAACAATACCTT
CTTCAATGGATATGATGAGATCC

QA 1 443 1 443
DS 

RD RS1CX82TF 443 0 0
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GGAGCATTCGAGGAAAAGGTGAAGATGAGGGCGATAGAGCTGAAGCGTTTGCTGACGAAA
GGTATCAAAGTCGTCGGCAAATCCTGCAAGAAGGGATGGTCCAAAGTCAAGAACCTTAAG
CGCTAATGATTCCCTCCATCCTTCCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCATCTTTATCTCTGTGT
TTTCTTTCTTTCTTCCCCTCTAAAAAAAAGATAAGATGCCCTAAGTTTTGTCTTCTGTTT
TTTTCTAATGGTGTGATTGATTTTATATTGATGTAAGTCTTTTCTTAATGGTGTCTTGTC
TTCATTCTTTTCTTCTTCGTCCTAATTACTTACGATATGGTTGGATGTCAACAATACCTT
CTTCAATGGATATGATGAGATCC

QA 1 443 1 443
DS 



AS 1 2

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TTATTTTTATTTTTAAATCACTCTTGTAAATTTGGAAAAGATGTTGCTTTACAACAAGCA
GAAGAAGAACCAGAACAACGCAAAGGGAAACAGAATCCTTATCAGCGTTACGGTTCTTGG
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TACTGCTCTCAAATGCTACGCTCGCGAAGGTCGTCTTCCTCTTCTCGGATCCGATTTCAA
TGATTTTCTTCTCTACTGTCCCATGGTTGGACCTGAAGCTTTAAGCGCGTGGAGTGCAAT
TGGATCGCTTGGTGCAAGGAACTTTACTCTGTGTAGGAAACCAGAGGAGAAGAAAGTGGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1C541TF U 1
AF RS1CZ76TF U 1
BS 1 153 RS1C541TF
BS 154 154 RS1CZ76TF
BS 155 168 RS1C541TF
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BS 281 660 RS1C541TF

RD RS1C541TF 660 0 0
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GAAGAAGAACCAGAACAACGCAAAGGGAAACAGAATCCTTATCAGCGTTACGGTTCTTGG
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TGATTTTCTTCTCTACTGTCCCATGGTTGGACCTGAAGCTTTAAGCGCGTGGAGTGCAAT
TGGATCGCTTGGTGCAAGGAACTTTACTCTGTGTAGGAAACCAGAGGAGAAGAAAGTGGT

QA 1 660 1 660
DS 

RD RS1CZ76TF 638 0 0
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CTGCCTCCTCTGTTTTCGCTTTCGGTTCCTGCAAAGAAGGCTGGTACTTCCGCTGCTTCG
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TTATTTTTATTTTTAAATCACTCTTGTAAATTTGGAAAAGATGTTGCTTTGCAACAAGCA
GAAGAAGAACCAGAACAACGCAAAGGGAAACAGAATCCTTATCAGCGTTACGGTTCTTGG
TAGCGCCGGTCCGATCCGGTTCGTTGCTTACGAGGAAGATCTCGTCGCCTCGGTTATCGA
TACTGCTCTCAAATGCTACGCTCGCGAAGGTCGTCTTCCTCTTCTCGGATCCGATTTCAA
TGATTTTCTTCTCTACTGTCCCATGGTTGGACCTGAAGCTTTAAGCGCGTGGAGTGCAAT
TGGATCGCTTGGTGCAAGGAACTTTACTCTGTGTAGGA

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

CO CL6793Contig1 621 2 2 U
TGGTAACAAATAGTATAACAACACTAAACTCAAAATATTAGTAGCAACAACACACATACA
ACAGTACGGATACAAGGCACAACCGGGCAGAAGGATAACAACACTTAACCGATGATCAAA
GTTTAAAAACAGAAAGATGAGAGGACTCATGACAACATTACTAATTTTAGCCCTTCCCTT
CAGCGACCAGAGAGACTAATCTGTTCACAGTTTTTATCAACAGACTCCTTAACAGCATCA
ACCACTAGCTGTGTCTTCCGGCTAATGCTCGGCCAAAACCCATCAGGCTTTGCACCTTTG
TTCTTGATTTCACCAACCAATCGAGCAAACTCTCTCACCATACATGCCTCTTGCGGAAGC
TCCGTCTTAACCGTGTGCTCGCTCGGGGGATTAACCCACGCGGTCACGAACTCATTGAAC
CAAGCTTTAGTGCTCGTTGTGAACGATGCCTCGGTCTCCTTAAACGGGATAATGAAATCA
TGAACACTAAGCGTGCCGTTGGTTCCAATGGCGTTTATCTCCATTGTCAAGTTTGCCAAG
AAGGAACAGTATATGGTAGCGGTTCGTCCGTCTTCCCAAGTCAGAGAAGCTCCACATGAG
AGTACCACTCCTGCTTCGTTC


BQ
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DS 



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BQ
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AF RS1CQ58JQ C 1
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BS 75 695 RS1CQ58TF

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QA 1 695 1 695
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QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DZ87TF U 1
AF RS1DZ87JQ C 139
BS 1 615 RS1DZ87TF
BS 616 616 RS1DZ87JQ
BS 617 733 RS1DZ87TF
BS 734 734 RS1DZ87JQ
BS 735 747 RS1DZ87TF
BS 748 748 RS1DZ87JQ
BS 749 764 RS1DZ87TF
BS 765 850 RS1DZ87JQ

RD RS1DZ87TF 782 0 0
GGAAAAAGAAAAAAAAAAAACCCTAGTCTGGTTTGGTCTCAGGAAAGCTAGGCGACTTCG
AATGTCTTTTTCTCTCTTGTTTCAGATCTATTTCTCCTTCTCTCTGAAATCTTGCTAGTC
TCTTCACCATCGACCTTATCTCTCTGTGTGCCTTCTTCTCTCACGGCTATCCTCTATGTT
TATCTCTCCCACTGAAATCTCTGACTGTCGTCGACCTCTCCCCTAAGCTTGAACCTTCCT
GGTTTCAGGTTTATGATTTTGTTTTTTGTAGAAACAAGGATGAGAGAAACAAAGATGATA
GAAGCAAATTACGTCATAGCGTTCTCTTTCTCAGGGTTTCAGGAAAGTTCTCACCTTTTG
AAGGAATTTCGATCAAAACACTGGCTTGTTACTCTCCTCTTCTCTGTGGTTTCTCTCTGT
TTCTTCTTCCTTGTGTTGAGTTCATAGTTAAAGGAGGAACTATATAAACGGATGGCTACA
CTTCAAGATATTGTTGAATCAGTTAGAAGTTCTTGGCTCATACAAAACGGGGCTTTATCT
TCCAACAAGTGATATCGATCTTATATCACTGGTCTTAACCATGCTGGATCTGATGGTCTC
AACGCTAAGTCCAAG*ACGATGAAGACTGTGTATGAACAACCTTACTCTTTTACACTTCA
ATCGTGGAAGTCTGAGTATTGGAGGATGTGAGTGCAATCTTTGGGTAACATGTAACAAAT
CAACTTAGTTTAG*TCAAGTGAGCTCA*GACTTCTGTCCATTGT
GGTTTAGATTAGTTTGTT

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1DZ87JQ 712 0 0
TCTCTCTGTGTGCCTTCTTCTCTCACGGCTATCCTCTATGTTTATCTCTCCCACTGAAAT
CTCTGACTGTCGTCGACCTCTCCCCTAAGCTTGAACCTTCCTGGTTTCAGGTTTATGATT
TTGTTTTTTGTAGAAACAAGGATGAGAGAAACAAAGATGATAGAAGCAAATTACGTCATA
GCGTTCTCTTTCTCAGGGTTTCAGGAAAGTTCTCACCTTTTGAAGGAATTTCGATCAAAA
CACTGGCTTGTTACTCTCCTCTTCTCTGTGGTTTCTCTCTGTTTCTTCTTCCTTGTGTTG
AGTTCATAGTTAAAGGAGGAACTATATAAACGGATGGCTACACTTCAAGATATTGTTGAA
TCAGTTAGAAGTTCTTGGCTCATACAAAACGGGGCTTTATCTTCCAACAAGTGATATCGA
TCTTATATCACTGGTCTTAACCATGCTGGATCTGATGGTCTCAACGCTAAGTCCAAGGAC
GATGAAGACTGTGTATGAACAACCTTACTCTTTTACACTTCAATCGTGGAAGTCTGAGTA
TTGGAGGATGTGAGTGCAATCTTTGGGTAACATGTAACAAATCAACTTAGTTTAGGTCAA
GTGAGCTCAAGACTTCTGTCCATTGTTGGTTTTAGATTTAGTTTTGTTTTATAGGTTTTG
TTATTTTGTAAACAATTTTGATATATTAAATTTTAAAATATTTTTATTTTGC

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 2

CO CL6796Contig1 1043 2 4 U
GAATTTGCGTACCAGCAGACGAAGAATTTCGAGAGGTTGTCTTTTCTTTATCTCATTACC
GGTAAGTTGGACAAGCTTTCAAAGTTGATGAAGATTGCAGAAGTTAAGAACAACGTAATG
GGTCAGTTCCACAATGCGCTCTACCTAGGAGATGTTGAAGAGCGTGTCAAGATACTTGAG
AATGCTGGTCATTTGCCCCTCGCTTATATCACTGCTTCGGTTCATGGTCTAAATGACATT
GCTGAGCGACTGGCGACTGAGCTTGGAGACAACGTGCCCTCATTGCCTGAAGGGAAAACT
CCATCGCTTCTAATGCCACCATCTCCCGTCATGTGTGGTGGTGATTGGCCTCTTCTAAGA
GTGATGAAGGGAATATTCGAAGGCGGACTTGAGAGTGCAGCCAGAGGAGGAGCTGTTGAT
GAAGATGAAGAAGATGTTGGTGGCGATTGGGGTGAGGGACTTGACATGGTCGATGTCGAT
GGAATGGAGGACACAGACATCAAAGCCATTTTGGAGGAAGCAGAAAGAGGAGAAGAAGAT
GATGAAAATGATGAAGAAGGTGGATGGTTGGGAATTGACGACTTGGAGCTCCCACCAGAG
CTTGACACTCCTAAGGCTTCTGCTAACGCACGTTCATCCGTCTTCGTGGCACCTACTCAA
GGTATGCCCGTAAGCCATATTTGGAGTCAGAAATCTTCCCTCGCTGCTGAGCAAGCTGCA
GCGGGAAGCTTCGACGCTGCAATGCGTCTGCTCCACAGACAGCTTGGCATCAAGAACTTC
GCCCCTTTGAAATCGATGTTTATTGATTTGTTCAACGGTAGCCACAGCTATCTGCGTGCT
TTCACTTCATCTCCTGTGGTTCCCCTTGCCATTGAGCGTGGATGGAGCGAGTCTTCAAGT
CCCAACGTCCGTGGCCCACCAGCTCTTGTTTATGATTTCTCCCACCAAGAAGAGAAGCTC
AAGTCTGGCTACAAAGCCACAACAAGTGGGAAACTGACTGAGGCTCTCCGTCTCTTCCTC
TCTATCCTCCACACCATTCCTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FO67TF U 1
AF RS1G069TF U 415
BS 1 487 RS1FO67TF
BS 488 488 RS1G069TF
BS 489 535 RS1FO67TF
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RD RS1FO67TF 535 0 0
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GGTCAGTTCCACAATGCGCTCTACCTAGGAGATGTTGAAGAGCGTGTCAAGATACTTGAG
AATGCTGGTCATTTGCCCCTCGCTTATATCACTGCTTCGGTTCATGGTCTAAATGACATT
GCTGAGCGACTGGCGACTGAGCTTGGAGACAACGTGCCCTCATTGCCTGAAGGGAAAACT
CCATCGCTTCTAATGCCACCATCTCCCGTCATGTGTGGTGGTGATTGGCCTCTTCTAAGA
GTGATGAAGGGAATATTCGAAGGCGGACTTGAGAGTGCAGCCAGAGGAGGAGCTGTTGAT
GAAGATGAAGAAGATGTTGGTGGCGATTGGGGTGAGGGACTTGACATGGTCGATGTCGAT
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QA 1 535 1 535
DS 

RD RS1G069TF 629 0 0
GTG
GATGAAGATGAAGAAGATGTTGGTGGCGATTGGGGTGAGGGACTTGACATGGTCGATGTT
GATGGAATGGAGGACACAGACATCAAAGCCATTTTGGAGGAAGCAGAAAGAGGAGAAGAA
GATGATGAAAATGATGAAGAAGGTGGATGGTTGGGAATTGACGACTTGGAGCTCCCACCA
GAGCTTGACACTCCTAAGGCTTCTGCTAACGCACGTTCATCCGTCTTCGTGGCACCTACT
CAAGGTATGCCCGTAAGCCATATTTGGAGTCAGAAATCTTCCCTCGCTGCTGAGCAAGCT
GCAGCGGGAAGCTTCGACGCTGCAATGCGTCTGCTCCACAGACAGCTTGGCATCAAGAAC
TTCGCCCCTTTGAAATCGATGTTTATTGATTTGTTCAACGGTAGCCACAGCTATCTGCGT
GCTTTCACTTCATCTCCTGTGGTTCCCCTTGCCATTGAGCGTGGATGGAGCGAGTCTTCA
AGTCCCAACGTCCGTGGCCCACCAGCTCTTGTTTATGATTTCTCCCACCAAGAAGAGAAG
CTCAAGTCTGGCTACAAAGCCACAACAAGTGGGAAACTGACTGAGGCTCTCCGTCTCTTC
CTCTCTATCCTCCACACCATTCCTCT

QA 4 629 4 629
DS 



AS 1 2

CO CL6797Contig1 735 2 4 U
GAACTGTTTGGTTATTAACGAATTTAAATTTTGTTTTGGTTTGGTTATTTTGGTTTTCGG
TTTGATTCGAATAACAATGTTATGAATCTGGTAAAACTGCGAGTTCAATTTGATTCTTGT
TCGGTTTTCATTTGAGTTCAATTTGATTATGATCCGGTTCCCATTCGATTATGTACTACT
GAATTTTTTTTTGAGAATATGTATGAACTATTGAATAAAACAGTTTATATTAGAATATGT
GTTTTCTAGTTGACCAGAGAAATATAGATTGCCACTTGACCAATAATATTTATACATGCA
TCATTACTTTTTAAGATGTTTTTTTGTAGACTGGTTAGTTTTTAAGATGTTGAACCTGCA
ACATATTTGTCATCGGATAAAGCATGTTTAAACCCATAATCTTCATTCATAGAAAGCCAG
TTCAATCACCCGCATATAAAAGGTTGGTTCATGGCAAGAAGAATAGAAGCAAAGGAATTA
GAGAGAAAATATGAATAGTTAACAAATTAATATAGGTGGAAAACTTGTGGATATATATTT
GTATAGTTTGTAGTTTATAGTCACGTTGTGTCCGTCAATATAGGAAACTGTTTTCTTCAA
ATTATTTAATTTTATTGAATAAATCTTTTGAATTTAAGTATATTCTTTAATGGCATTGCT
GTAAATACTTTAAAAATCAAAGGGATATCTAAAAAAAGGTTGCTGTTTTAATTGTATTGA
TAGGGGCTGTGTTAC


BQ
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AF RS1FN46TF U 1
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GTAAATACTTTAAAA
TC

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BQ
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AF RS1C548JQ C 1
AF RS1C548TF U 1
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QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C616TF U 1
AF RS1C616JQ C 379
BS 1 696 RS1C616TF
BS 697 697 RS1C616JQ
BS 698 744 RS1C616TF
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BS 746 768 RS1C616TF
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RD RS1C616TF 768 0 0
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AGCGCTTGACTCCTTCATTGCCTGGGAGTTAGAGTTCCCTCTTGTCATAGTCAAGAAGGC
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GCTGAGCAAAGGCCAAGGAAGAACAATGGGAACTTACTTCTCGTTACTAAACGCTCTAGC
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TGCGATTGTGGATATGGTTGGGAAAGTGTTTTTGAA*CTTGGGATGAATGATAAGTACGA
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QA 1 768 1 768
DS 

RD RS1C616JQ 713 0 0
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TGGGAAAGTGTTTTTGAAACTTGGGATGAATGATAAGTACGAGAAGCTGATGAAGAAGTA
TCCTCCACCACAGTGGGAGTTCAGATACATCAAAGGAAGACGTGTAAGGTCAAGGCTAAG
CAGCTGAATGAGCTAAGCGAAGGGGAAGGAGGTTTAAGCAGCGACGAAGACAAGATTGAG
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TTGGGGGCGAATCAAAGACAGATTGGAACATCTAGAGAACCATGTCTTGATCATTTGGAC
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TCATGCATGGAAACATTTTGAGTCATGTTTCTGTCAGAAACTCAAGCTCAGTC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1ET87TF U 1
AF RS1ET87JQ C 1
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QA 1 616 1 616
DS 

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TATTATGATGATGATCTTTAATC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

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AAATCGCAAACTAGTTAGGG


BQ
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AF RS1EO17JQ C 1
AF RS1EO17TF U 1
BS 1 620 RS1EO17TF

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TTCATCATGGTTGTCTTTAGGCTTACTCTTTCAGCGGTCTATAGCTTCACTGAGGATGAT
GATCTACTTCATTTGTTTTGATGTACTCTTATTTGTTTTCTCAGTGTGTGTGTTGTGTTA
TAGACATTTCTTAGGGATGTACTCAAAACTACACAGGACATCAGATTCCTCTCCCAAGCT
AAATCGCAAACTAGTTAGGG

QA 1 620 1 620
DS 

RD RS1EO17TF 620 0 0
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GAAACATCATCTCGTATCAACCGATTGATACTACCTGAGTTTATCCTCCAAGCCTCACTC
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CGTGGTATTAGCTTTGAAAAGAAGCTCCGTTTTACCAAACTCGGGTTCTACATCTTTCTC
TTCATCATGGTTGTCTTTAGGCTTACTCTTTCAGCGGTCTATAGCTTCACTGAGGATGAT
GATCTACTTCATTTGTTTTGATGTACTCTTATTTGTTTTCTCAGTGTGTGTGTTGTGTTA
TAGACATTTCTTAGGGATGTACTCAAAACTACACAGGACATCAGATTCCTCTCCCAAGCT
AAATCGCAAACTAGTTAGGG

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 2

CO CL6802Contig1 1244 2 10 U
GGGAGGCTTCTTCAACTCCGACATCGGCTTGTTTAATTCGTTTTGCATTTTTTTTTGGAT
CTGTTTTGTTTCCAGTCACTGTTTTATTGCCAATTTATTTTGAATCTGACGAAGTTTTTT
ATTGTTCTTTCGTATGCTTTTTCCAATTGGTTTGGAAAAACAAAACTTTTTGTTCAGTTG
AACTATTTAGAAAAATTAATTGACAGATCTACTGTGGATGATGGCGACGGGTCTTACCGG
CTTCAATTGTTGATGGTTCTTCATTCGATGGTGATGGAGTTCTTGCTGCAAACTATGGTT
ACTTCGAAAGGCAGCATGAAGTTCTATGGAACGGTAATCTCTTTGACTCTGATAATAGAG
TAAAATAGAGAGTTGTCTTATCTCGGTGGCTCCTACTGGAGTAATAAAAAGAGAATGACA
ATCGTTTTCAACTCACTCTGAAGCGTGGTGCTTTTGGATTAATTTGAAGGTTATCTCCTT
TGAGGTTCGTCTATTCCAGAAGCAAATATGAAGCTTTTATATGAAAAAATCTTTAGTTAT
CCATACGCAAAATAGATATGTTAGTTTATTTTGGATCCCTATTGGTGTATTCCTTTTCTA
TGTTGTTTTACTGGTTCTCATTGTTTAAAACTTTTTGACTTGAAGGCTAATAATACAATT
CAGTGACAAAAAAAAAAGACCATGAATCATGAAAGTTTCAATTGTTGCAAAATATGTATA
CACACAGAAGCGCTATATATGTATTATGTATATATGTTACAACTACCAAAAGCTAGAGAA
GTCTTTTTTTTTTTTATCAAGCTAGAGAAGTCTCTTTTAAAAGCTGTAGTTAGCTAGACG
CGAAATACATTTACTACCACGTAGCTGAAGTTAAGTATGGTTTTATTAACTTACGAAAAT
GATTGAAGTCTATATATGTAATACACCAATGGTTGTTTTCTTTTGTTAAAATGCACCAAA
GTTTTTATTACTCGCATCCTTGACACAAATGCATTACAAACCGTAATTTCTTCATGTAAT
TTCAGCAATAAAATTAATATAATGGTCTCAACCGACGAAATAGTCATTTTTTGTCAACGA
CTCGCACACTACCGAGTTAATTGTGGGTGGCTAAGATTTTTGTATGCATCATTCATCTTT
TATCATCATCTCGACATATACAAAGAGAAGCAGGACATGATATTTTTTTAAAATATTTGA
TCGCTTCTAGATAGAAGTCGTAAACTACTTATAGTAGTTTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CH40TF U 1
AF RS1CH40JQ C 472
BS 1 645 RS1CH40TF
BS 646 646 RS1CH40JQ
BS 647 676 RS1CH40TF
BS 677 677 RS1CH40JQ
BS 678 711 RS1CH40TF
BS 712 712 RS1CH40JQ
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BS 730 741 RS1CH40TF
BS 742 1244 RS1CH40JQ

RD RS1CH40TF 741 0 0
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CTGTTTTGTTTCCAGTCACTGTTTTATTGCCAATTTATTTTGAATCTGACGAAGTTTTTT
ATTGTTCTTTCGTATGCTTTTTCCAATTGGTTTGGAAAAACAAAACTTTTTGTTCAGTTG
AACTATTTAGAAAAATTAATTGACAGATCTACTGTGGATGATGGCGACGGGTCTTACCGG
CTTCAATTGTTGATGGTTCTTCATTCGATGGTGATGGAGTTCTTGCTGCAAACTATGGTT
ACTTCGAAAGGCAGCATGAAGTTCTATGGAACGGTAATCTCTTTGACTCTGATAATAGAG
TAAAATAGAGAGTTGTCTTATCTCGGTGGCTCCTACTGGAGTAATAAAAAGAGAATGACA
ATCGTTTTCAACTCACTCTGAAGCGTGGTGCTTTTGGATTAATTTGAAGGTTATCTCCTT
TGAGGTTCGTCTATTCCAGAAGCAAATATGAAGCTTTTATATGAAAAAATCTTTAGTTAT
CCATACGCAAAATAGATATGTTAGTTTATTTTGGATCCCTATTGGTGTATTCCTTTTCTA
TGTTGTTTTACTGGTTCTCATTGTTTAAAACTTTTTGACTTGAAG*CTAATAATACAATT
CAGTGACAAAAAAAAA*GACCATGAATCATGAAAGTTTCAATTGTTGCAAA*TATGTATA
CACACAGA*GCGCTATATATG

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1CH40JQ 773 0 0
TATCTCCTTTGAGGTTCGTCTATTCCAGAAGCAAATATGAAGCTTTTATATGAAAAAATC
TTTAGTTATCCATACGCAAAATAGATATGTTAGTTTATTTTGGATCCCTATTGGTGTATT
CCTTTTCTATGTTGTTTTACTGGTTCTCATTGTTTAAAACTTTTTGACTTGAAGGCTAAT
AATACAATTCAGTGACAAAAAAAAAAGACCATGAATCATGAAAGTTTCAATTGTTGCAAA
ATATGTATACACACAGAAGCGCTATATATGTATTATGTATATATGTTACAACTACCAAAA
GCTAGAGAAGTCTTTTTTTTTTTTATCAAGCTAGAGAAGTCTCTTTTAAAAGCTGTAGTT
AGCTAGACGCGAAATACATTTACTACCACGTAGCTGAAGTTAAGTATGGTTTTATTAACT
TACGAAAATGATTGAAGTCTATATATGTAATACACCAATGGTTGTTTTCTTTTGTTAAAA
TGCACCAAAGTTTTTATTACTCGCATCCTTGACACAAATGCATTACAAACCGTAATTTCT
TCATGTAATTTCAGCAATAAAATTAATATAATGGTCTCAACCGACGAAATAGTCATTTTT
TGTCAACGACTCGCACACTACCGAGTTAATTGTGGGTGGCTAAGATTTTTGTATGCATCA
TTCATCTTTTATCATCATCTCGACATATACAAAGAGAAGCAGGACATGATATTTTTTTAA
AATATTTGATCGCTTCTAGATAGAAGTCGTAAACTACTTATAGTAGTTTTTTC

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

CO CL6803Contig1 1159 2 2 U
GGGGCGGCACAACCGGCGAGACGAGTCAAAACCACGAGATGGAGAACCAGATTCAGATCG
GAGGCTCATCACCATCTTCGTGGTCTTCTTCATCGCGATCCCCGCAGTCTCAATGGCGGT
GTACAAAGTCAAATTCGCGGATCGAGTCATCATCGAAACGGAGCCGTCGATACGTCAAAA
GGGAATCATCAAAACCGATATCCATTTCCAAGAGATCCTCTCTGAACATTCAAAGGCTTC
AGAGAATTCATCAGCTAGGCATTATGATTATCCAGTGTTGGCTTACATTACTCCATGGAA
CTCTAAAGGATATGATATGGCAAAGATATACAACTCCAAGTTTACTCATTTATCACCTGT
TTGGTACGACCTGAAGAGTAGTCAAGGAAATGGATTGGTTTTGGAAGGGAGACATAATGC
TGATAAGGGATGGATCCAAGAGCTTCGTTCAAGAGGAAATGCCATGATATTACCAAGAGT
TGTTCTAGAAGCAGTTCCCGAGGAGTTGCTCAAGAAAAAGAAACTAAGAGCAAAAGCTAT
TAGTCTTATTGTCACAGAGTGCAAGGAAATGGAATATGATGGTATTGTGCTAGAGTCTTG
GTCAAGATGGGCAGCTTATGGTGTTTTGCATGACCCGAACATGCGGAAAATGGCCCTGCA
ATTCGTAAAACAACTTGGAGACGCCCTTCACGAGCAGCATATGCAGTTCATGTATGTCAT
TGGTCCACCACGTTCGGACACGCTCCAAATGTACGATTTTGGGCCAGAAGATCTTCAGCT
CTTGAAAGATTCGGTGGATGGGTTCTCTTTAATGACCTACGATTTCTCAAATGCCCAGAA
CCCTGGCCCCAATGCTCCTCTCAAGTGGATAGATCTCACACTCAAACTCCTACTTGGCTC
ATCCAACAACGTAGACTCAAGCCTGGCAAGAAAGGTTTTTCTTGGTATCAACTTTTACGG
CAACGATTTTGCAATCTCTGGAGGAGGTGGAGGCGCTATCATCGGAAGGGATTACCTAGC
GTTACTCCAGAAACACAAGCCAACGTTGCATTGGGACAAAGAAAGCGGCGAGCATATTAT
CATGTATAGAGATGATAAGAACATCAAGCATGCTGTTTTCTATCCTACATTGATGTCAAT
CCTTTTACGGCTTGAGAAT


BQ
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AF RS1BA46TF U 1
AF RS1BA46JQ C 550
BS 1 720 RS1BA46TF
BS 721 1159 RS1BA46JQ

RD RS1BA46TF 732 0 0
GGGGCGGCACAACCGGCGAGACGAGTCAAAACCACGAGATGGAGAACCAGATTCAGATCG
GAGGCTCATCACCATCTTCGTGGTCTTCTTCATCGCGATCCCCGCAGTCTCAATGGCGGT
GTACAAAGTCAAATTCGCGGATCGAGTCATCATCGAAACGGAGCCGTCGATACGTCAAAA
GGGAATCATCAAAACCGATATCCATTTCCAAGAGATCCTCTCTGAACATTCAAAGGCTTC
AGAGAATTCATCAGCTAGGCATTATGATTATCCAGTGTTGGCTTACATTACTCCATGGAA
CTCTAAAGGATATGATATGGCAAAGATATACAACTCCAAGTTTACTCATTTATCACCTGT
TTGGTACGACCTGAAGAGTAGTCAAGGAAATGGATTGGTTTTGGAAGGGAGACATAATGC
TGATAAGGGATGGATCCAAGAGCTTCGTTCAAGAGGAAATGCCATGATATTACCAAGAGT
TGTTCTAGAAGCAGTTCCCGAGGAGTTGCTCAAGAAAAAGAAACTAAGAGCAAAAGCTAT
TAGTCTTATTGTCACAGAGTGCAAGGAAATGGAATATGATGGTATTGTGCTAGAGTCTTG
GTCAAGATGGGCAGCTTATGGTGTTTTGCATGACCCGAACATGCGGAAAATGGCCCTGCA
ATTCGTAAAACAACTTGGAGACGCCCTTCACGAGCAGCATATGCAGTTCATGTATGTCAT
GGTCACACGTCG

QA 1 720 1 720
DS 

RD RS1BA46JQ 610 0 0
TGTCACAGAGTGCAAGGAAATGGAATATGATGGTATTGTGCTAGAGTCTTGGTCAAGATG
GGCAGCTTATGGTGTTTTGCATGACCCGAACATGCGGAAAATGGCCCTGCAATTCGTAAA
ACAACTTGGAGACGCCCTTCACGAGCAGCATATGCAGTTCATGTATGTCATTGGTCCACC
ACGTTCGGACACGCTCCAAATGTACGATTTTGGGCCAGAAGATCTTCAGCTCTTGAAAGA
TTCGGTGGATGGGTTCTCTTTAATGACCTACGATTTCTCAAATGCCCAGAACCCTGGCCC
CAATGCTCCTCTCAAGTGGATAGATCTCACACTCAAACTCCTACTTGGCTCATCCAACAA
CGTAGACTCAAGCCTGGCAAGAAAGGTTTTTCTTGGTATCAACTTTTACGGCAACGATTT
TGCAATCTCTGGAGGAGGTGGAGGCGCTATCATCGGAAGGGATTACCTAGCGTTACTCCA
GAAACACAAGCCAACGTTGCATTGGGACAAAGAAAGCGGCGAGCATATTATCATGTATAG
AGATGATAAGAACATCAAGCATGCTGTTTTCTATCCTACATTGATGTCAATCCTTTTACG
GCTTGAGAAT

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 2

CO CL6804Contig1 877 2 2 U
GGCAGCGCTCTTAGCAATGTGTTGGTACTGGGCTTCTGATGGCGTTGGTTCCAAGGATAT
GGTTATCCTTCCTTACAAGGATAGCTTATTACTATTTAGCCGGTATTTGCAGCAGCTGGT
CATGGAATCACTAGGAAAGGAGTTTGATCTTGACGGTAACACTGTTAATCAAGGGTTAAC
TGTATATGGAAACAAAGGGAGCACAGACCAGCGCGCCTACATTCAACAGCTGAGAGAGGG
TGTCCACAATTTCTTTGCAACCTTCATAGAAGTACTACGTGACAGACCCCCAGGTCATGA
TTGGGATCTTGAGCCAGGTGTCACTTGTGGAGACTACCTCTTTGGGATGCTACAGGGAAC
TAGATCTGCTTTATATGCAAACGGCAGAGAGTCCATTAGTGTTACCATCGAGGAAGTGAC
ACCAAGATCTGTTGGTGCTCTTATAGCTCTTTATGAAAGAGCGGTCGGTTTATATGCCTC
ACTTGTCAACATTAATGCTTACCACCAACCCGGTGTGGAAGCTGGTAAAAAGGCAGCAGC
AGAAGTTCTGGCCCTGCAAAAGCGTGTATTGTCAGTTCTTAATGAAGCCAGTTGTAAAGA
CCCAGTAGAGCCATTGACGCTAGACGAAATAGCTGATCGTTGCCATGCTCCTGAAGAAAT
TGAGATGATATACAAGATCATAGCACACATGTTTGCAAACGACAGAGTTTTAATAGCTGA
AGGAAGCTGCGGATCGCCAAGGAGTGTCAAAGTGTTCCTGGGCGAGTGTAATGTGGATGA
CATGTACGCATAGTATAACTCATCACTATGACCAAAACTCAAAAAGAGACTCATTTTCTG
TTTTTCTTTATTTATTTTTGCCATGACTATGATTTCG


BQ
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AF RS1F280TF U 1
AF RS1F280JQ C 184
BS 1 641 RS1F280TF
BS 642 877 RS1F280JQ

RD RS1F280TF 641 0 0
GGCAGCGCTCTTAGCAATGTGTTGGTACTGGGCTTCTGATGGCGTTGGTTCCAAGGATAT
GGTTATCCTTCCTTACAAGGATAGCTTATTACTATTTAGCCGGTATTTGCAGCAGCTGGT
CATGGAATCACTAGGAAAGGAGTTTGATCTTGACGGTAACACTGTTAATCAAGGGTTAAC
TGTATATGGAAACAAAGGGAGCACAGACCAGCGCGCCTACATTCAACAGCTGAGAGAGGG
TGTCCACAATTTCTTTGCAACCTTCATAGAAGTACTACGTGACAGACCCCCAGGTCATGA
TTGGGATCTTGAGCCAGGTGTCACTTGTGGAGACTACCTCTTTGGGATGCTACAGGGAAC
TAGATCTGCTTTATATGCAAACGGCAGAGAGTCCATTAGTGTTACCATCGAGGAAGTGAC
ACCAAGATCTGTTGGTGCTCTTATAGCTCTTTATGAAAGAGCGGTCGGTTTATATGCCTC
ACTTGTCAACATTAATGCTTACCACCAACCCGGTGTGGAAGCTGGTAAAAAGGCAGCAGC
AGAAGTTCTGGCCCTGCAAAAGCGTGTATTGTCAGTTCTTAATGAAGCCAGTTGTAAAGA
CCCAGTAGAGCCATTGACGCTAGACGAAATAGCTGATCGTT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1F280JQ 694 0 0
ATATGGAAACAAAGGGAGCACAGACCAGCGCGCCTACATTCAACAGCTGAGAGAGGGTGT
CCACAATTTCTTTGCAACCTTCATAGAAGTACTACGTGACAGACCCCCAGGTCATGATTG
GGATCTTGAGCCAGGTGTCACTTGTGGAGACTACCTCTTTGGGATGCTACAGGGAACTAG
ATTTGCTTTATATGCAAACGGCAGAGAGTCCATTAGTGTTACCATCGAGGAAGTGACACC
AAGATCTGTTGGTGCTTTTATAGCTCTTTATGAAAGAGCGGTCGGTTTATATGCCTCACT
TGTCAACATTAATGCTTACCACCAACCCGGTGTGGAAGCTGGTAAAAAGGCAGCAGCAGA
AGTTCTGGCCCTGCAAAAGCGTGTATTGTCAGTTTTTAATGAAGCCAGTTGTAAAGACCC
AGTAGAGCCATTGACGCTAGACGAAATAGCTGATCGTTGCCATGCTCCTGAAGAAATTGA
GATGATATACAAGATCATAGCACACATGTTTGCAAACGACAGAGTTTTAATAGCTGAAGG
AAGCTGCGGATCGCCAAGGAGTGTCAAAGTGTTCCTGGGCGAGTGTAATGTGGATGACAT
GTACGCATAGTATAACTCATCACTATGACCAAAACTCAAAAAGAGACTCATTTTCTGTTT
TTCTTTATTTATTTTTGCCATGACTATGATTTCG

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL6805Contig1 781 2 2 U
GGGATTGAAGAATAAGGAAACCGAACTAAGACGCAGACGAGGAAGAAGAAGCTGTATTAG
ATTTGAAGACAGCTCGGCTTTTCATTGGATCTGAGGATTTGTTCAAAAATGGAGGAGGAA
GGTAGCTCCTCTATAGAGTCGATTTTGGAGTTTCTGAGGAAGAATCGTTTCATGAGAGCT
GAAGCTGCGTTGATTAGTGAGCTCTCCAATAACAAGAACTCAATCTCAAATGGTGTCTTT
GATAAGAAGAAGCAAGTTTCTGATGAATTTGTTGTCAAAGAGATACAATGCGGAGGAGCA
GCTGCTGGTGCCACTGAGAAGAGTCATCATCATCATCACACCATGAATGATGTTTCTGTT
CAGACGACACAAAGTCCCTCTGCTACTGCTGCTGCTAATAATAATAACAACTCATTCTGG
GAGGACAGGTTCACGTTTTCTGACAGTTTAGTAGATACAGAGCTTGATTTATTACCCCCA
TGGAATCATACCGACGCTGAGGTTTACAGTATTGATCCAACAACTACTATAAGGAGCTTT
GTGAATCCATTGAGTCATCATGAAAAGGTTAATAAAAGCAATAAAGTGGCTGTGGAAGAA
GACATCTTCTCTCACTATGACCATGCCAAAGCATCTCAATCCTTGGGAGTTGATAGTATA
CAAGAAGGATTTATCACCACCACCTCATCAGACCAGTGGAAGGACTGTTCCGTTACAACT
ATTTATTCACTGTCCAAAGGAGGAAGCACGTCAAGTAAGGATATCGGTGTACCCGTTTTA
G


BQ
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10 

AF RS1CB73TF U 1
AF RS1CB73JQ C 5
BS 1 661 RS1CB73TF
BS 662 781 RS1CB73JQ

RD RS1CB73TF 661 0 0
GGGATTGAAGAATAAGGAAACCGAACTAAGACGCAGACGAGGAAGAAGAAGCTGTATTAG
ATTTGAAGACAGCTCGGCTTTTCATTGGATCTGAGGATTTGTTCAAAAATGGAGGAGGAA
GGTAGCTCCTCTATAGAGTCGATTTTGGAGTTTCTGAGGAAGAATCGTTTCATGAGAGCT
GAAGCTGCGTTGATTAGTGAGCTCTCCAATAACAAGAACTCAATCTCAAATGGTGTCTTT
GATAAGAAGAAGCAAGTTTCTGATGAATTTGTTGTCAAAGAGATACAATGCGGAGGAGCA
GCTGCTGGTGCCACTGAGAAGAGTCATCATCATCATCACACCATGAATGATGTTTCTGTT
CAGACGACACAAAGTCCCTCTGCTACTGCTGCTGCTAATAATAATAACAACTCATTCTGG
GAGGACAGGTTCACGTTTTCTGACAGTTTAGTAGATACAGAGCTTGATTTATTACCCCCA
TGGAATCATACCGACGCTGAGGTTTACAGTATTGATCCAACAACTACTATAAGGAGCTTT
GTGAATCCATTGAGTCATCATGAAAAGGTTAATAAAAGCAATAAAGTGGCTGTGGAAGAA
GACATCTTCTCTCACTATGACCATGCCAAAGCATCTCAATCCTTGGGAGTTGATAGTATA
C

QA 1 661 1 661
DS 

RD RS1CB73JQ 777 0 0
A
TGAAGAATAAGGAAACCGAACTAAGACGCAGACGAGGAAGAAGAAGCTGTATTAGATTTG
AAGACAGCTCGGCTTTTCATTGGATCTGAGGATTTGTTCAAAAATGGAGGAGGAAGGTAG
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TGCGTTGATTAGTGAGCTCTCCAATAACAAGAACTCAATCTCAAATGGTGTCTTTGATAA
GAAGAAGCAAGTTTTTGATGAATTTGTTGTCAAAGAGATACAATGCGGAGGAGCAGCTGC
TGGTGCCACTGAGAAGAGTCATCATCATCATCACACCATGAATGATGTTTCTGTTCAGAC
GACACAAAGTCCCTTTGCTACTGCTGCTGCTAATAATAATAACAACTCATTCTGGGAGGA
CAGGTTCACGTTTTTTGACAGTTTAGTAGATACAGAGCTTGATTTATTACCCCCATGGAA
TCATACCGACGCTGAGGTTTACAGTATTGATCCAACAACTACTATAAGGAGCTTTGTGAA
TCCATTGAGTCATCATGAAAAGGTTAATAAAAGCAATAAAGTGGCTGTGGAAGAAGACAT
CTTCTCTCACTATGACCATGCCAAAGCATCTCAATCCTTGGGAGTTGATAGTATACAAGA
AGGATTTATCACCACCACCTCATCAGACCAGTGGAAGGACTGTTCCGTTACAACTATTTA
TTCACTGTCCAAAGGAGGAAGCACGTCAAGTAAGGATATCGGTGTACCCGTTTTAG

QA 2 777 2 777
DS 



AS 1 2

CO CL6806Contig1 800 2 6 U
GGGCTTCTCTCTTTGAGAAAGTAAAAATAATAAAAAGGGAGGAAAAATGGTTACCACCCG
GCAAACGAAGGCCAGAGTCACCACATCTTCTCACCGCCGGCAACTACCGGAGCCAGATTC
TTCGGTGAAGAAGTTCTTCAAGGTGGTTTTACCTTCAACAATGAAGAGAAACATGCTGAT
GTTTCCACCAAGATTTGTGAAGCTACAAGGGAGTGCACTCTCTGAAGTCGTTACATTGGA
GACTCCTGTGGGATTCAGGCGTTCGATAAAGCTTAAGCGGATCGGTGAAGAGATTTGGTT
ACATGTCGGTTGGAGTGAGTTTGCAGAGGCTCATTCCATCAGTGAAGGCCATTTTCTCTT
CTTCGACTACAAAGGAAACTCAAGTTTCAGTGTAATGATCTTTAGTGTCTCGGCTTGCGA
GATTGATTATCCACTGGATGCAGTTCATATCAGTGACAGCGACGATGACGTAATGGACGT
TACAGACGAAGGGTTTCTTGGAACCCAAGGTGCTAGGAGAAATGATCAATCTGTTGATGA
TGGTGGTAAGAGACCAAGAGACGAGGACTTTGAGAAGATTCTAAACGATGTTGATGGGAT
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GTACGTCCTTAAATGAAACTCAAAAAACTTGGAACTGTAATGTTTAAACAAAACTGTAAC
CAGGTCTTGTTTTGATTTTT


BQ
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AF RS1BC72TF U 1
AF RS1BC72JQ C 218
BS 1 638 RS1BC72TF
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BS 640 656 RS1BC72TF
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BS 738 800 RS1BC72JQ

RD RS1BC72TF 740 0 0
GGGCTTCTCTCTTTGAGAAAGTAAAAATAATAAAAAGGGAGGAAAAATGGTTACCACCCG
GCAAACGAAGGCCAGAGTCACCACATCTTCTCACCGCCGGCAACTACCGGAGCCAGATTC
TTCGGTGAAGAAGTTCTTCAAGGTGGTTTTACCTTCAACAATGAAGAGAAACATGCTGAT
GTTTCCACCAAGATTTGTGAAGCTACAAGGGAGTGCACTCTCTGAAGTCGTTACATTGGA
GACTCCTGTGGGATTCAGGCGTTCGATAAAGCTTAAGCGGATCGGTGAAGAGATTTGGTT
ACATGTCGGTTGGAGTGAGTTTGCAGAGGCTCATTCCATCAGTGAAGGCCATTTTCTCTT
CTTCGACTACAAAGGAAACTCAAGTTTCAGTGTAATGATCTTTAGTGTCTCGGCTTGCGA
GATTGATTATCCACTGGATGCAGTTCATATCAGTGACAGCGACGATGACGTAATGGACGT
TACAGACGAAGGGTTTCTTGGAACCCAAGGTGCTAGGAGAAATGATCAATCTGTTGATGA
TGGTGGTAAGAGACCAAGAGACGAGGACTTTGAGAAGATTCTAAACGATGTTGATGGGAT
CAATTCAATCAAACCGCTTGAGGAAGAAGAAGAAGAAG*CAAGAGAGTCTTCAGGG*ACA
CCAGTTCTTTTAACAGAACAGAAGACCTGCATGTGTTTATGTTGTGTAATGTAAAATATT
GTACGTCCTTAAATGAA
CTC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RS1BC72JQ 583 0 0
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AGCGACGATGACGTAATGGACGTTACAGACGAAGGGTTTCTTGGAACCCAAGGTGCTAGG
AGAAATGATCAATCTGTTGATGATGGTGGTAAGAGACCAAGAGACGAGGACTTTGAGAAG
ATTTTAAACGATGTTGATGGGATCAATTCAATCAAACCGCTTGAGGAAGAAGAAGAAGAA
GGCAAGAGAGTTTTCAGGGGACACCAGTTCTTTTAACAGAACAGAAGACCTGCATGTGTT
TATGTTGTGTAATGTAAAATATTGTACGTCCTTAAATGAAACTCAAAAAACTTGGAACTG
TAATGTTTAAACAAAACTGTAACCAGGTCTTGTTTTGATTTTT

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 2

CO CL6807Contig1 655 2 2 U
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AGCAATCATATCAGAAACAACAACAAGAAGGAGGAAAACATCAAACAACATCAAAAGAAT
AAAAAACATTGCAATCATATGCAAACAGAGTGTGTAAGACAAAGACGGTAATATGTTGTG
TGGCAGCAGCTAAAGAGCTTAGCTTCTCACTTGGAGGTGGTGGAGTAAAGAAAGGGATGG
TAGGAATGCTGGTGGGAATATTAAAGGGGAAATTGTTTGGAATGCTAATTGGGAAATTAG
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GTATTTGTGGGTTTGGTAATGGTGGAAACGCTGCAGGTTGAGGAAGCGAAAAAGGCATTG
GTGGTGGCATTGTGGGTTTGGGAAGAGGTGGGAATGTTGTTGTAACCGGTGGTTGAGTGG
CTGGTGTTGATTGGAGAAGATGGCGAGCAGATAGACCAGTGAATAAGCTAGTGAATGTAA
CTGCAATGACGATGGATGATAGCCAAGAAACCATTTTGGGGACTTAGGATTTTGTGTTGT
TACTTGAGAGAGGGGATGAGGGCTGTGTGAGTATTTTTAGGTTTGTTTGATGGCC


BQ
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AF RS1DJ90TF C 1
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DS 

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DS 



AS 1 2

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AGGTAAAGAACCCTAGCCTTTTGATTCAAATTACTTATTTAATGATTAATATCTTTGTGA
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GTTTTACTAGCTGGGAAGTTGTACTTTAACAGCTACGATTTCTACTTAGAGTTTGACCAT
GATATATATATATATACACTGTTACATGTCCAATCGTGAAAGGTGATGTAGAAATAAGTT
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CATGTGATTATTTGCTAAGTTTTATATTAGACACATTACTTATTTGTTATCCTTTAACAT
GTAATCACTTACAAAATACATTTCTTTAACACATATATTACTGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BZ09TF U 1
AF RS1BZ09JQ C 467
BS 1 783 RS1BZ09TF
BS 784 1186 RS1BZ09JQ

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TTA

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DS 

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AGTCATTTATATGAATCCTCTTGAATTATGTTTGTGTTCTGTTATGTCCATGGAAGTATG
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TCGCTGGCGGAAAGAATGATTTGTTGAAAGCTACACCGGAAGAACATGGATGTCTCGCTA
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QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

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TTGTTGTTGGTCTCTTTTGTCTTAACGAAGAACAGGGTGATTTATGTCGGCTGGGTTTGA
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ATCATCTTCAACTAAATCTTATCTGGCAAACGATCTTCATCACTTCTGCTCTAATAAGCA
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BQ
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AF RS1FA37TF U 1
AF RS1FA37JQ C 41
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RD RS1FA37TF 674 0 0
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TGTTGTTGTTTTTTCTTTCCTTCTCTGCAACTTTGTCACGGATCCTTCGTTTTTATTTTA
TCTATATAAAACCATAGGATAAATCTCGTCCCCAGAAATCTAATCTCTCTAGGGTTTTAG
CTGTGTGGGTTTTTTATTTTCGTGTTTCTTTTCTCACTTCTTTTTTTGTTCTTCTTCTCG
TTGTTGTTGGTCTCTTTTGTCTTAACGAAGAACAGGGTGATTTATGTCGGCTGGGTTTGA
ATCAAAAGCTGTGATTTTGTCTCTGCTTAACAACAACATCTCTTGTCTGATTTCATCATC
ATCATCTTCAACTAAATCTTATCTGGCAAACGATCTTCATCACTTCTGCTCTAATAAGCA
GAGGCTTGTTCTCGAGAGTCCTTCTCTCTCCATGCGCTTAAGACCCAAAAGGACTTGTTC
CGGCGTTGAAGTCTTCGGTGGTTTTCACGTAAAGCAGTTCATTGTTCGCTGAGATTTTTT
TTTATTACAAAACAAGTTTTGATCTGAAGAGTGCTCTGTCTTTTTTTTTCTGGGTGTTTT
TTTTTTCTTTGAGGATTTGTGACGGAAAAAA*TGGTAGGGATTATAAGTAAACAACTGTC
TTTGAGTGATATGA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1FA37JQ 658 0 0
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GATCCTTCGTTTTTATTTTATCTATATAAAACCATAGGATAAATCTCGTCCCCAGAAATC
TAATCTCTCTAGGGTTTTAGCTGTGTGGGTTTTTTATTTTCGTGTTTCTTTTCTCACTTC
TTTTTTTGTTCTTCTTCTCGTTGTTGTTGGTCTCTTTTGTCTTAACGAAGAACAGGGTGA
TTTATGTCGGCTGGGTTTGAATCAAAAGCTGTGATTTTGTCTTTGCTTAACAACAACATC
TCTTGTCTGATTTCATCATCATCATCTTCAACTAAATCTTATCTGGCAAACGATCTTCAT
CACTTTTGCTCTAATAAGCAGAGGCTTGTTCTCGAGAGTCCTTCTCTCTCCATGCGCTTA
AGACCCAAAAGGACTTGTTCCGGCGTTGAAGTTTTCGGTGGTTTTCACGTAAAGCAGTTC
ATTGTTCGCTGAGATTTTTTTTTATTACAAAACAAGTTTTGATCTGAAGAGTGCTCTGTC
TTTTTTTTTCTGGGTGTTTTTTTTTTCTTTGAGGATTTGTGACGGAAAAAAATGGTAGGG
ATTATAAGTAAACAACTGTCTTTGAGTGATATGAAGAAACCAAAGATATGCAATCCTC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

CO CL6810Contig1 1305 2 4 U
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GATAAAAAATGTCTCTGAAAGCAATTCATGTAACGGAAGTGCCAAGCCTCGACAACTTCC
CGGAGAATCCCTCCCTCTGCGCTTCTCGTTTCTCCCCTGGTGGTCTAAGCTCTTTCAAGA
TCCCAAAGTTTCTGGTGGTGGGGCATAGAGGTCACGGCATGAACATGTTGCAGTCCCCGG
ATCCAAGGTTCTCTGCCTTCAAAGAAAACTCCATCCTCTCCTTCAATGCCGCTTCAAAAC
TCCCTCTCGACATTATCGAATTCGATGTTCAGGTCACCAGAGATGGCTGCCCAGTCATTT
TCCACGACGACTTCATCTACTCTGAAGATAACGGAGTGGTCTACGAGAAGAGGGTCACGG
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AGCCATTGCTGAGGAAGTCCAAGGAAGGAAAGATCCTCAAGTGGTGCGTCCAACAAGACG
ACTCTCACTGTACTCTTCAGGAGGCTTTTGAGAAAGTTGACCCCAAGTTGGGTTTCAACA
TCGAGCTCAAGCTTGACGACAACCTTGTCTATTCCTCCGACCACCTCTCCCGTCTTCTCC
TCCCGATCTTGCAGGTTGTGTCTGATTATGGAAAAGACAGACCCATCATCTTCTCCAGCT
TTCACCCTGATGCTGCCCTCCTCGCCAGGAAGTTGCAGAGCATCTACCCTGTGTTCTTCT
TGACAAACGGAGGAACAGAGATGTACTACGACGTGAGAAGGAATTCGCTGGAGGAAGCAA
TCAAAGTATGTATAGAGGGAGGCCTCCAAGGGATTGTCTCGGAGGTGAAGGGTGTTTTCC
GAAACCCAGCGGTGGTCAACAGGATAAAAGAATCCAAACTCTCCCTGATGACATACGGGA
AGCTCAACAATGTAGCTGAGGCTGTGTATATGCAGCATTTGATGGGAATAGAAGGAGTCA
TAGTTGATCATGTGGAAGAGATAACAGAGGCTGTGAGAGAGATGACCAATAGAGATGCTC
ATGATACTAAGCCAAAGCCAAACTTTTCTGAGAGAGAGCTCTCCTTTCTTCTCAAGCTCA
TTCCTGAGTTGATACAACACTGAACTGTTAACTCTCTGTTAGTTACATATTATAATAGGA
TATGTTGTTTTCCCAAAAACTGGGTATATGAAAAATCTGACAATGTATGTGGGGATGCTG
TTATCCTGAGAGCCCAAATGTTATATATAGATTGATATCAGTACC


BQ
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AF RS1CJ39TF U 1
AF RS1CJ39JQ C 520
BS 1 694 RS1CJ39TF
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RD RS1CJ39TF 740 0 0
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GATAAAAAATGTCTCTGAAAGCAATTCATGTAACGGAAGTGCCAAGCCTCGACAACTTCC
CGGAGAATCCCTCCCTCTGCGCTTCTCGTTTCTCCCCTGGTGGTCTAAGCTCTTTCAAGA
TCCCAAAGTTTCTGGTGGTGGGGCATAGAGGTCACGGCATGAACATGTTGCAGTCCCCGG
ATCCAAGGTTCTCTGCCTTCAAAGAAAACTCCATCCTCTCCTTCAATGCCGCTTCAAAAC
TCCCTCTCGACATTATCGAATTCGATGTTCAGGTCACCAGAGATGGCTGCCCAGTCATTT
TCCACGACGACTTCATCTACTCTGAAGATAACGGAGTGGTCTACGAGAAGAGGGTCACGG
AGGTTAGCTCGTCCGAGTTCATGTCCTATGGGAAACAAAGGGAAACAGAGAAGAGCGGGA
AGCCATTGCTGAGGAAGTCCAAGGAAGGAAAGATCCTCAAGTGGTGCGTCCAACAAGACG
ACTCTCACTGTACTCTTCAGGAGGCTTTTGAGAAAGTTGACCCCAAGTTGGGTTTCAACA
TCGAGCTCAAGCTTGACGACAACCTTGTCTATTCCTCCGACCACCTCTCCCGTCTTCTCC
TCCCGATCTTGCAGGTTGTGTCTGATTATGGAAA*GACAGACCCATCATCTTCTCCAGCT
TTCACCCTGATGCTGCCC
CC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1CJ39JQ 786 0 0
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ACCACCTCTCCCGTCTTCTCCTCCCGATCTTGCAGGTTGTGTCTGATTATGGAAAAGACA
GACCCATCATCTTCTCCAGCTTTCACCCTGATGCTGCCCTCCTCGCCAGGAAGTTGCAGA
GCATCTACCCTGTGTTCTTCTTGACAAACGGAGGAACAGAGATGTACTACGACGTGAGAA
GGAATTCGCTGGAGGAAGCAATCAAAGTATGTATAGAGGGAGGCCTCCAAGGGATTGTCT
CGGAGGTGAAGGGTGTTTTCCGAAACCCAGCGGTGGTCAACAGGATAAAAGAATCCAAAC
TCTCCCTGATGACATACGGGAAGCTCAACAATGTAGCTGAGGCTGTGTATATGCAGCATT
TGATGGGAATAGAAGGAGTCATAGTTGATCATGTGGAAGAGATAACAGAGGCTGTGAGAG
AGATGACCAATAGAGATGCTCATGATACTAAGCCAAAGCCAAACTTTTCTGAGAGAGAGC
TCTCCTTTCTTCTCAAGCTCATTCCTGAGTTGATACAACACTGAACTGTTAACTCTCTGT
TAGTTACATATTATAATAGGATATGTTGTTTTCCCAAAAACTGGGTATATGAAAAATCTG
ACAATGTATGTGGGGATGCTGTTATCCTGAGAGCCCAAATGTTATATATAGATTGATATC
AGTACC

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

CO CL6811Contig1 499 2 1 U
GGATGAGATGTTCAGAGTCATCAGATCTGGGAAGAGGAAAACAAAACAGTGGAAGAGGAT
GGTTACAAAAGCTACATTTGTTGGACTGGTTTCACTAGGAAGCCGCCAAAGTACGAGCGA
TTCATCCGCCCTTCTGGACTTCGTTTCACCAAGGCCCACGTCACTCACCCTGAACTAAGA
TGCACTTTCTGTCTTGAGATCATCGGAATCAAGAAGAATCCCAACGGTCCAATGTACACA
TCGCTTGGTGTCATGACCAGAGGAACAATCATCGAGGTCAATGTGAGTGAGCTTGGTCTT
GTTACACCAGCTGGAAAAGTTGTCTGGGGGAAGTACGCTCAGGTGACAAACAATCCAGAG
AATGACGGGTGTATAAACGCTGTTCTGCTTGTGTAATCAAAATCTCCGGCGAGAATCATG
TTGTTTACTTTTTTTTGTTCTCTACTGAAACAATTTTGTCTTTAACTCAAGCTTTTTATT
TATCGGTGTTCTTTATTAC


BQ
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AF RS1C883JQ C 1
AF RS1C883TF U 1
BS 1 499 RS1C883TF

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TATCGGTGTTCTTTATTAC

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DS 

RD RS1C883TF 499 0 0
GGATGAGATGTTCAGAGTCATCAGATCTGGGAAGAGGAAAACAAAACAGTGGAAGAGGAT
GGTTACAAAAGCTACATTTGTTGGACTGGTTTCACTAGGAAGCCGCCAAAGTACGAGCGA
TTCATCCGCCCTTCTGGACTTCGTTTCACCAAGGCCCACGTCACTCACCCTGAACTAAGA
TGCACTTTCTGTCTTGAGATCATCGGAATCAAGAAGAATCCCAACGGTCCAATGTACACA
TCGCTTGGTGTCATGACCAGAGGAACAATCATCGAGGTCAATGTGAGTGAGCTTGGTCTT
GTTACACCAGCTGGAAAAGTTGTCTGGGGGAAGTACGCTCAGGTGACAAACAATCCAGAG
AATGACGGGTGTATAAACGCTGTTCTGCTTGTGTAATCAAAATCTCCGGCGAGAATCATG
TTGTTTACTTTTTTTTGTTCTCTACTGAAACAATTTTGTCTTTAACTCAAGCTTTTTATT
TATCGGTGTTCTTTATTAC

QA 1 499 1 499
DS 



AS 1 2

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CTTCATCTGCTCTCAAGTAGGTTAAATCGATTTTGTTTCTTATCAGCGATCATCTGCTTT
GCGATATTTCTGTAATCTTCGAAATCGGGGTGATCGGAGGAACCATGTTCAATTTCTGGG
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TCTTGAACTCCCTTGAGCAGGTTACTATTCAAAACAACATAAGAGAAGAGCTTCGCAAAG
AAACATTACATCTTGCTAGAGAAAACTTGGAGAAAGAACCACAGATGGTGGAGCTCAGAA
ACCAATGCAGAATAATCCGTACGAGTGAGCTTGCAACTGCTCAAGAGAAGCTCAATGAGC
TCGAGAATCAAAGAGACGAGATCCTCAAATTCTACTCTCCTGCTTCTCTTCTTCATAGAC
TTCAAGATGCTATTAAGAAGGGAGATGAAGAATCAGAGGAGCTGCAACAGAAGTATATGG
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ATCGTCGCGCTTTAATCCATCTCTCTGCTAAAACTTCATTCACCGGTTGAAAGCTCCTTG
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AAAACAATATTATTGGATTGCAGAATCATTCTATTATATGATATCTGAAGCTGAACCGTG
TAATGTTTGAATCTTTTTTTGTTATATTACATGGTGG


BQ
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AF RS1C022TF U 1
AF RS1C022JQ C 290
BS 1 681 RS1C022TF
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BS 683 786 RS1C022TF
BS 787 997 RS1C022JQ

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GCGATATTTCTGTAATCTTCGAAATCGGGGTGATCGGAGGAACCATGTTCAATTTCTGGG
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CATGGTATTCTCCGTCTCTGGTCACCTCTCCTAGCTTATCTCGGCCTCAGTCATCATCAG
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AAGACAAAAGTGTGGATGAGCTCAGTAAGCTTCTGACTGACAAGGATGCGTACCAACACT
TCTTGAACTCCCTTGAGCAGGTTACTATTCAAAACAACATAAGAGAAGAGCTTCGCAAAG
AAACATTACATCTTGCTAGAGAAAACTTGGAGAAAGAACCACAGATGGTGGAGCTCAGAA
ACCAATGCAGAATAATCCGTACGAGTGAGCTTGCAACTGCTCAAGAGAAGCTCAATGAGC
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TTCAAGATGCTATTAAGAAGG*AGATGAAGAATCAGAGGAGCTGCAACAGAAGTATATGG
AGAAGGAGATCGATACAGCAGCGTTTGTGCAGAAGTATAAGAAGCTAAGAGGGCAGTACC
ATCGTC

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GGAGCTCAGAAACCAATGCAGAATAATCCGTACGAGTGAGCTTGCAACTGCTCAAGAGAA
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TCTTCATAGACTTCAAGATGCTATTAAGAAGGGAGATGAAGAATCAGAGGAGCTGCAACA
GAAGTATATGGAGAAGGAGATCGATACAGCAGCGTTTGTGCAGAAGTATAAGAAGCTAAG
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AAAGCTCCTTGGTTGTTTCCTTAAGCCGTTGTGTAAGTATAAAATACAATTCAGTAATTG
AGATATATCTGAAAACAATATTATTGGATTGCAGAATCATTCTATTATATGATATCTGAA
GCTGAACCGTGTAATGTTTGAATCTTTTTTTGTTATATTACATGGTGG

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

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ATATCCCCAGTCTACAACTATTACACAGGCGCCATCACAACAAAGAAAGACTTTCTTATT
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TCTGTTCCTCGCTCTCCACAGTTCTTGACGTCTTCTCGTGACAAACAGTGGTGGTTTTAT
CATCCGACTTTGTTTTGGCTGCTTCATCTGATCTCTCCTTTGTTTCCTCCTTTGGCTTCG
CATCCAAAACTGGATCTTCAGCAAGACTTTTCTCAAGGCCATTAGTCTTAGCTTTCTTTT
TCGAGTGATGATGTTCTAAGCGCTCAGCTGAGCTCTGGGGAGTTTTGTTGACTTGTGTGT
CTTTACTAGCACTCGGTTCTTTGTCACCATCAACTTCTTCAGAGTCCAGCGTGTTGTTGT
GAGTGACAATCCTTCCTGGTGGCATGTCATGGTCGTGGTTCCCCTCGTACGTCATTATAA
GCATCTTCGTGTCATGAGATGACCTCTCTACGTGTTTCTTGACAGGCATCCAGAACTTGA
ACATCTATAGTAGCTCCTTGGATATGGACTGCCTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H437JQB U 1
AF RS1E661JQ U 1
BS 1 816 RS1E661JQ

RD RS1H437JQB 640 0 0
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ATATCCCCAGTCTACAACTATTACACAGGCGCCATCACAACAAAGAAAGACTTTCTTATT
TTGTGCTACCCAACTTTTATTTGAACCAAATCGAAATGGCTTAATGCGCATATGCTATAA
TATTAAAGGGTCATAAGCATACACTATACCATCCATTATACACTAAATCTAATCTGGTTC
CCGCTTGAACACCAAGCTGTATGCCTGTACTAATCTCTATGTTAAGCATCTCTTGTATAT
ATCATTTAACACCTCACAAATGCCACCTTTTTTAGCTTTGACCAGACTCTGCTTTGGGTT
TCTGTTCCTCGCTCTCCACAGTTCTTGACGTCTTCTCGTGACAAACAGTGGTGGTTTTAT
CATCCGACTTTGTTTTGGCTGCTTCATCTGATCTCTCCTTTGTTTCCTCCTTTGGCTTCG
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TCGAGTGATGATGTTCTAAGCGCTCAGCTGAGCTCTGGGGAGTTTTGTTGACTTGTGTGT
CTTTACTAGCACTCGGTTCTTTGTCACCATCAACTTCTTC

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1E661JQ 816 0 0
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ATATCCCCAGTCTACAACTATTACACAGGCGCCATCACAACAAAGAAAGACTTTCTTATT
TTGTGCTACCCAACTTTTATTTGAACCAAATCGAAATGGCTTAATGCGCATATGCTATAA
TATTAAAGGGTCATAAGCATACACTATACCATCCATTATACACTAAATCTAATCTGGTTC
CCGCTTGAACACCAAGCTGTATGCCTGTACTAATCTCTATGTTAAGCATCTCTTGTATAT
ATCATTTAACACCTCACAAATGCCACCTTTTTTAGCTTTGACCAGACTCTGCTTTGGGTT
TCTGTTCCTCGCTCTCCACAGTTCTTGACGTCTTCTCGTGACAAACAGTGGTGGTTTTAT
CATCCGACTTTGTTTTGGCTGCTTCATCTGATCTCTCCTTTGTTTCCTCCTTTGGCTTCG
CATCCAAAACTGGATCTTCAGCAAGACTTTTCTCAAGGCCATTAGTCTTAGCTTTCTTTT
TCGAGTGATGATGTTCTAAGCGCTCAGCTGAGCTCTGGGGAGTTTTGTTGACTTGTGTGT
CTTTACTAGCACTCGGTTCTTTGTCACCATCAACTTCTTCAGAGTCCAGCGTGTTGTTGT
GAGTGACAATCCTTCCTGGTGGCATGTCATGGTCGTGGTTCCCCTCGTACGTCATTATAA
GCATCTTCGTGTCATGAGATGACCTCTCTACGTGTTTCTTGACAGGCATCCAGAACTTGA
ACATCTATAGTAGCTCCTTGGATATGGACTGCCTTT

QA 1 816 1 816
DS 



AS 1 2

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GTTACTTCTCCTAGCTTCTCGTCACCATCTTCCGATGACATCTCCGAACTGTTCGACGCT
TGGTGCCAGAGACACGGCAAAACGTACGCTTCGGAAGCAGAGAGGCAACGCAGAATCCAA
ATCTTTAAAGACAATCACGACTTCGTCACACGCCACAACGACATCGCTAACGCTACTTAC
TCTCTCTCACTCGACAACGCCTTCGCGGATCTGACTCACCACGAGTTCAAGGCCTCTCGT
CTCGGACTCTCTGCTTCTTCAGCTCCCTTGCTGATGATGATGGATAAGGGACAGAGCGTT
GAAAAATTTGGTGGGAAGGTTCCAGATTCTGTTGATTGGAGGAAGAAAGGAGCTGTTACT
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GAAGGAATCAACCAGATTGTAACAGGAGACCTCATCAGCCCCTCTGAGCAAGAACTCATC
GATTGTGACAAGTCATACAACGATGGCTGCAATGGTGGTCTCATGGACTATGCTTTTGAG
TTTGTCATTAAAAACCATGGAATCGACACTGAGAAAGATTATCCTTATCAAGAACGTGAT
GGCACCTGCAAGAAAGATAAGTTGAAAACACGGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EG65TF U 1
AF RS1BK50TF U 66
BS 1 124 RS1EG65TF
BS 125 125 RS1BK50TF
BS 126 491 RS1EG65TF
BS 492 492 RS1BK50TF
BS 493 569 RS1EG65TF
BS 570 570 RS1BK50TF
BS 571 580 RS1EG65TF
BS 581 581 RS1BK50TF
BS 582 673 RS1EG65TF
BS 674 674 RS1BK50TF
BS 675 699 RS1EG65TF
BS 700 700 RS1BK50TF
BS 701 713 RS1EG65TF
BS 714 714 RS1BK50TF
BS 715 730 RS1EG65TF
BS 731 756 RS1BK50TF

RD RS1EG65TF 744 0 0
GGACGACGACGACCAAACAAAAAGCTCTTCTTGTTTTTGGTTTCCCTGTAAGGAAAAGAG
ATGTCACCATCATCGTCATCTTCTTACTTTCTCTCTCTCACTTTCTTCTTCCTTCTTCTA
GTTATTTCTCCTAGCTTCTCGTCACCATCTTCCGATGACATCTCCGAACTGTTCGACGCT
TGGTGCCAGAGACACGGCAAAACGTACGCTTCGGAAGCAGAGAGGCAACGCAGAATCCAA
ATCTTTAAAGACAATCACGACTTCGTCACACGCCACAACGACATCGCTAACGCTACTTAC
TCTCTCTCACTCGACAACGCCTTCGCGGATCTGACTCACCACGAGTTCAAGGCCTCTCGT
CTCGGACTCTCTGCTTCTTCAGCTCCCTTGCTGATGATGATGGATAAGGGACAGAGCGTT
GAAAAATTTGGTGGGAAGGTTCCAGATTCTGTTGATTGGAGGAAGAAAGGAGCTGTTACT
AATGTCAAAGATCAAGGAAGCTGCGGAGCGTGTTGGTCTTTCTCGGCGACTGGAGCTATG
GAAGGAATCAACCAGATTGTAACAGGAGATCTCATCAGCCTCTCTGAGCAAGAACTCATC
GATTGTGACAAGTCATACAACGATGGCTGCAATGGTGGTCTCATGGACTATGCTTTTGAG
TTTGTCATTAAAA*CCATGGAATCGACACTGAGAAAGAT*ATCCTTATCAAGA*CGTGAT
GGCACCTGCA
GAAGATAGTGAAAA

QA 1 730 1 730
DS 

RD RS1BK50TF 691 0 0
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TTCTCCTAGCTTCTCGTCACCATCTTCCGATGACATCTCCGAACTGTTCGACGCTTGGTG
CCAGAGACACGGCAAAACGTACGCTTCGGAAGCAGAGAGGCAACGCAGAATCCAAATCTT
TAAAGACAATCACGACTTCGTCACACGCCACAACGACATCGCTAACGCTACTTACTCTCT
CTCACTCGACAACGCCTTCGCGGATCTGACTCACCACGAGTTCAAGGCCTCTCGTCTCGG
ACTCTCTGCTTCTTCAGCTCCCTTGCTGATGATGATGGATAAGGGACAGAGCGTTGAAAA
ATTTGGTGGGAAGGTTCCAGATTCTGTTGATTGGAGGAAGAAAGGAGCTGTTACTAATGT
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AATCAACCAGATTGTAACAGGAGACCTCATCAGCCCCTCTGAGCAAGAACTCATCGATTG
TGACAAGTCATACAACGATGGCTGCAATGGTGGTCTCATGGACTATGCTTTTGAGTTTGT
CATTAAAAACCATGGAATCGACACTGAGAAAGATTATCCTTATCAAGAACGTGATGGCAC
CTGCAAGAAAGATAAGTTGAAAACACGGGTC

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

CO CL6815Contig1 1387 2 8 U
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AAAGAGAGAGAGAGATTCCGATCAAAACAAGTAAACGAAAAATCTAATCACCGTTTGAGT
TCTTTCTCTCTTCTCTGGGGTTCTTCTTCTTCTACAAGCTTCATCCACTAAACATGAGTC
GTCATCCTGGAGTTAAATGGGCAGAGACCACTGACAAGATTTTCCTCACCGTAGTGTGGC
TGATTCCAAGGAGACATAAGTTAATCTTCTCACTGAAGTTGTCTTCGATTTCTCTGCAAA
AGCTGGTCCTGAAAATCACGTTTATGAGCTTAAACTCGAGCTTCACAACAAAGTCAATGT
TGAGGAGAGCAAAATCAACATTGGATTGAGAAGCATATTCTGCATAATTGAGAAAATAGA
GCCTGAAACGTGGGACAAACTAATCCTTCGAAAGGGCCACACTATGTCAAGATTGATTGG
GAGGCTGTACTGCTTACAATCAAGGGACCGGACGAGGAACGTCTGTATTAGAAATGGTTG
CTGCTTTTAAAAAAAGCTTCTGGCAAGAAAATAGCTATCAAGCTTTGTCCGAGAAGACCA
GGAGATGCAACTGCAGTTTATACTTCAACAGAGAGAGCTGAGAAAGAACTTGGCTGCAAG
ATAAAAGAGAGAAAGAGCAACAACTTCTATGTAATATCCAAAGAGATGATTATGCTGTAA
CATCACAAGAACCTACTACTCCTAATGCTGGCGATGCCTTACGTTCACGGTAGATCATGG
AGTGCATGCGTGATTACAAGAGCAAGGAAGAGACTGTAAAATATCTGTTGGATCAATATC
GAATCACACATGAATCGACCAACACATGAAACTAAAAAGCCTTTGGTCTTGTGCCTTTTC
ATTCAAAGGAAGACCATAGTGAGCTACTCCGTTGTGTGGTGGTTGCGTACGGCATGGTCA
AACGGCTCAAAAGTCTCATGGTAAGGACATACCTATTCTTTATATGTTTTGATGTGACAT
GGTGTTGAATTGGGTGGCGCAAGAAGCACAAGTGGCAGGGTGTCAGTTTGAGGTCTGAAG
CAGAGAGGGATCTAGGGAGGAAGAGGCAGCGATAGAACAAAGGGAAACGGGGTCTAGACC
TCCTAACCAAGCAACTTAAAGCAAGGTGTATGATTTTGACCTGATCGGGTTCACGGAGTC
TCAACTACTGTACGAAATCCAGGAGAAACGAGGCGAAGTCGGACATGGTGTAGAAAGAAA
AGGAAGAAGTCATCTCTGGCTTCTGCAAAATAACTAACTTTCATTCAGTTTTTAAGAACA
TATAAATGTTTAAGAGCGTTCAAAGCTGTCTCTATTCATTTGTTTCGGTTCTGTAAAAAG
CTTATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BJ52TF U 1
AF RS1BJ52JQ C 650
BS 1 693 RS1BJ52TF
BS 694 694 RS1BJ52JQ
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BS 732 769 RS1BJ52TF
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RD RS1BJ52TF 776 0 0
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AAAGAGAGAGAGAGATTCCGATCAAAACAAGTAAACGAAAAATCTAATCACCGTTTGAGT
TCTTTCTCTCTTCTCTGGGGTTCTTCTTCTTCTACAAGCTTCATCCACTAAACATGAGTC
GTCATCCTGGAGTTAAATGGGCAGAGACCACTGACAAGATTTTCCTCACCGTAGTGTGGC
TGATTCCAAGGAGACATAAGTTAATCTTCTCACTGAAGTTGTCTTCGATTTCTCTGCAAA
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TGAGGAGAGCAAAATCAACATTGGATTGAGAAGCATATTCTGCATAATTGAGAAAATAGA
GCCTGAAACGTGGGACAAACTAATCCTTCGAAAGGGCCACACTATGTCAAGATTGATTGG
GAGGCTGTACTGCTTACAATCAAGGGACCGGACGAGGAACGTCTGTATTAGAAATGGTTG
CTGCTTTTAAAAAAAGCTTCTGGCAAGAAAATAGCTATCAAGCTTTGTCCGAGAAGACCA
GGAGATGCAACTGCAGTTTATACTTCAACAGAGAGAGCTGAGAAAGAACTTGGCTGCAAG
ATAAAAGAGAGAAAGAGCAACAACTTCTATGTA*TATCCAAAGAGATGATTATGCTGTA*
CATCACAAGA*CCTACTACTCCTAATGCTGGCGATGCCTTACGTTCACG
TAGATCA

QA 1 769 1 769
DS 

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GGGCTGCAAG
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GAGTGCATGCGTGATTACAAGAGCAAGGAAGAGACTGTAAAATATCTGTTGGATCAATAT
CGAATCACACATGAATCGACCAACACATGAAACTAAAAAGCCTTTGGTCTTGTGCCTTTT
CATTCAAAGGAAGACCATAGTGAGCTACTCCGTTGTGTGGTGGTTGCGTACGGCATGGTC
AAACGGCTCAAAAGTCTCATGGTAAGGACATACCTATTCTTTATATGTTTTGATGTGACA
TGGTGTTGAATTGGGTGGCGCAAGAAGCACAAGTGGCAGGGTGTCAGTTTGAGGTCTGAA
GCAGAGAGGGATCTAGGGAGGAAGAGGCAGCGATAGAACAAAGGGAAACGGGGTCTAGAC
CTCCTAACCAAGCAACTTAAAGCAAGGTGTATGATTTTGACCTGATCGGGTTCACGGAGT
CTCAACTACTGTACGAAATCCAGGAGAAACGAGGCGAAGTCGGACATGGTGTAGAAAGAA
AAGGAAGAAGTCATCTCTGGCTTCTGCAAAATAACTAACTTTCATTCAGTTTTTAAGAAC
ATATAAATGTTTAAGAGCGTTCAAAGCTGTCTCTATTCATTTGTTTCGGTTCTGTAAAAA
GCTTATAT

QA 11 738 11 738
DS 



AS 1 2

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GAATCATGTGCTAAAGATTTTGCTGAATACATTTATTAAAAAAACTTCGACTC


BQ
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AF RS1F373JQ C 1
AF RS1F373TF U 1
BS 1 643 RS1F373TF
BS 644 653 RS1F373JQ

RD RS1F373JQ 653 0 0
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GTTTCAAAGGCTGAGCTAAAGGAGAAGTTGGCAAGGATGTACGAGGTGAAGGATCCAAAT
GCAATCTTTGTTTTCAAATTCAGAACCCACTTTGGAGGTGGCAAATTTTCTGGATTTGGT
TTGATCTATGACAATGTCGAGAGTGCCAAGAAATTCGAGCCCAAGTACAGGCTCATCAGG
AATGGACTTGACACCAAGATTGAGAAATCAAGGAAACAGATTAAGGAGAGAAAGAACAGG
GCCAAGAAAATCCGTGGTGTTAAGAAGACCAAGGCTGGTGACCCCAAGAAGAAGTAAGGT
GTTGAAGACTAGCAGCAGCATTTTGGGTTTTTTTTTGCATCATCGCTTCTTTATTTGGAT
TTTGTACTTGTCATTATCACATTGTTCTGTCTCGTTTTGCATTATGCGTTAAGCTTTAGA
GAATCATGTGCTAAAGATTTTGCTGAATACATTTATTAAAAAAACTTCGACTC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RS1F373TF 643 0 0
GGGCCGCAGCGAGAGAGAGTAGCATTCACAAACCGGAGAGTTCAGTGTGATCTCGGAGGA
ATCGCAGCAGCAGCCATGGCGGAGAAAGCAGTCACCATCAGGACCAGGAAGTTCATGACC
AACAGACTTCTCTCCAGGAAGCAGTTTGTTATTGATGTTCTTCACCCAGGGAGAGCCAAT
GTTTCAAAGGCTGAGCTAAAGGAGAAGTTGGCAAGGATGTACGAGGTGAAGGATCCAAAT
GCAATCTTTGTTTTCAAATTCAGAACCCACTTTGGAGGTGGCAAATCTTCTGGATTTGGT
TTGATCTATGACAATGTCGAGAGTGCCAAGAAATTCGAGCCCAAGTACAGGCTCATCAGG
AATGGACTTGACACCAAGATTGAGAAATCAAGGAAACAGATTAAGGAGAGAAAGAACAGG
GCCAAGAAAATCCGTGGTGTTAAGAAGACCAAGGCTGGTGACCCCAAGAAGAAGTAAGGT
GTTGAAGACTAGCAGCAGCATTTTGGGTTTTTTTCTGCATCATCGCTTCTTTATTTGGAT
TTTGTACTTGTCATTATCACATTGTTCTGTCTCGTTTTGCATTATGCGTTAAGCTTTAGA
GAATCATGTGCTAAAGATTTTGCTGAATACATTTATTAAAAAA

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 2

CO CL6817Contig1 976 2 2 U
TTTTTATAGAGTTTTCCTTTAAATTTATCTAAAAGTCGACGCCGGTGAATGGGTTCGTCT
TCGTCGTCGCTTAACAAGTCCCCGTTTAGAACAGACAGCATGGTAACACCAGAGTCTCCC
ACGAAACATATTAGTTCAGTGCAGAAAAACGACGCCGTCGTCTCGATCGTAGCTAATTCG
TCTCCTTCCACCAAGAAAACCTTCGAATCACCGAGAAAGAGTACAACATCGATTCCTCCG
GTGGCTTCTCCGGCCGTCAAATCTCGGTGGTCGTTTTCTTCTTCTAAGAAAAGTTTCGGA
AGTAAAGATGAAACTTTCTTTGATACGCAGCAGCAGTGGCTACAATCTGACTCGGACGAT
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TTCTCGGACAGGCCTCCTCGTATCCAAAGCCTTATATTCCACGAGAGGAAGTCTTCTCGT
GGCTCTTCTCCAGCGCCAAGACCGAGGAGGAAGAAGCTTGGTGAGCTTTTCAGAGATAGT
ATTAGAGAACAACCAGTGGAAAGCTCTGGAGCGTCATCATCTCTCAGCTCTCCTTACCTC
TCGGGTGTAAACTCAGGGGAACTCAACAACACGGCCATTGAAGACATTAGCGTGAAGGAA
GAGAAGAAGAAGAAGAAGTCTAACTGGCAGCATCATCGATGTCTTCCTGGTTTCTCATCA
TGTGGTGGAAGTTTCATCGAGAGGAGAAAGAAGTTGAACTCTGAAACTGGGGTTGTTAAT
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AAAATGAATCCGATAGTTGAAGTAAAAAAATGTAAAAAAATTATGGTGTTTTGATAATTT
ATATATTTGGTGGGTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FW61TF U 1
AF RS1FW61JQ C 259
BS 1 609 RS1FW61TF
BS 610 976 RS1FW61JQ

RD RS1FW61TF 609 0 0
TTTTTATAGAGTTTTCCTTTAAATTTATCTAAAAGTCGACGCCGGTGAATGGGTTCGTCT
TCGTCGTCGCTTAACAAGTCCCCGTTTAGAACAGACAGCATGGTAACACCAGAGTCTCCC
ACGAAACATATTAGTTCAGTGCAGAAAAACGACGCCGTCGTCTCGATCGTAGCTAATTCG
TCTCCTTCCACCAAGAAAACCTTCGAATCACCGAGAAAGAGTACAACATCGATTCCTCCG
GTGGCTTCTCCGGCCGTCAAATCTCGGTGGTCGTTTTCTTCTTCTAAGAAAAGTTTCGGA
AGTAAAGATGAAACTTTCTTTGATACGCAGCAGCAGTGGCTACAATCTGACTCGGACGAT
GATTTCCACAGCGTTAATGGCGATTTCACACCATCGCGTGGAAACACTCCAAAGCGCAGC
TTCTCGGACAGGCCTCCTCGTATCCAAAGCCTTATATTCCACGAGAGGAAGTCTTCTCGT
GGCTCTTCTCCAGCGCCAAGACCGAGGAGGAAGAAGCTTGGTGAGCTTTTCAGAGATAGT
ATTAGAGAACAACCAGTGGAAAGCTCTGGAGCGTCATCATCTCTCAGCTCTCCTTACCTC
TCGGGTGTA

QA 1 609 1 609
DS 

RD RS1FW61JQ 718 0 0
AAATCTCGGTGGTCGTTTTCTTCTTCTAAGAAAAGTTTCGGAAGTAAAGATGAAACTTTC
TTTGATACGCAGCAGCAGTGGCTACAATCTGACTCGGACGATGATTTCCACAGCGTTAAT
GGCGATTTCACACCATCGCGTGGAAACACTCCAAAGCGCAGCTTCTCGGACAGGCCTCCT
CGTATCCAAAGCCTTATATTCCACGAGAGGAAGTCTTCTCGTGGCTCTTCTCCAGCGCCA
AGACCGAGGAGGAAGAAGCTTGGTGAGCTTTTCAGAGATAGTATTAGAGAACAACCAGTG
GAAAGCTCTGGAGCGTCATCATCTCTCAGCTCTCCTTACCTCTCGGGTGTAAACTCAGGG
GAACTCAACAACACGGCCATTGAAGACATTAGCGTGAAGGAAGAGAAGAAGAAGAAGAAG
TCTAACTGGCAGCATCATCGATGTCTTCCTGGTTTCTCATCATGTGGTGGAAGTTTCATC
GAGAGGAGAAAGAAGTTGAACTCTGAAACTGGGGTTGTTAATGGGAAATAAGATGTAGAG
AATAATAATAACGTTTTGTATATGAAAAGATGAGAAAGAGATATCAGAGTAAAAAGCTCT
GATAATTTTTTTACAGGGTACTTCACTTACTGTGAAGAGATGAAAATGAATCCGATAGTT
GAAGTAAAAAAATGTAAAAAAATTATGGTGTTTTGATAATTTATATATTTGGTGGGTC

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

CO CL6818Contig1 890 2 16 U
GGATTTTGCTCCCAGTTATGTTCGTTCAAGTGAAGCCTGCAAAATGGTTCGTTGATGCCC
TGGCTCTCTTTGGGGCAGGAGATATGTTGGGGGATGCTTTTCTTCACCAATTACCCCATG
CTTTTGGTGGTGGTCACTCTCATTCGCATGATCACCATGAGAGCCATGACCATCATGATC
ATTCTAATTCGCCTTCACATTCACATTCTATAAAAGATCTGTCTGTTGGATTGTCCGTTC
TCGCTGAGATTGTGGTCTTCCTTCTCGTGGAGAAGTTGGTGCGGTATGTTGAAGAAAACT
CGTCTGGATCCAATACTTGGGGCGGCCATCACCACCACCACCATGCAGGCAGCAGTAAGA
AACTGAAGGACGAGGATGATCATAACAACGCGGACGAACAGTGTCCCTCCGAAAATTCAT
CAGAGAAACTCTCTAAAGATAAATCACTCCGTAAAAGAAAGACTTCTTCTGCTAGTGATG
ATGGTGTGGAGGATAAATCAAACTCAGGCGCAGATATTACTTTAGATGAAACATTGAACA
AACCTCAACAGGTGGAGAAGAAGAATTCAAGCTTAGTATTTGGGTACCTCAACTTGTTGT
CTGATGGTGTTGTAAGTACGTGTGATAGGTGACGAGGTGCTGACATGGCAACAATAGAAG
AGTATGAAAAAGAGTGACCTGGCACCTGCAGGGAGAAAAGAAGATTCAGTTATGTTTGTA
AAGAGCCAGAGAGTCATATAGTATAAATAGATGAGTGCTTGTAACAGAATCTTTATGCAT
CTTGTGGTGATGTATCTGGGAGAGTTAGTGACTCTTGAATAAACCCTAGGATCTGGAGAT
TGGGAGATTGTAATCACAGTTCTTGATCAATATAAGCCTGTGTTCTTACC


BQ
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AF RS1DF67TF U 1
AF RS1DF67JQ C 223
BS 1 681 RS1DF67TF
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RD RS1DF67TF 818 0 0
GGATTTTGCTCCCAGTTATGTTCGTTCAAGTGAAGCCTGCAAAATGGTTCGTTGATGCCC
TGGCTCTCTTTGGGGCAGGAGATATGTTGGGGGATGCTTTTCTTCACCAATTACCCCATG
CTTTTGGTGGTGGTCACTCTCATTCGCATGATCACCATGAGAGCCATGACCATCATGATC
ATTCTAATTCGCCTTCACATTCACATTCTATAAAAGATCTGTCTGTTGGATTGTCCGTTC
TCGCTGAGATTGTGGTCTTCCTTCTCGTGGAGAAGTTGGTGCGGTATGTTGAAGAAAACT
CGTCTGGATCCAATACTTGGGGCGGCCATCACCACCACCACCATGCAGGCAGCAGTAAGA
AACTGAAGGACGAGGATGATCATAACAACGCGGACGAACAGTGTCCCTCCGAAAATTCAT
CAGAGAAACTCTCTAAAGATAAATCACTCCGTAAAAGAAAGACTTCTTCTGCTAGTGATG
ATGGTGTGGAGGATAAATCAAACTCAGGCGCAGATATTACTTTAGATGAAACATTGAACA
AACCTCAACAGGTGGAGAAGAAGAATTCAAGCTTAGTATTTGGGTACCTCAACTTGTTGT
CTGATGGTGTTGTAAGTACGTGTGATAGGTGACGAGGTGCTGACATGGCAACAATAGAAG
AGTATGAAAAAGAGTGACCTG*CACCTGCAGG*AGAAA*GAAGATTCAGTTATGTTTGTA
AAGAGC*AGAGAGTCATATAGTATAAATAGATGAGTGCTTGTA*CAGA*TCTTTATGCAT
CTTGTGGTGATGTATCTGGGAGAGT*AGTGACTCTTGA

QA 1 818 1 818
DS 

RD RS1DF67JQ 668 0 0
CTGTTGGATTGTCCGTTCTCGCTGAGATTGTGGTCTTCCTTCTCGTGGAGAAGTTGGTGC
GGTATGTTGAAGAAAACTCGTCTGGATCCAATACTTGGGGCGGCCATCACCACCACCACC
ATGCAGGCAGCAGTAAGAAACTGAAGGACGAGGATGATCATAACAACGCGGACGAACAGT
GTCCCTCCGAAAATTCATCAGAGAAACTCTCTAAAGATAAATCACTCCGTAAAAGAAAGA
CTTCTTCTGCTAGTGATGATGGTGTGGAGGATAAATCAAACTCAGGCGCAGATATTACTT
TAGATGAAACATTGAACAAACCTCAACAGGTGGAGAAGAAGAATTCAAGCTTAGTATTTG
GGTACCTCAACTTGTTGTCTGATGGTGTTGTAAGTACGTGTGATAGGTGACGAGGTGCTG
ACATGGCAACAATAGAAGAGTATGAAAAAGAGTGACCTGGCACCTGCAGGGAGAAAAGAA
GATTCAGTTATGTTTGTAAAGAGCCAGAGAGTCATATAGTATAAATAGATGAGTGCTTGT
AACAGAATCTTTATGCATCTTGTGGTGATGTATCTGGGAGAGTTAGTGACTCTTGAATAA
ACCCTAGGATCTGGAGATTGGGAGATTGTAATCACAGTTCTTGATCAATATAAGCCTGTG
TTCTTACC

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL6819Contig1 1160 2 14 U
GGAACAGCATGTATGTACTCGAAGTGGCTTGTCTTTGCTCTACTTAGCCCCTCGCCATGA
TTTCTCTCCTCAAAGCTCGCGAGAGGCTTCTCTCTCCTCTCTTCAGCTCCTCTATACGCC
GTCGTCTCTCCTCTAACCTCTCCTATTATTGTGAAGAACCAAGAGATCCTGACGTCTTTA
TACATCCAAGTGCCGTCGTCCACCCAAGTGCTGTGATCGGAAAGGGAGTTTCAGTTGGCC
CATTCTGTACTGTTGGCTCTTCAGTGAAGCTAGGCAATGGCTGCAAACTCCATCCTTCTA
GTCATATCTTTGGAAACACAGAGCTGGGGGACTCTTGTGTCCTCATGACTGGTGCTGTTG
TTGGCGATGAGCTTCCTGGTTGTACAGTCATAGGAGGCAATAACATAATCGGTCACCACG
CTGTGGTTGGTGTTAAATGTCAAGACTTGAAGTACAAGGATGGGGATGAATGCTTTCTTT
GCATCGGTGACAACAATCTAATCATGGGCTCTTGTCACATCGCTCATGATTGCAAGATTG
GTGACCGCAACATATTTAACAACAACACACTTCTTGCAGGCCATGTGATTGTAGAAGACT
ATACACACACAGCAGGAGCTTCGGTCGTCCACCAGTTCTGTCATATTGGTTCTTTTGCTT
TCATTGGTGGTGGTTCTGTGGTTTCACAAGATGTTCCAAAGTACATGATGGTGACTGGAG
AAAGAGCTGAGCTTCGCGGTTTGAATCTGGAGGGACTTAGACGCAATGGATTTACCATGT
CAGAGATGAAGAGCCTGAGAGCAGCCTATCGTAAGATATTCATGTCTACTGAGACAGTCC
CCTTAAGTCTTGAAGAGCGCCTCACGAAGATGGAGCATAACCAAGAGATGAACAGTGTTC
CTGCGGTTGGTGCCATGTTGCATTCATTCCGAGATTCTTTCACAGAAGGTCGTCGTGGGA
TATGCAAGTTCAGACAGTGGCTTGATTCGTGAGTTTTCAATTCACAGCTTAGAGACTTAG
ATTAGCCATTCATTGATCAACAATGGCTCAACACTGTCTCTTTCACTGACTCTGTAATAG
TATATTAGATAACTTAAACCAAGTGTTGTCAACATTTGAGTGATTACAGAACATAAATCA
ATGAAAGGAATATTCCATTT


BQ
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AF RS1F554JQ C 315
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BS 724 741 RS1F554TF
BS 742 1160 RS1F554JQ

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GATCTGAGGAC

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DS 

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TTTAACAACAACACACTTCTTGCAGGCCATGTGATTGTAGAAGACTATACACACACAGCA
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CAGTGGCTTGATTCGTGAGTTTTCAATTCACAGCTTAGAGACTTAGATTAGCCATTCATT
GATCAACAATGGCTCAACACTGTCTCTTTCACTGACTCTGTAATAGTATATTAGATAACT
TAAACCAAGTGTTGTCAACATTTGAGTGATTACAGAACATAAATCAATGAAAGGAATATT
CCATTT

QA 1 846 1 846
DS 



AS 1 2

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CCTACACAAAATCTACCGGAGACTCTTCTCTTGCTGACATGCCTGAATGCCAGAAGGGTA
TACGGTTGATACTTAGCCTTTGTCTCTCTGAGGGATTTGATACCTTTCCCACTCTCTTAT
GTGCTGATGGTTGCTGTATGATTGATCGTAGGATGGGAGTATATGGCTACCCTATAGAGA
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GGAGTTACTTTTGGCTAGACTTGAAGCAGCTTAATGACATTTACCGATACAAGACAGAGG
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GGATTTCCGTTGGTTTGCCTTGGGCAATTGTATAGCCATATTGTCTTCCATGGCTACTCC
TGAACAGTCAACCGCAATTATGGATCTCATAGAATCTCGCTGGGAAGAGTTGGTTGGAGA
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ATGGCTACTGACGGCTGCTTGTATCAAAACTGGTCGACCTCAAATAGCAAGACGAGCAAT
TGAAGTGGCTGAGGCTAGGCTTCACAAAGACAATTGGCCTGAATACTATGATGGAAAGCT
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AGTAGCCAAGATGATGCTGGAAGATCCGTCGCATGTCGGTATGGTTGCTCTTGAGGAAGA
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AF RS1EV03TF U 1
AF RS1EV03JQ C 649
BS 1 730 RS1EV03TF
BS 731 731 RS1EV03JQ
BS 732 770 RS1EV03TF
BS 771 1379 RS1EV03JQ

RD RS1EV03TF 783 0 0
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TCAAAGTTTTCCATGATCCTGTTAGAAACCATGAAACCTTGATAGCTGATTTTGGTGAGA
GCGCGATTGGAAGAGTAGCGCCAGTTGATTCTGGATTCTGGTGGATTATTCTGCTCAGAG
CCTACACAAAATCTACCGGAGACTCTTCTCTTGCTGACATGCCTGAATGCCAGAAGGGTA
TACGGTTGATACTTAGCCTTTGTCTCTCTGAGGGATTTGATACCTTTCCCACTCTCTTAT
GTGCTGATGGTTGCTGTATGATTGATCGTAGGATGGGAGTATATGGCTACCCTATAGAGA
TCCAAGCCCTTTTCTTTATGGCCTTAAGGTGTGCACTGCTCGTACTTAAACATGATGGAG
AAGGTAAAGAAATGGTGGAACAGATAGTGAAGCGACTCCATGCATTGAGCTACCACATGA
GGAGTTACTTTTGGCTAGACTTGAAGCAGCTTAATGACATTTACCGATACAAGACAGAGG
AATACTCTCATACTGCTGTCAACAAGTTCAACGTAATCCCTGATTCTCTTCCAGAATGGA
TTTTCGACTTTATGCCATCTCACGGAGGGTTTTTTATTGGCAATGTGAGCCCCGCAAAAT
GGATTTCCGTTGGTTTGCCTTGGGCAATTGTATAGCCATATTGTCTTCCATGGCTACTCC
TGAACAGTCA*CCGCAATTATGGATCTCATAGAATCTCGCTGGGAAGAGT
GGGTGGAGAATGC

QA 1 770 1 770
DS 

RD RS1EV03JQ 731 0 0
CCCCGCA
AAAATGGATTTCCGTTGGTTTGCCTTGGGCAATTGTATAGCCATATTGTCTTCCATGGCT
ACTCCTGAACAGTCAACCGCAATTATGGATCTCATAGAATCTCGCTGGGAAGAGTTGGTT
GGAGAAATGCCACTGAAAGTTTGTTACCCTGCAATAGAAAGCCATGAATGGAGAATAGTA
ACTGGTTGTGACCCCAAAAACACCCGATGGAGTTACCACAATGGAGGGTCCTGGCCAGTG
CTGCTATGGCTACTGACGGCTGCTTGTATCAAAACTGGTCGACCTCAAATAGCAAGACGA
GCAATTGAAGTGGCTGAGGCTAGGCTTCACAAAGACAATTGGCCTGAATACTATGATGGA
AAGCTGGGGAGATATGTGGGAAAGCAGTCACGTAAATGCCAGACCTGGTCAATCGCCGGA
TACTTAGTAGCCAAGATGATGCTGGAAGATCCGTCGCATGTCGGTATGGTTGCTCTTGAG
GAAGACAAGCAAATGAAACCCGTAATGAGAAGATCCAACTCCTGGACTTGTTGAAGTTTG
ATAATCTTCGTGAAGGTAATAAGTAATCAAGAGATGAGATGAGCTAAGAAGAAACTTCAT
GATACCTCGTTTACTGTTGATAACAACTCATCGTTTTTCAAATGGCACATTTTACGTTGC
TTTGCTTTGTGAAATATACTTACTATGAAACATCTAAGCATCGTTAAAAAGAGTTATTCT
CTTT

QA 8 731 8 731
DS 



AS 1 2

CO CL6821Contig1 1081 2 2 U
GGGTCTCGGAACCAGCCTGACCCGTATAGAAACCGAATACCCACCCATCTCGGCACACTG
CTAGAAATCAGCATCACATTCCCCGGGGAAAACAAAAGAAAATAAAAATGTACTCTGCGA
TTCGGTCGTCGCTTCCGCTAGATGGCAGCATGGGAATAGAGTATTCCGACGGAACTAACC
TTCCCGTCGACGCCTGCTTGGTCCTAACTACTGACCCCAAACCCCGCCTTCGCTGGACTT
CAGAGCTCCATGAGCGATTCGCCGACGCCGTCACCCAGCTCGGCGGCCCCGACAAAGCAA
CGCCCAAAACGATAATGAGGACGATGGGGGTGAAGGGTCTCACTCTCTACCACCTCAAAT
CTCATCTTCAGAAATTCCGCCAGGGAAGGCAGTCATGCAAAGAATCAACTGAAAACTCTA
AGGATGTTTCTTGTGTTGCGGAGAGTCAGGACACGGGTTCATCTTCAACGTCATCCTTAA
GATTGGCTGCCCAGGAACAGAACGAGATCTATCAGGTTACTGAAGCTTTGCGTGCCCAGA
TGGAAGTTCAAAGAAGACTACACGAGCAGCTAGAGTATGCGCAGGTGCAACGGCGACTAC
AGCTCAGGATCGAGGCACAGGGGAAGTATCTGCAATCAATTCTAGAGAAAGCTTGCAAGG
CTATAGAGGATCAAGCTGTTGCGTTCGCTGGGCTAGACGCAGCTAGGGAAGAGCTTTCAG
AGCTAGCCATAAAGGTCTCCAGTGGGTGCCAAGGCACATTCGACACCACCAAAATGACGG
TTCCATCCTTATCTGAGCTTGCTGTAGCGATAGAGCACAAGAACAACTGTTCAGCAGAGA
GTTCAAGCACTGTGGGAAGCCCGGTTTCAGCTTCTTTGATGAAGAAGAGGTATAGGGGTG
TGCTTGGAAACGGAGAAAGACTTGTAATGGGCCATGAAGCTGGGTGGGTTATGCCTAGTA
GTAGTAGCCTTGGGTGAAGGTAGAGAGGGGGCCAGATTTTAGATAATTTGCTTTGTTCTT
GTAATTTAAACTTGAAAAACTGTCAGCTAATGTATAAATTTGTTGAAGCTCTAGTGTCTC
C


BQ
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10 

AF RS1GM02TF U 1
AF RS1GM02JQ C 280
BS 1 603 RS1GM02TF
BS 604 1081 RS1GM02JQ

RD RS1GM02TF 603 0 0
GGGTCTCGGAACCAGCCTGACCCGTATAGAAACCGAATACCCACCCATCTCGGCACACTG
CTAGAAATCAGCATCACATTCCCCGGGGAAAACAAAAGAAAATAAAAATGTACTCTGCGA
TTCGGTCGTCGCTTCCGCTAGATGGCAGCATGGGAATAGAGTATTCCGACGGAACTAACC
TTCCCGTCGACGCCTGCTTGGTCCTAACTACTGACCCCAAACCCCGCCTTCGCTGGACTT
CAGAGCTCCATGAGCGATTCGCCGACGCCGTCACCCAGCTCGGCGGCCCCGACAAAGCAA
CGCCCAAAACGATAATGAGGACGATGGGGGTGAAGGGTCTCACTCTCTACCACCTCAAAT
CTCATCTTCAGAAATTCCGCCAGGGAAGGCAGTCATGCAAAGAATCAACTGAAAACTCTA
AGGATGTTTCTTGTGTTGCGGAGAGTCAGGACACGGGTTCATCTTCAACGTCATCCTTAA
GATTGGCTGCCCAGGAACAGAACGAGATCTATCAGGTTACTGAAGCTTTGCGTGCCCAGA
TGGAAGTTCAAAGAAGACTACACGAGCAGCTAGAGTATGCGCAGGTGCAACGGCGACTAC
AGC

QA 1 603 1 603
DS 

RD RS1GM02JQ 802 0 0
TCGGCGGCCCCGACAAAGCAACGCCCAAAACGATAATGAGGACGATGGGGGTGAAGGGTC
TCACTCTCTACCACCTCAAATCTCATCTTCAGAAATTCCGCCAGGGAAGGCAGTCATGCA
AAGAATCAACTGAAAACTCTAAGGATGTTTCTTGTGTTGCGGAGAGTCAGGACACGGGTT
CATCTTCAACGTCATCCTTAAGATTGGCTGCCCAGGAACAGAACGAGATCTATCAGGTTA
CTGAAGCTTTGCGTGCCCAGATGGAAGTTCAAAGAAGACTACACGAGCAGCTAGAGTATG
CGCAGGTGCAACGGCGACTACAGCTCAGGATCGAGGCACAGGGGAAGTATCTGCAATCAA
TTCTAGAGAAAGCTTGCAAGGCTATAGAGGATCAAGCTGTTGCGTTCGCTGGGCTAGACG
CAGCTAGGGAAGAGCTTTCAGAGCTAGCCATAAAGGTCTCCAGTGGGTGCCAAGGCACAT
TCGACACCACCAAAATGACGGTTCCATCCTTATCTGAGCTTGCTGTAGCGATAGAGCACA
AGAACAACTGTTCAGCAGAGAGTTCAAGCACTGTGGGAAGCCCGGTTTCAGCTTCTTTGA
TGAAGAAGAGGTATAGGGGTGTGCTTGGAAACGGAGAAAGACTTGTAATGGGCCATGAAG
CTGGGTGGGTTATGCCTAGTAGTAGTAGCCTTGGGTGAAGGTAGAGAGGGGGCCAGATTT
TAGATAATTTGCTTTGTTCTTGTAATTTAAACTTGAAAAACTGTCAGCTAATGTATAAAT
TTGTTGAAGCTCTAGTGTCTCC

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 2

CO CL6822Contig1 969 2 2 U
GGAAACAACGATGAGTTAGCTTAAACCCCACGTTCTTTTGAGAAAGAATCATTTTCTTCA
AATCAACAACCACAAGATAAGTAAAATCCAAAAAAAATGCAAACTGCTTTAGATAAGAGA
GTGGAAATAGTGAAGTCGAGATTCAAGAGGGTTTGTGTGTTCTGTGGAAGCAGCAGCGGA
AACAAAGACTGTTACAGAGACGCTGCCATTGATCTAGCTCAAGAGCTGGTTGAGAGGAAA
CTGAATCTTGTGTATGGAGGAGGAAGCATTGGTCTCATGGGTTTGGTTTCGCAAGCTGTT
CATGAAGCTGGAGGACATGTACTAGGGTATGTTACTTAAATCAATGACTCACTTCAGCTT
TGTGAAAATTCACCGCTTTTTACTGATCTAATATTGTTGTGTGATTTGCTTAATTGCTTC
CATCTTGCTTTGCTTTTATGGGTCAGGGTCATACCAAGAACTCTTATGGACAAAGAGATA
ACCGGAGAAACATTTGGTGAGGTAAGAGCTGTGGCTGATATGCATCAACGGAAAGCCGAA
ATGGCAAGCCACTCCGACTGTTTCATTGCATTACCAGGTGGGTATGGAACATTGGAGGAG
TTATTGGAAGTAATAACATGGGCACAACTTGGAATCCACGACAAGCCTGTGGGACTGTTA
AATGTGGATGGTTATTACAATTACCTCCTCACTTTCATTGATAAAGCCGTTGATGATGGC
TTTATCAAGCCATCTCAGCGTCACATCTTTGTCTCTGCCCCTAATTCCAAAGAGCTTGTC
CAAAAACTTGAGGCATATGAGCCTGTGAGTGATGGAGTCATAGCAAAATCAAAGTGGGAG
GTTCAGAAGAATGTGCAACAACAACAACAAGCTGTGCTATGTTCCAACACAAACATGCAC
ACTGAGATTGCTCTTTAGAGGGTCATTTACGATGTTTCCGTGTCATTTTATTCAACTCTA
TTGTTGTTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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GTCTCTG

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ATTCAACTCTATTGTTGTTC

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DS 



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TTCACCTTCTTGTGCTTGTGCTTGATCTTCTTCGGCTTGGTGTACGTCTTCTTCTTCCTC
TTCTTCGCGCCACCACGGAGACGGAGGACGAGATGAAGCGTCGACTCCTTCTGGATGTTG
TAGTCGGCGAGTGTGCGGCCGTCTTCCAGCTGTTTCCCGGCGAAGATCAATCGCTGCTGG
TCCGGTGGGATTCCCTCCTTGTCCTGGATCTTGGCTTTGACATTGTCGATGGTGTCGGAT
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DS 

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GGGATTCCCTCCTTGTCCTGGATCTTGGCTTTGACATTGTCGATGGTGTCGGATGATTCG
ACCTCGAGGGTGATCGTCTTCCCCGTTAGGGTTTTCACGAAGATCTGCATCTTTGCGGCT
GAATGAAGAAAAAAAA

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

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TTATTTTGAGTATTTTCGTCGAATTACTGATGTATGTCTACTGCGTTTTAGTTGGGTCGT
AGCCTCCTATGCGTATCCGGCTACACTTGTTCGATT


BQ
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AF RS1ER23TF U 1
AF RS1FA22TF U 1
BS 1 636 RS1ER23TF

RD RS1ER23TF 636 0 0
GATCGCGACGAAAAAGAACGTGCGTGTTTTCAATCTTCAGAAGAAAGAGCTGGCCATCAA
AAAGCTCGAGACTGGGTTGAGAGAGATCTCGTCGATGGCGATTCATCCTGGTGGTGATAA
TCTGATAGTAGGAAGCAAAGAAGGGAAGATGTGTTGGTTTGACATGGACCTGTCTTCGAA
ACCTTACAAGACTCTCAAGAACCATCCTAAAGACATTACGAACGTGGCGTTTCACCGCTC
GTATCCGCTCTTCGCTTCGTGCTCGGAGGATTCAACGGCTTATGTGTTCCATGGAAAGGT
GTATAGTGATCTGAACGAGAATCCTCTGATTGTGCCATTGGAGATTCTGAGAGGCCATTC
TACTTCTTCAAATAGAGGAGTCTTGGACTGCAAGTTTCATCCGAGGCAACCATGGCTATT
CACTGCAGGCGCTGACTCAATTATAAAACTTTATTGTCACTAAATTTCTGCTTAAACCCT
ATTTTTGACAATTTTCATCTCTTTTTTATGTTGCTGTTTATCACATTGCTCGACCTTTTT
TTATTTTGAGTATTTTCGTCGAATTACTGATGTATGTCTACTGCGTTTTAGTTGGGTCGT
AGCCTCCTATGCGTATCCGGCTACACTTGTTCGATT

QA 1 636 1 636
DS 

RD RS1FA22TF 635 0 0
GATCGCGACGAAAAAGAACGTGCGTGTTTTCAATCTTCAGAAGAAAGAGCTGGCCATCAA
AAAGCTCGAGACTGGGTTGAGAGAGATCTCGTCGATGGCGATTCATCCTGGTGGTGATAA
TCTGATAGTAGGAAGCAAAGAAGGGAAGATGTGTTGGTTTGACATGGACCTGTCTTCGAA
ACCTTACAAGACTCTCAAGAACCATCCTAAAGACATTACGAACGTGGCGTTTCACCGCTC
GTATCCGCTCTTCGCTTCGTGCTCGGAGGATTCAACGGCTTATGTGTTCCATGGAAAGGT
GTATAGTGATCTGAACGAGAATCCTCTGATTGTGCCATTGGAGATTCTGAGAGGCCATTC
TACTTCTTCAAATAGAGGAGTCTTGGACTGCAAGTTTCATCCGAGGCAACCATGGCTATT
CACTGCAGGCGCTGACTCAATTATAAAACTTTATTGTCACTAAATTTCTGCTTAAACCCT
ATTTTTGACAATTTTCATCTCTTTTTTATGTTGCTGTTTATCACATTGCTCGACCTTTTT
TTATTTTGAGTATTTTCGTCGAATTACTGATGTATGTCTACTGCGTTTTAGTTGGGTCGT
AGCCTCCTATGCGTATCCGGCTACACTTGTTCGAT

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

CO CL6825Contig1 905 2 2 U
GGAAGAGGGCGATTTCAATGGCTGACGATGATTATAACGAAGTTGATGATTTGGGGTATT
CCCTCTCCTTCTCTCCGTTTCCTATCCTAGTTCTAGGTTTCGCTCGATTTCAAAGGATTC
TCAATTTTTCTCCTCGAAGAATTGTAAACTTTTGAGAGAAATTAAGATTAGTTCTCGTCA
TTATTGAAGCTTGTCTGTGGGATTATTCTTTCAATCGATTCTCGGTTGATATATAAAAGA
AGAGTCTAGTTTTGATGCAATGGTTATTAGACAATTGTCATCTTATTTTCATTCGGTAAT
TCAGTTTGTTACTGTTGTCTCAATTGCCTTTTTTCTTCCTTTCCTGCAGTTATGAGGATG
AGCCAGTGGAGCCTGAAATTGAAGAAGGAGTAGAGGAAGATGTTGATATGAAGGATAACG
AGGATATCAATGGAGAGCCTTTTGAAACTGAAGATAAGGCCGAAGCAGAACCTGTTCAAC
GTCCTCGTAAAACCTCCAAGTTTATGACCAAGTATGAACGTGCACGTATCCTAGGCACTC
GCGCTCTGCAGATCAGCATGAATGCTCCTGTCATGGTCGAGCTTGAGGGTGAGACTGACC
CACTTGAGGTGCTCACTACTTTACTTGCGCTCACTTATCCTCTGTTCTTTCTGGACATCT
AGCTAATTTAATGATGTTGACTTATAAGATTGCTATGAAGGAGCTGAGGCAAAGAAAGAT
ACCATTCACTATTAGACGTTACCTACCTGATGGGAGTTTTGAGGAGTGGGGAGTTGATGA
GTTGTTTGTTGAAGACTCATGGAAACGTCAAGTTGGTGGTGATTGATAATCTTATTGTTG
ACCAAATAATACTAATATGTATTTTTGCAAGAAGCTTGTTACCTCTCATGAAGTTGATCA
ATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RS1G587TF U 1
AF RS1G587JQ C 263
BS 1 444 RS1G587TF
BS 445 905 RS1G587JQ

RD RS1G587TF 444 0 0
GGAAGAGGGCGATTTCAATGGCTGACGATGATTATAACGAAGTTGATGATTTGGGGTATT
CCCTCTCCTTCTCTCCGTTTCCTATCCTAGTTCTAGGTTTCGCTCGATTTCAAAGGATTC
TCAATTTTTCTCCTCGAAGAATTGTAAACTTTTGAGAGAAATTAAGATTAGTTCTCGTCA
TTATTGAAGCTTGTCTGTGGGATTATTCTTTCAATCGATTCTCGGTTGATATATAAAAGA
AGAGTCTAGTTTTGATGCAATGGTTATTAGACAATTGTCATCTTATTTTCATTCGGTAAT
TCAGTTTGTTACTGTTGTCTCAATTGCCTTTTTTCTTCCTTTCCTGCAGTTATGAGGATG
AGCCAGTGGAGCCTGAAATTGAAGAAGGAGTAGAGGAAGATGTTGATATGAAGGATAACG
AGGATATCAATGGAGAGCCTTTTG

QA 1 444 1 444
DS 

RD RS1G587JQ 643 0 0
GTTATTAGACAATTGTCATCTTATTTTCATTCGGTAATTCAGTTTGTTACTGTTGTCTCA
ATTGCCTTTTTTCTTCCTTTCCTGCAGTTATGAGGATGAGCCAGTGGAGCCTGAAATTGA
AGAAGGAGTAGAGGAAGATGTTGATATGAAGGATAACGAGGATATCAATGGAGAGCCTTT
TGAAACTGAAGATAAGGCCGAAGCAGAACCTGTTCAACGTCCTCGTAAAACCTCCAAGTT
TATGACCAAGTATGAACGTGCACGTATCCTAGGCACTCGCGCTCTGCAGATCAGCATGAA
TGCTCCTGTCATGGTCGAGCTTGAGGGTGAGACTGACCCACTTGAGGTGCTCACTACTTT
ACTTGCGCTCACTTATCCTCTGTTCTTTCTGGACATCTAGCTAATTTAATGATGTTGACT
TATAAGATTGCTATGAAGGAGCTGAGGCAAAGAAAGATACCATTCACTATTAGACGTTAC
CTACCTGATGGGAGTTTTGAGGAGTGGGGAGTTGATGAGTTGTTTGTTGAAGACTCATGG
AAACGTCAAGTTGGTGGTGATTGATAATCTTATTGTTGACCAAATAATACTAATATGTAT
TTTTGCAAGAAGCTTGTTACCTCTCATGAAGTTGATCAATTTT

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 2

CO CL6826Contig1 1074 2 4 U
AGGTCAACATACAAAAAATGATTAACACCATTCTCAATATTTTTCTTCCTCCTCTTACCA
TCATCTTTCTCTTCCTCTTGTACCCATCTTACCTTTTGGGCAAACTTGTGATTCGTCTCT
ATAAGCACCTGAGCTTTGAAAATGTGGCCAGAAAAGTAGTTCTAATCACTGGAGCTTCCT
CCGGCATTGGAGAGCATGTAGCCTACGAGTATGCAAAGAAAGGAGCGTGTTTGGTTCTCG
TTGCTCGAAGAAGGGATCGTCTAGAGATAGTAGCCCAAAAATCACATCAATTAGGATCTG
GTGATGTCCTCGTCATACCTGGTGATGTTGCTAATATTAATGACTGCAAGAAGTTAATCG
ATGATACGATTCATAATTTCGGTAAACATAGTAGACCACTTGATCAACAATGCTGGTGTA
TTTCAAACTATTCTTTTCGAAGATTTCACTCAAATTCAAGACGCTAATCCTATTATGGAT
ATTAACTTTTGGGGTTCAACATACATCACTTATTTTGCCATTCCTCATCTTCGAAAGAGA
AAAGGAAAGATCATTGTGATTACTTCTGGTGCAGCTAATATACCCTTGCCATTGGCGAGC
GTCTATTCAGCAAGCAAAGCAGCTTTGGTAAGATTCTTTGAGACACTAAGAGTTGAGCTC
AGTCCGGATATCAAAATAACAATCGTTTTCCCCGGAGTTATATCTACAGATATGACCACT
CCTCACTTTGTAGAAAAGTATGGTTCAGATTTTTTCCTCTCGGAATCAGTGACTAAATGT
GCAAAAGCAATCTTCAGAGGAATCGCTAGAGGAGAGACGTACATAGAAGAGCCATCTTGG
TTAAAATGGATGTTTTTGATAAACAGTGTGACTCCTGAAATGTTTGACTACTTAGTCAAC
TATTTATTTTTTCGTTATCTCAAACCTTATTTCAAGCGTGATTGATCGTATTCGTATCAG
CCCATTGCTATAATACTCTTGAAAATGGTTGTATTTCAACGGGAAATGAAACTGAACGAT
ACTTGTTTTCCATTAGCTAATTATTGCAACCAAGTCTATTACTCTTTTGAAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D486TF U 1
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BQ
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DS 



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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F188TF U 1
AF RS1F188JQ C 1
BS 1 620 RS1F188TF
BS 621 621 RS1F188JQ
BS 622 631 RS1F188TF
BS 632 632 RS1F188JQ
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BS 649 658 RS1F188TF
BS 659 747 RS1F188JQ

RD RS1F188TF 658 0 0
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QA 1 658 1 658
DS 

RD RS1F188JQ 747 0 0
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ACCTGCTCGTATCCTGGCATCAAGTTCAACTACCAACCTGATTCCTACTTCGACAATGAG
GTTTCGGTTGTGGAGATGGATGGGCAATTCGATAGACTTGACGAGCTAATTTACGTGGAG
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ATGCTAACTTCCCTGGTAGCAACAATGGAACTGGTCTTTTCCAGACCATTGTTGGATTGA
AGATCAGAGATCTTTATGAGCAGCTCATTGCCAACAAAGCCACTGCTCCTTCAGAAGCTG
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QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

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TTCTGACGCCTTTATTAACTCCATAAAAAATTTATTTACCTCCTCTGTTCTCTCGTGGCT
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AAATCCA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F668JQ U 1
AF RS1E632JQ U 1
BS 1 21 RS1E632JQ
BS 22 22 RS1F668JQ
BS 23 321 RS1E632JQ
BS 322 322 RS1F668JQ
BS 323 332 RS1E632JQ
BS 333 333 RS1F668JQ
BS 334 506 RS1E632JQ
BS 507 507 RS1F668JQ
BS 508 667 RS1E632JQ

RD RS1F668JQ 652 0 0
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CTTGAAATAACCGGGAGTTTCAGGGGTGAGGTTAGTCCAATCGGTTGGTGTTTTCTTCAT
TTCTGACGCCTTTATTAACTCCATAAAAAATTTATTTACCTCCTCTGTTCTCTCGTGGCT
AACAAGACGACCTCCATGAAGATCCACCATTCTAGCAACGGGATACAGTCTCTGCGCCAA
TCTTCTCGCGTGACGTATCTGAGCAATGACATCATGCCTTCCGTGAATGATA

QA 1 652 1 652
DS 

RD RS1E632JQ 667 0 0
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AATGGCAACAAATGTTCCTCGTGGAATGATTCCTCTTACACAGGTATGTATATATCAACA
GTTTCATATTGTTACTATCTCTTCCATGTACAAGCAGTGGGCTCCTTCTCTAGCGTCTGT
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GAGACAAGGCCCAACTTTGACGGGTTTGACGACCCTGAAAGCTCTTCTTGCATGCTCAAA
TGCCAAAACCAGAAAACCTAAGAGGAAAAGTAGACATCGATGAAACTTTTCCATGATGAA
AGACGGTGGAAAGGATGCGTTCTTGCCTTCTGATGAGGTTCCAATCATTTCTATTCTCCT
CTTGAAATAACCGGGAGTTTCAGGGGTGAGGTTAGTCCAATCGGTTGGTGTTTTCTTCAT
TTCTGACGCCTTTATTAACTCCATAAGAAATTTATTTACCTCCTCTGTTCTCTCGTGGCT
AACAAGACGACCTCCATGAAGATCCACCATTCTAGCAACGGGATACAGTCTCTGCGCCAA
TCTTCTCGCGTGACGTATCTGAGCAATGACATCATGCCTTCCGTGAATGATAGAGACAAG
AAATCCA

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 2

CO CL6830Contig1 640 2 1 U
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GAAGAATCCTTTCTATGAGATTGAGATGCCTATTCGTTGCGAGCTTTTCGACATCAACCT
TACTCAAGCTGTTCAGTCTGATCGCGTTGCTCTCTTAGGACGTTGAGCTCCACAAGATTG
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CTTATCCATATAACATTTTATATCCGACAAACACTTGAACATTGCAACAAAACCTTTGTT
TTTTTTTAATGCCAAGAAAGAGCACCTAAGTTCATAGTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CI55JQ C 1
AF RS1CI55TF U 1
BS 1 640 RS1CI55TF

RD RS1CI55JQ 640 0 0
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AACTCCTCACATAGAGAGCCTCCTTAGATACATTTACGAACTCTACACTGACTACGTCTT
GAAGAATCCTTTCTATGAGATTGAGATGCCTATTCGTTGCGAGCTTTTCGACATCAACCT
TACTCAAGCTGTTCAGTCTGATCGCGTTGCTCTCTTAGGACGTTGAGCTCCACAAGATTG
ATTTTCTGCTGTGATCTCTCTTACCTCTTTACCTTTTTTTGTTTTGTTTCCTCTAGTCTT
CTTATCCATATAACATTTTATATCCGACAAACACTTGAACATTGCAACAAAACCTTTGTT
TTTTTTTAATGCCAAGAAAGAGCACCTAAGTTCATAGTCC

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1CI55TF 640 0 0
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TTACATAATCAACAAATCTGGTGGTTTGATCTTTTACAAGGATTGTGGAACGAAGGGAAG
GATGGACACGAATGATAGCTTGAGGGTAGCCAGTTTATGGCACTCAATGCACGCCATTTC
TCAGCAGCTTTCACCTGTCAACGGTTGTTCCGGCATCGAGCTTCTCCAAGCCGATACCTT
TGATCTCCATTGTTTCCAGTCTCTCCCAGGAACAAAGTTCTTTGTGGTGTGTGAACCTGG
AACTCCTCACATAGAGAGCCTCCTTAGATACATTTACGAACTCTACACTGACTACGTCTT
GAAGAATCCTTTCTATGAGATTGAGATGCCTATTCGTTGCGAGCTTTTCGACATCAACCT
TACTCAAGCTGTTCAGTCTGATCGCGTTGCTCTCTTAGGACGTTGAGCTCCACAAGATTG
ATTCTCTGCTGTGATCTCTCTTACCTCTTTACCTTTTTTTGTTTTGTTTCCTCTAGTCTT
CTTATCCATATAACATTTTATATCCGACAAACACTTGAACATTGCAACAAAACCTTTGTT
TTTTTTTAATGCCAAGAAAGAGCACCTAAGTTCATAGTCC

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

CO CL6831Contig1 864 2 2 U
GGGTCCAACAGAATCCCTTTCCCGATCTTGGCTCCGGGGTGAAAGTCGACGGCGAAAGCT
TCCGATACTCTGTTTTGGATCAATAAAGCGAGGATCTTTCTGTCTTGAGTCCAGAGCTTG
TGGGAGATGCGATGGGCTTGGCAAGCGAGGAAGCCTTTGAAGCTTAGGAAGCAATGGACG
TAGCTTGAGCAAGCTGGGTCTCTTTCCTTTGCTGCTTTTAGGTCTTGCTTCGCCGATTCC
ACGATCTCGGGGCTTTCTTTTAAGACGCTGATGAACATCTCGAATAGGGTTTCGCTTGGT
AAGGTTAAAGTGCTTAGCTTTAGTGAGAGGATGTTGGCCAAAGCGGAATCTAAGGATCGG
TGCGATGTAATGGAAGCGTGATAGTAGCTTGACAAAATGGGTTCTTGCTCTACGTCGGAT
TTGGCTTCTTCAAGCATCTTGAGCCAGACATCACCGCTGTCGTCCAGCGAGTTTGTTGTC
ATGGGTGTTCGTGGAGGGAAATGACACGGTCGGAAGAGATTCATGTAACAGAACCGAGAA
GAGTCCTCGTCATGGGGTTTACATGTTCTGTAAGTTTCAATGCAGGGAGCCATAGAATCT
TTGGGATTGGAACAAGAGAGGAGGGAATGGTTGTTGTGTGGAGGAGGAGAAGATGAACAC
AGCTTATATAGGAGATGGCCACGACTTGTGCTGCTGATCGAGAACATGATGTTGGTAAGT
ATAGTAACAATATTATTTTACTCAAGTATGCTTTTTCGGATTTTAAAATTTGTTCATTTC
TAACGAGAAAAAAGTTGTTATGTTAATAATATGACAAGCAACACATGTAGAACGCATCGC
AGTTATAAGTCTCCTTTTATCTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
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AF RS1CG30TF U 1
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BS 752 864 RS1CG30JQ

RD RS1CG30TF 751 0 0
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QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

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TTGCATCGTTTGTGATTGTTTGATGTAAGTTTCATTTCTCTAAAAGTTTGGATTTGTAAG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
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AF RS1BJ50TF U 1
AF RS1BJ50JQ C 26
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BS 680 827 RS1BJ50JQ

RD RS1BJ50TF 679 0 0
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QA 1 679 1 679
DS 

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CAAGAGAGAGCTCTCGCAGAGGTGAAGGAGAAGCTGAGCATCATAGAGAAAGAAGGCCTC
AAGGAGATTTTCTCGGATACTGATGGTAAACCTAACGTGACAGACGAGACCATGAGCCTC
GTTGACATTGTGATGTGCACTTTGCTTAGCCCTTACAAGGCACACGAAGAAGTTTTGGGT
GTGAAGATCGTCGACCCAGAGACAGTTCCTCGTGTCTATGGTTGGCTCAATGCTATTAAC
GTAACCGATGTGGTCAAAGATCTAAGTCCTCCTATGAACAAGTCCTAGAGATTCTTAGGG
CTTTCAGACACATGTCTCTCTCCCATTCCTAAGTTTTGCATCGTTTGTGATTGTTTGATG
TAAGTTTCATTTCTCTAAAAGTTTGGATTTGTAAGTAACGTCTACTAAGTCATTGTACCT
TAATCCGTTCTTGCAACATTTT

QA 1 802 1 802
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGATCTTCACTCCGCGGCGAGATCCGGTGATTTAGCGGCAGTTCAACTAATCATAAGCTC
TAATCCTCTTGCCGTCAATTCTAGGGATAAACACTCTCGGACTCCACTACACTTGGCAGC
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AGAGGAGACTGATGACACCGAAGCTGATCAAGAAGAAGTGTCTACTTGAAATGAGTTGTA
ACATCCATCACATGAGATAATTGAGAGATTTTACCAATACCTTAGTTTGTTTCTATGATA
CGTATAAGTTTGTAGAAGAATTCATCAGTTTCTTTTAGGCTGTTTAATCAAAACGTTCAT
CAGATTCC


BQ
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0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CC39TF U 1
AF RS1CC39JQ C 143
BS 1 655 RS1CC39TF
BS 656 656 RS1CC39JQ
BS 657 689 RS1CC39TF
BS 690 690 RS1CC39JQ
BS 691 699 RS1CC39TF
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BS 757 757 RS1CC39JQ
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BS 781 781 RS1CC39JQ
BS 782 785 RS1CC39TF
BS 786 786 RS1CC39JQ
BS 787 810 RS1CC39TF
BS 811 908 RS1CC39JQ

RD RS1CC39TF 810 0 0
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TGTGAGGACTCTACTGTCTGTCGGAGTTTCTTTGAAGTCCATCACTCGCAAAGGACTGAC
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*CATC*ATCACATGAGATAATTGAGAGATT

QA 1 810 1 810
DS 

RD RS1CC39JQ 766 0 0
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GTGAGCTACTTATGCAAGAACAAAGCCGATGTTGGTGCTGCAGCAGTGGATGATATGGGT
GCCATCCACTTTGCTTCTCAGAAGGGACACTTGGAAGTTGTGAGGACTCTACTGTCTGTC
GGAGTTTCTTTGAAGTCCATCACTCGCAAAGGACTGACACCTCTTCACTACGCTGCTCAA
GGTTCTCACTTGGACCTCGTCAAGTACTTGGTTAAGAAAGGAGCCAATGTCAGAGCCACG
ACTGAGGCCGGGAAGAATCCTGCGGATGTTGCGGGGAACCCTGAAACGCAAAGCTTCCTT
GAAGAATGCGAAGAGCAAGCGAGGAAAGATAAGGTGAAGAAGAACAGTCAGAAAAAGACA
GAGGAAGTGAAGAAACCAGAGAGTTCTAGTGTCGAAGGAGCAGCTGACAAGGGTTTGAAA
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AAAGCGAAGAAGCCAAAAGTTGTTCTTCGTCATCTTCAAGAGGAGACTGATGACACCGAA
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GAGAGATTTTACCAATACCTTAGTTTGTTTCTATGATACGTATAAGTTTGTAGAAGAATT
CATCAGTTTCTTTTAGGCTGTTTAATCAAAACGTTCATCAGATTCC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

CO CL6835Contig1 811 2 6 U
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ATGGCGCTGACACAACACTGTTCCGTCTCAGCCACCTCCGCGGTTCGATTGAGCTTCTCC
TCCTCCGCATCACCCCCGTTGCCGCCGACAAGGGTTTCTCTCAATCTTCACCCGGAGAAG
AAGGGTCAGAGTCATTCCCGGAGAATGATAAGCAGAGCTATGGTACAAGAGGCAGCTCAA
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CTCGCCTTCAATGATGCTGGAGGGTTTGAGGCTTTAGTTACAGGGAAGATCACTGATTTT
CAAAAGATTGATGTGAATGAGAGGATAACTACACTAGAGCGGCTTAACCCGACTCCTAGA
CCAACCACGTCTCCTTATCTCGAAGGGAGACGGAGTTTTGAGTGGTTTGGATCCAACACT
CCTGGTTCACTTGCCGCTCGGCTTATATTCGAGAGGTTTCCTTCTTCATTTGTGAGTCTA
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AGGATGAAGGAAGAGTATCTAGAGGGAATGCTAGAGTCGCCAACTGTTATTGAAGAAGCA
GTACTGGAACAGCTAAGAGGTTTACTTGGTCAAGCTACCACTACTTTGCAGCAGCTTCCT
GAACCTGTTAAAGATACTCTAGCCAATGGTC


BQ
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AF RS1F561TF U 1
AF RS1AN44TF U 235
BS 1 410 RS1F561TF
BS 411 411 RS1AN44TF
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BS 452 662 RS1F561TF
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RD RS1F561TF 663 0 0
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ATGGCGCTGACACAACACTGTTCCGTCTCAGCCACCTCCGCGGTTCGATTGAGCTTCTCC
TCCTCCGCATCACCCCCGTTGCCGCCGACAAGGGTTTCTCTCAATCTTCACCCGGAGAAG
AAGGGTCAGAGTCATTCCCGGAGAATGATAAGCAGAGCTATGGTACAAGAGGCAGCTCAA
GGCATCCCTTCGGTTTACGCCAGAGAAATGGAGCGTCTCTCCGCTAAAGAATCGCTCATT
CTCGCCTTCAATGATGCTGGAGGGTTTGAGGCTTTAGTTACAGGGAAGATCACTGATTTT
CAAAAGATTGATGTGAATGAGAGGATAACTACACTAGAGCGGCTTAACCCTACTCCTAGA
CCAACCACGTCTCCTTATCTCGAAGGGAGATGGAGTTTTGAGTGGTTTGGATCCAACACT
CCTGGTTCACTTGCCGCTCGGCTTATATTCGAGAGGTTTCCTTCTTCATTTGTGAGTCTA
TCAAGTATGGACATTGTCATTAAAGATGCTAGCACAAGGGCCACAGCTAACGTTAAGCTG
CTAAACATGATAGAAAACAAAGTCATCTTGACGTCGAAATTGACAGTGGAAGGGCCTTTA
AG
A

QA 1 662 1 662
DS 

RD RS1AN44TF 577 0 0
CCGGGG
GGCATCCCTTCGGTTTACGCCAGAGAAATGGAGCGTCTCTCCGCTAAAGAATCGCTCATT
CTCGCCTTCAATGATGCTGGAGGGTTTGAGGCTTTAGTTACAGGGAAGATCACTGATTTT
CAAAAGATTGATGTGAATGAGAGGATAACTACACTAGAGCGGCTTAACCCGACTCCTAGA
CCAACCACGTCTCCTTATCTCGAAGGGAGACGGAGTTTTGAGTGGTTTGGATCCAACGCT
CCTGGTTCACTTGCCGCTCGGCTTATATTCGAGAGGTTTCCTTCTTCATTTGTGAGTCTA
TCAAGTATGGACATTGTCATTAAAGATGCTAGCACAAGGGCCACAGCTAACGTTAAGCTG
CTAAACATGATAGAAAACAAAGTCATCTTGACGTCGAAATTGACAGTGGAAGGGCCTTTA
AGGATGAAGGAAGAGTATCTAGAGGGAATGCTAGAGTCGCCAACTGTTATTGAAGAAGCA
GTACTGGAACAGCTAAGAGGTTTACTTGGTCAAGCTACCACTACTTTGCAGCAGCTTCCT
GAACCTGTTAAAGATACTCTAGCCAATGGTC

QA 7 577 7 577
DS 



AS 1 2

CO CL6836Contig1 742 2 1 U
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TATTGTGTACGCTTCTAGAGAAAGAGGAAGAGGAAGAAGAAGACTCATGTCTGGATTATA
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TCCTGAGATCGACAGTTCTCAGTACTTGTCGGAGCTTCTCGCCGAACATCAAAAGCTTAC
ACCTTTTATGCAAGTCTTGCCCATATGCAGCCGCCTTTTGAATCAAGAGATGTTCAGGGT
ATCTGGAATGATGCCTAACCAAGGAGGATTTGGCGATTTTGATAGACTCAGACACAGAAG
TCCCAGTCCTATGGCTTCTTCTAACCTTATGTCTAATGTCTCTAACTCCGGTTTAGGTGG
TTGGAACGGAGGTCTCTCTCAGGAGAGACTTAGTGGAACACCTGGAATGACAATGGATTG
GCAAGGTGCACCTGGAAGTCCAAGCTCATACACTGTGAAAAGGATATTGCGTCTGGAGAT
TCCTGTTGATAGCTATCCTAATTTCAATTTTGTTGGACGGCTTCTTGGTCCAAGAGGCAA
CTCATTAAAACGTGTTGAAGCTACCACTGGCTGCCGTGTGTTCATCAGAGGGAAAGGTTC
AATCAAGGATCCTGAAAAGGAAGATAAGCTAAAGGGGAAGACCAGGATATGAACATCTAA
ATGAGCAGCTTCACATCTTAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GN26TF U 3
AF RS1AO43TFB U 1
BS 1 742 RS1AO43TFB

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CTAGAGAAAGAGGAAGAGGAAGAAGAAGACTCATGTCTGGATTATACAACAACAACTCCT
CTTACTTCTCTCCTGCTAGAGCTGCTTCTCCTCAGATCAGAAGCACTCCTGAGATCGACA
GTTCTCAGTACTTGTCGGAGCTTCTCGCCGAACATCAAAAGCTTACACCTTTTATGCAAG
TCTTGCCCATATGCAGCCGCCTTTTGAATCAAGAGATGTTCAGGGTATCTGGAATGATGC
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CTTCTTCTAACCTTATGTCTAATGTCTCTAACTCCGGTTTAGGTGGTTGGAACGGAGGTC
TCTCTCAGGAGAGACTTAGTGGAACACCTGGAATGACAATGGATTGGCAAGGTGCACCTG
GAAGTCCAAGCTCATACACTGTGAAAAGGATATTGCGTCTGGAGATTCCTGTTGATAGCT
ATCCTAATTTCAATTTTGTTGGACGGCTTCTTGGTCCAAGAGGCAACTCATTAAAACGTG
TTGAAGCTACCACTGGCTGCCGTGTGTTCATC

QA 13 644 13 644
DS 

RD RS1AO43TFB 742 0 0
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TATTGTGTACGCTTCTAGAGAAAGAGGAAGAGGAAGAAGAAGACTCATGTCTGGATTATA
CAACAACAACTCCTCTTACTTCTCTCCTGCTAGAGCTGCTTCTCCTCAGATCAGAAGCAC
TCCTGAGATCGACAGTTCTCAGTACTTGTCGGAGCTTCTCGCCGAACATCAAAAGCTTAC
ACCTTTTATGCAAGTCTTGCCCATATGCAGCCGCCTTTTGAATCAAGAGATGTTCAGGGT
ATCTGGAATGATGCCTAACCAAGGAGGATTTGGCGATTTTGATAGACTCAGACACAGAAG
TCCCAGTCCTATGGCTTCTTCTAACCTTATGTCTAATGTCTCTAACTCCGGTTTAGGTGG
TTGGAACGGAGGTCTCTCTCAGGAGAGACTTAGTGGAACACCTGGAATGACAATGGATTG
GCAAGGTGCACCTGGAAGTCCAAGCTCATACACTGTGAAAAGGATATTGCGTCTGGAGAT
TCCTGTTGATAGCTATCCTAATTTCAATTTTGTTGGACGGCTTCTTGGTCCAAGAGGCAA
CTCATTAAAACGTGTTGAAGCTACCACTGGCTGCCGTGTGTTCATCAGAGGGAAAGGTTC
AATCAAGGATCCTGAAAAGGAAGATAAGCTAAAGGGGAAGACCAGGATATGAACATCTAA
ATGAGCAGCTTCACATCTTAAT

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL6837Contig1 644 2 7 U
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ATCTTATTTTCTTTTTATGTGAAACAGTTTCACATAGTTAAACAAGAGGAAGGAAAAAAA
ACGAAAAGGGAGGAGATAATAATCCTGAAAATGCAGCAACAAACTTTTCATCACCAACAA
GAAGAAAATACTGAAAAGCAGAGCCCCACACTTCTTCACAGTTCCAGAGAATCCCGGGGG
AAGCTGGAAGATCGAATCGATTAGGGCTACGCATTAGCGGTTTTAGGGATAAGAGGAACA
CCCTTCCCTTGTATCTTATTCTGTTTAGCCTTGGCTTCTTCCTCGCGGATCTTCCGCATC
GCGAGCATCCTCTCCATCACGAGCTCGTACTCGCACTTCTCGTACACGTGGCGCTCGTCC
TCGCACTTCCACGGGAGGAAGAACTCGACCTGGCGACATTTGTTGAGCGGGATCAGGAGA
TGAGCGCACTGATCTCTGTATCCGAGCGGTACTTTGGCTTCAACCATCTCTTCCTGCGTT
GCGATCATCTTCTTCGATGAACCTGGAACCTCCATTTTCGTCTTCGCGATCCCTTCTCTA
CCCAAACCTCTCCTTTTCTTTTTTTTTCTCTTCGGCGACTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GW80TF C 1
AF RS1DH58JQ U 32
BS 1 32 RS1GW80TF
BS 33 354 RS1DH58JQ
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BS 356 365 RS1DH58JQ
BS 366 366 RS1GW80TF
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BS 614 644 RS1GW80TF

RD RS1GW80TF 644 0 0
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ATCTTATTTTCTTTTTATGTGAAACAGTTTCACATAGTTAAACAAGAGGAAGGAAAAAAA
ACGAAAAGGGAGGAGATAATAATCCTGAAAATGCAGCAACAAACTTTTCATCACCAACAA
GAAGAAAATACTGAAAAGCAGAGCCCCACCCTTCTTCACAGTTCCGGAGAATCCCGGGGG
AAGCTGGAAGATCGAATCGATTAGGGCTACGCATTAGCGGTTTTAGGGATAAGAGGAACA
CCCTTCCCTTGTATCTTATTCTGTTTAGCCTTGGCTTCTTCCTCGCGGATCTTCCGCATC
GCGAGCATCCTCTCCATCACGAGCTCGTACTCGCACTTCTCGTACACGTGGCGCTCGTCC
TCGCACTTCCACGGGAGGAAGAACTCGGCCTGGCGACATTTGTTGAGCGGGATCAGGAGA
TGAGCGCACTGATCTCTGTATCCGAGCGGTACTTTGGCTTCAACCATCTCTTCCTGCGTT
GCGATCATCTTCTTCGATGAACCTGGAACCTCCATTTTCGTCTTCGCGATCCCTTCTCTA
CCCAAACCTCTCCTTTTCTTTTTTTTTCTCTTCGGCGACTCCCC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1DH58JQ 582 0 0
G
GAAAACCAACAAAAAGATGAGTGTTTGCATCTTATTTTCTTTTTATGTGAAACAGTTTCA
CATAGTTAAACAAGAGGAAGGAAAAAAAACGAAAAGGGAGGAGATAATAATCCTGAAAAT
GCAGCAACAAACTTTTCATCACCAACAAGAAGAAAATACTGAAAAGCAGAGCCCCACACT
TCTTCACAGTTCCAGAGAATCCCGGGGGAAGCTGGAAGATCGAATCGATTAGGGCTACGC
ATTAGCGGTTTTAGGGATAAGAGGAACACCCTTCCCTTGTATCTTATTCTGTTTAGCCTT
GGCTTCTTCCTCGCGGATCTTCTGCATCGCGAGTATCCTCTCCATCACGAGCTCGTACTC
GCACTTCTCGTACACGTGGCGCTCGTCCTCGCACTTCCACGGGAGGAAGAACTCGACCTG
GCGACATTTGTTGAGCGGGATCAGGAGATGAGCGCACTGATCTCTGTATCCGAGCGGTAC
TTTGGCTTCAACCATCTCTTCCTGCGTTGCGATCATCTTCTTCGATGAACCTGGAACCTC
CATTTTCGTCTTCGCGATCCCTTCTCTACCCAAACCTCTCC

QA 2 582 2 582
DS 



AS 1 2

CO CL6838Contig1 435 2 2 U
CCTCTCCCCTCTCCTCCTCCTCATCGCTGCTCAGGTCTCCTCCTTCTCCCGCAAGGATCT
CGCCACCCTCTGGGAGCATCTCCAGTACAATCTCATCTCAGTGGTCCTCTGCTCGGCTCT
CCTCGTCTTCATAACCACCATCTACGTCATGACTCGCCCCCGTCCTGTCTACTTGGAGAG
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TCCCGGTTGATGTCCCCACACACGCAACAATCTAGAAACCACTCAGCCAGCGTTGTGTAT
TGTTCTGAAGAGACCTCTCTTGTTTTTGTTTTGTTTCCATGTTCTCTTGAGTTTTCTTAT
CTTTGAGATTCTGCTTTTGTTCCATTTTCTCTTCCTAATGAGCTTAGCTTGTTCTTGATT
GGTCGGCAAATTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C855TF U 1
AF RS1C855JQ C 21
BS 1 412 RS1C855TF
BS 413 435 RS1C855JQ

RD RS1C855TF 412 0 0
CCTCTCCCCTCTCCTCCTCCTCATCGCTGCTCAGGTCTCCTCCTTCTCCCGCAAGGATCT
CGCCACCCTCTGGGAGCATCTCCAGTACAATCTCATCTCAGTGGTCCTCTGCTCGGCTCT
CCTCGTCTTCATAACCACCATCTACGTCATGACTCGCCCCCGTCCTGTCTACTTGGAGAG
CAGTGAGGTCTGTAAATCCTAAAAAGGAGAAGAACCCATGGATGGATGAGATTCATGAGT
TCCCGGTTGATGTCCCCACACACGCAACAATCTAGAAACCACTCAGCCAGCGTTGTGTAT
TGTTCTGAAGAGACCTCTCTTGTTTTTGTTTTGTTTCCATGTTCTCTTGAGTTTTCTTAT
CTTTGAGATTCTGCTTTTGTTCCATTTTCTCTTCCTAATGAGCTTAGCTTGT

QA 1 412 1 412
DS 

RD RS1C855JQ 415 0 0
TCATCGCTGCTCAGGTCTCCTCCTTCTCCCGCAAGGATCTCGCCACCCTCTGGGAGCATC
TCCAGTACAATCTCATCTCAGTGGTCCTCTGCTCGGCTCTCCTCGTCTTCATAACCACCA
TTTACGTCATGACTCGCCCCCGTCCTGTCTACTTGGAGAGCAGTGAGGTCTGTAAATCCT
AAAAAGGAGAAGAACCCATGGATGGATGAGATTCATGAGTTCCCGGTTGATGTCCCCACC
CACGCAACAATCTAGAAACCACTCAGCCAGCGTTGTGTATTGTTCTGAAGAGACCTCTCT
TGTTTTTGTTTTGTTTCCATGTTTTCTTGAGTTTTCTTATCTTTGAGATTCTGCTTTTGT
TCCATTTTTTCTTCCTAATGAGCTTAGCTTGTTCTTGATTGGTCGGCAAATTTAC

QA 1 415 1 415
DS 



AS 1 2

CO CL6839Contig1 1420 2 4 U
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TCTCCTTCTCGATCCGCTTCACATCATGCACCATCACGATTCACAGTTTTTCCCGATGGT
TTTCTTTTGATTTTTCAGTGGGATCTCGTGAAAGAGGGAGTCACCTTTTTTTTTTGAAAA
GTTGTTAAATCCGACGAGTCACTTCCTAAGCTTCGATTACTTGATTGATGCTCATGGAGA
ATAGTTTCAACGGATCTGTCTCCTTTTCTGAGTGCTACGTTATAGATTTGGGATGCTGGT
TGACTAAACTGAAGACGGGCAGGTTCGCTTGAGTTGTCTTTCATGTCTAGACCATTTGTG
AGAAGGGAGGTGTTATTTGCACCGTTCGCCCCACCAGTCTTTCATTCTGCAGTGAGTATT
GTGCTAAATTAAGGAAAATAGCTTTGTTCAACATATTACACTACTGTTTTAAAAACAATC
CTATAGTTAGATGCTTTTACAGTTAGAGATACGTATCTGTATCTTTCCGGCTACCAAAAC
GTTAAGAACCAATTAGAAAGGTCAGCCATTATTGCCTTGATTAAGCTGTTTTAATTCTGT
CATCATAATCTGATCCTTCATGAGTTTTAAGTATATATTTGTTTTATATATATAAACTGC
ATTCACAGCATTTCTGGATACTGCATAAATAATTTTATCCTTGCTTTTGGACTTTGTTCA
TGCTGATCTCCTATATAATTTACACTTCGGGCAGCCATTTAGCCTAAGAGATGTCAAACT
TCTATCGAGAGTGTTAGAGGTTTAGCTAGTAATTTGTATCTTGCACTACTTAGCCACACT
AGTTCACTTGATAATAAATGAACTGTGGGGAAGGTGCTGGGTTATTATTCCCTTCTCATC
GATGGTCTAGATGTGCGAGGTGACTCTCATGGAAGTAAAGAGATATGGTTATGACTTTGG
GAAGCATTCAGGTTAGAAGATTTCCTACTTGCGAAACTATTGGTATTGCTTGATTTTGGA
ATCAGTGATCTGCTAATGCAACACATGTGATACTTCCGAGTATATTGTGTGAAGTTTTTT
TTCTTCAGGTTGAGTACACCACGCCTTTATTCAAACTAAACAGAAGCGATGGATACGTAA
GCATGTTGCAATAACTTTTGTTGCGAGGTCCTTTGCCAAAAACTGAAGAAGTGCAAGGGC
TAAAGAAGTCAGAAGTGTTTATCGATGAAAGAGCAAAGAGACTTTTTTGACTTGTTGTCA
CTATTTCTCTCATTTATTCATTTCTAGCTGCAAGAGAAAACACCAAAGAGGTGGTGTGTT
TACCTGACGTAACGCCAAGCATTAAGAATATTTTGCTTGTACGCACCAGTACCTGGTTGA
TTCTAACTACAAATGAAAGATATGTAGGAATTTAGCTGAC


BQ
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AF RS1FB70TF U 1
AF RS1FB70JQ C 727
BS 1 777 RS1FB70TF
BS 778 778 RS1FB70JQ
BS 779 802 RS1FB70TF
BS 803 1420 RS1FB70JQ

RD RS1FB70TF 802 0 0
GGGTGCTCTCTCCTCCCTTCTTCACTCTATATTACCTCTCTTGCCCTAGGTGTTTAAGCT
TCTCCTTCTCGATCCGCTTCACATCATGCACCATCACGATTCACAGTTTTTCCCGATGGT
TTTCTTTTGATTTTTCAGTGGGATCTCGTGAAAGAGGGAGTCACCTTTTTTTTTTGAAAA
GTTGTTAAATCCGACGAGTCACTTCCTAAGCTTCGATTACTTGATTGATGCTCATGGAGA
ATAGTTTCAACGGATCTGTCTCCTTTTCTGAGTGCTACGTTATAGATTTGGGATGCTGGT
TGACTAAACTGAAGACGGGCAGGTTCGCTTGAGTTGTCTTTCATGTCTAGACCATTTGTG
AGAAGGGAGGTGTTATTTGCACCGTTCGCCCCACCAGTCTTTCATTCTGCAGTGAGTATT
GTGCTAAATTAAGGAAAATAGCTTTGTTCAACATATTACACTACTGTTTTAAAAACAATC
CTATAGTTAGATGCTTTTACAGTTAGAGATACGTATCTGTATCTTTCCGGCTACCAAAAC
GTTAAGAACCAATTAGAAAGGTCAGCCATTATTGCCTTGATTAAGCTGTTTTAATTCTGT
CATCATAATCTGATCCTTCATGAGTTTTAAGTATATATTTGTTTTATATATATAAACTGC
ATTCACAGCATTTCTGGATACTGCATAAATAATTTTATCCTTGCTTTTGGACTTTGTTCA
TGCTGATCTCCTATATAATTTACACTTCGGGCAGCCATTTAGCCTAAGAGATGTCAA*CT
TCTATCGAGAGTGTTAGAGGTT

QA 1 802 1 802
DS 

RD RS1FB70JQ 694 0 0
TCTCCTATATAATTTACACTTCGGGCAGCCATTTAGCCTAAGAGATGTCAAACTTCTATC
GAGAGTGTTAGAGGTTTAGCTAGTAATTTGTATCTTGCACTACTTAGCCACACTAGTTCA
CTTGATAATAAATGAACTGTGGGGAAGGTGCTGGGTTATTATTCCCTTCTCATCGATGGT
CTAGATGTGCGAGGTGACTCTCATGGAAGTAAAGAGATATGGTTATGACTTTGGGAAGCA
TTCAGGTTAGAAGATTTCCTACTTGCGAAACTATTGGTATTGCTTGATTTTGGAATCAGT
GATCTGCTAATGCAACACATGTGATACTTCCGAGTATATTGTGTGAAGTTTTTTTTCTTC
AGGTTGAGTACACCACGCCTTTATTCAAACTAAACAGAAGCGATGGATACGTAAGCATGT
TGCAATAACTTTTGTTGCGAGGTCCTTTGCCAAAAACTGAAGAAGTGCAAGGGCTAAAGA
AGTCAGAAGTGTTTATCGATGAAAGAGCAAAGAGACTTTTTTGACTTGTTGTCACTATTT
CTCTCATTTATTCATTTCTAGCTGCAAGAGAAAACACCAAAGAGGTGGTGTGTTTACCTG
ACGTAACGCCAAGCATTAAGAATATTTTGCTTGTACGCACCAGTACCTGGTTGATTCTAA
CTACAAATGAAAGATATGTAGGAATTTAGCTGAC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL6840Contig1 645 2 2 U
TTTTTTTAACAAAAAAACATTCAACTTGGAACCTCGTTCACAAGAAACATTGTTCTGACA
AAATGAAACAAACGAGCTTAAATGACAAAACACGAGCTAAACTCAACAAACATTGTTCTG
ACAAAATGAAACACAATTGTTCAGAGCCTCCTTCCTCTTCTCCCACCCTTTCTGCGGGTA
CTGTCCGTTGGGATCGGAGTAACATCCTCAATGCCAATTTTCATGCCAGAACGGGCAAGA
GCTCTAAGAGCGGACTGAGCACCGGGACCGGGTGTCTTGGTCTTGTTTCCACCAGTGGCA
CGGAGCTTCACGTGCATCGCGGTGATTCCAAGCTCCTTGCATCGCTGAGCAACATCTTGT
GCAGCAAGCATAGCTGCGTAAGGTGAGGACTCATCCCTGTCAGCTTTCACCTTCATCCCA
CCAGTGATACGAACAAGGGTTTCACGTCCAGACAGATCAGTAACGTGAATGAAAGTGTCG
TTGAAGGAAGCGAAGATGTGGACAACACCGAAGACTTGCTCTCCATCACGAACAGCTGGT
CCAAGTGTCACTGTCTCCTCCTTTGGCTCTCTCGTCTTTCTCCTCGACATTGTTATGATC
GATCACAGCAAAGGTCACTTCTTCCTTGTGTAGTTTCCGGCTTCC


BQ
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AF RS1E358TF C 1
AF RS1E358JQ U 8
BS 1 7 RS1E358TF
BS 8 645 RS1E358JQ

RD RS1E358TF 645 0 0
TTTTTTTAACAAAAAAACATTCAACTTGGAAC*TCGTTCACAAGAAACATTGTTCTGACA
AAATGAAACAAACGAGCTTAAATGACAAAACACGAGCTAAACTCAACAAACATTGTTCTG
ACAAAATGAAACACAATTGTTCAGAGCCTCCTTCCTCTTCTCCCACCCTTTCTGCGGGTA
CTGTCCGTTGGGATCGGAGTAACATCCTCAATGCCAATTTTCATGCCAGAACGGGCAAGA
GCTCTAAGAGCGGACTGAGCACCGGGACCGGGTGTCTTGGTCTTGTTTCCACCAGTGGCA
CGGAGCTTCACGTGCATCGCGGTGATTCCAAGCTCCTTGCATCGCTGAGCAACATCTTGT
GCAGCAAGCATAGCTGCGTAAGGTGAGGACTCATCCCTGTCAGCTTTCACCTTCATCCCA
CCAGTGATACGAACAAGGGTTTCACGTCCAGACAGATCAGTAACGTGAATGAAAGTGTCG
TTGAAGGAAGCGAAGATGTGGACAACACCGAAGACTTGCTCTCCATCACGAACAGCTGGT
CCAAGTGTCACTGTCTCCTCCTTTGGCTCTCTCGTCTTTCTCCTCGACATTGTTATGATC
GATCACAGCAAAGGTCACTTCTTCCTTGTGTAGTTTCCGGCTTCC

QA 1 645 1 645
DS 

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AACAAAAAAACATTCAACTTGGAACCTCGTTCACAAGAAACATTGTTCTGACAAAATGAA
ACAAACGAGCTTAAATGACAAAACACGAGCTAAACTCAACAAACATTGTTCTGACAAAAT
GAAACACAATTGTTCAGAGCCTCCTTCCTCTTCTCCCACCCTTTCTGCGGGTACTGTCCG
TTGGGATCGGAGTAACATCCTCAATGCCAATTTTCATGCCAGAACGGGCAAGAGCTCTAA
GAGCGGACTGAGCACCGGGACCGGGTGTCTTGGTCTTGTTTCCACCAGTGGCACGGAGCT
TCACGTGCATCGCGGTGATTCCAAGCTCCTTGCATCGCTGAGCAACATCTTGTGCAGCAA
GCATAGCTGCGTAAGGTGAGGACTCATCCCTGTCAGCTTTCACCTTCATCCCACCAGTGA
TACGAACAAGGGTTTCACGTCCAGACAGATCAGTAACGTGAATGAAAGTGTCGTTGAAGG
AAGCGAAGATGTGGACAACACCGAAGACTTGCTCTCCATCACGAACAGCTGGTCCAAGTG
TCACTGTCTCCTCCTTTGGCTCTCTCGTCTTTCTCCTCGACATTGTTATGATCGATCACA
GCAAAGGTCACTTCTTCCTTGTGTAGTTTCCGGCTTCC

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

CO CL6841Contig1 527 2 1 U
GGACTCTTATCGCAGCTTCCTTCTTCTTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACACA
CACTTACTTTGTTGGGCGTCGAAACAACGCTGTCCGAATCATATCTTCTCGATTCTGATT
TTTATTCTTTCTTCATGAATACGTATAGTCACTAAGTGTTTCTTCATCCTCAAAAAAGGA
AAAAAAAAAAACAAATCCCTCAAAAAACAATAATCTCGGGACTAGTTGGTTTCTCGATTC
ATCAATGGCGACAGTTAACCCTTTCGATCTCTTGGACGATGACACAGAGGATCTCCACAA
GCTCGTCGCGGCTAAGCCGTTGAAGGTTGAGAAACCTGCTCCGGTTCAGCCTGGGAAGCT
GCCGACTAAGCCGCTTCCTCCTTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACACACACACTT
ACTTTGTTGGGCGTCGAAACAACGCTGTCCGAATCATATCTTCTCGATTCTGATTTTTAT
TCTTTCTTCATGAATACGTATAGTCACTAAGTGTTTCTTCATCCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1EL26TF U 1
AF RS1EL26JQ C 32
BS 1 527 RS1EL26TF

RD RS1EL26TF 527 0 0
GGACTCTTATCGCAGCTTCCTTCTTCTTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACACA
CACTTACTTTGTTGGGCGTCGAAACAACGCTGTCCGAATCATATCTTCTCGATTCTGATT
TTTATTCTTTCTTCATGAATACGTATAGTCACTAAGTGTTTCTTCATCCTCAAAAAAGGA
AAAAAAAAAAACAAATCCCTCAAAAAACAATAATCTCGGGACTAGTTGGTTTCTCGATTC
ATCAATGGCGACAGTTAACCCTTTCGATCTCTTGGACGATGACACAGAGGATCTCCACAA
GCTCGTCGCGGCTAAGCCGTTGAAGGTTGAGAAACCTGCTCCGGTTCAGCCTGGGAAGCT
GCCGACTAAGCCGCTTCCTCCTTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACACACACACTT
ACTTTGTTGGGCGTCGAAACAACGCTGTCCGAATCATATCTTCTCGATTCTGATTTTTAT
TCTTTCTTCATGAATACGTATAGTCACTAAGTGTTTCTTCATCCTCC

QA 1 527 1 527
DS 

RD RS1EL26JQ 496 0 0
TCTCTCTCTCACACACACACACACACACACACTTACTTTGTTGGGCGTCGAAACAACGCT
GTCCGAATCATATCTTCTCGATTCTGATTTTTATTCTTTCTTCATGAATACGTATAGTCA
CTAAGTGTTTCTTCATCCTCAAAAAAGGAAAAAAAAAAAACAAATCCCTCAAAAAACAAT
AATCTCGGGACTAGTTGGTTTCTCGATTCATCAATGGCGACAGTTAACCCTTTCGATCTC
TTGGACGATGACACAGAGGATCTCCACAAGCTCGTCGCGGCTAAGCCGTTGAAGGTTGAG
AAACCTGCTCCGGTTCAGCCTGGGAAGCTGCCGACTAAGCCGCTTCCTCCTTCTCTCTCT
CTCACACACACACACACACACACACACTTACTTTGTTGGGCGTCGAAACAACGCTGTCCG
AATCATATCTTCTCGATTCTGATTTTTATTCTTTCTTCATGAATACGTATAGTCACTAAG
TGTTTCTTCATCCTCC

QA 1 496 1 496
DS 



AS 1 2

CO CL6842Contig1 664 2 2 U
GGGGCATCAAGCAAGCAACTCTTCATTGTTCACCAAATATATTGTATCTAGAGAGAGAAA
GAAAATACTCTTTCTAGGATCATATTTACATACGTAAATAAATACTTAAATAAATACATA
AGTGTACGTATATCTCTCAAATAAAGAGAAAATGAAGGGAGGGGAGAAGCAATGTGGGAA
AGTGGATAAACTGAAGCCAATAATAGCGATCATATCACTCCAATTCGGATATGCAGGCAT
GTATATCATTACAATGGTTTCTTTCAAGCATGGAATGAACCATTGGGTCCTTGCCACCTA
TCGACATGTCGTCGCTACCATCGTCATGGCTCCTTTTGCTCTAATTCTCGAAAGGAAAAT
ACGGCCAAAGATGACATGGCCATTATTCCTTAGGATCCTTGCCCTCGGAATCCTAGAACC
GCTTATGGACCAGAACTTCTACTACATAGGAATGAAAGCCACATCAGCAACGTACAGTTC
TGCCTTTGTTAATGCACTTCCCGCCGTCACCTTCATAATGGCCGTCATTTTCAGGTTAGA
AACTGTGAATTTGAAGAAGATACGTAGTCTTGCAAAGGTGATTGGAACAGCAATAACCGT
GGGTGGGGCAATGGTAATGACGTTATACAAAGGCCCAGCCATCGAGCTCATCAAAGCCGC
TCAT


BQ
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1FO40TF U 1
AF RS1FS19TF U 2
BS 1 633 RS1FO40TF
BS 634 664 RS1FS19TF

RD RS1FO40TF 647 0 0
GGGGCATCAAGCAAGCAACTCTTCATTGTTCACCAAATATATTGTATCTAGAGAGAGAAA
GAAAATACTCTTTCTAGGATCATATTTACATACGTAAATAAATACTTAAATAAATACATA
AGTGTACGTATATCTCTCAAATAAAGAGAAAATGAAGGGAGGGGAGAAGCAATGTGGGAA
AGTGGATAAACTGAAGCCAATAATAGCGATCATATCACTCCAATTCGGATATGCAGGCAT
GTATATCATTACAATGGTTTCTTTCAAGCATGGAATGAACCATTGGGTCCTTGCCACCTA
TCGACATGTCGTCGCTACCATCGTCATGGCTCCTTTTGCTCTAATTCTCGAAAGGAAAAT
ACGGCCAAAGATGACATGGCCATTATTCCTTAGGATCCTTGCCCTCGGAATCCTAGAACC
GCTTATGGACCAGAACTTCTACTACATAGGAATGAAAGCCACATCAGCAACGTACAGTTC
TGCCTTTGTTAATGCACTTCCCGCCGTCACCTTCATAATGGCCGTCATTTTCAGGTTAGA
AACTGTGAATTTGAAGAAGATACGTAGTCTTGCAAAGGTGATTGGAACAGCAATAACCGT
GGGTGGGGCAATGGTAATGACGTTATACAAAGG
TCCATCGAGCTCAT

QA 1 633 1 633
DS 

RD RS1FS19TF 663 0 0
GGGCATCAAGCAAGCAACTCTTCATTGTTCACCAAATATATTGTATCTAGAGAGAGAAAG
AAAATACTCTTTCTAGGATCATATTTACATACGTAAATAAATACTTAAATAAATACATAA
GTGTACGTATATCTCTCAAATAAAGAGAAAATGAAGGGAGGGGAGAAGCAATGTGGGAAA
GTGGATAAACTGAAGCCAATAATAGCGATCATATCACTCCAATTCGGATATGCAGGCATG
TATATCATTACAATGGTTTCTTTCAAGCATGGAATGAACCATTGGGTCCTTGCCACCTAT
CGACATGTCGTCGCTACCATCGTCATGGCTCCTTTTGCTCTAATTCTCGAAAGGAAAATA
CGGCCAAAGATGACATGGCCATTATTCCTTAGGATCCTTGCCCTCGGAATCCTAGAACCG
CTTATGGACCAGAACTTCTACTACATAGGAATGAAAGCCACATCAGCAACGTACAGTTCT
GCCTTTGTTAATGCACTTCCCGCCGTCACCTTCATAATGGCCGTCATTTTCAGGTTAGAA
ACTGTGAATTTGAAGAAGATACGTAGTCTTGCAAAGGTGATTGGAACAGCAATAACCGTG
GGTGGGGCAATGGTAATGACGTTATACAAAGGCCCAGCCATCGAGCTCATCAAAGCCGCT
CAT

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

CO CL6843Contig1 640 2 1 U
GGCCGCCACCTAGGGTTTTCAGCGGCGATAACGAAGAAGACGAAGAAGAGGGATCTAGAG
AAACAAGTGAAGCAACAATGGTGAAGTTCCTGAAGCAGAACAAGGCAGTTATCCTCCTCC
AAGGCCGATACGCCGGAAAGAAGGCCGTGATCATCCGCTCCTTCGACGACGGAAACCGCG
AGCGCCCTTACGGACACTGCCTCGTGGCCGGACTCAAGAAGTACCCGAGCAAGGTCATCC
GCAAGGACTCGGCGAAGAAGACGGCCAAGAAATCTAGGGTTAAGTGTTTCATCAAGGTCG
TCAACTACCAGCACCTGATGCCTACGCGTTACCCCCTTGACGTGGACCTCAAGGAAGTCG
CGACCCTCGAGGCTCTTTCTTCCAAGGACAAGAAGGTCGCCGCTCTCAAGGAGGCCAAGG
CTAAGCTCGAGGAGCGTTTCAAGACCGGGAAGAACAGGTGGTTCTTTACCAAACTCAGGT
TCTGAAGGAGTTCTTGTCGGAAGAAAGCGTTTTTGTTGCTGCATTTTCGTATCTGATATT
TAAAACAGCGTATTATTAGTTTCGTATGGAGAGCAATGTGGATTCCTGTTTTGGGATTGT
GAAAGACGAGTTTGATTATCTATTTGCATTTTGATTACCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1ET46JQ C 1
AF RS1ET46TF U 1
BS 1 640 RS1ET46TF

RD RS1ET46JQ 640 0 0
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AAACAAGTGAAGCAACAATGGTGAAGTTCCTGAAGCAGAACAAGGCAGTTATCCTCCTCC
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AGCGCCCTTACGGACACTGCCTCGTGGCCGGACTCAAGAAGTACCCGAGCAAGGTCATCC
GCAAGGACTCGGCGAAGAAGACGGCCAAGAAATCTAGGGTTAAGTGTTTCATCAAGGTCG
TCAACTACCAGCACCTGATGCCTACGCGTTACCCCCTTGACGTGGACCTCAAGGAAGTCG
CGACCCTCGAGGCTCTTTCTTCCAAGGACAAGAAGGTCGCCGCTCTCAAGGAGGCCAAGG
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QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1ET46TF 640 0 0
GGCCGCCACCTAGGGTTTTCAGCGGCGATAACGAAGAAGACGAAGAAGAGGGATCTAGAG
AAACAAGTGAAGCAACAATGGTGAAGTTCCTGAAGCAGAACAAGGCAGTTATCCTCCTCC
AAGGCCGATACGCCGGAAAGAAGGCCGTGATCATCCGCTCCTTCGACGACGGAAACCGCG
AGCGCCCTTACGGACACTGCCTCGTGGCCGGACTCAAGAAGTACCCGAGCAAGGTCATCC
GCAAGGACTCGGCGAAGAAGACGGCCAAGAAATCTAGGGTTAAGTGTTTCATCAAGGTCG
TCAACTACCAGCACCTGATGCCTACGCGTTACCCCCTTGACGTGGACCTCAAGGAAGTCG
CGACCCTCGAGGCTCTTTCTTCCAAGGACAAGAAGGTCGCCGCTCTCAAGGAGGCCAAGG
CTAAGCTCGAGGAGCGTTTCAAGACCGGGAAGAACAGGTGGTTCTTTACCAAACTCAGGT
TCTGAAGGAGTTCTTGTCGGAAGAAAGCGTTTTTGTTGCTGCATTTTCGTATCTGATATT
TAAAACAGCGTATTATTAGTTTCGTATGGAGAGCAATGTGGATTCCTGTTTTGGGATTGT
GAAAGACGAGTTTGATTATCTATTTGCATTTTGATTACCG

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

CO CL6844Contig1 530 2 1 U
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AGATGGTTCAGCTTCTTCAAATCGCAATGGCTTGTGTCGCTACGGTTCCTGATCAACGAC
CGGTGATGCAGGAAGTGCTGAGAATGATTGAGGATGTGAACAGAAGTGAAACAACCGATG
ACGGGTTAAGACAATCGTCTGATGACCCGTCCAAAGGTTCAGAGGGTCAGACTCCTCCAG
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TTGGGTTACGTTAAAGCAAAAAAAGGCTGGACCAGACCAGTGTGGCATTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1B531JQ C 1
AF RS1B531TF U 1
BS 1 530 RS1B531TF

RD RS1B531JQ 530 0 0
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CGGTGATGCAGGAAGTGCTGAGAATGATTGAGGATGTGAACAGAAGTGAAACAACCGATG
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QA 1 530 1 530
DS 

RD RS1B531TF 530 0 0
GGGATGTGTACAGTTTCGGGGTGTTGCTGCTTGAACTGTTGACTGGCAAATCACCAAACC
AGGCATCACTTGGCGAAGAAGGCATTGATCTGCCTCGGTGGGTGCTGTCTGTGGTTAGAG
AAGAATGGACCGCTGAAGTGTTCGATGTCGAGCTGATGCGGTACCACAACATAGAGGAAG
AGATGGTTCAGCTTCTTCAAATCGCAATGGCTTGTGTCGCTACGGTTCCTGATCAACGAC
CGGTGATGCAGGAAGTGCTGAGAATGATTGAGGATGTGAACAGAAGTGAAACAACCGATG
ACGGGTTAAGACAATCGTCTGATGACCCGTCCAAAGGTTCAGAGGGTCAGACTCCTCCAG
GGGAATCAAGGACGCCACCACGTTCGGTCACGCCTTAGTAGTAACTCAAAGCAGCTTTAG
TTTGTGTGTGTTCACTTTCTCCTCAAAAGGAGATAAAAAGAAAAGTGTGTTAGGTCTTTG
TTGGGTTACGTTAAAGCAAAAAAAGGCTGGACCAGACCAGTGTGGCATTC

QA 1 530 1 530
DS 



AS 1 2

CO CL6845Contig1 835 2 2 U
GGACCACTGGTACTAAGGAGATGGCAAGCCATGCAGTATGCATTCAACGCGTGGCACCAC
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CAATAGCCATCTACACTCCTCACGAGGGTGGATACGAAGGTAGGTATCTTAACCGTCTCA
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CACTCCTTAACCCTTATCCTGTTTGCCCTGCCCACCTTGGGAAACAACCAATAGCAAGGT
GGTACTATCCACCAGAAGTTGACTACAGACTCTCAGCTCTTCCGCCTAGTGCCAAGGGAC
TTGTCGTCTGGGTCATTGAAGCAAAGGTCCTCTCAAAGTCTGAACTCCAGTTTCTCGCTC
TGCTTCCTTCTCTCCGTCCTAATGTCAGGGTTGTTGCTGAATGTGGCAGCTGGAGAAAGT
TCGTGTGGAAGCCCCTTGCAGAAATTGCAGAGCTAGCTGCATAAGAGTAACTTAATGAAC
TCATGCACCAATGGAGAGCTTACCATGTATAGTTTTCATGTATTATCATCTCCTGCAAGT
GTAGTTAGTATTCATCGCATTGTAAAATTTGAAATTTGTGCAATGTCATAAGACCCTTAT
CTGATACTCTTCACTCTGATTTTCCACAAATGAAATAGCAAAATATTGATGGGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BZ86TF U 1
AF RS1BZ86JQ C 112
BS 1 743 RS1BZ86TF
BS 744 835 RS1BZ86JQ

RD RS1BZ86TF 743 0 0
GGACCACTGGTACTAAGGAGATGGCAAGCCATGCAGTATGCATTCAACGCGTGGCACCAC
CGTGTCTCGGAGCCTCGCAAGTGAATAGGAGCAAAACAGTTAGTCCCTTCTCTGTGAGTA
TTATTACTAGAAGGAAGAGAAGAAGCAGTGGCGTGAGATGCAGCCTCGTTGACTTCATCG
GAGGAGACCTGGTGAAGCCAGACATCGGTCGTTGGCTCGAGGACGTGGAAAAGCACAAGT
CAATAGCCATCTACACTCCTCACGAGGGTGGATACGAAGGTAGGTATCTTAACCGTCTCA
AAGAACAGGGCTACTACTTTCTTGACATCTCAGCTCGAGGACTTGGTGATCCAGAGACCA
CACTCCTTAACCCTTATCCTGTTTGCCCTGCCCACCTTGGGAAACAACCAATAGCAAGGT
GGTACTATCCACCAGAAGTTGACTACAGACTCTCAGCTCTTCCGCCTAGTGCCAAGGGAC
TTGTCGTCTGGGTCATTGAAGCAAAGGTCCTCTCAAAGTCTGAACTCCAGTTTCTCGCTC
TGCTTCCTTCTCTCCGTCCTAATGTCAGGGTTGTTGCTGAATGTGGCAGCTGGAGAAAGT
TCGTGTGGAAGCCCCTTGCAGAAATTGCAGAGCTAGCTGCATAAGAGTAACTTAATGAAC
TCATGCACCAATGGAGAGCTTACCATGTATAGTTTTCATGTATTATCATCTCCTGCAAGT
GTAGTTAGTATTCATCGCATTGT

QA 1 743 1 743
DS 

RD RS1BZ86JQ 724 0 0
CTGTGAGTATTATTACTAGAAGGAAGAGAAGAAGCAGTGGCGTGAGATGCAGCCTCGTTG
ACTTCATCGGAGGAGACCTGGTGAAGCCAGACATCGGTCGTTGGCTCGAGGACGTGGAAA
AGCACAAGTCAATAGCCATCTACACTCCTCACGAGGGTGGATACGAAGGTAGGTATCTTA
ACCGTCTCAAAGAACAGGGCTACTACTTTCTTGACATCTCAGCTCGAGGACTTGGTGATC
CAGAGACCACACTCCTTAACCCTTATCCTGTTTGCCCTGCCCACCTTGGGAAACAACCAA
TAGCAAGGTGGTACTATCCACCAGAAGTTGACTACAGACTTTCAGCTCTTCCGCCTAGTG
CCAAGGGACTTGTCGTTTGGGTCATTGAAGCAAAGGTCCTCTCAAAGTCTGAACTCCAGT
TTCTCGCTCTGCTTCCTTCTCTCCGTCCTAATGTCAGGGTTGTTGCTGAATGTGGCAGCT
GGAGAAAGTTCGTGTGGAAGCCCCTTGCAGAAATTGCAGAGCTAGCTGCATAAGAGTAAC
TTAATGAACTCATGCACCAATGGAGAGCTTACCATGTATAGTTTTCATGTATTATCATCT
CCTGCAAGTGTAGTTAGTATTCATCGCATTGTAAAATTTGAAATTTGTGCAATGTCATAA
GACCCTTATCTGATACTCTTCACTCTGATTTTCCACAAATGAAATAGCAAAATATTGATG
GGTC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL6846Contig1 888 2 4 U
AAGGGAAAGGTCTTGGCAAGCAAGAGCAAGGGATAACGGAGCCTATAAAGTCCGGTATAA
GGGACCGAAGGCTCGGTTTAGGGAAGCAAGAAGAGGATGATTATTTCACTGCAGAGGAAA
ACATCCAAAGGAGGAAGCCTGATATTGAGATCGAGGAGACTGAGGAGATCGCTAAGAAAC
GGGAGGTCCAAGCAGAACGTGAGCTGAAGATTGAGAGCGATGTCAAAGAAATACGCAAAA
CCTTCTACCGTGAACTCTGCAGCAAGCAGTATAGAACGGTGATGGAGTTTGAAGGTCACT
TGAGCTCGTATGATCACAACCATAAGAAGAGATTCAAAGAGATGAAAGAAATGCATGGTG
CAAGCAGCCGGGATGATAGGAAGAAGCGAGAGCAGCAGTGTCAAGAGAGGGAGCTGACTA
AAATGGCTGATGCTCGTAAACAGCAGCAGATGCAACAGCAGAACATGCAAGAAGACCCAG
AGAATGCCCCAGTTCCATTGCCTGCAAAGACCACTCTTGTACCACTTGTTGTCCAAGATC
AGCGGAAGTCTTTGAAGTTTTGGCTTTTCTTCAAAAAGCGGCAGTACATCAAAGAACCAA
CCCAAGAGCAGCATCAAGAAGCCTAAAATAGCGATTGCATCTGTTTTTGGCAACGATAGC
GACGAAGACTAAGGTTTACATGCATCATCGAGAATATTGTACTAAATGTAATTCTATTTT
ATGGTTCTTCGTTTCACACTGAACATGGTCTGAAAAAATCTTCACATCTCAGGACCACAA
CATAGCCTTGCAACTTTTTGTGTTTATTAAAGGAAATCTTAAAAGACACTTGGGGCTAGA
CTAATGCGTTTTAGTCCAATGAATGAATGTATTCAGTTCTTATTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BL08TF U 1
AF RS1BL08JQ C 112
BS 1 672 RS1BL08TF
BS 673 673 RS1BL08JQ
BS 674 757 RS1BL08TF
BS 758 888 RS1BL08JQ

RD RS1BL08TF 757 0 0
AAGGGAAAGGTCTTGGCAAGCAAGAGCAAGGGATAACGGAGCCTATAAAGTCCGGTATAA
GGGACCGAAGGCTCGGTTTAGGGAAGCAAGAAGAGGATGATTATTTCACTGCAGAGGAAA
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GGGAGGTCCAAGCAGAACGTGAGCTGAAGATTGAGAGCGATGTCAAAGAAATACGCAAAA
CCTTCTACCGTGAACTCTGCAGCAAGCAGTATAGAACGGTGATGGAGTTTGAAGGTCACT
TGAGCTCGTATGATCACAACCATAAGAAGAGATTCAAAGAGATGAAAGAAATGCATGGTG
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AAATGGCTGATGCTCGTAAACAGCAGCAGATGCAACAGCAGAACATGCAAGAAGACCCAG
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CCCAAGAGCAGCATCAAGAAGCCTAAAATAGCGATTGCATCTGTTTTTGGCAACGATAGC
GACGAAGACTAATGTTTACATGCATCATCGAGAATATTGTACTAAATGTAATTCTATTTT
ATGGTTCTTCGTTTCACACTGAACATGGTCTGAAAAA

QA 1 757 1 757
DS 

RD RS1BL08JQ 777 0 0
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TACGCAAAACCTTCTACCGTGAACTCTGCAGCAAGCAGTATAGAACGGTGATGGAGTTTG
AAGGTCACTTGAGCTCGTATGATCACAACCATAAGAAGAGATTCAAAGAGATGAAAGAAA
TGCATGGTGCAAGCAGCCGGGATGATAGGAAGAAGCGAGAGCAGCAGTGTCAAGAGAGGG
AGCTGACTAAAATGGCTGATGCTCGTAAACAGCAGCAGATGCAACAGCAGAACATGCAAG
AAGACCCAGAGAATGCCCCAGTTCCATTGCCTGCAAAGACCACTCTTGTACCACTTGTTG
TCCAAGATCAGCGGAAGTCTTTGAAGTTT*GGCTTTTCTTCAAAAAGCGGCAGTACATCA
AAGAACCAACCCAAGAGCAGCATCAAGAAGCCTAAAATAGCGATTGCATCTGTTTTTGGC
AACGATAGCGACGAAGACTAAGGTTTACATGCATCATCGAGAATATTGTACTAAATGTAA
TTCTATTTTATGGTTCTTCGTTTCACACTGAACATGGTCTGAAAAAATCTTCACATCTCA
GGACCACAACATAGCCTTGCAACTTTTTGTGTTTATTAAAGGAAATCTTAAAAGACACTT
GGGGCTAGACTAATGCGTTTTAGTCCAATGAATGAATGTATTCAGTTCTTATTTTCT

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 2

CO CL6847Contig1 829 2 2 U
GGACAATCTCTCCGATCCGACGCCAAAAGCAGTCAATTTCCATATCGGAGAAGATGCAGC
AGAGGAAAACGACGGCGGCGGGTAGGCCAAGTGGTACCGATGGATCTGATTTCTCGTATC
GGATGGTCGTTGACTCTCGTTACACGAAGGTCACTAAAGGGAGATCTCGTCTCCGTCTCT
TGATCCTTGTTCAGGCTACGATATATCTGATTGGACTGTCTTGTGCATTCATGACAGGTA
CTAAAGATGACGAGAAGAACACACTTGGAATTGCATCTGCTGCTACTGGCTTACTCTTTT
CATTCATTGGAGATTTTGGTTGCAGACGCAGCAGAGTAACCCTTTTGAGGCTCTACACGG
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TGGAGGAACGGAATAGCTCTGGAACAGCAGCTAAGCTTGAGCTCTTAGGGTTCATTTCTG
CTCAATTGGGAGCGGTGGTGCAGATATTAGCAATCATCGTTACGGGTTCCCTTGTCAATA
ATATGTCTCCGCCTACGAAGACAGAATAGAGAAGACAAGAGAGTTTCACAAAAAAAAAAA
AGGACAGTTTGTGGTACTGGCATGTGTGATTTTGCTACATGAGGAAGACATTAAGAATTT
TGTAGTTTTCGTTCCACCAAATGAATAGTTGTTTACTTCAGTATTTTCTTTCGTTATTCG
AGAAGATTCGAGAGCAACAGACGTGTATGCCTGTTTGGCATTGCGTTTTGGCTCCTCCGT
CCTTTCACAATTGATTCATATTCTATCGAGTTTGGTGATTCGTATTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AW32TF U 1
AF RS1AW32JQ C 325
BS 1 591 RS1AW32TF
BS 592 829 RS1AW32JQ

RD RS1AW32TF 591 0 0
GGACAATCTCTCCGATCCGACGCCAAAAGCAGTCAATTTCCATATCGGAGAAGATGCAGC
AGAGGAAAACGACGGCGGCGGGTAGGCCAAGTGGTACCGATGGATCTGATTTCTCGTATC
GGATGGTCGTTGACTCTCGTTACACGAAGGTCACTAAAGGGAGATCTCGTCTCCGTCTCT
TGATCCTTGTTCAGGCTACGATATATCTGATTGGACTGTCTTGTGCATTCATGACAGGTA
CTAAAGATGACGAGAAGAACACACTTGGAATTGCATCTGCTGCTACTGGCTTACTCTTTT
CATTCATTGGAGATTTTGGTTGCAGACGCAGCAGAGTAACCCTTTTGAGGCTCTACACGG
CTGCCTCTACCGCTGTCATGGTTCTTTCTGTGTTTTCTGCTGTTAGGAGCAGATTAACAA
TGGAGGAACGGAATAGCTCTGGAACAGCAGCTAAGCTTGAGCTCTTAGGGTTCATTTCTG
CTCAATTGGGAGCGGTGGTGCAGATATTAGCAATCATCGTTACGGGTTCCCTTGTCAATA
ATATGTCTCCGCCTACGAAGACAGAATAGAGAAGACAAGAGAGTTTCACAA

QA 1 591 1 591
DS 

RD RS1AW32JQ 505 0 0
GACGCAGCAGAGTAACCCTTTTGAGGCTTTACACGGCTGCCTCTACCGCTGTCATGGTTC
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CAGCAGCTAAGCTTGAGCTCTTAGGGTTCATTTTTGCTCAATTGGGAGCGGTGGTGCAGA
TATTAGCAATCATCGTTACGGGTTCCCTTGTCAATAATATGTCTCCGCCTACGAAGACAG
AATAGAGAAGACAAGAGAGTTTCACAAAAAAAAAAAAGGACAGTTTGTGGTACTGGCATG
TGTGATTTTGCTACATGAGGAAGACATTAAGAATTTTGTAGTTTTCGTTCCACCAAATGA
ATAGTTGTTTACTTCAGTATTTTCTTTCGTTATTCGAGAAGATTCGAGAGCAACAGACGT
GTATGCCTGTTTGGCATTGCGTTTTGGCTCCTCCGTCCTTTCACAATTGATTCATATTCT
ATCGAGTTTGGTGATTCGTATTTTT

QA 1 505 1 505
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6849Contig1 638 2 3 U
GAACTCACGAGTACGTTGCACCGGAAGTCGCCTCCGGTGGGTCCCACGGAAACGCCGTCG
ACTGGTGGGCCTTCGGAGTATTCCTCTACGAGATCATATACGGGCGGACTCCGTTCACCG
CGCCGACTAATGACGTCATCCTACGTAACATAGTGAAAAGACCGTTGAGTTTTCCGACTG
ATTCTCCGGCGACGATGTTCGAGCTTCACGCTCGGAGTTTGATCTCCGGGTTGCTCAACA
AGGATCCGAGTAAAAGACTCGGGTCACGGCGAGGCGCGGCGGAGGTGAAAGTGCATCCGT
TTTTCAAGGGTCTAAACTTTGCGCTCATCCGTACAATGACTCCGCCGGAGATTCCCTCCG
ACGTCAGAGGACCGAAGAAGTCGGCGACGTTTGGCGGTAGAGGTAGCAAACCAGCGGCGT
TCGATTTCTTTTGAAAACCAACGTTAGAGATTTAGTTAGCATCACCGATCACGTGTTAGT
CGGTTTAAGTCGGTGCCAGGTTTTTAGCGACTGCCTTGTGACGATAGCTGTTTTAGCTGT
ACATATTCCCTTAATGATGTCCTTAATTTGTTTTTTTTAAATCGTTTATCTGAGTTTTAA
TATTTAAATCAGGTGAGTTCTCACGCGATTTGTATAAC


BQ
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AF RS1AU34JQ C 1
AF RS1AU34TF U 1
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AGGATCCGAGTAAAAGACTCGGGTCACGGCGAGGCGCGGCGGAGGTGAAAGTGCATCCGT
TTTTCAAGGGTCTAAACTTTGCGCTCATCCGTACAATGACTCCGCCGGAGATTCCCTCCG
ACGTCAGAGGACCGAAGAAGTCGGCGACGTTTGGCGGTAGAGGTAGCAAACCAGCGGCGT
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TATTTAAATCATGTGAGTTCTCACGCGATTTGTATAAC

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1E735TF U 11
AF RS1F482TF U 1
BS 1 425 RS1F482TF
BS 426 426 RS1E735TF
BS 427 742 RS1F482TF

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GG
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QA 3 657 3 657
DS 

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CGTCGCTGATTCTTTCCCCGTCAACGAAGACGGCGGTTTTCGACGGAAGAAGCCGTTCGG
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TGGTTTGTTCATCGGCTTTGGACAGGTTGTTGACTGTCGCATTTGCGGGGACCCAAACTC
AGTACTTAAGTTTGCTTTCATCGAGTTCACTGATGAAGGGGGTGCAAGAGCTGCGCTGAA
TCTGTCTGGGACGGTGCTGGGATTCTATCCTGTGAAGGTATGCCGTCCAAAACTGCTATT
GCACCGGTTAACCCGACGTTAT

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1DL89JQ C 1
AF RS1DL89TF U 1
BS 1 634 RS1DL89TF

RD RS1DL89JQ 634 0 0
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TCTTATTACAAAAGAGACAATGGCTTTCGCTTTGAGGTTCTTCACATGCCTTATTTTGAC
GGTGTGCATAGTTGCATCAGTAGATGCAGCAATCTCATGTGGCACAGTGGCAAGTAGCTT
GGTTCCATGTGCCGGCTACCTATCCAAAGGTGGGGTGGTACCGCCTCCATGCTGTGCGGG
AGTCAAAAAAACTGAATGGTATGGCTCAAACCACACCGGACCGCCAACAAGCATGCAAAT
GTCTAAAGGCCGCTGCAAATAGCATCAACCCAAGTCTAGCCTCTAGCCTTCCTGGAAAGT
GCGGTGTTAGCATTCCCTATCCCATCTCCATGAGCACTAACTGCGACACCGTCAAGTGAA
GTGAGAACTCATACATCATCCTGAGGATTAAGAGTGCTTGGTCTAGCATAAGTAAAATAA
AAAGGGGTCTATGTACGCTGACTTCAGCATACCCTGCTTTGTCTTGTTTTTATTTCGTTG
TTGGAAAGTTCGTCATGTTATTTTGTAGTCTTTTGCTCTGTATTGTATCCTGATTATGGT
TATGATATGATAATAGTAGCCTACTTATTTATCT

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1DL89TF 634 0 0
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TCTTATTACAAAAGAGACAATGGCTTTCGCTTTGAGGTTCTTCACATGCCTTATTTTGAC
GGTGTGCATAGTTGCATCAGTAGATGCAGCAATCTCATGTGGCACAGTGGCAAGTAGCTT
GGTTCCATGTGCCGGCTACCTATCCAAAGGTGGGGTGGTACCGCCTCCATGCTGTGCGGG
AGTCAAAAAAACTGAATGGTATGGCTCAAACCACACCGGACCGCCAACAAGCATGCAAAT
GTCTAAAGGCCGCTGCAAATAGCATCAACCCAAGTCTAGCCTCTAGCCTTCCTGGAAAGT
GCGGTGTTAGCATTCCCTATCCCATCTCCATGAGCACTAACTGCGACACCGTCAAGTGAA
GTGAGAACTCATACATCATCCTGAGGATTAAGAGTGCTTGGTCTAGCATAAGTAAAATAA
AAAGGGGTCTATGTACGCTGACTTCAGCATACCCTGCTTTGTCTTGTTTTTATTTCGTTG
TTGGAAAGTTCGTCATGTTATTTTGTAGTCTTTTGCTCTGTATTGTATCCTGATTATGGT
TATGATATGATAATAGTAGCCTACTTATTTATCT

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 2

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TGTTTCGTTTCTGCTAATGGTTTAAATTTGTCGTTTTTGAATAAAATTTTATTGGGATTT
TAATCTCTTTTTTTCAGTTTAAGCGAATCTCCCTCAAGAGTTTGTGAAGAGGAACTTTTA
TGTTTGGCTTTTGATAATATTAAGTTGTGTTTTATCAGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1FJ58JQ C 1
AF RS1FJ58TF U 1
BS 1 637 RS1FJ58TF
BS 638 639 RS1FJ58JQ

RD RS1FJ58JQ 639 0 0
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QA 1 639 1 639
DS 

RD RS1FJ58TF 639 0 0
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TGGTGTCGTGGTATGACAACGAATGGGGTTACAGCGCCCGTGTGGTCGACTTGATCATCC
ACATGTCCAAGTGCTAAGTCTGAGAAGGGTCTGGAATGGTGTTTGGAGGAAGAAGTCCTG
TGTTTCGTTTCTGCTAATGGTTTAAATTTGTCGTTTTTGAATAAAATTTTATTGGGATTT
TAATCTCTTTTTTTCAGTTTAAGCGAATCTCCCTCAAGAGTTTGTGAAGAGGAACTTTTA
TGTTTGGCTTTTGATAATATTAAGTTGTGTTTTATCA
CG

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 2

CO CL6853Contig1 734 2 2 U
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TAGCTCTAGATCAGAGAGAGAGAGGGTGATCATGCTGTTCAATGGTACTGACGTGAAGAG
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CATATTACTATTATGTTGTTGTTATCCATAAAATTCATTTTTAAAGTTTTACGTAGGCAT
GGGCATTCGGGGTCCCAATCGGGTTTCGGTTTTATCCAATCGGGTTTCGGTTTTTCGGGT
TTATCAAAATCAGCCCCATTCGGATTATTTGAAAGTTCGGTTCGGGACCGGTTCGGGTTC
TTTCGGGTTCGGGTCGGGGTTAGTAAATCTTCAAAGAACCGGTACAACCCAATGTACTTT
CGGGTTCGGATCTCAATCGGTTTTTCGGTTTAAAAATATTTGATTTGTACCTACTTTGTA
ACCAAAACATAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F328TF U 1
AF RS1F328JQ C 126
BS 1 634 RS1F328TF
BS 635 734 RS1F328JQ

RD RS1F328TF 637 0 0
AGATTAACGATGAAAACAGAGGCATTTGTTGCCGGTTGATAAGGTACGTGTGGTTAAACT
CATGTCGGGTCAAAAGGAAGATAAGTCTGCCAAGAAGAAACTGATCAAGAAGGGATCAAA
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TAGCTCTAGATCAGAGAGAGAGAGGGTGATCATGCTGTTCAATGGTACTGACGTGAAGAG
CGTGCCGAGTGAAGCTAGCTTTGTCGCTAAGCCTGAAGATGTGAGGAAAAGATCACAACC
GAAGCCAGTTTCGATTGATATTGATAAGAAATCAGATGCTTTTATCCAAAGTAGACTCGA
GATGATGAGAAAAAGGCTATAGCCTTTCCTTAGAACCAGAGATACAGTACTGGTGCTATT
CATATTACTATTATGTTGTTGTTATCCATAAAATTCATTTTTAAAGTTTTACGTAGGCAT
GGGCATTCGGGGTCCCAATCGGGTTTCGGTTTTATCCAATCGGGTTTCGGTTTTTCGGGT
TTATCAAAATCAGCCCCATTCGGATTATTTGAAAGTTCGGTTCGGGACCGGTTCGGGTTC
TTTCGGGTTCGGGTCGGGGTTAGTAAATCTTCAA
GAA

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1F328JQ 609 0 0
ATATCACAATTCACTTCAAGGAAAGAGAAGATAACGCTGCTAATGCCATCAACACTAGCT
TTAGATCAGAGAGAGAGAGGGTGATCATGCTGTTCAATGGTACTGACGTGAAGAGCGTGC
CGAGTGAAGCTAGCTTTGTCGCTAAGCCTGAAGATGTGAGGAAAAGATCACAACCGAAGC
CAGTTTCGATTGATATTGATAAGAAATCAGATGCTTTTATCCAAAGTAGACTCGAGATGA
TGAGAAAAAGGCTATAGCCTTTCCTTAGAACCAGAGATACAGTACTGGTGCTATTCATAT
TACTATTATGTTGTTGTTATCCATAAAATTCATTTTTAAAGTTTTACGTAGGCATGGGCA
TTCGGGGTCCCAATCGGGTTTCGGTTTTATCCAATCGGGTTTCGGTTTTTCGGGTTTATC
AAAATCAGCCCCCTTCGGATTATTTGAAAGTTCGGTTCGGGACCGGTTCGGGTTCTTTCG
GGTTCGGGTCGGGGTTAGTAAATCTTCAAAGAACCGGTACAACCCAATGTACTTTCGGGT
TCGGATCTCAATCGGTTTTTCGGTTTAAAAATATTTGATTTGTACCTACTTTGTAACCAA
AACATAAGT

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 2

CO CL6854Contig1 861 2 4 U
GCTTCAGGAAGTCATTTCTTTATCTGCTTCACAAAAATGGAGCTCTAGGCATGGCGCAGT
TCTCTGTATTGCATCCTTGTTGAAGCACAACCCTTCGACAATTATGACATCTTCACTCTT
TTCCGCATTGTTAAATTCTCTTAAGAGCTCTTTGAAGGACGAGAAGTTTCCACTACGTGA
AACCTCGACAAAGGCCTTGGGAAGGCTTTTACTACATCAACTTGCAGTGGAGCCTTCCAG
CACAGCAAGAGTGGTTATCGATGTCCTTTCATCGATAGTCTCAGCTTTGCATGATGATTC
GAGTGAGGTCCGAAGAAGAGCTCTCTCTTCACTTAAAGCTTTTGCAAAAAACAACCCGGC
AGCAACCAGTGACAATGTCAGTGTTATAGGGCCTCCGCTTGCTGAATGTTTGAAAGATGG
AAGCACACCAGTGAGACTTGCTGCAGAAAGATGTGCTATGTACGTGTTCCAACTAACAAA
GGGTGCAGAAAATGTTCAAGCAGCTCAGAAATATATCACAGGATTGGATGCCCGACGGTT
ATCCAAGTTGCCTGAACAAAGCGATGACAGCGACGATAGTGAAGATGATAATGGGCGTGG
GTAGGAGGAAACTTGTGTTCTCTCCTCTTCCACTTCTTAGAAGAGGTTCATTGGTTTTCC
CTATACACATATTTCTGCAAAAGCATTATACCGTGAGTTGCGGATGATACTTGATCTCAA
TTCCTTGGCTTGAGACTATAGTACTAGCAGTTACACCAATGATATAAGACCATACCTTGT
TTTGGTTTATCAAATATTTGGGTTTTTGGTTGGAAATTATGTATCAATTTTTAGTGTCAG
AAATGGCCAATTTTTTGCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EG63TF U 1
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DS 

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TCAAATATTTGGGTTTTTGGTTGGAAATTATGTATCAATTTTTAGTGTCAGAAATGGCCA
ATTTTTTGCCTC

QA 1 732 1 732
DS 



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BQ
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AF RS1E094TF U 1
AF RS1E094JQ C 1
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BS 634 707 RS1E094JQ

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DS 

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GCAGTGAAAATACATTTTACTTTGAAAGGGTAAAATGCAAATGGTTTTAAGAGGTTCGGG
AATTGACTTCCCCTGCAACATATACTGGATTAGAAAAGTTATAAGGTCACAGATGCTTGC
ATAAACTTAGTGTTTTTGTGTCACAGTTGTGTTTCTTCTTTCTGTCTTCTAGTTATTAAG
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CACACTTTTTAGGTTACCTTTTAAGTTATGAAGCAGAGATTCCAAGG

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 2

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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FT88TF U 1
AF RS1BE21TF U 54
BS 1 423 RS1FT88TF
BS 424 424 RS1BE21TF
BS 425 702 RS1FT88TF
BS 703 833 RS1BE21TF

RD RS1FT88TF 702 0 0
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CACTCATGAATCTCCCCCATCTCGCAACTCCAAACCTCTCGCTTCCCGTAACCCTAATCC
CCAAACTTCCAATTCGTCATCTAGCAGCTCCAATCATCGGCCGGAAGTTCGCAAACCCTA
ATCTTCTACTTCCGGCCGCGAAAAGGGTTTTCTGGGTTAGAGCCACAGTGGACGGAGATG
GTGGAAAAACCGGGAATTGGGTTAACCGGTTACCGATTCCGGGACTCGGAGCTGAGAATG
TATTCAGATTGATTTCGAGCGCTACGGGAAGTCCAATCGGACAGTTCATATCGTCCCCTG
TGACGTTCTTGCACTCTGTTGATCCCAGAATCAAATTGGTATGGCTATTAACTCTGGTAG
TTCTCCCAGCAAGAGCAAATATCGTTGTGCGTTTGGGACTTGTTCTCTGTACTGCTCTTT
TGTCTATCTCTGTTCTCCCAAGACAAGTTTGGATGGACCAATTGGCGAGAGTTTCACTCC
TTTCGGGTATCCTCTTCATTACCTTGGGTCTAGGTTCAGATGGTGCACCTCCGATGCTTC
AATCAAGAACTCCACCATCTTCACTCACGGGCTTGCCTGATCTTCCCATGTCTTTGAGCG
GTTATTCCTACATGTTGCTCAAGCTCGGACCTTTGCAGTTCA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RS1BE21TF 780 0 0
AGG
GAACCACTCATGAATCTCCCC*ATCTCGCAACTCCAAACCTCTCGCTTCCCGTAACCCTA
ATCCCCAAACTTCCAATTCGTCATCTAGCAGCTCCAATCATCGGCCGGAAGTTCGCAAAC
CCTAATCTTCTACTTCCGGCCGCGAAAAGGGTTTTCTGGGTTAGAGCCACAGTGGACGGA
GATGGTGGAAAAACCGGGAATTGGGTTAATCGGTTACCGATTCCGGGACTCGGAGCTGAG
AATGTATTCAGATTGATTTCGAGCGCTACGGGAAGTCCAATCGGACAGTTCATATCGTCC
CCTGTGACGTTCTTGCACTCTGTTGATCCCAGAATCAAATTGGTATGGCTATTAACTCTG
GTAGTTCCCCCAGCAAGAGCAAATATCGTTGTGCGTTTGGGACTTGTTCTCTGTACTGCT
CTTTTGTCTATCTCTGTTCTCCCAAGACAAGTTTGGATGGACCAATTGGCGAGAGTTTCA
CTCCTTTCGGGTATCCTCTTCATTACCTTGGGTCTAGGTTCAGATGGTGCACCTCCGATG
CTTCAATCAAGAACTCCACCATCTTCACTCACGGGCTTGCCTGATCTTCCCATGTCTTTG
AGCGGTTATTCCTACATGTTGCTCAAGCTCGGACCTTTGCAGTTCACTAGGAAAGGCTTA
TCTGTTGGAAGCACAGCTGCATGCTTAACCTTTATCATCTTCCAAAGTGCTAGCATTTGC
CTTGCACCACTACACCGGAGCACTTGCTCTAGCTCTACGTTGGTTCTTGTCCCGTGA

QA 4 780 4 780
DS 



AS 1 2

CO CL6857Contig1 1271 2 2 U
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CTACTTCTCTCTTGTTTTCAGCCTTTGAGTCTTGGCTCATTGCTGAGCACAACAAGAGGA
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TGGTCGCTATTCTCTCCGGGTTGTTTGGAAACCTTCTTGTCGATACTTTCTCATTTGGCC
CTGTAGCTCCCTTTGACGCCGCCGCATGCATTCTTGCGATTGGAATGGCCATCATTTTGT
CAACATGGTCGGAGAATTATGGAGATCCATCGGACAGTAAAGATCTTCTGACTCAGTTCA
AAGTTGCTGCCATAGCCATAGCTTCAGATGAGAAGATTGCATTGCTTGGGGCTATTCAAT
CTCTTTTTGAAGCCTCGATGTACACATTTGTTTTCCTGTGGACACCAGCTCTGAGCCCAA
ACGACGAAGAAATTCCACATGGCTTCGTATTTGCGACCTTCATGTTGGCCTCCATGTTGG
GAAGCTCTCTTGCCGCTCGTCTCATGGCCCGTTCATCTCTCAGAGTCGAAAACTACATGC
AAATTGTCTTTCTAGTCTCCGCTGCTTCTCTTCTGCTTCCCATCACAACAAGTGTCTTGG
TGGCGCCATCAAAGGTGAAAGAGGAAGGCTTGTCTTTGACTTGCTCCATTCAACTACTTG
GTTTCTGTGTTTTCGAGGCTTGTGTTGGAATCTTTTGGCCATCGATCACGAAGATGAGAT
CACAGTATATCCCTGAAGAAGCAAGAAGCACCATAATGAATTTCTTCCGTGTTCCGCTCA
ACATATTTGTCTGCATCGTCTTGTACAACGTTGATGCATTTCCAATCACGATCATGTTTG
GTATGTGCTCAATCTTCCTCTTCGTAGCTTCCATATTACAACGGCGGCTTATGGTCATCT
CCGAAAAGCCAAAGGGAGAAGAGTGGAGTCCAATGAAGGATAGAAACTTGAAGTTGATCC
TCTTACCCTCTGATCATTTTCCACTTTTTTTTTGGTTAATTGATTTTCGCCGAATCATTG
AGAAATAGAGAAAGAAACAGTCTAAATGAAGAAAGGTAATGGTTTGCTCAAGATCTTGCA
TGTATGGTTTAGTGATGTTGATTTTTTTTTAATAGTGTACGTAACTCTCTATTTTGCCTT
TACCAATTGAATGTTATAATTTTACAAATAGTGTGTTTTAAGTTTGTGAACTTCTTTGTT
CACTATGTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DW09TF U 1
AF RS1DW09JQ C 542
BS 1 670 RS1DW09TF
BS 671 1271 RS1DW09JQ

RD RS1DW09TF 670 0 0
GCACCAAGCACTCTCCACAGTACAGAGTTTTGATGGTTGGTCGTATCTTGGGTGGTATTG
CTACTTCTCTCTTGTTTTCAGCCTTTGAGTCTTGGCTCATTGCTGAGCACAACAAGAGGA
ACTTTGACCAACAGTGGCTGTCACTGACATTCTCTAAGGCGGTTTTCCTTGGAAATGGTC
TGGTCGCTATTCTCTCCGGGTTGTTTGGAAACCTTCTTGTCGATACTTTCTCATTTGGCC
CTGTAGCTCCCTTTGACGCCGCCGCATGCATTCTTGCGATTGGAATGGCCATCATTTTGT
CAACATGGTCGGAGAATTATGGAGATCCATCGGACAGTAAAGATCTTCTGACTCAGTTCA
AAGTTGCTGCCATAGCCATAGCTTCAGATGAGAAGATTGCATTGCTTGGGGCTATTCAAT
CTCTTTTTGAAGCCTCGATGTACACATTTGTTTTCCTGTGGACACCAGCTCTGAGCCCAA
ACGACGAAGAAATTCCACATGGCTTCGTATTTGCGACCTTCATGTTGGCCTCCATGTTGG
GAAGCTCTCTTGCCGCTCGTCTCATGGCCCGTTCATCTCTCAGAGTCGAAAACTACATGC
AAATTGTCTTTCTAGTCTCCGCTGCTTCTCTTCTGCTTCCCATCACAACAAGTGTCTTGG
TGGCGCCATC

QA 1 670 1 670
DS 

RD RS1DW09JQ 730 0 0
AAGCTCTCTTGCCGCTCGTCTCATGGCCCGTTCATCTCTCAGAGTCGAAAACTACATGCA
AATTGTCTTTCTAGTCTCCGCTGCTTCTCTTCTGCTTCCCATCACAACAAGTGTCTTGGT
GGCGCCATCAAAGGTGAAAGAGGAAGGCTTGTCTTTGACTTGCTCCATTCAACTACTTGG
TTTCTGTGTTTTCGAGGCTTGTGTTGGAATCTTTTGGCCATCGATCACGAAGATGAGATC
ACAGTATATCCCTGAAGAAGCAAGAAGCACCATAATGAATTTCTTCCGTGTTCCGCTCAA
CATATTTGTCTGCATCGTCTTGTACAACGTTGATGCATTTCCAATCACGATCATGTTTGG
TATGTGCTCAATCTTCCTCTTCGTAGCTTCCATATTACAACGGCGGCTTATGGTCATCTC
CGAAAAGCCAAAGGGAGAAGAGTGGAGTCCAATGAAGGATAGAAACTTGAAGTTGATCCT
CTTACCCTCTGATCATTTTCCACTTTTTTTTTGGTTAATTGATTTTCGCCGAATCATTGA
GAAATAGAGAAAGAAACAGTCTAAATGAAGAAAGGTAATGGTTTGCTCAAGATCTTGCAT
GTATGGTTTAGTGATGTTGATTTTTTTTTAATAGTGTACGTAACTCTCTATTTTGCCTTT
ACCAATTGAATGTTATAATTTTACAAATAGTGTGTTTTAAGTTTGTGAACTTCTTTGTTC
ACTATGTACC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL6858Contig1 771 2 6 U
GGGAAGCAGCTAGAAGACGGACGTACTCTTGCGGATTACAACATTCAGAAAGAGTCTACG
CTGCATCTTGTGCTTCGTCTCAGAGGTGGTATGCAGATTTTTGTCAAGACCCTCACCGGC
AAAACCATCACTTTGGAGGTTGAGAGCTCTGACACAATCGATAATGTCAAGGCTAAGATT
CAGGACAAGGAAGGGATCCCACCAGACCAGCAGAGACTCATCTTCGCTGGGAAACAGCTT
GAGGATGGTCGTACGCTTGCAGATTACAGTATCCAGAAGGAGTCGACTCTTCACCTTGTG
TTGCGTCTCCGTGGTGGTATGCAAATCTTTGTGAAGACTCTGACAGGCAAGACTATAACC
TTGGAAGTGGAGTGCTCGGACACAATCGACAACGTGAAGGCCAGGATTCAGGACAAGGAA
GGGATCCCTCCGGATCAGCAGAGACTCATCTTCGCTGGTAAGCAGCTTGAGGATGGTCGC
ACGCTTGCCGACTACAATATCCAGAAGGAGTCGACTCTTCACTTGGTTCTTCGTCTTCGT
GGTGGACGCTTCTGAGCTATGTGATCTGTGTGGTGAAAACTGGTGTTCTCTGAGCCTCGT
TAATGCACTTGGGAGGTGATCTCTGTTTTGCTTCTGCAAAAATGGATTATCTGTTTCCTC
TTGTTTTTCATGTTCTGTTTTCTTTATTTTCTTTTCGTTGTGAACCTTTCGGTTGGGCTC
TTGATGGCCCCTTTATGTTTCAAGTTTAAATAATAATCCCAAGTGCTTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CW20TF U 1
AF RS1CW20JQ C 47
BS 1 667 RS1CW20TF
BS 668 668 RS1CW20JQ
BS 669 680 RS1CW20TF
BS 681 681 RS1CW20JQ
BS 682 694 RS1CW20TF
BS 695 771 RS1CW20JQ

RD RS1CW20TF 705 0 0
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CTGCATCTTGTGCTTCGTCTCAGAGGTGGTATGCAGATTTTTGTCAAGACCCTCACCGGC
AAAACCATCACTTTGGAGGTTGAGAGCTCTGACACAATCGATAATGTCAAGGCTAAGATT
CAGGACAAGGAAGGGATCCCACCAGACCAGCAGAGACTCATCTTCGCTGGGAAACAGCTT
GAGGATGGTCGTACGCTTGCAGATTACAGTATCCAGAAGGAGTCGACTCTTCACCTTGTG
TTGCGTCTCCGTGGTGGTATGCAAATCTTTGTGAAGACTCTGACAGGCAAGACTATAACC
TTGGAAGTGGAGTGCTCGGACACAATCGACAACGTGAAGGCCAGGATTCAGGACAAGGAA
GGGATCCCTCCGGATCAGCAGAGACTCATCTTCGCTGGTAAGCAGCTTGAGGATGGTCGC
ACGCTTGCCGACTACAATATCCAGAAGGAGTCGACTCTTCACTTGGTTCTTCGTCTTCGT
GGTGGACGCTTCTGAGCTATGTGATCTGTGTGGTGAAAACTGGTGTTCTCTGAGCCTCGT
TAATGCACTTGGGAGGTGATCTCTGTTTTGCTTCTGCAAAAATGGATTATCTGTTTCCTC
TTGTTTT*CATGTTCTGTTT*CTTTATTTTCTTT
CGTGTGACCTT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RS1CW20JQ 725 0 0
AGAAAGAGTCTACGCTGCATCTTGTGCTTCGTCTCAGAGGTGGTATGCAGATTTTTGTCA
AGACCCTCACCGGCAAAACCATCACTTTGGAGGTTGAGAGCTCTGACACAATCGATAATG
TCAAGGCTAAGATTCAGGACAAGGAAGGGATCCCACCAGACCAGCAGAGACTCATCTTCG
CTGGGAAACAGCTTGAGGATGGTCGTACGCTTGCAGATTACAGTATCCAGAAGGAGTCGA
CTCTTCACCTTGTGTTGCGTCTCCGTGGTGGTATGCAAATCTTTGTGAAGACTCTGACAG
GCAAGACTATAACCTTGGAAGTGGAGTGCTCGGACACAATCGACAACGTGAAGGCCAGGA
TTCAGGACAAGGAAGGGATCCCTCCGGATCAGCAGAGACTCATCTTCGCTGGTAAGCAGC
TTGAGGATGGTCGCACGCTTGCCGACTACAATATCCAGAAGGAGTCGACTCTTCACTTGG
TTCTTCGTCTTCGTGGTGGACGCTTCTGAGCTATGTGATCTGTGTGGTGAAAACTGGTGT
TCTCTGAGCCTCGTTAATGCACTTGGGAGGTGATCTCTGTTTTGCTTCTGCAAAAATGGA
TTATCTGTTTCCTCTTGTTTTTCATGTTCTGTTTTCTTTATTTTCTTTTCGTTGTGAACC
TTTCGGTTGGGCTCTTGATGGCCCCTTTATGTTTCAAGTTTAAATAATAATCCCAAGTGC
TTGCG

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL6859Contig1 1113 2 2 U
GGGTGACGAAAAAAGAAACGCTCCTTTTCTCTCTCGAACAAAAAAGAACAGACACAGTTA
ACCCTAGCTCCGGCCTGCCTCCGTGGTGGTGCCGGAGGCAACTTCTTCCCTTTTCATCCT
CCTTTTCTCTTTGCTATCCTCCTCCTCTTCCAACCCTAGTTGATATGCAATCTTCTCTGA
GCCGTTTCGAGTTCTCGTGAACCTGCGATTAGTTCGACGGTGACGGTGACCGGCGTCCAT
TGGAGAGGTGGCGAGACCTGCGGTGTGTTTGAGGAGAGGATAGTCGGCTTTTAGGACTGG
AGAACTCGCCAGATCTAGTTTTCATTTTTTCAGATCTATGGGGAGAGGTTCACGGCGGCG
GCGCGTGAGTGGGTCGGACGTCTCCCATGTCTCGGTTATACCTTATGGTGTGACGGTGAG
ACAGATGGAGAAGAAATTTGATGTGCGGTGAATGAAGGGTTGTTCTCTGGTTCTCAGGGA
CAACATGCTCCAAGATTTATATTGATGGAGTAGTCACCCAGAGATGTGATCTTGGCCGGT
GAAGTGTGGCAGAATCATACATCCCGACACCGGTGACTGGTTGTGTCTCGTCCCGGCGGT
ATGAGGTCTGCACCTTCTGTAGCTGCGACTTGGGGTATCACTCATGATTATCGACGTCAC
AGTCCGACTTTCAGTCCGGATGGCTTCTGTCCGGTTTTTTTGGCTATGGATCGAGACAAG
GGTTGACAACGGGTATGGGTCAAGTTCAGAATTCGCTGTCTGGCGATGAAGCTGTTGGTA
CACGGACTGAATTCAAATCTTGTGGAGACCAATCGCTAGTGTTTTACATCGAATCTGGCT
CTTCTCATAGTCTGTTTGTTTGTACTGTTGTTTTCGTATCATGTGGTCTTAATAGAGGTC
AAGAGACGGTTCTTCTCGGGTCGTGGGAAGAACTCGTCTCATTGTGGTGAAAAATACACC
GATGAATTAGATTGGGTAGTCTAGGATCCAAACCAGTTTCGACTCCAGTGTTCCTGGGCG
ATACTAGATCTCATTGGTTGTATGTTGGGTTTAAAATCTCTTGAGGTTGTAATCCTGTAT
TCACATTTGGTTAATGAAAAGTTGATGTTGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BI54TF U 1
AF RS1BI54JQ C 342
BS 1 651 RS1BI54TF
BS 652 1113 RS1BI54JQ

RD RS1BI54TF 651 0 0
GGGTGACGAAAAAAGAAACGCTCCTTTTCTCTCTCGAACAAAAAAGAACAGACACAGTTA
ACCCTAGCTCCGGCCTGCCTCCGTGGTGGTGCCGGAGGCAACTTCTTCCCTTTTCATCCT
CCTTTTCTCTTTGCTATCCTCCTCCTCTTCCAACCCTAGTTGATATGCAATCTTCTCTGA
GCCGTTTCGAGTTCTCGTGAACCTGCGATTAGTTCGACGGTGACGGTGACCGGCGTCCAT
TGGAGAGGTGGCGAGACCTGCGGTGTGTTTGAGGAGAGGATAGTCGGCTTTTAGGACTGG
AGAACTCGCCAGATCTAGTTTTCATTTTTTCAGATCTATGGGGAGAGGTTCACGGCGGCG
GCGCGTGAGTGGGTCGGACGTCTCCCATGTCTCGGTTATACCTTATGGTGTGACGGTGAG
ACAGATGGAGAAGAAATTTGATGTGCGGTGAATGAAGGGTTGTTCTCTGGTTCTCAGGGA
CAACATGCTCCAAGATTTATATTGATGGAGTAGTCACCCAGAGATGTGATCTTGGCCGGT
GAAGTGTGGCAGAATCATACATCCCGACACCGGTGACTGGTTGTGTCTCGTCCCGGCGGT
ATGAGGTCTGCACCTTCTGTAGCTGCGACTTGGGGTATCACTCATGATTAT

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1BI54JQ 772 0 0
GGAGAGGTTCACGGCGGCGGCGCGTGAGTGGGTCGGACGTCTCCCATGTCTCGGTTATAC
CTTATGGTGTGACGGTGAGACAGATGGAGAAGAAATTTGATGTGCGGTGAATGAAGGGTT
GTTCTCTGGTTCTCAGGGACAACATGCTCCAAGATTTATATTGATGGAGTAGTCACCCAG
AGATGTGATCTTGGCCGGTGAAGTGTGGCAGAATCATACATCCCGACACCGGTGACTGGT
TGTGTCTCGTCCCGGCGGTATGAGGTCTGCACCTTCTGTAGCTGCGACTTGGGGTATCAC
TCATGATTATCGACGTCACAGTCCGACTTTCAGTCCGGATGGCTTCTGTCCGGTTTTTTT
GGCTATGGATCGAGACAAGGGTTGACAACGGGTATGGGTCAAGTTCAGAATTCGCTGTCT
GGCGATGAAGCTGTTGGTACACGGACTGAATTCAAATCTTGTGGAGACCAATCGCTAGTG
TTTTACATCGAATCTGGCTCTTCTCATAGTCTGTTTGTTTGTACTGTTGTTTTCGTATCA
TGTGGTCTTAATAGAGGTCAAGAGACGGTTCTTCTCGGGTCGTGGGAAGAACTCGTCTCA
TTGTGGTGAAAAATACACCGATGAATTAGATTGGGTAGTCTAGGATCCAAACCAGTTTCG
ACTCCAGTGTTCCTGGGCGATACTAGATCTCATTGGTTGTATGTTGGGTTTAAAATCTCT
TGAGGTTGTAATCCTGTATTCACATTTGGTTAATGAAAAGTTGATGTTGAGC

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

CO CL6860Contig1 639 2 1 U
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TTCTACTATTATTAATTTCCTTCTTTCATCGCTTTCGTCTCCAGCATCGCCATGGCAGCC
GCTCCTTCTCTTACTCTCCTCATCACTCTCTCTCCTCTCTTCATTTCCCTCCCGAGATCT
GAACCTCTCCCGGAGAATCCTTCCATGACTCTTATAGGCGACGGATTCGACTGGCCGATC
TCTCACGGCGACGCATTCGACATCATCGACGGAGGAGAAAGCTCTGAAGATGTCGCAGAT
CGACGGTCGTTGTACTGGCAGAGGAAGAGATACTACATATCCTACGGTGCATTGTCGGCG
AACAGAGTCCCGTGTCCTCCCAGATCTGGAAGATCTTACTACACTCACAACTGCTTCAGA
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TAGAAAATGGCATTTTCCAATCACGGACTCCTGTTTGTATTTGCTCGTTCGATTTCCATG
TATCGTGTTGTGTGTAGTAAACCGTGATTAATTACGTTTGTTTAAATTAATTCATCCCGC
GGTATTATTATTCGAATGATAATATGATATCTAATGTAT


BQ
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AF RS1CK91JQ C 1
AF RS1CK91TF U 1
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AACAGAGTCCCGTGTCCTCCCAGATCTGGAAGATCTTACTACACTCACAACTGCTTCAGA
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DS 

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GCTCCTTCTCTTACTCTCCTCATCACTCTCTCTCCTCTCTTCATTTCCCTCCCGAGATCT
GAACCTCTCCCGGAGAATCCTTCCATGACTCTTATAGGCGACGGATTCGACTGGCCGATC
TCTCACGGCGACGCATTCGACATCATCGACGGAGGAGAAAGCTCTGAAGATGTCGCAGAT
CGACGGTCGTTGTACTGGCAGAGGAAGAGATACTACATATCCTACGGTGCATTGTCGGCG
AACAGAGTCCCGTGTCCTCCCAGATCTGGAAGATCTTACTACACTCACAACTGCTTCAGA
GCTAGAGGTCAGGTTCATCCATACACTCGAGGCTGCTCCTCCATCACTCGATGCCGGAGA
TAGAAAATGGCATTTTCCAATCACGGACTCCTGTTTGTATTTGCTCGTTCGATTTCCATG
TATCGTGTTGTGTGTAGTAAACCGTGATTAATTACGTTTGTTTAAATTAATTCATCCCGC
GGTATTATTATTCGAATGATAATATGATATCTAATGTAT

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 2

CO CL6861Contig1 1169 2 2 U
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GACGACTGGATGGTTTGCTGCGGAAGCTCCGACTTCGCGAAGCTGATGGTGAAAGCTTCC
CCCTTTAACTCTTTGGAAGCAGCGGTCGAATCCGCAAGAGACATCTGGTTCAACCAAGTC
AACGTCGCGGCTTGGCTCGAAGCCTTTGCTGCTCATCCTCAGATTGGGAAGTCTCCTTCT
CCTTCCAGCAACTCCGATTTCGCTCGAAGGAGCGTGACGGAGCAGTCCAGGGCCTTTGCC
ACAACCTCTGCTTCTGCCTTGGAGAAGCTTGCAGAGTGGAATGTACTGTACAGGCAAAAG
TTTGGTTTTATCTTTATTATTTGCGCTTCCGGCAGGACTCACGCCGAGATGCTCGCTGAG
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ATGAAAATCACAGAGCTCCGGATGGCAAAGCTCTTCTCCGAGAAGGCCAAAGCTGTTTCA
CAATCTGAGTCCACAAAACCACAAGATCGTCTGAGAATCATAGGAGGACATTTGAATGTT
GCAGAAGCTCCCAAGAGAAGTAGGCCGCCCATCACCACTCATGTCTTAGACGTCTCACGT
GGTGCCCCAGCTGTAGGTGTTGAAGTGCGATTGGAGGTGTGGAATGGTACTACCAGTCCT
TCCTTTGGAAATGGAGGTCGTGGGGACTGGTCCATGGTGGGAACTTCAGCTACTGCTAAA
GATGGGCGTAGCGGGCTACTGATGGATTTGGTCGAGGCTTTGAAGCCAGGGACGTATAGA
ATGAGCTTTAACACTGGGAAGTATTGCCCAGGAGGCTTCTTCCCATATGTTTCCATTGCG
TTTGAGGTCACTGAATCTCAGAAGTGGGAGCATTTCCACGTCCCCCTGTTACTCTCACCA
TTTTCTTTCACCACATACCGTGGGAGCTAGAGCTGCTGATACGTTTGGTTTTGGTGGTAC
CGTCACCGCACATGTGTCAAAATTGCTGTCAAATAAAATCTGGATTTGTGTATTTCTTTG
TGTTTCGTTACCTTGTAGAACCCAGAATGACTTGGCAAATAAGTAAAAGCATAGCTGTGT
GTTTGTTACAGTAATAGCTTTAAGCTCAG


BQ
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AF RS1EU74TF U 1
AF RS1EU74JQ C 573
BS 1 780 RS1EU74TF
BS 781 1169 RS1EU74JQ

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GGACGATCAGTGAAAAAAAAAAGAAGAGAAATGGCGATGACGATGGAGATGATCAGGGAA
GACGACTGGATGGTTTGCTGCGGAAGCTCCGACTTCGCGAAGCTGATGGTGAAAGCTTCC
CCCTTTAACTCTTTGGAAGCAGCGGTCGAATCCGCAAGAGACATCTGGTTCAACCAAGTC
AACGTCGCGGCTTGGCTCGAAGCCTTTGCTGCTCATCCTCAGATTGGGAAGTCTCCTTCT
CCTTCCAGCAACTCCGATTTCGCTCGAAGGAGCGTGACGGAGCAGTCCAGGGCCTTTGCC
ACAACCTCTGCTTCTGCCTTGGAGAAGCTTGCAGAGTGGAATGTACTGTACAGGCAAAAG
TTTGGTTTTATCTTTATTATTTGCGCTTCCGGCAGGACTCACGCCGAGATGCTCGCTGAG
TTAAAGGGAAGGTATGCAAATAGACCGATAGTGGAACTAGAGATTGCTGCTAAGGAGCAG
ATGAAAATCACAGAGCTCCGGATGGCAAAGCTCTTCTCCGAGAAGGCCAAAGCTGTTTCA
CAATCTGAGTCCACAAAACCACAAGATCGTCTGAGAATCATAGGAGGACATTTGAATGTT
GCAGAAGCTCCCAAGAGAAGTAGGCCGCCCATCACCACTCATGTCTTAGACGTCTCACGT
GGTGCCCCAGCTGTAGGTGTTGAAGTGCGATTGGAGGTGTGGAATGGTACTACCAGTCCT
TCCTTTGGAAATGGAGGTCGTGGGGACTGGTCCATGGTGGGAACTTCAGCTACTGCTAAA

QA 1 780 1 780
DS 

RD RS1EU74JQ 597 0 0
GAGAATCATAGGAGGACATTTGAATGTTGCAGAAGCTCCCAAGAGAAGTAGGCCGCCCAT
CACCACTCATGTCTTAGACGTCTCACGTGGTGCCCCAGCTGTAGGTGTTGAAGTGCGATT
GGAGGTGTGGAATGGTACTACCAGTCCTTCCTTTGGAAATGGAGGTCGTGGGGACTGGTC
CATGGTGGGAACTTCAGCTACTGCTAAAGATGGGCGTAGCGGGCTACTGATGGATTTGGT
CGAGGCTTTGAAGCCAGGGACGTATAGAATGAGCTTTAACACTGGGAAGTATTGCCCAGG
AGGCTTCTTCCCATATGTTTCCATTGCGTTTGAGGTCACTGAATCTCAGAAGTGGGAGCA
TTTCCACGTCCCCCTGTTACTCTCACCATTTTCTTTCACCACATACCGTGGGAGCTAGAG
CTGCTGATACGTTTGGTTTTGGTGGTACCGTCACCGCACATGTGTCAAAATTGCTGTCAA
ATAAAATCTGGATTTGTGTATTTCTTTGTGTTTCGTTACCTTGTAGAACCCAGAATGACT
TGGCAAATAAGTAAAAGCATAGCTGTGTGTTTGTTACAGTAATAGCTTTAAGCTCAG

QA 1 597 1 597
DS 



AS 1 2

CO CL6862Contig1 494 2 1 U
GGATCCACAGTGTGCCCTAAATTTCTACCGGCGAGGGTAAAGCGATGTCGTACGATGATG
TAGAGATAGAGGATATGGAGTGGAACGAAGAGATTCAAGCGTACGCGTACCCCTGCCCTT
GTGGCGATTTGTTCCAGATCACGAAGGAGGATCTACGTCTCGGCGAGGAGATCGCCAATT
GCCCAAGCTGCTCCCTCTATATCACCGTCATCTACAACATGGAGGACTTTCAGAACGATA
CCAAGAAGATTAACGAACCTAAAAGTCGTCAAGCCGTCGCCGTCGCCTGAGATTGTAGAA
TGTCATGTATCATCGGTTGGGAGATTATTGGAGAACAGCAGGAGAGATTGTTCTCGTGCA
AAAGTTTTGGAAACCATATTGGAAGTGTGTCACCATCCTTAGATTATGAGTATTATTATT
ACATTAACCTCATGTATAAACAAGTAAACAAAGTTGGTTGTGTTGCTGGTCATTGATGAT
TATTTTTGAAAGAG


BQ
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AF RS1FZ59TF U 1
AF RS1GN25TF U 1
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TATTTTTGAAAGAG

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DS 

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TAGAGATAGAGGATATGGAGTGGAACGAAGAGATTCAAGCGTACGCGTACCCCTGCCCTT
GTGGCGATTTGTTCCAGATCACGAAGGAGGATCTACGTCTCGGCGAGGAGATCGCCAATT
GCCCAAGCTGCTCCCTCTATATCACCGTCATCTACAACATGGAGGACTTTCAGAACGATA
CCAAGAAGATTAACGAACCTAAAAGTCGTCAAGCCGTCGCCGTCGCCTGAGATTGTAGAA
TGTCATGTATCATCGGTTGGGAGATTATTGGAGAACAGCAGGAGAGATTGTTCTCGTGCA
AAAGTTTTGGAAACCATATTGGAAGTGTGTCACCATCCTTAGATTATGAGTATTATTATT
ACATTAACCTCATGTATAAACAAGTAAACAAAGTTGGTTGTGTTGCTGGTCATTGATGAT
TATTTTTGAAAGA

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DS 



AS 1 2

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GCTCGAGGAGAAAAACGCAGCTGTTGATAAGCTAAGGAACCAGCTCCAAACCTACCTCAA
AGCTAAAAGATGCAAAGAGAAGACCCTTGAACCACCTCAGACTGAAGAGTACCTGAACCA
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TCTTTCTTTACAGAGAAGCATATCGGATTGTGTTGATTGGGTTGTACAGAGCGAGAAGCT
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CTCGGGTCCAAGACTAAGTAACTTCCGTGGTGGATCTGTTTTGAAGTCGCGGTTGTCGGA
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ACTAGTGATCTACATTGTCTCTTGTACCCGCTCGTTTTGTCAAGAGTGATTTTCTTATGT
AAGTTGACAAAAAAAAACTTTATTAAAGTTTTGGACTGAAAATGATCCAAAATATGT


BQ
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AF RS1DD02TF U 1
AF RS1DD02JQ C 600
BS 1 712 RS1DD02TF
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BS 774 1317 RS1DD02JQ

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GCTCGAGGAGAAAAACGCAGCTGTTGATAAGCTAAGGAACCAGCTCCAAACCTACCTCAA
AGCTAAAAGATGCAAAGAGAAGACCCTTGAACCACCTCAGACTGAAGAGTACCTGAACCA
CCACCACCACATGGGTTTCGGTTCGTATAACATCGAAGATGGAGAAGTTGAG*ACGAAAA
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CAGAGCTATA

QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1DD02JQ 718 0 0
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TCTCGGGTCCAAGACTAAGTAACTTCCGTGGTGGATCTGTTTTGAAGTCGCGGTTGTCGG
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GCAGTAAATGTATTCACATTTTGGGAGCAGAGATCTGTAGAATCTAAAGACTTTTACATG
TACTAGTGATCTACATTGTCTCTTGTACCCGCTCGTTTTGTCAAGAGTGATTTTCTTATG
TAAGTTGACAAAAAAAAACTTTATTAAAGTTTTGGACTGAAAATGATCCAAAATATGT

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

CO CL6864Contig1 966 2 16 U
GGGAAAACATCAAACACAACAAAAAAAAACACACTTCATTAAAATTCTTCTAGTTGTCCT
AAGATCATGGAAACAAACTCCAATTCTACTACACTCCCTCCAGGTTTCCGACTTCATCCT
ACCGATGAAGAGCTCATCGTTTACTATCTCCGAAACCAGACCATGTCTAAGCCATGCCCT
GTCTCCATCATCCCAGAAGTAGATATCTACAAATTCGACCCATGGCAGTTACCCGAGAAA
ACAGAGTTTGGAGAAAATGAATGGTATTTCTTCAGCCCGAGAGAGCGAAAGTATCCGAAC
GGAGTCAGGCCAAACCGGGCTGCTGTTTCCGGTTATTGGAAAGCAACCGGTACAGACAAA
GCAATTCACAGTGGTTCGAGAAACGTGGGTGTCAAGAAAGCTCTCGTTTTCTACAAAGGC
CGACCTCCCAAAGGGATCAAAACTGATTGGATCATGCACGAGTACCGTCTCCATGATTCA
CGTAAAGCATCAACAAAACGTAACGGGTCGATGAGGTTAGATGAATGGGTACTATGTAGA
ATATACAAGAAGAAAGGAGCAGGGAAGCTTCTAGATGAGAAAGAAGGTTTCATGGATGAA
GTACAAATTGATGAGACGTTAGCAGGGAGAAAAAATGAGGAAGAGATAATGATGATGACG
TCGACAAAACTTCCAAGAACGTGTTCGCTTGCTCATTTGCTAGAAATGGATTATATGGGA
CCCATTTCTCACATTTTAACACCGTTCGATCTTCATCATCCTGATTTGAACGGCATGAAC
GAGTCTGGATGGTTCGGAGATCTACGGGTTAACCAAGACGTCTCGAACCATCATCGTCAG
GCTAGTATGTTCCAGTTTTAGTGGTGAAAAAGAGATGTACTTGGAAAGTTAATCTCGCAC
ATGAAAATTGTAAAATATTAACTAGAAAGACCCATATGAATGTGAAATGAAAACATGTTT
AACTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1FW90TF U 1
AF RS1FW90JQ C 129
BS 1 634 RS1FW90TF
BS 635 635 RS1FW90JQ
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BS 780 807 RS1FW90TF
BS 808 966 RS1FW90JQ

RD RS1FW90TF 810 0 0
GGGAAAACATCAAACACAACAAAAAAAAACACACTTCATTAAAATTCTTCTAGTTGTCCT
AAGATCATGGAAACAAACTCCAATTCTACTACACTCCCTCCAGGTTTCCGACTTCATCCT
ACCGATGAAGAGCTCATCGTTTACTATCTCCGAAACCAGACCATGTCTAAGCCATGCCCT
GTCTCCATCATCCCAGAAGTAGATATCTACAAATTCGACCCATGGCAGTTACCCGAGAAA
ACAGAGTTTGGAGAAAATGAATGGTATTTCTTCAGCCCGAGAGAGCGAAAGTATCCGAAC
GGAGTCAGGCCAAACCGGGCTGCTGTTTCCGGTTATTGGAAAGCAACCGGTACAGACAAA
GCAATTCACAGTGGTTCGAGAAACGTGGGTGTCAAGAAAGCTCTCGTTTTCTACAAAGGC
CGACCTCCCAAAGGGATCAAAACTGATTGGATCATGCACGAGTACCGTCTCCATGATTCA
CGTAAAGCATCAACAAAACGTAACGGGTCGATGAGGTTAGATGAATGGGTACTATGTAGA
ATATACAAGAAGAAAGGAGCAGGGAAGCTTCTAGATGAGAAAGAAGGTTTCATGGATGAA
GTACAAATTGATGAGACGTTAGCAGGGAGAAAAA*TGAGGAAGAGATAATGATGATGACG
TCGACAAA*CTTCCAAGAACGTGTTCGCTTGCTCATTTGCTAGAAATGGAT*ATATGGGA
CC*ATTTCTCACATTTTA*CACCGTTCGATCTTCATCATCCTGATTTGAC**GCATGA*C
GAGTCTGGATGGTTCGGAGATCTACGG
TTA

QA 1 807 1 807
DS 

RD RS1FW90JQ 838 0 0
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CATCCCAGAAGTAGATATCTACAAATTCGACCCATGGCAGTTACCCGAGAAAACAGAGTT
TGGAGAAAATGAATGGTATTTCTTCAGCCCGAGAGAGCGAAAGTATCCGAACGGAGTCAG
GCCAAACCGGGCTGCTGTTTCCGGTTATTGGAAAGCAACCGGTACAGACAAAGCAATTCA
CAGTGGTTCGAGAAACGTGGGTGTCAAGAAAGCTCTCGTTTTCTACAAAGGCCGACCTCC
CAAAGGGATCAAAACTGATTGGATCATGCACGAGTACCGTCTCCATGATTCACGTAAAGC
ATCAACAAAACGTAACGGGTCGATGAGGTTAGATGAATGGGTACTATGTAGAATATACAA
GAAGAAAGGAGCAGGGAAGCTTCTAGATGAGAAAGAAGGTTTCATGGATGAAGTACAAAT
TGATGAGACGTTAGCAGGGAGAAAAAATGAGGAAGAGATAATGATGATGACGTCGACAAA
ACTTCCAAGAACGTGTTCGCTTGCTCATTTGCTAGAAATGGATTATATGGGACCCATTTC
TCACATTTTAACACCGTTCGATCTTCATCATCCTGATTTGAACGGCATGAACGAGTCTGG
ATGGTTCGGAGATCTACGGGTTAACCAAGACGTCTCGAACCATCATCGTCAGGCTAGTAT
GTTCCAGTTTTAGTGGTGAAAAAGAGATGTACTTGGAAAGTTAATCTCGCACATGAAAAT
TGTAAAATATTAACTAGAAAGACCCATATGAATGTGAAATGAAAACATGTTTAACTAT

QA 1 838 1 838
DS 



AS 1 2

CO CL6865Contig1 696 2 8 U
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GGACTCATCTCAAGTGAAACAACTTGAAGAAAGGATCCAATCACTGAGTAGAGAAATTGA
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ATTCTTTTGGGCCAAGATTAGAAGATACACATATATTACTTGTCTTTTTTTTTTTCAAGT
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TTTATTATATAAAAGAAGGTGAATTGAGTTGGGCCG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
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AF RS1AX45TF U 1
AF RS1AX45JQ C 1
BS 1 594 RS1AX45TF
BS 595 595 RS1AX45JQ
BS 596 627 RS1AX45TF
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BS 639 657 RS1AX45TF
BS 658 696 RS1AX45JQ

RD RS1AX45TF 657 0 0
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TCAAGCTGAGTTGATTCAGACATATCTGCCAAGCATGTCTGAAGACAATGGAGAAATTGA
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GCAAATGATCGCTGAGCTGAGATTAGAAAATGAGTTTCTCAGATCCCAATTTAAGGAAGT
GGACTCATCTCAAGTGAAACAACTTGAAGAAAGGATCCAATCACTGAGTAGAGAAATTGA
AGTAGAAAAACAAACAAGAGTTGCAGCTGAGCAAGCTCTTGAGCATCTCAGGGAATCATA
CTCTGAGGGTGATGATGCAAAAGCCCAACAATATTCCCAAGTTCAGCAGAAACTGGAGCA
GGAAATCAAAGAGCGAGAAGAGAAATACGCGGACCTTGACGCCAAATTTACCAGGCTTCA
CAAAAGGGCTAAACAGCGCATTCAAGAAGTCCAAAAGGAAAAAGACGAGAGCTACATCAC
ATTCTTTTGGGCCAAGATTAGAAGATACACATATATTACTTGTCTTTTTTTTTT*CAAGT
CCTTCGTTTTGTGTAATGAACGTCAAA*GTCAAGAAA*CACATTTGTCCAGATGTTT

QA 1 657 1 657
DS 

RD RS1AX45JQ 696 0 0
GGGCGTCACTGGCGATCTCACAACGCTCTCAATCCCAAGCATCCGATCCCTCCCATCATC
TCAAGCTGAGTTGATTCAGACATATCTGCCAAGCATGTCTGAAGACAATGGAGAAATTGA
TGGGATAGCAGAATCCGTGAAAGAAAAGGTTGAGACAGAAAATGGTGGGGATGAGCTACT
GCAAATGATCGCTGAGCTGAGATTAGAAAATGAGTTTCTCAGATCCCAATTTAAGGAAGT
GGACTCATCTCAAGTGAAACAACTTGAAGAAAGGATCCAATCACTGAGTAGAGAAATTGA
AGTAGAAAAACAAACAAGAGTTGCAGCTGAGCAAGCTCTTGAGCATCTCAGGGAATCATA
CTTTGAGGGTGATGATGCAAAAGCCCAACAATATTCCCAAGTTCAGCAGAAACTGGAGCA
GGAAATCAAAGAGCGAGAAGAGAAATACGCGGACCTTGACGCCAAATTTACCAGGCTTCA
CAAAAGGGCTAAACAGCGCATTCAAGAAGTCCAAAAGGAAAAAGACGAGAGCTACATCAC
ATTCTTTTGGGCCAAGATTAGAAGATACACATATATTACTTGTCTTTTTTTTTTTCAAGT
CCTTCGTTTTGTGTAATGAACGTCAAAAGTCAAGAAAACACATTTGTCCAGATGTTTTTT
TTTATTATATAAAAGAAGGTGAATTGAGTTGGGCCG

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL6866Contig1 1074 2 2 U
GGGGGACATCTGGCCGGTTTAGAAGGTGAAAAGAAAGAGGTGTACACTGAAAAAGGATCC
AAGAAAGTCAAATGGGTGAAAAACGGTGAACGCAAGCCTCTTACGTGGTACAAGACTTAC
TTTGAGACACCGGAGGGAGAGAACACGGTTGCGATTAGGATGAAGGGAATGGGAAAAGGA
TTGATTTGGGTGAATGGGATTGGGATAGGGAGATACTGGATGTCTTTCCTTTCACCTATT
GGACAGCCAACTCAATCCGAGTATCATATACCAAGAACTTTCATGAAGAAAAAGGAGAAG
AATATGCTTGTCATTTTTGAAGAAGAGCCAGGTGTGAAACTTGAAGCTATTGATTTCGTG
TTAGTGAATAGAGACACCATATGTAGTTTCGTCGAAGAGAATTATCCAGCTTCAGTGAAA
TATTGGAAGAGAGAAGGGCCTAATATAGTTCCAAGAAACAAAGATATGAGGTTGAAGTCA
CTCATCAAGTGTCCCCCTGAGAAACAGATTGTGTCCGTAGAATTTGTAAGTTTTGGAGAT
CCAACAGGAACTTGTGGAAATTTCACAATGGGAAAGTGCTCTGCATCCAAGTCCAAAGAA
GTGGTGGAAAAGAAATGTTTGGGAAAGAGTCGTTGTTCAATAGTAGTAGAAAGAGAGACA
TTTGAAGACAAGAAGTGTCCAGAGATAGTTAAGACGTTGGCAGTGCAAGTGAAGTGTGAG
AAGAAACAAGGAAATGAGCAGAAAAGTGATGATGAAGAGGAAGACGATGATGAAGAAGAA
GAAGAAAAGGAAAGGGAGGGAAAGAATCAAGATTTAAAAGATAGGGAAAAGCAAAAGCAA
GATCATTAATTAAACAAGAGTTGCTATCTCTTTGAGTTTTGATCTAATCTAAATGAAATT
TCTCTTTGTGAAGCAAGCTTGAAATGAAATGTTGAGTTTACTTATAGCTTGTGTTTTTTA
TTTGTTGGTGTCTCTATTTTGTTTCTGCGTGTGGGGACTAGCTAATATAACTCTTGCTTT
TGCTCTCGTTGATTGTTTGTTGTTCCTTTTTAAGCATATAAGTATTTTCGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1H247TF U 1
AF RS1H247JQB C 313
BS 1 636 RS1H247TF
BS 637 1074 RS1H247JQB

RD RS1H247TF 636 0 0
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AAGAAAGTCAAATGGGTGAAAAACGGTGAACGCAAGCCTCTTACGTGGTACAAGACTTAC
TTTGAGACACCGGAGGGAGAGAACACGGTTGCGATTAGGATGAAGGGAATGGGAAAAGGA
TTGATTTGGGTGAATGGGATTGGGATAGGGAGATACTGGATGTCTTTCCTTTCACCTATT
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TTAGTGAATAGAGACACCATATGTAGTTTCGTCGAAGAGAATTATCCAGCTTCAGTGAAA
TATTGGAAGAGAGAAGGGCCTAATATAGTTCCAAGAAACAAAGATATGAGGTTGAAGTCA
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QA 1 636 1 636
DS 

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CA
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CACCATATGTAGTTTCGTCGAAGAGAATTATCCAGCTTCAGTGAAATATTGGAAGAGAGA
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CCCTGAGAAACAGATTGTGTCCGTAGAATTTGTAAGTTTTGGAGATCCAACAGGAACTTG
TGGAAATTTCACAATGGGAAAGTGCTCTGCATCCAAGTCCAAAGAAGTGGTGGAAAAGAA
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GGAGGGAAAGAATCAAGATTTAAAAGATAGGGAAAAGCAAAAGCAAGATCATTAATTAAA
CAAGAGTTGCTATCTCTTTGAGTTTTGATCTAATCTAAATGAAATTTCTCTTTGTGAAGC
AAGCTTGAAATGAAATGTTGAGTTTACTTATAGCTTGTGTTTTTTATTTGTTGGTGTCTC
TATTTTGTTTCTGCGTGTGGGGACTAGCTAATATAACTCTTGCTTTTGCTCTCGTTGATT
GTTTGTTGTTCCTTTTTAAGCATATAAGTATTTTCGTTTT

QA 3 762 3 762
DS 



AS 1 2

CO CL6867Contig1 706 2 3 U
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BQ
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AF RS1AG82JQ C 60
BS 1 688 RS1AG82TF
BS 689 689 RS1AG82JQ
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RD RS1AG82TF 706 0 0
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ACGAAAAAAGTATTACCAAATTTGAACCGAAACTAGATAAATATTCGAACGGATTTACCA
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TGTATTTAAAAGAGAAAATGACTAAGATAGCACCAAACCAAGTTTTTATTCCCAAAATAG
CACTCAAGATCCAAAGTCACAAAAATATGTTTCATTAAAAGAATATTTACCCTTATGCCC
TTTCCTTTGAATGATTAAAAAAATCAATTGGAGAAAACGATCGCCAGACAATCGCCTTTA
TCTATCTCCTCTCGCCGGACAATTCGCCGTCGTCTATATCCTCTCACCGGACGATTCGCC
GTCGTCATCTCCTCTCGCTTTGCATCGTCGTCCGTCCTCGTTTGCTCAGAGATGTACTTA
AATTATTGATTTCGTCGGGACGTAGGCGACAGGGCGTTGAACCATCTCCTCGTTCTCGTA
GACCCAGAGCGTCTGGGTGTGCTTCTCGACGGATTCGATGTAGGTGTCGGGACGGAGGAA
GATGTGATCGAGCTGCGACTTCTTCTGGTACATCTCCTCGATCGTATATAACCAAAAAGT
TCGAAACTTTTGTTTTTTCCGTTTGAAG*TGGAGACTTTGATTACC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RS1AG82JQ 647 0 0
AAG
GAAAAAAGTATTACCAAATTTGAACCGAAACTAGATAAATATTCGAACGGATTTACCATT
TTGCATCTAAAGAACCATAACCAAACCTGATCCGAACAAAATATTTTGGAAATTTGAATG
TATTTAAAAGAGAAAATGACTAAGATAGCACCAAACCAAGTTTTTATTCCCAAAATAGCA
CTCAAGATCCAAAGTCACAAAAATATGTTTCATTAAAAGAATATTTACCCTTATGCCCTT
TCCTTTGAATGATTAAAAAAATCAATTGGAGAAAACGATCGCCAGACAATCGCCTTTATC
TATCTCCTCTCGCCGGACAATTCGCCGTCGTCTATATCCTCTCACCGGACGATTCGCCGT
CGTCATCTCCTCTCGCTTTGCATCGTCGTCCGTCCTCGTTTGCTCAGAGATGTACTTAAA
TTATTGATTTCGTCGGGACGTAGGCGACAGGGCGTTGAACCATCTCCTCGTTCTCGTAGA
CCCAGAGCGTCTGGGTGTGCTTCTCGACGGATTCGATGTAGGTGTCGGGACGGAGGAAGA
TGTGATCGAGCTGCGACTTCTTCTGGTACATCTCCTCGATCGTATATAACCAAAAAGTTC
GAAACTTTTGTTTTTTCCGTTTGAAGGTGGAGACTTTGATTACC

QA 4 647 4 647
DS 



AS 1 2

CO CL6868Contig1 694 2 1 U
GGCCAATTAGGTTTCGTCTTCCGCTTTCCTCTTGCTCCTGCGAAATCGACGACGAAATTC
ACAGAGACTTAAAGCGCCCTTTGATCTCCACAACATCTCAACCATCCTTTAATCCGTTCT
TTATTTCCAGTTTTCCCTTGATTAATCCACTCCTCCCACTTGAAGATTTAGATCTACCTC
TTCGTTTCCCCCAGTAACCGGCTGAAGCTTCAGCTTTAAATATCGACCTTCCTAAGATGC
ACAATTCAACTCCTTCTCTATCTCTCTCTCGCTTCCTCCAACTTCATTTGTGTTTTTGCT
TTTTATTTTGGTTTGATCCAGAGCTCGATTTGGTTTCGTTCTTTAATTCTCCATCGATCT
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CGATGAGTCTGTGAAGAAGAAGCTTTCCCTAGCTTGAAAACCGTCATATGCTTGCAGAGG
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GAAACAACATGTTCATATAGTTAAAGTTTCATCC


BQ
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AF RS1CI50TF U 1
AF RS1CI50JQ C 55
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TTTTATTTTGGTTTGATCCAGAGCTCGATTTGGTTTCGTTCTTTAATTCTCCATCGATCT
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DS 

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CAGAGGGATCGAATGTTGATGGAGTATTGGAGTGCTGGGGTAAGGTTAAGCCGGTATCAT
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ATTGTCGAAACAACATGTTCATATAGTTAAAGTTTCATCC

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AG06JQ C 1
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DS 

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CGGATTTTTATTTCCGATAAATCATTTTCTTTTCTCTTTCGTTTTTCTTTGTTTGGGAAA
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DS 



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BQ
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CTTATCGAATTAGCCGTCAAGAACGCCAGAGACACCGTTATTTCCAGTGGGGCTTCGAGT
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GATAAGATAGAGAACATTAAGCTTACC

QA 1 387 1 387
DS 



AS 1 2

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ATTTTTAACATAACAAACCATCTCTCTCAAATGCTAAGCCTAGCTGTGAAATCCCACTAC
ATAAAGATATCTTACAATAAATTATAAACTCAGAAGCATCATTTAACGAAACATAGTTTG
ACACCGGCGAAAACGTTTTGTGAATGTGAGAAGCTTCTTTGTGATATCTGAATCCGTTAG
ACACAATATCAGCTTCTTTATAACTAAGGAATCCTCAAGAAAGTACCTCACTACTTCCAT
CCATATTTTCTTCTTCTTCTTTGTTATTCTCAACGCCCTTGTCTTATTAGTCCTCATCAT
CCCAGTTTCTTCTCCGGTAATCACTTCTTTAATCTCAACACACTCCAGAGTCGATAGTAA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1ET92TF C 1
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ACACAATATCAGCTTCTTTATAACTAAGGAATCCTCAAGAAAGTACCTCACTACTTCCAT
CCATATTTTCTTCTTCTTCTTTGTTATTCTCAACGCCCTTGTCTTATTAGTCCTCATCAT
CCCAGTTTCTTCTCCGGTAATCACTTCTTTAATCTCAACACACTCCAGAGTCGATAGTAA
GCACCGAGGAACATTCGTAAGCTCAAGATTTTCTCCTTCAATCTCCGTTGAGAAAACTAG
GTACAAGGTGAGGAATCTGGGAGTAAGCTTATTCTATCGTACAGAGGTGAAATCGAGAGA
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DS 

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ACATAACAAACCATCTCTCTCAAATGCTAAGCCTAGCTGTGAAATCCCACTACATAAAGA
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CGAAAACGTTTTGTGAATGTGAGAAGCTTCTTTGTGATATCTGAATCCGTTAGACACAAT
ATCAGCTTCTTTATAACTAAGGAATCCTCAAGAAAGTACCTCACTACTTCCATCCATATT
TTCTTCTTCTTCTTTGTTATTCTCAACGCCCTTGTCTTATTAGTCCTCATCATCCCAGTT
TCTTCTCCGGTAATCACTTCTTTAATCTCAACACACTCCAGAGTCGATAGTAAGCACCGA
GGAACATTCGTAAGCTCAAGATTTTCTCCTTCAATCTCCGTTGAGAAAACTAGGTACAAG
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GATGGACTCACCGTCGATTTGATTCGCCGCAGTCCCGCAGTCTTCGGCTTTGGGAAACTA
GTTGATCAGTATTCAAACAAGCAGAGATCAATTTCAACCA

QA 1 640 1 640
DS 



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GGCTCCTTTCAAGGACTTCATCAAGGCTATGCATATGCTGTCTCGGCCATTATTGGTCCT
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TGCCTCTAGTGCATCATCTTCAGAATCACAATCTGAGCCGCAGACGTCTCAGTCTCTATC
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AGATATATCTTTAACTTTTTCTGTAAATTCAGAATTGAAGATGAGGCTACACATCCTGCA
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CAGAGAGATCAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BV49TF U 1
AF RS1CP66TF U 86
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AGATATATCTTTAACTTTTTCTGTAAATTCAGAATTGA*GATGAG*CTACACATCCTGCA
ACTTCACAAGACTG

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DS 

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GCTATGCATATGCTGTCTCGGCCATTATTGGTCCTCACGATTGCGGAGGCTCTCACAGAC
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TCACAATCTGAGCCGCAGACGTCTCAGTCTCTATCAGACATCAGGTACATGTTGTCAGTT
GTCTTATCTATAAATTTATTATGTTGCACTTGAAAATTTTGTAAAACCCCCTGAAATTAT
TAAACCACTTGACAGTCGTTTTCTGAGTATCGTCTAGATATATCTTTAACTTTTTCTGTA
AATTCAGAATTGAAGATGAGGCTACACATCCTGCAACTTCACAAGACTGGCTTAAACAAC
TTTATGAAGAACTGGAAAACAGAGACTTAGCTTGCCAGAGAGATCAA

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 2

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GGCTCCTTACAAAGTGTATACATTGTTTTCCTTAAACTGAACTTTTCAAACAATTTTAGC
AAAAAGGCACTCTAGAACAATAAACTATATATATAAACTGCATATATCTGTTCAAATATC
CAAATCCTTCTGAGTCTCTTAGATAAACATCGATCCCAACGAATCATCTACTATAATAAC
CCACTTTGAGAAATATAATCCAAAATGATGTACTCTTCATCGTCTGTACTAAAACGCCTC
ATTTTGATCAATTTCTTGGCCATACAACTACTCCTTATAAGCGGTGAATTGCCCTTAAAC
ACGACCAATGCGTATCTCAACCACAAATGCTTGGTTAGTCAAGGAAAATACAAGCCGGGA
AGTGAATACGAGAGAGATGTAAATACTATGATCAAAATGTTCTACAGTGGCAGTTACAAA
GGTTTCTACCTGTTAGGTTTTGGTGCTTTCTCCACTATCCTCCAGTGCCGCGCCGATTCC
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CCGTGGTACAAGGGCATGATAATTTGGTTTGACCAATGTCTTCTCGCCTTTAGTTCTATA
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TTAGCCACCACCACTAAAAGTAAAGATAATTACACTATGTTCTCTGCGGGGGAGACGTGG
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GGAGCAAGATTTGTGGGTGGGACCTGTACTTTTAGGTTTGAGTTTTACCCTTTTATTTTT
GAGCCGGTCCGAAATATTTAATGAGCTAAATAAATGTTACACTTTTTGTATGAATTTTTT
CAGTCAAAAATTTATGT


BQ
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AF RS1EH87TF U 1
AF RS1EH87JQ C 453
BS 1 782 RS1EH87TF
BS 783 1037 RS1EH87JQ

RD RS1EH87TF 782 0 0
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AAAAAGGCACTCTAGAACAATAAACTATATATATAAACTGCATATATCTGTTCAAATATC
CAAATCCTTCTGAGTCTCTTAGATAAACATCGATCCCAACGAATCATCTACTATAATAAC
CCACTTTGAGAAATATAATCCAAAATGATGTACTCTTCATCGTCTGTACTAAAACGCCTC
ATTTTGATCAATTTCTTGGCCATACAACTACTCCTTATAAGCGGTGAATTGCCCTTAAAC
ACGACCAATGCGTATCTCAACCACAAATGCTTGGTTAGTCAAGGAAAATACAAGCCGGGA
AGTGAATACGAGAGAGATGTAAATACTATGATCAAAATGTTCTACAGTGGCAGTTACAAA
GGTTTCTACCTGTTAGGTTTTGGTGCTTTCTCCACTATCCTCCAGTGCCGCGCCGATTCC
TACGGGACCAAGTGCCACGACTGCTTTGCCACCGCCCTCGCTGTGCTTCGTAGGAAATGT
CCGTGGTACAAGGGCATGATAATTTGGTTTGACCAATGTCTTCTCGCCTTTAGTTCTATA
GATTCTCTTGGGAAGATCGATTACGACAATAACTTTTGTATGTCCAACGCGAAGAAGTTG
GGAGGAGATAAGCTTGCTTTTTCTAGGACTTTGAATACTCTCATGGACAATCTGACGACT
TTAGCCACCACCACTAAAAGTAAAGATAATTACACTATGTTCTCTGCGGGGGAGACGTGG
TA

QA 1 782 1 782
DS 

RD RS1EH87JQ 585 0 0
CACTATCCTCCAGTGCCGCGCCGATTCCTACGGGACCAAGTGCCACGACTGCTTTGCCAC
CGCCCTCGCTGTGCTTCGTAGGAAATGTCCGTGGTACAAGGGCATGATAATTTGGTTTGA
CCAATGTTTTTTCGCCTTTAGTTCTATAGATTTTCTTGGGAAGATCGATTACGACAATAA
CTTTTGTATGTCCAACGCGAAGAAGTTGGGAGGAGATAAGCTTGCTTTTTTTAGGACTTT
GAATACTTTCATGGACAATTTGACGACTTTAGCCACCACCACTAAAAGTAAAGATAATTA
CACTATGTTTTTTGCGGGGGAGACGTGGTACAAGGGTGATAGGATGTATGGAATGGTACA
GTGTACATATGACCTAACACCAAGAGCTTGTAAGGAGTGTTTGGTCATTAATGGCTTGCG
TTTTAAAGATTGTTTGAGTGATAAACGAGGAGCAAGATTTGTGGGTGGGACCTGTACTTT
TAGGTTTGAGTTTTACCCTTTTATTTTTGAGCCGGTCCGAAATATTTAATGAGCTAAATA
AATGTTACACTTTTTGTATGAATTTTTTCAGTCAAAAATTTATGT

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 2

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GGCTGAGGGGAAGAAGCTTTACTCTCTTGAAGCCAACTCTGTGATCCACGCGCTCTGCTT
TAGCCCTAATAGGTACTGGCTCTGTGCTGCGACTGAGCAGGGTATTAAGATTTGGGATCT
TGAGAGCAAGAGTGTAGTTGAGGACTTGAAGGTTGATCTGAAGGCTGAGGCTGAGAAGTC
TGATGGAAGTGCTACTGCTGGCAACAAAAGGAAGGTAATTTACTGCACCAGCCTGAACTG
GAGTGCGGATGGAAGCACGTTGTTCAGTGGTTATACCGATGGAGTTATCCGAGTTTGGGG
TATTGGCCGCTACTAGTTATATCCAATCGCTTTGCTCTTCTCTGTTTGGATCTTTTTATG
TATCACTTGTTTTTTCAGCAAACTCTAATACCCCCGAGATTTTGCAAGGATGTTTTTGTT
TTATGTCAAACAACTCTAGGTTTGGATCTTTTATATGTTTGTGATGGTTTTGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1D414JQ C 1
AF RS1D414TF U 17
BS 1 16 RS1D414JQ
BS 17 655 RS1D414TF

RD RS1D414JQ 655 0 0
GCAGCCGACGATTGTGTCGGCATCGTGGGACAAGACCGTGAAAGTTTGGAACTTGGCGAA
CTGTAAGCTCAGGTCGACTCTTGCGGGTCACGGTGGGTATGTGAACACTGTTGCTGTTTC
GCCTGATGGTTCTCTGTGCGCGAGTGGAGGGAAAGACGGTGTGGTGTTGCTGTGGGATTT
GGCTGAGGGGAAGAAGCTTTACTCTCTTGAAGCCAACTCTGTGATCCACGCGCTCTGCTT
TAGCCCTAATAGGTACTGGCTCTGTGCTGCGACTGAGCAGGGTATTAAGATTTGGGATCT
TGAGAGCAAGAGTGTAGTTGAGGACTTGAAGGTTGATCTGAAGGCTGAGGCTGAGAAGTC
TGATGGAAGTGCTACTGCTGGCAACAAAAGGAAGGTAATTTACTGCACCAGCCTGAACTG
GAGTGCGGATGGAAGCACGTTGTTCAGTGGTTATACCGATGGAGTTATCCGAGTTTGGGG
TATTGGCCGCTACTAGTTATATCCAATCGCTTTGCTCTTCTCTGTTTGGATCTTTTTATG
TATCACTTGTTTTTTCAGCAAACTCTAATACCCCCGAGATTTTGCAAGGATGTTTTTGTT
TTATGTCAAACAACTCTAGGTTTGGATCTTTTATATGTTTGTGATGGTTTTGATT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1D414TF 639 0 0
TCGGCATCGTGGGACAAGACCGTGAAAGTTTGGAACTTGGCGAACTGTAAGCTCAGGTCG
ACTCTTGCGGGTCACGGTGGGTATGTGAACACTGTTGCTGTTTCGCCTGATGGTTCTCTG
TGCGCGAGTGGAGGGAAAGACGGTGTGGTGTTGCTGTGGGATTTGGCTGAGGGGAAGAAG
CTTTACTCTCTTGAAGCCAACTCTGTGATCCACGCGCTCTGCTTTAGCCCTAATAGGTAC
TGGCTCTGTGCTGCGACTGAGCAGGGTATTAAGATTTGGGATCTTGAGAGCAAGAGTGTA
GTTGAGGACTTGAAGGTTGATCTGAAGGCTGAGGCTGAGAAGTCTGATGGAAGTGCTACT
GCTGGCAACAAAAGGAAGGTAATTTACTGCACCAGCCTGAACTGGAGTGCGGATGGAAGC
ACGTTGTTCAGTGGTTATACCGATGGAGTTATCCGAGTTTGGGGTATTGGCCGCTACTAG
TTATATCCAATCGCTTTGCTCTTCTCTGTTTGGATCTTTTTATGTATCACTTGTTTTTTC
AGCAAACTCTAATACCCCCGAGATTTTGCAAGGATGTTTTTGTTTTATGTCAAACAACTC
TAGGTTTGGATCTTTTATATGTTTGTGATGGTTTTGATT

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 2

CO CL6875Contig1 752 2 6 U
AATCAAACTTATAACTCGAAGATAACCCACAAACAAAGAAATGAAAACAAATCCAAAATC
ATATTAACACAAGAATATCTCTTAACGGGAAAAAAACAAACATAAACGAAAGACAATATA
TTCAACTCTTTGTTTCTTGTTCTGCATAAGGAACAAAAGCTAGAAGCCATGAGCCTTAGG
ACTGATGTCACTGAACCTGAACTGTGATAAAGTTCAGCATCTGATCTCATAAGATCCCGC
TTTAGTTATGTATCTAACCCACTCGACCGTGTTGTAACCGCTCTTCTCCCACACCTTGAG
GAAACGAAATCGCAAACCAAATGCTGCGAACATTGGCACCTGAAACTCCATTTGGATTGG
TGGCCTTGTCCAAGATTTCTTTTCTCCCATTGTTGAAATCAACTCAATCTCTGCACTTAG
TGTGGACTCTGTTTGTCCTGGAAATTTTCTTATCTTCCAAACCAAGCAATCAATTGATGG
ATTGTACTTAGCGCGACCAGATGTCACTTGGAAGTTAGTCTTTGCTGTTTGTTTTGGCAC
TGGAATTTTAACTACGACGCCGAGGGCAAACATTTTAGCACCAAACACACTTTTAACCTT
GACATTTACTTCCATGCGTGTACGACCAAGCTCTTTGATTGTTGGTAATACGCGGAAAGG
CAGATTCACACCCTCTGTTATTCGATACTTCATCAGTTCAAATTCACCGTCCGGGGGTAC
AAAGCTAACGGTCTTCTCGGAGTTGAATCTTG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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ATATTAACACAAGAATATCTCTTAACGGGAAAAAAACAAACATAAACGAAAGACAATATA
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TTTAGTTATGTATCTAACCCACTCGACCGTGTTGTAACCGCTCTTCTCCCACACCTTGAG
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TGGCCTTGTCCAAGATTTCTTTTCTCCCATTGTTGAAATCAACTCAATCTCTGCACTTAG
TGTGGACTCTGTTTGTCCTGGAAATTTTCTTATCTTCCAAACCAAGCAATCAATTGATGG
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TGGAATTTTAACTACGACGCCGAGGGCAAACATTTTAGCACCAAACACACTTTTAACCTT
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AAAGCTAACGGTCTTCTCGGAGT

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DS 

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G
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CTCATAAGATCCCGCTTTAGTTATGTATCTAACCCACTCGACCGTGTTGTAACCGCTCTT
CTCCCACACCTTGAGGAAACGAAATCGCAAACCAGATGCTGCGAACATTGGCACCTGAAA
CTCCATTTGGATTGGTGGCCTTGTCCAAGATTTCTTTTCTCCCATTGTTGAAATCAACTC
AATCTCTG*ACTTAGTGTGGACTCTGTTTGTCCTGGAAATTTTCTTATCTTCCAAACCAA
GCAATCAATTGATGGATTGTACTTAGCGCGACCAGATGTCACTTGGAAGTTAGTCTTTGC
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CACACTTTTAACCTTGACATTTACTTCCATGCGTGTACGACCAAGCTCTTTGATTGTTGG
TAATACGCGGAAAGGCAGATTCACACCCTCTGTTATTCGATACTTCATCAGTTCAAATTC
ACCGTCCGGGGGTACAAAGCTAACGGTCTTCTCGGAGTTGAATCTTG

QA 2 648 2 648
DS 



AS 1 2

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TCAACAAGGCAGGTCTCTCGTCTCCAAACACTGGGGTTTTAGATCCACTCATCGCTACAA
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CTACAACCTCTGATCTCGATGACTTCCTCAAGAAAGAAGCTGTTTTCCTCCTCCTTAACT
CGAAAACGACTCTCTGTTGCTTCAGTTCCTCGACTGCTTCTTCGTTGCCTTGACACTCGA
GACCAAAAGATTGATCCCAGACGAGGCTTTCTGATTTATGACGGAGCTCTCTTGTGTTTA
TTTCTATCGTTCTGTTATGTCCTGCAGAGAGATAGAACCTAACGAACAGAGTACTAGCTT
GTGACTTGACCTCCACGTTTCTTGCTTCTATTACTCTCACTTCGCATTTTAGTGAGCTAA
GTTTCTTCCCCATAACACCCATTTTTTTTTCTTTTTTTACAAAATCAAGAATCAAGATGA
AGTTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DD68TF C 1
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BS 1 9 RS1DD68TF
BS 10 667 RS1DD68JQ

RD RS1DD68TF 649 0 0
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TCAACAAGGCAGGTCTCTCGTCTCCAAACACTGGGGTTTTAGATCCACTCATCGCTACAA
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CTACAACCTCTGATCTCGATGACTTCCTCAAGAAAGAAGCTGTTTTCCTCCTCCTTAACT
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GACCAAAAGATTGATCCCAGACGAGGCTTTCTGATTTATGACGGAGCTCTCTTGTGTTTA
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GTGACTTGACCTCCACGTTTCTTGCTTCTATTACTCTCACTTCGCATTTTAGTGAGCTAA
GTTTCTTCCCCATAACACCCATTTTTTTTTCTTTTTTTACAAAATCAAG

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DS 

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GCTTCTCTTTCTTGTTGATCAACGACATAGCTTGGACTTTTAAACCTATCTTCAACAAGG
CAGGTCTCTCGTCTCCAAACACTGGGGTTTTAGATCCACTCATCGCTACAAATCTCTCTA
TCTCCATGCCCCGTGACGAGAAAACCGATTCCCATGAGACCTATCCTCTCCCTACAACCT
CTGATCTCGATGACTTCCTCAAGAAAGAAGCTGTTTTCCTCCTCCTTAACTCGAAAACGA
CTCTCTGTTGCTTCAGTTCCTCGACTGCTTCTTCGTTGCCTTGACACTCGAGACCAAAAG
ATTGATCCCAGACGAGGCTTTCTGATTTATGACGGAGCTCTCTTGTGTTTATTTCTATCG
TTCTGTTATGTCCTGCAGAGAGATAGAACCTAACGAACAGAGTACTAGCTTGTGACTTGA
CCTCCACGTTTCTTGCTTCTATTACTCTCACTTCGCATTTTAGTGAGCTAAGTTTCTTCC
CCATAACACCCATTTTTTTTTCTTTTTTTACAAAATCAAGAATCAAGATGAAGTTCCT

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

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GTAGCCGAAACAAATCTTGGAAGCCCCTCTTCAAAGAACAATAACAACAGCAACAACAAA
GAACAAGACCGGTTTCTTCCAATTGCCAATGTCGGAAGAATTATGAAAAAGGTTCTTCCC
GGTAATGGTAAGATCTCGAAAGACGCCAAAGAAACCGTTCAAGAATGTGTATCAGAGTTC
ATCAGTTTCGTTACTGGTGAAGCTTCTGATAAGTGTCAAAGAGAGAAGAGGAAAACCATC
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TTAAAGGTCTATCTCAACAAATACCGAGAAACCGAAGGAGAGAAAGCCAATAGCCCAAAA
CAGAGACAACAATAAGTACAACAGAATAATCATTTCCAGTTCCAAGAACAGGACCATAAC
AACATGTCATGTACTAGTTACATCTCTCATCATCATCCTTCTCCGTTCTTTCCCGCTGAT
CATCAACCTTTTCCAAATCTCCCTTTCTCACCTAAATCATTGCAGAAACAGTTCCCGCAG
CAGCAGCAGCATGACAACACTGATTCCATTGGTCAATGGTCAGTGTGAGTCCTAAATTGT
TTGTACTTTTCTTTTATATATATTATATTGTTTTGTTTCCCTTTGTGAGTACCTCTTGAT
GCTTATATATTGTCGCTATACATATACATTAGATACGTACATCTTGATATTTTCTGTATC
CCGATGTTATATTTTGTGTAACAGACGAATACTTCTTGATATATTATCGGCAGGTTATGT
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RS1BP66TF U 1
AF RS1BP66JQ C 116
BS 1 674 RS1BP66TF
BS 675 675 RS1BP66JQ
BS 676 730 RS1BP66TF
BS 731 731 RS1BP66JQ
BS 732 764 RS1BP66TF
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GAACAAGACCGGTTTCTTCCAATTGCCAATGTCGGAAGAATTATGAAAAAGGTTCTTCCC
GGTAATGGTAAGATCTCGAAAGACGCCAAAGAAACCGTTCAAGAATGTGTATCAGAGTTC
ATCAGTTTCGTTACTGGTGAAGCTTCTGATAAGTGTCAAAGAGAGAAGAGGAAAACCATC
AATGGAGATGACATAATTTGGGCCATTACAACTCTCGGTTTCGAAGACTACGTGGCTCCG
TTAAAGGTCTATCTCAACAAATACCGAGAAACCGAAGGAGAGAAAGCCAATAGCCCAAAA
CAGAGACAACAATAAGTACAACAGAATAATCATTTCCAGTTCCAAGAACAGGACCATAAC
AACATGTCATGTACTAGTTACATCTCTCATCATCATCCTTCTCCGTTCTTTCCCGCTGAT
CATCAACCTTTTCCAAATCTCCCTTTCTCACCTAAATCATTGCAGAAACAGTTCCCGCAG
CAGCAGCAGCATGACAACACTGATTCCATTGGTCAATGGTCAGTGTGAGTCCTAAATTGT
TTGTACTTTTCTTT*ATATATATTATATTGTTTTGTTTCCCTTTGTGAGTACCTCTTGAT
GCTTATATAT*GTCGCTATACATATACATTAGATACGTACATCT

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1BP66JQ 726 0 0
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TTCCCGGTAATGGTAAGATCTCGAAAGACGCCAAAGAAACCGTTCAAGAATGTGTATCAG
AGTTCATCAGTTTCGTTACTGGTGAAGCTTCTGATAAGTGTCAAAGAGAGAAGAGGAAAA
CCATCAATGGAGATGACATAATTTGGGCCATTACAACTCTCGGTTTCGAAGACTACGTGG
CTCCGTTAAAGGTCTATCTCAACAAATACCGAGAAACCGAAGGAGAGAAAGCCAATAGCC
CAAAACAGAGACAACAATAAGTACAACAGAATAATCATTTCCAGTTCCAAGAACAGGACC
ATAACAACATGTCATGTACTAGTTACATCTCTCATCATCATCCTTCTCCGTTCTTTCCCG
CTGATCATCAACCTTTTCCAAATCTCCCTTTCTCACCTAAATCATTGCAGAAACAGTTCC
CGCAGCAGCAGCAGCATGACAACACTGATTCCATTGGTCAATGGTCAGTGTGAGTCCTAA
ATTGTTTGTACTTTTCTTTTATATATATTATATTGTTTTGTTTCCCTTTGTGAGTACCTC
TTGATGCTTATATATTGTCGCTATACATATACATTAGATACGTACATCTTGATATTTTCT
GTATCCCGATGTTATATTTTGTGTAACAGACGAATACTTCTTGATATATTATCGGCAGGT
TATGTC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

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GAGAGCAGAGTAGCTTCTAGTTGTGAGCCTTTTGTAATCCCTGATCTCCCCGGTGACATA
GTGATAACTCGAGAACAGGTCGTAGACAGCGAATCCGAGATGGGAAAGTTTCTTTTCGAT
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GATGAGGGTGAATGCCTCAAATGGCTTGACTCCAAGAAACAAGATTCAGTCATTTACATT
TCATTTGGGGAGCGTTGCTTGCTTCAAGAACAAGCAACTGCTTGAGATCGCTGCAGGGTT
AGAAGCTTCTGGCGCAAGTTTCATCTGGGTTGTGAGGAAAAGCACAGTGAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GC01TF U 1
AF RS1H796TF U 1
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BS 550 550 RS1H796TF
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QA 1 643 1 643
DS 

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GAGAGCAGAGTAGCTTCTAGTTGTGAGCCTTTTGTAATCCCTGATCTCCCCGGTGACATA
GTGATAACTCGAGAACAGGTCGTAGACAGCGAATCCGAGATGGGAAAGTTTCTTTTCGAT
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CCTGATTACGTAGTTTTTTACAAGAGATTTGTAGCTAAGAGAGCGTGGCAAGTCGGCCCG
CTCTCTGTTACAAACAGAGGATTTGAGGAGAAGGCTGAGAGAGGAAAGAAATCAAGCATT
GATGAGGGTGAATGCCTCAAATGGCTTGACTCCAAGAAACAAGATTCAGTCATTTACATT
TCATTTGGGGAGCGTTGCTTGCTTCAAGAACAAGCAACTGCTTGAGATCGCTGCAGGGTT
AGAAGCTTCTGGCGCAAGTTTCATCTGGGTTGTGAGGAAAAGCACAGTGAC

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 2

CO CL6879Contig1 659 2 2 U
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TTTGTTGTCGTTGTTTCTAAAAACTGAACACCTCTTGTTTCCGGGAATTCACAGAGATCA
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BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1E458TF C 1
AF RS1E458JQ U 3
BS 1 2 RS1E458TF
BS 3 659 RS1E458JQ

RD RS1E458TF 659 0 0
TTAATCAAAGTAAACACACAATTTTATACTAGAGGAGGTCTTCAACAAACAGGGATAATC
TAGAATTCACAAAAAGAAAAAAGAAACAAGTTTCCCACCAATCAAATCATCTGAGATTGG
AAGCAAAGCACACTGATCTTTCCTTGAGCCAATTTACATGAACTAAGCTTCATCTCTTTA
AAGCTGCAGAATAAGCTTCCTTAGGATTGTGACTCATTCTATGTCTTTGCTTTACTCCCC
TTTGTTGTCGTTGTTTCTAAGAACTGAACACCTCTTGTTTCCGGGAATTCACAGAGATCA
TCTAGATAAATGTTCCTTTACAATTCACTAGTCTACGCTAGGCTCCCCTGAACCATGACG
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CGGTTCCGACTGAACACACCGGGAGATTATATCAGCAAAGTGTGACAATGACTTTGCAGG
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AGGGATTGCCCACCTCACCAAGAACTGCTCTGCTCTAGTCCGGTCCCTGTCGTAGGACAT
TCTACCAGTCAAGAGTTCTAACATAACAACACCAAAACTGTACACATCACTCTGCCATC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RS1E458JQ 657 0 0
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GAATTCACAAAAAGAAAAAAGAAACAAGTTTCCCACCAATCAAATCATCTGAAATTGGAA
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GCTGCAAAATAAGCTTCCTTAGGATTGTGACTCATTCTATGTCTTTGCTTTACTCCCCTT
TGTTGTCGTTGTTTCTAAAAACTGAACACCTCTTGTTTCCGGGAATTCACAGAGATCATC
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CTCTTCTGATCATATCTAGAAGGTCTTGCACTACTTCAAACATCAATGGTCTAAACTCCG
GTTCCGACTGAACACACCGGGAGATTATATCAGCAAAGTGTGACAATGACTTTGCAGGGT
ACTGTCTGTTAAGAGATGGATCAACCATTTTGCCCAATGCATCGATATCATGAAGCTGAG
GGATTGCCCACCTCACCAAGAACTGCTCTGCTCTAGTCCGGTCCCTGTCGTAGGACATTC
TACCAGTCAAGAGTTCTAACATAACAACACCAAAACTGTACACATCACTCTGCCATC

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 2

CO CL6880Contig1 644 2 2 U
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CTTGTGGTTGTTGTGTCCCTTTCCGCGCAGTCCTCTGTTCTTCTTTCCCTCTGACGTAAG
TCCCCTGAGCCCACGGTGCTTGTGAACCGGGTTGCAGATCCAGTTGATTCTCGGGTCATT
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CTCATTGAGCCAGTAGGAGTTGACGACTCTTAAACCACCGAGTTTCCTTCCGGCACGCTC
CTCAGCAACAGAACGCTTGCTCCTCTGGAACTTGAGTTGAGTAACTCCCTGGTTTGTGGG
TTTACCATAGACAATACCCTTTGGCACTGGCCTCTTGCGTCCACCACGTCTCACACGGAC
ACGGTACACAACAAAGCCCTGTTTGGCCTTGTAACCCAAACGACGAGCCTTGTCGGGACG
AGTAGGCCTGACGAGACGGACAATGGAAGGCAGCTGTCTGTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DK77TF C 1
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DS 

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CTGACGAGACGGACAATGGAAGGCAGCTGTCTGTACC

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1EV93JQ U 1
AF RS1B474JQ U 28
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QA 1 567 1 567
DS 

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QA 1 540 1 540
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1AT79JQ C 1
AF RS1AT79TF U 1
BS 1 638 RS1AT79TF

RD RS1AT79JQ 638 0 0
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QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1AT79TF 638 0 0
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CAACTATGCATTTAAACAAAATTTTCATATTCATTGAATTTTTTCTATTTTTTTAGATAC
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TAAGTTTATGGCGATAATTAAGTTTATAGCGATAAAATTCATATTCATTGAATTTTTTCA
AAAAAATTAGATACTAGAGACATCTTCTCGCAGCATATATATTATAAAGAAAACCATGAT
TAATTACTATAGTTAAGTTTATGGCGATAAGCAGAGAAGAAAACCATGAGGTTGATGATC
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TAAAACGATGTAAGAATATTTATAATCACTTTGTCGAC

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

CO CL6883Contig1 818 2 5 U
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CTGAAATGCCAGAAGGCTTGGAGAATGCTGGATACACAGCTGCGTTTGTGAGTCTTCACA
ATGCTGGGAGAAGGGAAGCGGATCCTCTCCCAGACATTAGAGATCCGAAGCAGTTCGTGG
TTGCTTCTTTGGCCAGGCTTTCTGCTGCTTCTCCTGGTAGATACCCGCAGATAATTGGTG
AGAATCTCGAAAAAGCTAACCAGGCAGCTTTGCTCCAGCTCTGCAGCGCTTACAGCAGTG
TAATCGTTTGAAAGAGAGATGCGTGTGAGGAGAAAGGAGGAGGAAAACACACAGCAACAT
TGCATTTGTGTCTGCGAAGAAAAGTGGTGGTTTTTTTTTCTTTGGGGTCTTAAACCGGGG
AGTTTCATATCATTTGGAAAGGGAGAAGAACATTATCTTACAAAACATGAGTTTCTTTGT
TTGGGTTTTTGGCAATTTTCATGGGGGTTGTTGTTTATCTATTGAATGGTGGTGTTACTA
TGTGTTTATGTGCATTCTGTTCTGTCGTTGTCTCCTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CB59JQ C 1
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TAATCGTTTGAAAGAGAGATGGGTGTGAGGAGAAAGGAGGAGGAAAACACACAGCAACAT
TGCATTTGTGTCTGCGAAGAAAAGTGGTGGTTTTTTTTTCTTTGGGGTCTTAAACCGGGG
AGTTTCATATCATTTGGAAAGGGAGAAGAACATTATCTTACAAAACATGAGTTTCTTTGT
TTGGGTTTTTGGCAATTTTCATGGGGGTTGTTGTTTATCTATTGAATGGTGGTGTTACTA
TGTGTTTATGTGCATTCTGTTCTGTCGTTGTCTCCTTT

QA 1 818 1 818
DS 

RD RS1DN60TF 257 0 0
GAG
AGAGAGATGCGTGTGAGGAGAAAGGAGGAGGAAAACACACAGCAACATTGCATTTGTGTC
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TTTGGAAAGGGAGAAGAACATTATCTTACAAAACATGAGTTTCTTTGTTTGGGTTTTTGG
CAATTTTCATGGGGGTTGTTGTTTATCTATTGAATGGTGGTGTTACTATGTGTTTATGTG
CATTCTGTTCTGTC

QA 4 257 4 257
DS 



AS 1 2

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CAGGGAACCGGAAGTAGCTCTTAGGATCATTCATTGTGTTTTCCAGATTCAGCTTCCCCT
CTCTCTCTCGCTATTTACGCAGTGTGTACATCAATTTTGAACCACTTTGTGCTTCCAAGC
TTTGTCGTCAGGGGAGAGTCTGGAAAATGTGAACGCCAGGGAACCGTGGGGATGTGAAAT
AATTGGGTTCAAAGGAGCTTCTTCTGACTGATCTTTCTCTCAGTTTGCTGCCTCCATCTC
CACTTTCATTTTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTCCCACAAATCTGACCCCCTTAAAATGTT
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CCTAATATCGTAAGCTTGTGTTCAAATAA


BQ
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AF RS1CT72JQ C 1
AF RS1CT72TF U 1
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BS 504 509 RS1CT72JQ

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CTCTCTCTCGCTATTTACGCAGTGTGTACATCAATTTTGAACCACTTTGTGCTTCCAAGC
TTTGTCGTCAGGGGAGAGTCTGGAAAATGTGAACGCCAGGGAACCGTGGGGATGTGAAAT
AATTGGGTTCAAAGGAGCTTCTTCTGACTGATCTTTCTCTCAGTTTGCTGCCTCCATCTC
CACTTTCATTTTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTCCCACAAATCTGACCCCCTTAAAATGTT
TGATGTATCATTTTTTTAATGTTTGTAATCCATCATGATTATGTCCTTAAAATCTGACCC
CCTAATATCGTAAGCTTGTGTTCAAATAA

QA 1 509 1 509
DS 

RD RS1CT72TF 503 0 0
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CAGGGAACCGGAAGTAGCTCTTAGGATCATTCATTGTGTTTTCCAGATTCAGCTTCCCCT
CTCTCTCTCGCTATTTACGCAGTGTGTACATCAATTTTGAACCACTTTGTGCTTCCAAGC
TTTGTCGTCAGGGGAGAGTCTGGAAAATGTGAACGCCAGGGAACCGTGGGGATGTGAAAT
AATTGGGTTCAAAGGAGCTTCTTCTGACTGATCTTTCTCTCAGTTTGCTGCCTCCATCTC
CACTTTCATTTTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTCCCACAAATCTGACCCCCTTAAAATGTT
TGATGTATCATTTTTTTAATGTTTGTAATCCATCATGATTATGTCCTTAAAATCTGACCC
CCTAATATCGTAAGCTTGTGTTC

QA 1 503 1 503
DS 



AS 1 2

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AGAGATGGGTTCGTGAGAACCAAAGGTGTTCAGTTTAGCCTCAATGGCTATCCTTATTAC
GCTAATGGCTTCAATGCCTATTGGCTCATGTACGTTGCCTCCGATCCTTCCCAAAGGCCT
AAGATCTCCGCCGCATTCCAAGAAGCGTCTCGCCATGGACTGACCGTAGCTCGAACCTGG
GCTTTCAGTGACGGCGGTTACAGGCCTCTCCAGTATTCCTCGACTGTTAACGTCATTGCT
CAGCAGTCGCGCAAGTTGACTTTGATCCGGAGAATCTTCGCAAGGATGGTCAATGTGGAG
AAATGGAAGAGAGCCAGAGGCTATGGGCCAGTAAGAAAAGGAGGTCACAATATTCAAAAC
TGAAAAATCTAGCGGGGTGTCTCTTGTAATGTTTTACCTTCTTTTTTCATTTACCAAATG
TGATCTTGAGAATGTGTTTTGTAAGATCTCAGCTTGTCCAAGAAAAGTTATAGTGATAGT
TTTTTTTTTACCTCGTAATGATACTTTATTAGTAGTAATGACAA


BQ
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AF RS1BI30JQ C 1
AF RS1BI30TF U 1
BS 1 640 RS1BI30TF
BS 641 644 RS1BI30JQ

RD RS1BI30JQ 644 0 0
GGGTAAGAGAAAGAGCACACAACAACAAGATAGGAGAAAATGAAGCCTCTGTGTCTGGTT
ACAATCCTATCGATCCTGATCCAACAAAGCTATTTGAAGCTCGGAGCAGATGCGTTTTCG
AGAGATGGGTTCGTGAGAACCAAAGGTGTTCAGTTTAGCCTCAATGGCTATCCTTATTAC
GCTAATGGCTTCAATGCCTATTGGCTCATGTACGTTGCCTCCGATCCTTCCCAAAGGCCT
AAGATTTCCGCCGCATTCCAAGAAGCGTCTCGCCATGGACTGACCGTAGCTCGAACCTGG
GCTTTCAGTGACGGCGGTTACAGGCCTCTCCAGTATTCCTCGACTGTTAACGTCATTGCT
CAGCAGTCGCGCAAGTTGACTTTGATCCGGAGAATCTTCGCAAGGATGGTCAATGTGGAG
AAATGGAAGAGAGCCAGAGGCTATGGGCCAGTAAGAAAAGGAGGTCACAATATTCAAAAC
TGAAAAATCTAGCGGGGTGTCTCTTGTAATGTTTTACCTTCTTTTTTCATTTACCAAATG
TGATCTTGAGAATGTGTTTTGTAAGATCTCAGCTTGTCCAAGAAAAGTTATAGTGATAGT
TTTTTTTTTACCTCGTAATGATACTTTATTAGTAGTAATGACAA

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1BI30TF 642 0 0
GGGTAAGAGAAAGAGCACACAACAACAAGATAGGAGAAAATGAAGCCTCTGTGTCTGGTT
ACAATCCTATCGATCCTGATCCAACAAAGCTATTTGAAGCTCGGAGCAGATGCGTTTTCG
AGAGATGGGTTCGTGAGAACCAAAGGTGTTCAGTTTAGCCTCAATGGCTATCCTTATTAC
GCTAATGGCTTCAATGCCTATTGGCTCATGTACGTTGCCTCCGATCCTTCCCAAAGGCCT
AAGATCTCCGCCGCATTCCAAGAAGCGTCTCGCCATGGACTGACCGTAGCTCGAACCTGG
GCTTTCAGTGACGGCGGTTACAGGCCTCTCCAGTATTCCTCGACTGTTAACGTCATTGCT
CAGCAGTCGCGCAAGTTGACTTTGATCCGGAGAATCTTCGCAAGGATGGTCAATGTGGAG
AAATGGAAGAGAGCCAGAGGCTATGGGCCAGTAAGAAAAGGAGGTCACAATATTCAAAAC
TGAAAAATCTAGCGGGGTGTCTCTTGTAATGTTTTACCTTCTTTTTTCATTTACCAAATG
TGATCTTGAGAATGTGTTTTGTAAGATCTCAGCTTGTCCAAGAAAAGTTATAGTGATAGT
TTTTTTTTTACCTCGTAATGATACTTTATTAGTAGTAATG
GA

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

CO CL6886Contig1 515 2 2 U
GAGATTACTGTTGGTTGCAAACATGAAACCTTAAGATTATATCCAAATTATTCCAGTGCA
CAAGACGTTGAACATTCAATAATAAATTAATCACATACATAAAACAATAAGAAGGATAAA
TACAATGAAATGCAAAGAAGTAAGTAATGTTTAACATCAAAAGAGTTTGCTTAAGTATTT
GCTGAGTAACTTATCAACCATAACTTGATAAGCTCTTTCAGTTGGATGGTAGCTATCCCA
AAATATATAGGTCGACGAATTAGAGCATGTGAATGGATTAAACAATCCACCGGGAAAGTC
TTTGCCGTAAGGAGGGGGACTTAAGAAGAGTAGAGAGATTGTTGTTGTTACCAGTATCCA
TTATTGAATCTCCGAAAACTATTAATGCAGGGATTTTAGCATTCTTTCTTTGCTTTGTTG
CGTGCGCTTGGACAGCTATTAATACCAACACGAGCCATAACATGCGAAGCTTCATTGTTT
GGTTTTGTTTAGTTTTCTGTCGAGATTTGGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DC90TF C 1
AF RS1DC90JQ U 56
BS 1 55 RS1DC90TF
BS 56 515 RS1DC90JQ

RD RS1DC90TF 515 0 0
GAGATTACTGTTGGTTGCAAACATGAAACCTTAAGATTATATCCAAATTATTCCAGTGCA
CAAGACGTTGAACATTCAATAATAAATTAATCACATACATAAAACAATAAGAAGGATAAA
TACAATGAAATGCAAAGAAGTAAGTAATGTTTAACATCAAAAGAGTTTGCTTAAGTATTT
GCTGAGTAACTTATCAACCATAACTTGATAAGCTCTTTCAGTTGGATGGTAGCTATCCCA
AAATATATAGGTCGACGAATTAGAGCATGTGAATGGATTAAACAATCCACCGGGAAAGTC
TTTGCCGTAAGGAGGGGGACTTAAGAAGAGTAGAGAGATTGTTGTTGTTACCAGTATCCA
TTATTGAATCTCCGAAAACTATTAATGCAGGGATTTTAGCATTCTTTCTTTGCTTTGTTG
CGTGCGCTTGGACAGCTATTAATACCAACACGAGCCATAACATGCGAAGCTTCATTGTTT
GGTTTTGTTTAGTTTTCTGTCGAGATTTGGTTTCC

QA 1 515 1 515
DS 

RD RS1DC90JQ 460 0 0
GTGCACAAGACGTTGAACATTCAATAATAAATTAATCACATACATAAAACAATAAGAAGG
ATAAATACAATGAAATGCAAAGAAGTAAGTAATGTTTAACATCAAAAGAGTTTGCTTAAG
TATTTGCTGAGTAACTTATCAACCATAACTTGATAAGCTCTTTCAGTTGGATGGTAGCTA
TCCCAAAATATATAGGTCGACGAATTAGAGCATGTGAATGGATTAAACAATCCACCGGGA
AAGTCTTTGCCGTAAGGAGGGGGACTTAAGAAGAGTAGAGAGATTGTTGTTGTTACCAGT
ATCCATTATTGAATCTCCGAAAACTATTAATGCAGGGATTTTAGCATTCTTTCTTTGCTT
TGTTGCGTGCGCTTGGACAGCTATTAATACCAACACGAGCCATAACATGCGAAGCTTCAT
TGTTTGGTTTTGTTTAGTTTTCTGTCGAGATTTGGTTTCC

QA 1 460 1 460
DS 



AS 1 2

CO CL6887Contig1 860 2 4 U
GAAACACATTTTGCATTTGAGAAAAAATTGGACGAGAATACAAAAATGGCAACGCGAGGA
GCTGCTGCTGCGTTCGTAATATGGAAGCACCGAAGCAACCCTTCTCTTCGATCTCAATCA
TCACACCATTTCTATCCCGTTTTCAAACCTCAAATCATCCCAAAAGGGTTTAGATATCAA
ATTAGGGCGATACAAGGAGCAAGTGTTGATCCCGTTACACAATTAAAGAACAACGATGAG
CCAAAACCTGAGAATTGGAAAATCAAAATGCTTTACGATGGGGATTGCCCTCTCTGTATG
CGTGAGGTTAATATGCTTAAGGAAAGGAATGAGGAAAATGGAACGATAAAGTTCGTTGAC
ATCAGTTCCGATGATTATCCCCCGCAAGAGAATCAAGGGCTTGATTACAAGACAGTTATG
GGGCAAATCCACGCGATTCAGTCCGATGGAAATGTGGTAACGGGTGTGGAGTCATTTAGG
AAACTATATGAGGAGGTTGGGCTTGGGTGGGTTTACACTATCACTAAATTTGAACCAATA
GGGAAGGTAGCTGATGCAGTGTATGATTTCTGGGCTAAGTATCGACTTCAGGTCACAGGG
CGGCCACCTATAGAAGCTATTTTGGAAGCGAGAAAGAAAAATAAGGTAGAGACATGTGGT
GACAGTAAGGCGTGCAAGACGTGATTTTTCTTACAAATTCACATATACCACAGCCAGTTT
GGACTTACTTATACTCTCTTGCCCACATTTTGTAAACTTGAGTGTTTCTATGTATTAGAA
AAGACCTCGTTACATATATTTCCGACCAGATCTTCCTTTGGAAATATGAATATTGGAAAT
CAAAATCAACATAGTTTGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CQ01TF U 1
AF RS1CQ01JQ C 120
BS 1 378 RS1CQ01TF
BS 379 379 RS1CQ01JQ
BS 380 760 RS1CQ01TF
BS 761 860 RS1CQ01JQ

RD RS1CQ01TF 760 0 0
GAAACACATTTTGCATTTGAGAAAAAATTGGACGAGAATACAAAAATGGCAACGCGAGGA
GCTGCTGCTGCGTTCGTAATATGGAAGCACCGAAGCAACCCTTCTCTTCGATCTCAATCA
TCACACCATTTCTATCCCGTTTTCAAACCTCAAATCATCCCAAAAGGGTTTAGATATCAA
ATTAGGGCGATACAAGGAGCAAGTGTTGATCCCGTTACACAATTAAAGAACAACGATGAG
CCAAAACCTGAGAATTGGAAAATCAAAATGCTTTACGATGGGGATTGCCCTCTCTGTATG
CGTGAGGTTAATATGCTTAAGGAAAGGAATGAGGAAAATGGAACGATAAAGTTCGTTGAC
ATCAGTTCCGATGATTATTCCCCGCAAGAGAATCAAGGGCTTGATTACAAGACAGTTATG
GGGCAAATCCACGCGATTCAGTCCGATGGAAATGTGGTAACGGGTGTGGAGTCATTTAGG
AAACTATATGAGGAGGTTGGGCTTGGGTGGGTTTACACTATCACTAAATTTGAACCAATA
GGGAAGGTAGCTGATGCAGTGTATGATTTCTGGGCTAAGTATCGACTTCAGGTCACAGGG
CGGCCACCTATAGAAGCTATTTTGGAAGCGAGAAAGAAAAATAAGGTAGAGACATGTGGT
GACAGTAAGGCGTGCAAGACGTGATTTTTCTTACAAATTCACATATACCACAGCCAGTTT
GGACTTACTTATACTCTCTTGCCCACATTTTGTAAACTTG

QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1CQ01JQ 741 0 0
ATCACACCATTTCTATCCCGTTTTCAAACCTCAAATCATCCCAAAAGGGTTTAGATATCA
AATTAGGGCGATACAAGGAGCAAGTGTTGATCCCGTTACACAATTAAAGAACAACGATGA
GCCAAAACCTGAGAATTGGAAAATCAAAATGCTTTACGATGGGGATTGCCCTCTCTGTAT
GCGTGAGGTTAATATGCTTAAGGAAAGGAATGAGGAAAATGGAACGATAAAGTTCGTTGA
CATCAGTTCCGATGATTATCCCCCGCAAGAGAATCAAGGGCTTGATTACAAGACAGTTAT
GGGGCAAATCCACGCGATTCAGTCCGATGGAAATGTGGTAACGGGTGTGGAGTCATTTAG
GAAACTATATGAGGAGGTTGGGCTTGGGTGGGTTTACACTATCACTAAATTTGAACCAAT
AGGGAAGGTAGCTGATGCAGTGTATGATTTCTGGGCTAAGTATCGACTTCAGGTCACAGG
GCGGCCACCTATAGAAGCTATTTTGGAAGCGAGAAAGAAAAATAAGGTAGAGACATGTGG
TGACAGTAAGGCGTGCAAGACGTGATTTTTCTTACAAATTCACATATACCACAGCCAGTT
TGGACTTACTTATACTCTCTTGCCCACATTTTGTAAACTTGAGTGTTTCTATGTATTAGA
AAAGACCTCGTTACATATATTTCCGACCAGATCTTCCTTTGGAAATATGAATATTGGAAA
TCAAAATCAACATAGTTTGAT

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL6888Contig1 888 2 27 U
GGATAGTGGAAAATGATTAAAGTTCGGTTTCCATTGATTGGATAAGAACAAAGACTGGTT
GTTGTTTCAGTCACATTTCCTCTCTCTCATCATTCACAAGCAATTCATTTCACTTCTACG
TACACAAAAGCTTCTCAGATTTCAATATCCGTTTCTCTGAGTTGTAGTAATGGGTTCTGA
AGGACCAACGGCAGTGACAATTAACATCACAGGCTTCAAGAAGTTCCATGGAGTTGCTGA
AAACCCAACGGAGAAAATAGCAAGCAACCTGAAAGAATATTTAGCTAAGAATCCCCAGTC
GAAAGACGTTGTTCTTGGAAGCTGTACCGTGCTTGAAACAGCCGGTCAAGGAGCTCTCGC
TTCTCTTTATCAGTTACTACAGTCCGCAATCAATACGAAAGAATCAGAGTCAGTGAGCTG
TGGAAGAACCATATGGGTTCATTTGGGAGTTAACAGTGGCGCTACAAAATTCGCAATTGA
GCAACAAGCTGTGAATGAAGCGACGTTCCGTTGCCCTGATGAAATGGGTTGGAAACCTCA
GCATTTGCCTATTGTTCCCTCTGATGGTCCAATCTCAACTGTAAGAAAGACTACTCTCCC
TGTTGAAGAGATAACAAAGGCCTTAGAGAAGAAGGGCTTTGAGGTGATAACATCAGATGA
TGCAGGTCGTTTTGTGTGCAACTACGCCTATTACCACTCACTGAGATTTGCAGAACAGAA
CAAGACCTATTCACTCTTTGTTCACGTTCCTCTTTTCGTTGCTGTGGACGAGGAGACTCA
GATGAGATTCACGGCTTCTCTCCTGGAGTACTCACTTCTGTTTGCAAGTATGTTCATGAA
TTGTGTCTATCATGACCGATTTGTCTTGCCACCAGTTATCGCCTATCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A776TF U 1
AF RS1F165TF U 120
BS 1 246 RS1A776TF
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RD RS1A776TF 888 0 0
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GTTGTTTCAGTCACATTTCCTCTCTCTCATCATTCACAAGCAATTCATTTCACTTCTACG
TACACAAAAGCTTCTCAGATTTCAATATCCGTTTCTCTGAGTTGTAGTAATGGGTTCTGA
AGGACCAACGGCAGTGACAATTAACATCACAGGCTTCAAGAAGTTCCATGGAGTTGCTGA
AAACCCTACGGAGAAAATAGCAAGCAACCTGAAAGAATATTTAGCTAAGAATCCCCAGTC
GAAAGACGTTGTTCTTGGAAGCTGTACCGTGCTTGAGACCGCTGGTCAAGGAGCTCTCGC
TTCTCTTTATCAGTTACTACAGTCCGCAATCAATACGAAAGAATCAGAGTCAGTGAGCTG
TGGAAGAACCATATGGGTTCATTTGGGAGTTAACAGTGGCGCTACGAAATTCGCAATTGA
GCAACAAGCTGTGAATGAAGCGACGTTCCGTTGCCCTGATGAAATGGGTTGGAAACCTCA
GTATTTGCCTATTGTTCCCTCTGATGGTCCAATCTCAACTGTAAGAAAGACTACTCTTCC
TGTTGAAGAGATAACAAAGGCCTTAGAGAAGAATGGCTTTGAGGTGATAACATCAGATGA
TGCAG*TCGTTTTGTGTGCAACTACGTCTATTACCACTCTCTGAGATTTGCAGAACAGAA
CAAGACCTATTCACTCTTTGTTCACGTTCCTCTTTTCGTTGCTGTGGACGAG*AGACTCA
GATGAGATTCACGGCTTCTCTCCTGGAGTACTCACTTCTGTTTGCA*GTATGTTCATGAA
TTGTGTCTATCATGACCGATTTGTCTTGCCACCAGTTATCGCCTATCA

QA 1 888 1 888
DS 

RD RS1F165TF 732 0 0
GG
ACACAAAAGCTTCTCAGATTTCAATATCCGTTTCTCTGAGTTGTAGTAATGGGTTCTGAA
GGACCAACGGCAGTGACAATTAACATCACAGGCTTCAAGAAGTTCCATGGAGTTGCTGAA
AACCCAACTGAGAAAATAGCTAGCTACCTGAAAGAATATTTGGCTAAGAATCCCCAGTCG
AAAGACGTTGTTCTTGGAAGCTGTACCGTGCTTGAAACAGCCGGTCAAGGAGCTCTCGCT
TCTCTTTATCAGTTACTACAGTCCTCAATCAATACGAAAGAATTAGAGTCAGTGAGCTGT
GGAAGAACCATATGGGTTCATTTGGGAGTTAACAGTGGCGCTACAAAATTCGCAATTGAG
CAGCAAGCTGTGAATGAAGCGACGTTCCGTTGCCCTGATGAAATGGGTTGGAAACCTCAG
CATTTGCCTATTGTTCTCTCTGATGGTCCAATCTCAACTGTAAGAAAGACTACTCTCCCT
GTTGAAGAGATAACAAAGGCCTTAGAGAAGAAGGGCTTTGAGGTGATAACATCAGATGAT
GCAGGTCGTTTTGTGTGCAACTACGCCTATTACCACTCACTGAGATTTGCAGAACAGAAC
AAGACCTATTCACTCTTTGTTCACGTTCCTCTTTTCGTTGCTGTGGATGAGGAGACTCAG
ATGAGATTCACGGCTTCTCTCCTGGAGTACTCACTTCTGTTTGCAAGTATGTTCATGAAT
TGTG
CTATCA

QA 3 726 3 726
DS 



AS 1 2

CO CL6889Contig1 894 2 4 U
GGAAGAGACTTTTGAAAGATCTCAACACACAGCAAAAGAGAACTAGGTAAAGAGAGAGCT
TTTGAGTTGTTTCTTTGGTGTGTAGATGGAAACAGAGAAGAACAGTAAGGAGCTAGGGCT
TAACCACCTAGGGTTCGTGAGAGTTGCAGCGATCCAAGTTCTTGTTACCCTCTCGAATCT
CTACGACTACGCCAAACAAAACTCCGGTCCTCTTAAACCTACCATCGGAAAGGTGGAAGG
CGCCGTTACCGCAGTGGTCACACCTGTCTACAACAAATTCAAAGATGTTCCAGATACTCT
CCTCCTCTTTCTTGATCACAAGGTAGGTGAAGTTTCGAACAAGTTTGATAAGCATGCTCC
TCCAATGGCTAAGAAAGTAGTAAGTCAAGCAAGTGTATTGATCCAGGCGACTGCAGAGAA
GGCTCAAAGCTTTGTGAAAGAGGCTCGTACCGGTGGTCCTAAAGCTGCCTTTAACTATGC
TGCAACTGAGTACAAGTACTTCGTTGTGACCAGCTCGGTTAAAGTCTGGGCTAAACTCAA
CCAGTACAAACCGATTCATGTAGTGGGAAACAAAGCTTTGCCCCTGGCTGCAAATTTGTG
TGGTATGTACAACGATTTGGTGACCGACATGACAAAGAGGGGTTACCCTGTGGTTGGTTA
TCTTCCTTTGGTTCCTGTTGATGACATTGTCAAGGCTTATGAAAAGGAACAAGATGCAGC
GCAAAAGAAAGGAGATACTACCACTGCTTCTGATGGAAACAAATCATTGTCGTCGTCTGA
GTCGTCGTCTGATTCGGACACCGATTGAAACATTTGTGAATCTTGTAGTCTTTGGAGTCT
GGCTTGTTGGGTTGGGAAACTTGTGTAAATGATCACAGAACTTGGTTTGTAGCC


BQ
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AF RS1GW94TF U 1
AF RS1GW94JQ C 205
BS 1 566 RS1GW94TF
BS 567 567 RS1GW94JQ
BS 568 694 RS1GW94TF
BS 695 894 RS1GW94JQ

RD RS1GW94TF 701 0 0
GGAAGAGACTTTTGAAAGATCTCAACACACAGCAAAAGAGAACTAGGTAAAGAGAGAGCT
TTTGAGTTGTTTCTTTGGTGTGTAGATGGAAACAGAGAAGAACAGTAAGGAGCTAGGGCT
TAACCACCTAGGGTTCGTGAGAGTTGCAGCGATCCAAGTTCTTGTTACCCTCTCGAATCT
CTACGACTACGCCAAACAAAACTCCGGTCCTCTTAAACCTACCATCGGAAAGGTGGAAGG
CGCCGTTACCGCAGTGGTCACACCTGTCTACAACAAATTCAAAGATGTTCCAGATACTCT
CCTCCTCTTTCTTGATCACAAGGTAGGTGAAGTTTCGAACAAGTTTGATAAGCATGCTCC
TCCAATGGCTAAGAAAGTAGTAAGTCAAGCAAGTGTATTGATCCAGGCGACTGCAGAGAA
GGCTCAAAGCTTTGTGAAAGAGGCTCGTACCGGTGGTCCTAAAGCTGCCTTTAACTATGC
TGCAACTGAGTACAAGTACTTCGTTGTGACCAGCTCGGTTAAAGTCTGGGCTAAACTCAA
CCAGTACAAACCGATTCATGTAGTGG*AAACAAAGCTTTGCCCCTGGCTGCAAATTTGTG
TGGTATGTACAACGATTTGGTGACCGACATGACAAAGAGGGGTTACCCTGTGGTTGGTTA
TCTTCCTTTGGTTCCTGTTGATGACATTGTCAAG
CTTATGA

QA 1 694 1 694
DS 

RD RS1GW94JQ 690 0 0
CGGTCCTCTTAAACCTACCATCGGAAAGGTGGAAGGCGCCGTTACCGCAGTGGTCACACC
TGTCTACAACAAATTCAAAGATGTTCCAGATACTCTCCTCCTCTTTCTTGATCACAAGGT
AGGTGAAGTTTCGAACAAGTTTGATAAGCATGCTCCTCCAATGGCTAAGAAAGTAGTAAG
TCAAGCAAGTGTATTGATCCAGGCGACTGCAGAGAAGGCTCAAAGCTTTGTGAAAGAGGC
TCGTACCGGTGGTCCTAAAGCTGCCTTTAACTATGCTGCAACTGAGTACAAGTACTTCGT
TGTGACCAGCTCGGTTAAAGTCTGGGCTAAACTCAACCAGTACAAACCGATTCATGTAGT
GGGAAACAAAGCTTTGCCCCTGGCTGCAAATTTGTGTGGTATGTACAACGATTTGGTGAC
CGACATGACAAAGAGGGGTTACCCTGTGGTTGGTTATCTTCCTTTGGTTCCTGTTGATGA
CATTGTCAAGGCTTATGAAAAGGAACAAGATGCAGCGCAAAAGAAAGGAGATACTACCAC
TGCTTCTGATGGAAACAAATCATTGTCGTCGTCTGAGTCGTCGTCTGATTCGGACACCGA
TTGAAACATTTGTGAATCTTGTAGTCTTTGGAGTCTGGCTTGTTGGGTTGGGAAACTTGT
GTAAATGATCACAGAACTTGGTTTGTAGCC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

CO CL6890Contig1 655 2 2 U
GGAAGGAGATCAGTTACTGGAGAATCTTCTCAGATTCATAAAAAAGCTTTGATTTGCTGA
GAGATTGAAGCATAGATAGAAAGAGATGATCAGAAGGCAGAAGAAGACGGTGAAGGTAGT
TACAGGGGTAATGGGACTATGCATCCTTGCTTACATTGCAGTACCTTCTTTGTATTGGCA
TCCCAACGAGACCATTGAAGACTCTCTCCATTCCTCTTGTCCTCCTTGTGTCTGTGACTG
TTCCTCTCAGCCTCTCCTCTCCATCCCTGACGGATTGAGCAATCATAGCTTCTTAGATTG
TATGAGACGTGAGGAAGGGAGTGAAGAGAGCAAGAGTAGTTTCACAGAAATGGTGGCTGA
AGAGCTGAAGCTAAGAGAAGCACAAGCTCAAGAAGATGAATGGCGTGCAGACAGGTTGCT
GCTAGATGCTAAGAAAGCAGCGTCTCAGTATCAGAAAGAAGCTGATAAGTGCAGCATGGG
GATGGAGACTTGTGAGCAAGCAAGAGAGAAGTCAGAGGGTGCTCTAGACGAACAGAGAAG
ACTGTCTTACATGTGGGGAGCTTCGAGCTCGGCAAAATGGATGGAAAGAAGTAGCCAACG
TTGTTGTTTCCTCTGATAATCTCTAAAAGAATCAATCAAATCTTTGTTTGTTTCC


BQ
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AF RS1D556JQ C 1
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QA 1 647 1 647
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TTTC


BQ
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10 10 10 10 

AF RS1BO63TF U 1
AF RS1BO63JQ C 84
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BS 713 724 RS1BO63JQ

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TATTTTTAGTCAATCTGTAGTCTGTACCTTGGTAATTTTTAAGTTTTGATTTCAGTGCAA
ATTATGTATTGAATTCGTCCGTGGGGGCTCTGGAGCAAATCGTTTGATGGATTAAATGGA
TTAGTAGCGTTAATTATGTTATGATTTTATAAGGTAGCGTTACTGTTATTGTCCATCTCA
CGACTATGTATTATTTTATCCCACAGCCTAAACTTTTGTATGTGTATTCCTCTCTCTATC
TCTCTGTGCTTGTGGTTTTGTTATGTATCTGCTTCTCGATTCAGTGAACAAG

QA 1 712 1 712
DS 

RD RS1BO63JQ 641 0 0
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TGTATCTGCTTCTCGATTCAGTGAACAAGTTTTGTCTTTTC

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

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TCTTGGAGGATTGGCTTAACATGGAGACAAACTTTGGTAATCTCGGGGATGTGAGTGTGG
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BQ
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AF RS1CY67JQ C 1
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DS 

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TCAAGATTCTTGAAGCTGCCTACAAATGGAAGAAGCAGAAGCTTGCTGGTTCAGAAGAGA
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CTTTCTTAGTTCTCTCTGTACATCGCCACTCATCCTTT

QA 1 638 1 638
DS 



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BQ
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AF RS1H244TF C 1
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DS 

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QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1GT15TF U 1
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GTGGGTTTTGGGTAAGAGTGTTAGCAGTGTGCCTCTTCGGAACACCGGCCAAAACGATGG
TTTTGTCGGTATCGCTGCACCTTCTTTGGCTAGGATTCTCCCAGTTGATCTGGCAATGTT
TGGTGGGGACATCCTTTGCCAGCCAGATTCATTTCTCTGTTCTGTCCATGATGTGAAAGT
CGTAAACTCTGTTTACCAGAGACATAGAGCTAGAAACATTGCTGCCGTTGGCGCTGAGGT
GTTTCTAAGACAAAGGCTATCTGGTCAGGGACTTGCTTTTATTACTGCCGGTGGCTCTGT
TGTACAGAAAA*CCTGGAGGTGGGAGAAGTTCTCACCATTGACGTTTCTTGCATTGCCGC
TCTCACTCCCTCCATCGATTTCAGA*TCAATTACC*TGCTGCACCTGTA*GACGGGTAGT
GTTCGGGG*TGATAACGTA

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1GT15JQ 800 0 0
TCTGGGTGGTGAAGCACAGGTTGTTCAGATAATGTTAAAACCACAGGAGAAGGTCATTGC
TAAGCCTGGTTCAGTGTGCTACATGTCTGGTTCCGTTGAGATGGAGAATACTTATACCCC
CGAACAAGAAGTTGGCGTTGTGCAGTGGGTTTTGGGTAAGAGTGTTAGCAGTGTGCCTCT
TCGGAACACCGGCCAAAACGATGGTTTTGTCGGTATCGCTGCACCTTCTTTGGCTAGGAT
TCTCCCAGTTGATCTGGCAATGTTTGGTGGGGACATCCTTTGCCAGCCAGATTCATTTCT
CTGTTCTGTCCATGATGTGAAAGTCGTAAACTCTGTTTACCAGAGACATAGAGCTAGAAA
CATTGCTGCCGTTGGCGCTGAGGTGTTTTTAAGACAAAGGCTATCTGGTCAGGGACTTGC
TTTTATTACTGCCGGTGGCTCTGTTGTACAGAAAAACCTGGAGGTGGGAGAAGTTCTCAC
CATTGACGTTTCTTGCATTGCCGCTCTCACTCCCTCCATCGATTTCAGAATCAATTACCC
TGCTGCACCTGTAAGACGGGTAGTGTTCGGGGGTGATAACGTAGTAACAGCGACCCTGAC
GGGACCAGGCATCGTGTTCATCCAAAGTTTACCGTTTCATCGGCTCTCCCAGCGAATCGC
AAGGTCTGTGACTTCCCCTAACATGAGGGAAAATCCACGATTTTTAGTTCAAATAGGATT
ATTCTTGTTCCTTGCGTACGTTGTAATTGCATCTTCTTTAATCCTTACCGAAATGTGAAA
CATAGAGAGACTTCCTTTCC

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 2

CO CL6896Contig1 1032 2 2 U
GGGAACAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCTCCGATCTGAGATAATCACAAAATGGCCG
TTTCATCGCGCGACGAGTACGTATACATGGCGAAGCTCTCGGAGCAGGCCGAGAGGTACG
AGGAGATGGTGGAGTTCATGGAGAAACTCTCCGCCGCCGCGGACGGCACCGAGCTCACCG
TCGAGGAGCGCAACCTCCTCTCCGTCGCGTACAAGAACGTGATCGGCGCTCGGCGCGCCT
CGTGGCGTATCATCTCCTCGATCGAGCAGAAGGAGGAGAGCCGCGGCAACGACGACCGCG
TCAAGACGATCCGCGACTACAAGGCGAAGATCGAGACGGAGCTAGCCGGGATCTGCGACG
GGATCCTGAAGCTGCTCGACTCCACGCTCGTCCCATCCGCCGCCTCCGAGGACTCCAAGG
TGTTCTACCTCAAGATGAAAGGTGATTACTATAGGTACTTGGCTGAGTCCAAGATCGGTA
AGGAGAGGGATGATGCGGCTGATAACACCTTATCGGCTTACGAATCTGCTCAGGACAATG
CGAAGGGGCTTGCTCCAACTCACCCGATCCGTCTTGGTTTGGCGTTGAACTTCTCTGTGT
TCTATTACGAGATCCTCAATTCTCCTGATCGTGCTTGCAACCTCGCCAAAACGGCTTTTG
ATGCTGCGATTGCTGAGTTGGATACACTAGGGGAAGAGTCGTACAAGGATAGCACTTTGA
TCATGCAGCTTCTCCGTGACAACCTCACTCTCTGGACATCCGACATGCAGGATGAAACTG
CAGATGAGATAAAGGAAGCAGCAAAGCCATCAGAAGAGCAGAAATGATGAATCTTCTTCG
TCAATTCTGTGTGTCTATTCAAGAGAGATGTCACTCTCTTTTCTTTTCCTATGTTGAAGT
TAACACTCTTCTATCTCCTTTTTTTCTTTTGCCCTTTTGGATTGAGCAGAATTAAATTGA
TCTTGCTCCGTTTCAAATCATGGAAGGTTTTTTCATGTGATTTGCGAAATAAATAACAAT
TTAATTTCAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BJ78TF U 1
AF RS1BJ78JQ C 231
BS 1 686 RS1BJ78TF
BS 687 1032 RS1BJ78JQ

RD RS1BJ78TF 686 0 0
GGGAACAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCTCCGATCTGAGATAATCACAAAATGGCCG
TTTCATCGCGCGACGAGTACGTATACATGGCGAAGCTCTCGGAGCAGGCCGAGAGGTACG
AGGAGATGGTGGAGTTCATGGAGAAACTCTCCGCCGCCGCGGACGGCACCGAGCTCACCG
TCGAGGAGCGCAACCTCCTCTCCGTCGCGTACAAGAACGTGATCGGCGCTCGGCGCGCCT
CGTGGCGTATCATCTCCTCGATCGAGCAGAAGGAGGAGAGCCGCGGCAACGACGACCGCG
TCAAGACGATCCGCGACTACAAGGCGAAGATCGAGACGGAGCTAGCCGGGATCTGCGACG
GGATCCTGAAGCTGCTCGACTCCACGCTCGTCCCATCCGCCGCCTCCGAGGACTCCAAGG
TGTTCTACCTCAAGATGAAAGGTGATTACTATAGGTACTTGGCTGAGTCCAAGATCGGTA
AGGAGAGGGATGATGCGGCTGATAACACCTTATCGGCTTACGAATCTGCTCAGGACAATG
CGAAGGGGCTTGCTCCAACTCACCCGATCCGTCTTGGTTTGGCGTTGAACTTCTCTGTGT
TCTATTACGAGATCCTCAATTCTCCTGATCGTGCTTGCAACCTCGCCAAAACGGCTTTTG
ATGCTGCGATTGCTGAGTTGGATACA

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1BJ78JQ 802 0 0
TC
GCGCGCCTCGTGGCGTATCATCTC*TCGATCGAGCAGAAGGAGGAGAGCCGCGGCAACGA
CGACCGCGTCAAGACGATCCGCGACTACAAGGCGAAGATCGAGACGGAGCTAGCCGGGAT
CTGCGACGGGATCCTGAAGCTGCTCGACTCCACGCTCGTCCCATCCGCCGCCTCCGAGGA
CTCCAAGGTGTTCTACCTCAAGATGAAAGGTGATTACTATAGGTACTTGGCTGAGTCCAA
GATCGGTAAGGAGAGGGATGATGCGGCTGATAACACCTTATCGGCTTACGAATCTGCTCA
GGACAATGCGAAGGGGCTTGCTCCAACTCACCCGATCCGTCTTGGTTTGGCGTTGAACTT
CTCTGTGTTCTATTACGAGATCCTCAATTCTCCTGATCGTGCTTGCAACCTCGCCAAAAC
GGCTTTTGATGCTGCGATTGCTGAGTTGGATACACTAGGGGAAGAGTCGTACAAGGATAG
CACTTTGATCATGCAGCTTCTCCGTGACAACCTCACTCTCTGGACATCCGACATGCAGGA
TGAAACTGCAGATGAGATAAAGGAAGCAGCAAAGCCATCAGAAGAGCAGAAATGATGAAT
CTTCTTCGTCAATTCTGTGTGTCTATTCAAGAGAGATGTCACTCTCTTTTCTTTTCCTAT
GTTGAAGTTAACACTCTTCTATCTCCTTTTTTTCTTTTGCCCTTTTGGATTGAGCAGAAT
TAAATTGATCTTGCTCCGTTTCAAATCATGGAAGGTTTTTTCATGTGATTTGCGAAATAA
ATAACAATTTAATTTCAAGC

QA 3 802 3 802
DS 



AS 1 2

CO CL6897Contig1 682 2 3 U
GGGAGGCCAAGGGCATGGAATATGCAAGGGATGCAAGTTTATTTTCAGTCAATTGTGGGA
GCAAAGGATTTCATCTATTTCATCTACTGCCTTACATTTGTCACTTCACATCTCTGTCTC
AAGTTTGCTTTGATTCCCATCTTGTGTCGAGCACTTGAACAAGTAGCCAAGTTCTTGAGA
CGTAATTTCACTCGCTCCACCATATACAGGAATTACTTGGAAGACCCTTGTGTTTGGGTG
GAGTCAAACACAACTACCCTCAACATCCTCTCATCGCAAGCTGAGATAGCCATTGGCTTC
CTTCTGATTATCTCTCTGCTCTCATGGCAACGCAACTTTATACAGACATTCATGTACTGG
CAGCTATTGAAGCTGATGTATCAAGCACCGGTGACAGCAGGATACCACCAGAGCAATTGG
AGCAAAATAGGGAGGACGGTGAATCCGATGATCCAACGTTACGCTCCCTTCTTGAATACT
CCGGTGACTGCCGTTCAGAGATGGTGGTTCAGGTGAAGAACAAACAAATTGCAGAGTTGA
CTTTTGAAACCCTTAAAAGAAAATAAAGTTTTAGCTTTCATGTTCAACAGTCCTCTTTAC
CTGTTTCAGCTTTCAGCGTAAAGTAGATTCTTCTTCTCTTTGTACCTCTCTATGGGTTAT
GAAATATTACTGTGTTGCTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EM26TF U 1
AF RS1EM26JQ C 113
BS 1 562 RS1EM26TF
BS 563 563 RS1EM26JQ
BS 564 682 RS1EM26TF

RD RS1EM26TF 682 0 0
GGGAGGCCAAGGGCATGGAATATGCAAGGGATGCAAGTTTATTTTCAGTCAATTGTGGGA
GCAAAGGATTTCATCTATTTCATCTACTGCCTTACATTTGTCACTTCACATCTCTGTCTC
AAGTTTGCTTTGATTCCCATCTTGTGTCGAGCACTTGAACAAGTAGCCAAGTTCTTGAGA
CGTAATTTCACTCGCTCCACCATATACAGGAATTACTTGGAAGACCCTTGTGTTTGGGTG
GAGTCAAACACAACTACCCTCAACATCCTCTCATCGCAAGCTGAGATAGCCATTGGCTTC
CTTCTGATTATCTCTCTGCTCTCATGGCAACGCAACTTTATACAGACATTCATGTACTGG
CAGCTATTGAAGCTGATGTATCAAGCACCGGTGACAGCAGGATACCACCAGAGCAATTGG
AGCAAAATAGGGAGGACGGTGAATCCGATGATCCAACGTTACGCTCCCTTCTTGAATACT
CCGGTGACTGCCGTTCAGAGATGGTGGTTCAGGTGAAGAACAAACAAATTGCAGAGTTGA
CTTTTGAAACCCTTAAAAGAAACTAAAGTTTTAGCTTTCATGTTCAACAGTCCTCTTTAC
CTGTTTCAGCTTTCAGCGTAAAGTAGATTCTTCTTCTCTTTGTACCTCTCTATGGGTTAT
GAAATATTACTGTGTTGCTACG

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1EM26JQ 570 0 0
TCTGTCTCAAGTTTGCTTTGATTCCCATCTTGTGTCGAGCACTTGAACAAGTAGCCAAGT
TCTTGAGACGTAATTTCACTCGCTCCACCATATACAGGAATTACTTGGAAGACCCTTGTG
TTTGGGTGGAGTCAAACACAACTACCCTCAACATCCTTTCATCGCAAGCTGAGATAGCCA
TTGGCTTCCTTTTGATTATCTTTTTGCTCTCATGGCAACGCAACTTTATACAGACATTCA
TGTACTGGCAGCTATTGAAGCTGATGTATCAAGCACCGGTGACAGCAGGATACCACCAGA
GCAATTGGAGCAAAATAGGGAGGACGGTGAATCCGATGATCCAACGTTACGCTCCCTTCT
TGAATACTCCGGTGACTGCCGTTCAGAGATGGTGGTTCAGGTGAAGAACAAACAAATTGC
AGAGTTGACTTTTGAAACCCTTAAAAGAAAATAAAGTTTTAGCTTTCATGTTCAACAGTC
CTCTTTACCTGTTTCAGCTTTCAGCGTAAAGTAGATTTTTTTTCTCTTTGTACCTCTCTA
TGGGTTATGAAATATTACTGTGTTGCTACG

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 2

CO CL6898Contig1 821 2 2 U
GGATGTGGGTGTGCTGAGGAATCTTTGAATCATGTATTTTTTGAATGCCCTCCAGCGCGG
CAAATATGGGCATTATCGACTATACCAACAAATCCAAACGTTTTCCCCTCAGAATCATTC
TTTACTAATATGGATCATTTATTCTGGAGAGTTCTACCCAAGATGAATGATCATCAGTTT
GCATGGATACTATGGTATATCTGGAAAGCAAGGAACAACAAGGTTTTTAGTAACCTGGAT
GTGGATGCCAGGGATACACTGACGTTGGCTGAAACGGAATCTACTATGTGGGCTGCGGCC
CAAGATTTGACTACCCGACAATCCATACCACCGCAAGTACATCCGCCTCCCTCAATTCCA
GGGAGATGGTGCTTCGTAGATGGTTCGTGGAAGGATAAGGACTCTTTCTCTGGACAAGGT
TGGTTCAGTACTCTTGAGGGTTATGAGGGCTTAATGGGGGCACGAAATGTTCGGGCAAGT
ATGTCTCCCCTGCACGCGGAGGTGGAAGCATTGATTTGGGCAATGGAATGTATGAGGAAT
TTACGTCAGTTTCAGGTTACGTTTGCAACGGATTGTTCTCAGTTGGTGAAGTGGTTTCAG
AACCAGAAGAGTGGCCGGCATTTGCAAGTTATCTGGAGGATATTAAGAGTCTACAAAGTA
GTTTCCATAGTTCACAGCTCATTCATGTACCAAGGACGGCAAATACAAAGGCGGATCGTT
TAGCACGTAGTGCCAGACAACAATCGTCTTTTGTCATTCACATGGATGCCGAGCTACCAG
TTTGGTGTACAGAGTCAATATGAGTCTGTATGTTTGATGAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C684TF U 1
AF RS1C684JQ C 1
BS 1 551 RS1C684TF
BS 552 821 RS1C684JQ

RD RS1C684TF 551 0 0
GGATGTGGGTGTGCTGAGGAATCTTTGAATCATGTATTTTTTGAATGCCCTCCAGCGCGG
CAAATATGGGCATTATCGACTATACCAACAAATCCAAACGTTTTCCCCTCAGAATCATTC
TTTACTAATATGGATCATTTATTCTGGAGAGTTCTACCCAAGATGAATGATCATCAGTTT
GCATGGATACTATGGTATATCTGGAAAGCAAGGAACAACAAGGTTTTTAGTAACCTGGAT
GTGGATGCCAGGGATACACTGACGTTGGCTGAAACGGAATCTACTATGTGGGCTGCGGCC
CAAGATTTGACTACCCGACAATCCATACCACCGCAAGTACATCCGCCTCCCTCAATTCCA
GGGAGATGGTGCTTCGTAGATGGTTCGTGGAAGGATAAGGACTCTTTCTCTGGACAAGGT
TGGTTCAGTACTCTTGAGGGTTATGAGGGCTTAATGGGGGCACGAAATGTTCGGGCAAGT
ATGTCTCCCCTGCACGCGGAGGTGGAAGCATTGATTTGGGCAATGGAATGTATGAGGAAT
TTACGTCAGTT

QA 1 551 1 551
DS 

RD RS1C684JQ 821 0 0
GGATGTGGGTGTGCTGAGGAATCTTTGAATCATGTATTTTTTGAATGCCCTCCAGCGCGG
CAAATATGGGCATTATCGACTATACCAACAAATCCAAACGTTTTCCCCTCAGAATCATTC
TTTACTAATATGGATCATTTATTCTGGAGAGTTCTACCCAAGATGAATGATCATCAGTTT
GCATGGATACTATGGTATATCTGGAAAGCAAGGAACAACAAGGTTTTTAGTAACCTGGAT
GTGGATGCCAGGGATACACTGACGTTGGCTGAAACGGAATCTACTATGTGGGCTGCGGCC
CAAGATTTGACTACCCGACAATCCATACCACCGCAAGTACATCCGCCTCCCTCAATTCCA
GGGAGATGGTGCTTCGTAGATGGTTCGTGGAAGGATAAGGACTCTTTCTCTGGACAAGGT
TGGTTCAGTACTCTTGAGGGTTATGAGGGCTTAATGGGGGCACGAAATGTTCGGGCAAGT
ATGTCTCCCCTGCACGCGGAGGTGGAAGCATTGATTTGGGCAATGGAATGTATGAGGAAT
TTACGTCAGTTTCAGGTTACGTTTGCAACGGATTGTTCTCAGTTGGTGAAGTGGTTTCAG
AACCAGAAGAGTGGCCGGCATTTGCAAGTTATCTGGAGGATATTAAGAGTCTACAAAGTA
GTTTCCATAGTTCACAGCTCATTCATGTACCAAGGACGGCAAATACAAAGGCGGATCGTT
TAGCACGTAGTGCCAGACAACAATCGTCTTTTGTCATTCACATGGATGCCGAGCTACCAG
TTTGGTGTACAGAGTCAATATGAGTCTGTATGTTTGATGAC

QA 1 821 1 821
DS 



AS 1 2

CO CL6899Contig1 892 2 4 U
GGGATCAGCTAGTTGAAATCATCAAAGTTCTTGGCACACCAACTCGAGAAGAGATCCGTT
GTATGAATCCACATTACACAGACTTTAGGTTCCCTCAGATAAAGGCACATCCTTGGCACA
AGATTTTCCACAAAAGGATGCCTCCAGAAGCCATTGATTTTGCATCAAGGCTGCTTCAGT
ACTCTCCAAGTCTTAGATGCACAGCGCTGGAAGCTTGTGCACATCCGTTCTTTGATGAAC
TGAGAGAACCAAATGCTCGTTTACCAAACGGACGGCCTTTCCCGCCAATCTTCAACTTCA
AGCAAGAGGTAGCTGGAGCTTCACCTGAGCTGGTCAACAAGCTGATCCCAGACCATATCA
AGAGACAGTTGGGTTAAGTTTCTTGAATCAGCCTGGAACTTAAAACGAACGAGCACAAGA
TCGAGAACTTTATTATGTATAATGTACCATTACTCAAGAGCCAGAAGAAGGTAGTTTGAA
GGCAACTTGGAGGATGACAATCAGAAGTTTTGCCTCCTTAAACTTTGTTCCAGGAATGTT
ACTATTCAGTGGCAAGTTTGATGATAGCTTCTACAACCTGACGACTTTCCCAAATCTGCA
AAGAAAAGCTTCAGATGTATCTTCTTTTTCCTTTTTTAAGTTTGGTTAAAAAAAACAAAA
TCTCCCCTTGCACTTCATTCTTTCCGCATCTGTAAATGAGTTTAGTCAAGAGTTTCTATT
TATATAGTAAAGTTTGAGCAGAATGTGAAAGAATCTTTAGTCAAAGAGGATCCAATGTCT
ACCAGAAGAGGAAGGCTGGAGGCTTTTGCAGTTTTATTGGGTAGCTTTGTATTTTGTTTC
TTTCTCCTTTTGAATGTTTCTCTTCTTTTAATGAAATACTAGTTTGTTTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EO73TF U 1
AF RS1EO73JQ C 125
BS 1 654 RS1EO73TF
BS 655 655 RS1EO73JQ
BS 656 783 RS1EO73TF
BS 784 892 RS1EO73JQ

RD RS1EO73TF 783 0 0
GGGATCAGCTAGTTGAAATCATCAAAGTTCTTGGCACACCAACTCGAGAAGAGATCCGTT
GTATGAATCCACATTACACAGACTTTAGGTTCCCTCAGATAAAGGCACATCCTTGGCACA
AGATTTTCCACAAAAGGATGCCTCCAGAAGCCATTGATTTTGCATCAAGGCTGCTTCAGT
ACTCTCCAAGTCTTAGATGCACAGCGCTGGAAGCTTGTGCACATCCGTTCTTTGATGAAC
TGAGAGAACCAAATGCTCGTTTACCAAACGGACGGCCTTTCCCGCCAATCTTCAACTTCA
AGCAAGAGGTAGCTGGAGCTTCACCTGAGCTGGTCAACAAGCTGATCCCAGACCATATCA
AGAGACAGTTGGGTTAAGTTTCTTGAATCAGCCTGGAACTTAAAACGAACGAGCACAAGA
TCGAGAACTTTATTATGTATAATGTACCATTACTCAAGAGCCAGAAGAAGGTAGTTTGAA
GGCAACTTGGAGGATGACAATCAGAAGTTTTGCCTCCTTAAACTTTGTTCCAGGAATGTT
ACTATTCAGTGGCAAGTTTGATGATAGCTTCTACAACCTGACGACTTTCCCAAATCTGCA
AAGAAAAGCTTCAGATGTATCTTCTTTTTCCTTTTTTAAGTTTGGTTAAAAAAA*CAAAA
TCTCCCCTTGCACTTCATTCTTTCCGCATCTGTAAATGAGTTTAGTCAAGAGTTTCTATT
TATATAGTAAAGTTTGAGCAGAATGTGAAAGAATCTTTAGTCAAAGAGGATCCAATGTCT
ACC

QA 1 783 1 783
DS 

RD RS1EO73JQ 768 0 0
TTTCCACAAAAGGATGCCTCCAGAAGCCATTGATTTTGCATCAAGGCTGCTTCAGTACTC
TCCAAGTCTTAGATGCACAGCGCTGGAAGCTTGTGCACATCCGTTCTTTGATGAACTGAG
AGAACCAAATGCTCGTTTACCAAACGGACGGCCTTTCCCGCCAATCTTCAACTTCAAGCA
AGAGGTAGCTGGAGCTTCACCTGAGCTGGTCAACAAGCTGATCCCAGACCATATCAAGAG
ACAGTTGGGTTAAGTTTCTTGAATCAGCCTGGAACTTAAAACGAACGAGCACAAGATCGA
GAACTTTATTATGTATAATGTACCATTACTCAAGAGCCAGAAGAAGGTAGTTTGAAGGCA
ACTTGGAGGATGACAATCAGAAGTTTTGCCTCCTTAAACTTTGTTCCAGGAATGTTACTA
TTCAGTGGCAAGTTTGATGATAGCTTTTACAACCTGACGACTTTCCCAAATTTGCAAAGA
AAAGCTTCAGATGTATTTTCTTTTTCCTTTTTTAAGTTTGGTTAAAAAAAACAAAATCTC
CCCTTGCACTTCATTCTTTCCGCATCTGTAAATGAGTTTAGTCAAGAGTTTTTATTTATA
TAGTAAAGTTTGAGCAGAATGTGAAAGAATCTTTAGTCAAAGAGGATCCAATGTCTACCA
GAAGAGGAAGGCTGGAGGCTTTTGCAGTTTTATTGGGTAGCTTTGTATTTTGTTTCTTTC
TCCTTTTGAATGTTTCTCTTCTTTTAATGAAATACTAGTTTGTTTATG

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL6900Contig1 790 2 2 U
GGATTCACCGAAAGCATCTGCAGAGGTTGATCATGACTCTCATCCACTTGCTGCTGCTAA
GGATACCGAAGCTGAATATGTGGATGAACAGCCGAAACATTCTTTGAAGCGTAAGGCTAG
CAATCCTTCTTTCGCTGCAGCGAGATCAAAGTTTGAGGAACTAACTTCATCTGCTGTTGG
TTCAAACAAAGCAATCACGCTTTCTTCTAAAGATGGTGTTTTAGGTGAACAAGGCAAAGA
TTCATCAGAGGCTAAAAAGGATCAGTCTGTGGAAGAAGTTGCTCCAGCGGAGCACAATGG
ATCTGAGTGTGGCACTGAACTCTCTGTGACTTCTTCTCTTGATTCGCTTGACAAGAAGTC
AGACGTTGAGAGTGGTGGAGAGCCCAAGGTTGGAGCTAAGCTTCTAGAAAACGGCACTCC
CAAGTCAGACCAAGCAGAGTTGATAGAAATTGATGTGAAATCTAAAACTCCATTGGCGGC
TACTGTAGATGACTCCAAGGAGAGAGTTGAGGTTACAGTGACAGAGCATGAAACGGTTAT
TATTAGTACACCAGATTCCAAAAAGAGAAGTGCAGAAGAAGATGAATCAGGTCCTCAAGC
ATCATACTCGTTACCTGAGGAAGCTGTAACTCCGATGACAATCACTGAATCTCAGCAACT
CCCGGCAAGTCAAGCATCCTCTTCGGTAGAGCAAGGAAGGATAGATCCCGGTAAGAGTGG
TTCAAGCCAGAAGCGGAAAGTTAGCAGAAAATAGCATCAAGTCCCAAACAGGAAACTGAT
ACTACTACTA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G490TF U 1
AF RS1H227TF U 1
BS 1 653 RS1G490TF
BS 654 790 RS1H227TF

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ATCTGAGTGTGGCACTGAACTCTCTGTGACTTCTTCTCTTGATTCGCTTGACAAGAAGTC
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TATTAGTACACCAGATTCCAAAAAGAGAAGTGCAGAAGAAGATGAATCAGGTCCTCAAGC
ATCATACTCGTTACCTGAGGAAGCTGTAACTCCGATGACAATCACTGAATCTC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RS1H227TF 790 0 0
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CAATCCTTCTTTCGCTGCAGCGAGATCAAAGTTTGAGGAACTAACTTCATCTGCTGTTGG
TTCAAACAAAGCAATCACGCTTTCTTCTAAAGATGGTGTTTTAGGTGAACAAGGCAAAGA
TTCATCAGAGGCTAAAAAGGATCAGTCTGTGGAAGAAGTTGCTCCAGCGGAGCACAATGG
ATCTGAGTGTGGCACTGAACTCTCTGTGACTTCTTCTCTTGATTCGCTTGACAAGAAGTC
AGACGTTGAGAGTGGTGGAGAGCCCAAGGTTGGAGCTAAGCTTCTAGAAAACGGCACTCC
CAAGTCAGACCAAGCAGAGTTGATAGAAATTGATGTGAAATCTAAAACTCCATTGGCGGC
TACTGTAGATGACTCCAAGGAGAGAGTTGAGGTTACAGTGACAGAGCATGAAACGGTTAT
TATTAGTACACCAGATTCCAAAAAGAGAAGTGCAGAAGAAGATGAATCAGGTCCTCAAGC
ATCATACTCGTTACCTGAGGAAGCTGTAACTCCGATGACAATCACTGAATCTCAGCAACT
CCCGGCAAGTCAAGCATCCTCTTCGGTAGAGCAAGGAAGGATAGATCCCGGTAAGAGTGG
TTCAAGCCAGAAGCGGAAAGTTAGCAGAAAATAGCATCAAGTCCCAAACAGGAAACTGAT
ACTACTACTA

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 2

CO CL6901Contig1 164 2 1 U
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CGGCTGGTTGCTAAAGACTAAGAGATGTACAAGAGCCTGTAATCAAAACAACTTGTTATA
TAAATCTGAACATGGCTAAAATGTCAGGACAAATTGTCTCATCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1C305JQ C 1
AF RS1C305TF U 1
BS 1 164 RS1C305TF

RD RS1C305JQ 164 0 0
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CGGCTGGTTGCTAAAGACTAAGAGATGTACAAGAGCCTGTAATCAAAACAACTTGTTATA
TAAATCTGAACATGGCTAAAATGTCAGGACAAATTGTCTCATCC

QA 1 164 1 164
DS 

RD RS1C305TF 164 0 0
GGTAAGCATCTGCTTCTTCTACTCTCAACCATTATAATTCAATTCTACTCGAGAGTTCTT
CGGCTGGTTGCTAAAGACTAAGAGATGTACAAGAGCCTGTAATCAAAACAACTTGTTATA
TAAATCTGAACATGGCTAAAATGTCAGGACAAATTGTCTCATCC

QA 1 164 1 164
DS 



AS 1 2

CO CL6902Contig1 977 2 2 U
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GTGATATGGCGGAGGAGAAGGAGAAGAACAAGTATAGCATAATCATTCCCACGTACAACG
AGCGCCTCAATATCGCTCTTATTGTCTACCTCATTTTCAAGCATCTCCGGGATGTTGATT
TTGAGATAATTGTTGTGGATGATGGGAGTCCTGATGGGACTCAAGAAATTGTCAAGCAGC
TGCAGTACTTGTATGGTGAAGACCGCATTCTTTTAAGAGCTAGAGCCAAGAAGCTTGGTT
TGGGAACTGCATATATCCATGGTTTGAAGCATGCTACAGGTGATTTCGTTGTCATCATGG
ATGCTGATCTTTCACATCATCCAAAGTATTTGCCAAGTTTCATCAAGAAACAACTAGAGA
CGAATGCAAGCATAGTGACAGGTACACGATATGTAAAAGGAGGTGGTGTACACGGGTGGA
ATCTTATGCGGAAACTCACAAGCAGAGGAGCAAATGTGCTAGCTCAAACACTTTTATGGC
CTGGTGTATCTGATTTAACCGGATCATTTAGGCTATACAAGAAATCGGTGCTTGAAGACG
TGATAAGCTCATGTGTGAGCAAAGGTTATGTCTTTCAGATGGAAATGATCGTTCGTGCTA
CCAGAAAAGGATACCATACTGAAGAGGTACCGATCACATTTGTGGATAGAGTCTTTGGAA
CTTCGAAGCTGGGAGGATCCGAAATAGTGGAATATCTAAAAGGACTCGTCTATCTTCTTC
TCACGACTTAAGAGACGAGAAACCAAACACAGCTCAACAACTTACACATGAATCTCTATT
TATACTCGTTCGTCTCTTATTACTAAACTCCACTTTTACCTTTGACTACAGACATAAAGT
TGCGCATCCTTCAAAGACTCAAAAAGATTCATAGTATCATAAACGTTCTTTTTTTGAATG
TTGAGTTTGAGAACGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B332TF U 1
AF RS1B332JQ C 184
BS 1 621 RS1B332TF
BS 622 977 RS1B332JQ

RD RS1B332TF 621 0 0
CACAGGCGGATAAAGGAAGCTCTCTCCGTTTGTAAAAGTTAGGTTTTTTTTGGGGATCGG
GTGATATGGCGGAGGAGAAGGAGAAGAACAAGTATAGCATAATCATTCCCACGTACAACG
AGCGCCTCAATATCGCTCTTATTGTCTACCTCATTTTCAAGCATCTCCGGGATGTTGATT
TTGAGATAATTGTTGTGGATGATGGGAGTCCTGATGGGACTCAAGAAATTGTCAAGCAGC
TGCAGTACTTGTATGGTGAAGACCGCATTCTTTTAAGAGCTAGAGCCAAGAAGCTTGGTT
TGGGAACTGCATATATCCATGGTTTGAAGCATGCTACAGGTGATTTCGTTGTCATCATGG
ATGCTGATCTTTCACATCATCCAAAGTATTTGCCAAGTTTCATCAAGAAACAACTAGAGA
CGAATGCAAGCATAGTGACAGGTACACGATATGTAAAAGGAGGTGGTGTACACGGGTGGA
ATCTTATGCGGAAACTCACAAGCAGAGGAGCAAATGTGCTAGCTCAAACACTTTTATGGC
CTGGTGTATCTGATTTAACCGGATCATTTAGGCTATACAAGAAATCGGTGCTTGAAGACG
TGATAAGCTCATGTGTGAGCA

QA 1 621 1 621
DS 

RD RS1B332JQ 794 0 0
GAGAT
ATTGTTGTGGATGATGGGAGTC*TGATGG*ACTCAAGAAATTGTCAAGCAGCTGCAGTAC
TTGTATGGTGAAGACCGCATTCTTTTAAGAGCTAGAGCCAAGAAGCTTGGTTTGGGAACT
GCATATATCCATGGTTTGAAGCATGCTACAGGTGATTTCGTTGTCATCATGGATGCTGAT
CTTTCACATCATCCAAAGTATTTGCCAAGTTTCATCAAGAAACAACTAGAGACGAATGCA
AGCATAGTGACAGGTACACGATATGTAAAAGGAGGTGGTGTACACGGGTGGAATCTTATG
CGGAAACTCACAAGCAGAGGAGCAAATGTGCTAGCTCAAACACTTTTATGGCCTGGTGTA
TCTGATTTAACCGGATCATTTAGGCTATACAAGAAATCGGTGCTTGAAGACGTGATAAGC
TCATGTGTGAGCAAAGGTTATGTCTTTCAGATGGAAATGATCGTTCGTGCTACCAGAAAA
GGATACCATACTGAAGAGGTACCGATCACATTTGTGGATAGAGTCTTTGGAACTTCGAAG
CTGGGAGGATCCGAAATAGTGGAATATCTAAAAGGACTCGTCTATCTTCTTCTCACGACT
TAAGAGACGAGAAACCAAACACAGCTCAACAACTTACACATGAATCTCTATTTATACTCG
TTCGTCTCTTATTACTAAACTCCACTTTTACCTTTGACTACAGACATAAAGTTGCGCATC
CTTCAAAGACTCAAAAAGATTCATAGTATCATAAACGTTCTTTTTTTGAATGTTGAGTTT
GAGAACGTT

QA 6 794 6 794
DS 



AS 1 2

CO CL6903Contig1 1050 2 4 U
TTCCGTTATGGGCGTTGGCGGAGGTGAAAGAGCGGCAACGCCAGTTCAACAGAAAGCGCA
TGAGGCCTGGAGGATTTACCAACACTACCTTGACAAGACTACTCCTCTTCCCACTTACAG
GTGGTTTGCTACTGCTCTTGTCGCCCTTTCCTACTCTTTCAGGGTCTACTACCTTCAGGG
CTTCTACATCATCGCCTACGGTCTTGGTATCTACCTTCTCAACCTTCTCATTGGCTTCTT
GTCCCCTCTTGTTGATCCTGAGTCTGCTGGTGGACCTTCTCTTCCTACCAGAGGTTCTGA
TGAGTTCAAGCCTTTTATCCGTCGTCTCCCTGAGTTCAAGTTCTGGTATTCAATGACAAA
GGCCTTCTGCATTGCGTTTGTGATGACTTTCTTCTCGGTGTTTGACGTTCCTGTCTTCTG
GCCTATCCTGCTTTGCTATTGGATCGTTCTCTTTTTTCTCACCATGAGACGCCAGATCTC
TCACATGATCAAGTACAAGTACATCCCTTTCAGCTTCGGCAAACAGGTTAACACCAACAA
CACTGTTTTTTAATTTGCAATTCTCAACTTATCCTCATTCATATATGTATGTGTGCATAG
AGTCAGTCATGGAAAGTTACTGACTTTGAGATTAGTTAAGGCTAATTCGTATGTAAAGTC
CTTTTCTCTCTTGGTTTTGTATTTTTTTACTATCGACACCTTCTCTTTGTTTATGCGACA
GAAATATGGTGGACGGAGTAGCAGCAGCGGCTCACGTGCGGACTGATCTGACCACCCCCT
TTTGTCTTTAACAAAAGAAAAGATATTTTGTTGTTAGAAAAAGGAAATCATTTTTGGACT
ATTTTTTTTTTTTTTCCATTGACCGACAGATTTATGCAGCTACAGCTCTACAAGTAAGAA
TTAGATGGGTGAACACAAGAAAAAAAAAGAGAAAACAGGATGAGATTCGCATTTGTTATT
TTAGCTCGGAGAAAAATTGGTCCTTGTATGTATTACTATCTGTTTTGTTGCTTTACTTCT
TCAAATAATTCTACGAATGAATTTGGCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GD90TF U 1
AF RS1GD90JQ C 371
BS 1 640 RS1GD90TF
BS 641 641 RS1GD90JQ
BS 642 707 RS1GD90TF
BS 708 1050 RS1GD90JQ

RD RS1GD90TF 707 0 0
TTCCGTTATGGGCGTTGGCGGAGGTGAAAGAGCGGCAACGCCAGTTCAACAGAAAGCGCA
TGAGGCCTGGAGGATTTACCAACACTACCTTGACAAGACTACTCCTCTTCCCACTTACAG
GTGGTTTGCTACTGCTCTTGTCGCCCTTTCCTACTCTTTCAGGGTCTACTACCTTCAGGG
CTTCTACATCATCGCCTACGGTCTTGGTATCTACCTTCTCAACCTTCTCATTGGCTTCTT
GTCCCCTCTTGTTGATCCTGAGTCTGCTGGTGGACCTTCTCTTCCTACCAGAGGTTCTGA
TGAGTTCAAGCCTTTTATCCGTCGTCTCCCTGAGTTCAAGTTCTGGTATTCAATGACAAA
GGCCTTCTGCATTGCGTTTGTGATGACTTTCTTCTCGGTGTTTGACGTTCCTGTCTTCTG
GCCTATCCTGCTTTGCTATTGGATCGTTCTCTTTTTTCTCACCATGAGACGCCAGATCTC
TCACATGATCAAGTACAAGTACATCCCTTTCAGCTTCGGCAAACAGGTTAACACCAACAA
CACTGTTTTTTAATTTGCAATTCTCAACTTATCCTCATTCATATATGTATGTGTGCATAG
AGTCAGTCATGGAAAGTTACTGACTTTGAGATTAGTTAAG*CTAATTCGTATGTAAAGTC
CTTTTCTCTCTTGGTTTTGTATTTTTTTACTATCGACACCTTCTCTT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1GD90JQ 680 0 0
ATTGCGTTTGTGATGACTTTCTTCTCGGTGTTTGACGTTCCTGTCTTCTGGCCTATCCTG
CTTTGCTATTGGATCGTTCTCTTTTTTCTCACCATGAGACGCCAGATCTCTCACATGATC
AAGTACAAGTACATCCCTTTCAGCTTCGGCAAACAGGTTAACACCAACAACACTGTTTTT
TAATTTGCAATTCTCAACTTATCCTCATTCATATATGTATGTGTGCATAGAGTCAGTCAT
GGAAAGTTACTGACTTTGAGATTAGTTAAGGCTAATTCGTATGTAAAGTCCTTTTCTCTC
TTGGTTTTGTATTTTTTTACTATCGACCCCTTCTCTTTGTTTATGCGACAGAAATATGGT
GGACGGAGTAGCAGCAGCGGCTCACGTGCGGACTGATCTGACCACCCCCTTTTGTCTTTA
ACAAAAGAAAAGATATTTTGTTGTTAGAAAAAGGAAATCATTTTTGGACTATTTTTTTTT
TTTTTCCATTGACCGACAGATTTATGCAGCTACAGCTCTACAAGTAAGAATTAGATGGGT
GAACACAAGAAAAAAAAAGAGAAAACAGGATGAGATTCGCATTTGTTATTTTAGCTCGGA
GAAAAATTGGTCCTTGTATGTATTACTATCTGTTTTGTTGCTTTACTTCTTCAAATAATT
CTACGAATGAATTTGGCTTC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

CO CL6904Contig1 664 2 2 U
GGAAGACAAGCTTCAATAAGTGAAGAGGAACCACAAAACCCTGTGGCTCCTGTCACCACC
GTCAATACACCAACTTACATGGTTGCAACAGAGTCAGCAAAGGCAAAGTCAAGATCACTG
AGCTCACCGAGGATAAGACCGAGAAGTTTCGACACGCAGTCAGAGAGTTACTCGCCGTAT
AAGAACAAGCTATGCCTGACGACTTCGGTGATGAGTGAAGCACCAAGCAAAGTGAGGGTT
GGGAATAACAATGGCAATAACAATAGGGCGAGTGCATACCAGCAAAGGTCTCCAGGGTTA
AGGGGGTTCAACATGGGCCCATTGAAATCATGCAATAATGGTACTTTATTAAACGATCTC
AGCATTAACTCGGAACGATCTCTACCTAGCTGGAGCAAGCAGAGCAGCTTGAGATGATGA
GTGGGATTTTGTGCCCTGTATATACTTACTACATACGTTCCAGTGTTTCTTTGTTGAGAA
GGTCACACTCGCACGTGTATCATCAAATCTTCTTTGGTTTCTTTTTTTTTGCTTACACTG
TGTCACTCAATTTCATTTAATTATATTGCACAAGGACAATGTAAACAAGGGATATTGCCA
TTTCGTTAATCAATCTATATGTAGAAAAAGAAACAAAAGTACTATGAAATAAAATAAGTT
TGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 

AF RS1H602TF U 1
AF RS1H602JQB C 76
BS 1 629 RS1H602TF
BS 630 664 RS1H602JQB

RD RS1H602TF 629 0 0
GGAAGACAAGCTTCAATAAGTGAAGAGGAACCACAAAACCCTGTGGCTCCTGTCACCACC
GTCAATACACCAACTTACATGGTTGCAACAGAGTCAGCAAAGGCAAAGTCAAGATCACTG
AGCTCACCGAGGATAAGACCGAGAAGTTTCGACACGCAGTCAGAGAGTTACTCGCCGTAT
AAGAACAAGCTATGCCTGACGACTTCGGTGATGAGTGAAGCACCAAGCAAAGTGAGGGTT
GGGAATAACAATGGCAATAACAATAGGGCGAGTGCATACCAGCAAAGGTCTCCAGGGTTA
AGGGGGTTCAACATGGGCCCATTGAAATCATGCAATAATGGTACTTTATTAAACGATCTC
AGCATTAACTCGGAACGATCTCTACCTAGCTGGAGCAAGCAGAGCAGCTTGAGATGATGA
GTGGGATTTTGTGCCCTGTATATACTTACTACATACGTTCCAGTGTTTCTTTGTTGAGAA
GGTCACACTCGCACGTGTATCATCAAATCTTCTTTGGTTTCTTTTTTTTTGCTTACACTG
TGTCACTCAATTTCATTTAATTATATTGCACAAGGACAATGTAAACAAGGGATATTGCCA
TTTCGTTAATCAATCTATATGTAGAAAAA

QA 1 629 1 629
DS 

RD RS1H602JQB 589 0 0
TACATGGTTGCAACAGAGTCAGCAAAGGCAAAGTCAAGATCACTGAGCTCACCGAGGATA
AGACCGAGAAGTTTCGACACGCAGTCAGAGAGTTACTCGCCGTATAAGAACAAGCTATGC
CTGACGACTTCGGTGATGAGTGAAGCACCAAGCAAAGTGAGGGTTGGGAATAACAATGGC
AATAACAATAGGGCGAGTGCATACCAGCAAAGGTCTCCAGGGTTAAGGGGGTTCAACATG
GGCCCATTGAAATCATGCAATAATGGTACTTTATTAAACGATTTCAGCATTAACTCGGAA
CGATCTCTACCTAGCTGGAGCAAGCAGAGCAGCTTGAGATGATGAGTGGGATTTTGTGCC
CTGTATATACTTACTACATACGTTCCAGTGTTTCTTTGTTGAGAAGGTCACACTCGCACG
TGTATCATCAAATCTTCTTTGGTTTCTTTTTTTTTGCTTACACTGTGTCACTCAATTTCA
TTTAATTATATTGCACAAGGACAATGTAAACAAGGGATATTGCCATTTCGTTAATCAATC
TATATGTAGAAAAAGAAACAAAAGTACTATGAAATAAAATAAGTTTGTT

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 2

CO CL6905Contig1 711 2 3 U
GTCATGTTTGTATTTTGCATTTAGCGTAGATACTCTGTTCTCCGAAAAAAAAAGAAGCAA
AATACATAAATGTGATTTTCGAAAGTTTTATTCAATGCCAGTCTTCTTCTTCAACATTTC
GATGAATTTTTCTTTCTCTTCATCTGTCATTCCATTGGTTGAACAGTCTCCTACTCCCCA
CTCTGCTCCTCTTAGACAATACTTGTCTTGAATCGCTCTTTCATTCTTTTCTTTGTTCAG
TTTGGAGTTCTCGAGTAGTTTCTTGAGAATTGGAGAATCTTTGAATCTAGAATCGTTTTC
AGCGTAAAACTTCTGGTTTCTAGCTGCAATTACGAAGCATTTTTCTTGAAGCAGACACAG
ACAAAAAAATACTTTTGTCTTAAAGATTTCAAAAGATTAGTAGTACCATTGAAACGTTCG
AGGAACTCGAGCTTAGGTAATTCAGGACCAGGAACTGATTCTATACCGGGACTTCCCGAC
ATTAAGCCTGCTTCAGCGGTGCAGGGAGAGAGGAGAAGGGTGAGTGAGGCAGCGAGAGGG
AAGGTAGACTTGCAGAGAAGGTTCTTAAACGGTGGTGGTGATGGTAAAGGTAAAGCCATG
GAGGAGATACGAGGTGCTCTTGTTTCATGGAGAGTGAAGCTCGGCCGAGAGAGATAAGAG
ATTTTGGTTTGCATCTTTGCTTCTAGATATTTTTTTTTGTGAGGATGGTCC


BQ
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AF RS1FH86TF C 1
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TGGTTGAACAGTCTCCTACTCCCCACTCTGCTCCTCTTAGACAATACTTGTCTTGAATCG
CTCTTTCATTCTTTTCTTTGTTCAGTTTGGAGTTCTCGAGTAGTTTCTTGAGAATTGGAG
AATCTTTGAATCTAGAATCGTTTTCAGCGTAAAACTTCTGGTTTCTAGCTGCAATTACGA
AGCATTTTTCTTGAAGCAGACACAGACAAAAAAATACTTTTGTCTTAAAGATTTCAAAAG
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TT
G

QA 1 662 1 662
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GR64JQ U 1
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TGGCTCTACTCCTACCCGCCTTAGGTGCAGCTGTAGATGCAAATTGACTTCATCAGGCCG
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ATCTGTAAGTTCATCTTTCAGAACTTGCGGAATCGCACAGTAATCATTGGTATCCATTAT
AGTGATGAATGAA

QA 1 733 1 733
DS 



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AS 0 0

AS 1 2

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TCTTGAATTGATCCATTGAGGACTGTAGCTCTTGGCTTCAAAGAGGAGGCGGTTCCTTGC
TGTCCACAGAGACCAAACAATCCAAGAGAAGACAGAGGAGGTGATACCTGATGGTGGAAG
ACATATAGCCTGTCGGTATCGGATAAGTGCTGTTTTGAAATCATCCTCTATAACCATAGA
GAATCGTTTGGCTCTGCCCCTATAACCATAGAGAAATCTTCCGTTGATGATGTTAATTAA
GAGAGCAAGCCCAGTTTAGAAGAACTTTTGATGCCCCTTGAGAAGCTCTTTCCATCAATT
GAATTTTGTTGAACCAAATAAAGGCAGTAAACTTTTCTTTCCAGCCACAAAAGCTTCCAT
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BQ
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BS 661 702 RS1C144JQ

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GAATCGTTTGGCTCTGCCCCTATAACCATAGAGAAATCTTCCGTTGATGATGTTAATTAA
GAGAGCAAGCCCAGTTTAGAAGAACTTTTGATGCCCCTTGAGAAGCTCTTTCCATCAATT
GAATTTTGTTGAACCAAATAAAGGCAGTAAACTTTTCTTTCCAGCCACAAAAGCTTCCAT
GTGTACACACCACAACCCAAAGAATAAGCTGAAAATCTTCAAAAGGCACTGCTTATTGAG
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TTCTGTCATTGTTTGACTTGCCTGCTAACTAGCTGGGCTGTCTCGTAAAGTCTCTAGACT
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DS 

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CTTGAATTGATCCATTGAGGACTGTAGCTCTTGGCTTCAAAGAGGAGGCGGTTCCTTGCT
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CATATAGCCTGTCGGTATCGGATAAGTGCTGTTTTGAAATCATCCTCTATAACCATAGAG
AATCGTTTGGCTCTGCCCCTATAACCATAGAGAAATCTTCCGTTGATGATGTTAATTAAG
AGAGCAAGCCCAGTTTAGAAGAACTTTTGATGCCCCTTGAGAAGCTCTTTCCATCAATTG
AATTTTGTTGAACCAAATAAAGGCAGTAAACTTTTCTTTCCAGCCACAAAAGCTTCCATG
TGTACACACCACAACCCAAAGAATAAGCTGAAAATCTTCAAAAGGCACTGCTTATTGAGT
AGAGAAATGAGTTTTCATGGACGGGCCTTCAACAATAAACTATTGCATTTCTTGAATTTT
TCTGTCATTGTTTGACTTGCCTGCTAACTAGCTGGGCTGTCTCGTAAAGTCTCTAGACTG
ATATGGTCACGATGTCCTACATGCGAGGATTCTATGTTTATGGACTGATTATCATTGTTC
CAAAAAGCTCTTTCCGATTAGTTTCATAGTTTTATTTTTTC

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DS 



AS 1 2

CO CL6911Contig1 1569 2 4 U
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CGGGCGAAGATGTCGAGAGATATCGAGGATGAGATCAGAGACGAGAAGAATCCTCGCCCA
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AATAAGTACCAGATACAGATTCCTCTACCTCCTAAAATCGATCCTAGTGTCACCATGATG
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CGGTCCAAAAAAGCTTGCATTGTGTTCTTCGATGAAGTTGATGCCATTGGTGGTGCAAGA
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CAGCTTGATGGGTTTGACGCTCGTGGTAACATCAAAGTTCTTATGGCAACCAACAGGCCT
GACACGCCAGACCCTGTTTTTTTACGTCCTGGACGTCTTGACCGTAAGGTTGAGTTTGGT
TTGCCTGATCTGGAGAGCAGGACCCAGATCTTCAAGATTCACACAAGAACCATGAACTGC
GAGAGAGACATCCGTTTTGAGCTCCTTGCTCGCCTCTGCCCAAACTCAACTGGAGCTGAT
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TTTCACTCC


BQ
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AF RS1A437TF U 1
AF RS1A437JQ C 722
BS 1 805 RS1A437TF
BS 806 806 RS1A437JQ
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BS 849 1569 RS1A437JQ

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GGGTTTCCTCTCCGGCAAGACAACTTGTCTGAACTCAATTCGCATTTCTCCGATCGAAAT
CGGGCGAAGATGTCGAGAGATATCGAGGATGAGATCAGAGACGAGAAGAATCCTCGCCCA
CTTGACGAAGATGATATCGCTCTCCTCAAGACTTATGGGTTAGGGCCTTACTCTGCACCG
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ATCAAGGAGTCTGATACTGGTTTAGCTCCTCCCAGTCAATGGGATCTCGTCTCTGATAAA
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AACACTGAAGACGCCAAGTACGTCATTAATGTCAAACAGATTGCCAAGTTTGTCGTTGGC
CTTGGAGACAAAGTTTCTCCTACTGATATCGAAGAAGGCATGCGAGTGGGAGTTGATAGG
AATAAGTACCAGATACAGATTCCTCTACCTCCTAAAATCGATCCTAGTGTCACCATGATG
ACTGTTGAAGAGAAACCTGATGTTACTTACAATGATGTTGGTGGCTGCAAGGAGCAGATT
GAGAAGATGCGAGAGGTCGTAGAACTGCCAATGCTTCACCCAGAGAAGTTTGTGAAACTT
GGAATAGATCCTCCCAAGGGAGTTCTCTGCTACGGTCCTCCTGGTACCGGTAAAACCCTT
TTGGCTAGAGCTGTTGCCAACAGAACCGATGCTTGCTTTATCAGAGTCATCGGCAGTGAG
CTTGTTCAGAAGTATGTGGGTGAAG*AGCTAGGATGGTTCGTGAACTGTTTCAGATGGCA
CGGTCCAA

QA 1 848 1 848
DS 

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TTGTTCAGAAGTATGTGGGTGAAGGAGCTAGGATGGTTCGTGAACTGTTTCAGATGGCAC
GGTCCAAAAAAGCTTGCATTGTGTTCTTCGATGAAGTTGATGCCATTGGTGGTGCAAGAT
TTGATGACGGTGTAGGAGGTGACAACGAAGTCCAGCGTACTATGCTTGAGATTGTGAATC
AGCTTGATGGGTTTGACGCTCGTGGTAACATCAAAGTTCTTATGGCAACCAACAGGCCTG
ACACGCCAGACCCTGTTTTTTTACGTCCTGGACGTCTTGACCGTAAGGTTGAGTTTGGTT
TGCCTGATCTGGAGAGCAGGACCCAGATCTTCAAGATTCACACAAGAACCATGAACTGCG
AGAGAGACATCCGTTTTGAGCTCCTTGCTCGCCTCTGCCCAAACTCAACTGGAGCTGATA
TCAGAAGTGTGTGCACTGAAGCTGGAATGTATGCAATCAGAGCTAGGAGAAAGACTGTGA
CTGAGAAAGACTTTTTGGATGCAGTGAACAAAGTCATCAAAGGTTATCAGAAGTTCAGTG
CAACCCCCAAGTATATGGTCTACAACTAATAAGAAAGACATGACGGTTGTTTCAATTTCT
TTACATGTCCCAGACTCAGAAACTCTCTTTGTCCTTTGTATTTTTCCGCAGCACGTGCGT
TTATTTATTCCAGTGACTTGTTTTCTTCTTTAGTGCCTGACATTTTTACTCTTTATGAAT
TTGGTAACCATTCTGAACTTCGTATATTTGTTTGTTTGTTTGTTGCAATGGTATATTTGT
TTCACTCC

QA 1 848 1 848
DS 



AS 1 2

CO CL6912Contig1 408 2 2 U
GGTGCGAATGGGAAGAGTTCAGGAGAATGAGATCGGCTATGAAGAGTTTGAGTCTCAAGA
AAGTTCCTAGGGTACAGCTCGGTCGAGATTTATCGAAAAGTTTACAGATTTGGAGCTGGG
GAAGAACCCTGTTTCGGAACAGAGGAGGTCTACAGGTTTCTTAGGAATCTTCTTCAGCAC
GTAACTCTCGAAACAGATTATTTACAGATCAACATGTTATAAGATTCTTAGCAACATTGA
CGAGTTAAAGAGCCATGTAGGAAACAGAGAAGCAGATTTTGTAATAACCAACCACTCTAA
CATATAACACAAATCATGTAATTCTTTTTTTTCTTTAGCCCTTGTAAGAGAGGACAAGAT
ATACAAAGGGAAACCAATACCCACAAACATGGGATGATTGAGAATAAT


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1A789JQ C 1
AF RS1A789TF U 5
BS 1 4 RS1A789JQ
BS 5 408 RS1A789TF

RD RS1A789JQ 408 0 0
GGTGCGAATGGGAAGAGTTCAGGAGAATGAGATCGGCTATGAAGAGTTTGAGTCTCAAGA
AAGTTCCT*GGGTACAGCTCGGTCGAGATTTATCGAAAAGTTTACAGATTTGGAGCTGGG
GAAGAACCCTGTTTCGGAACAGAGGAGGTCTACAGGTTTCTTAGGAATCTTCTTCAGCAC
GTAACTCTCGAAACAGATTATTTACAGATCAACATGTTATAAGATTCTTAGCAACATTGA
CGAGTTAAAGAGCCATGTAGGAAACAGAGAAGCAGATTTTGTAATAACCAACCACTCTAA
CATATAACACAAATCATGTAATTCTTTTTTTTCTTTAGCCCTTGTAAGAGAGGACAAGAT
ATACAAAGGGAAACCAATACCCACAAACATGGGATGATTGAGAATAAT

QA 1 408 1 408
DS 

RD RS1A789TF 404 0 0
CGAATGGGAAGAGTTCAGGAGAATGAGATCGGCTATGAAGAGTTTGAGTCTCAAGAAAGT
TCCTAGGGTACAGCTCGGTCGAGATTTATCGAAAAGTTTACAGATTTGGAGCTGGGGAAG
AACCCTGTTTCGGAACAGAGGAGGTCTACAGGTTTCTTAGGAATCTTCTTCAGCACGTAA
CTCTCGAAACAGATTATTTACAGATCAACATGTTATAAGATTCTTAGCAACATTGACGAG
TTAAAGAGCCATGTAGGAAACAGAGAAGCAGATTTTGTAATAACCAACCACTCTAACATA
TAACACAAATCATGTAATTCTTTTTTTTCTTTAGCCCTTGTAAGAGAGGACAAGATATAC
AAAGGGAAACCAATACCCACAAACATGGGATGATTGAGAATAAT

QA 1 404 1 404
DS 



AS 1 2

CO CL6913Contig1 663 2 2 U
TTTTGGGGAAAGTAACATAACTTTATATAAATAAATAAAATGGAAATATTTTAGGTAATC
CTACCCAAATGCCATTGAAATATCAAAACCATCTCTGGAATCACAAAAGCTCAGAATAAA
TAACCAAAGAAGCAAAAAGAAAAAAAAACTATCACTCTTCAAAAAGTGTGTGCTTCCCAC
TCCCTTGCTCTCTTTTTTTCTTTTGCGCATAACAATCTCTCACTCTCTCTTCTGACGTTT
TGACTCTGGAGATGACGGTGGTTCAGGTCTCCGACTTGGTTCCCCTCTCTCTGCACCTTC
CCCCTCCTGTCTTGAAGAGGAGGCCTGTCTATTGCTATTGCTGGCTCTGCCTGCAGTTTC
AACTGAGCTTGAGGAAGGGACGTTTTGAGATATGAATGGCATGATTTGCTGAAGAACACT
TGATATGAAATTCCCTTCATCCATCCCTGTTGCTGGCTCTACTTGTGCAGCATTTGAAAC
TGCTTCGTTTGTTTCCGTTGATGCTGTGGCAGATGAATATACTGCCACCTGAGGCTCTCC
TCGACTAAATACGGGTCTCATAACCTGATGGATTCTGTTTCTGAACTCAGCGAAACCTCG
AGCGCCTGGAGCAGAATTGCTATCACCTTCTCTTCCTGGAGTACTGGCACTCTGTGGCTG
CCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RS1BE06TF C 1
AF RS1BE06JQ U 6
BS 1 5 RS1BE06TF
BS 6 663 RS1BE06JQ

RD RS1BE06TF 663 0 0
TTTTGGGGAAAGTAACATAACTTTATATAAATAAATAAAATGGAAATATTTTAGGTAATC
CTACCCAAATGCCATTGAAATATCAAAACCATCTCTGGAATCACAAAAGCTCAGAATAAA
TAACCAAAGAAGCAAAAAGAAAAAAAAACTATCACTCTTCAAAAAGTGTGTGCTTCCCAC
TCCCTTGCTCTCTTTTTTTCTTTTGCGCATAACAATCTCTCACTCTCTCTTCTGACGTTT
TGACTCTGGAGATGACGGTGGTTCAGGTCTCCGACTTGGTTCCCCTCTCTCTGCACCTTC
CCCCTCCTGTCTTGAAGAGGAGGCCTGTCTATTGCTATTGCTGGCTCTGCCTGCAGTTTC
AACTGAGCTTGAGGAAGGGACGTTTTGAGATATGAATGGCATGATTTGCTGAAGAACACT
TGATATGAAATTCCCTTCATCCATCCCTGTTGCTGGCTCTACTTGTGCAGCATTTGAAAC
TGCTTCGTTTGTTTCCGTTGATGCTGTGGCAGATGAATATACTGCCACCTGAGGCTCTCC
TCGACTAGATACGGGTCTCATAACCTGATGGATTCTGTTTCTGAACTCAGCGAAACCTCG
AGCGCCTGGAGCAGAATTGCTATCACCTTCTCTTCCTGGAGTACTGGCACTCTGTGGCTG
CCC

QA 1 663 1 663
DS 

RD RS1BE06JQ 658 0 0
GGGAAAGTAACATAACTTTATATAAATAAATAAAATGGAAATATTTTAGGTAATCCTACC
CAAATGCCATTGAAATATCAAAACCATCTCTGGAATCACAAAAGCTCAGAATAAATAACC
AAAGAAGCAAAAAGAAAAAAAAACTATCACTCTTCAAAAAGTGTGTGCTTCCCACTCCCT
TGCTCTCTTTTTTTCTTTTGCGCATAACAATCTCTCACTCTCTCTTCTGACGTTTTGACT
CTGGAGATGACGGTGGTTCAGGTCTCCGACTTGGTTCCCCTCTCTCTGCACCTTCCCCCT
CCTGTCTTGAAGAGGAGGCCTGTCTATTGCTATTGCTGGCTCTGCCTGCAGTTTCAACTG
AGCTTGAGGAAGGGACGTTTTGAGATATGAATGGCATGATTTGCTGAAGAACACTTGATA
TGAAATTCCCTTCATCCATCCCTGTTGCTGGCTCTACTTGTGCAGCATTTGAAACTGCTT
CGTTTGTTTCCGTTGATGCTGTGGCAGATGAATATACTGCCACCTGAGGCTCTCCTCGAC
TAAATACGGGTCTCATAACCTGATGGATTCTGTTTCTGAACTCAGCGAAACCTCGAGCGC
CTGGAGCAGAATTGCTATCACCTTCTCTTCCTGGAGTACTGGCACTCTGTGGCTGCCC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

CO CL6914Contig1 716 2 2 U
GTAACACAGATATATCTGTAAATATTACACCAAAAAGATAGATGTGTAAAATATATAGAG
ATAATAATAGTTAACTATGAGTATCTGAAAATAATGAAAATCTAGAACTTTTATTCCAGT
ATATTTTGATAACTTGGATGAGATTAATTAGGTTCCTCTTAATTAACGACTTTTTAGTTT
CACTAATTGAGTAGATTTTAGCTATTACTGTTTGTTCATGTCACTCCATAAATTCACTTA
CCATCACTCCCAAGTTTGCTCCGTAACCAAGAAAATAGCCAAAGGGAATGCCAAAAATGA
AATAACAAGCCAAGTTGATATAAGCCACTGTGCGTTGCCAACCACCTCCAATAGCCACAC
CTAAAAAAAACATGAATAAACCGAAATGATTATAATTTTGTGATACCTATGGTTAGGTTT
ACATGAAAGACTTAGATTTTTTTTTTGTACCGGTAAGAACTTGCTGGACGCCGTTGAGAA
CCATGGTTATACCAAGAAGATAAGCCAGCTTAGACACAGCACGCTGAAGTACTTGGCTGT
TTGTAAACATTATGGCAAAATGGTCTCTGGCTATGATGACAGCCACCATAAAGACAAGAC
CGATGAGGAGAGACTCGAACAGTGCGACATAGACAGAGTATTTCGCTGCTCGTGGACGCC
CTTGCCAAGCTCAGTGCCGACAATCATACTAGTAAAGTGGACAAGTTTGTTATAAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GN33TF U 1
AF RS1H087TF U 1
BS 1 654 RS1GN33TF
BS 655 716 RS1H087TF

RD RS1GN33TF 654 0 0
GTAACACAGATATATCTGTAAATATTACACCAAAAAGATAGATGTGTAAAATATATAGAG
ATAATAATAGTTAACTATGAGTATCTGAAAATAATGAAAATCTAGAACTTTTATTCCAGT
ATATTTTGATAACTTGGATGAGATTAATTAGGTTCCTCTTAATTAACGACTTTTTAGTTT
CACTAATTGAGTAGATTTTAGCTATTACTGTTTGTTCATGTCACTCCATAAATTCACTTA
CCATCACTCCCAAGTTTGCTCCGTAACCAAGAAAATAGCCAAAGGGAATGCCAAAAATGA
AATAACAAGCCAAGTTGATATAAGCCACTGTGCGTTGCCAACCACCTCCAATAGCCACAC
CTAAAAAAAACATGAATAAACCGAAATGATTATAATTTTGTGATACCTATGGTTAGGTTT
ACATGAAAGACTTAGATTTTTTTTTTGTACCGGTAAGAACTTGCTGGACGCCGTTGAGAA
CCATGGTTATACCAAGAAGATAAGCCAGCTTAGACACAGCACGCTGAAGTACTTGGCTGT
TTGTAAACATTATGGCAAAATGGTCTCTGGCTATGATGACAGCCACCATAAAGACAAGAC
CGATGAGGAGAGACTCGAACAGTGCGACATAGACAGAGTATTTCGCTGCTCGTG

QA 1 654 1 654
DS 

RD RS1H087TF 716 0 0
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ATAATAATAGTTAACTATGAGTATCTGAAAATAATGAAAATCTAGAACTTTTATTCCAGT
ATATTTTGATAACTTGGATGAGATTAATTAGGTTCCTCTTAATTAACGACTTTTTAGTTT
CACTAATTGAGTAGATTTTAGCTATTACTGTTTGTTCATGTCACTCCATAAATTCACTTA
CCATCACTCCCAAGTTTGCTCCGTAACCAAGAAAATAGCCAAAGGGAATGCCAAAAATGA
AATAACAAGCCAAGTTGATATAAGCCACTGTGCGTTGCCAACCACCTCCAATAGCCACAC
CTAAAAAAAACATGAATAAACCGAAATGATTATAATTTTGTGATACCTATGGTTAGGTTT
ACATGAAAGACTTAGATTTTTTTTTTGTACCGGTAAGAACTTGCTGGACGCCGTTGAGAA
CCATGGTTATACCAAGAAGATAAGCCAGCTTAGACACAGCACGCTGAAGTACTTGGCTGT
TTGTAAACATTATGGCAAAATGGTCTCTGGCTATGATGACAGCCACCATAAAGACAAGAC
CGATGAGGAGAGACTCGAACAGTGCGACATAGACAGAGTATTTCGCTGCTCGTGGACGCC
CTTGCCAAGCTCAGTGCCGACAATCATACTAGTAAAGTGGACAAGTTTGTTATAAG

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

CO CL6915Contig1 783 2 4 U
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AATGATTCACTAAACCCTCTACTTCTGTGGATCCATAGTTAAAGAACAATGAGTGTTACA
AGCTTTAGCAATAGTGCTAACTCCACAGCACCAGCATCTGTGTATTCAGTACGGAAACTC
CCTTTTCTATCCGTGTCTGAATCGTTGCCTTGCCCGAAGAGTTCTAGAAAACCACCGTCT
CCTCCTTTAAGATGTAGATGGAGATCAAGATCGGATTTGCTTTGTGGAAAATTTACTGTT
CATGCATCAAATGCTGGTGTTGGATCTGGGAGTGAGGAGGATGGATCTCAAAGTAGTTCT
CTTGATCAGTCTTCACAAGAAAGCTTAAAACCTCAAGGGCCATTCCCTTACTCTTTATCG
ATAGCACTTGTACTACTGAGTTGCGGTTTGGTATTCTCTCTAATCACTTTTGTCAAGGGA
GGACCATCCTCAGTTCTAGCAGCAGTAGCAAAATCAGGCTTCACCGCAGCCTTCTCACTG
ATCTTCGTTTCTGAGATTGGTGACAAGACATTTTTTATTGCTGCTTTGTTGGCTATGCAA
TACGAGAAAACATTGGTCCTTTTAGGTTCAATGGGAGCTTTATCGTTGATGACTGTCTTA
TCGGTTGTTATCGGGAAAGTTTTTCAATCCGTGCCTGCTCAGTTCCAGACAACTGTACCG
ATAGGAGAATATGCTGCAATTGCGCTTCTCATGTTCTTTGGATTGAAATCCATCAAGGAT
GCA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1F522TF U 1
AF RS1FE09TF U 1
BS 1 52 RS1F522TF
BS 53 53 RS1FE09TF
BS 54 671 RS1F522TF
BS 672 783 RS1FE09TF

RD RS1F522TF 671 0 0
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CCTCCTTTAAGATGTAGATGGAGATCAAGATCGGATTTGCTTTGTGGAAAATTTACTGTT
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TACGAGAAAACATTGGTCCTTTTAGGTTCAATGGGAGCTTTATCGTTGATGACTGTCTTA
TCGGTTGTTAT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1FE09TF 783 0 0
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AATGATTCACTAAACC*TCTACTTCTGTGGATCCATAGTTAAAGAACAATGAGTGTTACA
AGCTTTAGCAATAGTGCTAACTCCACAGCATCAGCATCTGTGTATTCAGTACGGAAACTC
CCTTTTCTATCCGTGTCTGAATCGTTGCCTTGCCCGAAGAGTTCTAGAAAACCACCGTCT
CCTCCTTTAAGATGTAGATGGAGATCAAGATCGGATTTGCTTTGTGGAAAATTTACTGTT
CATGCATCAAATGCTGGTGTTGGATCTGGGAGTGAGGAGGATGGATCTCAAAGTAGTTCT
CTTGATCAGTCTTCACAAGAAAGCTTAAAACCTCAAGGGCCATTCCCTTACTCTTTATCG
ATAGCACTTGTACTACTGAGTTGCGGTTTGGTATTCTCTCTAATCACTTTTGTCAAGGGA
GGACCATCCTCAGTTCTAGCAGCAGTAGCAAAATCAGGCTTCACCGCAGCCTTCTCACTG
ATCTTCGTTTCTGAGATTGGTGACAAGACATTTTTTATTGCTGCTTTTTTGGCTATGCAA
TACGAGAAAACATTGGTCCTTTTAGGTTCAATGGGAGCTTTATCGTTGATGACTGTCTTA
TCGGTTGTTATCGGGAAAGTTTTTCAATCCGTGCCTGCTCAGTTCCAGACAACTGTACCG
ATAGGAGAATATGCTGCAATTGCGCTTCTCATGTTCTTTGGATTGAAATCCATCAAGGAT
GCA

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 2

CO CL6916Contig1 1004 2 2 U
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GCACTTGATAAAGATTGTAGCGGATCGCTGAGCAAACAAGAACTTAAAGAATACGCGGAT
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GAGAACCTTCTCCAAGAAGAAGAAGAACCACCTGAGGAAGAGTCTCAGTGATGTTATTTT
CCAGTGTTGTATCTAAACATTAAGCCACGTGGGTTCAGGGGCGGATCTATTAAACCAAGT
TAGGGAGTCTGCTGATTTTTTTTTAATTTCTTCTTTAACTACGTACAAGTTCAGTCATTC
CCTATTAATCATGTATTTAACCACTTTCCACGTTCGATTTCACATTTCTTAAAAAAACTC
TATTTGTTGCATTAATGCACACATTGAGTATATTAACCTTTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AR84TFB U 1
AF RS1AR84JQ C 88
BS 1 741 RS1AR84TFB
BS 742 1004 RS1AR84JQ

RD RS1AR84TFB 741 0 0
GTGAGGGATATGCCGGATGCTTTTACTAACATGTATTGCCGTATAGCTTCACAAAAGTTT
TTCTTCTTCTGTGATCCCCATAGGCGAGGAAAAGCATGCATTAAGAAGATACTGCTCAGC
AACTGTCTGCAGGAACTAATGGAATTGCATCAGGAAAGCGAGAAGGAAGTCACAGACACA
GAGCAGGCTGAAAATTGGTTCTCTTTGACTTCAGCTCAACGTATATGTGATATGTTTCTT
GCACTTGATAAAGATTGTAGCGGATCGCTGAGCAAACAAGAACTTAAAGAATACGCGGAT
GGGACCCTGACGGAGATTTTCATCGAAAGAGTGTTTGATGAGCATGTCCGCCGTGGCAAA
AGCGGCTCACGCAATTCCAGGGAAATGGACTTTGACAGCTTCCTAGATTTCGTTCTTGCG
TTGGAGAACAAAGACACACCAGAGGGCTTGACATACTTATTCCGCTGTCTTGATCTCCAA
GGGAGAGGCTTTCTCACCACTGCTGATATTCACTCTCTTTTCAGAGATGTGCACCAGAAA
TGGATAGAAGGAGGGAACTACGAGCTGTGCATAGAGGACGTTAGGGACGAGATCTGGGAC
ATGGTGAAACCGTCTGATCCATTGAAGATCACTCTGGATGATCTGTTGGGATGTAAACAA
GGGGGAACCGTCGCGAGCATGCTGATAGATGTTCGTGGCTTCTGGGCTCATGACAACCGT
GAGAACCTTCTCCAAGAAGAA

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1AR84JQ 917 0 0
GGAAAAGCATGCATTAAGAAGATACTGCTCAGCAACTGTCTGCAGGAACTAATGGAATTG
CATCAGGAAAGCGAGAAGGAAGTCACAGACACAGAGCAGGCTGAAAATTGGTTCTCTTTG
ACTTCAGCTCAACGTATATGTGATATGTTTCTTGCACTTGATAAAGATTGTAGCGGATCG
CTGAGCAAACAAGAACTTAAAGAATACGCGGATGGGACCCTGACGGAGATTTTCATCGAA
AGAGTGTTTGATGAGCATGTCCGCCGTGGCAAAAGCGGCTCACGCAATTCCAGGGAAATG
GACTTTGACAGCTTCCTAGATTTCGTTCTTGCGTTGGAGAACAAAGACACACCAGAGGGC
TTGACATACTTATTCCGCTGTCTTGATCTCCAAGGGAGAGGCTTTCTCACCACTGCTGAT
ATTCACTCTCTTTTCAGAGATGTGCACCAGAAATGGATAGAAGGAGGGAACTACGAGCTG
TGCATAGAGGACGTTAGGGACGAGATCTGGGACATGGTGAAACCGTCTGATCCATTGAAG
ATCACTCTGGATGATCTGTTGGGATGTAAACAAGGGGGAACCGTCGCGAGCATGCTGATA
GATGTTCGTGGCTTCTGGGCTCATGACAACCGTGAGAACCTTCTCCAAGAAGAAGAAGAA
CCACCTGAGGAAGAGTCTCAGTGATGTTATTTTCCAGTGTTGTATCTAAACATTAAGCCA
CGTGGGTTCAGGGGCGGATCTATTAAACCAAGTTAGGGAGTCTGCTGATTTTTTTTTAAT
TTCTTCTTTAACTACGTACAAGTTCAGTCATTCCCTATTAATCATGTATTTAACCACTTT
CCACGTTCGATTTCACATTTCTTAAAAAAACTCTATTTGTTGCATTAATGCACACATTGA
GTATATTAACCTTTTGT

QA 1 917 1 917
DS 



AS 1 2

CO CL6917Contig1 743 2 8 U
GGGAGAGTCAAGAGAGACTAAGGAAGAAGAAGAAGAAGATCGGAGATATCGAAGCTTCTG
ACTTTCTCTCACAACCAAGAATCAAATCAATAGTGAGAGATTTAGCTATTGGATTGGATA
TGCCGAGCTTAGCTGCTTCGTTGGTCACTGGGGTCGGCCTGAGACCCGAACGGTCGCTTC
TTTACCAGCCCACTTCCTTTCCTTCCTCGAGAAGGAACACTCACGGTGCTGTTAAGGCCT
CTGCTCGGGTCGATAAGTTCTCAAAAACCGATATCATTGTTTCTCCATCGATCCTATCTG
CCAACTTCTCCAAATTGGGCGAGCAGGTAAAAGCTGTTGAGTTAGCAGGTTGTGATTGGA
TTCATGTTGATGTGATGGATGGTCGTTTTGTTCCCAACATTACTATTGGGCCGCTTGTGG
TTGACGCTCTGCGCCCTGTTACAGATCTTCCGTTGGATGTTCATCTTATGATAGTGGAAC
CTGAGCAGAGAGTGCCTGATTTCATCAAAGCAGGCGCAGATATAGTTAGTGTACATTGTG
AGCAGTCCTCTACCATCCATTTACACCGTACAGTCAACCAAATTAAAAGCTTGGGAGCTA
AAGCTGGAGTTGTGCTTAATCCTGGCACTCCATTGACTGCAATCGAATATGTATTAGACT
GTGTTGATCTGATCTTGATAATGTCTGTGGACCTGGGTTTGGTGGGCAGAGCTTTATCGA
AAGCCAAGTGAAGAAATCGCAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BU82TF U 1
AF RS1DY86TF U 18
BS 1 76 RS1BU82TF
BS 77 77 RS1DY86TF
BS 78 79 RS1BU82TF
BS 80 80 RS1DY86TF
BS 81 394 RS1BU82TF
BS 395 395 RS1DY86TF
BS 396 689 RS1BU82TF
BS 690 743 RS1DY86TF

RD RS1BU82TF 690 0 0
GGGAGAGTCAAGAGAGACTAAGGAAGAAGAAGAAGAAGATCGGAGATATCGAAGCTTCTG
ACTTTCTCTCACAACCCAGTATCAAATCAATAGTGAGAGATTTAGCTATTGGATTGGATA
TGCCGAGCTTAGCTGCTTCGTTGGTCACTGGGGTCGGCCTGAGACCCGAACGGTCGCTTC
TTTACCAGCCCACTTCCTTTCCTTCCTCGAGAAGGAACACTCACGGTGCTGTTAAGGCCT
CTGCTCGGGTCGATAAGTTCTCAAAAACCGATATCATTGTTTCTCCATCGATCCTATCTG
CCAACTTCTCCAAATTGGGCGAGCAGGTAAAAGCTGTTGAGTTAGCAGGTTGTGATTGGA
TTCATGTTGATGTGATGGATGGTCGTTTTGTTCCTAACATTACTATTGGGCCGCTTGTGG
TTGACGCTCTGCGCCCTGTTACAGATCTTCCGTTGGATGTTCATCTTATGATAGTGGAAC
CTGAGCAGAGAGTGCCTGATTTCATCAAAGCAGGCGCAGATATAGTTAGTGTACATTGTG
AGCAGTCCTCTACCATCCATTTACACCGTACAGTCAACCAAATTAAAAGCTTGGGAGCTA
AAGCTGGAGTTGTGCTTAATCCTGGCACTCCATTGACTGCAATCGAATATGTATTAGACT
GTGTTGATCTGATCTTGATAATGTCTGTG
A

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1DY86TF 726 0 0
GG
AAGGAAGAAGAAGAAGAAGATCGGAGATATCGAAGCTTCTGACTTTCTCTCACAACCAAG
AATCAAATCAATAGTGAGAGATTTAGCTATTGGATTGGATATGCCGAGCTTAGCTGCTTC
GTTGGTCACTGGGGTCGGCCTGAGACCCGAACGGTCGCTTCTTTACCAGCCCACTTCCTT
TCCTTCCTCGAGAAGGAACACTCACGGTGCTGTTAAGGCCTCTGCTCGGGTCGATAAGTT
CTCAAAAACCGATATCATTGTTTCTCCATCGATCCTATCTGCCAACTTCTCCAAATTGGG
CGAGCAGGTAAAAGCTGTTGAGTTAGCAGGTTGTGATTGGATTCATGTTGATGTGATGGA
TGGTCGTTTTGTTCCCAACATTACTATTGGGCCGCTTGTGGTTGACGCTCTGCGCCCTGT
TACAGATCTTCCGTTGGATGTTCATCTTATGATAGTGGAACCTGAGCAGAGAGTGCCTGA
TTTCATCAAAGCAGGCTCAGATATAGTTAGTGTACATTGTGAGCAGTCCTCTACCATCCA
TTTACACCGTACAGTCAACCAAATTAAAAGCTTGGGAGCTAAAGCTGGAGTTGTGCTTAA
TCCTGGCACTCCATTGACTGCAATCGAATATGTATTAGACTGTGTTGATCTGATCTTGAT
AATGTCTGTGGACCTGGGTTTGGTGGGCAGAGCTTTATCGAAAGCCAAGTGAAGAAATCG
CAGA

QA 3 726 3 726
DS 



AS 1 2

CO CL6918Contig1 1048 2 2 U
TTCCATGTTCCATTTCGCCCATTCTAAGCTATAGTTTATTTCATGATTTGAAATATAAGA
AAACATAAGTTTTTTTTTTGTAAACTACCAAGAAAGTATAAGTTTGGTAAAAAGACATTT
TATTTTTGCGTGTGAAGTCTATAAAGTAGTAATGGGTGGTCGTAAACCATGTTGTGATGA
GGTTGGATTGAGAAAGGGGCCATGGACAGCGGACGAAGATGGGAAACTAGTTGATTTCTT
AAGGACACGTGGAGGAAGCGGTGGATGGTGCTGGAGAGATGTGCCAAAGCTGGCGGGGCT
AAGGCGGTGCGGCAAAAGTTGCCGTCTCCGGTGGACTAAATATCTGCGGCCAGATCTCAA
GAGAGGTCTTTTTAGTGAAGAGGAAATTCAACTAGTCATTGATCTTCATTCGCAACTTGG
CAATAGATGGTCGAAGATTGCAGCAGAACTACCGGGAAGAACAGATAACGATATAAAAAA
TTATTGGAACACTCATATAAAGAGGAAGCTCATAAGAATGGGTATTGATCCAAACACGCA
TCATCCGTTTGACCAACAGAAAGTCAACAGCGAAAAGGAGGAGACGACACCGGTCAACGG
TCGAAACCCTCGGGACGAGGCAGAGGTACCAGTGGGTTCGCAGAATGACACGTCTGCAGG
AAATCCAAACCACTTAGCTGACGTGGACGGTGACAATATTCAACCGTGGAGCTTTTTAAT
GGAGAATGACGGAGGAGGATGCTCCTCCGCGGGAGAGCTGACCATGCTATTGTCCGGCGA
CATTACGTCATCATGTTCGTCATCGTCATCACTGTGGTTGAAGTATGGAGAGTTTGGATA
CGAAGATTTAGAACTTGGATGTTTCGACGACTAGAGAGAGAATAAAATACATGCTAGCTT
GGTTATGTTTAGGTTCATTTCACTTAATTCTATACACATACGTGGATTAATGTTGTTGGA
CCAGTTACTTATAAGTTATAACGAATAACATCATCAAGAGCTAGTATTTTGTATTTTCTG
ATTAATAATAAACGTTCTTTGCGTCACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G881TF U 1
AF RS1G881JQ C 332
BS 1 528 RS1G881TF
BS 529 1048 RS1G881JQ

RD RS1G881TF 528 0 0
TTCCATGTTCCATTTCGCCCATTCTAAGCTATAGTTTATTTCATGATTTGAAATATAAGA
AAACATAAGTTTTTTTTTTGTAAACTACCAAGAAAGTATAAGTTTGGTAAAAAGACATTT
TATTTTTGCGTGTGAAGTCTATAAAGTAGTAATGGGTGGTCGTAAACCATGTTGTGATGA
GGTTGGATTGAGAAAGGGGCCATGGACAGCGGACGAAGATGGGAAACTAGTTGATTTCTT
AAGGACACGTGGAGGAAGCGGTGGATGGTGCTGGAGAGATGTGCCAAAGCTGGCGGGGCT
AAGGCGGTGCGGCAAAAGTTGCCGTCTCCGGTGGACTAAATATCTGCGGCCAGATCTCAA
GAGAGGTCTTTTTAGTGAAGAGGAAATTCAACTAGTCATTGATCTTCATTCGCAACTTGG
CAATAGATGGTCGAAGATTGCAGCAGAACTACCGGGAAGAACAGATAACGATATAAAAAA
TTATTGGAACACTCATATAAAGAGGAAGCTCATAAGAATGGGTATTGA

QA 1 528 1 528
DS 

RD RS1G881JQ 717 0 0
TGGACTAAATATCTGCGGCCAGATCTCAAGAGAGGTCTTTTTAGTGAAGAGGAAATTCAA
CTAGTCATTGATCTTCATTCGCAACTTGGCAATAGATGGTCGAAGATTGCAGCAGAACTA
CCGGGAAGAACAGATAACGATATAAAAAATTATTGGAACACTCATATAAAGAGGAAGCTC
ATAAGAATGGGTATTGATCCAAACACGCATCATCCGTTTGACCAACAGAAAGTCAACAGC
GAAAAGGAGGAGACGACACCGGTCAACGGTCGAAACCCTCGGGACGAGGCAGAGGTACCA
GTGGGTTCGCAGAATGACACGTCTGCAGGAAATCCAAACCACTTAGCTGACGTGGACGGT
GACAATATTCAACCGTGGAGCTTTTTAATGGAGAATGACGGAGGAGGATGCTCCTCCGCG
GGAGAGCTGACCATGCTATTGTCCGGCGACATTACGTCATCATGTTCGTCATCGTCATCA
CTGTGGTTGAAGTATGGAGAGTTTGGATACGAAGATTTAGAACTTGGATGTTTCGACGAC
TAGAGAGAGAATAAAATACATGCTAGCTTGGTTATGTTTAGGTTCATTTCACTTAATTCT
ATACACATACGTGGATTAATGTTGTTGGACCAGTTACTTATAAGTTATAACGAATAACAT
CATCAAGAGCTAGTATTTTGTATTTTCTGATTAATAATAAACGTTCTTTGCGTCACG

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 2

CO CL6919Contig1 775 2 2 U
GCAAAAACATCTTTTGCCCACAGATGATCACACGGATTTACAGTAACATTTTGCCAGAGG
TTGGTAAAGATTATTCTTAAATAAGATGTTAAAAAGAGATTATTCCTTTGAACTAAAAAC
GAATACTCAATTGTTTACAGATCCTATTGATTTCACAGATACAAAGAGACTATACTCCAG
AGACTGATTCATGTCTTTCAGGAGGAATTATTGCACACATGACATTACTTACTAGGTCAT
TGACTCAGGCAAACTCAGCTCCAGAAAGTAAAGACTTGCAGACATACAAGCCATGCCGAC
AAACACAGCTTTTACAGCTTGTTTCTGTCCAGCATAATCAAATGCCAAAGGGAGCATTTC
GTGCAAAGTTAGGAATGCCATGATTCCACCAACTGCTCCCAACAATCCTTCAAGGATTTC
TAGACTCAAGCTGCTCGGGAATAGATAAGCCACGATAATAACACCTAGAGGCTCAGCTAA
TCCAGAGAGTGTTGCCAATTTGAATGCCTGCCATTTGCTCTCTGTTGCAAAATATATAGG
AAGTGCAACCGCAACACCCTCGGGAATGTTATGTAAAGCGATTGCCAAAGCCAGATTAAC
ACCAACTCGCATGCCCTTAATTGATCCGAGAAATACAGCCATCCCTTCTGGAAAATTGTG
CAAGCTTATTCCAATAGCTGTAACAATTCCACTGTATAAGACTTGGCGGCGATGCTTCTT
CGCCATATCCTTACCTCCCTCGTCTCCATTTTTCTTTCTTCTTTTCACATCAGTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G308JQ U 1
AF RS1GK21JQ U 91
BS 1 748 RS1G308JQ
BS 749 775 RS1GK21JQ

RD RS1G308JQ 748 0 0
GCAAAAACATCTTTTGCCCACAGATGATCACACGGATTTACAGTAACATTTTGCCAGAGG
TTGGTAAAGATTATTCTTAAATAAGATGTTAAAAAGAGATTATTCCTTTGAACTAAAAAC
GAATACTCAATTGTTTACAGATCCTATTGATTTCACAGATACAAAGAGACTATACTCCAG
AGACTGATTCATGTCTTTCAGGAGGAATTATTGCACACATGACATTACTTACTAGGTCAT
TGACTCAGGCAAACTCAGCTCCAGAAAGTAAAGACTTGCAGACATACAAGCCATGCCGAC
AAACACAGCTTTTACAGCTTGTTTCTGTCCAGCATAATCAAATGCCAAAGGGAGCATTTC
GTGCAAAGTTAGGAATGCCATGATTCCACCAACTGCTCCCAACAATCCTTCAAGGATTTC
TAGACTCAAGCTGCTCGGGAATAGATAAGCCACGATAATAACACCTAGAGGCTCAGCTAA
TCCAGAGAGTGTTGCCAATTTGAATGCCTGCCATTTGCTCTCTGTTGCAAAATATATAGG
AAGTGCAACCGCAACACCCTCGGGAATGTTATGTAAAGCGATTGCCAAAGCCAGATTAAC
ACCAACTCGCATGCCCTTAATTGATCCGAGAAATACAGCCATCCCTTCTGGAAAATTGTG
CAAGCTTATTCCAATAGCTGTAACAATTCCACTGTATAAGACTTGGCGGCGATGCTTCTT
CGCCATATCCTTACCTCCCTCGTCTCCA

QA 1 748 1 748
DS 

RD RS1GK21JQ 685 0 0
AAAAAGAGATTATTCCTTTGAACTAAAAACGAATACTCAATTGTTTACAGATCCTATTGA
TTTCACAGATACAAAGAGACTATACTCCAGAGACTGATTCATGTCTTTCAGGAGGAATTA
TTGCACACATGACATTACTTACTAGGTCATTGACTCAGGCAAACTCAGCTCCAGAAAGTA
AAGACTTGCAGACATACAAGCCATGCCGACAAACACAGCTTTTACAGCTTGTTTCTGTCC
AGCATAATCAAATGCCAAAGGGAGCATTTCGTGCAAAGTTAGGAATGCCATGATTCCACC
AACTGCTCCCAACAATCCTTCAAGGATTTCTGGACTCAAGCTGCTCGGGAATAGATAAGC
CACGATAATAACACCTAGAGGCTCAGCTAATCCAGAGAGTGTTGCCAATTTGAATGCCTG
CCATTTGCTCTCTGTTGCAAAATATATAGGAAGTGCAACCGCAACACCCTCGGGAATGTT
ATGTAAAGCGATTGCCAAAGCCAGATTAACACCAACTCGCATGCCCTTAATTGATCCGAG
AAATACAGCCATCCCTTCTGGAAAATTGTGCAAGCTTATTCCAATAGCTGTAACAATTCC
ACTGTATAAGACTTGGCGGCGATGCTTCTTCGCCATATCCTTACCTCCCTCGTCTCCATT
TTTCTTTCTTCTTTTCACATCAGTA

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL6920Contig1 836 2 2 U
GGAGGGTTTTGAGATCATAACATTCGCAGCAATCAATCTCTATTAGACCAGAGAGAGAGC
ACATCCTCCCTCCATTACCTCACTCCCAATGGCATCAAACACCACCGACAACTCCTCCTC
TCAGGCGCCTCACCAAAGACCCCGCCAAAGAAACGGACCTCCTCCTCCTCGCCGCCACGG
AAGAAACCCGCCGCCTCGTTATCACCAGACGACGGCCACGGCCACTGCTCAGGCTCCTCA
GGAGAAGAAGAAACCCGTCTTCGTCAAGGTCGATCATCTCAGAAACCGAACGCCGCCGCC
GCCGCCTCTTCCCACCTCCGTCCTAATCGGATCTCCGAGTGCCTCGTCGGAGACGAGACC
GCTTCCATCCTCTTCACCGCTCGCAACGATCAAGTGGACTTGATGAAGCCGGGAGCTACT
GTGAATCTCCGGAATGCGAAGATAGATATGTTCAAGGGGTCAATGAGGCTTACGGTTGAC
AAATGGGGTCGTATTGAGGTCACTGAGCCTGTTGAAATGACTGTTAAAGAGGATAACAAT
CTTTCTCTTGTGGAGTATGAGCTCGTCAATGTTGAGGAATGATCGATCAAGCGTCCACAA
TGGGGTTTTGTTTTGTGGTAATGTAACAGGCGAAATGAAATGAAGAAAAAGTTGGGGGGA
GATTATATGTTTTTATTATCTTATGACAGTTGCAAGTTTGGTACATTATGTTGATCTTTG
GGTTTTGGTGCACACAATATGTCATCATGGGTATGTATGTACTCTTTCAGTTTGTGACCT
CTTCTCTGTTTTTTGTATGGGTATTGAACAGAGAGGTTAATGAAAAAAACTTGGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CP01TF U 1
AF RS1CP01JQ C 80
BS 1 733 RS1CP01TF
BS 734 836 RS1CP01JQ

RD RS1CP01TF 733 0 0
GGAGGGTTTTGAGATCATAACATTCGCAGCAATCAATCTCTATTAGACCAGAGAGAGAGC
ACATCCTCCCTCCATTACCTCACTCCCAATGGCATCAAACACCACCGACAACTCCTCCTC
TCAGGCGCCTCACCAAAGACCCCGCCAAAGAAACGGACCTCCTCCTCCTCGCCGCCACGG
AAGAAACCCGCCGCCTCGTTATCACCAGACGACGGCCACGGCCACTGCTCAGGCTCCTCA
GGAGAAGAAGAAACCCGTCTTCGTCAAGGTCGATCATCTCAGAAACCGAACGCCGCCGCC
GCCGCCTCTTCCCACCTCCGTCCTAATCGGATCTCCGAGTGCCTCGTCGGAGACGAGACC
GCTTCCATCCTCTTCACCGCTCGCAACGATCAAGTGGACTTGATGAAGCCGGGAGCTACT
GTGAATCTCCGGAATGCGAAGATAGATATGTTCAAGGGGTCAATGAGGCTTACGGTTGAC
AAATGGGGTCGTATTGAGGTCACTGAGCCTGTTGAAATGACTGTTAAAGAGGATAACAAT
CTTTCTCTTGTGGAGTATGAGCTCGTCAATGTTGAGGAATGATCGATCAAGCGTCCACAA
TGGGGTTTTGTTTTGTGGTAATGTAACAGGCGAAATGAAATGAAGAAAAAGTTGGGGGGA
GATTATATGTTTTTATTATCTTATGACAGTTGCAAGTTTGGTACATTATGTTGATCTTTG
GGTTTTGGTGCAC

QA 1 733 1 733
DS 

RD RS1CP01JQ 757 0 0
TCACTCCCAATGGCATCAAACACCACCGACAACTCCTCCTCTCAGGCGCCTCACCAAAGA
CCCCGCCAAAGAAACGGACCTCCTCCTCCTCGCCGCCACGGAAGAAACCCGCCGCCTCGT
TATCACCAGACGACGGCCACGGCCACTGCTCAGGCTCCTCAGGAGAAGAAGAAACCCGTC
TTCGTCAAGGTCGATCATCTCAGAAACCGAACGCCGCCGCCGCCGCCTCTTCCCACCTCC
GTCCTAATCGGATCTCCGAGTGCCTCGTCGGAGACGAGACCGCTTCCATCCTCTTCACCG
CTCGCAACGATCAAGTGGACTTGATGAAGCCGGGAGCTACTGTGAATCTCCGGAATGCGA
AGATAGATATGTTCAAGGGGTCAATGAGGCTTACGGTTGACAAATGGGGTCGTATTGAGG
TCACTGAGCCTGTTGAAATGACTGTTAAAGAGGATAACAATCTTTCTCTTGTGGAGTATG
AGCTCGTCAATGTTGAGGAATGATCGATCAAGCGTCCACAATGGGGTTTTGTTTTGTGGT
AATGTAACAGGCGAAATGAAATGAAGAAAAAGTTGGGGGGAGATTATATGTTTTTATTAT
CTTATGACAGTTGCAAGTTTGGTACATTATGTTGATCTTTGGGTTTTGGTGCACACAATA
TGTCATCATGGGTATGTATGTACTCTTTCAGTTTGTGACCTCTTCTCTGTTTTTTGTATG
GGTATTGAACAGAGAGGTTAATGAAAAAAACTTGGTG

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

CO CL6921Contig1 885 2 7 U
ACTTGTACGGTGACGGAGTACTTGCGCCCTCGAAGAAAGCGCAGGTTGGACATAGCCTCG
GGAGAATCGAGATCCTCAGCGACACGCCCAAATCTCCGGTCTTTCAACTCGCGCGACGAT
GAGTGCATCCGACAGTACATCTCGTACTATTACCAGTTTCAAAAGAGCGAGGGTTTCGAG
ATAGATTGGGATAAACTGGACTACCTGTTCGACACGATGCCTATGATTGATCCATATCGT
GCCAGTGAATATAAGACCAACGATGAAATAATCCGTTAAGGGACCTGTCTTACCATTGCC
CGACACGATTCCGACAAGGGAACTAGGCTTGTTTTCCTCGATCACGTTTCAGCAAGTTAC
AGGTGCTGTGCTGGTGTGCTTTACTATGTTACATTCTGGGCCATGGATTTGGCTTCATCC
AGTCCCGTGCCAAAACTTTATCAATCAAACTTTCGCCGGTGTGGACCCACATTTTGTGAG
GTTTATCTCTTCAGGCTTAAACCAACGGACCAAGAGATTGCTGCTGTTCAGGTGGATCCT
CCCCCCTCCATTGAATGAAGATATCCCAGAACGACCCACTGTATTGTTCACTGTAACGGG
TCCAGGGTCTGGGTTCATACCCAACGTTGTCTTCACTAGGATTCTTGCTCAAGTGTCTGT
CTCGTTGCCAGAATCATCCTCACCATCCCTTCTTGTTACCTAACTACGCAAGTTTGTTGC
ACTCAGCCGTTTATGTGTTTTTTCTTTTTTTTTTTCTTTTTAATTTGGATATATTAGTTT
ATGGCAAGTGTTTAACTGTAATAAAATGACTGATGTCGTCTCATTCGTTGTTATCGTTTT
TCATGGCAATACGTTGAGAATTTTTTTATAAAAAGTTTTTGGAAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AI70JQ C 1
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CTT

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BQ
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10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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BS 720 779 RS1ER62JQ

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AS 1 2

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ACTCGGTGAGCTGGACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EK64TF U 4
AF RS1C740TF U 1
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BS 83 83 RS1EK64TF
BS 84 272 RS1C740TF
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BS 755 755 RS1EK64TF
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RD RS1EK64TF 767 0 0
GGGAGTCG
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GGAGGATGGACCTTTTGGAGTTCGATCTATCTCTACTCAAGTGGTGCGTAACCGTATGAA
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TAGAGCTGTTCAAGGACGAGCTGAGAACTCCCGTGGTCTTTGGCAGCCATTTACTGCTCT
TCTTGGAGATAATCCCAGCATTGACGTGAAGAAGAGTGTGGTGGTCACTCTCTCTTCTGA
CAAGGGTCTCTGTGGTGGAATTAACTCCACTGTTGTTAAAGTCAGCAGGGCTCTCTACAA
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TATAATGTTTCGTGACTCAAAGAACGACATCTCCCTTACTGTCACAGAGCT*AACAAGAA
TCCACTCAATTATGCTCAGGTCTCAGTTCTAGCTGATGACATCCTGAA*AACGTTGAATT
TGATGCTTTGCGCATTGTCTACAACAAGTTCCACTCCGTTGTCGCATTTCTACAACTGTG
GC*ACTGTGTTGTCCCCTGAGATCATTGAAAGGATCTGA

QA 9 767 9 767
DS 

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GGGTGTCGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAATAGTCGGATCTGAGCAAGCTAGGGTTTCGT
CTATCATCAATCAATCAATCTCGGATCAAAATGGCAATGGCTGTTTTCCGACGCGAAGGG
AGGCGTCTCCTCCCTTCAATCGCAGCTCGTCCAATCGCTGCCACCACACCGTCTCCTCTC
TCTTCTGACCGGGAGGAGGGACCTTTTGGAGTTCGATCTATCTCTACTCAAGTGGTGCGT
AACCGTATGAAGAGTGTAAAGAACATCCAGAAGATCACAAAGGCCATGAAGATGGTTGCT
GCTTCTAAGCTTAGAGCTGTTCAAGGCAGAGCTGAGAACTCCCGTGGTCTTTGGCAGCCA
TTTACTGCTCTTCTTGGAGATAATCCCAGTATTGACGTAAAGAAGAGTGTGGTGGTCACT
CTCTCTTCTGACAAGGGTCTCTGTGGTGGAATTAACTCCACTGTTGTTAAAGTCAGCAGG
GCTCTCTACAAGTTGAACGCTGGTCCTGAAAAGGACGTGAAGTTTGTTATCGTGGGAGAG
AAAGCGAAAGCTATAATGTTTCGTGACTCGAAGAACGACATCTCCCTTACAGTCACAGAG
CTGAACAAGAATCCACTCAATTATGCTCAGGTCTCAGTTCTTGCTGATGACATCCTGAAG
AACGTTGAATTTGATGCTTTGCGCATTGTCTACAACAAGTTCCATTCCGTTGTCGCATTT
CTACAACTGTGGCCACTGTTTTGTCTCCTGAGAT*ATCGAAAGGATCTGAAGTCGGGGAA
ACTCGGTGAGCTGGACTC

QA 1 798 1 798
DS 



AS 1 2

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GCCACTGACTGTGTCCCAGGTCTATACTGTGGGAACTGTCCTGCTATTGGAAGAACCAAA
CCCATTTGCACAAGAGACCAAGCCACTATCCCTACTTCCATTATCAATGGATTGCCTTTC
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AATGGAGTTAGAGGACTAATGCTGGATATGTATGACTTCAACGACGATATCTGGCTTTGC
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TGGTGCAGAGATCACAGGCTCTTGGTTTTCACT


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1CA10TF U 1
AF RS1D291TF U 4
BS 1 150 RS1CA10TF
BS 151 152 RS1D291TF
BS 153 632 RS1CA10TF
BS 633 633 RS1D291TF
BS 634 635 RS1CA10TF
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BS 637 687 RS1CA10TF
BS 688 753 RS1D291TF

RD RS1CA10TF 687 0 0
GGAAAACATCATTCACTCACACTGATTTCTCTCTCTCTCTTTCTCTTTGAAGGAGCGATG
TCGGCGTGCACCAACGGCTTAAGCAGAGCCGTAACACTCTCTCTTCTTCTTCTTCCCTTC
TTATCCCTTTCCTCTGCTTGCTCTAATGGAC*CTGCCAGATGCTGGAATCATGCTCCTCA
GCCACTGACTGTGTCCCAGGTCTATACTGTGGGAACTGTCCTGCTATTGGAAGAACCAAA
CCCATTTGCACAAGAGACCAAGCCACTATCCCTACTTCCATTATCAATGGATTGCCTTTC
AACAAGTATACATGGTTAATGACTCATAATGCTTTTAGCAATGCAAATCAACCGCCTTTG
CCAGGTGTTCAGAGGCTTACATTCTTCAACCAAGAAGATACTGTTACTAATCAGCTTAGA
AATGGAGTTAGAGGACTAATGCTGGATATGTATGACTTCAACGACGATATCTGGCTTTGC
CACTCTCTTAGAGGCCAATGTTTCAACTTCACCGCCTTTCAACCTGCAATTAACACATTG
AGGGAAGTTGAGGCATTCTTGACTCAGAACCCAACGGAGATTGTTACCATCGTTATTGAG
GACTATGTGCACAGACCTAAAGGCTTATCAACTCT*TTTGCTAACGCTGGTCTAGACAAG
TACTGGTTTCCTGTTTCGAAATGCCTA

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1D291TF 750 0 0
GG
ACATCATTCACTCACACTGATTTCTCTCTCTCT**TTCTCTTTGAAGGAGCGATGTCGGC
GTGCACCAACGGCTTAAGCAGAGCCGTAACACTCTCTCTTCTTCTTCTTCCCTTCTTATC
CCTTTCCTCTGCTTGCTCTAATGGAAACTGCCAGATGCTGGAATCATGCTCCTCAGCCAC
TGACTGTGTCCCAGGTCTATACTGTGGGAACTGTCCTGCTATTGGAAGAACCAAACCCAT
TTGCACAAGAGGCCAAGCCACTATCCCTACTTCCATTATCAATGGATTGCCTTTCAACAA
GTATACATGGTTAATGACTCATAATGCTTTTAGCAATGCAAATCAACCGCCTTTGCCAGG
TGTTCAGAGGCTTACATTCTTCAACCAAGAAGATACTGTTACTAATCAGCTTAGAAATGG
AGTTAGAGGACTAATGCTGGATATGTATGACTTCAACGACGATATCTGGCTTTGCCACTC
TCTTAGAGGCCAATGTTTCAACTTCACCGCCTTTCAACCTGCAATTAACACATTGAGGGA
AGTTGAGGCATTCTTGACTCAGAACCCAACGGAGATTGTTACCATCGTTATTGAGGACTA
TGTGCACAGACCTAAAGGCTTATCAACCCTGTTTGCTAACGCTGGTCTAGACAAGTACTG
GTTTCCTGTTTCGAAATGCCTAAAAGGGGAGAAGACTGGCCTACTGTGACTGACATGGTG
CAGAGATCACAGGCTCTTGGTTTTCACT

QA 3 750 3 750
DS 



AS 1 2

CO CL6925Contig1 941 2 4 U
CCATTGCGAAAAATCAATTCGTAAATAGTAGTATAAATTTTACATTGAACAAAAATATGT
AAGAAATTATCCGGCTTCCCATATCCTTCTTGAAATTTCCTAAGCCAAATAAAAAAATTT
CTAAAACTACACGTCTAACCCAAAGTATTGTCCAAGTGAAAGATAATTCCTAAGGAGACA
AATAACGCATGGTGTAATCGATTTGATCATTGTTCATGTTCATAGATTGAACCATGTTGT
ATGCATGCACACATGCATGAATCATGATGTTATGTTGATGAACACTTAAAATCAAACTGT
GCATCCACAGCTTCAAGCAAGCTGATCTCATCACATGACTCTTCTCCGCAAACGTCATCG
TCAAGAGAGAGGTTAAGATCCAGTGCGACGCAAGTAACAACGTTCTTGTCCTCAGACTGA
TCTGAACCGTCCGATTTCTCATTAAAAGGAGGAGAACAAGCTCTTGATCTTGAGATGAAT
CTTTCACAGCTCAAGATCACAATAGCATCTCTAAGCGAAGCTTCTTCACCACTCAAACTA
CGAACTCTTCCTCTCTCAATGGCTCTCTTGAAACCCTTTTGAGACAAATAGTCAGCTTGC
TCTATATCTTCCACTAAGAACACTCTGTTTGGATCAGAACAAACAGCTTCAGAGAATTTC
TCAATGTAACTCCAGTTCTGTTCATCTCTCGACCTCTTGTTCCTCAAATCTTTCGATGAG
AAACTGCTCAAACATATGGAGACAAAGCTGTCTCGCGAACCAAACACGAGTTTAGCCAAT
TCTCTACCGATCTTCTCTTTAGCCTCTACATCAAGACCTTGAAAGAACATCCATGTATCT
TCTCTTACATCTTTGTCTCCGTTGATTGTTCTCGTACTCGAGCCTGATCTGCATCTCAAG
ACTGTTTTCGCTATATTTGAGATTATATCCTTCTGCCATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GM26JQ U 1
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BQ
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AF RS1CF44JQ C 1
AF RS1CF44TF U 1
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QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 2

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GCTCTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

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AAGATGGATCGAGGTGAAACCACAAACTCTATGGATGGGAGTTTGATAAATCACAATATT
GCTCTCC

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1FH72JQ C 1
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DS 

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TGTCTAATGGTTAATATAATAATACACTAGTGGGGGGAATCATTTTT

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
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TCGAGTTTCTTGGAAGGCAAGACCATCCACAACTGCAGTTTGAGGCCGCATGGGCTTTGA
CCAACGTTGCGTCAGGAACATCAGATCATACTCGGGTTGTGATTGATCGTGGGGCGGTAC
CTATCTTCGTTGAGCTTCTTAGCTCTGCTAGTGATGACGTTCGAGAGCAGGCGGTGTGGG
CCTTGGGGAATGTTGCTGGAGACTCCCCAAACTGCAGGAATCTTGTTCTCAGCTGTGGTG
CTCTTATACCCTTGCTGTCTCAGTTAAACGAAAATTCAAAGT*ATCCATGCTAAGAATGC
TACATGGACCTTGTCCAACTTTTGTCGTGGGAA

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1AE68TF 743 0 0
GGAG
AGAGAGAAGTAGAGAGAGAGACTAACGAA*GATGTCGCTGAGGCCGAGCACACGCGCGGA
GCTGAGGAAGAAGATATACAAGACAGGTGTCGATGCCGATGAAGCCAGGCGGAGGAGAGA
AGACAATCTCGTCGAGATCAGAAAAAACAAGCGCGAGGACAGTCTCCTCAAGAAACGACG
AGAAGGGATGATGCTCCAGCAGCAGC***CTATCGGAGCTGGTCTCGATGCCCTCCAGAG
CGCTGCCGCCGTTGAGAAACGATTGGAAGGTATCCCAATGATGGTACAAGGTGTTTATTC
TGATGATCCTCAAGCTCAGCTAGAAGCCACTACTCAATTTAGAAAGTTGTTGTCTATAGA
GCGCAGTCCTCCAATAGATGAAGTGATCAAAGCTGGTGTAATCCCACGTTTTGTGGAGTT
TCTTGGAAGGCAAGACCATCCACAACTGCAGTTTGAGGCTGCATGGGCTTTGACCAACGT
TGCGTCAGGAACATCAGATCATACTCGGGTTGTGATTGATCATGGGGCGGTACCTATCTT
CGTTGAGCTTCTTAGCTCTGCTAGTGATGACGTTCGAGAGCAGGCGGTGTGGGCCTTGGG
GAATGTTGCTGGAGACTCCCCAAACTGCAGGAATCTTGTTCTCAGCTGTGGTGCTCTTAT
ACCCTTGCTCTCTCAGTTAAACGAAAATTCAAAGTTATCCATGCTAAGAATGCTACATGG
ACCTTGTCTAACTTTTGTC

QA 5 743 5 743
DS 



AS 1 2

CO CL6930Contig1 665 2 5 U
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TTTATGTCGTGGCTTATGTCTACATTGACCGGTTCTGTCAGAATAATCAAGGTTTCAGAA
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TCGAAGACATGAACTACAGAAACTCGTACTTTGCGAAAGTAGGAGGATTAGAGACAGAAG
ATTTAAACAACTTGGAACTGGAGTTCTTGTTCTTGATGGGGTTTAAGTTGCATGTGAATG
TGAGCGTGTTCGAGAGTTACTGTTGTCATCTTGAGAGAGAAGTAAGTACAGGAGGAGGTT
ATCAGATCGAGAAGGCATTGCGTTGCGCTGAGGAAATCAAATCCAGACAAATTGTTCAAG
ATCCAAAACACCATAATCAATTTTCAAGAATCTTGTTGTAGTCAAAAACTCTGTTTTGTT
TTGTCGGTTTGCTTTTGAGGGTGTTTGACTTTTTGATTACCTTGTGTCCTTGTCGGTTGG
GTTTTTCTTGAAATGTAAATAGAGAGAAAATATAGAGACTGGTGTTGTATGTATCTATGT
ATTAGCAAATTTAGATTCTTCTATCATTCTGTGTACCTGTTGAGGTTTAAGGAAATGGTT
TTCTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 

AF RS1F767JQ C 1
AF RS1F767TF U 1
BS 1 644 RS1F767TF
BS 645 645 RS1F767JQ
BS 646 651 RS1F767TF
BS 652 652 RS1F767JQ
BS 653 665 RS1F767TF

RD RS1F767JQ 665 0 0
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TTTATGTCGTGGCTTATGTCTACATTGACCGGTTCTGTCAGAATAATCAAGGTTTCAGAA
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TCGAAGACATGAACTACAGAAACTCGTACTTTGCGAAAGTAGGAGGATTAGAGACAGAAG
ATTTAAACAACTTGGAACTGGAGTTCTTGTTCTTGATGGGGTTTAAGTTGCATGTGAATG
TGAGCGTGTTCGAGAGTTACTGTTGTCATCTTGAGAGAGAAGTAAGTACAGGAGGAGGTT
ATCAGATCGAGAAGGCATTGCGTTGCGCTGAGGAAATCAAATCCAGACAAATTGTTCAAG
ATCCAAAACACCATAATCAATTTTCAAGAATCTTGTTGTAGTCAAAAACTCTGTTTTGTT
TTGTCGGTTTGCTTTTGAGGGTGTTTGACTTTTTGATTACCTTGTGTCCTTGTCGGTTGG
GTTTTTCTTGAAATGTAAATAGAGAGAAAATATAGAGACTGGTGTTGTATGTATCTATGT
ATTAGCAAATTTAGATTTTTCTATCATTCTGTGTACCTGTTGAGGTTTAAGGAAATGGTT
TTCTC

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1F767TF 665 0 0
GCATGACGATCCAATCGTATTTAGAGAGGATTTTCCGGTATACCAAAGCCGGTCCATCGG
TTTATGTCGTGGCTTATGTCTACATTGACCGGTTCTGTCAGAATAATCAAGGTTTCAGAA
TCAGTCTCACTAATGTACATCGTCTCCTCATCACAACCATCATGGTCGCTTCCAAATACG
TCGAAGACATGAACTACAGAAACTCGTACTTTGCGAAAGTAGGAGGATTAGAGACAGAAG
ATTTAAACAACTTGGAACTGGAGTTCTTGTTCTTGATGGGGTTTAAGTTGCATGTGAATG
TGAGCGTGTTCGAGAGTTACTGTTGTCATCTTGAGAGAGAAGTAAGTACAGGAGGAGGTT
ATCAGATCGAGAAGGCATTGCGTTGCGCTGAGGAAATCAAATCCAGACAAATTGTTCAAG
ATCCAAAACACCATAATCAATTTTCAAGAATCTTGTTGTAGTCAAAAACTCTGTTTTGTT
TTGTCGGTTTGCTTTTGAGGGTGTTTGACTTTTTGATTACCTTGTGTCCTTGTCGGTTGG
GTTTTTCTTGAAATGTAAATAGAGAGAAAATATAGAGACTGGTGTTGTATGTATCTATGT
ATTAGCAAATTTAGATTCTTCTATCATTCTGTGTACCTGTTGAG*TTTAAG*AAATGGTT
TTCTC

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

CO CL6931Contig1 661 2 2 U
TCGAAATTGCAATTATAAATTAAATTTGATTTATAAATTAAAATTGTATTACAAAAGATT
AAACCCAATTTTTTAAAAAGAAAAGAAGCCTAAACACAAAAGAAAAACCTAGATCTAATC
TTCTCAGCCGCATGTGTCTTTTCCGTCAAAGCCGGCTAGGTGAGCAGCGGCGCCCTCAAA
GAGCGTGACTGGAGACGCAGCGGAAAGAGCTCGGGATCTGCCAACGATGTCGTCCACTTC
TTCTTTCTTCTCCCTCTCAGCGGAGAGAACCACGGGGTCCTAGACCACCGCCGTCAGCCT
TTTGCTTCGTCTCCTCAGGCTACTAAATCTGTTTACCATACTATGACTGAAAGAGAGACT
GAAGGTTGTGGTGATGAGTGACTCTGGGACTCCGAATCGTCATGCGTCCACTTCCGGCGA
CTCCGCTTCATCACGCTACCACCTCCGACGAGGTGACTTCGTCACGCCACTGCTTCTTCT
TCTAGCCATCATTTCTCAAATTTTCTCAGATCTGTAAAGAAAGAACAATTGATTAGAAAC
AATATAAAGGAAAAGAAAGAGAAATGAGAAATATGAATACGCAGAGAAAAAGAAGAAACA
GATTAGATCGTCGGAGGGATACATATTTCAGATCGAGAAAGTGGAGAAAAGAAGGAGACC
C


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 

AF RS1BV15TF C 1
AF RS1BV15JQ U 2
BS 1 1 RS1BV15TF
BS 2 661 RS1BV15JQ

RD RS1BV15TF 661 0 0
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AAACCCAATTTTTTAAAAAGAAAAGAAGCCTAAACACAAAAGAAAAACCTAGATCTAATC
TTCTCAGCCGCATGTGTCTTTTCCGTCAAAGCCGGCTAGGTGAGCAGCGGCGCCCTCAAA
GAGCGTGACTGGAGACGCAGCGGAGAGAGCTCGGGATCTGCCAACGATGTCGTCCACTTC
TTCTTTCTTCTCCCTCTCAGCGGAGAGAACCACGGGGTCCTAGACCACCGCCGTCAGCCT
TTTGCTTCGTCTCCTCAGGCTACTAAATCTGTTTACCATACTATGACTGAGAGAGAGACT
GAAGGTTGTGGTGATGAGTGACTCTGGGACTCCGAATCGTCATGCGTCCACTTCCGGCGA
CTCCGCTTCATCACGCTACCACCTCCGACGAGGTGACTTCGTCACGCCACTGCTTCTTCT
TCTAGCCATCATTTCTCAAATTTTCTCAGATCTGTAAAGAAAGAACAATTGATTAGAAAC
AATATAAAGGAAAAGAAAGAGAAATGAGAAATATGAATACGCAGAGAAAAAGAAGAAACA
GATTAGATCGTCGGAGGGATACATATTTCAGATCGAGAAAGTGGAGAAAAGAAGGAGACC
C

QA 1 661 1 661
DS 

RD RS1BV15JQ 660 0 0
CGAAATTGCAATTATAAATTAAATTTGATTTATAAATTAAAATTGTATTACAAAAGATTA
AACCCAATTTTTTAAAAAGAAAAGAAGCCTAAACACAAAAGAAAAACCTAGATCTAATCT
TCTCAGCCGCATGTGTCTTTTCCGTCAAAGCCGGCTAGGTGAGCAGCGGCGCCCTCAAAG
AGCGTGACTGGAGACGCAGCGGAAAGAGCTCGGGATCTGCCAACGATGTCGTCCACTTCT
TCTTTCTTCTCCCTCTCAGCGGAGAGAACCACGGGGTCCTAGACCACCGCCGTCAGCCTT
TTGCTTCGTCTCCTCAGGCTACTAAATCTGTTTACCATACTATGACTGAAAGAGAGACTG
AAGGTTGTGGTGATGAGTGACTCTGGGACTCCGAATCGTCATGCGTCCACTTCCGGCGAC
TCCGCTTCATCACGCTACCACCTCCGACGAGGTGACTTCGTCACGCCACTGCTTCTTCTT
CTAGCCATCATTTCTCAAATTTTCTCAGATCTGTAAAGAAAGAACAATTGATTAGAAACA
ATATAAAGGAAAAGAAAGAGAAATGAGAAATATGAATACGCAGAGAAAAAGAAGAAACAG
ATTAGATCGTCGGAGGGATACATATTTCAGATCGAGAAAGTGGAGAAAAGAAGGAGACCC

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL6932Contig1 611 2 1 U
GAACCACCGGTTCTTCCGTCATGGTCTCTACCACTACGCTGCTATTCTTCATCTTTGTAC
CCTTATACTCCTGTCTTCCGCCATAACCGCTGCCTGAAATCAGTCTTCTTATCACTCCGG
TTGATAAAGCACAAATTTCTACTGGTCAAAGAACAGATTCTTCGTTGGACCATTCTTGAT
TAGAATGCCAACTCTACTGGATCCTTCTTAAATCAGTGAAAACCTCCAGCACGTCTTCTT
CTCTATACTGGAAACTTTACTCATCTATCATCAATCGAATCCATATATATGGATGAGTGA
AGATTGACTCCAATCTAGAAAAGGATCTGTGCATAACCATTGTAGAAAGATAACTGATTC
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GAATATTTTAC


BQ
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AF RS1FP42JQ C 1
AF RS1FP42TF U 1
BS 1 611 RS1FP42TF

RD RS1FP42JQ 611 0 0
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TAGAATGCCAACTCTACTGGATCCTTCTTAAATCAGTGAAAACCTCCAGCACGTCTTCTT
CTCTATACTGGAAACTTTACTCATCTATCATCAATCGAATCCATATATATGGATGAGTGA
AGATTGACTCCAATCTAGAAAAGGATCTGTGCATAACCATTGTAGAAAGATAACTGATTC
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GAATATTTTAC

QA 1 611 1 611
DS 

RD RS1FP42TF 611 0 0
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CCTTATACTCCTGTCTTCCGCCATAACCGCTGCCTGAAATCAGTCTTCTTATCACTCCGG
TTGATAAAGCACAAATTTCTACTGGTCAAAGAACAGATTCTTCGTTGGACCATTCTTGAT
TAGAATGCCAACTCTACTGGATCCTTCTTAAATCAGTGAAAACCTCCAGCACGTCTTCTT
CTCTATACTGGAAACTTTACTCATCTATCATCAATCGAATCCATATATATGGATGAGTGA
AGATTGACTCCAATCTAGAAAAGGATCTGTGCATAACCATTGTAGAAAGATAACTGATTC
AAGCACCACGGGATTTTGAAAGAAATTGCGTAAAAGGAAGAAATCTAGAACTAATACAGT
TTGATCAAAAGATCAGAACTTTATTAAGATCAAACCAAATTGAAGATAGAAGATCAAAAC
TTGAAGAACTGCTTCTATTGGTTTAATTAACACCACAAAAAGTCGCTTTAGCGAATACGA
AAGTCTCCAAAGAGAAAAAAGAAACTCGTCTAGCGAAGAGAAGAGTTAATCACATGGATT
GAATATTTTAC

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 2

CO CL6933Contig1 727 2 2 U
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CGGTTTCATGTTGGAGACTCTCTCGTATGGAGGTACGATGGGGACAAGGACTTGGTTTTG
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AAAAGCAACTGTGTCCAAGGCGAGAAGCTTCACATTGTTGTCATGTCATCTCGTCGTGGT
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CTTTTATCTGTGAGATTGTTTTAAAATTCTTTTAGCTCTGCTGAATGAAATCATATACTA
AACCCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B729TF U 1
AF RS1B729JQ C 272
BS 1 526 RS1B729TF
BS 527 727 RS1B729JQ

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AAAAGCAACTGTGTCCAAGGCGAGAAGCTTCACATTGTTGTCATGTCATCTCGTCGTGGT
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QA 1 526 1 526
DS 

RD RS1B729JQ 456 0 0
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ATTTGACTAGTCGAGTTGGGGTTTTAATGGGTTTTGTTGGATTAGCAATCGTTTTGCTCT
GAGTTCTATATAGACTTTTTGTCTAGATTCTTTTATCTGTGAGATTGTTTTAAAATTCTT
TTAGCTCTGCTGAATGAAATCATATACTAAACCCAC

QA 1 456 1 456
DS 



AS 1 2

CO CL6934Contig1 1292 2 2 U
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TTTGTTGTTTATTGCGGATCTTAACCTGGAAATGAAGCCGGGCAAATCGGAGTGTGCTAC
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AGGTGAAACCCTCGGATCCAGGGGCGAAGCCAAATGATAGAGAAGGGGTGCACAGGCACC
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AAAAAAAACATGGAGTGAGCTGTTTCAGACCTCGGGATCAAGGTGTCTACAGCTACAGAC
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CGCACTCCTGGACACTGTTTACGTGGCATTGGAGGAGTTAAGTGGCGGAGCAGTGAAGAT
CATGGTGTCGGAGAGCGGTTGGCCAACAGCGGGAGGAACGGCTGCCAGTGTGTATAATGC
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GAGAGCTACCGAGACTTATCTATTGTTGGATTTTGATGTCAAGTTAGTGAATAATTGTTC
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GCTTTTAAGTTTGGTTCTATTTCTTTTACGTTTTCAAACGTTGAGCTAAAAATTCGACCT
GACTACATGTGGAACAAAGAAATCAATCCTTGATCTAAACCAACAAAGTGAATCCTCGTC
TAGTAGAAATCACTACACCATCATTTTACCCC


BQ
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AF RS1DP02TF U 1
AF RS1DP02JQ C 712
BS 1 780 RS1DP02TF
BS 781 1292 RS1DP02JQ

RD RS1DP02TF 780 0 0
GGATATCATATTGAATAATCTATTTAGATTAGAGTTTTCAGAATTTGATTAAATGCATTT
TTTGTTGTTTATTGCGGATCTTAACCTGGAAATGAAGCCGGGCAAATCGGAGTGTGCTAC
GGGAAATTTGGAAACAACCTGCCACGTCCCGCAGATGCGGTTGCGTTTTACCGGCAGCGT
AACATCCAGCTGATGCGTCTTTACGATCCCAACCATGAGGTTCTCGAGCTTATAATCGAT
GTTCCCAACTCTGATATCCAGCGTATCGCCTCCAACCAAGCTGAAGCGGACACATGGGTC
CGTAACAACGTCCGCAACTACACAAAGGGGGTCAATTCCGCTACATATCGGTAGGAAACA
AGGTGAAACCCTCGGATCCAGGGGCGAAGCCAAATGATAGAGAAGGGGTGCACAGGCACC
CATAACTTTTTTAAAGAATAGTGTAAATGTTAAGTAAATTATATGCACCCATTAGAATTT
ATAGTTGTGCACCCATAAGAATTTAGATTAAGCCTAAATGAAAAACTAAATAAATTCCAA
AAAAAAAACATGGAGTGAGCTGTTTCAGACCTCGGGATCAAGGTGTCTACAGCTACAGAC
ACCAGAAGCCTTACAGGGTTTCCGCCCTCGAGAGGATCTTTCACACTGGTATTCCGGATT
TTTATCGCGCGGGTGATAGATTTCTTGGTGAGCAAGAAATCTCTTCTGCTCGTGAATATC
GACACTTACTTCATCTACTTTAAGAACATGGAAGCCCGTCAGTTTGGTGTACCCTCTGTT

QA 1 780 1 780
DS 

RD RS1DP02JQ 581 0 0
GTGAATATCGACACTTACTTCATCTACTTTAAGAACATGGAAGCCCGTCAGTTTGGTGTA
CCCTCTGTTAGCTGAAAAAAAAAACACTGTAGTCAATGACGGGTTAAACAAATACCGAAA
CCTTTTCGTCGCACTCCTGGACACTGTTTACGTGGCATTGGAGGAGTTAAGTGGCGGAGC
AGTGAAGATCATGGTGTCGGAGAGCGGTTGGCCAACAGCGGGAGGAACGGCTGCCAGTGT
GTATAATGCAAGAACATATGTGAACAATTTGATACAAGCTGCGAAGAATGGAACTCCAAG
GAGGCCAGAGAGAGCTACCGAGACTTATCTATTGTTGGATTTTGATGTCAAGTTAGTGAA
TAATTGTTCTGATCGATTTTTCATGATCAAGGTTTGATGATAATAGGAGATGTTTTTTTT
TTCTGTTTTGCTTTTAAGTTTGGTTCTATTTCTTTTACGTTTTCAAACGTTGAGCTAAAA
ATTCGACCTGACTACATGTGGAACAAAGAAATCAATCCTTGATCTAAACCAACAAAGTGA
ATCCTCGTCTAGTAGAAATCACTACACCATCATTTTACCCC

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

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AATCTCATCGTCTCGATCGATAAAAAAGAAAGAGCAACATCGGAGAGGGCATAGAGCGCG
GCGGTTCCGTTCTGGAGAGCGGCGGGGATGACATACATAACATAATCAATCGCTAAAAAG
TTCACTTCTCCCTCTCCAAATGGATTGATGGAAATCCCCAGAAACCAGGAGCGGAGGTAT
GATGAGGATTCGATCGAACATACCTGAGTATCTTGCGTTTGTTCGTTTCACTTGATGCAG
AGAGAATGTGATCAGAGATCAAACGAGGTTAGCTTTTTCATTGAAGTTCCAAGAAGTGAA
AAAGGACAAGCTTTTGCTTATCTCCTGAAGAAGCTCAACACTGAATGGAAGCTTCCTCTT
AATCAAAAGCAGAAAATCATATATGTAATGTTTCCATGTTGGCTGCTCAATCCAGGGAAT
AATATTTCAAGCTGAAGAATAAGCTACAGCTTCTCACAGTTGGCATTGGTGGTGTAGGTT
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TATGCTTGTTTGAGTTAGGTTGTGGTTAGAATTTTTTTTTATTTTAAGAATCTTTGATTA
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CTAAAGTACATTTATATACTTAAATAATCCTTAAGAAACACAAATGGGTTTCCGTGGATA
ATCATGCTCTTAGTTTCTTGACT


BQ
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AF RS1B080TF U 1
AF RS1B080JQ C 89
BS 1 639 RS1B080TF
BS 640 640 RS1B080JQ
BS 641 684 RS1B080TF
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BS 698 740 RS1B080TF
BS 741 803 RS1B080JQ

RD RS1B080TF 740 0 0
GGAACTCTAATTAGACCAATAGCTTCTGTCGTGATCTCCGCTTCTGTCGATGTTCTTCTC
AATCTCATCGTCTCGATCGATAAAAAAGAAAGAGCAACATCGGAGAGGGCATAGAGCGCG
GCGGTTCCGTTCTGGAGAGCGGCGGGGATGACATACATAACATAATCAATCGCTAAAAAG
TTCACTTCTCCCTCTCCAAATGGATTGATGGAAATCCCCAGAAACCAGGAGCGGAGGTAT
GATGAGGATTCGATCGAACATACCTGAGTATCTTGCGTTTGTTCGTTTCACTTGATGCAG
AGAGAATGTGATCAGAGATCAAACGAGGTTAGCTTTTTCATTGAAGTTCCAAGAAGTGAA
AAAGGACAAGCTTTTGCTTATCTCCTGAAGAAGCTCAACACTGAATGGAAGCTTCCTCTT
AATCAAAAGCAGAAAATCATATATGTAATGTTTCCATGTTGGCTGCTCAATCCAGGGAAT
AATATTTCAAGCTGAAGAATAAGCTACAGCTTCTCACAGTTGGCATTGGTGGTGTAGGTT
TAGTCTGGGCAGCTACGTTTACTTGTCCCCCTTTTGTTAGGATTGTTTGCCTGGTTTGAA
TATGCTTGTTTGAGTTAGGTTGTGGTTAGAATTTTTTTT*ATTTTAAGAATCTTTGATTA
AGAAACTTCCATTGGGAGGTACAA*TTCCAATAGTT*CTTAAGCAAAGTTCTGAAGTCTA
CTAAAGTACATTTATATACT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RS1B080JQ 715 0 0
AAAGAGCAACATCGGAGAGGGCATAGAGCGCGGCGGTTCCGTTCTGGAGAGCGGCGGGGA
TGACATACATAACATAATCAATCGCTAAAAAGTTCACTTCTCCCTCTCCAAATGGATTGA
TGGAAATCCCCAGAAACCAGGAGCGGAGGTATGATGAGGATTCGATCGAACATACCTGAG
TATCTTGCGTTTGTTCGTTTCACTTGATGCAGAGAGAATGTGATCAGAGATCAAACGAGG
TTAGCTTTTTCATTGAAGTTCCAAGAAGTGAAAAAGGACAAGCTTTTGCTTATCTCCTGA
AGAAGCTCAACACTGAATGGAAGCTTCCTCTTAATCAAAAGCAGAAAATCATATATGTAA
TGTTTCCATGTTGGCTGCTCAATCCAGGGAATAATATTTCAAGCTGAAGAATAAGCTACA
GCTTCTCACAGTTGGCATTGGTGGTGTAGGTTTAGTCTGGGCAGCTACGTTTACTTGTCC
CCCTTTTGTTAGGATTGTTTGCCTGGTTTGAATATGCTTGTTTGAGTTAGGTTGTGGTTA
GAATTTTTTTTTATTTTAAGAATCTTTGATTAAGAAACTTCCATTGG*AGGTACAAATTC
CAATAGTTTCTTAAGCAAAGTTCTGAAGTCTACTAAAGTACATTTATATACTTAAATAAT
CCTTAAGAAACACAAATGGGTTTCCGTGGATAATCATGCTCTTAGTTTCTTGACT

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

CO CL6936Contig1 1207 2 2 U
GCTTATAATGTCCAACAAACAAAACAATGGAAAATTAAGGGTCACCATAATGCTTGAACT
CCGACCTGCAACTTATTAAACGTAGAAAATCAGTAAAAAAGCAAAACAAATACACAAAAG
AGACACAAAACAATTGAGATAGATTGACATTATTACCTTTAACTCTAATGATGAGATTCT
CTTGTAATTTACAGATCTCGACAATGAAAAAAAAATTTGAAATTTTCTCATGGTTTCACA
ACCTGATAATAAGAAAATTAAGTCAGAGAGAGACATGTGTCGAGAGACTCATAATCAACT
AAACCTTCAATCTGAATCCACCATAAACGTCTAACGACAAATCGATTCAACAAGAACCCT
AAATCTCAAATCTATCCAAACTCATCCTTCGATCCAAATCAAACACTAAGAGACACTCTC
ACACTGATAATCGACCCATCATTTAAGCCAAATCATTAGCCCCTATTGATTTTGACAGAA
GCCCTAAATGTCAAATCAATCACAAACTCAAAAAATACACATAACTAGAGAAGAGAGTGA
AGAACTTACCTACACGGAACAGAGAGTGGTCGAAAAGATGGAAGAATCAGACGAAGAAGA
CGAGTTGCTAGGGTTGAAAATCCGACGAAGCTGCCGCTCGAGTTTGAGGACGAAAAGAGA
GATTAGGTTTGTTTAGGTTAATAAGATACATATATATACCTAGGTTAAATATCGGTTAAC
CGATCGGATATCATGAACCGAACCGAACCGATGCACTAACCGAACATTTTGTAAAATCAT
TCCGATCGGTTTGCTCTCAATAACCGAACGATAACCGAATTTCATAATTTTCGGTTCGGT
TCGGTTCGGACCGTCCGGTTCGGGTCAGAATCCCAGGCCTAGTTTCAGGTATGGGGTAAA
TAAATTTTATCCATAGCAATTTTGAAGAGGTTGACTCATGAGTGGATTAATAAAAATGGA
ATTTATTAATTAGAAGCACAAGATAAGTATAGAAGTCCGGACGAAGTAGTCCAAGTGGTA
AGGACGGGCCTTGGTGGCAAACACCATCCGGGTTCGATCCCCCCATGCGGAAACTACCCT
GCTTCGCTCTGGACACCAAAGTGGTACTGGGTTCGATCTAGCTCAGGTAAAGCCCTCCCG
GGTGAAGTGGACCGCTGCCTGACCGGGCTCAGGGGTTGACCCGCGAAGCGGGGAACCCTG
GATTATC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EI09TF U 1
AF RS1EI09JQ C 488
BS 1 666 RS1EI09TF
BS 667 1207 RS1EI09JQ

RD RS1EI09TF 671 0 0
GCTTATAATGTCCAACAAACAAAACAATGGAAAATTAAGGGTCACCATAATGCTTGAACT
CCGACCTGCAACTTATTAAACGTAGAAAATCAGTAAAAAAGCAAAACAAATACACAAAAG
AGACACAAAACAATTGAGATAGATTGACATTATTACCTTTAACTCTAATGATGAGATTCT
CTTGTAATTTACAGATCTCGACAATGAAAAAAAAATTTGAAATTTTCTCATGGTTTCACA
ACCTGATAATAAGAAAATTAAGTCAGAGAGAGACATGTGTCGAGAGACTCATAATCAACT
AAACCTTCAATCTGAATCCACCATAAACGTCTAACGACAAATCGATTCAACAAGAACCCT
AAATCTCAAATCTATCCAAACTCATCCTTCGATCCAAATCAAACACTAAGAGACACTCTC
ACACTGATAATCGACCCATCATTTAAGCCAAATCATTAGCCCCTATTGATTTTGACAGAA
GCCCTAAATGTCAAATCAATCACAAACTCAAAAAATACACATAACTAGAGAAGAGAGTGA
AGAACTTACCTACACGGAACAGAGAGTGGTCGAAAAGATGGAAGAATCAGACGAAGAAGA
CGAGTTGCTAGGGTTGAAAATCCGACGAAGCTGCCGCTCGAGTTTGAGGACGAAAAGAGA
GATTAG
TTTGT

QA 1 666 1 666
DS 

RD RS1EI09JQ 720 0 0
ATGTCAAATCAATCACAAACTCAAAAAATACACATAACTAGAGAAGAGAGTGAAGAACTT
ACCTACACGGAACAGAGAGTGGTCGAAAAGATGGAAGAATCAGACGAAGAAGACGAGTTG
CTAGGGTTGAAAATCCGACGAAGCTGCCGCTCGAGTTTGAGGACGAAAAGAGAGATTAGG
TTTGTTTAGGTTAATAAGATACATATATATACCTAGGTTAAATATCGGTTAACCGATCGG
ATATCATGAACCGAACCGAACCGATGCACTAACCGAACATTTTGTAAAATCATTCCGATC
GGTTTGCTCTCAATAACCGAACGATAACCGAATTTCATAATTTTCGGTTCGGTTCGGTTC
GGACCGTCCGGTTCGGGTCAGAATCCCAGGCCTAGTTTCAGGTATGGGGTAAATAAATTT
TATCCATAGCAATTTTGAAGAGGTTGACTCATGAGTGGATTAATAAAAATGGAATTTATT
AATTAGAAGCACAAGATAAGTATAGAAGTCCGGACGAAGTAGTCCAAGTGGTAAGGACGG
GCCTTGGTGGCAAACACCATCCGGGTTCGATCCCCCCATGCGGAAACTACCCTGCTTCGC
TCTGGACACCAAAGTGGTACTGGGTTCGATCTAGCTCAGGTAAAGCCCTCCCGGGTGAAG
TGGACCGCTGCCTGACCGGGCTCAGGGGTTGACCCGCGAAGCGGGGAACCCTGGATTATC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL6937Contig1 869 2 2 U
GGCTCCTCCCTTTGGTTTCTCCGCCTTCTCTCCTCTTCCTCTCTTCCACTTGTGTTTTTC
AGATGACCGGCGCGTGGCGGTTCCGTTAACGCCAGCGCCGGTCCCAATCTCCATAGTTTT
TCTTCTAGTTTAATATATGTTCGGCGTGTAGCGACTGGAGCCTATTTTGATGGAGATTTG
GTTGGAAAAACTTAGCTTTCTCCCCTCAGATCTGTGTTGGTTTTGGGAAGCGAAAGTACC
GGATCGTTAGATCAACGGTTTGTTTCTTCATTCCTTTCTCTATCTTGTTACTGGTGGGAT
TTTGGGTGGACTTGTTCACTTTTTTGGAAGTTTCTGTGGATTCTAATCGGTTCTGTGTTG
AGCCAATCATGTGGAATTGGTGTCTCTGAGTTGGTTAGGCTTGGCTCCTTGTTTCTCTGT
CAGATCTAGGTGTGATCTGGTTTCTTAATAAGCTCCGTCACTAGGCATTGAAAGGCCGTG
ACTGCCTTGCCGTTTCCGAGAGTGTGTGGTGAATCTGGTGATTCCAACTTGTCGGAAGGT
GGAGTTTGGTTACTTGGTTCCTGAGGTATACCCTCGTTGTTCAAGGAGAAAGTGGCTTAT
TGGTGGTTTGGCCGTGGACAATCTCTATAAGCATCTTTTATGGAGTTCTGAATTTGTTGT
TTCATGTTCACTTGAAATCTTTGTCTGTAACTTTTGGTTTCAGTTGTTTTATTTTTCCTT
ACTGTTAAGTGTTTAAGTGTATCTGTTGGTTAATTAGCATCCCTTGTATGGGTTTAGATT
CCAGGGTCGGTTTTGTGTGACCGCTAGTTTGTGTACCAGATGTAATCCTTTGGTTTAAGA
ATGTATCTTGTAATCTTTCATGTTCTTCT


BQ
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AF RS1C125TF U 1
AF RS1C125JQ C 187
BS 1 709 RS1C125TF
BS 710 869 RS1C125JQ

RD RS1C125TF 710 0 0
GGCTCCTCCCTTTGGTTTCTCCGCCTTCTCTCCTCTTCCTCTCTTCCACTTGTGTTTTTC
AGATGACCGGCGCGTGGCGGTTCCGTTAACGCCAGCGCCGGTCCCAATCTCCATAGTTTT
TCTTCTAGTTTAATATATGTTCGGCGTGTAGCGACTGGAGCCTATTTTGATGGAGATTTG
GTTGGAAAAACTTAGCTTTCTCCCCTCAGATCTGTGTTGGTTTTGGGAAGCGAAAGTACC
GGATCGTTAGATCAACGGTTTGTTTCTTCATTCCTTTCTCTATCTTGTTACTGGTGGGAT
TTTGGGTGGACTTGTTCACTTTTTTGGAAGTTTCTGTGGATTCTAATCGGTTCTGTGTTG
AGCCAATCATGTGGAATTGGTGTCTCTGAGTTGGTTAGGCTTGGCTCCTTGTTTCTCTGT
CAGATCTAGGTGTGATCTGGTTTCTTAATAAGCTCCGTCACTAGGCATTGAAAGGCCGTG
ACTGCCTTGCCGTTTCCGAGAGTGTGTGGTGAATCTGGTGATTCCAACTTGTCGGAAGGT
GGAGTTTGGTTACTTGGTTCCTGAGGTATACCCTCGTTGTTCAAGGAGAAAGTGGCTTAT
TGGTGGTTTGGCCGTGGACAATCTCTATAAGCATCTTTTATGGAGTTCTGAATTTGTTGT
TTCATGTTCACTTGAAATCTTTGTCTGTAACTTTTGGTTTCAGTTGTTT
A

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1C125JQ 683 0 0
AAAACTTAGCTTTCTCCCCTCAGATCTGTGTTGGTTTTGGGAAGCGAAAGTACCGGATCG
TTAGATCAACGGTTTGTTTCTTCATTCCTTTCTCTATCTTGTTACTGGTGGGATTTTGGG
TGGACTTGTTCACTTTTTTGGAAGTTTCTGTGGATTCTAATCGGTTCTGTGTTGAGCCAA
TCATGTGGAATTGGTGTCTTTGAGTTGGTTAGGCTTGGCTCCTTGTTTTTCTGTCAGATC
TAGGTGTGATCTGGTTTCTTAATAAGCTCCGTCACTAGGCATTGAAAGGCCGTGACTGCC
TTGCCGTTTCCGAGAGTGTGTGGTGAATCTGGTGATTCCAACTTGTCGGAAGGTGGAGTT
TGGTTACTTGGTTCCTGAGGTATACCCTCGTTGTTCAAGGAGAAAGTGGCTTATTGGTGG
TTTGGCCGTGGACAATCTCTATAAGCATCTTTTATGGAGTTCTGAATTTGTTGTTTCATG
TTCACTTGAAATCTTTGTCTGTAACTTTTGGTTTCAGTTGTTTTATTTTTCCTTACTGTT
AAGTGTTTAAGTGTATCTGTTGGTTAATTAGCATCCCTTGTATGGGTTTAGATTCCAGGG
TCGGTTTTGTGTGACCGCTAGTTTGTGTACCAGATGTAATCCTTTGGTTTAAGAATGTAT
CTTGTAATCTTTCATGTTCTTCT

QA 1 683 1 683
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL6939Contig1 714 2 2 U
GATGTAGAGTTCTTAAGAGGTGTTGCTAATCCTCTTGGAATCAAGGTGAGTGATAAGATG
GATCCAAAGGAGCTAGTGAAGCTGATTGAGATCTTGAATGCTGATAATAAGCCTGGAAGG
ATCACGATTATCACAAGAATGGGAGCAGAGAATATGAGAGTGAAGCTTCCTCATTTGATC
AGAGCTGTGAGACGTGCTGGACAGATTGTGACTTGGGTCAGTGATCCAATGCATGGAAAC
ACCATCAAGGCTCCTTGTGGTCTCAAGACTCGTCCCTTTGACTCCATCTTGGCTGAAGTG
AGAGCGTTCTTCGACGTGCACGAGCAAGAGGGAAGCCACCCGGGAGGTGTTCACCTAGAG
ATGACAGGTCAGAACGTGACCGAGTGCATCGGTGGTTCACGCACAGTCACTTTCGATTAC
TTGGGGTCGCGATACCACACGCACTGTGACCCTCGCCTCAACGCCTCGCAGTCTCTCGAG
CTCTCTTTCATCATCGCTGAACGCCTTAGAAAGAGACGCATCAAGTCCCAACAGGCTTTT
TCTATCTAATTCAGACATGTGTTGTGTTATATCTTTATAATAAATGTTTGCGTGTGTGAA
CTCAATACGGTTACGGTCTCGTTTATATTTGATTCTGATGCTGGGTCAACAGAACGCGTA
AGGTTTTGTTTTATCGTTGTTAATGAGTTTTATTATTTCCATTTTGGATTTACT


BQ
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AF RS1ES74TF U 1
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QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

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AF RS1AR61TFB U 1
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GG
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QA 3 678 3 678
DS 



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QA 1 580 1 580
DS 



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BQ
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AF RS1EZ74JQ C 1
AF RS1EZ74TF U 1
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QA 1 652 1 652
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

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ACTTTGCCCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CQ57TF C 1
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CGATCGATTAGACCGAGGATTAGGGTTTCGGCCACTTCTTTGAGTTACCTGGACTTTGCC
CC

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

CO CL6946Contig1 674 2 2 U
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BQ
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AATTCATCC

QA 1 669 1 669
DS 



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AATTCCGGCTCTTCGGTTCAGCTCGGCGGCAGCTCTTCTCCGCCCGCTCCTTTCCGCACG
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BQ
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ATAAAAA

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DS 



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TT


BQ
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20 20 

AF RS1C680TF C 1
AF RS1C680JQ U 7
BS 1 6 RS1C680TF
BS 7 662 RS1C680JQ

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TT

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DS 

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TAAAATCTAGGCTTCTCCAATCCGGTGACCGAGGCGTATTCCGGCCGTAGGCTGATACGT
ATACTCGCCGCTAATATGAATCCATTTCGATGGGTGTCAGGATACACTGAGTTATT

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1CZ05TF U 1
AF RS1CZ05JQ C 26
BS 1 681 RS1CZ05TF
BS 682 706 RS1CZ05JQ

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QA 1 681 1 681
DS 

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TGCTTCTCCACTGGTCCTTTTTTGAGTTCTCATCTGTGTTTTGTTGGTCATGAAGTACAT
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QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

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TTT


BQ
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10 10 10 

AF RS1G375TF U 1
AF RS1G375JQ C 147
BS 1 795 RS1G375TF
BS 796 843 RS1G375JQ

RD RS1G375TF 809 0 0
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AAGCTAAAAATCTCGGTTTATCTCTATCCGGCGGCGTTGGAGTTGCAGAAGCGGCGAAAG
TGGGAGTAAACAAACCAGAACTGCTCCCAAAAGAGTTCACTTCTGTCATAGATGTTGCTG
GTTTCCTCTCTGATGGCCAGGAGAAGAGGATTGCTGAAGAAATCGATGATATTGAAAAAG
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TCAAGGATTACTGGCAAGTTGATGATAACACTATTGTGTTTGTCGCTGATCCCACTTTTG
GGAACATATTGAACTTCAATGTTGGGGCTACTGTTGATTTGGACATACCTCGTAGTTTCT
GGAGTCGTTTAGCTGGGAAGTACGGCAACATGTTTTACTGGAAAGAAAAGGGTGAAGATG
CATCCATCGAAGCTGCAGTAATGGCTATATCAAGTTGCTTAAGGGAACCCGTTGGTGCAA
ATAACTGTGCAGAGATTTACTGAAGTTTTATGACCTGATATTAATGTATGTTACAAAACA
CATATAAACATCGATACCACATGTGATAGTAAGAGTATAGATGTTGATTGTTGAATCTGA
CATCAACCCTATATAGTTTTTGTATTTGTGTTATATCGTACTGTATTAGTACGTTTGTCG
AGATTGTTCAAAGCA
CACTTGGATCATTT

QA 1 795 1 795
DS 

RD RS1G375JQ 697 0 0
TCCGGCGGCGTTGGAGTTGCAGAAGCGGCGAAAGTGGGAGTAAACAAACCAGAACTGCTC
CCAAAAGAGTTCACTTCTGTCATAGATGTTGCTGGTTTCCTCTCTGATGGCCAGGAGAAG
AGGATTGCTGAAGAAATCGATGATATTGAAAAAGATACAGGGTTTAAGCTGAGAGTCTTG
GCTCAAAACTATCCTGTTACACCTGGACTAGCTGTCAAGGATTACTGGCAAGTTGATGAT
AACACTATTGTGTTTGTCGCTGATCCCACTTTTGGGAACATATTGAACTTCAATGTTGGG
GCTACTGTTGATTTGGACATACCTCGTAGTTTCTGGAGTCGTTTAGCTGGGAAGTACGGC
AACATGTTTTACTGGAAAGAAAAGGGTGAAGATGCATCCATCGAAGCTGCAGTAATGGCT
ATATCAAGTTGCTTAAGGGAACCCGTTGGTGCAAATAACTGTGCAGAGATTTACTGAAGT
TTTATGACCTGATATTAATGTATGTTACAAAACACATATAAACATCGATACCACATGTGA
TAGTAAGAGTATAGATGTTGATTGTTGAATCTGACATCAACCCTATATAGTTTTTGTATT
TGTGTTATATCGTACTGTATTAGTACGTTTGTCGAGATTGTTCAAAGCAACAACTTGGAT
CATTTGTCAAACTTTGAAGAAGAATGTGGAATTGTTT

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 2

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GGCTCTAAAAGTCGTTTCCCTAGAAAAAAATGTCATCCAAGGACAAGAAACCGGTGAGGC
CATCAAGTAGCCGAGCCGGTGGAATCCGCACTTTGTCCGATCTCAATCGAAGGTCTGGTC
CTGACTCCGACAGTGATTCCGACAGTCCTCAGGAATACTACACCGGTGGTGAGAAAAGTG
GTATGCTTGTTCAAGATCCTTCAAAGAAAGATGATGTTGATGAGATATTCAATCAAGCCA
GACAACTAGGAGCCGTGGAAGGACCTCTCGAGACTCCTTCTTCGAGTTCCACGAGCTTCA
CCGGAACTGAGAGATTGCTTTCAGGAGAAAGCGTTTCAACTGGTACTCAACAGCCTGAGC
CTGTGGTTCACACCATTGTTTTTTGGGCTAATGGATTCACCATTGATGATGGTCCTTTGA
GGAAGTTGGATGATCCAGAGAACGCTTCTTTTCTCGAGAGCATTCGAAAGTCTGAGTGCC
CGAAAGAGCTTGGGCCTGCAGATAGAAGAGCCCCTGTTCATGTCAATCTGATGCGGAGGG
AAGAGAAATGTCCAGAACGAGAGAAGCGTAAGGTTTCATTCCAGGGTGTTGGGAGGACTC
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CCGCCATTCCCATCCAAACCAACCAAACCGGTTTAGCAGCACCAACTCCAAGTCTTGTAA
TAGATGAAACCCTTCCGACCACATCGATCCAGATTAGACTAACGGATGGGACCAGGCTTG
TGGGCAAGTTCAATCTTCATCACACTGTCAACGACATTCGAGGTTTCATTGACTCTTCTC
GGCCTGGAGCTCCGGTTAACTACCAGCTTCAGACGATGGGGTTCCCACCTGCGCCTTTGA
CTGATCCCACTCAGACCATTGAACAAGCTGGTCTCGCCAACTCTGTTGTTCTTCAGAAGT
TCTAGAAGGTTTCTTGTTTTTTTTTGTCTTTCTATATGGATTATGATCAGAGCTTCATAA
CTGTTATTGTAATCATAAAAAAGATGGTTGGCATGTCTGCAAGTTACTTATATACGCAGC
ATAAGTGATCTCCCATGTGGGAAGAAAAGACTTGTGTTATAGTTTTTCTTAATTTATCGA
AAATAATTATTTCATGTTGTTGGT


BQ
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AF RS1DD37TF U 1
AF RS1DD37JQ C 531
BS 1 784 RS1DD37TF
BS 785 1164 RS1DD37JQ

RD RS1DD37TF 784 0 0
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CATCAAGTAGCCGAGCCGGTGGAATCCGCACTTTGTCCGATCTCAATCGAAGGTCTGGTC
CTGACTCCGACAGTGATTCCGACAGTCCTCAGGAATACTACACCGGTGGTGAGAAAAGTG
GTATGCTTGTTCAAGATCCTTCAAAGAAAGATGATGTTGATGAGATATTCAATCAAGCCA
GACAACTAGGAGCCGTGGAAGGACCTCTCGAGACTCCTTCTTCGAGTTCCACGAGCTTCA
CCGGAACTGAGAGATTGCTTTCAGGAGAAAGCGTTTCAACTGGTACTCAACAGCCTGAGC
CTGTGGTTCACACCATTGTTTTTTGGGCTAATGGATTCACCATTGATGATGGTCCTTTGA
GGAAGTTGGATGATCCAGAGAACGCTTCTTTTCTCGAGAGCATTCGAAAGTCTGAGTGCC
CGAAAGAGCTTGGGCCTGCAGATAGAAGAGCCCCTGTTCATGTCAATCTGATGCGGAGGG
AAGAGAAATGTCCAGAACGAGAGAAGCGTAAGGTTTCATTCCAGGGTGTTGGGAGGACTC
TAGGCGGTAGCAGCAACGACAGCAGCGGAAGTGGCTCATCAATAGCTCCAGATGCCGTTG
CCGCCATTCCCATCCAAACCAACCAAACCGGTTTAGCAGCACCAACTCCAAGTCTTGTAA
TAGATGAAACCCTTCCGACCACATCGATCCAGATTAGACTAACGGATGGGACCAGGCTTG
TGGG

QA 1 784 1 784
DS 

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GGGAGGACTCTAGGCGGTAGCAGCAACGACAGCAGCGGAAGTGGCTCATCAATAGCTCCA
GATGCCGTTGCCGCCATTCCCATCCAAACCAACCAAACCGGTTTAGCAGCACCAACTCCA
AGTCTTGTAATAGATGAAACCCTTCCGACCACATCGATCCAGATTAGACTAACGGATGGG
ACCAGGCTTGTGGGCAAGTTCAATCTTCATCACACTGTCAACGACATTCGAGGTTTCATT
GACTCTTCTCGGCCTGGAGCTCCGGTTAACTACCAGCTTCAGACGATGGGGTTCCCACCT
GCGCCTTTGACTGATCCCACTCAGACCATTGAACAAGCTGGTCTCGCCAACTCTGTTGTT
CTTCAGAAGTTCTAGAAGGTTTCTTGTTTTTTTTTGTCTTTCTATATGGATTATGATCAG
AGCTTCATAACTGTTATTGTAATCATAAAAAAGATGGTTGGCATGTCTGCAAGTTACTTA
TATACGCAGCATAAGTGATCTCCCATGTGGGAAGAAAAGACTTGTGTTATAGTTTTTCTT
AATTTATCGAAAATAATTATTTCATGTTGTTGGT

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 2

CO CL6952Contig1 1134 2 6 U
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AAAAAGATTGGTGTGTCTGAGGGAAAAGGAGATCTAAGACGCCACTTCTCCTCTTTTTAG
CTTTCACTTAAAGACAAAAAAAAAAAAAAGATGAGTTTGTGGGGAGTGATGGGAGAAGGA
TGGGGACTGGTAGAAGAAGGTTGGAGAAAAGGGCCTTGGACTGCTGAAGAAGACCGTCTA
TTGATCGATTATGTGCGGCTTCACGGTGAAGGTCGATGGAACTCTGTGGCGAGGCTCGCA
GGATTGAAGAGAAATGGCAAAAGCTGTAGGTTAAGATGGGTTAATTACTTAAGACCAGAC
CTCAAGAGAGGACAAATCACTCCTCATGAAGAAACCATTATCCTTGAGTTACATGCTAAG
TGGGGCAACAGGTGGTCAACAATCGCTCGGAGTTTACCAGGAAGAACAGACAACGAGATC
AAGAACTATTGGAGAACACATTTCAAGAAGAAGACAAAATCTCCGACTAACAATGCGGAG
AAGACGAAAAGCAGAATCTTAAAGAGGCAACAATTTCAGCAGCAAAGACAGATGGAGTTG
CAGCGAGAACAACAATTGCTTCAATTCAACCAAATCGACATGAAAAAGATCATGTCTTTA
CTAGACGATGACAACAATAATAATAATGGTGATAATGACTTCAGTAGCAATAGTAGCGGC
AGTTATGGCGAAGATGGTGCCTTCTATGTTCCTCATCAGATCACAAATCCAACACCAAAT
TCTGGTCAAGACCCAAATGGTAATGGGTTTTTCCCGGTGGTTCCGGTGCCAACACCTGAG
GCTAACGTGAATGAAAATTACCCAATTTGGAATGGAATATGGAATCTGGATTTAGTAGAA
GGACAAGGAAGCTTTGGTGACGGTGCTTGTGCCCCAAGAAAGCACTGTTTCCAGAGCTGG
CCTATTCCCTTTGACTTAAGCTTTTAAGTGTCTTATCTGCTGAAAAATGTCATAACTTGA
CTGACGAGTTTGGTCGAGTTTGAGTTTGGTTTTGTTTTATCTTTCCATATTTTGGATTTA
ACATACAGTAGTTTTGTTATCCATTGTGTGATGTTATAAGAAGCTCATTTAGGC


BQ
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AF RS1F823TF U 1
AF RS1F823JQ C 524
BS 1 673 RS1F823TF
BS 674 674 RS1F823JQ
BS 675 694 RS1F823TF
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BS 696 764 RS1F823TF
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RD RS1F823TF 764 0 0
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CTTTCACTTAAAGACAAAAAAAAAAAAAAGATGAGTTTGTGGGGAGTGATGGGAGAAGGA
TGGGGACTGGTAGAAGAAGGTTGGAGAAAAGGGCCTTGGACTGCTGAAGAAGACCGTCTA
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CTCAAGAGAGGACAAATCACTCCTCATGAAGAAACCATTATCCTTGAGTTACATGCTAAG
TGGGGCAACAGGTGGTCAACAATCGCTCGGAGTTTACCAGGAAGAACAGACAACGAGATC
AAGAACTATTGGAGAACACATTTCAAGAAGAAGACAAAATCTCCGACTAACAATGCGGAG
AAGACGAAAAGCAGAATCTTAAAGAGGCAACAATTTCAGCAGCAAAGACAGATGGAGTTG
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CTAGACGATGACA*CAATAATAATAATGGTGATA*TGACTTCAGTAGCAATAGTAGCGGC
AGTTATGGCGAAGATGGTGCCTTCTATGTTCCTCATCAGATCAC

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1F823JQ 611 0 0
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AAAGACAGATGGAGTTGCAGCGAGAACAACAATTGCTTCAATTCAACCAAATCGACATGA
AAAAGATCATGTCTTTACTAGACGATGACAACAATAATAATAATGGTGATAATGACTTCA
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CGGTGCCAACACCTGAGGCTAACGTGAATGAAAATTACCCAATTTGGAATGGAATATGGA
ATCTGGATTTAGTAGAAGGACAAGGAAGCTTTGGTGACGGTGCTTGTGCCCCAAGAAAGC
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AAAATGTCATAACTTGACTGACGAGTTTGGTCGAGTTTGAGTTTGGTTTTGTTTTATCTT
TCCATATTTTGGATTTAACATACAGTAGTTTTGTTATCCATTGTGTGATGTTATAAGAAG
CTCATTTAGGC

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 2

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CGTTTCTGCATGATTTACTTAAGGGATGATGAAGGATTAGGAAGATAAACAAAGAGTTCA
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C


BQ
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20 

AF RS1GZ44JQ C 1
AF RS1GZ44TF U 1
BS 1 661 RS1GZ44TF

RD RS1GZ44JQ 661 0 0
GGACAACGTTCTTGTCATCTCCTTCATATTCTCCTCCTTTATCTCTCTCTCTCTCTCAAC
TCTTTTTCAGGCGCAACCAAATAGAAACATAAACACTTAAGAGCATAAACCAACCATAGA
TTCTTGGGACACTTCTTAGTTTTGACCGATTCTGATCCGTTATAGTTGTTTCAAACGACA
CGGTGAAACGTTTGTTCTTATTTAAAATATCATACTCCTCTTTTCTTTCTCCTCCTTCTC
TATCGAAACAATGTGCTGATGATTTGCTACAAAAAAAATTGCGGCTGATTGTGATGGGAG
TTTTATGGACTAATGGATCTCTGTAGATAGAAATAGATGTGGTCTCCAATTAGAATTGAG
AGAGTGATTTGAAGAGCAGGTGCAGAACAGGAACAAAAAAGATGGGTAGATCTTTTAGGT
TTAATTTGGAGCAATGAAAAAACATCATGATTTAAGAAGTCCTGTGTGTTGTGTTTATAA
CGTTTTTGCATGATTTACTTAAGGGATGATGAAGGATTAGGAAGATAAACAAAGAGTTCA
AGCAAGACATGTACAATGTGTTTCCCTCTGTTTATTTTTTAATCTCATCTCTCTTTAAAA
TTTGCAATGTAGACATTTGATTTCATGTTGATTTTTGTGATTGAGAATTACTAAATTATG
C

QA 1 661 1 661
DS 

RD RS1GZ44TF 661 0 0
GGACAACGTTCTTGTCATCTCCTTCATATTCTCCTCCTTTATCTCTCTCTCTCTCTCAAC
TCTTTTTCAGGCGCAACCAAATAGAAACATAAACACTTAAGAGCATAAACCAACCATAGA
TTCTTGGGACACTTCTTAGTTTTGACCGATTCTGATCCGTTATAGTTGTTTCAAACGACA
CGGTGAAACGTTTGTTCTTATTTAAAATATCATACTCCTCTTTTCTTTCTCCTCCTTCTC
TATCGAAACAATGTGCTGATGATTTGCTACAAAAAAAATTGCGGCTGATTGTGATGGGAG
TTTTATGGACTAATGGATCTCTGTAGATAGAAATAGATGTGGTCTCCAATTAGAATTGAG
AGAGTGATTTGAAGAGCAGGTGCAGAACAGGAACAAAAAAGATGGGTAGATCTTTTAGGT
TTAATTTGGAGCAATGAAAAAACATCATGATTTAAGAAGTCCTGTGTGTTGTGTTTATAA
CGTTTCTGCATGATTTACTTAAGGGATGATGAAGGATTAGGAAGATAAACAAAGAGTTCA
AGCAAGACATGTACAATGTGTTTCCCTCTGTTTATTTTTTAATCTCATCTCTCTTTAAAA
TTTGCAATGTAGACATTTGATTTCATGTTGATTTTTGTGATTGAGAATTACTAAATTATG
C

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 2

CO CL6954Contig1 836 2 2 U
GCACCTAAGGTGGTATACAAATCGCCACCACACCCACATGTTTGTGTTTGTCCACCTCCT
CCTCCATGTTACTCTCCTTCTCCAAAGATTGAGTACAAATCTCCTCCAACACCATATCTT
TACCATTCTCCACCTCCCCCACCTTATTACTCGCCTTCACCTAAACATGCATACAAATCT
CCTCCACCACCATACGTTTACAGCTCTCCACCACCACCATACTACTCGCCTACTCCTAAG
CATGCATACAAATCTCCTCCACCACCATACGTTTACAGCTCCCCACCACCACCTTACTAC
TCTCCTTCCCCTAAGCCCACATACAAATCTCCTCCACCACCATATGTCTATAGCTCTCCA
CCCCCACCACCGTATTACTCCCCTTCTCCAAAGGTTGAATACAAATCTCCTCCACCACCC
TATGTTTACAGCTCTCCACCTCCACCACTGTATTACTCTCCTTCTCCAAAGGTGGAGTAC
AAATCTCCTCCACCACCGTATGTTTACAGCTCTCCTCCCCCACCACCATATTACTCTCCA
TCCCCAAAGGTCGAGTACAAATCTCCACCACCACCAACAACATACTCTCCATCTCCAAAC
GCCGAATACAAATCTCCTCCTCCACCTTCGTATTATTAAGCTCGTTCTATGTAACTCATA
AGTAAGATACCAAGTCTCATCTGATGTTCTATCTTTTTATTTTTGTGTGTCTAGTCCTTT
TTAATTTCCAAGGTTCGAGTGAATTCTTTGGCTATTGAAATTTGATTTAAATTCATGTTT
CCATTGTCTTTTTTATGGGCTGTAGGTTGCCTTTAATCCATATGTAAGTTTGTTGC


BQ
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AF RS1CI24TF U 1
AF RS1CI24JQ C 504
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BS 594 836 RS1CI24JQ

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TACCATTCTCCACCTCCCCCACCTTATTACTCGCCTTCACCTAAACATGCATACAAATCT
CCTCCACCACCATACGTTTACAGCTCTCCACCACCACCATACTACTCGCCTACTCCTAAG
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TCTCCTTCCCCTAAGCCCACATACAAATCTCCTCCACCACCATATGTCTATAGCTCTCCA
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DS 

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QA 1 333 1 333
DS 



AS 0 0

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AAGATGGAGATTCTGTGATTGTTGATGTTGATGCTGAAGGAAGTGTGGTTGTGTTGAATG
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BQ
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AF RS1A725JQ C 1
AF RS1A725TF U 1
BS 1 658 RS1A725TF

RD RS1A725JQ 658 0 0
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AAGATGGAGATTCTGTGATTGTTGATGTTGATGCTGAAGGAAGTGTGGTTGTGTTGAATG
GTAAGAATGGAAGTGGTGACGGTTTTGTTGCTGAAGAAGCCATGGAGGATCCAATTCCTG
TCTTGTAGAAGGGAAGAGGAGAGTTCTAGAGAGAGATTTGATTTTTCTTCTATGTTGTCT
TTGAAGTGTTGTTGAACCGTCTCATTTGATTAGTTTTTGTACTTTTAAATTGTTTCTGGA
TATTGATTGCTCGTGAACCATGGAGAGCTTCCCCTCAACACAAAAAATAAATGAATAA

QA 1 658 1 658
DS 

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GGAAGAATCGGGTTTGATCTGGACTACGACGAGAAAGACAGCAGCTACAACAGGATCAAG
AGCTTGGTGACTGAGGAACTGAAACAGTATTTCAGACCTGAGTTCTTGAACAGGTTAGAT
GAGATGATTGTTTTCAGACAGTTGACGAAGCTCGAAGTGAAGGAGATTGCTGATATAATG
CTTAAAGAAGTGGTGGTGAGGCTAAGGACAAGGAGATTGAGCTTCAAGTGACCGAGAGGT
TTAAGGAGAGAGTGGTGGATGAAGGGTTTGACCCGAGTTACGGTGCGAGGCCGCTGAGAA
GAGCGATAATGAGGCTTTTGGAAGATAGCATGGCGGAGAAGATGCTTTCAAGGGAGATTA
AAGATGGAGATTCTGTGATTGTTGATGTTGATGCTGAAGGAAGTGTGGTTGTGTTGAATG
GTAAGAATGGAAGTGGTGACGGTTTTGTTGCTGAAGAAGCCATGGAGGATCCAATTCCTG
TCTTGTAGAAGGGAAGAGGAGAGTTCTAGAGAGAGATTTGATTTTTCTTCTATGTTGTCT
TTGAAGTGTTGTTGAACCGTCTCATTTGATTAGTTTTTGTACTTTTAAATTGTTTCTGGA
TATTGATTGCTCGTGAACCATGGAGAGCTTCCCCTCAACACAAAAAATAAATGAATAA

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

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GTGCCACAGTGAAGAAAAACCTTTTGTTAGCAATACCGTTCACACCTCTCCGCCTCCTCC
CATTTCCATCTCCTTGTGCTGCTCCTCTTGTGTTCAGAATCCATTCCACGGCCTGAGTTT
AGCCAAAAGGGTTAAAAGCCTTTGAAAAGGGGATTTAGATCATCAGAAAATGATTCAAGA
ACCAGGGCATTTGGTTTTTCATGGTTAAAATTCATTAACGAAAACAAAATATACGTGGAT
TAGATTTTTAAAATATCCAATAACGCAAATACCGACACCACAACACAACAATATGAAACT
AGGGAGATCCTTTTGAATCAACAAACAACACCAAAAACGAGTTCATAATCATATAGAGCC
TAACGAAGGAGAGGTTCCTCAAAGCAAAGAATACAACTTAAAAACTGGTGATAAATAGAA
AAACCATCGTACCGGAGCATGTGTGTTCAACAAGTGTTCGTCGACATGTTTTTTGGGAAC
CATATCACCACAGATGTTACATTTTTCGAGATTCCGGGCACAATGTACACGATGCAGATC
CATGTTTGGTGATGGAATGTCTCTCTCACTGCAAAAAACATTAAAAAAACGTCAGTTACG
TCAAGCTTTATAAGCCAGTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTCTCATGCAATCCAAGTAGAGT
AGATGCTAACATCCATAGTCTTGTAATTCTCTTAACTCTTTTGCCAAAAAAAAGAATGGT
TTGCATATCATAATAGTTGCATAACCATCATCCATCTAATCCCTAGTTATATAACTAATC
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CCAATTGCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FG04TF U 1
AF RS1FG04JQ C 117
BS 1 685 RS1FG04TF
BS 686 686 RS1FG04JQ
BS 687 712 RS1FG04TF
BS 713 715 RS1FG04JQ
BS 716 792 RS1FG04TF
BS 793 849 RS1FG04JQ

RD RS1FG04TF 792 0 0
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CATTTCCATCTCCTTGTGCTGCTCCTCTTGTGTTCAGAATCCATTCCACGGCCTGAGTTT
AGCCAAAAGGGTTAAAAGCCTTTGAAAAGGGGATTTAGATCATCAGAAAATGATTCAAGA
ACCAGGGCATTTGGTTTTTCATGGTTAAAATTCATTAACGAAAACAAAATATACGTGGAT
TAGATTTTTAAAATATCCAATAACGCAAATACCGACACCACAACACAACAATATGAAACT
AGGGAGATCCTTTTGAATCAACAAACAACACCAAAAACGAGTTCATAATCATATAGAGCC
TAACGAAGGAGAGGTTCCTCAAAGCAAAGAATACAACTTAAAAACTGGTGATAAATAGAA
AAACCATCGTACCGGAGCATGTGTGTTCAACAAGTGTTCGTCGACATGTTTTTTGGGAAC
CATATCACCACAGATGTTACATTTTTCGAGATTCCGGGCACAATGTACACGATGCAGATC
CATGTTTGGTGATGGAATGTCTCTCTCACTGCAAAAAACATTAAAAAAACGTCAGTTACG
TCAAGCTTTATAAGCCAGTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTCTCATGCAATCCAAGTAGAGT
AGATGCTAACATCCATAGTCTTGTA*TTCTCTTAACTCTTTTGCCAAAAAAAG**ATGGT
TTGCATATCATAATAGTTGCATAACCATCATCCATCTAATCCCTAGTTATATAACTAATC
ACCGACACAGAC

QA 1 792 1 792
DS 

RD RS1FG04JQ 733 0 0
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AAGAACCAGGGCATTTGGTTTTTCATGGTTAAAATTCATTAACGAAAACAAAATATACGT
GGATTAGATTTTTAAAATATCCAATAACGCAAATACCGACACCACAACACAACAATATGA
AACTAGGGAGATCCTTTTGAATCAACAAACAACACCAAAAACGAGTTCATAATCATATAG
AGCCTAACGAAGGGGAGGTTCCTCAAAGCAAAGAATACAACTTAAAAACTGGTGATAAAT
AGAAAAACCATCGTACCGGAGCATGTGTGTTCAACAAGTGTTCGTCGACATGTTTTTTGG
GAACCATATCACCACAGATGTTACATTTTTCGAGATTCCGGGCACAATGTACACGATGCA
GATCCATGTTTGGTGATGGAATGTCTCTCTCACTGCAAAAAACATTAAAAAAACGTCAGT
TACGTCAAGCTTTATAAGCCAGTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTCTCATGCAATCCAAGTA
GAGTAGATGCTAACATCCATAGTCTTGTAATTCTCTTAACTCTTTTGCCAAAAAAAAGAA
TGGTTTGCATATCATAATAGTTGCATAACCATCATCCATCTAATCCCTAGTTATATAACT
AATCACCGACACAGACTAATCTCATTCAAGTGTGTTCAATACCCACACAACTTGCAATCA
CCCACCAATTGCC

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 2

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CCTTTTGAGTATCAAACAAATGGAAACTTAACCGAACCAAAATTTATGTAAGCTCTTTTT
TTTTTATAATTTTGTGGGGGAAATTGGGCTTAGCCGTCCCCGTATACATAAGGAAACTTG
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AACCGGTCTGGCAGTGTGTATAAATTAACGACGGCAACTAACTCATTTCACCAAAAACCC
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TCAGCAGCCGACTCCACCAAAGTTGCCAAGCGAGCGAAGAAGATGCTTCCCAAACTGTTG
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GCGGACGGTGAAATCGTCGAGAGCGAAGACGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EN35JQ U 99
AF RS1EN35TF C 1
BS 1 98 RS1EN35TF
BS 99 274 RS1EN35JQ
BS 275 694 RS1EN35TF

RD RS1EN35JQ 176 0 0
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QA 1 176 1 176
DS 

RD RS1EN35TF 694 0 0
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TCTTAGTTTTGTATAGTTTTCCGAATGCATTTGGATTTTCGTCGTTAAACACCATCGTAA
CCTTTTGAGTATCAGACAAATGGAAACTTAACCGAACCAAAATTTATGTAAGCTCTTTTT
TTTTTATAATTTTGTGGGGGAAATTGGGCTTAGCCGTCCCCGTATACATAAGGAAACTTG
TATTGCATGGTCTTAAAAAATCTAATTATCAAATAACGAACCGGTTGAACCGTAGAAATA
AACCGGTCTGGCAGTGTGTATAAATTAACGACGGCAACTAACTCATTTCACCAAAAACCC
TAGTAGAGCAAAGAAGTAATCGACTACTTATTAAGATAAACGAAAGCCCTAGCATAGCAT
TCAGCAGCCGACTCCACCAAAGTTGCCAAGCGAGCGAAGAAGATGCTTCCCAAACTGTTG
TTGGGCGGTGACGTTGATCAGAACAAAGGCCCCGTTGAGCTCGAGGTCGACGAGGAATAC
CGTCGTAAGTTGGAACGCAGAAGAGAGGCCGAGGATAACAAGCGATACGCCAAGGCGGTG
GCGGACGGTGAAATCGTCGAGAGCGAAGACGGCC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL6959Contig1 625 2 3 U
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CAGGTTTCTTGGGAGGGAAGAAACTGAGGCTGAGCAAGAAGTTGAGTGTTCCAGCTGGTT
CCAGATCGGCTGCGTCCGTGCGCGCCGCCGCAGCTGATCCGGATAGACCAATCTGGTTCC
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CTCTTGGTCTTTCGTCTGACCCGGATAGCTTAAAGTGGAACGCACAAGCAGAGCTAGTCC
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CTGATATCATTAAGCCAGGCAGCGTCAACACTGACCCAATCTTCCCAAACAACAAACTGA
CGGGGACAGACGTTGGGTACCCGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EN18TF U 23
AF RS1H060TF U 1
BS 1 384 RS1H060TF
BS 385 385 RS1EN18TF
BS 386 625 RS1H060TF

RD RS1EN18TF 460 0 0
GG
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TTTGTGCTTCTTCTGCCATCACCGCTATTTCTTCTCCAGGTTTCTTGGGAGGGAAGAAAC
TGAGGCTGAGCAAGAAGTTGAGTGTTCCAGCTGGTTCCAGATCGGCTGCGTCCGTGCGCG
CCGCCGCAGCTGATCCGGATAGACCAATCTGGTTCCCTGGAAGCACTCCTCCAGAGTGGC
TAGACGGTAGCCTCCCTGGTGACTTCGGGTTTGATCCTCTTGGTCTTTCGTCTGACCCGG
ATAGTTTAAAGTGGAACGCACAAGCAGAGCTAGTCCACTGCCGGTGGGCGATGTTAGGCG
CCGCCGGGATTTTTATCCCGGAGTTTCTAACCAAGATAGGAATCCTCAACACGCCGTCGT
GGTACACGGCAGGAGAGCAAGAGTACTTCACCGACAAA

QA 3 460 3 460
DS 

RD RS1H060TF 625 0 0
GGGATCGTTTCTTCTTCTTCTCCTAACACTTAACATTTCTGAGTCTTGAAGAAGGTCAAC
CAGCTTCGAGAATAATGGCTTCTCTTTGTGCTTCTTCTGCCATCACCGCTATTTCTTCTC
CAGGTTTCTTGGGAGGGAAGAAACTGAGGCTGAGCAAGAAGTTGAGTGTTCCAGCTGGTT
CCAGATCGGCTGCGTCCGTGCGCGCCGCCGCAGCTGATCCGGATAGACCAATCTGGTTCC
CTGGAAGCACTCCTCCAGAGTGGCTAGACGGTAGCCTCCCTGGTGACTTCGGGTTTGATC
CTCTTGGTCTTTCGTCTGACCCGGATAGCTTAAAGTGGAACGCACAAGCAGAGCTAGTCC
ACTGCCGGTGGGCGATGTTAGGCGTCGCCGGGATTTTTATCCCGGAGTTTCTAACCAAGA
TAGGAATCCTCAACACGCCGTCGTGGTACACGGCAGGAGAGCAAGAGTACTTCACCGACA
AAACCACACTCTTCGTCGTTGAGCTCATCTTAATAGGATGGGCCGAGGGACGTAGATGGG
CTGATATCATTAAGCCAGGCAGCGTCAACACTGACCCAATCTTCCCAAACAACAAACTGA
CGGGGACAGACGTTGGGTACCCGGG

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 2

CO CL6960Contig1 661 2 2 U
TTTGTGTCCAACATCATATATTCTTGGAATCTAAAAGCAAAGCCAAAACTCATCCTTTGT
GGCTAAAACACCAAGTTATTTATGACATTGCAGCATTACAGATTAAAGAGTAAATAAATT
ATAGCTTGGAACTGGGAGAAATGGCTTGGAAACCATAGCTTGAGAATCACAATCTCTTTC
CTAGGTTATGCAGCTGAATTCTAGGGTATATCACCCAGCAGAGCAGGGACATTGCAGGTT
TGATAACAGAGCCGCACTCTACCTTAGCGAGACAAAACGTTTATTCAATCCCAAAAATTT
GTCCTCCCTGAACGACGCATTTATCTTGTAGTAGGGACAAACCACGCTACATATATCTTA
TTAGATCCGCTGTAAAACAAAGCAAAGTAAAACCCAAAGCACGTCAAACTAACCGATGGG
CGGACATGGAACTCCAACTGACCAGCCATGACTTCTCCATTGATCCACACTGGTGTTAAT
TCCGGCATACAAACATTCCTTGTAGTGAGAAACAACAATGTCCCTTCCAAACGATTTGTC
AGCTCCCATTGCAGTAGTATGGTCCTATAAGATTACTTCACTGTTTGCCAGGAGCTTCAC
CAATGTTGGAACCATCCTGGCTGTGCTTCTCATGTACATACCAGAACCACCTACACTCTC
C


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 

AF RS1AS57TF C 1
AF RS1AS57JQ U 4
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BS 4 661 RS1AS57JQ

RD RS1AS57TF 661 0 0
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GGCTAAAACACCAAGTTATTTATGACATTGCAGCATTACAGATTAAAGAGTAAATAAATT
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CTAGGTTATGCAGCTGAATTCTAGGGTATATCACCCAGCAGAGCAGGGACATTGCAGGTT
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GTCCTCCCTGAACGACGCATTTATCTTGTAGTAGGGACAAACCACGCTACATATATCTTA
TTAGATCCGCTGTAAAACAAAGCAAAGTAAAACCCAAAGCACGTCAAACTAACCGATGGG
CGGACATGGAACTCCAACTGACCAGCCATGACTTCTCCATTGATCCACACTGGTGTTAAT
TCCGGCATACAAACATTCCTTGTAGTGAGAAACAACAATGTCCCTTCCAAACGATTTGTC
AGCTCCCATTGCAGTAGTATGGTCCTATAAGATTACTTCACTGTTTGCCAGGAGCTTCAC
CAATGTTGGAACCATCCTGGCTGTGCTTCTCATGTACATACCAGAACCACCTACACTCTC
C

QA 1 661 1 661
DS 

RD RS1AS57JQ 658 0 0
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TAAAACACCAAGTTATTTATGACATTGCAGCATTACAGATTAAAGAGTAAATAAATTATA
GCTTGGAACTGGGAGAAATGGCTTGGAAACCATAGCTTGAGAATCACAATCTCTTTCCTA
GGTTATGCAGCTGAATTCTAGGGTATATCACCCAGCAGAGCAGGGACATTGCAGGTTTGA
TAACAGAGCCGCACTCTACCTTAGCGAGACAAAACGTTTATTCAATCCCAAAAATTTGTC
CTCCCTGAACGACGCATTTATCTTGTAGTAGGGACAAACCACGCTACATATATCTTATTA
GATCCGCTGTAAAACAAAGCAAAGTAAAACCCAAAGCACGTCAAACTAACCGATGGGCGG
ACATGGAACTCCAACTGACCAGCCATGACTTCTCCATTGATCCACACTGGTGTTAATTCC
GGCATACAAACATTCCTTGTAGTGAGAAACAACAATGTCCCTTCCAAACGATTTGTCAGC
TCCCATTGCAGTAGTATGGTCCTATAAGATTACTTCACTGTTTGCCAGGAGCTTCACCAA
TGTTGGAACCATCCTGGCTGTGCTTCTCATGTACATACCAGAACCACCTACACTCTCC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

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CTCTTCTTCCTCCGATTCTCATTTATACTCCCCCTCTCTCTCCAAAGAATAACCAGAGAG
AGAAAGAGTTACACAATGGCTGTTGCACTTGGTGGAAGGGTTGCAGAGGAGGTGATCTTT
GGGGATGACAATGTGACGACTGGAGCATCAAATGATTTCATGCAGGTGTCTCGTGTGGCA
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ACGGACATCATAACAACTCACATTGATATCTTGCACAAGCTTGCGCAGCTCTTGATCGAG
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TATGTTTCTTAGATTTTTATCAAATATTCCAAAGTTGACATTTGCTTTTTAAATACCATT
AGCTGTTAATGTATACTAGACCATTGCGTATATATTTTCTTTTGTAAAATACTCTGTTTT
TACTTGGACTGCATCCTTATGAACCATCATACTTAGTAAGCTTAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F147TF U 1
AF RS1F147JQ C 1
BS 1 544 RS1F147TF
BS 545 705 RS1F147JQ

RD RS1F147TF 544 0 0
GGAGGATAATGGTTGCTGTTTCAATCTCTTCCTCCAGAATTTTCACAAAGTAAAGCTCCT
CTCTTCTTCCTCCGATTCTCATTTATACTCCCCCTCTCTCTCCAAAGAATAACCAGAGAG
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AAAGAAACTGTTGATGGAGAAGAGTTCATGAGTCTCTTTATTGACGGCCAAGCTGAGTTG
TATG

QA 1 544 1 544
DS 

RD RS1F147JQ 705 0 0
GGAGGATAATGGTTGCTGTTTCAATCTCTTCCTCCAGAATTTTCACAAAGTAAAGCTCCT
CTCTTCTTCCTCCGATTCTCATTTATACTCCCCCTCTCTCTCCAAAGAATAACCAGAGAG
AGAAAGAGTTACACAATGGCTGTTGCACTTGGTGGAAGGGTTGCAGAGGAGGTGATCTTT
GGGGATGACAATGTGACGACTGGAGCATCAAATGATTTCATGCAGGTGTCTCGTGTGGCA
CGTCAAATGATCGAGAGGTTCGGGTTCAGCAAAAAGATTGGACAAGTAGCCGTTGGTGGC
CCTGGTGGAAATCCCTTCATGGGTCAACAAATGTCTTCACAGAAAGATTACTCAATGGCA
ACTGCTGATATCGTAGATGCTGAGGTGAGAGAGCTGGTGGAGAAGGCGTACAAGAGAGCC
ACGGACATCATAACAACTCACATTGATATCTTGCACAAGCTTGCGCAGCTCTTGATCGAG
AAAGAAACTGTTGATGGAGAAGAGTTCATGAGTCTCTTTATTGACGGCCAAGCTGAGTTG
TATGTTTCTTAGATTTTTATCAAATATTCCAAAGTTGACATTTGCTTTTTAAATACCATT
AGCTGTTAATGTATACTAGACCATTGCGTATATATTTTCTTTTGTAAAATACTCTGTTTT
TACTTGGACTGCATCCTTATGAACCATCATACTTAGTAAGCTTAG

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL6962Contig1 674 2 4 U
GATATAACAGATTCCATTTCTTCCTTCGTACCTTTCGAGATTTGATTTTTTTTCATCGGA
GGAGAATGGGCGGAGACGGCAAAGTTTACACCTTGGCGGAGGTTTCACAGCACACTACCG
CCAAGGATTGCTGGATCGTCATCGATGGCAAGGTTTATGATGTGACAAAGTTCTTGGACG
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TTGAGGATGTGGGACACAGTTCGACTGCTAAAGCTATGCTTGATGAGTACTATGTGGGTG
ATATTGATACAGCCACTGTCCCAGCCAAAACCAAGTTCGTTCCTCCTTCTCCTCCTAAGC
AAACCGAGTCTAACCAGAACCAGAGCTCGGATTTCGTCGTTAAGATCCTTCAGTTCCTCG
TTCCTCTTCTCATCTTAGGCTTGGCTCTCGGTATCCGTTCTTACACCAAGACTCCTTCTT
CTTCTTGAGGACTCTCTATTGGGGATAGGTCTTTGAGTGTTTTGCCCATTTATCTTATCT
GCCTGTCTTGTAAGACTTCAGATATTATATTCTTGTTCAGTCAAGTGGATCTGTTTATGT
CTGAGAAGACCTTTTTGATTTGAAAATCAGCTACATTGTTGTCTTATATCATATTATCAT
TTGCACAAGTTACC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BR80JQ C 1
AF RS1BR80TF U 1
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QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1BR80TF 663 0 0
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GGAGAATGGGCGGAGACGGCAAAGTTTACACCTTGGCGGAGGTTTCACAGCACACTACCG
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ACCATCCTGGTGGTGACGAGGTCATCTTGACTTCTACAGGGAAAGACGCGACGGATGATT
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TTCCTCTTCTCATCTTAGGCTTGGCTCTCGGTATCCGTTCTTACACCAAGACTCCTTCTT
CTTCTTGAGGACTCTCTATTGGGGATAGGTCTTTGAGTGTTTTGCCCATTTATCTTATCT
GCCTGTCTTGTAAGACTTCAGATATTATATTCTTGTTCAGTCAAGTGGATCTGTTTATGT
CTGAGAAGACCTTTTTGATTTGAAA*TCAGCTACATTGTTGTCTTATATCATATTATCAT
TTG

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

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TTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 

AF RS1CW75JQ C 1
AF RS1CW75TF U 1
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TTT

QA 1 663 1 663
DS 

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TTT

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BW86TF U 1
AF RS1BW86JQ C 156
BS 1 811 RS1BW86TF
BS 812 851 RS1BW86JQ

RD RS1BW86TF 811 0 0
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TTTTTTATATGATTGAAATACTATTTTGTAA

QA 1 811 1 811
DS 

RD RS1BW86JQ 696 0 0
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CGATGATCTTACCGAGATGACGATGCTCCGGAATGGTTTTGTAATGGGAAGGACAACAGA
TTCGCTTGATCACTTCCACAACTTGAGGCTTGATGTTGATAATATGTCATACGAGCAACT
ACTAGAGCTTGGTGATAGAATTGGTTATGTGAATACTGGACTAAAAGAGAGCGAGATACG
TCGTTGTCTTCGGAAAATCAATCCATTCTTATCAAACACTCTTCTTGCTGATAGAAAATG
CAGCATTTGTCAGGATTAGTATGAGAGAGAGGGTCAGGTTGGGAAACTGGAATGTGGACA
CAGCTTCCATGTCCACTGCGTGAAGCAGTGGCTATCGAGGAAGAATGCTTGTCCTGTCTG
TAAGAAGACAGCATACGTCAAGGCTTAAGAGTGAGTTGTGTGTCTTGTTTAGTTTATGAT
ATCTTAAGATCTTTCATTAAAATGCCCCTATGTCTTTTGCATTTGCTGTATAGAACCAAA
TCATCTGATTCTTTATTTCATGCGTGTTGTTCTGTGATTTAGCAGTCATGTGTGTGTTCT
TGATCTTGTTTTCCTTTGTTGTTTTTTTTTTATATGATTGAAATACTATTTTGTAAGAAC
AACAGTTTGTGACCTAAGGATTCTGCAGCTTATACT

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL6965Contig1 761 2 9 U
GGACTCCTTACTTCCTTCCTTCTCTGAGTGTCACCTATGCCAAATCAAACCGTTGTGCCT
TCGACATCGATTTGCAGGTTGGTGCAGGTATAATGTTGAAGCAAGTTGTTGGCAAGTATT
CGATAGGTAAAGCAATTTATGGAAGTGACAGAGCAAAGCTTAGACCCTTCTTATACCCAA
CCAACTGTGGATTTCACATTGGGCAGACCGTTCTTGCTCCGAGAAGCTTCTTCGGCGTAG
AAGACTACGTAGACGATGACACAAGCCGACCATACACATACCAAAAAGAGAAAAAATCGA
AGAATCCTGACAAACACGTCTCCTTCAAGCAACGGACAGTCGCGTACATGGAGCCCTTCA
CACTCGACGTGTTCATCTCGAAACGTTTTGTATCCGCATCCTCACGCACCGCGTCACGTG
CAAGCAAGTCGCGGTTGCGGGAACAAACTCAAAAGACGTAAAAGCGGTGTTGAGGTCTAG
ATGCGACATCCCAGCGTGCATGTCCATAGGGAGGATCTTGTCCGAACGTGCGAAAGAGGC
TGATGTGTACACTGCTTCTTACACGCCGCGAGACCAAGATAAGTTTGAAGGGAAAATCAG
AGCTGTTGTCCAGTCCCTTATTGATAACGGAATCGATGTCAAAATCTACCTGGATTAGAT
ACCAAAATGTTTGGGTATGTGTTTAAAATTTTAAGGTTTGACTTCGAAGTGTACTTGCTA
TGTATCTGTTTAATCAAACCACAAATAAAGCGTCAGTTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1B662TF U 1
AF RS1B662JQ C 85
BS 1 655 RS1B662TF
BS 656 656 RS1B662JQ
BS 657 695 RS1B662TF
BS 696 696 RS1B662JQ
BS 697 732 RS1B662TF
BS 733 733 RS1B662JQ
BS 734 739 RS1B662TF
BS 740 740 RS1B662JQ
BS 741 761 RS1B662TF

RD RS1B662TF 761 0 0
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CGATAGGTAAAGCAATTTATGGAAGTGACAGAGCAAAGCTTAGACCCTTCTTATACCCAA
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AAGACTACGTAGACGATGACACAAGCCGACCATACACATACCAAAAAGAGAAAAAATCGA
AGAATCCTGACAAACACGTCTCCTTCAAGCAACGGACAGTCGCGTACATGGAGCCCTTCA
CACTCGACGTGTTCATCTCGAAACGTTTTGTATCCGCATCCTCACGCACCGCGTCACGTG
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ATGCGACATCCCAGCGTGCATGTCCATAGGGAGGATCTTGTCCGAACGTGCGAAAGAGGC
TGATGTGTACACTGCTTCTTACACGCCGCGAGACCAAGATAAGTTTGAAGGGAAAATCAG
AGCTGTTGTCCAGTCCCTTATTGATAACGGAATCGATGTCAAAATCTACCTGGAT*AGAT
ACCAAAATGTTTGGGTATGTGTTTAAAATTTTAAG*TTTGACTTCGAAGTGTACTTGCTA
TGTATCTGTTTA*TCAAAC*ACAAATAAAGCGTCAGTTCAT

QA 1 761 1 761
DS 

RD RS1B662JQ 677 0 0
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GTGACAGAGCAAAGCTTAGACCCTTCTTATACCCAACCAACTGTGGATTTCACATTGGGC
AGACCGTTCTTGCTCCGAGAAGCTTCTTCGGCGTAGAAGACTACGTAGACGATGACACAA
GCCGACCATACACATACCAAAAAGAGAAAAAATCGAAGAATCCTGACAAACACGTCTCCT
TCAAGCAACGGACAGTCGCGTACATGGAGCCCTTCACACTCGACGTGTTCATCTCGAAAC
GTTTTGTATCCGCATCCTCACGCACCGCGTCACGTGCAAGCAAGTCGCGGTTGCGGGAAC
AAACTCAAAAGACGTAAAAGCGGTGTTGAGGTCTAGATGCGACATCCCAGCGTGCATGTC
CATAGGGAGGATCTTGTCCGAACGTGCGAAAGAGGCTGATGTGTACACTGCTTCTTACAC
GCCGCGAGACCAAGATAAGTTTGAAGGGAAAATCAGAGCTGTTGTCCAGTCCCTTATTGA
TAACGGAATCGATGTCAAAATCTACCTGGATTAGATACCAAAATGTTTGGTTATGTGTTT
AAAATTTTAAGGTTTGACTTCGAAGTGTACTTGCTATGTATCTGTTTAATCAAACCACAA
ATAAAGCGTCAGTTCAT

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 2

CO CL6966Contig1 663 2 2 U
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AGATTCATCACACTACATTTAAAAGAACCATTACATATAATATTAATTTTGAACCGATTT
AAGACGAGAAGACAAAAGAAAAGTACATAATATTTGAACATCATATCGAGCGAGTTCTAA
CGTCTAAGAGATCAATGTCGGTTAACACGACACAGATAATAATCCTAAAACGTACCAAAA
GCCACCGACTAAAATTATTTCCCTTGATTAATTAAAACGCTAATTATTCTACTTTAGTTA
TATCAAAATATTATTAATTTAATGGTACAAAACGAGCCGACGATCGCAAGAAGAACACAA
ATACTTCCTCTTGATCTTGAAACAGAGCGGAACGAAACAAAACATCCATTTTCTTTCGAC
ATCAAGCATTTGCACTTTACCTCCACAATACGGACACGATCCAGGTGCTTGCTGTCTACC
TAGCTCTGTCTCTTCATCATCGCATAAACACACCAGACACATTCTTTTTCTTTTTTTTTT
CAGATCTGATTCTTCTCTCTATCTGTTTTTTGGGGAGATTTATAGTTTTTTTTCTTGTTC
TCAACTTCCTACGGAGGCTTTTATTGAAATATTTTTTGAAGTTTTTTTCAATGTCGCATA
TCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RS1BM92TF C 1
AF RS1BM92JQ U 9
BS 1 8 RS1BM92TF
BS 9 663 RS1BM92JQ

RD RS1BM92TF 663 0 0
GACGGTTCAAACAGGTGACGTAGTAATATAGAAAAGGAAATCGCCGGTATACCAAACTTG
AGATTCATCACACTACATTTAAAAGAACCATTACATATAATATTAATTTTGAACCGATTT
AAGACGAGAAGACAAAAGAAAAGTACATAATATTTGAACATCATATCGAGCGAGTTCTAA
CGTCTAAGAGATCAATGTCGGTTAACACGACACAGATAATAATCCTAAAACGTACCAAAA
GCCACCGACTAAAATTATTTCCCTTGATTAATTAAAACGCTAATTATTCTACTTTAGTTA
TATCAAAATATTATTAATTTAATGGTACAAAACGAGCCGACGATCGCAAGAAGAACACAA
ATACTTCCTCTTGATCTTGAAACAGAGCGGAACGAAACAAAACATCCATTTTCTTTCGAC
ATCAAGCATTTGCACTTTACCTCCACAATACGGACACGATCCAGGTGCTTGCTGTCTACC
TAGCTCTGTCTCTTCATCATCGCATAAACACACCAGACACATTCTTTTTCTTTTTTTTTT
CAGATCTGATTCTTCTCTCTATCTGTTTTTTGGGGAGATTTATAGTTTTTTTTCTTGTTC
TCAACTTCCTACGGAGGCTTTTATTGAAATATTTTTTGAAGTTTTTTTCAATGTCGCATA
TCC

QA 1 663 1 663
DS 

RD RS1BM92JQ 655 0 0
AAACAGGTGACGTAGTAATATAGAAAAGGAAATCGCCGGTATACCAAACTTGAGATTCAT
CACACTACATTTAAAAGAACCATTACATATAATATTAATTTTGAACCGATTTAAGACGAG
AAGACAAAAGAAAAGTACATAATATTTGAACATCATATCGAGCGAGTTCTAACGTCTAAG
AGATCAATGTCGGTTAACACGACACAGATAATAATCCTAAAACGTACCAAAAGCCACCGA
CTAAAATTATTTCCCTTGATTAATTAAAACGCTAATTATTCTACTTTAGTTATATCAAAA
TATTATTAATTTAATGGTACAAAACGAGCCGACGATCGCAAGAAGAACACAAATACTTCC
TCTTGATCTTGAAACAGAGCGGAACGAAACAAAACATCCATTTTCTTTCGACATCAAGCA
TTTGCACTTTACCTCCACAATACGGACACGATCCAGGTGCTTGCTGTCTACCTAGCTCTG
TCTCTTCATCATCGCATAAACACACCAGACACATTCTTTTTCTTTTTTTTTTCAGATCTG
ATTCTTCTCTCTATCTGTTTTTTGGGGAGATTTATAGTTTTTTTTCTTGTTCTCAACTTC
CTACGGAGGCTTTTATTGAAATATTTTTTGAAGTTTTTTTCAATGTCGCATATCC

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 2

CO CL6967Contig1 663 2 1 U
GGGCCGTATCGCTCGTTATCTTGCAAACAAGTGCTCTATAGCTTCCCGTATTGATTGTTT
CGCTGATGGAGCAACAACGGCATTTGGTGAGAAGCTTCGTGAACAAGTAGAGGAAAGGCT
AGACTTTTACGACAAAGGTGTTGCTCCACGCAAGAACGTAGATGTAATGAAGGAGGTGAT
AGAGAATCTGCAAAACAAAGATGAGGAAGAGAAGGAGGCAGTGGATGAGGAGAAGTCAGA
GAAAAAGAAGAAGAAAGAGAAGAGGAAGATGGAGACAGAAGAGGAGAATGAGAAATCAGA
GAAGAAGAAGAAGAAAAAGAAGAGCAAGTCTGGAGGAGAGGAAGAGACTGATGATGGTGG
TCAGAGCAAGAAGAAATCGAAGAAGAAGAAGAAGTCAAAGAGTGAGGATGACGACGAATA
GGGAGGGGATGATCCACAACATAATGGACCCTGTATTCTGTTTCTTTTTTGCTGTGTTTC
TTTTTTCTTAGTAAACTCTTCTGCTAGAGTATCTGTGTTCTATTCTGAAAACTATTTGAT
AACATCTTAAGTTTTGCCCATCATTTTAGTATTATTTTTTGTCCAATTTGCTTTTAAAAT
ATTTTCTACTTTATTATTCGAGAAGACTCGTATGCTTTTTATTGAAACAAGAACTTATCT
TGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 

AF RS1AA74JQ C 1
AF RS1AA74TF U 1
BS 1 663 RS1AA74TF

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TGC

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DS 

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CGCTGATGGAGCAACAACGGCATTTGGTGAGAAGCTTCGTGAACAAGTAGAGGAAAGGCT
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GGGAGGGGATGATCCACAACATAATGGACCCTGTATTCTGTTTCTTTTTTGCTGTGTTTC
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ATTTTCTACTTTATTATTCGAGAAGACTCGTATGCTTTTTATTGAAACAAGAACTTATCT
TGC

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1C127TF U 1
AF RS1C127JQ C 71
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GAAGTTTTTGACATTGTTGGGCTCTGTTGTCACATTGATGAAGAGCATCCTGTCGAGGCC
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ACTACGCAACATGCAAACTTCTTCAAGGTGCAGCGAAGGAGAAGGTTGAGAATAGGAGGA
TACAGCTCGGCTAATCTCGCCTTGAAGAAAGAACTCCGAGAAGCAAACTTACAGTCACTT
CTTGGTGGATCTTCTTCAAGTTTCACTTCTTCAACCAATATAGATTCTGATCCGCTGCTG
TCATCCTTTATGTTCAACTCACCTCCAAGCAAATCCGCTGCACCTGTTGTAGAAGGAACC
TCAGCTACAAAACTCTCCCATAAGGAAACTCTCAAAAGAGACATCCGAGAAGCTCCACTT
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ATGAT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1C127JQ 793 0 0
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ACATTGTTGGGCTCTGTTGTCACATTGATGAAGAGCATCCTGTCGAGGCCAAGAACGGGG
TCTGTCCTGTATGCACAAAGAGAGTGGGGTTAGATATCGTTGGTCATATCACTACGCAAC
ATGCAAACTTCTTCAAGGTGCAGCGAAGGAGAAGGTTGAGAATAGGAGGATACAGCTCGG
CTAATCTCGCCTTGAAGAAAGAACTCCGAGAAGCAAACTTACAGTCACTTCTTGGTGGAT
CTTCTTCAAGTTTCACTTCTTCAACCAATATAGATTCTGATCCGCTGCTGTCATCCTTTA
TGTTCAACTCACCTCCAAGCAAATCCGCTGCACCTGTTGTAGAAGGAACCTCAGCTACAA
AACTCTCCCATAAGGAAACTCTCAAAAGAGACATCCGAGAAGCTCCACTTTCAAGCGAAG
ATCAAGAGAAGGCAAAGAAAAGCGAGTTTGTGCGAGGTTTGTTCTTGTCAACCATGCTTG
GAGATGATTACTAGAGCGGTTTGAAATTGTTAAAGAGTGAGTCTCGATGTATGATGGAGA
AAGCTTGCAAGATAAGGTGAAGCAGAGTTTAAACCATATCTTACTACTAGTCATTGTACC
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GTTCATAGATTTT

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

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GAGTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 

AF RS1CW31JQ C 1
AF RS1CW31TF U 1
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DS 

RD RS1CW31TF 306 0 0
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ACACTTGAAGTAAATTTGTTATGCCAGGGAGTTGAGAGGTACATTTTCCAAAACTACAAA
TAGATTTGCTACAAATGTCTATCTGGAGAATAAAATAAATAAAACAATACATGAATCCAG
GAGTCC

QA 1 306 1 306
DS 



AS 1 2

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TCAAGACTACACTACGCAACAAGCTTCCCTCTTAAGCAATTGTCAGGAGCTTACAAGCTC
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CCTCAGGCTAAAGTGACGAAAAAGGTTTACTTTGATATTGAGATTGGTGGTGAAGTCGCT
GGAAGGATTGTGATGGGTCTGTTTGGTGATGTTGTCCCTAGAACCGTCGACAACTTCCGT
GCCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGGTACAAAGGTTCTTCCTTTCACCGTATCATT
AAGGACTTCATGATCCAAGGAGGTGATTTCACTGAGGGAAATGGTACTGGAGGTATTAGT
ATCTACGGTGCCAGGTTTGAAGATGAAAACTTCACCCTGAAGCATACTGGACCTGGAATT
TTGAGCATGGCTAACGCTGGTCCTAATACCAATGGAAGCCAGTTTTTCATTTGCACCGCC
AAGACTTCATGGTTAGATGGGATGCATGTTGTGTTTGGACAAGTCATTGAAGGTATGAAC
ATTGTGAGGAGACTTTAGTTTCAGGAGACGCGTGCCATGGATGTTCCCAAGAAACCTTGC
AGAATTTATGCCTGTGGAGAGCTCCCAATGGAAGCTTGATTAACGTTGGATTTTATTTTT
GTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCATGAGAAGCCAAAGATTTTGAAGTTTATGTCTCTTTTGT
TTCTTCACTATGGATGCATGAGTT


BQ
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AF RS1FI49TF U 1
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CGTCTTCTTCACTTTGACTCTTACAGTATCAACCAATCAATGGCTTCTTCGTCTCCATTG
CAAATGGTTCACACTTCTCGCACCATCTCTCAGATTGGTGTGAAGTCGCAGCTAGTCTCC
GCACATCGAACACCTCAATCACTTTGCTTCGGAGCTCGTTCCTCTGGTTTCTCACTTTCT
TCAAGACTACACTACGCAACAAGCTTCCCTCTTAAGCAATTGTCAGGAGCTTACAAGCTC
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CCTCAGGCTAAAGTGACGAAAAAGGTTTACTTTGATATTGAGATTGGTGGTGAAGTCGCT
GGAAGGATTGTGATGGGTCTGTTTGGTGATGTTGTCCCTAGAACCGTCGACAACTTCCGT
GCCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAGTATGGGTACAAAGGTTCTTCCTTTCACCGTATCATT
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QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1FI49JQ 720 0 0
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ATGGCCGCTGAGGAGGAAGAAGAAGCGCTAGCACCTCCTCAGGCTAAAGTGACGAAAAAG
GTTTACTTTGATATTGAGATTGGTGGTGAAGTCGCTGGAAGGATTGTGATGGGTCTGTTT
GGTGATGTTGTCCCTAGAACCGTCGACAACTTCCGTGCCTTGTGTACTGGTGAGAAGAAG
TATGGGTACAAAGGTTTTTCCTTTCACCGTATCATTAAGGACTTCATGATCCAAGGAGGT
GATTTCACTGAGGGAAATGGTACTGGAGGTATTAGTATTTACGGTGCCAGGTTTGAAGAT
GAAAACTTCACCCTGAAGCATACTGGACCTGGAATTTTGAGCATGGCTAACGCTGGTCCT
AATACCAATGGAAGCCAGTTTTTCATTTGCACCGCCAAGACTTCATGGTTAGATGGGATG
CATGTTGTGTTTGGACAAGTCATTGAAGGTATGAACATTGTGAGGAGACTTTAGTTTCAG
GAGACGCGTGCCATGGATGTTCCCAAGAAACCTTGCAGAATTTATGCCTGTGGAGAGCTC
CCAATGGAAGCTTGATTAACGTTGGATTTTATTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCATG
AGAAGCCAAAGATTTTGAAGTTTATGTCTCTTTTGTTTCTTCACTATGGATGCATGAGTT

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

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TATATTCTCCATCTTCTGCTAGTTAAGGAAGACAAGAATGGTGGATCTTCAAAGAAAAGT
GTGTTGCATGTGTGGTGATGTGGGTTTCTTCGACAAGCTCTTTCACTGCAGCAAGTGCCT
TAATCGCTTCCAACACTCGTACTGTAGTAGCTATTATAAAGAGCAAGGTGATCCAATTAA
GATCTGCGATTGGTGTCAATATGAAGCGAAGAGTCGAACAGGAGCAAAGCACGGTGTTAG
CGGTGGATCGTCTAAGAGATCGTACCGGTCGGAATATTCTTCAGCCAACCAGATCAAACA
ACAAGAGATTAACCAGATTTCTGCAAGTAGTAGTATACCTCCGGTAGCCGAGAAGGGTAA
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GTGTTAGTAATGTTTTTTTTAAATAACCAAGAGTTGAGAGAGTTATAGCTATAGTGTTTA
TTAGGATCTGAGATGATAATAAGACGCATGAATGTAAGATACAATTAGGGATGTTTTGTA
GATGTTGCCATGTGTGAGAAGCAATGTAACGTACCTGCGGAGTTATGTATGTTAAGGATA
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BQ
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AF RS1FU24TF U 1
AF RS1FU24JQ C 1
BS 1 654 RS1FU24TF
BS 655 684 RS1FU24JQ

RD RS1FU24TF 654 0 0
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TAATCGCTTCCAACACTCGTACTGTAGTAGCTATTATAAAGAGCAAGGTGATCCAATTAA
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ACAAGAGATTAACCAGATTTCTGCAAGTAGTAGTATACCTCCGGTAGCCGAGAAGGGTAA
AACTGGTGTACCTTCTCCTAGAACGGCCACTCGCAAGTACAAGCTTCTCAAGGATGTCAT
GTGTTAGTAATGTTTTTTTTAAATAACCAAGAGTTGAGAGAGTTATAGCTATAGTGTTTA
TTAGGATCTGAGATGATAATAAGACGCATGAATGTAAGATACAATTAGGGATGTTTTGTA
GATGTTGCCATGTGTGAGAAGCAATGTAACGTACCTGCGGAGTTATGTATGTTA

QA 1 654 1 654
DS 

RD RS1FU24JQ 684 0 0
GGATAGCATCAGTTCTTCCCTTTTGTTCTCTCTCATTCTCACATCTCCTCCTCTCCTTCA
TATATTCTCCATCTTCTGCTAGTTAAGGAAGACAAGAATGGTGGATCTTCAAAGAAAAGT
GTGTTGCATGTGTGGTGATGTGGGTTTCTTCGACAAGCTCTTTCACTGCAGCAAGTGCCT
TAATCGCTTCCAACACTCGTACTGTAGTAGCTATTATAAAGAGCAAGGTGATCCAATTAA
GATCTGCGATTGGTGTCAATATGAAGCGAAGAGTCGAACAGGAGCAAAGCACGGTGTTAG
CGGTGGATCGTCTAAGAGATCGTACCGGTCGGAATATTCTTCAGCCAACCAGATCAAACA
ACAAGAGATTAACCAGATTTCTGCAAGTAGTAGTATACCTCCGGTAGCCGAGAAGGGTAA
AACTGGTGTACCTTCTCCTAGAACGGCCACTCGCAAGTACAAGCTTCTCAAGGATGTCAT
GTGTTAGTAATGTTTTTTTTAAATAACCAAGAGTTGAGAGAGTTATAGCTATAGTGTTTA
TTAGGATCTGAGATGATAATAAGACGCATGAATGTAAGATACAATTAGGGATGTTTTGTA
GATGTTGCCATGTGTGAGAAGCAATGTAACGTACCTGCGGAGTTATGTATGTTAAGGATA
TATGATGATGTTAGTGAGTGTTTC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL6972Contig1 552 2 2 U
GGGATTATATCAGTACAAGAGAGACTTGTGAGTTATTAAAGATGTCGTCGTCTATAGTTT
CTTTGATGCTATCTCTTCTTCTCCTGGTGGTGTTGCTTAATATGGATCACGCATTTGGTG
CTCAGACTGAGATCCGTAAACTTAAAGATACAAGGATGAAATTGGAAGGAGATGACAACA
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TTAAAAACATGGCGACCAGTTATCGTACTGATCATGGTCATCTTCCAGGAGGATACTTGT
CTTCTCTCTGTCAGCCATGCAGCTCGGGAAAATGTATTGTTTATAGGTGTATTACCACCA
AAGTCTGCCAATACATCAACGGCTCACCAACGACGTGCACAAGCTCCGAGGACTGTCAAC
CCGTATCTAGCAACTGATCGGATTATAAAACTTTGTTATACATATATCGTGTTTTTTTTT
TTGCTTTTTCTATGGTTATTCGTTTCACATGTATGTTTGTGTGTTGCCACATATATTCTC
ATATTTTTATCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GI45TF U 1
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TT
TTG

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G
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TCTGCCAATACATCAACGGCTCACCAACGACGTGCACAAGCTCCGAGGACTGTCAACCCG
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CTTTTTCTATGGTTATTCGTTTCACATGTATGTTTGTGTGTTGCCACATATATTCTCATA
TTTTTATCC

QA 2 430 2 430
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1ES62TF U 1
AF RS1ES62JQ C 52
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DS 

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QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1B407JQ C 1
AF RS1B407TF U 1
BS 1 655 RS1B407TF

RD RS1B407JQ 655 0 0
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GGAAATTGGAAAGGGGAAGATACCGGACCCTGGTTCACTGAAAGCAAAGGACATGACGGT
TCTTGATGTTCCAATGGTGGTACCGTATAGAATACTGCTCAACTTGGCTCTAGACGTTGG
TGCGGACTGGGACATTGACTATTTACTCGAAATAGGTCTCACCATTGATCTTCCTGTTGT
CGGGGATTTTACTATCCCTATTACCAGCAAGGGCGAAATCAAACTCCCTACTTTTAAAGA
CTTCTTCTGAATCAACTTTGCGCAATTGAAAAAAAAAATCAAATATCGTTTGTAATGGTG
ATATGATGTAACTGATAACTGTGGTTTGCCTATAAAATCAAATATTGTTTCTTAC

QA 1 655 1 655
DS 

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CGACCTTAAAGACGTGAACGGTGACTCCGTCGAGTACTTAGCCAAAGTGTCAGTCACCAA
TCCTTACAGTCACGCGATTCCGATCTGCGAGATCAATTTCACTATCCACAGCGCTGGCCG
GGAAATTGGAAAGGGGAAGATACCGGACCCTGGTTCACTGAAAGCAAAGGACATGACGGT
TCTTGATGTTCCAATGGTGGTACCGTATAGAATACTGCTCAACTTGGCTCTAGACGTTGG
TGCGGACTGGGACATTGACTATTTACTCGAAATAGGTCTCACCATTGATCTTCCTGTTGT
CGGGGATTTTACTATCCCTATTACCAGCAAGGGCGAAATCAAACTCCCTACTTTTAAAGA
CTTCTTCTGAATCAACTTTGCGCAATTGAAAAAAAAAATCAAATATCGTTTGTAATGGTG
ATATGATGTAACTGATAACTGTGGTTTGCCTATAAAATCAAATATTGTTTCTTAC

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 2

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GACAAATAAGATCTCTTTTGCTT


BQ
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AF RS1GE78JQ C 1
AF RS1GE78TF U 1
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QA 1 563 1 563
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RD RS1GE78TF 563 0 0
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TAACTGAAAAATCAGGCGACGTTGAGCTTTTTCATTACTTGAGAATTGCGTCTCAGTGTC
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CTTTGGTGGAAGAACCACGAGATAAAGAGCCTTGAAGGTCTTCTTATGGAAGGGGTTTGT
TACCATTATACACGGTTCTAGGCTATAGAGAAATACTTTATTGTAAAGTTTTTTTTTTTG
GACAAATAAGATCTCTTTTGCTT

QA 1 563 1 563
DS 



AS 1 2

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CATGGTTCTTTGATTTCATTGCTCTTCTTATTCCTGATCTTGATCCACTGGCGATGAGGA
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C


BQ
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20 

AF RS1CL85TF C 1
AF RS1CL85JQ U 7
BS 1 6 RS1CL85TF
BS 7 661 RS1CL85JQ

RD RS1CL85TF 661 0 0
TTTTTTGCTCAAAAAAAAGATGTGTAAATTTGAACTTCCTTTATTGGGTCACGTACAACA
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TCTTGCATGAGAAGTTACTGTCTGAGTTAGAATTGGGATTGGAGTTTGATCTCTTTCCTT
CATGGTTCTTTGATTTCATTGCTCTTCTTATTCCTGATCTTGATCCACTGGCGATGAGGA
AGATGTTTGCCATTGATTAGAATCTCGTGAGCTCTGTGTGTATTTTAATGTTTCTTGTTC
C

QA 1 661 1 661
DS 

RD RS1CL85JQ 655 0 0
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CGGAAGAAGATGAGTAACAAGACGAGACCGATGTGGAAGATGATGCTGTTGATGAGCAGT
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TCTCGGTGAGACATAGGGAACATACTCCAGGAGACTGTCTGTGTTTCGTGTGCTTCTTGC
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TCTTTGATTTCATTGCTCTTCTTATTCCTGATCTTGATCCACTGGCGATGAGGAAGATGT
TTGCCATTGATTAGAATCTCGTGAGCTCTGTGTGTATTTTAATGTTTCTTGTTCC

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 2

CO CL6977Contig1 900 2 4 U
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TCTTATGCTTTGTGATTATGATCCTACTTTCAATGAAGTGACTTTAGACAATTTTGAATA
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AGATGGCCAGAGACGTGTCCACATAGCAATCTCTTCTTTACAACTTAGCTTTCTGATTCC
TCCATAAAACCCCTCTTCCTCGTTACCTTCCTCTCTATGATCTCTCTTGTTTATCATCGT
TCTTCTCCACCTCGATCCCACTGTGTACTGGTTGAATTCCAACACCACCAACTCATTAAA
ATGGCAGTGACAATGGTTGAAATTCCCATCACAGGATTCTAAGTGGCCAACGACACCATA
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F107JQ U 1
AF RS1C813JQ U 91
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BS 600 600 RS1C813JQ
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A

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DS 



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BQ
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QA 1 757 1 757
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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AF RS1FY93TF U 1
AF RS1FY93JQ C 47
BS 1 656 RS1FY93TF

RD RS1FY93TF 656 0 0
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TGACCAATGCATTCTTGTCTTCTTTTATATTTCTTTTCTTAATCGGTTTCTCGTACGCGA
TTACAAGTTCAGAGATGAGCACAATCTGTGACAAAACTTTAGATCCATCTTTCTGTCTTG
ACTTTCTCAACACAGAATTTTCATCTCCTAATCTTCAAGCCTTGGCGAATTCTACACTTG
ATGCTGCACAAGCAAAAGCAACACAAACATTCAAAGACTTCAATCTATTATTGATGGAGG
AGTCGACCCACGATCGAAACTAGCTTACAGATCATGCTTAGATGAATACGAGAATGCTAT
TGGAAACCTCGAGGAAGCTTTTGAGCATTTAGCTTCCGGTGAAGGTGAGGGGCTGAACAC
TAAAGTTTCTGCTGTATTGGATGGAGCTGATACATGTCTAGATTATGTGAAGAGACTGAG
ATCTATAGATGATTCTGTTTTGAATAATAGTAAGGAAATTAAAAATCTTTGTGGTATTAC
TCTTGTTATCTCCAACATCCTACCACGCAAATATTAATTTGGAACCATCATCATGTGTTT
GACTGATTAAGTTGTATTATTGGTAAGATAATAATTACATTTATCATATACTAATC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RS1FY93JQ 610 0 0
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TTTCTCGTACGCGATTACAAGTTCAGAGATGAGCACAATCTGTGACAAAACTTTAGATCC
ATCTTTCTGTCTTGACTTTCTCAACACAGAATTTTCATCTCCTAATCTTCAAGCCTTGGC
GAATTCTACACTTGATGCTGCACAAGCAAAAGCAACACAAACATTCAAAGACTTCAATCT
ATTATTGATGGAGGAGTCGACCCACGATCGAAACTAGCTTACAGATCATGCTTAGATGAA
TACGAGAATGCTATTGGAAACCTCGAGGAAGCTTTTGAGCATTTAGCTTCCGGTGAAGGT
GAGGGGCTGAACACTAAAGTTTCTGCTGTATTGGATGGAGCTGATACATGTCTAGATTAT
GTGAAGAGACTGAGATCTATAGATGATTCTGTTTTGAATAATAGTAAGGAAATTAAAAAT
CTTTGTGGTATTACTCTTGTTATCTCCAACATCCTACCACGCAAATATTAATTTGGAACC
ATCATCATGTGTTTGACTGATTAAGTTGTATTATTGGTAAGATAATAATTACATTTATCA
TATACTAATC

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 2

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CTATAGTGTACCTTGCATAATAAAATTATAATTGTTGGAACTCTGATTTTTGGAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1ED10JQ C 1
AF RS1ED10TF U 1
BS 1 655 RS1ED10TF

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DS 

RD RS1ED10TF 655 0 0
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GGAGCAGAGCAGTTCTACAACGAGAGGCTATTGACAAAAGTGTTGAAAACAGGAGTGAAC
GTAGGAGCTACCGAGTTGGTGAAAAAAGGAAAGTTGATTAGTAGAGAGGAAGTTGAGAAG
GCAGTGAGAGAAGTGATAGTTGGGGAAGAAGCAGAAGAAAGACGGGAACGGGCCAAGAAG
CTAGGCGAGATGGCTAAAGCTGCTGTCGAGGAAGGAGGACCTTCTTATAAGGATTTGAAC
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QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 2

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TGG


BQ
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20 20 20 

AF RS1CY16JQ C 1
AF RS1CY16TF U 1
BS 1 663 RS1CY16TF

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GTTTGGAGCATGAAGTTTTGATGTTTTGTATACAACTCTTAAATCAGTTTTATCACTCGA
TGG

QA 1 663 1 663
DS 

RD RS1CY16TF 663 0 0
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TAACTAAGTCAGCAAATTTACATTTTCTGATGTTTTTCTTGTGGCTACTTTTTCCTCTTT
TTGGTTGTTTTTGTTATATTTGATACATTGCTTTTTAGTGGAAAAAAGGTCTTGAGAATT
GTTTGGAGCATGAAGTTTTGATGTTTTGTATACAACTCTTAAATCAGTTTTATCACTCGA
TGG

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

CO CL6983Contig1 655 2 1 U
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GGGCGGTGTATGCGCTTCGGAACTGCGACGGTATTGTGGAAGAAGCCACGGAAGAGGAGC
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CCGTGGTGGTGAGTACTGCTCACGGTTTGAAGTTCACTCAGGCTAAGATCGATTACCACT
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ATAGGAAAGTCCTAGATGTTTAGGAGTTATCTAAACATCCTTATCTAATGTGTATTAGGG
CTTTAATATCTTATATATATGGAGGTGTCAAAGTGTGGCATCTCATAAGAGTTTT


BQ
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QA 1 655 1 655
DS 



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BQ
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TGAAAAAAAACAAAAAAAAACAATCTTCAATCGTGGTTCAAGCTTCCGATCTGTAAAGTT
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QA 1 659 1 659
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AAACATGGATGGATCAAGATCCTCTGCATTCCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1FK16JQ U 9
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BS 660 694 RS1FK16TF

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TCTTCTTGTACTTAAGAACCCCAAATAAGTTCATGATGCTCCAAGGAAGCTCATCAGGCT
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TGAGATTCCTCACACCTTCCCAATCTACTTTATCAGGTGTGTTCTCTCCACTCCACCTCT
GGGAAGGAAAAGCTGTAGTTCCCGTGCAGCAAATCACATGTGTCACACCCT

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1FK16TF 694 0 0
TTTTTTTTGATCATGTTTATGTATAGATGAAAGTTATTACACAAGTATATGTGTATACAC
AAGTAGACCACCATATCTGTACACATTTCTCAGTAGCATCTCCTATCATTTGGATTCTGC
AACTTTAAACAACTCTCGCCATTTCTGTGGATCACTTCCTGGACCATCTCCCTTGACTGA
ATTGATCTCATAAGCTTTCCCTTGTGTGAACTCAATATCAAGTGCCTGTATGCAAGCTTC
AGCCACCACAAGTCTGCTTACCTCTCCAACAAGTTTATCACCTTGACCAATAACAACAGC
ACGCCGTTCACCGGCTGTAGCTTTGAGCAAAGTATTGAGATCATAGGATGTGTATGGTCC
ATCAGTCAATCTACCCGGTCTGATAATGGTGAATGGAAGACCAGATTCCCGAAGAAAATC
TTCCCCCATCTTCTTGTACTTAAGAACCCCAAATAAGTTCATGATGCTCCAAGGAAGCTC
ATCAGGCTTGGTGACACCTACTGATGAAACCAGAACAACTCTCTCCACCGATGAGGGCAT
TGCTGAAATGAGATTCCTCACACCTTCCCAATCTACTTTATCAGGTGTGTTCTCTCCACT
CCACCTCTGGGAAGGAAAAGCTGTAGTTCCCGTGCAGCAAATCACATGTGTCACACCCTC
AAACATGGATGGATCAAGATCCTCTGCATTCCTC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL6987Contig1 768 2 11 U
GGAACTAAACACTACAAACAATAAAGTTCTTAGAAGCCATCACAGATTAAGCATGAAGAT
ATTCATACTCTCCATCCTACTTCTAAGCATCACCACGTTAATCAATGGTGGAATAACAAG
CAAATACGTGCGACAAGCCCAACCAGCAAACGAGATGTCTCTCGAAACATTCCCTTCTCC
ACCCGGTCACAATGCTCCAGAACAGGTTCATCTAACGCAAGGAGATCGCGATGGCCGTGG
CATGATCATCTCGTGGGTGACACCGTTAAACCTAGCTGGTTCTGACGTGGTTACTTACTG
GATCGCCGATAATGGAAGTGACGTGAAGCGAAGAAAGAAGAAAGCCTCCACGTCGTCTTA
CAAATTTTATGACTATTCTTCTGGATTTCTTCATCACGCCACCATTAAAAATCTCGAGTA
CGATACTAAATACATCTATGAGGTTGGTACTGATAAATCAGTTAGACAATTCTCCTTCAC
AACTCCACCGAAGGTTGGACCTGATGTTCCATACACATTCGGGATTATTGGTGATCTTGG
ACAAACCTATGCTTCTAACGAAACATTGTACCAATACATGTCGAACCCTAAAGGCCAAAC
CATTCTCTTTCCCGGAGACTTGGCTTACCAAGACAACCATCCAAACCATGACCAGAGAAA
ATGGGATACTTATGGAAGATTCATGGAGCCTTGCGCTGCTTACCAGCCCATTATCTATGC
CGCCGGGATCACGAGATTGATTTCGTTCCAACATAGTGAGCGTCACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C455TF U 12
AF RS1BC11TF U 1
BS 1 82 RS1BC11TF
BS 83 83 RS1C455TF
BS 84 446 RS1BC11TF
BS 447 447 RS1C455TF
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BS 487 487 RS1C455TF
BS 488 564 RS1BC11TF
BS 565 565 RS1C455TF
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BS 643 643 RS1C455TF
BS 644 768 RS1BC11TF

RD RS1C455TF 691 0 0
GG
ACAAACAATAAAGTTCTTAGAAGCCATCACAGATTAAGCATGAAGATATTCATACTCTCC
ATCCTACTTCTAAGCATCACCACGTTAATCAATGGTGGAATAACAAGCAAATACGTG**A
CAAGCTCAACCAGCAAACGAGATGTCTCTCGAAACATTCCCTTCTCCACCCGGTCACAAT
GCTCCAGAACAGGTTCATCTAACGCAAGGAGATCGCGATGGCCGTGGCATGATCATCTCG
TGGGTGACACCGTTAAACCTAGCTGGTTCTGACGTGGTTACTTACTGGATCGCCGATAAT
GGAAGTGACGTGAAGCGGAGAAAGAAGAAAGCCTCCACGTCGTCTTACAAATTTTATGAC
TATTCTTCTGGATTTCTTCATCACGCCACCATTAAAAATCTCGAGTACGATACTAAATAC
ATCTATGAGGTTGGTACTGATAAATCAGTTAGACAATTCTCCTTCACAACTCCACCGAAG
GTTGGACCTGATGTTCCATACACATTCGGGATTATTGGTGATCTTGGACAAACCTATGCT
TCTAACGAAACATTGTACCAATACATGTCTAACCCTAAAGGCCAAACCATTCTCTTTCCC
GGAGACTTGGCTTACCAAGACAACCATCCAAACCATGACCAGAGAAAATGGGATACTTAT
GGAAGATTCATGGAGCCTTGCGCTGCTTA

QA 3 691 3 691
DS 

RD RS1BC11TF 768 0 0
GGAACTAAACACTACAAACAATAAAGTTCTTAGAAGCCATCACAGATTAAGCATGAAGAT
ATTCATACTCTCCATCCTACTTTTAAGCATCACCACGTTAATCAATGGTGGAATAACAAG
CAAATACGTGCGACAAGCCCAACCAGCAAACGAGATGTCTCTCGAAACATTCCCTTCTCC
ACCCGGTCACAATGCTCCAGAACAGGTTCATCTAACGCAAGGAGATCGCGATGGCCGTGG
CATGATCATCTCGTGGGTGACACCGTTAAACCTAGCTGGTTCTGACGTGGTTACTTACTG
GATCGCCGATAATGGAAGTGACGTGAAGCGAAGAAAGAAGAAAGCCTCCACGTCGTCTTA
CAAATTTTATGACTATTCTTCTGGATTTCTTCATCACGCCACCATTAAAAATCTCGAGTA
CGATACTAAATACATCTATGAGGTTG*TACTGATAAATCAGTTAGACAATTCTCCTTCAC
AACTCCCCCGAAGGTTGGACCTGATGTTCCATACACATTCGGGATTATTGGTGATCTTGG
ACAAACCTATGCTTCTAACGAAACCTTGTACCAATACATGTCGAACCCTAAAGGCCAAAC
CATTCTCTTTCCCGGAGACTTGGCTTACCAAGACAACCATCCGAACCATGACCAGAGAAA
ATGGGATACTTATGGAAGATTCATGGAGCCTTGCGCTGCTTACCAGCCCATTATCTATGC
CGCCGGGATCACGAGATTGATTTCGTTCCAACATAGTGAGCGTCACCC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL6988Contig1 1053 2 2 U
GGAAAGGAAACAAAGCGTTTGGTGCGAGCGTGTCTCGTGCTCGTCAAAATCCTTGGAAAA
TGTTGGGTAGGCTAGCTGCGAAGCGTCTTCTGGAGATCCGTCAAGTTTTCCGTCAACCAC
CGTCTCAGGCGTCGCGCAGCTTTTCAACAGCATTGAACTACCACCTGGATTCTCCTGATA
ACAAACCTGATCTTCCATGGGAGTTTTCAGAGGCCAACAAATCTAAGGTTAAGGAGATAC
TCTCTTACTATCCATCAAACTACAAGCAGTCTGCAGTGATCCCTCTTCTAGATCTTGCTC
AACAACAGCACGGCGGCTGGCTCCCTGTTTCTGCTATGAATGCGGTTGCTAAAGTTATAG
AAGTTGCTCCTATCCGTGTTCATGAGGTTGCTACATTCTACTCAATGTTCAACAGGGCAA
AGGTCGGAAAGTACCACCTCCTAGTTTGTGGCACAACACCTTGCATGATCCGTGGTTCAC
GGGATATCGAATCAGCTTTGCTAGACCATTTTGGAGTGAAACGCGGTGAAGTTACAAAAG
ATGGTTTGTTCTCTGTTGGAGAGATGGAATGCATGGGATGCTGTGTGAATGCGCCCATGA
TCACTGTGGCTGATTATTCCAGCGGATCAGAGGGATATACATACAACTATTTCGAAGACG
TTACACCTGAGAAAGTTGTAGAGATCGTTGAAAAGCTGAGAAAAGGAGAAAAGCCACCGC
ATGGAACTCAAAACTCAAAGAGGATCAAGTGTGGACCTGAAGGAGGAAACACTACACTGC
TAGGGGAGCCAAAGCCACCGCAGTTCCGTGATCTTGACGCTTGCTAAGCTAAGTTCTTTA
AGCCCGGTGGGTTTTATGTGGTTCAAATAACGCAAAAGGCTATAGCTATGTTTGAAGCCT
ATAGCATCAAACTGAGTTTGCATACTCTTTGTAGTCTTCTTGATTTGAAATTTAGACTCC
ATTTTAAAACGAATGGCCAAAAGCATCTTCTTTTGCTATCATCTCACTTCCAAGACTTTT
GTGAAATTGATGTAATAAAGACTTTTGTTACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ES34TF U 1
AF RS1ES34JQ C 329
BS 1 703 RS1ES34TF
BS 704 1053 RS1ES34JQ

RD RS1ES34TF 708 0 0
GGAAAGGAAACAAAGCGTTTGGTGCGAGCGTGTCTCGTGCTCGTCAAAATCCTTGGAAAA
TGTTGGGTAGGCTAGCTGCGAAGCGTCTTCTGGAGATCCGTCAAGTTTTCCGTCAACCAC
CGTCTCAGGCGTCGCGCAGCTTTTCAACAGCATTGAACTACCACCTGGATTCTCCTGATA
ACAAACCTGATCTTCCATGGGAGTTTTCAGAGGCCAACAAATCTAAGGTTAAGGAGATAC
TCTCTTACTATCCATCAAACTACAAGCAGTCTGCAGTGATCCCTCTTCTAGATCTTGCTC
AACAACAGCACGGCGGCTGGCTCCCTGTTTCTGCTATGAATGCGGTTGCTAAAGTTATAG
AAGTTGCTCCTATCCGTGTTCATGAGGTTGCTACATTCTACTCAATGTTCAACAGGGCAA
AGGTCGGAAAGTACCACCTCCTAGTTTGTGGCACAACACCTTGCATGATCCGTGGTTCAC
GGGATATCGAATCAGCTTTGCTAGACCATTTTGGAGTGAAACGCGGTGAAGTTACAAAAG
ATGGTTTGTTCTCTGTTGGAGAGATGGAATGCATGGGATGCTGTGTGAATGCGCCCATGA
TCACTGTGGCTGATTATTCCAGCGGATCAGAGGGATATACATACAACTATTTCGAAGACG
TTACACCTGAGAAAGTTGTAGAGATCGTTGAAAAGCTGAGAAA
GGAGA

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1ES34JQ 725 0 0
TTCTGCTATGAATGCGGTTGCTAAAGTTATAGAAGTTGCTCCTATCCGTGTTCATGAGGT
TGCTACATTCTACTCAATGTTCAACAGGGCAAAGGTCGGAAAGTACCACCTCCTAGTTTG
TGGCACAACACCTTGCATGATCCGTGGTTCACGGGATATCGAATCAGCTTTGCTAGACCA
TTTTGGAGTGAAACGCGGTGAAGTTACAAAAGATGGTTTGTTCTCTGTTGGAGAGATGGA
ATGCATGGGATGCTGTGTGAATGCGCCCATGATCACTGTGGCTGATTATTCCAGCGGATC
AGAGGGATATACATACAACTATTTCGAAGACGTTACACCTGAGAAAGTTGTAGAGATCGT
TGAAAAGCTGAGAAAAGGAGAAAAGCCACCGCATGGAACTCAAAACTCAAAGAGGATCAA
GTGTGGACCTGAAGGAGGAAACACTACACTGCTAGGGGAGCCAAAGCCACCGCAGTTCCG
TGATCTTGACGCTTGCTAAGCTAAGTTCTTTAAGCCCGGTGGGTTTTATGTGGTTCAAAT
AACGCAAAAGGCTATAGCTATGTTTGAAGCCTATAGCATCAAACTGAGTTTGCATACTCT
TTGTAGTCTTCTTGATTTGAAATTTAGACTCCATTTTAAAACGAATGGCCAAAAGCATCT
TCTTTTGCTATCATCTCACTTCCAAGACTTTTGTGAAATTGATGTAATAAAGACTTTTGT
TACAT

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL6989Contig1 743 2 6 U
GGGTCGTCAGCAACCACCGGGACTCGTCAGACCGATCTAGGGTTTCGCCGTCGTCATGTA
CCGCATGGCAGCTTTACGAGCCAAGGCTCTTACGGGCTGTCTTAGCCGGGGTTTCAGGGC
ATCACGCTATGCAAGCTCAACTGCTGCTATTGCAACGGCTTCACCAGTTTTCTCAGGTGG
CTCGATTCCTTCGTTGAACATTCCCTTGGAAGGTGTCTCTCTTCCACCATCACTCTCTGA
TAATCTCAACCCTAGCAAGCTTCACACCACTACTCTTCCCAATGGTCTCAAAATAGCCTC
TGAGATGTCTCCGAATCCAGCAGCTTCGGTTGGTTTATACGTTGACTGCGGCTCTATCTA
CGAGACACCTTATTCACGCGGAGCTACGCACTTGCTTGAGAGGATGGCTTTCAAGAGCAC
GTTGAACAGAAGCCATCTTCGTCTTGTGAGGGAGATAGAGTCCATGGGAGCAAACACTTC
AGCCTCTGCTTCCCGAGAGCAGATGGGTTACACCATCGATGCTCTCAAAACATATGTTCC
TCACATGGTTGAAGTGCTTGTCGACAGTGTGAGGAACCCTGCTTTCCTCGATTGGGAAGT
CAACGAAGAGCTCGGGAAAGTGAAAGTGGAGATAGGAGAGCTTGCAAAGAACCCTATGGG
TTATCTCCTCGAGGCGGCTCATTCTGCTGCTTACTCTGGCGCTATGGCTAATCCTTTGTA
CGCACCTGAATCTGCAATTAGTG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GA52TF U 1
AF RS1CV61TF U 4
BS 1 171 RS1GA52TF
BS 172 172 RS1CV61TF
BS 173 453 RS1GA52TF
BS 454 454 RS1CV61TF
BS 455 665 RS1GA52TF
BS 666 743 RS1CV61TF

RD RS1GA52TF 665 0 0
GGGTCGTCAGCAACCACCGGGACTCGTCAGACCGATCTAGGGTTTCGCCGTCGTCATGTA
CCGCATGGCAGCTTTACGAGCCAAGGCTCTTACGGGCTGTCTTAGCCGGGGTTTCAGGGC
ATCACGCTATGCAAGCTCAACTGCTGCTATTGCAACGGCTTCACCAGTTTT*TCAGGTGG
CTCGATTCCTTCGTTGAACATTCCCTTGGAAGGTGTCTCTCTTCCACCATCACTCTCTGA
TAATCTCAACCCTAGCAAGCTTCACACCACTACTCTTCCCAATGGTCTCAAAATAGCCTC
TGAGATGTCTCCGAATCCAGCAGCTTCGGTTGGTTTATACGTTGACTGCGGCTCTATCTA
CGAGACACCTTATTCACGCGGAGCTACGCACTTGCTTGAGAGGATGGCTTTCAAGAGCAC
GTTGAACAGAAGCCATCTTCGTCTTGTGAGGGATATAGAGTCCATGGGAGCAAACACTTC
AGCCTCTGCTTCCCGAGAGCAGATGGGTTACACCATCGATGCTCTCAAAACATATGTTCC
TCACATGGTTGAAGTGCTTGTCGACAGTGTGAGGAACCCTGCTTTCCTCGATTGGGAAGT
CAACGAAGAGCTCGGGAAAGTGAAAGTGGAGATAGGAGAGCTTGCAAAGAACCCTATGGG
TTATC

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1CV61TF 740 0 0
GG
GTCAGCAACCACCGGGACTCGTCAGACCGATCTAGGGTTTCGCCGTCGTCATGTACCGCA
TGGCAGCTTTACGAGCCAAGGCTCTTACGGGCTGTCTTAGCCGGGGTTTCAGGGCATCAC
GCTATGCAAGCTCAACTGCTGCTATTGCAACGGCTTCACCAGTTTTCTCAGGTGGCTCGA
TTCCTTCGTTGAACATTCCCTTGGAAGGTGTCTCTCTTCCACCATCACTCTCTGATAATC
TCAACCCTAGCAAGCTTCACACCACTACTCTTCCCAATGGTCTCAAAATAGCCTCTGAGA
TGTCTCCGAATCCAGCAGCTTCGGTTGGTTTATACGTTGACTGCGGCTCTATCTACGAGA
CACCTTATTCACGCGGAGCTACGCACTTGCTTGAGAGGATGGCTTTCAAGAGCACGTTGA
ACAGAAGCCATCTTCGTCTTGTGAGGGAGATAGAGTCCATGGGAGCAAACACTTCAGCCT
CTGCTTCCCGAGAGCAGATGGGTTACACCATCGATGCTCTCAAAACATATGTTCCTCACG
TGGTTGAAGTGCTTGTCGACAGTGTGAGGAACCCTGCTTTCCTCGATTGGGAAGTCAACG
AAGAGCTCGGGAAAGTGAAAGTGGAGATAGGAGAGCTTGCAAAGAACCCTATGGGTTATC
TCCTCGAGGCGGCTCATTCTGCTGCTTACTCTGGCGCTATGGCTAATCCTTTGTACGCAC
CTGAATCTGCAATTAGTG

QA 3 740 3 740
DS 



AS 1 2

CO CL6990Contig1 681 2 1 U
ATGCGCATGCTAGATTGGATCCTGATGTTGAAGACCTCCTTTTGGAGTTAGCGGATGACT
TCATTGATTCGGTGACTTCATTTGCTTGTAGCTTGGCTAAGCATCGTAAATCATCCATAC
TGGAACCAAAGGATATATTACTCCACCTAGAGAAAAACTTACACTTGACAGTTCCTGATT
CTCAAGTGAGGATAAACACCAAACAAAAAACGCACCAACTGATCTCCACAAGAAGCGAGT
TGCAATGGTGCGTGCTTTGATGGAATCCTCAAAACCGGAGACGAATGCGAGCAATTCTAA
GGAAACTAATAGACAAGTGATGGTTAACCCAAATGGTCAAAACCATCTCTTAAGACCATC
ACCAAGTTCAGAGCAATTGGTTTCGCAGACATCCGGTCCTCACATGTTACAACATATGAC
ACGCTACTGAAGGACTTCAATACACAAGTCTATGCTACGTTCATCTTCTTGGTTTCAGGA
GTTTACACTTCTATCTATACCAGATATTAAAGAGAGTGAAGGCACAGGGAGTCGAGTTAA
ACTGTATGTATATTATATATATGAGTCTTCTAGGCAAACAAATAAAACAGTTATTTCTTC
CCATAGTTTGATCTATTTAATAGTCACATACAGTACATTGTAATTGATAATGATTTGCAT
TGAAGTTTTTGGGGATTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A105TV U 1
AF RS1A105TF U 18
BS 1 681 RS1A105TV

RD RS1A105TV 681 0 0
ATGCGCATGCTAGATTGGATCCTGATGTTGAAGACCTCCTTTTGGAGTTAGCGGATGACT
TCATTGATTCGGTGACTTCATTTGCTTGTAGCTTGGCTAAGCATCGTAAATCATCCATAC
TGGAACCAAAGGATATATTACTCCACCTAGAGAAAAACTTACACTTGACAGTTCCTGATT
CTCAAGTGAGGATAAACACCAAACAAAAAACGCACCAACTGATCTCCACAAGAAGCGAGT
TGCAATGGTGCGTGCTTTGATGGAATCCTCAAAACCGGAGACGAATGCGAGCAATTCTAA
GGAAACTAATAGACAAGTGATGGTTAACCCAAATGGTCAAAACCATCTCTTAAGACCATC
ACCAAGTTCAGAGCAATTGGTTTCGCAGACATCCGGTCCTCACATGTTACAACATATGAC
ACGCTACTGAAGGACTTCAATACACAAGTCTATGCTACGTTCATCTTCTTGGTTTCAGGA
GTTTACACTTCTATCTATACCAGATATTAAAGAGAGTGAAGGCACAGGGAGTCGAGTTAA
ACTGTATGTATATTATATATATGAGTCTTCTAGGCAAACAAATAAAACAGTTATTTCTTC
CCATAGTTTGATCTATTTAATAGTCACATACAGTACATTGTAATTGATAATGATTTGCAT
TGAAGTTTTTGGGGATTTATC

QA 1 681 1 681
DS 

RD RS1A105TF 647 0 0
GATCCTGATGTTGAAGACCTCCTTTTGGAGTTAGCGGATGACTTCATTGATTCGGTGACT
TCATTTGCTTGTAGCTTGGCTAAGCATCGTAAATCATCCATACTGGAACCAAAGGATATA
TTACTCCACCTAGAGAAAAACTTACACTTGACAGTTCCTGATTCTCAAGTGAGGATAAAC
ACCAAACAAAAAACGCACCAACTGATCTCCACAAGAAGCGAGTTGCAATGGTGCGTGCTT
TGATGGAATCCTCAAAACCGGAGACGAATGCGAGCAATTCTAAGGAAACTAATAGACAAG
TGATGGTTAACCCAAATGGTCAAAACCATCTCTTAAGACCATCACCAAGTTCAGAGCAAT
TGGTTTCGCAGACATCCGGTCCTCACATGTTACAACATATGACACGCTACTGAAGGACTT
CAATACACAAGTCTATGCTACGTTCATCTTCTTGGTTTCAGGAGTTTACACTTCTATCTA
TACCAGATATTAAAGAGAGTGAAGGCACAGGGAGTCGAGTTAAACTGTATGTATATTATA
TATATGAGTCTTCTAGGCAAACAAATAAAACAGTTATTTCTTCCCATAGTTTGATCTATT
TAATAGTCACATACAGTACATTGTAATTGATAATGATTTGCATTGAA

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 2

CO CL6991Contig1 685 2 2 U
GGTCTGAGAGGTCTCTGGTTGCGTTAGAAGAGAAGAGAGGCAGCAGAAGAAGCTTCAGAG
CATTTCCTGTTTTCAAGGAACAAGAGATTGAGGAAGATGAGGAAAGCAGGAGAGAGCGAG
GGAAAGGAAACGTTGAGAAATGGCTCCACATATTACTTGACAACAACAACAAAACCACCA
TCCACAGGATCTTCTTCAAGCTGAAAGAAACAAGAAGATTGATGAAATGATAGAGAAACT
AGACCACAAGTTCCCTCTGCTTAACAAGGTTAATGAAGAAGATGCTGTAGACTTGCAGTT
GAAGGCTGAGAAGGCAAACAAGGTGGAGGAAACAAGAACTAAAAGCTCACGTAGAAGCAG
AATGAGTTTTGATCTGAAGAACACAACACCAGAGAAGAAGAGTGGCAGAGATAAAGTGGT
GAAGAGATCAGAGAGTGCTAGAGCTTTCAGAAGGATTCCATCATCTCCTTCACTCATCTT
TGGAATGAAAAAGGGACTTAATAAGAAGCCAGTGGTTCCAGGTCATGACGATGAGAATGA
GTACCTCGTTAAGAACAACTTCATCAAGTCATCTCTCCAAACAATCAAACGAGCTGTCAA
ATTCTAAACCAACATTTTTTTTCATTACATGGATTTGTTTTGGTTTGTGTACAAAAAAAA
GACTTCCTTCCTTCCTCTATGTGTA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BS10TF U 1
AF RS1BS10JQ C 1
BS 1 651 RS1BS10TF
BS 652 685 RS1BS10JQ

RD RS1BS10TF 651 0 0
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AGACCACAAGTTCCCTCTGCTTAACAAGGTTAATGAAGAAGATGCTGTAGACTTGCAGTT
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QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1BS10JQ 685 0 0
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CATTTCCTGTTTTCAAGGAACAAGAGATTGAGGAAGATGAGGAAAGCAGGAGAGAGCGAG
GGAAAGGAAACGTTGAGAAATGGCTCCACATATTACTTGACAACAACAACAAAACCACCA
TCCACAGGATCTTCTTCAAGCTGAAAGAAACAAGAAGATTGATGAAATGATAGAGAAACT
AGACCACAAGTTCCCTCTGCTTAACAAGGTTAATGAAGAAGATGCTGTAGACTTGCAGTT
GAAGGCTGAGAAGGCAAACAAGGTGGAGGAAACAAGAACTAAAAGCTCACGTAGAAGCAG
AATGAGTTTTGATCTGAAGAACACAACACCAGAGAAGAAGAGTGGCAGAGATAAAGTGGT
GAAGAGATCAGAGAGTGCTAGAGCTTTCAGAAGGATTCCATCATCTCCTTCACTCATCTT
TGGAATGAAAAAGGGACTTAATAAGAAGCCAGTGGTTCCAGGTCATGACGATGAGAATGA
GTACCTCGTTAAGAACAACTTCATCAAGTCATCTCTCCAAACAATCAAACGAGCTGTCAA
ATTTTAAACCAACATTTTTTTTCATTACATGGATTTGTTTTGGTTTGTGTACAAAAAAAA
GACTTCCTTCCTTCCTCTATGTGTA

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL6992Contig1 841 2 2 U
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ATGGGTGGAGAAGGAGGAGATTCGAGTAAGCCGCAGACTGCTGGTGGTGAAGGAGGAGAT
GTGGTGGCCGTGGCCGTGAACGTCAGGTGCTCGAATGGATCCAAATTCAGCGTGAGCACG
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AGCTATGGTTTGCAGGCTGATCACACCGTTCATATGGTTCGAGGCTCTGCGCCTTCTTCA
TCACCTCCTCCTGCTCCTACTCCGGCTACAACCCAAACCACTGCACCTGGTGTTACTCGA
GGGGTTGGTTCAAACGACAGCTCAATCCCTGGGCTTGGATTTAATCCTCTGGGTGGTGGG
AATCCTATGTCTGGGCTATTTGGAGCTGGTCTTCCGGATCTTGAGCAGGCACAGCAACAG
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ATTGTCTCCGTCCATGTCTGTGGCATTCTCTCAGTTATAGAATAAACAGCCTTTTGAAAA
TGTGTTTCGGTAATGAATGATGATATTCATGGAATTTTTATAAAACTATATTTATGATAG
GATCGTGAAAGTTGTGGATAAAGATATATTTTGAGTCATCGTCGTATCATCTTTCAGTTT
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RS1DN66TF U 1
AF RS1DN66JQ C 62
BS 1 711 RS1DN66TF
BS 712 841 RS1DN66JQ

RD RS1DN66TF 711 0 0
GGGACTTTAAGAGCTTTCGTTGATCTCTTCCTCTTGATCGATTTCGCGGACGATCTAAAA
ATGGGTGGAGAAGGAGGAGATTCGAGTAAGCCGCAGACTGCTGGTGGTGAAGGAGGAGAT
GTGGTGGCCGTGGCCGTGAACGTCAGGTGCTCGAATGGATCCAAATTCAGCGTGAGCACG
AGTCTCGATTCCACGGTGGAGGCCTTCAAAGAGCTGGTGGCTCAGAAGAGCGAAGTGCCA
GCGAATCTGCAGCGTCTGATTTACAAGGGTCGGATCCTCAAGGACGACCAGTCTCTCCTC
AGCTATGGTTTGCAGGCTGATCACACCGTTCATATGGTTCGAGGCTCTGCGCCTTCTTCA
TCACCTCCTCCTGCTCCTACTCCGGCTACAACCCAAACCACTGCACCTGGTGTTACTCGA
GGGGTTGGTTCAAACGACAGCTCAATCCCTGGGCTTGGATTTAATCCTCTGGGTGGTGGG
AATCCTATGTCTGGGCTATTTGGAGCTGGTCTTCCGGATCTTGAGCAGGCACAGCAACAG
CTAGCTCAGAACCCTAACATGATTAGAGATATGATGAACACGCCAGCCATTCAGATCCTA
ATGAACAACCCTGAGTTTATGAGGAGTATTGGCCAGTAGTAGCAGCAAGTTCGTGAACTG
ATTGTCTCCGTCCATGTCTGTGGCATTCTCTCAGTTATAGAATAAACAGCC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RS1DN66JQ 780 0 0
TGGGTGGAGAAGGAGGAGATTCGAGTAAGCCGCAGACTGCTGGTGGTGAAGGAGGAGATG
TGGTGGCCGTGGCCGTGAACGTCAGGTGCTCGAATGGATCCAAATTCAGCGTGAGCACGA
GTCTCGATTCCACGGTGGAGGCCTTCAAAGAGCTGGTGGCTCAGAAGAGCGAAGTGCCAG
CGAATCTGCAGCGTCTGATTTACAAGGGTCGGATCCTCAAGGACGACCAGTCTCTCCTCA
GCTATGGTTTGCAGGCTGATCACACCGTTCATATGGTTCGAGGCTTTGCGCCTTCTTCAT
CACCTCCTCCTGCTCCTACTCCGGCTACAACCCAAACCACTGCACCTGGTGTTACTCGAG
GGGTTGGTTCAAACGACAGCTCAATCCCTGGGCTTGGATTTAATCCTCTGGGTGGTGGGA
ATCCTATGTCTGGGCTATTTGGAGCTGGTCTTCCGGATCTTGAGCAGGCACAGCAACAGC
TAGCTCAGAACCCTAACATGATTAGAGATATGATGAACACGCCAGCCATTCAGATCCTAA
TGAACAACCCTGAGTTTATGAGGAGTATTGGCCAGTAGTAGCAGCAAGTTCGTGAACTGA
TTGTCTCCGTCCATGTCTGTGGCATTCTCTCAGTTATAGAATAAACAGCCTTTTGAAAAT
GTGTTTCGGTAATGAATGATGATATTCATGGAATTTTTATAAAACTATATTTATGATAGG
ATCGTGAAAGTTGTGGATAAAGATATATTTTGAGTCATCGTCGTATCATCTTTCAGTTTT

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL6993Contig1 354 2 2 U
GTATGCAACTTATGACAAACACAATAATAATATCTGTTACAGAAAGATCTCTTGCTTATC
TTGGTATAAACCCAATTATTATATCTTTCAAGGAAACATTAGGAAGTATAGTGTTTTTGA
CTCAAAGCTTGGAAGGAGGTTTGTACCATCCCCATGGTTCATCAGAGATATACTGTGTCA
CCTGCTTCACACTCAAGTAGTTCTCAAGTCCCCATTCTCCTAGTTCACGGCCAAAACCAC
TGCGTTTGGTTCCACCCCATGGAGCCTGACAGAAACATGGCTGAAAGCAGTTGACCCACA
CAATACCCGCCTCGAATGCCTTACTAACGCGATCACACCTCTCCAGATCATTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FC18TF C 1
AF RS1FC18JQ U 169
BS 1 168 RS1FC18TF
BS 169 354 RS1FC18JQ

RD RS1FC18TF 329 0 0
GTATGCAACTTATGACAAACACAATAATAATATCTGTTACAGAAAGATCTCTTGCTTATC
TTGGTATAAACCCAATTATTATATCTTTCAAGGAAACATTAGGAAGTATAGTGTTTTTGA
CTCAAAGCTTGGAAGGAGGTTTGTACCATCCCCATGGTTCATCAGAGATATACTGTGTCA
CCTGCTTCACACTCAAGTAGTTCTCAAGTCCCCATTCTCCTAGTTCACGGCCAAAACCAC
TGCGTTTGGTTCCACCCCATGGAGCCTGACAGAAACATGGCTGAGAGCAGTTGACCCACA
CAATACCCGCCTCGAATGCCTTACTAACG

QA 1 329 1 329
DS 

RD RS1FC18JQ 186 0 0
TATACTGTGTCACCTGCTTCACACTCAAGTAGTTCTCAAGTCCCCATTCTCCTAGTTCAC
GGCCAAAACCACTGCGTTTGGTTCCACCCCATGGAGCCTGACAGAAACATGGCTGAAAGC
AGTTGACCCACACAATACCCGCCTCGAATGCCTTACTAACGCGATCACACCTCTCCAGAT
CATTTC

QA 1 186 1 186
DS 



AS 1 2

CO CL6994Contig1 712 2 11 U
TTTTCTTTCGCTTCTAATAAAGAACCTATAATAAGATAATTTTCTTTTAAGTTTTCTTTA
ACATGACAAACGAAGCAGCTTTGAGATCGTCAATGGTAGGTCTTGCATTGGTGATGGTGT
TGGCATGGTTATGGACACAGTCTTTAAAGAAGACGGTTGTTACCTATGCAATCGGTGTTT
CTCTGATCGCTGGCATAGTCTTACCTGACTGGGACTTCTTTGATCGGAGTTTCTCCCGGT
GGACCTACCCTGTTACGGCCGAGGAAAGAGCAGCTGCTCTCTCCCGCAAATCACAATCTT
CAAGGTTTAGAGTGTACCCTATGCGGATGGTCGTATACGTAACGGTGTACGGATATGCAG
TGTATAGGTGGTGGATGTTCGTGACGAAATGAAGCCATTTTGTTCCATCTTTCTGTGTGT
TTAGCGTTGATTAACATATTATGTTAGCGGTGTTTCTTTAAATAAAATTTTGAAATCTGA
ATAATATGTCAGACCTACTGAAACCAAAAAAAGGAAAGAGATCCACCATCGCACAATGGT
GTCTGTTAAAGATAGTACAAAAACCGTAAAATGTATATTGGAAGTTTTTTTGTTTTTTTT
TTAAAGTTGTACAGAAAAATATGGGACGAAAATAAATTAACGATAAACTATGATACGTTT
AAGTTTTGTTTGTCAGAAATACTTTGAGCTAGAAAAAAGAATTGTCTGACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BF27JQ C 1
AF RS1BF27TF U 40
BS 1 39 RS1BF27JQ
BS 40 601 RS1BF27TF
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BS 680 697 RS1BF27TF
BS 698 712 RS1BF27JQ

RD RS1BF27JQ 712 0 0
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ATAATATGTCAGACCTACTGAAACCAAAAAAAGGAAAGAGATCCACCATCGCACAATGGT
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QA 1 712 1 712
DS 

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GTCTTGCATTGGTGATGGTGTTGGCATGGTTATGGACACAGTCTTTAAAGAAGACGGTTG
TTACCTATGCAATCGGTGTTTCTCTGATCGCTGGCATAGTCTTACCTGACTGGGACTTCT
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TCTCCCGCAAATCACAATCTTCAAGGTTTAGAGTGTACCCTATGCGGATGGTCGTATACG
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TTGTTCCATCTTTCTGTGTGTTTAGCGTTGATTAACATATTATGTTAGCGGTGTTTCTTT
AAATAAAATTTTGAAATCTGAATAATATGTCAGACCTACTGAAACCAAAAAAAGGAAAGA
GATCCACCATCGCACAATGGTGTCTGTTAAAGATAGTACAAAAACCGTAAAATGTATATT
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GATTGTCTGACGC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FD16TF U 1
AF RS1F084TF U 1
BS 1 715 RS1F084TF

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QA 1 646 1 646
DS 

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AGACAGGAACCTCTCGTAGATTTGTCTTTGCGATTGAACACAAATTAGGGTTTTTTATTT
CCAGGTTCTGATTCTGCTTCTTCGATTTTAAATGGGAAAATTTTGTTGCTTCACTTCCCC
TTCCGAGGTTGTGGGAGGACAATCATCATCTCGATCTGGTAAAGGAAGAAGCGATGAAGG
TTTAATCAAGTACGGCTTCAGTCTAGTCAAAGGCAAAGCTAACCACCCCATGGAGGATTA
CCATGTCGCTAACCTCATCAACAGTTCTGACTTGGGACGTGGCGGTTCCACCGCTGTTAC
GGCTATATTGATTAACGGGAGGAGGTTGTGGATAGCCAATGTTGGCGATTCGAGAGCGCT
TCTTTCTCAAGGAGGTAGGACGATGCAGATGAGTACGGATCATGAGCCTGGTGTCGAGAG
GTCGAGTATTGAGGATAGAGGTGGATTTGTATCCAATCTCCCAGGTGATGTTCCTCGAGT
GAATGGTCAGTTAGCGGTGTCTCGTGCCTTTGGAGATAAGGGATTAAAGACACATCTGAG
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AAGTGATGGCATTTGGAAGGTGATGTCAAATGAAGAGGCAATGGAGATAGCTAGA

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

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AGAAAAAAAAACTTTCATCATGTACATGTTTTAAGATTTATATAGATAGTAGCAGTACTG
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TCTAAAAACTGGAATAGTTAAATCGATAGAGAACAAAAACATTTCTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EY54JQ C 1
AF RS1EY54TF U 1
BS 1 407 RS1EY54TF

RD RS1EY54JQ 407 0 0
GAAGGATAAGGTGAGAGTGTGAGGTTCTTGCCAGGGGGTGTAATAATAATCAGATATGAT
GGGCCTTTAAATGGGCCGGTATTTTGTAAACTCAGGATCCTTTTATTTCTGGCGTAACAT
ATGATGTCTTTTGGGATTAAGCTAGTTTCATTCGCTGTTGCTCATCAAAAAAAAAACTGT
AGTTTCATTCGCTTGCTTTACTTACACATGGAATAAAACTTTGATCTTGATCAAAAAAAG
AGAAAAAAAAACTTTCATCATGTACATGTTTTAAGATTTATATAGATAGTAGCAGTACTG
GATAGTAGATTAGAAAAGAGAGCTGGAAAACCTTTATTTGTGTTATCTAACATATCATTA
TCTAAAAACTGGAATAGTTAAATCGATAGAGAACAAAAACATTTCTC

QA 1 407 1 407
DS 

RD RS1EY54TF 407 0 0
GAAGGATAAGGTGAGAGTGTGAGGTTCTTGCCAGGGGGTGTAATAATAATCAGATATGAT
GGGCCTTTAAATGGGCCGGTATTTTGTAAACTCAGGATCCTTTTATTTCTGGCGTAACAT
ATGATGTCTTTTGGGATTAAGCTAGTTTCATTCGCTGTTGCTCATCAAAAAAAAAACTGT
AGTTTCATTCGCTTGCTTTACTTACACATGGAATAAAACTTTGATCTTGATCAAAAAAAG
AGAAAAAAAAACTTTCATCATGTACATGTTTTAAGATTTATATAGATAGTAGCAGTACTG
GATAGTAGATTAGAAAAGAGAGCTGGAAAACCTTTATTTGTGTTATCTAACATATCATTA
TCTAAAAACTGGAATAGTTAAATCGATAGAGAACAAAAACATTTCTC

QA 1 407 1 407
DS 



AS 1 2

CO CL6997Contig1 795 2 4 U
GGACGTCCACAAATCTCCTGTCCACAACTTCTCCTTTCATACCTCATCCATCCACAACTC
ATCTTTTCACACCTCGTCCATCCATAACTTCCCTGTCCACAACCACGACATCATCAGACA
ATCATCCTTTGAGCCCTCATCCACCCCCAATCAACTAAACCCTAGAAATTGTTCCCATCC
ACCATAGTCACTAGCCAAGAAGAACTCCAGATTCAAGAGGGGAATAAGACCAGGGGAACC
ACGAAGGCTGTCTCGCACTAGACCTTGTCTCTTCCGTCAATTAAGCACAGATCCGGGTTA
TACCAAAGGAGAGGAGACGGATTAATGGCGAGCTCCGGTGAGTCGGAGGGCTTCCCCTTG
AACATGAAAACCAGGTGCAGACACAGAGGCGCAGTCACGGAAACAAATTCGCAGAAGAAA
AACATAATAGAGAGACGGAGATCAATTGAGGGAAAGAAGAGACTTGAAAGATGTAATCGA
AGGTGGTATAGGTTTAGTCTCTGCCGCAAACGAGACATAAAGAGAGATAGTGAGAGAGGA
TGAGATTGCTCGAAACTAGGAAAATAAAATTTAGGGTTTTAAGATGATTGGGTTAGTATG
ATGAGATGATTTGGGTTGGTGTGATTGGGTTTAGATAAAGTGATTTCTGGTTTGGTTTTT
TGGTTTGATTTTTTTTAGTATAAAGGCATTCATGTCTTTGGCTAGGTATAATGTGTCTTT
CAAGTGTAATGTGTCTTAACATGATATATGAAACTCAAAAAGTGTCTTGGAGAGTAATAA
AATCATTTTTGAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G635TF U 1
AF RS1G635JQ C 273
BS 1 660 RS1G635TF
BS 661 661 RS1G635JQ
BS 662 673 RS1G635TF
BS 674 795 RS1G635JQ

RD RS1G635TF 673 0 0
GGACGTCCACAAATCTCCTGTCCACAACTTCTCCTTTCATACCTCATCCATCCACAACTC
ATCTTTTCACACCTCGTCCATCCATAACTTCCCTGTCCACAACCACGACATCATCAGACA
ATCATCCTTTGAGCCCTCATCCACCCCCAATCAACTAAACCCTAGAAATTGTTCCCATCC
ACCATAGTCACTAGCCAAGAAGAACTCCAGATTCAAGAGGGGAATAAGACCAGGGGAACC
ACGAAGGCTGTCTCGCACTAGACCTTGTCTCTTCCGTCAATTAAGCACAGATCCGGGTTA
TACCAAAGGAGAGGAGACGGATTAATGGCGAGCTCCGGTGAGTCGGAGGGCTTCCCCTTG
AACATGAAAACCAGGTGCAGACACAGAGGCGCAGTCACGGAAACAAATTCGCAGAAGAAA
AACATAATAGAGAGACGGAGATCAATTGAGGGAAAGAAGAGACTTGAAAGATGTAATCGA
AGGTGGTATAGGTTTAGTCTCTGCCGCAAACGAGACATAAAGAGAGATAGTGAGAGAGGA
TGAGATTGCTCGAAACTAGGAAAATAAAATTTAGGGTTTTAAGATGATTGGGTTAGTATG
ATGAGATGATTTGGGTTGGTGTGATTGGGTTTAGATAAAGTGATTTCTGGTTTGGTTTTT
*GGTTTGATTTTT

QA 1 673 1 673
DS 

RD RS1G635JQ 523 0 0
TCCGTCAATTAAGCACAGATCCGGGTTATACCAAAGGAGAGGAGACGGATTAATGGCGAG
CTCCGGTGAGTCGGAGGGCTTCCCCTTGAACATGAAAACCAGGTGCAGACACAGAGGCGC
AGTCACGGAAACAAATTCGCAGAAGAAAAACATAATAGAGAGACGGAGATCAATTGAGGG
AAAGAAGAGACTTGAAAGATGTAATCGAAGGTGGTATAGGTTTAGTTTTTGCCGCAAACG
AGACATAAAGAGAGATAGTGAGAGAGGATGAGATTGCTCGAAACTAGGAAAATAAAATTT
AGGGTTTTAAGATGATTGGGTTAGTATGATGAGATGATTTGGGTTGGTGTGATTGGGTTT
AGATAAAGTGATTTCTGGTTTGGTTTTTTGGTTTGATTTTTTTTAGTATAAAGGCATTCA
TGTCTTTGGCTAGGTATAATGTGTCTTTCAAGTGTAATGTGTCTTAACATGATATATGAA
ACTCAAAAAGTGTCTTGGAGAGTAATAAAATCATTTTTGAGCT

QA 1 523 1 523
DS 



AS 1 2

CO CL6998Contig1 656 2 1 U
GAACACACAGACAGAACCGATGGGAGCTCCTAATCTGAGAGCGGTGGCTCTTATCGCCGG
CGATAAAAACGTCCGAGGATGTATTCAGTTCATTCAAGACACTTCCGGGACTACTCATGT
TACAGGAAAGATCTCAGGACTGTCTCCTGGCTTCCATGGATTTCATATTCACTCTTTTGG
TGATACCACGAATGGCTGCAACTCTACTGGACCTCACTTCAATCCATTAAATCGAGTTCA
TGGGCCACCGGATGAGGAAGAGCGTCATGCTGGAGACTTGGGTAACATTCTTGCAGGATC
AGACGGTGTTGCTGAAATCTCAATCAAGGACAAACAGATACCACTTAGTGGGCAGTATTC
GATACTTGGGAGGGCGGTTGTTGTACATGGTGATCCTGATGATCTTGGCAGAGGAGGACA
CAAGCTTAGCAAATCAACAGGAAACCCAGGCGCACGAGTTGGATGCGGTATTATCGGACT
TCAATCAGCTGTGGATCCTAAACTTTAGCTTTTGAGATCAATGAACTTACCCACACCAAA
GCTACACTCAGTTTTTTTATCTGTACATGTACATCAGAGACCATAGTTTGTATATTGATA
TACTGTTTGAGACGCAAGTCATAATAATGTAAGCCAGTACGTGAATTCAAGTTATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1FQ91JQ C 1
AF RS1FQ91TF U 1
BS 1 656 RS1FQ91TF

RD RS1FQ91JQ 656 0 0
GAACACACAGACAGAACCGATGGGAGCTCCTAATCTGAGAGCGGTGGCTCTTATCGCCGG
CGATAAAAACGTCCGAGGATGTATTCAGTTCATTCAAGACACTTCCGGGACTACTCATGT
TACAGGAAAGATCTCAGGACTGTCTCCTGGCTTCCATGGATTTCATATTCACTCTTTTGG
TGATACCACGAATGGCTGCAACTTTACTGGACCTCACTTCAATCCATTAAATCGAGTTCA
TGGGCCACCGGATGAGGAAGAGCGTCATGCTGGAGACTTGGGTAACATTCTTGCAGGATC
AGACGGTGTTGCTGAAATTTCAATCAAGGACAAACAGATACCACTTAGTGGGCAGTATTC
GATACTTGGGAGGGCGGTTGTTGTACATGGTGATCCTGATGATCTTGGCAGAGGAGGACA
CAAGCTTAGCAAATCAACAGGAAACCCAGGCGCACGAGTTGGATGCGGTATTATCGGACT
TCAATCAGCTGTGGATCCTAAACTTTAGCTTTTGAGATCAATGAACTTACCCACACCAAA
GCTACACTCAGTTTTTTTATCTGTACATGTACATCAGAGACCATAGTTTGTATATTGATA
TACTGTTTGAGACGCAAGTCATAATAATGTAAGCCAGTACGTGAATTCAAGTTATC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RS1FQ91TF 656 0 0
GAACACACAGACAGAACCGATGGGAGCTCCTAATCTGAGAGCGGTGGCTCTTATCGCCGG
CGATAAAAACGTCCGAGGATGTATTCAGTTCATTCAAGACACTTCCGGGACTACTCATGT
TACAGGAAAGATCTCAGGACTGTCTCCTGGCTTCCATGGATTTCATATTCACTCTTTTGG
TGATACCACGAATGGCTGCAACTCTACTGGACCTCACTTCAATCCATTAAATCGAGTTCA
TGGGCCACCGGATGAGGAAGAGCGTCATGCTGGAGACTTGGGTAACATTCTTGCAGGATC
AGACGGTGTTGCTGAAATCTCAATCAAGGACAAACAGATACCACTTAGTGGGCAGTATTC
GATACTTGGGAGGGCGGTTGTTGTACATGGTGATCCTGATGATCTTGGCAGAGGAGGACA
CAAGCTTAGCAAATCAACAGGAAACCCAGGCGCACGAGTTGGATGCGGTATTATCGGACT
TCAATCAGCTGTGGATCCTAAACTTTAGCTTTTGAGATCAATGAACTTACCCACACCAAA
GCTACACTCAGTTTTTTTATCTGTACATGTACATCAGAGACCATAGTTTGTATATTGATA
TACTGTTTGAGACGCAAGTCATAATAATGTAAGCCAGTACGTGAATTCAAGTTATC

QA 1 656 1 656
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7000Contig1 668 2 2 U
GACCCATATGAATGAGCAGTCCTCGAGGAGTCATTTCGTGTTTACTCTTAGGATTTCTGG
TGTGAATGAGAGCACTGAACAGCAGGTACAAGGTGTTCTTAACCTAATTGATCTTGCTGG
AAGTGAGCGACTCTCAAAGAGTGGGGCAACAGGAGAGCGATTAAAGGGAACGCAGGCAAT
AAACAAAAGCTTGTCTGCTTTGAGTGATGTTATATTTGCACTGGCAAAGAAAGAGGATCA
TGTTCCTTTCAGAAACTCCAAGTTGACATACCTGCTACAGCCATGTTTAGGAGGTGACTC
AAAGACGTTAATGTTTGTTAACATATCACCGGATCCAACTTCTACTGGAGAGTCCCTCTG
TTCTCTTCGTTTTGCTGCTAGAGTCAACGCATGTGAGATTGGGATACCGCGAAGACAAAC
TTCCTCAAAACTTATTGACAATCGCCTAAGTTACGGTTAAAGACTGGTGGTTTTGTCCCT
CATATGTGTGTGTTTACACAAGCAATTGCTTTGCTTTTAGAGGTTTGGTAATAACTGATT
GTGTGGTTTTGACTTAGTGTCTGTCTTGCTGTATGAAGCGCCCTTGAGTTCATATGCAGA
TTTGTTTCTAGATTCCATTTGATTGTGGAAACTACTACTTTCTATCTACTTGTATGAGAA
ATTGATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BI35JQ C 1
AF RS1BI35TF U 9
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TGTGTTTACACAAGCAATTGCTTTGCTTTTAGAGGTTTGGTAATAACTGATTGTGTGGTT
TTGACTTAGTGTCTGTCTTGCTGTATGAAGCGCCCTTGAGTTCATATGCAGATTTGTTTC
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DS 



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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1C441TF U 1
AF RS1FB41TF U 1
BS 1 194 RS1C441TF
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QA 1 527 1 527
DS 



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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DH45TF U 1
AF RS1DH45JQ C 114
BS 1 747 RS1DH45TF
BS 748 748 RS1DH45JQ
BS 749 766 RS1DH45TF
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RD RS1DH45TF 766 0 0
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ATTGACAACCACCACTCTACTAGACAAGGAGTTTTGGAGACTCAAGTCATCAGAAGACAT
GTGGGAGAAGATTTTTACGATTGATTTATTTTCTACTCCGCTCTATTGGATTGGCAATGA
GTCTTCTTGGACACCGGTGACAATGTGGAAGAAGACGAAGATGTTGCTCTCTCATCCATG
TTCCATGAATCTGGTAATATACAATCTCCAAACTAGGTCTGTCCGTATACTCAATATCCA
GCCACATACAGTTTGTACGCCATATTT*GAGAGTCTGATCTCTCAT

QA 1 766 1 766
DS 

RD RS1DH45JQ 752 0 0
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AATTAGTGTGGTTGTATAATTCTTTTCCAAACGAGGGAGTCACAGTCACCACGTGTGAGG
TTTTCGATTTTAGGGCAAACGCTTGGAGACACTTGACTTTTACGCCAAGTTTACGCGTTT
TTGGTATGCCAGAATCTGCCAACGGGTCAGTTTATTGGTTCACGGAAGTAGATAACAACT
ACAAAATCGACGTAATAGCTTTCGATATCCATACTGAAAAATTTCGTTTGCTGCCTAATA
TTCATCCAGTTACTTCTAGTTCAGTTTGTCATAGTAGCATGTGCACTCTGGATGATCGTT
TGTGTGTATTGACAACCACCACTCTACTAGACAAGGAGTTTTGGAGACTCAAGTCATCAG
AAGACATGTGGGAGAAGATTTTTACGATTGATTTATTTTCTACTCCGCTCTATTGGATTG
GCAATGAGTCTTCTTGGACACCGGTGACAATGTGGAAGAAGACGAAGATGTTGCTCTCTC
ATCCATGTTCCATGAATCTGGTAATATACAATCTCCAAACTAGGTCTGTCCGTATACTCA
ATATCCAGCCACATACAGTTTGTACGCCATATTTTGAGAGTCTGATCTCTCATATATAGA
ATGCTTTTGATCGATTATATAAAGCATATTGGGAAGTATGTAAGAATCAGAACATTTCTT
TATGTTGTCTTATGAGTTTTGTTCTTCTTATG

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

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GACAACAATGTAGCAACAACAACAAAAAAAACAATTAACAAGAAGATTTTACAGGAAACA
AAAAAAATATTATAATAATAATAATGGGAACTTGGAAGAAGAAGAAGAAGAGAGACCAAA
TATTGAAACTTTTCTCCTGAATTGATGATATCACAATTCTCTATATAGCTCTAAACCCTC
ATTTACCCTTTTCGCATTCCAACTTCTTCCAACCGTTTCCAAGTGGCTTCACGTTTGGCC
TTGGTCTCACCTTCCTTTGATTCGTCTTCTTTGAACTTAGCAAGGCATTCCTTGAACAGC
TCAGGGTCCAGGTCTTGGAATATCTTCCTCACGTTCAGCGTCAAGCTATGAACAGCTTGG
TTCCAATGTTTCTGTGCGTTTCTCTCCAACGCAGGGAATATAATTGGGAGAATGACTTTG
CGGCTCTGCATTATCAGATTCTCTATGTGATTGTTGTTCCATAAGAATAAAGCTCTCTCT
GCCACCTGAAAATGCAGGCTGTTCAAACACCGAGCTATCTGGCGAAAGAGCGGCACCATA
CACCGTTGGAACTCCGGAGGCTGTGTCGCTTCAAGCACTTCCTCCAACTCATTCAGAAAC
ATGACTTCTTTGGAACTATTCGTCACGGGCCAGTACTTGAGCAACCCTCTTATAACCGTA
TCAGCGAGTTTGCAATCCTTCTCCACAAACTGCGTGATGCAATAAGACAACTGCTGGTGA
TACATCTGTAAGCACTTGGGTTTGTGGAGCGGTATCAAAACCCGAACCAGAAACACTTTG
TGCTCTTCTTTCA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A011JQ U 1
AF RS1A011TR U 1
BS 1 648 RS1A011JQ
BS 649 853 RS1A011TR

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QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1A011TR 853 0 0
GCAGGTATCAAAGCAGAGAAAATGAATGAACAAAGACAGTCTCAAGAACGTGGGAACATA
GACAACAATGTAGCAACAACAACAAAAAAAACAATTAACAAGAAGATTTTACAGGAAACA
AAAAAAATATTATAATAATAATAATGGGAACTTGGAAGAAGAAGAAGAAGAGAGACCAAA
TATTGAAACTTTTCTCCTGAATTGATGATATCACAATTCTCTATATAGCTCTAAACCCTC
ATTTACCCTTTTCGCATTCCAACTTCTTCCAACCGTTTCCAAGTGGCTTCACGTTTGGCC
TTGGTCTCACCTTCCTTTGATTCGTCTTCTTTGAACTTAGCAAGGCATTCCTTGAACAGC
TCAGGGTCCAGGTCTTGGAATATCTTCCTCACGTTCAGCGTCAAGCTATGAACAGCTTGG
TTCCAATGTTTCTGTGCGTTTCTCTCCAACGCAGGGAATATAATTGGGAGAATGACTTTG
CGGCTCTGCATTATCAGATTCTCTATGTGATTGTTGTTCCATAAGAATAAAGCTCTCTCT
GCCACCTGAAAATGCAGGCTGTTCAAACACCGAGCTATCTGGCGAAAGAGCGGCACCATA
CACCGTTGGAACTCCGGAGGCTGTGTCGCTTCAAGCACTTCCTCCAACTCATTCAGAAAC
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TCAGCGAGTTTGCAATCCTTCTCCACAAACTGCGTGATGCAATAAGACAACTGCTGGTGA
TACATCTGTAAGCACTTGGGTTTGTGGAGCGGTATCAAAACCCGAACCAGAAACACTTTG
TGCTCTTCTTTCA

QA 1 853 1 853
DS 



AS 1 2

CO CL7004Contig1 1056 2 6 U
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GCATGCGGCTGTGGTAGGTCAGGACGGGAGAGTGTATACTTGGGGTTGGGGAAGATACGG
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GGAAAATTGCGGTCACTTTGGAGGGGTTTGTACAAAAGGGGGAAACATAAGTTAAGGAAC
TTGTCTTAACATTTCATTTGTATAGGGTTTTACATTATTCTAATTGTTCATGGGTCATGA
TTTTAGGTTGTTAATTGTCGAATAATTTCATTTAGTCCATTTATTGTAAGGTTCAGATTC
TATTTCATTTTGTATAAAAAGCCTCAAGGCTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DG15TF U 1
AF RS1DG15JQ C 413
BS 1 666 RS1DG15TF
BS 667 667 RS1DG15JQ
BS 668 697 RS1DG15TF
BS 698 698 RS1DG15JQ
BS 699 722 RS1DG15TF
BS 723 1056 RS1DG15JQ

RD RS1DG15TF 722 0 0
GGAGCCACGTCCTTTGTTAGGCGCGCTTGAGAACGTACCCGTTGTTCAGATTGCCGCTGG
TTATTGCTACCTTCTTGCCTTAGCTTGTCTACCAAATGGCAGCATGTCGGTTTATTCGGT
TGGTTGTGGTTTGGGAGGCAAGCTTGGTCACGGGTCTAAGACTGATGAGAAGTATCCTCG
GCTTATCGAGCAGTTTCAGGTGTTGAACATTCAACCTAGGGTAGTTGCAGCGGGCGCTTG
GCATGCGGCTGTGGTAGGTCAGGACGGGAGAGTGTATACTTGGGGTTGGGGAAGATACGG
TTGCTTAGGACACGGTAACGAGGAGTGTGAATCAGTGCCTAAAGCCGTTGAAGGGCTAAG
CCATGTCAAAGCGGTTCATGTCGCAACGGGAGACTACACTACTTTTGTTGTCTCGGAGGA
TGGTGATGTTTACTCGTTTGGTTGTGGCGAGTCTGCTAGTCTCGGTCACCATATAGCCTT
TGATGAACAGGTTAGCAGTATTGTCTACTAAACTTGCGTTGCAAGCTATTTGACTATTAT
GTTTTTTTTTGTTTGTTTATTAGGGTAATAGAAATGGGAATGTGCTGAGTCCAGCGGTAG
TAACGTCGCTGAAACAAGTGAAGGAGAAGATGGTTCAGATTAGTCTAACGAACTCTATAT
ATTGGA*CGCTCATACGTTTGCGCTCTCGGAGTCAGG*AAGCTGTTCGCGTTTGGTGCGG
GT

QA 1 722 1 722
DS 

RD RS1DG15JQ 644 0 0
TCGGAGGATGGTGATGTTTACTCGTTTGGTTGTGGCGAGTCTGCTAGTCTCGGTCACCAT
ATAGCCTTTGATGAACAGGTTAGCAGTATTGTTTACTAAACTTGCGTTGCAAGCTATTTG
ACTATTATGTTTTTTTTTGTTTGTTTATTAGGGTAATAGAAATGGGAATGTGCTGAGTCC
AGCGGTAGTAACGTCGCTGAAACAAGTGAAGGAGAAGATGGTTCAGATTAGTCTAACGAA
CTCTATATATTGGAACGCTCATACGTTTGCGCTCTCGGAGTCAGGGAAGCTGTTCGCGTT
TGGTGCGGGTGATAAGGGTCAGCTTGGAGCAGAGCTTGGTCGTGACCAGACAGAAAGGTG
TGTTCCTGAAAAAGTAAATATCGATCTCAGTTAGCGGTTTGTTGGCAGATCAGACAAAAA
AAACACATGGAAAATTGCGGTCACTTTGGAGGGGTTTGTACAAAAGGGGGAAACATAAGT
TAAGGAACTTGTCTTAACATTTCATTTGTATAGGGTTTTACATTATTCTAATTGTTCATG
GGTCATGATTTTAGGTTGTTAATTGTCGAATAATTTCATTTAGTCCATTTATTGTAAGGT
TCAGATTCTATTTCATTTTGTATAAAAAGCCTCAAGGCTTTACC

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 2

CO CL7005Contig1 778 2 4 U
GGAGGGAGATGAGAAAAGTTTATCCTCTGCATATTCAGATTGAATAAAAAAAAGAAATTT
CGAATCGTAAAACAGAGACAAAGATGGTCGGAAGCAAGGAGAAACGAGACAAGAGACTCC
AACAAGTCTCTCTCCTTCGTACTATTCCGTACTCCGATCACCAGAGGTGGTGGACATCTG
AAACTGTGGCGGTGGTAACGGGTGCAAATAGAGGCATAGGATTTGAGATAGTGAAACAAT
TGGCTGGACATGGCTTAACTGTGATATTAACATCTAGAGACGAGAATGTTGGCTTCGAAG
CCGCTAAAGTCTTGCAAGAAGGTGGCTTCAACGTTGATTTCCACCGTCTTGACATCTTGG
ACCCGTCCTCAATTCAAGACTTCTGCCAATGGATTAAGGATAAATATGGGTTCATTGATG
TTTTAATAAACAATGCAGGTGTAAACTACAATGTTGGAACACATAACTCCGTCGAGAACT
CCCACATGGTGCTATCTACAAACTACAATGGGACAAAGAACATAATCAAAGCCATGCTTC
CATTGATGAGACAAGCTTCTCCTGGTGCTCGTATTGCCAATGTCACCTCCAGGCTCGGTA
GATTAAAAGGCCGCCACAGTAAACTCGAGAACGAAGCCGTGAGAGCTAAGCTTATGGATG
TGGACTCTCTGACAGAGGAAGTCGTCGACGAAACAGTTACAGAGTTTCTGAAGCAGTGGA
AGAAGGACGTGGGAATCAGAGTTGGCACACTCTTTCACAGACTACTCCGTCTCGAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C483TF U 1
AF RS1EN87TF U 6
BS 1 11 RS1C483TF
BS 12 12 RS1EN87TF
BS 13 671 RS1C483TF
BS 672 778 RS1EN87TF

RD RS1C483TF 671 0 0
GGAGGGAGATGGGAAAAGTTTATCCTCTGCATATTCAGATTGAATAAAAAAAAGAAATTT
CGAATCGTAAAACAGAGACAAAGATGGTCGGAAGCAAGGAGAAACGAGACAAGAGACTCC
AACAAGTCTCTCTCCTTCGTACTATTCCGTACTCCGATCACCAGAGGTGGTGGACATCTG
AAACTGTGGCGGTGGTAACGGGTGCAAATAGAGGCATAGGATTTGAGATAGTGAAACAAT
TGGCTGGACATGGCTTAACTGTGATATTAACATCTAGAGACGAGAATGTTGGCTTCGAAG
CCGCTAAAGTCTTGCAAGAAGGTGGCTTCAACGTTGATTTCCACCGTCTTGACATCTTGG
ACCCGTCCTCAATTCAAGACTTCTGCCAATGGATTAAGGATAAATATGGGTTCATTGATG
TTTTAATAAACAATGCAGGTGTAAACTACAATGTTGGAACACATAACTCCGTCGAGAACT
CCCACATGGTGCTATCTACAAACTACAATGGGACAAAGAACATAATCAAAGCCATGCTTC
CATTGATGAGACAAGCTTCTCCTGGTGCTCGTATTGCCAATGTCACCTCCAGGCTCGGTA
GATTAAAAGGCCGCCACAGTAAACTCGAGAACGAAGCCGTGAGAGCTAAGCTTATGGATG
TGGACTCTCTG

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1EN87TF 773 0 0
GG
GATGAGAAAAGTTTATCCTCTGCATATTCAGATTGAATAAAAAAAAGAAATTTCGAATCG
TAAAACAGAGACAAAGATGGTCGGAAGCAAGGAGAAACGAGACAAGAGACTCCAACAAGT
CTCTCTCCTTCGTACTATTCCGTACTCCGATCACCAGAGGTGGTGGACATCTGAAACTGT
GGCGGTGGTAACGGGTGCAAATAGAGGCATAGGATTTGAGATGGTGAAACAATTGGCTGT
ACATGGCTTAACTGTGATATTAACATCTAGAGACGAGAATGTTGGCTTCGAAGCCGCTAA
AGTCTTGCAAGAAGGTGGCTTCAACGTTGATTTCCACCGTCTTGACATCTTGGACCCGTC
CTCAATTCAAGACTTCTGCCAATGGATTAAGGATAAATATGGGTTCATTGATGTTTTAAT
AAACAATGCAGGTGTAAACTACAATGTTGGAACACATAACTCCGTCGAGAACTCCCACAT
GGTGCTATCTACAAACTACAATGGGACAAAGAACATAATCAAAGCCATGCTTCCATTGAT
GAGACAAGCTTCTCCTGGTGCTCGTATTGTCAATGTCACCTCCAGGCTCGGTAGATTAAA
AGGCCGCCACAGTAAACTCGAGAACGAAGCCGTGAGAGCTAAGCTTATGGATGTGGACTC
TCTGACAGAGGAAGTCGTCGACGAAACAGTTACAGAGTTTCTGAAGCAGTGGAAGAAGGA
CGTGGGAATCAGAGTTGGCACACTCTTTCACAGACTACTCCGTCTCGAAAT

QA 3 773 3 773
DS 



AS 1 2

CO CL7006Contig1 880 2 3 U
TATGAAATTAACTGGTGGTGGACAGTAAGCAAATACATATTTTTAATAATCGGTTTAAAA
CAAAAAAAAACATTAATTCCCACCAAAAATATGAAAGGGTATGCAAAACCTTCAGTAAGT
TTTCTCGAGCAGAACTTACAGCAATCTCTCAGTCCAGGAGCAAGAACCTTTGATCGATCG
GGACTGGAACCAGAGAATCTTTAGTGTTTTCTTTTTAAGGAATTGAGATTCCGGAAGAGA
TTCGAAGGTTGGAGTCTGCTCCTCCGCTCACTACGCTGTCTCCTTTCCACCAGTCAGTAC
ATAAAACCTTATCCTTGTGTGTGTCTATAACTGACAAAGGCCAAGCGGTTCTAAGATCCC
AAAGCATGATTTTGCCATCATAGGAAGCTGAGACCAAGTGAAACCAAGAGCTTTTGTGCC
ACTTGCAAGCGGAAATCCATGATGCGTGTGAAGCAAATTGAAACACTGGAGCAGATGTTC
CAGGCTTACGAGGATCCCATACTCAAAGGATTGGATCTGAACCACCGGCTGCTACAAGCG
CAGAGCCTTCACCGCCAACATCTATCGTGTTGAGAGCTTTTCCACAGAACAAGTACAAAG
ATTCTTTCCCTGTCGAAACATCCCATCTCCTAACGGAATGGTCCCATGAACACGAATATA
TTACATCATGCTCCGGCCAAACAACTGACGAGACACACTGTGTGTGTCCAACAAATGAAG
TATCCGCCTCTCCCTCTAAATGAGTTTCCTCGGCCTGATTATTCCCTTTTCTTCTCTTCC
TGCTACTGACAACTCTGAAGTAGCCTCATCTGTGTCCATAAATTGATCGTGCATCCATGA
CCCGAGCAATCTTGCTCCCGTATTCTGAGCTGCACACTTG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CK57JQ U 1
AF RS1B427JQ U 1
BS 1 418 RS1B427JQ
BS 419 419 RS1CK57JQ
BS 420 880 RS1B427JQ

RD RS1CK57JQ 652 0 0
TATGAAATTAACTGGTGGTGGACAGTAAGCAAATACATATTTTTAATAATCGGTTTAAAA
CAAAAAAAAACATTAATTCCCACCAAAAATATGAAAGGGTATGCAAAACCTTCAGTAAGT
TTTCTCGAGCAGAACTTACAGCAATCTCTCAGTCCAGGAGCAAGAACCTTTGATCGATCG
GGACTGGAACCAGAGAATCTTTAGTGTTTTCTTTTTAAGGAATTGAGATTCCGGAAGAGA
TTCGAAGGTTGGAGTCTGCTCCTCCGCTCACTACGCTGTCTCCTTTCCACCAGTCAGTAC
ATAAAACCTTATCCTTGTGTGTGTCTATAACTGACAAAGGCCAAGCGGTTCTAAGATCCC
AAAGCATGATTTTGCCATCATAGGAAGCTGAGACCAAGTGAAACCAAGAGCTTTTGTGCC
ACTTGCAAGCGGAAATCCATGATGCGTGTGAAGCAAATTGAAACACTGGAGCAGATGTTC
CAGGCTTACGAGGATCCCATACTCAAAGGATTGGATCTGAACCACCGGCTGCTACAAGCG
CAGAGCCTTCACCGCCAACATCTATCGTGTTGAGAGCTTTTCCACAGAACAAGTACAAAG
ATTCTTTCCCTGTCGAAACATCCCATCTCCTAACGGAATGGTCCCATGAACA

QA 1 652 1 652
DS 

RD RS1B427JQ 880 0 0
TATGAAATTAACTGGTGGTGGACAGTAAGCAAATACATATTTTTAATAATCGGTTTAAAA
CAAAAAAAAACATTAATTCCCACCAAAAATATGAAAGGGTATGCAAAACCTTCAGTAAGT
TTTCTCGAGCAGAACTTACAGCAATCTCTCAGTCCAGGAGCAAGAACCTTTGATCGATCG
GGACTGGAACCAGAGAATCTTTAGTGTTTTCTTTTTAAGGAATTGAGATTCCGGAAGAGA
TTCGAAGGTTGGAGTCTGCTCCTCCGCTCACTACGCTGTCTCCTTTCCACCAGTCAGTAC
ATAAAACCTTATCCTTGTGTGTGTCTATAACTGACAAAGGCCAAGCGGTTCTAAGATCCC
AAAGCATGATTTTGCCATCATAGGAAGCTGAGACCAAGTGAAACCAAGAGCTTTTGTGGC
ACTTGCAAGCGGAAATCCATGATGCGTGTGAAGCAAATTGAAACACTGGAGCAGATGTTC
CAGGCTTACGAGGATCCCATACTCAAAGGATTGGATCTGAACCACCGGCTGCTACAAGCG
CAGAGCCTTCACCGCCAACATCTATCGTGTTGAGAGCTTTTCCACAGAACAAGTACAAAG
ATTCTTTCCCTGTCGAAACATCCCATCTCCTAACGGAATGGTCCCATGAACACGAATATA
TTACATCATGCTCCGGCCAAACAACTGACGAGACACACTGTGTGTGTCCAACAAATGAAG
TATCCGCCTCTCCCTCTAAATGAGTTTCCTCGGCCTGATTATTCCCTTTTCTTCTCTTCC
TGCTACTGACAACTCTGAAGTAGCCTCATCTGTGTCCATAAATTGATCGTGCATCCATGA
CCCGAGCAATCTTGCTCCCGTATTCTGAGCTGCACACTTG

QA 1 880 1 880
DS 



AS 1 2

CO CL7007Contig1 885 2 2 U
GGAGAACAGATCTAACCCTAAACTCACAGAGGCGACCGTCTCAACAAATAGCTTCCAATC
GTAAGCGTCTCAAATTTTCTCGATGAGCCCTACCGGAAATTCACACCGGGGTTTCGAAGA
TCTCGGCAGTAAAAATTCTGTGACATCCATACATGTCATCGTGGACTTTGATGATATGCC
AATCCATGAACCAAAGGAAATCAAAGAGAAAGTTAGATTCCATTTACGGCACGAAGGTTA
TCATGGGATGGTGTCAACCAGTGCTTTCTATAGTGATAAGAATCAATTCTCTGATGAACG
GCTTCAAGAGTATTGCAACTATGGAATTATCCCCATTTTACTTAGAGGGGATAGAGGTTC
CAGAATCCGCATGATGCTAATAGACATCATTTTCTAGGCACAGACCTGTAGTGATGAAAG
TAATGAACCACTCTATGTCCTTGTAATCTCTAAAGACGAAAACTTAGAAAAAGACGCCAA
GTTCTCCACTGTTCGTCAATTTTTGATAGAACACATGGATTTCCATCTTACCGTTGCTCA
GCCTGATACCATCCTAGGCTTTTGAATCCGTCGTAGCTGTTCTGAGGTGTCTCAACTTCG
GTGTTTTGCTTTTATGAGCCCTCTGTAATATTCAGACAACACCGTTCATTCTAAGATGCT
TTCCCGAGTGTTTAAACATAATCCATAACTATGTTTTATAAGCGCCTGCTACATTTCTTG
TTCACTTTTCTTCTATTTCCAATGTAATTTCTCCTTTTATTTTATTGCTTTGGTTGTTGA
GCCTTTTTGAATTTACTATGTCTCGTCCTTTTTCGCATCCATCATACATGTATACAATTT
TGGCACTCTTTACCAATCAATATGTCTAGGCCTGGGCATTCGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DE12TF U 1
AF RS1DE12JQ C 294
BS 1 719 RS1DE12TF
BS 720 885 RS1DE12JQ

RD RS1DE12TF 719 0 0
GGAGAACAGATCTAACCCTAAACTCACAGAGGCGACCGTCTCAACAAATAGCTTCCAATC
GTAAGCGTCTCAAATTTTCTCGATGAGCCCTACCGGAAATTCACACCGGGGTTTCGAAGA
TCTCGGCAGTAAAAATTCTGTGACATCCATACATGTCATCGTGGACTTTGATGATATGCC
AATCCATGAACCAAAGGAAATCAAAGAGAAAGTTAGATTCCATTTACGGCACGAAGGTTA
TCATGGGATGGTGTCAACCAGTGCTTTCTATAGTGATAAGAATCAATTCTCTGATGAACG
GCTTCAAGAGTATTGCAACTATGGAATTATCCCCATTTTACTTAGAGGGGATAGAGGTTC
CAGAATCCGCATGATGCTAATAGACATCATTTTCTAGGCACAGACCTGTAGTGATGAAAG
TAATGAACCACTCTATGTCCTTGTAATCTCTAAAGACGAAAACTTAGAAAAAGACGCCAA
GTTCTCCACTGTTCGTCAATTTTTGATAGAACACATGGATTTCCATCTTACCGTTGCTCA
GCCTGATACCATCCTAGGCTTTTGAATCCGTCGTAGCTGTTCTGAGGTGTCTCAACTTCG
GTGTTTTGCTTTTATGAGCCCTCTGTAATATTCAGACAACACCGTTCATTCTAAGATGCT
TTCCCGAGTGTTTAAACATAATCCATAACTATGTTTTATAAGCGCCTGCTACATTTCTT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RS1DE12JQ 592 0 0
ATGAACGGCTTCAAGAGTATTGCAACTATGGAATTATCCCCATTTTACTTAGAGGGGATA
GAGGTTCCAGAATCCGCATGATGCTAATAGACATCATTTTCTAGGCACAGACCTGTAGTG
ATGAAAGTAATGAACCACTCTATGTCCTTGTAATCTCTAAAGACGAAAACTTAGAAAAAG
ACGCCAAGTTCTCCACTGTTCGTCAATTTTTGATAGAACACATGGATTTCCATCTTACCG
TTGCTCAGCCTGATACCATCCTAGGCTTTTGAATCCGTCGTAGCTGTTCTGAGGTGTCTC
AACTTCGGTGTTTTGCTTTTATGAGCCCTCTGTAATATTCAGACAACACCGTTCATTCTA
AGATGCTTTCCCGAGTGTTTAAACATAATCCATAACTATGTTTTATAAGCGCCTGCTACA
TTTCTTGTTCACTTTTCTTCTATTTCCAATGTAATTTCTCCTTTTATTTTATTGCTTTGG
TTGTTGAGCCTTTTTGAATTTACTATGTCTCGTCCTTTTTCGCATCCATCATACATGTAT
ACAATTTTGGCACTCTTTACCAATCAATATGTCTAGGCCTGGGCATTCGTGC

QA 1 592 1 592
DS 



AS 1 2

CO CL7008Contig1 739 2 7 U
GGATCTCTCTCCAATCGCAAGCTGCAAGTGGTAGTGGGTTGCAGAAGAATCTTCCTTCAA
CGTTGTCAACGATGAGTCGTCGTCTTCTCCTTGCTCTCGTTGTTCTTCTTCTTCATCTAT
GCATCCTTTCTGCAGCAGTGGGTGACGAGATCGTGTCGAGATTTCAGGAGTATCTCCGAA
TCGACACGGTTCATCCAAATCCAGATTACTACAAAGCCGTTGACTTTATAAACACTCAGG
CCAAATCACTCTCCCTCGAATCTCAGACGACTGAGTTCGTTAAGGGAAAGCCGCATATCC
TCCTCAAGTGGGTTGGCTCCGACCCAACTCTACCTGCCCTTCTACTCAACTCCCACACCG
ATGTCGTTCCCTTCGAGGAATCCAAGTGGATCCACCACCCACCCCAAGCTCACATGCATC
AACAGATGCTCGCTACTTCCGGATGGCTGGCGTTCCCGCGTTTGGCTTCTCTCCCATTTC
AAACACCCCTAGTTTGCTTCATTACCACAATGAGTATTTGGGTAGAGCTGAGTATCTGAA
GGGGATTGACGTGTATGTTTCAATTATCAAAGCTTATGCATCATATGAAAGCAAGAGTGG
TTCACGAGATGAGTTATAAAAAGGTCCACTTATAGTTGCGCATCAAGTCTTTCTGTAACA
ACAATCAATAAGATCTGAACCCACCATGCTGTTGTAAAATCAGACAAAACATGTTATTTT
CAACTTTATGTGATGTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BD22TF U 1
AF RS1BD22JQ C 76
BS 1 698 RS1BD22TF
BS 699 699 RS1BD22JQ
BS 700 708 RS1BD22TF
BS 709 709 RS1BD22JQ
BS 710 719 RS1BD22TF
BS 720 720 RS1BD22JQ
BS 721 739 RS1BD22TF

RD RS1BD22TF 739 0 0
GGATCTCTCTCCAATCGCAAGCTGCAAGTGGTAGTGGGTTGCAGAAGAATCTTCCTTCAA
CGTTGTCAACGATGAGTCGTCGTCTTCTCCTTGCTCTCGTTGTTCTTCTTCTTCATCTAT
GCATCCTTTCTGCAGCAGTGGGTGACGAGATCGTGTCGAGATTTCAGGAGTATCTCCGAA
TCGACACGGTTCATCCAAATCCAGATTACTACAAAGCCGTTGACTTTATAAACACTCAGG
CCAAATCACTCTCCCTCGAATCTCAGACGACTGAGTTCGTTAAGGGAAAGCCGCATATCC
TCCTCAAGTGGGTTGGCTCCGACCCAACTCTACCTGCCCTTCTACTCAACTCCCACACCG
ATGTCGTTCCCTTCGAGGAATCCAAGTGGATCCACCACCCACCCCAAGCTCACATGCATC
AACAGATGCTCGCTACTTCCGGATGGCTGGCGTTCCCGCGTTTGGCTTCTCTCCCATTTC
AAACACCCCTAGTTTGCTTCATTACCACAATGAGTATTTGGGTAGAGCTGAGTATCTGAA
GGGGATTGACGTGTATGTTTCAATTATCAAAGCTTATGCATCATATGAAAGCAAGAGTGG
TTCACGAGATGAGTTATAAAAAGGTCCACTTATAGTTGCGCATCAAGTCTTTCTGTAACA
ACAATCAATAAGATCTGAACCCACCATGCTGTTGTAAA*TCAGACAAA*CATGTTATTT*
CAACTTTATGTGATGTACC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1BD22JQ 664 0 0
GTCGTCGTCTTCTCCTTGCTCTCGTTGTTCTTCTTCTTCATCTATGCATCCTTTCTGCAG
CAGTGGGTGACGAGATCGTGTCGAGATTTCAGGAGTATCTCCGAATCGACACGGTTCATC
CAAATCCAGATTACTACAAAGCCGTTGACTTTATAAACACTCAGGCCAAATCACTCTCCC
TCGAATTTCAGACGACTGAGTTCGTTAAGGGAAAGCCGCATATCCTCCTCAAGTGGGTTG
GCTCCGACCCAACTCTACCTGCCCTTCTACTCAACTCCCACACCGATGTCGTTCCCTTCG
AGGAATCCAAGTGGATCCACCACCCACCCCAAGCTCACATGCATCAACAGATGCTCGCTA
CTTCCGGATGGCTGGCGTTCCCGCGTTTGGCTTCTCTCCCATTTCAAACACCCCTAGTTT
GCTTCATTACCACAATGAGTATTTGGGTAGAGCTGAGTATCTGAAGGGGATTGACGTGTA
TGTTTCAATTATCAAAGCTTATGCATCATATGAAAGCAAGAGTGGTTCACGAGATGAGTT
ATAAAAAGGTCCACTTATAGTTGCGCATCAAGTCTTTCTGTAACAACAATCAATAAGATC
TGAACCCACCATGCTGTTGTAAAATCAGACAAAACATGTTATTTTCAACTTTATGTGATG
TACC

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

CO CL7009Contig1 729 2 2 U
GCTGCAGGTTTGCTTACAATGAAACTATGAAGAAAATGTACAGTGTCAAGAATGTGGACT
CATTGCCTCCAATGCCTGAGAATGGGGATACATGGTCTGTGATGCAGAGCTGGGTGTTGC
AAACAAGATCCTTCGTAGAGTTTGTCATGTTCTCACGAATGTTTGTGGATTCTTTGGATG
CACAAATGTATGAAGAGCATCATAGAACAAACCGTTGCTATCTGAGTTTAACCAAAGACA
AGCATTGCTATTCACGGGTACTAGAGCTTCTGGTGAACGTATGGGCATACCACAGCGCGA
GGCGCATCGTCTACATAGATCCCGTGACTGGTTTGATGGAGGAGCAACACAAACAGAAAG
ACCGGAGAGGGAAAATGTGGGTGGACTGGTTCAGTTACAAAACTCTGAAAACGATGGACG
AGGATCTTGCAGAGGAAGCAGACTCAGACCGTCGTGTGGGTCACTGGCTACGGCCATTGA
CTGGTGAGGTGGTGTGGCAAGGGTCATTAGAGAAAGAGAGGCAAAGAAAGAACGTAGAGA
AAGAGGAGCAGAAGAAGAGAAGTAAAGATAAGCTTAATAGAATGAGAAGAAAAAGTCACC
GCCAGAAAGCAATCGGCAAATATATTAAACCGCCTCCTGAAAACGCAAACGTTACTACTT
TGTTAAACGCAGACGCTTAAAAGATTTGTTTCATTCATTATAAAAAGGTCTCAAAGTCTC
AATCATTCG


BQ
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AF RS1FD19TF U 1
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BS 1 612 RS1FD19TF
BS 613 729 RS1FD19JQ

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GCCAGAAAGCAA

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DS 

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AAGTCTCAATCATTCG

QA 1 436 1 436
DS 



AS 1 2

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TAAAGTTTATATATGCAAATATTGGAGAGAATGGGGAAGGGAATGAAACAATCATCATCC
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BQ
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AF RS1EZ60JQ U 1
AF RS1DM80TF C 96
BS 1 606 RS1EZ60JQ
BS 607 749 RS1DM80TF

RD RS1EZ60JQ 606 0 0
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ATATAGGTTTTGCCTCAAACAAATCCCATTATCCCCTCCTCCCCCTCTATTTTGTGTAAA
AGAATCTCATCTCCACACAGGCAAATAAATAAAATTATTTAACTCCACCCTGAATGTATG
GAGAGAAGGGGAAAATTATCTTCGCAAAAAAATAAATAAAACTTGGTCTGTCTTGTACCT
TAAAGTTTATATATGCAAATATTGGAGAGAATGGGGAAGGGAATGAAACAATCATCATCC
ATCCATTCATCACTCGTCTTCGCTTGCGGTGAGAATGAAAGAAAAAGGAGCGAACTTGTA
ACCATCTCCTTCGTAAAATTTGTTCTGGAACTCAACCCAGTGGAGACGCAGTGCGTGAAG
AAACGCGCTCAGTGTCTCCATCACCAGCAGCACTCCCACCGTGGCGAATACGAAGACGAT
GATCCCAACGATCAAGATCAACCAATTGTTATATCCCCAAGCGAGAAGGAGAACCTTCTC
ATAGAA

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TATTTAATTCCACCCTGAATGTATGGAGAGAAGGGGAAAATTATCTTCGCAAAAAAATAA
ATAAAACTTGGTCTGTCTTGTACCTTAAAGTTTATATATGCAAATATTGGAGAGAATGGG
GAAGGGAATGAAACAATCATCATCCATCCATTCATCACTCGTCTTCGCTTGCGGTGAGAA
TGAAAGAGAAAGGAGCGAACTTGTAACCATCTCCTTCGTAGAATTTGTTCTGGAACTCAA
CCCAGTGGAGACGCAGTGCGTGAAGAAACGCGCTCAGTGTCTCCATCACCAGCAGCACTC
CCACCGTGGCGAATACGAAGACGATGATCCCAACGATCAAGATCAACCAATTGTTATATC
CCCAAGCGAGAAGGAGAACCTTCTCATAGAAGACTGATGATAGCTCTGAGTGTGCAAGAC
TGAGAGCCCATAGACGCAGGTAAGAAGCGGTGTTGGATACAGCTCCAAGCACAAACTCTA
TGGTGTGAATCAGCTGATGCACAAATACCTCGCTGAATTCAAACTCCTCGTACC

QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 2

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AATATCTTTGCTGTCTTAGGTTTGCCTCCATCAACCAAACACAATGGCGAACGCGGCGTC
AGGAATGGCGGTGGAAGACGAATGTAAGCTGAAGTTTTTGGAGTTAAAAGCTAAAAGAAA
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AGCATGGTCACCGGATTCATCGAGAGTGAGGATGAAGATGGTGTATGCAAGCTCAAAGGA
CAGGTTCAAGAGAGAACTGGATGGAATCCAGGTGGAGTTACAAGCCACGGACCCAAGCGA
GATGAGTTTCGACATCATCAAAAGTCGAGCTCTCTAGATTCATATTGCCTAATTTCTCAT
CATATATCCATAAATGATCCATCATCAACAAATTAAAGAACTTCTCCATGTTATGTAACT
TTCTTGGTTCATTCTCCTTCCTCTTTGACTTTTTTTGTTTATTTACATTTCAAACTGACA
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CATACTCCGTTGGAAAATAAAATATATTACTTTTCCATTGCAG


BQ
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AF RS1DO08TF U 1
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AG

QA 1 722 1 722
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BQ
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AF RS1EA85JQ C 1
AF RS1EA85TF U 1
BS 1 649 RS1EA85TF

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QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1DU83TF U 1
AF RS1DU83JQ C 459
BS 1 574 RS1DU83TF
BS 575 1110 RS1DU83JQ

RD RS1DU83TF 574 0 0
GCTCCATATTGGACATAAGAAGACAGTAATGACAATGCAGATACATGTTCCAATTGCAAT
AGTTGATGCTCTTTGCTGAGCCATATCAAACAGCTTATCTACTCGGTAACCTCCTACTGA
GACTAGACTAAATGTAAGGATAAAGATCACTACTCCATAGTCGAATCTGGATTTGAATGA
TGGGAAAAACCGCGAGTAAGTAGCTGTGAAGGCTGCAAGAATCAAACCCATAAAAAGGAA
TTTTAATAAAGATTATTTACAAGAAAATAAAAGACTGATATTTTTTTAGGGTTTCGACCA
TTACTTACCAAAGAGGAAAACAGAGCATGCAGTCACAAAAATCTCAGCCTTTCCTGATTG
AGCTGCAACCCAATTAACAGCAATGCCTGGTGTTCCAGCTAATATAGTTGCCACCACTCT
GCGTTGATACCACTGCTTTAGTGGTATCAACGCAGAGTGGCGGGGGTCCCACCAAAACAT
CACCGGAGAGTCCGACGGCCTCTTAGCACCGACGGCTACTGTAGAAAGACTGTTTATCTT
CTTGGGGGTATTTTACTTACCTTTTGGAAGAAAC

QA 1 574 1 574
DS 

RD RS1DU83JQ 652 0 0
GGCGGGGGTCCCACCAAAACATCACCGGAGAGTCCGACGGCCTCTTAGCACCGACGGCTA
CTGTAGAAAGACTGTTTATCTTCTTGGGGGTATTTTACTTACCTTTTGGAAGAAACACAA
CGTCTTTCGCGGTAGCTAAAAGCTAAGCTCGGTCGGTATATATACATATTTTATCTAAAA
TAACACAATGGCAGCTGCTCGTTCACTCTCAGGCGCCGTTAAATCTCTTTGCTCCGCCGC
ATCCCACAGCTTTTCTGGTTCCATTGTCTTGAGGAGGAGTTACGTTGCGACAGTACCAGG
ATTTGGTAAGGGAGGTTCCACAAGAGTTACGGTGGGAAAGATGGAACAAAGAGCAAATCA
AGAGGCAGAGTCTGCTTGGGCCCCGGATCCGGTCACGGGATACTACAGACCATCTAATCG
TTCGGATGAAATTGATCCAGCGGAGCTCCGTGAGATGCTTTTGAAAAGTAAAGCCAAGCC
TTTCTGAGGATTTCAATTGGCTGGGTCCCACTAAACTATGTTGTAACCTTGTATGGGATT
GGGATTACTGATTCCCGTTTGTTATGTTTATCTTAATTATCTACTTTTTGGAGATTATCA
TAAAATAAAGATACTATGTATCTCAGTTAATAGATATATGGATCTACTTCGT

QA 1 652 1 652
DS 



AS 1 2

CO CL7014Contig1 654 2 2 U
TTTTTTTTTCGCAAGTCAGGCCCATCAGAACATCTCAATAGTGAATAAGGGAAGTTGTAG
CACATAAAGTAAAAAAAAACTCATAAAACCAAACTTTTCTAGCTTTCCTCTATACAAACA
ATCCCTAATACGATCGATCATCAAGCTCCGCCGTTTTTCATCATCAGCTTAAACTCCTCG
AAGTTAACGCAACCATCACCATCCGTATCAACTTTGCTAATCATCTTCCTGCAGTCCTGA
ACAGAACACTTCTCCCCCAGACTCTTCATCACCGAGTGAAGCTCCTTCGCCGAGATCCGC
CCGTTACCGTCCAGATCGTACAGCTCGAACGCTTCCTTCAGATCGTTCTTGCTGTTCCCT
CCTCCTCCTCCTTGACTCATTCCGATCTGGAAAAGAGAGACGAACTCGTCCATGTCGATG
AATCCGTTTCCGTCCAGATCGAACTGTTTCATCATCTTCACTGTCTCCTCCGGCGACGAG
GTGGGGCTCAGCGCGCGGATCACCTCCTTGAGCTCGTCGACGGAGATTTTTCCGTCTCCG
TTTTTGTCGAATCGCTGGAAGACGACGCGGATGTCGTCCATCGAGCCTAAACAGCTACGA
GCTCCGTTGTTCTTGGACATTGCAACTGATGAGAATCTGATAGTGACCAAAAAA


BQ
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AF RS1CM46TF C 1
AF RS1CM46JQ U 10
BS 1 9 RS1CM46TF
BS 10 654 RS1CM46JQ

RD RS1CM46TF 654 0 0
TTTTTTTTTCGCAAGTCAGGCCCATCAGAACATCTCAATAGTGAATAAGGGAAGTTGTAG
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AAGTTAACGCAACCATCACCATCCGTATCAACTTTGCTAATCATCTTCCTGCAGTCCTGA
ACAGAACACTTCTCCCCCAGACTCTTCATCACCGAGTGAAGCTCCTTCGCCGAGATCCGC
CCGTTACCGTCCAGATCGTACAGCTCGAACGCTTCCTTCAGATCGTTCTTGCTGTTCCCT
CCTCCTCCTCCTTGACTCATTCCGATCTGGAAAAGAGAGACGAACTCGTCCATGTCGATG
AATCCGTTTCCGTCCAGATCGAACTGTTTCATCATCTTCACTGTCTCCTCCGGCGACGAG
GTGGGGCTCAGCGCGCGGATCACCTCCTTGAGCTCGTCGACGGAGATTTTTCCGTCTCCG
TTTTTGTCGAATCGCTGGAAGACGACGCGGATGTCGTCCATCGAGCCTAAACAGCTACGA
GCTCCGTTGTTCTTGGACATTGCAACTGATGAGAATCTGATAGTGACCAAAAAA

QA 1 654 1 654
DS 

RD RS1CM46JQ 645 0 0
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TAAAAAAAAACTCATAAAACCAAACTTTTCTAGCTTTCCTCTATACAAACAATCCCTAAT
ACGATCGATCATCAAGCTCCGCCGTTTTTCATCATCAGCTTAAACTCCTCGAAGTTAACG
CAACCATCACCATCCGTATCAACTTTGCTAATCATCTTCCTGCAGTCCTGAACAGAACAC
TTCTCCCCCAGACTCTTCATCACCGAGTGAAGCTCCTTCGCCGAGATCCGCCCGTTACCG
TCCAGATCGTACAGCTCGAACGCTTCCTTCAGATCGTTCTTGCTGTTCCCTCCTCCTCCT
CCTTGACTCATTCCGATCTGGAAAAGAGAGACGAACTCGTCCATGTCGATGAATCCGTTT
CCGTCCAGATCGAACTGTTTCATCATCTTCACTGTCTCCTCCGGCGACGAGGTGGGGCTC
AGCGCGCGGATCACCTCCTTGAGCTCGTCGACGGAGATTTTTCCGTCTCCGTTTTTGTCG
AATCGCTGGAAGACGACGCGGATGTCGTCCATCGAGCCTAAACAGCTACGAGCTCCGTTG
TTCTTGGACATTGCAACTGATGAGAATCTGATAGTGACCAAAAAA

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 2

CO CL7015Contig1 1299 2 4 U
CACTTTACCACTTTCTTCTTCTCTTCACATCACTGATCTTTGAAGTTTTCTTCTGAAACG
ATGGAGTTGGATCTTACACCGAAGCTGCCTAAGCAAGTGTACGGAGGAGATGGTGGATCG
TACTTCGCCTGGTGCCCGGAGGAGTTGCCGATGCTGAAAGAGGGTAACATCGGAGCAGCC
AAGCTTGCTCTTGAGCAGCACGGTTTCGCTGTTCCTCGTTACTCTGACTCTCCCAAGGTT
GCCTATGTTCTTCAAGGATCTAGAACGGCGGGGATTGTACTCCCTGAGCAGGAGGAGAAG
GTGATCGGTATCAAAGAAGGCGACTCTATTGCTCTTCCTTTCGGTGTTGTGACATGGTGG
TTCAACAGTGGGGATAGCGAGCTTGTTATCCTCTTCCTTGGTGAAACCCACAAGGCTCAC
AAGAGGGGAGAGTTTACCGACTTTTACCTCACCGGTTCTAACGGAATCTTCACCGGTTTT
ACCCCCGAGTTTGTCGGCAGAGCGTGGGATCTCGATGAGGGGACCGTGAAGAAACTTGTG
GGCTCTCAGACCGGGAAAGGCATTGTGAAGCTCGATGCTGGTGTCAAGATGCCGCAGCCG
AAGGAGGGTGACCGTGAAGGGTTTGTGTTGAACTGCTTGGAAGCTCCTCTTGATGTTGAC
ATCAAGGACGGTGGGAGAGTTGTGGTGTTGAACACTAAGAACCTTCCTCTGGTTGGGGAG
GTTGGGTTTGGTGCTGATCTCGTTAGGATCGATGCGCATTCCATGTGTTCGCCAGGTTTC
TCTTGTGACTCGGCGCTTCAGGTGACTTACATTGTTGCCGGGAGTGGGAGAGTCCAGGTT
GTTGGTGCTGATGGGAAGAGGGTTCTTGAGACTCATATCAAGGCTGGCTCTCTCTTTATT
GTTCCGAGGTTCTTTGTGGTTTCCAAGATTGCTGATCCTGAGGGCATGTCTTGGTTCTCC
ATTGTGACTACTCCTGATCCAATCTTCACGCATTTGGCTGGGAGGACATCGGTTTGGAAG
GCACTGTCTCCAGAGGTTTTGCAGGCGGCGTTTAAGGTTGATCCTGAGGTTGAGCAGTCC
TTCCGTTCAAAGAGAACTTCCGACGCCATTTTCTTCCCTCCTTCCAACTGAATAAGGCGA
AGAAATGAGAACAAGAACCAGCTTTGTCTTTAGTCGTTGTTTTTCCCCTGTTTTCTCTTT
GCTTGTGACCCCCGGAAGCACTTAGGGTTTGCTTCTGTTTGTGTTTTATCCTGGACCGGT
TCTTGTTCTCTCTGTTGATCTTTACGCTTTGTTATTGAA


BQ
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AF RS1BA14TF U 1
AF RS1BA14JQ C 483
BS 1 691 RS1BA14TF
BS 692 692 RS1BA14JQ
BS 693 701 RS1BA14TF
BS 702 1299 RS1BA14JQ

RD RS1BA14TF 701 0 0
CACTTTACCACTTTCTTCTTCTCTTCACATCACTGATCTTTGAAGTTTTCTTCTGAAACG
ATGGAGTTGGATCTTACACCGAAGCTGCCTAAGCAAGTGTACGGAGGAGATGGTGGATCG
TACTTCGCCTGGTGCCCGGAGGAGTTGCCGATGCTGAAAGAGGGTAACATCGGAGCAGCC
AAGCTTGCTCTTGAGCAGCACGGTTTCGCTGTTCCTCGTTACTCTGACTCTCCCAAGGTT
GCCTATGTTCTTCAAGGATCTAGAACGGCGGGGATTGTACTCCCTGAGCAGGAGGAGAAG
GTGATCGGTATCAAAGAAGGCGACTCTATTGCTCTTCCTTTCGGTGTTGTGACATGGTGG
TTCAACAGTGGGGATAGCGAGCTTGTTATCCTCTTCCTTGGTGAAACCCACAAGGCTCAC
AAGAGGGGAGAGTTTACCGACTTTTACCTCACCGGTTCTAACGGAATCTTCACCGGTTTT
ACCCCCGAGTTTGTCGGCAGAGCGTGGGATCTCGATGAGGGGACCGTGAAGAAACTTGTG
GGCTCTCAGACCGGGAAAGGCATTGTGAAGCTCGATGCTGGTGTCAAGATGCCGCAGCCG
AAGGAGGGTGACCGTGAAGGGTTTGTGTTGAACTGCTTGGAAGCTCCTCTTGATGTTGAC
ATCAAGGACGGTGGGAGAGTTGTGGTGTTGA*CACTAAGAA

QA 1 701 1 701
DS 

RD RS1BA14JQ 817 0 0
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CTCTCAGACCGGGAAAGGCATTGTGAAGCTCGATGCTGGTGTCAAGATGCCGCAGCCGAA
GGAGGGTGACCGTGAAGGGTTTGTGTTGAACTGCTTGGAAGCTCCTCTTGATGTTGACAT
CAAGGACGGTGGGAGAGTTGTGGTGTTGAACACTAAGAACCTTCCTCTGGTTGGGGAGGT
TGGGTTTGGTGCTGATCTCGTTAGGATCGATGCGCATTCCATGTGTTCGCCAGGTTTCTC
TTGTGACTCGGCGCTTCAGGTGACTTACATTGTTGCCGGGAGTGGGAGAGTCCAGGTTGT
TGGTGCTGATGGGAAGAGGGTTCTTGAGACTCATATCAAGGCTGGCTCTCTCTTTATTGT
TCCGAGGTTCTTTGTGGTTTCCAAGATTGCTGATCCTGAGGGCATGTCTTGGTTCTCCAT
TGTGACTACTCCTGATCCAATCTTCACGCATTTGGCTGGGAGGACATCGGTTTGGAAGGC
ACTGTCTCCAGAGGTTTTGCAGGCGGCGTTTAAGGTTGATCCTGAGGTTGAGCAGTCCTT
CCGTTCAAAGAGAACTTCCGACGCCATTTTCTTCCCTCCTTCCAACTGAATAAGGCGAAG
AAATGAGAACAAGAACCAGCTTTGTCTTTAGTCGTTGTTTTTCCCCTGTTTTCTCTTTGC
TTGTGACCCCCGGAAGCACTTAGGGTTTGCTTCTGTTTGTGTTTTATCCTGGACCGGTTC
TTGTTCTCTCTGTTGATCTTTACGCTTTGTTATTGAA

QA 1 817 1 817
DS 



AS 1 2

CO CL7016Contig1 645 2 1 U
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TGCTCTCAAGCTTCCCGTCGAAGCCGATTTCCAAACTTCCTCTTCCTTCCTCAAGCGTTT
TTCACCTCTTCCTCAAGAACTGAGGTCTTGTTCTGTCACGAATAGACACTTAACCCTCGT
TAGAACTGAGGTCTTGCTCTGTCGTGATATGTGTTCTGTAAGAGGATTTGGCTTTTGGAG
TTTAGTAGTTGTCAGATTGGAAGGTTGACAGTCTAATGCCGGATCAGGAGAACGGTGTGT
CTTTCTAGTTGGATTAGTTTTATCAGTTCTATTTGATTATGTTCGTTTTTTCAAGATATG
GTCTACAACCTCAAGCTATTTATTAGTCGAACAGAGAAGCCGATGAGACACGTACGACAT
GTTTGGTTTGTTCTTTTTCAAGTGATAGGACACTGTTGTGTTTCTTTTACAGTCTAGATG
TGTACTCTTTTTCTCTTCGGAAATTTATCTATTACCCCGCCGTATTGGTGTGCGTGAACT
TTTTTAAGTTTTTTTTTTAACTTGAACTGTTTAAGTTTCTTTTGTATCCATCAATACCTT
TATGATAAATGATATTGTATCGTCGAATGACTATATGGAATAAAA


BQ
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AF RS1AZ44JQ C 1
AF RS1AZ44TF U 1
BS 1 645 RS1AZ44TF

RD RS1AZ44JQ 645 0 0
GGAGACATTTTGTTTTGGCCGTCAAATTCAGGAGAGCTCGATTCTCACCTCCTTCACCGT
TGCTCTCAAGCTTCCCGTCGAAGCCGATTTCCAAACTTCCTCTTCCTTCCTCAAGCGTTT
TTCACCTCTTCCTCAAGAACTGAGGTCTTGTTCTGTCACGAATAGACACTTAACCCTCGT
TAGAACTGAGGTCTTGCTCTGTCGTGATATGTGTTCTGTAAGAGGATTTGGCTTTTGGAG
TTTAGTAGTTGTCAGATTGGAAGGTTGACAGTCTAATGCCGGATCAGGAGAACGGTGTGT
CTTTCTAGTTGGATTAGTTTTATCAGTTCTATTTGATTATGTTCGTTTTTTCAAGATATG
GTCTACAACCTCAAGCTATTTATTAGTCGAACAGAGAAGCCGATGAGACACGTACGACAT
GTTTGGTTTGTTCTTTTTCAAGTGATAGGACACTGTTGTGTTTCTTTTACAGTCTAGATG
TGTACTCTTTTTCTCTTCGGAAATTTATCTATTACCCCGCCGTATTGGTGTGCGTGAACT
TTTTTAAGTTTTTTTTTTAACTTGAACTGTTTAAGTTTCTTTTGTATCCATCAATACCTT
TATGATAAATGATATTGTATCGTCGAATGACTATATGGAATAAAA

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1AZ44TF 645 0 0
GGAGACATTTTGTTTTGGCCGTCAAATTCAGGAGAGCTCGATTCTCACCTCCTTCACCGT
TGCTCTCAAGCTTCCCGTCGAAGCCGATTTCCAAACTTCCTCTTCCTTCCTCAAGCGTTT
TTCACCTCTTCCTCAAGAACTGAGGTCTTGTTCTGTCACGAATAGACACTTAACCCTCGT
TAGAACTGAGGTCTTGCTCTGTCGTGATATGTGTTCTGTAAGAGGATTTGGCTTTTGGAG
TTTAGTAGTTGTCAGATTGGAAGGTTGACAGTCTAATGCCGGATCAGGAGAACGGTGTGT
CTTTCTAGTTGGATTAGTTTTATCAGTTCTATTTGATTATGTTCGTTTTTTCAAGATATG
GTCTACAACCTCAAGCTATTTATTAGTCGAACAGAGAAGCCGATGAGACACGTACGACAT
GTTTGGTTTGTTCTTTTTCAAGTGATAGGACACTGTTGTGTTTCTTTTACAGTCTAGATG
TGTACTCTTTTTCTCTTCGGAAATTTATCTATTACCCCGCCGTATTGGTGTGCGTGAACT
TTTTTAAGTTTTTTTTTTAACTTGAACTGTTTAAGTTTCTTTTGTATCCATCAATACCTT
TATGATAAATGATATTGTATCGTCGAATGACTATATGGAATAAAA

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 2

CO CL7017Contig1 722 2 3 U
GGAAGAAAAAACTTTCTTTTGTCACTTGCTTCTTCTGTGTGTTGCCTTTCGTAATTTTCC
ACGGAAAAAGAAATCTCAACTTTCTCACAACCAGATCTTGAATTTCGACTCTGGTCTGGT
CTCTCTGAGTAACTTAGGGTTTCGTAGGAGCGAAAATGTTGGTGCCGAGGGAGATAGAGA
GCTTGGAAATAGTTTTGGGCTTTTGGAGACTCTCCGGCCATGGGTTCCTCTTCTCCTTCA
CGCTTCTTGTCGCTCTCAAACTTGACCATCTTCTTTCTGATTCATGGTGGTGTGTATTTA
CACCCTTGTGGTGGCTGTGTCATGCCGTGATTTCCTCCGGTAGATTTTCGTTGCCTACTC
CACCAATGCCTCATGATAAGGATTGGGCTCCTTTTCACTCTGTCATGGCAACACCACTGC
TTCTTGCTTTTGAGATCCTGCTCTTTCTACATCTTGAAGATAAATATGCCCTTGACTTAA
AGTTTGTCTTCTTACCATTGCTTGCATTCGAGGTAGCCATTTTGGTACATAATGTCAGTC
AGTGCTTCACAGTAAGGCCTACAGATGAGGAAACTATGGGTGATGAACCACTTCTCTACA
CATGGGCTTCCATATGGATGGTTTCCTTCATTGCTGCCATTACCTTCACTCTTGTTAAAG
CACGTGGCGATGTAGCTGCGTTGGACTGGTGGGACTTATCTATAAACTTGGGCATAGCAG
AG


BQ
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10 10 

AF RS1GJ89TF U 1
AF RS1EC48TF U 1
BS 1 469 RS1EC48TF
BS 470 470 RS1GJ89TF
BS 471 722 RS1EC48TF

RD RS1GJ89TF 656 0 0
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AAAGAAATCTCAACTTTCTCACAACCAGATCTTGAATTTCGACTCTGGTCTGGTCTCTCT
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AAATAGTTTTGGGCTTTTGGAGACTCTCCGGCCATGGGTTCCTCTTCTCCTTCACGCTTC
TTGTCGCTCTCAAACTTGACCATCTTCTTTCTGATTCATGGTGGTGTGTATTTACACCCT
TGTGGTGGCTGTGTCATGCTGTGATTTCCTCCGGTAGATTTTCGTTGCCTACTCCACCAA
TGCCTCATGATAAGGATTGGGCTCCTTTTCACTCTGTCATGGCAACACCACTGCTTCTTG
CTTTTGAGATCCTGCTCTTTCTACATCTTGAAGATAAATATGCCCTTGACTTAAAGTTTG
TCTTCTTACCATTGCTTGCATTCGAGGTAGCCATTTTGGTATATAATGTCAGTCAGTGCT
TCACAGTAAGGCCTACAGATGAGGAAACTATGGGTGATGAACCACTTCTCTACACATGGG
CTTCCATATGGATGGTTTCCTTCATTGCTGCCATTACCTTCACTCTTGTT

QA 7 656 7 656
DS 

RD RS1EC48TF 722 0 0
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ACGGAAAAAGAAATCTCAACTTTCTCACAACCAGATCTTGAATTTCGACTCTGGTCTGGT
CTCTCTGAGTAACTTAGGGTTTCGTAGGAGCGAAAATGTTGGTGCCGAGGGAGATAGAGA
GCTTGGAAATAGTTTTGGGCTTTTGGAGACTCTCCGGCCATGGGTTCCTCTTCTCCTTCA
CGCTTCTTGTCGCTCTCAAACTTGACCATCTTCTTTCTGATTCATGGTGGTGTGTATTTA
CACCCTTGTGGTGGCTGTGTCATGCCGTGATTTCCTCCGGTAGATTTTCGTTGCCTACTC
CACCAATGCCTCATGATAAGGATTGGGCTCCTTTTCACTCTGTCATGGCAACACCACTGC
TTCTTGCTTTTGAGATCCTGCTCTTTCTACATCTTGAAGATAAATATGCTCTTGACTTAA
AGTTTGTCTTCTTACCATTGCTTGCATTCGAGGTAGCCATTTTGGTACATAATGTCAGTC
AGTGCTTCACAGTAAGGCCTACAGATGAGGAAACTATGGGTGATGAACCACTTCTCTACA
CATGGGCTTCCATATGGATGGTTTCCTTCATTGCTGCCATTACCTTCACTCTTGTTAAAG
CACGTGGCGATGTAGCTGCGTTGGACTGGTGGGACTTATCTATAAACTTGGGCATAGCAG
AG

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL7018Contig1 645 2 1 U
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GTTTCCTTACACCATCTTCAACTACGCTATCGTTGTGACAAGCATGAGGTTCTCGCCTTA
CTTGTTCGGTTCCGTAGCTGGAATGGTACCTGAAGCTTTCATCTACATTTACAGCGGTCG
GTTGATCAGAACATTCGCTGATGTGCAATACGGACATCAACGTTTGGCAACAGTAGAGAT
TGTGTACAATGTAATCTCGTTAGTCATTGCGGTTGTGACCACTGTGGCTTTCCCTGTGTA
CGCGAGAATATCTTTGAGAGAGCTGCAAAACGCTGAAGCTAACGAAGATGTAAGTAAAGA
GGCGAGATTTGAGATGAATAACGTTGTTGAACATGAAGATAATCATTGACGTTTGGGTTC
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GTTGATTTGGTATTTCAGCAGGAGTAAGTAAGAAAAAAATAACAAAGAAAAAAAGGTGGA
ATATCCGAATATGTCTGATGTAGTAAACCAGGAAGACTAGTCAAACGTTGGATTCCAAAC
AATAGTGTTACTGATTCCAGTTACTGAAATAAATAAGAAGTAACT


BQ
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AF RS1B990JQ C 1
AF RS1B990TF U 1
BS 1 645 RS1B990TF

RD RS1B990JQ 645 0 0
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GGCGAGATTTGAGATGAATAACGTTGTTGAACATGAAGATAATCATTGACGTTTGGGTTC
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AATAGTGTTACTGATTCCAGTTACTGAAATAAATAAGAAGTAACT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1B990TF 645 0 0
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GTTTCCTTACACCATCTTCAACTACGCTATCGTTGTGACAAGCATGAGGTTCTCGCCTTA
CTTGTTCGGTTCCGTAGCTGGAATGGTACCTGAAGCTTTCATCTACATTTACAGCGGTCG
GTTGATCAGAACATTCGCTGATGTGCAATACGGACATCAACGTTTGGCAACAGTAGAGAT
TGTGTACAATGTAATCTCGTTAGTCATTGCGGTTGTGACCACTGTGGCTTTCCCTGTGTA
CGCGAGAATATCTTTGAGAGAGCTGCAAAACGCTGAAGCTAACGAAGATGTAAGTAAAGA
GGCGAGATTTGAGATGAATAACGTTGTTGAACATGAAGATAATCATTGACGTTTGGGTTC
TTCTCATGCACTGCCTTGACTGAAAACTCTCACTAATGATAGATTTGTATAAAGCTTAAT
GTTGATTTGGTATTTCAGCAGGAGTAAGTAAGAAAAAAATAACAAAGAAAAAAAGGTGGA
ATATCCGAATATGTCTGATGTAGTAAACCAGGAAGACTAGTCAAACGTTGGATTCCAAAC
AATAGTGTTACTGATTCCAGTTACTGAAATAAATAAGAAGTAACT

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 2

CO CL7019Contig1 555 2 4 U
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GAAGGTTATAAAGAGTGCTGGTGCATCCGTGCATAGATAAATGATCATTTTAGCGTATAG
TAATAAATTCTACAAGGAAACTTACTAGTTACTAGTTATTACAATAAAATACATCATAAT
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CAATAAAATGTTCATATCTAAATTAAATAAATTCCAGGTTATATATTTTAAGTATGACAA
TACGTTTCTAGCTAGGAAAAACTAGTGACTTTTTCTGTCTAATTGTACATCAAAGATTCA
AAACAAAAGAAAAAA


BQ
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AF RS1H708TF U 1
AF RS1EM92TF U 70
BS 1 301 RS1H708TF
BS 302 302 RS1EM92TF
BS 303 421 RS1H708TF
BS 422 555 RS1EM92TF

RD RS1H708TF 421 0 0
GGGAAAACCAAAAAAAGAAAAATAAGTTATTTTCTAATTATTTTTTTGGAAGACAACATC
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ACTGCTTTTGTTATCGGAGTCGACTCTGTTGGAGAAGCTTCTCATGCCACTCCGATGGAA
TTTCGTAAATGTTGGAACTCTGGCAAAAAAGGGTGCCAAATGCACTCCCGCCCGGTGCTT
GAAGGTTATAAAGAGTGCTGGTGCATCCGTGCATAGATAAATGATCATTTTAGCGTATAG
TGATAAATTCTACAAGGAAACTTACTAGTTACTAGTTATTACAATAAAATACATCATAAT
TTATTTCGTTAAGTTAAGACTAATGTTTTAAGTCTTTTTAAAAAATAAATATGTTCCATA
C

QA 1 421 1 421
DS 

RD RS1EM92TF 486 0 0
GGATGGAGAGGAATTGCAGTATGTTGCCTCTTAACAATTTTGGTTTTAACCACTGCTTTT
GTTATCGGAGTCGACTCTGTTGGAGAAGCTTCTCATGCCACTCCGATGGAATTTCGTAAA
TGTTGGAACTCTGGCAAAAAAGGGTGCCAAATGCACTCCCGCCCGGTGCTTGAAGGTTAT
AAAGAGTGCTGGTGCATCCGTGCATAGATAAATGATCATTTTAGCGTATAGTAATAAATT
CTACAAGGAAACTTACTAGTTACTAGTTATTACAATAAAATACATCATAATTTATTTCGT
TAGGTTAAGACTAATGTTTTAAGTCTTTTTAAAAAATAAATATGTTCCATACAATAAAAT
GTTCATATCTAAATTAAATAAATTCCAGGTTATATATTTTAAGTATGACAATACGTTTCT
AGCTAGGAAAAACTAGTGACTTTTTCTGTCTAATTGTACATCAAAGATTCAAAACAAAAG
AAAAAA

QA 1 486 1 486
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7021Contig1 646 2 1 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGCTTATCGA
AAGATCTCAAACGTCCAATGTCAGCCGCCAGATCAGTCTTCCGCTCCGCCGCGAGCCGAG
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CTCTGCTCAATTCGATGCTCTCTGCTTCTCGCCGTGGTTGGATCGTCGAAGATTGCAATG
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CCACTTGTGTTGATTCTTAAACCATAACAACAAATGTTTTTTTTTTTTTTATTACTTTAT
AAAAGATCCAAGTGGATTGTTGAATCAGTCTCCTTCATCCCATCGCCTTGTATTGTAGGT
CGTTCTAGTGTTTTGTCATCTGAAGTTACACTTATCATTGATGAAT


BQ
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AF RS1A033TF U 1
AF RS1A033TV U 1
BS 1 646 RS1A033TF

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CGGTTGAATTGAGCTGCTGCGTGGAGACGGTGCTCCCTTACCACACGGCCACTGCTTCCG
CTCTGCTCAATTCGATGCTCTCTGCTTCTCGCCGTGGTTGGATCGTCGAAGATTGCAATG
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TGGATGACTCTCCTTCTCACCATTGCAGTAAACAGGAAGATTTGTTTAAGAGTTTTAAAA
CCACTTGTGTTGATTCTTAAACCATAACAACAAATGTTTTTTTTTTTTTTATTACTTTAT
AAAAGATCCAAGTGGATTGTTGAATCAGTCTCCTTCATCCCATCGCCTTGTATTGTAGGT
CGTTCTAGTGTTTTGTCATCTGAAGTTACACTTATCATTGATGAAT

QA 1 646 1 646
DS 

RD RS1A033TV 646 0 0
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AAGATCTCAAACGTCCAATGTCAGCCGCCAGATCAGTCTTCCGCTCCGCCGCGAGCCGAG
CATCCGCCGCCGCGTCAAGGTTCTCAACCGGACCCAAGCCTATGCCATCTGCGGCATCTT
CTCGGCCTGCGTTTCGGATGCCGAAACAGAGCCCTCTCTCGAACCGCATTTTCAGATCTC
CGGTTGAATTGAGCTGCTGCGTGGAGACGGTGCTCCCTTACCACACGGCCACTGCTTCCG
CTCTGCTCAATTCGATGCTCTCTGCTTCTCGCCGTGGTTGGATCGTCGAAGATTGCAATG
ATGATGTATGATGAATTTACTGAGGAGAGGTCAGCGATGCATGCAGTTCTTAAGCAAAGA
TGGATGACTCTCCTTCTCACCATTGCAGTAAACAGGAAGATTTGTTTAAGAGTTTTAAAA
CCACTTGTGTTGATTCTTAAACCATAACAACAAATGTTTTTTTTTTTTTTATTACTTTAT
AAAAGATCCAAGTGGATTGTTGAATCAGTCTCCTTCATCCCATCGCCTTGTATTGTAGGT
CGTTCTAGTGTTTTGTCATCTGAAGTTACACTTATCATTGATGAAT

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 2

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CACTTGACACTCCACGATCCTCATCTTCGTTCTCAAGGTCTCTTTACCATGTTCCGAGAT
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CTGATCTCAGCAAAACAGTTCACTCCAACGAAAATTTCAGAAGAGCCAACTTCACTTCTG
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GTGACCTCGGTGGTGCCAAGATCGAAGGCGCTGACTTTAGTGACGCTGTGATTGATCTTC
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TATAGTAGTGAATTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BE87TF U 1
AF RS1BE87JQ C 189
BS 1 667 RS1BE87TF
BS 668 668 RS1BE87JQ
BS 669 689 RS1BE87TF
BS 690 976 RS1BE87JQ

RD RS1BE87TF 689 0 0
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CACTTGACACTCCACGATCCTCATCTTCGTTCTCAAGGTCTCTTTACCATGTTCCGAGAT
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CTAGGGAAGATTGTTGCTCCGGTGGAGAATCGAATACGTGGAAGAGGTTTTTATCTGGAG
CATTAGCAGCGACTGTGATAGTCTCGAGCTCAGGGTTTCCAGCAATGGCAGATCTTAACA
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CAGTTGCATACAAAGCTAACTTCTCAGGTGCTGATTTGAGTGATACATTGATGGATCGGA
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GTGACCTCGGTGGTGCCAAGATCGAAGGCGCTGACTTTAGTGACGCTGTGATTGATCTTC
TTCAAAA*CAGGCTCTGTGTAAATACGCA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1BE87JQ 788 0 0
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GTGATAGTCTCGAGCTCAGGGTTTCCAGCAATGGCAGATCTTAACAAGTTCGAGGCGGAT
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ACAGTTCACTCCAACGAAAATTTCAGAAGAGCCAACTTCACTTCTGCAGATATGAGAGAG
TCTGACTTCAGTGGTTCGACCTTCAACGGCGCCTATCTTGAGAAAGCAGTTGCATACAAA
GCTAACTTCTCAGGTGCTGATTTGAGTGATACATTGATGGATCGGATGGTGCTAAACTAG
GCAAATCTGACGAATGCAATTCTTGTACGTTCGGTTCTAACACGTAGTGACCTCGGTGGT
GCCAAGATCGAAGGCGCTGACTTTAGTGACGCTGTGATTGATCTTCTTCAAAAACAGGCT
CTGTGTAAATACGCAAACGGGACAAACCCATTGACTGGAGTGAGCACAAGGAAGAGCCTT
GGCTGTGGAAATAGCAGGAGAAATGCATATGGCTCCCCTTCGTCTCCTTTACTCAGTGCA
CCACCTCAACGTCTTCTCGGTCGTGATGGATTCTGCGATGAGAAGACCGGTCTTTGTGAC
GCCTCGTAGTTTCAGTCCGTTAAGACCATGTGTGTGGTTACAATGCAGATGTAATAACAT
TTGTTTCATAATATGTTGTGTTACATTAGTCGTGTATTGTATGTTTTATAGTAGTGAATT
AC

QA 7 788 7 788
DS 



AS 1 2

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AAAATGTTTGATCTGTGCTTGAATGCTCTTGCTGTTTACGGACGACTCATTGTGATTGGA
ATGATCTCCCAGTATCAAGGGGAGAAGGGATGGCAGCCCGCAAACTATCCAGGGCTGTGC
GAGAAAATCCTTGCAAAAAGCCAAACGGTGGCCGGTTTCTTTCTGGTGCAATATAGTCAA
CTCTGGAAACAAAATCTTGAAAAGTTATTCAATCTTTACTCTCTTGGAAAGCTCAAGGTT
GGGATTGATCAGAAAAAGTTTATAGGTCTAAACACTGTTTCAGACGCCATTGAGTGTCTG
CATTCCGGTAAAAGCACCGGAAAGGTTGTGGTTTGCATGGATCCAACGTTTGAGCAGACA
ACGTCGAGGCTGTGAACAAAAAAGGAGGACAAATCCAAATACAGTTTGAGATTCAGTAAA
AGAACCCTTAGGGTTGTGGAGTTCTTGAGTAGCTACGAAGTTGTTTAGCTTTACATGGGA
AATAAGCTGTTTGATCTCATGTAGACTCTCCCGTCAATAAGCTTTCAATGCGGACATGCT
TAGCTTTCAACTAGATGGTCGTACGTTTGAGAGCATTATAGTAAAATTTGATTCTCTTTG
TGTTATAGGCGATATGATATATGATGAATTTACATGATTGCTTCCCTGAGCCTGC


BQ
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AF RS1BN47TF U 1
AF RS1BN47JQ C 10
BS 1 655 RS1BN47TF

RD RS1BN47TF 655 0 0
AAAATGTTTGATCTGTGCTTGAATGCTCTTGCTGTTTACGGACGACTCATTGTGATTGGA
ATGATCTCCCAGTATCAAGGGGAGAAGGGATGGCAGCCCGCAAACTATCCAGGGCTGTGC
GAGAAAATCCTTGCAAAAAGCCAAACGGTGGCCGGTTTCTTTCTGGTGCAATATAGTCAA
CTCTGGAAACAAAATCTTGAAAAGTTATTCAATCTTTACTCTCTTGGAAAGCTCAAGGTT
GGGATTGATCAGAAAAAGTTTATAGGTCTAAACACTGTTTCAGACGCCATTGAGTGTCTG
CATTCCGGTAAAAGCACCGGAAAGGTTGTGGTTTGCATGGATCCAACGTTTGAGCAGACA
ACGTCGAGGCTGTGAACAAAAAAGGAGGACAAATCCAAATACAGTTTGAGATTCAGTAAA
AGAACCCTTAGGGTTGTGGAGTTCTTGAGTAGCTACGAAGTTGTTTAGCTTTACATGGGA
AATAAGCTGTTTGATCTCATGTAGACTCTCCCGTCAATAAGCTTTCAATGCGGACATGCT
TAGCTTTCAACTAGATGGTCGTACGTTTGAGAGCATTATAGTAAAATTTGATTCTCTTTG
TGTTATAGGCGATATGATATATGATGAATTTACATGATTGCTTCCCTGAGCCTGC

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1BN47JQ 646 0 0
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CAGTATCAAGGGGAGAAGGGATGGCAGCCCGCAAACTATCCAGGGCTGTGCGAGAAAATC
CTTGCAAAAAGCCAAACGGTGGCCGGTTTCTTTCTGGTGCAATATAGTCAACTCTGGAAA
CAAAATCTTGAAAAGTTATTCAATCTTTACTCTCTTGGAAAGCTCAAGGTTGGGATTGAT
CAGAAAAAGTTTATAGGTCTAAACACTGTTTCAGACGCCATTGAGTGTCTGCATTCCGGT
AAAAGCACCGGAAAGGTTGTGGTTTGCATGGATCCAACGTTTGAGCAGACAACGTCGAGG
CTGTGAACAAAAAAGGAGGACAAATCCAAATACAGTTTGAGATTCAGTAAAAGAACCCTT
AGGGTTGTGGAGTTCTTGAGTAGCTACGAAGTTGTTTAGCTTTACATGGGAAATAAGCTG
TTTGATCTCATGTAGACTCTCCCGTCAATAAGCTTTCAATGCGGACATGCTTAGCTTTCA
ACTAGATGGTCGTACGTTTGAGAGCATTATAGTAAAATTTGATTCTCTTTGTGTTATAGG
CGATATGATATATGATGAATTTACATGATTGCTTCCCTGAGCCTGC

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 2

CO CL7024Contig1 592 2 3 U
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GAGTCTCAAAGACAGTATTCATATCATAACAACAAATTGACCGAAACAAATGATTTTTAT
GTAATATAAGGACGGGATCCTGGAACATGATGGAGATCAGTTTCAGTTGTCGTAAGTACG
ACACTCGTTAGTCTCGGGATTGTCTTTGCAGTACTCCTCCAAAGGGTCGGAATCTTTCTT
CTTGTCTCTAGCGTGGCTAGCTGCTGCGCTAAGCTCTTCGACCTCGTACCACGCAGCTAC
ACACTCTCCGCTCGCAGGGTCGCCAGCACAAGCCTCCTCGGCGTCCTTGATGCTCTTCTC
CACTTTATCCGATATCACTCCTTCTGGCGTTGCTTTTACTGGCCTAAAGTTCACCATCCG
GTTCGTTGTTCTTGAACCAAGACTCCACGGATTGTTCAAACGGACCGGACCTGCGAGACG
AACTGGACGAGCCTCGCTGGTGATAACGGCTCGTTGAGTTCCAAAGTTAAGACTAGTAGA
AGCTATAGTTGCCATAGTTGGATGAAGCAGAGGCTTTGAAGTTTTTAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CC49JQ U 162
AF RS1CC49TF C 1
BS 1 161 RS1CC49TF
BS 162 469 RS1CC49JQ
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RD RS1CC49JQ 308 0 0
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CGTCCTTGATGCTCTTCTCCACTTTATCCGATATCACTCCTTCTGGCGTTGCTTTTACTG
GCCTAAAGTTCACCATCCGGTTCGTTGTTCTTGAACCAAGACTCCACGGATTGTTCAAAC
GGACCGGA

QA 1 308 1 308
DS 

RD RS1CC49TF 592 0 0
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GAGTCTCAAAGACAGTATTCATATCATAACAACAAATTGACCGAAACAAATGATTTTTAT
GTAATATAAGGACGGGATCCTGGAACATGATGGAGATCAGTTTCAGTTGTCGTAAGTACG
ACACTCGTTAGTCTCGGGATTGTCTTTGCAGTACTCCTCCAAAGGGTCGGAGTCTTTCTT
CTTGTCTCTAGCGTGGCTAGCTGCTGCGCTAAGCTCTTCGACCTCGTACCACGCAGCTAC
ACACTCTCCGCTCGCAGGGTCGCCAGCACAAGCCTCCTCGGCGTCCTTGATGCTCTTCTC
CACTTTATCCGATATCACTCCTTCTGGCGTTGCTTTTACTGGCCTAAAGTTCACCATCCG
GTTCGTTGTTCTTGAACCAAGACTCCACGGATTGTTCAAACGGACCGGACCTGCGAGACG
AACTGGACGAGCCTCGCTGGTGATAACGGCTCGTTGAGTTCCAAAGTTAAGACTAGTAGA
AGCTATAGTTGCCATAGTTGGATGAAGCAGAGGCTTTGAAGTTTTTAGATCC

QA 1 592 1 592
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7026Contig1 582 2 6 U
GGGTGAAGAATAGAAGAAACCTAATTGCCGACGACCATGATGCTGAACCTGAGATCTTTG
ATTGCGAAGGCTTACCGCGTTCGTCAAGGACGTGCTTTCTGTTCCTCCTCCGCATCCTCC
TCAGCTCCCAATTCTATCGGTGACGAAGGAGGAAATTCTATTGTCAGGTATCTCGTAAGT
CGAGGCGTGATAATGCTAGCGGGATTCGGCGCAGGTAGTTACAAGTCGGAAGAGAGAGTC
GCCAAATATGAGGAGACGATAAAAGCGATTGACAATGAGGCTTGGGATATCTTGGCGCAG
CAGCAAGCGCTGTTGACCAAGGACTTTTCAAAAAAATCCTAGTTATCTTATGGTCATCGT
TCGTGGAGGTGCACCAAAAACAAAGCCAAGCTTCTATTTTAGGTTCCATAGTTTGTCTCT
CTTTATGTGTCACTTTACGTCTGGTGGTTCATGTTAACAGAGTTTGCTTATGCGCATGGA
TTTCTTCTCTCTCTAGTGATATTTTGGGTCTCTATATATACTTCCGTCTCCCTCATTGTA
ATTCTCTGTCTGGTTCATGTAAAAGAGTCTTGTTTATGCGCA


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 

AF RS1H127TF U 1
AF RS1BD67TF U 2
BS 1 185 RS1H127TF
BS 186 186 RS1BD67TF
BS 187 437 RS1H127TF
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BS 439 578 RS1H127TF
BS 579 582 RS1BD67TF

RD RS1H127TF 578 0 0
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ATTGCGAAGGCTTACCGCGTTCGTCAAGGACGTGCTTTCTGTTCCTCCTCCGCATCCTCC
TCAGCTCCCAATTCTATCGGTGACGAAGGAGGAAATTCTATTGTCAGGTATCTCGTAAGT
CGAGGTGTGATAATGCTAGCGGGATTCGGCGCAGGTAGTTACAAGTCGGAAGAGAGAGTC
GCCAAATATGAGGAGACGATAAAAGCGATTGACAATGAGGCTTGGGATATCTTGGCGCAG
CAGCAAGCGCTGTTGACCAAGGACTTTTCAAAAAAATCCTAGTTATCTTATGGTCATCGT
TCGTGGAGGTGCACCAAAAACAAAGCCAAGCTTCTATTTTAGGTTCCATAGTTTGTCTCT
CTTTATGTGTCACTTTATGTCTGGTGGTTCATGTTAACAGAGTTTGCTTATGCGCATGGA
TTTCTTCTCTCTCTAGTGATATTTTGGGTCTCTATATATACTTCCGTCTCCCTCATTGTA
ATTCTCTGTCTGGTTCATGTAAAAGAGTCTTGTTTATG

QA 1 578 1 578
DS 

RD RS1BD67TF 581 0 0
GGG
GAAGAATAGAAGAAACCTAATTGCCGACGACCATGATGCTGAACCTGAGATCTTTGATTG
CGAAGGCTTACCGCGTTCGTCAAGGACGTGCTTTCTGTTCCTCCTCCGCATCCTCCTCAG
CTCCCAATTCTATCGGTGACGAAGGAGGAAATTCTATTGTCAGGTATCTCGTAAGTCGAG
GCGTGATAATGCTAGCGGGATTCGGCGCAGGTAGTTACAAGTCGGAAGAGAGAGTCGCCA
AATATGAGGAGACGATAAAAGCGATTGACAATGAGGCTTGGGATATCTTGGCGCAGCAGC
AAGCGCTGTTGACCAAGGACTTTTCAAAAAAATCCTAGTTATCTTATGGTCATCGTTCGT
GGAGGTGCACCAAAAACAAAGCCGAGCTTCTATTTTAGGTTCCATAGTTTGTCTCTCTTT
ATGTGTCACTTTACGTCTGGTGGTTCATGTTAACAGAGTTTGCTTATGCGCATGGATTTC
TTCTCTCTCTAGTGATATTTTGGGTCTCTATATATACTTCCGTCTCCCTCATTGTAATTC
TCTGTCTGGTTCATGTAAAAGAGTCTTGTTTATGCGCA

QA 4 581 4 581
DS 



AS 1 2

CO CL7027Contig1 437 2 2 U
GGAAAATATTTTCTGTAGTATTCACTCTCTCGTCGGAAGGAAGGAAGAAGGAGAAGAAAG
AGAGGATCTGGAGATTTGAACAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGAGGATCTGGAGATGCCGCT
GTACGACCGTATGCTTCTGTTCAAGCCAGTAATCAGGAAGGAAGGCCTGATCGATCTCGT
CGCTCGCATCGGTAAACACGTTTACAGCAGAAATGGTGTCCTCACGGAGGTCAAATCCTT
CGGCAAGGTCGAATTGGGTTACGGTATCAAGAAGCTCGACGGTAGACACTATCAGGGGCA
ACTGATGCAGATAACAATGATGGCAACTCCAAACATGAACAAGGAGCTTCATTACCTCAA
CAAGGAAGACAAACTCCTCCGCTGGCTCCTTGTTAAACACCGCGACGTCAAGATTGGTCC
TTCCGAAATGGAAGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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BS 418 437 RS1A670JQ

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CGGCAAGGTCGAATTGGGTTACGGTATCAAGAAGCTCGACGGTAGACACTATCAGGGGCA
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CAAGGAAGACAAACTCCTCCGCTGGCTCCTTGTTAAACACCGCGACGTCAAGATTGG

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DS 

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GGAAGACAAACTCCTCCGCTGGCTCCTTGTTAAACACCGGGACGTCAAGATTGGTCCTTC
CGAAATGGAAGACC

QA 1 134 1 134
DS 



AS 1 2

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AAAAGCTACAGTCTTGGCCATTCCTGATCTATCTCATGGTGTGGAACATATGGGACTTAA
AGACGGTGGTTTGTCTTCTTGTGAAGATGCATTGTCTGAAGCTTATACCAGTGAGATGCT
CCAGTCCATAGAGATGGTTACCAACGTGCTTGAGTTCCTTGTTAAGAGGGTTTCAGCAGC
AGAATCTGAGACTGCTGTTCAAAAGGAGATGGTGATTTTGGGAGAGGAAGAGCTTAGTAA
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CGGGACGAATAGTGTTTTGAGCGAAATGAGGGAGAGGATTGAGGAGCTAGTTGAAGAGAC
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GTTCGAGTCGCTTAAAAGCTATGTCAGTACTTTCACCAATGTCAGAGAGACACTCCTTTC
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CCTCATCTCTCTTGTTATTAATTTTTTTTGAGACAAAGACAATGCTTTCGCAGAAGAGAA
GATCTTCCAGATTGTTGCAAAGCTGCGCTTACTCTATTGTTCTTTTGTTTCAGATAAAAG
AAACATTCTTGTAACCT


BQ
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AF RS1H692TF U 1
AF RS1H692JQB C 509
BS 1 695 RS1H692TF
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TCAAGAGGATACTAAGAGTGAATTGGAGTCTGGTCGGTTTCAGGTAGATAGTTTAGAAGC
TGAGCTTTTGGATGTCAAGGCTTGCCTTGAGTTCGGTTCAGAGGAAGACGCCAGGAAGGA
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AAAAGCTACAGTCTTGGCCATTCCTGATCTATCTCATGGTGTGGAACATATGGGACTTAA
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CCAGTCCATAGAGATGGTTACCAACGTGCTTGAGTTCCTTGTTAAGAGGGTTTCAGCAGC
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QA 1 718 1 718
DS 

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TTACTCTATTGTTCTTTTGTTTCAGATAAAAGAAACATTCTTGTAACCT

QA 1 769 1 769
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TTATGAATGTCTTTGCATGTGTGATATCCTTTAGTGTATTTGTATGTACC


BQ
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AF RS1DL56JQ C 1
AF RS1DL56TF U 1
BS 1 650 RS1DL56TF

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QA 1 650 1 650
DS 

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TGTCAAGACTTCCGTTTCTCGTCCATTAGCATGGTCAAAAGGTAACATGTCACCAGGCCA
AAACACCCAAGGGGAAAGTGGGTCGGGCCGTGGGCCTAACTGGGAGTACAATTGGGGTTG
GGGTTCTGCTCCTGGATCCGGATGGGGTTACGGGTCAGGCTCAGGTAGATCTCCCACGGG
TTGGGGAAGAGGATCCGGATATGGGTATGGGTCTGGATCTGGATCAGGTGGCGGATATGG
GTACGGTTCCGGAGGTGGAGGAGCACGTGGTGGTGGGTATGGTTATGGAAGCGGAAATGG
TCGGTCTGGAGGTGGTGGTGGTGGTAGTGGTGGTGATAATGGTGAAGTTGCCGCTTTGGG
CCACGGTGGTAAGTCTCATCCGTGATGATAATAAGCTTGTAATTCTCCCAACTTAAAAGG
TTTTCGGAGTAGTTTAAGTGTTTGAAATATCAAGGTTATTAGGCTTGGTACCCTTTTTAA
ATGTAACTTCCTTTGTCTTGTATGCTTAAAATATGGTATGGATTATGTGGTCGACATATC
TTATGAATGTCTTTGCATGTGTGATATCCTTTAGTGTATTTGTATGTACC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL7031Contig1 501 2 2 U
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AGAGGTCCAGTCCAGTCTTTT


BQ
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AF RS1CD85TF U 1
AF RS1CD85JQ C 1
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BS 463 501 RS1CD85JQ

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TCAGCTGGATGGCAAGTGAATGGCAGAAACATAGATCAAAGGAACGTGAGAAAACACATC
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QA 1 462 1 462
DS 

RD RS1CD85JQ 501 0 0
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CAGCGGAAGTGTTACTCGATGAAGACTTCAGCAACATCATGAAGTCTTGGCCGTATGAAA
TCAGCCCTAACTCTAAAACGAGCTTTGAAGTAGCTCTGCGGAATGACACCGAGTTTCTCA
GTAGCGTACGAGTCATGGATTACTCGCTCTTCATTGGCGTTGATCAATTTAGCCATGAGT
TGATCTGTGGTATAATTGATTACCTATACTGAAATCTACGATTGGATGTTGCATACAACC
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TCAGCTGGATGGCAAGTGAATGGCAGAAACATAGATCAAAGGAACGTGAGAAAACACATC
AACCTGTGAATATGTAAATGTTTGAGATCTACTAAAGACATTATTACTAGTCTGTAAATA
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QA 1 501 1 501
DS 



AS 1 2

CO CL7032Contig1 667 2 2 U
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TTATCAACAAAAGAGCAATATTATTACGATAACTAGAGGTCTTTCACATTAACGAAACTG
CTTTGAATTTTGATCGACTCAAACGAACCCGTTACCATTAGCATGACCATGACCATGACC
ATTGCCATTGGTGAGCTTCTCCATGACATGAGCTTCAAGCGTGATCTCCACATCGATGCT
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CGAGCTCCCCACCGCCACGCAGTTCACTCCCGCGTCTTTGGCTCGGTCGAAAAATGGTTG
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GTTTCTTCCCTAGTATCGGCTTGTTTGGTTGCACATGGGTTTTGCTAGTTATCTATCTTC
ATGGTGAAAAGAGATTTTACTTAGCCTTTTTACTCAATGTACTATTTGTGAGATTGTAGT
GTGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CL04TF C 1
AF RS1CL04JQ U 6
BS 1 5 RS1CL04TF
BS 6 667 RS1CL04JQ

RD RS1CL04TF 667 0 0
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ATCCAACATACTACAACATGATCAAATTACATAACTCACACGTCGGCATTCTGCTGATTA
TTATCAACAAAAGAGCAATATTATTACGATAACTAGAGGTCTTTCACATTAACGAAACTG
CTTTGAATTTTGATCGACTCAAACGAACCCGTTACCATTAGCATGACCATGACCATGACC
ATTGCCATTGGTGAGCTTCTCCATGACATGAGCTTCAAGCGTGATCTCCACATCGATGCT
CACACCTCCAGCTTTCCCCGGGTACAGATACATCATCCCATTAAACCGGTTATTCGAACC
GCTCCTAACCGTTTCCGGTTTACCCCAACCGAAGTCCACCTCGTAGACACGGAACCTCGG
CGAGCTCCCCACCGCCACGCAGTTCACTCCCGCGTCTTTGGCTCGGTCGAGAAATGGTTG
TGTCGAGATGGTTGTAGTAGAAAGCTAGGTAAGGAAGATCAAATGTGGTGAGATGGAATT
GTTTCTTCCCTAGTATCGGCTTGTTTGGTTGCACATGGGTTTTGCTAGTTATCTATCTTC
ATGGTGAAAAGAGATTTTACTTAGCCTTTTTACTCAATGTACTATTTGTGAGATTGTAGT
GTGGTCC

QA 1 667 1 667
DS 

RD RS1CL04JQ 662 0 0
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ACATACTACAACATGATCAAATTACATAACTCACACGTCGGCATTCTGCTGATTATTATC
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AATTTTGATCGACTCAAACGAACCCGTTACCATTAGCATGACCATGACCATGACCATTGC
CATTGGTGAGCTTCTCCATGACATGAGCTTCAAGCGTGATCTCCACATCGATGCTCACAC
CTCCAGCTTTCCCCGGGTACAGATACATCATCCCATTAAACCGGTTATTCGAACCGCTCC
TAACCGTTTCCGGTTTACCCCAACCGAAGTCCACCTCGTAAACACGGAACCTCGGCGAGC
TCCCCACCGCCACGCAGTTCACTCCCGCGTCTTTGGCTCGGTCGAAAAATGGTTGTGTCG
AGATGGTTGTAGTAAAAAGCTAGGTAAGGAAGATCAAATGTGGTGAGATGGAATTGTTTC
TTCCCTAGTATCGGCTTGTTTGGTTGCACATGGGTTTTGCTAGTTATCTATCTTCATGGT
GAAAAGAGATTTTACTTAGCCTTTTTACTCAATGTACTATTTGTGAGATTGTAGTGTGGT
CC

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

CO CL7033Contig1 963 2 2 U
GGGTTTCGCTGGAGGCGTTGAAACGGCCCTCTTAACAGCTCACTTAGTTCACATTCCTCT
CCATCTTCGATAATATTCTACTTGCTTGTTATATAAATATATGTTCCTCTCTCTCACAAA
TATTCCAGCATCAGCAGATAGAAAAATGGCATCGCTCTTGGAGAAGGCAACTTCTGCTCT
TAGCGAAGTCAAAGAATCCGTTACAGCCACCGCTGAATCCGTCGGTGCCTCTCTAACTGA
TGCTCAGAAAACCGTGGCGGCCTCCACTGAAACTGTCACGACCTCTCTAACCGAGGCTGG
AGAAACCGCTGCGGCCTCCGCGGAAACCGTCCAGAGGTCTGTAACCGATGCTGGAGAAAC
CGTTGCAGCCTCCACTGAAACAATCAAGACTGAAGCGGCAGCAGCACCAGAGAAAGTCTC
TAATGTGTCAACACAGGCAAGAGAGGTAGTGAACAATGCTTTCTCAAAAGGTATAGAAGG
ACTCAGCACTTTGCTCCATGGTCTTGAGGAGAAGAAGACTGATATTTCCTCCAAGATCGT
TGACACTGCTACCAAGGCTGTTGCTGGCGCATCGAGCAGCACCACCGTGGCAAGCCGAGA
CGTTCCTATATCCACAGACAATCAGCCTCTGTTAGCTAGTGAGCGTGGGGCTGAGACTAC
CCCGTGGTGGAAAAATTGTTGTGGAGTTCTTGATCTTCTCAAGACATCTGCTTCAAAATG
AAAGGCTAATGCATTTCACCATGAAGGAAGGACGGAGCACTAGAAGAAGTACCTATCCCA
AAACAACTTTCGGTTACGTATTTGCTTTCTTTTATATTTTGATTTGTTATTGTGTCCATC
TTAACTTTGGTTGTTTTTTGTTTTGCTTTTCTGTTGATAATCCTGTTGAGTCTTGATTGT
TTACAAGAAGTTGTGTAAGAGCCAATAAACCCCCAAAAATGTAAAATTTCCTTTGTGATG
ACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 

AF RS1H023TF U 1
AF RS1H023JQB C 311
BS 1 666 RS1H023TF
BS 667 963 RS1H023JQB

RD RS1H023TF 666 0 0
GGGTTTCGCTGGAGGCGTTGAAACGGCCCTCTTAACAGCTCACTTAGTTCACATTCCTCT
CCATCTTCGATAATATTCTACTTGCTTGTTATATAAATATATGTTCCTCTCTCTCACAAA
TATTCCAGCATCAGCAGATAGAAAAATGGCATCGCTCTTGGAGAAGGCAACTTCTGCTCT
TAGCGAAGTCAAAGAATCCGTTACAGCCACCGCTGAATCCGTCGGTGCCTCTCTAACTGA
TGCTCAGAAAACCGTGGCGGCCTCCACTGAAACTGTCACGACCTCTCTAACCGAGGCTGG
AGAAACCGCTGCGGCCTCCGCGGAAACCGTCCAGAGGTCTGTAACCGATGCTGGAGAAAC
CGTTGCAGCCTCCACTGAAACAATCAAGACTGAAGCGGCAGCAGCACCAGAGAAAGTCTC
TAATGTGTCAACACAGGCAAGAGAGGTAGTGAACAATGCTTTCTCAAAAGGTATAGAAGG
ACTCAGCACTTTGCTCCATGGTCTTGAGGAGAAGAAGACTGATATTTCCTCCAAGATCGT
TGACACTGCTACCAAGGCTGTTGCTGGCGCATCGAGCAGCACCACCGTGGCAAGCCGAGA
CGTTCCTATATCCACAGACAATCAGCCTCTGTTAGCTAGTGAGCGTGGGGCTGAGACTAC
CCCGTG

QA 1 666 1 666
DS 

RD RS1H023JQB 653 0 0
GCGGCCTCCGCGGAAACCGTCCAGAGGTCTGTAACCGATGCTGGAGAAACCGTTGCAGCC
TCCACTGAAACAATCAAGACTGAAGCGGCAGCAGCACCAGAGAAAGTCTCTAATGTGTCA
ACACAGGCAAGAGAGGTAGTGAACAATGCTTTCTCAAAAGGTATAGAAGGACTCAGCACT
TTGCTCCATGGTCTTGAGGAGAAGAAGACTGATATTTCCTCCAAGATCGTTGACACTGCT
ACCAAGGCTGTTGCTGGCGCATCGAGCAGCACCACCGTGGCAAGCCGAGACGTTCCTATA
TCCACAGACAATCAGCCTCTGTTAGCTAGTGAGCGTGGGGCTGAGACTACCCCGTGGTGG
AAAAATTGTTGTGGAGTTCTTGATCTTCTCAAGACATCTGCTTCAAAATGAAAGGCTAAT
GCATTTCACCATGAAGGAAGGACGGAGCACTAGAAGAAGTACCTATCCCAAAACAACTTT
CGGTTACGTATTTGCTTTCTTTTATATTTTGATTTGTTATTGTGTCCATCTTAACTTTGG
TTGTTTTTTGTTTTGCTTTTCTGTTGATAATCCTGTTGAGTCTTGATTGTTTACAAGAAG
TTGTGTAAGAGCCAATAAACCCCCAAAAATGTAAAATTTCCTTTGTGATGACC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 2

CO CL7034Contig1 799 2 2 U
GAAATGGGTATTCACCCACATCGCCGGATCTGGCTCGGAGAGTTGGTTGAACAAACACGC
CGACTTTAGCAAAGTGTTCCTCGCCGGAGACAGCGCGGGCGCCACCATCGCTCATCACAT
GGCGATGAGAGCTGCGAGGGAGAAACTCAGTCCCGAGTTAAGCGACACAGGAATCTCCGG
GATCAACCTGGTTCATCCTTACTTCTGGTCGAAAACACCAGTCGACGACAAGGAGACGAA
AGATGAAACGTTGAGGTCGAAGATCGAGGCGTTCTGGATGATGGCTACTCCAAACAACAA
AGACGGAGTCGATGATCCGTTGATCAACGTGGTTCAGTCAGAGTCGGTGGATATCTCCGG
GTTGGGATGCGGGAAAGTGTTGGTGATGGTGGCTGAGAAAGACGCGTTGGCGAGGCAAGG
CTGGGGGTACGCGGCAAAGCTTGAGAAGAGTGGGTGGAAAGGGAAAGTGGAGTTGGTGGA
GAGTGAAGGAGAAGACCATGTTTTTCATTTGATGAGACCCGATTGTGAGAAAGCTCTTGA
GGCCATGAAGATATTCGCGGGCTTTCTTAAGGGAGAGATGCAGTAGCTGTGCTGCATGTG
TGGTCCGTCCGGTGAGATGAAGATATAGTTTGGTCTCTCTCAGTCTCGGTAATGTTTTTT
ATTGATTTTATCTTATTAGCATGAATAACACGAGAGACTAATAATACCATAAGCACATGA
CAAGAGGACCAAGTGAGATTACCATTGTATTGTCTTAAACATAATTTATGTTTTTCTGGG
TTATATGACTATTTGTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GV02TF U 1
AF RS1GV02JQ C 360
BS 1 565 RS1GV02TF
BS 566 799 RS1GV02JQ

RD RS1GV02TF 565 0 0
GAAATGGGTATTCACCCACATCGCCGGATCTGGCTCGGAGAGTTGGTTGAACAAACACGC
CGACTTTAGCAAAGTGTTCCTCGCCGGAGACAGCGCGGGCGCCACCATCGCTCATCACAT
GGCGATGAGAGCTGCGAGGGAGAAACTCAGTCCCGAGTTAAGCGACACAGGAATCTCCGG
GATCAACCTGGTTCATCCTTACTTCTGGTCGAAAACACCAGTCGACGACAAGGAGACGAA
AGATGAAACGTTGAGGTCGAAGATCGAGGCGTTCTGGATGATGGCTACTCCAAACAACAA
AGACGGAGTCGATGATCCGTTGATCAACGTGGTTCAGTCAGAGTCGGTGGATATCTCCGG
GTTGGGATGCGGGAAAGTGTTGGTGATGGTGGCTGAGAAAGACGCGTTGGCGAGGCAAGG
CTGGGGGTACGCGGCAAAGCTTGAGAAGAGTGGGTGGAAAGGGAAAGTGGAGTTGGTGGA
GAGTGAAGGAGAAGACCATGTTTTTCATTTGATGAGACCCGATTGTGAGAAAGCTCTTGA
GGCCATGAAGATATTCGCGGGCTTT

QA 1 565 1 565
DS 

RD RS1GV02JQ 440 0 0
GGTTGGGATGCGGGAAAGTGTTGGTGATGGTGGCTGAGAAAGACGCGTTGGCGAGGCAAG
GCTGGGGGTACGCGGCAAAGCTTGAGAAGAGTGGGTGGAAAGGGAAAGTGGAGTTGGTGG
AGAGTGAAGGAGAAGACCATGTTTTTCATTTGATGAGACCCGATTGTGAGAAAGCTCTTG
AGGCCATGAAGATATTCGCGGGCTTTCTTAAGGGAGAGATGCAGTAGCTGTGCTGCATGT
GTGGTCCGTCCGGTGAGATGAAGATATAGTTTGGTCTCTCTCAGTCTCGGTAATGTTTTT
TATTGATTTTATCTTATTAGCATGAATAACACGAGAGACTAATAATACCATAAGCACATG
ACAAGAGGACCAAGTGAGATTACCATTGTATTGTCTTAAACATAATTTATGTTTTTCTGG
GTTATATGACTATTTGTGCT

QA 1 440 1 440
DS 



AS 1 2

CO CL7035Contig1 653 2 2 U
GGAGCGGCAGACAAAAAGAGCAGAAACTCCCAAACCATGGCGACAAAACCAGCTGCTGCA
TCCGTTCAATGCTTCGGAAGGAAGAAGACAGCAGTTGCCGTCACCCACTGCAAACGCGGA
TGCGGCCTGATCAAGCTCAACGGTTCCCCGATCGAGCTATTCAACCCAGAGATCCTCCGG
TTCAAGATCTTCGAGCCTGTCTTTCTCCTCGGGAAACACCGTTTCGCTGGTGTTGACATG
AGGATCCGCGTCAACGGCGGTGGTCACACTTCCCAGGTATACGCCATCCGTCAGAGCATC
GCCAAGGCTCTCGTCGCGTTCTACCAGAAGTATGTTGATGAGCAGTCGAAGAAGGAGGTG
AAGGATATTCTGAATCGTTACGATGGGACACTGCTCGTGGCGGATCCGAGGAGGTGCGAG
CCGAAGAAGTTTGGTGGGCGTGGTGCTCGTTCTCGTTTCCAGAAGAGTTACCGTTAAAAC
AATTCTGGTTTTGTTTTGTTTGGATCGTTGCAAGGTTTGTTTTTTTTGTTTGGGAGTCAT
GAGTATGATGGAGTTGTAAGACTTTTTAGATTATATCATTTTCAGTTCTTTTTATGCTTT
ATTTGGATTATGTTTGACGATGTTTACCTCTTTGCTATCAGAAATTTTTTAAC


BQ
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BQ
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AF RS1D247JQ C 3
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ATTATATTTCTTCTTAACGAAATCATGTAAGATCATCCCTAGTTATCATAATTTGGT

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TATATTTCTTCTTAACGAAATCATGTAAGATCATCCCTAGTTATCATAATTTGGTCAGGC
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BQ
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AF RS1BU52JQ C 1
AF RS1BU52TF U 1
BS 1 650 RS1BU52TF

RD RS1BU52JQ 650 0 0
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CACAAAAGGTGTCTACACAGTAGCGGAGACAATGCCAGAGAGCGAACGTTGGGACGCGCG
CCTTGCAAGACCCATCAGCAGCTTCCACACTTCTTGCAACCACCTAAACCAGGCAAATAA
TGGGATCAAATTCAGTTATAACCGCCTTTCCGGTTACTTTCATGCCGTGAAACCATTTGT
GTATCGACACCAGTACGCACCTTCTTATTGCTGAATTGAATGAGCCTTTGTACCCCTTTC
TAAGTTGTGTAAACTTGTAGTAATAATTGAAATATGAAATAGTTTGGATACTTGTGTATA
ATGTTAATATTGGAGCATGGACGTCAATTCGGGTTGGTCCGGCCTAACCC

QA 1 650 1 650
DS 

RD RS1BU52TF 650 0 0
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CCTTTTCTTGTTCATGGATTCGCTGATGCGTAAACTCGTGATGGGTTTGGTCGTGATGAT
TGCGATCTTCGGGGCTTCAGGTGTCGACGCGTGGACTGGCGAGATTCGCGTCAGAGTAGT
ATGCGATGTCTGTGCCGATTCTTCAATCGGGCCAGAAGATCATGTCCTTGAAGGAGCTGA
GGTTGCGGTACTCTGCATAACCAAATCTGGAGAAGTTGTGAACTACCAAGCTTTCACAAA
CACAAAAGGTGTCTACACAGTAGCGGAGACAATGCCAGAGAGCGAACGTTGGGACGCGCG
CCTTGCAAGACCCATCAGCAGCTTCCACACTTCTTGCAACCACCTAAACCAGGCAAATAA
TGGGATCAAATTCAGTTATAACCGCCTTTCCGGTTACTTTCATGCCGTGAAACCATTTGT
GTATCGACACCAGTACGCACCTTCTTATTGCTGAATTGAATGAGCCTTTGTACCCCTTTC
TAAGTTGTGTAAACTTGTAGTAATAATTGAAATATGAAATAGTTTGGATACTTGTGTATA
ATGTTAATATTGGAGCATGGACGTCAATTCGGGTTGGTCCGGCCTAACCC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL7038Contig1 648 2 2 U
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ATCAGTTCTGACGGGACAGAGCAAGAAAAACAGTAGCCGCTGAGATTTGAACTTTGAGAT
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CTTCAAGTCTAATCAATTTAATTGCATCATCGATCTGCAACTTCCCACAGTAGATGCCAA
GAGCAATTACTACAGAGTGAGCTGATGCTTCAAGCGCATCGATGCTTGCGAGTTCACCAT
CATTTGTCTTCTTAAGCAGATCCCCTACTGCTTTCACTAGCTTATCATCTTGTTTTCCTC
CAAAGATGCTCGAATAAACTTTGGGTTTGATCCCAAACTCTGATTCTATCCACTCCAGTA
AAGGATCAATCCTATCCACCTGAACCTCATGGACGTCACTAGTAAGATCGTTATCTTCAG
GCGCTCGGAAAAAGACGAGATCTTGATGTAACTTTCTTAATAGATGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DV49TF C 1
AF RS1DV49JQ U 9
BS 1 8 RS1DV49TF
BS 9 648 RS1DV49JQ

RD RS1DV49TF 648 0 0
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CTTCAAGTCTAATCAATTTAATTGCATCATCGATCTGCAACTTCCCACAGTAGATGCCAA
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CATTTGTCTTCTTAAGCAGATCCCCTACTGCTTTCACTAGCTTATCATCTTGTTTTCCTC
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QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1DV49JQ 640 0 0
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AAAAAGACGAGATCTTGATGTAACTTTCTTAATAGATGCC

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

CO CL7039Contig1 766 2 2 U
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AGTGCTGAACCAAACCGAGACATGGTTGTGCCAGTTAGTTACATAAGTCCTGACTGTGTC
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BQ
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AF RS1D582TF U 1
AF RS1D582JQ C 93
BS 1 742 RS1D582TF
BS 743 766 RS1D582JQ

RD RS1D582TF 742 0 0
GGCCAACAAAGTCATACAAAGTTTCTCTTTATCAGTTTCCGATCTACGAATCGAGTACTA
CCGCTACGAATCGGCTGTGTTTTTTCTTTGTTCTGGTTAAATTATTTGATCGGTGAAGTT
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CATGAAGATAGGGGTAGCGAAAAAAACCACTTAAATAGTAATACTTTTATCAAGAGGCAG
GGCGATATGTTAGGAAGGAATCCTTGGTCTGAGAAAAATAGTGTCGGCTCCCCAGTTTCT
CGTGAAGCCGGATCAGACAAAGATGTTCAGGATATGAGACTAGAGGAAACCCAAGAACTT
AGAACCGAAGCTGTAGCAAGTGACAACAAGTAGTGATGTCAACTGGAAACCGGCTCTTTC
AGTGCTGAACCAAACCGAGACATGGTTGTGCCAGTTAGTTACATAAGTCCTGACTGTGTC
TTTCATTAGGATCATGGATTTTGTAACGAGGTTGGGAAATGATTGTCTGGTTTGGATTCC
ATTTCCAATTTGATTGTACATTGTACACTTGGTTGCTCGGGTCTTTGAGACATGTTAATT
GCCTTTGTCGTATGCTCAAGTTGTTAAGTAGAGAGAGGCACATAGCAATTATGTAGATAA
AGATGTTAGTATCTCCTTTTTT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RS1D582JQ 674 0 0
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CAATAATACTTCAGACGAGTTTTATGGTAACGATGATGGTATAGTGCCAAACTCGGCGTA
CGAGGCCAGTAGCAGGAAGAAACAAAGACATGAAGATAGGGGTAGCGAAAAAAACCACTT
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GAAAAATAGTGTCGGCTCCCCAGTTTCTCGTGAAGCCGGATCAGACAAAGATGTTCAGGA
TATGAGACTAGAGGAAACCCAAGAACTTAGAACCGAAGCTGTAGCAAGTGACAACAAGTA
GTGATGTCAACTGGAAACCGGCTCTTTCAGTGCTGAACCAAACCGAGACATGGTTGTGCC
AGTTAGTTACATAAGTCCTGACTGTGTCTTTCATTAGGATCATGGATTTTGTAACGAGGT
TGGGAAATGATTGTCTGGTTTGGATTCCATTTCCAATTTGATTGTACATTGTACACTTGG
TTGCTCGGGTCTTTGAGACATGTTAATTGCCTTTGTCGTATGCTCAAGTTGTTAAGTAGA
GAGAGGCACATAGCAATTATGTAGATAAAGATGTTAGTATCTCCTTTTTTTTTTTCTGTT
GCAATGCTATAACC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

CO CL7040Contig1 761 2 8 U
GGCTTTCAGACACACAAAAAAAGCTCTCTCGAAGGAATCCTCAATCCCCTCTCCTTCGCG
TAGCTTCTTCTTCAGGTTAAAATGGGAGACAATCATGGTGACGACAAGAACATTGAGATA
TGGAAGATTAAGAAGCTCATCAAGTCCCTTGAAGCTGCGAGGGGCAATGGAACCAGCATG
ATCTCGCTCATCATGCCTCCACGTGATCAGGTCTCTCGTGTCACAAAGATGTTGGGCGAT
GAGCATGGAACGGCTTCCAACATCAAGAGCAGAGTCAATCGCCAGTCTGTTTTGGGTGCC
ATCACTTCTGCGCAGCAAAGGCCGAAACTTTACAACCGGGTCCCTCCCAATGGTCTAGTC
CTCTACACCGGGACCATTGTCAACGACGAAGGCAAGGAGAAGAAGGTGACCATTGACTTT
GAGCCTTTCAAGCCCATTAACAACACACTCTACCTCTGCGACAACAAGTTCCACACCGAA
GCTCTGAACGAGTTGCTGGAGTCTGATGACAAGTTTGGTTTCATTGTGATGGACGGGAAC
GGGACTCTCTTTGGAACCCTGAGCGGTAACACTCGCGAGGTGCTTCACAAGTTCTCTGTT
GATCTTCCGAAGAAGCACGGGGAGAGGAGGGCAGTCTGCGCTTCGGTTTGCACGTCTGCG
TATGGAGAAGCGTCACAACTACGTGAGGAAACGCTGAGCTCGCCACGCAGTACTACATCA
ACCCCGCGACGAGTCAGCCTAATGTGTCTGGTCTGATACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1CY52TF U 1
AF RS1CZ75TF U 7
BS 1 243 RS1CY52TF
BS 244 244 RS1CZ75TF
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RD RS1CY52TF 690 0 0
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TAGCTTCTTCTTCAGGTTAAAATGGGAGACAATCATGGTGACGACAAGAACATTGAGATA
TGGAAGATTAAGAAGCTCATCAAGTCCCTTGAAGCTGCGAGGGGCAATGGAACCAGCATG
ATCTCGCTCATCATGCCTCCACGTGATCAGGTCTCTCGTGTCACAAAGATGTTGGGCGAT
GAGTATGGAACGGCTTCCAACATCAAGAGCAGAGTCAATCGCCAGTCTGTTTTGGGTGCC
ATCACTTCTGCGCAGCAAAGGCCGAAACTTTACAACCGGGTCCCTCCCAATGGTCTAGTC
CTCTACACTGGGACCATTGTCAACGACGAAGGCAAGGAGAAGAAGGTGACCATTGACTTT
GAGCCTTTCAAGCCCATTAACAACACACTCTACCTCTGCGACAACAAGTTCCACACCGAA
GCTCTGAACGAGTTGCTGGAGTCTGATGACAAGTTTGGTTTCATTGTGATGGACGGGAAC
GGGACTCTCTTTGGAGCCCTGAGCGGTAACACTCGCGAGGTGCTTCACAAGTTCTCTGTT
GATCTTCCGAAGAAGCACGGGGAGAGGAGGGCAGTCTGCGCTTCGGTTTGCACGTCTGCG
TATGGAGAAGCGTCACAACTACGTGAGGAA

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1CZ75TF 755 0 0
GGAGACACAC
AAAAAAGCTCTCTCGAAGGAATCCTCAATCCCCTCTCCTTCGCGTAGCTTCTTCTTCAGG
TTAAAATGGGAGACAATCATGGTGACTACAAGAACATTGAGATATGGAAGATTAAGAAGC
TCATCAAGTCCCTTGAAGCTGCGAGGGGCAATGGAACCAGCATGATCTCGCTCATCATGC
CTCCACGTGATCAGGTCTCTCGTGTCACAAAGATGTTGGGCGATGAGCATGGAACGGCTT
CCAACATCAAGAGCAGAGTCAATCGCCAGTCTGTTTTGGGTGCCATCACTTCTGCGCAGC
AAAGGCTGAAACTTTACAACCGGGTCCCTCCCAATGGTCTAGTCCTCTACACCGGGACCA
TTGTCAACGACGAAGGCAAGGAGAAGAAGGTGACCATTGACTTTGAGCCTTTCAAGCCCA
TTAACAACACACTCTACCTCTGCGACAACAAGTTCCACACCGAAGCTCTGAACGAGTTGC
TGGAGTCTGATGACAGGTTTGGTTTCATTGTGATGGACGGGAACGGGACTCTCTTTGGAA
CCCTGAGCGGTAACACTCGCGAGGTGCTTCACAAGTTCTCTGTTGATCTTCCGAAGAAGC
ACGGG*AGAGGAGGGCAGTCTGCGCTTCGGTTTGCACGTCTGCGTATGGAGAAGCGTCAC
AACTACGTGAGGAAACGCTGAGCTCGCCACGCAGTACTACATCAACCCCGCGACGAGTCA
GCCTAATGTGTCTGGTCTGATACTC

QA 11 755 11 755
DS 



AS 1 2

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GCGGTGGGAAATGCAGGGGCACTTGGGTTGTGAAGATGATAGAGAATCATCATGGAAGAG
TGTTTCGCCCGCCTTAGTGTGTCGTACTGATAGTTGTTGCCTTGGCAAAGATTTAGGAAA
GCTTGCCTATTATCAAAGCACTCGCTCTGAATGTTGTCATCTTTGTCCTCGATCTCAATG
GGAACGTCTTTGATAGCCACCTGCAGAGATCATCCACCACACCTTTGTCATTTTTCTAAG
ATACAAAAAAAATATGGTGCTCTAACCACCACCAAAGAAACTTACAGGAAACAGTGAGTG
CTTCACTTTCCGATTGATTGGATGCCTCTCTTTCTCTACGCGCTTCTGTTCCACTTGGTA
ACACCTGCGGTCAAAAGTGAGTTGATTATTATTTTTTTTTTAAAACTTAAATAACTGAAG
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BQ
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AF RS1E877JQ C 1
AF RS1E877TF U 1
BS 1 659 RS1E877TF

RD RS1E877JQ 659 0 0
GTACAAACTTGGCAGTGCCAGCCTTGAGCATTCTCGATTTCTTGTTGGCAGATGGTGCAT
GCGGTGGGAAATGCAGGGGCACTTGGGTTGTGAAGATGATAGAGAATCATCATGGAAGAG
TGTTTCGCCCGCCTTAGTGTGTCGTACTGATAGTTGTTGCCTTGGCAAAGATTTAGGAAA
GCTTGCCTATTATCAAAGCACTCGCTCTGAATGTTGTCATCTTTGTCCTCGATCTCAATG
GGAACGTCTTTGATAGCCACCTGCAGAGATCATCCACCACACCTTTGTCATTTTTTTAAG
ATACAAAAAAAATATGGTGCTCTAACCACCACCAAAGAAACTTACAGGAAACAGTGAGTG
CTTCACTTTCCGATTGATTGGATGCCTCTCTTTCTTTACGCGCTTCTGTTCCACTTGGTA
ACACCTGCGGTCAAAAGTGAGTTGATTATTATTTTTTTTTTAAAACTTAAATAACTGAAG
TATGAATTATGATCATGTAGCAAAGATCTTACTTGTCACAGATCTGAAAATTCTTGCAGC
GGTTGCACACTCACCGATTTCCAGATACCATGAGGGTGCAACAGTGCTTGCAGCAATGTT
GCAAGTGAACCATGATTAAATCTTCCTTCATTGGACAAGTGATCTCACCGAGCTACCAC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RS1E877TF 659 0 0
GTACAAACTTGGCAGTGCCAGCCTTGAGCATTCTCGATTTCTTGTTGGCAGATGGTGCAT
GCGGTGGGAAATGCAGGGGCACTTGGGTTGTGAAGATGATAGAGAATCATCATGGAAGAG
TGTTTCGCCCGCCTTAGTGTGTCGTACTGATAGTTGTTGCCTTGGCAAAGATTTAGGAAA
GCTTGCCTATTATCAAAGCACTCGCTCTGAATGTTGTCATCTTTGTCCTCGATCTCAATG
GGAACGTCTTTGATAGCCACCTGCAGAGATCATCCACCACACCTTTGTCATTTTTCTAAG
ATACAAAAAAAATATGGTGCTCTAACCACCACCAAAGAAACTTACAGGAAACAGTGAGTG
CTTCACTTTCCGATTGATTGGATGCCTCTCTTTCTCTACGCGCTTCTGTTCCACTTGGTA
ACACCTGCGGTCAAAAGTGAGTTGATTATTATTTTTTTTTTAAAACTTAAATAACTGAAG
TATGAATTATGATCATGTAGCAAAGATCTTACTTGTCACAGATCTGAAAATTCTTGCAGC
GGTTGCACACTCACCGATTTCCAGATACCATGAGGGTGCAACAGTGCTTGCAGCAATGTT
GCAAGTGAACCATGATTAAATCTTCCTTCATTGGACAAGTGATCTCACCGAGCTACCAC

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

CO CL7042Contig1 676 2 3 U
GGAACTTTGGCTGCTGTAATTGCAGCCTCTTTCAAACTCTGTTTCATGAATCAATCAATC
TATTTTAATTCTTGGTGACAACTTTAAGTTTATCTCTTCCTTTTATGTTTCCTGCACAAT
AAAGCTTTATAAGCTATTTCATTTTCTATCTTTCAATAAAGCTTTTATGAGCTCAATCTT
TCTAGTTTCATAAACATTCACATGGTATCAGAGCTTCAGTCGGTTCATGGGTATTATTCC
TCTTTCAGAGCTTCTATTAAACTTGTCAAGTCAGCTTCCTTATCAGTTTTGGTAGAGTTT
CTTTCCTGAACTCGAAATCCAAAGAAAGGTTGAGACTTTCTTGCGTTTTCAAGCCCTCTT
TCTTCACAGACGGTTCATAGGATTATTCTGTTCATCTTCAAGCCTTAGTTTGCTCTGTCT
GAGCAAATCCAGTCCTGTTTTCTTGAAGTCTTTTCGGCAGTGACCAAGACAGAGAAGAAG
CTCGCCTGGTAAAACAAAGTTGGTGTTTTGGTGAAGCTGGCCACGCTGTCTGAAGAGGAT
AATGACTTTTCAAACAAAACTAGTAGTTTCTCCAAGTCACATGTCATGTTTCTTCTCACG
GTAATATCTCTGTTCTTTCATGTGAAAATAGATAGCTTCAGAACTGGAAACATATCGCTG
GCTAGGTAGTTGCAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FG79TF U 1
AF RS1H522TF U 8
BS 1 48 RS1FG79TF
BS 49 49 RS1H522TF
BS 50 676 RS1FG79TF

RD RS1FG79TF 676 0 0
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TATTTTAATTCTTGGTGACAACTTTAAGTTTATCTCTTCCTTTTATGTTTCCTGCACAAT
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TCTAGTTTCATAAACATTCACATGGTATCAGAGCTTCAGTCGGTTCATGGGTATTATTCC
TCTTTCAGAGCTTCTATTAAACTTGTCAAGTCAGCTTCCTTATCAGTTTTGGTAGAGTTT
CTTTCCTGAACTCGAAATCCAAAGAAAGGTTGAGACTTTCTTGCGTTTTCAAGCCCTCTT
TCTTCACAGACGGTTCATAGGATTATTCTGTTCATCTTCAAGCCTTAGTTTGCTCTGTCT
GAGCAAATCCAGTCCTGTTTTCTTGAAGTCTTTTCGGCAGTGACCAAGACAGAGAAGAAG
CTCGCCTGGTAAAACAAAGTTGGTGTTTTGGTGAAGCTGGCCACGCTGTCTGAAGAGGAT
AATGACTTTTCAAACAAAACTAGTAGTTTCTCCAAGTCACATGTCATGTTTCTTCTCACG
GTAATATCTCTGTTCTTTCATGTGAAAATAGATAGCTTCAGAACTGGAAACATATCGCTG
GCTAGGTAGTTGCAAT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1H522TF 656 0 0
G
GGCTGCTGTAATTGCAGCCTCTTTCAAACTCTGTTTCATGAATCAATCAATCTATTTTAA
TTCTTGGTGACAACTTTAAGTTTATCTCTTCCTTTTATGTTTCCTGCACAATAAAGCTTT
ATAAGCTATTTCATTTTCTATCTTTCAATAAAGCTTTTATGAGCTCAATCTTTCTAGTTT
CATAAACATTCACATGGTATCAGAGCTTCAGTCGGTTCATGGGTATTATTCCTCTTTCAG
AGCTTCTATTAAACTTGTCAAGTCAGCTTCCTTATCAGTTTTGGTAGAGTTTCTTTCCTG
AACTCGAAATCCAAAGAAAGGTTGAGACTTTCTTGCGTTTTCAAGCCCTCTTTCTTCACA
GACGGTTCATAGGATTATTCTGTTCATCTTCAAGCCTTAGTTTGCTCTGTCTGAGCAAAT
CCAGTCCTGTTTTCTTGAAGTCTTTTCGGCAGTGACCAAGACAGAGAAGAAGCTCGCCTG
GTAAAACAAAGTTGGTGTTTTGGTGAAGCTGGCCACGCTGTCTGAAGAGGATAATGACTT
TTCAAACAAAACTAGTAGTTTCTCCAAGTCACATGTCATGTTTCTTCTCACGGTAATATC
TCTGTTCTTTCATGTGAAAATAGATAGCTTCAGAACTGGAAACATATCGCTGGCT

QA 2 656 2 656
DS 



AS 1 2

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GAAAAGATGAGACGGGTTGTGCGAGGAAAGTCTGTTTCTTTGCGCATGACGTGAGGAGAT
GAGACCGGTTAATGCTTCCACTGGCTCAGCTGTGTCTCAATCTCCGTTGGAGATGATGAA
TGGTTTGTCTCCGCTTGCCTACTCTTCAGGTGTTTCGACACGTCCCGTCTCTCCGATGGG
TAATAATAGTGTTGCTTCCTCTCCAAGAAACGGGTCATGGCAGAACAGAGTTAATTCTCT
GTCTCCACCTACTCTTCAGCTCAACGGTGGAAGTAGGTTGAAGTCTACACTGAGTGCTAG
AGATCTTGATATCGATATGGAGATGGAGCTGAGACTTAGAGGTTTCAACAATGTGGAAGA
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CCAGCATTACCCTTCTTCCCCGGTAAGGCAACAGCCTCCTCCTCACCACTTTGACTCTTC
AGCGGCTGTGGCAGCTGCAGTGATGAACGCAAGATCATCTGCGTTTGCTAAACGCAGCTT
GAGTTTCAAACCTCAAGTAGCATCATCACCATCGAATCTTTCCGATCGGGGATCACCTAG
TGGGAAGCTGGACTGGGGAGTGCAAGGAGATGAGCTGAGTAAGATGAGAAGAAGTGTTTC
ATTTGGAATCCGTGGAGACAACAACAGTAACAATGCAGAGAGAGATTATAGGAACGAGCC
AGATGTTTCGTGGGTTAACTCTTTGGTTAAAGACAGTGTTGTGTCTGAGAGAGGCTTTGG
GATGAATGAGAGGGTGAGGATAATGTCTTGGGCTGAGCAGATGTACAGAGAGAAGGAGCA
GACTGTTGTGTAAACACACACACACGCAGAAACTTGTTTATTCTTTAATCTTTTGTTACT
TTTTAATTGTTTCTGTTAGTATATGATTTGTAGTCACTATGAGAAAGATAACTGGGCTAA
TAGCTTATTAGTCTCTATATTGGTCATTTTTTCTTGTAATTCCAAACTATGAAATGGTCT
TA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RS1AF68TF U 1
AF RS1AF68JQ C 170
BS 1 773 RS1AF68TF
BS 774 1022 RS1AF68JQ

RD RS1AF68TF 777 0 0
GAAAAGATGAGACGGGTTGTGCGAGGAAAGTCTGTTTCTTTGCGCATGACGTGAGGAGAT
GAGACCGGTTAATGCTTCCACTGGCTCAGCTGTGTCTCAATCTCCGTTGGAGATGATGAA
TGGTTTGTCTCCGCTTGCCTACTCTTCAGGTGTTTCGACACGTCCCGTCTCTCCGATGGG
TAATAATAGTGTTGCTTCCTCTCCAAGAAACGGGTCATGGCAGAACAGAGTTAATTCTCT
GTCTCCACCTACTCTTCAGCTCAACGGTGGAAGTAGGTTGAAGTCTACACTGAGTGCTAG
AGATCTTGATATCGATATGGAGATGGAGCTGAGACTTAGAGGTTTCAACAATGTGGAAGA
GAGTTTTGGGTCTTATGTCTCCTCCCCAAGTAGGAACTCTCAGATGGGTCAGAACATGAA
CCAGCATTACCCTTCTTCCCCGGTAAGGCAACAGCCTCCTCCTCACCACTTTGACTCTTC
AGCGGCTGTGGCAGCTGCAGTGATGAACGCAAGATCATCTGCGTTTGCTAAACGCAGCTT
GAGTTTCAAACCTCAAGTAGCATCATCACCATCGAATCTTTCCGATCGGGGATCACCTAG
TGGGAAGCTGGACTGGGGAGTGCAAGGAGATGAGCTGAGTAAGATGAGAAGAAGTGTTTC
ATTTGGAATCCGTGGAGACAACAACAGTAACAATGCAGAGAGAGATTATAGGAACGAGCC
AGATGTTTCGTGGGTTAACTCTTTGGTTAAAGACAGTGTTGTGTCTGAGAGAG
CTTT

QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1AF68JQ 853 0 0
TCTCCGATGGGTAATAATAGTGTTGCTTCCTCTCCAAGAAACGGGTCATGGCAGAACAGA
GTTAATTCTCTGTCTCCACCTACTCTTCAGCTCAACGGTGGAAGTAGGTTGAAGTCTACA
CTGAGTGCTAGAGATCTTGATATCGATATGGAGATGGAGCTGAGACTTAGAGGTTTCAAC
AATGTGGAAGAGAGTTTTGGGTCTTATGTCTCCTCCCCAAGTAGGAACTTTCAGATGGGT
CAGAACATGAACCAGCATTACCCTTCTTCCCCGGTAAGGCAACAGCCTCCTCCTCACCAC
TTTGACTCTTCAGCGGCTGTGGCAGCTGCAGTGATGAACGCAAGATCATCTGCGTTTGCT
AAACGCAGCTTGAGTTTCAAACCTCAAGTAGCATCATCACCATCGAATCTTTCCGATCGG
GGATCACCTAGTGGGAAGCTGGACTGGGGAGTGCAAGGAGATGAGCTGAGTAAGATGAGA
AGAAGTGTTTCATTTGGAATCCGTGGAGACAACAACAGTAACAATGCAGAGAGAGATTAT
AGGAACGAGCCAGATGTTTCGTGGGTTAACTCTTTGGTTAAAGACAGTGTTGTGTCTGAG
AGAGGCTTTGGGATGAATGAGAGGGTGAGGATAATGTCTTGGGCTGAGCAGATGTACAGA
GAGAAGGAGCAGACTGTTGTGTAAACACACACACACGCAGAAACTTGTTTATTCTTTAAT
CTTTTGTTACTTTTTAATTGTTTCTGTTAGTATATGATTTGTAGTCACTATGAGAAAGAT
AACTGGGCTAATAGCTTATTAGTCTCTATATTGGTCATTTTTTCTTGTAATTCCAAACTA
TGAAATGGTCTTA

QA 1 853 1 853
DS 



AS 1 2

CO CL7044Contig1 651 2 1 U
GGATGCATCACTTATAACAAACCAATACTACAACCAAAAAGAAAAACTCATGGCTAAGCT
CATTTTCTTCATCTCCCTCCAAATCCTCTTCCTCCTCGCTCTTGTTCATTCCAACTTCGC
CAAAACCATAGATCGTAAACTTCTCGGTCTTCACAGGAAAGAGAAGCTAACCCATTTCAA
AGTCTATTGGCACGACCAGACAAGCGGTCCAAACCCAACGGCCATCATTATCATACCACC
AGTTAAGAACTCTACTACCGACTTTGGAGGAGTCTCTATTATCGATAACCCTTTGACGGC
CAAAGTTTCGAGGAACTCCACGTTAGTTGGCAAGGCGCAAGGGTTTTATGCGGGAGCGGA
CCAAAAGGAGTTTGCTTTCATAGCGGCGATGAATTTTGTTTTTATGACAGGGAAGTACAA
CGGAAGCACGATCACAATCCTTGGTCATAACTCGATTATGTCGAAGGTTAGAGAAATGCC
GATAGTGGGAGGAAGTGGACTTTTCCGCTTTGCTAGAGGCTACGTTGAGCTTCGAACAAA
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TTGATGTTTTATATTTTGATTTGACGACGTAATAATAAAACAAGCTTTCTC


BQ
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QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1H220TF U 1
AF RS1H220JQB C 72
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BS 727 882 RS1H220JQB

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CACTAC

QA 1 726 1 726
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ATATACTCTTAATGGATATGGCTGCTGCACT

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 2

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BQ
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1B447TF U 1
AF RS1B447JQ C 53
BS 1 660 RS1B447TF
BS 661 661 RS1B447JQ
BS 662 712 RS1B447TF

RD RS1B447TF 712 0 0
GGATCTTCTATATTTTACAGTCCCGATTCATCTTCTCTCCAGCTCCGACCAGGACGTAAC
AGGTAAGTACAAAAAGAGTGGTGAAAGATGGGTCGTGTTCGTACCAAAACAGTGAAGAAA
TCGTCACGTCAGGTGATCGAGAAGTACTACTCGAGGATGACACTCGACTTCCACACGAAC
AAGAAGATCTTGGAGGAAGTCGCAATCATCCCTTCCAAAAGACTACGCAACAAGATCGCT
GGATTCTCCACCCACTTGATGAAGCGTATCCAAAAGGGACCGGTGCGTGGGATCTCGCTC
AAGCTGCAGGAGGAGGAGCGCGAACGAAGAATGGACTTTGTCCCCGACGAGTCGGCGATC
AAGACCGATGATGTGAAGGTGGACAAGGAGACGCTGGAGATGCTTGCTTCGTTGGGAATG
TCTGACGTTTCCGGGTTTTCTCAAGTGGAGACACAAGCGGCCGTGGCACCAGGCAATGCG
TTTGGCCGTGGTGGAAGAAGATTCTAAGGCATGAGTTTTGTTTTTTTTGTTTTGTGTTAT
GGAATGATTCAACGTTGTTAATCTCTTTCGTATATTCTTGCAGTACTGTTTTTATCCAAG
TTTCAGAAGTGTTGAATTGAATCATTTCGAATCAACAAATGAGTTTTAATTTTTTCTTTT
*GTATTGGGGAATTATGGATTAATTCAACATTGTTTAGTTGCTTCACGATCG

QA 1 712 1 712
DS 

RD RS1B447JQ 660 0 0
GACGTAACAGGTAAGTACAAAAAGAGTGGTGAAAGATGGGTCGTGTTCGTACCAAAACAG
TGAAGAAATCGTCACGTCAGGTGATCGAGAAGTACTACTCGAGGATGACACTCGACTTCC
ACACGAACAAGAAGATCTTGGAGGAAGTCGCAATCATCCCTTCCAAAAGACTACGCAACA
AGATCGCTGGATTCTCCACCCACTTGATGAAGCGTATCCAAAAGGGACCGGTGCGTGGGA
TCTCGCTCAAGCTGCAGGAGGAGGAGCGCGAACGAAGAATGGACTTTGTCCCCGACGAGT
CGGCGATCAAGACCGATGATGTGAAGGTGGACAAGGAGACGCTGGAGATGCTTGCTTCGT
TGGGAATGTCTGACGTTTCCGGGTTTTCTCAAGTGGAGACACAAGCGGCCGTGGCACCAG
GCAATGCGTTTGGCCGTGGTGGAAGAAGATTTTAAGGCATGAGTTTTGTTTTTTTTGTTT
TGTGTTATGGAATGATTCAACGTTGTTAATCTCTTTCGTATATTCTTGCAGTACTGTTTT
TATCCAAGTTTCAGAAGTGTTGAATTGAATCATTTCGAATCAACAAATGAGTTTTAATTT
TTTCTTTTTGTATTGGGGAATTATGGATTAATTCAACATTGTTTAGTTGCTTCACGATCG

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL7047Contig1 821 2 2 U
GTTAACCTGTTTGTGAAGATTCGTTCCCTGGTCCTCATGGACGGAGCGAGTGCGGAGCTT
TTGGGCTTCGGTGGCGGCTCGCTAGAGCTATCTCTTCCCTTTTGGTGGTTTTTGGCCTGC
CTTTGGTAGTTTTGGCTCTCTCTTCTTTGTGCAGGTTCCGGAATTGTGGCGTTTGCAATC
CTCAACCTCCATCCCTAATAAGAGTTCAATTTGGCGTTTGAGGCGTTGAGGACTGCTACT
CTCAGCAGTTGGATCTTTTTCTCTATGACTTTGTGTGCAGCAGCTCTCTCAATCGGCGGT
TACCCCTGGTGGAAGAGCAGATGTCTCATGCGGTGGTGCGGAGTCGCTATCCGTGCTGCA
AAGGTCCCCGCTAGATCGGTGCGGTTGAAGCACAAGACCAAACCTTTATCCGGGATCTCC
GGTTTCGATCGGGCCGAGTTGTCTGTTTCCTTGTGCACCCATCAGGTTTCCAATGAGAGT
TTGTAGCTGTTTGGGTTGCTTCGCTTGTTAACTTTGTTTAGGACTTCAAAGAAGCTGCAT
GAGTAGAGATGGTTTTGAGGGCTGGCCTACTCTCTGTAGCTCGCGGTAACTTAAAGGGAC
TGAGCTTTGGTAGTTTTGTGGGCAGTTCATCGCAATCGACGTCTCTAGAGTAGTTTCCTT
TTGTTTGTTTGTAGTCTTCTCCTCTTCTTTATCTTCGCAAATTGTTTCGTTTTTCTTTTA
TTTTTTTGTAGTTGTTTGTCTTTTATTTCTTTCTGCTACCAGTTTTCATTGTAATTTCCG
TAAAAAATTAAAAATCGGTAATATATTTTAACATGTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BM70TF U 1
AF RS1BM70JQ C 64
BS 1 714 RS1BM70TF
BS 715 821 RS1BM70JQ

RD RS1BM70TF 714 0 0
GTTAACCTGTTTGTGAAGATTCGTTCCCTGGTCCTCATGGACGGAGCGAGTGCGGAGCTT
TTGGGCTTCGGTGGCGGCTCGCTAGAGCTATCTCTTCCCTTTTGGTGGTTTTTGGCCTGC
CTTTGGTAGTTTTGGCTCTCTCTTCTTTGTGCAGGTTCCGGAATTGTGGCGTTTGCAATC
CTCAACCTCCATCCCTAATAAGAGTTCAATTTGGCGTTTGAGGCGTTGAGGACTGCTACT
CTCAGCAGTTGGATCTTTTTCTCTATGACTTTGTGTGCAGCAGCTCTCTCAATCGGCGGT
TACCCCTGGTGGAAGAGCAGATGTCTCATGCGGTGGTGCGGAGTCGCTATCCGTGCTGCA
AAGGTCCCCGCTAGATCGGTGCGGTTGAAGCACAAGACCAAACCTTTATCCGGGATCTCC
GGTTTCGATCGGGCCGAGTTGTCTGTTTCCTTGTGCACCCATCAGGTTTCCAATGAGAGT
TTGTAGCTGTTTGGGTTGCTTCGCTTGTTAACTTTGTTTAGGACTTCAAAGAAGCTGCAT
GAGTAGAGATGGTTTTGAGGGCTGGCCTACTCTCTGTAGCTCGCGGTAACTTAAAGGGAC
TGAGCTTTGGTAGTTTTGTGGGCAGTTCATCGCAATCGACGTCTCTAGAGTAGTTTCCTT
TTGTTTGTTTGTAGTCTTCTCCTCTTCTTTATCTTCGCAAATTGTTTCGTTTTT

QA 1 714 1 714
DS 

RD RS1BM70JQ 758 0 0
GGCTTCGGTGGCGGCTCGCTAGAGCTATCTCTTCCCTTTTGGTGGTTTTTGGCCTGCCTT
TGGTAGTTTTGGCTCTCTCTTCTTTGTGCAGGTTCCGGAATTGTGGCGTTTGCAATCCTC
AACCTCCATCCCTAATAAGAGTTCAATTTGGCGTTTGAGGCGTTGAGGACTGCTACTCTC
AGCAGTTGGATCTTTTTCTCTATGACTTTGTGTGCAGCAGCTCTCTCAATCGGCGGTTAC
CCCTGGTGGAAGAGCAGATGTCTCATGCGGTGGTGCGGAGTCGCTATCCGTGCTGCAAAG
GTCCCCGCTAGATCGGTGCGGTTGAAGCACAAGACCAAACCTTTATCCGGGATCTCCGGT
TTCGATCGGGCCGAGTTGTCTGTTTCCTTGTGCACCCATCAGGTTTCCAATGAGAGTTTG
TAGCTGTTTGGGTTGCTTCGCTTGTTAACTTTGTTTAGGACTTCAAAGAAGCTGCATGAG
TAGAGATGGTTTTGAGGGCTGGCCTACTCTCTGTAGCTCGCGGTAACTTAAAGGGACTGA
GCTTTGGTAGTTTTGTGGGCAGTTCATCGCAATCGACGTCTCTAGAGTAGTTTCCTTTTG
TTTGTTTGTAGTCTTCTCCTCTTCTTTATCTTCGCAAATTGTTTCGTTTTTCTTTTATTT
TTTTGTAGTTGTTTGTCTTTTATTTCTTTCTGCTACCAGTTTTCATTGTAATTTCCGTAA
AAAATTAAAAATCGGTAATATATTTTAACATGTTTACC

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL7048Contig1 1108 2 2 U
GGGATAAGAAGCAGATAATAATCTATCGTGACGATGGATGAATACAAAGCGAAATCGAAG
CTGAGCGAGAGCTCAACCTCCACGGTCTGGCTAGCGAGGCACATGCCAACCGGAGAAGAA
GCGGTGATGAAGTGCTTCCATCTCTCGAAGCTCAATCACAATCTCAGAACCTGTTTGGAA
AACGAGCTCGAGTTTCTCTCTTCGGTCCATCACCCCAACATCATCCGCCTCCTCCAAGTT
CTCCACGACAAGGATCTACTCGTCATGATTCTCGAGTATTGCGACGGTGGAACTTTATCA
TCTTACATTAAGCGTCACGGGAGGGTTGAAGAACATATCGCCAAGAGATTCATGAAGCAA
ATTGGAGCTGGTTTAGAAATCATTCATGATAACCACATTATCCATAGGGATCTTAAACCG
GAGAACATTATAATAGCTGGATCAGGTGATGAATCTGTGTTGAAGATAGCTGATTTTAGT
CTTTCAAGAAAGCTGCTTCCGGGAAAGTATCTAGAGACGGTGTGTGGTTCTCCGTTTTAC
ATGTCTCCCGAAGTTCTTCAGTTTCAGAGATACAATGAAAAGGCTGACATGTGGAGTGTA
GGAGCGATTCTATTCGAGCTTCTTCATGGTTATCCACCTTTTGGTGGTAGGAACAATGTT
CAGGTGAGATCTTGATTTGGTTTAGGATTCTTTTGATCCAAAAGCTTGTTACCTTTTTGT
CTTTTCCACTGACCATAGGTTTTAAGGAACATCAAGTCTAGTTTATCTCTTCCTTTCTCT
CGGTCGATTGTTCAGCAGTTGCATCCAGATTGCATTGACGTGTGTTCAAGGCTGCTCTCT
ACTAACCCAGTTACTCGTCTCTCATTTGATGAATTCTACAAACATAAGTTCTTCAGTATC
TGGTGATATCCCTGAGGTTAAAGGAAGATGGAAATTCTATGTAATGTGTCAAATTTTCTA
GAAACCTTGTATAGAATCACTTGTGACTCGGCTTGTTTTTACGTCTCATAGATATAGTTT
GATGATGTAATGTTTAATGAAAAGGCTAGGGTTTATCCTTTGTGGTAAATATCTCCTGAA
TGAGTATAAAAGACCCTTCTTTGATGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AH60TF U 1
AF RS1AH60JQ C 262
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AACGAGCTCGAGTTTCTCTCTTCGGTCCATCACCCCAACATCATCCGCCTCCTCCAAGTT
CTCCACGACAAGGATCTACTCGTCATGATTCTCGAGTATTGCGACGGTGGAACTTTATCA
TCTTACATTAAGCGTCACGGGAGGGTTGAAGAACATATCGCCAAGAGATTCATGAAGCAA
ATTGGAGCTGGTTTAGAAATCATTCATGATAACCACATTATCCATAGGGATCTTAAACCG
GAGAACATTATAATAGCTGGATCAGGTGATGAATCTGTGTTGAAGATAGCTGATTTTAGT
CTTTCAAGAAAGCTGCTTCCGGGAAAGTATCTAGAGACGGTGTGTGGTTCTCCGTTTTAC
ATGTCTCCCGAAGTTCTTCAGTTTCAGAGATACAATGAAAAGGCTGACATGTGGAGTGTA
GGAGCGATTCTATTCGAGCTTCTTCATGGTTATCCACCTTTTGGTGGTAGGAACAATGT

QA 1 659 1 659
DS 

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AGGGTTGAAGAACATATCGCCAAGAGATTCATGAAGCAAATTGGAGCTGGTTTAGAAATC
ATTCATGATAACCACATTATCCATAGGGATCTTAAACCGGAGAACATTATAATAGCTGGA
TCAGGTGATGAATCTGTGTTGAAGATAGCTGATTTTAGTCTTTCAAGAAAGCTGCTTCCG
GGAAAGTATCTAGAGACGGTGTGTGGTTCTCCGTTTTACATGTCTCCCGAAGTTCTTCAG
TTTCAGAGATACAATGAAAAGGCTGACATGTGGAGTGTAGGAGCGATTCTATTCGAGCTT
CTTCATGGTTATCCACCTTTTGGTGGTAGGAACAATGTTCAGGTGAGATCTTGATTTGGT
TTAGGATTCTTTTGATCCAAAAGCTTGTTACCTTTTTGTCTTTTCCACTGACCATAGGTT
TTAAGGAACATCAAGTCTAGTTTATCTCTTCCTTTCTCTCGGTCGATTGTTCAGCAGTTG
CATCCAGATTGCATTGACGTGTGTTCAAGGCTGCTCTCTACTAACCCAGTTACTCGTCTC
TCATTTGATGAATTCTACAAACATAAGTTCTTCAGTATCTGGTGATATCCCTGAGGTTAA
AGGAAGATGGAAATTCTATGTAATGTGTCAAATTTTCTAGAAACCTTGTATAGAATCACT
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AAGGCTAGGGTTTATCCTTTGTGGTAAATATCTCCTGAATGAGTATAAAAGACCCTTCTT
TGATGAT

QA 1 847 1 847
DS 



AS 1 2

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TTTCTGCTTTCAGGTGCACCATCAGAAGCTTGTCCTGATGAGGATGGTTGAACAGAGTTT
TGTGGAGGATTGTCATCTCCCATTGGTTTATCTACTTGCATAGTGGATGAAGAATCTACA
CTCAGCTTTCGCTTATTTGGCTCAGTATTGATTATTTTCCCCTTTCCCTTATTGAGAAAG
CTTGGTGAAGGAGATGGTAAATATGGGAAGATTTTAAGCCGGTCATGTATACACAGGCCT
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TGCTTCTCAGCATCCAATTCTGGTTCGAGAAGACTCAGATACGGTTCAAGATTTGGCAGA
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AGTCAAAG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FM36JQ U 1
AF RS1E412JQ U 5
BS 1 659 RS1FM36JQ
BS 660 848 RS1E412JQ

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TTTCTGCTTTCAGGTGCACCATCAGAAGCTTGTCCTGATGAGGATGGTTGAACAGAGTTT
TGTGGAGGATTGTCATCTCCCATTGGTTTATCTACTTGCATAGTGGATGAAGAATCTACA
CTCAGCTTTCGCTTATTTGGCTCAGTATTGATTATTTTCCCCTTTCCCTTATTGAGAAAG
CTTGGTGAAGGAGATGGTAAATATGGGAAGATTTTAAGCCGGTCATGTATACACAGGCC

QA 1 659 1 659
DS 

RD RS1E412JQ 844 0 0
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CGGTTTAGAGGAATAATGACATCTCTGTAGAAGGGATGAAAGGAAGGATCCTATCACCAT
AGAGTTGGTGCAGTTTCACCAAGAGCCTTCCAGAATCGAGGTCATTTTTCCAGACCTGAT
CAAGGATTGCTTTCATGGTGATAGCCCGGCCCTTGTTGCCTTCTTTCTCCTTTGCGTTTC
TGCTTTCAGGTGCACCATCAGAAGCTTGTCCTGATGAGGATGGTTGAACAGAGTTTTGTG
GAGGATTGTCATCTCCCATTGGTTTATCTACTTGCATAGTGGATGAAGAATCTACACTCA
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AAGCGTACGACATTGTGCCCCAAGGCCGCTAATCCTTGAATTGCACCGTAGTGCTGAGTC
AAAG

QA 1 844 1 844
DS 



AS 1 2

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CTTGGTTTAAAAAGATTTGAATAAAGTTTTATTCACGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1FO63TF U 1
AF RS1FO63JQ C 1
BS 1 651 RS1FO63TF
BS 652 698 RS1FO63JQ

RD RS1FO63TF 652 0 0
GGACACACCATACCGAAAATTTGTGGTAACGAGTGCCAGTCTTTCTCTAACTCCCCTCTC
CCTTAAAATGCTGGTGCTATCTCCGATCAACGCCTCTTTATCACCGTCGTTTCACCGGGC
AACACTGATCCGGCAACCAACTAAGACGTCATGTAGGATCATAACAAAGGCCAAGGACAA
CACCGAGTCTAGCGTGGTTCTCGAGAATGCGACTATAGCCGGTGGTTTAGTATCGACGCC
GGTGATTGGATGGTCACTCTACACTCTGAAGACCACTGGTTGTGGTTTACCTCCAGGCCC
GGCCGGTTCAATCGGCGCGTTGGAAGGTGTGAGCTACTTGGTGGTGTTGGGAATCGTGGG
CTGGTCACTGTACACCAAGACCAAAACTGGCTCGGGTCTGCCAAACGGGCCGTTTGGTTT
GCTGGGTGCGGTCGAAGGCTTGTCTTACCTGTCGCTTCTAGCCATTCTTGTTGTGTTCGG
TTTACAGTTCTTGGGTAACGGGTCGGTTCCTGGTCCACTTCCAAGTGACCAGTGTTTTGG
TTAACCAATCAGTTTCGCTCCTTCTCCAAGTGCAATGTCGTATAATACCGAACATATTTT
ATTTCAATTTGTGACTGGTCATTTGCTGTTGCTGTAATCGCTTTTGTAGAA
T

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1FO63JQ 698 0 0
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CCTTAAAATGCTGGTGCTATCTCCGATCAACGCCTCTTTATCACCGTCGTTTCACCGGGC
AACACTGATCCGGCAACCAACTAAGACGTCATGTAGGATCATAACAAAGGCCAAGGACAA
CACCGAGTCTAGCGTGGTTCTCGAGAATGCGACTATAGCCGGTGGTTTAGTATCGACGCC
GGTGATTGGATGGTCACTCTACACTCTGAAGACCACTGGTTGTGGTTTACCTCCAGGCCC
GGCCGGTTCAATCGGCGCGTTGGAAGGTGTGAGCTACTTGGTGGTGTTGGGAATCGTGGG
CTGGTCACTGTACACCAAGACCAAAACTGGCTCGGGTCTGCCAAACGGGCCGTTTGGTTT
GCTGGGTGCGGTCGAAGGCTTGTCTTACCTGTCGCTTCTAGCCATTCTTGTTGTGTTCGG
TTTACAGTTCTTGGGTAACGGGTCGGTTCCTGGTCCACTTCCAAGTGACCAGTGTTTTGG
TTAACCAATCAGTTTCGCTCCTTCTCCAAGTGCAATGTCGTATAATACCGAACATATTTT
ATTTCAATTTGTGACTGGTCATTTGCTGTTGCTGTAATCGCTTTTGTAGAAATAAAAAAA
CTTGGTTTAAAAAGATTTGAATAAAGTTTTATTCACGT

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL7051Contig1 656 2 1 U
GGGCTGAAGCTACAAGTAAGCGGGAAGGCGATCTTGTCGAGTGTTCGTTGTAGGAGACAG
ATGTCGACTTCTTCTTCCTTTGTCTTTGGACCTTACAAGATCGATCCCCGTGAAGTGTTC
TACGCAACTCCTCTCTCTTACGCCATGGTTAATCTCCGTCCTCTTCTTCCTGGTCATGTT
CTTGTCTATCCAAGACGCCTTGTGCCGCGCTTTACTGATCTCACAGCTGATGAGACAAGT
GATCTGTGGCTTACTACTCAGAAGGTTGGCTCTCGGATTGAGACCTTCCACAATGCATCT
TCTCTCACGTTAGCCATCCAAGATGGTCCTCAGGCGGGACAGAGTGTTCCACATGTGCAC
ATTCACGTCTTGCCTCGTAAAGGTGGTGACTTTGAGAAGAATGATGAGATTTACGATGCA
ATTGATGAGAAGGAGAAGGAACTGAAGCAGAAGCTTGATCTAGACAAAGACCGTGTTGAT
AGGAGCATTGAGGAGATGGCTAACGAGGCTTCTCAGTACAGATCTCTTTTCGATTGCTAG
TTTTAAGCAAAAGCTCTTTTTAATAAGAACATTGTGACAAGCGTCCCTCAAGTTGAGGTT
GATGTTTGAGACTTCAATTCGAACTTGTAATCTCTTTCTTATGTCACCAAAACTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CN52TF U 1
AF RS1CN52JQ C 7
BS 1 656 RS1CN52TF

RD RS1CN52TF 656 0 0
GGGCTGAAGCTACAAGTAAGCGGGAAGGCGATCTTGTCGAGTGTTCGTTGTAGGAGACAG
ATGTCGACTTCTTCTTCCTTTGTCTTTGGACCTTACAAGATCGATCCCCGTGAAGTGTTC
TACGCAACTCCTCTCTCTTACGCCATGGTTAATCTCCGTCCTCTTCTTCCTGGTCATGTT
CTTGTCTATCCAAGACGCCTTGTGCCGCGCTTTACTGATCTCACAGCTGATGAGACAAGT
GATCTGTGGCTTACTACTCAGAAGGTTGGCTCTCGGATTGAGACCTTCCACAATGCATCT
TCTCTCACGTTAGCCATCCAAGATGGTCCTCAGGCGGGACAGAGTGTTCCACATGTGCAC
ATTCACGTCTTGCCTCGTAAAGGTGGTGACTTTGAGAAGAATGATGAGATTTACGATGCA
ATTGATGAGAAGGAGAAGGAACTGAAGCAGAAGCTTGATCTAGACAAAGACCGTGTTGAT
AGGAGCATTGAGGAGATGGCTAACGAGGCTTCTCAGTACAGATCTCTTTTCGATTGCTAG
TTTTAAGCAAAAGCTCTTTTTAATAAGAACATTGTGACAAGCGTCCCTCAAGTTGAGGTT
GATGTTTGAGACTTCAATTCGAACTTGTAATCTCTTTCTTATGTCACCAAAACTGG

QA 1 656 1 656
DS 

RD RS1CN52JQ 650 0 0
AAGCTACAAGTAAGCGGGAAGGCGATCTTGTCGAGTGTTCGTTGTAGGAGACAGATGTCG
ACTTCTTCTTCCTTTGTCTTTGGACCTTACAAGATCGATCCCCGTGAAGTGTTCTACGCA
ACTCCTCTCTCTTACGCCATGGTTAATCTCCGTCCTCTTCTTCCTGGTCATGTTCTTGTC
TATCCAAGACGCCTTGTGCCGCGCTTTACTGATCTCACAGCTGATGAGACAAGTGATCTG
TGGCTTACTACTCAGAAGGTTGGCTCTCGGATTGAGACCTTCCACAATGCATCTTCTCTC
ACGTTAGCCATCCAAGATGGTCCTCAGGCGGGACAGAGTGTTCCACATGTGCACATTCAC
GTCTTGCCTCGTAAAGGTGGTGACTTTGAGAAGAATGATGAGATTTACGATGCAATTGAT
GAGAAGGAGAAGGAACTGAAGCAGAAGCTTGATCTAGACAAAGACCGTGTTGATAGGAGC
ATTGAGGAGATGGCTAACGAGGCTTCTCAGTACAGATCTCTTTTCGATTGCTAGTTTTAA
GCAAAAGCTCTTTTTAATAAGAACATTGTGACAAGCGTCCCTCAAGTTGAGGTTGATGTT
TGAGACTTCAATTCGAACTTGTAATCTCTTTCTTATGTCACCAAAACTGG

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL7052Contig1 764 2 5 U
GGATTAAAAAGGAAACTAACTTGAAACGAACAAATATGGCTCTTAAAGCGATTATCTTTC
TTGGTTTGCTTCTCGCCGTGATATCTTCTCCGACCACCGTCGATGGTGGATCAGTTTGTC
CGAAGGCTTCCACTTTTGGTAGAGGAAGCTTTCCCGATGGTTTCTTGTTCGGTGCCACAA
CTTCTGCTTTCCAGCATGAAGGTGCACCAGAGGAAGGAGGCAGAGGTTTGAGCATTTGGG
ACTCATTCACTCATAAACATTCAGAGAAAAACAATAACCTTCTGGGAGTTGATTTCTATC
ACCATTACAAGGAAGATGTTCAACTATTGAAAAATTTCAACATGGATGCCTTTAGGTTCT
CCATCTCTTGGTCAAGAATCTTTCCTCATGGGAAAAAGGACAAGGGAGTGAGTGAAACCG
GAGTTAAATTCTACAATGATCTCATCAACGAGCTCATTGCAAATGGTGCAACGCCTGTGG
TTACATTATTCCAATGGGATGTACCTCAAGCCCTAGAAGATGAGTATGGCGGTTTCTTGA
GTGACCGTATCTTGGAGGACTTCCGAGAGTTTGCAAAATTTGCTTTCAACGAATATGGTG
ATAGAGTGAAGCATTGGGTCACCATAAACGAGCCTTACGAGTTTAGCCTTGGTGGATACG
CACTGGAGAGAAAGCACCAGGAAGTGTTCTAAATGCGTTGCTGGAGATCAGACGTGAAGT
CTACACCGTGAGTCATAACTTGTTGTTGCTCATGCTGAGCTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E773TF U 21
AF RS1E213TF U 1
BS 1 333 RS1E213TF
BS 334 334 RS1E773TF
BS 335 468 RS1E213TF
BS 469 469 RS1E773TF
BS 470 764 RS1E213TF

RD RS1E773TF 636 0 0
GG
GAAACGAACAAATATGGCTCTTAAAGCGATTATCTTTCTTGGTTTGCTTCTCGCCGTGAT
ATCTTCTCCGACCACCGTCGATGGTGGATCAGTTTGTCCGAAGGCTTCCACTTTTGGTAG
AGGAAGCTTTCCCGATGGTTTCTTGTTCGGTGCCACAACTTCTGCTTTCCAGCATGAAGG
TGCACCAGAGGAAGGAGGCAGAGGTTTGAGCATTTGGGACTCATTCACTCATAAACATTC
AGAGAAAAACAATAACCTTCTGGGAGTTGATTTCTATCACCATTACAAGGAAGATGTTCA
ACTATTGAAAAATTTGAACATGGATGCCTTTAGGTTCTCCATCTCTTGGTCAAGAATCTT
TCCTCATGGGAAAAAGGACAAGGGAGTGAGTGAAACCGGAGTTAAATTCTACAATGATCT
CATCAACGAGCTCATTGCAAATGGTGCAACGCCTGTGGTTACATTATTCCAATGGGATGT
ACCTCAAGCCCTAGAAGATGAGTATGGCGGTTTCTTGAGTGACCGTATCTTGGAGGACTT
CCGAGAGTTTGCAAAATTTGCTTTCGACGAATATGGTGATAGAGTGAAGCATTGGGTCAC
CATAAACGAGCCTTACGAGTTTAGCCTTGGTGGA

QA 3 636 3 636
DS 

RD RS1E213TF 764 0 0
GGATTAAAAAGGAAACTAACTTGAAACGAACAAATATGGCTCTTAAAGCGATTATCTTTC
TTGGTTTGCTTCTCGCCGTGATATCTTCTCCGACCACCGTCGATGGTGGATCAGTTTGTC
CGAAGGCTTCCACTTTTGGTAGAGGAAGCTTTCCCGATGGTTTCTTGTTCGGTGCCACAA
CTTCTGCTTTCCAGCATGAAGGTGCACCAGAGGAAGGAGGCAGAGGTTTGAGCATTTGGG
ACTCATTCACTCATAAACATTCAGAGAAAAACAATAACCTTCTGGGAGTTGATTTCTATC
ACCATTACAAGGAAGATGTTCAACTATTGAAAA*TTTCAACATGGATGCCTTTAGGTTCT
CCATCTCTTGGTCAAGAATCTTTCCTCATGGGAAAAAGGACAAGGGAGTGAGTGAAACCG
GAGTTAAATTCTACAATGATCTCATCAACGAGCTCATTGCAAATGGTGTAACGCCTGTGG
TTACATTATTCCAATGGGATGTACCTCAAGCCCTAGAAGATGAGTATGGCGGTTTCTTGA
GTGACCGTATCTTGGAGGACTTCCGAGAGTTTGCAAAATTTGCTTTCAACGAATATGGTG
ATAGAGTGAAGCATTGGGTCACCATAAACGAGCCTTACGAGTTTAGCCTTGGTGGATACG
CACTGGAGAGAAAGCACCAGGAAGTGTTCTAAATGCGTTGCTGGAGATCAGACGTGAAGT
CTACACCGTGAGTCATAACTTGTTGTTGCTCATGCTGAGCTGTC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL7053Contig1 844 2 2 U
GGCCCCATTGTCTTCCTCGTCACAAAACTCACTTTGTGCACAGAGAGACAGAGAGAGAGA
GATCAAAGAAAGAAAGAAAACCGTAATTTTAAGGCAGAAGAACGATGTCGAGCTTACAGA
AGAAGCCGAGCTTCTCAGAAACATGTAGTCGTTTGAGTCGTTACCTCAAGGAGAAAGGTA
GCTTCGGAGATCTGAGCTTGGGGATGACATGCAACCCCGACATCAATGGAGTTTCTGCTG
TGTCACGTCAGCCAACGATGATGAATCTCTTCCCTTGTGAAGAAGGTTCGTCTCCTCCTG
AAGACGTTAAACCAAAGCATATGGTTCCTCCTCGCCAGTCAAGCTTTTCTTGCTCCTCTT
CCTCTGAAGTTAAGGAGGAAGTGGAGAAGACCGTGGAGTCTCAATCGTCTCCGTTGACCA
TATTCTACGGTGGTCAAGTTATGGTGTTTGATGATTTCCCTGCTGAGAAAGCCAAACAAG
TCACTGACTTGGCTAACAAAGGAAGTGCTTATACTCAAAACTTAGCCAAGAACCAAAAGG
AGATTGCAGCAGCACCAGAGCCAATCCAGACCAACACGCCTTCTCTAGCTTGCGAACTGC
CAATTGCTAGGAGAGCTTCGCTTCATCGGTTCCTGGAGAAGAGAAAGGATAGGATTACAT
CAAAGGCACCGTACCAGGTAGACGGTTCAACCGAAGCATCTTCCAAGCCTAACACATCTT
GGCTCGGTTCTCAGTAATCTTGACACCATCTCTAAAGACTCTATCGATGCTCTGTCGTTT
ACAAATTATCAAGCTCCTCCCTTGTTGATTGTTTATATAAAAAAAATATTTTTCACGTTT
GTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RS1G823TF U 1
AF RS1G823JQ C 244
BS 1 590 RS1G823TF
BS 591 844 RS1G823JQ

RD RS1G823TF 590 0 0
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AGAAGCCGAGCTTCTCAGAAACATGTAGTCGTTTGAGTCGTTACCTCAAGGAGAAAGGTA
GCTTCGGAGATCTGAGCTTGGGGATGACATGCAACCCCGACATCAATGGAGTTTCTGCTG
TGTCACGTCAGCCAACGATGATGAATCTCTTCCCTTGTGAAGAAGGTTCGTCTCCTCCTG
AAGACGTTAAACCAAAGCATATGGTTCCTCCTCGCCAGTCAAGCTTTTCTTGCTCCTCTT
CCTCTGAAGTTAAGGAGGAAGTGGAGAAGACCGTGGAGTCTCAATCGTCTCCGTTGACCA
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TCACTGACTTGGCTAACAAAGGAAGTGCTTATACTCAAAACTTAGCCAAGAACCAAAAGG
AGATTGCAGCAGCACCAGAGCCAATCCAGACCAACACGCCTTCTCTAGCT

QA 1 590 1 590
DS 

RD RS1G823JQ 601 0 0
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ACGTTAAACCAAAGCATATGGTTCCTCCTCGCCAGTCAAGCTTTTCTTGCTCCTCTTCCT
CTGAAGTTAAGGAGGAAGTGGAGAAGACCGTGGAGTCTCAATCGTCTCCGTTGACCATAT
TCTACGGTGGTCAAGTTATGGTGTTTGATGATTTCCCTGCTGAGAAAGCCAAACAAGTCA
CTGACTTGGCTAACAAAGGAAGTGCTTATACTCAAAACTTAGCCAAGAACCAAAAGGAGA
TTGCAGCAGCACCAGAGCCAATCCAGACCAACACGCCTTCTCTAGCTTGCGAACTGCCAA
TTGCTAGGAGAGCTTCGCTTCATCGGTTCCTGGAGAAGAGAAAGGATAGGATTACATCAA
AGGCACCGTACCAGGTAGACGGTTCAACCGAAGCATCTTCCAAGCCTAACACATCTTGGC
TCGGTTCTCAGTAATCTTGACACCATCTCTAAAGACTCTATCGATGCTCTGTCGTTTACA
AATTATCAAGCTCCTCCCTTGTTGATTGTTTATATAAAAAAAATATTTTTCACGTTTGTT
C

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 2

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ATAAAAGTATTTCTTGCGCCAGTCGTCGTCACTGGCCGAGAACTTGAATATGCCTAGCCC
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CATCCTTTTGACCCTCGCCCCAATCGAATCTTTAACTTTCTTCTTCCCGGCGTCATTCGT
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GAAGGAAGATTGGGTAGAGATGAACAAGAGTGAAATCTCTAAAGAAGCTTAGGAATGAAA
ATCGAATTCGGAAGAGATAT


BQ
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AF RS1EY39TF U 1
AF RS1EY39JQ C 22
BS 1 695 RS1EY39TF
BS 696 800 RS1EY39JQ

RD RS1EY39TF 695 0 0
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TGAAAAGAGACTCATCAGCTCGGTCGAACCAACAATGACTCCTTCCTCTTTGGCTCTAGT
GATAAATCCGTTTATCACTCGGATAACCGAGGGACAAAGTTGAGGAAGAGCCAGCTGATA
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GTACTTCTCGTGAACGCAGAACCAACCCTCCGGGACAGTTTCGGGGGTTTCGTCGTCGTT
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GCTCTTTAGGAGCGACGGAGAGTGAGGTCCAGAGGAAGCGCTCTTGCCACCTTTCTTCTT
CATCCTTTTGACCCTCGCCCCAATCGAATCTTTAACTTTCTTCTTCCCGGCGTCATTCGT
CTTTTCTCCGGTTTCTTGTTTGACTTTCATAAGACGAGCACCGGAAGTGGAGATTTGAAT
TGCGCCGGAGCTATCTTTCTTACTCATCGTAAGTA

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1EY39JQ 779 0 0
GG
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CGTCGTCACTGGCCGAGAACTTGAATATGCCTAGCCCTGGACGACAGGGGAGGTAATAGG
TACCGCTTCCACCATCCTTGGATGTACTCTCCTTTATTGAAAAGAGACTCATCAGCTCGG
TCGAACCAACAATGACTCCTTCCTCTTTGGCTCTAGTGATAAATCCGTTTATCACTCGGA
TAACCGAGGGACAAAGTTGAGGAAGAGCCAGCTGATAGTGGTTTAGGAGATCAAGCAAGA
GGGTGGGAAGGGGAAACCGAAGGTGACATTTGGCGATGTACTTTTCGTGAACGCAGAACC
AACCCTCCGGGACAGTTTCGGGGGTTTTGTCGTCGTTACAAGCCCTAGCTAGGTCATTCT
TTCCGTGGGCTTGAACGATAAGGTTGGTAACGTCTTGGCTCTTTAGGAGCGACGGAGAGT
GAGGTCCAGAGGAAGCGCTCTTGCCACCTTTTTTTTTCATCCTTTTGACCCTCGCCCCAA
TCGAATCTTTAACTTTTTTCTTCCCGGCGTCATTCGTCTTTTCTCCGGTTTCTTGTTTGA
CTTTCATAAGACGAGCACCGGAAGTGGAGATTTGAATTGCGCCGGAGCTATCTTTCTTAC
TCATCGTAAGTAAAAGGAAAAGGGAGGAGAAGCGAAAGAAGGAAGATTGGGTAGAGATGA
ACAAGAGTGAAATCTCTAAAGAAGCTTAGGAATGAAAATCGAATTCGGAAGAGATAT

QA 3 779 3 779
DS 



AS 1 2

CO CL7055Contig1 731 2 2 U
GGACTCCTTAGCAAGCTCAAGGCGGAAACACACAAAGAAACCCTAGATCCCCGTCGTCCT
TTTGTTCGAAATCATGTCGAGGAGAAAGACAAGAGAGCCAAAGGAAGAGACAGTGACACT
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CAACGACACTTTCATCCATGTCACTGATTTGTCTGGACGGGAAACACTTGTCCGTATCAC
TGGTGGGATGAAGGTGAAAGCCGACAGAGATGAGTCCTCACCTTATGCTGCGATGCTTGC
TGCTCCAGATGTCGCTCAGCGTTGCAAGGAACTTGGAATCACAGCCGTGCATGTGAAGCT
TCGTGCCACAGGTGGTAACAAGACAAAGACCCCTGGTCCTGGTGCTCAGTCTGCTCTCAG
AGCCCTTGCCCGTTCTGGCATGAAAATTGGTCGCATTGAGGATGTTACTCCAATCCCAAC
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TTGTTTTGTTTAGTAGACTGAAAAAGAGATCTCGGTTACTATATGCGTTGTTGTTTTCTC
AAATCTTTACACATTTATGTTCCTGTGACATGACCATCAAATATTCAAACGATTTGGTTG
AAGTATTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TTGTTTTGTTTAGTAGACTGAAAAAGAGATCTCGGTTACTATATGCGTTGTTGTTTTCTC
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AAGTATTT

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QA 1 651 1 651
DS 



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BQ
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CA

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ACGACTTAGTTTAAGTCGTCCGTTTGACCAGAAGACTCATCAGTAAGTCTTCTACATACA
GATGACTTACTTGTAAGTCTTCTACGCAAACAGATTTTGAAAAAAATTCAAATTCGTACC
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QA 5 764 5 764
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AS 1 2

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AACTTCGTAAACATACATTTTGTTTTGTTCTTCAAAAAAAAAAAAACATATATTTTGTTC
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H391TF U 1
AF RS1H391JQB C 60
BS 1 702 RS1H391TF
BS 703 778 RS1H391JQB

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CTTTTTACATTGATTATGTAGTAAGAAGATTCGACAGATCTTTGGTGATATCAGGCTCCT
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TTTTGGTTGGCGACGTGAGGCAGCAGTCTAAAAGGGTATGCCCTATCTCGGGACAACATT
AACAAGTTTGTACATAGTGGTAGCTAATTTTAATATAATCCTTAGTCGCTATCAAAATCA
AACTTCGTAAACATACATTTTGTTTTGTTCTTCAAAAAAAAA

QA 1 702 1 702
DS 

RD RS1H391JQB 719 0 0
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GAAAGTAGGGAAGCAGATGTAACTTTGCATGCTTTACTTGATGATAAGGGGGTTGACTCC
TCTTTTTACATTGATTATGTAGTAAGAAGATTCGACAGATCTTTGGTGATATCAGGCTCC
TGCAACAACAGACTCCGACATTGAATAGATTCTCAAGAGGCTCTTGCTGCTCAAAAAGAC
CTCTGAATAGGATATGTGATTGTTTCTCACAGTTATATGCAAAGAGCATTACTCCTACTG
ATAAACAAGAACTTGATGAAGTTTTGCTACAAGAGGAGATGGAGTTGTGGAGTCCGAGAA
GTGAAATAGAGAAACTAGAAACATCAAAGCAGAAGCCATAGAAGCTTCGCTTACCAGAGT
AAAGGTTCAGTTTGAGCAATGGAGGAAAGCAACTGAGACGGAAACTTCTCATTACATTCT
GTTTTGGTTGGCGACGTGAGGCAGCAGTCTAAAAGGGTATGCCCTATCTCGGGACAACAT
TAACAAGTTTGTACATAGTGGTAGCTAATTTTAATATAATCCTTAGTCGCTATCAAAATC
AAACTTCGTAAACATACATTTTGTTTTGTTCTTCAAAAAAAAAAAAACATATATTTTGTT
CTTTTAAGCAAAATGATTGTTGTTATAGATTTTGGAAATTAACTGCGCATAGATTGAGT

QA 1 719 1 719
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AAGAAAAAATAAAGCCAAAGCTTTATGGTTGGTGGCGACTGGTGATTAGCATTACTTAAC
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TGATACCAACACAGGAGATGTTGAATCCACGGTAAAGTCCAGCAATACCATCAGACTTGA
GGGTCTTCTTGTAGACATCGACAAGACCATTGAACTGCCTTTCACCTCCCTTCTTGG


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E040JQ U 1
AF RS1FN55JQ U 6
BS 1 657 RS1E040JQ
BS 658 717 RS1FN55JQ

RD RS1E040JQ 657 0 0
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AAGAAAAAATAAAGCCAAAGCTTTATGGTTGGTGGCGACTGGTGATTAGCATTACTTAAC
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GCACACCAGCACCTGCAATGGCCCGCAGGATGTTGGCACCAGCACCCTTGAAGAGTGACT
TGGGTCCTTCCTTCTTGAGGATCTGCTGGAAGGCATCCATCGAACTCTTGTACTTCACGG
CCTCACCCGACGTCATCATCATTCTTCTACGGACAGTGTCAATGGGGTATGATGCAAGAC
CTGCACCGTTGGTGATGAGCCATCCAAGGGCAAAGCTAGCGAAGAAGCTGTCCTGGAGGT
CAGCAGGGAGAAGAGGCTTCAAAGAGTCGTACAGACCAAAGTAGAGACCACGGTAGACAA
TGATACCAACACAGGAGATGTTGAATCCACGGTAAAGTCCAGCAATACCATCAGACT

QA 1 657 1 657
DS 

RD RS1FN55JQ 712 0 0
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AAAATAAAGCCAAAGCTTTATGGTTGGTGGCGACTGGTGATTAGCATTACTTAACCAGAT
CCTGATCCGTACTTCTTTCCGAGAAGAAGTAACTGCAGCTTGTCGTATCCAGAGAGCACA
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CCTTCCTTCTTGAGGATCTGCTGGAAGGCATCCATCGAACTCTTGTACTTCACGGCCTCA
CCCGACGTCATCATCATTCTTCTACGGACAGTGTCAATGGGGTATGATGCAAGACCTGCA
CCGTTGGTGATGAGCCATCCAAGGGCAAAGCTAGCGAAGAAGCTGTCCTGGAGGTCAGCA
GGGAGAAGAGGCTTCAAAGAGTCGTACAGACCAAAGTAGAGACCACGGTAGACAATGATA
CCAACACAGGAGATGTTGAATCCACGGTAAAGTCCAGCAATACCATCAGACTTGAGGGTC
TTCTTGTAGACATCGACAAGACCATTGAACTGCCTTTCACCTCCCTTCTTGG

QA 1 712 1 712
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7061Contig1 705 2 3 U
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GGTTGCTAGATAGATTAATCAATGCTGCTCACGGCCTGAGCATGAACGCAACAAGAGTGA
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CGTTGATGCTCCTACCTTGTAAAATTGCTTAATATGACCTCTACTAAATAGTGGGAAGTA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FT27TF U 265
AF RS1FT27JQ C 1
BS 1 264 RS1FT27JQ
BS 265 411 RS1FT27TF
BS 412 705 RS1FT27JQ

RD RS1FT27TF 147 0 0
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GGATCTGTTTCTAAACCAGTTGATGTGGTGGCAAATGGTTGCTAGATAGATTAATCAATG
CTGCTCACGGCCTGAGCATGAACGCAA

QA 1 147 1 147
DS 

RD RS1FT27JQ 705 0 0
GATATTACCCTTGAGAACAATGAAAACAAGCCTGTCACTAACTCTAGAGACACCCAAGAG
GTCAAGTTGGAGCAAGGTGTGAAGATTATGAAAATTTTTAAAGAGCATACGAGCAAGACT
TGCATTTTGGATGACCTTTCCTTTTATGAGGTTCGACAGAAGACTATCTTGGAGAAGAAA
GCCAAGCATCAGCAAACCCAGAAACAGGTAAGTGAGGAGAATAGTACAGAGGATGAGAAA
AAGAAATTTGCAACTGCTGAGCCGGCTCACAAGGAATTTCCTCCAGCTGCTCAAACTACC
CGTGATGTCAAGGTTTATGAGAATGGATCTGTTTTTAAACCAGTTGATGTGGTGGCAAAT
GGTTGCTAGATAGATTAGTCAATGCTGCTCACGGCCTGAGCATGAACGCAACAAGAGTGA
AGGTTTTTCTTGAGAACGAGTGCCGTGAAGCTTTGAAGCAAGGAGGAGCTTTAGTACCTA
AGAAGACCGAGAACTGTTTCTTTACCCTTAGAAATTAAAATCATATTTTTTTTTTATCTT
TTTTTTGTTCTTGTTTCACCTGTCTTTTCAATTTTTTGTTTTTTTCGCTTTTTTGTTTTC
CGTTGATGCTCCTACCTTGTAAAATTGCTTAATATGACCTCTACTAAATAGTGGGAAGTA
GTGGAGAAAAAAAAAGGAGATAAAAGCAGGGTGGGATTTGTTTTC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL7062Contig1 686 2 1 U
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GAAGAAAGACGAAATCATGGCAGGAGTTGGACCGCTGACACAAGATTGGGAGCCGGTGGT
GATCCGCAAGAAAGCCCCTAACTCCGCCGCCAAACGCGACGAGAAAACCGTCAACGCCGC
TCGTCGATCCGGCGCCGATATCGAATCCGTCCGAAAATACAATGCTGGAACCAACAAGGC
AGCCTCAAGCGGCACATCTCTCAACACTAAGAGGCTTGATGACGACACTGAGAACCTCGC
TCATGAGCGTGTGCCTACTGAGCTAAAGAAAGCCATTATGCAAGCTCGAACTGAAAAGAA
GCTTACCCAGTCCCAACTTGCTCAAATCATCAATGAGAAGCCACAAGTGATCCAAGAGTA
CGAGTCTGGTAAAGCAATCCCCAACCAGCAGATCCTTTCTAAGCTTGAGAGAGCACTTGG
AGCTAAACTCCGTGGTAAAAAGTGATCAAGTCCTGAAGATAGACAAACTTTAATCGCAGT
TTCACTTTCCTTAACAACGGTGTGGTAAACAACAATCAGTGCTTTGTCGTAATTTTTCTA
AAGAATAATCTTTTCTCATGTAAGAAAGATAAAACCGTTTGAATGTTTGGTTGATGAATC
ACTCTTTTCATAAACATATATCAATA


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A970TF U 1
AF RS1E225TF U 5
BS 1 686 RS1A970TF

RD RS1A970TF 686 0 0
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GATCCGCAAGAAAGCCCCTAACTCCGCCGCCAAACGCGACGAGAAAACCGTCAACGCCGC
TCGTCGATCCGGCGCCGATATCGAATCCGTCCGAAAATACAATGCTGGAACCAACAAGGC
AGCCTCAAGCGGCACATCTCTCAACACTAAGAGGCTTGATGACGACACTGAGAACCTCGC
TCATGAGCGTGTGCCTACTGAGCTAAAGAAAGCCATTATGCAAGCTCGAACTGAAAAGAA
GCTTACCCAGTCCCAACTTGCTCAAATCATCAATGAGAAGCCACAAGTGATCCAAGAGTA
CGAGTCTGGTAAAGCAATCCCCAACCAGCAGATCCTTTCTAAGCTTGAGAGAGCACTTGG
AGCTAAACTCCGTGGTAAAAAGTGATCAAGTCCTGAAGATAGACAAACTTTAATCGCAGT
TTCACTTTCCTTAACAACGGTGTGGTAAACAACAATCAGTGCTTTGTCGTAATTTTTCTA
AAGAATAATCTTTTCTCATGTAAGAAAGATAAAACCGTTTGAATGTTTGGTTGATGAATC
ACTCTTTTCATAAACATATATCAATA

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1E225TF 663 0 0
GG
AATACATATCTGGAGACGAACGAAACCCTAGATTTTGTCAAGCTCGAAGAAGAAGAAGAA
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ATCCGGCGCCGATATCGAATCCGTCCGAAAATACAATGCTGGAACCAACAAGGCAGCCTC
AAGCGGCACATCTCTCAACACTAAGAGGCTTGATGACGACACTGAGAACCTCGCTCATGA
GCGTGTGCCTACTGAGCTAAAGAAAGCCATTATGCAAGCTCGAACTGAAAAGAAGCTTAC
CCAGTCCCAACTTGCTCAAATCATCAATGAGAAGCCACAAGTGATCCAAGAGTACGAGTC
TGGTAAAGCAATCCCCAACCAGCAGATCCTTTCTAAGCTTGAGAGAGCACTTGGAGCTAA
ACTCCGTGGTAAAAAGTGATCAAGTCCTGAAGATAGACAAACTTTAATCGCAGTTTCACT
TTCCTTAACAGCGGTGTGGTAAACAACAATCAGTGCTTTGTCGTAATTTTTCTAAAGAAT
AATCTTTTCTCATGTAAGAAAGATAAAACCGTTTGAATTTTTGGTTGATGAATCACTCTT
T

QA 3 663 3 663
DS 



AS 1 2

CO CL7063Contig1 655 2 2 U
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ATGCCGTCTTACTGGATCCTCTAGGAAAACTTGTGCAAAAATCAGTGGATGCATCGTTTC
TAGGACCGAGACATGTCCTCAGGGATATCCATATGACATTCTCGAAAACTCTGGTGATGC
TGTCAATGAATACTGCAAGTTGGGGTGTGCATCCTCTGTGTGTGGTGCCTTAACCATTCT
CCAGAACTCCGATGCAAGTGAAACTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCAAGGCATG
TTCTAATTTCTGCAGCAAGGACTCGGCTAATGCAGTTGAAACTGCTTAAAAAGCATATCC
ACTATCTATGTGTTGCGTGTGTTGTTGTTCTCCTCGTTTTCAATAATTATCGTGTATGTG
GCAAAATGACTCTTGTGTTATTTCCTGGTTTTCTATGTAACGTAGAAGGTCATCGATCCC
TAGATTGTTTTTCCCTTCTACTTGCTATATCTAAATAAAGAGTAATGTTTCATTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D184JQ C 1
AF RS1D184TF U 1
BS 1 649 RS1D184TF
BS 650 655 RS1D184JQ

RD RS1D184JQ 655 0 0
GGACAAGTTTATACTTTAAGTGCTCTCTCTCTCTCTACGTACCAAACAAATAATCAGTCT
AGAGATGGAAGGCAAAACTGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTCTTGTCATGGCGCA
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ATGCCGTCTTACTGGATCCTCTAGGAAAACTTGTGCAAAAATCAGTGGATGCATCGTTTC
TAGGACCGAGACATGTCCTCAGGGATATCCATATGACATTCTCGAAAACTCTGGTGATGC
TGTCAATGAATACTGCAAGTTGGGGTGTGCATCCTCTGTGTGTGGTGCCTTAACCATTCT
CCAGAACTCCGATGCAAGTGAAACTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCAAGGCATG
TTCTAATTTCTGCAGCAAGGACTCGGCTAATGCAGTTGAAACTGCTTAAAAAGCATATCC
ACTATCTATGTGTTGCGTGTGTTGTTGTTCTCCTCGTTTTCAATAATTATCGTGTATGTG
GCAAAATGACTCTTGTGTTATTTCCTGGTTTTCTATGTAACGTAGAAGGTCATCGATCCC
TAGATTGTTTTTCCCTTCTACTTGCTATATCTAAATAAAGAGTAATGTTTCATTC

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1D184TF 649 0 0
GGACAAGTTTATACTTTAAGTGCTCTCTCTCTCTCTACGTACCAAACAAATAATCAGTCT
AGAGATGGAAGGCAAAACTGTGATTTTAAGTGTGCTCATAATGAGTCTTGTCATGGCGCA
GAATCAAGTCGAAGGAAAGAGTTGTTGCCCGGACACCACTGCCAGAAACGCATATAATAT
ATGCCGTCTTACTGGATCCTCTAGGAAAACTTGTGCAAAAATCAGTGGATGCATCGTTTC
TAGGACCGAGACATGTCCTCAGGGATATCCATATGACATTCTCGAAAACTCTGGTGATGC
TGTCAATGAATACTGCAAGTTGGGGTGTGCATCCTCTGTGTGTGGTGCCTTAACCATTCT
CCAGAACTCCGATGCAAGTGAAACTGTGAATGGAGCGGTTGCACAATGCACCAAGGCATG
TTCTAATTTCTGCAGCAAGGACTCGGCTAATGCAGTTGAAACTGCTTAAAAAGCATATCC
ACTATCTATGTGTTGCGTGTGTTGTTGTTCTCCTCGTTTTCAATAATTATCGTGTATGTG
GCAAAATGACTCTTGTGTTATTTCCTGGTTTTCTATGTAACGTAGAAGGTCATCGATCCC
TAGATTGTTTTTCCCTTCTACTTGCTATATCTAAATAAAGAGTAATGTT

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 2

CO CL7064Contig1 1286 2 2 U
GGGCATCCACCTCTCTCTCTTTCTCTAAAGTCTGAAATGAATTCAATCCCTCTTGATCTT
TTTTACGTGATATTCTCTAGACTGCCAGCCAAGTCAATAGGGAGGTGCCGTTGCGTGTCG
GAGCAATGGAGGTCCATACTTTACAGTGCAGATTTCACTGAGTATTGCTCAACCAATAGT
CGTCCCAGTCTCTTATTCGCCATGCGTAAATTTAACAGCAGTGAGTTTCTCTTCTTCTCC
TCGCCTCAGACTCAGTCGAGGCCGTCGTCCTTAGCCGCCCCCTATTTTGAACTGAATTTG
CCGCTATACTTTTGTGGTCATGCCTCTGGTTTGTTTTGTTTCCGTCGTATGAAAATGACA
ACGATGGAGATGAGAGAGGATACAGTGGAGCATGTGATATGTAACCCATGCATGGGACAG
TATGTTTTCTTACCTAAACTGAAGACTACGAGTCATCGTAGCTTTTTAGGGTTTGATCCG
ATTGACAAGGCATTCAAGGTATTGTCACCCTATTCATCATCTTCTGCTTATATTTTGACA
TTTGGAACTGGTGAAAGGAGGTGGAGAAAGATACACTTTCCCTTGGACCATTTTCCTTCG
TCTGAAGGGATATGCATCAATGGAGCTTTATATTACTTGGCTCGAGAAGCCTATGCTCCA
ACTAACTTTATAGCCTGCTTTGATGTTCGGTCTGAGAAATTCAAGGTTATTCAGGAGGAA
AGACTTACTGATTCGGATGCAACATTGATAAACTACAAGGGTAAATTAGGTGCGATTAGT
TTTAGCCAGGAGGAGGTGCGTATATGGGTTCTAGAGGACGACGAGAAACAGGATTGGTCG
GAGTATGCCTACACTCTCCTTGGTGATAAAGTCCGTGACGTTGAATGTGATGTGTTAAAG
GTTTACGTAGCTGGAGTGACGTCAGCTACAGGGGAAATTGTTTTGATGAATCTAAACTAT
CAGCACCCGCCGGGACCATTTTATGTTTTCTACTTGCATCCCGAAAGGAACGTTATCAAA
CGTGTTGAAGTCCAAGGTTTTGGGTGTCATGGTGCAGTTGACGCTTTTGTAGACCATGTA
GATGATCTTAGGTTTGATATTAAATCTTGGCAGCCGGATGTTCCTAGGTTTGAAAGCATT
AACAAATTCAATGCTCTGCGTCTTTTGGAGGATATGTGAATTTGGCGATCGACGATCCCT
TCTCCTAGTCCAGTAAAAGTTCTATTTTTTTTAATAAAATGTGTGTTCTTTGTAAACATC
AAGTTAAATAAAAGTTAATTAAGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1F289TF U 1
AF RS1F289JQ C 526
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BS 611 1286 RS1F289JQ

RD RS1F289TF 610 0 0
GGGCATCCACCTCTCTCTCTTTCTCTAAAGTCTGAAATGAATTCAATCCCTCTTGATCTT
TTTTACGTGATATTCTCTAGACTGCCAGCCAAGTCAATAGGGAGGTGCCGTTGCGTGTCG
GAGCAATGGAGGTCCATACTTTACAGTGCAGATTTCACTGAGTATTGCTCAACCAATAGT
CGTCCCAGTCTCTTATTCGCCATGCGTAAATTTAACAGCAGTGAGTTTCTCTTCTTCTCC
TCGCCTCAGACTCAGTCGAGGCCGTCGTCCTTAGCCGCCCCCTATTTTGAACTGAATTTG
CCGCTATACTTTTGTGGTCATGCCTCTGGTTTGTTTTGTTTCCGTCGTATGAAAATGACA
ACGATGGAGATGAGAGAGGATACAGTGGAGCATGTGATATGTAACCCATGCATGGGACAG
TATGTTTTCTTACCTAAACTGAAGACTACGAGTCATCGTAGCTTTTTAGGGTTTGATCCG
ATTGACAAGGCATTCAAGGTATTGTCACCCTATTCATCATCTTCTGCTTATATTTTGACA
TTTGGAACTGGTGAAAGGAGGTGGAGAAAGATACACTTTCCCTTGGACCATTTTCCTTCG
TCTGAAGGGA

QA 1 610 1 610
DS 

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GACCATTTTCCTTCGTCTGAAGGGATATGCATCAATGGAGCTTTATATTACTTGGCTCGA
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TGTGATGTGTTAAAGGTTTACGTAGCTGGAGTGACGTCAGCTACAGGGGAAATTGTTTTG
ATGAATCTAAACTATCAGCACCCGCCGGGACCATTTTATGTTTTCTACTTGCATCCCGAA
AGGAACGTTATCAAACGTGTTGAAGTCCAAGGTTTTGGGTGTCATGGTGCAGTTGACGCT
TTTGTAGACCATGTAGATGATCTTAGGTTTGATATTAAATCTTGGCAGCCGGATGTTCCT
AGGTTTGAAAGCATTAACAAATTCAATGCTCTGCGTCTTTTGGAGGATATGTGAATTTGG
CGATCGACGATCCCTTCTCCTAGTCCAGTAAAAGTTCTATTTTTTTTAATAAAATGTGTG
TTCTTTGTAAACATCAAGTTAAATAAAAGTTAATTAAGTTC

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL7065Contig1 830 2 4 U
GGAGTACTGAAAATCTTCAACGAATTGCTTCTCCTCTGTAAAAAGACTTTGCTTCTCTAG
TTTTCTCTAGAAACCTCCGCTTGATCTTGCCGGCTTATCGGCTCCGGTTGCTTCTTAGCG
CCGGGGCCGATCCATCCTTTTCTTTTGTTTTATTTTCCTTCTCTCTCGGATTGATCTTTC
TAGTTTGAAGTGAGTTGGATACTTGTATCCGTCAGATTTGGTTCTATCTAAGAACCTTGC
ATGTGGCTTTGATTGAATTGCATGTCGATTTTGAGCTTTCTTTGGTTCATACCAGGTCTC
GATCTTCAACCCTCTCAGTCTCTTGAGCTTGGTTTTTCCTGGTTTTGAGTTGTTTCACTC
CTTGTCATTAACCTCAAGATCCGATCGAGATCTTCTCTTCCGTTTGGCTTCGATGGGCGT
TTCTATTCTTCTGCACCATCCTTTTCCTGTTGATGACTTATGAACAAGACGTGTTCTGTC
TCCTGGAGTTTGAAGCTTTGGTCTATCAATTGCATGTGCTATTTATTATAGGAGGAATCG
CAAACCAGAGGTTTATCCAAGAATGGCTACCTCGCTTTGCCTTGTTTAAGAAGCTCTGCT
AATCATCATGTTTTATTGTTCACTTTTGGTGAATGTTTATTTTGATCTGTATACTCACTT
CTTCTAGTTTGATTAGGTGCTGTTCTTGTGGTTTCCCTTGTCTGGGCTTTAGTTTCTGGA
AAACCTTAGGTTTGTCCAGCTTTCTTTCCAGAGTCACTGATGTGTGCTGCTGGCTTTGTA
TCTCACCAATGTATCTCCTCGTTCTCCATGTTTGAATGAATGCAGTGTCC


BQ
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AF RS1FU58TF U 1
AF RS1FU58JQ C 38
BS 1 676 RS1FU58TF
BS 677 677 RS1FU58JQ
BS 678 691 RS1FU58TF
BS 692 830 RS1FU58JQ

RD RS1FU58TF 691 0 0
GGAGTACTGAAAATCTTCAACGAATTGCTTCTCCTCTGTAAAAAGACTTTGCTTCTCTAG
TTTTCTCTAGAAACCTCCGCTTGATCTTGCCGGCTTATCGGCTCCGGTTGCTTCTTAGCG
CCGGGGCCGATCCATCCTTTTCTTTTGTTTTATTTTCCTTCTCTCTCGGATTGATCTTTC
TAGTTTGAAGTGAGTTGGATACTTGTATCCGTCAGATTTGGTTCTATCTAAGAACCTTGC
ATGTGGCTTTGATTGAATTGCATGTCGATTTTGAGCTTTCTTTGGTTCATACCAGGTCTC
GATCTTCAACCCTCTCAGTCTCTTGAGCTTGGTTTTTCCTGGTTTTGAGTTGTTTCACTC
CTTGTCATTAACCTCAAGATCCGATCGAGATCTTCTCTTCCGTTTGGCTTCGATGGGCGT
TTCTATTCTTCTGCACCATCCTTTTCCTGTTGATGACTTATGAACAAGACGTGTTCTGTC
TCCTGGAGTTTGAAGCTTTGGTCTATCAATTGCATGTGCTATTTATTATAGGAGGAATCG
CAAACCAGAGGTTTATCCAAGAATGGCTACCTCGCTTTGCCTTGTTTAAGAAGCTCTGCT
AATCATCATGTTTTATTGTTCACTTTTGGTGAATGTTTATTTTGATCTGTATACTCACTT
CTTCTAGTTTGATTAG*TGCTGTTCTTGTGG

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1FU58JQ 793 0 0
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TCGGCTCCGGTTGCTTCTTAGCGCCGGGGCCGATCCATCCTTTTCTTTTGTTTTATTTTC
CTTCTCTCTCGGATTGATCTTTCTAGTTTGAAGTGAGTTGGATACTTGTATCCGTCAGAT
TTGGTTCTATCTAAGAACCTTGCATGTGGCTTTGATTGAATTGCATGTCGATTTTGAGCT
TTCTTTGGTTCATACCAGGTCTCGATCTTCAACCCTCTCAGTCTCTTGAGCTTGGTTTTT
CCTGGTTTTGAGTTGTTTCACTCCTTGTCATTAACCTCAAGATCCGATCGAGATCTTCTC
TTCCGTTTGGCTTCGATGGGCGTTTCTATTCTTCTGCACCATCCTTTTCCTGTTGATGAC
TTATGAACAAGACGTGTTCTGTCTCCTGGAGTTTGAAGCTTTGGTCTATCAATTGCATGT
GCTATTTATTATAGGAGGAATCGCAAACCAGAGGTTTATCCAAGAATGGCTACCTCGCTT
TGCCTTGTTTAAGAAGCTCTGCTAATCATCATGTTTTATTGTTCACTTTTGGTGAATGTT
TATTTTGATCTGTATACTCACTTCTTCTAGTTTGATTAGGTGCTGTTCTTGTGGTTTCCC
TTGTCTGGGCTTTAGTTTCTGGAAAACCTTAGGTTTGTCCAGCTTTCTTTCCAGAGTCAC
TGATGTGTGCTGCTGGCTTTGTATCTCACCAATGTATCTCCTCGTTCTCCATGTTTGAAT
GAATGCAGTGTCC

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

CO CL7066Contig1 650 2 2 U
GGTGCGAACTCAAAAGCTGTCACTATTTTCATCCGTGGAGGTAACAAAATGATGATAGAA
GAAACTAAGCGTAGTATCCACGACGCTCTGTGTGTGGCGAGGAATCTCATCCGCAATAAT
TCAATTGTATATGGAGGTGGTGCAGCTGAAATCACATGCTCACTTGCTGTTGATGCAGCT
GCTGATAAATACCCTGGCGTCGAACAGTACGCAATAAGGGCATTCGCAGAAGCTCTGGAC
TCTGTGCCCATGGCTCTTGCAGAGAACAGTGGATTACAGCCCATAGAGACACTCTCTGCG
GTTAAATCTCAGCAGATTAAGGAGAACATTCCTTTCTATGGGATAGATTGCAATGACGTG
GGAACAAACGATATGAGGGAGCAAAATGTGTTTGAAACATTGATAGGAAAGCAGCAGCAG
ATCTTGCTTGCAACTCAAGTCGTTAAGATGATTCTTAAGATCGACGATGTCATCTCTAAT
TCTGAATACTGATGATGTACTGACATTTGCACTTCTTTCCTTTTCCCTCCTTTGTTTGCT
TTCTATTAGCTTTTGATACTATTCATCAATTTTTTCCTCTCTTGTAAGCTTTTATTGTAA
CCTTGGGCCTGTACTTGGGTTTGTGTACTTTCGGTGTTTGGACTTGGTAT


BQ
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AF RS1H129JQB C 1
AF RS1H129TF U 1
BS 1 611 RS1H129TF
BS 612 650 RS1H129JQB

RD RS1H129JQB 650 0 0
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TCAATTGTATATGGAGGTGGTGCAGCTGAAATCACATGCTCACTTGCTGTTGATGCAGCT
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CCTTGGGCCTGTACTTGGGTTTGTGTACTTTCGGTGTTTGGACTTGGTAT

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DS 

RD RS1H129TF 611 0 0
GGTGCGAACTCAAAAGCTGTCACTATTTTCATCCGTGGAGGTAACAAAATGATGATAGAA
GAAACTAAGCGTAGTATCCACGACGCTCTGTGTGTGGCGAGGAATCTCATCCGCAATAAT
TCAATTGTATATGGAGGTGGTGCAGCTGAAATCACATGCTCACTTGCTGTTGATGCAGCT
GCTGATAAATACCCTGGCGTCGAACAGTACGCAATAAGGGCATTCGCAGAAGCTCTGGAC
TCTGTGCCCATGGCTCTTGCAGAGAACAGTGGATTACAGCCCATAGAGACACTCTCTGCG
GTTAAATCTCAGCAGATTAAGGAGAACATTCCTTTCTATGGGATAGATTGCAATGACGTG
GGAACAAACGATATGAGGGAGCAAAATGTGTTTGAAACATTGATAGGAAAGCAGCAGCAG
ATCTTGCTTGCAACTCAAGTCGTTAAGATGATTCTTAAGATCGACGATGTCATCTCTAAT
TCTGAATACTGATGATGTACTGACATTTGCACTTCTTTCCTTTTCCCTCCTTTGTTTGCT
TTCTATTAGCTTTTGATACTATTCATCAATTTTTTCCTCTCTTGTAAGCTTTTATTGTAA
CCTTGGGCCTG

QA 1 611 1 611
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7068Contig1 1147 2 8 U
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GTCACCGTCACCATCGGTCGGTCGTGTCCAGAACCGTATCATAAGTTCATAACCTTGCGC
TAATGGAGGAGGGACGTCAAAAGGAGTTGCAGTTTTTGGAAGAAATCACACATATGGGCC
ACGTAACAGCTTCTCCCTTGTCTTAGCCGCACTTAAGATGAACAATTCAGGTTTGAGTTT
CTTGTAATTAGGAGGAGCTGTTCTTGGTTTAGTCATTCACAATACTTTGCTCTTCTTGTG
AGTCTTATTTACACCAGCAAAGTCACTGTGCATTCTTATCTAGTAAATTTACACCATCTA
GTAAAGTCATAGTTCTTGTTTTAGTCATTCACAATACACTGCTGTTCTAGTGAGCTTTTA
GTTTAGTTGGAAATTTCTTTTTCTCCTTAACGGCTACTCCCATTTCAGCTCTGATTTGCG
GAAAAACCTTGAAACTCTGGAGAAAAATGGTGTAAACAGTCTCAAAACGACGGTCAACCT
CGGTTCAGAAGTTTACATGCAAGCTGAAGTGCCAGATACAAGGCACGTATTCATGGATGC
AGGGCTCGGCTTTTATGTGGAGTTTACCCGTCAAGAAGCTCTTGACTATATTCCACAAAG
GGAGGAAAGAGTCCAAAAACAATTAGAAGAAGTAACTGGTGTAATTGCGCAGATCAAAGG
GCGCATCAAGCTGGCTCATCACCAGATTCAGCTAATACTAAATCTTCCAGACGAGAATCC
ATCATCATACAGGCAACATGCGTTTCGGTACTGATCATGGGGAGAGAAAAACAAAAGAAG
ATTGTAATTGCCCTCTGTTGATTGGAGGAGCTTGAAGAGACGTTTCCTGATGATGTTGAC
AAGTATAGAGAAATCCGTGCTACTTCTGTCTCATGTTGGTTAATATACTACTACCACCAC
CCAGTAAAGAACTAAAGGTGACAGTTGATCTTCAATAATCCAGGAAGCCAAACGGCTGTC
CCAGTCTTAAAGTGTGTTGCCAAATGGGGATGCCAAGGTTAAGATCCTAATTTTAGCTTG
CAGAATAATCTTTCTGAGTAAATGAATATGGATGGTTGTAAACGATACAACGGACAAGAC
CAATTTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B694TF U 1
AF RS1B694JQ C 449
BS 1 673 RS1B694TF
BS 674 675 RS1B694JQ
BS 676 690 RS1B694TF
BS 691 691 RS1B694JQ
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BS 705 715 RS1B694TF
BS 716 1147 RS1B694JQ

RD RS1B694TF 715 0 0
GGTCGCGCTCAATCTGCAAAACCAATTAGTCCTCTCTCGCGCTCACCCTCGCCACTCGCC
GTCACCGTCACCATCGGTCGGTCGTGTCCAGAACCGTATCATAAGTTCATAACCTTGCGC
TAATGGAGGAGGGACGTCAAAAGGAGTTGCAGTTTTTGGAAGAAATCACACATATGGGCC
ACGTAACAGCTTCTCCCTTGTCTTAGCCGCACTTAAGATGAACAATTCAGGTTTGAGTTT
CTTGTAATTAGGAGGAGCTGTTCTTGGTTTAGTCATTCACAATACTTTGCTCTTCTTGTG
AGTCTTATTTACACCAGCAAAGTCACTGTGCATTCTTATCTAGTAAATTTACACCATCTA
GTAAAGTCATAGTTCTTGTTTTAGTCATTCACAATACACTGCTGTTCTAGTGAGCTTTTA
GTTTAGTTGGAAATTTCTTTTTCTCCTTAACGGCTACTCCCATTTCAGCTCTGATTTGCG
GAAAAACCTTGAAACTCTGGAGAAAAATGGTGTAAACAGTCTCAAAACGACGGTCAACCT
CGGTTCAGAAGTTTACATGCAAGCTGAAGTGCCAGATACAAGGCACGTATTCATGGATGC
AGGGCTCGGCTTTTATGTGGAGTTTACCCGTCAAGAAGCTCTTGACTATATTCCACAAAG
GGAGGAAAGAGTC**AAAACAATTAGAAGA*GTAACTGGTGTA*TTGCGCAGATC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1B694JQ 699 0 0
AACGGCTACTCCCATTTCAGCTCTGATTTGCGGAAAAACCTTGAAACTCTGGAGAAAAAT
GGTGTAAACAGTCTCAAAACGACGGTCAACCTCGGTTCAGAAGTTTACATGCAAGCTGAA
GTGCCAGATACAAGGCACGTATTCATGGATGCAGGGCTCGGCTTTTATGTGGAGTTTACC
CGTCAAGAAGCTCTTGACTATATTCCACAAAGGGAGGAAAGAGTTCAAAAACAATTAGAA
GAAGTAACTGGTGTAATTGCGCAGATCAAAGGGCGCATCAAGCTGGCTCATCACCAGATT
CAGCTAATACTAAATCTTCCAGACGAGAATCCATCATCATACAGGCAACATGCGTTTCGG
TACTGATCATGGGGAGAGAAAAACAAAAGAAGATTGTAATTGCCCTCTGTTGATTGGAGG
AGCTTGAAGAGACGTTTCCTGATGATGTTGACAAGTATAGAGAAATCCGTGCTACTTCTG
TCTCATGTTGGTTAATATACTACTACCACCACCCAGTAAAGAACTAAAGGTGACAGTTGA
TCTTCAATAATCCAGGAAGCCAAACGGCTGTCCCAGTCTTAAAGTGTGTTGCCAAATGGG
GATGCCAAGGTTAAGATCCTAATTTTAGCTTGCAGAATAATCTTTCTGAGTAAATGAATA
TGGATGGTTGTAAACGATACAACGGACAAGACCAATTTG

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 2

CO CL7069Contig1 1237 2 4 U
GGATCACTAACACAATAAACTATCTCCTTCTCTAATCAAAAACCAAAAAGAAACAAAGAT
GGAGATCTCAAAAACCCTTTTGCTAGTTATTTCCCTTGTAGCTGCAACTTGTTTCTTGCA
AGCCGGGGCAGCTGGAGTTTACTGTAGCAACCCTTACACTGGATGTTACCGCAAGTACAT
TCAATGTCCAGGGGAATGTCCAAGCACAACTGCCATGAACTCCAAGAACAAAGTGTGCTA
CGCTGATTGCGATAGACCCACTTGCAAATCCCAATGCCGCATGAGGAAACCTAATTGCAA
CAGACCAGGATCAGCTTGTTATGACCCGAGGTTCATTGGAGGAGACGGCATTGTGTTCTA
CTTCCATGGAAAGAGCAACGAAGATTTCAGCCTCGTCTCTGACTCTGACCTACAGATCAA
TGGTAGGTTCATTGGTCACAGACCCGCTGGTCGTGCCAGAGACTTCACATGGATCCAAGC
TCTCGGATTCCTCTTCAACTCCCACAAATTCTCTCTTGAAGCTGCTAAATCCGCCTCATG
GGACAGCAAAGTCGACCATCTCAAATTCACTTTGGATGGCCAAGATTTATCTGTCCCAGA
AGCAACTCTCTACACCTGGTACTCACCAAACAAAGATATTAAGATCGAGAGAGTGACTTT
GAGAAACAGCGTGATCGTGACAATCAAAGACAAAGCCGAGATCATGGTCAATGTTGTTCC
AGTGACAAAAGAAGACGACAGGATCCACAGCTACAAAGTACCATCAGACAACTGTTTTGC
ACATCTTGAGGTTCAGTTCAAATTTTTCAACCTTTCACCAAAGGTCGATGGAATCTTGGG
ACGAACATACAAACCTGATTTCCAGAATCCTGCTAAGCCTGGAGTCGCAATGCCAGTTGT
TGGTGGTGAAGACAGCTTCAAGACCTCTTCCCTCCTCTCCAATGACTGCAAAACTTGTAT
TTTCTTTAAATCACAAGCAGAGATTGCTTTCGTTAAGTCAGAGATTGAATATGCTACTTT
GGATTGTACACGTGGAGCGTCTTCTGGTAACGGAATCATTTGCAGGAAGTAAAGAGATTG
TATAAAAGCTTGGCTTGAAGGAAGACTAATGCCAAGAGGTTTTCTTTTAAAGTATAAGTA
AATGAAAAATAAAACCGATGATGTATTTTATATTGTACCATCACATGTATTCCAATTTGT
ATTAACCTAATCATTGTTAATGATATGTAATATTTAG


BQ
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AF RS1H045TF U 1
AF RS1H045JQB C 497
BS 1 732 RS1H045TF
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BS 734 761 RS1H045TF
BS 762 1237 RS1H045JQB

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GGAGATCTCAAAAACCCTTTTGCTAGTTATTTCCCTTGTAGCTGCAACTTGTTTCTTGCA
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TGGTAGGTTCATTGGTCACAGACCCGCTGGTCGTGCCAGAGACTTCACATGGATCCAAGC
TCTCGGATTCCTCTTCAACTCCCACAAATTCTCTCTTGAAGCTGCTAAATCCGCCTCATG
GGACAGCAAAGTCGACCATCTCAAATTCACTTTGGATGGCCAAGATTTATCTGTCCCAGA
AGCAACTCTCTACACCTGGTACTCACCAAACAAAGATATTAAGATCGAGAGAGTGACTTT
GAGAAACAGCGTGATCGTGACAATCAAAGACAAAGCCGAGATCATGGTCAATGTTGTTCC
AGTGACAAAAGA*GACGACAGGATCCACAGCTACAAAGTAC

QA 1 761 1 761
DS 

RD RS1H045JQB 741 0 0
AACTCCCACAAATTCTCTCTTGAAGCTGCTAAATCCGCCTCATGGGACAGCAAAGTCGAC
CATCTCAAATTCACTTTGGATGGCCAAGATTTATCTGTCCCAGAAGCAACTCTCTACACC
TGGTACTCACCAAACAAAGATATTAAGATCGAGAGAGTGACTTTGAGAAACAGCGTGATC
GTGACAATCAAAGACAAAGCCGAGATCATGGTCAATGTTGTTCCAGTGACAAAAGAAGAC
GACAGGATCCACAGCTACAAAGTACCATCAGACAACTGTTTTGCACATCTTGAGGTTCAG
TTCAAATTTTTCAACCTTTCACCAAAGGTCGATGGAATCTTGGGACGAACATACAAACCT
GATTTCCAGAATCCTGCTAAGCCTGGAGTCGCAATGCCAGTTGTTGGTGGTGAAGACAGC
TTCAAGACCTCTTCCCTCCTCTCCAATGACTGCAAAACTTGTATTTTCTTTAAATCACAA
GCAGAGATTGCTTTCGTTAAGTCAGAGATTGAATATGCTACTTTGGATTGTACACGTGGA
GCGTCTTCTGGTAACGGAATCATTTGCAGGAAGTAAAGAGATTGTATAAAAGCTTGGCTT
GAAGGAAGACTAATGCCAAGAGGTTTTCTTTTAAAGTATAAGTAAATGAAAAATAAAACC
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TTAATGATATGTAATATTTAG

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL7070Contig1 1449 2 2 U
GACAAGACTCGCAACGGACTGAGAGAATCAATCAATCCATGGCAACTCGCTCGATCTTCC
ATAACATTAGAGGTCGATTGACAAATGGTGGTGTTGTCGGAAGCAATTACATTCGAAACG
CCGAATCTAGTCCTTTCTCCAAGCCGTACAGTGCTGACGCGGCAATCGGAGGCTCGCCTG
TCGATGAATCAGAGGAGAAAGACGATCTGAGGAGCAGGATTTTCAGATTGAGACTTCCGA
AGCGGAGCGCGACGACGGTTCTCGAGAAATGGGTTGGCGAAGGGAATCAGATTACGGTCA
ACGAACTTCGAGACATCTCCAGAGAGCTCAGAAGAACTCGCCGTTACAAACACGCTCTCG
AGGTCACAGAGTATTTGGTTCAGAATGAAGAATCTAACATCTCAGACGCTGATTACGCAT
CTCGTATAGATCTGATTTCAAAAGTGTTCGGAATCGATGCAGCCGAACGCTACTTCGAAG
GCCTGAAACTAGCTTCAAAGACATCTGAAACCTATACTTCTCTCCTTCATGCTTACGCTG
CCTCCAAACAAACCGAGAGAGCCGAGGCCTTGTTCAAGAGAATCGTTGAGAGCGAGAGTC
TCACCTTCGGTGCCATCACTTACAACGAGATGATGACTCTGTACATGTCAGTTGGAGAAG
TTGAGAAAGTACATGAGGTTATTGAAGTGTTAAAGCGCAAAAAGGTTTCTCCTGATATCT
TTACATACAACCTGTGGCTGAGTTCATGCGCTGCAACGTTTAGTATTGATGAGCTTAGAA
GGATTCTTGAGGAGATGAGGCGTGATGGTGGTTCGAACGAGGGTTGGGCTCGGTATATCG
ATCTTACTAGTGTCTACATTGACAGTAGTCGGTTAACGAATGCAGAGTCCACCTCACCGG
TTGAGTCTGAGAAGTCTATTTCGCAAAGAGAGTGGGTGACGTATGACTTTCTTATGATTC
TGCACACTGGGTTAGGAAACAAGGATATGGTAGATCAGATCTGGAAGTCTCTGAGAAACA
CTAACCAGAAGTTGAGCAGCAGAAGCTACATATGTGTTATTTCGTCTTATCTAATGCTTG
GTCATTTGAGAGAAGCTGGGGAAGTTGTGGATCAGTGGAAGGAGTCTAAAACGACGGAGT
TTGATGCTTCTGCTTGTTCGAGGATCTTGAATGCTTTTAGAGAAGTTGGTTTAGAGGAAA
AAGCTAGTGGCTTTCAGTTGCTTTTGGTGCAGAAGAAATGCAGCTTGGAAGACGAGGTAT
CATAATCTCTGAGATAACTAGAACCAAGTCAAGCTCATCAATAAAGTAGAAGTTTCTCTC
GCTTCACTGTGATTTTGTGTGTTTTATACACTTTTTGCTTTGGCAAATTTTTGTTATTTT
CGTTGGGACCTGCTGAGACTTACTTCTTTCACACGGCACGATGCTGCTTTTGATAACACT
ATTACAACC


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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B896TF U 1
AF RS1B896JQ C 639
BS 1 699 RS1B896TF
BS 700 1449 RS1B896JQ

RD RS1B896TF 699 0 0
GACAAGACTCGCAACGGACTGAGAGAATCAATCAATCCATGGCAACTCGCTCGATCTTCC
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TCGATGAATCAGAGGAGAAAGACGATCTGAGGAGCAGGATTTTCAGATTGAGACTTCCGA
AGCGGAGCGCGACGACGGTTCTCGAGAAATGGGTTGGCGAAGGGAATCAGATTACGGTCA
ACGAACTTCGAGACATCTCCAGAGAGCTCAGAAGAACTCGCCGTTACAAACACGCTCTCG
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CTCGTATAGATCTGATTTCAAAAGTGTTCGGAATCGATGCAGCCGAACGCTACTTCGAAG
GCCTGAAACTAGCTTCAAAGACATCTGAAACCTATACTTCTCTCCTTCATGCTTACGCTG
CCTCCAAACAAACCGAGAGAGCCGAGGCCTTGTTCAAGAGAATCGTTGAGAGCGAGAGTC
TCACCTTCGGTGCCATCACTTACAACGAGATGATGACTCTGTACATGTCAGTTGGAGAAG
TTGAGAAAGTACATGAGGTTATTGAAGTGTTAAAGCGCA

QA 1 699 1 699
DS 

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TTTAGTATTGATGAGCTTAGAAGGATTCTTGAGGAGATGAGGCGTGATGGTGGTTCGAAC
GAGGGTTGGGCTCGGTATATCGATCTTACTAGTGTCTACATTGACAGTAGTCGGTTAACG
AATGCAGAGTCCACCTCACCGGTTGAGTCTGAGAAGTCTATTTCGCAAAGAGAGTGGGTG
ACGTATGACTTTCTTATGATTCTGCACACTGGGTTAGGAAACAAGGATATGGTAGATCAG
ATCTGGAAGTCTCTGAGAAACACTAACCAGAAGTTGAGCAGCAGAAGCTACATATGTGTT
ATTTCGTCTTATCTAATGCTTGGTCATTTGAGAGAAGCTGGGGAAGTTGTGGATCAGTGG
AAGGAGTCTAAAACGACGGAGTTTGATGCTTCTGCTTGTTCGAGGATCTTGAATGCTTTT
AGAGAAGTTGGTTTAGAGGAAAAAGCTAGTGGCTTTCAGTTGCTTTTGGTGCAGAAGAAA
TGCAGCTTGGAAGACGAGGTATCATAATCTCTGAGATAACTAGAACCAAGTCAAGCTCAT
CAATAAAGTAGAAGTTTCTCTCGCTTCACTGTGATTTTGTGTGTTTTATACACTTTTTGC
TTTGGCAAATTTTTGTTATTTTCGTTGGGACCTGCTGAGACTTACTTCTTTCACACGGCA
CGATGCTGCTTTTGATAACACTATTACAACC

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 2

CO CL7071Contig1 630 2 3 U
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AAGGATCAACAAACAAAACATTCTGAAACATAAAAACGAAACAGAGAAATTGTCCATAAC
TTCAAAAACTATTACATTCCAGTGAATGCCTTCTTTGCAAAGGCAGATGCCCCGGCTGGG
ATCACCTTCAACACATTGAACCTCACGGTCTTTGACAACGGCCTGCATTGGCCAATGATG
ACATGGGCTGGGATGTTGGAATGCCTCTTCTCGTATCTTTGATACTTCTTGACGAAGTGG
AGATAGTTTCGGCGAACAATGATGGTTCTCTGCATCTTGGCACTGTGGCAAGTACCAGCT
AAGATACGTCCTCTCACAGAGACAGTTCCAGTGAACGGACATTTCTTGTCAATGTAATGT
CCTTCAATGGCATCGCGGGGAGTCTTGAAACCCAAACCAATGTTCTTCCAGAAACGGTTT
CCACCTTTGCCAGGCCTCTTTCCTTTCCCTGATTTCTTCGAGCTTAGGAACACCTTTGGT
TGCTTTAGAAATGCATTCTCAGTCTGTTCCGCCATGGCTACTGGTTGCTCCTCCTGCTGC
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BQ
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AF RS1FW83JQ U 161
AF RS1FW83TF C 1
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BS 161 270 RS1FW83JQ
BS 271 630 RS1FW83TF

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QA 1 110 1 110
DS 

RD RS1FW83TF 630 0 0
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ATCACCTTCAACACATTGAACCTCACGGTCTTTGACAACGGCCTGCATTGGCCAATGATG
ACATGGGCTGGGATGTTGGAATGCCTCTTCTCGTATCTTTGATACTTCTTGACGAAGTGG
AGATAGTTTCGGCGAACAATGATGGTTCTCTGCATCTTGGCACTGTGGCAAGTACCAGCT
AAGATACGTCCTCTCACAGAGACAGTTCCAGTGAACGGACATTTCTTGTCAATGTAATGT
CCTTCAATGGCATCGCGGGGAGTCTTGAAACCCAAACCAATGTTCTTCCAGAAACGGTTT
CCACCTTTGCCAGGCCTCTTTCCTTTCCCTGATTTCTTCGAGCTTAGGAACACCTTTGGT
TGCTTTAGAAATGCATTCTCAGTCTGTTCCGCCATGGCTACTGGTTGCTCCTCCTGCTGC
TTCTGCTCTCCACCGATGGATTTGAGGCCC

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 2

CO CL7072Contig1 512 2 1 U
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AGTAATTGTATATTGATACCCGGTTTGTCCCGGTTAGGAAGTTACAACTGTATATAGTCA
TTTGACTACGATTAATGAAAGCTAACTGATAT


BQ
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AF RS1AU64JQ C 1
AF RS1AU64TF U 1
BS 1 512 RS1AU64TF

RD RS1AU64JQ 512 0 0
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GCCATAGCTCCTGCTCGTCACCACCAAAGCTCCTCATCGTCACCACCAAAGCTCCTCGTC
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TCTGGAGATATGCTAATCTCTCTCTATATATGTTCTGAATCTGAAAATTTTGTTTTCTTG
GTAAAGGAAGGTGAGAGGAGACAGAGGAGCTTAATGGAGGTGGTGAGATGATGTTGGTGT
GGAAGCATCAGAGACAAGAGGAGGTACGTCGTTGTAGTGATGGAGGAGGAGGCGCGTCGC
TCCATCCTTAACACCGGTGGTTATTGATGTAATTGATTGTCGGTTATGTAAATCTGGTTT
AGTAATTGTATATTGATACCCGGTTTGTCCCGGTTAGGAAGTTACAACTGTATATAGTCA
TTTGACTACGATTAATGAAAGCTAACTGATAT

QA 1 512 1 512
DS 

RD RS1AU64TF 512 0 0
GGACCTAATCTTCATCGCCACCACATCTCACTCCATTGGTTCATCTTCATCGTCACTACT
GCCATAGCTCCTGCTCGTCACCACCAAAGCTCCTCATCGTCACCACCAAAGCTCCTCGTC
GTCCATTGACGGCGGAGGTGAATGAAGCAAAGAACAAGAGGACCGGTCACCTGCTCAGTC
TCTGGAGATATGCTAATCTCTCTCTATATATGTTCTGAATCTGAAAATTTTGTTTTCTTG
GTAAAGGAAGGTGAGAGGAGACAGAGGAGCTTAATGGAGGTGGTGAGATGATGTTGGTGT
GGAAGCATCAGAGACAAGAGGAGGTACGTCGTTGTAGTGATGGAGGAGGAGGCGCGTCGC
TCCATCCTTAACACCGGTGGTTATTGATGTAATTGATTGTCGGTTATGTAAATCTGGTTT
AGTAATTGTATATTGATACCCGGTTTGTCCCGGTTAGGAAGTTACAACTGTATATAGTCA
TTTGACTACGATTAATGAAAGCTAACTGATAT

QA 1 512 1 512
DS 



AS 1 2

CO CL7073Contig1 703 2 2 U
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TTAGCGGAGGAGACAGGTCTCACCAACGTCTACGTAGCTCAGCTGCTCCGTCGCCAAGCC
CAGCTCAAACCCGACACTGTCCCAAAGCTCCGTGAAGCTTTGCCTGCTCTGAACGACGAA
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ATCAATGAAGATTTTGGCGATGGCATCATGTCGGCGATAGACTTTTATTGCTCCGTGGAC
AAAGTTAAAGGAGTGGATGGTAATAACCGCGTTGTCGTGACACTTGATGGAAAGTATCTT
TCTCATTCCGAACAGAGGACGGAGAATATGGTCTCAAGGCTAAACCTCAAGGGAAGTACA
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TGAAGGCTTTATGTCTGAAACTGTAAAATTGTACGATTTATTGGGTTTGTTCATCTGTAC
TCTATGCAACTCCAGCCTCGAGCTATTTCAGGTTGAATAAAAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1A585JQ C 1
AF RS1A585TF U 1
BS 1 687 RS1A585TF
BS 688 703 RS1A585JQ

RD RS1A585JQ 703 0 0
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AAAGTTAAAGGAGTGGATGGTAATAACCGCGTTGTCGTGACACTTGATGGAAAGTATCTT
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TGAAGGCTTTATGTCTGAAACTGTAAAATTGTACGATTTATTGGGTTTGTTCATCTGTAC
TCTATGCAACTCCAGCCTCGAGCTATTTCAGGTTGAATAAAAT

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1A585TF 687 0 0
GGGATTACTCCTCCCTCCACTTGTTTGGTCAAAAAGAAAATGGAGGCGGCGACGACGAAG
CAGAGCGTTACAAACCGACTTCTGACCGTGAAGTCAGCCTCCGGCAAGACTTACAGCCAA
TTAGCGGAGGAGACAGGTCTCACCAACGTCTACGTAGCTCAGCTGCTCCGTCGCCAAGCC
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CCTACCGTCTACAGGTTGAACGAAGCAGTGATGCATTTCGGTGAGAGTATAAAAGAGATT
ATCAATGAAGATTTTGGCGATGGCATCATGTCGGCGATAGACTTTTATTGCTCCGTGGAC
AAAGTTAAAGGAGTGGATGGTAATAACCGCGTTGTCGTGACACTTGATGGAAAGTATCTT
TCTCATTCCGAACAGAGGACGGAGAATATGGTCTCAAGGCTAAACCTCAAGGGAAGTACA
AGCGAATGATATGTAAAATGTAAGAATAAAACGATTCAGATGAATGTATGCAGCAATCCA
TGAAGGCTTTATGTCTGAAACTGTAAAATTGTACGATTTATTGGGTTTGTTCATCTGTAC
TCTATGCAACTCCAGCCTCGAGCTATT

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

CO CL7074Contig1 836 2 8 U
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CTCATAATAGACTCATAAAAAAGACTCATTTTCCTTTTAATTTCCCTTTCTCAAACACGC
CCACTACTCCCTCTCCTTTTTTTGAGATAACTCAAATCATAGGAAACCAAAACACACTAA
TAAATCCTTCTGATAAATCTTATATTGATTTTCATTTTCATCACTGATTTTTATAAACCC
ATCAAGTTTTTTTCGCATGAGACTATACTGGGGGAGTCGTAACTGATCTCTGTTTCCCCT
TAAGTTGGTTGTTCAGAAAGTTTAGTAATCATGGGATTCCAGAGACCATCATCAGAAAAG
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ACCACTTTCATAGCCCCTTCGTCACTTTCTTCTCCATATGTTACGAATTCTGGGAAACTA
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AAAAAAAATTATTTTTAATGATGAATCAATAATTAACTAAAATGGTCAAATACTGTGTTT
CATTTCATATACTCCCTGTTTCTAAAGAGTGTCATTTTAGTTTTTTTATTTTGTTTTAAA
ATAAGTGTCACTTTGTATTTCCAATGCACATTTTATTATTAAATTTCTTTCTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B563TF U 1
AF RS1B563JQ C 19
BS 1 416 RS1B563TF
BS 417 417 RS1B563JQ
BS 418 667 RS1B563TF
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RD RS1B563TF 772 0 0
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AACTTAGCAATGCTTAGGTACCTTCCTTAATTACTTACCTCTTCCAACACTCTTCCTCTC
CTTTTATCTCCACACTCCGAAATTCAATTGCACGTTTTGCAGTAAACCCCTCCTTGTTCG
CTCATAATAGACTCATAAAAAAGACTCATTTTCCTTTTAATTTCCCTTTCTCAAACACGC
CCACTACTCCCTCTCCTTTTTTTGAGATAACTCAAATCATAGGAAACCAAAACACACTAA
TAAATCCTTCTGATAAATCTTATATTGATTTTCATTTTCATCACTGATTTTTATAAACCC
ATCAAGTTTTTTTCGCATGAGACTATACTGGGGGAGTCGTAACTGATCTCTGTTTCTCCT
TAAGTTGGTTGTTCAGAAAGTTTAGTAATCATGGGATTCCAGAGACCATCATCAGAAAAG
TCGAGAGCCAAATTCAGTCTCTTTTATATATTCCTACTTTGCATTATCCTCTGTGTGTTG
ACCACTTTCATAGCCCCTTCGTCACTTTCTTCTCCATATGTTACGAATTCTGGGAAACTA
GGGCATGCACAGGTTCGTAAGCTTTTTCTATCCTTTTACTTCCTTGCAGTCATCCAACAT
AAAAAAA*TTATTTTTAATGATGAATCAATAATTAACTAAAATGGTCAAATACTGTGTT*
CATTTCATATACTCCCTGTTTCTAAAGAGTGTCATTT
AGTTTTTTATTTTGT

QA 1 757 1 757
DS 

RD RS1B563JQ 818 0 0
GTACAAT
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CTTAATTACTTACCTCTTCCAACACTCTTCCTCTCCTTTTATCTCCACACTCCGAAATTC
AATTGCACGTTTTGCAGTAAACCCCTCCTTGTTCGCTCATAATAGACTCATAAAAAAGAC
TCATTTTCCTTTTAATTTCCCTTTCTCAAACACGCCCACTACTCCCTCTCCTTTTTTTGA
GATAACTCAAATCATAGGAAACCAAAACACACTAATAAATCCTTCTGATAAATCTTATAT
TGATTTTCATTTTCATCACTGATTTTTATAAACCCATCAAGTTTTTTTCGCATGAGACTA
TACTGGGGGAGTCGTAACTGATCTCTGTTTCCCCTTAAGTTGGTTGTTCAGAAAGTTTAG
TAATCATGGGATTCCAGAGACCATCATCAGAAAAGTCGAGAGCCAAATTCAGTCTCTTTT
ATATATTCCTACTTTGCATTATCCTCTGTGTGTTGACCACTTTCATAGCCCCTTCGTCAC
TTTCTTCTCCATATGTTACGAATTCTGGGAAACTAGGGCATGCACAGGTTCGTAAGCTTT
TTCTATCCTTTTACTTCCTTGCAGTCATCCAACATAAAAAAAATTATTTTTAATGATGAA
TCAATAATTAACTAAAATGGTCAAATACTGTGTTTCATTTCATATACTCCCTGTTTCTAA
AGAGTGTCATTTTAGTTTTTTTATTTTGTTTTAAAATAAGTGTCACTTTGTATTTCCAAT
GCACATTTTATTATTAAATTTCTTTCTTACC

QA 8 818 8 818
DS 



AS 1 2

CO CL7075Contig1 793 2 2 U
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GCCTGGAGTACCGGTGGATGTTAGACGAGTGAAGTTCTCTAGATCGCATACGACAGGGCA
TCCGGTGGTTCAACCGGGGGAATGTACCGAGCGGTTTACTCTCCGGTTACCTGAAGATGT
AAGGAAGAGGGTGATGGAGAATTGGAAGTTAAACCGGTCGAGTAGTCTTGTGGCTCTTCC
CAGGGGAGGAGGGAGTTCAAGGAGAGGTAAACCGATTGACCGGTCAAGGGCTCGGTCTGA
TCGATGGTTGTTCCGTAAAACGCCGTCGTTTATGTGGAGAAGCAGAGATGATGGTTCGAT
TAGGCTAGGTTCTACCGGTAGTATTCGAGCTAATACCGGTGATTCCATACGGTCAGACCG
GTGGGCTTTTCTTAGAAATGGGTCGTTGTTGTGGAGGAACTCTTCGGTACATAGGGGAGG
AGTCAATAAGGACTGCGAAGGAACTTCGGTTAAACCGACCGGTACAGGGGGCTCAACTAA
CGGTTCGGTGAGATTACCGGTTTAGTTGACTTTTCTTTTGTGGATGCACCTACACTTTGC
TCATCTTTTTCATTTTTGTTTCTGTATGGGATTGTTTATAAACACGCAATACATATTCCT
TTTTTTAATTGTTAATTTTTTATTCTTTAATTTCTGTAGCGTACATATGAATCAAAGTCA
AATCTAGATAAGG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DO13TF U 1
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TTTTT
AA

QA 1 725 1 725
DS 

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TCCGGTGGTTCAACCGGGGGAATGTACCGAGCGGTTTACTCTCCGGTTACCTGAAGATGT
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CAGGGGAGGAGGGAGTTCAAGGAGAGGTAAACCGATTGACCGGTCAAGGGCTCGGTCTGA
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AS 0 0

AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AR65JQ U 8
AF RS1AR65TFB C 1
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QA 1 743 1 743
DS 

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ATTATGCTTGGTGGTGACAATGACCTTGTCAGCGACCAAGTAAGCAGAGTAGAAACCAAC
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AGAGATAGTAGAGAGGATGCGGAGTCC

QA 1 807 1 807
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1FR16TF U 1
AF RS1CQ54JQ C 36
BS 1 333 RS1FR16TF
BS 334 334 RS1CQ54JQ
BS 335 718 RS1FR16TF
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BS 797 830 RS1CQ54JQ

RD RS1FR16TF 796 0 0
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GACTGGACTACCAAGACAAC**AAACTCTGTATATTACTTT*GTATCTTGATGTTGATCA
AACTGTGTATGCTATT

QA 1 796 1 796
DS 

RD RS1CQ54JQ 795 0 0
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ACCCAAACCAGGATATGAATCTGAACATCAGTTTGTCATCGCCTCCTCTTGTAAAGATAT
CAGAGCAGTATGTGGGAGCTAATGTGAACGCGGACCTAGTAATCAATGTTCTAGAAGCAG
ACCAAGTGATACCAGTAGCATGCATCTCCTTGGTGATCCGAGGGTCGGGTGCTCTCAGAG
TGATGGGTAATAACCTTGGAGGCAGCGTGAGATTAGAGGATTTCTCCATGTCTTTGGAGT
GGAGCAACATTGGAAATCTCCATCTGCATCTTCTTCAGCCAATAGTGTGGACCGTTATAC
TAACTGTGTTTGTGCCATATGCAAATGACCATCTAGAAAAAGGCTTCCCTTTGCCCATAA
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GTAGCGATGTTGCCTACTTGGATTCGTCTCAACAGCCTCGGTCACAGTTGAGTCTATCAA
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ATTGGGGTCTGGTATCTGGACCGGAGACTGGACTACCAAGACAAACAAAACTCTGTATAT
TACTTTTGTATCTTGATGTTGATCAAACTGTGTATGCTATTCTTCTTTATATGAAATAAA
AATGTCTTTGTAATT

QA 1 795 1 795
DS 



AS 1 2

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GGTGAGTTGTCTGCAGCTGAGATCGACAACCTCATGACTATTGTTGCCAACCCAAAACAG
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TTCCGCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AF15TF U 1
AF RS1AF15JQ C 37
BS 1 766 RS1AF15TF
BS 767 787 RS1AF15JQ

RD RS1AF15TF 766 0 0
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GGCAGGCGTTTGGCCAACATCGTCTGCAAGAAAGCCGATGTCGACATGAACAAGAGGGCT
GGTGAGTTGTCTGCAGCTGAGATCGACAACCTCATGACTATTGTTGCCAACCCAAAACAG
TACAAGATCCCAGACTGGTTCTTGAACAGACGAAAGACTACAAGGATGGAAAGTACTCTC
AAGTTGTCTCCAATGCCCTTGACATGAAGCTCAGGGATGATCTTGAACGCCTCAAGAAAA
TCAGGAACCACCGTGGGCTGAGACACTACTGGGGTCTCCGTGTCCGTGGTCAACACACCA
AGACAACTGGTCGCAGGGGAAAGACTGTTGGTGTCTCTAAGAAGCGTTAAGCCAGTGTTC
GTTGCTGCAGCTGGATTGAACCTTTAATAAGAACCGTTTTTAAGATAATTTGAACAATTT
TGCAAAACCCTATTATGTCGTTTATCCTGCACTGTTTTTTTTGTTACATTATAAGATAAT
ATTTTGTTACTGTGTCTTTTCCAATTATCTAGTTTCATTTTTGGTCGTGGCCTATTCATT
TACTTGTTTCTGTTCTATATAAGTACAACAGTATCCGGATTTGATC

QA 1 766 1 766
DS 

RD RS1AF15JQ 751 0 0
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TTCCAGCACATTCTGCGTGTGCTCAACACTAACGTCGATGGGAAGCAAAAGATCATGTTT
GCCCTTACCTCCATCAAGGGTATTGGCAGGCGTTTGGCCAACATCGTCTGCAAGAAAGCC
GATGTCGACATGAACAAGAGGGCTGGTGAGTTGTCTGCAGCTGAGATCGACAACCTCATG
ACTATTGTTGCCAACCCAAAACAGTACAAGATCCCAGACTGGTTCTTGAACAGACGAAAG
ACTACAAGGATGGAAAGTACTCTCAAGTTGTCTCCAATGCCCTTGACATGAAGCTCAGGG
ATGATCTTGAACGCCTCAAGAAAATCAGGAACCACCGTGGGCTGAGACACTACTGGGGTC
TCCGTGTCCGTGGTCAACACACCAAGACAACTGGTCGCAGGGGAAAGACTGTTGGTGTCT
CTAAGAAGCGTTAAGCCAGTGTTCGTTGCTGCAGCTGGATTGAACCTTTAATAAGAACCG
TTTTTAAGATAATTTGAACAATTTTGCAAAACCCTATTATGTCGTTTATCCTGCACTGTT
TTTTT*GTTACATTATAAGATAATATTTTGTTACTGTGTCTTTTCCAATTATCTAGTTTC
ATTTTTGGTCGTGGCCTATTCATTTACTTGTTTCTGTTCTATATAAGTACAACAGTATCC
GGATTTGATCAAAAATAAACTTTATTCCGCC

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

CO CL7080Contig1 739 2 6 U
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AGAGCCGGTCTCGTTCGCCTCCAGCTGAAGAGTGAATGAAAAGTGGATACATCAAAGTAG
GGTGGTGTAGTCAAACTCTCTGTGTCATGTGTTGTGTTTAGTTTCTTTGCTATTTGAAAC
ATTCGAACTGGGATCTCTTTTATTGTCGGATTGAAAAACTCTTCTCTTGTGTGCTTAAAA
TATGCCATGTTACTGAATT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RS1EV74JQ C 1
AF RS1EV74TF U 1
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RD RS1EV74JQ 739 0 0
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TATGCCATGTTACTGAATT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1EV74TF 734 0 0
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GCCCAAGGAGGGAGAGATCAAGGTCTAGCCCTGAGAATGGGCAAGTTGAGAGCCCTGGCT
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AGAGCCGGTCTCGTTCGCCTCCAGCTGAAGAGTGAATGAAAAGTGGATACATCAAAGTAG
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TATGCCATGTTACT

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL7081Contig1 839 2 6 U
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AAGGAGATGGGATCTGAAACAGCTTATTGGGTCCGGAGGAATGCCTTCTTCTCACTCAGC
TACCGTTACTGCTCTCGCTGTTGCTATCGGTTTGCAAGAGGGCTTTGGTGGTTCTCATTT
CGCTATTGCTCTCATCTTAGCTTCTGTTGTGATGTATGATGCTACTGGTGTGAGGTTACA
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TCTGGCTGAAAGCAGACCATTGCGTGAACTTCTCGGCCATACCCCTCCCCAGGTAGTTGC
TGGCGGAATGCTTGGAAGTGTCACAGCAGTCACTGGATATTTATTTACCAGGGTTGCTAC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GS20TF U 1
AF RS1GS20JQ C 32
BS 1 713 RS1GS20TF
BS 714 714 RS1GS20JQ
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RD RS1GS20TF 779 0 0
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CTCTACCTAAAGCTAAAGCTATCGCGCGATTGATCCATCCACCATCGGCGCTATGGAGGA
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AAGGAGATGGGATCTGAAACAGCTTATTGGGTCCGGAGGAATGCCTTCTTCTCACTCAGC
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CGCTATTGCTCTCATCTTAGCTTCTGTTGTGATGTATGATGCTACTGGTGTGAGGTTACA
TGCCGGTCGCCAAGCTGAGGTTCTCAATCAGATCGTGTACGAACTTCCTGCAGAACATCC
TCTGGCTGAAAGCAGACCATTGCGTGAACTTCTCGGCCATACCCCTCCCCAGGTAGTTGC
TGGCGGAATGCTTGGAAGTGTCACAGCAGTCACTGGATATTTATTTACCAGGGTTGCTAC
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ACCGCTGGACAGTGGACAGAACCGAAAGCAGATTTACAATCAAAGCCTTAGTT*AATTCA
CTCTATATATAATCGTCGTATTCATGA*TATTCTATTTGAA
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QA 1 761 1 761
DS 

RD RS1GS20JQ 808 0 0
TATGGA
TCTTCTTCTTCTCCTCCTTCTCTCTCTACCTAAAGCTAAAGCTATCGCGCGATTGATCCA
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TTCACGAATTACCCTCTCATCTCCTCCCTCACGGCTTTCACCATCGCTCAATTCATCAAA
CTCTTCACCTCCTGGTATAGGGAAAGGAGATGGGATCTGAAACAGCTTATTGGGTCCGGA
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GAGGGCTTTGGTGGTTCTCATTTCGCTATTGCTCTCATCTTAGCTTCTGTTGTGATGTAT
GATGCTACTGGTGTGAGGTTACATGCCGGTCGCCAAGCTGAGGTTCTCAATCAGATCGTG
TACGAACTTCCTGCAGAACATCCTCTGGCTGAAAGCAGACCATTGCGTGAACTTCTCGGC
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CGCCTGCTTCATTCCCTAGTGCAACCGCTGGACAGTGGACAGAACCGAAAGCAGATTTAC
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TGAAATGTAAAGAAAACTTGAACACCATTACAACAAAGAAAAAACGTAATCTTATTTGGA
AAATAATACAAAGAATTTGTCG

QA 7 808 7 808
DS 



AS 1 2

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AATCAGATAGAATATTATGAGCATATCAGAGACAGTGACAGAAACACTAATACGCTGTCG
TTTAACGTATATTTCCTCAAAAAAATTCC


BQ
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AF RS1FA50TF U 1
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CTTTTTTTTTTTATCCAGAACTCTTTAATTTGAACAGAGACTTTATTTTAATAGTTTTCC
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CAATGAAACCGTTATAAGACCAAGTAAACCCTTTTCACAAGTACACATATATTAGAATAG
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TAACCCACTAAACTGTAAGAACACTAAATAAAACACAGGCAGTAATTTACATTTCAAAAA
GAAAAGAACTTTTCTTAGCCTTTTCTTGATAGTGTTCTCCATGA

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TTATATCAGAGATTTTGAGGAAAAATAAATGTGTGCACGTGTGTAGAATAACTTAGTCTT
CAAGATGAGCATGTATTTACAACTCGTCTTCAGATTGAATTTAATAAAGTAATTAACCCA
CTAAACTGTAAGAACACTAAATAAAACACAGGCAGTAATTTACATTTCAAAAAGAAAAGA
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GCAGTAAGAAAAAAATATTTTTGTAAAAAAAAGACAGACTTTTACAAACAAGTCTTGTTA
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ATGGACTCCAAGTAGGCTGACCATATTCGTAGTACTGGGCCGAAACTAAACCTTTAAATT
TTAGATATTTTAATATTTGGGAGAAAAAAAAAACTTCATAATTTAAGCTTCTCAATCAGA
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QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

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ATTACTAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FQ93TF U 1
AF RS1FQ93JQ C 65
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AGCTAAGAAGTAGCTTCTCTTCCGCTACTAATGCGAGGCGTATCGCTGTTCCTAAGGGCA
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TGACGGGCCGGAAGAAGCAACCGGACCAGCTTCAGACAGCAGAGGGATGGGCTAAGTTCA
CTGGAGGGTTCTTCTTCGGAGGGATCTCTGGTGTGACTTGGGCTTATTTCCTTCTCTACG
TTCTTGACCTTCCTTACTTCGTCAAATGAATGTACTTAATAATATGATCTTTCACCAATC
TTCTCGACCTTCAAATACTTTCTTGCATCATTGTTTTTT*ACTCTTGTCTTCATCA*GAT
TCTTGAATCTCACGATGCTTAATGTACCAT

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DS 

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AAGCTTAGAAACTCCAGTAACGTCAAGCCCACTGATCGCGTGGTATCTCTCCAACCTCCC
GGCTTACCGCACGGCCGTCAACCCTCTCCTCCGTGGTGTCGAAGTGGGTTTGGCTCATGG
TTTCCTCTTAGTGGGCCCATTTGTCAAAGCGGGCCCATTAAGGAACACTGCTTACGCTGG
CTCCGCCGGCTCTTTAGCCGCTGCTGGGCTTGTAGTCATCCTCAGCATGTGCCTCACTAT
CTATGGAATCTCTTCGTTCAAGGAAGGAGAGCCGTCAATTGCACCAAGTTTGACTTTGAC
GGGCCGGAAGAAGCAACCGGACCAGCTTCAGACAGCAGAGGGATGGGCTAAGTTCACTGG
AGGGTTTTTTTTCGGAGGGATCTCTGGTGTGACTTGGGCTTATTTCCTTCTTTACGTTCT
TGACCTTCCTTACTTCGTCAAATGAATGTACTTAATAATATGATCTTTCACCAATCTTCT
CGACCTTCAAATACTTTCTTGCATCATTGTTTTTTTACTCTTGTCTTCATCAAGATTCTT
GAATCTCACGATGCTTAATGTACCATTTCAAAAAAAAAAATTGATGCTATTAGTATATTA
CTAT

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 2

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TCTCTCACTGTTTAACGCCGCCGCCTCTGTGTTTTCCCTTTGTTTTTCAATTCCCTGTCG
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AGGAAAAAAAACATTAGCACGTTAGGAAGAAGATGAGACTTGAATCAAAAGAAAGCTCCG
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AATGACTCATTTTTATACTGAGTTGTTGTGTAATAGAAAACAAGAGTCTCACACCCTTTT
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TTGAATCGTGTAGTGACTTGACACAAATATCAGCCACATCAGCGCAACTGATACCCTGAG
ATATTCTGTTTCCCTGATCAAATATCAGAGCTCGTTGACCGCCTGGCTCTTCCTTCAAGG
GACCGGGACGAATAATGGTGTATCCAAGGCCTGATCTTCTCAATGAATCTTCACCAGCTC
TCTTAGCTTTTAACACTTGCTCTCTTCTGTTGGGTTCTACTCCAGAACCAGTACATGAAA
CCAAAATAAA


BQ
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TGAAACCAAAATAAA

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DS 



AS 0 0

AS 1 2

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ATAGCTTTCTTTTACACATACACTATGCTAGTTTATTCGACTTTCAGGTTCCTACCTTCT
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CTTTTCTTACCCTTTTACCTATTGTTGTTTGTATTATTCATCAGGTAAAGAAGGAAGAGA
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TTAATATGTTTGTATCATGCAATGTCTAAAAATGGAATGTATGTAGTAACTCAAAATTTC
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BQ
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AF RS1F458TF U 1
AF RS1F458JQ C 508
BS 1 728 RS1F458TF
BS 729 1228 RS1F458JQ

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AGAGTCACTGGGAAGATCGTGACAATGAAAGGTATGTTGACAACTTCAAAAGGAAATTTG
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GGATCGTTTCTTCAATCAATTACTTTTTCAGGAGTTCAATGCAATAAAAAGAAGATGCAA
TGGGCTCCAAAGCCAGAAATGTCCTTGTATCGTTGCGGTATAACTCTGTTTTCGAATTAT
ATAGCTTTCTTTTACACATACACTATGCTAGTTTATTCGACTTTCAGGTTCCTACCTTCT
TTTCTTTGTCAAGAGTACTTTTCATTTGTCAGCAGCTATCGTTTTTACATTGCTGTCTAG
ATTATTTTGTTACATATACGTTATGTTTGCTTGTTTAATTTTTAGGATTATATTGTTTTG
CTTTTCTTACCCTTTTACCTATTGTTGTTTGTATTATTCATCAGGTAAAGAAGGAAGAGA
AGCACATTAAACGTTCTGTAATCAAAAGTGTGGTTGGGACGCTTGATTTGTACATTCGTT
TTTTCTTG

QA 1 728 1 728
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GTGTGGTTGGGACGCTTGATTTGTACATTCGTTTTTTCTTGCAAGGAGAGACCTTTCCTG
GGGAAAAGGTGAAGTTTCAATTGTTTTGCACCATTAACCGGGAAGGTTCAAATAGGTATG
GTTATATTGCTAATTTATGTGTTGCCAAATCAGCACGCCGCCAGGGTATTGCTTGCAACA
TGTTACGTTTCGCTGTCGAATCAGCCAGATTGAGTGGAGTTGAGCAAGTATATGTTCATG
TACATAGAAACAATTTAGTTGCTCAGGAACTATACCAGAAGACTGGTTTCGAGGTCGTTG
AAATGGGACAGTTTGAATCATCAGATGATACATACTTGCTCCAGTACGCAAGATGATGAC
TCACAAGAAACGATGCGTGTTGTCTCTTTTCCCTTTCTTTACTTTTTATTTCGGAGGATG
GGATAATTGAACCAAAACGCAGAAAAGTGATTATTAATATGTTTGTATCATGCAATGTCT
AAAAATGGAATGTATGTAGTAACTCAAAATTTCATGTACGATTGTTGTGGATAAATTTAC
A

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

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AAGTCTTCGTTTTCATTCCTGATTTATGACTTGGCGGGTTTTGTGAAAGCTGCAGCTATG
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ACGAAATGCTTCGCGTACTTCAGAAACTCCACTTCGTGGGAGAAGTCAGAGACGTTATGC
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AAACTATGTAATGCAAACGCTACTAGCTGTTGGATCGGAGGAAGAAGCCTGAACTCTTCT
ACCGTGGGCTTTAACTGGACCTGGTCCGATCCCAAGACTCCTCAGTGGAACCAAACCATG
TTTCCTAAAGTGCCGGTTCGTACACCATGTCGCAATGGCAGCTCATCTCGCGGTGCTGAC
ATATGTATGGTTTTGACAAACGGTTCATTACAAGTCTTTGGTGAAAGATGTAACGCCTCT
CATGCTTTCATTTGCTCTGTTGATTCTGGTAATAACACTCCCTTGTCTCACTATAGCTAG
TATCCAGACAGCAAACACTAAGCATAGGCTTCTGTCTCTTTTTTTTTGCAGACACCAAAT
GTAGTAACTGTCACGGTGAATATAAAATCATCCTTTTGGTTGTAAGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AK48TF U 1
AF RS1AK48JQ C 102
BS 1 828 RS1AK48TF

RD RS1AK48TF 828 0 0
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TATCCAGACAGCAAACACTAAGCATAGGCTTCTGTCTCTTTTTTTTTGCAGACACCAAAT
GTAGTAACTGTCACGGTGAATATAAAATCATCCTTTTGGTTGTAAGCG

QA 1 828 1 828
DS 

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TGAAAGATGTAACGCCTCTCATGCTTTCATTTGCTCTGTTGATTCTGGTAATAACACTCC
CTTGTCTCACTATAGCTAGTATCCAGACAGCAAACACTAAGCATAGGCTTCTGTCTCTTT
TTTTTTGCAGACACCAAATGTAGTAACTGTCACGGTGAATATAAAATCATCCTTTTGGTT
GTAAGCG

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

CO CL7088Contig1 894 2 16 U
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GTGTCAAAATCTCGGTCAAAGTCGCTGGAATCCACTGGCACTACGGGACACGCTTTCACG
CCCCTGAGCTCACAGCAGGATACTACAACACTAGGTTCAGAGACGGATACCTCCCCATCG
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AACTGGGGGAAGTTTGTAGGGTTTGTGAAAAAAATGGGTGAAGGGAGAGACTCTGATAGG
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CAAGAAGCTGCAGTGGCTCTCACTCACTAGAAAGAGAGATTGTGGCATGGTTCGACCCAA
TGGTTTATGTTTGTATGCGATGTGATGAAATGATTACTATGATGATGCCGAAAAGATGTT
TAGGCTAAGGTTGTGTATGTATCGGCGGTATAAAAAATGATTATGGGCCATAGCTGTGGT
TTTTTTGGCTCAGGGTTGTGGCGTTTGTACTATTTCTGATACATACTAAAAAAATATGTA
TATGTTTTCTTCTTTTTGTTCTTATATAATAGCATGAGGAAGATGATTTCAGTC


BQ
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AF RS1G231TF U 1
AF RS1G231JQ C 48
BS 1 713 RS1G231TF
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BS 796 818 RS1G231TF
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RD RS1G231TF 818 0 0
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AACTGGGGGAAGTTTGTAGGGTTTGTGAAAAAAATGGGTGAAGGGAGAGACTCTGATAGG
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TTTTT*GGCTCAGG*TTGTGGCGTTTGTACTATTTCTG

QA 1 818 1 818
DS 

RD RS1G231JQ 847 0 0
ATTCC
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GAGAGACCACGAGCAGCCTCAAGACGCGCTTTGTGCACCAGAGAAGCTAGTGAACCAGGT
GGCTCTAGCTACTCTAGCTGCAGAAGTTCCTCTGGCTGGTGAAAACGCACTGCCTAGGTA
CGATGACTACGCGCACGAGCAGATCCTCAAGGCGTCGGCGCTGAGCTTTGATCAGAACAG
CGGGGAAAAACAGAGAGATGTGTGCGTTTACGTACCTGAGGATGAACCCGGAGCTGTTTA
AGGCGGATAACTGGGGGAAGTTTGTAGGGTTTGTGAAAAAAATGGGTGAAGGGAGAGACT
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GCTGTGGTTTTTTTGGCTCAGGGTTGTGGCGTTTGTACTATTTCTGATACATACTAAAAA
AATATGTATATGTTTTCTTCTTTTTGTTCTTATATAATAGCATGAGGAAGATGATTTCAG
TC

QA 6 847 6 847
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1AR35JQ C 1
AF RS1AR35TFB U 1
BS 1 731 RS1AR35TFB

RD RS1AR35JQ 731 0 0
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QA 1 731 1 731
DS 

RD RS1AR35TFB 731 0 0
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ATGTACCTGGTTTAAGGATACCTAAGCCTGTGGAGTTTTCTCAGTCACTAGGTGATCATT
TGCCCAAGACTCTTGTCGAGCGGTTAACAGCTTTGTGAACAATAATTTTCGTGAGCCTAG
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AACGGGATGCTACATAGATTAGTTGTTGTTAATGGGAGTAGTGTGTATTATCATCCACTT
AGTTTAATGGG

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

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ATAATTTATTTTCCCTTTTCGTTTTACTTCATACTTGTGATGATACTTTGATTTATTCTT
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TATACTTGATAATAC


BQ
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AF RS1CX43TF U 1
AF RS1CX43JQ C 528
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CTTTACCGGAGGTAAAGGTGACCGCGAGATGCAGTTCCATCTCTGGTTCGATCCCACCGC
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QA 1 586 1 586
DS 

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CGCAAGGCGGTCGCGTGAAGATTGACTGGAGCAACGCACCATTCAGCGCCTCCTACAGGA
GCTTCAACGACCAAAGCGCATGTAGCAGGACCTCGAACGCAACATGGGTGGCTTGTGACG
CAAACAAAGACTCGTGGATGTGGACCTCTCTCAATAACCACCAGTACGGACAGATGAAGT
GGGTGCAGGACGAATTTATGATCTACAACTATTGTACCGATTATAAGAGGTTCCCTCAGG
GTCTTGCCAAGGAGTGTAACCTTTAAACCAACTTGGTTAATTTTACTTTGAGAATTTTCG
AGCATTTTTTTCAATAATTTATTTTCCCTTTTCGTTTTACTTCATACTTGTGATGATACT
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GAAAATAACAAGTTATACTTGATAATAC

QA 1 568 1 568
DS 



AS 1 2

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CCACGCTCAAACTTTTCGCCATGGCCGTTTACTGCAAGAACTAGCTTATTAGCCCCTACG
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CCAATGG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D717JQ U 1
AF RS1DX13JQ U 36
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DS 

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ACGGCTCGTGTAGAAACTCAGAGACTTGACAACATTAGATTTGTCTGAATTATTCAGTGG
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TGTGGCGACTCCACTATGACCACCATGTACAACGGACCAAACAGATTGGCCATTCTTATC
GTACTCGACTTGTAATGAAGAGATGGCATCATTTGCCCTTGTTACAAATATCTGCTTGAT
CCCTGAAAATAAACCATCGTCCCATGGTTTGCCTCCGTTGCCTCCCCACGGTCCAGACCC
ATTCTGTGTTGGTTCTTTCACGACTCCACGCTCAAACTTTTCGCCATGGCCGTTTACTGC
AAGAACTAGCTTATTAGCCCCTACGCCAGTGTTATTATGAGGAGATGGCTTGAAGGGACT
TATTTTGCATGGCATAACATGAACACCAATGG

QA 1 812 1 812
DS 



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ACCACAGCGAAAATGCTACGCATGGTCAGTTTGCGTTTACAACCCAGGAATCAGGAACCT
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GCGAGTCGCGTGGTACAGTATAATGTCACTAGGCATCTGCATTGTGGTCTCTGGTTTACA
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TGGGTACTTGAGACACCAACAGACTGTTCAGTTTCCTTTGCTTTTGTTTCTTGTAACACT
GTTTCGTTTTCCTGTAACACTCTGCTTCGAACCTGTTAGTATACAAATTTTGTTC


BQ
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AF RS1CF15TF U 1
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ACCACAGCGAAAATGCTACGCATGGTCAGTTTGCGTTTACAACCCAGGAATCAGGAACCT
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GTTTCGTTT*CCTGTAACACTCTGCT
CGAA

QA 1 806 1 806
DS 

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GTGCCGGAGCTGATTCCGGTATGCGAAGCCGTGTGGCTCACCATTCCCAAGACCGGAACA
AAGTGCGTGTCGGGGGAAATCCAGAGCAAGGTCGTCGTTTTGGCCGTTTACCTCGTCATC
TCCGACGAACATTCCATCTTCCCTACTGTTTCTCTCAAGGTTACATCACCATATGGCAGC
GTTTTGCACCACAGCGAAAATGCTACGCATGGTCAGTTTGCGTTTACAACCCAGGAATCA
GGAACCTACTTGGCCTGTTTTGAGGCCGTAGGGAATAGTCACTTAACAAGGATATCAGCA
TCAACCTTGACTGGAAAACTGGAATCGCCGCCAAGGATTGGGACTCCATTGCTAGGAAAG
AGAAGATTGAGGGTGTGGAGCTTGAGCTTAGGAAACTCGAAGGTTCAGTTGAAGCCATAC
ATGAAAACCTACTTTACCTCCGTAACAGAGAAGCAGACATGAGGATTGTGAGTGAAAAAA
CAAACTCGCGAGTCGCGTGGTACAGTATAATGTCACTAGGCATCTGCATTGTGGTCTCTG
GTTTACAGATTTTGTACTTGAAGCAATACTTTGAAAAGAAGAAGCTTATTTAGATGAGAG
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TAACACTGTTTCGTTTTCCTGTAACACTCTGCTTCGAACCTGTTAGTATACAAATTTTGT
TC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

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AGACTTTATTGCATGATGACGAGAGATATCAAGAAACCGTCCATGATGTACCTTCTCTCC
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ATGAAGAATTTGACTGGACCGAGGAGATGACTAGTCATGAGCAGGTGCCTAAGTGGCTTC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1A311TF U 1
AF RS1A311TV U 37
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QA 1 763 1 763
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ATGAAGAGCGGCGAATGACATTGGAGACTTTATTGCATGATGACGAGAGATATCAAGAAA
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ATGAGCAGGTGCCTAAGTGGCTTCGGGCTAGTACCAGAGACGTGAATACTACCGTTGCAG
ATTTGTCTAAGAAACCTTCAAAGAACATGTTGTCAAGCAGTAATCTAATTGTGCAAACTG
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QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 2

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ACAGTTGATGATTAATTTGGAACGATCTAGGTACACGGATCTTAGGGGCAACTAGGGTTT
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AAGTTTCCACCCAAAACCCAAATCTGAGCCAAGCTAAACTCATTAGGCATC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FS96JQ U 1
AF RS1FX60JQ U 27
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RD RS1FS96JQ 761 0 0
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ACAGTTGATGATTAATTTGGAATGATCTAGGTACACGGATCTTAGGGGCAACTAGGGTTT
CTACCCGGACCACCATAATAGAAGTGACTTCCCCAAGAACCTCCACTGCCACTCTTGACA
TTGTAACAGTTCTCTTGATCAGTGAACACTTGAAGATTATCAGGGCTTCTCAGCTCATTT
GATCCATCAACTATTTGAATGTTCTTGAAGTAACTAGCTTTGCCCCAACCTTCCTCTGCG
AACCTACCACTTCCCATCTGAGTTGTAGTGTGTTGTCCTTCCTCAGACTGCGAGTTAACC
ACTTCACCACCCCATTCGATCATTGATGCACTTTCTGATAAGTAAGAAAAGAGTGAAGCT
GGCCAGTATCCTATTATGTACTTCTCTCCAAATTGTAACCACCAGTGTCCTTCTTTTGGA
TCCTTCCAGATAAGTATGGTAATGTCATACTGAGAGTCTCCAAAGCTTGACAGAGGTGAG
ATTGATCCACCCATTGCAATCTCCCTGTTGATTTGAACGAATCCTGAGCACAGAAGATTG
TAGCAGCCTGTTCCTTGGTATGCATCACTAGTCCAATAAGTGAAGAGCCTGGTGCGACTA
TCACCATACAACTGTGGACTTACCTGCCAGCCAGCTTCAATACTATTAAGATCAGAATTG
AAGTTTCCACCCAAAACCCAAATCTGAGCCAAGCTAAACTC

QA 1 761 1 761
DS 

RD RS1FX60JQ 745 0 0
C
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TAGGTACACGGATCTTAGGGGCAACTAGGGTTTCTACCCGGACCACCATAATAGAAGTGA
CTTCCCCAAGAACCTCCACTGCCACTCTTGACATTGTAACAGTTCTCTTGATCAGTGAAC
ACTTGAAGATTATCAGGGCTTCTCAGCTCATTTGATCCATCAACTATTTGAATGTTCTTG
AAGTAACTAGCTTTGCCCCAACCTTCCTCTGCGAACCTACCACTTCCCATCTGAGTTGTA
GTGTGTTGTCCTTCCTCAGACTGCGAGTTAACCACTTCACCACCCCATTCGATCATTGAT
GCACTTTCTGATAAGTAAGAGAAGAGTGAAGCTGGCCAGTATCCTATTATGTACTTCTCT
CCAAATTGTAACCACCAGTGTCCTTCTTTTGGATCCTTCCAGATAAGTATGGTAATGTCA
TACTGAGAGTCTCCAAAGCTTGACAGAGGTGAGATTGATCCACCCATTGCAATCTCCCTG
TTGATTTGAACGAATCCTGAGCACAGAAGATTGTAGCAGCCTGTTCCTTGGTATGCATCA
CTAGTCCAATAAGTGAAGAGCCTGGTGCGACTATCACCATACAACTGTGGACTTACCTGC
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GCCAAGCTAAACTCATTAGGCATC

QA 2 745 2 745
DS 



AS 1 2

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ATCAAATTCTCTCCT


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FM90TF C 1
AF RS1FM90JQ U 6
BS 1 5 RS1FM90TF
BS 6 735 RS1FM90JQ

RD RS1FM90TF 735 0 0
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AAACAGGTCATGAGAGCACTGATCCCAGCAACTAGACCAGCTGGCATAACCTTTTGAGTG
AGCAAGTAACGCTGTCCCATGACTAGTGTGAGGGCAGCTGAGATTACTGTCTGAAGAACA
GCAGCGATATATGAATTCTTCTTCTTCTCGAAAGCCTTGAGACTGAGATATCCAGCGAGG
ATGAGTAGTAACCCAGCGCCTGCACCTCCGGCGAAAGATGTAATACTTCCTTTCTTCATG
TACCCGATGAACCCACCGCCGGTTAGAAGCATCCCGTACGGGATTGTGAAGCAGAAATCA
TGCATTTCTCGAGATTGGGTTCTTTGTTTTTTTTTTGGATAAACAGAAGATTGGGTTCTT
TGTTAAATTCCTGTTTTTCAGGAAAAGTAGAAGAAACTTGAGATGAAGACAATGTTTTGT
AGTGGTGAGCGCGTGGAAGAAGTCCGTCTTTTTTTTTCTTAAGTCAACGATCGTTTTGGG
ATCAAATTCTCTCCT

QA 1 735 1 735
DS 

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TCATTCAGATTTTGATGGGATTTTATTGCCACCAGTAGCGATCTTGTATACGTAAAAACA
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TAGTAACCCAGCGCCTGCACCTCCGGCGAAAGATGTAATACTTCCTTTCTTCATGTACCC
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TTCTCGAGATTGGGTTCTTTGTTTTTTTTTTGGATAAACAGAAGATTGGGTTCTTTGTTA
AATTCCTGTTTTTCAGGAAAAGTAGAAGAAACTTGAGATGAAGACAATGTTTTGTAGTGG
TGAGCGCGTGGAAGAAGTCCGTCTTTTTTTTTCTTAAGTCAACGATCGTTTTGGGATCAA
ATTCTCTCCT

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

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TCTCGGAGAACCGAACATCAGCTCGCCATTGAACAATCAAGCAGCTCAGCTTTGGAGCAA
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CCTTTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AM23TF U 1
AF RS1AM23JQ C 43
BS 1 790 RS1AM23TF

RD RS1AM23TF 790 0 0
GGGGAAAAAAAGGAGAAGAAGAACGCTCCTTCTCTCCTTTTTATACTTTCGATCAAAATT
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TGAGACTTGCTGCTTCCATCCCAATGTCGACCTCTATGGCAATATTTGCTTGGACATTCT
TCAGGATAAATGGTCATCGGCTTACGATGTGGGGACGTTATTGCTCTCGATTCAAAGCCT
TCTCGGAGAACCGAACATCAGCTCGCCATTGAACAATCAAGCAGCTCAGCTTTGGAGCAA
TCAAAAAGAGTACAGGAAGATGGTTGAGAAGCTCTACAAACCATTGAACGCATGATTCTC
GATGTAATTGGTACAGCTATATTATGATTTTCCAGAAGAAAGAGAAATCACTGCTTTCAA
TAGATCATGTTTCTTCTACTTTGTAATCTCAGTTCGAGCCTATATTAGCAAATCAAAGAC
CCTTTTTATT

QA 1 790 1 790
DS 

RD RS1AM23JQ 748 0 0
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TCGAGGGATGGCGGCGGTAAATGGGCACCAAGGAAACACTCCGGCGGAGACAACCCCGGC
GGCCACCGGATCGAAACAACCTGCTCCTCCGGCTAAACCCGTAGATAGCCACTCCGTTCT
CAAAAGGCTGCAATCTGAACTAATGGGTTTAATGATGGGAGGTGATCCGGGGATATCTGC
TTTCCCGGAGGAAGACAATATATTCTGCTGGAAAGGAACAATCACTGGGAGCAAAGATAC
TGTGTTCCAAGGGACTGAGTACAGACTCTCCCTCGCTTTCTCCAACGATTATCCTTTCAA
ACCTCCCAAAGTTAAGTTTGAGACTTGCTGCTTCCATCCCAATGTCGACCTCTATGGCAA
TATTTGCTTGGACATTCTTCAGGATAAATGGTCATCGGCTTACGATGTGGGGACGTTATT
GCTCTCGATTCAAAGCCTTCTCGGAGAACCGAACATCAGCTCGCCATTGAACAATCAAGC
AGCTCAGCTTTGGAGCAATCAAAAAGAGTACAGGAAGATGGTTGAGAAGCTCTACAAACC
ATTGAACGCATGATTCTCGATGTAATTGGTACAGCTATATTATGATTTTCCAGAAGAAAG
AGAAATCACTGCTTTCAATAGATCATGTTTCTTCTACTTTGTAATCTCAGTTCGAGCCTA
TATTAGCAAATCAAAGACCCTTTTTATT

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL7097Contig1 909 2 19 U
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TGGTGGCAGTGCTAAACAGGGTCGTGACAGACGTTTTCAGGCAATACTTCCACTGAGAGG
TAAAATTCTGAACATTGAAAGAAAGGACGAAGCAGCCATGTATAAGAACGAAGAAATTCA
AAATCTAATTCTTGGCCTTGGACTTGGAGTAAAGGGAGAAGATTTCAAGATGGAGAATCT
GCGGTACCATAAGATTATCATCCCAACAGATGCAGATGTTGATGGTGCACATATCCGCAC
ACTTTTGTTGACATTTTTCTTCAGATATCAGAGAGCCCTGTTTGACGCTGGTTGCATCTA
TGTTGGAGTTCCACCTCTTTTCAAGGTTGAGAGGGGAAAACAAGCACATTATTCCTATGA
TGAAGCAGAACTCAAAAAAGTTACCGCTAACTTCCCTGCAAACGCATCCTACACCATTCA
AAGGTTCAAAGGTTTGGGAGAGATGATGCCTGAGCAGCTTTGGGAAACAACGATGAATCC
AGAAACAAGGATTCTAAAGCAACTAGTCGTTGATGACATAGCAGAAGCTAACATGACTTT
CTCCTCTCTTATGGGTGCTCGGGTCGATGCCAGGAAAGAACTCATAAAAAATGCAGCAAC
TAGGATCAATCTGCAGCATCTCGACATATGAACATGAACCACTGGAGGCCGGTCAAACGA
CATTAGAAGATGTCGGATACATCATATTTTGATTTTAGATTATTTTAGTCAGAGACATCA
TATTACTTCTTCCTCTGGCCCAGCAAAAGTAACCACCACCAGGACATTTTTATTATTATT
GCATTTTAACTCGGTCGTTAGTTTCTTCAAGTTCTATGCCCCCAATAAAATGCAAGTATA
GATTCGTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FN13TF U 21
AF RS1AP55TFB U 1
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RD RS1FN13TF 813 0 0
G
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TA

QA 2 811 2 811
DS 

RD RS1AP55TFB 909 0 0
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GCATTTTAACTCGGTCGTTAGTTTCTTCAAGTTCTATGCCCCCAATAAAATGCAAGTATA
GATTCGTCA

QA 1 909 1 909
DS 



AS 1 2

CO CL7098Contig1 743 2 2 U
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DO71TF C 1
AF RS1DO71JQ U 13
BS 1 12 RS1DO71TF
BS 13 743 RS1DO71JQ

RD RS1DO71TF 743 0 0
TTTTTTTTTCTTGTAATGTTACTCGTCATTTTTT*ATTTATTTT*GCTTTCATAAAATAA
CTTAATCCAAAACAATAAAACGACAAACATAAATATAGTCAAACAAGCTTGAGTAAGTCT
CTTGTCTTATTTTGATCATTGTCCTGACCGGAGTTTTAAGACGGAACCACCTTGTCTGAA
GTCAAACTCCTTTTTTTCCGATTACTTGGACCTTACGCCATGTTTAGGAACAGAAGTTGA
TCCTTTCTTTCCTCCGCCCCCTCCTTTCTTGTTATCAAACCCAAACTCAATGTCTCCTCC
GTTTCGACCAGAGAGTTTGCTCATTGGACCAGGACGCTTTACATCGAACCCAAGCTCCAA
ATCATCACCTCTCTGTCTCGGCTCACGCTCCACAGGTCTGATCTCACGGTTCTTCTTTGA
CGACGGTTTCTCATACTTTGAAGCTTTGTTGTTGTTTTTGTTGTCCTTGCGGCCACGGTT
GCATAGCCTTCCGAACACACAAGCCAGTGCAGCCAAGACAAGGATGGCTGCAAGAACTAT
GAATGCTGTACCGAATGAGCCACTTGAACCAGAGGACGAGGGAGGTGCATATGTGGAAGA
TGATGATGATGAAGATGGATACACAATAAGAGGTTGCTGAAACTGTGGTTGTTGTTGTTG
ATCTTCCATTTTATTTTGGTGGGTTTGGTTTTTGATTGTGATATTGGGAGCTCTGTGATG
TTAAATAGCACTTCAATTTATCC

QA 1 743 1 743
DS 

RD RS1DO71JQ 731 0 0
GTAATGTTACTCGTCATTTTTTTATTTATTTTTGCTTTCATAAAATAACTTAATCCAAAA
CAATAAAACGACAAACATAAATATAGTCAAACAAGCTTGAGTAAGTCTCTTGTCTTATTT
TGATCATTGTCCTGACCGGAGTTTTAAGACGGAACCACCTTGTCTGAAGTCAAACTCCTT
TTTTTCCGATTACTTGGACCTTACGCCATGTTTAGGAACAGAAGTTGATCCTTTCTTTCC
TCCGCCCCCTCCTTTCTTGTTATCAAACCCAAACTCAATGTCTCCTCCGTTTCGACCAGA
GAGTTTGCTCATTGGACCAGGACGCTTTACATCGAACCCAAGCTCCAAATCATCACCTCT
CTGTCTCGGCTCACGCTCCACAGGTCTGATCTCACGGTTCTTCTTTGACGACGGTTTCTC
ATACTTTGAAGCTTTGTTGTTGTTTTTGTTGTCCTTGCGGCCACGGTTGCATAGCCTTCC
GAACACACAAGCCAGTGCAGCCAAGACAAGGATGGCTGCAAGAACTATGAATGCTGTACC
GAATGAGCCACTTGAACCAGAGGACGAGGGAGGTGCATATGTGGAAGATGATGATGATGA
AGATGGATACACAATAAGAGGTTGCTGAAACTGTGGTTGTTGTTGTTGATCTTCCATTTT
ATTTTGGTGGGTTTGGTTTTTGATTGTGATATTGGGAGCTCTGTGATGTTAAATAGCACT
TCAATTTATCC

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

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GCTCCTCCATCATCGTGGTCGTCTTGCTCTGCTCCCTGCTCCCCCATCGTCATAGTCATC
AAATCTCCTTCGTGGCCGACTTCATTTCCTCCATGATTCACCTTTGCGTTGAGCTCGCAC
GATGAGTTCCTCTCTTCTTGTCACTGCCTCATCCGTTGCCAATCACCTCTGCATAACTCC
ATCGCGCTCGGATCCACCGCCGTGAACTTCCGGAGTCGTCGTCACGAATCCTATGTTAAT
TGAAAGCTTGAGCAACAATGATTGTTCCTCAAATCCAGCCTCAAACTTTAAAATTAACGT
TTCAGCCCCTCGTTTATATGCATCTGTCCTTAAAGAACTTTAAGCTTTCCAAGAGGCTGA
AAGGCTAGCAGACTGAAATACGAAGGAGACGAATTAGCAAAGTATGTGAGATCTTGTGAT
GAAGAAAGATTGGAGCTTGTAAAATAGGTAACAGAGGAGTTGGTCTTGCAAATTTTGTGA
GAGCTTTATGATAAAAAAAATTTGGTGATTGCAGAGTATGAGTTAATGGAGGAGACGTTT
TGATTGTTTAACGCCTTATTGTTGGGATCATGTGACGTCTTGTACATGTGTATATGTGTA
TTCCAAGAATATACAATCTTGTACATGTGTGCAACAAGATTTTGTATACAACAACTCTTG
TAGACATGTACACAAATATAACAGGGAAAATA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BV91TF U 1
AF RS1BV91JQ C 11
BS 1 619 RS1BV91TF
BS 620 620 RS1BV91JQ
BS 621 735 RS1BV91TF
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RD RS1BV91TF 794 0 0
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AAATCTCCTTCGTGGCCGACTTCATTTCCTCCATGATTCACCTTTGCGTTGAGCTCGCAC
GATGAGTTCCTCTCTTCTTGTCACTGCCTCATCCGTTGCCAATCACCTCTGCATAACTCC
ATCGCGCTCGGATCCACCGCCGTGAACTTCCGGAGTCGTCGTCACGAATCCTATGTTAAT
TGAAAGCTTGAGCAACAATGATTGTTCCTCAAATCCAGCCTCAAACTTTAAAATTAACGT
TTCAGCCCCTCGTTTATATGCATCTGTCCTTAAAGAACTTTAAGCTTTCCAAGAGGCTGA
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GAAGAAAGATTGGAGCTTGTAAAATAGGTAACAGAGGAGTTGGTCTTGCAAATTTTGTGA
GAGCTTTATGATAAAAAAA*TTTGGTGATTGCAGAGTATGAGTTAATGGAGGAGACGTTT
TGATTGTTTAACGCCTTATTGTTGGGATCATGTGACGTCTTGTACATGTGTATATGTGTA
TTCCAAGAATATACA*TCTTGTACATGTGTGCAC**AGATTTTGTATACAC**ACTCTTG
TAGACATGTA
ACAA

QA 1 790 1 790
DS 

RD RS1BV91JQ 802 0 0
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GAACCCAAGTCTCCACCGAGAAATCAAGCTTCTCGTCGTCGTCTTGTTCTGCTCCTCCAT
CATCGTGGTCGTCTTGCTCTGCTCCCTGCTCCCCCATCGTCATAGTCATCAAATCTCCTT
CGTGGCCGACTTCATTTCCTCCATGATTCACCTTTGCGTTGAGCTCGCACGATGAGTTCC
TCTCTTCTTGTCACTGCCTCATCCGTTGCCAATCACCTCTGCATAACTCCATCGCGCTCG
GATCCACCGCCGTGAACTTCCGGAGTCGTCGTCACGAATCCTATGTTAATTGAAAGCTTG
AGCAACAATGATTGTTCCTCAAATCCAGCCTCAAACTTTAAAATTAACGTTTCAGCCCCT
CGTTTATATGCATCTGTCCTTAAAGAACTTTAAGCTTTCCAAGAGGCTGAAAGGCTAGCA
GACTGAAATACGAAGGAGACGAATTAGCAAAGTATGTGAGATCTTGTGATGAAGAAAGAT
TGGAGCTTGTAAAATAGGTAACAGAGGAGTTGGTCTTGCAAATTTTGTGAGAGCTTTATG
ATAAAAAAAATTTGGTGATTGCAGAGTATGAGTTAATGGAGGAGACGTTTTGATTGTTTA
ACGCCTTATTGTTGGGATCATGTGACGTCTTGTACATGTGTATATGTGTATTCCAAGAAT
ATACAATCTTGTACATGTGTGCAACAAGATTTTGTATACAACAACTCTTGTAGACATGTA
CACAAATATAACAGGGAAAATA

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 2

CO CL7100Contig1 1498 2 2 U
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ATTCCGACGCCGGCAGCTCCTTAGCTCGCCGGCGTCACCGTCCTTTCTCTTTGTTTCTCT
TTTGTAGTTCTTCCTTTGTTTCTTTTGTTGATTTTCTTCAAGTTTGTCCTGTTTCTTAGG
TTTCTTATGTTCTTCCTTTGTTCATGGTTGTGTAAGCTGTCGTTCCTTTCATATCCAAAC
CAGTTGGCTCTTGTTTCTCACTTGTAGTCCAGCTCCGTCCGTCACAGCAGCACTTGTATC
AGATCTGGCCTTTGAGGGTTGTGTGTGTACTGCCTTATCTTGTTCTCTAAAGACTTCCGT
ACGGTCAGATCTGTCTCTCTCTTTGTCCTTTTGGGCATTGAAATTTCTCCCTACAGGGAA
GACTTGCTTTAATTTATATGTTTGTGAACGAAGCTTCTGGTGTAGTGGTTTTCAAGGTTC
ATTCGCCAGATCTACGAGCCTTGGTTGCTCTGAGCTCTACTCCTCATCCTCTGAGGCGAA
TCAACTCTTGTCTGAAGACCTAAAGGCCAATCACCTATATCTGTCATTACCGTTCACAGT
GGCTAAATCCGGTGCTTGCTCTCCTTTCCATAGCAGGACAGATTCGGCTGACACTTGGCT
TAACTTTGGTTTCATAAATACTCATTGTCTCCGATACGGTAATATTGGTGGCCAGAGTCT
TTTGTTGATCACAGTTTTCACCATTCCGCCAAATCCCGTCAAGCTTGTTTGTTGTTACGC
CGGTGTAAAGGTGGCTCAGGCATCACCATCAGGGTCATTTGCTCTCCACCATCAGTTATT
CAGTGAGGCACTATCTCCAAAAGCTTTAACTCATATGTCTCGAGTGTGTCAACTAAAGCT
TGCTAGCTTGAACTCAAGTCAATACTCTGTATCATCTCCAAATTTGAGACTTCTGAAGCT
TCCATCAAGCTGTCCTTTAAAATTTTCTTTTGCAGATAATTTTATTAAAACTTCCTCTCG
ACAGGGCCGAGAGAGATCATCATCATTTTCTTCCTTTTCACAGGAGAGAATCTTTCCACC
ACAGTCCCTCTTTTTAAGAGGTGATCCTCTTTTGGTATTCAAAATCCAGAAAACTTATCC
TTATCCTAGCTGTTTGCTATTTTATGTGAAGGTCTGTTTGGGACCGGTAGATGCAACGAT
CCTCATTCATTTGAGAGTCGAAGCTTGGGATGGTGTTGCGACGTCACTTGCTATTGTGAC
TAATCGTTCGTTATTTGCAGAGTTTGAAGTGTGGTATCAGTCTTTTATAGATCGGATCAC
ATGTGGCAACTTTGATATCTTGCATAACGTTTTATCAAACTTTAAGTTTGTGTCTCTATC
CTTGTTCTATGTTGTTTTATATGCTCGGGAGTTAGCCTGTTGGCTTGCACATCGTGTCTT
GTATGATGTTGCTATTAGTCTTGTAATCGTTTAAACTATGAATGGAAATTTGGTGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AI96TF U 1
AF RS1AI96JQ C 727
BS 1 786 RS1AI96TF
BS 787 1498 RS1AI96JQ

RD RS1AI96TF 786 0 0
GGAAACACACATCGTCTTCTCTCCCAAGCACACAAATCGAGGCAGCCGTTTCTTCAATGG
ATTCCGACGCCGGCAGCTCCTTAGCTCGCCGGCGTCACCGTCCTTTCTCTTTGTTTCTCT
TTTGTAGTTCTTCCTTTGTTTCTTTTGTTGATTTTCTTCAAGTTTGTCCTGTTTCTTAGG
TTTCTTATGTTCTTCCTTTGTTCATGGTTGTGTAAGCTGTCGTTCCTTTCATATCCAAAC
CAGTTGGCTCTTGTTTCTCACTTGTAGTCCAGCTCCGTCCGTCACAGCAGCACTTGTATC
AGATCTGGCCTTTGAGGGTTGTGTGTGTACTGCCTTATCTTGTTCTCTAAAGACTTCCGT
ACGGTCAGATCTGTCTCTCTCTTTGTCCTTTTGGGCATTGAAATTTCTCCCTACAGGGAA
GACTTGCTTTAATTTATATGTTTGTGAACGAAGCTTCTGGTGTAGTGGTTTTCAAGGTTC
ATTCGCCAGATCTACGAGCCTTGGTTGCTCTGAGCTCTACTCCTCATCCTCTGAGGCGAA
TCAACTCTTGTCTGAAGACCTAAAGGCCAATCACCTATATCTGTCATTACCGTTCACAGT
GGCTAAATCCGGTGCTTGCTCTCCTTTCCATAGCAGGACAGATTCGGCTGACACTTGGCT
TAACTTTGGTTTCATAAATACTCATTGTCTCCGATACGGTAATATTGGTGGCCAGAGTCT
TTTGTTGATCACAGTTTTCACCATTCCGCCAAATCCCGTCAAGCTTGTTTGTTGTTACGC
CGGTGT

QA 1 786 1 786
DS 

RD RS1AI96JQ 772 0 0
GATCACAGTTTTCACCATTCCGCCAAATCCCGTCAAGCTTGTTTGTTGTTACGCCGGTGT
AAAGGTGGCTCAGGCATCACCATCAGGGTCATTTGCTCTCCACCATCAGTTATTCAGTGA
GGCACTATCTCCAAAAGCTTTAACTCATATGTCTCGAGTGTGTCAACTAAAGCTTGCTAG
CTTGAACTCAAGTCAATACTCTGTATCATCTCCAAATTTGAGACTTCTGAAGCTTCCATC
AAGCTGTCCTTTAAAATTTTCTTTTGCAGATAATTTTATTAAAACTTCCTCTCGACAGGG
CCGAGAGAGATCATCATCATTTTCTTCCTTTTCACAGGAGAGAATCTTTCCACCACAGTC
CCTCTTTTTAAGAGGTGATCCTCTTTTGGTATTCAAAATCCAGAAAACTTATCCTTATCC
TAGCTGTTTGCTATTTTATGTGAAGGTCTGTTTGGGACCGGTAGATGCAACGATCCTCAT
TCATTTGAGAGTCGAAGCTTGGGATGGTGTTGCGACGTCACTTGCTATTGTGACTAATCG
TTCGTTATTTGCAGAGTTTGAAGTGTGGTATCAGTCTTTTATAGATCGGATCACATGTGG
CAACTTTGATATCTTGCATAACGTTTTATCAAACTTTAAGTTTGTGTCTCTATCCTTGTT
CTATGTTGTTTTATATGCTCGGGAGTTAGCCTGTTGGCTTGCACATCGTGTCTTGTATGA
TGTTGCTATTAGTCTTGTAATCGTTTAAACTATGAATGGAAATTTGGTGCCC

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

CO CL7101Contig1 811 2 2 U
GAGAGCTATGGCGGAGGAAGGAACGGGAGCGTAGCGAAACCAAGAGCCAAGAAAGACGTT
GCTGCAGGGAGGTTGATAGATACCTATGCGGCACAATGCGAAAACTGTCACCAGTGGAGG
GTCATTGATAGCCAGGAGGAGTACGAGGATATCAGAAGTCGTATGATCGACGACCCTTTT
ACCTGCGACAAGAAGAAACAAGTCTCCTGTGAAGACCCTGCGGATCTCGACTATGACTCC
TCTCGTACCTGGGTCATCGACAAGCCTGGTCTTCCCAAAACTCCCAAAGGTTTCAAGAGG
AGCCTTGTCCTCAGAAAAGACTACTCTAAGATGGATACTTACTACTTCACTCCCACCGGT
AAAAAGCTTAGGAGCCGCAATGAGGTCGCTTCCTACGTTGAAGCCAATCCTGAATTCAAG
GGTGCGCCTCTTGAAGACTTCTCTTTCACTGTCCCCAAGGTGATGGAGGACACCTTTCCT
CCTGATCCCAAGGTTGCCTCTCCTCCTGTTGCTGCTAAGGGTGTATCTCCCGTTTCTACA
CCTTGTGATGATGTTTCGGACAAGAGCACCAAATCCAAGCAAATTAAAGGAAAATTCAAG
CTTGAAGAAGAGACCATCCTCTCTGGTTCTCCACACGTTTCTCCTGCTCCCTAGTCTTAA
CTCATTGCTGAGTTTGTTTGTAGATTTGTTTTTTTCTTTTTTGGTCCCAGACTGTTATGA
TGTGTCTACTAAGTTGGATATTTATTTTTACTTTCTTGCAAAGAAGCTGATTCGCCTCTC
TGACCCTCTTTAATAAGAAGTCGTAGTTTTG


BQ
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AF RS1FV46TF U 1
AF RS1FV46JQ C 204
BS 1 694 RS1FV46TF
BS 695 811 RS1FV46JQ

RD RS1FV46TF 697 0 0
GAGAGCTATGGCGGAGGAAGGAACGGGAGCGTAGCGAAACCAAGAGCCAAGAAAGACGTT
GCTGCAGGGAGGTTGATAGATACCTATGCGGCACAATGCGAAAACTGTCACCAGTGGAGG
GTCATTGATAGCCAGGAGGAGTACGAGGATATCAGAAGTCGTATGATCGACGACCCTTTT
ACCTGCGACAAGAAGAAACAAGTCTCCTGTGAAGACCCTGCGGATCTCGACTATGACTCC
TCTCGTACCTGGGTCATCGACAAGCCTGGTCTTCCCAAAACTCCCAAAGGTTTCAAGAGG
AGCCTTGTCCTCAGAAAAGACTACTCTAAGATGGATACTTACTACTTCACTCCCACCGGT
AAAAAGCTTAGGAGCCGCAATGAGGTCGCTTCCTACGTTGAAGCCAATCCTGAATTCAAG
GGTGCGCCTCTTGAAGACTTCTCTTTCACTGTCCCCAAGGTGATGGAGGACACCTTTCCT
CCTGATCCCAAGGTTGCCTCTCCTCCTGTTGCTGCTAAGGGTGTATCTCCCGTTTCTACA
CCTTGTGATGATGTTTCGGACAAGAGCACCAAATCCAAGCAAATTAAAGGAAAATTCAAG
CTTGAAGAAGAGACCATCCTCTCTGGTTCTCCACACGTTTCTCCTGCTCCCTAGTCTTAA
CTCATTGCTGAGTTTGTTTGTAGATTTGTTTTTT
CTT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RS1FV46JQ 608 0 0
CTCCTGTGAAGACCCTGCGGATCTCGACTATGACTCCTCTCGTACCTGGGTCATCGACAA
GCCTGGTCTTCCCAAAACTCCCAAAGGTTTCAAGAGGAGCCTTGTCCTCAGAAAAGACTA
CTTTAAGATGGATACTTACTACTTCACTCCCACCGGTAAAAAGCTTAGGAGCCGCAATGA
GGTCGCTTCCTACGTTGAAGCCAATCCTGAATTCAAGGGTGCGCCTCTTGAAGACTTTTC
TTTCACTGTCCCCAAGGTGATGGAGGACACCTTTCCTCCTGATCCCAAGGTTGCCTCTCC
TCCTGTTGCTGCTAAGGGTGTATCTCCCGTTTTTACACCTTGTGATGATGTTTCGGACAA
GAGCACCAAATCCAAGCAAATTAAAGGAAAATTCAAGCTTGAAGAAGAGACCATCCTCTC
TGGTTCTCCACACGTTTTTCCTGCTCCCTAGTCTTAACTCATTGCTGAGTTTGTTTGTAG
ATTTGTTTTTTTCTTTTTTGGTCCCAGACTGTTATGATGTGTCTACTAAGTTGGATATTT
ATTTTTACTTTCTTGCAAAGAAGCTGATTCGCCTCTCTGACCCTCTTTAATAAGAAGTCG
TAGTTTTG

QA 1 608 1 608
DS 



AS 1 2

CO CL7102Contig1 774 2 1 U
CATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATCAGTCGACGGTACCGGACATATGCC
CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGATCTATCGTTTGGGCCCAAGTACCCTGGCATTCA
CAACCCACTTGATGACACAAACCGAATCCTGCATGACACTAGTGGAACATTCAAATACTA
CATTAAGATTGTTCCCACAGAATATAGATATCTCTCAAAAGACATACTGACAACGAATCA
GTACTCTGTAACTGAATATTACACACCTATGAACGAATTCGACCGGACATGGCCAGCCGT
CTACTTCTTGTATGACCTTTCACCCATCACTGTGACCATTAAGGAAGAACGCCGTAGTTT
TCTCCACTTGATCACTCGGCTTTGCGCTGTATTAGGTGGCACCTTTGCTTTGACAGGAAT
GCTAGATCGTTGGATGTTCCGTTTGATAGAATCTTTCACCAAGAAACCGAGTACCAGAAG
CATACACAAGTGAAACAGAGAGAAGAGAAAAAGATCAAGGAAGGAAGAAGAATCTGTCAA
ACCCTAAATCATGAATCTACCTTCCGAGAATACATTGAGAGATGAAAAAAAAATCAGAAC
ATGGATGTAGTTTTGCGTGTTGTCAGTCTTTTTGAGTATTTTTTATCTCTTATGTATTCT
CTGGTCCTCCCTACATCATCTAGTAGAATTATATGTAATTTTATAAAGACACTGCATCTT
GGGATTTTAGTATCTTCTTAACCTCACTGAGATAAAGAAAAGTTAATCTGTGAA


BQ
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AF RS1A392TF U 1
AF RS1A392TV U 37
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GTACTCTGTAACTGAATATTACACACCTATGAACGAATTCGACCGGACATGGCCAGCCGT
CTACTTCTTGTATGACCTTTCACCCATCACTGTGACCATTAAGGAAGAACGCCGTAGTTT
TCTCCACTTGATCACTCGGCTTTGCGCTGTATTAGGTGGCACCTTTGCTTTGACAGGAAT
GCTAGATCGTTGGATGTTCCGTTTGATAGAATCTTTCACCAAGAAACCGAGTACCAGAAG
CATACACAAGTGAAACAGAGAGAAGAGAAAAAGATCAAGGAAGGAAGAAGAATCTGTCAA
ACCCTAAATCATGAATCTACCTTCCGAGAATACATTGAGAGATGAAAAAAAAATCAGAAC
ATGGATGTAGTTTTGCGTGTTGTCAGTCTTTTTGAGTATTTTTTATCTCTTATGTATTCT
CTGGTCCTCCCTACATCATCTAGTAGAATTATATGTAATTTTATAAAGACACTGCATCTT
GGGATTTTAGTATCTTCTTAACCTCACTGAGATAAAGAAAAGTTAATCTGTGAA

QA 1 774 1 774
DS 

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TGGGCCCAAGTACCCTGGCATTCACAACCCACTTGATGACACAAACCGAATCCTGCATGA
CACTAGTGGAACATTCAAATACTACATTAAGATTGTTCCCACAGAATATAGATATCTCTC
AAAAGACATACTGACAACGAATCAGTACTCTGTAACTGAATATTACACACCTATGAACGA
ATTCGACCGGACATGGCCAGCCGTCTACTTCTTGTATGACCTTTCACCCATCACTGTGAC
CATTAAGGAAGAACGCCGTAGTTTTCTCCACTTGATCACTCGGCTTTGCGCTGTATTAGG
TGGCACCTTTGCTTTGACAGGAATGCTAGATCGTTGGATGTTCCGTTTGATAGAATCTTT
CACCAAGAAACCGAGTACCAGAAGCATACACAAGTGAAACAGAGAGAAGAGAAAAAGATC
AAGGAAGGAAGAAGAATCTGTCAAACCCTAAATCATGAATCTACCTTCCGAGAATACATT
GAGAGATGAAAAAAAAATCAGAACATGGATGTAGTTTTGCGTGTTGTCAGTCTTTTTGAG
TATTTTTTATCTCTTATGTATTCTCTGGTCCTCCCTACATCATCTAGTAGAATTATATGT
AATTTTATAAAGACACTGCATCTTGGGATTTTAGTATCTTCTTAACCTCACTGAGATAAA
GAAAAGTTAATCTGTGAA

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

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GGAATTGAAAACAAGTTTCCGTGTTGGCTTAATCGCTGGTTGCCAACTCGATCATCTTAT
ACCTAACGCTACTATCTTTCATCGCTATCTTCTGAATCCGATCTCTTGCCTCCGACTCAG
ATCAGAAACCGAAACAGTGAGGGGAAGATGGCGGCGAAGACGGGCAGATCGAAAAGCACA
ACAACTTGCATTACTTGCAAACGCATCACTGCTAGCTGATGAACTACTCCCTCGTGCTGC
CATGAAACTCGCTCCTCTTGATCAGACAAGTCAAAGGACAGACGACCTAAGGAGACCTTC
AGACAGACAAAATCGTAATCCTGAACAGCGAGAATGGAAGCGGCGTTTACTTAGTACTGT
TGACAAGTTAAAAGATGCGTTTTGTCGCCAGCATGCCCTGGATCTCATTTTTACCGAGGA
AGGAGATAGCCATTTGTCCGCGGATATGTACATAAACATGGACGGAAATGGCGATGATGT
GGACTGGTTCCCATCTCTGATATTCCAGGAACTTTATGCGAAACTTAACAGGATGGCAAG
TCTAGCAGCAGATATGTTTGAAGGAAGAGAAAGATTTGCCACTTCTTTGTTGATGCGATT
AACAGAGACAGTGATCTTATGGCTTTCCGGAGACCAGAGCTTCTGGGATGACATTGAGGA
AGGACCTAGACCTTTGGGGCCTCTTGGCCTCCGGCAGCTGTATTTGGACATGAGGTTTGT
CATATGCTTTGCATCCCAAGGTCGCTACCTATCGAGGAATTTGAACAGGGGAACTAATGA
GATAATAACTAAAGCCGTAGCAGCTTTCAGTGCAACAGGACTAGATCCATATAGTGAGCT
GCCAGAAGACGACTGGTTCAACGAGATATGTCTGGATGGAATGGAAAGATTGAGTGGTAA
AACAAAAGGCAACAATGGGGAAGTCCACAGTCCGACTGCTTCATTGTCGGCTCAGTCTGT
CTCATCAGCGAGATCTCATGGCAGCTATTAAACCAATTGCATCTTTCATTTGTAAAGAAG
GTGAGTGGTAATGACTTTTGATCTTCTCTTCTCAACTCTGCTTTACTTTTGTAGACTCGC
AAATTATATGATGAGATGATTCTGGGATTTGTAAATGTGATTGTGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1C668TF U 1
AF RS1C668JQ C 408
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RD RS1C668TF 735 0 0
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ACCTAACGCTACTATCTTTCATCGCTATCTTCTGAATCCGATCTCTTGCCTCCGACTCAG
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ACAACTTGCATTACTTGCAAACGCATCACTGCTAGCTGATGAACTACTCCCTCGTGCTGC
CATGAAACTCGCTCCTCTTGATCAGACAAGTCAAAGGACAGACGACCTAAGGAGACCTTC
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TGACAAGTTAAAAGATGCGTTTTGTCGCCAGCATGCCCTGGATCTCATTTTTACCGAGGA
AGGAGATAGCCATTTGTCCGCGGATATGTACATAAACATGGACGGAAATGGCGATGATGT
GGACTGGTTCCCATCTCTGATATTCCAGGAACTTTATGCGAAACTTAACAGGATGGCAAG
TCTAGCAGCAGATATGTTTGAAGGAAGAGAAAGATTTGCCACTTCTTTGTTGATGCGATT
AACAGAGACAGTGATCTTATGGCTTTCCGGAGACCAGAGCTTCTGGGATGACATTGAGGA
AG*ACCTAGACCTTTGGGGCCTCTTGGCCTCCGGCAGCTGTATT*GGACATGAG*TTTGT
CATATGCTTTGCATC

QA 1 735 1 735
DS 

RD RS1C668JQ 720 0 0
TTTTTACCGAGGAAGGAGATAGCCATTTGTCCGCGGATATGTACATAAACATGGACGGAA
ATGGCGATGATGTGGACTGGTTCCCATCTCTGATATTCCAGGAACTTTATGCGAAACTTA
ACAGGATGGCAAGTCTAGCAGCAGATATGTTTGAAGGAAGAGAAAGATTTGCCACTTCTT
TGTTGATGCGATTAACAGAGACAGTGATCTTATGGCTTTCCGGAGACCAGAGCTTCTGGG
ATGACATTGAGGAAGGACCTAGACCTTTGGGGCCTCTTGGCCTCCGGCAGCTGTATTTGG
ACATGAGGTTTGTCATATGCTTTGCATCCCAAGGTCGCTACCTATCGAGGAATTTGAACA
GGGGAACTAATGAGATAATAACTAAAGCCGTAGCAGCTTTCAGTGCAACAGGACTAGATC
CATATAGTGAGCTGCCAGAAGACGACTGGTTCAACGAGATATGTCTGGATGGAATGGAAA
GATTGAGTGGTAAAACAAAAGGCAACAATGGGGAAGTCCACAGTCCGACTGCTTCATTGT
CGGCTCAGTCTGTCTCATCAGCGAGATCTCATGGCAGCTATTAAACCAATTGCATCTTTC
ATTTGTAAAGAAGGTGAGTGGTAATGACTTTTGATCTTCTCTTCTCAACTCTGCTTTACT
TTTGTAGACTCGCAAATTATATGATGAGATGATTCTGGGATTTGTAAATGTGATTGTGTG

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

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GGATCCATCCAGCTGTAGTCGCCGGGAGAAATCAAGATGCTTCGCGGCAGAGGCTCGTGG
GTCGGATTCGCGACCCGGTTAAAACACTACAGGATCCGACGTTTCTGCACTAAAGGAGAG
AACGGACCCGATAAGAAGGAATCGAGCGTTGTTGTTTCTCGATACGACGAGACGTACAAG
AAACTCGACAAGCTCGATTTCGTGCCGGCTGCGAAGATCTTGTTCACTGAACCACCCAAG
AAGAATAAGTTTGGGCTAGACTGGCATGTGGTGCAGTTCATTATCGTCTGCTTGCCATCT
CTAGGTATATTTTCTGTTCAAAGATCTCAATGTTGCTTGTTGTTCGAATGGCTATTGTTT
TTTTGTTGTTCTTGTATGTAACAGCTGCGTATTTGGTTGCTCAATATGCTCGCCGTAAAA
TGAAGATCATGGACGCTGAACTTGGAGAGAAGAAGAGAGAAGAAGAAGAAAAGAAAGAGA
AAGAAGAAGCTGAAAGGAAGGCGTTAGAAGAAGCAGAAGCAACCAAGTCTCAGAGTGAGT
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AAACAAAGAAACCTTCAGGGAATGGTCCAACCAAAACACATGACGATCGATCTACTAAAC
TCACACCAAAAGAAGAATCTAAACCGAGCAAGGAACATAAGGACAGTGTACAGAAGAAAC
CTGGTGAGAATCGAGCAAATGTGGATTCACCCTAGACCTCAGTGAGATGATTAGAAAGGA
AACTTAGGTGATAGGTGAAGAATGATATGTTTTGGCTTTTGGAACTAATGCTGCAGTAGT
TGATGCGCTATTGGCTTGTTTTGCTTTCATTTCTTGACTCACTTCAGGTTTAATACACAA
CTCAGTTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G356TF U 1
AF RS1G356JQ C 376
BS 1 673 RS1G356TF
BS 674 909 RS1G356JQ

RD RS1G356TF 673 0 0
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GTCGGATTCGCGACCCGGTTAAAACACTACAGGATCCGACGTTTCTGCACTAAAGGAGAG
AACGGACCCGATAAGAAGGAATCGAGCGTTGTTGTTTCTCGATACGACGAGACGTACAAG
AAACTCGACAAGCTCGATTTCGTGCCGGCTGCGAAGATCTTGTTCACTGAACCACCCAAG
AAGAATAAGTTTGGGCTAGACTGGCATGTGGTGCAGTTCATTATCGTCTGCTTGCCATCT
CTAGGTATATTTTCTGTTCAAAGATCTCAATGTTGCTTGTTGTTCGAATGGCTATTGTTT
TTTTGTTGTTCTTGTATGTAACAGCTGCGTATTTGGTTGCTCAATATGCTCGCCGTAAAA
TGAAGATCATGGACGCTGAACTTGGAGAGAAGAAGAGAGAAGAAGAAGAAAAGAAAGAGA
AAGAAGAAGCTGAAAGGAAGGCGTTAGAAGAAGCAGAAGCAACCAAGTCTCAGAGTGAGT
TAATGGAGATGAAACAGAGACTGAGAAAGATCGAAGAGACGATAAAAGAGATTGTTCTGG
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TCACACCAAAAGA

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DS 

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GGAAGGCGTTAGAAGAAGCAGAAGCAACCAAGTCTCAGAGTGAGTTAATGGAGATGAAAC
AGAGACTGAGAAAGATCGAAGAGACGATAAAAGAGATTGTTCTGGAAACAAAGAAACCTT
CAGGGAATGGTCCAACCAAAACACATGACGATCGATCTACTAAACTCACACCAAAAGAAG
AATCTAAACCGAGCAAGGAACATAAGGACAGTGTACAGAAGAAACCTGGTGAGAATCGAG
CAAATGTGGATTCACCCTAGACCTCAGTGAGATGATTAGAAAGGAAACTTAGGTGATAGG
TGAAGAATGATATGTTTTGGCTTTTGGAACTAATGCTGCAGTAGTTGATGCGCTATTGGC
TTGTTTTGCTTTCATTTCTTGACTCACTTCAGGTTTAATACACAACTCAGTTCC

QA 1 534 1 534
DS 



AS 1 2

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AACAGATACTTTCTCACTTTTGGACTCTCTACTGGAGAGACTGAGCATCGGAGTTGCACC
TTCCCAGATCGACTCCAACGTGAAGGATTCACCAATTTCTAAACCATTTGCTCTAGCAAA
ATCTTTCCAGCCCTTTCCCAAACTCATTCTTCCTTGGCTTTCTCGTAGAAGATTTGTCAT
CCACTTTGTCCCATCTTTTCCCAACAGAGCTATCGTCCCAGGTTCGTTCATGCCGTTTTC
CCTCATGAATGGCAATGGAAGTCCCAGTCTACTGTTTTTGAAGCTATCTTGTGTAAGTGT
TAAAGTCACAAATCGGGTCTGGCTTCTGAACTCCGTACTGAGAAAACTGAGCACCGGAGT
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GTTTTCTTTCAAGAATGGCAATGGGAGATACAGTCTGCTACTTTGAGCTATCATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1F531JQ U 1
AF RS1BD10JQ U 13
BS 1 286 RS1F531JQ
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BS 749 787 RS1F531JQ
BS 788 837 RS1BD10JQ

RD RS1F531JQ 787 0 0
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TGCATTTTCCCAGATCAACTCCAATGTGAAGGAATCGCCCATGTTTAATCCGTTTGCTCT
AGCAAAATCTTTCAAGCCCTTTCCTAAACTCATTCTTCCTGAGTTCTCCCGTAGAAGATT
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GTTTTCT

QA 1 787 1 787
DS 

RD RS1BD10JQ 825 0 0
GG
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AACTTTTTTTAAGAGAAAAAAACACCTAGTTTTATAAATTTACCAAAGTGCTAGCTAGTG
TCATCTAGCTAGTGTCATGAATCAGTTTTGGACTCGTGAAGATGCATTGCTCCTCAATGT
TATTTTCATCTTTCTTGGTTTCGTTTCCAATATTAGGTTCGGTGGAAACAGATACTTTCT
CACTTTTGGACTCTCTACTGGAGAGACTGAGCATCGGAGTTGCACCTTCCCAGATCGACT
CCAACGTGAAGGATTCACCAATTTCTAAACCATTTGCTCTAGCAAAATCTTTCCAGCCCT
TTCCCAAACTCATTCTTCCTTGGCTTTCTCGTAGAAGATTTGTCATCCACTTTGTCCCAT
CTTTTCCCAACAGAGCTATCGTCCCAGGTTCGTTCATGCCGTTTTCCCTCATGAATGGCA
ATGGAAGTCCCAGTCTACTGTTTTTGAAGCTATCTTGTGTAAGTGTTAAAGTCACAAATC
GGGTCTGGCTTCTGAACTCCGTACTGAGAAAACTGAGCACCGGAGTTGCATTTTCCCAGA
TCAACTCCAATGTGAAGGAATCGCCCATGTTTAATCCGTTTGCTCTAGCAAA*TCTTTCA
AGCCCTTTCCTAAACTCATTCTTACTGAGTTCTCCCGTAGAAGATTTGCCAGCCTCCTTG
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ATGGCAATGGGAGATACAGTCTGCTACTTTGAGCTATCATTTG

QA 3 825 3 825
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AATGAATAAGCGACTTACAGTTAAACCAGTTGGTGGATTGATTTATATCTTTAATATTTT
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AGTTTTTACG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FK75TF U 1
AF RS1FK75JQ C 2
BS 1 679 RS1FK75TF
BS 680 680 RS1FK75JQ
BS 681 730 RS1FK75TF

RD RS1FK75TF 730 0 0
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AAAGGTAGACTTTAGTGGGTGGGAGAAGATTGATGCCAAAGAAAAACAAATGGGTATTGA
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QA 1 730 1 730
DS 

RD RS1FK75JQ 729 0 0
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TACGTATGTGGATGGCTCAAAAGAGGACCAGTAGGCATAATTGCCACAAACCTTTACTGC
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ATGAATAAGCGACTTACAGTTAAACCAGTTGGTGGATTGATTTATATCTTTAATATTTTG
TAACGAGGTGCATTTTCAACTTGTTTTATTTTGTGGCCTCGTATGATTGTTATTGGCACA
GTTTTTACG

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

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AAGAATAAGTTAATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AG22JQ C 1
AF RS1AG22TF U 69
BS 1 68 RS1AG22JQ
BS 69 796 RS1AG22TF

RD RS1AG22JQ 796 0 0
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GGTGAACATTCCATCGTTCATGGTGAGACTTGACTTTCAGAAACACATCGACTTTGCTCT
AACCAGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCAGGAAGAGTAAAGAGAAGGAATGAGAAGTCTGC
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ACCGGGGTTTTAGCTATGCGGTTTTGGCTATTTTGTACTTCGTTGTTGAGGATTGTTTAA
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AAGAATAAGTTAATAC

QA 1 796 1 796
DS 

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ACGAGAAGAACCCCAAGAGGATCTTCGAAGGCGAGGCGCTTCTGAGGAAGATGAATCGCT
ACGGGCTTCTCGACGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCGCTTACCGTGGAGA
ACTTTCTCGAGCGTCGTCTTCAGACCATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCGATCC
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TTCCATCGTTCATGGTGAGACTTGACTCTCAGAAACACATCGACTTTGCTCTAACCAGTC
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AGACTTTTTTCTGCTCACCTTATAAGTTGTCTTATTTCTAGATTACGGTTTAAAGAATAA
GTTAATAC

QA 1 728 1 728
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7110Contig1 730 2 5 U
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GGAGGCAGCAATGAAAGACATAGCGCTTATAACAGGGCAGAAGCCTGTCAAGACAAGAGC
TAGAGCTTCCATTGCTACTTTCAAGATTAGGGAAGATCAACCTCTTGGGATCGCCGTCAC
TCTCAGAGGAGACGTGATGTACTCGTTCCTGGACCGTCTGATCAATTTAGCACTTCCAAG
AACAAGAGATTTCCAAGGTGTGAGTCCCAGTAGCTTTGATGGCAACGGAAACTACAGCAT
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TGAACGAAAGAAAATTTTCATTTGTGTTGTTGTATTATTGTCTTCATGGATTATCTAATG
ATTTTGTTTT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1B842JQ C 1
AF RS1B842TF U 1
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QA 1 730 1 730
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QA 1 730 1 730
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BQ
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AF RS1FB28JQ C 1
AF RS1FB28TF U 1
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BQ
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AF RS1BC26TF U 1
AF RS1BC26JQ C 2
BS 1 627 RS1BC26TF
BS 628 628 RS1BC26JQ
BS 629 682 RS1BC26TF
BS 683 683 RS1BC26JQ
BS 684 693 RS1BC26TF
BS 694 694 RS1BC26JQ
BS 695 709 RS1BC26TF
BS 710 710 RS1BC26JQ
BS 711 717 RS1BC26TF
BS 718 718 RS1BC26JQ
BS 719 729 RS1BC26TF
BS 730 730 RS1BC26JQ
BS 731 738 RS1BC26TF
BS 739 739 RS1BC26JQ
BS 740 757 RS1BC26TF
BS 758 765 RS1BC26JQ

RD RS1BC26TF 765 0 0
GGCTTCACCTATGTCGGATGTTTTCAGCTTCGGTGTTGTTCTGTTCGAGCTTATAACCGG
GTGAAAACCGATACAAAAGCCTAGCGTTTGCAACAACAAAGGAGAAGAAAGTCTTGTTAT
TTGGGTAAAAAATTAAATTAACAGCACTACAAGTTTAATTATAAATCTATTTTACCAACA
ATGTTATAAGTCTTTGTGTGTTAGGCTATGCCGCGTTTACAAGACAGTAAGAGGGTGATC
GAGGAGCTGCCTGATCCGATGCTCAACGGGAAGTTTGCTGAAGAAGAGATGCAGATAATG
GCGTATCTTGCTAAAGAGTGTTTGCTTTTGGAGCCAGAAGCTAGGCCGACAATGAGAGAG
GTTGTTCAGATTCTTTCTACCATCATGCCAGACACTTCCAGACGTAGAAACTTCCCCATC
AATCATCTTTTTCCGAGTAATGAGAAGAAGAAAGAAAGCAAAGTAGGATGGTCAAGAGGT
GGGAGCAGGAGTGCGCATGAAGAGGAGTCAGTGGATCTGACTGAGCCACGGTTCGAGTCC
TTTTGCTTGCCGAATGTGAAGCCGGTCTTGCTTGAACCATCTGCACATATTTAATACTAG
ATAAAAAAACACAGAACAAGAAAAAAA*CAATACCGAGCCATCTCGCATGTGTGTAGATA
AATAGCTCACTCTGGGCAAAGG*TAAACAGCAT*GAGGCTTGAGAGTTT*ATTGTAT*AA
GTGTGTCAA*TTTGTTTT*AAACTGTGACTTTTAATT
ATGATCTA

QA 1 757 1 757
DS 

RD RS1BC26JQ 764 0 0
GGCTTCA
CTATGTCGGATGTTTTCAGCTTCGGTGTTGTTCTGTTCGAGCTTATAACCGGGTGAAAAC
CGATACAAAAGCCTAGCGTTTGCAACAACAAAGGAGAAGAAAGTCTTGTTATTTGGGTAA
AAAATTAAATTAACAGCACTACAAGTTTAATTATAAATCTATTTTACCAACAATGTTATA
AGTCTTTGTGTGTTAGGCTATGCCGCGTTTACAAGACAGTAAGAGGGTGATCGAGGAGCT
GCCTGATCCGATGCTCAACGGGAAGTTTGCTGAAGAAGAGATGCAGATAATGGCGTATCT
TGCTAAAGAGTGTTTGCTTTTGGAGCCAGAAGCTAGGCCGACAATGAGAGAGGTTGTTCA
GATTCTTTCTACCATCATGCCAGACACTTCCAGACGTAGAAACTTCCCCATCAATCATCT
TTTTCCGAGTAATGAGAAGAAGAAAGAAAGCAAAGTAGGATGGTCAAGAGGTGGGAGCAG
GAGTGCGCATGAAGAGGAGTCAGTGGATCTGACTGAGCCACGGTTCGAGTCCTTTTGCTT
GCCGAATGTGAAGCCGGTCTTGCTTGAACCATCTGCACATATTTAATACTAGATAAAAAA
ACACAGAACAAGAAAAAAAACAATACCGAGCCATCTCGCATGTGTGTAGATAAATAGCTC
ACTCTGGGCAAAGGGTAAACAGCATTGAGGCTTGAGAGTTTTATTGTATTAAGTGTGTCA
AATTTGTTTTTAAACTGTGACTTTTAATTTATGATCT

QA 8 764 8 764
DS 



AS 1 2

CO CL7113Contig1 709 2 1 U
GAACGACCGCGAGCGTCTCCAGATATACCTCTCCGACGCCGGCGTCCTCTCCGTCTGCTA
CGGTCTCTACCGCTACGCCGCTTCGCGAGGAGTGGCCTCCCTGGTCTGCCTCTACGGAGT
CCCGCTTCTGATTGTCAACGGTTTCCTCGTTTTGATCACTTACTTGCAGCACACGCATCC
TTCGTTGCCTCACTACGACTCATCGGAGTGGGACTGGTTGAGAGGAGCTTTGGCTACTGT
GGACAGAGACTACGGAATCTTGAACAAGGTGTTCCATAACATCACGGACACGCACGTGGC
GCATCATCTGTTCTCGACGATGCCGCATTATGACGCGATGGAAGCGACCGAGGCGATAAA
GCCGATACTTGGGGAGTATTACCAGTTCGATGGGACGCCGGTGGTTAAGGCCATGTGGAG
GGAGGCGAAGGAGTGTATCTATGTGGAGCCGGATAGGCAAGGGGAGAAGAAAGGTGTGTT
CTGGTACAACAACAAGTTGTAATGAGAGGATGCTAGTGAAAAAAAGTTGTCGACCTTTCT
CTTGTGTCTGGTTGTCTTTGAGTTAAAGAAGTCTGTTTCTTTTACCAATAATCATCTTAT
TAGTATCCACTTTGTTGTGTTATGACATTTTGGCTAAGTTAATTATGTGATGTGGGAAGT
TAGTGTTCGGTGTCTGTTACAGTTGTATGCTTTATTATGCCTCTCTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EH34TF U 1
AF RS1EH34JQ C 195
BS 1 709 RS1EH34TF

RD RS1EH34TF 709 0 0
GAACGACCGCGAGCGTCTCCAGATATACCTCTCCGACGCCGGCGTCCTCTCCGTCTGCTA
CGGTCTCTACCGCTACGCCGCTTCGCGAGGAGTGGCCTCCCTGGTCTGCCTCTACGGAGT
CCCGCTTCTGATTGTCAACGGTTTCCTCGTTTTGATCACTTACTTGCAGCACACGCATCC
TTCGTTGCCTCACTACGACTCATCGGAGTGGGACTGGTTGAGAGGAGCTTTGGCTACTGT
GGACAGAGACTACGGAATCTTGAACAAGGTGTTCCATAACATCACGGACACGCACGTGGC
GCATCATCTGTTCTCGACGATGCCGCATTATGACGCGATGGAAGCGACCGAGGCGATAAA
GCCGATACTTGGGGAGTATTACCAGTTCGATGGGACGCCGGTGGTTAAGGCCATGTGGAG
GGAGGCGAAGGAGTGTATCTATGTGGAGCCGGATAGGCAAGGGGAGAAGAAAGGTGTGTT
CTGGTACAACAACAAGTTGTAATGAGAGGATGCTAGTGAAAAAAAGTTGTCGACCTTTCT
CTTGTGTCTGGTTGTCTTTGAGTTAAAGAAGTCTGTTTCTTTTACCAATAATCATCTTAT
TAGTATCCACTTTGTTGTGTTATGACATTTTGGCTAAGTTAATTATGTGATGTGGGAAGT
TAGTGTTCGGTGTCTGTTACAGTTGTATGCTTTATTATGCCTCTCTTAC

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1EH34JQ 515 0 0
ACGACTCATCGGAGTGGGACTGGTTGAGAGGAGCTTTGGCTACTGTGGACAGAGACTACG
GAATCTTGAACAAGGTGTTCCATAACATCACGGACACGCACGTGGCGCATCATCTGTTTT
CGACGATGCCGCATTATGACGCGATGGAAGCGACCGAGGCGATAAAGCCGATACTTGGGG
AGTATTACCAGTTCGATGGGACGCCGGTGGTTAAGGCCATGTGGAGGGAGGCGAAGGAGT
GTATCTATGTGGAGCCGGATAGGCAAGGGGAGAAGAAAGGTGTGTTCTGGTACAACAACA
AGTTGTAATGAGAGGATGCTAGTGAAAAAAAGTTGTCGACCTTTCTCTTGTGTCTGGTTG
TCTTTGAGTTAAAGAAGTCTGTTTCTTTTACCAATAATCATCTTATTAGTATCCACTTTG
TTGTGTTATGACATTTTGGCTAAGTTAATTATGTGATGTGGGAAGTTAGTGTTCGGTGTC
TGTTACAGTTGTATGCTTTATTATGCCTCTCTTAC

QA 1 515 1 515
DS 



AS 1 2

CO CL7114Contig1 782 2 10 U
GGGATTCTCGTCGTCGGCTAACGAAAAGGTTTTGGCTCCGAGGGAGGAGAAAGGAAGAGA
TGGGTCAAGCTCTGAGTAACGAGAACTCTGCGTCGACTAGTAGTAATACTCCTCCTCCTT
CCACGAATTCGCCGCGGGATTCTGATGATACTTCGTCGTCTCCGATGGGGTCTCTCCTTG
CAGAAGCTGCAGCATTTGGGGAAGGTGACAATGAGAATGAGTCGCTTGAAGTCAAGGCAC
AAAAAGCACTCGATTGTCCTTGCATTGCAGATCTGCGTAATGGATCCTGCGGGTCTCAGT
TCACCGAGGCTTTCCGTTGCTTTCTCATAAGCACTGCTGAAGAAAAGGGATCAGACTGTG
TTCATCCATTCGTTGCATTGCAAAGCTGTATCAAAGCCAACCCAAACGCATTCTCTAAAG
AGGTTCTTGAGGACGAGAAAAAGGAGGAAGAGCAGCAGCAGCCTGTGCAACAAGACCATA
GAATCATCCCACCTCTCTGGGCAAAGGATCCTCCTCGCGGTGGCAAATCCAAGCTTTAGA
ACCTCTATCCACAACAATGGAAAGCTTATTTTTTCTCCCTTCCTTCTCCTACGAACAACA
AACTGAAGAAGTAAAAGAAGCCATTGTGTAAACACGTTTGGTTCTTAGTTTACATTCTCT
CGTGTATTGATCCAAAACGAATCGCTTATTCGGAAGCTTAACCGTTTGGTTTAATTCAAA
TAGCCGATCGGTTTGGATTCGAGACTTTAATTAGAAGTTTAATAAAATGCTTTAGTTTTC
GT


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1AZ33TF U 1
AF RS1AZ33JQ C 3
BS 1 692 RS1AZ33TF
BS 693 693 RS1AZ33JQ
BS 694 713 RS1AZ33TF
BS 714 714 RS1AZ33JQ
BS 715 719 RS1AZ33TF
BS 720 720 RS1AZ33JQ
BS 721 738 RS1AZ33TF
BS 739 739 RS1AZ33JQ
BS 740 751 RS1AZ33TF
BS 752 782 RS1AZ33JQ

RD RS1AZ33TF 759 0 0
GGGATTCTCGTCGTCGGCTAACGAAAAGGTTTTGGCTCCGAGGGAGGAGAAAGGAAGAGA
TGGGTCAAGCTCTGAGTAACGAGAACTCTGCGTCGACTAGTAGTAATACTCCTCCTCCTT
CCACGAATTCGCCGCGGGATTCTGATGATACTTCGTCGTCTCCGATGGGGTCTCTCCTTG
CAGAAGCTGCAGCATTTGGGGAAGGTGACAATGAGAATGAGTCGCTTGAAGTCAAGGCAC
AAAAAGCACTCGATTGTCCTTGCATTGCAGATCTGCGTAATGGATCCTGCGGGTCTCAGT
TCACCGAGGCTTTCCGTTGCTTTCTCATAAGCACTGCTGAAGAAAAGGGATCAGACTGTG
TTCATCCATTCGTTGCATTGCAAAGCTGTATCAAAGCCAACCCAAACGCATTCTCTAAAG
AGGTTCTTGAGGACGAGAAAAAGGAGGAAGAGCAGCAGCAGCCTGTGCAACAAGACCATA
GAATCATCCCACCTCTCTGGGCAAAGGATCCTCCTCGCGGTGGCAAATCCAAGCTTTAGA
ACCTCTATCCACAACAATGGAAAGCTTATTTTTTCTCCCTTCCTTCTCCTACGAACAACA
AACTGAAGAAGTAAAAGAAGCCATTGTGTAAACACGTTTGGTTCTTAGTTTACATTCTCT
CGTGTATTGATCCAAAACGAATCGCTTATTCG*AAGCTTAACCGTTTGGTTTA*TTCAA*
TAGCCGATCGGTTTGGAT*CGAGACTTTAAT
AGAGTTAT

QA 1 751 1 751
DS 

RD RS1AZ33JQ 780 0 0
GGA
TCTCGTCGTCGGCTAACGAAAAGGTTTTGGCTCCGAGGGAGGAGAAAGGAAGAGATGGGT
CAAGCTCTGAGTAACGAGAACTCTGCGTCGACTAGTAGTAATACTCCTCCTCCTTCCACG
AATTCGCCGCGGGATTCTGATGATACTTCGTCGTCTCCGATGGGGTCTCTCCTTGCAGAA
GCTGCAGCATTTGGGGAAGGTGACAATGAGAATGAGTCGCTTGAAGTCAAGGCACAAAAA
GCACTCGATTGTCCTTGCATTGCAGATCTGCGTAATGGATCCTGCGGGTCTCAGTTCACC
GAGGCTTTCCGTTGCTTTTTCATAAGCACTGCTGAAGAAAAGGGATCAGACTGTGTTCAT
CCATTCGTTGCATTGCAAAGCTGTATCAAAGCCAACCCAAACGCATTCTCTAAAGAGGTT
CTTGAGGACGAGAAAAAGGAGGAAGAGCAGCAGCAGCCTGTGCAACAAGACCATAGAATC
ATCCCACCTCTCTGGGCAAAGGATCCTCCTCGCGGTGGCAAATCCAAGCTTTAGAACCTC
TATCCACAACAATGGAAAGCTTATTTTTTCTCCCTTCCTTCTCCTACGAACAACAAACTG
AAGAAGTAAAAGAAGCCATTGTGTAAACACGTTTGGTTCTTAGTTTACATTCTCTCGTGT
ATTGATCCAAAACGAATCGCTTATTCGGAAGCTTAACCGTTTGGTTTAATTCAAATAGCC
GATCGGTTTGGATTCGAGACTTTAATTAGAAGTTTAATAAAATGCTTTAGTTTTCGT

QA 4 780 4 780
DS 



AS 1 2

CO CL7115Contig1 1251 2 4 U
TTTTTGAGTTAACCATGCAGGCGAAAGAGAGCTTAATAAAGATAGTTAAGAAGGTTGCGG
AGGAGAGACAAGAGGCTACGATCGAGAGGACAAATTCTCCAGCGAATGACGCGGTGGATG
TGCTTTTAAGAGACGTTAACGACGGTGGTGGTTCGGATAAGCAATCTCAGCCGTTAGATT
TCGTCAGTGGAAAGATCGTAGAGATGATGATACCCGGAGAGGAAACGATGCCAACGGCGA
TGACGTTGGCTGTCAAATTCCTAAGCGACAATCCCGTCGCTCTAGTCAAACTCGTGGTAC
GTATTGGTATACAAACTTCCACAGCACCCACCACACGTGTGTGTGTCTCTAAATTCATAT
TGTCGACGTCTTCGGACCGTAGCTTCTGATGTTTTTGTCTTTTGAAATGATTTTAACCGC
TGAGATTTTAGCTCTAGATAGTGGAAGTGGAACTAGATGTGGGGCCAAAGGAAAGGGTTT
TGACTTTTGTTTCCGTGTCACGTAACTATCGAAAGTCTTCTTGACGTGACACTAGAGAGT
ACACGCACGTGTGGGAAGGGAAGAGACACGTGATAGTTTAGGAACCGTAGGATTTAAAAG
GCGGTGTGGACAGTGTCGGAAGAGGACGATTTGAATTAACGTCTTTGTCTGTACGAGCGA
CCACACCGCTTGTCAAAACAGCGTTTCACGTCAAGAAGCACGCTTTGTTTTCAACTCCCT
CATTAATGTTTCAATCAAAACGCGTTATCTAATTTTTTTCTCATTTAAATATATTTTAAT
ATAGATTTTATAAATATATTTGAATGCAGGAGGAGAATATGGAGATGAAGATGCGTAAAT
CGGAGTCGGGAAAAGAATACAATTGGTCAGATTATATGTCTCTCTCTTTTACTCAAAACG
TGAGTGCCACTAGTCAAAATAAGCTACCAATTATATTAGAAAGAACTAATGAATGTTTAA
TTGCTTTGTAAATTTTAATTTATTTTTGACCTCTCGAATCGCAAACAGGTGATAAATGAA
ACATTGAGAATGGCTAGTATCATTAACGGTGTGTGGAGAAAGGCTCTTAAAGATGTGGAA
ATTAAAGGTATATGTGTTAATTTACGATTAGCACACATTAGGATTAGGTCTCGACTTTAT
ATGATAAAATGAAATCACATATGTATGCATGCTTATCTTATATGAATTCGAAGTAATTTA
TGATATACTTGGATATAAGACTTGGTGGGTCATTGCAGGTTACTTGATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EL34TF U 1
AF RS1EL34JQ C 599
BS 1 677 RS1EL34TF
BS 678 678 RS1EL34JQ
BS 679 708 RS1EL34TF
BS 709 1251 RS1EL34JQ

RD RS1EL34TF 708 0 0
TTTTTGAGTTAACCATGCAGGCGAAAGAGAGCTTAATAAAGATAGTTAAGAAGGTTGCGG
AGGAGAGACAAGAGGCTACGATCGAGAGGACAAATTCTCCAGCGAATGACGCGGTGGATG
TGCTTTTAAGAGACGTTAACGACGGTGGTGGTTCGGATAAGCAATCTCAGCCGTTAGATT
TCGTCAGTGGAAAGATCGTAGAGATGATGATACCCGGAGAGGAAACGATGCCAACGGCGA
TGACGTTGGCTGTCAAATTCCTAAGCGACAATCCCGTCGCTCTAGTCAAACTCGTGGTAC
GTATTGGTATACAAACTTCCACAGCACCCACCACACGTGTGTGTGTCTCTAAATTCATAT
TGTCGACGTCTTCGGACCGTAGCTTCTGATGTTTTTGTCTTTTGAAATGATTTTAACCGC
TGAGATTTTAGCTCTAGATAGTGGAAGTGGAACTAGATGTGGGGCCAAAGGAAAGGGTTT
TGACTTTTGTTTCCGTGTCACGTAACTATCGAAAGTCTTCTTGACGTGACACTAGAGAGT
ACACGCACGTGTGGGAAGGGAAGAGACACGTGATAGTTTAGGAACCGTAGGATTTAAAAG
GCGGTGTGGACAGTGTCGGAAGAGGACGATTTGAATTAACGTCTTTGTCTGTACGAGCGA
CCACACCGCTTGTCAAA*CAGCGTTTCACGTCAAGAAGCACGCTTTGT

QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1EL34JQ 653 0 0
AGGCGGTGTGGACAGTGTCGGAAGAGGACGATTTGAATTAACGTCTTTGTCTGTACGAGC
GACCACACCGCTTGTCAAAACAGCGTTTCACGTCAAGAAGCACGCTTTGTTTTCAACTCC
CTCATTAATGTTTCAATCAAAACGCGTTATCTAATTTTTTTCTCATTTAAATATATTTTA
ATATAGATTTTATAAATATATTTGAATGCAGGAGGAGAATATGGAGATGAAGATGCGTAA
ATCGGAGTCGGGAAAAGAATACAATTGGTCAGATTATATGTCTCTCTCTTTTACTCAAAA
CGTGAGTGCCACTAGTCAAAATAAGCTACCAATTATATTAGAAAGAACTAATGAATGTTT
AATTGCTTTGTAAATTTTAATTTATTTTTGACCTCTCGAATCGCAAACAGGTGATAAATG
AAACATTGAGAATGGCTAGTATCATTAACGGTGTGTGGAGAAAGGCTCTTAAAGATGTGG
AAATTAAAGGTATATGTGTTAATTTACGATTAGCACACATTAGGATTAGGTCTCGACTTT
ATATGATAAAATGAAATCACATATGTATGCATGCTTATCTTATATGAATTCGAAGTAATT
TATGATATACTTGGATATAAGACTTGGTGGGTCATTGCAGGTTACTTGATACC

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 2

CO CL7116Contig1 743 2 2 U
GGTCCAGTATTAGGGTTTTGATTAGGATCGAGAAAACTATGTCAGGTCTCCACCGATCAT
CAAGCTCATCGAAGAACGTCGGAAAGTCTCTCCCTTCCAAGGAGCTTCTCGACGATCTCT
GCAGTCGATTCGTTCTGAACGTTCCTGAAGAAGACCAACAGTCTTTCGAGAGGATTCTCT
TCCTGGTTGAGTATGCTTATTGGTACTACGAAGACAATGCTGTTGAGAACGATCCGACGC
TAAAGTCTCTCTCTTTGAAGGAGTTTACTTCACTCTTGTTCAACAGCTGTGATGTTTTGA
GACCTTACGTCTCTAACATTGATGATATCTTCAAAGACTTTACGTCTTACAAGTGTAGAG
TTCCTGTCACTGGAGCTATTATCCTCGATGAGACTTATGAACGGTGCTTGTTGGTGAAGG
GATGGAAAGGGTCAAGCTGGAGCTTTCCCCGCGGGAAGAAGAGTAAGGATGAAGAAGACT
ATGTTTGTGCTATCCGTGAGGCCTTAGAGGAAACTGGATTTGATGTCTCAAAGCTACTGA
AGAAAGAAGAATATATTGAGTTTACATTCAGACAGCAAAGAGTTCGACTTTACATAGTTG
CTGGGGGTGACAGATGATACATCTTTTGCACCACAAACAAAGAAGGAAATCAGTGAGATT
GCTTGGCATCGGCTTGATCATCTTCAGCCAGCAAGTAATGAGTGATACTCATGGAGTTGC
TGGTCTCAAGTTGTATATGGTTG


BQ
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15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1B873TF U 1
AF RS1CE62TF U 1
BS 1 728 RS1B873TF
BS 729 743 RS1CE62TF

RD RS1B873TF 732 0 0
GGTCCAGTATTAGGGTTTTGATTAGGATCGAGAAAACTATGTCAGGTCTCCACCGATCAT
CAAGCTCATCGAAGAACGTCGGAAAGTCTCTCCCTTCCAAGGAGCTTCTCGACGATCTCT
GCAGTCGATTCGTTCTGAACGTTCCTGAAGAAGACCAACAGTCTTTCGAGAGGATTCTCT
TCCTGGTTGAGTATGCTTATTGGTACTACGAAGACAATGCTGTTGAGAACGATCCGACGC
TAAAGTCTCTCTCTTTGAAGGAGTTTACTTCACTCTTGTTCAACAGCTGTGATGTTTTGA
GACCTTACGTCTCTAACATTGATGATATCTTCAAAGACTTTACGTCTTACAAGTGTAGAG
TTCCTGTCACTGGAGCTATTATCCTCGATGAGACTTATGAACGGTGCTTGTTGGTGAAGG
GATGGAAAGGGTCAAGCTGGAGCTTTCCCCGCGGGAAGAAGAGTAAGGATGAAGAAGACT
ATGTTTGTGCTATCCGTGAGGCCTTAGAGGAAACTGGATTTGATGTCTCAAAGCTACTGA
AGAAAGAAGAATATATTGAGTTTACATTCAGACAGCAAAGAGTTCGACTTTACATAGTTG
CTGGGGGTGACAGATGATACATCTTTTGCACCACAAACAAAGAAGGAAATCAGTGAGATT
GCTTGGCATCGGCTTGATCATCTTCAGCCAGCAAGTAATGAGTGATACTCATGGAGTTGC
TGGTCTCA
GTTG

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1CE62TF 743 0 0
GGTCCAGTATTAGGGTTTTGATTAGGATCGAGAAAACTATGTCAGGTCTCCACCGATCAT
CAAGCTCATCGAAGAACGTCGGAAAGTCTCTCCCTTCCAAGGAGCTTCTCGACGATCTCT
GCAGTCGATTCGTTCTGAACGTTCCTGAAGAAGACCAACAGTCTTTCGAGAGGATTCTCT
TCCTGGTTGAGTATGCTTATTGGTACTACGAAGACAATGCTGTTGAGAACGATCCGACGC
TAAAGTCTCTCTCTTTGAAGGAGTTTACTTCACTCTTGTTCAACAGCTGTGATGTTTTGA
GACCTTACGTCTCTAACATTGATGATATCTTCAAAGACTTTACGTCTTACAAGTGTAGAG
TTCCTGTCACTGGAGCTATTATCCTCGATGAGACTTATGAACGGTGCTTGTTGGTGAAGG
GATGGAAAGGGTCAAGCTGGAGCTTTCCCCGCGGGAAGAAGAGTAAGGATGAAGAAGACT
ATGTTTGTGCTATCCGTGAGGCCTTAGAGGAAACTGGATTTGATGTCTCAAAGCTACTGA
AGAAAGAAGAATATATTGAGTTTACATTCAGACAGCAAAGAGTTCGACTTTACATAGTTG
CTGGGG*TGACAGATGATACATCTTTTGCACCACAAACAAAGAAGGAAATCAGTGAGATT
GCTTGGCATCGGCTTGATCATCTTCAGCCAGCAAGTAATGAGTGATACTCATGGAGTTGC
TGGTCTCAAGTTGTATATGGTTG

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

CO CL7117Contig1 440 2 1 U
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GGGTGGTTGTGGCGGCACTAACGGTTTCTGGGCATGGAACGGCTTCAATCAACGGAGGAG
GAAGAAGAACAACTCTTCCAGCGATAGACGCAATCAACGCAACTATGGATCGTCTTATTC
CGTCGAGTGAGCAGAGACTCCAGTGGTTATCGATTCAAGTTGTTTACATTGTTGAATCTC
GTCTCTACTTTGATAATTAGAATGAAGCTAAATCTTTACAGAACCAAACTGCGTTTTAAT
GAGGATGTTTGATTAGTGAATAGTTAGTGACAGTGTCTTGTTTCTGGGAGATATTTGCTC
TTCTTACATTGTTGAAACTTAGCTCTTCTTACTTTGTTGTGTTTATGTTTACTTAAAGAA
GTTGCGAGAATCCCCTGCTT


BQ
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AF RS1DN18JQ C 1
AF RS1DN18TF U 1
BS 1 440 RS1DN18TF

RD RS1DN18JQ 440 0 0
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GGGTGGTTGTGGCGGCACTAACGGTTTCTGGGCATGGAACGGCTTCAATCAACGGAGGAG
GAAGAAGAACAACTCTTCCAGCGATAGACGCAATCAACGCAACTATGGATCGTCTTATTC
CGTCGAGTGAGCAGAGACTCCAGTGGTTATCGATTCAAGTTGTTTACATTGTTGAATCTC
GTCTCTACTTTGATAATTAGAATGAAGCTAAATCTTTACAGAACCAAACTGCGTTTTAAT
GAGGATGTTTGATTAGTGAATAGTTAGTGACAGTGTCTTGTTTCTGGGAGATATTTGCTC
TTCTTACATTGTTGAAACTTAGCTCTTCTTACTTTGTTGTGTTTATGTTTACTTAAAGAA
GTTGCGAGAATCCCCTGCTT

QA 1 440 1 440
DS 

RD RS1DN18TF 440 0 0
GAAGATGATCTCTTTTGCGACGGAGGGTTTGACTTCGGGTACAGAAACAAGAAGGGGATT
GGGTGGTTGTGGCGGCACTAACGGTTTCTGGGCATGGAACGGCTTCAATCAACGGAGGAG
GAAGAAGAACAACTCTTCCAGCGATAGACGCAATCAACGCAACTATGGATCGTCTTATTC
CGTCGAGTGAGCAGAGACTCCAGTGGTTATCGATTCAAGTTGTTTACATTGTTGAATCTC
GTCTCTACTTTGATAATTAGAATGAAGCTAAATCTTTACAGAACCAAACTGCGTTTTAAT
GAGGATGTTTGATTAGTGAATAGTTAGTGACAGTGTCTTGTTTCTGGGAGATATTTGCTC
TTCTTACATTGTTGAAACTTAGCTCTTCTTACTTTGTTGTGTTTATGTTTACTTAAAGAA
GTTGCGAGAATCCCCTGCTT

QA 1 440 1 440
DS 



AS 1 2

CO CL7118Contig1 897 2 11 U
CTAATCATTTTATTCATTACTTTTACAGCTCAACCACCGCTCTAGCGAGTTCTGTAAACA
TGTCGGAAATCAAAACCGAGTGGGCTACAACAATAGTAGGTTTCATAAGATTAGACATAC
ATATTCATAAAGAAACTGAGTTTTGTTTTGGTCTTTTTTTTAATATCACTGACAACCGAT
CAATCTCGCCCAATCCACAAACTGCATCCCACCGTAGATGTTATTAGCAAACCGTACACC
AACAGTAAACGCCAAAGCCACAGGAGGCACTTTCTTGGCGAAAGGCGATGCTTCAACCAC
TCTCTCCAAACCATTGATGATCTGATAACGAGTATTCGAAGAAACACTCAAGAACACACC
CCAAAGAGCTGCACTCTTGATGAGAGGTGGTACCGGGATGTCTTCTTCTGATTTATTTAT
GCTCCGTTTAGCAGTCATGATGAGATTAGCAATGCCTTGACCTACAATGCCACATCCAAA
CCCAACAGCACCATACATTATACCCTTGTAGAAGTAGGTAGCAAGTCTCTGTTGAGCAGA
AAAACTACATCCTGGTCTCTCAGCTTCAAACACGCTGCTGGGAAGCGCATTATAAGCATT
AAGCATACGTCCTAAGAAGCCACTAGACGCAGACGAGGGTTGGCCAAAACGGACAAAAGG
AGCCAACATACCGACGAGAGCAACGTTAACCACAACTCCAACAAGAAGATCAGCAACATA
GAGCTCAAACTCTGCCCAGAAATCTTTCCCTCTCTTTTGAACTTCAGCAACAGTGGCGCA
ACAAGAATCAATGACTATCTCAGTCCCTATTTTGAAGAGGAAAGATGGATCAGCAAGCAT
TCTTTACGAAGCAAGACATGACCTTATAGCAAACCAAGCAGCCTGCTGAGCTCTGCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DL23JQ U 54
AF RS1FQ30JQ U 1
BS 1 160 RS1FQ30JQ
BS 161 161 RS1DL23JQ
BS 162 243 RS1FQ30JQ
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BS 245 285 RS1FQ30JQ
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BS 287 306 RS1FQ30JQ
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BS 541 541 RS1DL23JQ
BS 542 897 RS1FQ30JQ

RD RS1DL23JQ 577 0 0
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GACATACAT**TCATAAAGAAACTGAGTTTTGTTTTGGTCTTTTTTTTAATATCACTGAC
AACCGCTCAATCTCGCCCAATCCACAAACTGCATCCCACCGTAGATGTTATTAGCAAACC
GTACACCAACAGTAAACGCCAAAGCCACAGGAGGCACTTTCTTGGCGAAAGGCGATGCTT
CGACCACTCTCTCCAGACCATTGATGATCTGATAACGAGTATTCGAAGAAACACTCAAGA
ATACACCCCAGAGAGCTGCACTCTTGATGAGAGGTGGTACCGGGATGTCTTCTTCTGATT
TATTTATGCTCCGTTTAGCAGTCATGATGAGATTAGCAATGCCTTGACCTACAATGCCAC
ATCCAAACCCAACAGCACCATACATTATACCCTTGTAGAAGTAGGTAGCAAGTCTCTGTT
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AAGCATTAAGCATGTGTCCTAAGAAGCCACTAGACGC

QA 1 577 1 577
DS 

RD RS1FQ30JQ 897 0 0
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TGTCGGAAATCAAAACCGAGTGGGCTACAACAATAGTAGGTTTCATAAGATTAGACATAC
ATATTCATAAAGAAACTGAGTTTTGTTTTGGTCTTTTTTT*AATATCACTGACAACCGAT
CAATCTCGCCCAATCCACAAACTGCATCCCACCGTAGATGTTATTAGCAAACCGTACACC
AACGGTAAACGCCAAAGCCACAGGAGGCACTTTCTTGGCGAAAGGGGATGCTTCAACCAC
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CCAAAGAGCTGCACTCTTGATGAGAGGTGGTACCGGGATGTCTTCTTCTGATTTATTTAT
GCTCCGTTTAGCAGTCATGATGAGATTAGCAATGCCTTGACCTACAATGCCACATCCAAA
CCCAACAGCACCATACATTATACCCTTGTAGAAGTAGGTAGCAAGTCTCTGTTGAGCAGA
GAAACTACATCCTGGTCTCTCAGCTTCAAACACGCTGCTGGGAAGCGCATTATAAGCATT
AAGCATACGTCCTAAGAAGCCACTAGACGCAGACGAGGGTTGGCCAAAACGGACAAAAGG
AGCCAACATACCGACGAGAGCAACGTTAACCACAACTCCAACAAGAAGATCAGCAACATA
GAGCTCAAACTCTGCCCAGAAATCTTTCCCTCTCTTTTGAACTTCAGCAACAGTGGCGCA
ACAAGAATCAATGACTATCTCAGTCCCTATTTTGAAGAGGAAAGATGGATCAGCAAGCAT
TCTTTACGAAGCAAGACATGACCTTATAGCAAACCAAGCAGCCTGCTGAGCTCTGCA

QA 1 897 1 897
DS 



AS 1 2

CO CL7119Contig1 750 2 2 U
TTTTTTAGAGCATTATTAGGAATTTTATTTGAGATGTTACACAAACATGCTCAACGACAT
GGGTTCAACTTCTCCCAACATGGAGTAATTACATTATTTACAAAGATAAGTGAACATATG
AATGGAAAACGACGATGAACAAATCAGTTCTCAAACCAAGGAAATTACATAACACTGAAA
AATCTTTCAACTTTTTTTTTTGGGAATATCAGAAATACGAAAGATGAATATATTAGATGC
TTTGATGACAAATCAACGAAAAGATCTAGAGAGCTCGGCTTTTGATAATGTCGAAACTCA
TCTCGCTAGGATCAGTGGCTTGCAACTCCACCTGAATCCCATCCAATTCTCTCTTGAACC
TATCCTTAGAGCTTGCGTACACCATCTTCATCCTCACTCTAGATGAATCCGGTGACCAGG
CGATGAAAAAAATTTTGCTCTTCTGGCAATTTTCATTGGTGGTAAAGTCGAAATCGAAAA
CCGCATAGCGGCACTCGTCGGCAGGGAGGGAAGCGGTGAAATCATCGTAAGTCTCTTGGG
GGTTTCCTAACTTTTCCACCACCACTTGCTGCCCGTCTATCCTGAATATTATGAACCGAT
AGGTTCTTTTCTTTAGCTCCAAAAACTTCAGCTTGCAGTTGTCCTCCACTGCCATCCCCG
ATGCCGCGTTGGCCATTGCTTTTGTTTAGTTTTTATGGTAAAGCTTGAGGAAGAGGAACT
TGTTTTGTATGAATATTGATTGTCCTCTCC


BQ
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AF RS1FO83TF C 1
AF RS1FO83JQ U 7
BS 1 6 RS1FO83TF
BS 7 750 RS1FO83JQ

RD RS1FO83TF 750 0 0
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GGGTTCAACTTCTCCCAACATGGAGTAATTACATTATTTACAAAGATAAGTGAACATATG
AATGGAAAACGACGATGAACAAATCAGTTCTCAAACCAAGGAAATTACATAACACTGAAA
AATCTTTCAACTTTTTTTTTTGGGAATATCAGAAATACGAAAGATGAATATATTAGATGC
TTTGATGACAAATCAACGAAAAGATCTAGAGAGCTCGGCTTTTGATAATGTCGAAACTCA
TCTCGCTAGGATCAGTGGCTTGCAACTCCACCTGAATCCCATCCAATTCTCTCTTGAACC
TATCCTTAGAGCTTGCGTACACCATCTTCATCCTCACTCTAGATGAATCCGGTGACCAGG
CGATGAAGAAGATTTTGCTCTTCTGGCAATTTTCATTGGTGGTAAAGTCGAAATCGAAAA
CCGCATAGCGGCACTCGTCGGCAGGGAGGGAAGCGGTGAAATCATCGTAAGTCTCTTGGG
GGTTTCCTAACTTTTCCACCACCACTTGCTGCCCGTCTATCCTGAATATTATGAACCGAT
AGGTTCTTTTCTTTAGCTCCAAAAACTTCAGCTTGCAGTTGTCCTCCACTGCCATCCCCG
ATGCCGCGTTGGCCATTGCTTTTGTTTAGTTTTTATGGTAAAGCTTGAGGAAGAGGAACT
TGTTTTGTATGAATATTGATTGTCCTCTCC

QA 1 750 1 750
DS 

RD RS1FO83JQ 744 0 0
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AACTTCTCCCAACATGGAGTAATTACATTATTTACAAAGATAAGTGAACATATGAATGGA
AAACGACGATGAACAAATCAGTTCTCAAACCAAGGAAATTACATAACACTGAAAAATCTT
TCAACTTTTTTTTTTGGGAATATCAGAAATACGAAAGATGAATATATTAGATGCTTTGAT
GACAAATCAACGAAAAGATCTAGAGAGCTCGGCTTTTGATAATGTCGAAACTCATCTCGC
TAGGATCAGTGGCTTGCAACTCCACCTGAATCCCATCCAATTCTCTCTTGAACCTATCCT
TAGAGCTTGCGTACACCATCTTCATCCTCACTCTAGATGAATCCGGTGACCAGGCGATGA
AAAAAATTTTGCTCTTCTGGCAATTTTCATTGGTGGTAAAGTCGAAATCGAAAACCGCAT
AGCGGCACTCGTCGGCAGGGAGGGAAGCGGTGAAATCATCGTAAGTCTCTTGGGGGTTTC
CTAACTTTTCCACCACCACTTGCTGCCCGTCTATCCTGAATATTATGAACCGATAGGTTC
TTTTCTTTAGCTCCAAAAACTTCAGCTTGCAGTTGTCCTCCACTGCCATCCCCGATGCCG
CGTTGGCCATTGCTTTTGTTTAGTTTTTATGGTAAAGCTTGAGGAAGAGGAACTTGTTTT
GTATGAATATTGATTGTCCTCTCC

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL7120Contig1 1084 2 6 U
GGGAGCTTTTGACATTGAATAAACAAGAGAAGGACTTCTTGTTATACAAGGTGTGATTCT
ATAATTTGCAGGTGATGGTACCTTTCAAGTACCAACAATTCACAGAAGACCTCACTGATC
TGGTTGAGTCAGGGGAAGTACCAATGGCACGAATCAATGATGCTGTTGAAAGAATACTTA
GAGTGAAGTTTGTAGCTGGTCTCTTTGACTATCCTCTCACAGACAGATCTTTGCTGCCTA
CTGTTGGTTGCAAGGAACATAGAGAAGTTGCACGCGAAGCAGTTCGAAAGTCCTTAGTTT
TGCTAAAGAATGGCAAAAATGTCGATAAACCATTTTTGCCGCTAGATCGTACGGCTGAGA
GGATTCTAGTGGTTGGAACGCACGCAGACGATCTTGGTAACCAGTGTGGCGGATGGACAA
AGACAAAATCTGGTCAAAGCGGGAAAATCACTGTTGGCACAACGCTTTTGGATGCCATAA
AAGCTGCAGTTGGAGACAAAACCGAAGTGATCTATGAGAAAACTCCATCAAAAGAAACAT
TAGACTCGTGTGAAGGCTTCTCCTACGCTATCATTGCACTGGGGGAGCCTCCCTACGCAG
AGATGAGAGGCGATAACTCTGAGCTCACAATGCCTTTAAATGGTAACGACATTGTAACTT
CGGTTGCAGAGAAAATCCCGAGTCTGGTGATTTTGTTCACAGGACGGCCAATGGTTCTTG
AGATGCCGATTCTTGAAGAGACTGAGGCTTTGGTCGCCGCTTGGTTCCCTGGAACCGAAG
GGCAAGGAATGGCTGATGTTATATTTGGAGATTATGATTTCGAAGGGAAGTTACCAGTGA
CCTGGTTCAAACGAGTAGACCAGTTGCCACTAAAAGCTGATGGCAGTTTATATGACCCAT
TGTTTCCTCTTGGTTTCGGTCTCAATTGCAATTCCAGTTAACTGGTTTAGCTTCAGTCGT
CTGTTCAAGTGTCTTGTGCAATTTATCGGTAACTTGTTGTGTGCAACTGTAAAGGATCAG
AGAAGAAGAGATATTGATGTGAAGATTTCTGTATATTACGTTCAATGAGAAGACCTCTTT
ATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RS1DM59TF U 1
AF RS1DM59JQ C 257
BS 1 662 RS1DM59TF
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RD RS1DM59TF 691 0 0
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ATAATTTGCAGGTGATGGTACCTTTCAAGTACCAACAATTCACAGAAGACCTCACTGATC
TGGTTGAGTCAGGGGAAGTACCAATGGCACGAATCAATGATGCTGTTGAAAGAATACTTA
GAGTGAAGTTTGTAGCTGGTCTCTTTGACTATCCTCTCACAGACAGATCTTTGCTGCCTA
CTGTTGGTTGCAAGGAACATAGAGAAGTTGCACGCGAAGCAGTTCGAAAGTCCTTAGTTT
TGCTAAAGAATGGCAAAAATGTCGATAAACCATTTTTGCCGCTAGATCGTACGGCTGAGA
GGATTCTAGTGGTTGGAACGCACGCAGACGATCTTGGTAACCAGTGTGGCGGATGGACAA
AGACAAAATCTGGTCAAAGCGGGAAAATCACTGTTGGCACAACGCTTTTGGATGCCATAA
AAGCTGCAGTTGGAGACAAAACCGAAGTGATCTATGAGAAAACTCCATCAAAAGAAACAT
TAGACTCGTGTGAAGGCTTCTCCTACGCTATCATTGCACTGGGGGAGCCTCCCTACGCAG
AGATGAGAGGCGATAACTCTGAGCTCACAATGCCTTTAAATGGTAACGACATTGTAACTT
CG*TTGCAGAGAAA*TCCCGAGTCTGGTGAT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1DM59JQ 828 0 0
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AAGCGGGAAAATCACTGTTGGCACAACGCTTTTGGATGCCATAAAAGCTGCAGTTGGAGA
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CTCTGAGCTCACAATGCCTTTAAATGGTAACGACATTGTAACTTCGGTTGCAGAGAAAAT
CCCGAGTCTGGTGATTTTGTTCACAGGACGGCCAATGGTTCTTGAGATGCCGATTCTTGA
AGAGACTGAGGCTTTGGTCGCCGCTTGGTTCCCTGGAACCGAAGGGCAAGGAATGGCTGA
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AGACCAGTTGCCACTAAAAGCTGATGGCAGTTTATATGACCCATTGTTTCCTCTTGGTTT
CGGTCTCAATTGCAATTCCAGTTAACTGGTTTAGCTTCAGTCGTCTGTTCAAGTGTCTTG
TGCAATTTATCGGTAACTTGTTGTGTGCAACTGTAAAGGATCAGAGAAGAAGAGATATTG
ATGTGAAGATTTCTGTATATTACGTTCAATGAGAAGACCTCTTTATAT

QA 1 828 1 828
DS 



AS 1 2

CO CL7121Contig1 738 2 2 U
TTTTTTTAATATCATAAGTAGTTATAATATTTCATTTAGTCGTATTATTAATTACAAAAT
GACAGCAACGCAACTTATATACTATGTGGGGAATTATTTGCTCCTCTCACTTGTAAAGCT
AAACTCCATAAACAAGTTCAATACTCCTTAAAACTCACTCAAAACACTAATCAGACCCTG
ATTATTATGTTTTGTCAATCCCTCCCTCCGTTTAGCCCAAAATCCTGCAAGATCGTTTGG
ATTACGGATGCAGGTTTCTTGTCTTTTGCAGGTGATGCAGGTTTCTTGTTTTTTGCAGGT
GGTGCAGGTTTCTTGTTTTTTGCAGGTGGTGCTTTCGTGACATTTTTTGCTGCCCTGCTG
AATGTTCTGAGTTTCTTTCCATAAGGAGCTACCTCCATATCCGTTTTGTGATCTTTTCCA
AGTTGATTTAACATCTCTTCAGATTTGCTCAAGGTTTTCATCTCAGTTGTCAAACCTTGA
ATGCTCGTTTTTGTTGCCTTTATGTCTTCCTCGATCTGGGCCTCGGCTTTGTGCAAGTCT
TTTTCAATTGCTTCATCGAATTTTCCCATGCGGTGAGCTTCATAAGCGTGGAGAGAGGCA
ACAAGGGCCATGACGAAAAGCAATAAGGAGATCTTTGCCATGACTAGAGCTCAGTTTAAT
TTTTCCCTTAACAAAAAAGTTTGAAATTATATTCAAATATATAGTTTGTTAAAGGAAAAG
AGGTGAGCAGAGATGCCC


BQ
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DS 

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DS 



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BQ
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GCTTCTCTGTAGCTGCCATCTCCTTAC

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1EZ25JQ C 1
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TTGCGAGTTATAAT

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DS 



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BQ
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AF RS1F462TF U 1
AF RS1F461TF U 341
BS 1 654 RS1F462TF

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QA 1 267 1 267
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1BX47TF U 1
AF RS1BX47JQ C 7
BS 1 737 RS1BX47TF

RD RS1BX47TF 737 0 0
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CAAACAACTTGAACTCC

QA 1 737 1 737
DS 

RD RS1BX47JQ 731 0 0
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ACTTGAACTCC

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

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TGTCAAGATGATCCTAGATGCAATTGAACAAGTGAAAGGTATTTACGTTGTGACTGCTGA
TCACGGAAATGCGGAGGACATGGTTAAGAGGGATAAGGCAGGGAAGCCTGCTTTGGACAA
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AGGTCCAGGATTGTCTGAAGGAGTGAGATTCCGTAAGGATCTGGAGACACCAGGACTTGC
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CACACTCATTGAAGTTGTGGAGAAGAACTGAGAGCCTTCTTAGCTTTTGAAGAGACGGCT
GAAACTCTGAAAACTATGTTATATTGCTTTCTATTTAATAATGTTTACACACAAGACAAT
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TTTTCCGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1C537JQ C 673
BS 1 779 RS1C537TF
BS 780 1448 RS1C537JQ

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TGGTCCTATCGTGGACGGTGACGCGGTTGTCACCTTCAACTTCAGGGCTGACCGTATGGT
TATGCACGCCAAGGCGCTTGAGTATGAGGACTTTGACAAGTTTGACCGTGTGAGGTTCCC
TAAGATCCGTTACGCTGGTATGCTCGAGTATGATGGAGAGCTAAAGCTGCCGAGCCATTA
CCTTGTTTCTCCCCCGGAGATTGATAGAACCTCTGGTGAATATTTGACTCACAATGGCGT
CAGTACTTTTGCTTGCAGTGAGACCGTCAAGTTTGGGCATGTGACATTCTTCTGGAATGG
AAACCGATCTGGATATTTCAACGAGAAACTGGAGCAGTATGTTGAAATCCCAAGTGACA

QA 1 779 1 779
DS 

RD RS1C537JQ 776 0 0
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ATATTTCAACGAGAAACTGGAGCAGTATGTTGAAATCCCAAGTGACAGTGGAATCTCGTT
CAATGTCAAGCCAAAGATGAAGGCATTGGAGATTGCTGAGAAGGCAAGGGACGCAATTCT
AAGTGGCAAGTTTGACCAGGTGCGAGTTAACTTGCCAAACAGTGACATGGTTGGACATAC
AGGTGACATTGATGCCACGGTTGTTGCTTGCGAGGCTGCTGATGTTGCTGTCAAGATGAT
CCTAGATGCAATTGAACAAGTGAAAGGTATTTACGTTGTGACTGCTGATCACGGAAATGC
GGAGGACATGGTTAAGAGGGATAAGGCAGGGAAGCCTGCTTTGGACAAGGAAGGGAACCT
CCAGATTCTAACCTCTCACACTCTCAAGCCAGTGCCTATTGCCATTGGAGGTCCAGGATT
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AGTTGTGGAGAAGAACTGAGAGCCTTCTTAGCTTTTGAAGAGACGGCTGAAACTCTGAAA
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TGCCTTTAAACACATTGATTTTGGTTTAAGTGATTGATATTCAAAGCTTTTTCCGT

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

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CAGACCTGCGACCCCTTTAGAGAGAAAAGAAGAAATGGGTTTCTTCTCTTTTCTAGGAAG
AGTTCTCTTCGCTTCTCTCTTCATCCTCTCCGCCTGGCAAATGTTCAATGACTTTGGAGC
TGACGGTGGTCCAGCAGCTAAAGAGTTGGCTCCGAAGCTTGATCTGGCCAAAGCACACCT
CTCTTCCAGATTAGGAGTAGCATTGCCCCACATAGAGGTGAAGCAAGCCGTATCGGCAAT
TGTTGCTCTGAAAGGGCTCGGAGGCTTACTCTTTGTTGTTGGCAACGTCTTTGGTGCCTA
TCTTTTGGCTTTCTACTTGGTGGTTGTTAGTCCCATCTTATATGATTTCTACAACTATGG
ACCCGAGGACCGCCAATTCTCGCTTCTATTGACTGAGTTCTTGCAGAGCGTTGCGCTTCT
CGGGGCATTGCTATTTTTCATTGGAATGAAGAATTCGAGGACTACGACCTCCTCAAAGAG
CAGCAACCTGAAGAAGAGGATACCCAAGCCTAAGGCTGCTTAGATCTGTTCTATTCTCTT
CCACACACGCTTATCAGGCTTTAGAACAGCTTCTGATGTGTTCAAGCTTTGCCTTTATTT
CGTCTTCCTTCCAACTTTTTCTACTGTAGGATTCTAGACTTGGTCACGATTCTTTTTTTT
CTCTTCTAGTTTTTATTTATTTTTGAGATCTAAGAATTTTCTTTTGTTTGATCATACAAT
TTTTTTGATCATAATTTATTGTTCCGACAATTTTTGGCAGCATAAACCATTTTTCTGC


BQ
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TTTT

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BQ
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AF RS1C038JQ C 1
AF RS1C038TF U 1
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QA 1 732 1 732
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AF RS1AN57JQ C 1
AF RS1AN57TF U 1
BS 1 738 RS1AN57TF

RD RS1AN57JQ 738 0 0
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TTAAGAAATCTTTCACTC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1AN57TF 738 0 0
GGGAGATCAATTTGCTGGAGAGAGAGAGGGGGAGAGAGAGAGAGATCGAATGGCGGGAGG
AGGAGGTGGATTTGTGGAGGCAGAGGCAATCATCGCGAGGATCGAAACCAAATCGACCAA
GATTGAAAGCTTACTCAAACAGTATAAACCAGTAGAAGCTCTGAAAACGGCTCTTGAAGG
TTCTCCTCCTAAAACTCTCGATGAGCGTTGCAAGTCGGCTAATTGGATAGTTGTGCACAG
AGCTTTAATGGCGATTAAGGACATTGAGGGGATGCTTAATGCCCTCGATGTTGAGTATTA
CGACATTCTCATGAAGTACTTATACAGAGGGCTTTCCACTGGGGACAGACCTACATGCGA
TCAGTGTTTGAAGATTCACGAGAAACTCACTGAGAGAGCTGGTCTCGGTTGCATTCTCCG
CTGTCTTACTGATACTATCAACACCGTTTGATCCTTACCATTGTATTATCGCCACCATTG
TATTACTTTTAAAAAGACATGAGTTTTTTTTGGTTTGATGATGATACATTCGTTGAAGAT
GCACTTTCAATAACCACGGAGAGAATCTATGCTCAGGAATCTTAGATTATATCTCATAAC
CAGGAAACTTAGAATCTGCCGGCGACGCTAGATCGAACCAGAGGGTGAAGGCTTTCTTTC
ATTTTCATCCATCAAAAACAATATAATACAATGTGTACTCTGTAAAATATTAACCAATTT
TTAAGAAATCTTTCACTC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

CO CL7131Contig1 988 2 6 U
TTAAATATATATCTCACACACAAACACAAACACAGACAATCCATCTCTCAATCTCGCCGG
CCGATGTCAGCAGGCATGGAAAAAGTAGTAATGTTTCACACTTCAAGCTTTCTCCTCCCG
TCGATTCCCGCCGACGAAGCATCAGCGTACGCTGTCGTCGTTCTGAACCAGAAGCTACCG
CGATTCACTCCTCTTCTCTGGGAACATGCAAAACTTCGTTTGTGTGCTGATGGAGGCGCA
AATCGCATCTACGATGAGTTACCTCTCTTCTTCCCTCACGATGACGCTCTCCTCGTCCGT
AACAGGTACAAACCAGATGTTATCAAGGGAGATATGGACTCTATTCGACCTGATGTCCTC
CGCTTTTATCTAAGCTTGGGAACTAAAGTGATAGATGAATCTCATGATCAAGATACCACG
GATCTTGATAAATGCATCTTGTATATCCGTGACTCTACTCTGAATCAAGAGAGCTCCAGA
ATTCTTGCTACAGGAGCACTCGGGGGAAGATTTGATCATGAAGCCGGTAATCTCAACGTC
TTGTATCGTTATCCGGACACAAGGATAATCCTTTTGTCTGATGATTGCCTCATCCAGCTC
CTTCCAAAGACTCATCGACACGAGATTCAAATTCAGCCTTCTCTCCAAGGTCCTCATTGT
GGGCTCATCCCTATGGGGACTCCATCTGCCAAAACCACAACCACAGGGCTTCAATGGGAT
CTCACCGACACTGAGATGAGGTTTGGCGGGTTGATAAGTACATCGAATAAGGTTAAAGGG
GAGAAAATCACAGTCGAGTCGGATTCAGATCTCTTGTGGACGATATCCATCAAGAAACCA
GACTCCACAAGCCCTTAGGCGTTGGGGGCAACAACTACAAGGACTCTTTGCTATATTTTA
CGATATTCTTGATCCTATTACTGTTTTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTCCACTGTAGCATCA
AGTAGGAATAAGACTCGCTTGTACCATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DM71TF U 1
AF RS1DM71JQ C 234
BS 1 563 RS1DM71TF
BS 564 564 RS1DM71JQ
BS 565 649 RS1DM71TF
BS 650 650 RS1DM71JQ
BS 651 690 RS1DM71TF
BS 691 988 RS1DM71JQ

RD RS1DM71TF 690 0 0
TTAAATATATATCTCACACACAAACACAAACACAGACAATCCATCTCTCAATCTCGCCGG
CCGATGTCAGCAGGCATGGAAAAAGTAGTAATGTTTCACACTTCAAGCTTTCTCCTCCCG
TCGATTCCCGCCGACGAAGCATCAGCGTACGCTGTCGTCGTTCTGAACCAGAAGCTACCG
CGATTCACTCCTCTTCTCTGGGAACATGCAAAACTTCGTTTGTGTGCTGATGGAGGCGCA
AATCGCATCTACGATGAGTTACCTCTCTTCTTCCCTCACGATGACGCTCTCCTCGTCCGT
AACAGGTACAAACCAGATGTTATCAAGGGAGATATGGACTCTATTCGACCTGATGTCCTC
CGCTTTTATCTAAGCTTGGGAACTAAAGTGATAGATGAATCTCATGATCAAGATACCACG
GATCTTGATAAATGCATCTTGTATATCCGTGACTCTACTCTGAATCAAGAGAGCTCCAGA
ATTCTTGCTACAGGAGCACTCGGGGGAAGATTTGATCATGAAGCCGGTAATCTCAACGTC
TTGTATCGTTATCCGGACACAAG*ATAATCCTTTTGTCTGATGATTGCCTCATCCAGCTC
CTTCCAAAGACTCATCGACACGAGATTCAAATTCAGCCTTCTCTCCAAG*TCCTCATTGT
GGGCTCATCCCTATGGGGACTCCATCTGCC

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1DM71JQ 755 0 0
AGGCGCAAATCGCATCTACGATGAGTTACCTCTCTTCTTCCCTCACGATGACGCTCTCCT
CGTCCGTAACAGGTACAAACCAGATGTTATCAAGGGAGATATGGACTCTATTCGACCTGA
TGTCCTCCGCTTTTATCTAAGCTTGGGAACTAAAGTGATAGATGAATCTCATGATCAAGA
TACCACGGATCTTGATAAATGCATCTTGTATATCCGTGACTCTACTCTGAATCAAGAGAG
CTCCAGAATTCTTGCTACAGGAGCACTCGGGGGAAGATTTGATCATGAAGCCGGTAATCT
CAACGTCTTGTATCGTTATCCGGACACAAGGATAATCCTTTTGTTTGATGATTGCCTCAT
CCAGCTCCTTCCAAAGACTCATCGACACGAGATTCAAATTCAGCCTTCTCTCCAAGGTCC
TCATTGTGGGCTCATCCCTATGGGGACTCCATCTGCCAAAACCACAACCACAGGGCTTCA
ATGGGATCTCACCGACACTGAGATGAGGTTTGGCGGGTTGATAAGTACATCGAATAAGGT
TAAAGGGGAGAAAATCACAGTCGAGTCGGATTCAGATCTCTTGTGGACGATATCCATCAA
GAAACCAGACTCCACAAGCCCTTAGGCGTTGGGGGCAACAACTACAAGGACTCTTTGCTA
TATTTTACGATATTCTTGATCCTATTACTGTTTTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTCCACTGT
AGCATCAAGTAGGAATAAGACTCGCTTGTACCATT

QA 1 755 1 755
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7133Contig1 751 2 4 U
GGAACCTAAACAAACAAATAAAAAACAGTCGAGGCTTTGTAACGAGAGAGAGAAATGGCG
ACGTCAGGAACATACGTGACGGAGGTTCCGTTAAAAGGGACGGTGGAGAAACATTACAGG
AGGTGGAGGAGCGAGAACCATGCCTTCCCGGAAGCCATCGGCCACCACATCCAAAATGTC
ACCATTCACGACGGCGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTTGGAACTACACATGC
GATGGGAAGCCAGAGGTATTCAAAGAAAGGAGAGAGATAGACGATGAGAAGAAAACGGTG
ACGTTTAGAGGACTTGAAGGTCACGTGATGGAGCAGCTCAAGGTGTATGACGTCATCTTG
GAGTTTATTCCCAAGTCCGAGGATGGCTGTGCCTGCAAAGTTACTATGATATGGGAGAAG
CGCAACGATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAATTTGCCAAGAGCATGGTTGCT
GACATGGACGACCATGTTCTCAAAGCTTAATTGTCATCATCATCATAATCGCCATCCAAA
TCATCACCATCACAATCACTCTCACCATGATCAATATCATCTCCATTACGAAATACTTAT
TAAGATTCTTTTCAATTCAATAAATGTGGTCTTGTGAAGTTTCATTTCTTTACAAGATCA
TGCTTTGATATGTTCTTGTGGTCATCGACCGGTTTGATATGTTATGCTTTGATATATTCC
AGTGTTATTAAGTTTGTCAAAGGTTTGTGGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BT33JQ C 1
AF RS1BT33TF U 1
BS 1 614 RS1BT33TF
BS 615 615 RS1BT33JQ
BS 616 737 RS1BT33TF
BS 738 751 RS1BT33JQ

RD RS1BT33JQ 751 0 0
GGAACCTAAACAAACAAATAAAAAACAGTCGAGGCTTTGTAACGAGAGAGAGAAATGGCG
ACGTCAGGAACATACGTGACGGAGGTTCCGTTAAAAGGGACGGTGGAGAAACATTACAGG
AGGTGGAGGAGCGAGAACCATGCCTTCCCGGAAGCCATCGGCCACCACATCCAAAATGTC
ACCATTCACGACGGCGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTTGGAACTACACATGC
GATGGGAAGCCAGAGGTATTCAAAGAAAGGAGAGAGATAGACGATGAGAAGAAAACGGTG
ACGTTTAGAGGACTTGAAGGTCACGTGATGGAGCAGCTCAAGGTGTATGACGTCATCTTG
GAGTTTATTCCCAAGTCCGAGGATGGCTGTGCCTGCAAAGTTACTATGATATGGGAGAAG
CGCAACGATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAATTTGCCAAGAGCATGGTTGCT
GACATGGACGACCATGTTCTCAAAGCTTAATTGTCATCATCATCATAATCGCCATCCAAA
TCATCACCATCACAATCACTCTCACCATGATCAATATCATCTCCATTACGAAATACTTAT
TAAGATTCTTTTCAATTCAATAAATGTGGTCTTGTGAAGTTTCATTTCTTTACAAGATCA
TGCTTTGATATGTTCTTGTGGTCATCGACCGGTTTGATATGTTATGCTTTGATATATTCC
AGTGTTATTAAGTTTGTCAAAGGTTTGTGGC

QA 1 751 1 751
DS 

RD RS1BT33TF 737 0 0
GGAACCTAAACAAACAAATAAAAAACAGTCGAGGCTTTGTAACGAGAGAGAGAAATGGCG
ACGTCAGGAACATACGTGACGGAGGTTCCGTTAAAAGGGACGGTGGAGAAACATTACAGG
AGGTGGAGGAGCGAGAACCATGCCTTCCCGGAAGCCATCGGCCACCACATCCAAAATGTC
ACCATTCACGACGGCGAATGGGACTCTCACGGGGCCATCAAGACTTGGAACTACACATGC
GATGGGAAGCCAGAGGTATTCAAAGAAAGGAGAGAGATAGACGATGAGAAGAAAACGGTG
ACGTTTAGAGGACTTGAAGGTCACGTGATGGAGCAGCTCAAGGTGTATGACGTCATCTTG
GAGTTTATTCCCAAGTCCGAGGATGGCTGTGCCTGCAAAGTTACTATGATATGGGAGAAG
CGCAACGATGAGTTCCCCGAACCAAGCAACTACATGAAATTTGCCAAGAGCATGGTTGCT
GACATGGACGACCATGTTCTCAAAGCTTAATTGTCATCATCATCATAATCGCCATCCAAA
TCATCACCATCACAATCACTCTCACCATGATCAATATCATCTCCATTACGAAATACTTAT
TAAGATTCTTTTCA*TTCAATAAATGTGGTCTTGTGAAGTTTCATTTCTTTACAAGATCA
TGCTTTGATATGTTCTTGTGGTCATCGACCGGTTTGATATGTTATGCTTTGATATATTCC
AGTGTTATTAAGTTTGT

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

CO CL7134Contig1 811 2 26 U
GCCAACCAATTGAGAATTTGCAGACAGTGTGTGGGCTGTTTTGTGTCTTTTCTGGGCCTC
CAAAGGATATTTCTTCTTCTCCTCACTCCCTTTCACTATTATTATAAACCCAGAAAACCA
TCTCCTCCTCCTGCTCCTCAATCATTCGTTTTCTCGATTTGCGATCTAATTCATAATCCA
AATTCTTATCCATTGACATGGCTCTCTCAACTCCTCTTTCTCAGATATCTGTTGCACTTC
CTATTGGAATTGATGGGTCGAGCCGATCTATGATTAAGGTGCAAAGTGTAAGCTTCACTG
AGAAGTCATGGGGTCCGCTTCTGAGATTAGATAAGGTACCTAGGAAACTGAGTTTGAAGA
AACGGCCCACAGTATGTATGTCACTTCAGCAGCAAGCTAGCAGATCCAAAGTCTCGGCTA
CTCCTCTAGAGCTTGAAGATCCCAAGGAGACTCCGTTGAACTTGTACAGGCCTAAGGAGC
CTTACACTGCAAAGATTGTCTCGGTTGAGAGAATCGTTGGCCCAAAAGCACCGGGAGAGA
CTTGCCACATTGTGATTGATCATGATGGGAAGGTTCCTTACTGGGAAGGACAGAGCTATG
GAGTGATCCCTCCTGGTGAGGATCCTAAGAAACCAGGTGCTCCTCACAATGTTCGGCTTT
ACTCTATTGCATCAACGAGATATGGTGATTCTTTTGATGGCAAGACGGCTAGCTTATGTG
TTCGCCGAGCTCAGTACTATGATCCAGAGACAGGAAAGGAAGATCCTTCCAAAGCTGGTG
TGTGTAGTAACTTCTTGTGCAATGCTAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BV58TF U 1
AF RS1EW10TF U 135
BS 1 189 RS1BV58TF
BS 190 190 RS1EW10TF
BS 191 226 RS1BV58TF
BS 227 227 RS1EW10TF
BS 228 370 RS1BV58TF
BS 371 371 RS1EW10TF
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BS 394 400 RS1BV58TF
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BS 419 532 RS1BV58TF
BS 533 533 RS1EW10TF
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BS 609 620 RS1BV58TF
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BS 622 674 RS1BV58TF
BS 675 675 RS1EW10TF
BS 676 702 RS1BV58TF
BS 703 703 RS1EW10TF
BS 704 707 RS1BV58TF
BS 708 708 RS1EW10TF
BS 709 743 RS1BV58TF
BS 744 811 RS1EW10TF

RD RS1BV58TF 743 0 0
GCCAACCAATTGAGAATTTGCAGACAGTGTGTGGGCTGTTTTGTGTCTTTTCTGGGCCTC
CAAAGGATATTTCTTCTTCTCCTCACTCCCTTTCACTATTATTATAAACCCAGAAAACCA
TCTCCTCCTCCTGCTCCTCAATCATTCGTTTTCTCGATTTGCGATCTAATTCATAATCCA
AATTCTTATTCATTGACATGGCTCTCTCAACTCCTCTTTCTCAGATGTCTGTTGCACTTC
CTATTGGAATTGATGGGTCGAGCCGATCTATGATTAAGGTGCAAAGTGTAAGCTTCACTG
AGAAGTCATGGGGTCCGCTTCTGAGATTAGATAAGGTACCTAGGAAACTGAGTTTGAAGA
AACGGCCCACTGTATGTATGTCACTTCAGCAGTAAGCTAGTAGATCCAAAGTCTCGGTTA
CTCCTCTAGAGCTTGAAGATCCCAAGGAGACTCCGTTGAACTTGTACAGGCCTAAGGAGC
CTTACACTGCAAAGATTGTCTCGGTTGAGAGAATCGTTGGCCCAAAAGCACCTGGAGAGA
CTTGCCACATTGTGATTGATCATGATGGGAAGGTTCCTTACTGGGAAGGACAGAGCTATG
GAGTGATTCCTCCTGGTGAG*ATCCTAAGAAACCAGGTGCTCCTCACAATGTTCGGCTTT
ACTCTATTGCATCA*CGAGATATGGTGATTCTTTTGATGGCA*GACG*CTAGCTTATGTG
TTCGCCGAGCTCAGTACTATGAT

QA 1 743 1 743
DS 

RD RS1EW10TF 677 0 0
GG
CTCAATCATTCGTTTTCTCGATTTGCGATCTAGTTCATAATCCAAATTCTTATCCATTGC
CATGGCTCTCTCAACTCCTCTTTCTCAGATATCTGTTGCACTTCCTATTGGAATTGATGG
GTCTAGCCGATCTATGATTAAGGTGCAAAGTGTAAGCTTCACTGAGAAGTCATGTGGTCC
GCTTCTGAGATTAGATACGGTATCTAGGAAACTGAGTTTGAAGAAACGGTCCACAGTATG
TATGTCACTTCAGCAGCAAGCTAGCAGATCCAAAGTCTCGGCTACTCCTCTAGAGCTTGA
AGATCCCAAGGAGACTCCGTTGAACTTGTACAGGCCTAAGGAGCCTTACACTGCAAAGAT
TGTTTCGGTTGAGAGAATCGTTGGTCCAAAAGCACCGGGTGAGACTTGCCACATTGTGAT
TGATCATGATGGGAAGGTTCCTTATTGGGAAGGACAGAGCTATGGAGTGATCCCTCCTGG
TGAGGATCCTAAGAAACCAGGTGCTCCTCACAATGTTCGGCTTTACTCTATTGCATCAAC
GAGATATGGTGATTCTTTTGATGGCAAGACGGCTAGCTTATGTGTTCGCCGAGCTCAGTA
CTATGATCCAGAGACAGGAAAGGAAGATCCTTCCAAAGCTGGTGTGTGTAGTAACTTCTT
GTGCAATGCTAAACC

QA 3 677 3 677
DS 



AS 1 2

CO CL7135Contig1 737 2 1 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGCCGAAAAG
CCATTGATATCACCAGGCCTAAAGGCCAGCAGTGCCTCACTGAATGGGTAATGAGTTCAT
CACATATGTTAGTTATCACCAAAGTAATAGTACTGATGCTGGTTGTCTATGATCTCAGGC
GCGTCCGCTACTGGAAGATTATGCGGTGGATGAACTTATCGATCCGAGGCTTGGGGACCG
TTTTGTAGAAAGTGAGGTCATTTGTATGCTTCATGCAGCTTCATTGTGCATACGTAGAGA
CCCACATTTGAGGCCACGCATGTCTCAGGTGTTGCGTATACTGGAAGGAGATATGATAGT
GGATGGGAACTACGGATCAACTCCAGGGTCAGACGCAGGCAACAGAAGTGGGCGGTTCTG
GGCGGAACATTACAGCGGTCAGATAACGAAAGATGGGTATGGGTCGGGTAGGTTCAGTGA
AAGGGTGTCTGTTGAAACGCCAAGACTAGCTTTACGGGAGAGGGAAAGAGGTCAGAGATT
CGAACTAAACGAGCAATACTAAGATGGGTAAAATCACATAACTGTGTCTTTAAGAAAAGT
TCAATTGTGTTAGGGGGTATTGAGGAAAGTCTCCCCTGTTTTGTTTTCAGTGATGTGGTC
CAAAGCTGGCAAGAAAGCTTTTTCTGACCCTCTTTGTTTGTATAGTGGGTAAGTTGCAAA
GGAAAAGTTACCAATAT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 

AF RS1A383TF U 1
AF RS1A383TV U 1
BS 1 737 RS1A383TF

RD RS1A383TF 737 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGCCGAAAAG
CCATTGATATCACCAGGCCTAAAGGCCAGCAGTGCCTCACTGAATGGGTAATGAGTTCAT
CACATATGTTAGTTATCACCAAAGTAATAGTACTGATGCTGGTTGTCTATGATCTCAGGC
GCGTCCGCTACTGGAAGATTATGCGGTGGATGAACTTATCGATCCGAGGCTTGGGGACCG
TTTTGTAGAAAGTGAGGTCATTTGTATGCTTCATGCAGCTTCATTGTGCATACGTAGAGA
CCCACATTTGAGGCCACGCATGTCTCAGGTGTTGCGTATACTGGAAGGAGATATGATAGT
GGATGGGAACTACGGATCAACTCCAGGGTCAGACGCAGGCAACAGAAGTGGGCGGTTCTG
GGCGGAACATTACAGCGGTCAGATAACGAAAGATGGGTATGGGTCGGGTAGGTTCAGTGA
AAGGGTGTCTGTTGAAACGCCAAGACTAGCTTTACGGGAGAGGGAAAGAGGTCAGAGATT
CGAACTAAACGAGCAATACTAAGATGGGTAAAATCACATAACTGTGTCTTTAAGAAAAGT
TCAATTGTGTTAGGGGGTATTGAGGAAAGTCTCCCCTGTTTTGTTTTCAGTGATGTGGTC
CAAAGCTGGCAAGAAAGCTTTTTCTGACCCTCTTTGTTTGTATAGTGGGTAAGTTGCAAA
GGAAAAGTTACCAATAT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RS1A383TV 732 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGCCGAAAAG
CCATTGATATCACCAGGCCTAAAGGCCAGCAGTGCCTCACTGAATGGGTAATGAGTTCAT
CACATATGTTAGTTATCACCAAAGTAATAGTACTGATGCTGGTTGTCTATGATCTCAGGC
GCGTCCGCTACTGGAAGATTATGCGGTGGATGAACTTATCGATCCGAGGCTTGGGGACCG
TTTTGTAGAAAGTGAGGTCATTTGTATGCTTCATGCAGCTTCATTGTGCATACGTAGAGA
CCCACATTTGAGGCCACGCATGTCTCAGGTGTTGCGTATACTGGAAGGAGATATGATAGT
GGATGGGAACTACGGATCAACTCCAGGGTCAGACGCAGGCAACAGAAGTGGGCGGTTCTG
GGCGGAACATTACAGCGGTCAGATAACGAAAGATGGGTATGGGTCGGGTAGGTTCAGTGA
AAGGGTGTCTGTTGAAACGCCAAGACTAGCTTTACGGGAGAGGGAAAGAGGTCAGAGATT
CGAACTAAACGAGCAATACTAAGATGGGTAAAATCACATAACTGTGTCTTTAAGAAAAGT
TCAATTGTGTTAGGGGGTATTGAGGAAAGTCTCCCCTGTTTTGTTTTCAGTGATGTGGTC
CAAAGCTGGCAAGAAAGCTTTTTCTGACCCTCTTTGTTTGTATAGTGGGTAAGTTGCAAA
GGAAAAGTTACC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7137Contig1 751 2 2 U
TTCTTTAGTTATCCATAATCCTCTCAGTCCCACGCAAAATCTGATTACATCTTTCATGCC
TAGATTCAGGCACAAACTCAATCAGATCCACTAAAGGATCTGTTATCACAAGAGAGCTAT
CACTAAACCTGTCTCTCCCAGGAACAACATGTCTCTCCCAAAAATCAACAAGCGTCGGTT
TCATCTCTCCCCAAAACACAGAATCTCTCTCAATCCTAAACAGACTGCTCCCGTTAACCG
TCCAACAATACAAATCCAACCAATCTCTCCCCACAATCTCCATCAAACCCTGAGCCTGTG
GAACATAATGCCACGGCACTTTCTTCCACGGATAACCCTCACCGTACGGACATTTCACTT
CAAGCATACCTTTCGACCCCTCGTTGACCAAACCGTACATGTCTCCATCGGGTGAAGCTC
CTAAACAGTCTTCATCTACCGTTAAAGTAATCTTGGTCCAACACGTGGCTGCGTTGCCTG
AAAATGGCTCTATCGCTCCGATTTTCTCTAACCAGAGCTGGACTCTGCGGTTTGGCCAGA
ACCCGATTGCTTGAGCGAAAGTACTCGATGTTAATCGATTCCTTCTTTGGGGCTCCCAGT
TCTTACGCCAATGTTGCATACAAGATGCCTCTGTAAATGAATTGGAGGGCGCAAAGGGTA
GCTAAGAGAGATCACAAACTGTGAAACTACAGTATTCAGAGATCTTTTATGTTTTTGAAC
GGACGGTCTGGTCTAACCGTGTCGGAGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
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AATGCCACGGCACTTTCTTCCACGGATAACCCTCACCGTACGGACATTTCACTTCAAGCA
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QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 2

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AF RS1AF22TF U 1
AF RS1AF22JQ C 495
BS 1 790 RS1AF22TF
BS 791 791 RS1AF22JQ
BS 792 820 RS1AF22TF
BS 821 821 RS1AF22JQ
BS 822 851 RS1AF22TF
BS 852 1426 RS1AF22JQ

RD RS1AF22TF 851 0 0
GGCTAGCATCTGCTGCTACTTTCTGGTCACCATGGCTTCATCAGCTGCTTTCTCTGCCCC
CAAACCATCTCTTCAGGGTTTCACTGAGTTCTCAGGATTGAGAAGCTCCTCTGCTTCTCT
TCCCTTCGGCAACAAGAAACTCTCTTCCGATGAGTTTGTCTCAGCCGTCACTTTCCAGAC
TTCTGCAATGGGAAGCAGTGGTGGATACAGGAAAGGTGTGACCGAGGCTAAACTAAAGGT
AGCCATCAATGGCTTCGGTAGGATCGGGAGGAACTTCTTGAGATGCTGGCATGGACGCAA
GGACTCTCCCTTTGATGTCATTGCCATCAACGACACTGGCGGTGTCAAGCAGGCTTCACA
TCTCCTTAAGTACGACTCTACTCTCGGAATCTTTGACGCTGATGTGAAACCTTCCGGAGA
CGCTGCTCTCTCTGTTGATGGAAAGATCATCAAGATTGTGTCTAACCGCAACCCTTCTCT
TCTCCCCTGGAAGGAGTTGGGGATAGACATTGTCATTGAAGGAACAGGAGTGTTTGCGGA
TAGAGGAGGCGCAGGGAAACACATTGAAGCTGGAGCCAAGAAGGTTATCATTACAGCTCC
AGGCAAAGGAGACATCCCAACTTATGTTGTTGGTGTCAACGCCCGATGCTTACAATCCTG
ATGAACCGATCATCAGCAATGCTTCTTGCACTACTAACTGTCTTGCTCCCTTTGTCAAAG
TTCTAGACCAGAAGTTCGGTATCATAAAGGGTACAATGACAACTACTCACTCATACACCG
GTGACCAGAG*TTACTAGACGCTAGCCACCGTGATCTAAG*AGAGCAAGAGCAGCTGCTT
TGAACATTGTT

QA 1 851 1 851
DS 

RD RS1AF22JQ 932 0 0
AGTTGGGGATAGACATTGTCATTGAAGGAACAGGAGTGTTTGCGGATAGAGGAGGCGCAG
GGAAACACATTGAAGCTGGAGCCAAGAAGGTTATCATTACAGCTCCAGGCAAAGGAGACA
TCCCAACTTATGTTGTTGGTGTCAACGCC*GATGCTTACAATCCTGATGAACCGATCATC
AGCAATGCTTCTTGCACTACTAACTGTCTTGCTCCCTTTGTCAAAGTTCTAGACCAGAAG
TTCGGTATCATAAAGGGTACAATGACAACTACTCACTCATACACCGGTGACCAGAGGTTA
CTAGACGCTAGCCACCGTGATTTAAGGAGAGCAAGAGCAGCTGCTTTGAACATTGTTCCC
ACATCTACAGGAGCAGCCAAAGCAGTGGCTCTTGTGCTCCCTAACCTCGAAGGAAAACTC
AACGGAATAGCTCTCCGTGTGCCGACACCAAATGTCTCAGTGGTTGATCTCGTTGTGCAG
GTCACCAAGAAGACTTTTGCAGAGGAAGTTAACGCTGCTTTCAGAGACTCTGCAGAGAAA
GAGCTTAAAGGTATCCTCGAAGTTTGCGATGAGCCGCTTGTGTCAGTTGATTTCAGATGC
TCGGATGTGTCGTCCACCATTGATTCTTCACTCACTATGGTGATGGGAGATGATATGGTT
AAGGTGATTGCTTGGTATGATAATGAATGGGGTTACTCACAGAGAGTTGTCGATCTCGCT
GACATTGTTGCCAACAACTGGAAGTGATTTGTAATGAAACCTCATGTTTTTTTCTCCTTT
TTCTGCATTCTGATTCTCAAAATATTGGTCAAGACTGTATAAACTATAGCCCTGAGTTGT
GGATTTGTAATAATGATAAAACTCAATTTAAACTTTTCACATTTGTACTTTTTTCTTACA
TGACGAGTTTACTTACACCATGTTGAAGATGT

QA 1 932 1 932
DS 



AS 1 2

CO CL7139Contig1 778 2 5 U
CCCACAAGGTTCCAAATGCAACAAACAGCTTGTGTGGGTATAAGATTGTGACCGGCCAGC
CATCAGATAGACTGGGGGAAGACTTCTCGGAGTCGAACAAGGACTTCACTGAGAGATTGA
CTACCGTTGAAGATCTAACCAAGACAACGATGAAAAAATTAACTCAGGGAATGACTGAGC
ACAACAAAGCCATGTCGGCTGCTAAGACAGATGAAGAGAAGGCAAGCGTTAAAACAAAGA
AGCAGAATACGACAACTGGACTTAGGACCTGTAATAACATATTGGCGATGACAAAGCCAC
TGCATGCAAAAGTGCCTTCATTTATCGGAGATACTAATATCAACCTTTCTTGGAAAGAAG
CCACAAAGCCGTTACCCTCTGCAACAACAACAATCGGAGGAAAACGACCTGCTAATAGCA
ACACTGGAAGTGGTAACAATGTCTCTGCAAAGAGGGGACGAGGTTCGAGTGGTATGTCAA
ACCAGCTTGTGAACAAGGCTTTTCAGGGAATATCATCTCACGGTGGTGGTAGAGGAGGAA
ACCGAAGACGCGGAGGTGGTCGCGGGAGAGGACAAGGAAGAGGTCACTGGTAACAATAAG
CTTCCATGAGTGGATTCCATATGACACTATGCTTATGTACTCTTTACATTTTCTATTTGT
CAGTAGGAGTTTTGGTTTGGTACTTGCTAGTTTGCTAGCTAGAGTTTGGGGACTTATCGC
ATCAGAACAAATCGTTGTGTCTTTCTTTATTCGCGATGGAGAATATTGATCTCGAGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BB53JQ C 1
AF RS1BB53TF U 7
BS 1 6 RS1BB53JQ
BS 7 726 RS1BB53TF
BS 727 727 RS1BB53JQ
BS 728 740 RS1BB53TF
BS 741 778 RS1BB53JQ

RD RS1BB53JQ 778 0 0
CCCACAAGGTTCCAAATGCAACAAACAGCTTGTGTGGGTATAAGATTGTGACCGGCCAGC
CATCAGATAGACTGGGGGAAGACTTCTCGGAGTCGAACAAGGACTTCACTGAGAGATTGA
CTACCGTTGAAGATCTAACCAAGACAACGATGAAAAAATTAACTCAGGGAATGACTGAGC
ACAACAAAGCCATGTCGGCTGCTAAGACAGATGAAGAGAAGGCAAGCGTTAAAACAAAGA
AGCAGAATACGACAACTGGACTTAGGACCTGTAATAACATATTGGCGATGACAAAGCCAC
TGCATGCAAAAGTGCCTTCATTTATCGGAGATACTAATATCAACCTTTCTTGGAAAGAAG
CCACAAAGCCGTTACCCTCTGCAACAACAACAATCGGAGGAAAACGACCTGCTAATAGCA
ACACTGGAAGTGGTAACAATGTCTCTGCAAAGAGGGGACGAGGTTCGAGTGGTATGTCAA
ACCAGCTTGTGAACAAGGCTTTTCAGGGAATATCATCTCACGGTGGTGGTAGAGGAGGAA
ACCGAAGACGCGGAGGTGGTCGCGGGAGAGGACAAGGAAGAGGTCACTGGTAACAATAAG
CTTCCATGAGTGGATTCCATATGACACTATGCTTATGTACTCTTTACATTTTCTATTTGT
CAGTAGGAGTTTTGGTTTGGTACTTGCTAGTTTGCTAGCTAGAGTTTGGGGACTTATCGC
ATCAGAACAAATCGTTGTGTCTTTCTTTATTCGCGATGGAGAATATTGATCTCGAGAC

QA 1 778 1 778
DS 

RD RS1BB53TF 734 0 0
AGGTTCCAAATGCAACAAACAGCTTGTGTGGGTATAAGATTGTGACCGGCCAGCCATCAG
ATAGACTGGGGGAAGACTTCTCGGAGTCGAACAAGGACTTCACTGAGAGATTGACTACCG
TTGAAGATCTAACCAAGACAACGATGAAAAAATTAACTCAGGGAATGACTGAGCACAACA
AAGCCATGTCGGCTGCTAAGACAGATGAAGAGAAGGCAAGCGTTAAAACAAAGAAGCAGA
ATACGACAACTGGACTTAGGACCTGTAATAACATATTGGCGATGACAAAGCCACTGCATG
CAAAAGTGCCTTCATTTATCGGAGATACTAATATCAACCTTTCTTGGAAAGAAGCCACAA
AGCCGTTACCCTCTGCAACAACAACAATCGGAGGAAAACGACCTGCTAATAGCAACACTG
GAAGTGGTAACAATGTCTCTGCAAAGAGGGGACGAGGTTCGAGTGGTATGTCAAACCAGC
TTGTGAACAAGGCTTTTCAGGGAATATCATCTCACGGTGGTGGTAGAGGAGGAAACCGAA
GACGCGGAGGTGGTCGCGGGAGAGGACAAGGAAGAGGTCACTGGTAACAATAAGCTTCCA
TGAGTGGATTCCATATGACACTATGCTTATGTACTCTTTACATTTTCTATTTGTCAGTAG
GAGTTTTGGTTTGGTACTTGCTAGTTTGCTAGCTAGAGTTTGGGGACTTATCGCATCAGA
*CAAATCGTTGTGT

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL7140Contig1 757 2 2 U
GGACATCAATGGCGGCTGCCGAGGAAGAGGTGACAACGACGGATGTTAAGGAAGGCGCTA
ACCTATTGGGGAAACCAAAGTACAAGAAACTCGAGAACGGGAGATTCAGATGCGTGCAAA
CAGGTCACGAGCTACTACAGGAAGACAAGGTGGTGTATTCAGAGAGTAAACGGTGCCGTT
TAGGGCTTATCGATCATGCTTTATCCCACAGCAAGCCACCACTTAACTTGTTCGAACAAG
ACCAGAGCTCTCGCTCGAAACTGAAATGTAAGCTAACGGGTGATACGGTGAACAAGACTG
AGGAACATATTTGGAAGCACATCAATGGACGACGCTTCCTCAACAAGTTAGAAGAGAAGG
AAAGAGAGAAAGAGTCTGGTGCTATTCCAGAAGAAGGTGGAGAAACTGTGGTTAAGGAGA
ATGGCGTAAAGGAAGAAAAGAAGAAGAATAAAAAGAATAAGAAGAAAAACAAGAAGTTAG
TTGAGAAGGAAGAGGATGGAGAGGATGTTGCTATGGATGAACTCGAACATGAGAATGCTG
AAGATGTTGAGGAGAGAGAGCTTGACTTTTGGATGCCACCAGATGGAGAGAGGTGGGACT
TTGATGATGGAGGAGACCGGTGGGGATCAGATTCAGAAGAGGACGATGAAAAGAATGTGG
AAGAGATCCAATAGTAGTGAGATCGATGAAGATGGAAAGAGTAGCTTGGATGAGTGCATA
ATAGTGAAGTTGATGAAGATGGCGAAATTAGTCTGGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E640TF U 1
AF RS1G140TF U 1
BS 1 206 RS1E640TF
BS 207 757 RS1G140TF

RD RS1E640TF 206 0 0
GGACATCAATGGCGGCTGCCGAGGAAGAGGTGACAACGACGGATGTTAAGGAAGGCGCTA
ACCTATTGGGGAAACCAAAGTACAAGAAACTCGAGAACGGGAGATTCAGATGCGTGCAAA
CAGGTCACGAGCTACTACAGGAAGACAAGGTGGTGTATTCAGAGAGTAAACGGTGCCGTT
TAGGGCTTATCGATCATGCTTTATCC

QA 1 206 1 206
DS 

RD RS1G140TF 757 0 0
GGACATCAATGGCGGCTGCCGAGGAAGAGGTGACAACGACGGATGTTAAGGAAGGCGCTA
ACCTATTGGGGAAACCAAAGTACAAGAAACTCGAGAACGGGAGATTCAGATGCGTGCAAA
CAGGTCACGAGCTACTAGAGGAAGACAAGGTGGTGTATTCAGAGAGTAAACGGTGCCGTT
TAGGGCTTATCGATCATGCTTTATCCCACAGCAAGCCACCACTTAACTTGTTCGAACAAG
ACCAGAGCTCTCGCTCGAAACTGAAATGTAAGCTAACGGGTGATACGGTGAACAAGACTG
AGGAACATATTTGGAAGCACATCAATGGACGACGCTTCCTCAACAAGTTAGAAGAGAAGG
AAAGAGAGAAAGAGTCTGGTGCTATTCCAGAAGAAGGTGGAGAAACTGTGGTTAAGGAGA
ATGGCGTAAAGGAAGAAAAGAAGAAGAATAAAAAGAATAAGAAGAAAAACAAGAAGTTAG
TTGAGAAGGAAGAGGATGGAGAGGATGTTGCTATGGATGAACTCGAACATGAGAATGCTG
AAGATGTTGAGGAGAGAGAGCTTGACTTTTGGATGCCACCAGATGGAGAGAGGTGGGACT
TTGATGATGGAGGAGACCGGTGGGGATCAGATTCAGAAGAGGACGATGAAAAGAATGTGG
AAGAGATCCAATAGTAGTGAGATCGATGAAGATGGAAAGAGTAGCTTGGATGAGTGCATA
ATAGTGAAGTTGATGAAGATGGCGAAATTAGTCTGGA

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

CO CL7141Contig1 1042 2 2 U
GGAGACACAAAAAAAATCGCTCAAACCCTACCCTCCTCTCTTCTCCCATCGACTCTTCTC
CCATTCGTCTCTTCGCCCATCCAACAGTCCTCTCCCAATCACCACCACGACCATCACCAC
AGTCCTCTCCCCTCCGTCAGCCTCTACACCTTATCTCTGCCTACCTCGTCTCCGTCTACC
TTGTCTCCTCCTCGGCACCGTAATATCTCTCTCTCTCTTTCCCTCTCTCTGCAAAACCCA
AGTCTCTGTTCAGGTCTAGCTTCTTCGATTTCTTCATCCTGAAACCCTAATTTCACACAA
TGAAGAATAAAGGTATAGGTTTCAAGGGTGTTAAACAAAGAGAGCTCTAATCGGAGCGGG
TGGTCAGATCCTGTTCTACCCGACTCTTATGTACAATCTCCTCCGCTTCAAGCTACAGTC
TCAGTTTCGATGAATAACCCGAGCTATGGACTTCATTCACAAGAAGGCTTTGCTCCGTAA
AACAACTTACGTCCATTGTGGGTGTCTGCTTGATAAGACCGCGGGTGGGAACAGAACCAA
GGCTAGGAAAGTACTTTGTCTAAAGAGTCTCAGCCACTTAAGCTTAAGACTGAAAAGAGT
CTCAATCAAATTCTTGGATCAGGAAGAGGGAGTAGCCATGTCTCATGAGGAAAAACGAGT
TGAAGAATCTATGGATGTCTGGAGAAGACTTACTTTGCATGGTGATCATATTGCTAATGG
TCCTAGCTTGAAGACACTGATGAATCTTGTGCGGATTCAAGATATCATTCTTATCAGCGA
CAACTTTGATGCTAAGCTGATGGGGGGCGTCAGCTCGGGATATTTTTTTTGAGAGATATA
TCAGCTAACAATCTAAGCGTCCTTCAATGGAGAGTTTATCATGGAGAAGAAGATGAAGGA
GAAGAAGAAGAAGAAGAAAGTTATGGTTTATTTTTTTTCGTTTGACTTAGACTTTTTATT
TATTTTTGTTCTAGCTTTGTAAACTGAAATTTAATTGTAAATCAATTTCAGCTTATAAAT
AAAATTTATTTTATTTTAATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DF57TF U 1
AF RS1DF57JQ C 378
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AGTCCTCTCCCCTCCGTCAGCCTCTACACCTTATCTCTGCCTACCTCGTCTCCGTCTACC
TTGTCTCCTCCTCGGCACCGTAATATCTCTCTCTCTCTTTCCCTCTCTCTGCAAAACCCA
AGTCTCTGTTCAGGTCTAGCTTCTTCGATTTCTTCATCCTGAAACCCTAATTTCACACAA
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TGGTCAGATCCTGTTCTACCCGACTCTTATGTACAATCTCCTCCGCTTCAAGCTACAGTC
TCAGTTTCGATGAATAACCCGAGCTATGGACTTCATTCACAAGAAGGCTTTGCTCCGTAA
AACAACTTACGTCCATTGTGGGTGTCTGCTTGATAAGACCGCGGGTGGGAACAGAACCAA
GGCTAGGAAAGTAC

QA 1 554 1 554
DS 

RD RS1DF57JQ 665 0 0
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CCCGAGCTATGGACTTCATTCACAAGAAGGCTTTGCTCCGTAAAACAACTTACGTCCATT
GTGGGTGTCTGCTTGATAAGACCGCGGGTGGGAACAGAACCAAGGCTAGGAAAGTACTTT
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TCTGGAGAAGACTTACTTTGCATGGTGATCATATTGCTAATGGTCCTAGCTTGAAGACAC
TGATGAATCTTGTGCGGATTCAAGATATCATTCTTATCAGCGACAACTTTGATGCTAAGC
TGATGGGGGGCGTCAGCTCGGGATATTTTTTTTGAGAGATATATCAGCTAACAATCTAAG
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AAGTTATGGTTTATTTTTTTTCGTTTGACTTAGACTTTTTATTTATTTTTGTTCTAGCTT
TGTAAACTGAAATTTAATTGTAAATCAATTTCAGCTTATAAATAAAATTTATTTTATTTT
AATAT

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

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TTTTTTGGGGTAAAATACAGCATCTAAGTTCCTCTGCTTTTATTTTCTTAGATTGGTAAA
CATAACTAACAGACATCTTCTACAATAGTCTGGCGCTTCCACAATTTTTTTTTTTCAAAT
ATTTCGACTTAGAAGAAATTTTCCTCATTGAAGAACTTTGGAGGAAAGAAAAAAGGTTTT
TAAGCGTTTGCTACAAAACACACATAGCAACGACGGGTAGAGCTCACCCTATGGACGGTG
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ATAAAGTTGAAGTTCCTCCGAAGCAAAACCTGTTCAATGAGTTCATGTACACTTTCAAAG
AAACCTTCTTCCACGATGATCCTCTTAGGGATTTCAAGGACCAGTCACTGTCCAAGAAGC
TCATGCTCGGGCTCCAGTCTGTCTTCCCGGTTTTCGAATGGGGACGAAAGTACAATCTCA
AGATGATTCGTGGAGATCTTATTGCCGGTTTAACCATAGCCAGTCTGTGCATTCCTCAGG
ATATTGGATATGCAAAGCTCGCAGGTCTCGACCCTAAGCATGGTCTATGTAAGTTAAATC
AGCCTCAATCTCATTTGATGCTCATAATTAAGCTAAGATTATTGTATGTTGCGTTGTATC
TTTTATTTAGAAGTAACTACTGTTTTACTAGATGTTTTGCCATACAGACTTAGTCTGTCT
TACTAATAGTTATTAATATAT


BQ
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AF RS1C270TF U 1
AF RS1C270JQ C 8
BS 1 727 RS1C270TF
BS 728 741 RS1C270JQ

RD RS1C270TF 727 0 0
TTTTTTGGGGTAAAATACAGCATCTAAGTTCCTCTGCTTTTATTTTCTTAGATTGGTAAA
CATAACTAACAGACATCTTCTACAATAGTCTGGCGCTTCCACAATTTTTTTTTTTCAAAT
ATTTCGACTTAGAAGAAATTTTCCTCATTGAAGAACTTTGGAGGAAAGAAAAAAGGTTTT
TAAGCGTTTGCTACAAAACACACATAGCAACGACGGGTAGAGCTCACCCTATGGACGGTG
AAGGAGAGCCTTCGGCGGTGGATATGTCTTCCCCGAGGCAGACAAACACACCGTTTGTCC
ATAAAGTTGAAGTTCCTCCGAAGCAAAACCTGTTCAATGAGTTCATGTACACTTTCAAAG
AAACCTTCTTCCACGATGATCCTCTTAGGGATTTCAAGGACCAGTCACTGTCCAAGAAGC
TCATGCTCGGGCTCCAGTCTGTCTTCCCGGTTTTCGAATGGGGACGAAAGTACAATCTCA
AGATGATTCGTGGAGATCTTATTGCCGGTTTAACCATAGCCAGTCTGTGCATTCCTCAGG
ATATTGGATATGCAAAGCTCGCAGGTCTCGACCCTAAGCATGGTCTATGTAAGTTAAATC
AGCCTCAATCTCATTTGATGCTCATAATTAAGCTAAGATTATTGTATGTTGCGTTGTATC
TTTTATTTAGAAGTAACTACTGTTTTACTAGATGTTTTGCCATACAGACTTAGTCTGTCT
TACTAAT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1C270JQ 734 0 0
GGGTAAAATACAGCATCTAAGTTCCTCTGCTTTTATTTTCTTAGATTGGTAAACATAACT
AACAGACATCTTCTACAATAGTCTGGCGCTTCCACAATTTTTTTTTTTCAAATATTTCGA
CTTAGAAGAAATTTTCCTCATTGAAGAACTTTGGAGGAAAGAAAAAAGGTTTTTAAGCGT
TTGCTACAAAACACACATAGCAACGACGGGTAGAGCTCACCCTATGGACGGTGAAGGAGA
GCCTTCGGCGGTGGATATGTCTTCCCCGAGGCAGACAAACACACCGTTTGTCCATAAAGT
TGAAGTTCCTCCGAAGCAAAACCTGTTCAATGAGTTCATGTACACTTTCAAAGAAACCTT
CTTCCACGATGATCCTCTTAGGGATTTCAAGGACCAGTCACTGTCCAAGAAGCTCATGCT
CGGGCTCCAGTCTGTCTTCCCGGTTTTCGAATGGGGACGAAAGTACAATCTCAAGATGAT
TCGTGGAGATCTTATTGCCGGTTTAACCATAGCCAGTCTGTGCATTCCTCAGGATATTGG
ATATGCAAAGCTCGCAGGTCTCGACCCTAAGCATGGTCTATGTAAGTTAAATCAGCCTCA
ATCTCATTTGATGCTCATAATTAAGCTAAGATTATTGTATGTTGCGTTGTATCTTTTATT
TAGAAGTAACTACTGTTTTACTAGATGTTTTGCCATACAGACTTAGTCTGTCTTACTAAT
AGTTATTAATATAT

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

CO CL7143Contig1 768 2 4 U
GCTTATAAAAGACCCCTTGGAAAATTAGAACCAAACCGTTCCAAAAGAGTAAAAACAATT
AAAAAAGTTGACAAAAAAAACAAATATGTTGACAAGAGATGCATTAAAATAAATAAAAAC
AACCCAAAAACTGAGAGAGAGATAAAGACTCATCATGCCTTGTGTTTCCTTGAAATGTTA
TCTTATCTCTCTCCAGGACAATGATAAATAGACCCAAAAAGACACATTCATAACCATATA
TACAGCAACCATATTCCAGGGGAGAAGAGAACAGTACTGTGTAGCCAAAGGGGTTTGGCC
ATTCTGGTCGAACTGGATAGGTTTCATATTGCTTGAGATGTGGGACAGATCACAACAACA
AAATAGTGTTCTGAGGCATTCGTTTTCTACACTTCTCTTGTTTTGGCTCTTTTCATACCC
AGGCTACTGAAAGGAGAAACAGAACCAGACATTGGAGATCCTCCTCCTTCACGAAGACTT
CCATTGAGCAATGCTAGCTCTCGCAGCTGTTGTTTCTTGTAAAAGTCATGAGTTTCCTCC
ATAGGAGTAAGAAGTTCATCTAGTACTTCACGAGCTTGCATGAGACGTGCATCGACTATT
TCAATAGGTAACTCAGCTTCGACTAAGATATGAAGTGGCTCACTTAAGTGCTCAAATCCA
GGCTTTCCTCTCATCATTTCCTCCTTAAATTGATCTTTAATACTGCCTCTTCCTCTTATA
AGAAAACGGCAACCAGTACTTGCTTCAACTCGCGTCAGTGAGTTTCCT


BQ
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AF RS1B067JQ U 27
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DS 

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AACTCGCTTCAGTGAGTTTCCT

QA 1 742 1 742
DS 



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BQ
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TGGTCAAACAGTGATGCCCCTTTTCTATGAAGTGGATCCAACTGATGTAAAGAAGCAGAC
CGGTGATTTTGGGAAGGTCTTCCG

QA 1 504 1 504
DS 



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AF RS1BG10TF U 1
AF RS1BG10JQ C 174
BS 1 725 RS1BG10TF
BS 726 888 RS1BG10JQ

RD RS1BG10TF 727 0 0
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ACCGTGTCATCTTCCTATTTTCTAGGATGTTTTGGACTCTCCCGGAAAATATACTCCGAC
AAGGCGATGGTTGCGGCGGATGAGGGTTGCGAGATGAAGGTGAAGAAGAAAAAGAGGCGA
AGTCGGTGGCTTTTATGTTCCAAGTTTCGCTTAAAGAACAGAGAGATCAAACCGGCGCCC
ATCGAGGAAATGGAGAAACCAACTTTGAGTGTAGAAGCTGATAAGAAGAAACTCGTTTCG
CCGATAAGTCGTATGACCAATGATGATAAGGCCGTGAATCAGGACAAAGAAGAGACAAAA
CCGAATGACTTACAAGACGTAACCACCGACCGATCAAATCCCATTGAACTGTTGGCTTCC
TCTAGAGAAGACACGTGTTCCGAAGGTATACCCAACATGAAACCGTCTCAGGAGAAAACC
GGGTCACGGGTCGGAAAGTTTGATCCGGTTATTGGAATTTCGGTCATTATATTGACGCTG
GTGATCATGTTAGTTTGGGGTCGACTCTTTGCGATTCTCTGTACATCCGCTTGGTGTTAT
TCTATACCTCGTCTCAGAAACGTGGCCGCGTTGGTAAAACGCAGCGCTGGCGACGGTTCT
GCACGGTTTGAATTCTGAGTCGTATAAAAGAAAAGTCGTTTCGGACGCCTTTCTTGGACG
GCAAA
TC

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1BG10JQ 715 0 0
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GGCGCCCATCGAGGAAATGGAGAAACCAACTTTGAGTGTAGAAGCTGATAAGAAGAAACT
CGTTTCGCCGATAAGTCGTATGACCAATGATGATAAGGCCGTGAATCAGGACAAAGAAGA
GACAAAACCGAATGACTTACAAGACGTAACCACCGACCGATCAAATCCCATTGAACTGTT
GGCTTCCTCTAGAGAAGACACGTGTTCCGAAGGTATACCCAACATGAAACCGTCTCAGGA
GAAAACCGGGTCACGGGTCGGAAAGTTTGATCCGGTTATTGGAATTTCGGTCATTATATT
GACGCTGGTGATCATGTTAGTTTGGGGTCGACTCTTTGCGATTCTCTGTACATCCGCTTG
GTGTTATTCTATACCTCGTCTCAGAAACGTGGCCGCGTTGGTAAAACGCAGCGCTGGCGA
CGGTTCTGCACGGTTTGAATTTTGAGTCGTATAAAAGAAAAGTCGTTTCGGACGCCTTTC
TTGGACGGCAAAATCGCGTTTCGTTGTTGTGACGATCGATCTATTGTTTTTTCTCTATAT
ATTATAATTGTATCCTCACTTTTTTTAAAGCATGGATAGACATTATCTCCATTTTCGGTT
GTGAATGGATAGATCAAATCAATAATATATTGTCTGTGGTTTTTATAAAAAAAAA

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

CO CL7146Contig1 828 2 8 U
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GATGATGATGATGATGAGAGTGCAGAGTCTAATGAGGAGGAAGAAGACAGCGAAGAAGTA
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GAGGAGATAGCCAATATTGAAAAAGAAACTCACAGACTGGCTATTGTCAACATTGACTGG
ATACATATTACTGCCATAGACTTGTACGTTGTTCTCGATTCTTCCTCAAGAAAGATGGGC
GCGTCTTGTCTGTTGCGGTCTATCCTACAGAGTTTGGGCTTGAGCGAATGAAACATGAGG
AAATGCATGGTCCTCTTGCTATTATTCGTGGTGGAGACAAAAAGAAGGAAGAAAATGATG
ACGATGGAGATGAAGACAAGGAGGCAATCAATGAGAGAATACGTGAATACGAAAAAAGTA
AATTTAAGTACTACGTTGGTGTTGTGGAATGTGATTCTAGTGCTACTGCTGATTACTTGT
ACAAATCATGTGATGGATTTGAGTTTCAAAGATCCTCTAACAAGCTCGACTTGAGATTTA
TTCCCGACTCCATTGGTTTCAATCATCCGCCTCGTGTATTGCCACCGAGGCACCTGCTAA
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GGATGAAGATGAGCCGCACCGCGTGAATACCTTAACCCAGAAATTCAACCCTGATCAGTT
GGCAGACCTTGAGTTGAAGGAGTTTTTAGCTTCTTATGAGAGTGAATC


BQ
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AF RS1AS85TF U 1
AF RS1AS85JQ C 2
BS 1 706 RS1AS85TF
BS 707 707 RS1AS85JQ
BS 708 708 RS1AS85TF
BS 709 710 RS1AS85JQ
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RD RS1AS85TF 746 0 0
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GAGGAGATAGCCAATATTGAAAAAGAAACTCACAGACTGGCTATTGTCAACATTGACTGG
ATACATATTACTGCCATAGACTTGTACGTTGTTCTCGATTCTTCCTCAAGAAAGATGGGC
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AAATGCATGGTCCTCTTGCTATTATTCGTGGTGGAGACAAAAAGAAGGAAGAAAATGATG
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AATTTAAGTACTACGTTGGTGTTGTGGAATGTGATTCTAGTGCTACTGCTGATTACTTGT
ACAAATCATGTGATGGATTTGAGTTTCAAAGATCCTCTAACAAGCTCGACTTGAGATTTA
TTCCCGACTCCATTGGTTTCAATCATCCGCCTCGTGTATTGCCACCGAGGCACCTGCTAA
TTATCAAGCTTTGGATTTTCAAAGCCAAGCATTGCAGATGAGTAAGTT**ATATTTCTTG
GGATGA*GATGAGCCGCAC
GCGTGAA

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1AS85JQ 827 0 0
GGAAGCAGAGTAAGAGTGAGAAGAAGCTTGCTTTTAATTCGGATGAAGAAGAATCTGATG
ATGATGATGATGATGAGAGTGCAGAGTCTAATGAGGAGGAAGAAGACAGCGAAGAAGTAT
TCGAAGAGGACGATGAAGCAGTTGTGCATGAGGACAGTGAACCCGAAATTCCGGAAGAGG
AGGAGATAGCCAATATTGAAAAAGAAACTCACAGACTGGCTATTGTCAACATTGACTGGA
TACATATTACTGCCATAGACTTGTACGTTGTTCTCGATTCTTCCTCAAGAAAGATGGGCG
CGTCTTGTCTGTTGCGGTCTATCCTACAGAGTTTGGGCTTGAGCGAATGAAACATGAGGA
AATGCATGGTCCTCTTGCTATTATTCGTGGTGGAGACAAAAAGAAGGAAGAAAATGATGA
CGATGGAGATGAAGACAAGGAGGCAATCAATGAGAGAATACGTGAATACGAAAAAAGTAA
ATTTAAGTACTACGTTGGTGTTGTGGAATGTGATTCTAGTGCTACTGCTGATTACTTGTA
CAAATCATGTGATGGATTTGAGTTTCAAAGATCCTCTAACAAGCTCGACTTGAGATTTAT
TCCCGACTCCATTGGTTTCAATCATCCGCCTCGTGTATTGCCACCGAGGCACCTGCTAAT
TATCAAGCTTTGGATTTTCAAAGCCAAGCATTGCAGATGAGTAAGGTTAATATTTCTTGG
GATGAAGATGAGCCGCACCGCGTGAATACCTTAACCCAGAAATTCAACCCTGATCAGTTG
GCAGACCTTGAGTTGAAGGAGTTTTTAGCTTCTTATGAGAGTGAATC

QA 1 827 1 827
DS 



AS 1 2

CO CL7147Contig1 861 2 10 U
GCATCGTTGCTGCAATGAACGCTGCTGGAACGGTGGTGGGGATCTACTTCATCGATCATT
GTGGACGGAAGAAGCTTGCTCTCTCGATTTTATGCGGTGTCATTGTATCTCTCATTATCC
TCTCAGTCTCGTTCTTGAAACAATCTGATGTATCTACTGATGGAGGGATCTACGGTTGGC
TCGCTGTGCTTGGCTTAGCTCTGTACATTGCGTTCTTTGCACCGGGAATGGGACCGGTTC
CGTGGACGGTGAACTCGGAGATATATCCACAACAGTACCGAGGCATATGCGGAGGCATGT
CTGCGACGGTTAACTGGATTAGCAACTTGATTGTGGCACAAACATTCTTGTCAATAGCAG
AAGCTGCTGGTACAGGAGTTACTTTCTTGATTTTGGCGGGAATCGCGGTTCTTGCGGTTG
TCTTTGTGATTGTGTTCGTCCCCGAGACTCAGGGGCTGACGTTTTCTGAAGTTGAGCAGA
TTTGGAAAGAGAGAGCTTGGGGTAGTAGCAGAGATAGCAACAACATGGAGGGGTTACTCG
AGCAAGGGTCTCGGTCTTAAGTGCTACATGCTCATACATGGTGGTATCACACAGTCTCCA
GAGTAAACCAAGATCGGTTCCGGTTTAGCTCAGTGATATGTAATGCGATACTTGAATTGG
TATAGTATGTTAGGAACTGTGTTTGTTATTATATACGTTTAGGGTCCACTTTGGATTCCA
GTCTTTTCTGTGTCTTATGTTCTAGAGATTTCTTGTCTATAACTCCCTGTATGATGCATG
TGTTTATGGTCAAAAGGTCTAAGCATAGAGAATAGGGCATTGAATACATGAATGTTGAAT
CACAAACATAAGACTTTTCAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CH68TF U 1
AF RS1CH68JQ C 34
BS 1 703 RS1CH68TF
BS 704 704 RS1CH68JQ
BS 705 716 RS1CH68TF
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BS 718 726 RS1CH68TF
BS 727 727 RS1CH68JQ
BS 728 750 RS1CH68TF
BS 751 751 RS1CH68JQ
BS 752 784 RS1CH68TF
BS 785 861 RS1CH68JQ

RD RS1CH68TF 784 0 0
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GTGGACGGAAGAAGCTTGCTCTCTCGATTTTATGCGGTGTCATTGTATCTCTCATTATCC
TCTCAGTCTCGTTCTTGAAACAATCTGATGTATCTACTGATGGAGGGATCTACGGTTGGC
TCGCTGTGCTTGGCTTAGCTCTGTACATTGCGTTCTTTGCACCGGGAATGGGACCGGTTC
CGTGGACGGTGAACTCGGAGATATATCCACAACAGTACCGAGGCATATGCGGAGGCATGT
CTGCGACGGTTAACTGGATTAGCAACTTGATTGTGGCACAAACATTCTTGTCAATAGCAG
AAGCTGCTGGTACAGGAGTTACTTTCTTGATTTTGGCGGGAATCGCGGTTCTTGCGGTTG
TCTTTGTGATTGTGTTCGTCCCCGAGACTCAGGGGCTGACGTTTTCTGAAGTTGAGCAGA
TTTGGAAAGAGAGAGCTTGGGGTAGTAGCAGAGATAGCAACAACATGGAGGGGTTACTCG
AGCAAGGGTCTCGGTCTTAAGTGCTACATGCTCATACATGGTGGTATCACACAGTCTCCA
GAGTAAACCAAGATCGGTTCCGGTTTAGCTCAGTGATATGTAATGCGATACTTGAATTGG
TATAGTATGTTAGGAACTGTGTTTGTTATTATATACGTTTAGG*TCCACTTTGGAT*CCA
GTCTTT*CTGTGTCTTATGTTCTAGAGATT*CTTGTCTATAACTCCCTGTATGATGCATG
TGTT

QA 1 784 1 784
DS 

RD RS1CH68JQ 828 0 0
GGGGT
GGGATCTACTTCATCGATCATTGTGGACGGAAGAAGCTTGCTCTCTCGATTTTATGCGGT
GTCATTGTATCTCTCATTATCCTCTCAGTCTCGTTCTTGAAACAATCTGATGTATCTACT
GATGGAGGGATCTACGGTTGGCTCGCTGTGCTTGGCTTAGCTCTGTACATTGCGTTCTTT
GCACCGGGAATGGGACCGGTTCCGTGGACGGTGAACTCGGAGATATATCCACAACAGTAC
CGAGGCATATGCGGAGGCATGTCTGCGACGGTTAACTGGATTAGCAACTTGATTGTGGCA
CAAACATTCTTGTCAATAGCAGAAGCTGCTGGTACAGGAGTTACTTTCTTGATTTTGGCG
GGAATCGCGGTTCTTGCGGTTGTCTTTGTGATTGTGTTCGTCCCCGAGACTCAGGGGCTG
ACGTTTTCTGAAGTTGAGCAGATTTGGAAAGAGAGAGCTTGGGGTAGTAGCAGAGATAGC
AACAACATGGAGGGGTTACTCGAGCAAGGGTCTCGGTCTTAAGTGCTACATGCTCATACA
TGGTGGTATCACACAGTCTCCAGAGTAAACCAAGATCGGTTCCGGTTTAGCTCAGTGATA
TGTAATGCGATACTTGAATTGGTATAGTATGTTAGGAACTGTGTTTGTTATTATATACGT
TTAGGGTCCACTTTGGATTCCAGTCTTTTCTGTGTCTTATGTTCTAGAGATTTCTTGTCT
ATAACTCCCTGTATGATGCATGTGTTTATGGTCAAAAGGTCTAAGCATAGAGAATAGGGC
ATTGAATACATGAATGTTGAATCACAAACATAAGACTTTTCAT

QA 6 828 6 828
DS 



AS 1 2

CO CL7148Contig1 767 2 2 U
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GCTTAGTGGATTGGGTTCTACTGTCTCGATCAAAAGGGGAAGCAGCGTCGGCCGTATAGA
TATGAGAGTTGGCTGGAAGAATGTGATCATTCCACCTCAGCGCAAGAAGTCGTGGGTCAT
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GGAAAAAGCCAAAGTGATGGAGGAAGAAGCTGTTTCAATTACAGAAAAAGCCAAAGATTT
CGTAGTTGAAAAAACAGGTGAAGCTAAAGATTTCATCATCGAAAAAGCTGGTGAAGCCAA
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AAAAAAAACTGTATAATCAGTGGTTTGTCTTTACTGAAATTTAATTC


BQ
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AF RS1E791TF U 1
AF RS1FV65TF U 1
BS 1 728 RS1E791TF
BS 729 767 RS1FV65TF

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GCTTAGTGGATTGGGTTCTACTGTCTCGATCAAAAGGGGAAGCAGCGTCGGCCGTATAGA
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AAAAAAAA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1FV65TF 767 0 0
GGACATCTTAAGAGAGAAGGCAAGAGGTGGCCTCATGGCAACTTTGATCTCCGGAGCTAT
GCTTAGTGGATTGGGTTCTACTGTCTCGATCAAAAGGGGAAGCAGCGTCGGCCGTATAGA
TATGAGAGTTGGCTGGAAGAATGTGATCATTCCACCTCAGCGCAAGAAGTCGTGGGTCAT
GGCCGCCGTGAAAGATGATGATGGCAACTCAAAGCTAGATCCAAAATGGCTCGATGATGC
CTCAGAGAAAGCTTCCGAGTACGTGAAGGAGAAAGGAAGCGAAGTTGGACACTTGACTGC
ACATGAAGGACAAGAGGTTTTAGATCACATACAAAGAGCAAAACACTACTTTATGGAGAA
AGCTGGTGTAGCCATGGACATGGTGACTGAAAATGCTCACACAGCTTCAGATTTTGTGGC
GGAAAAAGCCAAAGTGATGGAGGAAGAAGCTGTTTCAATTACAGAAAAAGCCAAAGATTT
CGTAGTTGAAAAAACAGGTGAAGCTAAAGATTTCATCATCGAAAAAGCTGGTGAAGCCAA
AGAGTTGGCGACGGATATGAGCAAAAAAACGGCTATATACATTGGAGAGAAAGCAGCCGA
GGCAAAAGAAGCGATATTGCCTCCAAATTCTGAAGAATAGATTGTATTTGTTTAGAGCCC
TAACGTCTAAACAAATACAAGTGTTGATATACAAAACATACTTTTTATCACGTGGAATAT
AAAAAAAACTGTATAATCAGTGGTTTGTCTTTACTGAAATTTAATTC

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL7149Contig1 702 2 2 U
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TATGTAAAACTAAAAAATGATCGAGTTTGTATTGGGACTTTTGTGCAGAGGAGGAGGAGA
CGACCATGAGCAGAGATCATCATCATACCGGAGCCACTTGATTTCTTCATCTGGACTGTT
GAGGATGTTGGATCTTGGCTTGAGGAGATAAACCTTGGCAACTACCGTCAGATGTTCAAA
GAAAATGGTATCAACGGAGAATGTCTAGAAAATGTCCGTGTTCACAACCGAACAGATCCT
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CAGAAGGATTAAAGTGGCTTGCTTGAAAGGTGAGCAGAGAGTTCGACGGCCATGGTGGGC
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TTTTTTTTTTCTGGTTACGGTTGTTTGTGGAGTTAAAAGCCACATATGCACTAGGAAGAA
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GGTACTTTGGTGTATACATGAAATGCTAATTTTTTTTAGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TTTTTTTTTTCTGGTTACGGTTGTTTGTGGAGTTAAAAGCCACATATGCACTAGGAAGAA
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GGTACTTTGGTGTATACATGAAATGCTAATT

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DS 

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QA 1 536 1 536
DS 



AS 1 2

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CC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 

AF RS1DE65TF C 1
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RD RS1DE65TF 722 0 0
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CACTTTCTCGAGAGAGGATAAAAATCTGAGAAAGTGAGAGTAGCTGGTACGAGGTGAGCA
CC

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DS 

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QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

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BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GS36TF U 1
AF RS1H044TF U 1
BS 1 720 RS1GS36TF
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RD RS1GS36TF 720 0 0
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QA 1 720 1 720
DS 

RD RS1H044TF 729 0 0
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GGAGGATGTGCCTGGTCCGGATCACGAACCTACAAGAGTGGAGACAGAACAGGATGAAGA
TGGTTCGGATGAGTTATGCATTCTTCAAGAGGTGCTCGAAGCGTCGGCTGTGTTTCCTAC
TTTTGGTAAGAATCAGCAGAAGATACTTTTTCGTAATCTGAAAAACCTTGCGGCTCAAAG
GAAGAAAGAACTAACTAACCGATGAGTGGAAGGCATTGCTTGATGAAAAAATGAAATGGA
ACATCAAGAAAATGACTTTTGAAGCAAAGCTAGCAAACCCGAGCGTCTGCTTAATTCGAG
AACAAGGGA

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

CO CL7152Contig1 542 2 1 U
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TCATAATGGCTCTCTCAAAGTCTCTAGGGTTCCTTCTTCTCGCCGCTTTCTTCGTCTCCT
TCACGGTGGCTCAGTCTCCGGTACCAGCACCAGCTCCTTCCAACGGAGGAAGGCGGATCT
CTCCGGCGCACTCACCTAAGAAGGCGTTGTCTCCTTCGGTTTCGCCCGCTGTTTCTCCGT
CTACCATCTCCGACTCTCCGGCTCAAGCTCCCGCTCCAGCAAGCGGCGCCGTTTCTAACA
GCTACGCGGTCTTTGTATCCGTCGCCATTATGTTAACCGCTGCCGTTTTGGCTATGTAGG
CTTCTTCTCGGCATGGGTTTTTTAGAATAAATTAGGTATTTATTTTATTTAAAATATTTG
CAGAGAGTGATGATTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCCTTTTTATATATCGAATATTCGGATT
ACTATTTGTTTCTCATTTTTGTTGATCTTATAATACATATTAATATATGAGTTTATCAGA
TT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 

AF RS1F552JQ C 1
AF RS1F552TF U 1
BS 1 542 RS1F552TF

RD RS1F552JQ 542 0 0
GGATCAAAAGCAATTAAGCAAACACACGAAAACAGCAAACTTCAAATCTCTCTCTATATA
TCATAATGGCTCTCTCAAAGTCTCTAGGGTTCCTTCTTCTCGCCGCTTTTTTCGTCTCCT
TCACGGTGGCTCAGTCTCCGGTACCAGCACCAGCTCCTTCCAACGGAGGAAGGCGGATCT
TTCCGGCGCACTCACCTAAGAAGGCGTTGTCTCCTTCGGTTTCGCCCGCTGTTTCTCCGT
CTACCATCTCCGACTCTCCGGCTCAAGCTCCCGCTCCAGCAAGCGGCGCCGTTTCTAACA
GCTACGCGGTCTTTGTATCCGTCGCCATTATGTTAACCGCTGCCGTTTTGGCTATGTAGG
CTTCTTCTCGGCATGGGTTTTTTAGAATAAATTAGGTATTTATTTTATTTAAAATATTTG
CAGAGAGTGATGATTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCCTTTTTATATATCGAATATTCGGATT
ACTATTTGTTTCTCATTTTTGTTGATCTTATAATACATATTAATATATGAGTTTATCAGA
TT

QA 1 542 1 542
DS 

RD RS1F552TF 542 0 0
GGATCAAAAGCAATTAAGCAAACACACGAAAACAGCAAACTTCAAATCTCTCTCTATATA
TCATAATGGCTCTCTCAAAGTCTCTAGGGTTCCTTCTTCTCGCCGCTTTCTTCGTCTCCT
TCACGGTGGCTCAGTCTCCGGTACCAGCACCAGCTCCTTCCAACGGAGGAAGGCGGATCT
CTCCGGCGCACTCACCTAAGAAGGCGTTGTCTCCTTCGGTTTCGCCCGCTGTTTCTCCGT
CTACCATCTCCGACTCTCCGGCTCAAGCTCCCGCTCCAGCAAGCGGCGCCGTTTCTAACA
GCTACGCGGTCTTTGTATCCGTCGCCATTATGTTAACCGCTGCCGTTTTGGCTATGTAGG
CTTCTTCTCGGCATGGGTTTTTTAGAATAAATTAGGTATTTATTTTATTTAAAATATTTG
CAGAGAGTGATGATTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCCTTTTTATATATCGAATATTCGGATT
ACTATTTGTTTCTCATTTTTGTTGATCTTATAATACATATTAATATATGAGTTTATCAGA
TT

QA 1 542 1 542
DS 



AS 1 2

CO CL7153Contig1 815 2 6 U
GGGCCGATACAGCTCGAAGACGTGGTGATGGGACAGTACAAGAGCACCACCAAAGGAGGA
GTCACTTATCCAGGCTACACCGACGATAAAACCGTGCCGAAAGATAGTCTGACGCCGACG
TTTGCAGCTGCTGCACTCTTTATAGACAATGCGAGATGGGATGGTGTGCCTTTTCTAATG
AAAGCTGGAAAAGCATTACACACCCGGAGTGCGGAGATAAGGGTGCAGTTCAAGCATGTG
CCTGGAAATCTGTATAACCGGAACTCCGGTACTAATCTTGACCGGACTACAAATGAGCTT
GTCATTCGTGTCCAACCAGATGAAGGCATCTATTTGAAAATCAACAACAAGGTCCCTGGT
TTAGGAATGAGATTAGACCAGAGTCACTTGAATCTTCTCTATTCAACTAGGTATTCAAAG
GAGATCCCAGATGCTTATGAGAGGCTGCTGCTGGATGCAATAGAAGGAGAACGGAGGTTG
TTCATAAGAAGCGATGAACTTGACGCTGCTTGGGCGCTTTTCACTCCGTTGCTCGAAGAG
ATTGAGGAAAAGAAGATGATTCCTGAGTTCTATCCTTACGGAAGTCGTGGTCCTGTTGGT
GCTCACTATCTAGCCGCGAAGCACAATGTCCAATGGGGAGATCTTTAGTCTCGACCTGCG
AAAGTGTGGGATGAGTTGATTAATCAAACCTTTCCTTTTGTTCTACTATTGATCCACGTC
TGAGGATTGTCATTGACTGTTACTTGCAAAATAAGTAAGGGTTTCTATACGTTATTGTTT
CCACCATTTTAATTGAATTTAGTTGGACTTAGTTT


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GT26TF U 1
AF RS1GT26JQ C 3
BS 1 714 RS1GT26TF
BS 715 715 RS1GT26JQ
BS 716 724 RS1GT26TF
BS 725 725 RS1GT26JQ
BS 726 746 RS1GT26TF
BS 747 815 RS1GT26JQ

RD RS1GT26TF 746 0 0
GGGCCGATACAGCTCGAAGACGTGGTGATGGGACAGTACAAGAGCACCACCAAAGGAGGA
GTCACTTATCCAGGCTACACCGACGATAAAACCGTGCCGAAAGATAGTCTGACGCCGACG
TTTGCAGCTGCTGCACTCTTTATAGACAATGCGAGATGGGATGGTGTGCCTTTTCTAATG
AAAGCTGGAAAAGCATTACACACCCGGAGTGCGGAGATAAGGGTGCAGTTCAAGCATGTG
CCTGGAAATCTGTATAACCGGAACTCCGGTACTAATCTTGACCGGACTACAAATGAGCTT
GTCATTCGTGTCCAACCAGATGAAGGCATCTATTTGAAAATCAACAACAAGGTCCCTGGT
TTAGGAATGAGATTAGACCAGAGTCACTTGAATCTTCTCTATTCAACTAGGTATTCAAAG
GAGATCCCAGATGCTTATGAGAGGCTGCTGCTGGATGCAATAGAAGGAGAACGGAGGTTG
TTCATAAGAAGCGATGAACTTGACGCTGCTTGGGCGCTTTTCACTCCGTTGCTCGAAGAG
ATTGAGGAAAAGAAGATGATTCCTGAGTTCTATCCTTACGGAAGTCGTGGTCCTGTTGGT
GCTCACTATCTAGCCGCGAAGCACAATGTCCAATGGGGAGATCTTTAGTCTCGACCTGCG
AAAGTGTGGGATGAGTTGATTAATCAAACCTTTCCTTTTGTTCTACTATTGATC*ACGTC
TGAG*ATTGTCATTGACTGTTACTTG

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1GT26JQ 813 0 0
GCCGATACAGCTCGAAGACGTGGTGATGGGACAGTACAAGAGCACCACCAAAGGAGGAGT
CACTTATCCAGGCTACAC*GACGATAAAACCGTGCCGAAAGATAGTCTGACGCCGACGTT
TGCAGCTGCTGCACTCTTTATAGACAATGCGAGATGGGATGGTGTGCCTTTTCTAATGAA
AGCTGGAAAAGCATTACACACCCGGAGTGCGGAGATAAGGGTGCAGTTCAAGCATGTGCC
TGGAAATCTGTATAACCGGAACTCCGGTACTAATCTTGACCGGACTACAAATGAGCTTGT
CATTCGTGTCCAACCAGATGAAGGCATCTATTTGAAAATCAACAACAAGGTCCCTGGTTT
AGGAATGAGATTAGACCAGAGTCACTTGAATCTTCTCTATTCAACTAGGTATTCAAAGGA
GATCCCAGATGCTTATGAGAGGCTGCTGCTGGATGCAATAGAAGGAGAACGGAGGTTGTT
CATAAGAAGCGATGAACTTGACGCTGCTTGGGCGCTTTTCACTCCGTTGCTCGAAGAGAT
TGAGGAAAAGAAGATGATTCCTGAGTTCTATCCTTACGGAAGTCGTGGTCCTGTTGGTGC
TCACTATCTAGCCGCGAAGCACAATGTCCAATGGGGAGATCTTTAGTCTCGACCTGCGAA
AGTGTGGGATGAGTTGATTAATCAAACCTTTCCTTTTGTTCTACTATTGATCCACGTCTG
AGGATTGTCATTGACTGTTACTTGCAAAATAAGTAAGGGTTTCTATACGTTATTGTTTCC
ACCATTTTAATTGAATTTAGTTGGACTTAGTTT

QA 1 813 1 813
DS 



AS 1 2

CO CL7154Contig1 990 2 4 U
GGTGACCACAACAGGAAAGCGGGACTCGACGCGCTCTGCGAGGTCGTGTGCGGCAACTTC
CTCCAGATGCCGTTCGATGATAACACCTTCGACGGCGCGTACTCGATCGAAGCGACTTGT
CACGCGCCGAAGCTCGAAGAAGTCTACGCGGAGATCTACAGGGTGTTGAAGCCCGGATCT
CTATACGTGTCGTACGAGTGGGTCACGACCGATAAGTTCAACGCTGAGAACGAGGAACAC
GTGGAGGTCATCCAAGGGATCGAGAGAGGAGACGCGCTTCCTGGGCTTAGGGCTTATTCC
GACATAGCCGAGACAGCGAATAAGGTTGGGTTCGAAGTTGTCAAGGAGAAGGATCTGGCG
GCTCCGCCGGCTGAGCCGTGGTGGACTAGGCTTAAGATGGGTCGGCTAGCTTACTGGAGG
AACCACATTGTGGTTCATGTTTTGTCTGCTGTCGGAGTTGCGCCTAAAGGAACCGTTGAT
GTTCACGAGATGTTGTTTAAGACCGCTGATTTCTTGTCCAGAGGAGGTGAAACTGAAATT
TTCTCTCCGATGCATATGATTCTCTGCCGGAAACCTACTTCTTGAAATAGAATCGTCTTC
CGATCTCTGTTTGTTTTTAATTTTTGTTTTTAATGGATTTTTAATCATGCTTGATCTGTC
AATGTACTCTTTTAGATTTTTAAAACCGTGTTTAATCTTAATTTGGTATTACTGTTTAGT
TTTTCCTGAATAAGTGAATCTTGAAATCGAGTTATCCGCCGGGAGCTTAGCGCCGACGAG
ACACCGTGGTGTAGTAGAACTGATTACTGTAAGAAGAAGGGTACTTTAGTAATCTAATGT
ACTTTGTAGTTATGTGTGGACAGCGTGTGACAGTAGTTGTGTGTGTTTTTATTTGACCAC
TTTGTAGTTATGTGTGGGCAGCGTGTGATAGTAGTTGATTAGTGTGAGTCAGTGTCTGGT
TTATGTGTGTAAATTAATTTATCTTTGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D907TF U 1
AF RS1D907JQ C 298
BS 1 619 RS1D907TF
BS 620 620 RS1D907JQ
BS 621 692 RS1D907TF
BS 693 990 RS1D907JQ

RD RS1D907TF 692 0 0
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CTCCAGATGCCGTTCGATGATAACACCTTCGACGGCGCGTACTCGATCGAAGCGACTTGT
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CTATACGTGTCGTACGAGTGGGTCACGACCGATAAGTTCAACGCTGAGAACGAGGAACAC
GTGGAGGTCATCCAAGGGATCGAGAGAGGAGACGCGCTTCCTGGGCTTAGGGCTTATTCC
GACATAGCCGAGACAGCGAATAAGGTTGGGTTCGAAGTTGTCAAGGAGAAGGATCTGGCG
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CGATCTCTGTTTGTTTTTA*TTTTTGTTTTTAATGGATTTTTAATCATGCTTGATCTGTC
AATGTACTCTTTTAGATTTTTAAAACCGTGTT

QA 1 692 1 692
DS 

RD RS1D907JQ 693 0 0
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GTCAATGTACTCTTTTAGATTTTTAAAACCGTGTTTAATCTTAATTTGGTATTACTGTTT
AGTTTTTCCTGAATAAGTGAATCTTGAAATCGAGTTATCCGCCGGGAGCTTAGCGCCGAC
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TGTACTTTGTAGTTATGTGTGGACAGCGTGTGACAGTAGTTGTGTGTGTTTTTATTTGAC
CACTTTGTAGTTATGTGTGGGCAGCGTGTGATAGTAGTTGATTAGTGTGAGTCAGTGTCT
GGTTTATGTGTGTAAATTAATTTATCTTTGATT

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

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TCAGCGTCGAGGATAAACTATGTGGTGTTACCGGAGTTCATTATTCAAGGAGTTCTATGT
GTATTCTATCTGTTTACAGGACACTGGTTCATGGCAATCCTTTGTCTCCCTTATATGTAC
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BQ
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AF RS1BH45TF U 1
AF RS1BH45JQ C 4
BS 1 723 RS1BH45TF
BS 724 764 RS1BH45JQ

RD RS1BH45TF 723 0 0
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ATGGGAGATATTTGGGCATGGCTTATATCCTTCTTCTTCCTCATCGCTCTTGTGGCAATC
ATCGTATACCAGCTTGTTTGCTTAGCGGATCTGGAGTTTGATTACATAAACCCATACGAC
TCAGCGTCGAGGATAAACTATGTGGTGTTACCGGAGTTCATTATTCAAGGAGTTCTATGT
GTATTCTATCTGTTTACAGGACACTGGTTCATGGCAATCCTTTGTCTCCCTTATATGTAC
TACAACTTCCAACTTTACTCGAAGCGACAACACTTGGTAGATGTAACGGAGATATTCAAC
CTGCTAAACTGGGAGAAGAAGAAACGGCTGTTCAAGCTTGCTTACATAATACTTAACCTC
TTTCTCACTATCTTCTGGATGATATATTCAGCGTTGGATGATTACGAGGACTGATTGACA
CAAGACGTCATCCATCTGATTGAGACACCGCTGCTTAAAGATGACAGCGAGTCCTCCTGC
TCGTCGTCCTCGTGGACACCATGGATAAAAAATGAAAGGACTAAATTGTATTTGCTTTTA
CCTGTTTGATGACGATGCATGTTTGTAAGATTATTAGTGGCAGAAAGATTCGTGTTATTG
TGTATCGTTCGTTATCCTGATGTTTCAGCTGTCTTGTTATGTCTGATGATTAATTGTAAA
AGC

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1BH45JQ 761 0 0
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GGAGATATTTGGGCATGGCTTATATCCTTCTTCTTCCTCATCGCTCTTGTGGCAATCATC
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GCGTCGAGGATAAACTATGTGGTGTTACCGGAGTTCATTATTCAAGGAGTTCTATGTGTA
TTCTATCTGTTTACAGGACACTGGTTCATGGCAATCCTTTGTCTCCCTTATATGTACTAC
AACTTCCAACTTTACTCGAAGCGACAACACTTGGTAGATGTAACGGAGATATTCAACCTG
CTAAACTGGGAGAAGAAGAAACGGCTGTTCAAGCTTGCTTACATAATACTTAACCTCTTT
CTCACTATCTTCTGGATGATATATTCAGCGTTGGATGATTACGAGGACTGATTGACACAA
GACGTCATCCATCTGATTGAGACACCGCTGCTTAAAGATGACAGCGAGTCCTCCTGCTCG
TCGTCCTCGTGGACACCATGGATAAAAAATGAAAGGACTAAATTGTATTTGCTTTTACCT
GTTTGATGACGATGCATGTTTGTAAGATTATTAGTGGCAGAAAGATTCGTGTTATTGTGT
ATCGTTCGTTATCCTGATGTTTCAGCTGTCTTGTTATGTCTGATGATTAATTGTAAAAGC
TAATTTTAAGCTCATAAACTAGTTGATCCACACAAACCATG

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL7156Contig1 728 2 4 U
GGATTGTCAACATCTTATCTTCTCTCGTATCTCCACACAGCATGTCTGCACAAGCAGGCG
CTCATGATCAACAACTAAAGAGGAAGAAATCGGTTATTGGGTCAAAGCCTCCCGCGTGTG
GAAACAAGTGCCTGAATTGCAAGCCTTGCCTTCCTTATCTATTTGACATTCATGGTGCTC
ATGATGATGATGATGATGATCGTGAACCATACTATCCGGTGAGAGGAGACATGAAGAAAG
CAGAAGAGTACTGTGAAAGAGCAATTTTGGGGAACACCAACGATGGAAACGTTCTCTCGC
TATACGCCGATATCATTTTGCAAAACCACGGCGACCGTAAAAGAGCCCACTCCTATTTCC
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GGCCACATGCCTCCAACTACCATCTTCCGTGATTTTCCCAAGCAAGCTCGTATTTCCACA
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TAGTATGTATGCATGTTTAATACACATATGCAAATGCAATATGCGTGTATAATATACATG
TTACGAAAATTTTATATGGTTTGTAGTCAGCACTCTGTACACCTAAAAGAAAAATGGCTA
GTTTCTCT


BQ
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20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RS1BA29JQ C 1
AF RS1BA29TF U 1
BS 1 713 RS1BA29TF
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BS 715 725 RS1BA29TF
BS 726 728 RS1BA29JQ

RD RS1BA29JQ 728 0 0
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CTCATGATCAACAACTAAAGAGGAAGAAATCGGTTATTGGGTCAAAGCCTCCCGCGTGTG
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CAGAAGAGTACTGTGAAAGAGCAATTTTGGGGAACACCAACGATGGAAACGTTCTCTCGC
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TGGGATGTGGAGGATGACGAATATGAAGAAGAAGAAAAAGAGCAATTGAGTGATGAAATT
GGCCACATGCCTCCAACTACCATCTTCCGTGATTTTCCCAAGCAAGCTCGTATTTCCACA
ACATCCTAAAGCACATATTTACACCTTCCGTTATATGTATTAGTATCTAAATAAACAATA
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TTACGAAAATTTTATATGGTTTGTAGTCAGCACTCTGTACACCTAAAAGAAAAATGGCTA
GTTTCTCT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1BA29TF 725 0 0
GGATTGTCAACATCTTATCTTCTCTCGTATCTCCACACAGCATGTCTGCACAAGCAGGCG
CTCATGATCAACAACTAAAGAGGAAGAAATCGGTTATTGGGTCAAAGCCTCCCGCGTGTG
GAAACAAGTGCCTGAATTGCAAGCCTTGCCTTCCTTATCTATTTGACATTCATGGTGCTC
ATGATGATGATGATGATGATCGTGAACCATACTATCCGGTGAGAGGAGACATGAAGAAAG
CAGAAGAGTACTGTGAAAGAGCAATTTTGGGGAACACCAACGATGGAAACGTTCTCTCGC
TATACGCCGATATCATTTTGCAAAACCACGGCGACCGTAAAAGAGCCCACTCCTATTTCC
AACAAGCTGCCAAAATGTCCCCCGAAGATTTCTGTGCAAGCTTCATACGCAAGGTTTCTG
TGGGATGTGGAGGATGACGAATATGAAGAAGAAGAAAAAGAGCAATTGAGTGATGAAATT
GGCCACATGCCTCCAACTACCATCTTCCGTGATTTTCCCAAGCAAGCTCGTATTTCCACA
ACATCCTAAAGCACATATTTACACCTTCCGTTATATGTATTAGTATCTAAATAAACAATA
TAGTATGTATGCATGTTTAATACACATATGCAAATGCAATATGCGTGTATAATATACATG
TTACGAAAATTTTATATGGTTTGTAGTCAGCACTCTGTACACCTAAAAGAAAA*TGGCTA
GTTTC

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL7157Contig1 860 2 10 U
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GGGCTGTTTCCTCTTCTTGCTCTTCGAGAAGCCATCGATCAGCAGCAACCACTGCTAAGT
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ATGATGATGTTGAACTGGATTACCCATGCCCGTTTTGCTCCGATGACTATGATTTAGTCG
AATTGTGTCACCATATCGACGAAGAACATCATCTTGAAGCTACCTATGGAGCATGTCCGG
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AAAACAAGACTTTGATTGAGGATTCTTCGGCAGGAAAAGACATGAAGCTGTCAACGCCTT
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ACACAAGAGTAGAGTTAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EG28TF U 1
AF RS1EG28JQ C 87
BS 1 686 RS1EG28TF
BS 687 687 RS1EG28JQ
BS 688 758 RS1EG28TF
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BS 833 860 RS1EG28JQ

RD RS1EG28TF 832 0 0
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GGGCTGTTTCCTCTTCTTGCTCTTCGAGAAGCCATCGATCAGCAGCAACCACTGCTAAGT
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AATTGTGTCACCATATCGACGAAGAACATCATCTTGAAGCTACCTATGGAGCATGTCCGG
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TCAGCAATTCTCCATTGCCGAACCAAACCAAGCCTGTGGTGGAGGTGGATTCAAGTGTAG
AAAACAAGACTTTGATTGAGGATTCTTCGGCAGGAAAAGACATGAAGCTGTCAACGCCTT
TGTCTGATGGTGAGCAACTGGAGAAG*CAAAGAAGTGTGAGTTTGTACAGGGACTATTGT
CGTCAGCTATGTTTGATGATGGATGTGACTTCTGAAAA**TAAAAGATGCGAAGG*AGGT
CATTGGCATTGTTATAATTCTATTCAGTTCTATT*ATTGTATATGTATCTTT

QA 1 832 1 832
DS 

RD RS1EG28JQ 774 0 0
AGA
TCACAATCGAATAAGATGGATGACGATATGTGGGCTGTTTCCTCTTCTTGCTCTTCGAGA
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CCGTTTTGCTCCGATGACTATGATTTAGTCGAATTGTGTCACCATATCGACGAAGAACAT
CATCTTGAAGCTACCTATGGAGCATGTCCGGTTTGTAGCAAAATGGTGAGGTCGCGTATG
GTGGATCATATAACCACACATCATAGAGATGTCTTGAAGAGCGGGCAGAAGGAGACTTAC
GCGGAAGATCCATATTCATATCGTCAAGATGATTTGTCGCCATCTATGAATCATTATCAT
ACCTCTAAAACCTATCAGTTCTTATCTTTCCTCAGCAATTCTCCATTGCCGAACCAAACC
AAGCCTGTGGTGGAGGTGGATTCAAGTGTAGAAAACAAGACTTTGATTGAGGATTCTTCG
GCAGGAAAAGACATGAAGCTGTCAACGCCTTTGTCTGATGGTGAGCAACTGGAGAAGGCA
AAGAAGTGTGAGTTTGTACAGGGACTATTGTCGTCAGCTATGTTTGATGATGGATGTGAC
TTCTGAAAAATAAAAAGATGCGAAGGCAGGTCATTGGCATTGTTATAATTCTATTCAGTT
CTATTTATTGTATATGTATCTTTTTTATCAGACACAAGAGTAGAGTTAGTC

QA 4 774 4 774
DS 



AS 1 2

CO CL7158Contig1 1268 2 6 U
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ATCTCTCTCCATGGCCGGCGTAAATCAACAGCTCCGTCACTCCGTTGCTCAACTGTTTCC
AGCTGTTTCTTCTTCCCCTCCTCCTCAACTCGGAATCTCACCTTCTCGTGTTCTCTTCCC
TAATCTCCGAGCTAACTCCGCCGCCTCCCTGCGAACCACTCGCCGTTCAAACACTGTATC
CGCGTCTCCCGTCGGTTCTTACACCTCCTCGGATTCGTTGGCGGGAGATGGAGACGAAGC
GGGAAGGAGGACGCCTTTGCTCGAGGTGAAGGATCTGAGAGCTGTGATTGTTGAATCGAG
GCAGGAGATACTAAAGGGAGTCAACTTGGTTGTCTACGAAGGAGAGATACACGCAGTGAT
GGGGAAGAATGGTTCAGGGAAGAGCACATTCTCTAAGGTTCTTGTTGGTCATCCTGATTA
TGAAGTGACGGGAGGGAGTATTGTGTTTAAAGGGAAGAATTTCTTGATATGGAACCTGAG
GAAAGATCTCTTGCTGGTTTGTTTATGAGTTTCCAGTCCCCAGTTGAGATCCCTGGTGTT
AGCAATATGGATTTTTTGAATATGGCTTTCAATGCTCGCAAAAGGAAGCTTGGCCAGCCA
GAGCTTGATCCGATCCAGTTCTACAGCCACTTAGTATCAAAACTCGAAGTTGTGAATATG
AAGACGGATTTTCTGAACCGGAATGTCAATGAAGGGTTTAGCGGTGGTGAAAGGAAACGC
AATGAGATTCTACAGTTAGCGGTCCTCGGAGCTGAGTTGGCTATACTGGACGAGATAGAT
TCAGGGCTGGATGTTGATGCTCTTCAAGATGTGGCAAAGGCGGTGAATGGGCTTTTGACA
CCAAAAAACTCTGTTCTGATGATAACCCACTATCAACGCCTACTTGACTACATCAAACCA
ACACTCATACACATCATGGAGAATGGAAGAATCATTAAAACCGGAGACAGGTCCTTGGCA
AAATTATTGGAAAAGGAAGGCTACAAAGCGATATCCTCCGGTTAATTATCGCAGCTCATA
GAAAACCGCTCTTCCATCTTTCTTGAAACAATCTTTTGACCGGTAGGCTTTTTTTTGGCT
TCATTGGTTTGCATGACAAACTATTGTATTTGGTATTTTTTTTCTTATGTATTGTTTATG
AACAGTTCTTCCATACTGTTTTGTAACCAACGAATAAATTTTCAGTTAAATAAACCTATT
TGTATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C067TF U 1
AF RS1C067JQ C 546
BS 1 644 RS1C067TF
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RD RS1C067TF 745 0 0
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GAGCTTGATCCGATCCAGTTCTACAGCCACTTAGTATCAAAACTCGAAGTTGTGAATATG
AAGACG*ATTTTCTGAACCGGA
TGT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RS1C067JQ 723 0 0
ATCTCTTGCTGGTTTGTTTATGAGTTTCCAGTCCCCAGTTGAGATCCCTGGTGTTAGCAA
TATGGATTTTTTGAATATGGCTTTCAATGCTCGCAAAAGGAAGCTTGGCCAGCCAGAGCT
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GGATTTTCTGAACCGGAATGTCAATGAAGGGTTTAGCGGTGGTGAAAGGAAACGCAATGA
GATTCTACAGTTAGCGGTCCTCGGAGCTGAGTTGGCTATACTGGACGAGATAGATTCAGG
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AAACTCTGTTCTGATGATAACCCACTATCAACGCCTACTTGACTACATCAAACCAACACT
CATACACATCATGGAGAATGGAAGAATCATTAAAACCGGAGACAGGTCCTTGGCAAAATT
ATTGGAAAAGGAAGGCTACAAAGCGATATCCTCCGGTTAATTATCGCAGCTCATAGAAAA
CCGCTCTTCCATCTTTCTTGAAACAATCTTTTGACCGGTAGGCTTTTTTTTGGCTTCATT
GGTTTGCATGACAAACTATTGTATTTGGTATTTTTTTTCTTATGTATTGTTTATGAACAG
TTCTTCCATACTGTTTTGTAACCAACGAATAAATTTTCAGTTAAATAAACCTATTTGTAT
TCC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1FQ21TF U 1
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RD RS1FQ21TF 762 0 0
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QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1FQ21JQ 809 0 0
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AGAAGAAGAAGAGAAGGAAGTGAATGAGGTAGCTAAACCAGAGAAGATGCCGGCTATCAG
CAAGCTTTCAATGTCTTTGAAAAGCACACTTATTGGTGAAAAGAGCCAGAAGTATCAGAA
ACACCCAGGAGCGAGAGCAGAGAGCGCGTATGCTTCGTCTGGACAGAGGAGTGCAGAAGA
ACAGATCCCAGCGAGCACAAGCTTTGTGAAGCTCTCGGATATGAGTGAAGTGGAGTGGAA
GATATTCCTGGAGAAGTATCAAGAGCTGCTTTATCCGGCGTTTGCAAAGCGCAAGGCTAT
AACTTTAGGACAGAATTTGAGGCAGAGGCTGGGAACTTCGTGTCAGTTTTGAGATGTTTG
CTGAGACTGTGGAAGAATAATAATAAAGGATCGTGTTACTAGAGGGCTTGTTTTATAGAC
AGAACTTTTGGTGGAGAAAGATGGTCAAGAAGAGATAAGTGGTGGTATGGATTTTAGTGT
AAATATTGGTTGATGTCAGCTTTTAGTGTGGAGGAGACTTTGAGTGATGAAGAGAGAGTT
TAGTCAGTCACTTGTCTTTTGTTCATTCTTTTTAAAATTTCTTAAAACCCTCAGGATCTC
GTTGTTGGTTTTTGCTGTCTCGTTTAAAGCATGTAGACCAGACCCTCTTTTATGTTTTAT
AAATCACTTTGTAGATTTAGAAAAAAGGGGATGGAAAAAAAAAAGCTTTGTTTCGTGTCA
TCCTAAACGGACAAGTCAAGATTTTCAGG

QA 1 809 1 809
DS 



AS 1 2

CO CL7160Contig1 748 2 2 U
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AACATAATAATACATAGTTGCAGGGGAGTTAAAAGAACTTGAGAGATCACAAATAACACA
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ACACGGTTGCTAAACCCTTTGATGGGAATCCAGATTTGAACTCATCTAAAGCTGCCATTG
TCTTTGCCAGATTAGGGTTGTTAGCCCATACATTGTTGGTGGACTTGTTGCCACTCTTGT
TCCCACCATGCTGCACCGTCGAATGCATCATAGGAAACAACAACCCACTGCAAAGCTATG
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TACGAATACCTTTTATTTCCACATTCCGAGTTAAAACGAATCTGATTGTAAGAAGAAATA
GATGCAACGGATACGTGTACATACCGTC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1G290TF C 1
AF RS1G290JQ U 8
BS 1 7 RS1G290TF
BS 8 748 RS1G290JQ

RD RS1G290TF 748 0 0
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CTCTCTTGTCTGGTCTTTTGGAACCAAATCCTCGACTGACGCCAAGTTCAAGAGCTTCTC
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TTTCTGCTTTGTCCTTGACATCTTCAGGAGTCTCTGTTCCTGTACCCCACCATTTGTTTG
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TCTTTGCCAGATTAGGGTTGTTAGCCCATACATTGTTGGTGGACTTGTTGCCACTCTTGT
TCCCACCATGCTGCACCGTCGAATGCATCATAGGAAACAACAACCCACTGCAAAGCTATG
GGTTTCAGAAAAGGCCATAGCTTTTTCCAATTTGTGGCATGAAAAAAGGAACTAATCTCC
TACGAATACCTTTTATTTCCACATTCCGAGTTAAAACGAATCTGATTGTAAGAAGAAATA
GATGCAACGGATACGTGTACATACCGTC

QA 1 748 1 748
DS 

RD RS1G290JQ 741 0 0
AGTGCATTCTTCTCAGACACTACTACAATAATGTTATTCATTTCAAATACCAAAACATAA
TAATACATAGTTGCAGGGGAGTTAAAAGAACTTGAGAGATCACAAATAACACAGAGCACT
AGTTCAAGAAGAGGAACTCTGTTCTAAACAAATATAAACACAAACTCAAGAAGAATCAGT
AACCCAATCCTTAGGCAGGGAAGACTTGAAGATCTGAGACAGAAGATGCTGATCTCTCTT
GTCTGGTCTTTTGGAACCAAATCCTCGACTGACGCCAAGTTCAAGAGCTTCTCTTCCTTC
TTCAGCTATTCTTTTCCTAATAGCTAGCAAAGAACTTTGCTTCTCAAAAGCTATTTCTGC
TTTGTCCTTGACATCTTCAGGAGTCTCTGTTCCTGTACCCCACCATTTGTTTGACACGGT
TGCTAAACCCTTTGATGGGAATCCAGATTTGAACTCATCTAAAGCTGCCATTGTCTTTGC
CAGATTAGGGTTGTTAGCCCATACATTGTTGGTGGACTTGTTGCCACTCTTGTTCCCACC
ATGCTGCACCGTCGAATGCATCATAGGAAACAACAACCCACTGCAAAGCTATGGGTTTCA
GAAAAGGCCATAGCTTTTTCCAATTTGTGGCATGAAAAAAGGAACTAATCTCCTACGAAT
ACCTTTTATTTCCACATTCCGAGTTAAAACGAATCTGATTGTAAGAAGAAATAGATGCAA
CGGATACGTGTACATACCGTC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

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AAACTCCTCTCCTCCGGCCAACTCCACGACATCGTCGGCATCCCGACATCGAAACGCACC
GAGGAGCAGGCCCGCTCCCTAGGCATCCCTCTCGTGGCCCTCGACACGCACCCCCGGATC
GACCTCGCCATCGACGGAGCGGACGAGGTGGATCCGAATTTAGATCTCGTCAAGGGACGA
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AATTATATTATTGATTTTTATTTTAAGGAGCCGTTGAAGGATGGGTTCGCGGCGGGGAGG
GAGATTGGGAAGTTGGAGGGAGTGGTGGAGCATGGTTTGTTTCTTGGTATGGCTACTTTT
GTTATTATCGCTGGGAAGAATGGTGTTGAAGTTATGACCAAATGAGAGTTTTTTCAAAAG
TTTTTTCTCTGTAATATTTTACCAAAATTGAGTTTTATGTTCTCCGTCTTGTTCTTTATC
TGTTAGTTGATGACTATGGGGATGGTCAAAAACGTCGCAATCTTTCAAATCCATTTTGTA
ACTATAAAAGTAAATATAAGAAACAAACATTGAGCCCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F008TF U 1
AF RS1F008JQ C 61
BS 1 695 RS1F008TF
BS 696 696 RS1F008JQ
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RD RS1F008TF 790 0 0
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CTATAAAGTA

QA 1 780 1 780
DS 

RD RS1F008JQ 758 0 0
AAACTCCTCTCCTCCGGCCAACTCCACGACATCGTCGGCATCCCGACATCGAAACGCACC
GAGGAGCAGGCCCGCTCCCTAGGCATCCCTCTCGTGGCCCTCGACACGCACCCCCGGATC
GACCTCGCCATCGACGGAGCGGACGAGGTGGATCCGAATTTAGATCTCGTCAAGGGACGA
GGAGGCGCGCTCTTAAGAGAGAAGATGGTGGAGGCAGTTGCGGAGAAGTTTATAGTGGTG
GCTGATGATACGAAGCTTGCGAAGGGGTTGGGTGGGAGTGGATTAGCGATGCCAGTGGAG
GTTGTTCAGTTCTGTTGGAAGTTTAATTTGATTAGGTTGAAGGATTTGTTTAAGGAGTTT
GGGTGTGATGCGAAGCTGAGGGTTGGTGGAGATGGGGAGGCGTATGTTACGGATAATAGT
AATTATATTATTGATTTTTATTTTAAGGAGCCGTTGAAGGATGGGTTCGCGGCGGGGAGG
GAGATTGGGAAGTTGGAGGGAGTGGTGGAGCATGGTTTGTTTCTTGGTATGGCTACTTTT
GTTATTATCGCTGGGAAGAATGGTGTTGAAGTTATGACCAAATGAGAGTTTTTTCAAAAG
TTTTTTTTCTGTAATATTTTACCAAAATTGAGTTTTATGTTCTCCGTCTTGTTCTTTATC
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ACTATAAAAGTAAATATAAGAAACAAACATTGAGCCCC

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL7162Contig1 709 2 2 U
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CCATATTAGGTTCGACAAAACTGGTATAATAGGATGTTTACCTTCACAGTCATGATGGAT
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BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1C756TF C 1
AF RS1C756JQ U 4
BS 1 3 RS1C756TF
BS 4 709 RS1C756JQ

RD RS1C756TF 709 0 0
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ATTCACACCTTCTATCACTGTGACTGCTTCCAAGATTGCGCTATTACATTTCCCACAGTT
TACATTCACCTTGATCTCAACTTTCTGCATAGAGACTAGTAACAACAAAATGGAAACATT
CCATATTAGGTTCGACAAAACTGGTATAATAGGATGTTTACCTTCACAGTCATGATGGAT
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QA 1 709 1 709
DS 

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ACTTTCATAGGTAGTAACAGACACAACATCGCAACTTGTGCAGTACGGAGACATAGGCTT
GCAGTTGCATACAGGCTTTGGTTTTTCAGGTGGTGGTGGAGGAGGCTTTGGTGGCTCAGG
CTCTGCTGGAGGCTTTGGTGGCTCTGGAGGCTTTGGCGGTTCTGGAGGTTTTGGTGGCGG
CCCAACGCTGATGATTACAGGTTTCTGTTTAATTTTCTTTAGCCGTGATGCAACGCAGAC
CGGATCCATTGTTCCCACCACGGTAAGTATGTTTTTCTCCTCATCTAATGATATATGATT
CACACCTTCTATCACTGTGACTGCTTCCAAGATTGCGCTATTACATTTCCCACAGTTTAC
ATTCACCTTGATCTCAACTTTCTGCATAGAGACTAGTAACAACAAAATGGAAACATTCCA
TATTAGGTTCGACAAAACTGGTATAATAGGATGTTTACCTTCACAGTCATGATGGATTAG
CCAAAATGAAAACTGGATTAGTGGAGTTTTGGAGAATGGAGAAAGAAGAGAAGAAGTTAT
TGGAAACATGTGAAGACAAGAGATGACAGATTGGAATTGTGTTGCC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1GK35TF U 30
AF RS1CM24TF U 1
BS 1 49 RS1CM24TF
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RD RS1GK35TF 612 0 0
GG
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QA 3 612 3 612
DS 

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QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

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CAAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1GK41TF U 1
AF RS1GK41JQ C 27
BS 1 607 RS1GK41TF
BS 608 608 RS1GK41JQ
BS 609 753 RS1GK41TF
BS 754 786 RS1GK41JQ

RD RS1GK41TF 753 0 0
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TGAAAACGACCAAGGCAGAGGAGGAGACGACGAAAACGACCAAGGCAGAGGAGGAGTTGG
TGCAGGCGAAGATGCACCGTGAGATTACGAAGCTCGATGATGAGAAGCTTTGGGCAGAGT
TTGAACCGTTGGAAATCGATAAGATCGAGAGTGGTGAAATCAAACCCAAGACCTTGATCA
CCAATCGTGGTCGGTTCCACTCTCCGCTATTTCGTAAGAGGGAACCTATAATTGTAAAGG
AGATGCTCTCAGTGTTCCCTAATTCTACTTACATTAAGTAGAAGAGAAGGTGGAATCCCG
ACTCGGTAAAAGACCTGATGGTAATAGCAGATTGATACAATCACTCTTCCCCAAGGCCCC
CACTAATTCCAGAACCAACAAACCCTGTCGAAAGAACGCTGCACTTTTCCAGTACAAAGA
TGGTTTTGTCTTTTACCGACATCATTGGCTCCACTCTGAGAAAGCAGCCGTTTCAGAAGA
AATGCCAAAGCTCACCTGGAAGGAAGTTGGACCTCGTTTCCAACTCTTGTTTCTAGGTGT
GAAGAAG*TATCACTTGTCACGGGGAATTTCAAACTTATCTGCATGCCTCGCCCCTCTCA
CTATTGCTGCCCACAACGTCGCCTTATGATTCCGCCTATTTAGATGCTCTCTCCATGTTT
GCTGTAGTATTCTGACATGGTCTTTTGCCTTGG

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1GK41JQ 760 0 0
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ACGACGAAAACGACCAAGGCAGAGGAGGAGTTGGTGCAGGCGAAGATGCACCGTGAGATT
ACGAAGCTCGATGATGAGAAGCTTTGGGCAGAGTTTGAACCGTTGGAAATCGATAAGATC
GAGAGTGGTGAAATCAAACCCAAGACCTTGATCACCAATCGTGGTCGGTTCCACTTTCCG
CTATTTCGTAAGAGGGAACCTATAATTGTAAAGGAGATGCTCTCAGTGTTCCCTAATTCT
ACTTACATTAAGTAGAAGAGAAGGTGGAATCCCGACTCGGTAAAAGACCTGATGGTAATA
GCAGATTGATACAATCACTTTTCCCCAAGGCCCCCACTAATTCCAGAACCAACAAACCCT
GTCGAAAGAACGCTGCACTTTTCCAGTACAAAGATGGTTTTGTCTTTTACCGACATCATT
GGCTCCACTTTGAGAAAGCAGCCGTTTCAGAAGAAATGCCAAAGCTCACCTGGAAGGAAG
TTGGACCTCGTTTCCAACTCTTGTTTTTAGGTGTGAAGAAGGTATCACTTGTCACGGGGA
ATTTCAAACTTATCTGCATGCCTCGCCCCTCTCACTATTGCTGCCCACAACGTCGCCTTA
TGATTCCGCCTATTTAGATGCTCTCTCCATGTTTGCTGTAGTATTCTGACATGGTCTTTT
GCCTTGGGGTCATTTATATTGGCCCTTTTTGTTACAAACT

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

CO CL7165Contig1 833 2 2 U
GGGATCTCAAAAGCAAATTAGGGTTCATTCATCCAAGGAGAGGCGATAACTTTAAATTCT
TGACGAGGCGATGCCTGAAGCATTTGAAGGATGGAATCAGTGGGTCGAAGATCCGTGTTT
GTTTTGGCGACCTGGGGATTATAACTATCAGACGCCTAAGCATGATCCCGAAAAGGCTAT
CTACACACCCGAACAAGAGTATGAAAGAATGAAGGAAGAAGTCGATAATAGCGAGGGTTT
CGACATCGATTTCGATAGCTTCCGTTGCGTTTTCAACTACCATCGTGCATACTTCGAGTC
AAATGAGTTCGTGGATGAGCCAGAAACCACTGGAGATTTACTCGTGAGGCTCTCCAAGGA
GGCCCTCGATGATCACAATGGAAAATATGTGACAGATTTTGAGTTTGTCAAGGTTGTTAA
AGCCAACTTCCACTACTCTGCTGGATTCATGTTTCTCATAACGTTTGAAGTTCGTGATCC
TTATGATGGTCTTATCAAACCATTCCAAGCAAGGGTGCGCCACCTTAAACATACCTTCAC
TGAGCATGTCTTCTGCAGGCCTAAACCCAACACCGGAGTGGAATACTTTGGGAATGCCAA
GACAGATATCGAGAAAGATGCCAAGAAACAAAGATTGGACTAGGAGCTTTACTATTCGGC
TACGAGTAGTGAGTAGTGAAACCTTGAGATATCTCTCTTGTTTAGTTATCTATTTGCATC
CTGAGAAATCTAGATCTCTCTCGTCTTGTTTTTGAATTTGCTTATTGAATAAACGAACTG
CTGCTTTGTTCTCTTTTATTCGTGACTTGTTCACTATTATCTATCTATGTAGC


BQ
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AF RS1GA12TF U 1
AF RS1GA12JQ C 184
BS 1 502 RS1GA12TF
BS 503 833 RS1GA12JQ

RD RS1GA12TF 502 0 0
GGGATCTCAAAAGCAAATTAGGGTTCATTCATCCAAGGAGAGGCGATAACTTTAAATTCT
TGACGAGGCGATGCCTGAAGCATTTGAAGGATGGAATCAGTGGGTCGAAGATCCGTGTTT
GTTTTGGCGACCTGGGGATTATAACTATCAGACGCCTAAGCATGATCCCGAAAAGGCTAT
CTACACACCCGAACAAGAGTATGAAAGAATGAAGGAAGAAGTCGATAATAGCGAGGGTTT
CGACATCGATTTCGATAGCTTCCGTTGCGTTTTCAACTACCATCGTGCATACTTCGAGTC
AAATGAGTTCGTGGATGAGCCAGAAACCACTGGAGATTTACTCGTGAGGCTCTCCAAGGA
GGCCCTCGATGATCACAATGGAAAATATGTGACAGATTTTGAGTTTGTCAAGGTTGTTAA
AGCCAACTTCCACTACTCTGCTGGATTCATGTTTCTCATAACGTTTGAAGTTCGTGATCC
TTATGATGGTCTTATCAAACCA

QA 1 502 1 502
DS 

RD RS1GA12JQ 650 0 0
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CATCGATTTCGATAGCTTCCGTTGCGTTTTCAACTACCATCGTGCATACTTCGAGTCAAA
TGAGTTCGTGGATGAGCCAGAAACCACTGGAGATTTACTCGTGAGGCTCTCCAAGGAGGC
CCTCGATGATCACAATGGAAAATATGTGACAGATTTTGAGTTTGTCAAGGTTGTTAAAGC
CAACTTCCACTACTCTGCTGGATTCATGTTTCTCATAACGTTTGAAGTTCGTGATCCTTA
TGATGGTCTTATCAAACCATTCCAAGCAAGGGTGCGCCACCTTAAACATACCTTCACTGA
GCATGTCTTCTGCAGGCCTAAACCCAACACCGGAGTGGAATACTTTGGGAATGCCAAGAC
AGATATCGAGAAAGATGCCAAGAAACAAAGATTGGACTAGGAGCTTTACTATTCGGCTAC
GAGTAGTGAGTAGTGAAACCTTGAGATATCTCTCTTGTTTAGTTATCTATTTGCATCCTG
AGAAATCTAGATCTCTCTCGTCTTGTTTTTGAATTTGCTTATTGAATAAACGAACTGCTG
CTTTGTTCTCTTTTATTCGTGACTTGTTCACTATTATCTATCTATGTAGC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL7166Contig1 738 2 3 U
TACAGAGAACTAATAGTTATTTAGATATTGTAGATGAACACAAGTATTATTATCAACCCA
TATCTGTTAATGGTTTAGAAAGGCCAAAACTAATACAGTTTATGTAAAGAGTTCTTTAAA
AAAAGCTAAAACAGAAACACATCTAAGAAAAGACTTCAACTCAACTCGACTTGCCTTCGT
TTAGCTTTGGGATTTTCTTGTATTCGTACGAGTTTATGTCCACCTTCCCTTGCATAGCCT
TGAGCTCGTCTTCAATGGAAGTGTTTTTAGGTTTGTAAGCATCGACAGGTCCAGTTCTAG
AAAGAGCCTTTTCGTCTCGATAATCTCCCATTCCTGGTCGTCTTTCACCTTTGCAATGTC
CTTACTGCCTTGGAGGAGTTGGCTGAGTCCAAGGGCTCCAAAAACAGTGAGAGAGATCAT
GGGAAGTCCGTATCTAACAAAAGGGTGTCTCCTTCCCCACCTTTTAAAATGAAGAGGAAG
ATGGTTGCTTGAGAGTAGTGGAAGGAGATGATGGCTTTTGAGTTTTTGGACCTGTTTCGA
TTGTTGTCATCTTTGTATATCCACAAAGAAAATGACTTTGCTTGGCGTCTCAGAGAGAGA
GAGAGAGAAGAAGAGAGTTCGAAAGCAGAATCGGAATTAGTGATCGAAGCTATTACATGC
ATACAACTAGTCGCGATCGCAAAACAGAGATCAAGGGGGGGAAGGCGGCGGAGAAGTGCA
AATCCGGTCCAAATTTCC


BQ
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AF RS1BQ17TF C 1
AF RS1BQ17JQ U 2
BS 1 1 RS1BQ17TF
BS 2 721 RS1BQ17JQ
BS 722 738 RS1BQ17TF

RD RS1BQ17TF 738 0 0
TACAGAGAACTAATAGTTATT*AGATAT*GTAGATGAACACAAGTATTAT*ATCAACCCA
TATCTGTTAATGGTTTAGAAAGGCCAAAACTAATACAGTTTATGTAAAGAGTTCTTTAAA
AAAAGCTAAAACAGAAACACATCTAAGAAAAGACTTCAACTCAACTCGACTTGCCTTCGT
TTAGCTTTGGGATTTTCTTGTATTCGTACGAGTTTATGTCCACCTTCCCTTGCATAGCCT
TGAGCTCGTCTTCAATGGAAGTGTTTTTAGGTTTGTAAGCATCGACAGGTCCAGTTCTAG
AAAGAGCCTTTTCGTCTCGATAATCTCCCATTCCTGGTCGTCTTTCACCTTTGCAATGTC
CTTACTGCCTTGGAGGAGTTGGCTGAGTCCAAGGGCTCCAAAAACAGTGAGAGAGATCAT
GGGAAGTCCGTATCTAACAAAAGGGTGTCTCCTTCCCCACCTTTTAAAATGAAGAGGAAG
ATGGTTGCTTGAGAGTAGTGGAAGGAGATGATGGCTTTTGAGTTTTTGGACCTGTTTCGA
TTGTTGTCATCTTTGTATATCCACAAAGAAAATGACTTTGCTTGGCGTCTCAGAGAGAGA
GAGAGAGAAGAAGAGAGTTCGAAAGCAGAATCGGAATTAGTGATCGAAGCTATTACATGC
ATACAACTAGTCGCGATCGCAAAACAGAGATCAAGGGGGGGAAGGCGGCGGAGAAGTGCA
AATCCGGTCCAAATTTCC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1BQ17JQ 720 0 0
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ATCTGTTAATGGTTTAGAAAGGCCAAAACTAATACAGTTTATGTAAAGAGTTCTTTAAAA
AAAGCTAAAACAGAAACACATCTAAGAAAAGACTTCAACTCAACTCGACTTGCCTTCGTT
TAGCTTTGGGATTTTCTTGTATTCGTACGAGTTTATGTCCACCTTCCCTTGCATAGCCTT
GAGCTCGTCTTCAATGGAAGTGTTTTTAGGTTTGTAAGCATCGACAGGTCCAGTTCTAGA
AAGAGCCTTTTCGTCTCGATAATCTCCCATTCCTGGTCGTCTTTCACCTTTGCAATGTCC
TTACTGCCTTGGAGGAGTTGGCTGAGTCCAAGGGCTCCAAAAACAGTGAGAGAGATCATG
GGAAGTCCGTATCTAACAAAAGGGTGTCTCCTTCCCCACCTTTTAAAATGAAGAGGAAGA
TGGTTGCTTGAGAGTAGTGGAAGGAGATGATGGCTTTTGAGTTTTTGGACCTGTTTCGAT
TGTTGTCATCTTTGTATATCCACAAAGAAAATGACTTTGCTTGGCGTCTCAGAGAGAGAG
AGAGAGAAGAAGAGAGTTCGAAAGCAGAATCGGAATTAGTGATCGAAGCTATTACATGCA
TACAACTAGTCGCGATCGCAAAACAGAGATCAAGGGGGGGAAGGCGGCGGAGAAGTGCAA

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL7167Contig1 723 2 2 U
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TGATGGAATATGATGAAGAGAACAACCAACTCGAAGCCGAGTTTTGTCCGGTTGAGCATC
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TTATCCACAATTCAACTGACAAAACCAAACCGGACTGGGTCAAACACAGAGCCAGCTGCG
AAACTCCGGTTTATTCACCTCCAAGGCATGTCCGTAACGTAAGGAAGAGACACAACTCGT
TCGTCGAAGGAGACAACAGTTTCTTCACGAGATCTATGTTCTCCACATCGACTCACGAGG
AAGAAACCACATCTCGAAGATCCACATCTCGAAGATCCACTGCCACAACAATATACCGAG
TTTTTCAACAAGTTCACGAGATGGAGCCGTGAAGAATCCAACTTTATGTTTTGAGATTTT
AAACTATATCCCTTGTTCGAGTTGCTTTTAGTTTCTGTTGGGTTTAACGTAGATCGTCGT
TCTGTAGTACCAAGTTTTCGGTATAGGTGTTATATTTTCATTCGGTGTTAACCGGCCCGG
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CGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 

AF RS1AY19TF U 1
AF RS1AY19JQ C 1
BS 1 706 RS1AY19TF
BS 707 723 RS1AY19JQ

RD RS1AY19TF 706 0 0
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TGATGGAATATGATGAAGAGAACAACCAACTCGAAGCCGAGTTTTGTCCGGTTGAGCATC
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TTATCCACAATTCAACTGACAAAACCAAACCGGACTGGGTCAAACACAGAGCCAGCTGCG
AAACTCCGGTTTATTCACCTCCAAGGCATGTCCGTAACGTAAGGAAGAGACACAACTCGT
TCGTCGAAGGAGACAACAGTTTCTTCACGAGATCTATGTTCTCCACATCGACTCACGAGG
AAGAAACCACATCTCGAAGATCCACATCTCGAAGATCCACTGCCACAACAATATACCGAG
TTTTTCAACAAGTTCACGAGATGGAGCCGTGAAGAATCCAACTTTATGTTTTGAGATTTT
AAACTATATCCCTTGTTCGAGTTGCTTTTAGTTTCTGTTGGGTTTAACGTAGATCGTCGT
TCTGTAGTACCAAGTTTTCGGTATAGGTGTTATATTTTCATTCGGTGTTAACCGGCCCGG
TTGGCAGATATGAAAGTTCATATTTTCGTGTATGTAAATGCAAGACCCAATGTTAAATTT
GGGCTTTCCGTACAATATTTTCAGTATCGTTATACTAACTACAGAT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RS1AY19JQ 723 0 0
GGACGAAGATAATGGACTTCCTTCCCCCAGTCAAACCAGAAAGTGTGGAGGAGATAGTGT
TGATGGAATATGATGAAGAGAACAACCAACTCGAAGCCGAGTTTTGTCCGGTTGAGCATC
CAGTTGAACCGGAAGAAGAAGATCGTCCAGTTAAATGTCCCGTACCAATCTCATCTTCTC
TTATCCACAATTCAACTGACAAAACCAAACCGGACTGGGTCAAACACAGAGCCAGCTGCG
AAACTCCGGTTTATTCACCTCCAAGGCATGTCCGTAACGTAAGGAAGAGACACAACTCGT
TCGTCGAAGGAGACAACAGTTTCTTCACGAGATCTATGTTCTCCACATCGACTCACGAGG
AAGAAACCACATCTCGAAGATCCACATCTCGAAGATCCACTGCCACAACAATATACCGAG
TTTTTCAACAAGTTCACGAGATGGAGCCGTGAAGAATCCAACTTTATGTTTTGAGATTTT
AAACTATATCCCTTGTTCGAGTTGCTTTTAGTTTCTGTTGGGTTTAACGTAGATCGTCGT
TCTGTAGTACCAAGTTTTCGGTATAGGTGTTATATTTTCATTCGGTGTTAACCGGCCCGG
TTGGCAGATATGAAAGTTCATATTTTCGTGTATGTAAATGCAAGACCCAATGTTAAATTT
GGGCTTTCCGTACAATATTTTCAGTATCGTTATACTAACTACAGATTATCTTTGCGTCCG
CGG

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

CO CL7168Contig1 718 2 2 U
GGGGAGACTCGCGATTTGAAATCTTTGTCGTCGTCTCATCTCCATCGTCGTCGTCAGCTC
CGCCAGCCATCGACGATCTCCTTCAGCTATGTCATCGACGTTATCTTTCAGCTCGGCCAT
CGGCGATCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCATTCTCTTTCTCTCTCTCTATCTCTC
TCTGATTTTGAATCGGAAATGTTATCTTCTTCTTCCTTGATCTCCTATCTCTCGCTTAGA
GGTTTTGACCGTTTCTGATTGACTGTATTTGATTGGATCGTATTTGCTGCGAAAATTCCA
CCGGTTTACAGGGAAGCTCATGACCTTAAGGAGAGCGAGTATGGTTACGCTCGCAAGGTT
TCAGGACCTGTCGTTGTTGCGGATGGTATGGCTGGTGCTGCCATGTATGAGTTATCTTCA
AGAACGTTCCTTTCAATCCTGGCTTCTACTCCGAAGCTTCTTTCTTCTTCAGAGGAGATA
GTTAGTGGAGATAGCTCCAAGATCATCCCATGCTTGTCGATCTCAAGAATGGAGAGACCT
ACAGTGGGCATTTAGTAAATTGTGATACGTGGATGAACATTTATATTCGTGAAGTAATCT
GCACATCAAAGGACGGTGACAGGTTTTGGAGAATGCCGGAATGTTGCATCTTGAACAAGG
ATTGTCTAATATTTTTGTGGCGACCGCCACTTTCGAATATGATAAAATAATTCGAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G406TF U 1
AF RS1G406JQ C 201
BS 1 429 RS1G406TF
BS 430 718 RS1G406JQ

RD RS1G406TF 429 0 0
GGGGAGACTCGCGATTTGAAATCTTTGTCGTCGTCTCATCTCCATCGTCGTCGTCAGCTC
CGCCAGCCATCGACGATCTCCTTCAGCTATGTCATCGACGTTATCTTTCAGCTCGGCCAT
CGGCGATCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCATTCTCTTTCTCTCTCTCTATCTCTC
TCTGATTTTGAATCGGAAATGTTATCTTCTTCTTCCTTGATCTCCTATCTCTCGCTTAGA
GGTTTTGACCGTTTCTGATTGACTGTATTTGATTGGATCGTATTTGCTGCGAAAATTCCA
CCGGTTTACAGGGAAGCTCATGACCTTAAGGAGAGCGAGTATGGTTACGCTCGCAAGGTT
TCAGGACCTGTCGTTGTTGCGGATGGTATGGCTGGTGCTGCCATGTATGAGTTATCTTCA
AGAACGTTC

QA 1 429 1 429
DS 

RD RS1G406JQ 518 0 0
GTTATCTTCTTCTTCCTTGATCTCCTATCTCTCGCTTAGAGGTTTTGACCGTTTCTGATT
GACTGTATTTGATTGGATCGTATTTGCTGCGAAAATTCCACCGGTTTACAGGGAAGCTCA
TGACCTTAAGGAGAGCGAGTATGGTTACGCTCGCAAGGTTTCAGGACCTGTCGTTGTTGC
GGATGGTATGGCTGGTGCTGCCATGTATGAGTTATCTTCAAGAACGTTCCTTTCAATCCT
GGCTTCTACTCCGAAGCTTCTTTCTTCTTCAGAGGAGATAGTTAGTGGAGATAGCTCCAA
GATCATCCCATGCTTGTCGATCTCAAGAATGGAGAGACCTACAGTGGGCATTTAGTAAAT
TGTGATACGTGGATGAACATTTATATTCGTGAAGTAATCTGCACATCAAAGGACGGTGAC
AGGTTTTGGAGAATGCCGGAATGTTGCATCTTGAACAAGGATTGTCTAATATTTTTGTGG
CGACCGCCACTTTCGAATATGATAAAATAATTCGAGAT

QA 1 518 1 518
DS 



AS 1 2

CO CL7169Contig1 909 2 16 U
ACATAAAGGCTTTTAACCATCTTATCCAGGCTCTCCAATTCACTTCAGACAATAAACCCA
CCAAGATTGATCATAATCAAGAACACCAGGAATCTCGAGATCAAGATTTGAGATCGAATT
TGATGGTAAGACCAATAAGAGGAATCGCTCTTCGCCAAAATCAAATCCTTGACCACTACT
ACTACACTCCCATTCCTTTCTTCTTCAGTGAAGTCAACGGTCAACACGCAAACCCTAATT
ATAGTTATAATCTTCACCACCGTCCTCATCGTCAAGCTCAGCCGCAAAGATTAACGGCAA
AACGAGGAGTAAGGGCTCCGAGGATGCGGTGGACGACGACCCTTCATGCCCATTTCGTTC
ATGCTGTTCAATTATTGGGTGGTCATGAAAGAGCCACTCCAAAATCAGTACTTGAGTTGA
TGGATGTTCAAGATCTCACACTGGCTCATGTTAAATCTCATCTACAGATGTATCGGACCA
TAAAATCTACTGAGAAGCCTACAACATCATCAGATATAGAGCAATCAGATACTTTCGAGA
AGGAATTAAAAGTAAACAGTGTGAGACAAGCCAAAGATCTCCAAGGTCTGTGGAATAACT
CCTCAAGTGAATCTCGGTTCCATTTAAAGGCAAAGGCATCAGGTCTAGACATTACATCCA
ATAAGAATGTGGATCAAAGATGTCCAAGCTACGAACGATTGTCGTCGGATTCGTCCAGTC
TCACTGGGACAAGACCAGAGATTGAAACTCCCAATCTCGAGTTCACTTTAGCTATACCAA
ACCTTCCTCCCTAGTTTTCTATATATATGTCAAAAACAAAATAAAAAAACTGTAAAAATA
TACAAATCTCAAACTTTACGGTTATGCTTGCGTTATGAAAAAATATGAAATGATGTTTGT
TTCTCCGAC


BQ
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AF RS1C754TF U 1
AF RS1C754JQ C 145
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AA

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QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

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BQ
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TCACATTACCTGTATTTCATTTTTATTTTTGTTAAACCGGTTTGAAAATTTGGCG

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DS 

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AAATGTTGGAAAGTTGTAGAAATCTCTTTTTTAGTTTGTGGTTGGTTCATCTCGTACGTT
CTCTGTTATGTAGAGTTGTGCTTATTTTGAACAATTATATAGAAGCAAGAAAAGATCATA
TCACATTACCTGTATTTCATTTTTATTTT*GTTAAACCGGTTTGAAAATTT

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

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AATGCAAACCCATTAAAATTCACAAGCTTAAATACCCAGATAGAGAAGCGGTGCAAGTGG
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TGCCTGAAACAGAAATCCCCGGCCGTCGTAAAGTTTCTACCACCGTAAATATTTTGATTT
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GTG


BQ
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20 20 20 

AF RS1BK55TF C 1
AF RS1BK55JQ U 17
BS 1 16 RS1BK55TF
BS 17 723 RS1BK55JQ

RD RS1BK55TF 723 0 0
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AATGCAAACCCATTAAAATTCACAAGCTTAAATACCCAGATAGAGAAGCGGTGCAAGTGG
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TGCCTGAAACAGAAATCCCCGGCCGTCGTAAAGTTTCTACCACCGTAAATATTTTGATTT
TTTTATTTTTATAAATTTTTTCCACCAGTGATTTTTTTCTTTTTCAAGACTTGAAACTCG
ATACCAATCGAACTCCATCATTCACTCAAACCGTCGTTTATGCTTGAGAACTCAGCCTCC
AATAGATGATAACTCAGGGAGAGCTCGGTAGATCAACAAAAGACTTTTGTCGTACCATCA
AAAAAATGCCGGCTTATCTAAAACTCACTTTAGGATTCAACTGAAAACAAATCCAACACC
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GACCATTTTACAGACTCATGTGGACTCTGTAGATACCCAGATAGAGAAGCGGTGCAAGTG
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GTG

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1BK55JQ 707 0 0
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AATTCACAAGCTTAAATACCCAGATAGAGAAGCGGTGCAAGTGGTGAGTATTCATGTTGA
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CCCCGGCCGTCGTAAAGTTTCTACCACCGTAAATATTTTGATTTTTTTATTTTTATAAAT
TTTTTCCACCAGTGATTTTTTTCTTTTTCAAGACTTGAAACTCGATACCAATCGAACTCC
ATCATTCACTCAAACCGTCGTTTATGCTTGAGAACTCAGCCTCCAATAGATGATAACTCA
GGGAGAGCTCGGTAGATCAACAAAAGACTTTTGTCGTACCATCAAAAAAATGCCGGCTTA
TCTAAAACTCACTTTAGGATTCAACTGAAAACAAATCCAACACCCAGATAGAGAATTGAA
TTTTTAATGATTGTTAAAATTTGTAAAATCTACCGTTATTGGTTTGTACATTCTCACATT
TTTATTAAAATTTAGTGTTACTGATTTGATGATTTTTGTTTGTCGACCATTTTACAGACT
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ACAAATTCATCTCCGTCACGACACGTGTCTTGTCGACGCTTTTCGTG

QA 1 707 1 707
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TACTTTATTTTCCCGTTTTACATTTATATTTCCTTAACCATGGTTTAGAACTTGTGTGGT
AATTTGATACAAAACAAATAGAATGGTGCATAAATGAACATATATACAATCAAGC


BQ
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AF RS1GB88TF U 1
AF RS1GB88JQ C 380
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BS 592 895 RS1GB88JQ

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GGTCGACCCGCTTGGCTTGGAACCGTTTCGGTCCGGTTGGGTGATATGTACGCTGGAGAA
GAGAGAGCGTTGCTCGTGGAAATCAAAGCGCCGGTTAGTTCTTCTTCCACCACGAGTAGG
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AACCCGGAAGATCGGGCGCTTCTGATTCCTTATCCTGTAACCGTACGATCATCATCCAAT
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CGGCTTATAGAGCGCAACGATTACTCTGGAGCTGAGAGATTGCTGACGTCAGCTCGAGCC
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QA 1 591 1 591
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CTTGGAAAGCGGCGGAGAGATTGGCTAAAGTGGCGAAGATGAGAAAACATATGAACAGAG
TCAGTGACTTGCATGGGTTCGAAAACGCTAGATTTTAGTTCTACTTTATTTTCCCGTTTT
ACATTTATATTTCCTTAACCATGGTTTAGAACTTGTGTGGTAATTTGATACAAAACAAAT
AGAATGGTGCATAAATGAACATATATACAATCAAGC

QA 1 516 1 516
DS 



AS 1 2

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GACTAAATTTTTTGTGGGAACTGGTTTGCGTTTCTAGACTTTTGCTGGATATTATGATTG
TTGTTTCTTTTTGGACC


BQ
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AF RS1AR18JQ C 1
AF RS1AR18TFB U 1
BS 1 737 RS1AR18TFB

RD RS1AR18JQ 737 0 0
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DS 

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GATGCCAAGAGGACGTGGACACCGTTACCCTCCTGGTAGAAACATGCCCGACGAAGGTCC
AATGCCAGGACCATTTCCACCTTATGACGTTAATGGAGTGCCTCTTGGTCAGCATATGCC
TGCTGGTACTGCTTCACTGGCTTCTTCCCTTGCTCAAGCTTCGCCTGCTCAGCAGAGAAC
TATGCTGGGAGAGGCTCTATACCCATTGGTGGATCAGATAGAGCACGAGAACGCAGCCAA
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GACTAAATTTTTTGTGGGAACTGGTTTGCGTTTCTAGACTTTTGCTGGATATTATGATTG
TTGTTTCTTTTTGGACC

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

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CAACTGTTGGAATCTGAAGAAGCGGTTCCTGCTCAAGAAGGCCACGACCAGATACCTTCC
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GGTAATTGCATCATCTTCGGTGTTTGTACCTCTCCAACTTATATATAGGCTTTACTTTGG
CAGTGCTTTGCTGCCCAATATTTTATCTTTCATGTAGTTTGAACTCTCATTGCAGTTTCT
GACTATTTCTTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EV64TF U 1
AF RS1EV64JQ C 601
BS 1 667 RS1EV64TF
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RD RS1EV64TF 790 0 0
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CAACTGTTGGAATCTGAAGAAGCGGTTCCTGCTCAAGAAGGCCACGACCAGATACCTTCC
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AAGTACC*TTTCCTCAAAAAG*CGGGCCAGATTGTGGAGCGACATCTTCATTTGCTTCTC
AGT
CCAAAAA

QA 1 783 1 783
DS 

RD RS1EV64JQ 613 0 0
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AGTTCCAAACAAAGGACGCTCGGCTACACGCAGGGCAATCTTCAGGCTCGGTCCACGTCA
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GGATGAGTTCCTCTGTAAACAAGACAGGAGTTCCAGCGACAAGAGCTATGTTGATCTTCC
TTTGCTTATGGGTTCTCTTACTATCTGTTAGCTTCAAAGTGGCAACCATGGTCTCTGCTC
GGTAATTGCATCATCTTCGGTGTTTGTACCTCTCCAACTTATATATAGGCTTTACTTTGG
CAGTGCTTTGCTGCCCAATATTTTATCTTTCATGTAGTTTGAACTCTCATTGCAGTTTCT
GACTATTTCTTCC

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 2

CO CL7176Contig1 1107 2 2 U
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TCGTACAAGAAACTCTCCCAAGCCTGATCAGGCGAGGACAAAACCGACAGCTAACAAGAT
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CAAGCCAGCTTCAAAAGTCACTTCACTGTCTACTTCCCAGTCTTCTGTAAAGAAGGAGAA
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TCTTGGCCCATCATCTGCCTCTGATCCTAGTGCTCTTACAAGCACTAGAAAATCGTTGAT
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TTATGACCTCGAAACTTCCGTCCAAGAGCAAAAGCAGATTCCAGCAAAGGCTACTACTAT
TCCGTCAGTAGCTACACGGCAGAAGGAAAATGGCAGGCATGCAAAAGCAAGTGGCATGGA
GAAGAGAAGTAGTACTAGCGCTCATGGTTATTCTGCGTCTCGTGGGTTGAAAAGCAATGC
GGCAGCTGAGAAACAACAAAAAGAGCTTTCCAAATCTGGCGCAAGACCTATAGACAAGAC
ACGCTTGCAGAAGAACCCAAAGGCTGGAGTGGTTGATGCCAAGACAAAGAGGGAGTCTCT
GACTCCGAAAGCAAAACCAGTACGTACCTTACCAAAAGTCTCTTCAGAGAAGATGTTATG
ATAGCTATATCCGTCCTGTTATAGTGTGATCTTTGCCACCAATGTTGTTTGTTTCATTAG
TCTTGAGGTGCAGAATCAATTTTTACTTTTGTTATATAGAGGAGTCTCTAGTATCATGTA
ATAAGGCCTAATGTTAAAATATCCCTTAGGGGATGATGAATAGTTATATCTTAAATTCAT
GTGTATGTGTATAGACTACGTTGGACC


BQ
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AF RS1C907TF U 1
AF RS1C907JQ C 273
BS 1 632 RS1C907TF
BS 633 1107 RS1C907JQ

RD RS1C907TF 632 0 0
GGTGACAGAGAACATTCTATGCAATGATACTACTGGCAATACGGATGAAACACCAAAGAA
GGAGATGGAGAAAGAGAAACCCCAAAAACTAATCAAGAAGGGTGGAAACTTGGGGATCAA
TCGTACAAGAAACTCTCCCAAGCCTGATCAGGCGAGGACAAAACCGACAGCTAACAAGAT
TGCAACAAGCAAGAAAACTCCACCGAGCAAGGAAGTCAAGAACATGATGAAACCAACAAA
GAAACCAGCAGCACCTATCTCAAAAGCAGCCTCACCAGGGTTTTCAACACCAAGAGTGTA
CAAGCCAGCTTCAAAAGTCACTTCACTGTCTACTTCCCAGTCTTCTGTAAAGAAGGAGAA
TGCCTCTTCTCTACTGAGAAACAAACAAACCGCTCCAAAGTCATTGCATATGTCTATGAG
TCTTGGCCCATCATCTGCCTCTGATCCTAGTGCTCTTACAAGCACTAGAAAATCGTTGAT
TATGGAGCGTATGGGAGATAAAGACATTGTCAAACGTGCGTTTAAGTCATTTCAAAAGAG
TTATGACCTCGAAACTTCCGTCCAAGAGCAAAAGCAGATTCCAGCAAAGGCTACTACTAT
TCCGTCAGTAGCTACACGGCAGAAGGAAAATG

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1C907JQ 835 0 0
CTCACCAGGGTTTC
ACACCAAGAGTGTACAAGCCAGCTTCAAAAGTCACTTCACTGTCTACTTCCCAGTCTTCT
GTAAAGAAGGAGAATGCCTCTTCTCTACTGAGAAACAAACAAACCGCTCCAAAGTCATTG
CATATGTCTATGAGTCTTGGCCCATCATCTGCCTCTGATCCTAGTGCTCTTACAAGCACT
AGAAAATCGTTGATTATGGAGCGTATGGGAGATAAAGACATTGTCAAACGTGCGTTTAAG
TCATTTCAAAAGAGTTATGACCTCGAAACTTCCGTCCAAGAGCAAAAGCAGATTCCAGCA
AAGGCTACTACTATTCCGTCAGTAGCTACACGGCAGAAGGAAAATGGCAGGCATGCAAAA
GCAAGTGGCATGGAGAAGAGAAGTAGTACTAGCGCTCATGGTTATTCTGCGTCTCGTGGG
TTGAAAAGCAATGCGGCAGCTGAGAAACAACAAAAAGAGCTTTCCAAATCTGGCGCAAGA
CCTATAGACAAGACACGCTTGCAGAAGAACCCAAAGGCTGGAGTGGTTGATGCCAAGACA
AAGAGGGAGTCTCTGACTCCGAAAGCAAAACCAGTACGTACCTTACCAAAAGTCTCTTCA
GAGAAGATGTTATGATAGCTATATCCGTCCTGTTATAGTGTGATCTTTGCCACCAATGTT
GTTTGTTTCATTAGTCTTGAGGTGCAGAATCAATTTTTACTTTTGTTATATAGAGGAGTC
TCTAGTATCATGTAATAAGGCCTAATGTTAAAATATCCCTTAGGGGATGATGAATAGTTA
TATCTTAAATTCATGTGTATGTGTATAGACTACGTTGGACC

QA 15 835 15 835
DS 



AS 1 2

CO CL7177Contig1 758 2 2 U
GGAAGGAAGATTCATCAAATGGAGCGTCCTCATGAAAGATCGAAACGCCTCCTTAACTTC
ACCTTACCTTATCTCCGTTGGGGTCAACAGAGATTCCTCAGATGCGTCAATCTACCTAAT
TCACATCATCTTCCTTCTTCTTCTTCGTCTCCTTCTCCAGATCACCCATCCCACAGATCC
GTCGTGGCGGCGGCGGCGGCTCGGCCGTGGAATCTGAGGACGAGAAGAGCTGCGTGTGGT
GAACCTGGAGACGAATCTCCGGCGAAGATCGAAATCGGCGTGAAGAGAGGTGTGGATGGA
GAAGAAATGGACAAGGATGAGAAACTGAAATTCTCTGTTTCGTTGTTGAAGAAAGAGATC
GAAGAGGATTTTTCGAACATGATTGGCAAAAGACTTCCAAGGAGACCTAAGAAGAGACCC
AGAACTGCTCAGAAGAAACTGAATACGATTTTTCCTGGATTGTGGTTGTCAGAAGAAGTA
ACGATAGATTCATATGACGTCCCTGAAGCTCTTGAAACGTGATAAAAGGTTGTTAACTTC
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AATGTCTCGGATCCGTGAAGAAACCCAAATTCTGGTTTCTTTTATTCATAACGTTTTAGT
TAAGAAGATTGTAGTGATGATGATATTCATCACCAGCCTAATTGTAATCTCCTGCTATTT
GTTTTATTTTATTTTAGTAAATTCAATTGCTTCAGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1F773TF U 1
AF RS1F773JQ C 34
BS 1 740 RS1F773TF
BS 741 758 RS1F773JQ

RD RS1F773TF 740 0 0
GGAAGGAAGATTCATCAAATGGAGCGTCCTCATGAAAGATCGAAACGCCTCCTTAACTTC
ACCTTACCTTATCTCCGTTGGGGTCAACAGAGATTCCTCAGATGCGTCAATCTACCTAAT
TCACATCATCTTCCTTCTTCTTCTTCGTCTCCTTCTCCAGATCACCCATCCCACAGATCC
GTCGTGGCGGCGGCGGCGGCTCGGCCGTGGAATCTGAGGACGAGAAGAGCTGCGTGTGGT
GAACCTGGAGACGAATCTCCGGCGAAGATCGAAATCGGCGTGAAGAGAGGTGTGGATGGA
GAAGAAATGGACAAGGATGAGAAACTGAAATTCTCTGTTTCGTTGTTGAAGAAAGAGATC
GAAGAGGATTTTTCGAACATGATTGGCAAAAGACTTCCAAGGAGACCTAAGAAGAGACCC
AGAACTGCTCAGAAGAAACTGAATACGATTTTTCCTGGATTGTGGTTGTCAGAAGAAGTA
ACGATAGATTCATATGACGTCCCTGAAGCTCTTGAAACGTGATAAAAGGTTGTTAACTTC
TTTTGTTCTATGTGTTCTTGAGACATTCTCAAGTTTAATTGTTGTTGAAGAAAATGTAGC
AATGTCTCGGATCCGTGAAGAAACCCAAATTCTGGTTTCTTTTATTCATAACGTTTTAGT
TAAGAAGATTGTAGTGATGATGATATTCATCACCAGCCTAATTGTAATCTCCTGCTATTT
GTTTTATTTTATTTTAGTAA

QA 1 740 1 740
DS 

RD RS1F773JQ 725 0 0
GAAAGATCGAAACGCCTCCTTAACTTCACCTTACCTTATCTCCGTTGGGGTCAACAGAGA
TTCCTCAGATGCGTCAATCTACCTAATTCACATCATCTTCCTTCTTCTTCTTCGTCTCCT
TCTCCAGATCACCCATCCCACAGATCCGTCGTGGCGGCGGCGGCGGCTCGGCCGTGGAAT
CTGAGGACGAGAAGAGCTGCGTGTGGTGAACCTGGAGACGAATCTCCGGCGAAGATCGAA
ATCGGCGTGAAGAGAGGTGTGGATGGAGAAGAAATGGACAAGGATGAGAAACTGAAATTC
TCTGTTTCGTTGTTGAAGAAAGAGATCGAAGAGGATTTTTCGAACATGATTGGCAAAAGA
CTTCCAAGGAGACCTAAGAAGAGACCCAGAACTGCTCAGAAGAAACTGAATACGATTTTT
CCTGGATTGTGGTTGTCAGAAGAAGTAACGATAGATTCATATGACGTCCCTGAAGCTCTT
GAAACGTGATAAAAGGTTGTTAACTTCTTTTGTTCTATGTGTTCTTGAGACATTCTCAAG
TTTAATTGTTGTTGAAGAAAATGTAGCAATGTCTCGGATCCGTGAAGAAACCCAAATTCT
GGTTTCTTTTATTCATAACGTTTTAGTTAAGAAGATTGTAGTGATGATGATATTCATCAC
CAGCCTAATTGTAATCTCCTGCTATTTGTTTTATTTTATTTTAGTAAATTCAATTGCTTC
AGTGC

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL7178Contig1 769 2 2 U
GGGCTGGTTAAGGAGGCAAGTTTTCTGGATATCAAAGCAAATATTACAGCTAGTTATGGA
AGATGCTGTGGATGACTGGCTCCTGAGGGAAGTGTGTTGGCTGCGGAATGAAGACACAGT
AGCTCATGGAATACGTTGGGCTCAAGATCTTCTTTGGCCAGATGGCGTGTTCTTTACCAG
AGTGGGTGACGGTCAAGAGGCATCGGATAGGACCGACCCTAGTGATAATGCTTTCCAAAT
AGCAGGCCAACTTGGTGGCATGAAGGATGTTAAACCCAGTACCTTTGAGCAGCAATTCGA
AGCTTCACGCAGGGCTAGTGAAATCAAGAAATTCCTTTTCGATGGGGCGCCAACAGCCTT
AGTGGGCTTGGTAGGGCACAATCAGTACAGGAGATGCGCAAGAGACATCTTCTATTTCAC
TCAGTCAAACATATGCATAAAGCAACTAACATTTGCAATACTGGAGTTGCTACTCCGAAC
GGTATTCCCGGAGCTGAAAGATCTTCTGAGAGACATTAGGGAGAACTCGAACGGTCGGTC
AGAGTAATAGCACCATGTTTATAATGAGGGAGGTAGCCTAAGATTGACATGAACCAGTTG
CTTTATCTTTCTCTTTATTAAACTTCGATTCTTTTTTTTTTTTGCTTTTAGTGCTTTTTG
GGGTTCTTTTAAATATTCTTCCTTGTGTATAAAACATCAATTTGCGAGGGTTCTGTATAC
AACAATGACAGAAGGGTTCTGTATATAAACCTTTTGTGTGTTTCTTTCT


BQ
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A
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DS 



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DS 

RD RS1BH95TF 570 0 0
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TCAACCCAGCTTCAATTTGATTTTCAAAGACTATAAATGGCTTTGGTAAGAGGTCTCTTG
GGTGCAAAGAAGATCATGAGCCGCTCTGTAACGGCTACAACACCAAAAGGGTTTCTTGCG
GTGTATGTTGGAGAGGACAAGGTCCAGAAGAAGAGATACATAGTTCCTGTCTCATATTTG
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CCAATGGGTGGCTTAACGATCCCTTGTCCTGAAGATACTTTCATAACTGTGACTTCTAGC
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ATATAATTATTCAATGTAAATAGGTCAACCTTTTTCCTCGTTCTTTGAGAGAAGAGAGTT
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ATCTCTGTTCAAATTGCAGAAAGCTTTCTG

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 2

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AF RS1GS80JQ C 1
AF RS1GS80TF U 1
BS 1 650 RS1GS80TF
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BS 716 716 RS1GS80JQ
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RD RS1GS80JQ 747 0 0
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CTGAAAATTGACAACTTCGACACTTCCAGTGCTGCTTAGGTTTGTGTGTTTTGTTCACAT
TTTAGTCCCAAACACAACAACAGTTCGTCTCTTTCTTTGTCTTGTTTTGTTATAATACAT
GGTGGTTGTTGACCATCTCTTTATCATAAACCATTCACATTCTCTTGCTTGGTGCCATCT
GGTAGCCGTAACATCACCTTTTTAAGG

QA 1 747 1 747
DS 

RD RS1GS80TF 743 0 0
GATGCATTTTCTTTGCCTATTTTATGTTGAAACAAAAATTCCGAGACATGTTTGGTTTGG
ACAGGTATCTTCTGGAAAGGCAGATGTTAAGCGGCTCTTTATATCTGGAGGTTCTGCAGG
AGTTACACAGCTCTTACAGCATTGGCATTAAGAAATGTCTTCAAGGCTGGAGCGTCTTTG
TACGGGGTGGCTGACCTTAAAATGCTGAAAGAAGGTCATAAGTTTGAATCCCGCTATATC
GACAGTCTTGTTGAAGAAGAAAAGGATTTCTATGAGAGATCACCAATCAACTTCGTCGAT
AGGTTCTCTTGCCCCATCATCCTTTTCCAAGGATTGGAAGACAAGATTGTAAACCCGGAT
CAAACTCGTAAAATCTATCAGGCACTGAAGGAAAAAGGTGTGCCTGTTGCCCTTGTCGAG
TACGAAGGAGAAGAACACGGTTTTCGTAAGGCAGAGAACATCAAATACACACTGGAGCAA
CTAATGGTGTTCTTTGCCCGAGTCGTCGGAGGGTTCCAAGTTGCTGATGACATCACTCCT
CTGAAAATTGACAACTTCGACACTTCCAGTGCTGCTTAGGTTTGTGTGTTTTGTTCACAT
TTTAGTCCCAAACACAACAACAGTTCGTCTCTTTCTTTGTCTTGTTTTGT*ATA*TACAT
GGTGGTTGTTGACCATCTCTTTATCATAAACCATTCACATTCTCTTGCTTGGTGC*ATCT
GGTAGCCGTAACATCACCTTTTT

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

CO CL7181Contig1 714 2 2 U
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CCGGAGGGCCAATTTACGACACTGATGGTGATGTCATAATTGGAGGAAGTTACTATGTTC
TCCCTCGCATCTGGGGTGCTGCAGGTGGCGGCCTGAATCTCGCCCCCCGTGGTGACAACC
AATGTCCCCTCTTTATCGGACAGGAGCCTTCAGAGGTCAACAAGGGCATTCCCGTAAGAT
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CTCACTTTAGGACGATGTTCGTAACGGCTGGTCGTAAGCCAGAACATGGAGAAGATTCAG
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TTTGCCCTGAGGATAAAGATTGCATCAATGTCGGGATAAAAGTGGACCGGTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DJ36TF U 1
AF RS1DJ36JQ C 522
BS 1 599 RS1DJ36TF
BS 600 714 RS1DJ36JQ

RD RS1DJ36TF 599 0 0
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TCTCAAACTGGAGGTCTAGAGTTAGGTTCGTTCCTGAATCAATGAATCTTAACATAAAGA
TGGATGTCAAAGCTACGGTCTGCGTTCAGTCAACTTACTGGTGGGTCACTGCAGCCGAAT
CTCACTTTAGGACGATGTTCGTAACGGCTGGTCGTAAGCCAGAACATGGAGAAGATTCA

QA 1 599 1 599
DS 

RD RS1DJ36JQ 193 0 0
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AGCGGTTACAAGATTGCATTTTGCCCTGAGGATAAAGATTGCATCAATGTCGGGATAAAA
GTGGACCGGTCTG

QA 1 193 1 193
DS 



AS 1 2

CO CL7182Contig1 735 2 4 U
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TGCGCGTCCAGGGTGATTCACAGCTCGTCTGTAAGCAGGTTCGAGGTGAATGGGCAACCC
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TTTTTTAGCATGTGCTATGTGTTAACATGAACACGATGCTCTTCTCTCTCTCTCTTTTGC
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ATTCAATAATTTTCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B385TF U 1
AF RS1B385JQ C 1
BS 1 667 RS1B385TF
BS 668 668 RS1B385JQ
BS 669 711 RS1B385TF
BS 712 735 RS1B385JQ

RD RS1B385TF 711 0 0
GACACTTGTTTACTCTCTTGAGCAGCACTCGGAATCAGGAAACCCTTTCTTTTGCTTTGC
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TTGACGGTGCTTCAAGAGGAAATCCAGGAAGAGCTGGTGCAGGAGCCGTTCTCCGTGCTT
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TGCGCGTCCAGGGTGATTCACAGCTCGTCTGTAAGCAGGTTCGAGGTGAATGGGCAACCC
GAGACCCGAAAATGACTCAGCTTTGTGGACAAGCACAGGAGCTTATGAGTCAGTTTAACT
CATGCGATGTTCAACACGTTCCCAGGGAATTCAATTCAGCGGCCGATGCCCAAGCTAACC
GTGCGACCAATCTGGCAGAGGGTGAATATCAGCAAGATAATGCAGGCGGCCGCCATGGAA
GAAGGGGATACTAATATCGAATATGCATATTCCTGGTTTCTTGTTTTTGGGATCATGTCT
TTTTTTAGCATGTGCTATGTGTTAACATGAACACGATGCTCTTCTCTCTCTCTCTTTTGC
TTTGTCC*ACGGCATGTTGACTTCCCAAGAACATGTCTATGTTGTCTAGTA

QA 1 711 1 711
DS 

RD RS1B385JQ 735 0 0
GACACTTGTTTACTCTCTTGAGCAGCACTCGGAATCAGGAAACCCTTTCTTTTGCTTTGC
TTGCTATGGCTCGTCGTGAGGATCGTTCTCTTCCCAAAGACTCATATTGTACCATCGAGT
TTGACGGTGCTTCAAGAGGAAATCCAGGAAGAGCTGGTGCAGGAGCCGTTCTCCGTGCTT
CAGATAACACTGTGATCTACTCTTCTCGCGAGGGTTTGGGGGTTGCTACAAACAACGTTG
CTGAGTATCGAGCTCTCAATCTTGGCCTCGAGTCTGCTCTTAACCAAGGCTTTACAAATG
TGCGCGTCCAGGGTGATTCACAGCTCGTCTGTAAGCAGGTTCGAGGTGAATGGGCAACCC
GAGACCCGAAAATGACTCAGCTTTGTGGACAAGCACAGGAGCTTATGAGTCAGTTTAACT
CATGCGATGTTCAACACGTTCCCAGGGAATTCAATTCAGCGGCCGATGCCCAAGCTAACC
GTGCGACCAATCTGGCAGAGGGTGAATATCAGCAAGATAATGCAGGCGGCCGCCATGGAA
GAAGGGGATACTAATATCGAATATGCATATTCCTGGTTTCTTGTTTTTGGGATCATGTCT
TTTTTTAGCATGTGCTATGTGTTAACATGAACACGATGCTCTTCTCTCTCTCTCTTTTGC
TTTGTCCCACGGCATGTTGACTTCCCAAGAACATGTCTATGTTGTCTAGTACTTTATTCC
ATTCAATAATTTTCC

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

CO CL7183Contig1 644 2 4 U
TACATTGGAGTACACGCCAAGAAGCTAAGGGTGCTGTCGATAGCATTTGCTGGAGACAGT
GATCTAATGCTACACCACTTGTTGTCTGGATGTGAGAGTTTAAAGAAGCTGGAGATAAGA
GATTGCCCCTTTGGAGACACTGCGCTGCTCGAGAACGCCGCTAAACTTGAAACCATGCGA
TCCCTTTGGATGTCTTCTTGCTTTGTGAGTTTTGGTGCTTGCAAGCAATTGAGTCAAAAG
ATGCCAAGGCTAAATGTTGAAGTCATTGATGAGCATCCTCCAAAGACAAGACCTGATAGC
TCTCCTGTTGAGAGGATATACATATATAGAACAGTCGCTGGACCGAGGTTGGATACGCCT
GAGTTTGTGTGGACAATACACAAGAAACCTGAGGTTGGAGTTTCACGTTTAGCTATACGG
TGAAGTTGGTGCTTCAGTATTATGCTCTTTCATATCGACTTTTTGCAGAAAATGTTGTGG
GGGATTCGTCTTCCAATATGTTCGTTTTTTCTTTCATATTGTTTTTTCACTAAGAGTGTT
AGAATCATTTCATTAGTTTTGTACTCTGTTAAACAAAAGCTTTTGTTGTCTTTGTACTAA
AAATGTCTGGAATAAGAGAAACTCTCACTTTGTGAGATTTCTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EV73JQ C 1
AF RS1BO51TF U 294
BS 1 294 RS1EV73JQ
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BS 336 336 RS1EV73JQ
BS 337 644 RS1BO51TF

RD RS1EV73JQ 586 0 0
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TCCCTTTGGATGTCTTCTTGCTTTGTGAGTTTTGGTGCTTGCAAGCAATTGAGTCAAAAG
ATGCCAAGGCTAAATGTTGAAGTCATTGATGAGCATCCTCCAAAGACAAGACCTGATAGC
TCTCCTGTTGAGAGGATATACATATATAGAACAGTCGCTGGACCGAGGTTGGATACGCCT
GAGTTTGTGTGGACAATACACAAGAAACCTGAGGTTGGAGTTTCACGTTTAGCTATACGG
TGAAGTTGGTGCTTCAGTATTATGCTCTTTCATATCGACTTTTTGCAGAAAATGTTGTGG
GGGATTCGTCTTCCAATATGTTCGTTTTTTCTTTCATATTGTTTTTTCACTAAGAGTGTT
AGAATCATTTCATTAGTTTTGTACTCTGTTAAACAAAAGCTTTTGT

QA 1 586 1 586
DS 

RD RS1BO51TF 351 0 0
G
GATAGCTCTCCTGTTGAGAGGATATACATATATAGAACAGTTGCTGGACCGAGGTTGGAT
ACGCCTGAGTTTGTGTGGACAATACACAAGAAACCTGAGGTTGGAGTTTCACGTTTAGCT
ATACGGTGAAGTTGGTGCTTCAGTATTATGCTCTTTCATATCGACTTTTTGCAGAAAATG
TTGTGGGGGATTCGTCTTCCAATATGTTCGTTTTTTCTTTCATATTGTTTTTTCACTAAG
AGTGTTAGAATCATTTCATTAGTTTTGTACTCTGTTAAACAAAAGCTTTTGTTGTCTTTG
TACTAAAAATGTCTGGAATAAGAGAAACTCTCACTTTGTGAGATTTCTAT

QA 2 351 2 351
DS 



AS 1 2

CO CL7184Contig1 713 2 3 U
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ATCCGATCTCAGAACGATGGGAAGCTACACTGATCTCTTCGATCTCACCACTCCGGTTCC
ATCCATTGGTGTTCTCCCCGAATAAATCGATGCCGTTTAGGACACAGAATAAGAAGATGA
TGAGCGTTTCTGCTGCCGCGTCTTCCGGGAAGGACCATTACTACGGAGGAGGGAGATTGG
TTGACGAGAACATGATCGTTTTGAGGAAACGCATACGAGATGAAGATGGTTGAGCGAAAC
TACGAGCCTCCTTCTCACTGGATGGATTGGGAGAAGCGTTTCTACAACAGCTACGACTCT
GTGATCTGCGAGTCCGTTGGTCTTCTCCAGAGTTTCCTCATGAATTCTCGCCCCACCGTC
GCAATCGCAATGCTGCTTCTCCTCTTGATCAGCGTTCCCGTTTCCTCCTCTGTTCTCGCG
TTTCGACTTCTTGATCTCCTTCATTGGGTTCTTGCCGCCGGAACACCTGGCCACATGGGC
TGAGCTGCTCGGCCCGTTTCATTCTATCTTTGGATATATTGGTTTTGTATATATTACACA
CATATTCTTTCATTATTTATCTGATTTTTACTTTAGCTTAAAATATGTTCAAAATCTCGT
TATTTCTTTATTCTTTCATGGGGGTCTGTACTTTATCTTCTATCAAAGTGACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AQ33JQ C 1
AF RS1AQ33TFB U 1
BS 1 80 RS1AQ33TFB
BS 81 81 RS1AQ33JQ
BS 82 713 RS1AQ33TFB

RD RS1AQ33JQ 713 0 0
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ATCCGATCTCAGAACGATGGGAAGCTACACTGATCTCTTCGATCTCACCACTCCGGTTCC
ATCCATTGGTGTTCTCCCCGAATAAATCGATGCCGTTTAGGACACAGAATAAGAAGATGA
TGAGCGTTTCTGCTGCCGCGTCTTCCGGGAAGGACCATTACTACGGAGGAGGGAGATTGG
TTGACGAGAACATGATCGTTTTGAGGAAACGCATACGAGATGAAGATGGTTGAGCGAAAC
TACGAGCCTCCTTCTCACTGGATGGATTGGGAGAAGCGTTTCTACAACAGCTACGACTCT
GTGATCTGCGAGTCCGTTGGTCTTCTCCAGAGTTTCCTCATGAATTCTCGCCCCACCGTC
GCAATCGCAATGCTGCTTCTCCTCTTGATCAGCGTTCCCGTTTCCTCCTCTGTTCTCGCG
TTTCGACTTCTTGATCTCCTTCATTGGGTTCTTGCCGCCGGAACACCTGGCCACATGGGC
TGAGCTGCTCGGCCCGTTTCATTCTATCTTTGGATATATTGGTTTTGTATATATTACACA
CATATTCTTTCATTATTTATCTGATTTTTACTTTAGCTTAAAATATGTTCAAAATCTCGT
TATTTCTTTATTCTTTCATGGGG*TCTGTACTTTATCTTCTATCAAAGTGACC

QA 1 713 1 713
DS 

RD RS1AQ33TFB 713 0 0
GGAAGCCACAACAACGATCTTCTTCAAACATTCCAAATTCACATAAAACAAATTTCAAGA
ATCCGATCTCAGAACGATGG*AAGCTACACTGATCTCTTCGATCTCACCACTCCGGTTCC
ATCCATTGGTGTTCTCCCCGAATAAATCGATGCCGTTTAGGACACAGAATAAGAAGATGA
TGAGCGTTTCTGCTGCCGCGTCTTCCGGGAAGGACCATTACTACGGAGGAGGGAGATTGG
TTGACGAGAACATGATCGTTTTGAGGAAACGCATACGAGATGAAGATGGTTGAGCGAAAC
TACGAGCCTCCTTCTCACTGGATGGATTGGGAGAAGCGTTTCTACAACAGCTACGACTCT
GTGATCTGCGAGTCCGTTGGTCTTCTCCAGAGTTTCCTCATGAATTCTCGCCCCACCGTC
GCAATCGCAATGCTGCTTCTCCTCTTGATCAGCGTTCCCGTTTCCTCCTCTGTTCTCGCG
TTTCGACTTCTTGATCTCCTTCATTGGGTTCTTGCCGCCGGAACACCTGGCCACATGGGC
TGAGCTGCTCGGCCCGTTTCATTCTATCTTTGGATATATTGGTTTTGTATATATTACACA
CATATTCTTTCATTATTTATCTGATTTTTACTTTAGCTTAAAATATGTTCAAAATCTCGT
TATTTCTTTATTCTTTCATGGGGGTCTGTACTTTATCTTCTATCAAAGTGACC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

CO CL7185Contig1 602 2 7 U
TTTTTTTTCTTATATTAATGGATTGTTTACATGGCCTACTCTATCAACAGAGCATGCCTG
TCTGCAATCTATGATAAATAAAGACCAAACTATTTTACATATCTTTTCTTTCTCATCTTC
CACACTGTTGAGGATTGGCACAAACCAACACACACAAACACCATATATTATACAACATTA
TTTATCGTTTTGTATATGGTTCCAGAACGATCAACTCTCAGAGCTTTGGAATCACTATTC
TCAGAATCCCATCCATAAATTCAGCACCAACGTTATCCTTGTTCACATTGCTAGGGAGTG
GCCAGGAAACTTTGAATGGACCTTGTAGTATTTCGTGCTTGTGATATCCAAAGATTGAAC
CCTTGGTACATGCATCAACTTTTTGACAGAGAGATGTGCGTCTACCTGTCACAGTCAAGT
TTAGGTTGTCGACCTCAACTCTTATATCATTGATACTAGCCCCTGGTAGCTCTACCGCCA
CAACATAGTTATGTTCATACTCTTCAACATTCGATCTCGGAGACCAAACAGTCCCGAGAT
TGGCTAACTTGGGAAGGTCAGGCGTGTATGGCTTTTCCAAGTCTTCCTTTAGCTGATATG
GT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1AU96JQ U 156
AF RS1BM89TF C 1
BS 1 164 RS1BM89TF
BS 165 239 RS1AU96JQ
BS 240 240 RS1BM89TF
BS 241 367 RS1AU96JQ
BS 368 368 RS1BM89TF
BS 369 477 RS1AU96JQ
BS 478 602 RS1BM89TF

RD RS1AU96JQ 322 0 0
ACAAACACC
ATATTATACAACATTATTTATCGTTTTGTATATGGTTCCAGAACGATCAACTCTCAGAGC
TTTGGAATCACTATTTTCAGAATCCCATCCATAAATTCAGCACCAACGTTATCCTTGTTC
ACATTGCTAGGGAGTGGCCAGGAAACTTTGAATGGACCTTGTAGTATTTCGTGCTTGTGA
TATCCAAAGATTGAACCCTTGGTGCATGCATCAACTTTTTGACAGAGAGATGTGCGTCTA
CCTGTCACAGTCAAGTTTAGGTTGTCGACCTCAACTCTTATATCATTGATACTAGCCCCT
GGTAGCTCTACCG

QA 10 322 10 322
DS 

RD RS1BM89TF 602 0 0
TTTTTTTTCTTATATTAATGGATTGTTTACATGGCCTACTCTATCAACAGAGCATGCCTG
TCTGCAATCTATGATAAATAAAGACCAAACTATTTTACATATCTTTTCTTTCTCATCTTC
CACACTGTTGAGGATTGGCACAAACCAACACACACAAACACCATATATTATACAACATTA
TTTATCGTTTTGTATATGGTTCCAGAACGATCAACTCTCAGAGCTTTGGAATCACTATTC
TCAGAATCCCATCCATAAATTCAGCACCAACGTTATCCTTGTTCACATTGCTAGGGAGTG
GCCAGGAAACTTTGAATGGACCTTGTAGTATTTCGTGCTTGTGATATCCAATGATTGAAC
CCTTGGTACATGCATCAACTTTTTGACAGAGAGATGTGCGTCTACCTGTCACAGTCAAGT
TTAGGTTGTCGACCTCAACTCTTATATCATTGATACTAGCCCCTGGTAGCTCTACCGCCA
CAACATAGTTATGTTCATACTCTTCAACATTCGATCTCGGAGACCAAACAGTCCCGAGAT
TGGCTAACTTGGGAAGGTCAGGCGTGTATGGCTTTTCCAAGTCTTCCTTTAGCTGATATG
GT

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 2

CO CL7186Contig1 458 2 5 U
GGGAGATAGAGCGATGAACACGCAAGTAGCGGCTCTTATGATTCTGGTGGCTTTGTCTTC
CACCTTGGATATGGTGACGGTAACGGAGGCTCAAGTAAACTGCATCGACAGTTGCACCAC
CGGCTGCGTCAAGCCTACCCCAAAAGAGACGATCCGATGCCACCACGAATGCGACAAAAA
GTGCAGCCGAGGTGGTAAAGGGGGAAGTGAGACTGCCGCTTAAACTTTATTTCACTGAAA
TCCATAAAGATTATGTTGTAATCTCATCTTTATAATCGTATCTACCTAAAACGTTATGTT
GTAACCAATAAATCAAGTGTTGTAGTTCATTGTTAAGTTAAAATGGTAAAGGATTTGTCC
TGTGGGTCAAATCCTTCCACTAACTATGGGCCTCCGTGTCGGCTATCTAAATAGTCTATG
TAAACGCTCTAAAGGCAAGATTATAAGGTTTTCGACAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1CQ45TF U 1
AF RS1BB66TF U 145
BS 1 186 RS1CQ45TF
BS 187 187 RS1BB66TF
BS 188 215 RS1CQ45TF
BS 216 216 RS1BB66TF
BS 217 458 RS1CQ45TF

RD RS1CQ45TF 458 0 0
GGGAGATAGAGCGATGAACACGCAAGTAGCGGCTCTTATGATTCTGGTGGCTTTGTCTTC
CACCTTGGATATGGTGACGGTAACGGAGGCTCAAGTAAACTGCATCGACAGTTGCACCAC
CGGCTGCGTCAAGCCTACCCCAAAAGAGACGATCCGATGCCACCACGAATGCGACAAAAA
GTGCAGTCGAGGTGGTAAAGGGGGAAGTGAGACTGGCGCTTAAACTTTATTTCACTGAAA
TCCATAAAGATTATGTTGTAATCTCATCTTTATAATCGTATCTACCTAAAACGTTATGTT
GTAACCAATAAATCAAGTGTTGTAGTTCATTGTTAAGTTAAAATGGTAAAGGATTTGTCC
TGTGGGTCAAATCCTTCCACTAACTATGGGCCTCCGTGTCGGCTATCTAAATAGTCTATG
TAAACGCTCTAAAGGCAAGATTATAAGGTTTTCGACAA

QA 1 458 1 458
DS 

RD RS1BB66TF 312 0 0
G
GAGACGATCCGATGCCACCACGAATGCGACAAAAAGTGCAGCCGAGGTGGTAAAGGGGGG
AGTGAGACTGCCGCTTAAACTTTATTTCACTGAAATCCATAAAGATTATGTTGTAGTCTC
ATCTTTATAATCGTATCTCCCTAAAACGTTATGTTGTAACCAATAAATCAAGTGTTGTAG
TTCATTGTTAAGTTAAAATGGTAAAGGATTTGTCCTGTGGGTCAAATCCTTCCACTGACT
ATGGGCCTCTGTGTCGGCTATCTAAATAGTCTATGTAAACGCTCTAAAGGCAAGATTATA
AGGTTTTCGAC

QA 2 312 2 312
DS 



AS 1 2

CO CL7187Contig1 814 2 3 U
GATAGATTTGCTACAATCTTCAGCCATGATTCTGATTCAATGCCACGTGTTTGGACTGGG
AAGGAGGACATCAGAGAAATCACCAAAATGGCTCGCTCTACATCCTTGAAGCTGCTTTCC
GTTATGGCTGTCATCCGCTTGGATGATGAACTCGACAATATTGAGAAGACATTGACTCTC
GCTCTGGTTAATCCTACGAGCAACAATGCTACCAACAGGAGCATCAGCACAATTGATTCA
CTTGCGTCAAGCACTTGGGAGCAGGTTGCACCAGAAAAGACGTTGATCACACCTGTACAG
TGTAAATCACTGTGGAGACAATTCAAAAACGAGACAGAATATACCGTTACACAGGCCATT
TCTGCACAGGAAGCTAACCGACGGAATAACAACTGGTTGCCACCTCCATGGGCAATCCTT
GCACTGGTCGTTCTTGGATTCAATGAATTTATGACGCTCTTAAGAAATCCTCTATGGCTC
TTGGTTCTGTTTGTTGGATACCTTGTTTCCAAAGCCTTGTGGGTGCAACTTAACATTTCA
GAAGAGTTCCGCAACGGAGCGCTACCTGGACTTCTTTCCTTGTCAACCAAGTTTCTTCCA
ATGGTAATGAACCTCCTCAAGAAACTAGCGGAAGAAGGACAAGCGCCGCCATCCACAAAT
ACCAACCAAACTGCGATGAGCTCCTCCGCTCAATCCGAGGTTACAACCAATGGTGAAATC
AGCAGCAGCAGCAGCAGCTCCCGTTCGTCTCCAGCGAGATCTGTTCCCATTGACACGAGT
TCATAGAACAAAGCCCACGAACCTATATATACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F091TF U 57
AF RS1A608TF U 1
BS 1 99 RS1A608TF
BS 100 100 RS1F091TF
BS 101 814 RS1A608TF

RD RS1F091TF 202 0 0
G
GGGAAGGAGGACATCAGAGAAATCACCAAAATGGCTCGCTCTACATCCTTGAAGCTGCTT
TCCGTTATGGCTGTCATCCGCTTGGATGATGAACTCGACAATATTGAGAAGACATTGACT
CTCGCTCTGGTTAATCCTACGAGCAACAATGCTGCCAACAGGAGCATCAGCACAATTGAT
TCACTTGCGTCAAGCACTTGG

QA 2 202 2 202
DS 

RD RS1A608TF 814 0 0
GATAGATTTGCTACAATCTTCAGCCATGATTCTGATTCAATGCCACGTGTTTGGACTGGG
AAGGAGGACATCAGAGAAATCACCAAAATGGCTCGCTCTGCATCCTTGAAGCTGCTTTCC
GTTATGGCTGTCATCCGCTTGGATGATGAACTCGACAATATTGAGAAGACATTGACTCTC
GCTCTGGTTAATCCTACGAGCAACAATGCTACCAACAGGAGCATCAGCACAATTGATTCA
CTTGCGTCAAGCACTTGGGAGCAGGTTGCACCAGAAAAGACGTTGATCACACCTGTACAG
TGTAAATCACTGTGGAGACAATTCAAAAACGAGACAGAATATACCGTTACACAGGCCATT
TCTGCACAGGAAGCTAACCGACGGAATAACAACTGGTTGCCACCTCCATGGGCAATCCTT
GCACTGGTCGTTCTTGGATTCAATGAATTTATGACGCTCTTAAGAAATCCTCTATGGCTC
TTGGTTCTGTTTGTTGGATACCTTGTTTCCAAAGCCTTGTGGGTGCAACTTAACATTTCA
GAAGAGTTCCGCAACGGAGCGCTACCTGGACTTCTTTCCTTGTCAACCAAGTTTCTTCCA
ATGGTAATGAACCTCCTCAAGAAACTAGCGGAAGAAGGACAAGCGCCGCCATCCACAAAT
ACCAACCAAACTGCGATGAGCTCCTCCGCTCAATCCGAGGTTACAACCAATGGTGAAATC
AGCAGCAGCAGCAGCAGCTCCCGTTCGTCTCCAGCGAGATCTGTTCCCATTGACACGAGT
TCATAGAACAAAGCCCACGAACCTATATATACTT

QA 1 814 1 814
DS 



AS 1 2

CO CL7188Contig1 831 2 10 U
GGACGGTACATTTTCCAAATTCAAGGTTAACTAAAGCACAAAAAAATCGTTTGAGACAAG
ACAAGAACCATGGATTTCCTCACCGATCAAGTAAAGAAGAAGTTCTCCGACAAGAAACCG
GAAACTTCAGACCCGGATCCGAACCACAACAATAACAAACCAGGCCACACCGATCCAACA
CATAAACCGGCTTCCAGCTCCGACCCAACGGCACATAAGCCAGCTACGAACGCCGAGCTC
ATGGCTAGTGCCAAGATCGTAGCCGAGGCTGCTCAAGCCGCTTCACGTAACGAGACAGAC
AAGCTCGACAAAGCTAAAGTCGCCGGAGCCACTGCTGACATACTAGACGCAGCTCAAAGA
TACGGTAAGTTCGATGAAAAGAGCGGTATTGGTCAGTACCTCGAGAAGGCTGAAAATTAT
CTCCACAAGTACGAAACTTCACACACTCACTCCTCTGGCGGCGCCGGAGGAAGCCACGGT
GGTGTCAGCGGAAGCCACGGTGGTGTCAGCGGAAGCCACGGGGGAGGAGCTGGAGAACAT
GCGGCTAAGAAAGAGGATGAGAAGTCGGGAGGTGGTAGCCATGGGTTAGGAGACTATGCT
AAGATGGCTCAAGGTTTCATGAAGTGAATTAATTAGTAGATAAAATAATAATAATTATGG
TAGTGATTTATCTTCCATGATTAGTTTTATGTATAAAGTTTGTCTATTTCTGAATTATTA
ACCGCTGAATTATCTTCCATAGGAATTTACTTTTTGTGGGTTGTTCTATTCCGGTCTGGT
TACCCAGACCACCTCAAGCTTGAGTAATAGAATAACCGTTTGCCGTTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D387TF U 1
AF RS1D387JQ C 71
BS 1 744 RS1D387TF
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AAGCTAAAGTCGCCGGAGCCACTGCTGACATACTAGACGCAGCTCAAAGATACGGTAAGT
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QA 1 761 1 761
DS 



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BQ
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AF RS1B203TF U 1
AF RS1B203JQ C 4
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ATGATCTCGCCGCTTCCTTGCCGGAGGACGACTGTCGCTACGCCGTGTTTGATTTCGATT
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ATATGTCATTAACAGCAGTAATTATCTATTAATGTTCGTTATTGTTGTTTAGTGCTTAAC
TTGGTATGTGAGACTTTCTTCCTTTCCTTCTATTGACAAGAGTTATCAACTATTAGTGGT
TCTGTTTGTTAGTCTAAATGTTGA*TGTTATTTTATGTCTCTTTT
GTCGCTATGCTTAA

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AAGACCGGACCAAATAAAATATTTACATTCCATTCAACCGGAGTTAAACCGTCAGTGATA
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QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

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AAGCTCTTGTTCTCGTTGTTAAGTAACGTTGTCAAATAATCTATTTAACTCTTTAGTGTC
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BQ
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AF RS1B656TF U 1
AF RS1BA26TF U 1
BS 1 704 RS1B656TF

RD RS1B656TF 704 0 0
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DS 

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AAGCTCTTGTTCTCGTTGTTAAGTAACGTTGTCAAATAATCTATTTAACTCTTTAGTGTC
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TGCAGACTATTAATGTTAATCAAGTAATCATCAATTACTTACTT

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

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CAATTGTTTCGACAT


BQ
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AF RS1E087TF U 1
AF RS1E087JQ C 299
BS 1 682 RS1E087TF
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TAATGAGTATACCTATAATATTTGTCTCAGTTTCACGCTGCAGTTGTGGTAGAAGAGATG
ATTAAGACAGAGTGCTTGAAAA*TGAACTGTGCTATTATGTACAATAAA*CCATAACTCA
ATCAGATCGTATGGATGAGACAA*GCCAATCGACTTAC*AGATCA*AAGTCACAACCAGT
TT

QA 1 782 1 782
DS 

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AACAATTGTTTCGACAT

QA 1 737 1 737
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GTCTTCTTGGACTCTTTTTTGTTCTTTCGTCTGTCTCAACACTTTTTATCATTTCATTTC
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GGCCTACG


BQ
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CT

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DS 

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QA 1 589 1 589
DS 



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AF RS1BY49JQ C 1
AF RS1BY49TF U 1
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RD RS1BY49JQ 705 0 0
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GAGTTCGAGAAGATTCGTCATGACGTCGAAGATCCACACTTGATTATCGACACTCTTATC
GACGTTCTTGTCAATTACCTAAAGGAGACCGATGGGAATCTTCTTCTATAAGCGTTTCTA
AATCACAAGGTTCGACTTTATGGAATGATGAATAATCTAATTAACAAACTTAAAAATTGA
ATTTAAATGGAACATATATGTGTGTGGGTCTACGATCATTGCAGTATCTTTTATTACGTT
TGGTACCTTAAGGTGTATGAGCTCGTATGACTTTCCAGTTTAATAAATCTTCGATTTTCA
TATTATTGTTGGACCGATGATTATATCAAAATATTAACAACTATCATGCAACTCATCTCT
TTATTAATAAAAAGCAGTGGATAAACATAAAAAAATTGGTTTGCC

QA 1 705 1 705
DS 

RD RS1BY49TF 705 0 0
GGATACACTAAACCTACAAAACTTACAAAAAAGGAAAAGAGAATGGAACTTCATGGAGTT
TCTTCTGGTGACCTGGAAGTTAAGTCTCCGGCTGAAAAGTTCTTTAGATCTGTCACCGAC
GACATAAACGGCCCCTTTGACAACATAGAGGATAAGATGGAGACGATGAATTTGGAGGAT
AGAACATTGACGGTGAGAATGAGTGGCTGTCTTATCTCGGAAAGTTACAAGACGGTCAAA
GCAACCATCACGGTCAGTCCTAAGGAAGATGGGGGCGGTAGCTGCGTGGCGTGGAAGGTT
GAGTTCGAGAAGATTCGTCATGACGTCGAAGATCCACACTTGATTATCGACACTCTTATC
GACGTTCTTGTCAATTACCTAAAGGAGACCGATGGGAATCTTCTTCTATAAGCGTTTCTA
AATCACAAGGTTCGACTTTATGGAATGATGAATAATCTAATTAACAAACTTAAAAATTGA
ATTTAAATGGAACATATATGTGTGTGGGTCTACGATCATTGCAGTATCTTTTATTACGTT
TGGTACCTTAAGGTGTATGAGCTCGTATGACTTTCCAGTTTAATAAATCTTCGATTTTCA
TATTATTGTTGGACCGATGATTATATCAAAATATTAACAACTATCATGCAACTCATCTCT
TTATTAATAAAAAGCAGTGGATAAACATAAAAAAATTGGTTTGCC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL7197Contig1 765 2 9 U
GTAAGAAAAATCACTATATTACAAAGAGCGTAATGACAGCTAAGAAAGAAGTTACAAATC
GTTTGTTTATACATACATCTTAAAATCCAAAAGATCAGGACCACGTAGCAAAAAAAAAAA
AAACATTAAAATCTCCAGCAATCAAAAGGCTCCACCGACCAAACAGTACCCAGATTTTCA
TCCTTCTGCACGTTTAGTCACAACACATGTCAGCCTTGTTCTCCGAAATTTTACCGGCCA
ACCTTTCTGATACCCTCAAGAACCAGGATTCGAAAGAAAAGTCTCGTAAACCATCAAACA
CCTGTCTGCTTCAGCCTTTAGCCATAAGCTTTTATAGAACAGTGCATGCTGGTTAATCTG
CTCCTCGCCTTGATGATTCTGCTGGTAACCACTTTTAGCCACAACCTGACCAAAGCCGTT
ATCTTTGGTCACACCATATTGATACAAACCAAAATCTGGAAACGTCTCCCCTGAGACCAC
AGAGTATTTCCCTTTCCTTCTAACATCAAGGTCGGCGGTCATATTGTTTGTCTTACTCTT
GTTAAATAAAAGCTGTAGATCATATGAATGGTGTTGTACAAGGCTTTGATTCACAGCCTG
TTCCTGAATGCCATTTTGGATGTACATGTTGAGATTCTGTACAGTACTGTTAATGAGATC
AAGCTCTTCCGGTGAATCTGAAGATTCCGAGCCATGTGCAAGTGTTAGCAACTCTGACAG
TCCATGAATCGTCGTAAGCAGTTTCATCACATCCATCTTTGGAGA


BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A237JQ U 1
AF RS1A237TR U 3
BS 1 45 RS1A237JQ
BS 46 46 RS1A237TR
BS 47 277 RS1A237JQ
BS 278 278 RS1A237TR
BS 279 451 RS1A237JQ
BS 452 452 RS1A237TR
BS 453 544 RS1A237JQ
BS 545 545 RS1A237TR
BS 546 765 RS1A237JQ

RD RS1A237JQ 765 0 0
GTAAGAAAAATCACTATATTACAAAGAGCGTAATGACAGCTAAGAGAGAAGTTACAAATC
GTTTGTTTATACATACATCTTAAAATCCAAAAGATCAGGACCACGTAGCAAAAAAAAAAA
AAACATTAAAATCTCCAGCAATCAAAAGGCTCCACCGACCAAACAGTACCCAGATTTTCA
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CCTGTCTGCTTCAGCCTTTAGCCATAAGCTTTTATAGAACAGTGCATGCTGGTTAATCTG
CTCCTCGCCTTGATGATTCTGCTGGTAACCACTTTTAGCCACAACCTGACCAAAGCCGTT
ATCTTTGGTCACACCATATTGATACAAACCAGAATCTGGAAACGTCTCCCCTGAGACCAC
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GTTAGATAAAAGCTGTAGATCATATGAATGGTGTTGTACAAGGCTTTGATTCACAGCCTG
TTCCTGAATGCCATTTTGGATGTACATGTTGAGATTCTGTACAGTACTGTTAATGAGATC
AAGCTCTTCCGGTGAATCTGAAGATTCCGAGCCATGTGCAAGTGTTAGCAACTCTGACAG
TCCATGAATCGTCGTAAGCAGTTTCATCACATCCATCTTTGGAGA

QA 1 765 1 765
DS 

RD RS1A237TR 722 0 0
AAGAAAAATCACTATATTACAAAGAGCGTAATGACAGCTAAGAAAGAAGTTACAAATCGT
TTGTTTATACATACATCTTAAAATCCAAAAGATCAGGACCACGTAGCAAAAAAAAAAAAA
ACATTAAAATCTCCAGCAATCAAAAGGCTCCACCGACCAAACAGTACCCAGATTTTCATC
CTTCTGCACGTTTAGTCACAACACATGTCAGCCTTGTTCTCCGAAATTTTACCGGCCAAC
CTTTCTGATACCCTCAAGAACCAGGATTCGAAAGAAAAGTCTCGTAAACCATCAAACACC
TGTCTGCTTCAGCCTTTAGCCATAAGCTTTTATAGAACAGTGCATGCTGGTTAATCTGCT
CCTCGCCTTGATGATTCTGCTGGTAACCACTTTTAGCCACAACCTGACCAAAGCCGTTAT
CTTTGGTCACACCATATTGATACAAACCAAAATCTGGAAACGTCTCCCCTGAGACCACAG
AGTATTTCCCTTTCCTTCTAACATCAAGGTCGGCGGTCATATTGTTTGTCTTACTCTTGT
TAAATAAAAGCTGTAGATCATATGAATGGTGTTGTACAAGGCTTTGATTCACAGCCTGTT
CCTGAATGCCATTTTGGATGTACATGTTGAGATTCTGTACAGTACTGTTAATGAGATCAA
GCTCTTCCGGTGAATCTGAAGATTCCGAGCCATGTGCAAGTGTTAGCAACTCTGACAGTC
CA

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL7198Contig1 833 2 10 U
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AGGAAGTAGGGAGAGCTGCGAGGATCTTATTCGTTTCTCTCTTTCCCACGCCATTATATA
AAAGAAAGAAAGGAAAGCTCATCGGTTTCTCAGATCCACTTCTTCTTTTGGTTGATCTCT
AGGGTTTTTCTCATCGCTTGTTTGGGTTTTCGTGTCTGAGCACATGTCTTCGAAGAGGAT
TTTGAAAGAGCTCAAGGATTTGCAGAAGGATCCTCCTTCAAATTGCAGCGCAGGTCCTGT
GGCTGAGGACATGTTCCATTGGCAAGCAACTATCATGGGACCTCCTGACAGTCCTTATGC
GGGAGGAGTCTTTTTGGTCTCCATTCACTTCCCTCCGGATTACCCTTTCAAGCCACCTAA
GGTGTCTTTTAAGACGAGGGTGTACCATCCCAACATCAACAGCAACGGAAGCATTTGCCT
TGATATCCTGAAAGAACAGTGGAGTCCTGCTCTTACCGTATCCAAGGTATTGCTGTCGAT
TTGCTCATTGCTGACAGACCCGAACCCAGATGATCCTCTTGTGCCAGAGATTGCCCGTAT
GTACAAGACGGATAAGACCAAGTACGAGTCAACTGCACGAAGCTGGACACAGAAGTACGC
CATGGGGTGATTGATGAAGACCCAAAAGTGGTGGTCCAATCATTAAAATAAAAACTGCAT
TTGTTGGGTTTATTTAGTAAAACGCTATTATTGTGTGATCATCATAATCGAGCAACTTTA
TATGCTTGATCTCTCTTAATCTTGTCTGCTGATCTCATTATCATCATTCACCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FR89TF U 1
AF RS1FR89JQ C 92
BS 1 713 RS1FR89TF
BS 714 714 RS1FR89JQ
BS 715 741 RS1FR89TF
BS 742 742 RS1FR89JQ
BS 743 774 RS1FR89TF
BS 775 775 RS1FR89JQ
BS 776 796 RS1FR89TF
BS 797 797 RS1FR89JQ
BS 798 817 RS1FR89TF
BS 818 833 RS1FR89JQ

RD RS1FR89TF 817 0 0
GGGCGGAATCAGAAGGTTCGAGTGCCGTCTTGAACATTCTCTGACTACTATAAAGAAAAA
AGGAAGTAGGGAGAGCTGCGAGGATCTTATTCGTTTCTCTCTTTCCCACGCCATTATATA
AAAGAAAGAAAGGAAAGCTCATCGGTTTCTCAGATCCACTTCTTCTTTTGGTTGATCTCT
AGGGTTTTTCTCATCGCTTGTTTGGGTTTTCGTGTCTGAGCACATGTCTTCGAAGAGGAT
TTTGAAAGAGCTCAAGGATTTGCAGAAGGATCCTCCTTCAAATTGCAGCGCAGGTCCTGT
GGCTGAGGACATGTTCCATTGGCAAGCAACTATCATGGGACCTCCTGACAGTCCTTATGC
GGGAGGAGTCTTTTTGGTCTCCATTCACTTCCCTCCGGATTACCCTTTCAAGCCACCTAA
GGTGTCTTTTAAGACGAGGGTGTACCATCCCAACATCAACAGCAACGGAAGCATTTGCCT
TGATATCCTGAAAGAACAGTGGAGTCCTGCTCTTACCGTATCCAAGGTATTGCTGTCGAT
TTGCTCATTGCTGACAGACCCGAACCCAGATGATCCTCTTGTGCCAGAGATTGCCCGTAT
GTACAAGACGGATAAGACCAAGTACGAGTCAACTGCACGAAGCTGGACACAGAAGTACGC
CATGGGGTGATTGATGAAGACCCAAAAGTGGTGGTCCAATCATTAAAATAAAA*CTGCAT
TTGTTGGGTTTATTTAGTAAA*CGCTATTATTGTGTGATCATCATAATCGAGCA*CTTTA
TATGCTTGATCTCTCT*AATCTTGTCTGCTGATCTCA

QA 1 817 1 817
DS 

RD RS1FR89JQ 742 0 0
TCG
TTCTCTCTTTCCCACGCCATTATATAAAAGAAAGAAAGGAAAGCTCATCGGTTTCTCAGA
TCCACTTCTTCTTTTGGTTGATCTCTAGGGTTTTTCTCATCGCTTGTTTGGGTTTTCGTG
TCTGAGCACATGTCTTCGAAGAGGATTTTGAAAGAGCTCAAGGATTTGCAGAAGGATCCT
CCTTCAAATTGCAGCGCAGGTCCTGTGGCTGAGGACATGTTCCATTGGCAAGCAACTATC
ATGGGACCTCCTGACAGTCCTTATGCGGGAGGAGTCTTTTTGGTCTCCATTCACTTCCCT
CCGGATTACCCTTTCAAGCCACCTAAGGTGTCTTTTAAGACGAGGGTGTACCATCCCAAC
ATCAACAGCAACGGAAGCATTTGCCTTGATATCCTGAAAGAACAGTGGAGTCCTGCTCTT
ACCGTATCCAAGGTATTGCTGTCGATTTGCTCATTGCTGACAGACCCGAACCCAGATGAT
CCTCTTGTGCCAGAGATTGCCCGTATGTACAAGACGGATAAGACCAAGTACGAGTCAACT
GCACGAAGCTGGACACAGAAGTACGCCATGGGGTGATTGATGAAGACCCAAAAGTGGTGG
TCCAATCATTAAAATAAAAACTGCATTTGTTGGGTTTATTTAGTAAAACGCTATTATTGT
GTGATCATCATAATCGAGCAACTTTATATGCTTGATCTCTCTTAATCTTGTCTGCTGATC
TCATTATCATCATTCACCT

QA 4 742 4 742
DS 



AS 1 2

CO CL7199Contig1 862 2 4 U
GGACGCGGAGGCAGACGCGGAGGACGTCCCGCTGAGGAGGAGAAGTGGACGCCAGTGACC
AAGCTCGGCCGTCTCGTGAAAGACGGAAAAATCCAGAAGCTCGAGCAGATCTATCTCCAC
TCGCTCCCCGTCAAGGAGTACCAGATCATCGACCTCCTCGTCGGCCCCACCTTGAAAGAC
GAGGTGATGAAGATCATGCCGGTTCAGAAACAGACCAGAGCCGGTCAGAGGACCAGGTTC
AAGGCCTTTGTTGTTGTCTGTGATTCCGGTGAGGAGAGGTTACTGGGGGAACAAGATTGG
GAAGCCGCATACGGTTCCTTGTAAGGTTACGGGGAAGTGTGGTTCAGTTACGGTGAGGAT
GGTGCCTGCTCCCAGAGGTGCGGGGATTGTGGCGGCTAGGGTTCCTAAGAAGGTTCTTCA
GTTCGCTGGGATTGATGACGTGTTCACTTCTTCCAGGGGGTCCACCAAAACCCTTGGAAA
CTTCGTAAAGGCGACATTTGATTGCCTTCAGAAGACATATGGATTCCTGACACCAGAGTT
CTGGAAAGAGACGAGCTTTAAGAAATCACCGTACCAGGAGTACACTGATTTGCTGGCCTC
AAAGGGAACTACGACCAAACTCATCACCGAGGTCGAAGACCAAGCCGCCGCCTAAATCAT
CACCAGTGTTTTAAATTATCCTTGATTTTGGTCGAACTCTGTTGGATTGCATCTTATGTT
TTACTCTCTTCCCAAACCATTACTTTTCAGTTTTATAGATGGATAATATTCTATCTTTTT
TTGTTTTCATTTCAAATCCATTTTCTTTTGATTCACATTTGTGCCCAATTTTAATTGTTC
TTCTACCCAGTTTTAACATAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DI69TF U 1
AF RS1DI69JQ C 67
BS 1 765 RS1DI69TF
BS 766 766 RS1DI69JQ
BS 767 781 RS1DI69TF
BS 782 862 RS1DI69JQ

RD RS1DI69TF 784 0 0
GGACGCGGAGGCAGACGCGGAGGACGTCCCGCTGAGGAGGAGAAGTGGACGCCAGTGACC
AAGCTCGGCCGTCTCGTGAAAGACGGAAAAATCCAGAAGCTCGAGCAGATCTATCTCCAC
TCGCTCCCCGTCAAGGAGTACCAGATCATCGACCTCCTCGTCGGCCCCACCTTGAAAGAC
GAGGTGATGAAGATCATGCCGGTTCAGAAACAGACCAGAGCCGGTCAGAGGACCAGGTTC
AAGGCCTTTGTTGTTGTCTGTGATTCCGGTGAGGAGAGGTTACTGGGGGAACAAGATTGG
GAAGCCGCATACGGTTCCTTGTAAGGTTACGGGGAAGTGTGGTTCAGTTACGGTGAGGAT
GGTGCCTGCTCCCAGAGGTGCGGGGATTGTGGCGGCTAGGGTTCCTAAGAAGGTTCTTCA
GTTCGCTGGGATTGATGACGTGTTCACTTCTTCCAGGGGGTCCACCAAAACCCTTGGAAA
CTTCGTAAAGGCGACATTTGATTGCCTTCAGAAGACATATGGATTCCTGACACCAGAGTT
CTGGAAAGAGACGAGCTTTAAGAAATCACCGTACCAGGAGTACACTGATTTGCTGGCCTC
AAAGGGAACTACGACCAAACTCATCACCGAGGTCGAAGACCAAGCCGCCGCCTAAATCAT
CACCAGTGTTTTAAATTATCCTTGATTTTGGTCGAACTCTGTTGGATTGCATCTTATGTT
TTACTCTCTTCCCAAACCATTACTTTTCAGTTTTATAGATGGATA*TATTCTATCTTTTT
T
GTT

QA 1 781 1 781
DS 

RD RS1DI69JQ 796 0 0
C
GCCGTCTCGTGAAAGACGGAAAA*TCCAGAAGCTCGAGCAGATCTATCTCCACTCGCTCC
CCGTCAAGGAGTACCAGATCATCGACCTCCTCGTCGGCCCCACCTTGAAAGACGAGGTGA
TGAAGATCATGCCGGTTCAGAAACAGACCAGAGCCGGTCAGAGGACCAGGTTCAAGGCCT
TTGTTGTTGTCTGTGATTCCGGTGAGGAGAGGTTACTGGGGGAACAAGATTGGGAAGCCG
CATACGGTTCCTTGTAAGGTTACGGGGAAGTGTGGTTCAGTTACGGTGAGGATGGTGCCT
GCTCCCAGAGGTGCGGGGATTGTGGCGGCTAGGGTTCCTAAGAAGGTTCTTCAGTTCGCT
GGGATTGATGACGTGTTCACTTCTTCCAGGGGGTCCACCAAAACCCTTGGAAACTTCGTA
AAGGCGACATTTGATTGCCTTCAGAAGACATATGGATTCCTGACACCAGAGTTCTGGAAA
GAGACGAGCTTTAAGAAATCACCGTACCAGGAGTACACTGATTTGCTGGCCTCAAAGGGA
ACTACGACCAAACTCATCACCGAGGTCGAAGACCAAGCCGCCGCCTAAATCATCACCAGT
GTTTTAAATTATCCTTGATTTTGGTCGAACTCTGTTGGATTGCATCTTATGTTTTACTCT
CTTCCCAAACCATTACTTTTCAGTTTTATAGATGGATAATATTCTATCTTTTTTTGTTTT
CATTTCAAATCCATTTTCTTTTGATTCACATTTGTGCCCAATTTTAATTGTTCTTCTACC
CAGTTTTAACATAGT

QA 2 796 2 796
DS 



AS 1 2

CO CL7200Contig1 535 2 2 U
GGATTATAATTTATTATAAATCATGGCTATCTTTTTATTTATGTTCTCGAATTGATTATA
AAGCTATTTGTGAGCTAACAAAAAAAAAAAAAACTATACCCCACCAAAAAGAACTATCCA
AAACAAACAATACATAGTGTCTGACACGGATAACGGATTATATATAATGGAGTTTTGAGG
ACTTTGTCTTTTAGTGTGTCTGAAAAACCGTTTTGAAGGCAGGAAAAAAGTTGGTAACAA
AACTTTTGCTTCTACTCTTTCTATGTCTTGGATTCGGTACTTTCTCAAGAAAAAACAAAA
CCTCAGGCATCGATGGTCTAACCTTAACCTCTCCGATACATTGTAAAGCCAAAAAAGACA
TCATAAACGCTGCTTTCTGAGGGTATTGACCCACAAGCTTAGTGTCCATTATCCTAAACA
CTTTTCGCTTGTCTCGCAAGTAAGGTTTGGCCCATTCCACTAGGTTTTCTTCTTCTCTAG
CTCTGTTTTTGTCTATGGCTCTACGTCCTGAGAGAATCTCTAGCAAGACAACACC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1F087JQ U 1
AF RS1G969JQ U 1
BS 1 511 RS1F087JQ
BS 512 535 RS1G969JQ

RD RS1F087JQ 516 0 0
GGATTATAATTTATTATAAATCATGGCTATCTTTTTATTTATGTTCTCGAATTGATTATA
AAGCTATTTGTGAGCTAACAAAAAAAAAAAAAACTATACCCCACCAAAAAGAACTATCCA
AAACAAACAATACATAGTGTCTGACACGGATAACGGATTATATATAATGGAGTTTTGAGG
ACTTTGTCTTTTAGTGTGTCTGAAAAACCGTTTTGAAGGCAGGAAAAAAGTTGGTAACAA
AACTTTTGCTTCTACTCTTTCTATGTCTTGGATTCGGTACTTTCTCAAGAAAAAACAAAA
CCTCAGGCATCGATGGTCTAACCTTAACCTCTCCGATACATTGTAAAGCCAAAAAAGACA
TCATAAACGCTGCTTTCTGAGGGTATTGACCCACAAGCTTAGTGTCCATTATCCTAAACA
CTTTTCGCTTGTCTCGCAAGTAAGGTTTGGCCCATTCCACTAGGTTTTCTTCTTCTCTAG
CTCTGTTTTTGTCTATGGCTCTACGTCCTGA
AAAAA

QA 1 511 1 511
DS 

RD RS1G969JQ 535 0 0
GGATTATAATTTATTATAAATCATGGCTATCTTTTTATTTATGTTCTCGAATTGATTATA
AAGCTATTTGTGAGCTAACAAAAAAAAAAAAAACTATACCCCACCAAAAAGAACTATCCA
AAACAAACAATACATAGTGTCTGACACGGATAACGGATTATATATAATGGAGTTTTGAGG
ACTTTGTCTTTTAGTGTGTCTGAAAAACCGTTTTGAAGGCAGGAGAAAAGTTGGTAACAA
AACTTTTGCTTCTACTCTTTCTATGTCTTGGATTCGGTACTTTCTCAAGAAAAAACAAAA
CCTCAGGCATCGATGGTCTAACCTTAACCTCTCCGATACATTGTAAAGCCAAGAAAGACA
TCATAAACGCTGCTTTCTGAGGGTATTGACCCACAAGCTTAGTGTCCATTATCCTAAACA
CTTTTCGCTTGTCTCGCAAGTAAGGTTTGGCCCATTCCACTAGGTTTTCTTCTTCTCTAG
CTCTGTTTTTGTCTATGGCTCTACGTCCTGAGAGAATCTCTAGCAAGACAACACC

QA 1 535 1 535
DS 



AS 1 2

CO CL7201Contig1 769 2 2 U
CACCGATGTTGCTGAGAAGTCAGTGCGTGCAACCAGCGAACTCAATTATACAGAGCCCAT
TGAAGATATGGTTGATTTTAATATGGAAGACATAGCCACCAATGGTGGTGATTATGATCC
GGGGACTGTAAATGGTGGACTCAACACAGACTGTACCAGTTTATCCAAATGTCTAACCAG
CAAACGAGGTGGGTCTGAGCCAGCGGTGGATCAGGATAACTTTAAGAAGCCTCCTTTTGA
CAAGGATCATGGAGAGCATGCAGATAAGCCAGAGAGAGTAATCAAACTGGTTACCTATTC
TAAGCGCAAGTCATCTGACAAAAAACAACTTGTTGATTTTAGTGAAGATCCTCAGCAGAA
GATCAACCAGGCTGTTGATTCTAAGACCGAAGTTGCTCTTGACAAGCCGCACTTGGTTCC
AAATATGGACTCCTGAACTCTGTTCCTTTGGTCTTCTTTCCAACAGAGGCTTCAGGATGT
TTTCTCAAAGACGATGTACAGTGGCCATAATAGCCTAAGCTTTTCAAGTCCATCTTAACT
GGATCCGCTTTGCTAATTCAAGTTTAGATGTTAAGAGAGTTTGATTAGTCGGTAGGATGG
TGATGTGTAAACCGGATATCTTTTCTTGAATTTAGTTTTCTCAGTTAAAATGTATTTTTC
TTTTTATATTTAAGAAATAAGTTTGTATTTTATCGTTTGTTGCGGGACGGTGCTGGAACC
GGATTCTTTTTTTTCAACTAAAGTTCATTGAAAAAGTTACTTGGAAGCT


BQ
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AF RS1A455TF U 1
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BS 1 705 RS1A455TF
BS 706 769 RS1A455JQ

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TGAAGATATGGTTGATTTTAATATGGAAGACATAGCCACCAATGGTGGTGATTATGATCC
GGGGACTGTAAATGGTGGACTCAACACAGACTGTACCAGTTTATCCAAATGTCTAACCAG
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CAAGGATCATGGAGAGCATGCAGATAAGCCAGAGAGAGTAATCAAACTGGTTACCTATTC
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GATCAACCAGGCTGTTGATTCTAAGACCGAAGTTGCTCTTGACAAGCCGCACTTGGTTCC
AAATATGGACTCCTGAACTCTGTTCCTTTGGTCTTCTTTCCAACAGAGGCTTCAGGATGT
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GGATCCGCTTTGCTAATTCAAGTTTAGATGTTAAGAGAGTTTGATTAGTCGGTAGGATGG
TGATGTGTAAACCGGATATCTTTTCTTGAATTTAGTTTTCTCAGTTAAAATGTATTTTTC
TTTTTATATTTAAGAAATAAGTTTGTATTTTATCGTTTGTTGCGG

QA 1 705 1 705
DS 

RD RS1A455JQ 769 0 0
CACCGATGTTGCTGAGAAGTCAGTGCGTGCAACCAGCGAACTCAATTATACAGAGCCCAT
TGAAGATATGGTTGATTTTAATATGGAAGACATAGCCACCAATGGTGGTGATTATGATCC
GGGGACTGTAAATGGTGGACTCAACACAGACTGTACCAGTTTATCCAAATGTCTAACCAG
CAAACGAGGTGGGTCTGAGCCAGCGGTGGATCAGGATAACTTTAAGAAGCCTCCTTTTGA
CAAGGATCATGGAGAGCATGCAGATAAGCCAGAGAGAGTAATCAAACTGGTTACCTATTC
TAAGCGCAAGTCATCTGACAAAAAACAACTTGTTGATTTTAGTGAAGATCCTCAGCAGAA
GATCAACCAGGCTGTTGATTCTAAGACCGAAGTTGCTCTTGACAAGCCGCACTTGGTTCC
AAATATGGACTCCTGAACTCTGTTCCTTTGGTCTTCTTTCCAACAGAGGCTTCAGGATGT
TTTCTCAAAGACGATGTACAGTGGCCATAATAGCCTAAGCTTTTCAAGTCCATCTTAACT
GGATCCGCTTTGCTAATTCAAGTTTAGATGTTAAGAGAGTTTGATTAGTCGGTAGGATGG
TGATGTGTAAACCGGATATCTTTTCTTGAATTTAGTTTTCTCAGTTAAAATGTATTTTTC
TTTTTATATTTAAGAAATAAGTTTGTATTTTATCGTTTGTTGCGGGACGGTGCTGGAACC
GGATTCTTTTTTTTCAACTAAAGTTCATTGAAAAAGTTACTTGGAAGCT

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

CO CL7202Contig1 957 2 2 U
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AACAAAAATGCTTGGGTGAGTGATCATGGTATCCATAAGCCTCACCTCTTCTATAACGTA
TCACCATATCTCGCTCAGGAGGAAAAAGACATTTGGCATGAGCTTTTGGTGAGTGACTTT
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GTGGAGATACTGAAGGAAGTTTTGCTTATGTGGGCTACTAACAAGATGATAGAGCTTGAG
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TATTACTTTGAGGATTCTATGGTTTTAAAATTTGGATAATTACTGTGTTTTCCGTAC


BQ
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AF RS1FZ62TF U 1
AF RS1FZ62JQ C 335
BS 1 672 RS1FZ62TF
BS 673 957 RS1FZ62JQ

RD RS1FZ62TF 672 0 0
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GTCCTTAGCGAAGTTTTAGCAGCTTGCACCTCCCTCGAGGTGATTGTGTTGCAAGTCGAC
TTCATTACCCAATATGTTGCGTTGAAGATTGAGAACAATAACTTGAAGTTCTTGCAAGTG
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ATCAGGGTTATCAAAGGTAAGAGAGAGGACTTCATCCTCGCTGCTCCCAACATCCAGGTT
AACAAAAATGCTTGGGTGAGTGATCATGGTATCCATAAGCCTCACCTCTTCTATAACGTA
TCACCATATCTCGCTCAGGAGGAAAAAGACATTTGGCATGAGCTTTTGGTGAGTGACTTT
CATGGTATGAGTCGGGATGGGTCTTTATCAGTGAGTGTAGATATAACTGATCCGAAAGAA
GTGGAGATACTGAAGGAAGTTTTGCTTATGTGGGCTACTAACAAGATGATAGAGCTTGAG
ATCTTTTTCAAGAACAAGAATGCTCCTAGAGATGAAGGTGAGTGTTCTACTAACAACAGA
GCACATAAAAATTTGTTGGAGGATGCAAAACCGTTCCCAGACGCTGCATTCCGCGTTTAT
AACGTGCGGTTG

QA 1 672 1 672
DS 

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GTGTAGATATAACTGATCCGAAAGAAGTGGAGATACTGAAGGAAGTTTTGCTTATGTGGG
CTACTAACAAGATGATAGAGCTTGAGATCTTTTTCAAGAACAAGAATGCTCCTAGAGATG
AAGGTGAGTGTTCTACTAACAACAGAGCACATAAAAATTTGTTGGAGGATGCAAAACCGT
TCCCAGACGCTGCATTCCGCGTTTATAACGTGCGGTTGTATAATTTCGACGGTTCGAATG
AGGAAGAGTTCGCGTTCGCTTCCCGTTTGGTGACGCAAAAGACGGTTGTTAGGAAGATGA
TGATCGAGACTTCTTCATTTCCTCCGGCGAAGAAGTTAAAGGTAGAAGCAGCTGTGGACA
AGTTGATGGAACTTCCTAAAGGTTACGAACGTCTTCGTATTGAATGCTTCTGATGATGAA
ACTTTTATTTTACTAGCCTTTTTATTTATTACTTTGAGGATTCTATGGTTTTAAAATTTG
GATAATTACTGTGTTTTCCGTAC

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 2

CO CL7203Contig1 1084 2 2 U
GACAAAAAGAAAACCGCCGATAAGACCCCGTCTTCGCCGCTACTCCGCCTCCGCTTCGAT
CTGGATTGAATTAGGTAAGCCTGTAATCGAAATTTTTCTATCTTCTTCATCATATAGATA
ATCGTGGTACAAGTAATCATCCACTCTTAATCTGATTATCGTTTCTGTAGAGAGATAAAA
CGATGGATCCGATGGATATAGTTGGAAAATCTAAGGAAGATGCTTCGCTACCAAAAGGTT
CGTCGTCCTCGTCGTCTTCTTTTCCTTCCTTCGATCTATATCGATCTCGTTTAAGAGTTT
GCGATTCAGGATTTGATTGCATTCGAGTAATATCCATAAACTCGTATTTAACAATATGTT
TGTTTGTTCCTTATGATTTTTTTTTGTTTTCAGCTACAATGACTAAAATTATAAACGAGA
TGTTACCAGCGGATGTTCGTGTTGCTAGAGATGCGCAAGATCTTCTCACCGAGTGTTGTG
TAGGTAAAATATGATGAATCATCACTCTTTTGTTCATCATTAGCTGATTATCGTTTTTCT
AACTGCTAATTTTCTTTCTATGATGGCAGAGTTTATAAATCTGATATCGTCAGAGTCTAA
TGAAGTGTGTAACAAAGAGGATAAACGAACAATCGCGCCTGAGCATGTGCTCAAAGCGCT
TCAGGTTCTTGGCTTTGGGGAATACGTTGAAGAAGTTTACGCTGCTTATGAGCAACATAA
ATACGAAACCATGGTAATAACATCATCATCCCTCCAATTTGTCCGAAAATTTATTTATAT
AAAGCTCTGAATTTGTTTTTTTTTTGCAAAATTGTGCAGCAAGATTCACAGAGGAGTGTG
AAGATGAACAGCGGAGCAGAGATGACGGAGGAGGAAGCAGCGGCGGAACAGCAGAGAATG
TTTGCCGAAGCTCGAGCGAGAATGAATGGTGGTGTTTCTATTCCTCAACCAGATCAAGAA
CAACAAGTAGATGATAATACCCAACAGTCGAATCTACAAAGCTAATCAAGAAGAAAGGGA
GAATCCTTTGTTTTTAACATTATCATTTTGACTTCATTTTTCTAGCGTTTCTTTGTAAAG
TGCC


BQ
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10 10 10 10 

AF RS1AI57TF U 1
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TC

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DS 

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GCTAGAGATGCGCAAGATCTTCTCACCGAGTGTTGTGTAGGTAAAATATGATGAATCATC
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GACGGAGGAGGAAGCAGCGGCGGAACAGCAGAGAATGTTTGCCGAAGCTCGAGCGAGAAT
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CATTTTGACTTCATTTTTCTAGCGTTTCTTTGTAAAGTGCC

QA 1 821 1 821
DS 



AS 1 2

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ATTCAACGTACCACATGTCTTGTGGTTACTTTCACCATCCCACATTCTCCAACCTTCTGG
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TTCCTGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EF63JQ U 1
AF RS1DL17TF C 404
BS 1 465 RS1EF63JQ
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RD RS1EF63JQ 617 0 0
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TAGCGACCTTAGCCCAGTTAACTCTCCTATTAGTGTTAGCTCCTGGTCCACGGTTGTTGT
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AACGGTTGCCGATTTTC

QA 1 617 1 617
DS 

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CTTTCTTGCACCATCTCCGAACATGAAGATGTTGTTCTTCTTCTTAGGGATGATAACTTG
CTCTCTGTAGATACCGGCCTTAATGTAGATGATGCATCGGCCAGGATTTTTATCGGGACA
AGCGTTAACAGCTTGTTGGATCGAGTTAAACTGGCCGCTTCCATCCTTGGCAACAACAAA
GTTGGCTCTGATTCTAGCACCACCACCGCGTCTTCGGCCACGTCCAGCATTAGCCAAGAG
CTTCCTGC

QA 17 744 17 744
DS 



AS 1 2

CO CL7205Contig1 787 2 3 U
TTTTTTTTACAAAATGAATGATTATCTATTAAATTATGTATTCTCATACTTGTATAAGAT
TAACAAAATTTGCAGATCCGACAAACAAATTTAGAAAACAACTTTTGATTAGGAGTATAA
CTCAACTTTCGCAACATTTTTTGGAGCAGAGGAGGTTTCATACCGTCTAAAGAGAGGACA
AAAGATGTTTGCATCAAACTCGCATCCATTGCTGTAAGAAGACGTTAACGCCTTTGATCT
TGACATGTTATCCATAAGAACCTGTCTGAGCTCCAATCCACAGGATAATGCATAACAAGC
CTTCATTTATCTGGTTTCATACGACTCCATGGTAAAGTCAGAGGTAGCAAGCTAAACAGA
ACCGCACAAAGATACTGACAGATCCTAAGGCACCAAAACAATATTTGATTGGATCCGGTT
AATCACCAGTAATCACCACAAGAGCAGGCTCCATCCTTAAAATGATGAAACCGGTTTGAA
TCCCTCACAACGATCTCTCTCTCAGTGATTCTCGATATGAACTTGGTAACGCTATGGCAA
TCACTACACACCCTCAGATTCTTAAAAATCTGAATCCTCGTATTTGGAGGAGTGGTAATA
AGCGCAAACGCAATAGCCAACCTTTCACTATGGCTCATTAGTATATGCTCTTTCTCATCG
TCCTCAACATCCTGCAGCACAAACCTATGGTCCGGTACATACCCAATCATCTTCATTTTC
TCGTGCAACAACGCCAACTCTTTGTAGATTTCCTAACACATGGGATGCGTTTGGTTCCCC
GTGTAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DG21JQ U 9
AF RS1DG21TF C 1
BS 1 8 RS1DG21TF
BS 9 764 RS1DG21JQ
BS 765 787 RS1DG21TF

RD RS1DG21JQ 756 0 0
ACAAAATGAATGATTATCTATTAAATTATGTATTCTCATACTTGTATAAGATTAACAAAA
TTTGCAGATCCGACAAACAAATTTAGAAAACAACTTTTGATTAGGAGTATAACTCAACTT
TCGCAACATTTTTTGGAGCAGAGGAGGTTTCATACCGTCTAAAGAGAGGACAAAAGATGT
TTGCATCAAACTCGCATCCATTGCTGTAAGAAGACGTTAACGCCTTTGATCTTGACATGT
TATCCATAAGAACCTGTCTGAGCTCCAATCCACAGGATAATGCATAACAAGCCTTCATTT
ATCTGGTTTCATACGACTCCATGGTAAAGTCAGAGGTAGCAAGCTAAACAGAACCGCACA
AAGATACTGACAGATCCTAAGGCACCAAAACAATATTTGATTGGATCCGGTTAATCACCA
GTAATCACCACAAGAGCAGGCTCCATCCTTAAAATGATGAAACCGGTTTGAATCCCTCAC
AACGATCTCTCTCTCAGTGATTCTCGATATGAACTTGGTAACGCTATGGCAATCACTACA
CACCCTCAGATTCTTAAAAATCTGAATCCTCGTATTTGGAGGAGTGGTAATAAGCGCAAA
CGCAATAGCCAACCTTTCACTATGGCTCATTAGTATATGCTCTTTCTCATCGTCCTCAAC
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CAACGCCAACTCTTTGTAGATTTCCTAACACATGGG

QA 1 756 1 756
DS 

RD RS1DG21TF 787 0 0
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*AACAAAATTTGCAGATCCGACAAACAAATT*AGAAAACAACTTTTGATTAGGAGTATAA
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AAAGATGTTTGCATCAAACTCGCATCCATTGCTGTAAGAAGACGTTAACGCCTTTGATCT
TGACATGTTATCCATAAGAACCTGTCTGAGCTCCAATCCACAGGATAATGCATAACAAGC
CTTCATTTATCTGGTTTCATACGACTCCATGGTAAAGTCAGAGGTAGCAAGCTAAACAGA
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AATCACCAGTAATCACCACAAGAGCAGGCTCCATCCTTAAAATGATGAAACCGGTTTGAA
TCCCTCACAACGATCTCTCTCTCAGTGATTCTCGATATGAACTTGGTAACGCTATGGCAA
TCACTACACACCCTCAGATTCTTAAAAATCTGAATCCTCGTATTTGGAGGAGTGGTAATA
AGCGCAAACGCAATAGCCAACCTTTCACTATGGCTCATTAGTATATGCTCTTTCTCATCG
TCCTCAACATCCTGCAGCACAAACCTATGGTCCGGTACATACCCAATCATCTTCATTTTC
TCGTGCAACAACGCCAACTCTTTGTAGATTTCCTAACACATGGGATGCGTTTGGTTCCCC
GTGTAAC

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

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ATCAACGATCTCTGTTACCCATGGCTCGTGAGTTTGCTCTTTTCTGGGAGTCAGGAGCGT
GCCCGTTCCCATACGGCCCGAACCATCCTTACCCGATCCAGGATCTGGTTGGTCGGATCA
ACCAAGCCTTGAAGCAGGAGAACCCTAACAACCAGCTCTCCGCGAACTACAAGTACGTCT
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AGATTTACCCGAGTGGATTTGAGGAATCAGGGGCGAGTGTTACGTTTAACTGGGAGCTCA
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TCGATGAAGAAGAGGTGGCTCCGTGGGGGGTGCCTGGAAGTGGTGACAAGTGAGGGGAAT
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DV27TF U 1
AF RS1DV27JQ C 367
BS 1 679 RS1DV27TF
BS 680 680 RS1DV27JQ
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BS 690 912 RS1DV27JQ

RD RS1DV27TF 694 0 0
GGAAAAATCATCTTCGGGTTTGGGCTGCTAGGGAAAGAAATCAAGGAGCTTGCCAAGAAG
ATCAACGATCTCTGTTACCCATGGCTCGTGAGTTTGCTCTTTTCTGGGAGTCAGGAGCGT
GCCCGTTCCCATACGGCCCGAACCATCCTTACCCGATCCAGGATCTGGTTGGTCGGATCA
ACCAAGCCTTGAAGCAGGAGAACCCTAACAACCAGCTCTCCGCGAACTACAAGTACGTCT
GCGGCCGTCCGGATCTGTTCACGGCCTCTGATAGAGCCTTCCTCGAGGACAACAACGGCT
TCCGCTTCTTCGACACCGAGGAGAGGAACATAGACTGCTGCTTTGTCGACGAGAACGGTG
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AGATTTACCCGAGTGGATTTGAGGAATCAGGGGCGAGTGTTACGTTTAACTGGGAGCTCA
TGCTTTGTGGAGGTGGTAG*CTGTACAAG
TGGGG

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1DV27JQ 546 0 0
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TAGGAGACCGTGGTTTCACTGTGTTTGTGGCTAAGAAACCTAACCGGGATGGAAAGATTT
ACCCGAGTGGATTTGAGGAATCAGGGGCGAGTGTTACGTTTAACTGGGAGCTCATGCTTT
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AAGAAGAGGTGGCTCCGTGGGGGGTGCCTGGAAGTGGTGACAAGTGAGGGGAATAGTTAA
TAAGCTAATTAGTATCGTTGTTTGTATTAGGTGCTGTGTGTAGTGGTCTCTTCTTAATTT
GACTTATGTGTTGAAGAACTATTTGAGTATTATTATTGATTGTTAGAGTATTGTTTAAAT
TTGACG

QA 1 546 1 546
DS 



AS 1 2

CO CL7207Contig1 548 2 2 U
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TGTGTGAGCTATGTCGAGTGCTGCTGTGGACGCGACGGGGAACCCGATCCCTACATCTGC
TGTGTTGACTGCCTCAGCGAAGCATATAGGTTTAAGATGTATGCCGGAGAACGTTGCGTT
TCTCAAATGCAAGAAGAATGATCCAAACCCTGAGAAATGTCTCGACAAGGGTCGTGACGT
CACTCGCTGTGTCCTTGGCTTGCTGAAGGATCTTCACCAGAAATGCCAAAAGGAGATGGA
TGACTATGTTGGGTGTATGTATTACTACACAAACGAGTTTGATCTGTGTAGGAAAGAGCA
AGAAGCCTTCGAGAAAGTTTGTCCCCTGAAATGAAGTTACTGTCTCATGTTTTAATTTGC
AATCTCCTAACTAAGCAGCATGTTCATTTTTCAATGAGCTTTCTTCATTCTTCTTCTGCT
TCTTTGCTTGATTGTTATTTAATCAGAACATAATGGATTTCACAAGGAATAATCTGGTTG
ATTCACCT


BQ
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CACTCGCTGTGTCCTTGGCTTGCTGAAGGATCTTCACCAGAAATGCCAAAAGGAGATGGA
TGACTATGTTGGGTGTATGTATTACTACACAAACGAGTTTGATCTGTGTAGGAAAGAGCA
AGAAGCCTTCGAGAAAGTTTGTCCCCTGAAATGAAGTTACTGTCTCATGTTTTAATTTGC
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TCTTTGCTTGATTGTTATTTAATCAGAACATAATGGATTTCACAAGGAATAATCTGGTTG
ATTCACCT

QA 1 548 1 548
DS 



AS 1 2

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TATCTCTGGGTAATGGTATTTATGACTCCTTTGGATGATGTTCTGTAACATTTTATGTAC
TATATGA

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DS 



AS 1 2

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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AL53TF U 1
AF RS1AL53JQ C 116
BS 1 721 RS1AL53TF
BS 722 722 RS1AL53JQ
BS 723 775 RS1AL53TF
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BS 777 826 RS1AL53TF
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BS 866 866 RS1AL53JQ
BS 867 875 RS1AL53TF
BS 876 891 RS1AL53JQ

RD RS1AL53TF 879 0 0
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ATCGTTGAGTACATTGATGAGACATGGAGCGCATCTGGACCGTCCATACTTCCTTCACAT
CCCCATGATCGCGCTCAAGCTCGCTTCTGGTCTGCCTTCGTTGATGACAAGTGGTTTCCG
GCTTTGAAAGCGGCCGCAATCACCAAATCCGAAGAGGCAAAAGGAAAAGGCATGAAAGAA
GTGGAAGAAGGGTTATTGCAACTCGAGGAAGCCTTTGTTTCTATAAGCAAAGGGAAACCG
TTTTTCGGAGGTGAAGCGATCGGGTTTATGGACATTTGCCTCGGAAGCTTTGTGGGTATC
TTGAAGGCTAGAGAGAAGCTTAAAGGAGAAAAGCTTTTAGACGAAACAAAAGTTCCTTCA
CTTTGTAAATGGGCGGACCAGTTCTTGTCTGATGATACTGTGAAGAATGTGGTGCCGGAG
ATCGATAAAATGGCTGAGTTTCTAGGAGGGCTTGTGGTTAGAGCTCAATCAGCGGTTTCA
G*AACTTGAGATCATCGTTGAAAAGCAAATGGACGTGTGTAATGTAAGTGCGAAA*TAAG
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TTATGGATAATGCTTTCAAATTTCA*TAATTGAAA
TGGC

QA 1 875 1 875
DS 

RD RS1AL53JQ 776 0 0
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ATCCAGTTCACAAGAAAGTCCCGGTTCTCATCCACAACAACAAACCGATTCTAGAGTCTC
TCAACATCGTTGAGTACATTGATGAGACATGGAGCGCATCTGGACCGTCCATACTTCCTT
CACATCCCCATGATCGCGCTCAAGCTCGCTTCTGGTCTGCCTTCGTTGATGACAAGTGGT
TTCCGGCTTTGAAAGCGGCCGCAATCACCAAATCCGAAGAGGCAAAAGGAAAAGGCATGA
AAGAAGTGGAAGAAGGGTTATTGCAACTCGAGGAAGCCTTTGTTTCTATAAGCAAAGGGA
AACCGTTTTTCGGAGGTGAAGCGATCGGGTTTATGGACATTTGCCTCGGAAGCTTTGTGG
GTATCTTGAAGGCTAGAGAGAAGCTTAAAGGAGAAAAGCTTTTAGACGAAACAAAAGTTC
CTTCACTTTGTAAATGGGCGGACCAGTTCTTGTCTGATGATACTGTGAAGAATGTGGTGC
CGGAGATCGATAAAATGGCTGAGTTTCTAGGAGGGCTTGTGGTTAGAGCTCAATCAGCGG
TTTCAGGAACTTGAGATCATCGTTGAAAAGCAAATGGACGTGTGTAATGTAAGTGCGAAA
ATAAGTGAAAGGTCGAAGTGTTGTATTGAATGTATGCTAGTAATTTATACAATGCTGTGT
ATGGTTTATGGATAATGCTTTCAAATTTCAATAATTGAAAATGGCAGATTATTAGT

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

CO CL7210Contig1 816 2 1 U
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AAAATGATACATCGAGCATGACATAAAAGTCTGACGACTCTGCTGATAAACCCAAACAAT
AAGCAGTGCTTCAAATCCGTTCCAAAATAAGATATGGTTCCATATGTTTCGGTTTTGATT
TTATTTATCTTTTTTTTTAGCTTCCAAGACTTAAAGCTCTGAAAAGTCCTCATTTTAAAT
ACACTACATTAACCAACTTAACTTCCCAATCTCTCCGGCATTAAATGCATTTTTTTTCCT
TCAGCTTCCTTTAAATGATGCTTAAACATTTCTATTTGCTTCAGCGTATGATCTTCCATA
AAAAATTTAAGTGATATCTGAATGCTCGCGTGACAACTGTTACTGTACAAGGACTATTCC
AGCGGTAGATGCTTTCCACAATTTTTTTTTCTATGCACAAGTCTCGAGGGTGCCATCTCG
AGCTTAACTTAATGAGACGGTCCATGATCGCTCATACACTATTCTCCATGAAGCATGATT
TCCATAGTCCAATGAGAAACCCCACAATCAACATATCCCATTTACAATCTGGGAGAAGTA
GATTGTGTAATAATCCAATAAATATTTGATGTTCTGTTTTGACCATATGACAATACTGAC
ATGACGACACAATGTAGCTCCATCTTTTTTCTTTTTCACTAGGCCCATGATAATAACATT
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AGACAGCCACTCCTGCTACTGAAACCATGTGACCCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1BV32JQ U 1
AF RS1A476JQ U 1
BS 1 816 RS1A476JQ

RD RS1BV32JQ 746 0 0
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QA 1 746 1 746
DS 

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AAAAATTTAAGTGATATCTGAATGCTCGCGTGACAACTGTTACTGTACAAGGACTATTCC
AGCGGTAGATGCTTTCCACAATTTTTTTTTCTATGCACAAGTCTCGAGGGTGCCATCTCG
AGCTTAACTTAATGAGACGGTCCATGATCGCTCATACACTATTCTCCATGAAGCATGATT
TCCATAGTCCAATGAGAAACCCCACAATCAACATATCCCATTTACAATCTGGGAGAAGTA
GATTGTGTAATAATCCAATAAATATTTGATGTTCTGTTTTGACCATATGACAATACTGAC
ATGACGACACAATGTAGCTCCATCTTTTTTCTTTTTCACTAGGCCCATGATAATAACATT
TCATATCTCGATACCTCTTAGGTTTCGGCCATTCTAAAATTGTAGTAGTCTTTTCCGAAC
AGACAGCCACTCCTGCTACTGAAACCATGTGACCCC

QA 1 816 1 816
DS 



AS 1 2

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AATGGTATGTTTAGTAGCTTGCGATAGTACTTTCAACAACTAGAGAAAAAAGTGTGTTTG
TATCTGCTTGCTCTTCATTGTGTATCCTCTTTCCTTTTGTATTATATTTAAAATTTGGTG
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TATATTTCATTAAAGTATGCAAAGTTTGGTACCTTTGCGCAATCACTCTCTCGAGGAAAT
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EI84TF U 1
AF RS1EI84JQ C 126
BS 1 473 RS1EI84TF
BS 474 887 RS1EI84JQ

RD RS1EI84TF 473 0 0
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TTGTACGTCTAACCCATTCGGTAGGCTTTTGTTTATACTTCTTCTTCTTTTACTCCAGAG
CCTATTGTTTCTGTGCTAAGAGGTACCTTTTATTATTTCAGTTTTATTGTTTCTTCCCTT
AGAATATGAGAAATAACGACATAGACAACAAAAGCAAGCATGTTTAATTATTGATTTTAG
AATGGTATGTTTAGTAGCTTGCGATAGTACTTTCAACAACTAGAGAAAAAAGTGTGTTTG
TATCTGCTTGCTCTTCATTGTGTATCCTCTTTCCTTTTGTATTATATTTAAAATTTGGTG
ATTGGTTCCACAAGATCATTACTCAGCAGGTTTGGTTTCAAACCAGGTCAGCTATTTTTT
TATATTTCATTAAAGTATGCAAAGTTTGGTACCTTTGCGCAATCACTCTCTCG

QA 1 473 1 473
DS 

RD RS1EI84JQ 762 0 0
TGTTTCTGTGCTAAGAGGTACCTTTTATTATTTCAGTTTTATTGTTTCTTCCCTTAGAAT
ATGAGAAATAACGACATAGACAACAAAAGCAAGCATGTTTAATTATTGATTTTAGAATGG
TATGTTTAGTAGCTTGCGATAGTACTTTCAACAACTAGAGAAAAAAGTGTGTTTGTATCT
GCTTGCTCTTCATTGTGTATCCTCTTTCCTTTTGTATTATATTTAAAATTTGGTGATTGG
TTCCACAAGATCATTACTCAGCAGGTTTGGTTTCAAACCAGGTCAGCTATTTTTTTATAT
TTCATTAAAGTATGCAAAGTTTGGTACCTTTGCGCAATCACTCTCTCGAGGAAATAATAA
AAAGAAATCTCTTTATAGCCTTCGACCAACTTTCTTTTTCTTTACTGAGAACCGGGGTTT
GCTGTTTTTGAAATGGTTGCAGATGAACTCGATAAATGAAGCTATAGACAGACGAATTTC
AGAGAGTAGGCTTGCTGGGCGGATGGCATTTTAGAGTTTTGACACCAAACCAAACATGTG
TGTTTGAAGAAACCATCCAAGAAGAGGATGATGATGGGCTTTTGTCACTCACATTTATTC
AGGTTTTTCAGAAGCTGAACTTGTGATTTGAATTTAAGTTATTACCATATATCTATATAT
GGTTGTAGTCTTTAGACTGGTGAGTTTTTTAGAGATCTCAGGGATGTTTTTACAGAGGTT
TTTGTTCTAAAAATCGTTTACTATATAAAAGAGATTCACCCG

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL7212Contig1 554 2 2 U
GGAGTAGTCTCTGAAATTGTATCCCAAAAAAAAACAAGCAACATGTCTTGCAAAGGAGAG
GTTGTGTTGCGTGCGGAGGAAGTATTGTTTCTCCTACCTTCAACCCTTTTCAATGAGATC
TTTCTTGATTACACCGGTCCATTTCCACAGAGCTATAGAGGATGTAGCTACCATGATAGG
AAGCCAAGGATGTGGCACGCCTTGAACCACTATGGTTCCATAAAGAAGCCAAGTAGTGAT
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ATGAGTATCATCTCAGAAGAGAAGAGACCCAAGAAGAAGACATGTCCCATCATCTCCTCT
CATTCCAGACAAGTCTTTCTTCCTAAAGAATGGGCTTATTAGCTAGTAATTAGCATTTAT
TTACCTTGTGTATATCGTATACTGCTATAAAACATTAAACACAAAAATAAGTTCTAATTT
TCCATCTCTAAAGTTTGGGATCTATAGCACCACTCCAATTAACAATACAAGTCCAGCTTC
AATTCATAAACATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FA59TF U 1
AF RS1B143TF U 224
BS 1 456 RS1FA59TF
BS 457 554 RS1B143TF

RD RS1FA59TF 456 0 0
GGAGTAGTCTCTGAAATTGTATCCCAAAAAAAAACAAGCAACATGTCTTGCAAAGGAGAG
GTTGTGTTGCGTGCGGAGGAAGTATTGTTTCTCCTACCTTCAACCCTTTTCAATGAGATC
TTTCTTGATTACACCGGTCCATTTCCACAGAGCTATAGAGGATGTAGCTACCATGATAGG
AAGCCAAGGATGTGGCACGCCTTGAACCACTATGGTTCCATAAAGAAGCCAAGTAGTGAT
GATGCCAGCAAAGGACGAGTTAAGCCACGTGGCACTGGAGTGTTTCTTCCTGCCAAACCG
ATGAGTATCATCTCAGAAGAGAAGAGACCCAAGAAGAAGACATGTCCCATCATCTCCTCT
CATTCCAGACAAGTCTTTCTTCCTAAAGAATGGGCTTATTAGCTAGTAATTAGCATTTAT
TTACCTTGTGTATATCGTATACTGCTATAAAACATT

QA 1 456 1 456
DS 

RD RS1B143TF 331 0 0
G
GAAGCCAAGTAGTGATGATGCCAGCAAAGGACGAGTTAAGCCACGTGGCACTGGAGTGTT
TCTTCCTGCCAAACCGATGAGTATCATCTCAGAAGAGAAGAGACCCAAGAAGAAGACATG
TCCCATCATCTCCTCTCATTCCAGACAAGTCTTTCTTCCTAAAGAATGGGCTTATTAGCT
AGTAATTAGCATTTATTTACCTTGTGTATATCGTATACTGCTATAAAACATTAAACACAA
AAATAAGTTCTAATTTTCCATCTCTAAAGTTTGGGATCTATAGCACCACTCCAATTAACA
ATACAAGTCCAGCTTCAATTCATAAACATG

QA 2 331 2 331
DS 



AS 1 2

CO CL7213Contig1 782 2 12 U
GGGTTACAAAGATTTGTCAAAAAATTTCACTGCCACGGGGTGTTAGATCCGATCTGAAAT
CGATCATCTAGCGATGGACTTGGCTGAACTCTGGGCGATTTTCGGGCCGGGTTTCTCCGG
AGCTGTTTTCGGCACTGGCTGGTGGTTTTGGGTCGACGCCGTTGTGTGCAGCTCCATCCA
AGTTCCCTTCCTCCATTACCTCCCCGGGATATTCGCATCTCTCGGAGCTTTGATGTTCAA
TTGCGTCAGAAAAGAAGATATCGATTACTCTCCTTACTACGAAGGCGAATGGAGGTTGAA
GTTATGGCTTTTCATAGCGTATGTGGTGGCGTTTGTTTCCCTAGCTGCTTCTGTTGGTCT
GCTGATTCAAGATTCCGTCGTCAAAACTGGACCTTCCACCTGGACTGGTGTCGCCGGTGT
CTTTCAATTTGTATTCGTATTGATAAGTGGGCTAATGTATTGGACATCACACTCGGAGTA
AGTAGACTTGCAGGGCACATACTCCAACGCAGATACTTGTGGTTACAACTTACAGATGCC
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CTAGATTCCTCCATTGCATTGGTGTGTTTGTTTTAAACTTTGTCGTTCTATGCTTGGGTT
ATAAGTTGTTGCTTCTTATGTAGAGGTTGGATAGAAAATAATCTTCAACTTTATGTGAAT
GTTATGGGACGCCTTGCCCGTGTCTGCACGGTCTCTTAATTCCATTGGAGTGAACGATTG
GT


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 

AF RS1AW34TF U 1
AF RS1AW34JQ C 2
BS 1 685 RS1AW34TF
BS 686 686 RS1AW34JQ
BS 687 697 RS1AW34TF
BS 698 698 RS1AW34JQ
BS 699 718 RS1AW34TF
BS 719 719 RS1AW34JQ
BS 720 722 RS1AW34TF
BS 723 723 RS1AW34JQ
BS 724 758 RS1AW34TF
BS 759 759 RS1AW34JQ
BS 760 773 RS1AW34TF
BS 774 782 RS1AW34JQ

RD RS1AW34TF 780 0 0
GGGTTACAAAGATTTGTCAAAAAATTTCACTGCCACGGGGTGTTAGATCCGATCTGAAAT
CGATCATCTAGCGATGGACTTGGCTGAACTCTGGGCGATTTTCGGGCCGGGTTTCTCCGG
AGCTGTTTTCGGCACTGGCTGGTGGTTTTGGGTCGACGCCGTTGTGTGCAGCTCCATCCA
AGTTCCCTTCCTCCATTACCTCCCCGGGATATTCGCATCTCTCGGAGCTTTGATGTTCAA
TTGCGTCAGAAAAGAAGATATCGATTACTCTCCTTACTACGAAGGCGAATGGAGGTTGAA
GTTATGGCTTTTCATAGCGTATGTGGTGGCGTTTGTTTCCCTAGCTGCTTCTGTTGGTCT
GCTGATTCAAGATTCCGTCGTCAAAACTGGACCTTCCACCTGGACTGGTGTCGCCGGTGT
CTTTCAATTTGTATTCGTATTGATAAGTGGGCTAATGTATTGGACATCACACTCGGAGTA
AGTAGACTTGCAGGGCACATACTCCAACGCAGATACTTGTGGTTACAACTTACAGATGCC
TCGTTTTCTTCTTCTCTGTAAATTCTTGTGTCTTTGTCTGGTCCAGCTTGGTGTTGTGTG
CTAGATTCCTCCATTGCATTGGTGTGTTTGTTTTAAACTTTGTCGTTCTATGCTTGGGTT
ATAAGTTGTTGCTTCTTATGTAGAG*TTGGATAGAAA*TAATCTTCAACTTTATGTGA*T
GT*ATGGGACGCCTTGCCCGTGTCTGCACGGTCTCTTA*TTCCATTGGAGTGA
CGATGGT

QA 1 773 1 773
DS 

RD RS1AW34JQ 781 0 0
GGG
TACAAAGATTTGTCAAAAA*TTTCACTGCCACGGGGTGTTAGATCCGATCTGAAATCGAT
CATCTAGCGATGGACTTGGCTGAACTCTGGGCGATTTTCGGGCCGGGTTTCTCCGGAGCT
GTTTTCGGCACTGGCTGGTGGTTTTGGGTCGACGCCGTTGTGTGCAGCTCCATCCAAGTT
CCCTTCCTCCATTACCTCCCCGGGATATTCGCATCTCTCGGAGCTTTGATGTTCAATTGC
GTCAGAAAAGAAGATATCGATTACTCTCCTTACTACGAAGGCGAATGGAGGTTGAAGTTA
TGGCTTTTCATAGCGTATGTGGTGGCGTTTGTTTCCCTAGCTGCTTCTGTTGGTCTGCTG
ATTCAAGATTCCGTCGTCAAAACTGGACCTTCCACCTGGACTGGTGTCGCCGGTGTCTTT
CAATTTGTATTCGTATTGATAAGTGGGCTAATGTATTGGACATCACACTCGGAGTAAGTA
GACTTGCAGGGCACATACTCCAACGCAGATACTTGTGGTTACAACTTACAGATGCCTCGT
TTTCTTCTTCTCTGTAAATTCTTGTGTCTTTGTCTGGTCCAGCTTGGTGTTGTGTGCTAG
ATTCCTCCATTGCATTGGTGTGTTTGTTTTAAACTTTGTCGTTCTATGCTTGGGTTATAA
GTTGTTGCTTCTTATGTAGAGGTTGGATAGAAAATAATCTTCAACTTTATGTGAATGTTA
TGGGACGCCTTGCCCGTGTCTGCACGGTCTCTTAATTCCATTGGAGTGAACGATTGGT

QA 4 781 4 781
DS 



AS 1 2

CO CL7214Contig1 806 2 2 U
GTTTAATGTTGAAAGACATTTTCTATCACTGGTTATAATTTTTTGTCTATTATCATATTG
AGGAAAAATAAAATATATGAAAAAATTATAAGTTTCTTAACAGTTTGTTATATGTATTAA
TAAATAAACAAAATTACCACTGCTAACTAATTTCGTGATTAAATAAGATACAATTCTTAA
ATTCTACTTTTTGAATGAAATGACACATTTTTAGAATGATAATTCACAATTTTAAAATTT
ATGAAAATATTAAGAATAAAACTTTATAAAAAAATATAGACCATTTGAAATTCTTTTAGA
TGAAAAGACAATCTTAAACAAATAGACACATACCTAATTGTTTCACAACCTTATGCCAAT
GAAGAAATGACAAATAAGTTTATATATTAATACTATGAACTGAGCAATCGCATGCAAGTC
AATGGTGAAAATCACATCCTTTGATTATAAGTTAGCTTAGTTGGATAAATGGTTACATTA
ATCACATTTAATCCAATTAATATGGAAGAGGTATAATACAATTGAAAAAGACTTTATGCT
TTTAATTAATGATTAATATACAAACTTTGGTACTTTAATTTTAAAGACATACAAAAGATA
TTATAAAAGATGTTATAAAAGAAATTATCAATAAATTTTATGGAAGTGATCACGAGGCTT
CGGAAAATGCAATGGTTAATTCTTCAGAAGTTAATCATACACGAAAAAATAAATTAGTAA
TGATAGTTATAGATATAAAACAAATGGCATATGACAATTTAAATGCAATGAAAGAATCAA
CCAAATAAATAAGAAAATTAATACGG


BQ
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AF RS1H147TF U 1
AF RS1H147JQB C 89
BS 1 651 RS1H147TF
BS 652 806 RS1H147JQB

RD RS1H147TF 651 0 0
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QA 1 651 1 651
DS 

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AATTTCGTGATTAAATAAGATACAATTCTTAAATTCTACTTTTTGAATGAAATGACACAT
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AAAAAATATAGACCATTTGAAATTCTTTTAGATGAAAAGACAATCTTAAACAAATAGACA
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AATACTATGAACTGAGCAATCGCATGCAAGTCAATGGTGAAAATCACATCCTTTGATTAT
AAGTTAGCTTAGTTGGATAAATGGTTACATTAATCACATTTAATCCAATTAATATGGAAG
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QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

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CGATAGACGCGGCGAGGCCGAGGGATGATAAGGAGAGGATCGGCGCGGAGCAGCAGTGTG
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BQ
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AF RS1BK35TF U 28
AF RS1BK35JQ C 1
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BS 773 802 RS1BK35JQ

RD RS1BK35TF 745 0 0
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TGTTCTGGAAGAGGAGACCCATGGCTACATGTTCCGCTTGGAAACCAAACCCAAATCAGA
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TTTTGAGGATGTGCAGTGATGTTTTCTGTTGTAGCATAAACTATAAAGTCAACTAATTAA
ATACCTATATATCTGTATACAAAGC

QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1BK35JQ 802 0 0
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CGTCGCCTTTCCTGTCGAGGTTCGCGGAGACGCTTGATTATTACACGGCGATGTTTGAGT
CGATAGACGCGGCGAGGCCGAGGGATGATAAGGAGAGGATCGGCGCGGAGCAGCAGTGTG
TGGCGAGTGACATAGTGAACATGATTGCGTGCGAGGAGAGGGAGAGAGTTGAGAGACACG
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GCAGATCCGCGGCGTTTGCAGCGGGTGAGATGCTTAAAGGTTACGACAAGAACTACAAAC
TAGGAGGGAGTGAAGGAGCGCTGTATCTGTTCTGGAAGAGGAGACCCATGGCTACATGTT
CCGCTTGGAAACCAAACCCAAATCAGATTGTGTAGGACATGGTGGATGAAGAAGAGTACA
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GCATAAACTATAAAGTCAACTAATTAAATACCTATATATCTGTATACAAAGCAAACCTGG
TAATTGTTTTTTTTCTTTCCTG

QA 1 802 1 802
DS 



AS 1 2

CO CL7216Contig1 800 2 4 U
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GCTTCAGAGCTTCCGATTCCACAAGACGTTTTAAAGAGGCTTTACCATATCAATGACCAG
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AATGGTACAATATAAATTTTATATCTTGTTGAGAAAAAGTGTGTTTAAGTTTTTAACTAA
TTGCTAAACTACGTGTAACT


BQ
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AF RS1EE92TF U 1
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BQ
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AF RS1FV67TF U 1
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DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1A096TF U 1
AF RS1A096TV U 1
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BS 747 782 RS1A096TV

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DS 

RD RS1A096TV 782 0 0
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GATCAATTATTACCCTTCAAAGTTTGATCCTGTCCGTTGCGCCGAGAAAGTTCCAATCCC
TAGCAAATCCTACACTGGAATAAGAACAAAGGTATGTGATTCACTCCATGCCTTTTTTAC
ATTTTCAAAACCTTATATAGCTTGTGAATATATAGGTTTCCTAAAACAAAGGTTTCATTG
CTATTGTTGTAGTGTGTCATCAAGAAGGAGAACAACTTCAAGCAGGCTGGAGATAGGTAC
AGATCCTGGGCACCAGACAGGTAAAGAAAAACTCTCTCCCTTACATAACCCTCCCAAAAG
ACAAAAGCTTAATTTATAATCTTCAAATGTTTACAGGCAAGACAGGTTTGTTAAGAGATG
GGTCGAGATCCTGTCAGAGCCGCGTCTCACTCATGAAATCCGTAGCATCTGGATCTCTTA
TTGGTCTCAAGTAAGAACAAATAAAAAACATAAATCTCTACTCTAAATTGTTTTTGAACC
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TC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AGATGTCTCAAACATAACAAAGGTAAAACCATAGCAAGACTTCTTCACTCTCCACCAGTT
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ACCCCGACAGCCCACACAGGCTGGTTCAAGCTTGGTGATGGACCATCTCCAAGAACCAGC
GATGCTAGTGATTGGATTGATTGCTATTCTAATTCATCATCATCATAAACATCCAAATCC
TCATCAAAAGCAGTCATGTCAAGCTGGTAACGAAGTATCCCTCCTATTCCTCCAAACCCT
CTGCAAAACTGAAACCCTTCCTGCGACTTGTTCGTCACAAACTCCAGCGCACACCCAAAA
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CTATTGTCTGCTTTGAAGTTCTCAGTGTTGGCTTCCTGTTCCTTGTTCAGGTGCTTTATC
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ACGATCAGCGTCTCAACAGCACCTGAATCCAAAGCGTTCAAAGTATCCCCCACACCAAAC
ACATACTTCCCCGTGTCCTGACTAATCTCTCAAAGTACTTCCCTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1CY52JQ U 1
AF RS1CZ75JQ U 19
BS 1 190 RS1CY52JQ
BS 191 191 RS1CZ75JQ
BS 192 791 RS1CY52JQ
BS 792 825 RS1CZ75JQ

RD RS1CY52JQ 799 0 0
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AGATGTCTCAGACATAACAAAGGTAAAACCATAGCAAGACTTCTTCACTCTCCACCAGTT
TCTTCAGTCTCCACCTTCCGGAAAAGATGCTTCTTCACTTAATTTCCAATTTTCTGCGTG
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GATGCTAGTGATTGGATTGATTGCTATTCTAATTCATCATCATCATAAACATCCAAATCC
TCATCAAAAGCAGTCATGTCAAGCTGGTAACGAAGTATCCCTCCTATTCCTCCAAACCCT
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CGCTTGTACTCGTTAGCCAGCCACTCAAGCAGCGACATCTTATCCTCCACGTCCAAGTCG
CTATTGTCTGCTTTGAAGTTCTCAGTGTTGGCTTCCTGTTCCTTGTTCAGGTGCTTTATC
ACAGTTCCACCAGTGGCACTGTTCTTCAACACGTATCTGTTGATGTCAAGGTTCTCCCAT
ACGATCAGCGTCTCAACAGCACCTGAATCCAAAGCGTTCAAAGTATCCCCCACACCAAAC
ACATACTTCCC
GTGTCTGA

QA 1 791 1 791
DS 

RD RS1CZ75JQ 807 0 0
CG
ATCAAAACAAAGGCGTAGATAGATTAAGTCACAAAACATCCATGCAATGCAATCGAGAAA
ATACCAAAAACCAAATCACTAAACCTTTCCTCTCTCAGACGAAGAGTATTATAGCACTGT
AAAGAAAAACAACCAACCAAAAGAAAAAAAACTCCATAATAGATGTCTCAAACATAACAA
AGGTAAAACCATAGCAAGACTTCTTCACTCTCCACCAGTTTCTTCAGTCTCCACCTTCCG
GAAAAGATGCTTCTTCACTTAATTTCCAATTTTCTGCGTGACCCCGACAGCCCATACAGG
CTGGTTCAAGCTTGGTGATGGACCATCTCCAAGAACCAGCGATGCTAGTGATTGGATTGA
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AAGCTGGTAACGAAGTATCCCTCCTATTCCTCCAAACCCTCTGCAAAACTGAGACCCTTC
CTGCGACTTGTTCGTCACAAACTCCAGCGCACACCCAAAACGCTTGTACTCGTTAGCCAG
CCACTCAAGCAGCGACATCTTATCCTCTACGTCCAAGTCGCTATTGTCTGCTTTGAAGTT
CTCAGTGTTGGCTTCCTGTTCCTTGTTCAGGTGCTTTATCACAGTTTCACCAGTGGCACT
GTTCTTCAACACGTATCTGTTGATGTCAAGGTTCTCCCATACGATCAGCGTCTCAACAGC
ACCTGAATCCAAAGCGTTCAAAGTATCCTCCACACCAAACACATACTTCCCCGTGTCCTG
ACTAATCTCTCAAAGTACTTCCCTA

QA 3 807 3 807
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7223Contig1 450 2 1 U
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AACTTTAGATAAAACTTAGAAACTGAGATGGAACCAGCAGGTTCTGACGTGTAATGTGTA
ACTTTGTTCCTTTGTTAGTTAGTTCTTTCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1ER73JQ C 1
AF RS1ER73TF U 1
BS 1 450 RS1ER73TF

RD RS1ER73JQ 450 0 0
GGGAGACGGTGAGAAGAAGGAAGGTGGCGCGCCGGCGGTGGCTACGGTGAATAAGATGGA
TTACTATGGATACTCGCATCCGACGGTTCCAATGTATTGGCAAGAAGGACACGTGTACGG
TCATACTTATTCAACAGAGGGTCAGACTTATCCAATAGGGGGTCAGAGTTATCCAGGTTC
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TCCTGGAATGTTCAGCGATGAGAACCCGAACGGTTGCTCCGTCATGTAACCATGGACCGA
ATTGTAAATATATGAAACTTCAAGGGTCGGGACGTAAAATGTGAAACATTCGCAAGTGGT
AACTTTAGATAAAACTTAGAAACTGAGATGGAACCAGCAGGTTCTGACGTGTAATGTGTA
ACTTTGTTCCTTTGTTAGTTAGTTCTTTCT

QA 1 450 1 450
DS 

RD RS1ER73TF 450 0 0
GGGAGACGGTGAGAAGAAGGAAGGTGGCGCGCCGGCGGTGGCTACGGTGAATAAGATGGA
TTACTATGGATACTCGCATCCGACGGTTCCAATGTATTGGCAAGAAGGACACGTGTACGG
TCATACTTATTCAACAGAGGGTCAGACTTATCCAATAGGGGGTCAGAGTTATCCAGGTTC
AGGATATAATTACGCAAGCCAAAGCTACGTGCCTTACCCTCAACCAAACATGAACGCGGC
TCCTGGAATGTTCAGCGATGAGAACCCGAACGGTTGCTCCGTCATGTAACCATGGACCGA
ATTGTAAATATATGAAACTTCAAGGGTCGGGACGTAAAATGTGAAACATTCGCAAGTGGT
AACTTTAGATAAAACTTAGAAACTGAGATGGAACCAGCAGGTTCTGACGTGTAATGTGTA
ACTTTGTTCCTTTGTTAGTTAGTTCTTTCT

QA 1 450 1 450
DS 



AS 1 2

CO CL7224Contig1 228 2 1 U
GATGACGATGAGGATATAACGCTCCCTCTTCTGAGTTCAGCTGAAGTAACTTGCTGGCAG
AATCGAACCTAATATTACTGGCCACCACTGAGTCATCTTTTTGCACCGTCCTTAAATGAT
TTTGCAAAGTTTTTTCTAATTCTTTAGTTTTGAATCATATTAATCGCGAATTGATATAGG
CTGTTGTGATAATGATGAAGCAATAAATCTAATCCAACACTTGATCTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1GN60JQ C 1
AF RS1GN60TF U 1
BS 1 228 RS1GN60TF

RD RS1GN60JQ 228 0 0
GATGACGATGAGGATATAACGCTCCCTCTTCTGAGTTCAGCTGAAGTAACTTGCTGGCAG
AATCGAACCTAATATTACTGGCCACCACTGAGTCATCTTTTTGCACCGTCCTTAAATGAT
TTTGCAAAGTTTTTTCTAATTCTTTAGTTTTGAATCATATTAATCGCGAATTGATATAGG
CTGTTGTGATAATGATGAAGCAATAAATCTAATCCAACACTTGATCTC

QA 1 228 1 228
DS 

RD RS1GN60TF 228 0 0
GATGACGATGAGGATATAACGCTCCCTCTTCTGAGTTCAGCTGAAGTAACTTGCTGGCAG
AATCGAACCTAATATTACTGGCCACCACTGAGTCATCTTTTTGCACCGTCCTTAAATGAT
TTTGCAAAGTTTTTTCTAATTCTTTAGTTTTGAATCATATTAATCGCGAATTGATATAGG
CTGTTGTGATAATGATGAAGCAATAAATCTAATCCAACACTTGATCTC

QA 1 228 1 228
DS 



AS 1 2

CO CL7225Contig1 750 2 5 U
GGAGGGATATTTATATATCGTGGGCAGCAAAAGTGTATGTAAAAAGGGGACAAAGAAACG
GATTAATCTTTTTTCTCAATCAATCGAGAAGAAAGTTAGGGTTCGTTATCAGCAATGATC
CCAGCGAAGAGTTCCGATGATTTCAGTTGGGAGAAAGATTTGTCAGAGGATCTTCGAATG
TATAATGAAGAGTGGGATAAGAGCGGGGGTTTCGATATCGACTTCTCGAAACTCCGTCAC
AAATTCGACACAGGAGCTGTGGATCTCAACGACGATAACCTGGTTCTTGACCCTGATGAT
GCCAACTTAGCTCTGCTCACCAGGTTGACGCACTTGGCTATCACGCACCACAAAAACGAG
ACGGGTATAACAAGCCTTGAGTTTGTCAGGGTCTTGAAAGCAAACTACCACCCATCCGCT
GGAGTCACCTACTACATCACATTCGAAGCCAATGATGGTAATCAGACTAAACAGTATCAG
GCAGTGGTTCGCTACTTGCCTATGAATACTCAAGTTATCTCTTGCTGGCCTAAACCCTCT
TGAATGTTTTCCACCACTGCCGCTCTCTATGAATGGGAAGAATAAAAAGTCGGTTACTGT
TATCTTGTTCCTTTAACTTCTATATGTCAGACTTTAAGTTGTTTCACTATGGCTTTTACC
AAATTATATGTGGTGGTTTATCTGGTGTTTGTTGCTACAAAAGCCGCTACTATTTACATC
AGCTACTTATGGAATATGTTGTTGTTTCGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FV78JQ C 1
AF RS1FV78TF U 1
BS 1 659 RS1FV78TF
BS 660 660 RS1FV78JQ
BS 661 701 RS1FV78TF
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BS 703 750 RS1FV78TF

RD RS1FV78JQ 750 0 0
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AAATTCGACACAGGAGCTGTGGATCTCAACGACGATAACCTGGTTCTTGACCCTGATGAT
GCCAACTTAGCTCTGCTCACCAGGTTGACGCACTTGGCTATCACGCACCACAAAAACGAG
ACGGGTATAACAAGCCTTGAGTTTGTCAGGGTCTTGAAAGCAAACTACCACCCATCCGCT
GGAGTCACCTACTACATCACATTCGAAGCCAATGATGGTAATCAGACTAAACAGTATCAG
GCAGTGGTTCGCTACTTGCCTATGAATACTCAAGTTATCTCTTGCTGGCCTAAACCCTCT
TGAATGTTTTCCACCACTGCCGCTCTCTATGAATGGGAAGAATAAAAAGTCGGTTACTGT
TATCTTGTTCCTTTAACTTCTATATGTCAGACTTTAAGTTGTTTCACTATGGCTTTTACC
AAATTATATGTGGTGGTTTATCTGGTGTTTGTTGCTACAAAAGCCGCTACTATTTACATC
AGCTACTTATGGAATATGTTGTTGTTTCGT

QA 1 750 1 750
DS 

RD RS1FV78TF 750 0 0
GGAGGGATATTTATATATCGTGGGCAGCAAAAGTGTATGTAAAAAGGGGACAAAGAAACG
GATTAATCTTTTTTCTCAATCAATCGAGAAGAAAGTTAGGGTTCGTTATCAGCAATGATC
CCAGCGAAGAGTTCCGATGATTTCAGTTGGGAGAAAGATTTGTCAGAGGATCTTCGAATG
TATAATGAAGAGTGGGATAAGAGCGGGGGTTTCGATATCGACTTCTCGAAACTCCGTCAC
AAATTCGACACAGGAGCTGTGGATCTCAACGACGATAACCTGGTTCTTGACCCTGATGAT
GCCAACTTAGCTCTGCTCACCAGGTTGACGCACTTGGCTATCACGCACCACAAAAACGAG
ACGGGTATAACAAGCCTTGAGTTTGTCAGGGTCTTGAAAGCAAACTACCACCCATCCGCT
GGAGTCACCTACTACATCACATTCGAAGCCAATGATGGTAATCAGACTAAACAGTATCAG
GCAGTGGTTCGCTACTTGCCTATGAATACTCAAGTTATCTCTTGCTGGCCTAAACCCTCT
TGAATGTTTTCCACCACTGCCGCTCTCTATGAATGGGAAGAATAAAAAGTCGGTTACTGT
TATCTTGTTCCTTTAACTTCTATATGTCAGACTTTAAGTTGTTTCACTATGGCTTTTAC*
AAATTATATGTGGTGGTTTATCTGGTGTTTGTTGCTACAAA*GCCGCTACTATTTACATC
AGCTACTTATGGAATATGTTGTTGTTTCGT

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL7226Contig1 780 2 5 U
GGAGAAAGCTTGAAAAGAAAATCTGCTTCAATGGCGCCTGTTAAGATAACTGGCGCTGTT
GTTGCAGCGGCAACGATGGTGATGCTGTCTTACTACTACTTGTGCTTCTCCGATAAAAAG
AAGCAGAGGAAGAATGATAAGCTAAGTAGGAGAAACGGGATCGTATATGCCATTGGCAAT
ACACCTCTCATTCGTATCAATTGCCTCTCCGACGCTACTGGCTATTCTTGGAAAGTGCGA
GTTTTTGAATCCAGGAGGAAGCGTTAAAGACAGAGTTGCTGTCAAGATCATCGAAGAGGC
TTTGGAATCTGGTAAGCTGTTTCCGGGGGGAATAGTAACAGAGGGTAGTGTTGGGAGTAC
TGCCATCAGCCTTGCTACTGTTGCTCCTGCTTATGGATGTCAATGCCATGTTGTTATTCC
TGATGATGTTGCTATTGAAAAGTCTCAAATAATTGAAGCCCTTGGAGCTACCGTTGAGAG
GGTGAGGCCAGTCTCAATTACTCACAAAGATCACTTCGTCAACATTGCTAGGCGACGTGC
TGACCAAGCTAATGGCTTAGCTTCATCTAAGAGAAGACTAGCACACCAGGAAGAAACTAA
TGGTTGTTGCACAGCTGAGGAAGAGAATGAGCCTTCCTTGTTCCCAGATTCAGTTACACG
TGGCTTCTTTGCAGATCAATTTGAAAACTTGGCAAATTATAGGGCTCATTACGAAGGTAC
TGGCCCTGAAATCTGGCACCAGACAAACGGTAACATCGATGCCTTTGTTGCTGCTGCGGG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F506TF U 1
AF RS1F994TF U 1
BS 1 658 RS1F506TF
BS 659 659 RS1F994TF
BS 660 686 RS1F506TF
BS 687 687 RS1F994TF
BS 688 780 RS1F506TF

RD RS1F506TF 780 0 0
GGAGAAAGCTTGAAAAGAAAATCTGCTTCAATGGCGCCTGTTAAGATAACTGGCGCTGTT
GTTGCAGCGGCAACGATGGTGATGCTGTCTTACTACTACTTGTGCTTCTCCGATAAAAAG
AAGCAGAGGAAGAATGATAAGCTAAGTAGGAGAAACGGGATCGTATATGCCATTGGCAAT
ACACCTCTCATTCGTATCAATTGCCTCTCCGACGCTACTGGCTATTCTTGGAAAGTGCGA
GTTTTTGAATCCAGGAGGAAGCGTTAAAGACAGAGTTGCTGTCAAGATCATCGAAGAGGC
TTTGGAATCTGGTAAGCTGTTTCCGGGGGGAATAGTAACAGAGGGTAGTGTTGGGAGTAC
TGCCATCAGCCTTGCTACTGTTGCTCCTGCTTATGGATGTCAATGCCATGTTGTTATTCC
TGATGATGTTGCTATTGAAAAGTCTCAAATAATTGAAGCCCTTGGAGCTACCGTTGAGAG
GGTGAGGCCAGTCTCAATTACTCACAAAGATCACTTCGTCAACATTGCTAGGCGACGTGC
TGACCAAGCTAATGGCTTAGCTTCATCTAAGAGAAGACTAGCACACCAGGAAGAAACTAA
TGGTTGTTGCACAGCTGAGGAAGAGAATGAGCCTTCCTTGTTCCCAGATTCAGTTACAGG
TGGCTTCTTTGCAGATCAATTTGAAA*CTTGGCAAATTATAGGGCTCATTACGAAGGTAC
TGGCCCTGAAATCTGGCACCAGACAAACGGTAACATCGATGCCTTTGTTGCTGCTGCGGG

QA 1 780 1 780
DS 

RD RS1F994TF 752 0 0
GGAGAAAGCTTGAAAAGAAAATCTGCTTCAATGGCGCCTGTTAAGATAACTGGCGCTGTT
GTTGCAGCGGCAACGATGGTGATGCTGTCTTACTACTACTTGTGCTTCTCCGATAAAAAG
AAGCAGAGGAAGAATGATAAGCTAAGTAGGAGAAACGGGATCGTATATGCCATTGGCAAT
ACACCTCTCATTCGTATCAATTGCCTCTCCGACGCTACTGGCTATTCTTGGAAAGTGCGA
GTTTTTGAATCCAGGAGGAAGCGTTAAAGACAGAGTTGCTGTCAAGATCATCGAAGAGGC
TTTGGAATCTGGTAAGCTGTTTCCGGGGGGAATAGTAACAGAGGGTAGTGTTGGGAGTAC
TGCCATCAGCCTTGCTACTGTTGCTCCTGCTTATGGATGTCAATGCCATGTTGTTATTCC
TGATGATGTTGCTATTGAAAAGTCTCAAATAATTGAAGCCCTTGGAGCTACCGTTGAGAG
GGTGAGGCCAGTCTCAATTACTCACAAAGATCACTTCGTCAACATTGCTAGGCGACGTGC
TGACCAAGCTAATGGCTTAGCTTCATCTAAGAGAAGACTAGCACACCAGGAAGAAACTAA
TGGTTGTTGCACAGCTGAGGAAGAGAATGAGCCTTCCTTGTTCCCAGATTCAGTTACACG
TGGCTTCTTTGCAGATCAATTTGAAAACTTGGCAAATTATAGGGCTCATTACGAAG*TAC
TGGCCCTGAAATCTGGCACCAGACAAACGGTA

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

CO CL7227Contig1 833 2 2 U
GGCCGATTCTCTTTTGTGTGTTCAAAGCAGCGAGAGTCGGGAGAGGGAAATCATGGCAGG
AAGTAAAGAAGAAGATGTGAAAGATCCGAGAATCCCAAAGATCGCCTCTTCCATTAGAGT
CATCCCCGACTTCCCTAAACCAGGGATCATGTTTCAGGACATAACGACGCTGCTTCTGGA
CACTGAGGCCTTTAAGGACACCATTGATATTTTTGTTGAAAGATACAAAGGCAAAGGCAT
CTCTGTTGTTGCAGGTGTTGAAGCAAGAGGTTTTATTTTTGGCCCTCCTATTGCCTTGGC
TATTGGTGCCAAATTTGTTCCCATGAGGAAGCCCAAGAAGCTTCCTGGGAAGGTAATATC
GGAGGAGTATTCGTTGGAGTATGGAACAGATAAGATAGAGATGCATGTAGGTGCTGTGGA
GCCTGGTGAGCGTGCTATCATCATTGATGACCTCATTGCCACTGGTGGCACTCTCGCTGC
TGCTATCCGTCTTCTTGAGCGAGTAGGAGTGACGATTGCTGAGTGTGCTTGCGTGATTGA
GTTACCAGTGCTCAAGGGAAGGGAGAAGCTAGGAGAGACGCCACTATTTATTCTTGTGAC
CTCTGATGCTGCTTAACAAGCTAAGGAGAAACCCAACCCTTAAGGACATGATGGGTTTTA
TTTATTATTGGATATCAAAACATGTTATTTTTCGTTGTATTGCTTTGGGATTTGATGGTC
CTTTGTTGTTCTCAGCTTTTATCATAATTGCCTCAGACAAGAAACTCGACCAAAAGGGTG
GTCTTATTCTTCTTCCTTTATTTTTATCCCATGATTGGCTTCGCTTGCAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BW49TF U 1
AF RS1BW49JQ C 30
BS 1 768 RS1BW49TF
BS 769 833 RS1BW49JQ

RD RS1BW49TF 768 0 0
GGCCGATTCTCTTTTGTGTGTTCAAAGCAGCGAGAGTCGGGAGAGGGAAATCATGGCAGG
AAGTAAAGAAGAAGATGTGAAAGATCCGAGAATCCCAAAGATCGCCTCTTCCATTAGAGT
CATCCCCGACTTCCCTAAACCAGGGATCATGTTTCAGGACATAACGACGCTGCTTCTGGA
CACTGAGGCCTTTAAGGACACCATTGATATTTTTGTTGAAAGATACAAAGGCAAAGGCAT
CTCTGTTGTTGCAGGTGTTGAAGCAAGAGGTTTTATTTTTGGCCCTCCTATTGCCTTGGC
TATTGGTGCCAAATTTGTTCCCATGAGGAAGCCCAAGAAGCTTCCTGGGAAGGTAATATC
GGAGGAGTATTCGTTGGAGTATGGAACAGATAAGATAGAGATGCATGTAGGTGCTGTGGA
GCCTGGTGAGCGTGCTATCATCATTGATGACCTCATTGCCACTGGTGGCACTCTCGCTGC
TGCTATCCGTCTTCTTGAGCGAGTAGGAGTGACGATTGCTGAGTGTGCTTGCGTGATTGA
GTTACCAGTGCTCAAGGGAAGGGAGAAGCTAGGAGAGACGCCACTATTTATTCTTGTGAC
CTCTGATGCTGCTTAACAAGCTAAGGAGAAACCCAACCCTTAAGGACATGATGGGTTTTA
TTTATTATTGGATATCAAAACATGTTATTTTTCGTTGTATTGCTTTGGGATTTGATGGTC
CTTTGTTGTTCTCAGCTTTTATCATAATTGCCTCAGACAAGAAACTCG

QA 1 768 1 768
DS 

RD RS1BW49JQ 804 0 0
GCGAGAGTCGGGAGAGGGAAATCATGGCAGGAAGTAAAGAAGAAGATGTGAAAGATCCGA
GAATCCCAAAGATCGCCTCTTCCATTAGAGTCATCCCCGACTTCCCTAAACCAGGGATCA
TGTTTCAGGACATAACGACGCTGCTTCTGGACACTGAGGCCTTTAAGGACACCATTGATA
TTTTTGTTGAAAGATACAAAGGCAAAGGCATCTCTGTTGTTGCAGGTGTTGAAGCAAGAG
GTTTTATTTTTGGCCCTCCTATTGCCTTGGCTATTGGTGCCAAATTTGTTCCCATGAGGA
AGCCCAAGAAGCTTCCTGGGAAGGTAATATCGGAGGAGTATTCGTTGGAGTATGGAACAG
ATAAGATAGAGATGCATGTAGGTGCTGTGGAGCCTGGTGAGCGTGCTATCATCATTGATG
ACCTCATTGCCACTGGTGGCACTCTCGCTGCTGCTATCCGTCTTCTTGAGCGAGTAGGAG
TGACGATTGCTGAGTGTGCTTGCGTGATTGAGTTACCAGTGCTCAAGGGAAGGGAGAAGC
TAGGAGAGACGCCACTATTTATTCTTGTGACCTCTGATGCTGCTTAACAAGCTAAGGAGA
AACCCAACCCTTAAGGACATGATGGGTTTTATTTATTATTGGATATCAAAACATGTTATT
TTTCGTTGTATTGCTTTGGGATTTGATGGTCCTTTGTTGTTCTCAGCTTTTATCATAATT
GCCTCAGACAAGAAACTCGACCAAAAGGGTGGTCTTATTCTTCTTCCTTTATTTTTATCC
CATGATTGGCTTCGCTTGCAGTCC

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 2

CO CL7228Contig1 1048 2 2 U
GGACCTTCCCTTTGGTGTTTTCTGCAACTTTCAAAAAACCCTAATTACACCCAAAAAAAA
AGAGATTGCTTTCCTAATTCTCTCCAACGATCTCCCCCGAGCAAAAATTCACCTAACGGT
GAGCACCTCGAACCTCGAATCGAAGAGTTCCCTTCAGGTCACTCTTGAGTTTGAAAGATG
AACACACAGCAGGGGTGGAGATCAACTCGAGGGATCAGACGGAGGAAAGCGTTGATTGAT
CTTAACGTGGCACCCAGTGATGTTGAAGGCACCTCTGCTTCTGTCAGAGCATCTCCCATT
GTGACACCACCTAGTTGTAATCTTCAAAGGGAGACTGTGCCTTCTCACCCTGCTCCCACC
ATGATTGATGTAGATGCTATTGAAGATGATGTTGTTGAATCATCAGCAAGTGCTTTTGCT
GAAGCTAGAAGTAAGTCAACAAGTGCACGTCGGAGGCGTTTGATGGTTGATGTAGAGTCA
GGTGGTGCGACTAGATTGTCTCCAAACAAACGGAGGAGGGTTCCTCCTAATCAACCTGTC
ATCGACTGTGAGCATGTCTCGTCGAGTGTGTCTAGCTCAAAGGTTCCAGCTCCTCCACCA
GAGGAGCCAAAGTTCTCTTGCCCAATTTGTATGTGCCCGTTTACTGAGGAGATGTCAACC
AAATGCGGCCACATTTTTTGCAAGGCATGTATAAAGATGGCGATATCTCACCAAAACAAG
TGCCCTACTTGTAGGAAAAAGGTGACTGCGAGAGAGCTGATTCGAGTATTCCTTCCAACC
ACCAGATGATTGGTACGTCGACATTAGCAGCCACCTTGTCTAATGGTTTGTCTGACTCTA
TCCTCAAATTCGCGTTGGATCATTGAAGGGACTTCGAGGAATTGGCGTTTTAGTTTGAAG
AAACAAACTTAATTGCTTAAGAAGGCCCCTACCATTTAGTGGTAGTGTCAAATTCCGAAG
TAACTCTTGGTTACTAGTTGTTGTACTATGTAATTTAGTGTCTCTGCAAACCTCAGTCGA
TGCCTCTGTCTCTGTTACAGATGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GG11TF U 1
AF RS1GG11JQ C 407
BS 1 467 RS1GG11TF
BS 468 1048 RS1GG11JQ

RD RS1GG11TF 467 0 0
GGACCTTCCCTTTGGTGTTTTCTGCAACTTTCAAAAAACCCTAATTACACCCAAAAAAAA
AGAGATTGCTTTCCTAATTCTCTCCAACGATCTCCCCCGAGCAAAAATTCACCTAACGGT
GAGCACCTCGAACCTCGAATCGAAGAGTTCCCTTCAGGTCACTCTTGAGTTTGAAAGATG
AACACACAGCAGGGGTGGAGATCAACTCGAGGGATCAGACGGAGGAAAGCGTTGATTGAT
CTTAACGTGGCACCCAGTGATGTTGAAGGCACCTCTGCTTCTGTCAGAGCATCTCCCATT
GTGACACCACCTAGTTGTAATCTTCAAAGGGAGACTGTGCCTTCTCACCCTGCTCCCACC
ATGATTGATGTAGATGCTATTGAAGATGATGTTGTTGAATCATCAGCAAGTGCTTTTGCT
GAAGCTAGAAGTAAGTCAACAAGTGCACGTCGGAGGCGTTTGATGGT

QA 1 467 1 467
DS 

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TTGATGTAGAGTCAGGTGGTGCGACTAGATTGTCTCCAAACAAACGGAGGAGGGTTCCTC
CTAATCAACCTGTCATCGACTGTGAGCATGTCTCGTCGAGTGTGTCTAGCTCAAAGGTTC
CAGCTCCTCCACCAGAGGAGCCAAAGTTCTCTTGCCCAATTTGTATGTGCCCGTTTACTG
AGGAGATGTCAACCAAATGCGGCCACATTTTTTGCAAGGCATGTATAAAGATGGCGATAT
CTCACCAAAACAAGTGCCCTACTTGTAGGAAAAAGGTGACTGCGAGAGAGCTGATTCGAG
TATTCCTTCCAACCACCAGATGATTGGTACGTCGACATTAGCAGCCACCTTGTCTAATGG
TTTGTCTGACTCTATCCTCAAATTCGCGTTGGATCATTGAAGGGACTTCGAGGAATTGGC
GTTTTAGTTTGAAGAAACAAACTTAATTGCTTAAGAAGGCCCCTACCATTTAGTGGTAGT
GTCAAATTCCGAAGTAACTCTTGGTTACTAGTTGTTGTACTATGTAATTTAGTGTCTCTG
CAAACCTCAGTCGATGCCTCTGTCTCTGTTACAGATGAAAAA

QA 1 642 1 642
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7230Contig1 1247 2 2 U
GGAGAGGGTTGAAGGTGAAAAGACTAGGGGAACGAAACCCCTCCTCCGGTGAACACCGAC
GGCTCTCCTATCCGATTCCGAGGCATCTCCGGCGGGGGTGTCCATGCCCTACACAGATCC
GCCACAGAAACCTTCAAGTCCGCCATCCACGGAGGTGTCCCGCGGCTCCAAGTCGCAGGA
TACGACTCCACAAACCCTAGCCGCCGCAAAGAGGTTGAATCTCATGCTGCTCAAAGTCCG
AACCACCGCGTATTACCTTCCATCAAAGCGTTGAAAGGTGAAACCGGATCTGATGGAGAA
GAAGCACAGGGAACCGCCATCCCTTATGAGCTCTCCGCCGTCTCCTGTAGCTCTCTCTAA
ATCGGAGGAGACAAATTCCCGCCCCAATGACTGACTTGCGGCTCCCTAACGGCGTCTCTG
CCGTCCTCTAACAGAGAGCAACCGCCAAGTCTCCGACGAGCCACCAGAGCAAGAAGTTTT
CTTAGGGGTCCTCCGCACACAAGACCCAACCGAAACGCGAGGAGGAGAAAGAAATACCAC
CATCTATCACCGGCGAGAACCATTCCGTCATGATGACCGGTATCCGGGAGGGGAAGGTCA
CCACGAACGCCGGCTAAACACCGGACAGTCGCAGTTTCCTCCACCCTCGGTGACTAAACG
ATGAGAAAGTTGAGAGGATTCTAGATCTGGCGCGTGTTGTGCACTTGCCGCTCAAAGGCC
TTTGATAGTGCTTTCCAAAAATATTTATTATAAGATGCTAATCTTGTGTCTTAACGCAAC
TTGTAGGAACGAGAGTACAAAGAAGCTCTTGAGGCATTCAACGAAAAGAACAGAGAGAAG
GTGCAGCTAATCACCAAGCTAATGGAGTTGGTGGGAGAAAGCGAAAAGATGAGAATGAAG
AAGCTAGAAGAGCTAAGCAAGAGCATAGATTCTTCTATACAACACTGACTTTGAGCCCAA
GACAGAAGAGAAACTTTGGGGGGCCAGAGATCATTTCTCTGAGTCTTTTAACTCCACGTT
TAGGTTTTGTGATGGTGAATGTAATTTCTATACTTTATAATCGTCGTGTGTTATATTACT
ACCATTGTTATTATTGTCTTTTATTAGGGTTTCCTGGAGATTTTATAATGTTTTTTAGGA
AGTAACTCCCAAAAAAATACTCATCGAGACAGGCTTGTAACTAAACACTACTCTCTTTCT
TCTGTTTTATCCTTTTTCTATGGTTTTAGCCTTTCTAATTGATTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D404TF U 1
AF RS1D404JQ C 467
BS 1 696 RS1D404TF
BS 697 1247 RS1D404JQ

RD RS1D404TF 696 0 0
GGAGAGGGTTGAAGGTGAAAAGACTAGGGGAACGAAACCCCTCCTCCGGTGAACACCGAC
GGCTCTCCTATCCGATTCCGAGGCATCTCCGGCGGGGGTGTCCATGCCCTACACAGATCC
GCCACAGAAACCTTCAAGTCCGCCATCCACGGAGGTGTCCCGCGGCTCCAAGTCGCAGGA
TACGACTCCACAAACCCTAGCCGCCGCAAAGAGGTTGAATCTCATGCTGCTCAAAGTCCG
AACCACCGCGTATTACCTTCCATCAAAGCGTTGAAAGGTGAAACCGGATCTGATGGAGAA
GAAGCACAGGGAACCGCCATCCCTTATGAGCTCTCCGCCGTCTCCTGTAGCTCTCTCTAA
ATCGGAGGAGACAAATTCCCGCCCCAATGACTGACTTGCGGCTCCCTAACGGCGTCTCTG
CCGTCCTCTAACAGAGAGCAACCGCCAAGTCTCCGACGAGCCACCAGAGCAAGAAGTTTT
CTTAGGGGTCCTCCGCACACAAGACCCAACCGAAACGCGAGGAGGAGAAAGAAATACCAC
CATCTATCACCGGCGAGAACCATTCCGTCATGATGACCGGTATCCGGGAGGGGAAGGTCA
CCACGAACGCCGGCTAAACACCGGACAGTCGCAGTTTCCTCCACCCTCGGTGACTAAACG
ATGAGAAAGTTGAGAGGATTCTAGATCTGGCGCGTG

QA 1 696 1 696
DS 

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GAAAGAAATACCACCATCTATCACCGGCGAGAACCATTCCGTCATGATGACCGGTATCCG
GGAGGGGAAGGTCACCACGAACGCCGGCTAAACACCGGACAGTCGCAGTTTCCTCCACCC
TCGGTGACTAAACGATGAGAAAGTTGAGAGGATTCTAGATCTGGCGCGTGTTGTGCACTT
GCCGCTCAAAGGCCTTTGATAGTGCTTTCCAAAAATATTTATTATAAGATGCTAATCTTG
TGTCTTAACGCAACTTGTAGGAACGAGAGTACAAAGAAGCTCTTGAGGCATTCAACGAAA
AGAACAGAGAGAAGGTGCAGCTAATCACCAAGCTAATGGAGTTGGTGGGAGAAAGCGAAA
AGATGAGAATGAAGAAGCTAGAAGAGCTAAGCAAGAGCATAGATTCTTCTATACAACACT
GACTTTGAGCCCAAGACAGAAGAGAAACTTTGGGGGGCCAGAGATCATTTCTCTGAGTCT
TTTAACTCCACGTTTAGGTTTTGTGATGGTGAATGTAATTTCTATACTTTATAATCGTCG
TGTGTTATATTACTACCATTGTTATTATTGTCTTTTATTAGGGTTTCCTGGAGATTTTAT
AATGTTTTTTAGGAAGTAACTCCCAAAAAAATACTCATCGAGACAGGCTTGTAACTAAAC
ACTACTCTCTTTCTTCTGTTTTATCCTTTTTCTATGGTTTTAGCCTTTCTAATTGATTTA
C

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 2

CO CL7231Contig1 783 2 6 U
AATAAAGGAAACTCCAGTTTATTTAACATTCATAAACATTATCAGAATGTAACCATCGAT
CTGATGTTATGGGACAGTTGAAATTCTTTTACGAAGACACCAGAAACAAAACTGAAAACA
CTATTCCTCATGATATCAACAAAACCATTTATAACAAAAGTATATTTTTGTATACACAAT
AGATGTATCTCCACATGAGCTAGACAAGCAAATCAGCGTAAGCATTGAGTCCATGACTGT
TCATGTTCTGCTTAAGCCTATACAATGCCCTGCTCTCTAGCTGCCTTACCCTCTCCTTGG
ACAGTCCATAAATCTCCCCTATCTCAAACAACGATCTCTGCTTCCCACCATCAATCCCAA
ACCTCAGCTTGATGATCTTTCTCTCCTTGGGGCTCAGCACATTGAGTAGATTCCTTACAT
GGTTCCTCATCATCCGCTTCCCTACGCTCGTGTCCGGGGTCTCAATCCCACTGTCCGGTG
TTACTTCCTGAAAGGTGATGTCTTGATCAGACCAAATGGGCTGTTGCATTGAAAGAGGTG
TTCTTGTGTTGTAAAGAAGCTTATCAAGCTTCTCTGTCGAAACACCGACGTGGCTTGCGA
GTTCCTCTTTGCTTGGACGATAGTTCCCTTCTTGCACGCACGTCTTTCTTGCTTCGGATA
CTTTGCCCAGTAGCATGTACACGTTCTCCGGCAAACGTATAGTCCTGGAGTTTTGAAATA
TAGACTTTCTTATGGATTGACGAATCCACCAGTATGCGTAGTAGCGAATCTGCAACCGGA
CTG


BQ
10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1CO73JQ U 1
AF RS1AV22JQ U 4
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RD RS1CO73JQ 757 0 0
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CTGATGTTATGGGACAGTTGAAATTCTTTTACGAAGACACCAGAAACAAAACTGAAAACA
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AGATGTATCTCCACATGAGCTAGACAAGCAAATCAGCGTAAGCATTGAGTCCATGACTGT
TCATGTTCTGCTTAAGCCTATACAATGCCCTGCTCTCTAGCTGCCTTACCCTCTCCTTGG
ACAGTCCATAAATCTCCCCTATCTCAAACAACGATCTCTGCTTCCCACCATCAATCCCAA
ACCTCAGCTTGATGATCTTTCTCTCCTTGGGGCTCAGCACATTGAGTAGATTCCTTACAT
GGTTCCTCATCATCTGCTTCCCTACGCTCGTGTCCGGGGTCTCAATCCCACTGTCCGGTG
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TTCTTGTGTTGTAAAGAAGCTTATCAAGCTTCTCTGTCGAAACACCGACGTGGCTTGCGA
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CTTTGCCCAGTAGCATGTACACGTTCTCCGGCAAACGTATAGTCCTGGAGTTTTGAAATA
TAGACTTTCTTATGGATTGACGAATCCACCAGTATGC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RS1AV22JQ 780 0 0
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GTCCATAAATCTCCCCTATCTCAGACAACGATCTCTGCTTCCCACCATCAATCCCAAACC
TCAGCTTGATGATCTTTCTCTCCTTGGGGCTCAGCACATTGAGTAGATTCCTTACATGGT
TCCTCATCATCCGCTTCCCTACGCTCGTGTCCGGTGTCTCAATCCCACTGTCCGGTGTTA
CTTCCTGAAAGGTGATGTCTTGATCAGACCAAATGGGCTGTTGCATTGAAAGAGGTGTTC
TTGTGTTGTAAAGAAGCTTATCAAGCTTCTCTGTCGAAACACCGACGTGGCTTGCGAGTT
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ACTTTCTTATGGATTGACGAATCCACCAGTATGCGTAGTAGCGAATCTGCAACCGGACTG

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

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ATCTCATGTTTTTTTTGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BS30JQ C 1
AF RS1BS30TF U 1
BS 1 730 RS1BS30TF
BS 731 739 RS1BS30JQ

RD RS1BS30JQ 739 0 0
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ATCTCATGTTTTTTTTGTT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1BS30TF 730 0 0
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GGCTTGTGCTTGTCGACTTCTGGGCACCATGGTGTGGACCTTGCAAAATGATTGACCCTC
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CTAGCATTGACAAGTTCTTGCAATGAGATTGTGAGTCTGTATTGATCACTCTCTCTCCCC
CTCTGTTTCGTATTCTCATTCTCTCTGTAACTTGCGCTTTCTCTATAGCTATCTGCTTCC
GCTGTATCTTTTCTTCATCACTGAACATCTAGACATGGATCAATAATACTATAATATAAT
ATCTCATGTT

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL7233Contig1 764 2 6 U
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BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CH27TF U 1
AF RS1CH27JQ C 2
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BS 759 764 RS1CH27JQ

RD RS1CH27TF 762 0 0
GGGCATACAAGAATGAACTACACTTTATTTTATAGAGGCAATGCATTAAATGAAACCAAC
AACTAAGTAACCCCACAGTCTACTCTCACTTCATGCATCTACCCTCTTGGCTCCCTCTCT
CTATATAAACACAAACTCTATTAGCTCTCTTCATCATCCAAAATTAAACCCATTAATTAA
GCAAAAGAGAAAGAGTGAGTATAAGATTATGGAGGGGCTCTTAAAGCTGTCAACATTGGT
GATTCTGTGCATGTTAATGTCCGCTCCAATGGCGTCAGAGGCAGCAGTCTCGTGCGGCAC
CGTTGCCAGCAACTTGGGGCAATGCATTAACTACCTGACCAGAGGCGGTTTCGTTCCTCG
AGGATGTTGTTCTGGCGTTCAGAGGCTCCGCAGCATGACTCGGACCACACGTGATCGGCA
ACAAGCTTGTCGCTGCATCCAAGGAGCAGCTAGAGCCTTGGGTTCCAGACTTAACCCAGG
CCGTGCTGCTCGTCTTCCCGGTGCTTGCCGTGTTAGGATCTCTTACCCCATCAGCGCAAG
AACCAACTGTAACAACATCAGGTGAGCATGAGAGGATATAGACGTTGAAGTGTTTTAATT
TCCATAAAAAATAATGTCACTAGTATAATTGTATATCCTTTATGTGTTGTTTTTAGAATT
GGTGTGTTTCATGTCTTTCTTTATATACGACGGTCGTCGTCTCTGTTATGTATTTA*GGC
TCTAAATAACGATATATGGAAA**TACTATATGTATTT
GTCC

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1CH27JQ 763 0 0
GGCATACAAGAATGAACTACACTTTATTT*ATAGAGGCAATGCATTAAATGAAACCAACA
ACTAAGTAACCCCACAGTCTACTCTCACTTCATGCATCTACCCTCTTGGCTCCCTCTCTC
TATATAAACACAAACTCTATTAGCTCTCTTCATCATCCAAAATTAAACCCATTAATTAAG
CAAAAGAGAAAGAGTGAGTATAAGATTATGGAGGGGCTCTTAAAGCTGTCAACATTGGTG
ATTCTGTGCATGTTAATGTCCGCTCCAATGGCGTCAGAGGCAGCAGTCTCGTGCGGCACC
GTTGCCAGCAACTTGGGGCAATGCATTAACTACCTGACCAGAGGCGGTTTCGTTCCTCGA
GGATGTTGTTCTGGCGTTCAGAGGCTCCGCAGCATGACTCGGACCACACGTGATCGGCAA
CAAGCTTGTCGCTGCATCCAAGGAGCAGCTAGAGCCTTGGGTTCCAGACTTAACCCAGGC
CGTGCTGCTCGTCTTCCCGGTGCTTGCCGTGTTAGGATCTCTTACCCCATCAGCGCAAGA
ACCAACTGTAACAACATCAGGTGAGCATGAGAGGATATAGACGTTGAAGTGTTTTAATTT
CCATAAAAAATAATGTCACTAGTATAATTGTATATCCTTTATGTGTTGTTTTTAGAATTG
GTGTGTTTCATGTCTTTCTTTATATACGACGGTCGTCGTCTCTGTTATGTATTTAAGGCT
CTAAATAACGATATATGGAAAATTACTATATGTATTTTGTTCC

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

CO CL7234Contig1 679 2 2 U
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GGCAAAGTGTTGAGAGTGAGATTGATAATGAAGGAAGGTGTTAAGTACTTCAGCCCTGTT
TACCTTTTCGATGAAGGCTCAACTATCTCGTGGATCCCTTGTGGTCGCAAACTCACCTGC
TCGTACCCTGGCATCAAGTTCAACTACGAACCTGATACCTACTTCGACCATGAGGTTTCG
GTTTTGGAGATGGATGGGCAATTCGATAGACTAGGCGAGCTGATTTACGTGGAGAGTCAT
TTGAGCAACCTCTCGACCAAATTCTACGGTGAAGTCACTCAACAGATGCTTAAACATGCT
GACTTCCCTGGCAGCAACAACGGGACTGGTCTATTCCAGACCATTGTTGGATTGAAGATC
AGAGATCTCTATGAGCAGCTCATTGCTAACAAAGTCACTGCTCCTGCAGAAGCTGCTAAA
GCCTAAGAAAACAAAGTAAAACCCGTCGATAAATCCATTCTCAGCTTCTTTCCTTCTTTC
TTTATGCCGCGGATTTTCATGGCGAAAAAGGACGGTCTTGCTTGGTTTGTAATTTGTGTG
GAGATGGTCAAAAAGAAAAATATGTGGAGATGGTCAAAAAGAAAAATATGAAATGCAGAG
AAGTTTATATATAGCAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EZ71TF U 1
AF RS1EZ71JQ C 481
BS 1 566 RS1EZ71TF
BS 567 679 RS1EZ71JQ

RD RS1EZ71TF 566 0 0
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GGCAAAGTGTTGAGAGTGAGATTGATAATGAAGGAAGGTGTTAAGTACTTCAGCCCTGTT
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TCGTACCCTGGCATCAAGTTCAACTACGAACCTGATACCTACTTCGACCATGAGGTTTCG
GTTTTGGAGATGGATGGGCAATTCGATAGACTAGGCGAGCTGATTTACGTGGAGAGTCAT
TTGAGCAACCTCTCGACCAAATTCTACGGTGAAGTCACTCAACAGATGCTTAAACATGCT
GACTTCCCTGGCAGCAACAACGGGACTGGTCTATTCCAGACCATTGTTGGATTGAAGATC
AGAGATCTCTATGAGCAGCTCATTGCTAACAAAGTCACTGCTCCTGCAGAAGCTGCTAAA
GCCTAAGAAAACAAAGTAAAACCCGTCGATAAATCCATTCTCAGCTTCTTTCCTTCTTTC
TTTATGCCGCGGATTTTCATGGCGAA

QA 1 566 1 566
DS 

RD RS1EZ71JQ 199 0 0
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TTTATGCCGCGGATTTTCATGGCGAAAAAGGACGGTCTTGCTTGGTTTGTAATTTGTGTG
GAGATGGTCAAAAAGAAAAATATGTGGAGATGGTCAAAAAGAAAAATATGAAATGCAGAG
AAGTTTATATATAGCAGAG

QA 1 199 1 199
DS 



AS 1 2

CO CL7235Contig1 781 2 4 U
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ACGCAGATCTGTAAAACAAAGGCTCCAATATATACAAGTTATCCAAGAATTGCAGGAGGA
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ACAAACAGATAAGGCACAGCAGGAGTTATTACTCAGCGAGATTCTTGATTGCGATGTTAT
GGGAAAGGAATGGCTTGACGAAAAAGAGAAAGAGGATTCGGCTTACCAATCGCTTCTGGC
AAGGAGAAGAACAGCTTTGAGGAACAAGGCTCGAGAACTCCGCCTCAGTCCTCCTCAAGA
CAGCCCTCCTCATAGCTATGACCCTGAAACTCTGATGTTAACCATCGAATCTTTGAAGAT
CGAGAAGGAGAGATTACGGCTTTTGAACCAGAGAATGATTGGTAAAGAGCTTGACGGTAT
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AAGAAGAGAAAAATAAGATAAAACGTGCAAGGCAGGTTCTTGGGGGCACATGAAGAAAAT
ATTGAATAAGACTCTTGTGACTATGTATTGTACTTAGATAATTATATGTTGTTGGTTCTG
GCTTTTGTGTGTTAATAATCTGTCTCTCTGGTGATAATTATATGATCAAACTTAAAAGAC
T


BQ
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10 

AF RS1AW11TF U 1
AF RS1AW11JQ C 1
BS 1 612 RS1AW11TF
BS 613 613 RS1AW11JQ
BS 614 752 RS1AW11TF
BS 753 781 RS1AW11JQ

RD RS1AW11TF 752 0 0
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ACGCAGATCTGTAAAACAAAGGCTCCAATATATACAAGTTATCCAAGAATTGCAGGAGGA
GATCAAAATGTTACAGATTTCCAACGAGAAACTGAATGGTGAGGGTCTAGACGGTCTGAG
CTACACCGAGCTGGCTTCACTTGAAAGTATGTTAAAGGAGGGCTTCCGCATTGTGGATGA
ACAAACAGATAAGGCACAGCAGGAGTTATTACTCAGCGAGATTCTTGATTGCGATGTTAT
GGGAAAGGAATGGCTTGACGAAAAAGAGAAAGAGGATTCGGCTTACCAATCGCTTCTGGC
AAGGAGAAGAACAGCTTTGAGGAACAAGGCTCGAGAACTCCGCCTCAGTCCTCCTCAAGA
CAGCCCTCCTCATAGCTATGACCCTGAAACTCTGATGTTAACCATCGAATCTTTGAAGAT
CGAGAAGGAGAGATTACGGCTTTTGAACCAGAGAATGATTGGTAAAGAGCTTGACGGTAT
GGGATACTTGGAGCTGTTGGTGTTTGGCTGTGCGATACAGGGGTGGTATGTTGAAAGCCG
AAGAAGAGAAAA*TAAGATAAAACGTGCAAGGCAGGTTCTTGGGGGCACATGAAGAAAAT
ATTGAATAAGACTCTTGTGACTATGTATTGTACTTAGATAATTATATGTTGTTGGTTCTG
GCTTTTGTGTGTTAATAATCTGTCTCTCTGGT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RS1AW11JQ 781 0 0
GGAGTACTGGAAACGGAACGCGGAAGCGCGTGAGAGAGAGATGCCAAGGCCAAGAACTAC
ACGCAGATCTGTAAAACAAAGGCTCCAATATATACAAGTTATCCAAGAATTGCAGGAGGA
GATCAAAATGTTACAGATTTCCAACGAGAAACTGAATGGTGAGGGTCTAGACGGTTTGAG
CTACACCGAGCTGGCTTCACTTGAAAGTATGTTAAAGGAGGGCTTCCGCATTGTGGATGA
ACAAACAGATAAGGCACAGCAGGAGTTATTACTCAGCGAGATTCTTGATTGCGATGTTAT
GGGAAAGGAATGGCTTGACGAAAAAGAGAAAGAGGATTCGGCTTACCAATCGCTTCTGGC
AAGGAGAAGAACAGCTTTGAGGAACAAGGCTCGAGAACTCCGCCTCAGTCCTCCTCAAGA
CAGCCCTCCTCATAGCTATGACCCTGAAACTCTGATGTTAACCATCGAATCTTTGAAGAT
CGAGAAGGAGAGATTACGGCTTTTGAACCAGAGAATGATTGGTAAAGAGCTTGACGGTAT
GGGATACTTGGAGCTGTTGGTGTTTGGCTGTGCGATACAGGG*TGGTATGTTGAAAGCCG
AAGAAGAGAAAAATAAGATAAAACGTGCAAGGCAGGTTCTTGGGGGCACATGAAGAAAAT
ATTGAATAAGACTCTTGTGACTATGTATTGTACTTAGATAATTATATGTTGTTGGTTCTG
GCTTTTGTGTGTTAATAATCTGTCTCTCTGGTGATAATTATATGATCAAACTTAAAAGAC
T

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 2

CO CL7236Contig1 796 2 1 U
GTGACGGAAAATGGTCATCTTTCATTAAAAATGCAAGAGTCGACTCATAAATTGTTTAAC
AAAATTAGCATAATAAGTCAAGCGATTTGACATCCATTAACAAGAAAAAAAAAGACTAAC
CAAGTTTCCTTTGCAAAGCAATTTATTTCATGTTTTGTCCCCATTTAGACTAGTTTCTCC
AGTTCTTCTACATACTTACTGACATAACCACTGATTATTCCAGAGCTAAGTATAGACTCC
TTCCATTTGGCATGGTTCCTCCTCACTAGGTTCCCTAGCTCGGTGTCTTTATCCATCAGA
GACCTGACGGCCCCGCTTATGTTCTCCTTTGAAAACCATCCTGTTTCGTCTCTTTTCACC
TCCACTGAGACCCAAGTTCCTCACTCATTAGCCTGGTGTTGAATATTTGTTCACCCAAAT
GTGGTATAAGCACTATTTGGCAGTCATTCAATAGAGACTCCCACATTGACCCGAACCCGC
AATGGCTCACAAAGCAACCTATTGATGGATGAGCCAATATCAGTGGCTGCTGCACCCATT
CTCCCCAAACCACTCCACGCTCTTTAACCCGCTCTTCGAACCCTTTTGGTAAGGCTTCTT
GGATTGTAGATGCGCCTTTTGGTGGCTTTACTGCTACAAGAAATGGTAAACCGGTCAGCT
CCATTCCTAAACAAAGTTCTTGAAATTCTTCCTTATCAAGAATGATTTGGCTGCCAAGTG
AACAATATACTACTGATCCTTGTTCGAACCGGTTCAACCAGTGATTCCATTGATCTTCGA
GTGGCTTGCTATTGTC


BQ
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AF RS1CE75JQ C 1
AF RS1CE75TF U 1
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CAGAAACTGTTTTAAAGTTTG

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1EN12TF U 1
AF RS1EN12JQ C 283
BS 1 621 RS1EN12TF
BS 622 990 RS1EN12JQ

RD RS1EN12TF 621 0 0
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TGTCAAGCATCTTCATGCAGTTGCAGCTGACGAGACAGATACCAAGCTACTGCAACTACA
AACATATGAGAAGTACAGAAAACCAGGAAGATTCTTTGAGATAGTGTACCATGAGAACGC
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TCTGGCGATTCAACTTATGAACAGCGGGAATGATCAGCCTGAAGTTACAGCTGTAGCAGT
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AAAAAAGCCTGGTCTATTTCTTAAGAGGAACAAGGCGAAAATGAGCGGTCCAGATGAATC
TTCAGGGTTGTCGCGTGCAATGGAAGGTTTGAAGATTATCAACGAGGTTGAATGTAAGAT
ATCTTGCAGTTCTTCCAAGGTCAAGTATGAACCAAACACATCAGATCTTTTGTATAGAAG
CAAGCAGAAGAAACCAAAACTGGATCCAAACGGGCTTGAAAATGATGAAACTCCTAGTAA
AAGTGAAATCTCGAGAAAGAG

QA 1 621 1 621
DS 

RD RS1EN12JQ 708 0 0
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GCTTGTACCTGATGAAGAAAAAAAGCCTGGTCTATTTCTTAAGAGGAACAAGGCGAAAAT
GAGCGGTCCAGATGAATCTTCAGGGTTGTCGCGTGCAATGGAAGGTTTGAAGATTATCAA
CGAGGTTGAATGTAAGATATCTTGCAGTTCTTCCAAGGTCAAGTATGAACCAAACACATC
AGATCTTTTGTATAGAAGCAAGCAGAAGAAACCAAAACTGGATCCAAACGGGCTTGAAAA
TGATGAAACTCCTAGTAAAAGTGAAATCTCGAGAAAGAGAAGGATATCACGTTTTCACGC
AAGTTTTAACCGTAGACTTGTTTCCTTGCCTTAATAAAGCGGCTCCAAGCACATTGTGCA
GGTGTGTGAATGTTCTTGGCTGAGATATGCAAGCAGAGCATCAGTCAGTGGTAGAGACTA
GAGACCAAAGTGTATTTTTGACAAGGATTCTTGCATAGTTTTGGCTCAAAGAGTGTTTGC
ATGAGAACGGTTTATTTTCCTAAATCTCGTCTGGAGATGCCAGTTTTGGTGTGTAGTGTT
AGATTATATATGTACCAGACAATGCTCTTATGTCGGGAGATTTTTTAATTCACTTCATTC
AAACAAATGCTGGATGTTCCCTTCTAATGTTATGTTTCTCTTTCAATA

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

CO CL7240Contig1 849 2 1 U
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AATTATGAAAAGATTACCATTTTTAGGAAACAAAAGAATCATAAATAGCGTGTACACCAC
TCCACCGTTTAAACAGACCCAGCCACGGCCTAACCCTAACCGAACCGGACCCAGAATCGT
TCGTCAGTGGCAAAACCGTCAATATGAAACTAACGCGGAGAAGAAGAAGAAGAAGACAAG
AAGAACAGGGAGGAGCACGGAGGCGAAGACAGAGACTTCTGGTCGGAAACCACCGCTGGG
GAGAAAAGGGTAAGTGTCAGGAGGCGGCATGACACAGTTGTCTCCATTAAAGTAGATCCT
ACGAGGAAAAGCCCATCCTTTCTCAAACGAGAAGGTTGCTTGATCCTTACGGAACAGAAT
CTCTGACTGCACATTCCCAAGAGGCCCTGCTTCTGATAAGAAGTCATTATAGAACTTCAC
TCCCCACAACATCGCCGTATCATTTAGTCCTGCATAAGGAGTGAGAGATTTGTAGTTGAA
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GTAGTTTAAACGGTAGTTGAAGTTTGTGATCGTGATCTTCACTCGCCAATACTCTTTGTA
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TGGAGGCAAGATGGTTCCTTTTCTTGGTCGGTGGTGAGACGACAGAAGCCAAGTGCGGTG
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TTGGACATC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FF85JQ U 1
AF RS1EE71JQ U 1
BS 1 849 RS1EE71JQ

RD RS1FF85JQ 745 0 0
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AAGAACAGGGAGGAGCACGGAGGCGAAGACAGAGACTTCTGGTCGGAAACCACCGCTGGG
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CTCTGACTGCACATTCCCAAGAGGCCCTGCTTCTGATAAGAAGTCATTATAGAACTTCAC
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GTAGTTTAAACGGTAGTTGAAGTTTGTGATCGTGATCTTCACTCGCCAATACTCTTTGTA
GTTCTGCTTCACGTGCCAATGCACTCTGATGGGACACAAGTGTCTTGTGCATTGCACCAG
TGGAGGCAAGATGGTTCCTTT
CTTG

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1EE71JQ 849 0 0
AGAGAAACTAATAACAAAATAAAGGAAAACAAGTAAGCTGAAAGCTATATTACATACAAA
AATTATGAAAAGATTACCATTTTTAGGAAACAAAAGAATCATAAATAGCGTGTACACCAC
TCCACCGTTTAAACAGACCCAGCCACGGCCTAACCCTAACCGAACCGGACCCAGAATCGT
TCGTCAGTGGCAAAACCGTCAATATGAAACTAACGCGGAGAAGAAGAAGAAGAAGACAAG
AAGAACAGGGAGGAGCACGGAGGCGAAGACAGAGACTTCTGGTCGGAAACCACCGCTGGG
GAGAAAAGGGTAAGTGTCAGGAGGCGGCATGACACAGTTGTCTCCATTAAAGTAGATCCT
ACGAGGAAAAGCCCATCCTTTCTCAAACGAGAAGGTTGCTTGATCCTTACGGAACAGAAT
CTCTGACTGCACATTCCCAAGAGGCCCTGCTTCTGATAAGAAGTCATTATAGAACTTCAC
TCCCCACAACATCGCCGTATCATTTAGTCCTGCATAAGGAGTGAGAGATTTGTAGTTGAA
ACTAAAGATCTGAGTGATGTTGTCGAAATTCGGATGTTGTGCCACCATGTTCCACTGCGA
GTAGTTTAAACGGTAGTTGAAGTTTGTGATCGTGATCTTCACTCGCCAATACTCTTTGTA
GTTCTGCTTCACGTGCCAATGCACTCTGATGGGACACAAGTGTCTTGTGCATTGCACCAG
TGGAGGCAAGATGGTTCCTTTTCTTGGTCGGTGGTGAGACGACAGAAGCCAAGTGCGGTG
TATCAGGGTCGAGACAGGCACCGGACTCTGTTCTGTTGTTTTGGCATCCGCAAGCGCAAG
TTGGACATC

QA 1 849 1 849
DS 



AS 1 2

CO CL7241Contig1 918 2 2 U
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ACCAAATTCCAGTGTGTTCCTCTACTCAGTGGAAGAGAAAAATACACTTCTGCTCTGAAG
TAAAACTTACATGTTGGACTTTTGACCATTCATCTCCACCTGATAATAGCTGAACCCCAA
GTTAAACCGGCTCCAAAACCGGAAGTGGCTATGGTGTGTCCCGGTTTAACTTTCCCACTC
CTCACCGCCTCATCAAGAGCTAGAGGGATGGAAGCAGCGCTTGTGTTGCCGTAATTAGCC
AAGTTTGATATCACTCGTTCCGGTGGAAACTTTAGCCTTGTAGCCACAGAGTCTAATATT
CTCTGGTTTGCCTGATGGGGAAGGAGCCAATCAATGGAAGAAGCAGGAAGACCGGCTTTT
TGTAAAGCGGACTCAAGAGACTGGGGAACACATTTGACAGCAAAGCGAAACACTTCTTGT
CCATTCATCTGAATGCAAGAATATGAAGATTGTTTTGGTGGAAAGTCACCCAACGCTGAC
CCATTGGAGCTCAAACCACCATCGGTTTGAGATTCTTTAACAGAAGCATTCAAGTGTCTA
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CAATCAACGAACCGAGATAACGAATCAGCTCCAATCACTAAAACATTCTTAAAACCACCA
CCTCTTATATGACAAGCA


BQ
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AF RS1BS39JQ U 1
AF RS1AN30TF C 542
BS 1 787 RS1BS39JQ
BS 788 918 RS1AN30TF

RD RS1BS39JQ 806 0 0
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ACGAAATCAGACAAAACGCGTTTTACTTCCAGTTCAACCGGACTAAACCAGACCGGTTTA
ACCAAATTCCAGTGTGTTCCTCTACTCAGTGGAAGAGAAAAATACACTTCTGCTCTGAAG
TAAAACTTACATGTTGGACTTTTGACCATTCATCTCCACCTGATAATAGCTGAACCCCAA
GTTAAACCGGCTCCAAAACCGGAAGTGGCTATGGTGTGTCCCGGTTTAACTTTCCCACTC
CTCACCGCCTCATCAAGAGCTAGAGGGATGGAAGCAGCGCTTGTGTTGCCGTAATTAGCC
AAGTTTGATATCACTCGTTCCGGTGGAAACTTTAGCCTTGTAGCCACAGAGTCTAATATT
CTCTGGTTTGCCTGATGGGGAAGGAGCCAATCAATGGAAGAAGCAGGAAGACCGGCTTTT
TGTAAAGCGGACTCAAGAGACTGGGGAACACATTTGACAGCAAAGCGAAACACTTCTTGT
CCATTCATCTGAATGCAAGAATATGAAGATTGTTTTGGTGGAAAGTCACCCAACGCTGAC
CCATTGGAGCTCAAACCACCATCGGTTTGAGATTCTTTAACAGAAGCATTCAAGTGTCTA
CGACCGTCTCCATCACTGTGCACATCAAAACTGTATAACCCATCATCCTCAATGTCACAA
GCCTGAA
CACACAGCACCAGCAGCAT

QA 1 787 1 787
DS 

RD RS1AN30TF 377 0 0
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CATTCATCTGAATGCAAGAATATGAAGATTGTTTTGGTGGAAAGTCACCCAACGCTGACC
CATTGGAGCTCAAACCACCATCGGTTTGAGATTCTTTAACAGAAGCATTCAAGTGTCTAC
GACCGTCTCCATCACTGTGCACATCAAGACTGTATAACCCATCATCCTCAATGTCACAAG
CCTGAATAACAACAGCACCAGCAGCATCTCCAAAGAGGATGCAAGTTCCTCTATCAGTCC
AATCAACGAACCGAGATAACGAATCAGCTCCAATCACTAAAACATTCTTAAAACCACCAC
CTCTTATATGACAAGCA

QA 1 377 1 377
DS 



AS 1 2

CO CL7242Contig1 1366 2 2 U
GACCGTGGCCCAGTTTGGTGTTGTTTTCCTCCTTTTTGCTTTGGGCTTGGAATTCTCAAT
GACTAAGCTGAAAATTGTTGGCCCAGTTGCTGTCCTTGGAGGACTTTTCCAAATCGTATT
ACTCATGTTTTTGTGTGGTGTAACTGCATTGTTATGTGGAGCACGGTTGTCAGAGGGTAT
TTTTGTTGGTGCTTTTCTATCTATGTCATCTACTGCAGTGGTGGTAAAGTTTTTGGTGGA
ACGGAATAGTACAAGTTCTCTTCATGGTCAAGTCACGATAGGGATACTTATCTTTCAGGA
CTGTGTGGTTGGTTTATTATTTGCACTGCTTCCGGTCTTGGGTGGTAACAGTGGTTTACT
ACAAGGAATTATATCAATGGGAAAGCTGCTCCTGATATTGTCCATTTATCTCACTGTTGC
ATCTCTTCTAACGTGGTCATTTGTGCCTCGCTTTCTGAAGCTAATGATTCAGTTATCATC
TCAAACAAATGAACTCTACCAATTAGCTGCTGTGGCGTTCTGCTTACTTTCTGCATGGTG
CAGTGATAAGCTGGGTCTTAGTCTTGAGTTGGGATCATTTGTGGCTGGTGTTATGCTGTC
CACAACTGAGTTTGCTCAACATACACTAGAGCAGGTGGAACCAATTCGTAATTTGTTTGC
CGCTCTCTTCCTGTCAAGTATCGGTATGCTCATAAATGTGCACTTTCTATGGAACCACGT
GGATATCCTTCTGGCATCTGTGATTCTAGTCATAGTTGTTAAGACGGCAATTGCAGCAAT
AGTGGTCAAGGCTTTTCGGTACAACATCAAGATATCTTTCCATGTCGGGGTACTTCTTGC
TCAGATTGGCGAGTTTGCCTTTGTTTTGCTAAGCCGAGCATCAAACCTACACGTTATCGA
GGGGAAAATGTATCTCCTCCTTTTGGGCACAACAGCTTTGAGTCTCGTGACTACTCCATT
GCTGTTCAAGTTGATACCGAGTGCAATGAACCTGGGTGTCATCCTTCGATGGTTCCCTTC
GGACAATAGCTCCCCGAACGAGAGTATGCAGGAGAAAGCATCGATGATAGAATTACATAA
CAGAACCAAGTGACCATCTCCTTTGTACATATAGTTTGAAAGATTACAAAACAGATTTTT
GATCCGACGAAACTGGACCAGGCCGCCAAATTTACAACAGTTGACCAGATCAGTCTTACC
AAGACTTGCCACTTGTTTTCTTGATTATTTTTGTGTGATAAAAATCGTATATAATTAGTA
TACACTACTAGCTAAGCCATCGGTGTAGTCCAAGCGGCGGAACTTATTATTTGGTGTAAC
GATATTAACCCAGTATTGTATTGAATTTTTGATAAACATTACAGGT


BQ
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AF RS1AF83TF U 1
AF RS1AF83JQ C 561
BS 1 630 RS1AF83TF
BS 631 1366 RS1AF83JQ

RD RS1AF83TF 630 0 0
GACCGTGGCCCAGTTTGGTGTTGTTTTCCTCCTTTTTGCTTTGGGCTTGGAATTCTCAAT
GACTAAGCTGAAAATTGTTGGCCCAGTTGCTGTCCTTGGAGGACTTTTCCAAATCGTATT
ACTCATGTTTTTGTGTGGTGTAACTGCATTGTTATGTGGAGCACGGTTGTCAGAGGGTAT
TTTTGTTGGTGCTTTTCTATCTATGTCATCTACTGCAGTGGTGGTAAAGTTTTTGGTGGA
ACGGAATAGTACAAGTTCTCTTCATGGTCAAGTCACGATAGGGATACTTATCTTTCAGGA
CTGTGTGGTTGGTTTATTATTTGCACTGCTTCCGGTCTTGGGTGGTAACAGTGGTTTACT
ACAAGGAATTATATCAATGGGAAAGCTGCTCCTGATATTGTCCATTTATCTCACTGTTGC
ATCTCTTCTAACGTGGTCATTTGTGCCTCGCTTTCTGAAGCTAATGATTCAGTTATCATC
TCAAACAAATGAACTCTACCAATTAGCTGCTGTGGCGTTCTGCTTACTTTCTGCATGGTG
CAGTGATAAGCTGGGTCTTAGTCTTGAGTTGGGATCATTTGTGGCTGGTGTTATGCTGTC
CACAACTGAGTTTGCTCAACATACACTAGA

QA 1 630 1 630
DS 

RD RS1AF83JQ 806 0 0
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ATACACTAGAGCAGGTGGAACCAATTCGTAATTTGTTTGCCGCTCTCTTCCTGTCAAGTA
TCGGTATGCTCATAAATGTGCACTTTCTATGGAACCACGTGGATATCCTTCTGGCATCTG
TGATTCTAGTCATAGTTGTTAAGACGGCAATTGCAGCAATAGTGGTCAAGGCTTTTCGGT
ACAACATCAAGATATCTTTCCATGTCGGGGTACTTCTTGCTCAGATTGGCGAGTTTGCCT
TTGTTTTGCTAAGCCGAGCATCAAACCTACACGTTATCGAGGGGAAAATGTATCTCCTCC
TTTTGGGCACAACAGCTTTGAGTCTCGTGACTACTCCATTGCTGTTCAAGTTGATACCGA
GTGCAATGAACCTGGGTGTCATCCTTCGATGGTTCCCTTCGGACAATAGCTCCCCGAACG
AGAGTATGCAGGAGAAAGCATCGATGATAGAATTACATAACAGAACCAAGTGACCATCTC
CTTTGTACATATAGTTTGAAAGATTACAAAACAGATTTTTGATCCGACGAAACTGGACCA
GGCCGCCAAATTTACAACAGTTGACCAGATCAGTCTTACCAAGACTTGCCACTTGTTTTC
TTGATTATTTTTGTGTGATAAAAATCGTATATAATTAGTATACACTACTAGCTAAGCCAT
CGGTGTAGTCCAAGCGGCGGAACTTATTATTTGGTGTAACGATATTAACCCAGTATTGTA
TTGAATTTTTGATAAACATTACAGGT

QA 1 806 1 806
DS 



AS 1 2

CO CL7243Contig1 800 2 3 U
GGATCACAATCACATCAGATCAGAGAGGAATCAAAGTTTAGGTATCTCATTTAAAACTCG
TTTGCGATCTCTCTCAGGCAGGCAAGCGAATGGCGGCCGCGACAAGTGAGAAACAGAACG
GATCAAAGGCTCCTCCTTTGCCTTCTCCTCTCCGCAACTCCAAGTTTCTCCAGTCGAATA
TGAGGATCTTGATATCGGGAGGAGCAGGGTTCATCGGTTCACACTTGGTTGATAAGCTAA
TGGAAAACGAGAAGAATGAGGTTGTGGTTGCTGATAATTATTTCACTGGCTCTAAAGATA
ACCTCAAGAAGTGGATCGGTCACCCCAGGTTTGAGCTTATTCGTCACGATGTTACGGAGC
CTCTATTGCTTGAAGTTGATAGGATTTACCATCTTGCTTGCCCTGCCTCTCCTATCTTCT
ACAAGTACAACCCCGTCAAGACAATCAAGACCAATGTGATGGGTACAATGAACATGCTCG
GTCTTGCCAAGCGTGTTGGAGCTAGGATTCTGCTCACCTCAACCTCGGAAGTGTATGGAG
ACCCTCTCATCCACCCTCAACCAGAGAGCTACTGGGGAAATGTCAACCCCATTGGTGTTC
GGAGTTGCTATGACGAAAGCAAGCGTGTAGCTGAGACTTTGATGTTTGACTACCACAGGC
AACACGGCATTGAAATCCGCATTGCTAGGATCTTCAACACTTATGGTCCTCGTATGAACA
TCGATGACGGCCGTGTGGTGAGCAACTTCATTGCTCAAGCACTCCGAGCGAGGCATTGAC
AGTTCAGAAACCGGGGACAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FJ62TF U 1
AF RS1EO77TF U 1
BS 1 617 RS1EO77TF
BS 618 618 RS1FJ62TF
BS 619 800 RS1EO77TF

RD RS1FJ62TF 769 0 0
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TTTGCGATCTCTCTCAGGCAGGCAAGCGAATGGCGGCCGCGACAAGTGAGAAACAGAACG
GATCAAAGGCTCCTCCTTTGCCTTCTCCTCTCCGCAACTCCAAGTTTCTCCAGTCGAATA
TGAGGATCTTGATATCGGGAGGAGCAGGGTTCATCGGTTCACACTTGGTTGATAAGCTAA
TGGAAAACGGGAAGAATGAGGTTGTGGTTGCTGATAATTATTTCACTGGCTCTAAAGATA
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CTCTATTGCTTGAAGTTGATAGGATTTACCATCTTGCTTGTCCTGCCTCTCCTATCTTCT
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GTCTTGCCAAGCGTGTTGGAGCTAGGATTCTGCTCACCTCAACCTCGGAAGTGTATGGAG
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AACACGGCATTGAAATCCGCATTGCTAGGATCTTCAACACTTATGGTCCTCGTATGA*CA
TCGATGACGGCCGTGTGGTGAGCAACTTCATTGCTCAAGCACTCCGAG
G

QA 1 768 1 768
DS 

RD RS1EO77TF 800 0 0
GGATCACAATCACATCAGATCAGAGAGGAATCAAAGTTTAGGTATCTCATTTAAAACTCG
TTTGCGATCTCTCTCAGGCAGGCAAGCGAATGGCGGCCGCGACAAGTGAGAAACAGAACG
GATCAAAGGCTCCTCCTTTGCCTTCTCCTCTCCGCAACTCCAAGTTTCTCCAGTCGAATA
TGAGGATCTTGATATCGGGAGGAGCAGGGTTCATCGGTTCACACTTGGTTGATAAGCTAA
TGGAAAACGAGAAGAATGAGGTTGTGGTTGCTGATAATTATTTCACTGGCTCTAAAGATA
ACCTCAAGAAGTGGATCGGTCACCCCAGGTTTGAGCTTATTCGTCACGATGTTACGGAGC
CTCTATTGCTTGAAGTTGATAGGATTTACCATCTTGCTTGCCCTGCCTCTCCTATCTTCT
ACAAGTACAACCCCGTCAAGACAATCAAGACCAATGTGATGGGTACAATGAACATGCTCG
GTCTTGCCAAGCGTGTTGGAGCTAGGATTCTGCTCACCTCAACCTCGGAAGTGTATGGAG
ACCCTCTCATCCACCCTCAACCAGAGAGCTACTGGGGAAATGTCAACCCCATTGGTGTTC
GGAGTTGCTATGACGAAGGCAAGCGTGTAGCTGAGACTTTGATGTTTGACTACCACAGGC
AACACGGCATTGAAATCCGCATTGCTAGGATCTTCAACACTTATGGTCCTCGTATGAACA
TCGATGACGGCCGTGTGGTGAGCAACTTCATTGCTCAAGCACTCCGAGCGAGGCATTGAC
AGTTCAGAAACCGGGGACAC

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 2

CO CL7244Contig1 882 2 4 U
GCTGTTAACCAACGAGGACCCCAGCGGGCAATGTAGGATTTGTAGCGTTGTTCTTTGGTA
ACACTTACTGCGATTTTCTCAGCCACTTGGTTGGTCGATGCGTTGATATCTTGGATCTTC
CAGTCAGGTTTAGCCAGAAGACAATCGCTAATCTCCACAGTGGCTTGACGATAACCCGGA
AAATGTTGAGGTTGAAGAATTGCCTTTACTCCTTGAGAAGAAGATGATTCGAAGATCACA
TTGTTGAATCGCATAGTCCGCATAATCTCAAAAGCCCAGTCAATAGCTTTTATTTCTGCC
TCCAATCTAGAGTGAACATTGTTGATGTAAAATGTCAACCCTGAAGTAGTCGCTGACGTA
GTTGCTGAAGGAGATGTCTTGTTGAGTGATGAAGACCATGTGGAGTCGAGATGCTGAGCT
GGAGTCAACAGACTTGGAGAGCAAGAGAATATCTTGAAGATATGGAAAGAGGAATAAACT
TGAGAAGCAAGTTTATGACTTAAAGGAAAAGGAATAAGTGCATTCCAAGAAAAGGAAAGT
TGCACTTATTGTTATGGAAGATGTCCATATTCATCTTGCCTTGGAAACTAGGTTTCAGGA
ACGTGGAGAATAATATAAAATAGCTATGGAGTCGTCTGTATGAAGACAGAGACACAGAGG
CTGAGTTTATAGAGAAAGAGAGAAGCTCTTGGAAGTGTTTTGAGTTGTGCTGAAGCAGTG
GCTGAAGTACTTGACGAAGGAGATATATAAGCGGTGTAGCTTAGGAATCTTTCAGTAGCG
TGTGTTAGGGTGTTAACACTAGACGTGTAAAAGCTGAATTAAGCAGATCTTGTAATAGAT
TGTTTAAAGAAGATTCTAATAAAGCATAGTGGTTGCTTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AU44TF U 1
AF RS1AU44JQ C 169
BS 1 534 RS1AU44TF
BS 535 535 RS1AU44JQ
BS 536 587 RS1AU44TF
BS 588 882 RS1AU44JQ

RD RS1AU44TF 587 0 0
GCTGTTAACCAACGAGGACCCCAGCGGGCAATGTAGGATTTGTAGCGTTGTTCTTTGGTA
ACACTTACTGCGATTTTCTCAGCCACTTGGTTGGTCGATGCGTTGATATCTTGGATCTTC
CAGTCAGGTTTAGCCAGAAGACAATCGCTAATCTCCACAGTGGCTTGACGATAACCCGGA
AAATGTTGAGGTTGAAGAATTGCCTTTACTCCTTGAGAAGAAGATGATTCGAAGATCACA
TTGTTGAATCGCATAGTCCGCATAATCTCAAAAGCCCAGTCAATAGCTTTTATTTCTGCC
TCCAATCTAGAGTGAACATTGTTGATGTAAAATGTCAACCCTGAAGTAGTCGCTGACGTA
GTTGCTGAAGGAGATGTCTTGTTGAGTGATGAAGACCATGTGGAGTCGAGATGCTGAGCT
GGAGTCAACAGACTTGGAGAGCAAGAGAATATCTTGAAGATATGGAAAGAGGAATAAACT
TGAGAAGCAAGTTTATGACTTAAAGGAAAAGGAATAAGTGCATTCCAAGAAAAG*AAAGT
TGCACTTATTGTTATGGAAGATGTCCATATTCATCTTGCCTTGGAAA

QA 1 587 1 587
DS 

RD RS1AU44JQ 714 0 0
CGATAACCCGGAAAATGTTGAGGTTGAAGAATTGCCTTTACTCCTTGAGAAGAAGATGAT
TCGAAGATCACATTGTTGAATCGCATAGTCCGCATAATCTCAAAAGCCCAGTCAATAGCT
TTTATTTCTGCCTCCAATCTAGAGTGAACATTGTTGATGTAAAATGTCAACCCTGAAGTA
GTCGCTGACGTAGTTGCTGAAGGAGATGTCTTGTTGAGTGATGAAGACCATGTGGAGTCG
AGATGCTGAGCTGGAGTCAACAGACTTGGAGAGCAAGAGAATATCTTGAAGATATGGAAA
GAGGAATAAACTTGAGAAGCAAGTTTATGACTTAAAGGAAAAGGAATAAGTGCATTCCAA
GAAAAGGAAAGTTGCACTTATTGTTATGGAAGATGTCCATATTCATCTTGCCTTGGAAAC
TAGGTTTCAGGAACGTGGAGAATAATATAAAATAGCTATGGAGTCGTCTGTATGAAGACA
GAGACACAGAGGCTGAGTTTATAGAGAAAGAGAGAAGCTCTTGGAAGTGTTTTGAGTTGT
GCTGAAGCAGTGGCTGAAGTACTTGACGAAGGAGATATATAAGCGGTGTAGCTTAGGAAT
CTTTCAGTAGCGTGTGTTAGGGTGTTAACACTAGACGTGTAAAAGCTGAATTAAGCAGAT
CTTGTAATAGATTGTTTAAAGAAGATTCTAATAAAGCATAGTGGTTGCTTGTTT

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL7245Contig1 871 2 3 U
ATCAGTCCACGATCTCACAATTGGTGTCGAGTTCGGTGATCGGATGGTCACCGTGGAGGG
ACGCCCCGTCAAACTACAAATTTAGGACACGGCTGGACAAGATTATTTTTTAGATCCATC
ACCAGATCGTACTACAGAGGAGCAGCCGGAGCTTTACTTGTTTACGACATCACCAGGAGA
GAAACGTTTAACCATCTGGCGAGCTGGTTAGAGAATGCTCGGCAACATGCTATTCCTAAC
ATGAGCATTATGCTGATGGGGAACAAATGCGATCTTGCTCACAAGAGAGCTGTTAGCAAA
GAGGAAGTAGAACAGTTTGCCAAAGAACACGGATCTTTGTTCTTAGAAGCATCTGCAAGA
ACAGCTCAAAACGTTGAGGAGGTTATGATACTTCCTTGCAATAAGCTGGAATGACATGCT
TAAATATCGCATTTAACATGAACAGGCCTTCGTAAAGACAGCAGCAAAGATCCTCCAGAA
CATTCAGGACGGCGTCTTTGATGTTATCCAACGAGGCAGCAAGGTTTGCTATGGGCGTCC
TCAAGGTGCAGCTGGAGGAAGAGATGGTGCTATCTCTCATGGAGGTTGGTGTTGTGGTTA
AAGAGACCTCAAGATGTGTCAACAGTCAACACTGATGTAATCTGGTGATTCAGAAACTAC
TCTTGCTTTTTTTTTCTAATCTCTGCAAATGGATACACCACAATGTTACCAGAGTCTCTT
GAGTAATCTTCATCCCTTCTTCTGAGTGTAATCTGTCATAGCTCTCTCTCTCTATGTTAG
ATAGAAGAAGAACCGATGAAGACAACTAATACATGTTCTTGCGATAAGTCAAAATTATTG
ACCAAGATCAAGTTACATGAAAACTTATCCG


BQ
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AF RS1AG75TF U 48
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BS 48 787 RS1AG75TF
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QA 1 871 1 871
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AF RS1BO05JQ C 1
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QA 1 741 1 741
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ATCCTTCTTCTCTTCCCCCTCCAATTTCTCGTCCTCAAGGGTTGATGTGGTAGTCTTTGT
AATTTGGGAGCTAGTGATCTTAGCATTCCTCGTGTTCTCAGCAGTCTCCCTCTACTTCAA
GCGGTTGGAACTCGCGCTCATCCTCGTTTGCGTCACTTTACTGTTACTCCTCTGCATGAA
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GAGAGATGGATGGGCTTAGCTTAGACAAAACACAACTGTCTACGTTATCAGCTTTTTTTG
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ATTT

QA 1 736 1 736
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BQ
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AF RS1AE83TF U 1
AF RS1AE83JQ C 599
BS 1 684 RS1AE83TF
BS 685 1423 RS1AE83JQ

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ACAGCTACGGAGGCTCAGATTAAGAAAGCTTACTACATCAAGGCACGTCAAGTACATCCA
GATAAGAATCCTAATGATCCTCAGGCTGCTCATAATTTCCAGGTGTTAGGAGAGGCCTAC
CAAGTACTGAGTGATCCAGGACAACGTCAGGCCTATGACACAAGCGGGAAGGCAGGGATT
TCAACTGAGATAATTGATCCCGCGGCAATATTTGCTATGCTTTTTGGGAGTGAACTTTTC
GAAGAGTACATAGGACAGCTTGCTATGGCATCAATGGCTTCACTTGATATCCTCTCTGAA
GGGGATCAGATTGATACTAAAAAGATCATTGAAAAAATGAGGGCTGTTCAGAAAGAGAGA
GAAGACAATCTTGCTCAGATTCTCAAGGACCGCCTCAACCTATACGTGACGAACAAAGAC
GAATTTATCAGCAATGCTGAAGCTGAAGTAACCAAACTCTCAAATGCAGCATACGGTGTG
GAGATGCTGAACACAATCGGATATATATACGTAAGACAAGCGGCGAAAGAGCTGGGGAAG
AAAGCTATATACCTCGGTGTACCATTTGTTGCTGAATGGTTTAGGACGAAAGGTCACTTC
ATCAAATCCCAAGTTACAGCTGCA

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1AE83JQ 825 0 0
AGAAAGCTATATACCTCGGTGTACCATTTGTTGCTGAATGGTTTAGGACGAAAGGTCACT
TCATCAAATCCCAAGTTACAGCTGCAACAGGTGCATATGCTTTATTCCAGCTGCAAGAGG
AAATGAAAAGGCAGCTAAGTGCTGAAGGCAACTATACTGAGAAGGAACTTGAAGAGTACA
TGAAGTCCCATAAGAAAGTGATGATTGATTCTTTGTGGAAACTCAATGTTGCTGATATCG
AAAACACTCTCTCCCGTGTTTGTGAGCTGGTTCTTCAAGATCCCACTGCCAAGAGAGAAG
AGCTTCGTGCAAGGGCAAAGGGATTAAAAACTTTGGGGAAGATCTTCCAGAAGAACAAGT
TGACCAGTGAGAGTGATCCTTTAGTAAGAGCCGAGCTTGACAAAATAAACGGAAATGGTC
AAGACCGTGATGCATCCACCTCACCAAATCCCATGAAGCATCTCATTCTACATTTGGGCC
TCAGGAACCGCAAAGCCCTTATGTGGAAGCACCGAAGCTTGGAGATGACCAATTCGACCA
TTACTTCCCAAGGCCCGCACCGCCTCCAGGCGCACAGAGACGCTCTTAAACCTTGCAAAT
GAATTATTCAGATAAAGAGATTACTAGAGGTAATCTCCCTTTTGTGCTATATATATTATA
TATAATATTTACAAAATTTCAAATATTATGCATTTTGATATACTTGCAATTGCAAGTCGG
TGGTGCAACATTATGTAATTTTGTTATTTGTTAGTAGAAGAAATGATTGGATGTTTGAAA
GCACGGCAAGTTATCATATTCGAGTATGTATAATGATTGTTTTTT

QA 1 825 1 825
DS 



AS 1 2

CO CL7248Contig1 1179 2 10 U
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CCGTGCTGTCTCCAAGAAGCAAAGGACCATTCATTGTCAGTGTCTCGAGTGTGACCGCTC
TGGGAAATATAAGAGATCCTTATTTAAAAAGATCTCAAACTTCTCTACATGGAGCAACTT
GACACTCGTGTTACTATGGGTCGTGATGATTTTCTTGATTTATTACACCAAGAACATGAG
CCGTGAGACTCAGGTTTTCGACCCATTCAGTATACTTGGATTGGAACCTGGAGTTTCAGA
TTCAGAAATTAAGAAAGCATATAGAAGGCTGTCGATTCAAATGGGCATTGCTCTTCCTAA
GTTTCTCCTAGACATAGATGGAGCATCCGGTGGAATATTATTGCTCTGGATAGTGGGTGT
GTGTATTCTCTTACCCCTTGTGATAGCTGTTATATATCTCTCGAGGTCATCAAAGTATAC
CGGGAACTATGTCATGCATCAAACTCTGTCCGCATATTATTATCTAATGAAACCCTCGTT
GGCCCCAAGCAAAGTTATGGACGTTTTTACCAAGGCAGCTGAGTACATGGAGATTCCAGT
TCGTAGAACCGATGATGAACCTCTGCAGAAGCTCTTTATGTCCGTGAGGAGCGAGCTAAA
TTTGGACCCGAAGAACATGAAGCAAGAGCAAGCTAAGTTTTGGAAACAGCATCCTGCTAT
AGTGAAGACGGAGCTGTTGATACAGGCCCAGTTAACTCGTGAATCAGGAGTCTTGTCTCC
AGCCCTGCAGGGTGATTTCAGACGTGTGCTAGAGCTTGCACCTCGCCTCCTTGAGGAGTT
ACTAAAGATGGCGGTTCTACCACGCACTTCCCAAGGGCATGGATGGCTGAGACCTGCAGT
CGGAGTAGTTGAGCTGTCTCAATGCATTGTTCAGGCTGTTCCCCTTAGTGCAAGGAAGTT
ATCTGGAGTCTCGTCAGAAGGAATTTCGCCTTTCTTGCAGCTCCCTCATTTCAGTGACGC
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CTTGGAGGACCGTTCTGAATTGCTAACCCAGGTAGCGGGTTTGTCAGCAACTGACGTTGA
GGACATTGAGAGGTTCTAGAGATGATGCCGTCGCTGACA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FV20TF U 1
AF RS1C876TF U 564
BS 1 730 RS1FV20TF
BS 731 731 RS1C876TF
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BS 793 811 RS1FV20TF
BS 812 1179 RS1C876TF

RD RS1FV20TF 811 0 0
GATTTTCATTTTGACGATCATGGCTATTCCGTTGGTGCCTTATACCATGGTCAAGTTAAG
CCGTGCTGTCTCCAAGAAGCAAAGGACCATTCATTGTCAGTGTCTCGAGTGTGACCGCTC
TGGGAAATATAAGAGATCCTTATTTAAAAAGATCTCAAACTTCTCTACATGGAGCAACTT
GACACTCGTGTTACTATGGGTCGTGATGATTTTCTTGATTTATTACACCAAGAACATGAG
CCGTGAGACTCAGGTTTTCGACCCATTCAGTATACTTGGATTGGAACCTGGAGTTTCAGA
TTCAGAAATTAAGAAAGCATATAGAAGGCTGTCGATTCAAATGGGCATTGCTCTTCCTAA
GTTTCTCCTAGACATAGATGGAGCATCCGGTGGAATATTATTGCTCTGGATAGTGGGTGT
GTGTATTCTCTTACCCCTTGTGATAGCTGTTATATATCTCTCGAGGTCATCAAAGTATAC
CGGGAACTATGTCATGCATCAAACTCTGTCCGCATATTATTATCTAATGAAACCCTCGTT
GGCCCCAAGCAAAGTTATGGACGTTTTTACCAAGGCAGCTGAGTACATGGAGATTCCAGT
TCGTAGAACCGATGATGAACCTCTGCAGAAGCTCTTTATGTCCGTGAGGAGCGAGCTAAA
TTTGGACCCGAAGAACATGAAGCAAGAGCAAGCTAAGTTTTGGAAACAGCATCCTGCTAT
AGTGAAGACG*AGCTGTTGATACAG*CCCAGTTAACTCGTGAATCAG*AGTCTTGTCTCC
AGCCCTGCAGG*TGATTTCAGACGTGTGCTA

QA 1 811 1 811
DS 

RD RS1C876TF 616 0 0
TTTTTACCAAGGCAGCTGAGTACATGGAGATTCCAGTTCGTAGAACCGATGATGAACCTC
TGCAGAAGCTCTTTATGTCCGTGAGGAGCGAGCTAAATTTGGACCCGAAGAACATGAAGC
AAGAGCAAGCTAAGTTTTGGAAACAGCATCCTGCTATAGTGAAGACGGAGCTGTTGATAC
AGGCCCAGTTAACTCGTGAATCAGGAGTCTTGTCTCCAGCCCTGCAGGGTGATTTCAGAC
GTGTGCTAGAGCTTGCACCTCGCCTCCTTGAGGAGTTACTAAAGATGGCGGTTCTACCAC
GCACTTCCCAAGGGCATGGATGGCTGAGACCTGCAGTCGGAGTAGTTGAGCTGTCTCAAT
GCATTGTTCAGGCTGTTCCCCTTAGTGCAAGGAAGTTATCTGGAGTCTCGTCAGAAGGAA
TTTCGCCTTTCTTGCAGCTCCCTCATTTCAGTGACGCTGTCGTTAAAAAGATAGCACGAA
AGAAGGTTAAATCATTCCAAGAGCTCCAAGAAATGAGCTTGGAGGACCGTTCTGAATTGC
TAACCCAGGTAGCGGGTTTGTCAGCAACTGACGTTGAGGACATTGAGAGGTTCTAGAGAT
GATGCCGTCGCTGACA

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 2

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GGGCTCTCCTTTTCCTCTCAATCAGGGCAGATCAATGTGCACACAAAGTTTGTAACTTTA
CCAAAGACAAAAGAGATCTTGTTGTTGAATTGGTTGATGATTTGGTGTTTAAAAGACCCA
ACATATGTTTTGATGAGGGTTTTGCTTTGTAAGATCCAGTGCCCTTCTTTCGTCTGCTTC
TGCAAGCCTTCTCCTCACATCTACGCATCTGGCTCTCTCAAATTGGAGGACACCCCCTCC
CTCCTCCTCAAGTGTCTTCGTTTGATGATAACGGTGATGATGATCAGTATGTTGATGCAC
AAGTAGATGAAGTTGTTGACCATAGGGAAGAAGAGTGTGCTAGAGAGGGAAAGGAAGAAG
ATTGTGGCTTAGAGGAGATAAAAGAAGGTCAAAGTACTGGTGGAGAGATCCTGAAAAGTA
GTTTCAAAAAGGAGGTTTTGGATCCAGAAGATGGTGAGAGAAGGGAGAAGAAGAAGAAGA
AGGTACAGTGGGTGGATTTGATGGGGAAAGAACTTGCTGAGATCCGTGAATTCGAGTCTA
GTGAAGAAGAAGAGATCAGATATGATGGCGATAGAAGCTGTGTTTGCGTTATTCTATGAT
CAATCCTGTTTTTTTAGTTTTACTCGGAGAGATTAAGGCAATGGTGAAAGGTGAAGAAGC
TGTTGGTCTTGTGGCTTTGGCTTTGGAATCCCCATATAAACATTGAGGTAGTATAGTAGT
ACATATATAGTAGTAGAATCTGCAACTGCGTTCTTGAACCAATCTACATTTTGCCAGCCT
GATGTTATATGAAGTTTCCAGATATAACATATGGTAGCATTCTGTTTACAGTTTTAGTAT
TGTGAAAAGATTTGTTCTCTATGACATTTGTTTCTTTGACCAGTTAGTGAATGGCTCTCT
CTTTCTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A835TF U 1
AF RS1A835JQ C 192
BS 1 236 RS1A835TF
BS 237 239 RS1A835JQ
BS 240 861 RS1A835TF
BS 862 910 RS1A835JQ

RD RS1A835TF 861 0 0
GGGCTCTCCTTTTCCTCTCAATCAGGGCAGATCAATGTGCACACAAAGTTTGTAACTTTA
CCAAAGACAAAAGAGATCTTGTTGTTGAATTGGTTGATGATTTGGTGTTTAAAAGACCCA
ACATATGTTTTGATGAGGGTTTTGCTTTGTAAGATCCAGTGCCCTTCTTTCGTCTGCTTC
TGCAAGCCTTCTCCTCACATCTACGCATCTGGCTCTCTCAAATTGGAGGACACCCCT**C
CTCCTCCTCAAGTGTCTTCGTTTGATGATAACGGTGATGATGATCAGTATGTTGATGCAC
AAGTAGATGAAGTTGTTGACCATAGGGAAGAAGAGTGTGCTAGAGAGGGAAAGGAAGAAG
ATTGTGGCTTAGAGGAGATAAAAGAAGGTCAAAGTACTGGTGGAGAGATCCTGAAAAGTA
GTTTCAAAAAGGAGGTTTTGGATCCAGAAGATGGTGAGAGAAGGGAGAAGAAGAAGAAGA
AGGTACAGTGGGTGGATTTGATGGGGAAAGAACTTGCTGAGATCCGTGAATTCGAGTCTA
GTGAAGAAGAAGAGATCAGATATGATGGCGATAGAAGCTGTGTTTGCGTTATTCTATGAT
CAATCCTGTTTTTTTAGTTTTACTCGGAGAGATTAAGGCAATGGTGAAAGGTGAAGAAGC
TGTTGGTCTTGTGGCTTTGGCTTTGGAATCCCCATATAAACATTGAGGTAGTATAGTAGT
ACATATATAGTAGTAGAATCTGCAACTGCGTTCTTGAACCAATCTACATTTTGCCAGCCT
GATGTTATATGAAGTTTCCAGATATAACATATGGTAGCATTCTGTTTACAGTTTTAGTAT
TGTGAAAAGATTTGTTCTCTA

QA 1 861 1 861
DS 

RD RS1A835JQ 719 0 0
TCCTCACATCTACGCATCTGGCTCTCTCAAATTGGAGGACACCCCCTCCCTCCTCCTCAA
GTGTCTTCGTTTGATGATAACGGTGATGATGATCAGTATGTTGATGCACAAGTAGATGAA
GTTGTTGACCATAGGGAAGAAGAGTGTGCTAGAGAGGGAAAGGAAGAAGATTGTGGCTTA
GAGGAGATAAAAGAAGGTCAAAGTACTGGTGGAGAGATCCTGAAAAGTAGTTTCAAAAAG
GAGGTTTTGGATCCAGAAGATGGTGAGAGAAGGGAGAAGAAGAAGAAGAAGGTACAGTGG
GTGGATTTGATGGGGAAAGAACTTGCTGAGATCCGTGAATTCGAGTCTAGTGAAGAAGAA
GAGATCAGATATGATGGCGATAGAAGCTGTGTTTGCGTTATTCTATGATCAATCCTGTTT
TTTTAGTTTTACTCGGAGAGATTAAGGCAATGGTGAAAGGTGAAGAAGCTGTTGGTCTTG
TGGCTTTGGCTTTGGAATCCCCATATAAACATTGAGGTAGTATAGTAGTACATATATAGT
AGTAGAATCTGCAACTGCGTTCTTGAACCAATCTACATTTTGCCAGCCTGATGTTATATG
AAGTTTCCAGATATAACATATGGTAGCATTCTGTTTACAGTTTTAGTATTGTGAAAAGAT
TTGTTCTCTATGACATTTGTTTCTTTGACCAGTTAGTGAATGGCTCTCTCTTTCTTATC

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 2

CO CL7250Contig1 581 2 3 U
TCTGAATCCCACAAAAAGGGTAAAAACACCAAAAGAGGCAAGAACAAGCTTGCTATGGCT
AATTCCTTTATTCGAGAATAGTCTGAATCACTCCAGCACCAACAGTCTTCCCACCTTCTC
TAATAGCAAACCTCATCCCTTGTTCACAAGCGACAGGCACAATAAGCTCCACAACAATCT
TAACCCTATCACCGGGCATAACCATCTTCGACTCCTCATCCTTATCGTTCATAATCTTAG
TCACTTTACCAGTAACATCAGTCGTCCTCATGTAAAACTGAGGTCTATAACCGGCGAAAA
ACGGAAAATGTCTTCCACCTTCTTCCTTCTTCAACACATACACAATGGCCTCAAACTTAG
TATGAGGAGTAATGGAACCGGGCTTAACTAAAACCATACCTCTCTGAATATCAGCCTTCT
GTATACCTCTAAGCAACAGTCCTACGTTATCTCCAGCCATTGCTTCATCAAGAATCTTCT
GGAACATCTCAACTCCTGTTACAGTGTAGTTCCTAGTCTCTCTTAATCCAACCAAATCCA
CGGTCTCTCCAACTTTAACCATACCTCTTTAGACACGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EK12JQ U 220
AF RS1EK12TF C 1
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BS 220 395 RS1EK12JQ
BS 396 581 RS1EK12TF

RD RS1EK12JQ 176 0 0
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GAGGTCTATAACCGGCGAAAAACGGAAAATGTCTTCCACCTTCTTCCTTCTTCAACACAT
ACACAATGGCCTCAAACTTAGTATGAGGAGTAATGGAACCGGGCTTAACTAAAACC

QA 1 176 1 176
DS 

RD RS1EK12TF 581 0 0
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AATTCCTTTATTCGAGAATAGTCTGAATCACTCCAGCACCAACAGTCTTCCCACCTTCTC
TAATAGCAAACCTCATCCCTTGTTCACAAGCGACAGGCACAATAAGCTCCACAACAATCT
TAACCCTATCACCGGGCATAACCATCTTCGACTCCTCATCCTTATCGTTCATAATCTTAG
TCACTTTACCAGTAACATCAGTCGTCCTCATGTAAAACTGAGGTCTATAACCGGCGAAAA
ACGGAGAATGTCTTCCACCTTCTTCCTTCTTCAACACATACACAATGGCCTCAAACTTAG
TATGAGGAGTAATGGAACCGGGCTTAGCTAAAACCATACCTCTCTGAATATCAGCCTTCT
GTATACCTCTAAGCAACAGTCCTACGTTATCTCCAGCCATTGCTTCATCAAGAATCTTCT
GGAACATCTCAACTCCTGTTACAGTGTAGTTCCTAGTCTCTCTTAATCCAACCAAATCCA
CGGTCTCTCCAACTTTAACCATACCTCTTTAGACACGACCC

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

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TGCTCCCTCTTATTACATAACTTTGGTTGCAATTGACGACACAGCTGGTGGTGGTGGATC
TTCTTCGCTTCAAACGTTTCAGATTCAAGTATCTCAAGAAAGCAGGGGCCAGTTTATTCT
GACTTGCGATATTGCAAGAATTCGAGGGGAATCAAGGGATGAGAACGAATCGATGATCCT
TGATATTGACTTGCCTGAGTGGCCAGCAGAGAATCCTTTTGAAAAATATTGCCTGGTGAA
ATCAGAGCTGCAAGACAATGATGACTGGATTCGTCTTTATTTGGAACTTGCTCTTGCCAT
AAAAGAACCTAGGGGGTGTTGGTGTCTTTAACTTGGAGATTGTGAAAGTGGCTACAGATG
TGGGTGAAGGGATCAATGCCAAAAATGCAACCTTCTACATAAGGTATAGTGACTTGTCCA
AGGCTGAGGATTCTGACCGCATCGCTATAGTTAGAAGAAGCTTCGATGAGGATACCGGAT
GCTTCATCCTTGTGGGTCAGAGTCATCAAAGTTCAGATCTTATACCAAAGAAGCGTAAGA
GTGTTGGTGAGGAGTCTGCGGAGAATAAAAGGATTAATACCGGACTTGGAAATCAAATCT
CTTCACCACCTCTAGCTACCCGTGAGGATGATGAAGCGGCAAATCGGAAGATTGTCAACT
CTGACTCAGGAGTTTCAATGGAGTAAGACATTGAGGTGTACATGGTTCCCATAGGATTGC
AGAATCCACAACTCTTACTGGAAAACGTGAAGGACACAGAGAAATTCTTCAAGTTGTTAA
TAAAATATTCTTTCATTAGTCAAATTAAATA


BQ
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AF RS1BK32TF U 1
AF RS1BK32JQ C 128
BS 1 516 RS1BK32TF
BS 517 871 RS1BK32JQ

RD RS1BK32TF 516 0 0
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TGCTCCCTCTTATTACATAACTTTGGTTGCAATTGACGACACAGCTGGTGGTGGTGGATC
TTCTTCGCTTCAAACGTTTCAGATTCAAGTATCTCAAGAAAGCAGGGGCCAGTTTATTCT
GACTTGCGATATTGCAAGAATTCGAGGGGAATCAAGGGATGAGAACGAATCGATGATCCT
TGATATTGACTTGCCTGAGTGGCCAGCAGAGAATCCTTTTGAAAAATATTGCCTGGTGAA
ATCAGAGCTGCAAGACAATGATGACTGGATTCGTCTTTATTTGGAACTTGCTCTTGCCAT
AAAAGAACCTAGGGGGTGTTGGTGTCTTTAACTTGGAGATTGTGAAAGTGGCTACAGATG
TGGGTGAAGGGATCAATGCCAAAAATGCAACCTTCTACATAAGGTATAGTGACTTGTCCA
AGGCTGAGGATTCTGACCGCATCGCTATAGTTAGAA

QA 1 516 1 516
DS 

RD RS1BK32JQ 744 0 0
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GACTTGCCTGAGTGGCCAGCAGAGAATCCTTTTGAAAAATATTGCCTGGTGAAATCAGAG
CTGCAAGACAATGATGACTGGATTCGTCTTTATTTGGAACTTGCTCTTGCCATAAAAGAA
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GGATTCTGACCGCATCGCTATAGTTAGAAGAAGCTTCGATGAGGATACCGGATGCTTCAT
CCTTGTGGGTCAGAGTCATCAAAGTTCAGATCTTATACCAAAGAAGCGTAAGAGTGTTGG
TGAGGAGTCTGCGGAGAATAAAAGGATTAATACCGGACTTGGAAATCAAATCTCTTCACC
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AGGAGTTTCAATGGAGTAAGACATTGAGGTGTACATGGTTCCCATAGGATTGCAGAATCC
ACAACTCTTACTGGAAAACGTGAAGGACACAGAGAAATTCTTCAAGTTGTTAATAAAATA
TTCTTTCATTAGTCAAATTAAATA

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL7252Contig1 778 2 2 U
GGCCGTGCTCGGTGGAAGACAAAGCAGCTCGAACGCGATTACGGCGTTCTCAAGTCAAAT
TTTGACTCACTCAAACGCAGCCGCGACTCGCTTCAACGTGATAACGATTCCCTCCTTGCA
GAGATTAAAGAGCTAAGAGCAAAACTTGACGGGGAAGGAACCGGCGTAAACAATGGTAAC
GCGGTGACAGAAGAAACCGGCGTTGTAAAAGTGCTTGAGACGGTCGCGTATCAGACGGTG
ATTGCTAATAACGAAGTCTTAGAGCTAAGCCAGCGTCCTCCGCCACATATTCCTACAGAA
GCTCAGGCATCGGAGCTAGCATACGAGATGTTTAGCATTTTCCCACGTACCGAAAGCTTC
AGAGAAGATCCTGCCGATAGTAGCGACTCGAGCGCTGTTTTGAACGAAGATTATAGTCCC
ACGGCGGCGGCGGCTGCGGCAGCGGTTGAAATGTCCACGATGGGATGTTTTGGCCAGTTT
GTGAAAATGGAAGAGCATGAGGATCTTTTTAGTGGAGAGGAAGCTTGCAAGTTGTTTGCG
GATAATGAGCAGTGGTTTTGCTCCGGTCAGTGGAGTTCCTAAAGCTAAAAGACATGATGC
TGAGGATAAAACTGAAACTAAAGAACAATGAGGGTTGTTTGTGAAAACATTGATCAAGGG
AAATGAAGCGAGCAGATAAAAAGATTAAAACCTAAAATTGCATGCACTTCCAAGTCAAGG
TTAATTAGGAGATTATGTGAAGATGAAATTGTTTTGGAAGTTTATATAATTTACTTGG


BQ
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AF RS1GV73TF U 1
AF RS1GV73JQ C 115
BS 1 674 RS1GV73TF
BS 675 778 RS1GV73JQ

RD RS1GV73TF 674 0 0
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TTTGACTCACTCAAACGCAGCCGCGACTCGCTTCAACGTGATAACGATTCCCTCCTTGCA
GAGATTAAAGAGCTAAGAGCAAAACTTGACGGGGAAGGAACCGGCGTAAACAATGGTAAC
GCGGTGACAGAAGAAACCGGCGTTGTAAAAGTGCTTGAGACGGTCGCGTATCAGACGGTG
ATTGCTAATAACGAAGTCTTAGAGCTAAGCCAGCGTCCTCCGCCACATATTCCTACAGAA
GCTCAGGCATCGGAGCTAGCATACGAGATGTTTAGCATTTTCCCACGTACCGAAAGCTTC
AGAGAAGATCCTGCCGATAGTAGCGACTCGAGCGCTGTTTTGAACGAAGATTATAGTCCC
ACGGCGGCGGCGGCTGCGGCAGCGGTTGAAATGTCCACGATGGGATGTTTTGGCCAGTTT
GTGAAAATGGAAGAGCATGAGGATCTTTTTAGTGGAGAGGAAGCTTGCAAGTTGTTTGCG
GATAATGAGCAGTGGTTTTGCTCCGGTCAGTGGAGTTCCTAAAGCTAAAAGACATGATGC
TGAGGATAAAACTGAAACTAAAGAACAATGAGGGTTGTTTGTGAAAACATTGATCAAGGG
AAATGAAGCGAGCA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1GV73JQ 664 0 0
CTTGCAGAGATTAAAGAGCTAAGAGCAAAACTTGACGGGGAAGGAACCGGCGTAAACAAT
GGTAACGCGGTGACAGAAGAAACCGGCGTTGTAAAAGTGCTTGAGACGGTCGCGTATCAG
ACGGTGATTGCTAATAACGAAGTCTTAGAGCTAAGCCAGCGTCCTCCGCCACATATTCCT
ACAGAAGCTCAGGCATCGGAGCTAGCATACGAGATGTTTAGCATTTTCCCACGTACCGAA
AGCTTCAGAGAAGATCCTGCCGATAGTAGCGACTCGAGCGCTGTTTTGAACGAAGATTAT
AGTCCCACGGCGGCGGCGGCTGCGGCAGCGGTTGAAATGTCCACGATGGGATGTTTTGGC
CAGTTTGTGAAAATGGAAGAGCATGAGGATCTTTTTAGTGGAGAGGAAGCTTGCAAGTTG
TTTGCGGATAATGAGCAGTGGTTTTGCTCCGGTCAGTGGAGTTCCTAAAGCTAAAAGACA
TGATGCTGAGGATAAAACTGAAACTAAGGAACAATGAGGGTTGTTTGTGAAAACATTGAT
CAAGGGAAATGAAGCGAGCAGATAAAAAGATTAAAACCTAAAATTGCATGCACTTCCAAG
TCAAGGTTAATTAGGAGATTATGTGAAGATGAAATTGTTTTGGAAGTTTATATAATTTAC
TTGG

QA 1 664 1 664
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7254Contig1 932 2 6 U
TACGAAGTTATCAGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGG
GGGGGGGCAATAAAAAGGTCGTCTTCTCTCTTCCTCACAATTCTCACCACTTCAAATACA
AACCTCGTTGAGCTCAAAATTAGACAAATTCAACTGTACAAACACAGAGAGAGCGAGATC
TTCTATATCTCCTTCTCCTTGAACAAGCCTCACTCACGAACCTCGTGATCACCGTGAACA
AGCTGCCGCAGCAGCCATGGTGTTTGATTCCGAGAAGCAATCGATCGTTTCTCTTGGACA
GGTTGGTGATTCATCTTCAGGTGGGATTAGCTCGGTCAAAGAACCTCTGATTAAGGAGAA
ACACCACAGCCCAGAAGACTACTCTGTTCTTGCAGCCATTCCCTCGTTTCTCTTTCCAGC
TCTTGGAGCTTTGCTTTTTGGTTACGAGATTGGTGCTACTTCTTGTGCAATCATTTCTAT
TAAGTCTCCTACGCTAAGTGGGATATCATGGTACAACTTGTCTCCAGTGGATGTCGGTAT
AATAACTAGTGGCTCCTTGTACGGTGCCTTAATTGGATCCATTGTGGCATTTACTATTGC
TGACACAATAGGAAGAAGAAAGGAGCTGATCTTGGCTGCATTTTGTTATCTAGTTGGAGC
CATTGTGACTTCACTAGCACCTGTCTTCTCCGTCCTGATAATTGGACGCCTTATGTATGG
CATTGGGATTGGACTGACAATGCACGCAGCTCCAATGTACATTGCGGAGACTTCACCAAG
TCAGATACGTGGAAAGATGATATCACTAAAAGAGTTCTCAACCGTCATTGGGTATGGTTG
GAGGCTATGGGATCGGTAGCCTCTGGGTCACTGTTATATCTGGTTGGCGTTACATGTACG
CAACGATCATCCCTGTGCCAGTTATCATGGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A026TF U 1
AF RS1A026TV U 69
BS 1 75 RS1A026TF
BS 76 76 RS1A026TV
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BS 832 832 RS1A026TV
BS 833 858 RS1A026TF
BS 859 932 RS1A026TV

RD RS1A026TF 858 0 0
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GGGGGGGCAATAAAATGGTCGTCTTCTCTCTTCCTCACAATTCTCACCACTTCAAATACA
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TTCTATATCTCCTTCTCCTTGAACAAGCCTCACTCACGAACCTCGTGATCACCGTGAACA
AGCTGCCGCAGCAGCCATGGTGTTTGATTCCGAGAAGCAATCGATCGTTTCTCTTGGACA
GGTTGGTGATTCATCTTCAGGTGGGATTAGCTCGGTCAAAGAACCTCTGATTAAGGAGAA
ACACCACAGCCCAGAAGACTACTCTGTTCTTGCAGCCATTCCCTCGTTTCTCTTTCCAGC
TCTTGGAGCTTTGCTTTTTGGTTACGAGATTGGTGCTACTTCTTGTGCAATCATTTCTAT
TAAGTCTCCTACGCTAAGTGGGATATCATGGTACAACTTGTCTCCAGTGGATGTCGGTAT
AATAACTAGTGGCTCCTTGTACGGTGCCTTAATTGGATCCATTGTGGCATTTACTATTGC
TGACACAATAGGAAGAAGAAAGGAGCTGATCTTGGCTGCATTTTGTTATCTAGTTGGAGC
CATTGTGACTTCACTAGCACCTGTCTTCTCCGTCCTGATAATTGGACGCCTTATGTATGG
CATTGGGATTGGACTGACAATGCACGCAGCTCCAATGTACATTGCGGAGACTTCACCAAG
TCAGATACGTGGAAAGATGATATCACTAAAAGAGTTCTCAACCGTCATTGG*TATGGTTG
GAGGCTATGGGATCGGTA

QA 1 858 1 858
DS 

RD RS1A026TV 864 0 0
AATAAAAAGGTCGTCTTCTCTCTTCCTCACAATTCTCACCACTTCAAATACAAACCTCGT
TGAGCTCAAAATTAGACAAATTCAACTGTACAAACACAGAGAGAGCGAGATCTTCTATAT
CTCCTTCTCCTTGAACAAGCCTCACTCACGAACCTCGTGATCACCGTGAACAAGCTGCCG
CAGCAGCCATGGTGTTTGATTCCGAGAAGCAATCGATCGTTTCTCTTGGACAGGTTGGTG
ATTCATCTTCAGGTGGGATTAGCTCGGTCAAAGAACCTCTGATTAAGGAGAAACACCACA
GCCCAGAAGACTACTCTGTTCTTGCAGCCATTCCCTCGTTTCTCTTTCCAGCTCTTGGAG
CTTTGCTTTTTGGTTACGAGATTGGTGCTACTTCTTGTGCAATCATTTCTATTAAGTCTC
CTACGCTAAGTGGGATATCATGGTACAACTTGTCTCCAGTGGATGTCGGTATAATAACTA
GTGGCTCCTTGTACGGTGCCTTAATTGGATCCATTGTGGCATTTACTATTGCTGACACAA
TAGGAAGAAGAAAGGAGCTGATCTTGGCTGCATTTTGTTATCTAGTTGGAGCCATTGTGA
CTTCACTAGCACCTGTCTTCTCCGTCCTGATAATTGGACGCCTTATGTATGGCATTGGGA
TTGGACTGACAATGCACGCAGCTCCAATGTACATTGCGGAGACTTCACCAAGTCAGATAC
GTGGAAGGATGATATCACTAAAAGAGTTCTCAACCGTCATTGGGTATGGTTGGAGGCTAT
GGGATCGGTAGCCTCTGGGTCACTGTTATATCTGGTTGGCGTTACATGTACGCAACGATC
ATCCCTGTGCCAGTTATCATGGGA

QA 1 864 1 864
DS 



AS 1 2

CO CL7255Contig1 1330 2 4 U
GGATTGGTGCTTACTTCATCAGTTCCATTTACTACTCTCTGTTTCTCATGCTCCTTCTAT
CCCAAAATACAGTTAGCAGAAAATTATATAACTCTATATGATGGCGGGCGAAATTCAAGA
ACCGCTTAACCTAAGCCTTCTGGAGAATTCTATTAACTCAGGATCCGTTTCATTTGGAAG
ATTTGAGAAGGAAGTTTTATCATGGGAGAAGAGATCATCTTTCTCTCACAATAGATATCT
AGAAGAGGCTGAGAAATTATCTAAGCCTGGCTCTGTTACTCAGATGAGAGCTCATTTCGA
GGCACATTTTAAGAAAAAAGGAATCCAACTTCTGACTTCTGTAGAACCTCAAACATGGGG
ACAAGTAGCTCAACAACATCATCAACAAACTGCTAGTGAGAAAGAAGAAATATTGTGGGA
GAGTATGAGTCAGTGTAGCTACTACAGCTATGAACTAGACAAATGTGATAGAGAAAAGAG
CCCATTCGGCGAGTCTTGTGTGAGTTATGTGTCTTATGGAGAGACTCTTCTGAATTCTGA
TGATGATCATAGTTCTGTTTCTGTTGCTTTGGAGAAGACTAATATTGGTTGCATTGAGAA
AAGTACAGTTACATTGAAGCCTTTAAGAAATGACCGGAAAGCTATTACTTGTTATGAGAA
AACGACTAAAGCTACTACCAAGAAGCATGTTGTCAAGGGCTCTTCAAGTTGTAATACTAA
GACCAGTTTGGACACTAAGAGAGGAAAGGAACTGAAGCCGACAAGGATTATTAAATCCCT
TGCATCTCAAGCTTCAACATCAAAGAAAACTGAGAGCCTAACTTCTCTAGCCACAAGCAA
GCTCAGGTCCAAGACTTGTATTGGTTCTGCTATAAAAGAGAGAACAGCCACTATTGGTTT
CAGTTCAAGAAGCAACGAGCGAGTTGAGAAGATAAAAGAGGAAAATGTGGAAGCTATAGT
GAGAAAAGCTCTCAACTTTAAAGCAAGACCAAAAAGCACACAAGCTAGACCTCAATACAT
ATCAAAAGATCAAGAAAAGGAAAGAAAAGATACTCAAGAACACTCATCTAAAGCTAGGTG
TGCTCGGTCATTGGTCAATGGAGCAGCCAAGAGTAAGCTCAATATTAACAAACAGAAGGT
GGATACACAGAGGATTCTAAGTGGGATTAGACCAAATAGCAGCGACAAGACAGCAAAAAA
CATCCCAAATAGGAGTTTAGCGGTTAGGCGTTCTACGGTTGAGATTGCTTTGTGAGCCAT
TCACCGTTTCAGCTATTTCTTTGCGTTTGTGTTTCTATGCTATAATGATCATTAGTATAT
TATACCATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H017TF U 1
AF RS1H017JQB C 535
BS 1 713 RS1H017TF
BS 714 714 RS1H017JQB
BS 715 760 RS1H017TF
BS 761 1330 RS1H017JQB

RD RS1H017TF 760 0 0
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CCCAAAATACAGTTAGCAGAAAATTATATAACTCTATATGATGGCGGGCGAAATTCAAGA
ACCGCTTAACCTAAGCCTTCTGGAGAATTCTATTAACTCAGGATCCGTTTCATTTGGAAG
ATTTGAGAAGGAAGTTTTATCATGGGAGAAGAGATCATCTTTCTCTCACAATAGATATCT
AGAAGAGGCTGAGAAATTATCTAAGCCTGGCTCTGTTACTCAGATGAGAGCTCATTTCGA
GGCACATTTTAAGAAAAAAGGAATCCAACTTCTGACTTCTGTAGAACCTCAAACATGGGG
ACAAGTAGCTCAACAACATCATCAACAAACTGCTAGTGAGAAAGAAGAAATATTGTGGGA
GAGTATGAGTCAGTGTAGCTACTACAGCTATGAACTAGACAAATGTGATAGAGAAAAGAG
CCCATTCGGCGAGTCTTGTGTGAGTTATGTGTCTTATGGAGAGACTCTTCTGAATTCTGA
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GACCAGTTTGGACACTAAGAGAGGAAAGGAACTGAAGCCG

QA 1 760 1 760
DS 

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TGAGAAAACGACTAAAGCTACTACCAAGAAGCATGTTGTCAAGGGCTCTTCAAGTTGTAA
TACTAAGACCAGTTTGGACACTAAGAGAGGAAAGGAACTGAAGCCGACAAGGATTATTAA
ATCCCTTGCATCTCAAGCTTCAACATCAAAGAAAACTGAGAGCCTAACTTCTCTAGCCAC
AAGCAAGCTCAGGTCCAAGACTTGTATTGGTTCTGCTATAAAAGAGAGAACAGCCACTAT
TGGTTTCAGTTCAAGAAGCAACGAGCGAGTTGAGAAGATAAAAGAGGAAAATGTGGAAGC
TATAGTGAGAAAAGCTCTCAACTTTAAAGCAAGACCAAAAAGCACACAAGCTAGACCTCA
ATACATATCAAAAGATCAAGAAAAGGAAAGAAAAGATACTCAAGAACACTCATCTAAAGC
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AAAAAACATCCCAAATAGGAGTTTAGCGGTTAGGCGTTCTACGGTTGAGATTGCTTTGTG
AGCCATTCACCGTTTCAGCTATTTCTTTGCGTTTGTGTTTCTATGCTATAATGATCATTA
GTATATTATACCATAG

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 2

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CACACTGGATCAGAGCGGATCTTTCTCTGGGGCTACTAAGAAACGAGTTAGAGAAGATTA
AAGACATATCCTGATCTGCACAAGTTGGAAGTTATGATACTGATTACTGACACAGTGACT
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TTGTACAAAACGTGTTCGTTACTCTTCCTCTTTCTTGCTTTTATGTGAATCTCTCACACC
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BQ
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AF RS1A160TF U 1
AF RS1A160TV U 1
BS 1 737 RS1A160TF

RD RS1A160TF 737 0 0
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TTGTACAAAACGTGTTCGTTACTCTTCCTCTTTCTTGCTTTTATGTGAATCTCTCACACC
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TTTCTGGTACTGTCTCAGTCCAAGCTTGTGCCTTTTAAGCTTGGTTCTGCTTTCTGATAA
GTACCATTTTTTTTTTT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RS1A160TV 737 0 0
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CGACAACACTTCAGCTCCATCAACAAACCTTTCGCAGAAACTGCAGAGTGGTTCTTCTAG
CACACTGGATCAGAGCGGATCTTTCTCTGGGGCTACTAAGAAACGAGTTAGAGAAGATTA
AAGACATATCCTGATCTGCACAAGTTGGAAGTTATGATACTGATTACTGACACAGTGACT
TGAGCTTGAAGTTTCTTTTTGTATAGGAGACATGTTTCTCTTGGAACTAAAGTTAGGGTT
TTGTACAAAACGTGTTCGTTACTCTTCCTCTTTCTTGCTTTTATGTGAATCTCTCACACC
AGAACCAACTAATCAACTTTTAAAATGGTGATGAGATGACGTGGACAAACCATTGTCTAG
TTGGACTATTGTCGGCTGATGAGTCAGCTACTGTAATGTTGCTGACGTGGCTTTACGACC
TAATAATTTACTCTTCTCTCCAATTTTTTTTTCTGTTTCGTTTCACAAAGCTCTGTTGTG
TTTCTGGTACTGTCTCAGTCCAAGCTTGTGCCTTTTAAGCTTGGTTCTGCTTTCTGATAA
GTACCATTTTTTTTTTT

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

CO CL7257Contig1 950 2 2 U
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CGAGAACGGAGATTCCGTGAAGAATGCAGAAGCTGATTCACAAAGAACACTGTACCCGTA
TGTTACTGGGACTTCGATCGTCGCAATCAAGTACAAAGATGGGGTTTTAATGGCTTCCGA
CATGGGAGGTTCATATGGATCCACCTTAAGGTACAAGAACATTGAGAGAATGAAGGCTAT
TGGTAAGCATTCTCTTCTCGGTGCCAGTGGAGAAATCAGTGACTTTCAGGAGATTCTCCG
TTATCTTGATGAGCTCGTGTTGAACGATAGCATGTGGGACGATGGTAACTCTTTGGGACC
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TCTCTGGAACACTCTCGTCCTTGGAGGTGTCAAGAATGGCGAAACTTACCTTGGCATGGT
GTCAATGATTGGTGTCAGTTTCGAGGACAATCATGTTGCCACCGGATTTGGAAACCATCT
CGCTAGGCCAATTCTTCGTGATGAGTGGCATGCGGATCTAAGCTTTGAAGATGGTGTCAA
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ATTCTGGGAATTCAAGGCGTTCAACAATCCGACTGCTGGTGCTGAAGGCTCCTGGTAAAG
AAGCCTAATCGACCACATGCTGCCTGGAGATCTTTCAAGAAGGCTTTCTTTTTTATGCTA
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BQ
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TCTAGTGGATTTCCTAGCAACAGCTGTTGTTATTTCATGAAATTTCGGAGTTAGATCAAT
AACAATTTATGGATATTTGTCG

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TTATGAACTTTGG


BQ
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TGGAATTTACAGTATGCTTATGTAGTTTCGAGAATGAATGTGGAACATGTTTTGGATGGT
TTATGAACTTTGG

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 2

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GTGGAGATGTCGGTGCCGTACTCAAGCCGGAGAAAAGGAAGGGGAAATCTGCGGTGGTCA
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AT


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AF RS1A088TF U 1
AF RS1A088TV U 1
BS 1 782 RS1A088TF

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TCAACCAGCTCATCTACGGGATCTTTAACGTTGGACCGTTTGCGTTCGACCCGGTCTGCC
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AT

QA 1 782 1 782
DS 

RD RS1A088TV 782 0 0
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CTCCATTTTACCCGCCGACAAAAGCCCCTGTTAAGCCCCCAACCAAAGCCCCGGTTAAGC
CTCCGGTCTCCCCTCCAGCCAAGCCACCGGTCTCCCCTCCTGCTAAGCCACCGGTGAGGC
CACCGGTTTACCCACCAAAATTCAACAGAAGCCTAGTTGCCGTTCAGGGTACGGTTTTCT
GCAAAAGCTGCCAATACGCTTCTTCCGATTCACTCATTGGCGCCAAACCCGTTGAAGGTG
CTGTTGTGAGACTACTGTGTAAGAGCAAGAAGAACATAGTCGCAGAGACCAAAACGGACA
AGAACGGATACTTCTTGTTGTTGGGTCCGAAGACGGTGACGAATTACGGGTTCAGGGGAT
GTCGTGTGTATCTTGTGAAATCAAAGGACTACAAATGCAACAAAGTGTCAAAGCTTTTCG
GTGGAGATGTCGGTGCCGTACTCAAGCCGGAGAAAAGGAAGGGGAAATCTGCGGTGGTCA
TCAACCAGCTCATCTACGGGATCTTTAACGTTGGACCGTTTGCGTTCGACCCGGTCTGCC
CCAAATGAAGATGCTGATGCTCTGTTACTTTCTTGATTATGTCATTCTCGAAAGAGTTCA
AGGGAGAGAGTTATGTGTTTATGCGTTCGAATTGTAATGTTAGCTATAGTTTTAAACTAA
ATGCTTGTGTGTTTTATTTATGAGTGTGTCCTTAAGTGGCCTCGTTTGGATTTCGTTTGA
AT

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

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TTCTTTTCAGTGTTCTTCACAGCATCATTCTTGAGAACAGCCAAGACCTCATCTGCAGCA
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GCAACAACATCACGCTCCTTCTTCTTCTTAGACTTGTTAAGCTTATCCTCCAGCTCCTGA
GGTCTTCCCTTAGCAACTCTATCTCCAAAGGACTTGGGATCAATCTTCCCCCACAGAGTC
TCAGGTTCTCCGGTAGGCTCGTGTGTATCGCGAGGACGGTTCTCACTGGTTAGCACCAAG
CTAGAGTTGGCTCTGTACTCGTACTGCTTGAATCTGGCATGAGCTTCTGCGCCGCCTCCC
AAGTTCGCCATCACTGAAACTCTAAGATTCGAAATTAAACAATGTTAAAACCACAAATCG
AATCTAATCAGCGACGAGATTTAAACCTAATAACCGCCACGAAACGAAGCAGAGAGAGAG
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AGCTTCGTGTAGATTTAGGGTTTCTTCGTTCTCCGGCTGCGAATCCTTTACCTAATTGTC
GAATTAACGGAAATCAAACAATGTTAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1A135TV U 1
AF RS1A135TF U 10
BS 1 810 RS1A135TV

RD RS1A135TV 810 0 0
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TTCTTTTCAGTGTTCTTCACAGCATCATTCTTGAGAACAGCCAAGACCTCATCTGCAGCA
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GGTCTTCCCTTAGCAACTCTATCTCCAAAGGACTTGGGATCAATCTTCCCCCACAGAGTC
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AATCTAATCAGCGACGAGATTTAAACCTAATAACCGCCACGAAACGAAGCAGAGAGAGAG
AGAGAGAGAGAGAGAGAATGTACTTACGGAAACAACTCGAATCTTCTCTGCAGAGAGTGA
AGCTTCGTGTAGATTTAGGGTTTCTTCGTTCTCCGGCTGCGAATCCTTTACCTAATTGTC
GAATTAACGGAAATCAAACAATGTTAAACC

QA 1 810 1 810
DS 

RD RS1A135TF 786 0 0
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GTGTTCTTCACAGCATCATTCTTGAGAACAGCCAAGACCTCATCTGCAGCACCACTAACA
ATATTCAGAGGCAACCCACCCAGCTGCTGCTGAATCAGACTAAGCATAGCCTCGTAAGCA
GCCCTCGTCTCCTTAGTCTTGGGCTGATAAACCACATCGTCAGTATCCGTGGGCACACTC
TCTTCCCTGAGCCGACGCCTCTTGCTCTGCCGAGCAGAAACAGTATCATCCGCAACAACA
TCACGCTCCTTCTTCTTCTTAGACTTGTTAAGCTTATCCTCCAGCTCCTGAGGTCTTCCC
TTAGCAACTCTATCTCCAAAGGACTTGGGATCAATCTTCCCCCACAGAGTCTCAGGTTCT
CCGGTAGGCTCGTGTGTATCGCGAGGACGGTTCTCACTGGTTAGCACCAAGCTAGAGTTG
GCTCTGTACTCGTACTGCTTGAATCTGGCATGAGCTTCTGCGCCGCCTCCCAAGTTCGCC
ATCACTGAAACTCTAAGATTCGAAATTAAACAATGTTAAAACCACAAATCGAATCTAATC
AGCGACGAGATTTAAACCTAATAACCGCCACGAAACGAAGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGA
GAGAGAGAATGTACTTACGGAAACAACTCGAATCTTCTCTGCAGAGAGTGAAGCTTCGTG
TAGATTTAGGGTTTCTTCGTTCTCCGGCTGCGAATCCTTTACCTAATTGTCGAATTAACG
GAA
TCA

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 2

CO CL7261Contig1 1037 2 4 U
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TAAGCTTTTCTCTTTCTCTTTAGTGTCGATGTCCTTTTTATTTTTCTGCTTGTGTGTTAC
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GGAGCCTGTACCCATCAACCGATTCAGACCCAACATCTTGGTTGATGGATGTGAACCATT
TGCTGAAGACTTATGGACAGAGATCCTTATAGACAATTTCACCTTTCACGGTGTGAAATT
ATGCTCCCGTTGCAAGGTGCCGACGATAAATCAAGACACTGGAATTGGAGGTGAAGAGCC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EB89TF U 1
AF RS1EB89JQ C 253
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RD RS1EB89TF 753 0 0
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CTCTAACTGGTTTTCAACCTTTGTCGGCAAGCCTTGTCGACTCGTTCGTTTTGATTCAGC
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QA 1 753 1 753
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GATTGGTGATTCTGTTCTTGTCCTTCGAAAACTCTCCTCTCCTACTGAAGCAGCAACTTG
AAAGC

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

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ATG


BQ
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20 20 20 

AF RS1AN05JQ C 1
AF RS1AN05TF U 1
BS 1 783 RS1AN05TF

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ATG

QA 1 783 1 783
DS 

RD RS1AN05TF 783 0 0
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ATGTCGGCGGCGGCGATCAGGAAAAAGGCCACGGAGGTCGGAGCTGAGGTTGACGCGTAC
GGGATGGCGGTGATGAACAGCAAACGCCGCCGCGTTTTTGGTCAAAAGGGTGACTATGCT
GGCGGGTTACTGGAGCGGGTTGACTTGAACAAGTTGCCTTACCCGGAAAATCAGGATAAC
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ATG

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 2

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ATTCGCTAATGAGAAGGAAGACATTTGC


BQ
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AF RS1F079TF U 1
AF RS1F079JQ C 180
BS 1 652 RS1F079TF
BS 653 808 RS1F079JQ

RD RS1F079TF 652 0 0
GGGCCGCGATGAATCCAGCAAATGCGACGGCGACGGAAGCCGAAGGTGGAGGAAACGGCG
ACGAGTACGAGGTGGGGAAGATGTACGAGGTGAAGCTGACGACTGGAATCGAGTTCAAGG
GGATCGTCTTGGCTTACGACTCCGATCAACGCGTCGTCATCTTCCAAGAGGGAGCGATGC
CGGAAACTGGCAAATCGATGACTACACGGACGGTGAAAGCGAACTTCATATCCGAGGCCA
GATTCATGAGGAAGTTCGAAGATCCGCTCGCGTCGAACAAGAAGAAGCGATTCGTTGATC
TCAGTGGACTCTTAAAGAAAGAGGCAGTCGCTATTAGGAAAATCGAGAGCATTGGTGTTG
GTGTTACTGCAGAGGCGCAGAAGATCTTCGACGCTTTCTCTAAGACGCATCGTGTCAAGT
GGGATAACAAAGACATAGTGATAAATGAAGATGTGCGTATTTCTAGCCCTTACCATTCTG
ATTGTGTCACTGGAGGAGCTCGTGCTGCCAATGATCAAATGAAGAAAGTGCTGAAGACCG
TGAGAGCGAAGCTGCAACTCAGTAGTGACACATGATGCAACTGAAGGAGTTGTTCACTGA
AAAAATAGCAAAAGGGTAAAGCTGTTACTATAGTGAATAAGTGAATGTATTG

QA 1 652 1 652
DS 

RD RS1F079JQ 629 0 0
CCGGAAACTGGCAAATCGATGACTACACGGACGGTGAAAGCGAACTTCATATCCGAGGCC
AGATTCATGAGGAAGTTCGAAGATCCGCTCGCGTCGAACAAGAAGAAGCGATTCGTTGAT
CTCAGTGGACTCTTAAAGAAAGAGGCAGTCGCTATTAGGAAAATCGAGAGCATTGGTGTT
GGTGTTACTGCAGAGGCGCAGAAGATTTTCGACGCTTTCTTTAAGACGCATCGTGTCAAG
TGGGATAACAAAGACATAGTGATAAATGAAGATGTGCGTATTTCTAGCCCTTACCATTCT
GATTGTGTCACTGGAGGAGCTCGTGCTGCCAATGATCAAATGAAGAAAGTGCTGAAGACC
GTGAGAGCGAAGCTGCAACTCAGTAGTGACACATGATGCAACTGAAGGAGTTGTTCACTG
AAAAAATAGCAAAAGGGTAAAGCTGTTACTATAGTGAATAAGTGAATGTATTGCTTATAA
TGGTAGCAGAGATTTAGTGTGGGTGATGACAATAACATAGAGAGTGTTGGTGTTTTCTTG
TGTATATAGAAAATTAGAATCCTCTGGATCAGAACAAATACATGTTTAAAAGCATAGCCC
TATTCGCTAATGAGAAGGAAGACATTTGC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 2

CO CL7264Contig1 961 2 2 U
GGATCTTTACTATAAACTTCTCTATCCTCTCAAACAACCCAAAAGCTTTCTTTTATTCTC
CTCTAACTCTTAAGGAAAACCCAGAAGTTACAGAGAAGTTTGTTGAGACAATGGATGAGT
TTGTTAACCTAAAGGGAACGGAGCTGAGGCTGGGATTACCAGGAACAGACAATGTATGTG
AACAAAGAGAAAGAGTTTCTTGCAATAAGAGAGCATTACAAGTTGGTGATGAGAATGAGA
TTGAGTCGTCAACGACGAAAACAGACACATCCCCTCCTAGAAAGGCTCAGATTGTCGGAT
GGCCACCAGTTAGATCATACAGGAAGAACAACATTCAGACAAAGAAGAATGAATCTGATC
GTGAGGGTCATGGAATCTATGTGAAAGTAAGTATGGATGGTGCACCATACCTGAGGAAAA
TAGATTTGAGTTGTTACAAAGGATACTCAGACTTGCTCAAAGCTTTAGAGACCATGTTCA
AGATCTCTGTGGGAGAGTATTTTGAGAGAGATGGATATAAAGGGTCAGATTTTGTGCCTA
CTTATGAAGACAAAGATGGTGATTGGATGCTCATTGGAGATGTTCCATGGGAGATGTTTA
AATGTAATTGCAAGAGATTAAGGATCATGAAAGGTTCAGAAGCCAAGGGTTTAGGCCCTG
GTGTGTGGGACAAAAGCTTGAGGAAACCTAACAGAGACACAAGAACCTAAGAGAACATAG
TTTCTCAGGTTGTCAGGGTTCATCAGATTGAATTAAAGTCATGGCCAAATTTTTTTTACC
TCATGGGTAAATCTCATATGTAGATAATGGTCTTCAGCATCTGGAAACTGAAACCTAATT
ACTATTTTTTTTGTTACAGATACAAGGCAAAAGGTTGTCCTTAGTCTGTGGTTTTGTATT
ACATTAAAAGTTGTTATGACATTGAATAGTTCATCTAATGTTTGTGACAACATGTTTTGT
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1D278TF U 1
AF RS1D278JQ C 288
BS 1 629 RS1D278TF
BS 630 961 RS1D278JQ

RD RS1D278TF 629 0 0
GGATCTTTACTATAAACTTCTCTATCCTCTCAAACAACCCAAAAGCTTTCTTTTATTCTC
CTCTAACTCTTAAGGAAAACCCAGAAGTTACAGAGAAGTTTGTTGAGACAATGGATGAGT
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TTGAGTCGTCAACGACGAAAACAGACACATCCCCTCCTAGAAAGGCTCAGATTGTCGGAT
GGCCACCAGTTAGATCATACAGGAAGAACAACATTCAGACAAAGAAGAATGAATCTGATC
GTGAGGGTCATGGAATCTATGTGAAAGTAAGTATGGATGGTGCACCATACCTGAGGAAAA
TAGATTTGAGTTGTTACAAAGGATACTCAGACTTGCTCAAAGCTTTAGAGACCATGTTCA
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CTTATGAAGACAAAGATGGTGATTGGATGCTCATTGGAGATGTTCCATGGGAGATGTTTA
AATGTAATTGCAAGAGATTAAGGATCATG

QA 1 629 1 629
DS 

RD RS1D278JQ 674 0 0
CAGATTGTCGGATGGCCACCAGTTAGATCATACAGGAAGAACAACATTCAGACAAAGAAG
AATGAATCTGATCGTGAGGGTCATGGAATCTATGTGAAAGTAAGTATGGATGGTGCACCA
TACCTGAGGAAAATAGATTTGAGTTGTTACAAAGGATACTCAGACTTGCTCAAAGCTTTA
GAGACCATGTTCAAGATCTCTGTGGGAGAGTATTTTGAGAGAGATGGATATAAAGGGTCA
GATTTTGTGCCTACTTATGAAGACAAAGATGGTGATTGGATGCTCATTGGAGATGTTCCA
TGGGAGATGTTTAAATGTAATTGCAAGAGATTAAGGATCATGAAAGGTTCAGAAGCCAAG
GGTTTAGGCCCTGGTGTGTGGGACAAAAGCTTGAGGAAACCTAACAGAGACACAAGAACC
TAAGAGAACATAGTTTCTCAGGTTGTCAGGGTTCATCAGATTGAATTAAAGTCATGGCCA
AATTTTTTTTACCTCATGGGTAAATCTCATATGTAGATAATGGTCTTCAGCATCTGGAAA
CTGAAACCTAATTACTATTTTTTTTGTTACAGATACAAGGCAAAAGGTTGTCCTTAGTCT
GTGGTTTTGTATTACATTAAAAGTTGTTATGACATTGAATAGTTCATCTAATGTTTGTGA
CAACATGTTTTGTG

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

CO CL7265Contig1 375 2 1 U
GCACGATACACCGATGTAAGAGGCAAAGATTTCGAGCTTATACCGTTTGGATCAGGACGA
AGAATGTGTCCAGGAATCACAATGTCATTGAAGACAACACCTATGGTGCTTGCCTCTCTT
CTCCATTCCTTTGACTGGAAACTTCAAGACGGTGTCGTCCCTGGAAACATGGACATGAGT
GAAGTCTTCGGTCTTACTTTGCATAAAGCTAAATCTCTCTTTGTTGTACCCATCAAGAAA
CCTATATTATCGTCTTAGTATTCTCCATGGTATTTTATTCTTTGTAAAATAAGACTTCTT
GTGGGTCAATATTAAGAACATAGATATCAGACACTCAATCCATTCAAAAAGAATTACCAA
AGGTTAAATTTTCAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1F660JQ C 1
AF RS1F660TF U 1
BS 1 375 RS1F660TF

RD RS1F660JQ 375 0 0
GCACGATACACCGATGTAAGAGGCAAAGATTTCGAGCTTATACCGTTTGGATCAGGACGA
AGAATGTGTCCAGGAATCACAATGTCATTGAAGACAACACCTATGGTGCTTGCCTCTTTT
CTCCATTCCTTTGACTGGAAACTTCAAGACGGTGTCGTCCCTGGAAACATGGACATGAGT
GAAGTCTTCGGTCTTACTTTGCATAAAGCTAAATCTCTCTTTGTTGTACCCATCAAGAAA
CCTATATTATCGTCTTAGTATTCTCCATGGTATTTTATTCTTTGTAAAATAAGACTTCTT
GTGGGTCAATATTAAGAACATAGATATCAGACACTCAATCCATTCAAAAAGAATTACCAA
AGGTTAAATTTTCAC

QA 1 375 1 375
DS 

RD RS1F660TF 375 0 0
GCACGATACACCGATGTAAGAGGCAAAGATTTCGAGCTTATACCGTTTGGATCAGGACGA
AGAATGTGTCCAGGAATCACAATGTCATTGAAGACAACACCTATGGTGCTTGCCTCTCTT
CTCCATTCCTTTGACTGGAAACTTCAAGACGGTGTCGTCCCTGGAAACATGGACATGAGT
GAAGTCTTCGGTCTTACTTTGCATAAAGCTAAATCTCTCTTTGTTGTACCCATCAAGAAA
CCTATATTATCGTCTTAGTATTCTCCATGGTATTTTATTCTTTGTAAAATAAGACTTCTT
GTGGGTCAATATTAAGAACATAGATATCAGACACTCAATCCATTCAAAAAGAATTACCAA
AGGTTAAATTTTCAC

QA 1 375 1 375
DS 



AS 1 2

CO CL7266Contig1 807 2 1 U
CCACTACTTTGATTACTATTCAGAAGATAAAGAGAAAGACTTTGTTACATGGGCACTCAC
TGCTGGTATTCTGATCAGAGTTGCCTCCATTGTTTACCAGAGATCTCCTGAGTTTCAAGA
ACTCAAGCCAAGCTTCTGGAAACAACCTTCTTGAAAATGTATCTTTATTTAAAAAAAAAC
ATGAAACTTATCCTTGTAATAATAAAGCGAAAACAAAGTACTCTTTTAGAACACCTCGTA
GAACTTCTCTGAAACGACAATTCCTGAATCCATAGACTCAAGAGGATCTTTCCTAAGACG
GTGTCTCAAGCAATTGGGTATAACTATACCAACATCTTCTGCTGTCACGTGATCTCTTCC
TTTGAGCGCAGCCAGCGCTCTCGCAGCTCTGTTCGTCACAATGTCACCTCTCAAACCATC
AACGTCGAGCTCAGCGCAAACCCTCGAGATCTTCACTTTCAAATCTTGATCGATCTCGAC
TTCAGAGAGATTGCTTCTGGCACACGTAATCTGCTCCTGAAGCTTCATCTGCTCCTCTAG
ATAAGACTCTCGAAACTCCTTTGGGTTACTATCAAAACGAGCTCTCTCTTCAACGATCTT
TACTCTCAGCTCAGCGTCTCTAACCGTCCCTACTTGCGCGTGCATACCAAACCTATCGAG
AAGCTGCGGTCTAAGCTCTCCTTCCTCCGGATTCCCTGAACCAATGAGGATAAACCTCGC
CGGATGAGAGATGGAGATCCCTTCTCTCTCAACAGTGTTCCAACCAGACGCAGCTGAATC
AAGAAGAACATCAACCAAATGATCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1AI68TF U 37
AF RS1EX50JQ U 1
BS 1 807 RS1EX50JQ

RD RS1AI68TF 199 0 0
G
GACTTTGTTACATGGGCACTCACTGCTGGTATTCTGATCAGAGTTGCCTCCATTGTTTAC
CAGAGATCTCCTGAGTTTCAAGAACTCAAGCCAAGCTTCTGGAAACAACCTTCTTGAAAA
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GTACTCTTTTAG
CTGAAC

QA 2 193 2 193
DS 

RD RS1EX50JQ 807 0 0
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TGCTGGTATTCTGATCAGAGTTGCCTCCATTGTTTACCAGAGATCTCCTGAGTTTCAAGA
ACTCAAGCCAAGCTTCTGGAAACAACCTTCTTGAAAATGTATCTTTATTTAAAAAAAAAC
ATGAAACTTATCCTTGTAATAATAAAGCGAAAACAAAGTACTCTTTTAGAACACCTCGTA
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GTGTCTCAAGCAATTGGGTATAACTATACCAACATCTTCTGCTGTCACGTGATCTCTTCC
TTTGAGCGCAGCCAGCGCTCTCGCAGCTCTGTTCGTCACAATGTCACCTCTCAAACCATC
AACGTCGAGCTCAGCGCAAACCCTCGAGATCTTCACTTTCAAATCTTGATCGATCTCGAC
TTCAGAGAGATTGCTTCTGGCACACGTAATCTGCTCCTGAAGCTTCATCTGCTCCTCTAG
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TACTCTCAGCTCAGCGTCTCTAACCGTCCCTACTTGCGCGTGCATACCAAACCTATCGAG
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CGGATGAGAGATGGAGATCCCTTCTCTCTCAACAGTGTTCCAACCAGACGCAGCTGAATC
AAGAAGAACATCAACCAAATGATCATC

QA 1 807 1 807
DS 



AS 1 2

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GTGCTGACTGCAAAACAAAAGGTCCAAGATGGGCTAGTGTTAATTTAGGTATCTTTATCT
GTATGCAATGTTCTGGGATCCACAGGAGTCTCGGGGTACACATTTCAAAGGTTCGATCTG
CCACTCTGGACACATGGCTCCCGGAGCAGGTTGCATTTATTCAGTCAATGGGAAACGAGA
TTGCAAATAGTTACTGGGAAGCTGAGCTACCTCCAAACTATGATAGAGTTGGGATTGAGA
ACTTCATACGTGCAAAGTATGAAGAGAAGAGATGGGTTTCTAGAGGTGAAAAGGCTAGAT
CACCCCCAAGAGCAGAGCAGGAACGGCGGAGATCTATGGAGAGGACTGGGCCTGTATATG
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GAAACCAAAAGTAAATGTTGCACCCGCATCAGAGCCTCCAAAGTGGATTTGCTACTGACC
TCTTTACATGCTATCAATGGATGAGCACTACAATACTCAGAGCAGCTCTGCTGATGACAC
TCA


BQ
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10 10 10 

AF RS1E111TF U 1
AF RS1AS92TF U 16
BS 1 214 RS1E111TF
BS 215 215 RS1AS92TF
BS 216 613 RS1E111TF
BS 614 783 RS1AS92TF

RD RS1E111TF 613 0 0
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TTAATGCCCGCCATAGGAAGATTCTTGAAGGGCTTCTTAAACATCCTGAGAACAGAGAAT
GTGCTGACTGCAAAACAAAAGGTCCAAGATGGGCTAGTGTTAATTTAGGTATCTTTATCT
GTATGCAATGTTCTGGGATCCACAGGAGTCTCGGTGTACACATTTCAAAGGTTCGATCTG
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TTGCAAATAGTTACTGGGAAGCTGAGCTACCTCCAAACTATGATAGAGTTGGGATTGAGA
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CACCCCCAAGAGCAGAGCAGGAACGGCGGAGATCTATGGAGAGGACTGGGCCTGTATATG
AGCATGGGCACACTAGTAGTCCTGTAAATTTATTTGAGGAAAAGAAAACTGTCCAAGCAC
CCAGAACAAGAAATAGTGTTTCCGCAACGAGGATAAGTCTTCCCGTGCCTCCACAAGGAC
CTGGTCAGGTTAT

QA 1 613 1 613
DS 

RD RS1AS92TF 768 0 0
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CCAAAGGTCCAAGATGGGCTAGTGTTAATTTAGGTATCTTTATCTGTATGCAATGTTCTG
GGATCCACAGGAGTCTCGGGGTACACATTTCAAAGGTTCGATCTGCCACTCTGGACACAT
GGCTCCCGGAGCAGGTTGCATTTATTCAGTCAATGGGAAACGAGATTGCAAATAGTTACT
GGGAAGCTGAGCTACCTCCAAACTATGATAGAGTTGGGATTGAGAACTTCATACGTGCAA
AGTATGAAGAGAAGAGATGGGTTTCTAGAGGTGAAAAGGCTAGATCACCCCCAAGAGCAG
AGCAGGAACGGCGGAGATCTATGGAGAGGACTGGGCCTGTATATGAGCATGGGCACACTA
GTAGTCCTGTAAATTTATTTGAGGAAAAGAAAACTGTCCAAGCACCCAGAACAAGAAATA
GTGTTTCCGCAACGAGGATAATTCTTCCCGTGCCTCCACAAGGACCTGGTCAGGTTATAA
AGCCACAGCAGACACAGAATCTGTAGCCGCTCCTGTCGAGATGACGAAACCAAAAGTAAA
TGTTGCACCCGCATCAGAGCCTCCAAAGTGGATTTGCTACTGACCTCTTTACATGCTATC
AATGGATGAGCACTACAATACTCAGAGCAGCTCTGCTGATGACACTCA

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

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CGTATTACAGAGGTGCTGTTGGAGCTCTTCTTGTTTACGACATCAGCAGAGTGCAGACTT
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GGAAGGCGTTGGCCGAAGCGCAGGGGCTCTTCTTTATGGAGACGTCAGCGTTGGACTCGT
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AAGTGATAAGCTCACAGGAGCTAAACAAGCAAGATCCTGCCTCGCTTAGCAATGGCAAGA
AAGTTGTGATTCCATCCGAGGGTGAGTCCAAGAAAGGTGGGTGTTGCTCTAGGTGATAGA
CGCTGATATTTGTAGAAAGCTTAAAAAAGGGAATCTGTTTGAATTGTTTCTCTGTCCATG
CTGCCTGCCTGCCATGAATGTTGAAAATTTGAGCTGTGTCTTGTGGTGTGGAAGTGTTTA
GGTGTAGCAAGAAATCTGTAAATTTTCAACTGCAGAAGCTTTATGAAAAAAACTCAAAAC
TCCTATCTATAAAGTTTTCCACTTTCTTGTTGTC


BQ
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AF RS1DG04JQ C 1
AF RS1DG04TF U 1
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RD RS1DG04JQ 694 0 0
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AAGTTGTGATTCCATCCGAGGGTGAGTCCAAGAAAGGTGGGTGTTGCTCTAGGTGATAGA
CGCTGATATTTGTAGAAAGCTTAAAAAAGGGAATCTGTTTGAATTGTTTCTCTGTCCATG
CTGCCTGCCTGCCATGAATGTTGAAAATTTGAGCTGTGTCTTGTGGTGTGGAAGTGTTTA
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TCCTATCTATAAAGTTTTCCACTTTCTTGTTGTC

QA 1 694 1 694
DS 

RD RS1DG04TF 693 0 0
GGATCAAAGCGCAGATATGGGACACGGCGGGACAAGAACGTTTCAGAGCAGTCACTTCTG
CGTATTACAGAGGTGCTGTTGGAGCTCTTCTTGTTTACGACATCAGCAGAGTGCAGACTT
TTCAAAGCATTGGTAGATGGCTCAACGAGCTCCACACGCACTCTGATATGAACGTTGTGA
CGATCCTGGTGGGGAACAAGTCGGATCTGAAGGACATAAGAGAAGTACCAACATCGGAAG
GGAAGGCGTTGGCCGAAGCGCAGGGGCTCTTCTTTATGGAGACGTCAGCGTTGGACTCGT
CTAACGTGGCAGCTGCGTTCGAGACGGTTGTGAAGGAGATATACAACATACTGAGCAGGA
AAGTGATAAGCTCACAGGAGCTAAACAAGCAAGATCCTGCCTCGCTTAGCAATGGCAAGA
AAGTTGTGATTCCATCCGAGGGTGAGTCCAAGAAAGGTGGGTGTTGCTCTAGGTGATAGA
CGCTGATATTTGTAGAAAGCTTAAAAAAGGGAATCTGTTTGAATTGTTTCTCTGTCCATG
CTGCCTGCCTGCCATGAATGTTGAAAATTTGAGCTGTGTCTTGTGGTGTGGAAGTGTTTA
G*TGTAGCAAGAAATCTGTAAATTTTCAACTGCAGAAGCTTTATGAAAAAA*CTCAAAAC
TCCTATCTATAAAGTTTTCCACTTTCTTGTTGT

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

CO CL7269Contig1 1008 2 2 U
GGAACGTCTAAACCAATGGACTACACTCCTGAACCAACTCAAATCTTGGATCATGATGTC
ACTATTGAGGAAATTGAAGAGTACTTCACTAACTACATTGTGAATGATAGTCTTGGAATC
ATCGCAAATGCTCATACGGCATTTGCTGATAAGGAACCACTCAAAGCTTTCAGTGATCCA
TGCATTGAGCTTGCAAAGTTCTCTATCGCTGTTGATTTCCCAAAAACCGGTGTTGCAGCC
GAGATACCCCAGCATCTCTATGTGAAAGAGTATCCAGATTTCATGGAGAAGCCAGATAAA
CCAACGTACGAGTCGAAAAACGTGATTGGTAAGCTTTTCAGAGAGGTGAAAGAGCGTGCT
CCACCGTTGATCTCGATCAAATCGTTTACTCTCGATGTTGCCGCCAAGTCTTATGATAAA
GACATGGAAGTCAACGGATTTGAGGAGTATGTTGATGAAGCTTTCTTCCACAAGGGAAAC
TACGATTACAAATTAGGCAATTTGATGGACTACTATGGGATTAAGACAGAGGCTGAGATA
CTTAGTGGTGGCATCATGGATGTCCAAGTCTTTCACCAAGCGACGGGACGCGGAATCTAT
TGGAAGGGCGGTTAGGTCACTTAGGAAGGAAGCTTTGTCATGGTTCAATGCTTCTGAAGA
AGATGAAGAGGTGGTTGATGAATCTGCAAAGGCCTCGGCATGGTATCACGTGACTTACCA
CCCAAGTTACTGGGGAGTTTATAATGAAGGTTTGAACCGCGACCATTTCTTGAGCTTTGC
GTGGTGCGTTTATGATAAGCTTGTGAGGATTAAGAAGGCGAATGTTGGGAGGCGTCAGCG
GCAGGAGACTCTTGAGCGGTTGGGCCTCATGCGTTTGAGTTGATTTTTAGCTTGATTTTT
ATGAACTTTTTTTTTCCTTTGGTTGTGAGTTTCTATGTACAAAATGTTAGGTGTGGAGTG
CTCTTTGTACTAAATGTTTGGTTTGTAATAATAAATCAGTAGTTTCGT


BQ
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AF RS1BT61TF U 1
AF RS1BT61JQ C 373
BS 1 692 RS1BT61TF
BS 693 1008 RS1BT61JQ

RD RS1BT61TF 692 0 0
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TGCATTGAGCTTGCAAAGTTCTCTATCGCTGTTGATTTCCCAAAAACCGGTGTTGCAGCC
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CCACCGTTGATCTCGATCAAATCGTTTACTCTCGATGTTGCCGCCAAGTCTTATGATAAA
GACATGGAAGTCAACGGATTTGAGGAGTATGTTGATGAAGCTTTCTTCCACAAGGGAAAC
TACGATTACAAATTAGGCAATTTGATGGACTACTATGGGATTAAGACAGAGGCTGAGATA
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AGATGAAGAGGTGGTTGATGAATCTGCAAAGG

QA 1 692 1 692
DS 

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ATCATGGATGTCCAAGTCTTTCACCAAGGGACGGGACGCGGAATTTATTGGAAGGGCGGT
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GGTTGATGAATCTGCAAAGGCCTCGGCATGGTATCACGTGACTTACCACCCAAGTTACTG
GGGAGTTTATAATGAAGGTTTGAACCGCGACCATTTCTTGAGCTTTGCGTGGTGCGTTTA
TGATAAGCTTGTGAGGATTAAGAAGGCGAATGTTGGGAGGCGTCAGCGGCAGGAGACTCT
TGAGCGGTTGGGCCTCATGCGTTTGAGTTGATTTTTAGCTTGATTTTTATGAACTTTTTT
TTTCCTTTGGTTGTGAGTTTCTATGTACAAAATGTTAGGTGTGGAGTGCTCTTTGTACTA
AATGTTTGGTTTGTAATAATAAATCAGTAGTTTCGT

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

CO CL7270Contig1 779 2 1 U
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TGGTAAAGTTGAGATCATGGCTTATGGCGTTGATGATGGTCATGACTTCAAGGAGGAAGC
TAAGTTCACTTCCTTTCCAGCAGGAGCTGACACTGATCGGCACACCAAGATGCTCGAAGA
CATTCGTGTCTGGTCATCTAATAGTCCCAGTCCATCAAACCTGTTCCTTATCATGGGAGA
CTCCGCAGTTGATTTCAAACCCGTTATTGAATTTCTGGTGAGCTCGAGACATTACAAGAT
TCACTATGTCAAACCATAGTTTCCTGAAGTCCCATAACGAATTCAGGAAAGAGAATCTAC
TACTAGTCTATCTATCTATACTATTACTAGGTGCGTATCCCCTGCGCTTGCGCGGGGTCG
TTGAAGGAATTGTTGCTTTATATAAATATTTTGGAGATGTGTTGTTAAGTGGTCTCTCGC
ATGTGAAAATTTATTGGATTTATGGTGAGGTAAGCTGCTGCGCTAGCATGTTTTGGGGAG
AAAAAGCTGTAACAGAGAGAAACCATGCAACTCCGAAGTCAATGCTTCAAGCAAAAAAAA
AAAACTCCAAAGTCAATGTATCATGACAAACAGTTCTATGTAGAGTGGGAAAGAGAGAAT
GATTCAACCGTGACAAAGCACATTAAGTTTAATGTGATAATAAATATTTTCATAGATGGA
GTTTAGTGGGATTCAATATGTACTCTCTGATATACACTTCTCCGCAGATATTGTTATAA


BQ
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AF RS1AI89JQ C 1
AF RS1AI89TF U 1
BS 1 779 RS1AI89TF

RD RS1AI89JQ 779 0 0
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TCACTATGTCAAACCATAGTTTCCTGAAGTCCCATAACGAATTCAGGAAAGAGAATCTAC
TACTAGTCTATCTATCTATACTATTACTAGGTGCGTATCCCCTGCGCTTGCGCGGGGTCG
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AAAACTCCAAAGTCAATGTATCATGACAAACAGTTCTATGTAGAGTGGGAAAGAGAGAAT
GATTCAACCGTGACAAAGCACATTAAGTTTAATGTGATAATAAATATTTTCATAGATGGA
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QA 1 779 1 779
DS 

RD RS1AI89TF 779 0 0
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TGGTAAAGTTGAGATCATGGCTTATGGCGTTGATGATGGTCATGACTTCAAGGAGGAAGC
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CATTCGTGTCTGGTCATCTAATAGTCCCAGTCCATCAAACCTGTTCCTTATCATGGGAGA
CTCCGCAGTTGATTTCAAACCCGTTATTGAATTTCTGGTGAGCTCGAGACATTACAAGAT
TCACTATGTCAAACCATAGTTTCCTGAAGTCCCATAACGAATTCAGGAAAGAGAATCTAC
TACTAGTCTATCTATCTATACTATTACTAGGTGCGTATCCCCTGCGCTTGCGCGGGGTCG
TTGAAGGAATTGTTGCTTTATATAAATATTTTGGAGATGTGTTGTTAAGTGGTCTCTCGC
ATGTGAAAATTTATTGGATTTATGGTGAGGTAAGCTGCTGCGCTAGCATGTTTTGGGGAG
AAAAAGCTGTAACAGAGAGAAACCATGCAACTCCGAAGTCAATGCTTCAAGCAAAAAAAA
AAAACTCCAAAGTCAATGTATCATGACAAACAGTTCTATGTAGAGTGGGAAAGAGAGAAT
GATTCAACCGTGACAAAGCACATTAAGTTTAATGTGATAATAAATATTTTCATAGATGGA
GTTTAGTGGGATTCAATATGTACTCTCTGATATACACTTCTCCGCAGATATTGTTATAA

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
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AF RS1BC78TF U 1
AF RS1BC78JQ C 80
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AAAAGATACTGTTTCTGGACCTTACTGCTGATCCATACCTTTTCAAAGGACCAAAAGGAG
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AGTCATTCGAGCGGTCTTCGAAAGATGAAAGAGA
TTG

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1BC78JQ 819 0 0
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QA 15 819 15 819
DS 



AS 1 2

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ATAAAGTTGTGAGTAACGGAGATCGACTCTCGATGATCGCCGGTGAC


BQ
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AF RS1CS71TF C 1
AF RS1CS71JQ U 6
BS 1 5 RS1CS71TF
BS 6 647 RS1CS71JQ

RD RS1CS71TF 647 0 0
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AAAGCTTTACAAAGGAAGGAG*AGAGAAAGAACACAACTTTCATAAATAACGTCATCTTC
TTCACACTTCAACTCTCTCCTCTCCCTCTCTTTCTCCAATGCGAATCCAATTAGTAAAAA
TCACAAACAACACAAAGTTATCTGTTACCAATCATCATCATCCAGGCTAGCCCTGTGAAA
ACACATGACGGTGCATATGAATATGAAGAACGATGTGAACTCTATCAGCATCGCACCCGT
CTCGATCATTCCAGCATGCCTTAATATGATCGGAATCGCCAGGCTGCCCACTGTTGATGC
TCCTGTCAAGAACTTCGCTGCATCTATCCACCCTCCACCATCTCGACTAATTAGGAATTG
GGTTGAGCCTCCTCCAAAGAACATGCATGGCATAGGCACAACCAAATACATGAGTGCTGA
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TGAAAACATGAAGGCAAGTCCAGCAAGTACTTCGATAGTCATCGCCATGTCGGCGACTGA
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AACAACACAAAGTTATCTGTTACCAATCATCATCATCCAGGCTAGCCCTGTGAAAACACA
TGACGGTGCATATGAATATGAAGAACGATGTGAACTCTATCAGCATCGCACCCGTCTCGA
TCATTCCAGCATGCCTTAATATGATCGGAATCGCCAGGCTGCCCACTGTTGATGCTCCTG
TCAAGAACTTCGCTGCATCTATCCACCCTCCACCATCTCGACTAATTAGGAATTGGGTTG
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TTGGCCACCAGTTACTATATATCGCACACGCCAGAATCTGTAGGAGGATACTGGATGAAA
ACATGAAGGCAAGTCCAGCAAGTACTTCGATAGTCATCGCCATGTCGGCGACTGAATAAA
GTTGTGAGTAACGGAGATCGACTCTCGATGATCGCCGGTGAC

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 2

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CTGTCCTGAGAAACGACCAAACTCCTTGTCCCATTTTCAGGAGTGCAATCGCTGAACTAG
GGAGACTATTGATGTATGAAGCATCTCGAGAGTGGCTGCCAGCTGTTGTTGGAGAAATCA
TGTCTCCAATGGGTGCTGCTGCTTCTGTTGAATTCATTGATCCTAGAGAGCCTATAGCGG
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ACCTCAACAAGTTGCCTGATGATTTTCCCGACAACTCGAGAGTGTTTTTGTTGGATCCAA
TGCTTGCTACAGGCGGTACCATAATTGCGGCGATGGATCTGTTGAAAGAACGTGGTTTGT
CTGTTCAGCAAATCAAAGTTATTTGTGCGGTTGCTGCACCTCCTGCACTATCTAAGCTTA
ACGAGAAGTATCCCGGGCTTCATGTGTATACTGGAATTATTGATCCTGAAGTCAATGAAA
AGGGGTTCATAATCCCTGGGCTTGGAGACGCTGGAGACCGCAGTTTTGGGACATGAAAAA
CAAGTCTTGAGGTTTTGGTTAAGCGTTTGATGAAGTGATTCTTGTGTTTGGGGAAAGGTC
TATGATGTAAGAGAGATCACATTGGAGAATATGAGTTCCTGATTATTAGGAAACAAAAGA
AGAAACTTGTAAACACCAGTTTTTGCTTCGTCCAGATTTGTATGTGTATCATTGTCATCT
GCTAGTGAAACAACTTTGTCAACAAAACTACTTTTTGAAAGAAAACAAAATTGTACGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DB09TF U 1
AF RS1DB09JQ C 246
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BS 733 1079 RS1DB09JQ

RD RS1DB09TF 732 0 0
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CTGTTCAGCAAATCAAAGTTATTTGTGCGGTTGCTGCACCTCCTGCACTATCTAAGCTTA
ACGAGAAGTATC

QA 1 732 1 732
DS 

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CTATTGATGTATGAAGCATCTCGAGAGTGGCTGCCAGCTGTTGTTGGAGAAATCATGTCT
CCAATGGGTGCTGCTGCTTCTGTTGAATTCATTGATCCTAGAGAGCCTATAGCGGTTGTT
CCAATTTTAAGAGCTGGTCTTGCTCTTGCAGAACACGCATCAACAGTTTTGCCTGCAAAT
AAAATATATCACTTAGGAATAAGTCGGGACGAGGAAACACTTTTGCCTTCGGTGTACCTC
AACAAGTTGCCTGATGATTTTCCCGACAACTCGAGAGTGTTTTTGTTGGATCCAATGCTT
GCTACAGGCGGTACCATAATTGCGGCGATGGATCTGTTGAAGGAACGTGGTTTGTCTGTT
CAGCAAATCAAAGTTATTTGTGCGGTTGCTGCACCTCCTGCACTATCTAAGCTTAACGAG
AAGTATCCCGGGCTTCATGTGTATACTGGAATTATTGATCCTGAAGTCAATGAAAAGGGG
TTCATAATCCCTGGGCTTGGAGACGCTGGAGACCGCAGTTTTGGGACATGAAAAACAAGT
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AS 0 0

AS 1 2

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CTCGGACTAGACCATCATTGGCCCGCCATCCCGCGGTTTGCGAAATCACCTAACGATTGG
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TCTAATGACACCGATACCGTCCTCAATGGATATTACCGCTCTCATGCTGATGAAGACACC
GCTGAACAATTCTTCATGCGATACGACGTTGAGCCTTTCGACATCATAAAAGATAACTAC
TACTCACAGGCTTTTGATACAGTGACTGAATGGTTTCGACCATCTGCTCCTATTCACCCT
GTCCATTTTACTGACGTAAGATGGTACCCCTGGAAGATATCTACTAGTGCTGAACGCCCG
TTCACGCACGACCCTTTACTCAAGAAAAAGGTGCAATTATCCAAGCAACTAGGCCTTCTC
GACAATGCTCGAATGTCCTTTCACAACTGCTACAATGATATATTTACCTATTGCCGTCAC
TACATTCACGAAGTGAAAGACGCGCGACCCGTAACCCTGCACCATATTGACTTACATGTG
AAACCTGCTCTGGTTCGCTCTGGCGAACCTCCAAAGATCAGAACCGTGTTCGGAGTCCCC
AAATCCTTAATCTTCGCTGAAGCTATGTTCTTCTGGCCTTTATTTAGTGATTATTTTACT
AACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGGAGATAAAATTCAACTTCACTTTTG
GCGCAAAATCCCAGATATTTTGTTCGCCAGGGACGGTGAGTTGGCAAAACTCACAAGTTT
CTCTGAATCCATCTTCTTTCCCAGAAACTTCTCGCGAATTCTGATACCGATTGTTTGATT
CCTTATTCGATTTGTACGCAGCCTAGGCTTTCCTTTTCATCGATTATCTCTTCAGTTTCC
TGGAAAAGTCCGAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FA61TF U 1
AF RS1E230TF U 239
BS 1 626 RS1FA61TF
BS 627 974 RS1E230TF

RD RS1FA61TF 631 0 0
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CTCGGACTAGACCATCATTGGCCCGCCATCCCGCGGTTTGCGAAATCACCTAACGATTGG
TACTTCGCCTGCCAACAACTCGTCCGTTCATCGATCTGCCTCTACTCCAGTCTACTCGGC
TCTAATGACACCGATACCGTCCTCAATGGATATTACCGCTCTCATGCTGATGAAGACACC
GCTGAACAATTCTTCATGCGATACGACGTTGAGCCTTTCGACATCATAAAAGATAACTAC
TACTCACAGGCTTTTGATACAGTGACTGAATGGTTTCGACCATCTGCTCCTATTCACCCT
GTCCATTTTACTGACGTAAGATGGTACCCCTGGAAGATATCTACTAGTGCTGAACGCCCG
TTCACGCACGACCCTTTACTCAAGAAAAAGGTGCAATTATCCAAGCAACTAGGCCTTCTC
GACAATGCTCGAATGTCCTTTCACAACTGCTACAATGATATATTTACCTATTGCCGTCAC
TACATTCACGAAGTGAAAGACGCGCGACCCGTAACCCTGCACCATATTGACTTACATGTG
AAACCTGCTCTGGTTCGCTCTGGCGA
CCTCC

QA 1 626 1 626
DS 

RD RS1E230TF 736 0 0
G
CGCTGAACAATTCTTCATGCGATACGACGTTGAGCCTTTCGACATCATAAAAGATAACTA
CTACTCACAGGCTTTTGATACAGTGACTGAATGGTTTCGACCATCTGCTCCTATTCACCC
TGTCCATTTTACTGACGTAAGATGGTACCCCTGGAAGATATCTACTAGTGCTGAACGCCC
GTTCACGCACGACCCTTTACTCAAGAAAAAGGTGCAATTATCCAAGCAACTAGGCCTTCT
CGACAATGCTCGAATGTCCTTTCACAACTGCTACAATGATATATTTACCTATTGCCGTCA
CTACATTCACGAAGTGAAAGACGCGCGACCCGTAACCCTGCACCATATTGACTTACATGT
GAAACCTGCTCTGGTTCGCTCTGGCGAACCTCCAAAGATCAGAACCGTGTTCGGAGTCCC
CAAATCCTTAATCTTCGCTGAAGCTATGTTCTTCTGGCCTTTATTTAGTGATTATTTTAC
TAACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGGAGATAAAATTCAACTTCACTTTT
GGCGCAAAATCCCAGATATTTTGTTCGCCAGGGACGGTGAGTTGGCAAAACTCACAAGTT
TCTCTGAATCCATCTTCTTTCCCAGAAACTTCTCGCGAATTCTGATACCGATTGTTTGAT
TCCTTATTCGATTTGTACGCAGCCTAGGCTTTCCTTTTCATCGATTATCTCTTCAGTTTC
CTGGAAAAGTCCGAT

QA 2 736 2 736
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7277Contig1 799 2 1 U
ATTACGGCCGGGGGCCTTTATACAGAAAGCGACACCCTGGTGTATCTAAGACTCCATCGC
GTCTCCTTGGGCGAGTTAAACTCTGTCTCTTTGCCTTCTCTCAAGACCATGCGGTTAGAA
CACAACGTCTACGCGGGCGACGCGAGTCTGGAGTCGCTCATCTCGTCTTGTTCTCTTCTC
GAGGATTTGAGCATTGTTAGAATGGTTCCGGATAACGTGAAGGTTGTGCTTGTGAGGTCT
CAGTCGTTGACAAGCTTTCATGTAGACTATCTGCTTGGTGAAGGTGATGACTTTTTTGGT
GACTTGGTGAGAGAAGGCTCGGGGGTTTTCATCGATGCGCCTAGGCTCAAGTACTTGAAG
TTCGATGATGATTTTTCGGACAGTAAAGTCATCGCCAATCCAGTGTCATTAGAGAAAGTC
AACCTTGCTTTCGTCTTTGGTGAGCATGATTTTACCGACGTGGTAGAGTTACCAAAGCGA
AACATGTTCCGTGGTTTCTTTAAGAGCATTTCGGGAGTTAAGGCGATGAAGATCTCTGCG
TATACTATGGAGTTTCTTGATAACAACAGGGAGTACGAGACATACGACCCGTTGCCTCAG
TTCTGCAATGTTTCCACTTTAAAAGTGGCGTTTTACGTGGTGAATCTTGATATGATGCCA
ACCCTTCTTGAGAGCTTCCCAAATCTTAAATCACTCGTCTTAACGCTGGATTTTTATGAT
CCTAGTTTGGAGGACGAGGCTGATGTGAGACACTTAGCTGTACCTACGTGTCTGCTGTCA
TCGTTAGAGTCTGTAAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1A368TV U 1
AF RS1A368TF U 16
BS 1 799 RS1A368TV

RD RS1A368TV 799 0 0
ATTACGGCCGGGGGCCTTTATACAGAAAGCGACACCCTGGTGTATCTAAGACTCCATCGC
GTCTCCTTGGGCGAGTTAAACTCTGTCTCTTTGCCTTCTCTCAAGACCATGCGGTTAGAA
CACAACGTCTACGCGGGCGACGCGAGTCTGGAGTCGCTCATCTCGTCTTGTTCTCTTCTC
GAGGATTTGAGCATTGTTAGAATGGTTCCGGATAACGTGAAGGTTGTGCTTGTGAGGTCT
CAGTCGTTGACAAGCTTTCATGTAGACTATCTGCTTGGTGAAGGTGATGACTTTTTTGGT
GACTTGGTGAGAGAAGGCTCGGGGGTTTTCATCGATGCGCCTAGGCTCAAGTACTTGAAG
TTCGATGATGATTTTTCGGACAGTAAAGTCATCGCCAATCCAGTGTCATTAGAGAAAGTC
AACCTTGCTTTCGTCTTTGGTGAGCATGATTTTACCGACGTGGTAGAGTTACCAAAGCGA
AACATGTTCCGTGGTTTCTTTAAGAGCATTTCGGGAGTTAAGGCGATGAAGATCTCTGCG
TATACTATGGAGTTTCTTGATAACAACAGGGAGTACGAGACATACGACCCGTTGCCTCAG
TTCTGCAATGTTTCCACTTTAAAAGTGGCGTTTTACGTGGTGAATCTTGATATGATGCCA
ACCCTTCTTGAGAGCTTCCCAAATCTTAAATCACTCGTCTTAACGCTGGATTTTTATGAT
CCTAGTTTGGAGGACGAGGCTGATGTGAGACACTTAGCTGTACCTACGTGTCTGCTGTCA
TCGTTAGAGTCTGTAAAGA

QA 1 799 1 799
DS 

RD RS1A368TF 783 0 0
CTTTATACAGAATGCGACACCCTGGTGTATCTAAGACTCCATCGCGTCTCCTTGGGCGAG
TTAAACTCTGTCTCTTTGCCTTCTCTCAAGACCATGCGGTTAGAACACAACGTCTACGCG
GGCGACGCGAGTCTGGAGTCGCTCATCTCGTCTTGTTCTCTTCTCGAGGATTTGAGCATT
GTTAGAATGGTTCCGGATAACGTGAAGGTTGTGCTTGTGAGGTCTCAGTCGTTGACAAGC
TTTCATGTAGACTATCTGCTTGGTGAAGGTGATGACTTTTTTGGTGACTTGGTGAGAGAA
GGCTCGGGGGTTTTCATCGATGCGCCTAGGCTCAAGTACTTGAAGTTCGATGATGATTTT
TCGGACAGTAAAGTCATCGCCAATCCAGTGTCATTAGAGAAAGTCAACCTTGCTTTCGTC
TTTGGTGAGCATGATTTTACCGACGTGGTAGAGTTACCAAAGCGAAACATGTTCCGTGGT
TTCTTTAAGAGCATTTCGGGAGTTAAGGCGATGAAGATCTCTGCGTATACTATGGAGTTT
CTTGATAACAACAGGGAGTACGAGACATACGACCCGTTGCCTCAGTTCTGCAATGTTTCC
ACTTTAAAAGTGGCGTTTTACGTGGTGAATCTTGATATGATGCCAACCCTTCTTGAGAGC
TTCCCAAATCTTAAATCACTCGTCTTAACGCTGGATTTTTATGATCCTAGTTTGGAGGAC
GAGGCTGATGTGAGACACTTAGCTGTACCTACGTGTCTGCTGTCATCGTTAGAGTCTGTA
AAG

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 2

CO CL7278Contig1 1147 2 2 U
GGCCGAAGAAGAAAATCAGAATCGGCAGTCCTGCTACTCAGTGGATTTCAGTCTATAATG
CGCGTCGTCCTATGAAACAGAGATATCATTACAATGTTGGAGAAACAAGGGTGCAGAAGC
ATGTAGAGAAAGGTAACGAGGATGGCCTTTTCATAAGCTGTGTAGCATCAGCAGCTAATC
TCTGGGCCCTCATCATGGATGCTGGGACTGGTTTTAGCTCTCAAGTTTATGAATTGTCCA
CAGTCTTCTTGCACAAGGACTGGATCATGGAACAATGGGAAAAGAACTTCTATGTCAGTT
CCATAGCTGGTGCTAATAACGGTAGCTCATTGGTTGTTATGTCGAAAGGAACTCCTTATA
CCCAGCAATCTTACAAAGTCAGCGACTCATTCCCATTCAAATGGATAAACAAAAAGTGGA
AAGAAGGGTTTCATGTAACCTCCATGACCACTGCTGGGAGTCGTTGGGGTGTAGTAATGT
CCAGAAACTCTGGCTATTCTGAACAGGTGGTGGAGCTTGATTTTTTGTACCCAAGTGAAG
GAATTCACCGAAGGTGGGAGAGTGGATTCAGGATAACATCAATGGCTGCAACAGCAGATC
AAGCAGCTCTCATATTGAGTATACCCAAACGAAAGATAACCGATGAAACCCAAGAGACTC
TCAGAACTTCTGCTTTCCCAAGCACCCATGTTAAGGAAAAATGGACGAAAAATCTGTACC
TTGCATCAATATGCTATGGTCGGACCGTTTGCTGAATAAAAACAGAGTGAGTGTACTGTC
TCAACCTCTCGCTCTAGGTTTCAGGGATGATTTTCTTATTACATACGAGGAGTGTCATCC
TCCTATAATCTTTCACTACAAAAGTAAGGGCCGCGACGCATGAAGCGCCAAGAATGGTAG
AGGAGTCTTGTACATATTTGGCCCACGAATCTTCTTCAGAGAATAATGAAGTTGCAAGAA
TAGGGATCTGAGCAGAGCAGATGGGATGTTGGGATCACGAAGATTGTGTGTGTGTCGTGA
GGGTGTATTGACTTAGAGTGAAGGTTATTAGTTGTTTGATCATTAGGTTCATGTGGGGGC
GAGAGAGAGAGAGAGAGTCCCTTATTACTCACTGTGTAACCGTTATCATTCAGTAATACA
AATATAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CB78TF U 1
AF RS1CB78JQ C 367
BS 1 671 RS1CB78TF
BS 672 1147 RS1CB78JQ

RD RS1CB78TF 671 0 0
GGCCGAAGAAGAAAATCAGAATCGGCAGTCCTGCTACTCAGTGGATTTCAGTCTATAATG
CGCGTCGTCCTATGAAACAGAGATATCATTACAATGTTGGAGAAACAAGGGTGCAGAAGC
ATGTAGAGAAAGGTAACGAGGATGGCCTTTTCATAAGCTGTGTAGCATCAGCAGCTAATC
TCTGGGCCCTCATCATGGATGCTGGGACTGGTTTTAGCTCTCAAGTTTATGAATTGTCCA
CAGTCTTCTTGCACAAGGACTGGATCATGGAACAATGGGAAAAGAACTTCTATGTCAGTT
CCATAGCTGGTGCTAATAACGGTAGCTCATTGGTTGTTATGTCGAAAGGAACTCCTTATA
CCCAGCAATCTTACAAAGTCAGCGACTCATTCCCATTCAAATGGATAAACAAAAAGTGGA
AAGAAGGGTTTCATGTAACCTCCATGACCACTGCTGGGAGTCGTTGGGGTGTAGTAATGT
CCAGAAACTCTGGCTATTCTGAACAGGTGGTGGAGCTTGATTTTTTGTACCCAAGTGAAG
GAATTCACCGAAGGTGGGAGAGTGGATTCAGGATAACATCAATGGCTGCAACAGCAGATC
AAGCAGCTCTCATATTGAGTATACCCAAACGAAAGATAACCGATGAAACCCAAGAGACTC
TCAGAACTTCT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1CB78JQ 781 0 0
CAATC
TACAAAGTCAGCGACTCATTCCCATTCAAATGGATAAACAAAAAGTGGAAAGAAGGGTTT
CATGTAACCTCCATGACCACTGCTGGGAGTCGTTGGGGTGTAGTAATGTCCAGAAACTCT
GGCTATTCTGAACAGGTGGTGGAGCTTGATTTTTTGTACCCAAGTGAAGGAATTCACCGA
AGGTGGGAGAGTGGATTCAGGATAACATCAATGGCTGCAACAGCAGATCAAGCAGCTCTC
ATATTGAGTATACCCAAACGAAAGATAACCGATGAAACCCAAGAGACTCTCAGAACTTCT
GCTTTCCCAAGCACCCATGTTAAGGAAAAATGGACGAAAAATCTGTACCTTGCATCAATA
TGCTATGGTCGGACCGTTTGCTGAATAAAAACAGAGTGAGTGTACTGTCTCAACCTCTCG
CTCTAGGTTTCAGGGATGATTTTCTTATTACATACGAGGAGTGTCATCCTCCTATAATCT
TTCACTACAAAAGTAAGGGCCGCGACGCATGAAGCGCCAAGAATGGTAGAGGAGTCTTGT
ACATATTTGGCCCACGAATCTTCTTCAGAGAATAATGAAGTTGCAAGAATAGGGATCTGA
GCAGAGCAGATGGGATGTTGGGATCACGAAGATTGTGTGTGTGTCGTGAGGGTGTATTGA
CTTAGAGTGAAGGTTATTAGTTGTTTGATCATTAGGTTCATGTGGGGGCGAGAGAGAGAG
AGAGAGTCCCTTATTACTCACTGTGTAACCGTTATCATTCAGTAATACAAATATAA

QA 6 781 6 781
DS 



AS 1 2

CO CL7279Contig1 812 2 4 U
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AAAAAGAAATCAGTATGGCTTACCAAACCAACTTTCATCAAACGCAACCGTTCGCCGTCG
CTCTTCGTCGGTGGTGGTCACGTCCAATGCTGACTATCCCACCATCTAGTGAACGTAGTT
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TCCAGTCCCTCGCCGTCTCCTCCGCAATGTGGCAAGGCGATTTTCTCGTGAAAATCCGAG
CTCGAGGTATTATATCTACTATGACGTCGATGAGGCTGCCGTGAGGCTAGGTTCTTTAAA
CGCCGCCGTTTTGAACATCACTAGTGAACGTGTTTCTAGGGATGACACGGCTTTCTCGTT
GGTTTTCGTTGCTGAGGAGGGAAGCGGAAGCGACGACGTTTCTGGAGAGCTTGAGATCAA
ACTCATGGCGAAGCATAAGCGTTACGTGGATAATGATGAAGCTGGACACTTTAATATTCG
GTGCCAAAATCTGACTTGCGAATCCTCTTTTACAGGTTTTAAGTTGTTCTCTTTAATAAG
AGAACGTGGGACAGCAATTGAATAAATCGATTAGGCTTCTAGTTTCTTTCTTATCTTCGT
GTATAACTAACTATTATGAATTATCCCATAAAGTTTGTTTTATTTCTTCCCCTTCCTACG
TATATCAGTTTCTATCTATTGGTGAGCTTCCC


BQ
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AF RS1AE43JQ C 1
AF RS1AE43TF U 1
BS 1 694 RS1AE43TF
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BS 696 811 RS1AE43TF
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RD RS1AE43JQ 812 0 0
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AAAAAGAAATCAGTATGGCTTACCAAACCAACTTTCATCAAACGCAACCGTTCGCCGTCG
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TCCAGTCCCTCGCCGTCTCCTCCGCAATGTGGCAAGGCGATTTTTTCGTGAAAATCCGAG
CTCGAGGTATTATATTTACTATGACGTCGATGAGGCTGCCGTGAGGCTAGGTTCTTTAAA
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ACTCATGGCGAAGCATAAGCGTTACGTGGATAATGATGAAGCTGGACACTTTAATATTCG
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AGAACGTGGGACAGCAATTGAATAAATCGATTAGGCTTCTAGTTTCTTTCTTATCTTCGT
GTATAACTAACTATTATGAATTATCCCATAAGGTTTGTTTTATTTCTTCCCCTTCCTACG
TATATCAGTTTCTATCTATTGGTGAGCTTCCC

QA 1 812 1 812
DS 

RD RS1AE43TF 811 0 0
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AAAAAGAAATCAGTATGGCTTACCAAACCAACTTTCATCAAACGCAACCGTTCGCCGTCG
CTCTTCGTCGGTGGTGGTCACGTCCAATGCTGACTATCCCACCATCTAGTGAACGTAGTT
GCACTAAAAAAGAATGTGCGGCTATGTGTGCACCCTGCTTTGGCGCCTTACTCACCGTTG
TCGGCGTGTACTTAATCTTTCTGCTCAACGACAAAGCTCAACTCCACGCCAAAATCTCCC
TCCAGTCCCTCGCCGTCTCCTCCGCAATGTGGCAAGGCGATTTTCTCGTGAAAATCCGAG
CTCGAGGTATTATATCTACTATGACGTCGATGAGGCTGCCGTGAGGCTAGGTTCTTTAAA
CGCCGCCGTTTTGAACATCACTAGTGAACGTGTTTCTAGGGATGACACGGCTTTCTCGTT
GGTTTTCGTTGCTGAGGAGGGAAGCGGAAGCGACGACGTTTCTGGAGAGCTTGAGATCAA
ACTCATGGCGAAGCATAAGCGTTACGTGGATAATGATGAAGCTGGACACTTTAATATTCG
GTGCCAAAATCTGACTTGCGAATCCTCTTTTACAGGTTTTAAGTTGTTCTCTTTAATAAG
AGAACGTGGGACAGCAATTGAATAAATCGATTAG*CTTCTAGTTTCTTTCTTATCTTCGT
GTATAACTAACTATTATGAATTATCCCATAAAGTTTGTTTTATTTCTTCCCCTTCCTACG
TATATCAGTTTCTATCTATTGGTGAGCTTCC

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 2

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CGTCCACATGCATTGTGTCCATGTTACTATTCCCGTTCCTTCACTTGTTACGCGTGAAAC
TGCGTCGATGGACGTGAGGTTTTTAAGTAACTCGTGTGTGACAACTTCAGGCATGAATGT
TCTTGGATGCCACTTTCCCTCAGACCAATCAACATATGTAAGAGTCCAGTTAGCAATGCC
ACCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RS1BL32JQ U 66
AF RS1BL32TF C 1
BS 1 65 RS1BL32TF
BS 66 191 RS1BL32JQ
BS 192 244 RS1BL32TF

RD RS1BL32JQ 126 0 0
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CGATGGACGTGAGGTTTTTAAGTAACTCGTGTGTGACAACTTCAGGCATGAATGTTCTTG
GATGCC

QA 1 126 1 126
DS 

RD RS1BL32TF 244 0 0
CATCAGTTTATCGGGAGCATCTGCGTGGACTCCTTCCAAAGAGATAGCAAGTCTTTGATC
CGTCCACATGCATTGTGTCCATGTTACTATTCCCGTTC*TTCACTTGTTACGCGTGAAAC
TGCGTCGATGGACGTGAGGTTTTTAAGTAACTCGTGTGTGACAACTTCAGGCATGAATGT
TCTTGGATGCCACTTTCCCTCAGACCAATCAACATATGTAAGAGTCCAGTTAGCAATGCC
ACCA

QA 1 244 1 244
DS 



AS 1 2

CO CL7281Contig1 830 2 3 U
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GAGATCAATCTGATTTCGAGTTTAAACAGACAACATGAAGGGGGGAAACAAGTGAGAACG
TTTAAGGGTGGGGACAAAGACAACCAGTACACCAAGTTGTTTTGACTAGAGAGCTTGCAT
TATTCTCCATCATTCCTCTGCAGCACTAGCTGCGTTAAGGTCCACACTTAGATCCAGTTC
CTTTCCCGTGATCAATTTATACATGTTCAACACATCAACAACCGTTGTATCAAAGTGTGT
TGTAGCATCATAACTCGTTGATATGAAGCAGTTGTCCAAAGTGGGTTCGTTGACAGGCTC
GTATCTATCATAAATGTCGAAAAACAGCTCATCAATTTGACCAAGAAGGTCGATTCCAGG
CTTCAGCTCGGTTTGCGGGTTATCCGTCTCTGCGTCCGTCGACACAAATGCTATGAACTT
TCCCTTGGGAGCAACGTTGTGGGAATACGAACAACAGAAGACATACATGTCTGATTTGCG
GCCCAATTGCTTTTGAGGTAGGATGACTTGCACCGAGTGAGAATCATTGGTGTTTGGAAT
AGGGTGGCTCATAATGGCAATTGCCCTAGCAACCTTGCCAATCTTCCTCACCTTGTTGGG
CAGGTATGAAGGATCGCAGACAACTTTCTTGCATTTTGCAGTCTCTCCCTCAGACGTAAC
ACCCATAACCTTACCTTCCTCATCGAACTCTACCTTGCACTCAGGTTTATTCAACATGTA
AGTCCCACCATACACAGCACTTAGTCGTGCAAATGCCTGAGGCAATTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1FT58JQ U 1
AF RS1GK20JQ U 21
BS 1 381 RS1FT58JQ
BS 382 382 RS1GK20JQ
BS 383 830 RS1FT58JQ

RD RS1FT58JQ 830 0 0
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GAGATCAATCTGATTTCGAGTTTAAACAGACAACATGAAGGGGGGAAACAAGTGAGAACG
TTTAAGGGTGGGGACAAAGACAACCAGTACACCAAGTTGTTTTGACTAGAGAGCTTGCAT
TATTCTCCATCATTCCTCTGCAGCACTAGCTGCGTTAAGGTCCACACTTAGATCCAGTTC
CTTTCCCGTGATCAATTTATACATGTTCAACACATCAACAACCGTTGTATCAAAGTGTGT
TGTAGCATCATAACTCGTTGATATGAAGCAGTTGTCCAAAGTGGGTTCGTTGACAGGCTC
GTATCTATCATAAATGTCGAAGAACAGCTCATCAATTTGACCAAGAAGGTCGATTCCAGG
CTTCAGCTCGGTTTGCGGGTTATCCGTCTCTGCGTCCGTCGACACAAATGCTATGAACTT
TCCCTTGGGAGCAACGTTGTGGGAATACGAACAACAGAAGACATACATGTCTGATTTGCG
GCCCAATTGCTTTTGAGGTAGGATGACTTGCACCGAGTGAGAATCATTGGTGTTTGGAAT
AGGGTGGCTCATAATGGCAATTGCCCTAGCAACCTTGCCAATCTTCCTCACCTTGTTGGG
CAGGTATGAAGGATCGCAGACAACTTTCTTGCATTTTGCAGTCTCTCCCTCAGACGTAAC
ACCCATAACCTTACCTTCCTCATCGAACTCTACCTTGCACTCAGGTTTATTCAACATGTA
AGTCCCACCATACACAGCACTTAGTCGTGCAAATGCCTGAGGCAATTCAC

QA 1 830 1 830
DS 

RD RS1GK20JQ 799 0 0
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TTTAAACAGACAACATGAAGGGGGGAAACAAGTGAGAACGTTTAAGGGTGGGGGCAAAGA
CAACCAGTACACCAAGTTGTTTTGACTAGAGAGCTTGCATTATTCTCCATCATTCCTCTG
CAGCACTAGCTGCGTTAAGGTCCACACTTAGATCCAGTTCCTTTCCCGTGATCAATTTAT
ACATGTTCAACACATCAACAACCGTTGTATCAAAGTGTGTTGTAGCATCATAACTCGTTG
ATATGAAGCAGTTGTCCAAAGTGGGTTCGTTGACAGGCTCGTATCTATCATAAATGTCGA
AAAACAGCTCATCAATTTGACCAGGAAGGTCGATTCCAGGCTTCAGCTCGGTTTGCGGGT
TATCCGTCTCTGCGTCCGTCGACACAAATGCTATGAACTTTCCCTTGGGAGCAACGTTGT
GGGAATACGAACAACAGAAGACATACATGTCTGATTTGCGGCCCAATTGCTTTTGAGGTA
GGATGACTTGCACCGAGTGAGAATCATTGGTGTTTGGAATAGGGTGGCTCATAATGGCAA
TTGCCCTAGCAACCTTGCCAATCTTCCTCACCTTGTTGGGCAGGTATGAAGGATCGCAGA
CAACTTTCTTGCATTTTGCAGTCTCTCCCTCAGACGTAACACCCATAACCTTACCTTCCT
CATCGAACTCTACCTTGCACTCAGGTTTATTCAACATGTAAGTCCCACCATACACAGCAC
TTAGTCGTGCAAATGCCTG

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 2

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GAGAGAGCTAGAGAACGAAATCAATGGCGGTTTCCGTTCCCATCCTCGCCGTCGTCACTT
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ATGTCTTTGATTGCGACCGTTTTGTACCTCTTGGCTCATTCCAAGGCTGACACTGGGTGG
ATGGGAGAAGCATCATGACGATGGGATGGGTATGACTGCTGCTGCTCCTTCTGCAGATGC
TCCAAAGCAGCAGCAGAACACCGATTTCGACAAGGTTTAAACAAACATAACTTACTGTTG
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TTTGTATCGTTAGATGTATGGTTGGCTTATATGTATGTCGCCGTATCTGAAACTTGGACT
GTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 

AF RS1AJ06JQ C 1
AF RS1AJ06TF U 10
BS 1 9 RS1AJ06JQ
BS 10 125 RS1AJ06TF
BS 126 126 RS1AJ06JQ
BS 127 800 RS1AJ06TF
BS 801 802 RS1AJ06JQ
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BS 823 842 RS1AJ06TF
BS 843 846 RS1AJ06JQ

RD RS1AJ06JQ 846 0 0
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GAGAGAGCTAGAGAACGAAATCAATGGCGGTTTCCGTTCCCATCCTCGCGGTCGTCACTT
CCCTTTCACCTCCCTGCCTTCGTATTCGCCTTCGGCGCCGAACGACGCCGTGGCACCGCT
CTAATAGCGCCCGACCAGTACGACGACCAGACCTTCTGCAAGTACGGAACAGCCGCCTCG
ACGGTGTACGGCATGTCCGCGTTCATGCTGCTCCTCGTCAGCCAAGCGGTGGTTAACGGC
GTCACCAAGTGTCTCTGCTGCGGAAAGGGTCTCGTCACCGGCGCTTCTTACACCGTCTGC
GCCATCGTCTTCTTCGTCGTCTCCTGGGTAAGCTTTCTAGGTGCGGAGGCGTGTTTGTTA
GCTGGATCGGCGAAGAACGCTTACCACACCAAAAGCAAAGGCGTGTACCAAGAAGGCAAA
ACGCTTTCGTGTGCGGTCTTACCCGTTGGTGTGTTCGCTGCTGGAGCTGCTCTGACTCTC
ATGTCTTTGATTGCGACCGTTTTGTACCTCTTGGCTCATTCCAAGGCTGACACTGG*TGG
ATGGGAGAAGCATCATGACGATGGGATTGGTATGACTGCTGCTGCTCCTTCTGCAGATGC
TCCAAAGCAGCAGCAGAACACCGATTTCGACAAGGTTTAAACAAACATAACTTACTGTTG
GGGTATAAACCATATAAAAATGTTGTTGTTGTTGTTGTTATAATTTGTTCATATAAACTC
TTTGTATCGTTAGATGTATTGTTGGCTTATATGTATGTCGCCGTATCTGAAACTTGGACT
GTTCTC

QA 1 846 1 846
DS 

RD RS1AJ06TF 837 0 0
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AGAGAACGAAATCAATGGCGGTTTCCGTTCCCATCCTCGCCGTCGTCACTTCCCTT*CAC
CTCCCTGCCTTCGTATTCGCCTTCGGCGCCGAACGACGCCGTAGCACCGCTCTAATAGCG
CCCGACCAGTACGACGACCAGACCTTCTGCAAGTACGGAACAGCCGCCTCGACGGTGTAC
GGCATGTCCGCGTTCATGCTGCTCCTCGTCAGCCAAGCGGTGGTTAACGGCGTCACCAAG
TGTCTCTGCTGCGGAAAGGGTCTCGTCACCGGCGCTTCTTACACCGTCTGCGCCATCGTC
TTCTTCGTCGTCTCCTGGGTAAGCTTTCTAGGTGCGGAGGCGTGTTTGTTAGCTGGATCG
GCGAAGAACGCTTACCACACCAAAAGCAAAGGCGTGTACCAAGAAGGCAAAACGCTTTCG
TGTGCGGTCTTACCCGTTGGTGTGTTCGCTGCTGGAGCTGCTCTGACTCTCATGTCTTTG
ATTGCGACCGTTTTGTACCTCTTGGCTCATTCCAAGGCTGACACTGGGTGGATGGGAGAA
GCATCATGACGATGGGATGGGTATGACTGCTGCTGCTCCTTCTGCAGATGCTCCAAAGCA
GCAGCAGAACACCGATTTCGACAAGGTTTAAACAAACATAACTTACTGTTGGGGTATAAA
CCATATAAAAATGTTGTTGTTGTTGTTGTTATAATTTGTTCATATAAACTCTTTGTATCG
TTAGATGTATG**TGGCTTATATGTATGTCGC*GTATCTGAAACTTGGACTGT
CTCA

QA 1 833 1 833
DS 



AS 1 2

CO CL7283Contig1 875 2 2 U
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CTAGGAACTAGGGTTTTTGGAAGATTCCATCGCAGCCATCATGGGGAAGAAGAAAGGCAC
CAGCAGCAAAGCAGATGATTTCCTGCAAACTCTCGAAGACTTCACCAGCAAAGAGAATTG
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TCAGCTCCGCGACTCGCTTCTACCTCTCCTCCGAGCTTCCTCGCCCCCTTCTTCTGGTTC
GCTTCAGATTCTTGTCCCCGGATGCGGAAACTCCCGCCTCTCCGAGCATTTGTACGACGC
GGGGTTCCGTGACGTCACCAATGTCGACTTCTCCAAGGTTGTTATCTCCGATATGCTTCG
TAGGAACATAAGGAGTAGGCCTGAGATGCGGTGGCGTGTTATGGACATTACAAAGTTGCA
GTTGGGTGATGAGTCTTTTGATATTGTGATGGATAAAGGTGCTCTTGATGCTTTAATGGA
GCCTGGAGTTGGTACCAAGCTGGGAAGTCAATACTTATCTGAGGCCAAGCGTGTTTTGAA
ACCTGGTGGGAAGTTTATCTGTTTAACGTTGGCAGAGTCTCATGTATTAGCATTGCTTTT
CTCAAGCTTTCGTTTTGGTTGGAAGATGACTGTTCATTCAATCTCTCAAAAACGGTCCAG
TCTTAAGACGTTTATGGTGGTGGCTGAAAAAGAAATGTCCATTGTGTTGCATGAGATAAC
CTCTTCTTTCGATCTTTTATCTCTTGGCCGCAATGATACTCAGGTTCTGGTATGTGTGAA
GCCCTTGAAAGTGAGACCAGATACGTAGAGACTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1A361TV U 1
AF RS1A361TF U 36
BS 1 819 RS1A361TV
BS 820 875 RS1A361TF

RD RS1A361TV 819 0 0
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CTAGGAACTAGGGTTTTTGGAAGATTCCATCGCAGCCATCATGGGGAAGAAGAAAGGCAC
CAGCAGCAAAGCAGATGATTTCCTGCAAACTCTCGAAGACTTCACCAGCAAAGAGAATTG
GGACAAGTTCTTCACTCTCCGAGGCAAAGACGACTCGTTCGAGTGGTACGCTGAGTGGCC
TCAGCTCCGCGACTCGCTTCTACCTCTCCTCCGAGCTTCCTCGCCCCCTTCTTCTGGTTC
GCTTCAGATTCTTGTCCCCGGATGCGGAAACTCCCGCCTCTCCGAGCATTTGTACGACGC
GGGGTTCCGTGACGTCACCAATGTCGACTTCTCCAAGGTTGTTATCTCCGATATGCTTCG
TAGGAACATAAGGAGTAGGCCTGAGATGCGGTGGCGTGTTATGGACATTACAAAGTTGCA
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CTCAAGCTTTCGTTTTGGTTGGAAGATGACTGTTCATTCAATCTCTCAAAAACGGTCCAG
TCTTAAGACGTTTATGGTGGTGGCTGAAAAAGAAATGTCCATTGTGTTGCATGAGATAAC
CTCTTCTTTCGATCTTTTATCTCTTGGCCGCAATGATAC

QA 1 819 1 819
DS 

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CCATCATGGGGAAGAAGAAAGGCACCAGCAGCAAAGCAGATGATTTCCTGCAAACTCTCG
AAGACTTCACCAGCAAAGAGAATTGGGACAAGTTCTTCACTCTCCGAGGCAAAGACGACT
CGTTCGAGTGGTACGCTGAGTGGCCTCAGCTCCGCGACTCGCTTCTACCTCTCCTCCGAG
CTTCCTCGCCCCCTTCTTCTGGTTCGCTTCAGATTCTTGTCCCCGGATGCGGAAACTCCC
GCCTCTCCGAGCATTTGTACGACGCGGGGTTCCGTGACGTCACCAATGTCGACTTCTCCA
AGGTTGTTATCTCCGATATGCTTCGTAGGAACATAAGGAGTAGGCCTGAGATGCGGTGGC
GTGTTATGGACATTACAAAGTTGCAGTTGGGTGATGAGTCTTTTGATATTGTGATGGATA
AAGGTGCTCTTGATGCTTTAATGGAGCCTGGAGTTGGTACCAAGCTGGGAAGTCAATACT
TATCTGAGGCCAAGCGTGTTTTGAAACCTGGTGGGAAGTTTATCTGTTTAACGTTGGCAG
AGTCTCATGTATTAGCATTGCTTTTCTCAAGCTTTCGTTTTGGTTGGAAGATGACTGTTC
ATTCAATCTCTCAAAA*CGGTCCAGTCTTAAGACGTTTATGGTGGTGGCTGAAAA*GAAA
TGTCCATTGTGTTGCATGAGATAACCTCTTCTTTCGATCTTTTATCTCTTGGCCGCAATG
ATACTCAGGTTCTGGTATGTGTGAAGCCCTTGAAAGTGAGACCAGATACGTAGAGACTGC

QA 1 840 1 840
DS 



AS 1 2

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GCTGGTGTAACGTAAGAGACGACGGCGGTGATGTCATCAAGCTTTCCTCCGTAAAACCTG
TATCCAGCCTCCTGAGCCGAGTCTGCGAAAGGACTCTGCCGTTTCTTGTCCAACGCCCTC
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GAGCTGACCACCACTCCTGTGATGTCCTCGTTGTATAGATTGTCATACACACCGTCCGTT
CCCGCCACAATCACGTCTCCAGCCTCCACATCTATCATGAAAACCTGACCGGAGCGAGGC
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ACCGGTGACTGAAACACCGTGGCCCCGTCTCTAACCACCGTGAATCCACTGTCTCCGAGA
TTAATAGCGTGTAGTCCCTTGTCTGTCAAAGCGATGATACAAGCAGTGGAGGAGCCTTGA
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GCCAGTTCTCTAATCGCTGATACAGAGTAAGACATGAGTTCGCGAGAGAACAAGCCAGCG
TTGATACCGACTTCAGCCCAACCGCCAACACCATCAGCAACACCGATAGCTTGTTCCTCT
TCGCAGATAAAGTGAGCGTCTTCTCCGCCTGTAGCTTCTTTCTCAGGTGCGGGAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1CO29JQ U 1
AF RS1E164JQ U 21
BS 1 297 RS1CO29JQ
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RD RS1CO29JQ 806 0 0
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ACCGTTACAAAAAATTTGAAACAAAAGGACCACTGATCTTAGGGCGGGATTGGTCTTTAA
GCTGGTGTAACGTAAGAGACGACGGCGGTGATGTCATCAAGCTTTCCTCCGTAAAACCTG
TATCCAGCCTCCTGAGCCGAGTCTGCGAAAGGACTCTGCCGTTTCTTGTCCAACGCCCTC
GCACGTGCCAAATCAGCAATCTTCTGAGCCGTGGCTTTCGGGTCTAATCCAGCTCTA*CC
GAGCTGACCACCACTCCTGTGATGTCCTCGTTGTATAGATTGTCATACACACCGTCCGTT
CCCGCCACAATCACGTCTCCAGCCTCCACATCTATCATGAAAACCTGACCGGAGCGAGGC
ATATCGCCACCACTGTCTCCAGTCCCTAATTGATAAGTAAAGTTGAACCCGTGCTGTTGA
ACCGGTGACTGAAACACCGTGGCCCCGTCTCTAACCACCGTGAATCCACTGTCTCCGAGA
TTAATAGCGTGTAGTCCCTTGTCTGTCAAAGCGATGATACAAGCAGTGGAGGAGCCTTGA
GCTTTGGTTTGAGAATGCGCTTTCTCTAAAACCAACAACGGGTCAATAAAAGAGCCCTTA
GCCAGTTCTCTAATCGCTGATACAGAGTAAGACATGAGTTCGCGAGAGAACAAGCCAGCG
TTGATACCGACTTCAGCCCAACCGCCAACACCATCAGCAACACCGATAGCTTGTTCCTCT
TCGCAGATAAAGTGAGCGTCTTCTCC

QA 1 806 1 806
DS 

RD RS1E164JQ 817 0 0
GG
TAGATAAAAATTTATTAGGATTCCTTAAAAAAGTTATTACCGTTACAAAAAATTTGAAAC
AAAAGGACCACTGATCTTAGGGCGGGATTGGTCTTTAAGCTGGTGTAACGTAAGAGACGA
CGGCGGTGATGTCATCAAGCTTTCCTCCGTAAAACCTGTATCCAGCCTCCTGAGCCGAGT
CTGCGAAAGGACTCTGCCGTTTCTTGTCCAACGCCCTCGCACGTGCCAAATCAGCAATCT
TCTGAGCCGTGGCTTTCGGGTCTAATCCAGCTCTAACCGAGCTGACCACCACTCCTGTGA
TGTCCTCGTTGTATAGATTGTCATACACACCGTCCGTTCCCGCCACAATCACGTCTCCAG
CCTCCACATCTATCATGAAAACCTGACCGGAGCGAGGCATATCGCCACCACTGTCTCCAG
TCCCTAATTGATAAGTAAAGTTGAACCCGTGCTGCTGAACCGGTGACTGAAACACCGTGG
CCCCGTCTCTAACCACCGTGAATCCACTGTCTCCGAGATTAATAGCGTGTAGTCCCTTGT
CTGTCAAAGCGATGATACAAGCAGTGGAGGAGCCTTGAGCTTTGGTTTGAGAATGCGCTT
TCTCTAAAACCAACAACGGGTCAATAAAAGAGCCCTTAGCCAGTTCTCTAATCGCTGATA
CAGAGTAAGACATGAGTTCGCGAGAGAACAAGCCAGCGTTGATACCGACTTCAGCCCAAC
CGCCAACACCATCAGCAACACCGATAGCTTGTTCCTCTTCGCAGATAAAGTGAGCGTCTT
CTCCGCCTGTAGCTTCTTTCTCAGGTGCGGGAGAT

QA 3 817 3 817
DS 



AS 1 2

CO CL7285Contig1 311 2 1 U
GTGTCTGCTGTGGTGTACGAATACAGAGATATTTCTGGAAGGGTTTACTCGAGTCCAATA
TCCGAATCAAAGAGGCAATGAATTGGATGAATGACAGGAGTTAAATAACACAGTTCAGTT
AACCACAGAGACTATTAATAGGATGGAGAGAGATTGTAAAGAGTGTATGCATGAGCCTCC
CCAGTAAATTGTAACTTAAACGCATCAGCCGGAGATAATAAAATCAACGAGGAGCTCCGG
CTGTTTGATAATCGGGTGTATGATGTTGTCTATCAAGGTCATGGATACATGAGCATATTA
ACTGGTTGGGG


BQ
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AF RS1GI28JQ C 1
AF RS1GI28TF U 1
BS 1 311 RS1GI28TF

RD RS1GI28JQ 311 0 0
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ACTGGTTGGGG

QA 1 311 1 311
DS 

RD RS1GI28TF 311 0 0
GTGTCTGCTGTGGTGTACGAATACAGAGATATTTCTGGAAGGGTTTACTCGAGTCCAATA
TCCGAATCAAAGAGGCAATGAATTGGATGAATGACAGGAGTTAAATAACACAGTTCAGTT
AACCACAGAGACTATTAATAGGATGGAGAGAGATTGTAAAGAGTGTATGCATGAGCCTCC
CCAGTAAATTGTAACTTAAACGCATCAGCCGGAGATAATAAAATCAACGAGGAGCTCCGG
CTGTTTGATAATCGGGTGTATGATGTTGTCTATCAAGGTCATGGATACATGAGCATATTA
ACTGGTTGGGG

QA 1 311 1 311
DS 



AS 1 2

CO CL7286Contig1 800 2 2 U
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TATAACTACATTCACAAGTACGGTTACAAGTCCAAGCTGATGGCTGCTGCTGTCAGAAAC
AAACAAGACTTGTTCAGTCTTCTCGGGGTTGATTATGTGATTGCACCTTTGAAGGTACTG
CAATCTCTCAAAGACTCACCAGCTATTCCTGACGATGAGAAATACTCTTTTGTTCGGAAA
CTTTCTCCTGAGACCGCGACGCACTACAACTTCACCAACAAAGAGCTGATCAAATGGGAC
CAGCTGAGCTTGGCTTCAGCTATGGGTCCTGCATCAGTGGAGCTTTTATCAGCTGGTGTG
GAAGGTTATGCGAACCAAGCGAAACGTGTTGAAGAGTTCTTTGGGAAGATTTGGCCACCT
CCAAATGTCTAAAAACGAAGCTTTGATCTTCTTCTCTACGGATCTTAAATCAATAAGATA
GAGAGAGAGAGCTAGACTCCATGCTACCTAACCTCTTTGTTTGCGTTATTTCGTTTTCCT
GTGCCTTGTTAATCACGGTTCCTGGTCTGAAACTTGAGCCACAAGATAAAGAGACCAATA
AAGCTGAAGTAAAATCAATC


BQ
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AF RS1D236TF U 1
AF RS1D236JQ C 144
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BS 546 800 RS1D236JQ

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AAACAAGACTTGTTCAGTCTTCTCGGGGTTGATTATGTGATTGCACCTTTGAAGGTACTG
CAATCTCTCAAAGACTCACCAGCTATTCCTGACGATGAGAAATACTCTTTTGTTCGGAAA
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CAGCTGAGCTTGGCTTCAGCTATGGGTCCTGCATCAGTGGAGCTTTTATCAGCTGGTGTG
GAAGG

QA 1 545 1 545
DS 

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CGGGGTTGATTATGTGATTGCACCTTTGAAGGTACTGCAATCTCTCAAAGACTCACCAGC
TATTCCTGACGATGAGAAATACTCTTTTGTTCGGAAACTTTCTCCTGAGACCGCGACGCA
CTACAACTTCACCAACAAAGAGCTGATCAAATGGGACCAGCTGAGCTTGGCTTCAGCTAT
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ACGTGTTGAAGAGTTCTTTGGGAAGATTTGGCCACCTCCAAATGTCTAAAAACGAAGCTT
TGATCTTCTTCTCTACGGATCTTAAATCAATAAGATAGAGAGAGAGAGCTAGACTCCATG
CTACCTAACCTCTTTGTTTGCGTTATTTCGTTTTCCTGTGCCTTGTTAATCACGGTTCCT
GGTCTGAAACTTGAGCCACAAGATAAAGAGACCAATAAAGCTGAAGTAAAATCAATC

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 2

CO CL7287Contig1 978 2 2 U
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CAATCCCCAGTCAGGAAGATGCCTCGCTATGATGATCGTTACGGGAACACTCGTCTTTAT
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GACTCTCTATCGCCAAGAGGCAGAGACCGCAGTCCGATTATGGATGATGAAGGTAGCCCA
AGGATCATAGACGGGAGCCCTCCACCATCTCCAAAGCTTGAAAAGCAAGCAGGATCAGAC
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GATGATGGTTAAACTTGC


BQ
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AF RS1GH01TF U 1
AF RS1GH01JQ C 293
BS 1 647 RS1GH01TF
BS 648 978 RS1GH01JQ

RD RS1GH01TF 647 0 0
GGATACGCTCTTCTTCCCCCTTTCGGTTTCGAAATTAGGGTTTCGCTCAGCGCTCTCCTT
CAATCCCCAGTCAGGAAGATGCCTCGCTATGATGATCGTTACGGGAACACTCGTCTTTAT
GTCGGACACTTGTCGTCCAGAACTCGTACCAGAGACCTTGAACGCCTTTTCAACAGATAC
GGAAGAGTGCGAGATGTGGATATGAAGCGGGACTATGCTTTTGTTGAGTTTAGTGATCCC
CGTGATGCTGATGACGCGAGACATTACTTGGATGGAAGAGACTTCGATGGAAGTCGCATC
ACTGTGGAGTTTTCAAGAGGACACATTGAGAGAAACTGCAAGAACAGTCCCAAGAAGCTC
AGGCGAAGTGGAAGCTACTCCAGGTCCCCTGTAAGATCCCGTTCTCCTCCTCGTCGTGGA
AGAAGCCCAAGCCGTAGCAGGAGTCTTAGCCGAAGCCGAAGCTACAGCCGATCAAGATCC
CCAGTGAAAAGAAGAGAGAGAAGTGTCGAGGAGAGATCTCGCAGTCCAAAGAGAATGGAG
GACTCTCTATCGCCAAGAGGCAGAGACCGCAGTCCGATTATGGATGATGAAGGTAGCCCA
AGGATCATAGACGGGAGCCCTCCACCATCTCCAAAGCTTGAAAAGCA

QA 1 647 1 647
DS 

RD RS1GH01JQ 686 0 0
GTCGCATCACTGTGGAGTTTTCAAGAGGACACATTGAGAGAAACTGCAAGAACAGTCCCA
AGAAGCTCAGGCGAAGTGGAAGCTACTCCAGGTCCCCTGTAAGATCCCGTTCTCCTCCTC
GTCGTGGAAGAAGCCCAAGCCGTAGCAGGAGTCTTAGCCGAAGCCGAAGCTACAGCCGAT
CAAGATCCCCAGTGAAAAGAAGAGAGAGAAGTGTCGAGGAGAGATCTCGCAGTCCAAAGA
GAATGGAGGACTCTCTATCGCCAAGAGGCAGAGACCGCAGTCCGATTATGGATGATGAAG
GTAGCCCAAGGATCATAGACGGGAGCCCTCCACCATCTCCAAAGCTTGAAAAGCAAGCAG
GATCAGACCATGATGGTGGTGTTAGCCCTCAAAACAATGGTGATGGCAGCAACACTGTGG
GACGCGGCGCTGACAGCCCGAGAGAGGACAGAAGCCCCGTTGATGATGATTACGAGGCCA
ACCGTGCTTCCCCTAGAGGAAGCGAGTCTCCTTGACTTTGATGGCTCATGGCCTCAAGTC
ACAGGCACTCTAGCATGTTGTACTATTAATATCAGACGGCTCCAGATAATACTTTCTCTT
TTCATGTGTGTTTGCTTTGGATCTTCTTATGTTCATGTTGTCAGGATTTCTTTCTTTTAC
TCAATTGAGATGATGGTTAAACTTGC

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 2

CO CL7288Contig1 804 2 2 U
TTGGGGGACTACTAGTGATGTGGACATTACAAAATGAAATAAGCTTAAACAAAGAGCAAC
TTTGTGTTTTTTTTTACATATACAGTTTCTAGCTTGTAAAGGTAACATTAGATATGTCCT
TGAACTTTTCTTTAATCGCTGCTTTAATTCCCATTCCAATCGATTCAGGTCCAACGTACT
TGACAACACAGTCTCCACCTTCAACTGATAAAACTTCCACGCTTCCACCATAGTTCTTGA
TCGCTGGTCTCAGTATATCAAGATGAGCATTCACTGCCTCCACGGCTATATGCTTAACTT
CTTCATCAAAAACTTGTCGAATATCTTTCAAAGCATTTCCAAACTTCTCTTTGAGTACCC
TTTCGATTCCCATCGTCATGGTTGTTGAAGAACTCGGACAGCTAGTACATGCTCCTTGGA
GTTTGAGAGAAACGACGCCGTCTTCAACAGAGACAACGTCGACGTTCCCACCATCAGAGA
TAAGGAACGGCCTGACATCTTCGAGGACCAAGTCGACGTTTTGAGGAGTCAAATCGAAAG
TCTGAGCAGAGTATAGACCCGGTGGTGACGCAACGGACGCGAAAGGTGAAGCCTTTGTTT
CCTCTTGGCTCGAAGCGTGTATCGCCGATCGGGGAAAGATCCCACTTTTAGAGATCGGTC
TAGCGAAAAGGAAGAAGACTCTCGAGTTGGGAAACCCAATTCTCTTTGAAGATGATGAAA
CGAGAATCTTGGAGGTTCCAGCTCCGGCAATGGAAGTCGCGAGAGAAGCCATCGTCGTCG
TCGTCGTGGGGATTCTATTGATTC


BQ
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AF RS1A849TF C 1
AF RS1A849JQ U 12
BS 1 11 RS1A849TF
BS 12 804 RS1A849JQ

RD RS1A849TF 804 0 0
TTGGGGGACTACTAGTGATGTGGACATTACAAAATGAAATAAGCTTAAACAAAGAGCAAC
TTTGTGTTTTTTTTTACATATACAGTTTCTAGCTTGTAAAGGTAACATTAGATATGTCCT
TGAACTTTTCTTTAATCGCTGCTTTAATTCCCATTCCAATCGATTCAGGTCCAACGTACT
TGACAACACAGTCTCCACCTTCAACTGATAAAACTTCCACGCTTCCACCATAGTTCTTGA
TCGCTGGTCTCAGTATATCAAGATGAGCATTCACTGCCTCCACGGCTATATGCTTAACTT
CTTCATCAAAAACTTGTCGAATATCTTTCAAAGCATTTCCAAACTTCTCTTTGAGTACCC
TTTCGATTCCCATCGTCATGGTTGTTGAAGAACTCGGACAGCTAGTACATGCTCCTTGGA
GTTTGAGAGAAACGACGCCGTCTTCAACAGAGACAACGTCGACGTTCCCACCATCAGAGA
TAAGGAACGGCCTGACATCTTCGAGGACCAAGTCGACGTTTTGAGGAGTCAAATCGAAAG
TCTGAGCAGAGTATAGACCCGGTGGTGACGCAACGGACGCGAAAGGTGAAGCCTTTGTTT
CCTCTTGGCTCGAAGCGTGTATCGCCGATCGGGGAAAGATCCCACTTTTAGAGATCGGTC
TAGCGAAAAGGAAGAAGACTCTCGAGTTGGGAAACCCAATTCTCTTTGAAGATGATGAAA
CGAGAATCTTGGAGGTTCCAGCTCCGGCAATGGAAGTCGCGAGAGAAGCCATCGTCGTCG
TCGTCGTGGGGATTCTATTGATTC

QA 1 804 1 804
DS 

RD RS1A849JQ 793 0 0
CTAGTGATGTGGACATTACAAAATGAAATAAGCTTAAACAAAGAGCAACTTTGTGTTTTT
TTTTACATATACAGTTTCTAGCTTGTAAAGGTAACATTAGATATGTCCTTGAACTTTTCT
TTAATCGCTGCTTTAATTCCCATTCCAATCGATTCAGGTCCAACGTACTTGACAACACAG
TCTCCACCTTCAACTGATAAAACTTCCACGCTTCCACCATAGTTCTTGATCGCTGGTCTC
AGTATATCAAGATGAGCATTCACTGCCTCCACGGCTATATGCTTAACTTCTTCATCAAAA
ACTTGTCGAATATCTTTCAAAGCATTTCCAAACTTCTCTTTGAGTACCCTTTCGATTCCC
ATCGTCATGGTTGTTGAAGAACTCGGACAGCTAGTACATGCTCCTTGGAGTTTGAGAGAA
ACGACGCCGTCTTCAACAGAGACAACGTCGACGTTCCCACCATCAGAGATAAGGAACGGC
CTGACATCTTCGAGGACCAAGTCGACGTTTTGAGGAGTCAAATCGAAAGTCTGAGCAGAG
TATAGACCCGGTGGTGACGCAACGGACGCGAAAGGTGAAGCCTTTGTTTCCTCTTGGCTC
GAAGCGTGTATCGCCGATCGGGGAAAGATCCCACTTTTAGAGATCGGTCTAGCGAAAAGG
AAGAAGACTCTCGAGTTGGGAAACCCAATTCTCTTTGAAGATGATGAAACGAGAATCTTG
GAGGTTCCAGCTCCGGCAATGGAAGTCGCGAGAGAAGCCATCGTCGTCGTCGTCGTGGGG
ATTCTATTGATTC

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

CO CL7289Contig1 1337 2 2 U
GGGACAAATCGCTCGGCGACAGAGACGACGAATCCGAGGAATCCAGCAACGATCTAGAAA
CCGCATACCGAGACTAGAATCAGAAACCACAGGCTTGAAAGTGTCGCTGACGCAAGGAGG
CTTTGAGAAGAGAGCAGCAGCATTGCCAATGGAGTCCACCGAGTCATATGCCCCTCCTCC
TCAAGAGCTCACCAAGCCTTCCCCTGAACCTTCCGAAGATGATTCTGGTGAGAAGCCAAC
ACACATTCGTTTCCTTGTATCCAATGCGGCTGCTGGTTCCGTCATTGGGAAAGGAGGCTC
CACCATCACTGAGTTTCAGGCTAAGTCCGGTGCGCGGATCCAGCTCTCGCGTAACCAAGA
GTTTTTCCCTGGGACCACTGATAGGATTATTATGATATCTGGCTCTATTAAAGAAGTTGT
CAGTGGACTTGAACTTATCCTTGATAAATTGCACAGCGAGCTTCATGCTGAAGAGGGTAG
TGATGTTGAGCCTAGGAGACGACTAAGACTTGTGGTTCCTAACAGTTCTTGTGGAGGCAT
CATTGGGAAAGGAGGGGCCACCATCAAGTCATTCATTGAGGAATCTAAAGCTGGTATTAA
GATATCCCCTCTGGATAATACCTTCTATGGGTTGAGTGATAGCTAGTGACGTTATCTGGA
ACCTTCGAGGAGCAGATGCGGGCTATTGATTTGATTTTGGCTAAGCTTACCGAGGACGAT
CATTACTCCCAGAATGTGCATTCCCCATATTCATATGCAGCCGGATACAATTCAGCTAAC
TATGCACACAACGGTTCTGGAGGCAGGTATCAAAACCACCAAAAGGAAGAGGCTGGTAGG
ACGGTGACAATTGGTGTGTCGGATGAGCATATAGGATTGGTGCTTGGTCGTGGAGGAAGA
AACATCATGGAAATCACTCAGATGACAGGTGCCCGAGTAAAAATATCAGACCGAGGCGAT
TTCATGTCTGGAACCACTGATAGGAAAGTGAGTATCACAGGATCACAGAGAGCAATTCAG
CAAGCTGAGACGATGATAAAACAGAAAGTTGATTCAGCCTTTGAGAGAGACACCGAATAA
AACCACCCACCGATGGAGCTGTCCATCGTGGTTCCTTATCTTTGGTCATTTGTTGAGGCT
TAAGCTTTGAGAATGGGATCACAAAATCATCTTGAAGTGAGGCAGAGAGTTGTCTTTAGG
AGCTTTTGTTTCTTCTTGTTTCATTTTCTTTTGCATGTCTTTGACATAATACAATGTGTT
TTTTTTTGTTCTTTCTCTTGGGAGAGAAGCAGGATTGGATTTAGAAGTACTGTTTTCACT
TTTGTTTTATTAATAAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H233TF U 1
AF RS1H233JQB C 668
BS 1 741 RS1H233TF
BS 742 1337 RS1H233JQB

RD RS1H233TF 741 0 0
GGGACAAATCGCTCGGCGACAGAGACGACGAATCCGAGGAATCCAGCAACGATCTAGAAA
CCGCATACCGAGACTAGAATCAGAAACCACAGGCTTGAAAGTGTCGCTGACGCAAGGAGG
CTTTGAGAAGAGAGCAGCAGCATTGCCAATGGAGTCCACCGAGTCATATGCCCCTCCTCC
TCAAGAGCTCACCAAGCCTTCCCCTGAACCTTCCGAAGATGATTCTGGTGAGAAGCCAAC
ACACATTCGTTTCCTTGTATCCAATGCGGCTGCTGGTTCCGTCATTGGGAAAGGAGGCTC
CACCATCACTGAGTTTCAGGCTAAGTCCGGTGCGCGGATCCAGCTCTCGCGTAACCAAGA
GTTTTTCCCTGGGACCACTGATAGGATTATTATGATATCTGGCTCTATTAAAGAAGTTGT
CAGTGGACTTGAACTTATCCTTGATAAATTGCACAGCGAGCTTCATGCTGAAGAGGGTAG
TGATGTTGAGCCTAGGAGACGACTAAGACTTGTGGTTCCTAACAGTTCTTGTGGAGGCAT
CATTGGGAAAGGAGGGGCCACCATCAAGTCATTCATTGAGGAATCTAAAGCTGGTATTAA
GATATCCCCTCTGGATAATACCTTCTATGGGTTGAGTGATAGCTAGTGACGTTATCTGGA
ACCTTCGAGGAGCAGATGCGGGCTATTGATTTGATTTTGGCTAAGCTTACCGAGGACGAT
CATTACTCCCAGAATGTGCAT

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1H233JQB 670 0 0
AGGAGCAGATGCGGGCTATTGATTTGATTTTGGTTAAGCTTACCGAGGACGATCATTACT
CCCAGAATGTGCATTCCCCATATTCATATGCAGCCGGATACAATTCAGCTAACTATGCAC
ACAACGGTTCTGGAGGCAGGTATCAAAACCACCAAAAGGAAGAGGCTGGTAGGACGGTGA
CAATTGGTGTGTCGGATGAGCATATAGGATTGGTGCTTGGTCGTGGAGGAAGAAACATCA
TGGAAATCACTCAGATGACAGGTGCCCGAGTAAAAATATCAGACCGAGGCGATTTCATGT
CTGGAACCACTGATAGGAAAGTGAGTATCACAGGATCACAGAGAGCAATTCAGCAAGCTG
AGACGATGATAAAACAGAAAGTTGATTCAGCCTTTGAGAGAGACACCGAATAAAACCACC
CACCGATGGAGCTGTCCATCGTGGTTCCTTATCTTTGGTCATTTGTTGAGGCTTAAGCTT
TGAGAATGGGATCACAAAATCATCTTGAAGTGAGGCAGAGAGTTGTCTTTAGGAGCTTTT
GTTTCTTCTTGTTTCATTTTCTTTTGCATGTCTTTGACATAATACAATGTGTTTTTTTTT
GTTCTTTCTCTTGGGAGAGAAGCAGGATTGGATTTAGAAGTACTGTTTTCACTTTTGTTT
TATTAATAAC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

CO CL7290Contig1 882 2 4 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATACGGCCATTACGGCCGGGGGATCCGAGTC
CATCCCGGTGAAATCGATTCGTAGCTCTGTGCCCTTCGCCTAAGGATCATTTCTCTCGAG
AGACGCGAAGCAAAGATCGTCTCCATTTTTTCTCCAATTTCTCGTTCCGATTCCGTTGTT
TTATCGTTTCACCGCCGAACCCTAAAACCCACCAATTGCCTTTCCGCGAGTCAAGTTTCG
CTGCTTCGAGATTTCTAGGGTTTCGTATCTGAATCTGCGGAGAACAGAAACCCTTCTCTG
TTGTGGGTTTTTCATTCAAAGGTTCTGAAAACGAGAGTGATATGGAGGCGCAAATTCATC
AACTTGAGCAGGAAGCATATACCGCTGTTTTAAGGGCCTTTAAAGCGCAGTCTGATGCTA
TTTCTTGGGACAAAGAAAGCTTGATAACAGAGTTGCGTAAAGAATTGAGAGTATCTGATG
ACGAGCATCGAGAGCTTCTGAGTAGGGTCAATAAGGACGATACTATCCAGCGAATAAGGG
ATTGGAGACAGGGAGGTGGAAGCCAAGTTCCTTCTAGACATGCAACTAATCTGGGTTTTG
ATGTTGTTCCTAGTCCAACTTTCTCTGCTTCTCGGAAGAAACAGAAGACATTCCCATCTT
ATCATCAATCAATTGTTCCGGCCGGAAACAGGTCATTCAATAGCCGTGTGGCATCCGGTG
GCATAACAGCAGATGGATCTGCTGAAGCACTTATCGGCAGAAAAGTGTGGACCAAATGGC
CTAAAGATAACCACTTTTATGAAGCAATTATAACCCAGTACAACGCAGTTGAGGGTCGGC
ATGCGTTGGTGTATGATATAAACGCAGTAAATGAAACGTGGG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1A110TF U 1
AF RS1A110TV U 5
BS 1 31 RS1A110TF
BS 32 32 RS1A110TV
BS 33 829 RS1A110TF
BS 830 882 RS1A110TV

RD RS1A110TF 829 0 0
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CATCCCGGTGAAATCGATTCGTAGCTCTGTGCCCTTCGCCTAAGGATCATTTCTCTCGAG
AGACGCGAAGCAAAGATCGTCTCCATTTTTTCTCCAATTTCTCGTTCCGATTCCGTTGTT
TTATCGTTTCACCGCCGAACCCTAAAACCCACCAATTGCCTTTCCGCGAGTCAAGTTTCG
CTGCTTCGAGATTTCTAGGGTTTCGTATCTGAATCTGCGGAGAACAGAAACCCTTCTCTG
TTGTGGGTTTTTCATTCAAAGGTTCTGAAAACGAGAGTGATATGGAGGCGCAAATTCATC
AACTTGAGCAGGAAGCATATACCGCTGTTTTAAGGGCCTTTAAAGCGCAGTCTGATGCTA
TTTCTTGGGACAAAGAAAGCTTGATAACAGAGTTGCGTAAAGAATTGAGAGTATCTGATG
ACGAGCATCGAGAGCTTCTGAGTAGGGTCAATAAGGACGATACTATCCAGCGAATAAGGG
ATTGGAGACAGGGAGGTGGAAGCCAAGTTCCTTCTAGACATGCAACTAATCTGGGTTTTG
ATGTTGTTCCTAGTCCAACTTTCTCTGCTTCTCGGAAGAAACAGAAGACATTCCCATCTT
ATCATCAATCAATTGTTCCGGCCGGAAACAGGTCATTCAATAGCCGTGTGGCATCCGGTG
GCATAACAGCAGATGGATCTGCTGAAGCACTTATCGGCAGAAAAGTGTGGACCAAATGGC
CTAAAGATAACCACTTTTATGAAGCAATTATAACCCAGTACAACGCAGT

QA 1 829 1 829
DS 

RD RS1A110TV 878 0 0
GACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATACGGCCATTACGGCCGGGGGATCCGAGTCCATC
CCGGTGAAATCGATTCGTAGCTCTGTGCCCTTCGCCTAAGGATCATTTCTCTCGAGAGAC
GCGAAGCAAAGATCGTCTCCATTTTTTCTCCAATTTCTCGTTCCGATTCCGTTGTTTTAT
CGTTTCACCGCCGAACCCTAAAACCCACCAATTGCCTTTCCGCGAGTCAAGTTTCGCTGC
TTCGAGATTTCTAGGGTTTCGTATCTGAATCTGCGGAGAACAGAAACCCTTCTCTGTTGT
GGGTTTTTCATTCAAAGGTTCTGAAAACGAGAGTGATATGGAGGCGCAAATTCATCAACT
TGAGCAGGAAGCATATACCGCTGTTTTAAGGGCCTTTAAAGCGCAGTCTGATGCTATTTC
TTGGGACAAAGAAAGCTTGATAACAGAGTTGCGTAAAGAATTGAGAGTATCTGATGACGA
GCATCGAGAGCTTCTGAGTAGGGTCAATAAGGACGATACTATCCAGCGAATAAGGGATTG
GAGACAGGGAGGTGGAAGCCAAGTTCCTTCTAGACATGCAACTAATCTGGGTTTTGATGT
TGTTCCTAGTCCAACTTTCTCTGCTTCTCGGAAGAAACAGAAGACATTCCCATCTTATCA
TCAATCAATTGTTCCGGCCGGAAACAGGTCATTCAATAGCCGTGTGGCATCCGGTGGCAT
AACAGCAGATGGATCTGCTGAAGCACTTATCGGCAGAAAAGTGTGGACCAAATGGCCTAA
AGATAACCACTTTTATGAAGCAATTATAACCCAGTACAACGCAGTTGAGGGTCGGCATGC
GTTGGTGTATGATATAAACGCAGTAAATGAAACGTGGG

QA 1 878 1 878
DS 



AS 1 2

CO CL7291Contig1 596 2 2 U
GGCCTTTAGCCGGTGGGTTACCAATTGGAGCGGTGCTTTTGACTGAAAAGGTTGCTGAGA
CCATCAAATATGGAGATCATGGTAGCACATTTGCAGGGAACCCTCTTGTTTGCAGTGCAG
CCATCGCTGTTGTTGATAAAGTATCTAAGCCCTCTTTCTTGTCAAGTGTCACGAGCAAAG
GTCTATACTTCAAGGAACTGTTGGTGAAGAAATTAGGAGGGAACTCGCACGTGAAGGAAG
TGAGAGGAGAAGGGCTTATCATAGGAGTGGAGCTGGATGTGCCAGCGAGTCCACTTGTGG
ATGCTTCCCGTGATTCAGGTCTTCTGATCCTGACGGCAGGGAAAGGGAATGTCGTCAGGA
TTGTTCCACCGTTGATTATATCGGAAGAGGAGATAGAACGTGCTGTTGAGATTATGTTCC
AAAATTTAACTGCTCTTGGTTGAAGCCTTAGAGGTTGAGGAGCTAGAGAGCACAAGAGCA
AATTGTTTATCGACTTTGATGTGTCTTTTTAAAAATCTTTACTTGTGTCTTGATTTAAGC
TCAAGTGTACTATTGCCTGTTTGTAAAACTTTCAATGTGATCAAATATGTCCCGCG


BQ
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AF RS1G756JQ C 1
AF RS1G756TF U 1
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DS 

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CCATCAAATATGGAGATCATGGTAGCACATTTGCAGGGAACCCTCTTGTTTGCAGTGCAG
CCATCGCTGTTGTTGATAAAGTATCTAAGCCCTCTTTCTTGTCAAGTGTCACGAGCAAAG
GTCTATACTTCAAGGAACTGTTGGTGAAGAAATTAGGAGGGAACTCGCACGTGAAGGAAG
TGAGAGGAGAAGGGCTTATCATAGGAGTGGAGCTGGATGTGCCAGCGAGTCCACTTGTGG
ATGCTTCCCGTGATTCAGGTCTTCTGATCCTGACGGCAGGGAAAGGGAATGTCGTCAGGA
TTGTTCCACCGTTGATTATATCGGAAGAGGAGATAGAACGTGCTGTTGAGATTATGTTCC
AAAATTTAACTGCTCTTGGTTGAAGCCTTAGAGGTTGAGGAGCTAGAGAGCACAAGAGCA
AATTGTTTATCGACTTTGATGTGTCTTTTTAAAAATCTTTACTTGTGTCTTGATTTAAGC
TCAAGTGTACTATTGCCTGTTTGT

QA 1 564 1 564
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1GN33JQ U 1
AF RS1H087JQB U 1
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ATGGAGACTATATTTAATTCTCTGTCCAACTTTGTAAGAAATTCTCAATGGAGTTGTTAC
TAGAGAGATACTATAGTATAACAAGCTAATTAATTTTGGACTTGAAACATGTAGCTTGGC
ATGAGTAGTGCACTTGAAACCCTCTGTAGCCAAGCATTTGGAGCTGGTGAAGTCAATAAG
TTAGGGGTGTACATGCAGAGAGCCTGGATTATCTCATTAGTTTCCTGCCTAGTCTTCCTC
CCTATATACATCTTTGCCACACCGGTTCTGAGACTTCTCGGTGAATCTGAGGAGGTTGCG
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TTCAGTGCCCTTGTCCTACATGTCTTTATGTTGTGGCTGTTTATAATCGTCTTTGGTTGG
GGAACAAATGGTGCTGCCTTGGCGTTTAATATCACCAACTGGGGAACAGCTATCTCTCTA
ATCGTTTACGTGGTTGGTTGGTGTAACGAAGCTGGTCTGGTTTATCTTGGTTGGCTTTAA

QA 1 840 1 840
DS 



AS 1 2

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AGCACCATCATAAGCATATGGGCTGCTTTTGTCTACACCAAATACCATAATTGTAGGGAT
C


BQ
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10 

AF RS1A276TR U 10
AF RS1A276JQ U 1
BS 1 841 RS1A276JQ

RD RS1A276TR 825 0 0
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GTCACTTCCACCGAAGATTCTCTGATAGTAATATCTCTAATATGTTTGGGAAGTTCTACA
TATGGATGGTTCCTCCTGTCATAGTGAGAAACATTCAACGGTTCGAATCCAAAAGTAGAG
AAATCAGGTGAAACCCTGGATTCTTCACAACTCATCCTTGGTACCTACATCAACATTATC
ATCACCTCCCATGAGTTCTTCGAGTGAGAATTCATCTTCCTCAATCACTTCCCCGTCTTT
ACCGTCCCACGCTTTTGTCTCAACGATCTCCGGTGTTCCGTTCATAGGCACGTTTCCTTT
TCCACCTGCCCCAGCATCCTTCACAAATTCTAAGAGGTGTTGAAGCTCAAATGCGCTTTT
AAGAGGAGCATACACTGCTTTCTTCACGTTCATGGCTACCATTGCTGGATAACCGTATCC
TCCCACGTTGACTTTCTTCTCCAAATCCGGTTGCGTAACAGCCGCCACCCACACAAAGCG
GTAAGGATGTCTCTTAAACTTCTCTGCAACGGATAACAACATGTCTAGATACTTGTTCCT
TCCTTCAGCTTTGGAATCGAGAATGTCTGGTAGGAAAGAGACGAAGCAAATAGCAGCAGA
ACCACACTTCTTTTCCATGACATCCGGTCCGGTTAGTTCAGTTACTTCAACAGGCCCAGC
ACTAGATTCCACAAGTTCTGTAGCAAAAGATTCTATAGCTGACGCAGATCTAGCACCATC
ATAAGCATATGGGCTGCTTTTGTCTACACCAAATACCATAATTGT

QA 1 825 1 825
DS 

RD RS1A276JQ 841 0 0
GAAGAGTTGGTATACTTTATTAGGAAGACAAAACCACTAAAACAAAAGTGAAGGGCGATG
TACTCTAATGTCACTTCCACCGAAGATTCTCTGATAGTAATATCTCTAATATGTTTGGGA
AGTTCTACATATGGATGGTTCCTCCTGTCATAGTGAGAAACATTCAACGGTTCGAATCCA
AAAGTAGAGAAATCAGGTGAAACCCTGGATTCTTCACAACTCATCCTTGGTACCTACATC
AACATTATCATCACCTCCCATGAGTTCTTCGAGTGAGAATTCATCTTCCTCAATCACTTC
CCCGTCTTTACCGTCCCACGCTTTTGTCTCAACGATCTCCGGTGTTCCGTTCATAGGCAC
GTTTCCTTTTCCACCTGCCCCAGCATCCTTCACAAATTCTAAGAGGTGTTGAAGCTCAAA
TGCGCTTTTAAGAGGAGCATACACTGCTTTCTTCACGTTCATGGCTACCATTGCTGGATA
ACCGTATCCTCCCACGTTGACTTTCTTCTCCAAATCCGGTTGCGTAACAGCCGCCACCCA
CACAAAGCGGTAAGGATGTCTCTTAAACTTCTCTGCAACGGATAACAACATGTCTAGATA
CTTGTTCCTTCCTTCAGCTTTGGAATCGAGAATGTCTGGTAGGAAAGAGACGAAGCAAAT
AGCAGCAGAACCACACTTCTTTTCCATGACATCCGGTCCGGTTAGTTCAGTTACTTCAAC
AGGCCCAGCACTAGATTCCACAAGTTCTGTAGCAAAAGATTCTATAGCTGACGCAGATCT
AGCACCATCATAAGCATATGGGCTGCTTTTGTCTACACCAAATACCATAATTGTAGGGAT
C

QA 1 841 1 841
DS 



AS 1 2

CO CL7294Contig1 939 2 2 U
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ATCTGAATCCAAGAAGCCCATTGTCGTCAAGTACGGGCTCAACCACGTGACTTACCTCAT
CGAGCAGAACAAGGCACAGCTTGTTGTCATTGCACACGATGTTGACCCCATCGAGCTTGT
TGTCTGGTTACCTGCACTGTGCAGGAAGATGGAAGTTCCTTACTGCATTGTCAAAGGAAA
ATCTCGTCTTGGAACGGTCGTTCACCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGCTTGACTACTGT
CAAGAACGAGGACAAGCTCGAGTTCAGCAAAATCCTTGAAGCCATCAAGGCAAACCTCAA
CGACAAGTACGAGGAGTACAGGAAGAAGTGGGGAGGTGGGATAATGGGATCCAAGTCTCA
AGCCAAGACCAAAGCTAAGGAGAGGGTTCTTGCCAAGGAGGTTGCCCGGAGAATGAACTA
AGCAGAGCGTCTTCACAACGATGATGATGGTTTTGTTTAGCGATTTAAATGAATGTTTTG
GAATTTATGCTTATTATCGTTGTTGCACACTTGAGATATTTAATCAGTTTTGTTAGACAT
TTTGCTTTCGACTTTATTAATATATTGATCCATGTTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AX34TF U 1
AF RS1AX34JQ C 171
BS 1 673 RS1AX34TF
BS 674 939 RS1AX34JQ

RD RS1AX34TF 678 0 0
GGAAACACCAATGGCACCGAAAAGAGGAGTGAAAGTGATTACCAAGAAGAAGACGGGGAA
GGTTACTAATCCATTGTTTGAGAGAAGGCCAAAACAATTCGGTATCGGTGGTGCTTTGCC
TCCTAAGAAAGACTTGACTCGTTACATCAAATGGCCCAAGTCAATCCGTCTTCAAAGGCA
GAAGCGTATCCTTAAGCAGAGGCTCAAGGTCCCACCGGCTTTGAACCAGTTCACCAAGAC
TCTTGACAAGAACCTTGCAACCCAGCTTTTCAAGGTCCTTATGAAGTATAGACCAGAGGA
CAAAGCGGCCAAGAAGGATCGTCTTTTGAAGAAAGCTCAAGCCGAGGCTGAGGGAAAGCC
ATCTGAATCCAAGAAGCCCATTGTCGTCAAGTACGGGCTCAACCACGTGACTTACCTCAT
CGAGCAGAACAAGGCACAGCTTGTTGTCATTGCACACGATGTTGACCCCATCGAGCTTGT
TGTCTGGTTACCTGCACTGTGCAGGAAGATGGAAGTTCCTTACTGCATTGTCAAAGGAAA
ATCTCGTCTTGGAACGGTCGTTCACCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGCTTGACTACTGT
CAAGAACGAGGACAAGCTCGAGTTCAGCAAAATCCTTGAAGCCATCAAGGCAAACCTCAA
CGACAAGTACGAG
AGTAC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RS1AX34JQ 769 0 0
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TCACCAAGACTCTTGACAAGAACCTTGCAACCCAGCTTTTCAAGGTCCTTATGAAGTATA
GACCAGAGGACAAAGCGGCCAAGAAGGATCGTCTTTTGAAGAAAGCTCAAGCCGAGGCTG
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CTTACCTCATCGAGCAGAACAAGGCACAGCTTGTTGTCATTGCACACGATGTTGACCCCA
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TCAAAGGAAAATCTCGTCTTGGAACGGTCGTTCACCAGAAGACTGCTGCTTGCTTGTGCT
TGACTACTGTCAAGAACGAGGACAAGCTCGAGTTCAGCAAAATCCTTGAAGCCATCAAGG
CAAACCTCAACGACAAGTACGAGGAGTACAGGAAGAAGTGGGGAGGTGGGATAATGGGAT
CCAAGTCTCAAGCCAAGACCAAAGCTAAGGAGAGGGTTCTTGCCAAGGAGGTTGCCCGGA
GAATGAACTAAGCAGAGCGTCTTCACAACGATGATGATGGTTTTGTTTAGCGATTTAAAT
GAATGTTTTGGAATTTATGCTTATTATCGTTGTTGCACACTTGAGATATTTAATCAGTTT
TGTTAGACATTTTGCTTTCGACTTTATTAATATATTGATCCATGTTTAC

QA 1 769 1 769
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7296Contig1 828 2 14 U
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TATATTGGATTTTCTTCCTTCTTTTGTGTTCTTTTAAAATTGAATTTGTCGAGTTATTGT
TAATGTTGCGTGTAGTAATTTGTTGCTACTTCTATTTTGTTTCATCGAGATGAGTTCTTG
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AAGGATGTTCGAATTTTTTTTGTATATAAGCTCATTTCTTGTGTGTATGTCTAATCTTCT
CTTTTGTCTCGGTTTTTTTATCAGTATATATCAATATATGTCCATATATAGATCTGAAAA
AAGTTTTTCTATTTCTTATCTTTGTTTTTGCTTTTTATTTTTTCTTCTCAAGGTTTTATT
GATGATGAGCAAAAATATCTTACTTCATCAGCAAGTGCAACAACAACAACAACAAGAGAA
TATGTCGAATCGAACATCAGCTTCTGGGGATCAAACAAGTGTGTCTTCGGGAAATAGAAC
TGAAGCAAGTGGTTCTAATTACTTCCCTCATCATCAACAACAAGAACAACAACAGTTCTT
TGTTCCTGAATCTCAGCCTCAGAAGAAGAGGAGGAACCAACCAGGAAATCCAGGTTCGTG
TGGAAAGAATGGTCATAAAAGAAAAAATAAACAACTTGTTCCTTGGTTTTGTACTGATTC
ATTGTTCCAACTATTTGATACTCATCTTCTTGGAAAATAATGGGCCTTCTACCAAAAAAG
AATATTCTTTTTACACCTTTTATTATATTTATCATCTCTATTCTAAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1B522TF U 1
AF RS1B522JQ C 262
BS 1 668 RS1B522TF
BS 669 669 RS1B522JQ
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BS 687 687 RS1B522JQ
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BS 737 756 RS1B522TF
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RD RS1B522TF 766 0 0
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TATATTGGATTTTCTTCCTTCTTTTGTGTTCTTTTAAAATTGAATTTGTCGAGTTATTGT
TAATGTTGCGTGTAGTAATTTGTTGCTACTTCTATTTTGTTTCATCGAGATGAGTTCTTG
TTGATTTAAAACATGAACCGGAAAAGTGGATAGAGGTTGTCTCTTGCGTTGAAGCCAAAG
AAGGATGTTCGAATTTTTTTTGTATATAAGCTCATTTCTTGTGTGTATGTCTAATCTTCT
CTTTTGTCTCGGTTTTTTTATCAGTATATATCAATATATGTCCATATATAGATCTGAAAA
AAGTTTTTCTATTTCTTATCTTTGTTTTTGCTTTTTATTTTTTCTTCTCAAGGTTTTATT
GATGATGAGCAAAAATATCTTACTTCATCAGCAAGTGCAACAACAACAACAACAAGAGAA
TATGTCGAATCGAACATCAGCTTCTGGGGATCAAACAAGTGTGTCTTCGGGAAATAGAAC
TGAAGCAAGTGGTTCTAATTACTTCCCTCATCATCAACAACAAGAACAACAACAGTTCTT
TGTTCCTGAATCTCAGCCTCAGAAGAAGAGGAGGAACCAACCAGGAAATCCAGGTTCGTG
TGGAAAGA*TGGTCATAAAAGAAAAA*TAAACAACTTGTTCCTTGGTTT*GTACTGAT*C
ATTGTTCCA*CTATT*GATACTCATCTTCTTGGAAA
TATGGGCCTT

QA 1 756 1 756
DS 

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CAGTATATATCAATATATGTCCATATATAGATCTGAAAAAAGTTTTTCTATTTCTTATCT
TTGTTTTTGCTTTTTATTTTTTCTTCTCAAGGTTTTATTGATGATGAGCAAAAATATCTT
ACTTCATCAGCAAGTGCAACAACAACAACAACAAGAGAATATGTCGAATCGAACATCAGC
TTCTGGGGATCAAACAAGTGTGTCTTCGGGAAATAGAACTGAAGCAAGTGGTTCTAATTA
CTTCCCTCATCATCAACAACAAGAACAACAACAGTTCTTTGTTCCTGAATTTCAGCCTCA
GAAGAAGAGGAGGAACCAACCAGGAAATCCAGGTTCGTGTGGAAAGAATGGTCATAAAAG
AAAAAATAAACAACTTGTTCCTTGGTTTTGTACTGATTCATTGTTCCAACTATTTGATAC
TCATCTTCTTGGAAAATAATGGGCCTTCTACCAAAAAAGAATATTCTTTTTACACCTTTT
ATTATATTTATCATCTCTATTCTAAAC

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 2

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CGTTGTTTCCCTGATGGCAAAGCTGTTTATGATAGCCTTGGAGATGTGATATGCCATGGT
GATAAAAGTGTTATAAGGGAAGGGCACAAAAGCTTCCCAAGTGGGCACACTTCATGGTCT
TTTGCGGGACTAGGATTCTTGTCGCTCTACTTATCAGGGAAGATTAGAGCGTTTGATGGT
AAAGGACACGTAGCGAAGCTGTGCATTGTTATACTCCCTTTGCTAGTTGCTTCTCTTGTT
GGTATCTCCCGTGTAGATGACTATTGGCATCACTGGCAAGACGTCTTTGCTGGAGGCTTG
CTAGGTCTTGTGGTCTCTACGTTCTGTTATCTTCAATTCTTCCCGCCACCATATCGCACT
GAAGCTTGGGGGCCATATGCTTACTTCCTAGTATTGGAGGCTGCACGAGCGCAAGCAGAA
GCTCAAGCAGCGGCCCAACCACCGCCACATGGAGATAACGTTGAAGAGGAAGACGGTGGA
TTTATGGGACTGCATTTGGTGGATAATCCTAGCATGAGGAGAGAGGAAGATGTAGAAACT
GGTAGAGTGCCTCCTAGAGGCTGAGTTATGAAAGTTTAACACTGAAGCTGGTTTTGTTGC
TGTTTAGGACACACTTTTTTCTGGTGTTCTTAATACATTCTTTTGTTTGGTTACTTGTCG
TTTGCTGTTTGGTTTACTGGTTATACCCCGGTTTTTGTTAAAGTTTATTGCTTCTAATTT
GTTCGGTTTGG


BQ
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AF RS1EL47TF U 1
AF RS1EL47JQ C 145
BS 1 482 RS1EL47TF
BS 483 851 RS1EL47JQ

RD RS1EL47TF 482 0 0
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GCAGTACTTACAGATTCAATAAAGAATGCAGTTGGTAGACCACGCCCTGACTCCTTCTGG
CGTTGTTTCCCTGATGGCAAAGCTGTTTATGATAGCCTTGGAGATGTGATATGCCATGGT
GATAAAAGTGTTATAAGGGAAGGGCACAAAAGCTTCCCAAGTGGGCACACTTCATGGTCT
TTTGCGGGACTAGGATTCTTGTCGCTCTACTTATCAGGGAAGATTAGAGCGTTTGATGGT
AAAGGACACGTAGCGAAGCTGTGCATTGTTATACTCCCTTTGCTAGTTGCTTCTCTTGTT
GGTATCTCCCGTGTAGATGACTATTGGCATCACTGGCAAGACGTCTTTGCTGGAGGCTTG
CTAGGTCTTGTGGTCTCTACGTTCTGTTATCTTCAATTCTTCCCGCCACCATATCGCACT
GA

QA 1 482 1 482
DS 

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CACAAAAGCTTCCCAAGTGGGCACACTTCATGGTCTTTTGCGGGACTAGGATTCTTGTCG
CTCTACTTATCAGGGAAGATTAGAGCGTTTGATGGTAAAGGACACGTAGCGAAGCTGTGC
ATTGTTATACTCCCTTTGCTAGTTGCTTCTCTTGTTGGTATCTCCCGTGTAGATGACTAT
TGGCATCACTGGCAAGACGTCTTTGCTGGAGGCTTGCTAGGTCTTGTGGTCTCTACGTTC
TGTTATCTTCAATTCTTCCCGCCACCATATCGCACTGAAGCTTGGGGGCCATATGCTTAC
TTCCTAGTATTGGAGGCTGCACGAGCGCAAGCAGAAGCTCAAGCAGCGGCCCAACCACCG
CCACATGGAGATAACGTTGAAGAGGAAGACGGTGGATTTATGGGACTGCATTTGGTGGAT
AATCCTAGCATGAGGAGAGAGGAAGATGTAGAAACTGGTAGAGTGCCTCCTAGAGGCTGA
GTTATGAAAGTTTAACACTGAAGCTGGTTTTGTTGCTGTTTAGGACACACTTTTTTCTGG
TGTTCTTAATACATTCTTTTGTTTGGTTACTTGTCGTTTGCTGTTTGGTTTACTGGTTAT
ACCCCGGTTTTTGTTAAAGTTTATTGCTTCTAATTTGTTCGGTTTGG

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 2

CO CL7298Contig1 863 2 6 U
GAACGAGACAGAAAGAGGCATGGAGTTCTTCGTTTTGTCCAAATGAATTGGTCTCGACAG
CTGAGAGTCTCGGGTTAGACCCCAATGCCTCGGTCTCGTCGTCCTGGGACAGCAGCCACA
AAAGTGTTATGAGTGGGATGTCAAATGCTGGGAGGAGAAGCAGAAGAAATAGCTTGGACT
CGACGACTACAATGGGAAGCAGAAAATCGAAGAAGAATCAGGTCAAGGTCACTTCATTGA
AGCCTTTCAATCTTAGAACCGAGCAAAGAGGTAGGGTAAAAGAGGAAGAGTTTGCAAAGA
AGATCCAAGAAATAACAATGGTGGAAGAAAAGATGAGAATCCCCATTGCTCAAGGTCTTC
CATGGACAACAGATGAACCTGAGTGTCTGGTTAAGCCTCAAGTGAAAGATATTACAATAC
CAGTTGACTTGACGCTCCACTCAGATGTCCGGGCAGTAGAGCGCGCAGAATTTGATCAGC
AGATTGCCGAGAAGATGAGTTTCATGGAGCAATACAAAATGGAAAGGGAAAGAGAACAGA
AGCTGGCGGAGGAAGAAGAGATAAGAAGGCTGAGGAAAGAATTGGTCCCAAAGGCGCAAC
CAATGCCATACTTTGATCGACCATTCATTCCAAGAAGGTCGAGCAAACATCCAACTGCGC
CACGAGATCCCAAGTTTCACATACCGCAACACAAAAAGATCAGATGCTGCGGTTCATCTT
CTTGTAGCGAAACAGCCTCTTACATGAGCGATTTCAGTTACCAGTTTCTCTAGTTTCTGG
TTACACTTTTGTTGGTTATGGTTCTTTCTTTAGAACTGATGTATTTTTTTATAAAGTCAA
TAAAATTATTCATCTTGTGTACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AJ05TF U 1
AF RS1AJ05JQ C 1
BS 1 637 RS1AJ05TF
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RD RS1AJ05TF 828 0 0
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AGCTGGCGGAGGAAGAAGAGATAAGAAGGCTGAGGAAAGAATTGGTCCCAAAGGCGCAAC
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CTTGTAGCGAAACAGCCTCTTACATGAGCGATTTCAGTTACCAGTTTCTCTAGTTTCTGG
TTACACTTTTGTTGGTTATGGTTCTTTCTTTAGA*CTGATGTATTTTT

QA 1 828 1 828
DS 

RD RS1AJ05JQ 863 0 0
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CTGAGAGTCTCGGGTTAGACCCCAATGCCTCGGTCTCGTCGTCCTGGGACAGCAGCCACA
AAAGTGTTATGAGTGGGATGTCAAATGCTGGGAGGAGAAGCAGAAGAAATAGCTTGGACT
CGACGACTACAATGGGAAGCAGAAAATCGAAGAAGAATCAGGTCAAGGTCACTTCATTGA
AGCCTTTCAATCTTAGAACCGAGCAAAGAGGTAGGGTAAAAGAGGAAGAGTTTGCAAAGA
AGATCCAAGAAATAACAATGGTGGAAGAAAAGATGAGAATCCCCATTGCTCAAGGTCTTC
CATGGACAACAGATGAACCTGAGTGTCTGGTTAAGCCTCAAGTGAAAGATATTACAATAC
CAGTTGACTTGACGCTCCACTCAGATGTCCGGGCAGTAGAGCGCGCAGAATTTGATCAGC
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AGCTGGCGGAGGAAGAAGAGATAAGAAGGCTGAGGAAAGAATTGGTCCCAAAGGCGCAAC
CAATGCCATACTTTGATCGACCATTCATTCCAAGAAGGTCGAGCAAACATCCAACTGCGC
CACGAGATCCCAAGTTTCACATACCGCAACACAAAAAGATCAGATGCTGCGGTTCATCTT
CTTGTAGCGAAACAGCCTCTTACATGAGCGATTTCAGTTACCAGTTTCTCTAGTTTCTGG
TTACACTTTTGTTGGTTATGGTTCTTTCTTTAGAACTGATGTATTTTTTTATAAAGTCAA
TAAAATTATTCATCTTGTGTACC

QA 1 863 1 863
DS 



AS 1 2

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CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGACATCATTTGTGATGAACAGTCATCCATCTTCG
CTGTCTGAACAAATGGCCCCTGTCTGAATCTGCGTTCTGTTGATTTTCTGCAAATTTTAG
TTTACCTATAATCTTTTGATAAAACCTTTGACACCACCATCTGACCAAATTTGGTTTGGC
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GGGACGATAGTCTATTAACAA


BQ
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AF RS1A204TV U 37
AF RS1A204TF U 1
BS 1 921 RS1A204TF

RD RS1A204TV 836 0 0
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CTGTTGATTTTCTGCAAATTTTAGTTTACCTATAATCTTTTGATAAAACCTTTGACACCA
CCATCTGACCAAATTTGGTTTGGCTGTATTCTCAGAGCAATACATCAAGCTGATGGTTGT
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CAAAAGTTTGATTCCATAGAGAAGTTAGAAGGTTCAACATCCCCGGAGACTACTGCTCAC
CTGGTAGCCCAGTATCAACTGTTTCTAAATAGAGAGGAACAAGCTCTCGCTGCTACTCGG
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AAATGCTTGCAATCCGTTGTGAACATTCAGTCACAGGTCTACGGCAAGAGAGCACAAATC
CCCAGAGGCTCTCACAGAGATTACGAAGAGAGCCACATGTTCAGCGAGAACATACT

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DS 

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TTTACCTATAATCTTTTGATAAAACCTTTGACACCACCATCTGACCAAATTTGGTTTGGC
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TTAGAAGGTTCAACATCCCCGGAGACTACTGCTCACCTGGTAGCCCAGTATCAACTGTTT
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GGTCGTGCAGTGAGACGCCAAGCAATGACTACACTCAAATGCTTGCAATCCGTTGTGAAC
ATTCAGTCACAGGTCTACGGCAAGAGAGCACAAATCCCCAGAGGCTCTCACAGAGATTAC
GAAGAGAGCCACATGTTCAGCGAGAACATACTCAAGTGGACACAAACGGTCAGAAGAGAT
GGGACGATAGTCTATTAACAA

QA 1 921 1 921
DS 



AS 1 2

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ATGATACCAACTCTAGACATGGCCAAGCTCTTCGCCACCAAAGGAGCAAAGTCCACCATC
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BQ
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AF RS1D590TF U 1
AF RS1GH30TF U 198
BS 1 543 RS1D590TF
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CTCACAACTCCTCTCAACTCCAAACTCTTCGAGAAACCCATCAAATCATTCAACCAGGAG
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AACTTGAATATGAAGTTTTTACTAGCAATGGAATATTTCAAAGACCAGTTAGAGGAGCTT
CTTGAGACAGTGAAACCAGACTGTTTCGTCGCCAATATGTTCTTCCCATGGGCGACTAAA
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CC
T

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DS 

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G
ATGGCCAAGCTCTTCGCCACCAAAGGAGCAAAGTCCACCATCCTCACAACTCCTCTCAAC
TCCAAACTCTTCGAGAAACCCATCAAATCATTCAACCAGGAGAATCCGGAACTCGAAGAC
ATCAAAATCCAGATCCTCAACTTCCCTTGCACAGAGCTAGGCTTACCCGAAGGATGCGAG
AACACCGACTTCATCTTCTCTAACCATGACCTAACCAAAGGTAACTTGAATATGAAGTTT
TTACTAGCAATGGAATATTTCAAATACCAGTTAGAGGAGCTTCTTGAGACAGTGAAACCA
GACTGTTTCGTCGCCAATATGTTCTTCCCATGGGCGACTAAAGTCACTGAGAAGTTTAAT
GTGCCGAGACTTGTCTTCCACGGAACAGGCTACTTCTCTCTATGTGCTTCTCATTGCTTA
AGACTCCACAAGCCTTACAAGAACGTGGCTTCGAGCTCTGAGCCCTTTGTGATCCCTGAA
CTTCCGGGAGACGTTGTCATTACAGAGGAACAGGTTATAGAGAAAGAAGAAGAGTCTGTG
ATGGGGAAGTTTATGAAGGAAATAAGAGATTCAGAGAGAGATAGCTTTGGTGTGTTGATG
AACAGCTTCTACGATCTTGAACCTGCTTATGCCGATTTTTTTCAAGAGCCATGTGGCGAA
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DS 



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AGCTTCC


BQ
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AF RS1D675JQ U 44
AF RS1D675TF C 1
BS 1 43 RS1D675TF
BS 44 454 RS1D675JQ
BS 455 727 RS1D675TF

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QA 1 411 1 411
DS 

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AATCAAATGACAGTTACTTTACCTGTGTTGGTGTCTCTTACGTGATCGGTTTTGATGTGT
TATTACAGTCGTCATCCTGAAGTGAAGTGGGCCGAGACCACTGACAAGATTTTCCTCACC
GTAGTGTTGGCTGACTCCAAGGAGACTAAAGTTAATCTTCTCCCTGAAGGTGTCTTTGAT
TTCTCGGCAAAAGCTGGTCCTGAAAACCACGTTTATGAACTCAAACTCGAACTTCACGAC
AAAGTCAACGTTGAGGTGAGTTTCGTTGACTAGCCTGGTCTTTGATTGTTGACTATTTAT
GGTTCTAGATCTTCAACTTTTTTATCTTCTGATTTTTTCAGGAAAGCAAAATCAACATCG
GAGTGAGAAGCATTTTCTGCATAATAGAGAAAGCAGAGCCGGAAAGGTGGAACAAGCTAA
TCCGCGGTGGGAAAGCGCCACACTATGTCAAGATTGATTGGGACAAGTGGGTAGATGAGG
ACGATGAAGGCACCGCTGGTTAGCATTCTTCTTTAAGCTTTTATATACATGTTCTTGTGT
TGCATTCTTTGTAAAGTTTTGAAGGTGTTAACTCGTTTTGTGCCGTTTTTTTTTTTGATT
TAGGTGCTGGAGATATGGATATGGGAGGAATGGGCGGAATGGATTTCTCGGTTTGTTTCT
AGCTTCC

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

CO CL7302Contig1 854 2 2 U
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TGGAGCTGCCTAACCTTCCGACGGATGTGGTGGCAGAGGAAGGACATATGAGCAATAAGC
TTCCCTTCCGAAGAGTTATGTCCGGTATACATTTTAGCGCCAAGGAGCGTCTTGAAATGC
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AGATTGGGCCTGGACAGACGAGGGTGAGACTGAAGCTGCCTCGGTCTCAGATCATGAAGT
TAGTGGGAGAGAGCCAAGATGCACCTGAAGTCACGGAGAGGATCATTGCTCTCTACCGAG
AGAGTTCCCGCGAGATACAAGGCGGCCGAGATAGCAATGATTTTCGTTGGGAACTTGGGG
CTGAAGATTTGAAGAACAACTACAAGCCAGAGAGAAGCATGTGAGCTTCGCGGAGAACGG
AGGAAGAGGTGAGATCTATCTTATTAAAACAGAAACATTCTGTTGGACCTAACATTTATT
TTGTAAGTTTTTAAATTAAATACTTTATAGTTAAACCTATATTAAATCACCAATGTTCCT
TTCTTTATACTACTATCCATGTTTCCAAACAATATACTTATTTCTTTATACTACTATCAA
TGTTTCCAAACAAT


BQ
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AF RS1A843JQ C 1
AF RS1A843TF U 1
BS 1 848 RS1A843TF
BS 849 854 RS1A843JQ

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AGAGTTCCCGCGAGATACAAGGCGGCCGAGATAGCAATGATTTTCGTTGGGAACTTGGGG
CTGAAGATTTGAAGAACAACTACAAGCCAGAGAGAAGCATGTGAGCTTCGCGGAGAACGG
AGGAAGAGGTGAGATCTATCTTATTAAAACAGAAACATTCTGTTGGACCTAACATTTATT
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TTCTTTATACTACTATCCATGTTTCCAAACAATATACTTATTTCTTTATACTACTATCAA
TGTTTCCAAACAAT

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CCACCAAAGAATATCCTGGCTTCGTGCTGTTTGACTCCGACTCCGTGAAAAGATATGGAG
TTCGCGTCAAGCCGCTTGAGCCGAACCACATCTTAGTGCCTAATAAAACTTATTTTCTAG
TGGAGCTGCCTAACCTTCCGACGGATGTGGTGGCAGAGGAAGGACATATGAGCAATAAGC
TTCCCTTCCGAAGAGTTATGTCCGGTATACATTTTAGCGCCAAGGAGCGTCTTGAAATGC
TAATGCTTTCCCGGAGGGCCGTTTCTGATGTGGCTTTAGCAAGATCTGACGGCGGAAATG
AGATTGGGCCTGGACAGACGAGGGTGAGACTGAAGCTGCCTCGGTCTCAGATCATGAAGT
TAGTGGGAGAGAGCCAAGATGCACCTGAAGTCACGGAGAGGATCATTGCTCTCTACCGAG
AGAGTTCCCGCGAGATACAAGGCGGCCGAGATAGCAATGATTTTCGTTGGGAACTTGGGG
CTGAAGATTTGAAGAACAACTACAAGCCAGAGAGAAGCATGTGAGCTTCGCGGAGAACGG
AGGAAGAGGTGAGATCTATCTTATTAAAACAGAAACATTCTGTTGGACCTAACATTTATT
TTGTAAGTTTTTAAATTAAATACTTTATAGTTAAACCTATATTAAATCACCAATGTTCCT
TTCTTTATACTACTATCCATGTTTCCAAACAATATACTTATTTCTTTATACTACTATCAA
TGTTTCCA

QA 1 848 1 848
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FL44TF U 1
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BS 612 779 RS1FL44JQ

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ACCTATCCAAGCCCTGCACCGTCGAGTTCGACTACCTCGTCTACTACGACAAGACCGTGT
CGGGACGAATCGGCTATGGCTCCATCACCGACCTCAAGGGCATCGAGGTGAAGCGTCTCT
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TCAAGGTCGGGTTTATCAACAAGAAGCTTGATATTGACCAGTTCAAGACTGTTTCATTCG
TGCGGTGATAACGGTGTCTCTTGTGGGAAGAGTTTTCTCCAGATTCCAGCAATGATGAAA
GAAGCTGAGATGCTGATCACCGAGTAAAGTACTCTCACCAATCACACCACAACACCAGGA
AGATGGAGTTT

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DS 

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TCAAGACTGTT*CATTCGTGCGGTGATAACGGTGTCTCTTGTGGGAAGAGTTTTCTCCAG
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AAGTCTTTGTTGTTAAAACTCTGTTCCACGGAAGAATGATGTATCTTTATGTATGCTATA
TGACTAAATGTTTCCAT

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 2

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ATGGGGTAGAGAACGGCACACAGTTATAATCTAAAACTCATTGGATGGATTATGGATCCA
TGGGGAAGGGTAGGCCTAAAACTTAGCAGCCCCTTTCCTTTTGTACTAAATCAAAAGAAA
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AAGAAATCATTCTTGCTGATTCTTTGATCTTTGTCGTCATCAAGCAAAATGTACAGCCCT
TGAATCTCATCCTTGTTCAAGTTTGGGATTGTGGGTTTCAGTACATCTCCAAGTTCTTGA
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AGTTTGAGAACCCGAAGAAAGTCATGTAGCGTAACACATCCAATTGAATCCGGATTCATG
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AACTCAGATGCTTTGTTGAGTAGCATCAAGTCCCCATAAGAATGAGATGTTTGGACGACA
TTCAAAGATGATGCAATTGCATGACTTGTCTTCTGCGAGAGACGCACAGCATTTTGTT


BQ
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AF RS1A765TF C 1
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BS 30 30 RS1A765TF
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RD RS1A765TF 863 0 0
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CTTCTTCTCATCATCATTGTCGTAATGATCCTTCTTCTTCTTTTTCTCATCACAATCATC
ATCATGGTCCTTGTCCTTCTTCTTTTTCTTCTCATAATCATCATCATCATCATCTTTCTT
CTTATCCTTCTTCTTCTCCTTCGTTTTGCTCTTCTCATCATCAGTGTCGACCTTGCCACT
GTATTTTTTGTGGCTTTGGCTCTCTTTGTTATCATCATCATCATTGCGACTGGCTTTCTT
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DS 

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TGATGGTCCTTCTTCTTCTTCTTTTCATCATAGCCATCACGATAGTCTTTCTTCTTCTTC
TTCTCATCATCATTGTCGTAATGATCCTTCTTCTTCTTTTTCTCATCACAATCATCATCA
TGGTCCTTGTCCTTCTTCTTTTTCTTCTCATAATCATCATCATCATCATCTTTCTTCTTA
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ATTCTTTTTGGGATCTCCC

QA 1 859 1 859
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1EC89TF U 1
AF RS1EC89JQ C 154
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BS 563 621 RS1EC89TF
BS 622 752 RS1EC89JQ

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TTGA

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DS 

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QA 1 599 1 599
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E086TF U 1
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DS 

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QA 1 631 1 631
DS 



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AAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 

AF RS1AD67TF U 1
AF RS1G148TF U 1
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AAAAA

QA 1 485 1 485
DS 



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BQ
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AF RS1CX90JQ C 1
AF RS1CX90TF U 1
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DS 

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TGTCTAATGCTGACTTCCAGTGTCTCTGCAAGCAGAAAACCAAAACTAATCCTTTCCTCA
GTGGGATCGACCTCCACCTCGCTTCTAAACTCCCGGAGAAGTGTGGATTATCTGGTGCAC
CTTGCTAAGACATGTTTCCTTTTGGAAGGTTTCGCTTTGTGTTTTGATTTTCTTCATGAT
TCCATTGTTGTTGTACTGTTTCTGTTCCTGTTGTTGTTGGTCTTGTTGTTCTGTGCTGAT
CTGATATTGTTTCCATTGTTGTTGTCTTAATTGTATTGCATTGCAATTGTGTTCCTTGAT
TT

QA 1 542 1 542
DS 



AS 1 2

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TGCAATATATTTTGGGAATTTAGTTTGATATAACTTACTGAGGTTTTTCCGAGAAAGATC
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TTTGG


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RS1CT17TF U 1
AF RS1CT17JQ C 4
BS 1 677 RS1CT17TF
BS 678 785 RS1CT17JQ

RD RS1CT17TF 677 0 0
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AGATCATGGCAAAGAACAAAGCTCAGTCCTTGAAAGAAACAGAGTTTGCTCTTTCTGCTC
TCATGGAGATTCCTCAACAATACAAGGCTACCTTGGAGCTTAACCTTTTAGGAAGAAGAA
ATGGGAATATAACGGAACGGTTTCCTCTTCCACCTCCAATGCAAGGTGGAGCATCGTCCT
ACAACAAGCCAAAGGCTAATGATCGTGTTCCAAGTTTCAAACCGAGTGTACCTTCTTATC
CAACTGAAAACTATCATGTAAGGTCTAGTCCTCCTGCGCCACCCGCTACGACCTCAGCTT
CTTCTGATAACCAGATATGTCCGATTTGTCTGAGCAACCCTAAAGACATGGCTTTTGGTT
GTGGTCATCAGACTTGTTGCGAATGTGGACCGGATCTTGAAATGTGTCCAATTTGCCGTG
CACCGATCCAGACAAGAATAAAACTCTACTAACAAAGTAGATCTCTCTTGTTCATCTTCT
TGCAATATATTTTGGGA

QA 1 677 1 677
DS 

RD RS1CT17JQ 782 0 0
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GCTGGGATTAGATCGTCTTGGTCGGTGTAGGGGATGGACCATGGGACATGATGAGGGAGT
TTGATGATAACATTCCTGCACGAGCTTTTGATAACTTCCAATTCGTCAACTTCACAGAGA
TCATGGCAAAGAACAAAGCTCAGTCCTTGAAAGAAACAGAGTTTGCTCTTTCTGCTCTCA
TGGAGATTCCTCAACAATACAAGGCTACCTTGGAGCTTAACCTTTTAGGAAGAAGAAATG
GGAATATAACGGAACGGTTTCCTCTTCCACCTCCAATGCAAGGTGGAGCATCGTCCTACA
ACAAGCCAAAGGCTAATGATCGTGTTCCAAGTTTCAAACCGAGTGTACCTTTTTATCCAA
CTGAAAACTATCATGTAAGGTCTAGTCCTCCTGCGCCACCCGCTACGACCTCAGCTTCTT
TTGATAACCAGATATGTCCGATTTGTCTGAGCAACCCTAAAGACATGGCTTTTGGTTGTG
GTCATCAGACTTGTTGCGAATGTGGACCGGATCTTGAAATGTGTCCAATTTGCCGTGCAC
CGATCCAGACAAGAATAAAACTCTACTAACAAAGTAGATCTCTCTTGTTCATCTTCTTGC
AATATATTTTGGGAATTTAGTTTGATATAACTTACTGAGGTTTTTCCGAGAAAGATCGGA
TCTTTCTGTAAAAAAAATATGTGTTAAGTGTGTTCCTTGATTCACTTTGCTTATTTCTTT
GG

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

CO CL7313Contig1 674 2 9 U
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AGCCAACAAGACAAAGTAAGAATAATAACAAACCACCTCAAAAGCAAACGAAACAAACAT
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GGAATCAATCTGATTTAAAGAGAGCAGTAAGCCTTGAGAGCAGATAAATCCCTCTTATGG
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AGACGGGGATGTTCATCATCAACAATCTCCTCAAGTGTATTTACCATCAGTCCTTCTTTG
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AAGCGTTTCCTCGC


BQ
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AF RS1EX58JQ U 32
AF RS1DD67JQ U 1
BS 1 35 RS1DD67JQ
BS 36 36 RS1EX58JQ
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BS 199 674 RS1DD67JQ

RD RS1EX58JQ 267 0 0
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AGTAAGCATCATAATTAAAAGGGTTAT

QA 1 267 1 267
DS 

RD RS1DD67JQ 674 0 0
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GTATCGGACGTATTGGTGATGTTGAACTTAAAGTAAGCATCATAATTAAAAGGCTTATAG
AGACGGGGATGTTCATCATCAACAATCTCCTCAAGTGTATTTACCATCAGTCCTTCTTTG
GGAAGCACGAACAGTCCAGCCACGTGCCGATCTTTCTTTCCGGTTATTACCACACGGTGA
TACGGAGGAAACACCCTACCATTCAGTAGTACATGAAGTGAAGCTCCGGCCATTATGAGG
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TCCACGCCATCTACTACGTCATTTTGACAAAGTATTGTAAGGACATGGCTATCGATATGA
GGGTTGAGGCCTGGCTGCTCCTCTTCGTTCTCGTCAAGCCCTCTATATTTGATGAGACCA
AAGCGTTTCCTCGC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

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AATCCCAGGTTGTTGAACTATATAGAGCGTATCTACTATCATTCTACCAACTTGCACTTC
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AAATTTATTTAGTTATATTATATGAACTATGTTTCTGTTTCCGTACTTTGTTACCTCAGT
TCTCAGTTATGAACCTACCGATTTATTTT


BQ
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AF RS1AR25JQ C 1
AF RS1AR25TFB U 1
BS 1 809 RS1AR25TFB

RD RS1AR25JQ 809 0 0
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TATGGTGATGCAGCTCAGGAGCCAGAGTTTTTCACTACTGCTCCTGCTCTGGCAATACCA
AAAGCTATTGCACATGCTGGTTTGGAATCTTCTCAAGTTGATTACTATGAGATCAATGAA
GCATTTGCAGTTGTAGCACTTGCAAATCAAAAGCTACTTGGGATTAGTTCGGAGAAGGTG
AATGTAAATGGAGGAGCCGTCTCCTTAGGACATCCTCTAGGCTGCAGTGGAGCGCGTATT
CTAATCACATTGCTTGGGATACTGAAGAAGAGAAACGGCAAGTACGGTGTCGGAGGAGTG
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AATCCCAGGTTGTTGAACTATATAGAGCGTATCTACTATCATTCTACCAACTTGCACTTC
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AAATTTATTTAGTTATATTATATGAACTATGTTTCTGTTTCCGTACTTTGTTACCTCAGT
TCTCAGTTATGAACCTACCGATTTATTTT

QA 1 809 1 809
DS 

RD RS1AR25TFB 809 0 0
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AGGTCTGGGAAGTTTGATGCTGCAAAACTGAGGAAACTCCGTCCGAGTTTCAAGGAGAAT
GGAGGCACAGTTACAGCTGGAAATGCCTCTAGCATAAGTGATGGTGCAGCTGCTGTTGTC
CTAGTGAGTGGAGAGAAGGCGCTTCAGCTAGGACTTCAAGTACTTGCAAAAGTTAAAGGT
TATGGTGATGCAGCTCAGGAGCCAGAGTTTTTCACTACTGCTCCTGCTCTGGCAATACCA
AAAGCTATTGCACATGCTGGTTTGGAATCTTCTCAAGTTGATTACTATGAGATCAATGAA
GCATTTGCAGTTGTAGCACTTGCAAATCAAAAGCTACTTGGGATTAGTTCGGAGAAGGTG
AATGTAAATGGAGGAGCCGTCTCCTTAGGACATCCTCTAGGCTGCAGTGGAGCGCGTATT
CTAATCACATTGCTTGGGATACTGAAGAAGAGAAACGGCAAGTACGGTGTCGGAGGAGTG
TGCAACGGAGGAGGAGGTGCTTCTGCTCTTGTTCTTGAACTCGTTTGATGCATTTATATG
AATCCCAGGTTGTTGAACTATATAGAGCGTATCTACTATCATTCTACCAACTTGCACTTC
AAGTTTGATATTGGTTTGGTCTCTCTCAATAAACGAGTGATGATGATCTTTGATGTTGTT
AAATTTATTTAGTTATATTATATGAACTATGTTTCTGTTTCCGTACTTTGTTACCTCAGT
TCTCAGTTATGAACCTACCGATTTATTTT

QA 1 809 1 809
DS 



AS 1 2

CO CL7315Contig1 678 2 2 U
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CTCGTCACTGACGGTTCCTGCTTGCTATGTAACTCCACTCTTGAAACTCGATCTCACCTC
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GCTGCGAGATACCTCCTACTTCTTACTTGGCAAACATCAATCTATGCAATTTGGACCGAA
CGGAATCACAGGCTGCATCGCTCCACCTTCCGCTCCATCTCCTCTATTCTCCTTGAGACA
GAAAGAACTATCAGAAGAAGGATTGCTAGCATCAGAGTGGACAATCGCGAACTCTCATCG
GACATGCTGGCCATTTGGTTCTCCTCCTCCCTTGCTGCACCACCGATCATCCCTTCCATC
CCCTGACTCTTCCGTTACTATCGATGTTTACTTCAAAACAGGATGGGCCTGTTTCTTTCT
TTTTCAATTATTCCTGGGCTTTCTTTAATTGGGTTCTACTCTAGATTGGGTTGTTTCACA
TGTAATGGCTCTTAGCCCACTAAGCTAGGCTTTGTATCATTTGCACTCTTATGCTTTTTA
AATAGAAAATCTCTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GM91TF U 1
AF RS1GM91JQ C 173
BS 1 624 RS1GM91TF
BS 625 678 RS1GM91JQ

RD RS1GM91TF 624 0 0
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GCTGCGAGATACCTCCTACTTCTTACTTGGCAAACATCAATCTATGCAATTTGGACCGAA
CGGAATCACAGGCTGCATCGCTCCACCTTCCGCTCCATCTCCTCTATTCTCCTTGAGACA
GAAAGAACTATCAGAAGAAGGATTGCTAGCATCAGAGTGGACAATCGCGAACTCTCATCG
GACATGCTGGCCATTTGGTTCTCCTCCTCCCTTGCTGCACCACCGATCATCCCTTCCATC
CCCTGACTCTTCCGTTACTATCGATGTTTACTTCAAAACAGGATGGGCCTGTTTCTTTCT
TTTTCAATTATTCCTGGGCTTTCTTTAATTGGGTTCTACTCTAGATTGGGTTGTTTCACA
TGTAATGGCTCTTAGCCCACTAAG

QA 1 624 1 624
DS 

RD RS1GM91JQ 506 0 0
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TTGAGACAGAAAGAACTATCAGAAGAAGGATTGCTAGCATCAGAGTGGACAATCGCGAAC
TCTCATCGGACATGCTGGCCATTTGGTTCTCCTCCTCCCTTGCTGCACCACCGATCATCC
CTTCCATCCCCTGACTCTTCCGTTACTATCGATGTTTACTTCAAAACAGGATGGGCCTGT
TTCTTTCTTTTTCAATTATTCCTGGGCTTTCTTTAATTGGGTTCTACTCTAGATTGGGTT
GTTTCACATGTAATGGCTCTTAGCCCACTAAGCTAGGCTTTGTATCATTTGCACTCTTAT
GCTTTTTAAATAGAAAATCTCTTATT

QA 1 506 1 506
DS 



AS 1 2

CO CL7316Contig1 859 2 4 U
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CCGTCATCGACGCAACCAAACCGGATGTTCGTGCACTCAGGCACGTCGGGAGGAGCAACA
AGCAACAACCCAAAGAAACTTGCATTAGGTTATCCTCAAAGAACCATTTTCGAAAATCTT
GATGAAGCCGATATCTCTTTCGGAATATACTTCCAGAATGTTCAGGCGGTATTGTTTTAT
CGTAACCTAAGGAAACTCAAATACATTTTTAAGTTCCATAGCTATGCCTTATCCTTCAAG
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ACAAAACTTGAGCCAGCTAGTGATGATCATCCATCTCATGACGTCTACCAAGGACAGAAG
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TTGATCACCTACGACGAGCACGGTGGATATTTCGACCATGTGTCAACACCGGTTCGCAAT
GTGCCTAGCCCGGACGGTATAGTCGGACCAGAACCATTCCTATTCGAATTCAACCGCTTA
GGTATTCGTGTACCAACAATAGCTGTGTCTCCATGGATAGAGAAAGGAACGGTCGTACAT
GGACCAAACGGGTCACCTTTCCCATCATCTGAATATGAGCATTCTTCGATCCCGGCGACT
GTAAAGAAACTGTTCAATCTATCAGCGCCTTTCCTCACAAAAAGAGATGAATGGGCAGGG
ACGTTTGAGAACATTTTGCAAATCCGAAAAGAGCCTAGAACTGATTGTCCCGAGACGTTA
CCCGAACCAGTTAAGATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A001TF U 1
AF RS1A001TV U 31
BS 1 50 RS1A001TF
BS 51 51 RS1A001TV
BS 52 851 RS1A001TF
BS 852 859 RS1A001TV

RD RS1A001TF 851 0 0
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CCGTCATCGACGCAACCAAACCGGATGTTCGTGCACTCAGGCACGTCGGGAGGAGCAACA
AGCAACAACCCAAAGAAACTTGCATTAGGTTATCCTCAAAGAACCATTTTCGAAAATCTT
GATGAAGCCGATATCTCTTTCGGAATATACTTCCAGAATGTTCAGGCGGTATTGTTTTAT
CGTAACCTAAGGAAACTCAAATACATTTTTAAGTTCCATAGCTATGCCTTATCCTTCAAG
GATCATGCAATGAAAGGAAAGCTCCCTGGTTATACTGTGATCGAGCAACGTTACATGGAT
ACAAAACTTGAGCCAGCTAGTGATGATCATCCATCTCATGACGTCTACCAAGGACAGAAG
TTTATAAAGGAAGTGTACGAGACACTAAGAGCTAGCCCACAATGGAATGAAACCCTACTC
TTGATCACCTACGACGAGCACGGTGGATATTTCGACCATGTGTCAACACCGGTTCGCAAT
GTGCCTAGCCCGGACGGTATAGTCGGACCAGAACCATTCCTATTCGAATTCAACCGCTTA
GGTATTCGTGTACCAACAATAGCTGTGTCTCCATGGATAGAGAAAGGAACGGTCGTACAT
GGACCAAACGGGTCACCTTTCCCATCATCTGAATATGAGCATTCTTCGATCCCGGCGACT
GTAAAGAAACTGTTCAATCTATCAGCGCCTTTCCTCACAAAAAGAGATGAATGGGCAGGG
ACGTTTGAGAACATTTTGCAAATCCGAAAAGAGCCTAGAACTGATTGTCCCGAGACGTTA
CCCGAACCAGT

QA 1 851 1 851
DS 

RD RS1A001TV 829 0 0
TTCGGCCATTACGGCCGGGGAGCATCGGTTCCGTCATCGACGCAACCAAACCGGATGTTC
GTGCACTCAGGCACGTCGGGAGGAGCAACAAGCAACAACCCAAAGAAACTTGCATTAGGT
TATCCTCAAAGAACCATTTTCGAAAATCTTGATGAAGCCGATATCTCTTTCGGAATATAC
TTCCAGAATGTTCAGGCGGTATTGTTTTATCGTAACCTAAGGAAACTCAAATACATTTTT
AAGTTCCATAGCTATGCCTTATCCTTCAAGGATCATGCAATGAAAGGAAAGCTCCCTGGT
TATACTGTGATCGAGCAACGTTACATGGATACAAAACTTGAGCCAGCTAGTGATGATCAT
CCATCTCATGACGTCTACCAAGGACAGAAGTTTATAAAGGAAGTGTACGAGACACTAAGA
GCTAGCCCACAATGGAATGAAACCCTACTCTTGATCACCTACGACGAGCACGGTGGATAT
TTCGACCATGTGTCAACACCGGTTCGCAATGTGCCTAGCCCGGACGGTATAGTCGGACCA
GAACCATTCCTATTCGAATTCAACCGCTTAGGTATTCGTGTACCAACAATAGCTGTGTCT
CCATGGATAGAGAAAGGAACGGTCGTACATGGACCAAACGGGTCACCTTTCCCATCATCT
GAATATGAGCATTCTTCGATCCCGGCGACTGTAAAGAAACTGTTCAATCTATCAGCGCCT
TTCCTCACAAAAAGAGATGAATGGGCAGGGACGTTTGAGAACATTTTGCAAATCCGAAAA
GAGCCTAGAACTGATTGTCCCGAGACGTTACCCGAACCAGTTAAGATAG

QA 1 829 1 829
DS 



AS 1 2

CO CL7317Contig1 877 2 1 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGTCTCTTCT
TCGCAAGGAAGGAGGGGGAAGGTGAAGGAAACCTTCTTCGAAAATCCCTTCCCTTCTTTA
ATAAGATGAAGAATCAGTATAGTCTTGGAATTGATGGTTTACGAACCTCTCTTTCCCCTC
CCCCCATCGATTCATCTTCTTCCAAATCTGAACACGAGGATTCTATCTTTCGTGATTATA
CTCTAGACCTCTCCTTCTTATCCTCCGATGATTCTCTATCCAACTTGTCTCGCCATGTGG
ACACAACCAAAGAAAGACAGATTGTAGAGGACAAGACAGTCCCTAATCCACTTGTCTCGA
AACTGCCTGAGACGCTGATTGTGTCCTCCACTGTTGCTGGTGATGGCAAATTGGAACTTT
CATGTCCCAACACAACTTTATTATCTGAAAATTCTTCAACAGACTCCGAGGAAGATACTC
CTTGCTGGGTAGGAATAAACTCTCGCAAGACTCTCCCCTCAGGTGCCATCTGCAGGCGCT
CTACTACTGATGATCTCACTGGGTTTCCTAGGTTGAATCCATTGGCCCCACAGTTCATAC
CATCCAACTCTAAGAAGATTCTTGAAAAGGATGTGAAAAGCTGTGAAGAGAAAGGCTCTT
CTTCTTCCTCTTTGAAGAAGTCTCTCTCTTCGGATTTTCCATCATCGTCGTCAGGTGAAA
GTTTGGGTTTTGTATCTCAAGATGAGTTCCAACAATCTAAGAGGTTGGATCCTTTGGCCC
CTCTGTTTGTTCCCTCCAATGCAAAACTAAGTCATGAAAAGCAAGTAGCTTTTGAGACAA
CTTCTGCTCTTACTTATTCAGATAATAAGTCGCTAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A237TV U 1
AF RS1A237TF U 54
BS 1 877 RS1A237TV

RD RS1A237TV 877 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGTCTCTTCT
TCGCAAGGAAGGAGGGGGAAGGTGAAGGAAACCTTCTTCGAAAATCCCTTCCCTTCTTTA
ATAAGATGAAGAATCAGTATAGTCTTGGAATTGATGGTTTACGAACCTCTCTTTCCCCTC
CCCCCATCGATTCATCTTCTTCCAAATCTGAACACGAGGATTCTATCTTTCGTGATTATA
CTCTAGACCTCTCCTTCTTATCCTCCGATGATTCTCTATCCAACTTGTCTCGCCATGTGG
ACACAACCAAAGAAAGACAGATTGTAGAGGACAAGACAGTCCCTAATCCACTTGTCTCGA
AACTGCCTGAGACGCTGATTGTGTCCTCCACTGTTGCTGGTGATGGCAAATTGGAACTTT
CATGTCCCAACACAACTTTATTATCTGAAAATTCTTCAACAGACTCCGAGGAAGATACTC
CTTGCTGGGTAGGAATAAACTCTCGCAAGACTCTCCCCTCAGGTGCCATCTGCAGGCGCT
CTACTACTGATGATCTCACTGGGTTTCCTAGGTTGAATCCATTGGCCCCACAGTTCATAC
CATCCAACTCTAAGAAGATTCTTGAAAAGGATGTGAAAAGCTGTGAAGAGAAAGGCTCTT
CTTCTTCCTCTTTGAAGAAGTCTCTCTCTTCGGATTTTCCATCATCGTCGTCAGGTGAAA
GTTTGGGTTTTGTATCTCAAGATGAGTTCCAACAATCTAAGAGGTTGGATCCTTTGGCCC
CTCTGTTTGTTCCCTCCAATGCAAAACTAAGTCATGAAAAGCAAGTAGCTTTTGAGACAA
CTTCTGCTCTTACTTATTCAGATAATAAGTCGCTAGG

QA 1 877 1 877
DS 

RD RS1A237TF 808 0 0
CTCTTCTTCGCAAGGAAGGAGGGGGAAGGTGAAGGAAACCTTCTTCGAAAATCCCTTCCC
TTCTTTAATAAGATGAAGAATCAGTATAGTCTTGGAATTGATGGTTTACGAACCTCTCTT
TCCCCTCCCCCCATCGATTCATCTTCTTCCAAATCTGAACACGAGGATTCTATCTTTCGT
GATTATACTCTAGACCTCTCCTTCTTATCCTCCGATGATTCTCTATCCAACTTGTCTCGC
CATGTGGACACAACCAAAGAAAGACAGATTGTAGAGGACAAGACAGTCCCTAATCCACTT
GTCTCGAAACTGCCTGAGACGCTGATTGTGTCCTCCACTGTTGCTGGTGATGGCAAATTG
GAACTTTCATGTCCCAACACAACTTTATTATCTGAAAATTCTTCAACAGACTCCGAGGAA
GATACTCCTTGCTGGGTAGGAATAAACTCTCGCAAGACTCTCCCCTCAGGTGCCATCTGC
AGGCGCTCTACTACTGATGATCTCACTGGGTTTCCTAGGTTGAATCCATTGGCCCCACAG
TTCATACCATCCAACTCTAAGAAGATTCTTGAAAAGGATGTGAAAAGCTGTGAAGAGAAA
GGCTCTTCTTCTTCCTCTTTGAAGAAGTCTCTCTCTTCGGATTTTCCATCATCGTCGTCA
GGTGAAAGTTTGGGTTTTGTATCTCAAGATGAGTTCCAACAATCTAAGATGTTGGATCCT
TTGGCCCCTCTGTTTGTTCC*TCCA*TGCAAA*CTAAGTCATGAAAAGCAAGTAGCTTTT
GAGACA*CTTCTGCTCTTACTTATTCAG

QA 1 808 1 808
DS 



AS 1 2

CO CL7318Contig1 779 2 3 U
TTCGAGACACGAGTTCATATTCATACGCACAAAGATATAAGTTCACATCTGCTCTTGTTA
TTCATGAAAATAGTAGGAATTTTCTCTGTTTTTTTTTTGGTCTTAAATAAAATGCTTTTG
ATCCACAAAGGAGCCACACACACACAAACTAGCCAGGTGTGGAGGTATATGACCTCCTTA
TTACATCACTATCTTCCTCGATAAAGTGACAGCTTAGCCCTGAAGACCAATAATACCGCA
AGCAACACGGCCGCCTGCATTTCCAGTAGCCAAGCTGAGTTCATGGCCTCCCTTTCCGAG
GTCATCAGGGTCTGCGTGGACAACAACAGCCCTTCCGACAATAGAGTTTGGTCCACTAAG
AGGAATCTGGCAGTCAGTGATTGTGAAGGTGGCAGTTCCATCATCTCCAACAGTGATGTT
TCCTAAATCACCAGCATGTCGATTAGCATCCTCCGGGGCACCGTGTTGTTTACCCTCAGG
GTTGAAATGTGGACCGGTAGACATGCAACCGTTAGTGGTGTCACCAAGAGCATGGACATG
GAAACCATGTAGACCAGGTTTAAGTCCAGAAACTGTTCCAGTCACAGTTGTCACACCGTC
TCCTTCCTGAGTGAAGAAGATAGTCCCCTTAACACCCTCGCTGCTGTTTAAAACTGCAAC
TCCCTTGGCCATAGTTTGTTATCCTTTGTGATCTCAGGGTACCCCTTTGGGAAAGAAGAT
TTTTAGCTATGAAAATGCCCGAATCTTCTTCTCTCGATGAGATTTGTGTGTGTTTCCCT


BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G206JQ U 2
AF RS1G206TF C 1
BS 1 3 RS1G206TF
BS 4 693 RS1G206JQ
BS 694 779 RS1G206TF

RD RS1G206JQ 692 0 0
CG
GAGACACGAGTTCATATTCATACGCACAAAGATATAAGTTCACATCTGCTCTTGTTATTC
ATGAAAATAGTAGGAATTTTCTCTGTTTTTTTTTTGGTCTTAAATAAAATGCTTTTGATC
CACAAAGGAGCCACACACACACAAACTAGCCAGGTGTGGAGGTATATGACCTCCTTATTA
CATCACTATCTTCCTCGATAAAGTGACAGCTTAGCCCTGAAGACCAATAATACCGCAAGC
AACACGGCCGCCTGCATTTCCAGTAGCCAAGCTGAGTTCATGGCCTCCCTTTCCGAGGTC
ATCAGGGTCTGCGTGGACAACAACAGCCCTTCCGACAATAGAGTTTGGTCCACTAAGAGG
AATCTGGCAGTCAGTGATTGTGAAGGTGGCAGTTCCATCATCTCCAACAGTGATGTTTCC
TAAATCACCAGCATGTCGATTAGCATCCTCCGGGGCACCGTGTTGTTTACCCTCAGGGTT
GAAATGTGGACCGGTAGACATGCAACCGTTAGTGGTGTCACCAAGAGCATGGACATGGAA
ACCATGTAGACCAGGTTTAAGTCCAGAAACTGTTCCAGTCACAGTTGTCACACCGTCTCC
TTCCTGAGTGAAGAAGATAGTCCCCTTAACACCCTCGCTGCTGTTTAAAACTGCAACTCC
CTTGGCCATAGTTTGTTATCCTTTGTGATC

QA 3 692 3 692
DS 

RD RS1G206TF 779 0 0
TTCGAGACACGAGTTCATATTCATACGCACAAAGATATAAGTTCACATCTGCTCTTGTTA
TTCATGAAAATAGTAGGAATTTTCTCTGTTTTTTTTT*GGTCTTAAATAAAATGCTTTTG
ATCCACAAAGGAGCCACACACACACAAACTAGCCAGGTGTGGAGGTATATGACCTCCTTA
TTACATCACTATCTTCCTCGATAAAGTGACAGCTTAGCCCTGAAGACCAATAATACCGCA
AGCAACACGGCCGCCTGCATTTCCAGTAGCCAAGCTGAGTTCATGGCCTCCCTTTCCGAG
GTCATCAGGGTCTGCGTGGACAACAACAGCCCTTCCGACAATAGAGTTTGGTCCACTAAG
AGGAATCTGGCAGTCAGTGATTGTGAAGGTGGCAGTTCCATCATCTCCAACAGTGATGTT
TCCTAAATCACCAGCATGTCGATTAGCATCCTCCGGGGCACCGTGTTGTTTACCCTCAGG
GTTGAAATGTGGACCGGTAGACATGCAACCGTTAGTGGTGTCACCAAGAGCATGGACATG
GAAACCATGTAGACCAGGTTTAAGTCCAGAAACTGTTCCAGTCACAGTTGTCACACCGTC
TCCTTCCTGAGTGAAGAAGATAGTCCCCTTAACACCCTCGCTGCTGTTTAAAACTGCAAC
TCCCTTGGCCATAGTTTGTTATCCTTTGTGATCTCAGGGTACCCCTTTGGGAAAGAAGAT
TTTTAGCTATGAAAATGCCCGAATCTTCTTCTCTCGATGAGATTTGTGTGTGTTTCCCT

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

CO CL7319Contig1 1097 2 8 U
AAAGTATTGTGACATGACACTTCTTTCTTGTGCGTATGCTGGAACTGGGAATGTCCTTAA
GGTCCAAGACCTTCTGGCTCAGTGTGGAGAGCATCTGGAGAAAGGTGATAACCACCAGGG
TCCAGCTGTGCTTGGATTAGCGATGGTTGTTATGTCTGAAGAATTGGGTCTTGATATGGC
GATCCGTTCTCTCGAGCGCGTGCTACAGTATGGAGAACAGAACGTTCGTCGTGCGGTGCC
TTTGGCCCTTGGTCTCCTATGTATATCAAACCCAAAGGTGACTGTTATGGACACCTTGAG
CCGACTTAGCCATGACACAGATTCAGAAGTTGCCATGTCAGCGATTATTTCCCTTGGTTT
GATCGGCGCTGGAACTAACAACGCAAGGATTGCCGGCATGCTTAGAAACCTCTCCAGCTA
TTATTACAAGGATGCCAGCCTTCTCTTCTGTGTGCGTATTGCTCAAGGGCTGGTGCATAT
GGGAAAGGGTCTCTTAACTCTAAGCCCCTTCCACTCCGAGAGGCTCTTGCTATCTCCAAC
CGCGCTTGCTGGTATAGTGACATTGTTGCATGCATGCCTTGACATGAAATCCATCATACT
GGGGAAATACCATTTTGTGCTCTACTTCCTCGTTCTAGCGATGCAGCCAAGGATGATGCT
GACGGTGGATGAGAACCTGAAGCCCATCTCCGTGCCGGTGCGGGTAGGACAAGCGGTTGA
TGTGGTTGGACAGGCAGGTCGACCCAAGACAATCACTGGGTTCCAAACGCACTCAACACC
AGTTCTCCTTGCTGCTGGGGAGAGAGCTGAGCTCGCAACTGACAAGTACATTCCGTTGTC
TCCCATACTGGAAGGTTTCATCATATTGAAAGAAAATCCAGACTATAGAGAGGAGTGAAT
CCAAAGTTTGAAGTGAAGAGCAGTCAACTACTCTCAGGAAGAGCTATCCTAATGGTTGTT
ATGTGCACAACGAATCCTTTTATTTGCTTAGTTTATTTGGCTTTATGTTCCCATTAAATG
GTTTAGTTAACAATTTATTTTTGTTGAAACGCTTATTGTGCACTAAATCATTCTAAAGTT
GGATCATCCTTTTCCCC


BQ
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AF RS1GJ62TF U 1
AF RS1GJ62JQ C 457
BS 1 651 RS1GJ62TF
BS 652 652 RS1GJ62JQ
BS 653 664 RS1GJ62TF
BS 665 665 RS1GJ62JQ
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BS 676 688 RS1GJ62TF
BS 689 1097 RS1GJ62JQ

RD RS1GJ62TF 688 0 0
AAAGTATTGTGACATGACACTTCTTTCTTGTGCGTATGCTGGAACTGGGAATGTCCTTAA
GGTCCAAGACCTTCTGGCTCAGTGTGGAGAGCATCTGGAGAAAGGTGATAACCACCAGGG
TCCAGCTGTGCTTGGATTAGCGATGGTTGTTATGTCTGAAGAATTGGGTCTTGATATGGC
GATCCGTTCTCTCGAGCGCGTGCTACAGTATGGAGAACAGAACGTTCGTCGTGCGGTGCC
TTTGGCCCTTGGTCTCCTATGTATATCAAACCCAAAGGTGACTGTTATGGACACCTTGAG
CCGACTTAGCCATGACACAGATTCAGAAGTTGCCATGTCAGCGATTATTTCCCTTGGTTT
GATCGGCGCTGGAACTAACAACGCAAGGATTGCCGGCATGCTTAGAAACCTCTCCAGCTA
TTATTACAAGGATGCCAGCCTTCTCTTCTGTGTGCGTATTGCTCAAGGGCTGGTGCATAT
GGGAAAGGGTCTCTTAACTCTAAGCCCCTTCCACTCCGAGAGGCTCTTGCTATCTCCAAC
CGCGCTTGCTGGTATAGTGACATTGTTGCATGCATGCCTTGACATGAAATCCATCATACT
GGGGAAATACCATTTTGTGCTCTACTTCCTCGTTCTAGCGATGCAGCCAAG*ATGATGCT
GACG*TGGATGAGA*CCTGAAGCCCATC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RS1GJ62JQ 641 0 0
TATTGCTCAAGGGCTGGTGCATATGGGAAAGGGTCTCTTAACTCTAAGCCCCTTCCACTC
CGAGAGGCTCTTGCTATCTCCAACCGCGCTTGCTGGTATAGTGACATTGTTGCATGCATG
CCTTGACATGAAATCCATCATACTGGGGAAATACCATTTTGTGCTCTACTTCCTCGTTCT
AGCGATGCAGCCAAGGATGATGCTGACGGTGGATGAGAACCTGAAGCCCATCTCCGTGCC
GGTGCGGGTAGGACAAGCGGTTGATGTGGTTGGACAGGCAGGTCGACCCAAGACAATCAC
TGGGTTCCAAACGCACTCAACACCAGTTCTCCTTGCTGCTGGGGAGAGAGCTGAGCTCGC
AACTGACAAGTACATTCCGTTGTCTCCCATACTGGAAGGTTTCATCATATTGAAAGAAAA
TCCAGACTATAGAGAGGAGTGAATCCAAAGTTTGAAGTGAAGAGCAGTCAACTACTCTCA
GGAAGAGCTATCCTAATGGTTGTTATGTGCACAACGAATCCTTTTATTTGCTTAGTTTAT
TTGGCTTTATGTTCCCATTAAATGGTTTAGTTAACAATTTATTTTTGTTGAAACGCTTAT
TGTGCACTAAATCATTCTAAAGTTGGATCATCCTTTTCCCC

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

CO CL7320Contig1 832 2 4 U
GGGTGGCTCATGCTTATTGGCTTCTCCATTTAACACGAAAGGAATAAAAGTCGTGTCTTC
TCTTTCCGCCGGCGCTCCTACGAACGAGCTCTGATGCAGCAAGCACGTCTACAACAACGT
TCATGGCAACATCTACCTCGATCCGGAGTTCTGACTTCAAAAACTTTTGGAACTTTAATC
TCTAAATCCTCTGAAGATTTAACCTCTGAAACTTTAAGAAGTTCCGACTCTGCAGATTTA
ACTTCATCAGTCCTGAGAACATTCTTATCTTCCAAGACCTCAGGAACATCCGAGTCTTTT
GTAACCTTAGCGTCACACGATTCAGGAGGAGCGTGAACCTCAGAACCTTCTGGAACTGTC
TTATCCTCAAAAACCTCAGGAACATCTGAATCTTTTGTAACCTTCACCTCAGACAATTCA
AGACGACCAAGAGCTTCAGAAACCTCTTACTCATTCTTATCTTCCAATACCTTAGGAACA
TCTGACTCTTTCGTAACTTTCATGTCAGATAATTCTAAAGCTTTGTCTTCATTATGCTCC
ACATTTCTCTTACCATTTGCTTTGATCCTTTGCTTAGAACAAGAATCACATTTCTCTTAT
CATTTTACTTTGCTTTCTACCTTTTTCTTTTTTGCTCTTATCATTTCTCTTCTATATGGC
TTCTCCTTCTAATAATATTGAAGACATGATGGATGAAAAATTTGATCAAATTTTTATCAA
CAATTCTAATCGGCTTTTTTCTCGTTTATGATTGGTATTTGTATTTTTAATATGCTTTTG
TCATTTTTATTAAAAATTTTATGTATACTTTTATTTTGAATCATTCAACTTT


BQ
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AF RS1AF32JQ C 1
AF RS1AF32TF U 1
BS 1 795 RS1AF32TF
BS 796 796 RS1AF32JQ
BS 797 819 RS1AF32TF
BS 820 832 RS1AF32JQ

RD RS1AF32JQ 832 0 0
GGGTGGCTCATGCTTATTGGCTTCTCCATTTAACACGAAAGGAATAAAAGTCGTGTCTTC
TCTTTCCGCCGGCGCTCCTACGAACGAGCTCTGATGCAGCAAGCACGTCTACAACAACGT
TCATGGCAACATCTACCTCGATCCGGAGTTCTGACTTCAAAAACTTTTGGAACTTTAATC
TCTAAATCCTCTGAAGATTTAACCTCTGAAACTTTAAGAAGTTCCGACTCTGCAGATTTA
ACTTCATCAGTCCTGAGAACATTCTTATCTTCCAAGACCTCAGGAACATCCGAGTCTTTT
GTAACCTTAGCGTCACACGATTCAGGAGGAGCGTGAACCTCAGAACCTTCTGGAACTGTC
TTATCCTCAAAAACCTCAGGAACATCTGAATCTTTTGTAACCTTCACCTCAGACAATTCA
AGACGACCAAGAGCTTCAGAAACCTCTTACTCATTCTTATCTTCCAATACCTTAGGAACA
TCTGACTCTTTCGTAACTTTCATGTCAGATAATTCTAAAGCTTTGTCTTCATTATGCTCC
ACATTTCTCTTACCATTTGCTTTGATCCTTTGCTTAGAACAAGAATCACATTTCTCTTAT
CATTTTACTTTGCTTTCTACCTTTTTCTTTTT*GCTCTTATCATTTCTCTTCTATATGGC
TTCTCCTTCTAATAATATTGAAGACATGATGGATGAAAAATTTGATCAAATTTTTATCAA
CAATTCTAATCGGCTTTTTTCTCGTTTATGATTGGTATTTGTATTTTTAATATGCTTTTG
TCATTTTTATTAAAAATTTTATGTATACTTTTATTTTGAATCATTCAACTTT

QA 1 832 1 832
DS 

RD RS1AF32TF 820 0 0
GGGTGGCTCATGCTTATTGGCTTCTCCATTTAACACGAAAGGAATAAAAGTCGTGTCTTC
TCTTTCCGCCGGCGCTCCTACGAACGAGCTCTGATGCAGCAAGCACGTCTACAACAACGT
TCATGGCAACATCTACCTCGATCCGGAGTTCTGACTTCAAAAACTTTTGGAACTTTAATC
TCTAAATCCTCTGAAGATTTAACCTCTGAAACTTTAAGAAGTTCCGACTCTGCAGATTTA
ACTTCATCAGTCCTGAGAACATTCTTATCTTCCAAGACCTCAGGAACATCCGAGTCTTTT
GTAACCTTAGCGTCACACGATTCAGGAGGAGCGTGAACCTCAGAACCTTCTGGAACTGTC
TTATCCTCAAAAACCTCAGGAACATCTGAATCTTTTGTAACCTTCACCTCAGACAATTCA
AGACGACCAAGAGCTTCAGAAACCTCTTACTCATTCTTATCTTCCAATACCTTAGGAACA
TCTGACTCTTTCGTAACTTTCATGTCAGATAATTCTAAAGCTTTGTCTTCATTATGCTCC
ACATTTCTCTTACCATTTGCTTTGATCCTTTGCTTAGAACAAGAATCACATTTCTCTTAT
CATTTTACTTTGCTTTCTACCTTTTTCTTTTTTGCTCTTATCATTTCTCTTCTATATGGC
TTCTCCTTCTAATAATATTGAAGACATGATGGATGAAAAATTTGATCAAATTTTTATCAA
CAATTCTAATCGGCTTTTTTCTCGTTTATGATTGGTATTTGTATTTTTAATATGCTTTTG
TCATTTTTATTAAAA*TTTTATGTATACTTTTATTTTGA
T

QA 1 819 1 819
DS 



AS 1 2

CO CL7321Contig1 937 2 4 U
GGGAACCGCGGCGTCACAGGGTGTGTACTACTACTTCTACCAAGTGTTTCGTAACCAAGT
TGAAGCTGCTGCTCTTCGACAAAAGAAGAAAGGGTTTGGTGACGGATCTGTTGGCATGTT
TTCTTCTCTCCTAGTTGCTGCCTTAGCTGGATCAGTTAATGTTCTTACGACGAATCCAAT
TTGGGTGATTGTTACACGCATGCAGACCCACAAAAAAATACCAAAAGGTCTGCAGACTGT
CCCCGAGCCACCTTCTGCTGATGTAGAAGCTCTGGTCCCAGTTGAGCCGCGTCCATACGG
CCTTTAACACGATTCAAGAGATTTACGATGAAGCTGGAGTGACTGGCTTCTGGAAAGGTG
TAATTCCTACATTGATCATGGTTTGTAATCCAGCAATGCAATTTATGTTATACGAGACAA
TGTTATCAAAGCTGAAGAAAAAACGTGCGCTCAAGGGTAGCACCAACGTGACGGCTTTGG
AGACATTTCTTCTTGGAGCTGTGGCTAAACTCGGAGCTACAGTCACAACTTATCCTCTCT
TGGTTGTAAAGTCACGACTTCAAGCCAAACAGGTCACCACAGGGGACAAAAAACAATATT
ACAAAGGAACGCTGGATGCGATTCTGAAGATGATACAATACGAAGGGCTGCACGGGTTCT
ACAAAGGGATGAGCACGAAGATTGTTCAGAGCGTTTTCGCTGCTGCTGTTCTGTTCATGA
TCAAAGAAGAGCTTGTCAAGGGTGCTAAGCTTTTGCTCTCCAACGCCACTTCTATCAAAT
CCAAGCCTTCTTGAAGCTCAATCCAACTAGGATTTTAAAAATAAGATGAGTATGGAAAAA
AAGAGAGGTTAAATTAAACTTCCTATTGGAATGTCATGTTCCTGATTATTGCAATTAAGT
ATTGTATTTCTGCAAGAATATTGTGTGTTTCTTATCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DL70TF U 1
AF RS1DL70JQ C 377
BS 1 696 RS1DL70TF
BS 697 697 RS1DL70JQ
BS 698 788 RS1DL70TF
BS 789 937 RS1DL70JQ

RD RS1DL70TF 798 0 0
GGGAACCGCGGCGTCACAGGGTGTGTACTACTACTTCTACCAAGTGTTTCGTAACCAAGT
TGAAGCTGCTGCTCTTCGACAAAAGAAGAAAGGGTTTGGTGACGGATCTGTTGGCATGTT
TTCTTCTCTCCTAGTTGCTGCCTTAGCTGGATCAGTTAATGTTCTTACGACGAATCCAAT
TTGGGTGATTGTTACACGCATGCAGACCCACAAAAAAATACCAAAAGGTCTGCAGACTGT
CCCCGAGCCACCTTCTGCTGATGTAGAAGCTCTGGTCCCAGTTGAGCCGCGTCCATACGG
CCTTTAACACGATTCAAGAGATTTACGATGAAGCTGGAGTGACTGGCTTCTGGAAAGGTG
TAATTCCTACATTGATCATGGTTTGTAATCCAGCAATGCAATTTATGTTATACGAGACAA
TGTTATCAAAGCTGAAGAAAAAACGTGCGCTCAAGGGTAGCACCAACGTGACGGCTTTGG
AGACATTTCTTCTTGGAGCTGTGGCTAAACTCGGAGCTACAGTCACAACTTATCCTCTCT
TGGTTGTAAAGTCACGACTTCAAGCCAAACAGGTCACCACAGGGGACAAAAAACAATATT
ACAAAGGAACGCTGGATGCGATTCTGAAGATGATACAATACGAAGGGCTGCACGGGTTCT
ACAAAGGGATGAGCACGAAGATTGTTCAGAGCGTTT*CGCTGCTGCTGTTCTGTTCATGA
TCAAAGAAGAGCTTGTCAAGGGTGCTAAGCTTTTGCTCTCCAACGCCACTTCTATCAAAT
CCAAGCCT
CTGAGCTCAT

QA 1 788 1 788
DS 

RD RS1DL70JQ 561 0 0
CATGGTTTGTAATCCAGCAATGCAATTTATGTTATACGAGACAATGTTATCAAAGCTGAA
GAAAAAACGTGCGCTCAAGGGTAGCACCAACGTGACGGCTTTGGAGACATTTCTTCTTGG
AGCTGTGGCTAAACTCGGAGCTACAGTCACAACTTATCCTCTCTTGGTTGTAAAGTCACG
ACTTCAAGCCAAACAGGTCACCACAGGGGACAAAAAACAATATTACAAAGGAACGCTGGA
TGCGATTCTGAAGATGATACAATACGAAGGGCTGCACGGGTTCTACAAAGGGATGAGCAC
GAAGATTGTTCAGAGCGTTTTCGCTGCTGCTGTTCTGTTCATGATCAAGGAAGAGCTTGT
CAAGGGTGCTAAGCTTTTGCTCTCCAACGCCACTTCTATCAAATCCAAGCCTTCTTGAAG
CTCAATCCAACTAGGATTTTAAAAATAAGATGAGTATGGAAAAAAAGAGAGGTTAAATTA
AACTTCCTATTGGAATGTCATGTTCCTGATTATTGCAATTAAGTATTGTATTTCTGCAAG
AATATTGTGTGTTTCTTATCA

QA 1 561 1 561
DS 



AS 1 2

CO CL7322Contig1 803 2 1 U
GCAAATAGAAGCATGCAAGCCTGAGGACGATGTTAACGGACAGCCTATTGTGCCGTGTGG
TCTGATCGCTTGGAGTCTCTTTAACGACACATACACTCTATCAAAAAACAACCAGCCTTT
AAACGTAAGCAAGAGAGGAATTGCGTGGAAGAGTGACAGGGAACACAAGTTCGGCAAAAA
TGTGTTTCCCAAGAACTTTCAGATGGGCAATATCACCGGTGGTGGCAGACTGATTCCAAA
CTTACCGCTGAGTGAGCAAGAGGATCTGATTGTGTGGATGAGGACTGCAGCTTTGCCAAC
GTTTAGGAAACTATATGCGAAGATAGAGACTGACCTGCAGGAGAATGATACAATACACGT
GGTTCTGGAGAACAACTACAACACGTACAGTTTCGATGGGAAGAAGAAGCTTGTTTTGTC
AACAACTAGTTGGCTGGGTGGGAAGAATGACTTCCTCGGCATTGCTTACCTCACGGTTGG
AGGAATCTGCTTCTTCTTGGCACTTGCGTTTACCATCATGTACCTTGTGAAACCAAGGCG
ACTTGGAGATCCTACTTACTTGTCATGGAACAGGGTACCAGGAGGAGGTCGGTAAACACA
AAGACTCTGTATTCTCCTTGTGTAAATCTCTTCTATCTTTTTTTTTTTAATTTTTGTAAC
ACATAAATCTCTTTTATCCTGAATGTAACTTCAGCCAAAACTCTGCTAGTAATGATATGT
ATTTGATAGATGTGAAATGCATGATGTAACAGTTGAAAGATTGCTACCATTACACGGATG
AGAAAAGCTACCTCTCTTTTCAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AH59JQ C 1
AF RS1AH59TF U 1
BS 1 803 RS1AH59TF

RD RS1AH59JQ 803 0 0
GCAAATAGAAGCATGCAAGCCTGAGGACGATGTTAACGGACAGCCTATTGTGCCGTGTGG
TCTGATCGCTTGGAGTCTCTTTAACGACACATACACTCTATCAAAAAACAACCAGCCTTT
AAACGTAAGCAAGAGAGGAATTGCGTGGAAGAGTGACAGGGAACACAAGTTCGGCAAAAA
TGTGTTTCCCAAGAACTTTCAGATGGGCAATATCACCGGTGGTGGCAGACTGATTCCAAA
CTTACCGCTGAGTGAGCAAGAGGATCTGATTGTGTGGATGAGGACTGCAGCTTTGCCAAC
GTTTAGGAAACTATATGCGAAGATAGAGACTGACCTGCAGGAGAATGATACAATACACGT
GGTTCTGGAGAACAACTACAACACGTACAGTTTCGATGGGAAGAAGAAGCTTGTTTTGTC
AACAACTAGTTGGCTGGGTGGGAAGAATGACTTCCTCGGCATTGCTTACCTCACGGTTGG
AGGAATTTGCTTCTTCTTGGCACTTGCGTTTACCATCATGTACCTTGTGAAACCAAGGCG
ACTTGGAGATCCTACTTACTTGTCATGGAACAGGGTACCAGGAGGAGGTCGGTAAACACA
AAGACTCTGTATTCTCCTTGTGTAAATCTCTTCTATCTTTTTTTTTTTAATTTTTGTAAC
ACATAAATCTCTTTTATCCTGAATGTAACTTCAGCCAAAACTCTGCTAGTAATGATATGT
ATTTGATAGATGTGAAATGCATGATGTAACAGTTGAAAGATTGCTACCATTACACGGATG
AGAAAAGCTACCTCTCTTTTCAG

QA 1 803 1 803
DS 

RD RS1AH59TF 803 0 0
GCAAATAGAAGCATGCAAGCCTGAGGACGATGTTAACGGACAGCCTATTGTGCCGTGTGG
TCTGATCGCTTGGAGTCTCTTTAACGACACATACACTCTATCAAAAAACAACCAGCCTTT
AAACGTAAGCAAGAGAGGAATTGCGTGGAAGAGTGACAGGGAACACAAGTTCGGCAAAAA
TGTGTTTCCCAAGAACTTTCAGATGGGCAATATCACCGGTGGTGGCAGACTGATTCCAAA
CTTACCGCTGAGTGAGCAAGAGGATCTGATTGTGTGGATGAGGACTGCAGCTTTGCCAAC
GTTTAGGAAACTATATGCGAAGATAGAGACTGACCTGCAGGAGAATGATACAATACACGT
GGTTCTGGAGAACAACTACAACACGTACAGTTTCGATGGGAAGAAGAAGCTTGTTTTGTC
AACAACTAGTTGGCTGGGTGGGAAGAATGACTTCCTCGGCATTGCTTACCTCACGGTTGG
AGGAATCTGCTTCTTCTTGGCACTTGCGTTTACCATCATGTACCTTGTGAAACCAAGGCG
ACTTGGAGATCCTACTTACTTGTCATGGAACAGGGTACCAGGAGGAGGTCGGTAAACACA
AAGACTCTGTATTCTCCTTGTGTAAATCTCTTCTATCTTTTTTTTTTTAATTTTTGTAAC
ACATAAATCTCTTTTATCCTGAATGTAACTTCAGCCAAAACTCTGCTAGTAATGATATGT
ATTTGATAGATGTGAAATGCATGATGTAACAGTTGAAAGATTGCTACCATTACACGGATG
AGAAAAGCTACCTCTCTTTTCAG

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

CO CL7323Contig1 853 2 6 U
CTTCTTTCCCCTCTTTCCCCACTCATGCGATTTCCATGGAGATTTCAAGTTCAGAAATCA
AAAGCAATACCGGTTTAGACTTTAATGATGGAGTCAAGATCTTCAACGATGAGGGCAGCA
AATCTGATTTGGACAAAAACTCAGTCCGTTGGTTGGAAACTCGTTAGATCGACGGAGGAC
TAATCATATGCCTGTCTCTTACACGAAGCGGGTGAAAATCTGATCAATTAAAATTGATTC
GACAACATCTCTGGATAGATAAAAGCCAAGTAATACTGGAAAGAAAAAACATAACGTACT
TTCAGAGAAAATATTCATTTTCCGACAACAACAATCATAGCGATGTCATTCTTCATTGGA
GAACAACATGATCTTAAAGTGAAAGATAAGTTACTTCCTCGTAATTTTTCTTCGTTTACA
TTAATATAAAAGTGTAATTTGCATATAAATATAACATGATTAGTTTATAGATTTAATGAC
ATGGAATATAGATGACAAAGTTTAGGTGTGTTATATTTGAGTCCGTGGACTAAATTTTGT
TACAATTCTTGTCCTGGTCATGCAGTTAAAAGTTTGAAGACACAGATTAATTCAGCTGAA
GGAGCATGGGACAAATGCGCAATACGAAGGAAAAAGGATGATCTGTTGCTCGGTACATGC
CAGTTGAAGGAGTGAGAGTGAAATTCTGAATGTGTCTCCATGCTCCAACAGGAAGAAGTC
GGCCTTTACTCTCCATCTTCATCGGATAGCACCATCCTCGAGGGTGTCCTCGTGCACTGG
GTTGTACTGCTTCCAAGAGTGCAGCACCTTCACATGTACTTTCCAGCCACTCTTGAAGAG
TTTCACATCTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A342TF U 1
AF RS1A342TV U 30
BS 1 707 RS1A342TF
BS 708 708 RS1A342TV
BS 709 795 RS1A342TF
BS 796 796 RS1A342TV
BS 797 847 RS1A342TF
BS 848 853 RS1A342TV

RD RS1A342TF 847 0 0
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AAAGCAATACCGGTTTAGACTTTAATGATGGAGTCAAGATCTTCAACGATGAGGGCAGCA
AATCTGATTTGGACAAAAACTCAGTCCGTTGGTTGGAAACTCGTTAGATCGACGGAGGAC
TAATCATATGCCTGTCTCTTACACGAAGCGGGTGAAAATCTGATCAATTAAAATTGATTC
GACAACATCTCTGGATAGATAAAAGCCAAGTAATACTGGAAAGAAAAAACATAACGTACT
TTCAGAGAAAATATTCATTTTCCGACAACAACAATCATAGCGATGTCATTCTTCATTGGA
GAACAACATGATCTTAAAGTGAAAGATAAGTTACTTCCTCGTAATTTTTCTTCGTTTACA
TTAATATAAAAGTGTAATTTGCATATAAATATAACATGATTAGTTTATAGATTTAATGAC
ATGGAATATAGATGACAAAGTTTAGGTGTGTTATATTTGAGTCCGTGGACTAAATTTTGT
TACAATTCTTGTCCTGGTCATGCAGTTAAAAGTTTGAAGACACAGATTAATTCAGCTGAA
GGAGCATGGGACAAATGCGCAATACGAAGGAAAAAGGATGATCTGTTGCTCGGTACATGC
CAGTTGAAGGAGTGAGAGTGAAATTCTGAATGTGTCTCCATGCTCCA*CAGGAAGAAGTC
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GTTGTACTGCTTCCA*GAGTGCAGCACCTTCACATGTACTTTCCAGCCACTCTTGAAGAG
TTTCACA

QA 1 847 1 847
DS 

RD RS1A342TV 824 0 0
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GGAGTCAAGATCTTCAACGATGAGGGCAGCAAATCTGATTTGGACAAAAACTCAGTCCGT
TGGTTGGAAACTCGTTAGATCGACGGAGGACTAATCATATGCCTGTCTCTTACACGAAGC
GGGTGAAAATCTGATCAATTAAAATTGATTCGACAACATCTCTGGATAGATAAAAGCCAA
GTAATACTGGAAAGAAAAAACATAACGTACTTTCAGAGAAAATATTCATTTTCCGACAAC
AACAATCATAGCGATGTCATTCTTCATTGGAGAACAACATGATCTTAAAGTGAAAGATAA
GTTACTTCCTCGTAATTTTTCTTCGTTTACATTAATATAAAAGTGTAATTTGCATATAAA
TATAACATGATTAGTTTATAGATTTAATGACATGGAATATAGATGACAAAGTTTAGGTGT
GTTATATTTGAGTCCGTGGACTAAATTTTGTTACAATTCTTGTCCTGGTCATGCAGTTAA
AAGTTTGAAGACACAGATTAATTCAGCTGAAGGAGCATGGGACAAATGCGCAATACGAAG
GAAAAAGGATGATCTGTTGCTCGGTACATGCCAGTTGAAGGAGTGAGAGTGAAATTCTGA
ATGTGTCTCCATGCTCCAACAGGAAGAAGTCGGCCTTTACTCTCCATCTTCATCGGATAG
CACCATC*TCGAGGGTGTCCTCGTGCACTGGGTTGTACTGCTTCCAAGAGTGCAGCACCT
TCACATGTACTTTCCAGCCACTCTTGAAGAGTTTCACATCTTTC

QA 1 824 1 824
DS 



AS 1 2

CO CL7324Contig1 810 2 6 U
GAAATACAAAAGAGTAGTAGTTAGCGATGACGGTGCACATTAGCATGGGATGCTCTTATA
CGAATGGTCCCCATATCGACCCTATTTTTATTGTGTGCACTCTATTATTATCATTTTTTT
CTTGCACTCGTATATAGATCGCTTTCATCTCTTTATATTAAGTTTTTTTTTCCTTTGTTT
CAAACAGTCGCAGCAAGAACGTTAATCCCGCAGGAGAATCTGACTCTTCAACACAAGTTG
TCGAGAAGAATGAAAAGGCTGTTACCTTGAGGAAGAGAAGAGGCTTTATAAGCTTTGGGG
AACAAGAAGAGGATGAGGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGCTAGTGGAGGCGGTGGTGGTA
GTAAAGGGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGCCAAGAAGAGCGGTGCTTTGGAGGAAGTATCAC
GGTGCAGCCGAGTTAACGGTAGAGGATGGAGATGTTGTCAGCAAACTCTTTATGGGTATT
CTCTTTGTGAGCATCATCTTGGTAAAGGAAGGGTAAGGAGCATGAACAAGAGTGCTGGCG
CTCGCGGCGGCCGACAGAAAAAGGCCGAGGTGGTGGAAGTGAAGAACAAGAGAGTGAAGC
TTGGGATGGTGAAGGCCCGTTCCATGAGTAGTTTGCTTGGACAAACCAGCACAAGTAGCG
GTATTGGTGATGTTCTTGTTGGTACTGAGAGTGAGATAAATGCACCTGCTGATCAGTTTG
ATGCTCCTGATAAGTAAGTCTGGCTATCCAACATTTACAGTTTTATGTATATTTTTAATG
TACATGATGATTATGGACGCAGCTTTATGT


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RS1CL71TF U 1
AF RS1CL71JQ C 2
BS 1 726 RS1CL71TF
BS 727 727 RS1CL71JQ
BS 728 775 RS1CL71TF
BS 776 776 RS1CL71JQ
BS 777 805 RS1CL71TF
BS 806 810 RS1CL71JQ

RD RS1CL71TF 805 0 0
GAAATACAAAAGAGTAGTAGTTAGCGATGACGGTGCACATTAGCATGGGATGCTCTTATA
CGAATGGTCCCCATATCGACCCTATTTTTATTGTGTGCACTCTATTATTATCATTTTTTT
CTTGCACTCGTATATAGATCGCTTTCATCTCTTTATATTAAGTTTTTTTTTCCTTTGTTT
CAAACAGTCGCAGCAAGAACGTTAATCCCGCAGGAGAATCTGACTCTTCAACACAAGTTG
TCGAGAAGAATGAAAAGGCTGTTACCTTGAGGAAGAGAAGAGGCTTTATAAGCTTTGGGG
AACAAGAAGAGGATGAGGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGCTAGTGGAGGCGGTGGTGGTA
GTAAAGGGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGCCAAGAAGAGCGGTGCTTTGGAGGAAGTATCAC
GGTGCAGCCGAGTTAACGGTAGAGGATGGAGATGTTGTCAGCAAACTCTTTATGGGTATT
CTCTTTGTGAGCATCATCTTGGTAAAGGAAGGGTAAGGAGCATGAACAAGAGTGCTGGCG
CTCGCGGCGGCCGACAGAAAAAGGCCGAGGTGGTGGAAGTGAAGAACAAGAGAGTGAAGC
TTGGGATGGTGAAGGCCCGTTCCATGAGTAGTTTGCTTGGACAAACCAGCACAAGTAGCG
GTATTGGTGATGTTCTTGTTGGTACTGAGAGTGAGATAAATGCACCTGCTGATCAGTTTG
ATGCTC*TGATAAGTAAGTCTGGCTATCCAACATTTACAGTTTTATGTATATTTT*AATG
TACATGATGATTATGGACGCAGCTT

QA 1 805 1 805
DS 

RD RS1CL71JQ 809 0 0
AAATACAAAAGAGTAGTAGTTAGCGATGACGGTGCACATTAGCATGGGATGCTCTTATAC
GAATGGTCCCCATATCGACCCTATTTTTATTGTGTGCACTCTATTATTATCATTTTTTTC
TTGCACTCGTATATAGATCGCTTTCATCTCTTTATATTAAGTTTTTTTTTCCTTTGTTTC
AAACAGTCGCAGCAAGAACGTTAATCCCGCAGGAGAATCTGACTCTTCAACACAAGTTGT
CGAGAAGAATGAAAAGGCTGTTACCTTGAGGAAGAGAAGAGGCTTTATAAGCTTTGGGGA
ACAAGAAGAGGATGAGGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGCTAGTGGAGGCGGTGGTGGTAG
TAAAGGGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGCCAAGAAGAGCGGTGCTTTGGAGGAAGTATCACG
GTGCAGCCGAGTTAACGGTAGAGGATGGAGATGTTGTCAGCAAACTCTTTATGGGTATTC
TCTTTGTGAGCATCATCTTGGTAAAGGAAGGGTAAGGAGCATGAACAAGAGTGCTGGCGC
TCGCGGCGGCCGACAGAAAAAGGCCGAGGTGGTGGAAGTGAAGAACAAGAGAGTGAAGCT
TGGGATGGTGAAGGCCCGTTCCATGAGTAGTTTGCTTGGACAAACCAGCACAAGTAGCGG
TATTGGTGATGTTCTTGTTGGTACTGAGAGTGAGATAAATGCACCTGCTGATCAGTTTGA
TGCTCCTGATAAGTAAGTCTGGCTATCCAACATTTACAGTTTTATGTATATTTTTAATGT
ACATGATGATTATGGACGCAGCTTTATGT

QA 1 809 1 809
DS 



AS 1 2

CO CL7325Contig1 839 2 4 U
AATATCATAATTATCATGATGTCTTGGATTTTATGAAGATATCAAGTACTTAACGTCAAC
ATTTTAAGACAGAAAAAGAGAGTTTTGATAACACAGTAGGCCTCAGGTGAAATCACAGTC
TTAGACTCTTGGATAGCTTTATGTAGACAAGAAGATACATCTGTTGTTTATTAAGAGGAA
GGCAGAATGCCCCACTGATGCAAAAACCCTTTTCCGGTGGTTACTTCTAGTACCAAGAGT
GCGAGCACTGCCAACATGGCTGCTCTTCCGTTCCATGTTTCTGCACTTCTGGTAAATCCC
CATTCCCACATCGTCACTGGAGCTGGCAATTCCCTCCTCTGTGAATCATAGGTCGCCAAT
AGTTCTTCAACACTCCCGAGCGGAACTAACGACTGTCGAGCTTCAAGGTTTGAGACTGCC
ATAGCTCCAACATATGGAAGGCTTTCCACAACAGCATCTGCCAAGTCAGATATAAACAAA
GGCTCTGTTCCTAGCGCAGGCACTCGTCCCCAATTCTTGATACCAGAACTCAAAGCCAAC
TCTTTATACTCAACATCTATCTCTTCCAGCGTTTCAATGTGCTCGCTCACGAAGCTTATG
GGTACAGCCAGAAGATTTTCAACACCTTTTTTACCAAGTTCAGTAATGGCTTCCTCCGTG
TATGGTTTCAGCCATTCCACAGGTCCAACTCTGCTCTGATAAGCGAGCGTGTAAGCGTTG
GTTATATTTCTCTTGTCTAATTCTTCCATTATCAGATCGACGCATTCTTCCATCTCTGCC
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BQ
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GCAGTCAACGCTGCTTCGGGGAGTGGTAGGTTCGTGATATATGTGAAGCAAGGCGTTTAC
AGTGAGAATCTTGAGATTCGAAAAAAGAATGTTATGTTGAGAGGTGATGGTATAGGGAGA
ACGATTATTACCGGAAGCAGAAGTGTTGGAGGAGGATCGACCACGTTTAATTCAGCTACT
GTCGGTATGTATTACAAAACAAAAAAAATGATTAATTTTATTTATTTTCATGAGAAATAT
ATATAGACTAAATGGTCGATCTTGTTTGCAAATTGTTACGTGCATGAAAACACCAAACTA
GAGCAAAACTGAAAGTGATATATAAGAACCACTTTCCGCGTCCTATAGGTTGTACATAAT
CAAGATAATCTTAAGGTCTTTAGTTGTCGTTGGTGTCTTTTTCTTGCAAATTAAATTTCC
ATAGAATTTTAGAAAAGGAAAGTCAA

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 2

CO CL7327Contig1 962 2 18 U
ACATGCAAATGAAACGGTGAGGAAAATTATCAAAGACATCAACGAAATTGTTTTTGATGC
GGAAGATATCATCGAGACGTTTCTTCTGAAAAAAACACTCCGGGAATCAAGCAGCAGCAG
CGTGAGAAGATTTGCATCTGTTACTGTGAGAACCATGGTGCTTGGGTTTGATATGAAACC
CATAAGGAATAGGATCTCTAAGGTGATCCGTGATATGCAGAGTTTTGGCGTTCTGCAGAA
TGAAGAGCGTATGCAGTCTCTAGAGGTAAGAGAAAGACAAAAGCGAGAAACGTTTTCTAT
AGATGACCAAGAGGAATCTATTGTTGGGATGGAGAGAAATATTGAGATATTGGTTGGCTA
TTTGGTGGAGGAGGGTAGCAGTCAAGTGGTTTCCATAACCGGGATGGGCGGGCTTGGTAA
AACCACACTCGCAAGAAAAGTTTTCAATCATGAAACAATAAAAAGTCATTTTCGAGAAGG
ATTAGCGTGGGTGTGTGTTTCACAACAATTTGAAAGAAAGTCTGTCTGGGAGACAATCTT
GCAACAACTGAGGTCAGAATGTTATAAGTCAAAGATGAAGGAAAACGAACTTCTAGAGAA
GATTGTTGGAGTGTTCGAAACACAAAAGGCTTTGATCGTCATTGATGATATATGGAGAGA
AGAAGACTGGGACCTAATCAAGCCTGTGTTTCTGCCAAATAAAGGTGAATCTCCTTACAT
ACTTAGGCGATGTTAACATGGGTGATTGCCCATAGGTTTACCCAAACCCACTAATATTGA
ATTGGGTTTTTATCCATCCAAAATTAATTGGGTCAATCATAGGTACAAAATTTAAAACCC
ATAATCATAGTGGATAAAACAAAAGGGTAATGGGTATCCATGAGTTTTAAATTATATGAT
TATATTTTTCACTATTTTAATTAAATAAGAAAATTTGCAAAAACTTTTTTTCTGTCAAAC
CC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1B492TF U 1
AF RS1B492JQ C 230
BS 1 628 RS1B492TF
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BS 710 726 RS1B492TF
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BS 728 746 RS1B492TF
BS 747 962 RS1B492JQ

RD RS1B492TF 747 0 0
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CATAAGGAATAGGATCTCTAAGGTGATCCGTGATATGCAGAGTTTTGGCGTTCTGCAGAA
TGAAGAGCGTATGCAGTCTCTAGAGGTAAGAGAAAGACAAAAGCGAGAAACGTTTTCTAT
AGATGACCAAGAGGAATCTATTGTTGGGATGGAGAGAAATATTGAGATATTGGTTGGCTA
TTTGGTGGAGGAGGGTAGCAGTCAAGTGGTTTCCATAACCGGGATGGGCGGGCTTGGTAA
AACCACACTCGCAAGAAAAGTTTTCAATCATGAAACAATAAAAAGTCATTTTCGAGAAGG
ATTAGCGTGGGTGTGTGTTTCACAACAATTTGAAAGAAAGTCTGTCTGGGAGACAATCTT
GCAACAACTGAGGTCAGAATGTTATAAGTCAAAGATGAAGGAAAACGAACTTCTAGAGAA
GATTGTTGGAGTGTTCGAAACACAAAAG*CTTTGATCGTCATTGATGATATATGGAGAGA
AGA*GACTGGGAC*TAATCAAGCCTGTGTT*CTGC*AAATAAAG*TGA*TCTCCTTACAT
ACTTAG*CGATGTTAACATGGGTGAT
G

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1B492JQ 733 0 0
GTTCTGCAGAATGAAGAGCGTATGCAGTCTCTAGAGGTAAGAGAAAGACAAAAGCGAGAA
ACGTTTTCTATAGATGACCAAGAGGAATCTATTGTTGGGATGGAGAGAAATATTGAGATA
TTGGTTGGCTATTTGGTGGAGGAGGGTAGCAGTCAAGTGGTTTCCATAACCGGGATGGGC
GGGCTTGGTAAAACCACACTCGCAAGAAAAGTTTTCAATCATGAAACAATAAAAAGTCAT
TTTCGAGAAGGATTAGCGTGGGTGTGTGTTTCACAACAATTTGAAAGAAAGTCTGTCTGG
GAGACAATCTTGCAACAACTGAGGTCAGAATGTTATAAGTCAAAGATGAAGGAAAACGAA
CTTCTAGAGAAGATTGTTGGAGTGTTCGAAACACAAAAGGCTTTGATCGTCATTGATGAT
ATATGGAGAGAAGAAGACTGGGACCTAATCAAGCCTGTGTTTCTGCCAAATAAAGGTGAA
TCTCCTTACATACTTAGGCGATGTTAACATGGGTGATTGCCCATAGGTTTACCCAAACCC
ACTAATATTGAATTGGGTTTTTATCCATCCAAAATTAATTGGGTCAATCATAGGTACAAA
ATTTAAAACCCATAATCATAGTGGATAAAACAAAAGGGTAATGGGTATCCATGAGTTTTA
AATTATATGATTATATTTTTCACTATTTTAATTAAATAAGAAAATTTGCAAAAACTTTTT
TTCTGTCAAACCC

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 2

CO CL7328Contig1 805 2 3 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGACGCCGTTGG
ATCCATTTCTCATGCTCTGCCTCCTCCAAGACCGGTTCTACTCTCTTCCTTTATGCTTCC
ATATAAACCAATGGTACCTCAAAAACTGAATCATATCATTGATACATTGTAGTTAGGCTT
TGTGACATATAATTAAGAATGTTATTTTTTTTTGTTGAGATAAAAGGATGTAGATTGAGC
CATGGAGCTAGAGCGTTATCCAAGCATGTTGATCGAAGCAGCGATAGGTTCTGGGGTGTT
CTTTCTGGATCCGGTAAGTAAAAGTAAGTAAGTAGCTTTTCAATATTTGGATGTGGACTC
TTCATTTCCTTAATTTTTCTCTCAGATTCAGATAAGAATAGGCTTGCGATGGACACTATC
AATAGCTTCATTTGGCACTGTTGCTGGATGAACGTACACATCGTTCCACCACACGGAGAA
GTTTTTGAGATAAGAGTAGTTCAAGGATATGGAGCACGTTGGTCTCGAGATGGAACCAGA
GTATACTATTTTATTCGCTTTGAACTTATTATCTCTCTTAATGTTTTGATCTATCAATTG
TTTTACCGATGATGAGTTTTGTTTATGTTTTGCAGTTCGTTGGATTTCTTGAGCCTTACA
CTGAGGATGGCCACTCCATGGCTTGGAAGCATTAGGCACTCACCACAAAAGAAAAACATT
TTTGTTTTCTTTCTTTCAACAAACTGTAATGTACTCTGGTTGTTTTCGTTAGTACATGTA
AACATTTGGGTTAGTAGTAAAACAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A259TF U 1
AF RS1A259TV U 1
BS 1 722 RS1A259TF
BS 723 723 RS1A259TV
BS 724 805 RS1A259TF

RD RS1A259TF 805 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGACGCCGTTGG
ATCCATTTCTCATGCTCTGCCTCCTCCAAGACCGGTTCTACTCTCTTCCTTTATGCTTCC
ATATAAACCAATGGTACCTCAAAAACTGAATCATATCATTGATACATTGTAGTTAGGCTT
TGTGACATATAATTAAGAATGTTATTTTTTTTTGTTGAGATAAAAGGATGTAGATTGAGC
CATGGAGCTAGAGCGTTATCCAAGCATGTTGATCGAAGCAGCGATAGGTTCTGGGGTGTT
CTTTCTGGATCCGGTAAGTAAAAGTAAGTAAGTAGCTTTTCAATATTTGGATGTGGACTC
TTCATTTCCTTAATTTTTCTCTCAGATTCAGATAAGAATAGGCTTGCGATGGACACTATC
AATAGCTTCATTTGGCACTGTTGCTGGATGAACGTACACATCGTTCCACCACACGGAGAA
GTTTTTGAGATAAGAGTAGTTCAAGGATATGGAGCACGTTGGTCTCGAGATGGAACCAGA
GTATACTATTTTATTCGCTTTGAACTTATTATCTCTCTTAATGTTTTGATCTATCAATTG
TTTTACCGATGATGAGTTTTGTTTATGTTTTGCAGTTCGTTGGATTTCTTGAGCCTTACA
CTGAGGATGGCCACTCCATGGCTTGGAAGCATTAGGCACTCACCACAAAAGAAAAACATT
TT*GTTTTCTTTCTTTCAACAAACTGTAATGTACTCTGGTTGTTTTCGTTAGTACATGTA
AACATTTGGGTTAGTAGTAAAACAG

QA 1 805 1 805
DS 

RD RS1A259TV 805 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGACGCCGTTGG
ATCCATTTCTCATGCTCTGCCTCCTCCAAGACCGGTTCTACTCTCTTCCTTTATGCTTCC
ATATAAACCAATGGTACCTCAAAAACTGAATCATATCATTGATACATTGTAGTTAGGCTT
TGTGACATATAATTAAGAATGTTATTTTTTTTTGTTGAGATAAAAGGATGTAGATTGAGC
CATGGAGCTAGAGCGTTATCCAAGCATGTTGATCGAAGCAGCGATAGGTTCTGGGGTGTT
CTTTCTGGATCCGGTAAGTAAAAGTAAGTAAGTAGCTTTTCAATATTTGGATGTGGACTC
TTCATTTCCTTAATTTTTCTCTCAGATTCAGATAAGAATAGGCTTGCGATGGACACTATC
AATAGCTTCATTTGGCACTGTTGCTGGATGAACGTACACATCGTTCCACCACACGGAGAA
GTTTTTGAGATAAGAGTAGTTCAAGGATATGGAGCACGTTGGTCTCGAGATGGAACCAGA
GTATACTATTTTATTCGCTTTGAACTTATTATCTCTCTTAATGTTTTGATCTATCAATTG
TTTTACCGATGATGAGTTTTGTTTATGTTTTGCAGTTCGTTGGATTTCTTGAGCCTTACA
CTGAGGATGGCCACTCCATGGCTTGGAAGCATTAGGCACTCACCACAAAAGAAAAACATT
TTTGTTTTCTTTCTTTCAACAAACTGTAATGTACTCTGGTTGTTTTCGTTAGTACATGTA
AACATTTGGGTTAGTAGTAAAACAG

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 2

CO CL7329Contig1 898 2 6 U
GGAGCTTGCCCTGCACAAGAATCTGGAATACATTTGGCGTCAGAGTTGGGATGCTATGGA
GACAACAGATATTTTTGTTCATATGATGCCTTTCTATTCATACGATATCCCACACACTTG
TGGGCCAGAGCCTGCAGTTTGCTGTCAGTTTGATTTTGCGCGGAAGCGTGGATTCAAATA
TGAACTTTGTCCATGGGGAAAGCACCCAGTGGAGACTACACAAGACAATGTGCAAGAGAG
GGCATCAAAGCTTCTGGATCAATACAGGAAAAAGTCTACCCTCTATCGAACCAATACTCT
TCTTATACCTCTGGGAGATGATTTTCGGTTCATCAGCATGGATGAAGCCGAGGCTCAGTT
CCGTAACTACCAGATGTTGTTCGATCACATCAACTCTAATCCTAGTCTAAACGCAGAGGC
AAAGTTTGGCACTCTGGATGATTATTTCACAGCACTAAGAGAAGAAGCTGATAGAGTAAA
TTATTCCCTTCCTGGTGAGGTTGGCTCTGGTCAGGTTGTTGGTTTCCCTTCTCTGTCAGG
TGACTTCTTTACATATGCAGATAGGCAACAAGACTATTGGAGTGGTTATTATGTTTCAAG
GCCTTTCTTCAAAGCTGTTGATCGTGTGCTCGAGCATACCCTCCGTGGAGCTGAGATCAT
GATGTCGTTTCTGCTAGGTTATTGCCATCGAGTTCAGTGTGAGAAATTTCCGACAAGTTT
TGCGTATAAGTTAACTTCTGCAAGAAGGAATCTAGCTCTTTTCCAGCATCACGATGGGGT
AACAGGAACTGCTAAGGATCATGTGGTACAAGATTACGGCTCCCGGATGCATACTTCACT
TCAAGACCTTCAGATCTTTATGTCTAAAGCAATTGAAATCCTCCTTGGGATCCGCCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DU17TF U 1
AF RS1DU17JQ C 252
BS 1 677 RS1DU17TF
BS 678 678 RS1DU17JQ
BS 679 705 RS1DU17TF
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BS 739 898 RS1DU17JQ

RD RS1DU17TF 738 0 0
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GACAACAGATATTTTTGTTCATATGATGCCTTTCTATTCATACGATATCCCACACACTTG
TGGGCCAGAGCCTGCAGTTTGCTGTCAGTTTGATTTTGCGCGGAAGCGTGGATTCAAATA
TGAACTTTGTCCATGGGGAAAGCACCCAGTGGAGACTACACAAGACAATGTGCAAGAGAG
GGCATCAAAGCTTCTGGATCAATACAGGAAAAAGTCTACCCTCTATCGAACCAATACTCT
TCTTATACCTCTGGGAGATGATTTTCGGTTCATCAGCATGGATGAAGCCGAGGCTCAGTT
CCGTAACTACCAGATGTTGTTCGATCACATCAACTCTAATCCTAGTCTAAACGCAGAGGC
AAAGTTTGGCACTCTGGATGATTATTTCACAGCACTAAGAGAAGAAGCTGATAGAGTAAA
TTATTCCCTTCCTGGTGAGGTTGGCTCTGGTCAGGTTGTTGGTTTCCCTTCTCTGTCAGG
TGACTTCTTTACATATGCAGATAGGCAACAAGACTATTGGAGTGGTTATTATGTTTCAAG
GCCTTTCTTCAAAGCTGTTGATCGTGTGCTCGAGCATACCCTCCGTGGAGCTGAGATCAT
GATGTCGTTTCTGCTAG*TTATTGCCATCGAGTTCAGTGTGAGAA*TTTCCGACAAGTTT
TGCGTATAAGTTAACTTC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1DU17JQ 647 0 0
TTCTGGATCAATACAGGAAAAAGTCTACCCTCTATCGAACCAATACTCTTCTTATACCTC
TGGGAGATGATTTTCGGTTCATCAGCATGGATGAAGCCGAGGCTCAGTTCCGTAACTACC
AGATGTTGTTCGATCACATCAACTCTAATCCTAGTCTAAACGCAGAGGCAAAGTTTGGCA
CTCTGGATGATTATTTCACAGCACTAAGAGAAGAAGCTGATAGAGTAAATTATTCCCTTC
CTGGTGAGGTTGGCTCTGGTCAGGTTGTTGGTTTCCCTTCTCTGTCAGGTGACTTCTTTA
CATATGCAGATAGGCAACAAGACTATTGGAGTGGTTATTATGTTTCAAGGCCTTTCTTCA
AAGCTGTTGATCGTGTGCTCGAGCATACCCTCCGTGGAGCTGAGATCATGATGTCGTTTC
TGCTAGGTTATTGCCATCGAGTTCAGTGTGAGAAATTTCCGACAAGTTTTGCGTATAAGT
TAACTTCTGCAAGAAGGAATCTAGCTCTTTTCCAGCATCACGATGGGGTAACAGGAACTG
CTAAGGATCATGTGGTACAAGATTACGGCTCCCGGATGCATACTTCACTTCAAGACCTTC
AGATCTTTATGTCTAAAGCAATTGAAATCCTCCTTGGGATCCGCCAC

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 2

CO CL7330Contig1 996 2 4 U
GGATAAACCACCTTCAGAGAAAATTACACATTAAACCCAAAAACTTTAGAAAACTTACTG
TACCGTTCAAAATGTGCGGAGGAGCAGTTATTTCCGAATACATAACGCCGTCACGATCCG
GCAGATCATCAGCCTCAAAATCCTCCTCCTGGAGACGCGAAAACGTCGTCGTTGACTTGA
CACTCGACGATTTCGAGGGAGTATTCGAGTCGGAGAACGAAGAATTCTACGGATTCTCAA
CGGCCAAGCCCGCAAGAGGATTCATCGAAGAAGATGCGAGGAAGAATATGAAGAAGAAGA
AGAAGAAGAGTAGCGAGTACAGAGGAATCAGGAGGCGTCCGTGGGGAAGATGGGCGGCTG
AGATTCGCGATCCGATAAAAGGAGTTCGAGTTTGGCTGGGGACGTTCAACACTGCAGAAG
ATGCTGCGAGGGCTTATGATCTTGAAGCTAAGAGGATCCGTGGAGCCAAAGCTAAGCTCA
ACTTCCCTAACGAATCACCTTCGAGAAAGCGTAAAGCTTCTTCTTCTTCTTCAAAACAGC
CTCCTCAGGTTAAGGTAGAGGAGAAGCGTGAGGAGGTTGCAGTGGCGTGTAGTAGCCTGT
GGGAGGGGGACACGATTCACGTTGATACACAGTGGCTTGAAGAAGCCATCAAGGGCGGTG
AGAAGAGACAGAAGGGCTGTGATGGTGATGGTGAAGGTGACGACGTGAATGCTCAGCTTT
CGGAGGAGCTTCTTGCTTTTGAGAAAGAGACGGAGTGTTTCTTCCAGATGCCGTTTATGG
AGGGGGCAAACTGTGGTTCTTCGTCGTCCACGACACCTATGACCAGTGTCTTTGAGGGAG
ATGATGTCTTGGATCTTTGGTATTGAATGGTTCTTTTGTACTCTTAATGAAATGATCTTG
AGTCGTTTGGTGTTGTATTTGTACAAGTCAGATTCTTGTTCTGCTTGTGTGTATTGACTC
TTGTAACTGTGATTCTTCTGCCTTGTCAATGTATAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B287TF U 1
AF RS1B287JQ C 176
BS 1 250 RS1B287TF
BS 251 251 RS1B287JQ
BS 252 678 RS1B287TF
BS 679 996 RS1B287JQ

RD RS1B287TF 678 0 0
GGATAAACCACCTTCAGAGAAAATTACACATTAAACCCAAAAACTTTAGAAAACTTACTG
TACCGTTCAAAATGTGCGGAGGAGCAGTTATTTCCGAATACATAACGCCGTCACGATCCG
GCAGATCATCAGCCTCAAAATCCTCCTCCTGGAGACGCGAAAACGTCGTCGTTGACTTGA
CACTCGACGATTTCGAGGGAGTATTCGAGTCGGAGAACGAAGAATTCTACGGATTCTCAA
CGGCCAAGCCTGCAAGAGGATTCATCGAAGAAGATGCGAGGAAGAATATGAAGAAGAAGA
AGAAGAAGAGTAGCGAGTACAGAGGAATCAGGAGGCGTCCGTGGGGAAGATGGGCGGCTG
AGATTCGCGATCCGATAAAAGGAGTTCGAGTTTGGCTGGGGACGTTCAACACTGCAGAAG
ATGCTGCGAGGGCTTATGATCTTGAAGCTAAGAGGATCCGTGGAGCCAAAGCTAAGCTCA
ACTTCCCTAACGAATCACCTTCGAGAAAGCGTAAAGCTTCTTCTTCTTCTTCAAAACAGC
CTCCTCAGGTTAAGGTAGAGGAGAAGCGTGAGGAGGTTGCAGTGGCGTGTAGTAGCCTGT
GGGAGGGGGACACGATTCACGTTGATACACAGTGGCTTGAAGAAGCCATCAAGGGCGGTG
AGAAGAGACAGAAGGGCT

QA 1 678 1 678
DS 

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AC
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CAACGGCCAAGCCCGCAAGAGGATTCATCGAAGAAGATGCGAGGAAGAATATGAAGAAGA
AGAAGAAGAAGAGTAGCGAGTACAGAGGAATCAGGAGGCGTCCGTGGGGAAGATGGGCGG
CTGAGATTCGCGATCCGATAAAAGGAGTTCGAGTTTGGCTGGGGACGTTCAACACTGCAG
AAGATGCTGCGAGGGCTTATGATCTTGAAGCTAAGAGGATCCGTGGAGCCAAAGCTAAGC
TCAACTTCCCTAACGAATCACCTTCGAGAAAGCGTAAAGCTTCTTCTTCTTCTTCAAAAC
AGCCTCCTCAGGTTAAGGTAGAGGAGAAGCGTGAGGAGGTTGCAGTGGCGTGTAGTAGCC
TGTGGGAGGGGGACACGATTCAGGTTGATACACAGTGGCTTGAAGAAGCCATCAAGGGCG
GTGAGAAGAGACAGAAGGGCTGTGATGGTGATGGTGAAGGTGACGACGTGAATGCTCAGC
TTTCGGAGGAGCTTCTTGCTTTTGAGAAAGAGACGGAGTGTTTCTTCCAGATGCCGTTTA
TGGAGGGGGCAAACTGTGGTTCTTCGTCGTCCACGACACCTATGACCAGTGTCTTTGAGG
GAGATGATGTCTTGGATCTTTGGTATTGAATGGTTCTTTTGTACTCTTAATGAAATGATC
TTGAGTCGTTTGGTGTTGTATTTGTACAAGTCAGATTCTTGTTCTGCTTGTGTGTATTGA
CTCTTGTAACTGTGATTCTTCTGCCTTGTCAATGTATAA

QA 3 821 3 821
DS 



AS 1 2

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TTTTTTTGTCAACTTTGGTCACTTTTGAACCGAACTCAAACTGAGGTAAGGAAGGATCGA
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CATTCTAAAGCTTTTGTTTATCTGATAAAGTTTATTTCAGAATCTTTCGTTTATGGGCGT
TGAATCGATTTTTGTGTCAATTTGTTGATCTGTTAATTATCAATTTTTTTTAATTTGCAG
GGCTAATTATTTTGACTTTTTAGGGTATTGTTCTCGGATAGACAAAGCGCTTGATTTTAA
GGAAGCTGGGAGAGTTGTAGTTCAGTTGAAAAGGGAGGATGTGACTTTACTCAATCCTGC
CGTTGCTTCAAATTTGTGGTGACCTCTTATTACGAGAAAGAAAAGCAAAGAAAACAGCAT
TACAAAAGACAGGAGGAGAAGGAAAAGTTGAGCTGAAAAGCAGAGATGGAGAAGAGGAAG
GAGCCCGATGGGTGATGGAGAGAAGTAATTATCCCCAGAACTAAGAACTTGATCTGCAAA
AGAAGTTGTTAATTTATTTTGTACATGTTGATCTTACGCATTTGGAACGTGTACAAGGTT
TAGCATTTACAGTTTGACTTATTGTGTCAAAACAAGATGTTAACATAGTTTGTACATATC
GTTCGTTCCTATGCATTTAGAGCTTTAGGTTATGATGTGAGTTGTGGCATTTATTTGATT
TTTTACACAACACAATCCTTTTATACTTTTGGAATAACTGTTTTGAACAAAGCCTTTGCG
AAAATATTACGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EF76TF U 1
AF RS1EF76JQ C 266
BS 1 706 RS1EF76TF
BS 707 707 RS1EF76JQ
BS 708 715 RS1EF76TF
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BS 755 782 RS1EF76TF
BS 783 914 RS1EF76JQ

RD RS1EF76TF 786 0 0
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TGAATCGATTTTTGTGTCAATTTGTTGATCTGTTAATTATCAATTTTTTTTAATTTGCAG
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GT
CGTT

QA 1 782 1 782
DS 

RD RS1EF76JQ 649 0 0
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TGATCTGTTAATTATCAATTTTTTTTAATTTGCAGGGCTAATTATTTTGACTTTTTAGGG
TATTGTTCTCGGATAGACAAAGCGCTTGATTTTAAGGAAGCTGGGAGAGTTGTAGTTCAG
TTGAAAAGGGAGGATGTGACTTTACTCAATCCTGCCGTTGCTTCAAATTTGTGGTGACCT
CTTATTACGAGAAAGAAAAGCAAAGAAAACAGCATTACAAAAGACAGGAGGGGAAGGAAA
AGTTGAGCTGAAAAGCAGAGATGGAGAAGAGGAAGGAGCCCGATGGGTGATGGAGAGAAG
TAATTATCCCCAGAACTAAGAACTTGATTTGCAAAAGAAGTTGTTAATTTATTTTGTACA
TGTTGATCTTACGCATTTGGAACGTGTACAAGTTTTAGCATTTACAGTTTGACTTATTGT
GTCAAAACAAGATGTTAACATAGTTTGTACATATCGTTCGTTCCTATGCATTTAGAGCTT
TAGGTTATGATGTGAGTTGTGGCATTTATTTGATTTTTTACACAACACAATCCTTTTATA
CTTTTGGAATAACTGTTTTGAACAAAGCCTTTGCGAAAATATTACGATT

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 2

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ACTTGCTCCTCACCGTCATCGTCTTCCTCCTCATCAGCTGAATCATGTTCATCACCGTTG
AAGTCAGACATCTTAGAGGGAAAACCAGAGAAATCTTCCATATCTTCTTCCTCTTCTTCA
AGCTCTTCATAGCCTTCAACATATTCAATCTCTGGCTCCTCCTCTTCTACCTCCTCCTCA
ACACCTTCTCCCACTTTCTTTTCTTCATCAAGAACCTTGTTCCACTCGAGCTCTGGGTAA
TTGTATATGTCACCATATATACCCTTCTTCAAACGCTCCAGCAACTCGGTCTCAATAGCC
TTATCCAAGACCGCTGCTTTAATAGCCTTCTCCCCCCTTCTTGATTCTCTCTTGATATCC
CTCCTCGGTGTAGTCATTATCTTCTCCCTTGTCTTGAGAGCAAGTTTCCTCATACGAATA
CGCATCTGAGTCATTTTGGTCAGTCTCTGTTTGATCTTGTGCTGTATACTTAGCCATACA
CAGTGCTTGTCATGGTTCAGAGCTTCTCGTA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B926JQ U 1
AF RS1AT78JQ U 6
BS 1 207 RS1B926JQ
BS 208 208 RS1AT78JQ
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RD RS1B926JQ 871 0 0
TGCTTCATTTTAACTAAGTATACAAAATTCAAACGTCAGAAGAACATATTAAGTTCCTAC
AATACATGAAAATGAAAAGGGTACAAAACTGGAAAGCGTTCAAGATATCTTTCAACTGTA
GTACACTGTCAAGAAGAAAGCTTGTCCCACAGTAGCACAACAAAACAAAACAAACTACAC
TTTCCTCTGCCATTTCAGCTTCAGCGTTTTGGCATCTAAGCTCAGCTTGCGGTTCTCAAG
GTTCGTATCACGTCTCCATCTTCTTGCTCCATCTCCACAATCACTCTCTTCTTCTTCTTC
TTTGATTTCCCAAGATCATCAGACTTTCTTGAATCTCTCTTTCCTTTTTTATGAATCACA
ACTTGCTCCTCACCGTCATCGTCTTCCTCCTCATCAGCTGAATCATGTTCATCACCGTTG
AAGTCAGACATCTTAGAGGGAAAACCAGAGAAATCTTCCATATCTTCTTCCTCTTCTTCA
AGCTCTTCATAGCCTTCAACATATTCAATCTCTGGCTCCTCCTCTTCTACCTCCTCCTCA
ACACCTTCTCCCACTTTCTTTTCTTCATCAAGAACCTTGTTCCACTCGAGCTCTGGGTAA
TTGTATATGTCACCATATATACCCTTCTTCAAACGCTCCAGCAACTCGGTCTCAATAGCC
TTATCCAAGACCGCTGCTTTAATAGCCTTCTCCTCCCTTCTTGATTCTCTCTTGATATCC
CTCCTCGGTGTAGTCATTATCTTCTCCCTTGTCTTGAGAGCAAGTTTCCTCATACGAATA
CGCATCTGAGTCATTTTGGTCAGTCTCTGTTTGATCTTGTGCTGTATACTTAGCCATACA
CAGTGCTTGTCATGGTTCAGAGCTTCTCGTA

QA 1 871 1 871
DS 

RD RS1AT78JQ 852 0 0
CG
TTTTAACTAAGTATACAAAATTCAAACGTCAGAAGAACATATTAAGTTCCTACAATACAT
GAAAATGAAAAGGGTACAAAACTGGAAAGCGTTCAAGATATCTTTCAACTGTAGTACACT
GTCAAGAAGAAAGCTTGTCCCACAGTAGCACAACAAAACAAAACAAACTACACTTTCCTC
TGCCATTTCAGCTTCAGCGTCTTGGCATCTAAGCTCAGCTTGCGGTTCTCAAGGTTCGTA
TCACGTCTCCATCTTCTTGCTCCATCTCCACAATCACTCTCTTCTTCTTCTTCTTTGATT
TCCCAAGATCATCAGACTTTCTTGAATCTCTCCTTCCTTTTTTATGAATCACAACTTGCT
CCTCACCGTCATCGTCTTCCTCCTCATCAGCTGAAT***GTTCATCATCGTTGAAGTCAG
ACATCTTAGAGGGAAAACCAGAGAAATCTTCCATATCTTCTTCCTCTTCTTCAAGCTCTT
CATAGCCTTCAACATATTCAATCTCTGGCTCCTCCTCTTCTACCTCCTCCTCAACACCTT
CTCCCACTTTCTTTTTTTCATCAAGAACCTTGTTCCACTCGAGCTCTGGGTAATTGTATA
TGTCACCATATATACCCTTCTTCAAACGCTCCAGCAACTCGGTCTCAATAGCCTTATCCA
AGACCGCTGCTTTAATAGCCTTGTCCCCCCTTCTTGATTCTCTCTTGATATCCCTCCTCG
GTGTAGTCATTATCTTCTCCCTTGTCTTGAGAGCAAGTTTCCTCATACGAATACGCATCT
GAGTCATTTTGGTCAGTCTCTGTTTGATCTTGTGCTGTATACTTAGC*ATACACAGTGCT
GTCATGTTCA

QA 3 842 3 842
DS 



AS 1 2

CO CL7333Contig1 1022 2 2 U
GATCAGCGGTTACCACCGGAGTGGACTCGAAGCCGCTGGGTGGCAAATCAGGACGATACA
GAGGATTCGAAACCCTAAAGCGGAGAAAGATGCTTACAACGAGTGGAACTACAGCAAGTT
CCGACTATGGCAGCTCACCGATTACGACAAGATCATCTTCATCGACGCGGATCTCTTAAT
CTTGAGAAACATCGACTTCTTGTTCTCGATGCCTGAGATCTCAGCCACGGGAAACAATGG
AACCCTATTCAACTCGGGAGTTATGGTGATCGAGCCTTGCAACTGTACGTTTGAGCTTTT
GATGGAACATATAAATGAGATTGAGTCGTACAACGGTGGTGATCAGGGCTACTTAAACGA
GGTCTTTACATGGTGGCATCGGATTCCGAAGCACATGAATTTCTTGAAGCATTTTTGGGT
TGGGGATGAAGATGACGTGAGAAGCAAGAAAACAGAGTTGTTTGGAGCAGAGCCTCCGGT
TCTTTATGTTCTTTATTACTTGGGAATGAAGCCGTGGCTATGTTACCGTGACTATGATTG
TAACTTCAACTCCGATGTATTCGTTGAGTTCGCGACGGATATTGCTCACCGACGATGGTG
GATGGTCCACGATGCAATGTCAAAGGAGCTTCACCAATTTTGTTACTTGCGATCCAAGCA
AAAGGCACAGCTGGAATATGATCGCCGGCAAGCCGAGGTGGCGAATTATACCGACGGCCA
CTGGAAAATAAGAGTAAAGGACCCGAGATTCAAGATTTGTATTGATAAATTGTGTAATTG
GAAAAGCATGTTGAAGCATTGGGGAGAATCAAATTCAAATTGGACCGACGACGAGTACTT
TGTACCTACCCCACCGGCTATCACCGCCGTCCGGGGATCCTCGCTTCCTGGCAATAACTT
GTGACTTGATACACAAAAACAACTACCCACATATATTAATGTACTTCACGAGTGTTTTTT
TCTGCGAGATTAGGTAAATATCAGATGTATAACTAATTTTCATATAGTGTTTTTTCAACT
GG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 

AF RS1G921TF U 1
AF RS1G921JQ C 513
BS 1 632 RS1G921TF
BS 633 1022 RS1G921JQ

RD RS1G921TF 632 0 0
GATCAGCGGTTACCACCGGAGTGGACTCGAAGCCGCTGGGTGGCAAATCAGGACGATACA
GAGGATTCGAAACCCTAAAGCGGAGAAAGATGCTTACAACGAGTGGAACTACAGCAAGTT
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CTTGAGAAACATCGACTTCTTGTTCTCGATGCCTGAGATCTCAGCCACGGGAAACAATGG
AACCCTATTCAACTCGGGAGTTATGGTGATCGAGCCTTGCAACTGTACGTTTGAGCTTTT
GATGGAACATATAAATGAGATTGAGTCGTACAACGGTGGTGATCAGGGCTACTTAAACGA
GGTCTTTACATGGTGGCATCGGATTCCGAAGCACATGAATTTCTTGAAGCATTTTTGGGT
TGGGGATGAAGATGACGTGAGAAGCAAGAAAACAGAGTTGTTTGGAGCAGAGCCTCCGGT
TCTTTATGTTCTTTATTACTTGGGAATGAAGCCGTGGCTATGTTACCGTGACTATGATTG
TAACTTCAACTCCGATGTATTCGTTGAGTTCGCGACGGATATTGCTCACCGACGATGGTG
GATGGTCCACGATGCAATGTCAAAGGAGCTTC

QA 1 632 1 632
DS 

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CGACGGATATTGCTCACCGACGATGGTGGATGGTCCACGATGCAATGTCAAAGGAGCTTC
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CCGAGGTGGCGAATTATACCGACGGCCACTGGAAAATAAGAGTAAAGGACCCGAGATTCA
AGATTTGTATTGATAAATTGTGTAATTGGAAAAGCATGTTGAAGCATTGGGGAGAATCAA
ATTCAAATTGGACCGACGACGAGTACTTTGTACCTACCCCACCGGCTATCACCGCCGTCC
GGGGATCCTCGCTTCCTGGCAATAACTTGTGACTTGATACACAAAAACAACTACCCACAT
ATATTAATGTACTTCACGAGTGTTTTTTTCTGCGAGATTAGGTAAATATCAGATGTATAA
CTAATTTTCATATAGTGTTTTTTCAACTGG

QA 1 510 1 510
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGGTTACGCCCCTGATGGGAAACGGATTTATGATCCTGTTAGAGGAAAGACTTGCCACCA
ATGCAGGCAGAAGACGCTTGGTTATCGTACACAATGCAGCAAGTTTCACCCTTCTGTCAC
AGGTCAATTCTGTGGAGATTGTTTGTACATGAGGTATGGAGAACATGTGCTTGAAACTCT
GGAGAATCCGGAGTGGATTTGTCCTGGCTGTCGCGGAATCTGCAACTGCAGTCTCTGTCG
TAAACGTAAAGGGTGGTTGCCGACTGGTACAGCTTACAAGAAGGTATGTAAGCTAGGGTA
CAAGTCTGTTGCACATTACCTGATTCAAAACAACAAGCAGTCAGAAACAGATGAGGACGA
TGATGAGACAGACGACACTCCTTCGCAAGCTTCTGCTAAGAGATCGCTATCTTTCAAAGA
AGCAAAGGTGTCTTCAGAAGATGATGATGATGATCTCAATCTCCTCCAGATCACCGATGG
GCTTGCGGTTCAGGAGACTCACATTGACGATGATAATGAAGGCACAGACAAGAATCAGGA
TTCAGCTAGAAAGTCATTGAGTTTCTTGTCTGCTGAGGACAATCAAACTTCAGTGAACGA
GATGGATCCAGCAACTCCTTTGTTGATGATTGATGTTAAGCCTTATTCTGGAGACAAAGA
GAATGGAAAAACAAGAGGAGGCAAGAGGAAAATGTCTGTTGAGCCAAACCCGAACAGTAT
TGGTGGAAGACTGAGGCAGCGTCGTCAGAGTCAAGCTTGAATGAAGATAAAAAGTTCATA
TTAGATATGAATGGAGAAACTCTCTCACTGTTCAAGGTCTTCATGTTTCCTGCATTTTAA
GGCATATCTAAATGTAATATCTTTCTTTACCTTTTCCAGACAGAGCAACCATGGATCATG
TAATCTCTTTTCAATGTTTTGTTTTTGTCTTAATTGCAAACTAGTTTTGCATTAAATTAT
TGTATTTCCTGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DU14TF U 1
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TGATGAGACAGACGACACTCCTTCGCAAGCTTCTGCTAAGAGATCGCTATCTTTCAAAGA
AGCAAAGGTGTCTTCAGAAGATGATGATGATGATCTCAATCTCCTCCAGATCACCGATGG
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GAATGGAAAA
CAA

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DS 

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ATGATGATGATCTCAATCTCCTCCAGATCACCGATGGGCTTGCGGTTCAGGAGACTCACA
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TCTTGTCTGCTGAGGACAATCAAACTTCAGTGAACGAGATGGATCCAGCAACTCCTTTGT
TGATGATTGATGTTAAGCCTTATTCTGGAGACAAAGAGAATGGAAAAACAAGAGGAGGCA
AGAGGAAAATGTCTGTTGAGCCAAACCCGAACAGTATTGGTGGAAGACTGAGGCAGCGTC
GTCAGAGTCAAGCTTGAATGAAGATAAAAAGTTCATATTAGATATGAATGGAGAAACTCT
CTCACTGTTCAAGGTCTTCATGTTTCCTGCATTTTAAGGCATATCTAAATGTAATATCTT
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TTTGTCTTAATTGCAAACTAGTTTTGCATTAAATTATTGTATTTCCTGATC

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DS 



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BQ
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AF RS1EW09JQ U 177
AF RS1EW09TF C 1
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CAAA
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DS 

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GTCGATCATTGCCTCGCTTCATGGCCAAGCTGGACATAAATCCAGAATC

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DS 



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BQ
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AF RS1AS15TF U 1
AF RS1AS15JQ C 297
BS 1 582 RS1AS15TF
BS 583 949 RS1AS15JQ

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CAGAAGGGAATCCCTTACCTGAACACATACGACGGTCGCACTATCCGTTACCCCGACCCG
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GAAACA

QA 1 582 1 582
DS 

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TCACTCCATCAGAGACGAGGAAGCAAAGTTCAAGCTGTGCAAAGTGAGAACTATCCGGCT
TGGTCAGAAGGGAATCCCTTACCTGAACACATACGACGGTCGCACTATCCGTTACCCCGA
CCCGCTCATCAAGCCCAACGACACCATCAAGCTAGACCTCGAGGAGAACAAGGTTGTGGA
GTTCATCAAGTTTGATGTTGGAAACGTTGTGATGGTGACTGGAGGAAGAAACAGAGGTCG
TGTTGGTGTGATCAAGAACCGGGAGAAACATAAGGGAAGCTTCGAGACCATCCACATTCA
AGACTCTACTGGACATGAGTTTGCAACGAGGTTAGGGAATGTGTTCACGCTTGGGAAAGG
AACAAAGCCGTGGGTGTCTCTTCCAAAGGGTAAAGGTATTAAGCTTACCATCATTGAGGA
AGCTAGGAAGAGGCTTTCTGCTCAACAAGCTGCTTGAAACTGTTTTTTTTCTTTTTGTTT
CCTCTGTTTCAGAAAACCTATGTTCTGTTTTTTTGTATCTTGCTATTGAGTTCCTTGTTC
TTATTAGACTTTCATGTCTTTGATTGCTATTGAGTTCTTTATTCAAGTACCAA

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 2

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AGACCGATCAGTCTCTCAAAGGCGGCAACGCTTCTCTCAAGTTTCGTTTCCTCAGAGACA
GAGGCCTCTCAAGACGTCGCCGCGTACCTCCGACGCGCCTCCGCTGCCTTCACTGAGCTT
AAGAGCTTCCACAGAGAGATTAGATCTACTACCAAGCCTGAATCCGAGGCAAAGGATGAG
AAGAAGAAGAGCAGAGAAGAAGAAGTTGTTGTTGAGGAGGAGAAGGAGAGTGTGAAGTTG
GAAGAGGAGGCAGTGAAGAAAGAGAGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGCAAAGGTGAA
GAAGATGTTGTTGTTGAAGAAAAAGTGGATGTGAAGTTAGAAGAAGAGCAAAGGAACGAT
GATGAGAGCAAGAAGAAAAAGAAGCACAAAAGGAAGAAAGGTGAAGAGAAGGTGAAGTTA
GAAGAAGAGCAAAGGAGTGACGAGAAGAAGAAAGGTGAAGATGTTGTTGACGAGAAGGTG
AAGAATGAAGAGAAAAAGAAGAAGAAGCGGAAGAGTGATGGAGAGGTTGGTTCTGAGGAG
AAGAAGAAGAGCAAGAAGAAGAGGAAATCAAAGGAGATTGATCCTTGAACTTGCTTTCTT
TTGAGACCAATTTTGTAGTGTGATTTTTTTTTTTCAAAAGTTTCGGGTAAGTGTAGGCTT
AAGATGTTCCTTATTGACAATTATGATTGATAAAAAGATTTGATTTTGTGGAACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DK79TF U 1
AF RS1DK79JQ C 137
BS 1 638 RS1DK79TF
BS 639 775 RS1DK79JQ

RD RS1DK79TF 638 0 0
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AAGAAGAAGAGCAAGAAGAAGAGGAAATCAAAGGAGAT

QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1DK79JQ 639 0 0
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AGAAGAGGAAATCAAAGGAGATTGATCCTTGAACTTGCTTTCTTTTGAGACCAATTTTGT
AGTGTGATTTTTTTTTTTCAAAAGTTTCGGGTAAGTGTAGGCTTAAGATGTTCCTTATTG
ACAATTATGATTGATAAAAAGATTTGATTTTGTGGAACT

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 2

CO CL7339Contig1 1051 2 2 U
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TAAATTGGCAAGTTTGACAAGTTCCAATATGATGTTTGAAGAAGTCTGGAGATTTTCTAC
AAATCAACTTACTGAGCGGCAGAAAGATATGTTACTAGACATAGCGTGTTTCTTCAACTC
AGAAGATGAGTATATTGTTAGGAGTTTACTAGATTCAGGAGATCTTGACTCCATTGATAC
TGTGAGTGAAGTAAGAGATCTCGCCAACAAGTTCCTGATTACAATATCTGACAGTCGAGT
AAATATGAATGATATGATGTATACGTTTGCCAAGGACCTTGGCTCTCCTCGATGGCTTAG
GCTTTGGAACTACGAAGATTTCATCAACGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D334TF U 1
AF RS1D334JQ C 399
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BS 682 1051 RS1D334JQ

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GGAAAACCCATCTCTCTTTCCTTCAACCGGAACAGAAGAAAAGCATGAAACACATCAGAA
CAAATAACACCTATTTGGAATGGAACAACACATGAAGCAATTAGAGAACAAGTTAGAGTT
TGATTGCGACGAAACTCGCATTATTGGGGTTGTTGGAATGCCTGGTATTGGTAAAACCAC
TCTCGCATTGATGCTGCACGAGAAGTGGAACTGCCAGTTTATACGTTGCGTGCCTCTTAT
GGATATCCGTAGGAAATCAAACAAATATGGGCCAATGTGGCTGCGAAAGACACTTCTTGA
AGTTTTACTAGAGGGAAAGTTTCCATTGATAAGTGACAAGACAACGCATGAATCCGTGAG
GGATATATTGCTTCATACTAAAGTTTTTGTTGTTCTTGATGACTTGAGTGACAAGAAACA
GTTGGAGTTTCTTCTCGGTGACCTTGGTTGGATTAAGAAGGGAAGCAAGATTGTTATTTC
AACATGTGACGAGTCATTGCTTGATGGATGTGCTCATGATACTTATGTAGTACCGGTATT
GAATGATAGAGAGGCCTTTCAGCTCTTTAATTATCATGCCTTCGATGATAAACTCTGCAG
TTCCACCAATACCTTCCCGACGCTCTCTAGAAAATTTGTGGATTACGCTCGAGGACACCC
ACTTGCCCTCAGTTTACTTGG

QA 1 681 1 681
DS 

RD RS1D334JQ 653 0 0
ATGACTTGAGTGACAAGAAACAGTTGGAGTTTCTTCTCGGTGACCTTGGTTGGATTAAGA
AGGGAAGCAAGATTGTTATTTCAACATGTGACGAGTCATTGCTTGATGGATGTGCTCATG
ATACTTATGTAGTACCGGTATTGAATGATAGAGAGGCCTTTCAGCTCTTTAATTATCATG
CCTTCGATGATAAACTCTGCAGTTCCACCAATACCTTCCCGACGCTCTCTAGAAAATTTG
TGGATTACGCTCGAGGACACCCACTTGCCCTCAGTTTACTTGGTAGGGAACTTCGTGGGA
AAGACAGGGCTCACTGGGAATATAAATTGGCAAGTTTGACAAGTTCCAATATGATGTTTG
AAGAAGTCTGGAGATTTTCTACAAATCAACTTACTGAGCGGCAGAAAGATATGTTACTAG
ACATAGCGTGTTTCTTCAACTCAGAAGATGAGTATATTGTTAGGAGTTTACTAGATTCAG
GAGATCTTGACTCCATTGATACTGTGAGTGAAGTAAGAGATCTCGCCAACAAGTTCCTGA
TTACAATATCTGACAGTCGAGTAAATATGAATGATATGATGTATACGTTTGCCAAGGACC
TTGGCTCTCCTCGATGGCTTAGGCTTTGGAACTACGAAGATTTCATCAACGAG

QA 1 653 1 653
DS 



AS 1 2

CO CL7340Contig1 825 2 4 U
GGATCTCCTTCAATATACGAATTCTATTCCCACGTTCTCTCTATATATATTACTCTTTCA
TCAAACTTTAAACCCCTAAAATCAAGAAAGGAGAAAGACAAGAAGAGAGACCAAAGAAAA
AAAATAGAAACAATGTCTTATTCTTCCCTCAAACTGCCATTCTTTCTCGTTCTCTCATCT
CTTCTCCATGCCGCCTTAGGAGAGGGGATTATTTGCGAGAATCTGCCAACGGGTATGTGT
GCGTTCTCGATATCGGCTTCAGGGAAAAGATGTTTATTGGAGACAGCTAACGTCGCCGGA
GAATACACTTGCCGGACTTCCGCGGTGGAGGTTGAAGGGATTGTAAACCACGTGGAGAGC
GATGAGTGTGTAGCTGCATGTGGGGTTGATCGGAAAACCGTAGGGATCTCGTCGGACGCA
ATGATGGAGGCAGGTTTCGCCGCTAAGCTTTGCTCTCCGGCTTGTTTGGATTATTGTCCT
AACATTCTTGATCTTTATTTTAATCTCGCCGCCGGTGAAGGTGCATTTTTACCTGATCTG
TGTGATGCTCAACGGATTAACCCCCACCGTTCCATGTTGGAAATGCTCAGTTCCAGTGCG
GCTCCTGGGCCTGTTTCCGAGACTGCTCCAGGCCCTGACTCCGACACCTCAGCCCCTGCA
CTAGCTCCGGCTGCTACGTAAAAGTAATGTTACTAATTTCACGTGTGTCATGATTTATAT
ATGTTTAATATTGATTCATATGAGAGAGCAGATGATACAGAGTGAGTTTGATTATTGGTT
CTGTTTCTAAAAATTTTCCCATATAATAAGAACTTTTGTAATATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CL26TF U 1
AF RS1CL26JQ C 22
BS 1 727 RS1CL26TF
BS 728 728 RS1CL26JQ
BS 729 792 RS1CL26TF
BS 793 825 RS1CL26JQ

RD RS1CL26TF 803 0 0
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CTTCTCCATGCCGCCTTAGGAGAGGGGATTATTTGCGAGAATCTGCCAACGGGTATGTGT
GCGTTCTCGATATCGGCTTCAGGGAAAAGATGTTTATTGGAGACAGCTAACGTCGCCGGA
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TGTGATGCTCAACGGATTAACCCCCACCGTTCCATGTTGGAAATGCTCAGTTCCAGTGCG
GCTCCTGGGCCTGTTTCCGAGACTGCTCCAGGCCCTGACTCCGACACCTCAGCCCCTGCA
CTAGCTCCGGCTGCTACGTAAAAGTAATGTTACTAATTTCACGTGTGTCATGATTTATAT
ATGTTTA*TATTGATTCATATGAGAGAGCAGATGATACAGAGTGAGTTTGATTATTGGTT
CTGTTTCTAAAA
TTTCCCATATA

QA 1 792 1 792
DS 

RD RS1CL26JQ 804 0 0
A
TCTATTCCCACGTTCTCTCTATATATAT*ACTCTTTCATCAAACTTTAAACCCCTAAAAT
CAAGAAAGGAGAAAGACAAGAAGAGAGACCAAAGAAAAAAAATAGAAACAATGTCTTATT
CTTCCCTCAAACTGCCATTCTTTCTCGTTCTCTCATCTCTTCTCCATGCCGCCTTAGGAG
AGGGGATTATTTGCGAGAATCTGCCAACGGGTATGTGTGCGTTCTCGATATCGGCTTCAG
GGAAAAGATGTTTATTGGAGACAGCTAACGTCGCCGGAGAATACACTTGCCGGACTTCCG
CGGTGGAGGTTGAAGGGATTGTAAACCACGTGGAGAGCGATGAGTGTGTAGCTGCATGTG
GGGTTGATCGGAAAACCGTAGGGATCTCGTCGGACGCAATGATGGAGGCAGGTTTCGCCG
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ATCTCGCCGCCGGTGAAGGTGCATTTTTACCTGATCTGTGTGATGCTCAACGGATTAACC
CCCACCGTTCCATGTTGGAAATGCTCAGTTCCAGTGCGGCTCCTGGGCCTGTTTCCGAGA
CTGCTCCAGGCCCTGACTCCGACACCTCAGCCCCTGCACTAGCTCCGGCTGCTACGTAAA
AGTAATGTTACTAATTTCACGTGTGTCATGATTTATATATGTTTAATATTGATTCATATG
AGAGAGCAGATGATACAGAGTGAGTTTGATTATTGGTTCTGTTTCTAAAAATTTTCCCAT
ATAATAAGAACTTTTGTAATATC

QA 2 804 2 804
DS 



AS 1 2

CO CL7341Contig1 936 2 4 U
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TACCACTTGATCATAAACATACAAAAGATTGTGGTCAAATTTGGAGGTTCATAAAGTTAA
CCTAATTTAACACCCTTTAAATTCAATATCTAGTTTTATACTAAGTTTTATAGGTAACTA
CTAGATACTCCCTCTGTTTTTATATGTAAGTAGTTTTAGCAAAAAATGTTTGTTTCACAA
TGTAAGATGTTTTCATAATTCAAAGCACCTTTTACATTTATTACACGTTGTGTGACCAAT
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AAGTAAAAGTTTTTTTAATATTCAAATATGTTTTCTCGCTTAATAATACGAGATACAGTA
TATGTTTCATATTGCATAAGTTTTTTTTTGCAACTCATATTACATAAGTTCAGATTTGAA
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AACTTCAAGCAAATAGTATCGCATAATTAAATCGTATCAAGATACAGTATAAGTCAAATT
TGATTTTGTGATGTTGATGTTCGTTTAATCGTTTTTGAAATATATATATATTTTTTCTGG
TAAAATTTTTGAAAGAGATATATTCCGTAGATGATTAAAAAACTTCAAGAAAGATAGTGT
CGCTTAATTTAATCGGATCAAGATATAAGTCGGTTTTGACTTTGTGATATGCATCATCCA
TATGGTCCTCTTTCAAATTTCCCCAAGGCTATTTATGAATTAAGCGCGAACATTTGAAAT
ATTGTCTTTAAAAAGAACGTTTGAAATATTGTCGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A939TF U 1
AF RS1A939JQ C 35
BS 1 80 RS1A939TF
BS 81 81 RS1A939JQ
BS 82 803 RS1A939TF
BS 804 936 RS1A939JQ

RD RS1A939TF 809 0 0
GGAGGTAAACCTTGTTTTACATGCTCCTGTTTGTTTTCGTGTGTGTGTGTGTGTCTATAT
GTTCATGACAAACAACAAAA*CGTGTTTTTCTCGCATACAATTCGTGTTGTGTTTATATG
TACCACTTGATCATAAACATACAAAAGATTGTGGTCAAATTTGGAGGTTCATAAAGTTAA
CCTAATTTAACACCCTTTAAATTCAATATCTAGTTTTATACTAAGTTTTATAGGTAACTA
CTAGATACTCCCTCTGTTTTTATATGTAAGTAGTTTTAGCAAAAAATGTTTGTTTCACAA
TGTAAGATGTTTTCATAATTCAAAGCACCTTTTACATTTATTACACGTTGTGTGACCAAT
CAAATAATTCATACCTATTTATTATTGGCTGAATTTATGCATTAAATGCTATTTTTACAA
AAGTAAAAGTTTTTTTAATATTCAAATATGTTTTCTCGCTTAATAATACGAGATACAGTA
TATGTTTCATATTGCATAAGTTTTTTTTTGCAACTCATATTACATAAGTTCAGATTTGAA
TTTGTGAGTTGTGATGTTGTTGTTCGTTTAGAAGGAGTTATACTCCACAGAAGATGAGAA
AACTTCAAGCAAATAGTATCGCATAATTAAATCGTATCAAGATACAGTATAAGTCAAATT
TGATTTTGTGATGTTGATGTTCGTTTAATCGTTTTTGAAATATATATATATTTTTTCTGG
TAAAATTTTTGAAAGAGATATATTCCGTAGATGATTAAAAAACTTCAAGAAAGATAGTGT
CGCTTAATTTAATCGGATCAAGA
ATATAA

QA 1 803 1 803
DS 

RD RS1A939JQ 902 0 0
TTTCGTGTGTGTGTGTGTGTCTATATGTTCATGACAAACAACAAAAACGTGTTTTTCTCG
CATACAATTCGTGTTGTGTTTATATGTACCACTTGATCATAAACATACAAAAGATTGTGG
TCAAATTTGGAGGTTCATAAAGTTAACCTAATTTAACACCCTTTAAATTCAATATCTAGT
TTTATACTAAGTTTTATAGGTAACTACTAGATACTCCCTCTGTTTTTATATGTAAGTAGT
TTTAGCAAAAAATGTTTGTTTCACAATGTAAGATGTTTTCATAATTCAAAGCACCTTTTA
CATTTATTACACGTTGTGTGACCAATCAAATAATTCATACCTATTTATTATTGGCTGAAT
TTATGCATTAAATGCTATTTTTACAAAAGTAAAAGTTTTTTTAATATTCAAATATGTTTT
CTCGCTTAATAATACGAGATACAGTATATGTTTCATATTGCATAAGTTTTTTTTTGCAAC
TCATATTACATAAGTTCAGATTTGAATTTGTGAGTTGTGATGTTGTTGTTCGTTTAGAAG
GAGTTATACTCCACAGAAGATGAGAAAACTTCAAGCAAATAGTATCGCATAATTAAATCG
TATCAAGATACAGTATAAGTCAAATTTGATTTTGTGATGTTGATGTTCGTTTAATCGTTT
TTGAAATATATATATATTTTTTCTGGTAAAATTTTTGAAAGAGATATATTCCGTAGATGA
TTAAAAAACTTCAAGAAAGATAGTGTCGCTTAATTTAATCGGATCAAGATATAAGTCGGT
TTTGACTTTGTGATATGCATCATCCATATGGTCCTCTTTCAAATTTCCCCAAGGCTATTT
ATGAATTAAGCGCGAACATTTGAAATATTGTCTTTAAAAAGAACGTTTGAAATATTGTCG
CC

QA 1 902 1 902
DS 



AS 1 2

CO CL7342Contig1 881 2 2 U
GGATCTCTTTCTCTCACTAAAAAAAATCCTAAGATCCAATGGATCAAAACGAACCAATAA
GCAAGAAGCTATGGAACATCGTACGTTTCCTCTTGTACATGATCCGAAAAGGTGTCTCAA
AACACAAACTCATCGCCGACTTCAACGCCACACTCAAACGCGGAAAGAATCTCATGTTCC
ACCACCGTCGCCGTGTCCCAGCCGCCGCCACTTCCTCATCGGCCACCGCAACCGTACCTC
AACGTCAAGAATACGAGTTTAGCTGCAGCAACACTCCGAACTACTCTTTCCCCTTTCCCA
ATATTGGGTTCATGAAGAAAAAGAGTCACAATAATCTCTTCGCGTGTGGTCAAACGCCTC
AGACGCTTGACGACGACGCTGCCGCAGCTAGAGCAGTCCTTGAGCTTCTTAACGGCGTTG
GTGAGAAAGGAAACGTTACTCCGGCGTATTTGTCGGCGGCTTTGTCTCCTTACTTTCCCG
GGTTTGGTCGGACTCCTTTGGTGAGGCCGTTGAGAGTAACGGACTCACCGTTTCCTTTAA
CACCGGAAAGTGGCGACGTGGCCAACGGACACGTGGACCAAGCAGCTGATGATTTCATAA
AGAAGTTTTATAAGAACTTAAATCAGCAGAAAAAAATGATTGAGTTCAGCTAAAATCTAA
TCTGATTAGTGTACTTCATATTTCTCTCCTTTTTTTCTTTTTGCTGATATTAATTGCTTA
ATATGTAATGATATAATGATATTGTTTACAAAAAAAAAAAATATGTAATGATATCTTTGG
GGGATTTTTTTTTTGTTAAAGTCTTTGGGGGATTTTTATTTTCACTTTTCTTGAAACAAT
TGGATATTGTCAATAAGAAGAATATCATGGTCTTTGTCAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AJ40TF U 1
AF RS1AJ40JQ C 24
BS 1 801 RS1AJ40TF
BS 802 881 RS1AJ40JQ

RD RS1AJ40TF 801 0 0
GGATCTCTTTCTCTCACTAAAAAAAATCCTAAGATCCAATGGATCAAAACGAACCAATAA
GCAAGAAGCTATGGAACATCGTACGTTTCCTCTTGTACATGATCCGAAAAGGTGTCTCAA
AACACAAACTCATCGCCGACTTCAACGCCACACTCAAACGCGGAAAGAATCTCATGTTCC
ACCACCGTCGCCGTGTCCCAGCCGCCGCCACTTCCTCATCGGCCACCGCAACCGTACCTC
AACGTCAAGAATACGAGTTTAGCTGCAGCAACACTCCGAACTACTCTTTCCCCTTTCCCA
ATATTGGGTTCATGAAGAAAAAGAGTCACAATAATCTCTTCGCGTGTGGTCAAACGCCTC
AGACGCTTGACGACGACGCTGCCGCAGCTAGAGCAGTCCTTGAGCTTCTTAACGGCGTTG
GTGAGAAAGGAAACGTTACTCCGGCGTATTTGTCGGCGGCTTTGTCTCCTTACTTTCCCG
GGTTTGGTCGGACTCCTTTGGTGAGGCCGTTGAGAGTAACGGACTCACCGTTTCCTTTAA
CACCGGAAAGTGGCGACGTGGCCAACGGACACGTGGACCAAGCAGCTGATGATTTCATAA
AGAAGTTTTATAAGAACTTAAATCAGCAGAAAAAAATGATTGAGTTCAGCTAAAATCTAA
TCTGATTAGTGTACTTCATATTTCTCTCCTTTTTTTCTTTTTGCTGATATTAATTGCTTA
ATATGTAATGATATAATGATATTGTTTACAAAAAAAAAAAATATGTAATGATATCTTTGG
GGGATTTTTTTTTTGTTAAAG

QA 1 801 1 801
DS 

RD RS1AJ40JQ 858 0 0
AAATCTTAAGATCCAATGGATCAAAACGAACCAATAAGCAAGAAGCTATGGAACATCGTA
CGTTTCCTCTTGTACATGATCCGAAAAGGTGTCTCAAAACACAAACTCATCGCCGACTTC
AACGCCACACTCAAACGCGGAAAGAATCTCATGTTCCACCACCGTCGCCGTGTCCCAGCC
GCCGCCACTTCCTCATCGGCCACCGCAACCGTACCTCAACGTCAAGAATACGAGTTTAGC
TGCAGCAACACTCCGAACTACTCTTTCCCCTTTCCCAATATTGGGTTCATGAAGAAAAAG
AGTCACAATAATCTCTTCGCGTGTGGTCAAACGCCTCAGACGCTTGACGACGACGCTGCC
GCAGCTAGAGCAGTCCTTGAGCTTTTTAACGGCGTTGGTGAGAAAGGAAACGTTACTCCG
GCGTATTTGTCGGCGGCTTTGTCTCCTTACTTTCCCGGGTTTGGTCGGACTCCTTTGGTG
AGGCCGTTGAGAGTAACGGACTCACCGTTTCCTTTAACACCGGAAAGTGGCGACGTGGCC
AACGGACACGTGGACCAAGCAGCTGATGATTTCATAAAGAAGTTTTATAAGAACTTAAAT
CAGCAGAAAAAAATGATTGAGTTCAGCTAAAATTTAATCTGATTAGTGTACTTCATATTT
CTCTCCTTTTTTTCTTTTTGCTGATATTAATTGCTTAATATGTAATGATATAATGATATT
GTTTACAAAAAAAAAAAATATGTAATGATATCTTTGGGGGATTTTTTTTTTGTTAAAGTC
TTTGGGGGATTTTTATTTTCACTTTTCTTGAAACAATTGGATATTGTCAATAAGAAGAAT
ATCATGGTCTTTGTCAAT

QA 1 858 1 858
DS 



AS 1 2

CO CL7343Contig1 778 2 2 U
CCCGATGAGTTTGCTTCGCTTCGTTGGTTCATAGATTCGCTAAAGCAAAAGCTCACCACA
CCAATCAACCAATCAAAATGGAGCTGGTGGGGAAAGTCGTTAGGAAAGAGATCCAAGGGG
TCGGGCTTTGCTCAGGGACGGTTCGATCTCGCGACGATTCGTCTGGACTCCTCGAGATCG
TTTACGAGAATGGCGTCACGGAGATCTCGGAGCCAGCTGAGGTCGCTGCTCTCGTGACGA
CGACGGGAGAAGAAGGTGAATCCCAGCAGCCTCGAGGGGACGTCGTCGATTTGAATTGTG
GTTTTGTGGAAACCCTAGGAGGTTTTGATTTGAATAGTAATGGGTTTGATGTCACTACGG
GGTTGGATTTGAATTTGAACGAGGGTTTAGGGTTGGTTGATGTGAGTATCGATTACGAGG
AGGAGTGTAGTGATAAGAGGAGGGGGTTTATTGATCTGAACGTGGATGCGAGCTGTGATT
TGGACAATGCGCACAAGAGGGAGGAGGGAGGGTTTGATTTGAACCTGGAGGTTAACGTTG
AGAACAGCGTTCAAGAAACCAACATGCAGAATCTTGAGAGTGGAGAATGTAAAGAAGTTC
ATGTTGCTGAAGTATCCAGCGTTCAGCTTTTGGAGGAGATAGGGAAACAGAACGGTGTTT
CTCTGCAGGAGATCAATACTCCTGATTCTAATGGAGCTGAGCGGGAGAATGATGGTAAGA
CTGTTGATAAGTCTCTCTCTGATAGGGAAATGTCGGATGGATACACTAGGGGTAGGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DA05TF U 1
AF RS1DA05JQ C 88
BS 1 493 RS1DA05TF
BS 494 778 RS1DA05JQ

RD RS1DA05TF 493 0 0
CCCGATGAGTTTGCTTCGCTTCGTTGGTTCATAGATTCGCTAAAGCAAAAGCTCACCACA
CCAATCAACCAATCAAAATGGAGCTGGTGGGGAAAGTCGTTAGGAAAGAGATCCAAGGGG
TCGGGCTTTGCTCAGGGACGGTTCGATCTCGCGACGATTCGTCTGGACTCCTCGAGATCG
TTTACGAGAATGGCGTCACGGAGATCTCGGAGCCAGCTGAGGTCGCTGCTCTCGTGACGA
CGACGGGAGAAGAAGGTGAATCCCAGCAGCCTCGAGGGGACGTCGTCGATTTGAATTGTG
GTTTTGTGGAAACCCTAGGAGGTTTTGATTTGAATAGTAATGGGTTTGATGTCACTACGG
GGTTGGATTTGAATTTGAACGAGGGTTTAGGGTTGGTTGATGTGAGTATCGATTACGAGG
AGGAGTGTAGTGATAAGAGGAGGGGGTTTATTGATCTGAACGTGGATGCGAGCTGTGATT
TGGACAATGCGCA

QA 1 493 1 493
DS 

RD RS1DA05JQ 691 0 0
TGGGGAAAGTCGTTAGGAAAGAGATCCAAGGGGTCGGGCTTTGCTCAGGGACGGTTCGAT
CTCGCGACGATTCGTCTGGACTCCTCGAGATCGTTTACGAGAATGGCGTCACGGAGATCT
CGGAGCCAGCTGAGGTCGCTGCTCTCGTGACGACGACGGGAGAAGAAGGTGAATCCCAGC
AGCCTCGAGGGGACGTCGTCGATTTGAATTGTGGTTTTGTGGAAACCCTAGGAGGTTTTG
ATTTGAATAGTAATGGGTTTGATGTCACTACGGGGTTGGATTTGAATTTGAACGAGGGTT
TAGGGTTGGTTGATGTGAGTATCGATTACGAGGAGGAGTGTAGTGATAAGAGGAGGGGGT
TTATTGATCTGAACGTGGATGCGAGCTGTGATTTGGACAATGCGCACAAGAGGGAGGAGG
GAGGGTTTGATTTGAACCTGGAGGTTAACGTTGAGAACAGCGTTCAAGAAACCAACATGC
AGAATCTTGAGAGTGGAGAATGTAAAGAAGTTCATGTTGCTGAAGTATCCAGCGTTCAGC
TTTTGGAGGAGATAGGGAAACAGAACGGTGTTTCTCTGCAGGAGATCAATACTCCTGATT
CTAATGGAGCTGAGCGGGAGAATGATGGTAAGACTGTTGATAAGTCTCTCTCTGATAGGG
AAATGTCGGATGGATACACTAGGGGTAGGAG

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

CO CL7344Contig1 865 2 4 U
GGATTACAATTTTCATTTTCGAATCTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGAAACCAGATTCT
AGAAAGGAGAAGAATCATCGGGGGGCATGGCTTCGCCGAGCAAACGCCGAGAGATGGACA
TGATGAAATTGATGATGAGTGATTACAAGGTGGATACTGTCAACGACGATTTGCAGATGT
TCTATGTTACTTTCCATGGCCCCACTGACAGTCTATATGAGGGAGGTGTATGGAAGATCA
AAGTCGAACTTCCTGAAGCTTATCCTTACAAATCTCCTTCTGTTGGTTTCGTTAACAAGA
TTTATCACCCCAATGTTGATGAATCTTCGGGTGCTGTTTGCTTAGATGTAATAAACCAGA
CATGGAGCCCAATGTTTGATCTTATCAATGTCTTCGAGTCATTCCTTCCTCAACTGCTTC
TATATCCAAACCCATCTGATCCATTCAATGGAGAAGCTGCCTCTCTCTTGATGCGAGACC
GTGCAGCCTATGAGAAGAAAGTCAAAGAGTACTGCAAAGCATATGCTAAACCAGAGGACA
TAGGAGCACCTGAGGATTTAAGTGATGATGAAGATGACGATGATGATGATAGCATGAGCG
AACGTGGTTCAGACTCGGATGACAACGATGAAATCGCTGGAAAAGCAGATCCTTGATGAT
GACTTGTGTGTGTGTTACAAATCAACCTTTCTTTGCACTTCATTTCCATATATATAAACC
CATTGATGTTCATTCCGTAGAGGAGAAAAAAATCACTCCTCTGTAAATTTGTAAACACTA
TTTTAATTCTTTAGGAATATTGAAAATATTCATTTGCTTCAACTGTAAATAAAATGTAAC
AACAATATGCAGAATCTTTTACAAC


BQ
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AF RS1AP76TFB U 1
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RD RS1AP76TFB 772 0 0
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QA 1 772 1 772
DS 

RD RS1AP76JQ 865 0 0
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TGATGAAATTGATGATGAGTGATTACAAGGTGGATACTGTCAACGACGATTTGCAGATGT
TCTATGTTACTTTCCATGGCCCCACTGACAGTCTATATGAGGGAGGTGTATGGAAGATCA
AAGTCGAACTTCCTGAAGCTTATCCTTACAAATCTCCTTCTGTTGGTTTCGTTAACAAGA
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AACGTGGTTCAGACTCGGATGACAACGATGAAATCGCTGGAAAAGCAGATCCTTGATGAT
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CATTGATGTTCATTCCGTAGAGGAGAAAAAAATCACTCCTCTGTAAATTTGTAAACACTA
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QA 1 865 1 865
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1EQ85TF U 1
AF RS1EQ85JQ C 151
BS 1 768 RS1EQ85TF
BS 769 931 RS1EQ85JQ

RD RS1EQ85TF 768 0 0
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GACTGACGATATGGAGTACGAGACGACGCCGTACATCTCTCTCTTTTA

QA 1 768 1 768
DS 

RD RS1EQ85JQ 781 0 0
G
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QA 2 781 2 781
DS 



AS 1 2

CO CL7346Contig1 816 2 1 U
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CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGATTCACAAAACCAAAAAAGAAACCTCATATAC
ATATATGCTTAGCCTATCATGAGCAACATCCCCACATCTCTCACCGACTCATCTCTTTCC
ATCTTTCTCCTTACTATCTCTTCTGCCGTCGATCCTTGGCCCTTTTCTATCTCCGTCTTC
TAACATCAACCTCTGCTTTATCTCCGTTGCGCGTTTCATTCAATCTATAAGAAAGATTCG
ATCTTTTTAATGGGTTTTGAAGATCAAGAAGAACAGAAACAGAGTCCAAAACAGAGTCAG
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TGCCGCGTCGATGAGTTTAAGCATGTTCAGGAGATTATCGACGAGGAGACTCATCGCCGT
CACAGTCATCACGGTAACGGGCACAACTACCATCATCACCACTACCACAACCATCTGCCA
TGTTTCTGAAGATCTGTACTTGGATTTGTTGGTTTAGTTTGGTATTGGTTTGGTTTGACA
TATAATTGGGTATTGGTTTGGTTTGACTTCTCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1A395TF U 1
AF RS1A395TV U 37
BS 1 816 RS1A395TF

RD RS1A395TF 816 0 0
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CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGATTCACAAAACCAAAAAAGAAACCTCATATAC
ATATATGCTTAGCCTATCATGAGCAACATCCCCACATCTCTCACCGACTCATCTCTTTCC
ATCTTTCTCCTTACTATCTCTTCTGCCGTCGATCCTTGGCCCTTTTCTATCTCCGTCTTC
TAACATCAACCTCTGCTTTATCTCCGTTGCGCGTTTCATTCAATCTATAAGAAAGATTCG
ATCTTTTTAATGGGTTTTGAAGATCAAGAAGAACAGAAACAGAGTCCAAAACAGAGTCAG
AGCCAGATGGTGTTCAAGTTCCACTTTCATGTTCCCCATCTACACATACACCATCATCAT
AACCATCATTATGTTCCGAAAGGCTGTGTCGCGATCATGGTGGGACACGAAGGAGATGAA
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CTCTTGAAAGAAGCTGAAGAAGAGTACGGATTCAAACACGCGGGCCCGATTACGATTCCT
TGCCGCGTCGATGAGTTTAAGCATGTTCAGGAGATTATCGACGAGGAGACTCATCGCCGT
CACAGTCATCACGGTAACGGGCACAACTACCATCATCACCACTACCACAACCATCTGCCA
TGTTTCTGAAGATCTGTACTTGGATTTGTTGGTTTAGTTTGGTATTGGTTTGGTTTGACA
TATAATTGGGTATTGGTTTGGTTTGACTTCTCTTTT

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DS 

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AACCAAAAAAGAAACCTCATATACATATATGCTTAGCCTATCATGAGCAACATCCCCACA
TCTCTCACCGACTCATCTCTTTCCATCTTTCTCCTTACTATCTCTTCTGCCGTCGATCCT
TGGCCCTTTTCTATCTCCGTCTTCTAACATCAACCTCTGCTTTATCTCCGTTGCGCGTTT
CATTCAATCTATAAGAAAGATTCGATCTTTTTAATGGGTTTTGAAGATCAAGAAGAACAG
AAACAGAGTCCAAAACAGAGTCAGAGCCAGATGGTGTTCAAGTTCCACTTTCATGTTCCC
CATCTACACATACACCATCATCATAACCATCATTATGTTCCGAAAGGCTGTGTCGCGATC
ATGGTGGGACACGAAGGAGATGAAGAAGGTCTACACAGATTCGTGGTTCCTTTGATGTTC
TTGAGCCATCCTCTGTTTTTGAGTCTCTTGAAAGAAGCTGAAGAAGAGTACGGATTCAAA
CACGCGGGCCCGATTACGATTCCTTGCCGCGTCGATGAGTTTAAGCATGTTCAGGAGATT
ATCGACGAGGAGACTCATCGCCGTCACAGTCATCACGGTAACGGGCACAACTACCATCAT
CACCACTACCACAACCATCTGCCATGTTTCTGAAGATCTGTACTTGGATTTGTTGGTTTA
GTTTGGTATTGGTTTGGTTTGACATATAATTGGGTATTGGTTTGGTTT

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

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CCCCTTTCTCTTCAAGGTGTTGTCGGTGGGAAGGGCCTTGTCGATTCAATCACATCCGGA
TAAGAATTTGGCTAAGAAATTGCATAAAGCTCATCCCAATCTTTATAAAGACGACAATCA
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TCAGGAGCTTAAGAGTGTTATTCGTGCTGTTCCGGAGATTGAAGAGCTTGTTGGAAGTGA
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CCGAACTATCTTCACCCTGCTAATGTCTGCAGGTCCCGACACAACAAAGCAAATTGTATC
CAAACTAAAACACCGTCTGCATATGGAGAGTCAGGAACGCCATCTGACAGACAAGGAGCG
GCTAGTTTTGAAGCTAGAAAAGCAATATCCAGATGATATTGGGGTCATCTCTGCATTCTT
CTTCAACTATGTGAAGCTCAACCCTGGTGAAGCCTTATACCTTGGTGCAAACGAGCCTCA
TGCCTACTTATTCGGTGAGTGCATTGAGGTCATGGCGACTTCAGACAACGTAGTACGAGC
TGGGCTTACTCCCAAACTCTGGATATTCAAACACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1BX87TF U 1
AF RS1BX05TF U 24
BS 1 816 RS1BX87TF

RD RS1BX87TF 816 0 0
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AGTCCGGTCCGAGTTACTTGGAGGATGACGATGGCTCCGATGGCGTGACGCTTAGATCGT
GGATTGCTGAAAACCCTAGTCTCTCGGAGATAGGGTTTTGGAGAAATGGGGTTGCGATCT
CCCCTTTCTCTTCAAGGTGTTGTCGGTGGGAAGGGCCTTGTCGATTCAATCACATCCGGA
TAAGAATTTGGCTAAGAAATTGCATAAAGCTCATCCCAATCTTTATAAAGACGACAATCA
CAAACCTGAGATGGCATTGGCCTATACTCAGTTCGACGCTCTTTGTGGGTTTACACCTCT
TCAGGAGCTTAAGAGTGTTATTCGTGCTGTTCCGGAGATTGAAGAGCTTGTTGGAAGTGA
AGAAGTAAACCAAGTCTTCTGCATCAGTGAACATGATGAGGAGAAAGTCAAATCTGCTGT
CCGAACTATCTTCACCCTGCTAATGTCTGCAGGTCCCGACACAACAAAGCAAATTGTATC
CAAACTAAAACACCGTCTGCATATGGAGAGTCAGGAACGCCATCTGACAGACAAGGAGCG
GCTAGTTTTGAAGCTAGAAAAGCAATATCCAGATGATATTGGGGTCATCTCTGCATTCTT
CTTCAACTATGTGAAGCTCAACCCTGGTGAAGCCTTATACCTTGGTGCAAACGAGCCTCA
TGCCTACTTATTCGGTGAGTGCATTGAGGTCATGGCGACTTCAGACAACGTAGTACGAGC
TGGGCTTACTCCCAAACTCTGGATATTCAAACACTT

QA 1 816 1 816
DS 

RD RS1BX05TF 775 0 0
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GATGACGATGGCTCCGATGGCGTGACGCTTAGATCGTGGATTGCTGAAAACCCTAGTCTC
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CGGTGGGAAGGGCCTTGTCGATTCAATCACATCCGGATAAGAATTTGGCTAAGAAATTGC
ATAAAGCTCATCCCAATCTTTATAAAGACGACAATCACAAACCTGAGATGGCATTGGCCT
ATACTCAGTTCGACGCTCTTTGTGGGTTTACACCTCTTCAGGAGCTTAAGAGTGTTATTC
GTGCTGTTCCGGAGATTGAAGAGCTTGTTGGAAGTGAAGAAGTAAACCAAGTCTTCTGCA
TCAGTGAACATGATGAGGAGAAAGTCAAATCTGCTGTCCGAACTATCTTCACCCTGCTAA
TGTCTGCAGGTCCCGACACAACAAAGCAAATTGTATCCAAACTAAAACACCGTCTGCATA
TGGAGAGTCAGGAACGCCATCTGACAGACAAGGAGCGGCTAGTTTTGAAGCTAGAAAAGC
AATATCCAGATGATATTGGGGTCATCTCTGCATTCTTCTTCAACTATGTGAAGCTCAACC
CTGGTGAAGCCTTATACCTTGGTGCAAACGAGCCTCATGCCTACTTATTCGGTGAGTGCA
TTGAG*TCATGGCGACTTCAGACAACGTAGTACGAGCTGGGCTTACTCCCAAAC
C

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL7348Contig1 865 2 2 U
GGCACTGGTTCAGATTTGCAGTACTGATAGCAAAAAAAAAACTCAAAACCGAGTGAAATT
TTCGGACATAAAAATCTCTCTCTAAAACCCTTTCTCTGATTTTTTTTTTCTGTTTTAGCT
CCAATTTTTCTAAGTCTTCCTGAGAAAACAAGAGAAGAAAAAAGACAGCAAATTGATACA
GAGAGAGAGAGAAAGCTGCATTTTTTTAAATATGTATGCTTTGTGCTCATCCTTCTTGAT
CTGACATTGCCGACAAATCCTAGGCGAATAATCAAGCTTCTTACATTTGGGGGTTTATTT
CAAAACCAACATGAAGCACTAATCTAATTCTTAAGAAACTAGAGTACTAGATCCTGTTCT
GTTCTCTCGAGTAATAACAATGGCTCGAGGTAGAATCAGATCAAAGCTGAGACTAAGCCA
CCTCTACACATTCGGATGTCTTAGACCAACTACACTCGACCAGAGAGCGTACAAAGGCAC
GAGAGGAGACAAAGATTGGTTTCACAGCTAGAGTTGATGCGAAGATCAGACATCTAAGGA
CGAAACTGGGCAAGAAGCAGTCGAATCTATCTCATTGTTCAGCTCAAGATGCAATGACAC
CTAGATCATTGTAGCATGTATAGGTTTCTTCAAATTCTCTGATGCGTCAAGACTTTGGAA
ATGGTTCTTGATGCTGTTTCTCTTTTTGTGGAGAGGTTTTAGGAGTGAGATCGATGTAAA
GAGTAGTTGCTGATGTGTTTTTTTTAATTGCTTGGTTCTCATTTTTTTAACATGCTTTTG
TTTCCTTTGTACAAAACTTAGGTTTTGTGGATATGCTTACTTAGGACACAGAATGCTAAA
GCCTAATTTTATTTCGCGTTTATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AK35TF U 1
AF RS1AK35JQ C 227
BS 1 795 RS1AK35TF
BS 796 865 RS1AK35JQ

RD RS1AK35TF 796 0 0
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GTTCTCTCGAGTAATAACAATGGCTCGAGGTAGAATCAGATCAAAGCTGAGACTAAGCCA
CCTCTACACATTCGGATGTCTTAGACCAACTACACTCGACCAGAGAGCGTACAAAGGCAC
GAGAGGAGACAAAGATTGGTTTCACAGCTAGAGTTGATGCGAAGATCAGACATCTAAGGA
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CTAGATCATTGTAGCATGTATAGGTTTCTTCAAATTCTCTGATGCGTCAAGACTTTGGAA
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TTTCCTTTGTACAAA
C

QA 1 795 1 795
DS 

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TTGGGGGTTTATTTCAAAACCAACATGAAGCACTAATCTAATTCTTAAGAAACTAGAGTA
CTAGATCCTGTTCTGTTCTCTCGAGTAATAACAATGGCTCGAGGTAGAATCAGATCAAAG
CTGAGATTAAGCCACCTCTACACATTCGGATGTCTTAGACCAACTACACTCGACCAGAGA
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AGATGCAATGACACCTAGATCATTGTAGCATGTATAGGTTTCTTCAAATTTTCTGATGCG
TCAAGACTTTGGAAATGGTTCTTGATGCTGTTTCTCTTTTTGTGGAGAGGTTTTAGGAGT
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TTAACATGCTTTTGTTTCCTTTGTACAAAACTTAGGTTTTGTGGATATGCTTACTTAGGA
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QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 2

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T


BQ
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10 

AF RS1A541TF U 1
AF RS1A541JQ C 3
BS 1 774 RS1A541TF
BS 775 781 RS1A541JQ

RD RS1A541TF 780 0 0
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TTTTTCCTGTTAAAAATCATATCTAAGCCATATTTTTAAATGTGTTTGCTCCATAAAAAA
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GTATTCTTACGATTTAACGCTAGTTCCGGTGGCCACCGCATGAATACACTTGTTTTACCA
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TATATTATTTGCTATTACATAATTTATCATTTTCAGTTCACAAATCTTTGTTAG
TTCTTT

QA 1 774 1 774
DS 

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ATTTATTTCTTTTTTTTTCTGGTTAGAATGTTTAGGTAAAAATTCATAAAATTACCTTGT
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TTTCCTGTTAAAAATCATATTTAAGCCATATTTTTAAATGTGTTTGCTCCATAAAAAAAG
AATTCTACATTCGCCACTGTTCACTTCCAATTGGTATTTAAGTCGGTCTTGTTTGTGAAC
TATATAACACATAAATATACTTTTTTTTGCTTAAAGTGAATACACTTCTTTTTTTTTTGA
TAATCGTGGGGTTCTGGGTTTCGTCCAGACTAATCACACGAAGCTGACGGCAATCCATGT
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TACGATTTTCTGCTTGTAAAACAAATATAATTGTTTACATCAAAAGACGTTTGATGTAAG
TGCCCAAAATGGTAAAAAGTTTGACTCTTCATATATTATTTTTTTGGTACTCTCTTCATA
TATTATTTGCTATTACATAATTTATCATTTTCAGTTCACAAATCTTTGTTAGGTTCTTT

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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BQ
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AF RS1EA57TF U 1
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QA 1 752 1 752
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BQ
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AF RS1A006TF U 1
AF RS1A006TV U 30
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TCATCTTTGGTCTCTTGATCTTAGCTATGGTAGCTAAATCCGTCAAAGCGACCTACCCAT
TGACTAAATCTTGCATCAATGGACAAGGTTGCATCGGAGATGATGATGAACTTGAATCTC
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TATTCTTCATTCTTGATCGTTAATGATTTCCTTTCTTAACGTACCCTATGTTATACGTAT
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TGATATATCGCCTATTTTCCTTTGTTGTTGTCTTTCCATTTCGTTTCGTTCATATATTAA
GTTCCGTTTGTCTATTA

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DS 

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CAAAAAAAACTTAAACAAAAAAAGTAATAATATATAACTCAAAAAATAAAATAAAAATAA
TAATACAGAATGGGTGGTGTCAAGTTGTTATTCATCTTTGGTCTCTTGATCTTAGCTATG
GTAGCTAAATCCGTCAAAGCGACCTACCCATTGACTAAATCTTGCATCAATGGACAAGGT
TGCATCGGAGATGATGATGAACTTGAATCTCTAATGGATTCAGAGACAAACCGTCGTCAA
CTCGCTAGAGGACGTCGTTACGTTGGCTATGATGCTCTCAAAAAGAACAATGTGCCTTGC
AATAGACGTGGCCGGTCTTACTACGATTGCAAGAAGAGGAGAAGGAATCCTTACAGGCGT
GGATGCAGTGCGATCACGCATTGTTATAGGTACGCTAAGTGAGAACAAAATGATAGAGAG
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CCTTTCTTAACGTACCCTATGTTATACGTATGATTTCTTATGTCTTTTTTTATTTAATCA
TCATCATGATGCATATAAGCTTTTGATACGTTGATATATCGCCTATTTTCCTTTGTTGTT
GTCTTTCCATTTCGTTTCGTTCATATATTAAGTTCCGTTTGTCTATTA

QA 1 768 1 768
DS 



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CAGAATCTCCAATGCCGGATCTGGACTCAGCTCTGAAGCTCAAGAGATTCAATCCAAAAG
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TCGATTACCTTCATTCTGGATTCGGATTCCCGATCGTTCACTGTGATTTGAAGCCGGCGA
ATATACTCCTCGACGGAGATCGAGTCGCTCACGTCAGCGATTTCGGAACTGCGAGGATTC
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AACAATCACAAGGGGTGAGTTTGCGTCAATTGGTGGAGGAATCGATTGGAGATGGAGTAG
AAGGGATGATTAATGCGTGATTCAGAGATTTAGTCTTGTATCGTTTCTCGGAAGCAGGAA
GAGGCTGTTGAAGATTTGTTGAAGCTTTGTTTGTATTGTACAAGCTCTAGACCTGAGGAT
AGGCCCGATATGAATGAGGTTCTTACGCATTTGATGAAACTCAGAGGAAAGACGATCTCA
GTTGTACCAGAAGTGTAGCTGCAAGCAAGCTAAGGAATAGGATGGTTGAAGCGATCAAAA
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CTGCTTTAGGCCCAATAACAGTGAATGTGTTCAGTTAGGCCCAAATTTATATATCTCGTA
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C645TF U 1
AF RS1C645JQ C 635
BS 1 711 RS1C645TF
BS 712 1391 RS1C645JQ

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AGCTAAAGCATCGAAACCTAGCAAAGATCCTAGGGTTCGCTTGGGAGAGCGGGAAGATGA
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TCGATTACCTTCATTCTGGATTCGGATTCCCGATCGTTCACTGTGATTTGA

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GGAGGAATCGATTGGAGATGGAGTAGAAGGGATGATTAATGCGTGATTCAGAGATTTAGT
CTTGTATCGTTTCTCGGAAGCAGGAAGAGGCTGTTGAAGATTTGTTGAAGCTTTGTTTGT
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CGTAAGCTAATGGACTAAGAGCCCATCTGCTTTAGGCCCAATAACAGTGAATGTGTTCAG
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QA 1 757 1 757
DS 



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TGTAGAATCCTAAAAGGCAATGTCCACGAGCCCAAACTCGTTTCCACCGAAGAATGATTT
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TTGTTTCTCCCCTGTTTCTCTATGTAAACCTTTGCAGGGTCCGCTCGTCTTCTTGTCTAT
GTAGTCTGACCAGAATCTAGCCTGAGTTCTCTGGTAAGGATCAGATGGGAGAATAGGGTT
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BQ
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AF RS1BI88TF C 1
AF RS1BI88JQ U 9
BS 1 14 RS1BI88TF
BS 15 798 RS1BI88JQ

RD RS1BI88TF 798 0 0
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T*GCGGAGAGATACATCT*CAAGGAAAATATAACATAACATGGGACGTTCTGCATATGAA
TCTAGTTGAT*CCTAAAATCTTCTTCCGATAGTCAGAGACTGACTTTAGCACCTTATCAG
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TGTAGAATCCTAAAAGGCAATGTCCACGAGCCCAAACTCGTTTCCACCGAAGAATGATTT
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TTGTTTCTCCCCTGTTTCTCTATGTAAACCTTTGCAGGGTCCGCTCGTCTTCTTGTCTAT
GTAGTCTGACCAGAATCTAGCCTGAGTTCTCTGGTAAGGATCAGATGGGAGAATAGGGTT
TGTACCAGGCCAGACTTGATCGATGTACTCAACCTGTATTATGGATTCGCAGATGGGTTT
GCCATTGTGAATCAAAACAGGAATCTTCTTGTGAATTGGGTTCATCTCAAGAAGCAAAGA
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AATCCTTGTCCTCATCCCAAACATGCTCGCCCAGTAATCCAAAAGAATCACCTCTTCTGC
CATCTTTAGTTGTTGTCC

QA 1 798 1 798
DS 

RD RS1BI88JQ 790 0 0
ACTCTA
ACACAAGATCATAGTTAAGTGGGGATACAATGTTATATAATAGTTATTGCGGAGAGATAC
ATCTTCAAGGAAAATATAACATAACATGGGACGTTCTGCATATGAATCTAGTTGATTCCT
AAAATCTTCTTCCGATAGTCAGAGACTGACTTTAGCACCTTATCAGAGTCGGGCAAGACC
TTAGCCACACTTTCTCTCTTCAAACACCTCTCTGCCCAAGCAATTAACTTAGGATACTCT
GCCACAATGCTGAAATTTGCAATAACCTCGTACGTACGGAACCAACTGTAGAATCCTAAA
AGGCAATGTCCACGAGCCCAAACTCGTTTCCACCGAAGAATGATTTGTCTCCTAGCTCCG
AGTCAAGGGTCTTGAGTACTTCGATGAACTCCATCTTTGCTGCCTCTTGTTTCTCCCCTG
TTTCTCTATGTAAACCTTTGCAGGGTCCGCTCGTCTTCTTGTCTATGTAGTCTGACCAGA
ATCTAGCCTGAGTTCTCTGGTAAGGATCAGATGGGAGAATAGGGTTTGTACCAGGCCAGA
CTTGATCGATGTACTCAACCTGTATTATGGATTCGCAGATGGGTTTGCCATTGTGAATCA
AAACAGGAATCTTCTTGTGAATTGGGTTCATCTCAAGAAGCAAAGAGCTCTTGTTACTGA
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TCCCAAACATGCTCGCCCAGTAATCCAAAAGAATCACCTCTTCTGCCATCTTTAGTTGTT
GTCC

QA 7 790 7 790
DS 



AS 1 2

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AAAAACTCAACCCCTCCCTCATTCACTCCGGCGATGTATCGAACGGCGGCGAAACGTCTT
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ACCATCATCCCTTACTCCTACACTTCCCCTCTCCGCACTTCCTCCTCGATGGGCCACACC
GAATCTCCGATTGGTAATCAATCCGTAAACCCTAATCAACCGGATCCCACTTCTTCTTCC
ACGGATACAAGAGAAGGAACTCGTCGAGATGAGAGCAGCAGGAAGCCGAGAGCTGAGTTT
CAGGAAGAGCAGGCTCGTGTCCTCGCCGCCTCTCTTCGCCACGTGCCGAGGTTAGGTTGG
ACGGAGGAAGCGATGATTGCAGGCTCGAGAGAGGTTGGTGTGTCTCCTTCCATTGTTGGG
TCTTTCTCCAGGAAAGAAGCTGCTCTTGTTGAGTACTTCATGGATGAATGCTTGCAACTG
CTTATCGACAGAGTAGACTCTGGTTTGGATCTCCAAAACCTGATCCCCAGTGAACGAGTT
TCCAAGCTCGTTAGGATTCGATTGGAGATGCAGATTCCTTACATGTCCAAATGGCCTCAA
GCTCTTAGTATTCAAGCGCATCCGGCGAATGTTCCGACGAGTTTTAAGCAACGGGCGATG
CTGGTTGATGAGATATGGCACACTGTTGGAGATGGAGCTTCTGATTTGGATTGGTATGTC
AAGCGTACTGTTCTTGGAGGTGTTTACTCAACCACCGAGATTTATATGCTTACTGATGAC
TCCCCAGAGTATCGAGATACATGGGCGTTCTTGGATGATAGAGTCAAAGATGCTTTTGAT
TTGAAGAAGAGCATACAAGAGGCCAAGTATTTTGCACAAGACATTGGTGCTGGAGTTGGG
AAATCGATTCAAGGACTGATGAGTGGAGTTATGCAGACCATGTCCAGGAGAGGTGGTAGC
TTTGCTTTTTGAAGAAGGATCATCACACCTTTGCACAAAAAGATGCTTCATCCTTTTAAG
ATGATCTAGTACTTTGAGTTTGAGATAAGCTCTAATAATTATGATTATTAGTATGTATAA
ACTATTTACTCAACACGAGTCACGATGTTCTCTTATCCGGGAGTGAAAGGGACCAGGAAG
GGATGGCTTAATGGCTCAATGGTTTCGCTTTTTGCTGAAAGAGGACATTTTTGTTACTTC
AACACCTTGCATATGGATTATATGAAGCTGTGGCTGTACTTTGGTTTT


BQ
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AF RS1H101TF U 1
AF RS1H101JQB C 570
BS 1 681 RS1H101TF
BS 682 1308 RS1H101JQB

RD RS1H101TF 681 0 0
GGGGGGATCAAAGGAAGAAGCTCCGTGGCAACGAACTCATCCACGTGTCCAAAAAAACAA
AAAAACTCAACCCCTCCCTCATTCACTCCGGCGATGTATCGAACGGCGGCGAAACGTCTT
CTCGGAGCTGGTTTCGCAACCAGCCGCCTCCTCCGATTACCCAAGCCCAGGCCCACCACC
ACCATCATCCCTTACTCCTACACTTCCCCTCTCCGCACTTCCTCCTCGATGGGCCACACC
GAATCTCCGATTGGTAATCAATCCGTAAACCCTAATCAACCGGATCCCACTTCTTCTTCC
ACGGATACAAGAGAAGGAACTCGTCGAGATGAGAGCAGCAGGAAGCCGAGAGCTGAGTTT
CAGGAAGAGCAGGCTCGTGTCCTCGCCGCCTCTCTTCGCCACGTGCCGAGGTTAGGTTGG
ACGGAGGAAGCGATGATTGCAGGCTCGAGAGAGGTTGGTGTGTCTCCTTCCATTGTTGGG
TCTTTCTCCAGGAAAGAAGCTGCTCTTGTTGAGTACTTCATGGATGAATGCTTGCAACTG
CTTATCGACAGAGTAGACTCTGGTTTGGATCTCCAAAACCTGATCCCCAGTGAACGAGTT
TCCAAGCTCGTTAGGATTCGATTGGAGATGCAGATTCCTTACATGTCCAAATGGCCTCAA
GCTCTTAGTATTCAAGCGCAT

QA 1 681 1 681
DS 

RD RS1H101JQB 739 0 0
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GCAGATTCCTTACATGTCCAAATGGCCTCAAGCTCTTAGTATTCAAGCGCATCCGGCGAA
TGTTCCGACGAGTTTTAAGCAACGGGCGATGCTGGTTGATGAGATATGGCACACTGTTGG
AGATGGAGCTTCTGATTTGGATTGGTATGTCAAGCGTACTGTTCTTGGAGGTGTTTACTC
AACCACCGAGATTTATATGCTTACTGATGACTCCCCAGAGTATCGAGATACATGGGCGTT
CTTGGATGATAGAGTCAAAGATGCTTTTGATTTGAAGAAGAGCATACAAGAGGCCAAGTA
TTTTGCACAAGACATTGGTGCTGGAGTTGGGAAATCGATTCAAGGACTGATGAGTGGAGT
TATGCAGACCATGTCCAGGAGAGGTGGTAGCTTTGCTTTTTGAAGAAGGATCATCACACC
TTTGCACAAAAAGATGCTTCATCCTTTTAAGATGATCTAGTACTTTGAGTTTGAGATAAG
CTCTAATAATTATGATTATTAGTATGTATAAACTATTTACTCAACACGAGTCACGATGTT
CTCTTATCCGGGAGTGAAAGGGACCAGGAAGGGATGGCTTAATGGCTCAATGGTTTCGCT
TTTTGCTGAAAGAGGACATTTTTGTTACTTCAACACCTTGCATATGGATTATATGAAGCT
GTGGCTGTACTTTGGTTTT

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

CO CL7356Contig1 656 2 4 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGAGCTTCTT
CTTCCTCTTCATTGAGCTTCCTTTTCTATAAGAGACTTAAACATTTTTTTGTTCGTTTAA
ACTCTTGATAATGGATTCGTATTACGTCAGGTTTGTGGAAAACGACGAGCCACACTTTCT
AGAGTCTTGCTCTCTTTGCCGCAAAACCCTTTCTCTTAACTTCGATATTTTCATGTACAG
AGGAGACATGGCATTTTGTAGCCAAGAGTGTAGACAAGAACAGATTGATTCTGATGAAAA
GAAAGCCAAGAGGTGGAGAAAGGCTTCGTCGTCGTCGTCTAGATCCAAAGACTCCGTCGC
CGGGAAAACCGTACGGACGGAAACTCTCGTCGTGTCTTAGTCATTAGACTCATTACATAT
TCACGAGAAGAGATCTTTTTGTTTGTGGTTTTCTTGGTTTCAGTTTAAAGAAAACAAAAA
TAATAATAATAATGATAAGTCACTTTCTGAATTAATGTGTTCTAATTTTAAATGGGCTTA
CCAAGATATATGTTGGCCCCATTTTGATAGGACCATGGGCTCATTTTTTGAAGATTTAAT
ATACTTTTTTTGTAACACCATTTTGGAGATTTAAATACACTATTTTGATTTTTTTT


BQ
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TCACGAGAAGAGATCTTTTTGTTTGTGGTTTTCTTGGTTTCAGTTTAAAGAAAACAAAAA
TAATAATAATAATGATAAGTCACTT*CTGAATTAATGTGTTCTAATTT
AAATGGG

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AGAGGAAGAAAAGCAAAAGATCTGATCCATTGATTTTATCCGATCGAATGGTTGATATTG
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TAC


BQ
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10 10 10 

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BS 1 834 RS1CP86TF
BS 835 843 RS1CP86JQ

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CCTCCGCCGTCAAGCTTCTTCCTCCTTCACCGTCGAGCTTCTTCTTCTGTCTCCTCCTCG
TCCTTCTCCTTCGTGGGATAGCGATGCGTTTCTCAACCTTGGTCTCTTTTTACGCCTCCG
CGCAAGCCCCGTCGTATTCTTCATCATCCTTGGAACTGTTTTTCAGATCCTCCATATCTA
TAAGATAAATTTAGTTAGCAGTGTAAAAGAGAAGAAGAGGAATAACGAGAACAGATTCAC
TCTGGGACTTGTCCAAATCAAAGGATTGGAGAGAAGGGAATGAAGGAAGACGCAGAGAAG
GTGGAGAATAGAAAGGAAAGAGATAGAGAGGAAGAAAAGCAAAAGATCTGATCCATTGAT
TTTATCCGATCGAATGGTTGATATTGTGATCCGCGTTAAAAGTATGGACCAATCAGAGAA
TTAGTTTAGAAATGAGAGAGAAGAAGAAAAACAAAAGATCTGATCCATTGATTATGCCCA
ATCTAATGGTTGGTATTGTTGATCCGCGTTATTAAAATATTGGCCAATCAGAGAATTAGT
TTAGAATATCAATAACACCGTAGTGTTTTATCTGTGTGTTTGCAACTTTGCATTGACAAA
TACGTACGATATAAGTATAAATTCTCTAC

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

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ACATATGAAGACAATTACTTCAGTTTTTGCGGCCATGAGAGACTATGACTCCCTTTTAAC
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AF RS1FP34TF C 1
AF RS1FP34JQ U 5
BS 1 4 RS1FP34TF
BS 5 762 RS1FP34JQ

RD RS1FP34TF 762 0 0
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GATTT*GCAACAACATTTCTTGTTT*CCTGGGAACTGAGATTTCGAAACATATATACACA
ACATATGAAGACAATTACTTCAGTTTTTGCGGCCATGAGAGACTATGACTCCCTTTTAAC
TTGCCAAAGCCGGTTTAAAGTACATACAGATGGGCGGATTGACCCTCAAGATCGATAGGA
TTGCAGATGGAATTGTCCAGATCCCATCTCCACAGATCAGACCTGATGCTACTGCACCCG
CAAAGTCCTCTGCATCTTTCCTGTTGATCCGTTCCCACACGAACAATATAACAGTCCCAA
CGAACATGTCGATAGCGAAGTAAGCTCCAATGTAGAACGGGACAGCCATCGCCATTGGGA
TAGGGATAAACTGAGAGACCTTAGGCGGCGTAATGTCCCTCAAGAGGTTCACTATCAGAG
CCGCAATGAAAAACCCGTAACAAAGAGCCAGACAGTGCTTAGGCAGTTCTGCGAATCCTT
CAATACCGAGAATCGCCATCTCACGGAAGATCACTGCGTAAGGTGCTTTGTAAGGACCGT
CGGGGTCTCCAATGTCGAAAGCAGACCAGAACAAGTAAAACGTGAGGGGAGCGATTATGC
AGCCCATTGCAGTTCCCACGAGCTGGCTTACGAACATGGATTTTGCTGATGATAAAGTGA
GGTAACCTGTTTTGAAGTCTTGCATGAGATCAGCTGCGGTTC

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1FP34JQ 758 0 0
AGCATTCAAAGGGACAACATCCCTTAAACAACAACATTGTCTAAAACATATAAAGAGATT
TTGCAACAACATTTCTTGTTTTCCTGGGAACTGAGATTTCGAAACATATATACACAACAT
ATGAAGACAATTACTTCAGTTTTTGCGGCCATGAGAGACTATGACTCCCTTTTAACTTGC
CAAAGCCGGTTTAAAGTACATACAGATGGGCGGATTGACCCTCAAGATCGATAGGATTGC
AGATGGAATTGTCCAGATCCCATCTCCACAGATCAGACCTGATGCTACTGCACCCGCAAA
GTCCTCTGCATCTTTCCTGTTGATCCGTTCCCACACGAACAATATAACAGTCCCAACGAA
CATGTCGATAGCGAAGTAAGCTCCAATGTAAAACGGGACAGCCATCGCCATTGGGATAGG
GATAAACTGAGAGACCTTAGGCGGCGTAATGTCCCTCAAGAGGTTCACTATCAGAGCCGC
AATGAAAAACCCGTAACAAAGAGCCAGACAGTGCTTAGGCAGTTCTGCGAATCCTTCAAT
ACCGAGAATCGCCATCTCACGGAAGATCACTGCGTAAGGTGCTTTGTAAGGACCGTCGGG
GTCTCCAATGTCGAAAGCAGACCAGAACAAGTAAAACGTGAGGGGAGCGATTATGCAGCC
CATTGCAGTTCCCACGAGCTGGCTTACGAACATGGATTTTGCTGATGATAAAGTGAGGTA
ACCTGTTTTGAAGTCTTGCATGAGATCAGCTGCGGTTC

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL7359Contig1 861 2 8 U
GGACTCATATGTTGTCGTTCTTCTTTTGAGAGAAAACAAGAAACAGAGTAAAACATTCGA
AAAAGCAGAGCTTATAGCGCCTTACCGCTAAACTCAAACTCAGAGATGGGAGAGGTGATA
ATATTCATCGAAGATAGAGATTTAAAATCGAATTGCTCACGTTGCAGAATCTGTCACGAA
GAAGAAGCCGAGAGCTACTTTGAAGCTCCTTGTTCTTGCTCAGGAACCCTCAAGTTCGCG
CACCGAGATTGCATACAACGATGGTGCCATGAGAAAGGAAACACCATTTGTGAAATTTGT
CTCCAGTTGTATTGCAGGAGTACAAACCTGGATATACCACAATTTCAAAACCATCTCGTT
TAATTGAAGCAGCAGTAACAATCAGAGTGAGGAGACAAATGGAGGAAGAAGAAATAGAAG
ACTAGTGGATAGAACTGAATCAGATTTTCAAGAATGCAACTCTGATGCTAGCAGAGGCAC
TTCTTGTTGTCGCTACTTTACTCTCCTTTTCTCGGCGGCTTTGTTGATAAAGCATGCGTT
AGATGTGGTTTATGGAGCCAACGAGTATCCCTTTACGATTTTCACGGTATTCGCATTGAA
GGCCATTGGTACACTATTGCCAATGCTCGTTATCATTCGGACTGTCGCAGCTATTCACAG
CAGTCTCCGACACCAATTTCTCGAATCTGAAGAAGATGCGTTGACCTCTGAAGAAGATGA
TTATGGTTTGGAGGAGGAAGAGCAACAACAACATTTGGCTTAATTTTTTTCTCTCTTCAA
ACCTTGTCATTTTTTTGGAAACAATCATATTTAAAAATAGGGATCTTTGACCACAAGCAA
ATGTAAATTATGTTAAGAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FP16TF U 1
AF RS1FP16JQ C 19
BS 1 738 RS1FP16TF
BS 739 739 RS1FP16JQ
BS 740 762 RS1FP16TF
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RD RS1FP16TF 812 0 0
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ATATTCATCGAAGATAGAGATTTAAAATCGAATTGCTCACGTTGCAGAATCTGTCACGAA
GAAGAAGCCGAGAGCTACTTTGAAGCTCCTTGTTCTTGCTCAGGAACCCTCAAGTTCGCG
CACCGAGATTGCATACAACGATGGTGCCATGAGAAAGGAAACACCATTTGTGAAATTTGT
CTCCAGTTGTATTGCAGGAGTACAAACCTGGATATACCACAATTTCAAAACCATCTCGTT
TAATTGAAGCAGCAGTAACAATCAGAGTGAGGAGACAAATGGAGGAAGAAGAAATAGAAG
ACTAGTGGATAGAACTGAATCAGATTTTCAAGAATGCAACTCTGATGCTAGCAGAGGCAC
TTCTTGTTGTCGCTACTTTACTCTCCTTTTCTCGGCGGCTTTGTTGATAAAGCATGCGTT
AGATGTGGTTTATGGAGCCAACGAGTATCCCTTTACGATTTTCACGGTATTCGCATTGAA
GGCCATTGGTACACTATTGCCAATGCTCGTTATCATTCGGACTGTCGCAGCTATTCACAG
CAGTCTCCGACACCAATTTCTCGAATCTGAAGAAGATGCGTTGACCTCTGAAGAAGATGA
TTATGGTTTGGAGGAGGA*GAGCAACAACAACATTTGGCTTA**TTTTTTCTCTCTTCAA
*CCTTGTCATTTTTT
GGAACATCATATTAAAA

QA 1 795 1 795
DS 

RD RS1FP16JQ 843 0 0
GTC
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GAAGCTCCTTGTTCTTGCTCAGGAACCCTCAAGTTCGCGCACCGAGATTGCATACAACGA
TGGTGCCATGAGAAAGGAAACACCATTTGTGAAATTTGTCTCCAGTTGTATTGCAGGAGT
ACAAACCTGGATATACCACAATTTCAAAACCATCTCGTTTAATTGAAGCAGCAGTAACAA
TCAGAGTGAGGAGACAAATGGAGGAAGAAGAAATAGAAGACTAGTGGATAGAACTGAATC
AGATTTTCAAGAATGCAACTCTGATGCTAGCAGAGGCACTTCTTGTTGTCGCTACTTTAC
TCTCCTTTTTTCGGCGGCTTTGTTGATAAAGCATGCGTTAGATGTGGTTTATGGAGCCAA
CGAGTATCCCTTTACGATTTTCACGGTATTCGCATTGAAGGCCATTGGTACACTATTGCC
AATGCTCGTTATCATTCGGACTGTCGCAGCTATTCACAGCAGTTTCCGACACCAATTTCT
CGAATCTGAAGAAGATGCGTTGACCTCTGAAGAAGATGATTATGGTTTGGAGGAGGAAGA
GCAACAACAACATTTGGCTTAATTTTTTTCTCTCTTCAAACCTTGTCATTTTTTTGGAAA
CAATCATATTTAAAAATAGGGATCTTTGACCACAAGCAAATGTAAATTATGTTAAGAATC

QA 4 843 4 843
DS 



AS 1 2

CO CL7360Contig1 860 2 2 U
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TCTCGCTGTCAAAGCTTCAACCTTTTTTCTCCACCACTCGGAATCAAAAACCCATCTCAG
ATCTAATGTCAGAAGGGTACGCGATCGAGCTCTACTTCGACCCAGCCCTCGAGAACCAAG
TCCTCAAAGCCTGGAACGTCTTCGCCCGCCGCCAAATCTCCACCAAGCTCATCACCACCG
AGTCCCGCCCCCACCTAACCCTCTTCTCCTCCTCCTCTTCCTCCTTCCTCGACTCCTCCT
CCTCCGCCGCCGCCAAGCTCGAGCCCGTCGTCAGAGCCTTCGCGTCCAAGCAAGAGCCTC
TCCCTCTCTCCTTCTCCTCCATCGGAAGCTTCTCCGGCGACAACAACTCCCTCTTCCCTC
TCCCCGACCCTCTCCCTCTCCCTCCTCAACCTCCAGGCCCAACTGATCGACGCCGTGAGG
AGAGAAGGAGGAGGAGGCGGCGCGGTGGTGGCGGAGATCGGCGAGGAGTTTCGTCAGGAT
TCGTGGGTCCCGTTCTGCCCCGTGGCGGTCGATGTGCCTAGGGCTCGTATGGCTGAGGCT
TTCTCTGTCTTGAGGGATTTGAAGATGCCAGTGAGTAGTTATGCGATGGATGTTGGCATC
GTTGAGTTCTCCCCTGTTCGTGAAGTCTTCTCCTTTGCTCTTGGTAACAGCTTGGAGTCT
TGATTATCACCTTGTGTCTGGTCCTAATGATGTATCTGTGTGGTTTTCTTTTAGCTTATT
GGGTTTATGTAATTTGATGGAACAGTACAGAAAGCTATGTACTTTGCTGAATAACTTAGC
TGTTTTGTCTTTGTTTCAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AA37TF U 1
AF RS1AA37JQ C 270
BS 1 731 RS1AA37TF
BS 732 860 RS1AA37JQ

RD RS1AA37TF 731 0 0
GGAATCATCTCTCTTCCTCTCATTCGATCCAGACCCTAAAAAGCTTTCCCCTTTCGTCTT
TCTCGCTGTCAAAGCTTCAACCTTTTTTCTCCACCACTCGGAATCAAAAACCCATCTCAG
ATCTAATGTCAGAAGGGTACGCGATCGAGCTCTACTTCGACCCAGCCCTCGAGAACCAAG
TCCTCAAAGCCTGGAACGTCTTCGCCCGCCGCCAAATCTCCACCAAGCTCATCACCACCG
AGTCCCGCCCCCACCTAACCCTCTTCTCCTCCTCCTCTTCCTCCTTCCTCGACTCCTCCT
CCTCCGCCGCCGCCAAGCTCGAGCCCGTCGTCAGAGCCTTCGCGTCCAAGCAAGAGCCTC
TCCCTCTCTCCTTCTCCTCCATCGGAAGCTTCTCCGGCGACAACAACTCCCTCTTCCCTC
TCCCCGACCCTCTCCCTCTCCCTCCTCAACCTCCAGGCCCAACTGATCGACGCCGTGAGG
AGAGAAGGAGGAGGAGGCGGCGCGGTGGTGGCGGAGATCGGCGAGGAGTTTCGTCAGGAT
TCGTGGGTCCCGTTCTGCCCCGTGGCGGTCGATGTGCCTAGGGCTCGTATGGCTGAGGCT
TTCTCTGTCTTGAGGGATTTGAAGATGCCAGTGAGTAGTTATGCGATGGATGTTGGCATC
GTTGAGTTCTCCCCTGTTCGTGAAGTCTTCTCCTTTGCTCTTGGTAACAGCTTGGAGTCT
TGATTATCACC

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DS 

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TCCTCCTCTTCCTCCTTCCTCGACTCCTCCTCCTCCGCCGCCGCCAAGCTCGAGCCCGTC
GTCAGAGCCTTCGCGTCCAAGCAAGAGCCTCTCCCTCTCTCCTTCTCCTCCATCGGAAGC
TTTTCCGGCGACAACAACTCCCTCTTCC*TCTCCCCGACCCTCTCCCTCTCCCTCCTCAA
CCTCCAGGCCCAACTGATCGACGCCGTGAGGAGAGAAGGAGGAGGAGGCGGCGCGGTGGT
GGCGGAGATCGGCGAGGAGTTTCGTCAGGATTCGTGGGTCCCGTTTTGCCCCGTGGCGGT
CGATGTGCCTAGGGCTCGTATGGCTGAGGCTTTCTCTGTCTTGAGGGATTTGAAGATGCC
AGTGAGTAGTTATGCGATGGATGTTGGCATCGTTGAGTTCTCCCCTGTTCGTGAAGTCTT
CTCCTTTGCTCTTGGTAACAGCTTGGAGTCTTGATTATCACCTTGTGTCTGGTCCTAATG
ATGTATCTGTGTGGTTTTCTTTTAGCTTATTGGGTTTATGTAATTTGATGGAACAGTACA
GAAAGCTATGTACTTTGCTGAATAACTTAGCTGTTTTGTCTTTGTTTCAAG

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 2

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AATTTTTACCAAAAAGAAAATTCAACCAAGAGAAGTTGGAGTTGGTCTCGCGAAGATCAA
AATTACTCTCAGAAATCTGAACAGGGTTCGTGATGGGTGCTCCTAAGCAGAAATGGACTC
AAGAAGAAGAGACAGCTCTAAGGTCCGGCGTTATCAAGCATGGACCTGGCAAATGGCGCA
CCATTCTCAAAGACCCTGACTTTAGTGAAGTCTTGTTCCTCCGTTCCAATGTTGATCTTA
AGGACAAATGGAGGAACATGAGTGTCATGCTGAATGGGTGGGGATCGCGTGAGAAGTCTA
GGGTTGGTGTTAAAAGGACGCCCTCTCTTCCTAAACAGGAAGATACCTCGCTTGCCGCCG
ATTCTAGCCCGCCGCAGAGTGATGAAGAAATGGCAGAAGAAGATGCCACTGGCACTTCTG
CACCTAATGTAGGGCTGGATAGCCTCATAATGGAAGCAATATCTACCATAAAAGAGCCCG
GTGGCTCTAACAAAACATCAATTGGTACCTACATTGAGGAACAATATCACGCTCCACCAG
ACTTCAAACGGTTGCTGTCAGCCAAGCTAAAGTACTTGACAGCTCGCCGGAAACTTATCA
AGGTTAAGCGCAAGTATAGGATTCCAAACTCCACTCCATTGTCTCCCCACAGAAGAAAAC
AGTTGGGGTCATCTTCTGGAAAACAGAGAAGTCTCTCTTTGCCTTCCCCTAAAACAGACG
GAGATGAAGTCAGTGTTGAGGCAAACGCACAGATTGATCCGGAGTTAGACAGAATGAAGA
CTATGAGCGTACAAGAAGCGGCAGCGATTGCAGCACAGGCAGTTGCAGAGGCAGAAGCTG
CCATGGCAGCGGCTGAAGAAGCTGCAAAGGATGCTGAGTTAGCAGAAGCGGAAGCAGAAG
TAGCTCAAGCTTTTGCAGAGGAAGCTATGAAGACACTGAAAGGAAGATACAACAACTGCA
AAGTGATGATTCGTGCCTAAGATGATGGAGAGAGAAGCTAAATGTGTTGAGAGAGAGAGA
GAGAAGTAGTGTGTTGTGTGTTTGATGATGATTCTCTACTTGGAAACTCTTTTTAGTTGT
AAGCAGTAATTATATGTGATGTCTGTTACTTGTACTTGTTCCTTACAGTTTTATATAGAA
TACTCTTTTAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E557TF U 1
AF RS1E557JQ C 335
BS 1 602 RS1E557TF
BS 603 603 RS1E557JQ
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RD RS1E557TF 696 0 0
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AATTACTCTCAGAAATCTGAACAGGGTTCGTGATGGGTGCTCCTAAGCAGAAATGGACTC
AAGAAGAAGAGACAGCTCTAAGGTCCGGCGTTATCAAGCATGGACCTGGCAAATGGCGCA
CCATTCTCAAAGACCCTGACTTTAGTGAAGTCTTGTTCCTCCGTTCCAATGTTGATCTTA
AGGACAAATGGAGGAACATGAGTGTCATGCTGAATGGGTGGGGATCGCGTGAGAAGTCTA
GGGTTGGTGTTAAAAGGACGCCCTCTCTTCCTAAACAGGAAGATACCTCGCTTGCCGCCG
ATTCTAGCCCGCCGCAGAGTGATGAAGAAATGGCAGAAGAAGATGCCACTGGCACTTCTG
CACCTAATGTAGGGCTGGATAGCCTCATAATGGAAGCAATATCTACCATAAAAGAGCCCG
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ACTTCAAACGGTTGCTGTCAGCCAAGCTAAAGTACTTGACAGCTCGCCGGAAACTTATCA
AG*TTAAGCGCAAGTATAGGATTCCAAACTCCACTCCATTGTCTCCC*ACAGAAGAAA*C
AGTTGGGGTCATCTTCTGGAAAACAGAGAAGTCTCT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RS1E557JQ 817 0 0
ACAGGAAGATACCTCGCTTGCCGCCGATTCTAGCCCGCCGCAGAGTGATGAAGAAATGGC
AGAAGAAGATGCCACTGGCACTTCTGCACCTAATGTAGGGCTGGATAGCCTCATAATGGA
AGCAATATCTACCATAAAAGAGCCCGGTGGCTCTAACAAAACATCAATTGGTACCTACAT
TGAGGAACAATATCACGCTCCACCAGACTTCAAACGGTTGCTGTCAGCCAAGCTAAAGTA
CTTGACAGCTCGCCGGAAACTTATCAAGGTTAAGCGCAAGTATAGGATTCCAAACTCCAC
TCCATTGTCTCCCCACAGAAGAAAACAGTTGGGGTCATCTTCTGGAAAACAGAGAAGTCT
CTCTTTGCCTTCCCCTAAAACAGACGGAGATGAAGTCAGTGTTGAGGCAAACGCACAGAT
TGATCCGGAGTTAGACAGAATGAAGACTATGAGCGTACAAGAAGCGGCAGCGATTGCAGC
ACAGGCAGTTGCAGAGGCAGAAGCTGCCATGGCAGCGGCTGAAGAAGCTGCAAAGGATGC
TGAGTTAGCAGAAGCGGAAGCAGAAGTAGCTCAAGCTTTTGCAGAGGAAGCTATGAAGAC
ACTGAAAGGAAGATACAACAACTGCAAAGTGATGATTCGTGCCTAAGATGATGGAGAGAG
AAGCTAAATGTGTTGAGAGAGAGAGAGAGAAGTAGTGTGTTGTGTGTTTGATGATGATTC
TCTACTTGGAAACTCTTTTTAGTTGTAAGCAGTAATTATATGTGATGTCTGTTACTTGTA
CTTGTTCCTTACAGTTTTATATAGAATACTCTTTTAT

QA 1 817 1 817
DS 



AS 1 2

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GGACGAAAACATTTTCAATTTGAAAAAAAAAAACACATAACATCAAATTTTACTTTTCTC
TTTCTTTCTTTCATCGTTTCACAGTCTACAAAAATGGAAGGAAGACAATACTACCCTCCA
AGAGAAACCATCGACGGAAACAGAACCACCATGGGAGGACCTCACTCGCCGTGGCATTCA
CCGGTTCCTTATCTCTTCGGTGGTTTAGCCGCGATGCTTGGTCTCATCGCCTTTGCTCTC
CTAATCCTCGGTTGCTCTTATTGGCGCCTCTCTGGTTACTTCGACGGTGAGGAAAACCAG
AGCAGAGACAGCGATCTTGAAGCCGGAGATTTGAAGCTCGATAAAGCGGTGAAGGCTGTA
GCTTTGCCGGAGAAGTTCTTGGTGATTATGGCTGGAGATGTGAATCCCACGTACTTGGCG
ACGCCGGCGGAAAAAAGCTGTACTTGTGACGATGATGAAGACGAGGAGGGTGGTGTTGAC
GTGAGGGGTAATGATCAGGTGGTGCGGCGGAGTACTGAAAGCAACGGTGGGACACATTGA
GAAACAGAGTACCCGAAGAGAAGAAACAGAGGATCGTCTATTGTGAACAGTTCTTTAGAC
TGTTTGTATCTGACCCGGTTGCTTCTGGATATCGGGTCGGGTCAGAGCTCTACATGATGA
GCTTTAATTATAGTCTGACTCATAAAGTGGCAGAAGAACTATTTATAAAAAAGTAAATTG
GAATTGAGTTTGGATCTTTAGGAAGGTATTAACAATGTTATTTAATCTTAGCTTTTGCTT
CATTAAGTTAATTAGGCTTTTTTTGTTTTTAAATTTGTAATTAGTTTGTAATTCATTAGT
ATTGTTCCATTTTTAAGTTATGATGAATATATCCTA


BQ
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AF RS1AK28TF U 1
AF RS1AK28JQ C 58
BS 1 791 RS1AK28TF
BS 792 876 RS1AK28JQ

RD RS1AK28TF 791 0 0
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AGAGAAACCATCGACGGAAACAGAACCACCATGGGAGGACCTCACTCGCCGTGGCATTCA
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CATTAAGTTAA

QA 1 791 1 791
DS 

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CCAAGAGAAACCATCGACGGAAACAGAACCACCATGGGAGGACCTCACTCGCCGTGGCAT
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CTCCTAATCCTCGGTTGCTCTTATTGGCGCCTCTCTGGTTACTTCGACGGTGAGGAAAAC
CAGAGCAGAGACAGCGATCTTGAAGCCGGAGATTTGAAGCTCGATAAAGCGGTGAAGGCT
GTAGCTTTGCCGGAGAAGTTCTTGGTGATTATGGCTGGAGATGTGAATCCCACGTACTTG
GCGACGCCGGCGGAAAAAAGCTGTACTTGTGACGATGATGAAGACGAGGAGGGTGGTGTT
GACGTGAGGGGTAATGATCAGGTGGTGCGGCGGAGTACTGAAAGCAACGGTGGGACACAT
TGAGAAACAGAGTACCCGAAGAGAAGAAACAGAGGATCGTCTATTGTGAACAGTTCTTTA
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TGAGCTTTAATTATAGTCTGACTCATAAAGTGGCAGAAGAACTATTTATAAAAAAGTAAA
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AGTATTGTTCCATTTTTAAGTTATGATGAATATATCCTA

QA 1 819 1 819
DS 



AS 1 2

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TTCTCTGAAGAAGGTTGAGCTTGCTTTATGTTATGGCCAAGCTCCAGTGGTGGAGTCACT
TACCAATCCCGTTTGCTGCGAACTTACTCACTGATGGATCTTAATACCCTGGAAAGCATT
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TTTCACGTGTAACTCTATTCATTCATCGGAC


BQ
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AF RS1BM49TF U 1
AF RS1BM49JQ C 44
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BS 459 811 RS1BM49JQ

RD RS1BM49TF 458 0 0
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TTCAAACAACCCGTGGTTTCGATTTCTTCTGCTGTCAAAGACAGCGATTATACTATAGAC
GAGGCTCATATGTTGCTAAAGAACGCCTCCCTGCCCGCTGAAACAACTATTGAAAACAAC
AGCGGGACAAGTGGAGCTTCTTCAAATGTAAGTTCTAACCGTTCTGATTTGAGCATGAAT
GCAGGAGCGGAAAGTGAGGAGGGTTGTGCCATTGATGGCTCCCCAGATTTTCAGCAGTTT
TTCAAGGAAACTGCTGAAGAAGCAGAGGTAAAGGATGA

QA 1 458 1 458
DS 

RD RS1BM49JQ 768 0 0
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GCGATTATACTATAGACGAGGCTCATATGTTGCTAAAGAACGCCTCCCTGCCCGCTGAAA
CAACTATTGAAAACAACAGCGGGACAAGTGGAGCTTCTTCAAATGTAAGTTCTAACCGTT
CTGATTTGAGCATGAATGCAGGAGCGGAAAGTGAGGAGGGTTGTGCCATTGATGGCTCCC
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TTGTAAATAGATTATTCGTAATCAAACAGTCTTTCTATTTGCATGGACTGCTTTTCTTTG
TTTCTTTTGTAATTTTCTTTCACGTGTAACTCTATTCATTCATCGGAC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL7364Contig1 780 2 2 U
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TTTGTACAGTGGTACAGGATCCGTTGGAATCGAAGCAATCAGCCGAGGATGTTCACAGGC
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CACTGGGTTTGTTGAAGCTTCGGTTCTACACACTGCTCGTGTCGAAAACTTCTTGGAACG
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AACAAGTTTGCAGTGTTATGATAGTTATGAAACCGGTAATGGTGTGTATGTCGCCCTATG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1EB49TF U 1
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BS 1 779 RS1EB49TF
BS 780 780 RS1EB49JQ

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DS 

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AACCGAACTTGGAGCACACTGGGTTTGTTGAAGCTTCGGTTCTACACACTGCTCGTGTCG
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CTATATATGGACCAAAGTGGGCTCAAAAGCCAAGAAAATCTTGAATCCACAGTGAATCTC
AGCAGTCACATTTTGCCATTTTGTCTTTTAAGGGCACTGGATAGAGGCTGGGATTGAAGA
GCTATAGCTTGTTCCAACCTTCGATTACTAGAGTGTTTTTGTACATTGATCGCCATTTTG
TTTGTCCTAAGATGGAAACAAGTTTGCAGTGTTATGATAGTTATGAAACCGGTAATGGTG
TGTATGTCGCCCTATGTGTTTGTGAAGCAGAAATTATAGTTGTACACACTTTGATAAATG
ATGTCAGTTAGAATTT

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

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AGGCTAATCCCAAAACCAAAGACTATAAAACATTCACCGAACTTCTTCCTCTTTTCCTAC
TTCTTGCTTTGTTTGTGGTTCTAGTCCTGCCATTCAACTTCTTTTACCGCTCGAGCCGCT
TTTTCTTCCTCACTTGTCTGTTTCATTGCCTCGCTGCTCCTCTTTACAAGGTAACACTGC
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TCTACATTTGTTACTATGGTTGGGGAGACTTCAAGCACAGACAGAACACTTGTAACAAAT
CTAGTGTGTACAACACTTTCTTATTCATTGTTGCTGTCATACCTTACGCCTCTCGCCTTC
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AGACAATGGTTACCGTTGTTGCTAGTCTTGAGATCATTCGTCGTGGTATATGGAATTTCT
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CATTACCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CS59TF U 1
AF RS1CS59JQ C 536
BS 1 573 RS1CS59TF
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BS 575 648 RS1CS59TF
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RD RS1CS59TF 648 0 0
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TTCTTGCTTTGTTTGTGGTTCTAGTCCTGCCATTCAACTTCTTTTACCGCTCGAGCCGCT
TTTTCTTCCTCACTTGTCTGTTTCATTGCCTCGCTGCTCCTCTTTACAAGGTAACACTGC
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CTAGTGTGTACAACACTTTCTTATTCATTGTTGCTGTCATACCTTACGCCTCTCGCCTTC
TTCAGTGCATGAGACGGCTGTTTGAGGAGAAAA*CCCGGAGCAAGGGTGGAACGGACTCA
AGTACTTCTTGACTATAGTGGCGGTTTGCTTGAGAACTGCTTACAGCA

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DS 

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GGTTCCATTACCG

QA 1 493 1 493
DS 



AS 1 2

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GGTCAAGACGGAGTTCTCGGCTTGGATCTTCATGTAGAGCTCAGAGGTGGCGGTGAGGCT
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GTGTTTCTGTTTGCGCATCCTTGATCTACGAGCAGATTCTCGGTTCGATAACATTCGCTT
ACGTTTCCGCTCGTCGACGGTGACGGCGGAGTCAGAGGGATTCCCGCCGTCGGAGGAGCT
CGAGCTCCGGTATGTGCTGCTTGATGACGCCATTTTATTACAATAAAATTACAAAGAACA
AGAAAAAGGGACAGATTTTTTTTGTTTGGTTGGTTTTAGATTTGTCTGAAAATAGTGAAT
ATATGATGTAATAATTAATTTAAAGATTATTTTGGC


BQ
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AF RS1AJ94TF U 1
AF RS1AJ94JQ C 20
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TTTTGTTTGGTTGGTTTTAGATTTGTCTGAAAATAGTGAATATATGATGTAATAATTAAT
TTAAAGATTATTTTGGC

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1EH46TF C 1
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BS 1 5 RS1EH46TF
BS 6 768 RS1EH46JQ

RD RS1EH46TF 768 0 0
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ACTGTGATTCCACATAACGAAAGATGAGACGTGGACGTTGATGCTTTGCTCTGATCCAGA
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GACGTCCCTGACGGTGTCGTCGGTCTGGAATCCGAGCTCTGATCTTGAGATGATTTTTGA
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QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FV86TF U 1
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1ED07JQ U 1
AF RS1GI95JQ U 4
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TTCCTTGTCTGGCTTCATCATCAACGCCTATCCGTCTTTCCTTTACCTCTCTTCCCTGAG
AACAAGTGCTTAGGTCTCAAAGTTGGGATAACTCTATCAGCTTCACCGCGTCTTGCACTC
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TCTTTGAACCCTTCACCAGGCACAACTTCATGTGGAGGTGGCCTTGACTGTGATCTCGCT
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TCCACTTCCATCGCATCGTTACCTGCCGCATCTTCTGATCGATCCCTCTTCCTCCCTCTC
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CTACCCATTCTCTTAGTTGTATACTTCTTATCCTTGTCAAACTTCCTTGGAACGGTTGAT
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AAGTGCTTAGGTCTCAGAGTTGGGATAACTCTATCAGCTTCACCGCGTCTTGCACTCTTG
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TTGAACCCTTCACCAGGCACAACTTCATGTGGAGGTGGCCTTGACTGTGATCTCGCTATC
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ATCTTCGCAAGCTGCTGCTTCTGCTCCTCCGTGAGCTCTTCCCCGTCCATCTC

QA 1 773 1 773
DS 



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AS 1 2

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AATGGGTCTGAGCAATACAATTCCCGCACTTTTGCTTTCGATTTTGATCTTTGGGGGTTT
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C342TF U 1
AF RS1C342JQ C 336
BS 1 737 RS1C342TF
BS 738 1137 RS1C342JQ

RD RS1C342TF 742 0 0
GGAACCCACGAATTCCTTTAGCCTTCTTATCTCTTGGTTAAAAAGCGGAGAGATTCCAAA
AATGGGTCTGAGCAATACAATTCCCGCACTTTTGCTTTCGATTTTGATCTTTGGGGGTTT
GGGTTATGCTCAGCTTACCTCTGATTTTTACTCCACAACCTGCCCTAATGTCACAGTCAT
TGCTCGGGGCTTGATCGAGCAAGCAAGCCGTAGCGACGTCAGACTCCCTGCTAAAGTCAT
GCGCCTTCACTTTCACGACTGTTTCGTGAACGGGTGCGATGGTTCGGTACTATTGGACGC
TGCACCGGCGGATGGAGTAGAGGGTGAAAAGGGAGTTTTACAAAACGCTAATTCTCTAGA
CGGTTTCGAGGTGATCGATGATATTAAAACTGCTCTCGAGAACGTCTGCCCTGGAATTGT
TTCTTGTGCCGATATCCTTGCTATCGCAGCTGAAATTTCCGTCTCACTGGCGGGAGGACC
GTCATGGGACGTATTGTTAGGAAGGAGAGATGGTCGGACTGCAAATAGTGCAGACGCGGC
GGCTTCACTTCCACTCGCGGGTGACTCTCTTGACATCCTTACCTCTAAGTTCTCGGTACA
TGATCTTGACACTACCGATCTCGTCGCTTTGTCTGGTGCTCATACCTTCGGGAGGGTGCA
GTGTGTAGTGATAACCAACCGTCTTTACAACTTTAGTGGTAACAACGGACAGTCAGACCC
GAGTATTGAACCGGAAT
CTACA

QA 1 737 1 737
DS 

RD RS1C342JQ 802 0 0
AGTTTAC
AAACGCTAATTCTCTAGACGGTTTCGAGGTGATCGATGATATTAAAACTGCTCTCGAGAA
CGTCTGCCCTGGAATTGTTTCTTGTGCCGATATCCTTGCTATCGCAGCTGAAATTTCCGT
CTCACTGGCGGGAGGACCGTCATGGGACGTATTGTTAGGAAGGAGAGATGGTCGGACTGC
AAATAGTGCAGACGCGGCGGCTTCACTTCCACTCGCGGGTGACTCTCTTGACATCCTTAC
CTCTAAGTTCTCGGTACATGATCTTGACACTACCGATCTCGTCGCTTTGTCTGGTGCTCA
TACCTTCGGGAGGGTGCAGTGTGTAGTGATAACCAACCGTCTTTACAACTTTAGTGGTAA
CAACGGACAGTCAGACCCGAGTATTGAACCGGAATTCTTACAAACTTTGCGACGACAGTG
CCCGCAGGGCGGAAGTGGCACCACCAGGGTCAATCTTGATTCTACGGGCCCTGACTCATT
TGATAACGACTATTTCAGGAACCTTCAAAACAACCGTGGAGTAATGGAATCAGACCAAAT
CCTATTTTCTTCGACAGGAGCGCCTACTGTATCTTTGGTGAATCGTTTCGCAGAGAACCA
AAGTGAGTTCTTTAGACATTTTGCGAGAGGCATGATCAAGATGGGAAATGTAAGAACTCT
CACAGGAATTGAAGGAGAGATTCGTAGAGACTGCAGACGGATCAACTAATTTGATTTGCA
TAAATGCATCTTCAAGTGATCAAATTTTACGTGTTGTTATACATGAAATAAGTGGTACTC
CCTCCGTTTCATATC

QA 8 802 8 802
DS 



AS 1 2

CO CL7373Contig1 806 2 8 U
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ATCAGAGTTTTCAGGACAAAACCGAGTTTCGCTCTCCGTCTTCTATCAAGAATATGCAAG
AAGCAGCGTTAGGTATGATCGTAGGCGGAGGAGGAGAAGGAGACGCAGCCGTGGCGGCGG
AGCAGAATAGACAAATGAAAGGTGAGATAGCTACACATCCCATGTACGAGCAGCTTTTGG
CCGCACACGTGGCATGTCTGAGAGTGGCGACTCCCATCGACCAGCTTCCGATCATTGAAG
CTCAGCTTTCTCACTCTCATCATCTTCTCCGATCTTATGCTTCGACAGCCGTTGGATTCT
CGCATCATGATCGTCAAGAGCTCGACAATTTCTTGGCACAATATGTAATGGTGTTGTGTA
GCTTCAAAGAACAGCTTCAACAACACGTGAGGGTTCATGCCGTCGAAGCTGTGATGGCTT
GCCGTGAAATTGAGAACAACCTCCACTCTCTCACAGGAGCGACATTAGGAGAAGGGTCCG
GTGCGACGATGTCCGAGGATGAGGACGATCTTCATATGGATTTCTCATCTGATAATTCCG
GCATTGATTTTAGCGGGGGACAAGATATGACGGGATTTGGTCCATTGCTTCCGACTGAAT
CTGAAAGATCTCTTATGGAAAGAGTCAGACAAGAGCTGAAACTCGAACTCAAACAGGGTT
TTAAATCAAGAATTGAAGATGTAAGAGAAGAGATAATGAGGAAAGAAGGGCTGGGAAATT
GCCTGGAGACACAACAACTGTCTTGA


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FF07TF U 1
AF RS1CP64TF U 3
BS 1 65 RS1FF07TF
BS 66 66 RS1CP64TF
BS 67 687 RS1FF07TF
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BS 689 769 RS1FF07TF
BS 770 770 RS1CP64TF
BS 771 792 RS1FF07TF
BS 793 806 RS1CP64TF

RD RS1FF07TF 792 0 0
GGATACGTACGTTGATTTCTTCGGTTCTCTCTAATCGTACAACCAAAATCAGGTCGAAGA
ATCAGGGTTTTCAGGACAAAACCGAGTTTCGCTCTCCGTCTTCTATCAAGAATATGCAAG
AAGCAGCGTTAGGTATGATCGTAGGCGGAGGAGGAGAAGGAGACGCAGCCGTGGCGGCGG
AGCAGAATAGACAAATGAAAGGTGAGATAGCTACACATCCCATGTACGAGCAGCTTTTGG
CCGCACACGTGGCATGTCTGAGAGTGGCGACTCCCATCGACCAGCTTCCGATCATTGAAG
CTCAGCTTTCTCACTCTCATCATCTTCTCCGATCTTATGCTTCGACAGCCGTTGGATTCT
CGCATCATGATCGTCAAGAGCTCGACAATTTCTTGGCACAATATGTAATGGTGTTGTGTA
GCTTCAAAGAACAGCTTCAACAACACGTGAGGGTTCATGCCGTCGAAGCTGTGATGGCTT
GCCGTGAAATTGAGAACAACCTCCACTCTCTCACAGGAGCGACATTAGGAGAAGGGTCCG
GTGCGACGATGTCCGAGGATGAGGACGATCTTCATATGGATTTCTCATCTGATAATTCCG
GCATTGATTTTAGCGGGGGACAAGATATGACGGGATTTGGTCCATTGCTTCCGACTGAAT
CTGAAAGATCTCTTATGGAAAGAGTCATACAAGAGCTGAAACTCGAACTCAAACAGGGTT
TTAAATCAAGAATTGAAGATGTAAGAGAAGAGATAATGAGGAAAGAAGG*CTGGGAAATT
GCCTGGAGACAC

QA 1 792 1 792
DS 

RD RS1CP64TF 804 0 0
GG
ACGTACGTTGATTTCTTCGGTTCTCTCTAATCGTACAACCAAAATCAGGTCGAAGAATCA
GAGTTTTCAGGACAAAACTGAGTTTCGCTCTCCGTCTTCTATCAAGAATATGCAAGAAGC
AGCGTTAGGTATGATCGTAGGCGGAGGAGGAGAAGGAGACGCAGCCGTGGCGGCGGAGCA
GAATAGACAAATGAAAGGTGAGATAGCTACACATCCCATGTACGAGCAGCTTTTGGCCGC
ACACGTGGCATGTCTGAGAGTGGCGACTCCCATCGACCAGCTTCCGATCATTGAAGCTCA
GCTTTCTCACTCTCATCATCTTCTCCGATCTTATGCTTCGACAGCCGTTGGATTCTCGCA
TCATGATCGTCAAGAGCTCGACAATTTCTTGGCACAATATGTAATGGTGTTGTGTAGCTT
CAAAGAACAGCTTCAACAACACGTGAGGGTTCATGCCGTCGAAGCTGTGATGGCTTGCCG
TGAAGTTGAGAACAACCTCCACTCTCTCACAGGAGCGACATTAGGAGAAGGGTCCGGTGC
GACGATGTCCGAGGATGAGGACGATCTTCATATGGATTTCTCATCTGATAATTC*GGCAT
TGATTTTAGCGGGGGACAAGATATGACGGGATTTGGTCCATTGCTTCCGACTGAATCTGA
AAGATCTCTTATGGAAAGAGTCAGACAAGAGCTGAAACTCGAACTCAAACAGGGTTTTAA
ATCAAGAATTGAAGATGTAAGAGAAGAGATAATGAGGAAAGAAGGGCTGGGAAATTGCCT
GGAGACACAACAACTGTCTTGA

QA 3 804 3 804
DS 



AS 1 2

CO CL7374Contig1 1222 2 2 U
GTCTGTCTATTGATAACGAGGAAGATTGCATCGAAACATCTTTGTCGCAGAAGGAGAAGC
AAGCTGCTGAATCACTTCTTCCAGCTCTGTCTATTGATAACGAGGAAGATTGCATCGAAA
CATCTTTGTCGCAGAAGGAGAAGCAAGCTGCTGAATCACTTCTTCCAGCTCTGTCTATTG
ATAACAAGGAAGATTGCATCGAAACATATCATGCTGAGAATGCTTCTAAGGTGAAAGATC
TTGCTGAGAATGCTTCTAAGGTGAAAGAGCAGCTTACTGTGTTGATTGAAGGTTTAAAAG
TCCAAGAGGAGCTGTTTAAAGTGATAGAGAGCCATCAAGCTGAGATTGCGACAAAAGGTT
ATCTAGACAATTTGGAGACTCGCATAACAAGAAACCTTAACACTGTGGCTAAAGAGGTAG
CCAGTGGAGTGGCATCAGTTGTTGGGAAGATCCTAACCTCGCGTAGGAGATCCAGTGCAT
CGACACAAATGGAGAGGATCAAGAGAAGCTCTGCGACCAGAGCTGCTCATGTTGTTGCTA
CTGTTACTGGCGGTAGCACTAAACAACAAATTTCCGTTTCCATTGTAAATCGCTACTATG
AAGAAGCCATCACTTTGGCTCTAGATGCCGATGAACCTACTTTAGGGTGGACATTGTATC
AGCTTAAAGATCATATGAATTCACATCCGGGGGACGAGAATAAAATTCTTTCGTTATTAG
GGCGGTTGGTGCCTCTGGTCACTGCAGAGGGAGGAGTGGACATTGGTGTGTTTACTCTTT
GGTTCGAAGCAATGCTCGAGAAGGCCGTCCTTAAAGACCTGGTGATCACAGCGGAAGTAC
TTGCGGCAGAAGAACATATCAGAGCGAGACATGTGCGTGAGCAGGAGCGTCTGGCTGCTG
CTATTGAAGGAGATATCGAGAAATACTTTGAGCAGTTTGGTTATGGTGATTAAAAAAGCA
AGTAGCTCAGGAGGAGTTGAAGATTCATGCAAGTGAGTGGAACTTGGAGCCTGAAAAATA
TATGTGATGGAGGCATGGAGTGTGGAACTTTTGTTTTTAATCTTTCATATGAATATAAAT
ATGTAAAACTTTGTTTTTTAAATTTCAGACTTAGAATTTGAGGACAAAAATTGTGATAAC
TTATTTCGTATGTCTTCATGAACAAATGACCCGCGTGGTGACTAATGACTAGTTGTCGTG
TTTGGGGTTGTTTTGTTCTCTC


BQ
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CTAATGACTAGTTGTCGTGTTTGGGGTTGTTTTGTTCTCTC

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DS 



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BQ
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AF RS1D686TF U 1
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TCGACATCATCAAAAGCCGAGCTCTCTAGATTCATTTATGTCTGATTCTTATAAAATATC
CATTCATAAATGATACATCATCATCATTTAAATTAAAAAGCTGATCTCCATGAAATTTTG
TAACTTTCTTGCATGGTTTCATTCATTCTTGTTCATCTTAAATATTTCCTTTCTTTTCTT
TTTACATTTTACATGACATGTGTTTAATACATTGGCTTTGGAGAAGCTCAAAACCATGTA
GGTTTTTGTGTAATAGTTGCATACTTTTTGTTGTAAAATAAAATATATTATTTCTATTTA
TCACAATTTTAAAGAAGTAGATATATCTGAATGAGGTGATATCACTTAAATTATACTAAA
GAATGACTTTACTATTTCAAATAAAAGGTTCAGTTGTAGAACTTAGAGATCGAATCCACA
CACAATAAACTCAAAACTCTAGATTAGGCTAGGTAAATAGATTAAAAGCAAATATATGAA
AGCCGAGAGAACAAGGTAGTTGTTCAGTTGGTTGATTCACTACAGGAAATATGGATATTA
ATAGCGGTCGTAAA
CGCTA

QA 1 734 1 734
DS 

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ATCTGAATGAGGTGATATCACTTAAATTATACTAAAGAATGACTTTACTATTTCAAATAA
AAGGTTCAGTTGTAGAACTTAGAGATCGAATCCACACACAATAAACTCAAAACTCTAGAT
TAGGCTAGGTAAATAGATTAAAAGCAAATATATGAAAGCCGAGAGAACAAGGTAGTTGTT
CAGTTGGTTGATTCACTACAGGAAATATGGATATTAATAGCGGTCGTAAAACGCTATAAG
TTATGTATAATAGCGTTTCTTTAGCCACTCTGACATAACCCATTATAATAGGTCCGACAC
TTTTAATAGTGGTTTATCGGTATGCTACAGTTAAATATTCAACAATAGCATTAGTTTGTA
TGCAATTGTTAATATTTATAATAACATAATACAAATGTTATTAAAACTCATTACTTTGAT
TTTTTCAATAGCAAAGATAGCAAATATTTCACGTTATTAATTTTTTTTTAATTATCTGAA
AGTTTATTAAAAACATAATTCAAAATAAAATCGAAAATTAATTTAATTTAAAAATAAAAA
TTTATTTATTAATTAAATTCAGTATTACACATTAAACCAAAAACAAATTAAAACATTAAA
CCAAAACATAATTAGCCAAAATATAATTAACCAAAACTTAAACTAAGCCTTTTGACC

QA 1 717 1 717
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AAGGCTAAGATTGAGCTTTTGGAGAGAAACCAGAGGCACCATCTTGGGGAAGACTTGCAA
GCAATGAGCCCCAAGGAGCTCCAGAATCTAGAGCAACAGCTTGACACTGCTCTTAAGCAC
ATCTGCTGTAGAAAAAACCAACTTATGTACGACTCCATCAATGAGCTCCAAAGAAAGGAG
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CTTAAGGCGCAACAAGAGCAATGGGACGAGCAGAACCATGGTAATAATATGCCTCCGCTT
CCACCCCCGCAGCAGCAGCAAATCCAGCATCCTTACATGCTCTCCCATCAGCCATCTCCT
TTTCTCAACATGGGTGGGCTGTATCAAGAAGAAGATCAAATGGCAATGAGGAGGAACGAT
CTCGATCTGTTTCTTGAACCCGTTTACAACTGCAATCTTGGCTGCTTTGGCGCATGAAGC
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TAAATTAGCAAGTTCCTATTTTGTCTCTTTTTATCCTTCTCAAGTTTTTCTCCTTCAGTA
TGAGGCAAAATTGTAATAACTGAACTGATATTTTTGAACCTTCTAATAAGTCAGTGTCC


BQ
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AF RS1GB23TF U 1
AF RS1GB23JQ C 312
BS 1 553 RS1GB23TF
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TTTCTCAACATGG

QA 1 553 1 553
DS 

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GTTCCTATTTTGTCTCTTTTTATCCTTCTCAAGTTTTTCTCCTTCAGTATGAGGCAAAAT
TGTAATAACTGAACTGATATTTTTGAACCTTCTAATAAGTCAGTGTCC

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 2

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GCTCATCAGAACTGAGTGTGGACAACATCAACATTTTGTGCTTAGATGGGAACGATGCTG
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BQ
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20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DN50TF U 1
AF RS1DN50JQ C 49
BS 1 723 RS1DN50TF
BS 724 724 RS1DN50JQ
BS 725 729 RS1DN50TF
BS 730 730 RS1DN50JQ
BS 731 776 RS1DN50TF
BS 777 777 RS1DN50JQ
BS 778 814 RS1DN50TF
BS 815 821 RS1DN50JQ

RD RS1DN50TF 814 0 0
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TTTACCAGACAGACCAGTCTCAGCTACAAGAGGCAGACCTGGAGTAGCCTCAGCGCCAGG
CTCAAGATCGTCTTCCATAGAGGTGGCAGTGGTGGCCCACCAGTGCTAGGCAATCTTGTT
CTCCTTCCAGACGTCGGGCTCCTATTGGGAACACCAACGGGAGCCTCCCAAGTGCGCGTG
GTGGGCGAGGAGGAAAGGCTAACAACGGTGGGAGTAGCTACGATAGCATGAGCCCATTTG
CTATGGGAAATAAAATGGTGGAGAGAGTGGTGAACATGAGGAAACTAGGTCCACCACGTG
TAACAGAGAATGGTGGTCGAGGAACCGTGAAATCTAACTCAGCTTTTAACAGCCTTGGGT
ATGGGAGAAACCTCTCCAAGAGCTCTATCGATATGGCCTTAAGACATATGGATATAAGAC
GAGGCATGACAGGAAATCTCCGGCCGCTGGTGACGAAAGTTCCGGCGTCATCAATGTACA
GCGTGAGAAGCGGGTCGACTAGTGTCACGAATTCTCCGGTGGCTACGAGCAGCACCATGA
GCTCATCAGAACTGAGTGTGGACAACATCAACATTTTGTGCTTAGATGGGAACGATGCTG
AAAACGATGATCTTCTCAGCGAGAGAAGCTATTCTTGACCTATATACCCTATGTTCTTTG
TTT*GTTAC*ATACTTAAATAACGTGTTTCTAGAGATACTGAAACGTATCGAGGCA*CTC
TTGATCATGTTTAAGTCTTCATGGAATTTTGATG

QA 1 814 1 814
DS 

RD RS1DN50JQ 773 0 0
TCTAAGGACTATTTTACCAGACAGACCAGTCTCAGCTACAAGAGGCAGACCTGGAGTAGC
CTCAGCGCCAGGCTCAAGATCGTCTTCCATAGAGGTGGCAGTGGTGGCCCACCAGTGCTA
GGCAATCTTGTTCTCCTTCCAGACGTCGGGCTCCTATTGGGAACACCAACGGGAGCCTCC
CAAGTGCGCGTGGTGGGCGAGGAGGAAAGGCTAACAACGGTGGGAGTAGCTACGATAGCA
TGAGCCCATTTGCTATGGGAAATAAAATGGTGGAGAGAGTGGTGAACATGAGGAAACTAG
GTCCACCACGTGTAACAGAGAATGGTGGTCGAGGAACCGTGAAATCTAACTCAGCTTTTA
ACAGCCTTGGGTATGGGAGAAACCTCTCCAAGAGCTCTATCGATATGGCCTTAAGACATA
TGGATATAAGACGAGGCATGACAGGAAATCTCCGGCCGCTGGTGACGAAAGTTCCGGCGT
CATCAATGTACAGCGTGAGAAGCGGGTCGACTAGTGTCACGAATTCTCCGGTGGCTACGA
GCAGCACCATGAGCTCATCAGAACTGAGTGTGGACAACATCAACATTTTGTGCTTAGATG
GGAACGATGCTGAAAACGATGATCTTCTCAGCGAGAGAAGCTATTCTTGACCTATATACC
CTATGTTCTTTGTTTTGTTACCATACTTAAATAACGTGTTTCTAGAGATACTGAAACGTA
TCGAGGCAACTCTTGATCATGTTTAAGTCTTCATGGAATTTTGATGAGTGTTC

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

CO CL7379Contig1 784 2 4 U
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GAAGAAGAAGAACAAGATTCTCAAGAAATGGTGGGCTTGCAAGCCGAGAGGATCGTGTAC
TCCTTGACGTTCCCAATGGTTTTCAAAGCTGCCTTGGAGCTGGGAGTCATCGACACGATG
GCTGCAATTGAGGATGGTATATGGCTCTCGCCTTCCGAGATAGCGTTTCGTCTCCCTACT
AAACCCACCAACCCGGAAGCTCCACTGATTCTGGACCGGATGATGCGATTACTCGCCAGC
CACTCGATCTTGAAATGTCGTGTTGTTGAAACCGGAGAGAACGACCAAACCGGAAAGATC
GAAAGGGTATACGCAGCCGAACCGGTTTACAAGTTTTTCTTGAAAGATGATGATGGCTCG
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GTACTATAGATTAATAAGATGAAATAAATGCAATTACGCCAAGGTAATTTACATATTTTC
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ATGTGTTTCTGCCCATGGTATGAAAGTCTTCGAATACATTGCTTCTGATGAACAATTCGC
TGAGAAGTTTAACCCGGGAATGTCGGACTCGTCAACCATGTTCATGAGAGTTTCTAGAAA
GTAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 

AF RS1EA37TF U 1
AF RS1FQ55TF U 1
BS 1 650 RS1EA37TF
BS 651 651 RS1FQ55TF
BS 652 767 RS1EA37TF
BS 768 784 RS1FQ55TF

RD RS1EA37TF 773 0 0
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GCTGCAATTGAGGATGGTATATGGCTCTCGCCTTCCGAGATAGCGTTTCGTCTCCCTACT
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CACTCGATCTTGAAATGTCGTGTTGTTGAAACCGGAGAGAACGACCAAACCGGAAAGATC
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GTACTATAGATTAATAAGATGAAATAAATGCAATTACGCCAAGGTAATTTACATATTTTC
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ATGTGTTTCTGCCCATGGTATGAAAGTCTTCGAATACATTGCTTCTGATGAACAATTCGC
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AGAAGT

QA 1 767 1 767
DS 

RD RS1FQ55TF 784 0 0
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GAAGAAGAAGAACAAGATTCTCAAGAAATGGTGGGCTTGCAAGCCGAGAGGATCGTGTAC
TCCTTGACGTTCCCAATGGTTTTCAAAGCTGCCTTGGAGCTGGGAGTCATCGACACGATG
GCTGCAATTGAGGATGGTATATGGCTCTCGCCTTCCGAGATAGCGTTTCGTCTCCCTACT
AAACCCACCAACCCGGAAGCTCCACTGATTCTGGACCGGATGATGCGATTACTCGCCAGC
CACTCGATCTTGAAATGTCGTGTTGTTGAAACCGGAGAGAACGACCAAACCGGAAAGATC
GAAAGGGTATACGCAGCCGAACCGGTTTACAAGTTTTTCTTGAAAGATGATGATGGCTCG
GGTTCCCTCAGATCTCTCTTCATGTTGTGCAATGACCACGTCGTTTTCAAGAATATGTAC
GTACTATAGATTAATAAGATGAAATAAATGCAATTACGCCAAGGTAATTTACATATTTTC
CTAAGTAATATTTTTCTACAGGTCACATATAAAGGATGTGATATTACAAGGAAGAGATGC
ATGTGTTTCTGCCCATGGTATGAAAGTCTTCGAATACATTGCTTCTGATGAACA*TTCGC
TGAGAAGTTTAACCCGGGAATGTCGGACTCGTCA*CCATGTTCATGAGAGTTTCTAGAAA
GTAC

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 2

CO CL7380Contig1 1281 2 4 U
CAATCATAATTAACAAGATACGTAACTAAACAGTTGAACAAACATTTTTCTGTATCTTTT
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TCACGTTTTCACTTGCAAACAATACGAATAAACTGAAACTTTGGTAATAAAGATCCTTGT
TTCTTTATCATATATCCTCACAATGTCTCACATGAGGAGCTAATCTTCAAAGTCAAAGAA
AGGAAGAGCATGGAAACAAGACTCCATCGACATAGCCCGAGGATCAGGAGCTGTACGGTT
GGTTATCATGTTTATAAAGTAACTAAGGCTTATAAACCCTCCAAGACCTTGAGCTACATG
TAGACTTTGGTAATAAAGATTCTTGTTATTTATCTAATGTAGACCAATCACTTGTCACAA
GGTTGTCTGTCATACTCAAAAGGTTACACATCAGCAATCCATCTTTTTTCTCCTCTCATT
TTAAAAGAGAAACTTGTTATATTAGAGAACTCAAAACGGGAAATACAGAATATATTGCTT
AGCAGATTATCTACCTTCTTCCCCTCAAAAAACATGTGTTATTAGTAGAGAACTCAAAAC
TGAAATCTGCCTTTACATAATCTATGACAAGGAGATGGAACTAACTAGTTGTCTTTGTCG
TCATCCTCGTCATAGTTAAACGGTAATGGAACCGTCTTGAATGCTCTGTACTTCCCCACA
TTGTTCAAATGCTCATTCTCTAACCTGAAAAAGTTCCATATCCCACGTCGGATAATCTCT
AAACTGGCTACAACTGCAACCATAGTGTTCCTGTGCATAAATGAGAAGTTGAAATCCAGC
ACCGTCTGCAGCCACGCAAATCTAAGCAAGATGTTCAATATCATTGCGATGAAGTATACT
TTCTTTTGCGGGATAAGGAGTTTGTCTCTGAGCCAACGGTTCTTAGAAGTCCTGTTCAGA
AGACCCCAGTCTGACCAAGTCCCAGTAAGTACAGAAAATAGCAGCAATAGCTGAGACAAC
CCCAGCTAACATTCTCCAGACAAACTTATGTTACTCGTCGACAACACCGTAAGCGGTCCT
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GTTCTCTTCAAATAGCCGTCTCAAGCACTGAAGGAGACGACAGACATATGGGAAGGCTGC
AACAATGAATAAGAAAGCATT


BQ
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AF RS1EN36TF C 1
AF RS1AV11JQ U 578
BS 1 577 RS1EN36TF
BS 578 650 RS1AV11JQ
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RD RS1EN36TF 698 0 0
CAATCATAATTAACAAGATACGTAACTAAACAGTTGAACAAACATTTTTCTGTATCTTTT
TGATCGTGCAGGAACTTGTGCAGAGTGCTTTGTTAGGGAGCAGTACAGGTAAACTGAAAC
TGAAACTGAAACTTTGGAGCAGCACAGAGTGTTTCTGTATCCTTTTTTGATCGTACTGTT
TCACGTTTTCACTTGCAAACAATACGAATAAACTGAAACTTTGGTAATAAAGATCCTTGT
TTCTTTATCATATATCCTCACAATGTCTCACATGAGGAGCTAATCTTCAAAGTCAAAGAA
AGGAAGAGCATGGAAACAAGACTCCATCGACATAGCCCGAGGATCAGGAGCTGTACGGTT
GGTTATCATGTTTATAAAGTAACTAAGGCTTATAAACCCTCCAAGACCTTGAGCTACATG
TAGACTTTGGTAATAAAGATTCTTGTTATTTATCTAATGTAGACCAATCACTTGTCACAA
GGTTGTCTGTCATACTCAAAAGGTTACACATCAGCAATCCATCTTTTTTCTCCTCTCATT
TTAAAAGAGAAACTTGTTATATTAGAGAACTCAAAACGGGAAATACAGAATATATTGCTT
AGCAGATTATCTACCTTCTTCCCCTCAAAAAACATGTGTTATTAGTAGAGAACTCAAAAC
TGAAATCTGCCTTTACATAATCTATGACAAGGAGATG
C

QA 1 697 1 697
DS 

RD RS1AV11JQ 704 0 0
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GAACTAACTAGTTGTCTTTGTCGTCATCCTCGTCATAGTTAAACGGTAATGGAACCGTCT
TGAATGCTCTGTACTTCCCCACATTGTTCAAATGCTCATTCTCTAACCTGAAAAAGTTCC
ATATCCCACGTCGGATAATCTCTAAACTGGCTACAACTGCAACCATAGTGTTCCTGTGCA
TAAATGAGAAGTTGAAATCCAGCACCGTCTGCAGCCACGCAAATCTAAGCAAGATGTTCA
ATATCATTGCGATGAAGTATACTTTCTTTTGCGGGATAAGGAGTTTGTCTCTGAGCCAAC
GGTTCTTAGAAGTCCTGTTCAGAAGACCCCAGTCTGACCAAGTCCCAGTAAGTACAGAAA
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TCGACAACACCGTAAGCGGTCCTCAAGCAGACCGCCATTATAGTCAAGAAGTACTTGAGA
CCATTATATCCTTGTTCTGCGTTGTTCTCTTCAAATAGCCGTCTCAAGCACTGAAGGAGA
CGACAGACATATGGGAAGGCTGCAACAATGAATAAGAAAGCATT

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

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TTCATCGATTTAGTTCTCCACAGACCCAAAGTATATAGGCACGTTCTCTTCAATGAAATC
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CTAGACTCTTATAGAAGCTTGCTACTGAGAGGAACTCATGAGCAATCCAGCTTGATTCTG
ATAACTGTGAAGGTTCTAGTCGACGTCATGTCTACAAATCTTGCCTTTCTCTTCTCTTTT
GCCATTGCTGCTAAGGGTTTGCTTAATGAAGTTTCCAGAAAAAGAGAGATTATTTTGGGG
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BQ
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AF RS1EB41TF U 1
AF RS1EB41JQ C 18
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RD RS1EB41TF 784 0 0
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TTCATCGATTTAGTTCTCCACAGACCCAAAGTATATAGGCACGTTCTCTTCAATGAAATC
AATCAAGAAACCGTTAATATTCAGCATCTGTTGTGGAAGTTGGTCTTCGCTTATCTTCTT
CTAGACTCTTATAGAAGCTTGCTACTGAGAGGAACTCATGAGCAATCCAGCTTGATTCTG
ATAACTGTGAAGGTTCTAGTCGACGTCATGTCTACAAATCTTGCCTTTCTCTTCTCTTTT
GCCATTGCTGCTAAGGGTTTGCTTAATGAAGTTTCCAGAAAAAGAGAGATTATTTTGGGG
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GTGTCAGTGATCTTCATTATAGATATACTTGTCTTAACATCCAACTCCATGGCTCTTAAA
GTGATGACTGAATCAACCACGAGCAGGTGCATAGCCGTATGCTTAATCGCGCACGCAGTT
AGATTCTTGGTGGGTCAGATCCTTGAGCCAACAACA*CATTCTTCACACAATTTGGATCT
CT*GTGTATCTATCTTCCTTGTTCAGAA*TGATTAAACACTTGATACATGTTTCATCCAG
CTCA

QA 1 784 1 784
DS 

RD RS1EB41JQ 816 0 0
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TATTCAGCATCTGTTGTGGAAGTTGGTCTTCGCTTATCTTCTTCTAGACTCTTATAGAAG
CTTGCTACTGAGAGGAACTCATGAGCAATCCAGCTTGATTCTGATAACTGTGAAGGTTCT
AGTCGACGTCATGTCTACAAATCTTGCCTTTCTCTTCTCTTTTGCCATTGCTGCTAAGGG
TTTGCTTAATGAAGTTTCCAGAAAAAGAGAGATTATTTTGGGGATATTAATCTCAAGTTA
CTTCAAGATCTTTCTGCTAGCGATGCTGGTATGGGAGTTCCCAGTGTCAGTGATCTTCAT
TATAGATATACTTGTCTTAACATCCAACTCCATGGCTCTTAAAGTGATGACTGAATCAAC
CACGAGCAGGTGCATAGCCGTATGCTTAATCGCGCACGCAGTTAGATTCTTGGTGGGTCA
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CTTGTTCAGAAATGATTAAACACTTGATACATGTTTCATCCAGCTCAATAAAACGTATGT
GTTATACAAATTGCAATGGCTAATTCATTTTATCTC

QA 1 816 1 816
DS 



AS 1 2

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TGAATCCTCCATCTCCTTCATCTAACCCTAAAGAACTTCATCAAAGATCGATCAAGATTC
TATAAAACACAAGAACATGCTTGCCGTCCACCGCCCTTCATCCGCCGTATCAGACGGAGA
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GCTGCTAGCTCCACCGAGCGTCTTGACATACTAGACGACGAGAGGCACGTCATTAGTTTC
ATCGTCGTCGGTGGTGATCATAGGCTCTCTAACTACCGATCCGTCACGACTCTTCACTCT
TCTCCGGTCTCGGGGACCGTCGTTGTTGAGTCTTACGTCGTCGATGTGCCTCCGGGGAAC
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TTTACGTCGTCTGAATAGTTTCGTTGAGATCCGACGTCGTTTCTTGATTTTTTTAGCCGT
CGTGTGATCTATGTTTTTTACCGGCTTATTGTGTGAAAAAAATGAAAAATACATTAGTAA
ATTAATCTCTCATGCATCATAATCTTATATAATT


BQ
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AF RS1CX57TF U 1
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BS 640 754 RS1CX57JQ

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TTGATTTTGCTCCTTTTTTATGATACACACATCTCCTCCTCTCTTTTAACATCTTCTTCT
TGAATCCTCCATCTCCTTCATCTAACCCTAAAGAACTTCATCAAAGATCGATCAAGATTC
TATAAAACACAAGAACATGCTTGCCGTCCACCGCCCTTCATCCGCCGTATCAGACGGAGA
CTCCCTCCAGATTCCAACGTTGGTAGCTTACGTCAAGTCCACGTCGTCTCTGGCCTCCCC
GCTGCTAGCTCCACCGAGCGTCTTGACATACTAGACGACGAGAGGCACGTCATTAGTTTC
ATCGTCGTCGGTGGTGATCATAGGCTCTCTAACTACCGATCCGTCACGACTCTTCACTCT
TCTCCGGTCTCGGGGACCGTCGTTGTTGAGTCTTACGTCGTCGATGTGCCTCCGGGGAAC
ACGAAGGAAGAGACATGCGACTTTGTTGACGTTATAGTACGATGCAATCTTCAGTCTCTT
GCTAAGATAGCTGAGATATCTGCGGCGGAGGGGAACAAGAAGACGTCCATTTGATATGTG
TTTACGTCGTCTGAATAGTTTCGTTGAGATCCGACGTCGTTTCTTGATTTTTTTAGCCGT
CGTGTGATCTATGTTTTTTACCGGCTTATTGTGTGAAAAAAATGAAAAATACATTAGTAA
ATTAATCTCTCATGCATCATAATCTTATATAATT

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1GP28TF U 1
AF RS1GP28JQ C 218
BS 1 733 RS1GP28TF
BS 734 734 RS1GP28JQ
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BS 785 866 RS1GP28JQ

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AATCATTCTTCTCCCTCTCTACATTCCGTAACAAAGGAAACGACTCGAAGCCAAGATAAC
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ATTT
CTT

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DS 

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AAACGACTCGAAGCCAAGATAACAGAAGAAGGAAACAAAACCATATCTGTGTTTCTTCCT
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TTGAAACACTAGAAAAGTATATAGAAATCTTCCCAACAGAGTTGTTTTG

QA 1 649 1 649
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1EC58TF U 1
AF RS1C593JQ C 42
BS 1 549 RS1EC58TF
BS 550 550 RS1C593JQ
BS 551 589 RS1EC58TF
BS 590 761 RS1C593JQ

RD RS1EC58TF 589 0 0
TTTCTGCATTGATCATCACAGTTTCCTCAGCTGTGCCTTCTTGTACGATATCTTCTGGGT
GTTTGTCTCCAAGAAGTTGTTCCACGAAAGCGTAATGATTGTCGTAGCTCGTGGTGATAA
AAGCGGAGAAGATGGCATCCCTATGCTACTGAAGATTCCACGCATGTTCGATCCGTGGGG
AGGCTACAGCATTATTGGATTCGGTGATATTCTTTTGCCCGGTTTGCTAATCGCATTTGC
TCTCAGATATGACTGGTTAGCTAACAAGACTCTTCGAACCGGCTATTTTATATGGGCGAT
GGTTGCTTACGGATTAGGTCTTTTGATTACTTACGTGGCTCTAAACCTAATGGATGGACA
CGGCCAACCAGCATTGCTCTACATTGTCCCTTTTACTCTCGGAACGATGCTAACACTAGC
TCGAAAACGAGACGATCTTTGGACTCTATGGACGAAAGGAGAGCCAGAAAGGGCATGTCC
TCACCACGTCAGGCTTGAACAGTGCTCTGAGTAATGAGACGACCTCACAAGAGATATATA
CATATAAAA*GCCTTTCGGGTTTGTAACCAATGTAACGTAAGCCGTAAG

QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1C593JQ 720 0 0
TGTACGATATCTTCTGGGTGTTTGTCTCCAAGAAGTTGTTCCACGAAAGCGTAATGATTG
TCGTAGCTCGTGGTGATAAAAGCGGAGAAGATGGCATCCCTATGCTACTGAAGATTCCAC
GCATGTTCGATCCGTGGGGAGGCTACAGCATTATTGGATTCGGTGATATTCTTTTGCCCG
GTTTGCTAATCGCATTTGCTCTCAGATATGACTGGTTAGCTAACAAGACTCTTCGAACCG
GCTATTTTATATGGGCGATGGTTGCTTACGGATTAGGTCTTTTGATTACTTACGTGGCTC
TAAACCTAATGGATGGACACGGCCAACCAGCATTGCTCTACATTGTCCCTTTTACTCTCG
GAACGATGCTAACACTAGCTCGAAAACGAGACGATCTTTGGACTCTATGGACGAAAGGAG
AGCCAGAAAGGGCATGTCCTCACCACGTCAGGCTTGAACAGTGCTCTGAGTAATGAGACG
ACCTCACAAGAGATATATACATATAAAAAGCCTTTCGGGTTTGTAACCAATGTAACGTAA
GCCGTAAGATTCTTATCCTCTCCAGTCCTCTTGAATTTATATTTGCATCGTCATCATTGA
AGAGGAATCCACGATCGTTCTGTGTCTATATGGTTTGTTCCTTTTGTAAGAGAAGAGTGT
TGTATATACACATAGTACAAACATGTTAAGCTATCAATATCATCATTGTGTTGATTTTGC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL7385Contig1 770 2 1 U
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ATTTTTGCTTCACCAACGAGCAATATTGTATAATCGATCAACCATTATTTGTTTTTAGAA
ACATAGTAAATTTAAACACATGCACAAACCACAATGATCAAATATCCATAAGCCCTTCGA
ACACCTTCATCGCCGAACCAGGAAGTCCAAGCAACACATTGATACTCTTCGTGTCACTGC
CACATGGCAAGAACAGAATCACTTCTTTCTCAGGTAAACCAACCGGTCCAGACACAACCG
GTTCACCCCAACCGAAATCTTTAGTATGAAATGAAAGTTTTGCCCACGATGTGATCAGAA
GCGTCGCCGTTAGACTCGGCCTAGCCCGAGTCACCTCGAAGTAATCAATCGCTGACCTCA
TGAAACCGTCGGTTACCATTTCAACGGCACTTTTAGCCAACCCCACGGTATGAGAAAGAG
GGTTTAGAGTCAATTCACCTGCCGTGGTAACGGAATAAGTGAACACAATCCCGTTTCCTG
AATATCCTTTAGGAAGTTCCGGAACGAATCTTGACCGTCCATCTGCCGCAAAGAGAAGTT
TTATACGTTGATCTGGTTTAAGCCCCAACGCTTGGCAACGAGCTCTCCATAGAAACCCGG
TTAGGGTTTGGAATGTCGTGGTTTTTGTCTCTGCCATGATCTTGAGCTTCTCCAGTTTTT
CGGGTTCAAATAGAAAGGATTTGTAGACGAGTTTCTCGTCGGAGTAGAGT


BQ
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AF RS1E717JQ U 1
AF RS1EI94JQ U 1
BS 1 770 RS1E717JQ

RD RS1E717JQ 770 0 0
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ACATAGTAAATTTAAACACATGCACAAACCACAATGATCAAATATCCATAAGCCCTTCGA
ACACCTTCATCGCCGAACCAGGAAGTCCAAGCAACACATTGATACTCTTCGTGTCACTGC
CACATGGCAAGAACAGAATCACTTCTTTCTCAGGTAAACCAACCGGTCCAGACACAACCG
GTTCACCCCAACCGAAATCTTTAGTATGAAATGAAAGTTTTGCCCACGATGTGATCAGAA
GCGTCGCCGTTAGACTCGGCCTAGCCCGAGTCACCTCGAAGTAATCAATCGCTGACCTCA
TGAAACCGTCGGTTACCATTTCAACGGCACTTTTAGCCAACCCCACGGTATGAGAAAGAG
GGTTTAGAGTCAATTCACCTGCCGTGGTAACGGAATAAGTGAACACAATCCCGTTTCCTG
AATATCCTTTAGGAAGTTCCGGAACGAATCTTGACCGTCCATCTGCCGCAAAGAGAAGTT
TTATACGTTGATCTGGTTTAAGCCCCAACGCTTGGCAACGAGCTCTCCATAGAAACCCGG
TTAGGGTTTGGAATGTCGTGGTTTTTGTCTCTGCCATGATCTTGAGCTTCTCCAGTTTTT
CGGGTTCAAATAGAAAGGATTTGTAGACGAGTTTCTCGTCGGAGTAGAGT

QA 1 770 1 770
DS 

RD RS1EI94JQ 752 0 0
GGTAACACAATAGCTTAACTTTATTTATTACACTTGATACGTATATCATGTCTTAGTTAC
ATTTTTGCTTCACCAACGAGCAATATTGTATAATCGATCAACCATTATTTGTTTTTAGAA
ACATAGTAAATTTAAACACATGCACAAACCACAATGATCAAATATCCATAAGCCCTTCGA
ACACCTTCATCGCCGAACCAGGAAGTCCAAGCAACACATTGATACTCTTCGTGTCACTGC
CACATGGCAAGAACAGAATCACTTCTTTCTCAGGTAAACCAACCGGTCCAGACACAACCG
GTTCACCCCAACCGAAATCTTTAGTATGAAATGAAAGTTTTGCCCACGATGTGATCAGAA
GCGTCGCCGTTAGACTCGGCCTAGCCCGAGTCACCTCGAAGTAATCAATCGCTGACCTCA
TGAAACCGTCGGTTACCATTTCAACGGCACTTTTAGCCAACCCCACGGTATGAGAAAGAG
GGTTTAGAGTCAATTCACCTGCCGTGGTAACGGAATAAGTGAACACAATCCCGTTTCCTG
AATATCCTTTAGGAAGTTCCGGAACGAATCTTGACCGTCCATCTGCCGCAAAGAGAAGTT
TTATACGTTGATCTGGTTTAAGCCCCAACGCTTGGCAACGAGCTCTCCATAGAAACCCGG
TTAGGGTTTGGAATGTCGTGGTTTTTGTCTCTGCCATGATCTTGAGCTTCTCCAGTTTTT
CGGGTTCAAATAGAAAGGATTTGTAGACGAGT

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

CO CL7386Contig1 894 2 7 U
GGGAATCGTATCAACACACTTTCAAAAAGGGTTGTGGATATCTTTTAAAACAACATTATC
AAGTTATCGACCAAGAAAACAGAAGTTGGGGGTGACCTGAGTTTTTCAACACGACACAAA
ATGTCAGGATTATTCAAAACGGTGACATTTATGGTTTTGGTTTTTGCTGCGGTTGTTTCC
GCAGAGGACTACGAGGTTGGTGATGATGCCAAATGGGCGAGACCTTCCGATCTCGAGTTC
TATAATACATGGGCTGCCGGTAAAACTTTCCTAGTAGGCGACGTGCTCGAATTTGATTTC
GATGCTGAGAGACATGATGTGGCAATCGTAACAGCAGATGAATATGAAAACTGCGAGAAA
GAGACACCCCTCAGCCTCATTAAGACTTCTCCAGCCAAGATTATGCTAAACGACACCGGA
CCAATATACTTCATCTGCACCGCCGCTGACCATTGCCGCTTTGGTCAAAAACTTACCGTC
AACGTAGTTGACGATGCTAGTGGTAGTCCTGGTGGACATAGCGGTGGCGACGCCAGTGCT
ACTCCTCCAGCACCTAGCAAGGCTACCACTCCCGCACCTAGCAAGGCTACCACTCCAGCA
TCCGGCGGTGCTACTACTCCAGCACCTAGCGGTGCAACCGCCCCAGGTGCTGAAGGAACC
TCTCCCAAAACCCCAGGAGCCGGGACTACTGCACCTACCGGATCTAGTGAAACAACTACA
CCAGCTCCCGCTGAAAGCACCGCTTCTTCATTAGGTGGTGCTTCTTTTATGGTCGCCTTT
GTTTCTGCTGTTGTTGCTCTCTTTTGAGTTAGATAATATTGAGTATATGTGTTTGTCTCG
CTTGTTATACGTATGTAATTTAATGATAAAAAAAAATCCTATGTGTTTGCTTTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A420TF U 31
AF RS1A420JQ C 1
BS 1 30 RS1A420JQ
BS 31 754 RS1A420TF
BS 755 755 RS1A420JQ
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CTAGTAGGCGACGTGCTCGAATTTGATTTCGATGCTGAGAGACATGATGTGGCAATCGTA
ACAGCAGATGAATATGAAAACTGCGAGAAAGAGACACCCCTCAGCCTCATTAAGACTTCT
CCAGCCAAGATTATGCTAAACGACACCGGACCAATATACTTCATCTGCACCGCCGCTGAC
CATTGCCGCTTTGGTCAAAAACTTACCGTCAACGTAGTTGACGATGCTAGTGGTAGTCCT
GGTGGACATAGCGGTGGCGACGCCAGTGCTACTCCTCCAGCACCTAGCAAGGCTACCACT
CCCGCACCTAGCAAGGCTACCACTCCAGCATCCGGCGGTGCTACTACTCCAGCACCTAGC
GGTGCAACCGCCCCAGGTGCTGAAGGAACCTCTCCCAAAACCCCAGGAGCCGGGACTACT
GCACCTACCGGATCTAGTGAAACAACTACACCAGCTCCCGCTGAAAGCACCGCTTCTTCA
TTAG*TGGTGCTTCTTT*ATGGTCGCCTTTGTTTCTGCTGT
GTGCTCTCTTTGAG

QA 1 761 1 761
DS 

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AAGTTATCGACCAAGAAAACAGAAGTTGGGGGTGACCTGAGTTTTTCAACACGACACAAA
ATGTCAGGATTATTCAAAACGGTGACATTTATGGTTTTGGTTTTTGCTGCGGTTGTTTCC
GCAGAGGACTACGAGGTTGGTGATGATGCCAAATGGGCGAGACCTTCCGATCTCGAGTTC
TATAATACATGGGCTGCCGGTAAAACTTTCCTAGTAGGCGACGTGCTCGAATTTGATTTC
GATGCTGAGAGACATGATGTGGCAATCGTAACAGCAGATGAATATGAAAACTGCGAGAAA
GAGACACCCCTCAGCCTCATTAAGACTTCTCCAGCCAAGATTATGCTAAACGACACCGGA
CCAATATACTTCATCTGCACCGCCGCTGACCATTGCCGCTTTGGTCAAAAACTTACCGTC
AACGTAGTTGACGATGCTAGTGGTAGTCCTGGTGGACATAGCGGTGGCGACGCCAGTGCT
ACTCCTCCAGCACCTAGCAAGGCTACCACTCCCGCACCTAGCAAGGCTACCACTCCAGCA
TCCGGCGGTGCTACTACTCCAGCACCTAGCGGTGCAACCGCCCCAGGTGCTGAAGGAACC
TCTCCCAAAACCCCAGGAGCCGGGACTACTGCACCTACCGGATCTAGTGAAACAACTACA
CCAGCTCCGGCTGAAAGCACCGCTTCTTCATTAGGTGGTGCTTCTTTTATGGTCGCCTTT
GTTTCTGCTGTTGTTGCTCTCTTTTGAGTTAGATAATATTGAGTATATGTGTTTGTCTCG
CTTGTTATACGTATGTAATTTAATGATAAAAAAAAATCCTATGTGTTTGCTTTC

QA 1 894 1 894
DS 



AS 1 2

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BQ
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20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FH38TF U 1
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TTT

QA 1 783 1 783
DS 

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TATATTCATCAACCCTCTAAGCATTAGTGTTTAGGAGTGATTCATAGATCTTGTTAGGTA
TATGTTCTCATAAATTACCCGTTTTTGTTTAACCTATGTTTTTCTTGTTAGATGGTATAT
GGTTGTAATTTGTAAATCTTACAGACATGGTGTTTTTTCCTTGTCTTTGTTAGTTTAACA
AAGATTCGCAAAACCTGACACTAACTAATGTCTTTGACGGGCG

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

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AGGCCCAACACTGGTGTCATCAGCCATGGGACTCCTGCATCATTAGAGTTACGCTACAAG
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AGTTGGCAGCTATGGTTGGACTCATTGGACTCATCATTGGTTTCATCCTAAAACTCGCCT
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BQ
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AF RS1CE70TF U 1
AF RS1CE70JQ C 325
BS 1 676 RS1CE70TF
BS 677 1046 RS1CE70JQ

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TTTTGTGTTCTCCTTTTCCCCCAGGTTTCGAGTTATAATAGATCTTCTTGCGTGTGGTAA
AGCTAAAAAAGAGAAATGAGCGGCGTTGGAGAGAATCAGCTTATCTCCATTCAACCTGAT
GAACTCAAATTCCTCTTCGAACTGGAAAAGCAAAGCTACTGTGATCTTAAAGTTTCCAAT
AAAACCGACAACTATGTTGCTTTCAAGGTGAAAACAACATCTCCAAAAAAGTATTTTGTA
AGGCCCAACACTGGTGTCATCAGCCATGGGACTCCTGCATCATTAGAGTTACGCTACAAG
CACAAAGGGAGTATCCTCCAGATACGCAGTGCAAAGACAAGTTTCTCCTTCAAAGTACCA
TTGTCCCTCCTCACACTGATGTTGATGACCTTCCTCAAGACACTTTTACCAAGGACAGTA
GCAAAACATTAACAGAGTGTAAGCTTAAGGTCTCGTATATCGCCACCTCTACACCCCAAA
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CTACTATACAGCGGCT

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DS 

RD RS1CE70JQ 722 0 0
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CGCAGTGCAAAGACAAGTTTCTCCTTCAAAGTACCATTGTCCCTCCTCACACTGATGTTG
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AGAGAGATGCAGCTGTTAAGCAAACACAACAGCTGCAACATGAATTGGAGACATTGAAGA
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TTGGACTCATCATTGGTTTCATCCTAAAACTCGCCTTAGCTTCTCCCAAATAACAGCTTC
TCCGCATCATCTACCATTTCAACTTACGAGGGATAGCTGTTAACTCTCTATGATCTTCTT
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TCATTGACCCAATAGAACCTTTCATGATTATGTTTACTTCTCCACTACATTTAGTGGAAA
TG

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1GV80TF U 1
AF RS1GL06TF U 1
BS 1 804 RS1GL06TF

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TAGGTGAGAGTGTTGAGAAGCCTTTGCTCTATTATAATAATAACCTTTTTGGCACTGTCA
TCCTTTTGGAGGTTATGTCTCAGTACGGCTGCAAAAATCTTGTGTTTTCGTCATCAGCTA
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QA 1 765 1 765
DS 

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CTGGCTACATCGGGAGCCACACGGTTCTTCAACTTCTCAACGGCGGTTACTCCGTCGTAG
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GCGATAACGGAAACCGCCTCTCCTTCCACGAGGTGGATCTCAGAGACAGGCCTGCGCTTG
AGAAGATTTTCTCTGAAACTAAGTTTGATGCAGTGATACACTTTGCTGGACTTAAAGCAG
TAGGTGAGAGTGTTGAGAAGCCTTTGCTCTATTATAATAATAACCTTTTTGGCACTGTCA
TCCTTTTGGAGGTTATGTCTCAGTACGGCTGCAAAAATCTTGTGTTTTCGTCATCAGCTA
CTGTCTATGGCTGGCCTAAAGAGGTTCCTTGCACCGAGGAGTCCCCAATCTCTGCAACCA
ACCCTTATGGCCGTACCAAGCTTTTTATCGAAGAGATTTGCCGGGATGTGCATCGTTCTG
ACCCGGAATGGAAGATCATATTGCTTCGATACTTCAACCCTGTTGGTGCACATCCTAGTG
GTTACATTGGTGAAGATCCTCTTGGAGTTCCAAACAATCTCATGCCTTATGTCCAGCAAG
TTGCTGTTGGCCGCAGACCTCACCTCACCGTCTTTGGACCGACTACAGACAAGATGGTAC
AGGGTGAGAGATACATTCATGTGA

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 2

CO CL7390Contig1 858 2 2 U
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AGTTGTTGACCACCCGGTTAGAAAGTCGCGCGAAGGGACGAGAAGCCGAGAAGAGAGCGG
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TGATGGATATACACACATTTTCAACAAAGTCCGTGAAGAGAGAAGCACTGGAGCTAATAA
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AATAATTGTGTGTATAGTTATCGAGAAATATGTGTGTGTTGTAATCTTAATTATCAGACG
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TTTGTATGTATGTTTTGT


BQ
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AF RS1AD77TF U 1
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BS 776 858 RS1AD77JQ

RD RS1AD77TF 775 0 0
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QA 1 775 1 775
DS 

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AACGACCCGGAGTATAACTCGGATTCGAGGACCAAACCTGAGGAAGTTGTTGACCACCCG
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GT

QA 1 842 1 842
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1BD18JQ C 1
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TCAATTAACTGGAGAATGATGATGGTCTATCTCAAACTCAAAAGGATGGTTTGAGAGATT
CAAGGAAGAGAGACAAGAAGGCTCTCTGTCTAATCTATCAAGGATTAGATGAAGATACAT
TTGAGAAGGTTGCTGGTGCAAAAACGTCCAAAGAAGCATGGGAAAAGCTTCGGACTTCTT
ACAAGGGAGCGGAACAAGTTAAGAAGGTACGACTTCAAACTCTAAGAGGAGAATTTGAAG
CATTACAAATGAAGGAAGGAGAACTCATCTCAGATTACTTCTCAAGAGTCTTGACGGTTA
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QA 1 770 1 770
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BG08TF U 1
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BS 739 854 RS1BG08JQ

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TACTGTCCCCAATAGTTACGACGGCCATGGCAAACTATTCATGACCATCCTCATCTCAGA
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GGGATGTTCGGTGTTCTTCAGTTTCCTGTGCTACTTGAGATCTTCTGCTCGACTTACTTC
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TCATTTATGTGATCATCA

QA 1 738 1 738
DS 

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AACTATTCATGACCATCCTCATCTCAGACGCTATATCTCTCTTCACCTCATGCATGTCTC
TGCTCATGTTCCTCGGCATTCTTAAGTCTCGTTACCGCGAGGGGACTTCCTTATATCGCT
TCCGACGAAACTGATCGTGGGTCTTGCGACTTTGTTTCTGTCGATGACGACAATGATGGT
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GTTTATGGTGCTCGCGGTTGTCCCGATTGGGATGTTCGGTGTTCTTCAGTTTCCTGTGCT
ACTTGAGATCTTCTGCTCGACTTACTTCCCTAGGGTTTTTGACAAGCCTCGCGAGTCGCA
GCGAATGTCTAAGCGCTGCTGGAGAAAATGATGTTGATATGAATATTTATCACTCTAGCC
AATGTTATGGAACACAGCC*GGAGCTATTCATTTATGTGATCATCAGAAGTTTGCTCGAC
CAAGTTTCTATTCATTTAATAGAGTTATCGAGTTTTTTTGTTTGTTTGTCCGACTAAACA
AGTAGTTGAAATAATGGATAAATAAAAGATGTATTTTTTACC

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

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TCTTGGTTTTTAGACTTCTCCATCTTTTTTTTTTTTTGTTTAAAGACTTCTCCATCTTGC
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BQ
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AF RS1FK07JQ U 9
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BS 15 625 RS1FK07JQ
BS 626 765 RS1FK07TF

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QA 7 617 7 617
DS 

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TCTTGGTTTTTAGACTTCTCCATCTTTTTTTTTTTTTGTTTAAAGACTTCTCCATCTTGC
GAGACGCCATTACTTCTTTCTTAAAAAGACGAAACTTTTCTTCAACTTCTGGAGAGTATG
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TACTTTTAGCCATTGTAACGAGAAGCTTCCGACCTCCCAAGTCGCTTCCATTGAGAGTTA
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TGGAAACACCGGTTTTACACTCGATGTGAACAAACACCCTTGTCAACTCTCCACACGAAC
TGAAATGTTTAGCCAATGCGCTCCTGATCTCATCCCTAGAACCGCTATTATCAAAACCCG
AGACGAAAATGGTACGCTCATCGTTTCCCTTTGCATCTTTAGTGCCATAACAACACCGTT
TCTTCTTCTCTGCGGTTTCTTCCTCCTCCTGTTTCTGCCTCTTCC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL7396Contig1 756 2 1 U
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TGGATCGGATCAGGTTCGGTTCTTCGGATTCGGTTTTTTTTCCCAGCCCTAGTCTGACCG
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TTAATCACTTTCTTTAGAAGTACAGTGAAACCTTTATAAATTAATAATGTTGAGACTACA
TCAAACTATAATTTTTTTAATTAATTTATAGAGATTATTAATTTATCGAATTATTAATTA
AACCAAAAACTCAATTTGAGACTATGAAATTATATTAATTTATAGAGATATTATTAGATT
ATTAATTTAAAGAGGTTATACTGTATATGCTTGCTGCTTGACAAACCTTACTCGTAAATT
ATTTTTAAATCTCAAAATATTTATGTAATTTTTCAAAATTTTGTAGAACAAATATAAAAT
TTTGAAATAAATATTTCAAATGATAATGATAATATTACAAATTTTTAAAAAATATAAAAT
CATAGATGCTGAAGTGTATATGTTTTGAAATGCAACACAAAAAATATGTTGTAAAATTCA
AAGTGGTTTGATATTTTTAAAATTTATGTTAATAAC


BQ
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AF RS1AQ59JQ C 1
AF RS1AQ59TFB U 1
BS 1 756 RS1AQ59TFB

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ATTAATTTAAAGAGGTTATACTGTATATGCTTGCTGCTTGACAAACCTTACTCGTAAATT
ATTTTTAAATCTCAAAATATTTATGTAATTTTTCAAAATTTTGTAGAACAAATATAAAAT
TTTGAAATAAATATTTCAAATGATAATGATAATATTACAAATTTTTAAAAAATATAAAAT
CATAGATGCTGAAGTGTATATGTTTTGAAATGCAACACAAAAAATATGTTGTAAAATTCA
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QA 1 756 1 756
DS 

RD RS1AQ59TFB 756 0 0
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CATTCGGGTACCCAAAATATTTTGGTTCGGATCGGGTTCGGTTTTGGTTCTTGAAATACC
AAAAATTTGAACTCATTCGGATATTTAATTAATTTCGATTCAAATTTAGTACTACTTTTT
TGGATCGGATCAGGTTCGGTTCTTCGGATTCGGTTTTTTTTCCCAGCCCTAGTCTGACCG
TCCGAGTTACACTATCAAGTTGGGGTAACGGCTATCAGATCAAGTGTCGGGTTAATGTAT
TTAATCACTTTCTTTAGAAGTACAGTGAAACCTTTATAAATTAATAATGTTGAGACTACA
TCAAACTATAATTTTTTTAATTAATTTATAGAGATTATTAATTTATCGAATTATTAATTA
AACCAAAAACTCAATTTGAGACTATGAAATTATATTAATTTATAGAGATATTATTAGATT
ATTAATTTAAAGAGGTTATACTGTATATGCTTGCTGCTTGACAAACCTTACTCGTAAATT
ATTTTTAAATCTCAAAATATTTATGTAATTTTTCAAAATTTTGTAGAACAAATATAAAAT
TTTGAAATAAATATTTCAAATGATAATGATAATATTACAAATTTTTAAAAAATATAAAAT
CATAGATGCTGAAGTGTATATGTTTTGAAATGCAACACAAAAAATATGTTGTAAAATTCA
AAGTGGTTTGATATTTTTAAAATTTATGTTAATAAC

QA 1 756 1 756
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7398Contig1 919 2 2 U
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CCAAGTCGAGTACGCCATTGAAGCTATCAAGCTTGGTTCTACTGCAATTGGAGTGAAGAC
AAAAGAGGGAGTTGTGCTTGCTGTTGAGAAGCGTATCACCTCTCCTTTGCTGGAGCCGAG
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GTTTGGTGAAGGAGATGAAGAATCAATGTCTCGGCCATTTGGAGTCTCTCTTCTCATTGC
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CCATATCTACACTCCACAGGAAGTCGAAGCAGTCATTAGTCGTCTTTGAGGAAGATACTC
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AATTTATTTTTCACCTGGTCTGCTAGATTTGATGTTTCATTTGACGTTTTAGTTGTGTTG
TGTAAGAGAATCTTTTCTT


BQ
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AF RS1BY39TF U 1
AF RS1EU06TF U 289
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BS 562 919 RS1EU06TF

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QA 1 561 1 561
DS 

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TTAGTTGTGTTGTGTAAGAGAATCTTTTCTT

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 2

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ATTTCTTATC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AQ89TFB U 1
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QA 1 771 1 771
DS 

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GATCGCGTTAAGCATCGCGTCTACAAACGCTTCGGACACGTCTTTCTACATCAAATCGAA
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CATCGACGTTGATATTTGGCTCAACACGGCTATTAGCGACGGAGAGGCTTGTGAAGATGC
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GCTTTGCAAAGATGCTCTTCTCATCAACACTATTTTAACTCCTTAAATTTCAAAACTTGT
TACCGATTCATTTATTTTGGTTTGTTTGTTGTAACTTTTTTTTTATATAAATGGCTTCGT
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GCATACTCCACTATATAGTACATACAGTGAATATGTATATTTTATTAATTTATGAAATAT
ATTTCTTATC

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1F755TF C 1
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BS 1 7 RS1F755TF
BS 8 755 RS1F755JQ
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QA 1 757 1 757
DS 

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QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

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BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1FP07JQ U 1
AF RS1FZ03JQ U 1
BS 1 449 RS1FP07JQ
BS 450 450 RS1FZ03JQ
BS 451 775 RS1FP07JQ

RD RS1FP07JQ 775 0 0
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CTGTGTTCAAACCAACATTGCTCACTTCAGACACTGAATCTGCACTTGTCACATCATCTT
TAACGCTCTTTCCAGTCACTGAATCCTTCACAGTTTCGCTGACGTCTCCACTATCATTCC
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DS 

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TACGCAGCTCAGCTCTGTTTGGACTGCCACCAGAAGTTCTACTGGCTTCCTTACCATCGA
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CAGCACCATCTGGCTTACCTAAGCCTTGAGCTAACGAAAAAGCAGCACCATCTGGTTTGT
CCGAGTCTTCTTGTGATGACGGAACACTCTCACCAGATTCTGGAACAGCTTCCTGTTGTT
TGCCCGAATCTCGAGCTGGAGACTCATCAAATGCAGGAGGGGGAGGAGCAGCATCAACTA
CTATTATTGATTCTGGAACTTTCTCACAACCAGTTTCCTTCTTCTCCTCAGAACTTGTGT
CTGTGTTCAAACCAACATTGCTCACTTCAGACACTGAATCTGCACTTGTCACATCATCTT
TAACGCTCTTTCCAGTCACTGAATCCTTCACAGTTTCGCTGACGTCTCCACTATCATTCC
CCTCAAGTTTCAATCTCGAAACATCTTTGGCAACTTCATCAACTTTTTCGCTAGCAGTCT
CCTCTTCATCATCAATATCCCAGCTCAACTCTTCCTCATCATCCAAAGCTGCTCG

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

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AACCAAGAATCATCTCTTCCTTTCTCGGAAACAACAACTCTATTCGATCAACGCAGCCTC
TTCCCCATCTCTTCCGCTTCCATTCAGGAAGAAGGCATGTTTCGATGCAATTATCAAGAA
CCTTTTCGGGATTAACCAATCTTCTGTTTAATACAAGAAACGTAGATGAAGTTGTTGACG
GGAAGAGAAAACGTCTGAAACCAGGACACGTGTCTCCAGGTCGCCCTGTCCCTCCCCACA
TAACCAAACCTCCTTACGTTGAGTCTTTTAAAGTCCCCGGAATCTCAAGTGGGCTCGAGA
TTCACGACAAGGAAGGTGTAGAGAGGATGAGAGCTTCTGGGAGGCTCGCAGCTAGAGTTC
GTGAATACGCTGGGACTTTGGTTAAGCCAGGTGTGACGACAGATGAGATTGATGAAGCGG
TTCACAACATGATTATAGAGAACGGAGCTTATCCTTCGCCTCTTGGCTACGGAGGTTTCC
CTAAAAGTGTTTGCACGTCTGTGAATGAGTGCATTTGCCATGGCATCCCTGATTCACGAC
CGCTTGAGGATGGAGATATAATCAACATTGATGTCACTGTTTATTTGAACGGCTATCACG
GTGATACCTCAGCTACTTTCTTCTGTGGTGATGTCGACGAGAAAGCTAAAAAGCTAGTTC
AGGTGACTAAAGAGTCTCTTGACAAAGCCATATCTATATGTGGTCCTGGTGTTGAGTACA
AGAAAATTGGCAAAATCATTCATGAGCATGCAGATAAGCATAAGTATGGAGTGGTTAGAG
AATTTGTAGGACACGGTATTGGACGTGTCTTCCATGCTGATCCTGTTGTTCTTCACTTTC
GGAACAATGAAGCTGGACGTATGGTCTTGAATCAAACCTTCACTATTGAACCAATGCTTA
CCATAGGAAGCAGAAAACCGGTTATGTGGGATGATAATTGGACCGTGGTAACAGAAGATG
CTAGCCTTTTTGCGCAATTCGAGCATACCATTCTTATTACCAAAGATGGAGCTGAGATTC
TAACCGACTGTTAAGAAAAAATTTGATTCTCAAATTGATCTTTTATTGGAATGTAACGCA
AAAAAGCCAACGTGGTATGTATGAAAACCATATTCATATATTCTGATATTCAAATATTCT
TTTGCGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DQ34TF U 1
AF RS1DQ34JQ C 593
BS 1 711 RS1DQ34TF
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TTCCCCATCTCTTCCGCTTCCATTCAGGAAGAAGGCATGTTTCGATGCAATTATCAAGAA
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GAAAA

QA 1 780 1 780
DS 

RD RS1DQ34JQ 615 0 0
TTCACGACCGCTTGAGGATGGAGATATAATCAACATTGATGTCACTGTTTATTTGAACGG
CTATCACGGTGATACCTCAGCTACTTTCTTCTGTGGTGATGTCGACGAGAAAGCTAAAAA
GCTAGTTCAGGTGACTAAAGAGTCTCTTGACAAAGCCATATCTATATGTGGTCCTGGTGT
TGAGTACAAGAAAATTGGCAAAATCATTCATGAGCATGCAGATAAGCATAAGTATGGAGT
GGTTAGAGAATTTGTAGGACACGGTATTGGACGTGTCTTCCATGCTGATCCTGTTGTTCT
TCACTTTCGGAACAATGAAGCTGGACGTATGGTCTTGAATCAAACCTTCACTATTGAACC
AATGCTTACCATAGGAAGCAGAAAACCGGTTATGTGGGATGATAATTGGACCGTGGTAAC
AGAAGATGCTAGCCTTTTTGCGCAATTCGAGCATACCATTCTTATTACCAAAGATGGAGC
TGAGATTCTAACCGACTGTTAAGAAAAAATTTGATTCTCAAATTGATCTTTTATTGGAAT
GTAACGCAAAAAAGCCAACGTGGTATGTATGAAAACCATATTCATATATTCTGATATTCA
AATATTCTTTTGCGC

QA 1 615 1 615
DS 



AS 1 2

CO CL7403Contig1 765 2 2 U
AGGAAAAAATTCGGATCTCTCTTATTAATCACTCTCGTTATTCTCCTTTCATCTGAGAGC
AACGTGAACATGGCGTCTGTTTCTGCTTTGGCAAAGTTTAAGTTGGTCTTCTTAGGAGAT
CAATCTGTGGGCAAAACAAGCATCATCACCCGTTTCATGTATGATAAATTCGACACCTCT
TACCAGCCTACCATTGGGATCGATTTTCTGTCCAAAACAATGTACCTCGAAGATCGAACT
GTTCGTTTGCAGCTTTGGGATACGGCTGGACAAGAAAGATTCAGGAGTCTGATCCCAAGT
TACATCAGAGACTCTTCTGTTGCAATCGTTGTCTATGATGTAGCCAATAGGCAAACGTTT
CTGAATATTCCGAAATGGATCGATGATGTACACAGAGAAAGAGGTGGTTCAGGCGACGTT
ATTATTGTCCTTGTTGGTAACAAAACTGATCTTGTTGATAAAAGACAAGTATTGATCAGT
GAAGGGGAAGAAAAGGGTAAAGAGCATGGCGTGATGTTCATTGAGACCAGCGCCAAAGAA
AATTTCAACATTAAGGCTTTGTTCAGGAAGATAGCTGCAGCATTGCCTGGGATGGATTCA
TATTCGTCGGCGACAAAATCAGATGATATGGTTGATGTGAACCTAAAGAACACTTCAAGT
TCATCACAAGGTGAGCAACAAGGAGGAGGTGGTGGAGGCGGCTGTTCTTGTTGATTCAAT
AAATTTATTTATAAAACATATTCCGTTTAAGACACTTGTGAAGCC


BQ
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AF RS1AJ73JQ C 1
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QA 1 765 1 765
DS 

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QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

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TCTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1AJ34TF U 8
AF RS1AJ34JQ C 1
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BS 8 779 RS1AJ34TF
BS 780 786 RS1AJ34JQ

RD RS1AJ34TF 778 0 0
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TCTCGC

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1H235TF U 1
AF RS1H235JQB C 225
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AGAGATAGAGAGACGACTGGTTCCAGGAACCAACCTCCTCCTGCGAGATCTGAGAAGAGT
AGTTTCTTCTCTTCTTCAGGGAGAAGTAGTAATGCTGCTCTTGCACTAACTCCATCTTTC
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CTTTCTTCGAGTGGTGGTGGACTCTATGGTTATGGAAGTTTCCCGGTGGGGAATAACAGT
TATGAATCTAACTCTTCATACTCATCCAGTAGATATGGAGGGTTGCCTCAGTCTACTACA
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TTGGACAACATAAGAAGGATATCAG*AGCTATGATAGAAATTTCTGATTCCAAATCTTCT
TCTCATGGTGATCGCATTGCTCT

QA 1 623 1 623
DS 

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ACTAACTCCATCTTTCATATCTTCTGTTCCGCAAGTTTCTTCTGTAGATTTTGATAGGAG
ACCAGAGCCAGGCACGCTTTCTTCGAGTGGTGGTGGACTCTATGGTTATGGAAGTTTCCC
GGTGGGGAATAACAGTTATGAATCTAACTCTTCATACTCATCCAGTAGATATGGAGGGTT
GCCTCAGTCTACTACAATGGAGATTCGAATCCCGTCCAATGCAGTGGGAAAAGTAATGGG
CAGAGGAGGAGGCAACTTGGACAACATAAGAAGGATATCAGGAGCTATGATAGAAATTTC
TGATTCCAAATCTTCTTCTCATGGTGATCGCATTGCTCTCATTTCCGGAACACCTGCACA
GAAGCGTACCGCAGAGAACTTGTTCCAAGCTTTTATCATGTCCACCTGAACAGTTTGCTT
GCTCTTGGCCCTCGAAATCCTCTTATCTATCCAAGGAAGTGTGTTCCTGTCTTTCTAGCT
CTCTCTCTCAATCCTTCCATCCATCAAGCTCATGTTTGAATAGGGTTGGATCTGTATTCT
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QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1AF58TF U 1
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BS 771 826 RS1AF58JQ

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QA 1 770 1 770
DS 

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TGATTTGGGTTGTCAATGTCCCAAGTTCACATGGTGTAATCAAAGGGAAGAAGGTCTCAT
ATGCAAAAAATTGGACAGATTCTTAGTAAATGAGACGTGGATGAATCAACGTACCCAAGC
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ATCTGGTTCGGTTAGTAGAAAGAAGCAGCAGAAGCGTTAGGTGTCATCGGAAGAAGAGGA
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QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 2

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1D439TF C 1
AF RS1D439JQ U 6
BS 1 11 RS1D439TF
BS 12 735 RS1D439JQ
BS 736 736 RS1D439TF

RD RS1D439TF 736 0 0
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TCCATTTTAAATAATAATCATCTTCTTACATGGGATGGGAGGAACAAACTTAGTATGGGA
ATTACAAAAACAAAGAAAAGGAACTAATGTTGGAGAATTGAGCAAACCAAACCCTTGCTG
TCCGTGCTTCTTCTGCATCCTCCACATCAAGCCAAAGAAAGAAAATAAAACAAGAAGAGG
GGAACTAAGAAAAGAGTTTTGAGGAAAGCAAAAGCTGATTGTATACTTTCACAGAAACTG
GATTTTTATGGTCGCACCAGAAATCCAATCCTTGGTATTGAACTGTTACTTTGTGTCTAA
GCCTGAGCAACTAAAAACATAGGGCGTCCTTGATCAATTGCTTTTATCAGTGGTAGGTGC
CAAGTTCAACTCCTGCATCTGTGTCTCAACTGGTACTAACCCTGTCTGAGCGAGAAACCA
ATTGAGGAGGACAAAGAGAGAAGATGCGATTAGAATGAGGAAGCCAACGTGAACAAGTAA
CATGGATTGGCCGCTGGTGAAAGCTATGGAGAGCATGAAAGTGAGACAGAGACCCAGCAG
AAGAAACGCGAACCTCAGAGTGTTCCATGTTGGAGCATTGACGCCTGGAGCTAGAGCTCC
GAGAAGAACAGCTTCCGTTGACGAAATCTCTGATTTTTGCTTCTTCTTCTCCTCCATCTT
TTTCTTTCTTCCTTCC

QA 1 736 1 736
DS 

RD RS1D439JQ 730 0 0
GCAAGT
TCATTGGATCTTAACTGAGGGATGTATTTGAGTTAAGATTACCCTTGAATCCATTTTAAA
TAATAATCATCTTCTTACATGGGATGGGAGGAACAAACTTAGTATGGGAATTACAAAAAC
AAAGAAAAGGAACTAATGTTGGAGAATTGAGCAAACCAAACCCTTGCTGTCCGTGCTTCT
TCTGCATCCTCCACATCAAGCCAAAGAAAGAAAATAAAACAAGAAGAGGGGAACTAAGAA
AAGAGTTTTGAGGAAAGCAAAAGCTGATTGTATACTTTCACAGAAACTGGATTTTTATGG
TCGCACCAGAAATCCAATCCTTGGTATTGAACTGTTACTTTGTGTCTAAGCCTGAGCAAC
TAAAAACATAGGGCGTCCTTGATCAATTGCTTTTATCAGTGGTAGGTGCCAAGTTCAACT
CCTGCATCTGTGTCTCAACTGGTACTAACCCTGTCTGAGCGAGAAACCAATTGAGGAGGA
CAAAGAGAGAAGATGCGATTAGAATGAGGAAGCCAACGTGAACAAGTAACATGGATTGGC
CGCTGGTGAAAGCTATGGAGAGCATGAAAGTGAGACAGAGACCCAGCAGAAGAAACGCGA
ACCTCAGAGTGTTCCATGTTGGAGCATTGACGCCTGGAGCTAGAGCTCCGAGAAGAACAG
CTTCCGTTGACGAAATCTCTGATTTTTGCTTCTTCTTCTCCTCCATCTTTTTCTTTCTTC
CTTC

QA 7 730 7 730
DS 



AS 1 2

CO CL7408Contig1 301 2 2 U
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AAGCGTAGTGATCTGCAGGAAACCGAAGATCGATATCTTCTTGTATCCTCATACATCCAT
TGCTGAAATTGGAGCTCTCTCTTTTCACCGGATACACCTGTCTCCCAAACAGAGTGACTG
TAGTAGTACCGATTGGATTATGCTTAGACGTCTCTTTATATGATACAACATGTTTCTGTG
ACAACACTTCTTCTTTGGACAAACCGAAGAAATACATGGCGTCTCCCTTTAACTAACCGT
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1F476TF C 1
AF RS1F476JQ U 96
BS 1 95 RS1F476TF
BS 96 301 RS1F476JQ

RD RS1F476TF 247 0 0
TTTTGGGGTTTCTCTTGCCACTCCAGCTTGTGGCTAACGCTTCTTCTTTCTCCTCATTAC
AAGCGTAGTGATCTGCAGGAAACCGAAGATCGATATCTTCTTGTATCCTCATACATCCAT
TGCTGAGATTGGAGCTCTCTCTTTTCACCGGATACACCTGTCTCCCAAACAGAGTGACTG
TAGTAGTACCGATTGGATTATGCTTAGACGTCTCTTTATATGATACAACATGTTTCTGTG
ACAACAC

QA 1 247 1 247
DS 

RD RS1F476JQ 206 0 0
TCTTCTTGTATCCTCATACATCCATTGCTGAAATTGGAGCTCTCTCTTTTCACCGGATAC
ACCTGTCTCCCAAACAGAGTGACTGTAGTAGTACCGATTGGATTATGCTTAGACGTCTCT
TTATATGATACAACATGTTTCTGTGACAACACTTCTTCTTTGGACAAACCGAAGAAATAC
ATGGCGTCTCCCTTTAACTAACCGTG

QA 1 206 1 206
DS 



AS 1 2

CO CL7409Contig1 807 2 2 U
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CCAATGGGCAATCATTTGCTCACTTTGTCTCTCCTCCTCGTGATTGTCTGCGTTTGCGTT
TCCATCATCACCACCAAGCTAAACCCTAAAGAAGCAATCGTATCTCCCTCCGATTCAAAT
CCCATCGAGATTCACGGAGTCAAGATCCTCCGACAACCTTCCGTTTCCAAACTTGCTCAA
CTAGGCGTCGCCTCTTGGCCCAAGTCGGTTCCTTTCCTTTTACCCTTCTGTTTAGTTATG
TCTTAAAGATTCTTCGTAATGCATTTTAGACATTTTGGTGAACTGGGCAGGTGGGAAGGT
GGTCCAAGCAAGTTTCCATGGACGTTTAAGAAGACAGAGACGATGTATTTCGTGGAAGGC
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GGAGATGTGGTTGTTTTCCCTAAAGATATGAAAGTTGTTTGGGAGATAACTGAAGCTGTC
AAGAAACACTACAACTTAGAGGATTAGTGTAACCTCATTCTGTGGAAAGATAAGTTGTGT
CCTTGTCGTTTAAGTTTGTTGCATGTCTGGTTTTTAGTTTGGAACTAGCTTTATCTAATG
GTGTCCGAAAAGCTTGTTCTTTTATATTTATTATTACCAATCTGAACCGGAAAGCAAACC
GGGAAATCATTTAGGACGTGTTTGTATTGATGAGTGATAAGTTGTTTCCAGTTTCAATTA
AAAACATCAGAGCATTTTACATGGCAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EH21JQ C 1
AF RS1EH21TF U 1
BS 1 783 RS1EH21TF
BS 784 807 RS1EH21JQ

RD RS1EH21JQ 807 0 0
GGGCTGCAGTTGCTTGCTGTAAACTTCGGCTTCTCT*CCAGTAAACAGAGTTTGCGAAAT
CCAATGGGCAATCATTTGCTCACTTTGTCTCTCCTCCTCGTGATTGTCTGCGTTTGCGTT
TCCATCATCACCACCAAGCTAAACCCTAAAGAAGCAATCGTATCTCCCTCCGATTCAAAT
CCCATCGAGATTCACGGAGTCAAGATCCTCCGACAACCTTCCGTTTCCAAACTTGCTCAA
CTAGGCGTCGCCTCTTGGCCCAAGTCGGTTCCTTTCCTTTTACCCTTCTGTTTAGTTATG
TCTTAAAGATTCTTCGTAATGCATTTTAGACATTTTGGTGAACTGGGCAGGTGGGAAGGT
GGTCCAAGCAAGTTTCCATGGACGTTTAAGAAGACAGAGACGATGTATTTCGTGGAAGGC
AAGATCAAAGTGAACGTTGACGGATATGACAGAGAAGAAGATGTCTTTGAGATAGGGAAA
GGAGATGTGGTTGTTTTCCCTAAAGATATGAAAGTTGTTTGGGAGATAACTGAAGCTGTC
AAGAAACACTACAACTTAGAGGATTAGTGTAACCTCATTCTGTGGAAAGATAAGTTGTGT
CCTTGTCGTTTAAGTTTGTTGCATGTCTGGTTTTTAGTTTGGAACTAGCTTTATCTAATG
GTGTCCGAAAAGCTTGTTCTTTTATATTTATTATTACCAATTTGAACCGGAAAGCAAACC
GGGAAATCATTTAGGACGTGTTTGTATTGATGAGTGATAAGTTGTTTCCAGTTTCAATTA
AAAACATCAGAGCATTTTACATGGCAG

QA 1 807 1 807
DS 

RD RS1EH21TF 783 0 0
GGGCTGCAGTTGCTTGCTGTAAACTTCGGCTTCTCTTCCAGTAAACAGAGTTTGCGAAAT
CCAATGGGCAATCATTTGCTCACTTTGTCTCTCCTCCTCGTGATTGTCTGCGTTTGCGTT
TCCATCATCACCACCAAGCTAAACCCTAAAGAAGCAATCGTATCTCCCTCCGATTCAAAT
CCCATCGAGATTCACGGAGTCAAGATCCTCCGACAACCTTCCGTTTCCAAACTTGCTCAA
CTAGGCGTCGCCTCTTGGCCCAAGTCGGTTCCTTTCCTTTTACCCTTCTGTTTAGTTATG
TCTTAAAGATTCTTCGTAATGCATTTTAGACATTTTGGTGAACTGGGCAGGTGGGAAGGT
GGTCCAAGCAAGTTTCCATGGACGTTTAAGAAGACAGAGACGATGTATTTCGTGGAAGGC
AAGATCAAAGTGAACGTTGACGGATATGACAGAGAAGAAGATGTCTTTGAGATAGGGAAA
GGAGATGTGGTTGTTTTCCCTAAAGATATGAAAGTTGTTTGGGAGATAACTGAAGCTGTC
AAGAAACACTACAACTTAGAGGATTAGTGTAACCTCATTCTGTGGAAAGATAAGTTGTGT
CCTTGTCGTTTAAGTTTGTTGCATGTCTGGTTTTTAGTTTGGAACTAGCTTTATCTAATG
GTGTCCGAAAAGCTTGTTCTTTTATATTTATTATTACCAATCTGAACCGGAAAGCAAACC
GGGAAATCATTTAGGACGTGTTTGTATTGATGAGTGATAAGTTGTTTCCAGTTTCAATTA
AAA

QA 1 783 1 783
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7411Contig1 1478 2 2 U
GCGAGGTGGGCCTCGAGGTCCCAAGTCTCTTTGTAACGCATGTGGCATAAGACAAAGAAA
GGCGAGGCGCGCCGCAATGGCTGCAGCCACAGCTACGGGCGACCAAGAGGTGGCGGCGGC
ACGGATGCAACATTTATCGGTGAAAAAGAAGTTGCAAAACAAGAAAAAACGATCAAATGG
AGGAGACAAATACAATAATACTCTCCCTGTAGTAGCCGATACAAAAAAGTGCAAGATCAA
CGAAGGAGAGGAGGACGCGACCACGGTTGGTGGAGATTCTGAAATCAGTAAATCAACAAC
TTCATCTGATTCTTCAGTTTCTTCCAACAAACTTTGCTTCGATGACTTGACGATAATGTT
GAGCAAAAGCTCAGCTTATCAACAAGTGTTCCCACAAGATGAGAAGGAAGCTGCTGTTTT
GCTCATGGCTTTGTCGTATGGAATGGTGCATGGATGATCAAATAATGACAAAATCTTCTG
ACGACAAAAGGTGGTTAATTTTATAATAATATATACATAGTAATCAAAATAATGATAGAT
TTTTGAATCTTGGAGAGATTCATATGGTTTTTGCAAGTTGGTCTAATATGAGAAGCCTAA
ACATTATTTAATAAGAATGTATGAGAGATTAATATAATAATTAATAGCTCTATATACATG
TTTTGGGAGATTTTGGTTTAGTGTTTACTAGGGTAAACCCGCCCTACGGACGGGCGTGTA
AATACATTTTTAATATAATATATAAAATGTTTACTTTACTTTTAACTAATATTAGTACCA
AAGTGCTTAATGCTTTTACAAAAGTTTTAACTATTCATTTAGAAAAAATATAGATTTGTC
TAACTATAATGAAATATTGAAAATACAATTATATAGTTTCTCTCGGTGTTTATTTAAATT
AATTTAACTATACCAATAAGTCTCATTTTTTTAAAGTACATACAATTGAAGTAAGTAGAA
TGAAGTTATTTTCTCTCGTAGTTATGGAGAAGGTTCTCCAAGTGTGTACCAAGATGATTA
AAAGACAAAGTGAAATCATGATCATCGATCTTGCAAATTAGAATCTTGAAGGAAGATATA
ATCATTCTGGGTATGTCACAACTATAACGGATTGCGGTTGAAGGATCAGTTAGTTAGTGT
ATAATCGAGTTGATGAGTGTGTCAATACCATGGTAATATTTGGTTTGAATATGTTTGAGA
TTCGTATAGTATTCCGTAGGAGTTTTTTTCTTGAACAACCGCCGTATAAGTTCAGAATGT
TTATTTTGAGTCTGTATTACCTAGGGCCGTAAGGAGCATTGGATTATTAAGTGTGTTTAA
GTGTTAATATTTTGGGTCATCCATTGTGTGTGATCGTTTGTTGTAGTTGAAAATTATGTT
GTTAAAAAAATTCCCCTTGTTCGGTGGTCTGATTGATTACTTGTTTGTCAAAGGATTAGA
TACTTTTATTTATAAAAAAGATCCATGTGTTGCTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CR51TF U 1
AF RS1CR51JQ C 747
BS 1 809 RS1CR51TF
BS 810 1478 RS1CR51JQ

RD RS1CR51TF 809 0 0
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GGCGAGGCGCGCCGCAATGGCTGCAGCCACAGCTACGGGCGACCAAGAGGTGGCGGCGGC
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AGGAGACAAATACAATAATACTCTCCCTGTAGTAGCCGATACAAAAAAGTGCAAGATCAA
CGAAGGAGAGGAGGACGCGACCACGGTTGGTGGAGATTCTGAAATCAGTAAATCAACAAC
TTCATCTGATTCTTCAGTTTCTTCCAACAAACTTTGCTTCGATGACTTGACGATAATGTT
GAGCAAAAGCTCAGCTTATCAACAAGTGTTCCCACAAGATGAGAAGGAAGCTGCTGTTTT
GCTCATGGCTTTGTCGTATGGAATGGTGCATGGATGATCAAATAATGACAAAATCTTCTG
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TTTTGAATCTTGGAGAGATTCATATGGTTTTTGCAAGTTGGTCTAATATGAGAAGCCTAA
ACATTATTTAATAAGAATGTATGAGAGATTAATATAATAATTAATAGCTCTATATACATG
TTTTGGGAGATTTTGGTTTAGTGTTTACTAGGGTAAACCCGCCCTACGGACGGGCGTGTA
AATACATTTTTAATATAATATATAAAATGTTTACTTTACTTTTAACTAATATTAGTACCA
AAGTGCTTAATGCTTTTACAAAAGTTTTA

QA 1 809 1 809
DS 

RD RS1CR51JQ 732 0 0
ATGTTTACTTTACTTTTAACTAATATTAGTACCAAAGTGCTTAATGCTTTTACAAAAGTT
TTAACTATTCATTTAGAAAAAATATAGATTTGTCTAACTATAATGAAATATTGAAAATAC
AATTATATAGTTTCTCTCGGTGTTTATTTAAATTAATTTAACTATACCAATAAGTCTCAT
TTTTTTAAAGTACATACAATTGAAGTAAGTAGAATGAAGTTATTTTCTCTCGTAGTTATG
GAGAAGGTTCTCCAAGTGTGTACCAAGATGATTAAAAGACAAAGTGAAATCATGATCATC
GATCTTGCAAATTAGAATCTTGAAGGAAGATATAATCATTCTGGGTATGTCACAACTATA
ACGGATTGCGGTTGAAGGATCAGTTAGTTAGTGTATAATCGAGTTGATGAGTGTGTCAAT
ACCATGGTAATATTTGGTTTGAATATGTTTGAGATTCGTATAGTATTCCGTAGGAGTTTT
TTTCTTGAACAACCGCCGTATAAGTTCAGAATGTTTATTTTGAGTCTGTATTACCTAGGG
CCGTAAGGAGCATTGGATTATTAAGTGTGTTTAAGTGTTAATATTTTGGGTCATCCATTG
TGTGTGATCGTTTGTTGTAGTTGAAAATTATGTTGTTAAAAAAATTCCCCTTGTTCGGTG
GTCTGATTGATTACTTGTTTGTCAAAGGATTAGATACTTTTATTTATAAAAAAGATCCAT
GTGTTGCTTGTC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AAGACAAAATCTCAAAGTGAACAACAGAAGTTAATATAGGTTCACATACAATGACCAAAC
TCAGAGATAGATCATTCAGGGAAAGAGATGTCTAGTTGTTTAATTACCGTATACATACAT
ATACATGTGGATTGATGCATGTACTGTGTACATGTATTTGTGTGTTTATAATGTAGGAGG
GATCCAGATGTAGCCATGAGTTTGAAGGTAACCAGCTTTCTCCAGTAACTGATCAGCTTC
TTTTGGTCCTCGGCTTCCTGGTTTGTATGGGATTGACTTCACTTCTCCTTTGTCAATCCT
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CTGTTGATCACCTTTAATTGTGTCAAGAATTAAGCGCTCGTATGCCTCCGGGATGGAGAC
ACCTTGATAAAGTTGTCCGTATGACAAG


BQ
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AF RS1DQ43JQ U 249
AF RS1G405JQ U 1
BS 1 396 RS1G405JQ
BS 397 397 RS1DQ43JQ
BS 398 508 RS1G405JQ

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AGGGTGTAAATATCTCCCACGCAACCTTCAGTTCGTCTCTGCGAACGAAATGCTGTTGAT
CACCTTTAATTGTGTCAAGAATTAAGCGCTCGTATGCCTCCGGG

QA 1 224 1 224
DS 

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AAGACAAAATCTCAAAGTGAACAACAGAAGTTAATATAGGTTCACATACAATGACCAAAC
TCAGAGATAGATCATTCAGGGAAAGAGATGTCTAGTTGTTTAATTACCGTATACATACAT
ATACATGTGGATTGATGCATGTACTGTGTACATGTATTTGTGTGTTTATAATGTAGGAGG
GATCCAGATGTAGCCATGAGTTTGAAGGTAACCAGCTTTCTCCAGTAACTGATCAGCTTC
TTTTGGTCCTCGGCTTCCTGGTTTGTATGGGATTGACTTCACTTCTCCTTTGTCAATCCT
GTGCAGCAACGGTGTAAATATCTCCCACGCAACCTTTAGTTCGTCTCTGCGAACGAAATG
CTGTTGATCACCTTTAATTGTGTCAAGAATTAAGCGCTCGTATGCCTCCGGGATGGAGAC
ACCTTGATAAAGTTGTCCGTATGACAAG

QA 1 508 1 508
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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ACCCTGCTTTGCTTGCTGGGAATTGGACGCAACTCTGTGCAACATGCAAGATTATCAGAC
CTGTTCGAGCTAAGCACTGTTCCACCTGTGATCGTTGTGTAGAGCAATTTGATCACCATT
GTCCTTGGGTGTCAAACTGTGTCGGAAAAAAAAAAACAAGTGGGACTTTTTTCTTTTTCT
TCTGTTTGAAGTACTAGCGATGCTGATAACTGGTGGCGTCACTCTTGCAAGAGTCTTGAG
TGACCCTTCAGCTCCATCTTCGTTTGGAACATGGATTAGCTATCTCGCTAGCAATCACGT
TGGTGCGTTATCCTTTCTGGTTGTGGAGTTCTGCCTCTTCTTCTCAGTTGCTGTCTTAAC
TGTCATACAAGCGTCTCAGATATCGAGGAATATAACCACAAACGAAATGGCTAACGCACT
GCGCTACAGCTACCTAAGAGGTCCAGGAGGTGGCTTCAGGAATCCATACGATCACGGTTG
CAAAAGAAACTGCTCGGATTTCTTGGTGAAAGGTTATAACGAAGATATCGAGTGTCATGA
AGAAGACACAACAACACCGAGGCAAGAAAGTATCAGCATGATGCAGATGCAGCGGGGTTC
TAATACTCAAAACGGCAATGGCCACGTTGCTATCGATGTCAACCCGATACATAAATCTCA
GTCAGCACATGTTCATTCTTCCAACTGCAGCCATAAACCATAGCAGTAAGTAAGTCATAG
AGTGATTTGCCGGAACCCAACTCCGACCTGTTGTACCTCCATGATATATTTATATGGTCG
CGTGCCAAATGTTCTTTTAAATCAAATGTGCATTTGTGTTGTAAGAATCACGTTTGTCCT
CTTGTTGAGTTTTAATAACATCTCATTTCAAGGC


BQ
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AF RS1FT84TF U 1
AF RS1FT84JQ C 187
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BS 704 934 RS1FT84JQ

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TCTGTTTGAAGTACTAGCGATGCTGATAACTGGTGGCGTCACTCTTGCAAGAGTCTTGAG
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DS 

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CACAACAACACCGAGGCAAGAAGGTATCAGCATGATGCAGATGCAGCGGGGTTTTAATAC
TCAAAACGGCAATGGCCACGTTGCTATCGATGTCAACCCGATACATAAATCTCAGTCAGC
ACATGTTCATTCTTCCAACTGCAGCCATAAACCATAGCAGTAAGTAAGTCATAGAGTGAT
TTGCCGGAACCCAACTCCGACCTGTTGTACCTCCATGATATATTTATATGGTCGCGTGCC
AAATGTTCTTTTAAATCAAATGTGCATTTGTGTTGTAAGAATCACGTTTGTCCTCTTGTT
GAGTTTTAATAACATCTCATTTCAAGGC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1C544JQ U 52
AF RS1C544TF C 1
BS 1 51 RS1C544TF
BS 52 416 RS1C544JQ
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ATACTTCTCCCTCCAAGTATAAACTAGGAAGAACACCCAAGAAACAGCCAAAGTAATATC
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TCTCCACAGAGCCATAAGCACATAGAGAACCACAGACCCTCCGGCGAAGAAGCCATGAAA
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ACCGG

QA 1 365 1 365
DS 

RD RS1C544TF 533 0 0
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CTTCTGACAACTATGAAACTGACAATAGTATGATCTACACAAAGCTAGTGGTTCTCTTAA
ATCTCCAGTTTTGCATAAAAGCCCTCATCTTTTTTTTAGCATCAATCAATCATACTTCTC
CCTCCAAGTATAAACTAGGAAGAACACCCAAGAAACAGCCAAAGTAATATCTCCAAGCGC
TTGCTTAGGACACTCAAACGCAAGATCTTCGATCTTCCACTCAAACACAACTCTCCACAG
AGCCATAAGCACATAGAGAACCACAGACCCTCCGGCGAAGAAGCCATGAAACTCTCTATC
CTTAACAAAGGACACCATGAGCAGCACCAGACCGATGGCAAAGAGGAGCAAACCGGAGAA
AGACTGAGAGATCTGGATGAGCAGCTCGTCGTGAGGCGTTGAGCCTTTGAGCTTGTTGGC
TATGTCGCTGCCGTGGCCAAAGATGGATGCTTTCTCCGTGTAGAACATCATCC

QA 1 533 1 533
DS 



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TCAAAGATGGTGGACAGAGAATTCCGACAAGGCCATGGAGTTATACAACGTGAAGCAGTT
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AATCGGATACTCTTCATCTGACTCACTTGATCAGCAACCAATCCAAACGCCAAAACGTTA
CGACTCTGCTGGTCTTGCTTCAACACCAAAGCTCTCTGGCATCAGTGGGACCAAGACTGA
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GATTCAAAAGCAGTACTTGTGACTTGATAGAATTTACTAAACACTTTCTTTCTCTTTATG
GGATAAAACATACTTTCTTGTCTTTTAAACCTTGAACAAAAACAAGTGATTAGACAAAGT
TTATGCGATTTGATTTAATTCATGTTTAGAAACCTACTTGCAGCAATAACAAAATGGATG
TATTCTGTCTTTACCATGTATAAAATTGTTTTTATTAGC


BQ
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AF RS1DZ92TF U 1
AF RS1DZ92JQ C 57
BS 1 695 RS1DZ92TF
BS 696 698 RS1DZ92JQ
BS 699 725 RS1DZ92TF
BS 726 819 RS1DZ92JQ

RD RS1DZ92TF 725 0 0
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TCAAAGATGGTGGACAGAGAATTCCGACAAGGCCATGGAGTTATACAACGTGAAGCAGTT
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AATACAGTCGGCTAAGGATAGCCCTGTAACTCCACCTATGAACAATGAGCAACCTCGAGG
AATCGGATACTCTTCATCTGACTCACTTGATCAGCAACCAATCCAAACGCCAAAACGTTA
CGACTCTGCTGGTCTTGCTTCAACACCAAAGCTCTCTGGCATCAGTGGGACCAAGACTGA
GACGTCGTCTATTGATGGTGGTTCTGTAAGAAGTAGCTCAGCAGATGAGGGTTCCGAGGA
GGTATCGGTGAGCAACGCAAGCGACACGGAGACTGAATGGGTGGAACAAGACGAGCCTGG
TATCTACATTACAATCAGAGCTTTACCAGATGGTAGCCGTGAGCTTAAACGTGTTCGGTT
CAGCCGAGACAAGTTTGGGGAAACACTTGCGAGGGTGTGGTGGGAACAGAACAGAGCGAG
GATTCAAAAGCAGTACTTGTGACTTGATAGAATTTACTAAACACTTTCTTTCTCTTTATG
GGATAAAACATACTTTCTTGTCTTTTAAACCTTGAC**AAAACAAGTGATTAGACAAAGT
TTATG

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1DZ92JQ 763 0 0
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AGTTCAACCAGGAGAGCGAGGAGCCACTCCCAACCCCTCCCGCATCTGAAGATGGGGGCT
CGCAAATACAGTCGGCTAAGGATAGCCCTGTAACTCCACCTATGAACAATGAGCAACCTC
GAGGAATCGGATACTCTTCATCTGACTCACTTGATCAGCAACCAATCCAAACGCCAAAAC
GTTACGACTCTGCTGGTCTTGCTTCAACACCAAAGCTCTCTGGCATCAGTGGGACCAAGA
CTGAGACGTCGTCTATTGATGGTGGTTCTGTAAGAAGTAGCTCAGCAGATGAGGGTTCCG
AGGAGGTATCGGTGAGCAACGCAAGCGACACGGAGACTGAATGGGTGGAACAAGACGAGC
CTGGTATCTACATTACAATCAGAGCTTTACCAGATGGTAGCCGTGAGCTTAAACGTGTTC
GGTTCAGCCGAGACAAGTTTGGGGAAACACTTGCGAGGGTGTGGTGGGAACAGAACAGAG
CGAGGATTCAAAAGCAGTACTTGTGACTTGATAGAATTTACTAAACACTTTCTTTCTCTT
TATGGGATAAAACATACTTTCTTGTCTTTTAAACCTTGAACAAAAACAAGTGATTAGACA
AAGTTTATGCGATTTGATTTAATTCATGTTTAGAAACCTACTTGCAGCAATAACAAAATG
GATGTATTCTGTCTTTACCATGTATAAAATTGTTTTTATTAGC

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

CO CL7418Contig1 1243 2 2 U
GCTTCCGGATGGCCAGCAATAGGTCGCACACCTGTTGTACAAGCACCTAGCGCTTCAGCC
CAATCTAGGTCCCATGCCAGAGTTGCGCAGCCCAGACCTCCTAGCTATGCGGTTCCGCAG
GCTGCTCGTAATGGAAATATGATTCCTCACTCATCCTCAGCCCCTAATCTATCTGATACG
AGATCACTTAATTCAGATTTTCCTCCTGTTTCTGCTGCTGCTCGCAAGACACCAACATCC
ACCATCACACAGGGAACTTCAAACTCCCAACCACCACCACCTCCAGATGTGCAATCTGCG
AACAAGTCATTGGTTGAGAAAATGAGAGCTGCACTTGGTCATGATGAAGATTTGTTTATG
ACCTTCAAAGATGTATCAGGACAGTATCGTCAAGGTTCGATTGATGCAAGAACTTACTTG
GAGTATGTGAAAGGTTATGGATTGTCGCACTTAGTTATTGATCTAGCTAGACTCTGCCCT
GACCCTAGAAGGCAGAAGGAACTCATTGATGCTCACACTGCCAGTTTGAGAAACGAAGCA
AAAGACAACAATGGTCAAGCTGCTGCTACTGCTGCAGGGCAGAGTTCGTCGTCTCAAGCT
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GCAGATGACTTTATGGAGACAGTGAGGAGATTGCAATCCTCTCAGAATTTTCATGAAGAA
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GAGTCTTCTTCAACCGGAAGCAAGCAGCAGCGTAAGAAAACCTCAAAGTTTCACAGAGTA
AGGCTTGGTGACGGATCAATGGCAGCATTGCTAAATGTCAACTCTTCTTACCATGAACCG
GAATCAAAAGATGACAATAACAATAGTAGTGACCAGAATCAAACCGGTGTACGTGGTGTT
TGGCGTAAAGGAGGTGCACAACTTTTCAACTAGAGATTCAAATCTGTCTTGGCTTTTTCT
GAAAGATGACCAAGTGGAAGATAATTATGTACAAGCTTGACTGGCCGCACATTTTTATGT
CAGTGTCAAGGAGAGCATTTTTGAGTAAGTTTTATGAATGATGGACGCGTTTTGTTACTT
CTGTGTTTTTTGTTTTCTTCGACGTTTTTGGTATGTTTGGTATTTTCCTTATTTTCTTGG
AGGGACTTAAAAAGAACGAAACTGTGATAATTAAATATTTGGC


BQ
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AF RS1B291TF U 1
AF RS1B291JQ C 491
BS 1 612 RS1B291TF
BS 613 1243 RS1B291JQ

RD RS1B291TF 612 0 0
GCTTCCGGATGGCCAGCAATAGGTCGCACACCTGTTGTACAAGCACCTAGCGCTTCAGCC
CAATCTAGGTCCCATGCCAGAGTTGCGCAGCCCAGACCTCCTAGCTATGCGGTTCCGCAG
GCTGCTCGTAATGGAAATATGATTCCTCACTCATCCTCAGCCCCTAATCTATCTGATACG
AGATCACTTAATTCAGATTTTCCTCCTGTTTCTGCTGCTGCTCGCAAGACACCAACATCC
ACCATCACACAGGGAACTTCAAACTCCCAACCACCACCACCTCCAGATGTGCAATCTGCG
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ACCTTCAAAGATGTATCAGGACAGTATCGTCAAGGTTCGATTGATGCAAGAACTTACTTG
GAGTATGTGAAAGGTTATGGATTGTCGCACTTAGTTATTGATCTAGCTAGACTCTGCCCT
GACCCTAGAAGGCAGAAGGAACTCATTGATGCTCACACTGCCAGTTTGAGAAACGAAGCA
AAAGACAACAATGGTCAAGCTGCTGCTACTGCTGCAGGGCAGAGTTCGTCGTCTCAAGCT
CAAGAGAGTAAG

QA 1 612 1 612
DS 

RD RS1B291JQ 753 0 0
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ATGGTCAAGCTGCTGCTACTGCTGCAGGGCAGAGTTCGTCGTCTCAAGCTCAAGAGAGTA
AGAAAAACAAAGGGAAAGCTGTGAAGGTTGTTGATCCAAAAGAAGCAGTAGCAGATGACT
TTATGGAGACAGTGAGGAGATTGCAATCCTCTCAGAATTTTCATGAAGAAGAAGAGGTAA
TATCGAAAGATAAGAATGAATACAGGTCTGACAAAGGCAAATCGAAAGTGGAGTCTTCTT
CAACCGGAAGCAAGCAGCAGCGTAAGAAAACCTCAAAGTTTCACAGAGTAAGGCTTGGTG
ACGGATCAATGGCAGCATTGCTAAATGTCAACTCTTCTTACCATGAACCGGAATCAAAAG
ATGACAATAACAATAGTAGTGACCAGAATCAAACCGGTGTACGTGGTGTTTGGCGTAAAG
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CAAGTGGAAGATAATTATGTACAAGCTTGACTGGCCGCACATTTTTATGTCAGTGTCAAG
GAGAGCATTTTTGAGTAAGTTTTATGAATGATGGACGCGTTTTGTTACTTCTGTGTTTTT
TGTTTTCTTCGACGTTTTTGGTATGTTTGGTATTTTCCTTATTTTCTTGGAGGGACTTAA
AAAGAACGAAACTGTGATAATTAAATATTTGGC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL7419Contig1 827 2 2 U
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TGGTCGATGACGAAGATTTGTCAGTCAGAGAAGTTGCTCTTTCGCTGATATCTGAAATGC
TAAAGAGCCAGAAAGATGCCTTGGAAGATTCGGTTGAGATAGTGATTGAGAAGCTGCTTC
ATGTCTCGAAGGACTCTATTCCAAAAGTTTCCAGTGAAGCTGAGCAATGTTTGACCACGG
TTTTGTCCCAATATGATCCTTTCAGATGCTTAAGTGTTATTGTGCCACAATTGGTTACAG
AAGATGAGAAAACTCTCGTCGCTTGCATCAATTGCTTAACTAAGCTTGTGGGTAGGCTCT
CGCAAGAGGAACTAATGGATCAGTTGTCTTCTTTCTTGCCTGCGGTTTTCGAAGCATTTG
GGAACCAAAGTGCAGATGCCCGAAAGACAGTGGTGTTCTGTCTGGTAGACATATATATAA
TGCTTGGGAAAGCATCCTTGCCGTATTTGGAAGGTCTAAACAGCACACAGGTTCGCCTAG
TGACCATCTACGCAAACAGGATCTCACAGGCTAGAACCGGTGCCCCTATCGACCCAGACA
CCTAACGAGCCACTTTGTGCTCGTGGTTCATTGGTTTTCCCCTCGCGTCTTTGGGGGGTT
TTATATTCATTAAATATTGTTCATTTTGTATATGGGTACGTGTGCGTCTTGTGTTTCTTG
TGATATCTTTGCTGTAATTTTGCAAGTTGTGGTTTTTCTTCTAATCC


BQ
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AF RS1CW30TF U 1
AF RS1CW30JQ C 50
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BS 643 827 RS1CW30JQ

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DS 



AS 0 0

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CC


BQ
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20 20 

AF RS1AX31TF C 1
AF RS1AX31JQ U 4
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BS 4 722 RS1AX31JQ

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CTTGGGCTTGGCAATGGATGGGATGTTGGTTAACTTCGGAGAAGAAAAATCAGCGCTAGT
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CATTAGCTTCTCCTCTGTGAAATCACCCTTCTTCGTCAACCGGTTCTGGGAGAGTCTGAT
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CC

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DS 

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TATATAATTCGTTTAAAGAAAAATGAAGAAACAGAGGAATTTTATTTATTTCTTTTTCTT
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QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 2

CO CL7422Contig1 769 2 2 U
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BQ
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AF RS1GW95TF U 1
AF RS1H539TF U 1
BS 1 718 RS1GW95TF
BS 719 769 RS1H539TF

RD RS1GW95TF 726 0 0
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CAAATATGTTGACTACTGTTGAGGCTGAAGGTGGACTTCCGAGTCTTCCACGTTTGAGGT
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CAAATGCTGATGGTCTTAGAACCTTAAGAGCATATGAAGCTCGTTCTCATGAAGTTGTAT
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TGGTGTTGGCGTTCTGGCTCTGGGAGCAAATGGTGTCCAAAGACTATGGAAGTGGAGC
GCATGAGC

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1H539TF 769 0 0
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AGAGGACTTATGTAGGCTTTAGGAAGAAATCAAACGGAGTTGTTCAGTTTGATACAACTC
GTAACCGTTTCTTGGCTGTTGGTGAAGACAATCAAGTCAAATTCTGGGACATGGATAATA
CAAATATGTTGACTACTGTTGAGGCTGAAGGTGGACTTCCGAGTCTTCCACGTTTGAGGT
TCAACAAGGAAGGAAATCTTCTTGCAGTTAGTACAGCGGATAACGGATTCAAGATCCTTG
CAAATGCTGATGGTCTTAGAACCTTAAGAGCATATGAAGCTCGTTCTCATGAAGTTGTAT
CATCTAAAGCATCCATTGAGATGAAGGTATCAACTTCCGCAATGGTATCAAGCATGAGCC
CAGCTGTTGGTAAAATTGAACACATGGACACAAGCTCTCCTGCAAGGCCCACACCAATTC
CTAATGGAATTGAGGCAATGTCAAGAAGTGTAGAAAAGCCAAGAAACTTAGAATCTGTTG
TTGATAAGACTAAACCCTTGGACCTAACAGAGATTGTCGATCCCACTCAGTGCAGACAAG
TGACCATGCCAGATAGCAAGGATTCTGTAAGCAAGTTGCTCGGCTTCTTTATACAAATTC
TGGTGTTGGCGTTCTGGCTCTGGGAGCAAATGGTGTCCAA*GACTATGGAAGTGGAGCCG
CATGAGCAGATCCTACTGGGAAGCGACTGCTAGTGTACTCCACAGCATG

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

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GCAACAAGAAGCGGAAGGCCAAGGCTTCTGAGCAAGACGGTGTACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AH12TF U 1
AF RS1AH12JQ C 66
BS 1 777 RS1AH12TF
BS 778 826 RS1AH12JQ

RD RS1AH12TF 791 0 0
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TGGATGTTGCTGAAATGGGGTCAGAAGAGTCTTCTGACTATGATAGTGAAGATGATGACG
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AAGAGAAGCCTGCCGAAGATAAAAAGACTAAACGATCAAAGAAGAAGAGTCAAGCTACCA
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TTGAGAGCGAAGATGAAGATGGTCTTCCTATTCCCAAAGAGAATAAGTCTGGTGAAG
TAGCAACAGAAGCG

QA 1 777 1 777
DS 

RD RS1AH12JQ 761 0 0
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AAAGAGAAGAGTGTGATCCAGTGTTCCGTAGAAGGAAACTCACCCATCTACTTGTGTTCA
CTTTTGCCTAACAAAACCGAGTGTTGCCCTCTGAATCTTGAGTTTGAGGATGAAGACGAG
ACCGTTGAGTTCTCGGTGACTGGTGACAGAAGCATCCACCTTTCTGGATTCATGGAGGAT
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GTTGCTGAAATGGGGTCAGAAGAGTCTTCTGACTATGATAGTGAAGATGATGACGAGGAT
GAGATGGATGAGGATCAGATGGATCAGTTTGAGGACTTTCTTGATCGCAATCTCGAAATG
TATCGCCAAGCCACCGTCCCAAACAGCGGAGTTGTGATTGAGGAGATAGAAGATGAAGAG
AAGCCTGCCGAAGATAAAAAGACTAAACGATCAAAGAAGAAGAGTCAAGCTACCAAAGAC
GAGAACGCAGATAAACAGATTGTTGTCAAAGAGATTGCACCAGATGTTCCAGTTCTTGAG
AGCGAAGATGAAGATGGTCTTCCTATTCCCAAAGAGAATAAGTCTGGTGAAGGTAGCAAC
AAGAAGCGGAAGGCCAAGGCTTCTGAGCAAGACGGTGTACA

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL7424Contig1 792 2 2 U
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TTCTTCTTAAATCTCAATATATTTTTTTTTTGTCAGAGGAACCCTAACCCTAGTTCAAAG
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AGCTCTGCGTGAATGGCTGCGGATTTTTCGGAACAGCTGCTACCATGAACCTTTGCTCCA
AATGCTATCACGACATCAAAACCACCCAAGTTCAAGCTAAAGCCTCCTTGGAGAAATCTC
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GCAGTGAAACGGCTCCACGGACTAGCGCCAAAACGAGGTGCTTGAGCTGTAACAAGAAAG
TGGGCTTGATGGGGTTTAAGTGCAAGTGTGGGAGCACATTCTGTGGAGACCATAGATATC
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AAGAATTTTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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GTTTTTTTTTTTTT
TGCTA

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DS 

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TCTGTAATAAAAGAATTTTCAT

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1BP26JQ C 1
AF RS1BP26TF U 1
BS 1 688 RS1BP26TF

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QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1B219JQ C 1
AF RS1B219TF U 1
BS 1 722 RS1B219TF
BS 723 755 RS1B219JQ

RD RS1B219JQ 755 0 0
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AGGAAGCTGCCGTCATTAGAAACCTACTCACGTAACTTTCCAATATATTGATTTACTATA
TAACTTATAATATATATTTGTAATGTAATGTTGATCGTCCTTAATTATGAAGCGACGTGT
TTTTCTCTTATGAGCTTCCGAGCTATGGTCCAGCAATTACATTAACGTCTACTCTGTAGT
CTCCGGAAGATGTGTTAATATGTTATTTATTACCC

QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1B219TF 722 0 0
GGAAGTTTCTCTGGACTTCAGTTTTCTTCTCGCTGCTCTTTCTATCCTCACACCCTTGAG
AAAATATAAAATTTGTGGGATAAACATAATTCCTCTATTTCTACTGGCTTAATAGCCTCT
CTCATTTTCACTAATTTAACTCCTTGTTAATTATTACAACATTTTCTATCTCTCCCTATT
CCTCTCCGTCTCTTCTCTATTGTTCAATCTAGAGGTCGAGATAAAGTACACAGCTTAAGG
GTCATTTTCTTGCGACATTGTAGTGTTACACCTAAGGAACAATCGAAGTCTTACAAGAAA
ATGTCTAACAGAAGATCAAGACAATCATCAAGTTCTACGAGGATCTCAGATGACCAGATG
ATCGACCTCGTTAGTAAGCTCCGTCAGTTTTTGCCGGAGATTCGTGAACGGCGCCGTTCT
GATAAGGTGTCAGCGTCGAAGGTACTGCAAGAGACATGCAACTACATAAGAAAGCTGCAT
AAGTTGACAATCTCAGCGACCGTTTGTCCCTGCTCCTCGACTCCGTTGATGAAGATAGCC
AGGAAGCTGCCGTCATTAGAAACCTACTCACGTAACTTTCCAATATATTGATTTACTATA
TAACTTATAATATATATTTGTAATGTAATGTTGATCGTCCTTAATTATGAAGCGACGTGT
TTTTCTCTTATGAGCTTCCGAGCTATGGTCCAGCAATTACATTAACGTCTACTCTGTAGT
CT

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL7427Contig1 1030 2 2 U
GAATGCGGTTAAGGAGCAAACACTACATAGCTTTACACCTTAGGTTTGAGCCAGACATGC
TCGCCTTCTCCGGATGTTACTACGGTGGTGGTGACAAGGAGAAGAAAGAGTTGGGATCTA
TCAGAAGGAGATGGAAAACTTTACATGTGAATAACCCGGAAAAGCAGAGGAGACAAGGAA
GATGTCCGTTGACACCAGAAGAAGTCGGATTAATGCTAAGAGCTTTGGGGTATGGAAGTG
ATGTTCATATATATGTTGCGTCAGGTGAAGTCTACGGAGGAGAAGAGTCGTTAGCTCCGT
TGAAAGCGCTCTTCCCACATTTCTATTCTAAAGACACTATAGCTACCAAAGAGGAGTTGG
AACCGTTTGCTTCCTACTCTTCACGGATGGCTGCGTTGGACTTCCTTGTGTGCGATGAAA
GCGATGTTTTCGTTACAAACAATAACGGAAACATGGCGAGAATATTAGCTGGTCGAAGGA
GATATTTTGGACATAAACCGACGATAAGACCGAACGCGAAGAAGCTGTACAAGTTATTTT
TAAGCAAAGAGAACACAACTTGGGAGGAGTTTGGTTCGAGAGTGAGAACGTTTCAGAAAT
GATTCATGGGAGAGCCCAAGGAAGTAAGAGCCGGTAGAGGCGAGTTTCATGAGAATCCTT
CCACTTGTATATGCGAAGATACCATTGCCAATGGTAAGTCAAAAGAGGGAGGAGGTATGG
ATTCAAGAAAACTCGGTAAGAAAAACAAAGTGAGTAATGGTGAGCAGAAGGAAGATGAAG
ATGCAGAGTGGTCGTCAGATTATGAGGAAGACCAAACTGATTTGCATGACAGAGGCTTGT
TTAATGGTACGAGGTTAGATTATGAGGATATTTCTTCCGATGACCCTGAGCTTGAAGAAA
TGCTTTCAGATTGATTTTTTTTTTAAAAGACTTCAAATTTTACAACCTTTTTGTTGTGGT
CAGATTTGCTGCTTCATCAATTTCTTTATGTACATAGAATCCAATCCGAGGAAGAATGAC
CTTTTTTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BQ81TF U 1
AF RS1BQ81JQ C 389
BS 1 474 RS1BQ81TF
BS 475 1030 RS1BQ81JQ

RD RS1BQ81TF 474 0 0
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TCGCCTTCTCCGGATGTTACTACGGTGGTGGTGACAAGGAGAAGAAAGAGTTGGGATCTA
TCAGAAGGAGATGGAAAACTTTACATGTGAATAACCCGGAAAAGCAGAGGAGACAAGGAA
GATGTCCGTTGACACCAGAAGAAGTCGGATTAATGCTAAGAGCTTTGGGGTATGGAAGTG
ATGTTCATATATATGTTGCGTCAGGTGAAGTCTACGGAGGAGAAGAGTCGTTAGCTCCGT
TGAAAGCGCTCTTCCCACATTTCTATTCTAAAGACACTATAGCTACCAAAGAGGAGTTGG
AACCGTTTGCTTCCTACTCTTCACGGATGGCTGCGTTGGACTTCCTTGTGTGCGATGAAA
GCGATGTTTTCGTTACAAACAATAACGGAAACATGGCGAGAATATTAGCTGGTC

QA 1 474 1 474
DS 

RD RS1BQ81JQ 642 0 0
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AAACATGGCGAGAATATTAGCTGGTCGAAGGAGATATTTTGGACATAAACCGACGATAAG
ACCGAACGCGAAGAAGCTGTACAAGTTATTTTTAAGCAAAGAGAACACAACTTGGGAGGA
GTTTGGTTCGAGAGTGAGAACGTTTCAGAAATGATTCATGGGAGAGCCCAAGGAAGTAAG
AGCCGGTAGAGGCGAGTTTCATGAGAATCCTTCCACTTGTATATGCGAAGATACCATTGC
CAATGGTAAGTCAAAAGAGGGAGGAGGTATGGATTCAAGAAAACTCGGTAAGAAAAACAA
AGTGAGTAATGGTGAGCAGAAGGAAGATGAAGATGCAGAGTGGTCGTCAGATTATGAGGA
AGACCAAACTGATTTGCATGACAGAGGCTTGTTTAATGGTACGAGGTTAGATTATGAGGA
TATTTCTTCCGATGACCCTGAGCTTGAAGAAATGCTTTCAGATTGATTTTTTTTTTAAAA
GACTTCAAATTTTACAACCTTTTTGTTGTGGTCAGATTTGCTGCTTCATCAATTTCTTTA
TGTACATAGAATCCAATCCGAGGAAGAATGACCTTTTTTCCT

QA 1 642 1 642
DS 



AS 1 2

CO CL7428Contig1 719 2 2 U
GGGAAAGAAATTTGAAAAAAAAAAACAATAAGCAACAATGTTGGTGTACCAAGACCTTCT
CACCGGTGATGAGCTTCTGTCTGACTCTTTCTCTTACAAGGAGATTGAGAATGGTATTCT
TTGGGAAGTTGAAGGAAAGTGGACTACCGTTGGAGCTCTAGATGTGGACATCGGTGCCAA
TCCCTCTGCTGAAGAAGGTGGTGAGGACGAGGGTGTTGATGACACTGCTCAAAAGGTTGT
TGACATTGTTGACACCTTCAGACTTCAGGAGCAACCGACTTATGATAAGAAGGGCTTCAT
CGCCTATATTAAAAAGTACATCAAGCTTTTGACACCCAAGCTCAGCGAGGAAGATCAAGC
AGCCTTCAAGAAGGGTATCGAGGGAGCTACCAAGTTCTTGCTCCCCAAGCTCAATGACTT
CCAATTCTTTGTTGGGGAGGGGATGCATGATGACAGCACTTTGGTCTTTGCTTACTACAA
GGAGGGTGCAACTAACCCAACATTTTTGTACTTCGCTCATGGTTTGAAGGAGGTCAAGTG
CTGAGTAGTCGGTCGCAGCTTCTTTATTTTGTTCTGTGTTTGGTCGTCTCCTATTAAAAT
TACCTACCACCATTCTGCTTTTTATCTTCTAGCTAAGTTATTTAATCCGAAAACAACGGT
TTATCATTTACTATTAATTGAATTTTGTGGCTTGCTTATCTAATTTAAATGTGGTTACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DL08JQ C 1
AF RS1DL08TF U 1
BS 1 718 RS1DL08TF
BS 719 719 RS1DL08JQ

RD RS1DL08JQ 719 0 0
GGGAAAGAAATTTGAAAAAAAAAAACAATAAGCAACAATGTTGGTGTACCAAGACCTTCT
CACCGGTGATGAGCTTCTGTCTGACTCTTTCTCTTACAAGGAGATTGAGAATGGTATTCT
TTGGGAAGTTGAAGGAAAGTGGACTACCGTTGGAGCTCTAGATGTGGACATCGGTGCCAA
TCCCTCTGCTGAAGAAGGTGGTGAGGACGAGGGTGTTGATGACACTGCTCAAAAGGTTGT
TGACATTGTTGACACCTTCAGACTTCAGGAGCAACCGACTTATGATAAGAAGGGCTTCAT
CGCCTATATTAAAAAGTACATCAAGCTTTTGACACCCAAGCTCAGCGAGGAAGATCAAGC
AGCCTTCAAGAAGGGTATCGAGGGAGCTACCAAGTTCTTGCTCCCCAAGCTCAATGACTT
CCAATTCTTTGTTGGGGAGGGGATGCATGATGACAGCACTTTGGTCTTTGCTTACTACAA
GGAGGGTGCAACTAACCCAACATTTTTGTACTTCGCTCATGGTTTGAAGGAGGTCAAGTG
CTGAGTAGTCGGTCGCAGCTTCTTTATTTTGTTCTGTGTTTGGTCGTCTCCTATTAAAAT
TACCTACCACCATTCTGCTTTTTATCTTCTAGCTAAGTTATTTAATCCGAAAACAACGGT
TTATCATTTACTATTAATTGAATTTTGTGGCTTGCTTATCTAATTTAAATGTGGTTACT

QA 1 719 1 719
DS 

RD RS1DL08TF 718 0 0
GGGAAAGAAATTTGAAAAAAAAAAACAATAAGCAACAATGTTGGTGTACCAAGACCTTCT
CACCGGTGATGAGCTTCTGTCTGACTCTTTCTCTTACAAGGAGATTGAGAATGGTATTCT
TTGGGAAGTTGAAGGAAAGTGGACTACCGTTGGAGCTCTAGATGTGGACATCGGTGCCAA
TCCCTCTGCTGAAGAAGGTGGTGAGGACGAGGGTGTTGATGACACTGCTCAAAAGGTTGT
TGACATTGTTGACACCTTCAGACTTCAGGAGCAACCGACTTATGATAAGAAGGGCTTCAT
CGCCTATATTAAAAAGTACATCAAGCTTTTGACACCCAAGCTCAGCGAGGAAGATCAAGC
AGCCTTCAAGAAGGGTATCGAGGGAGCTACCAAGTTCTTGCTCCCCAAGCTCAATGACTT
CCAATTCTTTGTTGGGGAGGGGATGCATGATGACAGCACTTTGGTCTTTGCTTACTACAA
GGAGGGTGCAACTAACCCAACATTTTTGTACTTCGCTCATGGTTTGAAGGAGGTCAAGTG
CTGAGTAGTCGGTCGCAGCTTCTTTATTTTGTTCTGTGTTTGGTCGTCTCCTATTAAAAT
TACCTACCACCATTCTGCTTTTTATCTTCTAGCTAAGTTATTTAATCCGAAAACAACGGT
TTATCATTTACTATTAATTGAATTTTGTGGCTTGCTTATCTAATTTAAATGTGGTTAC

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

CO CL7429Contig1 852 2 18 U
GGACATACATAGACATATGTACATACTAACACAAAAATAACATATGATATATATACGTAG
AATCAATCCTCGTTTGTATACAACAATGACAAAGACACTTGAGATTGACATAAGATCCGC
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GTTTGGCTGCACAAAGACTTGTGATATTTATTTTTTGTTACTATACAAAAAAGAAAAACT
TATTTGATGTTTGGAAACAAAAAAGGATTACGAGGTTCAGTATTAAAGTCAAACTTGTTA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ED06TF U 1
AF RS1ED06JQ C 42
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QA 1 804 1 804
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QA 1 811 1 811
DS 



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BQ
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AF RS1DP29TF U 1
AF RS1DP29JQ C 1
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BS 719 753 RS1DP29JQ

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TTATTCAAATAAAATAACTAAAAATAAATCTCAAAATTCACGAAACAGACTAATATATTT
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QA 1 718 1 718
DS 

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ACTGTTGTATGTCTCTGTTTTGGAAAGGAGACACATCTTTCAACTTAGAACAGCCATATT
TACTATAATAGCAAAAAAGGAGGTTACAATCATAAGAAATATATTATGAAAACTAATAAA
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GTTTATGTAATAATCTATGTAAGTTGGATATTATCATAATGTAAAAGTTGTCGAGAATAA
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QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL7431Contig1 1348 2 2 U
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ATTCGTTCGTCCATTAAAAAAAAGGGAGGAAAGAAGCTCTAACCACCATCTATTATCTGG
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CAGATACACCCTTGAAATCAGGTGATTTTGCTTCTCGCTGAACAAAGACACAACCAAGAC
ATTTGCTGATGAGGCCAACAAGAGGAAGCTTGCCCACTGATCTCTTGGCGACAAAACTTG
GGAAAGAAGCAGACATATGATACAAAATGTCAAGGTACGAAACGTGATTAGACACAATGA
CACCAGGCCTTTCTGGCTCCTCCTTATCGGTTTCACCATTCTCTGCAATCTGAGAAGAAG
TTGTTTTGAGATCAAATCAAAACGATCC


BQ
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AF RS1EM86TF U 1
AF RS1FS82JQ U 520
BS 1 648 RS1EM86TF
BS 649 1348 RS1FS82JQ

RD RS1EM86TF 648 0 0
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GATGGGTTAAACGAGCAGCTAGAAGAGGACTCACGTTGCCTAGAGCATCTGCAACTTCAG
CTGCTTCAAGAGAGAAGCAAGAGAACAGAGATTGAAAGAGAGAACACAATGTTGAAAGAG
CAAGTCGATATGCTTGTCAACATGATACAACAAGATGAAGTAGAAGAAGTAGCAGAAGAA
CCCTAGCTAGTCTGTACGTCCCCCCGTCTACCTACCTATAATAGCTCCGCTCTGTTTTTT
ATTCGTTCGTCCATTAAAAAAAAGGGAGGAAAGAAGCTCTAACCACCATCTATTATCTGG
TTAAGCTACTGTTGTTGTTTCCTCCTGTTAGAAACAAATAAAGAATCAAGAACACTATAT
ATTCCGAGTCAAGTTCTCTGCAAGTTCTTGGGACGATGAAGAACTGTTTTAAGTGTCTGT
GTGTGTGTGTCTAAAGTTGCTTCAGCACGGGATAGAGGCAGAAGAAAAATACAAAAATAT
AGAAATTGAGATAGGATCATGTACAGATATGTTGTGGTGTTAAGAAGTGTAATCCTTGTG
TCCTATGAATAAATGAAATCTACGGACCACGAATATCGAGTGTCCATC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1FS82JQ 829 0 0
CC
AAGAAAAATACAAAAATATAGAAATTGAGATAGGATCATGTACAGATATGTTGTGGTGTT
AAGAAGTGTAATCCTTGTGTCCTATGAATAAATGAAATCTACGGACCACGAATATCGAGT
GTCCATCATTACTTAGCTTTTGCAAAACAAACCATTGAGGGTCGCGTGATATATCCTCTT
GTCTCCAAGTCCTAAGTCCGATAGAATCAAGTTACCCTTGGTGGCCATTAATCTCCGGAC
ATTGCTAGCATAGAGTTTGGGATTGTCTTTCTCTTCTTGTGAAGGGTAGTATACAGGTAA
CCGTATCACCTCCAAATGGTTTACGAATTGACAGAGAAGGAAGATAATGTGGCGTGCTCC
GGAGATTGTATCCCATGCCACACTGAAACGCTCGTATGGATATTTTAAAATAACGGGAAG
AAAGGAGTTCCTGCCAGAAATGCACCTGTCTTGAATTGAAGCAAGTAGTCTCCATTGGTA
GTTGTTCCCTCTGGAAAAAGCATAATAGTTGGAGCAGATTTATTCCTATGAGCTTCTCTA
ACTCTTTCATTTACTGTGCCAGATACACCCTTGAAATCAGGTGATTTTGCTTCTCGCTGA
ACAAAGACACAACCAAGACATTTGCTGATGAGGCCAACAAGAGGAAGCTTGCCCACTGAT
CTCTTGGCGACAAAACTTGGGAAAGAAGCAGACATATGATACAAAATGTCAAGGTACGAA
ACGTGATTAGACACAATGACACCAGGCCTTTCTGGCTCCTCCTTATCGGTTTCACCATTC
TCTGCAATCTGAGAAGAAGTTGTTTTGAGATCAAATCAAAACGATCC

QA 3 829 3 829
DS 



AS 1 2

CO CL7432Contig1 353 2 2 U
ACGTTAAAGTGCGTAGTTATTGGTATTTTTATACAAAAAAAATTATGTAATATCAGTAGT
GGGACAAAAAAAGGGAGAGAAATAGAGTTTGACGTCCTAATGTGAAATATCAGCTAGGAC
AAGTAAAAAACAAAAATGGCATATATGTATACCAGTTGTTTGAATGGTAACCAGCGATGG
TGGCCACACCTTCCAAAGCTTTTTTCCATGTCTCAATCTCGTCACTTGTTTTGCCTTTAC
ATGTTTTTCTGAAGGACTTCCCAAAATCTTTCCTCTGCTTCTTTATATCAGCTGGATCCA
CTTCATAGAAAATGGTCATTACTGTCTGACCAAGCTCTGTCCTACACTTCATC


BQ
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AF RS1AA52TF C 1
AF RS1AA52JQ U 31
BS 1 30 RS1AA52TF
BS 31 353 RS1AA52JQ

RD RS1AA52TF 353 0 0
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GGGACAAAAAAAGGGAGAGAAATAGAGTTTGACGTCCTAATGTGAAATATCAGCTAGGAC
AAGTAAAAAACAAAAATGGCATATATGTATACCAGTTGTTTGAATGGTAACCAGCGATGG
TGGCCACACCTTCCAAAGCTTTTTTCCATGTCTCAATCTCGTCACTTGTTTTGCCTTTAC
ATGTTTTTCTGAAGGACTTCCCAAAATCTTTCCTCTGCTTCTTTATATCAGCTGGATCCA
CTTCATAGAAAATGGTCATTACTGTCTGACCAAGCTCTGTCCTACACTTCATC

QA 1 353 1 353
DS 

RD RS1AA52JQ 323 0 0
ATACAAAAAAAATTATGTAATATCAGTAGTGGGACAAAAAAAGGGAGAGAAATAGAGTTT
GACGTCCTAATGTGAAATATCAGCTAGGACAAGTAAAAAACAAAAATGGCATATATGTAT
ACCAGTTGTTTGAATGGTAACCAGCGATGGTGGCCACACCTTCCAAAGCTTTTTTCCATG
TCTCAATCTCGTCACTTGTTTTGCCTTTACATGTTTTTCTGAAGGACTTCCCAAAATCTT
TCCTCTGCTTCTTTATATCAGCTGGATCCACTTCATAGAAAATGGTCATTACTGTCTGAC
CAAGCTCTGTCCTACACTTCATC

QA 1 323 1 323
DS 



AS 1 2

CO CL7433Contig1 707 2 1 U
GGGAGGATGATGACTATGATGATGTCTCTCCCCAAAATGAAACTATCTTCTCTGCAACCT
CATCTCCATTTGAGCAGCAGCAGATTACTAGCACCAGCTAAGGCGTCGTCTCCGAGCTCA
ACCATAAGCACCAGAACACCGTGCCGCCGTGTTCAGTGCGAAGCATCCACAAGAAGATCA
ACGGCGGAAAGCAACAGAGCCAGGCTTGAAAAGACACAACCTTTGACTCTGGAGAAGAAG
CAACTGAGACGAGCTCTGGTGACCGGTGTCTCCGTAGGTTTGATGATGGCTTTGGCATTA
GGAATAGATGGAGAAAAGGCGATGGCTTTGGGACCGGAAGGTCCTCTGATGGAAGAGTTC
TGGGACAACGTGAGAAGGTACGGTCTTTACGCACTCACCGTCAGCACGGGAGCTCTCTCC
GCCGTGTTCTAGCCCATCTTCGAACTCCTCAAGAACCCGATCTCCGCCGTTCTCATCGTG
ATCATCTTAGGTGGAAGCTTCTACATCGTCTCCCAAGTCGTCTCGGCCATGGTTGGTGTC
AACGAGTTTGCTTATGATTATGGATACTGAGAGTTAAATACTCTGTTTCTTTGAATACTC
TGTTTCTACTACATGTTATGGTCATCGATACTCTGTTTCTGCATTAGTCTTATGAACTTA
ATGAGTCAGTGACATTTTATTTGACATTAAAGAGATCAACTTTGTAC


BQ
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AF RS1DU50JQ C 1
AF RS1DU50TF U 1
BS 1 707 RS1DU50TF

RD RS1DU50JQ 707 0 0
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ATGAGTCAGTGACATTTTATTTGACATTAAAGAGATCAACTTTGTAC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1DU50TF 707 0 0
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CATCTCCATTTGAGCAGCAGCAGATTACTAGCACCAGCTAAGGCGTCGTCTCCGAGCTCA
ACCATAAGCACCAGAACACCGTGCCGCCGTGTTCAGTGCGAAGCATCCACAAGAAGATCA
ACGGCGGAAAGCAACAGAGCCAGGCTTGAAAAGACACAACCTTTGACTCTGGAGAAGAAG
CAACTGAGACGAGCTCTGGTGACCGGTGTCTCCGTAGGTTTGATGATGGCTTTGGCATTA
GGAATAGATGGAGAAAAGGCGATGGCTTTGGGACCGGAAGGTCCTCTGATGGAAGAGTTC
TGGGACAACGTGAGAAGGTACGGTCTTTACGCACTCACCGTCAGCACGGGAGCTCTCTCC
GCCGTGTTCTAGCCCATCTTCGAACTCCTCAAGAACCCGATCTCCGCCGTTCTCATCGTG
ATCATCTTAGGTGGAAGCTTCTACATCGTCTCCCAAGTCGTCTCGGCCATGGTTGGTGTC
AACGAGTTTGCTTATGATTATGGATACTGAGAGTTAAATACTCTGTTTCTTTGAATACTC
TGTTTCTACTACATGTTATGGTCATCGATACTCTGTTTCTGCATTAGTCTTATGAACTTA
ATGAGTCAGTGACATTTTATTTGACATTAAAGAGATCAACTTTGTAC

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 2

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TCACACAAGATAGCAAATTTGTCTGTCACTGATGGATCCCATGGAATCGTCTGGTGAAGA
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GCAGTGGAAAAACTAGTTTCCTTCATCGTTTGGTCTGCCATACCTTTGATGCAAACAAGC
GTGGGTATGTGTTGAACCTTGACCCTGCTGTTATGTCTCTTCCTTTCGGTGCCAACATCG
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TCTTCACATGGTCTGCTTCTGGGGCTATAATCACTGAAGCTTTTGCTTCTACCTTCCCAA
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TCTCACTCTACGAGTTTTACCGGAATATAAGATCTGTTGGTGTTTCTGCAATCACTGGTG
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AAAAGGAAATGGAGAAACTGAGGAAGGATATGGAGCGTTCTCAGGGAGGGACTGTGGTTC
TAAACACTGGCTTGAAAGATAGAGACGCAGCTGAGAAGATGATGGTTGAGGAAGAGGATG
ATGATGACTTTAAGATTGAAGAAGACAGTGATGATGCCATAGATGAGGATGAGGAAGATG
AAGAGATGAATCGTTTCTACGTATAAATTAAACTCAAAAACTAAATCATTCAGACCTTAT
CAAGTTGCTTCAACTCGTTTTGTTTGTGTCCTTGCCTTGCTTTCCCCGTTGTGTAGTTAA
AACCATGGAGTCTGAATCTCTTTGTGAGACATGGTCTAATGATCTAATGATTATCACT


BQ
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AF RS1FY31TF U 1
AF RS1FY31JQ C 615
BS 1 673 RS1FY31TF
BS 674 1378 RS1FY31JQ

RD RS1FY31TF 673 0 0
GGGACGAACAAACACGAATCAAAAGACCTAACTCTGTGTTGCTCTGCGTCAAGTTAAAAA
TCACACAAGATAGCAAATTTGTCTGTCACTGATGGATCCCATGGAATCGTCTGGTGAAGA
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TGGCAGCTCTTCCTCCAATTTCAAGAAGAAGCCTGTTATCATCATTGTTGTTGGAATGGC
GCAGTGGAAAAACTAGTTTCCTTCATCGTTTGGTCTGCCATACCTTTGATGCAAACAAGC
GTGGGTATGTGTTGAACCTTGACCCTGCTGTTATGTCTCTTCCTTTCGGTGCCAACATCG
ATATAAGGGACACTGTCAAGTACAAGGAAGTTATGAAGCAGTATAACCTGGGGCCTAATG
GTGGTATTATGACTTCTCTCAACTTGTTTGCTACTAAATTCGACGAGGTTGTCTCTGTGA
TTGAGAAACGTGCAGACCAGCTTGACTATGTCCTTGTGGATACTCCTGGTCAGATTGAAA
TCTTCACATGGTCTGCTTCTGGGGCTATAATCACTGAAGCTTTTGCTTCTACCTTCCCAA
CTGTTGTCACCTATGTGGTTGATACTCCACGTTCCACAAGCCCAATCACTTTCATGAGCA
ACATGCTCTACGC

QA 1 673 1 673
DS 

RD RS1FY31JQ 764 0 0
GTGGTTGATACTCCACGTTCCACAAGCCCAATCACTTTCATGAGCAACATGCTCTACGCC
TGTAGTATCCTCTACAAGACCCGGCTGCCTCTTGTCTTGGCTTTCAACAAAACTGATGTG
GCAGATCACAAGTTTGCTTTAGAGTGGATGGAAGATTTCGAGGTGTTTCAAGCAGCGATA
CAGTCTGATAACTCGTACACATCGACCTTGGCTAACAGCCTCTCCCTCTCACTCTACGAG
TTTTACCGGAATATAAGATCTGTTGGTGTTTCTGCAATCACTGGTGCTGGAATGGATGAC
TTCTTCAAAGCCATTGAAGCAAGTGCTGATGAATACATGCAAACTTACAAGGCTGATCTT
GACAAGAGAAAGGCGGAGAAGGAGCAGTTGGAAGAAGAGCGAAGGGAAAAGGAAATGGAG
AAACTGAGGAAGGATATGGAGCGTTCTCAGGGAGGGACTGTGGTTCTAAACACTGGCTTG
AAAGATAGAGACGCAGCTGAGAAGATGATGGTTGAGGAAGAGGATGATGATGACTTTAAG
ATTGAAGAAGACAGTGATGATGCCATAGATGAGGATGAGGAAGATGAAGAGATGAATCGT
TTCTACGTATAAATTAAACTCAAAAACTAAATCATTCAGACCTTATCAAGTTGCTTCAAC
TCGTTTTGTTTGTGTCCTTGCCTTGCTTTCCCCGTTGTGTAGTTAAAACCATGGAGTCTG
AATCTCTTTGTGAGACATGGTCTAATGATCTAATGATTATCACT

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL7435Contig1 792 2 7 U
CGATAAAAAGGTATGCCGACACTTAACCAAACCAGGCTCATTTGGAAATTCGAAACAGCA
TAAAAATGTCATCACAAAACCACTGTGACTGTGTTACTTAGTGTTAATGTAGTAAGAAAA
TATTTATTGGAATACAAAATTCCATTTAAATAAAAAATAATAATATTTGGTTGGGTCTTC
TTCTCTTCTCCCCAAAAGATTTATTTTACAAGTCTCAAAACATTGTTGAATGTCTAGCAA
ATATTTTCCTGCTTCAACAAAACTTGCTGCTTACGGTGTCGTAACTCGGAACAGACAACA
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CGTATGTAAGTATCTGCCTGCCAATGTCTTCTGCTGCAATCATCCGAGATTCCAAATTCA
TCAAAACTGCAGATTTTGTGGCTGCCTTGGCCCGATCTAAATGCTTCTGGTTAACTTTTC
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TGCATGACTGAACTTGCTGATATTCATTCAGAATACGGAGATATAGCCATGAGTGCATTC
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AGGCGATGAGTG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F858JQ U 25
AF RS1G315JQ U 1
BS 1 73 RS1G315JQ
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RD RS1F858JQ 732 0 0
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TGTCTTTCAATGTAAGTTCGTCTACTGTCTTCAAGAACTGCTCAACTGGTTTCCTCTCTC
CGTATGTAAGTATCTGCCTGCCAATGTCTTCTGCTGCAATCATCCGAGATTCCAAATTCA
TCAAAACTGCAGATTTTGTGGCTGCCTTGGCGCGATCTAAATGCTTCTGGTTAACTTTTC
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AGGCGATGAGTG

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1BU22JQ C 1
AF RS1BU22TF U 1
BS 1 712 RS1BU22TF

RD RS1BU22JQ 712 0 0
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TTATAACATTTGTTGGATTTATGGCTTGGTTTGTCTTGGGTTTGGACTTGAGCTTTAATA
CGGTTAACGATTTAAATTCAATTCTGATTATTTTCATAAGTTTGTTTATTCACTTACAAA
TTTATAATTAAGTGCACTGGGATAATAAGATATGTTGGAATACAAGAGATCA

QA 1 712 1 712
DS 

RD RS1BU22TF 712 0 0
GATTCCCATTCATATTCGTTGTTCTTCCTCATCATCATAACATCACTTTACATTACATCA
AGTTTTGACTTTTGTGTATATACATTTTTTAATTCGAAATAGTTTTATATTGCTTCCTAC
CAGTATTTGTACATTTTAAAATTTTTGAGAATGGTGGGGTGGAAATTCTATTTTTTGGTG
TACGACAGAAACTATAAAAAATATGAGACACGTGAGGTTCCGGTTTGAAGATAATCAGAA
AACTAGACACTAGACTTTGCTAGTTGACAAAAAAAAAAAGACACTAGACTTTGCTCAGAT
GAGCTTTATTAAGATAGAATAGAAAAATATTGAAATGACTTATTAAAATTTTATTGTGCA
ACGAAACTAAAGGAAGGAAGAAGCTTTAATCTTGTCACCAAGATAAGTAAGGTTGTAAAT
GATTCATAAATGTAAAAGGAGAGGCTGCATTCAACGCAGCCAAAATTACTCTATTCATCA
CATTACATTCACATTTATACTACTAGTCTACTTGCAAGAACAACCCTAATACACATAGAT
TTATAACATTTGTTGGATTTATGGCTTGGTTTGTCTTGGGTTTGGACTTGAGCTTTAATA
CGGTTAACGATTTAAATTCAATTCTGATTATTTTCATAAGTTTGTTTATTCACTTACAAA
TTTATAATTAAGTGCACTGGGATAATAAGATATGTTGGAATACAAGAGATCA

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 2

CO CL7437Contig1 778 2 8 U
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TATATCTCTATCTGTAAGTGGCGAGTGTTTCAACTCTTTTTTCTTCTGAGTGAACCGGAT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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BQ
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AF RS1AK73JQ C 1
AF RS1AK73TF U 1
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BQ
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AF RS1AY86TF C 1
AF RS1AY86JQ U 365
BS 1 364 RS1AY86TF
BS 365 370 RS1AY86JQ
BS 371 371 RS1AY86TF
BS 372 435 RS1AY86JQ
BS 436 436 RS1AY86TF
BS 437 487 RS1AY86JQ
BS 488 536 RS1AY86TF

RD RS1AY86TF 536 0 0
GGCTCAGAAGACATGTTTATTGCAAAAAACAAAGAGACCAAATCCTTTCTCTTTAAGTGA
ACAATATGTCCAAAGTTTCTACTTCTTCTTCTAGATGCCAACAACATATAAATATGAAGT
ACCCCAAAAACACTGGGAAAGAAACAGAGAAATCAATAAGACCATTATAACTACCAATTG
ACCCATCAGTCTATGGATCCATATGCCACATTACTTTCTTCCGCGGGTTAACCTCTGCAA
ATGGCAGTTAATGTTTCCCCACGACTTGGACTTCTCCGCATGTCCGTTCATACAAACGCT
AAGGAGGTTCTTCTGTTTCTCGCAGTTATCATCTTTGCATTTGTTAAGAGCCATGCAGTT
GAGAAACGACACCATCTCCTTCATACACGGTTTCGCTATACCGCCTAGCTTTTTCGGGTT
TATGTACAAATTTCCAGCCTTTCTCCCCATGGCTCACTCAAAGATAAAGATAAAACACCA
AAGTGTTGGTAAAAGCGGAATCAAGGATTGATTTTTGACAAGACGCTGGAGAAATC

QA 1 536 1 536
DS 

RD RS1AY86JQ 123 0 0
AACGACCCCATCTCCTTCATACACGGTTTCGCTATACCGCCTAGCTTTTTCGGGTTTATG
TACAAATTTCCCGCCTTTCTCCCCATGGCTCACTCAAAGATAAAGATAAAACACCAAAGT
GTT

QA 1 123 1 123
DS 



AS 1 2

CO CL7441Contig1 720 2 2 U
GGGAAATTGGTATTCTCTAGGATTTGTTCCAGAGTATATTCAAAGTGAAACAAAATCAAA
ACACTGATTCTTCTATCTACTACGATGGGTGAGAAGAAGGAAGAAACGGCGACGAAACCT
GAAGGAGAGAAGAAGCCAGCCACCATCACAGTCATGAAGCTTGATATGCATTGCGAAGGT
TGTGGGAAGAAAATCAAACGACTCTTGAAACATTACAAAGGCGTGGAAGATGTTCAGATT
GATTATAAAGACAACAAAATGACGGTGGTCGGGAACGTAGATGCAGAGGCAGTTCGTGAT
AAAGTCGCCGGGAGAATTAAGAGGAAGGTGGAAATCGTGTCTCCCAAGAAAGAGTCTCCT
CCTCCTCCTCCTCCTCCAGGCGGTGAAAAGAAGGTGGCGGATGAGAAACCTGCCGAGAAG
AAGCCCGCCGATGAGAAACCCGCCGGCGACAAAAAAGAAGAGAAGAAGAAAGACGAAGGA
GCGAAGACAGCTCCTCCTCCTGCTCCACCAAAAGAGAATACGGTGGTTCTGAAGACTAAA
TTACATTGCGAAGGTTGTGAACACAAAATCAAAAGAATCGTCAACAAGATTAAGGGGGTT
AATTCAGTCGCCATTGAAAGCGCCAAGGACTTGGTGATAGTGAAAGGGATCATTGACGTT
AAACAACTCACTCCTTATCTCAACGAGAAGCTTAAACGCACCGTTGAAGTTGTTCCACCG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1DS59TF U 1
AF RS1FH50TF U 1
BS 1 719 RS1DS59TF
BS 720 720 RS1FH50TF

RD RS1DS59TF 719 0 0
GGGAAATTGGTATTCTCTAGGATTTGTTCCAGAGTATATTCAAAGTGAAACAAAATCAAA
ACACTGATTCTTCTATCTACTACGATGGGTGAGAAGAAGGAAGAAACGGCGACGAAACCT
GAAGGAGAGAAGAAGCCAGCCACCATCACAGTCATGAAGCTTGATATGCATTGCGAAGGT
TGTGGGAAGAAAATCAAACGACTCTTGAAACATTACAAAGGCGTGGAAGATGTTCAGATT
GATTATAAAGACAACAAAATGACGGTGGTCGGGAACGTAGATGCAGAGGCAGTTCGTGAT
AAAGTCGCCGGGAGAATTAAGAGGAAGGTGGAAATCGTGTCTCCCAAGAAAGAGTCTCCT
CCTCCTCCTCCTCCTCCAGGCGGTGAAAAGAAGGTGGCGGATGAGAAACCTGCCGAGAAG
AAGCCCGCCGATGAGAAACCCGCCGGCGACAAAAAAGAAGAGAAGAAGAAAGACGAAGGA
GCGAAGACAGCTCCTCCTCCTGCTCCACCAAAAGAGAATACGGTGGTTCTGAAGACTAAA
TTACATTGCGAAGGTTGTGAACACAAAATCAAAAGAATCGTCAACAAGATTAAGGGGGTT
AATTCAGTCGCCATTGAAAGCGCCAAGGACTTGGTGATAGTGAAAGGGATCATTGACGTT
AAACAACTCACTCCTTATCTCAACGAGAAGCTTAAACGCACCGTTGAAGTTGTTCCACC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RS1FH50TF 720 0 0
GGGAAATTGGTATTCTCTAGGATTTGTTCCAGAGTATATTCAAAGTGAAACAAAATCAAA
ACACTGATTCTTCTATCTACTACGATGGGTGAGAAGAAGGAAGAAACGGCGACGAAACCT
GAAGGAGAGAAGAAGCCAGCCACCATCACAGTCATGAAGCTTGATATGCATTGCGAAGGT
TGTGGGAAGAAAATCAAACGACTCTTGAAACATTACAAAGGCGTGGAAGATGTTCAGATT
GATTATAAAGACAACAAAATGACGGTGGTCGGGAACGTAGATGCAGAGGCAGTTCGTGAT
AAAGTCGCCGGGAGAATTAAGAGGAAGGTGGAAATCGTGTCTCCCAAGAAAGAGTCTCCT
CCTCCTCCTCCTCCTCCAGGCGGTGAAAAGAAGGTGGCGGATGAGAAACCTGCCGAGAAG
AAGCCCGCCGATGAGAAACCCGCCGGCGACAAAAAAGAAGAGAAGAAGAAAGACGAAGGA
GCGAAGACAGCTCCTCCTCCTGCTCCACCAAAAGAGAATACGGTGGTTCTGAAGACTAAA
TTACATTGCGAAGGTTGTGAACACAAAATCAAAAGAATCGTCAACAAGATTAAGGGGGTT
AATTCAGTCGCCATTGAAAGCGCCAAGGACTTGGTGATAGTGAAAGGGATCATTGACGTT
AAACAACTCACTCCTTATCTCAACGAGAAGCTTAAACGCACCGTTGAAGTTGTTCCACCG

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL7442Contig1 762 2 2 U
GAGTGACAGTGAGAGAGAGAGGGAGAGTTTGGTTGGGGGGAGAGATGGAAGGCGTAGGGT
CGAGATTGAGCCGAACGTCGTCGAGATACAGTGGTCCGGCAGCGACGGCGGTTTTCAGCG
GCCGCGTAAGGAAGTGGAAGAAGAAGTGGGTACGTGTCTCCACGTCACCCGTCGGCGTTT
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TGCTTCTCCATAAGTGGACTCCACTTTCCTCCGAAGCTAATGGCTCCGGTGAGACGGAGG
AGCCGCCTAAACGAAGATTCAGATACGCTCCTATTGCGATGTTTGAACATAGAGAGAAAG
TGGGTGCTGAAGTTGAAGCGGAAGAGACTGACGAATTCGACAATGATTCTCCATTGCCTA
AAGCCGTTGTTGGGCTGGACATGAACTTAACAGACTCAGACCAAACTAAGGTTTAAGCTT
CTAACTGGTTTTGTATGATTGCGATGTAAGTGTTGAGTTTGTTTCTTCTTCCTCTGTAGG
AGGCAAAAAATCGTCACTTGAAACTGGGACTGTGTCTGAATTCTGAAGGGACTGAAGAAT
GAAGAGAGAGAGATTCATGCTTTAATTGAGATGAAGCAACTTGTTGTAGCCTTTTGCTTC
CTTTCTTATTAGAGTTTGATCCTCTTCTGGATATGTATCTAGTGTATCTTTGGTTAGAAG
AAGCTATATGTGTATGTTATCTGTATGATCAAAGTTACAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RS1CC81TF U 1
AF RS1CC81JQ C 42
BS 1 759 RS1CC81TF
BS 760 762 RS1CC81JQ

RD RS1CC81TF 761 0 0
GAGTGACAGTGAGAGAGAGAGGGAGAGTTTGGTTGGGGGGAGAGATGGAAGGCGTAGGGT
CGAGATTGAGCCGAACGTCGTCGAGATACAGTGGTCCGGCAGCGACGGCGGTTTTCAGCG
GCCGCGTAAGGAAGTGGAAGAAGAAGTGGGTACGTGTCTCCACGTCACCCGTCGGCGTTT
TCCGAGCATCTAAATCCAACGGTCGTAGCAACAACAGCAGCAGCAATTCCCCTCACCATC
TGCTTCTCCATAAGTGGACTCCACTTTCCTCCGAAGCTAATGGCTCCGGTGAGACGGAGG
AGCCGCCTAAACGAAGATTCAGATACGCTCCTATTGCGATGTTTGAACATAGAGAGAAAG
TGGGTGCTGAAGTTGAAGCGGAAGAGACTGACGAATTCGACAATGATTCTCCATTGCCTA
AAGCCGTTGTTGGGCTGGACATGAACTTAACAGACTCAGACCAAACTAAGGTTTAAGCTT
CTAACTGGTTTTGTATGATTGCGATGTAAGTGTTGAGTTTGTTTCTTCTTCCTCTGTAGG
AGGCAAAAAATCGTCACTTGAAACTGGGACTGTGTCTGAATTCTGAAGGGACTGAAGAAT
GAAGAGAGAGAGATTCATGCTTTAATTGAGATGAAGCAACTTGTTGTAGCCTTTTGCTTC
CTTTCTTATTAGAGTTTGATCCTCTTCTGGATATGTATCTAGTGTATCTTTGGTTAGAAG
AAGCTATATGTGTATGTTATCTGTATGATCAAAGTTACA
CC

QA 1 759 1 759
DS 

RD RS1CC81JQ 721 0 0
GAGATGGAAGGCGTAGGGTCGAGATTGAGCCGAACGTCGTCGAGATACAGTGGTCCGGCA
GCGACGGCGGTTTTCAGCGGCCGCGTAAGGAAGTGGAAGAAGAAGTGGGTACGTGTCTCC
ACGTCACCCGTCGGCGTTTTCCGAGCATCTAAATCCAACGGTCGTAGCAACAACAGCAGC
AGCAATTCCCCTCACCATCTGCTTCTCCATAAGTGGACTCCACTTTCCTCCGAAGCTAAT
GGCTCCGGTGAGACGGAGGAGCCGCCTAAACGAAGATTCAGATACGCTCCTATTGCGATG
TTTGAACATAGAGAGAAAGTGGGTGCTGAAGTTGAAGCGGAAGAGACTGACGAATTCGAC
AATGATTCTCCATTGCCTAAAGCCGTTGTTGGGCTGGACATGAACTTAACAGACTCAGAC
CAAACTAAGGTTTAAGCTTCTAACTGGTTTTGTATGATTGCGATGTAAGTGTTGAGTTTG
TTTCTTCTTCCTCTGTAGGAGGCAAAAAATCGTCACTTGAAACTGGGACTGTGTCTGAAT
TCTGAAGGGACTGAAGAATGAAGAGAGAGAGATTCATGCTTTAATTGAGATGAAGCAACT
TGTTGTAGCCTTTTGCTTCCTTTCTTATTAGAGTTTGATCCTCTTCTGGATATGTATCTA
GTGTATCTTTGGTTAGAAGAAGCTATATGTGTATGTTATCTGTATGATCAAAGTTACAAC
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL7443Contig1 719 2 2 U
GGACACAACTCGATTCTCAATGGCAGAAGAAGCAAAATCAAAAGGAAACGCCTCCTTCTC
CTCCGGCGATTATGCCGCCGCAATCACCCACTTCACCGAAGCAATCAACCTCTCCCCAAC
CAACCACATCCTCTACTCGAACCGATCCGCCGCCTACGCATCCCTCCACCGCTACGCCGA
AGCTCTATCCGACGCCAAGAAAACCGTAGACCTCAAACCGGACTGGTCCAAAGGCTACAG
CCGGTTAGGCGCGGCGTACACGGGCCTATCTCGGTACCAAGAAGCCGCCGATGCTTATAA
GAGAGGCTTAGAGATCGATCCGAACAACGAGGCGCTGAAGACGGGGCTAGCCGACGCGTC
GAGACCACGCGGCGGCGGCGGCGCTAAGTCGAATCCCTTCGTCGAGGCGTTTCAAGGAGA
GGAGATGTGGGCGAAGCTGACGGCGGATCCGGGGACTAGGGTTTATTTGCAGCAGGCTGA
TTTCGTGAAGACGATGCAGGAGATTCAGAGGAACCCTAATAACCTTAATTTGTATATGAA
GGATAAGAGAGTGATGCAGGCTTTGGGTGTTTTGTTGAATGTTAAGATCGGTGGTGAAGA
TACGGAGATGCAGGAGGCTGGATCGGCTCCTGAGCCGGAGCCTGAGCCGGAGCCGGAGCC
TATGGAGTTGACGGAGGAGGAGAGGGAGAAGAAAGAGAGGAAGGAGGAGGCGAAGAAGG


BQ
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AF RS1CL02TF U 1
AF RS1CL02JQ C 106
BS 1 286 RS1CL02TF
BS 287 719 RS1CL02JQ

RD RS1CL02TF 286 0 0
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CTCCGGCGATTATGCCGCCGCAATCACCCACTTCACCGAAGCAATCAACCTCTCCCCAAC
CAACCACATCCTCTACTCGAACCGATCCGCCGCCTACGCATCCCTCCACCGCTACGCCGA
AGCTCTATCCGACGCCAAGAAAACCGTAGACCTCAAACCGGACTGGTCCAAAGGCTACAG
CCGGTTAGGCGCGGCGTACACGGGCCTATCTCGGTACCAAGAAGCC

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DS 

RD RS1CL02JQ 614 0 0
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CCACCGCTACGCCGAAGCTCTATCCGACGCCAAGAAAACCGTAGACCTCAAACCGGACTG
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GCTAGCCGACGCGTCGAGACCACGCGGCGGCGGCGGCGCTAAGTCGAATCCCTTCGTCGA
GGCGTTTCAAGGAGAGGAGATGTGGGCGAAGCTGACGGCGGATCCGGGGACTAGGGTTTA
TTTGCAGCAGGCTGATTTCGTGAAGACGATGCAGGAGATTCAGAGGAACCCTAATAACCT
TAATTTGTATATGAAGGATAAGAGAGTGATGCAGGCTTTGGGTGTTTTGTTGAATGTTAA
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GCCGGAGCCGGAGCCTATGGAGTTGACGGAGGAGGAGAGGGAGAAGAAAGAGAGGAAGGA
GGAGGCGAAGAAGG

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 2

CO CL7444Contig1 744 2 2 U
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GGCGTTTTCCGAGCATCTAAATCCAACGGTCGTAGCAACAACAGCAGCAGCAATTCCCCT
CACCATCTGCTTCTCCATAAGTGGACTCCACTTTCCTCCGAAGCTAATGGCTCCGGTGAG
ACGGAGGAGCCGCCTAAACGAAGATTCAGATACGCTCCTATTGCGATGTTTGAACATAGA
GAGAAAGTGGGTGCTGAAGTTGAAGCGGAAGAGACTGACGAATTCGACAATGATTCTCCA
TTGCCTAAAGCCGTTGTTGGGCTGGACATGAACTTAACAGACTCAGACCAAACTAAGGAG
GCAAAAAATCGTCACTTGAAGCTGGGACTGTGTCTGAATTCTGAAGGGACTGAAGAATGA
AGAGAGAGAGATTCATGCTTTAATTGAGATGAAGCAACTTGTTGTAGCCTTTTGCTTCCT
TTCTTATTAGAGTTTGATCCTCTTCTGGATATGTATCTAGTGTATCTTTGGTTAGAAGAA
GCTATATGTGTATGTTATCTGTATGATCAAAGTTACAATCAAGACTCGATGTTCCATTTT
TTTTAATTTCATGAAAATTTTGCG


BQ
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AF RS1DS37TF U 1
AF RS1DS37JQ C 1
BS 1 715 RS1DS37TF
BS 716 744 RS1DS37JQ

RD RS1DS37TF 715 0 0
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GTAGGGTCGAGATTGAGCCGAACGTCGTCGAGATACAGTGGTCCGGCAGCGACGGCGGTT
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GGCGTTTTCCGAGCATCTAAATCCAACGGTCGTAGCAACAACAGCAGCAGCAATTCCCCT
CACCATCTGCTTCTCCATAAGTGGACTCCACTTTCCTCCGAAGCTAATGGCTCCGGTGAG
ACGGAGGAGCCGCCTAAACGAAGATTCAGATACGCTCCTATTGCGATGTTTGAACATAGA
GAGAAAGTGGGTGCTGAAGTTGAAGCGGAAGAGACTGACGAATTCGACAATGATTCTCCA
TTGCCTAAAGCCGTTGTTGGGCTGGACATGAACTTAACAGACTCAGACCAAACTAAGGAG
GCAAAAAATCGTCACTTGAAGCTGGGACTGTGTCTGAATTCTGAAGGGACTGAAGAATGA
AGAGAGAGAGATTCATGCTTTAATTGAGATGAAGCAACTTGTTGTAGCCTTTTGCTTCCT
TTCTTATTAGAGTTTGATCCTCTTCTGGATATGTATCTAGTGTATCTTTGGTTAGAAGAA
GCTATATGTGTATGTTATCTGTATGATCAAAGTTACAATCAAGACTCGATGTTCC

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1DS37JQ 744 0 0
GGGCAGTGACAGTGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTTTGGTTGGGGGGAGAGATGGAAGGC
GTAGGGTCGAGATTGAGCCGAACGTCGTCGAGATACAGTGGTCCGGCAGCGACGGCGGTT
TTCAGCGGCCGCGTAAGGAAGTGGAAGAAGAAGTGGGTACGTGTCTCCACGTCACCCGTC
GGCGTTTTCCGAGCATCTAAATCCAACGGTCGTAGCAACAACAGCAGCAGCAATTCCCCT
CACCATCTGCTTCTCCATAAGTGGACTCCACTTTCCTCCGAAGCTAATGGCTCCGGTGAG
ACGGAGGAGCCGCCTAAACGAAGATTCAGATACGCTCCTATTGCGATGTTTGAACATAGA
GAGAAAGTGGGTGCTGAAGTTGAAGCGGAAGAGACTGACGAATTCGACAATGATTCTCCA
TTGCCTAAAGCCGTTGTTGGGCTGGACATGAACTTAACAGACTCAGACCAAACTAAGGAG
GCAAAAAATCGTCACTTGAAGCTGGGACTGTGTCTGAATTCTGAAGGGACTGAAGAATGA
AGAGAGAGAGATTCATGCTTTAATTGAGATGAAGCAACTTGTTGTAGCCTTTTGCTTCCT
TTCTTATTAGAGTTTGATCCTCTTCTGGATATGTATCTAGTGTATCTTTGGTTAGAAGAA
GCTATATGTGTATGTTATCTGTATGATCAAAGTTACAATCAAGACTCGATGTTCCATTTT
TTTTAATTTCATGAAAATTTTGCG

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL7445Contig1 736 2 5 U
TTTTTGTGATTGAAGAATGGCCGACGGGGAAGACATTCAACCGCTTGTTTGTGACAATGG
AACTGGAATGGTTAAGGCCGGATTCGCAGGTGATGATGCACCAAGAGCGGTCTTCCCGAG
CATTGTTGGCCGTCCTCGTCACACGGGTGTTATGGTTGGGATGGGACAAAAAGATGCTTA
TGTTGGAGACGAGGCTCAGTCAAAACGTGGTATCTTGACTCTCAAGTACCCTATTGAGCA
TGGTATCGTCAACAATTGGGACGACATGGAGAAAATTTGGCATCACACTTTCTATAACGA
GCTTCGTGTTGCCCCTGAAGAACATCCGGTTCTCTTAACCGAAGATCCACTTAATCCCAA
GGCTAACCGTGAGAAGATGACTCAGATCATGTTTGAAACATTCAACACTCCTGCTATGTA
TGTTGCCATTCAAGCTGTTTTGTCACTCTACGCTAGTGGCCGCACAACTGGTATTGTATT
GAACTCTGGAGATGGTGTGAGCCACACTGTACCGATCTACGAGGGTTATGCTCTCCCACA
TGCAATCCTACGTCTTGATCTAGCGGGGCGTGATCTCACGGACTACCTCATGAAAATTCT
AACAGAGCGGGGTTACTCTTTCACCACAACTGCTGAGCGTGAAATCGTTAGGGACATGAA
AGAAAAGCTCTCTTACATTGCTCTAGACTATGAACAAGAGTTAGAGACTTCCAATACAAG
TTCTTCTGTAGAAAAA


BQ
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F905TF U 1
AF RS1A661TF U 6
BS 1 481 RS1F905TF
BS 482 482 RS1A661TF
BS 483 701 RS1F905TF
BS 702 702 RS1A661TF
BS 703 736 RS1F905TF

RD RS1F905TF 736 0 0
TTTTTGTGATTGAAGAATGGCCGACGGGGAAGACATTCAACCGCTTGTTTGTGACAATGG
AACTGGAATGGTTAAGGCCGGATTCGCAGGTGATGATGCACCAAGAGCGGTCTTCCCGAG
CATTGTTGGCCGTCCTCGTCACACGGGTGTTATGGTTGGGATGGGACAAAAAGATGCTTA
TGTTGGAGACGAGGCTCAGTCAAAACGTGGTATCTTGACTCTCAAGTACCCTATTGAGCA
TGGTATCGTCAACAATTGGGACGACATGGAGAAAATTTGGCATCACACTTTCTATAACGA
GCTTCGTGTTGCCCCTGAAGAACATCCGGTTCTCTTAACCGAAGATCCACTTAATCCCAA
GGCTAACCGTGAGAAGATGACTCAGATCATGTTTGAAACATTCAACACTCCTGCTATGTA
TGTTGCCATTCAAGCTGTTTTGTCACTCTACGCTAGTGGCCGCACAACTGGTATTGTATT
GGACTCTGGAGATGGTGTGAGCCACACTGTACCGATCTACGAGGGTTATGCTCTCCCACA
TGCAATCCTACGTCTTGATCTAGCGGGGCGTGATCTCACGGACTACCTCATGAAAATTCT
AACAGAGCGGGGTTACTCTTTCACCACAACTGCTGAGCGTGAAATCGTTAGGGACATGAA
AGAAAAGCTCTCTTACATTGCTCTAGACTATGAACAAGAGT*AGAGACTTCCAATACAAG
TTCTTCTGTAGAAAAA

QA 1 736 1 736
DS 

RD RS1A661TF 725 0 0
GTGATTGAAGAATGGCCGACGGGGAAGACATTCAACCGCTTGTTTGTGACAATGGAACTG
GAATGGTTAAGGCCGGATTCGCAGGTGATGATGCACCAAGAGCGGTCTTCCCGAGCATTG
TTGGCCGTCCTCGTCACACGGGTGTTATGGTTGGGATGGGACAAAAAGATGCTTATGTTG
GAGACGAGGCTCAGTCAAAACGTGGTATCTTGACTCTCAAGTACCCTATTGAGCATGGTA
TCGTCAACAATTGGGACGACATGGAGAAAATTTGGCATCACACTTTCTATAACGAGCTTC
GTGTTGCCCCTGAAGAACATCCGGTTCTCTTAACCGAAGATCCACTTAATCCCAAGGCTA
ACCGTGAGAAGATGACTCAGATCATGTTTGAAACATTCAACACTCCTGCTATGTATGTTG
CCATTCAAGCTGTTTTGTCACTCTACGCTAGTGGCCGCACAACTGGTATTGTATTGAACT
CTGGAGATGGTGTGAGCCACACTGTACCGATCTACGAGGGTTATGCTCTCCCACATGCAA
TCCTACGTCTTGATCTAGCGGGGCGTGATCTCACGGACTACCTCATGAAAATTCTAACAG
AGCGGGGTTACTCTTTCACCACAACTGCTGAGCGTGAAATCGTTAGGGACATGAAAGAAA
AGCTCTCTTACATTGCTCTAGACTATGAACAAGAGTTAGAGACTTCCAATACAAGTTCTT
CTGTA

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL7446Contig1 675 2 6 U
GGGCCGCTCTCTTCTCTTCTCCTCTGAGCTTTCTCTTCTCCTCTACAGACGCATCTGGAG
CTCTCTCCATCTCCAACCTCTCTCAAGCTCGCTCTCCATTTCTCTCAAACTCTCGACCCT
CTCTCCATCTCGCACGATCTCGAGCTCTCCATCTCCAACCTCTCTCAAGCTCGCTCTCCA
TCTCCAACGCATCTCAAGCTCGCTCTACACCTCTCGACCCTCTCTCCATCAAGCTTCGTC
TCGTCTCTCACACCATCTCCAGAGCTCTCTCTCTCGATCTCAAACCCAGGCTCTCCACAT
CTCGACCCTCTCTCCATCAAGCTTCGTGCATCTCCTTCAAGGACTCTGCTTGTCGCTGCT
TCAGTTATATGGTGTCTAAGAAGAAGTACATCTTCACTATTGACGACGATTGCTTCGCTC
TCTCAGGCTTCTCCATAGCATCTCCGGCTCTGTCTGTGTGTCTCAAGCTCTCCTAAGCTT
TGTCTGTCTTTCACTCTCTCGCTCACAAGTACTTGCGGCAAAGAAGTGTGTTGAATAAGA
GTTTGTTTTCACAAGTTTTAAACTTTGTTCTAAAGAAATTTGAAAAGAGTACATGGCCTC
TTCGTTCATTTGTGTACAAGAACACGTCTACTAGAGCCATACTTTCGAATCGACTTCCTT
GAATGTTATATTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FM77TF U 1
AF RS1AP86TFB U 18
BS 1 495 RS1FM77TF
BS 496 496 RS1AP86TFB
BS 497 497 RS1FM77TF
BS 498 499 RS1AP86TFB
BS 500 533 RS1FM77TF
BS 534 675 RS1AP86TFB

RD RS1FM77TF 533 0 0
GGGCCGCTCTCTTCTCTTCTCCTCTGAGCTTTCTCTTCTCCTCTACAGACGCATCTGGAG
CTCTCTCCATCTCCAACCTCTCTCAAGCTCGCTCTCCATTTCTCTCAAACTCTCGACCCT
CTCTCCATCTCGCACGATCTCGAGCTCTCCATCTCCAACCTCTCTCAAGCTCGCTCTCCA
TCTCCAACGCATCTCAAGCTCGCTCTACACCTCTCGACCCTCTCTCCATCAAGCTTCGTC
TCGTCTCTCACACCATCTCCAGAGCTCTCTCTCTCGATCTCAAACCCAGGCTCTCCACAT
CTCGACCCTCTCTCCATCAAGCTTCGTGCATCTCCTTCAAGGACTCTGCTTGTCGCTGCT
TCAGTTATATGGTGTCTAAGAAGAAGTACATCTTCACTATTGACGACGATTGCTTCGCTC
TCTCAGGCTTCTCCATAGCATCTCCGGCTCTGTCTGTGTGTCTCAAGCTCTCCTAAGCTT
TGTCTGTCTTTCACTTT**CGCTCACAAGTACTTGCGGCAAAGAAGTGTGTTG

QA 1 533 1 533
DS 

RD RS1AP86TFB 658 0 0
G
CTCCTCTGAGCTTTCTCTTCTCCTCTACAGACGCATCTGGAGCTCTCTCCATCTCCAACC
TCTCTCAAGCTCGCTCTCCATTTCTCTCAAACTCTCGACCCTCTCTCCATCTCGCACGAT
CTCGAGCTCTCCATCTCCAACCTCTCTCAAGCTCGCTCTCCATCTCCAACGCATCTCAAG
CTCGCTCTACACCTCTCGACCCTCTCTCCATCAAGCTTCGTCTCGTCTCTCACACCATCT
CCAGAGCTCTCTCTCTCGATCTCAAACCCAGGCTCTCCACATCTCGACCCTCTCTCCATC
AAGCTTCGTGCATCTCCTTCAAGGACTCTGCTTGTCGCTGCTTCAGTTATATGGTGTCTA
AGAAGAAGTACATCTTCACTATTGACGACGATTGCTTCGCTCTCTCAGGCTTCTCCATAG
CATCTCCGGCTCTGTCTGTGTGTCTCAAGCTCTCCTAAGCTTTGTCTGTCTTTCACTCTC
TCGCTCACAAGTACTTGCGGCAAAGAAGTGTGTTGAATAAGAGTTTGTTTTCACAAGTTT
TAAACTTTGTTCTAAAGAAATTTGAAAAGAGTACATGGCCTCTTCGTTCATTTGTGTACA
AGAACACGTCTACTAGAGCCATACTTTCGAATCGACTTCCTTGAATGTTATATTTGC

QA 2 658 2 658
DS 



AS 1 2

CO CL7447Contig1 1252 2 6 U
GGACCCTCTCAAATCTCGAAGTCTTGCCCAAACGAAAATGACAGGTTCGATCTCAACCTC
ATGGCTTTTGTCGTCTCTTCCGAATTCAAAATCCATCGCCATCTCAAAGTCCATCTCTTT
CCCGCCCCGAGTTCGAGTCTCATCGAGATCTCCGCTACCCACAACCCAAATCCGAGCCGG
AATCCGCGAGCTACGAGAGCGAATCGATAGCGTAAAAAACACTCAGAAGATCACAGAGGC
GATGAAACTCGTGGCGGCGGCTAGGGTTCGCCGAGCTCAAGAAGCCGTCATCAATTGCAG
ACCTTTCACCGAAACCCTCGTCGGTATCCTCCACTCCATCAACCAGTGCGCTCAATCGGA
AGACGTAGACTTCCCTCTCAGCAACGTCAGACCCGTAAAGAGAGTCGCTTTGGTCGTCGT
CACCGGTGATAAAGGCTTGTGCGGCGGTTTCAACAACGCAGTGATCAAGAAAGCTAACTC
ACGGGTCGACGAGTTGAAGCAGAGAGGTGTAAGCTGCGTTGTGGTGAGCGTAGGAAAGAA
AGGGAACGCTTACTTTAGTAGGAGAGACGATGTCGAAGTCGATAAATGTATCGAAGGAGG
AGGTGTTTATCCGACGGCGAAAGAAGCTCAGGTAATCGCAGACGACGTGTTCTCCTTGTT
CGTGAGCGAGGAGGTTGATAAAGTCGAGCTCGTGTACACAAAGTTCGTGTCTTTAGTGAA
ATCAGATCCTGTGATCCACACTCTGTTACCGTTGTCTGTCAAAGGAGAGTCTCGCGACGT
GAATGGAGAGTGTGTTGACGCTATGGAGGATGAGATGTTTAGGCTGACGAGCAAAGACGG
GAAGCTCGCTGTGGAGAGGACCAAAGTTGAGGTTGTTGAGAGACCGGAGATGATCTCGCC
GTTGATGCAGTTTGAGCAAGACCCTGTTCAGATTCTTGACGCGATGATGCCATTGTATCT
GAACAGTCAGATTCTGAGAGCGTTGCAGGAGTCTTTGGCGAGTGAGCTGGCGTCGAGGAT
GAGTGCTATGAGCAATGCGACGGATAATGCGGTTGAGTTGAAGAAGAGTCTGACGGTTGC
TTATAATCGGGAGAGGCAGGCTAAGATCACTGGGGAGTTGCTGGAGATTGTGGCTGGAGC
CGAAGCTCTTCGAGGGACTTAGTTAGGAGAAAACTATATTTTTGTTAAAACCATTTGTTG
TTTGTGTAACAATGTCATGAAAGAATAAAAAATCGACAAAACACTGATACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D215TF U 1
AF RS1D215JQ C 399
BS 1 536 RS1D215TF
BS 537 537 RS1D215JQ
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ATGGCTTTTGTCGTCTCTTCCGAATTCAAAATCCATCGCCATCTCAAAGTCCATCTCTTT
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AATCCGCGAGCTACGAGAGCGAATCGATAGCGTAAAAAACACTCAGAAGATCACAGAGGC
GATGAAACTCGTGGCGGCGGCTAGGGTTCGCCGAGCTCAAGAAGCCGTCATCAATTGCAG
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CACCGGTGATAAAGGCTTGTGCGGCGGTTTCAACAACGCAGTGATCAAGAAAGCTAACTC
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AGGTGTTTATCCGACGGCGAAAGAAGCTCAG*TAATCGCAGACGACGTGTTCT

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DS 

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CAGACGACGTGTTCTCCTTGTTCGTGAGCGAGGAGGTTGATAAAGTCGAGCTCGTGTACA
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TTAGGCTGACGAGCAAAGACGGGAAGCTCGCTGTGGAGAGGACCAAAGTTGAGGTTGTTG
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TGAAGAAGAGTCTGACGGTTGCTTATAATCGGGAGAGGCAGGCTAAGATCACTGGGGAGT
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TTTTTGTTAAAACCATTTGTTGTTTGTGTAACAATGTCATGAAAGAATAAAAAATCGACA
AAACACTGATACTT

QA 1 854 1 854
DS 



AS 1 2

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TCACGGCGTAAGGAGCTGGTTTGGAATAGAATCTGGAGAGGTTTAGAGTGGAGGAAGGTT
GTGTTGTTGTCCTTAGAAGAGATCTCGCGCTCTGTATCATTTGCATCCACGCCATTATCG
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CGGGGCC


BQ
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AF RS1AY47TF C 1
AF RS1AY47JQ U 4
BS 1 3 RS1AY47TF
BS 4 727 RS1AY47JQ

RD RS1AY47TF 727 0 0
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TACGGGACAACAACAAAAA*GAAAAAAAAGAGAACCCCAATACAAAACATTCACCACTTC
AAAATCCTACTTCGTGATTTCCAAGCCTCTGGCTTTAACGTTTCCAGACCCATGGAGACA
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TATGCCTAAGACCACTCTGAAAACAAAACAACGCATGACAACACTCGCAATTCGACAGAG
GAGAGGGGAACTAATCTCAGGCCTTTATAGCGTCAGCTCTAGGTTTCCATAGCCCTAGCC
TGTACTTATGGCTATATTTCAGTATCAGCTTCCTATGTTTGCAAGGGACGCCATGCTTCT
TGAGCCTGAGGGTACGAGTCACAAGCAGTTTCGAAAGATCACCAATCTCAGTTTCGAGTT
TAGCGATATGAGTCTCAACTCCTCCCCCAATCCCACTCAAGAACTCTGGGATCCCAACCT
TCACGGCGTAAGGAGCTGGTTTGGAATAGAATCTGGAGAGGTTTAGAGTGGAGGAAGGTT
GTGTTGTTGTCCTTAGAAGAGATCTCGCGCTCTGTATCATTTGCATCCACGCCATTATCG
CCGGAGCTTTTCTTCAGTCAGTCAGGCGTTGACAAATCTTCTCTTCCTCCCTCGTACCGG
CGGGGCC

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1AY47JQ 724 0 0
AACTGAAACAAACATCTATGTTCGTGTAGTTTTGTAGCCATAGCAGGTGATCAACAATAC
GGGACAACAACAAAAAAGAAAAAAAAGAGAACCCCAATACAAAACATTCACCACTTCAAA
ATCCTACTTCGTGATTTCCAAGCCTCTGGCTTTAACGTTTCCAGACCCATGGAGACAACA
AGGACATGAATGCAGAAAAAAAGAAAAGACTGAGTTTCAAGTAATTGGCAACGTTGATAT
GCCTAAGACCACTCTGAAAACAAAACAACGCATGACAACACTCGCAATTCGACAGAGGAG
AGGGGAACTAATCTCAGGCCTTTATAGCGTCAGCTCTAGGTTTCCATAGCCCTAGCCTGT
ACTTATGGCTATATTTCAGTATCAGCTTCCTATGTTTGCAAGGGACGCCATGCTTCTTGA
GCCTGAGGGTACGAGTCACAAGCAGTTTCGAAAGATCACCAATCTCAGTTTCGAGTTTAG
CGATATGAGTCTCAACTCCTCCCCCAATCCCACTCAAGAACTCTGGGATCCCAACCTTCA
CGGCGTAAGGAGCTGGTTTGGAATAGAATCTGGAGAGGTTTAGAGTGGAGGAAGGTTGTG
TTGTTGTCCTTAGAAGAGATCTCGCGCTCTGTATCATTTGCATCCACGCCATTATCGCCG
GAGCTTTTCTTCAGTCAGTCAGGCGTTGACAAATCTTCTCTTCCTCCCTCGTACCGGCGG
GGCC

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL7449Contig1 845 2 2 U
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AGTTTATTACTTTGCAATGGAGCAAAGCAAGAAGCTCAAAATTTCTTCTGAGTTGTCCTT
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AGAGTCAGTTTCTTGCCGGAATATTCATAAGGCAGACCGAGAGAAGATACGTAGAGATAA
GCTCAACGAACAGTTTCTTGAGCTAGGAAATGCACTTGATCCTGACAGGCCTAAGAGTGA
CAAAGCTTCGATTCTCATTGACACAATACAAACCCTGAAAGATTTAATGACTCAAGTAGA
TAGACTAAAAGCTGAGCATGTCACACTTTCTCAAGAGTCTCGTGAACTAGTACAAGAGAA
GAGCGAGCTCAGAGAGGAGAAAACATCTCTTAAATCCGACATAGAGATTCTTAATGCTCA
ATATCAGCATAGAGTCAGAAGCATGGTCCCATGGATTCCACATTACACTTATCCTGTCCC
TTTAGTTGCCATAACTCAGGGTCCAGTCTCCACTCTGCCTTTTCCACTCCATGGAACTCA
AAACCCTGCACCGTCACCTAACTCATGCTCTACCTTTATGCCCTATTCAGCCCACTCAGT
CCTAAAACAGAACAAAGAGATGATGTTGGTTTAGAGCTTGAGCTTAACATCCATGCCTTC
TCTTCAGCTCAACAGGATGTTTCTGGAAAAGAAAAGAAAGGAAACTTGACAATCCCTGCA
AGCTCATCTAATAGCTACTACTCATCATCTCAAGCTGTTCAAGATAGTTCCCTTGGTAAT
GTAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RS1CB42TF U 1
AF RS1CB42JQ C 180
BS 1 680 RS1CB42TF
BS 681 845 RS1CB42JQ

RD RS1CB42TF 680 0 0
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AGTTTATTACTTTGCAATGGAGCAAAGCAAGAAGCTCAAAATTTCTTCTGAGTTGTCCTT
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GCTCAACGAACAGTTTCTTGAGCTAGGAAATGCACTTGATCCTGACAGGCCTAAGAGTGA
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ATATCAGCATAGAGTCAGAAGCATGGTCCCATGGATTCCACATTACACTTATCCTGTCCC
TTTAGTTGCCATAACTCAGGGTCCAGTCTCCACTCTGCCTTTTCCACTCCATGGAACTCA
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CCTAAAACAGAACAAAGAGA

QA 1 680 1 680
DS 

RD RS1CB42JQ 666 0 0
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AGCTCAACGAACAGTTTCTTGAGCTAGGAAATGCACTTGATCCTGACAGGCCTAAGAGTG
ACAAAGCTTCGATTCTCATTGACACAATACAAACCCTGAAAGATTTAATGACTCAAGTAG
ATAGACTAAAAGCTGAGCATGTCACACTTTCTCAAGAGTCTCGTGAACTAGTACAAGAGA
AGAGCGAGCTCAGAGAGGAGAAAACATCTCTTAAATCCGACATAGAGATTCTTAATGCTC
AATATCAGCATAGAGTCAGAAGCATGGTCCCATGGATTCCACATTACACTTATCCTGTCC
CTTTAGTTGCCATAACTCAGGGTCCAGTCTCCACTCTGCCTTTTCCACTCCATGGAACTC
AAAACCCTGCACCGTCACCTAACTCATGCTCTACCTTTATGCCCTATTCAGCCCACTCAG
TCCTAAAACAGAACAAAGAGATGATGTTGGTTTAGAGCTTGAGCTTAACATCCATGCCTT
CTCTTCAGCTCAACAGGATGTTTCTGGAAAAGAAAAGAAAGGAAACTTGACAATCCCTGC
AAGCTCATCTAATAGCTACTACTCATCATCTCAAGCTGTTCAAGATAGTTCCCTTGGTAA
TGTAAA

QA 1 666 1 666
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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ACCCCGATCCAATCTTAGCCCCCTCTCCTACAGTAATATTCCCCAGTATACAACTCCCTT
CCGATACTCTGTTTTGAATCGAAACGTCGTCTCCGATCACCGCCGTCTCTCCAAGCGAGG
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GCTGCTTTTAGGTCTTGCTTCGCCGATTCCACGATCTCGGGGCTTTCTTTTAAGACGCTG
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ATGTTGGCCAAAGCGGAATCTAAGGATCGGTGCGATGTAATGGAAGCGTGATAGTAGCTT
GACAAAATGGGTTCTTGCTCTACGTCGGATTTGGCTTCTTCAAGCATCTTGAGCCAGACA
TCACCGCTGTCGTCCAGCGAGTTTGTTGTCATGGGTGTTCGTGGAGGGAAATGACACGGT
CGGAAGAGATTCATGTAACAGAACCGAGAAGAGTCCTCGTCATGGGGTTTACATGTTCTG
TAAGTTTCAATGCAGGGAGCCATAGAATCTTTGGGATTGGAACAAGAGAGGAGGGAATGG
CTGTTGTGTGGAGAAGGAGAAGATGAACACAGCTTATATAGGAGATGGCCACGACTTGTG
CTGCTGATCGAGAACATGATGTTGGTAAGTATAGTAACAATATTATTTTACTCAAGTATG
CTTTTTCGGATTTTAAAATTTGTTCATTTCTAACGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AP46TFB U 1
AF RS1AP46JQ C 62
BS 1 784 RS1AP46TFB
BS 785 817 RS1AP46JQ

RD RS1AP46TFB 784 0 0
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ACCCCGATCCAATCTTAGCCCCCTCTCCTACAGTAATATTCCCCAGTATACAACTCCCTT
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GCTGCTTTTAGGTCTTGCTTCGCCGATTCCACGATCTCGGGGCTTTCTTTTAAGACGCTG
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ATGTTGGCCAAAGCGGAATCTAAGGATCGGTGCGATGTAATGGAAGCGTGATAGTAGCTT
GACAAAATGGGTTCTTGCTCTACGTCGGATTTGGCTTCTTCAAGCATCTTGAGCCAGACA
TCACCGCTGTCGTCCAGCGAGTTTGTTGTCATGGGTGTTCGTGGAGGGAAATGACACGGT
CGGAAGAGATTCATGTAACAGAACCGAGAAGAGTCCTCGTCATGGGGTTTACATGTTCTG
TAAGTTTCAATGCAGGGAGCCATAGAATCTTTGGGATTGGAACAAGAGAGGAGGGAATGG
CTGTTGTGTGGAGAAGGAGAAGATGAACACAGCTTATATAGGAGATGGCCACGACTTGTG
CTGCTGATCGAGAACATGATGTTGGTAAGTATAGTAACAATATTATTTTACTCAAGTATG
CTTT

QA 1 784 1 784
DS 

RD RS1AP46JQ 756 0 0
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CTGCTTTTAGGTCTTGCTTCGCCGATTCCACGATCTCGGGGCTTTCTTTTAAGACGCTGA
TGAACATCTCGAATAGGGTTTCGCTTGGTAAGGTTAAAGTGCTTAGCTTTAGTGAGAGGA
TGTTGGCCAAAGCGGAATTTAAGGATCGGTGCGATGTAATGGAAGCGTGATAGTAGCTTG
ACAAAATGGGTTCTTGCTCTACGTCGGATTTGGCTTCTTCAAGCATCTTGAGCCAGACAT
CACCGCTGTCGTCCAGCGAGTTTGTTGTCATGGGTGTTCGTGGAGGGAAATGACACGGTC
GGAAGAGATTCATGTAACAGAACCGAGAAGAGTCCTCGTCATGGGGTTTACATGTTCTGT
AAGTTTCAATGCAGGGAGCCATAGAATCTTTGGGATTGGAACAAGAGAGGAGGGAATGGC
TGTTGTGTGGAGAAGGAGAAGATGAACACAGCTTATATAGGAGATGGCCCCGACTTGTGC
TGCTGATCGAGAACATGATGTTGGTAAGTATAGTAACAATATTATTTTACTCAAGTATGC
TTTTTCGGATTTTAAAATTTGTTCATTTCTAACGAG

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL7452Contig1 399 2 1 U
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TTTGTCAGTCTCAAATGTGTAATAACACAAGAAAAAATCACTCCCAAGTGATCAGAAAAG
AGGACTCATTTGGTTTTTATGGCAATGTTGTTATATATG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DR50JQ C 1
AF RS1DR50TF U 1
BS 1 399 RS1DR50TF

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GCCATTTGGGTCGTCCAACCATTTGATTGGATAAAGAAGACGTTCATCGATAAACCTGCA
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GTTTTGGGTTTTTATTTTTGGGGCTTTTTGGTTTTCATTTAATGTCTTCAGTGTAGACTT
TTTGTCAGTCTCAAATGTGTAATAACACAAGAAAAAATCACTCCCAAGTGATCAGAAAAG
AGGACTCATTTGGTTTTTATGGCAATGTTGTTATATATG

QA 1 399 1 399
DS 

RD RS1DR50TF 399 0 0
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AAGATCCAACCGGTGGACATTCAGGCCGCCGTAGGATGGGGTGTCGCCGCCGTAGCCGGC
GCCATCTGGGTCGTCCAACCATTTGATTGGATAAAGAAGACGTTCATCGATAAACCTGCA
CCGGAAGAGAACTGATGGATCAAACAAGATGTATACTTTCTTTGTGATGTGACTGAATAA
GTTTTGGGTTTTTATTTCTGGGGCTTTTTGGTTTTCATTTAATGTCTTCAGTGTAGACTT
TTTGTCAGTCTCAAATGTGTAATAACACAAGAAAAAATCACTCCCAAGTGATCAGAAAAG
AGGACTCATTTGGTTTTTATGGCAATGTTGTTATATATG

QA 1 399 1 399
DS 



AS 1 2

CO CL7453Contig1 811 2 1 U
GGGCGTCGAAAGAAAAGAAAAAGAGAGAGACCTGGCAAATACTGCACTTGATATCATCAT
CCTTTTCCATAGAAATGGCACCGGTTTCATCTGCCACTTGATAAATGCTTCTCTTGAGGC
TTCTTGAGAGTGCTTCTTCGATTAGAGCTGTGCTCACTGTTCCCATTTCATCCCCCAAAG
CTAGTAGTTCCTCATATGACATGTTATCAATGTCAAGCCTCATATCGCTATGCTGATCGT
AGAATCTGATCATACCACTTGAGAATAGATTCGTCTCTAAAGAAGACATTTGCTCATATG
TAAGCACTTGATCATTTTCAATTCTTTCCAGGGCCAACAATACCTCTGCAATTCCATCAA
TGTTGTAGAGAGTTAAACCATCACGGTTCACCAAAGAGCTTGATGGGTCAGCTTCTGAGG
GGCTACCAGGCATCGTGCTACGCAGCCAGCCGGTACTGCTGTTCGGCCTACTGTAACTAT
TCGATGGACCAAATGAACGAGAAGGATTAGGATTGGTTGGTGCTGCAGGTTGAGGCGTTT
GTCGAGAAGCAGCAGGGGATGCAAAAGCTCTAAGTCTCCCTGATCTACCAGAATTATTAC
CAGATCTCCTACCACCACTTGAAACAACACTATTATCCCTGATAGTTGGTGGTACCATAC
GATTCCTTCTGTTATCAGAAACTGTGATCCCGTTTCCATGTGTAGAACTTTGATTCCTTC
CCTTGATCACCGACACGCTACTCTTACTGCCTTGGCTAGAGGAGCTGCTCTCTCCATCTG
AGCTTTTCTTTTTAGTCACGCTGACTTTTGT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1FK54JQ U 1
AF RS1F433JQ U 1
BS 1 811 RS1F433JQ

RD RS1FK54JQ 716 0 0
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DS 

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CCTTTTCCATAGAAATGGCACCGGTTTCATCTGCCACTTGATAAATGCTTCTCTTGAGGC
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CTAGTAGTTCCTCATATGACATGTTATCAATGTCAAGCCTCATATCGCTATGCTGATCGT
AGAATCTGATCATACCACTTGAGAATAGATTCGTCTCTAAAGAAGACATTTGCTCATATG
TAAGCACTTGATCATTTTCAATTCTTTCCAGGGCCAACAATACCTCTGCAATTCCATCAA
TGTTGTAGAGAGTTAAACCATCACGGTTCACCAAAGAGCTTGATGGGTCAGCTTCTGAGG
GGCTACCAGGCATCGTGCTACGCAGCCAGCCGGTACTGCTGTTCGGCCTACTGTAACTAT
TCGATGGACCAAATGAACGAGAAGGATTAGGATTGGTTGGTGCTGCAGGTTGAGGCGTTT
GTCGAGAAGCAGCAGGGGATGCAAAAGCTCTAAGTCTCCCTGATCTACCAGAATTATTAC
CAGATCTCCTACCACCACTTGAAACAACACTATTATCCCTGATAGTTGGTGGTACCATAC
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AGCTTTTCTTTTTAGTCACGCTGACTTTTGT

QA 1 811 1 811
DS 



AS 1 2

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GTTTATTATTATTCTGTTTAATCTTGTTTTTCCTCAGACATGAATTGTGTAACTTTTTTT
TATTATATTGACAAGTGTATTTTCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1A613TF U 1
AF RS1A613JQ C 86
BS 1 807 RS1A613TF

RD RS1A613TF 807 0 0
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GTTTATTATTATTCTGTTTAATCTTGTTTTTCCTCAGACATGAATTGTGTAACTTTTTTT
TATTATATTGACAAGTGTATTTTCTAC

QA 1 807 1 807
DS 

RD RS1A613JQ 722 0 0
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GACTAAGAGTGCTTCTGACTATGAGCTTGAAGTGCTTCTCTCCAACAGGTTTGAGTACAA
TGCTTCTGCCTCGTTAGTGAAGGAAGTTTCGTTTGAGGAAGCTGAAGGGGGTATCAAGAC
CAGTTTTAAGTGGAAGTGACTGCACCTCACCTTTCCTCGCTGTTCATAAACTTTCGTTTT
GGCTACTAAAAAGCTCAACTCAGAGCGGTAATGTTGTTTATTATTATTCTGTTTAATCTT
GTTTTTCCTCAGACATGAATTGTGTAACTTTTTTT*ATTATATTGACAAGTGTATTTTCT
AC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL7455Contig1 751 2 3 U
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CAAAAACAACGAAGAAGACAAAAGAGGAACAGAAAGTGGACACAAGAAAAATAAAATGGG
TTTTCTTTTGGAAATGGGAAACATATGGTTGAGAGATCCGACTTTTCCTGATTTTAGTTA
GATTCAATATGCTTCTTGACGATGTTGAGTGCAGTTGTCTCCTCACCGTAATCCTTGACT
ACAAGGCACGAGCACCCAACAACCTTCCTTGCATTGCCCTCTGAATCAATCTTGCAAAGA
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GAGAGAGAGAGGCGCTACAAGGACGAGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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TACCGGAATAGTACTGACCCAAGAAAAACTTCCGAACTTCTCTACCTTCAAGCCATTCGC
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QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1FO29TF U 1
AF RS1FO29JQ C 491
BS 1 734 RS1FO29TF
BS 735 735 RS1FO29JQ
BS 736 773 RS1FO29TF
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BS 803 813 RS1FO29TF
BS 814 1229 RS1FO29JQ

RD RS1FO29TF 813 0 0
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CGGCTCTGGTGGGTACACGTGTCGTCAAACGAGCACAAGATGGACACCAACAACTGAGCA
AATCAGAATCCTCAAAGATCTTTACTACAACAACGGAGTCCGATCACCAACGGCCGACCA
GATCCAGAAGATCTCTGCAAGGCTGAGACAGTATGGAAAAATCGAGGGTAAAAACGTCTT
TTACTGGTTCCAGAACCGTAAGGCTCGTGAGCGACAGAAGAAGAGATTCAACGGCACAGT
AATGACCACGCCTACGTCTTCATCTTCCAACTCGGTTATGATGGCTAGTGATCATTATTA
TAACAATCATCAGAATCATCATCCTCTTCTTCACCATCCTCATAATGGTGTTACCATGCA
GAGACCTGCTTCAGTAAACGCTAAGCTTGACCAAGAAAATCACTTGCTTCATCAGAACAT
ATCATATCCTAGCTTCAATAACGGCACTGAATGTGGCGTTCTTAACGCGTCATCTTATGG
CTACATGAATAGCCATCTCTATGGATCTATGGAACAAGATTTTTCAATGAGCTACAACAA
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CTTCTTCCATAGAC*AAAGCCTATATTTGAAGTAGAACGTCATCAAGAAGAAG*AGAATA
TGGTGGCGATGCTTATCTGGA*CACAGACGTAC

QA 1 813 1 813
DS 

RD RS1FO29JQ 739 0 0
TCAGTAAACGCTAAGCTTGACCAAGAAAATCACTTGCTTCATCAGAACATATCATATCCT
AGCTTCAATAACGGCACTGAATGTGGCGTTCTTAACGCGTCATCTTATGGCTACATGAAT
AGCCATCTCTATGGATCTATGGAACAAGATTTTTCAATGAGCTACAACAACGTAGGTGGA
GAGTGGACAAACATGGATCATAATCATCACTACGCTGCTCCAGCATACAACTTCTTCCAT
AGACCAAAGCCTATATTTGAAGTAGAAGGTCATCAAGAAGAAGGAGAATATGGTGGCGAT
GCTTATCTGGAACACAGACGTACACTTCCTCTCTTCCCTATGCACGGCGAGGATCACATT
AACGCTGTTGGTGGTGCCGTTTGGAAGCACGGACAAGCGGACGGTCGTGACCATTATGGT
AGAGGACATTGTGCTTCTCTTAAGCTATGTCTGAACTCCTACACCAGCGTCACACAGGAC
TAATGCTTTCTTGAGCTACGTCTCAACTCCTAAGCCGGCGTCGCACTGTATTGAAGCTTT
CTTTAGCTATCTCTTAATCGTATGTTTGGATCGTATTATGCAGTTATAATAGTAGTATCT
ACCGTACGTACGTAGTTTAAACAATTGTAGTTATTACTATCGTCTAGGTTGAACTTTAAT
TGACCGTGGTTTTCTACTTTCTTTTATAATGTATAACGTTGAATTTATATCACTATGAAA
TTTGAGTCTATTTCAGTAC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

CO CL7458Contig1 995 2 2 U
GCAAAGCAAAATTGTGTTTTCTGTGTAGCCGAGGAGGTTGAGTTTGACATCTCTCGTGTC
GCCGTCGTCGGTGAAGCCTCCCTCCTCTCCCACTAGGAGAACCATTGATCTTGGCCATGG
AAGCGACCTCATCTACATTCAGAGGCTTCTTCCCTTTCAAAAGTCTTGGACTTTCTTTGA
TTATCTCGACAAACATATTCCTTGGACCAGGCCCACCATCCGTGTCTTTGGTCGTTCTTG
CCTTCAGCCGAGGGATACATGTTGTGTTGCAAGTAGCGGACTGACGCCGCTCATCTATAG
TGGATATCGACCTGATGCCTATTCCTGGGATGATTTTCCACCTCTCAAGGAGATCCTAGA
TGCTATTTGCGAAGCCCTTCCTGGAAGCAGATTCAACAGCTTGCTTTTGAATAGGTACAA
AGGTGCCAATGACTATGTTGGTTGGCATTCAGATGATGAAAAACTTTACGGTCCTACTCC
TGAAATTGCTTCCCTCTCTTTTGGATGCGAACGTGACTTTGTGCTCAAGAAAAAGAAACT
TCAAGAAGACTCTTCTCATCGTATGGAAACTTTTTTGATTCATGCAAGACTCAGTGAGGG
ACTAACGTTTGTTTCGGTGTGTGTGGATCTGCAGAGAAAAGAGGAGATGGTGGACCAGCG
AAGAAGAGGTTAAAGAAAAGCAGCAGAGGAGAGGATCAACAGAGTTTCACATTGAAGCAT
GGATCATTGCTGGTGATGAGGGGATACACGCAAAGGGACTGGATTCATTCTGTGCCGAAG
CGTGCAAAGGCAGAGGGCACTCGTATTAACCTCACCTTCAGGCTTGTTTTGTAAACCAAA
GCATCGTCATCAACAAGCTTAGCTTGGTCTCTGGCTGATCTCCAAGTCACATTGATTGAC
TAGGCTTTTCTCATCTTAGTTCTTTGACATTATGAGATATAAACACAAGCTGGTGTAAGA
CATTTTAAGAAGCTAATCACTAAACTTAACGTGGC


BQ
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AF RS1AN38TF U 1
AF RS1AN38JQ C 170
BS 1 786 RS1AN38TF
BS 787 995 RS1AN38JQ

RD RS1AN38TF 786 0 0
GCAAAGCAAAATTGTGTTTTCTGTGTAGCCGAGGAGGTTGAGTTTGACATCTCTCGTGTC
GCCGTCGTCGGTGAAGCCTCCCTCCTCTCCCACTAGGAGAACCATTGATCTTGGCCATGG
AAGCGACCTCATCTACATTCAGAGGCTTCTTCCCTTTCAAAAGTCTTGGACTTTCTTTGA
TTATCTCGACAAACATATTCCTTGGACCAGGCCCACCATCCGTGTCTTTGGTCGTTCTTG
CCTTCAGCCGAGGGATACATGTTGTGTTGCAAGTAGCGGACTGACGCCGCTCATCTATAG
TGGATATCGACCTGATGCCTATTCCTGGGATGATTTTCCACCTCTCAAGGAGATCCTAGA
TGCTATTTGCGAAGCCCTTCCTGGAAGCAGATTCAACAGCTTGCTTTTGAATAGGTACAA
AGGTGCCAATGACTATGTTGGTTGGCATTCAGATGATGAAAAACTTTACGGTCCTACTCC
TGAAATTGCTTCCCTCTCTTTTGGATGCGAACGTGACTTTGTGCTCAAGAAAAAGAAACT
TCAAGAAGACTCTTCTCATCGTATGGAAACTTTTTTGATTCATGCAAGACTCAGTGAGGG
ACTAACGTTTGTTTCGGTGTGTGTGGATCTGCAGAGAAAAGAGGAGATGGTGGACCAGCG
AAGAAGAGGTTAAAGAAAAGCAGCAGAGGAGAGGATCAACAGAGTTTCACATTGAAGCAT
GGATCATTGCTGGTGATGAGGGGATACACGCAAAGGGACTGGATTCATTCTGTGCCGAAG
CGTGCA

QA 1 786 1 786
DS 

RD RS1AN38JQ 826 0 0
ACTTTCTTTGATTATCTCGACAAACATATTCTTTGGACCAGGCCCACCATCCGTGTCTTT
GGTCGTTCTTGCTTTCAGCCGAGGGATACATGTTGTGTTGCAAGTAGCGGACTGACGCCG
CTCATCTATAGTGGATATCGACCTGATGCCTATTCCTGGGATGATTTTCCACCTCTCAAG
GAGATCCTAGATGCTATTTGCGAAGCCCTTCCTGGAAGCAGATTCAACAGCTTGCTTTTG
AATAGGTACAAAGGTGCCAATGACTATGTTGGTTGGCATTCAGATGATGAAAAACTTTAC
GGTCCTACTCCTGAAATTGCTTCCCTCTCTTTTGGATGCGAACGTGACTTTGTGCTCAAG
AAAAAGAAACTTCAAGAAGACTCTTCTCATCGTATGGAAACTTTTTTGATTCATGCAAGA
CTCAGTGAGGGACTAACGTTTGTTTCGGTGTGTGTGGATCTGCAGAGAAAAGAGGAGATG
GTGGACCAGCGAAGAAGAGGTTAAAGAAAAGCAGCAGAGGAGAGGATCAACAGAGTTTCA
CATTGAAGCATGGATCATTGCTGGTGATGAGGGGATACACGCAAAGGGACTGGATTCATT
CTGTGCCGAAGCGTGCAAAGGCAGAGGGCACTCGTATTAACCTCACCTTCAGGCTTGTTT
TGTAAACCAAAGCATCGTCATCAACAAGCTTAGCTTGGTCTCTGGCTGATCTCCAAGTCA
CATTGATTGACTAGGCTTTTCTCATCTTAGTTCTTTGACATTATGAGATATAAACACAAG
CTGGTGTAAGACATTTTAAGAAGCTAATCACTAAACTTAACGTGGC

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 2

CO CL7459Contig1 754 2 6 U
GAGGAACCCCTGGGAAAGCATCTTGATCAGATCTAGACGAATTAGCCAGATAGGCAGACA
CCCAATGGAAAGATGAGTGCTGTTCAATTATTTGAGTTCGGTCTAATTTTGACCTAACAA
GAGCAACGGAATCACGCTCTGTAGGATTTGAACCTACGACATTGGGTTTTGGAGACCCAC
GTTCTACCGAACTGAACTAAGAGCGCTTTCTTATCACAATTAATAAGACTGTAAAGACGA
GGATTCTTTTTTTTTTTTTATAACCCCAATAAATTCTCCACGCCTATACTATTATATATA
ATATGAGAAATTGAAAGATTATCTATGTCCAATTTGAATCGATCTCAAATTGATCCCTCC
TTACTGCTCAGAGGAGAAAGAATAGGTAGGGATGACAGGAGAAGTCTCAGATGATCCTAT
CATTTGAGGATTCGAACCTGTGACATTTTTGACTCAAAACAAAGGCGCTACCAAGCTGCG
CTACATCCCTTTCAATTGGTCTACGGTCTCATTGTAGAGAATCCCTGCCCTCTTTTCCAC
GTCCGAGGAACGCCTCCATCGATATCAAATTTCTCTTGCCATTTTTTCTTTTTGCTTTTG
ATTTATATACTCATCATAATCCCGCCCCTCCTACAAACGCTAACTTACTTATGAGAAAAA
AGGCTGATAAATAATCAGCCCTTTGAATTGAATAAGCGAGGCTTTCCCGATAGAAATGCT
CGCATGCGAGAGAGATCCCAATTCCGTCTATCCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AW81JQ C 1
AF RS1AW81TF U 1
BS 1 662 RS1AW81TF
BS 663 663 RS1AW81JQ
BS 664 715 RS1AW81TF
BS 716 716 RS1AW81JQ
BS 717 726 RS1AW81TF
BS 727 754 RS1AW81JQ

RD RS1AW81JQ 754 0 0
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CCCAATGGAAAGATGAGTGCTGTTCAATTATTTGAGTTCGGTCTAATTTTGACCTAACAA
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GTTCTACCGAACTGAACTAAGAGCGCTTTCTTATCACAATTAATAAGACTGTAAAGACGA
GGATTCTTTTTTTTTTTTTATAACCCCAATAAATTCTCCACGCCTATACTATTATATATA
ATATGAGAAATTGAAAGATTATCTATGTCCAATTTGAATCGATCTCAAATTGATCCCTCC
TTACTGCTCAGAGGAGAAAGAATAGGTAGGGATGACAGGAGAAGTCTCAGATGATCCTAT
CATTTGAGGATTCGAACCTGTGACATTTTTGACTCAAAACAAAGGCGCTACCAAGCTGCG
CTACATCCCTTTCAATTGGTCTACGGTCTCATTGTAGAGAATCCCTGCCCTCTTTTCCAC
GTCCGAGGAACGCCTCCATCGATATCAAATTTCTCTTGCCATTTTTTCTTTTTGCTTTTG
ATTTATATACTCATCATAATCCCGCCCCTCCTACAAACGCTAACTTACTTATGAGAAAAA
AGGCTGATAAATAATCAGCCCTTTGAATTGAATAAGCGAGGCTTTCCCGATAGAAATGCT
CGCATGCGAGAGAGATCCCAATTCCGTCTATCCG

QA 1 754 1 754
DS 

RD RS1AW81TF 726 0 0
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GTTCTACCGAACTGAACTAAGAGCGCTTTCTTATCACAATTAATAAGACTGTAAAGACGA
GGATTCTTTTTTTTTTTTTATAACCCCAATAAATTCTCCACGCCTATACTATTATATATA
ATATGAGAAATTGAAAGATTATCTATGTCCAATTTGAATCGATCTCAAATTGATCCCTCC
TTACTGCTCAGAGGAGAAAGAATAGGTAGGGATGACAGGAGAAGTCTCAGATGATCCTAT
CATTTGAGGATTCGAACCTGTGACATTTTTGACTCAAAACAAAGGCGCTACCAAGCTGCG
CTACATCCCTTTCAATTGGTCTACGGTCTCATTGTAGAGAATCCCTGCCCTCTTTTCCAC
GTCCGAGGAACGCCTCCATCGATATCAAATTTCTCTTGCCATTTTTTCTTTTTGCTTTTG
ATTTATATACTCATCATAATCCCGCCCCTCCTACAAACGCTAACTTACTTATGAGAAAAA
AG*CTGATAAATAATCAGCCCTTTGAATTGAATAAGCGAGGCTTTCCCGATAGAA*TGCT
CGCATG

QA 1 726 1 726
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL7462Contig1 729 2 3 U
TTTTTCTTCTTCTTTCTCTCTCCTTTCTCCACTCTCCCTCTCTCTCTCATTGCGAAGATG
ATAGATTCTACCTTGGAGTTCGTCAACAAAACCACTTCCAATTCTTTATTCATGTTCCTC
TTCTGCAACTTGATCATCATATTAATCCTCTTGGGAAACTCTAAACCGGGTTCAGAAGAC
AAGCTCGGTTCGAAGGAATCCATGTTGGTACCTGAATCGGTTCTCTCTTCCAAGTCCATA
TTGTTATCTGAGTCGAGGACTCTCAGCTCAAAGACCGATTTTAAGAAACCCGTGTTGATA
CCTGAATCGGTTCTGTCTTTCAAACCCGTGTTAGTATCTGAATCGGTTCTCTCTTCCAAA
CCCGGTTTGGAGAAACCAGGGTTAATATCTGATTCTACTCTCCCGTTAAATTCCGGTTTA
AAAGAACCGGAAATGATATCAAAGTCGGTTGGCTCCTCCCAGCCTGTGGGTTCTGATCAA
TCGTTGACTTCTAAACCCGGTTTGAATGTAATATCTTCTGGGTTGAAACTCGGTTCAGAC
TGTTTAGAGAAGGAGGACGAGAGAGGGAGAATGAGAAAGAAAGAGAGCTTGGAAGTAGAA
AATGAGAGCCTGGAAGTGGAGTGTGTGCTTAGAAGACGAGCTGAAGAATTTATTCGTAAA
GTTAATACTCAATGGAAATTAGAGAATACTCGTCTCCTATACTAATCAGAGTTTTGTTTG
TAATTATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CD21TF U 1
AF RS1CD21JQ C 8
BS 1 714 RS1CD21TF
BS 715 715 RS1CD21JQ
BS 716 729 RS1CD21TF

RD RS1CD21TF 729 0 0
TTTTTCTTCTTCTTTCTCTCTCCTTTCTCCACTCTCCCTCTCTCTCTCATTGCGAAGATG
ATAGATTCTACCTTGGAGTTCGTCAACAAAACCACTTCCAATTCTTTATTCATGTTCCTC
TTCTGCAACTTGATCATCATATTAATCCTCTTGGGAAACTCTAAACCGGGTTCAGAAGAC
AAGCTCGGTTCGAAGGAATCCATGTTGGTACCTGAATCGGTTCTCTCTTCCAAGTCCATA
TTGTTATCTGAGTCGAGGACTCTCAGCTCAAAGACCGATTTTAAGAAACCCGTGTTGATA
CCTGAATCGGTTCTGTCTTTCAAACCCGTGTTAGTATCTGAATCGGTTCTCTCTTCCAAA
CCCGGTTTGGAGAAACCAGGGTTAATATCTGATTCTACTCTCCCGTTAAATTCCGGTTTA
AAAGAACCGGAAATGATATCAAAGTCGGTTGGCTCCTCCCAGCCTGTGGGTTCTGATCAA
TCGTTGACTTCTAAACCCGGTTTGAATGTAATATCTTCTGGGTTGAAACTCGGTTCAGAC
TGTTTAGAGAAGGAGGACGAGAGAGGGAGAATGAGAAAGAAAGAGAGCTTGGAAGTAGAA
AATGAGAGCCTGGAAGTGGAGTGTGTGCTTAGAAGACGAGCTGAAGAATTTATTCGTAAA
GTTAATACTCAATGGAAATTAGAGAATACTCGTCTCCTATACTAATCAGAGTTT*GTTTG
TAATTATCG

QA 1 729 1 729
DS 

RD RS1CD21JQ 722 0 0
TCTTCTTTCTCTCTCCTTTCTCCACTCTCCCTCTCTCTCTCATTGCGAAGATGATAGATT
CTACCTTGGAGTTCGTCAACAAAACCACTTCCAATTCTTTATTCATGTTCCTCTTCTGCA
ACTTGATCATCATATTAATCCTCTTGGGAAACTCTAAACCGGGTTCAGAAGACAAGCTCG
GTTCGAAGGAATCCATGTTGGTACCTGAATCGGTTCTCTCTTCCAAGTCCATATTGTTAT
CTGAGTCGAGGACTCTCAGCTCAAAGACCGATTTTAAGAAACCCGTGTTGATACCTGAAT
CGGTTCTGTCTTTCAAACCCGTGTTAGTATCTGAATCGGTTCTCTCTTCCAAACCCGGTT
TGGAGAAACCAGGGTTAATATCTGATTCTACTCTCCCGTTAAATTCCGGTTTAAAAGAAC
CGGAAATGATATCAAAGTCGGTTGGCTCCTCCCAGCCTGTGGGTTCTGATCAATCGTTGA
CTTCTAAACCCGGTTTGAATGTAATATCTTCTGGGTTGAAACTCGGTTCAGACTGTTTAG
AGAAGGAGGACGAGAGAGGGAGAATGAGAAAGAAAGAGAGCTTGGAAGTAGAAAATGAGA
GCCTGGAAGTGGAGTGTGTGCTTAGAAGACGAGCTGAAGAATTTATTCGTAAAGTTAATA
CTCAATGGAAATTAGAGAATACTCGTCTCCTATACTAATCAGAGTTTTGTTTGTAATTAT
CG

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL7463Contig1 1271 2 4 U
GGACCAAAACATTTTCTCTTTAAATTATCTATCTCTTTGATTCATCAATGGCTGAAGCTT
GTGGAGTACGGAGGATGAAACTTGGGAGCCAAGGCCTTGAGGTTTCAGCTCAGGGACTTG
GTTGCATGGGTCTCTCTGCCTTCTACGGTGCTCCAACACCAGAGACAAACGCCGTCGCTC
TTCTCCGTCATGCCATTAACGCCGGCGTCACATTCCTAGACACTTCAGACATATACGGCC
CCGAGACTAACGAGCTGCTCCTGGGCAAGGCTTTGAAAGATGGGTTGAGGGAGAAAGTGG
AATTGGCAACAAAGTTTGGGATCATTGCTTCTGAAGATGGAAAATTTGGTTTTAGGGCAG
ATCCAGAGTATGTACGGTCTGCTTGTGAGGCAAGCTTAAGGCGTCTTGGTGTTACCTCCA
TTGATCTTTACTACCAGCATAGGATTGATACCACTGTCCCCATCGAAGTCACGATGGGAG
AACTGAAGAAGCTTGTAGAAGAAGGCAAAATAAAATACATAGGTTTGTCTGAAGCCTCTG
CTTCAACTATCAGAAGAGCACATGCTGTTCACCCCGATAACTGCTGTGCAGATAGAATGG
TCCCTGTGGTCAAGAGACGTGGAAGAAGATATCATTCCTACCTGCAGGGAACTTGGGATT
GGAATTGTAGCTTATAGCCCTTTAGGAAGAGGGTTCTTGGCAGCAGGACCTAAGCTTGCT
GAGAATTTGGAGGACGATGATTATCGAAAGGGTCTACCGAGATTCCAAGAGGAGAATCTA
AAGCACAACAAGATTCTTTACGAGAAAGTTGTGGCGATGGCGACAAAGAAAAGCTGCACT
CCTGCACAGCTAGCTCTTGCATGGGTTCACCACCAGGGAGATGACGTCTGTCCCATTCCA
GGAACCTCCAAGATTGAAAACCTGAACCATAACATTGGAGCTTTATCTGTGAAGCTTACT
CCTGATGAGATGGCTGAGCTGGAAGCCATTGCCCGACCTGATTTTGTGAAAGGGGAACGA
TACGACAGCGACATGACTACTTACAAGGACTCGGAGACTCCGCCACTGTCTTCTTGGAAA
GCAGCATAAATCGCATCTTTGGAATGCCGTTTTATTGTGCTTTAGTTTGTTTCTGTGTGT
TTGAATAAGTTCAGGTTAATGGATGGGTCTGCGAGTTTGCAGTAAGAAAAATCCAATGCC
TAAGAAAGAACAAGTTTTATGTAATAGTATTTGTGGTGTTTTTGTCTTGCAATTTAATAA
TTTGATCAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GC47TF U 1
AF RS1GC47JQ C 549
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RD RS1GC47TF 681 0 0
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GGAATTGTAGCTTATAGCCCT

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DS 

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GGAGGACGATGATTATCGAAAGGGTCTACCGAGATTCCAAGAGGAGAATCTAAAGCACAA
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CGACATGACTACTTACAAGGACTCGGAGACTCCGCCACTGTCTTCTTGGAAAGCAGCATA
AATCGCATCTTTGGAATGCCGTTTTATTGTGCTTTAGTTTGTTTCTGTGTGTTTGAATAA
GTTCAGGTTAATGGATGGGTCTGCGAGTTTGCAGTAAGAAAAATCCAATGCCTAAGAAAG
AACAAGTTTTATGTAATAGTATTTGTGGTGTTTTTGTCTTGCAATTTAATAATTTGATCA
AGC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

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AATAACATGTGGCGAAGAAGGGTAAGCATTTATATTATTAAAATTTTCTTTTGTTTGCTC
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GATGTTATTTTGCTGGTTTACTATGTTCAGAGACCTTGAGTTCCATGTAATTTTTCTTTC
GTTGTTGTGTTTAGTAAATTTTGGTGTAATAGTTTAGATTAGTAGTTAACCATATCTCAC
ATTTATGTAATGAAATCTATCATATGTCAGTAAGTTACAGTAATATTTGTGTCTCTTCTT
TAAGTTAAGTAGTAAGGCTGACTTCCAATCAACTCAACCAATATGTTGATAAACGTTTTT
ATAGGAGTTCCGTGGTTCCATTTTGGTTACCCAAAATCAAGCCCTTTCTTGTTTGTTAAC
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BQ
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AF RS1BF29TF U 1
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GTTGTTGTGTTTAGTAAATTTTGGTGTAATAGTTTAGATTAGTAGTTAACCATATCTCAC
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TAAGTTAAGTAGTAAGGCTGACTTCCAATCAACTCAACCAATATGTTGATAAACGTTTTT
ATAGGAGTTCCGTGGTTCCATTTTGGTTACCCAAAATCAAGCCCTTTCTTGTTTGTTAAC
TAAGAAGGAAAAGTTTTAAATTCAACTTTTATTGGAGCTGCTTGTGTTTACTCTGCTTCG
AAGCTGAGTTTGTCTTTCAA*GCTGTCTGAATTTGCCTAAAAAA*TCTAATAAGTGAAAC
TTCTATATTTTTT*AGAGTAA*GCTTTGGTCCA*TATGAT*CTCAGCTAGCA
GC

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DS 

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AGGGTAAGCATTTATATTATTAAAATTTTCTTTTGTTTGCTCCAGTTATATTGTATTAAT
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GCTTAGATTGTAGGCGATTTGGGATGACTGATGAATGAGTGATAGGGCAGGAAAAAAATT
ATTTATTTGGGCAAAGTTTGCCTTACCATCCATTTGAAGCTGGATGTTATTTTGCTGGTT
TACTATGTTCAGAGACCTTGAGTTCCATGTAATTTTTCTTTCGTTGTTGTGTTTAGTAAA
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ATCATATGTCAGTAAGTTACAGTAATATTTGTGTCTCTTCTTTAAGTTAAGTAGTAAGGC
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CATTTTGGTTACCCAAAATCAAGCCCTTTCTTGTTTGTTAACTAAGAAGGAAAAGTTTTA
AATTCAACTTTTATTGGAGCTGCTTGTGTTTACTCTGCTTCGAAGCTGAGTTTGTCTTTC
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TAAAGCTTTGGTCCAATATGATTCTCAGCTAGCAAGCCAGG

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

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CTCCGGCCATGCACAAAGCTGCTGAACATATGCAGGGCTCGTGAAGGCTGCGCATAGGGC
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AGACGATGAGCGAGTTCTAGTACGAGACTTCTTGAACCAAGAAGTGGAACAACAGCATCT
TGATCTCCACTGAAGATCCAAACAGGAGTTTTGTTCTGTATAATTCTCTTAAGAATCGGA
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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BS 16 738 RS1F908JQ

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AGACGATGAGCGAGTTCTAGTACGAGACTTCTTGAACCAAGAAGTGGAACAACAGCATCT
TGATCTCCACTGAAGATCCAAACAGGAGTTTTGTTCTGTATAATTCTCTTAAGAATCGGA
AGCATGTTGATGCTGGTGTCGGTGTCACTGTAATTCAACAGGCCGCTGCACATAGACCAT
TGGTAAGGTAAATGAGTTTGGTTGGCGTGAAGAGCTTGTTGGACCTCTGGGAGATTGAAA
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TGCTTGAGTCTCAGCTCC

QA 1 738 1 738
DS 

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TCTAGTACGAGACTTCTTGAACCAAGAAGTGGAACAACAGCATCTTGATCTCCACTGAAG
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TAACTCATACAAACATCCACCCCCATGCTAATCTTAGTTGCCATTTGCTTGAGTCTCAGC
TCC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

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AAAGAAGAAAACCAAGCATGGGTTTATCACTCAAGCTCTCCTCTCTTTGCATCATCATCA
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CGCAGGCTCTCTCTGCAATGTTTGGCTCATTGGTCACTCAGTCGACTAAAACCAAGTTCT
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AAGTTGCTGGCTTTGCTCAAATTTCAGGGATGGAGATGTTATTCAAGACATGTGGGAAGA
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AAATTCTGTGG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B633TF U 1
AF RS1B633JQ C 468
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AAAGAAGAAAACCAAGCATGGGTTTATCACTCAAGCTCTCCTCTCTTTGCATCATCATCA
TACTCTCCATGGCTCTGTTCTCAGATCTCAAGCTAGTGGAGTCTGCATCACCAGACTACA
CAAACTTAATCTACAAAGGATGTGCGAGACAGCAGTTCTCAGATCCGTCTGGTCTTTACT
CGCAGGCTCTCTCTGCAATGTTTGGCTCATTGGTCACTCAGTCGACTAAAACCAAGTTCT
ACAAAACCACTACTGGTACGACGAGCCAAACCACCATTACTGGTCTTTTCCAGTGTAGAG
GTGACTTGAGCAACAACGACTGTTACAACTGTGTTAGCCGTCTCCCTGTTCTCTCCGGGA
AGCTCTGCGGCAAAACCATTGCTTCTAGAGTTCAGCTCTCCGGCTGTTATCTTCTCTATG
AAGTTGCTGGCTTTGCTCAAATTTCAGGGATGGAGATGTTATTCAAGACATGTGGGAAGA
ACAACGTGGCCGGAACAGGGTTCGAAGAAATGAGAGACACTGCCTTTGGTGTAATGCAAA
ACGGAGTCGTTTCAGGGCACGGCTTCTACGCGACGACGTACGAATCTGTTTACGTTTTAG
*ACAATGCGAAGTCGATGTAG*AGATTCAGATTGTAGCGGCTGCATCAAGA*CGCGTTAG
AGAAG*CTCAAGTGGAATGTGGAAGCTCGAGT*CTGGTCAGATT*ATCTTCACA
GTGTTCATCGGTA

QA 1 774 1 774
DS 

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ACATGTGGGAAGAACAACGTGGCCGGAACAGGGTTCGAAGAAATGAGAGACACTGCCTTT
GGTGTAATGCAAAACGGAGTCGTTTCAGGGCACGGCTTCTACGCGACGACGTACGAATCT
GTTTACGTTTTAGGACAATGCGAAGTCGATGTAGGAGATTCAGATTGTAGCGGCTGCATC
AAGAACGCGTTAGAGAAGGCTCAAGTGGAATGTGGAAGCTCGAGTTCTGGTCAGATTTAT
CTTCACAAGTGTTTCATCGGTTATAAGTATTACCCTAATGGTGTTCCCAGAGGAGCTTCT
TCTTTTCCGTCAAGCTCTGGCTCTTCTTCGGGTTCTTCTTCTTCAGGAACAACAGGCAAA
ACGGTGGCAATAATAGTAGGAGGAACAGCTGGTCTTGGATTTCTTATCATTTGTTTGCTT
TTCGTCAAAAACTTGATGAGGAAGAAATATGATGATTATTGAAAATAAGGAGGGATGAAG
CCAACAAAAAGAGACCAACCCCGGAATAGAGGTAAAAGCTAATGTGGATTCCGAGGTGCA
TGCAATTAATTTCCGATTCTGGATTCCTTCGGATTGATATTCTATTTGATTTTTTTTTTT
TTTGCGGTGATGGATGAGGAAATGGGACCATTACATTATGTTAGAGGGGACTCGAGTCTT
CAAACATGTTTTCAAATTCTGTGG

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

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GGTGACAGAGCTTGTTGGACCATCGTCTTCTGGTAAAACACAGTTTTGTATGCGAGCTGC
TGCGAGCGTGGCAGAGAAGCAAGAAGGCAGTGTTTTTTATATAGACACGGGGAACTCTTT
TTCTGCCCGACGCATTGCTCAATTTATCTGTGGCAGTTCGGCTGCTGCTTCCTTACGAAA
GAGAGTCTTGAGCAGGATATCATGTCACACGGTCTATGACATCTATACAATGTTTGATAC
GCTGCAAGGTCTAGAGGTTGCGTTGAGGTCTCAGGAGCAGATGAATGTGAACGAGTGCCG
GTTAGGGTTGTTGGTTGTTGATTCGATCTCTTCTTTGATAACCCCAATCCTCGGAGGCAG
TGGCTCACAGGGTATATGTCCTTGACGTGCTTTAATGGTGGCACTTGGATATTCTCTTAA
GAAGCTGGCACATGAACATAACATTGCTGTTCTGGTGACGAACCACGCGGTGGGTGCTGG
AGAAAACGGTAAAACCAAACCGGCTCTTGGCGAAACTTGGAAAAGCATTCCACACGTGAG
ACTTATGCTATCACGTGACAACAGGAACAACAGCTGCACAATCTCCATCTTGAAACACAC
GTCATTGCCTTCTGGCCAGACTGTGACTCGCAAGGACAATCAACAATGTTTATAGCCAAC
TTCTTCTGGAGTAGTGCTGGTTTCACCAGCGAAGAATAAGCTTGGATTTGCAATAAACAG
TGATAGATATGTAATGCTAAAATGTCCTGTTTAACAACTGAATAACTTTCAAGATAGATA
GATAGTTACTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C263TF U 1
AF RS1C263JQ C 48
BS 1 710 RS1C263TF
BS 711 711 RS1C263JQ
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BS 794 854 RS1C263JQ

RD RS1C263TF 809 0 0
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GGTGACAGAGCTTGTTGGACCATCGTCTTCTGGTAAAACACAGTTTTGTATGCGAGCTGC
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GCTGCAAGGTCTAGAGGTTGCGTTGAGGTCTCAGGAGCAGATGAATGTGAACGAGTGCCG
GTTAGGGTTGTTGGTTGTTGATTCGATCTCTTCTTTGATAACCCCAATCCTCGGAGGCAG
TGGCTCACAGGGTATATGTCCTTGACGTGCTTTAATGGTGGCACTTGGATATTCTCTTAA
GAAGCTGGCACATGAACATAACATTGCTGTTCTGGTGACGAACCACGCGGTGGGTGCTGG
AGAAAACGGTAAAACCAAACCGGCTCTTGGCGAAACTTGGAAAAGCATTCCACACGTGAG
ACTTATGCTATCACGTGACAACAGGAACAACAGCTGCACAATCTCCATCTTGAAACACAC
GTCATTGCCTTCTGGCCAGACTGTGACTCGCAAGGACAATCAACAATGTT*ATAGCCA*C
TTCTTCTGGAGTAGTGCTGGTTTCACCAGCGAAGAT**AGCTTGGATT*GCAA*AAACAG
TGATAGATATGTA
TGCTAAATGTCTGTTA

QA 1 793 1 793
DS 

RD RS1C263JQ 807 0 0
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CTTCCTTACGAAAGAGAGTCTTGAGCAGGATATCATGTCACACGGTCTATGACATCTATA
CAATGTTTGATACGCTGCAAGGTCTAGAGGTTGCGTTGAGGTCTCAGGAGCAGATGAATG
TGAACGAGTGCCGGTTAGGGTTGTTGGTTGTTGATTCGATCTCTTCTTTGATAACCCCAA
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GATATTCTCTTAAGAAGCTGGCACATGAACATAACATTGCTGTTCTGGTGACGAACCACG
CGGTGGGTGCTGGAGAAAACGGTAAAACCAAACCGGCTCTTGGCGAAACTTGGAAAAGCA
TTCCACACGTGAGACTTATGCTATCACGTGACAACAGGAACAACAGCTGCACAATCTCCA
TCTTGAAACACACGTCATTGCCTTCTGGCCAGACTGTGACTCGCAAGGACAATCAACAAT
GTTTATAGCCAACTTCTTCTGGAGTAGTGCTGGTTTCACCAGCGAAGAATAAGCTTGGAT
TTGCAATAAACAGTGATAGATATGTAATGCTAAAATGTCCTGTTTAACAACTGAATAACT
TTCAAGATAGATAGATAGTTACTTTCG

QA 1 807 1 807
DS 



AS 1 2

CO CL7468Contig1 733 2 6 U
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AGTTGCCGGAAGGAGTTATCTCTGGTGATCTGGATATGACCGACATGTTTGGTCTCACGG
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TTATACAATGTGTTGTTGTTTTGTTTTTGTTGAACTGTTTGCTGTTTCGTGATACAATGT
GTTGTTGTGGTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1E604JQ C 1
AF RS1E604TF U 1
BS 1 687 RS1E604TF
BS 688 688 RS1E604JQ
BS 689 716 RS1E604TF
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BS 718 732 RS1E604TF
BS 733 733 RS1E604JQ

RD RS1E604JQ 733 0 0
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TCGTAAAGCTGCAGCAAGAGCTCGCTGGCGTCATCGGATTGAACCGTCAGTTTCACGAAT
CTGATCTGGAGAATCTTCCTTACTTCAGGTGCGCGATGAAAGAGACGTTGAGGCTACACC
CTCCGATTCCTCTTCTCCTCCACGAGGCGGCGGCGGATTCCGTCGTCTCCGGCTACTCCA
TTCCCCGTGACTCTCGCGTCATGATCAACGTGTACGCGATCGGGCGAGACGGATCGGTAT
GGACTGAACCGGGTGCGTTCAGACCGGGTCGGTTTATGGAAGACAAAGCTCCGGATTTCA
AAGGTAGTGACTTCGAGTTTCTTCCGTTTGGGTCGGGTCGAAGGTCGTGCCCGGGTATGC
AGTTGGGGCTTTATGCTATGGAGCTCGCCGTCGCGCACATGCTCCATTCATTTGACTGGA
AGTTGCCGGAAGGAGTTATCTCTGGTGATCTGGATATGACCGACATGTTTGGTCTCACGG
CGCCTAGAGCCACCAGGCTCATCGCTGTTCCGAGCTACCGGCTAAAATGTCCGATGGTGA
TTTGAAATTCGTGTTGTTTGATACTGTTTTATTTCAACTGTTCGCTGTTTTCATGACTCC
TTATACAATGTGTTGTTGTTTTGTTTTTGTTGAACTGTTTGCTGTTTCGTGATACAATGT
GTTGTTGTGGTTT

QA 1 733 1 733
DS 

RD RS1E604TF 732 0 0
GGACGGTGGCGTCTGCGATTGAATGGACCATGACGGAGCTGATGAAGAATCCTCACGAAC
TCGTAAAGCTGCAGCAAGAGCTCGCTGGCGTCATCGGATTGAACCGTCAGTTTCACGAAT
CTGATCTGGAGAATCTTCCTTACTTCAGGTGCGCGATGAAAGAGACGTTGAGGCTACACC
CTCCGATTCCTCTTCTCCTCCACGAGGCGGCGGCGGATTCCGTCGTCTCCGGCTACTCCA
TTCCCCGTGACTCTCGCGTCATGATCAACGTGTACGCGATCGGGCGAGACGGATCGGTAT
GGACTGAACCGGGTGCGTTCAGACCGGGTCGGTTTATGGAAGACAAAGCTCCGGATTTCA
AAGGTAGTGACTTCGAGTTTCTTCCGTTTGGGTCGGGTCGAAGGTCGTGCCCGGGTATGC
AGTTGGGGCTTTATGCTATGGAGCTCGCCGTCGCGCACATGCTCCATTCATTTGACTGGA
AGTTGCCGGAAGGAGTTATCTCTGGTGATCTGGATATGACCGACATGTTTGGTCTCACGG
CGCCTAGAGCCACCAGGCTCATCGCTGTTCCGAGCTACCGGCTAAAATGTCCGATGGTGA
TTTGAAATTCGTGTTGTTTGATACTGTTTTATTTCAACTGTTCGCTGTTTTCATGACTCC
TTATACAATGTGTTGTTGTTTTGTTTT*GTTGAACTGTTTGCTGTTTCGTGATACA*TGT
GTTGTTGTGGTT

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL7469Contig1 697 2 1 U
GGAAGCTATATGATGCTGGAGCAGTGAAAGCAGTCAAGTTTGATGTGAGAGCGTCTTCGA
GTCGCAAATCGTTTAAGAAACTCAGAAGAAATACTCAATTACAAGGTAAAGACATAACCA
CAAAAAATGTTACAGAAGAAGAAGTAATAACTCGAGTTGATGATGACACTTCGACTTCAA
AGGCCTCCTCTATCAATGTTGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTCCTCGAGACAAAG
TGCTTCAAGCCTGCACTCTAACTTCCGGTTTAATGGCTGCATTAGGCCTTCTCATCAGGA
AGGCGTCTCATGTTGCGTCGACTGAAGGGTTACCAATCCCAGACTGCTCTTGGATATACC
ATTTGGTTTCGAAACATGGCATCTAGGGTTAATCGCTGGAACGGTTGTGTTGATATCGTC
AAGCAGGTTCTTGCTACTAAAGTCTTGGCCAGATTTTGCTGATTCAAGCCAAGCAGCAAA
CCAACAGATCCTTACTTCGCTGGAACCGCTAGACTACCTTGTTGTCGCTACTTTACCTGG
TATTAGTGAGGAGATGCTGTTTAGAGGTGCGTTGATGCCTTTGTTTGGAACCAGTTGGGG
AAGTATTGTGGGAGTTGGACTCATCTTCGGTTTACTTCATCTTGGAAGCGGAAGAAAGTA
CTCCTTTGCTCTTTGGGCGTCGGTAGTGGGTATAGTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1GW05TF U 1
AF RS1EW21TF U 1
BS 1 697 RS1EW21TF

RD RS1GW05TF 562 0 0
GGAAGCTATATGATGCTGGAGCAGTGAAAGCAGTCAAGTTTGATGTGAGAGCGTCTTCGA
GTCGCAAATCGTTTAAGAAACTCAGAAGAAATACTCAATTACAAGGTAAAGACATAACCA
CAAAAAATGTTACAGAAGAAGAAGTAATAACTCGAGTTGATGATGACACTTCGACTTCAA
AGGCCTCCTCTATCAATGTTGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTCCTCGAGACAAAG
TGCTTCAAGCCTGCACTCTAACTTCCGGTTTAATGGCTGCATTAGGCCTTCTCATCAGGA
AGGCGTCTCATGTTGCGTCGACTGAAGGGTTACCAATCCCAGACTGCTCTTGGATATACC
ATTTGGTTTCGAAACATGGCATCTAGGGTTAATCGCTGGAACGGTTGTGTTGATATCGTC
AAGCAGGTTCTTGCTACTAAAGTCTTGGCCAGATTTTGCTGATTCAAGCCAAGCAGCAAA
CCAACAGATCCTTACTTCGCTGGAACCGCTAGACTACCTTGTTGTCGCTACTTTACCTGG
TATTAGTGAGGAGATGCTGTTT

QA 1 562 1 562
DS 

RD RS1EW21TF 697 0 0
GGAAGCTATATGATGCTGGAGCAGTGAAAGCAGTCAAGTTTGATGTGAGAGCGTCTTCGA
GTCGCAAATCGTTTAAGAAACTCAGAAGAAATACTCAATTACAAGGTAAAGACATAACCA
CAAAAAATGTTACAGAAGAAGAAGTAATAACTCGAGTTGATGATGACACTTCGACTTCAA
AGGCCTCCTCTATCAATGTTGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTCCTCGAGACAAAG
TGCTTCAAGCCTGCACTCTAACTTCCGGTTTAATGGCTGCATTAGGCCTTCTCATCAGGA
AGGCGTCTCATGTTGCGTCGACTGAAGGGTTACCAATCCCAGACTGCTCTTGGATATACC
ATTTGGTTTCGAAACATGGCATCTAGGGTTAATCGCTGGAACGGTTGTGTTGATATCGTC
AAGCAGGTTCTTGCTACTAAAGTCTTGGCCAGATTTTGCTGATTCAAGCCAAGCAGCAAA
CCAACAGATCCTTACTTCGCTGGAACCGCTAGACTACCTTGTTGTCGCTACTTTACCTGG
TATTAGTGAGGAGATGCTGTTTAGAGGTGCGTTGATGCCTTTGTTTGGAACCAGTTGGGG
AAGTATTGTGGGAGTTGGACTCATCTTCGGTTTACTTCATCTTGGAAGCGGAAGAAAGTA
CTCCTTTGCTCTTTGGGCGTCGGTAGTGGGTATAGTC

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 2

CO CL7470Contig1 818 2 2 U
GATAGAAGACATCGAAGCCCCCATTTTCAAGGAGATTCTGTTTGCGAGTGTACGACCCGG
GATCTTCTCCTGGGGGGCACTGCTCATATATAACTCACCCGGGATAAGATGTTACTCCAT
TTTATCTACTGGGACGAATTGCCTGATATGGAAGACTTAATGGGCACAGACTTGAAATGG
GCATCGACACTTGTGGCTCAGCATCTGCTTGCGGCTGCAGACCGTTATGCTCTCGAGCGG
CTTAGAACAATCTGCCAGTCAAAACTGTGTGAAGGAATCAGTGTTAACACGGTTGCAACC
ACCTTGGCTTTGGCAGAGCAGCATCATTGTTTCCAGCTGAAAACTGCATGCCTCAAATTC
ATTGCTTTGCCAGCAAACCTGAAAGCTGTGATGGAAACGGATGGGTTTGATTATCTGAAG
GAAAGCTGTCCGGGCTTACTAAGTGAGCTTCTGGAGTCTGTTGCTAGACTGAGTGAGCAT
TCTTTAGCATTAACGGTGAATAATAGGAAGGAGTTTTATCCTGACGGCTGTGACGTGAAT
GGGAGACGCGTGAAGCAGCGGTTACACTGAGGGAGAGAGAGACTGATGATGTTGGAGCCC
CATTTGATAAACAGGATTCTAGAAGAGTCGAGATTTGTGAATTTGTCATTGTAAAAGGAT
TAGTGATTGGTTATGTATGTACGTGTTCGTCGCAAGTAGAGTGAAATGTTTCTCTTTGTA
ACTTTCTTTTTTTCTTCTTTTTTTTTCTTTACCCTCTGTAAAAACCGCTTCTCTCAAGGA
AAAGTTACAGTGATGAATCAAGAGCTTGGATTGGTTCC


BQ
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AF RS1AC23TF U 1
AF RS1AC23JQ C 1
BS 1 722 RS1AC23TF
BS 723 818 RS1AC23JQ

RD RS1AC23TF 722 0 0
GATAGAAGACATCGAAGCCCCCATTTTCAAGGAGATTCTGTTTGCGAGTGTACGACCCGG
GATCTTCTCCTGGGGGGCACTGCTCATATATAACTCACCCGGGATAAGATGTTACTCCAT
TTTATCTACTGGGACGAATTGCCTGATATGGAAGACTTAATGGGCACAGACTTGAAATGG
GCATCGACACTTGTGGCTCAGCATCTGCTTGCGGCTGCAGACCGTTATGCTCTCGAGCGG
CTTAGAACAATCTGCCAGTCAAAACTGTGTGAAGGAATCAGTGTTAACACGGTTGCAACC
ACCTTGGCTTTGGCAGAGCAGCATCATTGTTTCCAGCTGAAAACTGCATGCCTCAAATTC
ATTGCTTTGCCAGCAAACCTGAAAGCTGTGATGGAAACGGATGGGTTTGATTATCTGAAG
GAAAGCTGTCCGGGCTTACTAAGTGAGCTTCTGGAGTCTGTTGCTAGACTGAGTGAGCAT
TCTTTAGCATTAACGGTGAATAATAGGAAGGAGTTTTATCCTGACGGCTGTGACGTGAAT
GGGAGACGCGTGAAGCAGCGGTTACACTGAGGGAGAGAGAGACTGATGATGTTGGAGCCC
CATTTGATAAACAGGATTCTAGAAGAGTCGAGATTTGTGAATTTGTCATTGTAAAAGGAT
TAGTGATTGGTTATGTATGTACGTGTTCGTCGCAAGTAGAGTGAAATGTTTCTCTTTGTA
AC

QA 1 722 1 722
DS 

RD RS1AC23JQ 818 0 0
GATAGAAGACATCGAAGCCCCCATTTTCAAGGAGATTCTGTTTGCGAGTGTACGACCCGG
GATCTTCTCCTGGGGGGCACTGCTCATATATAACTCACCCGGGATAAGATGTTACTCCAT
TTTATCTACTGGGACGAATTGCCTGATATGGAAGACTTAATGGGCACAGACTTGAAATGG
GCATCGACACTTGTGGCTCAGCATCTGCTTGCGGCTGCAGACCGTTATGCTCTCGAGCGG
CTTAGAACAATCTGCCAGTCAAAACTGTGTGAAGGAATCAGTGTTAACACGGTTGCAACC
ACCTTGGCTTTGGCAGAGCAGCATCATTGTTTCCAGCTGAAAACTGCATGCCTCAAATTC
ATTGCTTTGCCAGCAAACCTGAAAGCTGTGATGGAAACGGATGGGTTTGATTATCTGAAG
GAAAGCTGTCCGGGCTTACTAAGTGAGCTTCTGGAGTCTGTTGCTAGACTGAGTGAGCAT
TCTTTAGCATTAACGGTGAATAATAGGAAGGAGTTTTATCCTGACGGCTGTGACGTGAAT
GGGAGACGCGTGAAGCAGCGGTTACACTGAGGGAGAGAGAGACTGATGATGTTGGAGCCC
CATTTGATAAACAGGATTCTAGAAGAGTCGAGATTTGTGAATTTGTCATTGTAAAAGGAT
TAGTGATTGGTTATGTATGTACGTGTTCGTCGCAAGTAGAGTGAAATGTTTCTCTTTGTA
ACTTTCTTTTTTTCTTCTTTTTTTTTCTTTACCCTCTGTAAAAACCGCTTCTCTCAAGGA
AAAGTTACAGTGATGAATCAAGAGCTTGGATTGGTTCC

QA 1 818 1 818
DS 



AS 1 2

CO CL7471Contig1 682 2 1 U
GGATTCAACTCACTCTTAACACTTTTGAGGTGTTAAATTCACTTGTAAGCTATGTCTTCT
TCTCTTCTGGTCACTGTCTTCCTCTGCATTTTCTTCTTGTCCGTAAACGCCAATGAGGTC
ACCGTCGGTGGAAAGTCCGGTGGCTGGAAGATCCCTCCTTCCTCTTCCTACTCTTTCAAC
GAATGGGGTGACAAGTCTCGTTTCATAATCGGCGACTTTCTCATTTTCAGCTACGAAGCC
GGTAAAGACTCAGTTCTTCAAGTGACAAGAGAGGCTTACGAGAAATGCAACACCACGAGC
CCGAAAGCCAGCTACACAGCAGATGGGAACACCAAGGTGAAGCTAGACCAACCCGGTCCG
GTCTACTTCATCAGTGGAACGCAAGGTCACTGTCAAAAGGGTCAGAAGCTTCGCCTTGTC
GTTTACATTCCTCATGTCTCTGCTTTCTCTCCGGCTCCTTCACCGTTTGACGGTCCCGCC
GTCGCGCCTACTAGTGGCGCTGCTAAGCTCACCAGCTTCATTGGTGTTGTTGGGCTTGTT
GTTGGATTCTGGGCCTTCTTCTGAGAGAAACTTGAATCTGAAATTATATTCTATTTATTA
AATTTTCTAACATGAAACAGAGATCTTTGTTCTCTGCCTAAAGTCTTGTTGTTACTATTT
TAGTATTAACAAAGATTAAGCT


BQ
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AF RS1E842JQ C 1
AF RS1E842TF U 1
BS 1 682 RS1E842TF

RD RS1E842JQ 682 0 0
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DS 

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TCTCTTCTGGTCACTGTCTTCCTCTGCATTTTCTTCTTGTCCGTAAACGCCAATGAGGTC
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QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1CO07JQ C 1
AF RS1AM13TF U 77
BS 1 77 RS1CO07JQ
BS 78 262 RS1AM13TF
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RD RS1CO07JQ 822 0 0
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TTGTGATGGAGAAACTTGTTCTTCTTTTGTACCCGCTTTTTTTTTTGTTTCCAATATCGC
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GTTTTTTTT**ACTTTCTTTAATGTGATTTGATCTCCCTTCT

QA 1 822 1 822
DS 

RD RS1AM13TF 746 0 0
G
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GTTCTTCTTTTGTACCCGCTTTTTTTTT*GTTTCCAATATCGCTTTTTCTTGTGTTGTAG
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TTTAATGTGATTTGATCTCCCTTCT

QA 2 746 2 746
DS 



AS 1 2

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ATAAATGATGAGTTGTGTGTTACCG


BQ
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AF RS1B016JQ C 1
AF RS1B016TF U 1
BS 1 705 RS1B016TF
BS 706 706 RS1B016JQ
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QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1B016TF 744 0 0
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GATCATATGGACGATCCAAAAGAGAACAAGAACTCGCCATGGCTATCAGTACCACAGTTT
GGAGACTGGGATCAGAAAGAAGGAACCGTTCCTGATTACTCAATGGATTTCTCAAAGATC
AGAGAGATGAGGAAACTGCACAAGAGAGATCCTTCCCGTGTCAGTCTTGGCAATGAACAA
GACTTCATTAACCCTTTTCATAATCAACCTACTTCTGTTGATAAAACTAAGGCTAAGCTC
ACGACTGTCCACAGTGACAACAACGTAACCGACAATGAGTTCCCCCACCACCGGCGACAT
CCTCCATCCACTAGGAGAGGAATCTTCAGCTGCTTCAACTGCTCCTGCGTTAAAGCTTGA
AGCTATTTTATAACTGAGAGTCAGATACAATGAGGAAATGTGTTTCACTTATTTATTATA
ATGACGACAGAAATGAGATATGGTAGTGACATCTTTTCACATACATTCCTGCGAAAGCAG
CAGCGTTAATCAAGTTTGTCTGCTGTTTACCGTTATCTTACGATTGTCTAACTATGTGTT
TGGTAATTGTCAAGAATAGTTAGCTTTATTTCTTTTCTTTTTGTTGTAGTTTTTGGTTTA
TTCAGAGATGTATAACTTTCAATATTGTGATACATTACTATAAAA*GATGCAT*AAGAT*
ATAAATGATGAGTTGTGTGT
ACCG

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

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AGATGAACCCTGGTCAAGGCGCCAAGCTAGTACGAGCTGCGGGAACAAACGCCAAGATCC
TCAAGGAGCCTGCTTCAGGGAAGTGCTTGATCAAGCTCCCTTCAGGTGACACCAGGTGGA
TCAACGCCAGGTGCCGTGCTACCATCGGTACAGTGTCGAACCCCGTCTCATGGAGTGAAG
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GCTAGTGTCAAGAAGAAGAAGAAGCGATGGCTGCTAGAGAAGCCAAGATGTGATCTTGAT
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AATGTTGTTACGTGTTTTCTTTTTTTTTCTTGAAACTGAAATCAAACGTTTTGATCGTGT
CATAAACGTTTTTAATAAACGCGTTTTTCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FE16TF U 1
AF RS1FE16JQ C 136
BS 1 492 RS1FE16TF
BS 493 872 RS1FE16JQ

RD RS1FE16TF 492 0 0
TGGAGATAGAGAGTGCAAAAAAGAAAAAAAAACTTTACTTTTCTCTCGCTCAATCAACTC
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TATTCAACAGCCTTGTGCGTCCAGCATTTCGCAGCTTCTCCACAGCTTTTGGTGATGTGC
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AGATGAACCCTGGTCAAGGCGCCAAGCTAGTACGAGCTGCGGGAACAAACGCCAAGATCC
TCAAGGAGCCTGCTTCAGGGAAGTGCTTGATCAAGCTCCCTTCAGGTGACACCAGGTGGA
TCAACGCCAGGTGCCGTGCTACCATCGGTACAGTGTCGAACCCCGTCTCATGGAGTGAAG
AAGCTGTATAAA

QA 1 492 1 492
DS 

RD RS1FE16JQ 737 0 0
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TGGCAGAAATGGAAGAAAAGATGCTCCACATGGACATCAACTCAATGATAGGAAGTTCCA
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AAGGCGCCAAGCTAGTACGAGCTGCGGGAACAAACGCCAAGATCCTCAAGGAGCCTGCTT
CAGGGAAGTGCTTGATCAAGCTCCCTTCAGGTGACACCAGGTGGATCAACGCCAGGTGCC
GTGCTACCATCGGTACAGTGTCGAACCC*GTTTCATGGAGTGAAGAAGCTGTATAAAGCA
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TCGGTTAGCCCTTGGGGGAAGCCGTGCAAAGGTGGTTACAAGTCTGCTAGTGTCAAGAAG
AAGAAGAAGCGATGGCTGCTAGAGAAGCCAAGATGTGATCTTGATAGAACAAGTTACAAT
AATGTCTTCAAATGCATCTTTTTTTTTGAGAGAGAGTTGGTTATGAATGTTGTTACGTGT
TTTCTTTTTTTTTCTTGAAACTGAAATCAAACGTTTTGATCGTGTCATAAACGTTTTTAA
TAAACGCGTTTTTCAGC

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

CO CL7475Contig1 715 2 7 U
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CGGCGGTTATGGTGATATGGATATCGGTGGTTGTGTTGCTTGCTTTCTTTGGTAAGTCGA
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TTATGAAGAAACTTTGGTCTCTTTCTGTTTCTTGTTTTTAACGTTTTGTTAATGTAGCAA
CTAGCAATGTATATGTACATTTTTTTAAATGATCATATAACTGAGGTTTTCATGG


BQ
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AF RS1F376JQ C 1
AF RS1F376TF U 1
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QA 1 715 1 715
DS 

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TTCTTATTAGAAAGGATTTTGATTCGGTTTAAAGGTTTTGATCTTGGAATCTGACGGTTT
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CTAGCAATGTATATGTACATTTTTT*AAATGATCATATAACTGAG*TTTTCATGG

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1FI73JQ U 1
AF RS1CA92JQ U 30
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RD RS1FI73JQ 649 0 0
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DS 

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AG
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QA 3 747 3 747
DS 



AS 1 2

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1EG77JQ C 1
AF RS1EG77TF U 1
BS 1 693 RS1EG77TF

RD RS1EG77JQ 693 0 0
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CGCCATCGCAACTGACGGTGTCACCGGAGCTGCTGTTGGCAGCGTAGCAGGAACGGTCAT
GATCATGTCCTGCCGCTGCCGGCGTAACCCTCGACCCGTAACTCAGTACGCTCTAAGGTG
TGCTCGGGACTGTTCAGCATCTTGCGCTGCATGGACTGGAACAGAGTACGTAATGAAAGG
AATCAGAGGCAAAGATGATCTTACGACTGCCATGGTCGGAGCATCAGGTGGTGGGTTGGC
ATACTCTTTTGTGAGCCAAGGCTTGAAAGTAAAGCCCGCACTCTCCTTGGCTGCTTGCTA
CGCTGTTGCGGGAGGAACACTTCATAAGGTGAAGGAAGCAATCAGAGAAAGAAGTGAACT
TTCCACCAGGGGCAAGGCTTTTGATACTTGATCCATATCAAGAAGTTTTAAGCCCAACAG
CAAGCCCAAGATTATGTCCATCCATCTTTATATAAATAGTAGTTTAAGGGTGTGTTTAGA
AAAAAAGTTTAGTAGTTTAAGGCTTTGTAAAACTTATCTTGGCTTCCATAAGAGCACCTT
CTACCACTTAATGAAATATCAACTTAGCTTCTTGTGTGCTTGGTGACAATCTAGATTTCA
TCATCTCTTTACTTTCTTGCTTATGAATGAAGA

QA 1 693 1 693
DS 

RD RS1EG77TF 693 0 0
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CGCCATCGCAACTGACGGTGTCACCGGAGCTGCTGTTGGCAGCGTAGCAGGAACGGTCAT
GATCATGTCCTGCCGCTGCCGGCGTAACCCTCGACCCGTAACTCAGTACGCTCTAAGGTG
TGCTCGGGACTGTTCAGCATCTTGCGCTGCATGGACTGGAACAGAGTACGTAATGAAAGG
AATCAGAGGCAAAGATGATCTTACGACTGCCATGGTCGGAGCATCAGGTGGTGGGTTGGC
ATACTCTTTTGTGAGCCAAGGCTTGAAAGTAAAGCCCGCACTCTCCTTGGCTGCTTGCTA
CGCTGTTGCGGGAGGAACACTTCATAAGGTGAAGGAAGCAATCAGAGAAAGAAGTGAACT
TTCCACCAGGGGCAAGGCTTCTGATACTTGATCCATATCAAGAAGTTTTAAGCCCAACAG
CAAGCCCAAGATTATGTCCATCCATCTTTATATAAATAGTAGTTTAAGGGTGTGTTTAGA
AAAAAAGTTTAGTAGTTTAAGGCTTTGTAAAACTTATCTTGGCTTCCATAAGAGCACCTT
CTACCACTTAATGAAATATCAACTTAGCTTCTTGTGTGCTTGGTGACAATCTAGATTTCA
TCATCTCTTTACTTTCTTGCTTATGAATGAAGA

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

CO CL7478Contig1 762 2 2 U
GGATCGGTCTTCAACTTTCATTAACATTTACTCTCTCAGACGGTAGACAAAGACAGAGAA
GAGAAACAGAGAAAAAAACAGAGTATTTGAAAGAACAAGAAGAAGACAAAGAAATGGGGA
GACAACCATGCTGTGACAAAGTAGGGTTGAAGAAAGGACCATGGACTGCAGATGAAGACA
GGAAGCTCATGAACTTCATCCTCACCCATGGACAATGTTGTTGGAGAGCTGTTCCTAAGC
TTGCTGGTCTTCTCAGGTGTGGCAAGAGTTGTAGACTTCGCTGGACCAATTATCTTCGAC
CAGACCTGAAAAGAGGTCTTCTCTCGGATAACGAGGAGAAGATGGTCATTGACCTTCATT
CCCAGCTCGGCAACAGATGGTCAAAGATAGCTTCTCATTTACCAGGAAGAACAGACAATG
AAATCAAGAACCACTGGAACACTCACATCAAGAAGAAGTTAAGGAAAATGGGGATCGATC
CTCTCACTCATAAACCACTCTCTATAGTTGAACAAGAAGAAGAAAAACCTTTAAAGAAGC
TAAGAAACCAATGGAGCAGACTGTGGAGGAACCACCTAATTATTCTCTTACCAAAGACAG
CAACAACAAGAACATGCTTGTAAGTTGCGATGATCAGCTTATGGCGATGAATCTTGAGTA
TGGCGTCGAAGAAGTCCCTATGATTGATCCAGAGTGTTAGAGCTATCTGCACACTCTTCA
TGTCTCATCACATCACGTCTCAGTCATCTATGATCAGTATCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FP56TF U 1
AF RS1G494TF U 1
BS 1 698 RS1FP56TF
BS 699 762 RS1G494TF

RD RS1FP56TF 703 0 0
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GAGAAACAGAGAAAAAAACAGAGTATTTGAAAGAACAAGAAGAAGACAAAGAAATGGGGA
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CAGACCTGAAAAGAGGTCTTCTCTCGGATAACGAGGAGAAGATGGTCATTGACCTTCATT
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AAATCAAGAACCACTGGAACACTCACATCAAGAAGAAGTTAAGGAAAATGGGGATCGATC
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CAACAACAAGAACATGCTTGTAAGTTGCGATGATCAGCTTATGGCGATGAATCTTGAGTA
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TAGAG

QA 1 698 1 698
DS 

RD RS1G494TF 762 0 0
GGATCGGTCTTCAACTTTCATTAACATTTACTCTCTCAGACGGTAGACAAAGACAGAGAA
GAGAAACAGAGAAAAAAACAGAGTATTTGAAAGAACAAGAAGAAGACAAAGAAATGGGGA
GACAACCATGCTGTGACAAAGTAGGGTTGAAGAAAGGACCATGGACTGCAGATGAAGACA
GGAAGCTCATGAACTTCATCCTCACCCATGGACAATGTTGTTGGAGAGCTGTTCCTAAGC
TTGCTGGTCTTCTCAGGTGTGGCAAGAGTTGTAGACTTCGCTGGACCAATTATCTTCGAC
CAGACCTGAAAAGAGGTCTTCTCTCGGATAACGAGGAGAAGATGGTCATTGACCTTCATT
CCCAGCTCGGCAACAGATGGTCAAAGATAGCTTCTCATTTACCAGGAAGAACAGACAATG
AAATCAAGAACCACTGGAACACTCACATCAAGAAGAAGTTAAGGAAAATGGGGATCGATC
CTCTCACTCATAAACCACTCTCTATAGTTGAACAAGAAGAAGAAAAACCTTTAAAGAAGC
TAAGAAACCAATGGAGCAGACTGTGGAGGAACCACCTAATTATTCTCTTACCAAAGACAG
CAACAACAAGAACATGCTTGTAAGTTGCGATGATCAGCTTATGGCGATGAATCTTGAGTA
TGGCGTCGAG**AGTCCCTATGATTGATCCAGAGTGTTAGAGCTATCTGCACACTCTTCA
TGTCTCATCACATCACGTCTCAGTCATCTATGATCAGTATCT

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL7479Contig1 775 2 6 U
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CAGTCTAATCAGATGGGAAGTTCTCAGGCCATAAAAGGAGAGATAGCACCAGCTGAAACA
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AGTATTTTGTATCATCCCTGCAATTTGTTTCAGCTTGCTGGAACTGCATTCCTTAAGTGT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C679TF U 1
AF RS1C679JQ C 20
BS 1 685 RS1C679TF
BS 686 686 RS1C679JQ
BS 687 691 RS1C679TF
BS 692 692 RS1C679JQ
BS 693 717 RS1C679TF
BS 718 775 RS1C679JQ

RD RS1C679TF 717 0 0
GGAATAATCTCGTCGTCTTCCGTTGATCATCTTCTTCCCATCAATCAATCAAAGAGAGTC
TCTCGAGGATTCAGAATCTCTCCCTTTCCGTCAAATCATATCCTCTCTCTTTATATAGTA
GATTCCGAGAAGGAGTTTGTGATGGTAGACAGCTACAGTAACCTATCGTGGCTGTTATGG
ATCCAAATGTCCGTCTTCTTCCTCCTCCTACTCCTCTTCTGCGTCTTCGGATTACTATCC
TCCTCAGATATCAGCGTCTCATCCGCTGATTCACTTCCTTCTTCGTCCGCCTCTCGGAGG
TTTCTATCTGGAGATCCGATTCCGATCAGCCGCCACCACGGCTTGGGGTTCTCCGTAGTT
CAGTCTAATCAGATGGGAAGTTCTCAGGCCATAAAAGGAGAGATAGCACCAGCTGAAACA
AGGAGAGTGACGAGAACAGAGGAAGAAGAATCTTCTTCTTCTGATGAAGACTCCAGTACT
AGTATTTTGTATCATCCCTGCAATTTGTTTCAGCTTGCTGGAACTGCATTCCTTAAGTGT
TTTGGGCTTGACCGGAGTACAGAAGAAACTGATGATTCTCTGAGACCAGAATCTAAGAAA
CAGAGGTGACCCCAAGTTCTTGTGAATATAGAAGCACAACATACACGTTTTTAATATGAG
TTCTCATTCGTAGTAAATTGAGTAG*AGAGA*TTAAGAAACTTGTAAGTATATACTA

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1C679JQ 756 0 0
CCGTTGATCATCTTCTTCCCATCAATCAATCAAAGAGAGTCTCTCGAGGATTCAGAATCT
CTCCCTTTCCGTCAAATCATATCCTCTCTCTTTATATAGTAGATTCCGAGAAGGAGTTTG
TGATGGTAGACAGCTACAGTAACCTATCGTGGCTGTTATGGATCCAAATGTCCGTCTTCT
TCCTCCTCCTACTCCTCTTCTGCGTCTTCGGATTACTATCCTCCTCAGATATCAGCGTCT
CATCCGCTGATTCACTTCCTTCTTCGTCCGCCTCTCGGAGGTTTCTATCTGGAGATCCGA
TTCCGATCAGCCGCCACCACGGCTTGGGGTTCTCCGTAGTTCAGTCTAATCAGATGGGAA
GTTCTCAGGCCATAAAAGGAGAGATAGCACCAGCTGAAACAAGGAGAGTGACGAGAACAG
AGGAAGAAGAATCTTCTTCTTCTGATGAAGACTCCAGTACTAGTATTTTGTATCATCCCT
GCAATTTGTTTCAGCTTGCTGGAACTGCATTCCTTAAGTGTTTTGGGCTTGACCGGAGTA
CAGAAGAAACTGATGATTCTCTGAGACCAGAATCTAAGAAACAGAGGTGACCCCAAGTTC
TTGTGAATATAGAAGCACAACATACACGTTTTTAATATGAGTTCTCATTCGTAGTAAATT
GAGTAGGAGAGAATTAAGAAACTTGTAAGTATATACTATGGAAAGGTTATTATTGTTGGG
GTTAACGCGAACGAGTTAACTCAGTGAATATACTAT

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL7480Contig1 761 2 1 U
AAAAAAAAAAGATCTTTTAACAACTCACAAAGGTAAATTAAACCTCCAGAATCCATAATC
ATAAAGGTAAATTAAACCTCCAGAATCCATAATCATAATGCATAAAGAAAATGGATAAGG
GACCACTAAGCCAAGTTTATGACACATCCACTGGCTTATGATCTTGTAGCTTTTTCTTGG
GACTTTCTCATGATGAAAAACCCACCATGGGCGAGTCTGGCTCCATTGCCCACTCAGTCC
AAGATCCATTGTAAATTGGCACATCGGTTTTTCCCAAACGATGAAGTCCCAATGCCAAAA
TACAAGCTGTTACACCCGTTCCACATGAGGCCATGATTGGACTGTCCACAGAAATGTCTT
TTTCTTCAAACCGTTTCTTAAGCTCCTCAGCTGGTAACAGTGTTTGAAAGGAATCAAACA
TTTGGGGAAAAGGGACACACTTGCTACCGGGTATATGACCGCTCGGTATTCCTTTGCGAG
GTTCTGGAGCAGTACCATCAAATCTAGCTTTTGCACGTGCATCTATGTGCTGGTAGGTCT
TATTCTCCATATTTTCCTTGACCTGATCAAGTGTCCATACAAGATGTGGCTGGAACTTCG
TCTTGAAAGTTATTGGACTAATTGATTGTCCTTGATAGACTTTCTCTACAACCTCACTTG
CTGCATTGGCTTTCAAAATGGCGTCACTGGAAGCACTGGATTCAACGTCATAGCCTGAAG
CACGCCATCTAGGTAAGCCTCCATCAAGTACCAAACATTTT


BQ
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AF RS1B865JQ U 1
AF RS1E153JQ U 1
BS 1 761 RS1B865JQ

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TTTCTTCAAACCGTTTCTTAAGCTCCTCAGCTGGTAACAGTGTTTGAAAGGAATCAAACA
TTTGGGGAAAAGGGACACACTTGCTACCGGGTATATGACCGCTCGGTATTCCTTTGCGAG
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DS 

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ATAAAGGTAAATTAAACCTCCAGAATCCATAATCATAATGCATAAAGAAAATGGATAAGG
GACCACTAAGCCAAGTTTATGACACATCCACTGGCTTATGATCTTGTAGCTTTTTCTTGG
GACTTTCTCATGATGAAAAACCCACCATGGGCGAGTCTGGCTCCATTGCCCACTCAGTCC
AAGATCCATTGTAAATTGGCACATCGGTTTTTCCCAAACGATGAAGTCCCAATGCCAAAA
TACAAGCTGTTACACCCGTTCCACATGAGGCCATGATTGGACTGTCCACAGAAATGTCTT
TTTCTTCAAACCGTTTCTTAAGCTCCTCAGCTGGTAACAGTGTTTGAGAGGAATCAAACA
TTTGGGGAAAAGGGACACACTTGCTACCGGGTATATGACCGCTCGGTATTCCTTTGCGAG
GTTCTGGAGCAGTACCATCAAATCTAGCTTTTGCACGTGCATCTATGTGCTGGTAGGTCT
TATTCTCCATATTTTCCTTGACCTGATCAAGTGTCCATACAAGATGTGGCTGGAACTTCG
TCTTGAAAGTTATTGGACTAATTGATTGTCCTTGATAGACTTTCTCTACAACCTCACTTG
CTGCATTGGCTTTCAAAATGGCGTCACTGGAAGCACTGGATTCAACGTCATAGCCTGAAG
CACGCCAT

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

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TGGTGAGAAAGAAGGAGAAGAAGAGAGTGCTGCAGCGAAGAAAAGGAAGAAGAAGAAGGA
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BQ
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AF RS1GX63TF U 1
AF RS1GX63JQ C 619
BS 1 672 RS1GX63TF
BS 673 1252 RS1GX63JQ

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GAAAGGTGCCGTTCTGGATGATGAAGAAGGAGACGATGTTGTTGTTCCGGAGATTGCTTT
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TGAAGATGAGGAGGAGGAAGAGGTGGATCCAGTCACTTTCTCTGGTAAGAAGAAGTCTTC
TAAATCGTCGTCCAAGAAGAGTGGGAACTCATTTGCGGCTGCTTTGCTTGATGATGATGA
GGAGGAGGAGAGTAAGGCAGTTGAGGAGGAAGAGAAGCCTGAGATTATGTTTACGGGGAA
GAAGAAGTCGTCTAAGAAGAAGGGAAGTAGTGTTTTGGCGTCGTTAGGTGATGATAATGA
TGACTCAGTTGC

QA 1 672 1 672
DS 

RD RS1GX63JQ 634 0 0
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AGTGAGTAAGGATAAAGCTTCTGATGCTAAGAGTGCGGAGGTTTTAGAACCTGCGAAGAG
TAAGAAAAAGAAGAAGAATAAGAGTGGGAGGACGGTACAGGAAGAGGATGATTTGGACAA
GCTTCTTGCTGAGCTTGGTGAAGGCCCTGTTTCTGGAAAACCTGCTGAAGAAGAGAAAGT
TCAAGCTCAGCCTCAGCCTGTTGTTGCAGCTGTAGAGAATGATGGTGAGAAAGAAGGAGA
AGAAGAGAGTGCTGCAGCGAAGAAAAGGAAGAAGAAGAAGGAGAAGGAGAAGGAAAAGAA
AGCTGCAGCTGCCGGAACCACTACTGTGGAGGCTAAGGAGGAAAAACAAGAAGAATCAGT
ACCTGAACCACTGCAGGGGAAGAAGAAGGATGCAAAGGCTAAAGCAGCTGAGAAGAAAAT
TCCTAAACATGTTAGAGAGATGCAAGAGGCTCTTGCACGGCGGCAGGAAGCTGAAGAGAG
AAAGAAGAAGGAAGAGGAAGAAAAATTGAGAAAGGAGGAAGAGGAGCGCCTTAGGCAGGA
AGAGCTTGAGAGGCAAGCTGAGGAGGCTAAGCGC

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 2

CO CL7482Contig1 1000 2 2 U
GGGCGACGAGGGAAAGAGACTGAAGTTTCTGGCGGTTCTCGGAGGAATGTTATAAAGGTA
TATTCGAAAAACGTAGAGGAAGAGGAAGGAGAAAAAAAATAGCTTTAGGAAAACAATGGT
GTTATGGGAGTTAGCTTTAGGAACAGCCTACTTCTTGGGACTCAGGCGGTCTTACCGGCT
CACATTGAAGACCCAGCGTCGGATTATTAGCCCTAATCATCCAAGGATCCGACAATTTCT
CCATAGGAGGACGCATCAAATATTTGATATGGCACTTAGGGTCCACAGGAACATACAACA
GAGAGACATGGAGATTGGTCGGAACCTTGGAAACTGGATTCTCCGGGGGCTCGACCGGAT
GAAGCCATCAGCTCAGGTTCTACGGCCAAAACAAATAGAGCCAAGCACAGGCAAGGCTGC
CAAGAGGCTATTAGAGTCAACACGTCTCAAACCGCATGCCAACACGAAGACGACTCCTCA
GAGTAATGAAGTCGGTAGGCACTTGTTCTTGTCTTTGAGGAATCTCAGGCCCAAGTTTTC
ACCGACTATCTCGATGATGATGAAGATCAAGCCGCCAAGACCCGTTGGAAGCACCACTCA
GTACAGGCCTTTCAGTGAATCCAGTCTTGTGAAACCATTCTATGCTAGAGGTGGGTTTGA
TGGTGTTATCAGGAAGGACATTTTGCAATGGATGGGGCAGAGATGAAGTCGCCACAATTC
ACCACAGCTGGTTCTCATGTTACAAGTAGCTGACGAATACCAAGAGCAATAAAAGAGAAC
TGTTCTTCATATATAGTCTTTTAATAAGTGGTCTAATCTCTTGGAGAATAACATGACTTG
TGACTAGTTTTACGTAACCACGCAACCAGAAATGTCATGTTAAAGATTCTAGGGGATCAA
CAAAACTAATACAAGTTCAGTTTCTAGGGGTTTTTCAACCTGTGTTATGATCACAACTAT
GTTCGTTGTCTAATATATTTAAGGGGAAACAATCTGGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1FI08TF U 1
AF RS1FI08JQ C 330
BS 1 668 RS1FI08TF
BS 669 1000 RS1FI08JQ

RD RS1FI08TF 668 0 0
GGGCGACGAGGGAAAGAGACTGAAGTTTCTGGCGGTTCTCGGAGGAATGTTATAAAGGTA
TATTCGAAAAACGTAGAGGAAGAGGAAGGAGAAAAAAAATAGCTTTAGGAAAACAATGGT
GTTATGGGAGTTAGCTTTAGGAACAGCCTACTTCTTGGGACTCAGGCGGTCTTACCGGCT
CACATTGAAGACCCAGCGTCGGATTATTAGCCCTAATCATCCAAGGATCCGACAATTTCT
CCATAGGAGGACGCATCAAATATTTGATATGGCACTTAGGGTCCACAGGAACATACAACA
GAGAGACATGGAGATTGGTCGGAACCTTGGAAACTGGATTCTCCGGGGGCTCGACCGGAT
GAAGCCATCAGCTCAGGTTCTACGGCCAAAACAAATAGAGCCAAGCACAGGCAAGGCTGC
CAAGAGGCTATTAGAGTCAACACGTCTCAAACCGCATGCCAACACGAAGACGACTCCTCA
GAGTAATGAAGTCGGTAGGCACTTGTTCTTGTCTTTGAGGAATCTCAGGCCCAAGTTTTC
ACCGACTATCTCGATGATGATGAAGATCAAGCCGCCAAGACCCGTTGGAAGCACCACTCA
GTACAGGCCTTTCAGTGAATCCAGTCTTGTGAAACCATTCTATGCTAGAGGTGGGTTTGA
TGGTGTTA

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1FI08JQ 671 0 0
GAAACTGGATTCTCCGGGGGCTCGACCGGATGAAGCCATCAGCTCAGGTTCTACGGCCAA
AACAAATAGAGCCAAGCACAGGCAAGGCTGCCAAGAGGCTATTAGAGTCAACACGTCTCA
AACCGCATGCCAACACGAAGACGACTCCTCAGAGTAATGAAGTCGGTAGGCACTTGTTCT
TGTCTTTGAGGAATCTCAGGCCCAAGTTTTCACCGACTATCTCGATGATGATGAAGATCA
AGCCGCCAAGACCCGTTGGAAGCACCACTCAGTACAGGCCTTTCAGTGAATCCAGTCTTG
TGAAACCATTTTATGCTAGAGGTGGGTTTGATGGTGTTATCAGGAAGGACATTTTGCAAT
GGATGGGGCAGAGATGAAGTCGCCACAATTCACCACAGCTGGTTCTCATGTTACAAGTAG
CTGACGAATACCAAGAGCAATAAAAGAGAACTGTTCTTCATATATAGTCTTTTAATAAGT
GGTCTAATCTCTTGGAGAATAACATGACTTGTGACTAGTTTTACGTAACCACGCAACCAG
AAATGTCATGTTAAAGATTCTAGGGGATCAACAAAACTAATACAAGTTCAGTTTCTAGGG
GTTTTTCAACCTGTGTTATGATCACAACTATGTTCGTTGTCTAATATATTTAAGGGGAAA
CAATCTGGTCC

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 2

CO CL7483Contig1 1530 2 4 U
GGATTTTGCAACTAAGCCATGTTGCAGAGTCTCTGTCCGTAGCTTCCTTTTCCGATGGAG
AAACTATAGTTACAAAGGATGAAAAGCTTCAGGGATTGCATGTTATCCAGAAGGGACTCG
TGAGAATTACTTTTGGTGCAGAGTTACTGGAGAGTCAAAATGTTTCAAGCCTTAAATCTG
AGGTCACTAAAGAAAATGACAATCTTGAAACCGAAACAGAAGTTTGCATAGAAAAGGAAG
AAGGAAGTTACTTTGGTGAATGGGCTCTTCTTGGTGAACTCAAAGATTCCTTAAGTGCAG
TTGCAGTGGGGGAAGTGGTCTGTGTTGTTTTAACAAAAGAAAAATTTGAGTCAGCGGTTG
GCCCTTTGGCCAATCTTGCAGATGACAGTCACAAGTCGAGACAATCTTCGTTCGATATAT
CAAAAGAATCTGCAAAAGTTACTGATACCACAGCTCTTGCTAAAGCCACTCTTGCAGACT
TGGAATGGACAACATGCTTGAGTTCAACAGACTGCAGTGAGGTCGGGCTGGTGCATTTGA
AAGACAAAGAAAATTTGCTCAGCTTGAAAAGATTTTCAAAGCAAAAGGTGAAGAAGCTAG
GCAAAGAGGCACAAGTCTTGAAAGAGCGGAATCTGATGAAGAACGCAATAAAGCCCTCAG
CGTTTGTTCCCGAGGTCTTGTGCACTTGTTCTGATCAAACATACGCAGCCATCTTACTGA
ACACTACTCTTGCTTGTCCTCTATCTTCATTGCTTCACTCTCCTATTGACGAGCCAGCTG
CCCGTTTCATTACCGCCTCATGTGTGTCTGCCTTGGAAGATATACACGAGAATGGCATTC
TCTTCAGAGGTTCATCTCCTGATTTACTGATGTTGGATCAATCTGGATATCTACAGATTG
TAGACTTCAGATTTGCCAAGAAACTGTCTGAGGAGAGAACATTTACAATCTGTGGGAATG
CAGATTATTTAGCCCCTGAAATTGTGCAAGGCAAAGGCCATGGTTTCGCAGCTGACTGGT
GGGCACTTGGAGTTTTGATATACTATATGCTAGAAAGTGAAATGCCATTTGGGTCATGGA
GACAAAACGAGCTAGACACGTTTCAGAAGATTGCTAAAGGCCAGCTTACTTTCCCTGGAG
CTCTAAGTTCAGAAGCTGAAGATCTCATCACAAAGTTGCTTGAAGTTGATGAAAACCTGC
GGCTCGGTAGCCAAGGAGGTCCTGAATCAATCAAGAAACATCCCTGGTTCAATGGACTCG
ACTGGGGTGCGATCAGTAACCGCGAAGTTCAAGTTCCTCAAGAGATAGTCTCCCGCATTC
ATCACCATCTAGAGAATGATAATGTTCTTCCTCTAGATACTTTACAATCAGTGGACACAA
CAGATGATCAGGATGCTCAGAACTGGCTTGAAGAATGGTAAAAATAGACTTGAAACAAAC
AAAAAAATTGTGGACTTGTATTTTTGTTCTGGTCCTCTTCATTTCAAATTTACATGCTTT
ATAGGTCTGTAAACAGTCATATTGATGTTG


BQ
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AF RS1AE09TF U 1
AF RS1AE09JQ C 722
BS 1 817 RS1AE09TF
BS 818 818 RS1AE09JQ
BS 819 831 RS1AE09TF
BS 832 1530 RS1AE09JQ

RD RS1AE09TF 839 0 0
GGATTTTGCAACTAAGCCATGTTGCAGAGTCTCTGTCCGTAGCTTCCTTTTCCGATGGAG
AAACTATAGTTACAAAGGATGAAAAGCTTCAGGGATTGCATGTTATCCAGAAGGGACTCG
TGAGAATTACTTTTGGTGCAGAGTTACTGGAGAGTCAAAATGTTTCAAGCCTTAAATCTG
AGGTCACTAAAGAAAATGACAATCTTGAAACCGAAACAGAAGTTTGCATAGAAAAGGAAG
AAGGAAGTTACTTTGGTGAATGGGCTCTTCTTGGTGAACTCAAAGATTCCTTAAGTGCAG
TTGCAGTGGGGGAAGTGGTCTGTGTTGTTTTAACAAAAGAAAAATTTGAGTCAGCGGTTG
GCCCTTTGGCCAATCTTGCAGATGACAGTCACAAGTCGAGACAATCTTCGTTCGATATAT
CAAAAGAATCTGCAAAAGTTACTGATACCACAGCTCTTGCTAAAGCCACTCTTGCAGACT
TGGAATGGACAACATGCTTGAGTTCAACAGACTGCAGTGAGGTCGGGCTGGTGCATTTGA
AAGACAAAGAAAATTTGCTCAGCTTGAAAAGATTTTCAAAGCAAAAGGTGAAGAAGCTAG
GCAAAGAGGCACAAGTCTTGAAAGAGCGGAATCTGATGAAGAACGCAATAAAGCCCTCAG
CGTTTGTTCCCGAGGTCTTGTGCACTTGTTCTGATCAAACATACGCAGCCATCTTACTGA
ACACTACTCTTGCTTGTCCTCTATCTTCATTGCTTCACTCTCCTATTGACGAGCCAGCTG
CCCGTTTCATTACCGCCTCATGTGTGTCTGCCTTGGA*GATATACACGAGA
TGGCATCT

QA 1 831 1 831
DS 

RD RS1AE09JQ 809 0 0
CACTACTCTTGCTTGTCCTCTATCTTCATTGCTTCACTCTCCTATTGACGAGCCAGCTGC
CCGTTTCATTACCGCCTCATGTGTGTCTGCCTTGGAAGATATACACGAGAATGGCATTCT
CTTCAGAGGTTCATCTCCTGATTTACTGATGTTGGATCAATCTGGATATCTACAGATTGT
AGACTTCAGATTTGCCAAGAAACTGTCTGAGGAGAGAACATTTACAATCTGTGGGAATGC
AGATTATTTAGCCCCTGAAATTGTGCAAGGCAAAGGCCATGGTTTCGCAGCTGACTGGTG
GGCACTTGGAGTTTTGATATACTATATGCTAGAAAGTGAAATGCCATTTGGGTCATGGAG
ACAAAACGAGCTAGACACGTTTCAGAAGATTGCTAAAGGCCAGCTTACTTTCCCTGGAGC
TCTAAGTTCAGAAGCTGAAGATCTCATCACAAAGTTGCTTGAAGTTGATGAAAACCTGCG
GCTCGGTAGCCAAGGAGGTCCTGAATCAATCAAGAAACATCCCTGGTTCAATGGACTCGA
CTGGGGTGCGATCAGTAACCGCGAAGTTCAAGTTCCTCAAGAGATAGTCTCCCGCATTCA
TCACCATCTAGAGAATGATAATGTTCTTCCTCTAGATACTTTACAATCAGTGGACACAAC
AGATGATCAGGATGCTCAGAACTGGCTTGAAGAATGGTAAAAATAGACTTGAAACAAACA
AAAAAATTGTGGACTTGTATTTTTGTTCTGGTCCTCTTCATTTCAAATTTACATGCTTTA
TAGGTCTGTAAACAGTCATATTGATGTTG

QA 1 809 1 809
DS 



AS 1 2

CO CL7484Contig1 867 2 2 U
GAAACTTGATTTTATTAATTTTCATTTTCAATTTTCTGGGAAATATCTATTTTGTCACAA
AGCATGCAAGTTTATTAATAATAAACGAAAAAAACAATTAAAATTCTACAACTTTCCACA
TTCAGTGGGAACAAACGACACCTTATCCTTCTCAAGATCATGAACTACATCAAAATTCTG
CTGCTGAAAATTTCCAAAAACAAACATCCCATTAAATTTCCCCATAGCCAAACACAAAAC
ACCACTACTCGGATCCTCCACCATGTAATTATCACCGGGAAGCTCCAAATCCCCACCCTT
AAAATGAAAAACCAGCTTAGGAACAGCGACATACTTATCCTCATTAAATAACGTATAGCA
CAAGTCAAGTCCTGTAAACCCTGATTCATCAACCGGTAAACTCATCCGCGAAGTAAACTC
CTTCTTCAAGCTATTAAACACCTCCTCCTCTAGATACGTGAGGGTCGTTCCAGAATCTAT
GATCATACCTCCTGTTCCATCTTCAGCTAGTTCGAACGTAGACTTCTCTATAGAAAGACG
TTTTGAACCGACGGTGATGCCTTGTAGGTCAAGGTAATAGAACGAGGGCTGGCTAGGGTT
TCGTAACAAGGAAATGGTTCTGGTGGCTTCGCCTTCTAACCTCCCACCGCTTTTCTTGAC
TATATTCGAGGCTAGAGATCCGATAAACAGCGAGCTAGACGCTTTGGTATCATCAATAGC
GGTCAAGCAATAAGAGAACTTAGTCTCCTTGAGCTGAGAAATAAGCGAGAGCGGTCCACG
ACCAAGACCTACAAGACCCGACCCTTGAGAGAACCCGTCTCCTTCGTTCTCATCCCCACA
CCCAAACCCTATACCCGAAACAGAGTT


BQ
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AF RS1GV51JQ U 1
AF RS1FU69JQ U 54
BS 1 424 RS1GV51JQ
BS 425 867 RS1FU69JQ

RD RS1GV51JQ 424 0 0
GAAACTTGATTTTATTAATTTTCATTTTCAATTTTCTGGGAAATATCTATTTTGTCACAA
AGCATGCAAGTTTATTAATAATAAACGAAAAAAACAATTAAAATTCTACAACTTTCCACA
TTCAGTGGGAACAAACGACACCTTATCCTTCTCAAGATCATGAACTACATCAAAATTCTG
CTGCTGAAAATTTCCAAAAACAAACATCCCATTAAATTTCCCCATAGCCAAACACAAAAC
ACCACTACTCGGATCCTCCACCATGTAATTATCACCGGGAAGCTCCAAATCCCCACCCTT
AAAATGAAAAACCAGCTTAGGAACAGCGACATACTTATCCTCATTAAATAACGTATAGCA
CAAGTCAAGTCCTGTAAACCCTGATTCATCAACCGGTAAACTCATCCGCGAAGTAAACTC
CTTC

QA 1 424 1 424
DS 

RD RS1FU69JQ 814 0 0
GTCACAAAGCATGCAAGTTTATTAATAATAAACGAAGGAAACAATTAAAATTCTACAACT
TTCCACATTCAGTGGGAACAAACGACACCTTATCCTTCTCAAGATCATGAACTACATTAA
AATTCTGCTGCTGAAAATTTCCAAAAACAGACATCCCATTAGATTTCCCCATAGCCAAAC
ACAAAACACCACTACTCGGATCCTCCACCATGTAATTATCACCGGGAAGCTCCAAATCCG
CACCCTTAAAATGAAAAACCAGCTTAGGAACAGCGACATTCTTATCCTCATTAGATAACG
TATAGCACAAGTCAAGTCCTGTAGACCCTGATTCATCAACCGGTAAACTCATCCGCGAAG
TAAACTCCTTCTTCAAGCTATTAAACACCTCCTCCTCTAGATACGTGAGGGTCGTTCCAG
AATCTATGATCATACCTCCTGTTCCATCTTCAGCTAGTTCGAACGTAGACTTCTCTATAG
AAAGACGTTTTGAACCGACGGTGATGCCTTGTAGGTCAAGGTAATAGAACGAGGGCTGGC
TAGGGTTTCGTAACAAGGAAATGGTTCTGGTGGCTTCGCCTTCTAACCTCCCACCGCTTT
TCTTGACTATATTCGAGGCTAGAGATCCGATAAACAGCGAGCTAGACGCTTTGGTATCAT
CAATAGCGGTCAAGCAATAAGAGAACTTAGTCTCCTTGAGCTGAGAAATAAGCGAGAGCG
GTCCACGACCAAGACCTACAAGACCCGACCCTTGAGAGAACCCGTCTCCTTCGTTCTCAT
CCCCACACCCAAACCCTATACCCGAAACAGAGTT

QA 1 814 1 814
DS 



AS 1 2

CO CL7485Contig1 948 2 2 U
GGATCTCTAAAACCCGAGTGGGGGACGCCTCTCCTCCGATAACGAAGACGATAAAGTAGG
AAGAAGATCGATTCGCCACGAGACCAGCCATGAGCTCATTCAACGGAAACAACAACAACA
TGGACAACCTCCTACTCCAAACCCTACTCGGCCGCCTCCAAATCCGCCCCCCAAACTCCC
CTTTCCTCTCCCAATCCCTAGACGACCTCCTCTTCAACAAATCCGACGACAGCGACAACG
ACAACGACGAAGAATCATCCCTCCAAAACAATCTCGAACGAGAAGAAGCCAAGCTCGAGA
AGGAGCTGATCCGCGTCATCGTCTCGGGCCGAATCGATTCCCTCAAGCCCAATTCAGGGC
AGGCCGTGACGGTCAACGAGCACCACATCTGCGTCGGGTTCCACGAGGACGAGGAGTCGG
ATTACCGTGTGTGGGAGTGGCATGGGCATATCATGCTTTTCGATGAGGAGAGTGGGTACA
CCCCTGAGTATATCTACGGGAATTACTTCGAGAGGTTGCCTGTGAAGTTGCCTAGTAAGG
ATAAGGAGAAGAAGGAGGTGAAAGAGAAGGAGGTGGAGGAGGAGGAGGTGGAGAGTTTGG
GTGGTTTGAGAGAGTTGATTGATGGTGGAGATGGTGATCGTGGTAGGGTTCTTCATAGGA
ACGTCAACATCGGTTCCTCAAGGGCTTAATTCCTCGGAGCGGTCTGGCAGTGAGAGGTGA
CATTGCTCGGGAAGATTTCAGATGTGTGAACAGACGACAACTCGGGACAAAAAAAAACAA
TAACGCGTTGGTGAAATTAGGGATTCTGTTCCGTTCTATTTAAACCAGTAAAACCCATGG
GTGAAAATCACCTGAAGTTGTTTTTGATCCAAATTTACAATACATGTTGGTGAACAGAGC
AAAGAGTACACATGATTATGGTCATTGAACCTGAAAGTTTTGTACTCC


BQ
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AF RS1ES91TF U 1
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BS 643 948 RS1ES91JQ

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AGGCCGTGACGGTCAACGAGCACCACATCTGCGTCGGGTTCCACGAGGACGAGGAGTCGG
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TTTACAATACATGTTGGTGAACAGAGCAAAGAGTACACATGATTATGGTCATTGAACCTG
AAAGTTTTGTACTCC

QA 1 555 1 555
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AAAAGATAACTAGTTTGAGATTT


BQ
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AF RS1F973TF U 1
AF RS1F973JQ C 28
BS 1 743 RS1F973TF

RD RS1F973TF 743 0 0
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CACATCTCTCAACACTAAGAGGCTTGATGGCGACACCGAGAACCTCGCTCATGAGCGTGT
GCCTACCGAGCTAAGGAAAGCCATTATGCAAGCTCGAACTGACAAGAAGCTTACCCAGTC
CCAACTTGCTCAAATCATCAATGAGAAGCCACAAGTGATCCAGGATTACGAGTCTGGTAA
AGCCATCCCCAACCAGCAGATCCTTTCTAAGCTTGAGAGAGCACTTGGAGCTAAACTCCG
TGGTAAGAAGTGATCATCATCAAGTCCTGAAGATGAACAAAACTTACTTGCAGTTTCACT
TTTCTTAATGACGATGTAGTAACAAGCTTCGATGTAATGTCATAACTTTGCTAAAGAATA
ATAATCTTTCTGATGTAAGAAAGACAGACCGTTTGAATGATTGGTTGATGAATCACTCTT
TCATTAACATATTTCATTATAAAAGTTAAGTTTGGGTTTTCTTGCATCACACATATATTT
AAAAGATAACTAGTTTGAGATTT

QA 1 743 1 743
DS 

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CGAGAAAACCGTCAACGCCGCACGTCGATCCGGCGCCGATATCGAATCCGTCAGAAAATA
CAATGCTGGAACCAACAAGGCAGCCTCAAGCGGCACATCTCTCAACACTAAGAGGCTTGA
TGGCGACACCGAGAACCTCGCTCATGAGCGTGTGCCTACCGAGCTAAGGAAAGCCATTAT
GCAAGCTCGAACTGACAAGAAGCTTACCCAGTCCCAACTTGCTCAAATCATCAATGAGAA
GCCACAAGTGATCCAGGATTACGAGTCTGGTAAAGCCATCCCCAACCAGCAGATCCTTTT
TAAGCTTGAGAGAGCACTTGGAGCTAAACTCCGTGGTAAGAAGTGATCATCATCAAGTCC
TGAAGATGAACAAAACTTACTTGCAGTTTCACTTTTCTTAATGACGATGTAGTAACAAGC
TTCGATGTAATGTCATAACTTTGCTAAAGAATAATAATCTTTTTGATGTAAGAAAGACAG
ACCGTTTGAATGATTGGTTGATGAATCACTCTTTCATTAACATATTTCATTATAAAAGTT
AAGTTTGGGTTTTCTTGCATCACACATATATTTAAAAGATAACTAGTTTGAGATTT

QA 1 716 1 716
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AATGGTTCTTCTTCGTGCCAAGACAAGAACGCGAAGCAAGAGGAGGCAGACCGAGCAGAA
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ACCGAATGATTGGAGTCAAGAAAACTATGGTGTTCTACACAGGAAGAGCACCAACAGGAA
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CAATCCCTAAGTTGAGACATGAATTCAGCTTATGTCGGGTCTACATAACATCAGGAAGCT
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ATGTTGCAGTTGGTGAGACATCAGTTCGCGTGGAAAGCTCACCATAAGCTTCGATGTCGG
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TTTGGGAATGGGAACAGCTGAACTGGCCTTGAAGCTTGCAGAGCGAGATTCATAATCAAG
CACACTGGAGTTACGTAGTAAAATAAATGAGTTATGTATTATTCCCTCCGTTTTCCATTA
ATCCATGTTTTGGGTTTCCACACTTATTAATAAAACACATTAAATTTTAGTAGTAAATGT
ATAGTTTTTTATAAGTAATATTTTCCCATAATTTTCAATCAATCAAAATTTAGTG


BQ
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AF RS1H288TF U 1
AF RS1H288JQB C 78
BS 1 611 RS1H288TF
BS 612 835 RS1H288JQB

RD RS1H288TF 611 0 0
GGATATGTGGTAGTGTTAGTTCGTGGTTTGTGAAACTTACACGTCCTCTCTCTCTTGTGG
GTTTTTTTCAATTTTTTTTATCAGATATGGCGGGAGAGAGATGTCTAGGAGATGCTGAGC
AATGGTTCTTCTTCGTGCCAAGACAAGAACGCGAAGCAAGAGGAGGCAGACCGAGCAGAA
CCATTGGTTCAGGGTACTGGAAAGCAACTGGATCACCTGGTCCAGTCTTTTCCAAAGATA
ACCGAATGATTGGAGTCAAGAAAACTATGGTGTTCTACACAGGAAGAGCACCAACAGGAA
GAAAAACAAAATGGAAGATGAATGAGTACAAAGCCGTTGACAAAACATTCAACGTTTCCA
CAATCCCTAAGTTGAGACATGAATTCAGCTTATGTCGGGTCTACATAACATCAGGAAGCT
CAAGAGCTTTTGATAGACGCCCAATGGGAAATTTTCAGGCAGAAAGAATGCTTACACGTG
ATGTTGCAGTTGGTGAGACATCAGTTCGCGTGGAAAGCTCACCATAAGCTTCGATGTCGG
GAGGAGAACATGGTTGTCTCTCTATGAATGGAGAGATTGTTGATGGTTTAACTGAACCAA
TTTGGGAATGG

QA 1 611 1 611
DS 

RD RS1H288JQB 758 0 0
TTATCAGATATGGCGGGAGAGAGATGTCTAGGAGATGCTGAGCAATGGTTCTTCTTCGTG
CCAAGACAAGAACGCGAAGCAAGAGGAGGCAGACCGAGCAGAACCATTGGTTCAGGGTAC
TGGAAAGCAACTGGATCACCTGGTCCAGTCTTTTCCAAAGATAACCGAATGATTGGAGTC
AAGAAAACTATGGTGTTCTACACAGGAAGAGCACCAACAGGAAGAAAAACAAAATGGAAG
ATGAATGAGTACAAAGCCGTTGACAAAACATTCAACGTTTCCACAATCCCTAAGTTGAGA
CATGAATTCAGCTTATGTCGGGTTTACATAACATCAGGAAGCTCAAGAGCTTTTGATAGA
CGCCCAATGGGAAATTTTCAGGCAGAAAGAATGCTTACACGTGATGTTGCAGTTGGTGAG
ACATCAGTTCGCGTGGAAAGCTCACCATAAGCTTCGATGTCGGGAGGAGAACATGGTTGT
CTCTCTATGAATGGAGAGATTGTTGATGGTTTAACTGAACCAATTTGGGAATGGGAACAG
CTGAACTGGCCTTGAAGCTTGCAGAGCGAGATTCATAATCAAGCACACTGGAGTTACGTA
GTAAAATAAATGAGTTATGTATTATTCCCTCCGTTTTCCATTAATCCATGTTTTGGGTTT
CCACACTTATTAATAAAACACATTAAATTTTAGTAGTAAATGTATAGTTTTTTATAAGTA
ATATTTTCCCATAATTTTCAATCAATCAAAATTTAGTG

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL7490Contig1 834 2 6 U
GGCCAAGCTTAGACACCCAAACCTCGTTTGCTTGTTGGGTCATTGCATAGACTGTGGTGG
GAAAGATGATTACAGTGTTGAGAAAGTATTCTTGATTTATGAATACATTCCAAATGGGAA
CTTTCAATCTTGTCTCTCAGATGATAGTTGGGGTAAGTCTATGAACTGGTCAGAGAGACT
GACTGTTCTTACAGGTGTTGCAAAGGCTGTTCATTATCTTCACACTGGAGTAATCCCTGG
ATTCTTTAGTAATAGACTCAAGACTAACAATGTCTTGCTTAATCAACACCGGTTTGCTAA
GCTGAGTGATTATGGTTTGTCCATTGTCTCTGAAGCAACCAGACATAACACAGAAATAGC
AAAATCATGGCAAATGTCGAGGTTAGAAGACGATGTCTACAGTTTCGGATTGATTCTTCT
ACAAGCTATTGTTGGACCATCTGTTTCAGCAAGAGAAGAAGCGTTTCTTAGAGATGAATT
GGCATCGTTGGAGAGTGAGGAAGGAAGGAGGAGAATGGTGAATCCGACAGTACAAGCTAC
TTGTCGGAACGGATCTTTGATAAGAGTGATAACTCTTATGAACAAATGTGTTTCCCCTGA
ATCGTTAAGCCGACCATCATTTGAAGATATCTTGTGGAACTTGCAGTATGCTTCTCAGTT
GCAGTCTGAAGATGGTGAACAGTATTAATGTACATAATCTTATTCTCTGTTCTTAAGTAT
GAAAAAATGAAAAACTTTGACATGCTTCATAGATTTGTATTGTGTGTATGGAAATCCCCT
ATTATTTATGGAACGATTAAAAAAGAAATAAATAACATGAATATTAATTTGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DS12TF U 1
AF RS1DS12JQ C 67
BS 1 726 RS1DS12TF
BS 727 727 RS1DS12JQ
BS 728 733 RS1DS12TF
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BS 735 796 RS1DS12TF
BS 797 834 RS1DS12JQ

RD RS1DS12TF 796 0 0
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GACTGTTCTTACAGGTGTTGCAAAGGCTGTTCATTATCTTCACACTGGAGTAATCCCTGG
ATTCTTTAGTAATAGACTCAAGACTAACAATGTCTTGCTTAATCAACACCGGTTTGCTAA
GCTGAGTGATTATGGTTTGTCCATTGTCTCTGAAGCAACCAGACATAACACAGAAATAGC
AAAATCATGGCAAATGTCGAGGTTAGAAGACGATGTCTACAGTTTCGGATTGATTCTTCT
ACAAGCTATTGTTGGACCATCTGTTTCAGCAAGAGAAGAAGCGTTTCTTAGAGATGAATT
GGCATCGTTGGAGAGTGAGGAAGGAAGGAGGAGAATGGTGAATCCGACAGTACAAGCTAC
TTGTCGGAACGGATCTTTGATAAGAGTGATAACTCTTATGAACAAATGTGTTTCCCCTGA
ATCGTTAAGCCGACCATCATTTGAAGATATCTTGTGGAACTTGCAGTATGCTTCTCAGTT
GCAGTCTGAAGATGGTGAACAGTATTAATGTACATAATCTTATTCTCTGTTCTTAAGTAT
GAAAAA*TGAAAA*CTTTGACATGCTTCATAGATTTGTATTGTGTGTATGGAAATCCCCT
ATTATTTATGGAACGA

QA 1 796 1 796
DS 

RD RS1DS12JQ 768 0 0
TGATTACAGTGTTGAGAAAGTATTCTTGATTTATGAATACATTCCAAATGGGAACTTTCA
ATCTTGTCTCTCAGATGATAGTTGGGGTAAGTCTATGAACTGGTCAGAGAGACTGACTGT
TCTTACAGGTGTTGCAAAGGCTGTTCATTATCTTCACACTGGAGTAATCCCTGGATTCTT
TAGTAATAGACTCAAGACTAACAATGTCTTGCTTAATCAACACCGGTTTGCTAAGCTGAG
TGATTATGGTTTGTCCATTGTCTCTGAAGCAACCAGACATAACACAGAAATAGCAAAATC
ATGGCAAATGTCGAGGTTAGAAGACGATGTCTACAGTTTCGGATTGATTCTTCTACAAGC
TATTGTTGGACCATCTGTTTCAGCAAGAGAAGAAGCGTTTCTTAGAGATGAATTGGCATC
GTTGGAGAGTGAGGAAGGAAGGAGGAGAATGGTGAATCCGACAGTACAAGCTACTTGTCG
GAACGGATCTTTGATAAGAGTGATAACTCTTATGAACAAATGTGTTTCCCCTGAATCGTT
AAGCCGACCATCATTTGAAGATATCTTGTGGAACTTGCAGTATGCTTCTCAGTTGCAGTC
TGAAGATGGTGAACAGTATTAATGTACATAATCTTATTCTCTGTTCTTAAGTATGAAAAA
ATGAAAAACTTTGACATGCTTCATAGATTTGTATTGTGTGTATGGAAATCCCCTATTATT
TATGGAACGATTAAAAAAGAAATAAATAACATGAATATTAATTTGACG

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL7491Contig1 1233 2 2 U
TTTTTCCTTTAGATCTAGCTCTGCGTTATCCAGATCTAGAACCTCTATATTGTATCTGCA
TGTTGTTTTCGACAAGATCCGATATGTCGTTATATATGAAACTCTAATTGGATTATAAGA
AATGTTTGTTTCGGCTGTGCTGCATTCCGACACGAACAGGAAAGAAATAGAGTTTTATGT
TCTGTCTGAATTTGGATTTGAATCTTAAGTTTTATTTTCTTTTGTGTGGTTATTTTTGTA
GATCTGTGCGATGGATGACGATGGGTTTCGTAATTGGGGTTACTACGAACCGGCGGCCGC
TACGTCATTCAAAGGTAACCTCGGTTTGCAGCTAATGCCAACCATTGATCGGAACACTAA
ACCGTTTCTACCCGGTCGAGACCCTAATCTAATGATTGGGCAAACCGGTTCATACCACCA
CCACCCTGAGCCCCACATGAGCTACAATTGGATTAACCAACACAAAGACAAGTTCTTCAA
CATGTTGCCTGTCACAACCACTCCTAATTACGGAAATGTCCTTCCCCAAACTTCCTCATC
CCCATCCATGCACATGAATCTCCACCATCATCATCACCAAACCGAGGAACACCCGGTTAA
ATGCGAACCGGACATTGTCGAGACTAAGAAGCGGAAGCCTAATTCGAAAGCTGCTGGCGG
CGCTACTAAGGCGAAGAAGCCTCGTAAACCAAAAGAGGAGAACGACAATAACACGAATGT
TTCACGAGTTAAACCGGCTAAGAAAAGCTTCGACCTGGTTATTAACGGAGTGAATATGGA
TATTTCCGGTTTACCCGTACCGGTCTGCACCTGCACTGGAGCTCCTCAGTAATGCTACCG
TTGGGGATGTGGGGGTTGGCAATCTGCGTGTTGCACCACGAACATATCGATGCATCCGTT
GCCGATGAGTACTAAGCGGCGTGGAGCGAGGATCTCTGGGAGGAAGATGAGTCAAGGCGC
CTTTAAGAAGGTTCTTGAGAAACTTGCTTCTGATGGGTTTAACTTTGGGAACCCCATCGA
TCTTAAGAGTCACTGGGCAAGACATGGAACTAACAAGTTCGTCACCATCAGATGATTAGT
TATCTTTATTTTTTGCTGGACTCTGTTTGTTTGTTTGTCTGAGAGGAAGAAGGTGACTTA
GAAAATCTGCAGGGAAGTTTGAATTCTTCTTCTTTTTTTTTTGTATTTTTCCCCCTTCCT
TCTGTTATCTTTATAAACATTTTACTGACTTGT


BQ
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DS 

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AATTCTTCTTCTTTTTTTTTTGTATTTTTCCCCCTTCCTTCTGTTATCTTTATAAACATT
TTACTGACTTGT

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DS 



AS 1 2

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CCGAGTCAGTTAGACATGGCCACCACCGCATCTCCAGCTCCGACGAAGAAATCGAGAAAC
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ATTCTCGGCGCTAAATGGAAATCTCTTAGCGCGGAAGAGAAGAAGCCTTACGAGGAGAGG
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AAGAAGAAGGAGAAAACAGACAATCTGATCAAGAAGGAAAAAGAGACCAAGAAGAAGAAG
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AAAGATGCAAGGAAGACTTTGACAGAAGAACGTCCTGGGACGAGCAACTCAACAGTTACC
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GCTGAGGCTACGACCAGTAGCTAGAAGAATATCTATCTCTCTTTTAAAATTGAAATAATG
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TTTCTTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C068TF U 1
AF RS1C068JQ C 716
BS 1 798 RS1C068TF
BS 799 1567 RS1C068JQ

RD RS1C068TF 799 0 0
GGACTCAGATCCACAATCTCCAAAAACATCCGAGATCTCCCTTCTCCCTTTGTGTGCGCT
CCGAGTCAGTTAGACATGGCCACCACCGCATCTCCAGCTCCGACGAAGAAATCGAGAAAC
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ATGCAGGCGATGCTGGAGAAGATGACGATCGAGAAGGATAAGACGGAGGAGTTGCTTAAG
GAGAAGGAGGAGATTCTGAGGAAGAAGGAGAAGGAGCTCGTGACGAGAGACGCTGAGCAG
GAGAGGCTCAAGACGGAGCTGAAGAAGCTTCAGAAGACGAAGGAGTTCAAACCTAACATG
ACGTTTGCTTGTGGACAGTCTCTCACACAAGGTGAGGAAGAAAAGGTGAACAAGAAGAAG
AAGAAGAAGGATTGTCCCGAGAGGAAGCGACCATCGTCGTCATACATTCTGTGGTGTAAG
GAGCAGAGGGATGAAATCAAGAAGGAGAATCCTGAAGCTGACTTTAAGGAGACTTCGAAT
ATTCTCGGCGCTAAATGGAAATCTCTTAGCGCGGAAGAGAAGAAGCCTTACGAGGAGAGG
TACAAGGTGGAGAAGGAAGCTTACCTCCAGGTGGTTGCTAAGGAGAAGCGTGAGAGAGAG
GCCATGAAGCTTCTTGATGATGAGCAGAAGCAGAAGACTGCTATGGACTTGCTTGATCAG
TATCTTCAGTTTGTGCAG
A

QA 1 798 1 798
DS 

RD RS1C068JQ 852 0 0
AGAGAGAGCCATGAAGCTC
TGATGATGAGCAGAAGCAGAAGACTGCTATGGACT*GCTTGATCAGTATCTTCAGTTTGT
GCAGGAAGGTGAACAGGATATAAAGAAGAAGAGCAAGAAGCAGAAGGATCCTCGGAAGCC
AAAGCATCCCATATCTGCCTTCCTGGTTTATGCCAACCAGAGGAGAGCTGAGTTACGTGA
AGAGAACAAGAACGTTGTCGAGGTAGCAAAGATGACAGGAGAAGAGTGGAAGAAGTTGTC
AGATAAACAAAAAGCACCCTTCGAAGAGGTTGCAAAGAAGAACAAGGAGACATACCTGGA
AGCGATGGAGGAGTACAAGAGAACGAAGGAAGAAGAGGCGATGAGCCAGAAGAAAGAAGA
AGAGGAGCTCTTGAAACTCCACAAACAGGAAGCTCTCCAGCTTCTTAAGAAGAAGGAGAA
AACAGACAATCTGATCAAGAAGGAAAAAGAGACCAAGAAGAAGAAGAACGAAAACGTAGA
CCCAAACAAACCCAAGAAGCCTGCTTCGTTATTCCTTCTCTTCAGCAAAGATGCAAGGAA
GACTTTGACAGAAGAACGTCCTGGGACGAGCAACTCAACAGTTACCGCTCTAATCTCAGT
GAAATGGAAGGAATTGGGTGAAGAAGAGAAGCAAAGTTACAACAACAAAGCAGCAAAGTT
GATGGAAGCATACAAGAAGGAACTTGAATATTACAACAAGAAGAGTGCTGAGGCTACGAC
CAGTAGCTAGAAGAATATCTATCTCTCTTTTAAAATTGAAATAATGTTCAAGTCCTGTTG
AACATGTGTCTTTTATGCATTTTGTTAGGATCTGAAACTCAAGTGATTTCTTC

QA 20 852 20 852
DS 



AS 1 2

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CAGATCACACGAACAGAACAACGGAGACGAACAGATGAGAAGCGGCGGTAGGATCCTTCT
AGGTTTCAAAGAGACTCCAAAAGGAAGCAACGTCACCTTCGAGTGCTCTCCTTCAGGTCC
TTGCGTCTCCTGCAACTCCTCCGAAAAGAGAGGTGAGAGGAGGAGGAGAGGAAGCTTCTT
CACACAAGAAAGACGCAGAAGAGACGACGCAACAAAATGATCAATCTAATGCCAGTAATA
ATGATGACGAAGAAGTTGTTGATGCATCGTCGGTGAAGCAGAGGAACCTGCGCGATGACT
CTTCTTCTTCACCGGCATCGAAAGCTAAGAAGTCTCAGTCTTACAAAACTTACAGAAGCT
GTGTCCCTTCTGCGGATGAGGAGAGAGTTTCAGTTCTTGGTTTCGAGGCGGTTATGCTAG
GACTGTTACTCGTGAGTGGATCCGCTGTATATTACAGAAAGAAACAGACAGTACCGATGG
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GAGTATATAATATAAGCTTTTAGGGGCTTTGATATAACTGGATTACTTGTTTCTTTAGAT
GATGACTGATTGTTTATGAGATCAATTCCCATTTGAAAAAAGATGTTATCACTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1F550TF U 1
AF RS1F550JQ C 4
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BS 673 673 RS1F550JQ
BS 674 727 RS1F550TF
BS 728 837 RS1F550JQ

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GACTGTTACTCGTGAGTGGATCCGCTGTATATTACAGAAAGAAACAGACAGTACCGATGG
CCGGAGTATCCAGTGGAAGATCACAGAGCAATTCCCGGTTTTAAGAGAAAACCTTTTTTT
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GAGTATA

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1F550JQ 834 0 0
AGACGAAGAG
AGGAGAAGAGAA*AAACAGCGAAAATGGCTTCCAAGAGTTATCATCCACTGCATTTGATC
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AACTCCTCCGAAAAGAGAGGTGAGAGGAGGAGGAGAGGAAGCTTCTTCACACAAGAAAGA
CGCAGAAGAGACGACGCAACAAAATGATCAATCTAATGCCAGTAATAATGATGACGAAGA
AGTTGTTGATGCATCGTCGGTGAAGCAGAGGAACCTGCGCGATGACTCTTCTTCTTCACC
GGCATCGAAAGCTAAGAAGTCTCAGTCTTACAAAACTTACAGAAGCTGTGTCCCTTCTGC
GGATGAGGAGAGAGTTTCAGTTCTTGGTTTCGAGGCGGTTATGCTAGGACTGTTACTCGT
GAGTGGATCCGCTGTATATTACAGAAAGAAACAGACAGTACCGATGGCCGGAGTATCCAG
TGGAAGATCACAGAGCAATTCCCGGTTTTAAGAGAAAACCTTTTTTTGATTTATGTAAAA
GCTTTCAACGGTTTTTTCATTGTTGCGAGAAACAGAGATATTACTACGAGTATATAATAT
AAGCTTTTAGGGGCTTTGATATAACTGGATTACTTGTTTCTTTAGATGATGACTGATTGT
TTATGAGATCAATTCCCATTTGAAAAAAGATGTTATCACTTGCC

QA 11 834 11 834
DS 



AS 1 2

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TGTCTACAGAGAGTTCCATGTTGAGTGTTTTGTTACTACTCTCCAAGTACCGGTTAAGAA
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CTGATTCGACTTTGGGCAGTGTTATAAACAGTTTGGCTTCGAGGTCGGTGCATCGAGTTT
ATGTTGGGGGATGGAGATGAGAATGAGCTTTATGGAGTTATTACACTGAGGGATGTGATC
TCTTGTTTCGTGTCAGAACCTCCCAACTACTTTGAGAACTGTCTAGGCTTCTCGGTTAAA
GAATGCTTAACCGATGATGATATCTTTTTTCCCAGCTTTTGGTCTTCTATGGATTTGGTC
TTCTTGTCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EL01TF U 1
AF RS1FR08TF U 1
BS 1 609 RS1EL01TF
BS 610 610 RS1FR08TF
BS 611 717 RS1EL01TF
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RD RS1EL01TF 717 0 0
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QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1FR08TF 789 0 0
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ACGTTCCGGTGATTAAACCAGGCGAACCAGATATCAAGAACTACATTACTCAATCTGCAG
TTGTTTATGGTCTTGAAGACTGCAAAGGCAGAGACTGGTTCGACCACATTTCAGCTCTCC
CCATTTCTGATCTAGTCCTTCCTTTCATGACACCCAATGAGGTTATTAGCATTGACAGCG
AAGAACATATACTTGAAGCATTTAAGCGAATGAGAGACAACAACATTGGTGGTCTTCCCG
TTGTTGAAGGGACAAACAAGAAGATAGTTGGAAACATAAGCATGAGAGACATCAGATATC
TGTTACTTCAACCTGAAGTCTTCTCCAATTTCAGGCATCTTACGGTGAGGAATTTCACTA
CAAAGATTGCTACGGCGGGAGAGGAATACGGTTTGGCTATTCCTGCGATAACCTGTAGGC
CTGATTCGACTTTGGGCAGTGTTATAAACAGTTTGGCTTCGAGGTCGGTGCATCGAGTTT
ATGTTGGGGGATGGAGATGAGAATGAGCTTTATGGAGTTATTACACTGAGGGATGTGATC
TCTTGTTTCGTGTCAGA*CCTCCCAACTACTTTGAGAACTGTCTAGGCTTCTCGGTTAAA
GAATGCTTAACCGATGATGATATCTTTTTTCCCAGCTTTTGGTCTTCTATGGATTTGGTC
TTCTTGTCT

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 2

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GTTGTACTCAAATATGTGCTGTACTCATATTCATCGTTTCTATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
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AF RS1GK30TF U 1
AF RS1GK30JQ C 60
BS 1 675 RS1GK30TF
BS 676 676 RS1GK30JQ
BS 677 714 RS1GK30TF
BS 715 715 RS1GK30JQ
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BS 775 775 RS1GK30JQ
BS 776 793 RS1GK30TF
BS 794 885 RS1GK30JQ

RD RS1GK30TF 793 0 0
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CTGCGATCGAGCAACACCAGAAGAGGATCACGGATGCTATACTCGAGCACGCTCGTCAAA
TCTATGCTGATAGATCGGTGAATGTGAAAACGCAAGTGGTTGTTGGAGATCCCAAGGATA
AGATCTGCGAGACTGTTGAGAATTTGAACGCTGATCTACTTGTCTTGGGTCCTCGTGCTT
ATGGCCCTATTAAGAGGATGTTTTTGGGAAGTGTAAGCAACTACTGCACCAACCACGCTC
AGTGTCCTGTTGTGATAATTAAACCCAAGGAGGATTCTCCTGAATGATCAGGAGATATGT
GTAAATATGCAAAGGGGATATCAAACCCATCTTTGTATGTTTGTGAAGCTATGGAAGCAA
AGCGAAGTATCCAAG*TGTTTTTACATGTTAAGGCATTGGTGTGTGAATGTAAA*TTTAA
TAAGATCTACAGAAACATTGGGTGCATCATCAGTCTCAGTCTCAGAATATGTGT*GTACT
CAAATACGTGTAT

QA 1 793 1 793
DS 

RD RS1GK30JQ 826 0 0
CTCATCATGGATGTCTCTGGAATCTTGACC*GCGTCGTCGTGGCGGTAGATGGAAGCGAG
GTGAGCATGGAAGCTCTGAAGTGGGCGCTAGACAACCTCAAGCTCGCATCGTCTTCTCCC
GATTCATCATCATCATTCGTCGTCCTACACGTCCAGCCTTCTCCTTCAATCGCCGCCGGA
GTCAACCCCGGCGCAATCCCCTTCGGTGGTCCCAGTGATGTGGAGGTTCCTGCTTTCGCA
GCTGCGATCGAGCAACACCAGAAGAGGATCACGGATGCTATACTCGAGCACGCTCGTCAA
ATCTATGCTGATAGATCGGTGAATGTGAAAACGCAAGTGGTTGTTGGAGATCCCAAGGAT
AAGATTTGCGAGACTGTTGAGAATTTGAACGCTGATCTACTTGTCTTGGGTCCTCGTGCT
TATGGCCCTATTAAGAGGATGTTTTTGGGAAGTGTAAGCAACTACTGCACCAACCACGCT
CAGTGTCCTGTTGTGATAATTAAACCCAAGGAGGATTTTCCTGAATGATCAGGAGATATG
TGTAAATATGCAAAGGGGATATCAAACCCATCTTTGTATGTTTGTGAAGCTATGGAAGCA
AAGCGAAGTATCCAAGGTGTTTTTACATGTTAAGGCATTGGTGTGTGAATGTAAAATTTA
ATAAGATCTACAGAAACATTGGGTGCATCATCAGTCTCAGTCTCAGAATATGTGTTGTAC
TCAAATACGTGTATTGTATTCACATTGGTTGGATCATCGGTCTCTCGGGCTCAGAATTTG
TGTTGTACTCAAATATGTGCTGTACTCATATTCATCGTTTCTATTG

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 2

CO CL7496Contig1 768 2 2 U
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AAACATCCTCTTAACCAAGTCATACGACGCCAAAGTCTCGGACTTTGGTTTGTCCCAGCT
CGTATCAGCCTCAACTACGACTCCAAACCGTGGTACGGGTTACCGTGCGCCTGAAGTAAC
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GCTGATTACGGGTAAAGCTCCTTCCAACTCGGTGATGAACGAGGAAGGAGTTGATCTGTC
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TTGGATTTTTAATTATTAATAGTTTAAGTTAATCAATGGTTGGGGGCAAAATTGATATGA
GTTATTGGTTTTAGAATCTTTCAGTTTTAAAATTTTAACTTGTGTTTTTGACCCCACTTG
CTAAAAGGAGGTGGGTTTTAGTGGTTAAGTCTGGTGGCATTTGCATTT


BQ
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AF RS1AQ70JQ C 1
AF RS1AQ70TFB U 1
BS 1 721 RS1AQ70TFB
BS 722 768 RS1AQ70JQ

RD RS1AQ70JQ 768 0 0
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TGGCTTAGACTACCTTCACTCACAAGGAGCCTCCACCTCTCACGGCAATGTCAAATCCTC
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GTTATTGGTTTTAGAATCTTTCAGTTTTAAAATTTTAACTTGTGTTTTTGACCCCACTTG
CTAAAAGGAGGTGGGTTTTAGTGGTTAAGTCTGGTGGCATTTGCATTT

QA 1 768 1 768
DS 

RD RS1AQ70TFB 721 0 0
GGCGGGAAGGACTCCACTAACTTGGGATGCACGTTCACGAATTGCTCTTGGTGCAGCTCG
TGGCTTAGACTACCTTCACTCACAAGGAGCCTCCACCTCTCACGGCAATGTCAAATCCTC
AAACATCCTCTTAACCAAGTCATACGACGCCAAAGTCTCGGACTTTGGTTTGTCCCAGCT
CGTATCAGCCTCAACTACGACTCCAAACCGTGGTACGGGTTACCGTGCGCCTGAAGTAAC
CGATCCTAAACGTGTGTCGCAGAAAGGTGACGTGTACAGCTTCGGTGTGGTGATTCTTGA
GCTGATTACGGGTAAAGCTCCTTCCAACTCGGTGATGAACGAGGAAGGAGTTGATCTGTC
GAGATGGGTTAAGTCTGTGGTGAGAGATGAGTGGAGGAGAGAGGTTTTTGACTCGGAGCT
GCTTAGCTTGGAAAGGGAGGAAGAAGAGATGATGGAGGAGATGGTGCAGCTAGGGATTGA
GTGTACGTCACAGCATCCGGACCAGAGGCCTGAGATGGCTGAAGTGGTTAGGAAGATTGA
GAATTTGAGATGGTCTGGTCCTGATCAAGTGGATGAAGCTTATTAATTAAGAATTAATAA
TTGGATTTTTAATTATTAATAGTTTAAGTTAATCAATGGTTGGGGGCAAAATTGATATGA
GTTATTGGTTTTAGAATCTTTCAGTTTTAAAATTTTAACTTGTGTTTTTGACCCCACTTG
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL7497Contig1 1137 2 2 U
GGTATGCTTGATGCTATTGAACGTGAGTTTGAAGCTGCGACTAAGGGCCATGTAGAAAAG
ACTTATAAAGAAGAAGCTGAAACTCATAGAAGCAGCATGTTGGAAGAAATTGAACGCGAA
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GGATCCAACTCTGGTTTTAGCAGTCTTCTAAAGTCTACAGATGGTGTGTGTGGTTGTTTT
AACCAAGGCAAAGATGGTATTAAGGTAGACACTGATTGTTCAATTAACATAGGAGAGATA
CTTGCTGAAGAATCAAACTTCCAGGGCTCAGAGACCTCTAGCCTCACCACTTCACTGAAC
AATCTCGTTCACACCCATAGACAAGAAACAACCTCAAAGGGACGCACAGACATTGTCTCG
TCTACATCCGAGAACATAGAGAGCTTAAAGCTAACCCTAAAGAAGCTACGCGGTCTAACC
GCACGTGACCTTGTAAACCATCCCAACTTCGACGAGATTATCGAAGCCGGTACACGTTAC
GAGGTACTCAGCTCAGCCTCAATAGGTTACATCTCTTTGTTAGCCAAATACAAAACCGTC
ATTAAAGAAGGACTCGAGGCTTCACAGAGAGTTCACATTGCTCAGACACGCGCCAAGCTT
CTCAAAGAAACCGCCATGGAGAAGCAGAGAGCCGTGGACGCTGAGTTCGCATTCGCCAAG
ACTCTTGCTCAAGGAGGAGACGCGTTGTCTATCAAAATCTTTGCGATCAAGAAACTGTTG
GTTAAGCTTGAAGCAGAGAAACTGAACATTGATCTTAAGTTTAAGTCTACGGAGACTAAC
CTAGCACGGCTTCTTAAGGAGGCTTCTCAGGCTTATGAAGAGTATCATGTGGCTGTGCGT
AAGGCGAAGGACGAGCAAGCTGCTGAGGAGTTCGCTCTTGAGACGACCAAGAGAGCAGAA
CATATTTGGGTTGAGTTTCTTAGTTCACTTAATTGAACTAATGAGGTTCTTGATTGTGGT
TAAGACATGTCTTCAACTAACTGTGGTTCTTGTCTTGTTTTTCTTGGTCTTGTTTTGTTA
CAGACTTTGTTTGTTGGTTATATCAGGTGAGAGACGCTGAACATTTTCAAAGATACC


BQ
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AF RS1FN10TF U 1
AF RS1FN10JQ C 448
BS 1 710 RS1FN10TF
BS 711 1137 RS1FN10JQ

RD RS1FN10TF 710 0 0
GGTATGCTTGATGCTATTGAACGTGAGTTTGAAGCTGCGACTAAGGGCCATGTAGAAAAG
ACTTATAAAGAAGAAGCTGAAACTCATAGAAGCAGCATGTTGGAAGAAATTGAACGCGAA
TATGAAGCAGCAGCTTCAAAGAATACACAAACCATAAGTAAAGTGCAGAAAACTTCTGGT
GGATCCAACTCTGGTTTTAGCAGTCTTCTAAAGTCTACAGATGGTGTGTGTGGTTGTTTT
AACCAAGGCAAAGATGGTATTAAGGTAGACACTGATTGTTCAATTAACATAGGAGAGATA
CTTGCTGAAGAATCAAACTTCCAGGGCTCAGAGACCTCTAGCCTCACCACTTCACTGAAC
AATCTCGTTCACACCCATAGACAAGAAACAACCTCAAAGGGACGCACAGACATTGTCTCG
TCTACATCCGAGAACATAGAGAGCTTAAAGCTAACCCTAAAGAAGCTACGCGGTCTAACC
GCACGTGACCTTGTAAACCATCCCAACTTCGACGAGATTATCGAAGCCGGTACACGTTAC
GAGGTACTCAGCTCAGCCTCAATAGGTTACATCTCTTTGTTAGCCAAATACAAAACCGTC
ATTAAAGAAGGACTCGAGGCTTCACAGAGAGTTCACATTGCTCAGACACGCGCCAAGCTT
CTCAAAGAAACCGCCATGGAGAAGCAGAGAGCCGTGGACGCTGAGTTCGC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1FN10JQ 690 0 0
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TACATCTCTTTGTTAGCCAAATACAAAACCGTCATTAAAGAAGGACTCGAGGCTTCACAG
AGAGTTCACATTGCTCAGACACGCGCCAAGCTTCTCAAAGAAACCGCCATGGAGAAGCAG
AGAGCCGTGGACGCTGAGTTCGCATTCGCCAAGACTCTTGCTCAAGGAGGAGACGCGTTG
TCTATCAAAATCTTTGCGATCAAGAAACTGTTGGTTAAGCTTGAAGCAGAGAAACTGAAC
ATTGATCTTAAGTTTAAGTCTACGGAGACTAACCTAGCACGGCTTCTTAAGGAGGCTTCT
CAGGCTTATGAAGAGTATCATGTGGCTGTGCGTAAGGCGAAGGACGAGCAAGCTGCTGAG
GAGTTCGCTCTTGAGACGACCAAGAGAGCAGAACATATTTGGGTTGAGTTTCTTAGTTCA
CTTAATTGAACTAATGAGGTTCTTGATTGTGGTTAAGACATGTCTTCAACTAACTGTGGT
TCTTGTCTTGTTTTTCTTGGTCTTGTTTTGTTACAGACTTTGTTTGTTGGTTATATCAGG
TGAGAGACGCTGAACATTTTCAAAGATACC

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

CO CL7498Contig1 869 2 4 U
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GATCTAGTTCCAGGAGCTCCATTGCCAAACCGACCAGCATATAGAGTCAATCCGGAGGAA
GCCAAAGAATTGGAGAGACAAGTACAAGACTTGATGGACAAGGGATACATAAGAGAAAGT
CTAAGTCCTTGTGCAGTTCCAGTTCTTCTAGTGCCAAAGAAAGATGGGACTTGGAGGATG
TGTGTTGATTGCCGAGCCATAAACAACATCACCATCAAGTATAGACATCCAATCCCACGG
CTAGATGACATGCTAGATGAACTCAGTGGTGCCACTATCTTCTCAAAGATAGACTTGAAG
AGTGGTTATCACCAGGTAAGAATGAAAGAAGGAGATGAGTGGAAGACTGCTTTCAAGACC
AAGAGAGGTCTCTATGAATGGCTAGTCATGCCATTTGGTCTTACCAATGCTCCAAGCACT
TTCATGCGCCTCATGAACCATGTTCTAAGGGAGTACATCTGTAAGTTTGTAGTTGTATAC
TTTGATGATATCTTAGTCTATAGCAACAGCTTAGAAGACCATCTTATCCATCTTGAAAAG
GTTTTGGAAACCTTGCGCCAAGAGCATCTTTATGCTAATCTCAAGAAGTGTACCTTTTGC
ACTGATCAACTAGTTTTCCTAGGCTTTGTTGTTAGTTCACAGGGTCTAAAGGTAGATGAA
GAGAAGATCAAAGGCAGTGCAAGAATGGCCCACGCCAACTACAATAGGTCATGTGAGGAG
TTTCCATGGACTAGCAAGCTTTTATAGAAGATTTGTCCGAGACTTCAGCACCATAGCAGC
CCCATTAACTTCAGTAATCAGAAGATGTA


BQ
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AF RS1A123TF U 1
AF RS1A123TV U 90
BS 1 766 RS1A123TF
BS 767 767 RS1A123TV
BS 768 820 RS1A123TF
BS 821 869 RS1A123TV

RD RS1A123TF 820 0 0
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TGTGTTGATTGCCGAGCCATAAACAACATCACCATCAAGTATAGACATCCAATCCCACGG
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AAGAGAGGTCTCTATGAATGGCTAGTCATGCCATTTGGTCTTACCAATGCTCCAAGCACT
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TTTCCATGGACTAGCAAGCTTTTATAGAAGATTTGTCCGA

QA 1 820 1 820
DS 

RD RS1A123TV 780 0 0
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CTTGATGGACAAGGGATACATAAGAGAAAGTCTAAGTCCTTGTGCAGTTCCAGTTCTTCT
AGTGCCAAAGAAAGATGGGACTTGGAGGATGTGTGTTGATTGCCGAGCCATAAACAACAT
CACCATCAAGTATAGACATCCAATCCCACGGCTAGATGACATGCTAGATGAACTCAGTGG
TGCCACTATCTTCTCAAAGATAGACTTGAAGAGTGGTTATCACCAGGTAAGAATGAAAGA
AGGAGATGAGTGGAAGACTGCTTTCAAGACCAAGAGAGGTCTCTATGAATGGCTAGTCAT
GCCATTTGGTCTTACCAATGCTCCAAGCACTTTCATGCGCCTCATGAACCATGTTCTAAG
GGAGTACATCTGTAAGTTTGTAGTTGTATACTTTGATGATATCTTAGTCTATAGCAACAG
CTTAGAAGACCATCTTATCCATCTTGAAAAGGTTTTGGAAACCTTGCGCCAAGAGCATCT
TTATGCTAATCTCAAGAAGTGTACCTTTTGCACTGATCAACTAGTTTTCCTAGGCTTTGT
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CCACGCCAACTACAATAGGTCATGTGAGGAGTTTCCATGGACTAGCAAGCTTTTATAGAA
GATTTGTCCGAGACTTCAGCACCATAGCAGCCCCATTAACTTCAGTAATCAGAAGATGTA

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL7499Contig1 1202 2 6 U
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AAATAAAACTATTTCTTGCTACAATGTTAGTATAAGTTTATACACAAATAAAATTACTTT
CTAATTAACATAGATGAAAATATACTAAAACACATTCATATAGTTGAGAAATTTTACACC
TACAGTTTTATACCTTCATCTCTTTTCATAGTCTAATAAAAGATTAAAAAAATATTTTAG
TCATAAAGTAGGATTAGCCTTTTTTTTACTAATAATAGATGTTATTCCCTTTTTGGCTAT
AAACTATTTGTAATATTTTTATTTGATCGATTTGTTTTTTATTTTATTTTCTTTAAGTCA
AGAACATGTTCTTTATTGAGAGGGCTGTACGTGTATATGGTCTAGTCTCTCAAATATTAC
TTTCTGAACTCCCCACACGAGTATTCGATTTAACTTTCAATAATTAATTACGCGTCCTAT
ATTTCATTATTTATAAATTGAAAAGTTCCACAATACCATAAGTAACACCATCAAACTCCA
AATCCACCACAACACCAAAAAAGAAAAAACAATCCCACAACATAATAAAACTCCAAACCC
ACCACTTCTACAATCAAAGAAAGGAAACACATAGAAACATTCCTCTCTGAAGCCGTATCT
AAAAGAGTTCTCATTTCTGATTCTTGATTGGTCTAAACCTTAATCAAGAAGATATGGTAT
GTTTCTGTTTCTTGGTGGATCAGAAGAGGAAAGTGGAGCGGAGTAAACCGGCGGCAGGAA
CTTGCTCACGGTGCGGCCATGGTGCGAGCATCGCTGACATGAAGACGTCGACGAGATTTT
GTTTCGTTCCAAATTTACTGGAAATCTTGGAGAGCCGCCGTTTGCAGTTTTTGTGGGTCT
GTTCTTAAGTCCTACCGTTGAAAGATTTTCTAGATTTTCATTATAATGTTTAACATAATT
ATAAAGTAACATATAAATATATATATATATCTATGTGTGTGGGTATAGAGATCATAGGTT
TTCCTTTGAATAAAATTCTACGAGTCTACATGCAAGAGGGGTTTTGACCTGTTAAAACCT
CTTGTAATTATTAAACGGAACAATATGGGTAGGGTTATCGTATACATATCATTAGTAAGG
GTTAAAGTGATTAGTGTGCTGAATATGATTTTAATAGTATAGGATGTTATCTAATTTTGT
AT


BQ
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10 10 

AF RS1AO18TFB U 1
AF RS1AO18JQ C 701
BS 1 777 RS1AO18TFB
BS 778 778 RS1AO18JQ
BS 779 852 RS1AO18TFB
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BS 854 869 RS1AO18TFB
BS 870 1202 RS1AO18JQ

RD RS1AO18TFB 869 0 0
GGGTAATTTTCAAACCTATACAACTTTACTATAATTTTTTTTTTTGTTCTTGAGAACTAC
AAATAAAACTATTTCTTGCTACAATGTTAGTATAAGTTTATACACAAATAAAATTACTTT
CTAATTAACATAGATGAAAATATACTAAAACACATTCATATAGTTGAGAAATTTTACACC
TACAGTTTTATACCTTCATCTCTTTTCATAGTCTAATAAAAGATTAAAAAAATATTTTAG
TCATAAAGTAGGATTAGCCTTTTTTTTACTAATAATAGATGTTATTCCCTTTTTGGCTAT
AAACTATTTGTAATATTTTTATTTGATCGATTTGTTTTTTATTTTATTTTCTTTAAGTCA
AGAACATGTTCTTTATTGAGAGGGCTGTACGTGTATATGGTCTAGTCTCTCAAATATTAC
TTTCTGAACTCCCCACACGAGTATTCGATTTAACTTTCAATAATTAATTACGCGTCCTAT
ATTTCATTATTTATAAATTGAAAAGTTCCACAATACCATAAGTAACACCATCAAACTCCA
AATCCACCACAACACCAAAAAAGAAAAAACAATCCCACAACATAATAAAACTCCAAACCC
ACCACTTCTACAATCAAAGAAAGGAAACACATAGAAACATTCCTCTCTGAAGCCGTATCT
AAAAGAGTTCTCATTTCTGATTCTTGATTGGTCTAAACCTTAATCAAGAAGATATGGTAT
GTTTCTGTTTCTTGGTGGATCAGAAGAGGAAAGTGGAGCGGAGTAAACCGGCGGCAG*AA
CTTGCTCACGGTGCGGCCATGGTGCGAGCATCGCTGACATGAAGACGTCGACGAGATTTT
GTTTCGTTCCAA*TTTACTGGAAATCTTG

QA 1 869 1 869
DS 

RD RS1AO18JQ 502 0 0
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GAGTAAACCGGCGGCAGGAACTTGCTCACGGTGCGGCCATGGTGCGAGCATCGCTGACAT
GAAGACGTCGACGAGATTTTGTTTCGTTCCAAATTTACTGGAAATCTTGGAGAGCCGCCG
TTTGCAGTTTTTGTGGGTCTGTTCTTAAGTCCTACCGTTGAAAGATTTTCTAGATTTTCA
TTATAATGTTTAACATAATTATAAAGTAACATATAAATATATATATATATCTATGTGTGT
GGGTATAGAGATCATAGGTTTTCCTTTGAATAAAATTCTACGAGTCTACATGCAAGAGGG
GTTTTGACCTGTTAAAACCTCTTGTAATTATTAAACGGAACAATATGGGTAGGGTTATCG
TATACATATCATTAGTAAGGGTTAAAGTGATTAGTGTGCTGAATATGATTTTAATAGTAT
AGGATGTTATCTAATTTTGTAT

QA 1 502 1 502
DS 



AS 1 2

CO CL7500Contig1 450 2 8 U
GGGCTTTGATAAATATCATTAATAAAATCATACATTTAATGATAAATCTATCATAATATG
AAAAAAGGAAACAGAAAGAGCTAGGGTGAGATGCTGTAAATTACAATCAACTCATCTCCT
AATCTCTTGTGTATATCCATACATCTCTATTGCTTTGGGTGAGAGTCTTCCTAAGGATCT
GAATACGTGATCAAGTGTGTTTGTGTTCTAAAGTAACAATAAGCTATAACCATTTGACTG
ATGCCTCCTCCAAATGTCTCCCACTCACTCATCATCACCTCCTTCCTCCGCGTTGTCCTG
CTCTTCGACCTGGGTTTCTTGAAAACTGGATCTGCAAATTTTTGGAGTCCGGTTCATTTT
CATCCATTCTATAGCCTTGCAGGGCGGTACGAACAGTTGCTGCACATGCAGGGCTTTCAA
AATCAACAAAACATAAAACAACAGGATCTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EO20JQ U 1
AF RS1GY69JQ U 1
BS 1 61 RS1EO20JQ
BS 62 62 RS1GY69JQ
BS 63 121 RS1EO20JQ
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BS 123 210 RS1EO20JQ
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BS 212 304 RS1EO20JQ
BS 305 450 RS1GY69JQ

RD RS1EO20JQ 304 0 0
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AGAAAAGGAAACAGAAAGAGCTAGGGTGAGATGCTGTAAATTACAATCAACTCATCTCCT
AGTCTCTTGTGTATATCCATACATCTCTATTGCTTTGGGTGAGAGTCTTCCTAAGGATCT
GAATACGTGATCAAGTGTGTTTGTGTTCTAGAGTAACAATAAGCTATAACCATTTGACTG
ATGCCTCCTCCAAATGTCTCCCACTCACTCATCATCACCTCCTTCCTCCGCGTTGTCCTG
CTCT

QA 1 304 1 304
DS 

RD RS1GY69JQ 450 0 0
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AAAAAAGGAAACAGAAAGAGCTAGGGTGAGATGCTGTAAATTACAATCAACTCATCTCCT
AATCTCTTGTGTATATCCATACATCTCTATTGCTTTGGGTGAGAGTCTTCCTAAGGATCT
GAATACGTGATCAAGTGTGTTTGTGTTCTAAAGTAACAATAAGCTATAACCATTTGACTG
ATGCCTCCTCCAAATGTCTCCCACTCACTCATCATCACCTCCTTCCTCCGCGTTGTCCTG
CTCTTCGACCTGGGTTTCTTGAAAACTGGATCTGCAAATTTTTGGAGTCCGGTTCATTTT
CATCCATTCTATAGCCTTGCAGGGCGGTACGAACAGTTGCTGCACATGCAGGGCTTTCAA
AATCAACAAAACATAAAACAACAGGATCTC

QA 1 450 1 450
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7502Contig1 822 2 4 U
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TCATCAACAACAACAACAACATGGGCTTCTCATCAAAGTTATCCTCAGTCTGGACCTGGC
AGCTACAACTATCCTCCTCCACCCTCTTTTTCTCCATCTCCTGCTCCCAGTTTTGGTGCT
CAGCCGCCTCCTCCTCCTTATACTCAAGAGGAAGGCTATGCTTATCCTTATCCTCCCACA
CACCCTCCTCATCCTCCTACTGATACGAAGAAGTTTGATCGCAGGTATTCCAAAATATCC
GATAACTACGCCTCTTTACATCAGGTGTCAGAGGCTCTAGGACGTGCAGGTCTTGAATCC
TCTAATCTTATCCTCGGTATTGATTTCACCAAAAGCAATGAGTGGACAGGCGCCAAGTCC
TTTAATAAGAAAAGCTTGCATCATATCAGCACCTATACTCCCAATCCTTACGAGCAAGCT
ATCACTATCATTGGACGAACCTTAGCCTCCTTTGACGACGATAACTTAATCCCTTGTTTT
GGTTTTGGTGACGCATCAACTCATGATCAAGACGTGTTTAGTTTCTATCCAGAGGGTCGA
TCCTCTAATGGATTTGAGCAAGTTTTGGCTCGCTACAGAGATATTGTCCCTAACCTTAAG
CTCGCAGGACCAACATCTTTTGCTCCATCATTGAATGGCGATGACAGTTGTTGAGCAGAG
TAGTGGCCAATACCATGTGTAGTGATCATAGCCGATGGACAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EG35TF U 1
AF RS1H755TF U 8
BS 1 41 RS1EG35TF
BS 42 42 RS1H755TF
BS 43 746 RS1EG35TF
BS 747 822 RS1H755TF

RD RS1EG35TF 752 0 0
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AGCTACAACTATCCTCCTCCACCCTCTTTTTCTCCATCTCCTGCTCCCAGTTTTGGTGCT
CAGCCGCCTCCTCCTCCTTATACTCAAGAGGAAGGCTATGCTTATCCTTATCCTCCCACA
CACCCTCCTCATCCTCCTACTGATACGAAGAAGTTTGATCGCAGGTATTCCAAAATATCC
GATAACTACGCCTCTTTACATCAGGTGTCAGAGGCTCTAGGACGTGCAGGTCTTGAATCC
TCTAATCTTATCCTCGGTATTGATTTCACCAAAAGCAATGAGTGGACAGGCGCCAAGTCC
TTTAATAAGAAAAGCTTGCATCATATCAGCACCTATACTCCCAATCCTTACGAGCAAGCT
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GGTTTTGGTGACGCATCAACTCATGATCAAGACGTGTTTAGTTTCTATCCAGAGGGTCGA
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CTCGCAGGACCAACATCTTTTGCTCC
CATCAT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1H755TF 815 0 0
GG
ATCTGTTGATGGCGTCGTCTTACTTGTCATGGC*GACGGAGTTTGACATATACTAAAAAG
ATGGGAGGAGGGAATTCTAAAGAAGATTGGAGGCAAGAGCCGCCATCGTCATCATCAACA
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TATCCTCCTCCACCCTCTTTTTCTCCATCTCCTGCTCCCAGTTTTGGTGCTCAGCCGCCT
CCTCCTCCTTATACTCAAGAGGAAGGCTATGCTTATCCTTATCCTCCCACACACCCTCCT
CATCCTCCTACTGATACGAAGAAGTTTGATCGCAGGTATTCCAAAATATCCGATAACTAC
GCCTCTTTACATCAGGTGTCAGAGGCTCTAGGACGTGCAGGTCTTGAATCCTCTAATCTT
ATCCTCGGTATTGATTTCACCAAAAGCAATGAGTGGACAGGCGCCAAGTCCTTTAATAAG
AAAAGCTTGCATCATATCAGCACCTATACTCCCAATCCTTACGAGCAAGCTATCACTATC
ATTGGACGAACCTTAGCCTCCTTTGACGACGATAACTTAATCCCTTGTTTTGGTTTTGGT
GACGCATCAACTCATGATCAAGACGTGTTTAGTTTCTATCCAGAGGGTCGATCCTCTAAT
GGATTTGAGCAAGTTTTGGCTCGCTACAGAGATATTGTCCCTAACCTTAAGCTCGCAG*A
CCAACATCTTTTGCTCCATCATTGAATGGCGATGACAGTTGTTGAGCAGAGTAGTGGCCA
ATACCATGTGTAGTGATCATAGCCGATGGACAG

QA 3 815 3 815
DS 



AS 1 2

CO CL7503Contig1 1115 2 2 U
GGAAAAAGCAAGGAAAAAAGAAAACATCAATAATTAAAAAAAAAAAGTATGTCTCTTCCT
CTTCCCCATCTCATCATCTACCTACTTCTCTTGACGGTAGCCACCGGTGAAATTCTCCGA
CCAAGATTCTACAGCGAAACATGCCCTGAAGCTGAATCCATAGTGAGAAACGAAATGAAG
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TGCTTCGTTAATGGATGTGACGGGTCCGTGTTGCTTGACGACACACCCAACATGCTCGGT
GAAAAACTCTCACTTTCCAACATCGATTCACTGAGATCTTTCGAAGTTGTAGACGACATC
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GCTTCTCGTGACGCCGTTGCTCTTACAGGAGGACCGGACTGGGAAGTGAAGCTAGGGAGG
AAAGACAGTTTAACAGCGAGTCAGAAAGATTCGGACGACATAATGCCGAGCCCAAGAGCA
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GCTTTGTCTGGATCACACTCGATTGGTAAAGGTCGGTGTTTTTCTATCATGTTCAGGCTT
TATAACCAATCCGGTTCTGGTAAACCGGATCCGGCTCTCGAACCGGTTTACAAGAAGAAG
CTTAACAAGCTTTGTCCTTTGGGTGGAGACGAGAACGTGACCGGTGATCTAGACGCGACG
CCTCGGGTTTTTGATAATCAGTACTTCAAAGACTTGGTTTCAGGGAGAGGGTTTCTTAAC
TCTGATCAGACTCTGTACACGAGTAGAGAGACCAGAGGGTTTGCGAAGTGGTTTAGCGAG
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TCTGGGAGACCTGGTGAGGTTAGGGTTAACTGTAGGGTTGTTAATACAAGGCATAATGAT
GTATTATTGCGTGACTCTTGAAATTAGAAGAGAGATATTATGTATGACTTGTTTTTCTTT
TTTGATCAAATTTATGTATGACTTTTAAATACAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BI71TF U 1
AF RS1BI71JQ C 407
BS 1 735 RS1BI71TF
BS 736 1115 RS1BI71JQ

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CTTCCCCATCTCATCATCTACCTACTTCTCTTGACGGTAGCCACCGGTGAAATTCTCCGA
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AAAGCCATGATCAGAGAAGCTAGAAGCGTCGCCTCCGTTATGCGTCTCCAGTTTCACGAC
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GAAAAACTCTCACTTTCCAACATCGATTCACTGAGATCTTTCGAAGTTGTAGACGACATC
AAAGAAGCTCTAGAGAAAGCTTGTCCCGCTACTGTCTCCTGTGCCGACATCGTCATCATG
GCTTCTCGTGACGCCGTTGCTCTTACAGGAGGACCGGACTGGGAAGTGAAGCTAGGGAGG
AAAGACAGTTTAACAGCGAGTCAGAAAGATTCGGACGACATAATGCCGAGCCCAAGAGCA
AACGCGACGTTCTTGGTCGATCTCTTCGAAAGATTCGATCTTTCGGTTAAAGACATGGTG
GCTTTGTCTGGATCACACTCGATTGGTAAAGGTCGGTGTTTTTCTATCATGTTCAGGCTT
TATAACCAATCCGGTTCTGGTAAACCGGATCCGGCTCTCGAACCGGTTTACAAGAAGAAG
CTTAACAAGCTTTGT

QA 1 735 1 735
DS 

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CGAGCCCAAGAGCAAACGCGACGTTCTTGGTCGATCTCTTCGAAAGATTCGATCTTTCGG
TTAAAGACATGGTGGCTTTGTCTGGATCACACTCGATTGGTAAAGGTCGGTGTTTTTCTA
TCATGTTCAGGCTTTATAACCAATCCGGTTCTGGTAAACCGGATCCGGCTCTCGAACCGG
TTTACAAGAAGAAGCTTAACAAGCTTTGTCCTTTGGGTGGAGACGAGAACGTGACCGGTG
ATCTAGACGCGACGCCTCGGGTTTTTGATAATCAGTACTTCAAAGACTTGGTTTCAGGGA
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TGGGTGATTTGCAATCTGGGAGACCTGGTGAGGTTAGGGTTAACTGTAGGGTTGTTAATA
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ACTTGTTTTTCTTTTTTGATCAAATTTATGTATGACTTTTAAATACAAA

QA 1 709 1 709
DS 



AS 1 2

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ATTATACCCGAAGGAGAAAAATCAATGAAGCTTGACCAAAAATACTTTGTATTTAAAGCA
AAGGAATACAATGCGAGTATAGAGTTCTACTGGGCACCGTATATTGTGGAATCGAACACG
GATTTGCCTGTGATTTTGGATTTGAAGAAAAGGATAGTGAAAGTGGATTCAGTGAAAGAT
CGATCCAAGCATTGGGAAGGAGCTGACATTCTAGTTTTCAACACTTATGTTTGGTGGATG
AGTGGAATCAGAATGAAAGCTTTGTGGGGTTCGTTTGGAAATGGGGAGAGAGGTGCGGAG
GCTTTGTACACAGCAGTGGCTTACAGGCTAGGTCTCAAGACATGGGCTAATTGGGTTGAC
TCTACCGTTGACTCTAACAAGACCAAAGTCTTCTTCACCACCATGTCTCCTACTCATTCT
AGGAGTGCGGATTGGGGGAAGCCAAACGGGCCGAAGTGTTTCAACGAGACGGAGCCAGTA
AAAGATAAGAGCTTTTGGGGGACTGGCTCCAGCAAGGAGCTGATGAAAGTGGTTTCAAGC
GTCGTGAAGCACATGGCCACGCACGTGACAGTCATTAACATTACGCAGCTCTCCGAGTAC
CGCATCGACGCGCACACATCCGTTTACACGGAGACAGGGGGCAAGATGCTAACGGCTGAG
GAGAGGGCTGATCCTATGCGTCACGCTGATTGCATACATTGGTGCCTCCCTGGATTGCTC
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GATGATGATGTGGTTGTAACGTGGTAAACGAAACGTGGAGAAAATTC


BQ
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AF RS1H536TF U 1
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BS 1 688 RS1H536TF
BS 689 1007 RS1H536JQB

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ATTATACCCGAAGGAGAAAAATCAATGAAGCTTGACCAAAAATACTTTGTATTTAAAGCA
AAGGAATACAATGCGAGTATAGAGTTCTACTGGGCACCGTATATTGTGGAATCGAACACG
GATTTGCCTGTGATTTTGGATTTGAAGAAAAGGATAGTGAAAGTGGATTCAGTGAAAGAT
CGATCCAAGCATTGGGAAGGAGCTGACATTCTAGTTTTCAACACTTATGTTTGGTGGATG
AGTGGAATCAGAATGAAAGCTTTGTGGGGTTCGTTTGGAAATGGGGAGAGAGGTGCGGAG
GCTTTGTACACAGCAGTGGCTTACAGGCTAGGTCTCAAGACATGGGCTAATTGGGTTGAC
TCTACCGTTGACTCTAACAAGACCAAAGTCTTCTTCACCACCATGTCTCCTACTCATTCT
AGGAGTGCGGATTGGGGGAAGCCAAACGGGCCGAAGTGTTTCAACGAGACGGAGCCAGTA
AAAGATAAGAGCTTTTGGGGGACTGGCT

QA 1 688 1 688
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TTCACCACCATGTTTCCTACTCATTTTAGGAGTGCGGATTGGGGGAAGCCAAACGGGCCG
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ATTAACATTACGCAGCTCTCCGAGTACCGCATCGACGCGCACACATCCGTTTACACGGAG
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ATACATTGGTGCCTCCCTGGATTGCTCGATACGTGGAACCGTATCCTATTGGCTCATTTG
TAAATAAGAAAAAAGCCATAGGAAACTGATGATGATGTGGTTGTAACGTGGTAAACGAAA
CGTGGAGAAAATTC

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 2

CO CL7505Contig1 826 2 2 U
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TCGGAAAGATTTGTCTTCAGGGTCCAACCAAATCCGGACACCCTTTGGTGCTTGTCTTAT
GCTCCAAGCATTTTCCTGCCAAGAATGCAGTTAACTTCAAGAAGTTTGTTGTTTATGTAC
TAGACAAAACAATAGCAAGTGGCATCAAAGACAAAGAAGTAGGAGATGAGAAGTTAGTAG
CCGTTTTCGATCTTGCTAACATTGCATACAAGAACCTTGATGCTCGTGGACTAATCACCA
GCTTTCAGTTCTTACAATCTTACTACCCGGAACGCCTTGCAAAATGCTACATGTTGCATA
TGCCTGGATTCTTCGTGTCCGTTTGGAGATTCGTCTGCCGTTTTCTAGAGAAATCTACTC
AAGAAAAGATTGTGATAGTAACGGATGGAGAAGAAGAGATAAAATTCAAAGAAGAGATCG
GAGTAGATGCCTTGCCGGAAGAATATGGTGGCCGAGCTAAACTCACACTAATCCAAGATG
TTCTTCTTCCTCAGACTGCTCCACAAATGTGAACAAGCCAAAGCAATAACCGTGTTTAAC
TCTTCTTGAGAAGCAATTATAAAACACTAAACCCTGCTTTAATCCA


BQ
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AF RS1DJ83TF U 1
AF RS1DJ83JQ C 112
BS 1 584 RS1DJ83TF
BS 585 826 RS1DJ83JQ

RD RS1DJ83TF 584 0 0
GGGAGCCAAACACAATGGAGGAAAGTCAAGGACTTGCTTTGACCCAGTTGAGAACATCGG
TCGAGAAACTCTCTTCTTCCACAGAGGGATATGAGAAACCGACGTTGATGAGGTTCCTGG
TGGCAAGATCAATGAAACCAGACAAGGCAGCAAAGATGTTTGTAGACTGGCAAAAGTGGA
GAGCCTCCATGGTTCCTCCAAATGGGATCCCAGACTCAGAAGTGAGAGATGAGTTGGAGT
TCGGAAAGATTTGTCTTCAGGGTCCAACCAAATCCGGACACCCTTTGGTGCTTGTCTTAT
GCTCCAAGCATTTTCCTGCCAAGAATGCAGTTAACTTCAAGAAGTTTGTTGTTTATGTAC
TAGACAAAACAATAGCAAGTGGCATCAAAGACAAAGAAGTAGGAGATGAGAAGTTAGTAG
CCGTTTTCGATCTTGCTAACATTGCATACAAGAACCTTGATGCTCGTGGACTAATCACCA
GCTTTCAGTTCTTACAATCTTACTACCCGGAACGCCTTGCAAAATGCTACATGTTGCATA
TGCCTGGATTCTTCGTGTCCGTTTGGAGATTCGTCTGCCGTTTT

QA 1 584 1 584
DS 

RD RS1DJ83JQ 715 0 0
GGTTCCTGGTGGCAAGATCAATGAAACCAGACAAGGCAGCAAAGATGTTTGTAGACTGGC
AAAAGTGGAGAGCCTCCATGGTTCCTCCAAATGGGATCCCAGACTCAGAAGTGAGAGATG
AGTTGGAGTTCGGAAAGATTTGTCTTCAGGGTCCAACCAAATCCGGACACCCTTTGGTGC
TTGTCTTATGCTCCAAGCATTTTCCTGCCAAGAATGCAGTTAACTTCAAGAAGTTTGTTG
TTTATGTACTAGACAAAACAATAGCAAGTGGCATCAAAGACAAAGAAGTAGGAGATGAGA
AGTTAGTAGCCGTTTTCGATCTTGCTAACATTGCATACAAGAACCTTGATGCTCGTGGAC
TAATCACCAGCTTTCAGTTCTTACAATCTTACTACCCGGAACGCCTTGCAAAATGCTACA
TGTTGCATATGCCTGGATTCTTCGTGTCCGTTTGGAGATTCGTCTGCCGTTTTCTAGAGA
AATCTACTCAAGAAAAGATTGTGATAGTAACGGATGGAGAAGAAGAGATAAAATTCAAAG
AAGAGATCGGAGTAGATGCCTTGCCGGAAGAATATGGTGGCCGAGCTAAACTCACACTAA
TCCAAGATGTTCTTCTTCCTCAGACTGCTCCACAAATGTGAACAAGCCAAAGCAATAACC
GTGTTTAACTCTTCTTGAGAAGCAATTATAAAACACTAAACCCTGCTTTAATCCA

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

CO CL7506Contig1 829 2 10 U
ACCTCGCTTAAGAGAGTTACGGTGCAATGTCTATGATCCCATCGTGCTTGGAGAGGGTGC
GGGTGTAGGATACTTGAAAGGACAAGATACTATGCCCATTCCCGAGGATTCAACTCTGTA
TGACCTTGTGCAGATGGGGATTAAGAGCACTCACGCTGCTGTTAGTGTCGTTGTGCGACT
TAGGAAAGAACTCTCACTCGTTAAAGATGTACCAGTGTTGATTGCAATTGATCAATACAA
CAATTGGTTTACATTCAGTGAGTTTGAAGAGCCCGTGACGCCACGTTCTTGCCGACCTAT
ACATGCCAGAGAACTTACAACGGTGAATGCATTCAGGAGCATGATGCATGATGATATGAT
GGTGGGTGCTTTCTCACATTCAACGGCAGTAGGCAAACTACGTAAAGACTTGCCAGATGT
TCCAGCCGATGCTCGTCAGGCTTTCCCTCGTTATAGTTTAGATGAAGCAGAAGCTGTCTG
CTATTACTACCTTCGGCAAAGACTGGTTAGGCGTGAGGTATTCTCAGAAGAAAACTGGAA
GAAGATATACTATTTGGCTAATGGAAATGGAGCAGAGATGCGTTGGTTAGTCCCTTTCAT
GCGTTGAGAAACAAACACATGAACAAACAACATAGTTCTTTTAATGTTGCCTTTGCTGCT
GTTTGAAGTTATCCCATTAGTTTGGAGGGAAAAAAAACTCTTTTCAGTTTCTGATTTAAA
AGGAAGATTCCTTGTTGTTTGAGTTTGCTAGTTTAGGTTTTTGTCTTGTCTGTAACAGAC
TTGTGGTTGGACCTAAATCTCTTCATAATAAAATCAGTGCCTTTCATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GM06TF U 1
AF RS1GM06JQ C 18
BS 1 533 RS1GM06TF
BS 534 534 RS1GM06JQ
BS 535 696 RS1GM06TF
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BS 757 829 RS1GM06JQ

RD RS1GM06TF 757 0 0
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GGGTGTAGGATACTTGAAAGGACAAGATACTATGCCCATTCCCGAGGATTCAACTCTGTA
TGACCTTGTGCAGATGGGGATTAAGAGCACTCACGCTGCTGTTAGTGTCGTTGTGCGACT
TAGGAAAGAACTCTCACTCGTTAAAGATGTACCAGTGTTGATTGCAATTGATCAATACAA
CAATTGGTTTACATTCAGTGAGTTTGAAGAGCCCGTGACGCCACGTTCTTGCCGACCTAT
ACATGCCAGAGAACTTACAACGGTGAATGCATTCAGGAGCATGATGCATGATGATATGAT
GGTGGGTGCTTTCTCACATTCAACGGCAGTAGGCAAACTACGTAAAGACTTGCCAGATGT
TCCAGCCGATGCTCGTCAGGCTTTCCCTCGTTATAGTTTAGATGAAGCAGAAGCTGTCTG
CTATTACTACCTTCGGCAAAGACTGGTTAGGCGTGAGGTATTCTCAGAAGAAA*CTGGAA
GAAGATATACTATTTGGCTAATGGAAATGGAGCAGAGATGCGTTGGTTAGTCCCTTTCAT
GCGTTGAGAAACAAACACATGAACAAACAACATAGTTCTTTTAATGTTGCCTTTGCTGCT
GTTTGAAGTTATCCCATTAGTTTGGAGGGAAAAAAA*CTCTTTTCAGTTTCTGATTTAAA
AG*AAGAT*CCTTGTTGTTTGAGTTTGCTAGTTTAG
T

QA 1 756 1 756
DS 

RD RS1GM06JQ 812 0 0
TACGGTGCAATGTCTATGATCCCATCGTGCTTGGAGAGGGTGCGGGTGTAGGATACTTGA
AAGGACAAGATACTATGCCCATTCCCGAGGATTCAACTCTGTATGACCTTGTGCAGATGG
GGATTAAGAGCACTCACGCTGCTGTTAGTGTCGTTGTGCGACTTAGGAAAGAACTCTCAC
TCGTTAAAGATGTACCAGTGTTGATTGCAATTGATCAATACAACAATTGGTTTACATTCA
GTGAGTTTGAAGAGCCCGTGACGCCACGTTCTTGCCGACCTATACATGCCAGAGAACTTA
CAACGGTGAATGCATTCAGGAGCATGATGCATGATGATATGATGGTGGGTGCTTTCTCAC
ATTCAACGGCAGTAGGCAAACTACGTAAAGACTTGCCAGATGTTCCAGCCGATGCTCGTC
AGGCTTTCCCTCGTTATAGTTTAGATGAAGCAGAAGCTGTCTGCTATTACTACCTTCGGC
AAAGACTGGTTAGGCGTGAGGTATTCTCAGAAGAAAACTGGAAGAAGATATACTATTTGG
CTAATGGAAATGGAGCAGAGATGCGTTGGTTAGTCCCTTTCATGCGTTGAGAAACAAACA
CATGAACAAACAACATAGTTCTTTTAATGTTGCCTTTGCTGCTGTTTGAAGTTATCCCAT
TAGTTTGGAGGGAAAAAAAACTCTTTTCAGTTTCTGATTTAAAAGGAAGATTCCTTGTTG
TTTGAGTTTGCTAGTTTAGGTTTTTGTCTTGTCTGTAACAGACTTGTGGTTGGACCTAAA
TCTCTTCATAATAAAATCAGTGCCTTTCATTT

QA 1 812 1 812
DS 



AS 1 2

CO CL7507Contig1 718 2 2 U
TTTAGGTTAAAAAGTGTATTTACACGATTCAGAATCACTACAAAAGCTATATTGGCAGTC
ACAAACATTAGAGACCGGTCGTATTGCCAAAAACTAACGACTAGGTGTTTTCTCCTACCT
CCAATATCTGTTCTCTTTTTTTTCTTCTTATTAAGTTAAAACTAATCTCTTTTATGAATC
CAAAAGATTACTGACAACAAATCCAATGAAGGAAAATAGAGTGGAAGGAAAAGCGAGTGG
AGATGTAAAGCTTCTGGAACGTGTCAAAAAATGTTGGGTTTTTTTTCTGAATCGAGCTGA
AAAGATATATGTACAGACAATCCTGGTTACTTGGCTATTATTACCCGTTTAGCTTAGCTA
GGAATTGGCCAAGATTGTACTCTTCTGTGTACTGTGATTGATCCCACAGTTCCTCTAAGT
TTCCCAAAATTGCTTTCATTCCTTTCCCTGTTCCAGCACTCTGATCATTATCCTCTGATC
CCTTCTTCGATGACGCACCACCCTTTTTCGAAGTTTCAGCTGAAGCAAATAAGTCTAGCA
ACTGATCAGTGTTCATTGTCTTCATACTAGCATTCTCAGCATTGATCACCGTATTGGCAA
CCGATACTTTGAATCTTTGGAGACTCATCACTTTTTCTTCCAGTGTGCCACGCATTATGA
GACGGTGTACATTTACAACTCTCTTCTGTCCCAATCTATGCGCTCTATCCATCGCCCT


BQ
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BQ
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AF RS1CX34JQ C 1
AF RS1CX34TF U 1
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TCAAGAGACGGATCCAACGGGATGGCGCTCTTCAATTTCGACCAGCCATCGGTTTTCGAC
TCGAGCGGTGAGGTAGGGGAGATAACCGGGCTGTACATGATCGACAAGGAAGGCGTGATT
CAGTCAACGGACGTGAACGCGAGATTCGTCAACGGGAAACCTGAAGGCATCGTGGCCAAG
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DS 



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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1A445TF C 1
AF RS1A445JQ U 37
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BS 37 720 RS1A445JQ

RD RS1A445TF 720 0 0
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GCACGTTTCTCTCCTGCGTGAAATTGATTGAGCTTTAGATCCGGGGATTGGAAGTCAAGA
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AGTTTCTGTCTAATCCTCGGTACGATGTCAGCTGCAGTGAGTTCCTCAGGGATCTTACAT
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ATGGGTTTGTTAGCAAAAAGGTTGAAACTTTTAGGGTTTTGTGAGGATGATGAACGACCC

QA 1 720 1 720
DS 

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TCCTCCAATATTTTCGTCGTCTTAACACGTTTCTCTCCTGCGTGAAATTGATTGAGCTTT
AGATCCGGGGATTGGAAGTCAAGACCAGTCAAATCACCATAAATCCGGATCGAAGCAGGA
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TTTTGTGAGGATGATGAACGACCC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EW22TF U 1
AF RS1EW22JQ C 1
BS 1 665 RS1EW22TF
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RD RS1EW22TF 694 0 0
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QA 1 694 1 694
DS 

RD RS1EW22JQ 747 0 0
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QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1EU64JQ C 1
AF RS1EU64TF U 1
BS 1 689 RS1EU64TF

RD RS1EU64JQ 689 0 0
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ATCTTTATACTTTATAGTTAAACATACAT

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1EU64TF 689 0 0
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ACCATTACTTTCAGTTGTTATTACATTTAAAGGTGTTTTTGTTTTTTGGAATCTATCTTA
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ATCTTTATACTTTATAGTTAAACATACAT

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 2

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TACTAAAAGAATCACTTTCTTTGTCTTGGATT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GU46JQ C 1
AF RS1GU46TF U 1
BS 1 572 RS1GU46TF

RD RS1GU46JQ 572 0 0
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QA 1 572 1 572
DS 

RD RS1GU46TF 572 0 0
GCAACGAAGCTCTCCATCTTCCGGCTTCCCACAAAATCTATGTCACTGTGGCCTCGCCTA
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TCGCCGTTGATTTTGAGTGGAAAAGTGGCGTGGAGGCGAAAGATTGGAGCACCATCGCCA
AGAGAGGCCAGATCAACATGATGGAGGTGGAGGTGAGCAAACTACTAGACGTGACGGAAT
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GATCGACAAACTCGAGAATGGCGACTTTAAGCTTACTGTCGATCGTGTTTACGTTGTCGG
TCGCTGGTCTACAACTATATCATCTCAAGTCATTCTTGGAGAGGAAGAAGCTTCTCTAAT
CAAACAAGTTGTTTCTCTTACTTTTATCAGATTTTTGTGTTCTCGGTTTTAGTTTCTTTT
TACTAAAAGAATCACTTTCTTTGTCTTGGATT

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 2

CO CL7514Contig1 799 2 6 U
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TATATTATATACAAAGAACATGTGGGAATATATTATGCCAGTCTTGTTTCATCCAAAACG
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AACAGACACTATGCCAAAGTAGCTTCATGTTCACGATATATCTCCTCCGCATGAGCTGTA
GTTACGTAAACTGCATTAGCCAGGGAGCTGTGTTTTCTTCCATAGAAAACATACACCAAC
ACTCCAATCACCAGCCACACAGATACACGAGCCCATGTCGCGGATCCAAGGTTAACCAAA
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AAACCAGCAAGGAGGAGACTTCCACCAACGCCACACAGTGGATATCTAATAACCCCTGGG
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TGTTTCTCCATAACTGGGAAATGAACCGAAGCATCAATCTCGGCAAGTAAAGGCTGTTTA
TTACTATTGTCAGAAGTGCCAACATGATCGGATGACTTTGTTTCACCACATGTAAAGGAG
ACAGAGTCGATTCTATCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BV17JQ U 1
AF RS1B803JQ U 25
BS 1 262 RS1BV17JQ
BS 263 263 RS1B803JQ
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BS 368 731 RS1BV17JQ
BS 732 799 RS1B803JQ

RD RS1BV17JQ 731 0 0
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GTTACGTAAACTGCATTAGCCATGGAGCTGTGTTTTCTTCCATAGAAAACATACACCAAC
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CTGCATCCAGAGACCTTCCTTCTGTTCTCTTCGCTCAAAACCCAACACCCAAGAGCTTCT
TGTTTCTCCATAACTGGGAAATGAACCGAAGCATCAATCTCGGCAAGTAAAGGCTGTTTA
TTACTATTGTC

QA 1 731 1 731
DS 

RD RS1B803JQ 775 0 0
AG
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AATATATTATGCCAGTCTTGTTTCATCCAAAACGATGTAATAGTACAGATTTTGTTACAT
ATGTATAGTTCTTGTCACCAAAGAACTTGCCTCAAACAGACACTATGCCAAAGTAGCTTC
ATGTTCACGATATATCTCCTCCGCATGAGCTGTAGTTACGTAAACTGCATTAGCCAGGGA
GCTGTGTTTTCTTCCATAGAAAACATACACCAACACTCCAATCACCAGCCACACAGATAC
ACGAGCCCATGTCGCGGATCCAAGGTTAACCAAAAGGTACATGTTGATTAGGATGCGTAT
GATTGGCAGGAGTGGTACAAACGGGCATATGAAACCTCCAGAATGTCCAAAAGTGTGTCT
GGCATCATCCTGATCTATAGAACTCAAAGCAATCAAACCAGCAAGGAGGAGACTTCCACC
AACGCCACACAGTGGATATCTAATAACCCCTGGGAAGTTGAGGCTTGATGCCGCATAACT
TAAAAGGAAGGCCCCAATACATGTGAACATAATGCTGCATCCAGAGACCTTCCTTCTGTT
CTCTTCGCTCAAAACCCAACACCCAAGAGCTTCTTGTTTCTCCATAACTGGGAAATGAAC
CGAAGCATCAATCTCGGCAAGTAAAGGCTGTTTATTACTATTGTCAGAAGTGCCAACATG
ATCGGATGACTTTGTTTCACCACATGTAAAGGAGACAGAGTCGATTCTATCCT

QA 3 775 3 775
DS 



AS 1 2

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CGCAAATCTTTCAGCGAAGCCACCACTTACCGAATCCTCCAATGCTCCTACTTCTCATGC
CCTCACAACTCCGTCCCTGATCCAAATACCACCCTCCCGTCGGATTCCGGGTCGGGTCGT
CATCGAGCCCAGCAACAACAGCAATGCCCTGACGTTTTCAGGTGGATTCACCGAGACTTG
GAGCCATGGGCAAAGACGGGGGTGACTAAAGACCACGTGGAGAAGGCCAAGCAAAACGCT
GCGTTCAGAGTGGTGATACTGTCGGGGAAGCTATACGTGGATCTTTACTACGCTTGCGTG
CAGAGCAGGATGATGTCCACCGTTTGGGGGATTCTGCAGCTGCTCAGCAAGTATCCAGGG
ATGGTTCCTGACGTCGACATGATGTTTGATTGCATGGACAAACCCATCATCAACCGGACA
GAACACCAGTCGTTCCCACCCCCTCTTTTTCGATACTGTACTAATGAAGCTCATCTGGAC
ATTCCTTTTCCTGATTGGTCTTTCTGGGGATGGTCGGAGACAAATCTAAAGCCGTGGGAA
GAAGAGTTTAGGGATATAAAGAAAGGGTCTAAGAGAAGAGCTGGGATAGCAAACAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1DE36TF U 1
AF RS1AO20TFB U 26
BS 1 203 RS1DE36TF
BS 204 204 RS1AO20TFB
BS 205 465 RS1DE36TF
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BS 741 837 RS1AO20TFB

RD RS1DE36TF 740 0 0
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CGTCTTCGTCTCCCTCACAAAAGCTCTCCAAAAACACCTTCACATCTCCTTCTATGCGTT
CTTGCTCTCTGCTTCTTCTCCTTCACCGCTCTTCTTCTCTACAAGGTTGACGACTTTGTA
GCTCAGACAAAGACTCTCGCCGGGCACAACTTGGAGCCGACACCGTGGCACATCTTCCCA
CGCAAATCTTTCAGCGAAGCCACCACTTACCGAATCCTCCAATGCTCCTACTTCTCATGC
CCTCACAACTCCGTCCCTGATCCAAATACCACCCTCCCGTCGGATTCCGGGTCGGGTCGT
CATCGAGCCCAGCAACAACAGCAATGCCCTGACGTTTTCAGGTGGATTCACCGAGACTTG
GAGCCATGGGCAAAGACGGGGGTGACTAAAGACCACGTGGAGAAG*CCAAGCAAAACGCT
GCGTTCAGAGTGGTGATACTGTCGGGGAAGCTATACGTGGATCTTTACTACGCTTGCGTG
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QA 1 740 1 740
DS 

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TTCTCTACAAGGTTGACGACTTTGTAGCTCAGACAAAGACTCTCGCCGGACACAACTTGG
AGCCGACACCGTGGCACATCTTCCCACGCAAATCTTTCAGCGAAGCCACCACTTACCGAA
TCCTCCAATGCTCCTACTTCTCATGCCCTCACAACTCCGTCCCTGATCCAAATACCACCC
TCCCGTCGGATTCCGGGTCGGGTCGTCATCGAGCCCAGCAACAACAGCAATGCCCTGACG
TTTTCAGGTGGATTCACCGAGACTTGGAGCCATGGGCAAAGACGGGGGTGACTAAAGACC
ACGTGGAGAAGGCCAAGCAAAACGCTGCGTTCAGAGTGGTGATACTGTCGGGGAAGCTAT
ACGTGGATCTTTACTACGCTTGCGTGCAGAGCAGGATGATGTTCACCGTTTGGGGGATTC
TGCAGCTGCTCAGCAAGTATCCAGGGATGGTTCCTGACGTCGACATGATGTTTGATTGCA
TGGACAAACCCATCATCAACCGGACAGAACACCAGTCGTTCCCACCCCCTCTTTTTCGAT
ACTGTACTAATGAAGCTCATCTGGACATTCCTTTTCCTGATTGGTCTTTCTGGGGATGGT
CGGAGACAAATCTAAAGCCGTGGGAAGAAGAGTTTAGGGATATAAAGAAAGGGTCTAAGA
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QA 10 812 10 812
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1DE92JQ C 1
AF RS1DE92TF U 1
BS 1 689 RS1DE92TF
BS 690 719 RS1DE92JQ

RD RS1DE92JQ 719 0 0
GGAAGCTAAGACACATCAAAAGCGAACGACATGGGCCATTAACGAGAACGAGAACCCACC
ATGCTAGCCTCAACCGGGGACGATGAACCGGACCTGGTCGTGGGACAAGATCTACCAACG
GAGGCCGCCACTCCAAGGGTGCTGACTATAATCTCCCACGTGATGGAGAGGCTAGTCGCA
CGGAATGAGTGGTTAGCTAAGCAAACTAAGGGATTCGGGAAGAGTTTGGAGGCGTTTCAC
GGCGTAAGAGCGCCTAGCATAAGTATAGGCAAGTACCTTGAGAGGATATATAAGTACACA
AAATGTAGCCCGTCGTGTTTCGTGGTCGGGTATGCGTACATAGACCGGTTGGCTCATAAG
CATCCTGGTTCTCTGGTTCTCTCCTTGAATGTTCATAGACTTCTTGTCACTTGTGTCATG
ATTGCTTCCAAGATGCTAGACGACGTGCACTACAACAACGAGTTCTATGCACGGGTGGGA
GGTGTGAGCAATGCAGACTTGAACCGAATGGAGTTGGAGCTTCTGTTCCTCCTTGACTTC
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CTATTAAATGGCCATACTTCTTCTCTCCAAGATAATGGACAAGTGCAAGAAACTCTATCA
GATGCATCTTCTTTGGCATCTTTATATGTTTAACCCTTAGCACACACGTTTTCTCTGTT

QA 1 719 1 719
DS 

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GGAAGCTAAGACACATCAAAAGCGAACGACATGGGCCATTAACGAGAACGAGAACCCACC
ATGCTAGCCTCAACCGGGGACGATGAACCGGACCTGGTCGTGGGACAAGATCTACCAACG
GAGGCCGCCACTCCAAGGGTGCTGACTATAATCTCCCACGTGATGGAGAGGCTAGTCGCA
CGGAATGAGTGGTTAGCTAAGCAAACTAAGGGATTCGGGAAGAGTTTGGAGGCGTTTCAC
GGCGTAAGAGCGCCTAGCATAAGTATAGGCAAGTACCTTGAGAGGATATATAAGTACACA
AAATGTAGCCCGTCGTGTTTCGTGGTCGGGTATGCGTACATAGACCGGTTGGCTCATAAG
CATCCTGGTTCTCTGGTTCTCTCCTTGAATGTTCATAGACTTCTTGTCACTTGTGTCATG
ATTGCTTCCAAGATGCTAGACGACGTGCACTACAACAACGAGTTCTATGCACGGGTGGGA
GGTGTGAGCAATGCAGACTTGAACCGAATGGAGTTGGAGCTTCTGTTCCTCCTTGACTTC
AGAGTTACAGTGAGTTTTAGAGCTTTCGAGAGCTATTGCTTTCACCTTGAGAAAAAGATG
CTATTAAATGGCCATACTTCTTCTCTCCAAGATAATGGACAAGTGCAAGAAACTCTATCA
GATGCATCTTCTTTGGCATCTTTATATGT

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 2

CO CL7517Contig1 832 2 2 U
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ACTAAACCAAACTCTCTTTCTTATCCTCTCAATCTCCTTCTTCTTCTCGCCGGCGCTCAC
TGCCGCCACCGCAGCCTCACGGGCTGGAGCCTCCAACAAAGCCGTGAACTTCATCCAATC
CTCTTGCAAAACCACCACATACCCAGCCGTGTGCTTCCACTCCCTCTCAGCCTACGCAAA
CGCTATACAAACAAGCCCTAAACGCTTAGCCGAGACCACTCTAGCCGTTACCCTGAGCCG
AGCCCAATCCACCAAACTCTTCGTCTCGCGTCTGACGCGTTTCAAGGGCCTTAAGAAGCG
CGAGGTTGAAGCCATCAAGGACTGCGTTGAGGAGATCAACGATACCATTGACCGTTTGAC
CAAGTCGGTCCAAGAGATGAAGCTATGTGGGAGTGCCAAAAATCAAGATCAGTTTGCGTT
CCACATGAGCAATGCTCAGACTTGGACTAGTGCGGCTTTGACAGATGAGAACACTTGCTC
CGATGGTTTCTCGGGTCGGGTCATGGATGGAAGGATCAAGAACTCGGTTCGAGCTAGAAT
TGTTAACGTGGGTCACGAAACTAGCAACGCCCTGTCCTTGATTAATGCATTTGCTAAGAA
GTATTAATTTAAGCTTTAAGAAATATTTTGTGGCATCTCATATATAAATAATATATATAA
TGGTCTCCGTAAATGTAATATATATATGCCGAGTCGGTTAGATTTTTTTTTCTTATTTGG
TTTGTACTATTGTCCATTTGTATTTTGAGATATAAAAGTTTAAGAAGTTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BA11TF U 1
AF RS1BA11JQ C 334
BS 1 678 RS1BA11TF
BS 679 832 RS1BA11JQ

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CTCTTGCAAAACCACCACATACCCAGCCGTGTGCTTCCACTCCCTCTCAGCCTACGCAAA
CGCTATACAAACAAGCCCTAAACGCTTAGCCGAGACCACTCTAGCCGTTACCCTGAGCCG
AGCCCAATCCACCAAACTCTTCGTCTCGCGTCTGACGCGTTTCAAGGGCCTTAAGAAGCG
CGAGGTTGAAGCCATCAAGGACTGCGTTGAGGAGATCAACGATACCATTGACCGTTTGAC
CAAGTCGGTCCAAGAGATGAAGCTATGTGGGAGTGCCAAAAATCAAGATCAGTTTGCGTT
CCACATGAGCAATGCTCAGACTTGGACTAGTGCGGCTTTGACAGATGAGAACACTTGCTC
CGATGGTTTCTCGGGTCGGGTCATGGATGGAAGGATCAAGAACTCGGTTCGAGCTAGAAT
TGTTAACGTGGGTCACGAAACTAGCAACGCCCTGTCCTTGATTAATGCATTTGCTAAGAA
GTATTAATTTAAGCTTTA

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1BA11JQ 499 0 0
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GATCAACGATACCATTGACCGTTTGACCAAGTCGGTCCAAGAGATGAAGCTATGTGGGAG
TGCCAAAAATCAAGATCAGTTTGCGTTCCACATGAGCAATGCTCAGACTTGGACTAGTGC
GGCTTTGACAGATGAGAACACTTGCTCCGATGGTTTCTCGGGTCGGGTCATGGATGGAAG
GATCAAGAACTCGGTTCGAGCTAGAATTGTTAACGTGGGTCACGAAACTAGCAACGCCCT
GTCCTTGATTAATGCATTTGCTAAGAAGTATTAATTTAAGCTTTAAGAAATATTTTGTGG
CATCTCATATATAAATAATATATATAATGGTCTCCGTAAATGTAATATATATATGCCGAG
TCGGTTAGATTTTTTTTTCTTATTTGGTTTGTACTATTGTCCATTTGTATTTTGAGATAT
AAAAGTTTAAGAAGTTGAG

QA 1 499 1 499
DS 



AS 1 2

CO CL7518Contig1 739 2 2 U
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AGGGTTAAGAGAAAATTTCTTGGATCAGACCAGACAAGATTAATTTCTCTAAGTCAACTA
CAGCTTGATGAGTTTCATCGATCTGAAACTCACTTCTCCAACCCAAATCCCAAACTCCAC
TTGTCATCTCTTTTTTCTTACTAAATAGATCCTTCTCCAAGACCATGTGTATGCTCTCTT
TAACGAAGCTGCTCTGATTTAAAAAAGTGTCTCTGTAACTTCTCAGGGAGTCAAACCCAT
CACAGACTTCCATTAGCAACTCATCGATGTGCAAAGAGCTTCTCAGGAGACAAGTTGGTT
CTGTAATGAGAAGAAGGCTTCTGCTTCTGGCTACTTCTTTGGCAAAGTCTAGTGCCAGTC
TTTGGTCTGAGATTACATTGCTGTCTCTATCCTGACAGGTTTTTTCTTTGCTTCTGTTAG
TGTTGGTGTTGAAGTCGAAAAGATTCTCTGCGTAGCTGATGAAATCTGAGGAGTTGGATA
AGAATGATCTAAGAGAGGTCTCTTGCTGAATTGTGGGAGCACAAGAAGTAACTTCTCCGC
TATCACAATGGCCTTGAATGTGAAGCTCCGAAGAAGTGGTTTCCTCTGCAGAAAGTTGGT
TTACTGATCCACTTGCGTCCTGTGAGGAACTTGAGTTATTGTCTCGTTGCTGAATTTTCT
TCTTGGGACTTCGTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
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AF RS1AZ17TF C 1
AF RS1AZ17JQ U 23
BS 1 25 RS1AZ17TF
BS 26 739 RS1AZ17JQ

RD RS1AZ17TF 739 0 0
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AGGGTTAAGAGAAAATTTCTTGGATCAGACCAGACAAGATTAATTTCTCTAAGTCAACTA
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TTGTCATCTCTTTTTTCTTACTAAATAGATCCTTCTCCAAGACCATGTGTATGCTCTCTT
TAACGAAGCTGCTCTGATTTAAAAAAGTGTCTCTGTAACTTCTCAGGGAGTCAAACCCAT
CACAGACTTCCATTAGCAACTCATCGATGTGCAAAGAGCTTCTCAGGAGACAAGTTGGTT
CTGTAATGAGAAGAAGGCTTCTGCTTCTGGCTACTTCTTTGGCAAAGTCTAGTGCCAGTC
TTTGGTCTGAGATTACATTGCTGTCTCTATCCTGACAGGTTTTTTCTTTGCTTCTGTTAG
TGTTGGTGTTGAAGTCGAAAAGATTCTCTGCGTAGCTGATGAAATCTGAGGAGTTGGATA
AGAATGATCTAAGAGAGGTCTCTTGCTGAATTGTGGGAGCACAAGAAGTAACTTCTCCGC
TATCACAATGGCCTTGAATGTGAAGCTCCGAAGAAGTGGTTTCCTCTGCAGAAAGTTGGT
TTACTGATCCACTTGCGTCCTGTGAGGAACTTGAGTTATTGTCTCGTTGCTGAATTTTCT
TCTTGGGACTTCGTTTACC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1AZ17JQ 717 0 0
GAT
TACAAAAAGAGGAAAACTTTTGTTTTGATGGCTCAAGGGTTAAGAGAAAATTTCTTGGAT
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AAACTCACTTCTCCAACCCAAATCCCAAACTCCACTTGTCATCTCTTTTTTCTTACTAAA
TAGATCCTTCTCCAAGACCATGTGTATGCTCTCTTTAACGAAGCTGCTCTGATTTAAAAA
AGTGTCTCTGTAACTTCTCAGGGAGTCAAACCCATCACAGACTTCCATTAGCAACTCATC
GATGTGCAAAGAGCTTCTCAGGAGACAAGTTGGTTCTGTAATGAGAAGAAGGCTTCTGCT
TCTGGCTACTTCTTTGGCAAAGTCTAGTGCCAGTCTTTGGTCTGAGATTACATTGCTGTC
TCTATCCTGACAGGTTTTTTCTTTGCTTCTGTTAGTGTTGGTGTTGAAGTCGAAAAGATT
CTCTGCGTAGCTGATGAAATCTGAGGAGTTGGATAAGAATGATCTAAGAGAGGTCTCTTG
CTGAATTGTGGGAGCACAAGAAGTAACTTCTCCGCTATCACAATGGCCTTGAATGTGAAG
CTCCGAAGAAGTGGTTTCCTCTGCAGAAAGTTGGTTTACTGATCCACTTGCGTCCTGTGA
GGAACTTGAGTTATTGTCTCGTTGCTGAATTTTCTTCTTGGGACTTCGTTTACC

QA 4 717 4 717
DS 



AS 1 2

CO CL7519Contig1 766 2 2 U
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TAAGCAATAAACTCAGCTGGTCAGTGATCCCGATACACACATCTTCACCATCTTATTCAT
AGATGGTTTCACCTGAGTGGTATGATGTACTATGTTGTATTTCTGAATCATTTTTTGCCT
TCTCTTACCGTATAAGTTTTCAAACTAATTACTTTTTCAAGAATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1D242TF U 1
AF RS1D242JQ C 32
BS 1 745 RS1D242TF
BS 746 766 RS1D242JQ

RD RS1D242TF 745 0 0
GATTGATGAGAAGCTATGTTATCAAATTCTGCATGAATACAAAATCCACAATGCTGAGGT
GCTATTCCGTGAGAATGCCACAGTGGATGACTTTATTGATGTCATTGAAGGCAATCGCAA
ATATATTAAGTGTGTGTATGTCTACAACAAAATTGATGTTGTTGGAATTGATGATGTGGA
TAGACTAGCACGGCAGCCAAATTCCATTGTTATTAGCTGCAATCTAAAGCTAAACTTAGA
CAGACTACTTGCAAGGATGTGGGACGAAATGGGACTTGTGAGAGTTTACTCGAAGCCTCA
GGGCCAGCAACCAGATTTCGATGAGCCTTTTGTCCTCTCATCTGATCGAGGTGGCTGCAC
GGTTGAAGACTTCTGTAACCACGTCCACAGGACATTGGTGAAGGATATGAAGTATGCTCT
TGTGTGGGGAACAAGCGCAAGGCACAATCCTCAGAATTGTGGTCTTTCTCAGCATCTTGA
AGACGAAGATGTTGTTCAGATTGTCAAGAAAAAGGAGAGAGACGAAGGAGGAAGAGGCCG
GTTCAAGTCACACTCTAATGCCCCTGCTAGAATTGCAGACCGAGAGAAGAAAGCTCCTCT
TAAGCAATAAACTCAGCTGGTCAGTGATCCCGATACACACATCTTCACCATCTTATTCAT
AGATGGTTTCACCTGAGTGGTATGATGTACTATGTTGTATTTCTGAATCATTTTTTGCCT
TCTCTTACCGTATAAGTTTTCAAAC

QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1D242JQ 735 0 0
CATGAATACAAAATCCACAATGCTGAGGTGCTATTCCGTGAGAATGCCACAGTGGATGAC
TTTATTGATGTCATTGAAGGCAATCGCAAATATATTAAGTGTGTGTATGTCTACAACAAA
ATTGATGTTGTTGGAATTGATGATGTGGATAGACTAGCACGGCAGCCAAATTCCATTGTT
ATTAGCTGCAATCTAAAGCTAAACTTAGACAGACTACTTGCAAGGATGTGGGACGAAATG
GGACTTGTGAGAGTTTACTCGAAGCCTCAGGGCCAGCAACCAGATTTCGATGAGCCTTTT
GTCCTTTCATCTGATCGAGGTGGCTGCACGGTTGAAGACTTCTGTAACCACGTCCACAGG
ACATTGGTGAAGGATATGAAGTATGCTCTTGTGTGGGGAACAAGCGCAAGGCACAATCCT
CAGAATTGTGGTCTTTCTCAGCATCTTGAAGACGAAGATGTTGTTCAGATTGTCAAGAAA
AAGGAGAGAGACGAAGGAGGAAGAGGCCGGTTCAAGTCACACTCTAATGCCCCTGCTAGA
ATTGCAGACCGAGAGAAGAAAGCTCCTCTTAAGCAATAAACTCAGCTGGTCAGTGATCCC
GATACACACATCTTCACCATCTTATTCATAGATGGTTTCACCTGAGTGGTATGATGTACT
ATGTTGTATTTCTGAATCATTTTTTGCCTTCTCTTACCGTATAAGTTTTCAAACTAATTA
CTTTTTCAAGAATAC

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

CO CL7520Contig1 717 2 2 U
GGACACAACCAATCACTTTATAGTCTATAGCAATAAGACTAAATACTCTCATGGCTACTA
AATTTATTACCCTTGCTCAAGTCCACCGCCCCAAAATCTCGATCTCAACCAGAAAACCTC
GCAGATGCAACCAAAACAAGCCCCGACCATCCAAATCCATAAGCGAAAACATGTTCAACA
ATGTTTTTCCTGGCAAAACGCTTACGGAAATCTATCCTAATGACCTAAACAATTCAGACC
CCTTACTAATTCTCTACTTTTTATGGAACATCAGCCAGTTAAAGAAGATGAGTCGACTCA
ACAAGAACACGGGAAGCTGTCCATATGCAACCACCAAGAAGACGGTAAGTCGATCATCGC
AACGAAAGACAGAGATTTGAGACGTGAGGTTGCTCAGTTAAGCTTGTTGTGGTACATGAA
ATGTTCCATAAGCTTTATATTAAGGAAGGCAAGAGCGTTTTACAATGAGTTTTCTTGTGA
TACTTCTGCTGGAAGTAGCACTATGGTTGTGGTCGATCCATATTTTTCTGTTCCAGTTTT
ACCTTACAATAATAATTAGTTTAATATCTCAAATTCTACGTGATTAAAAGTTGTAGTTAG
CATTTTGCTGTGTTGTAATGTGTTGAAAGTCCACATATATGTAAAAAATACGTCAACTTA
TGTAACTGATATCGTTGTATCTAAATTAATTCCGTGTTGTGTTGTGATATAAAAAAA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BV36JQ C 1
AF RS1BV36TF U 1
BS 1 710 RS1BV36TF
BS 711 717 RS1BV36JQ

RD RS1BV36JQ 717 0 0
GGACACAACCAATCACTTTATAGTCTATAGCAATAAGACTAAATACTCTCATGGCTACTA
AATTTATTACCCTTGCTCAAGTCCACCGCCCCAAAATCTCGATCTCAACCAGAAAACCTC
GCAGATGCAACCAAAACAAGCCCCGACCATCCAAATCCATAAGCGAAAACATGTTCAACA
ATGTTTTTCCTGGCAAAACGCTTACGGAAATCTATCCTAATGACCTAAACAATTCAGACC
CCTTACTAATTCTCTACTTTTTATGGAACATCAGCCAGTTAAAGAAGATGAGTCGACTCA
ACAAGAACACGGGAAGCTGTCCATATGCAACCACCAAGAAGACGGTAAGTCGATCATCGC
AACGAAAGACAGAGATTTGAGACGTGAGGTTGCTCAGTTAAGCTTGTTGTGGTACATGAA
ATGTTCCATAAGCTTTATATTAAGGAAGGCAAGAGCGTTTTACAATGAGTTTTCTTGTGA
TACTTCTGCTGGAAGTAGCACTATGGTTGTGGTCGATCCATATTTTTCTGTTCCAGTTTT
ACCTTACAATAATAATTAGTTTAATATCTCAAATTCTACGTGATTAAAAGTTGTAGTTAG
CATTTTGCTGTGTTGTAATGTGTTGAAAGTCCACATATATGTAAAAAATACGTCAACTTA
TGTAACTGATATCGTTGTATCTAAATTAATTCCGTGTTGTGTTGTGATATAAAAAAA

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1BV36TF 710 0 0
GGACACAACCAATCACTTTATAGTCTATAGCAATAAGACTAAATACTCTCATGGCTACTA
AATTTATTACCCTTGCTCAAGTCCACCGCCCCAAAATCTCGATCTCAACCAGAAAACCTC
GCAGATGCAACCAAAACAAGCCCCGACCATCCAAATCCATAAGCGAAAACATGTTCAACA
ATGTTTTTCCTGGCAAAACGCTTACGGAAATCTATCCTAATGACCTAAACAATTCAGACC
CCTTACTAATTCTCTACTTTTTATGGAACATCAGCCAGTTAAAGAAGATGAGTCGACTCA
ACAAGAACACGGGAAGCTGTCCATATGCAACCACCAAGAAGACGGTAAGTCGATCATCGC
AACGAAAGACAGAGATTTGAGACGTGAGGTTGCTCAGTTAAGCTTGTTGTGGTACATGAA
ATGTTCCATAAGCTTTATATTAAGGAAGGCAAGAGCGTTTTACAATGAGTTTTCTTGTGA
TACTTCTGCTGGAAGTAGCACTATGGTTGTGGTCGATCCATATTTTTCTGTTCCAGTTTT
ACCTTACAATAATAATTAGTTTAATATCTCAAATTCTACGTGATTAAAAGTTGTAGTTAG
CATTTTGCTGTGTTGTAATGTGTTGAAAGTCCACATATATGTAAAAAATACGTCAACTTA
TGTAACTGATATCGTTGTATCTAAATTAATTCCGTGTTGTGTTGTGATAT

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL7521Contig1 869 2 6 U
GGACACTCGTCTCCTTAACAACCTTCACCTCTCTCCACCGCCACAATTCTTCTCCGTTTC
TCAATCTCAGTCTCTTCACCGCCTTTCGTTCTCCCTTCTCCCGCATGGAGACCGGAACCG
GTTCGACCGGAAATAAAGCAATGGTGGAAAATCTGAAGCGGTTCGGCGTGATATCATCGA
AGAAAGTAGCTGAAGTGATGGAGGCTTTAGACAGAGGTCTCTTTGTACCAGTTGGATCTT
CAGCTTATGCTGATACTCCCTTGCCTATAGGTTACAACGCCACCATATCCGCTCCACATA
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ATGTTGGCTCAGGTTCATATAACCTTTTCTTGAGGTTTCAGCTAGCTTCATGGTTTTTGA
CCTTTGATCGTGTCTTTTTTGTTAGGAACTGGTTACTTGACTGGCTGCTTTGCTCTGATG
GTTGGAGCTGAAGGACGCGTTGTTGGCGTGGATCATATCCCTCAGCTGGTCGATATGTCT
ATCAAGAACGTTGAAAAGAGTGTTGCTGGTTCTTTGCTACAGACGATCTCTCTCCTTACA
TGTTGGTGATGGAAGGAAAGGTTGGGAAGAGTTTGCACCATACGATGCGATTCACGTAGG
AGCAGCGGCATCAGAGGTCCCTCTGGCGCTGTTGGACCAGCTGAAACCTGGTGGAAGAAT
GGTGATTCCAGTAGGAACATATCTTCAAGAGCTTAAAGTGATTGATAAAAGCGAGGATGG
TTCCATCAAGACACGTACTGAAACTTCAGTTAGGTATGTGCCTCTTACTAGCCGCGTCGA
ACAGACGGGAGGGTTTTGAAGAAACCAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AO46TFB U 1
AF RS1AO46JQ C 117
BS 1 734 RS1AO46TFB
BS 735 735 RS1AO46JQ
BS 736 813 RS1AO46TFB
BS 814 814 RS1AO46JQ
BS 815 839 RS1AO46TFB
BS 840 869 RS1AO46JQ

RD RS1AO46TFB 839 0 0
GGACACTCGTCTCCTTAACAACCTTCACCTCTCTCCACCGCCACAATTCTTCTCCGTTTC
TCAATCTCAGTCTCTTCACCGCCTTTCGTTCTCCCTTCTCCCGCATGGAGACCGGAACCG
GTTCGACCGGAAATAAAGCAATGGTGGAAAATCTGAAGCGGTTCGGCGTGATATCATCGA
AGAAAGTAGCTGAAGTGATGGAGGCTTTAGACAGAGGTCTCTTTGTACCAGTTGGATCTT
CAGCTTATGCTGATACTCCCTTGCCTATAGGTTACAACGCCACCATATCCGCTCCACATA
TGCACGCCACGTGTTTGCAGCTATTGGAAGATAAGCTTCAGCCTGGGATGCGCGCTTTGG
ATGTTGGCTCAGGTTCATATAACCTTTTCTTGAGGTTTCAGCTAGCTTCATGGTTTTTGA
CCTTTGATCGTGTCTTTTTTGTTAGGAACTGGTTACTTGACTGGCTGCTTTGCTCTGATG
GTTGGAGCTGAAGGACGCGTTGTTGGCGTGGATCATATCCCTCAGCTGGTCGATATGTCT
ATCAAGAACGTTGAAAAGAGTGTTGCTGGTTCTTTGCTACAGACGATCTCTCTCCTTACA
TGTTGGTGATGGAAGGAAAGGTTGGGAAGAGTTTGCACCATACGATGCGATTCACGTAGG
AGCAGCGGCATCAGAGGTCCCTCTGGCGCTGTTGGACCAGCTGAAACCTGGTGGAAGAAT
GGTGATTCCAGTAG*AACATATCTTCAAGAGCTTAAAGTGATTGATAAAAGCGAGGATGG
TTCCATCAAGACACGTACTGAAACTTCAGTTAG*TATGTGCCTCTTACTAGCCGCGTCG

QA 1 839 1 839
DS 

RD RS1AO46JQ 753 0 0
ACCGGTTCGACCGGAAATAAAGCAATGGTGGAAAATCTGAAGCGGTTCGGCGTGATATCA
TCGAAGAAAGTAGCTGAAGTGATGGAGGCTTTAGACAGAGGTCTCTTTGTACCAGTTGGA
TCTTCAGCTTATGCTGATACTCCCTTGCCTATAGGTTACAACGCCACCATATCCGCTCCA
CATATGCACGCCACGTGTTTGCAGCTATTGGAAGATAAGCTTCAGCCTGGGATGCGCGCT
TTGGATGTTGGCTCAGGTTCATATAACCTTTTCTTGAGGTTTCAGCTAGCTTCATGGTTT
TTGACCTTTGATCGTGTCTTTTTTGTTAGGAACTGGTTACTTGACTGGCTGCTTTGCTCT
GATGGTTGGAGCTGAAGGACGCGTTGTTGGCGTGGATCATATCCCTCAGCTGGTCGATAT
GTCTATCAAGAACGTTGAAAAGAGTGTTGCTGGTTCTTTGCTACAGACGATCTCTCTCCT
TACATGTTGGTGATGGAAGGAAAGGTTGGGAAGAGTTTGCACCATACGATGCGATTCACG
TAGGAGCAGCGGCATCAGAGGTCCCTCTGGCGCTGTTGGACCAGCTGAAACCTGGTGGAA
GAATGGTGATTCCAGTAGGAACATATCTTCAAGAGCTTAAGGTGATTGATAAAAGCGAGG
ATGGTTCCATCAAGACACGTACTGAAACTTCAGTTAGGTATGTGCCTCTTACTAGCCGCG
TCGAACAGACGGGAGGGTTTTGAAGAAACCAAG

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL7522Contig1 1336 2 2 U
GTGGGATGCAAAGGACATCAATAAGAATGGGGAACTTTTGGGAATAACCCTTCTGCTACT
TGATGAGGTGGTGATGGTTCTTTCTGATTGACTTGCTTTAATGTATATAACAATATTATT
TCTTTCCACTGCATTCGCTTAATGTTAATAACATTAAGATTCATAAATATGATTGTAATC
GTGTGTTAGGGCATGGAAGGTTTTTTAGTATTTAGAGTATGTACGTTATATAGATTTCTC
TAAGTATACGTATTTAAGTCACGGATATCATATGCTATGTTGTTTTGTTTAGGTTAGATC
ATTAATGCGAGAAAGCCAAGGAGATCTTAATGGATGAAAGCAATGTTCAGGTCAGTTCTT
GGTCTTGCATCTCTCACCGCTTTTTGGCGATTAAATTTTTCAAATGTGGTAGACTGTGGT
ATTAGAAATGAATTCATTCTTTAACTCTTTCCTGCGTTCAGCCTGTTAAAAACCATGTGA
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GGAATGGTAACATCTATTAAATACCCCTTTCGTACATATGGCTCTGGTTGCTGATTTTCG
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CTGAGCAAGATCCACACTTACATGTTCTTAAAGATGGACACTGGCAAGAGCAAGATGCGT
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TACCGATGACCAGGACGATGGAGTGAGCAAGTCTTCTCTGGTTCTACGAGTAAGGAAGGT
GAAATATAAGCTAATGTGGTAGCTACCGGTTCTCTTTGGTAAAACAGCATGCTTGGTAGA
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ACGGGAGATTTTCACG


BQ
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DS 

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ATGTAACTGGACATCTTCAACAGGTTCTTTTGGTTTCTTTTTGTTTTTAAAATTTACTAT
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TCCCGCAGTGGGAAATCAGTTACATTGCTTTCTAATTATTTATGAAACGTTGACGGGAGA
TTTTCACG

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

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AATCCACCCGTTGCAGACTGCTTCTAGCCTCTCCAAAGAGCAATGTGAAGCCTTGCACAC
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GCCAGCACCTTCAATGAATCGAAGCTTAACATTTTGAGGGTTCTGTTTCTCAAACTCCTC
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TTTAGCAGTCTCTAGCAAGGCAAAGCCAGGCCCTCCGCTTGACAAATATGGTAGACGATA
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CAATATAGCATTTTGGCACGTGAATTCACCAAAGAGGGGAATCCTCAGCTGCTTAAAGAG
TCCAGGGACTGGGGATGAAACGGTCAACGGAGTATTAAGGATTGCAAGCTTGTCGACCTT
GCTTGGATTTTTCAGTGCCCATGTTAA


BQ
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AF RS1FO59JQ U 1
AF RS1FN86JQ U 17
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BS 462 462 RS1FN86JQ
BS 463 747 RS1FO59JQ

RD RS1FO59JQ 747 0 0
GCAAAACCACTCTTTTGACTCGCAAAGTGTTCTCTTTTCTTTGGAAATTTGTACATTTTA
CGACTCAATTTACATGTTGTAGGATTGATGTTCTGCTTGTCTTTCTCTTTCACAGGCAAG
AATCCACCCGTTGCAGACTGCTTCTAGCCTCTCCAAAGAGCAATGTGAAGCCTTGCACAC
ATCCATCAAAGGGGTAAGACTCTAACACCAATACCTTTGACCTTGTTTTAACTTTGGAAG
TTAGAAAAATGATCGGAGGGCAGCAACTACTTTCTCTGGCCAGTCTTCCTGAGGCAAATG
GCCAGCACCTTCAATGAGTCGAAGCTTAACATTTTGAGGGTTCTGTTTCTCAAACTCCTC
TGCTATAGACTGAGACAGGTACTTGTCAGCTATACCCCACGCCAGAAGCGTGGGTTTATC
CCAGCTGCCTGATGAAAACCCATTTGCAATTTGACCCAAGGTGTCTCCGAAGTTGATCTT
TTTAGCAGTCTCTAGCAAGGCAAAGCCAGGCCCTCCGCTTGACAAATATGGTAGACGATA
TACATCAGCTTTCTCATTCTTCAAGACGTATGGGCTACCTCCTTCAATGAACCGCTCTGC
CAATATAGCATTTTGGCACGTGAATTCACCAAAGAGGGGAATCCTCAGCTGCTTAAAGAG
TCCAGGGACTGGGGATGAAACGGTCAACGGAGTATTAAGGATTGCAAGCTTGTCGACCTT
GCTTGGATTTTTCAGTGCCCATGTTAA

QA 1 747 1 747
DS 

RD RS1FN86JQ 730 0 0
GACTCGCAAAGTGTTCTCTTTTCTTTGGAAATTTGTACATTTTACGACTCAATTTACATG
TTGTAGGATTAATGTTCTGCTTGTCTTTCTCTTTCACAGGCAAGAATCCACCCGTTGCAG
ACTGCTTCTAGCCTCTCCAAAGAGCAATGTGAAGCCTTGCACACATCCACCAAAGAGGTA
AGACTCTAACACCAATACCTTTGACCTTGTTTTAACTTTGGAAGTTAGAAAAATGATCGG
AGGGCAGCAACTACTTTCTCTGGCCAGTCTTCCTGAGGCAAATGGCCAGCACCTTCAATG
AATCGAAGCTTAACATTTTGAGGGTTCTGTTTCTCAAACTCCTCTGCTATAGACTGAGAC
AGGTACTTGTCAGCTATACCCCACGCCAGAAGCGTGGGTTTATCCCAGCTGCCTGATGAA
AACCCATTTGCAATTTGACCCAAGGGGTCTCCGAAGTTGATCTTTTTAGCAGTCTCTAGC
AAGGCAAAGCCAGGCCCTCCGCTTGACAAATATGGTAGACGATATACATCAGCTTTCTCA
TTCTTCAAGACGTATGGGCTACCTCCTTCAATGAACCGCTCTGCCAATATAGCATTTTGG
CACGTGAATTCACCAAAGAGGGGAATCCTCAGCTGCTTAAAGAGTCCAGGGACTGGGGAT
GAAACGGTCAACGGAGTATTAAGGATTGCAAGCTTGTCGACCTTGCTTGGATTTTTCAGT
GCCCATGTTA

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL7524Contig1 759 2 4 U
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AAATTCCAAAACCTTCAGAACCAAAGGAGGAGATGGCAATGGAAGTAATCTCTGAAAGAG
AGGTGGCACCCACAGAAGCCATTGAGTCTAGTAATGTAACACTAAGAAGCGATGAAGTTG
TGACTGAAGAAGCAAAAGCTGAGACCTCAAGCAACATTGATGGGATTTTAGAGAGTCCTG
GGTCCAAAGAAACTCCTGAAGATTTAGGGGAAAGCATCGCAGAGTATAAAGTAAAGACAG
AGGAGAAGAAAGGGAAGGGTAAGTCCGATTCTTCAAGCTCAAGCTCTAGTTCAAGTGACT
CCCCTTGAAAAATAATTCTAAGGGTAATACAACTCAACTCCTAGTGAACATATGTTTGTT
ACACGGTAATGGTAGGCACTTCTTGGTTTTGTTTTATCATCAGACTGTGTGCTCTGTTTT
AAAAGGGGCAGGAAGAAGCCGCTATTCATTTTTTGTACCAAGTTTTCTCCTTTTCCTGGT
TTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTCCTTTTCTCGTGTTTCGGCTTCCATATTTATTGA
TTTGATTGATTTGTATTTCTTGATACTATTCGGAGTTTTTTGTTTGTTTCAGGGTCTTTT
GGTTTGTGACTTTTAATTATTTTCTCATTTTTTGGGGGGTCTGTTCTAAATTATTTGTAA
TGAACCTGAGAAAATGAGAAGTGTATTGTTGTTTGGGTT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FP14TF U 1
AF RS1FP14JQ C 1
BS 1 653 RS1FP14TF
BS 654 654 RS1FP14JQ
BS 655 714 RS1FP14TF
BS 715 759 RS1FP14JQ

RD RS1FP14TF 714 0 0
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TGACTGAAGAAGCAAAAGCTGAGACCTCAAGCAACATTGATGGGATTTTAGAGAGTCCTG
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AGGAGAAGAAAGGGAAGGGTAAGTCCGATTCTTCAAGCTCAAGCTCTAGTTCAAGTGACT
CCCCTTGAAAAATAATTCTAAGGGTAATACAACTCAACTCCTAGTGAACATATGTTTGTT
ACACGGTAATGGTAGGCACTTCTTGGTTTTGTTTTATCATCAGACTGTGTGCTCTGTTTT
AAAAGGGGCAGGAAGAAGCCGCTATTCATTTTTTGTACCAAGTTTTCTCCTTTTCCTGGT
TTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTCCTTTTCTCGTGTTTCGGCTTCCATATTTATTGA
TTTGATTGATTTGTATTTCTTGATACTATTCGGAGTTTTTTGTTTGTTTCAGG*TCTTTT
GGTTTGTGACTTTTAATTATTTTCTCATTTTTTGGGGGGTCTGTTCTAAATTAT

QA 1 714 1 714
DS 

RD RS1FP14JQ 759 0 0
GACCGAAAGAGATAACAAAATCATCAGATGCGTCGTCTATAGAAACTCGATCACTGGAGG
AAATTCCAAAACCTTCAGAACCAAAGGAGGAGATGGCAATGGAAGTAATCTCTGAAAGAG
AGGTGGCACCCACAGAAGCCATTGAGTCTAGTAATGTAACACTAAGAAGCGATGAAGTTG
TGACTGAAGAAGCAAAAGCTGAGACCTCAAGCAACATTGATGGGATTTTAGAGAGTCCTG
GGTCCAAAGAAACTCCTGAAGATTTAGGGGAAAGCATCGCAGAGTATAAAGTAAAGACAG
AGGAGAAGAAAGGGAAGGGTAAGTCCGATTCTTCAAGCTCAAGCTCTAGTTCAAGTGACT
CCCCTTGAAAAATAATTCTAAGGGTAATACAACTCAACTCCTAGTGAACATATGTTTGTT
ACACGGTAATGGTAGGCACTTCTTGGTTTTGTTTTATCATCAGACTGTGTGCTCTGTTTT
AAAAGGGGCAGGAAGAAGCCGCTATTCATTTTTTGTACCAAGTTTTCTCCTTTTCCTGGT
TTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTCCTTTTCTCGTGTTTCGGCTTCCATATTTATTGA
TTTGATTGATTTGTATTTCTTGATACTATTCGGAGTTTTTTGTTTGTTTCAGGGTCTTTT
GGTTTGTGACTTTTAATTATTTTCTCATTTTTTGGGGGGTCTGTTCTAAATTATTTGTAA
TGAACCTGAGAAAATGAGAAGTGTATTGTTGTTTGGGTT

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 2

CO CL7525Contig1 1169 2 4 U
GAAGTGTATGACATGATGCATGTGATGGTGAGTGTGAAGTCGAGAAGCGTTCCCGGGGCG
ATGAGTGATGAGGAGCTCTTTGCTGTTGATGGAGATAGAATGGCGGCGAATGGGAGTGGT
GAGAATGATGGTTTTGAGGATGTGTTGACATCTGAGGAGAGAAAACAGTTGGATTCTGCT
CTGCGGATGGGGGAAGATGAAGAGAATGATGTTAATGATCACCACCATGATGGTCCAAGT
GGAGAAGTGAATGGTTCTTCTTCTCTCAAGGAGAAGAAAGGCTGGTTTGGTTGGAATAAG
AAAGGCTCAAAACCTGGTTATGATGGTACTGAAGAGACAACAACAACAAAGCTTAAGAAA
GGCTCTAAGTCGGCACCAGAAGAAGGGAAAGGGAAAAGCCAGAGAACGTCAACGGTATCT
GATAACACCACAAAGGACAACAAAGGCAGTGCCAAGAAGAAAAAGAGTGAAAGCGAGTAC
AAGAAAGGGTTGAGACCTGTGTTGTGGTTAACACCTGACTTCCCTCTTAAGACAGAAGAG
CTTCTTCTTCTTCTTGACATATTAGCCAATAAGGTCAAAGCAGTGAGGAGACTCAGAGAG
CTTCTCACCACAAAACTTCCAACAGGGACATTCCCTGTTAAGATTGCTATCCCCATTATT
CCAACCGTCCGTGTTCTTGTCACTTTTACTAAATTCGAAGAGCTCCAACCATCTGAGGAA
TTCTCAACGCCTCCTTCTAGCCCCGTTTTTCATGATGCAAAGTCATCAGATAATTCGTCA
TGGGTGTCATGGATGAAAGGCACACGCGGTGGAGGCCAGTCAAGTGACTACGAGAGTAAC
CGTTACAGGGACGATGAAGTGGACCCTTTCCTCATACCGTCAGATTACACATGGGTAGAC
TCAGCTGAGAAGAAACGCAGGATGAAAGCCAAGAAAGCTAGAATCAGGAAGAACAAGAAG
CACGGTGCTCCAAAACCTGGCTCCTCGAGTTCACGTTCCAATCAAGAACCGGATGCTTAA
TTGCACATCCTGAAGAAACAGGGTGTGAAACTTAGATGAGAAGAGGTTGGTTGTGTTATT
GTTTGTAGTATCATACTACTAGTATGCAATCTTGTTTGTGAAATTTTTTTAAGTAACATG
TTTTGCTATAAGGAACAGCCATTTTGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EP38TF U 1
AF RS1EP38JQ C 363
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QA 1 744 1 744
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TCTTCTTCTTCTTGACATATTAGCCAATAAGGTCAAAGCAGTGAGGAGACTCAGAGAGCT
TCTCACCACAAAACTTCCAACAGGGACATTCCCTGTTAAGATTGCTATCCCCATTATTCC
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QA 1 807 1 807
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BJ63TF C 1
AF RS1BJ63JQ U 4
BS 1 3 RS1BJ63TF
BS 4 713 RS1BJ63JQ

RD RS1BJ63TF 713 0 0
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AGCGACGGGCATATCACTGACGCGAGCTCGGAGGAGAGCGAAGCGGTGGTGGAAGGAGGC
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QA 1 713 1 713
DS 

RD RS1BJ63JQ 710 0 0
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QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL7527Contig1 796 2 2 U
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CACTGGTTTCCTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1A545TF C 1
AF RS1A545JQ U 87
BS 1 86 RS1A545TF
BS 87 796 RS1A545JQ

RD RS1A545TF 796 0 0
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TAACCTCCCTGAACCAGTGAACATCTCCGACACAGAAATCCCTCTCTCCGTGTCAGGCTC
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AGAGCTCTCAGCTCGATTCTCATCTTGCGTAAGCGAAGCTACAGAGTTGAGCTCCGTAGC
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GAAAGGAATCTCGGGTTGTCCTAAAGACTGGTCTATAATAGCTTCAAGCCCTTCTCTGCT
CGTGAGGAGAGACCTAGTCCACGAAACTAAGTTCTCTTGACCTGGTGGCTGAGTCATATC
CACTGGTTTCCTCCCC

QA 1 796 1 796
DS 

RD RS1A545JQ 710 0 0
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AGACACTCTCTTTCCTTTTCCTTTTCTTAACTTAGGGCAAATCAGAAACCCCCAATGTTC
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GCTCGCTCAAGCTTCCCGTCGATAACCTCCTCATCTTCTGCCAGAACCTCTTGCCTCGAC
CTGAAGCCAAGGGACCCGAGTTAGACTGTCTCTCTAACCTCCCTGAACCAGTGAACATCT
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GCGTAAGCGAAGCTACAGAGTTGAGCTCCGTAGCTTCGTCGCATTCGTTGCACACAAGTT
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QA 1 710 1 710
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CTCAATAAAGAGAAGTCTTTGCTCTGAAATCTTGAAAATGGATTCTTTGATCAAACTCTT
TTTATGCCTCTATGGAGTTCTATCCACTTCTCTACTTTTTGCTGAAATTAATGGAGTTGA
GGGCTCAGAAAAGAATCATCGTTTGTACGGATTCAGACCAACGAAGCTGTTTGTGTTCGG
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CGCGGGAAAGAAACGTTTACAGTACGGAATGAACTTTGCGTTCGGAGGAACCGGAGTGTT
CAACACTCAAGTTCCATTGCCGAATATGACCACTCAAATCGATTTCTTCAAGAACATTCT
CAACGTTGGAGACATCTACACTCCCTCCAACCTTATCTCCTCGGTCGCGCTCGTCAGCGT
CGCCGGCAACGACTATTCCACTTTCATCTCGCAAAACCGCCCTGCCTCGGACTTTCCAGC
ATTCATAAAGCAAGTGGTGGATCAAACAGAAGTGAATCTGAGGCGGATCCACGCCTTGGG
TGTAAAGAAAGTAGCAGTACCGTTGCTGCAGCCTCTCGGTTGCCTCCCTGGCATCACCTT
TGCCTCCTCGTTCCAGCGTTGTAACGAGACACAAAACGCTTTAGTGAGACTCCACAACAG
CTTGTTGCAACAAGCCGTGGTAAAGCTCAATAACGAAATCAAACAGTCCACTTTCATCAT
CATTGATCTTTACAACGCTTTCTTGAACGTCTTCAACAACAAAGGAGCAAATCCAGGGAG
TGCGACGTTTCAGAGCCCGTTGAAACCGTGCTGCGTAGGCGTGAGCAGTGAGTATTTCTG
TGGAAGTGTGGATGAAAAGGGAGTTAAGAAGTATATGATGTGTGATGATCCTAAGTCTGC
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H237TF U 1
AF RS1H237JQB C 651
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BS 704 787 RS1H237TF
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CTCAATAAAGAGAAGTCTTTGCTCTGAAATCTTGAAAATGGATTCTTTGATCAAACTCTT
TTTATGCCTCTATGGAGTTCTATCCACTTCTCTACTTTTTGCTGAAATTAATGGAGTTGA
GGGCTCAGAAAAGAATCATCGTTTGTACGGATTCAGACCAACGAAGCTGTTTGTGTTCGG
AGACTCTTATGCAGACACAGGGAACATTAAGAAGTCTCTCTCTAGTTCTTGGAAATTTCC
TTACGGTATCACTTTCCCCGGTAAACCCGCTGGCCGTTTTTCCGATGGCCGCGTCGCCAC
TGATTTTCTAGCAAAATTCGTGGGGATAAAATCACCTATCCCATACTTCTGGAAAAATTA
CGCGGGAAAGAAACGTTTACAGTACGGAATGAACTTTGCGTTCGGAGGAACCGGAGTGTT
CAACACTCAAGTTCCATTGCCGAATATGACCACTCAAATCGATTTCTTCAAGAACATTCT
CAACGTTGGAGACATCTACACTCCCTCCAACCTTATCTCCTCGGTCGCGCTCGTCAGCGT
CGCCGGCAACGACTATTCCACTTTCATCTCGCAAAACCGCCCTGCCTCGGACTTTCCAGC
ATTCATAAAGCAAGTGGTGGATCAAACAGAAGTGAATCTGAG*CGGATCCACGCCTTGGG
TGTAAAGAAAGTAGCAGTACCGTTGCTGCAGCCTCTCGGTTGCCTCCCTGGCATCACCTT
TGCCTCC

QA 1 787 1 787
DS 

RD RS1H237JQB 670 0 0
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ACGCCTTGGGTGTAAAGAAAGTAGCAGTACCGTTGCTGCAGCCTCTCGGTTGCCTCCCTG
GCATCACCTTTGCCTCCTCGTTCCAGCGTTGTAACGAGACACAAAACGCTTTAGTGAGAC
TCCACAACAGCTTGTTGCAACAAGCCGTGGTAAAGCTCAATAACGAAATCAAACAGTCCA
CTTTCATCATCATTGATCTTTACAACGCTTTCTTGAACGTCTTCAACAACAAAGGAGCAA
ATCCAGGGAGTGCGACGTTTCAGAGCCCGTTGAAACCGTGCTGCGTAGGCGTGAGCAGTG
AGTATTTCTGTGGAAGTGTGGATGAAAAGGGAGTTAAGAAGTATATGATGTGTGATGATC
CTAAGTCTGCCTTCTTTTGGGATGATAGTCACCCTACAGAAGAAGGATGGAGATCGGTTT
ACTCTGTTTTACACGAAAGTCTTACAGCCTCTTTTATGAAAGCGTGAGGAGGAAGAAACA
AAAAAAAAGCACTTTTAGGGTTCTTTTCAGTTGCTTTTTCTTTCTCTGTTTTGTTCAGTA
TCACTTCATTCATTTTGTGTTTCTATGTTCTGTGTTAAAAGTCTTTGCCACTAAATAAAA
CTAAACGTGT

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

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ACCGGGAAGAAAAAAGGGACAGAAATCCATAAAGTCAAAAAATATGGCACGAAAAGGAAA
TCCGATTTCGGTAAGACTTGGAAAAAATCGTAGTTCAGATTCAAGTTGGTTCAGTGAGGG
CGACCGCGAAAGTCACCGAATGGGTAAGTCTTTTCCTTCAGTTTATCCTATATTTTCAAA
AAAAGCGTGGGAGGACGTTGCAGATGTCCGGGACGGACACGACTTCTTCTAACGCTAGAA
GACCACTGGAAAACACCCGGAACCAGAGCATGTCGTGAAAGAAGCACACTGGATGGGCGT
GCTTCGACCGTGTCTCCGGGGCACAGTTGAATGTAGATATCATTAACGCGAGGTGTAGGA
TACCAGGCCGAGAAACCCAGGCAACCCAACCCCCCCCTATGCGCCGATCGCTAGCGCATC
CAGGTCCCCGGCGCCCAGCTCTGCGGGGGAAGCCTAGTCTGATCTGAGAAGTGCTAATTC
GGTTCGGATAGACTTCAAAAAAGAACGCCGCCGCCCAATAATCAAAATCAAACAAGTGCT
AAGTTTCAGATAGTGAATAAACCGAAACGAAAGAAGAGAGGTTTCTCGCTCGGCGCCTAA
AGCGCACTATGCTCCGTTTTAACAAATGAGAGTTTTCGGTGGAACCGGTGAAACCACGCG
AGCTGGTTAGATGTGTGGGACAGAGGGCTCATAGTACCTGTTAGCGCAGCTATGCAGTGG
AAGGGAAGGAGCCTATAAATCGACCCCTTCCTTCTTTTTTTCTTTGAAAAAAAAAGCAGT
ACAAAGAGATTAGACTCTCGGATGAGACTAAGCGGCCACCGACCGTTCCGACGCACCCCT
GACCGATTTTGATTAAGACCGAAAACCTATCTAAAATGAAGCCTAGTTTAAGCTGTCAAA
CAAATGATAGAATGG


BQ
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AF RS1C189TF U 1
AF RS1C189JQ C 515
BS 1 680 RS1C189TF
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DS 

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QA 1 521 1 521
DS 



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BQ
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AF RS1FB91TF C 1
AF RS1FB91JQ U 5
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BS 5 721 RS1FB91JQ
BS 722 728 RS1FB91TF

RD RS1FB91TF 728 0 0
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GCCATCCACGTGTTGTAAGTTGTCTTCTTGTTGTAGAAGAAGAAGCCTTGTGCACGAGCC
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GTGTTATCACTGTCGTAGGCAACGTTATGGAGATGGAGGAGAAAATGTTTGCATGGTTTT
TTCAGGTTGATTGATTTTCGGACCGATAAAACAGTATCAGAAGGGAGTAAAACGAATAAG
AAGAAAGACAATAGGGTTTTAATATGTTTCGAGACTTGATTTGCCATGATTCTAGAGTTA
AGGAAAAA

QA 1 728 1 728
DS 

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AAGACAATAGGGTTTTAATATGTTTCGAGACTTGATTTGCCATGATTCTAGAGTTAA

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1G418TF C 1
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BQ
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AF RS1H145JQB C 1
AF RS1H145TF U 1
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GA

QA 1 691 1 691
DS 



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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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DS 

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TGTTATAATATTAAGACTTTTAATTCC

QA 1 687 1 687
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7536Contig1 700 2 4 U
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ATAGTTAAATAAAATTCATTACATAGAGAAAAAACATCTTATGCAAATACAGTCTTTAAT
TCTCCTCTGGATGATTAGAAATGTCCTTCAAAACGAAAAAAAAAGAGAGGGATTCCAAGA
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GCGTCGCTTCTCCTACTGTCTCCATTTTTTTTTTCTGGCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1C926TF C 1
AF RS1C926JQ U 2
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BS 2 50 RS1C926JQ
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RD RS1C926TF 700 0 0
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GCGTCGCTTCTCCTACTGTCTCCATTTTTTTTTTCTGGCC

QA 1 700 1 700
DS 

RD RS1C926JQ 699 0 0
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CTCCATATTCTCCGGGTCCTGATTCGGATCCACAAGCGTCGCACGCAAGAACACAGTGAC
GTAGTGAGACGGCTTGGGCGCCTCCTTGAAAACGTTGTTGGTGACAGTCAAGAGCTTCGT
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CGTCGCTTCTCCTACTGTCTCCATTTTTTTTTTCTGGCC

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 2

CO CL7537Contig1 744 2 2 U
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CTGAGGCTCTTCATGTCCATCAAGTACATAACAGCAAACGTAGTGGACAGAAACAACGGG
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AAAAAAAAATGAAGTTTCCTGTGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DP78TF U 1
AF RS1DP78JQ C 1
BS 1 687 RS1DP78TF
BS 688 744 RS1DP78JQ

RD RS1DP78TF 687 0 0
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GGTTTGGTCTGCTTCGGTTCTGTATAAGTCTTTCTCGATTTCTCTCTTCTCCAAGCTCCT
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CGTTCTTTTGAGGGTCACCGTTAACCTCACAAGCTTTACTTTCTGTGTCATCTTCTGGAA
TCTTATGTAACAGAATAAAGAGTGTTC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1DP78JQ 744 0 0
GGAAAGGTGAATAGTCGGTTTGGGTATCACAAATAAGCCAACCGGTTAACGAAATGTTAG
GGTTTGGTCTGCTTCGGTTCTGTATAAGTCTTTCTCGATTTCTCTCTTCTCCAAGCTCCT
TCGTTCGACTCTGGACAATTTCCGGCGACTTGGACTTGGGATTCCGGCAACTCAGCAGAC
CTCGATTCCCAGATAGAACAGGCTTCGATAGAACCAATGACGGTTCTCAAAAGGTACGTC
CTGAGGCTCTTCATGTCCATCAAGTACATAACAGCAAACGTAGTGGACAGAAACAACGGG
AGAGTAGTGACAACCGCTTCAACAGTAGAGCATGCGATCAAGAACTCACTGGAGTGCGGC
CGGACTTGCAACGCCAAAGCAGCTGCTATCGTGGGAGAGGTTTTGGCGATGAGGTTGAAA
GTAGAAGGGCTCCAGGATGGGCAAGGAAGAGGTATCCACGCCGATGTCAAGAAAGAAATC
GAGAAGAAAGGGTTCAAGAGTCGAACCAAGGTGTGGGCTGTTATCAACTCGCTAAAGAAC
AATGGTGTTACGCTCATCCTTGATGATTATGATTCTGATGATGACAAAGATTATCGAGAT
CGTTCTTTTGAGGGTCACCGTTAACCTCACAAGCTTTACTTTCTGTGTCATCTTCTGGAA
TCTTATGTAACAGAATAAAGAGTGTTCGATGTAAGAACTTTAGTTTTTTTTCACGTTTAT
AAAAAAAAATGAAGTTTCCTGTGT

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL7538Contig1 899 2 2 U
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CCAGTGGCTCCTCGCAGTTTTTATCCACTGGATTGACATCAGAGGTCCATATTCTTCTTA
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AGTCTCAAAGATCTGCTTCAGCTTCCTTCAAGAGTGCTTCTACCATTGTAGAAGACGATG
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AAGAAGCTAAACAGATCTCAGCCTCGGGTTACAAGGAACTATGGAGCTCTAAGAAGATAA
AATGGCAAGCTCTCTGACGTCCCAGCTCACAACGAAGCTTTATATCTTTCTTTTTTTCTG
CTTTTTTAGCGACTTAAAAGAGCAACCAAATACTAATGAGTCTTTGTGAAATGTGTAGTG
AGAATTTTGTAGTCTTTTTGAGTTTTGTTGTTGATCAATGAGGAAATATATTTCATATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CI90TF U 1
AF RS1CI90JQ C 329
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BS 621 899 RS1CI90JQ

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DS 

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DS 



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BQ
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AF RS1BC66JQ C 1
AF RS1BC66TF U 1
BS 1 691 RS1BC66TF
BS 692 710 RS1BC66JQ

RD RS1BC66JQ 710 0 0
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TACAAAAAGTGTACGTTTCAGTTTTTCGCTAAGCCGCCAGGGAATGAAAGACGGTACTGC
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CTTCACCCGTGTTGTGCTATGCTTCCTATGGTTTTGGACGATGGAGAATTGGCAGGAGCT
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CGAGCATCACCACCGTAGCAGCAGCAAAGGCAAAGTCCAGAAGTGCTGTGAGATCGCTGG
AATGGCCGTGCAGTTCGTTATTTCTGCCGTGCTTGGTGATCCAACGGCCCTTATCGCCGG
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TTCCTACTTTGGGTGTTCACTTATCGTGTTATATATAAAAACTCTTAACT

QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1BC66TF 691 0 0
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GATGGTTGCAATGAAGTAGGGATCGGCTCTCGGTATCGCTGCTCCAATGATCATCAAAGC
TGCGATTTCTATCTCCATGCACACTGCGCGTTACCTTCCGCCACCATAACACATCCTTTC
TACAAAAAGTGTACGTTTCAGTTTTTCGCTAAGCCGCCAGGGAATGAAAGACGGTACTGC
AACGCGTGCCAGAAGGACGTGTCCGGATTCGTGTACCATTGCAGGGCATGCGGTTTTGAT
CTTCACCCGTGTTGTGCTATGCTTCCTATGGTTTTGGACGATGGAGAATTGGCAGGAGCT
GTACAATGGACAAAGTGGTAAAAGCATAGAATGCAAGAGCCTGGCGTTAAAGAACACGCT
CGAGCATCACCACCGTAGCAGCAGCAAAGGCAAAGTCCAGAAGTGCTGTGAGATCGCTGG
AATGGCCGTGCAGTTCGTTATCTCTGCCGTGCTTGGTGATCCAACGGCCCTTATCGCCGG
AGTTGTAGGCTCCCTCATCTCCCGAGGATGATCCACCTTCTAATTAATGATATCTCCATC
TTCCTACTTTGGGTGTTCACTTATCGTGTTA

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

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AACGCTTGGTGCAGCCGATGATGATGACGATGTTTGGATTTAGATCTAGGTTTAATTTGT
TTCGGTTGTTGAAGGGGTTCCAAAGATCAAGGCCGGTACAATCCTGCAACATGTATGCTT
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TCCGTTCTAATGGTGAATAATTAAAAAAAACATGAGTACGGTCCTTATCGTTGATGATAA
GAACATGGATATCTCCACGCTTGAGAAGTTTCTTC


BQ
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AF RS1B170TF U 1
AF RS1B170JQ C 62
BS 1 564 RS1B170TF
BS 565 815 RS1B170JQ

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GTTGTTCTCCTGGACGAGGCTTCCATGGTTCAGATCGTAAGAGATGAATAAAGGGGAAGT
TCTTAGCCTCTATTTTCCATGAACTTTTCTGGTCAATATGTCTCTCTCACTCTGATTTGT
TTGTTTTTTGGTACGTGAAGCATTGTCGTGAGCAGAGTTGGTGGTCGTGAGCTTTAACAC
GGAGGAGGCACGGCGCGGTGGTGATGGTACAATAACCTGTTTTTTCCTAAAGCAGAAGAC
AACGCTTGGTGCAGCCGATGATGATGACGATGTTTGGATTTAGATCTAGGTTTAATTTGT
TTCGGTTGTTGAAGGGGTTCCAAAGATCAAGGCCGGTACAATCCTGCAACATGTATGCTT
GACGTCACTACTCCTTCAATGGAGTCACAAACGAGTGCGGACTTTGCTCAACTATTCACC
GCAGCTTAATCTTACTAATTTCAA

QA 1 564 1 564
DS 

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TTGTTCTCCTGGACGAGGCTTCCATGGTTCAGATCGTAAGAGATGAATAAAGGGGAAGTT
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TGTTTTTTGGTACGTGAAGCATTGTCGTGAGCAGAGTTGGTGGTCGTGAGCTTTAACACG
GAGGAGGCACGGCGCGGTGGTGATGGTACAATAACCTGTTTTTTCCTAAAGCAGAAGACA
ACGCTTGGTGCAGCCGATGATGATGACGATGTTTGGATTTAGATCTAGGTTTAATTTGTT
TCGGTTGTTGAAGGGGTTCCAAAGATCAAGGCCGGTACAATCCTGCAACATGTATGCTTG
ACGTCACTACTCCTTCAATGGAGTCACAAACGAGTGCGGACTTTGCTCAACTATTCACCG
CAGCTTAATCTTACTAATTTCAATTTCTATACGAGGCATCAGGCCTTCACTGTGTCCCAC
ATCTATCGCCTTCACTGTCCAGCTGCAGCAACGTTGGCAATTCATAGTTTAGACTGTTAA
CAGAGCTCAGAGTCGGAGGCGGTCTGTTTCAACTGTCCAAGTCTCCTAAAATATGGTCTT
CCGTTCTAATGGTGAATAATTAAAAAAAACATGAGTACGGTCCTTATCGTTGATGATAAG
AACATGGATATCTCCACGCTTGAGAAGTTTCTTC

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

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GGCCTCCCGTGGGCAGAAAGGAGCCTCTTATCACCAACATCATGTGGAGAAACCTGTTGA
TTCAGGCTATCTATCAAGTGAGTGTATTACTGGTTCTCAATTTCCGAGGGATAAGCATAC
TTGGCCTCGAGCATGAAGTTCCTACACATGCCACCAGAGTGAAGAACACAATAATTTTCA
ACGCCTTCGTGCTCTGCCAAGCATTCAACGAGTTCAATGCTCGAAAACCAGACGAGAAGA
ACATCTTCAAAGGCGTTATCAAGAATCGTCTCTTCATGGGAATAATAGTCATAACTCTCG
TCCTCCAGGTTATCATTGTTGAGTTCCTCGGCAAATTCGCTTCCACGACAAAACTTAACT
GGCAACAATGGCTAATATGTGTTGCCATCGGTGTGATCAGTTGGCCTCTTGCTCTGGTGG
GAAAATTCATTCCGGTGTCAAAAACTCCTCTCAGCAACAAACTAAAGTGCTGGGGCAAGA
AAAAATCTTCTGGAGAAGGTTCACTCTGATTTGGTGGATACCCGGGGTTTTATGACAAGA
CGCTCCGCGAGTTTTAAGTACTACTTTCTAGGACTAACAAGAACAAAAAAGTATCGTTTG
GTGTTAACTATGGGGGTTTATAATTGATATTGGGAGACCCCAAAAGTACAGTTTTTCCGG
GTTTGTCTATGCGGTCAAGTTTGGATTCATGTTTTTTCGGTTATTGATAATACGATTGCT
TGACTTTGGAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AH06TF U 50
AF RS1AH06JQ C 1
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BS 50 649 RS1AH06TF
BS 650 650 RS1AH06JQ
BS 651 755 RS1AH06TF
BS 756 793 RS1AH06JQ

RD RS1AH06TF 706 0 0
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CATAACTCTCGTCCTCCAGGTTATCATTGTTGAGTTCCTCGGCAAATTCGCTTCCACGAC
AAAACTTAACTGGCAACAATGGCTAATATGTGTTGCCATCGGTGTGATCAGTTGGCCTCT
TGCTCTGGTGGGAAAATTCATTCCGGTGTCAAAAACTCCTCTCAGCAACAAACTAAAGTG
CTGGGGCAAGAAAAAATCTTCTGGAGAAGGTTCACTCTGATTTGGTGGATACCCGGGGTT
TTATGACAAGACGCTCCGCGAGTTTTAAGTACTACTTTCTAGGACTAACAAGAACAAAAA
*GTATCGTTTGGTGTTAACTATGGGGGTTTATAATTGATATTGGGAGACCCCAAAAGTAC
AGTTTTTCCGGGTTTGTCTATGCGGTCAAGTTTGGATTCATGTTTT

QA 1 706 1 706
DS 

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GGCCTCCCGTGGGCAGAAAGGAGCCTCTTATCACCAACATCATGTGGAGAAACCTGTTGA
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TTGGCCTCGAGCATGAAGTTCCTACACATGCCACCAGAGTGAAGAACACAATAATTTTCA
ACGCCTTCGTGCTCTGCCAAGCATTCAACGAGTTCAATGCTCGAAAACCAGACGAGAAGA
ACATCTTCAAAGGCGTTATCAAGAATCGTCTCTTCATGGGAATAATAGTCATAACTCTCG
TCCTCCAGGTTATCATTGTTGAGTTCCTCGGCAAATTCGCTTCCACGACAAAACTTAACT
GGCAACAATGGCTAATATGTGTTGCCATCGGTGTGATCAGTTGGCCTCTTGCTCTGGTGG
GAAAATTCATTCCGGTGTCAAAAACTCCTCTCAGCAACAAACTAAAGTGCTGGGGCAAGA
AAAAATCTTCTGGAGAAGGTTCACTCTGATTTGGTGGATACCCGGG*TTTTATGACAAGA
CGCTCCGCGAGTTTTAAGTACTACTT*CTAGGACTAACAAGAACAAAAAAGTATCGTTTG
GTGTTAACTATGGGGGTTTATAATTGATATTGGGAGACCCCAAAAGTACAGTTTTTCGGG
GTTTGTCTATGCGGTCAAGTTTGGATTCATGTTTTTTCGGTTATTGATAATACGATTGCT
TGACTTTGGAATC

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

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AAAAGGGGTATAATCTTGCTCAATTGTTATTATGTTTAATAATCGAATATAGAATGGATT
AATCTTATTACTCAGCATCATGATTTCAATAGAATTCAAAATCTTTTTTTCTTTTCTCTT
TTCTCTTTATCTTTTCTTTTTTGTGCCATGAAGATGCAAAAAAATAGAAAACATAATACA
GCACATGAATTATACCTTTAAACATAATTTAAGAAAGGGATGACACGAAGTTGATCAAAC
GATTAGATAGTTACCTTCATCTTATTAGTCGTATATATCCTTTCTTCTTTCTATTGTCTT
TTAATACCACTTCTCCATACTACTTTTTTTCCCTCTGTAACTGTCTCTATCTTACTTATT
ACCCATAATCATAGTAATACATAAATTTTACGATAACCTAAAATAATGAAAAGGAAAACT
GAGTGAGATGATTGTCAATAAAGAAAACCCCTTTTTGTGCTATGAATATGTGAACAAAAA
TTCAGAATTAGAATGCATGAACTACCTACAATTTACAAACAAACATATAATAACTTAAGC
AAGAGACTTTTTTCGAGAAAATAACTTAAGCAAGAGATGACACAAAGTTGATCAGACTAT
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CCTCTTCTTCCTCCATCTTACTTATCAGCCAAAGATACAGTCATAATAAATTGTACGGAA
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AAAATTAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C592JQ U 26
AF RS1C592TF C 1
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RD RS1C592JQ 698 0 0
T
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CAATAGAATTCAAAATCTTTTTTTCTTTTCTCTTTTCTCTTTATCTTTTCTTTTTTGTGC
CATGAAGATGCAAAAAAATAGAAAACATAATACAGCACATGAATTATACCTTTAAACATA
ATTTAAGAAAGGGATGACACGAAGTTGATCAAACGATTAGATAGTTACCTTCATCTTATT
AGTCGTATATATCCTTTCTTCTTTCTATTGTCTTTTAATACCACTTCTCCATACTACTTT
TTTTCCCTCTGTAACTGTCTCTATCTTACTTATTACCCATAATCATAGTAATACATAAAT
TTTACGATAACCTAAAATAATGAAAAGGAAAACTGAGTGAGATGATTGTCAATAAAGAAA
ACCCCTTTTTGTGCTATGAATATGTGAACAAAAATTCAGAATTAGAATGCATGAACTACC
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QA 2 698 2 698
DS 

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TTCTCTTTATCTTTTCTTTTTTGTGCCATGAAGATGCAAAAAAATAGAAAACATAATACA
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TTAATACCACTTCTCCATACTACTTTTTTTCCCTCTGTAACTGTCTCTATCTTACTTATT
ACCCATAATCATAGTAATACATAAATTTTACGATAACCTAAAATAATGAAAAGGAAAACT
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TTCAGAATTAGAATGCATGAACTACCTACAATTTACAAACAAACATATAATAACTTAAGC
AAGAGACTTTTTTCGAGAAAATAACTTAAGCAAGAGATGACACAAAGTTGATCAGACTAT
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AAAATTAC

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EG20TF U 1
AF RS1EG20JQ C 286
BS 1 637 RS1EG20TF
BS 638 638 RS1EG20JQ
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DS 

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ATTCCTGCTTCGGCAAAGAAGAAAGCGTTGAAGCTTCAAGTCTCCTATGCCAACGAAGCC
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GAATAATAGAAACAACTTTTTAAACATCTTCTCTCTACGCGTTGATATATGAACTCTCTT
TTTTTTGG

QA 1 548 1 548
DS 



AS 1 2

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G


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1H041TF U 1
AF RS1H041JQB C 1
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BS 713 721 RS1H041JQB

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TCTCCAGTGGGGGCTTGCAGCTGGATTATACTCGGGTATAACGTTTAGTATGAAGGAGAC
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GATGGCTATGACGACCTCAGAGAGGACAAGCCATGAGCAAGTGGTTCAGTCTGCTCTTAC
AGGAGCAGCCATTTCCACTGCTGCTAATCTCCTTTCTAGCGTTTTCTAGATGCACCCATT
AAAAGTCTTGTTATTTGCGTTATGTTTTAGCATAAACACGTGTCTTTTTATAAAACTGTC
TACGTTATCTGTCAAGACTAGGCTCTCTTAAGCCAGATATTACATTTCCTTC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RS1H041JQB 721 0 0
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GAGTGGAGGAAGAAAGGTGATGGATGAGATAAGGAGCTTTGAGAAGGCAAATTTGTTCGA
TCTTGGCCATCCTCTTCTCAACCGCATCGCTGATTCTTTCGTCAAAGCCGCCGGTGTCGG
AGCTTTTCAAGCTGTGTTTAGGGAAGCTTACTTTACGGTGGTTGATGGGGCAGGGTTTGA
CGCGAGCAACATGGGTCCACCTTTTGAGAATGCCGGCAGCAAGAAACATAGGTTTCCTAA
TTTCAGAGGGAAAAGAAGCAAATCGTTGGATGCATTTGTGAAGAACACAGGAAAAGAATC
TCTCCAGTGGGGGCTTGCAGCTGGATTATACTCGGGTATAACGTTTAGTATGAAGGAGAC
TCGTGGAGGAGCTCATGACTGGAGGAATAGCGCCGTGGCTGGAGCATTAACAGGAGCGGC
GATGGCTATGACGACCTCAGAGAGGACAAGCCATGAGCAAGTGGTTCAGTTTGCTTTTAC
AGGAGCAGCCATTTCCACTGCTGCTAATCTCCTTTCTAGCGTTTTCTAGATGCACCCATT
AAAAGTCTTGTTATTTGCGTTATGTTTTAGCATAAACACGTGTCTTTTTATAAAACTGTT
TACGTTATCTGTCAAGACTAGGCTCTCTTAAGCCAGATATTACATTTCCTTCCCTTTGAC
G

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL7545Contig1 869 2 2 U
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GACAACAACCAACAGTTTTTGGTTCACTTAGTACAGAGTTCGCGATGACAACAGTAGCCT
CCGGCTTCGTATCATTTTCGCCGACGCTGTATCTGGCCAAATCTCGACGGTCCTGTCGCA
ACATTCGAACTCGGTCTGCATGTCTTCCTGTAGTTTCCTCATCGTTAACCCAAGTCGAAG
TAGACACAGCAACAACAAGCCTCTATTCAAGTATTATCTCGTCAAAACCGATCTCGGAGG
CCTTGCATAACATATCTCTAGCAGATCTGGATCCAGGAACTGCAAAGCTTGCGATTGGGA
TCTTGGGTCCTGCCTTATCAGCTTTTGGGTTTCTCTTTATTTTGAGGATTGTTATGTCTT
GGTACCCGAAGCTTCCCGTTGACAAGTTCCCTTACGTTTTGGCGTACGCTCCTACCGAAC
CAATCCTTGTTCAGACGAGGAAAGTGATTCCGCCACTTGCAGGAGTCGATGTAACTCCAG
TGGTTTGGTTCGGGCTTGTGAGTTTCCTTAGTGAGATTTTGGTTGGTCCACAGGGACTTC
TCGTTCTTGTTTCTCAACAACAAATTAGCTAGAATCTGAGGGTCATACTCCGTAATACAT
TTGTTTCTGTACGCTCTTTTGGCCTCTGTTGATGGTATCTCTTTGTGTATGTGCTGCTCA
GTATTCTTTGAACTCTGGCATCGATATTTTGAGATTTTGGTGCATTAAGATGCAAATGCT
CAAAAAGTCAAAATCTATGTTAATAAAGTTGCAGTATGGAGATGTTTAGATATAAGGATA
GGATTTTTAATGAAATGTGATTGAAAGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EN02TF U 1
AF RS1EN02JQ C 76
BS 1 767 RS1EN02TF
BS 768 869 RS1EN02JQ

RD RS1EN02TF 767 0 0
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GACAACAACCAACAGTTTTTGGTTCACTTAGTACAGAGTTCGCGATGACAACAGTAGCCT
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CCTTGCATAACATATCTCTAGCAGATCTGGATCCAGGAACTGCAAAGCTTGCGATTGGGA
TCTTGGGTCCTGCCTTATCAGCTTTTGGGTTTCTCTTTATTTTGAGGATTGTTATGTCTT
GGTACCCGAAGCTTCCCGTTGACAAGTTCCCTTACGTTTTGGCGTACGCTCCTACCGAAC
CAATCCTTGTTCAGACGAGGAAAGTGATTCCGCCACTTGCAGGAGTCGATGTAACTCCAG
TGGTTTGGTTCGGGCTTGTGAGTTTCCTTAGTGAGATTTTGGTTGGTCCACAGGGACTTC
TCGTTCTTGTTTCTCAACAACAAATTAGCTAGAATCTGAGGGTCATACTCCGTAATACAT
TTGTTTCTGTACGCTCTTTTGGCCTCTGTTGATGGTATCTCTTTGTGTATGTGCTGCTCA
GTATTCTTTGAACTCTGGCATCGATATTTTGAGATTTTGGTGCATTA

QA 1 767 1 767
DS 

RD RS1EN02JQ 794 0 0
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TTTCGCCGACGCTGTATCTGGCCAAATCTCGACGGTCCTGTCGCAACATTCGAACTCGGT
CTGCATGTCTTCCTGTAGTTTCCTCATCGTTAACCCAAGTCGAAGTAGACACAGCAACAA
CAAGCCTCTATTCAAGTATTATCTCGTCAAAACCGATCTCGGAGGCCTTGCATAACATAT
CTCTAGCAGATCTGGATCCAGGAACTGCAAAGCTTGCGATTGGGATCTTGGGTCCTGCCT
TATCAGCTTTTGGGTTTCTCTTTATTTTGAGGATTGTTATGTCTTGGTACCCGAAGCTTC
CCGTTGACAAGTTCCCTTACGTTTTGGCGTACGCTCCTACCGAACCAATCCTTGTTCAGA
CGAGGAAAGTGATTCCGCCACTTGCAGGAGTCGATGTAACTCCAGTGGTTTGGTTCGGGC
TTGTGAGTTTCCTTAGTGAGATTTTGGTTGGTCCACAGGGACTTCTCGTTCTTGTTTCTC
AACAACAAATTAGCTAGAATTTGAGGGTCATACTCCGTAATACATTTGTTTCTGTACGCT
CTTTTGGCCTCTGTTGATGGTATCTCTTTGTGTATGTGCTGCTCAGTATTCTTTGAACTC
TGGCATCGATATTTTGAGATTTTGGTGCATTAAGATGCAAATGCTCAAAAAGTCAAAATC
TATGTTAATAAAGTTGCAGTATGGAGATGTTTAGATATAAGGATAGGATTTTTAATGAAA
TGTGATTGAAAGCG

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

CO CL7546Contig1 938 2 4 U
GGATCTCCCCTTCCATTATTCGGTCTTATCCTTATCTTCTTCCTTGTTCTATTTCGCTTC
TAATCTCTCTCTCTCTCATAATCATTACATCTTCTTGTCTAACTTCTTGGTATCTTTGAT
CATAGCTTCTGCAAACTCTAGTGTTATTATACATTGACAAAAGATAAATGTCGATGGACG
GAGTTATGAAATGAGAAATCTAAACCAGTTCTCTAGATTCCTTGCTTGTCATTCTGTATC
CGTTGTGATTCTCCACTGGTTTTACGTCTTTTCTTGAATTTTTATTTTATTTTTTCCGCA
AAAAGTATTAACTATAGAACAAGAACATGTCAAACGCAGAGAAGACAAGTTCAGGTTCCG
ACATAGATGAGAAAAAGAGGAAACGCAAGTTGTCAAACCGCGAATCAGCTAGAAGGTCGC
GTTTGAAGAAACAGAAACTAATGCAAGACACCATCAACGAGATCTCGGCTCTCGAGAGAC
GAATCAAAGAGAACAGCGAGAGATGCAAAGTGGCGAGACGGAGGCTAGACTCGCTAGAGT
CTGAAAACGTGGTTTTGAGATCGGAGAAGACGTGGCTTTTGGGATACGTCAGCGATTTAG
AGAACATGATCGCCACGACTACTTTAACGCTGACGCATAGTGGCGGCGATGATGAGAACG
TAAACGCGGAAACAGCAGTTGGATTAGATTGTACGCGTGGACCATGGCAGCATTCTCTAC
AATCAGTTGCGTCCTTCAAAACATGAGCATTGTTTTTTTAAGTTTGTATCTTTTTAGTAT
CGAATTGTTTTCTCTCCTCGATACATTCGAAAAAGGTTACGGAGGTTGTTAATTGTTGAT
GCGTTGTAACACATAAAAGTCGCTCTCAAACATCTATTGGGCTAACTCTATCTGATACCA
GAGAGCTAACATCTTATTCAAACTATTGGATTAAGGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GS46TF U 1
AF RS1GS46JQ C 127
BS 1 702 RS1GS46TF
BS 703 703 RS1GS46JQ
BS 704 759 RS1GS46TF
BS 760 938 RS1GS46JQ

RD RS1GS46TF 759 0 0
GGATCTCCCCTTCCATTATTCGGTCTTATCCTTATCTTCTTCCTTGTTCTATTTCGCTTC
TAATCTCTCTCTCTCTCATAATCATTACATCTTCTTGTCTAACTTCTTGGTATCTTTGAT
CATAGCTTCTGCAAACTCTAGTGTTATTATACATTGACAAAAGATAAATGTCGATGGACG
GAGTTATGAAATGAGAAATCTAAACCAGTTCTCTAGATTCCTTGCTTGTCATTCTGTATC
CGTTGTGATTCTCCACTGGTTTTACGTCTTTTCTTGAATTTTTATTTTATTTTTTCCGCA
AAAAGTATTAACTATAGAACAAGAACATGTCAAACGCAGAGAAGACAAGTTCAGGTTCCG
ACATAGATGAGAAAAAGAGGAAACGCAAGTTGTCAAACCGCGAATCAGCTAGAAGGTCGC
GTTTGAAGAAACAGAAACTAATGCAAGACACCATCAACGAGATCTCGGCTCTCGAGAGAC
GAATCAAAGAGAACAGCGAGAGATGCAAAGTGGCGAGACGGAGGCTAGACTCGCTAGAGT
CTGAAAACGTGGTTTTGAGATCGGAGAAGACGTGGCTTTTGGGATACGTCAGCGATTTAG
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TAAACGCGGAAACAGCAGTTGGATTAGATTGTACGCGTGGAC*ATGGCAGCATTCTCTAC
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TAACATCTTATTCAAACTATTGGATTAAGGGT

QA 1 812 1 812
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AS 0 0

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BM03JQ C 1
AF RS1BM03TF U 1
BS 1 704 RS1BM03TF

RD RS1BM03JQ 704 0 0
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QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1BM03TF 704 0 0
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CAAGATCCGTTGTAGCGCTTGGTTTCTCGCATCGGTTCAGGTCTAAGTATGTCACTGTTG
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TTAAAATTGTGTTGGAATCTTGCTTCTTTGTGGATTCAGTTTGGTATATACAAAAAAACC
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GGACGTTTATATAAAATCTTCCTGCGCTGTTTGTAACAAGTCGCTTTATGTTTGGTTGTT
TAACCGAATCCACATACATCTCTATTGAAGATATGCATTTAATT

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1B033TF C 1
AF RS1B033JQ U 2
BS 1 1 RS1B033TF
BS 2 689 RS1B033JQ

RD RS1B033TF 689 0 0
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QA 1 689 1 689
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CAACAATAACGCCATATATAGCTACAGCTTCGCAAAAGATTACACTGATGAGATTCTTGG
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QA 1 688 1 688
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AS 0 0

AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1GB35TF U 1
AF RS1FW86TF U 179
BS 1 234 RS1GB35TF
BS 235 235 RS1FW86TF
BS 236 267 RS1GB35TF
BS 268 268 RS1FW86TF
BS 269 285 RS1GB35TF
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BS 287 497 RS1GB35TF
BS 498 498 RS1FW86TF
BS 499 547 RS1GB35TF
BS 548 828 RS1FW86TF

RD RS1GB35TF 547 0 0
GGGTGCATATTTTCTTGTTCGTTGACCTGATAACAAAAAGAAAAAAAGGCATCGAAGATG
AATGTTAGGGTTTTGTTTCTGGCTCTCCTTCTCCTTGCATCTCCGCTGCTTCAAGTTGCT
AGATGTCAAGTAGATTCGGAGGATCATTCGAGTATTGTTGACGATGTTGTGGGAGAACAC
AGCGATGCTGGTGCTGAGGAAGATGATCAGGATTTGGATATCAACTTGACCTCTTCTCCT
GGAGTTGAGACTGTCTCTGTTTTCCCCCAAAACAGTGCCAAATTGGTTCCAGCTGGAGAA
GAGACCGAGCTCCTTGTTGCTCTCAAAAACGATGGCAAATCTAGCGTAGGTGTGATGGGG
ATTAGGGCCAGCGTCCATCTTCCTTATGATCATAAGCTCTTGGTTCAGAATCTTACCATG
ATGAGATTCAACAATGCGTCCATCCCAACTTCTGTTCAAGCAACATTCTCTTACATCTTT
GCAGTCAGCCAGTACCTTCAGCCTGGAGCATTTGATCTGATGGGTTATATCATCTACGAC
GTGGAGG

QA 1 547 1 547
DS 

RD RS1FW86TF 650 0 0
G
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TGGTGTTGAGACTGTCTCTGTTTTCCCCAAAAACAGTGCCAAATTGATTCCAGCTGGAGA
AGAGACCGAGCTCCTTGTTGCTCTCAAAAACGATGGCAAATCTAGCGTAGGTGTGATGGG
GATTAGGGCCAGCGTCCATCTTCCTTATGATCATAAGCTCTTGGTTCAGAATCTTACCAT
GATGAGATTCAACAATGCGTCCATCCCAACTTCTGTTCAAGCAACATTCTCTTACATCTT
TGCAGTCAGCCAGTACCTGCAGCCTGGAGCATTTGATCTGGTGGGTTATATCATCTACGA
CGTGGAGGGAAAGGCACACCAGAGTGTCTTCTACAATGGGACCATTGAGGTAGTTGAATC
TGGAGGTCTTCTCAGCGGTGAGTCTGTCTTCCTCGTAACACTTGGGATTGCTCTCCTCCT
CCTCCTCGGTCTATGGGCATACAGCCAAGTGCAGCGTCTCACTAAGAAAACCAAAAAGGT
GTCCAAGGTGGAAGTAGGAACCAGGTCCGTCGACGCATCAATGGACGAGTGGCTCGAGGG
AACTCATTTGGCCAAGATATTGTCCGGGAAATCAAAGAGCAAGAAGAAC

QA 2 650 2 650
DS 



AS 1 2

CO CL7553Contig1 772 2 2 U
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TCTTTGTAGCCTCCCTCCCTCCCTCTCTCTCTCTTTCTCCTTCTCCTGTGTCTTACACAA
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AAGAAAAAACTGGCTATGACCGGAATCCGACACCAGTTACTGCTACTCCTTCGCCGCCGT
CACCGTTTATTTCCTCTGGTCTCTGCCTTCTCCGGCTGTCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTC
TCCTTTTCCTTCCCTCCTGTGATCCATCGCTCACCACCAGGTAGGAAGAATCAAATTGCC
GTGGAACCCAAGCTTCTTGTACCCGAAAATGGAGGAAGATCGGATCGGCACTTATGGAGC
TCGAAATTGTCCAACTCCTACTATGGCTGCAGCAATGCCAGTGACACCTTTCAAGTTTTG
GATAAGACGAGTCAAACAGATCGATATCTACTGATCGCTACGAGCGGAGGGTTAAACCAA
CAGCGAACAGGGATAATAGACGCTGTGGTTGCGGCTTACATCCTAAATGCCACTCTTGTG
ATCCCTAAACTGGACCAAAATTCATACTGGAAGGACACCAGCAACTTCGAAGAAATATTT
GACGTTGATTGGTTCATTACGCATCTCTCCAAAGATGTCAAGATCATCAAGGAGCTCCTA
AAGGAGAGAGTCAAGACTCACTGGCTACAGTCCATTCGTGTTCCCAGGAGTG


BQ
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AF RS1FD41TF U 1
AF RS1GR16TF U 1
BS 1 716 RS1FD41TF
BS 717 772 RS1GR16TF

RD RS1FD41TF 722 0 0
GGATCCTCGGCCTCCTCGTTTTGCACACTCTCCTTTCCATTTCTCTTGTTTTCTTCTTAT
TCTTTGTAGCCTCCCTCCCTCCCTCTCTCTCTCTTTCTCCTTCTCCTGTGTCTTACACAA
TTAATGGCGTCTTTAAATTTGAAGATGAAGAAAAGGGAGAATTATGGCACCGAACCTGAC
AAGAAAAAACTGGCTATGACCGGAATCCGACACCAGTTACTGCTACTCCTTCGCCGCCGT
CACCGTTTATTTCCTCTGGTCTCTGCCTTCTCCGGCTGTCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTC
TCCTTTTCCTTCCCTCCTGTGATCCATCGCTCACCACCAGGTAGGAAGAATCAAATTGCC
GTGGAACCCAAGCTTCTTGTACCCGAAAATGGAGGAAGATCGGATCGGCACTTATGGAGC
TCGAAATTGTCCAACTCCTACTATGGCTGCAGCAATGCCAGTGACACCTTTCAAGTTTTG
GATAAGACGAGTCAAACAGATCGATATCTACTGATCGCTACGAGCGGAGGGTTAAACCAA
CAGCGAACAGGGATAATAGACGCTGTGGTTGCGGCTTACATCCTAAATGCCACTCTTGTG
ATCCCTAAACTGGACCAAAATTCATACTGGAAGGACACCAGCAACTTCGAAGAAATATTT
GACGTTGATTGGTTCATTACGCATCTCTCCAAAGATGTCAAGATCATCAAGGAGCT
TCCTAA

QA 1 716 1 716
DS 

RD RS1GR16TF 772 0 0
GGATCCTCGGCCTCCTCGTTTTGCACACTCTCCTTTCCATTTCTCTTGTTTTCTTCTTAT
TCTTTGTAGCCTCCCTCCCTCCCTCTCTCTCTCTTTCTCCTTCTCCTGTGTCTTACACAA
TTAATGGCGTCTTTAAATTTGAAGATGAAGAAAAGGGAGAATTATGGCACCGAACCTGAC
AAGAAAAAACTGGCTATGACCGGAATCCGACACCAGTTACTGCTACTCCTTCGCCGCCGT
CACCGTTTATTTCCTCTGGTCTCTGCCTTCTCCGGCTGTCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTC
TCCTTTTCCTTCCCTCCTGTGATCCATCGCTCACCACCAGGTAGGAAGAATCAAATTGCC
GTGGAACCCAAGCTTCTTGTACCCGAAAATGGAGGAAGATCGGATCGGCACTTATGGAGC
TCGAAATTGTCCAACTCCTACTATGGCTGCAGCAATGCCAGTGACACCTTTCAAGTTTTG
GATAAGACGAGTCAAACAGATCGATATCTACTGATCGCTACGAGCGGAGGGTTAAACCAA
CAGCGAACAGGGATAATAGACGCTGTGGTTGCGGCTTACATCCTAAATGCCACTCTTGTG
ATCCCTAAACTGGACCAAAATTCATACTGGAAGGACACCAGCAACTTCGAAGAAATATTT
GACGTTGATTGGT*CATTACGCATCTCTCCAAAGATGTCAAGATCATCAAGGAGCTCCTA
AAGGAGAGAGTCAAGACTCACTGGCTACAGTCCATTCGTGTTCCCAGGAGTG

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

CO CL7554Contig1 1335 2 2 U
TTTTTCGACAAGATTTGATCGTCCCAAAAGAAACTACATCTCGGGTGAATCACAAGAAAG
ATGGACAAATTGAAGATAGCTGAATGGGGAGAGAAGCTGAAGACAGGAGGAGCTCAGATG
AGCAGGATGGTGAGCGAGAAGTTCAAAGACATCCTCCAAGCTCCAACTCTGGAATCCAAA
ATGGTCGACGAAGCAACTCTCGAGACTCTCGAGGAGCCCAACTGGGGAATGAACATGAGG
ATATGCGCTCAGATCAACAACCAGGAGTTCAACGCCGTCGAGATCGTCAGAGCCATCAAG
AGGAAGATCTCTGGTAATAATAAAAGCCCCGTGAGCCAGAGGCTGAGCCTTGAGCTTCTC
GAGGCTTGTGCTATGAACTGTGAGAAGATTTTCTCTGAAGTTGCTTCTGAGGGGGTTCTT
GATGAGATGGTTTGGTTGGTTAAGAACGGTGAAGCTGATTCCGAGAACAGGAGCAGAGCT
TTTCAGCTTATTAGAGCTTGGGGACGGTCTAAAGATCTTGCTTATCTTCCTGTTTTCAAG
CAGACTTATATGAGCTTGGAGGGAGAGAAAGGTTTGAACGCTCGTAACGAGGAGAATCCA
GTGGCGGGACAGAGTTCTCTGGAGTCTCTCATGCAACGGCCTCTTCCAGTTCCTCCACCT
GGTAGCTATCCGGTTCCTCCTAATCAAGAACAGGCTCGTGGAGACCATGATGGTGGTCTT
CTTGACTATAACTTTGGGAACTTATCGATCAAGGATAAGAAAGAACAGATTGAGATTACG
CGGAACAGCCTCGAGTTGCTCTCTAGCATGTTGAACACTGATGGAAAGCCGAATCACACA
GAGGACGAGCTAACAGTAAGCCTGATGGAGAAATGCAAGCAGTCACAACCGTTGATTCAA
ATGATCATAGAGAGCACAACAGACGATGAGAGTGTCCTTTTTGAGGCTTTGCATTTCAAC
GATGAGCTCCAACGCGTTCTATCTATGTACGAGAAGGCTGATGGAACTGAGAAGAAGGCG
TTGTCCATGGTGGACCAAGAATCATCAGGAAGCAAAGATGCTGGTGGTCCGAAACCAACA
GAAGAACATCTTGTGAAACAAAAGGATGAACATCATCCAGAATCACCAGGATCCTCCAAC
AAGACTGGTAAAGAAGATAAGCAAGTGAAAATAGAACTCGGGTTATCCAGTGATGAAGAT
GAGAAATGAGCAAGTCTAATGTTTGTCTTCTTACGTCATGGTTATCAGAATGTTGTAGAA
GATTTAACTGTTCTTTTGATGTTTACTTTTGCAATGTACTTTTTACTATATGTTTATGGA
ACCTTTCTTAGCTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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BS 1 785 RS1CO06TF
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GAGGCTTGTGCTATGAACTGTGAGAAGATTTTCTCTGAAGTTGCTTCTGAGGGGGTTCTT
GATGAGATGGTTTGGTTGGTTAAGAACGGTGAAGCTGATTCCGAGAACAGGAGCAGAGCT
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GGTAGCTATCCGGTTCCTCCTAATCAAGAACAGGCTCGTGGAGACCATGATGGTGGTCTT
CTTGACTATAACTTTGGGAACTTATCGATCAAGGATAAGAAAGAACAGATTGAGATTACG
CGGAA

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GACAGAGTTCTCTGGAGTCTCTCATGCAACGGCCTCTTCCAGTTCCTCCACCTGGTAGCT
ATCCGGTTCCTCCTAATCAAGAACAGGCTCGTGGAGACCATGATGGTGGTCTTCTTGACT
ATAACTTTGGGAACTTATCGATCAAGGATAAGAAAGAACAGATTGAGATTACGCGGAACA
GCCTCGAGTTGCTCTCTAGCATGTTGAACACTGATGGAAAGCCGAATCACACAGAGGACG
AGCTAACAGTAAGCCTGATGGAGAAATGCAAGCAGTCACAACCGTTGATTCAAATGATCA
TAGAGAGCACAACAGACGATGAGAGTGTCCTTTTTGAGGCTTTGCATTTCAACGATGAGC
TCCAACGCGTTCTATCTATGTACGAGAAGGCTGATGGAACTGAGAAGAAGGCGTTGTCCA
TGGTGGACCAAGAATCATCAGGAAGCAAAGATGCTGGTGGTCCGAAACCAACAGAAGAAC
ATCTTGTGAAACAAAAGGATGAACATCATCCAGAATCACCAGGATCCTCCAACAAGACTG
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GAGCAAGTCTAATGTTTGTCTTCTTACGTCATGGTTATCAGAATGTTGTAGAAGATTTAA
CTGTTCTTTTGATGTTTACTTTTGCAATGTACTTTTTACTATATGTTTATGGAACCTTTC
TTAGCTCG

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 2

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CGCTTCTTCACTTTCCTCTCTCTCTCCCTCTCTGAAACAAAGAAAAACGAGATTCAAGAC
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GGCGGAAGAAGGCGATGGACAGACTTTGGAGGCTAGAGAAGAAAGAGATAGGAAGAAGAA
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TTGTAGATACGATACATCATCCTTGTGTTCTGTTGTTTGGTTTGGAAATATGGTCACCTC
GTCAACGGCAAAGGGAGTCTCTGCTTCTGAAGTCTGGTTGCTGCAAACCCTCGGAACAAT
GCCAATTTACTTACATAAGTGCCACAAACTGGACCAAGACGGCTGGACCATATGCTAATC
CAGACTGCCAAAGCTGGGACAACGCACCAAACAAGCTCTGCTTCGATTGCCAATCTTGCA
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AGAGATTCGTTCACTGTTCTTTATGACACGCAGTGCTGGAGTTTGCTTTTATGTTTTTAT
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TAGTGTGTTCTGGCTAAACCATGATATTGTTTAATTATATGT


BQ
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AF RS1FS49TF U 1
AF RS1FS49JQ C 233
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CGCTTCTTCACTTTCCTCTCTCTCTCCCTCTCTGAAACAAAGAAAAACGAGATTCAAGAC
CAAGGCTAGATCCGAAGAAGCATGTCTCTCGCCACCGACGCCGTATTAGAAGAAGCATGG
CTCACGATCCAAGCTATTCAAGAACAGAACATAACTATGTTCTCTGTTTTTTTTCTGTGT
TTAAGAAACGAGAGGAATAAGAAGAAGAAGATAGCTTGAGAAGGACAGGCTTGGAATCAT
GGCGGAAGAAGGCGATGGACAGACTTTGGAGGCTAGAGAAGAAAGAGATAGGAAGAAGAA
GAAGACGGCCTAGTGTTTAGGTTTTGGAAACGAGAAGGGGCAAAGGTGTAGTTTGAAAGA
TTGTAGATACGATACATCATCCTTGTGTTCTGTTGTTTGGTTTGGAAATATGGTCACCTC
GTCAACGGCAAAGGGAGTCTCTGCTTCTGAAGTCTGGTTGCTGCAAACCCTCGGAACAAT
GCCAATTTACTTACATAAGTGCCACAAACTGGACCAAGACGGCTGGACCATATGCTAATC
CAGACTGCCAAAGCTGGGACAACGCACCAAACAAGCTCTGCTTCGATTGCCAATCTTGCA
AG*CGGGTCTTCTCGACAACGTCAAGAGCGCATGGAAGAAAGTTGCAGTAGTGAACATCA
TCGTCCTTGTCTTCCTTATCAT*GTCTACTCTGT

QA 1 754 1 754
DS 

RD RS1FS49JQ 770 0 0
TTCTGTGTTTAAGAAACGAGAGGAATAAGAAGAAGAAGATAGCTTGAGAAGGACAGGCTT
GGAATCATGGCGGAAGAAGGCGATGGACAGACTTTGGAGGCTAGAGAAGAAAGAGATAGG
AAGAAGAAGAAGACGGCCTAGTGTTTAGGTTTTGGAAACGAGAAGGGGCAAAGGTGTAGT
TTGAAAGATTGTAGATACGATACATCATCCTTGTGTTCTGTTGTTTGGTTTGGAAATATG
GTCACCTCGTCAACGGCAAAGGGAGTCTCTGCTTCTGAAGTCTGGTTGCTGCAAACCCTC
GGAACAATGCCAATTTACTTACATAAGTGCCACAAACTGGACCAAGACGGCTGGACCATA
TGCTAATCCAGACTGCCAAAGCTGGGACAACGCACCAAACAAGCTCTGCTTCGATTGCCA
ATCTTGCAAGGCGGGTCTTCTCGACAACGTCAAGAGCGCATGGAAGAAAGTTGCAGTAGT
GAACATCATCGTCCTTGTCTTCCTTATCATTGTCTACTCTGTTGGTTGCTGTGCTTTTAG
GAACAACAAGAGAGATGACAGTTATGGCTATGGATATAAGCCTTGAAGGCTTTTGAGTGT
TTTAGAACAGAGATTCGTTCACTGTTCTTTATGACACGCAGTGCTGGAGTTTGCTTTTAT
GTTTTTATGGATTTAACATCTTGGTGTTTTGAGACCTATTGCTTGTACAGCTCTCTTATG
ATACTTGTTAGTGTGTTCTGGCTAAACCATGATATTGTTTAATTATATGT

QA 1 770 1 770
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7557Contig1 1134 2 8 U
GGTCTTCAAGCAGACCTCGAAGAATTCCTCTGAAACTCCGAGTCTTCGGTCTGAATCAAG
CTGGAATAGCCAGAGCTTGTTGCTTCAGAACAAATTGGAGAACAATAAGAAGAAGAAGAG
CCACATCAACAGCTCTAGCTGCAACAGTTACTTGCAGGAGAAGGATGTTAGTAGCAACCA
AAAGGTGAGTAGCAACAACAAGAAGGGCTTTCTCGTGAATCTTGGCTACAAAGGCGTTTG
CTCTAACTGGAATGCAGTGGATGTCGTCGTCGCAGACGAGAAGAGAAGAGCCTCTGGTCT
GAAGAAGATCAAGACGCAGTTGAGTTTCTCTGGAGATCTTACCTCGGAGATGAAGCTTCA
TAAGCAGCAACAACAACAAGCAACGTTAGAGCAGAGGAAGTCTCTGGAGATATTTGGATC
TCCTCTTATTGAGAAGAGAATCATTTCCAAGAACGTTCCATGGGAATACTCAACCTCTGC
AAAGCATGAGGAAGAAGTAGAAGAGGAAGATGGGAGTGTGAGCGATTTAAGTTCAGATCT
ATTTGAGATTGAGAGTGTAACAGGGAAGACAAAACCATATCTTGCAAGGCAAGAAAGCAG
CGATGCAGAGTCACCGGATTGTTATGCGCCAAGTGAGGTAAGCATAGCTTGGAGTGCAGT
GACAGCTAGTGTTGCGGATTACCCTGTTATGTCTGAATGTGCTACGAGTCCTGTCAAGAA
CCGGTCTTTCCAGATCCCTCGAATCCCTATAACCGCCAAATCAAACCGAGAAAACGAGCC
TCAGAGACAGAAACCGAGAAGTGGTGGTGGTTTATTGTTGGGCTGCAAGAGTCACAAAGC
TGTCAGAGTGTCAGGTGATTCGTACACAAACGTGAACAGAACACCGAGTTATGTTCCAAG
GTTCCCTCTAGAAGCTAATCCAACAAGTATCGAGACAAGGAGGAAAGTAAGCAGCAGTTC
CGTTTCCCGCACGCAATCTCCTTTTCTGTATATTTAATGATGCCCTAAAACCCTGAGCGC
CTTTCTCTTTACATGTAATGTTCATTGAGTGAAAAAGATTTGTTTTACTAATACTATATT
CAAATGTATTATCGTGTGATCCTAGAACTCATTTTTCATCAATCAGAAGACTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BO53TF U 1
AF RS1BO53JQ C 360
BS 1 679 RS1BO53TF
BS 680 680 RS1BO53JQ
BS 681 696 RS1BO53TF
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BS 712 729 RS1BO53TF
BS 730 1134 RS1BO53JQ

RD RS1BO53TF 729 0 0
GGTCTTCAAGCAGACCTCGAAGAATTCCTCTGAAACTCCGAGTCTTCGGTCTGAATCAAG
CTGGAATAGCCAGAGCTTGTTGCTTCAGAACAAATTGGAGAACAATAAGAAGAAGAAGAG
CCACATCAACAGCTCTAGCTGCAACAGTTACTTGCAGGAGAAGGATGTTAGTAGCAACCA
AAAGGTGAGTAGCAACAACAAGAAGGGCTTTCTCGTGAATCTTGGCTACAAAGGCGTTTG
CTCTAACTGGAATGCAGTGGATGTCGTCGTCGCAGACGAGAAGAGAAGAGCCTCTGGTCT
GAAGAAGATCAAGACGCAGTTGAGTTTCTCTGGAGATCTTACCTCGGAGATGAAGCTTCA
TAAGCAGCAACAACAACAAGCAACGTTAGAGCAGAGGAAGTCTCTGGAGATATTTGGATC
TCCTCTTATTGAGAAGAGAATCATTTCCAAGAACGTTCCATGGGAATACTCAACCTCTGC
AAAGCATGAGGAAGAAGTAGAAGAGGAAGATGGGAGTGTGAGCGATTTAAGTTCAGATCT
ATTTGAGATTGAGAGTGTAACAGGGAAGACAAAACCATATCTTGCAAGGCAAGAAAGCAG
CGATGCAGAGTCACCGGATTGTTATGCGCCAAGTGAGGTAAGCATAGCTTGGAGTGCAGT
GACAGCTAGTGTTGCGGAT*ACCCTGTTATGTCTGA*TGTGCTACGAGTC*TGTCAAGAA
CCGGTCTTT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RS1BO53JQ 775 0 0
ATAAGCAGCAACAACAACAAGCAACGTTAGAGCAGAGGAAGTCTCTGGAGATATTTGGAT
CTCCTCTTATTGAGAAGAGAATCATTTCCAAGAACGTTCCATGGGAATACTCAACCTCTG
CAAAGCATGAGGAAGAAGTAGAAGAGGAAGATGGGAGTGTGAGCGATTTAAGTTCAGATC
TATTTGAGATTGAGAGTGTAACAGGGAAGACAAAACCATATCTTGCAAGGCAAGAAAGCA
GCGATGCAGAGTCACCGGATTGTTATGCGCCAAGTGAGGTAAGCATAGCTTGGAGTGCAG
TGACAGCTAGTGTTGCGGATTACCCTGTTATGTCTGAATGTGCTACGAGTCCTGTCAAGA
ACCGGTCTTTCCAGATCCCTCGAATCCCTATAACCGCCAAATCAAACCGAGAAAACGAGC
CTCAGAGACAGAAACCGAGAAGTGGTGGTGGTTTATTGTTGGGCTGCAAGAGTCACAAAG
CTGTCAGAGTGTCAGGTGATTCGTACACAAACGTGAACAGAACACCGAGTTATGTTCCAA
GGTTCCCTCTAGAAGCTAATCCAACAAGTATCGAGACAAGGAGGAAAGTAAGCAGCAGTT
CCGTTTCCCGCACGCAATCTCCTTTTCTGTATATTTAATGATGCCCTAAAACCCTGAGCG
CCTTTCTCTTTACATGTAATGTTCATTGAGTGAAAAAGATTTGTTTTACTAATACTATAT
TCAAATGTATTATCGTGTGATCCTAGAACTCATTTTTCATCAATCAGAAGACTAC

QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

CO CL7558Contig1 863 2 2 U
GGGAAACGCGTCGAGACCTTTCCCCCAAATTCAAATAAAAACCCTAATTATCTAATTGGA
ATCTCCACCGATAGATCTGAATCGATTTTCAACATGGGCAACACAGACAAGCTGATGAAT
CAGATATTCGACCTGAAGTTCACGTCCAAGTCTCTCCAGAGGCAGTCGAGGAAGTGCGAG
AAGGAGGAGAAGGCAGAGAAGCTCAAGGTTAAGAAGGCGATCGAGAAGGGGAACATGGAC
GGTGCTCGGATCTACGCCGAGAACGCGATCCGCAAGCGTAGCGAGCAGATGAACTACCTC
CGCCTCGCTTCTCGCCTCGACGCTGTTGTGGCTCGCTTGGACACTCAGGCCAAGATGGCG
ACCATCACCAAATCGATGACTAACATCGTCAAGTCCCTTGAGTCTTCCCTTGCCACAGGC
AACCTACAGAAGATGTCAGAGACGATGGATTCATTTGAGAAGCAGTTTGTGAACATGGAG
GTGCAAGCCGAGTTCATGGAGAACGCAATGGCTGGTTCGACATCATTGTCAACTCCGGAA
GGCGACGTAAACAACCTGATGCAGCAGGTGGCAGATGACTACGGTCTTGAAGTCTCTGTT
GGACTTCCTCACGCTGCTGGCCACACCATCCCTACTGCTACAGAGGAGAAAGTCGATGAG
GATGATCTGTCAAGGAGGCTTGCAGAACTCAAGGCCAGAGGATGAACTATCTGCCACTTA
CGACGAGATCCTTATCGAAATGTTGCTACTATTATCTGCGAACACTGACGCATTTGTGTA
TATTGCTCACTTTTGAGACTTGCTTTGTTTACTAACTTCAATGATATGAGTTTGTGCAGC
AATAAAGTAACATCCTTATCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AZ36TF U 1
AF RS1AZ36JQ C 47
BS 1 651 RS1AZ36TF
BS 652 863 RS1AZ36JQ

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AAGGAGGAGAAGGCAGAGAAGCTCAAGGTTAAGAAGGCGATCGAGAAGGGGAACATGGAC
GGTGCTCGGATCTACGCCGAGAACGCGATCCGCAAGCGTAGCGAGCAGATGAACTACCTC
CGCCTCGCTTCTCGCCTCGACGCTGTTGTGGCTCGCTTGGACACTCAGGCCAAGATGGCG
ACCATCACCAAATCGATGACTAACATCGTCAAGTCCCTTGAGTCTTCCCTTGCCACAGGC
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GTGCAAGCCGAGTTCATGGAGAACGCAATGGCTGGTTCGACATCATTGTCAACTCCGGAA
GGCGACGTAAACAACCTGATGCAGCAGGTGGCAGATGACTACGGTCTTGAAGTCTCTGTT
GGACTTCCTCACGCTGCTGGCCACACCATCCCTACTGCTACAGAGGAGAAA

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DS 

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AGGGGAACATGGACGGTGCTCGGATCTACGCCGAGAACGCGATCCGCAAGCGTAGCGAGC
AGATGAACTACCTCCGCCTCGCTTCTCGCCTCGACGCTGTTGTGGCTCGCTTGGACACTC
AGGCCAAGATGGCGACCATCACCAAATCGATGACTAACATCGTCAAGTCCCTTGAGTCTT
CCCTTGCCACAGGCAACCTACAGAAGATGTCAGAGACGATGGATTCATTTGAGAAGCAGT
TTGTGAACATGGAGGTGCAAGCCGAGTTCATGGAGAACGCAATGGCTGGTTCGACATCAT
TGTCAACTCCGGAAGGCGACGTAAACAACCTGATGCAGCAGGTGGCAGATGACTACGGTC
TTGAAGTCTCTGTTGGACTTCCTCAGGCTGCTGGCCACACCATCCCTACTGCTACAGAGG
AGAAAGTCGATGAGGATGATCTGTCAAGGAGGCTTGCAGAACTCAAGGCCAGAGGATGAA
CTATCTGCCACTTACGACGAGATCCTTATCGAAATGTTGCTACTATTATCTGCGAACACT
GACGCATTTGTGTATATTGCTCACTTTTGAGACTTGCTTTGTTTACTAACTTCAATGATA
TGAGTTTGTGCAGCAATAAAGTAACATCCTTATCTAC

QA 1 817 1 817
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TAGTGAGAAAGAGTGAGCTCAGTGTTCTTCACTATGTCTCAAGAGAGACCTGACGAAGAG
AAACCAGAGACTTGCGATATTCGAGTCCAAGATCGGATCCAAGGAGCAGCTAGTCCGGTT
CAGTCACCGACCCGACTCGGCCCAACCCGGTTCTCTGAAGTAGCTGGAGAGAAAATCCGG
AATACCGGGTCGGATTTGATAGGATCGATTTGGTCTTGGATCAACGGCGACCCGAACCGG
AATCTGAAAAATCCGGTTAAGAGAGGGAAGAGGAAGAGAATCAGAACGGCGAAAACCGCC
GTGGGAGTAATCGCGCTTGTGGGCTTCTTCATTTTTGTTAATTGGTTTATGCTCTCTCAG
CTCCACGAAGGTCGAGCTTGGCTTCGAAGAGGGTTCTCAAAGAACCGGAATCCAAAACCG
AATCCGAAACCAAACCCGGATCTAAGCCCGAGTACCAAACGGGTATCTGTTAAAGTGTCG
GCTGCGTCGGTACAGCACGTAGAGAAGAAAAAGATGGGGAAACCAAAGAAGAAATACAAT
GGAACATATGGTAGATTGTTGGCTTATGCTGCTCATGCATTAGCTGAGGGACAAAACAAA
ATTGAGCCAAAAGAGTTGTGGCGAGAACCAAAAGACCAAGCTTTGGCTTGGGAAGCCTTG
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CTCACGCTACACTCGTGTCCCAAGTTATGTTCAGCGATGTCTGACGATTCAGTCAGTTTG
AGATATCTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AM77TF U 1
AF RS1A654TF U 22
BS 1 233 RS1AM77TF
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AATACCGGGTCGGATTTGATAGGATCGATTTGGTCTTGGATCAACGGCGACCCGAACCGG
AATCTGAAAAATCCGGTTAAGAGAGGGAAGAGGAAGAGAATCAGAACGGCGAAAACCGCC
GTGGGAGTAATCGCGCTTGTGGGCTTCTTCATTTTTTTTAATTGGTTTATGCTCTCTCAG
CTCCACGAAGGTCGAGCTTGGCTTCGAAGAGGGTTCTCAAAGAACCGGAATCCAAAACCG
AATCCGAAACCAAACCCGGATCTAAGCCCGAGTACCAAACGGGTATCTGTTAAAGTGTCG
GCTGCGTCGGTACAGCACGTAGAGAAGAAAAAGATGGGGAAACCAAAGAAGAAATACAAT
GGAACATATGGTAGATTGTTGGCTTATGCTGCTCATGCATTAGCTGAGGGACAAAACAAA
ATTGAGCCAAAAGAGTTGTGGCGAGAACCAAA*GACCAAGCTTTGGCTTGGGAAGCCTTG
CGCTGATCAACGTTCTTGGAAGCCCAACGATGGGAAGA

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DS 

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GG
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AACCCGGTTCTCTGAAGTAGCTGGAGAGAAAATCCGGAATACCGGGTCGGATTTGATAGG
ATCGATTTGGTCTTGGATCAACGGCGACCCGAACCGGAATCTGAAAAATCCGGTTAAGAG
AGGGAAGAGGAAGAGAATCAGAACGGCGAAAACCGCCGTGGGAGTAATCGCGCTTGTGGG
CTTCTTCATTTTTGTTAATTGGTT*ATGCTCTCTCAGCTCCACGAAGGTCGAGCTTGGCT
TCGAAGAGGGTTCTCAAAGAACCGGAATCCAAAACCGAATCCGAAACCAAACCCGGATCT
AAGCCCGAGTACCAAACGGGTATCTGTTAAAGTGTCGGCTGCGTCGGTACAGCACGTAGA
GAAGAAAAAGATGGGGAAACCAAAGAAGAAATACAATGGAACATATGGTAGATTGTTGGC
TTATGCTGCTCATGCATTAGCTGAGGGACAAAACAAAATTGAGCCAAAAGAGTTGTGGCG
AGAACCAAAAGACCAAGCTTTGGCTTGG*AAGCCTTGCGCTGATCAACGTTCTTGGAAGC
CCAACGATGGGAAGAATGGATATATAATGGTAACTGCAAATGGAGGGATCAATCAACAGA
GAGTTGCTGTTTGTAACATTGTTGTTGTTGCTCGGTACTCACGCTACACTCGTGTCCCAA
GTTATGTTCAGCGATGTCTGACGATTCAGTCAGTTTGAGATATCTA

QA 3 888 3 888
DS 



AS 1 2

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TAGGGTGTTGTATGACATCTTGATCCAAGCTGGGAGAGTAATCGATCTACACATCCCTCG
CGATAAAGAAACCGATAAACCAAAAGGCTTCGCGTTCGCAGAGTATGAGACTGAAGAGAT
CGCCGATTACGCCGTCAAGCTCTTCTCCGGTCTTGTCTCTCTCTACAATCGAACTCTCAA
ATTCGCCGTAAGTCCTCTCCTCCCTCCTTTCTTTGACTTTGTGGTGGTGCTGATTTTGGC
TTGGTTGGGTTTTAGATATCTGGACAAGACAAAGCACAGTCAGGTTCCGGTCACAGGACA
AGACCTCAGTCTCTGAGTTTCGATCATCACCATTCGGAGAGATTCTCATCACAGTTGATG
TCTTCACCTTCTCCTATGCCTCTTGCTTACACTCAAGAGCCACCTCCGCCAGGGGTTTCA
AATAGAGCCGGTTTGGAGTACAGTAGAAGGGTTCTGAGTTCGGCACTAGATATTAACCCG
TCAAGACCGGGCCGCTACTGAACTAGTGTGAGAACACCACTTTTCTTTGCTTTTTGTTGT
TGTGATAAATTAATATGATAATCAGTGTGTCTCTTGATTCATCCTGAAAAGAAAGAAAGA
AAGAACTCGTGATTGCAATCATCCAAGGAAGTTTAGTAGAACTGATGTAACCTTGTTTTT
TTATTAAAAA


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BH40TF U 1
AF RS1BH40JQ C 9
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TTGGTTGGGTTTTAGATATCTGGACAAGACAAAGCACAGTCAGGTTCCGGTCACAGGACA
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AATAGAGCCGGTTTGGAGTACAGTAGAAGGGTTCTGAGTTCGGCACTAGATATTAACCCG
TCAAGACCGGGCCGCTACTGAACTAGTGTGAGAACACCACTTTTCTTTGCTTTTTGTTGT
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AAGAACTCGTGATTGCA*TCATCCAAGGA
G

QA 1 749 1 749
DS 

RD RS1BH40JQ 782 0 0
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AAACCGATAAACCAAAAGGCTTCGCGTTCGCAGAGTATGAGACTGAAGAGATCGCCGATT
ACGCCGTCAAGCTCTTCTCCGGTCTTGTCTCTCTCTACAATCGAACTCTCAAATTCGCCG
TAAGTCCTCTCCTCCCTCCTTTCTTTGACTTTGTGGTGGTGCTGATTTTGGCTTGGTTGG
GTTTTAGATATCTGGACAAGACAAAGCACAGTCAGGTTCCGGTCACAGGACAAGACCTCA
GTCTCTGAGTTTCGATCATCACCATTCGGAGAGATTCTCATCACAGTTGATGTCTTCACC
TTCTCCTATGCCTCTTGCTTACACTCAAGAGCCACCTCCGCCAGGGGTTTCAAATAGAGC
CGGTTTGGAGTACAGTAGAAGGGTTCTGAGTTCGGCACTAGATATTAACCCGTCAAGACC
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GTGATTGCAATCATCCAAGGAAGTTTAGTAGAACTGATGTAACCTTGTTTTTTTATTAAA
AA

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1EO77JQ U 1
AF RS1FJ62JQ U 6
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BS 134 209 RS1EO77JQ
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BS 211 568 RS1EO77JQ

RD RS1EO77JQ 568 0 0
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CCAACACTTGTTTAGCCTTGCTTATGTCTGGCTTCCTCTGTCTTGGATCGTCCGGTGTGT
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QA 1 568 1 568
DS 

RD RS1FJ62JQ 550 0 0
GG
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GATAAGTC

QA 3 550 3 550
DS 



AS 1 2

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TTATCTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AA25TF U 1
AF RS1AA25JQ C 1
BS 1 651 RS1AA25TF
BS 652 848 RS1AA25JQ

RD RS1AA25TF 651 0 0
GGAATAATACTTGTTTGTATCTACGGGGGAGAAAGCTTTGGTTTCTGTGCTCACATTCTA
GGATCTTCTAAGCGAGGGCAACAGATCAGCGCCTTCGAGTGATGGCTACAGGAGAGGAGA
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TCTTTCTTAGGGTTCTGTTTCTATGGAGAGATGATTTTGTGGCTTTTTTTTGTTTGGTTC
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TGTCGAGAAAGCCAAAGCACTCTGTCAGAGCAAGTCGGTTCATGGCGCAATGATAGAAGT
TTTTGAAGGCGATGCAAGGAATATCCTGTGCGAGGTTGTTGATAAACACCGTGCTTCTCT
TCTCGTTGTTGGAAGCCATGGTTATGGAGCTATCAAGAGGGCGGTTCTCGGTAGCGTCAG
TGATTACTGTGCTCACCATGCTCATTGCTCGGTGATGATCGTGAAGAAGCC

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1AA25JQ 848 0 0
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TCTCGTTGTTGGAAGCCATGGTTATGGAGCTATCAAGAGGGCGGTTCTCGGTAGCGTCAG
TGATTACTGTGCTCACCATGCTCATTGCTCGGTGATGATCGTGAAGAAGCCTAAGATCAA
GGTCTGAAACAATTGTCTCACTCAAAGCATTCTCAGTCTCGGTGAGAAGTGAAATAATGT
TAGCTTCCATGTGTGAAGTGATCCAAGACAATCCATTTATATGTGTAATTGTGTTATACA
TTGTGCTCTTGTTTTAGTATACCTCCTAAACTATAACTTCATGTTTAATAATATCGTGGG
TTATCTTT

QA 1 848 1 848
DS 



AS 1 2

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AAATTGCGGTGCATCAACCACCATGAAGGTTGTCAAAAAGAATTGTCTTGGAAAACACAT
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1H150JQB C 1
AF RS1H150TF U 1
BS 1 531 RS1H150TF

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QA 1 531 1 531
DS 

RD RS1H150TF 531 0 0
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TCAAACTGCTTACACTCACTATGGCAAAGACATGGGTAAGGAATATATTATGTGTACAGA
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AAAAATCAATTTTGCTGATTATGGTAATCCTTCCGGTAAATGTGAACACTATAAACACGG
AAATTGCGGTGCATCAACCACCATGAAGGTTGTCAAAAAGAATTGTCTTGGAAAACACAT
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QA 1 531 1 531
DS 



AS 1 2

CO CL7565Contig1 921 2 2 U
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F961TF U 1
AF RS1F961JQ C 182
BS 1 642 RS1F961TF
BS 643 921 RS1F961JQ

RD RS1F961TF 642 0 0
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CTTTGGGAGTTCGATTGATCTTAAGAGCCATTGGGCTAGACATGGGACTAACAAGTTCGT
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QA 1 642 1 642
DS 

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AACGGAGTGAACATGGACATCTCGGGTCTACCTGTACCGGTCTGCACTTGCACTGGAGCT
CCTCAGCAGTGTTACCGTTGGGGCTGTGGAGGCTGGCAGTCTGCGTGTTGCACCACAAAC
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AAGATGAGTCAAGGCGCGTTTAAGAAGGTGCTTGAGAAACTTGCTTCTGATGGGTTTAAC
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ACGATCAGATGAGTTAGTTTCTTCTTTTCAATTAGTAAAAAGAAGGAAAAAAAGAGACGT
ATCTCTTCCGGGACTGAGGTCTCTCAGTGATCGTGTGTATACTATAACGAAAACTCTGAT
GTCTTTGACCTTTTGAGTTCTGTCTACAATCTGAGTTTGCAGGTGACCACCATTTGCTGG
AGTCTGTATGTTTGTCTGAGGGAAGAAGGTGACTGAGAAATGAAGTTTGATTTTTTCCCT
CCTTTTGTTATCCTTATAAAACATTTACTGACTTGTAAGTTGTAACAGATATTCTTTTAA
TTAAAATGTTTTTATTTCTC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

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AATCAAATGCAGCATCTGCTGCATCACTGTCGGCGGCACCTGATAATGTGGATCGTACGG
CATTGGAGAAGGAGTCGGTGTAAGAGATTAACTCATCAGCGAATGTTTCCTTCTCTACAC
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TCTCTCCCATCACTCGGTTATTGTGCTCTAATGCAGGCACCTTGTTAGCCGGGTACACTT
TCTCCTTGTACCAAGCAGGTCTGTTCTTGAGATCAATTGGTACAAGTTCTATCTTGTCTT
GCAAACCCTTGTAGTTCCGAGCAATCCACGCACGTTGCGCAAATGGGCAAGAGTAAGATA
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GAACACGACTTGACTTTATAACAGCCGACACTGGCTTGGTTCTGCGTGTTCCGTTTGATT
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GAGATGAGGAAGGGAGAGAAACATCCCTCGAGGATAACGCAAGCGATGGATATGAGCACA
CGCTAACTCTCACTCCTAAACTCATACTCGATCCTTTTTTCCGTTCGTTTTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BY03JQ U 9
AF RS1BY03TF C 1
BS 1 8 RS1BY03TF
BS 9 728 RS1BY03JQ
BS 729 836 RS1BY03TF

RD RS1BY03JQ 720 0 0
ATATGCAATATCAACCTGTGTGTATTAATCATTCACCATTTTAGACTCAAACATCAGATA
TAGCTGATATGAGTAGAAGAAACTGAAGAAGATAAAAGGACAAATAATACCAAACTAAAT
AGGCCGAGGAAGAAAGGCCCTTGTTTGAATTTGGAAAGAGCCTGCTCAATGCAATCAAAT
GCAGCATCTGCTGCATCACTGTCGGCGGCACCTGATAATGTGGATCGTACGGCATTGGAG
AAGGAGTCGGTGTAAGAGATTAACTCATCAGCGAATGTTTCCTTCTCTACACTAGTGGGT
GCAAGTGAAGGCCCTTCGAAATTGGTGTCGATGTACTTAATCAGGTCAAGGCTCTCTCCC
ATCACTCGGTTATTGTGCTCTAATGCAGGCACCTTGTTAGCCGGGTACACTTTCTCCTTG
TACCAAGCAGGTCTGTTCTTGAGATCAATTGGTACAAGTTCTATCTTGTCTTGCAAACCC
TTGTAGTTCCGAGCAATCCACGCACGTTGCGCAAATGGGCAAGAGTAAGATATGTACAAC
CTTGTCGAGCCATCGAACACTTGAATTGGTTCCGAAGAGGAATCAATCTCCGGAACACGA
CTTGACTTTATAACAGCCGACACTGGCTTGGTTCTGCGTGTTCCGTTTGATTTACAACGT
AGCTTCAGGTCAGTATCGAAGCTTGATCGGTGAATTTTCTGACCAAAGTAGAGAGATGAG

QA 1 720 1 720
DS 

RD RS1BY03TF 836 0 0
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ATCAGATATAGCTGATATGAGTAGAAGAAACTGAAGAAGATAAAAGGACAAATAATACCA
AACTAAATAGGCCGAGGAAGAAAGGCCCTTGTTTGAATTTGGAAAGAGCCTGCTCAATGC
AATCAAATGCAGCATCTGCTGCATCACTGTCGGCGGCACCTGATAATGTGGATCGTACGG
CATTGGAGAAGGAGTCGGTGTAAGAGATTAACTCATCAGCGAATGTTTCCTTCTCTACAC
TAGTGGGTGCAAGTGAAGGCCCTTCGAAATTGGTGTCGATGTACTTAATCAGGTCAAGGC
TCTCTCCCATCACTCGGTTATTGTGCTCTAATGCAGGCACCTTGTTAGCCGGGTACACTT
TCTCCTTGTACCAAGCAGGTCTGTTCTTGAGATCAATTGGTACAAGTTCTATCTTGTCTT
GCAAACCCTTGTAGTTCCGAGCAATCCACGCACGTTGCGCAAATGGGCAAGAGTAAGATA
TGTACAACCTTGTCGAGCCATCGAACACTTGAATTGGTTCCGAAGAGGAATCAATCTCCG
GAACACGACTTGACTTTATAACAGCCGACACTGGCTTGGTTCTGCGTGTTCCGTTTGATT
TACAACGTAGCTTCAGGTCAGTATCGAAGCTTGATCGGTGAATTTTCTGACCAAAGTAGA
GAGATGAGGAAGGGAGAGAAACATCCCTCGAGGATAACGCAAGCGATGGATATGAGCACA
CGCTAACTCTCACTCCTAAACTCATACTCGATCCTTTTTTCCGTTCGTTTTCTCCC

QA 1 836 1 836
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TTTGTCCTCGCAAGAACAGCTCAAGGAGATCGCTATTGGTTTAGAGAGAAGCGAGCAGAG
GTTCTTGTGGGTGGTCCGTAATCCACCGGAGCTACAAAACCAAACCGAACCGGGCTTGAC
GTCTCTCTTACCGGAAGGGTTTCTAAACCGAACCGGAAACAGGGGAATGGTGGTTAAATC
GTGGGCTCCGCAAGTTCCGGTTCTGAACCATAGAGCAATCGGCGGGTTCGTTACTCACTG
CGGCTGGAACTCCATTCTTGAAGGTGTTTGCGCGGGTGTACCGATGGTGGCTTGGCCGTT
GTATGCTGAGCAGAGGTTTAACAGAGTGGTGATTGTGGATGAGATCAAGATTGCTATTTC
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GGTAGTGGAGGAGGGTCCGGTTAGGGAGAGAACCAAGGCCATGAAGAATGCGGCTGAATC
AGCCTTGGTCGAAACCGGTTCGTCTAGTCACGCGTTGACTGCTTTACTCCAGTCGTGGAG
TTCAAAACAAGCTTAGACTCTGCGTCAGTTAAGTTTTGTGATAAGAAAGCACTTGGTTCG
AATAAGGTAAAGTGTGTGTGACTGAAGAAGACTATGACCGATTGATATGCAATTGAAATC
AATGGTTAAGATTGGAAAATAAAACGGCTATGTTTTTGTAACAAGCAAATGTTACTTACT
TGGTCTGAGTTTGAATAAGTTCTCCTTCATTATTATAGGAGGTTAAACAAGTTTTTTTTT
TTGATAAAAGAAAAAACAAGTCTTTTTTTTCGGTTTGGTGTTTGGTTTCTATTTCAGTTG
TAATGTTTAAAAACCTATTTGTGAGATCATTTACTTTTGAGTTCAACAAGAAAGTAAGAT
TAGTCCAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CY48TF U 1
AF RS1CY48JQ C 426
BS 1 544 RS1CY48TF
BS 545 1029 RS1CY48JQ

RD RS1CY48TF 544 0 0
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GAACTGGCTAGATTCTCAGCCGGAACAGAGTGTTGTGTTCCTCTGTTTCGGTAGCTTGGG
TTTGTCCTCGCAAGAACAGCTCAAGGAGATCGCTATTGGTTTAGAGAGAAGCGAGCAGAG
GTTCTTGTGGGTGGTCCGTAATCCACCGGAGCTACAAAACCAAACCGAACCGGGCTTGAC
GTCTCTCTTACCGGAAGGGTTTCTAAACCGAACCGGAAACAGGGGAATGGTGGTTAAATC
GTGGGCTCCGCAAGTTCCGGTTCTGAACCATAGAGCAATCGGCGGGTTCGTTACTCACTG
CGGCTGGAACTCCATTCTTGAAGGTGTTTGCGCGGGTGTACCGATGGTGGCTTGGCCGTT
GTATGCTGAGCAGAGGTTTAACAGAGTGGTGATTGTGGATGAGATCAAGATTGCTATTTC
GATGAATGAATCTGAGACGGGCTTCGTGAGTTGGATGGAGGTGGAGAAACGAGTCCGGGA
GGTA

QA 1 544 1 544
DS 

RD RS1CY48JQ 604 0 0
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ATGAATCTGAGACGGGCTTCGTGAGTTGGATGGAGGTGGAGAAACGAGTCCGGGAGGTAG
TGGAGGAGGGTCCGGTTAGGGAGAGAACCAAGGCCATGAAGAATGCGGCTGAATCAGCCT
TGGTCGAAACCGGTTCGTCTAGTCACGCGTTGACTGCTTTACTCCAGTCGTGGAGTTCAA
AACAAGCTTAGACTCTGCGTCAGTTAAGTTTTGTGATAAGAAAGCACTTGGTTCGAATAA
GGTAAAGTGTGTGTGACTGAAGAAGACTATGACCGATTGATATGCAATTGAAATCAATGG
TTAAGATTGGAAAATAAAACGGCTATGTTTTTGTAACAAGCAAATGTTACTTACTTGGTC
TGAGTTTGAATAAGTTCTCCTTCATTATTATAGGAGGTTAAACAAGTTTTTTTTTTTGAT
AAAAGAAAAAACAAGTCTTTTTTTTCGGTTTGGTGTTTGGTTTCTATTTCAGTTGTAATG
TTTAAAAACCTATTTGTGAGATCATTTACTTTTGAGTTCAACAAGAAAGTAAGATTAGTC
CAAA

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 2

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AGTATGCTAAGGAAATCACTGTGGGAGCAGAAGAAGCGTCTTTGAATAACCAAGACACTT
TGTGTAGAATAAGTGCGTTTCTAGAAGAAGCATTTCAGTCATCTTGTGAAGGAATCATGG
TTAAGTCTTTAGATGTTGATGCCGGATACTGCCCCACAAAGCGTTCTGATTCATGGCTTA
AGGTTAAGCGAGATTATGTAGATGGATTAGGTGACACATTGGATTTAGTTCCTATTGGTG
CTTGGCATGGCAACGGGAGAAAAGCGGGATGGTATAGTCCGTTCCTCATGGCCTGCTACA
ACCCTGAGACTGAGGAATTCCAGAGTGTCTGCCGTGTCATGTCTGGGTTTTCTGATGCGT
TTTACATCGAGATGAAAGAGTTCTACTCCGAGGATAAGATCCTTGCGAAAAAGCCGTCAT
ACTACAGAACAGCGGAGACACCAGACATGTGGTTTCCTGCTGAGGTTGTTTGGGAAATCA
GAGGTGCGGATCTAACCGTCTCACCTGTACACTGTGCGGCTTTAGGTCTGGTCCATCCAT
CACGAGGCATCTCTGTTAGGTTTCCGAGATTCATCTGTAAAAGAATGGATAGGAATCCGG
AGGAATGCAGCACGGCTGCAGATATAGCAGAGATGTTTCATGCTCAAACCAGGAAAATGA
ACATCAACTCTCAACACTGACATGTGTCCTCAGCTACTTTTGGTTCTTTTAGGAAGTTTC
CAAATCCAACTCCCAATATTTTGTGTTGGCTTTATGGTTAACTCATGTGTAAAAATTTGT
ACGTAAAACTATGTAAATATTCTGTGTATATAAATAATCTAGGGACCC


BQ
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AF RS1F248TF U 1
AF RS1F248JQ C 26
BS 1 714 RS1F248TF
BS 715 715 RS1F248JQ
BS 716 744 RS1F248TF
BS 745 828 RS1F248JQ

RD RS1F248TF 744 0 0
AGTATGCTAAGGAAATCACTGTGGGAGCAGAAGAAGCGTCTTTGAATAACCAAGACACTT
TGTGTAGAATAAGTGCGTTTCTAGAAGAAGCATTTCAGTCATCTTGTGAAGGAATCATGG
TTAAGTCTTTAGATGTTGATGCCGGATACTGCCCCACAAAGCGTTCTGATTCATGGCTTA
AGGTTAAGCGAGATTATGTAGATGGATTAGGTGACACATTGGATTTAGTTCCTATTGGTG
CTTGGCATGGCAACGGGAGAAAAGCGGGATGGTATAGTCCGTTCCTCATGGCCTGCTACA
ACCCTGAGACTGAGGAATTCCAGAGTGTCTGCCGTGTCATGTCTGGGTTTTCTGATGCGT
TTTACATCGAGATGAAAGAGTTCTACTCCGAGGATAAGATCCTTGCGAAAAAGCCGTCAT
ACTACAGAACAGCGGAGACACCAGACATGTGGTTTCCTGCTGAGGTTGTTTGGGAAATCA
GAGGTGCGGATCTAACCGTCTCACCTGTACACTGTGCGGCTTTAGGTCTGGTCCATCCAT
CACGAGGCATCTCTGTTAGGTTTCCGAGATTCATCTGTAAAAGAATGGATAGGAATCCGG
AGGAATGCAGCACGGCTGCAGATATAGCAGAGATGTTTCATGCTCAAACCAGGAAAATGA
ACATCAACTCTCAACACTGACATGTGTCCTCAGCTACTTTTGGTTCTTTTAGGA*GTTTC
CAAATCCAACTCCCAATATTTTGT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1F248JQ 803 0 0
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AGAAGCATTTCAGTCATCTTGTGAAGGAATCATGGTTAAGTCTTTAGATGTTGATGCCGG
ATACTGCCCCACAAAGCGTTCTGATTCATGGCTTAAGGTTAAGCGAGATTATGTAGATGG
ATTAGGTGACACATTGGATTTAGTTCCTATTGGTGCTTGGCATGGCAACGGGAGAAAAGC
GGGATGGTATAGTCCGTTCCTCATGGCCTGCTACAACCCTGAGACTGAGGAATTCCAGAG
TGTCTGCCGTGTCATGTCTGGGTTTTCTGATGCGTTTTACATCGAGATGAAAGAGTTCTA
CTCCGAGGATAAGATCCTTGCGAAAAAGCCGTCATACTACAGAACAGCGGAGACACCAGA
CATGTGGTTTCCTGCTGAGGTTGTTTGGGAAATCAGAGGTGCGGATCTAACCGTCTCACC
TGTACACTGTGCGGCTTTAGGTCTGGTCCATCCATCACGAGGCATCTCTGTTAGGTTTCC
GAGATTCATCTGTAAAAGAATGGATAGGAATCCGGAGGAATGCAGCACGGCTGCAGATAT
AGCAGAGATGTTTCATGCTCAAACCAGGAAAATGAACATCAACTCTCAACACTGACATGT
GTCCTCAGCTACTTTTGGTTCTTTTAGGAAGTTTCCAAATCCAACTCCCAATATTTTGTG
TTGGCTTTATGGTTAACTCATGTGTAAAAATTTGTACGTAAAACTATGTAAATATTCTGT
GTATATAAATAATCTAGGGACCC

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

CO CL7570Contig1 993 2 2 U
GGACCTCCAATTTCAGTTCCCCAGAGGAAGAATCTTTCGCTTCCAAAGTCCAAAGATGCA
CGGCAAAACAGATTCGGAGGTGACGAGCATCGCCGCCTCGTCACCAGCCAGATCTCCACG
CCGACCAGTCTACTACGTCCAATCTCCGTCTCGCGACTCTCACGACGGAGAGAAAACAGC
AACCTCCTTCCACTCAACTCCCGTGCTCAGTCCGATGGGATCTCCGCCGCACTCTCAATC
CTCCATGGGCCGCCACTCGCGAGAATCCTCCTCGACCCGGTTCTCCGGGTCCTTAAAACC
CGGGTCGCGGAAAGTCAATGACAGCTCAGCGAAGCGGAAAGGACACAACGGAGAGAAGCA
GTTCGCGATGATCGAAGAGGAAGGGCTGTTAGACGATGGAGAGAGAGATCGTGATACGCT
TCCTCGTCGGTGCTATGTCTTAGCCTTCGTCGTTGGGTTCTTCGTACTCTTTGGTCTCTT
CTCTTTGATTCTCTACGGTGCTGCTAAACCTCAGAAACCAAAGATAACCGTCAAGAGTAT
AACATTCGAGACGCTCAAGATCCAAGCTGGTCAAGATGCTGGTGGTGTGGGAACCGATAT
GATCACCATGAACGCGACTCTTAGAATGTTGTATCGAAACCCTGGAACTTTTTTCGGTGT
GCATGTAACTTCAACTCCTGTCGATTTCAGTTTCTCTCAGATGAAAATTGACTCCGGTTC
TGTAAGTGGTCCTAATCAAAAGTCAGACATTGCATTAATCGGACAATACTCTGCAAACTA
GGCCTCAGTTTTAGAATTTTTCGGCTGTTCTTGTCGGATTCAATACTTGTCGGAAGTTTC
AGTTCAGTTTTAAATCGGTTCGGGTCAATCTGCAATTAAAGTCCCTAAATTGTTTTTATT
TTATTTTTTGAACATCCAATAAAAATTGAGATTAGCATAATCTCCAACACATACAATTGT
TTGTGATTTTTATCCAAAATATATGTTTATTAT


BQ
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AF RS1GW71TF U 1
AF RS1GW71JQ C 441
BS 1 555 RS1GW71TF
BS 556 993 RS1GW71JQ

RD RS1GW71TF 555 0 0
GGACCTCCAATTTCAGTTCCCCAGAGGAAGAATCTTTCGCTTCCAAAGTCCAAAGATGCA
CGGCAAAACAGATTCGGAGGTGACGAGCATCGCCGCCTCGTCACCAGCCAGATCTCCACG
CCGACCAGTCTACTACGTCCAATCTCCGTCTCGCGACTCTCACGACGGAGAGAAAACAGC
AACCTCCTTCCACTCAACTCCCGTGCTCAGTCCGATGGGATCTCCGCCGCACTCTCAATC
CTCCATGGGCCGCCACTCGCGAGAATCCTCCTCGACCCGGTTCTCCGGGTCCTTAAAACC
CGGGTCGCGGAAAGTCAATGACAGCTCAGCGAAGCGGAAAGGACACAACGGAGAGAAGCA
GTTCGCGATGATCGAAGAGGAAGGGCTGTTAGACGATGGAGAGAGAGATCGTGATACGCT
TCCTCGTCGGTGCTATGTCTTAGCCTTCGTCGTTGGGTTCTTCGTACTCTTTGGTCTCTT
CTCTTTGATTCTCTACGGTGCTGCTAAACCTCAGAAACCAAAGATAACCGTCAAGAGTAT
AACATTCGAGACGCT

QA 1 555 1 555
DS 

RD RS1GW71JQ 553 0 0
TAGCCTTCGTCGTTGGGTTCTTCGTACTCTTTGGTCTCTTCTCTTTGATTCTCTACGGTG
CTGCTAAACCTCAGAAACCAAAGATAACCGTCAAGAGTATAACATTCGAGACGCTCAAGA
TCCAAGCTGGTCAAGATGCTGGTGGTGTGGGAACCGATATGATCACCATGAACGCGACTC
TTAGAATGTTGTATCGAAACCCTGGAACTTTTTTCGGTGTGCATGTAACTTCAACTCCTG
TCGATTTCAGTTTCTCTCAGATGAAAATTGACTCCGGTTCTGTAAGTGGTCCTAATCAAA
AGTCAGACATTGCATTAATCGGACAATACTCTGCAAACTAGGCCTCAGTTTTAGAATTTT
TCGGCTGTTCTTGTCGGATTCAATACTTGTCGGAAGTTTCAGTTCAGTTTTAAATCGGTT
CGGGTCAATCTGCAATTAAAGTCCCTAAATTGTTTTTATTTTATTTTTTGAACATCCAAT
AAAAATTGAGATTAGCATAATCTCCAACACATACAATTGTTTGTGATTTTTATCCAAAAT
ATATGTTTATTAT

QA 1 553 1 553
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL7573Contig1 1173 2 2 U
TTTTTGGTGATATCTAAGATTGTGGAGCATGGGGCTCCAGTCCCTGTCTCTAAAACCGAA
GTCTTGAAGAATGAACTCAATCCGGTTTGGAAACCAGTCTCTCTAAGTGTTCAGCAAGTG
GGGAGTAAGGATAGCCCACTGGTAATAGAGTGCTTAGACTTCAATGGCAATGGCAACCAC
AATCTTATCGGAAAAGTTCAGAAGTCACTTGCAGATTTAGAAAAGCTTCATTCGAGTGGT
CAAGGAATCAATTTGTTCTTACCTACTGGTGTTGGACATAAACATGAAGACAGGGCATTA
AAGAGTCAGCTTTTCGTGGACAAGTTTACTGAAACTGTTCAGCATACGTTCCTAGAATAC
TTGGCTGCTGGTTTTGAATTGAACTTCATGGTCGCTATTGATTTCACAGCTTCAAATGGA
AACCCTCGCCTCCCTGATTCATTACATTACATTGACCCTACAGGAAGATTAAATGCCTAC
CAGAGAGCAATAGTGGAAGTTGGAGAAGTGTTGCAGTTCTATGACACTGACAAACGCTTT
CCAGCGTGGGGCTTTGGAGCTCGTCCTATTGACATCCCCGTTTCGCATTGCTTTAACCTC
AACGGAAGCAGTACTTACTGTGAGGTAGATGGGATTCAAGGTATCATGAATGCATACAAT
GGTGCTCTCTTCAACGTCTCTTTTGCAGGCCTACTCTCTTTGGTCCTGTTATCAACGCTG
CTGCAACTATAGCAAGCGAGTCACTCGCTCAAAATTCAAAGAGATATTACGTCTTGTTGA
TCATCACTGATGGAGTAATAACAGATCTGCAAGAGACGAAAGACGCATTGGTCAGCGCAT
CAGATCTCCCATTATCAATCCTCATCGTTGGAGTAGGAGGAGCTGACTATAAAGAAATGG
AGGTACTAGATGGAGACAAAGGAGAGAGATTAGAAAGCTCGAACGGTCGTGTAGCGTCGC
GTGATATCGTCCAGTTCGTTGCACTACGAGACATACAATATGGAGAGGTCTCAGTGGTAG
AAGCGTTACTAGCAGAATTACCTTCACAGTTTTTGACGTACATGAGAAACCGTAACATCA
CTCCTTCAAGTATTACCACCTCTGCTTCTTGATGCATTCTCAACAACTCTGTACATACAT
TCAGCTGTAAACGCTGTCGTTTTGGTTTTCTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1H620TF U 1
AF RS1H620JQB C 679
BS 1 753 RS1H620TF
BS 754 1173 RS1H620JQB

RD RS1H620TF 759 0 0
TTTTTGGTGATATCTAAGATTGTGGAGCATGGGGCTCCAGTCCCTGTCTCTAAAACCGAA
GTCTTGAAGAATGAACTCAATCCGGTTTGGAAACCAGTCTCTCTAAGTGTTCAGCAAGTG
GGGAGTAAGGATAGCCCACTGGTAATAGAGTGCTTAGACTTCAATGGCAATGGCAACCAC
AATCTTATCGGAAAAGTTCAGAAGTCACTTGCAGATTTAGAAAAGCTTCATTCGAGTGGT
CAAGGAATCAATTTGTTCTTACCTACTGGTGTTGGACATAAACATGAAGACAGGGCATTA
AAGAGTCAGCTTTTCGTGGACAAGTTTACTGAAACTGTTCAGCATACGTTCCTAGAATAC
TTGGCTGCTGGTTTTGAATTGAACTTCATGGTCGCTATTGATTTCACAGCTTCAAATGGA
AACCCTCGCCTCCCTGATTCATTACATTACATTGACCCTACAGGAAGATTAAATGCCTAC
CAGAGAGCAATAGTGGAAGTTGGAGAAGTGTTGCAGTTCTATGACACTGACAAACGCTTT
CCAGCGTGGGGCTTTGGAGCTCGTCCTATTGACATCCCCGTTTCGCATTGCTTTAACCTC
AACGGAAGCAGTACTTACTGTGAGGTAGATGGGATTCAAGGTATCATGAATGCATACAAT
GGTGCTCTCTTCAACGTCTCTTTTGCAGGCCTACTCTCTTTGGTCCTGTTATCAACGCTG
CTGCAACTATAGCAAGCGAGTCACTCGCTCAAA
TCAAAG

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1H620JQB 495 0 0
CTTTTGCAG
GGCCTACTCTCTTTGGTCCTGTTATCAACGCTGCTGCAACTATAGCAAGCGAGTCACTCG
CTCAAAATTCAAAGAGATATTACGTCTTGTTGATCATCACTGATGGAGTAATAACAGATC
TGCAAGAGACGAAAGACGCATTGGTCAGCGCATCAGATCTCCCATTATCAATCCTCATCG
TTGGAGTAGGAGGAGCTGACTATAAAGAAATGGAGGTACTAGATGGAGACAAAGGAGAGA
GATTAGAAAGCTCGAACGGTCGTGTAGCGTCGCGTGATATCGTCCAGTTCGTTGCACTAC
GAGACATACAATATGGAGAGGTCTCAGTGGTAGAAGCGTTACTAGCAGAATTACCTTCAC
AGTTTTTGACGTACATGAGAAACCGTAACATCACTCCTTCAAGTATTACCACCTCTGCTT
CTTGATGCATTCTCAACAACTCTGTACATACATTCAGCTGTAAACGCTGTCGTTTTGGTT
TTCTAT

QA 10 495 10 495
DS 



AS 1 2

CO CL7574Contig1 716 2 3 U
GGGCAGGGCTTCCTCTGGTACAGAAATATCTGTTACAGTCTGATCAGTTGGTAAGAGAGC
TAATGCCAAAACTAGGAGAACACTTCACTCAAGAAATGATCAATCCGAGTATGTATGCAA
GCCAGTGGTTCATAACCGTCTTCTCCTACTCGTTTCCTTTCCATTCAGCTCTAAGAATCT
GGGACGTGTTTCTAGCCGAGGGTATAATTATTGTGTTCAAAGTGGGGTTAGCATTGTTGA
AGCACTGCCATGATGATTTGGTGAAATTGCCGTTTGAGGAACTTATGCATGCTTTGAGGA
ACTTCCCTGAAGATGCCATGGATCCTGATACTTTACTTCCATTGGCTTACTCCATCAAGG
TAGCAAAGCGTTTGGAAGAAATGAAACAGGATGGTGAGAAGGTTGTAGCTAAACCGGCTC
AAACGACCAACCCGGTTCAGCAATAGTGTTTGATGATCTTGAGCCCCATGGTCTCTCTTT
TACTCAATTTTTTTTGTGCAACTCATGTGTGCAGAAAGTACAATAGTTTTTTTTTTATTC
TTTTGTATTTAAGTTCCAAGAAAATCAAACTTTCTAGTCTCTCCTTTCTATTTTTTTTGG
CATGATTTGTTTGGTGTGTTTAACATGCTTCTGTAACGTCTAAGTCACAATGTATTGCAT
CTTTATAAAGTTCAAATGTAATTGTAAAACAGATATTATGAGAAACTCTTATATGT


BQ
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AF RS1BE69JQ C 1
AF RS1BE69TF U 1
BS 1 688 RS1BE69TF
BS 689 689 RS1BE69JQ
BS 690 716 RS1BE69TF

RD RS1BE69JQ 716 0 0
GGGCAGGGCTTCCTCTGGTACAGAAATATCTGTTACAGTCTGATCAGTTGGTAAGAGAGC
TAATGCCAAAACTAGGAGAACACTTCACTCAAGAAATGATCAATCCGAGTATGTATGCAA
GCCAGTGGTTCATAACCGTCTTCTCCTACTCGTTTCCTTTCCATTCAGCTCTAAGAATCT
GGGACGTGTTTCTAGCCGAGGGTATAATTATTGTGTTCAAAGTGGGGTTAGCATTGTTGA
AGCACTGCCATGATGATTTGGTGAAATTGCCGTTTGAGGAACTTATGCATGCTTTGAGGA
ACTTCCCTGAAGATGCCATGGATCCTGATACTTTACTTCCATTGGCTTACTCCATCAAGG
TAGCAAAGCGTTTGGAAGAAATGAAACAGGATGGTGAGAAGGTTGTAGCTAAACCGGCTC
AAACGACCAACCCGGTTCAGCAATAGTGTTTGATGATCTTGAGCCCCATGGTCTCTCTTT
TACTCAATTTTTTTTGTGCAACTCATGTGTGCAGAAAGTACAATAGTTTTTTTTTTATTC
TTTTGTATTTAAGTTCCAAGAAAATCAAACTTTCTAGTCTCTCCTTTCTATTTTTTTTGG
CATGATTTGTTTGGTGTGTTTAACATGCTTCTGTAACGTCTAAGTCACAATGTATTGCAT
CTTTATAAAGTTCAAATGTAATTGTAAAACAGATATTATGAGAAACTCTTATATGT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RS1BE69TF 716 0 0
GGGCAGGGCTTCCTCTGGTACAGAAATATCTGTTACAGTCTGATCAGTTGGTAAGAGAGC
TAATGCCAAAACTAGGAGAACACTTCACTCAAGAAATGATCAATCCGAGTATGTATGCAA
GCCAGTGGTTCATAACCGTCTTCTCCTACTCGTTTCCTTTCCATTCAGCTCTAAGAATCT
GGGACGTGTTTCTAGCCGAGGGTATAATTATTGTGTTCAAAGTGGGGTTAGCATTGTTGA
AGCACTGCCATGATGATTTGGTGAAATTGCCGTTTGAGGAACTTATGCATGCTTTGAGGA
ACTTCCCTGAAGATGCCATGGATCCTGATACTTTACTTCCATTGGCTTACTCCATCAAGG
TAGCAAAGCGTTTGGAAGAAATGAAACAGGATGGTGAGAAGGTTGTAGCTAAACCGGCTC
AAACGACCAACCCGGTTCAGCAATAGTGTTTGATGATCTTGAGCCCCATGGTCTCTCTTT
TACTCAATTTTTTTTGTGCAACTCATGTGTGCAGAAAGTACAATAGTTTTTTTTTTATTC
TTTTGTATTTAAGTTCCAAGAAAATCAAACTTTCTAGTCTCTCCTTTCTATTTTTTTTGG
CATGATTTGTTTGGTGTGTTTAACATGCTTCTGTAACGTCTAAGTCACAATGTATTGCAT
CTTTATAAAGTTCAAATGTAATTGTAAA*CAGATATTATGAGAAACTCTTATATGT

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

CO CL7575Contig1 731 2 2 U
GGATTCATTCATCGCTAACGTCGAGTCCTCCTCCTCTCTCTCTCGCTCTATCTATCTTTG
CCGTTTCGAATCAAAGTCGTTTCTTTTACCGCAGATATGTCGAAGAAGATCATCCTGAAG
AGTTCCGACGGCGAATCGTTCGAGGTCGATGAAGCGGTTGCGCTCGAGTCGCAGACGATC
AAGCACATGGTCGAAGACGACTGCGTCGCTGACGGGATCCCTCTTCCGAACGTCACGAGT
GTCATCCTCGCTAAGGTAATCGAGTACTGCAAGAAGCACGTCGACGCCGCCGCCGAAGCT
GAGGCCGGAGACAAGGATATCTACGGTAACACCGAGGACACCGAGCTCAAGAAGTGGGAT
ACCGAGTTCGTCAATGTTGATCAGCCTACGCTCTTCGATCTCATCTTGGCTGCCAACTAT
CTGAACATCAGTGGACTTCTTGACTTGACGTGCAAGACTGTGGCGGATATGATGGTAGGC
AAGACTCCAGAGCAGATGCGCGCCCACTTCAACATCAAGAACGACTACACGAAGGAGGAA
GAAGAAGAGGTTCGCAAGGAGCATGCATGGGCCTTCGAGTGACTTATGATCTCTCCTGGT
GTTTGTTTTAGGATTGTCTTCTATTAGATGTCTTCTTTCTTTTTCTCTTTTGGTTTGAAG
TTTCATCATCTGTGTACGAACCCCTAATGGCTTTGTTCTACTGACAAGCTCTGTTGGTTT
TTTTTTAGAGC


BQ
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GTTTTAGGATTGTCTTCTATTAGATGTCTTCTTTCTTTTTCTCTTTTGGTTTGAAGTTTC
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TTAGAGC

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BQ
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DS 



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BQ
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BS 745 753 RS1F818TF
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AAAGTTCATCTCCATTGAGGTATTTTATCGAACACGTTGTGGGCGTGATAAGAAGATCGG
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TTTTTCGTTTGAACCGCCGTCGATTGATGGGTATGGTGGTCGGATTGTAACTGGAGTTCC
GGTTTGGCGTTTGACATCATAAACTGGTGTTTGGTCCCCACCGCTTGCGCTGTAATACTT
CATGCCCGAGGAAGAAGACGTGTTATTACAGGAGTAACTTTTTTGGGTGTGTGTTTCAAC
GGCCGACATACACTGGTGTTTGGCTTGCACGTCTGTCCTAAGGATTTTTCCCAATTCGGA
ATTGAGGAAGAAAGATGTGATTAGTGTTTTTTCTATACAAGAAAAAATGAGTTTGTTGTA
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QA 1 763 1 763
DS 

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ATAACCTACGATATATTTAGGCAGAATAAATCCTCTGTTTTATACAACAATGACAAAAAC
ACTTGAGATTGACATCAGATCCGCAGAGGGGCTCAAGATAAACCGGAGACTTATCAAGAA
GAAAAAGACTTTCGCCGTCGCAAGGATCGGCGATAAGTCTCGAAAAACGTATCTAGACGA
CTCGGGAGGAAGCAATCCAACGTGGAACTTCAAGTCGGAGATGCCAATGCAAGGGAGTGT
AAAGTTCATCTCCATTGAGGTATTTTATCGAACACGTTGTGGGCGTGATAAGAAGATCGG
AGAAGCTCCAATCCCGGCGACGGATTTCATGGAAACGACAATGTTCATGGCTCCTTCTTC
TTCTTCGTCTGAACCGCCGTCGATTGATGGGTATGGTGGTCGGATTGTAACTGGAGTTCC
GGTTTGGCGTTTGACATCATAAACTGGTGTTTGGTCCCCACCGCTTGCGCTGTAATACTT
CATGCCCGAGGAAGAAGACGTGTTATTACAGGAGTAACTTTTTTGGGTGTGTGTTTCAAC
GGCCGACATACACTGGTGTTTGGCTTGCACGTCTGTCCTAAG*ATTTTTCCCAATTCGGA
ATTGAG*AAGAAAGATGTGATTAGTGTTTTTTCTATACAG**AAAAATGAGTTTGTTGTA
TGAAATTGAT*ACGAATTTCGAA*TAAAGTCGA
CTTTTCCG

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

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AAAACATATGGGAACAATTCCAACT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GT34TF U 1
AF RS1GT34JQ C 1
BS 1 710 RS1GT34TF
BS 711 745 RS1GT34JQ

RD RS1GT34TF 710 0 0
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QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1GT34JQ 745 0 0
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CTTTTCTTCTTGTGCTTCCGGTGTTGACCATTGGGTTCCACATGCACTGCAAATGCCGTT
ACCTACCTGCTTTTGTCACATACTCTTTACAGGAAGCCATGATCCAAGATACACTGGAAC
GCACACGTGAGCCAAACCTAAACCTCAAGGCTTTCTTTCGAAACGCGTATGCTCACCCGG
AGTTCAGGGTGGGAGAAGACCTAGAGCTAGAGATGGCCGTGGAGAAGCCTGATAAGACAC
CGGAGCTAGTTTCCACTAAGCGTGGCTCATGGAGGAACACTCCTTTGCCTAGCAGCAAAC
ATAGCTGCCCTTATTCACCTTGATGCTTTTGCTTTTTTCTACCTTTAAAGGTGATTCTTT
CATGTTCTATGTACATAGTAACAATTGTATCAAATGCAAGTAAAGAAACACCATTTGAAA
AAAACATATGGGAACAATTCCAACT

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 2

CO CL7579Contig1 841 2 4 U
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ATCACAGAACCAGCCAAAACTGAAGCCAAACTGAATTCTTATTCAAGACCTCTCTCTCCC
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GACTTTAGATGGTACCTTCTGTCGGTTCTGAGACGAGTAATACTCTGGTTTTTTTTAATG
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C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1FC17TF U 1
AF RS1AZ62JQ C 42
BS 1 720 RS1FC17TF
BS 721 721 RS1AZ62JQ
BS 722 769 RS1FC17TF
BS 770 841 RS1AZ62JQ

RD RS1FC17TF 769 0 0
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AAAACTGAAACCAAACCGCAATCTTATCCGAGACCTCTATCTCCATATGCATCGTACGCT
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AAAGCGGCCACTGCACAAGTAAACTCAGAGCCCGCACTGGAAGCCGCCACTGAACAAGTA
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TATGCATCGTACCCTGACTTGAAGCCTCCAACATCTCCGACACCATCGCATCCATGAAAC
AGAATAACAATATTGATCGAAACGTTGTACACTTCTTGTCTGTTTTATGTTTCCTTCAAG
*ACTTTAGATGGTACCTTCTGTCGGTTCTGAGACGAGTAATACTCTGGT

QA 1 769 1 769
DS 

RD RS1AZ62JQ 800 0 0
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CATAGGAAGGGCTTTCCTTCCTCCATCAGCAAGCAGCAAAGCTCTTCCCGCACCAGCAGT
AGCAGTAGCAGAAGCAGCTACAACCACCACTGTGGATGAAAAGGAGCCTGAGCCAGTGAT
TGAAGCGGCCACTGCACAAGTAACCTCAGAGGCAGCGACCAAAGCAGCAGCCAGTGAACA
AATAATCACAGAACCAACGAAAACTGAAACCAAACCGCAATCTTATCCGAGACCTCTATC
TCCATATGCATCGTACGCTGACTTGAAGCCTCCAACATCCCCCACACCAGTAAGCAGCAA
GGGTCTTCCCGCACCAGCACCAGTAGCAGCTACAACCACCACCGTCAATGAACCAGTTCC
TGAGCTAGAGCCAGCAATCAAAGCGGCCACTGCACAAGTAAACTCAGAGCCCGCACTGGA
AGCCGCCACTGAACAAGTAATCACAGAACCAGCCAAAACTGAAGCCAAACTGAATTCTTA
TTCAAGACCTCTCTCTCCCTATGCATCGTACCCTGACTTGAAGCCTCCAACATCTCCGAC
ACCATCGCATCCATGAAACAGAATAACAATATTGATCGAAACGTTGTACACTTCTTGTCT
GTTTTATGTTTCCTTCAAGGACTTTAGATGGTACCTTCTGTCGGTTCTGAGACGAGTAAT
ACTCTGGTTTTTTTTAATGCTGTGATGTTGCATTGTTCAAACATCTTTGACCAACACAGT
CAAATCTATAATTTTGCGCC

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 2

CO CL7580Contig1 341 2 1 U
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QA 1 341 1 341
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CG


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10 10 

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AF RS1ED12TF U 1
AF RS1ED12JQ C 150
BS 1 559 RS1ED12TF
BS 560 917 RS1ED12JQ

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GGGTAGTGACGGCTCGATTATGATCCCTCCTCCTCGTCCAAAGAGGAAACCGACGCATCC
TTATCCTCGAAAATCGCCTGTTCCATACTCTCGGTCTCCTTCCTCAGCTATGGAGAAAGA
AACAAAGTCTCCAACTTCTGTGCTATCAGCGTTTGCTACAGAGGATGTGGTCAATCGATG
CTCCTCTCCTAACTCATGTACCACTGACATCCAGTCCATTGATAAGAAGAATGACTACGC
AGTATCCAATCAATCTTTTAAAGAGGATGGTGCTGTAACCGGTTCAACACCCATCTCTAG
CATTATGCTTTTTGGGAAGATTGTGCTAGTTGCAGGAGGATCTAACAAAACATCTTCTTC
CAGAGAGGGCGGTGCTAATCATAAATCAATGACGGGTCAAGATTCTAGTCATGTAGATAC
TGTTTTATCTCTAGGGGTATGGGAAACGTCCTGTACCGTTTCTAATGCATATGGCTCGGT
CACCAAAGTTTCGGGGAACTTGGAGAAGAGCGCAGAACCCTGTTATCCTGTAAATGGGTT
CAGACCATACAAGAGATGC

QA 1 559 1 559
DS 

RD RS1ED12JQ 768 0 0
CGTTTGCTACAGAGGATGTGGTCAATCGATGCTCCTCTCCTAACTCATGTACCACTGACA
TCCAGTCCATTGATAAGAAGAATGACTACGCAGTATCCAATCAATCTTTTAAAGAGGATG
GTGCTGTAACCGGTTCAACACCCATCTCTAGCATTATGCTTTTTGGGAAGATTGTGCTAG
TTGCAGGAGGATCTAACAAAACATCTTCTTCCAGAGAGGGCGGTGCTAATCATAAATCAA
TGACGGGTCAAGATTCTAGTCATGTAGATACTGTTTTATCTCTAGGGGTATGGGAAACGT
CCTGTACCGTTTCTAATGCATATGGCTCGGTCACCAAAGTTTCGGGGAACTTGGAGAAGA
GCGCAGAACCCTGTTATCCTGTAAATGGGTTCAGACCATACAAGAGATGCTTATCAGAAA
GAGAAGTGACATCCTCCTTGTCGTTGGTAGCTTCAGAAGAAGAGGGAAGCAGGAGAAGAG
CACGTGTATGCTCGTAGCGCAGGTGCATGCCCTCTTTGTACAGTTGCTAAAAACCACAGT
TTTAGGGTTGATGTCGATGAGTCAAAGGTTCCGACATTGTTGGGAGACTCTGAGAACAGA
GAGGACGAATCAAACGCTAATCCATTTGGATATATGAATTTTCTTGGTTTTAATGAGGTT
TGATGCACTGTCTGACATTTAAAAAAAAAAGACAGTCCCTTTTTTTCTTCATCAACAAGT
TTATCTTCTCAACCACCTAATTGTAACTCTATCACAAGCTTAAGTATC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL7584Contig1 1227 2 2 U
TACCAATTAGCTTTCCACGACGACGACGACGGAGAAAGCAAACTAAGTAACCTCACAGAA
AGTCTCCATCTTTCTTCTCCCGAACGATCGAATCGTTCTCGTGGATGCGATTATAAAGAA
TCGTTCTTTTCGATCTCGCTTTAGATTCGATGGATGAGTCGTTCGCTAATCTACAAACGA
GCCATTTGCTTGGTTCAGTTCCCGCTGTGATCAGCGATGACGACAAGAAGAGCACTAATG
TGCATATAGCAAGCGTTAATGAAGCAGCAGGTCCCTCTGCGGCAAACATGCAGATATTTC
CACCGCATCAAGGAAACAATGCATCAAAGGGTTATCAAACTCTTCAGACCCCAACAGAAG
GACCTGAACAACAGCCGTCGAACAACTGGAAGGGATACTTTAACGTCTACTCGTACGCCC
AGTACTTCAACGTTGACACCGGCGTTGTTCTTAACAGACTGATGAGTTCCTTGTACCCCA
CCACTGGTGATTTTTTCAGCAAGATTGATGCCAACCCTGATTTGTATGGCCTTGTCTGGA
TCTGCACTACGCTTGTGTTTGTGCTTTCCTCTCTCGGAAACTGTGCCACGTACCTCGTGA
AGAAACGAACCGACAGTGAAGCTCCTTGGGTCTTTGATGTGAACTATATAAACTTGGCAG
CCTCTTTGATCTACGGCTATGCAATAATTGTGCCGGTGGCGTTTTATTTCTCACTCCGGT
ATATGGGGTCCAGAGCTGATCTTCTAAGATTCTGGTGCCTCTGGGGATACTCTCTCTTCG
TTTTCGTTCCAACCACTCTTCCATTGCTTATTCCAGTGGAGTTTCTGAGATGGGTGATTA
TACTCTTAGCTGGTGGCGCATCGTCTTGCTTTGTTGCCCTGAATCTACGGTCTTACCTTG
AGGCGAGCAATGATCTGACTGCTGTAGTGGCTGCAGCGTTTGGTCTGCAAATGGTACTGT
CTATCTTCATCAAAGTCTGGTTCTTTCCTTAAGTGTCTCCACACCACACGACGAAACATA
TATATAATGTTTGTAAAAAACGTTTTAGATTTTGATGTGATGTGATGTGATGTGGTAGAA
CAATGAATTTGTCATTACCAGAGAACAAAACCCCACAAAGTAACATATACACTGAACTGA
ATCATCGGGATTCGTTTTGACTTGCTTAGTTTCTTGTTTGCTTTTTTTTCTTTTCTTGTG
AGTTGAATGTCTAAGGATTTTAAATGG


BQ
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AF RS1F886TF U 1
AF RS1F886JQ C 541
BS 1 671 RS1F886TF
BS 672 1227 RS1F886JQ

RD RS1F886TF 671 0 0
TACCAATTAGCTTTCCACGACGACGACGACGGAGAAAGCAAACTAAGTAACCTCACAGAA
AGTCTCCATCTTTCTTCTCCCGAACGATCGAATCGTTCTCGTGGATGCGATTATAAAGAA
TCGTTCTTTTCGATCTCGCTTTAGATTCGATGGATGAGTCGTTCGCTAATCTACAAACGA
GCCATTTGCTTGGTTCAGTTCCCGCTGTGATCAGCGATGACGACAAGAAGAGCACTAATG
TGCATATAGCAAGCGTTAATGAAGCAGCAGGTCCCTCTGCGGCAAACATGCAGATATTTC
CACCGCATCAAGGAAACAATGCATCAAAGGGTTATCAAACTCTTCAGACCCCAACAGAAG
GACCTGAACAACAGCCGTCGAACAACTGGAAGGGATACTTTAACGTCTACTCGTACGCCC
AGTACTTCAACGTTGACACCGGCGTTGTTCTTAACAGACTGATGAGTTCCTTGTACCCCA
CCACTGGTGATTTTTTCAGCAAGATTGATGCCAACCCTGATTTGTATGGCCTTGTCTGGA
TCTGCACTACGCTTGTGTTTGTGCTTTCCTCTCTCGGAAACTGTGCCACGTACCTCGTGA
AGAAACGAACCGACAGTGAAGCTCCTTGGGTCTTTGATGTGAACTATATAAACTTGGCAG
CCTCTTTGATC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1F886JQ 687 0 0
TCTGCACTACGCTTGTGTTTGTGCTTTCCTCTCTCGGAAACTGTGCCACGTACCTCGTGA
AGAAACGAACCGACAGTGAAGCTCCTTGGGTCTTTGATGTGAACTATATAAACTTGGCAG
CCTCTTTGATCTACGGCTATGCAATAATTGTGCCGGTGGCGTTTTATTTCTCACTCCGGT
ATATGGGGTCCAGAGCTGATCTTCTAAGATTCTGGTGCCTCTGGGGATACTCTCTCTTCG
TTTTCGTTCCAACCACTCTTCCATTGCTTATTCCAGTGGAGTTTCTGAGATGGGTGATTA
TACTCTTAGCTGGTGGCGCATCGTCTTGCTTTGTTGCCCTGAATCTACGGTCTTACCTTG
AGGCGAGCAATGATCTGACTGCTGTAGTGGCTGCAGCGTTTGGTCTGCAAATGGTACTGT
CTATCTTCATCAAAGTCTGGTTCTTTCCTTAAGTGTCTCCACACCACACGACGAAACATA
TATATAATGTTTGTAAAAAACGTTTTAGATTTTGATGTGATGTGATGTGATGTGGTAGAA
CAATGAATTTGTCATTACCAGAGAACAAAACCCCACAAAGTAACATATACACTGAACTGA
ATCATCGGGATTCGTTTTGACTTGCTTAGTTTCTTGTTTGCTTTTTTTTCTTTTCTTGTG
AGTTGAATGTCTAAGGATTTTAAATGG

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

CO CL7585Contig1 1470 2 2 U
ATCCCATCTCTTTCTCTCTCTTGAAATCTAGACGACTCGTCTTCTTCTCCTCGACGATGA
ATGGAATCCTTGATAGTTTTTCTGGGTTTTTTTTCTTCTGTTGTAGTCTCCTATTTATGA
TCTCAATCATCTGTTGTAGCTTTGATATCATGGGATTGCAGAGGCGATACTGCGAACCAC
CAATCTCTCAGTTCCCTTAAAGTAGCAGAGGAGATAACAATAATCAGATTGTTAGCAATT
ATAGTTTTGAAGAAGAAGAAGATGAAGCTGAGGCCTTGAGTGATGCGATTGAAAGGTTTT
CGATGGTTTCTAAGGAGGTTGTTAGGATCAAAGACATCTTGCTCGACAAAGACGACGAGT
ACTTATGTTTCTCTCGGAGTCTCCGGTCTTCCTCTTCTTCTTTTAACCAACACAGATGAC
GATCAAATCGTCCCTCACTGAATCAATTTTTATCACAGTTTTGGTGGAAGAGAAATCTCA
AGTGTTAGAATCTTGACACTGCAGCTGAATGCCCCGCCTTTCCAAATGGTACTGAATCTT
CCTCCCTATTGTGCAATTAGCTTCGTCATGACTCAATCTTCTATGGTACTGGTGGTGATG
TTTCAGCTGTTGTTTGTGACATCGTACAAAGTATGTATCATCATCTTTCCTCCTTCTCCT
TCTCCATCTTTCTTTTCCTTTTCCTACTTTCAGCTTCTTTTTCCGTTGACTAGGCAATTG
ATGCCAAGTTCTTCTCAGATAAATACATGCTCAACTATGTTATGGCCACCTATACCAAAC
TTCATCTCTCACCCTACTCTCCGTCCTTTTAATGAATTACTCAAAGCTCATGTGTTCGTT
TTCATTTAGGTTTCAATTTTGAATAGTATTGTATTGTCATGGGTGGCGGAGCTGGTGTCT
CCGTCCATGGTCGTTTTCGTATTGCAACTGAGAACACGGTATTCATTAGCATGACTTATA
AATAAATGCAGTCTCTTCTACAAAGAGGATTGTTGTGATAAGTGTTTTGTTTGTGTCATT
TGCCCTTTAGCTACTTGCTCTTGCCTCTCTGCATTTGCAGGATCAGCTGATATAACTCTT
TTGTGGCCTGATCTTGTGCCTTGAATCATTCCTTTGAGCTATAGTGAATTGGTTTTGAAG
AAGCAGAAAACAGAGGAGTCAGGAAAGAGAAAGGTCATCGTGGGGCTCCAGATATGGAAG
TAGCTGGACTAAAAAACATCTCCAAGCTAAAATCAGGACCAGATATTGATCTTCTGCCAC
CAACTTTGGTTTTTTTCAACGCCGGCGTAATAGCCCACAATGGACATAAGAATACTCTGT
AAGAAGTTTTGTTTCTGTTTGTCATGTTCTTGCCACTGACTGTCTGATGTTCATGTCATG
TCCTGCACGTTAGTCATGTCTTTGGAACAGACTTGTAGTTGTTGCTGGAATTGTCGTCAT
GTTTAAGTAGTTGTTTTCGATGTATGTTTC


BQ
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AF RS1BM59TF U 1
AF RS1BM59JQ C 688
BS 1 794 RS1BM59TF
BS 795 1470 RS1BM59JQ

RD RS1BM59TF 794 0 0
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ATGGAATCCTTGATAGTTTTTCTGGGTTTTTTTTCTTCTGTTGTAGTCTCCTATTTATGA
TCTCAATCATCTGTTGTAGCTTTGATATCATGGGATTGCAGAGGCGATACTGCGAACCAC
CAATCTCTCAGTTCCCTTAAAGTAGCAGAGGAGATAACAATAATCAGATTGTTAGCAATT
ATAGTTTTGAAGAAGAAGAAGATGAAGCTGAGGCCTTGAGTGATGCGATTGAAAGGTTTT
CGATGGTTTCTAAGGAGGTTGTTAGGATCAAAGACATCTTGCTCGACAAAGACGACGAGT
ACTTATGTTTCTCTCGGAGTCTCCGGTCTTCCTCTTCTTCTTTTAACCAACACAGATGAC
GATCAAATCGTCCCTCACTGAATCAATTTTTATCACAGTTTTGGTGGAAGAGAAATCTCA
AGTGTTAGAATCTTGACACTGCAGCTGAATGCCCCGCCTTTCCAAATGGTACTGAATCTT
CCTCCCTATTGTGCAATTAGCTTCGTCATGACTCAATCTTCTATGGTACTGGTGGTGATG
TTTCAGCTGTTGTTTGTGACATCGTACAAAGTATGTATCATCATCTTTCCTCCTTCTCCT
TCTCCATCTTTCTTTTCCTTTTCCTACTTTCAGCTTCTTTTTCCGTTGACTAGGCAATTG
ATGCCAAGTTCTTCTCAGATAAATACATGCTCAACTATGTTATGGCCACCTATACCAAAC
TTCATCTCTCACCC

QA 1 794 1 794
DS 

RD RS1BM59JQ 783 0 0
C
TTCAGCTTCTTTT*CCGTTGACTAGGCAATTGATGCCAAGTTCTTCTCAGATAAATACAT
GCTCAACTATGTTATGGCCACCTATACCAAACTTCATCTCTCACCCTACTCTCCGTCCTT
TTAATGAATTACTCAAAGCTCATGTGTTCGTTTTCATTTAGGTTTCAATTTTGAATAGTA
TTGTATTGTCATGGGTGGCGGAGCTGGTGTCTCCGTCCATGGTCGTTTTCGTATTGCAAC
TGAGAACACGGTATTCATTAGCATGACTTATAAATAAATGCAGTCTCTTCTACAAAGAGG
ATTGTTGTGATAAGTGTTTTGTTTGTGTCATTTGCCCTTTAGCTACTTGCTCTTGCCTCT
CTGCATTTGCAGGATCAGCTGATATAACTCTTTTGTGGCCTGATCTTGTGCCTTGAATCA
TTCCTTTGAGCTATAGTGAATTGGTTTTGAAGAAGCAGAAAACAGAGGAGTCAGGAAAGA
GAAAGGTCATCGTGGGGCTCCAGATATGGAAGTAGCTGGACTAAAAAACATCTCCAAGCT
AAAATCAGGACCAGATATTGATCTTCTGCCACCAACTTTGGTTTTTTTCAACGCCGGCGT
AATAGCCCACAATGGACATAAGAATACTCTGTAAGAAGTTTTGTTTCTGTTTGTCATGTT
CTTGCCACTGACTGTCTGATGTTCATGTCATGTCCTGCACGTTAGTCATGTCTTTGGAAC
AGACTTGTAGTTGTTGCTGGAATTGTCGTCATGTTTAAGTAGTTGTTTTCGATGTATGTT
TC

QA 2 783 2 783
DS 



AS 1 2

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TTTTGTTGATCTCATAAAAACAAAAATACATTACAAAAGGACAAAGCGATGGATATCAAT
GGCCTTGCATGTCCAACATCTCATCAAGTTGTTTAATCCTCTCTATTCCTTCACTAATCA
AAAACCTGATCTTTTGCTTGTCCTTGCACTCACTGTTCTTCTCCATCTCTTGCCTAATAC
TCTGTTTTAGTTCCCCTCTAGCCTGAGGAGGAGCTCTGTGAGCTATCTTCAAAGCTTGCC
TGTAAAGTTTAAGCACTCGAGCTCTGAGAATAAAGCTCTGCAAATCTAACGCATTAACCA
TTCCCTGAGAAATTAAAAACAAAACACCAACGATGTCATATGACGAAACTGGTCGTTGTT
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GATCTAAATCAAAAGATTGTAACTTTTGATA


BQ
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AF RS1GX26JQ U 10
AF RS1GX26TF C 1
BS 1 9 RS1GX26TF
BS 10 211 RS1GX26JQ
BS 212 212 RS1GX26TF
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BS 249 511 RS1GX26TF

RD RS1GX26JQ 239 0 0
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TCTCATAAAAACAAAAATACATTACAAAAGGACAAAGCGATGGATATCAATGGCCTTGCA
TGTCCAACATCTCATCAAGTTGTTTAATCCTCTCTATTCCTTCACTAATCAAAAACCTGA
TCTTTTGCTTGTCCTTGCACTCCCTGTTCTTCTCCATCTCTTGCCTAATACTCTGTTTT

QA 1 239 1 239
DS 

RD RS1GX26TF 511 0 0
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TTTTGTTGATCTCATAGAAACAAGAATACATTACAAAAGGACAAAGCGATGGATATCAAT
GGCCTTGCATGTCCAACATCTCATCAAGTTGTTTAATCCTCTCTATTCCTTCACTAATCA
GATACCTGATCTTTTGCTTGTCCTTGCACTCACTGTTCTTCTCCATCTCTTGCCTAATAC
TCTGTTTTAGTTCCCCTCTAGCCTGAGGAGGAGCTCTGTGAGCTATCTTCAAAGCTTGCC
TGTAAAGTTTAAGCACTCGAGCTCTGAGAATAAAGCTCTGCAAATCTAACGCATTAACCA
TTCCCTGAGAAATTAAAAACAAAACACCAACGATGTCATATGACGAAACTGGTCGTTGTT
GACAGCATTAGAGGCTCATCATAACTAAACCATTAACATCAACAGCTTTAATAACATCTA
GATCTAAATCAAAAGATTGTAACTTTTGATA

QA 1 511 1 511
DS 



AS 1 2

CO CL7587Contig1 1424 2 2 U
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AACTGACCCTTGGCATTTACGAGGTGAAATAGCCTACTGCATCAGGTTACTGGTAGTGCC
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GATGTTGCAGAAGGGAAGAGGCTCCTAGGAAGAACAAGATTTATAGTGCTGCTTTCGGTG
TCTGGTTCAAGCGTTTCACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGTGAAGAGAAC
GAATCCAAATCCAATCCTACTATTCGTAGAGAATGAACTAAACCCTATTCGGACAGCAGA
ATAACAAACAATGAAAGCTGCTGTCTTTCCCTCTAAAATCGCAAGTCTAGGCCTCCCCTC
TGGCCGTTTCCCACTGTTCTTCCGATCACCGGGATTGTCGATAACAACAACTCCTTGTCG
GAAGCTGACAGGAGGAAGGAAGGGTATTGAAGGATTGATGTCTCAGTCTCAGTCGTCATC
TTCTCAATTGTTTTCGTCTCTATCGAATTCATTCTCCTCTCAGTCGGAATCGGAGTTACC
TCAGGTTCAGTTACCTTCCCCGAGGCCAAAGTCTCCGCCGCCGCAGCTCCCGTGGCTCAT
AGTCGGTTTGGGGAATCCCGGAAAGAAATTCCAGGGCACTCGCCACAACGTTGGGTTTGA
GATGGTGGACGCTTTGGCTGATGCAGAAGGGATATCAATGAACACCGTTAACTTCAAGGC
CTTGTTTGGCAAAGGCGTTATTGGAAACATACCGATTATGCTGGCGAAACCTCAAACTTT
CATGAACGCCAGTGGTGAGTCTGTTGGACAAATTATTTCGTTTTACAAGATCCCGCTAAA
GCAAGTACTTGTGATTTACGATGATTTAGACTTGCCCTTTGGTAAACTGCGTTTATTGCC
AAAAGGTGGCCACGGAGGGCACAATGGGATGAGAAGCATTATAGACCGGCTAAAAGGGAG
CCGCGATTTTCCACGTCTAAGAATAGGGATTGGACGGCCTCCAGGGAAGATGGATACAGC
CAATTATGTTTTTCGCCAGTTTAACAAACAAGAACAGGAAGAGTTGGATTATACATTTCA
AACAGGGTTAGAGGCAATAAGGATCATGTTGCTTGAAGGGTTCAACAAAAGTGCGACCTT
TGTCAACACTCAGAAATCTATGCAACAACTCAGTTGAAAAAGAGAGAGAGAGATTGTCCC
ATCACATATGAAGAACTGCAGATTTTTCAGGCCGATTCATTATTAAAAAAAAATCAATTC
ATATTTCCTTTTGAGCAAATTGTATATCACATGAAAAACCAAAAATTTATTAGCCTTCAC
ATAATTTGCTCTTGATTATAATAAAATTGAAATATCAAATATTT


BQ
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BS 641 826 RS1DF76JQ

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GTATGCAGAGCCTAAAGAAGTAGAGAAACTTGTGATCAATCCTGTGAAGAAAGAACTGGG
CCTTGCATTCAAGGGAAATCAGAAGAATGTTGTTGAATCTTTGGAGGCGATGAACGAGAA
AGAAGCTATGGAGATGAAGGCAACCCTGGAATCCAAGGGGGAAGTGGAGTTCTACGTGTG
TACCCTCGGGAAAAACGTGAGCATCAAGAAGAACATGGTGTCAATCTCAAAGGAGAAGAA
GAAAGAGCACCAGCGTGTTTTCACACCGTCAGTGATCGAGCCATCTTTCGGGATTGGTCG
GATCATATATTGTCTGTACGAGCACTGTTTCAGCACAAGACCAAGCAAAGCAGGGGATGA
ACAGCTGAACGTGTTCCGGTTCCCTCCTCTTGTGGCTCCCATCGAGTGCACGGTTTTCCC
GCTGGTTCAGAACCAACAATTCGAGGAAGCAACCAAAGTCATTTCCAAGGAACTCACTTC
TGTTGGCATCTCACATAAGATTGACATCACTGGTACATCGATAGGGAAAAGGTATGCGAG
AACGGATGAGCTTGGTGTGCCATTTGCGATAACGGTGGACTCGGATACATCAGTGACAAT
CAGAGAAAGAGACAGCAAAGACCAAGTCAGAGTTAGCTTG

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1DF76JQ 636 0 0
AAAAACGTGAGCATCAAGAAGAACATGGTGTCAATCTCAAAGGAGAAGAAGAAAGAGCAC
CAGCGTGTTTTCACACCGTCAGTGATCGAGCCATCTTTCGGGATTGGTCGGATCATATAT
TGTCTGTACGAGCACTGTTTCAGCACAAGACCAAGCAAAGCAGGGGATGAACAGCTGAAC
GTGTTCCGGTTCCCTCCTCTTGTGGCTCCCATCGAGTGCACGGTTTTCCCGCTGGTTCAG
AACCAACAATTGGAGGAAGCAACCAAAGTCATTTCCAAGGAACTCACTTCTGTTGGCATC
TCACATAAGATTGACATCACTGGTACATCGATAGGGAAAAGGTATGCGAGAACGGATGAG
CTTGGTGTGCCATTTGCGATAACGGTGGATTCGGATACATCAGTGACAATCAGAGAAAGA
GACAGCAAAGACCAAGTCAGAGTTAGCTTGAAAGAGGCAGCCTCTGTGGTGAGCTCAGTC
GCGGAGGGGAAGATGACATGGCAAGACGTGTGGGCAAGCTTCCCTCACCACTCTTTTGCT
GCTGCAGACGAGCAGGAGTGATTAGCTCCTCTACTTATCGTGGAAAAATTAAAGTACAAT
TTTAAACCTATGTTTTGTGATAATCGTTTACTGGAC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

CO CL7590Contig1 767 2 2 U
GGAGTTTGCACATGCGTATCATTTCATCTCTATCGGTGATACATCTTTGATTAGAGATTC
AAGACCTAAGAGAACTTCGATTCTTGTCTGAAGTGTGAGGGCTGTGTTCTTTTTCGGTTT
TGGAATCTTTGTCTTGAGTGGATAATGGGAATGAGTCTCGATTTTGATGTCGATCTTGAG
AAAGGAATCGTCGATACACAATTGCCGGAGGAGCCAATGATACCGATGTCTCCGGATAAC
AAACCGGTTATAACCGGAGAAGAAACCGTCGGTTCGTTAGAAAACAGTAAGGCACCGGTT
CAGTCTGCGGCTTCTTCTCTCGGCAATGTATTGGCCACGCTTCTCACCGTTATATTCTTC
TTCGTCCTTGTTTTGCGAGGATTTCCACCGAGAGCAGCCGCTAGCTCCGGGAGGTCTCCG
TTAGTAGACACCGGTAAAGCTAGTGGTGGTTATGTTTCGGTTCAATATGCGGGAAATCCG
TCTGCGAGTGAACCGGATGGTGGTTATACCGGTTCGGGTTTAACACAGAGTCAGAGATTG
CCGAATTTACCAAAACCGGTTTCCGGTTTGAAAAGAAGGTGAATAGAGTTTCACAATGAA
GCGTAAACCAAAGAGCTGGAATTGGACAATTTCATCACTGGTTCATCGAACCATTGTCGG
TTTAGATTGTCGGTGCTTCGGTGGACCATGTACTCTACTCGTACAGATAAATTTTTGGGG
GCAAAAACAATAAACTATCCGATGTGGGTAAGAATTGTTTTGTAATG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FA78TF U 1
AF RS1FA78JQ C 1
BS 1 715 RS1FA78TF
BS 716 767 RS1FA78JQ

RD RS1FA78TF 716 0 0
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G

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1FA78JQ 767 0 0
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AAGACCTAAGAGAACTTCGATTCTTGTCTGAAGTGTGAGGGCTGTGTTCTTTTTCGGTTT
TGGAATCTTTGTCTTGAGTGGATAATGGGAATGAGTCTCGATTTTGATGTCGATCTTGAG
AAAGGAATCGTCGATACACAATTGCCGGAGGAGCCAATGATACCGATGTCTCCGGATAAC
AAACCGGTTATAACCGGAGAAGAAACCGTCGGTTCGTTAGAAAACAGTAAGGCACCGGTT
CAGTCTGCGGCTTCTTCTCTCGGCAATGTATTGGCCACGCTTCTCACCGTTATATTCTTC
TTCGTCCTTGTTTTGCGAGGATTTCCACCGAGAGCAGCCGCTAGCTCCGGGAGGTCTCCG
TTAGTAGACACCGGTAAAGCTAGTGGTGGTTATGTTTCGGTTCAATATGCGGGAAATCCG
TCTGCGAGTGAACCGGATGGTGGTTATACCGGTTCGGGTTTAACACAGAGTCAGAGATTG
CCGAATTTACCAAAACCGGTTTCCGGTTTGAAAAGAAGGTGAATAGAGTTTCACAATGAA
GCGTAAACCAAGGAGCTGGAATTGGACAATTTCATCACTGGTTCATCGAACCATTGTCGG
TTTAGATTGTCGGTGCTTCGGTGGACCATGTACTCTACTCGTACAGATAAATTTTTGGGG
GCAAAAACAATAAACTATCCGATGTGGGTAAGAATTGTTTTGTAATG

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL7591Contig1 752 2 5 U
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AAAAAAAATAGAACTAAATTACCTTCTTTAATTTCTTGAAATTGTGAAGCTTGATAAAAA
AAGAAGAAAAAATGGGCTTCGATAAAGGAAACAAGAAGAAGAAATGCATCATCGCTGGGG
TTATCACGGCTTTGCTCGTTATCATGGTAGTCTCCGTGGCCGTCATAACGAACCAACATG
CCCGTACTTGTAATCACAAAAAAGCCGACGCGAATATTAAAATGACCAGCAAGGCAGTCG
AGGCGGTTTGTGCACCTACTGACTTCAAAGAAACATGTGTCAACAGCTTCATGAAAGCTT
CTCCTAACGCCACCGAGCCTCTCGATCTCATCAAGCTGAGCTTCAACATCACCATTCAAT
CCATCAAGGATGGTATCAAGAAATCCTCTGTAGAGCTCAAAGCCAAGGCAGATGATGAGA
CCAAAGGGTCTCTGGAGTTGTGTGAGACGATTATGAATGACGCTATAGATGATCTGACCA
AGTGTTTTGATAACTTTGCTGGCTTTTCAGTTGATCAGATTGAGAAATTCGTCGATGATC
TTCGTGTCTGGCTCAGTGGGTCCATTTCGTATCAACAGACATGCATGGATGCTTTTGAGG
AAGTTAAGTCACCCTTGCAGAGACATGAAAAC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BP76TF U 1
AF RS1DH12TF U 1
BS 1 169 RS1BP76TF
BS 170 170 RS1DH12TF
BS 171 694 RS1BP76TF
BS 695 695 RS1DH12TF
BS 696 752 RS1BP76TF

RD RS1BP76TF 752 0 0
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GCCTCTCCTACTCTGTTTTTTTTTCTTGTATTTTTACAGTTTACAATAAAACATTAACTT
AAAAAAAATAGAACTAAATTACCTTCTTTAATTTCTTGAAATTGTGAAGTTTGATAAAAA
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TTATCACGGCTTTGCTCGTTATCATGGTAGTCTCCGTGGCCGTCATAACGAACCAACATG
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AGGCGGTTTGTGCACCTACTGACTTCAAAGAAACATGTGTCAACAGCTTCATGAAAGCTT
CTCCTAACGCCACCGAGCCTCTCGATCTCATCAAGCTGAGCTTCAACATCACCATTCAAT
CCATCAAGGATGGTATCAAGAAATCCTCTGTAGAGCTCAAAGCCAAGGCAGATGATGAGA
CCAAAGGGTCTCTGGAGTTGTGTGAGACGATTATGAATGACGCTATAGATGATCTGACCA
AGTGTTTTGATAACTTTGCTGGCTTTTCAGTTGATCAGATTGAGAAATTCGTCGATGATC
TTCGTGTCTGGCTCAGTGGGTCCATTTCGTATCA*CAGACATGCATGGATGCTTTTGAGG
AAGTTAAGTCACCCTTGCAGAGACATGAAAAC

QA 1 752 1 752
DS 

RD RS1DH12TF 737 0 0
GGACAAACAGTAAAATAAAAAGAAAAACAGAGTCAGAAGGGGCTTAAGCCATCCTTACAA
GCCTCTCCTACTCTGTTTTTTTTTCTTGTATTTTTACAGTTTACAATAAAACATTAACTT
AAAAAAAATAGAACTAAATTACCTTCTTTAATTTCTTGAAATTGTGAAGCTTGATAAAAA
AAGAAGAAAAAATGGGCTTTGATAAAGGAAACAAGGAGAAGAAATGCATCATCGCTGGGG
TTATCACGGCTTTGCTCGTTATCATGGTAGTCTCCGTGGCCGTCATAACGAACCAACATG
CCCGTACTTGTAATCACAAAAAAGCCGACGCGAATATTAAAATGACCAGCAAGGCAGTCG
AGGCGGTTTGTGCACCTACTGACTTCAAAGAAACATGTGTCAACAGCTTCATGAAAGCTT
CTCCTAACGCCACCGAGCCTCTCGATCTCATCAAGCTGAGCTTCAACATCACCATTCAAT
CCATCAAGGATGGTATCAAGAAATCTTCTGTAGAGCTCAAAGCCAAGGCAGATGATGAGA
CCAAAGGGTCTCTGGAGTTGTGTGAGACGATTATGAATGACGCTATAGATGATCTGACCA
AGTGTTTTGATAACTTTGCTGGCTTTTCAGTTGATCAGATTGAGAAATTCGTCGATGATC
TTCGTGTCTGGCTCAGTGGGTCCATTTCGTATCAACAGACATGCATGGATGCTTTTGAGG
AAGTTAAGTCA
ACCCTT

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

CO CL7592Contig1 755 2 2 U
CATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATCAGTCGACGGTACCGGACATATGCC
CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGCACACAAATGTCTCATTACACAAAAACTAAGAG
CTAATATAAACATTACTGTGGCTATCAGAGAAGAGACATTGTTTTCTTCGAAAACTGATC
TTGGTTCCAAGAATAGGCTCAGAGTCGATTTTTTCGGGGTGAAATCTTGGAGCCATAAGT
GTTTGTCTCTTTGGTTTGAAAGCTACTTTGAGAGCAAGTGGCGATGTCAATGTCATCACT
GACCCCAACATCTCTGATGATATCATCAATTCTCCAGTCGGTTAGGTAGCCTGGCTTGGA
AGTTACATCACTGACCTCAACATCTCCGGACAACATAGCCACTACTCGGGACATTGGTGG
TCTCAAGGAATGAGAGGCTTGTGTGCACAGCAGAGCAACGCCAATCACTCGTTTCACTTC
TTCCACGTCGAAATCACTCAGCCTATCATCTATTAGTTCAACTTCACGGCCTTGCTCGTG
TAGATTCCATGCCTGTGATCACCAGAGACACAAAAAGGATCCTTAGATTTTGTTTACACT
CGATTATAGCAAAGTGAGAACGTACCCATTCAAGAAGATACTTTTTCTCATCATCTAAGA
TCTCATCAGAGTTGGGCCTTCCACTAACAAGCTCAAGAGCCACAACACCAAAGGCATACA
CATCTGTTTTCTCTGTTAGAAGTCCACGCATTGCA


BQ
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AF RS1A248TF U 1
AF RS1A248TV U 37
BS 1 736 RS1A248TF
BS 737 755 RS1A248TV

RD RS1A248TF 736 0 0
CATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATCAGTCGACGGTACCGGACATATGCC
CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGCACACAAATGTCTCATTACACAAAAACTAAGAG
CTAATATAAACATTACTGTGGCTATCAGAGAAGAGACATTGTTTTCTTCGAAAACTGATC
TTGGTTCCAAGAATAGGCTCAGAGTCGATTTTTTCGGGGTGAAATCTTGGAGCCATAAGT
GTTTGTCTCTTTGGTTTGAAAGCTACTTTGAGAGCAAGTGGCGATGTCAATGTCATCACT
GACCCCAACATCTCTGATGATATCATCAATTCTCCAGTCGGTTAGGTAGCCTGGCTTGGA
AGTTACATCACTGACCTCAACATCTCCGGACAACATAGCCACTACTCGGGACATTGGTGG
TCTCAAGGAATGAGAGGCTTGTGTGCACAGCAGAGCAACGCCAATCACTCGTTTCACTTC
TTCCACGTCGAAATCACTCAGCCTATCATCTATTAGTTCAACTTCACGGCCTTGCTCGTG
TAGATTCCATGCCTGTGATCACCAGAGACACAAAAAGGATCCTTAGATTTTGTTTACACT
CGATTATAGCAAAGTGAGAACGTACCCATTCAAGAAGATACTTTTTCTCATCATCTAAGA
TCTCATCAGAGTTGGGCCTTCCACTAACAAGCTCAAGAGCCACAACACCAAAGGCATACA
CATCTGTTTTCTCTGT

QA 1 736 1 736
DS 

RD RS1A248TV 719 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGCACACAAAT
GTCTCATTACACAAAAACTAAGAGCTAATATAAACATTACTGTGGCTATCAGAGAAGAGA
CATTGTTTTCTTCGAAAACTGATCTTGGTTCCAAGAATAGGCTCAGAGTCGATTTTTTCG
GGGTGAAATCTTGGAGCCATAAGTGTTTGTCTCTTTGGTTTGAAAGCTACTTTGAGAGCA
AGTGGCGATGTCAATGTCATCACTGACCCCAACATCTCTGATGATATCATCAATTCTCCA
GTCGGTTAGGTAGCCTGGCTTGGAAGTTACATCACTGACCTCAACATCTCCGGACAACAT
AGCCACTACTCGGGACATTGGTGGTCTCAAGGAATGAGAGGCTTGTGTGCACAGCAGAGC
AACGCCAATCACTCGTTTCACTTCTTCCACGTCGAAATCACTCAGCCTATCATCTATTAG
TTCAACTTCACGGCCTTGCTCGTGTAGATTCCATGCCTGTGATCACCAGAGACACAAAAA
GGATCCTTAGATTTTGTTTACACTCGATTATAGCAAAGTGAGAACGTACCCATTCAAGAA
GATACTTTTTCTCATCATCTAAGATCTCATCAGAGTTGGGCCTTCCACTAACAAGCTCAA
GAGCCACAACACCAAAGGCATACACATCTGTTTTCTCTGTTAGAAGTCCACGCATTGCA

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 2

CO CL7593Contig1 794 2 1 U
GGGTTTGATAGCGTCTCACTATAGTAAGCTGAAAGACACTGTTTGTGCTATCCACAGAGA
GATTGAGAAGGAAGCGATGGCGGAGTTGCGTCACTCGAGCTCCTCTCTCGGGAGCCGATC
TTCTTCCTCTCCGCTACGTGGTCCCGCCGGAGATGAGGACTCCACGTCGTATTCGTCTCC
TCATCACTCTGACGACGAAGAAGAGCGCCATCCCTCGAGAGATCGAGACCGTCCGATCTG
GTGGTTTCATTTCCTCCTCGGCGACGATCTTAGGGCGAAGACTAGTAGTAGTAAAGTATC
CATCTTTTTGGTACTCTTCCTCTCCGTCGCAAGCTTGATCTCCGTTTACGCCATTGTTAA
CCACTTGAATGCAGCTTACTTGTGTAAGAAAGATGGGATTGTGCTGAACTGTCCTCATGT
AAAGGAGTCAGCTTCTCGTTGGGAGAATCCTCTGTCTGCTACTACTTCTTGGAAGCCTTG
CGCTGAGCGCCGGGTTGGTGGAGTCTCAGATATTCTTCCTGAGAATTAAACAAATGGATA
TGTTTTCATTCATGCTGAAGGTGGTTTGAATAAGCAGAGGATTGCTATCTGTAATGCAGT
AGCTGTTGCCAAGATTATGAATGCAACTCTGATTCTACCAGTACTTAAGCAGACCAAGTT
TGGAAAGACCAAACGAAGTTTGAAGACATTTTTGATGTAGATCATTTCATTGATTACTTG
AAAGATGATGTCCGAATCGTTAGAGATATACCTGACTGGTTCACTGACAAGCAGAGTTAT
TCTCTAGTATAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FZ25TF U 221
AF RS1FZ13TF U 1
BS 1 794 RS1FZ13TF

RD RS1FZ25TF 114 0 0
GATCGAGACCGTCCGATCTGGTGGTTTCATTTCCTCCTCGGCGACGATCTTAGGGCGAAG
ACTAGTAGTAGTAAAGTATCCATCTTTTTGGTACTCTTCCTCTCCGTCGCAAGC

QA 1 114 1 114
DS 

RD RS1FZ13TF 794 0 0
GGGTTTGATAGCGTCTCACTATAGTAAGCTGAAAGACACTGTTTGTGCTATCCACAGAGA
GATTGAGAAGGAAGCGATGGCGGAGTTGCGTCACTCGAGCTCCTCTCTCGGGAGCCGATC
TTCTTCCTCTCCGCTACGTGGTCCCGCCGGAGATGAGGACTCCACGTCGTATTCGTCTCC
TCATCACTCTGACGACGAAGAAGAGCGCCATCCCTCGAGAGATCGAGACCGTCCGATCTG
GTGGTTTCATTTCCTCCTCGGCGACGATCTTAGGGCGAAGACTAGTAGTAGTAAAGTATC
CATCTTTTTGGTACTCTTCCTCTCCGTCGCAAGCTTGATCTCCGTTTACGCCATTGTTAA
CCACTTGAATGCAGCTTACTTGTGTAAGAAAGATGGGATTGTGCTGAACTGTCCTCATGT
AAAGGAGTCAGCTTCTCGTTGGGAGAATCCTCTGTCTGCTACTACTTCTTGGAAGCCTTG
CGCTGAGCGCCGGGTTGGTGGAGTCTCAGATATTCTTCCTGAGAATTAAACAAATGGATA
TGTTTTCATTCATGCTGAAGGTGGTTTGAATAAGCAGAGGATTGCTATCTGTAATGCAGT
AGCTGTTGCCAAGATTATGAATGCAACTCTGATTCTACCAGTACTTAAGCAGACCAAGTT
TGGAAAGACCAAACGAAGTTTGAAGACATTTTTGATGTAGATCATTTCATTGATTACTTG
AAAGATGATGTCCGAATCGTTAGAGATATACCTGACTGGTTCACTGACAAGCAGAGTTAT
TCTCTAGTATAGAG

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

CO CL7594Contig1 914 2 4 U
TTTTTTTTTCTTAGTTAATTCACGAAGTCCTTTGTTTACTCATCATATCTGAGAAGTTGA
TAGGGAATTTCTGGGTAAAGAAGAAAAGGCTCGGATTATTGCATACATCATACGACTACT
CTCCGATTATCTTAGATTTGTGCTTCCTTAGAGACCATTGCTTATCTCATACAAAGATAC
GAGGTTCTTATATGCGCTATCGGTAAGATATGGTGTTATTTGCTTTGCCGATCACGATAC
ACATGAATTTGCCTAGATGGTTCAGTTGATTTCCACAGAGTGAGCAATAGTCCTTTCGTT
CTTTTGTTTTTGTAGTGCCCCTTACTTTATTAACAAATGGAAAACTTTACTCTCATTTGT
ATTACTAGAGTGGTGTGCTCCTAGAGCGGTTATCGTTTGGCAGGGTATACTAATATGCAG
GTTTTGGAGCAACTGATGGAGAATCTCTATGGCGACCTCACTGTTACAAGAGCTCTTGGA
GACTTCTTAGTTAAAAGGTACTCACCCAGTGGAGGATCTTTGTCGCCTCTGGTCTCAGAT
CCGGATTTTCTGCAGATGGTTCTAACTGAGGAAGATGAGTAATTGATTATGCGATGGGAC
ATAATGACAAAGCCAGTATGCTGCTACATTCGCCATGCCAGGCTCATGAGATACGGTGAC
CCAAAAAGTTGTGTGATGGAACTTGGAAGGGAAGCATTAAGGCTTGAGTCGTCTAATAAT
GTTATAGCGGTGGTCATTTTGCTTCACGCTGTCATCACCAACTCCGGAGAAGAATACAAT
TTTGTATTTCTTATGAATCTCGAGCCTGGTTGATTACATGCTATTAGTTTTGTATATATG
TGTTTGGTTGAGGACGTAGAGGTTTTGGTAAAGTTATATTTTAAATTCATGAATGTGTTT
TTAGTTTACTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ED86TF U 1
AF RS1ED86JQ C 153
BS 1 655 RS1ED86TF
BS 656 656 RS1ED86JQ
BS 657 667 RS1ED86TF
BS 668 914 RS1ED86JQ

RD RS1ED86TF 667 0 0
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GAGGTTCTTATATGCGCTATCGGTAAGATATGGTGTTATTTGCTTTGCCGATCACGATAC
ACATGAATTTGCCTAGATGGTTCAGTTGATTTCCACAGAGTGAGCAATAGTCCTTTCGTT
CTTTTGTTTTTGTAGTGCCCCTTACTTTATTAACAAATGGAAAACTTTACTCTCATTTGT
ATTACTAGAGTGGTGTGCTCCTAGAGCGGTTATCGTTTGGCAGGGTATACTAATATGCAG
GTTTTGGAGCAACTGATGGAGAATCTCTATGGCGACCTCACTGTTACAAGAGCTCTTGGA
GACTTCTTAGTTAAAAGGTACTCACCCAGTGGAGGATCTTTGTCGCCTCTGGTCTCAGAT
CCGGATTTTCTGCAGATGGTTCTAACTGAGGAAGATGAGTAATTGATTATGCGATGGGAC
ATAATGACAAAGCCAGTATGCTGCTACATTCGCCATGCCAGGCTCATGAGATACG*TGAC
CCAAAAA

QA 1 667 1 667
DS 

RD RS1ED86JQ 762 0 0
GACCATTGCTTATCTCATACAAAGATACGAGGTTCTTATATGCGCTATCGGTAAGATATG
GTGTTATTTGCTTTGCCGATCACGATACACATGAATTTGCCTAGATGGTTCAGTTGATTT
CCACAGAGTGAGCAATAGTCCTTTCGTTCTTTTGTTTTTGTAGTGCCCCTTACTTTATTA
ACAAATGGAAAACTTTACTCTCATTTGTATTACTAGAGTGGTGTGCTCCTAGAGCGGTTA
TCGTTTGGCAGGGTATACTAATATGCAGGTTTTGGAGCAACTGATGGAGAATCTCTATGG
CGACCTCACTGTTACAAGAGCTCTTGGAGACTTCTTAGTTAAAAGGTACTCACCCAGTGG
AGGATCTTTGTCGCCTCTGGTCTCAGATCCGGATTTTCTGCAGATGGTTCTAACTGAGGA
AGATGAGTAATTGATTATGCGATGGGACATAATGACAAAGCCAGTATGCTGCTACATTCG
CCATGCCAGGCTCATGAGATACGGTGACCCAAAAAGTTGTGTGATGGAACTTGGAAGGGA
AGCATTAAGGCTTGAGTCGTCTAATAATGTTATAGCGGTGGTCATTTTGCTTCACGCTGT
CATCACCAACTCCGGAGAAGAATACAATTTTGTATTTCTTATGAATCTCGAGCCTGGTTG
ATTACATGCTATTAGTTTTGTATATATGTGTTTGGTTGAGGACGTAGAGGTTTTGGTAAA
GTTATATTTTAAATTCATGAATGTGTTTTTAGTTTACTTTCT

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL7595Contig1 919 2 8 U
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CTCTCCGGCTCTCCTGGCTCTTGCTTAGAGATAGGGAGCGGAGAGAACGACTCATGGTTC
ATGCCACTATTGCAACAAGCAAGTGTAGCGTGTAAGAAAGTTAAACAGATGAAAGAGCTG
AGTCAAGGCTACAACATTGTTGCACAATCTCAAGGAAACATGGTCGCTAGAGGCCTTATC
GAGTTCTGCGACGATGCTCCTCCTGTCATCAACTATGTATCCTTAGCAGGACCTCATGCT
GGAATTGCTGCAGTCCCCAAGTGTAAATCTGGTCCAAAATGTGATATAGCAGAAGCTATC
TTGAAGTCAGAGATCTATAACGACTTCGTTCAAGATCATATTGCTCCTAGTGGTTATATC
AAGATCCCTGGTGAAATGACAAAGTATTTGGAACACTATAAGTATCCACCAAACCTTAAC
AATGAGAGACCTGACGAAAGAAACTCCACTTTCAAAGACCGTTTCACGAGCTTACATAAC
TTAGTTCTTGTCATGTTCCAGAACGACACAACACTGATCCCTAAAGAAACTTCTTGGTTT
GGATATTATACTGATGAAGGATTCGATACTCTTTTGTCAACTCAACAGACAAAACTATAC
AGAGAAGACTGGATTGGTCTGAAAGCATTGGATGACGTAGGAAAAGTCAAATTTGTGAGT
GTCTCAGGGAACCACCTTATGATAGCGTATGAGGATGTTGTGAAATATGTTGTCCCTTAC
TTGATGAAGACAACTTTGTAAATTTTTCAACATCCGACTTTTCTTGTCGTTTTTGTCATT
TTATGAAGTTCATACAATAATATTTTGAACTAGTGCTTCCCTCCATCTTGCGCATGCATA
ATCACCTATTTTTAATACG


BQ
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AF RS1GX44TF U 1
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RD RS1GX44TF 749 0 0
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AGTCAAGGCTACAACATTGTTGCACAATCTCAAGGAAACATGGTCGCTAGAGGCCTTATC
GAGTTCTGCGACGATGCTCCTCCTGTCATCAACTATGTATCCTTAGCAGGACCTCATGCT
GGAATTGCTGCAGTCCCCAAGTGTAAATCTGGTCCAAAATGTGATATAGCAGAAGCTATC
TTGAAGTCAGAGATCTATAACGACTTCGTTCAAGATCATATTGCTCCTAGTGGTTATATC
AAGATCCCTGGTGAAATGACAAAGTATTTGGAACACTCTAAGTATCCACCAAACCTTAAC
AATGAGAGACCTGACGAAAGAAACTCCACTTTCAAAGACCGTTTCACGAGCTTACATAAC
TTAGTTCTTGTCATGTTCCAGAACGACACAACACTGATCCCTAAAGAAACTTCTTGGTTT
GGATATTATACTGATGAAGGATTCGATACTCTTTTGTCAACTCAACAGACAAAACTATAC
AGAGAAGACTGGATTGGTCTGAAAGCATTGGATGACGTAG**AAAGTCAAATTTGTGAGT
GTCTCAGGGA**CACCTTATGATAGCGTA

QA 1 749 1 749
DS 

RD RS1GX44JQ 481 0 0
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AGAAACTCCACTTTCAAAGACCGTTTCACGAGCTTACATAACTTAGTTCTTGTCATGTTC
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GGATTCGATACTCTTTTGTCAACTCAACAGACAAAACTATACAGAGAAGACTGGATTGGT
TTGAAAGCATTGGATGACGTAGGAAAAGTCAAATTTGTGAGTGTCTCAGGGGACCACCTT
ATGATAGCGTATGAGGATGTTGTGAAATATGTTGTCCCTTACTTGATGAAGACAACTTTG
TAAATTTTTCAACATCCGACTTTTCTTGTCGTTTTTGTCATTTTATGAAGTTCATACAAT
AATATTTTGAACTAGTGCTTCCCTCCATCTTGCGCATGCATAATCACCTATTTTTAATAC
G

QA 1 481 1 481
DS 



AS 1 2

CO CL7596Contig1 712 2 2 U
GGGACCGAATAAATTTTCTCCGGCCGGCGGGTTTCGGGAGCAGAGCATCATCAGCTTCTC
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CTAGGGTTTATGTAACTAATCCAAATTGTTATCGTTTTCTATTAGGGTGAGTCAATCGGA
ATCGGGGATGTTTGTTGATATTTCAAATCAGATCTCTCACTTTTTTTGCCCCTTTGATTG
CATTGTGATTAATATTTTGTTCTCTCAGCGATCCGAAAGAGAGAAGAAGAAGTTTTTCAG
TGTTTGAGGATCTGCAAATAGTATCCATCCAAGGTTTTCAAACTATGGTTTTATTACAGT
TGGACCCGTTCCTCAATGAACTCACGAGCATGTTCGAGAAAAGCAAAGAGAAGGGTTCTG
TGTGGGTTACTTTGAAAAGATCATCTTTGAAGTCTAAGCTGCAGAAGAGGAAACTGAGCT
CTGCTGGAGAATCCATAGAGTACAGATGTCTTATTCGAGCTACTGATGCTAAGAAAACCA
TTTCTACTTCGGTATGTCTTCTCTACTCATTCAGACTCAAGATTAATAACATTCTCCAAC
ATAGTTTTTTTCCAAAGCGTTATGCATATATGAGTAAACCATAATATACAAA


BQ
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DS 

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QA 1 701 1 701
DS 



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BQ
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QA 1 706 1 706
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CAAGACTAATAAATATTTGATTTTTCCGACTGAAAAAA

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B065TF U 1
AF RS1B065JQ C 575
BS 1 639 RS1B065TF
BS 640 640 RS1B065JQ
BS 641 737 RS1B065TF
BS 738 739 RS1B065JQ
BS 740 746 RS1B065TF
BS 747 747 RS1B065JQ
BS 748 771 RS1B065TF
BS 772 1393 RS1B065JQ

RD RS1B065TF 786 0 0
GGATTGCCATAAACTTTACGTTTAGTCCGCCTCTTGAAGTCCGTCGCATTGACTGTCTCG
TCTCTCTACGGTTTCAAGCCGAGCCATGAATTCACAGCCTAGGAACAACGTTTCTGGTGA
TGGTCAATCCACTAATCGACGACACAACACGCGATCGAAAACCACAGATCACGGAAGAGA
AGGCTTCGCATTGCCGATACCAACAGATCTCACACTCGACATCTTCTCGAGGCTGCCGTT
GAAGTCAATAGCCATATGTCGTTGCGTATCGAAGCTCTGGGCCTCCGTACTCCGCCTTCC
AGGTTTCACCGACCTCTTCTCAGCCAAAGCTTCTGCTCGGCCGCAGATCTTGCTCGCACC
GGAATCACATCGCGAGTTGTTCTTCTTCTCTTCACCACATCCTCAGAATCTGCACGAGAG
CTCGTCTCCTGTGGTCGTCCTGTCCATGGTCTGGTCTGTCTTAGCCAGTTGCGGGTCTTA
GAGGGAGAGAGGGAGACAGTGTTATTTATATGTAACCCTAGCACCAGACAAGTCTTACAT
TTGCCCAAAGTAAAGACGAGGAGACCTGTGGTGAGGAGCATGTTTGGGTATGATCCGATT
GATAAACAGTTCAAGGTATTGTGCATGACACGGTTAAGG*ATGGAGTAGACTATGGAGAG
CATCAAGTTCTGACATTGGCAGCTCCAGACCGGTCATGGAGAATGCTCGAGTGTTGCATT
CGCCATCATGGTTATCA**CTAAAGG*ATATGTATCAATGGTGTTTTGTAT
ATAATCTATAGTAGT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RS1B065JQ 819 0 0
GGAGCATGTTTGGGTATGATCCGATTGATAAACAGTTCAAGGTATTGTGCATGACACGGT
TAAGGGATGGAGTAGACTATGGAGAGCATCAAGTTCTGACATTGGCAGCTCCAGACCGGT
CATGGAGAATGCTCGAGTGTTGCATTCGCCATCATGGTTATCCACCTAAAGGGATATGTA
TCAATGGTGTTTTGTATTATAAATCTATTAGTAAGTCAACAGAGGCTTATTTAATAGTTT
GCTTTGACGTTAGGTCTGAGAAGTTCAGTTTTATCGAAGTAAAGGTAACACTACAAACAG
CACTGCTCCGTGGAGTTCTGATTAACTACAATGGTAAATTGGGTTTATTTCTGTCTGAAG
ATAATGGGAAGTATTTTGGAAGCTCTGTTAGTGGAAGAAGTACAAGTGTTCAGTTGTGGG
TTCTCGAAGATGTCGAAAAACAGGAATGGTCGGATCATATCTACTTATTGCCAGCTTTGT
GGAAGAATCTAGTTGGAACAGACTATTTATTCTTTGCTGGAGTGACTCGGACAAACGAGA
TTGTGTTGGCGCCGAGCCGTCCATCCGACCCTTTATACCTTTTCTATCTAAGTACCAAGA
GGGACACTGTCGTTGTAAGATTTGTTGAAATCCAAGGAATAGATGTGTCTGACAATTATA
TGGATCACATCGTTTTAGATCATGTGGAGGACGTGAAGCTCTATGATGTTTAGGTACTTC
TTAAATTTGTGACTCTGTTTAGCTTTTTAGGTTCTCATCAGTTGATCATTAGACAGATCT
TAATATATGTACGATTAATTAAATTCAGTTTTTATTTAC

QA 1 819 1 819
DS 



AS 1 2

CO CL7599Contig1 777 2 10 U
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GACCAGAGATATGGCGACGGAGTTAGAAGAGCTTGTCGAGTTCCTATCGTCTCCTTCTCC
TCCTGTGAAGAAAGCTGCGGTGGAGATTGTTAGCGGATTAACTGGTTCGGAGGAAGGTCT
ACAATCTCTATCCAAGTATTCCGAGATTCTACTTCCATCACTCTCTCGTCTCCTTAGTGA
AAGCAAGGAGGTCTCAGAGCCAGCAGCTCAGGCTCTTGTAAATCTTTCCCAGAACTCTGA
ACTAACTAAGAAGATGATTCAGATGGGTTTGATCAAAGTGGCCATGGACATGTTGTATAA
GCCACAGTCTTGTATCACTAGATTGCTTGTTATGCTTCTGGTGAATCTCACTCAGTCGGA
TGATGGCGTTTCTTCCTTGCTTCAGATTGAGGATGAGAAGATGCGTGGACTACATATCAT
GAAGCTTGTAAGGTCATTTTGCAGGTCTTCTGGAGAAACTGCTGATGATCAGTTTGAGCA
TGTTGGCTCAATCCTAGTGAACATATCGAAAACAGAAGATGGGAGGAAAATGTTACTTGA
GCCAAAGAGAGGACTACTAAAACAGATCATTAGGCAGTTTGATTCAACAAACCAATTGCG
TAAGAAAGGGGTTGCTGGGACTATCCGTAACTGCTCTTTGGAAGCCAAGAACCAACTGGA
GATATACTCTTGATATCAGAGTTTCTCTGGCCGCTCTCCTCTACAGTGCAGCAGTAG


BQ
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AF RS1C492TF U 1
AF RS1GU38TF U 1
BS 1 117 RS1C492TF
BS 118 119 RS1GU38TF
BS 120 454 RS1C492TF
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BS 701 752 RS1C492TF
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RD RS1C492TF 755 0 0
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GACCAGAGATATGGCGACGGAGTTAGAAGAGCTTGTCGAGTTCCTATCGTCTCCTTC**C
TCCTGTGAAGAAAGCTGCGGTGGAGATTGTTAGCGGATTAACTGGTTCGGAGGAAGGTCT
ACAATCTCTATCCAAGTATTCCGAGATTCTACTTCCATCACTCTCTCGTCTCCTTAGTGA
AAGCAAGGAGGTCTCAGAGCCAGCAGCTCAGGCTCTTGTAAATCTTTCCCAGAACTCTGA
ACTAACTAAGAAGATGATTCAGATGGGTTTGATCAAAGTGGCCATGGACATGTTGTATAA
GCCACAGTCTTGTATCACTAGATTGCTTGTTATGCTTCTGGTGAATCTCACTCAGTCGGA
TGATGGCGTTTCTTCCTTGCTTCAGATTGAGGATTAGAAGATGCGTGGACTACATATCAT
GAAGCTTGTAAGGTCATTTTGCAGGTCTTCTGGAGAAACTGCTGATGATCAGTTTGAGCA
TGTTGGCTCAATCCTAGTGAACATATCGAAAACAGAAGATGGGAGGAAAATGTTACTTGA
GCCAAAGAGAGTACTACTAAAACAGATCATTAGGCAGTTTGATTCAACAAACCAATTGCG
TAAGAAAGGGGTTGCTGGGACTATCCGTAACTGCTCTTTTGAAGCCAAGAACCAACTGGA
GATATACTCTTGATATCAGAGTTTCTCTGGCC
CCC

QA 1 752 1 752
DS 

RD RS1GU38TF 777 0 0
GT
GGCAGAGACATTGCGCGCAGAGAAGCACAAACGTGAATACTCTCTCTATCTCGGCGGAGA
CCAGAGATATGGCGACGGAGTTAGAAGAGCTTGTCGAGTTCCTATCGTCTCCTTCTCCTC
CTGTGAAGAAAGCTGCGGTGGAGATTGTTAGCGGATTAACTGGTTCGGAGGAAGGTCTAC
AATCTCTATCCAAGTATTCCGAGATTCTACTTCCATCACTCTCTCGTCTCCTTAGTGAAA
GCAAGGAGGTCTCAGAGCCAGCAGCTCAGGCTCTTGTAAATCTTTCCCAGAACTCTGAAC
TAACTAAGAAGATGATTCAGATGGGTTTGATCAAAGTGGCCATGGACATGTTGTATAAGC
CACAGTCTTGTATCACTAGATTGCTTGTTATGCTTCTGGTGAATCTCACTCAGTCGGATG
ATGGCGTTTCTTCCTTGCTTCAGATTGAGGATGAGAAGATGCGTGGACTACATATCATGA
AGCTTGTAAGGTCATTTTGCAGGTCTTCTGGAGAAACTGCTGATGATCAGTTTGAGCATG
TTGGCTCAATCCTAGTGAACATATCGAAAACAGAAGATGGGAGGAAAATGTTACTTGAGC
CAAAGAGAGGACTACTAAAACAGATCATTAG*CAGTTTGATTCAACAAACCAATTGCGTA
AGAAAGGG*TTGCTGGGACTATCCGTAACTGCTCTTTG**AGCCAG**ACCAGCTGGAGA
TATACTCT*GATATCAGAGTTTCTCTGGCCGCTCTCCTCTACAGTGCAGCAGTAG

QA 3 777 3 777
DS 



AS 1 2

CO CL7600Contig1 892 2 8 U
GGAAAAGCCAAAGGTACGTTTACAGATTCGTTAAGTCGTAGTGTTCTTCTGATCAGAGAA
ATGGCGTAAATCTGATTTAACTCTCTTCCCCTCTCCTATCTATTAGGCAGAAGAAGAACA
CATGTCGATCTACGTCGCGTCACGGCGACTTTCCGCCAGAACAACCGCGGGGACGCTGCG
TTATGCCAGTGCTCTGAGATCTTATTCAACGTCGTCGTTTAGGGAGGAGAGGGACACCTT
CGGGCCGATCCAAGTTCCTTCCGATAAATTGTGGGGAGCCCAGACGCAGAGATCGCTACA
GAACTTCGAAATCGGTGGTGAGCGGGAGCGTATGCCCGAACCTATCGTCCGCGCTTTCGG
CGTCTTGAAGAAGTGCGCTGCCAAGGTAAACATGGAGTATGGACATGATCCAACGATTGG
GAAAGCGATTATGGAAGCAGCTCAGGAAGTAGCTGAGGGCAAACTCAATGATCATTTCCC
CCTTGTTGTTTGGCAAACTGGTAGTGGCACTCAGAGTAACATGAATGCCAATGAGGTCAT
TGCTAACAGAGCAGCTGAGATTCTTGGTCGCAAACGTGGTGAAAAATGCGTCCACCCTAA
TGACCATGTCAACCGTTCTCAATCATCTAACGACACTTTCCCTACTGTCATGCACATTGC
AGCTGCAACCGAGATTAATTCAAGGCTCATTCCTAGTTTGAAAACTTTGCATTCCACTCT
CGACTCTAAGTCCTTCGAGTTCAAAGATATTGTCAAAATTGGAAGAACTCACACTCAAGA
TGCTACTCCTTTGACCCTAGACAAGAATTTGGTGGCTATGCTACTCAAGTTAAGTATGGA
CTTAATCGAGTCACATGCACTCTCCCCCCTATGTTATGTTTGGTGTCTCGTT


BQ
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AF RS1DE05TF U 1
AF RS1FL52TF U 95
BS 1 404 RS1DE05TF
BS 405 405 RS1FL52TF
BS 406 682 RS1DE05TF
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BS 815 892 RS1FL52TF

RD RS1DE05TF 814 0 0
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CGACTCTAAGTCCTTCGAGTTCAAAGATATTGTCAAAATTGGAAGA*CTCACACTCAAGA
TGCTACTCCTTTGACCCTAGACAAGAATTTGGTG

QA 1 814 1 814
DS 

RD RS1FL52TF 798 0 0
GGAAAGCCAA
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CGCAGAGATCGCTACAGAACTTCGAAATCGGTGGTGAGCGGGAGCGTATGCCCGAACCTA
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ATGATCCAACGATTGGGAAAGCGATTATGGAAGCAGCTCAGGAAGTAGCTGAGGGCAAAC
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GTCTCGTT

QA 11 798 11 798
DS 



AS 1 2

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CATACTGCATTGTCTTCCCTTCTTTGTCCTCAAGTATCTCAACTATCTCCCCCGTCTCCC
CGGATATTTTGACGGCGACCCCATGCGGCTTAAACCCGTTCACTAACCCAATCAACAACT
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GGATGTTGTCAGGATAACCAGGAACCTTGGCGAAGATATCACGAGTCCCGGCTTTAGGAC
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AAAATACTTCCCTGAAATGATACTTGTCACTACTATCATTGAAGTAGAAGACATCTTCCT
CTTCGTCATA


BQ
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AF RS1EU57JQ U 1
AF RS1CB92JQ U 1
BS 1 578 RS1CB92JQ
BS 579 579 RS1EU57JQ
BS 580 790 RS1CB92JQ

RD RS1EU57JQ 710 0 0
G
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ATACTGCATTGTCTTCCCTTCTTTGTCCTCAAGTATCTCAACTATCTCCCCCGTCTCCCC
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TCCAAATAAGTTTTTCTTACAGTGTATGCCAATCCAAAAATCACCCGTGGGTGTTAAACG
GATGTTGTCAGGATAACCAGGAACCTTGGCGAAGATATCACGAGTCCCGGCTTTAGGACC
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QA 2 710 2 710
DS 

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CAGGCTTAAAAACCGACCCAAACCATATCTTACCATCATCTCTCTCATAAGCCTCACTCA
CATACTGCATTGTCTTCCCTTCTTTGTCCTCAAGTATCTCAACTATCTCCCCCGTCTCCC
CGGATATTTTGACGGCGACCCCATGCGGCTTAAACCCGTTCACTAACCCAATCAACAACT
CTAACTTCACCGTCTTTTCAACCAACTTACCTAACCACTGATAATTATTCACGGCCAGTC
TTCCAAATAAGTTTTTCTTACAGTGTATGCCAATCCAAAAATCACCCGTGGGTGTTAAAA
GGATGTTGTCAGGATAACCAGGAACCTTGGCGAAGATATCACGAGTCCCGGCTTTAGGAC
CTTTAATCCAATATCTATGGACAAGGCCAGTGGCAGACTCACATGAGATTAAGAAAGATC
TATCTTTGTTTAGAGCCAAACCGTTGTTACAACGGAGATTGTCCATGACAACTTTGGCCT
CTTTCGTCTTCTTGTTGTATCTGATCACTCTTCCTGACCGCTCACCGTTGACAGTCACGT
AAAATACTTCCCTGAAATGATACTTGTCACTACTATCATTGAAGTAGAAGACATCTTCCT
CTTCGTCATA

QA 1 790 1 790
DS 



AS 1 2

CO CL7602Contig1 722 2 2 U
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CATATAACAAATATTGATCACCTTCTTCTTTGGGAAGATAATAATGATATACAACAAGAA
ATTGGTAGCACATTCAAAATGAAGAGACAAGAAAGAGTTTTGCCTGTTGGGGGGGGGGAT
GATTTGTATTAAACACTCAAAAATGAGAGAGAGAGAATCAAAAAGCAGAGCCAGAGTTAT
TGGATTTGCCAAGCATGATATCTCTGGCTTCATTGATCTTAGAAGCAAGATAGTGACTAC
CTCCAGCGTCAGGGTGGTTTGCTACCATCACTCTCCTGTGAGCTTCTTTCACCTTCTCCG
CCACTACCCTCTCCCTAACACCAAGAATGAGAGCAGCTTCGCGCCGTGTCATGGCAGCTT
GGAAACCACCTTCATAGAACCTGCGCATTCTAGGAACGATGGGCCTGGCCTTGAAAGCTT
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GGGATGCGGGGGGGATGGGTTTTAGGGTTCTTCTTCAAGAGGAAAGAGGAAAACAAAACC
CC


BQ
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20 20 

AF RS1EX76TF C 1
AF RS1EX76JQ U 21
BS 1 20 RS1EX76TF
BS 21 722 RS1EX76JQ

RD RS1EX76TF 722 0 0
GATCAATTTCTTTTTTTATTCAGTACATGTGTCTGATTACACAGGCTAAGGTGTTTGTAT
CATATAACAAATATTGATCAC*TTCTTCTTTGGGAAGATAATAATGATATACAACAAGAA
ATTGGTAGCACATTCAAAATGAAGAGACAAGAAAGAGTTTTGCCTGTTGGGGGGGGGGAT
GATTTGTATTAAACACTCAAAAATGAGAGAGAGAGAATCAAAAAGCAGAGCCAGAGTTAT
TGGATTTGCCAAGCATGATATCTCTGGCTTCATTGATCTTAGAAGCAAGATAGTGACTAC
CTCCAGCGTCAGGGTGGTTTGCTACCATCACTCTCCTGTGAGCTTCTTTCACCTTCTCCG
CCACTACCCTCTCCCTAACACCAAGAATGAGAGCAGCTTCGCGCCGTGTCATGGCAGCTT
GGAAACCACCTTCATAGAACCTGCGCATTCTAGGAACGATGGGCCTGGCCTTGAAAGCTT
GCCAAGCGAGTATACCGTATCTACCAGCTATAGCAGCAGCAGCTACTGCAGCACCTGCAA
CCATTGGCGTAGCCATCGTATCGTTGTTCACGTAGGTTTGAGCGAAGAAGCTACACAGAT
GAAATTGGATTAAACAAATATAATATTCTTCGATTATCGATTCTTCTCTCTATCAGATCG
GGGATGCGGGGGGGATGGGTTTTAGGGTTCTTCTTCAAGAGGAAAGAGGAAAACAAAACC
CC

QA 1 722 1 722
DS 

RD RS1EX76JQ 702 0 0
CAGTACATGTGTCTGATTACACAGGCTAAGGTGTTTGTATCATATAACAAATATTGATCA
CCTTCTTCTTTGGGAAGATAATAATGATATACAACAAGAAATTGGTAGCACATTCAAAAT
GAAGAGACAAGAAAGAGTTTTGCCTGTTGGGGGGGGGGATGATTTGTATTAAACACTCAA
AAATGAGAGAGAGAGAATCAAAAAGCAGAGCCAGAGTTATTGGATTTGCCAAGCATGATA
TCTCTGGCTTCATTGATCTTAGAAGCAAGATAGTGACTACCTCCAGCGTCAGGGTGGTTT
GCTACCATCACTCTCCTGTGAGCTTCTTTCACCTTCTCCGCCACTACCCTCTCCCTAACA
CCAAGAATGAGAGCAGCTTCGCGCCGTGTCATGGCAGCTTGGAAACCACCTTCATAGAAC
CTGCGCATTCTAGGAACGATGGGCCTGGCCTTGAAAGCTTGCCAAGCGAGTATACCGTAT
CTACCAGCTATAGCAGCAGCAGCTACTGCAGCACCTGCAACCATTGGCGTAGCCATCGTA
TCGTTGTTCACGTAGGTTTGAGCGAAGAAGCTACACAGATGAAATTGGATTAAACAAATA
TAATATTCTTCGATTATCGATTCTTCTCTCTATCAGATCGGGGATGCGGGGGGGATGGGT
TTTAGGGTTCTTCTTCAAGAGGAAAGAGGAAAACAAAACCCC

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 2

CO CL7603Contig1 757 2 5 U
GGGATCCAACCAAAAAAAGAAGAAATGTCTCTGTTTCTTTTTCTTCTTCTTCTACTACTC
CCATTCATCACTCCATCTTCTCAATCCTCAATCCGAAACCTTCTTGAAGCTCGTGGTTTA
CCAGGTGGGTTGTTTCCCGACAACGTGGAGAGTTACAGTCTAGACGTAAAGACTGGGGAA
CTCGAAGTTCAGTTACAGAATCCTTGTTTTGCTCGGTTCGAAAACAGAGTATACTTTGAT
AGTGTGATTAAAGCAAATCTTAGCTATGGTGGGCTTGTTGGGCTTCAAGGTTTAACACAA
GAAGAGCTTTTTCTTTGGTTGCCAGTCAAAGGCATTGCAGTGAATGATTCTACTTCTGGA
CTTGTTCTTTTTGATATTGGTGTTGCTCATAAACAAATCTCTCGCTCTCTCTTTGAAGAT
CCTCCTGTTTGCTATCCTCCTGGATCAATTATGGAGAACATAGAGAAGAGGAAGATGGAT
ATTCAACTCCAGAGATAAGAGAGCTTCTTTTGGGGTGTATGACATTCAAAACTTAAATCT
TCTCTGTGAAACGTGAAAGAAAGATGTACTTCTTTTTTTTGAGGGGGGCTGGGCTGTTTT
GTGAAAACTGAAATATGGGAGAAATTATGTAAAATCAGGAAAGAAGAGGAAATTTTGGAA
CTTTGTATAAACTATGGGGTCCACAAAGTAATCAATTTTGTCACTTGTCTCTTTTTCTTC
AAAATGTGAGAATATATAGAGAGTATTTAAATACATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1F410TF U 1
AF RS1F410JQ C 52
BS 1 723 RS1F410TF
BS 724 724 RS1F410JQ
BS 725 731 RS1F410TF
BS 732 732 RS1F410JQ
BS 733 757 RS1F410TF

RD RS1F410TF 757 0 0
GGGATCCAACCAAAAAAAGAAGAAATGTCTCTGTTTCTTTTTCTTCTTCTTCTACTACTC
CCATTCATCACTCCATCTTCTCAATCCTCAATCCGAAACCTTCTTGAAGCTCGTGGTTTA
CCAGGTGGGTTGTTTCCCGACAACGTGGAGAGTTACAGTCTAGACGTAAAGACTGGGGAA
CTCGAAGTTCAGTTACAGAATCCTTGTTTTGCTCGGTTCGAAAACAGAGTATACTTTGAT
AGTGTGATTAAAGCAAATCTTAGCTATGGTGGGCTTGTTGGGCTTCAAGGTTTAACACAA
GAAGAGCTTTTTCTTTGGTTGCCAGTCAAAGGCATTGCAGTGAATGATTCTACTTCTGGA
CTTGTTCTTTTTGATATTGGTGTTGCTCATAAACAAATCTCTCGCTCTCTCTTTGAAGAT
CCTCCTGTTTGCTATCCTCCTGGATCAATTATGGAGAACATAGAGAAGAGGAAGATGGAT
ATTCAACTCCAGAGATAAGAGAGCTTCTTTTGGGGTGTATGACATTCAAAACTTAAATCT
TCTCTGTGAAACGTGAAAGAAAGATGTACTTCTTTTTTTTGAGGGGGGCTGGGCTGTTTT
GTGAAAACTGAAATATGGGAGAAATTATGTAAAATCAGGAAAGAAGAGGAAATTTTGGAA
CTTTGTATAAACTATGGGGTCCACAAAGTAATCAATTTTGTCACTTGTCTCTTTTTCTTC
AAA*TGTGAGA*TATATAGAGAGTATTTAAATACATC

QA 1 757 1 757
DS 

RD RS1F410JQ 706 0 0
CTACTACTCCCATTCATCACTCCATCTTCTCAATCCTCAATCCGAAACCTTCTTGAAGCT
CGTGGTTTACCAGGTGGGTTGTTTCCCGACAACGTGGAGAGTTACAGTCTAGACGTAAAG
ACTGGGGAACTCGAAGTTCAGTTACAGAATCCTTGTTTTGCTCGGTTCGAAAACAGAGTA
TACTTTGATAGTGTGATTAAAGCAAATCTTAGCTATGGTGGGCTTGTTGGGCTTCAAGGT
TTAACACAAGAAGAGCTTTTTCTTTGGTTGCCAGTCAAAGGCATTGCAGTGAATGATTCT
ACTTCTGGACTTGTTCTTTTTGATATTGGTGTTGCTCATAAACAAATCTCTCGCTCTCTC
TTTGAAGATCCTCCTGTTTGCTATCCTCCTGGATCAATTATGGAGAACATAGAGAAGAGG
AAGATGGATATTCAACTCCAGAGATAAGAGAGCTTCTTTTGGGGTGTATGACATTCAAAA
CTTAAATCTTCTCTGTGAAACGTGAAAGAAAGATGTACTTCTTTTTTTTGAGGGGGGCTG
GGCTGTTTTGTGAAAACTGAAATATGGGAGAAATTATGTAAAATCAGGAAAGAAGAGGAA
ATTTTGGAACTTTGTATAAACTATGGGGTCCACAAAGTAATCAATTTTGTCACTTGTCTC
TTTTTCTTCAAAATGTGAGAATATATAGAGAGTATTTAAATACATC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL7604Contig1 1222 2 8 U
GGATTTCATTTCGGACAACCAACTTGCGACCAAAGAAAGCAAATCAAGACTCGAGTCTTT
AAGCACCAACCACTCCTTTGGTCTGTGTCTTTAAAACAATAATTAAATATATTTTTAATG
GACTGTTCTTCGTTTCTCGACATATCTCTCAATCTCAACACCAACACGATCGATCGTAGT
TTCCCGGCAAAACTTCCGAAGAAGGAGGTCAAGGTTTCAACTTCTGCTGATTTTAAAAGG
AAATGGGTTGTCAAAGACGAGAGCGCAATTGAGTTAAGAGAGGAGCTAAACAGAGTCAAC
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CAACATTATTTGGAGAAGCTTCAGAGTCGACAAAGCCCTGATATAGATCAGATCGAACAA
CCGACAAAGAAAGGAAAACAAGATTCGGATGATGCGTCCTTAAGCCTTCTTTATGGACTC
AGTAGTGGAAAAACTGACAACATCTCCAGTAACGAAGATCTTCATCAGCAAAAAAATCAG
ATTCTTTCATTCAATGGACCAGTATCTGATAACTTCAACAAAGCAAAGATTTTAACAGTC
TACTTTCCTACTGTTTCTTCCGACACAAGCTTGACCGTAAAAGATGGGTATCAATGGAGG
AAATACGGACAAAAAGTTACTAGAGATAACCCTTCACCAAGGGCTTACTTTAGATGCTCG
TTTGCGCCTTCTTGTCCAGTGAAAAAGAAGGTGCAACGCAGCGCAGAGGATCCTTCAGTA
CTGGTTGCTACATACGAAGGGACGCATAACCACTTAGGTCCAAACGCTTCTGAAGGGGAT
GCTACAAGCCAAGTTGGATCAAGAACTGTGACTCTGGATATGGTTCACGGTGGTCATAGA
TTAGCTTTGGAGAAGAACGAAAGGGAGACGATGCAAGAGGTTCTAGTTCAGCAGATGGCG
TCTTCGTTAACGAAAGATTCAAGGTTTACAGCTGCTCTTGCGGCTGCTATATCTGGGAGG
TTGATGGAGCAGTCTAGAACATGAAGCTTTCAGTGAATTTCTGTCTTGGTTTATCGTCCC
TAGAAATAGGAGTGGCTAATTTCTTTCAAAATTTTATCTTTTACTTGGGAGAAAAAGATG
GAAACGTTAGTGTACATAAATATTGTAACTAACTACATGAAAAATCATAAGCAATCAAGA
AAATTTAAATGTTAGTTGTTTT


BQ
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AF RS1EJ82TF U 1
AF RS1EJ82JQ C 470
BS 1 736 RS1EJ82TF
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CTGGTTGCTACATACGA

QA 1 797 1 797
DS 

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TTAGATGCTCGTTTGCGCCTTCTTGTCCAGTGAAAAAGAAGGTGCAACGCAGCGCAGAGG
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CTGAAGGGGATGCTACAAGCCAAGTTGGATCAAGAACTGTGACTCTGGATATGGTTCACG
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QA 1 753 1 753
DS 



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BQ
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AF RS1BB39TF U 1
BS 1 699 RS1BB39TF

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DS 

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QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 2

CO CL7606Contig1 699 2 1 U
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BQ
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AF RS1A406JQ C 1
AF RS1A406TF U 1
BS 1 699 RS1A406TF

RD RS1A406JQ 699 0 0
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DS 

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AACACCATGAATGGTGTTCGCATCAAGAAATGGCCTGGATCTCCTCCTGGTATTGCCTCC
AACATTATTTTTGAGGATATCACAATGGACAATGTTAGCACTCCCGTTCTCATCGACCAA
GAGTACTGTCCTTATGCCGACTGCAAAGTTGGGGTACCATCTAAGGTGAAATTGTCGGAC
GTGACCTTCAAGAACATTAAGGGCACATCAGCGACCAAGATTGCTGTGAAATTAATCTGC
AGCTCAGGCACGCCTTGCACTAATGTTGCTCTTGCTGACATCAACTTGGTCCACAAAGGT
GCAGAAGGACCAGCTGTAGGGGCCTGTGCTAACATGAAGCCTGTTCTCACCGGACAGATG
ATTCCACCTGCTTGCACTGAGATTGCTAAATCGGGTCCTTGAATTTTATAGTCGCTTGTC
CACCAAGCATCCATCTAATTAAGACACTTTGATTAACTAGACTGCGATGGAAAAGTTAAT
TCTGATATATCACTCTTGTATTTATAATATCTTTTTGACATATCAGTGATGTGGATATCT
CTAGAGAGAGTGACACATGACTGAGTAGTAAATTTTGTATGATTCTCAATATGCAAGAGT
GCTTTAATATATATAATAAAATTATTAAAATTTTGAAGC

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 2

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CAGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 

AF RS1CA37TF U 31
AF RS1GK79TF U 1
BS 1 70 RS1GK79TF
BS 71 71 RS1CA37TF
BS 72 128 RS1GK79TF
BS 129 129 RS1CA37TF
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RD RS1CA37TF 738 0 0
T
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GAAAGGACCAGGTCTCTACACTGACATCGGCAAAAAAAGCCAAAGATCTGCTGTACAAGG
ACCACAACAGCGACCAGAAATTCAGTATCACCACTTCCACTCCTGCCGGTGTTGCCATCA
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AAAAAAA*CACCACTACCGATTTGAGAGTTTCCACTGACAATACCGTTTTGATCACTGCT
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AACTCCGGCAAGATTGAGCTTCAGTACTTGCATGAATATGCCGGTATCAGCACAAGCATG
GGCTTGACTCAAAACCCCACTGTCAACTTCTCTGGTGTTATGGGTACCAATGTGTTGGCC
CTTGGTACCGATGTTTCCTTCGACACCAAATCAGGCAGTTTCACCAAGATCAATGCTGGA
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GACCCCTTGAC
CACTGT

QA 2 732 2 732
DS 

RD RS1GK79TF 785 0 0
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GCAAAAAA*GCCAAAGATCTGCTGTACAAGGACCACAACAGCGACCAGAAATTCAGTATC
ACCACTTCCACTCCTTCCGGTGTTGCCATCACTTCAACTGGAACCAAGAAAGGTGACTCA
CTCTTTGGAGATGTTGCTTTTCAACTCAAGCAAAAAAAACACCACTACCGATTTGAGAGT
TTCCACTGACAATACCGTTTTGATCACTGCTACGGTTGATGAGGCTGCACCTGGATTGAA
GTCCATCTTCAGCTTCAGGGCCCCTGACCAAAACTCCGGCAAGATTGAGCTTCAGTACTT
GCATGAATATGCTGGTATCAGCACAAGCATGGGCTTGACTCAAAACCCCACTGTCAACTT
CTCTGGTGTTATGGGTACCAATGTGTTGGCCCTTGGTACTGATGTTTCCTTCGACACCAA
ATCAGGCAGTTTCACCAAGATCAATGCTGGAGTTAACTTCATCAAGGATGATTTAATTGC
CTCCCTTACCCTGAACGACAAAGGAGATACTGTCAACGCTTCATTCTACCACCTTGTTAA
CCCGCTGTTCAACACCGCTGTTGGAGCTGAAGTGAACCACAAGTTCTCCACCAATGTCAA
CACCATAACCGTGGGAACGCAGCATTCGCTTGACCCCTTGACACTGTAAAGCTCGTGTGA
CAGTG

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

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GGATGCTCCGGAAGAAAGCATTCCTGCGTTTCAAAGGGCGGGAACTATCATCCCGAGGAA
AGACCGGTTCAGGCGAAGTTCTTCTCAAATGGACAATGATCCTTATACTCTGGTGGTAGC
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BQ
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TGGAAGTTTTAGACTTA

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AGGGCGGGAACTATCATCCCGAGGAAAGACCGGTTCAGGCGAAGTTCTTCTCAAATGGAC
AATGATCCTTATACTCTGGTGGTAGCTTTGAACAGTACTCAAGAAGCAGATGGTGAACTC
TACATTGACGATGGAAAAAGCTTCGAGTTCAGACGAGGCTCTTACATCCACCGCCGCTTC
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TCCGGATGTTTGATCGACAGAATTATCCTCCTGGGACACACCTCTGGTCCGAAATCTGCA
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CTAGTGGTTTCCTCCGGTACAAAGGTCTTGACTATCCGCAAACCAGGTGTCCGAGTGGAC
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QA 1 770 1 770
DS 



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BQ
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QA 1 431 1 431
DS 



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TAATCTTTGGTATTTGCTTCTTCGACTCTTTAAAACATTGTCAGTATTTTATCCTTTTGT
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TGTTTTTAAAAATTTCTGTGCTTTTAAAAAAATTTTTTAGTTATGTTAATGTTTATCATG
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BQ
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AF RS1EE22JQ C 1
AF RS1EE22TF U 31
BS 1 30 RS1EE22JQ
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BS 726 726 RS1EE22JQ
BS 727 753 RS1EE22TF
BS 754 774 RS1EE22JQ

RD RS1EE22JQ 774 0 0
ATTGCACAATGATTTCGATTTTGGGAAATGGAGATCCTTAATTCATCATTTGACCAAATA
GATCTTTTGACCTATTTTCTACAGTATGTCCATGTTTCATATGCTTCTAGTTGTATCATT
TGGTGATTTGATTGATATGTTTAATGTTTTTTTTACTTGCTATACTACATTTGTTTGTTT
GGAGAACTGAGTTGGTGAGAGTAGGAAGTATTATTTATATTATTCAGACTAGCCATGTTT
GAGTTATAATAGACTAGAAGTATTATTTATATTATTCAGACTAGCCATATTATCACATTC
AGTAAATGTTGGGGGTTTTCGTATAAATTAGGAAACCATGTAACAGTAAAATTTGGTATC
ATATAGTTTGTATGTGCTCGCGTTTTTTTATATGGTTAGATTATATTGGTGTTGGCATTT
TTGAGAAGTCATGTCTTCTTTGACTTGTATGAATGATATCTTCGTATTAGTTAATGCAAG
CTTACGCGTATGTGTGTGTTAGATAGGTGATTGTCTTGATACCACTCATTTGCTTATCAT
TAATCTTTGGTATTTGCTTTTTCGACTCTTTAAAACATTGTCAGTATTTTATCCTTTTGT
GGTTGTTGTTTTGTTATGATTTGCTTTTATGTTCTTGGTCTGTTGGGACTTTTGATGAAA
TGTTTTTAAAAATTTCTGTGCTTTTAAAAAAATTTTTTAGTTATGTTAATGTTTATCATG
TGCTAATATCGTTTAGAGATTTGATATACTCCAGTTCACCAAGTTTCATGACGT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RS1EE22TF 723 0 0
GAGATCCTTAATTCATCATTTGACCAAATAGATCTTTTGACCTATTTTCTACAGTATGTC
CATGTTTCATATGCTTCTAGTTGTATCATTTGGTGATTTGATTGATATGTTTAATGTTTT
TTTTACTTGCTATACTACATTTGTTTGTTTGGAGAACTGAGTTGGTGAGAGTAGGAAGTA
TTATTTATATTATTCAGACTAGCCATGTTTGAGTTATAATAGACTAGAAGTATTATTTAT
ATTATTCAGACTAGCCATATTATCACATTCAGTAAATGTTGGGGGTTTTCGTATAAATTA
GGAAACCATGTAACAGTAAAATTTGGTATCATATAGTTTGTATGTGCTCGCGTTTTCTTA
TATGGTTAGATTATATTGGTGTTGGCATTTTTGAGAAGTCATGTCTTCTCTGACTTGTAT
GAATGATATCTTCGTATTAGTTAATGCAAGCTTACGCGTATGTGTGTGTTAGATAGGTGA
TTGTCTTGATACCACTCATTTGCTTATCATTAATCTTTGGTATTTGCTTCTTCGACTCTT
TAAAACATTGTCAGTATTTTATCCTTTTGTGGTTGTTGTTTTGTTATGATTTGCTTTTAT
GTTCTTGGTCTGTTGGGACTTTTGATGAAATGTTTTTAAAAATTTCTGTGCTTTTAAAAA
A*TTTTTTAGTTATGTTAATGTTTATCATGTGCTA*TATCGTTTAGAGATCTGATATACT
CCA

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

CO CL7611Contig1 932 2 2 U
GGTGCTATTGGAGCAGCTGGATTTGTTAGCCAACAGTGCAAGACTATTGTGGATCAGCAC
GGACAGACCATTTTGGAACTCCTTTTGTCTGAGACCCAGCGGAAGAAAATCTACTCGCAG
ATTGGTCTGTGCACTTTCGATGGTAAACGTGGTGTCAGCATGGCCATTGAGTCAGTGGTT
GACAAGGAAAACGCCAAATCGTCCAATGGTGTTGGAGATGCCTCGTGTTCTGCATGTGAG
ATGGCAGTTGTTTGGACACAGAGTCAGTTGAGGCAGAACATGACTCAGGAACGCATATTG
GACTCCTACATTAACGATCTATGCGAGCGTCTTCCCAGCCAATTGGGAGAGTCTGCAGTG
GACTGTGCACAACTCACAATTGGAGGCAAAGTCTTTGATCTTGCTCCAGAGGAGTATGTT
CTGAAGGTTGGTGAGGGCCCTGCGGCACAGTGCATGTTACGTACGAGGAAAGGTACCCAC
CGAGAAGAGGCCGAAAGGAGGGGGAAAGACTTGAAGGAAGACTAAGTCCAAGTCCATGAA
GGAGAATAAAGGAGACTACTTGGCGGGCAAGGAGTCTTAGTAGGAGTAGTAGCTATCGTG
TCAATAAGACAAAGGAGACTGCCGCACGTGGGGTGTTGGATCAGTAGCCTTTGTATGACG
AGAAGGAATATCTCCTTTATAAGTCACGTCGTTAGTGTGTCTAGGAAAGTTATCAAGTTA
TTGGTTATCATCATGTTCATGTTAGAGAGAGAGTTGAGGCTTTTCTTTCTATTGTAGCCG
TTCTTGAGTGATCAATACAGTCTGAGTTTTCTTGTAACACTTTCTTACATATCTCGAGTA
GCAAATCGTAACAGTGCATCAGTGACTTTTGGTCAAATACCACACCGTGTTTGACTTGGG
AAATGAGCAGGTCGGGTTTGCAGAGGCAGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EC71TF U 1
AF RS1EC71JQ C 191
BS 1 610 RS1EC71TF
BS 611 932 RS1EC71JQ

RD RS1EC71TF 610 0 0
GGTGCTATTGGAGCAGCTGGATTTGTTAGCCAACAGTGCAAGACTATTGTGGATCAGCAC
GGACAGACCATTTTGGAACTCCTTTTGTCTGAGACCCAGCGGAAGAAAATCTACTCGCAG
ATTGGTCTGTGCACTTTCGATGGTAAACGTGGTGTCAGCATGGCCATTGAGTCAGTGGTT
GACAAGGAAAACGCCAAATCGTCCAATGGTGTTGGAGATGCCTCGTGTTCTGCATGTGAG
ATGGCAGTTGTTTGGACACAGAGTCAGTTGAGGCAGAACATGACTCAGGAACGCATATTG
GACTCCTACATTAACGATCTATGCGAGCGTCTTCCCAGCCAATTGGGAGAGTCTGCAGTG
GACTGTGCACAACTCACAATTGGAGGCAAAGTCTTTGATCTTGCTCCAGAGGAGTATGTT
CTGAAGGTTGGTGAGGGCCCTGCGGCACAGTGCATGTTACGTACGAGGAAAGGTACCCAC
CGAGAAGAGGCCGAAAGGAGGGGGAAAGACTTGAAGGAAGACTAAGTCCAAGTCCATGAA
GGAGAATAAAGGAGACTACTTGGCGGGCAAGGAGTCTTAGTAGGAGTAGTAGCTATCGTG
TCAATAAGAC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RS1EC71JQ 742 0 0
ACGCCAAATCGTCCAATGGTGTTGGAGATGCCTCGTGTTCTGCATGTGAGATGGCAGTTG
TTTGGACACAGAGTCAGTTGAGGCAGAACATGACTCAGGAACGCATATTGGACTCCTACA
TTAACGATCTATGCGAGCGTCTTCCCAGCCAATTGGGAGAGTCTGCAGTGGACTGTGCAC
AACTCACAATTGGAGGCAAAGTCTTTGATCTTGCTCCAGAGGAGTATGTTCTGAAGGTTG
GTGAGGGCCCTGCGGCACAGTGCATGTTACGTACGAGGAAAGGTACCCACCGAGAAGAGG
CCGAAAGGAGGGGGAAAGACTTGAAGGAAGACTAAGTCCAAGTCCATGAAGGAGAATAAA
GGAGACTACTTGGCGGGCAAGGAGTCTTAGTAGGAGTAGTAGCTATCGTGTCAATAAGAC
AAAGGAGACTGCCGCACGTGGGGTGTTGGATCAGTAGCCTTTGTATGACGAGAAGGAATA
TCTCCTTTATAAGTCACGTCGTTAGTGTGTCTAGGAAAGTTATCAAGTTATTGGTTATCA
TCATGTTCATGTTAGAGAGAGAGTTGAGGCTTTTCTTTCTATTGTAGCCGTTCTTGAGTG
ATCAATACAGTCTGAGTTTTCTTGTAACACTTTCTTACATATCTCGAGTAGCAAATCGTA
ACAGTGCATCAGTGACTTTTGGTCAAATACCACACCGTGTTTGACTTGGGAAATGAGCAG
GTCGGGTTTGCAGAGGCAGTGC

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL7612Contig1 805 2 2 U
GGGACTACTTCTACTTCACACTTATCAAGCGGCGATGGCGATGTCTCTTCTGAAGCTAAG
AAACTCACCTGCTTTGAGATCGGCGGCGAATATTTCCCCGATCGGAGTTTTATCAAGGGC
TTTCTCAAAGCTCTCTGAGGGCACGGACATAACCTCGGCGGCTCCAGGCGTTTCCCTCCA
GAAAGCTCGCAGCTGGGACGAAGGCGTCTCTTCCAAATTCTCCACCACACCATTGGCCGA
CATCTTCAAGGGGAAGAAAGTCGTCATCTTTGGACTTCCTGGCGCGTACACAGGAGTCTG
CTCACAGCAGCATGTGCCAAGCTACAAGAGCCACATTGATAAGTTCAAAGCCAAAGGCAT
TGACTCCGTCATCTGTGTCTCTGTCAATGATCCATATACTATAAATGGTTGGGCAGACAA
GATTGGAGCCAAAGACGCTATTGAGTTTTATGGAGATTTGATGGGAAATTCCATAAAAGC
TTGGGGCTAGACAAGGATCTCTCTGCTGCATTGCTCGGCCCTCGGTCTGAGAGATGGTCG
GCTTATGTAGAAGACGGCAAGGTGAAGGCTGTGAACGTGGAAGAAGCACCGTCTGACTTC
AAGGTGTCAGGAGCAGAAGTCATTTTAGGACAGATCTAACAAGTGTTTCGACAAGTTCTT
CTTTGTCTCTGTTGTTTCCTCTTTTATATGAGTTGCGAGTGAGAATAAGTTTGATCCGAA
CATCACCAAAGGATCACACCAAGTCAACAACTCCACTTCTTTTTTTGGATCTTGTTTTAT
GTTTCAATAACAAAAAAGTTTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CB60TF U 1
AF RS1CB60JQ C 195
BS 1 609 RS1CB60TF
BS 610 805 RS1CB60JQ

RD RS1CB60TF 612 0 0
GGGACTACTTCTACTTCACACTTATCAAGCGGCGATGGCGATGTCTCTTCTGAAGCTAAG
AAACTCACCTGCTTTGAGATCGGCGGCGAATATTTCCCCGATCGGAGTTTTATCAAGGGC
TTTCTCAAAGCTCTCTGAGGGCACGGACATAACCTCGGCGGCTCCAGGCGTTTCCCTCCA
GAAAGCTCGCAGCTGGGACGAAGGCGTCTCTTCCAAATTCTCCACCACACCATTGGCCGA
CATCTTCAAGGGGAAGAAAGTCGTCATCTTTGGACTTCCTGGCGCGTACACAGGAGTCTG
CTCACAGCAGCATGTGCCAAGCTACAAGAGCCACATTGATAAGTTCAAAGCCAAAGGCAT
TGACTCCGTCATCTGTGTCTCTGTCAATGATCCATATACTATAAATGGTTGGGCAGACAA
GATTGGAGCCAAAGACGCTATTGAGTTTTATGGAGATTTGATGGGAAATTCCATAAAAGC
TTGGGGCTAGACAAGGATCTCTCTGCTGCATTGCTCGGCCCTCGGTCTGAGAGATGGTCG
GCTTATGTAGAAGACGGCAAGGTGAAGGCTGTGAACGTGGAAGAAGCACCGTCTGACTTC
AAGGTGTCA
CGA

QA 1 609 1 609
DS 

RD RS1CB60JQ 611 0 0
GGGACGAAGGCGTCTCTTCCAAATTCTCCACCACACCATTGGCCGACATCTTCAAGGGGA
AGAAAGTCGTCATCTTTGGACTTCCTGGCGCGTACACAGGAGTCTGCTCACAGCAGCATG
TGCCAAGCTACAAGAGCCACATTGATAAGTTCAAAGCCAAAGGCATTGACTCCGTCATCT
GTGTCTCTGTCAATGATCCATATACTATAAATGGTTGGGCAGACAAGATTGGAGCCAAAG
ACGCTATTGAGTTTTATGGAGATTTGATGGGAAATTCCATAAAAGCTTGGGGCTAGACAA
GGATCTTTCTGCTGCATTGCTCGGCCCTCGGTCTGAGAGATGGTCGGCTTATGTAGAAGA
CGGCAAGGTGAAGGCTGTGAACGTGGAAGAAGCACCGTCTGACTTCAAGGTGTCAGGAGC
AGAAGTCATTTTAGGACAGATCTAACAAGTGTTTCGACAAGTTCTTCTTTGTCTCTGTTG
TTTCCTCTTTTATATGAGTTGCGAGTGAGAATAAGTTTGATCCGAACATCACCAAAGGAT
CACACCAAGTCAACAACTCCACTTCTTTTTTTGGATCTTGTTTTATGTTTCAATAACAAA
AAAGTTTGTTT

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 2

CO CL7613Contig1 714 2 4 U
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GTTGGTTGCCCTCGTTGCCTTATGTACGTTATGCTCTCTCAAGATGACCCAAAATGTCCA
AAATGCAAAAGCACCGTCCTACTCGATTTTCTCAACCAAGACGCCTCCGCCGCTACAACT
GCTCCTGCCACCACCACTGAACGCAATAAGACATGGTGGAACTTTTTTGTTTAATCCAAC
CCTTTGTCCGAATATAAACCTATATAGGCTGGCTGATCCAACCTTGCTTGTTTCTATATA
TTTCTTTTGCTTCTTCTCGTGGTTGTTTGGTGTCAGAGTAGTGCTAATCACGCTCCACGT
TTAGACCAGACATGAAGTGGAGCGCGAGTGGCACTAACTTTGCTTTTAATGCAATACGAA
ATTATTAGAGCAAATGGTGTTCAGTATGATGAAACATTCGCACTTTGTGTGTCTATGTGT
CAACCTTTGCACCTTGGAGATTTGAAAGACTAATGTCCTCTTTTTCTTAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C581TF U 1
AF RS1C581JQ C 188
BS 1 662 RS1C581TF
BS 663 663 RS1C581JQ
BS 664 708 RS1C581TF
BS 709 714 RS1C581JQ

RD RS1C581TF 708 0 0
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GCTCCTGCCACCACCACTGAACGCAATAAGACATGGTGGAACTTTTTTGTTTAATCCAAC
CCTTTGTCCGAATATAAACCTATATAGGCTGGCTGATCCAACCTTGCTTGTTTCTATATA
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TTAGACCAGACATGAAGTGGAGCGCGAGTGGCACTAACTTTGCTTTTAATGCAATACGAA
ATTATTAGAGCAAATGGTGTTCAGTATGATGAAACATTCGCACTTTGTGTGTCTATGTGT
CA*CCTTTGCACCTTGGAGATTTGAAAGACTAATGTCCTCTTTTTCTT

QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1C581JQ 527 0 0
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CCGAATATAAACCTATATAGGCTGGCTGATCCAACCTTGCTTGTTTCTATATATTTCTTT
TGCTTCTTCTCGTGGTTGTTTGGTGTCAGAGTAGTGCTAATCACGCTCCACGTTTAGACC
AGACATGAAGTGGAGCGCGAGTGGCACTAACTTTGCTTTTAATGCAATACGAAATTATTA
GAGCAAATGGTGTTCAGTATGATGAAACATTCGCACTTTGTGTGTCTATGTGTCAACCTT
TGCCCCTTGGAGATTTGAAAGACTAATGTCCTCTTTTTCTTAAAAAA

QA 1 527 1 527
DS 



AS 1 2

CO CL7614Contig1 740 2 2 U
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CAAATGTGCTCACATTGTCAAGGTCTTTGAGGATGCATATAAATCACCAATGAGCATCAT
TATCCTTGATGATATCGAAAGATTGTTGGAGTACGTAGCAATCGGTCCTCGTTTCTCAAA
CATTATTCCTCAGACGTTAATGGTTCTTCTCAAACGACTTCCTCCAAAGGGGAAGAAACT
TCTCGTGTTTGGGACAACAAGTCAACTAACCTTCTTAGACTCTGTTGGTATCTGTGATGC
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GCCAATCAAGAAGCTGTACATGCTAATAGAGATGGCGGCGCAAGGAGAAGACGGTGGATC
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ACAAGACGTTGTCCGATTCTAAAAACTTCCCAGGCAAATCATATTTTCTTCTTCATAAAG
CTTTTGAAACAATTGGTTTGGTTATTAACTCTTTGGATTTTATTTTATTTGGTGGATGAA
TTGAACTGAGAGGGCTTTCTTGTGCTGTTGCATTGTTCTTTTGGTGAATGAGACAATATT
GCTTTTGGCTTTTTAGTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BP80TF U 1
AF RS1BP80JQ C 16
BS 1 707 RS1BP80TF
BS 708 740 RS1BP80JQ

RD RS1BP80TF 721 0 0
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TATCCTTGATGATATCGAAAGATTGTTGGAGTACGTAGCAATCGGTCCTCGTTTCTCAAA
CATTATTCCTCAGACGTTAATGGTTCTTCTCAAACGACTTCCTCCAAAGGGGAAGAAACT
TCTCGTGTTTGGGACAACAAGTCAACTAACCTTCTTAGACTCTGTTGGTATCTGTGATGC
CTTCTCTATCACTTACTCTGTTCCAACATTGAGAACAGAGGATGCAAAGAAGGTGCTGAA
GCAGCTTAATGTCTTCTCGGAGGATGATATCGATGCAGCTGCCGAGGCTCTCGATGATAT
GCCAATCAAGAAGCTGTACATGCTAATAGAGATGGCGGCGCAAGGAGAAGACGGTGGATC
CGCAGAAGCTATCTATGCTGGGAGAGAGAAAATCAAGATCACTCATTTCTTCGATTGCCT
ACAAGACGTTGTCCGATTCTAAAAACTTCCCAGGCAAATCATATTTTCTTCTTCATAAAG
CTTTTGAAACAATTGGTTTGGTTATTAACTCTTTGGATTTTATTTTATTTGGTGGATGAA
TTGAACTGAGAGGGCTTTCTTGTGCTGTTGCATTGTTCTTTTGGTGA
TGAGACATATTGCT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1BP80JQ 725 0 0
TAAGATCGTCTCTGCTGAAACTATGATTGGTCTTCAGGAGAGCACCAAATGTGCTCACAT
TGTCAAGGTCTTTGAGGATGCATATAAATCACCAATGAGCATCATTATCCTTGATGATAT
CGAAAGATTGTTGGAGTACGTAGCAATCGGTCCTCGTTTCTCAAACATTATTCCTCAGAC
GTTAATGGTTCTTCTCAAACGACTTCCTCCAAAGGGGAAGAAACTTCTCGTGTTTGGGAC
AACAAGTCAACTAACCTTCTTAGACTCTGTTGGTATCTGTGATGCCTTCTCTATCACTTA
CTCTGTTCCAACATTGAGAACAGAGGATGCAAAGAAGGTGCTGAAGCAGCTTAATGTCTT
CTCGGAGGATGATATCGATGCAGCTGCCGAGGCTCTCGATGATATGCCAATCAAGAAGCT
GTACATGCTAATAGAGATGGCGGCGCAAGGAGAAGACGGTGGATCCGCAGAAGCTATCTA
TGCTGGGAGAGAGAAAATCAAGATCACTCATTTCTTCGATTGCCTACAAGACGTTGTCCG
ATTCTAAAAACTTCCCAGGCAAATCATATTTTCTTCTTCATAAAGCTTTTGAAACAATTG
GTTTGGTTATTAACTCTTTGGATTTTATTTTATTTGGTGGATGAATTGAACTGAGAGGGC
TTTCTTGTGCTGTTGCATTGTTCTTTTGGTGAATGAGACAATATTGCTTTTGGCTTTTTA
GTTAC

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL7615Contig1 870 2 6 U
GGATGCAACACACAAGAATTTGTCTATTACTTCAGCGGTTTTTCTTCATTGTAAAATAAG
CAACTGGATACATAACTCTTAAATCTAGTTTGAAACAAATCAGAGAGAACACATACATTA
TTGACCTTTGTTGACGTTGCTATGGACATAGAAGCAGGCTTATGAAAATTCAAATAACAA
TGAGCTTGTCTGAAGATTGTAGCAACTAGACCTCAGTGAAATCAGGTATGAAGCAGTCCT
TACCAAAACCTGAACCAGTTTAGCTTTATAGTATCTCAACAACACCACGGCTCACGATCT
TTCCTTGGTTGAGATCTTGAAACGCTTTCCCTGCATCTTCAAACTTGTACTTGCTTGAAA
CCGCGTTCGTTAGATTGAAGATCCCTGACTCTGCTAGTTTCACTACTTTTGGAAGATCCT
GCCTTGCTCTTCCTCCGTATGACCCTATCACTTTTATCTTCCTACGAACAAGTCGGTTAA
TGTCTATTTCCCCAACGGAGCCAGCTTGTGAGAGTCCAATCATCACAGCTTTTCCACCAT
CTTTCACACTGAGTGTGCACTGCATGAAAGTCTGAGGCTTTCCCAAGGCTTCAACAGCAA
CATCCACACCCATCCCACCCGTTATTTCCCTTATCCTGTCAACAGCATCTTCTTTAGCAG
CATTGACAATATGAGTAGCACCAAGAGTCTTAGCCTTCTCCAATTTATCATCCTGAACAT
CCACAGCTATTATATCAGAGGCTCCAAAAGCCCTAGCTATCTGCAAACAACTAGAGCCAA
CACCACCAATTCCAATCACAGCAATAGATCGCCAGGACGGTCTCAGCAGCATGAGCCATA
GCACCATACGCAGTGAAACAGCACACCTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1C778JQ U 1
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CTTTCACACTGAGTGTGCACTGCATGAAAGTCTGAGGCTTTCCCAAGGCTTCAACAGCAA
CATCCACACCCATCCCACCCGTTATTTCCCTTATCCTGTCAACAGCATCTTCTTTAGCAG
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CCACAGCTATTATATCA

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DS 

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C
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AGTATCTCAACAACACCACGGCTCACGATCTTTCCTTGGTTGAGATCTTGAAACGCTTTC
CCTGCATCTTCAAACTTGTACTTGCTTGAAACCGCGTTCGTTAGATTGAAGATCCCTGAC
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TTAGCCTTCTCCAATTTATCATCCTGAACATCCACAGCTATTATATCAGAGGCTCCAAAA
GCCCTAGCTATCTGCAAACAACTAGAGCCAACACCACCAATTCCAATCACAGCAATAGAT
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G

QA 2 842 2 842
DS 



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GAAAATACTTAATAGCAAGTGTCTAAGTTCTTAAGTGGGCCGAATAAGTTATACGAAGTA
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BQ
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AF RS1C919TF C 1
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BS 1 4 RS1C919TF
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RD RS1C919TF 645 0 0
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AACAGACGGCGAGATATGAAACAGCCCAATAAGTTCAAATATAAACTGTTCATGGGTTTT
GAAAATACTTAATAGCAAGTGTCTAAGTTCTTAAGTGGGCCGAATAAGTTATACGAAGTA
AGGGCCCATGTAACATCTGGAGAACGAGGGAAAAAACAAAGGAAGAGTCGCTTCCCTCGT
AGATCTCTCTTCGTTTCTGGTACGGTGGTGGTGTACAGATAGATAGTTTTAACAGATTTT
CAGAGAGAAGATCAAACTAGAATTTGCGTTTGAAGGCTCGAAAAGGATGGGATACGCAAG
GAAATTGGAAGACGACAACTCAAAGCTGTTGATTGCGACTATGTGCATCATCGGTTTGCA
GGTTCACGTTCACGTCAAGGACGGTTCTGTGTTTTCCGGTTTATC

QA 1 645 1 645
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CAGACGAGTTACAGATGAAAGTAGGGTTTTTAAATCCCAAAAAAAAACGATCTCGACCGG
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CCCAAAGTCACCATATAGAGAGACAGACGTGAATGCATACACGGCAGTTCTATACAAACA
GACGGCGAGATATGAAACAGCCCAATAAGTTCAAATATAAACTGTTCATGGGTTTTGAAA
ATACTTAATAGCAAGTGTCTAAGTTCTTAAGTGGGCCGAATAAGTTATACGAAGTAAGGG
CCCATGTAACATCTGGAGAACGAGGGAAAAAACAAAGGAAGAGTCGCTTCCCTCGTAAAT
CTCTCTTCGTTTCTGGTACGGTGGTGGTGTACAGATAGATAGTTTTAACAGATTTTCAGA
GAGAAGATCAAACTAGAATTTGCGTTTGAAGGCTCGAAAAGGATGGGATACGCAAGGAAA
TTGGAAGACGACAACTCAAAGCTGTTGATTGCGACTATGTGCATCATCGGTTTGCAGGTT
CACGTTCACGTCAAGGACGGTTCTGTGTTTTCCGGTTTATC

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

CO CL7617Contig1 707 2 2 U
GGAATCACATTTCACAGAAACATCAACCAATCACATTTTTTTTTTAGTTTCAGTAATTAC
TGTGGATCACAAAACTTTCTTCAACAATCGATTCTTCTCATTACAAACCTCTGCTCCCTC
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TGTTACGAGTTCTGCACTGAATGCAACGATATTTTGCGAAACTAGATTCGAAACAAGAGA
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BQ
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AF RS1CS23JQ C 1
AF RS1CS23TF U 1
BS 1 680 RS1CS23TF
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RD RS1CS23JQ 707 0 0
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QA 1 707 1 707
DS 

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GAAAGACAGTGTGCTTGGAATGCTAATTAAAGACTGCGTCATGATTTATAAAGATAATTA
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TGTTACGAGTTCTGCACTGAATGCAACGATATTTTGCGAAACTAGATTCGAAACAAGAGA
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TCCTTTGGCTTTTACAAAAA

QA 1 680 1 680
DS 



AS 1 2

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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AY23JQ C 1
AF RS1AY23TF U 1
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QA 1 685 1 685
DS 

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QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AB86JQ C 1
AF RS1AB86TF U 1
BS 1 681 RS1AB86TF
BS 682 708 RS1AB86JQ

RD RS1AB86JQ 708 0 0
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QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1AB86TF 681 0 0
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ACAGTTTCCAGAGAACCCATCGATGGACTCGGCGTTTGTGGATAGAGCTTGGGACAAATG
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GACACCTTTGTTCTTGGTTCCAACCAGTACATAATAACATCGATCCACGAGAATTGGTTT
GCTGCTCGGTGCTTAAACACAACCCAGCCTGCTGGTGAAGGAGCTATTGTTATGCAGACC
GCGGTTTATGTTTTGGTTGCTCTGTGTGATGGATCGATTGGTTCAGCTTCTCGAGCTATG
GCTGCAGCTGATCACTTTGCATCGCAGCTGAGTAGGAAAAACTTGTAGCTTCATCTTTTT
GCCAAGATCACTAAAGAACCATATTTCTCTGTATTGGAAGTAACAAACTTTTGAGTATGT
TTTTGAGAAGTATTATGAAAA

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

CO CL7620Contig1 1046 2 2 U
TTTTTACTTAGGCCTTGAGTATTTTAACCTGTTGGCTGACGGCTCTAAGTCCACCTTCCT
TCGGCGTCTCAACCTTTCCCTCTCCGTCGTGATCCACTCCATCTACGTCGCCGACCATTT
CCTTAGATCTCATCAAGCCGTACTACCTCCTCCTCAATCTCAGAATGTTGTGACTCCGAT
TTTCTCCGGTGATGTGCACAAGGACGTGGAGAAGGTGAAGGAGTTAGTGGAAGATGGGAT
GAAGATGATGACATCTATGGAGCACATGATCCACTCTTTTCTCGAAACTCTTAGAAAAGA
TTGGAGAGAGTTTCGTGATGATGAGAAGAAGGAGATGAACATACAACAAGTGGATGTTGT
GGAGCAAATGGTCTGCTCAAAGATGGAAACTCTGAAAGACAACGTTCGCCTCAACGTTGA
TGAGATCTGGACAGGTCTCCTAGATGACCTGAGATCTATAGTCGCCGAAGATATCAAAGC
TTTGAGACAAGACAGCGGCGAGTATGTGAAATCTGTCACCGACCAACTCGACAAGACCTA
CCTTGCCATCCAAGAAACAGCCAAAGAAGCAATGACTACAGCCGACAAGGCCCAAGAGAC
GTACCTTGCCATCAAAGAAACCTCCAAAGAAGCGAAGACTACAGCCGACAAGGCCCTCGA
GACCTTCCTTGCCGTCCAAGAAACCTACAAAGAAGCGAAGACTACAGCCGACAAGGCCCT
CGAGACCTACCTTGTCTTCCAAGAAGGCCAAAACAAGAGACGGATGATAAGAGGGGAGGA
TGTAGAGGGGTTTGTCGAGCTGAAGGAGCAAGTGCGTCGAATGTCGGTGGAAGCGGAGAT
TGCAGCGGAGGAGCAGGCTCGTGCTACGGGAGAGTTGGTGGATGCACGGATTCAGCAATG
GGAGGAGGACAATGCCGATTATCTTGCCTCCCTCCCGCTCTTGTATTGCAATAAGCATAA
CTAATATTATATGATTTGATTTCATCGTCTCTTTCCTTTCTTGGTTTTTATGGAGCTTGT
TGGTTAGATTTTAGTAACTAAAATAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1ET03TF U 1
AF RS1ET03JQ C 379
BS 1 466 RS1ET03TF
BS 467 1046 RS1ET03JQ

RD RS1ET03TF 466 0 0
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TTTCTCCGGTGATGTGCACAAGGACGTGGAGAAGGTGAAGGAGTTAGTGGAAGATGGGAT
GAAGATGATGACATCTATGGAGCACATGATCCACTCTTTTCTCGAAACTCTTAGAAAAGA
TTGGAGAGAGTTTCGTGATGATGAGAAGAAGGAGATGAACATACAACAAGTGGATGTTGT
GGAGCAAATGGTCTGCTCAAAGATGGAAACTCTGAAAGACAACGTTCGCCTCAACGTTGA
TGAGATCTGGACAGGTCTCCTAGATGACCTGAGATCTATAGTCGCC

QA 1 466 1 466
DS 

RD RS1ET03JQ 668 0 0
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CCTAGATGACCTGAGATCTATAGTCGCCGAAGATATCAAAGCTTTGAGACAAGACAGCGG
CGAGTATGTGAAATCTGTCACCGACCAACTCGACAAGACCTACCTTGCCATCCAAGAAAC
AGCCAAAGAAGCAATGACTACAGCCGACAAGGCCCAAGAGACGTACCTTGCCATCAAAGA
AACCTCCAAAGAAGCGAAGACTACAGCCGACAAGGCCCTCGAGACCTTCCTTGCCGTCCA
AGAAACCTACAAAGAAGCGAAGACTACAGCCGACAAGGCCCTCGAGACCTACCTTGTCTT
CCAAGAAGGCCAAAACAAGAGACGGATGATAAGAGGGGAGGATGTAGAGGGGTTTGTCGA
GCTGAAGGAGCAAGTGCGTCGAATGTCGGTGGAAGCGGAGATTGCAGCGGAGGAGCAGGC
TCGTGCTACGGGAGAGTTGGTGGATGCACGGATTCAGCAATGGGAGGAGGACAATGCCGA
TTATCTTGCCTCCCTCCCGCTCTTGTATTGCAATAAGCATAACTAATATTATATGATTTG
ATTTCATCGTCTCTTTCCTTTCTTGGTTTTTATGGAGCTTGTTGGTTAGATTTTAGTAAC
TAAAATAA

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL7621Contig1 836 2 10 U
GAGGTTCACAAATGTCGCCTGCTGTTTCATCCGTTAGTGATGCTCCCTCATTGGACACAC
AGAGACAACAGGATATCCAGTCCAGGCTAGCTACCAGTGTTTCAGATGATTCTGATGACG
AAGATCCTGATGGAGAGACGGTAACAACAGTAGATGCTGATGATCCTACCGATGTAAAGC
GTGCTAGGAGGATGCTTTCAAACCGAGAATCCGCTAGGCGCTCTAGAAGAAGGAAGCAAG
AACATATGAGTGACCTTGCTTCACAGGTTGGTCAATTACGCGATGAGCATTCAACTTTGC
TTAAGCGACTTGGTGCCATGAATCAGAAGGTTATCACCGCTGTTGTCGATAACAGAGTCT
TAAAAGCTGAACTCGAGACAATGAGAACAAAGGTGAAGATGGCAGAAGACACTGTGAAAA
GAATGACAGGACCATACATCGTACCATTGGATAGGACGCTGATGGATTCTTCTCAGCCAA
ACTTGAATCAGCCCGATATGATTCCAAATCAAGGATCAGATAACGAGAGCTTTGCAAGCA
ACACGGTTGTTACTTTGGAAACCAGTTGCATTGTTTTTGAAACTCTGCCGCATTGGGATC
TGGAAGCAGGGAAAAATAAACCGCAAGAGTGAAATCAGCTGGATTTGATATATAACTAGG
ATGCAACTTGAACAAATGTGGTGGATGGAGCCAAAAAGTGGAGAAAAGGTGTGTTGTTAA
ATGATTGTTGGACAATTTAATTATTGGAAACAAATCGTATGGAACAGGAAAAAAAAAACT
ACAAGTGTTATCAAATGTTGTTTAGCCTTTTACTTTGGGTATTGATTATGACAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1EA75TF U 1
AF RS1EA75JQ C 39
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BS 745 836 RS1EA75JQ

RD RS1EA75TF 744 0 0
GAGGTTCACAAATGTCGCCTGCTGTTTCATCCGTTAGTGATGCTCCCTCATTGGACACAC
AGAGACAACAGGATATCCAGTCCAGGCTAGCTACCAGTGTTTCAGATGATTCTGATGACG
AAGATCCTGATGGAGAGACGGTAACAACAGTAGATGCTGATGATCCTACCGATGTAAAGC
GTGCTAGGAGGATGCTTTCAAACCGAGAATCCGCTAGGCGCTCTAGAAGAAGGAAGCAAG
AACATATGAGTGACCTTGCTTCACAGGTTGGTCAATTACGCGATGAGCATTCAACTTTGC
TTAAGCGACTTGGTGCCATGAATCAGAAGGTTATCACCGCTGTTGTCGATAACAGAGTCT
TAAAAGCTGAACTCGAGACAATGAGAACAAAGGTGAAGATGGCAGAAGACACTGTGAAAA
GAATGACAGGACCATACATCGTACCATTGGATAGGACGCTGATGGATTCTTCTCAGCCAA
ACTTGAATCAGCCCGATATGATTCCAAATCAAGGATCAGATAACGAGAGCTTTGCAAGCA
ACACGGTTGTTACTTTGGAAACCAGTTGCATTGTTTTTGAAACTCTGCCGCATTGGGATC
TGGAAGCAGGGAAAAATAAACCGCAAGAGTGAAATCAGCTGGATTTGATATATAACTAGG
ATGCAACTTGAACAAATGTGGTGGATGGAGCCAAAA*GTG*AGAAAAG*TGTGTTGTTAA
ATGATTGTTGGACA*TTTAATTAT

QA 1 744 1 744
DS 

RD RS1EA75JQ 798 0 0
GATGCTCCCTCATTGGACACACAGAGACAACAGGATATCCAGTCCAGGCTAGCTACCAGT
GTTTCAGATGATTCTGATGACGAAGATCCTGATGGAGAGACGGTAACAACAGTAGATGCT
GATGATCCTACCGATGTAAAGCGTGCTAGGAGGATGCTTTCAAACCGAGAATCCGCTAGG
CGCTCTAGAAGAAGGAAGCAAGAACATATGAGTGACCTTGCTTCACAGGTTGGTCAATTA
CGCGATGAGCATTCAACTTTGCTTAAGCGACTTGGTGCCATGAATCAGAAGGTTATCACC
GCTGTTGTCGATAACAGAGTCTTAAAAGCTGAACTCGAGACAATGAGAACAAAGGTGAAG
ATGGCAGAAGACACTGTGAAAAGAATGACAGGACCATACATCGTACCATTGGATAGGACG
CTGATGGATTTTTTTCAGCCAAACTTGAATCAGCCCGATATGATTCCAAATCAAGGATCA
GATAACGAGAGCTTTGCAAGCAACACGGTTGTTACTTTGGAAACCAGTTGCATTGTTTTT
GAAACTCTGCCGCATTGGGATCTGGAAGCAGGGAAAAATAAACCGCAAGAGTGAAATCAG
CTGGATTTGATATATAACTAGGATGCAACTTGAACAAATGTGGTGGATGGAGCCAAAAAG
TGGAGAAAAGGTGTGTTGTTAAATGATTGTTGGACAATTTAATTATTGGAAACAAATCGT
ATGGAACAGGAAAAAAAAAACTACAAGTGTTATCAAATGTTGTTTAGCCTTTTACTTTGG
GTATTGATTATGACAAGC

QA 1 798 1 798
DS 



AS 1 2

CO CL7622Contig1 874 2 2 U
GGCGTTCCCAGTCACTAAAGAGTTTCAAGATATTGTCTATACATGGCGGAAGGGACTGTC
GTGTTGTTGCAATTGACACTCCAGAACTTGAGTGTATGACTCTCACTGATCAGGTGTCTG
ACAGCTTCATAATACACAGTATTGGTCCCTCTGCAAAGGTAAACATCGATGTTCTCTTTA
ATGTGGGATATGGTGAGCCACTGGATCGTGATGATCCTTCCAAGATTACTATGCTCCGTA
AATTTCTCACTGGATTATCTACAGTCAGCAGCATGATCATCTCTGCTAACACTCTAAGTG
TTATTCATGGTTACTGTGAAATGGAACAGCTACCTACATTCTCCAACTTGTATTACTTGC
ATGCTTGCTTCCATGCCACTAAGTGGAAGATGTTACCAGTCTTACTTGAGAGTTGCCCAA
ATCTACACTCTGTCGTCCTGGAATTCACCTATTTTCGAGATAATGAGCAGGTTGACCTTT
CATCTGCACCACAATGTCTCCAATCATCTGTTGAGTGTTCACCTGAAGACACCTTACGGT
GTAAACATACAAAAGGAAGGGACACCACTCACGGGAACAACGCGTAAGATGAAATTAGCA
AAGTACATCCTAGAGAATGCTGCAGCTCTCAAGAAACTGACTCTAAGTCGGAGTTTCTGT
ACCATCATCAACCAAGTCAAATTGATTCCAAGACGCTCTACGGGGTGTGAAGTTGTAATG
GTCCTAGTGGATTAGTCGAGCCAGCTTTGTGTTCTGACGGTATTGCCCTCATTGTGCTTT
GTTAAAACTAGGACTCACCTTTTGCTTTCTTACTTCGTGATGTAACACAAACATTTTTAT
TCACGATGAAAAAGTGACGATTAAGGCTTATTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C985TF U 1
AF RS1C985JQ C 20
BS 1 704 RS1C985TF
BS 705 874 RS1C985JQ

RD RS1C985TF 705 0 0
GGCGTTCCCAGTCACTAAAGAGTTTCAAGATATTGTCTATACATGGCGGAAGGGACTGTC
GTGTTGTTGCAATTGACACTCCAGAACTTGAGTGTATGACTCTCACTGATCAGGTGTCTG
ACAGCTTCATAATACACAGTATTGGTCCCTCTGCAAAGGTAAACATCGATGTTCTCTTTA
ATGTGGGATATGGTGAGCCACTGGATCGTGATGATCCTTCCAAGATTACTATGCTCCGTA
AATTTCTCACTGGATTATCTACAGTCAGCAGCATGATCATCTCTGCTAACACTCTAAGTG
TTATTCATGGTTACTGTGAAATGGAACAGCTACCTACATTCTCCAACTTGTATTACTTGC
ATGCTTGCTTCCATGCCACTAAGTGGAAGATGTTACCAGTCTTACTTGAGAGTTGCCCAA
ATCTACACTCTGTCGTCCTGGAATTCACCTATTTTCGAGATAATGAGCAGGTTGACCTTT
CATCTGCACCACAATGTCTCCAATCATCTGTTGAGTGTTCACCTGAAGACACCTTACGGT
GTAAACATACAAAAGGAAGGGACACCACTCACGGGAACAACGCGTAAGATGAAATTAGCA
AAGTACATCCTAGAGAATGCTGCAGCTCTCAAGAAACTGACTCTAAGTCGGAGTTTCTGT
ACCATCATCAACCAAGTCAAATTGATTCCAAGACGCTCTACGGG
T

QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1C985JQ 855 0 0
GAGTTTCAAGATAT*GTCTATACATGGCGGAAGGGACTGTCGTGTTGTTGCAATTGACAC
TCCAGAACTTGAGTGTATGACTCTCACTGATCAGGTGTCTGACAGCTTCATAATACACAG
TATTGGTCCCTCTGCAAAGGTAAACATCGATGTTCTCTTTAATGTGGGATATGGTGAGCC
ACTGGATCGTGATGATCCTTCCAAGATTACTATGCTCCGTAAATTTCTCACTGGATTATC
TACAGTCAGCAGCATGATCATCTCTGCTAACACTCTAAGTGTTATTCATGGTTACTGTGA
AATGGAACAGCTACCTACATTCTCCAACTTGTATTACTTGCATGCTTGCTTCCATGCCAC
TAAGTGGAAGATGTTACCAGTCTTACTTGAGAGTTGCCCAAATCTACACTCTGTCGTCCT
GGAATTCACCTATTTTCGAGATAATGAGCAGGTTGACCTTTCATCTGCACCACAATGTCT
CCAATCATCTGTTGAGTGTTCACCTGAAGACACCTTACGGTGTAAACATACAAAAGGAAG
GGACACCACTCACGGGAACAACGCGTAAGATGAAATTAGCAAAGTACATCCTAGAGAATG
CTGCAGCTCTCAAGAAACTGACTCTAAGTCGGAGTTTCTGTACCATCATCAACCAAGTCA
AATTGATTCCAAGACGCTCTACGGGGTGTGAAGTTGTAATGGTCCTAGTGGATTAGTCGA
GCCAGCTTTGTGTTCTGACGGTATTGCCCTCATTGTGCTTTGTTAAAACTAGGACTCACC
TTTTGCTTTCTTACTTCGTGATGTAACACAAACATTTTTATTCACGATGAAAAAGTGACG
ATTAAGGCTTATTCG

QA 1 855 1 855
DS 



AS 1 2

CO CL7623Contig1 710 2 2 U
GGATTCCATACGTTCATTCTCTCTCTCACTCAGGAGAGTGAATCTTGCTTGCTTGTTTGC
TTGAATCATGGCCTCTCGTATTGCTAAAGATGTTACCGAATTGAAAGTGCTATTCTCTCC
GGTGGGAAGCCAGGCCCTCACAAGATTCAAGGGATAGGTGCTGGTTTTATACCAAGCGTG
TTGGAGGTTGATCTTATAGATGAAGTTGTTCAAGTTTCAAGTGATGAATCCATCGACATG
GCAAGGCTTCTTGCTCTTAAAGAAGGTCTTCTTGTGGGAATATCATCTGGTGCAGCAGCA
GCCGCAGCAATCAAACTTGCAAAGAGGCCAGAAAATGCCGGGAAGCTTTTCTTGGCTGTG
TTCCCAAGTTTTGGGGAGAGGTACCTGTCCACTGTACTATTCGATGCCACAAGGAAAGAA
GCAGAATCAATGACCTTCGAGGCTTGAATTGTCTCACCTGAAAATTTCATTTCTCTGTTT
CTTTTCATTTGAGACGCCAAAAATAAAAAAGAGAGATGTTCAGTTTTCTCCTGAAGAGAA
TCTCTTCATCTTCAGCTTCAGTGCGTCTTTGTGTTTGTGTTTCTGTATCTTTCTTTTGTG
TGAGAATAAAAAACAATTTAGATTTTCTCTGTTTTTCTCTTTTGAAGAACACTTTGCTGT
CAATAAGTGTGAGTCTACTTTGATTTGATTTCTATATTTTCATAATGACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1E625JQ C 1
AF RS1E625TF U 1
BS 1 684 RS1E625TF
BS 685 710 RS1E625JQ

RD RS1E625JQ 710 0 0
GGATTCCATACGTTCATTCTCTCTCTCACTCAGGAGAGTGAATCTTGCTTGCTTGTTTGC
TTGAATCATGGCCTCTCGTATTGCTAAAGATGTTACCGAATTGAAAGTGCTATTCTCTCC
GGTGGGAAGCCAGGCCCTCACAAGATTCAAGGGATAGGTGCTGGTTTTATACCAAGCGTG
TTGGAGGTTGATCTTATAGATGAAGTTGTTCAAGTTTCAAGTGATGAATCCATCGACATG
GCAAGGCTTCTTGCTCTTAAAGAAGGTCTTCTTGTGGGAATATCATCTGGTGCAGCAGCA
GCCGCAGCAATCAAACTTGCAAAGAGGCCAGAAAATGCCGGGAAGCTTTTCTTGGCTGTG
TTCCCAAGTTTTGGGGAGAGGTACCTGTCCACTGTACTATTCGATGCCACAAGGAAAGAA
GCAGAATCAATGACCTTCGAGGCTTGAATTGTCTCACCTGAAAATTTCATTTTTCTGTTT
CTTTTCATTTGAGACGCCAAAAATAAAAAAGAGAGATGTTCAGTTTTCTCCTGAAGAGAA
TCTCTTCATCTTCAGCTTCAGTGCGTCTTTGTGTTTGTGTTTCTGTATCTTTCTTTTGTG
TGAGAATAAAAAACAATTTAGATTTTCTCTGTTTTTCTCTTTTGAAGAACACTTTGCTGT
CAATAAGTGTGAGTCTACTTTGATTTGATTTCTATATTTTCATAATGACC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1E625TF 684 0 0
GGATTCCATACGTTCATTCTCTCTCTCACTCAGGAGAGTGAATCTTGCTTGCTTGTTTGC
TTGAATCATGGCCTCTCGTATTGCTAAAGATGTTACCGAATTGAAAGTGCTATTCTCTCC
GGTGGGAAGCCAGGCCCTCACAAGATTCAAGGGATAGGTGCTGGTTTTATACCAAGCGTG
TTGGAGGTTGATCTTATAGATGAAGTTGTTCAAGTTTCAAGTGATGAATCCATCGACATG
GCAAGGCTTCTTGCTCTTAAAGAAGGTCTTCTTGTGGGAATATCATCTGGTGCAGCAGCA
GCCGCAGCAATCAAACTTGCAAAGAGGCCAGAAAATGCCGGGAAGCTTTTCTTGGCTGTG
TTCCCAAGTTTTGGGGAGAGGTACCTGTCCACTGTACTATTCGATGCCACAAGGAAAGAA
GCAGAATCAATGACCTTCGAGGCTTGAATTGTCTCACCTGAAAATTTCATTTCTCTGTTT
CTTTTCATTTGAGACGCCAAAAATAAAAAAGAGAGATGTTCAGTTTTCTCCTGAAGAGAA
TCTCTTCATCTTCAGCTTCAGTGCGTCTTTGTGTTTGTGTTTCTGTATCTTTCTTTTGTG
TGAGAATAAAAAACAATTTAGATTTTCTCTGTTTTTCTCTTTTGAAGAACACTTTGCTGT
CAATAAGTGTGAGTCTACTTTGAT

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL7624Contig1 1074 2 2 U
GCAAATATACACTTGCAGATGAGGAAGATTTGGATGCTATGGAGCTAGAGCTACAAGAGA
GGCCTCTCTGCAAATGCGATGATGACGCCGAGGCTGAAGACATCGAAACTGCTTCAACAA
CCCCACAGCAAATGGATGATGAAAGTTCGAAAACGGGTTTCTCTGGACTTGATACAATCA
AGTTAGTGCTTCGCCTTTTGCCCATATGGACGATGCTTCTCATGTTTGCGGTCATCTTCC
AGCTACCAGCGACCTTCTTCACTAAACAAGGTATGACCATGAAGCGAAACATCGGTTCCA
GCTTCAAAATCCCTCCTGCGACCCTGCAAAGCACCATTACGCTATCCATAATCCTCCTCA
CGCCGCTGTATGAGAAGATCTTGATCCCTGTCACCAAAAGAACCAAGAACAACGGTCAAG
GCATCTCTGTGATGGAGAGAATGGGAGTTGGAATGTTCCTATCCATCATTGCCATTGTTA
TCGCGGCGATGGTCGAGAGGAAAAGACTAGACATAAGCCAAAAGGTGAAGAGTTTACCTG
ATTACGATCCAGAAACAGTCCCGTTCAGCATCTTCTGGCTGCTGCCTCAGTACATACTCC
TGGGAATCTCGGATATATTCACAGTGGTTGGGATGCAAGAGTTTTTCTACGCCGAGGTTC
CGGTTAGAATGAGAACAATGGGATTTGCTCTGTACACAAGTGTGTTTGGCGTAGGAGGCT
TTGTGAGCGCAGGGCTGATCTCAGTGGTGGAGGCTTATTCAACCTCAACAGGTGAAGGGC
AAAACTGGTTTGCAGATGATTTGTCGGAAGCTAGGCTAGACAAATACTACTGGCTGCTTG
CGCTAACAAGTACTATAAGCTTTGTGGTTTACGTTGTTCTATGCAAGTATTTCAAGAGTA
GTAGTAGTGATCAAGGCAGTGAAGAAGAAAAAGAAAAAGCTCCTAAATAAGACAAAAGGA
ACAGTTTCGATTTCTTTGACTTTTAAAACTAACCGTTTGCCACAACACGAGTGAACTAAC
TGTAATAGCTTAAGAAGTAACTCTCTTATAAACGCAAAAGATTTTAACTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EO79TF U 1
AF RS1EO79JQ C 350
BS 1 710 RS1EO79TF
BS 711 1074 RS1EO79JQ

RD RS1EO79TF 710 0 0
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GGCCTCTCTGCAAATGCGATGATGACGCCGAGGCTGAAGACATCGAAACTGCTTCAACAA
CCCCACAGCAAATGGATGATGAAAGTTCGAAAACGGGTTTCTCTGGACTTGATACAATCA
AGTTAGTGCTTCGCCTTTTGCCCATATGGACGATGCTTCTCATGTTTGCGGTCATCTTCC
AGCTACCAGCGACCTTCTTCACTAAACAAGGTATGACCATGAAGCGAAACATCGGTTCCA
GCTTCAAAATCCCTCCTGCGACCCTGCAAAGCACCATTACGCTATCCATAATCCTCCTCA
CGCCGCTGTATGAGAAGATCTTGATCCCTGTCACCAAAAGAACCAAGAACAACGGTCAAG
GCATCTCTGTGATGGAGAGAATGGGAGTTGGAATGTTCCTATCCATCATTGCCATTGTTA
TCGCGGCGATGGTCGAGAGGAAAAGACTAGACATAAGCCAAAAGGTGAAGAGTTTACCTG
ATTACGATCCAGAAACAGTCCCGTTCAGCATCTTCTGGCTGCTGCCTCAGTACATACTCC
TGGGAATCTCGGATATATTCACAGTGGTTGGGATGCAAGAGTTTTTCTACGCCGAGGTTC
CGGTTAGAATGAGAACAATGGGATTTGCTCTGTACACAAGTGTGTTTGGC

QA 1 710 1 710
DS 

RD RS1EO79JQ 725 0 0
T
ATCCTCCTCACGCCGCTGTATGAGAAGATCTTGATCCCTGTCACCAAAAGAACCAAGAAC
AACGGTCAAGGCATCTCTGTGATGGAGAGAATGGGAGTTGGAATGTTCCTATCCATCATT
GCCATTGTTATCGCGGCGATGGTCGAGAGGAAAAGACTAGACATAAGCCAAAAGGTGAAG
AGTTTACCTGATTACGATCCAGAAACAGTCCCGTTCAGCATCTTCTGGCTGCTGCCTCAG
TACATACTCCTGGGAATCTCGGATATATTCACAGTGGTTGGGATGCAAGAGTTTTTTTAC
GCCGAGGTTCCGGTTAGAATGAGAACAATGGGATTTGCTCTGTACACAAGTGTGTTTGGC
GTAGGAGGCTTTGTGAGCGCAGGGCTGATCTCAGTGGTGGAGGCTTATTCAACCTCAACA
GGTGAAGGGCAAAACTGGTTTGCAGATGATTTGTCGGAAGCTAGGCTAGACAAATACTAC
TGGCTGCTTGCGCTAACAAGTACTATAAGCTTTGTGGTTTACGTTGTTCTATGCAAGTAT
TTCAAGAGTAGTAGTAGTGATCAAGGCAGTGAAGAAGAAAAAGAAAAAGCTCCTAAATAA
GACAAAAGGAACAGTTTCGATTTCTTTGACTTTTAAAACTAACCGTTTGCCACAACACGA
GTGAACTAACTGTAATAGCTTAAGAAGTAACTCTCTTATAAACGCAAAAGATTTTAACTT
TATT

QA 2 725 2 725
DS 



AS 1 2

CO CL7625Contig1 543 2 3 U
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AACTTCACATGCCCACCGATCCTTCACTGCGACCTTAAGCCAAGTTATATGCTTCTCGGC
AGAGACATGATCCCAAAAATCTAGATGTTAGGCTGGCTCAGATGATGGAAACTGGCACCA
CAGAAGCTGCCATGGGAACAGCAGGGCTGCATGTCTGAAGAATATGGGAAAGATGATATC
ATATCTGAGAAATCGGATGTCTTCAGTTATGGAGTAGTGTTGTTAGAGATTCTTACTGGA
AGGAGAAACCATGAGTATTGTATTACAAATCAAGGAGATAGTCTTCTCGACTACGTTTGG
AGGCGGTGGACGGAAGGTGCTGGATTCCAGCTTCCATGATGATTCATTGTAGAAGACCAG
GTTTTACGATCAGTGAAGATTGTCTATCCTGGGTTCAACAAAATATGCACGATAGACCTA
TCACAAGGACCGTCGTGCTTGAAAGTAGCCCATGATCAGAAATTCCAGAACCGACGAAAC
CAA


BQ
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10 10 10 

AF RS1C257TF U 187
AF RS1C257JQ C 1
BS 1 186 RS1C257JQ
BS 187 403 RS1C257TF
BS 404 543 RS1C257JQ

RD RS1C257TF 217 0 0
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GAGAAATCGGATGTCTTCAGTTATGGAGTAGTGTTGTTAGAGATTCTTACTGGAAGGAGA
AACCATGAGTATTGTATTACAAATCAAGGAGATAGTCTTCTCGACTACGTTTGGAGGCGG
TGGACGGAAGGTGCTGGATTCCAGCTTCCATGATGAT

QA 1 217 1 217
DS 

RD RS1C257JQ 543 0 0
AATTGGGAGCATAGTTTCGTTATAGTGAAAGGTATTGTGGAAGGATTATGCTACCTCCAT
AACTTCACATGCCCACCGATCCTTCACTGCGACCTTAAGCCAAGTTATATGCTTCTCGGC
AGAGACATGATCCCAAAAATCTAGATGTTAGGCTGGCTCAGATGATGGAAACTGGCACCA
CAGAAGCTGCCATGGGAACAGCAGGGCTGCATGTCTGAAGAATATGGGAAAGATGATATC
ATATCTGAGAAATCGGATGTCTTCAGTTATGGAGTAGTGTTGTTAGAGATTCTTACTGGA
AGGAGAAACCATGAGTATTGTATTACAAATCAAGGAGATAGTCTTCTCGACTACGTTTGG
AGGCGGTGGACGGAAGGTGCTGGATTCGAGCTTCCATGATGATTCATTGTAGAAGACCAG
GTTTTACGATCAGTGAAGATTGTCTATCCTGGGTTCAACAAAATATGCACGATAGACCTA
TCACAAGGACCGTCGTGCTTGAAAGTAGCCCATGATCAGAAATTCCAGAACCGACGAAAC
CAA

QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 2

CO CL7626Contig1 556 2 8 U
GGGCAACAACACTCACCTTTCCAAAATACATCCGCTTTTTCAGATAATTAAGGGGAAACG
TAAGTTTCTTTTTTTTTTCTTTTCTACCTTGATAAAAAGATGTCGCTAGCTATCGCAGAT
GTATACACGGTGAGGAAGTTCCATAGAGAGAGCATGAAGAAGCCTACCAAACCTGCGGTG
GTTACCGGCGAGGGAGAAGAAAAGATGGCCGGAGGAGAGCTCCGGGAGGTCATGAAAACA
CCGGCGAAACAGAGTGGGACTAGAAGATTCGGACGATGGTTTGTTGGAAAGCCAGGAGTG
AAGAAAAGCTCTGCTAAAGTTTCGGATCCCATGGCGATTGAGCGATCAAGAAGAAGAAGA
AAACGTTCTCTTATTTTCTTTTTTCATGCGTCTTTTTAAGTTTCTTCTCTTTCATTTTAC
CGTGTGATTGTAATTTTATAAATAGTTGGTAAACGTTGTAAATTATAAAGTTAAAATATG
AACAAAAACATATGTAGAGCGTGGGGCTTTTGGAAAAATGTACTGAATTCCCTTAATACA
CAATAGCTACTTGGTG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DT09TF U 1
AF RS1FP03TF U 1
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BS 79 234 RS1DT09TF
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CCGGCGAAACAGAGTGGGACTAGAAGATTCGGACGATGGTTTGTTGGAAAGCCAGGAGTG
AAGAAAAGCTCTGCTAAAGTTTCGGATCCCATGGCGATTGAGCGATCAAGAAGAAGAAGA
AAACGTTCTCTTATTTTCTTTTTTCATGCGTCTTTTTATGTTTCTTCTCTTTCATTTTAC
CGTGTGATTGTAATTTTATAAATAGTTGGTAAACGTTGTAAATTATAAAGTTAAAATATG
AACAAAAACATATGT

QA 1 495 1 495
DS 

RD RS1FP03TF 556 0 0
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TAAGTTTCTTTTTTTTTTCTTTTCTACCTTGATAAAAAGATGTCGCTAGCTATCGCAGAT
GTATACACGGTGAGGAAGTTCCATAGAGAGAGCATGAAGAAGCCTACCAAACCTGCGGTG
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CCGGCGAAACAGAGTGGGACTAGAAGATTCGGACGATGGTTTGTTGGAAAGCCAGGAGTG
AAGAAAAGCTCTGCTAAAGTTTCGGATCCCATGGCGTTTGAGTGATCAAGAAGAAGAAGA
AAACGTTCTCTTATTTTCTTTTTTCATGCGTCTTTTTAAGTTTCTTCTCTTTCATTTTAC
CGTGTGATTGTAATTTTATAAATAGTTGGTAAACGTTGTAAATTATAAAGTTAAAATATG
AACAAAAACATATGTAGAGCGTGGGGCTTTTGGAAAAATGTACTGAATTCCCTTAATACA
CAATAGCTACTTGGTG

QA 1 556 1 556
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AGAGACAAGAAGGTCAGAAACCGATCTTCAGCGTCCGGAGATCGTCGATAATCGGACGGT
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GCGAAGTGGACGCGTCAACGAACGTGATGCTTGGACGAGATGTGTTCACTCTCGAGATAA
AACCCGGTTTCGACGGTGCTTTCGCAATGGGTCTGGTCCTCGTGCTTGACCAGATCAACG
GTGATGATCCAGTTGAGATTGGTGATGAACAAGTACACCCTTTTGTGGAGGATTAGTTTC
TTCAACTCTCACTTTCACCTCGTCAAGTCTTTGTTCCGGTTTTAACCAATCGAATCGAAT
CTTTGGGTTTTGTCAAATCTTTGGATTTGGACATTTGAGGTTGTTTTGTATGTCATTTAA
GTTGTTACGTTACATAATCTATAGTCTCTGTCTCGTGAACTTTGTTGACTGTATGTTGAT
GTTACAAAGTTCTTGTCTGCTTTCTAATTCATACATACTACATTATATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GK11TF U 1
AF RS1GK11JQ C 216
BS 1 723 RS1GK11TF
BS 724 889 RS1GK11JQ

RD RS1GK11TF 723 0 0
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TGGTGGGCAAAGCTTATCTCTACGATGAAGACAACCCACTGACCGTATGCAAAACCTCTC
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AGAGACAAGAAGGTCAGAAACCGATCTTCAGCGTCCGGAGATCGTCGATAATCGGACGGT
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TCTCGCTACGGAAATGCGTCATATACGACACGGAGAAGCGAACTGTGGCTGAGATCAAAC
GCGAAGTGGACGCGTCAACGAACGTGATGCTTGGACGAGATGTGTTCACTCTCGAGATAA
AACCCGGTTTCGACGGTGCTTTCGCAATGGGTCTGGTCCTCGTGCTTGACCAGATCAACG
GTGATGATCCAGTTGAGATTGGTGATGAACAAGTACACCCTTTTGTGGAGGATTAGTTTC
TTCAACTCTCACTTTCACCTCGTCAAGTCTTTGTTCCGGTTTTAACCAATCGAATCGAAT
CTT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1GK11JQ 674 0 0
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CGGAGATCGTCGATAATCGGACGGTGCACGATGGAAGTAGAAGTGTACGACGGAAGCGGA
GAAGAGTACACGATAGACGGTGACTTCTCGCTACGGAAATGCGTCATATACGACACGGAG
AAGCGAACTGTGGCTGAGATCAAACGCGAAGTGGACGCGTCAACGAACGTGATGCTTGGA
CGAGATGTGTTCACTCTCGAGATAAAACCCGGTTTCGACGGTGCTTTCGCAATGGGTCTG
GTCCTCGTGCTTGACCAGATCAACGGTGATGATCCAGTTGAGATTGGTGATGAACAAGTA
CACCCTTTTGTGGAGGATTAGTTTTTTCAACTCTCACTTTCACCTCGTCAAGTCTTTGTT
CCGGTTTTAACCAATCGAATCGAATCTTTGGGTTTTGTCAAATCTTTGGATTTGGACATT
TGAGGTTGTTTTGTATGTCATTTAAGTTGTTACGTTACATAATCTATAGTCTCTGTCTCG
TGAACTTTGTTGACTGTATGTTGATGTTACAAAGTTCTTGTCTGCTTTCTAATTCATACA
TACTACATTATATC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

CO CL7629Contig1 716 2 2 U
GCAACAAACAGCCAACCAATATCTGAACATTTCTCTCCAACCCCACAAGATGGTCTTCTT
CATCTCTAGAAAACGTTTGTCGCATGTCTCTTTCTCTTACCTCCAGAGCCTGCATATACC
TGTCATCGACAAGGACCTTCTGTACGCCAAGATTCTGCATATCAATGATCACCTCAGAGA
TCCTCTTACGTATGGTTTTCATATCAGACCCAAGCCCCCTGCGTTTTATAGCAACGTACG
CCGATCTTTTCATGATGTTGCTGCTTGATTCTCCAAGTTCTTTCTTCATAAGAAAGGTTT
CGACGATATCTTCTGCATCCAAAACAATTTCTTTGATGTCTTTGATAGTTTTTGTCACCA
TTTTACTTGCATGTTTCTTGGCCTCTGCGTCTTTCAGAAAGCACCTTAACTTTTCCACAT
CATTTTTCAATCCCTCGAACTGCTCTTCAACTCCTTGAAATTGCTTAGTTTCTCGGACAA
GTAGGTTCCAAAGCCTCTCGACTGCAAAAGGTAAAAGTGCAACTGCCAGCTCAGCCATAA
GTCTCCTGCTCAAACATGAAATAAGTAATCAATCATCACACGAGAGCAAGGATCCTTGGG
TTCATACATAGTCCGGTTAATATTTATTTCTTCAAATTCTAGCCTAGATAATATATACTA
TTATGTGGGATTTAATCTATTGAAAGATATGAACAATTGAGATGAAATAAATATGC


BQ
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AF RS1D116JQ C 1
AF RS1D116TF U 1
BS 1 686 RS1D116TF
BS 687 716 RS1D116JQ

RD RS1D116JQ 716 0 0
GCAACAAACAGCCAACCAATATCTGAACATTTCTCTCCAACCCCACAAGATGGTCTTCTT
CATCTCTAGAAAACGTTTGTCGCATGTCTCTTTCTCTTACCTCCAGAGCCTGCATATACC
TGTCATCGACAAGGACCTTCTGTACGCCAAGATTCTGCATATCAATGATCACCTCAGAGA
TCCTCTTACGTATGGTTTTCATATCAGACCCAAGCCCCCTGCGTTTTATAGCAACGTACG
CCGATCTTTTCATGATGTTGCTGCTTGATTCTCCAAGTTCTTTCTTCATAAGAAAGGTTT
CGACGATATCTTCTGCATCCAAAACAATTTCTTTGATGTCTTTGATAGTTTTTGTCACCA
TTTTACTTGCATGTTTCTTGGCCTCTGCGTCTTTCAGAAAGCACCTTAACTTTTCCACAT
CATTTTTCAATCCCTCGAACTGCTCTTCAACTCCTTGAAATTGCTTAGTTTTTCGGACAA
GTAGGTTCCAAAGCCTCTCGACTGCAAAAGGTAAAAGTGCAACTGCCAGCTCAGCCATAA
GTCTCCTGCTCAAACATGAAATAAGTAATCAATCATCACACGAGAGCAAGGATCCTTGGG
TTCATACATAGTCCGGTTAATATTTATTTCTTCAAATTCTAGCCTAGATAATATATACTA
TTATGTGGGATTTAATCTATTGAAAGATATGAACAATTGAGATGAAATAAATATGC

QA 1 716 1 716
DS 

RD RS1D116TF 686 0 0
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CATCTCTAGAAAACGTTTGTCGCATGTCTCTTTCTCTTACCTCCAGAGCCTGCATATACC
TGTCATCGACAAGGACCTTCTGTACGCCAAGATTCTGCATATCAATGATCACCTCAGAGA
TCCTCTTACGTATGGTTTTCATATCAGACCCAAGCCCCCTGCGTTTTATAGCAACGTACG
CCGATCTTTTCATGATGTTGCTGCTTGATTCTCCAAGTTCTTTCTTCATAAGAAAGGTTT
CGACGATATCTTCTGCATCCAAAACAATTTCTTTGATGTCTTTGATAGTTTTTGTCACCA
TTTTACTTGCATGTTTCTTGGCCTCTGCGTCTTTCAGAAAGCACCTTAACTTTTCCACAT
CATTTTTCAATCCCTCGAACTGCTCTTCAACTCCTTGAAATTGCTTAGTTTCTCGGACAA
GTAGGTTCCAAAGCCTCTCGACTGCAAAAGGTAAAAGTGCAACTGCCAGCTCAGCCATAA
GTCTCCTGCTCAAACATGAAATAAGTAATCAATCATCACACGAGAGCAAGGATCCTTGGG
TTCATACATAGTCCGGTTAATATTTATTTCTTCAAATTCTAGCCTAGATAATATATACTA
TTATGTGGGATTTAATCTATTGAAAG

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 2

CO CL7630Contig1 1125 2 4 U
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ATCCTCCTCCGCTCAGCTTCTGAGACCTAAGCTCGGGTTTACGGTTTCTCTTCCTCGGAG
AGCATCGATCGCTTCTTCTTCATCTTCTTCTTCGCGTCCCCGTTTCTTGCGGATGGAAAC
TCATTTTCAGCCTCCTCAATCTATCTCCTCCGCTTCTTCACCCACCAACAACGTCTCTTC
TCTCTCTATCCAATCAGCTAGAGTTGGAGAAGTGAAGAGAGTAACAAAGGAGACGAATGT
GTCAGTGAAGATCAATTTAGATGGCACTGGAGTTGCTGACAGTTCCGCTGGAATCCCTTT
CCTTGACCATATGCTGGATCAACTTGCTTCGCATGGCTTGTTTGATGTGCACGTCAGAGC
TACTGGTGATGTTCACATCGATGACCATCACACTAATGAAGATATTGCTCTTGCCATTGG
AACCGCTCTGTTAAAGGCACTTGGTGAGCGTAAAGGGATTAATCGGTTTGGTGACTTCAC
AGCTCCTCTAGATGAAGCCCTTATTCATGTTTCCCTGGATTTGTCTGGTAGACCATATCT
TGGTTACAACTTGGAGATTCCAACACAGAGAGTTGGGAACTATGACACTCAGTTGGTGGA
GCACTTTTCCCAGTCATTGGTGAATACTTCCGGTATGACACTTCACATCCGTCAGCTTGC
TGGTAAAAACTCGCATCACATAATAGAGGCGACATTTAAGGCCTTTGCCAGGGCTTTAAG
ACAAGCCACGGAGAATGATCCTCGCCGTGGTGGGACCATACCAAGTTCAAAAGGAGTCTT
GTCACGGTCCTGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGCTGAGCAAAAACAAAAACAAGGATGTTG
CCAAAATGTGAAGAAGAAGAAGTGAATTAGACTGAAGATCACACACACTTGGGTTCCATC
TATAAAAAGATAGATATTCTGTATTTTCTTTTAAGCATTGCTGTATCAAACTCTTAAAAC
TTACTGCAAGGAAGGACTGATCGAGTCATTTGCTAGAATAAGTAATCAAAACGCCTGTCT
TTTAATCCTTATATCGGTAGTCAACGGCAAAACGTATTGCATCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GW40TF U 1
AF RS1GW40JQ C 462
BS 1 668 RS1GW40TF
BS 669 669 RS1GW40JQ
BS 670 683 RS1GW40TF
BS 684 1125 RS1GW40JQ

RD RS1GW40TF 687 0 0
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AGCATCGATCGCTTCTTCTTCATCTTCTTCTTCGCGTCCCCGTTTCTTGCGGATGGAAAC
TCATTTTCAGCCTCCTCAATCTATCTCCTCCGCTTCTTCACCCACCAACAACGTCTCTTC
TCTCTCTATCCAATCAGCTAGAGTTGGAGAAGTGAAGAGAGTAACAAAGGAGACGAATGT
GTCAGTGAAGATCAATTTAGATGGCACTGGAGTTGCTGACAGTTCCGCTGGAATCCCTTT
CCTTGACCATATGCTGGATCAACTTGCTTCGCATGGCTTGTTTGATGTGCACGTCAGAGC
TACTGGTGATGTTCACATCGATGACCATCACACTAATGAAGATATTGCTCTTGCCATTGG
AACCGCTCTGTTAAAGGCACTTGGTGAGCGTAAAGGGATTAATCGGTTTGGTGACTTCAC
AGCTCCTCTAGATGAAGCCCTTATTCATGTTTCCCTGGATTTGTCTGGTAGACCATATCT
TGGTTACAACTTGGAGATTCCAACACAGAGAGTTGGGAACTATGACACTCAGTTGGTGGA
GCACTTTTTCCAGTCATTGGTGA
TACT

QA 1 683 1 683
DS 

RD RS1GW40JQ 664 0 0
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ATCGGTTTGGTGACTTCACAGCTCCTCTAGATGAAGCCCTTATTCATGTTTCCCTGGATT
TGTCTGGTAGACCATATCTTGGTTACAACTTGGAGATTCCAACACAGAGAGTTGGGAACT
ATGACACTCAGTTGGTGGAGCACTTTTCCCAGTCATTGGTGAATACTTCCGGTATGACAC
TTCACATCCGTCAGCTTGCTGGTAAAAACTCGCATCACATAATAGAGGCGACATTTAAGG
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TGTATCAAACTCTTAAAACTTACTGCAAGGAAGGACTGATCGAGTCATTTGCTAGAATAA
GTAATCAAAACGCCTGTCTTTTAATCCTTATATCGGTAGTCAACGGCAAAACGTATTGCA
TCCC

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

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GCTTTCTGGATCGCTAGATCTGCTTTGTACCTCAATCTCTCTGCCCTTTCTCGCTTCGCC
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GTATCCCTACTACTACTGCTATGTAACTCTTCCGCATCAAGACAAACAAGATTGGAACCG
GGGGAGGATTCATAATAGCCTCTTGCATTCCACCGTTCACTCATATTCCTCTTCCCGTTG
ATTCTTCGAGACTTGTTTTGGTGACATCCGCTCGAGAAATATCCCATGCCTAGGTCACGT
GGAGAATACGTCGTCCCAGGATGATGATGATGACTCAGAAATTCCTCCGAATGCTCGTAG
TTGTGGTTTGAGTACACAAACCTCTCCTCTCCAGAGGCCAGACCACCAGCACATCTTCTT
CCTGCAGATGAATTATAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GW62TF C 1
AF RS1DH69JQ U 60
BS 1 61 RS1GW62TF
BS 62 679 RS1DH69JQ

RD RS1GW62TF 352 0 0
ACTTGAACTCCGAGTTCGATCTTTCTATAACACAAGATGCAATGTTATAACTTGAACTGG
ACGGCTACAATAGCAACATGATATTCAACTCAAACCTTGTTCCCTAGCTGATCAAAACTA
AAACATAGTAATGGTTCTGTAGAAATTTAATATTTATTTTTTTAAATGATTTTTATTTAC
GTTGCCGTGCCGTCTCCCGTCCCCATGCTACTACAGTCTGCAAACATGAGAGCAGCTGCG
GCTTTCTGGATCGCTAGATCTGCTTTGTACCTCAATCTCTCTGCCCTTTCTCGCTTCGCC
TTGGCTATAGCGCATGCCCGCCTTGCAGCACCAGCTGCTTCTCGCAATTTG
C

QA 1 351 1 351
DS 

RD RS1DH69JQ 620 0 0
GG
CGGCTACAATAGCAACATGATATTCAACTCAAACCTTGTTCCCTAGCTGATCAAAACTAA
AACATAGTAATGGTTCTGTAGAAATTTAATATTTATTTTTTTAAATGATTTTTATTTACG
TTGCCGTGCCGTCTCCCGTCCCCATGCTACTACAGTCTGCAAACATGAGAGCAGCTGCGG
CTTTCTGGATCGCTAGATCTGCTTTGTACCTCAATCTCTCTGCCCTTTCTCGCTTCGCCT
TGGCTATAGCGCATGCCCGCCTTGCAGCACCAGCTGCTTCTCGCAATTTGTATTCATCAG
TATCCCTACTACTACTGCTATGTAACTCTTCCGCATCAAGACAAACAAGATTGGAACCGG
GGGAGGATTCATAATAGCCTCTTGCATTCCACCGTTCACTCATATTCCTCTTCCCGTTGA
TTCTTCGAGACTTGTTTTGGTGACATCCGCTCGAGAAATATCCCATGCCTAGGTCACGTG
GAGAATACGTCGTCCCAGGATGATGATGATGACTCAGAAATTCCTCCGAATGCTCGTAGT
TGTGGTTTGAGTACACAAACCTCTCCTCTCCAGAGGCCAGACCACCAGCACATCTTCTTC
CTGCAGATGAATTATAGG

QA 3 620 3 620
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7633Contig1 913 2 12 U
GTGTAAAGAGAGAAGCAGAAGGCGATCTCGCTACTCTGCCTGTCTGTCTGTGTGAATAAA
CCCAAAAGTTAAAGAAGAAATGTCAGAAGGAGCAGCAGCAAAAAAGGCGGCATTCCTAGG
GGCACTCGTTGTCTCATTCAAGGAGCAAATTCACGCTGATGTTCTCGTTCATCCTGGTGC
TGATCATCATCATCATCATCATGCTCTCCCCATCCCTACCCACAAGGCCCTCCTCTCGTC
AAGATCTAAGGTCTTCAGGAACATGCTAGACTCCGATGAATGCAAGGCCTCTGCCGAGGA
ATCTATCACTCTCCCCGATTTGAACCACGATGAGCTCAACTCTCTTCTCGAGTTCCTCTA
CTCCGGCAACCTACTTGCTCCTTACATCCAGTACCGAGCCCTCTATCTTGCTGCCGACAA
ATACGACATTCCTTATCTCCAAGACGTTTGCCGCGACCATTTCATCGCTTCTCTCACCTC
CAGGAACGTCCTTGACGTCCTGGAGCTCGCCAGCATTCCTTCCGACACCATCTTGAAATC
CGCCGCCATCAACCATGTGGTTAAACATATGGAGGAAGTGGTGGTTCCCATGAAATACGA
GACTTTTGTGCAGAGGAACCCCAATCTTGGCGTTGAGATCACCAGAGCTTATCTTAGAGA
GACCAAAGCTCTAGCCAAAGACAACAACAGATCAACTGCTTCTATTCGCCCTCATTCTCG
CATGTACTGACGATCAACCCAAACAGCTTCCCTAATATCTCACTTTGCTAAATGTGATGA
TTATGCCCCTCCTCCTTCTTCTTTTTCTTTGAGTGAGAGAATTTGAAAATACTTGTTTTA
TGGATTTATTTCAAGGTGTTGGTTGATGCCATATACAATATCAACCATATATATATATAT
ATATTCTCTTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DD51TF U 1
AF RS1DD51JQ C 364
BS 1 683 RS1DD51TF
BS 684 684 RS1DD51JQ
BS 685 715 RS1DD51TF
BS 716 716 RS1DD51JQ
BS 717 736 RS1DD51TF
BS 737 737 RS1DD51JQ
BS 738 754 RS1DD51TF
BS 755 755 RS1DD51JQ
BS 756 771 RS1DD51TF
BS 772 772 RS1DD51JQ
BS 773 781 RS1DD51TF
BS 782 913 RS1DD51JQ

RD RS1DD51TF 786 0 0
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CCCAAAAGTTAAAGAAGAAATGTCAGAAGGAGCAGCAGCAAAAAAGGCGGCATTCCTAGG
GGCACTCGTTGTCTCATTCAAGGAGCAAATTCACGCTGATGTTCTCGTTCATCCTGGTGC
TGATCATCATCATCATCATCATGCTCTCCCCATCCCTACCCACAAGGCCCTCCTCTCGTC
AAGATCTAAGGTCTTCAGGAACATGCTAGACTCCGATGAATGCAAGGCCTCTGCCGAGGA
ATCTATCACTCTCCCCGATTTGAACCACGATGAGCTCAACTCTCTTCTCGAGTTCCTCTA
CTCCGGCAACCTACTTGCTCCTTACATCCAGTACCGAGCCCTCTATCTTGCTGCCGACAA
ATACGACATTCCTTATCTCCAAGACGTTTGCCGCGACCATTTCATCGCTTCTCTCACCTC
CAGGAACGTCCTTGACGTCCTGGAGCTCGCCAGCATTCCTTCCGACACCATCTTGAAATC
CGCCGCCATCAACCATGTGGTTAAACATATGGAGGAAGTGGTGGTTCCCATGAAATACGA
GACTTTTGTGCAGAGGAACCCCAATCTTGGCGTTGAGATCACCAGAGCTTATCTTAGAGA
GACCAAAGCTCTAGCCAAAGACA*CAACAGATCAACTGCTTCTATTCGCCCTCAT*CTCG
CATGTACTGACGATCA*CCCAAACAGCTTCCCTA*TATCTCACTTTGCTAA*TGTGATGA
T
ATGCC

QA 1 781 1 781
DS 

RD RS1DD51JQ 550 0 0
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CGACATTCCTTATCTCCAAGACGTTTGCCGCGACCATTTCATCGCTTCTCTCACCTCCAG
GAACGTCCTTGACGTCCTGGAGCTCGCCAGCATTCCTTCCGACACCATCTTGAAATCCGC
CGCCATCAACCATGTGGTTAAACATATGGAGGAAGTGGTGGTTCCCATGAAATACGAGAC
TTTTGTGCAGAGGAACCCCAATCTTGGCGTTGAGATCACCAGAGCTTATTTTAGAGAGAC
CAAAGCTCTAGCCAAAGACAACAACAGATCAACTGCTTCTATTCGCCCTCATTCTCGCAT
GTACTGACGATCAACCCAAACAGCTTCCCTAATATCTCACTTTGCTAAATGTGATGATTA
TGCCCCTCCTCCTTCTTCTTTTTCTTTGAGTGAGAGAATTTGAAAATACTTGTTTTATGG
ATTTATTTCAAGGTGTTGGTTGATGCCATATACAATATCAACCATATATATATATATATA
TTCTCTTGCG

QA 1 550 1 550
DS 



AS 1 2

CO CL7634Contig1 786 2 3 U
TTTTTTTTGAAATAAAACTATTATAAATATTATTAACCCACAAAACTACTACCACAAATC
CACCAGACACACCATAAACCAAAATGCAAAAAGAAAACTTAAGAAAGCATAACATATAAA
AATCTTATTAGGTCGCCATGAAATATATAATTACTACAAAAAAACATCAATAATGCAAAA
CATAACAGCTATACTCAACAGTAGCATCGCCGTTCTTGAGATTAATCCACTTTGTCCGAG
CCTCAGCGTAGCCTCTAGCAAATCGGAAAAGCCCACTTCCTCCGACAATAGGCATTTCTC
TGACCTCCGACATCGCGGTGTTCCGACCAAGAATCGTGATGGTGCTTCCGTTGTACTTCC
CTGTCTTAAAAGCAAAGTTCATCGCCATTAGAAAACCCAATTCCTTTTGGGCTGCTCCGG
CGTAAAAGCCTCGGGCCTGACCCAACAGAGTTGAGTTCATCGGAACTTTCGCCGTCAAGG
CGTTGTCGATCATGGAGATGGCTCCGAAGTAGGAATTGTTTGTAACTGGTGGTTGAATCA
TGATGGAGGTTGGGTTTGGACCACTTAAGATGTCGTGCCAATAGACTTTGAAATGGGTTA
GCTTCTCTTTCTTGTGGAGACCGAGAAGCTTCCGATCTATGGTTCTGGCAAAGTTTTCTC
CGTCGTCTCCGGTGGAAGAAACGATGGCGAGGAGGAAGATTTGGACGGCTAAGAAGAAAA
TGAGCTTAGCCATGAGTTTTTCTTTGGTTTCTGTGGAGTTGGTTTGTTGATGATATAAGT
GGTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1EY58JQ U 23
AF RS1EY58TF C 1
BS 1 22 RS1EY58TF
BS 23 703 RS1EY58JQ
BS 704 786 RS1EY58TF

RD RS1EY58JQ 681 0 0
ATAAATATTATTAACCCACAAAACTACTACCACAAATCCACCAGACACACCATAAACCAA
AATGCAAAAAGAAAACTTAAGAAAGCATAACATATAAAAATCTTATTAGGTCGCCATGAA
ATATATAATTACTACAAAAAAACATCAATAATGCAAAACATAACAGCTATACTCAACAGT
AGCATCGCCGTTCTTGAGATTAATCCACTTTGTCCGAGCCTCAGCGTAGCCTCTAGCAAA
TCGGAAAAGCCCACTTCCTCCGACAATAGGCATTTCTCTGACCTCCGACATCGCGGTGTT
CCGACCAAGAATCGTGATGGTGCTTCCGTTGTACTTCCCTGTCTTAAAAGCAAAGTTCAT
CGCCATTAGAAAACCCAATTCCTTTTGGGCTGCTCCGGCGTAAAAGCCTCGGGCCTGACC
CAACAGAGTTGAGTTCATCGGAACTTTCGCCGTCAAGGCGTTGTCGATCATGGAGATGGC
TCCGAAGTAGGAATTGTTTGTAACTGGTGGTTGAATCATGATGGAGGTTGGGTTTGGACC
ACTTAAGATGTCGTGCCAATAGACTTTGAAATGGGTTAGCTTCTCTTTCTTGTGGAGACC
GAGAAGCTTCCGATCTATGGTTCTGGCAAAGTTTTCTCCGTCGTCTCCGGTGGAAGAAAC
GATGGCGAGGAGGAAGATTTG

QA 1 681 1 681
DS 

RD RS1EY58TF 786 0 0
TTTTTTTTGAAATAAAACTATTATAAATATTATTAACCCACAAAACTACTACCACAAATC
CACCAGACACACCATAAACCAAAATGCAAAAAGAAAACTTAAGAAAGCATAACATATAAA
AATCTTATTAGGTCGCCATGAAATATATAATTACTACAAAAAAACATCAATAATGCAAAA
CATAACAGCTATACTCAACAGTAGCATCGCCGTTCTTGAGATTAATCCACTTTGTCCGAG
CCTCAGCGTAGCCTCTAGCAAATCGGAAAAGCCCACTTCCTCCGACAATAGGCATTTCTC
TGACCTCCGACATCGCGGTGTTCCGACCAAGAATCGTGATGGTGCTTCCGTTGTACTTCC
CTGTCTTAAAAGCAAAGTTCATCGCCATTAGAAAACCCAATTCCTTTTGGGCTGCTCCGG
CGTAAAAGCCTCGGGCCTGACCCAACAGAGTTGAGTTCATCGGAACTTTCGCCGTCAAGG
CGTTGTCGATCATGGAGATGGCTCCGAAGTAGGAATTGTTTGTAACTGGTGGTTGAATCA
TGATGGAGGTTGGGTTTGGACCACTTAAGATGTCGTGCCAATAGACTTTGAAATGGGTTA
GCTTCTCTTTCTTGTGGAGACCGAGAAGCTTCCGATCTATGGTTCTGGCAAAGTTTTCTC
CGTCGTCTCCGGTGGAAGAAACGATGGCGAGGAGGAAGATTTGGACGGCTAAGAAGAAAA
TGAGCTTAGCCATGAGTTTTTCTTTGGTTTCTGTGGAGTTGGTTTGTTGATGATATAAGT
GGTCCC

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

CO CL7635Contig1 685 2 1 U
GGATTAATTAAATACTTGACGTTACAGTTCAGAGTTCAGACTTAGATGCTACCAATCTTC
AGCCGACCGGTTAATCACAAGAGCTAGCTACTTGGGAGTTGTAACGCAGCGATCACCACC
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BQ
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AF RS1E807JQ C 36
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AF RS1CX28TF C 1
AF RS1CX28JQ U 8
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AAAAAATTTAAAACCCCCACACCCCTGTTACATGTTTTATACTCACATCCTGATACTAAT
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CTTCTCCACCATCCACTCTTCTTGCTTTGGTTTTCGTAAGGATCCTCTATCCCTTGACTT
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TCCTTACCCACACAACCAAAAAAATATACATGGCACATAACAAAAGAAAAAAAAAAAAAT
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CCCAAAAGAAAACTAAAATCACAATTCACCTAGGTGAATTCTGACAAGCTGGTGACTGTA
GCGCTATTAATTAGCCCGCGATTTTGGCGATGTGAGCCACCTGGAACTGCGGAACGTAAT
TATTGGGTCGACCCTCTTCCTCCCTTGGCTCATTCAAGAACGCCCAGTTGCTTCTTCTCC
ACCATCCACTCTTCTTGCTTTGGTTTTCGTAAGGATCCTCTATCCCTTGACTTTCCGCAA
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

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BS 717 847 RS1B902JQ

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CCAACTGGTTAGGGAGACTTGGTCTTGAGAAACAAATGTTATTTTGCTACAGATGT
A

QA 1 716 1 716
DS 

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GCTGTAATGATCCAAGATGTGGCTGTGAATGCTACCAATGAGTTTCTTATCAATC

QA 7 841 7 841
DS 



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BQ
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AF RS1GN73TF U 1
AF RS1GN73JQ C 639
BS 1 740 RS1GN73TF
BS 741 741 RS1GN73JQ
BS 742 782 RS1GN73TF
BS 783 783 RS1GN73JQ
BS 784 792 RS1GN73TF
BS 793 1124 RS1GN73JQ

RD RS1GN73TF 792 0 0
GGATAATAATAGCCTGGAGACGTCTAAGACATGGTGGCTAAATTTTTAGGGAGAACCATC
AAATCTAGTTGATGTAAATAAGATGCTCAACTTGTCAAGAACATTGGACACTCGGGATCT
GGAAATATCTTATCGTCAAGGCTTCATGGTTGGCTCTGCCTGGAAAGATGGTATTATATC
GTCGATGCAGAGCAGGATCTACAATTGGGTCTTTATTTCTGACTTTGGCTTTGTGTCTCT
TGAGTTTGTTTTGTATTCTAGAAAATTTCTCACTTTGATGTCTATGCTTACGACTTACGA
GTATGACTCCACAGGGTGTTGAACCGAGGCCTTTATTCTCCCGTAGGTTTGCTGCTTTCG
TCCCAGCACCAACATGCTACAGCAGGCCGTTGGAGCTTAACGTTCTTCCAGATTATAGAC
CAACATTCTCATATTACAACAATATATATCAACATCCCCCTTGGCCTCATGCAACCCGAT
ACAGTAACGGGCAACGTTTTCAACCTATCATGGACCATGCAGTTGGTTCGAGTGCTGCTT
TTGCGACGTCAGAAGGCATAACGAGTTCAATTTCGCCGGATTTTGGTATAGATCCAACAA
GCATGAACGATGATATCGTTTTGACATTAGCTTTTGCTGCGGAGGCAGAAGACATAACGA
GTTTTACTTCCTTTGATTTCGACGAATACTCTACCACAACAAGCATGCACGATGAGATAG
TCTCGGGATCTCATAATACG*TGACAGAAAACATGACGAGGTTAAGCTCATCGGATTTGG
AC*AATACCCTA

QA 1 792 1 792
DS 

RD RS1GN73JQ 486 0 0
GCGGAGGCAGAAGACATAACGAGTTTTACTTCCTTTGATTTCGACGAATACTCTACCACA
ACAAGCATGCACGATGAGATAGTCTCGGGATCTCATAATACGGTGACAGAAAACATGACG
AGGTTAAGCTCATCGGATTTGGACCAATACCCTACCATGGCTCCAACAATCATGCACAAT
GATATAGTTTCAGCATCTCAAGCTGGGAAGCGAGAAAACAAAAAGAGCTGTATCTCAATC
TTGTGTAGCTGGTTCAAACGTTGTTTCTTTCTTACACGGGGTGAAAAAGCAGCTGACGAG
GTCTAGTAGACTTGAAGCTACTCGTACAGTTGTACTTGTACTTGTCTTCTAAGCAAAAGT
TTCTGTTTTTTCTAGGAAAAGTTGATGATTACTGATAGCCTCTACTGGTGACTGTTTCTA
CAAGTATAACACCTTATTGAGAGTATATTTATATCTTGTTTAATGTCATAGAAATATTGA
TTAACC

QA 1 486 1 486
DS 



AS 1 2

CO CL7641Contig1 928 2 14 U
CGAATCATGCATTTACAGTGAGCGAAGACGAATCCAGGCGAAGAAGAAGAGACCAAATCA
ACATCATTTCGATTCGTCAGTAAAGATGAGGAAACCGAACAGCTCTAAGCTGGGCAGGAC
AGCTGTGAAGAGGAAACTAATAGATCTCGGTAGAATGCTGGCTCTTCGTGGCGGTGAAGT
GGATTCACCACCCCAAGCCCACTCGACGCTAGAAGTAATATGCAGATTGTTTGCGCTGAT
GATGTGGAGTATGATCTAGACTATATGAAGTACTTGACGATCTTTAAGGAAAGCAATCAC
CACCATCCTCATTTGCTTGAGAGGGAGGCTTCTCCACTGCGTATTACGTACACTACTGAT
AAGGAAGTGAAGCGTAGAGGAAGGAGAATAAGATCAGAGCCTCCTCCTTTCGTTTCAAAG
AAGTTGGAGAGTGGGACTCGTAAAGAAGATCATAAGTCAACTGTCTTCAGGAAAGATGTT
GTTCTAAGAGGAAGGAAGATGCTATGACTAAGATTCCTATCAAAGCAGAGCATAGAAGCA
AAGACATCCAACAAAAGAAAGAAGCCCCTCTACAGAGAAAGAAGAAGACTGATATGTCCA
CCAAGAGCACTATCAAGTTAGAGCATAGAAGTTATGGTGGCAAAGACACCAAGAAAGAGA
AAGAAGTCTCTCTGCACAAGAACACTATCAAAGTAGAGAGTACAAGTGATGTCAAAGACA
AAAATCAAGAGAAAGAAGTTACTAGACGAGGAAGGAAGCCAATGAATGCAATTCCTCAGG
CAATGTTCAGAGCTTCAAAGAGACTGAAGGCTGAGAAGATCATCCCAGTGGTTAACACCA
CCAAAGATGCTCCACAAGGGAAGAAGAGTTGTGTGACCAAGAGCGATTTCAAAGCCAGCA
AGAAGGAGAATGAGGATAGCAATGGCGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AB40TF U 1
AF RS1AB40JQ C 119
BS 1 193 RS1AB40TF
BS 194 194 RS1AB40JQ
BS 195 199 RS1AB40TF
BS 200 200 RS1AB40JQ
BS 201 779 RS1AB40TF
BS 780 780 RS1AB40JQ
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BS 810 810 RS1AB40JQ
BS 811 816 RS1AB40TF
BS 817 817 RS1AB40JQ
BS 818 834 RS1AB40TF
BS 835 835 RS1AB40JQ
BS 836 851 RS1AB40TF
BS 852 928 RS1AB40JQ

RD RS1AB40TF 851 0 0
CGAATCATGCATTTACAGTGAGCGAAGACGAATCCAGGCGAAGAAGAAGAGACCAAATCA
ACATCATTTCGATTCGTCAGTAAAGATGAGGAAACCGAACAGCTCTAAGCTGGGCAGGAC
AGCTGTGAAGAGGAAACTAATAGATCTCGGTAGAATGCTGGCTCTTCGTGGCGGTGAAGT
GGATTCACCACCC*AAGCC*ACTCGACGCTAGAAGTAATATGCAGATTGTTTGCGCTGAT
GATGTGGAGTATGATCTAGACTATATGAAGTACTTGACGATCTTTAAGGAAAGCAATCAC
CACCATCCTCATTTGCTTGAGAGGGAGGCTTCTCCACTGCGTATTACGTACACTACTGAT
AAGGAAGTGAAGCGTAGAGGAAGGAGAATAAGATCAGAGCCTCCTCCTTTCGTTTCAAAG
AAGTTGGAGAGTGGGACTCGTAAAGAAGATCATAAGTCAACTGTCTTCAGGAAAGATGTT
GTTCTAAGAGGAAGGAAGATGCTATGACTAAGATTCCTATCAAAGCAGAGCATAGAAGCA
AAGACATCCAACAAAAGAAAGAAGCCCCTCTACAGAGAAAGAAGAAGACTGATATGTCCA
CCAAGAGCACTATCAAGTTAGAGCATAGAAGTTATGGTGGCAAAGACACCAAGAAAGAGA
AAGAAGTCTCTCTGCACAAGAACACTATCAAAGTAGAGAGTACAAGTGATGTCAAAGACA
AAAATCAAGAGAAAGAAGTTACTAGACGAGGAAGGAAGCCAATGAATGCAATTCCTCAG*
CAATGTTCAGAGCTTCAAAGAGACTGAAG*CTGAGA*GATCATCCCAGTGGTTA*CACCA
CCAAAGATGCT

QA 1 851 1 851
DS 

RD RS1AB40JQ 810 0 0
ACAGCTGTGAAGAGGAAACTAATAGATCTCGGTAGAATGCTGGCTCTTCGTGGCGGTGAA
GTGGATTCACCACCCCAAGCCCACTCGACGCTAGAAGTAATATGCAGATTGTTTGCGCTG
ATGATGTGGAGTATGATCTAGACTATATGAAGTACTTGACGATCTTTAAGGAAAGCAATC
ACCACCATCCTCATTTGCTTGAGAGGGAGGCTTCTCCACTGCGTATTACGTACACTACTG
ATAAGGAAGTGAAGCGTAGAGGAAGGAGAATAAGATCAGAGCCTCCTCCTTTCGTTTCAA
AGAAGTTGGAGAGTGGGACTCGTAAAGAAGATCATAAGTCAACTGTCTTCAGGAAAGATG
TTGTTCTAAGAGGAAGGAAGATGCTATGACTAAGATTCCTATCAAAGCAGAGCATAGAAG
CAAAGACATCCAACAAAAGAAAGAAGCCCCTTTACAGAGAAAGAAGAAGACTGATATGTC
CACCAAGAGCACTATCAAGTTAGAGCATAGAAGTTATGGTGGCAAAGACACCAAGAAAGA
GAAAGAAGTCTCTCTGCACAAGAACACTATCAAAGTAGAGAGTACAAGTGATGTCAAAGA
CAAAAATCAAGAGAAAGAAGTTACTAGACGAGGAAGGAAGCCAATGAATGCAATTCCTCA
GGCAATGTTCAGAGCTTCAAAGAGACTGAAGGCTGAGAAGATCATCCCAGTGGTTAACAC
CACCAAAGATGCTCCACAAGGGAAGAAGAGTTGTGTGACCAAGAGCGATTTCAAAGCCAG
CAAGAAGGAGAATGAGGATAGCAATGGCGA

QA 1 810 1 810
DS 



AS 1 2

CO CL7642Contig1 719 2 7 U
GGTTTGGCCCAAGACTGAGAATCCAGAAGAACTCTTTCAAGTAACAACAACAACTTCAGG
GAAGAGCTTGTTCGCTACTGTCAATGGAGAGTGCGTTGATGATCCTAAATCAATGGCATC
GGAGTTAACCGGAGAGTCACTTCTAGACTTTGCTGTTGCAACAAACAGAGACATTATAAG
CATTGCTCTCTCCAATCTGATTAGGGTTCATTGGAGACGTGCTTCGAAGCCAACACCTGG
ACAAATGCTGACTGCTCCACTTAGTGAACTTAACAACTTCAGGATTTCTAATTTTCCTTT
GTTGCGGCCTCAAGACCTTAGGTTGGCTATTGCGGCTGCAGAAAGGCTGTTGATATTGGA
ACCTAATAACTGGATAGTTCGAAGAGAACTTGGCATGATGTACTACTACGTCAGGCAATG
TAGAGATGCGATTTTTGAGCTGAGCATATGCATAGCCAACTTTGCGATTGGGGAAGAAGA
AGCAAAAGAGTTGGAGATTTTTGTTGAGAAACTTCATCGAATCTTTTCATTGATGTCTTC
TCCCTTAGACTCTGATCGCTTGGCCGTTCATTAGAAAACTCCCTGTTTCACTTGTAAATA
CTCTCTTTCTATTAGTCTCTGTTGTGTTTGGAAAAGACCCTTTTGTGGGAGACCATGGAG
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BQ
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AF RS1AX22JQ C 1
AF RS1AX22TF U 1
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GGAGTTAACCGGAGAGTCACTTCTAGACTTTGCTGTTGCAACAAACAGAGACATTATAAG
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ACAAATGCTGACTGCTCCACTTAGTGAACTTAACAACTTCAGGATTTCTAATTTTCCTTT
GTTGCGGCCTCAAGACCTTAGGTTGGCTATTGCGGCTGCAGAAAGGCTGTTGATATTGGA
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BQ
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AF RS1CS43TF U 1
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GG
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AACCGCGATATCAAGCAAGCCATCTCGATCGGGTCAGGTACACACGTTTTCCGCTTTAGA
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ATCCTTTGACCTTGACTCGGTTCGGATTCCGTTGTCGGAGCTCCTCTCGATGTACCCGCC
CGTAATTGGTCGGGTCAATAAAACCCAGGAAGGGATCTTGGAGGTCGAGTGTAACGATGC
TGGACTTCGAGCCTTGAAAGCCAAAGTTTCTGTTGGTATTGATGAGTGGCTAAGATCAGC
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GAGCTGTCCACACATGCATGCAGACGCAACAACGTTAACAGTTCTCTTAAAGTCATGGGC
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QA 3 758 3 758
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AS 1 2

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TATTTTACTATGGCTAACACCCTTTTGACAAGCTAAGTGTTCTTGATTTGGGTCTAACTC
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BQ
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AF RS1A286TV U 1
AF RS1A286TF U 40
BS 1 753 RS1A286TV

RD RS1A286TV 753 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGACCAAATAA
ACTCATGGAACTTGCCAAGTTCAAAGGTAAGAAAGCAAGCTTTTCTTTAGTATGTCTTGC
AATGGAAATAACGAAGACAAAAGTGGTAACGAGAGAGAGACAGGGAACAAGCAGAGCATG
GATTGAGTTTTACCAAAACATCAAATGACTATGTTTGGTCTCTTCCCATGCACTGCCTCT
TCCCTGGCTCCCTCTTTCTCTCCCTCTCTTCTTTTTCTAGCTTTGAATGAATTTATATTT
TATTTTACTATGGCTAACACCCTTTTGACAAGCTAAGTGTTCTTGATTTGGGTCTAACTC
TGTATTCATGAAGTGGAGCTGAAAGAAGCAATGGCGTCCATCTCTTGGCGCAAGAGAAGT
GCGTCGATGAAGGTGTCCAGATTCTCTCCTTCCATCATATCTTCAATAGCGTGGTGAGTG
ATTCCCACACGGTGATCCGTGACTCTCCCTTGTGGAAAATTGTACGTACGTATGCGTCCG
GATCGGTCTCCACTGCCAATCTGTTAACGGGATTACACAGAGATCAGCTAATACAGAAAA
TGACTGAATACATTAGAATAAAAAAGATTGTTAATCACATACGTACCTGTTCTGAACGTA
GCTTTGAACGGCTGCTCTGTAATCTCAACCTTTCAATCTCATAGAGCTTTGCGCAGAGTA
CTTTAAGTGCTTTGGCTTTGTTCTGTTATAAAT

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1A286TF 708 0 0
TACGGCCGGGGGACCAAATAAACTCATGGAACTTGCCAAGTTCAAAGGTAAGAAAGCAAG
CTTTTCTTTAGTATGTCTTGCAATGGAAATAACGAAGACAAAAGTGGTAACGAGAGAGAG
ACAGGGAACAAGCAGAGCATGGATTGAGTTTTACCAAAACATCAAATGACTATGTTTGGT
CTCTTCCCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCTCCCTCTTTCTCTCCCTCTCTTCTTTTTCTA
GCTTTGAATGAATTTATATTTTATTTTACTATGGCTAACACCCTTTTGACAAGCTAAGTG
TTCTTGATTTGGGTCTAACTCTGTATTCATGAAGTGGAGCTGAAAGAAGCAATGGCGTCC
ATCTCTTGGCGCAAGAGAAGTGCGTCGATGAAGGTGTCCAGATTCTCTCCTTCCATCATA
TCTTCAATAGCGTGGTGAGTGATTCCCACACGGTGATCCGTGACTCTCCCTTGTGGAAAA
TTGTACGTACGTATGCGTCCGGATCGGTCTCCACTGCCAATCTGTTAACGGGATTACACA
GAGATCAGCTAATACAGAAAATGACTGAATACATTAGAATAAAAAAGATTGTTAATCACA
TACGTACCTGTTCTGAACGTAGCTTTGAACGGCTGCTCTGTAATCTCAACCTTTCAATCT
CATAGAGCTTTGCGCAGAGTACTTTAAGTGCTTTGGCTTTGT
CTGTAT

QA 1 702 1 702
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GTTGCAAAAAAAAAGAAAAACATCATCCCAGACAAGCGAGTGGCGTCCCTGAGCCAAGCA
TGGCTCCTGGTATTCAAGGACCGCCCAGTGTTGTTGGACAAGTGAGTGCCGTCCCTGAGC
CAAGCATGGCCCCTGGTATTCAAGGACCGCCTGGTGTTGTTGGACAAGTGAGTGGCGTCC
CTGAGCCAAGCATGGCCCCGGCCCCTGGTATTCAAGGACCGCCCTTACCGCCCGTGGTGA
AGGACGTAGTGTTTTCTGTCGACGGAGGGCAAGTCTTGCCCAACGTTCCCTATTACATCA
GCTTCATGTCGGCCGACTACAACATGTGGATTTGTCGAATGAATCCAAGTTCCTCAGATC
CCAAGACATGCCCACACCAACCGGTAATGTTCACTAGACCAACTATAGCACCCGAGCCCG
TTATGTTTATATTACCATCATCAACACCAGATACTGTCATACTTGAATCAACTAAACTTA
GCATTAAGTTCGTAAACCCAAGTCAATGCGGCGAATCAGGGGTTTGGAGAGTAGCAAATG
GTGAAGTAGTCCTGAACGGAGTTGAGGGAAGGGAAGATAGTTTGTTCCGGATCCACATGA
CTGACTCGTATTACAAGTTTACTATAGGTGAAAGTGTCTATCCAGACGTTTATGAAACGA
GTATCAGTTTATCTAACAGTCCAATTGGTAAAGATAGGTTGATAGCGAAGCAGCCTTCTG
GAGAGATGGAGGTTCTTTTCCTCCAGCATTATCCTCCTGAATATTATTATTAAGTCACAT
GTTTCGTTTTTACCCGGGCTTAATTTATTAGTATGTAATCTATTTTCATTTCAAAATTAA
TAAAACTTGATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EU65TF U 1
AF RS1EU65JQ C 305
BS 1 449 RS1EU65TF
BS 450 973 RS1EU65JQ

RD RS1EU65TF 451 0 0
GGAGACACACACACACAAAAGAAACAAAAACTCAGAAATAAACATACACAAATATGACAA
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GTTGCAAAAAAAAAGAAAAACATCATCCCAGACAAGCGAGTGGCGTCCCTGAGCCAAGCA
TGGCTCCTGGTATTCAAGGACCGCCCAGTGTTGTTGGACAAGTGAGTGCCGTCCCTGAGC
CAAGCATGGCCCCTGGTATTCAAGGACCGCCTGGTGTTGTTGGACAAGTGAGTGGCGTCC
CTGAGCCAAGCATGGCCCCGGCCCCTGGTATTCAAGGACCGCCCTTACCGCCCGTGGTGA
AGGACGTAGTGTTTTCTGTCGACGGAGGGCAAGTCTTGCCCAACGTTCCCTATTACATCA
GCTTCATGTCGGCCGACTACAACATGTGG
TT

QA 1 449 1 449
DS 

RD RS1EU65JQ 669 0 0
GCCAAGCATGGCCCCGGCCCCTGGTATTCAAGGACCGCCCTTACCGCCCGTGGTGAAGGA
CGTAGTGTTTTCTGTCGACGGAGGGCAAGTCTTGCCCAACGTTCCCTATTACATCAGCTT
CATGTCGGCCGACTACAACATGTGGATTTGTCGAATGAATCCAAGTTCCTCAGATCCCAA
GACATGCCCACACCAACCGGTAATGTTCACTAGACCAACTATAGCACCCGAGCCCGTTAT
GTTTATATTACCATCATCAACACCAGATACTGTCATACTTGAATCAACTAAACTTAGCAT
TAAGTTCGTAAACCCAAGTCAATGCGGCGAATCAGGGGTTTGGAGAGTAGCAAATGGTGA
AGTAGTCCTGAACGGAGTTGAGGGAAGGGAAGATAGTTTGTTCCGGATCCACATGACTGA
CTCGTATTACAAGTTTACTATAGGTGAAAGTGTCTATCCAGACGTTTATGAAACGAGTAT
CAGTTTATCTAACAGTCCAATTGGTAAAGATAGGTTGATAGCGAAGCAGCCTTCTGGAGA
GATGGAGGTTCTTTTCCTCCAGCATTATCCTCCTGAATATTATTATTAAGTCACATGTTT
CGTTTTTACCCGGGCTTAATTTATTAGTATGTAATCTATTTTCATTTCAAAATTAATAAA
ACTTGATGT

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 2

CO CL7647Contig1 728 2 3 U
TTTTTTTTTGCAGTAAGTGTTGAGCAATATGGGAAAACACTCAAATACAGAGTAGATAGT
AATCTATACTCTCAATGGAGAGTTTACGCAAACAAACAATATTTACATGATCAAACCGAA
AAGAAGAAGAGCGATTCAATCAAGGAGCGATAACAAAACTGAAACGTCAAACCCATTACC
TAATCACTGCCAAGGAAACCAAAGTTTCCAACTTTATCGATAAGTAGAGAAAAAGATTAA
AACTTTACCAGCGACCCACAAAAGGAACGGCACAGAGAGAGAGACGTGAAAGCGAAGTTG
AGCTATGAGAATATGTCTTTGTAGGCGGTGGAAGAAAAGAAAAAAAAGCGAATTGATCGA
TGATGGAGAAAAAAAAGGGAAATTGGGTTTGCGTGGAGGATGAAAGGAAGTAAATAAAAT
ATTTGATCCTTTATGCTTGGACGTCTTGTTTTCTGAAGCTATTGGCGGTCGCGGGAAGTG
TTGCACCGTTGTTGTGAGGACGGTCGCCTCTTCCCCACCACTGGCTCCTACCATCATCTA
AAGGAGGATGGGAATGATCTCCATCAGGTTGGTGATGATGGCGGAGAATGCTGCTCTCTG
AGAAGAACTGACCCGATGTGCTTGCTACCATGTCTTCACCACGGACTCCCAAGTTAGGAG
GCCAACAATCCTCCACAGGGTTTTGGTTTGAAGTCAAGATCGGTTGGTGATGATTGGTTC
TGTTGTGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BU46JQ U 10
AF RS1BU46TF C 1
BS 1 9 RS1BU46TF
BS 10 544 RS1BU46JQ
BS 545 728 RS1BU46TF

RD RS1BU46JQ 535 0 0
GCAGTAAGTGTTGAGCAATATGGGAAAACACTCAAATACAGAGTAGATAGTAATCTATAC
TCTCAATGGAGAGTTTACGCAAACAAACAATATTTACATGATCAAACCGAAAAGAAGAAG
AGCGATTCAATCAAGGAGCGATAACAAAACTGAAACGTCAAACCCATTACCTAATCACTG
CCAAGGAAACCAAAGTTTCCAACTTTATCGATAAGTAGAGAAAAAGATTAAAACTTTACC
AGCGACCCACAAAAGGAACGGCACAGAGAGAGAGACGTGAAAGCGAAGTTGAGCTATGAG
AATATGTCTTTGTAGGCGGTGGAAGAAAAGAAAAAAAAGCGAATTGATCGATGATGGAGA
AAAAAAAGGGAAATTGGGTTTGCGTGGAGGATGAAAGGAAGTAAATAAAATATTTGATCC
TTTATGCTTGGACGTCTTGTTTTCTGAAGCTATTGGCGGTCGCGGGAAGTGTTGCACCGT
TGTTGTGAGGACGGTCGCCTCTTCCCCACCACTGGCTCCTACCATCATCTAAAGG

QA 1 535 1 535
DS 

RD RS1BU46TF 728 0 0
TTTTTTTTTGCAGTAAGTGT*GAGCAATATGGGAAAACACTCAAATACAGAGTAGATAGT
AATCTATACTCTCAATGGAGAGTTTACGCAAACAAACAATATTTACATGATCAAACCGAA
AAGAAGAAGAGCGATTCAATCAAGGAGCGATAACAAAACTGAAACGTCAAACCCATTACC
TAATCACTGCCAAGGAAACCAAAGTTTCCAACTTTATCGATAAGTAGAGAAAAAGATTAA
AACTTTACCAGCGACCCACAAAAGGAACGGCACAGAGAGAGAGACGTGAAAGCGAAGTTG
AGCTATGAGAATATGTCTTTGTAGGCGGTGGAAGAAAAGAGAAGAGAGCGAATTGATCGA
TGATGGAGAAGAAGAAGGGAAATTGGGTTTGCGTGGAGGATGAGAGGAAGTAAATAAAAT
ATTTGATCCTTTATGCTTGGACGTCTTGTTTTCTGAAGCTATTGGCGGTCGCGGGAAGTG
TTGCACCGTTGTTGTGAGGACGGTCGCCTCTTCCCCACCACTGGCTCCTACCATCATCTA
AAGGAGGATGGGAATGATCTCCATCAGGTTGGTGATGATGGCGGAGAATGCTGCTCTCTG
AGAAGAACTGACCCGATGTGCTTGCTACCATGTCTTCACCACGGACTCCCAAGTTAGGAG
GCCAACAATCCTCCACAGGGTTTTGGTTTGAAGTCAAGATCGGTTGGTGATGATTGGTTC
TGTTGTGA

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL7648Contig1 1070 2 4 U
GGGCACAAAGATGGATTCTGTTAGTCTCCTTCAGCCTCTCCACAATCTATCTTCCACCAT
CTTCTTTTCACAGCAGCGAACTCCTCGTTTGACGATTCATTTAACATCCTCCCTGAAACC
TTTACCCTCGAAAAGACTCAATCTTTCGAAACCCTCTACTCTCACATTTGCTCTTGCCGA
ATCAGATTCTCCTCAGCCTTTAGAAACAAGCTCGAAATCTCTTCTCCTCCAACTCTCTAA
GTGTTTAGATCTTCCATCAGATTACTTCCAGCAGCTACCAAGTGATCTTCGTCTCGATTT
AAATGATGCTGCCTTTGATCTCTCCAATGGACCCATCATCGATGAGTGTGGTCAAGAGCT
TGGGGAGACGTTACTGAATCTGTCCCATGCTTGGGAACAAGCTGACACATCAACCTCTCG
TACTTTAGTGAAGAAATTTCCCGAACTGGAAACTTCTTTAACAGATGGTGCCAAATCAGC
CTTTGGGAGGCGTCTGATATCTGCGGGAAAAAGGTTCAAGGGAATGGGACAGTACGGTCA
AGGTGAATTACAGAAGATTGCTAAAGCGATGATTACAACTGGAGAGATCTTATCTGCAAA
TACGTCATCTGCTTCGGTCAGTAATGAATCTAAGTCGACAACCAGGATGTTTAAGTTTGG
GGAACTTCAGGTTGCTGTGAGTCCAGAGAAAGCATACGCTGGAGCTACCATTTCATTTGT
GTTTGGGATACTTTCATGGCAAATCAGTCAGGGAATCCAAAGCATACCAGAGAGCTCATT
GCAGTACGCTAATGACAATGCATTGCAACTCGCAAAGTCTCTAAGAGGGTCTCTTCTAGC
TACGTTTTATGCGTCAGCCGTTTTGTCAGGCTTCACAACAGTTGGCCTCCTCCTTCTCGC
TAAGCAGCTTTCATCAGAGAAAGACTCATCATAATCCTTCCGGGGATGATCTCTAATGTT
AAATCATGTACCTACTACAATCTTTAATTCTGTCTGTTAAAACTGTGGAATGGGTTGAGT
TGTATTTTGTTTTCAGAGCAAATGAAATAAATCTCTCTTTGATACGAGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1H205TF U 1
AF RS1H205JQB C 221
BS 1 670 RS1H205TF
BS 671 671 RS1H205JQB
BS 672 748 RS1H205TF
BS 749 1070 RS1H205JQB

RD RS1H205TF 748 0 0
GGGCACAAAGATGGATTCTGTTAGTCTCCTTCAGCCTCTCCACAATCTATCTTCCACCAT
CTTCTTTTCACAGCAGCGAACTCCTCGTTTGACGATTCATTTAACATCCTCCCTGAAACC
TTTACCCTCGAAAAGACTCAATCTTTCGAAACCCTCTACTCTCACATTTGCTCTTGCCGA
ATCAGATTCTCCTCAGCCTTTAGAAACAAGCTCGAAATCTCTTCTCCTCCAACTCTCTAA
GTGTTTAGATCTTCCATCAGATTACTTCCAGCAGCTACCAAGTGATCTTCGTCTCGATTT
AAATGATGCTGCCTTTGATCTCTCCAATGGACCCATCATCGATGAGTGTGGTCAAGAGCT
TGGGGAGACGTTACTGAATCTGTCCCATGCTTGGGAACAAGCTGACACATCAACCTCTCG
TACTTTAGTGAAGAAATTTCCCGAACTGGAAACTTCTTTAACAGATGGTGCCAAATCAGC
CTTTGGGAGGCGTCTGATATCTGCGGGAAAAAGGTTCAAGGGAATGGGACAGTACGGTCA
AGGTGAATTACAGAAGATTGCTAAAGCGATGATTACAACTGGAGAGATCTTATCTGCAAA
TACGTCATCTGCTTCGGTCAGTAATGAATCTAAGTCGACAACCAGGATGTTTAAGTTTGG
GGAACTTCAG*TTGCTGTGAGTCCAGAGAAAGCATACGCTGGAGCTACCATTTCATTTGT
GTTTGGGATACTTTCATGGCAAATCAGT

QA 1 748 1 748
DS 

RD RS1H205JQB 850 0 0
CTTCTCCTCCAACTCTCTAAGTGTT*AGATCTTCCATCAGAT*ACTTCCAGCAGCTACCA
AGTGATCTTCGTCTCGATTTAAATGATGCTGCCTTTGATCTCTCCAATGGACCCATCATC
GATGAGTGTGGTCAAGAGCTTGGGGAGACGTTACTGAATCTGTCCCATGCTTGGGAACAA
GCTGACACATCAACCTCTCGTACTTTAGTGAAGAAATTTCCCGAACTGGAAACTTCTTTA
ACAGATGGTGCCAAATCAGCCTTTGGGAGGCGTCTGATATCTGCGGGAAAAAGGTTCAAG
GGAATGGGACAGTACGGTCAAGGTGAATTACAGAAGATTGCTAAAGCGATGATTACAACT
GGAGAGATCTTATCTGCAAATACGTCATCTGCTTCGGTCAGTAATGAATCTAAGTCGACA
ACCAGGATGTTTAAGTTTGGGGAACTTCAGGTTGCTGTGAGTCCAGAGAAAGCATACGCT
GGAGCTACCATTTCATTTGTGTTTGGGATACTTTCATGGCAAATCAGTCAGGGAATCCAA
AGCATACCAGAGAGCTCATTGCAGTACGCTAATGACAATGCATTGCAACTCGCAAAGTCT
CTAAGAGGGTCTCTTCTAGCTACGTTTTATGCGTCAGCCGTTTTGTCAGGCTTCACAACA
GTTGGCCTCCTCCTTCTCGCTAAGCAGCTTTCATCAGAGAAAGACTCATCATAATCCTTC
CGGGGATGATCTCTAATGTTAAATCATGTACCTACTACAATCTTTAATTCTGTCTGTTAA
AACTGTGGAATGGGTTGAGTTGTATTTTGTTTTCAGAGCAAATGAAATAAATCTCTCTTT
GATACGAGTG

QA 1 850 1 850
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7650Contig1 797 2 10 U
GGAACAAGCGCTTGAAAGAAGGCACATACAAGGGCAAGAAATTCAATGCTATATGCCACT
TCTTTGGTTACCAAGCTCGTGGATCTCTCCCATCGAAGTTTGGTTGTGATTATGCTTATG
TTCTTGGACATATATGTTACCACATCCTCGCAGCTGGCCTGAATGGTTACATGGCAACAG
TGACCAACCTAAAGAGTCCTGTAAACAAGTGGAAGTGTGGTGCTGCACCTATTACAGCAA
TGATGACGGTGAAGAACTGGTCCCAAAATGCTGGCTCTGCATCATCAACTTCAATTGGTA
GACCTGCAATTCATCCGGCAATGGTGGATTTGAAAGGCAAAGCATACGAGCTTTTGAGAC
AGAACGCAGAGAAACTCTTGATGGAAGATCTGTACAGAAACCCAGGACCGCTTCAGTACG
ATGGACCTGGTGCAGATGCTAAAGCAGTGAGTCTCTGTGTTGAAGATCAAGATTACATGG
GACGTATCAAGAAGCTGCAGGAATATCTAGACCAGGTGAGGAGGATAGTGAAGCCAGGAT
GTTCGCAAGACGTACTGAAAGCAGCACTGAGCGTGATGGCTTCGGTGACCGATGTTCTCA
CTACCATTTCTTCATCTTCAAATGGTGGTCAACAAACTGCTTAGAACTCAAAAGAGAGAG
AGAGAGAGAACCAACCAACTCTTTAGAAAGCTTCAAATGTTCTTTCAATATCCCCACATT
TCGTGTTTTGGTTTTGTTTAGAAAGGAAGATGAACAAACAAGTTTTGGATTTTTACGTTA
TTCGACAGACTTTACGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RS1F993TF U 1
AF RS1F993JQ C 73
BS 1 707 RS1F993TF
BS 708 708 RS1F993JQ
BS 709 734 RS1F993TF
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BS 775 793 RS1F993TF
BS 794 797 RS1F993JQ

RD RS1F993TF 793 0 0
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TCTTTGGTTACCAAGCTCGTGGATCTCTCCCATCGAAGTTTGGTTGTGATTATGCTTATG
TTCTTGGACATATATGTTACCACATCCTCGCAGCTGGCCTGAATGGTTACATGGCAACAG
TGACCAACCTAAAGAGTCCTGTAAACAAGTGGAAGTGTGGTGCTGCACCTATTACAGCAA
TGATGACGGTGAAGAACTGGTCCCAAAATGCTGGCTCTGCATCATCAACTTCAATTGGTA
GACCTGCAATTCATCCGGCAATGGTGGATTTGAAAGGCAAAGCATACGAGCTTTTGAGAC
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ATGGACCTGGTGCAGATGCTAAAGCAGTGAGTCTCTGTGTTGAAGATCAAGATTACATGG
GACGTATCAAGAAGCTGCAGGAATATCTAGACCAGGTGAGGAGGATAGTGAAGCCAGGAT
GTTCGCAAGACGTACTGAAAGCAGCACTGAGCGTGATGGCTTCGGTGACCGATGTTCTCA
CTACCATTTCTTCATCTTCAAATGGTGGTCAACAAACTGCTTAGAACTCAAAAGAGAGAG
AGAGAGAGAACCAACCAACTCTTTAGAAAGCTTCAAATGTTCTTTCA*TATCCCCACATT
TCGTGTTTTGGTTT*GTTTAGAAAGGAAGATGAACAAACAAGTTT*GGATTTT*ACGTTA
TTCGACAGACTTT

QA 1 793 1 793
DS 

RD RS1F993JQ 725 0 0
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TATGTTACCACATCCTCGCAGCTGGCCTGAATGGTTACATGGCAACAGTGACCAACCTAA
AGAGTCCTGTAAACAAGTGGAAGTGTGGTGCTGCACCTATTACAGCAATGATGACGGTGA
AGAACTGGTCCCAAAATGCTGGCTCTGCATCATCAACTTCAATTGGTAGACCTGCAATTC
ATCCGGCAATGGTGGATTTGAAAGGCAAAGCATACGAGCTTTTGAGACAGAACGCAGAGA
AACTCTTGATGGAAGATCTGTACAGAAACCCAGGACCGCTTCAGTACGATGGACCTGGTG
CAGATGCTAAAGCAGTGAGTCTCTGTGTTGAAGATCAAGATTACATGGGACGTATCAAGA
AGCTGCAGGAATATCTAGACCAGGTGAGGAGGATAGTGAAGCCAGGATGTTCGCAAGACG
TACTGAAAGCAGCACTGAGCGTGATGGCTTCGGTGACCGATGTTCTCACTACCATTTCTT
CATCTTCAAATGGTGGTCAACAAACTGCTTAGAACTCAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAACC
AACCAACTCTTTAGAAAGCTTCAAATGTTCTTTCAATATCCCCACATTTCGTGTTTTGGT
TTTGTTTAGAAAGGAAGATGAACAAACAAGTTTTGGATTTTTACGTTATTCGACAGACTT
TACGC

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL7651Contig1 996 2 2 U
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GAATCCTGGTTGTGTCCATAGGGGGTTTCTGGATAGGAACTCAAGAGACAACCATCAACT
GGGTTGTCCACACCGAGACAGTTGCTTACCGTATGGAGGAGCAGGACCGTCCAGGTTCCA
TGTCAACGAAGTTAAGCCTGTCGTTGGATTTTCTCAGGCAATGCCAGTGAACCAGCCAAT
TGACTTAACGGGTGTTGGAGTTCCTGAAGATGGGCAGAAGATGATCTCCGAGCTCATGTC
AATGTACGACAGGAACGTCCAGAGCAACCAAACTCCTATGGTCATGAACCAACGGTCCAG
AGTCATCAAGAGTATCTCCATTTCCAAGGAAACATGGTGGAAGGGAGTTTCTTTGAAGAC
TTCAACATCCCAAACAGAGCTAACCAAACGTACAACATCAATGGGTTCAACTACTACGAC
ACTGCACACAACAATAACAACTCCGAAGCTGCGCATAACAATAGTAGCAGAAACAGTTTT
CAGGGTGTGTATGATTCTGCTGGACCGATCGATATGGCCTCATTCGTTTACAGAGATGAT
ATGTTAACGCCGCCAGGAGTAGTTGGAACGATGCAACAAAAGCAGCATGATGTTTCCATA
TGGTTCTAAGTCTTGGAAGTAGATTTCATCTTCTGTTTATTTTTTTATCTTGTGCTCCTG
CATTCACTCTTCGGTGTGGGGACCTCTCTCTCTTACTGTGTCTTGGTCTTGGCTGGTGGA
TCTCTTTCATAGCTTCTTTTAGTTACACACCCCATACTTGGGGACAAACACAATGTAAGT
TCTCATAATATATATCACTTGGAAATTGGAATTAATCTCAATTACTGTCGTTGTTCAGCC
TTTGTAATCCGATGATTTGAACAATGGTGATGTGTTTCACTTGACCCACTTCGAATCTTA
AATTGGGGACAATTATTTAATACAAAAAGATGAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AQ39TFB U 1
AF RS1AQ39JQ C 154
BS 1 861 RS1AQ39TFB
BS 862 996 RS1AQ39JQ

RD RS1AQ39TFB 861 0 0
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GAATCCTGGTTGTGTCCATAGGGGGTTTCTGGATAGGAACTCAAGAGACAACCATCAACT
GGGTTGTCCACACCGAGACAGTTGCTTACCGTATGGAGGAGCAGGACCGTCCAGGTTCCA
TGTCAACGAAGTTAAGCCTGTCGTTGGATTTTCTCAGGCAATGCCAGTGAACCAGCCAAT
TGACTTAACGGGTGTTGGAGTTCCTGAAGATGGGCAGAAGATGATCTCCGAGCTCATGTC
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AGTCATCAAGAGTATCTCCATTTCCAAGGAAACATGGTGGAAGGGAGTTTCTTTGAAGAC
TTCAACATCCCAAACAGAGCTAACCAAACGTACAACATCAATGGGTTCAACTACTACGAC
ACTGCACACAACAATAACAACTCCGAAGCTGCGCATAACAATAGTAGCAGAAACAGTTTT
CAGGGTGTGTATGATTCTGCTGGACCGATCGATATGGCCTCATTCGTTTACAGAGATGAT
ATGTTAACGCCGCCAGGAGTAGTTGGAACGATGCAACAAAAGCAGCATGATGTTTCCATA
TGGTTCTAAGTCTTGGAAGTAGATTTCATCTTCTGTTTATTTTTTTATCTTGTGCTCCTG
CATTCACTCTTCGGTGTGGGGACCTCTCTCTCTTACTGTGTCTTGGTCTTGGCTGGTGGA
TCTCTTTCATAGCTTCTTTTAGTTACACACCCCATACTTGGGGACAAACACAATGTAAGT
TCTCATAATATATATCACTTG

QA 1 861 1 861
DS 

RD RS1AQ39JQ 843 0 0
TGGAGGAGCAGGAC*GTCCAGGTTCCATGTCAACGAAGTTAAGCCTGTCGTTGGATTTTC
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GCAGAAGATGATCTCCGAGCTCATGTCAATGTACGACAGGAACGTCCAGAGCAACCAAAC
TCCTATGGTCATGAACCAACGGTCCAGAGTCATCAAGAGTATCTCCATTTCCAAGGAAAC
ATGGTGGAAGGGAGTTTCTTTGAAGACTTCAACATCCCAAACAGAGCTAACCAAACGTAC
AACATCAATGGGTTCAACTACTACGACACTGCACACAACAATAACAACTCCGAAGCTGCG
CATAACAATAGTAGCAGAAACAGTTTTCAGGGTGTGTATGATTCTGCTGGACCGATCGAT
ATGGCCTCATTCGTTTACAGAGATGATATGTTAACGCCGCCAGGAGTAGTTGGAACGATG
CAACAAAAGCAGCATGATGTTTCCATATGGTTCTAAGTCTTGGAAGTAGATTTCATCTTC
TGTTTATTTTTTTATCTTGTGCTCCTGCATTCACTCTTCGGTGTGGGGACCTCTCTCTCT
TACTGTGTCTTGGTCTTGGCTGGTGGATCTCTTTCATAGCTTCTTTTAGTTACACACCCC
ATACTTGGGGACAAACACAATGTAAGTTCTCATAATATATATCACTTGGAAATTGGAATT
AATCTCAATTACTGTCGTTGTTCAGCCTTTGTAATCCGATGATTTGAACAATGGTGATGT
GTTTCACTTGACCCACTTCGAATCTTAAATTGGGGACAATTATTTAATACAAAAAGATGA
ACC

QA 1 843 1 843
DS 



AS 1 2

CO CL7652Contig1 793 2 2 U
GAAGAATCCTCATCACCGACATCTTCTTTAGGTGCATCATCATTGGAAACCTCAGTCTCA
GCTGTCACACTGTTACTCTTTACACCATCATTCCCTACGGTATGAGAAGCCTCTTCCAAG
GCACTGAAGTGGTTCAAAAGACTTATTTCCTCACCTCCATCATCATCTGACAAAGGAGAT
GAAGCATCATCATTATCCACATCCTCTTCAAACGAACCATCGTCAGAAAGACCATCATCA
TCATCATCATCAGAACCCTCTTCAGATACGCCATCATCGTCTGAATCCTCATTTTCTTCA
CAAGAAGAATCCCTCTGAGATTTTCCAACGGATTCATCATCAGCTTGGCTGCTAAGAGGT
TCAGTAATCTTGAGAGTTTCCTCTGGTACAACAAGAGAGGCTGGAAGTACATGTAGTTCA
GCAAGGATAATGAGTCTGCTATTCACCAGAAACCCTTCAGTCTTGTCATGAAGTTTAGCA
AGGGACACGAACTTAGTATAACCCCAAGCCTTATTCTTTACATCGAAACAACATTGCCCT
CCTGCCACGACAAAACAGAATATCATATTGCAAAGCGCTAATTAATGAGTAATGATAATG
AGGAGCTAACAAAACATGAGCGTACCCAATACTATGCTCGATTTTCCCCAAGCTTTAGTG
AAGAGAGCGAGGGTAAACTTGACTTCTCTTGACCATCCCGGTGGCAGAGAAGCCGGATCT
TCAAACTCCAGATACAAGGATAAGTGACCATCCTTCTTATCTCCCTTAGGATAAGCAAGA
AGACGCCTTTACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BF66TF U 1
AF RS1BF66JQ C 1
BS 1 712 RS1BF66TF
BS 713 793 RS1BF66JQ

RD RS1BF66TF 712 0 0
GAAGAATCCTCATCACCGACATCTTCTTTAGGTGCATCATCATTGGAAACCTCAGTCTCA
GCTGTCACACTGTTACTCTTTACACCATCATTCCCTACGGTATGAGAAGCCTCTTCCAAG
GCACTGAAGTGGTTCAAAAGACTTATTTCCTCACCTCCATCATCATCTGACAAAGGAGAT
GAAGCATCATCATTATCCACATCCTCTTCAAACGAACCATCGTCAGAAAGACCATCATCA
TCATCATCATCAGAACCCTCTTCAGATACGCCATCATCGTCTGAATCCTCATTTTCTTCA
CAAGAAGAATCCCTCTGAGATTTTCCAACGGATTCATCATCAGCTTGGCTGCTAAGAGGT
TCAGTAATCTTGAGAGTTTCCTCTGGTACAACAAGAGAGGCTGGAAGTACATGTAGTTCA
GCAAGGATAATGAGTCTGCTATTCACCAGAAACCCTTCAGTCTTGTCATGAAGTTTAGCA
AGGGACACGAACTTAGTATAACCCCAAGCCTTATTCTTTACATCGAAACAACATTGCCCT
CCTGCCACGACAAAACAGAATATCATATTGCAAAGCGCTAATTAATGAGTAATGATAATG
AGGAGCTAACAAAACATGAGCGTACCCAATACTATGCTCGATTTTCCCCAAGCTTTAGTG
AAGAGAGCGAGGGTAAACTTGACTTCTCTTGACCATCCCGGTGGCAGAGAAG

QA 1 712 1 712
DS 

RD RS1BF66JQ 793 0 0
GAAGAATCCTCATCAC*GACATCTTCTTTAGGTGCATCATCATTGGAAAC*TCAGTCTCA
GCTGTCACACTGTTACTCTTTACACCATCATTCCCTACGGTATGAGAAGCCTCTTCCAAG
GCACTGAAGTGGTTCAAAAGACTTATTTCCTCACCTCCATCATCATCTGACAAAGGAGAT
GAAGCATCATCATTATCCACATCCTCTTCAAACGAACCATCGTCAGAAAGACCATCATCA
TCATCATCATCAGAACCCTCTTCAGATACGCCATCATCGTCTGAATCCTCATTTTCTTCA
CAAGAAGAATCCCTCTGAGATTTTCCAACGGATTCATCATCAGCTTGGCTGCTAAGAGGT
TCAGTAATCTTGAGAGTTTCCTCTGGTACAACAAGAGAGGCTGGAAGTACATGTAGTTCA
GCAAGGATAATGAGTCTGCTATTCACCAGAAACCCTTCAGTCTTGTCATGAAGTTTAGCA
AGGGACACGAACTTAGTATAACCCCAAGCCTTATTCTTTACATCGAAACAACATTGCCCT
CCTGCCACGACAAAACAGAATATCATATTGCAAAGCGCTAATTAATGAGTAATGATAATG
AGGAGCTAACAAAACATGAGCGTACCCAATACTATGCTCGATTTTCCCCAAGCTTTAGTG
AAGAGAGCGAGGGTAAACTTGACTTCTCTTGACCATCCCGGTGGCAGAGAAGCCGGATCT
TCAAACTCCAGATACAAGGATAAGTGACCATCCTTCTTATCTCCCTTAGGATAAGCAAGA
AGACGCCTTTACC

QA 1 793 1 793
DS 



AS 1 2

CO CL7653Contig1 913 2 2 U
GGGTGGATCTAAATCTAAGCGTCTCTTAGTTTACTCCGATCAAAAACAATGGCGTCGTAC
CGGCCGCCGCCTCCTCCTTCTCCTCTCCCACCGCCACCAATAAAAACTTGCACCCTGTTG
AAGTTTTACCATTATTGCCAAATTTTGACAGGTACGAGGAGCAGTTTGTGGTAGCGAATT
TTGATAGTGCTCCTACAGCTGATTCTGAATTTTTTGGCAAGTTGGACTCTTCAGTTCGTG
ATGAACATGAATCACGGGCCATTTTAAAAAGCTATGTGATTGCTGGATCGGACATTGGTA
ATCCCGAAAAAATCCTGGCGTACATGGTTCCTTCCTTGGATGAGTTGTCTAAAGATATTC
ATGATGAAAACGAGGATATCTCTTATACTTGGGTTCGCGAATACCTCTGGGATATACCAC
CAAATGAGCCAAACGAGCGTGACACGTACCTGGTATCGTTCGAGGATGGGACCGCTAGCT
ATCTGCCTCTACCAACAAGGCTGAACATAAGGAAGAGAAGGGCCAGAGAAGGAAGAGCGT
CTGATGAGATCGAACACTTACCAGTACCTTCAAGGGTGACTGTGAGGAACAGATCGTCTG
TATCAATAATCGAACATAAAGATTCAATGGTTAATAATTCAAATTCTAGGAATGGTGCGT
CAGCTCCAAGATGAGAAGGTTAGAGGTTGAAGAAGGCCTTGGCAGATCTTGGAAACACGG
GATGGAACAAGATGCTAATCAATATAGTGATAATAATGATGATTATTCTGAATGAATGTG
CACTATACAAAAACAATTATTATGTGTCGGGATCAGACATACCTTGAGCATTCCATAGGG
TCGAGACATGTTTCGCCAGTAGTGTATTTTGACAATGTGGTTTTTAATAGATAAGGACTT
GTGTGTTCCCTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BW83TF U 1
AF RS1BW83JQ C 216
BS 1 270 RS1BW83TF
BS 271 913 RS1BW83JQ

RD RS1BW83TF 270 0 0
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CGGCCGCCGCCTCCTCCTTCTCCTCTCCCACCGCCACCAATAAAAACTTGCACCCTGTTG
AAGTTTTACCATTATTGCCAAATTTTGACAGGTACGAGGAGCAGTTTGTGGTAGCGAATT
TTGATAGTGCTCCTACAGCTGATTCTGAATTTTTTGGCAAGTTGGACTCTTCAGTTCGTG
ATGAACATGAATCACGGGCCATTTTAAAAA

QA 1 270 1 270
DS 

RD RS1BW83JQ 698 0 0
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TTGGATGAGTTGTCTAAAGATATTCATGATGAAAACGAGGATATCTCTTATACTTGGGTT
CGCGAATACCTCTGGGATATACCACCAAATGAGCCAAACGAGCGTGACACGTACCTGGTA
TCGTTCGAGGATGGGACCGCTAGCTATCTGCCTCTACCAACAAGGCTGAACATAAGGAAG
AGAAGGGCCAGAGAAGGAAGAGCGTCTGATGAGATCGAACACTTACCAGTACCTTCAAGG
GTGACTGTGAGGAACAGATCGTCTGTATCAATAATCGAACATAAAGATTCAATGGTTAAT
AATTCAAATTCTAGGAATGGTGCGTCAGCTCCAAGATGAGAAGGTTAGAGGTTGAAGAAG
GCCTTGGCAGATCTTGGAAACACGGGATGGAACAAGATGCTAATCAATATAGTGATAATA
ATGATGATTATTCTGAATGAATGTGCACTATACAAAAACAATTATTATGTGTCGGGATCA
GACATACCTTGAGCATTCCATAGGGTCGAGACATGTTTCGCCAGTAGTGTATTTTGACAA
TGTGGTTTTTAATAGATAAGGACTTGTGTGTTCCCTAG

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL7654Contig1 794 2 3 U
GTTAGTATGGAAGGAGGTAATTTCAGAAAATGGTCACCTCTCTCGGCAGCTAGTAAGGAA
GACTTCTGGAAAACCAAAGTTAAGATTGGTTCCTCAAGTCGGTTATGTCAGTTTCTTTCC
CTTCATGTCTAGAATCATCCCAGCTGCATCGCCAATCCTGGAGAAACAGCTTGATCTCAT
TTCAAACAGGAGCATATTATGGAGTGAGTATGGACTAGTTTCGCTAGCCAAAACCAGTTC
GATGTATATGAAACGTAACACTGAGCATGATGCACCATACTGGAGAGGCCCTATATGGAT
GAACATGAACTACATGATTCTTTCATCTCTGCACCATTACTCTACAGTGGATGGGCCGTA
TAGCGAAAAGGCAAGAGCAATTTACAAGGAACTGAGGAGCAATTTGATAAGGAACGTGGT
AAGAAACTATTATGAGACGGGGTACATATGGGAACAATATGATCAAGATAAGGGAACAGG
CAAAGGCACACGTCTCTTCACTGGCTGGTCTGCACTTACCTTGTTAATAATGTCCGAAGA
GTATCCTATTTTTTGAAAACCTCTTTTATCAAAACTCGAGGAAAAGAAAGTTAAACTACA
AACATGTTAGTTAGAAGAACAGTTTTGATGTGTTTAGGGCTTTCTATATTCGGGCTCATA
GTTGGTTTATAGAGAAAGTGCTGTCACAGATCTTACTTTGGTCTAGACATGTCTCAGATT
TATGTCCAAAATGACAATCAAATGTTGGCACAGATATAGCAGAGAATCATTTAAGATTGC
TGTGATCTTTACGG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DO73TF U 54
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G
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CTTTCCCTTCATGTCTAGAATCATCCCAGCTGCATCGCCAATCCTGGAGAAACAGCTTGA
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CAGTTCGATGTATATGAAACGTAACACTGAGCATGATGCACCATACTGGAGAGGCCCTAT
ATGGATGAACATGAACTACATGATTCTTTCATCTCTGCACCATTACTCTACAGTGGATGG
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AACAGGCAAAGGCACACGTCTCTTCACTGGCTGGTCTGCACTTACCTTGTTAATAATGTC
CGAAGAGTATCCTATTTTTTGAAAACCTCTTTTATCAAAACTCGAGGAAAAGAAAGTTAA
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CTCATAGTTGGTTTATAGAGAAAGTGCTGTCACAGATCTTACTTTGGTCTAGACATGTCT
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QA 2 719 2 719
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TAGCGAAAAGGCAAGAGCAATTTACAAGGAACTGAGGAGCAATTTGATAAGGAACGTGGT
AAGAAACTATTATGAGACGGGGTACATATGGGAACAATATGATCAAGATAAGGGAACAGG
CAAAGGCACACGTCTCTTCACTGGCTGGTCTGCACTTACCTTGTTAATAATGTCCGAAGA
GTATCCTATTTTTTGAAAACCTCTTTTATCAAAACTCGAGGAAAAGAAAGTTAAACTACA
AACATGTTAGTTAGAAGAACAGTTTTGATGTGTTTAGGGCTTTCTATATTCGGGCTCATA
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TGTGATCTTTACGG

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ES66TF U 1
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AGACATCGGAAAAGGTGAAAGAGAAGAGGAAAGTTCGTCGTAAAAGTGATGGCGGCTGCG
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QA 1 756 1 756
DS 

RD RS1ES66JQ 745 0 0
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TAGTAATGTAATGATGTAGCATTAATGTATGTATATGTTACTATGTGTTTGATATTACTG
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TCATATGCAGCACGTAGAGTAACCC

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 2

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TTTTTCATTATGTTTTAGAGACTAGT


BQ
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AF RS1BM05TF U 1
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BS 746 806 RS1BM05JQ

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GAAGAAGATCTGTCATCATCAGCCTCAAAGACATTCCTCCTCTCGATCCTTCTTCTATCC
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AATCATTGTACTGTTTTATAAAAAA

QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1BM05JQ 764 0 0
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GTACATTTAATAAAGTGAATGAGGTTGAAGAAGGCAATGCCATATCTTCCTTCTCCAACA
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TTCCTAAACCCCAAGAAGAAGACGCCAAATCAGTATCTAAAGATGAATCCAAGAAAGGTT
CAGCAAAACGGGTGTTACACGAACTATGTATATCCAAGAGATGGAAGCCTCCGGTTTATG
ATTGCTGCAATGTTGATGGACCTTGTCACATGAGATTATTTACATACAAAGTTGTGGTTG
AGATTAGAGACTCTTCAGGAACAACTGTTTTGGAATGTTTTGGTGATCCCAAACGTAAGA
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GAGAGTTTAGAAGAGTCTTTATACATTTCTTTTTTCTTAATCTAGGGAAGTCTTAAAATA
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ACAAAAATATCTCAAAAGTTTTTCATTATGTTTTAGAGACTAGT

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1EB92JQ C 1
AF RS1EB92TF U 1
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BS 700 711 RS1EB92JQ

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QA 1 711 1 711
DS 

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ACGACACGTGGCACCGTGTTGAGAGATCGAGCGGGCAGTTCACGAGGAAGTTCAGGCTTC
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CGGTTCCTAAGGCCGAGACCAAGAAGCCTGATGTTAAGTCTATTCAGATCTCTGGCTAAG
GCACTGACGACCGTTGCTTCGAGCTATTTTCCTTATAGTCTTGTGTTTCAATGTGTTGTG
TGCTAGTTCTGTTTTACTGAGTGATTGAGTGGTGCTGATGCATATTAATAAAAGTGGAAT
AAATAATTTAATGTGAATCTGTTTTACCTTTTGTATAAA
GAAATATTGT

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 2

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TTACCACCAGTTTGATCATCTCAGATGTTCCATTGGTGTTGGTTTGTCATTCGTATTTGA
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GGTACTTCATGTTTAGACGCTTCATGTTTCAATGCCTTTAGTTTTTTATTGTATGAAACT
GCTGAGAATATGAAAAAAAAATTGTGAAACATGCTTTTTATACATTGTTTTCCATTGTAT
TAAATTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FP71TF U 1
AF RS1FP71JQ C 529
BS 1 745 RS1FP71TF
BS 746 746 RS1FP71JQ
BS 747 777 RS1FP71TF
BS 778 1328 RS1FP71JQ

RD RS1FP71TF 777 0 0
TTTTTTCCCCAATCTCAGATCACTTCATCTCCTACAGAAGCTCTCGATCTCCCTCCTCGG
CATCGACCCTCACCGGCGAACTTCTCGATCTCCCCTCCTCGGCATCGACCCTCACCGGCG
AACTTCTCGATCTCCCTCCTCGGCAGCAAATCTCCGACGAACCGAAGCTCTCCCCTCACC
ACCACTATCTCAACTCATCATCCGAAGCTCTCCTCTCACCACCACCATCTCATCACCATC
AGGTCTCTCTCTCTTCGCCGTTTTTTTTATGGGTTTTCAGAGAAAGCTTTGATTCTCTTC
AAGAGCTTTTGAGTTTTTGAGTTATGTGTATTTCGTTTTGTTTCGTTGTGGGTTTTTCAG
AGAAAGCTTGTGAGTATTTTGTTAGGAATCCTTTCGTTATGTCTTTCAAATGGTTCAAAT
GAAGTTGATTAACTGTCTTTCTGTAGAATAAGTATACATTCATTAGTTTCTGGGCAAGTA
TTCTTTGACATGCCTGTATATAAGTTCGTAGTTCATAAAATATTAGTTCTGTATACGATT
TGGGTTCTCGTATTGGTTTGTAAGCGCAAAAGAGCAGTAGTTATTATGTATTAGAATGGC
TTACCACCAGTTTGATCATCTCAGATGTTCCATTGGTGTTGGTTTGTCATTCGTATTTGA
GGTTTACTTCTGAGATATAACACTCTTCCATGTTGGATCCTGTCGATATGTGAATATGAG
ATTGTATCCACTTTCATAATCTTTT*CTGTGTGTATTCTGATTAGTCTGTGTGTATT

QA 1 777 1 777
DS 

RD RS1FP71JQ 800 0 0
CTGTATACGATTTGGGTTCTCGTATTGGTTTGTAAGCGCAAAAGAGCAGTAGTTATTATG
TATTAGAATGGCTTACCACCAGTTTGATCATCTCAGATGTTCCATTGGTGTTGGTTTGTC
ATTCGTATTTGAGGTTTACTTCTGAGATATAACACTCTTCCATGTTGGATCCTGTCGATA
TGTGAATATGAGATTGTATCCACTTTCATAATCTTTTTCTGTGTGTATTCTGATTAGTCT
GTGTGTATTTCTGAATGATATTGATAAGTCTTCTTTTTGTGTGCTCTCTTGATATGCTTA
GGAAGAGCTTGAGCTTGTAGATAGATTTTGCTTGGTTTGTAATGGTTCATAGCTTCAGTT
TTTTTTGAGCTTTCACAAGACTAACTATATAACTATGAACCATCGGCGATACTTGTGTAT
AACTATGGACGAAGATTTAAGTCTTGACTGCACTTTAGGAGATGGTTATATAGTTTTGAC
TGTTGGACTCTGCTTGGTTTGTAATGATTCACTCTGAGCTCACTTCATGTTATCTTCATG
TTTCAGGTACTTGTAAGGAAGAGGTGAACATGAGAGTACGAAGACATGCCTCAGCCTCTT
GATTCTCAAATTACTGTAGTTAATCTTACAATACTTATCTCTTGAATTACTGTTTTAATG
CTTAGACAATTTGGTACTTCATGTTTAGACGCTTCATGTTTCAATGCCTTTAGTTTTTTA
TTGTATGAAACTGCTGAGAATATGAAAAAAAAATTGTGAAACATGCTTTTTATACATTGT
TTTCCATTGTATTAAATTTT

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FU74TF U 1
AF RS1FU74JQ C 232
BS 1 693 RS1FU74TF
BS 694 694 RS1FU74JQ
BS 695 740 RS1FU74TF
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BS 757 772 RS1FU74TF
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RD RS1FU74TF 772 0 0
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TTCAATTATATGAACGCTTCTGATAGGCTCCGGCTTTTCTTGATACTTGGGAAAAAAACT
TCTATTTAATGATGATGGAAGAGCAAAGCCAAAGAGAGACAGAGACACAGAGCCTATATC
AGAGAATAAAGTGGTGAAGTGGATTGAAACAAACAAGCCATGGAGTCTCCTAGGAACCAT
GGAGTCCTTGAGGAAGAGGAATACAGCAGTTGTGAGTCAGGGTATACTATGTACATAGGA
GACGCCTTTCAAGGGGATGACCATTCTACTGTTGTTGTTGTTGATGATGATTCATATGTA
AAAGATGCCGATGATGGTTATGAGAATGATGATGATGGTAAAGAGAGTGATGATTCAATG
GCCTCTGATGCATCTTCAGGGCCTAGCAATCAGCTTCCAAATAAAATCAACAAACATGCA
ACTAAACAAGTCTACATTCAAAAACGCCAACCTACAGAGAAAACATTAAGCAATGAAGGA
GAAAAATCAGAGCTCAAAGCTAGAACAAGAACAAGTGCAGCTAGTCGTGTCCAGAGTAGA
GGCAAGGTGAGCAAAACTAAATGATACTCATGAGAAGAATAATAAAGTGGTTCCAATAGA
ATCCAAATCCTGTAATGAAGAGAGATGTATAAG*TCCCTCACCAATCCTGTTGTTTGCCT
TTAATAAGCCATGTGTGTAG*TAGTTGCTTTGTTT*CGTTTGCCGGTATATG

QA 1 772 1 772
DS 

RD RS1FU74JQ 594 0 0
AGGAACCATGGAGTCCTTGAGGAAGAGGAATACAGCAGTTGTGAGTCAGGGTATACTATG
TACATAGGAGACGCCTTTCAAGGGGATGACCATTCTACTGTTGTTGTTGTTGATGATGAT
TCATATGTAAAAGATGCCGATGATGGTTATGAGAATGATGATGATGGTAAAGAGAGTGAT
GATTCAATGGCTTCTGATGCATCTTCAGGGCCTAGCAATCAGCTTCCAAATAAAATCAAC
AAACATGCAACTAAACAAGTCTACATTCAAAAACGCCAACCTACAGAGAAAACATTAAGC
AATGAAGGAGAAAAATCAGAGCTCAAAGCTAGAACAAGAACAAGTGCAGCTAGTCGTGTC
CAGAGTAGAGGCAAGGTGAGCAAAACTAAATGATACTCATGAGAAGAATAATAAGGTGGT
TCCAATAGAATCCAAATCCTGTAATGAAGAGAGATGTATAAGGTCCCTCACCAATCCTGT
TGTTTGCCTTTAATAAGCCATGTGTGTAGGTAGTTGCTTTGTTTTCGTTTGCCGGTATAT
GTTTTTCTTTTGTAGATGCAGTCCTAAATATGTTATTGCACGGTTTTCCGTTGC

QA 1 594 1 594
DS 



AS 1 2

CO CL7660Contig1 790 2 4 U
GGATTCTCTCTCATTTTCTCTCTCTTTCTGTAGATTTATACACTGAAAATCAAGTTTCCG
AGTTCAGTTTCTGACAATGGAAGCAAACCAGTTATACGGTTTGTCTACACTTGTTGTTAT
TCTGGTATTGTCGGTGACTTCGACAGTGACATCCAAGGACGAGGTTGTTTCCTGTACAAT
GTGTTCTTCCTGCGACAATCCTTGTAACCCCGTCCAATCATATCCTCCCCCTCCGCCACC
TTCTCGCCCACCACCGTCTCCACCAACCACCACCGCATGTCCTCCACCTCCTAGCTCCGG
CGGTGGTGGTGGTAGCTCTTACTATTACCCTCCTCCATCTCAGTCCGGTGGCGGAAATAC
CCTCCTCCGTATGGTGACGGTGGTCAAGGTTATTACTATCCTCCTCCGTATTCAGGAAAC
TATCCTACTCCACCTCCGCCCAATCCGATCGTCCCCTACTTCCCGTTTTACTATCATACG
CCACCACCAGGTTCTGGAGCAGATCGGTTTAAGGGTTCTAACTCTATTCTGTTTGCTCTT
TTCGCCGTCTTCCTCTGTTTAGTGTGACGGAAAATAGTCCGAGTTGGCCGGAAAATACCA
AGTAATGTGGCAGATCGGTAGATCTACAATACTCTTTGAAGGTTTTAGACATATCTGATG
TTGGATCCAAATCATTATCTCTTACTCTCTTTAACCTTTTCTTGTGTGGACAATCTGTAT
TTATTTTTCCTTGTTAATTAACATTTTGATTACTAGCTATTCAGAAATAAAGTATTATTA
CTTTCTATGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CK87TF U 1
AF RS1CK87JQ C 8
BS 1 641 RS1CK87TF
BS 642 642 RS1CK87JQ
BS 643 712 RS1CK87TF
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RD RS1CK87TF 714 0 0
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TTCTCGCCCACCACCGTCTCCACCAACCACCACCGCATGTCCTCCACCTCCTAGCTCCGG
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CCTCCTCCGTATGGTGACGGTGGTCAAGGTTATTACTATCCTCCTCCGTATTCAGGAAAC
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TTCGCCGTCTTCCTCTGTTTAGTGTGACGGAAAATAGTCCGAGTTGGCCGGAAAATACCA
AGTAATGTGGCAGATCGGTAGATCTACAATACTCTTTGAAG*TTTTAGACATATCTGATG
TTGGATCCAAATCATTATCTCTTACTCTCTTTAACCTTTTCTTGTGTGGACA
TC

QA 1 712 1 712
DS 

RD RS1CK87JQ 783 0 0
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TTTCTGACAATGGAAGCAAACCAGTTATACGGTTTGTCTACACTTGTTGTTATTCTGGTA
TTGTCGGTGACTTCGACAGTGACATCCAAGGACGAGGTTGTTTCCTGTACAATGTGTTCT
TCCTGCGACAATCCTTGTAACCCCGTCCAATCATATCCTCCCCCTCCGCCACCTTCTCGC
CCACCACCGTCTCCACCAACCACCACCGCATGTCCTCCACCTCCTAGCTCCGGCGGTGGT
GGTGGTAGCTCTTACTATTACCCTCCTCCATCTCAGTCCGGTGGCGGAAATACCCTCCTC
CGTATGGTGACGGTGGTCAAGGTTATTACTATCCTCCTCCGTATTCAGGAAACTATCCTA
CTCCACCTCCGCCCAATCCGATCGTCCCCTACTTCCCGTTTTACTATCATACGCCACCAC
CAGGTTCTGGAGCAGATCGGTTTAAGGGTTCTAACTCTATTCTGTTTGCTCTTTTCGCCG
TCTTCCTCTGTTTAGTGTGACGGAAAATAGTCCGAGTTGGCCGGAAAATACCAAGTAATG
TGGCAGATCGGTAGATCTACAATACTCTTTGAAGGTTTTAGACATATCTGATGTTGGATC
CAAATCATTATCTCTTACTCTCTTTAACCTTTTCTTGTGTGGACAATCTGTATTTATTTT
TCCTTGTTAATTAACATTTTGATTACTAGCTATTCAGAAATAAAGTATTATTACTTTCTA
TGC

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1BL39TF C 1
AF RS1BL39JQ U 80
BS 1 79 RS1BL39TF
BS 80 697 RS1BL39JQ

RD RS1BL39TF 622 0 0
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GAGTACCACCATACCAACCATTGGCTTCGCTGGTTGATGTGATCGACAGGTACTTCTGGA
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CACTCTCTTCGGGCTTTCTTGA

QA 1 622 1 622
DS 

RD RS1BL39JQ 618 0 0
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TCCAATGTTGTCCATTACATCGACTGTGTTCATGCGAAGAACTTCCGCATAGTTTTGTTC
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ATGTCGGTAAATTTCGCTGTTTTCATCTTGGTCACCGAGGAGAGTACCACCATACCAACC
ATTGGCTTCGCTGGTTGATGTGATCGACAGGTACTTCTGGAAGACATCTTCTTGATGATC
GTTAGGCTCAGAAAGCCAGTCTAAGTTGCAGAAATCGTGGACTCTCTCACTCGAGGCCGC
TCCTTTCTCACTATCGTCTGCACCAGGTCTTGTGGCAGAGCCACTCTCTTCGGGCTTTCT
TGAACCAAACAGCCAATTGGGGCTCTTGAGCTGAATCTCAGCTGCATCAGGAGCCACACC
AGTGCTTCCAGTGCTAGC

QA 1 618 1 618
DS 



AS 1 2

CO CL7662Contig1 722 2 3 U
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TCCTTAGTTTTTTCACTTCTTAAGATGATTCCTCCAGTAGATGATCCACGTATAAACAAA
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GCCTCAGTAAGTAGTAAAGCCAAAAGATGGTCAATGCAGATCCAGGAAGACAAGAGTACC
AGAACCACCGTCTATGATCATTCTTCTTATCTAGTAGCCCGACAATTGAGAGGCAGCAAG
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AATCGATGTCTTCGAAAGTAGGAAGGACGAGTTTATCATCATCTTCGTCGTCGTCGTCGT
CGTCGTCGCGACGAGTTCTCCGCCATCTTCTCGCTAACTTCTCCATTAGATTTTTTTAGA
TC


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10 10 

AF RS1GW20JQ U 9
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BS 9 708 RS1GW20JQ
BS 709 722 RS1GW20TF

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CGACGAGTTCTCCGCCATCTTCTCGCTAACTTCTCCATTA

QA 1 700 1 700
DS 

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TCCTTAGTTTTT*CACTTCTTAAGATGATTCCTCCAGTAGATGATCCACGTATAAACAAA
TTCCAGCTCCGCAGAGGGGAGCAAATGGAAGCCAGATAACATCCCACCGGAACTTCGGAA
GCCTCAGTAAGTAGTAAAGCCAAAAGATGGTCAATGCAGATCCAGGAAGACAAGAGTACC
AGAACCACCGTCTATGATCATTCTTCTTATCTAGTAGCCCGACAATTGAGAGGCAGCAAG
CCATGATAGCAATCCACTCAGCTGAAATGACCATCCACGACTTAAGATCTTCCATAAAGT
AGGCATGATACCGCAGGTCCCACGGCGACATGAACTGCTGAAAAATGGAGTAGAAGAGGA
AAGCTCCGTAGCAAACCAGAAGAACCGCGAACACTCTCTTCCACTGGCGACTTTGCTGAG
CGTGAGCTTCTTCGAGCGAACTGACGTACTCTTCTTGCTCTTGCGTATCAATAGGTCGAG
AATCGATGTCTTCGAAAGTAGGAAGGACGAGTTTATCATCATCTTCGTCGTCGTCGTCGT
CGTCGTCGCGACGAGTTCTCCGCCATCTTCTCGCTAACTTCTCCATTAGATTTTTTTAGA
TC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

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TAACCGAGAGCTCGAGAGTAACCACCAAGCATGCCTTTGCCACCTTGTCGTTTCTAGCCG
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TGAGTGACAGCCCGGGGACATCGGTTGCAGTGAGCTCAATTCTGATGGGTCTAGTGATGC
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GCGGGAACGCAATCATGATTACCAGCACTATAACCGTTTGTCTTGTTAGCACCATGGTGT
TTGGTATGCTGACCAAACCGCTCATTAGACACCTGATGCCACATCAAAGCACGACCACCA
GCATGTTATCGGACGACAACACTCCGAAGTCTATGCACATGCCGCTCCTCGATGGCGAGC
AGCAGGATTCATTCGTGGAGTTCTCTGGGAGCCACCATGACGTTCCACGACCAGACAGCC
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ATGCATTCATGCGTCCTGTGTTTGGTGGTCGCGGTTTTGTTCCCTTTGTCCCTGGTTCTC
CGATCGAGAGAAGCACCCAAGATCTCAGTAAACCTTGAGATATTTTTTTATAGAAACTTC
TCAGAAAACCCAAAAGAACTTAATCTTCCTTCTTATATAGTCACTCACTACTGGTGATGT
AAAGTTTTTTTCTCTCTTTTTTGTTCAAATTTATAACTTTTGTGTATATTTATTTCAGTA
TTATTATTACGACTATCACTATTAGTGGATGAAGATGAAGCTTCTTTCTATGC


BQ
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BS 662 1073 RS1D754JQ

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A

QA 1 661 1 661
DS 

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ATGCACATGCCGCTCCTCGATGGCGAGCAGCAGGATTCATTCGTGGAGTTCTCTGGGAGC
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TTATATAGTCACTCACTACTGGTGATGTAAAGTTTTTTTCTCTCTTTTTTGTTCAAATTT
ATAACTTTTGTGTATATTTATTTCAGTATTATTATTACGACTATCACTATTAGTGGATGA
AGATGAAGCTTCTTTCTATGC

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

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ATGAGCAAGCAGTATATGGCTAATGTGGCTCTGAAAATTAATGTTAAAGTTGGAGGAAGG
AATACAGTGCTTGTTGATGCCTTGTCAAGGCGAATTCCTCTGGTCAGTGATCGCCCTACC
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AAAGGGGTGGTGACTGGTGGCATGATAAAGGAGTTACTTATAGCCTTCCGTAGATCAACT
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BQ
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AF RS1FZ90TF U 1
AF RS1FO88TF U 1
BS 1 827 RS1FO88TF

RD RS1FZ90TF 704 0 0
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ATGGCCTTTAATCCGGAACCAGTCCTCCCACCAGTTAGTGCTCGCCCGGAGCATGTGGAG
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GATCTCCTTATTGTCATTCTGCCAGACAATAATGGATCATTATATGGTGATCTGAAGCGC
ATCTGCGAGACTGAACTCGGCATTGTGTCTCAGTGCTGCCTGACTAAGCATGTCTTCAAG
ATGAGCAAGCAGTATATGGCTAATGTGGCTCTGAAAATTAATGTTAAAGTTGGAGGAAGG
AATACAGTGCTTGTTGATGCCTTGTCAAGGCGAATTCCTCTGGTCAGTGATCGCCCTACC
ATAATCTTTGGTGCTGATGTAACCCATCCTCATCCTGGAGAGGATTCAAGCCCGTCCATT
GCTGCTGTTGTCGCATCCCAGGACTGGCCTGAAGTTACCAAATATGCTGGACTGGTTTGT
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AAAGGGGTGGTGACTGGTGGCATGATAAAGGAGTTACTTATAGCCTTCCGTAGATCAACT
GGGCATAAGCCGTTGAGGATCATTTTCTACAGG*ATGGAGTCAG

QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1FO88TF 827 0 0
GCAGACAATATGGCACGTTCTTTCTGTCAGGAACTTGCTCAGATGTGCCACATATCTGGC
ATGGCCTTTAATCCGGAACCAGTCCTCCCACCAGTTAGTGCTCGCCCGGAGCATGTGGAG
AAAGTCTTGAAAACTCGATATCATGATGCCATGGCCAAGCTATCTCAAGGAAAAGAGATT
GATCTCCTTATTGTCATTCTGCCAGACAATAATGGATCATTATATGGTGATCTGAAGCGC
ATCTGCGAGACTGAACTCGGCATTGTGTCTCAGTGCTGCCTGACTAAGCATGTCTTCAAG
ATGAGCAAGCAGTATATGGCTAATGTGGCTCTGAAAATTAATGTTAAAGTTGGAGGAAGG
AATACAGTGCTTGTTGATGCCTTGTCAAGGCGAATTCCTCTGGTCAGTGATCGCCCTACC
ATAATCTTTGGTGCTGATGTAACCCATCCTCATCCTGGAGAGGATTCAAGCCCGTCCATT
GCTGCTGTTGTCGCATCCCAGGACTGGCCTGAAGTTACCAAATATGCTGGACTGGTTTGT
GCTCAGGCTCATAGACAGGAGCTCATTCAGGATCTGTTCAAAGAATGGAAGGATCCTCAG
AAAGGGGTGGTGACTGGTGGCATGATAAAGGAGTTACTTATAGCCTTCCGTAGATCAACT
GGGCATAAGCCGTTGAGGATCATTTTCTACAGGGATGGAGTCAGTGAGGGACATTCTATC
AGTTTTGCTGTATGAGCTTGATGCATCCGCAAGGCATGTGCCTCGCTGGAGCAGTTATCA
GCACAGTGACGTTTGTGGTGGTGCAGAGCGCCATCACACGAGCTGTT

QA 1 827 1 827
DS 



AS 1 2

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ATCTGCGACTGCGTTGCCGAGTCAACCCTTCTGCGTATCTACCAGCTAGTCTCAGCAACT
CGAACGTACATCCACTGGTGATTGCGGCACATCCGCAAGAACCAAACATGTTTGCTGTTG
GACTCTCAGACGGAGGAGTTCATATATTCGAGCCTGTTGAGTCGGAAGGTAAATGGGGAG
TGGCTCCACCTACTGAGAACGGGTCAGCAAGCGGCGCAGCGGCTGCACCATCTGTTGGAG
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GTCTTTTAAAGTCTTTCTTTTCTGTTTTTTTTGGTAGAAAGACTTGTGACCAAGTATTCT
GACATGCTTTAGATGTAACATATCCATTTCAGAGTAATTTAATGGGGAAGTTGTTTCTC


BQ
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AF RS1FL92TF U 1
AF RS1FL92JQ C 12
BS 1 696 RS1FL92TF
BS 697 697 RS1FL92JQ
BS 698 708 RS1FL92TF
BS 709 709 RS1FL92JQ
BS 710 719 RS1FL92TF

RD RS1FL92TF 719 0 0
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TGAAACAGTGGCCTGTGAGAGAATCATCAGCTCCTATCACTCATGCAACGTTCTCATGTG
ATAGCCAACTGGTCTATGCCAGTTTTATGGATGCAACGATCTGTGTGTTCAGCTCTGCAA
ATCTGCGACTGCGTTGCCGAGTCAACCCTTCTGCGTATCTACCAGCTAGTCTCAGCAACT
CGAACGTACATCCACTGGTGATTGCGGCACATCCGCAAGAACCAAACATGTTTGCTGTTG
GACTCTCAGACGGAGGAGTTCATATATTCGAGCCTGTTGAGTCGGAAGGTAAATGGGGAG
TGGCTCCACCTACTGAGAACGGGTCAGCAAGCGGCGCAGCGGCTGCACCATCTGTTGGAG
CCTCTGCCTCTGACCGGCCACAGAGATGATCTGATCCAAGCCACCTACTTCTCCTATTCT
GTCTTTTAAAGTCTTTCTTTTCTGTTTTTTTTGGTAGAAAGACTTGTGACCAAGTATTCT
GACATGCTTTAGATGTAACATATCCATTTCAGAGTA*TTTAATGGGGA*GTTGTTTCTC

QA 1 719 1 719
DS 

RD RS1FL92JQ 708 0 0
AACACAGATGGATGGGAGAAGCAAAGAAGCAAGGTTCTGCCGCTTCCACAGGGAAGACCG
AGTACTGCACCTTCAGATACGCGTGTTCAGTTCCACCAAGATCAAGCTCACTTCCTCGTG
GTGCACGAGACACAGCTTGCTATTTACGAAACAACCAAGCTCGATTGCATGAAACAGTGG
CCTGTGAGAGAATCATCAGCTCCTATCACTCATGCAACGTTCTCATGTGATAGCCAACTG
GTCTATGCCAGTTTTATGGATGCAACGATCTGTGTGTTCAGCTCTGCAAATCTGCGACTG
CGTTGCCGAGTCAACCCTTCTGCGTATCTACCAGCTAGTCTCAGCAACTCGAACGTACAT
CCACTGGTGATTGCGGCACATCCGCAAGAACCAAACATGTTTGCTGTTGGACTCTCAGAC
GGAGGAGTTCATATATTCGAGCCTGTTGAGTCGGAAGGTAAATGGGGAGTGGCTCCACCT
ACTGAGAACGGGTCAGCAAGCGGCGCAGCGGCTGCACCATCTGTTGGAGCCTCTGCCTCT
GACCGGCCACAGAGATGATCTGATCCAAGCCACCTACTTCTCCTATTCTGTCTTTTAAAG
TCTTTCTTTTCTGTTTTTTTTGGTAGAAAGACTTGTGACCAAGTATTCTGACATGCTTTA
GATGTAACATATCCATTTCAGAGTAATTTAATGGGGAAGTTGTTTCTC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

CO CL7666Contig1 826 2 1 U
CTAATAATAAACTTCAAAACTTTGATAAAAATTGCAAAGAGGGTTGACAAGTTTGACATG
TTTGGAAATAAAAGAAGCAAAGGAAATAAAGAGATATATAGACACCTATATTAGTAGACT
CCTCTACTTACTAATCTCTTAAGACAATGAAACTGATAACCTTACACAAACATCAAAGCC
ACAAACATTCTAAGAATGTGTTCGGCAAATGGATTGATGATAAATCAACCAGATCCTCTT
ATGTCTTAAAAACATGGTCACACCTCAACAGAACTTCCAGTGGTTGTCGCAGTTAACACA
CGTAACATAAGTCGTCATCGGCTCATCAGCACTCCTCGTCTGCATCTGATAGTAAGTGCA
TTTCCTCTGACCACACCTCCCACACTTGAACTGATCCGTACTCGCTTTCGGCGCCTGGCC
ACGCTCACAATCGAACAGAAACTTCTCCTTGATCTGGTTGGTCTCCTGTTTCCTCTTGTC
GCTCGCCATCTCTTCACCAAACAGCGTGATGAGTTTCTCCGGCGACACCTCCCCTGTGAG
CACTCTCCTCCTCAGGTCCGGATTGTTACTGTCCCTCAGGTTGAACATTATAGACCTGTA
CTTCACCTTCTGAGCTCCCGTCGACCGTCCCAACTTCTCAAACATGTGAGACTCCACAGC
CACAGCTACGCGGATTGGATCGCATCCAACAACTCTGGCTCTATCGTAGTCATAAGATTC
TTCATGAACCTTGGACATGGCGTCAACAAGCAGCTCACGGATTTTGTCACGCACGGGGTC
GTTGCATTTGACCATCGCAGTCAGCTTCGTGCACCATTACTTGCTG


BQ
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AF RS1GZ57JQ U 1
AF RS1FS59JQ U 1
BS 1 826 RS1FS59JQ

RD RS1GZ57JQ 699 0 0
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TTTGGAAATAAAAGAAGCAAAGGAAATAAAGAGATATATAGACACCTATATTAGTAGACT
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ATGTCTTAAAAACATGGTCACACCTCAACAGAACTTCCAGTGGTTGTCGCAGTTAACACA
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CACAGCTACGCGGATTGGATCGCATCCAACAACTCTGGC

QA 1 699 1 699
DS 

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CCTCTACTTACTAATCTCTTAAGACAATGAAACTGATAACCTTACACAAACATCAAAGCC
ACAAACATTCTAAGAATGTGTTCGGCAAATGGATTGATGATAAATCAACCAGATCCTCTT
ATGTCTTAAAAACATGGTCACACCTCAACAGAACTTCCAGTGGTTGTCGCAGTTAACACA
CGTAACATAAGTCGTCATCGGCTCATCAGCACTCCTCGTCTGCATCTGATAGTAAGTGCA
TTTCCTCTGACCACACCTCCCACACTTGAACTGATCCGTACTCGCTTTCGGCGCCTGGCC
ACGCTCACAATCGAACAGAAACTTCTCCTTGATCTGGTTGGTCTCCTGTTTCCTCTTGTC
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CACTCTCCTCCTCAGGTCCGGATTGTTACTGTCCCTCAGGTTGAACATTATAGACCTGTA
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QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 2

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AATTGGAGACACTTAAGTTCCTAATCTTCAAAGGCGCTTCTACTCTTTAAAAATCAAACC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BG71TF U 1
AF RS1BG71JQ C 27
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TATGTGTTGGCCTTTGTGTCATCAATAAGACTGCAATGT

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DS 

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AAGACTGCAATGTACAGGATCTTTAT

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 2

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TGTAAGAAATGTCGTCAAACTTAGCTTCTCGTTGCTCTGGTTTGTTTCTTTGTAGTGATT
TTTTTTTAAATAACATTACATGTTTCGTAATTTATACTATTTAAATAAGGT


BQ
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20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CW26TF U 1
AF RS1CW26JQ C 55
BS 1 708 RS1CW26TF
BS 709 709 RS1CW26JQ
BS 710 723 RS1CW26TF
BS 724 724 RS1CW26JQ
BS 725 767 RS1CW26TF
BS 768 891 RS1CW26JQ

RD RS1CW26TF 767 0 0
GGTGGAAGCTAAATTAGAATCCTCTCAAGATCTCTCTGGCGATTGAGGTGTGTGGTAGCG
AGTGATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATGTTCGTGATTGATTGGTT
CTATGGCGTTCTCGCTTCGCTAGGTTTATGGCAGAAGGAGGCTAAGATCTTGTTCCTCGG
GCTCGATAACGCCGGCAAAACCACCTTGCTTCACATGCTCAAAGACGAGAGGTTGGTGCA
GCACCAGCCGACGCAGCATCCAACGTCTGAAGAACTGAGCATTGGTAAAATCAAGTTCAA
GGCTTTTGATTTGGGCGGTCATCAGATTGCTCGCAGGGTCTGGAAGGATTACTACGCTAA
GGTGGATGCTGTGGTCTACCTAGTGGATGCTTACGACAAGGAGAGATTTGCAGAATCGAA
AAAGGAACTGGACGCACTTCTCTCGGACGAATCTCTAGCCACCGTTCCGTTCCTCATCCT
AGGAAACAAGATTGACATACCATACGCTGCATCAGAAGACGAGCTCCGTTACCATCTCGG
CCTCTCCAACTTCACCACGGGAAAGGGTAAAGTGAATCTAGTGGACTCCAATGTAAGACC
ATTGGAGGTTTTCATGTGCAGCATCGTCAGGAAGATGGGTTATGGCGAAAGCTTCAAATG
GCTCTCTCAGTACATCAAGTAACTACTAAAGCCACCAAGACTCCAACA*CCACATGGCCT
TGT*ATTGCTAAACCATAAGTTTCCAGCTTTGTCTACCTTGTCTTGC

QA 1 767 1 767
DS 

RD RS1CW26JQ 837 0 0
GTAGCGAGTGATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATGTTCGTGATTGA
TTGGTTCTATGGCGTTCTCGCTTCGCTAGGTTTATGGCAGAAGGAGGCTAAGATCTTGTT
CCTCGGGCTCGATAACGCCGGCAAAACCACCTTGCTTCACATGCTCAAAGACGAGAGGTT
GGTGCAGCACCAGCCGACGCAGCATCCAACGTCTGAAGAACTGAGCATTGGTAAAATCAA
GTTCAAGGCTTTTGATTTGGGCGGTCATCAGATTGCTCGCAGGGTCTGGAAGGATTACTA
CGCTAAGGTGGATGCTGTGGTCTACCTAGTGGATGCTTACGACAAGGAGAGATTTGCAGA
ATCGAAAAAGGAACTGGACGCACTTCTCTCGGACGAATCTCTAGCCACCGTTCCGTTCCT
CATCCTAGGAAACAAGATTGACATACCATACGCTGCATCAGAAGACGAGCTCCGTTACCA
TCTCGGCCTCTCCAACTTCACCACGGGAAAGGGTAAAGTGAATCTAGTGGACTCCAATGT
AAGACCATTGGAGGTTTTCATGTGCAGCATCGTCAGGAAGATGGGTTATGGCGAAGGCTT
CAAATGGCTCTCTCAGTACATCAAGTAACTACTAAAGCCACCAAGACTCCAACAACCACA
TGGCCTTGTTATTGCTAAACCATAAGTTTCCAGCTTTGTCTACCTTGTCTTGCTTTTTTC
ATGTTTTGTAAGAAATGTCGTCAAACTTAGCTTCTCGTTGCTCTGGTTTGTTTCTTTGTA
GTGATTTTTTTTTAAATAACATTACATGTTTCGTAATTTATACTATTTAAATAAGGT

QA 1 837 1 837
DS 



AS 1 2

CO CL7669Contig1 762 2 2 U
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CACAGAGGAACGGAAAGCCTGGCGTAAGAACCATCCTCATGCTTTTGTTGCCAAGCCGGA
GACTTGTTCAGATGGAACAAATAACCTAATGATCTGGCAGTGCATCATCCCTGGCAAATC
TGGGACTGATTGGGAAGGTGGGTTTTATCCACTGACACTCAATTTCTCGGAGGACTACCC
AAGCAAACCTCCAAAGTGCAAGTTTCCTCAAGGCTTCTTTCATCCTAATGTCTATCCTTC
TGGAACTGTTTGCCTCTCAATCCTTAATGAAGATTATGGATGGAGACCAGCCATCACTGT
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ATAAAGTTATTTCTCTGAATGTTTCTCTCTCTCTACTTTGTAAGAGCTATTGAAACACTT
TCACATTTTCAGTAATAAGAAAATTACATTTTCATGCCGACAGATCGATGGTTGTTACTT
ACGCAGTCTAGCAATAGTAATGATTAGTTTAGTTGATGTAAAACTTACAACACAACCTTT
GAACATTATTCCTAAATAAAAATGTACTGGAAACTGTCGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DB94TF U 1
AF RS1DB94JQ C 338
BS 1 700 RS1DB94TF
BS 701 762 RS1DB94JQ

RD RS1DB94TF 700 0 0
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CACAGAGGAACGGAAAGCCTGGCGTAAGAACCATCCTCATGCTTTTGTTGCCAAGCCGGA
GACTTGTTCAGATGGAACAAATAACCTAATGATCTGGCAGTGCATCATCCCTGGCAAATC
TGGGACTGATTGGGAAGGTGGGTTTTATCCACTGACACTCAATTTCTCGGAGGACTACCC
AAGCAAACCTCCAAAGTGCAAGTTTCCTCAAGGCTTCTTTCATCCTAATGTCTATCCTTC
TGGAACTGTTTGCCTCTCAATCCTTAATGAAGATTATGGATGGAGACCAGCCATCACTGT
GAAGCAAATCTTGGTTGGTATTCAGGACTTGCTCGATGAACCAAACCCAAATGACCCTGC
TCAGACTGAAGGATACCAGCTCTTTGTCCAGGATAAGAATGAATACAAGAGAAGGGTGAA
ACAACAGGCTAAACAGTACCCACCAACTATTTGATATCTTGCCTTGTCTCAAGTTCAAGG
ATAAAGTTATTTCTCTGAATGTTTCTCTCTCTCTACTTTGTAAGAGCTATTGAAACACTT
TCACATTTTCAGTAATAAGAAAATTACATTTTCATGCCGACAGATCGATGGTTGTTACTT
ACGCAGTCTAGCAATAGTAATGATTAGTTTAGTTGATGTA

QA 1 700 1 700
DS 

RD RS1DB94JQ 425 0 0
GGATGGAGACCAGCCATCACTGTGAAGCAAATCTTGGTTGGTATTCAGGACTTGCTCGAT
GAACCAAACCCAAATGACCCTGCTCAGACTGAAGGATACCAGCTCTTTGTCCAGGATAAG
AATGAATACAAGAGAAGGGTGAAACAACAGGCTAAACAGTACCCCCCAACTATTTGATAT
CTTGCCTTGTCTCAAGTTCAAGGATAAAGTTATTTTTTTGAATGTTTCTCTCTCTTTACT
TTGTAAGAGCTATTGAAACACTTTCACATTTTCAGTAATAAGAAAATTACATTTTCATGC
CGACAGATCGATGGTTGTTACTTACGCAGTCTAGCAATAGTAATGATTAGTTTAGTTGAT
GTAAAACTTACAACACAACCTTTGAACATTATTCCTAAATAAAAATGTACTGGAAACTGT
CGTCT

QA 1 425 1 425
DS 



AS 1 2

CO CL7670Contig1 703 2 2 U
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TGGGCATCGTGTTTACAAAAACTACGACCCGAGAGCAAAAGTCATCAAGAAACTGGCGGA
TGAAGTGTTCTCCATTGTTGGAAGGGATCCTCTAATCGAGGTAGCAGTTGCTCTAGAGAA
GGCAGCACTCTCTGATGAATATTTTGTGAAGAGAAAGCTATACCCAAATGTTGATTTCTA
CTCTGGATTAATCTATAGGGCAATGGGATTCCCACCTGAATTCTTCACAGTCCTATTTGC
AGTCCCGCGAATGGCTGGATACTTGTCTCATTGGCGTGAGTCGTTGGATGATCCTGACGC
TAAGATCATGAGACCCCAACAGGCCTACACTGGGGTGTGGCTAAGGCACTACGAGCCGGT
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ATCAAGAAGGCGTTTATCTGGATCTGCACTTTAAGTCTCAAACTCTACTACTACATACGA
ATAAAGACAGAAGACACCTCTTCTCAACATTCTTTGTTGTTTCCATTCTCTTAAAAACTC
AATAATCCATTCCAGTTTACTGCATTATGTGTCTGTTATTTTGTACTTGATGATTTAAAA
CATATTTCATACTTCCATTTAATAACAATGTCTTAACAGGGCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RS1H604JQB C 1
AF RS1H604TF U 1
BS 1 700 RS1H604TF
BS 701 703 RS1H604JQB

RD RS1H604JQB 703 0 0
GGAAAATATCCCAGAGTTCATAGAAGGCGTGAAGAACAGAAAGAGGAAGATGTCAGGTTT
TGGGCATCGTGTTTACAAAAACTACGACCCGAGAGCAAAAGTCATCAAGAAACTGGCGGA
TGAAGTGTTCTCCATTGTTGGAAGGGATCCTCTAATCGAGGTAGCAGTTGCTCTAGAGAA
GGCAGCACTCTCTGATGAATATTTTGTGAAGAGAAAGCTATACCCAAATGTTGATTTCTA
CTCTGGATTAATCTATAGGGCAATGGGATTCCCACCTGAATTCTTCACAGTCCTATTTGC
AGTCCCGCGAATGGCTGGATACTTGTCTCATTGGCGTGAGTCGTTGGATGATCCTGACGC
TAAGATCATGAGACCCCAACAGGCCTACACTGGGGTGTGGCTAAGGCACTACGAGCCGGT
GAGAGAAAGAACTCTGTCAAGTGGTTCAGATAAGATGGGTCAAGTTTCCATTTCGAATGC
ATCAAGAAGGCGTTTATCTGGATCTGCACTTTAAGTCTCAAACTCTACTACTACATACGA
ATAAAGACAGAAGACACCTCTTCTCAACATTCTTTGTTGTTTCCATTCTCTTAAAAACTC
AATAATCCATTCCAGTTTACTGCATTATGTGTCTGTTATTTTGTACTTGATGATTTAAAA
CATATTTCATACTTCCATTTAATAACAATGTCTTAACAGGGCG

QA 1 703 1 703
DS 

RD RS1H604TF 703 0 0
GGAAAATATCCCAGAGTTCATAGAAGGCGTGAAGAACAGAAAGAGGAAGATGTCAGGTTT
TGGGCATCGTGTTTACAAAAACTACGACCCGAGAGCAAAAGTCATCAAGAAACTGGCGGA
TGAAGTGTTCTCCATTGTTGGAAGGGATCCTCTAATCGAGGTAGCAGTTGCTCTAGAGAA
GGCAGCACTCTCTGATGAATATTTTGTGAAGAGAAAGCTATACCCAAATGTTGATTTCTA
CTCTGGATTAATCTATAGGGCAATGGGATTCCCACCTGAATTCTTCACAGTCCTATTTGC
AGTCCCGCGAATGGCTGGATACTTGTCTCATTGGCGTGAGTCGTTGGATGATCCTGACGC
TAAGATCATGAGACCCCAACAGGCCTACACTGGGGTGTGGCTAAGGCACTACGAGCCGGT
GAGAGAAAGAACTCTGTCAAGTGGTTCAGATAAGATGGGTCAAGTTTCCATTTCGAATGC
ATCAAGAAGGCGTTTATCTGGATCTGCACTTTAAGTCTCAAACTCTACTACTACATACGA
ATAAAGACAGAAGACACCTCTTCTCAACATTCTTTGTTGTTTCCATTCTCTTAAAAACTC
AATAATCCATTCCAGTTTACTGCATTATGTGTCTGTTATTTTGTACTTGATGATTTAAAA
CATATTTCATACTTCCATTTAATAACAATGTCTTAACAGG
CGA

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

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GACTATTATATTACCGACCTTCCCGTTAGATTCACGTTTCATGTCAACGTCCTTAGCACG
GCACAGATACGAGTGTCAGCACATGATCTCCTCATCCTACGACGCTATCAGAGCCATTGT
GTTTTCTCGTTCTATAGTTGTTGACGTTGTGGCTAGAGTCTATGACTCGAGCCCTGGATT
TGACAATCTCGTCATGGAAGCTCCGATGAGAAAACACGGAGAAGATTCTTCTTCGGGGAG
AGCGTCGTTTTATTCGCTCCCGTGGAATTACAGAGCCTTTGAAGATCCTTTGCCTGATAG
GTTTTGGCTTCAGATAGAAGTGACTGACATCAAAGGAAGATCGACTTTGTCAGAGATGAG
GCCGTTTTCGATCAACGGTCTGAGCTCTGAAGTCTCGTGGACGTGGAACGAGTTTCGTGT
CATGGGATGCCAGTGGGCGGCGTTGTATTTCCCTATTCTATGGTCTGTGCTGTGCTGTTT
GTTGATGGCTTTGCTCGTCCCTAAATGCATCATCGTTGTTTTCAAGAAGCAGTACACTCT
CAAGAAGTTCATCGCCAAGAAAGGACTAGTCACGCTTGTGATGTGGATTCTCCAGGACCT
ATGCAGACTCCCTGTGGTTTGGTTCGGTTACGTGGCGTATTTGTTTTATCTCGTATTCTT
CCCTTGGTTCTCCGGTGAAGTGTTTACTGACTCCGGGAAGAGAACGTACATGACTATTAT
GGGGTGGGTGGTCACGAGCTCAGATAGGAAACATGAGTACGTTGGAGAGCCTGATGTAAT
GGTTCTGGTGATTCCGCATCTGGTTTTCGTTGTCATCCCGATTTTGTTGATCGTGTGTTG
TTTAGTTGCTGAGAGAGAACTCTATAAAGAGCACGCTAGAGCTGTTTCTGGTAAGAAGGA
AGATGACCATGACAGGGGAAGGAAGAAGAGATGGCAACGGCGATCTGTGTTGTTCTCTAA
GAGGAGACTGGTTCGGAAGACGCTTTTGTTAGCTTCATTGGCTCTGTACTGGAAGCATTT
CAAGAATTGCTGGAGTCTAGCTAGAGCTTATGAGATGAATGTGGTTCATTTTCCAGGTTA
CAGTCTTGTGGTTCCTTTGCTGCTACTTTATGTTATTTGCAAAACTCATAGAGCTCCATG
AGAGAAACAACAAACAATCTTTTGGCAGTT


BQ
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AF RS1BZ59TF U 1
AF RS1BZ59JQ C 517
BS 1 728 RS1BZ59TF
BS 729 1230 RS1BZ59JQ

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GACTATTATATTACCGACCTTCCCGTTAGATTCACGTTTCATGTCAACGTCCTTAGCACG
GCACAGATACGAGTGTCAGCACATGATCTCCTCATCCTACGACGCTATCAGAGCCATTGT
GTTTTCTCGTTCTATAGTTGTTGACGTTGTGGCTAGAGTCTATGACTCGAGCCCTGGATT
TGACAATCTCGTCATGGAAGCTCCGATGAGAAAACACGGAGAAGATTCTTCTTCGGGGAG
AGCGTCGTTTTATTCGCTCCCGTGGAATTACAGAGCCTTTGAAGATCCTTTGCCTGATAG
GTTTTGGCTTCAGATAGAAGTGACTGACATCAAAGGAAGATCGACTTTGTCAGAGATGAG
GCCGTTTTCGATCAACGGTCTGAGCTCTGAAGTCTCGTGGACGTGGAACGAGTTTCGTGT
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GTTGATGGCTTTGCTCGTCCCTAAATGCATCATCGTTGTTTTCAAGAAGCAGTACACTCT
CAAGAAGTTCATCGCCAAGAAAGGACTAGTCACGCTTGTGATGTGGATTCTCCAGGACCT
ATGCAGACTCCCTGTGGTTTGGTTCGGTTACGTGGCGTATTTGTTTTATCTCGTATTCTT
CCCTTGGT

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1BZ59JQ 714 0 0
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TGTTTTCAAGAAGCAGTACACTCTCAAGAAGTTCATCGCCAAGAAAGGACTAGTCACGCT
TGTGATGTGGATTCTCCAGGACCTATGCAGACTCCCTGTGGTTTGGTTCGGTTACGTGGC
GTATTTGTTTTATCTCGTATTCTTCCCTTGGTTCTCCGGTGAAGTGTTTACTGACTCCGG
GAAGAGAACGTACATGACTATTATGGGGTGGGTGGTCACGAGCTCAGATAGGAAACATGA
GTACGTTGGAGAGCCTGATGTAATGGTTCTGGTGATTCCGCATCTGGTTTTCGTTGTCAT
CCCGATTTTGTTGATCGTGTGTTGTTTAGTTGCTGAGAGAGAACTCTATAAAGAGCACGC
TAGAGCTGTTTCTGGTAAGAAGGAAGATGACCATGACAGGGGAAGGAAGAAGAGATGGCA
ACGGCGATCTGTGTTGTTCTCTAAGAGGAGACTGGTTCGGAAGACGCTTTTGTTAGCTTC
ATTGGCTCTGTACTGGAAGCATTTCAAGAATTGCTGGAGTCTAGCTAGAGCTTATGAGAT
GAATGTGGTTCATTTTCCAGGTTACAGTCTTGTGGTTCCTTTGCTGCTACTTTATGTTAT
TTGCAAAACTCATAGAGCTCCATGAGAGAAACAACAAACAATCTTTTGGCAGTT

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

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TTTTTATTCGAACATTTAATGTATTGATAAACCTGAAAGTATTGAATTGTATTATATTGA
TTCATAATGACAAAAAGTAACAAGGAACAGCATGAAATCAACATGGCCTGTATTGAAAAT
TCAATTAAACAACTTTTTAAAACAGTAAAGCAAAACCTAACACAGCCTTGGTCGTTCCCA
ACAACCACCTCATTGCTAAAGTTCCATATCGACTTCGTCGTCGTTATCACCGGGAAACCT
CGAGACGATAACATCAATCTTGACTCGTATCCTATCAATCTCCAGAGAATCAGACACGGA
CTCGTGTTTCTTTAAATCCAATATCTTTCTAGTTAACGTGCGCACGATATCAGAGTAAGA
AGGGACTTGGATCTTCTCAAGAATCTTAAAGACGTTGGCTTTTATCTGCTCCCTATCGCC
ACCGATGAGCCACTCTCTATCGAACTCGTGGGTTTGACGAACGATTCGAGTTTCTAAGTT
GCAGAGGTCTTCAGCATCTTCGTCTGATAAATCTGAATCTGAGTTTGGTTTGGGGGCTCG
CCTGTAAACCAATACGAAATCGAAGACAAATTTAGGGTTCTTGCTCTTGTGTTGAGTGTC
GGTGAAGACTGGGTCGAAGGAGACTAAAGAGTCAGGTTCGTCGCAACCCTCAAACCAGAA
CATGATTCTGTTCTTGAAAGAAAGATTGATGAATAAGAAATTGGATTCGCTGTTTAGGTT
GGGAGGAACAGAGAGAGTCTGAAGAGAAAACAGAAATAGTTAAACTTGATCACCC


BQ
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AF RS1CF04JQ U 9
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QA 1 775 1 775
DS 



AS 1 2

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G


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 

AF RS1CR60TF U 1
AF RS1CR60JQ C 3
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RD RS1CR60TF 703 0 0
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QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BB57TF U 1
AF RS1BB57JQ C 1
BS 1 691 RS1BB57TF
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CTTGAAGCATAAACATCATTCAACCTAGACGATGATCGTATATCACTCCTTCCAGTACTT
ATATTTCTCTTCTATATATTATATGAAAAAA*TGTAATCTATTA
CTGTATACCCTAGAAATTG

QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1BB57JQ 763 0 0
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GAGAAAGAGAAACGGCGGAAGAGAATAATGAAACTACAAATGTGAAACGAAGGAAGCTAG
AGGAGGTAGAAACTAGGATGATCTTATCTCCGTGTGTACAAGAAGCGAATCGTGGTGGAA
TCGTGTCTGATACTAGCGTCGTAGAAGAACAGTGTCATCAGAATCCAAACGTAGAGTGTA
ATTTGTTAGAAAGCGTTTCGTCGTTGTCGGTTTCTTGCTGCTCCGACCATGACGGTGGTG
AATTTGATCAGACAGAAAATTCGTGGATTTGTGATAACTTCAACAAGATGAGAGATCCTG
AAGAAGAGGAATCGGCAAACGTTGGTTCTGCGGCTATGGAGATGGAAGAGGTAGAGTCTT
GCGGGATTAAGAAGCAGAAGAAGAGGTGTGAGACGGTGAAAGAAGACGAGGTAGAAGATT
TTTTCAAGGCGGCGGAGAAAGATGTCCGAAATGAGATGTTGGAATGTTCAAGCAAGTATA
ATTTCGATTTCGAGAAAGATGAGCCACTCGATGGACGATACAAGTGGCTAAAATTCAATC
CTTGAAGCATAAACATCATTCAACCTAGACGATGATCGTATATCACTCCTTCCAGTACTT
ATATTTCTCTTCTATATATTATATGAAAAAAATGTAATCTATTAACTGTTATTACCCTAA
GAAAATTGTATATATATCTTTCAATAATCGAGAAACTCCAACC

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

CO CL7675Contig1 734 2 2 U
GGATAATCAATTATCCTTGGAAAAGCCATACGAGAGATAGAGAGAAAAAAGGAAAAAAAA
CATGAACCTAGGATCGGTTACGCGGTATCTTGAGGGAGAAGTAATTGAGAATGATCAAAA
GGACAAGGAATCAAAAGTTGCGAAACTACCATCCAGATTCATCGAGCGATTCGTGATGAA
AGGTATAAAAGTAGATTTCATGGAACCTGGTCGAATTGTCTGCTCCATGAAAGTCCAACC
ACATCTCCTGAACGCGGGAAAATTCTTACATGGAGGAGCAATGGCGACAGTGGTGGATTT
GATAGGAACAGCTGCAATTTACACAAACGTAGATTCAGATCTGGCGGAGGGAGTGTCAGT
GGAGATCAATGTTTCATACCTTGATGCTGCTTTCCTTGACGAAGAGCTAGAGATTGAATC
GAGGGCACTGCGTGTGGGTAAAGCTGTTGCGGTTGCGAGTGTTGAGCTGAGGAGGAAGAA
GAATGGTAATATTATTGCTCAAGGTCGCCATACTAAGTACCTTGCTCCCCGTCCTAAGCT
TTGAATGAATTTTAATTATTTCTTTACTATATCTCTTTCTTTTACCTCATGCAAATAAGA
ATATCAGTTTGTTTTTTATCTGATCATGCATGAGTTTGCGTGAATCAGATACTTCATAAT
AATAATGCTAATAAAACCCCAGGGATCTACAATATTTGTAATGGCCATCTTTGTTGGTAA
CTTAGAATTTGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1FJ57TF U 1
AF RS1FJ57JQ C 34
BS 1 733 RS1FJ57TF
BS 734 734 RS1FJ57JQ

RD RS1FJ57TF 733 0 0
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GGACAAGGAATCAAAAGTTGCGAAACTACCATCCAGATTCATCGAGCGATTCGTGATGAA
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GATAGGAACAGCTGCAATTTACACAAACGTAGATTCAGATCTGGCGGAGGGAGTGTCAGT
GGAGATCAATGTTTCATACCTTGATGCTGCTTTCCTTGACGAAGAGCTAGAGATTGAATC
GAGGGCACTGCGTGTGGGTAAAGCTGTTGCGGTTGCGAGTGTTGAGCTGAGGAGGAAGAA
GAATGGTAATATTATTGCTCAAGGTCGCCATACTAAGTACCTTGCTCCCCGTCCTAAGCT
TTGAATGAATTTTAATTATTTCTTTACTATATCTCTTTCTTTTACCTCATGCAAATAAGA
ATATCAGTTTGTTTTTTATCTGATCATGCATGAGTTTGCGTGAATCAGATACTTCATAAT
AATAATGCTAATAAAACCCCAGGGATCTACAATATTTGTAATGGCCATCTTTGTTGGTAA
CTTAGAATTTGAT

QA 1 733 1 733
DS 

RD RS1FJ57JQ 701 0 0
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GGGAGAAGTAATTGAGAATGATCAAAAGGACAAGGAATCAAAAGTTGCGAAACTACCATC
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AATTGTCTGCTCCATGAAAGTCCAACCACATCTCCTGAACGCGGGAAAATTCTTACATGG
AGGAGCAATGGCGACAGTGGTGGATTTGATAGGAACAGCTGCAATTTACACAAACGTAGA
TTCAGATCTGGCGGAGGGAGTGTCAGTGGAGATCAATGTTTCATACCTTGATGCTGCTTT
CCTTGACGAAGAGCTAGAGATTGAATCGAGGGCACTGCGTGTGGGTAAAGCTGTTGCGGT
TGCGAGTGTTGAGCTGAGGAGGAAGAAGAATGGTAATATTATTGCTCAAGGTCGCCATAC
TAAGTACCTTGCTCCCCGTCCTAAGCTTTGAATGAATTTTAATTATTTCTTTACTATATC
TCTTTCTTTTACCTCATGCAAATAAGAATATCAGTTTGTTTTTTATCTGATCATGCATGA
GTTTGCGTGAATCAGATACTTCATAATAATAATGCTAATAAAACCCCAGGGATCTACAAT
ATTTGTAATGGCCATCTTTGTTGGTAACTTAGAATTTGATT

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 2

CO CL7676Contig1 713 2 3 U
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TCCTCTACAAGCAAAGCTTCAAACTGTATCAAATACTCGGTTCTTTTGAATACAAGGCGT
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ACCACATCTTCAACGACAACTTCCCCAGTCATGGAAGACGTCACCTCGTGGACAGTGTTA
CGCTTTTTGATCCCATCACTTGCCATCATATACGGAATGCGAGCTGCTTCATCATCGTTT
CTAGGAGCTAGTTGTGTCACCATGGGAGATAAATCATTCTGGATATCCTCCATGCTGACG
CCATTATGGCTACTGTCCAGATAAACCATTATGAGACGAGCAGCCCTAGCACTCTCGACA
ACCTGCCACTGTCCTTCCTCTGAACAGAACAGCCACTCATGAGCACGAGTCTTAGGGACA
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GCTAAATCTCCTTTAACGCCAAGTTTCAAATCTTCATGAGAGTACAACAAGTCTGATCCA
TTGCTGCAGTCTCTACGTATCTGGTTCTCACTTTCAAGGGCTTCACACATACC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 

AF RS1A361JQ U 1
AF RS1A361TR U 1
BS 1 535 RS1A361JQ
BS 536 536 RS1A361TR
BS 537 713 RS1A361JQ

RD RS1A361JQ 713 0 0
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CTAAATGCCAAATCACCAGAAGGCGATAAGCCTCCAGGATTACTAGGAGTGCTTTCATAA
ACCACATCTTCAACGACAACTTCCCCAGTCATGGAAGACGTCACCTCGTGGACAGTGTTA
CGCTTTTTGATCCCATCACTTGCCATCATATACGGAATGCGAGCTGCTTCATCATCGTTT
CTAGGAGCTAGTTGTGTCACCATGGGAGATAAATCATTCTGGATATCCTCCATGCTGACG
CCATTATGGCTACTGTCCAGATAAACCATTATGAGACGAGCAGCCCTAGCACTCTCGACA
ACCTGCCACTGTCCTTCCTCTGAACAGAACAGCCACTCATGAGCACGAGTCTTAGGGACA
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GCTCTATAACTGAAGTTGCTTGCTAAAGTAAATTTTACACGACGACCTCCAGTAAGCTCT
GCTAAATCTCCTTTAACGCCAAGTTTCAAATCTTCATGAGAGTACAACAAGTCTGATCCA
TTGCTGCAGTCTCTACGTATCTGGTTCTCACTTTCAAGGGCTTCACACATACC

QA 1 713 1 713
DS 

RD RS1A361TR 712 0 0
CGTTTTGATTGAGAAGCATTTATAGTTTTCTCTGTCTGAGATTGATCAACAATCTCACCA
TCCTCTACAAGCAAAGCTTCAGACTGTATCAAATACTCGGTTCTTTTGAATACAAGGCGT
CTAAATGCCAAATCACCAGAAGGCGATAAGCCTCCAGGATTACTAGGAGTGCTTTCATAA
ACCACATCTTCAACGACAACTTCCCCAGTCATGGAAGACGTCACCTCGTGGACAGTGTTA
CGCTTTTTGATCCCATCACTTGCCATCATATACGGAATGCGAGCTGCTTCATCATCGTTT
CTAGGAGCTAGTTGTGTCACCATGGGAGATAAATCATTCTGGATATCCTCCATGCTGACG
CCATTATGGCTACTGTCCAGATAAACCATTATGAGACGAGCAGCCCTAGCACTCTCGACA
ACCTGCCACTGTCCTTCCTCTGAACAGAACAGCCACTCATGAGCACGAGTCTTAGGGACA
AGGAAAACACCACAATGATAAACGAACGGCTCGGTCTGCTTCTGAGCGTCAAGAAAAACA
GCTCTATAACTGAAGTTGCTTGCTAAAGTAAATTTTACACGACGACCTCCAGTAAGCTCT
GCTAAATCTCCTTTAACGCCAAGTTTCAAATCTTCATGAGAGTACAACAAGTCTGATCCA
TTGCTGCAGTCTCTACGTATCTGGTTCTCACTTTCAAGGGCTTCACACATAC

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 2

CO CL7677Contig1 1372 2 4 U
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AAGTTTATTGTTTACAAGTCATAAGCTGATGAGAGTGTTAGATCTCTCTTATATGTGCTT
TCAATGGGGGAAGGTACCCACAAGCATCGGGAAGCTCATCCACTTGAGATATTTGAGTTT
GAGAGATGCACGTGTAATTCAACTGCCTTCTTCAATTCTTGTCTTTTCCCAAGGGATTAC
ATGATGAGACAAAGTTGGAATTGGGGAATCTGGTCAAGCTGGAGACGTTGAAGAATTTCA
ACACAAAACATGGGAGAGTGACGGATCTACAGGACATGACACGGCTCAGATCTCTCTCTA
TCAATATTACAGACAAGGGCTATACCATTAAGACTCTATCTTCATCTCTACGTGAAATGA
GATGCTTGGAGAGTCTTACTATATATCATTACAAGTTGTATACTCGCACGAATGATGATG
ATGAAGAAGGATTTGTTTGGGATTTTGTTAATCTCAAACAGCTGTGGTTGGAGAAGATAT
ATATGCCAAGGTTACCGGATGCGCAACATTTTCCTTCTCAACTCTTAACTATATTTCTAA
GTGATTGTTATTTGGAGAAGGATCCAATGACGATTCTAGAGAAATTGCTTCGTTTGAAAG
AGATTAGTTTACATTTGTCGATCTTTCAGTGGGAAAAGAATGGTTTGCTCGAGGGATGGG
TTTCCTCAATTGCATAATCTAGAATTTATTGGATTGGAGGAGTGGGAAGAGTGGATAGTA
GAAGAAGGCTCCATGCCCCTTCTTCATACTCTCAAAATTGGCTATTGTCCAAAGTTAAAG
GAGCTTCCCGATGGACTGCGATTCATCACTTCTTTGAAGAGTCTGACCTGTTTTGATGAC
ACGAAAAAGGGATGGGAGAAGAGACTGCCGAAAGGAGGAAAAGATTATTACAAAGTACAA
CACATATTCCTTCTGTTATATTCTATAATATATGATTGATCTCGGCAACAGTGAGTCAGA
CAACAGCTGAAGGAGACGAGACTCTCAGCAATTACGGGCTATCAGTGGCAAACAGAGTAT
ATTTTACAAGTGAAACATACTGGCACACTGACGCGGTGAAGCTGTTCGACGGAAGTGTCT
AACTGAGACACTTGATCTCCTGCACTGCTTTAAGTTTGCCTATTATTAGTATTCTCTTTA
CATTTTCTTGTATTTGTTCTTCTTAAAGATTTTAACAACATATCGATTTTTTTTTTTTAA
GATTTTTCATTTTGTTTTTGTAACTCAAAAATTTACATGCCTTTGTACAAAGATTTATGG
ATTGATTTCCACAGAATAGTTGTTTTTTTTCAGTAAATATTATTTGGATTAT


BQ
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AF RS1C776TF U 1
AF RS1C776JQ C 637
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TCAATGGGGGAAGGTACCCACAAGCATCGGGAAGCTCATCCACTTGAGATATTTGAGTTT
GAGAGATGCACGTGTAATTCAACTGCCTTCTTCAATTCTTGTCTTTTCCCAAGGGATTAC
ATGATGAGACAAAGTTGGAATTGGGGAATCTGGTCAAGCTGGAGACGTTGAAGAATTTCA
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TCAATATTACAGACAAGGGCTATACCATTAAGACTCTATCTTCATCTCTACGTGAAATGA
GATGCTTGGAGAGTCTTACTATATATCATTACAAGTTGTATACTCGCACGAATGATGATG
ATGAAGAAGGATTTGTTTGGGATTTTGTTAATCTCAAACAGCTGTGGTTGGAGAAGATAT
ATATGCCAAGGTTACCGGATGCGCAACATTTTCCTTCTCAACTCTTAACTATATTTCTAA
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AGATTAGTTTACATTTGTCGATCTTTCAGTGGGAAAAGA*TGGTTTGCTCGAGGGATGGG
TTTCCTCAATTGCATAATCTAGAATTT
TTGGAT

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DS 

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AGAATGGTTTGCTCGAGGGATGGGTTTCCTCAATTGCATAATCTAGAATTTATTGGATTG
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ATTGGCTATTGTCCAAAGTTAAAGGAGCTTCCCGATGGACTGCGATTCATCACTTCTTTG
AAGAGTCTGACCTGTTTTGATGACACGAAAAAGGGATGGGAGAAGAGACTGCCGAAAGGA
GGAAAAGATTATTACAAAGTACAACACATATTCCTTCTGTTATATTCTATAATATATGAT
TGATCTCGGCAACAGTGAGTCAGACAACAGCTGAAGGAGACGAGACTCTCAGCAATTACG
GGCTATCAGTGGCAAACAGAGTATATTTTACAAGTGAAACATACTGGCACACTGACGCGG
TGAAGCTGTTCGACGGAAGTGTCTAACTGAGACACTTGATCTCCTGCACTGCTTTAAGTT
TGCCTATTATTAGTATTCTCTTTACATTTTCTTGTATTTGTTCTTCTTAAAGATTTTAAC
AACATATCGATTTTTTTTTTTTAAGATTTTTCATTTTGTTTTTGTAACTCAAAAATTTAC
ATGCCTTTGTACAAAGATTTATGGATTGATTTCCACAGAATAGTTGTTTTTTTTCAGTAA
ATATTATTTGGATTAT

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

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GATAATTACTCCTGCAATCAATCTTGCTTTCAATCCTCTGTCAACGTCTCTTACGATTTG
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CCCGCCTCGCATGTCATCTCCGCCAACGGATTCAACCTCATGATGTTCCGCGACATCACC
TACGGTCCACAAGAAGCGGAGTTGAGATTCCGACTCCTCCACTTTTGGGAAGCTCGCGTG
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ACTTGG


BQ
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AF RS1GF68TF U 1
AF RS1GF68JQ C 41
BS 1 638 RS1GF68TF
BS 639 666 RS1GF68JQ

RD RS1GF68TF 638 0 0
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GATAATTACTCCTGCAATCAATCTTGCTTTCAATCCTCTGTCAACGTCTCTTACGATTTG
TCTTCCTCGATGGATCATTATAAAGACTTCTACCGGCTTTGCTTTTTTTACTTCTCCAAC
ATCTGAATCGGGAAATACTCTGCTCCAACCAAAGCCATGTCGAAGAAGGCCAACGGGAAA
GCCATTGACTACTCCGGTTCCGGTAACGCTGCTGCTGACAAGGTCTCCAATCGAAGCCTT
CCCGCCTCGCATGTCATCTCCGCCAACGGATTCAACCTCATGATGTTCCGCGACATCACC
TACGGTCCACAAGAAGCGGAGTTGAGATTCCGACTCCTCCACTTTTGGGAAGCTCGCGTG
CCGGGGAAGAACACACTGCTGGGTCTGGAACTGCTTCTCATTGACGAACATGTATTGAAC
CTCTTTTCTGATTTTTTTGCTTTGTGGTAAAGTTTCTATTTTGTAACAAACGTTTGCTTC
CCTTAGTAGTTTGATATTATTAGGTTCCTGTGTTTCAAACTTATGTAACTTGACTCCTCC
CATGTTATGTATTTAAAATTTTGTTGTAAGCTTTTGCA

QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1GF68JQ 626 0 0
TTGGATAATCTCCGTTACTCGATAATTACTCCTGCAATCAATCTTGCTTTCAATCCTCTG
TCAACGTCTCTTACGATTTGTCTTCCTCGATGGATCATTATAAAGACTTCTACCGGCTTT
GCTTTTTTTACTTCTCCAACATCTGAATCGGGAAATACTCTGCTCCAACCAAAGCCATGT
CGAAGAAGGCCAACGGGAAAGCCATTGACTACTCCGGTTCCGGTAACGCTGCTGCTGACA
AGGTCTCCAATCGAAGCCTTCCCGCCTCGCATGTCATCTCCGCCAACGGATTCAACCTCA
TGATGTTCCGCGACATCACCTACGGTCCACAAGAAGCGGAGTTGAGATTCCGACTCCTCC
ACTTTTGGGAAGCTCGCGTGCCGGGGAAGAACACACTGCTGGGTCTGGAACTGCTTCTCA
TTGACGAACATGTATTGAACCTCTTTTCTGATTTTTTTGCTTTGTGGTAAAGTTTCTATT
TTGTAACAAACGTTTGCTTCCCTTAGTAGTTTGATATTATTAGGTTCCTGTGTTTCAAAC
TTATGTAACTTGACTCCTCCCATGTTATGTATTTAAAATTTTGTTGTAAGCTTTTGCAAA
AAAAAAGGAATCCTGCTTTGACTTGG

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 2

CO CL7679Contig1 707 2 2 U
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GAACTCATTTTTCTTTCATACAGCATTTCGGTATCATATATCTTGCAATAATAACAGGAA
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TCGGTATAATAGTTGACACTATATTAATATAGAAAATTAGTATTTAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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BS 701 707 RS1EY53JQ

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DS 

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QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

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TCAGCGGAATGCCGTATTTGTCAGGACGAGTGCCCTATCAAGACTCTCGAGAGCCCTTGT
GCTTGCAGTGGCAGCCTCAAGTATGCTCACAGAAAATGTGTTCAGCGCTGGTGCAATGAA
AAGGGAAATATTATATGTGAGATCTGTCATCAGCCTTACCAACCTGGATACACCGCTCCA
CCACCTCCTCCTCAGCCTGAAGAAACCACTATTGACATTGGTGGAGGATGGACGATCTCA
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GAGTCTGAATACGTGGAATATACTGCTTCAAGTGCTAGTGGAGCTGCCTTTTGTCGCTCA
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BQ
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AF RS1DD63TF U 1
AF RS1DD63JQ C 467
BS 1 728 RS1DD63TF
BS 729 1176 RS1DD63JQ

RD RS1DD63TF 728 0 0
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TGCGACTAACCAGCAGGGACATCTCTTTCCATTTTCGCAGGAGTCGGAGGAATGATAGGT
TTATCAGCAGAGAGCAGTCACATGGTGGTCAATGTGGATGGACTGATGCCACCGGTGCCG
TCGCCGCCGGTTAATGCGGAGGTCGAGAATATAAGACAAGAGTCGACGGTGGTTGTTAAT
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GCTTGCAGTGGCAGCCTCAAGTATGCTCACAGAAAATGTGTTCAGCGCTGGTGCAATGAA
AAGGGAAATATTATATGTGAGATCTGTCATCAGCCTTACCAACCTGGATACACCGCTCCA
CCACCTCCTCCTCAGCCTGAAGAAACCACTATTGACATTGGTGGAGGATGGACGATCTCA
GGTTTGGATTTGCATGATCCTCGCCTTCTTCCCATTGCAGAAGCTGAACGTCGCTATCTA
GAGTCTGAATACGTGGAATATACTGCTTCAAGTGCTAGTGGAGCTGCCTTTTGTCGCTCA
GCTGCCCTAATATTAATGGCACTTCTTCTCTTACGACATGCACTGACCATAACAAGCGAT
GATGGAGA

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1DD63JQ 710 0 0
GATACACCGCTCCACCACCTCCTCCTCAGCCTGAAGAAACCACTATTGACATTGGTGGAG
GATGGACGATCTCAGGTTTGGATTTGCATGATCCTCGCCTTCTTCCCATTGCAGAAGCTG
AACGTCGCTATCTAGAGTCTGAATACGTGGAATATACTGCTTCAAGTGCTAGTGGAGCTG
CCTTTTGTCGCTCAGCTGCCCTAATATTAATGGCACTTCTTCTCTTACGACATGCACTGA
CCATAACAAGCGATGATGGAGAAGACGAGGATGACCCATCTAACATACTATCTCTCGTCT
TGCTCCGAGCTGCTGGATTTTTTTTTCCTTGCTATATCATGGCTTGGGCGATCAGTATCC
TACAGCACCGAAGGCAAAGACAGGAAGCTGCAGCTCTGGCTACACAGTTTGCATTAGTGC
TTCAGTCAGTATCAACCTAGAATAGTTCACTTCACCGTGGAACCAGAACCACCATCACCC
TCCATGGCTACTGCAACTACGTCTACACAACAATTTGAAGAACCCGTTTGATTCTCCTGA
CTCATAAGCTTTCATGGAACCAAGTGAATCGAGTGGAGACTTGATGTCTCTAAATTTTAG
AATGTATTGAGTAAAGGATAATCATTTGAGCTGTAACCAAAAATGTCACTAGTTTTTTTT
TCACAAATTTGTAAATTCTGTTTTACTATCTTCCAAATATTGTCTTGAGG

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

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TTGTTTTATTATATGTTTTTGCTTGTATCAAAAATCATGCAGAATTAAAACCACAATAGC
AAAAGCTTTTTCTTATTATTCTTCTATCTTCATCTTTGGTCAAGAAGACAATGGAAAAAA
AAACAGGCAACTTTTGATACATTGGAGGAGATCAAGCAGTTCTCTTAATGATATGGACTC
CACTGTCTGTATCCACAATCTCGCTTATATCACCAAACTTGAGTGCGTATGTTGCCTCCT
CAAACGGTTTCTGCATTTGACCTCTCCCAAACGGACCTAGATCGCCGCCGCGTTTGGCGG
AGCTACAGTCGGAAACGCGAGTGGCAACATCCTCGAAGTTAGCTGCCAGAGAGAATGTCT
TCGCGGATCGATTTGAGCTGTTCGACGGCTGCTTCTCTCGTGGTAGTCATTATGATCTTT
CCTTCGGGATCCTTCCACGACGCCTTCCTACGAGATCCTTGGTGCTTTATCAGAATGTGC
GACGCCTTTACTTGCTCTCTCGACGCCATCTTTTCTTTTCCCGGCGCTTGTTGTGGATGT
GGTGATGATCGTCTATCAAGAGAAGAGAGGTTAAAGTGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D142JQ U 11
AF RS1D142TF C 1
BS 1 10 RS1D142TF
BS 11 216 RS1D142JQ
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CTTTTGATACATTGGAGGAGATCAAG

QA 1 206 1 206
DS 

RD RS1D142TF 641 0 0
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TTGTTTTATTATATGTTTTTGCTTGTATCAAAAATCATGCAGAATTAAAACCACAATAGC
AAAAGCTTTTTCTTATTATTCTTCTATCTTCATCTTTGGTCAAGAAGACAATGGAAAAAA
AAACAGGCAACTTTTGATACATTGGAGGAGATCAAGCAGTTCTCTTAATGATATGGACTC
CACTGTCTGTATCCACAATCTCGCTTATATCACCAAACTTGAGTGCGTATGTTGCCTCCT
CAAACGGTTTCTGCATTTGACCTCTCCCAAACGGACCTAGATCGCCGCCGCGTTTGGCGG
AGCTACAGTCGGAAACGCGAGTGGCAACATCCTCGAAGTTAGCTGCCAGAGAGAATGTCT
TCGCGGATCGATTTGAGCTGTTCGACGGCTGCTTCTCTCGTGGTAGTCATTATGATCTTT
CCTTCGGGATCCTTCCACGACGCCTTCCTACGAGATCCTTGGTGCTTTATCAGAATGTGC
GACGCCTTTACTTGCTCTCTCGACGCCATCTTTTCTTTTCCCGGCGCTTGTTGTGGATGT
GGTGATGATCGTCTATCAAGAGAAGAGAGGTTAAAGTGTCC

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

CO CL7682Contig1 691 2 1 U
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GTTAAAATATATTAGTGTTGATAGGATAGCC


BQ
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AF RS1EH19JQ C 1
AF RS1EH19TF U 1
BS 1 691 RS1EH19TF

RD RS1EH19JQ 691 0 0
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TGGACTATTTCTCCTAATTCTGCTTATTTCATACTTTTGAATCTATTTTGGAAACAATTT
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QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1EH19TF 691 0 0
GGACTCCCAACCCTTCCATTTCTCATCTCTTCCAATCCGTTTCAAGGATTAACTTCACGA
GTAATTGCTCTAATCAATGAATCTTTGGAAGCTCATGATGGAGCAAGCAAAGGCAAATAC
ACCATTGGACTTGGCCAAGATTGTTTAGCTTTTTTGCACTGAGCTTGAAGACGTCATCTC
AATGAGTTTCAATGGGTAGAAGTTGGACTTTGAGGAGGAACGTTTCCGGTTCCATTCCTA
TGAAGACTTCGAAGCTGGCTGTGATATGAAAGGTGATCTTTTCGGGGACCTGTTCTGAAG
CTCTATCTTTGGGACCAAGCTGCTGTGGATTTCTGCAAGAAGTTCAAGTCTTCTGACAAC
ACTCCCTCCGTGATTTTGGTGACTACTGTTTACCCCAAACGTTTTTTAGAGAGTAATGAA
ACACTTGGGACTGGGGATGACGTTATGGAGCCATCCAAAAGCCCTCAAGATAGGTGATGG
TGTTGAGATAGGCAACGCTAAACGTTCTAAAGATGGGAACTAATATGCCCCTCATCGTGG
CAAAGAATGCAACTTTTAATACACTTATCTGTTTTAGCTTTCCAGTTTTTTGGCTTTTGT
TGGACTATTTCTCCTAATTCTGCTTATTTCATACTTTTGAATCTATTTTGGAAACAATTT
GTTAAAATATATTAGTGTTGATAGGATAGCC

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

CO CL7683Contig1 855 2 8 U
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GTTTATCATTAAAATATGAGAAACTGAAGCAGTTATAGCTTATGTCTTTCCATTGCCGCA
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CTTGTTCTGTTTCTTCAATGTCAAGCTGTGTAAAGTTTCACTTGACTATTTAACAATGTC
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AAAAGGATGTGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BE88TF U 1
AF RS1BE88JQ C 32
BS 1 659 RS1BE88TF
BS 660 660 RS1BE88JQ
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BS 730 730 RS1BE88JQ
BS 731 740 RS1BE88TF
BS 741 855 RS1BE88JQ

RD RS1BE88TF 740 0 0
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CTTGTTCTGTTTCTTCAATGTCAAGCTGTGTAAAGTTTCACTTGACTATTTAACAATGTC
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CACACTGTTGCTGATATTTTCTGCTGCTGTTGCGGACAGAATGTTGGTTGGAAATATGAA
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DS 

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GTTATAGCTTATGTCTTTCCATTGCCGCAGAGGAAAGGCTTACCTGTTCAATCGTTCGTA
AGTACAAACTTCTTTGATATTATTATGTACTTGTTCTGTTTCTTCAATGTCAAGCTGTGT
AAAGTTTCACTTGACTATTTAACAATGTCAGGCTTAAGCATTCTTTTTTTTAGCTCTCTA
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QA 1 824 1 824
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1G320TF U 1
AF RS1FX72TF U 1
BS 1 784 RS1FX72TF

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QA 1 691 1 691
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CCAGCGCAAAGCCTGAAGAGGTGGAAAATGAGGTCATTGAAATGGTCGGAGATCATAACT
CGACGAACAGCACGAGGCGAAGCTTAAAAGGTAAAGGCAAAGGAAAATGGAGTAAGCTCA
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AGGA

QA 1 784 1 784
DS 



AS 1 2

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 

AF RS1FB40JQ C 1
AF RS1FB40TF U 1
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RD RS1FB40JQ 715 0 0
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GTGCTGTTTTTTCAGGAAGCCAGCGCCGAGCAAAACAAATTGCTTCTCAAATTCAGTGCG
GCGTTGCTGCAATCAATGACTTTGCATCGAACTACATTTGCCAGTCGCTCCCGTTCGGAG
GTGTAAAGGATAGCGGGTTTGGACGCTTTGCTGGCATAGAAGGTTTAAGAGCTTGCTGTC
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CTATTCAGTACCCGGTAGCAGAAAACGCATTTGAATTCCAGGAGGCACTAGTTGAAACCC
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CCGATCAGAGCTCTCACGTGAGCAGAACTAGAAAGAGCCACTAAAGACCCGTTGACGAAT
AACTTTCATGTCCTCCACAAAGCACTTTTACGATTTACATGCGTAATTTGAGTTGCTAGT
TTTGGTTTATTAGTAAGCTTTTGGATTTACAACATAAGCCTCAGAGAGACTTGTTTTTTC
CTCGGAAGGGCGATTTGTGACTTGTGAGACGCTTGAAATCACTTTTGCGTTGTCT

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1FB40TF 712 0 0
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AATTCAGTACCGATGAAGAGGTCATCAAGCTGGCCAATGATTCACGCTATGCGCTCGGCT
GTGCTGTTTTTTCAGGAAGCCAGCGCCGAGCAAAACAAATTGCTTCTCAAATTCAGTGCG
GCGTTGCTGCAATCAATGACTCTGCATCGAACTACATTTGCCAGTCGCTCCCGTTCGGAG
GTGTAAAGGATAGCGGGTTTGGACGCTTTGCTGGCATAGAAGGTCTAAGAGCTTGCTGTC
TAGTGAAATCCGTGGTCGAGGATAGATTTTGGCCACTCATCAAAACCAAGATTCCAAAAC
CTATTCAGTACCCGGTAGCAGAAAACGCATTTGAATTCCAGGAGGCACTAGTTGAAACCC
TTTATGGACTCAACGTCTGGGACCGACTAAGATCCCTAGTGGATGTCCTCAAGTTCCTTA
CCGATCAGAGCTCTCACGTGAGCAGAACTAGAAAGAGCCACTAAAGACCCGTTGACGAAT
AACTTTCATGTCCTCCACAAAGCACTTTTACGATTTACATGCGTAATCTGAGTTGCTAGT
TTTGGTTTATTAGTAAGCTTTTGGATTTACAACATAAGCCTCAGAGAGACTTGTTTTT*C
CTCGGAAGGGCGATTTGTGACTTGTGAGACGCTTGAA*TCACTTTTGCGTTG

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 2

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GCTGCCAGGTCCTCCGGAGGATATAGAGACAGGACTGCGGAATCAAAGCATGACACCGAG
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CGCTTGTCGGACCGTGCAAAGCTCCCAAGTCGTGGCACCCAATTCAGAACATGACGATGG
TACAATGGACATGCTATTGGTTCACGGGTGTGGAAGACTGAGGTTAATTAGGTTTTTTAT
CCTTCTGCAAACCGGTCGACACCTCTCGCTTCCATACGTAGAGTGTGTAAAGGTGAAGTC
GGTTAAGATAAAGGCGGGAAAGCAGACGCATGATAGTTGTGGTATAGACGGAGATGTTTG
CATTGAATGGAGAAGTGATATCGACGATGCTACCGGAACAATGCAGATTGATCGGTAATG
CTCCTGAACGACATTAGTAGTTATATTAAAATCTCATCAAATTATGTGGATGGAAAGAGA
AGAGTCCAGGTGGTGTCTGTAGGTTTCTTTTTTTTGGGGTGTTGTTTTTGATCTGGTCGG
CGGCGTCAATAGCTCTGCGAAAAGAGGAATAAGTACCATCCTTCCCTTTTGTAATCCATA
AGTTCCCTAAACCCCTAAACCTTTTGTGTATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GQ27TF U 1
AF RS1GQ27JQ C 383
BS 1 622 RS1GQ27TF
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BS 636 655 RS1GQ27TF
BS 656 753 RS1GQ27JQ

RD RS1GQ27TF 655 0 0
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ATTCGAAAATAAATGAGTTGCTAGAAAAGGACATTTCCTTGGGATCATGGTGTGTAACCA
CGCTTGTCGGACCGTGCAAAGCTCCCAAGTCGTGGCACCCAATTCAGAACATGACGATGG
TACAATGGACATGCTATTGGTTCACGGGTGTGGAAGACTGAGGTTAATTAGGTTTTTTAT
CCTTCTGCAAACCGGTCGACACCTCTCGCTTCCATACGTAGAGTGTGTAAAGGTGAAGTC
GGTTAAGATAAAGGCGGGAAAGCAGACGCATGATAGTTGTGGTATAGACGGAGATGTTTG
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CTCCTGAACGACATTAGTAGTTATATTAAAATCTCATCAAATTATGTGGATGGAAAGAGA
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QA 1 655 1 655
DS 

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ATATTAAAATCTCATCAAATTATGTGGATGGAAAGAGAAGAGTCCAGGTGGTGTCTGTAG
GTTTCTTTTTTTTGGGGTGTTGTTTTTGATCTGGTCGGCGGCGTCAATAGCTCTGCGAAA
AGAGGAATAAGTACCATCCTTCCCTTTTGTAATCCATAAGTTCCCTAAACCCCTAAACCT
TTTGTGTATTC

QA 1 371 1 371
DS 



AS 1 2

CO CL7687Contig1 735 2 4 U
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CGTGTACACACATTTTAGAAGGCCACACTGGGGCTATCTCTTCTATTGCTTTTGTTAACT
CCGAAGGTGCTGAAAATGTTACTGTTGCAACTGGCGCTAAAGATCGAACATTGAGATTGT
TTAAGGTTGATACAGCTGAATCTGGTGACCCTACTACTAGAGTTGGGGCTTACAAGGTAT
TGCGTGGGCACAAGGCGTCGGTGGCAAGTGTTGCAGCTCAGAAATACGGGAGCAAGATTT
GCTCGGGTTCATGGGATTGCACGATCAATTTATGGGACACAGATGAGCTACTTCAGAGTT
GTCAGTAGCAGGAGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B427TF U 1
AF RS1CK57TF U 1
BS 1 594 RS1B427TF
BS 595 595 RS1CK57TF
BS 596 685 RS1B427TF
BS 686 735 RS1CK57TF

RD RS1B427TF 685 0 0
GAGAGGCGATAATGGACGGCGGAGGAGAAGACGCGGCTAAAGTAATCCACGTGAAGTTCG
TGACGAAGCTTGACTCCCCGTTCCAAGCTCCGTCCAGCTCCGTCGTTATCCCTTCCAATG
TCACTCGTCTCGGTCTCTCCTCCATCGTCAACTCTCTTCTCACTCTCGAGAAACATGAGG
CATTTGACTTTTTGATCGATGGAGAGCTTATTCGAATTTCACTTGAGCAGTTTCTTCTCG
CCAAGGGAATCTCAGCGGAACGAACTCTTGAGATAGAATACATAAGGGCTGTGGCGCCAC
GGAAGGAGGAGAAACCCTCATTGCATGATGACTGGGTCAGTGCTGTTGATGGTTCTTCTC
CCAGGTTCATTTTGACCGGCTGCTATGATGGTTTAGGAAGGATATGGAGCTCTGCTGAAT
CGTGTACACACATTTTAGAAGGCCACACTGGGGCTATCTCTTCTATTGCTTTTGTTAACT
CCGAAGGTGCTGAAAATGTTACTGTTGCAACTGGCGCTAAAGATCGAACATTGAGATTGT
TTAAGGTTGATACAGCTGAATCTGGTGACCCTACTACTAGAGTTGGGGCTTACAGGGTAT
TGCGTGGGCACAAGGCGTCGGTGGCAAGTGTTGCAGCTCAGAAATACGGGAGCAAGATTT
GCTCGGGTTCATGGGATTGCACGAT

QA 1 685 1 685
DS 

RD RS1CK57TF 735 0 0
GAGAGGCGATAATGGACGGCGGAGGAGAAGACGCGGCTAAAGTAATCCACGTGAAGTTCG
TGACGAAGCTTGACTCCCCGTTCCAAGCTCCGTCCAGCTCCGTCGTTATCCCTTCCAATG
TCACTCGTCTCGGTCTCTCCTCCATCGTCAACTCTCTTCTCACTCTCGAGAAACATGAGG
CATTTGACTTTTTGATCGATGGAGAGCTTATTCGAATTTCACTTGAGCAGTTTCTTCTCG
CCAAGGGAATCTCAGCGGAACGAACTCTTGAGATAGAATACATAAGGGCTGTGGCGCCAC
GGAAGGAGGAGAAACCCTCATTGCATGATGACTGGGTCAGTGCTGTTGATGGTTCTTCTC
CCAGGTTCATTTTGACCGGCTGCTATGATGGTTTAGGAAGGATATGGAGCTCTGCTGAAT
CGTGTACACACATTTTAGAAGGCCACACTGGGGCTATCTCTTCTATTGCTTTTGTTAACT
CCGAAGGTGCTGAAAATGTTACTGTTGCAACTGGCGCTAAAGATCGAACATTGAGATTGT
TTAAGGTTGATACAGCTGAATCTGGTGACCCTACTACTAGAGTTGGGGCTTACAAGGTAT
TGCGTGGGCACAAGGCGTCGGTGGCAAGTGTTGCAGCTCAGAAATACGGGAGCAAGATTT
GCTCGGGTTCATGGGATTGCACGATCAATTTATGGGACACAGATGAGCTACTTCAGAGTT
GTCAGTAGCAGGAGA

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

CO CL7688Contig1 1025 2 2 U
GCACATGCATGCTTCTGAAACCATTAAACAACGATGAGTTCGAAGTTAGCGAGTCTGATG
AACTGGGCTTCTTTGCTCCCTTCTATAAAGATTTCAGGATAAGGTTCTCTAAGCTGTTGA
GCGATAAGTTCAAGAAGATGGATTATAAACTCGCAATGAGTGTCTTAAACCCTAAGATCA
ACTTCACAGAAGTTGATTCTTCGGATAATTCAGCAAATGGATATTTGAAGAAACTCGGCA
GAGTCTTTTCTCCTTATGATATGGAGAGACTCAGAGCATACACTGACAATCTTGTTGACT
TCAATCTGGTTTATGACCTCTGCAAAACTCTAGCACATCACTATTTTCAAGAGAAGCTCC
CTGTCACACTTTCATATGTCCAAGCATCTGTTCTCCTATGCTTGGGCTTGCAGGAGTCAG
ACTTCTCTACCATCGAGAGACAAATGCAGCTAGAGAGGGGGCAAATACACTCTCTTCTAT
TGAAGGTTGGAAAGAAGTTATACAAATATTTGAATGGAATCGCAGCTTCGGAGATCGAAG
CCACCTTCCCTCGGTTGAAAGAAAGAGTGCTTGAACCTCACAATGTATCTGTAGATGAAG
ATCTCAAGGAAGGAGCAAAACAAGTCGAGGAACAAATGAGGGCAAAGATAGAATTGGATC
CTGAGCTGCTCGAACAATTTGCTATTGGTGACAAAGAAGCTGAAGCGTTGGAGAAGTCTA
AGATCTCTGCAAGTGGTATCATCAGTATCGAGACTAGCAGATCTTCTGAATACAAGGCAA
GAAAACCAAGCGGGTCTACTGATAAATCAGCCAAAAAGAGAGGCAATGATTATAAGCACT
CCTCCAAATCCCACAAGAAGAGGAGAGCCTGATCTGGATTTTATGTGTGCGATAGATGAT
GAATTTTGATCAATTTGTTTTCTTTTTGGCTTTTTGAATCTGTAACCAGAACTTGAATAT
TTATAAGCATTTTGTATTGAACATCAGAGATGAAAAATTCTTACAGTGTTTTTGATTCAG
TTGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RS1B947TF U 1
AF RS1B947JQ C 473
BS 1 733 RS1B947TF
BS 734 1025 RS1B947JQ

RD RS1B947TF 733 0 0
GCACATGCATGCTTCTGAAACCATTAAACAACGATGAGTTCGAAGTTAGCGAGTCTGATG
AACTGGGCTTCTTTGCTCCCTTCTATAAAGATTTCAGGATAAGGTTCTCTAAGCTGTTGA
GCGATAAGTTCAAGAAGATGGATTATAAACTCGCAATGAGTGTCTTAAACCCTAAGATCA
ACTTCACAGAAGTTGATTCTTCGGATAATTCAGCAAATGGATATTTGAAGAAACTCGGCA
GAGTCTTTTCTCCTTATGATATGGAGAGACTCAGAGCATACACTGACAATCTTGTTGACT
TCAATCTGGTTTATGACCTCTGCAAAACTCTAGCACATCACTATTTTCAAGAGAAGCTCC
CTGTCACACTTTCATATGTCCAAGCATCTGTTCTCCTATGCTTGGGCTTGCAGGAGTCAG
ACTTCTCTACCATCGAGAGACAAATGCAGCTAGAGAGGGGGCAAATACACTCTCTTCTAT
TGAAGGTTGGAAAGAAGTTATACAAATATTTGAATGGAATCGCAGCTTCGGAGATCGAAG
CCACCTTCCCTCGGTTGAAAGAAAGAGTGCTTGAACCTCACAATGTATCTGTAGATGAAG
ATCTCAAGGAAGGAGCAAAACAAGTCGAGGAACAAATGAGGGCAAAGATAGAATTGGATC
CTGAGCTGCTCGAACAATTTGCTATTGGTGACAAAGAAGCTGAAGCGTTGGAGAAGTCTA
AGATCTCTGCAAG

QA 1 733 1 733
DS 

RD RS1B947JQ 553 0 0
TCTTCTATTGAAGGTTGGAAAGAAGTTATACAAATATTTGAATGGAATCGCAGCTTCGGA
GATCGAAGCCACCTTCCCTCGGTTGAAAGAAAGAGTGCTTGAACCTCACAATGTATCTGT
AGATGAAGATCTCAAGGAAGGAGCAAAACAAGTCGAGGAACAAATGAGGGCAAAGATAGA
ATTGGATCCTGAGCTGCTCGAACAATTTGCTATTGGTGACAAAGAAGCTGAAGCGTTGGA
GAAGTTTAAGATCTCTGCAAGTGGTATCATCAGTATCGAGACTAGCAGATCTTCTGAATA
CAAGGCAAGAAAACCAAGCGGGTCTACTGATAAATCAGCCAAAAAGAGAGGCAATGATTA
TAAGCACTCCTCCAAATCCCACAAGAAGAGGAGAGCCTGATCTGGATTTTATGTGTGCGA
TAGATGATGAATTTTGATCAATTTGTTTTCTTTTTGGCTTTTTGAATCTGTAACCAGAAC
TTGAATATTTATAAGCATTTTGTATTGAACATCAGAGATGAAAAATTCTTACAGTGTTTT
TGATTCAGTTGGG

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 2

CO CL7689Contig1 763 2 2 U
GTTGAAGGAGGACAAGTAGAGGGAATGACAAAGCCATGTGTTGGTTCAATGGATAGAAGT
CCACCAAAGGGAATAACGTGGGGATTATATCCCAACAGGTTGTTCTTTGGCCGTGAATCT
ACAAATGTTTGGGGTCAAGGAGGAGTTGCTTTCCTCAACCCTCTTACTAATCTCACTGAC
CAAACTCACATGTGTTTGTACAGAATCACTCTCGAACAGTTCAACGATGTTCTGTTTCAG
GAAAATGGCTTGAACGTGGATTTTGATTCTCCAATCTTTGATCTAACTGCTCTCAAGTTA
GTAGAGAACAATGGATCCACTCCACTTGAAGCTGATTTGGCTCCTTGGTATGGAAACGTT
GTCTGTATGGGAAGAGAAGGCGACATACCTATACTTACAATGACTTGCACATTGTCTCTT
GTTGAGAAGTTTACATCTGGTGAAATCCCACTAAGACCTCCTGCAAAAGCCTATGCCAAC
ACTTTTATAAGAGGACTTGTTGAAGGAGGAATATTCTCTGAAGAAGAAGCTGAGGCTTAC
ATTGACAATGCTGCTTCTAAACCTCTCTAAGATTATTATTTGGAGCTGAGTTTATTCAGT
TACACTATTGAAACCGCACGGTTTTAGAAAACTGTCATATTTTGTTACATGTTACCATTT
GTCAAAAGATAAGACAATAAACATTGGTGGGAGGGGGAATTAATTATGTTAAGCTGAATT
TATTGGAAAATAAAAGATTTATCATCAACCATTGGTTCTACGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1H380TF U 1
AF RS1H380JQB C 1
BS 1 691 RS1H380TF
BS 692 763 RS1H380JQB

RD RS1H380TF 691 0 0
GTTGAAGGAGGACAAGTAGAGGGAATGACAAAGCCATGTGTTGGTTCAATGGATAGAAGT
CCACCAAAGGGAATAACGTGGGGATTATATCCCAACAGGTTGTTCTTTGGCCGTGAATCT
ACAAATGTTTGGGGTCAAGGAGGAGTTGCTTTCCTCAACCCTCTTACTAATCTCACTGAC
CAAACTCACATGTGTTTGTACAGAATCACTCTCGAACAGTTCAACGATGTTCTGTTTCAG
GAAAATGGCTTGAACGTGGATTTTGATTCTCCAATCTTTGATCTAACTGCTCTCAAGTTA
GTAGAGAACAATGGATCCACTCCACTTGAAGCTGATTTGGCTCCTTGGTATGGAAACGTT
GTCTGTATGGGAAGAGAAGGCGACATACCTATACTTACAATGACTTGCACATTGTCTCTT
GTTGAGAAGTTTACATCTGGTGAAATCCCACTAAGACCTCCTGCAAAAGCCTATGCCAAC
ACTTTTATAAGAGGACTTGTTGAAGGAGGAATATTCTCTGAAGAAGAAGCTGAGGCTTAC
ATTGACAATGCTGCTTCTAAACCTCTCTAAGATTATTATTTGGAGCTGAGTTTATTCAGT
TACACTATTGAAACCGCACGGTTTTAGAAAACTGTCATATTTTGTTACATGTTACCATTT
GTCAAAAGATAAGACAATAAACATTGGTGGG

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1H380JQB 763 0 0
GTTGAAGGAGGACAAGTAGAGGGAATGACAAAGCCATGTGTTGGTTCAATGGATAGAAGT
CCACCAAAGGGAATAACGTGGGGATTATATCCCAACAGGTTGTTCTTTGGCCGTGAATCT
ACAAATGTTTGGGGTCAAGGAGGAGTTGCTTTCCTCAACCCTCTTACTAATCTCACTGAC
CAAACTCACATGTGTTTGTACAGAATCACTCTCGAACAGTTCAACGATGTTCTGTTTCAG
GAAAATGGCTTGAACGTGGATTTTGATTCTCCAATCTTTGATCTAACTGCTCTCAAGTTA
GTAGAGAACAATGGATCCACTCCACTTGAAGCTGATTTGGCTCCTTGGTATGGAAACGTT
GTCTGTATGGGAAGAGAAGGCGACATACCTATACTTACAATGACTTGCACATTGTCTCTT
GTTGAGAAGTTTACATCTGGTGAAATCCCACTAAGACCTCCTGCAAAAGCCTATGCCAAC
ACTTTTATAAGAGGACTTGTTGAAGGAGGAATATTCTCTGAAGAAGAAGCTGAGGCTTAC
ATTGACAATGCTGCTTCTAAACCTCTCTAAGATTATTATTTGGAGCTGAGTTTATTCAGT
TACACTATTGAAACCGCACGGTTTTAGAAAACTGTCATATTTTGTTACATGTTACCATTT
GTCAAAAGATAAGACAATAAACATTGGTGGGAGGGGGAATTAATTATGTTAAGCTGAATT
TATTGGAAAATAAAAGATTTATCATCAACCATTGGTTCTACGT

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

CO CL7690Contig1 1225 2 4 U
GGATGGCGTCCGAAACTGAGTCAGCGACAGAAAACAACATAAAAGGAGTACTTGTTCATG
GAGGAAGATATTTTCAGTACAATGTGTATGGAAACATGTTTGAAGTCTCCAACAAGTATG
TTCCTCCTATCCGACCAATCGGTAGAGGAGCTTACGGCTTTGTCTGTGCTGCAGTAGATT
CTGAGACACAAGAAGAGATTGCAATCAAGAAGATAGGTAAAGCCTTCGACAACAAAGTAG
ATGCTAAGCGAACGCTGAGAGAAATTAAGCTACTTCGTCATTTAGAACATGAGAACGTTG
TCATTATAAAAGACATCATCAGACCACCAAAGAAGGAGACATTCACAGATGTTTATATAG
TCTATGAGTTAATGGATACTGATCTTCATCAGATTATTCGTTCAGACCAGCCCTTGAATG
ATGATCATTGTCAGTACTTCTTGTATCAGATTCTACGTGGACTCAAGTACATACATTCAG
CAAATGTCTTACATCGTGACCTTAAGCCGAGTAACTTGCTTCTGAATGCAAACTGCGACC
TTAAGATTGCAGACTTCGGTTTGGCAAGGACGACATCTGAGACAGATCTCATGACAGAAT
ATGTTGTCACGAGATGGTACCGAGCACCAGAGCTGCTTCTTAACAGTTCTGAGTACGCAT
CTGCGATTGATGTCTGGTCTGTTGGTTGCATATTTGCTGAGATCATGACGAGGGAACCTC
TGTTCCCTGGGAAAGACTATGTCCACCAGCTTAAACTTATAACCGAGTTGATAGGGTCAC
CTGATGGAACGAGCCTAGAGTTTCTCAGAAGCGAGAATGCCAGAGAGTATGTCAAAGAAC
TACCAAAGTTCCCGAGGCAGAGCTTTGCAGCTAGGTTTCCTAGTATGAGTTCTATAGCTA
TCGATCTGCTGGAGAAAATGCTAGTGTTTGATCCTGAAAAACGCATCACGGTTGAGGAAG
CATTGTGTCATCCTTTCTTGTCAGCACTTCACGACCTTAACGACGAGCCTGTTTGTTCAA
ACCATTTCAGTTTCGATTTTGAGAACCCGTCTTCCACTGAAGAAGAGATTAAGGAGCTCG
TGTGGCTAGAATCAGTGAAGTTCAACCCTCATCCGACCACTTAAGTCCATTGTTTATTGT
AAGGTTGCCTCTTATAAGCTTCTGTTTCATCAATGTTGTTTTAGCCTTTTCATCTGTCAA
AAAAAACTATATATCATGCAATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F639TF U 1
AF RS1F639JQ C 425
BS 1 754 RS1F639TF
BS 755 755 RS1F639JQ
BS 756 770 RS1F639TF
BS 771 1225 RS1F639JQ

RD RS1F639TF 770 0 0
GGATGGCGTCCGAAACTGAGTCAGCGACAGAAAACAACATAAAAGGAGTACTTGTTCATG
GAGGAAGATATTTTCAGTACAATGTGTATGGAAACATGTTTGAAGTCTCCAACAAGTATG
TTCCTCCTATCCGACCAATCGGTAGAGGAGCTTACGGCTTTGTCTGTGCTGCAGTAGATT
CTGAGACACAAGAAGAGATTGCAATCAAGAAGATAGGTAAAGCCTTCGACAACAAAGTAG
ATGCTAAGCGAACGCTGAGAGAAATTAAGCTACTTCGTCATTTAGAACATGAGAACGTTG
TCATTATAAAAGACATCATCAGACCACCAAAGAAGGAGACATTCACAGATGTTTATATAG
TCTATGAGTTAATGGATACTGATCTTCATCAGATTATTCGTTCAGACCAGCCCTTGAATG
ATGATCATTGTCAGTACTTCTTGTATCAGATTCTACGTGGACTCAAGTACATACATTCAG
CAAATGTCTTACATCGTGACCTTAAGCCGAGTAACTTGCTTCTGAATGCAAACTGCGACC
TTAAGATTGCAGACTTCGGTTTGGCAAGGACGACATCTGAGACAGATCTCATGACAGAAT
ATGTTGTCACGAGATGGTACCGAGCACCAGAGCTGCTTCTTAACAGTTCTGAGTACGCAT
CTGCGATTGATGTCTGGTCTGTTGGTTGCATATTTGCTGAGATCATGACGAGGGAACCTC
TGTTCCCTGGGAAAGACTATGTCCACCAGCTTAA*CTTATAACCGAGTTG

QA 1 770 1 770
DS 

RD RS1F639JQ 801 0 0
TCATTGTCAGTACTTCTTGTATCAGATTCTACGTGGACTCAAGTACATACATTCAGCAAA
TGTCTTACATCGTGACCT*AAGCCGAGTAACTTGCTTCTGAATGCAAACTGCGACCTTAA
GATTGCAGACTTCGGTTTGGCAAGGACGACATCTGAGACAGATCTCATGACAGAATATGT
TGTCACGAGATGGTACCGAGCACCAGAGCTGCTTCTTAACAGTTCTGAGTACGCATCTGC
GATTGATGTCTGGTCTGTTGGTTGCATATTTGCTGAGATCATGACGAGGGAACCTCTGTT
CCCTGGGAAAGACTATGTCCACCAGCTTAAACTTATAACCGAGTTGATAGGGTCACCTGA
TGGAACGAGCCTAGAGTTTCTCAGAAGCGAGAATGCCAGAGAGTATGTCAAAGAACTACC
AAAGTTCCCGAGGCAGAGCTTTGCAGCTAGGTTTCCTAGTATGAGTTCTATAGCTATCGA
TCTGCTGGAGAAAATGCTAGTGTTTGATCCTGAAAAACGCATCACGGTTGAGGAAGCATT
GTGTCATCCTTTCTTGTCAGCACTTCACGACCTTAACGACGAGCCTGTTTGTTCAAACCA
TTTCAGTTTCGATTTTGAGAACCCGTCTTCCACTGAAGAAGAGATTAAGGAGCTCGTGTG
GCTAGAATCAGTGAAGTTCAACCCTCATCCGACCACTTAAGTCCATTGTTTATTGTAAGG
TTGCCTCTTATAAGCTTCTGTTTCATCAATGTTGTTTTAGCCTTTTCATCTGTCAAAAAA
AACTATATATCATGCAATACC

QA 1 801 1 801
DS 



AS 1 2

CO CL7691Contig1 726 2 2 U
GGAATACGACATTGAAGAAGTCCAGAGCCATTGTCACGATCTATTCGAGCAGCAGGAGAT
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GGCAAGTCTTCAACAAAAGGTTAAACTGATCTTTCAAGTCTATGATTCTGACTGCAACGG
GAAGGTCTCGTTTAGAGATATCATGGAAGTGTTGCAGGACTTGTCGGGGTCATTCATGTC
TGATGAGCAAAGAGAGCAAGTGCTGAGCCAGGTTTTGAACGAATCAGGCTACACCAATGA
CCCTTTCTTAACACTGGAGGATTTCATAAAGGTCTTTGGAAGTTGTAAACCGGAGATGGA
CGTTGAAATTCCTGTGGATTAGGTGGTCTATGACATCATATATGTTCAAACTCCAAACTC
AACATCTCACCATGTATTCGTCCACTTCGTTAGTATTTGATCACACCATCCGCAGATTTC
AACAATATGTATGATTACATTTCCTCTTCCCCTTAAGCATTGTTTTCAATTGATTTAGAT
TATACCTGTTCTACTATAAGCACACTTGTTAATGGTATTGAAAATAAAAATAAAAGTTTT
ATTCGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1EJ09TF U 1
AF RS1EJ09JQ C 1
BS 1 691 RS1EJ09TF
BS 692 726 RS1EJ09JQ

RD RS1EJ09TF 691 0 0
GGAATACGACATTGAAGAAGTCCAGAGCCATTGTCACGATCTATTCGAGCAGCAGGAGAT
ACTATCTCTGTATCAGAGGTTTTGCCAGTTAGATCGTAACGCAAAGGGATTTATATCTTC
TGATGAGTTTCTCTCTGTCCCTGAGTTCGCCATGAATCCTCTCTCTCTCAGGCTGCTTAA
GATGGTTGATGGTTTGAACTTTAAGGATTTTGTCGCCTTCTTGTCTGCTTTCAGTGCCAA
GGCAAGTCTTCAACAAAAGGTTAAACTGATCTTTCAAGTCTATGATTCTGACTGCAACGG
GAAGGTCTCGTTTAGAGATATCATGGAAGTGTTGCAGGACTTGTCGGGGTCATTCATGTC
TGATGAGCAAAGAGAGCAAGTGCTGAGCCAGGTTTTGAACGAATCAGGCTACACCAATGA
CCCTTTCTTAACACTGGAGGATTTCATAAAGGTCTTTGGAAGTTGTAAACCGGAGATGGA
CGTTGAAATTCCTGTGGATTAGGTGGTCTATGACATCATATATGTTCAAACTCCAAACTC
AACATCTCACCATGTATTCGTCCACTTCGTTAGTATTTGATCACACCATCCGCAGATTTC
AACAATATGTATGATTACATTTCCTCTTCCCCTTAAGCATTGTTTTCAATTGATTTAGAT
TATACCTGTTCTACTATAAGCACACTTGTTA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1EJ09JQ 726 0 0
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ACTATCTCTGTATCAGAGGTTTTGCCAGTTAGATCGTAACGCAAAGGGATTTATATCTTC
TGATGAGTTTCTCTCTGTCCCTGAGTTCGCCATGAATCCTCTCTCTCTCAGGCTGCTTAA
GATGGTTGATGGTTTGAACTTTAAGGATTTTGTCGCCTTCTTGTCTGCTTTCAGTGCCAA
GGCAAGTCTTCAACAAAAGGTTAAACTGATCTTTCAAGTCTATGATTCTGACTGCAACGG
GAAGGTCTCGTTTAGAGATATCATGGAAGTGTTGCAGGACTTGTCGGGGTCATTCATGTC
TGATGAGCAAAGAGAGCAAGTGCTGAGCCAGGTTTTGAACGAATCAGGCTACACCAATGA
CCCTTTCTTAACACTGGAGGATTTCATAAAGGTCTTTGGAAGTTGTAAACCGGAGATGGA
CGTTGAAATTCCTGTGGATTAGGTGGTCTATGACATCATATATGTTCAAACTCCAAACTC
AACATCTCACCATGTATTCGTCCACTTCGTTAGTATTTGATCACACCATCCGCAGATTTC
AACAATATGTATGATTACATTTCCTCTTCCCCTTAAGCATTGTTTTCAATTGATTTAGAT
TATACCTGTTCTACTATAAGCACACTTGTTAATGGTATTGAAAATAAAAATAAAAGTTTT
ATTCGT

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL7692Contig1 727 2 4 U
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TCTTTTCTTTGCTTTCTCTTATCTGGCGGCTCTAACCAGCTCTCGAGTTGTTCGTTTCTC
TGGTTAATGGATACTGAACCCTCTTGGGATCTTGGGGGGGTGGTAAATTTTTTTTCTAAA
TTGCATGGCAACATCAAATGACCAAACCAATAACAAATCATCATATTCTCACACTCTTCT
TCTTCTCCTCGTATTATTATCTTTTATTCTCTTCATTGGCCTTACAATCCCAATGACTCA
TCATCAATCCACATCTACGGTTGTTCCCTTCAAGAGGATTCTTCTTAAATCTTCGGCTCC
AGCTTCATTCACGATGGATTTGCGTCCAAATGATCGCCCACGACCCAGCCGCACTTCTAG
AAAGAGAGAGTTTGGAAATGATGCTCATGAAGTTCCTAGTGGTCCAAACCCTATTTCCAA
CTAGGTGAGCTGGCATATTTGGTTTTACCCCTGAGTTTAAAAGATAAGTTTTTAAGATCG
ATATTATGTTATTATATTGGGAAAAGCCTCTGATCGATGGAGATTAGAGAAGAACTTAAT
TGTTATGGATTTAGTATATATATATTGAATGGATTGGTTTGGTACGTACCATTCATTTCC
CTTCTAATATTTTGTTCGTTTTAAAATTGCTTCCTCCATCTTTTAAGTTTTGTGAAGTTA
GAGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FU38TF U 1
AF RS1FU38JQ C 7
BS 1 681 RS1FU38TF
BS 682 682 RS1FU38JQ
BS 683 705 RS1FU38TF
BS 706 727 RS1FU38JQ

RD RS1FU38TF 714 0 0
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TCTTTTCTTTGCTTTCTCTTATCTGGCGGCTCTAACCAGCTCTCGAGTTGTTCGTTTCTC
TGGTTAATGGATACTGAACCCTCTTGGGATCTTGGGGGGGTGGTAAATTTTTTTTCTAAA
TTGCATGGCAACATCAAATGACCAAACCAATAACAAATCATCATATTCTCACACTCTTCT
TCTTCTCCTCGTATTATTATCTTTTATTCTCTTCATTGGCCTTACAATCCCAATGACTCA
TCATCAATCCACATCTACGGTTGTTCCCTTCAAGAGGATTCTTCTTAAATCTTCGGCTCC
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AAAGAGAGAGTTTGGAAATGATGCTCATGAAGTTCCTAGTGGTCCAAACCCTATTTCCAA
CTAGGTGAGCTGGCATATTTGGTTTTACCCCTGAGTTTAAAAGATAAGTTTTTAAGATCG
ATATTATGTTATTATATTGGGAAAAGCCTCTGATCGATGGAGATTAGAGAAGAACTTAAT
TGTTATGGATTTAGTATATATATATTGAATGGATTGGTTTGGTACGTACCATTCATTTCC
CTTCTAATATTTTGTTCGTTT*AAAATTGCTTCCTCCATCTTTTA
GTTTGTGAA

QA 1 705 1 705
DS 

RD RS1FU38JQ 721 0 0
TCTTTATCTCAAGC*TATTCTTCTTCTTAATTACTAGATCTCTCTTTTGTTTCATCTTTT
CTTTGCTTTCTCTTATCTGGCGGCTCTAACCAGCTCTCGAGTTGTTCGTTTCTCTGGTTA
ATGGATACTGAACCCTCTTGGGATCTTGGGGGGGTGGTAAATTTTTTTTCTAAATTGCAT
GGCAACATCAAATGACCAAACCAATAACAAATCATCATATTCTCACACTCTTCTTCTTCT
CCTCGTATTATTATCTTTTATTCTCTTCATTGGCCTTACAATCCCAATGACTCATCATCA
ATCCACATCTACGGTTGTTCCCTTCAAGAGGATTCTTCTTAAATCTTCGGCTCCAGCTTC
ATTCACGATGGATTTGCGTCCAAATGATCGCCCACGACCCAGCCGCACTTCTAGAAAGAG
AGAGTTTGGAAATGATGCTCATGAAGTTCCTAGTGGTCCAAACCCTATTTCCAACTAGGT
GAGCTGGCATATTTGGTTTTACCCCTGAGTTTAAAAGATAAGTTTTTAAGATCGATATTA
TGTTATTATATTGGGAAAAGCCTCTGATCGATGGAGATTAGAGAAGAACTTAATTGTTAT
GGATTTAGTATATATATATTGAATGGATTGGTTTGGTACGTACCATTCATTTCCCTTCTA
ATATTTTGTTCGTTTTAAAATTGCTTCCTCCATCTTTTAAGTTTTGTGAAGTTAGAGTTG
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL7693Contig1 711 2 2 U
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GTGTAATGCATTATCTCTCTTACAATAATGATCTTGTTGCAAACTACAGTCTTTTGTATT
GAGTAGGTTCACTGAGACTATAAGATGAGGAACTTGGAGACTGAAAAAAAAAACTATGGG
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ACCATCATGACTTCATTAGGTTGGATGTCCCATGCAGAACATATATGCAGAAGCGGGTCT
GGGTTTGGTTTATATGGACGAAACTCTCTGCCTAGTGCCGGAAAAAAGACAACCTCAAAA
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ATCCCCTGCTGCTCGTAATCGGCGATGATTTCGAACGCCTTCTGCTGCTTATCGGGGCTC
CACGACTCGATATGGTGAAGAATATCGATTCCGGTAGGGCTCTCCGCCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1F941TF C 1
AF RS1F941JQ U 7
BS 1 6 RS1F941TF
BS 7 711 RS1F941JQ

RD RS1F941TF 711 0 0
TTTTTTGCAGACGAACAGAACTCTGTAATTTATAATCAATGGCTATC*TGAACAGATACT
GTGTAATGCATTATCTCTCTTACAATAATGATCTTGTTGCAAACTACAGTCTTTTGTATT
GAGTAGGTTCACTGAGACTATAAGATGAGGAACTTGGAGACTGAGAAAAAAAACTATGGG
TTGAGGTCGAAGTTCGTTTCCAATATGTTCTGAATTTTGGACAGCGAGTCAACCTTAAAA
TCAGGATGCAGTCCAGAGACAGAAAAGTCATCTGGTCCATACCTTCCGGTTTCATCAAGC
AAGCATGTGAAAGCTCCAGCTCCTTTCCCACAAGCTATATCATCTTTCAAGCTATCACCA
ACCATCATGACTTCATTAGGTTGGATGTCCCATGCAGAACATATATGCAGAAGCGGGTCT
GGGTTTGGTTTATATGGACGAAACTCTCTGCCTAGTGCCGGAGAAAAGACAACCTCAAAA
CGTTGGTGGAATATGTCGATTGCTTTCTTAACATTGCGTGTAATCAGCCCCCTCTTTATC
TTCTTGGAATCAAGAAAGCCACATAGCTCAACAGCACCGGGCATGATTTGGAGCTTATCA
ATCCCCTGCTGCTCGTAATCGGCGATGATTTCGAACGCCTTCTGCTGCTTATCGGGGCTC
CACGACTCGATATGGTGAAGAATATCGATTCCGGTAGGGCTCTCCGCCTTC

QA 1 711 1 711
DS 

RD RS1F941JQ 705 0 0
GCAGACGAACAGAACTCTGTAATTTATAATCAATGGCTATCCTGAACAGATACTGTGTAA
TGCATTATCTCTCTTACAATAATGATCTTGTTGCAAACTACAGTCTTTTGTATTGAGTAG
GTTCACTGAGACTATAAGATGAGGAACTTGGAGACTGAAAAAAAAAACTATGGGTTGAGG
TCGAAGTTCGTTTCCAATATGTTCTGAATTTTGGACAGCGAGTCAACCTTAAAATCAGGA
TGCAGTCCAGAGACAGAAAAGTCATCTGGTCCATACCTTCCGGTTTCATCAAGCAAGCAT
GTGAAAGCTCCAGCTCCTTTCCCACAAGCTATATCATCTTTCAAGCTATCACCAACCATC
ATGACTTCATTAGGTTGGATGTCCCATGCAGAACATATATGCAGAAGCGGGTCTGGGTTT
GGTTTATATGGACGAAACTCTCTGCCTAGTGCCGGAAAAAAGACAACCTCAAAACGTTGG
TGGAATATGTCGATTGCTTTCTTAACATTGCGTGTAATCAGCCCCCTCTTTATCTTCTTG
GAATCAAGAAAGCCACATAGCTCAACAGCACCGGGCATGATTTGGAGCTTATCAATCCCC
TGCTGCTCGTAATCGGCGATGATTTCGAACGCCTTCTGCTGCTTATCGGGGCTCCACGAC
TCGATATGGTGAAGAATATCGATTCCGGTAGGGCTCTCCGCCTTC

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL7694Contig1 756 2 4 U
GGCTCTGCCACTAGAACCAATCTCAACAGATAAGGAAACTTCACAAGACAGAAACAGAGA
GAGAGATGAGCCGTTGCTGCTATCTTGGGCTCTGTGTCCCGAATGCTTTGTCCCCTCTTT
CTCCAAGGCCTCGCAGCGTCAAAGCTCCTTTCTGTATTACATCTCACGCAAAACCCATCT
CTAACACCGATTCACTTCTTCAAAATGTTGCCAAGATGAGAGCAAAGGCTGGTGATATCT
TTGGAGCAAAGAAGACAATCTTTGCAGCTCAACTAGGGACAGTTCTTGCCATGATTGATC
ATCCGGCGTTGGCTATAACTGGAGTCAACCACGAGCAGGAACTGGGCAGCGTGGTGCTCG
ACATCGGTATCATATCTGTTTTCTACTTCCTAGTAATGCCACCAATCATAATGAACTGGC
TGAGAGTAAGATGGTACAGAAGGAAGTTCTTCGAGATGTATTTACAGTTCATGTTCGTCT
TCATGTTCTTCCCCGGGCTACTGTTATGGGCACCATTTCTCAACTTCAGAAAGTTCCCAA
GAGATCCAAATATGAAGTATCCTTGGGACAAACCAAAAGACCCTTCCACTATCAAGAACG
GTTACCTCAAGTACCCATTTGCACAGCCAGAAGACTACGACTACTAAAAGTTCCTTACAT
ATCTTGTCACTGTATATACTCTGGACCCACTCAATGTGCAGGCTCTTTTCTTATACTCAG
TCTTTAAGGCTCTATGTTCAATATAGACTCGTTTAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BF01TF U 1
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BQ
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AF RS1AC47JQ C 1
AF RS1AC47TF U 1
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QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 2

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1F703JQ C 1
AF RS1F703TF U 1
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QA 1 701 1 701
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

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TTTATCTTGG


BQ
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15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DB69JQ U 35
AF RS1G370JQ U 1
BS 1 43 RS1G370JQ
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RD RS1DB69JQ 253 0 0
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TTACCAGAATCCG

QA 1 253 1 253
DS 

RD RS1G370JQ 670 0 0
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TTTATCTTGG

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

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G


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 

AF RS1H052TF U 1
AF RS1F638TF U 1
BS 1 512 RS1F638TF
BS 513 513 RS1H052TF
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GTTTGTGCAGTTGTATTTTTCTATTTAACATGCA
GTATGT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RS1F638TF 721 0 0
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ACCTACTTCTCTCCCCGTCTCTCAACGCCTTAGTAGTCCCACTAAAGATGATCAGCCTGG
TGTTATACGCCGTCGTCTCTCTTCTCTCTCACTCAATCTCCTAAACCAACCTTCAGAGAT
CGCGTCTCGGTTCCCCAAGTCCAAATCCGTTTCAGATATGGGAAAGCAAGTAGGAAGCTC
GGCGAAAGAATGGTGGGAGTGGGGCTGGTCATGGATCCTCTCGAGGAAACCCATTTTCAT
CAGAGACCTCGAGCTTAACAGAGAGGAAGCTAAAGCAATTGGTTCTCACAACAAAGGTAG
CATAATGCACGTCTTCTTCAAGCTCCGTTCTCAGATCCGCACCCTCATGGGATCTTCTTC
CGACAGTCTTCCTCTTTCATGCAAACAGAAGCGTCAACGATGATGATGATGATTCTCTGT
TTGTCATTTGTCTCAAAGAATATTATTCGTTTTCATTTTGTTGAATTGGAGGTATAATCA
AAATCATATACAAGAGATGTGTTCATTTTAAAAAAAATGATGATGTATTTTGTTGCTATA
ATTAATTTGCCTAGTTTTTTTTAAGACAATATTTCATTAGTTTGGTTTGTTTTACATGTT
GTTTGTGCAGTTGTATTTTTCTATTTAACATGCAAGTATGTAAAATCTGTTATTTTGTTT
G

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL7701Contig1 617 2 3 U
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ATAACAAACGGGAATCATAATAATCCCATACAAGGTTACAACATAGTCTAGTGGGACCCA
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GCTGGATCAATCTCATCCGCACGGTTAGATGGTCTGTAGTACCCCGTGACTGGATCCGGG
GACCAAGCAGACTCTGCCTCTTGATTTGCTCTTTGTTCCATCTTTCCCACCATAACTCTT
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GAACCAGAAAAGCTGTGGGATGCGGTGGAGCAAAGAGATTTAACGGCGCCGGAGAGCGAA
CGAGCAGCTGCCATTGTGTTATTTTAGATAAAATATGTATATATACTGACTGAGCTTAGC
TTTTAGCTACTGCGAAAGACGTTATGTTTCTTCCAAAAGGTAAGTAAAATACCCCCAAGA
AGATAAACAATCTTTCTGCAGTAGTAGTCGGTGCTAAGCCGCCGTCAGATTCTCCGGTGA
TGTTTTTTTGGTGGGCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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CGGGGACCAAGC

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DS 

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GCTGGATCAATCTCATCCGCACGGTTAGATGGTCTGTAGTACCCCGTGACTGGATCCGGG
GACCAAGCAGACTCTGCCTCTTGATTTGCTCTTTGTTCCATCTTTCCCACCATAACTCTT
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GAACCAGAAAAGCTGTGGGATGCGGTGGAGCAAAGAGATTTAACGGCGCCGGAGAGCGAA
CGAGCAGCTGCCATTGTGTTATTTTAGATAAAATATGTATATATACTGACTGAGCTTAGC
TTTTAGCTACTGCGAAAGACGTTATGTTTCTTCCAAAAGGTAAGTAAAATACCCCCAAGA
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TGTTTTTTTGGTGGGCC

QA 1 617 1 617
DS 



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GTGGGGACGAGGAGGATGAGGGGAGGGTTTCAGTTCGATGACTTGAGGTCTGGTATTCAA
GAAAAGAAAGAAGCTGAAGATGCCAGAAAATCACTTGCACTTCAGAACGTGGATCTTTTC
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ACTTATTTCCACCCGGATAACATGTCATCTGCGGAGAAGATGAAAACTGAGCTTGCAAAG
GTCAGGGAAGAGTTCAAGATGTCTGAATCCGATTGTGGTTCTGCACGTGTTCAAGTGGCA
CAACTGACTACTAAGGTCGAGCATCTATCCTCTGTTCTACATAAAAAGGACAAGCATTCG
AGGAAGGGACTTATAGCAATGGTGCATAGAAGGAAGAAACTGTTGAAGTATATGAGACGA
ACGGACTGGGACTCTTACTGCCTTTCGCTCTCAAAACTAGGTCTTCGTGACAACCCTGAT
TACAAGTTTTAAAACAAATGAATCTTTATTGATCTATGTAACTCTCTTTTTTGTTCTTTT
CTTTTTGGCAAATGAGATAATGTTGGTCTCTCTTATCCATCATTTTGGGCATAGAAACGC
TGTTCTAGAGTTTATTGTTGCAGGCTATATAGGCAAAGATACTTAAGAGTTGTGTGGGAA
GTTTGATAATAAAGTTAAATTCTAGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GL73TF U 1
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CTTTTTGGCAAATGAGATAATGTTGGTCTCTCTTATCCATCATTTTGGGCATAGAAACGC
TGTTCTAGAGTTTATTGTTGCAG*CTATATAGGCAAAGATACTTAAGAGTTGTGTGGGAA
GTTTG

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DS 

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CTGGAGCCTCCCAAAGAGGAGCTTGTTCAAACTTATTTCCACCCGGATAACATGTCATCT
GCGGAGAAGATGAAAACTGAGCTTGCAAAGGTCAGGGAAGAGTTCAAGATGTCTGAATCC
GATTGTGGTTCTGCACGTGTTCAAGTGGCACAACTGACTACTAAGGTCGAGCATCTATCC
TCTGTTCTACATAAAAAGGACAAGCATTCGAGGAAGGGACTTATAGCAATGGTGCATAGA
AGGAAGAAACTGTTGAAGTATATGAGACGAACGGACTGGGACTCTTACTGCCTTTCGCTC
TCAAAACTAGGTCTTCGTGACAACCCTGATTACAAGTTTTAAAACAAATGAATCTTTATT
GATCTATGTAACTCTCTTTTTTGTTCTTTTCTTTTTGGCAAATGAGATAATGTTGGTCTC
TCTTATCCATCATTTTGGGCATAGAAACGCTGTTCTAGAGTTTATTGTTGCAGGCTATAT
AGGCAAAGATACTTAAGAGTTGTGTGGGAAGTTTGATAATAAAGTTAAATTCTAGACG

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

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CACTAGTTGGTCAAGGAAAAACATTTGTAAAAACAAATATAATAATCAAATGATTATTAG
CTAAGGGGATTTGCGAGCCACAAGATACCCACAATTTTCATCAGCGTTCCTGTGACAACA
AAACCTGTGTGAAACCGCCTATGTTCTGTAGCCAAGCATCAAATGCTTGTAATAACGAGC
ACGGATAATTCTCTGCCACCAATATTTGGTTGAGCTGTAATAACTCATCTTCATTCGTTC
TTGGATGAGCCATCTAACGAGGCATCTTTTAATGCCTTGGGATATAGGACGGAAAAAAGA
CGGATCTCGCTGAATATATAGTATCCCGACCTCAACCAATGCTATAGCAAAAGGGTCTTC
AAAGATCTCAAGGCTGTAGTCACCCAAATAATTTACCGCGAATTCTGTATTGACAAGAGC
CTGAACAAAGTCCATCAGCTGAATTTTAGCCCATTCGG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1EF69JQ U 1
AF RS1GG31JQ U 1
BS 1 518 RS1EF69JQ

RD RS1EF69JQ 518 0 0
GAACTGTAATCAATGTAAATTTAATAAGTTTATTTAATGTATACATTTTTTTTGGCTATT
CACTAGTTGGTCAAGGAAAAACATTTGTAAAAACAAATATAATAATCAAATGATTATTAG
CTAAGGGGATTTGCGAGCCACAAGATACCCACAATTTTCATCAGCGTTCCTGTGACAACA
AAACCTGTGTGAAACCGCCTATGTTCTGTAGCCAAGCATCAAATGCTTGTAATAACGAGC
ACGGATAATTCTCTGCCACCAATATTTGGTTGAGCTGTAATAACTCATCTTCATTCGTTC
TTGGATGAGCCATCTAACGAGGCATCTTTTAATGCCTTGGGATATAGGACGGAAAAAAGA
CGGATCTCGCTGAATATATAGTATCCCGACCTCAACCAATGCTATAGCAAAAGGGTCTTC
AAAGATCTCAAGGCTGTAGTCACCCAAATAATTTACCGCGAATTCTGTATTGACAAGAGC
CTGAACAAAGTCCATCAGCTGAATTTTAGCCCATTCGG

QA 1 518 1 518
DS 

RD RS1GG31JQ 515 0 0
GAACTGTAATCAATGTAAATTTAATAAGTTTATTTAATGTATACATTTTTTTTGGCTATT
CACTAGTTGGTCAAGGAAAAACATTTGTAGAAACAAATATAATAATCAAATGATTATTAG
CTAAGGGGATTTGCGAGCCACAAGATACCCACAATTTTCATCAGCGTTCCTGTGACAACA
AAACCTGTGTGAAACCGCCTATGTTCTGTAGCCAAGCATCAAATGCTTGTAATAACGAGC
ACGGATAATTCTCTGCCACCAATATTTGGTTGAGCTGTAATAACTCATCTTCATTCGTTC
TTGGATGAGCCATCTAACGAGGCATCTTTTAATGCCTTGGGATATAGGACGGAAGAAAGA
CGGATCTCGCTGAGTATATAGTATCCCGACCTCAACCAATGCTATAGCAGAAGGGTCTTC
AAAGATCTCAAGGCTGTAGTCACCCAAATAATTTACCGCGAATTCTGTATTGACAAGAGC
CTGAACAAAGTCCATCAGCTGAATTTTAGCCCATT

QA 1 515 1 515
DS 



AS 1 2

CO CL7704Contig1 727 2 2 U
GTCTCATGGAGAGTTCGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCATGCTTAACACATGC
AAGTCGGACGGGAAGTGGTGTTTCCAGTGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTAAGAACCTGT
CCTTGGGAGGGGAACAACAGCTGGAAACGGCTGCTAATACCCCGTAGGCTGAGGAGCAAA
AGGAGGAATCCGCCCGAGGAGGGGCTCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGCAATAGCT
TACCAAGGCGATGATCAGTAGCTGGTCATCTTGGTAAAGTTGAGATCATGGCTTATGGCG
TTGATGATGGTCATGACTTCAAGGAGGAAGCTAAGTTCACTTCCTTTCCAGCAGGAGCTG
ACACTGATCGGCACACCAAGATGCTCGAAGACATTCGTGTCTGGTCATCTAATAGTCCCA
GTCCATCAAACCTGTTCCTTATCATGGGAGACTCCGCAGTTGATTTCAACCCCGTTATTG
AATCTCTGGTGAGCTCGAAACATTACAAGATTCACTATGTCAAACCATAGTTTCCTGAAG
TCCCATAACGAATTCAGGAAAGAGAATCTACTACTAGTCTATCTATACTATTATTTATGA
AGTGATTTTGATGATTTGTCATATTCTCCATGATTTTAGCTATTTTCTTATTTGTTATAT
TCTTATTAATTTTTAGATTAAATCATCAATTTATTAATTAATGTAATATAAATATTTCAA
ACTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D120TF U 1
AF RS1D120JQ C 33
BS 1 720 RS1D120TF
BS 721 727 RS1D120JQ

RD RS1D120TF 726 0 0
GTCTCATGGAGAGTTCGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCATGCTTAACACATGC
AAGTCGGACGGGAAGTGGTGTTTCCAGTGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTAAGAACCTGT
CCTTGGGAGGGGAACAACAGCTGGAAACGGCTGCTAATACCCCGTAGGCTGAGGAGCAAA
AGGAGGAATCCGCCCGAGGAGGGGCTCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGCAATAGCT
TACCAAGGCGATGATCAGTAGCTGGTCATCTTGGTAAAGTTGAGATCATGGCTTATGGCG
TTGATGATGGTCATGACTTCAAGGAGGAAGCTAAGTTCACTTCCTTTCCAGCAGGAGCTG
ACACTGATCGGCACACCAAGATGCTCGAAGACATTCGTGTCTGGTCATCTAATAGTCCCA
GTCCATCAAACCTGTTCCTTATCATGGGAGACTCCGCAGTTGATTTCAACCCCGTTATTG
AATCTCTGGTGAGCTCGAAACATTACAAGATTCACTATGTCAAACCATAGTTTCCTGAAG
TCCCATAACGAATTCAGGAAAGAGAATCTACTACTAGTCTATCTATACTATTATTTATGA
AGTGATTTTGATGATTTGTCATATTCTCCATGATTTTAGCTATTTTCTTATTTGTTATAT
TCTTATTAATTTTTAGATTAAATCATCAATTTATTAATTAATGTAATATAAATATTTCAA
CTTTCT

QA 1 720 1 720
DS 

RD RS1D120JQ 695 0 0
GAACGCTGGCGGCATGCTTAACACATGCAAGTCGGACGGGAAGTGGTGTTTCCAGTGGCG
GACGGGTGAGTAACGCGTAAGAACCTGTCCTTGGGAGGGGAACAACAGCTGGAAACGGCT
GCTAATACCCCGTAGGCTGAGGAGCAAAAGGAGGAATCCGCCCGAGGAGGGGCTCGCGTC
TGATTAGCTAGTTGGTGAGGCAATAGCTTACCAAGGCGATGATCAGTAGCTGGTCATCTT
GGTAAAGTTGAGATCATGGCTTATGGCGTTGATGATGGTCATGACTTCAAGGAGGAAGCT
AAGTTCACTTCCTTTCCAGCAGGAGCTGACACTGATCGGCACACCAAGATGCTCGAAGAC
ATTCGTGTCTGGTCATCTAATAGTCCCAGTCCATCAAACCTGTTCCTTATCATGGGAGAC
TCCGCAGTTGATTTCAACCCCGTTATTGAATCTCTGGTGAGCTCGAAACATTACAAGATT
CACTATGTCAAACCATAGTTTCCTGAAGTCCCATAACGAATTCAGGAAAGAGAATCTACT
ACTAGTCTATCTATACTATTATTTATGAAGTGATTTTGATGATTTGTCATATTCTCCATG
ATTTTAGCTATTTTCTTATTTGTTATATTCTTATTAATTTTTAGATTAAATCATCAATTT
ATTAATTAATGTAATATAAATATTTCAAACTTTCT

QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

CO CL7705Contig1 941 2 4 U
GGGAGATGGCAAGGGTAAAACTGTTATTTCTGGAGGGAAGAGTATTTTTGACAACATTAC
CACTTTCCACACGGCGTCGTTTGCCGCAACTGGAGCTGGATTTATTGCCAGGGACATTAC
ATTTGAAAACTGGGCTGGTCCAGAAAAGCACCAAGCAGTGGCCCTTCGCGTTGGAGCTGA
CCATGCGGTGATCTACCGGTGCAGTATAATCGGTTATCAAGACACACTCTATGTCCATTC
AAACCGTCAGTTCTTCCGTGAATGCGATATCTACGGTACAGTCGATTTCATCTTCGGTAA
TGCAGCTGTAGTGCTACAAAACTGTAGCATCTATGCACGCAAACCCATGGCTCTTCAGAA
AAACACAATCACAGCTCAAAACAGAAAAGATCCGAACCAAAACACCGGAATATCGATACA
TGCCTCTAGAGTTTTGGCAACACCTGATCTCCAAGCGACCAATGGTACTACCCAGACGTA
TTTAGGCCGGCCATGGAAACTATACTCTAGAACGGTTTACATGCTATTGTATATCGGCAA
TCATGTACACACCAGAGGTTGGCTCGAGTGGAACACAACATTTGCTTTAGATACTCTATA
CTACGGTGAGTATTTGAACACGGGACCAGGGTCGAACATTTCACAACGTGTGAATTGGCC
AGGGTATCGGGTCATCAATTCAACGGCTGAGGCAAACCGGTTTACGGTATCAGAATTTAT
TTATGGTTCGTCGTGGTTGCCTTCAACCGGGGTTTCGTTTTTGGCCGGATTAAACCTTTA
GCTAGAGTAAAATAAAGTGATTTCCTTTCCGATGCATTGTTTCATTCTTACGTCCCTTAT
ACTAATGGGCATATATGAATAATCCTATATATATAAATTAACTATTTTAATTGTATGATA
TTTCCGATAGTTGTTATTCAACAAGTGATTCGACGATAGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BM35TF U 1
AF RS1BM35JQ C 503
BS 1 691 RS1BM35TF
BS 692 692 RS1BM35JQ
BS 693 702 RS1BM35TF
BS 703 941 RS1BM35JQ

RD RS1BM35TF 702 0 0
GGGAGATGGCAAGGGTAAAACTGTTATTTCTGGAGGGAAGAGTATTTTTGACAACATTAC
CACTTTCCACACGGCGTCGTTTGCCGCAACTGGAGCTGGATTTATTGCCAGGGACATTAC
ATTTGAAAACTGGGCTGGTCCAGAAAAGCACCAAGCAGTGGCCCTTCGCGTTGGAGCTGA
CCATGCGGTGATCTACCGGTGCAGTATAATCGGTTATCAAGACACACTCTATGTCCATTC
AAACCGTCAGTTCTTCCGTGAATGCGATATCTACGGTACAGTCGATTTCATCTTCGGTAA
TGCAGCTGTAGTGCTACAAAACTGTAGCATCTATGCACGCAAACCCATGGCTCTTCAGAA
AAACACAATCACAGCTCAAAACAGAAAAGATCCGAACCAAAACACCGGAATATCGATACA
TGCCTCTAGAGTTTTGGCAACACCTGATCTCCAAGCGACCAATGGTACTACCCAGACGTA
TTTAGGCCGGCCATGGAAACTATACTCTAGAACGGTTTACATGCTATTGTATATCGGCAA
TCATGTACACACCAGAGGTTGGCTCGAGTGGAACACAACATTTGCTTTAGATACTCTATA
CTACGGTGAGTATTTGAACACGGGACCAGGGTCGAACATTTCACAACGTGTGAATTGGCC
AGGGTATCGGGTCATCAATTCAACGGCTGAG*CAAACCGGTT

QA 1 702 1 702
DS 

RD RS1BM35JQ 439 0 0
TATTT
TAGAACGGTTTACATGTTATTGTATATCGGCAATCATGTACACACCAGAGGTTGGCTGGA
GTGGAACACAACATTTGCTTTAGATACTTTATATTACGGTGAGTATTTGAACACGGGACC
AGGGTCGAACATTTCACAACGTGTGAATTGGCCAGGGTATCGGGTCATCAATTCAACGGC
TGAGGCAAACCGGTTTACGGTATCAGAATTTATTTATGGTTCGTCGTGGTTGCCTTCAAC
CGGGGTTTCGTTTTTGGCCGGATTAAACCTTTAGCTAGAGTAAAATAAAGTGATTTCCTT
TCCGATGCATTGTTTCATTCTTACGTCCCTTATACTAATGGGCATATATGAATAATCCTA
TATATATAAATTAACTATTTTAATTGTATGATATTTCCGATAGTTGTTATTCAACAAGTG
ATTCGACGATAGTT

QA 6 439 6 439
DS 



AS 1 2

CO CL7706Contig1 877 2 12 U
GGACCGCAAGAAACTTAATCACAACTCTCCTTTTCACTCTCTCTTCTCATTCTCAATGGC
GACCCAAGATTCCCAAGGGATCAAACTCTTTGGCAAAACCATTACATTCAACGCGAGTAA
CATCACAACAACGACCATTAAAAAAGAAGTGCAGCAACAACAACAACAACCAGAGCTACA
AACAACAACAAGCGTTAGATCATCATCATCATCATCGGATCTAACTGTGGAGAAGCGTCC
AGACAAGATAATAGCATGTCCGAGATGCAAGAGCATGGAGACTAAGTTCTGTTACTTCAA
TAATTATAACGTTAAACAACCAAGACACTTCTGCAGAGGTTGTCAGCGTTACTGGACCGC
CGGCGGAGCACTCCGGAATGTTCCCGTCGGCGCTGGTCGCCGGAAAGCCAAACCTCCGGG
TCGTGTCGGTGGATTCGCCGAGTTTCTTGGGGCTGCGACTGGAGCCGTTGATCAGGTCGA
GCTTGACGCTTTGCTGGCGGAAGAGTGGCGAGCAGCTGCGTCATACGATGGTTTCCGGCA
TGATTTTCCGGTGAAGAGACTCCGTTGCTACACCGATGGTCAATCTTGTTAACTTTTCTA
TAATTTAAAATTTTCTTTTTTTTTATATTATTTGTTTTGGGTTTGGGTTTAACCCGTTAG
AAAGAACGTGGTTAAATTCGCTTTGATTTGCTTACTGGATACGTACAGGCTAGCAACAAA
AGCTAACTACGTAATTAATTAATCAGGAAGTTTAATACTTGATTATCTGCTAAACAGCTG
TCGTTTTTTTATCAGTTTCTCTTGTTGAATTTCATTTGTACACTCCATTGAGGCTCGTGG
GATTTTTCTTCTAAAAAGAAAGACCGTGTTGTTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B292TF U 1
AF RS1B292JQ C 100
BS 1 708 RS1B292TF
BS 709 709 RS1B292JQ
BS 710 737 RS1B292TF
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BS 765 789 RS1B292TF
BS 790 877 RS1B292JQ

RD RS1B292TF 791 0 0
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CATCACAACAACGACCATTAAAAAAGAAGTGCAGCAACAACAACAACAACCAGAGCTACA
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AGACAAGATAATAGCATGTCCGAGATGCAAGAGCATGGAGACTAAGTTCTGTTACTTCAA
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GCTTGACGCTTTGCTGGCGGAAGAGTGGCGAGCAGCTGCGTCATACGATGGTTTCCGGCA
TGATTTTCCGGTGAAGAGACTCCGTTGCTACACCGATGGTCAATCTTGTTAACTTTTCTA
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AAAGAACGTGGTTAAATTCGCTTTGATTTGCTTACTGGATACGTACAG*CTAGCAACAAA
AGCTAACTACGTAATTA*TTAATCAG**AGTTTA*TACTTGAT*ATCTGCTAAACAGCTG
TCGTTTTTT
AT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RS1B292JQ 778 0 0
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ACAACAACAACCAGAGCTACAAACAACAACAAGCGTTAGATCATCATCATCATCATCGGA
TCTAACTGTGGAGAAGCGTCCAGACAAGATAATAGCATGTCCGAGATGCAAGAGCATGGA
GACTAAGTTCTGTTACTTCAATAATTATAACGTTAAACAACCAAGACACTTCTGCAGAGG
TTGTCAGCGTTACTGGACCGCCGGCGGAGCACTCCGGAATGTTCCCGTCGGCGCTGGTCG
CCGGAAAGCCAAACCTCCGGGTCGTGTCGGTGGATTCGCCGAGTTTCTTGGGGCTGCGAC
TGGAGCCGTTGATCAGGTCGAGCTTGACGCTTTGCTGGCGGAAGAGTGGCGAGCAGCTGC
GTCATACGATGGTTTCCGGCATGATTTTCCGGTGAAGAGACTCCGTTGCTACACCGATGG
TCAATCTTGTTAACTTTTCTATAATTTAAAATTTTCTTTTTTTTTATATTATTTGTTTTG
GGTTTGGGTTTAACCCGTTAGAAAGAACGTGGTTAAATTCGCTTTGATTTGCTTACTGGA
TACGTACAGGCTAGCAACAAAAGCTAACTACGTAATTAATTAATCAGGAGGTTTAATACT
TGATTATCTGCTAAACAGCTGTCGTTTTTTTATCAGTTTCTCTTGTTGAATTTCATTTGT
ACACTCCATTGAGGCTCGTGGGATTTTTCTTCTAAAAAGAAAGACCGTGTTGTTGACC

QA 1 778 1 778
DS 



AS 1 2

CO CL7707Contig1 727 2 3 U
TTTTTTTTTGGGCAAAACAGATTCTCTATATATTTTTTTGGTTTATTTTTACGTCAATGT
CAAAAATTCTAACTCTAAATCTCTGTGGTAAAACAGAAAAGAAACCTAACTAAAATGTGA
GAAGAGCCCAAAATATGAAAAGTAGTTTGTCAAGTGAGTGGTGATGAACATAAGAAAGAG
TCGTCAATATCCTTCGTTCCTGTCTGTCTCTTATCTTCTCTGGAAATTGAGGAACCTGAC
TGAAAGTGCGAATCCAGAGAAGAAGAGAGCGCAAAATCCGACAAGAACAGCAGCAGACAC
ACCTATCATGTCTGGTTTGAACCCAAAGTACTGTTCAATGAACTGCTTGACCGTTCCATT
GAACATTGGCTCCTTGATGATGCTCTCCACGTCACCAAGCTGCGAGAGGATTATACCTTG
AAGTGTCCACGCCACTGGACATATGTAATAGAACCATATCCACCACACCGGAATCAAAGG
TTTTTGGACGGAAACCAGATAGGAGATTCCAAAGAGAGTAAAACGCAGAGGAGATCACAG
CAGCTAAGTGCTGATTCGGGGTGAGACCAACCGCCATCATGCCGTAGAAAGTGAAGTAGG
TGAAAGTGAGGAACATGAACACCAAGTAGAGCACAAACTTACTGAACGTTCTTTCGAAAC
CAATGGTGAAGTAAGTGATGACACCATAGAGAATTGTTTGGGCGAGAATGTAAGGTATCT
CCACAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GD32JQ U 10
AF RS1GD32TF C 1
BS 1 9 RS1GD32TF
BS 10 704 RS1GD32JQ
BS 705 727 RS1GD32TF

RD RS1GD32JQ 695 0 0
GGGCAAAACAGATTCTCTATATATTTTTTTGGTTTATTTTTACGTCAATGTCAAAAATTC
TAACTCTAAATCTCTGTGGTAAAACAGAAAAGAAACCTAACTAAAATGTGAGAAGAGCCC
AAAATATGAAAAGTAGTTTGTCAAGTGAGTGGTGATGAACATAAGAAAGAGTCGTCAATA
TCCTTCGTTCCTGTCTGTCTCTTATCTTCTCTGGAAATTGAGGAACCTGACTGAAAGTGC
GAATCCAGAGAAGAAGAGAGCGCAAAATCCGACAAGAACAGCAGCAGACACACCTATCAT
GTCTGGTTTGAACCCAAAGTACTGTTCAATGAACTGCTTGACCGTTCCATTGAACATTGG
CTCCTTGATGATGCTCTCCACGTCACCAAGCTGCGAGAGGATTATACCTTGAAGTGTCCA
CGCCACTGGACATATGTAATAGAACCATATCCACCACACCGGAATCAAAGGTTTTTGGAC
GGAAACCAGATAGGAGATTCCAAAGAGAGTAAAACGCAGAGGAGATCACAGCAGCTAAGT
GCTGATTCGGGGTGAGACCAACCGCCATCATGCCGTAGAAAGTGAAGTAGGTGAAAGTGA
GGAACATGAACACCAAGTAGAGCACAAACTTACTGAACGTTCTTTCGAAACCAATGGTGA
AGTAAGTGATGACACCATAGAGAATTGTTTGGGCG

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1GD32TF 727 0 0
TTTTTTTTTGGGCAAAACAGATTCTCTATATATTTTTT*GGTTTATTTTTACGTCAATGT
CAAAAATTCTAACTCTAAATCTCTGTGGTAAAACAGAAAAGAAACCTAACTAAAATGTGA
GAAGAGCCCAAAATATGAAAAGTAGTTTGTCAAGTGAGTGGTGATGAACATAAGAAAGAG
TCGTCAATATCCTTCGTTCCTGTCTGTCTCTTATCTTCTCTGGAAATTGAGGAACCTGAC
TGAAAGTGCGAATCCAGAGAAGAAGAGAGCGCAAAATCCGACAAGAACAGCAGCAGACAC
ACCTATCATGTCTGGTTTGAACCCAAAGTACTGTTCAATGAACTGCTTGACCGTTCCATT
GAACATTGGCTCCTTGATGATGCTCTCCACGTCACCAAGCTGCGAGAGGATTATACCTTG
AAGTGTCCACGCCACTGGACATATGTAATAGAACCATATCCACCACACCGGAATCAAAGG
TTTTTGGACGGAAACCAGATAGGAGATTCCAAAGAGAGTAAAACGCAGAGGAGATCACAG
CAGCTAAGTGCTGATTCGGGGTGAGACCAACCGCCATCATGCCGTAGAAAGTGAAGTAGG
TGAAAGTGAGGAACATGAACACCAAGTAGAGCACAAACTTACTGAACGTTCTTTCGAAAC
CAATGGTGAAGTAAGTGATGACACCATAGAGAATTGTTTGGGCGAGAATGTAAGGTATCT
CCACAAC

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

CO CL7708Contig1 830 2 3 U
GGGCCGAAAAACTCTTCACACGTCTGTAACTTTTACTTCTCTCACCAATCATGGCCGCTT
CAATAGCGAAACCCATCTCCACAACTCCTCTCCTTTTCCATTTCAACCCAAAGACCAACA
TTTCCTTCTCCGATTGCATCTCGATTTCTTCTGGATTCCGACATTCCCCACCGTCTTCCC
TCGCTTTGGTCGCAAAACCACCGACCAGCACTCGCGTTTCCCATCTCGTTAGAGCCGAAA
GCTCTTGTGATTATATTCCGGACTCGAAGTTTTACAAGGTTGAAGCAATTGTCAGGCCAT
GGAGGATCCAGCATGTTTCATCGGCTTTATTGAAAATCGGGATTAGAGGTGTTACGGTTT
CTGATGTCCGAGGGTTTGGTGCACAAGGTGGATCCAAGGAGAGACATGGTGGGTCTGAGT
TCTCTGAAGACAGGTTTGTCGCTAAAGTTAAAATGGAGATCGTTGTCAAGAAAGAACAAG
TGGAGTCTGTAATCAACACTATAATCGATGGAGCAAGGACAGGAGAGATCGGTGATGGCA
AAATATTCGTTTTGCCTGTGTCAGATGTCATAAGGGTTCGGACAGGTGAGCGTGGAGAAG
AAGCAGAGAAGATGACTGGTGATATGCTTTCGTCATCTTAGGAACAAAACAGAGCTCAAA
GAATGGCTTCTGGTAATAATAAAATGAATGGAGTCTTTAGTTTCCTTTTTGTTTGCTGTT
GAGTTGATCGAGATGTGTGTTTAAACTGTACATGAATGATGCAGAAACATCTGTCTTGGT
TCTTAGACATCGAATCTCTCTTCCTAATAAAAGCATTTAGTCCTTGCCTT


BQ
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AF RS1BN56TF U 1
AF RS1BN56JQ C 132
BS 1 641 RS1BN56TF
BS 642 642 RS1BN56JQ
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RD RS1BN56TF 830 0 0
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TCGCTTTGGTCGCAAAACCACCGACCAGCACTCGCGTTTCCCATCTCGTTAGAGCCGAAA
GCTCTTGTGATTATATTCCGGACTCGAAGTTTTACAAGGTTGAAGCAATTGTCAGGCCAT
GGAGGATCCAGCATGTTTCATCGGCTTTATTGAAAATCGGGATTAGAGGTGTTACGGTTT
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TCTCTGAAGACAGGTTTGTCGCTAAAGTTAAAATGGAGATCGTTGTCAAGAAAGAACAAG
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AAATATTCGTTTTGCCTGTGTCAGATGTCATAAGGGTTCGGACAGGTGAGCGTGGAGAAG
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DS 

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TATATTCCGGACTCGAAGTTTTACAAGGTTGAAGCAATTGTCAGGCCATGGAGGATCCAG
CATGTTTCTTCGGCTTTATTGAAAATCGGGATTAGAGGTGTTACGGTTTCTGATGTCCGA
GGGTTTGGTGCACAAGGTGGATCCAAGGAGAGACATGGTGGGTCTGAGTTCTCTGAAGAC
AGGTTTGTCGCTAAAGTTAAAATGGAGATCGTTGTCAAGAAAGAACAAGTGGAGTCTGTA
ATCAACACTATAATCGATGGAGCAAGGACAGGAGAGATCGGTGATGGCAAAATATTCGTT
TTGCCTGTGTCAGATGTCATAAGGGTTCGGACAGGTGAGCGTGGAGAAGAAGCAGAGAAG
ATGACTGGTGATATGCTTTCGTCATCTTAGGAACAAAACAGAGCTCAAAGAATGGCTTCT
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QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1GB14TF U 1
AF RS1GQ26TF U 1
BS 1 689 RS1GB14TF
BS 690 769 RS1GQ26TF

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QA 1 689 1 689
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ACATAAACTATCATCTCTTCCACCTATGCCTGGTCCTGCCAAAACAGGGTTTAAGGTGGT
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QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

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ATATATAAAAGAACTTTCGCCACG


BQ
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AF RS1CG04TF U 1
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DS 

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DS 



AS 1 2

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AC


BQ
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10 10 

AF RS1C044JQ U 9
AF RS1C044TF C 1
BS 1 8 RS1C044TF
BS 9 685 RS1C044JQ
BS 686 722 RS1C044TF

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DS 

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GCACGTGACTCCATCTGAGATAAATTTCGGTAGGCCGTTTCACTCTCCCCTCTCAGAGCC
ACTTGCTGCCTCTCCACCTCAACAATCTTGTGTTTAAGAGCCATCATCTCTCCCTCTAGA
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TTCCTGCCAAAGCGATGACTCCTTAGCAAAAGGCAAAACGACTATTCTCATCGTTTGATC
AC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL7712Contig1 844 2 2 U
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ATAT


BQ
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10 10 10 10 

AF RS1A876TF U 1
AF RS1A876JQ C 321
BS 1 716 RS1A876TF
BS 717 844 RS1A876JQ

RD RS1A876TF 716 0 0
GAGAATTATCTTACTTTAATATATCATTGAATTTTTGATGTTCTGTTTTCCTTTTCACAC
TCATATCTCTGTTACTTTGGGTACGTGTAAGGAGCGCCTAATATTCTTCAAACACACATG
GAATATTTTCATGCAGGACATTGTTCTTGGATGTCACCTCAGGAACACATGTATCTTTCG
ACAAGGAAACTGATGCAGGGGATTCTGTTTTTTAGAGTAGGTGTTTGATGCTTCATAAAT
TATTATATCCATAATAAACTTTCACGTATATGTTTCTGCAAAGTTCAATATGTAGAACAT
TGAATTTGTCTGCACTGGAATGGTGACTGATATCAAAATGTAGATAGGCTGGTGTTATGT
CTCTTGCTTTAGATGGACAAAGAACTTCCAACGAACGGTCTCATCCTTTACTTGCGTGAC
CTGCAATAACTTGGTTTGCTCAGGTATATTGGACTATTTGAATTATTTAGTTGTTTTTAG
TTTATAAAAGTTATTGTACATTCACACTCTGATATAGCAACATGTACTAATACTTTATAT
CTGCTTTGTAAGGTACCGTGTGGAGGGTGTCTTTGTTGGATTCGATGGTGAGATGACAAA
ACTACATACCTGTGAGGCTGGTAATTTAAGTGTAGGAACATCTCCAAGTGGTGTCGCCAT
CAAGAAACCTCACGCATCAAATTCTTTAAAGGTGGTGAAGATGCCACGTAAAGAAT

QA 1 716 1 716
DS 

RD RS1A876JQ 524 0 0
TGGTGACTGATATCAAAATGTAGATAGGCTGGTGTTATGTCTCTTGCTTTAGATGGACAA
AGAACTTCCAACGAACGGTTTCATCCTTTACTTGCGTGACCTGCAATAACTTGGTTTGCT
CAGGTATATTGGACTATTTGAATTATTTAGTTGTTTTTAGTTTATAAAAGTTATTGTACA
TTCACACTCTGATATAGCAACATGTACTAATACTTTATATCTGCTTTGTAAGGTACCGTG
TGGAGGGTGTCTTTGTTGGATTCGATGGTGAGATGACAAAACTACATACCTGTGAGGCTG
GTAATTTAAGTGTAGGAACATCTCCAAGTGGTGTCGCCATCAAGAAACCTCAGGCATCAA
ATTCTTTAAAGGTGGTGAAGATGCCACGTAAGGAATAGGTGAAGCTGAGATTGTGATGCG
GATGGAGTACTTATATTTCAAAAATGAGTTGTATTGGTTTTTATTTTAGAATATGTTCTC
TTATGTAGTTTTTGGTATGGTTTATTAAAAATCTAAAACAATAT

QA 1 524 1 524
DS 



AS 1 2

CO CL7713Contig1 1132 2 2 U
GAGACTCAAACCCTGAAGACTTCAACCGTCCAGGACACATCTTCCCACTCAAGTACCGAG
AAGGAGGGGTTTTGAAAAGAGCTGGACACACCGAAGCATCTCTTGACCTCACCGTGTTAG
CTGGACTAGATCCTGTTGGAGTACTATGTGAGATTGTTGATGATGATGGTTCCATGGCTA
GATTACCAAAGCTCCGTGAGTTTGCAGCTGAGAACAGCCTCAAAATCGTTTCCATTGCGG
ATTTGATCAGATATCGAAGGAAGAGAGATAAGCTAGTGGAACGTTCTTCTGCAGCTCGGA
TCCCAACAATGTGGGGACCTTTCACAGCTTATTGCTATAAGTCTATAGACGGCATTGAGC
ACATTGCAATGGTTAAGGGAGAGATTGGTGACGGTCAAGACATTCTAGTGAGGGTTCATT
CAGAATGTCTCACGGGGGACATATTTGGATCAGCGAGGTGTGACTGCGGGAACCAGCTAG
CTCTTGCGATGCAGCAGATTGAGTCTGCTGGTCGTGGCGTGTTGGTTTACCTGCGTGGAC
ATGAAGGGAGAGGGATCGGTTTAGGACACAAGCTTAGAGCTTATAATTTGCAAGATGCTG
GCCGGGACACGGTTGAAGCTAATGAGGAACTAGGACTTCCCGTTGACTCTAGAGAGTATG
GAATTGGTGCACAGATACTAAGGGATTTGGGAGTGAGGACGATGAAGCTGATGACGAATA
ATCCGGCTAAGTATGTTGGTTTGAAGGGATATGGTTTAGCTATTGTGGGGAGAGTTCCTC
TGTTGAGTCTTATCACAAAGGAGAATAAGAGATATTTGGAGACGAAGAGGACCAAGATGG
GTCACATGTATGGTTTGAAGTTCAATGGTGATGATGTTGTGGAGAAGATTGATGATTCTG
CAACCACTGAGCCATGAGTCTTTAAGCGGAAGAACCAGGATGAACCGAACCAAATAAAAT
TGAACCGAGTCATAAATAGTAGATGATATGCTTCAAGAGAACACCAAAAAAAGAGACATG
ACATAGAAGAGCAAGGAAGGAAATACTTCTGATCTATTTTGCTTTATGTTATATTTTTAT
CTTGATCTGATTTTTTCTATAATTCTTGTTTTACAAAGTTTTCAACATTGTC


BQ
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AF RS1B872TF U 1
AF RS1B872JQ C 398
BS 1 561 RS1B872TF
BS 562 1132 RS1B872JQ

RD RS1B872TF 561 0 0
GAGACTCAAACCCTGAAGACTTCAACCGTCCAGGACACATCTTCCCACTCAAGTACCGAG
AAGGAGGGGTTTTGAAAAGAGCTGGACACACCGAAGCATCTCTTGACCTCACCGTGTTAG
CTGGACTAGATCCTGTTGGAGTACTATGTGAGATTGTTGATGATGATGGTTCCATGGCTA
GATTACCAAAGCTCCGTGAGTTTGCAGCTGAGAACAGCCTCAAAATCGTTTCCATTGCGG
ATTTGATCAGATATCGAAGGAAGAGAGATAAGCTAGTGGAACGTTCTTCTGCAGCTCGGA
TCCCAACAATGTGGGGACCTTTCACAGCTTATTGCTATAAGTCTATAGACGGCATTGAGC
ACATTGCAATGGTTAAGGGAGAGATTGGTGACGGTCAAGACATTCTAGTGAGGGTTCATT
CAGAATGTCTCACGGGGGACATATTTGGATCAGCGAGGTGTGACTGCGGGAACCAGCTAG
CTCTTGCGATGCAGCAGATTGAGTCTGCTGGTCGTGGCGTGTTGGTTTACCTGCGTGGAC
ATGAAGGGAGAGGGATCGGTT

QA 1 561 1 561
DS 

RD RS1B872JQ 735 0 0
AGACATTCTAGTGAGGGTTCATTCAGAATGTCTCACGGGGGACATATTTGGATCAGCGAG
GTGTGACTGCGGGAACCAGCTAGCTCTTGCGATGCAGCAGATTGAGTCTGCTGGTCGTGG
CGTGTTGGTTTACCTGCGTGGACATGAAGGGAGAGGGATCGGTTTAGGACACAAGCTTAG
AGCTTATAATTTGCAAGATGCTGGCCGGGACACGGTTGAAGCTAATGAGGAACTAGGACT
TCCCGTTGACTCTAGAGAGTATGGAATTGGTGCACAGATACTAAGGGATTTGGGAGTGAG
GACGATGAAGCTGATGACGAATAATCCGGCTAAGTATGTTGGTTTGAAGGGATATGGTTT
AGCTATTGTGGGGAGAGTTCCTCTGTTGAGTCTTATCACAAAGGAGAATAAGAGATATTT
GGAGACGAAGAGGACCAAGATGGGTCACATGTATGGTTTGAAGTTCAATGGTGATGATGT
TGTGGAGAAGATTGATGATTCTGCAACCACTGAGCCATGAGTCTTTAAGCGGAAGAACCA
GGATGAACCGAACCAAATAAAATTGAACCGAGTCATAAATAGTAGATGATATGCTTCAAG
AGAACACCAAAAAAAGAGACATGACATAGAAGAGCAAGGAAGGAAATACTTCTGATCTAT
TTTGCTTTATGTTATATTTTTATCTTGATCTGATTTTTTCTATAATTCTTGTTTTACAAA
GTTTTCAACATTGTC

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

CO CL7714Contig1 690 2 1 U
GAATAGATCTCGTCGTTAATTAAATGAATTCAAAAAAATGAATAATGAATATAAATTTTT
TTTTAGTGAGAGGTAAACCTTATGATAAAGAAGAAAAAGAAGAAATCATATACTTCCGTA
TATGCTTTAGGGCAATATATATCTACGTCTTCCCACAAAGCACGGAGAGTTATTGATCAG
ATCCGTGGACGTTCCTACGAAGAAGCACTTATGATATTAGAACTTATGCCGTATCGAGGA
TGTTATCCCATTTTTAAATTAGTTTATTCTGCAGCAGCAAATGCTAGTCACAATAAGGGT
TTCAAAGAAACCAATTTAGTCATTAGTAAAGCTGAAGTGAATCAAGGAAATACGGTGAAA
AAATTAAAACCTCGGGCACGAGGACGGAGTTTCCCAATAAAAAGATCCACTTGTCATATA
ACTATCGTATTGGAAGATATATCCTTATATCAACAATATGAAGAATATTTAATGTATTTA
AAAAAACCTGGATGCAGCAATGAAAACATAAATCTAACATGTTACGATACATATAGTAGT
GGAGGCCTATGGGACAAAAAATAAATCCACTTGGTTTCAGACTTGGTACAACCCAAAGTC
ATCATTCTATTTGGTTTGCACAACCAAAAAAGTATTCTGAAGGTTTAGAAGAGGATAAAA
AAATACGAGACTGTATTAAAAATTATGTCC


BQ
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AF RS1AI88JQ C 1
AF RS1AI88TF U 1
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QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DC28TF U 1
AF RS1DC28JQ C 66
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DS 

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QA 1 695 1 695
DS 



AS 1 2

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BQ
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ATTTATTTTTTATCTATTTTTCTTCTCTAGATTTTTCGTATTCTAGTTTCTGCAGAACTT
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DS 



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BQ
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AF RS1BC76JQ C 1
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GG

QA 1 706 1 706
DS 



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TTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 

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GATG

QA 1 763 1 763
DS 

RD RS1B919JQ 705 0 0
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AGGACACGATAAAGAAAGCGTCCCCGATCACGAGAGGGATAGCTCTTATCTTCTCCCTCC
TCGCCTTCCTAATCATGGTCTGTAACAAACACGGACCCGGGAGAAACTTCGACGAGTACG
AAGAGTACAGATATGTAGTGGCGATCGCGATCACCGCAACGTTGTACACTGCGTGGCAAA
CGTTCGTACATCTCTCCAAAAGAGACTTCTTTGATCGCCGGACTTCCATTTTCGTCGATT
TCTCCGGCGACCAGATAGTAGCGTACCTTCTCATATCAGCTGCTTCCTCTGCGATCCCGT
TGACTAATAGGTTCAGAGAAGGCCAAGATAACATTTTTACTGACTCTGCTGCTTCTGCTA
TCACAATGGCTGTACTCGCCTTTGTTTCTTTAGCTCTCTCTGCTCTCTTCTCCGGTTACA
AACTCTCTACTTCTCATTCTTTTGTATGAATCTCCTGCTCTAAGCCTCTCCCCTGTTTGT
ATCGTTTGTTTGTTTATACGAGTTAATCTAATTCTTTAAAGTATATGTGCATATAGCATC
ATCTTACTTCTGTTATTAGTCTCTGTGACTCTGTGTATGTTCTCTCTTCGATACATTTGT
AAAAGTGAAAACATGATGTGAAAGTTGATTGGTTTTATTCCATTT

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL7719Contig1 745 2 4 U
GGGAAATAGATTTGTCTTTCCATGACGAAAAATCTCTAAAATCAAATATATTTTTTTGAG
AAAGAAAGAGAGATTGTGAAGAGGAGAAGATGTCTAGTAGATCTCTCGTGAAACGATTTG
TCCCGTATGTATCTGCTCGTATAAGAGAGAATCATCGGATGCTTAATTATTGTTCTTCCA
CTTCTTCTGCTCTCAAAGAAGCTTCTTCCTCCCAATCTGAATCCCCTTCTCTCGAAGCTG
TTCACCTTAGCGACAATTGTATCCGGAGAATGAAAGAGTTGCAATCGAGTGAGCCGAAGA
AGAAGCTGCTTCGATTGGGTGTAGAAACTGGAGGTTGTTCTGGTTTCCAGTATGTCTTTG
AGCTCGATCACACAACCAATCCTGATGACAGGGTTTTCGAGAAGAACGGTGTTAAATTGG
TTGTAGATAATGTCTCTTATGACTTTGTCAAAGGCGCTACTGTTGATTACGTCGAGGAGC
TCATCCGTTCTGCTTTCGTGGTAGCTGAAAACCCGGCCGCAGTGGGAGGATGCAGTTGTA
AGAGCTCCTTCATGGTGAAACAGTGAAGCATTCTTCTTTTACATGACTAGAAAACCAAAT
TTGATCCTTTTTTTTTGTTATTTACTTGTACAATGTCTCACAAGGTTTTGCTTTGTATCA
TTTAAAAGGTATAACTAGGGAAAGATAATCAAACCGTGTAGGCTTGTACCTCAACAAAAA
TCATATATAAGTTCATCCTATTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C469TF U 1
AF RS1C469JQ C 482
BS 1 615 RS1C469TF
BS 616 616 RS1C469JQ
BS 617 639 RS1C469TF
BS 640 745 RS1C469JQ

RD RS1C469TF 639 0 0
GGGAAATAGATTTGTCTTTCCATGACGAAAAATCTCTAAAATCAAATATATTTTTTTGAG
AAAGAAAGAGAGATTGTGAAGAGGAGAAGATGTCTAGTAGATCTCTCGTGAAACGATTTG
TCCCGTATGTATCTGCTCGTATAAGAGAGAATCATCGGATGCTTAATTATTGTTCTTCCA
CTTCTTCTGCTCTCAAAGAAGCTTCTTCCTCCCAATCTGAATCCCCTTCTCTCGAAGCTG
TTCACCTTAGCGACAATTGTATCCGGAGAATGAAAGAGTTGCAATCGAGTGAGCCGAAGA
AGAAGCTGCTTCGATTGGGTGTAGAAACTGGAGGTTGTTCTGGTTTCCAGTATGTCTTTG
AGCTCGATCACACAACCAATCCTGATGACAGGGTTTTCGAGAAGAACGGTGTTAAATTGG
TTGTAGATAATGTCTCTTATGACTTTGTCAAAGGCGCTACTGTTGATTACGTCGAGGAGC
TCATCCGTTCTGCTTTCGTGGTAGCTGAAAACCCGGCCGCAGTGGGAGGATGCAGTTGTA
AGAGCTCCTTCATGGTGAAACAGTGAAGCATTCTTCTTTTACATGACTAGAAAACCAAAT
TTGATCCTTTTTTTT*GTTATTTACTTGTACAATGTCTC

QA 1 639 1 639
DS 

RD RS1C469JQ 264 0 0
CATCCGTTTTGCTTTCGTGGTAGCTGAAAACCCGGCCGCAGTGGGAGGATGCAGTTGTAA
GAGCTCCTTCATGGTGAAACAGTGAAGCATTTTTTTTTTACATGACTAGAAAACCAAATT
TGATCCTTTTTTTTTGTTATTTACTTGTACAATGTCTCACAAGGTTTTGCTTTGTATCAT
TTAAAAGGTATAACTAGGGAAAGATAATCAAACCGTGTAGGCTTGTACCTCAACAAAAAT
CATATATAAGTTCATCCTATTTTT

QA 1 264 1 264
DS 



AS 1 2

CO CL7720Contig1 762 2 12 U
GCTGGGAAGCCTATTGTAAAAGAAGTGAACATAAATGTAACCAATCATATACTAGAGATT
CGGTTGTACTGGGCGGGGAAGGGGACAACCCTCATTCCCGAACGAGGAAACTATGGTCCT
ATTATCTCTGCCATCTCCTTGTGTCACAGCAGTTAGTACCCATGAAACTCCAGAATCATT
TACTATTTCGAGGCTCTACTTTGACAACCTTACTTCTTATCCTACTGTTTTTTTCTTTCT
TTTTCTTCAGTATCAAGTGGCTACTTTCATCTTATTAATATTGGTTCCTGTTACCTAATG
AGAATATTCATCTTTCCAACTTTCAGGTTTGGGGCTAAGATGTGGAGGTCCAAAGACAAA
AACATTGCTTTGTTAAAAAATATTTTTCTGTAGTTTCGTGTTTTATATGATGCATCATGT
ATATATCTTTACAATTTTTCATGTCTCATTTTTCAGCGGAAAATACAAAACATCAGAATA
ATTTATCCATTAATTTTTCGGGATAACAAGTACGTTGTTAGCAATTTACACTCTTGGCTT
TTGGGTTTATATGCTCAGAAAAGATGCAGGGGAGCCCAAGAACACAAGAGAACGAGATCT
GAGAGCTCATGGTCTGCAAACAGTTTGCTTTTACCTGGAGGCAACTCCAAGCTGCCACAA
ACAATTTTGATGAAGCCAACAAACTTGGACAAGAAGGTTTCGGGTCTGTATTCAAAGGAG
ATGGGTTAGATGGAACTATCATAGCAGTTAAACAGCTTTCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GI41TF U 1
AF RS1AK92TF U 269
BS 1 386 RS1GI41TF
BS 387 387 RS1AK92TF
BS 388 403 RS1GI41TF
BS 404 404 RS1AK92TF
BS 405 438 RS1GI41TF
BS 439 439 RS1AK92TF
BS 440 452 RS1GI41TF
BS 453 453 RS1AK92TF
BS 454 483 RS1GI41TF
BS 484 484 RS1AK92TF
BS 485 496 RS1GI41TF
BS 497 762 RS1AK92TF

RD RS1GI41TF 496 0 0
GCTGGGAAGCCTATTGTAAAAGAAGTGAACATAAATGTAACCAATCATATACTAGAGATT
CGGTTGTACTGGGCGGGGAAGGGGACAACCCTCATTCCCGAACGAGGAAACTATGGTCCT
ATTATCTCTGCCATCTCCTTGTGTCACAGCAGTTAGTACCCATGAAACTCCAGAATCATT
TACTATTTCGAGGCTCTACTTTGACAACCTTACTTCTTATCCTACTGTTTTTTTCTTTCT
TTTTCTTCAGTATCAAGTGGCTACTTTCATCTTATTAATATTGGTTCCTGTTACCTAATG
AGAATATTCATCTTTCCAACTTTCAGGTTTGGGGCTAAGATGTGGAGGTCCAAAGACAAA
AACATTGCTTTGTTAAAAAATATTTT*CTGTAGTTTCGTGTTT*ATATGATGCATCATGT
ATATATCTTTACAATTTT*CATGTCTCATTTT*CAGCGGAAAATACAAAACATCAGAATA
ATT*ATCCATTAATTT

QA 1 496 1 496
DS 

RD RS1AK92TF 494 0 0
ATCTTATTAATATTGGTTCCTGTTACCTAATGAGAATATTCATCTTTCCAACTTTCAGGT
TTGGGGCTAAGATGTGGAGGTCCAAAGACAAAAACATTGCTTTGTTAAAAAATATTTTTC
TGTAGTTTCGTGTTTTATATGATGCATCATGTATATATCTTTACAATTTTTCATGTCTCA
TTTTTCAGCGGAAAATACAAAACATCAGAATAATTTATCCATTAATTTTTCGGGATAACA
AGTACGTTGTTAGCAATTTACACTCTTGGCTTTTGGGTTTATATGCTCAGAAAAGATGCA
GGGGAGCCCAAGAACACAAGAGAACGAGATCTGAGAGCTCATGGTCTGCAAACAGTTTGC
TTTTACCTGGAGGCAACTCCAAGCTGCCACAAACAATTTTGATGAAGCCAACAAACTTGG
ACAAGAAGGTTTCGGGTCTGTATTCAAAGGAGATGGGTTAGATGGAACTATCATAGCAGT
TAAACAGCTTTCTG

QA 1 494 1 494
DS 



AS 1 2

CO CL7721Contig1 922 2 2 U
CTTTTGTATAATTTTCCGAGAAAATTTTCATTTGGGAGAATTCGATTTTTATATGAATTC
TAGTTTCTGGGTTCGGCGATTGAAGTGATGAGCAACCTTAGAGCTATCTGTAGACCACAC
ACGGTGTTTGCTTCGATCGTGTGTTGCAGTAGAAACCAATCTCGATCAATCGTCAAGGTT
TCGATTCAAAAACTCAGATTTAGAACTCGGGTCTCGAGTTCGTTTCCGTCTTCGTCACGG
GTCGCGTCGAAAGATTCGAACTTTTGGTTTGGTGTGAGTCAGAGGAAGACTCTCGTCAGG
GCGGCTTCGGATTGGAGCGAAGAGAAGTCTCCTTACGATACTCTCGAGCTGGAACGAGAT
GCAGAGGAAGAGCAGATTAAGGTGGCATACAGACGATTAGCCAAGTATTATCATCCTGAT
GTTTATGATGGGAAAGGGACGCTTGAAGAAGGAGAGACAGCAGAAGGTAGATTCATCAAG
ATTCAGGCGGCATACGAGCTGCTCATGGACACGGAGAAGAGAAGAGAGTATGATATGGAT
AACCGAGTGAATCCAATGAAGGCATCACAAGCTTGGATGGAATGGCTGATGAAAAGGCGT
AAAGCATCGAGAGAGTTGTTTAACAGTACTTTGAAGAGACACACGCTGGTATTGAAGAAA
AGAGATTTGATGCGAAAGAAAGCAGAGGAGGATAAGAAGAAGCTCATTACTCAGCTGTTA
GCAGCAGAAGGTCTCGAGCTTGATACGGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAAGCAGCCAAGTGA
TTATTTTGGAAAGCTTTACCTCTCTTCTATCTACTCCGAGTATTGTACTCTCTGTATTTC
AGTTTCAACGTCTCTTGCATGTAGAAAACATACATGTAGAAAACATACATGTAGATATTA
AATCTTATAATTACCAGAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BA51TF U 1
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DS 



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BQ
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DS 

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ATGTATGTGCTTGTATATTCATTGATTTGTTATACTTGTAAAAACAAATGATATACTTGT
AAATATGTCAATGATATACTCTTGTAACTAAAAGTTTTTCTTATTTGTTTCGCTGAATTT
CAAAATTTGAAATTAAACTTTGATGTAGTT

QA 1 690 1 690
DS 



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BQ
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AF RS1BK17TF U 1
AF RS1BK17JQ C 569
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BS 821 1350 RS1BK17JQ

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TGGATTTACCTCTCAAGTTTATGAATTGTCAAAGGTCTTCCTGCACAAGGACTGGATTAT
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GACTTCTGGCAATCGTTGGGGTGTGGTGATGTCGAGGAAC

QA 1 820 1 820
DS 

RD RS1BK17JQ 782 0 0
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TGGAAAGAAGATTTTCATGTGACGTCCATGACGACTTCTGGCAATCGTTGGGGTGTGGTG
ATGTCGAGGAACGCTGGCTTCTCTGATCAGGTGGTGGAGCTTGACTTTTTGTACCCGAGC
GATGGAATACATAGGAGGTGGGAGAGCGGGTACCGAATCACATCGATGGCGGCAACTGCG
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ATTTGAGGGCTTTTGGAAGAGCCTTCCAAGTGTGTGTGCTTATTTATTATTATCATCCAC
TT

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

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CCTTCTCTTCTTTT


BQ
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AF RS1FV48TF U 1
AF RS1AJ77TF U 157
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AAAGCTTAAGCTTGAGCCTCAAGGCAAGTTCTTTTTCTCTGCTACAGGTGGAGCCAGCAA
GACAAAGTACGAGGTGGACCTCGATCTGTTCGACAGTGTCGATGTGAATGAGAGCAAAGC
GAGTGTGAGCTCGAGGAGTGTGTGTTACCTGGTGAAGAAAGCAGAGAGCAAGTGGTGGAA
AAGGTTGATTAAACAGGAAGGGAAACCTCCTGTGTACTTGAAAGTTGATTGGGATAAATG
GGTTGATGAAGACGAAGATGACAAAGATATGGACTTTGGAGATTTTGATTTCAGTGGTCT
GAACATGGGAGATAGTGACGAGATTGGAGACGAAGAGGAGGATAGTGAGCTAGAGGGTGT
AACTGTGGC

QA 1 489 1 489
DS 

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CTTGAAAGTTGATTGGGATAAATGGGTTGATGAAGACGAAGATGACAAAGATATGGACTT
TGGAGATTTTGATTTCAGTGGTCTGAACATGGGAGATAGTGACGAGATTGGAGACGAAGA
GGAGGATAGTGAGCTAGAGGGTGAAACTGTGGCAGAGACAAAAGAAACGAAGGACATTGT
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TTATTCTAAGATTTCTCTACTACTGTTTTTACTTGAAATGGGTTTTGTAGTGGTATGAAG
GACATAGTTTCAACTTTCAATGAACCTTCTCTTCTTTT

QA 1 518 1 518
DS 



AS 1 2

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GTTCCATAGAGAGCACCCCAAAGAACAAATCCCTAACAGTGTCCAAACCAACGAGACGAG
CGAGCTAGACGACCAGAACCCTCCCTTTATGCCCGAGACCGAAAACGGATACGGCTTGTA
CGGTCAAGAGACAACCTACAACAACAATGAAGATCAGTTTAAGAACAACAAATACGACGA
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TTACAGGCCGGAGAAGAGAGAGGAGGCGTACAAGGGTTATGACAACAACGTGGAGAGACA
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CAGAAACCACGGACGTTTCTACCAGAAGCATTTCTACAACTACAATCCCACCAATTACAA
CGAGGACTCGAGCTTCAAGAATCCATACAGTTCTAAAAACACGATGAACGGACAGTCCGA
GATGTTTGACGAAGGGCAAGGAGATCAGTTCACTCCATGATCACGCGGAGAACAAATCAT
ATTAAATATTTTAAAATTTGTTTTCTAAACTAATATTAAAGTTACGATGGTTGGTTTATA
CGTGAAACTATTAATCGTTTGCATATAAAGTTTGAAGAATAAATATGTAATGCTTTTTAT
GTTAATTTTCTTATTTGGTTTAATATTATCTATAGAAATTT


BQ
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AF RS1CJ29TF U 1
AF RS1CJ29JQ C 340
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CGAGGACTCGAGCTTCA*GAATCCATACAGTTCTAAAA*CACGATGAA

QA 1 768 1 768
DS 

RD RS1CJ29JQ 662 0 0
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TTACAACGAAAACAACAAGGACTCGAGCTACTACGAGAACTCCAACGGTTACGGGCCGGA
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CTACTCCGAAAACTCCAATGCTTACAGGCCGGAGAAGAGAGAGGAGGCGTACAAGGGTTA
TGACAACAACGTGGAGAGACAAGGGATGAGTGATACGAGGTTCATGGCCAATGGTAAGTA
CTTCTATGACCTTGACGACGACAGAAACCACGGACGTTTCTACCAGAAGCATTTCTACAA
CTACAATCCCACCAATTACAACGAGGACTCGAGCTTCAAGAATCCATACAGTTCTAAAAA
CACGATGAACGGACAGTCCGAGATGTTTGACGAAGGGCAAGGAGATCAGTTCACTCCATG
ATCACGCGGAGAACAAATCATATTAAATATTTTAAAATTTGTTTTCTAAACTAATATTAA
AGTTACGATGGTTGGTTTATACGTGAAACTATTAATCGTTTGCATATAAAGTTTGAAGAA
TAAATATGTAATGCTTTTTATGTTAATTTTCTTATTTGGTTTAATATTATCTATAGAAAT
TT

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

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GCTACTTTATCTGCAATGCCTCTCTCTGAGTTCATGTTTCAAGGGAGGAACCCAAGAACT
CAACTACACTCCATTCTCGGCTTCTACCAGTCACTCTCCTGTTCAGAGCTTGTGACCGTA
AGAGACCTATTCTCCTTTCTGCTACAACTGATTCGTGGGAACCAAGCGAAAGCCACAACA
ACTACAACATCGTCTGTGCTTTATGCTTGGAGTAGAAGTGATGTAGAACGTGTACAGCAA
ACCATGGTTAAGATATTAAAAGCTGCAGGAGGTCAAGGAGCTTACTGGGTTAAAAGGTGG
GCTCTTAAAAGGTCTATTTGCAAAACAGGCTCCCCACAGCTGATTGATTATTGTCTCAAG
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GGCTCAAACGACTTTGAGTACAGGCTTGAACCTGTCAACAATGTGCACCGCTTATCTAAT
CAAGACATAAATTATGCATCCGAAGAGCAAATCAAATGCGACTTGAGATATTTATATGAC
ACATTATTGCACCCACAAACCATGGCCGAGTTCAGGTCTCAAGCTACTAGTGATAAAATG
ATTGATGCAGCCACAAAGATACTTGACTGCAAGCATTTCATAAAAGATTATTCGTCCAGC
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CCCATCCCCACCACCCGAACTGTTGGTACTTCCACTGAACGCTACTGTATCTGACCTAAA
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GGAGCTTCTAGGTTACCACTCTATGGATGATTCCATTACCCTGAAGTTTTTAATTGGTAC
AAATGGAGTCATGCGGGTCAGAGGGAGATGCTCATCTAAAGAAGGGCTTCTCCAGTACCG
CATGGAGAGAGGGGTGGAGAACTGGGAAGTTGATTGCAAGTGTGGCACAAAGGATGATGA
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GATTGAAAATGCCGATGCACTACCTTCCAAGTTCCATTGTTTCAGATGCATTGAACTGTA
CAGCAAGAAACCAAAGCAATCTGTTAATGAGCGTGGTTCTAGTCAAGTGTCCCTAATTGG
CTTTTGTAGAGGTGAGTCAGCTGCTATGGACAGTGGGTCTAATTTATCTTTAACACTTAG
TGTAGGCTGACTGTATTTATGTAAATATGTCTTTGTAAGGTGATTATGGATGCTAAACTT
TTGTTATGTTATCAAGGGTTTGGG


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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DG77TF U 1
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ACTACAACATCGTCTGTGCTTTATGCTTGGAGTAGAAGTGATGTAGAACGTGTACAGCAA
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ACATTATTGCACCCACAAACCATGGCCGAGT

QA 1 571 1 571
DS 

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CTTTTCAGGAAGTGTATGCAATGTTCAAGAGTTTTGAAGTGGAGGAGCTTCTAGGTTACC
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CACTACCTTCCAAGTTCCATTGTTTCAGATGCATTGAACTGTACAGCAAGAAACCAAAGC
AATCTGTTAATGAGCGTGGTTCTAGTCAAGTGTCCCTAATTGGCTTTTGTAGAGGTGAGT
CAGCTGCTATGGACAGTGGGTCTAATTTATCTTTAACACTTAGTGTAGGCTGACTGTATT
TATGTAAATATGTCTTTGTAAGGTGATTATGGATGCTAAACTTTTGTTATGTTATCAAGG
GTTTGGG

QA 1 847 1 847
DS 



AS 1 2

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GC30TF U 1
AF RS1GC30JQ C 9
BS 1 707 RS1GC30TF

RD RS1GC30TF 707 0 0
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AGAGCTCTCTCCGTCTCACGTGGCCGTATCACGTGCTCCGTCGTCGTCACGCCTGCCCTT
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ATGTCTTATCTCTCTGCTGCTCCTGTTTCGAGTGAATTGGTGGTGGAAGGATCAGTGGTG
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TCTGAACTTTTGTTGATTCTTTATTATTATTGTTCAATAAGACAAGAGTCTGTTTATGTA
TACAGATTAGTATATGGACCTACGAGATATATAATGAGCGTTACTAC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1GC30JQ 699 0 0
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CAAAAACGTATCCCTATTCGAAAACTTCCTCCACTCCTTCACCCACCCAGACTCCTCCCT
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CTTTAATGGGTTACACGGAGGAGCAGTGGCGTCAATTGCAGAGAGATTATCAATGGCTTG
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TCTTTCTGCTGCTCCTGTTTCGAGTGAATTGGTGGTGGAAGGATCAGTGGTGAGGAGTGG
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TTTGTTGATTCTTTATTATTATTGTTCAATAAGACAAGAGTCTGTTTATGTATACAGATT
AGTATATGGACCTACGAGATATATAATGAGCGTTACTAC

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 2

CO CL7728Contig1 704 2 2 U
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BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1EX94TF C 1
AF RS1EX94JQ U 6
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BS 6 704 RS1EX94JQ

RD RS1EX94TF 704 0 0
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GAACCAGTTACCAACAGTTGTCCTACCTGGATTCCCTTGGACGCCACAAGTTCCAATGAA
CCATTGATTCGTCTTCTCGTCGACATTGTCCAAGTTCCAGATCGAAGTAGCTGAGAATTT
GAAGTTTAGATCGGTTGAGACACGGATGATTCTTGATTTGTCTGATGGTGAGAATGTCAA
CGGCATGCCGTTAGAGACTTCGAACCGTTCTTGGATAACACTTTTCGGACAGGTTTTGCT
TTCGGCTTTGGACATGGTTAGTCCCCCGCCGCGACCGCGAACTACTGGCAAGATGTAGTA
TTTGGTGCCTGTTCTGAGACGTTGACCATAGATGTCGGTTACTGGCTCCACCGCGGCTTC
GGTGGTGACTCCACGGTGGCTGGTGAAGACGGCTAAGAGGAGGAAGGTGTTGAGCAGTGA
TGACATTTTAGTAAGCTTTCTTTAAGTGGAAACCTTTTTGAGTC

QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1EX94JQ 699 0 0
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ATTTATATGTAATCTATGCTCTTCTGAACATAACTTTTAGTGGTACATCACTCAGAACGA
GTCTTCTCATCCCATCTTGCACATACACACCAATGTCTCTACACATGACTTTGCAGATAT
CGCATACCGAAGGACAAAATACGATCTTGTAGTGATCTTCGTACTTGTCGATCTTGAACC
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GATTCGTCTTCTCGTCGACATTGTCCAAGTTCCAGATCGAAGTAGCTGAAAATTTGAAGT
TTAGATCGGTTGAGACACGGATGATTCTTGATTTGTCTGATGGTGAGAATGTCAACGGCA
TGCCGTTAGAGACTTCGAACCGTTCTTGGATAACACTTTTCGGACAGGTTTTGCTTTCGG
CTTTGGACATGGTTAGTCCCCCGCCGCGACCGCGAACTACTGGCAAGATGTAGTATTTGG
TGCCTGTTCTGAGACGTTGACCATAGATGTCGGTTACTGGCTCCACCGCGGCTTCGGTGG
TGACTCCACGGTGGCTGGTGAAGACGGCTAAGAGGAGGAAGGTGTTGAGCAGTGATGACA
TTTTAGTAAGCTTTCTTTAAGTGGAAACCTTTTTGAGTC

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 2

CO CL7729Contig1 706 2 2 U
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TTTTCGTAATTTTTTCAGTAAAAGTCACTTAACACCTCTTTTTAAAATCTGGCCTATCAT
CTCCACTAGACTAATGATGATATATCATAATAAACACCCGAGGAATGTTGATCATTGTTA
AGAGAAGATTATTCTCTTTTTTGACGGGAGATATCTGTTGATTGTCGCCGTTGAATTTCA
ACTCGCAAAATATTGGTGCATCAACTGCATCACCAATATCAAATTGAGCCTTCGTGAAGT
TCCCCTTTTTGAGGTTGTTCAAACCTGAGTTTAACATGTGAGCGCCCTTGGAGTAAAGCT
TAAGGCACTCTTCCAACAACTTCTTACTAAGGCTACTCTTATATTTCTTCTCTTTTATAA
TCTTCTCCACAGTTCTGTCCACGTTTTTTAAGTATGATATGGCATTATTCGTTCCTACCA
AGATCAGATCATCAATATTTCTCGCTTTCTGGCTCTCCGGATTCTCTTTGAGAGATGCAA
TGCAATCCTTTTCGAAATGTGGAATAGGTTCCACAAATAAAAATTCTGAAACGTTTTGCA
AGATTTTTGAATCAGAGAATTTGCTACTTTGTTGGCCATGCAACCATTGAAGAGAATAAC
AAACACAACAATGTACATCAGCATTTTCATTGTGTATTGTTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GR14TF C 1
AF RS1GR14JQ U 8
BS 1 7 RS1GR14TF
BS 8 706 RS1GR14JQ

RD RS1GR14TF 706 0 0
TATATCAACCAAAGAAGAATTTAACATACAAAACAAAATTATTAATGAGAACTATTTATA
TTTTCGTAATTTTT*CAGTAAAAGTCACTTAACACCTCTTTTTAAAATCTGGCCTATCAT
CTCCACTAGACTAATGATGATATATCATAATAAACACCCGAGGAATGTTGATCATTGTTA
AGAGAAGATTATTCTCTTTTTTGACGGGAGATATCTGTTGATTGTCGCCGTTGAATTTCA
ACTCGCAAAATATTGGTGCATCAACTGCATCACCAATATCAAATTGAGCCTTCGTGAAGT
TCCCCTTTTTGAGGTTGTTCAAACCTGAGTTTAACATGTGAGCGCCCTTGGAGTAAAGCT
TAAGGCACTCTTCCAACAACTTCTTACTAAGGCTACTCTTATATTTCTTCTCTTTTATAA
TCTTCTCCACAGTTCTGTCCACGTTTTTTAAGTATGATATGGCATTATTCGTTCCTACCA
AGATCAGATCATCAATATTTCTCGCTTTCTGGCTCTCCGGATTCTCTTTGAGAGATGCAA
TGCAATCCTTTTCGAAATGTGGAATAGGTTCCACAAATAAAAATTCTGAAACGTTTTGCA
AGATTTTTGAATCAGAGAATTTGCTACTTTGTTGGCCATGCAACCATTGAAGAGAATAAC
AAACACAACAATGTACATCAGCATTTTCATTGTGTATTGTTTTTCC

QA 1 706 1 706
DS 

RD RS1GR14JQ 699 0 0
ACCAAAGAAGAATTTAACATACAAAACAAAATTATTAATGAGAACTATTTATATTTTCGT
AATTTTTTCAGTAAAAGTCACTTAACACCTCTTTTTAAAATCTGGCCTATCATCTCCACT
AGACTAATGATGATATATCATAATAAACACCCGAGGAATGTTGATCATTGTTAAGAGAAG
ATTATTCTCTTTTTTGACGGGAGATATCTGTTGATTGTCGCCGTTGAATTTCAACTCGCA
AAATATTGGTGCATCAACTGCATCACCAATATCAAATTGAGCCTTCGTGAAGTTCCCCTT
TTTGAGGTTGTTCAAACCTGAGTTTAACATGTGAGCGCCCTTGGAGTAAAGCTTAAGGCA
CTCTTCCAACAACTTCTTACTAAGGCTACTCTTATATTTCTTCTCTTTTATAATCTTCTC
CACAGTTCTGTCCACGTTTTTTAAGTATGATATGGCATTATTCGTTCCTACCAAGATCAG
ATCATCAATATTTCTCGCTTTCTGGCTCTCCGGATTCTCTTTGAGAGATGCAATGCAATC
CTTTTCGAAATGTGGAATAGGTTCCACAAATAAAAATTCTGAAACGTTTTGCAAGATTTT
TGAATCAGAGAATTTGCTACTTTGTTGGCCATGCAACCATTGAAGAGAATAACAAACACA
ACAATGTACATCAGCATTTTCATTGTGTATTGTTTTTCC

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 2

CO CL7730Contig1 702 2 2 U
TTTTTTTTGTCATCTGATATTTTATTAATCGAACACATTACAAACCCAAACATGAGTGGT
TACAAGTCTGAAACATCTGGTACCAACGACCGCAAAAGAGAACCCAAGACGAAATTTTAG
ATGACACCTAAAACCCGAAGCCACAAGCCGGCGGTTGCTAAAGAAACACCCCGGAGTCTA
AACAAACACAAACAACTAGACAATACTAAACACTAAAGACCCTAGATGATAATCAAACCG
ATAATGGGAGAAACCAAAACGACACATTAGTAAACGAAACCGTTGCTGTAAACACCCTCT
AACTCCAACTAAACTTGCCACACCAACTCCAACTAAACTCGCCATCGGACCTTGCCACCA
CACCACAGCAAAGCCTGAAAGCTTTCTGTACACGAACCTTATTAATACAGCCGGTAATCA
GATACTAATCACCACAGACCACCGGATCTGTTAAGATCGAAGTCGGTAGAGTTCGATTTG
ATACTCCCGCCTTAGATCTGAGATCTGAAGTTTAATATCAGATTTAAAGTACCATCTAGG
AGAAGAAAAGGATCTAAGCCAACTAAAAACACAAGAGCACCTTCTCACAGTACGAACGAC
ACGAAGCCGTCGACCGGAGAAGGTGAGGACAACAAGTTCTCTCTTTTTTCTCTCTCGCTC
TCGCTTTTTTTTTGTGACATATTATCGATTGGAATTTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1C846TF C 1
AF RS1C846JQ U 9
BS 1 8 RS1C846TF
BS 9 702 RS1C846JQ

RD RS1C846TF 702 0 0
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TACAAGTCTGAAACATCTGGTACCAACGACCGCAAAAGAGAACCCAAGACGAAATTTTAG
ATGACACCTAAAACCCGAAGCCACAAGCCGGCGGTTGCTAAAGAAACACCCCGGAGTCTA
AACAAACACAAACAACTAGACAATACTAAACACTAAAGACCCTAGATGATAATCAAACCG
ATAATGGGAGAAACCAAAACGACACATTAGTAAACGAAACCGTTGCTGTAAACACCCTCT
AACTCCAACTAAACTTGCCACACCAACTCCAACTAAACTCGCCATCGGACCTTGCCACCA
CACCACAGCAAAGCCTGAAAGCTTTCTGTACACGAACCTTATTAATACAGCCGGTAATCA
GATACTAATCACCACAGACCACCGGATCTGTTAAGATCGAAGTCGGTAGAGTTCGATTTG
ATACTCCCGCCTTAGATCTGAGATCTGAAGTTTAATATCAGATTTAAAGTACCATCTAGG
AGAAGAAAAGGATCTAAGCCAACTAAAAACACAAGAGCACCTTCTCACAGTACGAACGAC
ACGAAGCCGTCGACCGGAGAAGGTGAGGACAACAAGTTCTCTCTTTTTTCTCTCTCGCTC
TCGCTTTTTTTTTGTGACATATTATCGATTGGAATTTCTCCC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RS1C846JQ 694 0 0
GTCATCTGATATTTTATTAATCGAACACATTACAAACCCAAACATGAGTGGTTACAAGTC
TGAAACATCTGGTACCAACGACCGCAAAAGAGAACCCAAGACGAAATTTTAGATGACACC
TAAAACCCGAAGCCACAAGCCGGCGGTTGCTAAAGAAACACCCCGGAGTCTAAACAAACA
CAAACAACTAGACAATACTAAACACTAAAGACCCTAGATGATAATCAAACCGATAATGGG
AGAAACCAAAACGACACATTAGTAAACGAAACCGTTGCTGTAAACACCCTCTAACTCCAA
CTAAACTTGCCACACCAACTCCAACTAAACTCGCCATCGGACCTTGCCACCACACCACAG
CAAAGCCTGAAAGCTTTCTGTACACGAACCTTATTAATACAGCCGGTAATCAGATACTAA
TCACCACAGACCACCGGATCTGTTAAGATCGAAGTCGGTAGAGTTCGATTTGATACTCCC
GCCTTAGATCTGAGATCTGAAGTTTAATATCAGATTTAAAGTACCATCTAGGAGAAGAAA
AGGATCTAAGCCAACTAAAAACACAAGAGCACCTTCTCACAGTACGAACGACACGAAGCC
GTCGACCGGAGAAGGTGAGGACAACAAGTTCTCTCTTTTTTCTCTCTCGCTCTCGCTTTT
TTTTTGTGACATATTATCGATTGGAATTTCTCCC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL7731Contig1 758 2 2 U
GCCAATGGAACAAGTGTTTACGCGTTAGACTTCACTGGGGAAAGCACTGTTCCTGTCTCT
CCATCAAATTCAAGCACAGGTACAACGAGTCCGAGTCCAAGTCCAAGTCCAGGTAACTCA
ACTGTGATCAGTGGAGGAGTAGGAGGAGGAGGAACCAGGAAATGGTGTGTTGCTTCATCC
CAAGCATCAGTGACGGAGCTGCAGAGTGCATTGGACTGGGCTGGCGGTCCTGGGAACGTT
GATTGTTCCGCTGTTCAACCAAACCAGCCTTGCTTTGAGCCAGATACTGTTCTCTCACAC
GCATCGTATGCGTTCAACACTTATTACCAGCAGAGCGGAGCGAGTAGCTTAGATTGCAGC
TTCGGAGGAGTCAGCGTTGAAGTTGACAAGGACCCTAGTAAGTGTTTTACATACATTCAC
TTATTATCTATAGAGTAAATGTGAAGCCATTGTAGCCTCACTTGAGTTCTCTCATGCAAC
TGCAGGCTATGGTAACTGTCTGTACATGATTGCTCCATCTACTGATGGAATGAACAGAAC
AATGGCGGGTAATATCACGGGAAACATAACTGCCATTGATTCCCCCATGGCTTCACCTTC
TTCGAGCAGTGAAAGATACAGACAAATGGTGGTCTCCGTTGCAGTCTCTGTTTTGTTGCC
GTGGTGCTTTGTAGTTAGTTTGAGTCTTTGGTGACCGCATGCATTTGTTTCCTTATTGTC
TGTTAAGTTTTGAGGTGAATTAAACCGTTATTTAACAG


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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BQ
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AATTGCAGATTTGGTATGATGTCATGGGCGGTTCTTGCCGTCACGTACTGCATTAAGCAG
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TATGTCACGAAATTTTTCTGGTGGGAAGCTGGTTACTGGAACTCCATGGATATCGCACAT
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DS 

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TTTGCTGGGGTTGTCTAGTGTGGGTGCCTTCTATTTATACCTCTCCAGGCATGTACCTTG
TGAACCACCCCGTCGAACTTGGAACTCAGTTGGCAATATACATTCTGGTGGCGGGGATTC
TTTGCATTTACATAAACTATGACTGCGATAGACAAAGGCAAGAGTTCAGGAGGACAAATG
GGAAATGCTCGGTTTGGGGCAAAGCACCGTCAAAGATTGTGGCAACATATAAGACAACGG
CTGGTGAAACTAAAACCAGTCTTCTCTTAACCTCTGGATGGTGGGGATTGGCTCGACATT
TCCATTATGTTCCTGAGATCTTAAGTTCTTTCTTCTGGACCGTACCAGCTCTCTTTAGTA
ACTTCTTGCCATACTTCTATGTCATATTCCTCACTATTCTTCTGTTTGATCGAGCCAAGA
GAGACGATGACCGATGCCGATCAAAGTATGGGAAATATTGGAAGCTGTATTGCGAAAAAG
TGCGATACAGGATTGTTCCTGGTATTTATTGATAGTCTGAGTTGTCTTCTCTGCTTTTGG
TTCGTTCATTCAAACGTTACAATCATCCAAAGACCAAATAGATATTTGTTTTGCTGATCT
GTAAGCTACTCTTGAATTTCTAGCCATGGGTTTCTTCTCC

QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

CO CL7733Contig1 458 2 2 U
GGCTTCTATCTCTGTGCCGAAACCGGCTTTCGATAACTGTTCACGAAAAAAGCGATTGAA
AGTTTAGTAGATCGGGGGAAGATCTGGGTTTAATCGATTTACATGTGGGATTGGTTTTCG
TAGATTGGGGAGGTTTAGATGTAGGGTTCAACCGATGTGTGTACTAGTGTACAGACGAGA
CTTACTTGATTTGCAGAGGACCGAAGCGCCGACGACGGACCGGATTTGACGGCGATGCGG
AGGCGACCAGGGAAAGAGCATTGCTTTTCAGCCATCTCCAAATTCGGAGCAAGGTGGGCA
AACGAGCTCTAATATTTGATCAAAGGAACAAAATAGAAGTCAACAAAAAAATTTAGATTA
GCGTTTTGCATATGTACACTTTTGTAGATGTCCACATGTACGCTTGTTTGTAGATATCCA
CATGTACGCTTGTTTGTAGTTATCCACATGTACACTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C419TF U 1
AF RS1C419JQ C 16
BS 1 181 RS1C419TF
BS 182 458 RS1C419JQ

RD RS1C419TF 181 0 0
GGCTTCTATCTCTGTGCCGAAACCGGCTTTCGATAACTGTTCACGAAAAAAGCGATTGAA
AGTTTAGTAGATCGGGGGAAGATCTGGGTTTAATCGATTTACATGTGGGATTGGTTTTCG
TAGATTGGGGAGGTTTAGATGTAGGGTTCAACCGATGTGTGTACTAGTGTACAGACGAGA
C

QA 1 181 1 181
DS 

RD RS1C419JQ 443 0 0
GCCGAAACCGGCTTTCGATAACTGTTCACGAAAAAAGCGATTGAAAGTTTAGTAGATCGG
GGGAAGATCTGGGTTTAATCGATTTACATGTGGGATTGGTTTTCGTAGATTGGGGAGGTT
TAGATGTAGGGTTCAACCGATGTGTGTACTAGTGTACAGACGAGACTTACTTGATTTGCA
GAGGACCGAAGCGCCGACGACGGACCGGATTTGACGGCGATGCGGAGGCGACCAGGGAAA
GAGCATTGCTTTTCAGCCATCTCCAAATTCGGAGCAAGGTGGGCAAACGAGCTCTAATAT
TTGATCAAAGGAACAAAATAGAAGTCAACAAAAAAATTTAGATTAGCGTTTTGCATATGT
ACACTTTTGTAGATGTCCACATGTACGCTTGTTTGTAGATATCCACATGTACGCTTGTTT
GTAGTTATCCACATGTACACTTG

QA 1 443 1 443
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7735Contig1 465 2 2 U
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AAGCAAATCCACGAGATCAAGGACTTTCTTCTGACAGCTAGAAGGAAGGATGCTCGGTCT
GTGAAGATCAAGAGAAGCAAAGACATTGTCAAGTTCAAGGTCAGATGCTCAAAGTACCTC
TACACGCTCTGCGTCTTCGACCAAGAGAAAGCCGACAAGCTTAAGCAGTCTCTTCCTCCA
GGTTTGAGTGTGCAAGACCTTTGAAGATGATGAATCCATATGAGAATATGTTTTTGTTTA
CTTCAGCTATTGTTCAAACTTTTTCGAGTAGGACTATGTTTTCTAAATTTTTCTCTCTCT
ATTGATTCTGTTTTTTTTTTCTATTACGTATCGATTTAATGCCTCTACGGTTAATTACAA
TCCTTAGATGTTGGTGTCCTTGATCTCAACATCTCTCTGAACTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1D530JQ C 1
AF RS1D530TF U 163
BS 1 162 RS1D530JQ
BS 163 465 RS1D530TF

RD RS1D530JQ 465 0 0
GGGGTTCTTGCTCTCTACGTGGACGGCGGCTAGGTTCAAACAACAGATCCGACAATGCCT
AAGCAAATCCACGAGATCAAGGACTTTCTTCTGACAGCTAGAAGGAAGGATGCTCGGTCT
GTGAAGATCAAGAGAAGCAAAGACATTGTCAAGTTCAAGGTCAGATGCTCAAAGTACCTC
TACACGCTCTGCGTCTTCGACCAAGAGAAAGCCGACAAGCTTAAGCAGTCTCTTCCTCCA
GGTTTGAGTGTGCAAGACCTTTGAAGATGATGAATCCATATGAGAATATGTTTTTGTTTA
CTTCAGCTATTGTTCAAACTTTTTCGAGTAGGACTATGTTTTCTAAATTTTTCTCTCTCT
ATTGATTCTGTTTTTTTTTTCTATTACGTATCGATTTAATGCCTCTACGGTTAATTACAA
TCCTTAGATGTTGGTGTCCTTGATCTCAACATCTCTCTGAACTTT

QA 1 465 1 465
DS 

RD RS1D530TF 303 0 0
AGATGCTCAAAGTACCTCTACACGCTCTGCGTCTTCGACCAAGAGAAAGCCGACAAGCTT
AAGCAGTCTCTTCCTCCAGGTTTGAGTGTGCAAGACCTTTGAAGATGATGAATCCATATG
AGAATATGTTTTTGTTTACTTCAGCTATTGTTCAAACTTTTTCGAGTAGGACTATGTTTT
CTAAATTTTTCTCTCTCTATTGATTCTGTTTTTTTTTTCTATTACGTATCGATTTAATGC
CTCTACGGTTAATTACAATCCTTAGATGTTGGTGTCCTTGATCTCAACATCTCTCTGAAC
TTT

QA 1 303 1 303
DS 



AS 1 2

CO CL7736Contig1 815 2 6 U
GGGTGACAGTGTCGATTCAGAATTCCCTCACCATAACAGTCTGAGTTAAGAGTCCGTGTT
TAATTCCCTCACCACTATGTCGTCTTCAATGTTCTTCTTCGATCTGAGAGGCGGTGATGT
TACAGTATAAATAGATCAATATCCAAACTGGAGAAGAAGAAGCTACTGTGAAACTGTATC
AAACTCAGCAGACTGCTATTGACAAGTTCATGGTCTATGAACTGATAAAAACGAGTGGGA
TTGGTGCAATCAAAAGGCGATTCAAGGGAAAATCATGTTTTATGTATTTACTTAGTAATG
AAAGAAGATTTTAACAGAAGGGTCACTGGTATCAAGATGGACAAAGATGGTGTTACGTTT
CTTGCTCCAACTGTACTAAGAAGCTTCAACGGACTGTCTCAGCCTTTTCCGTCTGCACTG
CATCATCAAACTTTCATAATCTCACGCATCCTTAGCCAAGGTGACCGTATGCCACTCTCT
GCCTTTGTTGATGATGGAGCAGCAATGACAATGGAGATGATATATGCTCGGTGCCATCTC
GGTACCTACTAAGGTGGACACGGGTGGTAGTACATTTCAGGAAGCATCGACTACATGAGC
AGCTCCAAGCGGTGTCAACACAAAGAAGCCTCCAGCGCAAACAGTTTCCAAGATGGGAAA
GAAAACACGCATGTCATAGGTTAAGACAATGACAGCGGTTAAGATGAGCATTGGACACAG
TATTTCATCTTTGAACAATGCTAATGCATTAATATTTTTTTTTGAACAAGCATGTTTTTG
TTCTCACGTTCTGCTTAAAAGAAAGAGGTTCATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CF63TF U 1
AF RS1CF63JQ C 52
BS 1 679 RS1CF63TF
BS 680 680 RS1CF63JQ
BS 681 734 RS1CF63TF
BS 735 737 RS1CF63JQ
BS 738 761 RS1CF63TF
BS 762 815 RS1CF63JQ

RD RS1CF63TF 763 0 0
GGGTGACAGTGTCGATTCAGAATTCCCTCACCATAACAGTCTGAGTTAAGAGTCCGTGTT
TAATTCCCTCACCACTATGTCGTCTTCAATGTTCTTCTTCGATCTGAGAGGCGGTGATGT
TACAGTATAAATAGATCAATATCCAAACTGGAGAAGAAGAAGCTACTGTGAAACTGTATC
AAACTCAGCAGACTGCTATTGACAAGTTCATGGTCTATGAACTGATAAAAACGAGTGGGA
TTGGTGCAATCAAAAGGCGATTCAAGGGAAAATCATGTTTTATGTATTTACTTAGTAATG
AAAGAAGATTTTAACAGAAGGGTCACTGGTATCAAGATGGACAAAGATGGTGTTACGTTT
CTTGCTCCAACTGTACTAAGAAGCTTCAACGGACTGTCTCAGCCTTTTCCGTCTGCACTG
CATCATCAAACTTTCATAATCTCACGCATCCTTAGCCAAGGTGACCGTATGCCACTCTCT
GCCTTTGTTGATGATGGAGCAGCAATGACAATGGAGATGATATATGCTCGGTGCCATCTC
GGTACCTACTAAGGTGGACACGGGTGGTAGTACATTTCAGGAAGCATCGACTACATGAGC
AGCTCCAAGCGGTGTCAACACAAAGAAGCCTCCAGCGCAAACAGTTTCCAAGATGGGAAA
GAAAACACGCATGTCATAG*TTAAGACAATGACAGCGGTTAAGATGAGCATTGGACACAG
TATTTCATCTTTGAC**ATGCTAATGCATTAATATTTTTTT
GA

QA 1 761 1 761
DS 

RD RS1CF63JQ 764 0 0
GTCCGTGTTTAATTCCCTCACCACTATGTCGTCTTCAATGTTCTTCTTCGATCTGAGAGG
CGGTGATGTTACAGTATAAATAGATCAATATCCAAACTGGAGAAGAAGAAGCTACTGTGA
AACTGTATCAAACTCAGCAGACTGCTATTGACAAGTTCATGGTCTATGAACTGATAAAAA
CGAGTGGGATTGGTGCAATCAAAAGGCGATTCAAGGGAAAATCATGTTTTATGTATTTAC
TTAGTAATGAAAGAAGATTTTAACAGAAGGGTCACTGGTATCAAGATGGACAAAGATGGT
GTTACGTTTCTTGCTCCAACTGTACTAAGAAGCTTCAACGGACTGTCTCAGCCTTTTCCG
TCTGCACTGCATCATCAAACTTTCATAATCTCACGCATCCTTAGCCAAGGTGACCGTATG
CCACTCTCTGCCTTTGTTGATGATGGAGCAGCAATGACAATGGAGATGATATATGCTCGG
TGCCATCTCGGTACCTACTAAGGTGGACACGGGTGGTAGTACATTTCAGGAAGCATCGAC
TACATGAGCAGCTCCAAGCGGTGTCAACACAAAGAAGCCTCCAGCGCAAACAGTTTCCAA
GATGGGAAAGAAAACACGCATGTCATAGGTTAAGACAATGACAGCGGTTAAGATGAGCAT
TGGACACAGTATTTCATCTTTGAACAATGCTAATGCATTAATATTTTTTTTTGAACAAGC
ATGTTTTTGTTCTCACGTTCTGCTTAAAAGAAAGAGGTTCATCT

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL7737Contig1 696 2 1 U
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CAGTTCCAGGACAATTGATCTGGGAGATCGTTAAGACCAACAACTGTTTCTTGGTCAAAC
AGTTCGGACGAGGCAACGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAAGAGAAGAACAATCTCTGCAACC
TTAACTCCTACAAGCACTCTGGCCTTGCAAACAAGAAGACAGTGACCATCCAGCCAGCTG
ACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAAGAAGCAGAACAAGCCTAAGG
TCTCTGTCAACAAGTCTATCCTGAAGAAGGAATTCCCCAGGATGTCCAAGGCTGTTGCTA
ACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAAATTCGCTCTTGCAAGACTCA
GTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGCCAAGCAAAGAAACCGTCAAG
CTTAAGCTTTTTCCAGAATGTTCTTTTTTTTTTATGGAAGTTAAAGATTACGTTGAACAT
GTTTTATCTGAGTTGTTTTGTTGAATCATAACACTGCTCCTAACTCCTTTTCAAAAGGAG
TTAGTTTTCCTTGTGCTTATGATTTAGTGTGTGTTTTGTTGGATCTATTTTGTCAAATCA
AGAACTTGATAAAACCTCTACTAGTCTTGTCCAACG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1B393JQ C 1
AF RS1B393TF U 1
BS 1 696 RS1B393TF

RD RS1B393JQ 696 0 0
GGGTCTTGCTCTCACTACCTCTGTCTCTCTCCGCGAAATTTCACGGTTTGGAAATGGCGA
CAGTTCCAGGACAATTGATCTGGGAGATCGTTAAGACCAACAACTGTTTCTTGGTCAAAC
AGTTCGGACGAGGCAACGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAAGAGAAGAACAATCTTTGCAACC
TTAACTCCTACAAGCACTCTGGCCTTGCAAACAAGAAGACAGTGACCATCCAGCCAGCTG
ACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAAGAAGCAGAACAAGCCTAAGG
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ACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAAATTCGCTCTTGCAAGACTCA
GTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGCCAAGCAAAGAAACCGTCAAG
CTTAAGCTTTTTCCAGAATGTTTTTTTTTTTTTATGGAAGTTAAAGATTACGTTGAACAT
GTTTTATTTGAGTTGTTTTGTTGAATCATAACACTGCTCCTAACTCCTTTTCAAAAGGAG
TTAGTTTTCCTTGTGCTTATGATTTAGTGTGTGTTTTGTTGGATCTATTTTGTCAAATCA
AGAACTTGATAAAACCTCTACTAGTCTTGTCCAACG

QA 1 696 1 696
DS 

RD RS1B393TF 696 0 0
GGGTCTTGCTCTCACTACCTCTGTCTCTCTCCGCGAAATTTCACGGTTTGGAAATGGCGA
CAGTTCCAGGACAATTGATCTGGGAGATCGTTAAGACCAACAACTGTTTCTTGGTCAAAC
AGTTCGGACGAGGCAACGCTAAGGTTCAGTTCAGCAAAGAGAAGAACAATCTCTGCAACC
TTAACTCCTACAAGCACTCTGGCCTTGCAAACAAGAAGACAGTGACCATCCAGCCAGCTG
ACAAGGAACAAGGTGTTGTCCTCGCCACCACCAAGACCAAGAAGCAGAACAAGCCTAAGG
TCTCTGTCAACAAGTCTATCCTGAAGAAGGAATTCCCCAGGATGTCCAAGGCTGTTGCTA
ACCAGGTGGTTGACAACTACTACAGGCCAGACTTGAAGAAATTCGCTCTTGCAAGACTCA
GTGTCATCAGCAAAAGCATTAGGGTTGCCAAGTCCGGTGCCAAGCAAAGAAACCGTCAAG
CTTAAGCTTTTTCCAGAATGTTCTTTTTTTTTTATGGAAGTTAAAGATTACGTTGAACAT
GTTTTATCTGAGTTGTTTTGTTGAATCATAACACTGCTCCTAACTCCTTTTCAAAAGGAG
TTAGTTTTCCTTGTGCTTATGATTTAGTGTGTGTTTTGTTGGATCTATTTTGTCAAATCA
AGAACTTGATAAAACCTCTACTAGTCTTGTCCAACG

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL7738Contig1 804 2 14 U
GGGCAGAGACAAAACCTACTAGAACAATCCTTTTCTCTCTCTCTCGCTTGACTTCTCTCA
CAGCGATGGTTACTTCTCAAACGAACTCATCAATCAAATTCCTCTGTAGCTATGGCGGGA
AGATTCTACCTCGCTATCCCGACGGCAAACTCCGTTATAACGGCGGCCACACCCGCGTCC
TCGCCGTTCCCCGCTCCGTCTCATTCTCCCAGCTATCATCGAAGATGGCGGAGATGTGCG
GATCCACCGTCACAATCCGGTGCCAGCTTCCGACGGAAGATCTCGACGCGCTCGTTTCCG
TTACTTCCGACGAAGATCTGGCGAATCTGATCGAAGAGTACGACCTCGTCTCCTCCTCGT
CGCCGCCGATGAAGATCAGAGTCTTCTTAAATCCGCCGAAATCCGCGACGATCGCGCCTC
CTCCGCAGTTAGCGTTGCCGTCGTCGTCGACCACGTCGTCATCATCATCATCTTCCTCCA
ATTCGTCCAGTCCTGGATCTCCGTTGACGTCGAAACCGCCGCTACCTCCGTCTCCGCCGA
GGTTAACAATGGTGAAGAATCAGTGTTACGGTTGTTACGTCGTCCACCGTAACTCGAGGA
ATATGTACCTCGTCCACAACGGGAATCACTGGCAATAACCGTAATTAACCGTCAGATTCA
AAAAAAGAATAACGAAGAATCGAATATATACATAAAGAAAAAGGTTTTTGTTTAAAAATG
TAAAGAGAGATATAAAATGTGCTAAGTGATCTCTCTATGACGATCAATGACCGTCGCCAT
TAATGAAATCATCCTAATGCTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BQ03TF U 1
AF RS1BQ03JQ C 44
BS 1 665 RS1BQ03TF
BS 666 666 RS1BQ03JQ
BS 667 683 RS1BQ03TF
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BS 746 759 RS1BQ03TF
BS 760 804 RS1BQ03JQ

RD RS1BQ03TF 759 0 0
GGGCAGAGACAAAACCTACTAGAACAATCCTTTTCTCTCTCTCTCGCTTGACTTCTCTCA
CAGCGATGGTTACTTCTCAAACGAACTCATCAATCAAATTCCTCTGTAGCTATGGCGGGA
AGATTCTACCTCGCTATCCCGACGGCAAACTCCGTTATAACGGCGGCCACACCCGCGTCC
TCGCCGTTCCCCGCTCCGTCTCATTCTCCCAGCTATCATCGAAGATGGCGGAGATGTGCG
GATCCACCGTCACAATCCGGTGCCAGCTTCCGACGGAAGATCTCGACGCGCTCGTTTCCG
TTACTTCCGACGAAGATCTGGCGAATCTGATCGAAGAGTACGACCTCGTCTCCTCCTCGT
CGCCGCCGATGAAGATCAGAGTCTTCTTAAATCCGCCGAAATCCGCGACGATCGCGCCTC
CTCCGCAGTTAGCGTTGCCGTCGTCGTCGACCACGTCGTCATCATCATCATCTTCCTCCA
ATTCGTCCAGTCCTGGATCTCCGTTGACGTCGAAACCGCCGCTACCTCCGTCTCCGCCGA
GGTTAACAATGGTGAAGAATCAGTGTTACGGTTGTTACGTCGTCCACCGTAACTCGAGGA
ATATGTACCTCGTCCACAACGGGAATCACTGGCAATAACCGTAATTAACCGTCAGATTCA
AAAAA*GAATAACGAAGAATCGA*TATATACATAAAGAAAAAG**TTTTGTTTAAAA*TG
TAAAGAGAGATATAAA*TGTGCTA*GTGATCTCTCTATG

QA 1 759 1 759
DS 

RD RS1BQ03JQ 761 0 0
TCGCTTGACT*CTCTCACAGCGATGGTTACTTCTCAAACGAACTCATCAATCAAATTCCT
CTGTAGCTATGGCGGGAAGATTCTACCTCGCTATCCCGACGGCAAACTCCGTTATAACGG
CGGCCACACCCGCGTCCTCGCCGTTCCCCGCTCCGTCTCATTCTCCCAGCTATCATCGAA
GATGGCGGAGATGTGCGGATCCACCGTCACAATCCGGTGCCAGCTTCCGACGGAAGATCT
CGACGCGCTCGTTTCCGTTACTTCCGACGAAGATCTGGCGAATCTGATCGAAGAGTACGA
CCTCGTCTCCTCCTCGTCGCCGCCGATGAAGATCAGAGTCTTCTTAAATCCGCCGAAATC
CGCGACGATCGCGCCTCCTCCGCAGTTAGCGTTGCCGTCGTCGTCGACCACGTCGTCATC
ATCATCATCTTCCTCCAATTCGTCCAGTCCTGGATCTCCGTTGACGTCGAAACCGCCGCT
ACCTCCGTCTCCGCCGAGGTTAACAATGGTGAAGAATCAGTGTTACGGTTGTTACGTCGT
CCACCGTAACTCGAGGAATATGTACCTCGTCCACAACGGGAATCACTGGCAATAACCGTA
ATTAACCGTCAGATTCAAAAAAAGAATAACGAAGAATCGAATATATACATAAAGAAAAAG
GTTTTTGTTTAAAAATGTAAAGAGAGATATAAAATGTGCTAAGTGATCTCTCTATGACGA
TCAATGACCGTCGCCATTAATGAAATCATCCTAATGCTTTT

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL7739Contig1 1088 2 2 U
GGACGAAAGTGAGGAAAAGAGTAGATAAAAAGAGAAGGGATTTCAAATTGAAAGGGACGT
CTGAGACCGGAGACCAAAGCTTCAAGCATCTCAATGGCGTCTCCCTATTGTCCTCCGATG
ATGAAGAAGCTCATGATCTTCTTTTTATCTACTCTACTTCTCACTAATATCGTAAACTCG
GAAACGCAGTGTCGGCGTTTCAAGTCGATCATCAGTTTCGGTGATTCCATTGCCGACACA
GGAAACTTGCTCGGCCTCTCTGATCCTAACCATCTCCCTCACGTGGCGTTTCCTCCGTAC
GGAGAGACCTTCTTTCACCATCCCACTGGCCGTTTCTCAAACGGTCGGCTCATCATCGAT
TTCATTGCTGAATTCTTGGGGTTTCCGCTTGTGCCTTCTTTTTATGGATCACAAAACGCA
AACTTTGAAAAGGGAGTTAACTTCGCGGTAGGGGGAGTTTCCCCTTGGATGCCCAGTAAC
CTACTTGACATTATATCAAACATCAAACAAGGAAGAATACGACCCTTCAGGTTGTTTGAA
ATGGTTGAACAAGTTTGCAAAATACCACAGTGACCAGCTTCAAGCGGAAATCAACAAGCT
CCAGGAGATGTACCCTCATGTCAACATCATCTACGCTGACTACTATAATGCTCTGTTACG
CCTTTTTCAAGAACCAGAGAAATTTGGGTTCACAGACAGACCCTTGCACGCTTGCTGCGG
TTTTGGAGGACCGTATAACTTCACATTTGGTAGGAAATGTGGCTTTAAAGGAGTGGAATC
TTGTAGTGATCCTTCAAAGTATGTTTGTTGGGATGGTGTCCATATGACTGAGGCTGCATA
CCAGTTGATGGCTGAGGGTATACTTAAGGGACCCTATGCTATTCCACCTTTCGATTGGTC
TTGCCTCAGCTCAGAAATTAAGAACAATGGATCATCTGATGCAAAGTATTCTTTAATGAT
CCACTGATATAACTTGGTCTGAAAATTTGAGAGAGAGAGAAGAATGCATACTGATAAAAA
CATGTATGTTCTTTAGCGCTTATGTTGGATCATGTTTTGTATTATTAAAAAAATTGTATT
GTGTTACG


BQ
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CCTTTTT

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DS 

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AAGAATGCATACTGATAAAAACATGTATGTTCTTTAGCGCTTATGTTGGATCATGTTTTG
TATTATTAAAAAAATTGTATTGTGTTACG

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 2

CO CL7740Contig1 1122 2 2 U
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ATCTGGTTTATTGTGATTGAGATCTCTTAAGTCTTGTGATCATGAATTATCTTCTTGGAG
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TCACTTCCTTGGTTCGTGAATTGGATGTCCCTGGAGATATATACGAGAGAAAGACATACC
CTTTTGAATTTCCAACTGTCGAGATGCCATATGATACATACAATGGTGTCAATGTGCGGC
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CTGTAAGACTGTTTCTTGCCCCGTACGATCTTACACCAACGCATCGCAACATCAACAACA
AATTCAGCGTCAAGTATTATCTGAATCTTGTACTGGTCGATGAAGAGGATCGCAGATACT
TCAAGCAGCAAGAAATCACGTTGTACAGGTTGAAGGCAGACACATCATCTGTTTGAGTCT
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TGGAAGTTGGAATGAATAGTTTGGTCATTGATCAAAGTTGTC


BQ
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BS 541 1122 RS1GQ11JQ

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ATCTGGTTTATTGTGATTGAGATCTCTTAAGTCTTGTGATCATGAATTATCTTCTTGGAG
CATTCAAACCCGCCTGCAATGTTTCAATCACTTTTTCTGATGGCAAAAATCGTAAACAGG
TACCCATGAAGAAAGAAAATGGTCAAACAGCTTTGGTGCCACTTTTCCAGAGTCAAGAAA
CTCTTTCCGGGAAGGTTTGCATTGAACCATATCAAGGGAAAAAGGTGGAGCATAATGGTG
TCAAAGTTGAGCTTCTTGGTCAAATAGAAATGTACTTTGACAGAGGAAACTTCTATGACT
TCACTTCCTTGGTTCGTGAATTGGATGTCCCTGGAGATATATACGAGAGAAAGACATACC
CTTTTGAATTTCCAACTGTCGAGATGCCATATGATACATACAATGGTGTCAATGTGCGGC
TAAGATATGTCCTCAAAGTTACCGTCACCCGTGGCTACGCTGGAAGCATCGTGGAATACC

QA 1 540 1 540
DS 

RD RS1GQ11JQ 641 0 0
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GGAATTCATGGTTCGGAACTATGCTCCACCTCCTCCAATTAATAACAGCATCAAGATGGA
AGTTGGGATAGAGGATTGCCTGCACATCGAGTTTGAGTACAACAAAAGCAAGTATCACCT
AAAAGATGTCATCCTTGGCAAAATATATTTTCTTCTTGTGAGGATCAAGATGAAGAATAT
GGATCTTGAGATCAGGAGGCGAGAATCAACAGGTGCTGGTGCTAATACTCATGTCGAGAC
AGAAACACTTGCGAAATTTGAGTTGATGGACGGAACCCCAGTTAGAGGTGAGTCGATACC
TGTAAGACTGTTTCTTGCCCCGTACGATCTTACACCAACGCATCGCAACATCAACAACAA
ATTCAGCGTCAAGTATTATCTGAATCTTGTACTGGTCGATGAAGAGGATCGCAGATACTT
CAAGCAGCAAGAAATCACGTTGTACAGGTTGAAGGCAGACACATCATCTGTTTGAGTCTT
TGTGTAAAGCCTTTTAGACTTTGTGTACTCAGATTTTAGCCAAAGACTGTTATTTGAGTT
GGAAGTTGGAATGAATAGTTTGGTCATTGATCAAAGTTGTC

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

CO CL7741Contig1 808 2 3 U
GGGAGAGAAGACACTGCTAAGTTCTCTGGTTTCCTCTTGATAACAATCCTGCTATGTACA
GGTTCAGCAACACAGTGATTGGGGTCTTAAACCTCCTCAGCTTACTAGCTTCGATACCAA
TCATAGGAACCGCTCTATGGAAGGCAAGAAGCAGCACAACTTGCAAGAACTTCCTCCAGA
CGCCGCTACTCGTTATAGGATTCGTCATACTATTAGTATCCCTTGCTGGTTTCATAGGAG
CCTGTTTCCACGTGGCATGGGCTCTTTGGGTGTACTTAGTTGTCATGATCTTCCTCATAG
CGACTCTCATGGGGTTAACTCTGTTTGGTCTGGTGGTGACCAGCCAAGGAGGCGGTGTGG
AAGTACCAGGGAGGGTTTATAAAGAGTATAGGCTTGGAGATTATCATCCATGGTTGAGAG
AGAGAGTTAGAGATCAAGAGTATTGAAACGTTTTGCTACGAGTGTGATGCTTGTAAAGCT
GGTGTTCTTGAAGAGATCCGTCTCGACTGGAGAAAGTTGTCGGTCGTCAACATTCTAGTC
CTAGTCCTCCTCATCGCCGTCTACGCTGCAGGTTGCTGCGCCTTCCACAACACTCGCCAC
GCAGCTCATCCTTATCATCCTTCTGATGATAACCGCATGACCAAAGTCCGTCCTCGTTGG
GACTATTATTGGTGGAGATGGTGGCATGAAAAGAAAGAACAGCTTTACTGAGAGCCTCGT
AGTCTTTGTTTTTCTTCTTCTTTTCATCATATTTTTCTATTTACCAACTTGAGATCAAGA
AAACACAAAGATAAGAAATGTTGACACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AJ31TF U 283
AF RS1AJ31JQ C 1
BS 1 282 RS1AJ31JQ
BS 283 669 RS1AJ31TF
BS 670 808 RS1AJ31JQ

RD RS1AJ31TF 387 0 0
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GCCAAGGAGGCGGTGTGGAAGTACCAGGGAGGGTTTATAAAGAGTATAGGCTTGGAGATT
ATCATCCATGGTTGAGAGAGAGAGTTAGAGATCAAGAGTATTGAAACGTTTTGCTACGAG
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AAAGTCCGTCCTCGTTGGGACTATTAT

QA 1 387 1 387
DS 

RD RS1AJ31JQ 808 0 0
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GGTTCAGCAACACAGTGATTGGGGTCTTAAACCTCCTCAGCTTACTAGCTTCGATACCAA
TCATAGGAACCGCTCTATGGAAGGCAAGAAGCAGCACAACTTGCAAGAACTTCCTCCAGA
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CCTGTTTCCACGTGGCATGGGCTCTTTGGGTGTACTTAGTTGTCATGATCTTCCTCATAG
CGACTCTCATGGGGTTAACTCTGTTTGGTCTGGTGGTGACCAGCCAAGGAGGCGGTGTGG
AAGTACCAGGGAGGGTTTATAAAGAGTATAGGCTTGGAGATTATCATCCATGGTTGAGAG
AGAGAGTTAGAGATCAAGAGTATTGAAACGTTTTGCTACGAGTGTGATGCTTGTAAAGCT
GGTGTTCTTGAAGAGATCCGTCTCGACTGGAGAAAGTTGTCGGTCGTCAACATTCTAGTC
CTAGTCCTCCTCATCGCCGTCTACGCTGCAGGTTGCTGCGCCTTCCACAACACTCGCCAC
GCAGCTCATCCTTATCATCCTTCTGATGATAACCGCATGACCAAAGTCCGTCCTCGTTGG
GACTATTATTGGTGGAGATGGTGGCATGAAAAGAAAGAACAGCTTTACTGAGAGCCTCGT
AGTCTTTGTTTTTCTTCTTCTTTTCATCATATTTTTCTATTTACCAACTTGAGATCAAGA
AAACACAAAGATAAGAAATGTTGACACT

QA 1 808 1 808
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL7744Contig1 696 2 1 U
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AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTTAAAGGAAACGACTTTGTTGTTGAAGGTCTGTATGGGTA
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ATTCTGATAGGTGGTCTAATGCTGGATGTGCTAATATCCATCACACTTGGTGTGTCTGCG
CTTCCGGTTAACATAATCATTGGAGTGATAGTGGTGCTAGGGCTAGGAACAGCACTAAGG
CTGACATTGGAGTTCTGCTACGAGTGGAGCTTGAGAAGAGCGGTTCAGAGGGCAGTTCAG
AGGAGTGAAACAGTCTTTAATAACATTGCATATCCACCTGCCTTGTAAGAGATAAATGTC
AAGCTGGGAACATCTTGTGTGTGTGTTAGTGTGTTATGTAAAAAAGTTGTGTGAAGAAGA
CAAAGTGTGATTGTTTTTACATACAATGCTGAATTCCTTGGGAGCGTCAACTTTTGTGTA
GCTTAAAGCTTTTACAAAATTAGTATTAACCCCAAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AD44JQ C 1
AF RS1AD44TF U 1
BS 1 696 RS1AD44TF

RD RS1AD44JQ 696 0 0
CGACAGAGAGGCTGAAGAAAAAAAAACACCTTTTGTTTTTTGTTTTTTTCGATTCACAAC
ATCTGTGTGCTCTGCTCTACTCCTCCTCCTCCGATTTCATACGTATTGAATCTGAAACGG
AAGCGCTTCTATGTTCAAAGCTTTAGTTTTGTTCTAGCTTCAGTTAACTGGAAGGGAGGG
AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTTAAAGGAAACGACTTTGTTGTTGAAGGTCTGTATGGGTA
CCTAGGAGAAGAAGGAACTTTTTGTTGTGGAAGGCAAGGATCAGATGCATAGCATTCTCA
ATTCTGATAGGTGGTCTAATGCTGGATGTGCTAATATCCATCACACTTGGTGTGTCTGCG
CTTCCGGTTAACATAATCATTGGAGTGATAGTGGTGCTAGGGCTAGGAACAGCACTAAGG
CTGACATTGGAGTTCTGCTACGAGTGGAGCTTGAGAAGAGCGGTTCAGAGGGCAGTTCAG
AGGAGTGAAACAGTCTTTAATAACATTGCATATCCACCTGCCTTGTAAGAGATAAATGTC
AAGCTGGGAACATCTTGTGTGTGTGTTAGTGTGTTATGTAAAAAAGTTGTGTGAAGAAGA
CAAAGTGTGATTGTTTTTACATACAATGCTGAATTCCTTGGGAGCGTCAACTTTTGTGTA
GCTTAAAGCTTTTACAAAATTAGTATTAACCCCAAT

QA 1 696 1 696
DS 

RD RS1AD44TF 696 0 0
CGACAGAGAGGCTGAAGAAAAAAAAACACCTTTTGTTTTTTGTTTTTTTCGATTCACAAC
ATCTGTGTGCTCTGCTCTACTCCTCCTCCTCCGATTTCATACGTATTGAATCTGAAACGG
AAGCGCTTCTATGTTCAAAGCTTTAGTTTTGTTCTAGCTTCAGTTAACTGGAAGGGAGGG
AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTTAAAGGAAACGACTTTGTTGTTGAAGGTCTGTATGGGTA
CCTAGGAGAAGAAGGAACTTTTTGTTGTGGAAGGCAAGGATCAGATGCATAGCATTCTCA
ATTCTGATAGGTGGTCTAATGCTGGATGTGCTAATATCCATCACACTTGGTGTGTCTGCG
CTTCCGGTTAACATAATCATTGGAGTGATAGTGGTGCTAGGGCTAGGAACAGCACTAAGG
CTGACATTGGAGTTCTGCTACGAGTGGAGCTTGAGAAGAGCGGTTCAGAGGGCAGTTCAG
AGGAGTGAAACAGTCTTTAATAACATTGCATATCCACCTGCCTTGTAAGAGATAAATGTC
AAGCTGGGAACATCTTGTGTGTGTGTTAGTGTGTTATGTAAAAAAGTTGTGTGAAGAAGA
CAAAGTGTGATTGTTTTTACATACAATGCTGAATTCCTTGGGAGCGTCAACTTTTGTGTA
GCTTAAAGCTTTTACAAAATTAGTATTAACCCCAAT

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL7745Contig1 617 2 1 U
GACACTTGACATCATTCACTACTAATCAACAAAAGAAAAACAAGATGTGGGATGAAACTG
TAGCTGGACCTAAGCCGGAGCATGGCCTTGGCCGCCTCCGCAACAAGATTAACGCCCAAC
CCATTGACATCAAAGGTGCAGGAGAAGGGAGCAGCAGCAAGGCTATGCCTGCGGTGGCCG
GGAGTCCTGGAACTCCAACGACGCCAGGATCGGCACGTAAAGAGAACGTGTGGAGGAGTG
TGTTTCATCCAGGAAGTAACATCGCCACCAGAGGAATGGGCACCAACCTTTTCGACAAGC
CCTCTCACCCAAACGCTCCCACCGTCTACGACTGGTTGTACAGCGACGATACTAGGAGCC
AGCACCGTTGAGCCGATACCGAGAGGGTGAAGTGCATGCCGGTGATGTAGTATATCCTGT
TTCCATTAGCCACGTGTTTAATTTCAGTTTATGGCTGTATTCGCAACCTTTTTTCTTTGT
TTGTTGTTGTTAGTGACCGTTTGATTTCCACCATCTGGGTTGGTTTTTAACGGTGGTAAT
GCGTCCTCTTGTCTCTTTTAATGTTTCTACTGTTTCATAATGGATATATTTAACTTTTAG
CTTCGAATGATTCAACT


BQ
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AF RS1GJ08JQ C 1
AF RS1GJ08TF U 1
BS 1 617 RS1GJ08TF

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DS 

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GACACTTGACATCATTCACTACTAATCAACAAAAGAAAAACAAGATGTGGGATGAAACTG
TAGCTGGACCTAAGCCGGAGCATGGCCTTGGCCGCCTCCGCAACAAGATTAACGCCCAAC
CCATTGACATCAAAGGTGCAGGAGAAGGGAGCAGCAGCAAGGCTATGCCTGCGGTGGCCG
GGAGTCCTGGAACTCCAACGACGCCAGGATCGGCACGTAAAGAGAACGTGTGGAGGAGTG
TGTTTCATCCAGGAAGTAACATCGCCACCAGAGGAATGGGCACCAACCTTTTCGACAAGC
CCTCTCACCCAAACGCTCCCACCGTCTACGACTGGTTGTACAGCGACGATACTAGGAGCC
AGCACCGTTGAGCCGATACCGAGAGGGTGAAGTGCATGCCGGTGATGTAGTATATCCTGT
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CTTCGAATGATTCAACT

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 2

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T


BQ
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10 

AF RS1E773JQ U 1
AF RS1E213JQ U 31
BS 1 257 RS1E773JQ
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BS 567 739 RS1E773JQ
BS 740 781 RS1E213JQ

RD RS1E773JQ 739 0 0
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TCTCTGATCATACTTATAACTCCTTCCTTGATTCCAAATCTACCTTAGACTTAATAGGAG
CTTTCTCAAGTAGCTTAGAGAGCCACTTAGCAGATTGTTTCTCGTGCCTTTCCAAGTTGT
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CATGTAATGCCATGAGATGTCTCATATGATAATACTTCCTGTTACTGTCGCTGAGCGCAT
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CCGGATCATTATAGTTCTCTTTGATGTACTTCAAAACCTTTCTTAACCCGTCTGCGCACA
CTGGATACTTAGCGCTAGCCGGCTGAGAACCAATCTTATACCCATCTGGATTTTGCAAAT
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GAGCAACAAACGCAGAAGT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1E213JQ 751 0 0
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TAACATTCACCTTATCCTCACAGACTGCTCCATGTAATGCCATGAGATGTCTCATATGAT
AATACTTCCTGTTACTGTCGCTGAGCGCATCCGGAAGTACATCTTTCTCTCCAAGTGTCT
CCTTGTACCCGTTTCCAGTGACCATGATCTCCGGATCATTATAGTTCTCTTTGATATACT
TCAAAACCTTTCTTAACCCGTCTGCGCACACTGGATACTTAGCGCTAGCCGGCTGAGAAC
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TCTGTTTCTCTTGATCAACATCCTCCACATGAGCAACAAACGCAGAAGTGAAGTAGTTGA
CACCAACAAAATCATAAGAACCCTTCAGTTT

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

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CTTCATTTTTGCTACCTTTCAGTTAAATATCTGGG


BQ
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QA 4 292 4 292
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1BJ93JQ C 1
AF RS1BJ93TF U 1
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GCATTTGTTGTATCTCCATTCTGTAAGTGTTTGTTTGTATGTATGTACCCTCTTTTTACA
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GAGTATCGCAGAGCAAGTGTTCCAAAATACAAAGGGGAAGTTCAGTTTATAGTAATAAAT
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ATCTATCAATCTATGATCTATCACAGAATCGCC

QA 1 693 1 693
DS 



AS 1 2

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TTTATCGTGTGATGTGTTTGATTTTAAATCAAAAGTACTCCTTTTTCTGCCTTTTCTTTT
TATCTTATTTTGCTTTTGCTTTTTGTTTGGTGTGTTACATGCATATGATATGATGTTTGC
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RS1BF71TF U 1
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BS 766 841 RS1BF71JQ

RD RS1BF71TF 784 0 0
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TGGTTGGTGATTAAATAAGGAACTATATCCGTAGCTCCGACGATTCTTCTTCTGTAGACG
AAGACATAACTTCTTCTATGTATTCCTCGGGAAAAGAGTGTATGCCTACAGAATGGACCG
ATGAGAAGCATAGTCTGTATCTTAAATCAATGGAAGCTTCATTCGTAGACCAGCTTTATA
GCTCCCTCGGTTGGAGTTTGATGAGCAAGGAGAACGTAGGAGGAAACCCATCTGAAGAAC
AGAAGATGAATGTAAGACAGCCTCATGAGTATCGTGTCAAAGGAAGAAGACAGGGTGGTG
GTTCTAACCATGAGTTTCTTAAGAGTCCGTGGATCAAGCACTATAGGACCATAGGAGAGG
TTTCTGACCAGAACTTTGCCAACGAAGTAACAAAAGGCGAAAATAGTGGAAGCTCGAAGA
AGATAAAGACAGTGATGAACGGATCGTCTAGTACTGATCAGGTTGTTCCACTCAGAAAAA
CTCCAGTAGACATGACGTAAATTGAACCCTCATCGTTAGTTGAAACACAGTGTTTTTGTG
GTAGCCTGTCTCCCTTTGTAATCCATATATATAGCACTGCTTTTGCTGATAC*AAGACTA
GATGTTCGGACAAGAACCCTGTGCAGCAAGA*GAT*ACCACGAATGCGTTTGCATCTGGT
TT*ATCGTGTGATGTGTTTGATTT*AAATCAAA*GTACTCCTTTT
CTGCCTTTCTTTTATCTAT

QA 1 765 1 765
DS 

RD RS1BF71JQ 741 0 0
ACGA
TCTTCTTCTGTAGACGAAGACATAACTTCTTCTATGTATTCCTCGGGAAAAGAGTGTATG
CCTACAGAATGGACCGATGAGAAGCATAGTCTGTATCTTAAATCAATGGAAGCTTCATTC
GTAGACCAGCTTTATAGCTCCCTCGGTTGGAGTTTGATGAGCAAGGAGAACGTAGGAGGA
AACCCATCTGAAGAACAGAAGATGAATGTAAGACAGCCTCATGAGTATCGTGTCAAAGGA
AGAAGACAGGGTGGTGGTTCTAACCATGAGTTTCTTAAGAGTCCGTGGATCAAGCACTAT
AGGACCATAGGAGAGGTTTCTGACCAGAACTTTGCCAACGAAGTAACAAAAGGCGAAAAT
AGTGGAAGCTCGAAGAAGATAAAGACAGTGATGAACGGATCGTCTAGTACTGATCAGGTT
GTTCCACTCAGAAAAACTCCAGTAGACATGACGTAAATTGAACCCTCATCGTTAGTTGAA
ACACAGTGTTTTTGTGGTAGCCTGTCTCCCTTTGTAATCCATATATATAGCACTGCTTTT
GCTGATACCAAGACTAGATGTTCGGACAAGAACCCTGTGCAGCAAGAAGATTACCACGAA
TGCGTTTGCATCTGGTTTTATCGTGTGATGTGTTTGATTTTAAATCAAAAGTACTCCTTT
TTCTGCCTTTTCTTTTTATCTTATTTTGCTTTTGCTTTTTGTTTGGTGTGTTACATGCAT
ATGATATGATGTTTGCT

QA 5 741 5 741
DS 



AS 1 2

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TTTCTGTTGGAATCTCTCGGACTAAGCAACGATGATGACTTCCTCCCAATCTTTATCGGA
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ATATTGGTTTCGTCCGTGCCAAAAGAAAGCAATGCATTCTACTCTCTTAGAGACCCCTCA
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ATTTGATGATTGTTTAGGAGTATCAGAAGAGCTTCATCCAACGCTGTCTTTTTATTTTAT
TTTATTTTATTTTCACTTTTTAGTTTCTGTTTTTTTTAACAGTTTCGGCATTTATATTTT
AATTTATCATTTTTCCATATTATCCATGGTTAAAAAATGTTATTACAATCAAAACTCTTT
TTATAATTCATTTCAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GL12TF U 1
AF RS1GL12JQ C 1
BS 1 608 RS1GL12TF
BS 609 676 RS1GL12JQ

RD RS1GL12TF 608 0 0
GGCGAAGAGGTTTACAAAAATCTCGTTGAGCTAACTAAATCTATTAAAGGTGCAAAAGTA
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TTTATTTTATTTTCACTTTTTAGTTTCTGTTTTTTTTAACAGTTTCGGCATTTATATTTT
AATTTATC

QA 1 608 1 608
DS 

RD RS1GL12JQ 676 0 0
GGCGAAGAGGTTTACAAAAATCTCGTTGAGCTAACTAAATCTATTAAAGGTGCAAAAGTA
GAGAACCACAAGTTCTGCGCCTCTGTTCATTACCGTAACGTTGATAGGGAAGACTGGGAA
CTCGTTGCTCAACGCGTTCATGACCACCTGAAACAATACCCTCGTCTGCGTCTAACTCAT
GGGAGAAAGGTTTTAGAGGTTCGTCCTGTGATCGAGTGGAACAAAGGGAAAGCAGTTGAG
TTTCTGTTGGAATCTCTCGGACTAAGCAACGATGATGACTTCCTCCCAATCTTTATCGGA
GACGACAAGACTGATGAGGATGCATTCAAGGTACTAAGGGATAGAGAGCAAGGTTTTGGA
ATATTGGTTTCGTCCGTGCCAAAAGAAAGCAATGCATTCTACTCTCTTAGAGACCCCTCA
GAGGTGAAGAAGTTCCTCAAGACTTTGGTGAAATGGAGAAAGATGGAAGACTCCACAAGT
ATTTGATGATTGTTTAGGAGTATCAGAAGAGCTTCATCCAACGCTGTCTTTTTATTTTAT
TTTATTTTATTTTCACTTTTTAGTTTCTGTTTTTTTTAACAGTTTCGGCATTTATATTTT
AATTTATCATTTTTCCATATTATCCATGGTTAAAAAATGTTATTACAATCAAAACTCTTT
TTATAATTCATTTCAT

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL7751Contig1 788 2 4 U
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CTCTTCTCAGGGATTGATGGAACTTGAATCAGAATTCAGCGCCCACAATTACCATCCTGT
CCCGGTTGTGTTTTCCCCGGGAATGGCTCAACCATATGGGACCCTGAAGGCAAAAAATAC
ATCGACTTTCTTGCTGCTTACTCCGCTGTTAATCAGGGACATTGCCACCCTAAGATCATC
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AAGTTCCCCGTCTTTGCACAGCGTCTCACTAACATGTTCGGTTACGAGATGGTGCTTCCT
ATGAACACCGGCGCTGAAGGTGTCGAAACCGCCTTGAAAATTGCAAGAAAGTGGGGTCAC
GACAAGAAACACATTCCCAAAGATGAGGCTATAATCGTCTCTTGTTGTGGTTGCTTTCAT
GGTCGTACGTTAGCAGTTATCTCCATGAGTTGTGACAACGATGCTACTCGCGGGTTTGGA
CCATTGTTGCCTGGCAATCTTAAAGTTGATTTTGGTGACGCCACTTCTCTTGAGATCCTC
TTTAAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D922TF U 1
AF RS1CM91TF U 392
BS 1 579 RS1D922TF
BS 580 580 RS1CM91TF
BS 581 654 RS1D922TF
BS 655 788 RS1CM91TF

RD RS1D922TF 654 0 0
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GAGAAGAGAAAAGCGCCCCAAAAAAAGAAAACATACGTTTTGCGTCCATTTCTGAAAGAC
TCTGATGGCAGCGACGAGACGATTGATTCAGCGTGTGACTACCAGAATTTCTACTGCCGG
AGCACGTCGTAGCTATGGAGGTCTGGCGGAATCGAACTCAAAAACTCCGTCGTCATCTTC
CTCTTCTCAGGGATTGATGGAACTTGAATCAGAATTCAGCGCCCACAATTACCATCCTGT
CCCGGTTGTGTTTTCCCCGGGAATGGCTCAACCATATGGGACCCTGAAGGCAAAAAATAC
ATCGACTTTCTTGCTGCTTACTCCGCTGTTAATCAGGGACATTGCCACCCTAAGATCATC
AAGGCACTGAAGGAACAAGTGGAGAAGCTCACTTTAAGTTCACGAGCCTTCTATAACGAC
AAGTTCCCCGTCTTTGCACAGCGTCTCACTAACATGTTCGGTTACGAGATGGTGCTTCCT
ATGAACACCGGCGCTGAAGGTGTCGAAACCGCCTTGAAAGTTGCAAGAAAGTGGGGTCAC
GACAAGAAACACATTCCCAAAGATGAGGCTATAATCGTCTCTTGTTGTGGTTGC

QA 1 654 1 654
DS 

RD RS1CM91TF 397 0 0
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ACATGTTCGGTTACGAGATGGTGCTTCCTATGAATACCGGCGCTGAAGGTGTCGAAACCG
CTTTGAAGATTGCAAGAAAGTGGGGTCACGAGAAGAAACACATTCCCAAAGATGAGGCTA
TAATCGTCTCTTGTTGTGGTTGCTTTCATGGTCGTACGTTAGCAGTTATCTCCATGAGTT
GTGACAACGATGCTACTCGCGGGTTTGGACCATTGTTGCCTGGCAATCTTAAAGTTGATT
TTGGTGACGCCACTTCTCTTGAGATCCTCTTTAAAGA

QA 1 397 1 397
DS 



AS 1 2

CO CL7752Contig1 777 2 7 U
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ACCAGATCCATATCCATATGCCGGACCAATGAACCAATTATCAATTGTCTTTTCGACGTT
ATCGAGGTTGCGTTGGTTAAAAACTCGAAGCTTGGCTCCAACATAAATTTTCTCATAGGG
CCTTAATTTCTCGTTCTCATTAAGGACAAGGAATATGGACACAGCTTTTCCCTTTACCGT
GGCACTACCACCGGGATACACTTTTATATTCCATTTTCTTCCTCCAATGGAAAACATGTC
AAAATAGTAAATATCTTTGAGCAAGGTGGAGAACTTCTGAATAGTCCATATGTACTTCGC
GTTATTGAACTTGTCAGTAACAGTGAAAAGTTCGGATTCTTTAGAGACAGTGGGAGTGGT
CACATCAACACCAAACTCGCAGTGATCTCCATCGTATAGGTATCCGTTGTTTGAGTCTTT
AAATGTATTAACAGGGAGAACCTGAGAGAACCCCCACATCGTTTTGAAAAAACTATACCT
CCATCCATCGGTATCTTGGATCGTGAGGTACTTCTTCTCTACCCTGTTGAAGACGTAAAA
CCTGAGATCCACGTAAACCTCTTGGTGTGGAGAGAGAGTTGAGTTGTCTATGGCTACGTA
AAGCGAAAGGTAACCTGCACCATTATCATTCTTGTTCCCGTTGGGGTACACAACAAGTGT
CCACTTATAGCCAGCAGCCGAGAAAGGACGTGAAACATATTTGTCTGCGTTGGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
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20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CM93JQ U 36
AF RS1F954TF C 1
BS 1 35 RS1F954TF
BS 36 122 RS1CM93JQ
BS 123 123 RS1F954TF
BS 124 235 RS1CM93JQ
BS 236 236 RS1F954TF
BS 237 326 RS1CM93JQ
BS 327 777 RS1F954TF

RD RS1CM93JQ 294 0 0
ATGGGATAAATTCATTATAACCCCAACCAGATCCATATCCATATGCCGGACCAATGAACC
AATTATCAATTGTCTTTTCGACGTTATTGAGGTTGCGTTGGTTAAAAACTCGAAGCTTGG
CTCCAACATAAATTTTCTCATAGGGCCTTAATTTCTCGTTCTCATTAAGGACAAGGAATA
TGGACACAGCTTTTCCCTTTCCCGTGGCACTACCACCGGGATACACTTTTATATTCCATT
TTCTTCCTCCAATGGAAAACATGTCAAAATAGTAAATATCTTTGAGCAAGG
GGG

QA 1 291 1 291
DS 

RD RS1F954TF 777 0 0
GTCACAAGAAACCCTTGATGATCTTGAGATCAGAGATGGGATAAATTCATTATAACCCCA
ACCAGATCCATATCCATATGC*GGACCAATGAACCAATTATCAATTGTCTTT*CGACGTT
ATCGAGGTTGCGTTGGTTAAGAACTCGAAGCTTGGCTCCAACATAAATTTTC**ATAGGG
TCTTAATTTCTCGTTCTCATTAAGGACAAGGAATATGGACACAGCTTTTCCCTTTACCGT
GGCACTACCACCGGGATACACTTTTATATTCCATTTTCTTCCTCCAATGGAGAACATGTC
AGAGTAGTAAATATCTTTGAGCAAGGTGGAGAACTTCTGAATAGTCCATATGTACTTCGC
GTTATTGAACTTGTCAGTAACAGTGAAAAGTTCGGATTCTTTAGAGACAGTGGGAGTGGT
CACATCAACACCAAACTCGCAGTGATCTCCATCGTATAGGTATCCGTTGTTTGAGTCTTT
AAATGTATTAACAGGGAGAACCTGAGAGAACCCCCACATCGTTTTGAAAAAACTATACCT
CCATCCATCGGTATCTTGGATCGTGAGGTACTTCTTCTCTACCCTGTTGAAGACGTAAAA
CCTGAGATCCACGTAAACCTCTTGGTGTGGAGAGAGAGTTGAGTTGTCTATGGCTACGTA
AAGCGAAAGGTAACCTGCACCATTATCATTCTTGTTCCCGTTGGGGTACACAACAAGTGT
CCACTTATAGCCAGCAGCCGAGAAAGGACGTGAAACATATTTGTCTGCGTTGGTTGC

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 2

CO CL7753Contig1 228 2 2 U
TTTTTCTTGCTTTAGGGTAGTTTCTTAATTTGCTGGTGATTTGGGTATATTGACCCAAGA
GTTGATAACACAATCAGACACTTTTTCTCTTTTTTTACTTCATTAGACACTTCCCACTTG
AGGGACACTTTCTACCTCTTCCCCTCTATGTATTTGTATTCATATACCCTTTTGTTGTGG
TTAAGACTTTGAAGAGATGAGTTAGTTTTACTAATATAACATTCTGCC


BQ
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AF RS1FD39JQ C 1
AF RS1FD39TF U 118
BS 1 117 RS1FD39JQ
BS 118 228 RS1FD39TF

RD RS1FD39JQ 228 0 0
TTTTTCTTGCTTTAGGGTAGTTTCTTAATTTGCTGGTGATTTGGGTATATTGACCCAAGA
GTTGATAACACAATCAGACACTTTTTCTCTTTTTTTACTTCATTAGACACTTCCCACTTG
AGGGACACTTTCTACCTCTTCCCCTCTATGTATTTGTATTCATATACCCTTTTGTTGTGG
TTAAGACTTTGAAGAGATGAGTTAGTTTTACTAATATAACATTCTGCC

QA 1 228 1 228
DS 

RD RS1FD39TF 111 0 0
TTGAGGGACACTTTCTACCTCTTCCCCTCTATGTATTTGTATTCATATACCCTTTTGTTG
TGGTTAAGACTTTGAAGAGATGAGTTAGTTTTACTAATATAACATTCTGCC

QA 1 111 1 111
DS 



AS 1 2

CO CL7754Contig1 780 2 2 U
GGGCTAGAGGATTCCCTGTGATTGATACAATGAAAGCCGCAGTGGAGAGAGCTTGCCCGA
GAACCGTTTCTTGCGCAGATATGCTCACCATCGCTGCTCAACAATCTGTCACATTGGCAG
GAGGTCCTTCTTGGAGGGTTCCTTTGGGGAGAAGAGACAGCTTACAAGCATTTTTCAACC
TATCTACTGCTAATCTTCCTTCTCCATTCTTCACACTTCCAGAACTTAAAGCCAGCTTTA
GAAACGTTGGCCTCGACCGTCCTTCTGATCTCGTTGCTCTCTCTGGCGGTCACACATTTG
GTAAAAATCAATGCCGGTTCATTATGCGCAGACTATACAATTTCAGCAACACCGGTTTAC
CTGATCCTACCCTCAACACTACTTACCTCCAAACTCTTCGTGGACTATGTCCCCTTAATG
GTAACCAAAGTGCCTTGGTGGATTTTGATCTGCGTACCCCTACAGTTTTCGACAACAAAT
ACTATGTGAATCTCAAAGAACAGAAAGGTCTTATCCAGACTGACCAAGAGTTGTTCTCTA
GCCCCAATGCCACTGACACAATCCCTTTGGTGAGAGAATATGCTGATGGCACACAAAAAT
TCTTCAATGCATTTGTGGAGGCTATGAATAGGATGGGCAACATTACACCTCTTACGGGCA
CTCAAAGAGAGATCAGATTGAATTGTACGTGGTGACTCCAACTCTCTACTCCATGATGTG
GTTGAAATCGTTGATTTCGTAGCTCTATATGAGATAGTATCTTAGTATGTGGCTACCAAA


BQ
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AF RS1FQ29TF U 1
AF RS1GP25TF U 1
BS 1 664 RS1FQ29TF
BS 665 780 RS1GP25TF

RD RS1FQ29TF 664 0 0
GGGCTAGAGGATTCCCTGTGATTGATACAATGAAAGCCGCAGTGGAGAGAGCTTGCCCGA
GAACCGTTTCTTGCGCAGATATGCTCACCATCGCTGCTCAACAATCTGTCACATTGGCAG
GAGGTCCTTCTTGGAGGGTTCCTTTGGGGAGAAGAGACAGCTTACAAGCATTTTTCAACC
TATCTACTGCTAATCTTCCTTCTCCATTCTTCACACTTCCAGAACTTAAAGCCAGCTTTA
GAAACGTTGGCCTCGACCGTCCTTCTGATCTCGTTGCTCTCTCTGGCGGTCACACATTTG
GTAAAAATCAATGCCGGTTCATTATGCGCAGACTATACAATTTCAGCAACACCGGTTTAC
CTGATCCTACCCTCAACACTACTTACCTCCAAACTCTTCGTGGACTATGTCCCCTTAATG
GTAACCAAAGTGCCTTGGTGGATTTTGATCTGCGTACCCCTACAGTTTTCGACAACAAAT
ACTATGTGAATCTCAAAGAACAGAAAGGTCTTATCCAGACTGACCAAGAGTTGTTCTCTA
GCCCCAATGCCACTGACACAATCCCTTTGGTGAGAGAATATGCTGATGGCACACAAAAAT
TCTTCAATGCATTTGTGGAGGCTATGAATAGGATGGGCAACATTACACCTCTTACGGGCA
CTCA

QA 1 664 1 664
DS 

RD RS1GP25TF 780 0 0
GGGCTAGAGGATTCCCTGTGATTGATACAATGAAAGCCGCAGTGGAGAGAGCTTGCCCGA
GAACCGTTTCTTGCGCAGATATGCTCACCATCGCTGCTCAACAATCTGTCACATTGGCAG
GAGGTCCTTCTTGGAGGGTTCCTTTGGGGAGAAGAGACAGCTTACAAGCATTTTTCAACC
TATCTACTGCTAATCTTCCTTCTCCATTCTTCACACTTCCAGAACTTAAAGCCAGCTTTA
GAAACGTTGGCCTCGACCGTCCTTCTGATCTCGTTGCTCTCTCTGGCGGTCACACATTTG
GTAAAAATCAATGCCGGTTCATTATGCGCAGACTATACAATTTCAGCAACACCGGTTTAC
CTGATCCTACCCTCAACACTACTTACCTCCAAACTCTTCGTGGACTATGTCCCCTTAATG
GTAACCAAAGTGCCTTGGTGGATTTTGATCTGCGTACCCCTACAGTTTTCGACAACAAAT
ACTATGTGAATCTCAAAGAACAGAAAGGTCTTATCCAGACTGACCAAGAGTTGTTCTCTA
GCCCCAATGCCACTGACACAATCCCTTTGGTGAGAGAATATGCTGATGGCACACAAAAAT
TCTTCAATGCATTTGTGGAGGCTATGAATAGGATGGGCAACATTACACCTCTTACGGGCA
CTCAAAGAGAGATCAGATTGAATTGTACGTGGTGACTCCAACTCTCTACTCCATGATGTG
GTTGAAATCGTTGATTTCGTAGCTCTATATGAGATAGTATCTTAGTATGTGGCTACCAAA

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL7755Contig1 841 2 2 U
GGCCAAAAACATAAATTAAAATTAAAAATCAATTTTCCTCTTCTCATTGAATTCAAAAAG
TTTTCAAATCTCCGGAAACTTTATTTCTGGAGAATATATATATAGTTTCCTCCTTACAAT
GACGTCCGAGAATCTGAATGATAAGGTTGCTGTCTTCAAGAAGCTCAAATCGAAATCTGA
TAATAAGATATGTTTCGATTGCAATGCGAAGAGCCCAACATGGGCTTCCGTTACTTACAG
GATCTTCCTATGCATCGATTGCTCTGCCGTTCATCGCAGCCTCGGCGTCCACATCAGCTT
CGTCAGGTCAACAAATCTAGACTCATGGAGCCCTGAGCAGTTGAAGATGATGGTGTACGG
AGGAAACAGCAGGGCTCATGTCTTCTTCAAGCAGCACGGTTGGAGCGGAGAAGGTAAAGC
CAAGGAAGCACAGCCACCAGCTAGTGCCCCAAACCCGCCTCTTGACCCCAAAGACGTGAT
TGATCCGCCTCTTCCTCCTGTTGCTAACATTGTCTCCGCTAATGCAAGTGGAGAAGTTTC
ACAACATGCCTCAGGCACCATTGCCACCAGTGCTAATCTTGGCCTTTCCTTGCTGGCAGT
ACTGGTCTTGGGACTCCTCTTTTGCTACTGAGTAAAGACTGATCACACCGGTATAACTTC
ATAGGTTGTAAACACGTGCGTCCTCAGCATTTTCCAATCTCACACAAGCTATTTTATGTT
TTCCTCGTATTAAGCTAAGCACACAGTGATTTTGTTGTTTATAGATTAAAGCTCTAAAGA
AACTTTTTTTTGTTATGATATGGATGTTTGATCTCAGTGATAACTCGGTCATATTCTGTC
C


BQ
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10 

AF RS1DU47TF U 1
AF RS1DU47JQ C 117
BS 1 655 RS1DU47TF
BS 656 841 RS1DU47JQ

RD RS1DU47TF 660 0 0
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TTTTCAAATCTCCGGAAACTTTATTTCTGGAGAATATATATATAGTTTCCTCCTTACAAT
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TAATAAGATATGTTTCGATTGCAATGCGAAGAGCCCAACATGGGCTTCCGTTACTTACAG
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CGTCAGGTCAACAAATCTAGACTCATGGAGCCCTGAGCAGTTGAAGATGATGGTGTACGG
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ACAACATGCCTCAGGCACCATTGCCACCAGTGCTAATCTTGGCCTTTCCTTGCTGGCAGT
ACTGGTCTTGGGACTCCTCTTTTGCTACTGAGTAAAGACTGATCACACCGGTATA
CTTCA

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1DU47JQ 725 0 0
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CTGATAATAAGATATGTTTCGATTGCAATGCGAAGAGCCCAACATGGGCTTCCGTTACTT
ACAGGATCTTCCTATGCATCGATTGCTCTGCCGTTCATCGCAGCCTCGGCGTCCACATCA
GCTTCGTCAGGTCAACAAATCTAGACTCATGGAGCCCTGAGCAGTTGAAGATGATGGTGT
ACGGAGGAAACAGCAGGGCTCATGTCTTCTTCAAGCAGCACGGTTGGAGCGGAGAAGGTA
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TGATTGATCCGCCTCTTCCTCCTGTTGCTAACATTGTCTCCGCTAATGCAAGTGGAGAAG
TTTCACAACATGCCTCAGGCACCATTGCCACCAGTGCTAATCTTGGCCTTTCCTTGCTGG
CAGTACTGGTCTTGGGACTCCTCTTTTGCTACTGAGTAAAGACTGATCACACCGGTATAA
CTTCATAGGTTGTAAACACGTGCGTCCTCAGCATTTTCCAATCTCACACAAGCTATTTTA
TGTTTTCCTCGTATTAAGCTAAGCACACAGTGATTTTGTTGTTTATAGATTAAAGCTCTA
AAGAAACTTTTTTTTGTTATGATATGGATGTTTGATCTCAGTGATAACTCGGTCATATTC
TGTCC

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1BF24JQ C 1
AF RS1BF24TF U 1
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BS 699 700 RS1BF24JQ

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GCTGAATGCAAGTAGGATTAAGTACCTTCAAGCACAAGATGACGTTGTCACCTCCATGAA
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TCTCAAGGCTCTCATCGTTGAGAGTTTGCTGCGGCTGAAAGAGCCATCAGTGCTGCTGAG
ATGCAGAGAGATGGACAAGAGGGTTGTTGAATCCATCATTGAGGATGGAAAGATTGTCTG
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ATTTTCATCTTGACGAAGAGAATAAACTTCTAATAATGCC

QA 1 700 1 700
DS 

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GGAGGAATTCAACATAGAGAAACTTCAGCTTCTTGAGAATGCCAAGCGTAAGCTCCGTCA
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AGACTCTGCGGCTAAGGATCTCCTTCGTGTTTCCAACGACAAGAACGCATACAAGAAACT
TCTCAAGGCTCTCATCGTTGAGAGTTTGCTGCGGCTGAAAGAGCCATCAGTGCTGCTGAG
ATGCAGAGAGATGGACAAGAGGGTTGTTGAATCCATCATTGAGGATGGAAAGATTGTCTG
CGAGAACATTTTAGACGCACGTCTAGACGTTGCCTTCAGACAGAAGCTTCCCCAGATCCG
GACACGCCTCGTTGGAGCTCCTGAAATCTCAAGAGCATGATACTACCAAACCAAGCTTGC
TTAAGCCCCTTAATAAGTGACATTCAAAAG*ATCATCACTTTTTTTTAATATGTCTAGTT
ATTTTCATCTTGACGAAGAGAATAAACTTCTAATAATG

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL7757Contig1 961 2 4 U
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TATCAACAAGTTGGGCATAGGGAAAACTTTTGATAAGGAAGAACCACCACCACCTTTGAA
TCAAATTCCGAAACCTCTTCCTCCTTCTCATCAGGATCAGGTTGCTAAGGTGCCATTTAA
AATCGCAATACCAAAGGATGGTTACGCATTTTCCCTTAGTAGAAATATGGCCCGGAGAGC
AAGAACATGTGTCTTCTGGGACACCAGGGCTTACCCACTCCCTCCTGGTCTCCATTCCTT
TGATGTTTGGCAAAACATAAAAGATGCTCTTTCTGAAAGGGGTTATTATGGCTATGTCTC
AATCACTGCGTTTCTTGATGTTCACCCCTGCCCCCCAGGCTATTCTGGATGTGATAACGT
CTCTTACCTAAAAGATGGAGATAGAGATGCGCGACATTGGCAGATTGCACTGCGCCTGCT
TGCTGCTGCTCGTTGCACTAGTATTGAGCCAGTAAATCATATGTTACTCCTGGGAGACAT
CTCAGGACACATTGAGCTCTTAAGGATAATTTACCTGTTGAATTTAAGATTTTCCTACAA
TGTTATCTTAGCTCAGCCTCCTTGTCAAAACGCATCATCAGGAGAGCTACTTGGTAAAGA
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GAAGACAAGTGTACCACCGTTGACTCCTTGGCAGGAGCTATTAAAAGCTGCAAACTCGGT
CGTCTTCTGGGACCTGGTGGATTGCCCAATACCTGTTGGTCTCACTGCTACTGAGGCTTC
ACAGACCATTAGATCGGCCTTTGAGAAATGAATTATCGTGGTACACTTACCATCCATGCT
TTGGGCAAGATCCGCTTGTCTCAGACCAGAGATGTGAGTCTACTACTGATGAAAACACAC
C


BQ
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10 

AF RS1A221TF U 1
AF RS1A221TV U 166
BS 1 183 RS1A221TF
BS 184 184 RS1A221TV
BS 185 868 RS1A221TF
BS 869 961 RS1A221TV

RD RS1A221TF 868 0 0
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TATCAACAAGTTGGGCATAGGGAAAACTTTTGATAAGGAAGAACCACCACCACCTTTGAA
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AATTGCAATACCAAAGGATGGTTACGCATTTTCCCTTAGTAGAAATATGGCCCGGAGAGC
AAGAACATGTGTCTTCTGGGACACCAGGGCTTACCCACTCCCTCCTGGTCTCCATTCCTT
TGATGTTTGGCAAAACATAAAAGATGCTCTTTCTGAAAGGGGTTATTATGGCTATGTCTC
AATCACTGCGTTTCTTGATGTTCACCCCTGCCCCCCAGGCTATTCTGGATGTGATAACGT
CTCTTACCTAAAAGATGGAGATAGAGATGCGCGACATTGGCAGATTGCACTGCGCCTGCT
TGCTGCTGCTCGTTGCACTAGTATTGAGCCAGTAAATCATATGTTACTCCTGGGAGACAT
CTCAGGACACATTGAGCTCTTAAGGATAATTTACCTGTTGAATTTAAGATTTTCCTACAA
TGTTATCTTAGCTCAGCCTCCTTGTCAAAACGCATCATCAGGAGAGCTACTTGGTAAAGA
CGGGATCTGCTCAAGCCTCTCAGCCGGAGACAAACTTCTAAGCCAAATCGAACAAAAATT
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ACAGACCATTAGATCGGCCTTTGAGAAA

QA 1 868 1 868
DS 

RD RS1A221TV 796 0 0
TAAGGTGCCATTTAAAATCGCAATACCAAAGGATGGTTACGCATTTTCCCTTAGTAGAAA
TATGGCCCGGAGAGCAAGAACATGTGTCTTCTGGGACACCAGGGCTTACCCACTCCCTCC
TGGTCTCCATTCCTTTGATGTTTGGCAAAACATAAAAGATGCTCTTTCTGAAAGGGGTTA
TTATGGCTATGTCTCAATCACTGCGTTTCTTGATGTTCACCCCTGCCCCCCAGGCTATTC
TGGATGTGATAACGTCTCTTACCTAAAAGATGGAGATAGAGATGCGCGACATTGGCAGAT
TGCACTGCGCCTGCTTGCTGCTGCTCGTTGCACTAGTATTGAGCCAGTAAATCATATGTT
ACTCCTGGGAGACATCTCAGGACACATTGAGCTCTTAAGGATAATTTACCTGTTGAATTT
AAGATTTTCCTACAATGTTATCTTAGCTCAGCCTCCTTGTCAAAACGCATCATCAGGAGA
GCTACTTGGTAAAGACGGGATCTGCTCAAGCCTCTCAGCCGGAGACAAACTTCTAAGCCA
AATCGAACAAAAATTGAAGACAAGTGTACCACCGTTGACTCCTTGGCAGGAGCTATTAAA
AGCTGCAAACTCGGTCGTCTTCTGGGACCTGGTGGATTGCCCAATACCTGTTGGTCTCAC
TGCTACTGAG*CTTCACAGACCATTAGATCGGCCTTTGAGAAATGAATTATCGTGGTACA
CTTACCATCCATGCTTTGGGCAAGATCCGCTTGTCTCAGACCAGAGATGTGAGTCTACTA
CTGATGAAAACACACC

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 2

CO CL7758Contig1 789 2 9 U
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AGATCCTAACGTGGCCAGACCGGTTAGCAATTCTGATTGAGATGGCAAAGGCAGTTCATT
TTCTTCATACTGGTGTAATGCCTGGCTCCTTCAACAATCAGCTGAAGACTAACAACATCT
TGCTTGACGAACACAAGATTGCGAAGCTCAGTGACTATGGAGTCTCTGCCATCATTGAAG
AGAATGAAAAGCTTGAGACAAAGTTAGAACCCCACAACAAGTCAAAGAAAATGGCTAAAA
GAGAAGATGATGTGTACAACTTTGGATTCATACTTCTGGAATCTCTCATAGGACCATTGC
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GCAAATCTGACACGTCCCCATGAATCCGGAGTGCTAATATTTGATTAAAAAAATCTATTT
TCGGTCTTTAAAAAATGTAAAGTTTTATAAGTTTGTTCTTAATATACAAGGTAGCATCTT
AAGGTTTCTAATATATGGATTAGCTTGTAACTTTAGAAACCATCATCATATACATACATT
TCTTGGGGG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FX74TF U 38
AF RS1D106JQ C 1
BS 1 38 RS1D106JQ
BS 39 416 RS1FX74TF
BS 417 417 RS1D106JQ
BS 418 710 RS1FX74TF
BS 711 711 RS1D106JQ
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BS 725 749 RS1FX74TF
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RD RS1FX74TF 712 0 0
G
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ATTTGATTAAAAAAATCTATTTTCGGTCTTTAAAAAATGTAAAGTTTTATAAGTTTGTTC
TTAATATACAAG*TAGCATCTTAAG*TTTCTAATATATGGATTAGCTTGTA

QA 2 712 2 712
DS 

RD RS1D106JQ 789 0 0
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AGATCCTAACGTGGCCAGACCGGTTAGCAATTCTGATTGAGATGGCAAAGGCAGTTCATT
TTCTTCATACTGGTGTAATGCCTGGCTCCTTCAACAATCAGCTGAAGACTAACAACATCT
TGCTTGACGAACACAAGATTGCGAAGCTCAGTGACTATGGAGTCTCTGCCATCATTGAAG
AGAATGAAAAGCTTGAGACAAAGTTAGAACCCCACAACAAGTCAAAGAAAATGGCTAAAA
GAGAAGATGATGTGTACAACTTTGGATTCATACTTCTGGAATCTCTCATAGGCCCATTGC
CCACTGCAAAGGGAGAAGCCTTTCTTCTAAACGAAATGACGTCATTTGAGAGCCAAGACG
GTCGACAGAAAATAGTGAGTCCAACGGTGCTAACAACTAGCTCTCAAGAGTCCTTAGCGA
TTGCGGTATCAATCGCTAATAAATGCGTTTTGCTTGAACCTTCCGCAAGGCCTTCTTTTG
AAGATGTTCTATGGAACTTACAATATGCAGCTCAAATGCAGTCTGCTGCAGACACTGAAC
GCAAATCTGACACGTCCCCATGAATCCGGAGTGCTAATATTTGATTAAAAAAATCTATTT
TCGGTCTTTAAAAAATGTAAAGTTTTATAAGTTTGTTCTTAATATACAAGGTAGCATCTT
AAGGTTTCTAATATATGGATTAGCTTGTAACTTTAGAAACCATCATCATATACATACATT
TCTTGGGGG

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 2

CO CL7759Contig1 1419 2 2 U
GGCGTTTACGGTAGAGAAACGATCTGTCCTAACTCGACAAAAGCGAAGAAGCGGCAAGCT
CTTTGAGCTCTGAAGCGATAGGAACAAATACTCAAAATCGCAATGGGGGAAGGCAACTTG
TCGTTTCGCCGTCTCACCAGCATCCGCCACCGAAAGAAGCGCACTGCGGCGAAGGATGAA
GCAGAGAGTAGCCTCATCTCGTCTTCACCGCCTCCTACGCCGATAACTCCAGCTGCGGTT
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GGAGCTATGGAAGTGGTGGAATGCGACAAGAGTACCATCATCAAACGTGCTTCTGTCCCC
GCTAGAGATCTCAGGATTCTTGGCCCTGTCTTCTCCCACTCTTCTAACATTCTTGCGAGG
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GAGATGTTGCTGGAGGCATACTTCATGCAACTAGAGGGGATGCGGAACAGGATACTTACG
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AATGAAATGATCCAGCTGCAGCTGACGCTGACCATAGCCTCGTTTGCGATCACTGCAAAC
ACGCTGTTGGTAAGTTTGTTCGGAATGAACATACCGTGTCCGTTGTATAAGATGGATGAT
GTCTTTGGTTACTTTTTGTCGAGTGTTATTGCAGTATGCGTTGTGATTTTCATGCTCACC
CTTGGTTACGCCTGGTGGAAGAAGCTGCTTGGCTCGTAATCACTCTTTTTTCACTTGTGT
AATCAAAACAAAACCCATTGCCACATGTTTAATATATAT


BQ
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CATGCTCACCCTTGGTTACGCCTGGTGGAAGAAGCTGCTTGGCTCGTAATCACTCTTTTT
TCACTTGTGTAATCAAAACAAAACCCATTGCCACATGTTTAATATATAT

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DS 



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TTCAGTGAGCTTTGTTGTTATTGGAGAAGAAGGGAAGGGAGTAAGGTCTAATCAAGATGG
TGAAGATGACATTGATAGCTCGTGTTACCGACGGCTTGCCTCTAGCCGAAGGTCTTGACG
ATGGACGTGACTTACCAGATTCCGACATGTACAAGCAACAGGTCAAGGCCTTGTTTAAGA
ATCTCTCCAGAGGTCACAACGAAGCTTCGAGAATGTCCGTTGAGACTGGTCCCTATGTTT
TCCATTACATCATAGAAGGACGTGTTTGCTACTTGACGATGTGTGACCGCTCTTACCCTA
AGAAACTGGCTTTCCAGTACCTGGAAGACCTCAGGAACGAGTTTGAACGTGTTAATGGGC
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BQ
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AF RS1AP87TFB U 1
AF RS1AP87JQ C 74
BS 1 771 RS1AP87TFB
BS 772 862 RS1AP87JQ

RD RS1AP87TFB 771 0 0
GGGGGATCATCATCGTCCGTCTTCCTCCTGGTTCTCAGATCCTCAAATCGAGAAGAACCA
TTCAGTGAGCTTTGTTGTTATTGGAGAAGAAGGGAAGGGAGTAAGGTCTAATCAAGATGG
TGAAGATGACATTGATAGCTCGTGTTACCGACGGCTTGCCTCTAGCCGAAGGTCTTGACG
ATGGACGTGACTTACCAGATTCCGACATGTACAAGCAACAGGTCAAGGCCTTGTTTAAGA
ATCTCTCCAGAGGTCACAACGAAGCTTCGAGAATGTCCGTTGAGACTGGTCCCTATGTTT
TCCATTACATCATAGAAGGACGTGTTTGCTACTTGACGATGTGTGACCGCTCTTACCCTA
AGAAACTGGCTTTCCAGTACCTGGAAGACCTCAGGAACGAGTTTGAACGTGTTAATGGGC
CTAACATTGAGACAGCTACTCGACCTTATGCCTTTATTAAGTTTGATACTTTCATACAGA
AAACGAAGAAACTGTACCAAGACACTCGTACGCAACGGAATATCTCTAAGCTGAACGATG
AACTCTATGAGGTTCATCAGATAATGACGAGGAATGTGCAGGAAGTCCTAGGTGTTGGTG
AAAAGCTGGACCGTAAGCAGACACATCTATTGTTTTTTATCCTGTGATCAAGGTGAGCGA
GATGTCGAGCCGACTAACATCTGAATCTCGTATATATGCTGACAAGGCTAAAGATTTGAA
CCGTCAGGCTTTGATCAGGAAGTGGGCACCAGTTGCCATCGTGCTTGGAGT

QA 1 771 1 771
DS 

RD RS1AP87JQ 789 0 0
GTTGTTATTGGAGAAGAAGGGAAGGGAGTAAGGTCTAATCAAGATGGTGAAGATGACATT
GATAGCTCGTGTTACCGACGGCTTGCCTCTAGCCGAAGGTCTTGACGATGGACGTGACTT
ACCAGATTCCGACATGTACAAGCAACAGGTCAAGGCCTTGTTTAAGAATCTCTCCAGAGG
TCACAACGAAGCTTCGAGAATGTCCGTTGAGACTGGTCCCTATGTTTTCCATTACATCAT
AGAAGGACGTGTTTGCTACTTGACGATGTGTGACCGCTCTTACCCTAAGAAACTGGCTTT
CCAGTACCTGGAAGACCTCAGGAACGAGTTTGAACGTGTTAATGGGCCTAACATTGAGAC
AGCTACTCGACCTTATGCCTTTATTAAGTTTGATACTTTCATACAGAAAACGAAGAAACT
GTACCAAGACACTCGTACGCAACGGAATATCTTTAAGCTGAACGATGAACTCTATGAGGT
TCATCAGATAATGACGAGGAATGTGCAGGAAGTCCTAGGTGTTGGTGAAAAGCTGGACCG
TAAGCAGACACATCTATTGTTTTTTATCCTGTGATCAAGGTGAGCGAGATGTCGAGCCGA
CTAACATCTGAATCTCGTATATATGCTGACAAGGCTAAAGATTTGAACCGTCAGGCTTTG
ATCAGGAAGTGGGCACCAGTTGCCATCGTGCTTGGAGTCGTGTTCCTTCTTTTCTGGGTC
AAGAACAAGCTTTGGTAAGAAAGGAGGAACCTGAGGCTAGACTTCTCCAGACATATATCG
ACCGGCACC

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 2

CO CL7761Contig1 1212 2 2 U
GCAAAACGACGTGCGCATGTCGCCGCCATCTCTTTAGGTAGTAGAGCCATCAACTCTTCA
CGACCGTTGACATTTTCTGGAGACTAGAAAATTAAAATTTTCCTTCTTTATTATTTTCCT
GAAAAAAAAAAAGGAAATCATTCCCAGTTTTCGATCTCTCTACGCTTCTTTTTGGACCCA
GGAGCTAATGACGATGTCTCGCCGCGGATTGTTGTTGATGTTCGTAGCAGTCTTCCTTGT
CCTGATTCAGTCATCAACTGCTCTGATTAGTTCTCCAAGCTCTATCATCAACCCTTCTAA
AGTCAAACAAGTTTCTTCAAAACCCAGGGCATTTGTGTATGAAGGTTTTCTAACGGACCT
GGAATGTGATCATTTGATCTCCTTTGCAAAAGAGAATCTACAGAGATCTGCGGTTGCTGA
TAACGACAATGGAGAGAGTCAAGTCAGTGACGTTCGGACCAGCTCCGGCACGTTTATCTC
CAAAGGAAAGGATCCTATTGTTTCTGGTATAGAGGACAAGCTCTCCACATGGACATTCCT
CCCAAAAGAAAACGGGGAGGATCTTCAGGTGCTGAGATATGAGCACGGTCAGAAATATGA
CGCTCACTTTGACTACTTCCACGACAAAGTCAACATCGCCCGCGGTGGACACCGTATAGC
AACCGTTTTCATGTATCTTTCCAATGTCACAAAGGGTGGAGAAACTGTTTTCCCTGATGC
AGTGGAGTTTTCACGCCTCAAGCTTTCTGTAAACAAAGACGACCTTTTTGATTGTGCAAA
GAAAGGAATTGCTGTGAAACCGAAGAAAGGAGATGCACTGTTGTTTTTCAACCTCCACCA
AGACGCAACCCCAGACACCTTGAGCCTTCACGGAGGCTGTCCTGTGATCGAAGGAGAGAA
ATGGTCAGCGACTAAATGGATTCACGTGGACTCGTTCGATAAGATTGTGACGCATGACGG
TAGCTGTTCGGATACGAACGAGAGCTGTGAAAGATGGGCAGTGCTTGGAGAATGCGCGAA
GAACCCTGAGTATATGGTGGGAACCCCAGAGCTCCCTGGAAACCGCAGGCGTAGCTGTAA
AGCTTGTTAAAGAGTTTAAATCTTTTTTTTTATTGCAATGTAACATTAAGTTCTTTTGAT
ATCGCTCTGTTTTGTCATTTTCTTGTTTTTGATGAGTTGTGTGTTCGTTGATGAGACCAT
CTCTTGTTCTTG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AD12TF U 1
AF RS1AD12JQ C 565
BS 1 617 RS1AD12TF
BS 618 1212 RS1AD12JQ

RD RS1AD12TF 617 0 0
GCAAAACGACGTGCGCATGTCGCCGCCATCTCTTTAGGTAGTAGAGCCATCAACTCTTCA
CGACCGTTGACATTTTCTGGAGACTAGAAAATTAAAATTTTCCTTCTTTATTATTTTCCT
GAAAAAAAAAAAGGAAATCATTCCCAGTTTTCGATCTCTCTACGCTTCTTTTTGGACCCA
GGAGCTAATGACGATGTCTCGCCGCGGATTGTTGTTGATGTTCGTAGCAGTCTTCCTTGT
CCTGATTCAGTCATCAACTGCTCTGATTAGTTCTCCAAGCTCTATCATCAACCCTTCTAA
AGTCAAACAAGTTTCTTCAAAACCCAGGGCATTTGTGTATGAAGGTTTTCTAACGGACCT
GGAATGTGATCATTTGATCTCCTTTGCAAAAGAGAATCTACAGAGATCTGCGGTTGCTGA
TAACGACAATGGAGAGAGTCAAGTCAGTGACGTTCGGACCAGCTCCGGCACGTTTATCTC
CAAAGGAAAGGATCCTATTGTTTCTGGTATAGAGGACAAGCTCTCCACATGGACATTCCT
CCCAAAAGAAAACGGGGAGGATCTTCAGGTGCTGAGATATGAGCACGGTCAGAAATATGA
CGCTCACTTTGACTACT

QA 1 617 1 617
DS 

RD RS1AD12JQ 648 0 0
TCAGGTGCTGAGATATGAGCACGGTCAGAAATATGACGCTCACTTTGACTACTTCCACGA
CAAAGTCAACATCGCCCGCGGTGGACACCGTATAGCAACCGTTTTCATGTATCTTTCCAA
TGTCACAAAGGGTGGAGAAACTGTTTTCCCTGATGCAGTGGAGTTTTCACGCCTCAAGCT
TTCTGTAAACAAAGACGACCTTTTTGATTGTGCAAAGAAAGGAATTGCTGTGAAACCGAA
GAAAGGAGATGCACTGTTGTTTTTCAACCTCCACCAAGACGCAACCCCAGACACCTTGAG
CCTTCACGGAGGCTGTCCTGTGATCGAAGGAGAGAAATGGTCAGCGACTAAATGGATTCA
CGTGGACTCGTTCGATAAGATTGTGACGCATGACGGTAGCTGTTCGGATACGAACGAGAG
CTGTGAAAGATGGGCAGTGCTTGGAGAATGCGCGAAGAACCCTGAGTATATGGTGGGAAC
CCCAGAGCTCCCTGGAAACCGCAGGCGTAGCTGTAAAGCTTGTTAAAGAGTTTAAATCTT
TTTTTTTATTGCAATGTAACATTAAGTTCTTTTGATATCGCTCTGTTTTGTCATTTTCTT
GTTTTTGATGAGTTGTGTGTTCGTTGATGAGACCATCTCTTGTTCTTG

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 2

CO CL7762Contig1 688 2 2 U
TTTTTGAACTGAAACAGAATCTTCTTCCCGCAAGTTCCAGATGGGAACATTAACACAGAC
AAAACATGAATAGTTTTACATATTGAAATAAGCAAAACAAAATGAGAATCAAAAAGAGAA
GCAAAGGAAACAGTGAGAATAAGAAAGTGTTGATAAATGATCATCATTCATCGTCTGAGT
ACTCAAACTTAACTGAATGTGATTGAAGATCAATCTCTCCTCCTCTGTAGCTTCCTCTTT
TCTTCTTCGTCTTCTCATGTCGGAAACCCCTTCCTCTGACTTGCCCTAGAACCTCTTGAG
CTTTAGCACCATAGCCCGAATCAGCACCACCCTTGGCCCAATAAGAGTTGTCTTTAAGCC
TATCGTCAGTGAACACAACTTCCTCAACGTTCACTCTCTGAAACGGTTTCTTCGGCTCTT
TAGAGTCAGAAAGCCCCTTTCCAGACTTCTTATTAGTTGATTTTGTTTCAACGTTACCGT
TCTCCTCAACATCAGTTTGCTTAACAGGTGTTTCTTGAACATCCATATCTTCCTTCTTCC
TACGTTTAGAGTCCTCATCATCATCATCTGTCTGTTCTTTTGTCTCTTCTTCAGGCTCTG
ATCTTTTTCTCTTCTTGGAAACTCTCTCCTCATCACCCAAAGTCTCAGACTCGGCAGCTT
TCGACTTGGTCTTCTTCTTCTTCTTTTC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DY63TF C 1
AF RS1DY63JQ U 6
BS 1 5 RS1DY63TF
BS 6 688 RS1DY63JQ

RD RS1DY63TF 688 0 0
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AAAACATGAATAGTTTTACATATTGAAATAAGCAAAACAAAATGAGAATCAAAAAGAGAA
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ACTCAAACTTAACTGAATGTGATTGAAGATCAATCTCTCCTCCTCTGTAGCTTCCTCTTT
TCTTCTTCGTCTTCTCATGTCGGAAACCCCTTCCTCTGACTTGCCCTAGAACCTCTTGAG
CTTTAGCACCATAGCCCGAATCAGCACCACCCTTGGCCCAATAAGAGTTGTCTTTAAGCC
TATCGTCAGTGAACACAACTTCCTCAACGTTCACTCTCTGAAACGGTTTCTTCGGCTCTT
TAGAGTCAGAAAGCCCCTTTCCAGACTTCTTATTAGTTGATTTTGTTTCAACGTTACCGT
TCTCCTCAACATCAGTTTGCTTAACAGGTGTTTCTTGAACATCCATATCTTCCTTCTTCC
TACGTTTAGAGTCCTCATCATCATCATCTGTCTGTTCTTTTGTCTCTTCTTCAGGCTCTG
ATCTTTTTCTCTTCTTGGAAACTCTCTCCTCATCACCCAAAGTCTCAGACTCGGCAGCTT
TCGACTTGGTCTTCTTCTTCTTCTTTTC

QA 1 688 1 688
DS 

RD RS1DY63JQ 683 0 0
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ATGAATAGTTTTACATATTGAAATAAGCAAAACAAAATGAGAATCAAAAAGAGAAGCAAA
GGAAACAGTGAGAATAAGAAAGTGTTGATAAATGATCATCATTCATCGTCTGAGTACTCA
AACTTAACTGAATGTGATTGAAGATCAATCTCTCCTCCTCTGTAGCTTCCTCTTTTCTTC
TTCGTCTTCTCATGTCGGAAACCCCTTCCTCTGACTTGCCCTAGAACCTCTTGAGCTTTA
GCACCATAGCCCGAATCAGCACCACCCTTGGCCCAATAAGAGTTGTCTTTAAGCCTATCG
TCAGTGAACACAACTTCCTCAACGTTCACTCTCTGAAACGGTTTCTTCGGCTCTTTAGAG
TCAGAAAGCCCCTTTCCAGACTTCTTATTAGTTGATTTTGTTTCAACGTTACCGTTCTCC
TCAACATCAGTTTGCTTAACAGGTGTTTCTTGAACATCCATATCTTCCTTCTTCCTACGT
TTAGAGTCCTCATCATCATCATCTGTCTGTTCTTTTGTCTCTTCTTCAGGCTCTGATCTT
TTTCTCTTCTTGGAAACTCTCTCCTCATCACCCAAAGTCTCAGACTCGGCAGCTTTCGAC
TTGGTCTTCTTCTTCTTCTTTTC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

CO CL7763Contig1 632 2 3 U
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1D760TF U 12
AF RS1DD92TF U 1
BS 1 258 RS1DD92TF
BS 259 259 RS1D760TF
BS 260 632 RS1DD92TF

RD RS1D760TF 531 0 0
GG
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QA 3 531 3 531
DS 

RD RS1DD92TF 632 0 0
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ACGACGATGTTGAGAAGCCACGGCCTAGCGGTGAGTCATCCGTTCAGAATCGATCGGTGT
CGGAGTCACAGTCTCCTCGAGGAGTTAAGGAAGACATCTCGGAGCTAACCAAGACCTTGA
GAAGCCAATTCTGGGGCGTAGCTTCGTTCCTCTCGCAACCGTCTCCATCTCCGGATCTCC
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CCGGGATTAGGAACGATTTCGCGGAGATCGGAGGGAGGTTCAGGACTGGGATTTCGAAGC
TCTCCGAGAACTTAGCGTCCAATTTCTTACAGTTGGGCTCGGAAGGAGTGGATCCGAAGG
GTTATGATGACGTAATCGGAGTGACCGATGAGGTAGTTGCGTTTTTGAGGGATCTCGCGA
TGAATCCTGATACTTGGTTGGATCTTCCTTTACCTGATGATGATGATACCTTTGATGAGT
TTGAAATGAGTGATGATCAACACGAGCATGCT

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 2

CO CL7764Contig1 695 2 1 U
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TTCAGAGAGAGGGAAGAGTATGCATACAAGGAGTAGTACCTGAGATTGCCATTCCAAGTG
ATTCAGGGTGCTTATACAGAATGCAAGTGCAGCAGCTCACCCCACCTGGTCCCTTTTCTA
TCACGTTTAATCTCCCAGGACAAGTGGATCCTCGCTTGTTTTCTCCAAAGTTTAGACCTG
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TGTTTTGAGCAATTTAATACTCCCTCCATTTTGGC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CJ08TF U 1
AF RS1CJ08JQ C 2
BS 1 695 RS1CJ08TF

RD RS1CJ08TF 695 0 0
GGACTGACGCTAGTCAAGGCCGAAACAACATCATCGAAGACTCACCGGAGATCGCTACGA
TTGGTTTGTGTTCTGTCCCTTGTGGAAAGCACAGACTCAACACCATGAACCCTGAGAATC
ATCAGACCACCACCACTCACTCGAAAGTCATCTCACATGTCTTTTTCACCGGTACCGCCA
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ACATCTTCAGAGTCTCTCTCCCTGGCATGGCCAAAAATCAAGATAAGATCAAATGTGAGA
TTCAGAGAGAGGGAAGAGTATGCATACAAGGAGTAGTACCTGAGATTGCCATTCCAAGTG
ATTCAGGGTGCTTATACAGAATGCAAGTGCAGCAGCTCACCCCACCTGGTCCCTTTTCTA
TCACGTTTAATCTCCCAGGACAAGTGGATCCTCGCTTGTTTTCTCCAAAGTTTAGACCTG
ATGGGATCTTCGAAGTTGTTGTCGTCAAGCTCGGTGTACGCATCCCAACGTCATAGCTCG
GTTCTTTGACCATTTAACTAAGTTATGTTCGATTGTTTTGTGTAGAAACATGTTCATAGT
GTTCCCGATTTCTTGAAGATGCTCTTGAACTGTGAAAGTAGTTAGATTTGAAACTGGTAC
TGTTTTGAGCAATTTAATACTCCCTCCATTTTGGC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1CJ08JQ 694 0 0
GACTGACGCTAGTCAAGGCCGAAACAACATCATCGAAGACTCACCGGAGATCGCTACGAT
TGGTTTGTGTTCTGTCCCTTGTGGAAAGCACAGACTCAACACCATGAACCCTGAGAATCA
TCAGACCACCACCACTCACTCGAAAGTCATCTCACATGTCTTTTTCACCGGTACCGCCAA
GCAAGGCAGTGCTGGGCCACCCCTTGGTCTTGTCGACATTGGTGTGAGCGACATTGCTTA
CATCTTCAGAGTCTCTCTCCCTGGCATGGCCAAAAATCAAGATAAGATCAAATGTGAGAT
TCAGAGAGAGGGAAGAGTATGCATACAAGGAGTAGTACCTGAGATTGCCATTCCAAGTGA
TTCAGGGTGCTTATACAGAATGCAAGTGCAGCAGCTCACCCCACCTGGTCCCTTTTCTAT
CACGTTTAATCTCCCAGGACAAGTGGATCCTCGCTTGTTTTCTCCAAAGTTTAGACCTGA
TGGGATCTTCGAAGTTGTTGTCGTCAAGCTCGGTGTACGCATCCCAACGTCATAGCTCGG
TTCTTTGACCATTTAACTAAGTTATGTTCGATTGTTTTGTGTAGAAACATGTTCATAGTG
TTCCCGATTTCTTGAAGATGCTCTTGAACTGTGAAAGTAGTTAGATTTGAAACTGGTACT
GTTTTGAGCAATTTAATACTCCCTCCATTTTGGC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL7765Contig1 688 2 2 U
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AAAAATTTTTTTAGTTATGACTTATACTCTTTATCACAAGCATATGTATTTTACAAATTA
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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BS 565 688 RS1GN31JQ

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QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

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BQ
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20 20 20 20 20 20 10 

AF RS1AV56TF U 1
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RD RS1AV56TF 726 0 0
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CTGGAC

QA 1 726 1 726
DS 

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QA 1 700 1 700
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1F236TF U 1
AF RS1F236JQ C 78
BS 1 639 RS1F236TF
BS 640 687 RS1F236JQ

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TGCTGGTGGTGGCTGGGGTACCGACTCACAGAAAGAAACCAATGCTGGTGGTAGCTGGGG
TACAGACTCGAAGAAAGAAACCAATGCTGGTGATGGTGATAAACCAAGCAATGAAAACAA
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AGGCAAAACAAATGCAGGAACGTCGTCATCAAGTGGCTCGTCGTGGGGAACCGGAGCTAA
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TTTTTTTGTCTTTTGTGGGCTTTCTCATGGTTTGAAAAA

QA 1 639 1 639
DS 

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ATGCTGGTGGTGGCTGGGGTACTGACTCAAAGAAAGAAACCAATGCTGGTGGTGGCTGGG
GTACCGACTCACAGAAAGAAACCAATGCTGGTGGTAGCTGGGGTACAGACTCGAAGAAAG
AAACCAATGCTGGTGATGGTGATAAACCAAGCAATGAAAACAAAGCAGCAGCTTGGGGAA
CTGCTAACGTTGAGGAGAATACAGGAAACAGCAATGATGGTTGGAGCAAGAAGTCAAGTG
ATGATGTTAAAACGAGTGGAGAAGCTGATGATAATGCATGGGGAGGCAAAACAAATGCAG
GAACGTCGTCATCAAGTGGCTCGTCGTGGGGAACCGGAGCTAAAAAATCCGGATGGTAAT
AAAAAAAAAAAGACCTGAAGTGACTTTGTAAGTAGGTCTCACTATCTATCTATCTTAGTC
TAAAGCCCAAGTTTAGTTGAAACGCTGCGAAGTGTCTTTCCTTTTTTTTTGTCTTTTGTG
GGCTTTCTCATGGTTTGAAAAACTCTTTAGGTTTGTTTATGGCCGTGACTAAAGGCTCAT
CAATAACTGG

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 2

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CAATCTATAATGTATCTATATATAATATCCAATGAAAAGGCTCTTCAAAAGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1C231JQ C 1
AF RS1C231TF U 25
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DS 

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AATGTGGGTGGAGAACTTCAACGAGACTAGACCGGTGGAGGTGGTTCACAGCCTGAGGTT
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ACATAACATTGTTTTTGGTCTGATTCTGGAAATTTTGGAAGAAGCAGAGGAGAGTTTATG
GAGCTAACTGTATTAGATCTTTCTTTATGTATAGAACAATCTATAATGTATCTATATATA
ATATCCAATGAAAAGGCTCTTCAAAAGTTG

QA 1 510 1 510
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1CD10TF C 1
AF RS1CD10JQ U 5
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RD RS1CD10TF 570 0 0
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GTTTATTAGCCAGACAAATCCTTAATTCGAAAGACGACAATCAAAGCATCACGACTCGTG
GAGCATTCATTCCTAAAAGGTGTAAACCTGTGAGATCGGTAGACAACCCGTAAAAGGAAG
CCGCTAGGCATCAAGCCCTATTATCTTACACCTAGGGAGGGTGGCCGTTGTTGAGTTTTT
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CCCTATGATGAGAAAAAGCTTTCCGAGTGGACGAGGACCGATCTTCTCTTTCTTTAGTCT
TGCTCGTCTTATGGCATTAGCCTTTGCGGATTCCTTAATCCGCGGGACAGCTGTCTCGGC
ACATGTCAATCCTTATGTCCCCAGCGAGCAGGTCAAGGTACTCTATGTTGCTGCTTGCCT
TTATCTTCCAGTCTGCCAAGCAAGCTTGCC

QA 1 570 1 570
DS 

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ATTCATTCCTAAAAGGTGTAAACCTGTGAGATCGGTAGACAACCCGTAAAAGGAAGCCGC
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ATTAAAGTCGCAAGGAGTTTGCTGCTCGTTGGTAGTGGAATGCTGACTAACCGTCCCCCT
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CGTCTTATGGCATTAGCCTTTGCGGATTCCTTAATCCGCGGGACAGCTGTCTCGGCACAT
GTCAATCCTTATGTCCCCAGCGAGCAGGTCAAGGTACTCTATGTTGCTGCTTGCCTTTAT
CTTCCAGTCTGCCAAGCAAGCTTGCC

QA 1 566 1 566
DS 



AS 1 2

CO CL7770Contig1 562 2 1 U
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ATGAAAACTTCATAAGCTACATCTGCAAAGCTTACAAAGGTAATAAAAAGCCTGCCGCAT
GTGCCAAATACTCATCCAGGAACTTCATTCGAAGTGCCAAAGTGAATCGCTTCCCTCTGG
TTTGCCGGAAAGGAGTCGATAACATGTGGGATTTTTTGGAACGTATCAAAACCTCTTTGT
TGTCGTACATCGACGTCACAGGCCTGCTATAAACACCCTTCTCTTTGTTTTATGATATGT
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TTAACACAAAGTGTATGGTTGTTGCTCTTGCCTGTTAGGTTGTGTGAAAGACCGGTTGAT
AATAAAGTCTCGTCTTTGAATT


BQ
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AF RS1BN49JQ C 1
AF RS1BN49TF U 1
BS 1 562 RS1BN49TF

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AATAAAGTCTCGTCTTTGAATT

QA 1 562 1 562
DS 

RD RS1BN49TF 562 0 0
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TCAGCAGTGGACATGGAGACAAACTTGAGTTGCAGTACGCTGCAGAAACGAGTCAGCTTC
AGCCGCCTCATCAATACGTGCCCTGGGTGGTTGTAGATGGTCAGCCTCTTTATGAGGATT
ATGAAAACTTCATAAGCTACATCTGCAAAGCTTACAAAGGTAATAAAAAGCCTGCCGCAT
GTGCCAAATACTCATCCAGGAACTTCATTCGAAGTGCCAAAGTGAATCGCTTCCCTCTGG
TTTGCCGGAAAGGAGTCGATAACATGTGGGATTTTTTGGAACGTATCAAAACCTCTTTGT
TGTCGTACATCGACGTCACAGGCCTGCTATAAACACCCTTCTCTTTGTTTTATGATATGT
AGCATGATTACTCTAAAAAGCTATATATATGGCTTCTGAGATATGATGAATATGTATGTA
TTAACACAAAGTGTATGGTTGTTGCTCTTGCCTGTTAGGTTGTGTGAAAGACCGGTTGAT
AATAAAGTCTCGTCTTTGAATT

QA 1 562 1 562
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL7773Contig1 1107 2 2 U
GGCATTAACACGGTCAGCTAGGAACTCTCCCGTTCGTGTAATTCCTGCTAAAATCAATCA
AGCAAATAATGTGACATCTGATTCATCACATATAAGATCCAGGCATCGATTTAGCCCAAC
TCAAACGCTGGCAACACCTGCGGTAATGGATCAGGTGGCTGATATGGCACTGGATGAGGC
ACATATAACACAAACTCAACCAGATTACGATATCTCGACCCAGAAGGAAGAGCCTCAGAT
ATCTGAGAGGGAGAGTCAAGATGACATCAGTGAGACATTAATGCAAACTCATAATGAGGT
CTTAAACACTCTTCAATCAAGGTTGACAAAATTACAGATTGTAAGACATTTTTGGGAGCG
TAGCGATATTAAAGGTGCAATCATGGCCTTGAAAAAGCTGTCAGATCACTCGGTTCAAGC
AGATGTGATCAGTATTCTAACAGACAAACCAGAGATTCTTACGCTGGATCTGTTTTCGCA
ATTAGCACCTGTCCTCACAGGCTTATTGGGGAGCCGGACTGAAAGGCCTGTAAGTGTCTC
CTTGGAAATGCTCTTGAAGCTAGTAGCAGTGTTCGGTACAGTTGTAAAATCAAATGTTTC
AGCAAGACGAAGTGTTGGTGTTGATCTTCATGCAGAAGAAAGACTACAGATCTGCCAAAA
TTGTTCTGCGGAATTGCAGAAGGTTCAAAAGATCCTTCCACTACTCACCAGAAGAGGAGG
TCTCATAGCTAGAAAGGCTCAAGAACTAAACTTAGTTCTACAGACACCATAAAGGTTCAG
ATTCAAGACCACTCAGAATCATTTTGAAACAGTGTTCATCTCCATCAATCTGTATGTTAT
CAAGAACTCGGTCTCCCTGTTCCTTCCAGCGATTTGGCATCCGTTGCTTTGAAGATTCGC
TTAGAAGTCGCAGTTTCTTGTGGCAGAATTTTGCTATAGAATCAACCCTTCCCGGAGAAT
TATCTCCCCCCTAAAAATCAGTATATGCTGTAAATCGATCTGTGTCTGGGATTATACTTG
TAGTGCTTCAGTTTCTTGATTCGGTAAATCACAAGTGTTACGATGTTTCCCTCTCTCCAT
GTGGACTTAATGAGAAGAGATTTCGGC


BQ
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AF RS1G506TF U 1
AF RS1G506JQ C 552
BS 1 654 RS1G506TF
BS 655 1107 RS1G506JQ

RD RS1G506TF 654 0 0
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AGCAAATAATGTGACATCTGATTCATCACATATAAGATCCAGGCATCGATTTAGCCCAAC
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ACATATAACACAAACTCAACCAGATTACGATATCTCGACCCAGAAGGAAGAGCCTCAGAT
ATCTGAGAGGGAGAGTCAAGATGACATCAGTGAGACATTAATGCAAACTCATAATGAGGT
CTTAAACACTCTTCAATCAAGGTTGACAAAATTACAGATTGTAAGACATTTTTGGGAGCG
TAGCGATATTAAAGGTGCAATCATGGCCTTGAAAAAGCTGTCAGATCACTCGGTTCAAGC
AGATGTGATCAGTATTCTAACAGACAAACCAGAGATTCTTACGCTGGATCTGTTTTCGCA
ATTAGCACCTGTCCTCACAGGCTTATTGGGGAGCCGGACTGAAAGGCCTGTAAGTGTCTC
CTTGGAAATGCTCTTGAAGCTAGTAGCAGTGTTCGGTACAGTTGTAAAATCAAATGTTTC
AGCAAGACGAAGTGTTGGTGTTGATCTTCATGCAGAAGAAAGACTACAGATCTG

QA 1 654 1 654
DS 

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GTGTTGGTGTTGATCTTCATGCAGAAGAAAGACTACAGATCTGCCAAAATTGTTCTGCGG
AATTGCAGAAGGTTCAAAAGATCCTTCCACTACTCACCAGAAGAGGAGGTCTCATAGCTA
GAAAGGCTCAAGAACTAAACTTAGTTCTACAGACACCATAAAGGTTCAGATTCAAGACCA
CTCAGAATCATTTTGAAACAGTGTTCATCTCCATCAATCTGTATGTTATCAAGAACTCGG
TCTCCCTGTTCCTTCCAGCGATTTGGCATCCGTTGCTTTGAAGATTCGCTTAGAAGTCGC
AGTTTCTTGTGGCAGAATTTTGCTATAGAATCAACCCTTCCCGGAGAATTATCTCCCCCC
TAAAAATCAGTATATGCTGTAAATCGATCTGTGTCTGGGATTATACTTGTAGTGCTTCAG
TTTCTTGATTCGGTAAATCACAAGTGTTACGATGTTTCCCTCTCTCCATGTGGACTTAAT
GAGAAGAGATTTCGGC

QA 1 556 1 556
DS 



AS 1 2

CO CL7774Contig1 676 2 6 U
CTGACAAAGAAAATATAAATCAATCGATTAATTGATTTGATTTGATATTCAGAGGGGATG
GGTTTTCTGGTGGACACCCAAAAGGAAGGAGGCGGACACTCGTGGGGTTACCTCAGGAGT
TTGGTCCGAAGGAAACAGGTCGACTCCGCAGCAGCCGAGCCTCGTTCTCATCATCTCCAG
CTCGCCAAAGCCTTAACTGTTCCTCACTTGGTTGCTATTGGTGTTGGAGCGACGATAGGA
GCGGGAGTGTATATACTTGTGGGAACAGTTGCAAGAGAGCACTCGGGACCCTCTCTTGCT
TTGTCCTTCCTTATTGCTGGAATCGCCGCTGCGCTCTCTGCCTTTTGCTATGCTGAACTC
TCTAGTCGTTGTCCCTCTGCTGGCAGCGCCTACCACTATTCTTACATTTGTGTCGACGAA
GGAGTTGCGTGGTTGATCGGTTGGGCCCTGATTCTGGAATACACCATTGGTGGCTCTGCT
GTTGCTCGTGGCATTTCCCCTAATCTGGCATTGATTTTTGGTGGTGAAGATGGTTTGCCT
TCATTCTTAGCGCGTCACCAGATCCCAGGTCTTGATGTTGTTGTTGATCCATCTGCTGCT
ATTCTTGTCTTCATTGTTACTGGCCTCTTGTGCCTTGGAATTAAGAGAGCACATTTGCTC
AGGGATTGTTACTGCA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B803TF U 1
AF RS1BV17TF U 62
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TCTAGTCGTTGTCCCTCTGCTGGCAGCGCCTACCACTATTCTTACATTTGTGTCGGCGAA
GGAGTTGCGTGGTTGATCGGTTGGGCCCTGATTCTGGAATACACCATTGGTGGCTCTGCT
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TCATTCTTAGCGCGTCACCAGATCCCAGGTCTTGATGTTGTTGTTGATCCATCTGCTGCT
ATTCTTGTCTTCATTGTTACTGGCCTCTTGTGCCTTGGA

QA 1 639 1 639
DS 

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CGGGAGTGTATATACTTGTGGGAACAGTTGCAAGAGAGCACTCGGGACCCTCTCTTGCTT
TGTCCTTCCTTATTGCTGGAATCGCCGCTGCGCTCTCTGCCTTTTGCTATGCTGAACTCT
CTAGTCGTTGTCCCTCTGCTGGCAGCGCCTACCACTATTCTTACATTTGTGTCGACGAAG
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TTGCTCGTGGCATTTCCCCTAATCTGGCATTGATTTTTGGTGGTGAAGATGGTTTTCCTT
CATTCTTAGCGCGTCACCAGATCCCAGGTCTTGATGTTGTTGTTGATCCATCTGCTGCTA
TTCTTGTCTTCATTGTTACTGGCCTCTTGTGCCTTGGAATTAAGAGAGCACATTTGCTCA
GGGATTGTTACTGCA

QA 1 615 1 615
DS 



AS 1 2

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TAAAACAAAGATGTGCAATGATCTTCTGATCTCTATTGTTCCTTGAATAATTGAGAAACT
TGTTTTTGTATTATACTAATAAGTCTCATTACTATATTAGATATCGATTTTGATTCCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1CK50TF U 1
AF RS1BL41TF U 80
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BS 186 186 RS1BL41TF
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RD RS1CK50TF 660 0 0
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GTATTCAGAACCAAAGTGTTTCACCCTAACATCAACAACAACGGGAACATCTGTTTGGAC
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TCTCTTCTCACAGACCCAAACCCTGACGATCCTCTGGTTCCAGATATAGCTCACATATAC
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TAAAACAAAGATGTGCAATGATCTTCTGATCTCTATTGTTCCTTGAATAATTGAGAAACT
TGTTTTTGTATTATACTAATAAGTCTCATTACTATATTAGATATCGATTTTGATTCCTGC

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DS 

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TAATGTCTACAACTTGTGGTTTTGGTCTTATTTTATTATAATAAAACAAAGATGTGCAAT
GATCTTCTGATCTCTATTGTTCCTTGAATAATTGAGAAACTTGTTTTTGTATTATACTAA
TAAGTCTCATTACTATATTAGATATCGATTTTGATTCC

QA 1 578 1 578
DS 



AS 1 2

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AAGACCTGTATATAATTTGTCTATATATCTTTCAGTTTCTGTTGTTTGTGTGTCAAAAAA
ACTTGTATTTATCGGTAAAAAAAACTTAATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1C396TF U 1
AF RS1C396JQ C 11
BS 1 572 RS1C396TF

RD RS1C396TF 572 0 0
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TGGAGCTGACGGGTTGATGTCGGGAAAACCACAACATATTTGAGTGTTGTCAGTGAGGCT
TCGAGTTTGCCACAAGAAGCTTCAGAGGATTCAAATACAGAAGCTGCGTTCTCCCACGAC
ATGATTAGGCACTGATATGTGCTCGTAGTTGACTCCGCGGCTATGAGCCATATGACAATG
AAACTGAGGTGGCCGATGCTACTGATCAAGATTAGAGGTTGCCAACGTTTGAGACCTTTG
CATGAACGTCTGAAGCACTTGAGGTCGTGAGAAGAACAAGTGGGAAGAACAAAGATGAAG
AAGACCTGTATATAATTTGTCTATATATCTTTCAGTTTCTGTTGTTTGTGTGTCAAAAAA
ACTTGTATTTATCGGTAAAAAAAACTTAATGC

QA 1 572 1 572
DS 

RD RS1C396JQ 562 0 0
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ACTGATATGTGCTCGTAGTTGACTCCGCGGCTATGAGCCATATGACAATGAAACTGAGGT
GGCCGATGCTACTGATCAAGATTAGAGGTTGCCAACGTTTGAGACCTTTGCATGAACGTC
TGAAGCACTTGAGGTCGTGAGAAGAACAAGTGGGAAGAACAAAGATGAAGAAGACCTGTA
TATAATTTGTCTATATATCTTTCAGTTTCTGTTGTTTGTGTGTCAAAAAAACTTGTATTT
ATCGGTAAAAAAAACTTAATGC

QA 1 562 1 562
DS 



AS 1 2

CO CL7777Contig1 821 2 8 U
ACATATTATAATATATCTGCTTGTCGACCCTCCTCTTTTCCCCTTTTTCTTAACGAGGTT
TTTTATTAAGCTTTGATGACGTCTGGGGTCTTTCTTTGGCACTGCTGCTTTTTGCTTTTC
TTTCTGTTTTCTACCTTCTACTCGCTGTTATCGCTGGGGCAATGATGCTGGGTTTGAAGC
TTTGTCTTCATTACCATTCATCCCGATGAAGTGGGGAGCTACTTTAATGAACTCTTTCCT
CTTCAATGTTGGGCTCATTCTTCTTTGTTCCATCAGTGTGATTCAGTTCTGTGCCACTGC
ATTTGGATACTACGCTCAAGCCACCGCTGCTCAGGAGATCTTTGGCCACACATTGCAGTC
GCTTCGAGGAATCAAGTATCTCTACAAGTACAACGTGTTCCAAATCGGGTTTGTTATCCT
GGCTGGATTGACCTTCCTATATTACATTGCCTTCGGATGGAGAAGAAAGAAACCTAGCGC
CCGTTTCCAGCTCTTTTTTTAATGTGAAAGTATTTCCCTTTCGCTGGGGATTTGATTGAG
TGCTGTCCACACAAAGTGTTTGATTTGTTTCCGGATCATACCGGAAGTATCTGGAGACTC
TGCTTGTGCTTATGAGTTTTTTTTTTTTTTTAATATTGTTTCTCATTTTTTTGTTATGTA
TTTACTGTTTGGTTGAGCAACTGTTAGCTGTCCTGTCTTGTCTTGTCTTGGTTTATTGTA
TTGTACTGTCTTCTGATGCCAGATTATGTAGTGAGAAGCCTTACATCTCACAAGACATTG
CCTTAGACTTTGCGATAGATTTCCTTGTGGTCAAGGACTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BX68TF U 1
AF RS1BX68JQ C 261
BS 1 334 RS1BX68TF
BS 335 335 RS1BX68JQ
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BS 399 821 RS1BX68JQ

RD RS1BX68TF 399 0 0
ACATATTATAATATATCTGCTTGTCGACCCTCCTCTTTTCCCCTTTTTCTTAACGAGGTT
TTTTATTAAGCTTTGATGACGTCTGGGGTCTTTCTTTGGCACTGCTGCTTTTTGCTTTTC
TTTCTGTTTTCTACCTTCTACTCGCTGTTATCGCTGGGGCAATGATGCTGGGTTTGAAGC
TTTGTCTTCATTACCATTCATCCCGATGAAGTGGGGAGCTACTTTAATGAACTCTTTCCT
CTTCAATGTTGGGCTCATTCTTCTTTGTTCCATCAGTGTGATTCAGTTCTGTGCCACTGC
ATTTGGATACTACGCTCAAGCCACCGCTGCTCAG*AGATCTTTGGCCACACATTGCAGTC
GCTTCGAGGAATCA*GTATCTCTACA*GTACAACGTGT
C

QA 1 398 1 398
DS 

RD RS1BX68JQ 561 0 0
TTCTTTGTTCCATCAGTGTGATTCAGTTCTGTGCCACTGCATTTGGATACTACGCTCAAG
CCACCGCTGCTCAGGAGATCTTTGGCCACACATTGCAGTCGCTTCGAGGAATCAAGTATC
TTTACAAGTACAACGTGTTCCAAATCGGGTTTGTTATCCTGGCTGGATTGACCTTCCTAT
ATTACATTGCCTTCGGATGGAGAAGAAAGAAACCTAGCGCCCGTTTCCAGCTCTTTTTTT
AATGTGAAAGTATTTCCCTTTCGCTGGGGATTTGATTGAGTGCTGTCCACACAAAGTGTT
TGATTTGTTTCCGGATCATACCGGAAGTATCTGGAGACTCTGCTTGTGCTTATGAGTTTT
TTTTTTTTTTTAATATTGTTTCTCATTTTTTTGTTATGTATTTACTGTTTGGTTGAGCAA
CTGTTAGCTGTCCTGTCTTGTCTTGTCTTGGTTTATTGTATTGTACTGTCTTCTGATGCC
AGATTATGTAGTGAGAAGCCTTACATCTCACAAGACATTGCCTTAGACTTTGCGATAGAT
TTCCTTGTGGTCAAGGACTGT

QA 1 561 1 561
DS 



AS 1 2

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GGAAAACAAAACCAAATTGCTCATCTCTCGACTGACGGAAACCAAAAGGGGATTAGGGTT
ACATCATATTTAACTTGTTCGAGGATCCCTAATATTTTGAGAAATTCTGTCTTTTTTTTT
ACCAGCTGATTCTTCACTATACACCGTGTACTCCACCATTTATGTCCTTTTCTCCTTCAT
GTTGCTTCTTCATCAACATTAACCATCATCTCCCCCCGTCAATAACTCCGTCCTTATCGT
CTCACACCATTTAGAGGTTATAGATCGGTGCATCTGTTCGTGCCGATACGTCTTCCTTGG
ACCATAAAAGGTGGTGGTGAATTTCCTCTGCTCAGAAATAATGAGTAGGCCAGGTTACCA
AGAATTTCATGTATCACCCTAGATGAGTATTCCCTGTCACTGCAGATATGAGGAAGACTC
ATCAAGATACCCTGCCTCTCACACCTGATGCATTCTAAAGGGGTAGAAAAGCTCTTAACT
GTTCTACATGACTGTTGCGTTCATATCCAAACATAGTTGCCGATTAAGAGGTGAAAACGG
AGTAGCAAGTGTGTAGAATATGAAGACCTCATGTTCAAATGTGGACGCATCCGTTAAATT
GTGTTACAAAGTAACTTTGTTTTAATTTACATGTTAAAGAACTCTTTTTAGTTAATTGGA
ACAACGATAATGGGTGTAGGTTCAATAAGTGGCATAATGCGTAAATACTCTAGCAATGAA
AGGAGAGTTATTTATTTAGGCTGAGGAGCATTGTGAGACTGCCACTTCAGCATAATGACA
TGAATGTAAATAAATTATAAATCAAGGTTATTCTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DR83TF U 1
AF RS1DR83JQ C 113
BS 1 675 RS1DR83TF
BS 676 817 RS1DR83JQ

RD RS1DR83TF 675 0 0
GGAAAACAAAACCAAATTGCTCATCTCTCGACTGACGGAAACCAAAAGGGGATTAGGGTT
ACATCATATTTAACTTGTTCGAGGATCCCTAATATTTTGAGAAATTCTGTCTTTTTTTTT
ACCAGCTGATTCTTCACTATACACCGTGTACTCCACCATTTATGTCCTTTTCTCCTTCAT
GTTGCTTCTTCATCAACATTAACCATCATCTCCCCCCGTCAATAACTCCGTCCTTATCGT
CTCACACCATTTAGAGGTTATAGATCGGTGCATCTGTTCGTGCCGATACGTCTTCCTTGG
ACCATAAAAGGTGGTGGTGAATTTCCTCTGCTCAGAAATAATGAGTAGGCCAGGTTACCA
AGAATTTCATGTATCACCCTAGATGAGTATTCCCTGTCACTGCAGATATGAGGAAGACTC
ATCAAGATACCCTGCCTCTCACACCTGATGCATTCTAAAGGGGTAGAAAAGCTCTTAACT
GTTCTACATGACTGTTGCGTTCATATCCAAACATAGTTGCCGATTAAGAGGTGAAAACGG
AGTAGCAAGTGTGTAGAATATGAAGACCTCATGTTCAAATGTGGACGCATCCGTTAAATT
GTGTTACAAAGTAACTTTGTTTTAATTTACATGTTAAAGAACTCTTTTTAGTTAATTGGA
ACAACGATAATGGGT

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1DR83JQ 705 0 0
TTTTTTTTACCAGCTGATTCTTCACTATACACCGTGTACTCCACCATTTATGTCCTTTTC
TCCTTCATGTTGCTTCTTCATCAACATTAACCATCATCTCCCCCCGTCAATAACTCCGTC
CTTATCGTCTCACACCATTTAGAGGTTATAGATCGGTGCATCTGTTCGTGCCGATACGTC
TTCCTTGGACCATAAAAGGTGGTGGTGAATTTCCTCTGCTCAGAAATAATGAGTAGGCCA
GGTTACCAAGAATTTCATGTATCACCCTAGATGAGTATTCCCTGTCACTGCAGATATGAG
GAAGACTCATCAAGATACCCTGCCTCTCACACCTGATGCATTCTAAAGGGGTAGAAAAGC
TCTTAACTGTTCTACATGACTGTTGCGTTCATATCCAAACATAGTTGCCGATTAAGAGGT
GAAAACGGAGTAGCAAGTGTGTAGAATATGAAGACCTCATGTTCAAATGTGGACGCATCC
GTTAAATTGTGTTACAAAGTAACTTTGTTTTAATTTACATGTTAAAGAACTCTTTTTAGT
TAATTGGAACAACGATAATGGGTGTAGGTTCAATAAGTGGCATAATGCGTAAATACTCTA
GCAATGAAAGGAGAGTTATTTATTTAGGCTGAGGAGCATTGTGAGACTGCCACTTCAGCA
TAATGACATGAATGTAAATAAATTATAAATCAAGGTTATTCTATT

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL7779Contig1 578 2 2 U
GCTGAGCTTGCTCTATATGTTCTTCCTCGTGCAGGCGATTCTCTGTGGGAGATACTTGTT
AACCGCCACATTCTTCCCAATATTAAAAACGCCGAGGTTGCTGTATTCTGTGGATGTATG
GGAGGAATCATGTATTACCTAGAACATGAGCCTGATACATTGGCTCCGTTTCTGAGAGGA
CTCATCCGTCGGTTTCTTGCTAGTCAAATAAGCAATCCAAGTAGCAAAATCAGTCAGAGT
TCTTCCTATACGTATCTCCACACTCTAGATGCATTGGAGAAGCCGAAACCGCCTCCTGAG
AGCCGAGAAGGTGAAATCCAAAAAGCTGAAGAGAAGTACAACCTGGAGGCAATTCCTGGT
CTTTAGAAGCAAAGATATCTGATAGTTTCAACAGCTGTAGTCGCATCATGGATATGGTTT
TGATTAAACTCCCCTGGAAAAAAAGGGTTCATCGACAGGAAAAAGAACTTGAGAGATTAA
AGTGGTTTTTATAGGATTTTAGGAGTCTTTTTAAGGTGTCTTTGTTTTATATTTGACAAT
CTTCCCAAAATAACAACAACAAAAAATTGTCTCTTCTT


BQ
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TCCTATACGTATCTCCACACTCTAGATGCATTGGAGAAGCCGAAACCGCCTCCTGAGAGC
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QA 1 575 1 575
DS 



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CGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1AC63TF C 1
AF RS1AC63JQ U 225
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QA 1 562 1 562
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1B181TF U 1
AF RS1B181JQ C 20
BS 1 587 RS1B181TF

RD RS1B181TF 587 0 0
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GAAATGTTATTTTCTTGACCACAAGCCCTTGGACCTGTGGTAGAAGC

QA 1 587 1 587
DS 

RD RS1B181JQ 568 0 0
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GACGGTGGCGGTGGAGGTGGTGAGGCTGGCTCCGCACCCCAAGTACAAAAGGCGCGTGAG
GATGAAGAAGAAGTATCAGGCGCATGACCCTGATAACGTGTTCAAGGTGGGTGACGTTGT
GAGGCTTGAGAAGAGCAGGCCCATCAGCAAGACCAAGTCTTTCGTCGCCCTTCCTGTTCT
CAAGAGGAATGATCTTGGGATTCCGATGGAGTCTCAGCAGTCGCCGCCGCCTCCGCAGGT
GGTAGAGTAGAGAAAGAATGGTTGTTTATTTGTATTTCTGCAAACTTTGAGTTGTAATTG
AGTTGAACTGTTGTTCTTGGAATGTGTTTTCGTTTTCAGTTGAAATGTTATTTTCTTGAC
CACAAGCCCTTGGACCTGTGGTAGAAGC

QA 1 568 1 568
DS 



AS 1 2

CO CL7782Contig1 868 2 2 U
GGGTACAAAACATTTATAATGGTTGTGAAACTATACGGACAGGTAACTGCAGCTTGTCCA
CAAAGAGTCTTGCTTTGTTTTTTGGAGAAAGAAATTGAGTTTGAGATTGTTCATGTCGAC
CTTGATACACTAGAGCAGAAGAAACCAGAACATCTTCTTCGTCAGCCATTTGGTCAAGTC
CCAGCCATAGAAGATGGAGATTTCAAGCTTTTTGAATCTAGAGCCATTGCGAGATATTAC
GCGACCAAGTACGCGGACCAAGGCACGAACCTTTTGGGCAAGTCTCTAGAGCACCGAGCC
ATCGTAGACCAGTGGGCCGACGTGGAGACCCATTACTTTAACGTTCTGGCCTTCCCCATT
GTGTTTAACCTACTCATTAAGCCCAGGTTAGGCGAAGAATGTGACGACGTTCTGGTCAAG
GAGACCAAGCTCAAGCTCGAGGTGGTTTTGGACATATACGAGAACCGGTTTGCTTCGAAC
CGGTTTTTGGCTGGTGGTGAATTCACTGTGGCTGATTTGACGCACATGCCGGCGATGGGG
CACTTGATGCATACCGATGTAAACCGGATGGTTAAGGCTAGAGTGAATATGAACCGGTGG
TGGGAAGAGATTACGGCTAGACCGGCTTGGAAGAAGCTTATGAATATGGCTGGTTTTTAG
TTAGCTTGGGTTTATAACGATCCAAACCAAATAAACGTTTCATACTTTCTGTTTAATATG
TTTGAGTTTTATGCATTCCAATAATTAAATCAATTTACTTTTGCAGAATAACTTCTGTTT
GTTTTCTTTCCCGTTTGTTTGGGGTTTTATGGTTCCTACTGGTGTCTTTTATCTGCATTC
TACTCTAGGGGTGATACTCCTTTGTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AV41TF U 1
AF RS1AV41JQ C 125
BS 1 318 RS1AV41TF
BS 319 868 RS1AV41JQ

RD RS1AV41TF 318 0 0
GGGTACAAAACATTTATAATGGTTGTGAAACTATACGGACAGGTAACTGCAGCTTGTCCA
CAAAGAGTCTTGCTTTGTTTTTTGGAGAAAGAAATTGAGTTTGAGATTGTTCATGTCGAC
CTTGATACACTAGAGCAGAAGAAACCAGAACATCTTCTTCGTCAGCCATTTGGTCAAGTC
CCAGCCATAGAAGATGGAGATTTCAAGCTTTTTGAATCTAGAGCCATTGCGAGATATTAC
GCGACCAAGTACGCGGACCAAGGCACGAACCTTTTGGGCAAGTCTCTAGAGCACCGAGCC
ATCGTAGACCAGTGGGCC

QA 1 318 1 318
DS 

RD RS1AV41JQ 744 0 0
ATACACTAGAGCAGAAGAAACCAGAACATCTTCTTCGTCAGCCATTTGGTCAAGTCCCAG
CCATAGAAGATGGAGATTTCAAGCTTTTTGAATCTAGAGCCATTGCGAGATATTACGCGA
CCAAGTACGCGGACCAAGGCACGAACCTTTTGGGCAAGTCTCTAGAGCACCGAGCCATCG
TAGACCAGTGGGCCGACGTGGAGACCCATTACTTTAACGTTCTGGCCTTCCCCATTGTGT
TTAACCTACTCATTAAGCCCAGGTTAGGCGAAGAATGTGACGACGTTCTGGTCAAGGAGA
CCAAGCTCAAGCTCGAGGTGGTTTTGGACATATACGAGAACCGGTTTGCTTCGAACCGGT
TTTTGGCTGGTGGTGAATTCACTGTGGCTGATTTGACGCACATGCCGGCGATGGGGCACT
TGATGCATACCGATGTAAACCGGATGGTTAAGGCTAGAGTGAATATGAACCGGTGGTGGG
AAGAGATTACGGCTAGACCGGCTTGGAAGAAGCTTATGAATATGGCTGGTTTTTAGTTAG
CTTGGGTTTATAACGATCCAAACCAAATAAACGTTTCATACTTTCTGTTTAATATGTTTG
AGTTTTATGCATTCCAATAATTAAATCAATTTACTTTTGCAGAATAACTTCTGTTTGTTT
TCTTTCCCGTTTGTTTGGGGTTTTATGGTTCCTACTGGTGTCTTTTATCTGCATTCTACT
CTAGGGGTGATACTCCTTTGTTCG

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL7783Contig1 951 2 2 U
GGACACAACACACAAAGAATGATGTTCCAGAAATAGTATGGCACTGAATCTCAGGATCCT
CTCGCCTAGATCATCAAGGAGATAGAAGATGAAAACATTATATTTAACCAGAGACGAGCT
AGCTCTTATAATCCTATACTTGAACAAGGCTGAGGCTAGAGATAAGATATGCAGAGCTAT
ACAGTACGGTTCCAAATTCTTGAGCGGTGGAAAACCTGGTACTGCTCAAAATGTCTACAG
AAACACCAGTTTGGCTAGAAAAGTGTTCCGTCTTTTCAAGTTTCTCAATGATTTTCAATT
GCTTATTAGCCCTGTGCATAGAAGGACTCCTCTTCCTCTTGTCTTGCTCGGAAAGTGCAA
GAATGCACTCTTGTGTACCTACTTCTTTCTTGATCAATTCGTCTGGCTTGGTAGATCCGG
CATATATAAGAACAAAATATTAACGGAGTTGATTAGCGGTTTCTCAATTTTCTGCTGGCT
TGGATCATCTATCTGTATTGTAATAATTGAGATTTGTGAGCTTATAAGGCTCTCTTCATC
TATGAAGAAGATGGACAAGGAACTCAAAGATGATGAAAAGAAGAATCATGATGAGTTGCA
TCGTGCTAAGCTTCAGAAAACAAAAGACAGAATAGTAGCTTTGATTAAATCAAGCATGGA
CATTGTTGTAGCCATTGGTCTGCTTCGTTTAGCTCCATGGATAATTGGTCATCGTGTCAC
TGGCTTTTTGGGGCTTATCACCTCACTTATCTCTTGTTATCAGTTGCTTCCAGTGCGTCC
CAAGTTAAAGACATCTTGAAGCAAGAAGAAGCTTCTTCTTCTCTAGACCTTCAGAATAAT
TGTTTCATGTTGATTTCATGTAATCTTAGGAGTCTACGTTGCTCCTATGCTGTAATAATG
ATAACTCTTATACGATACTTATACTCTGAACAGGATTCTATGTTCAAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CH24TF U 1
AF RS1CH24JQ C 190
BS 1 752 RS1CH24TF
BS 753 951 RS1CH24JQ

RD RS1CH24TF 752 0 0
GGACACAACACACAAAGAATGATGTTCCAGAAATAGTATGGCACTGAATCTCAGGATCCT
CTCGCCTAGATCATCAAGGAGATAGAAGATGAAAACATTATATTTAACCAGAGACGAGCT
AGCTCTTATAATCCTATACTTGAACAAGGCTGAGGCTAGAGATAAGATATGCAGAGCTAT
ACAGTACGGTTCCAAATTCTTGAGCGGTGGAAAACCTGGTACTGCTCAAAATGTCTACAG
AAACACCAGTTTGGCTAGAAAAGTGTTCCGTCTTTTCAAGTTTCTCAATGATTTTCAATT
GCTTATTAGCCCTGTGCATAGAAGGACTCCTCTTCCTCTTGTCTTGCTCGGAAAGTGCAA
GAATGCACTCTTGTGTACCTACTTCTTTCTTGATCAATTCGTCTGGCTTGGTAGATCCGG
CATATATAAGAACAAAATATTAACGGAGTTGATTAGCGGTTTCTCAATTTTCTGCTGGCT
TGGATCATCTATCTGTATTGTAATAATTGAGATTTGTGAGCTTATAAGGCTCTCTTCATC
TATGAAGAAGATGGACAAGGAACTCAAAGATGATGAAAAGAAGAATCATGATGAGTTGCA
TCGTGCTAAGCTTCAGAAAACAAAAGACAGAATAGTAGCTTTGATTAAATCAAGCATGGA
CATTGTTGTAGCCATTGGTCTGCTTCGTTTAGCTCCATGGATAATTGGTCATCGTGTCAC
TGGCTTTTTGGGGCTTATCACCTCACTTATCT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RS1CH24JQ 762 0 0
TTCCAAATTCTTGAGCGGTGGAAAACCTGGTACTGCTCAAAATGTCTACAGAAACACCAG
TTTGGCTAGAAAAGTGTTCCGTCTTTTCAAGTTTCTCAATGATTTTCAATTGCTTATTAG
CCCTGTGCATAGAAGGACTCCTCTTCCTCTTGTCTTGCTCGGAAAGTGCAAGAATGCACT
CTTGTGTACCTACTTCTTTCTTGATCAATTCGTCTGGCTTGGTAGATCCGGCATATATAA
GAACAAAATATTAACGGAGTTGATTAGCGGTTTCTCAATTTTCTGCTGGCTTGGATCATC
TATCTGTATTGTAATAATTGAGATTTGTGAGCTTATAAGGCTCTCTTCATCTATGAAGAA
GATGGACAAGGAACTCAAAGATGATGAAAAGAAGAATCATGATGAGTTGCATCGTGCTAA
GCTTCAGAAAACAAAAGACAGAATAGTAGCTTTGATTAAATCAAGCATGGACATTGTTGT
AGCCATTGGTCTGCTTCGTTTAGCTCCATGGATAATTGGTCATCGTGTCACTGGCTTTTT
GGGGCTTATCACCTCACTTATCTCTTGTTATCAGTTGCTTCCAGTGCGTCCCAAGTTAAA
GACATCTTGAAGCAAGAAGAAGCTTCTTCTTCTCTAGACCTTCAGAATAATTGTTTCATG
TTGATTTCATGTAATCTTAGGAGTCTACGTTGCTCCTATGCTGTAATAATGATAACTCTT
ATACGATACTTATACTCTGAACAGGATTCTATGTTCAAGTCC

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL7784Contig1 716 2 10 U
ATTTGTTTCGGCAAATCTCCTTTGGCATTTCAGAGTCCTTAGTTGGCTCACCTTTATCCC
TCTAGGCGAGCAAATCTCCTTTGGCATTATCAGAGTCCATACCTGGCTCACGTTATCAGT
TAGCGAGCAAATCTCCTTTGGCATTATCAGAGTCTTACACTCGACTCCTACTATCTTAGT
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1CP47TF U 1
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TA

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DS 

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G
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QA 2 685 2 685
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1GT42JQ C 1
AF RS1GT42TF U 1
BS 1 567 RS1GT42TF

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TGGATTAATCTCAAGCTGAGTTATTTT

QA 1 567 1 567
DS 

RD RS1GT42TF 567 0 0
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TCCTTTCTCTTCTCCAAGGCTTCAACTTTCGTCTTTCGCTTCACCAGTTTTCAGCCTTAA
ACCCAACACCGTCGAGTCTAAGAACAGAGTCTCACTCAGTGCGCACAACTTGAGCAATAG
TCATGGAAGAAGAGCAGTGATTGTGAAGGCAGCTGCTTCTGGAGTCGACGGAGCTGAGCC
CGAGAGCAATGACGAACCACCTAAGACTGTTGTCGCTGCTGTTCCAGTTGACAAACTACC
ATTGGAATCAAAAGAAGCTAAAGAGAAGTTACTGCTTGAACAGAGGATGAAGATGAAGCT
GGCCAAGAAGATTAGGCTACGCAGGAAACGTCTGGTTCGCAAGCGTAAGCTGAGGAAGAA
GGGTCGTTGGCCACCTTCCAAGATGAAGATGCTCAAGAATGTTTAGAGCTAATGCTGATC
CCTTTGCTCCCCCTCTCATTTGAATTTTTCTTTGTAAACTTTCTGGAACCATTGTTTTTT
TGGATTAATCTCAAGCTGAGTTATTTT

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 2

CO CL7786Contig1 995 2 6 U
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CGGGTAAGCCCTTACCCCTGAACCCTTTCCCCGGCTTTTTCGCGATTGCTCGGACTGGCA
TCTTCTGGGATATAGACCAATTCAAGATTGATGCTCAGAGCAATGCTTATTCCACTGCGC
AGAACATCAGAAGGACGCTTTCTGTGGCTGGTCATCTTGGTAAAGTTGAGATCATGGCTT
ATGGCGTTGATGATGGTCATGACTTCAAGGAGGAAGCTAAGTTCACTTCCTTTCCAGCAG
GAGCTGACACTGATCGGCACACCAAGATGCTCGAAGACATTCGTGTCTGGTCATCTAATA
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TTATTGAATCTCTGGAGTCTTGTTCGTCTTCTCGTTTTCTAGGAGTTCTTTCAGTCTTCG
ATGTTTCTCGCCGATTCGTGAGAATGACTCATTTCTCCTTTCTTTATTTATCGGTCATCA
TCAATCTTCAGTAACTATGAATCTTCTCTTAGCCGGATTGAATCTGGAGCTCTGAGTGGT
ATCTGGAACTTGTGTGACGGCGAGGCATCAACCGAGTTTGTGGAAGCAGTTTCATTTCTG
AAATGTCATCGTGGACAGATAATTTTATTTGTTGGTCGCTTATGATTGTCATAGTTTTAC
CACATTTTTTCATCTCCTCTTTAAATTTGCATGTTTGTTAGTTCCTTTAGCCTAATTTTT
CTTCTAGTGTTTTTGTCCCGGTTGACCAAAATTTATAACTATTCCGATGTATTTGAATTG
TTGTTAAAAAAAATACATTTGTATTGTTGTTTACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D029TF U 1
AF RS1D029JQ C 216
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CGGGTAAGCCCTTACCCCTGAACCCTTTCCCCGGCTTTTTCGCGATTGCTCGGACTGGCA
TCTTCTGGGATATAGACCAATTCAAGATTGATGCTCAGAGCAATGCTTATTCCACTGCGC
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TTATTGAATCTCTGGAGTCTTGTTCGTCTTCTCGTTTTCTAGGAGTTCTTTCAGTCTTCG
ATGTTTCTCGCCGATTCGTGAGAATGACTCATTTCTCCTTTCTTTATTTATCGGTCATCA
TCAATCTTCAGTAACTATGAATCTTCTCTTAGCCGGATTGAATCTGGAGCTCTGAGTGGT
ATCTGGAACTTGTGTGACGGCGAGGCATCAACCGAGTTTGTGGA*GCAGTTTCATTTCTG
AA*TGTCATCGTG

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DS 

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C
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TTGGTAAAGTTGAGATCATGGCTTATGGCGTTGATGATGGTCATGACTTCAAGGAGGAAG
CTAAGTTCACTTCCTTTCCAGCAGGAGCTGACACTGATCGGCACACCAAGATGCTCGAAG
ACATTCGTGTCTGGTCATCTAATAGTCCCAGTCCATCAAACCTGTTCCTTATCATGGGAG
ACTCCGCAGTTGATTTCAACCCCGTTATTGAATCTCTGGAGTCTTGTTCGTCTTCTCGTT
TTCTAGGAGTTCTTTCAGTCTTCGATGTTTCTCGCCGATTCGTGAGAATGACTCATTTCT
CCTTTCTTTATTTATCGGTCATCATCAATCTTCAGTAACTATGAATCTTCTCTTAGCCGG
ATTGAATCTGGAGCTCTGAGTGGTATCTGGAACTTGTGTGACGGCGAGGCATCAACCGAG
TTTGTGGAAGCAGTTTCATTTCTGAAATGTCATCGTGGACAGATAATTTTATTTGTTGGT
CGCTTATGATTGTCATAGTTTTACCACATTTTTTCATCTCCTCTTTAAATTTGCATGTTT
GTTAGTTCCTTTAGCCTAATTTTTCTTCTAGTGTTTTTGTCCCGGTTGACCAAAATTTAT
AACTATTCCGATGTATTTGAATTGTTGTTAAAAAAAATACATTTGTATTGTTGTTTACC

QA 2 780 2 780
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1DY47JQ U 17
AF RS1H795JQB U 1
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TGGTGCAGGTCTTGATCCAAAACCAGGTTGCTGTGGGTATGATTGGTAAGCAGCTGGAGG
TGGTGCATAGTGGTGGTGCATTGGACCAGGATACTGCTGCTGGTAGGGCGATGGCATGTA
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CTGCTGCATTGGTGGTGGTTGATTATGTTGCT

QA 1 572 1 572
DS 

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TGATTCATTCAGAGTACGAAAATCTTTTGAGCATGGCAAAGATAAACGTTGCTGAACATT
TTAAGCAAGGATTCTTCTATTGAGATGAATCAGTCGTAGTAAAAGCAGCAGGAGGTTGCT
GAGCGGATCC*GAAGGTGGTGCGCTAGACCCAGCAGGTGCAGAGTCAGGTGGTGGAGCAA
AGGCTGCGTTTGGAGTTGGTGCAGGTCTTGATCCAAAACCAGGTTGCTGTGGGTATGATT
GGTAAGCAGCTGGAGGTGGTGCATAGTGGTGGTGCATTGGACCAGGATACTGCTGCTGGT
AGGGCGATGGCATGTATCCATATGGTGCTGGTGGGTACGGCTGGTGTGGAGGCATCATGT
AAGAAGACGAAGGTGCGTTGTTCTCAGTGCTTGAACCACCAGCTTCTTGGGTTGAAACAA
CTGCACCCATTCTCTGTGGGTCCATAGATGGGTAATAAGGTTTGTCTTGGTTGGGTGGTG
GTGGGTGCATGTAGTACTGCTGCATTGGTGGTGGTTGATTATGTTGCTGAGATATAATGG
TTCGAGGTAGCAAACCACTATGAGCCACACCGCCCTGTTGGTTCGAACCATCTTGA

QA 1 656 1 656
DS 



AS 1 2

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ATGGACCCGCAAGTTGTAACTGGATCTCATGACACTACTATTAAATTCTGGGACCTTCGA
TATGGCAAAACAATGACGACTCTAACACATCATAAGAAATCTGTCAGAGCAATGACCCTT
CATCCTAAAGAGAATGCATTTGCTTCTGCATCAGCTGACAACACCAAAAAGTTTAGCCTT
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GACTGGAAGAGTGGCCACAGTTTCCAACAGACAGAAACTATTGTACAACCTGGTTCACTG
GAGAGTGAAGCGGGTATATACGCAGCGTGTTATGATCAGACAGGTTCGAGATTGGTAACA
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CACCCTGTCAATTTCAAACCACCCAAGGAGATTAGGGGCTTTTGATAGGCTCACTTTTTT
ACTA


BQ
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20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1D688TF U 1
AF RS1CN48JQ C 379
BS 1 529 RS1D688TF
BS 530 530 RS1CN48JQ
BS 531 631 RS1D688TF
BS 632 664 RS1CN48JQ

RD RS1D688TF 631 0 0
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GATCAAATTTTTGCACTCACAGGACATGAGAGCACCGTTTGTTCTGTCTTCACTCGTCCA
ATGGACCCGCAAGTTGTAACTGGATCTCATGACACTACTATTAAATTCTGGGACCTTCGA
TATGGCAAAACAATGACGACTCTAACACATCATAAGAAATCTGTCAGAGCAATGACCCTT
CATCCTAAAGAGAATGCATTTGCTTCTGCATCAGCTGACAACACCAAAAAGTTTAGCCTT
CCAAAAGGAGAGTTTTGCCACAACATGCTTTCGCAGCAGAAAACCATAATTAACGCAATG
ACTGTGAACGAGGATGGTGTAATGGTCACTGGAGGTGATAATGGAAGTTTATGGTTCTGG
GACTGGAAGAGTGGCCACAGTTTCCAACAGACAGAAACTATTGTACAACCTGGTTCACTG
GAGAGTGAAGCGGGTATATACGCAGCGTGTTATGATCAGACAGGTTCGATATTGGTAACA
TGTGAGGCGGATAAGACGATAAAGATGTGGAAAGAAGATGAGAATGCTACTCCAGAAACT
CACCCTGTCAATTTCAAACCACCCAAGGAGA

QA 1 631 1 631
DS 

RD RS1CN48JQ 286 0 0
GTAATGGTCACTGGAGGTGATAATGGAAGTTTATGGTTTTGGGACTGGAAGAGTGGCCAC
AGTTTCCAACAGACAGAAACTATTGTACAACCTGGTTCACTGGAGAGTGAAGCGGGTATA
TACGCAGCGTGTTATGATCAGACAGGTTCGAGATTGGTAACATGTGAGGCGGATAAGACG
ATAAAGATGTGGAAAGAAGATGAGAATGCTACTCCAGAAACTCCCCCTGTCAATTTCAAA
CCCCCCAAGGAGATTAGGGGCTTTTGATAGGCTCACTTTTTTACTA

QA 1 286 1 286
DS 



AS 1 2

CO CL7789Contig1 959 2 8 U
GGGAGTAAAATGGTGATGGCAGGATCGATATTGACATGCGAACAAGCACATTGACGAAAC
CGATCGTTCTCTTCTCGATCTCACTGTTGAGCACCGTCCTCTTCTTCGCATTCTTCTTCG
AAGACAAGCCTTACTCATCATCATCATCTCCCTCTTCTTCAGACTCCATGGCTCGAAGAA
CCTTCATCTTGTGGCTTCACGGGCTTGGAGATTCCGGACCTGCCAACGAACCCATCAAGA
CACTTTTCAAGTCTCCCGAGTTTAGCAACACCAAATGGCTCTTCCCATCCTCTCCTCCGA
ATCCAGTCTCCTGCAATCATGGTATGGTGATGCCTTCTTGGTTTGACATCCGTGAGCTTC
CTCTTACCGCGGCCTCTCCAAATGATGAAAGCAGTGTGCTTGAAGCAGTTAAGAACGTTC
ATGCTGTTATAGATAAGGAGATTGCAGGAGGAATCAAGCCAGAAAACGTGTATATCTGTG
GATTTAGCCAAGGAGGGGCATTAACCTTGGCTAGTGCTCTGCTTTACCCTAAAACTCTTG
GAGGAGGTGCAGTCTTTAGTGGATGGGTTCCATTCAATTCTTCTGTCATCAATCAGTTTA
CCAAAGATGCTATCAAGACGCCAATCTTGTGGTCTCATGGGATTGATGACAAGACTGTAC
TATTCGAAGCTGGTCAAGCAGCTCTTCCTTTCCTTCAACAAGCTGGTGTCACTTGTGAAT
TTAAGGCATATCCAGATCTTGGACACTCGATTAGTAATAATGAGCTTCAGTATCTGGAGT
CATGGATCAAACAGAGGATGCTGAGTTCCTCTTCTTCTTCTTAAAAGCTTTTGAGATCGA
GTTTGTTTGTCCAACCAGTTCAATTTTCTATTTGCTAAATGGATAATCAGAAGATTGAAC
ATATGGAAATGATTAAACACTCTAAAAAACAACTAAAATATTCTAAAATCTTCCATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CL38TF U 1
AF RS1CL38JQ C 225
BS 1 718 RS1CL38TF
BS 719 719 RS1CL38JQ
BS 720 725 RS1CL38TF
BS 726 726 RS1CL38JQ
BS 727 756 RS1CL38TF
BS 757 759 RS1CL38JQ
BS 760 806 RS1CL38TF
BS 807 959 RS1CL38JQ

RD RS1CL38TF 807 0 0
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CACTTTTCAAGTCTCCCGAGTTTAGCAACACCAAATGGCTCTTCCCATCCTCTCCTCCGA
ATCCAGTCTCCTGCAATCATGGTATGGTGATGCCTTCTTGGTTTGACATCCGTGAGCTTC
CTCTTACCGCGGCCTCTCCAAATGATGAAAGCAGTGTGCTTGAAGCAGTTAAGAACGTTC
ATGCTGTTATAGATAAGGAGATTGCAGGAGGAATCAAGCCAGAAAACGTGTATATCTGTG
GATTTAGCCAAGGAGGGGCATTAACCTTGGCTAGTGCTCTGCTTTACCCTAAAACTCTTG
GAGGAGGTGCAGTCTTTAGTGGATGGGTTCCATTCAATTCTTCTGTCATCAATCAGTTTA
CCAAAGATGCTATCAAGACGCCAATCTTGTGGTCTCATGGGATTGATGACAAGACTGTAC
TATTCGAAGCTGGTCAAGCAGCTCTTCCTTTCCTTCAACAAGCTGGTGTCACTTGTGA*T
TTAAG*CATATCCAGATCTTGGACACTCGATTAGTAT**ATGAGCTTCAGTATCTGGAGT
CATGGATCAAACAGAGGATGCTGAGT
C

QA 1 806 1 806
DS 

RD RS1CL38JQ 735 0 0
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CCATCCTCTCCTCCGAATCCAGTCTCCTGCAATCATGGTATGGTGATGCCTTCTTGGTTT
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AACGTGTATATCTGTGGATTTAGCCAAGGAGGGGCATTAACCTTGGCTAGTGCTTTGCTT
TACCCTAAAACTCTTGGAGGAGGTGCAGTCTTTAGTGGATGGGTTCCATTCAATTCTTCT
GTCATCAATCAGTTTACCAAAGATGCTATCAAGACGCCAATCTTGTGGTCTCATGGGATT
GATGACAAGACTGTACTATTCGAAGCTGGTCAAGCAGCTCTTCCTTTCCTTCAACAAGCT
GGTGTCACTTGTGAATTTAAGGCATATCCAGATCTTGGACACTCGATTAGTAATAATGAG
CTTCAGTATCTGGAGTCATGGATCAAACAGAGGATGCTGAGTTCCTCTTCTTCTTCTTAA
AAGCTTTTGAGATCGAGTTTGTTTGTCCAACCAGTTCAATTTTCTATTTGCTAAATGGAT
AATCAGAAGATTGAACATATGGAAATGATTAAACACTCTAAAAAACAACTAAAATATTCT
AAAATCTTCCATTTT

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

CO CL7790Contig1 560 2 1 U
GCAGATTGTAAGAAGCATGAGTGGAAACGCAGGGTTTCAACAACAACAGCAGCAGCAGCA
GCATGGGAATGGTGGTAAAGAAAGAGTTGGCTCTTCCTCTGATTCGGCCGACAGAAACAG
CATGAACGTGAATCCTGGTGGTGGTGGTTCTACAAGTTCACCACCGTATGGAATCCATCA
TGCTAGTTTCTAGCTAAAGGAAAAAAATTAAAAGGTTTTACATTCATCAGAGTACGTACA
TGCTATATCTTTCAGGTATGCAGATCGTCATCAAAATCCCATTTGAAGTAGTCCCTCAGT
ATTTAAGTTTATCAGAAAAGTAATAATAAATAGTTGCATTTTATCTAAACTCAGCTCTCT
TTTTGTAAAATATTTTGCCATTATAGTTTATATAAATGGGGTTCTCCTGAACAATATTCA
GAGTTTATAGCTTATTGTTTCATAGTGAAGATTTTTTTATAACTATATTTTACAGAATTC
TGCAGTTCTAAATTCTCTTGGATTATGAAGATTATATAATATTTTCTGTAATGGCTATAA
TATCAATTATTTGTTGAGAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FR63JQ C 1
AF RS1FR63TF U 1
BS 1 560 RS1FR63TF

RD RS1FR63JQ 560 0 0
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GCATGGGAATGGTGGTAAAGAAAGAGTTGGCTCTTCCTCTGATTCGGCCGACAGAAACAG
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TGCTAGTTTCTAGCTAAAGGAAAAAAATTAAAAGGTTTTACATTCATCAGAGTACGTACA
TGCTATATCTTTCAGGTATGCAGATCGTCATCAAAATCCCATTTGAAGTAGTCCCTCAGT
ATTTAAGTTTATCAGAAAAGTAATAATAAATAGTTGCATTTTATCTAAACTCAGCTCTCT
TTTTGTAAAATATTTTGCCATTATAGTTTATATAAATGGGGTTCTCCTGAACAATATTCA
GAGTTTATAGCTTATTGTTTCATAGTGAAGATTTTTTTATAACTATATTTTACAGAATTC
TGCAGTTCTAAATTCTCTTGGATTATGAAGATTATATAATATTTTCTGTAATGGCTATAA
TATCAATTATTTGTTGAGAC

QA 1 560 1 560
DS 

RD RS1FR63TF 560 0 0
GCAGATTGTAAGAAGCATGAGTGGAAACGCAGGGTTTCAACAACAACAGCAGCAGCAGCA
GCATGGGAATGGTGGTAAAGAAAGAGTTGGCTCTTCCTCTGATTCGGCCGACAGAAACAG
CATGAACGTGAATCCTGGTGGTGGTGGTTCTACAAGTTCACCACCGTATGGAATCCATCA
TGCTAGTTTCTAGCTAAAGGAAAAAAATTAAAAGGTTTTACATTCATCAGAGTACGTACA
TGCTATATCTTTCAGGTATGCAGATCGTCATCAAAATCCCATTTGAAGTAGTCCCTCAGT
ATTTAAGTTTATCAGAAAAGTAATAATAAATAGTTGCATTTTATCTAAACTCAGCTCTCT
TTTTGTAAAATATTTTGCCATTATAGTTTATATAAATGGGGTTCTCCTGAACAATATTCA
GAGTTTATAGCTTATTGTTTCATAGTGAAGATTTTTTTATAACTATATTTTACAGAATTC
TGCAGTTCTAAATTCTCTTGGATTATGAAGATTATATAATATTTTCTGTAATGGCTATAA
TATCAATTATTTGTTGAGAC

QA 1 560 1 560
DS 



AS 1 2

CO CL7791Contig1 890 2 2 U
GTTACTACCAAGGAGGCAACTTCTCCATGCTTCTTCACGGAAACAACGAAGGAGGAAGAG
CAGCGTTGGATTGGGAAGCGAGGTTAAAGATTTGTTTAGGAGCTGCGAAAGGAATAGCTC
ACATACATTCTTCATCCGGTGCTAAACTCCTTCACGGGAACATCAAATCACCGAACGTCC
TCTTAACGCAAGACCTCAACGCTTGCGTCTCGGATTACTGCATAGCTCCACTGATGAGCC
ACCACACCTTGCTCCCATCGAGAAGCCTAGGATACAGAGCACCCGAGGCCATAGAGACAC
GGAAACATACTCAAAAATCCGACGTGTACAGCTTCGGCGTGCTTCTGCTAGAAATGCTGA
CGGGGAAAGCGGCAGGGAAGACGGCGGCGGGGCACGAGGAAGTGGTTGATCTGCCGAAGT
GGGTTCAGTCGGTGGTGAGAGAGGAGTGGACTGGAGAAGTGTTCGACGTGGAGCTGATCA
AGCAGCAGCAGCACAGCGTTGAGGAAGAGATGGTGCAGATGTTGCAAGTGGCAATGGCTT
GTGTGTCGAAGCATCCGGATTTTAGGCCTTCCATGGAGGAAGTGGTTAACATGATGGAGG
AGGTTAGGCCTTCTGCAGGTTCGGGTGCTGGTTCTGGAAACAGAGCCTCTTCCCCTGAGA
TGATCAGAAGCTCTGATAGCCCGGTTTAGATTGGTTCTTTTCTCAATATCATTATTTTTT
TTTTGCTTTTTTTTTCTTTTACTTTATTGGGGAATAAACCTTTTAGTAGTTGACTAATTC
AGCATGTGATTTCTTCTAGTCATTATCTGAAAAAGTAGTGTAATTGAAACTCTCTATACA
TTGTTTCTTTTTTAGTTATTGTGTGTGTGGTTAATATATTTTCCATTTCT


BQ
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AF RS1GL78TF U 1
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GTGTGTCGAAGCATCCGGATT
CTAGCCTTCCAT

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DS 

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GTAGTGTAATTGAAACTCTCTATACATTGTTTCTTTTTTAGTTATTGTGTGTGTGGTTAA
TATATTTTCCATTTCT

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

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ATGGATGGAAACGAC


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ACAAGATTAGTGTTGGAGAGAGGGTTTTTTATGGCTATGATTGGGAACAGAGTTATGTGC
GTTTCTGTACCGCTATTGCTATGGATGTTTGGGCCGTTACCAGTGTTTGTGTCTTCACTA
GGCCTTGTTTGGGTATTGTACCAGATTGATTTTCAGGCAGTCGCCACAATTTCCGTTTGT
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ATGGATGGAAACGAC

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DS 

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TTAGGGAGTATACAAGATTAGTGTTGGAGAGAGGGTTTTTTATGGCTATGATTGGGAACA
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TTTCCGTTTGTAAACGATAAAATAAAAAAAATCAAATCGGTTGATTATTGTTTACATTCA
AAATAACAATAATGGATGGAAACGAC

QA 1 566 1 566
DS 



AS 1 2

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AF RS1H201JQB C 1
AF RS1H201TF U 1
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DS 

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GCCTGAGAACAAGCCTTTCGTTGTGAAGGCGAAGCTTATCTCGAAGACTGCTGAGAAGAA
GATTAAGGAAGCTGGTGGTGCTGTTGTTCTTACAGCTTAGGCTTTTGTCAGTTGTTTTTG
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TGTTATGACATTCGGATTTT

QA 1 560 1 560
DS 



AS 1 2

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TCTTCTTTGTTACATTCATGTCACTGGCTCTTCTTAGTCTCCGACACTATCAACGGCCTA
ATTCTGACACGGGCGGACTCGTCGCTGGACTCGGTTACCCTATTGGCTTCCCTAATGGAC
GCTTATTTTTTCGGCGATCCACGGGACGTTTGTCCTACGGACGTCTCCTCATCGATTTCC
TCTGCCAGAGTTTGAATACAAGTCTCTTGAGGCCATACTTAGATTCTTTGGGTGGATCAA
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ATGGAGGGAGTCCTTACAACTACAATGCGAAAATAACATGTGCACATAGAGGCGCTAACG
TATGTGACAAAGGATCTCGGTTCATAAGCTGGGATGGGATTCATTACACTGAGACAGCTA
ATGCCATTGTTGCTATGAAAGTGCTTTCAATGCAATACTCGAAGCCACAAGCGCCCTTCC
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GTGACCAAATGTAACTTAGAGAACAAATAAAGCTTGTGGAACAAATATATTTAAATTTTG
TTATAATGGACAGTAACACAATATCAAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1F735TF U 1
AF RS1F735JQ C 547
BS 1 737 RS1F735TF
BS 738 1290 RS1F735JQ

RD RS1F735TF 737 0 0
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TCTTCTTTGTTACATTCATGTCACTGGCTCTTCTTAGTCTCCGACACTATCAACGGCCTA
ATTCTGACACGGGCGGACTCGTCGCTGGACTCGGTTACCCTATTGGCTTCCCTAATGGAC
GCTTATTTTTTCGGCGATCCACGGGACGTTTGTCCTACGGACGTCTCCTCATCGATTTCC
TCTGCCAGAGTTTGAATACAAGTCTCTTGAGGCCATACTTAGATTCTTTGGGTGGATCAA
AGTTCCAAAACGGTGCGAACTTTGCAATTGCTGGATCCTCTACTCTCCCTAAAAACGTGC
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TCGCTTCTACTTCAAATCCATCAAAGGGGATGTACATAAGCGAGAGTGGATTCAGAAACG
CATTGTACATGATCGATATAGGACAGAACGACATTGCTCGTTCCTTCTCTGTAGGCAACT
CGTATTCTCAGACGGTCAAGCTGATTCCACAATTTATTTCCGAGATAAAAACAAGCATAA
AGAGATTGTATGATGAAGGAGGAAGGAGATTCTGGATCCACAACACTGGTCCACTGGGCT
GTCTACCTCAGAAACTCTCAATGGCTCAGAGCAAAGATCTTGACCAGCATGGTTGCTTAG
CCAGTTACAACTCGGCA

QA 1 737 1 737
DS 

RD RS1F735JQ 744 0 0
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TGTATGATGAAGGAGGAAGGAGATTCTGGATCCACAACACTGGTCCACTGGGCTGTCTAC
CTCAGAAACTCTCAATGGCTCAGAGCAAAGATCTTGACCAGCATGGTTGCTTAGCCAGTT
ACAACTCGGCAGCAAAACTGTTTAACCAAATGTTAGATCATATGTGTGAGAAACTGAGGA
TTGAACTGAGAGATGCCACCATAATTTATGTTGACATATACGCTATCAAATACAGCCTCA
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GGAGTCCTTACAACTACAATGCGAAAATAACATGTGCACATAGAGGCGCTAACGTATGTG
ACAAAGGATCTCGGTTCATAAGCTGGGATGGGATTCATTACACTGAGACAGCTAATGCCA
TTGTTGCTATGAAAGTGCTTTCAATGCAATACTCGAAGCCACAAGCGCCCTTCCATTTTT
TTTGCCGTCGCTGAGCACCAAACTTGTTCAACTGAAAATGTTATAAGTAAAGAAGAGAGA
AAGATGAAAATGTTAGTCAAATGGATAATGAGTTTATATGAGGATACAAGTTTGGTGACC
AAATGTAACTTAGAGAACAAATAAAGCTTGTGGAACAAATATATTTAAATTTTGTTATAA
TGGACAGTAACACAATATCAAATT

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL7795Contig1 627 2 2 U
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CTTGTTAAGTACCCCTTCATAGACTATAGATGAAAATATGAATCAACAGCTTAAAAAGAA
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TATAGCGGTTTGTTGTCGGGGTTGAATGCACAGAGAAAGCAAAGGGTGCAGGTCAATAGT
GTCCATACTCCGAACGTACGTCCATGAACTTCACTCATGGTGGTCTGAGAGAAAACGGCG
AGACGAAAAGCCCAAATGTTGAAAAAACCAAACCAGACGGAAGCTAATCTCAGTGAACCA
ACCACCATTAGCCAATACCCTAACGCCTTCATCTTCCCTCTTCCCCTTCTCTTCTCTTCT
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ATTCCTTTTGCGTGTTGTCATCACTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AAGGCGTAAATGAATGAAAAAAAGGTAGCCAAGTATAGCGGTTTGTTGTCGGGGTTGAAT
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DS 



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BQ
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AF RS1G090TF U 1
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GCTGACTGATGTGGTGGATGATGATGAGGAGGAGGATGAAGAAGAGATGGGGAG

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GGG
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AACAACAACATCCACAAGCTCGTCAACTTCAAAGAAGCAAAAGCAGTTTAAAAAACGTGG
AAGCTTCTGGCATCCTCGCTGCTCTCCCCGAGCTATCTGGAAACAGTTACCTCAACCACG
TGTTTCACCACAAACCCGCCTCTGTTCTCTCCACTTCGGTCTCCTCCACAGCATCTTCAT
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AACCGCCTCAAGAACGGCTTCCGTTCACCTCTTCTTTTATAAACGGAGGGAAGTTTCCTC
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DS 



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ATAAACCATTTCTCCTCCTCTCTCAATCACCTTCAATATCTCCCTTTCTCCTCTCTCTCT
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ATATATGTATATGCCTGGCTCCCTGTATGCCATACACTAAGTTCATCGACCATCGGCGAC
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TGTTATAGTACTAATTAAATTGTATTGAACTTGTTTTTTAGGAATCTATTTTAATTGCTC
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BQ
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AF RS1CB06TF U 1
AF RS1CB06JQ C 143
BS 1 679 RS1CB06TF
BS 680 858 RS1CB06JQ

RD RS1CB06TF 679 0 0
GGTGTCTGCATAATACATATATACATCTGAATCTCTCCCATCCCACCCTTAATTTTTTAT
ATAAACCATTTCTCCTCCTCTCTCAATCACCTTCAATATCTCCCTTTCTCCTCTCTCTCT
GGATCATCAATCTCGACCTTCTTATTTTGTTTATTGATTCTCATCTTCTCTTTTGTATTT
TCAAGAAATCGGCATTTAGGGTTTCAAGAACAGTTAACCTCAATTCCTCCTGAGGAGAGA
GAGAAAACAAAAGATATCATCAATTTCATTTTCTTACATGCAAATCATAATCCATGCTTT
AGATTGTTTCTATAGTCATACATATGTGCTGTTATATCTGTTCATGCATGTCCAGGTGGA
GATCTAGCTAGATATAGCTTTACTTAAAAACATAATTAGACATCCATTTAGGGCAATTAG
TTTCAATACATAATAACATGTATATGCATCATGACATATATGCATATATGTTGATGTATT
ATATATGTATATGCCTGGCTCCCTGTATGCCATACACTAAGTTCATCGACCATCGGCGAC
CTCGGTGGATGGCGTATGAGGAGCCAAGCATATTCTCAGCATAGACATATTTTCTAATTA
TGTTATAGTACTAATTAAATTGTATTGAACTTGTTTTTTAGGAATCTATTTTAATTGCTC
CATCCAATCATGTGAAGAA

QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1CB06JQ 716 0 0
TATTTTGTTTATTGATTCTCATCTTCTCTTTTGTATTTTCAAGAAATCGGCATTTAGGGT
TTCAAGAACAGTTAACCTCAATTCCTCCTGAGGAGAGAGAGAAAACAAAAGATATCATCA
ATTTCATTTTCTTACATGCAAATCATAATCCATGCTTTAGATTGTTTCTATAGTCATACA
TATGTGCTGTTATATCTGTTCATGCATGTCCAGGTGGAGATCTAGCTAGATATAGCTTTA
CTTAAAAACATAATTAGACATCCATTTAGGGCAATTAGTTTCAATACATAATAACATGTA
TATGCATCATGACATATATGCATATATGTTGATGTATTATATATGTATATGCCTGGCTCC
CTGTATGCCATACACTAAGTTCATCGACCATCGGCGACCTCGGTGGATGGCGTATGAGGA
GCCAAGCATATTCTCAGCATAGACATATTTTCTAATTATGTTATAGTACTAATTAAATTG
TATTGAACTTGTTTTTTAGGAATCTATTTTAATTGCTCCATCCAATCATGTGAAGAAGAT
TAGAAGGTACCTCAGTGAACCGTCTAGCTACCACCGATGCTTCTTGTGGTCTCCAAAATT
CCACTGACGGATATTTTGGTGAAATCTTACGATTAGTATTTTTCCACTACAAATGTTTGT
CATGTCACAACACTTCTTACGAGGATTTATTCTGTGATAACATCAATGTACAACTC

QA 1 716 1 716
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7799Contig1 965 2 2 U
TAGAGGATGATTTCAAGCTGGTCGTCGGAGTCAGCCCTGTCCTGTGGGCATCTTTTGTTC
TTTTCCTTCTCCTAAATGTTGAAGGATTCAAGATCTTGTACATTGGATCTGCACTGCCGG
TTATTATAATCTTAGCTGTGGGAACAAAGCTTCAAGCAATCATGACAAGGATGGCTCTTG
GGATCACTGACAAACACGCAGTGGTCCAAGGAATGCCACTTGTACAAGGCAACGATGAGT
ACTTCTGGTTCCGTCGTCCCCAGTTGATTCTCCATCTCATCCATTTCGCCTTGTTTCAGA
ACGCGTTTCAGATCACATACTTCTTCTGGATATGGGTGACAAACTTAAAAAGAATTTTCT
TTAATGACTTCCTTTTGTTTGTTACAAGAATGACTAATCCTTCTATTAATATTCAGTATT
CGTTTGGGAAAAACTCTTGCTACCATCCTAACTTCAAGATTGCCCTTGTAAAAGTGGCCA
TAGCTCTTGGAGTGTTATGCCTTTGTAGCTACATCACACTCCCTCTTTACGCACTCGTTA
CTCAGATGGGTTCAAGGATGAAGAAATCTGTATTCGACGAACAAACATCAAAGGCCCTCA
AGAAATGGAGAATGTCAGTGAAGAAGAAGAAAGGCGGTAAAGCTAGCACCACCAAGAGGC
TAGGTGGAGATGGAAGCGTGAGCCCTACGGCATCATCAACTGTTAGGTCTTCTCTGTCCG
TTAGGTCTTTGCAGCGCTATAAAACCACAGGGCATTCGATGAGGTACGAAGGACTTGACC
CTGAGACATCGGATCTCGACACAGACAACGAAGCAGCTTTGACTCCGCCAATGTCTCCAT
CCGCCGTGCCAACGGCTCCAGGCATTGAGCTTGCTGCGGTGAAGGTTGAACAAGATAAAC
TAGAGACCAAGACCGGTGAGACTAGCCGTGACGGTGAAAATCATTCTAAGGAGTTCTCCT
TTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1CR04TF U 1
AF RS1CR04JQ C 520
BS 1 704 RS1CR04TF
BS 705 965 RS1CR04JQ

RD RS1CR04TF 704 0 0
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TTTTCCTTCTCCTAAATGTTGAAGGATTCAAGATCTTGTACATTGGATCTGCACTGCCGG
TTATTATAATCTTAGCTGTGGGAACAAAGCTTCAAGCAATCATGACAAGGATGGCTCTTG
GGATCACTGACAAACACGCAGTGGTCCAAGGAATGCCACTTGTACAAGGCAACGATGAGT
ACTTCTGGTTCCGTCGTCCCCAGTTGATTCTCCATCTCATCCATTTCGCCTTGTTTCAGA
ACGCGTTTCAGATCACATACTTCTTCTGGATATGGGTGACAAACTTAAAAAGAATTTTCT
TTAATGACTTCCTTTTGTTTGTTACAAGAATGACTAATCCTTCTATTAATATTCAGTATT
CGTTTGGGAAAAACTCTTGCTACCATCCTAACTTCAAGATTGCCCTTGTAAAAGTGGCCA
TAGCTCTTGGAGTGTTATGCCTTTGTAGCTACATCACACTCCCTCTTTACGCACTCGTTA
CTCAGATGGGTTCAAGGATGAAGAAATCTGTATTCGACGAACAAACATCAAAGGCCCTCA
AGAAATGGAGAATGTCAGTGAAGAAGAAGAAAGGCGGTAAAGCTAGCACCACCAAGAGGC
TAGGTGGAGATGGAAGCGTGAGCCCTACGGCATCATCAACTGTT

QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1CR04JQ 446 0 0
TCCCTCTTTACGCACTCGTTACTCAGATGGGTTCAAGGATGAAGAAATCTGTATTCGACG
AACAAACATCAAAGGCCCTCAAGAAATGGAGAATGTCAGTGAAGAAGAAGAAAGGCGGTA
AAGCTAGCACCACCAAGAGGCTAGGTGGAGATGGAAGCGTGAGCCCTACGGCATCATCAA
CTGTTAGGTCTTCTCTGTCCGTTAGGTCTTTGCAGCGCTATAAAACCACAGGGCATTCGA
TGAGGTACGAAGGACTTGACCCTGAGACATCGGATCTCGACACAGACAACGAAGCAGCTT
TGACTCCGCCAATGTCTCCATCCGCCGTGCCAACGGCTCCAGGCATTGAGCTTGCTGCGG
TGAAGGTTGAACAAGATAAACTAGAGACCAAGACCGGTGAGACTAGCCGTGACGGTGAAA
ATCATTCTAAGGAGTTCTCCTTTGTC

QA 1 446 1 446
DS 



AS 1 2

CO CL7800Contig1 340 2 1 U
GGACTTGACTATTCTCACATTCAGAACTTTGCAATCTCTCTCTCTCGACCACATCGCCAT
GGCTGACAAGAAGATTAAGATCGGAATTAACGGTTTCGGAAGAATCGGTCGTTTGGTGGC
GAGAGTGATCATTCACATGTCCAAAGCCTAGAGCGCCCAAGGGAAACAAGAGATTTCAAA
CGATGTAATGGTGTCTGTCAGTTTTTTCGAATAAATTTTCTCTGAGATCTAAAAACTCAT
CTTTTTCTTTTTGGTTTTAGCGAGTCTCCTTCACGTGACGTGATAGGAAGTTTGTAAACC
TTGTTTTATTTCTACACTGAAAACCCTTTGATACAAGTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BG39JQ C 1
AF RS1BG39TF U 1
BS 1 340 RS1BG39TF

RD RS1BG39JQ 340 0 0
GGACTTGACTATTCTCACATTCAGAACTTTGCAATCTCTCTCTCTCGACCACATCGCCAT
GGCTGACAAGAAGATTAAGATCGGAATTAACGGTTTCGGAAGAATCGGTCGTTTGGTGGC
GAGAGTGATCATTCACATGTCCAAAGCCTAGAGCGCCCAAGGGAAACAAGAGATTTCAAA
CGATGTAATGGTGTCTGTCAGTTTTTTCGAATAAATTTTCTCTGAGATCTAAAAACTCAT
CTTTTTCTTTTTGGTTTTAGCGAGTCTCCTTCACGTGACGTGATAGGAAGTTTGTAAACC
TTGTTTTATTTCTACACTGAAAACCCTTTGATACAAGTTT

QA 1 340 1 340
DS 

RD RS1BG39TF 340 0 0
GGACTTGACTATTCTCACATTCAGAACTTTGCAATCTCTCTCTCTCGACCACATCGCCAT
GGCTGACAAGAAGATTAAGATCGGAATTAACGGTTTCGGAAGAATCGGTCGTTTGGTGGC
GAGAGTGATCATTCACATGTCCAAAGCCTAGAGCGCCCAAGGGAAACAAGAGATTTCAAA
CGATGTAATGGTGTCTGTCAGTTTTTTCGAATAAATTTTCTCTGAGATCTAAAAACTCAT
CTTTTTCTTTTTGGTTTTAGCGAGTCTCCTTCACGTGACGTGATAGGAAGTTTGTAAACC
TTGTTTTATTTCTACACTGAAAACCCTTTGATACAAGTTT

QA 1 340 1 340
DS 



AS 1 2

CO CL7801Contig1 1050 2 4 U
TTTTTTTCTTTCTCAAAAACTATTTCAAACCCTAGCAAGCAAGTTTTCTTCGATCCAATT
CATGTCGACGATGGCGGGAATTCAAGGCCAGGTCCTCGAGGTCACTGTGGTTGGGTGCCA
GAAACTGAAAGACACGGAATGGTTCTCGAGGCAAGATCCGTACGTTGTCCTCGAGTACAG
CGGCACTAGACACCGTACACGAACCTGCACAGATGGTGGGAAGAACGCAGTCTTTCAAGA
GAAGTTTATGTTCACTCTGCTTGAAGGCCTTAGGGATCTTAAAGTTGCTGTTTGGAACAG
CAATACGCTCTCCACTGATGACTTCATTGGCAATGCTACGATTCAGTTGCAGAAGGTTCT
TTCTCAGGGATACGACGACTGTACCTGGACTCTCCAGTCCAAAACTGGCAGATTTGCGGG
AGAAGTAAGACTAATTCTGCATTATGCAGGCGCAAAGAAACAAAATTACGGGTCTGCGCC
ATCAGCACCACCGTATGCCCCTCAAGTACCTCAATACTCAGCACCGCCTGCTCCATCTCC
GTATTCATCACCACCATACTCTGGACCATCTATGTACCCACAAGTACAATACTCTCAGCC
GCAATCAGCTTACCCACCAGCTTCAGCTTATCCTCCTCAGCCATCTGCGTATCCTCCTCC
TCCCTCAACTGCTTATCCTCCCGGTCCTTCAGCTTACCCTCCCGGTCCTTCTGCGTACCC
TCCAGGTCCTTCAGCTTACCCTCCTCCTCCATACCCTCCTCAACCATCAGCTTATTACCC
GCAAGGTCCATATCCAGGACAGTACCCACCCCCTCCCTACTAAAGCTCCGGCATTTAAAA
TCTGACGTGAAGATGCTAATACTATGATGCTATTCCTAGAACTTGATGACGATTTTTTTT
TGTTCTTTCTTTTATCTTCTGTGTGATCTTGTTAGCTTAATGGTTAGTTTTATGCGATGG
TCAGTGAGACTCATTAGGAAGTTTGGATATGTTCAACATTAAGCCAGCTTGCAGATTATG
TTGCAGAAAAATCTAATTATAACTTAACAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DK63TF U 1
AF RS1DK63JQ C 638
BS 1 719 RS1DK63TF
BS 720 720 RS1DK63JQ
BS 721 732 RS1DK63TF
BS 733 1050 RS1DK63JQ

RD RS1DK63TF 732 0 0
TTTTTTTCTTTCTCAAAAACTATTTCAAACCCTAGCAAGCAAGTTTTCTTCGATCCAATT
CATGTCGACGATGGCGGGAATTCAAGGCCAGGTCCTCGAGGTCACTGTGGTTGGGTGCCA
GAAACTGAAAGACACGGAATGGTTCTCGAGGCAAGATCCGTACGTTGTCCTCGAGTACAG
CGGCACTAGACACCGTACACGAACCTGCACAGATGGTGGGAAGAACGCAGTCTTTCAAGA
GAAGTTTATGTTCACTCTGCTTGAAGGCCTTAGGGATCTTAAAGTTGCTGTTTGGAACAG
CAATACGCTCTCCACTGATGACTTCATTGGCAATGCTACGATTCAGTTGCAGAAGGTTCT
TTCTCAGGGATACGACGACTGTACCTGGACTCTCCAGTCCAAAACTGGCAGATTTGCGGG
AGAAGTAAGACTAATTCTGCATTATGCAGGCGCAAAGAAACAAAATTACGGGTCTGCGCC
ATCAGCACCACCGTATGCCCCTCAAGTACCTCAATACTCAGCACCGCCTGCTCCATCTCC
GTATTCATCACCACCATACTCTGGACCATCTATGTACCCACAAGTACAATACTCTCAGCC
GCAATCAGCTTACCCACCAGCTTCAGCTTATCCTCCTCAGCCATCTGCGTATCCTCCTCC
TCCCTCAACTGCTTATCCTCCCGGTCCTTCAGCTTACCCTCCCGGTCCTTCTGCGTACC*
TCCAGGTCCTTC

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1DK63JQ 413 0 0
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CCTCCCGGTCCTTCTGCGTACCCTCCAGGTCCTTCAGCTTACCCTCCTCCTCCATACCCT
CCTCAACCATCAGCTTATTACCCGCAAGGTCCATATCCAGGACAGTACCCACCCCCTCCC
TACTAAAGCTCCGGCATTTAAAATCTGACGTGAAGATGCTAATACTATGATGCTATTCCT
AGAACTTGATGACGATTTTTTTTTGTTCTTTCTTTTATCTTCTGTGTGATCTTGTTAGCT
TAATGGTTAGTTTTATGCGATGGTCAGTGAGACTCATTAGGAAGTTTGGATATGTTCAAC
ATTAAGCCAGCTTGCAGATTATGTTGCAGAAAAATCTAATTATAACTTAACAT

QA 1 413 1 413
DS 



AS 1 2

CO CL7802Contig1 970 2 2 U
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AAGTAAACATCTTCGCTGAAAAGGAAAAAAATCGAAATATCAATCCGATCACAGCCGGCA
TTTTGTGAGTCTTGAAGCAAAATGGAGGGAATACAGAATCCTGTTGTACCTCGAAGTGTG
GAAGAGGTGTTCAGCGACTTTAGGGGTCGAAGAGCTGCTCTCCTCAAGGCTCTCTCTACA
GATGTACGCAAGTTTTACCATGAGTGTGACCCTGACAAGGAAAACTTGTGTCTTTATGGA
CTTCCAAATGAGACATGGGAGGTGAACCTTCCTGTCGACGAGGTCCCTCCGGAGCTTCCT
GAACCAGCTCTAGGCATTAACTTTGCAAGGGACGGAATGCCTGAAAAAGACTGGATTTCT
TTGGTTGCTGTTCACAGTGACTCATGGCTCATCTCTGTTGCCTTCTACTTTGGCGCCCGT
TTCAGGTTTGGGAAGAGTGAGAGGAAGAGGCTCTTCCAGATGATAAATGATCTCCCAACC
ATTTTCGAGGTTATAACTGGCAACGCAAAGCAATCCAAGGATCAATCTGCTGACCACAAC
AGTAGCAGAAGCAAGTCTAGTGCTGTCAAGCCTCGACAGTCTGAATCTCAGACTAATCCT
TCAAAGATGTCTCCACCACCAAGAGAAGAAGATGATGAGAGTGGAGATGATGAGGAAGAT
GAGGAACAAGGTGCGGTTTGTGGTGCGTGTGGAGACAACCATGATGATTTCTGGATATGT
TGTGATGCTTGTGAGAAATGGTTCCATGGCAAATGCGTGAAGATCACACCTGCAAAGGCT
GAGCACATCAAACATTACAAATGCCCTACTTGCACTACCAACAAGAAAATCAAAGCTTGA
AAGGTTATAAACTAATTTGTCTTTATGTTTCTGCGAAAACTGTCTTTAAGCTTTTGATTG
TCTCTGTTTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GV52TF U 1
AF RS1GV52JQ C 168
BS 1 669 RS1GV52TF
BS 670 970 RS1GV52JQ

RD RS1GV52TF 669 0 0
GGAAGAACAATTCCTATAATGAAGATTAATAGATTGTCTCGCTCTGGATACGAATCTTCC
AAGTAAACATCTTCGCTGAAAAGGAAAAAAATCGAAATATCAATCCGATCACAGCCGGCA
TTTTGTGAGTCTTGAAGCAAAATGGAGGGAATACAGAATCCTGTTGTACCTCGAAGTGTG
GAAGAGGTGTTCAGCGACTTTAGGGGTCGAAGAGCTGCTCTCCTCAAGGCTCTCTCTACA
GATGTACGCAAGTTTTACCATGAGTGTGACCCTGACAAGGAAAACTTGTGTCTTTATGGA
CTTCCAAATGAGACATGGGAGGTGAACCTTCCTGTCGACGAGGTCCCTCCGGAGCTTCCT
GAACCAGCTCTAGGCATTAACTTTGCAAGGGACGGAATGCCTGAAAAAGACTGGATTTCT
TTGGTTGCTGTTCACAGTGACTCATGGCTCATCTCTGTTGCCTTCTACTTTGGCGCCCGT
TTCAGGTTTGGGAAGAGTGAGAGGAAGAGGCTCTTCCAGATGATAAATGATCTCCCAACC
ATTTTCGAGGTTATAACTGGCAACGCAAAGCAATCCAAGGATCAATCTGCTGACCACAAC
AGTAGCAGAAGCAAGTCTAGTGCTGTCAAGCCTCGACAGTCTGAATCTCAGACTAATCCT
TCAAAGATG

QA 1 669 1 669
DS 

RD RS1GV52JQ 803 0 0
ACCTCGAAGTGTGGAAGAGGTGTTCAGCGACTTTAGGGGTCGAAGAGCTGCTCTCCTCAA
GGCTCTCTCTACAGATGTACGCAAGTTTTACCATGAGTGTGACCCTGACAAGGAAAACTT
GTGTCTTTATGGACTTCCAAATGAGACATGGGAGGTGAACCTTCCTGTCGACGAGGTCCC
TCCGGAGCTTCCTGAACCAGCTCTAGGCATTAACTTTGCAAGGGACGGAATGCCTGAAAA
AGACTGGATTTCTTTGGTTGCTGTTCACAGTGACTCATGGCTCATCTCTGTTGCCTTCTA
CTTTGGCGCCCGTTTCAGGTTTGGGAAGAGTGAGAGGAAGAGGCTCTTCCAGATGATAAA
TGATCTCCCAACCATTTTCGAGGTTATAACTGGCAACGCAAAGCAATCCAAGGATCAATC
TGCTGACCACAACAGTAGCAGAAGCAAGTCTAGTGCTGTCAAGCCTCGACAGTCTGAATC
TCAGACTAATCCTTCAAAGATGTCTCCACCACCAAGAGAAGAAGATGATGAGAGTGGAGA
TGATGAGGAAGATGAGGAACAAGGTGCGGTTTGTGGTGCGTGTGGAGACAACCATGATGA
TTTCTGGATATGTTGTGATGCTTGTGAGAAATGGTTCCATGGCAAATGCGTGAAGATCAC
ACCTGCAAAGGCTGAGCACATCAAACATTACAAATGCCCTACTTGCACTACCAACAAGAA
AATCAAAGCTTGAAAGGTTATAAACTAATTTGTCTTTATGTTTCTGCGAAAACTGTCTTT
AAGCTTTTGATTGTCTCTGTTTC

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

CO CL7803Contig1 629 2 3 U
GGAAAGAACACTACAAAGAAACTCCGGCGAGGGAGGGGGAGAGAGAGAGAGAAACGATGT
CGTTTTTGTATGAGAAGAGCGATACGTGGAGATGGCTAGTGAGGAAGACGAGAGATTCGA
GATCCTTCTTCTTCACGTTCGCTACCGTATGCGGTGTCATTCCTGGGATAATCGGCTACG
GGGTTATGCAGGCCACCAATTCCACTAACCCGGAGCTTGAGGCCCGGCTCCGACAATCCG
CCCGACCCGAAACCGTCATGATGGGTAAAGTAAACCAAGAGAGGCTAGCTGAATACCTCG
GCGAGTTGAAACAGAAGCAGGATACAAACGACAGATACGTGGCTGCTCTAAGGGGAGAGA
CTCTTACCAGGAAGCCTTACCAAAGAATTCAACCAGTGCCAAAGCCAAATGACACGGTCA
CAACCAAACCTCAGTAATGAATGATCACTTGTTAGAAGAGCTATTGTAATGGATGTTTAT
TGGCAGTAATATTTTGTTTTTGAATACGGCATGCTTTGTGGTTATCGAAACTGGTGCAAG
ATTCAGTTATTTTCAAACGTTTTGTGACAGACAGTGAATAAAGATGTGAAACCCCATGTT
TTGTACATTGCTTCTTCATTCTTGTTGGC


BQ
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AD39TF U 8
AF RS1FD25TF U 1
BS 1 420 RS1FD25TF
BS 421 421 RS1AD39TF
BS 422 629 RS1FD25TF

RD RS1AD39TF 577 0 0
GG
ACTACAAAGAAACTCCGGCGAGGGAGGGGGAGAGAGAGAGA**AACGATGTCGTTTTTGT
ATGAGAAGAGCGATACGTGGAGATGGCTAGTGAGGAAGACGAGAGATTCGAGATCCTTCT
TCTTCACGTTCGCTACCGTATGCGGTGTCATTCCTGGGATAATCGGCTACGGGGTTATGC
AGGCCACCAATTCCACTAACCCGGAGCTTGAGGCCCGGCTCCGACAATCCGCCCGACCCG
AAACCGTCATGATGGGTAAAGTAAACCAAGAGAGGCTAGCTGAATACCTCGGCGAGTTGA
AACAGAAGCAGGATACAAACGACAGATACGTGGCTGCTCTAAGGGGAGAGACTCTTACCA
GGAAGCCTTACCAAAGAATTCAACCAGTGCCAAAGCCAAATGACACGGTCACAACCAAAC
CTCAGTAATGAATGATCACTTGTTAGAAGAGCTATTGTAATGGATGTTTATTGGCAGTAA
TATTTTGTTTTTGAATACGGCATGCTTTGTGGTTATCGAAACTGGTGCAAGATTCAGTTA
TTTTCAAACGTTTTGTGACAGACAGTGAATAAAGA

QA 3 577 3 577
DS 

RD RS1FD25TF 629 0 0
GGAAAGAACACTACAAAGAAACTCCGGCGAGGGAGGGGGAGAGAGAGAGAGAAACGATGT
CGTTTTTGTATGAGAAGAGCGATACGTGGAGATGGCTAGTGAGGAAGACGAGAGATTCGA
GATCCTTCTTCTTCACGTTCGCTACCGTATGCGGTGTCATTCCTGGGATAATCGGCTACG
GGGTTATGCAGGCCACCAATTCCACTAACCCGGAGCTTGAGGCCCGGCTCCGACAATCCG
CCCGACCCGAAACCGTCATGATGGGTAAAGTAAACCAAGAGAGGCTAGCTGAATACCTCG
GCGAGTTGAAACAGAAGCAGGATACAAACGACAGATACGTGGCTGCTCTAAGGGGAGAGA
CTCTTACCAGGAAGCCTTACCAAAGAATTCAACCAGTGCCAAAGCCAAATGACACGGTCA
GAACCAAACCTCAGTAATGAATGATCACTTGTTAGAAGAGCTATTGTAATGGATGTTTAT
TGGCAGTAATATTTTGTTTTTGAATACGGCATGCTTTGTGGTTATCGAAACTGGTGCAAG
ATTCAGTTATTTTCAAACGTTTTGTGACAGACAGTGAATAAAGATGTGAAACCCCATGTT
TTGTACATTGCTTCTTCATTCTTGTTGGC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 2

CO CL7804Contig1 816 2 2 U
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AAAGGAGGAGAAGAAGAAGCTCAAAGATTCCTCTGGATCTAACTACCCCAAATGGACCTA
CCACAGCACCTCAAAGCCGTAACTCTCACACACGTCCGTTACCGCCGCGGTGACCATCTC
GGCCACTTCCTCGCGTGGATCTCCCTCGTCCCCGTCTTCATCAGCCTCGGCGGTTTCGTC
TCTCATTTCCTCTTCCGCCGCGAGCTCCAGGGGATCTTCTTCGGCGTCGGCCTCGTGATC
TCCCAGTTCATCAACGAGTTCATCAAAACCACCGTCGAGCAGGCTCGCCCCGAGACCTGC
GCCATCCTCGAGGCCTGCGACTCGCACGGGTGGCCTTCGAGCCACTCGCAGTTCATGTTC
TTCTTCGCGACGTACTTCAGTTTGATGGGGTGCAAAGGGATCGGGTTCTGGTTCGGGCTG
AAGAGCAGATGGATTCTGAATCTGCTGTATTGGTCTCTCGCTGTTGTGACGATGTACTCT
AGGGTTTACTTGGGGTACCACACGGTGGTGCAGGTTTTCGCGGGGGCGGCGTTGGGGGTG
GTTGTTGGCGGGAGTTGGTTCTGGGTGGTGAATAGTGTGTTGTTTCGTTATTTTCCGGTG
ATTGAGGAGAGTGCGTTGGGGAGGATGCTGTGTGTGAAGGATACTTCTCATATCCCTGAT
GTGTTGAAGTTTGAGTATGACAATGCTAGGGCTGCTAGGAAGAATATGGTGGACTCTAAG
TCCCATTGATTTGTGTTTTCCTGGTCGGGAAAGCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1A121TF U 1
AF RS1A121TV U 202
BS 1 763 RS1A121TF
BS 764 816 RS1A121TV

RD RS1A121TF 763 0 0
AGTCGACGGTACGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGACTTCAGGGA
AAAGGAGGAGAAGAAGAAGCTCAAAGATTCCTCTGGATCTAACTACCCCAAATGGACCTA
CCACAGCACCTCAAAGCCGTAACTCTCACACACGTCCGTTACCGCCGCGGTGACCATCTC
GGCCACTTCCTCGCGTGGATCTCCCTCGTCCCCGTCTTCATCAGCCTCGGCGGTTTCGTC
TCTCATTTCCTCTTCCGCCGCGAGCTCCAGGGGATCTTCTTCGGCGTCGGCCTCGTGATC
TCCCAGTTCATCAACGAGTTCATCAAAACCACCGTCGAGCAGGCTCGCCCCGAGACCTGC
GCCATCCTCGAGGCCTGCGACTCGCACGGGTGGCCTTCGAGCCACTCGCAGTTCATGTTC
TTCTTCGCGACGTACTTCAGTTTGATGGGGTGCAAAGGGATCGGGTTCTGGTTCGGGCTG
AAGAGCAGATGGATTCTGAATCTGCTGTATTGGTCTCTCGCTGTTGTGACGATGTACTCT
AGGGTTTACTTGGGGTACCACACGGTGGTGCAGGTTTTCGCGGGGGCGGCGTTGGGGGTG
GTTGTTGGCGGGAGTTGGTTCTGGGTGGTGAATAGTGTGTTGTTTCGTTATTTTCCGGTG
ATTGAGGAGAGTGCGTTGGGGAGGATGCTGTGTGTGAAGGATACTTCTCATATCCCTGAT
GTGTTGAAGTTTGAGTATGACAATGCTAGGGCTGCTAGGAAGA

QA 1 763 1 763
DS 

RD RS1A121TV 615 0 0
TCCCTCGTCCCCGTCTTCATCAGCCTCGGCGGTTTCGTCTCTCATTTCCTCTTCCGCCGC
GAGCTCCAGGGGATCTTCTTCGGCGTCGGCCTCGTGATCTCCCAGTTCATCAACGAGTTC
ATCAAAACCACCGTCGAGCAGGCTCGCCCCGAGACCTGCGCCATCCTCGAGGCCTGCGAC
TCGCACGGGTGGCCTTCGAGCCACTCGCAGTTCATGTTCTTCTTCGCGACGTACTTCAGT
TTGATGGGGTGCAAAGGGATCGGGTTCTGGTTCGGGCTGAAGAGCAGATGGATTCTGAAT
CTGCTGTATTGGTCTCTCGCTGTTGTGACGATGTACTCTAGGGTTTACTTGGGGTACCAC
ACGGTGGTGCAGGTTTTCGCGGGGGCGGCGTTGGGGGTGGTTGTTGGCGGGAGTTGGTTC
TGGGTGGTGAATAGTGTGTTGTTTCGTTATTTTCCGGTGATTGAGGAGAGTGCGTTGGGG
AGGATGCTGTGTGTGAAGGATACTTCTCATATCCCTGATGTGTTGAAGTTTGAGTATGAC
AATGCTAGGGCTGCTAGGAAGAATATGGTGGACTCTAAGTCCCATTGATTTGTGTTTTCC
TGGTCGGGAAAGCAT

QA 1 615 1 615
DS 



AS 1 2

CO CL7805Contig1 934 2 6 U
GATTCCAGGCTCGTTCTTCTTCTTCGTCAAGTCTATTTCTCGGTGGTGTGTGAGCTAATG
AATACAGAATCCAAAGGAAGAGGATGGTATGGTAAAATCTACCGTAAGTTGGAAACCATT
CTTGTGGAGGTAGACAGTTTGGCTGCTCAGGGTAAGGTTTCTTTGAGTTCAAGTGATTCT
CCAGGACTGGATTCTTCAAGAGATGATGAACCAGAGAAACTTAAAGAGGATCATTGTTTG
CGTACAGAGCCGGGTGATTGTAATCAGAAGGCAACCACTTCCTTCTGCTGCAACAATCCA
AAATCTTCTCAAGCATGTAATGATGATGATGATACTCTTGTTTCTCCCTCTGGGAACTGT
ACGGGTGATTCAAATCTCATCCCGCTTGCTACAGAGACTCGAGCTGCTCCTCCTGGTCAT
TATAAAATGGCAAACATGAGATCCTTTAGCAGCAACTCTATGATGGTTAATCAAGATGAG
TTCTTCATTGAAGACTTCGATGAGGCTCCACTGGATACTATTGATTTGTACGACATGACA
TTTCGAGAAGACCCTTCAGATTTTGACGACAATTTGCTGTATGCAGCTCGTGACAGAAGC
AGGCAGCTCAGATCATTTAAGGGAAAGATTATGGATGCTTTAACTTCGAAAAGAAGAAGA
GAGAAGGAATATGAGCAGCTTGCAATATGGTTCGGAGATGCAGAAATGGGCTGTGATATG
ATGAACACCAAGAAACATGAGACAGCATCTCTAAACCCCCAACGCAGCTCAGAGTCAAAT
GTGCCATTTGCTTCAGAAGATTCCGAGTGGGAGCTATTGTAATGATAAAGATTGTAACCC
TATTTATACAGGCTTCGCAGTTCTATTTTTGTGAGACTCTTGTGATGCTTTGAACAATAT
GTATAATACCAAGTTCCAATCTGGTTTTAATATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AN63TF U 1
AF RS1AN63JQ C 278
BS 1 666 RS1AN63TF
BS 667 667 RS1AN63JQ
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BS 799 847 RS1AN63TF
BS 848 934 RS1AN63JQ

RD RS1AN63TF 847 0 0
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AATACAGAATCCAAAGGAAGAGGATGGTATGGTAAAATCTACCGTAAGTTGGAAACCATT
CTTGTGGAGGTAGACAGTTTGGCTGCTCAGGGTAAGGTTTCTTTGAGTTCAAGTGATTCT
CCAGGACTGGATTCTTCAAGAGATGATGAACCAGAGAAACTTAAAGAGGATCATTGTTTG
CGTACAGAGCCGGGTGATTGTAATCAGAAGGCAACCACTTCCTTCTGCTGCAACAATCCA
AAATCTTCTCAAGCATGTAATGATGATGATGATACTCTTGTTTCTCCCTCTGGGAACTGT
ACGGGTGATTCAAATCTCATCCCGCTTGCTACAGAGACTCGAGCTGCTCCTCCTGGTCAT
TATAAAATGGCAAACATGAGATCCTTTAGCAGCAACTCTATGATGGTTAATCAAGATGAG
TTCTTCATTGAAGACTTCGATGAGGCTCCACTGGATACTATTGATTTGTACGACATGACA
TTTCGAGAAGACCCTTCAGATTTTGACGACAATTTGCTGTATGCAGCTCGTGACAGAAGC
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TATTTAT

QA 1 847 1 847
DS 

RD RS1AN63JQ 657 0 0
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TTGTTTCTCCCTCTGGGAACTGTACGGGTGATTCAAATCTCATCCCGCTTGCTACAGAGA
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CTATTGATTTGTACGACATGACATTTCGAGAAGACCCTTCAGATTTTGACGACAATTTGC
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CTTTAACTTCGAAAAGAAGAAGAGAGAAGGAATATGAGCAGCTTGCAATATGGTTCGGAG
ATGCAGAAATGGGCTGTGATATGATGAACACCAAGAAACATGAGACAGCATCTCTAAACC
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TGTAATGATAAAGATTGTAACCCTATTTATACAGGCTTCGCAGTTCTATTTTTGTGAGAC
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QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 2

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GTTTGGATTTTGGTCCATGATGGCCTTTTTATTTATTTTGACGATTGGATTTCTCTATGA
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BQ
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AF RS1G811TF U 1
AF RS1G811JQ C 1
BS 1 561 RS1G811TF
BS 562 657 RS1G811JQ

RD RS1G811TF 561 0 0
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CTACCTTTCGGGATGGGCTTTTGCTTCTTTCTTTATTTTTCGATATGCCGCTTCTTCGCC
AGCAAGGAGCGAGAAAACAAAGTGGGCTGTAATGATGTTAGAATTTGCACCAATTTTTAT
CTATTTAGTGATTAGTCTGCTAGTTTCTTTGATCCTACTCGGTGTTCCTTTTCTATTTGC
TTCCAATAGTTCTACCTACCCAGAAAAATTGTCGGCCTACGAATGTGGTTTCGATCCTTT
CGGTGATGCCAGAAGTCGTTTCGATATACGATTTTATCTTGTTTCAATTTTATTTTTAAT
CTTTGATCTGGAAGTCACCTTTTTCTTTCCTTGGGCAGTATCTCTCAACAAGATTGATCT
GTTTGGATTTTGGTCCATGAT

QA 1 561 1 561
DS 

RD RS1G811JQ 657 0 0
GCTCGGGCCCTCGACAATCCCCGTACCGCCACGGGAGAGCACTCCGTGAAGCAGTTATAC
CACCTGTTAAGTGCTCTAAATGAGCGCGGTAAAGAGGCCCCAGAATTTCAGGAACTCAAA
AATAGAGTGTTCCTCAAGAAAGGCGGCCCTGGGGGGGACTCTATCGCATAAGTAAGCAAG
CTACCTTTCGGGATGGGCTTTTGCTTCTTTCTTTATTTTTCGATATGCCGCTTCTTCGCC
AGCAAGGAGCGAGAAAACAAAGTGGGCTGTAATGATGTTAGAATTTGCACCAATTTTTAT
CTATTTAGTGATTAGTCTGCTAGTTTCTTTGATCCTACTCGGTGTTCCTTTTCTATTTGC
TTCCAATAGTTCTACCTACCCAGAAAAATTGTCGGCCTACGAATGTGGTTTCGATCCTTT
CGGTGATGCCAGAAGTCGTTTCGATATACGATTTTATCTTGTTTCAATTTTATTTTTAAT
CTTTGATCTGGAAGTCACCTTTTTCTTTCCTTGGGCAGTATCTCTCAACAAGATTGATCT
GTTTGGATTTTGGTCCATGATGGCCTTTTTATTTATTTTGACGATTGGATTTCTCTATGA
ATGGAAAAGGGGTGCTTTGGATTGGGAGTAAAGTGATAGGGCAAAAAATGGGGGGGG

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 2

CO CL7807Contig1 1083 2 6 U
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CAACAGTCCCCATAGAGCGTCTCAAGAACCGCATAATCTTCCACGACGGCCGTCTAGTCC
AACGTCCGACGCCGTTAAACGCCTTAGTCATTTACCTTTGGCTTCCTTTCGGCTTCATGC
TCTCCATCTTCCGTGTCTACTTCAACCTCCCTTTACCCGAACGCTTCGTTCGTTACACTT
ACGAGATCCTCGGCATTCACCTCACCATCCGTGGCCACCGTCCCCCTCCTCCTTCCCCCG
GCACACCTGGAAACCTCTACGTCCTCAACCATCGTACTGCTCTTGACCCCATTATCATCG
CCATTGCTCTCGGCCGTAAGATCTCATGCGTCACTTATAGTTTCTCTCGCCTCTCCCGGA
TGCTCTCACCCATCCCTGCCGTCGCTCTGACCCGAGATCGTGCCGCCGATGCTGCTCGCA
TGAGAAAACTCCTCGAGAAAGGTGATTTGGTGATCTGTCCTGAAGGTACGACTTGTAGAG
AACCGTATCTGCTGCGATTTAGTGCTCTATTCGCAGAGCTAAGCGACCGGATCGTACCTG
TGGCCATGAACTGTAAGCAAGGGATGTTCAATGGAACAACAGTCAGAGGTGTGAAATTCT
GGGATCCTTACTCCTTCTTCATGAACCCTAGACCTAGCTATGAGGCCACTTTCTTGGACC
GTTTGCCTGAAGAAATGACGGTAAACGGCGGCGGTAAAACTCCAATCGAGGTGGCTAATT
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ATAAGTATCTTTTGCTTGGAGGCAACGACGGGAAGGTTGAGTCTATCAAGAAGACAAAGG
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TCACTGGTTTTGGCGATTACATTTTAATGAATTGTTGGAGGAAAAAAACTTTAGTCGAAC
ATGCATTGGATAATGAATTTCATTAAATTTCATGTACATGCAATTTACTATTTTCCCATC
ACC


BQ
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10 10 10 

AF RS1B079TF U 1
AF RS1B079JQ C 317
BS 1 638 RS1B079TF
BS 639 639 RS1B079JQ
BS 640 655 RS1B079TF
BS 656 656 RS1B079JQ
BS 657 675 RS1B079TF
BS 676 1083 RS1B079JQ

RD RS1B079TF 687 0 0
CTTATAATTGAAAAAAAAAATATCAGGAAGGTTACATGGCGCACGAGACCAAATCAGCAA
CAACAGTCCCCATAGAGCGTCTCAAGAACCGCATAATCTTCCACGACGGCCGTCTAGTCC
AACGTCCGACGCCGTTAAACGCCTTAGTCATTTACCTTTGGCTTCCTTTCGGCTTCATGC
TCTCCATCTTCCGTGTCTACTTCAACCTCCCTTTACCCGAACGCTTCGTTCGTTACACTT
ACGAGATCCTCGGCATTCACCTCACCATCCGTGGCCACCGTCCCCCTCCTCCTTCCCCCG
GCACACCTGGAAACCTCTACGTCCTCAACCATCGTACTGCTCTTGACCCCATTATCATCG
CCATTGCTCTCGGCCGTAAGATCTCATGCGTCACTTATAGTTTCTCTCGCCTCTCCCGGA
TGCTCTCACCCATCCCTGCCGTCGCTCTGACCCGAGATCGTGCCGCCGATGCTGCTCGCA
TGAGAAAACTCCTCGAGAAAGGTGATTTGGTGATCTGTCCTGAAGGTACGACTTGTAGAG
AACCGTATCTGCTGCGATTTAGTGCTCTATTCGCAGAGCTAAGCGACCGGATCGTACCTG
TGGCCATGAACTGTAAGCAAGGGATGTTCAATGGAACA*CAGTCAGAGGTGTGAATTTCT
GGGATCCTTACTCCT
CTTCATGACCCT

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1B079JQ 767 0 0
CTACGTCCTCAACCATCGTACTGCTCTTGACCCCATTATCATCGCCATTGCTCTCGGCCG
TAAGATCTCATGCGTCACTTATAGTTTCTCTCGCCTCTCCCGGATGCTCTCACCCATCCC
TGCCGTCGCTCTGACCCGAGATCGTGCCGCCGATGCTGCTCGCATGAGAAAACTCCTCGA
GAAAGGTGATTTGGTGATCTGTCCTGAAGGTACGACTTGTAGAGAACCGTATCTGCTGCG
ATTTAGTGCTCTATTCGCAGAGCTAAGCGACCGGATCGTACCTGTGGCCATGAACTGTAA
GCAAGGGATGTTCAATGGAACAACAGTCAGAGGTGTGAAATTCTGGGATCCTTACTCCTT
CTTCATGAACCCTAGACCTAGCTATGAGGCCACTTTCTTGGACCGTTTGCCTGAAGAAAT
GACGGTAAACGGCGGCGGTAAAACTCCAATCGAGGTGGCTAATTACGTTCAGAAGGTGAT
AGGTGGAGTATTGGGGTTCGAGTGCACTGAACTTACAAGGAAGGATAAGTATCTTTTGCT
TGGAGGCAACGACGGGAAGGTTGAGTCTATCAAGAAGACAAAGGAGTGATATACTCCAGC
TAGTTACGGCTTTCTACTATTTTACATGGGAATGAAGTTAGGCCTCACTGGTTTTGGCGA
TTACATTTTAATGAATTGTTGGAGGAAAAAAACTTTAGTCGAACATGCATTGGATAATGA
ATTTCATTAAATTTCATGTACATGCAATTTACTATTTTCCCATCACC

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL7808Contig1 991 2 6 U
GGGCCAGCTTCCGACACACACACTCTCTCTCTCTCTCTATCTCTATCTTCAGAGGAGATT
CGAAATGCAAGAGCAAGCGACAAGCTCTTTAGCTGCAAGCTCTCTACCATCAAGCAGCGA
GAGATCATCAAGCTCTAATCCACATTTGGAGATCAAAGAAGGACTTGAAAGCGATGAGGA
GATACGGAGAGTGCCGGAGTTTGCAAAAGAAACCTCTGGATCAGCGAACGGCCAGGACAG
GGCACAGACAGCTGTCGGAGAACGTCAAAGGAAGCGAGGGAGGACTCCGGCGGAGAAAGA
GACCAAGCGGCTAAAGAGGTTGTTGAGGAATAGAGTATCAGCGCAGCAAGCAAGAGAGAG
GAAGAAAGCTTACTTGGGTGAGTTGGAGAATAGAGTGAAAGACTTGGAGACAAAAACTCT
GAGCTTGATGAGAGACTCTCTACTTTGCAGAACGAGAACCAGATGCTTAGACAGGTATGA
ATTCGTTTTTTTTATCTTTATCCTGTAAACCTTGATCATAATCTGCCAATGTTAATGATT
GCTCCATTAATTTGCAAAGCCTTGAGACCTATTCATCAAATAGATTAGTAAACTAAAAGA
CTAATAAGGAGCTAGTTCACAAGATTCTTTAATGGTTCTTGGAATGTTCATTCACTGTGG
TCTATGTGGAAGCTTTGGTTCTTTGTTATGTTATTTCTGTGGATTTTCTGTTAAGTTTTG
GGTGAATGCAGATTCTGAAGAACACAACAGGAAACAAGAGAGGAGGCGGTGGTTCTAACG
CTGCTGCAAGCCTTTGATCTCTCCCCACTTGTTCTTTTCCTATTTTATGTGGATAAAATT
TACAGGGAAATTGTATTAATAAAATTATTGTTACAATTTCTATATTGCATGGGGGTGTGA
CTTGTGTGATATATAGAGTATCTTGTAATCTTTAGATATTTATTTTCTTAATTCAAAAGT
GTGCAACTGTCATTTGGCAGTTTGCTAGAGC


BQ
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AF RS1EE46TF U 1
AF RS1EE46JQ C 231
BS 1 750 RS1EE46TF
BS 751 751 RS1EE46JQ
BS 752 777 RS1EE46TF
BS 778 778 RS1EE46JQ
BS 779 808 RS1EE46TF
BS 809 991 RS1EE46JQ

RD RS1EE46TF 808 0 0
GGGCCAGCTTCCGACACACACACTCTCTCTCTCTCTCTATCTCTATCTTCAGAGGAGATT
CGAAATGCAAGAGCAAGCGACAAGCTCTTTAGCTGCAAGCTCTCTACCATCAAGCAGCGA
GAGATCATCAAGCTCTAATCCACATTTGGAGATCAAAGAAGGACTTGAAAGCGATGAGGA
GATACGGAGAGTGCCGGAGTTTGCAAAAGAAACCTCTGGATCAGCGAACGGCCAGGACAG
GGCACAGACAGCTGTCGGAGAACGTCAAAGGAAGCGAGGGAGGACTCCGGCGGAGAAAGA
GACCAAGCGGCTAAAGAGGTTGTTGAGGAATAGAGTATCAGCGCAGCAAGCAAGAGAGAG
GAAGAAAGCTTACTTGGGTGAGTTGGAGAATAGAGTGAAAGACTTGGAGACAAAAACTCT
GAGCTTGATGAGAGACTCTCTACTTTGCAGAACGAGAACCAGATGCTTAGACAGGTATGA
ATTCGTTTTTTTTATCTTTATCCTGTAAACCTTGATCATAATCTGCCAATGTTAATGATT
GCTCCATTAATTTGCAAAGCCTTGAGACCTATTCATCAAATAGATTAGTAAACTAAAAGA
CTAATAAGGAGCTAGTTCACAAGATTCTTTAATGGTTCTTGGAATGTTCATTCACTGTGG
TCTATGTGGAAGCTTTGGTTCTTTGTTATGTTATTTCTGTGGATTTTCTGTTAAGTTTTG
GGTGAATGCAGATTCTGAAGAACACAACAG*AAACAAGAGAGGAGGCGGTGGTTCTA*CG
CTGCTGCAAGCCTTTGATCTCTCCCCAC

QA 1 808 1 808
DS 

RD RS1EE46JQ 761 0 0
GCCAGGACAGGGCACAGACAGCTGTCGGAGAACGTCAAAGGAAGCGAGGGAGGACTCCGG
CGGAGAAAGAGACCAAGCGGCTAAAGAGGTTGTTGAGGAATAGAGTATCAGCGCAGCAAG
CAAGAGAGAGGAAGAAAGCTTACTTGGGTGAGTTGGAGAATAGAGTGAAAGACTTGGAGA
CAAAAACTTTGAGCTTGATGAGAGACTCTTTACTTTGCAGAACGAGAACCAGATGCTTAG
ACAGGTATGAATTCGTTTTTTTTATCTTTATCCTGTAAACCTTGATCATAATCTGCCAAT
GTTAATGATTGCTCCATTAATTTGCAAAGCCTTGAGACCTATTCATCAAATAGATTAGTA
AACTAAAAGACTAATAAGGAGCTAGTTCACAAGATTCTTTAATGGTTCTTGGAATGTTCA
TTCACTGTGGTCTATGTGGAAGCTTTGGTTCTTTGTTATGTTATTTCTGTGGATTTTCTG
TTAAGTTTTGGGTGAATGCAGATTCTGAAGAACACAACAGGAAACAAGAGAGGAGGCGGT
GGTTCTAACGCTGCTGCAAGCCTTTGATCTCTCCCCACTTGTTCTTTTCCTATTTTATGT
GGATAAAATTTACAGGGAAATTGTATTAATAAAATTATTGTTACAATTTCTATATTGCAT
GGGGGTGTGACTTGTGTGATATATAGAGTATCTTGTAATCTTTAGATATTTATTTTCTTA
ATTCAAAAGTGTGCAACTGTCATTTGGCAGTTTGCTAGAGC

QA 1 761 1 761
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7810Contig1 680 2 2 U
GATCACAACCAAATGGGAAACTATTTAGTACAATCAACGGCAGGATCTTTAGCTACGAGT
CAGACTCCTGCTACGGCACCGTTTTGGAGTAGTGGTGATTATACGCAGAATCTATGGGCT
TTTAATATCAACCCTCATCATTCCGCTGACGTTTACAACACAAACGGTGGTGGTGGTGGA
GGAGGAGCAGGAGTACATCTCAAATTTTGCAGCTCCCATTGCTTTGTTTTCCGGACAGCC
TTTGCCGTCTGGTTACGGAGGAGGAGGTGGGGAACAAAACCATTATGGAGTTTTAGGGGC
GTTGAACGCGGCTTACCGGCCGGTTCAGGAGACGGCGAACCAGCAAAACCGCGACGGAGA
TCATCATCACAGCCATCAAGAAGATGGAAGCACAAGTCATCATTCCTAGACGATAAAACA
CACACAAACAATATATCTGTGAGATTCGTTGTTATTTTCTTTTTTTTTTTTTGGGTTTTA
AATTCTGATCGGGTTTCATTCTTCTTTTATTAATGTATTAAGACGAGCATGATTAATTCG
ATGTATCTTAGTATGTGGTTTCTGCAACCAGGGTTTGGTTTTGTTTTTTCCCAAAGTTTG
TGGCGTAGTATTTTTCTTGTGAAATGTTTTCTCTACACTCTTGAGTGTTAAGAGTTTTCT
AATGAGACATAATACTTGGT


BQ
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BQ
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AF RS1FS37TF U 1
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QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1FN91TF U 1
AF RS1FN91JQ C 115
BS 1 578 RS1FN91TF
BS 579 806 RS1FN91JQ

RD RS1FN91TF 578 0 0
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CTTTGTTCCTCTTTGCATTGTTCTCTCTCACATCTGCAAGATCTTTCGTCACCACAAGAC
CTGGACCGATTGATTCATTTCTCCCTAAACCAAAGCTAGAGGGTGCGAATGTGTGTTCTT
ACACAGTGATCATTAAGACAAGCTGTTCGTCAGTGTCTTACACCAGAGATAAGATCAGTA
TTGCCTTTGGTGATGTGTACGGCAACGAGGTGTACGTGAAGAGACTAGACAATCCAAAGG
CGAGGGCTTTTGAAAAGTGTTCCTCAGACACATACAAGATAGCGGGACCGTGTATGCGTG
ACGTATGTTATCTCCACCTACTCAGGCAAGGATCCGACGGCTGGAAACCGGAGAACGTCA
AGGTCTACGGCTCATCCATCAGATCAGTCACTTTCTACTATAACCTCTTCTTGCCTAACG
GAGTTTGGTACGGCTTTAACGTCTGCAACGGCATTGCCAATGCCAGTGACAACGACAAGT
CTTCTCAACCCATCATTGCCTCCGTTGCTGCTATGTAA

QA 1 578 1 578
DS 

RD RS1FN91JQ 692 0 0
CAAGACCTGGACCGATTGATTCATTTCTCCCTAAACCAAAGCTAGAGGGTGCGAATGTGT
GTTCTTACACAGTGATCATTAAGACAAGCTGTTCGTCAGTGTCTTACACCAGAGATAAGA
TCAGTATTGCCTTTGGTGATGTGTACGGCAACGAGGTGTACGTGAAGAGACTAGACAATC
CAAAGGCGAGGGCTTTTGAAAAGTGTTCCTCAGACACATACAAGATAGCGGGACCGTGTA
TGCGTGACGTATGTTATCTCCACCTACTCAGGCAAGGATCCGACGGCTGGAAACCGGAGA
ACGTCAAGGTTTACGGCTCATCCATCAGATCAGTCACTTTTTACTATAACCTCTTCTTGC
CTAACGGAGTTTGGTACGGCTTTAACGTTTGCAACGGCATTGCCAATGCCAGTGACAACG
ACAAGTCTTCTCAACCCATCATTGCCTCCGTTGCTGCTATGTAAGATTAATAAATACAAA
CAAGGTTGATTATCTGTGGATTTGCTGTTTTGCGGCGGAAACTGAAGAGAAGCAACTTGC
GTTTTGAGTATGTTTATGAGAAGAAGAAAAAAACATGTAATGTTATATAATGCCTTGATC
TGATTTGATGATCTCTCTTGCATTTTGGGGCTTTTACCAAGTGGCCAAGTCCTCTTTATA
TGAAATAAATAAATATAGCGTGCATTGGATTT

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 2

CO CL7813Contig1 501 2 2 U
TCATAACAAACTTTGAAGTTAAGAGACTTAAACCATTGTGCATTACATAGAATATGAAAG
TCTCTAGCACTAAATACAATAGGCATAAACTGAATTTGTTGGACTAATGGAAAACGAAAG
TAGATATAAGATATTAAATAAATTATTCATCCAGGTATTTATAATCTCTGATGTAGGTTC
TCCGAATAGCTTATAACATTATTCCGCACATTTCTTTACAAAATTCCATCTTAGCGTAAC
ACCTGTACTGATTCCCATCATTGGAGACACAACAATTACAATTAAGTTTATTGTCTTCGC
CGCATTTGATTTGCTTACAAGCTTCTTTACCCACACTAAGAACTTGGCCATCAACAAATT
CACGACGAGGAAATAAAGTAATCAAGATAATACAAAAGATAACGAACTGTGATGACGACA
TATTGTTCTTTGTAATATTCTTACGTTACAAACAAGTTTATTTTTTTTTTCTTTTGAATT
TTACATTTATTGGTTCGATCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BS35TF C 1
AF RS1BS35JQ U 3
BS 1 2 RS1BS35TF
BS 3 501 RS1BS35JQ

RD RS1BS35TF 431 0 0
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TCTCTAGCACTAAATACAATAGGCATAAACTGAATTTGTTGGACTAATGGAAAACGAAAG
TAGATATAAGATATTAAATAAATTATTCATCCAGGTATTTATAATCTCTGATGTAGGTTC
TCCGAATAGCTTATAACATTATTCCGCACATTTCTTTACAAAATTCCATCTTAGCGTAAC
ACCTGTACTGATTCCCATCATTGGAGACACAACAATTACAATTAAGTTTATTGTCTTCGC
CGCATTTGATTTGCTTACAAGCTTCTTTACCCACACTAAGAACTTGGCCATCAACAAATT
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TATTGTTCTTT

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DS 

RD RS1BS35JQ 499 0 0
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TCTAGCACTAAATACAATAGGCATAAACTGAATTTGTTGGACTAATGGAAAACGAAAGTA
GATATAAGATATTAAATAAATTATTCATCCAGGTATTTATAATCTCTGATGTAGGTTCTC
CGAATAGCTTATAACATTATTCCGCACATTTCTTTACAAAATTCCATCTTAGCGTAACAC
CTGTACTGATTCCCATCATTGGAGACACAACAATTACAATTAAGTTTATTGTCTTCGCCG
CATTTGATTTGCTTACAAGCTTCTTTACCCACACTAAGAACTTGGCCATCAACAAATTCA
CGACGAGGAAATAAAGTAATCAAGATAATACAAAAGATAACGAACTGTGATGACGACATA
TTGTTCTTTGTAATATTCTTACGTTACAAACAAGTTTATTTTTTTTTTCTTTTGAATTTT
ACATTTATTGGTTCGATCC

QA 1 499 1 499
DS 



AS 1 2

CO CL7814Contig1 567 2 1 U
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TCAGAAATTTGCTATTTGCTTCACCCTTGGATGTGGATTTATCATCGGATCATTCTTCGC
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CATAGGTTTCATTGCCACCATGGTTGGTACTATATACGTCTCCATGGTTCTTCACAGCTA
CATTCTCTCTGTCGTCTTCTCTGTCTTGCAGGTTCTTGCGTTGGTGTACTACTGTATATC
CTACTTCCCTGGAGGATCATCCGGCATGAGGTTCCTAAGTTCTGCTCTCACTTCATCTGT
TCTAAGAGGTTTTGGGAGATGAGCTTTTCGCGGGAGAAAGAACAAAACTTTACTTCTATC
TGGTGTATAGAGTTTTTTTTCGAAAAGACAATATGATCCTTAAATAGATGTTAAAAGGAA
GAAACCAACTGATGCTATCACTCTTTTTTTTTTTACTACTGTTGATTACTGGTGGGCATA
TATATAATGTTTTGTTTGTTGTTTTCG


BQ
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AF RS1EA77JQ C 1
AF RS1EA77TF U 1
BS 1 567 RS1EA77TF

RD RS1EA77JQ 567 0 0
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TCAGAAATTTGCTATTTGCTTCACCCTTGGATGTGGATTTATCATCGGATCATTCTTCGC
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CATTCTCTCTGTCGTCTTCTCTGTCTTGCAGGTTCTTGCGTTGGTGTACTACTGTATATC
CTACTTCCCTGGAGGATCATCCGGCATGAGGTTCCTAAGTTCTGCTCTCACTTCATCTGT
TCTAAGAGGTTTTGGGAGATGAGCTTTTCGCGGGAGAAAGAACAAAACTTTACTTCTATC
TGGTGTATAGAGTTTTTTTTCGAAAAGACAATATGATCCTTAAATAGATGTTAAAAGGAA
GAAACCAACTGATGCTATCACTCTTTTTTTTTTTACTACTGTTGATTACTGGTGGGCATA
TATATAATGTTTTGTTTGTTGTTTTCG

QA 1 567 1 567
DS 

RD RS1EA77TF 567 0 0
GGGTGTCTTCTTCATCTTCATTGCCTTCACTATGTTTCTTCCTGTCATGGTGCTCATGCC
TCAGAAATTTGCTATTTGCTTCACCCTTGGATGTGGATTTATCATCGGATCATTCTTCGC
ACTTCGTGGCCCACAAAACCAGCTCGCACACATGTCATCCATGGAGAGGCTTCCTTTTAC
CATAGGTTTCATTGCCACCATGGTTGGTACTATATACGTCTCCATGGTTCTTCACAGCTA
CATTCTCTCTGTCGTCTTCTCTGTCTTGCAGGTTCTTGCGTTGGTGTACTACTGTATATC
CTACTTCCCTGGAGGATCATCCGGCATGAGGTTCCTAAGTTCTGCTCTCACTTCATCTGT
TCTAAGAGGTTTTGGGAGATGAGCTTTTCGCGGGAGAAAGAACAAAACTTTACTTCTATC
TGGTGTATAGAGTTTTTTTTCGAAAAGACAATATGATCCTTAAATAGATGTTAAAAGGAA
GAAACCAACTGATGCTATCACTCTTTTTTTTTTTACTACTGTTGATTACTGGTGGGCATA
TATATAATGTTTTGTTTGTTGTTTTCG

QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 2

CO CL7815Contig1 764 2 8 U
TCAATAATTTTGATTGAACGATTCGGATGTGGAAAACCTCGGATCGGCGATGAAAGGCGT
CTCGTCGGCGCCTGGAGATTACGTCTACTTCAAATCTCAGGTTCCTCTTCACAAGATTCC
CATTGGGACAAAGCAATGGCGTTATTATGACTATGGTCCGAAGACTGTTCCTCCACTCAT
TTGTATTCCTGGCATCGCAGGAACTGCAGATGTTTATTATAAACAGATCATGGCATTGTC
TATCAAGGGTTATCGGGTAATTTCAGTTGACATTCCACGGGTCTGGAGTTATCATGAGTG
GATTCAAGCATTTGAGAAATTCCTTGACACCATTGATGTTCATCACGTGCATCTCTATGG
TACTTCCCTTGGAGGCTTTTTAGCGCAACTCTTTGCTCATCACCGACCAAGAAGGGTTAA
ATCATTGGTTCTATCAAATACATACTTGGACACTCGCAGTTTTGCTGCTGCAATGCCATG
GGCTCCTTTTGTAAGTTGGACTCCTTCCTTTTTGCTGAAACGATACGTCTTAACAGGAAT
ACGTGACGGACCTCACGAACCCTTTATCGCTGACTCTGTCGACTTTGCTGTCTCTCACGT
TGAGACATTGTCAAAAGATGATTTGGCTTCTCGGTTAACGTTAACAGTTGAGACGCGTCT
GTGGGGTCTCTACACCACACTCTGATCATCATCACTATATGGATACAATGATACTGTGCG
ATCCGCAGTTCTGAAAGATGACTACAGATAGATATCCCGAGCAA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CD58TF U 1
AF RS1GR64TF U 4
BS 1 35 RS1CD58TF
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BS 37 497 RS1CD58TF
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RD RS1CD58TF 595 0 0
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CTCGTCGGCGCCTGGAGATTACGTCTACTTCAAATCTCAGGTTCCTCTTCACAAGATTCC
CATTGGGACAAAGCAATGGCGTTATTATGACTATGGTCCGAAGACTGTTCCTCCACTCAT
TTGTATTCCTGGCATCGCAGGAACTGCAGATGTTTATTATAAACAGATCATGGCATTGTC
TATCAAGGGTTATCGGGTAATTTCAGTTGACATTCCACGGGTCTGGAGTTATCATGAGTG
GATTCAAGCATTTGAGAAATTCCTTGACACCATTGATGTTCATCACGTGCATCTCTATGG
TACTTCCCTTGGAGGCTTTTTAGCGCAACTCTTTGCTCATCACCGACCAAGAAGGGTTAA
ATCATTGGTTCTATCAAATACATACTTGGACACTCGCAGTTTTGCTGCTGCAATGCCATG
GGCTCCTTTTGTAAGTTTGACTCCTTCCTTTTTGCTGAAACGATACGTCTTAACAGGAAT
ACGTGACGGACCTCACGAACCCTTTATCGCTGACTCTGT**ACTTTGCTGTCTCT

QA 1 595 1 595
DS 

RD RS1GR64TF 761 0 0
ATAATTTTGATTGAACGATTCGGATGTGGAAAACCTCGGATCGGCGATGAAAGGCGTCTC
GTCGGCGCCTGGAGATTACGTCTACTTCAAATCTCAGGTTCCTCTTCACAAGATTCCCAT
TGGGACAAAGCAATGGCGTTATTATGACTATGGTCCGAAGACTGTTCCTCCACTCATTTG
TATTCCTGGCATCGCAGGAACTGCAGATGTTTATTATAAACAGATCATGGCATTGTCTAT
CAAGGGTTATCGGGTAATTTCAGTTGACATTCCACGGGTCTGGAGTTATCATGAGTGGAT
TCAAGCATTTGAGAAATTCCTTGACACCATTGATGTTCATCACGTGCATCTCTATGGTAC
TTCCCTTGGAGGCTTTTTAGCGCAACTCTTTGCTCATCACCGACCAAGAAGGGTTAAATC
ATTGGTTCTATCAAATACATACTTGGACACTCGCAGTTTTGCTGCTGCAATGCCATGGGC
TCCTTTTGTAAGTTGGACTCCTTCCTTTTTGCTGAAACGATACGTCTTAACAGGAATACG
TGACGGACCTCACGAACCCTTT**CGCTGACTCTGTCGACTTTGCTGTCTCTCACGTTGA
GACATTGTCAAAAGATGATTTGGCTTCTCGGTTAACGTTAACAGTTGAGACGCGTCTGTG
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CGCAGTTCTGAAAGATGACTACAGATAGATATCCCGAGCAA

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

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CGACCAGCATCACAGCTTGGATATCGACCGCTTGATCTCTAATCACGTCGAGATAATTAG
AATGGAGATTGACGAGAAGAGAAATACTCAAGGTAGGAAAATAATGGAAGCCTCGAACAA
GGGTTGATGGAGAAACTAAGAAACAAAGACGAAGAGATCAACCACATCCAAAAACTAAAC
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GCACAGTCTAATGAAGCCACCGTGAACGCTCTAAGATCAAACTTACAACAAGTCCTTGCC
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TGTAAATCTCCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EW34TF U 1
AF RS1EW34JQ C 139
BS 1 654 RS1EW34TF
BS 655 655 RS1EW34JQ
BS 656 663 RS1EW34TF
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BS 667 697 RS1EW34TF
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BS 699 705 RS1EW34TF
BS 706 706 RS1EW34JQ
BS 707 719 RS1EW34TF
BS 720 721 RS1EW34JQ
BS 722 752 RS1EW34TF
BS 753 793 RS1EW34JQ

RD RS1EW34TF 752 0 0
AACTTACAACATCTCACCGGTTGATTATTTGGTTCATCAGTCTATAAAACCTACAATTCA
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AAGCCAGAAACGTTGCACCGATCCTCTCATGTTCCTTGGCCAAGACTTGTCTCCAAAAAT
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GCACAGTCTAATGAAGCCACCGTGAACGCTCTAAGATCAAACTTACAACAAGTCCTTGCC
GACGTGGAACGTAGGGAGGAGCCTACGGCGGCTGATGACACGCAGTCTTGCTGCGGAAGC
AACGACGAGGGTGACAGTGACGAGACGTGGAGGCTAGTGGGAGAGGAAGCGCAG*TGCGT
ACGT**ACAAGGACGATGTGTAGAGGCTGTGGAGAAG*AGAAGCA*GTGTGTTACTGTA*
*CATGCAGACACATGTGTTTATGTCTTGTGTG

QA 1 752 1 752
DS 

RD RS1EW34JQ 655 0 0
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GGATATCGACCGCTTGATCTTTAATCACGTCGAGATAATTAGAATGGAGATTGACGAGAA
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GTTAAGTCACTTTGCGCAGAGAATCAGATATGGCGTGACGTGGCACAGTTTAATGAAGCC
ACCGTGAACGCTTTAAGATCAAACTTACAACAAGTCCTTGCCGACGTGGAACGTAGGGAG
GAGCCTACGGCGGCTGATGACACGCAGTCTTGCTGCGGAAGCAACGACGAGGGTGACAGT
GACGAGACGTGGAGGCTAGTGGGAGAGGAAGCGCAGGTGCGTACGGTAACAAGGACGATG
TGTAGAGGCTGTGGAGAAGGAGAAGCAAGTGTGTTACTGTTACCATGCAGACACATGTGT
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QA 1 655 1 655
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CAGGTGCAACCTCTAACTTCACTGGACCAAACACCTTTCCTGAGGAGAACGTGTCCGAGG
TAGCCTAGAATTATACAGCAATAATCTTTTTTGGAACAAACCAATCAAACAAAAGGGCCA
TTTTTGGGTTTCCATAAAACTTTTTCAACAGACATTTTCTTTTAGGTAAAGAGACTGCAG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DH08TF U 1
AF RS1DH08JQ C 25
BS 1 595 RS1DH08TF
BS 596 611 RS1DH08JQ

RD RS1DH08TF 595 0 0
GAGTCATTTACGAACTTCGTGTCTATTCTCTCCAAAAGGAAAGCTTTGGTTCAGTAATCG
TGTCACGGCAAATTAGAGCTGCGCATTGCTTGACCTCTATCCAGTTCTCTCCCACCTCCG
AGCACATACTTGCATATGGACGGCATCATGGTTCTCTTTTGAATAGCATCGTTAGTGATG
GTGAAGCTACATTACATTTTTTTACAGTGTTGGAGATATACAGAGTTTCGGATATGGAGC
TTGTGAGAGTACTCCCAAGTTCAGAGGATGAAGTGAATGTTGCTTGTTTTCATCCTTCTC
CCGGAGGTGGCCTTGTTTATGGGACCAAGGAGGGTTCACTGAGGATCTTCCAGTACAATA
CAGGTGCAACCTCTAACTTCACTGGACCAAACACCTTTCCTGAGGAGAACGTGTCCGAGG
TAGCCTAGAATTATACAGCAATAATCTTTTTTGGAACAAACCAATCAAACAAAAGGGCCA
TTTTTGGGTTTCCATAAAACTTTTTCAACAGACATTTTCTTTTAGGTAAAGAGACTGCAG
ATAAAGAAAATGTAAAAAATATTGTTTTTGTTGTTACCCTTACCTTTATATATCT

QA 1 595 1 595
DS 

RD RS1DH08JQ 587 0 0
ATTCTCTCCAAAAGGAAAGCTTTGGTTCAGTAATCGTGTCACGGCAAATTAGAGCTGCGC
ATTGCTTGACCTCTATCCAGTTCTCTCCCACCTCCGAGCACATACTTGCATATGGACGGC
ATCATGGTTCTCTTTTGAATAGCATCGTTAGTGATGGTGAAGCTACATTACATTTTTTTA
CAGTGTTGGAGATATACAGAGTTTCGGATATGGAGCTTGTGAGAGTACTCCCAAGTTCAG
AGGATGAAGTGAATGTTGCTTGTTTTCATCCTTCTCCCGGAGGTGGCCTTGTTTATGGGA
CCAAGGAGGGTTCACTGAGGATCTTCCAGTACAATACAGGTGCAACCTCTAACTTCACTG
GACCAAACACCTTTCCTGAGGAGAACGTGTCCGAGGTAGCCTAGAATTATACAGCAATAA
TCTTTTTTGGAACAAACCAATCAAACAAAAGGGCCATTTTTGGGTTTCCATAAAACTTTT
TCAACAGACATTTTTTTTTAGGTAAAGAGACTGCAGATAAAGAAAATGTAAAAAATATTG
TTTTTGTTGTTACCCTTACCTTTATATATCTATCTTATTAAAGCCGT

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 2

CO CL7819Contig1 740 2 2 U
TTTTTCTTGTGTTCAACTCTGCAGCGATCGTCACTGCTTGAAAGAACGGCTTGCCTCTTT
TCCGAATCTCATCTCTGCAAATCATAATGTCTTTGGTCGCAAACGAGGAGTTTCAGCATA
TTCTCCGTGTGCTCAACACAAATGTTGATGGTAAGCAGAAGATAATGTTTGCCCTTACCT
CTATCAAAGGTATTGGGAGGCGATTGGCTAACATCGTCTGCAAGAAGGCTGATGTCGACA
TGAACAAAAGGGCTGGTGAGTTATCTGCTGCTGAGATCGACAACCTGATGACAATTGTCG
CTAACCCGAAGCAGTACAAGATCCCAGACTGGTTCCTGAACAGACAGAAGGATTACAAAG
ACGGGAAGTACTCTCAAGTTGTCTCCAATGCCCTTGACATGAGGCTCAGGGATGACCTTG
AACGTCTCAAGAAAATCAGGAACCATCGTGGTCTGAGACACTACTGGGGTCTCCGTGTTC
GTGGACAACACACCAAGACAACTTGCCGCAGAGGAAAGACTGTTGGTGTGTCAAAGAAGC
GTTAAGCAAGCCTATTGGTGTTGCTAGTTACTGCTTTACTGGATATGTTTCACAAGAATC
GATTTTAATTTATGTTTTTTTTTCGAACTAGTTTGTGAGACACCTTTTGAATCTAGTTTT
GAGACCTTTTCAATCTTATGATCTGTCTTTGTGAACCATTTGTTACACATGTGCCTGCTC
CCTTCTCTATTGCTATCTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EL23TF U 1
AF RS1EL23JQ C 22
BS 1 512 RS1EL23TF
BS 513 740 RS1EL23JQ

RD RS1EL23TF 512 0 0
TTTTTCTTGTGTTCAACTCTGCAGCGATCGTCACTGCTTGAAAGAACGGCTTGCCTCTTT
TCCGAATCTCATCTCTGCAAATCATAATGTCTTTGGTCGCAAACGAGGAGTTTCAGCATA
TTCTCCGTGTGCTCAACACAAATGTTGATGGTAAGCAGAAGATAATGTTTGCCCTTACCT
CTATCAAAGGTATTGGGAGGCGATTGGCTAACATCGTCTGCAAGAAGGCTGATGTCGACA
TGAACAAAAGGGCTGGTGAGTTATCTGCTGCTGAGATCGACAACCTGATGACAATTGTCG
CTAACCCGAAGCAGTACAAGATCCCAGACTGGTTCCTGAACAGACAGAAGGATTACAAAG
ACGGGAAGTACTCTCAAGTTGTCTCCAATGCCCTTGACATGAGGCTCAGGGATGACCTTG
AACGTCTCAAGAAAATCAGGAACCATCGTGGTCTGAGACACTACTGGGGTCTCCGTGTTC
GTGGACAACACACCAAGACAACTTGCCGCAGA

QA 1 512 1 512
DS 

RD RS1EL23JQ 719 0 0
CAGCGATCGTCACTGCTTGAAAGAACGGCTTGCCTCTTTTCCGAATCTCATCTCTGCAAA
TCATAATGTCTTTGGTCGCAAACGAGGAGTTTCAGCATATTCTCCGTGTGCTCAACACAA
ATGTTGATGGTAAGCAGAAGATAATGTTTGCCCTTACCTCTATCAAAGGTATTGGGAGGC
GATTGGCTAACATCGTTTGCAAGAAGGCTGATGTCGACATGAACAAAAGGGCTGGTGAGT
TATCTGCTGCTGAGATCGACAACCTGATGACAATTGTCGCTAACCCGAAGCAGTACAAGA
TCCCAGACTGGTTCCTGAACAGACAGAAGGATTACAAAGACGGGAAGTACTCTCAAGTTG
TCTCCAATGCCCTTGACATGAGGCTCAGGGATGACCTTGAACGTCTCAAGAAAATCAGGA
ACCATCGTGGTTTGAGACACTACTGGGGTCTCCGTGTTCGTGGACAACACACCAAGACAA
CTTGCCGCAGAGGAAAGACTGTTGGTGTGTCAAAGAAGCGTTAAGCAAGCCTATTGGTGT
TGCTAGTTACTGCTTTACTGGATATGTTTCACAAGAATCGATTTTAATTTATGTTTTTTT
TTCGAACTAGTTTGTGAGACACCTTTTGAATCTAGTTTTGAGACCTTTTCAATCTTATGA
TCTGTCTTTGTGAACCATTTGTTACACATGTGCCTGCTCCCTTCTCTATTGCTATCTAT

QA 1 719 1 719
DS 



AS 1 2

CO CL7820Contig1 874 2 2 U
GACGGCCTCTTCTCTCAGATCGAGCTATCGTTCTCGGCTTCCAATTTGCGAGACCGAGAC
GTGACTTCAAAGAGCGACGCAATGGTGGTTGTTTATACGAAAGGAAGAGATGGAACAACA
CTCGCTGAATCTTTCCGTAGGGAAGTTGTTTTGAACTCTTTGAATCCTAGATGGATAACA
AGTTCACGATTAGTTATCAGTTCGAGGTTGTGCAGACTTTGCTGTTTCGCCTCTATGACA
TTGATACTCAGTTTCAAAAATCAAAGGAGGAGGTTTAAGAGTGGACTAGTGGAATGTTTC
GAGAATTCTGAGACTGGATGAATTTGTGGATAGTTTTTATGTTGCAATAAACAGCGTTTT
TGATCAAGCAATTTGACAAGGAATCTTGATGAACAACGAGTAACGCTATTAAGGATCTAT
ATCTTCTGCTCCCACCTCCAGACAAAGAGCCTTTTATACTGCAAATGCAAATAAGGCATG
GGTGCTTGGTAAAAGACCAGTCAATCTTCCAATAACTATGCGTCGACATAACTTACTGCT
GCTGGATCTATAAAGGTGACATCGACAAACCAAATCTCTCAGAAAGACTATATCACTTAA
AGATGCAACTTGCTAGGGCTCAATTTTGCTTGAGTATTTTCGTCCACTTGAGAGAGCCAA
TCATTTTCTTATTACTTCTTTTAAAGGTGTTCAGATCTTTTGAGTTTTAGAAGCTGCAAA
GGCAAATCATCAGTCCAGCAGAACCACTGAGAGTTGGGTGATGGAAATCTTTGTCTCTCT
TCTCATGTGTAAACTACTTACACCACCAACTCACACAAATAAGACAACGACAAAAATGAA
ACGTCACGAACACTCAACAAATCACAAAAGCTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BS41TF U 1
AF RS1BS41JQ C 580
BS 1 665 RS1BS41TF
BS 666 874 RS1BS41JQ

RD RS1BS41TF 665 0 0
GACGGCCTCTTCTCTCAGATCGAGCTATCGTTCTCGGCTTCCAATTTGCGAGACCGAGAC
GTGACTTCAAAGAGCGACGCAATGGTGGTTGTTTATACGAAAGGAAGAGATGGAACAACA
CTCGCTGAATCTTTCCGTAGGGAAGTTGTTTTGAACTCTTTGAATCCTAGATGGATAACA
AGTTCACGATTAGTTATCAGTTCGAGGTTGTGCAGACTTTGCTGTTTCGCCTCTATGACA
TTGATACTCAGTTTCAAAAATCAAAGGAGGAGGTTTAAGAGTGGACTAGTGGAATGTTTC
GAGAATTCTGAGACTGGATGAATTTGTGGATAGTTTTTATGTTGCAATAAACAGCGTTTT
TGATCAAGCAATTTGACAAGGAATCTTGATGAACAACGAGTAACGCTATTAAGGATCTAT
ATCTTCTGCTCCCACCTCCAGACAAAGAGCCTTTTATACTGCAAATGCAAATAAGGCATG
GGTGCTTGGTAAAAGACCAGTCAATCTTCCAATAACTATGCGTCGACATAACTTACTGCT
GCTGGATCTATAAAGGTGACATCGACAAACCAAATCTCTCAGAAAGACTATATCACTTAA
AGATGCAACTTGCTAGGGCTCAATTTTGCTTGAGTATTTTCGTCCACTTGAGAGAGCCAA
TCATT

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1BS41JQ 295 0 0
CAGAAAGACTATATCACTTAAAGATGCAACTTGCTAGGGCTCAATTTTGCTTGAGTATTT
TCGTCCACTTGAGAGAGCCAATCATTTTCTTATTACTTCTTTTAAAGGTGTTCAGATCTT
TTGAGTTTTAGAAGCTGCAAAGGCAAATCATCAGTCCAGCAGAACCACTGAGAGTTGGGT
GATGGAAATCTTTGTCTCTCTTCTCATGTGTAAACTACTTACACCACCAACTCACACAAA
TAAGACAACGACAAAAATGAAACGTCACGAACACTCAACAAATCACAAAAGCTAA

QA 1 295 1 295
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7822Contig1 561 2 2 U
GGCACAGAGATGAGGAGATCAATTACTACCCATCAAAGTTTGACCCCGTCCGCTGCGCAG
AGAAGGTTCCTATCCCTAACAAATCCTACACTGGAATCAGAACAAAGTGTATCATCAAGA
AGGAGAACAACTTCAAACAGGCTGGAGACAGATACAGATCCTGGGCACCAGACAGGCAAG
ACAGGTTTGTGAAGAGATGGGTTGAGATACTGTCAGAGCCACGGCTGACTCATGAGATCC
GCAGCATCTGGATCTCTTACTGGTCTCAGGCTGATCGATCACTGGGACAGAAACTTGCAA
GCCGTCTGAACGTGAGGCCAAGCATCTAGAGTTTGCTTGTCCTTGGGAAAGGTACAAATC
ATGATCGATCCTTCATCACTCTAAAAAAATCCCTCAAAAGATATTTTATCCCATGTGTTG
TTGTTTCTATGTTTGTATAATAATAATGATGCTTTGTAATCCTTTTAAACCAATGTTTCC
TTGGTATTTTTACTTGTCAACATTGTAATCATGTCTTCATAATAAAAATCAATGAAAATA
ACGCAATACTACTTATTTCAG


BQ
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AF RS1DW59JQ C 1
AF RS1DW59TF U 1
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BS 560 561 RS1DW59JQ

RD RS1DW59JQ 561 0 0
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GCAGCATTTGGATTTTTTACTGGTCTCAGGCTGATCGATCACTGGGACAGAAACTTGCAA
GCCGTCTGAACGTGAGGCCAAGCATTTAGAGTTTGCTTGTCCTTGGGAAAGGTACAAATC
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ACGCAATACTACTTATTTCAG

QA 1 561 1 561
DS 

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AGAAGGTTCCTATCCCTAACAAATCCTACACTGGAATCAGAACAAAGTGTATCATCAAGA
AGGAGAACAACTTCAAACAGGCTGGAGACAGATACAGATCCTGGGCACCAGACAGGCAAG
ACAGGTTTGTGAAGAGATGGGTTGAGATACTGTCAGAGCCACGGCTGACTCATGAGATCC
GCAGCATCTGGATCTCTTACTGGTCTCAGGCTGATCGATCACTGGGACAGAAACTTGCAA
GCCGTCTGAACGTGAGGCCAAGCATCTAGAGTTTGCTTGTCCTTGGGAAAGGTACAAATC
ATGATCGATCCTTCATCACTCTAAAAAAATCCCTCAAAAGATATTTTATCCCATGTGTTG
TTGTTTCTATGTTTGTATAATAATAATGATGCTTTGTAATCCTTTTAAACCAATGTTTCC
TTGGTATTTTTACTTGTCAACATTGTAATCATGTCTTCATAATAAAAATCAATGAAAATA
ACGCAATACTACTTATTTC

QA 1 559 1 559
DS 



AS 1 2

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AGCTGAGGCGGCTCAAGAAGAAGTACCGTAACGTGATGAGCAAGATTAGCTCCGGGAAAG
AGGTCTTCTTCAAGAGCCCTCACGATCAGTCCACTTTCGAGATCTCTAGGAAGATTTGGA
ACCAGACTGGGAAGATCATCGGGTTCGAGGACAACAATGTCATGGATTTCGAGGAGACTA
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CGAGATCGAGAATAGGGAAGATTGAGGAAGACAGCAAACCTGTCATTGATGGGAACATAC
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GGAACATCGGTGTTTTGATTGAAGAGACTGTGAAGAGCTGTGTCTCTCCTCTGATCAAGG
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ATGGTGTGGAAGGAGGAGGTGGGAACAAGGCGGTGAATGATGAGCGGTGGAGGAAGCAAC
AGATACTGGAGCTGGAAGTGTATTCGAGGAGATTAGAGCTGGTTCAAGAGCAGATTAGAG
CTACATTGCATGAGTTAAAGACGATGCCGAGTGGTGTATGATGATGATGAAACAAGAAGA
AGAGGAATAAGACAATAACCAGTTAGGTTGATATTTGATTATGAGTTTAACCTTCTGGAA
TGTGTGTGGTGAGTATTAGTAGTATGAGAGATTTGAATATTTTTCCAGTTATAAATTTGC
TTAAGGTATTATTGTGATATTATTCTAGGTTTTGATTTTTGTTTTTCTCTTCTTTAAATT
ATTTGTCAATAGGGATGAATCATCATAGTGGGGGTTTGTGTATAACCTTTGTATTAGATT
TATAGTTTTTTCGTATAACCTTTGTTTCATGATGCAGTTACTGAAGTGTATGATTATTAT
TACTATATTTGACACATGACTTGAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EO96TF U 1
AF RS1EO96JQ C 583
BS 1 654 RS1EO96TF
BS 655 1227 RS1EO96JQ

RD RS1EO96TF 654 0 0
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AGGTCTTCTTCAAGAGCCCTCACGATCAGTCCACTTTCGAGATCTCTAGGAAGATTTGGA
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CGAGATCGAGAATAGGGAAGATTGAGGAAGACAGCAAACCTGTCATTGATGGGAACATAC
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AGATGATGAACGGGACGACGAGTATGATGATGGCTGCAATGGGAGGAGGAGGTG

QA 1 654 1 654
DS 

RD RS1EO96JQ 645 0 0
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GATGATGAAACAAGAAGAAGAGGAATAAGACAATAACCAGTTAGGTTGATATTTGATTAT
GAGTTTAACCTTCTGGAATGTGTGTGGTGAGTATTAGTAGTATGAGAGATTTGAATATTT
TTCCAGTTATAAATTTGCTTAAGGTATTATTGTGATATTATTCTAGGTTTTGATTTTTGT
TTTTCTCTTCTTTAAATTATTTGTCAATAGGGATGAATCATCATAGTGGGGGTTTGTGTA
TAACCTTTGTATTAGATTTATAGTTTTTTCGTATAACCTTTGTTTCATGATGCAGTTACT
GAAGTGTATGATTATTATTACTATATTTGACACATGACTTGAAGC

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 2

CO CL7824Contig1 675 2 1 U
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TCTCGCCGTCGTCTCCGATTTCTCTCATCGCCGTCGCTATTGTTTTATCTGATCGGTGGG
TTTGAAGGAAAAGATGGCTAGTGGTAGCCTGAAAAGCCTTGTAACTTCAGCAGTCACTGT
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GTCTCCTCATAAGATCTTAAGGAAGAAGCTTTTTGGTGATAAGGTTGCCGAGTGGTATCC
ATACTACATTAAGAACGAGGATCCCAATGTCTTGGCTAGAGAAGAAAAAGAGCGCTTATC
GAAGCTTGAGATGTTGAAGCGTCGTGATAAAGGACCACCAAAGAAGGGTCATGGAAGACG
TGCTGCGAAGCGTAACAAGTAGAAAAAGTAGTGATCGTAGCTTCCAAAACATAAACCAAA
AAATCCTCTGCACTTTTAGTATCACACTATTTTGGTTAATAATGTCAACCATAACTTTTC
TTCACTATGCTGTGACAAAGTTGAAAGCTATTTGCCTTTCCTTTTGTTTCTCTTTTTTTT
TTTCTTTTTTTCTCTGCTTTTGTCAATTCTTTACTCGCTACGATGCGTAAGCTGATATAC
TCAAATTGTGGAACC


BQ
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AF RS1EK24TF U 1
AF RS1EK24JQ C 104
BS 1 675 RS1EK24TF

RD RS1EK24TF 675 0 0
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TTCACTATGCTGTGACAAAGTTGAAAGCTATTTGCCTTTCCTTTTGTTTCTCTTTTTTTT
TTTCTTTTTTTCTCTGCTTTTGTCAATTCTTTACTCGCTACGATGCGTAAGCTGATATAC
TCAAATTGTGGAACC

QA 1 675 1 675
DS 

RD RS1EK24JQ 572 0 0
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AAGGGTCATGGAAGACGTGCTGCGAAGCGTAACAAGTAGAAAAAGTAGTGATCGTAGCTT
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GTCAACCATAACTTTTTTTCACTATGCTGTGACAAAGTTGAAAGCTATTTGCCTTTCCTT
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TGCGTAAGCTGATATACTCAAATTGTGGAACC

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 2

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ATACTACTCTCTCAAACCTTGCATTGGAGCTGTTCTAAGTATTATCTTTGACAGTGATAT
TTTCATTGTGAAAATGTTGGCAAGAAAGTATTTATATATAAATAAAATAAAAATATTTAT
TCTGTTTTATATTACAGAACATAAGAGCACCTATAATACAGGGTTCTAGTTCTGGGGTGC
AAAAAATATATATATTTGTTTATGTATATACTATACATATGTAATTATTGGGATTCTATA
CTTTACAGAAAACTCAGTTACATATACATACATAGTATATACATACACAAATGTATATAC
TTTTAGAGCTCCGAAGTTAGAATATCGCGTTGAAAATACTCTAAAATTGTATTTACAAAT
TTCTGGAATCTAAGGGTATCATTATCAATAAGACTTTGATAGTCCTTAAAATTAAAAAAA
AAAGCAAACGAAACATGAAAAAGAAGAAGGAAGAAGAAGGACGAGCACTGGGACGTCCTT
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TCATATCAATAGAGTAAAAGTACAACTAACTGTTTAGAAAAACCAAAAGATAGAAAAGAA
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BQ
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AF RS1C119TF U 1
AF RS1C119JQ C 172
BS 1 622 RS1C119TF
BS 623 878 RS1C119JQ

RD RS1C119TF 622 0 0
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ATACTACTCTCTCAAACCTTGCATTGGAGCTGTTCTAAGTATTATCTTTGACAGTGATAT
TTTCATTGTGAAAATGTTGGCAAGAAAGTATTTATATATAAATAAAATAAAAATATTTAT
TCTGTTTTATATTACAGAACATAAGAGCACCTATAATACAGGGTTCTAGTTCTGGGGTGC
AAAAAATATATATATTTGTTTATGTATATACTATACATATGTAATTATTGGGATTCTATA
CTTTACAGAAAACTCAGTTACATATACATACATAGTATATACATACACAAATGTATATAC
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TTCTGGAATCTAAGGGTATCATTATCAATAAGACTTTGATAGTCCTTAAAATTAAAAAAA
AAAGCAAACGAAACATGAAAAA

QA 1 622 1 622
DS 

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AATATTTATTCTGTTTTATATTACAGAACATAAGAGCACCTATAATACAGGGTTCTAGTT
CTGGGGTGCAAAAAATATATATATTTGTTTATGTATATACTATACATATGTAATTATTGG
GATTCTATACTTTACAGAAAACTCAGTTACATATACATACATAGTATATACATACACAAA
TGTATATACTTTTAGAGCTCCGAAGTTAGAATATCGCGTTGAAAATACTCTAAAATTGTA
TTTACAAATTTCTGGAATCTAAGGGTATCATTATCAATAAGACTTTGATAGTCCTTAAAA
TTAAAAAAAAAAGCAAACGAAACATGAAAAAGAAGAAGGAAGAAGAAGGACGAGCACTGG
GACGTCCTTGTTTAAGATCTTTTTGCCTTGGTCCTCTTTGGTCCTCCTTGGTAAACGTGA
AGGACGAATATGAAGGACGTGTTGATAATGTTGCTCTAAGAACTACTTACTTTATTTAAA
CTAGGACCGTCATATCAATAGAGTAAAAGTACAACTAACTGTTTAGAAAAACCAAAAGAT
AGAAAAGAAAAAGATTGTTATTGATAAAAAAAAAGATTGTGTTTCAG

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 2

CO CL7826Contig1 858 2 2 U
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CTTTTCAGAAAGTAGTGAACTTGTGGCTTTAGGTCATTCAGTGTTGGGTCATGTGGCACT
TTTATCGCCTTGACGCCTTGGTGCGACCTCTTACTGCAGTATGCAGATTTCGATGAGGAT
TTGCTTTGGATTAGTTGAGACTTTTATAGCCATTTCTTTCACTTAAGTGATGGTTTTACG
AGGAGCTTAGTCTTCCTTCCAGTTTTATGACCTTTCTACCGTTGTTGCAGTGTCTAACCA
TGTTGATTTGACATGTTGCACTTTTGTTGGTATTTCTAAGCTTGTTGCAGGTCAGACTCT
CAAGAACTTATTCGCTTTCTTTCAGAGAGTTGGTCAACTGATGTCCATCAGATCTTACTC
GTTATTCAATTCCTTATCGTGTTTTCTGAAGTTTCTCATCTTGTATTTAGCTTTGCGTGT
TGTATGGCAAAGATTGTAGTTGGTTATCATTTTCTGTTTTGTAAGTTTTTTTCTCCTTTA
ATGGAGTGTAAACTAAAATCTTTGAATTAATGAAGTATGGTTTGTCCCAAAAAAAACTAA
ATATCTAATTTGATCCTT


BQ
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BS 718 858 RS1DJ56JQ

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CAAGTTTTTCCAGATCCAAATTTTATTTCGGTGTTTACTGACCCTGAATCCCTGATATTT
GCTCTCCAGTGGAACATCTCAGGCTGATGTATAATCTCATTTCAGGCCCTCTTCTGTTGC
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TTTATCGCCTTGACGCCTTGGTGCGACCTCTTACTGCAGTATGCAGATTTCGATGAGGAT
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CAAGAACTTATTCGCTTTCTTTCAGAGAGTTGGTCAACTGATGTCCATCAGATCTTACTC
GTTATTCAATTCCTTATCGTGTTTTCTGAAGTTTCTCATCTTGTATTTAGCTTTGCG

QA 1 717 1 717
DS 

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QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1EP67TF U 1
AF RS1EP67JQ C 190
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BS 718 765 RS1EP67TF

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AGGCCATGCATGCGGAGCAGTTCGAGTATCTTAAGAACAACATACACGCACTAAAACAAT
CCCGACGCTTGGTTCTTACGGCCCCACCTCAGAATGATGATGAGCAGAAGTGATCTTATT
ATATATATTCGCATTTTAGTTCGAGTTTGAACTAATAATATATGTAATCGAAGAAA*CAT
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QA 1 765 1 765
DS 

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CGCATTTTAGTTCGAGTTTGAACTAATAATATATGTAATCGAAGAAAACATAATGATTTC
TGTTTAATATTATGCTGCATAAATGAACAACTCCCC

QA 1 576 1 576
DS 



AS 1 2

CO CL7828Contig1 887 2 2 U
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TCTCTCTCTCACTTGTTTTTCTCCTCTGGCTACTTCTCTTCCTCTCCACCTTCTTCATTA
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CAGAAAACAAAGACAATGAGATTCTGAAGCAAAATCAGAAGATGAAC


BQ
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AF RS1AJ74TF U 1
AF RS1AJ74JQ C 152
BS 1 718 RS1AJ74TF
BS 719 887 RS1AJ74JQ

RD RS1AJ74TF 718 0 0
GGGCTGTTTCCGTCTACGCCTCGTCGCCGTCAGTGATACTACCCGCAGATCATCATATCT
CCTCTATTGAATCCTAATCGGCGGCGGATTTCGAATCGGAGAACCCTATCCGAATAATCC
TCTAGAGAGGAATACTTGCTTCGATTCCGTCTCAGGGCGTTTACTGCTGCTCCTCCTCCT
CTCTTGGCTTTGTGGATGTGCCAATGCAAACTCTTCTGGCTAGAACTAGAAGAAGAAGAA
GAGTTTCTGACTACAATTCTTCTAATGGGATGATGATGATGAACAAGAGTTTCTACAAAG
TCTCTCTCTCACTTGTTTTTCTCCTCTGGCTACTTCTCTTCCTCTCCACCTTCTTCATTA
GCCACGGAGATGCTGGTAAAGATGTTGACTCTGTTGGATTACCTGATCTTGATGAGACGG
CTGTGCCTTTCGATGATGCACCGCCATTACTAGAGTCTGATTCTCTTCATGGTACATCTG
ATCTGAGTCCGAACGACGATATAACCTCGTCTGAGGAAAGTGAAGACCAAGAAAAGTCTG
TGAAGCAAGAAGATACCAATAGCACAGATGCAGGGAGTGATGATTCAGAAAACAAGGACA
ATGATCTTTCGAGTCGAAGTGAGACAAACAAGACAGATACAGAAAGCAAAGACACTGACT
TTTCCAAGCAAAGTGAGATGAACAAGACATGTCTATTGAATGATGCAGAGGGCAATGA

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1AJ74JQ 736 0 0
TCAGGGCGTTTACTGCTGCTCCTCCTCCTCTCTTGGCTTTGTGGATGTGCCAATGCAAAC
TCTTCTGGCTAGAACTAGAAGAAGAAGAAGAGTTTCTGACTACAATTCTTCTAATGGGAT
GATGATGATGAACAAGAGTTTCTACAAAGTCTCTCTCTCACTTGTTTTTCTCCTCTGGCT
ACTTCTCTTCCTCTCCACCTTCTTCATTAGCCACGGAGATGCTGGTAAAGATGTTGACTC
TGTTGGATTACCTGATCTTGATGAGACGGCTGTGCCTTTCGATGATGCACCGCCATTACT
AGAGTCTGATTCTCTTCATGGTACATCTGATCTGAGTCCGAACGACGATATAACCTCGTC
TGAGGAAAGTGAAGACCAAGAAAAGTCTGTGAAGCAAGAAGATACCAATAGCACAGATGC
AGGGAGTGATGATTCAGAAAACAAGGACAATGATCTTTCGAGTCGAAGTGAGACAAACAA
GACAGATACAGAAAGCAAAGACACTGACTTTTCCAAGCAAAGTGAGATGAACAAGACATG
TCTATTGAATGATGCAGAGGGCAATGACAATGTCCACCTTTTGCAGCAAAGTCAGACGAA
CAAGACAGGCACCGGGAGTGGTACAGAAACCAAAGACAATGAGATTCTGAAGCAAAATCA
GACAGACAAGACAGGCACCGGGAGTGATACAGAAAACAAAGACAATGAGATTCTGAAGCA
AAATCAGAAGATGAAC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

CO CL7829Contig1 959 2 10 U
GGACCTTACATTGTAGCTGTGCGGATTTGGATCGAAAACCTCCAAGTCCTCCTTGTCCAA
GGACCACAACTTGAAGCTCTCTCTTCTCTTCTCCAGCCTCTCTCTTCTCTCTTTGAGTTT
TGTCTGTAAGCTACTCAGTGCTTTAGGAACTTCATAAACCGGTGAAGAATCTGATCTCTC
CTGTTGCCTTTCCACTGTGAACCTCCTTGGCGAAACATCCTTCTCAATGCTTAGCTTGAA
GACATCAGACTCAACACGTTTCTTGCGCCTAAACACTGGTGACTCCGGGCTTCTATAGCC
AACTGCACTGCTAGAAACATCGCCAGAAGCCTCGGTGTCTTTGTTAGATCCAACAACAAG
CTTCAACTTCTTGGTTAGATGTTTGAATCTCAAGTACTTTCTGTCGTCAACCAAGCTTGG
TAGTCTAGGCTTCAAGAGAACGATCTCATCCAAATCATCAGCCAGTGAAGGAGATTTATC
ACGCCGTTCCTTCACATGAGGTCTCTCCAAGTCTTGACCTTTTTTGGCTGAGAACGAGTT
AGGATCTTGTAAGAGTGTAATGAACAACTCTTTGTTCGAGCTTAGAATATCTAATGCTTC
CATGAACTGCTTGGACCGGTCTTTTCCTTTCTCCTCTGCCTTGGAACTGATCAATGTTTC
AGCAGCTTCATTCACACAAACTTGAAGGTTAATCTCTGAGCTCTTCTTTTTACAATCTCT
CCCATTCTTCAGATCCATTTGCTTAGCCTTCTCAACTTGGCTCAAAGAAGTTTCCTCCTT
TGCATTCTTGATCCTCTTTATCTCTCTCTCTAGTAATCCCTCAACAGGTTTTGATTCATA
GCTCTCGTCTTCTCTTTCAAAACTAAAAGATCTTCTCCTCGTTTTAGGCTTACATGAGTT
CTCTCCTTCCACAATCCGCTGAACAAATCAAGAGATTCAATTTTCTACAAAGATAACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CZ22TF U 1
AF RS1CZ22JQ C 273
BS 1 685 RS1CZ22TF
BS 686 686 RS1CZ22JQ
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RD RS1CZ22TF 793 0 0
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GGACCACAACTTGAAGCTCTCTCTTCTCTTCTCCAGCCTCTCTCTTCTCTCTTTGAGTTT
TGTCTGTAAGCTACTCAGTGCTTTAGGAACTTCATAAACCGGTGAAGAATCTGATCTCTC
CTGTTGCCTTTCCACTGTGAACCTCCTTGGCGAAACATCCTTCTCAATGCTTAGCTTGAA
GACATCAGACTCAACACGTTTCTTGCGCCTAAACACTGGTGACTCCGGGCTTCTATAGCC
AACTGCACTGCTAGAAACATCGCCAGAAGCCTCGGTGTCTTTGTTAGATCCAACAACAAG
CTTCAACTTCTTGGTTAGATGTTTGAATCTCAAGTACTTTCTGTCGTCAACCAAGCTTGG
TAGTCTAGGCTTCAAGAGAACGATCTCATCCAAATCATCAGCCAGTGAAGGAGATTTATC
ACGCCGTTCCTTCACATGAGGTCTCTCCAAGTCTTGACCTTTTTTGGCTGAGAACGAGTT
AGGATCTTGTAAGAGTGTAATGAACAACTCTTTGTTCGAGCTTAGAATATCTAATGCTTC
CATGAACTGCTTGGACCGGTCTTTTCCTTTCTCCTCTGCCTTGGAACTGATCAATGTTTC
AGCAGCTTCATTCACACAAACTTGA*GGTTAATCTCTGAGCTCTTCTTTT*ACAATCTCT
CCCATTCTTCAGATCCATTTGCTTAGCCTTCTCA*CTTGGCTCAAAGA*GTTTCCTCCTT
TGCATTCTTGATC

QA 1 793 1 793
DS 

RD RS1CZ22JQ 687 0 0
ACACTGGTGACTCCGGGCTTCTATAGCCAACTGCACTGCTAGAAACATCGCCAGAAGCCT
CGGTGTCTTTGTTAGATCCAACAACAAGCTTCAACTTCTTGGTTAGATGTTTGAATCTCA
AGTACTTTCTGTCGTCAACCAAGCTTGGTAGTCTAGGCTTCAAGAGAACGATCTCATCCA
AATCATCAGCCAGTGAAGGAGATTTATCACGCCGTTCCTTCACATGAGGTCTCTCCAAGT
CTTGACCTTTTTTGGCTGAGAACGAGTTAGGATCTTGTAAGAGTGTAATGAACAACTCTT
TGTTCGAGCTTAGAATATCTAATGCTTCCATGAACTGCTTGGACCGGTCTTTTCCTTTCT
CCTCTGCCTTGGAACTGATCAATGTTTCAGCAGCTTCATTCACACAAACTTGAAGGTTAA
TCTCTGAGCTCTTCTTTTTACAATCTCTCCCATTCTTCAGATCCATTTGCTTAGCCTTCT
CAACTTGGCTCAAAGAAGTTTCCTCCTTTGCATTCTTGATCCTCTTTATCTCTCTCTCTA
GTAATCCCTCAACAGGTTTTGATTCATAGCTCTCGTCTTCTCTTTCAAAACTAAAAGATC
TTCTCCTCGTTTTAGGCTTACATGAGTTCTCTCCTTCCACAATCCGCTGAACAAATCAAG
AGATTCAATTTTCTACAAAGATAACCC

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

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GGGCTTCATAAACACATCTCTGTTCCTCTCTTCACTAAAACACTGCCACACAAACAGAGA
GAGAAAGACAAAGAGAAAGAGAGAGAGATACCAATGGCTACCAGCATGATCACGTTTGGC
GTGGGGATATGTTGCACCAGCCAGCTTCCATTCAAGCGAGTCACCGTTGAAACGGGGAGG
AAGCAGCAGAGAATGGCGGTGGTGAGAGCAGAAGGCGGAGGAGGAGGAGGAGGAATCAAT
CCAGAGATCAGAAAAAACGAGGAGAAGGTGGTGGACTCTGTCGTGGTCACCGAGCTTTCC
AAAAACATAACTCCATATTGCAGGTTTCTCTTCTTTTTTTCTTTTCGACCGAAATAAGAA
TACTTTACTGTTACTGCTTTTATGGATTTGAAGTTTGAACTAAGTTTTTATTCATGACAT
CATACAAGATTACAAGTTATATATCTGTAAAATTTCGGCATCTTAGCTAAGGCCACGGTC
TTTTCAAATTGTGTTAATTTAAAATCTTCATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GA72TF U 1
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AAAAACATAACTCCATATTGCAGGTTTCTCTTCTTTTTTTCTTTTCGACCGAAATAAGAA
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TTTTCAAATTGTGTTAATTTAAAATCTTCATT

QA 1 512 1 512
DS 

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CAGCAGAGAATGGCGGTGGTGAGAGCAGAAGGCGGAGGAGGAGGAGGAGGAATCAATCCA
GAGATCAGAAAAAACGAGGAGAAGGTGGTGGACTCTGTCGTGGTCACCGAGCTTTCCAAA
AACATAACTCCATATTGCAGGTTTTTTTTCTTTTTTTCTTTTCGACCGAAATAAGAATAC
TTTACTGTTACTGCTTTTATGGATTTGAAGTTTGAACTAAGTTTTTATTCATGACATCAT
ACAAGATTACAAGTTATATATCTGTAAAATTTCGGCATCTTAGCTAAGGCCACGGTCTTT
TCAAATTGTGTTAATTTAAAATCTTCATT

QA 1 389 1 389
DS 



AS 1 2

CO CL7831Contig1 566 2 1 U
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AATTTCTTTAGGAAATTCCATGCTGCCTATGTAGATGCAGTCTCAAACCCATTCCATGTC
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TACGGTTTGAACTGACCCCTCGTACTTGCTTTGTGTGCATTGGAGGAACTGCATTTCTTT
TTATCATTTCTCTTGTCGATATCAACGCTTGGATTGTTGTAAGAAGAATTATTGGGTTCA
CATGAATGGATATTTAAGTTTGTTTT


BQ
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AF RS1DW21TF U 1
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CATGAATGGATATTTAAGTTTGTTTT

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DS 

RD RS1DW21TF 566 0 0
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CATTGCTCCCTCGACGTCATCGAATAGCGAGTGAACAATCCCAAAACCACATTGAACGAG
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CCTGGCAAGAAGATAACCTCTAGAACCTTTGCTCAAACTGTGAGCAACATTGTCGGATCA
TACGGTTTGAACTGACCCCTCGTACTTGCTTTGTGTGCATTGGAGGAACTGCATTTCTTT
TTATCATTTCTCTTGTCGATATCAACGCTTGGATTGTTGTAAGAAGAATTATTGGGTTCA
CATGAATGGATATTTAAGTTTGTTTT

QA 1 566 1 566
DS 



AS 1 2

CO CL7832Contig1 538 2 2 U
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BQ
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AF RS1C395JQ C 1
AF RS1C395TF U 9
BS 1 8 RS1C395JQ
BS 9 538 RS1C395TF

RD RS1C395JQ 538 0 0
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CAATGCAAGCAGTTGTAGATGGTAAGAAGCCCGTTGACGACACCAAAGTTGCAAATAAAC
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TGCAGAAGCCAGTTGCTAAGAAGTAATGAAAATGACAGTTAAAGAGAAAGCTTCAAGACT
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TTTGACTATCTATTTTTTCTTCAGAACTATCATATAGTAGTTCTACATTTGGATCTTG

QA 1 538 1 538
DS 

RD RS1C395TF 530 0 0
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QA 1 530 1 530
DS 



AS 1 2

CO CL7833Contig1 818 2 2 U
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AT44TF U 1
AF RS1AT44JQ C 62
BS 1 626 RS1AT44TF
BS 627 818 RS1AT44JQ

RD RS1AT44TF 626 0 0
GACTCGAAGATACTTCTGGTTTTGTCTGTATTCTCTTTTTGTTTTCTTGATACCCTTTTT
TGATCACTACTTACAGTTAATGCGTGTGAGCAGGAGGAGCAGAAACATTGTTGACACCTC
ATATCAAGGACTACTCGAGTTTAGTATTCTCTCAGTTTCAGGAGCTGTCTAGTGTGGGGC
TATTTGATATACATTGCTATGTCAGGTTCTTTCTTGAATACTGAGAGTAATGGTACTGTG
AGCAGAACGTGCATCTTGTTGGTCCTGATGGTTGTATTGTGGGCTTTGTTGCTGGAACGC
TAGTTGCTAGGTCACAAGTCCAGGTCATTGTTGGAAGCTTTGTATCAGAGAAACTGAAAC
TGAGCACAAGGCGTGTTGAGAATAACTTAAGCCAGGTTCAGCTTCACCATCTGTATTGGT
GGGAAGAGCGTTGGTGAAGTATTAGGAAGCTGGAAAATGGTGTGCCATGTTGTGTATGGG
ACAGGCGTGTATGTGACATGATTAAGAGGAGAAGTCTACGCACCAGAGCTATTAAGCTTT
TGAGTCTTGATGAATCTGATGAGATGCTGAGCAGACGGTTCAAGGACCGATAAGCTGATA
AGATCCGCAACAAACTAGTACCCTGG

QA 1 626 1 626
DS 

RD RS1AT44JQ 757 0 0
GATCACTACTTACAGTTAATGCGTGTGAGCAGGAGGAGCAGAAACATTGTTGACACCTCA
TATCAAGGACTACTCGAGTTTAGTATTCTCTCAGTTTCAGGAGCTGTCTAGTGTGGGGCT
ATTTGATATACATTGCTATGTCAGGTTCTTTCTTGAATACTGAGAGTAATGGTACTGTGA
GCAGAACGTGCATCTTGTTGGTCCTGATGGTTGTATTGTGGGCTTTGTTGCTGGAACGCT
AGTTGCTAGGTCACAAGTCCAGGTCATTGTTGGAAGCTTTGTATCAGAGAAACTGAAACT
GAGCACAAGGCGTGTTGAGAATAACTTAAGCCAGGTTCAGCTTCACCATCTGTATTGGTG
GGAAGAGCGTTGGTGAAGTATTAGGAAGCTGGAAAATGGTGTGCCATGTTGTGTATGGGA
CAGGCGTGTATGTGACATGATTAAGAGGAGAAGTCTACGCACCAGAGCTATTAAGCTTTT
GAGTCTTGATGAATCTGATGAGATGCTGAGCAGACGGTTCAAGGACCGATAAGCTGATAA
GATCCGCAACAAACTAGTACCCTGGCAGGGCAGGACTATGCGGAGTGGTGCCACACTTTG
CCATCACTAACGCAGGTCCCGATTCTTATGAAAAGAAGAGGTAGTTCGTTGCCATCAACA
ACCAAAGTCTTGGTAAAAAGCTTTTTGTAGATGTCACTAGTTTAGATATATTTGTCTCAG
AAACATAAAGCTTTCATGTTTGTACTAACACTTGTGA

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

CO CL7834Contig1 763 2 9 U
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CGAATTGATCGGAAAATGAGCAACGAGAAGGACAGTTTCAACGTCGGCGATCTCACCGCT
GCTCTTAAAGATGAGGACAGAGCAGGCCTTGTCAACGCTCTTAAGAACAAGCTGCAGAAT
CTGGCTGGTCAGCATTCTGATGTGCTCGAGAATCTGACTCCTAAGATCAGAAGACGTGTT
GAGGTCTTGAGAGAGATTCAGGGAAAACATGATGAAATAGAGGCCAAGTTTCGCGAGGAG
AGAGCTGCTCTTGAAGCCAAGTATCAAAAATTATATCAGCCCTTGTATACCAAGCGTTAT
GAGATTGTGAATGGAGCTATCGAAGTTGAAGGAGCTCAAGAGGATGTTAAGATGGACCAA
GGAGACGACAAATCTCCACAAGAGAAAGGAGTTCCTAGTTTCTGGCTGACCGCATTGAAA
AACAATGATGTTATATCTGAGGAGATAACCGAGCGTGATGAAGGAGCCCTCATGTATCTT
AAAGATATTAAGTGGTGCAAGATTGAGGAACCAAAGGGATTCAAACTTGAGTTTTTCTTC
GACCAGAACCCTTACTTCAAAACACCCTATTAACTAAGGCCTATCACATGATTGATGAAG
ATGAGCCTCTGCTTGGGAAGCTATTGGGACAGAGATTGATTGGTATCCTGGAAATGCTTG
ACTCAGAGATTCTTAAGAGAGCCTAGAAAGTGCGAGATGCCAG


BQ
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AF RS1F058TF U 36
AF RS1GR76TF U 1
BS 1 86 RS1GR76TF
BS 87 87 RS1F058TF
BS 88 249 RS1GR76TF
BS 250 250 RS1F058TF
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BS 277 599 RS1GR76TF
BS 600 600 RS1F058TF
BS 601 763 RS1GR76TF

RD RS1F058TF 599 0 0
CTCCTCAACCT
CTCTCTTTCAAACTCGAATTGATCGGAAAATGAGCAACGAGAAGGACAGTTTCAACGTCG
GCGATCTCACCGCTGCTTTTAAAGATGAGGACAGAGCAGGCCTTGTCAACGCTCTTAAGA
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TCAGAAGACGTGTTGAGGTCTTGAGAGAGATTCAGGGAAAACATGATGAAATAGAGGCCA
AGTTTCGCGAGGAGAGAGCTGCTCTTGAAGCCAAGTATCAAAAATTATATCAGCCCTTGT
ATACCAAGCGTTATGAGATTGTGAATGGAGCTATCGAAGTTGAAGGAGCTCAAGAGGATG
TTAAGATGGACCAAGGAGACGACAAATCTGCACAAGAGAAAGGAGTTCCTAGTTTCTGGC
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CCCTCATGTATCTTAAAGATATTAAGTGGTGCAAGATTGAGGAACCAAAGGGATTCAAAC
TTGAGTTTTTCTTCGACCAGAACCCTTACTTCAAAACACCCTATTAAC

QA 12 599 12 599
DS 

RD RS1GR76TF 763 0 0
GGGTCTCTAGTCGCCACCCAGAAACCCCTCCCTCCTCTTCCTCAACCTCTCTTTCAAACT
CGAATTGATCGGAAAATGAGCAACGATAAGGACAGTTTCAACGTCGGCGATCTCACCGCT
GCTCTTAAAGATGAGGACAGAGCAGGCCTTGTCAACGCTCTTAAGAACAAGCTGCAGAAT
CTGGCTGGTCAGCATTCTGATGTGCTCGAGAATCTGACTCCTAAGATCAGAAGACGTGTT
GAGGTCTTGCGAGAGATTCAGGGAAAACATGATGATATAGAGGCCAAGTTTCGCGAGGAG
AGAGCTGCTCTTGAAGCCAAGTATCAAAAATTATATCAGCCCTTGTATACCAAGCGTTAT
GAGATTGTGAATGGAGCTATCGAAGTTGAAGGAGCTCAAGAGGATGTTAAGATGGACCAA
GGAGACGACAAATCTCCACAAGAGAAAGGAGTTCCTAGTTTCTGGCTGACCGCATTGAAA
AACAATGATGTTATATCTGAGGAGATAACCGAGCGTGATGAAGGAGCCCTCATGTATCTT
AAAGATATTAAGTGGTGCAAGATTGAGGAACCAAAGGGATTCAAACTTGAGTTTTTCTTT
GACCAGAACCCTTACTTCAAAACACCCTATTAACTAAGGCCTATCACATGATTGATGAAG
ATGAGCCTCTGCTTGGGAAGCTATTGGGACAGAGATTGATTGGTATCCTGGAAATGCTTG
ACTCAGAGATTCTTAAGAGAGCCTAGAAAGTGCGAGATGCCAG

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

CO CL7835Contig1 724 2 5 U
GGAGCTCTCTCGATCACATAAACTCTGTTTCTATTTTAAAGAAGATCCTGAGCAGATATT
TTGCAGGGTTTTGTTCGTTTGGTCGAAAACTATGAAGAAAGTTTGTTTCTTTATGTTCCT
TGTCTGCTTAAACGCAGCGTCGTTTCTAGTGGCTGCTGATCCACAAACGTGTCCTGCGGA
TTTGGGAGGGAAGTGCAGTGATTCTGATGATTGGCAAGGAGAGTTCTTCCCTGAGATCCC
TCAGATTAAGTATGAGGGACCTTCTAGCAAGAACCCACTTGCTTACAGGTGGTATAACGC
TGAAGAGGAGATTCTTGGCAAGAAAACGAAGGATTGGTTTAGATTCAGTGTTGCGTTTTG
GCATACGTTCCGTGGGACTGGAGGTGACCCATTTGGTGCTGCTACAAAGTATTGGCCCTG
GGAAGATGGTACTAACTCTGTCTCTATGGCCAAGAGAAGAATGAGAGCCAACTTTGAGTT
CTTGAAGAAACTTGGAGTTGATTGGTGGTGTTTCCATGATAGAGACATTGCCCCTGATGG
CAACACACTTGAGGAATCCAACAAAAATTTGGATGAAGTTATCGAACTCGCCAAAGAACT
CCAAAAGGGAAGCAAGATCAGACCATTGTGGGGAACAGCTCAGTTATTCTTGCATCCTCG
TTACATGCATGGAGGAGCAACCAGCTCTGAGTTGGAGTCTATGCTTACGCCGTCGCTCAG
TGAA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1EU56TF U 25
AF RS1F803TF U 1
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BS 328 724 RS1F803TF

RD RS1EU56TF 579 0 0
GG
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AAACTATGAAGAAAGTTTGTTTCTTTATGTTCCTTGTCTGCTTAAACGCAGCGTCGTTTC
TAGTGGCTGCTGATCCACAAACGTGTCCTGCGGATTTGGGAGGGAAGTGCAGTGATTCTG
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GCAAGAACCCACTTGCTTACAGGTGGTATAACGCTGAAGAGGAGATTCTTGGCAAGAAAA
CGAAGGATTGGTTTAGATTCAGTGTTGCGTTTTGGCATACGTTCCGTGGGACTGGAGGTG
ACCCATTTGGTGCTGCTACAAAGTATTGGCCCTGGGAAGATGGTACTAACTCTGTCTCTA
TGGCCAAGAGAAGAATGAGAGCCAACTTTGAGTTCTTGAAGAAACTTGGAGTTGATTGGT
GGTGTTTCCATGATAGAGACATTGCCCCTGATGGCAACACACTTGAGGAATCCAACAAAA
ATTTGGATGAAGTTATCGAACTCGCCAAGGAACTCCA

QA 3 579 3 579
DS 

RD RS1F803TF 724 0 0
GGAGCTCTCTCGATCACATAAACTCTGTTTCTATTTTAAAGAAGATCCTGAGCAGATATT
TTGCAGGGTTTTGTTCGTTTGGTCGAAAACTATGAAGAAAGTTTGTTTCTTTATGTTCCT
TGTCTGCTTAAACGCGGCGTCGTTTCTAGTGGCTGCTGATCCACAAACGTGTCCTGCGGA
TTTGGGAGGGAAGTGCAGTGATTCTGATGATTGGCAAGGAGAGTTCTTCCCTGAGATCCC
TCAGATTAAGTATGAGGGACCTTCTAGCAAGAACCCACTTGCTTACAGGTGGTATAACGC
TGAAGAGGAGATTCTTGGCAAGAAAATGAAGGATTGGTTTAGATTCAGTGTTGCGTTTTG
GCATACGTTCCGTGGGACTGGAGGTGACCCATTTGGTGCTGCTACAAAGTATTGGCCCTG
GGAAGATGGTACTAACTCTGTCTCTATGGCCAAGAGAAGAATGAGAGCCAACTTTGAGTT
CTTGAAGAAACTTGGAGTTGATTGGTGGTGTTTCCATGATAGAGACATTGCCCCTGATGG
CAACACACTTGAGGAATCCAACAAAAATTTGGATGAAGTTATCGAACTCGCCAAAGAACT
CCAAAAGGGAAGCAAGATCAGACCATTGTGGGGAACAGCTCAGTTATTCTTGCATCCTCG
TTACATGCATGGAGGAGCAACCAGCTCTGAGTTGGAGTCTATGCTTACGCCGTCGCTCAG
TGAA

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

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AACAAGGCAAACATTACTACTCCATGTGGCAGACTCTGTTCGAAATCGACACCAAGTATG
TTCCTATCAAACCCATCGGCAGAGGAGCTTACGGTGTGGTTTGCTCTTCGGTCAACCGTG
AGACCAACGAGAGAGTCGCTATCAAAAAGATTCATAGCGTGTTTGAGAATCGTGTTGATG
CTCTGAGGACGTTGAGAGAGCTTATGCTTCTTAGGCATGTGAGGCACGAGAATGTGATCG
CGCTTAAAGATGTTATGTTGCCTTCCGTTAGATCCAGTTTCAAAGATGTTTACTTGGTTT
ATGAGCTCATGGATACTGATCTTCATCAGATCATCAAGTCCTCTCAGTCTCTTTCTGATG
ATCACTGCAAGTACTTCTTGTTTCAGTTGCTAAGAGGGTTGAAGTATCTTCACTCTGCGT
TGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGACCTGAATACGCCGGCCCGTTAGGAATTCTTCAAG
CTTTAGCCGACGGGACAAAACTACTTTTCAAAGAAGACCTTCGTCCATCTAGAGGAAATA
CTCCTTTATTTAGTATTGGACCATCTATAGCAGTTATCTCTATTTTACTAAGTTATTCAG
TAATTCCCTTTAGCAATCACCTTGTTTTAGCGGATCTCAATATCGGTATTTTTTTATGGA
TTGCCATCTCAAGTGTTGCTCCGATCGGACTTCTTATGTCAGGATATGGATCAAATAATA
AATATTCTTTTTTAGGTGGTTTGCGAGCTGCTGCCCAAGCAATTAGTTATGAAATACCAT
TAACTCTATGTGTTTTATCAATATCTCTACGTGCGATTCGTTGAAACAGAAAGGTTTATT
CCGTTTTTTCTAGATAAAAAAAAATGAAAAAAACGGAATATATATATTTATCTTTGGGGT
TAATCTTAATAAAAGGAATTTGATAGTTATATATGAGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1H258TF U 1
AF RS1H258JQB C 190
BS 1 758 RS1H258TF
BS 759 999 RS1H258JQB

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AACAAGGCAAACATTACTACTCCATGTGGCAGACTCTGTTCGAAATCGACACCAAGTATG
TTCCTATCAAACCCATCGGCAGAGGAGCTTACGGTGTGGTTTGCTCTTCGGTCAACCGTG
AGACCAACGAGAGAGTCGCTATCAAAAAGATTCATAGCGTGTTTGAGAATCGTGTTGATG
CTCTGAGGACGTTGAGAGAGCTTATGCTTCTTAGGCATGTGAGGCACGAGAATGTGATCG
CGCTTAAAGATGTTATGTTGCCTTCCGTTAGATCCAGTTTCAAAGATGTTTACTTGGTTT
ATGAGCTCATGGATACTGATCTTCATCAGATCATCAAGTCCTCTCAGTCTCTTTCTGATG
ATCACTGCAAGTACTTCTTGTTTCAGTTGCTAAGAGGGTTGAAGTATCTTCACTCTGCGT
TGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGACCTGAATACGCCGGCCCGTTAGGAATTCTTCAAG
CTTTAGCCGACGGGACAAAACTACTTTTCAAAGAAGACCTTCGTCCATCTAGAGGAAATA
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TAATTCCCTTTAGCAATCACCTTGTTTTAGCGGATCTCAATATCGGTATTTTTTTATGGA
TTGCCATCTCAAGTGTTGCTCCGATCGGACTTCTTATG

QA 1 758 1 758
DS 

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CGTTGAGAGAGCTTATGCTTCTTAGGCATGTGAGGCACGAGAATGTGATCGCGCTTAAAG
ATGTTATGTTGCCTTCCGTTAGATCCAGTTTCAAAGATGTTTACTTGGTTTATGAGCTCA
TGGATACTGATCTTCATCAGATCATCAAGTCCTCTCAGTCTCTTTCTGATGATCACTGCA
AGTACTTCTTGTTTCAGTTGCTAAGAGGGTTGAAGTATCTTCACTCTGCGTTGATACCAC
TGCTTACGGCCGGGGGACCTGAATACGCCGGCCCGTTAGGAATTTTTCAAGCTTTAGCCG
ACGGGACAAAACTACTTTTCAAAGAAGACCTTCGTCCATCTAGAGGAAATACTCCTTTAT
TTAGTATTGGACCATCTATAGCAGTTATCTCTATTTTACTAAGTTATTCAGTAATTCCCT
TTAGCAATCACCTTGTTTTAGCGGATCTCAATATCGGTATTTTTTTATGGATTGCCATCT
CAAGTGTTGCTCCGATCGGACTTCTTATGTCAGGATATGGATCAAATAATAAATATTCTT
TTTTAGGTGGTTTGCGAGCTGCTGCCCAAGCAATTAGTTATGAAATACCATTAACTCTAT
GTGTTTTATCAATATCTCTACGTGCGATTCGTTGAAACAGAAAGGTTTATTCCGTTTTTT
CTAGATAAAAAAAAATGAAAAAAACGGAATATATATATTTATCTTTGGGGTTAATCTTAA
TAAAAGGAATTTGATAGTTATATATGAGTG

QA 1 810 1 810
DS 



AS 1 2

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ACAAGTATAAGTCTGTGTCAGCATTTGCACCAATTGCCAATCCCATAAACTGCCAGTGGG
GACAGAAAGCATTCAACAATTATCTAGGCGACAACAAGTCTGCTTGGGAGGAATATGATG
CCACTTGTCTTATTTCAAAGTTCAACAACCTGTCTGCCACAATTCTTATTGATCAGGGAG
AAAGCGACCAGTTCTTCCCTGATCAGTTATTGCCAAACAATTTTGAAGAGGCATGCAAGA
AGGTGAATGCGCCGCTCTTACTACGTCTGCACCCAGGATACGACCACTCCTACTACTTTA
TTGCTACCTTCATCGAAGACCACATCACTCACCATTCTCAAGCCCTTAAGCTGTAGCTCG
CTACAGTTACTCGGTGCATTGCCTTTGTCCAAATATTAGTATCAATAATAAAAGGAAGTG
GACTTGTAATGTTTTGTGTTCAATGGCTGTTCTGGTGTGGTGTGTTTGGCTACGATAATA
AAAGATTCCATCTTCAGTTGGACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DH03JQ C 1
AF RS1DH03TF U 1
BS 1 564 RS1DH03TF

RD RS1DH03JQ 564 0 0
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ACAAGTATAAGTCTGTGTCAGCATTTGCACCAATTGCCAATCCCATAAACTGCCAGTGGG
GACAGAAAGCATTCAACAATTATCTAGGCGACAACAAGTCTGCTTGGGAGGAATATGATG
CCACTTGTCTTATTTCAAAGTTCAACAACCTGTCTGCCACAATTCTTATTGATCAGGGAG
AAAGCGACCAGTTCTTCCCTGATCAGTTATTGCCAAACAATTTTGAAGAGGCATGCAAGA
AGGTGAATGCGCCGCTCTTACTACGTCTGCACCCAGGATACGACCACTCCTACTACTTTA
TTGCTACCTTCATCGAAGACCACATCACTCACCATTCTCAAGCCCTTAAGCTGTAGCTCG
CTACAGTTACTCGGTGCATTGCCTTTGTCCAAATATTAGTATCAATAATAAAAGGAAGTG
GACTTGTAATGTTTTGTGTTCAATGGCTGTTCTGGTGTGGTGTGTTTGGCTACGATAATA
AAAGATTCCATCTTCAGTTGGACC

QA 1 564 1 564
DS 

RD RS1DH03TF 564 0 0
GGATCTCTGGACACTCCATGGGTGGACATGGAGCTCTTACTATTTACCTGAAGAACCTAG
ACAAGTATAAGTCTGTGTCAGCATTTGCACCAATTGCCAATCCCATAAACTGCCAGTGGG
GACAGAAAGCATTCAACAATTATCTAGGCGACAACAAGTCTGCTTGGGAGGAATATGATG
CCACTTGTCTTATTTCAAAGTTCAACAACCTGTCTGCCACAATTCTTATTGATCAGGGAG
AAAGCGACCAGTTCTTCCCTGATCAGTTATTGCCAAACAATTTTGAAGAGGCATGCAAGA
AGGTGAATGCGCCGCTCTTACTACGTCTGCACCCAGGATACGACCACTCCTACTACTTTA
TTGCTACCTTCATCGAAGACCACATCACTCACCATTCTCAAGCCCTTAAGCTGTAGCTCG
CTACAGTTACTCGGTGCATTGCCTTTGTCCAAATATTAGTATCAATAATAAAAGGAAGTG
GACTTGTAATGTTTTGTGTTCAATGGCTGTTCTGGTGTGGTGTGTTTGGCTACGATAATA
AAAGATTCCATCTTCAGTTGGACC

QA 1 564 1 564
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7839Contig1 649 2 1 U
GCCAGAGACTAATGTCTATAGTTTTGGAGTATTAATGCTTGAGATTATCTCTGGAAGGCT
CTCAGATTCAGATGAAGAAGGATCAATTCTGAAATGGGCATCAAAGTATCTGGAGAGTGA
TCATTTGAAAGATATGATTGATCCCACATTAACAGCGTTTAAAGAAGAGGACCTTGAAGT
GATCTGTGACGTGGCAAGGCATTGTCTGAGAATTGACCAAAGTCAACGACCTACAATGAA
AGATGTTCTTGAACAACTGAAACAAGTAATCAACATTTCTCCAGAACAAGCTACACCCAG
ACTCTCTCCTCTTCGGTGGGCAGAACTTGAGATCTTATCCTCTGAAGCTACTTAACCTGA
AGAATGATTCTCTCTCCTCTCTCTCTTTCTGTCTCCGAGTTATCACACGTGTCAGAGGTT
CACGCTCTTTCTCTCGCTCTTCACGGTGAAATTAAAAAAAATGTTAAAAAGTTGTTTTCT
TCAATTCATCATACTAAATTTGTTTATTGGTCAAAAAAATGTTTATTGGTTGGTTTTGAT
AGTGTATTTGGATCCAGATAATATAACGCTGTGTTTGTATAATTGTATACATATTACCTG
TATTATGTATATTTGTATGTATTGTGGTGAAAAGTTGTTTGTAACTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1F642TF U 1
AF RS1F642JQ C 54
BS 1 649 RS1F642TF

RD RS1F642TF 649 0 0
GCCAGAGACTAATGTCTATAGTTTTGGAGTATTAATGCTTGAGATTATCTCTGGAAGGCT
CTCAGATTCAGATGAAGAAGGATCAATTCTGAAATGGGCATCAAAGTATCTGGAGAGTGA
TCATTTGAAAGATATGATTGATCCCACATTAACAGCGTTTAAAGAAGAGGACCTTGAAGT
GATCTGTGACGTGGCAAGGCATTGTCTGAGAATTGACCAAAGTCAACGACCTACAATGAA
AGATGTTCTTGAACAACTGAAACAAGTAATCAACATTTCTCCAGAACAAGCTACACCCAG
ACTCTCTCCTCTTCGGTGGGCAGAACTTGAGATCTTATCCTCTGAAGCTACTTAACCTGA
AGAATGATTCTCTCTCCTCTCTCTCTTTCTGTCTCCGAGTTATCACACGTGTCAGAGGTT
CACGCTCTTTCTCTCGCTCTTCACGGTGAAATTAAAAAAAATGTTAAAAAGTTGTTTTCT
TCAATTCATCATACTAAATTTGTTTATTGGTCAAAAAAATGTTTATTGGTTGGTTTTGAT
AGTGTATTTGGATCCAGATAATATAACGCTGTGTTTGTATAATTGTATACATATTACCTG
TATTATGTATATTTGTATGTATTGTGGTGAAAAGTTGTTTGTAACTACT

QA 1 649 1 649
DS 

RD RS1F642JQ 596 0 0
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AGAGTGATCATTTGAAAGATATGATTGATCCCACATTAACAGCGTTTAAAGAAGAGGACC
TTGAAGTGATTTGTGACGTGGCAAGGCATTGTTTGAGAATTGACCAAAGTCAACGACCTA
CAATGAAAGATGTTCTTGAACAACTGAAACAAGTAATCAACATTTTTCCAGAACAAGCTA
CACCCAGACTCTTTCCTTTTCGGTGGGCAGAACTTGAGATCTTATCCTCTGAAGCTACTT
AACCTGAAGAATGATTCTCTCTCCTCTCTCTCTTTCTGTTTCCGAGTTATCACACGTGTC
AGAGGTTCACGCTCTTTCTCTCGCTCTTCACGGTGAAATTAAAAAAAATGTTAAAAAGTT
GTTTTTTTCAATTCATCATACTAAATTTGTTTATTGGTCAAAAAAATGTTTATTGGTTGG
TTTTGATAGTGTATTTGGATCCAGATAATATAACGCTGTGTTTGTATAATTGTATACATA
TTACCTGTATTATGTATATTTGTATGTATTGTGGTGAAAAGTTGTTTGTAACTACT

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 2

CO CL7840Contig1 602 2 2 U
TTTTTTTTTCTCAGTTTCACAATTCCATCGTCGACTATTTTTAGAGGTTTCTCTATTTGT
AACAAGGTATAGAGAAACAAAGAAGAAACAAAAAAATACAAATGGAAGGGAAAGAGAAAA
AACAAGAAGCGAAGAGGACGATGACGATGAAGATCAACAAACTTAAGGAGACACCTCAAG
AGATAAGCCAAGAAGACGTTAAAAGACAAGAAGCTTACAACATGTCTCCACGCGCACGTG
GTGGTGGTGGTGGCCCGATGGGTATGGGGAAGTCATCGAGCGTGAGGCAAAACTGTTTAT
GCGCACCAACAACACACCCTGGCTCCTTCAGGTGCCGTTACCACCGTCGTAACTCTGCAC
TCGGAATGTCACGTGGCATATCTGTCCCGACTAACCTATCTATGTTGGGAGGAGGAGGTT
CTCCTGAGTCATAAGGTCGTCGGTCTCATGATTAGAATAATTTGTAATGTATTTCTTTCT
CGATTCAAAACCTCTACAGTGTGTTTGTGTGTATATAAAACCTAAGACAAGCTTGTGGTT
TTCTTTTCTTTTACGTTCTTGTTTGTAAAGGATTTACTTTTCTTCAAAATACGAAAATGC
AT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 

AF RS1BK74JQ C 1
AF RS1BK74TF U 38
BS 1 37 RS1BK74JQ
BS 38 602 RS1BK74TF

RD RS1BK74JQ 602 0 0
TTTTTTTTTCTCAGTTTCACAATTCCATCGTCGACTATTTTTAGAGGTTTCTCTATTTGT
AACAAGGTATAGAGAAACAAAGAAGAAACAAAAAAATACAAATGGAAGGGAAAGAGAAAA
AACAAGAAGCGAAGAGGACGATGACGATGAAGATCAACAAACTTAAGGAGACACCTCAAG
AGATAAGCCAAGAAGACGTTAAAAGACAAGAAGCTTACAACATGTCTCCACGCGCACGTG
GTGGTGGTGGTGGCCCGATGGGTATGGGGAAGTCATCGAGCGTGAGGCAAAACTGTTTAT
GCGCACCAACAACACACCCTGGCTCCTTCAGGTGCCGTTACCACCGTCGTAACTCTGCAC
TCGGAATGTCACGTGGCATATCTGTCCCGACTAACCTATCTATGTTGGGAGGAGGAGGTT
CTCCTGAGTCATAAGGTCGTCGGTCTCATGATTAGAATAATTTGTAATGTATTTCTTTCT
CGATTCAAAACCTCTACAGTGTGTTTGTGTGTATATAAAACCTAAGACAAGCTTGTGGTT
TTCTTTTCTTTTACGTTCTTGTTTGTAAAGGATTTACTTTTCTTCAAAATACGAAAATGC
AT

QA 1 602 1 602
DS 

RD RS1BK74TF 565 0 0
TTTTTAGAGGTTTCTCTATTTGTAACAAGGTATAGAGAAACAAAGAAGAAACAAAAAAAT
ACAAATGGAAGGGAAAGAGAAAAAACAAGAAGCGAAGAGGACGATGACGATGAAGATCAA
CAAACTTAAGGAGACACCTCAAGAGATAAGCCAAGAAGACGTTAAAAGACAAGAAGCTTA
CAACATGTCTCCACGCGCACGTGGTGGTGGTGGTGGCCCGATGGGTATGGGGAAGTCATC
GAGCGTGAGGCAAAACTGTTTATGCGCACCAACAACACACCCTGGCTCCTTCAGGTGCCG
TTACCACCGTCGTAACTCTGCACTCGGAATGTCACGTGGCATATCTGTCCCGACTAACCT
ATCTATGTTGGGAGGAGGAGGTTCTCCTGAGTCATAAGGTCGTCGGTCTCATGATTAGAA
TAATTTGTAATGTATTTCTTTCTCGATTCAAAACCTCTACAGTGTGTTTGTGTGTATATA
AAACCTAAGACAAGCTTGTGGTTTTCTTTTCTTTTACGTTCTTGTTTGTAAAGGATTTAC
TTTTCTTCAAAATACGAAAATGCAT

QA 1 565 1 565
DS 



AS 1 2

CO CL7841Contig1 1294 2 4 U
GGATATCAACAAAACCTAATCACTTGGCATCTCCTTCGTCGAATCCTAAACCCTAATTTT
CACCTTTGAAGCTATCGGCAATGGCAGATCAGAGCAAGAACAACACTCCTGAGATCTTCG
AGCTCAACAATGAATCCATGCATGTCAAGATCTCAAATTATGGCGCCACCATCACCTCCT
TGTCTGTCCCCGACAAGAACGGAAAATTGGCTGATGTAGTCCTCGGATTCGACTCGGTGG
ATCCATATGTGAAAGTGCTTGCACCCTACTTTGGTTGCATAGTTGGTCGTGTAGCAAATC
GGATCAAAGAGGGCAAGTTTAGTCTCAATGGAGTCGACTACACTCTTCCCATCAACAAGC
CTCCCAACAGCCTCCACGGTGGTAACAAAGGTTTTGATAAGAAGATATGGGACGTTGCAG
GACACAAGAAAGACGGTGAAAAACCTTTCATCATTTTCAAATATCACAGTGCCGATGGAG
AAGAAGGTTACCCCGGTGCGGTTGCTGTGACGGCAACATACACTCTCACGTCAGCAACGA
CCATGAGACTTGACATGGAAGCAACTCCTGAGAACAAAGATACTCCCATCAACTTAGCTC
AGCATACATACTGGAACTTGGCTGGTCACGACTCAGGAAACATTCTTGACCACATGATCC
AGATTTGGGGGTCTCACGTCACCCCTGTGGATCAGTTCACAGTTCCTACAGGGGTGATTT
TACCGGTGAAGGGAACTCCTTTCGATTTCACCGAGGAGAAACGTATAGGCGAGTCTATTG
GAGAGGTGGGTTTAGGATACGACCACAACTACGTGTTGGACTGTCCTGATCAAGAGAAGG
AGGGGCTGAAATACGCGGCGAAGCTAAGAGATGGTGCGAGCTCGAGGGTGATGGACTTGT
GGACAAATGCTCCGGGGGTGCAGTTTTATACTGGGAACTATGTGAATGGAGTGGTTGGGA
AAGGGAATGCGGTTTATGGGAAGCATGCAGGTGTGTGCCTTGAGACGCAAGGCTTCCCAA
ACGCGATTAACCAGTCTAATTTCCCGTCTGTTGTGGTTAAGGCTGGTGAGAAGTACAAGC
ATACTATGTTGTTTGAGTTTTCAGCTTGAGTGAGACCGGTTTGATTGGTCCACAGAACCG
GAAAGAGTGTTCTTTTTATTTTATTTTATTTTATCTTGCCTGGTTCTGGGCAGGTGTACA
CCAAACTGAACCTAATAATTTCTTTAAAGGAAAAGTACTTTAGCTTTGAATTATCTTTGG
TTATTAGATTTAAAATTAATCAATATATTTAAGC


BQ
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AF RS1DQ85TF U 1
AF RS1DQ85JQ C 614
BS 1 636 RS1DQ85TF
BS 637 637 RS1DQ85JQ
BS 638 707 RS1DQ85TF
BS 708 1294 RS1DQ85JQ

RD RS1DQ85TF 707 0 0
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AGCTCAACAATGAATCCATGCATGTCAAGATCTCAAATTATGGCGCCACCATCACCTCCT
TGTCTGTCCCCGACAAGAACGGAAAATTGGCTGATGTAGTCCTCGGATTCGACTCGGTGG
ATCCATATGTGAAAGTGCTTGCACCCTACTTTGGTTGCATAGTTGGTCGTGTAGCAAATC
GGATCAAAGAGGGCAAGTTTAGTCTCAATGGAGTCGACTACACTCTTCCCATCAACAAGC
CTCCCAACAGCCTCCACGGTGGTAACAAAGGTTTTGATAAGAAGATATGGGACGTTGCAG
GACACAAGAAAGACGGTGAAAAACCTTTCATCATTTTCAAATATCACAGTGCCGATGGAG
AAGAAGGTTACCCCGGTGCGGTTGCTGTGACGGCAACATACACTCTCACGTCAGCAACGA
CCATGAGACTTGACATGGAAGCAACTCCTGAGAACAAAGATACTCCCATCAACTTAGCTC
AGCATACATACTGGAACTTGGCTGGTCACGACTCAG*AAACATTCTTGACCACATGATCC
AGATTTGGGGGTCTCACGTCACCCCTGTGGATCAGTTCACAGTTCCT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1DQ85JQ 681 0 0
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AACTCCTTTCGATTTCACCGAGGAGAAACGTATAGGCGAGTCTATTGGAGAGGTGGGTTT
AGGATACGACCACAACTACGTGTTGGACTGTCCTGATCAAGAGAAGGAGGGGCTGAAATA
CGCGGCGAAGCTAAGAGATGGTGCGAGCTCGAGGGTGATGGACTTGTGGACAAATGCTCC
GGGGGTGCAGTTTTATACTGGGAACTATGTGAATGGAGTGGTTGGGAAAGGGAATGCGGT
TTATGGGAAGCATGCAGGTGTGTGCCTTGAGACGCAAGGCTTCCCAAACGCGATTAACCA
GTCTAATTTCCCGTCTGTTGTGGTTAAGGCTGGTGAGAAGTACAAGCATACTATGTTGTT
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TTTTATTTTATTTTATTTTATCTTGCCTGGTTCTGGGCAGGTGTACACCAAACTGAACCT
AATAATTTCTTTAAAGGAAAAGTACTTTAGCTTTGAATTATCTTTGGTTATTAGATTTAA
AATTAATCAATATATTTAAGC

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

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GGGGCTCGACGGACTCCGCAAGGGATTGGTCGCCGTCACGCGTAACCTCCTGAAACCGTT
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GATGCCATCGTGCGACGGAGATTCCTGCACGCCGTCGGAGCACCTCCGTCACCAGAAATC
GATGATGAAATCCCAGCGAAACGCGCTTCTCATCGCGGCGGCGCTCGTGTTCTACTGGAT
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AAACTGTTTACTGTTTGTTTTTTACTGATTAAAATTGAATTTTGATTTAACTCAGAATCT
TCTATGCAAGACAAGCATTGATGAC


BQ
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AF RS1B753JQ C 1
AF RS1B753TF U 1
BS 1 565 RS1B753TF

RD RS1B753JQ 565 0 0
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GATGCCATCGTGCGACGGAGATTCCTGCACGCCGTCGGAGCACCTCCGTCACCAGAAATC
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TCTATGCAAGACAAGCATTGATGAC

QA 1 565 1 565
DS 

RD RS1B753TF 565 0 0
GGGCGAAGAAGAGATTCAGATCTAACCTTTTGATCGATCAGTGAGAATGGCTCTCGAATG
GGTTGTGCTAGGTTACGCCGCGGCGGCCGAAGCGATCATGGTGATCCTTCTGACGATGCT
GGGGCTCGACGGACTCCGCAAGGGATTGGTCGCCGTCACGCGTAACCTCCTGAAACCGTT
TCTGTCGATAGTCCCGTTCTGCCTCTTCCTGTTGATGGACATCTACTGGAAGTACGAGAC
GATGCCATCGTGCGACGGAGATTCCTGCACGCCGTCGGAGCACCTCCGTCACCAGAAATC
GATGATGAAATCCCAGCGAAACGCGCTTCTCATCGCGGCGGCGCTCGTGTTCTACTGGAT
CCTCTTCTCTGTTACCAGTCTGGTTGTTAAGATCGAGCAGCTTAACCAGCGGATCGAGAG
GCTCAAGAACAAGGATTAATCGTCCTTCCTTCGAGTCTCTTTTTACTGTTTCTCTGTTTG
AAACTGTTTACTGTTTGTTTTTTACTGATTAAAATTGAATTTTGATTTAACTCAGAATCT
TCTATGCAAGACAAGCATTGATGAC

QA 1 565 1 565
DS 



AS 1 2

CO CL7843Contig1 969 2 8 U
GATTACCTCTCTAACACGTCCCTGATGCCAGAACCCAAATGAGGTTGTCCCGCTTTTTTA
TAGAACTCGTTTCCTAGTCTCAGAGATATAATCAAATGCTCTGAAACAAGGAGCTTTTCC
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GTCCCTGGTAATGTTGGTTTCCTAGCCAACCGAGCTATAAACAAATGCTTCATAACAGAA
AACAAATGAGCTTGCCATGCGGTAGAGTCGAGAATGTCCCTGCCTAACTCGGTTTCCTAG
TCACCCCAGCTCTTAACCAATGTCTCGAAATCAGGTAATCTTAATTACCTATGTCCCTGA
TGACAGAACTCAAGTGAGCTTATCAGGTAATCTTAATTACCTCTCTGAAACGTCCCTATG
TCACCTAACGCTAGATTGCAAATGAGGTTGTCCCTTTGGGCTACTTTGGATCCTGGTTAC
CTGAGTTAAACACTTGGAGTTGCTTGAATGTCCCTGATTCTACACGAACAAGCTTGTCCC
TGAATAAGTTGGCTTTTTTAATCAACCGAGCTATAAGCAAATAAGAACACATGTGGCTTG
TCCTGCGGAATTTCCATGCATAACTCGGTTTTCCTAGTCACTCGAGCTTTAAACAAATGC
CTCGTAACAAGGTAATCTTAATTACCTCTCCGAAAAGTCCCTACTAGTTACCAGAGTTAA
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TTGCTTGAGATCCTAGTCACTCAAGCTAAATGAAAGCCAAGAGACTAAAGGATACAAATG
ATGAGGTTTCTGGTCACTTAAGTTAAACACAAAAGGCCTCGCGCCAGGTCTAATGAAAAT
GCTCAAACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CE67TF U 1
AF RS1CE67JQ C 193
BS 1 671 RS1CE67TF
BS 672 672 RS1CE67JQ
BS 673 711 RS1CE67TF
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BS 713 717 RS1CE67TF
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BS 719 758 RS1CE67TF
BS 759 969 RS1CE67JQ

RD RS1CE67TF 758 0 0
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TAGAACTCGTTTCCTAGTCTCAGAGATATAATCAAATGCTCTGAAACAAGGAGCTTTTCC
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GTCCCTGGTAATGTTGGTTTCCTAGCCAACCGAGCTATAAACAAATGCTTCATAACAGAA
AACAAATGAGCTTGCCATGCGGTAGAGTCGAGAATGTCCCTGCCTAACTCGGTTTCCTAG
TCACCCCAGCTCTTAACCAATGTCTCGAAATCAGGTAATCTTAATTACCTATGTCCCTGA
TGACAGAACTCAAGTGAGCTTATCAGGTAATCTTAATTACCTCTCTGAAACGTCCCTATG
TCACCTAACGCTAGATTGCAAATGAGGTTGTCCCTTTGGGCTACTTTGGATCCTGGTTAC
CTGAGTTAAACACTTGGAGTTGCTTGAATGTCCCTGATTCTACACGAACAAGCTTGTCCC
TGAATAAGTTGGCTTTTTTAATCAACCGAGCTATAAGCAAATAAGAACACATGTGGCTTG
TCCTGCGGAATTTCCATGCATAACTCGGTTTTCCTAGTCACTCGAGCTTTAAACAAATGC
CTCGTAACAAG*TAATCTTAATTACCTCTCCGAAAAGTCCCTACTAGTTAC*AGAGT*AA
ACACTTGGAGTTGCTTGATATCCTAGTCACTCAAGTGA

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1CE67JQ 777 0 0
TGTTGG
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CTTATCAGGTAATCTTAATTACCTCTCTGAAACGTCCCTATGTCACCTAACGCTAGATTG
CAAATGAGGTTGTCCCTTTGGGCTACTTTGGATCCTGGTTACCTGAGTTAAACACTTGGA
GTTGCTTGAATGTCCCTGATTCTACACGAACAAGCTTGTCCCTGAATAAGTTGGCTTTTT
TAATCAACCGAGCTATAAGCAAATAAGAACACATGTGGCTTGTCCTGCGGAATTTCCATG
CATAACTCGGTTTTCCTAGTCACTCGAGCTTTAAACAAATGCCTCGTAACAAGGTAATCT
TAATTACCTCTCCGAAAAGTCCCTACTAGTTACCAGAGTTAAACACTTGGAGTTGCTTGA
TATCCTAGTCACTCAAGTGAAATTCAAAGCCAAACGAAAGTCCCATGATGCTAAAATGCA
AATGAGGCTGTCACACTTTATTAATTACTTTATCCTCTGGAATTGCTTGAGATCCTAGTC
ACTCAAGCTAAATGAAAGCCAAGAGACTAAAGGATACAAATGATGAGGTTTCTGGTCACT
TAAGTTAAACACAAAAGGCCTCGCGCCAGGTCTAATGAAAATGCTCAAACC

QA 7 777 7 777
DS 



AS 1 2

CO CL7844Contig1 801 2 4 U
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TCCATGGAAGAAGTGGCAGCACACAACAAGCAAGATGACTGCTGGATTGTAATCGACGGC
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GCTGTCACAGGCAAAGATGCAACGGATGAATTCGAAGACGCGGGGCACAGCAAAACAGCT
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ATATGATTATTGGATATGCTTTGGTTTTCTTATAAAAAAAAAAAAATCTGTTTGTCATCC
TTTTGACCTTCCTTTTACTTGGCATTGCACCAAATAGCTTCACCAAGTTTACATTATATC
TATTGACTCTTGTGTTTGTCG


BQ
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AF RS1B241TF U 1
AF RS1B241JQ C 100
BS 1 583 RS1B241TF
BS 584 584 RS1B241JQ
BS 585 693 RS1B241TF
BS 694 801 RS1B241JQ

RD RS1B241TF 693 0 0
GGACCTACCCAAAACCTAAAACCCCAGAACAAAAAGTGAGAATAAACCAAAACTGCTATC
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TCCATGGAAGAAGTGGCAGCACACAACAAGCAAGATGACTGCTGGATTGTAATCGACGGC
AAGGTCTATGACGTAACCTCTTATATGGACGAGCACCCTGGAGGAGATGATGTCCTTCTT
GCTGTCACAGGCAAAGATGCAACGGATGAATTCGAAGACGCGGGGCACAGCAAAACAGCT
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CCAGAGCTCAAGATCTACAAGAAGGAGGAGCCAAGGGACTCTGTTCAGAAGCTTGTCGAC
TTGACCAAGCAGTACTGGGTTGTTCCCGTCTCGGTTATCACCATCTCTGTTGCCGTGAGT
GTCTTGTTCTCTCGCAGGAAGTAGTAAGAGTTAGTCTCTGGAGATGATCTGAGAGCTATT
GAATTACTCTGGGGGAATCAACTATCCACGAGAACTCCCCCTCTCTCATTATAGATTTTG
AATCACAGAAAATAATTGCAGTTTTCAATCACTTAATGGTTTTACATTTTTGAGTTAATG
ATATGATTATTGGATATGCTTTGGTTTTCTTAT

QA 1 693 1 693
DS 

RD RS1B241JQ 702 0 0
CCGACGCTCACAAAGATTTACTCCATGGAAGAAGTGGCAGCACACAACAAGCAAGATGAC
TGCTGGATTGTAATCGACGGCAAGGTCTATGACGTAACCTCTTATATGGACGAGCACCCT
GGAGGAGATGATGTCCTTCTTGCTGTCACAGGCAAAGATGCAACGGATGAATTCGAAGAC
GCGGGGCACAGCAAAACAGCTAGGGAACTCATGGAGGAGTATTTCATCGGCGAGCTAGAC
GAAGATTCCGTACAGGAAATACCAGAGCTCAAGATTTACAAGAAGGAGGAGCCAAGGGAC
TCTGTTCAGAAGCTTGTCGACTTGACCAAGCAGTACTGGGTTGTTCCCGTTTCGGTTATC
ACCATTTCTGTTGCCGTGAGTGTCTTGTTCTCTCGCAGGAAGTAGTAAGAGTTAGTCTCT
GGAGATGATTTGAGAGCTATTGAATTACTTTGGGGGAATCAACTATCCACGAGAACTCCC
CCTCCCTCATTATAGATTTTGAATCACAGAAAATAATTGCAGTTTTCAATCACTTAATGG
TTTTACATTTTTGAGTTAATGATATGATTATTGGATATGCTTTGGTTTTTTTATAAAAAA
AAAAAAATCTGTTTGTCATCCTTTTGACCTTCCTTTTACTTGGCATTGCACCAAATAGCT
TCACCAAGTTTACATTATATCTATTGACTCTTGTGTTTGTCG

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 2

CO CL7845Contig1 490 2 1 U
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AGAAGACTTACTGTAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCATACGTTGCACAAGGTGACCCAGT
ACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTTGCTGCCCAAGGAAAGCGTCGTTATGACCGCAAGCAAT
CTGGTTATGGTGGTCAGACCAAACCCGTCTTCCACAAGAAGGCTAAGACGACCAAGAAGA
TTGTGCTGAGGCTCCAATGCCAAACCTGCAAGCATTTCTCTCAACACTCAATTAAGAGGT
GCAAGCACTTTGAGATTGGTGGAGACAAGAAGGGAAAAGGAACATCTCTCTTTTAAGTTG
TTTCCTCTATCTACTTTTTTTTTTTTTATCTTTTGTTTGGTACTTGTCTTGCTTGGGCAT
TCGCATACATTTTGAATCTTCAAAAAATGGTTGTGGACCTATGATCTTTTAATTAAGAGG
ACATTTTCGT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BF52JQ C 1
AF RS1BF52TF U 1
BS 1 490 RS1BF52TF

RD RS1BF52JQ 490 0 0
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ACATTTTCGT

QA 1 490 1 490
DS 

RD RS1BF52TF 490 0 0
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AGAAGACTTACTGTAAGAACAAGGAATGCAAGAAGCATACGTTGCACAAGGTGACCCAGT
ACAAGAAGGGTAAAGACAGTCTTGCTGCCCAAGGAAAGCGTCGTTATGACCGCAAGCAAT
CTGGTTATGGTGGTCAGACCAAACCCGTCTTCCACAAGAAGGCTAAGACGACCAAGAAGA
TTGTGCTGAGGCTCCAATGCCAAACCTGCAAGCATTTCTCTCAACACTCAATTAAGAGGT
GCAAGCACTTTGAGATTGGTGGAGACAAGAAGGGAAAAGGAACATCTCTCTTTTAAGTTG
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TCGCATACATTTTGAATCTTCAAAAAATGGTTGTGGACCTATGATCTTTTAATTAAGAGG
ACATTTTCGT

QA 1 490 1 490
DS 



AS 1 2

CO CL7846Contig1 720 2 8 U
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CTCTCTCTCTCTTTTTTCTCTCTGTCTCTGTTTCTCTCTTTTTTCTCTCTGTCTCTGTTT
CTCTCTTTCTCTCTGTCTCGTTATCTCTCTCTCCCTCTGTTTGTCCATGTCTCGCTATCT
CTCTCTTTCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTTATCTCTCTTTCTCCGTCTCTATTGAA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EF29TF U 1
AF RS1EF29JQ C 132
BS 1 573 RS1EF29TF
BS 574 574 RS1EF29JQ
BS 575 593 RS1EF29TF
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RD RS1EF29TF 711 0 0
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TCTTTTCTCCGTATCACTCTCTTCATCATCTCCTTTCTCTGTATCTCCCTGTCACTCTCT
CTCTCTCTCTCTTTTTTCTCTCTGTCTCTGTTTCTCTCTTTTTTCTCTCTGTCTCTGTTT
CTCTCTTTCTCTCTGTCTCGTTATCTCTCTCTCCCTCTGTTTGTCCATGTCTCGCTATCT
CTCTCTTTCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTTATCTCTCTTTCTCCGTCTCTATTGAA
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GGTTTTCCGGTTTAGTGTAAACCGAATTGGATAAACCGTTGTGGTTTACTTTATTTT*AT
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QA 1 711 1 711
DS 

RD RS1EF29JQ 589 0 0
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TCTGTCTCGTTATCTCTCTCTCCCTCTGTTTGTCCATGTCTCGCTATCTCTCTCTTTCTC
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TTTGTTTCTCGTAGGTTGTGAGCAGAGATGCTGGTCTGTGGTTGCGAGCAGCGTGGTCGT
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TTAGTGTAAACCGAATTGGATAAACCGTTGTGGTTTACTTTATTTTTATTTTTTCTTGTT
TAGTTTTGTAAACCAAAATTTATTTATCAATAAATTTTATTTTATTTTT

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 2

CO CL7847Contig1 654 2 6 U
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AGTTCACCAATTTCGTTGAGTTTCGAACGCATAAGGTTATATACAGGAGATATGCTGGGT
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TCCTTCCTGTTATGCTCTGTCTACGTTAAACACACACCTTTTTCATTTTTTACTCATTAA
GACCTCTAATGGTAAACAGAGAACATATATTTGGGCAACTCAAAGAAAGAATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GA81TF U 1
AF RS1EG70TF U 27
BS 1 255 RS1GA81TF
BS 256 256 RS1EG70TF
BS 257 545 RS1GA81TF
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RD RS1GA81TF 609 0 0
GGCCGAGAAGATCTTACGTTTTCTTGTGTCTTGCGATTCCGGGAATAATGATCCGATTCA
TATTATTGCAGAACAGACAAGGAAAGACTCGTCTTGCAAAGTACTATGTTCCTCTCGAGG
AGTCTGAGAAACACAAGGTTGAATACGAGGTCCATAGATTGGTGGTCAATCGCGACTCAA
AGTTCACCAATTTCGTTGAGTTTCGAACGCATAAGGTTATATACAGGAGATATGCTGGGT
TGTTTTTCTCCTTGTGCGTTGACATAACAGACAATGAGTTGGCTTACCTTGAATGCATCC
ACTTGTTCGTTGAGATTTTGGACCATTTCTTCAGCAATGTCTGTGAGCTTGATTTGGTTT
TCAACTTCCACAAGGTGTACTTAATACTGGATGAATTCATTCTTGCTGGAGAGCTTCAAG
AAACAAGCAAGCGGGCGATCATTGAGAGGATGTCAGAACTGGAGAAGCTTGACTGATGAG
ATTATATGATATTCAAGAATGAAAATGAGAGCAGTAGGAGTCTTCCGACTTCCGTTTAGC
TCCTTTCTGTTATGCTCTGTCTACGTTAAACACACACCTTTTTCATTTTTTACTCATTAA
GACCTCTAA

QA 1 609 1 609
DS 

RD RS1EG70TF 628 0 0
TGTCTTGTGATTCCGGGAATAATGATCCGATTCATATTATTGCAGAACAGACAAGGAAAG
ACTCGTCTTGCAAAGTACTATGTTCCTCTCGAGGAGTCTGAGAAACACAAGGTTGAATAC
GAGGTCCATAGATTGGTGGTCAATCGCGACTCAAAGTTCACCAATTTCGTTGAGTTTCGA
ACGCATAAGGTTATATACAGGAGATATGCTGGGTTGTTTTTCTCCTTGTACGTTGACATA
ACAGACAATGAGTTGGCTTACCTTGAATGCATCCACTTGTTCGTTGAGATTTTGGACCAT
TTCTTCAGCAATGTCTGTGAGCTTGATTTGGTTTTCAACTTCCACAAGGTGTACTTAATA
CTGGATGAATTCATTCTTGCTGGAGAGCTTCAAGAAACAAGCAAGCGGGCGATCATTGAG
AGGATGTCAGAACTGGAGAAGCTTGACTGATGAGATTATATGATATTCAAGAATGAAAAT
GAGAGCAGTAGGAGTCTTCCGACTTCCGTTTAGCTCCTTCCTGTTATGCTCTGTCTACGT
TAAACACACACCTTTTTCATTTTT*ACTCATTAAGACCTCTAATGGTAAACAGAGAACAT
ATATTTGGGCAACTCAAAGAAAGAATAT

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 2

CO CL7848Contig1 578 2 7 U
GAGTTCAGTTGCTTCAAATCAAAATTACAAAAAACAATTTGGGTGAAAAAATGTGAATAA
AAAAACCGGCAATTGGTAGTAGGCTGTAAAAAAAAAGCTCAAATGTGTTTTTATCTTTTA
CTCCAATCTTCCTTTGGTGCTTTTATGAAGTGGGATTAAAAGCACTTCCTATGCACAATT
GATGGTCCTGATTCATCATATTCTGCCTTTGCAATCCACATCTGCTGGAAAGTACTAAGG
GAAGCCAATATAAAACCACCGATCCAAACACTGTACTTCCTCTCAGGCGGAGCCACGACC
TTAATCTTCATACTACTCGGAGCCAAAGCCGTAATCTCTTTGCTCATTCTATCACCAATG
CCACCAAACATTGGGGTTCCACCACTTAGCACAATGTTGCCATACAAATCTTTTCTAATA
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ATCACTTGTCCATCAGGAAGCTCGAAGCTTTTTTCTAC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1F905JQ U 1
AF RS1A661JQ U 1
BS 1 31 RS1A661JQ
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QA 1 578 1 578
DS 



AS 1 2

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BQ
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QA 1 570 1 570
DS 

RD RS1A612TF 570 0 0
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TCAACCGGAGAGTGACCGAGCTTTTAGCACAAGACATGAAAGACTCTTTGGACTGTGCAG
ATTTGCTCTTGTTTTCTTTCTTTTTTTCTGTCTTTTGGAAACATGGCAGTCTTTTGGACT
GAAGATTCATGTAATGTGTGTACGAGCTTGAGTAATGTATTGCTACACTCAACATTAGTC
TCTCGTTATCAAATAAGTCTCCTTTTCCTC

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1A989JQ C 1
AF RS1A989TF U 1
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QA 1 586 1 586
DS 

RD RS1A989TF 586 0 0
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CCAGCGAGTATTATCTCTTGTTTAATAAATAGCTTGTTTGACTATT

QA 1 586 1 586
DS 



AS 1 2

CO CL7851Contig1 881 2 2 U
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AGGATGTCGGAAACTATAAGCAACCACTTGTCTGGATTGACTTGGAGATGACTGGTCTTA
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CTATAAGTGAAAGGCAAGCTGAACAAGAGGTCATCCAATTTGTAAAAAAGCATGTTGGTA
ATGAAAATCCACAGTTAGCTGGAAACTCTATCTACGTGGATTTCCTTTTCCTAAAGAAGT
ACATGCCAGATTTGGCTGCCCTTTTCCCTCATGTACTTGTCGATGTCAGTAGTGTCAAGT
CTTTATGCAACCGATGGTTTCCAAGAGAGAAAAACAGAGCTCCTGCAAAGAAAAACAATC
ACAGAGCCATGGATGATATAAGAGAAAGCATCAAGGAGCTTAAGTACTACAAAGAAACCA
TATTTAAAGCAAACAAAGGCAGGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTTGGAGCGAAATCTCCTTT
GATTAACCTTCTTGATTAGAAGATATCGTTTTTTTTTTGTTTAGGGAAAGGGTATATTGA
CATTGTCGTTTAGGAGTCATTCTCTTGAATGTTTTTGTATTATGAAACCTAGTTACATGA
TGATCTTTAGTTATTGAGACTGGTACTAAATCTATTATCTT


BQ
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AF RS1EO46TF U 1
AF RS1EO46JQ C 110
BS 1 679 RS1EO46TF
BS 680 881 RS1EO46JQ

RD RS1EO46TF 679 0 0
AGTAAATGGAGAAACAGCTCTCCAATGCTTTCTCTCTCCTTGCTTTAGCCGACGACGAAG
ATGGTCTCCCCTCGTCTTCTTCTTCCTCCTCCGCTGGGAAACAAGGAGAAAGAGTAGTAG
AGGATGTCGGAAACTATAAGCAACCACTTGTCTGGATTGACTTGGAGATGACTGGTCTTA
ATGTTGAAGTTGACAGGATATTGGAGATTGCTTGTATAATTACTGATGGACAATTAACCA
AATCAGTGGAGGGTCCAGATTTAGTTGTACATCAAACGAAAGACTGCATGGATAAAATGG
GTGATTGGTGTCAAACTCATCATGGAGACAGTGGTTTGACAAAGAAAGTGCTCTCTAGTA
CTATAAGTGAAAGGCAAGCTGAACAAGAGGTCATCCAATTTGTAAAAAAGCATGTTGGTA
ATGAAAATCCACAGTTAGCTGGAAACTCTATCTACGTGGATTTCCTTTTCCTAAAGAAGT
ACATGCCAGATTTGGCTGCCCTTTTCCCTCATGTACTTGTCGATGTCAGTAGTGTCAAGT
CTTTATGCAACCGATGGTTTCCAAGAGAGAAAAACAGAGCTCCTGCAAAGAAAAACAATC
ACAGAGCCATGGATGATATAAGAGAAAGCATCAAGGAGCTTAAGTACTACAAAGAAACCA
TATTTAAAGCAAACAAAGG

QA 1 679 1 679
DS 

RD RS1EO46JQ 772 0 0
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GACTGGTCTTAATGTTGAAGTTGACAGGATATTGGAGATTGCTTGTATAATTACTGATGG
ACAATTAACCAAATCAGTGGAGGGTCCAGATTTAGTTGTACATCAAACGAAAGACTGCAT
GGATAAAATGGGTGATTGGTGTCAAACTCATCATGGAGACAGTGGTTTGACAAAGAAAGT
GCTCTCTAGTACTATAAGTGAAAGGCAAGCTGAACAAGAGGTCATCCAATTTGTAAAAAA
GCATGTTGGTAATGAAAATCCACAGTTAGCTGGAAACTCTATTTACGTGGATTTCCTTTT
CCTAAAGAAGTACATGCCAGATTTGGCTGCCCTTTTCCCTCATGTACTTGTCGATGTCAG
TAGTGTCAAGTCTTTATGCAACCGATGGTTTCCAAGAGAGAAAAACAGAGCTCCTGCAAA
GAAAAACAATCACAGAGCCATGGATGATATAAGAGAAAGCATCAAGGAGCTTAAGTACTA
CAAAGAAACCATATTTAAAGCAAACAAAGGCAGGAGGTGAGGTGAGGTGAGGTTGGAGCG
AAATCTCCTTTGATTAACCTTCTTGATTAGAAGATATCGTTTTTTTTTTGTTTAGGGAAA
GGGTATATTGACATTGTCGTTTAGGAGTCATTCTCTTGAATGTTTTTGTATTATGAAACC
TAGTTACATGATGATCTTTAGTTATTGAGACTGGTACTAAATCTATTATCTT

QA 1 772 1 772
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7853Contig1 1422 2 4 U
GGACATCGAAGCAAAGAAACCTAAACTCACAAAAACCTAAAAGCAAAACCTAGTGGACGA
CGGCGACAGGAGGAGAAGAGAGAAACTCAGATCTTTTGTCATGGCACCGAAGCAGTCGGA
CAAGATCGAGAACCCTCCTCCGGCTGCCTCTTCCAGCGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGTC
CGGCTCATCCGGAGAAGAAGAAGAATCCGGATCTTCCGACGACGAAGCTGGCGACGTCCA
GTCCAAGCTCACTCAGAAACCTCCTCCTCCTGCTACAAAGAAGACTCCCGAATCCGACTC
CGAAGAAGACGAATCCGAATCCGATTCCGATTCCGAACCTCCCACCAAAACCAAGCCTCT
CAACACCGTCGCCTCCAGACCAAAGCCAGAGACATCCGGATCTGCTTCCGCGTCTCTCCC
CAAGAGCTCTACTACAGCCAAACGCTCCCTAAAGCAAGCAGACGAAGAAGAGCCTAAGAA
GAAGGCGAAGACAACAACAGAGAATGTGAAGAAGAAGAAGGATGAAGAGGTTAAGAAGAT
CTCCGGAGAAGACGCGAAGAAGATGTTCCAGAGACTGTTCAGCGAGACCGACGAAATCGC
GATGCTTCGTGGCTTTCTAGACTTCACATCCACTAGAGGCGACCCTTACGAGAACATGGA
CGCCTTCTGCGACTACGTCAAGAACTTGATCGATTTCAACGCTTCCAAGGCTCAGATTGT
CACCAAGCTACAGAGGTGTAAGAAGAAGTTTGTGAACATAGTGAAGAACGCGCTCAAGAA
AGGCAAGACCGAGGATAAGGTCACGTGTTCCAAGGATCTTGACCAGAAAGCTTTCGACTT
GTCGAGGAAGATTTGGGGAGCTAACGGTGTTCTTCCTGCTAAACCGAGGAAGAAGTCGTC
GAAAGAGGATGTGAAGTCTCCTCCTTCGCCTTCGCACACGCCTAAGAAAGTGGAGAAGTA
GAAGGGGATTGTTGTTGTGGATGATGCTCAGCTCTCGTCGAGTAGAGAGATGGCGATGTT
CTTTAAGGCGGAGAATGTGAGTGTTTTTGGTTTGGATGAGTCGACGGTGAGTGCGGTTTG
GGATGTGGTTGAGGATGGGCCGAAGAAGAGGGAGGTGGAGGGGAAGCTGAAGAAGCTCAA
GGCTATGCAGGTGGAGCTGTGTTTGCAGAGAACTGCGTTGTTGGACACTACTGCAAAGAT
GATATTCAAAGACAATGCGTCGTCCTCGTCGTCATGATTGATGAGATATATTGACGGTTT
GTTCTTTTTGTTTTTTAACTTTTTTTTATAGTATGCATAGCTTGTGGAACTAAGGCTATC
GTAAGTCTTAGTCGATGTTTTTCTTTTATGCCCCTTATGTTGTTGGATTATATATTCCCC
TATGTGGAATGAAATATTTATTCCCTTATATGCTTTTGTGCT


BQ
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AF RS1D504TF U 1
AF RS1D504JQ C 668
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CAAGATCGAGAACCCTCCTCCGGCTGCCTCTTCCAGCGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGTC
CGGCTCATCCGGAGAAGAAGAAGAATCCGGATCTTCCGACGACGAAGCTGGCGACGTCCA
GTCCAAGCTCACTCAGAAACCTCCTCCTCCTGCTACAAAGAAGACTCCCGAATCCGACTC
CGAAGAAGACGAATCCGAATCCGATTCCGATTCCGAACCTCCCACCAAAACCAAGCCTCT
CAACACCGTCGCCTCCAGACCAAAGCCAGAGACATCCGGATCTGCTTCCGCGTCTCTCCC
CAAGAGCTCTACTACAGCCAAACGCTCCCTAAAGCAAGCAGACGAAGAAGAGCCTAAGAA
GAAGGCGAAGACAACAACAGAGAATGTGAAGAAGAAGAAGGATGAAGAGGTTAAGAAGAT
CTCCGGAGAAGACGCGAAGAAGATGTTCCAGAGACTGTTCAGCGAGACCGACGAAATCGC
GATGCTTCGTGGCTTTCTAGACTTCACATCCACTAGAGGCGACCCTTACGAGAACATGGA
CGCCTTCTGCGACTACGTCAAGAACTTGATCGATTTCAACGCTTCCA*GGCTCAGATTGT
CACCAAGCTACAGAG
TGTA

QA 1 735 1 735
DS 

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AAGATTTGGGGAGCTAACGGTGTTCTTCCTGCTAAACCGAGGAAGAAGTCGTCGAAAGAG
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ATTGTTGTTGTGGATGATGCTCAGCTCTCGTCGAGTAGAGAGATGGCGATGTTCTTTAAG
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GTTGAGGATGGGCCGAAGAAGAGGGAGGTGGAGGGGAAGCTGAAGAAGCTCAAGGCTATG
CAGGTGGAGCTGTGTTTGCAGAGAACTGCGTTGTTGGACACTACTGCAAAGATGATATTC
AAAGACAATGCGTCGTCCTCGTCGTCATGATTGATGAGATATATTGACGGTTTGTTCTTT
TTGTTTTTTAACTTTTTTTTATAGTATGCATAGCTTGTGGAACTAAGGCTATCGTAAGTC
TTAGTCGATGTTTTTCTTTTATGCCCCTTATGTTGTTGGATTATATATTCCCCTATGTGG
AATGAAATATTTATTCCCTTATATGCTTTTGTGCT

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

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GATGATCTTAAAAACTTGTTTCACTGTTACCTTTTTGTGTTGGGTTATTTTCTCTCTTTT
TTTTTTGTTTTTCTGATTGTGAAAATAAGACCTTTGTATGTAGATAGTTTGTAAAAGCTA
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BQ
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AF RS1G466TF U 1
AF RS1G466JQ C 1
BS 1 554 RS1G466TF
BS 555 683 RS1G466JQ

RD RS1G466TF 554 0 0
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GTTTCCTGCTCTTTCAAGGTTCCTCTCCGTTTGACGGACAGAGAAGGGTATCTAGCAAAT
GGTGCAATTGCAAATCTTGTTGATGAAGTTGGTGGAGCGGTTGTATATGTAGATGGTTTA
CCCATGAATGTTTCGGTGGACATGTCCATTGCTTTCCTTTCAAAAGCTAAGCTTGGTGAG
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GTTGTGAGAAACAAGATGACTGGAGAGATTATTGCTGAAGGTCGTCATTCTTTGTTTGGC
AGACAACCTAGTAAGCTCTGAGGTCAAATCTAATCTTTTTCTCTTGGTGGTAATGTAAAA
GATGATCTTAAAAA

QA 1 554 1 554
DS 

RD RS1G466JQ 683 0 0
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CTTCGGCTGAGCGAAGACTTTGACGTCGGCGACGCACCGCGAAAAGTAGAGAAAGGAAGA
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GGTGCAATTGCAAATCTTGTTGATGAAGTTGGTGGAGCGGTTGTATATGTAGATGGTTTA
CCCATGAATGTTTCGGTGGACATGTCCATTGCTTTCCTTTCAAAAGCTAAGCTTGGTGAG
GAGCTGGAGATAACATCGAGAGTGATGGGAGAGAGAGGAGGTTATAAAGGAACGATCGTT
GTTGTGAGAAACAAGATGACTGGAGAGATTATTGCTGAAGGTCGTCATTCTTTGTTTGGC
AGACAACCTAGTAAGCTCTGAGGTCAAATCTAATCTTTTTCTCTTGGTGGTAATGTAAAA
GATGATCTTAAAAACTTGTTTCACTGTTACCTTTTTGTGTTGGGTTATTTTCTCTCTTTT
TTTTTTGTTTTTCTGATTGTGAAAATAAGACCTTTGTATGTAGATAGTTTGTAAAAGCTA
AAGCCTTTGTGGACTTGTGAATC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

CO CL7855Contig1 740 2 3 U
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TCTGTTACAACAAGCTGTTTATTTTAATTTTCAACAAGTACTCATACCATAAAGCTGTTT
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CGAAGTTGGAGACGGAAAAGCAGATATGGTGACCCATAGGGAGATGGCTAGGATCTCGAA
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CGTCGGATGATTCTCTAGCGATATGGCCTAGACTCGCCATGTATGGTTCGGTTCCAAGAA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1F434JQ U 136
AF RS1F434TF C 1
BS 1 135 RS1F434TF
BS 136 687 RS1F434JQ
BS 688 740 RS1F434TF

RD RS1F434JQ 552 0 0
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TGTTTATTTTAATTTTCAACAAGTACTCATACCATAAAGCTGTTTATTTTAATTTTCAAC
AAGTACTCATTACCACAAACTTCCGGTTTCAAGATTCAGATCGGCTTGCTACCTCTAATC
CGTTTCCATCAGGATCAAAGAAAAAAACTTGCTTGACTTTTCCGTCAGGGAGAGACTTCT
GGAAAGTTTCTATCCTTTTCTCCTTGAGAGAGCGAAGGAAGGAGTCGAAGTTGGAGACGG
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CACTGAAAGGACCTTCAGGGAGGTTTGTTGAAGTGTTTCTCTGGATGATGTGCATCGCAA
AAGCACCTGGTAAGTTTAGCCATATCACTTTTAAGTCTCCAAAATCAGGGCTCTCGATCT
CCTCAAACCCAAATACCTCTTTGTAGAACTGAGCGAGGCGTGTGACGTCGGATGATTCTC
TAGCGATATGGC

QA 1 552 1 552
DS 

RD RS1F434TF 740 0 0
TTTTTTTGGACAAGAAAAACTCATTAATGCGATACATCCAACATTCAAACATGAAGTGTA
AATTGTCCGAAGTAAACATCAAGCCTAGACAACATAGAGACCTCAAGACTGTTCCAAAAC
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TCTGTTACAACAAGCTGTTTATTTTAATTTTCAACAAGTACTCATACCATAAAGCTGTTT
ATTTTAATTTTCAACAAGTACTCATTACCACAAACTTCCGGTTTCAAGATTCAGATCGGC
TTGCTACCTCTAATCCGTTTCCATCAGGATCAAAGAAGAAAACTTGCTTGACTTTTCCGT
CAGGGAGAGACTTCTGGAAAGTTTCTATCCTTTTCTCCTTGAGAGAGCGAAGGAAGGAGT
CGAAGTTGGAGACGGAGAAGCAGATATGGTGACCCATAGGGAGATGGCTAGGATCTCGAA
CCGCAGAGGTGGTGGCACTGAAAGGACCTTCAGGGAGGTTTGTTGAAGTGTTTCTCTGGA
TGATGTGCATCGCAAAAGCACCTGGTAAGTTTAGCCATATCACTTTTAAGTCTCCAAAAT
CAGGGCTCTCGATCTCCTCAAACCCAAATACCTCTTTGTAGAACTGAGCGAGGCGTGTGA
CGTCGGATGATTCTCTAGCGATATGGCCTAGACTCGCCATGTATGGTTCGGTTCCAAGAA
GAGTGCTAAATCTTAATCCC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL7856Contig1 1415 2 2 U
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AGAAGGGCGCGAACTTTTTGTACGCCGTATGCCTACTTTTTTTGAAACATTTCCGGTTGT
TTTGGTAGACGGAGACGGAATTGTTAGAGCGGACGTCCCGTTTAGAAGGGCAGAATCTAA
ATATAGTGTCGAACAAGTAGGTGTAACTGTTGAGTTTTACGGTGGTGAACTCAATGGAGT
GAGTTATAGTGATCCCGCAACTGTGAAAAAATATGCTAGACGGGCTCAATTGGGTGAGAT
TTTTGAATTAGATCGTGCTACTTTGAAATCTGATGGTGTTTTTCGTAGCAGTCCAAGAGG
TTGGTTTACTTTTGGGCATGCTTCGTTTGCTCTACTTTTCTTCTTTGGACACATTTGGCA
TGGTTCTAGAACCCTCTTCAGAGATGTTTTTGCTGGTATTGATCCAGATTTGGATGCTCA
GGTGGAATTTGGGGCATTCCAAAAACTTGGAGATCCAACTACAAAAAGACAGGCAGTCTG
ATGCAACATTGCTTTTTTTCTTTTAGTTTCTGTTTGCGATTTTTTTGATTTCATTTTATT
TAAATTTTATTTAATTAGGTAGGGTACTGTAGGAATCTTGATTTAAATCGCTGCCGTTTC
TTTGACTCTTTTTGTTCTTTATCCGGAGGGATACTCCTCAGTAAACATAAACAGGTATGA
AAGCTATAATTGTAAACCACGATCAAATTTATGGAAGCATTGGTTTATACATTTCTCTTA
GTATCGACTTTAGGGATCATTTTTTTCGCTATTTTTTTTCGGGAACCGCCTACAATTTCA
ACTAAAAAATGAAATAATTTTTCATTCTCTTCATTGACGTAATCAGCCTCCAAATAGTTG
GAGGCTAATTACGTTAACTAGTCCCCGTGTTCCTCGAATGGATCTCTTAGTTGTTGAGAG
GGTTGCCCAAAGGCAGTATATAGAGCATACCCAGTAAAACTTACAAGTAACCCAGATATA
AAGATGGCGACTAGAGTTGCTGTTTCCATTATTATAGAATTGAAAGACCACAATGGATCT
ATGCTAAGATCGTTTATTTACAACGGAATGGTATACAAAGTCAACAGATCGTAATGAATA
CAAAATAAGATTTATGGCTACACAAACTGTTGAAGATAGTTCTAGATCTGGTCCAAGAAG
CACTACTGTAGGGAAGTTATTGAAACCGTTGAATTCTGAATATGGTAAAGTAGCTCCTGG
ATGGGGAACGACCCCTTTGATGGGTGTTGCAATGGCGCTATTTGCGGTATTCCTATCTAT
TATTTTGGAGATTTATAATTCTTCTGTTCTACTGGATGGAATTTCAGTGAATTAGACTGA
GAAGAATCTTGAAGTCCTAGCTTTTTGTTCGATAC


BQ
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AF RS1EZ15TF U 1
AF RS1EZ15JQ C 674
BS 1 787 RS1EZ15TF
BS 788 1415 RS1EZ15JQ

RD RS1EZ15TF 787 0 0
GATGGACAATGGGGATGGAATAGCTGTTGGATGGTTAGGACACCCTGTCTTTAGAAATAA
AGAAGGGCGCGAACTTTTTGTACGCCGTATGCCTACTTTTTTTGAAACATTTCCGGTTGT
TTTGGTAGACGGAGACGGAATTGTTAGAGCGGACGTCCCGTTTAGAAGGGCAGAATCTAA
ATATAGTGTCGAACAAGTAGGTGTAACTGTTGAGTTTTACGGTGGTGAACTCAATGGAGT
GAGTTATAGTGATCCCGCAACTGTGAAAAAATATGCTAGACGGGCTCAATTGGGTGAGAT
TTTTGAATTAGATCGTGCTACTTTGAAATCTGATGGTGTTTTTCGTAGCAGTCCAAGAGG
TTGGTTTACTTTTGGGCATGCTTCGTTTGCTCTACTTTTCTTCTTTGGACACATTTGGCA
TGGTTCTAGAACCCTCTTCAGAGATGTTTTTGCTGGTATTGATCCAGATTTGGATGCTCA
GGTGGAATTTGGGGCATTCCAAAAACTTGGAGATCCAACTACAAAAAGACAGGCAGTCTG
ATGCAACATTGCTTTTTTTCTTTTAGTTTCTGTTTGCGATTTTTTTGATTTCATTTTATT
TAAATTTTATTTAATTAGGTAGGGTACTGTAGGAATCTTGATTTAAATCGCTGCCGTTTC
TTTGACTCTTTTTGTTCTTTATCCGGAGGGATACTCCTCAGTAAACATAAACAGGTATGA
AAGCTATAATTGTAAACCACGATCAAATTTATGGAAGCATTGGTTTATACATTTCTCTTA
GTATCGA

QA 1 787 1 787
DS 

RD RS1EZ15JQ 742 0 0
GTTCTTTATCCGGAGGGATACTCCTCAGTAAACATAAACAGGTATGAAAGCTATAATTGT
AAACCACGATCAAATTTATGGAAGCATTGGTTTATACATTTCTCTTAGTATCGACTTTAG
GGATCATTTTTTTCGCTATTTTTTTTCGGGAACCGCCTACAATTTCAACTAAAAAATGAA
ATAATTTTTCATTCTCTTCATTGACGTAATCAGCCTCCAAATAGTTGGAGGCTAATTACG
TTAACTAGTCCCCGTGTTCCTCGAATGGATCTCTTAGTTGTTGAGAGGGTTGCCCAAAGG
CAGTATATAGAGCATACCCAGTAAAACTTACAAGTAACCCAGATATAAAGATGGCGACTA
GAGTTGCTGTTTCCATTATTATAGAATTGAAAGACCACAATGGATCTATGCTAAGATCGT
TTATTTACAACGGAATGGTATACAAAGTCAACAGATCGTAATGAATACAAAATAAGATTT
ATGGCTACACAAACTGTTGAAGATAGTTCTAGATCTGGTCCAAGAAGCACTACTGTAGGG
AAGTTATTGAAACCGTTGAATTCTGAATATGGTAAAGTAGCTCCTGGATGGGGAACGACC
CCTTTGATGGGTGTTGCAATGGCGCTATTTGCGGTATTCCTATCTATTATTTTGGAGATT
TATAATTCTTCTGTTCTACTGGATGGAATTTCAGTGAATTAGACTGAGAAGAATCTTGAA
GTCCTAGCTTTTTGTTCGATAC

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL7857Contig1 762 2 10 U
GGACAATCTCCGCCGGCGAATCTGAAATTTTCTTCGAGACTAACAATGGCGGCAGCTAAC
AGTGGGACAGGGCGACAAAAGCCGAACATACTGATCACGGGAACTCCCGGTACCGGCAAA
TCGACGACGGCTTCTGCTCTGGCCGAAGCCACGAACTTCCGGCACATCTGCGTCGGAGAT
CTCGTCAAAGAGAAGAGCTTGCACGACGGCTGGGGCGATCAGTTCGATTCCTACGTCATC
AACGAAGACTTGGTGTGTGATGAGCTAGAAGATATAATGGAAGGGGGAGGGAACATTGTG
GACTACCATGGCTGCGACTTCTTCCCTGAGCGTTGGTTTGATCGTGTTGTCGTGCTTCAG
ACCGAGAACTCCGTCTTGTACGACCGTTTAACCAGGAGGGGTTATTCGGGAACCAAGCTC
AGTAACAACATTGAATGCGAGATCTTCCAAGTCATGCTCGAAGAAGCGAGTGATAGTTAC
GAAGAGGAGATTGTTGTCGCGCTGCAGAGTAACACGCTCGAAGATATCTCTAGCAATGTG
GCTAGTTTGACTGAATGGATTGAGTCATGGAGTCCCTGAGTAATCATCATATGATGATGA
TGCATATTTTATAGCTATAAAGTTCGGTTTTTTTTGTAGTTTTTTTTTTTTATGAATTCT
GCATTGATCTTTGTTAGTTTTGCAAATTTATAAGCGCAGTTCAGCTGTTGCAAGACCACC
TTATGTATGTGTTCCTTTTGATAATTAAAAAAAGTTTTCATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1FW15TF U 1
AF RS1FW15JQ C 176
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ACCGAGAACTCCGTCTTGTACGACCGTTTAACCAGGAGGGGTTATTCGGGAACCAAGCTC
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GCTAGTTTGACTGAATGGATTGAGTCATGGAGTCCCTGAGTAATCATCATATGATGATGA
TGCATATTTTATAGCTATAAAGTTCGGTTTTTTTTGTAGTTTTTTTTTTT*ATGAATTCT
GCATTGATCTTTGTTAGTTTTGCAA*TTTATAAGCGCAGTTCAGCTGTTGCA*GAC*ACC
TTATGTATGTGTTCCTTTTGATA
TTAAAAAA

QA 1 743 1 743
DS 

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GTTACGAAGAGGAGATTGTTGTCGCGCTGCAGAGTAACACGCTCGAAGATATCTCTAGCA
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GATGATGCATATTTTATAGCTATAAAGTTCGGTTTTTTTTGTAGTTTTTTTTTTTTATGA
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QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1H253JQB U 5
AF RS1DP46JQ U 1
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CCATTGAGCATCTACCACTCCAATTTTCTCGTGCGCATTCTGAACGCATTTTCGAACCGC
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TGCTTTACGGGAGAAAAC

QA 1 558 1 558
DS 

RD RS1DP46JQ 659 0 0
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GAGAGAAAGAGACAGTTTTTGTTTTTGTTTCTTTTTCTTTTGGTTACCGCCGGTGAGGTC
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CATCGAATCTGTCTTGGAACATCGTCCACTCTCTCCTGCATCTTTCCCTCACCCCTTCCC
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TGATCCATTGAGCATCTACCACTCCAATTTTCTCGTGCGCATTCTGAACGCATTTTCGAA
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GCCATGCTTTACGGGAGAAAACAGGAGCCATTATCTCAACGAATGCTGCACAAGGGGGTA
GATTTGGATCACTGCACCACCCATTCCTCTCCTCAGCATTCTTGTGGACTTCAGTGTCA

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

CO CL7859Contig1 688 2 3 U
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GTTTGTGTAAATACAAAATGTGATTGCT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DY07TF U 12
AF RS1DY07JQ C 1
BS 1 11 RS1DY07JQ
BS 12 564 RS1DY07TF
BS 565 688 RS1DY07JQ

RD RS1DY07TF 553 0 0
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GGAAAATTCTATC

QA 1 553 1 553
DS 

RD RS1DY07JQ 688 0 0
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TCCTTCATATCTTCTTCTTCTCCTAATTAATCTTGACGCAGATAATTATTATTATTTTAA
CCTCCGATCGAGATCCATTCCTCGTCGGAGAATTCAGATCGATATTATAAATAGAAGAAA
CTAAACCCTTATGGAGAGTTCTTTAGGTTTCATGGCGGTCTTCGCCGTCTCAGGGAGCGT
CGTGTTCCGCTAGTCAATTCCACAAGCGTCTCCTCTCTGATTACATGGACAAGTTCGAAT
TCGAAATCCGATCGAGAGAGAATGTGGTGATGAAGAAGAAGGTGAGATTTGCGGCGGATG
TGGTGGAGCCGTCGGGGAATAACAAAGAGTATCGCCGGAGACACTCTTCCAAGGCTAAAT
TTGATAAGGAATCCAAGATGGCGGCAATTGTTTGAAGGTTTTTTTTCTTTTTTTTTCGAA
GGAGTGGTTGTGTAATTATTCAATTGGGGTCTGTGATTTGATTTGATTTGATTTTCGTTA
TTAATTTTGGGGGAAAATTCTATCTCAAATCTGATGAATCTGGGGAAAAACCTTTTAGGT
CTTCCCATGGTCAAATATTTTTCCTATTTTTGTAAATTTTTCTTGGGTTTGTAAATATTT
GTTTGTGTAAATACAAAATGTGATTGCT

QA 1 688 1 688
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL7862Contig1 554 2 1 U
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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BQ
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GGACCAGCTGTTGCAACTGGAGACTTCTCTGGTCACTGGGTCTACTGGGTGGGACCACTT
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BQ
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AF RS1AL58JQ U 134
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QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

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AAAAAACTTCGACCT


BQ
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AF RS1F327JQ C 1
AF RS1F327TF U 1
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AAAAAACTTCGACCT

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DS 

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GCCCAAGTACAGGCTCATCAGGAATGGACTTGACACCAAGATTGAGAAATCAAGGAAACA
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ATCATCGCTTCTTTATTTGGATTTTGTACTTGTCATTATCACATTGTTCCGTCTCGTTTT
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AAAAAACTTCGACCT

QA 1 555 1 555
DS 



AS 1 2

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ATGAATTAAAAAGTT


BQ
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AF RS1B832JQ C 1
AF RS1B832TF U 1
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QA 1 555 1 555
DS 

RD RS1B832TF 555 0 0
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ATGAATTAAAAAGTT

QA 1 555 1 555
DS 



AS 1 2

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GTTTGTT

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TATAAAATCAAATACACTCTTTAAGTCTATTCATGTAAAATAATTTGTTATCCAATTAAT
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DS 



AS 1 2

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BQ
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QA 1 567 1 567
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1GZ09TF C 1
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BS 1 1 RS1GZ09TF
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QA 1 575 1 575
DS 

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TAGGTTGGGGTGGCAGCAAGAATCTTCCCAGTCTAGGGATGAAACCAAATGGTTGGGGTG
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AATCTGAAGCTTGAATGTTTTGGTTTTGTGTGTC

QA 1 574 1 574
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AAGGCGATCGTTGAGCTATATTGTTTCTTTCTCGTGAAGATCATGTGTTTTAGGGTCTTC
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BQ
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AF RS1DM33TF U 1
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AAG*CGATCGTTGAGCTATATTGTTTCTTTCTCGTGA*GATCATGTGTTT
AGGTCTTCGAGATGTTTC

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DS 

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ACAGCCTACTGGACCATCGTGGTAAGAAGGGTTGTTGATAACATTGCACTTTACCTTCAG
TTCACTGTGAAGAATCTTGTGAACAGTCAGTTTCAGAAGGATATAGTGGCGGAAATGGTG
GATCCTAGGGGCGGAGGAGAAGTTGAGAAGATGCTTGATGAGTCTCCTCCGGTGGCTTGC
AAAAGGGAGAAGCTGAAGAACAGTATCAAGCTTCTCAAGGAGTCAAAGGACGCCGTTGCG
GCCATTGTTTATCAGAACTCTGGGTAAAAGGCGATCGTTGAGCTATATTGTTTCTTTCTC
GTGAAGATCATGTGTTTTAGGGTCTTCGAGAATGTTTCTTTTTTCGGTATTTTTCAGTTG
TGGCTTTTATGAACTCTTGAACTTTTGGTTTATCGTTTATGTTAAGTTTTTAATTGTTTT

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

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CACGTCAATGCTAATCACGAATACGGTGTGCCAGAAGTAATTGCATTGCCCATAACTGGT
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GTTCACTTG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BG76TF U 1
AF RS1BG76JQ C 31
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BS 465 465 RS1BG76JQ
BS 466 609 RS1BG76TF

RD RS1BG76TF 609 0 0
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CACGTCAATGCTAATCACGAATACGGTGTGCCAGAAGTAATTGCATTGCCCATAACTGGT
GGGAGCGACAAGTATCTAGAATGGTTGAAAAACAGTACAAGGAACTGAGACATCTCGGTA
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GTTCACTTG

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DS 

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AATAGCATAGTCCAAGAAAAGCTTGCTGCGTGTGTCAACATTGTGCCAGGTGTTGAATCC
GTGTACGAGTGGGAAGGAAAGGTTCAGAGTGATTCCGAGGAGCTACTAATAATCAAAACA
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CCAGAAGTAATTGCATTGCCCATAACTGGTGGGAGCGACAAGTATCTAGAATGGTTGAAA
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TGTGTGTCATGTGTAATAGTACTAAGACCAGTTCACTTG

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

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TTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 

AF RS1FC82TF U 1
AF RS1FC82JQ C 95
BS 1 663 RS1FC82TF

RD RS1FC82TF 663 0 0
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GCAAGCCTCCTGGAAACCCAACAAAGTATAATCTGACACGTTTCGCAATGATGCTTAATG
AGCTTACGCCTGGGCTTAAGGACAAGCTGCCGCCGACAGATTCAAGGCTGCGACCGGACC
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AGCGACAACGTCAGGCTAGGAAGATGCAGGAGAGAGGATGGAAGCCGAGGTGGTTCACGA
AAGAGGAAGGAAGCGAGGCTTACCGATACAAAGGAGGGTACTGGGAAGCCCGCGAGAGCG
GATCATGGGAAGACTGTCCAGATATCTTCGGTCACATCGATTCCGAACAACAAACTGAGT
AAACAACATAAGCTTCAGTTCGTTTCTCATCGATTCTTAAATCACAAAATCTAACCGACT
ATATTTTTTTTCATGGGCTTTCTTTTTTTCTCATTATTCATTTACTCACAAGTTTGCTTT
AAAAGTGATTTTACTTATCATTTTTTTTTGTAATCTAGAATAAGTTCGATTAGTATACAA
ATTTGTTCAATCCTTGTAAATGGAGGAACATGCAGTAAATCATATTTCGCTTTTATTTTT
TTG

QA 1 663 1 663
DS 

RD RS1FC82JQ 569 0 0
GACACGTTTCGCAATGATGCTTAATGAGCTTACGCCTGGGCTTAAGGACAAGCTGCCGCC
GACAGATTCAAGGCTGCGACCGGACCAGAGGTATCTGGAGAATGGAGAGTTTGAAATGGC
CAACGCAGAGAAGTTGCGGCTGGAACAGCGACAACGTCAGGCTAGGAAGATGCAGGAGAG
AGGATGGAAGCCGAGGTGGTTCACGAAAGAGGAAGGAAGCGAGGCTTACCGATACAAAGG
AGGGTACTGGGAAGCCCGCGAGAGCGGATCATGGGAAGACTGTCCAGATATTTTCGGTCA
CATCGATTCCGAACAACAAACTGAGTAAACAACATAAGCTTCAGTTCGTTTTTCATCGAT
TCTTAAATCACAAAATCTAACCGACTATATTTTTTTTCATGGGCTTTTTTTTTTTTTCAT
TATTCATTTACTCACAAGTTTGCTTTAAAAGTGATTTTACTTATCATTTTTTTTTGTAAT
CTAGAATAAGTTCGATTAGTATACAAATTTGTTCAATCCTTGTAAATGGAGGAACATGCA
GTAAATCATATTTCGCTTTTATTTTTTTG

QA 1 569 1 569
DS 



AS 1 2

CO CL7876Contig1 942 2 4 U
GGAGCCCAAATATACACACTACCAATCGTGAACGTCTCTCTCCTCCACAAGCTCCACTAT
CGTAATCCATCAGTACTCTCGCCGCCGGTGAATCGCCGGCGTAATCAGCAAACTGAAAAA
TCGTTAGTCGGTCCGAGAAAGGGAATATATTGTTGTTTACTGATGCGTAGAAGCGGTTAG
TTTCTGAACGATAAGAATGTCTCTGAGGATAAAATTAGTGGTGGATAAGTTTGTGGAGGA
GCTAAAGCAAGCACTCGACGCCGACATACAAGATCGGATCATGAAGGAGAGGGAGATGCA
GAGCTACATCGAGGAGCGAGAGCGCGAAGTCGCTGAGCGAGAAGCCGCCTGGAAAGCCGA
GCTCTCTCGCCGCGAGACGGAGATTGCTAGACAGGAAGCGAGGTTGAAGATGGAGAGGGA
GAATCTGGAGAAGGAGAAGAGCGTTCTCATGGGGACCGCGTCGAACCAGGACAATCAAGA
CGGTGCTCTGGAGATTACTGTGAGTGGTGAGAAGTATCGCTGCCTTAGATTCTCCAAGGC
CAAGAAATGACTGCACTAATCAGTTCTAAAATGCTTCCTGCTTAGGGTTTGTTTGATTCA
TGTATCTTTGCTATAACTTTACTACTCTGAATCTAGGGCCTTTTCTAGTGGAAAGAACAC
AATATGAAGAACATTTAGATCTCAATGTTGGTTTGGGGAGCTTATGTTCTTGGAAGATGT
ATTCTTTTGTGGTCTTGTTAGATTTGCTGGACCGGCAGACAAATTTGGTCCGACATGGTA
TCTCTCTCAAGGAAATATATGTCTGCCTTCCTTTAGTTTTGCACATCCTATCTTTGCTAT
GAATCTAAACGTACTGGTCTGTCTATTCAAGGATTGGATGTTGATCGGTGACTACTTTAG
CCCCACTCTTTTTGCTTGTCAAGGTGTGTGTAGTAGTCATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C156TF U 1
AF RS1C156JQ C 190
BS 1 714 RS1C156TF
BS 715 715 RS1C156JQ
BS 716 752 RS1C156TF
BS 753 942 RS1C156JQ

RD RS1C156TF 762 0 0
GGAGCCCAAATATACACACTACCAATCGTGAACGTCTCTCTCCTCCACAAGCTCCACTAT
CGTAATCCATCAGTACTCTCGCCGCCGGTGAATCGCCGGCGTAATCAGCAAACTGAAAAA
TCGTTAGTCGGTCCGAGAAAGGGAATATATTGTTGTTTACTGATGCGTAGAAGCGGTTAG
TTTCTGAACGATAAGAATGTCTCTGAGGATAAAATTAGTGGTGGATAAGTTTGTGGAGGA
GCTAAAGCAAGCACTCGACGCCGACATACAAGATCGGATCATGAAGGAGAGGGAGATGCA
GAGCTACATCGAGGAGCGAGAGCGCGAAGTCGCTGAGCGAGAAGCCGCCTGGAAAGCCGA
GCTCTCTCGCCGCGAGACGGAGATTGCTAGACAGGAAGCGAGGTTGAAGATGGAGAGGGA
GAATCTGGAGAAGGAGAAGAGCGTTCTCATGGGGACCGCGTCGAACCAGGACAATCAAGA
CGGTGCTCTGGAGATTACTGTGAGTGGTGAGAAGTATCGCTGCCTTAGATTCTCCAAGGC
CAAGAAATGACTGCACTAATCAGTTCTAAAATGCTTCCTGCTTAGGGTTTGTTTGATTCA
TGTATCTTTGCTATAACTTTACTACTCTGAATCTAGGGCCTTTTCTAGTGGAAAGAACAC
AATATGAAGAACATTTAGATCTCAATGTTGGTTTGGGGAGCTTATGTTCTTGGA*GATGT
ATTCTTTTGTGGTCTTGTTAGATTTGCTGGAC
GGCAGAAAAA

QA 1 752 1 752
DS 

RD RS1C156JQ 753 0 0
GATAAGAATGTCTCTGAGGATAAA*TTAGTGGTGGATAAGTT*GTGGAGGAGCTAAAGCA
AGCACTCGACGCCGACATACAAGATCGGATCATGAAGGAGAGGGAGATGCAGAGCTACAT
CGAGGAGCGAGAGCGCGAAGTCGCTGAGCGAGAAGCCGCCTGGAAAGCCGAGCTCTCTCG
CCGCGAGACGGAGATTGCTAGACAGGAAGCGAGGTTGAAGATGGAGAGGGAGAATCTGGA
GAAGGAGAAGAGCGTTCTCATGGGGACCGCGTCGAACCAGGACAATCAAGACGGTGCTCT
GGAGATTACTGTGAGTGGTGAGAAGTATCGCTGCCTTAGATTCTCCAAGGCCAAGAAATG
ACTGCACTAATCAGTTCTAAAATGCTTCCTGCTTAGGGTTTGTTTGATTCATGTATCTTT
GCTATAACTTTACTACTCTGAATCTAGGGCCTTTTCTAGTGGAAAGAACACAATATGAAG
AACATTTAGATCTCAATGTTGGTTTGGGGAGCTTATGTTCTTGGAAGATGTATTCTTTTG
TGGTCTTGTTAGATTTGCTGGACCGGCAGACAAATTTGGTCCGACATGGTATCTCTCTCA
AGGAAATATATGTCTGCCTTCCTTTAGTTTTGCACATCCTATCTTTGCTATGAATCTAAA
CGTACTGGTCTGTCTATTCAAGGATTGGATGTTGATCGGTGACTACTTTAGCCCCACTCT
TTTTGCTTGTCAAGGTGTGTGTAGTAGTCATAT

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL7877Contig1 805 2 4 U
TTTTTGCGGATATAGCACTATCTAGGCATGAGCACTGGTCGGCGTTGGCTCCTCTTCCAT
TTGAGCTTGTCACCTCTGCAGCACAGAAGGCCAAGGATTTATCTTGGGATAAAGGTGGGA
ATGATCGGAGTAGAGCTGCTAGAGATTTGAGTGATCTAACTGGAGAAGGAAATATTGAAA
CTATGCTTTCAGTTGAGATGGGTTTGAGAGAGCTAGCATCATTGAAGGTTGAGAATGCTA
TCGCTCTTGCATTTGCCCAGCAGAGAAAACCAAGTTTGATACGTCAAACTGTTTCTGATC
CCAGAGGTCATGGAGAATCCAGATTTGTAGATGCATATGAATTGGGTGAGGCGGAACAAG
AAGATGTTGCGTTTAAGCAGGCATGGCTGATGTACTTCTGGGGCAGAGCCAAGCTACTGG
GTGTGGAAGAAGACATCGCAGAAGAACGTGTCCAGCTTTGGATCAGCCGTAGCAACGGGA
AATCGACTACTTCTCACGATTCCTTGGATGTGGAAAGAGGATTGATAGAGCTGAGGAAAC
TGGGAATAGAGCAACAGTTATGGGAAGCTTCCAGAAGAGAAATTGAACAGCTTTCATCTC
CTACTTCTTCTCCTTCCAATCACGATCTCGATGCTGATCCATAGTTCCTCTCTTTCGTAT
ATGAAATTTTCGGTTTGTATATTTATTCCTCTTCATGCAAGTTTCACGAAGAATCTGTGT
TCTTTATTTTCGCTTTTTCTCACACTTAGACTGTGTAAGCTTTGGTACTCTTGTATTCGC
AATTCAAGTTCAGCAAGCTTTGGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CB55TF U 1
AF RS1CB55JQ C 98
BS 1 616 RS1CB55TF
BS 617 617 RS1CB55JQ
BS 618 667 RS1CB55TF
BS 668 805 RS1CB55JQ

RD RS1CB55TF 667 0 0
TTTTTGCGGATATAGCACTATCTAGGCATGAGCACTGGTCGGCGTTGGCTCCTCTTCCAT
TTGAGCTTGTCACCTCTGCAGCACAGAAGGCCAAGGATTTATCTTGGGATAAAGGTGGGA
ATGATCGGAGTAGAGCTGCTAGAGATTTGAGTGATCTAACTGGAGAAGGAAATATTGAAA
CTATGCTTTCAGTTGAGATGGGTTTGAGAGAGCTAGCATCATTGAAGGTTGAGAATGCTA
TCGCTCTTGCATTTGCCCAGCAGAGAAAACCAAGTTTGATACGTCAAACTGTTTCTGATC
CCAGAGGTCATGGAGAATCCAGATTTGTAGATGCATATGAATTGGGTGAGGCGGAACAAG
AAGATGTTGCGTTTAAGCAGGCATGGCTGATGTACTTCTGGGGCAGAGCCAAGCTACTGG
GTGTGGAAGAAGACATCGCAGAAGAACGTGTCCAGCTTTGGATCAGCCGTAGCAACGGGA
AATCGACTACTTCTCACGATTCCTTGGATGTGGAAAGAGGATTGATAGAGCTGAGGAAAC
TGGGAATAGAGCAACAGTTATGGGAAGCTTCCAGAAGAGAAATTGAACAGCTTTCATCTC
CTACTTCTTCTCCTTC*AATCACGATCTCGATGCTGATCCATAGTTCCTCTCTTTCGTAT
ATGAAAT

QA 1 667 1 667
DS 

RD RS1CB55JQ 708 0 0
TTTT
TCTTGGGATAAAGGTGGGAATGATCGGAGTAGAGCTGCTAGAGATTTGAGTGATCTAACT
GGAGAAGGAAATATTGAAACTATGCTTTCAGTTGAGATGGGTTTGAGAGAGCTAGCATCA
TTGAAGGTTGAGAATGCTATCGCTCTTGCATTTGCCCAGCAGAGAAAACCAAGTTTGATA
CGTCAAACTGTTTTTGATCCCAGAGGTCATGGAGAATCCAGATTTGTAGATGCATATGAA
TTGGGTGAGGCGGAACAAGAAGATGTTGCGTTTAAGCAGGCATGGCTGATGTACTTTTGG
GGCAGAGCCAAGCTACTGGGTGTGGAAGAAGACATCGCAGAAGAACGTGTCCAGCTTTGG
ATCAGCCGTAGCAACGGGAAATCGACTACTTCTCACGATTCCTTGGATGTGGAAAGAGGA
TTGATAGAGCTGAGGAAACTGGGAATAGAGCAACAGTTATGGGAAGCTTCCAGAAGAGAA
ATTGAACAGCTTTCATTTCCTACTTTTTTTCCTTCCAATCACGATCTCGATGCTGATCCA
TAGTTCCTTTCTTTCGTATATGAAATTTTCGGTTTGTATATTTATTCCTCTTCATGCAAG
TTTCACGAAGAATCTGTGTTCTTTATTTTCGCTTTTTCTCACACTTAGACTGTGTAAGCT
TTGGTACTCTTGTATTCGCAATTCAAGTTCAGCAAGCTTTGGTT

QA 5 708 5 708
DS 



AS 1 2

CO CL7878Contig1 554 2 2 U
GTAAAATATCAATGGTAACCATAATCAAAGTTGGTGAAACTGTTTGAGAAAAGAGCATAA
AGCGAAGAAGAACAAAACAAGTTTGCATCAAAAACACAACAAAAAGCTGAAACAGAGTTT
CTAGTAGAACGAACTTAAACTTTGATAGCGTACTTTCTGATTGGGAAGTACATCTCCTTC
TTCTTCTCACGCTCTGTCTTCAAAGAGAGCTGATGTTTGGTGAGGCGTCTGAGGATAGCA
CGGGTCTTCTTAGGACGGAGATCAAGAGGGATGAACTTCTTGTTCTTGTATGCTTCTCTT
AGAGCAGATTTCTGCTTCTGTGAGGTCACGGTCAACACCTGAGCTATGGATTTCCGGACA
ACCTTAGTTTTAGAGAGCTTGTTGGGAGCACCACCGGTGACTTTAGCGACACGGAGGAGA
GCGAGCTCAGCCTTGAGATCCTGAAGCTGGTTCTGAAGATCGCTCTTCGACTTGTCCCTC
AGTTCGTGAACCTTAATCCTTGCCATCGTGATCTTCACTCGTGTTACGCCGCCGCTACTC
TTCTTTTAGCTCCC


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1D020TF C 1
AF RS1D020JQ U 3
BS 1 2 RS1D020TF
BS 3 554 RS1D020JQ

RD RS1D020TF 554 0 0
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AGCGAAGAAGAACAAAACAAGTTTGCATCAAAAACACAACAAAAAGCTGAAACAGAGTTT
CTAGTAGAACGAACTTAAACTTTGATAGCGTACTTTCTGATTGGGAAGTACATCTCCTTC
TTCTTCTCACGCTCTGTCTTCAAAGAGAGCTGATGTTTGGTGAGGCGTCTGAGGATAGCA
CGGGTCTTCTTAGGACGGAGATCAAGAGGGATGAACTTCTTGTTCTTGTATGCTTCTCTT
AGAGCAGATTTCTGCTTCTGTGAGGTCACGGTCAACACCTGAGCTATGGATTTCCGGACA
ACCTTAGTTTTAGAGAGCTTGTTGGGAGCACCACCGGTGACTTTAGCGACACGGAGGAGA
GCGAGCTCAGCCTTGAGATCCTGAAGCTGGTTCTGAAGATCGCTCTTCGACTTGTCCCTC
AGTTCGTGAACCTTAATCCTTGCCATCGTGATCTTCACTCGTGTTACGCCGCCGCTACTC
TTCTTTTAGCTCCC

QA 1 554 1 554
DS 

RD RS1D020JQ 552 0 0
AAAATATCAATGGTAACCATAATCAAAGTTGGTGAAACTGTTTGAGAAAAGAGCATAAAG
CGAAGAAGAACAAAACAAGTTTGCATCAAAAACACAACAAAAAGCTGAAACAGAGTTTCT
AGTAGAACGAACTTAAACTTTGATAGCGTACTTTCTGATTGGGAAGTACATCTCCTTCTT
CTTCTCACGCTCTGTCTTCAAAGAGAGCTGATGTTTGGTGAGGCGTCTGAGGATAGCACG
GGTCTTCTTAGGACGGAGATCAAGAGGGATGAACTTCTTGTTCTTGTATGCTTCTCTTAG
AGCAGATTTCTGCTTCTGTGAGGTCACGGTCAACACCTGAGCTATGGATTTCCGGACAAC
CTTAGTTTTAGAGAGCTTGTTGGGAGCACCACCGGTGACTTTAGCGACACGGAGGAGAGC
GAGCTCAGCCTTGAGATCCTGAAGCTGGTTCTGAAGATCGCTCTTCGACTTGTCCCTCAG
TTCGTGAACCTTAATCCTTGCCATCGTGATCTTCACTCGTGTTACGCCGCCGCTACTCTT
CTTTTAGCTCCC

QA 1 552 1 552
DS 



AS 1 2

CO CL7879Contig1 980 2 4 U
GTGTTCAAGAAATACGACAATGACTCTCAAGTACTACTTAAAGGGTCATGAAGCTCTGAT
TATTTGAGGTAAGTGGTAGTAACAAAGAGACTTTGATTATCTTCAATTTTTCCAATCCTA
TCTGTAGTTCTGTTAGGTAGCACCAAAGAAGTTTGTAACCCATTACAACAATAAATTTTT
ACCTGAGTTGTACTCGACCATAAATGGCTTGCAAGATCATCGTTAATTGAAACAGGAAGG
GCAGGCATCTCCTTCATACTGCAGCGGAAAGTAAGAGTTTAGTAATTGAATGCTTCAATC
ATAGAAAGGAAAAGAAGACAGATGACATGTCTCAATTGCAAGAACTGATATCTGATATAA
AAGTCCACATACTGAGTCAGAATGGCGCTGATGTTATTTCTTGTCTGATAAAAGAGACCG
ATGTTTTCATTCAACTGTATTCACAATACGTGTCTCAATTCCATTGCAAAAGAATAACAA
TTAAACCAAAAATATGGTACACAACTAGCCACAAGGATTGCAAAAAAAACAAAAAACAAA
AAAAACAAATTACCTTGCCCACAGAGAGATTGTAAGAAAATTTGACTAAAAGCTTGAGCA
TTTTACTGTAGAAGATCAAGTAAGGCATCACTTGAACCTGAGAACAAGAGTTCAACAAAG
GTAGCTCTCTGAAAATACTGATTTATTTATTTGTTTGCAAACAAGGAGAAGAACAAATAA
TTAAAAGAGCACTAAACCTTCACGAGGCATGTGTGTATTGTGACATATACTGTTCATGAC
ATATAAAGCGTTTTGTTGTGGCACATTGGCTAACATGCTCAGTTCTGGGGATGTATCCAC
CACCTTACCATGAAGAATCATGGTTTTTAGAATCATGTTCAAAAGCATATTGATTTCAAG
TAATCCAGTAAAAAGAAAAGCGCATGAAATGAAACCAACCAATATATAGATTTCTCCTTT
AATCAAAAATGTCATAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BU42TF U 1
AF RS1BU42JQ C 536
BS 1 579 RS1BU42TF
BS 580 580 RS1BU42JQ
BS 581 656 RS1BU42TF
BS 657 980 RS1BU42JQ

RD RS1BU42TF 656 0 0
GTGTTCAAGAAATACGACAATGACTCTCAAGTACTACTTAAAGGGTCATGAAGCTCTGAT
TATTTGAGGTAAGTGGTAGTAACAAAGAGACTTTGATTATCTTCAATTTTTCCAATCCTA
TCTGTAGTTCTGTTAGGTAGCACCAAAGAAGTTTGTAACCCATTACAACAATAAATTTTT
ACCTGAGTTGTACTCGACCATAAATGGCTTGCAAGATCATCGTTAATTGAAACAGGAAGG
GCAGGCATCTCCTTCATACTGCAGCGGAAAGTAAGAGTTTAGTAATTGAATGCTTCAATC
ATAGAAAGGAAAAGAAGACAGATGACATGTCTCAATTGCAAGAACTGATATCTGATATAA
AAGTCCACATACTGAGTCAGAATGGCGCTGATGTTATTTCTTGTCTGATAAAAGAGACCG
ATGTTTTCATTCAACTGTATTCACAATACGTGTCTCAATTCCATTGCAAAAGAATAACAA
TTAAACCAAAAATATGGTACACAACTAGCCACAAGGATTGCAAAAAAAACAAAAAACAAA
AAAAACAAATTACCTTGCCCACAGAGAGATTGTAAGAAA*TTTGACTAAAAGCTTGAGCA
TTTTACTGTAGAAGATCAAGTAAGGCATCACTTGAACCTGAGAACAAGAGTTCAAC

QA 1 656 1 656
DS 

RD RS1BU42JQ 445 0 0
ACAAAAAAAACAAATTACCTTGCCCACAGAGAGATTGTAAGAAAATTTGACTAAAAGCTT
GAGCATTTTACTGTAGAAGATCAAGTAAGGCATCACTTGAACCTGAGAACAAGAGTTCAA
CAAAGGTAGCTCTCTGAAAATACTGATTTATTTATTTGTTTGCAAACAAGGAGAAGAACA
AATAATTAAAAGAGCACTAAACCTTCACGAGGCATGTGTGTATTGTGACATATACTGTTC
ATGACATATAAAGCGTTTTGTTGTGGCACATTGGCTAACATGCTCAGTTCTGGGGATGTA
TCCACCACCTTACCATGAAGAATCATGGTTTTTAGAATCATGTTCAAAAGCATATTGATT
TCAAGTAATCCAGTAAAAAGAAAAGCGCATGAAATGAAACCAACCAATATATAGATTTCT
CCTTTAATCAAAAATGTCATAAAAA

QA 1 445 1 445
DS 



AS 1 2

CO CL7880Contig1 1355 2 2 U
GGGGTGCAACTCCTCGGCCAGTTTCTTCGCCTGGAAATCAATCTGATGTAGCAGTTATCA
GTGAAGGCTTAAATAACAGCACAACAATAGCTGCACAGACAACTGGATCAGAAATGGAAG
TAGTAGCAGTTATCAGTGAAGGCTTAAATAACAGCACAACAATGGCTGCACAGACAACTG
GATCAGAAATGGAAGTAGCAGAACCTGATGCCCCAGTAGAACAATCAACTTTTGCAAATA
ACGTTGCACCCCTTGTCCCTGAAGTTGTTGTGGAGCCTTCAGCAGTTGTAACAGCTCCTG
TTCAATCACATCTTAACAATGTTACGGGACGGAGTGCTACTCAAACTGTTCCTCAAATAC
CTTTCCCTGTGTTCAGTGACCCATTTCAGCATGAACTGGAGAAGTTGCGGAGAGAATCAG
AGAACACAAAGAAGAGTTATGAAGAAAAGAAATCAGTTTTAAAAGCTGAATTTGACAGGA
AAATGACTGAACTACAAGCAGAGTATCAAAGGAACTTACATGAGGTACAAGCTGAGCATA
CAGCCAAAGCGACAAAGTTACAGACGAGCATGAACTTTATTATAATGAACAAGCTGTTGA
CGAATGCCTTCTTGTCTAAATGTACGAGCAGAATGGAATCTCATCCCTCGGCAGCTCCAA
AGGGGTAGAATTCAGCAGCTAGCACAGAGAGCAGCACAAATGAGCGCACTGAGAAATTAT
TATACAGCTTCGGCTCCTGCTCCTATGCAGCCTCCTCGGGCATCTTCTTTTCCATCTTCA
GTTTCTCGCTCATCATACCTTCCTCCGAGTACCACCCACTGCCCAATGCCTCAGCCAAGA
CAGCCTCTCATCTCCAACCCAGCTCCATCTTTTTCAGCTTCTCCTGCAAGTGCAACTAAC
GTAGCTGCCAATGGAAGACTAGTTTCTCCTGCACCGCAGATAAACCCATATAGATCGTCA
TCCTCTTCATTTCCCATCCCTAGAACTACCCAAACCTCGTCAGCTGCTCCTCAAGCTTTA
ACATATTCCTCTTCAGTTCCCATCCCCTCGACAACTACTCCAACCTCATCAGCTGTTCCT
CAAGCTTTAACATATTCCTCTTCAGTTCCCATACCCTTGACCTTGTCAACTACTCCAACC
TCGTCCGCTGTTCCTCAAGCTTTAACATATTCAAGTGCGTTAACTCAGCTGCAAGAGCAT
CAACAGCAACAGAACTTGGGAAGTGGATCGCAGAGGAGTGGTGATGTGGTTTGTCTCTCT
GATGATGAGTGATGTTTAGCGTATAATAATGATTGATTTAGAGTTTGTATAACCTAATAC
TGTAGGATTCAATAATGAGTTAGTGAGTTTAAAAG


BQ
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BS 1 853 RS1A823TF
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GATCAGAAATGGAAGTAGCAGAACCTGATGCCCCAGTAGAACAATCAACTTTTGCAAATA
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TTCAATCACATCTTAACAATGTTACGGGACGGAGTGCTACTCAAACTGTTCCTCAAATAC
CTTTCCCTGTGTTCAGTGACCCATTTCAGCATGAACTGGAGAAGTTGCGGAGAGAATCAG
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CGAATGCCTTCTTGTCTAAATGTACGAGCAGAATGGAATCTCATCCCTCGGCAGCTCCAA
AGGGGTAGAATTCAGCAGCTAGCACAGAGAGCAGCACAAATGAGCGCACTGAGAAATTAT
TATACAGCTTCGGCTCCTGCTCCTATGCAGCCTCCTCGGGCATCTTCTTTTCCATCTTCA
GTTTCTCGCTCATCATACCTTCCTCCGAGTACCACCCACTGCCCAATGCCTCAGCCAAGA
CAGCCTCTCATCT

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DS 

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TATGCAGCCTCCTCGGGCATCTTCTTTTCCATCTTCAGTTTCTCGCTCATCATACCTTCC
TCCGAGTACCACCCACTGCCCAATGCCTCAGCCAAGACAGCCTCTCATCTCCAACCCAGC
TCCATCTTTTTCAGCTTCTCCTGCAAGTGCAACTAACGTAGCTGCCAATGGAAGACTAGT
TTCTCCTGCACCGCAGATAAACCCATATAGATCGTCATCCTCTTCATTTCCCATCCCTAG
AACTACCCAAACCTCGTCAGCTGCTCCTCAAGCTTTAACATATTCCTCTTCAGTTCCCAT
CCCCTCGACAACTACTCCAACCTCATCAGCTGTTCCTCAAGCTTTAACATATTCCTCTTC
AGTTCCCATACCCTTGACCTTGTCAACTACTCCAACCTCGTCCGCTGTTCCTCAAGCTTT
AACATATTCAAGTGCGTTAACTCAGCTGCAAGAGCATCAACAGCAACAGAACTTGGGAAG
TGGATCGCAGAGGAGTGGTGATGTGGTTTGTCTCTCTGATGATGAGTGATGTTTAGCGTA
TAATAATGATTGATTTAGAGTTTGTATAACCTAATACTGTAGGATTCAATAATGAGTTAG
TGAGTTTAAAAG

QA 1 792 1 792
DS 



AS 1 2

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TCTGTCTCGCCTCGCCGAGAGCAAAGTCGGCAACTTGCAATTCAAACCTTTCTCCAACCA
CAACCACCGTTAGCTCGCGCACAGAGCTGGCCGCATTTCGTCCTCAGTTCCGTTTATTCT
CTCGCGTTTCTCCTTCCCGCCGCCGTCTCTACGCTTCGAGCCCCGCCGATTCGGGAATCT
TCCTCCCTCACCTCGTCGCTTCTATGGAGCAAGTTGAGGAGACTTACATTATGGTCAAAC
CAGACGGCATCCAACGAGGCCTTGTAGGAGAAATCATCTCTCGTTTTGAGAAGAAGGGTT
TTAAACTGATTGGACTTAAGATGTTCCAATGTCCAAAAGATTTGGCCGAGGAACATTATA
AGGATCTTAGTGCTAAGTCATTCTTTCCTAGCCTGATTGAGTACATCACTTCTGGCCCTG
TTGTGTGTATGGCTTGGAAGGTGTTGGTGTGGTTGCTTCAGCCAGGAAGCTGATTGGGAA
AACAGACCCCCTTCAAGCTGAACCTGGTACCATAAGAGGAGATCTTGCTGTACAAACTGG
AAGGAACATTGTGCATGGTAGTGATAGTCCTGAAAACGGAAAGCGTGAGATTGCTTTGTG
GTTCAAAGAAGGCGAGCTGTGCAAGTGGGATTCAGCTCTAGCTACATGGCTGAGGGAGTG
ATCCTCCAGAAGACAGATCCAATACTTTTTTTCTTGCTACTGAGTGCGAACGGCTTGGTC
CTTTGTTTTTTCTTTTTTAATTTTGGCGGCATTGTCAGTGCCATTTATGGCGTATACTTG
AACTTCTTGATCATTCTCGTATTTGTGATATCATGTAACGAAATGAGTTAATAGATTCAC
CCACATTTGGTTTAAATCATATTTTCTCTACACAGAGC


BQ
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AF RS1BP19JQ C 114
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TCTGTCTCGCCTCGCCGAGAGCAAAGTCGGCAACTTGCAATTCAAACCTTTCTCCAACCA
CAACCACCGTTAGCTCGCGCACAGAGCTGGCCGCATTTCGTCCTCAGTTCCGTTTATTCT
CTCGCGTTTCTCCTTCCCGCCGCCGTCTCTACGCTTCGAGCCCCGCCGATTCGGGAATCT
TCCTCCCTCACCTCGTCGCTTCTATGGAGCAAGTTGAGGAGACTTACATTATGGTCAAAC
CAGACGGCATCCAACGAGGCCTTGTAGGAGAAATCATCTCTCGTTTTGAGAAGAAGGGTT
TTAAACTGATTGGACTTAAGATGTTCCAATGTCCAAAAGATTTGGCCGAGGAACATTATA
AGGATCTTAGTGCTAAGTCATTCTTTCCTAGCCTGATTGAGTACATCACTTCTGGCCCTG
TTGTGTGTATGGCTTGGAAGGTGTTGGTGTGGTTGCTTCAGCCAGGAAGCTGATTGGGAA
AACAGACCCCCTTCAAGCTGAACCTGGTACCATAAGAGGAGATCTTGCTGTACAAACTGG
AAGGAACATTGTGCATGGTAGTGATAGTCCTGAAAACGGAAAGCGTGAGATTGCTTTGTG
GTTCA

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1BP19JQ 825 0 0
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TTATTCTCTCGCGTTTCTCCTTCCCGCCGCCGTCTCTACGCTTCGAGCCCCGCCGATTCG
GGAATCTTCCTCCCTCACCTCGTCGCTTCTATGGAGCAAGTTGAGGAGACTTACATTATG
GTCAAACCAGACGGCATCCAACGAGGCCTTGTAGGAGAAATCATCTCTCGTTTTGAGAAG
AAGGGTTTTAAACTGATTGGACTTAAGATGTTCCAATGTCCAAAAGATTTGGCCGAGGAA
CATTATAAGGATCTTAGTGCTAAGTCATTCTTTCCTAGCCTGATTGAGTACATCACTTCT
GGCCCTGTTGTGTGTATGGCTTGGAAGGTGTTGGTGTGGTTGCTTCAGCCAGGAAGCTGA
TTGGGAAAACAGACCCCCTTCAAGCTGAACCTGGTACCATAAGAGGAGATCTTGCTGTAC
AAACTGGAAGGAACATTGTGCATGGTAGTGATAGTCCTGAAAACGGAAAGCGTGAGATTG
CTTTGTGGTTCAAAGAAGGCGAGCTGTGCAAGTGGGATTCAGCTCTAGCTACATGGCTGA
GGGAGTGATCCTCCAGAAGACAGATCCAATACTTTTTTTCTTGCTACTGAGTGCGAACGG
CTTGGTCCTTTGTTTTTTCTTTTTTAATTTTGGCGGCATTGTCAGTGCCATTTATGGCGT
ATACTTGAACTTCTTGATCATTCTCGTATTTGTGATATCATGTAACGAAATGAGTTAATA
GATTCACCCACATTTGGTTTAAATCATATTTTCTCTACACAGAGC

QA 1 825 1 825
DS 



AS 1 2

CO CL7882Contig1 676 2 1 U
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ATCTGAAATTCCTAAGCTCTTATACAGTTTTTCTTGAGCCATGACTGCGCAGAAATCAGT
GTTGCAACTGAGTGTTCACGAAGAAAGGATCAGGAAGAAAGCATGGAAGACCGTTTCTAG
GTTTTCAGGAGTTACTTCGATAGAAATGGATGACAAAACCGGAAAAATGACGGTGGTGGG
AGAAGTTGATGTACCAAGACTCGTAAAGAAGCTAAGGAAGATATGTACCGCAGATATTGT
TTCGGTAGAAATTGTTAAACCACCTGAGAAAAAGGAAGAGAAAAAGGAACCGGAGAAACC
GAAACAACCAGAGGTTATTGTCAACCCGATTACCTATTGGAACAACCAGTACCAGTACCA
TCCTGCTTCATATGCAAGTACTTACTATCCACCATGCAGGTATTCTAGAGTTGTGGTGGA
GGAACCAAGGCCTTGTGTGATTTTGTAATTTTTCCTAAATTATCTCAGATAATGTTAGTT
ATGTTTGCACTTAAATTTTGATGGAAGAGTGTATGTTTTGGATATTGTCATCTACATTTC
CCTTATTCGATAAAAACAGTCACTTTATGTATGACGAGATTGATCTTAGATACGCTTTAT
AAACTTTTTTACTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AY75TF U 1
AF RS1AY75JQ C 93
BS 1 676 RS1AY75TF

RD RS1AY75TF 676 0 0
GGATCCAGAAGCTTCAACGTCTAAAATCATCTCTCCTCTCTGACTCTCTCTTTAAAATAT
ATCTGAAATTCCTAAGCTCTTATACAGTTTTTCTTGAGCCATGACTGCGCAGAAATCAGT
GTTGCAACTGAGTGTTCACGAAGAAAGGATCAGGAAGAAAGCATGGAAGACCGTTTCTAG
GTTTTCAGGAGTTACTTCGATAGAAATGGATGACAAAACCGGAAAAATGACGGTGGTGGG
AGAAGTTGATGTACCAAGACTCGTAAAGAAGCTAAGGAAGATATGTACCGCAGATATTGT
TTCGGTAGAAATTGTTAAACCACCTGAGAAAAAGGAAGAGAAAAAGGAACCGGAGAAACC
GAAACAACCAGAGGTTATTGTCAACCCGATTACCTATTGGAACAACCAGTACCAGTACCA
TCCTGCTTCATATGCAAGTACTTACTATCCACCATGCAGGTATTCTAGAGTTGTGGTGGA
GGAACCAAGGCCTTGTGTGATTTTGTAATTTTTCCTAAATTATCTCAGATAATGTTAGTT
ATGTTTGCACTTAAATTTTGATGGAAGAGTGTATGTTTTGGATATTGTCATCTACATTTC
CCTTATTCGATAAAAACAGTCACTTTATGTATGACGAGATTGATCTTAGATACGCTTTAT
AAACTTTTTTACTTTT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1AY75JQ 584 0 0
CTTGAGCCATGACTGCGCAGAAATCAGTGTTGCAACTGAGTGTTCACGAAGAAAGGATCA
GGAAGAAAGCATGGAAGACCGTTTTTAGGTTTTCAGGAGTTACTTCGATAGAAATGGATG
ACAAAACCGGAAAAATGACGGTGGTGGGAGAAGTTGATGTACCAAGACTTGTAAAGAAGC
TAAGGAAGATATGTACCGCAGATATTGTTTCGGTAGAAATTGTTAAACCCCCTGAGAAAA
AGGAAGAGAAAAAGGAACCGGAGAAACCGAAACAACCAGAGGTTATTGTCAACCCGATTA
CCTATTGGAACAACCAGTACCAGTACCATCCTGCTTCATATGCAAGTACTTACTATCCCC
CATGCAGGTATTTTAGAGTTGTGGTGGAGGAACCAAGGCCTTGTGTGATTTTGTAATTTT
TCCTAAATTATTTCAGATAATGTTAGTTATGTTTGCACTTAAATTTTGATGGAAGAGTGT
ATGTTTTGGATATTGTCATTTACATTTCCCTTATTCGATAAAAACAGTCACTTTATGTAT
GACGAGATTGATTTTAGATACGCTTTATAAACTTTTTTACTTTT

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 2

CO CL7883Contig1 976 2 4 U
GGACACTTCTCACTCTCTCTATCTCTCTCTATCTCAAAGTCCACTTGCTTTGTCTGTCCA
CTTCATAAACTACTAGGTCCGTTTCCACATAGTTGTACGATCGATCAAGGTAGTAGCGGA
AACAGCGGAGGCTACGATGGTTTTCACGACGGAGGGACCTCGCATTTCCTTCTCCGCCGA
TCTGTCGTCCTCAGACAGCGAGGGAAACTACATCTGCATCAACCCGGACAATCTGCTTCC
ACAAGACAGAAGCTCGGTGAAAGTCACCGGAGACTTTGAGTTTCTGTCGAACACCCAAAC
GATGCTCACCGCCGCAGACGAGCTGTTCTCCGAAGGGAAGCTGCTTCCCTTCTGGCAGGT
CAAACACTCGGAGAAGCTTCAAAACGTTACACTGAAAACAAAAGTCGTCGACGTGGAAGA
AGAATTAGAAGAAGATCGTAAAGTGGTTAAAGAAGAGACTGTTCACAACAATAACAACAC
CAAGGAGCAGGATAGTAACAGCAATAACAGAGGAAGCTGGTTTCTTGACGATGATCCTTC
TCCTCGTCCACCAAACTGCACTGTTCTTTGGAAGGAGCTTTTGTGGCTGAAGAAACAGAG
GACCACTAAGACTACAACGACGGTTTCTTCGACGAAGGCATCGACTCTCTCGCCTTCTTC
ATCTTCGAGCTCGACTTCGTCTTCTTCGAGCTCTATCGGGGATGCGGTGAAGGAGGAGAG
CGAGAAGAAAGGGAAGAAAGGGTTAGAGAGGACGAGATCTGTGACTATGAGGATAAGACC
CATGATTCATGTTCCTGTTTGTACCCCCTCTAAGCCTCCTCTCTTTCCTCTAAGGCTTCA
GAGAAACAGAGCAGAGAAACGAACTTGATGAATGGTTGTGATGAACATTGTTTTTTTTTA
ATCTATTTGTCTTTGTATTATCAACCTTTCTTTTTGGTTAGGTTTTGTGATTAGATCAAT
GGATTGTGTGTTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F094TF U 1
AF RS1F094JQ C 173
BS 1 712 RS1F094TF
BS 713 713 RS1F094JQ
BS 714 732 RS1F094TF
BS 733 976 RS1F094JQ

RD RS1F094TF 736 0 0
GGACACTTCTCACTCTCTCTATCTCTCTCTATCTCAAAGTCCACTTGCTTTGTCTGTCCA
CTTCATAAACTACTAGGTCCGTTTCCACATAGTTGTACGATCGATCAAGGTAGTAGCGGA
AACAGCGGAGGCTACGATGGTTTTCACGACGGAGGGACCTCGCATTTCCTTCTCCGCCGA
TCTGTCGTCCTCAGACAGCGAGGGAAACTACATCTGCATCAACCCGGACAATCTGCTTCC
ACAAGACAGAAGCTCGGTGAAAGTCACCGGAGACTTTGAGTTTCTGTCGAACACCCAAAC
GATGCTCACCGCCGCAGACGAGCTGTTCTCCGAAGGGAAGCTGCTTCCCTTCTGGCAGGT
CAAACACTCGGAGAAGCTTCAAAACGTTACACTGAAAACAAAAGTCGTCGACGTGGAAGA
AGAATTAGAAGAAGATCGTAAAGTGGTTAAAGAAGAGACTGTTCACAACAATAACAACAC
CAAGGAGCAGGATAGTAACAGCAATAACAGAGGAAGCTGGTTTCTTGACGATGATCCTTC
TCCTCGTCCACCAAACTGCACTGTTCTTTGGAAGGAGCTTTTGTGGCTGAAGAAACAGAG
GACCACTAAGACTACAACGACGGTTTCTTCGACGAAGGCATCGACTCTCTCGCCTTCTTC
ATCTTCGAGCTCGACTTCGTCTTCTTCGAGCTCTATCGGGGATGCGGTGAAG*AGGAGAG
CGAGAAGAAAGG
AAGA

QA 1 732 1 732
DS 

RD RS1F094JQ 804 0 0
TCCGCCGATCTGTCGTCCTCAGACAGCGAGGGAAACTACATCTGCATCAACCCGGACAAT
CTGCTTCCACAAGACAGAAGCTCGGTGAAAGTCACCGGAGACTTTGAGTTTCTGTCGAAC
ACCCAAACGATGCTCACCGCCGCAGACGAGCTGTTCTCCGAAGGGAAGCTGCTTCCCTTC
TGGCAGGTCAAACACTCGGAGAAGCTTCAAAACGTTACACTGAAAACAAAAGTCGTCGAC
GTGGAAGAAGAATTAGAAGAAGATCGTAAAGTGGTTAAAGAAGAGACTGTTCACAACAAT
AACAACACCAAGGAGCAGGATAGTAACAGCAATAACAGAGGAAGCTGGTTTCTTGACGAT
GATCCTTCTCCTCGTCCACCAAACTGCACTGTTCTTTGGAAGGAGCTTTTGTGGCTGAAG
AAACAGAGGACCACTAAGACTACAACGACGGTTTTTTCGACGAAGGCATCGACTCTCTCG
CCTTCTTCATCTTCGAGCTCGACTTCGTCTTCTTCGAGCTCTATCGGGGATGCGGTGAAG
GAGGAGAGCGAGAAGAAAGGGAAGAAAGGGTTAGAGAGGACGAGATCTGTGACTATGAGG
ATAAGACCCATGATTCATGTTCCTGTTTGTACCCCCTCTAAGCCTCCTCTCTTTCCTCTA
AGGCTTCAGAGAAACAGAGCAGAGAAACGAACTTGATGAATGGTTGTGATGAACATTGTT
TTTTTTTAATCTATTTGTCTTTGTATTATCAACCTTTCTTTTTGGTTAGGTTTTGTGATT
AGATCAATGGATTGTGTGTTTTCT

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 2

CO CL7884Contig1 378 2 1 U
CATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGACGCTTACAGTTACATCGTCATCG
TCCCCTACTTCTGTTTCTACTTCAGGAGTTGGGAAGATCGGAATAGAAAGGAGGTCGTTG
ATGGTAAACGTCCAAGATTATGATGGCCCGTCTGCAAATCCAAAACACAATCCCGGCACT
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TCTCAGTTTTACATGTTCAGTTTGTGTGAGATGAAATGAAATGAAATTCTCTGTTTCTAC
ACTTTTCTCCAACATGTATATTGATATTAATGTGTCACAATTTCTTCTTATAAATAAAGT
TTCTTGAAGAGGGGTATC


BQ
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15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A082TV U 1
AF RS1A082TF U 42
BS 1 378 RS1A082TV

RD RS1A082TV 378 0 0
CATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGACGCTTACAGTTACATCGTCATCG
TCCCCTACTTCTGTTTCTACTTCAGGAGTTGGGAAGATCGGAATAGAAAGGAGGTCGTTG
ATGGTAAACGTCCAAGATTATGATGGCCCGTCTGCAAATCCAAAACACAATCCCGGCACT
CCTCCAGTTACTACCAGCCCCACCAGAGGCTGACACCCACAAGGGAAGAAGAAATTAATC
TCTCAGTTTTACATGTTCAGTTTGTGTGAGATGAAATGAAATGAAATTCTCTGTTTCTAC
ACTTTTCTCCAACATGTATATTGATATTAATGTGTCACAATTTCTTCTTATAAATAAAGT
TTCTTGAAGAGGGGTATC

QA 1 378 1 378
DS 

RD RS1A082TF 337 0 0
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AATAGAAAGGAGGTCGTTGATGGTAAACGTCCAAGATTATGATGGCCCGTCTGCAAATCC
AAAACACAATCCCGGCACTCCTCCAGTTACTACCAGCCCCACCAGAGGCTGACACCCACA
AGGGAAGAAGAAATTAATCTCTCAGTTTTACATGTTCAGTTTGTGTGAGATGAAATGAAA
TGAAATTCTCTGTTTCTACACTTTTCTCCAACATGTATATTGATATTAATGTGTCACAAT
TTCTTCTTATAAATAAAGTTTCTTGAAGAGGGGTATC

QA 1 337 1 337
DS 



AS 1 2

CO CL7885Contig1 965 2 4 U
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CCCAATAAGCCATGGTCCCTCGCAGATTTCGAGATCGGGAGACCCTTAGGCAAAGGCAAA
TTCGGCAGAGTCTATCTCGCTCGCGAAGCCAAGAGTCACTTCGTGGTGGCGTTGAAAGTG
ATATTCAAGGAACAGATCGAGAAATACAAACTCCACCACCAGCTACGGAGAGAGATGGAG
ATCCAAACGAACCTAAGGCACCCCAACATCCTCCGTCTCTACGGTTGGTTCGACGACGAC
GAGAGGATCTTCCTGATCCTCGAGTACGCTCACGGTGGTGAGCTCTACGGTCTCCTCAAA
GAGAACGGTCATCTCACCGAGCAACAAGCCGCCACTTACATTTCGAGTCTTAGTCAAGCG
CTGGCTTATTGTCATGGGAAGTGTGTGATTCACAGAGATATTAAACCTGAAAACCTATTG
CTCGATCATGAGGGAAGGTTGAAAATTGCTGATTTTGGGTGGTCAGTGCAGTCGAGTAAC
AAGAGGAAGACAATGTGTGGGACTTTGGATTACTTAGCTCCTGAGATGGTTGAGAACAAA
GATCACGATCATGCTGTTGATAACTGGACTTTAGGGATTCTGTGTTACGAGTTTCTCTAT
GGTAACCCTCCTTTTGAGGCTGAGAGTCAGAAAGATACATTCAAGAGAATTGTTAAGATC
GATTTGAGTTTTCCTGCTACGCCAAATGTCTCAGCAGAAGCTAAGAATCTAATCAGTCAG
CTTCTTGTTAAGGATCCTTCCAAAAGACTCTCTCTTACGAAAATCATGCAACACCCTTGG
ATCGTCAAGAACGCAGATCCTAAAGGTGTGTGCCTCATTTGATGCTTAGAAGTGGCTTAT
TTACATGTAATCTAACGTTGTGGGAAGAAAGTCTTAGAAGTTCAGAGAACGCATGTATGT
TGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 

AF RS1DQ68TF U 1
AF RS1DQ68JQ C 381
BS 1 678 RS1DQ68TF
BS 679 679 RS1DQ68JQ
BS 680 763 RS1DQ68TF
BS 764 965 RS1DQ68JQ

RD RS1DQ68TF 763 0 0
GGAGCCACGGTGATCGGAGAAATGGATAAGAAACCGGAAGAAGATCCTTACGTTCGCGAC
CCCAATAAGCCATGGTCCCTCGCAGATTTCGAGATCGGGAGACCCTTAGGCAAAGGCAAA
TTCGGCAGAGTCTATCTCGCTCGCGAAGCCAAGAGTCACTTCGTGGTGGCGTTGAAAGTG
ATATTCAAGGAACAGATCGAGAAATACAAACTCCACCACCAGCTACGGAGAGAGATGGAG
ATCCAAACGAACCTAAGGCACCCCAACATCCTCCGTCTCTACGGTTGGTTCGACGACGAC
GAGAGGATCTTCCTGATCCTCGAGTACGCTCACGGTGGTGAGCTCTACGGTCTCCTCAAA
GAGAACGGTCATCTCACCGAGCAACAAGCCGCCACTTACATTTCGAGTCTTAGTCAAGCG
CTGGCTTATTGTCATGGGAAGTGTGTGATTCACAGAGATATTAAACCTGAAAACCTATTG
CTCGATCATGAGGGAAGGTTGAAAATTGCTGATTTTGGGTGGTCAGTGCAGTCGAGTAAC
AAGAGGAAGACAATGTGTGGGACTTTGGATTACTTAGCTCCTGAGATGGTTGAGAACAAA
GATCACGATCATGCTGTTGATAACTGGACTTTAGGGATTCTGTGTTACGAGTTTCTCTAT
GGTAACCCTCCTTTTGAG*CTGAGAGTCAGAAAGATACATTCAAGAGAATTGTTAAGATC
GATTTGAGTTTTCCTGCTACGCCAAATGTCTCAGCAGAAGCTA

QA 1 763 1 763
DS 

RD RS1DQ68JQ 585 0 0
GCAACAAGCCGCCACTTACATTTCGAGTCTTAGTCAAGCGCTGGCTTATTGTCATGGGAA
GTGTGTGATTCACAGAGATATTAAACCTGAAAACCTATTGCTCGATCATGAGGGAAGGTT
GAAAATTGCTGATTTTGGGTGGTCAGTGCAGTCGAGTAACAAGAGGAAGACAATGTGTGG
GACTTTGGATTACTTAGCTCCTGAGATGGTTGAGAACAAAGATCACGATCATGCTGTTGA
TAACTGGACTTTAGGGATTCTGTGTTACGAGTTTCTCTATGGTAACCCTCCTTTTGAGGC
TGAGAGTCAGAAAGATACATTCAAGAGAATTGTTAAGATCGATTTGAGTTTTCCTGCTAC
GCCAAATGTCTCAGCAGAAGCTAAGAATCTAATCAGTCAGCTTCTTGTTAAGGATCCTTC
CAAAAGACTCTCTCTTACGAAAATCATGCAACACCCTTGGATCGTCAAGAACGCAGATCC
TAAAGGTGTGTGCCTCATTTGATGCTTAGAAGTGGCTTATTTACATGTAATCTAACGTTG
TGGGAAGAAAGTCTTAGAAGTTCAGAGAACGCATGTATGTTGTCT

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 2

CO CL7886Contig1 571 2 2 U
GTTAGCCAAGATTTTGACCGGATACGAAATCACTGGTGCTCGATCTAGTGATATTTTTAT
GGGGATTCTATTTATCGCTGTAGGATTCCTATTCAAGATCACTGCAGTTCCTTTTCGGGC
GGCTGTAGGACGGACGGCCGCCTATAGGTGGTAGGGTAGGGTGGGTGGTACCGCTCAGAT
TGCGGCCAATCTTCCTAACCGCGCGCGGGCCGGGCTTAGAGCGAGTGAAACTCATCACTA
CCTCGTAAGGGCATTGAGACCATAGCATGTTACACGAGGAAAAAAAACCTTGTAGTGTTG
TCATACAGCTGCCCGCCTAGAAGAGCCACTCGCTCTGTAGTGTTGTCACACAAGATAAGC
ACGCCGCCCGCCTGCTGGCCGGGCGAATCGAAGTTCTCTTCCGGTCAACTGTCCACCCAG
TCAAGTGCAAAAAACACAGTAGAATCACGCAACGCACGCTGCTGGTGTGCTTCCTGCCCG
CGAGGAAAGAAAGAAGAGCGACAAGGTTGAGTTCTGATTTGACTGTTTGCAGCATGGGAG
CAGATTACCCAAAAAATCCCTGGGAACAATG


BQ
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AF RS1GB76JQ C 1
AF RS1GB76TF U 1
BS 1 556 RS1GB76TF
BS 557 571 RS1GB76JQ

RD RS1GB76JQ 571 0 0
GTTAGCCAAGATTTTGACCGGATACGAAATCACTGGTGCTCGATCTAGTGATATTTTTAT
GGGGATTCTATTTATCGCTGTAGGATTCCTATTCAAGATCACTGCAGTTCCTTTTCGGGC
GGCTGTAGGACGGACGGCCGCCTATAGGTGGTAGGGTAGGGTGGGTGGTACCGCTCAGAT
TGCGGCCAATCTTCCTAACCGCGCGCGGGCCGGGCTTAGAGCGAGTGAAACTCATCACTA
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DS 

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TGCGGCCAATCTTCCTAACCGCGCGCGGGCCGGGCTTAGAGCGAGTGAAACTCATCACTA
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ACGCCGCCCGCCTGCTGGCCGGGCGAATCGAAGTTCTCTTCCGGTCAACTGTCCACCCAG
TCAAGTGCAAAAAACACAGTAGAATCACGCAACGCACGCTGCTGGTGTGCTTCCTGCCCG
CGAGGAAAGAAAGAAGAGCGACAAGGTTGAGTTCTGATTTGACTGTTTGCAGCATGGGAG
CAGATTACCCAAAAAA

QA 1 556 1 556
DS 



AS 1 2

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TTATCTGTTCTCC


BQ
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AF RS1AV52JQ C 1
AF RS1AV52TF U 1
BS 1 553 RS1AV52TF

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TTATCTGTTCTCC

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DS 

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TTATCTGTTCTCC

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 2

CO CL7888Contig1 1064 2 4 U
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BQ
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AF RS1DT33TF U 1
AF RS1DT33JQ C 402
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RD RS1DT33TF 696 0 0
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DS 

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ATATGGTTTTGGGCTTTACACAGTTTCACTTTGGTGTAAAAGAACAACAGTTAAATACTC
CTT

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

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AGCCGTTTACACAGCCGCTATTTTGGAGTACTTGACCGCAGAGGTCTTGGAGCTCGCTGG
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ATCAACTCTGTCTCTTTTGGACCTCCTTTTTGTTAAATAGTGGTCTATGTTTTAAGATAC
TAGTGGAGATTGTCTGTTTGTTTGTTTGTTTAAGACTCACGTGTGACTTGTTTCTCTCGT
TTCTGATTAGTGTTTTGGTGTTTGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GX75TF U 1
AF RS1GX75JQ C 78
BS 1 630 RS1GX75TF
BS 631 687 RS1GX75JQ

RD RS1GX75TF 630 0 0
GGCTACTTCTCTTTTAATTTTATCCGGTCCGGATCTCTCTCTCTCTCTCCGACACAGACA
CACACTCTCTCTATATCTCTTCGTGTAAGACACTGGTGTGACTGTTTTAAAGGCGGGGAA
AATGTCAGGAAAAGGAGCGAAAGGGCCGATAATGGGGAAATCAAGCGGTAACGACAAGGA
CAAAGACAAGAAGAAGCCCACTACTCGCTCTTCTCGTGCTGGTCTTCAGTTTCCAGTTGG
GAGAGTCCACAGACTGCTGAAAGGAAGGTCAACCGCTCACGGACGCGTCGGCGCAACCGC
AGCCGTTTACACAGCCGCTATTTTGGAGTACTTGACCGCAGAGGTCTTGGAGCTCGCTGG
TAACGCGAGCAAGGATCTGAAAGTGAAGCGTATCACACCGAGGCATCTGCAGCTCGCTAT
CCGCGGTGACGAAGAGCTCGATACTCTCATCAAAGGAACTATCGCTGGTGGTGGTGTCAT
TCCTCACATTCACAAGTCCCTCATCAACAAATCTGGCCAAGAATAGCTCCTCTCTACCTC
ATCAACTCTGTCTCTTTTGGACCTCCTTTTTGTTAAATAGTGGTCTATGTTTTAAGATAC
TAGTGGAGATTGTCTGTTTGTTTGTTTGTT

QA 1 630 1 630
DS 

RD RS1GX75JQ 610 0 0
TCTTCGTGTAAGACACTGGTGTGACTGTTTTAAAGGCGGGGAAAATGTCAGGAAAAGGAG
CGAAAGGGCCGATAATGGGGAAATCAAGCGGTAACGACAAGGACAAAGACAAGAAGAAGC
CCACTACTCGCTCTTCTCGTGCTGGTCTTCAGTTTCCAGTTGGGAGAGTCCACAGACTGC
TGAAAGGAAGGTCAACCGCTCACGGACGCGTCGGCGCAACCGCAGCCGTTTACACAGCCG
CTATTTTGGAGTACTTGACCGCAGAGGTCTTGGAGCTCGCTGGTAACGCGAGCAAGGATC
TGAAAGTGAAGCGTATCACACCGAGGCATCTGCAGCTCGCTATCCGCGGTGACGAAGAGC
TCGATACTCTCATCAAAGGAACTATCGCTGGTGGTGGTGTCATTCCTCACATTCACAAGT
CCCTCATCAACAAATCTGGCCAAGAATAGCTCCTCTCTACCTCATCAACTCTGTCTCTTT
TGGACCTCCTTTTTGTTAAATAGTGGTCTATGTTTTAAGATACTAGTGGAGATTGTCTGT
TTGTTTGTTTGTTTAAGACTCACGTGTGACTTGTTTCTCTCGTTTCTGATTAGTGTTTTG
GTGTTTGATC

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 2

CO CL7890Contig1 1011 2 2 U
GGGATTAAAACACAAAAAAAAACATGAAGGCGGAGCTAAATTTACCGGCGGGATTCCGAT
TTCACCCGACGGACGAAGAGCTAGTCAAGTTCTATCTCTGCCCGAGATGCGCGTCGGAGC
CAATCAGCGTTCCGGTGATCGCGGAGATCGATCTATACAAGTTCAATCCATGGGAGCTTC
CAGGCATGGCTTTGTACGGAGAGAAAGAATGGTACTTCTTCTCACACCGAGACCGAAAAT
ACCCAAACGGTTCACGTCCGAACCGGGCAGCGGGAACCGGTTATTGGAAAGCGACGGGAG
CTGATAAACCAATCGGTAAACCGAAGAAGTTAGGGATCAAGAAAGCGCTCGTCTTCTACG
CGGGGAAAGCTCCTAAAGGTGCGAAGACGAATTGGATCATGCACGAGTATCGTCTCGCTA
ATGTCGACCGCTCTGCTTCTTCCAACAAGAAGAACAACTTAAGACTTGATGATTGGGTGT
TATGTCGGATTTACAATAAGAAAGGAACGATGGAGAAGTATTATCCGGCGGATGAGAAAG
AGACGGCGATGATGATGACTACTACTACTACGACCACGTCGGATTCGAAATGCTCAAGTC
ACGTGATCTCACCGGACGTCACGTGTTCTTCCGAGGTTCAGAGCGAGTCGAAGTGGGTTG
ATGATCTTGTTGAGGACGTAGCATTTGACGCGTCAGTGTTTGGCTCCTTGCTGCAAAATG
ACGCTTTTGTCCCTCAGTTTCCGTATCAGTCCGACTTCGCCACTATGTTCGAGGATCCGC
CGGAGCAGAAACCATTCTTGAACTGGAGTTTTGCTCCTCAGGGGTAAAACTGTAAAAGAG
CATAAAATTTGGAGCTTTCTCAGAGCACCTGGCAACTGCACGGGTCGGATCCTGACCCGG
AAATCAAGATTGGTCATACAAACTACTGAGACAATCAACTTCAGATTCTTGATACAAACA
GTGACCATATATGTATTCATCATAATCAATGAGCATGAGCTTATTTATCCG


BQ
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AF RS1BL73TF U 1
AF RS1BL73JQ C 259
BS 1 811 RS1BL73TF
BS 812 1011 RS1BL73JQ

RD RS1BL73TF 811 0 0
GGGATTAAAACACAAAAAAAAACATGAAGGCGGAGCTAAATTTACCGGCGGGATTCCGAT
TTCACCCGACGGACGAAGAGCTAGTCAAGTTCTATCTCTGCCCGAGATGCGCGTCGGAGC
CAATCAGCGTTCCGGTGATCGCGGAGATCGATCTATACAAGTTCAATCCATGGGAGCTTC
CAGGCATGGCTTTGTACGGAGAGAAAGAATGGTACTTCTTCTCACACCGAGACCGAAAAT
ACCCAAACGGTTCACGTCCGAACCGGGCAGCGGGAACCGGTTATTGGAAAGCGACGGGAG
CTGATAAACCAATCGGTAAACCGAAGAAGTTAGGGATCAAGAAAGCGCTCGTCTTCTACG
CGGGGAAAGCTCCTAAAGGTGCGAAGACGAATTGGATCATGCACGAGTATCGTCTCGCTA
ATGTCGACCGCTCTGCTTCTTCCAACAAGAAGAACAACTTAAGACTTGATGATTGGGTGT
TATGTCGGATTTACAATAAGAAAGGAACGATGGAGAAGTATTATCCGGCGGATGAGAAAG
AGACGGCGATGATGATGACTACTACTACTACGACCACGTCGGATTCGAAATGCTCAAGTC
ACGTGATCTCACCGGACGTCACGTGTTCTTCCGAGGTTCAGAGCGAGTCGAAGTGGGTTG
ATGATCTTGTTGAGGACGTAGCATTTGACGCGTCAGTGTTTGGCTCCTTGCTGCAAAATG
ACGCTTTTGTCCCTCAGTTTCCGTATCAGTCCGACTTCGCCACTATGTTCGAGGATCCGC
CGGAGCAGAAACCATTCTTGAACTGGAGTTT

QA 1 811 1 811
DS 

RD RS1BL73JQ 753 0 0
CGAACCGGGCAGCGGGAACCGGTTATTGGAAAGCGACGGGAGCTGATAAACCAATCGGTA
AACCGAAGAAGTTAGGGATCAAGAAAGCGCTCGTCTTCTACGCGGGGAAAGCTCCTAAAG
GTGCGAAGACGAATTGGATCATGCACGAGTATCGTCTCGCTAATGTCGACCGCTCTGCTT
CTTCCAACAAGAAGAACAACTTAAGACTTGATGATTGGGTGTTATGTCGGATTTACAATA
AGAAAGGAACGATGGAGAAGTATTATCCGGCGGATGAGAAAGAGACGGCGATGATGATGA
CTACTACTACTACGACCACGTCGGATTCGAAATGCTCAAGTCACGTGATCTCACCGGACG
TCACGTGTTCTTCCGAGGTTCAGAGCGAGTCGAAGTGGGTTGATGATCTTGTTGAGGACG
TAGCATTTGACGCGTCAGTGTTTGGCTCCTTGCTGCAAAATGACGCTTTTGTCCCTCAGT
TTCCGTATCAGTCCGACTTCGCCACTATGTTCGAGGATCCGCCGGAGCAGAAACCATTCT
TGAACTGGAGTTTTGCTCCTCAGGGGTAAAACTGTAAAAGAGCATAAAATTTGGAGCTTT
CTCAGAGCACCTGGCAACTGCACGGGTCGGATCCTGACCCGGAAATCAAGATTGGTCATA
CAAACTACTGAGACAATCAACTTCAGATTCTTGATACAAACAGTGACCATATATGTATTC
ATCATAATCAATGAGCATGAGCTTATTTATCCG

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

CO CL7891Contig1 634 2 2 U
GGATATAATCCCTTGTCTTACCATAGGACACATGATACATAATCTACTATTGTTAACTGA
TCCCTAAGAGGATTCCTGTGCAAATGTACAGAGGAATGTCCGTAATACAAATACATTTGT
TTTTCTTGAAATCCAGCTTCTTATTCTTCTTTTCAAATTACTTTATGATTATATTATTAA
GAAAATAACAATGATTAGAGACAACTAATAGTCCTCTTTAGAAGGGAAGAAAGAAGAAAA
AGAGGCCAGCTAATTCAAATGAGGTGCTCTCCCATACACTCTTCTGTGTATGCTAAAGAT
TCAAGATTTAATGTTTTATTTTTCAATTGGGTTTCTGTAAAGGCAAATGTCTGATCAATT
GTAGAACTCCGGGTAAGAGCACTTGTGATATATTAATAGCTACTATGTAAAAAGATGTTT
TATTGATTGATTAAAATTAATTGTTGTCGTGTGCATGAACCTAGTGAGATGTGATATGAG
ATCTCAAGTTGATTTTATTTTGAATTGAATCATATATTGTAAATATGATTCAATTTTTAA
TACTTCATCCGTTTCAAATTACTTGTTGTTTTAGAGTAGAATTTTCGTTTCAAAATAAGT
GTCGTTTTCGGTTTTCAATGCAAAATTTATTGAC


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AF RS1DQ87TF U 1
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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1FP59JQ C 1
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GAAGTTATGATGGGAC

QA 1 556 1 556
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GR94TF U 1
AF RS1GR94JQ C 446
BS 1 688 RS1GR94TF
BS 689 1072 RS1GR94JQ

RD RS1GR94TF 688 0 0
GGATGACCACACAAAATCAGCAAACAAGAACATAAAGAAAATAGAAAAGAAACAGAAAGA
AGAACATGCAAACAGCATGACATCTCCATGTCGTAAGCTTCATAGGTTTTCTCTCTCTCC
TTAGACTACTCTATCCTCTCTTGAAATGGTTCATCACGAGATTCCTCCTCACTGACCCCG
GGCGGGTCAAGCGTTATGGCTCGTGGGCTTTGGTCACTGGAGCCACAGATGGGATCGGAC
GAGCCTTTGCTCACGAGCTGGCAAAACACGGCCTTAACCTCATCCTAGTCAGTAGAAACC
CTTCTAAGCTCGCTTCTGTTTCCGATGATTTCCGACAAGAGTTTCCACAAAACAAGATCA
AGATCATTCCCTTTGACTTCTCCTCTGAAAGAGGATATGAAGCTATCGAGGAGGGGATCA
AAGACCTTGAAGTTGGAATTCTGATAAACAACGTTGGGATAACTTACCCACGAGCCATGT
TCTTCCACGAGGTTGACCAACTCACATGGACCAAAATCATTAGGGTCAATCTTGAAGCCA
CCACTTGGGTCACGAGATCTCTCATCGGACCAATGCTTCACCGCCGTCGAGGAGCTATCA
TAAATATTAGCTCCGGTGCCGCCGTTGTTGTCCCTTCTCATCCTCTCTATGCCATCTACG
CCGCCACCAAAGCCTATGTTGATAAACT

QA 1 688 1 688
DS 

RD RS1GR94JQ 627 0 0
AAACAACGTTGGGATAACTTACCCACGAGCCATGTTCTTCCACGAGGTTGACCAACTCAC
ATGGACCAAAATCATTAGGGTCAATCTTGAAGCCACCACTTGGGTCACGAGATCTCTCAT
CGGACCAATGCTTCACCGCCGTCGAGGAGCTATCATAAATATTAGCTCCGGTGCCGCCGT
TGTTGTCCCTTCTCATCCTCTCTATGCCATCTACGCCGCCACCAAAGCCTATGTTGATAA
ACTATCAAGGTCTTTGCATGTGGAATATAAGCATTTTGGTATCCACGTCCAGTGCCAGGT
TCCGTTATACGTGGCAACGAGGATGGTATCAGAAGTAGCAGACATAGATAAACCAAGCTT
CTTTGTACCATCGCCGGAAGTATATGCAAAAGCGGCGGTGGAGCAGATCGGAATTGGATC
ACGATGCTCGCCATTTTGGGCTCATTCCCTTCAGTGGTTTCTCGCTGGTCTTTTGCCGAA
GAATCTTCTTGATACTTGGCGTCTCTCTATCGGTCTTCGTAGAAGAAGTTTGTCTTAGTC
CCTCGCTTTTTATGTTTTAAGTTATTAAGTTTATATATTTCCGGTTACTTCCTTTAACAT
ATAAAATTACTCAAAAATAAATTTTAC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL7894Contig1 660 2 3 U
AATAAGAACAATGATAAATAGACTCTTTGATCAGATCACAAAATATGGTTGATCAAGAAA
GAACATTCTTTCTTCTCTAGTTCTTTCAAATCTCTGACAAAGCTAATAGTAATTAATGGT
TATTGACTCCATTATATCAGTCCTCTTCATCAACTCCTCTGAAAGGAAGTGGCACTGTCT
TTACAGCTCGAAACTTCCCCGCATCATTTAGATGCTCATTCTCCAATCGGTAAAAGTTCC
AGTGTCCTCTCCTGATGACTTCAAGAGCAGCCAAGAACAATCCTGTCACTCTATAATCCA
CATGCTCAAAACTTGAGTGCACAACTGTTTGTAGCCATGCCAGCCTTAGAACAAGATTTA
AAACCATAGAGAAGTAGTAAATAGATTTTTGGCGAAGCATGAGTTGGTTCCTAAGCCAAG
GGTTGTTGGAATTATGTTGGAGTAAACCCCAATCTTTTACAAAGTCCCAATACAATTGGT
AAACGGTGGCTATACTTGACATAGCCACCACAAGGCAGAGCCAACCAGTGCTCCTCTCTT
TCTCGTAAGCCACTTTGGTTCCAGCCGCTAACATCGCTGATACATACTTACCTAGGTTCA
CTAAGTGGCTTGTCTCGCCTTCGTCAAACCACCTCCTTGCACACTGCATTGCTCTCCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AQ43JQ U 39
AF RS1AQ43TFB C 1
BS 1 38 RS1AQ43TFB
BS 39 594 RS1AQ43JQ
BS 595 660 RS1AQ43TFB

RD RS1AQ43JQ 556 0 0
CAAAATATGGTTGATCAAGAAAGAACATTCTTTCTTCTCTAGTTCTTTCAAATCTCTGAC
AAAGCTAATAGTAATTAATGGTTATTGACTCCATTATATCAGTCCTCTTCATCAACTCCT
CTGAAAGGAAGTGGCACTGTCTTTACAGCTCGAAACTTCCCCGCATCATTTAGATGCTCA
TTCTCCAATCGGTAAAAGTTCCAGTGTCCTCTCCTGATGACTTCAAGAGCAGCCAAGAAC
AATCCTGTCACTCTATAATCCACATGCTCAAAACTTGAGTGCACAACTGTTTGTAGCCAT
GCCAGCCTTAGAACAAGATTTAAAACCATAGAGAAGTAGTAAATAGATTTTTGGCGAAGC
ATGAGTTGGTTCCTAAGCCAAGGGTTGTTGGAATTATGTTGGAGTAAACCCCAATCTTTT
ACAAAGTCCCAATACAATTGGTAAACGGTGGCTATACTTGACATAGCCACCACAAGGCAG
AGCCAACCAGTGCTCCTCTCTTTCTCGTAAGCCACTTTGGTTCCAGCCGCTAACATCGCT
GATACATACTTACCTA

QA 1 556 1 556
DS 

RD RS1AQ43TFB 660 0 0
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GAACATTCTTTCTTCTCTTGTTCTTTCAAATCTCTGACAAAGCTAATAGTAATTAATGGT
TATTGACTCCATTATATCAGTCCTCTTCATCAACTCCTCTGAAAGGAAGTGGCACTGTCT
TTACAGCTCGAAACTTCCCCGCATCATTTAGATGCTCATTCTCCAATCGGTAAAAGTTCC
AGTGTCCTCTCCTGATGACTTCAAGAGCAGCCAAGAACAATCCTGTCACTCTATAATCCA
CATGCTCAAAACTTGAGTGCACAACTGTTTGTAGCCATGCCAGCCTTAGAACAAGATTTA
AAACCATAGAGAAGTAGTAAATAGATTTTTGGCGAAGCATGAGTTGGTTCCTAAGCCAAG
GGTTGTTGGAATTATGTTGGAGTAAACCCCAATCTTTTACAAAGTCCCAATACAATTGGT
AAACGGTGGCTATACTTGACATAGCCACCACAAGGCAGAGCCAACCAGTGCTCCTCTCTT
TCTCGTAAGCCACTTTGGTTCCAGCCGCTAACATCGCTGATACATACTTACCTAGGTTCA
CTAAGTGGCTTGTCTCGCCTTCGTCAAACCACCTCCTTGCACACTGCATTGCTCTCCAGC

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL7895Contig1 553 2 1 U
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ATACTTGGATCAAAAGGCATAAAGATGGTGATAATAAATCCAAGATTTGAAGTCTTAGAA
AAGATGATGTTATCACATTTTGTAGAGAAGATAGGAAAAGAGTATGTGTTCCTATCCATT
GACGATGCGGTTCAAGCCTGCCGGTTTAATCTTTCCACCGCCAAACCCGAACCCTGACAC
TGTTTATCAATGGAGGGTTCTAATAAAAGTCGTATTTTAGGTTCTGTGCTCAAATAAACA
ATAACTAGCTAGTCTCTTCTAGACTACTATAACTACTACGTGAATGCTTCGTGGGTATGC
TTGTAACATAAAGAAACCGAGTGAGATATGGAAGTTTAGAGAGATGGAGATTTCAATATC
ATTTGAATTAAGC


BQ
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AF RS1D266JQ C 1
AF RS1D266TF U 1
BS 1 553 RS1D266TF

RD RS1D266JQ 553 0 0
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GAAAGGATTTTGAGGTGGATTCGTGATGAACCTGAAGGCGTCGAGTTTCTTCTCCTTGAT
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ATACTTGGATCAAAAGGCATAAAGATGGTGATAATAAATCCAAGATTTGAAGTCTTAGAA
AAGATGATGTTATCACATTTTGTAGAGAAGATAGGAAAAGAGTATGTGTTCCTATCCATT
GACGATGCGGTTCAAGCCTGCCGGTTTAATCTTTCCACCGCCAAACCCGAACCCTGACAC
TGTTTATCAATGGAGGGTTCTAATAAAAGTCGTATTTTAGGTTCTGTGCTCAAATAAACA
ATAACTAGCTAGTCTCTTCTAGACTACTATAACTACTACGTGAATGCTTCGTGGGTATGC
TTGTAACATAAAGAAACCGAGTGAGATATGGAAGTTTAGAGAGATGGAGATTTCAATATC
ATTTGAATTAAGC

QA 1 553 1 553
DS 

RD RS1D266TF 553 0 0
GGTTATGTCATTCTTCAAATGGGTTCTCCTATCTTCTTTGCCAACAGTACTTATGTCCGT
GAAAGGATTTTGAGGTGGATTCGTGATGAACCTGAAGGCGTCGAGTTTCTTCTCCTTGAT
CTCTCTGGGGTTTCAAGCGTTGACATGACCGGGATGGAAACACTGCTCGAAGTGCGGAGA
ATACTTGGATCAAAAGGCATAAAGATGGTGATAATAAATCCAAGATTTGAAGTCTTAGAA
AAGATGATGTTATCACATTTTGTAGAGAAGATAGGAAAAGAGTATGTGTTCCTATCCATT
GACGATGCGGTTCAAGCCTGCCGGTTTAATCTTTCCACCGCCAAACCCGAACCCTGACAC
TGTTTATCAATGGAGGGTTCTAATAAAAGTCGTATTTTAGGTTCTGTGCTCAAATAAACA
ATAACTAGCTAGTCTCTTCTAGACTACTATAACTACTACGTGAATGCTTCGTGGGTATGC
TTGTAACATAAAGAAACCGAGTGAGATATGGAAGTTTAGAGAGATGGAGATTTCAATATC
ATTTGAATTAAGC

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 2

CO CL7896Contig1 576 2 1 U
GCCTTTTCATACTTTTGGATTTGTCGGTCGTCCACCTGGCCGCTAAGGAAGAGGATTTGT
CCTCCAATTGTAGACTTTCCAGCATCTACAATGGAAAAAGTGGCCATGTGAATATTAAAT
AGACTAAGCTTTGAAACGAAGTGAATTTAAATCAATTAGCTTTGAAACCATGTGTCTACA
AAAAGCAACTTTCTTACGATCTAAATTGGAACAGACTTCACCGGAAACTACAGAAAAATT
ATCTATGAAAAAAACTGAATTGATGGAAAATTCATCAAGTAGATGGCCATACCAACATGT
CCAATGAACACCACATTCAAGTGTCTCTTCTTGTTTGCTTCTGCCTCCTCTTCAGCTTCC
TCTTTGGCGGCCTTCTCTTGGGCTGCCTTCTCCTTAGCTAAATTGATTGTATAGGCGAGA
GATAAAAAAAAAAGTCTTCAGTCAGACAACACGATCACATAAAGATGAGAAACAAACGAG
TAGTATAATAGATATAAGAACCTTTCGCTGGGTTATGCACTGGATGGAGCACTTCCTGAT
CATGATCCTCTGATGCTGAAACCACCAATTTCCAGT


BQ
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AF RS1G840TF U 1
AF RS1G840JQ C 63
BS 1 576 RS1G840TF

RD RS1G840TF 576 0 0
GCCTTTTCATACTTTTGGATTTGTCGGTCGTCCACCTGGCCGCTAAGGAAGAGGATTTGT
CCTCCAATTGTAGACTTTCCAGCATCTACAATGGAAAAAGTGGCCATGTGAATATTAAAT
AGACTAAGCTTTGAAACGAAGTGAATTTAAATCAATTAGCTTTGAAACCATGTGTCTACA
AAAAGCAACTTTCTTACGATCTAAATTGGAACAGACTTCACCGGAAACTACAGAAAAATT
ATCTATGAAAAAAACTGAATTGATGGAAAATTCATCAAGTAGATGGCCATACCAACATGT
CCAATGAACACCACATTCAAGTGTCTCTTCTTGTTTGCTTCTGCCTCCTCTTCAGCTTCC
TCTTTGGCGGCCTTCTCTTGGGCTGCCTTCTCCTTAGCTAAATTGATTGTATAGGCGAGA
GATAAAAAAAAAAGTCTTCAGTCAGACAACACGATCACATAAAGATGAGAAACAAACGAG
TAGTATAATAGATATAAGAACCTTTCGCTGGGTTATGCACTGGATGGAGCACTTCCTGAT
CATGATCCTCTGATGCTGAAACCACCAATTTCCAGT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RS1G840JQ 514 0 0
TCCAATTGTAGACTTTCCAGCATCTACAATGGAAAAAGTGGCCATGTGAATATTAAATAG
ACTAAGCTTTGAAACGAAGTGAATTTAAATCAATTAGCTTTGAAACCATGTGTCTACAAA
AAGCAACTTTCTTACGATCTAAATTGGAACAGACTTCACCGGAAACTACAGAAAAATTAT
TTATGAAAAAAACTGAATTGATGGAAAATTCATCAAGTAGATGGCCATACCAACATGTCC
AATGAACACCACATTCAAGTGTCTCTTCTTGTTTGCTTCTGCCTCCTCTTCAGCTTCCTC
TTTGGCGGCCTTCTCTTGGGCTGCCTTCTCCTTAGCTAAATTGATTGTATAGGCGAGAGA
TAAAAAAAAAAGTCTTCAGTCAGACAACACGATCACATAAAGATGAGAAACAAACGAGTA
GTATAATAGATATAAGAACCTTTCGCTGGGTTATGCACTGGATGGAGCACTTCCTGATCA
TGATCCTCTGATGCTGAAACCACCAATTTCCAGT

QA 1 514 1 514
DS 



AS 1 2

CO CL7897Contig1 805 2 2 U
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TTTACAAGGTACTGGCGCCGAACAGCCGAAACCCCTTCCTTCCCCAAGCAAACCAGCTGT
GGAGAAGCCCCAGTCGCAACCACAGCCACAAGAGGCAGCTTCTCCTATGGCCACTTCATT
TTACTCAGAAGTGCTCAGCAGAAAAACCAAGTCGCTTTTGGAGGAATATTTCAATGTACG
TCTAATGGATGAGGCATTACAATGCGTAGAGGAACTGAAAGCCCCAGCTCACCATCCCGA
GCTCGTCAAGGAAGCTATCTCCCTCGGCTTGGAGAAAAATCCACCGTGCGTTGAACCAGT
GGCGAGACTCTTGGAATATTTGGTCTCCAAGAACGTTCTAGCTCCTAAAGACATCGGGAG
TGGTTGTCTGCTTTACGGGTCTATGCTCGATGACATTGGGATCGATCTGCCAAAGGCACC
AAACAACTTTGGGGAGATCCTTGGGAGTTTGGTTATGGCCAATGCATCGGATTTTGGGAC
GGTGGAAGAGATTCTAATGAAAATGGAAGATGATCGGTTCAAGAAAGCAGTCTTGGATGC
TGTGATAAAGAGTGTTAGCGAATCTCTGTTGGCCGCGCAAGCAGCTAAAGTCGAGGCTTG
CCGTAGTTTGGTGTAAGCTTTTGTGTGGTTTCATCTCTGTTACAGGATACTTCAATACAT
CCTCTATTTCCTCTGTTTTGATAAGCATTTTTCGTTTTTGGTTCAACCTGAATATGTTTG
AATAAATTTGGTTATGTATCCTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FJ37TF U 1
AF RS1FJ37JQ C 103
BS 1 664 RS1FJ37TF
BS 665 805 RS1FJ37JQ

RD RS1FJ37TF 664 0 0
GAATTCAAGGCTCCTACCTCAGGGCAGTGGAGGTCTCTTGGCTGGAAGACCAAGTGCCCT
TTTACAAGGTACTGGCGCCGAACAGCCGAAACCCCTTCCTTCCCCAAGCAAACCAGCTGT
GGAGAAGCCCCAGTCGCAACCACAGCCACAAGAGGCAGCTTCTCCTATGGCCACTTCATT
TTACTCAGAAGTGCTCAGCAGAAAAACCAAGTCGCTTTTGGAGGAATATTTCAATGTACG
TCTAATGGATGAGGCATTACAATGCGTAGAGGAACTGAAAGCCCCAGCTCACCATCCCGA
GCTCGTCAAGGAAGCTATCTCCCTCGGCTTGGAGAAAAATCCACCGTGCGTTGAACCAGT
GGCGAGACTCTTGGAATATTTGGTCTCCAAGAACGTTCTAGCTCCTAAAGACATCGGGAG
TGGTTGTCTGCTTTACGGGTCTATGCTCGATGACATTGGGATCGATCTGCCAAAGGCACC
AAACAACTTTGGGGAGATCCTTGGGAGTTTGGTTATGGCCAATGCATCGGATTTTGGGAC
GGTGGAAGAGATTCTAATGAAAATGGAAGATGATCGGTTCAAGAAAGCAGTCTTGGATGC
TGTGATAAAGAGTGTTAGCGAATCTCTGTTGGCCGCGCAAGCAGCTAAAGTCGAGGCTTG
CCGT

QA 1 664 1 664
DS 

RD RS1FJ37JQ 703 0 0
CCCAAGCAAACCAGCTGTGGAGAAGCCCCAGTCGCAACCACAGCCACAAGAGGCAGCTTC
TCCTATGGCCACTTCATTTTACTCAGAAGTGCTCAGCAGAAAAACCAAGTCGCTTTTGGA
GGAATATTTCAATGTACGTCTAATGGATGAGGCATTACAATGCGTAGAGGAACTGAAAGC
CCCAGCTCACCATCCCGAGCTCGTCAAGGAAGCTATCTCCCTCGGCTTGGAGAAAAATCC
ACCGTGCGTTGAACCAGTGGCGAGACTCTTGGAATATTTGGTCTCCAAGAACGTTCTAGC
TCCTAAAGACATCGGGAGTGGTTGTTTGCTTTACGGGTCTATGCTCGATGACATTGGGAT
CGATCTGCCAAAGGCACCAAACAACTTTGGGGAGATCCTTGGGAGTTTGGTTATGGCCAA
TGCATCGGATTTTGGGACGGTGGAAGAGATTCTAATGAAAATGGAAGATGATCGGTTCAA
GAAAGCAGTCTTGGATGCTGTGATAAAGAGTGTTAGCGAATCTCTGTTGGCCGCGCAAGC
AGCTAAAGTCGAGGCTTGCCGTAGTTTGGTGTAAGCTTTTGTGTGGTTTCATCTCTGTTA
CAGGATACTTCAATACATCCTCTATTTCCTCTGTTTTGATAAGCATTTTTCGTTTTTGGT
TCAACCTGAATATGTTTGAATAAATTTGGTTATGTATCCTTCG

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 2

CO CL7898Contig1 831 2 6 U
GCAGGGGACGTGGCGCGGGAAGAGGAAGGAGAGTGGAAAATATGTTGCATGGCGCTGACA
GTTCCATAGGTACTCAGAGAACTAATGCCCGAGCATCTCTTTCTGGTGATCCTGTAGCGT
CCAATTTAGCAACTCTTCCCGTCTCTTTGGTTGATATTGATACAAAAGTCCCTAAGCCTA
TTAAAGGAAGTAATTCTAATCTTCAGTCGGGGCCTTCCATACATTCTGTTACCACTGCGC
TGCAGCCCTCTCCTACTGTCTCCCTACCAGAAAGTAGCCTGCTGGATGCACCTCCTGGTT
TTGGTTCTGGATCACGTGTTCAGCCGCTAAATGTATCGGAGGATTCCTTGGTAAAAAAGG
CAGCTGCTATAAAGAGCAAGCCTGCTGTTCCAGATGTTAGAAATAACCAGGGTTCAGGAG
TTCTAAAACAGCCAGTTAACATACCAAGCTCTGCTGCTTTAGGCCCAGGTCAAAGTCAGA
CAACTGCACCTTTAAGTGCTAATCAGCCATTGAGTCCCCACCTTGTTGGTTCTACAGTTG
AAGCTCAAGGCGCCAGTGTTCTTTCTCCTCCTGCACCCATGCCTGTGAAGAGGCAAGGTC
GGAATACGCCAAACAGAGGAGATACTCCTAGACGGCGAGGAAAGAGACATGCTCAAGCTT
CACCCGCTGCTGATGGCTCTTCTGCACGGAGTACAGTATCAACACCACAAACTGAGGTCA
AGGTTGGTGATTCATCAGGATCCAAAGTTACATCAGTTGGTGACGCTGTTGTCCAAGAAC
AACCCCATTTCAACCCGTCAGTTGCACACTCGTCTGCCAGTACAAGTCAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FY07TF U 1
AF RS1FY07JQ C 198
BS 1 720 RS1FY07TF
BS 721 721 RS1FY07JQ
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BS 740 772 RS1FY07TF
BS 773 831 RS1FY07JQ

RD RS1FY07TF 772 0 0
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GTTCCATAGGTACTCAGAGAACTAATGCCCGAGCATCTCTTTCTGGTGATCCTGTAGCGT
CCAATTTAGCAACTCTTCCCGTCTCTTTGGTTGATATTGATACAAAAGTCCCTAAGCCTA
TTAAAGGAAGTAATTCTAATCTTCAGTCGGGGCCTTCCATACATTCTGTTACCACTGCGC
TGCAGCCCTCTCCTACTGTCTCCCTACCAGAAAGTAGCCTGCTGGATGCACCTCCTGGTT
TTGGTTCTGGATCACGTGTTCAGCCGCTAAATGTATCGGAGGATTCCTTGGTAAAAAAGG
CAGCTGCTATAAAGAGCAAGCCTGCTGTTCCAGATGTTAGAAATAACCAGGGTTCAGGAG
TTCTAAAACAGCCAGTTAACATACCAAGCTCTGCTGCTTTAGGCCCAGGTCAAAGTCAGA
CAACTGCACCTTTAAGTGCTAATCAGCCATTGAGTCCCCACCTTGTTGGTTCTACAGTTG
AAGCTCAAGGCGCCAGTGTTCTTTCTCCTCCTGCACCCATGCCTGTGAAGAGGCAAGGTC
GGAATACGCCAAACAGAGGAGATACTCCTAGACGGCGAGGAAAGAGACATGCTCAAGCTT
CACCCGCTGCTGATGGCTCTTCTGCACGGAGTACAGTATCAACACCACAAACTGAGGTCA
*GGTTGGTGATTCATCAG*ATCCAAAGTTACATCAGTTGGTGACGCTGTTGT

QA 1 772 1 772
DS 

RD RS1FY07JQ 634 0 0
AATCTTCAGTCGGGGCCTTCCATACATTCTGTTACCACTGCGCTGCAGCCCTCTCCTACT
GTCTCCCTACCAGAAAGTAGCCTGCTGGATGCACCTCCTGGTTTTGGTTCTGGATCACGT
GTTCAGCCGCTAAATGTATCGGAGGATTCCTTGGTAAAAAAGGCAGCTGCTATAAAGAGC
AAGCCTGCTGTTCCAGATGTTAGAAATAACCAGGGTTCAGGAGTTCTAAAACAGCCAGTT
AACATACCAAGCTTTGCTGCTTTAGGCCCAGGTCAAAGTCAGACAACTGCACCTTTAAGT
GCTAATCAGCCATTGAGTCCCCACCTTGTTGGTTCTACAGTTGAAGCTCAAGGCGCCAGT
GTTCTTTCTCCTCCTGCACCCATGCCTGTGAAGAGGCAAGGTCGGAATACGCCAAACAGA
GGAGATACTCCTAGACGGCGAGGAAGGAGACATGCTCAAGCTTCACCCGCTGCTGATGGC
TCTTCTGCACGGAGTACAGTATCAACACCACAAACTGAGGTCAAGGTTGGTGATTCATCA
GGATCCAAAGTTACATCAGTTGGTGACGCTGTTGTCCAAGAACAACCCCATTTCAACCCG
TCAGTTGCACACTCGTCTGCCAGTACAAGTCAGG

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 2

CO CL7899Contig1 956 2 2 U
GCTGATAAGGAAGAGCCAGATGCTGATGGAGGACAGTCAATGCTTGGTCTCCAAAGCTAT
TGGGATGCAGCTTACTCTGATGAGCTCTCTAATTTCAGGGAGCATGGCCATACTGGCGAA
GTTTGGTTTGGAGATGATGTCATGGAAATTGTTACCTCTTGTACGAAAGACTTGTGCGTT
GAGATTTCTCAGAAGGAGATGTCTGTTTCTGACAACGGTGAGGTGAATGATCAGGCTGAC
AAGTATTTGTCTAGCTGGAATGTGCTTGACCTTGGTACTGGAAATGGCTTACTTCTTCAT
CAGCTTGCTAAGGAGGGGTTCTCTGATTTAACCGGGACTGATTATAGTGAAGGAGCGGTT
GAACTCGCTCAACATCTCTCCCAACGTGATGGGTTCCCAAATATACGTTTCATGGTTGAT
GATATCCTTGATACAAAATTGGAAAGGCAGTTCAAGCTGGTGATGGACAAAGGAACTTTG
GATGCCATTGGTTTGCATCCTGATGGCCCTGTCAAAAGAGTTATGTATTGGGATTCAGTG
TCCAAGCTGGTTGCTCCTGGTGGTATACTGGTTATTACGTCATGTAACAACACAAAGGAC
GAACTCTTGGAAGAAGTGGAGAATTTCAACATGAGAAAATCAAATTTAACTGGAGATGTT
TCTTCCGAAGCTGCAAGTGGAACCGATCATCCTCCGTTTGAGTATCTGAGCCACGTTAGG
ACGTACCCAACGTTCATGTTTGGTGGGTCTGTGGGATCGCGTGTGGCAACTGTTGCTTTT
TTAAGGAAGTGATAACAGCTTTTCTTTTTGTTTTGGGGGAGAATTGCATAACATAATGAT
GATGCCCATGCTTTTCTTTTTTAAACCTTTTTTTTTCTTGTGGCAAGACTTGTTCATGTG
CTTTTTGGGAGCACTTAATAACCTCTAAATTTGTTTTCAGAAACTACTGATAACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CS60TF U 1
AF RS1CS60JQ C 152
BS 1 709 RS1CS60TF
BS 710 956 RS1CS60JQ

RD RS1CS60TF 709 0 0
GCTGATAAGGAAGAGCCAGATGCTGATGGAGGACAGTCAATGCTTGGTCTCCAAAGCTAT
TGGGATGCAGCTTACTCTGATGAGCTCTCTAATTTCAGGGAGCATGGCCATACTGGCGAA
GTTTGGTTTGGAGATGATGTCATGGAAATTGTTACCTCTTGTACGAAAGACTTGTGCGTT
GAGATTTCTCAGAAGGAGATGTCTGTTTCTGACAACGGTGAGGTGAATGATCAGGCTGAC
AAGTATTTGTCTAGCTGGAATGTGCTTGACCTTGGTACTGGAAATGGCTTACTTCTTCAT
CAGCTTGCTAAGGAGGGGTTCTCTGATTTAACCGGGACTGATTATAGTGAAGGAGCGGTT
GAACTCGCTCAACATCTCTCCCAACGTGATGGGTTCCCAAATATACGTTTCATGGTTGAT
GATATCCTTGATACAAAATTGGAAAGGCAGTTCAAGCTGGTGATGGACAAAGGAACTTTG
GATGCCATTGGTTTGCATCCTGATGGCCCTGTCAAAAGAGTTATGTATTGGGATTCAGTG
TCCAAGCTGGTTGCTCCTGGTGGTATACTGGTTATTACGTCATGTAACAACACAAAGGAC
GAACTCTTGGAAGAAGTGGAGAATTTCAACATGAGAAAATCAAATTTAACTGGAGATGTT
TCTTCCGAAGCTGCAAGTGGAACCGATCATCCTCCGTTTGAGTATCTGA

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1CS60JQ 805 0 0
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TTGGTACTGGAAATGGCTTACTTCTTCATCAGCTTGCTAAGGAGGGGTTCTCTGATTTAA
CCGGGACTGATTATAGTGAAGGAGCGGTTGAACTCGCTCAACATCTCTCCCAACGTGATG
GGTTCCCAAATATACGTTTCATGGTTGATGATATCCTTGATACAAAATTGGAAAGGCAGT
TCAAGCTGGTGATGGACAAAGGAACTTTGGATGCCATTGGTTTGCATCCTGATGGCCCTG
TCAAAAGAGTTATGTATTGGGATTCAGTGTCCAAGCTGGTTGCTCCTGGTGGTATACTGG
TTATTACGTCATGTAACAACACAAAGGACGAACTCTTGGAAGAAGTGGAGAATTTCAACA
TGAGAAAATCAAATTTAACTGGAGATGTTTCTTCCGAAGCTGCAAGTGGAACCGATCATC
CTCCGTTTGAGTATCTGAGCCACGTTAGGACGTACCCAACGTTCATGTTTGGTGGGTCTG
TGGGATCGCGTGTGGCAACTGTTGCTTTTTTAAGGAAGTGATAACAGCTTTTCTTTTTGT
TTTGGGGGAGAATTGCATAACATAATGATGATGCCCATGCTTTTCTTTTTTAAACCTTTT
TTTTTCTTGTGGCAAGACTTGTTCATGTGCTTTTTGGGAGCACTTAATAACCTCTAAATT
TGTTTTCAGAAACTACTGATAACTT

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 2

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GTAAGGTTCTGCCAAATGGTCAAACCTGGAGACCTCAGTTGTTGCTGTTGTGCTACTCCC
TGAAGGTTTTGTCAGAAGCAAACTCTCTGCTTAAGCCTCAAGAACCATTGGACCAACGTA
AACTATTTGGTTTCCGAGTTCGATCCCCCCCTCTCCCGTACTTGTTGTCTTCGCTGTTGC
AGTCACGTGCACATCCTAAGCTCCCTACAGACCAAGGTGGTGATAGTGTTGACTCTGATA
TTGAGATTGATGACGTGTCTGATTCTGAGCAGGAAGATGGGGATGATGATGAGTATGATC
AGCTGCCACCATTCAAGCCTCTTCGAAAAACTCAACTTGCAAAACCCTCAAAGGATCAGA
GAAAGGCATATCTGGAGGAGTATGATTATAGGGTAAAGCTTCTGCAGAAGAAGCAATGGA
GAGAGGAATTGAAGAGGATGAGGGAGATGAAGAAAAACGGGAAGAAGGTGGGTGAAAATG
AGTTTGGTTATCCGGGTGAAGAAGAGGATCCGGAGAACGGTGCTCCAGCTGCAGTGCCAG
TTCCATTACCAGATATGGTCTTGCCACCTTCATTTGACAGTGATAATTCAGCTTACCGAT
ACCGTTTCCTGGAACCCACTTCACAGCTCCTAACCAGGCCAGTATTGGATACCCATGGTT
GGGACCATGACTGTGGGTATGACGGTGTCAATGCAGAATACAGTCTTGCTATAGCAAGCC
GGTTCCCTGCTACAGCTACTGTCCAAACCACCAAGGACAAGAAAGAGTTCAACATTCATC
TGGACTCCTCCGTGTCTGCTAAGCACGGTGAAAGTGGCTCCACCATGGCAGTTT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D884TF U 80
AF RS1CO49TF U 1
BS 1 184 RS1CO49TF
BS 185 186 RS1D884TF
BS 187 371 RS1CO49TF
BS 372 372 RS1D884TF
BS 373 427 RS1CO49TF
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BS 429 493 RS1CO49TF
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BS 641 641 RS1D884TF
BS 642 834 RS1CO49TF

RD RS1D884TF 601 0 0
G
AACTCTCTGCTTAAGCCTCAAGAACCATTGGACCAACGTAAACTATTTGGTTTCCGAGTT
CGATCCCCTCCTCTCCCGTACTTGTTGTCTTCGCTGTTGCAGTCACGTGCACATCCTAAG
CTCCCTACAGACCAAGGTGGTGATAGTGTTGACTCTGATATTGAGATTGATGACGTGTCT
GATTCTGAGCAGGAAGATGGGGATGATGATGAGTATGATCAGCTGCCACCATTCAAGCCT
CTTCGAAAAACTCAACTTGCAAAACTCTCAAAGGATCAGAGAAAGGCATATCTGGAGGAG
TATGATTATCGGGTAAAGCTTCTGCAGAAGAAGCAATGGAGAGAGGAATTGAAGAGGATG
AGGGAGATGAAGAAAAACGGGAAGAAGGTGGGTGAAAATGAGTTTGGTTATCCGGGTGAA
GAAGAGGATCCGGAGAACGGTGCTCCAGCTGCAGTGCCAGTTCCATTACCAGATATGGTC
TTGCCACCTTCATTTGACAGTGATAATTCAGCTTACCGATACCGTTTCCTGGAACCCACT
TCACAGCTCCTAACTAGGCCAGTATTGGATACCCATGGTTGGGACCATGACTGTGGGTAT

QA 2 601 2 601
DS 

RD RS1CO49TF 834 0 0
GTAAGGTTCTGCCAAATGGTCAAACCTGGAGACCTCAGTTGTTGCTGTTGTGCTACTCCC
TGAAGGTTTTGTCAGAAGCAAACTCTCTGCTTAAGCCTCAAGAACCATTGGACCAACGTA
AACTATTTGGTTTCCGAGTTCGATCCCCCCCTCTCCCGTACTTGTTGTCTTCGCTGTTGC
AGTC**GTGCACATCCTAAGCTCCCTACAGACCAAGGTGGTGATAGTGTTGACTCTGATA
TTGAGATTGATGACGTGTCTGATTCTGAGCAGGAAGATGGGGATGATGATGAGTATGATC
AGCTGCCACCATTCAAGCCTCTTCGAAAAACTCAACTTGCAAAACCCTCAAAGGATCAGA
GAAAGGCATATTTGGAGGAGTATGATTATAGGGTAAAGCTTCTGCAGAAGAAGCAATGGA
GAGAGGAGTTGAAGAGGATGAGGGAGATGAAGAAAAACGGGAAGAAGGTGGGTGAAAATG
AGTTTGGTTATCCTGGTGAAGAAGAGGATCCGGAGAACGGTGCTCCAGCTGCAGTGCCAG
TTCCATTACCAGATATGGTCTTGCCACCTTCATTTGACAGTGATAATTCAGCTTACCGAT
ACCGTTTCCTGGAACCCACTTCACAGCTCCTAACCAGGCCGGTATTGGATACCCATGGTT
GGGACCATGACTGTGGGTATGACGGTGTCAATGCAGAATACAGTCTTGCTATAGCAAGCC
GGTTCCCTGCTACAGCTACTGTCCAAACCACCAAGGACAAGAAAGAGTTCAACATTCATC
TGGACTCCTCCGTGTCTGCTAAGCACGGTGAAAGTGGCTCCACCATGGCAGTTT

QA 1 834 1 834
DS 



AS 1 2

CO CL7901Contig1 965 2 4 U
GGACAACAAACATTAAAACTCATCTATCTCTTGCTCTCTCTGTCTCTCATCATCATCATC
TTTGGCCATGGCAAAGGACTTGGAGGTGCAAGAGAGGGGAGCAACGGCGGCGAGAGATTA
CGTTGATCCGCCTCCGGCGCCTTTGTTAGACATGGAGGAACTTGGGAAGTGGTCGCTCTA
CAGAGCGGTCATAGCTGAGTTTGTGGCGACACTTCTCTTCCTTTACGTCTCAGTCCTCAC
CGTAATCGGCTACAAAGCTCAGACCGACGCAAACGCGGGAGGAGTTGATTGCGGCGGTGT
AGGAATATTGGGGATTGCGTGGGCTTTCGGTGGAATGATTTTTGTTCTCGTTTACTGTAC
CGCCGGTGTCTCCGGTGGTCATATAAATCCGGCTGTTACGTTCGGATTGTTCTTAGCTAG
AAAAGTCTCATTGGTGCGGACAGTGTTATACATTGTGGCTCAGTGCCTTGGTGCCATCTG
CGGTTGCGGTCTTGTCAAAGCATTCCAAAGTTCTTACTACACCAGATATGGAGGTGGAGC
TAATGAGCTAGCTGACGGCTACAACAAAGGAACTGGACTCGGTGCGGAGATCATCGGGAC
ATTTGTCCTAGTCTACACCGTTTTCTCGGCCACAGATCCCAAGCGAAGCGCACGTGACTC
TCACATTCTTGTTTTGGCGCCACTTCCTATTGGTTTTGCCGTCTTCATGGTTCACTTAGC
CACCATTCCCATCACCGGAACCGGAATCAACCCGGCTCGTAGCTTCGGAGCTGCAGTTAT
CTACAACCAAGAAAAGGCCTGGGACGACCAATGGATCTTTTGGGTGGGACCATTGATCGG
GGCAGCCGCAGCTGCGTTATACCATCAGTTTGTTCTAAGAGCAGCTGGGATTAAAAGTCT
TGGCTCCTTTAGGAGCTCTGCTTAATTTTAATTGTTTAAATTAAGCCACAAGTTGATCTT
TATTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RS1CZ15TF U 1
AF RS1CZ15JQ C 172
BS 1 696 RS1CZ15TF
BS 697 697 RS1CZ15JQ
BS 698 738 RS1CZ15TF
BS 739 965 RS1CZ15JQ

RD RS1CZ15TF 738 0 0
GGACAACAAACATTAAAACTCATCTATCTCTTGCTCTCTCTGTCTCTCATCATCATCATC
TTTGGCCATGGCAAAGGACTTGGAGGTGCAAGAGAGGGGAGCAACGGCGGCGAGAGATTA
CGTTGATCCGCCTCCGGCGCCTTTGTTAGACATGGAGGAACTTGGGAAGTGGTCGCTCTA
CAGAGCGGTCATAGCTGAGTTTGTGGCGACACTTCTCTTCCTTTACGTCTCAGTCCTCAC
CGTAATCGGCTACAAAGCTCAGACCGACGCAAACGCGGGAGGAGTTGATTGCGGCGGTGT
AGGAATATTGGGGATTGCGTGGGCTTTCGGTGGAATGATTTTTGTTCTCGTTTACTGTAC
CGCCGGTGTCTCCGGTGGTCATATAAATCCGGCTGTTACGTTCGGATTGTTCTTAGCTAG
AAAAGTCTCATTGGTGCGGACAGTGTTATACATTGTGGCTCAGTGCCTTGGTGCCATCTG
CGGTTGCGGTCTTGTCAAAGCATTCCAAAGTTCTTACTACACCAGATATGGAGGTGGAGC
TAATGAGCTAGCTGACGGCTACAACAAAGGAACTGGACTCGGTGCGGAGATCATCGGGAC
ATTTGTCCTAGTCTACACCGTTTTCTCGGCCACAGATCCCAAGCGAAGCGCACGTGACTC
TCACATTCTTGTTTTGGCGCCACTTCCTATTGGTTT*GCCGTCTTCATGGTTCACTTAGC
CACCATTCCCATCACCGG

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1CZ15JQ 794 0 0
GTCGCTCTACAGAGCGGTCATAGCTGAGTTTGTGGCGACACTTCTCTTCCTTTACGTCTC
AGTCCTCACCGTAATCGGCTACAAAGCTCAGACCGACGCAAACGCGGGAGGAGTTGATTG
CGGCGGTGTAGGAATATTGGGGATTGCGTGGGCTTTCGGTGGAATGATTTTTGTTCTCGT
TTACTGTACCGCCGGTGTCTCCGGTGGTCATATAAATCCGGCTGTTACGTTCGGATTGTT
CTTAGCTAGAAAAGTCTCATTGGTGCGGACAGTGTTATACATTGTGGCTCAGTGCCTTGG
TGCCATCTGCGGTTGCGGTCTTGTCAAAGCATTCCAAAGTTCTTACTACACCAGATATGG
AGGTGGAGCTAATGAGCTAGCTGACGGCTACAACAAAGGAACTGGACTCGGTGCGGAGAT
CATCGGGACATTTGTCCTAGTCTACACCGTTTTTTCGGCCACAGATCCCAAGCGAAGCGC
ACGTGACTCTCACATTCTTGTTTTGGCGCCACTTCCTATTGGTTTTGCCGTCTTCATGGT
TCACTTAGCCACCATTCCCATCACCGGAACCGGAATCAACCCGGCTCGTAGCTTCGGAGC
TGCAGTTATCTACAACCAAGAAAAGGCCTGGGACGACCAATGGATCTTTTGGGTGGGACC
ATTGATCGGGGCAGCCGCAGCTGCGTTATACCATCAGTTTGTTCTAAGAGCAGCTGGGAT
TAAAAGTCTTGGCTCCTTTAGGAGCTCTGCTTAATTTTAATTGTTTAAATTAAGCCACAA
GTTGATCTTTATTC

QA 1 794 1 794
DS 



AS 1 2

CO CL7902Contig1 570 2 2 U
CGGTTTTATTACATGACATATACTGATTAACAAATTTTTCATGGCCTCAGTCAAAATTCT
TAATCGGCTCCCGATAACCACAAATTGAAACATTAATATATATAAAAATAGCAAATATTC
CAAACTTAGTAAAATTAAACACGAGAAAATTAAAGTTGCAATACATATATATATATAACA
TGCTGCATATAAGACATATATCTGTCACATGCAACGGTTTATTATTCGGTTATAGAATAC
TAAGTGGGAAATTATAAATATCTCCACATACTCATTTTTTTCATTTCTTATTAAGCTGAC
GCTGGTTCTTGAAGTGGTCTCTTGGGTTGGCTTCGAAAGGTGCCCTAGGAATAATAGAAC
CATTCCCACCAGGAGCCTTCATCATCTTCTCTTTTGGACCGTTCTCTTCCGAGCCTGAGG
TCATCCACGAGAATAGACTCACGGCCGCTCCAATGGCTCCAACCACACCTATGACTTTCG
TTGCGTTATCGTAAAATGTCGAACTCTCATCCTTGTCATCTTTTCTGCTCATATTGATAT
GGTCACTATATGAGTGTTTTGACTTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CB44TF C 1
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TGCTGCATATAAGACATATATCTGTCACATGCAACGGTTTATTATTCGGTTATAGAATAC
TAAGTGGGAAATTATAAATATCTCCACATACTCATTTTTTTCATTTCTTATTAAGCTGAC
GCTGGTTCTTGAAGTGGTCTCTTGGGTTGGCTTCGAAAGGTGCCCTAGGAATAATAGAAC
CATTCCCACCAGGAGCCTTCATCATCTTCTCTTTTGGACCGTTCTCTTCCGAGCCTGAGG
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GGTCACTATATGAGTGTTTTGACTTGTTCC

QA 1 570 1 570
DS 

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AATTAAACACGAGAAAATTAAAGTTGCAATACATATATATATATAACATGCTGCATATAA
GACATATATCTGTCACATGCAACGGTTTATTATTCGGTTATAGAATACTAAGTGGGAAAT
TATAAATATCTCCACATACTCATTTTTTTCATTTCTTATTAAGCTGACGCTGGTTCTTGA
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GAGCCTTCATCATCTTCTCTTTTGGACCGTTCTCTTCCGAGCCTGAGGTCATCCACGAGA
ATAGACTCACGGCCGCTCCAATGGCTCCAACCACACCTATGACTTTCGTTGCGTTATCGT
AAAATGTCGAACTCTCATCCTTGTCATCTTTTCTGCTCATATTGATATGGTCACTATATG
AGTGTTTTGACTTGTTCC

QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 2

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CGGAAAAGGGGGAGCGGAGTTCGGTGGGTG


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BO45TF C 1
AF RS1BO45JQ U 2
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QA 1 570 1 570
DS 

RD RS1BO45JQ 569 0 0
AGA
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AACTCTTCTTGCATCTCATCCGGAACAAACGGCGTTTAAGGAGAGGACACGTCTTCTGAT
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AAAGGGGGAGCGGAGTTCGGTGGGTG

QA 4 569 4 569
DS 



AS 1 2

CO CL7904Contig1 873 2 2 U
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ATTACAGAGCACAACGTGTTACATGTCTCATTT


BQ
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AF RS1C631TF U 1
AF RS1C631JQ C 159
BS 1 720 RS1C631TF
BS 721 873 RS1C631JQ

RD RS1C631TF 720 0 0
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GGGACGAATCTACCAAGAAAACTTACTATGGGAATACAGTTACATCTGAGACCTCTTGGA

QA 1 720 1 720
DS 

RD RS1C631JQ 715 0 0
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AGTTTGGTGGACAAGTGGAAAGCTGCGAAAGAGGAGCTAAACGATAGTGAAGAAGAGGAA
GAAGAAGATAATTACGGGATCCTAGATAGAAAAAGACGACGAGAAATAGAAGAATGGAAG
TCACGACAGATTGCGAGTGGAGAGGCTAAAGACAATGCTAACTTCCAACCACTCGGTGGT
GACTGGCGTGAGAAAGTAAAAAGGAGGAAAGAACGAGGGAGACGTGAAGGTGATGATGAG
CCTAAGAAGAAAGAAGACGAGCAACAAAAACCTGATCTGACCAAACTCTCAGCACATCTT
CCCTCGGGATGGCAGGCTTATTGGGACGAATCTACCAAGAAAACTTACTATGGGAATACA
GTTACTTCTGAGACCTCTTGGACACGGCCCACTTCCAACCCCTGAGTCTCTTTATCTGTT
ATCTTCACCCAAAGTTTTGTACTATTACTTACATTTCTAGAATACATTTGTTTCTTAGAT
TCTCTCATCTTCATGTAAATCTATTACAGAGCACAACGTGTTACATGTCTCATTT

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

CO CL7905Contig1 1460 2 2 U
GGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGATCACAGGCGAATTGAGCACTTTGTTTCTCTTGT
GGGATCATACAGAGTGAGTGAGAATATGGGGAGGACCTATTATAGTTACAGTCCATCACC
ACCAAGGAGAAGGTACAGAAGCCCAAGTCCCGTGGGACACTACGGAGCTCGGAGTAGAGA
TCCCCCAACCAGTCTACTTGTTCGCAATCTCCGGCTCGACTGTCGGCCAGATGATCTCCG
TAGACCATTTGGGCGGTTTGGTCGTCTCAAGGATATCTACATACCTCGTAACTATTACAC
TGGGTGAGTGATTGGCGATTTTTTTCCGTTACCTCTTACTGTCCTAGCTTTGTATTAAGT
GACAGTATAATTATGATCAATCTTGTTGGTTTATCAAAAAGTTTGGTTTGTCTTATTGGA
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GAAATACTTTGTTTGGGACTACAAGAGGTGGGTTAAGAGTAGTGTTGATAACAGAGTTGG
TTTCTTGTTTCGATTTTGAAGATGTTCTGGTCAAAGTCGAAGTTAGTACAGTGGCTTCGA
AAAGGTTAGAAGCTAGCTGATTGTTTGTGCTTGATCTATTCAAGTTTTTTTTGTGTGTTT
CATGATTCATGCTGAAGTTCTCTATTGCCAATTTTGTTCAAAACTTAGAAGAGAGTTACT
TGTTTTGATAATTGTAGGCTCAATTTGTGACGCTGGTGACTTGCAGGGAGCCTCGCGGAT
TTGGCTTTGTGCAGTACTATGATCCTGATGATGCTGCAGATGCAAAGTACCATCTGGATG
GCTATGTTCTTCTAGGCCGCGAAATCACTGTGGTGTTTGCAGAGGAGAACAGAAAGAAGC
CTTCTGAAATGAGAGAACGATCAAGTTAAAGAATTGTTTTATTGGTCAACTTCAGAGGAA
GGACATCTACAAGATCTCCATATGGTTACTCCCGGTCTCCTGGCTATTCACGTTCGCCAA
ATTACAGAAGGAGCTACTCACGTTCGCCAGTCTACAGAAGGAGCTACTCACGTTCGCCAT
ATGATGAAAGGCACCGTTCAAGCAGATCTGTTTCACCGGGGGATAGGAGGCGATCGTACT
CAAGGTCGAGCTCAAGATCTCGCTATAAGTCGAGAAGCAGGAGCCAGAGTCCTGGATGCT
CACGCTGATTTGCTATATGACCCAAGAATGTGAAGATGGGTTGTGGTCTCTCACATTCTG
CTTGTTTAGTCATGTATCAAAAATAATAAACCATAGTTTGGAGTTAGAGGACAAACGTAT
CTATGGTTTGGTTTCCTTAGTACTTAGTGGCAGCCTTCTGTATGTTCACGCGTGACATCT
ATGCCTACTTATTGTGTTGCATGTGTTGTACCACGAGACAGTTCGGATTCTCATTAGTCA
CTACATATGAAATTTGGAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AO35TFB U 1
AF RS1AO35JQ C 651
BS 1 733 RS1AO35TFB
BS 734 1460 RS1AO35JQ

RD RS1AO35TFB 733 0 0
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GGGATCATACAGAGTGAGTGAGAATATGGGGAGGACCTATTATAGTTACAGTCCATCACC
ACCAAGGAGAAGGTACAGAAGCCCAAGTCCCGTGGGACACTACGGAGCTCGGAGTAGAGA
TCCCCCAACCAGTCTACTTGTTCGCAATCTCCGGCTCGACTGTCGGCCAGATGATCTCCG
TAGACCATTTGGGCGGTTTGGTCGTCTCAAGGATATCTACATACCTCGTAACTATTACAC
TGGGTGAGTGATTGGCGATTTTTTTCCGTTACCTCTTACTGTCCTAGCTTTGTATTAAGT
GACAGTATAATTATGATCAATCTTGTTGGTTTATCAAAAAGTTTGGTTTGTCTTATTGGA
AGTGATGAAGATGAAGAAGTAGGAAAGATTAATGTGCATGAGACCCAAAGTGAAGTAATG
GAAATACTTTGTTTGGGACTACAAGAGGTGGGTTAAGAGTAGTGTTGATAACAGAGTTGG
TTTCTTGTTTCGATTTTGAAGATGTTCTGGTCAAAGTCGAAGTTAGTACAGTGGCTTCGA
AAAGGTTAGAAGCTAGCTGATTGTTTGTGCTTGATCTATTCAAGTTTTTTTTGTGTGTTT
CATGATTCATGCTGAAGTTCTCTATTGCCAATTTTGTTCAAAACTTAGAAGAGAGTTACT
TGTTTTGATAATT

QA 1 733 1 733
DS 

RD RS1AO35JQ 810 0 0
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GAGAGTTACTTGTTTTGATAATTGTAGGCTCAATTTGTGACGCTGGTGACTTGCAGGGAG
CCTCGCGGATTTGGCTTTGTGCAGTACTATGATCCTGATGATGCTGCAGATGCAAAGTAC
CATCTGGATGGCTATGTTCTTCTAGGCCGCGAAATCACTGTGGTGTTTGCAGAGGAGAAC
AGAAAGAAGCCTTCTGAAATGAGAGAACGATCAAGTTAAAGAATTGTTTTATTGGTCAAC
TTCAGAGGAAGGACATCTACAAGATCTCCATATGGTTACTCCCGGTCTCCTGGCTATTCA
CGTTCGCCAAATTACAGAAGGAGCTACTCACGTTCGCCAGTCTACAGAAGGAGCTACTCA
CGTTCGCCATATGATGAAAGGCACCGTTCAAGCAGATCTGTTTCACCGGGGGATAGGAGG
CGATCGTACTCAAGGTCGAGCTCAAGATCTCGCTATAAGTCGAGAAGCAGGAGCCAGAGT
CCTGGATGCTCACGCTGATTTGCTATATGACCCAAGAATGTGAAGATGGGTTGTGGTCTC
TCACATTCTGCTTGTTTAGTCATGTATCAAAAATAATAAACCATAGTTTGGAGTTAGAGG
ACAAACGTATCTATGGTTTGGTTTCCTTAGTACTTAGTGGCAGCCTTCTGTATGTTCACG
CGTGACATCTATGCCTACTTATTGTGTTGCATGTGTTGTACCACGAGACAGTTCGGATTC
TCATTAGTCACTACATATGAAATTTGGAAC

QA 1 810 1 810
DS 



AS 1 2

CO CL7906Contig1 460 2 2 U
GGATAGTTCTTTTATAAAACCATAAGATGTGTTTGAGATCTTTAGAATCATTCCCAGACA
CACGCACACCCACGATGAGATCAGCTTCATGCCACAACAAACGTAACTTTAAGACACAAA
CCCATCTTCGTGTCCTCAGTCTCACCAGGAGGAGAAGAATACTTAGGGAAGAGAAGGAGA
TGGAGATGAGAAACATGAAGCTCTTCCTAGAGAATCAAAGTATCATACGAGAGAATGAGG
CTCTAAAGAAGAAAGCTGCTCTTCTCCACCAAGAAAACAATGCTCTCTTCTCTCTGCTTC
ATCCAAAACTCTCCCCTGTTTCATCCTCCTTCCCCTAGTGATGTTCTTAAACCCTGTTTC
TTTATTACGTTTGTACTACTCGTCTTGTATTGTACCCTCGCTAGAGACCTAAATTTATCT
ATGTACTAAGTGTTAATACATATCAATGATTATATTCGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AH33JQ C 1
AF RS1AH33TF U 32
BS 1 33 RS1AH33JQ
BS 34 460 RS1AH33TF

RD RS1AH33JQ 460 0 0
GGATAGTTCTTTTATAAAACCATAAGATGTGTTTGAGATCTTTAGAATCATTCCCAGACA
CACGCACACCCACGATGAGATCAGCTTCATGCCACAACAAACGTAACTTTAAGACACAAA
CCCATTTTCGTGTCCTCAGTCTCACCAGGAGGAGAAGAATACTTAGGGAAGAGAAGGAGA
TGGAGATGAGAAACATGAAGCTCTTCCTAGAGAATCAAAGTATCATACGAGAGAATGAGG
CTCTAAAGAAGAAAGCTGCTTTTCTCCACCAAGAAAACAATGCTCTTTTCTTTTTGCTTC
ATCCAAAACTCTCCCCTGTTTCATCCTCCTTCCCCTAGTGATGTTCTTAAACCCTGTTTC
TTTATTACGTTTGTACTACTCGTCTTGTATTGTACCCTCGCTAGAGACCTAAATTTATCT
ATGTACTAAGTGTTAATACATATCAATGATTATATTCGCT

QA 1 460 1 460
DS 

RD RS1AH33TF 429 0 0
TC
TGAGATCTTTAGAATCATTCCCAGACACACGCACACCCACGATGAGATCAGCTTCATGCC
ACAACAAACGTAACTTTAAGACACAAACCCATCTTCGTGTCCTCAGTCTCACCAGGAGGA
GAAGAATACTTAGGGAAGAGAAGGAGATGGAGATGAGAAACATGAAGCTCTTCCTAGAGA
ATCAAAGTATCATACGAGAGAATGAGGCTCTAAAGAAGAAAGCTGCTCTTCTCCACCAAG
AAAACAATGCTCTCTTCTCTCTGCTTCATCCAAAACTCTCCCCTGTTTCATCCTCCTTCC
CCTAGTGATGTTCTTAAACCCTGTTTCTTTATTACGTTTGTACTACTCGTCTTGTATTGT
ACCCTCGCTAGAGACCTAAATTTATCTATGTACTAAGTGTTAATACATATCAATGATTAT
ATTCGCT

QA 3 429 3 429
DS 



AS 1 2

CO CL7907Contig1 885 2 2 U
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AACCACTACGCTAATCTCTTCCGCATGAAAGCTGATGCTGCAAAGGCTGATGTCTTCTTC
TTGATTTCTGGTATGTGGCGAACTTCCACCGAACGCTTCTTCCAGTGGATCGGAGGTTTC
CGCCCTTCCGAGCTCTTAAATGTTGTGATGCCGTACATTGAGCCGTTAACGGATCAGCAA
CTCTTGGAGGTGAGAAACCTACAACAGTCGTCTCAGCAAGCAGAGGAAGCTCTTCTCAAG
GCTTGGATAAACTCCAGCAAGGTCTTGTCGAGAACATTGCTGTTGACATGAGAGTTGTGG
AGTCTGTGAGTCACGGTGCTCAGATGGTTTCTGCTATGGAGAATCTTCAGGCATTGGAGG
GTTTTGTTAACCAGGCGGATCATCTGAGAAAGCAGACACTGCAGCAAATGAGTAAGATCT
TGACGACAAGACAGGCTGCTCGAGGGTTGCTCGCTTTAGGAGAGTACTTTCACAGGCTCC
GTGCTCTGAGTTCTCTTTGGGCAGCTCGTCCACGAGAACGCACTTAAACAAGTTTTTTTT
TGGAGTCAAATCAAAAGGGAACAGAGAAGCACAGGGTGAAAGACTGAGTCAACACTCGAA
TGATGTTAGCTAGTAGGGACTTGTTTATCTAAGTGTATGGAGAAGATGTAGAGTGATTTT
ATTCTCTCCATTAGAGCATAATCATCATCATCTTCCTCATTGATGTTTTTGGTTTTGCTA
AATGAATTCTTTAGAGAAATGAATAAAGATGATGTAAATTTGGGTTGGAAAAACATTTGA
ACATGTTAATATTTGTATTTAATGTAAAAACCTCAAGTCTGCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CB95TF U 1
AF RS1CB95JQ C 154
BS 1 712 RS1CB95TF
BS 713 885 RS1CB95JQ

RD RS1CB95TF 712 0 0
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AACCACTACGCTAATCTCTTCCGCATGAAAGCTGATGCTGCAAAGGCTGATGTCTTCTTC
TTGATTTCTGGTATGTGGCGAACTTCCACCGAACGCTTCTTCCAGTGGATCGGAGGTTTC
CGCCCTTCCGAGCTCTTAAATGTTGTGATGCCGTACATTGAGCCGTTAACGGATCAGCAA
CTCTTGGAGGTGAGAAACCTACAACAGTCGTCTCAGCAAGCAGAGGAAGCTCTTCTCAAG
GCTTGGATAAACTCCAGCAAGGTCTTGTCGAGAACATTGCTGTTGACATGAGAGTTGTGG
AGTCTGTGAGTCACGGTGCTCAGATGGTTTCTGCTATGGAGAATCTTCAGGCATTGGAGG
GTTTTGTTAACCAGGCGGATCATCTGAGAAAGCAGACACTGCAGCAAATGAGTAAGATCT
TGACGACAAGACAGGCTGCTCGAGGGTTGCTCGCTTTAGGAGAGTACTTTCACAGGCTCC
GTGCTCTGAGTTCTCTTTGGGCAGCTCGTCCACGAGAACGCACTTAAACAAGTTTTTTTT
TGGAGTCAAATCAAAAGGGAACAGAGAAGCACAGGGTGAAAGACTGAGTCAACACTCGAA
TGATGTTAGCTAGTAGGGACTTGTTTATCTAAGTGTATGGAGAAGATGTAGA

QA 1 712 1 712
DS 

RD RS1CB95JQ 732 0 0
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TACATTGAGCCGTTAACGGATCAGCAACTCTTGGAGGTGAGAAACCTACAACAGTCGTCT
CAGCAAGCAGAGGAAGCTCTTCTCAAGGCTTGGATAAACTCCAGCAAGGTCTTGTCGAGA
ACATTGCTGTTGACATGAGAGTTGTGGAGTCTGTGAGTCACGGTGCTCAGATGGTTTCTG
CTATGGAGAATCTTCAGGCATTGGAGGGTTTTGTTAACCAGGCGGATCATCTGAGAAAGC
AGACACTGCAGCAAATGAGTAAGATCTTGACGACAAGACAGGCTGCTCGAGGGTTGCTCG
CTTTAGGAGAGTACTTTCACAGGCTCCGTGCTCTGAGTTCTCTTTGGGCAGCTCGTCCAC
GAGAACGCACTTAAACAAGTTTTTTTTTGGAGTCAAATCAAAAGGGAACAGAGAAGCACA
GGGTGAAAGACTGAGTCAACACTCGAATGATGTTAGCTAGTAGGGACTTGTTTATCTAAG
TGTATGGAGAAGATGTAGAGTGATTTTATTCTCTCCATTAGAGCATAATCATCATCATCT
TCCTCATTGATGTTTTTGGTTTTGCTAAATGAATTCTTTAGAGAAATGAATAAAGATGAT
GTAAATTTGGGTTGGAAAAACATTTGAACATGTTAATATTTGTATTTAATGTAAAAACCT
CAAGTCTGCTAC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL7908Contig1 500 2 4 U
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TTGCAGGTACTTGATTTCCTTCTCTTTTCGCTTCTTGATCTAGCCCGTAGCTTTTGTCAA
GGATTTTTCTTATGTTAGTTATTTTAGGCTGTCAGCTACAATGATCGCCGTATATGCTTC
CTGATTTAGTGACATGTCCTTGTTATCACTTACACATGTTTCCTTCTTTCTCATCTCATT
TTATACCTGCACACTATTGTGTTTGCAGGAGTTGCGGGAGAGTTAAGCTGCCACATTTCT
TTTGTTGCAGCGGTGAGCGAGGAAACCCTAGTGAGCAAGGCAATTAGATCAACTATTCCA
AGATTTCCTTTTATGATTTGTCACCTGTTGGGTGTTTAGAGGAAAAATATATCTTGGCTT
TCTTAGTCGAGTGATACTATACACTTGGTTGGTTGTGTCGAATTATTTGGGCTTTTTCTT
GCAAAATCATGTTATTCCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D925JQ C 1
AF RS1D925TF U 287
BS 1 286 RS1D925JQ
BS 287 309 RS1D925TF
BS 310 310 RS1D925JQ
BS 311 500 RS1D925TF

RD RS1D925JQ 500 0 0
GCACAAGAGAGGGATACGAAATGGGCCCAAGGCTCTTAAGCCTGTTCCTGTCATCATCCG
TTGCAGGTACTTGATTTCCTTCTCTTTTCGCTTCTTGATCTAGCCCGTAGCTTTTGTCAA
GGATTTTTCTTATGTTAGTTATTTTAGGCTGTCAGCTACAATGATCGCCGTATATGCTTC
CTGATTTAGTGACATGTCCTTGTTATCACTTACACATGTTTCCTTCTTTCTCATCTCATT
TTATACCTGCACACTATTGTGTTTGCAGGAGTTGCGGGAGAGTTAAGCTGCCACATTTCT
TTTGTTGCAGCGGTGAGCGAGGAAACCCTAGTGAGCAAGGCAATTAGATCAACTATTCCA
AGATTTCCTTTTATGATTTGTCACCTGTTGGGTGTTTAGAGGAAAAATATATCTTGGCTT
TCTTAGTCGAGTGATACTATACACTTGGTTGGTTGTGTCGAATTATTTGGGCTTTTTCTT
GCAAAATCATGTTATTCCCG

QA 1 500 1 500
DS 

RD RS1D925TF 214 0 0
GCTGCCACATTTCTTTTGTTGCATCGGTGAGCGAGGAAACCCTAGTGAGCAAGGCAATTA
GATCAACTATTCCAAGATTTCCTTTTATGATTTGTCACCTGTTGGGTGTTTAGAGGAAAA
ATATATCTTGGCTTTCTTAGTCGAGTGATACTATACACTTGGTTGGTTGTGTCGAATTAT
TTGGGCTTTTTCTTGCAAAATCATGTTATTCCCG

QA 1 214 1 214
DS 



AS 1 2

CO CL7909Contig1 619 2 2 U
AGGGAAGGCTTCACAACAGTGAGCACGCGTATAGACTAGTTACTCATATTTTTGATCTGG
TGGATCCGTTAAACGAACGTAACTATGAAGGAGGACTGTATACTAACTTGTTCACAGCTC
ACCCGCCGTTCCAGATCGACGCCAACTTTGGATTCTCAGCAGCTGTGGCAGAGATGTTAG
TGCAGAGCACAACGAAGGATCTGTATTTACTACCTGCCCTTCCTACTGATAAATGGCCTA
ACGGTTATGTGAAAGGGCTGAGGGCACGGGGTGGTGTGACGGTGAATATAAGGTGGATGG
AAGGGAACCTTGTGGAGTTTGGTCTTTGGTCAGAGCAGAGTGTGTCTACCAGAATAGTGT
ACAGAGGAAACTCTGTGGCTTCCACATTGTCGCCAGGGAAACTCTTTACTTTTGACAAAG
ATTTGAAATGCATTCGGACAGAGAACTTATAGAAAGTAAGATATGATATCTGTTTTTGTC
ATCATATGTTTTGTTCATCTAAGAGAGAGAGGAAAAAGCATTGTTTGTCCATCGTTCAAC
GAGCTATGTACAAGTGTAACGTAACCCACATGTATCCACACAAACAAGTTTACAGTGAAG
TAATGTATCTTTGGTATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
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AF RS1AG18JQ C 1
AF RS1AG18TF U 60
BS 1 59 RS1AG18JQ
BS 60 619 RS1AG18TF

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TGGATCCGTTAAACGAACGTAACTATGAAGGAGGACTGTATACTAACTTGTTCACAGCTC
ACCCGCCGTTCCAGATCGACGCCAACTTTGGATTCTCAGCAGCTGTGGCAGAGATGTTAG
TGCAGAGCACAACGAAGGATCTGTATTTACTACCTGCCCTTCCTACTGATAAATGGCCTA
ACGGTTATGTGAAAGGGCTGAGGGCACGGGGTGGTGTGACGGTGAATATAAGGTGGATGG
AAGGGAACCTTGTGGAGTTTGGTCTTTGGTCAGAGCAGAGTGTGTCTACCAGAATAGTGT
ACAGAGGAAACTCTGTGGCTTCCACATTGTCGCCAGGGAAACTCTTTACTTTTGACAAAG
ATTTGAAATGCATTCGGACAGAGAACTTATAGAAAGTAAGATATGATATCTGTTTTTGTC
ATCATATGTTTTGTTCATCTAAGAGAGAGAGGAAAAAGCATTGTTTGTCCATCGTTCAAC
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TAATGTATCTTTGGTATCT

QA 1 619 1 619
DS 

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GTGCAGAGCACAACGAAGGATCTGTATTTACTACCTGCCCTTCCTACTGATAAATGGCCT
AACGGTTATGTGAAAGGGCTGAGGGCACGGGGTGGTGTGACGGTGAATATAAGGTGGATG
GAAGGGAACCTTGTGGAGTTTGGTCTTTGGTCAGAGCAGAGTGTGTCTACCAGAATAGTG
TACAGAGGAAACTCTGTGGCTTCCACATTGTCGCCAGGGAAACTCTTTACTTTTGACAAA
GATTTGAAATGCATTCGGACAGAGAACTTATAGAAAGTAAGATATGATATCTGTTTTTGT
CATCATATGTTTTGTTCATCTAAGAGAGAGAGGAAAAAGCATTGTTTGTCCATCGTTCAA
CGAGCTATGTACAAGTGTAACGTAACCCACATGTATCCACACAAACAAGTTTACAGTGAA
GTAATGTATCTTTGGTATCT

QA 1 560 1 560
DS 



AS 1 2

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GAAAAGTGTCGGCTTTGGGGGAAGCAGGTTCAGGGTCTAGGGACAGCGTTGAAAATACTC
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ATTATACAAACTCAAGATTTTGAT


BQ
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AF RS1DF84JQ C 1
AF RS1DF84TF U 1
BS 1 564 RS1DF84TF

RD RS1DF84JQ 564 0 0
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ATTATACAAACTCAAGATTTTGAT

QA 1 564 1 564
DS 

RD RS1DF84TF 564 0 0
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GCATGTCCTGTTCCGTTTGATGAAGCTAAGCTCTGGCAAGGTCAAGCTGGACCTGAACTC
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GAAAAGTGTCGGCTTTGGGGGAAGCAGGTTCAGGGTCTAGGGACAGCGTTGAAAATACTC
TTCTCTGTTGGGAATCAAGACAAGGAGGGTGACCAAACACTGCAACTGCAACGTAATGAG
GTGATTGCACTGGTGAATTTGCTCAACCGTCTCTCTGAGTCGGTTAAAATGGTTCACGAT
ATGGGACCAGACGTGGAGAGGCTAATGGAGGATCAGATAGCTAAGGCATCAACTAAACCT
GGTGGATTAAGAAGAGTATTGGATTTAGCTTTCTCCTTCTGGTGAAATAATCATCGATTA
GGCAATTCATGCTGAATCAAATGGATAGTCATCGTTGTAACAAAATTAAAGAAAAGTATC
ATTATACAAACTCAAGATTTTGAT

QA 1 564 1 564
DS 



AS 1 2

CO CL7911Contig1 860 2 8 U
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CGGAGCATCAATTCATATCAAGAAAAGACGAAGGAGATAGAGTAATCGTGTTCGAAAGAG
GTGATCTGGTCTTCGTCTTCAACTTCCACTGGACCAGCAGCTACTTTGATTACCGCATTG
GTTGCTCCAAGCCAGGCAAATACAAGATCGTATTGGACTCGGACGATCCTCTGTTCGGTG
GATTCGGCAGGCTCGATCGCAAGTCAGAGTATTTCACATTTGAGGGGTCTTATGACGGAC
GACCCTCCTCTTTCATGGTCTACACACCATGCAGAACAGCAGTGGTTTACGCTTTAGCAG
ACCGTGATGATGGTCTCGAGACTTTGGATCCAAAATCGTAAGGAGAGAGAGAGTATGAAC
ATATGTAATGTCACTGAGGATGTAAAGTCTGTAAACGAAAATATCTAAAACACTACCGGA
GAAATAGCTCCTGATTAGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GO59TF U 1
AF RS1GO59JQ C 228
BS 1 754 RS1GO59TF
BS 755 755 RS1GO59JQ
BS 756 762 RS1GO59TF
BS 763 763 RS1GO59JQ
BS 764 787 RS1GO59TF
BS 788 788 RS1GO59JQ
BS 789 801 RS1GO59TF
BS 802 860 RS1GO59JQ

RD RS1GO59TF 801 0 0
GAGAGAAGTGTATTGCTTATGCTGAGAGTCACGATCAAGCTCTTGTCGGTGATAAAACAA
TTGCCTTCTGGTTAATGGACAGGGATATGTATGATTTCATGGCAGTAGACAGGCCATCAA
CTCCTCTGGTCGATAGAGGAATAGCTTTGCATAAAATGATCAGGCTTATAACCATGGGAT
TAGGCGGTGAAGGCTACTTAAATTTTATGGGGAACGAGTTCGGACATCCAGAATGGATCG
ATTTTCCCAGAGGCGAGCAGCGTCTTTCTGATGGGAGTGTGATTCCTGGGAACAACAACA
GTTATGACAAATGCAGGCGCAGATTTGATCTTGGGGATGCGGACTATCTTAGATACCACG
GACTGCAAGAGTTTGATCGGGCAATGCAGCATCTTGAAGAGAAATACGGTTTTATGACAT
CGGAGCATCAATTCATATCAAGAAAAGACGAAGGAGATAGAGTAATCGTGTTCGAAAGAG
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GTTGCTCCAAGCCAGGCAAATACAAGATCGTATTGGACTCGGACGATCCTCTGTTCGGTG
GATTCGGCAGGCTCGATCGCAAGTCAGAGTATTTCACATTTGAGGGGTCTTATGACGGAC
GACCCTCCTCTTTCATGGTCTACACACCATGCAGAACAGCAGTGGTTTACGCTTTAGCAG
ACCGTGATGATGGTCTCGAGACTTTGGATCCAAA*TCGTAAG*AGAGAGAGAGTATGAAC
ATATGTA*TGTCACTGAGGAT

QA 1 801 1 801
DS 

RD RS1GO59JQ 633 0 0
CCAGAATGGATCGATTTTCCCAGAGGCGAGCAGCGTCTTTCTGATGGGAGTGTGATTCCT
GGGAACAACAACAGTTATGACAAATGCAGGCGCAGATTTGATCTTGGGGATGCGGACTAT
CTTAGATACCACGGACTGCAAGAGTTTGATCGGGCAATGCAGCATCTTGAAGAGAAATAC
GGTTTTATGACATCGGAGCATCAATTCATATCAAGAAAAGACGAAGGAGATAGAGTAATC
GTGTTCGAAAGAGGTGATCTGGTCTTCGTCTTCAACTTCCACTGGACCAGCAGCTACTTT
GATTACCGCATTGGTTGCTCCAAGCCAGGCAAATACAAGATCGTATTGGACTCGGACGAT
CCTCTGTTCGGTGGATTCGGCAGGCTCGATCGCAAGTCAGAGTATTTCACATTTGAGGGG
TCTTATGACGGACGACCCTCCTCTTTCATGGTCTACACACCATGCAGAACAGCAGTGGTT
TACGCTTTAGCAGACCGTGATGATGGTCTCGAGACTTTGGATCCAAAATCGTAAGGAGAG
AGAGAGTATGAACATATGTAATGTCACTGAGGATGTAAAGTCTGTAAACGAAAATATCTA
AAACACTACCGGAGAAATAGCTCCTGATTAGCG

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 2

CO CL7912Contig1 895 2 4 U
GGGACTTCATAAGGAAAGAAAAAAATATCAGACCAAAAAATGTCAGAAGAAAAAGTGGTC
GTGTTTGAACTTCTGGCCAAGCATGTTCGGAGCAAGAGTGATCATGGCGTTAGAGGAAAA
AGAGATCAAATTCGAGTACAAGGAAGAAGATGTATTTGGTGACAAGACCGATTTATTGCT
CCAATCCAACCCGGTTCACAAGAAAATTCCGGTACTCATCCACAACGGTAAACCGGTATG
CGAGTCCAATATCATACTCGAATATATCGACGAGGTCTGGAATGACGACAAGACTCTTCG
TCTACTACCTTCTGATCCTTTTGAGAAGGCAAAGTGTAGATTTTGGGCTGATTTAATTGA
TAAAAAGGTTTTTGACGCAGGAAGAAGAACATGGACGAAGAAAGGCAAAGAACAAGAAGA
AGCAAAACGAGAGTTTATAGAGACATTGAAAGTATTAGAAACAGAGCTTGGGGAAAAGGT
TTACTTCGGAGGAAACGAAACTGTTTCAGTGGTCGACTTGGTCCTCATCTCTTATTACCC
TTGGTTCCACACTTGGGAGACAATAGGTGAATTTAGCCTGGAGGACCATACTCCCAAGCT
AATGGATTGGGTCCGTAGATGTTTAGCCCGACCAGCTATCTCAAAATCTCTACCCGACCG
GCTTAAGATCCTTGGTCGAGTGTCTCAGATCATAAAGGTCCATGAGTTCTTCTATGGTTA
TTGATATATCAATATTTCTAGCTTTTAAATAAAATAATGATGTGAATCATAACGAGTGAG
TGTAATGGACCGATTTTCATTCGTGGTGCTCGTATGAAAAATAATGTGTTTTTTGTTGCT
AAGTTTGAAAAGAAAAATGTTATGTTTGCTATTTTAATTGAAATAAGTTTATTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EA71TF U 1
AF RS1EA71JQ C 92
BS 1 583 RS1EA71TF
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RD RS1EA71TF 656 0 0
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DS 

RD RS1EA71JQ 804 0 0
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GTATTTGGTGACAAGACCGATTTATTGCTCCAATCCAACCCGGTTCACAAGAAAATTCCG
GTACTCATCCACAACGGTAAACCGGTATGCGAGTCCAATATCATACTCGAATATATCGAC
GAGGTCTGGAATGACGACAAGACTCTTCGTCTACTACCTTCTGATCCTTTTGAGAAGGCA
AAGTGTAGATTTTGGGCTGATTTAATTGATAAAAAGGTTTTTGACGCAGGAAGAAGAACA
TGGACGAAGAAAGGCAAAGAACAAGAAGAAGCAAAACGAGAGTTTATAGAGACATTGAAA
GTATTAGAAACAGAGCTTGGGGAAAAGGTTTACTTCGGAGGAAACGAAACTGTTTCAGTG
GTCGACTTGGTCCTCATCTCTTATTACCCTTGGTTCCACACTTGGGAGACAATAGGTGAA
TTTAGCCTGGAGGACCATACTCCCAAGCTAATGGATTGGGTCCGTAGATGTTTAGCCCGA
CCAGCTATCTCAAAATCTCTACCCGACCGGCTTAAGATCCTTGGTCGAGTGTCTCAGATC
ATAAAGGTCCATGAGTTCTTCTATGGTTATTGATATATCAATATTTCTAGCTTTTAAATA
AAATAATGATGTGAATCATAACGAGTGAGTGTAATGGACCGATTTTCATTCGTGGTGCTC
GTATGAAAAATAATGTGTTTTTTGTTGCTAAGTTTGAAAAGAAAAATGTTATGTTTGCTA
TTTTAATTGAAATAAGTTTATTGT

QA 1 804 1 804
DS 



AS 1 2

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ATATATATTAAACACTCTATATATTCTTTTCTTTCGTTTACTCTTTTCAATAACTTGTGT
ACATTATTTTTATAAGAATATGTTATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EW23TF U 1
AF RS1EW23JQ C 108
BS 1 674 RS1EW23TF
BS 675 688 RS1EW23JQ

RD RS1EW23TF 674 0 0
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AATTGGCGGTGGAAGGGATGGAGGCTGTAGCAGAAATGGTAGAAAAAGTGGCTACGGCCA
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TGGCTGTGGTTCTGGAACACATTTCAGAGGTTGCTGCACATGAAGCACATCTAACCCAAG
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AGCCTTTGGTGGACAAAAATGAGGCAAATGCTGAAACTAAGCAACAAGGTGATGAAAAAG
AAACAAACTCTAATCCTTCACGCCACTAATCTGTTCATCATCTAATTTAGACGCCAAAAT
ATATATATTAAACACTCTATATATTCTTTTCTTTCGTTTACTCTTTTCAATAACTTGTGT
ACATTATTTTTATA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1EW23JQ 581 0 0
TCTTCTCCAAACCCATGGTTTAATCTTCCTTCTTGCAGGGGAGGATGGGTCATAGGTTTT
GCGATTTCCGTGGTGTTATCTTTCTGGAACAATAATAGGATGCAGAAACTGAAACGGATC
AAAGCGGAGGCGGAATTGGCGGTGGAAGGGATGGAGGCTGTAGCAGAAATGGTAGAAAAA
GTGGCTACGGCCACTGAAGAAATGGCTGAAGTAATGGAAAAGAATCTGCCTGAGCAAAGC
AAACTTAAACAAGTGGCTGTGGTTTTGGAACACATTTCAGAGGTTGCTGCACATGAAGCA
CATCTAACCCAAGATTTCCTTCACAAGGTGGAAGATGTCGCCCAAGATTTGGATGAGCTG
GAGGCAATGATAGAGCCTTTGGTGGACAAAAATGAGGCAAATGCTGAAACTAAGCAACAA
GGTGATGAAAAAGAAACAAACTCTAATCCTTCACGCCACTAATCTGTTCATCATCTAATT
TAGACGCCAAAATATATATATTAAACACTCTATATATTCTTTTCTTTCGTTTACTCTTTT
CAATAACTTGTGTACATTATTTTTATAAGAATATGTTATCG

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

CO CL7914Contig1 917 2 2 U
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TATTCGCGGTCCACTGGATCTCAGCGGTTATGTAGCCGCCACCAACCAAGTTGAAGCTAA
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TCCAACACTTAACGAGCTAAGGGGACCGGGCATTGGTTCTGAGGGTGATAATGTAAGAGC
AAATGGGTTTCTCAAGGTTTATCCCAAGGAGTTTGATAAGGACAGTCGTTTCATAGGTGC
TAAACGGAGGAAGTCTGGTTCTGTGAGAAGATTCAAACAAGACGGAACCGCTAGTAACAA
CAACAACAACCACACAAAAGCTACTACACCAGATCAGAACCAGACACCAGAGTTGACTAC
CTTAGACTCTTTGGTAAAACCGCAAGGATAGGGAATGTGTTGGAAAATAACAGTATCTCT
CAGAAAAGCAAGGTGGAGGAATTGGACATAGTGAGGATCATCAAGCCAGCGAGATTTTCT
TCATCTATAACAAACAATGTACAAGACGCGTTGGTTACCTTTTCCGCGTTGAGGTCTGAT
GGGAAGGAAGTAACAGTAGACAATAGATTTCTCAAGGCTCACAATCCTCTTCTGCTGATT
GAGTTCTACGAGCAACATCTCAAGTACAATCCGGAAAGATAACTATTTGTTTGTACACAG
CACTTTGTAGGTAGAAAAAGATTAGATGAGCAACGTGTAGAGTTGAGGTAGTGGCTAGTG
TTATCTTTATCTCTTCTGGTTCGTTATTTCCACTTTCTATCAAGTAAATCTTTTCACTTA
GACTTTTACGTTTCTTGAGCTGAGATTTTGTTATTGCATGTTCAAAGATTAATATATATA
CATGGATCAGTAGATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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BS 1 723 RS1AN60TF
BS 724 917 RS1AN60JQ

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CAC

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DS 

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CAGACACCAGAGTTGACTACCTTAGACTCTTTGGTAAAACCGCAAGGATAGGGAATGTGT
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QA 1 757 1 757
DS 



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TAGACAGCTGAATTAGCAG


BQ
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AF RS1BB29JQ C 1
AF RS1BB29TF U 1
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CGAACCGGTTCTTGCCCGTGACTGTGATGTTGGTTCTTGTTTTATTGGTTTTATTTGGAA
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AGTAGAATTTTCGTTTTCTGGCTGCTCGTGAAAAAACCGCGTGACCGAGCAAAAAACGTT
CTTTGGTTTATTTCCTTGTTACGTTGTTTCTTGTCTGTTTCTTTCATAGTTGTTAATTTT
TAGACAGCTGAATTAGCAG

QA 1 559 1 559
DS 



AS 1 2

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TTTCAATATAAC


BQ
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AF RS1BU70TF U 1
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AAGAGGAAGCTGACGCTGCAGATGAAGTGTCTGAAGCTGGGAATAAAACCGCAAGAACCA
CAAAGAGGGTGACACGTGTGGTGTTGAACAAGCGAGCTAGACAAAAGGCGCCGCGAGAGG
AGGAGACGAAGGAGAAGCATAAAGAGAAGTTATCAAAGGAGATTGACAGGTATTTATTTG
AATTTTAATGCTCAAATAAAATATTTATTCAAACGAAGTTGTGTTTGTTCTTACTATTCT
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GAAGCTGAACAAAAAGATAAGACAGACCATTGCTAAGGAGGAAGTGCTTAAGATACGTCC
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GATGACCGGTTCACTTCGTAAGCTCAAGGCGTGTTGCACACTTGCGAGAGATAGATTCAA
GAGTCTGGAGAAGAGAGGAATACTTGTTCCATCAAAGACCATTAGAAG
AACA

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CAAGCGAGCTAGACAAAAGGCGCCGCGAGAGGAGGAGACGAAGGAGAAGCATAAAGAGAA
GTTATCAAAGGAGATTGACAGGTATTTATTTGAATTTTAATGCTCAAATAAAATATTTAT
TCAAACGAAGTTGTGTTTGTTCTTACTATTCTTCTTATTTTTTTTTGTAGCTTGCCCAAA
ATAATAAAAGAAATAGCCGAAGAAGATGAGGAGAAGCTGAACAAAAAGATAAGACAGACC
ATTGCTAAGGAGGAAGTGCTTAAGATACGTCCTCCTCGTTTGGGAAAGCACAAGTATGAG
GCTCCTCCTGTTCAAGTCCTCTTAACAGAAGAGATGACCGGTTCACTTCGTAAGCTCAAG
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CCATCAAAGACCATTAGAAGGAACAAGGAAGGAACTCTTCTCACTTTGAAAAAAAAGCTT
TTTGATGCTGATACTGTCTCAATAGACGACTCATATGTGTTCAACGTTTAAGTTTGGTTT
TATTGTGTTATAAATTGTGAGTTTGGGAGGAAAACAAAAAATGTTGCTACCAATTTCTTT
ACTCATAATGTCACAAACATGTTCTTCAGTCATTTCAATATAAC

QA 1 764 1 764
DS 



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BQ
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AF RS1GG64TF U 1
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QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 2

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ACCTTGTTGCATTGAGATTCTCTTGCCAGATCAATGGATTTGCATCACTTAATCTTACTA
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AGTATGAAACCTTACCTGGATGAAAGTCTGACATATCCTCAATAAGAAACTATGCTGAGC
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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ATGGCACTCGTGTGGACTCGTTCCCTGGTGATCTTCGTCTTCTTGAAGAATTGCAAGTGG
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DS 

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AATGGATTTGCATCACTTAATCTTACTAAGCTTGATGTGCTTTCTGACCTGGACGAAATC
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CTTCGTCTTCTTGAAGAATTGCAAGTGGAGTATGAAACCTTACCTGGATGAAAGTCTGAC
ATATCCTCAATAAGAAACTATGCTGAGCTCCCAAAGGCTGCACAGCAATATGTTGAGAGG
ATTGAAGAACTAGTGGGTGTGCCCATTCATTACATTGGTATTGGACCCGGTCGTGATGCC
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TAAAGATGAATTATGTGTGTTAAGCAGTGAGTTTGTTGCGTCC

QA 1 703 1 703
DS 



AS 1 2

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ATTCTGATGATTACTCTGATGCTAAAGAGATGGTGAAGTTGTCTGAATCTAATATGGAGG
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ACTCTGAAAAGGCAGAGATGGTGAAGACTTCAGAAGCTGAATCAGGACAGTCTGATTTGG
AGGAGAGTCTAGTTAATGACTCGGTGAAAGAGACTTCTAGTGAGGAGATGGTGAGGGTTT
TTGAAGGTGATGATGAATCAGAAGTTATTGATGCTGGTGAAGAGACACTAAAGGAGAATA
AAGCTGAAGATCACAAAGAGGAGCTTCAAGACCAAACTGAAGAAACCACAACAAAGGTTC
CATATAACCGTAAACAAAAGCCCTGCAACCAAGAAGAGTCAGATGCCACTATATCTTGGA
CCATCACCAAAGGCAAGAAGCCTGTGGCAGAGGCAGAGGAGTTGAAGGATTTCAACCCAG
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CTAATAAATTTGATGTGTTGCAAGTTATGGTTATGAAAAAACTTTCATGGTTTTTATGTT
TGGTTGTAATATGAATGATATGATTCTCCTTAATCTGTGAGGAGGACTCAGTGTGTGCTT
GCTTTGAGACTAATGTATGGGGATAATCTTATGTATTTGTCTAGTTATATGTAACTATTC
GAAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1B138TF U 1
AF RS1B138JQ C 173
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GAGTATGG

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DS 

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ATGA
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AATAAAGCTGAAGATCACAAAGAGGAGCTTCAAGACCAAACTGAAGAAACCACAACAAAG
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TGGACCATCACCAAAGGCAAGAAGCCTGTGGCAGAGGCAGAGGAGTTGAAGGATTTCAAC
CCAGGAGAACCCAATTACCTTCCCCTTGTGCCAGATGCGGATGCTGAAAAGGTTGACCTC
AAGCATCAGGACATAGATGAGAGGAGAAACTCAGAGAACTGGATGTTTGATTATGCTCTA
CAGCGTGCTGTTAACAAACTTTCCTCAGAGAGGAAGAAGAAAGTTGCATTGCTTGTGGAG
GCATTTGAAACCGTGAAACCTGTTATGCCACATGGTCGAGAGCCTGCACCAGTTTTGAGT
TATGGAAGACACCTTCAGACCTGCAATTAACAGAGGTAATCAACTGAATCTCTTACAAAC
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TGTTTGGTTGTAATATGAATGATATGATTCTCCTTAATCTGTGAGGAGGACTCAGTGTGT
GCTTGCTTTGAGACTAATGTATGGGGATAATCTTATGTATTTGTCTAGTTATATGTAACT
ATTCGAAACG

QA 5 854 5 854
DS 



AS 1 2

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GGCTGGGACGTGTTGCCTCCAGCGCCTAAGGTATAGATCTGCTCATCTCCGTATCATCCA
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ATTTTACGTTCGATCTATATATATGTGTGTGTGTTGATTCTTCCGGATCTGCGATTTTTA
ATATATTTTAAATCAATTAAGCTCTTGAAAATACCAATTCTTATGTAATTATGTGTTGTA
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GGAGATTAGTAGCTCTACTTCTCTTTCTGTTAAGACTGTTGCTCGTAATGATTCTCCTCC
CTGGCGTGAAGATGACAAGGACGGACATTACATGTTTGAACTGGGAGATGACTTAACTCC
ACGCTGTAATACACACTTTTCCATTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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TGAATCATAACTTTATATATTTTGTTTAATTCCTTCAGATCTCCGATTTTTTTTCTTCAA
ATTTTACGTTCGATCTATATATATGTGTGTGTGTTGATTCTTCCGGATCTGCGATTTTTA
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QA 1 594 1 594
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AACAATATATAAATCGGGTTTCAATTCTAGATAATTGTGTTAAGGTGTTAAGATAGAATA
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DS 



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CATGTTTGGTTTTCGTC


BQ
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AF RS1AT59JQ C 1
AF RS1AT59TF U 1
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DS 

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CATGTTTGGTTTTCGTC

QA 1 557 1 557
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1D370TF U 1
AF RS1D370JQ C 165
BS 1 720 RS1D370TF
BS 721 858 RS1D370JQ

RD RS1D370TF 720 0 0
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QA 1 720 1 720
DS 

RD RS1D370JQ 694 0 0
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AAACTCATGAAAATAGGAATAGACCCAACCAACCATCGTCTCTACCATCACGCAAACTAT
ATTTCAAGACAATACCTCAGCTCCTCTCGTAAGAAACTTGAAACAGATATCGTTAGTGAT
CAATCTTCTTCACTATCCGAATCATGTGATATGAGAATATTACCCGTTTCAAGTACCGAT
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AGCAGTGGTTCGACGCGTCAAAACGCTTCTTCTTTTCCGGTGAAATCGGATATTTTATTG
CTACATAAGAAATGAAAAATGGTGTATGTCATCC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL7923Contig1 908 2 6 U
GGATATACTTTTATTTTCTCTCCCAAAGTTTCTCCCTTTTCGATTCCAAAAGATGAGTGG
AGAGGAAACGAAAGAGAACAACCAGAAGCTGCAGAGACCTGCTCCTCGTCTTAACGAGAG
GATCCTCTCTTCCTTGTCCCGACGATCCGTTGCTGCTCATCCATGGCATGATCTTGAGAT
TGGACCTGGAGCTCCACAGATATTCAATGTGGTCGTTGAGATCACAAAGGGGAGCAAGGT
CAAATATGAACTTGACAAAAAGACTGGACTCATCAAGGTTGATCGTATTCTGTACTCATC
AGTTGTTTACCCTCACAACTATGGTTTCGTTCCTCGCACTTTATGTGAAGACAATGACCC
TATTGATGTACTAGTCATCATGCAGGAACCTGTCCTTCCTGGTTGTTTTCTGCGTGCTCG
TGCTATTGGATTAATGCCTATGATTGATCAGGGTGAGAAAGATGACAAGATTATTGCAGT
TTGTGTTGATGATCCTGAGTACAAGCATTACACTGACATCAAAGAACTCCCTCCTCACCG
TCTCTCTGAGATCCGTCGTTTCTTTGAAGACTACAAGAAGAATGAGAACAAGGAAGTTGC
AGTTAATGATTTTCTGCCATCTGAGAATGCTATCGAAGCTATCCAGTACTCAATGGACCT
TTATGCTGAGTACATTCTCCATACCCTAAGACGTTGAAGCTTCTCTTCGGGACTTTTCGT
GCAACACCTTGGTTTCTGTTTCTTTAAGAAACACCTTTATCTTAATTCATACTTTCTCTG
CTTTTTCTTTTAAGACGTGGGATCTATCATTTGTCCTTGTGAACTCATTTCGACTGAATC
ATTCACCAACACCCTCGTTAAGCATTTTCATCCATGGATGTATAGAAAATTATCATCCAC
TTTTCCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GM29TF U 1
AF RS1GM29JQ C 197
BS 1 734 RS1GM29TF
BS 735 735 RS1GM29JQ
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BS 748 785 RS1GM29TF
BS 786 908 RS1GM29JQ

RD RS1GM29TF 788 0 0
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AGAGGAAACGAAAGAGAACAACCAGAAGCTGCAGAGACCTGCTCCTCGTCTTAACGAGAG
GATCCTCTCTTCCTTGTCCCGACGATCCGTTGCTGCTCATCCATGGCATGATCTTGAGAT
TGGACCTGGAGCTCCACAGATATTCAATGTGGTCGTTGAGATCACAAAGGGGAGCAAGGT
CAAATATGAACTTGACAAAAAGACTGGACTCATCAAGGTTGATCGTATTCTGTACTCATC
AGTTGTTTACCCTCACAACTATGGTTTCGTTCCTCGCACTTTATGTGAAGACAATGACCC
TATTGATGTACTAGTCATCATGCAGGAACCTGTCCTTCCTGGTTGTTTTCTGCGTGCTCG
TGCTATTGGATTAATGCCTATGATTGATCAGGGTGAGAAAGATGACAAGATTATTGCAGT
TTGTGTTGATGATCCTGAGTACAAGCATTACACTGACATCAAAGAACTCCCTCCTCACCG
TCTCTCTGAGATCCGTCGTTTCTTTGAAGACTACAAGAAGAATGAGAACAAGGAAGTTGC
AGTTAATGATTTTCTGCCATCTGAGAATGCTATCGAAGCTATCCAGTACTCAATGGACCT
TTATGCTGAGTACATTCTCCATACCCTAAGACGTTGAAGCTTCTCTTCGGGACTTTTCGT
GCAACACCTTGGTT*CTGTTTCTTTA*GAAACACCTTTATCTTAATTCATACTTTCTCTG
CTTTT
CTT

QA 1 785 1 785
DS 

RD RS1GM29JQ 712 0 0
CAGATATTCAATGTGGTCGTTGAGATCACAAAGGGGAGCAAGGTCAAATATGAACTTGAC
AAAAAGACTGGACTCATCAAGGTTGATCGTATTCTGTACTCATCAGTTGTTTACCCTCAC
AACTATGGTTTCGTTCCTCGCACTTTATGTGAAGACAATGACCCTATTGATGTACTAGTC
ATCATGCAGGAACCTGTCCTTCCTGGTTGTTTTCTGCGTGCTCGTGCTATTGGATTAATG
CCTATGATTGATCAGGGTGAGAAAGATGACAAGATTATTGCAGTTTGTGTTGATGATCCT
GAGTACAAGCATTACACTGACATCAAAGAACTCCCTCCTCACCGTCTTTTTGAGATCCGT
CGTTTCTTTGAAGACTACAAGAAGAATGAGAACAAGGAAGTTGCAGTTAATGATTTTTTG
CCATCTGAGAATGCTATCGAAGCTATCCAGTACTCAATGGACCTTTATGCTGAGTACATT
CTCCATACCCTAAGACGTTGAAGCTTTTTTTCGGGACTTTTCGTGCAACACCTTGGTTTC
TGTTTCTTTAAGAAACACCTTTATCTTAATTCATACTTTTTCTGCTTTTTCTTTTAAGAC
GTGGGATCTATCATTTGTCCTTGTGAACTCATTTCGACTGAATCATTCACCAACACCCTC
GTTAAGCATTTTCATCCATGGATGTATAGAAAATTATCATCCACTTTTCCAT

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 2

CO CL7924Contig1 1219 2 2 U
GTGGAGGCCCCCGATTGAGGAAACGGAAGTGGATGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAAGATGA
AGTAGACGATGCAGAAGAGGAAGAGGACCTTTTATCCCTAGTTGATCCGGAAACTGCAAG
AGAAATCGCGAAACAAATGTTTTCGATTGGCACAATTGTTGAGGTTAGCAGCGATGAGGA
AGGTTTCAAAGGGGCTTGGTTTGCAGCTAAAGTCATTGAACACATTGGCGAAGACAAGTA
CCTTGTTGAGTACCGAGACTTGAGAGAAGAGAACGGCATCGAGCCTTTGAGAGAAGAAGC
CGACTATCTGCACATAAGGCCACCACCACCGACTGATGAGGATATAGATTTTTCTGTCGG
CGACAAGATTGATGCGTTTTACAATGACGCCTGGTGGGTAGGTGATGTCATAGAGACTAG
TATGAAGGACGGAATCGTTGGTATCTGTTTCAGGCCATCAGGAGAAAAGATGCGGTTTGG
GAGACAGGGTCTTCGTCTGCATAAAGACTGGATCAACGGGACCTGGCAGCTACCACTGAA
ACGAGGAGAGATGAAGAGGGCAGCAAAGAAAGTTCCGTGTGATCGGAACGTAAGACCTAG
AAAAGCAATCGACAAGGAATATTTCAGCATTGGAACTCCAGTGGAGGTTAGCAGTGTTGA
AGAAGGATTTGAAGATTCTTGGTTTCTTGCAAAGGTTATTGAGTACATAGGAAGGGACAA
GTGCCTCGTGGAGTATGAGAAGCTGAAAGCTGAAGATGGGAAAGACCCATTGAGGGAAGA
GGTTAATGTTTTTCAAATGAGGCCTAGACCACAAGAGACGGTCATGGTTAATCCGTTGGA
GAAGCTTGAAAAAGTTGATGCTTTGTATAATGATGGATGGTGGGTCGGGTTGGATAGAAA
GGTTCTTGCAAAGTCGAGCTACCTAGTTCATTTCCCGAAAACAGATGAGGTGCTAAAGTT
TCATGTTTCTCGGCTAAGGCCACATCAGGAATGGATTGATGGCAAGTGGATAGAATCTTC
CAAGACTCAAACGGTGTAGTTGAGCTGGAGAACACGGTAGGATTCTGGGGATCTCAAGTT
TTGTTAATTTGGAGGCATTTGAATCTGAGAGCTTAGCCTTGATGTTCCCTTTCTATTGTA
TACAGTTGCATTTATGATGATGATTGACCAGAAGATAAAAGAAAAGAGTTGATATTTTAT
TAATTTCCATTCATTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EB20TF U 1
AF RS1EB20JQ C 455
BS 1 661 RS1EB20TF
BS 662 1219 RS1EB20JQ

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AGTAGACGATGCAGAAGAGGAAGAGGACCTTTTATCCCTAGTTGATCCGGAAACTGCAAG
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AGGTTTCAAAGGGGCTTGGTTTGCAGCTAAAGTCATTGAACACATTGGCGAAGACAAGTA
CCTTGTTGAGTACCGAGACTTGAGAGAAGAGAACGGCATCGAGCCTTTGAGAGAAGAAGC
CGACTATCTGCACATAAGGCCACCACCACCGACTGATGAGGATATAGATTTTTCTGTCGG
CGACAAGATTGATGCGTTTTACAATGACGCCTGGTGGGTAGGTGATGTCATAGAGACTAG
TATGAAGGACGGAATCGTTGGTATCTGTTTCAGGCCATCAGGAGAAAAGATGCGGTTTGG
GAGACAGGGTCTTCGTCTGCATAAAGACTGGATCAACGGGACCTGGCAGCTACCACTGAA
ACGAGGAGAGATGAAGAGGGCAGCAAAGAAAGTTCCGTGTGATCGGAACGTAAGACCTAG
AAAAGCAATCGACAAGGAATATTTCAGCATTGGAACTCCAGTGGAGGTTAGCAGTGTTGA
A

QA 1 661 1 661
DS 

RD RS1EB20JQ 765 0 0
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AACGGGACCTGGCAGCTACCACTGAAACGAGGAGAGATGAAGAGGGCAGCAAAGAAAGTT
CCGTGTGATCGGAACGTAAGACCTAGAAAAGCAATCGACAAGGAATATTTCAGCATTGGA
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GTTATTGAGTACATAGGAAGGGACAAGTGCCTCGTGGAGTATGAGAAGCTGAAAGCTGAA
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GAGACGGTCATGGTTAATCCGTTGGAGAAGCTTGAAAAAGTTGATGCTTTGTATAATGAT
GGATGGTGGGTCGGGTTGGATAGAAAGGTTCTTGCAAAGTCGAGCTACCTAGTTCATTTC
CCGAAAACAGATGAGGTGCTAAAGTTTCATGTTTCTCGGCTAAGGCCACATCAGGAATGG
ATTGATGGCAAGTGGATAGAATCTTCCAAGACTCAAACGGTGTAGTTGAGCTGGAGAACA
CGGTAGGATTCTGGGGATCTCAAGTTTTGTTAATTTGGAGGCATTTGAATCTGAGAGCTT
AGCCTTGATGTTCCCTTTCTATTGTATACAGTTGCATTTATGATGATGATTGACCAGAAG
ATAAAAGAAAAGAGTTGATATTTTATTAATTTCCATTCATTTTCT

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

CO CL7925Contig1 1196 2 2 U
GGACCTCCAATGGATTCTGTTTCCCTTTCTGAGGTTACTGTCATGAGAAGAACACATTTG
GGGTTTATGCACAGTTTCAGACAACCATTTTCTGGTGTTACAATATCTCCCAAGTTCTAC
CACTCCAAAGTTGTAGGATCAAGGGCAATGTCTTCAAGTGTTTCCAGTACAAAGAGCCAA
TATGTTTATGGAGAAAGCTTAGCTGCAACTGCAGATTCAGATTATAAGATGAATGGATTA
ACCCTAAAAAACAGAATCAGTTCTGTTAAAGAAAGATTATTACTTGATGCTTTTGATGAT
GAGTATGGTGGAGTAGTAGTTGATCATGAAAAATTACCATCAAACCCTAACGCTTTCACA
GCAATGCTTAGAAACTCTCTCTCGGATTGGAGAAGAAAGGGAAAGAAGGGAGTTTGGTTG
AAGTTACCTGTGGAACAATCTGAGTTAGTCCCAGTTGCTGTAAAGGAAGGATTTGAATAT
CATCATGCAGAGAAAGGATATGTGATGTTAACTTATTGGATACCAGAGGAGGAGCCTTGT
ATGCTTCCTGGAAATGCTTCACATCAAGTTGGTGTTGGAGGCTTTGTCTTGAACCAATAT
AAAGAGGTGCTTGTGGTGCAAGAAAAGTATTGTACTTCATCAAATACAGGTCTATGGAAA
TTGCCAACTGGATTTATTAATGAATCAGAAGAAATCTTCTCTGGAGCTGTAAGAGAAGTC
AAGGAAGAAACTGGGGTAGATACAGATTTCTTAGAGGTTATAGCTTTCAGACATGCACAC
AACGTCGCGTTTGAGAAGTCTGATCTGTTCTTCATCTGTATGTTGAAGCCACTCTCTGAT
AAGATCAGCATCGACAACCTTGAGATCAAAGCCGCTAAGTGGATGCCATTGACGGAGTTT
GTGGAGCAACCAATGATAAAAGGAGACAAAATGTTTAAGAGAGTGATTGAAATATGTGAA
GCGAGATTAAGACATCGTTACTGTGGTCTTTCTCCTCATCGACTTGTCTCTGCTTTTGAT
GGCAGACCTTCTTCTCTCTACTACAACGTTGTTGATGATGATGATCTTTCCCACTCCAAC
TGTACAGCTGAATTTTATTAATAACCGGATCAAACCGGACGGGAACAAAAGTCAAGTGGT
AAGATTCTGTGTATATATAATTCCATGTAATGAATGTTGTTATTTGAACACTCTTC


BQ
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AF RS1D156TF U 1
AF RS1BH54TF U 523
BS 1 639 RS1D156TF
BS 640 1196 RS1BH54TF

RD RS1D156TF 639 0 0
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GGGTTTATGCACAGTTTCAGACAACCATTTTCTGGTGTTACAATATCTCCCAAGTTCTAC
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TATGTTTATGGAGAAAGCTTAGCTGCAACTGCAGATTCAGATTATAAGATGAATGGATTA
ACCCTAAAAAACAGAATCAGTTCTGTTAAAGAAAGATTATTACTTGATGCTTTTGATGAT
GAGTATGGTGGAGTAGTAGTTGATCATGAAAAATTACCATCAAACCCTAACGCTTTCACA
GCAATGCTTAGAAACTCTCTCTCGGATTGGAGAAGAAAGGGAAAGAAGGGAGTTTGGTTG
AAGTTACCTGTGGAACAATCTGAGTTAGTCCCAGTTGCTGTAAAGGAAGGATTTGAATAT
CATCATGCAGAGAAAGGATATGTGATGTTAACTTATTGGATACCAGAGGAGGAGCCTTGT
ATGCTTCCTGGAAATGCTTCACATCAAGTTGGTGTTGGAGGCTTTGTCTTGAACCAATAT
AAAGAGGTGCTTGTGGTGCAAGAAAAGTATTGTACTTCA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RS1BH54TF 674 0 0
G
CAGAGGAGGAGCCTTGTATGCTTCCTGGAAATGCTTCACATCAAGTTGGTGTTGGAGGCT
TTGTCTTGAACCAATATAAAGAGGTGCTTGTGGTGCAAGAAAAGTATTGTACTTCATCAA
ATACAGGTCTATGGAAATTGCCAACTGGATTTATTAATGAATCAGAAGAAATCTTCTCTG
GAGCTGTAAGAGAAGTCAAGGAAGAAACTGGGGTAGATACAGATTTCTTAGAGGTTATAG
CTTTCAGACATGCACACAACGTCGCGTTTGAGAAGTCTGATCTGTTCTTCATCTGTATGT
TGAAGCCACTCTCTGATAAGATCAGCATCGACAACCTTGAGATCAAAGCCGCTAAGTGGA
TGCCATTGACGGAGTTTGTGGAGCAACCAATGATAAAAGGAGACAAAATGTTTAAGAGAG
TGATTGAAATATGTGAAGCGAGATTAAGACATCGTTACTGTGGTCTTTCTCCTCATCGAC
TTGTCTCTGCTTTTGATGGCAGACCTTCTTCTCTCTACTACAACGTTGTTGATGATGATG
ATCTTTCCCACTCCAACTGTACAGCTGAATTTTATTAATAACCGGATCAAACCGGACGGG
AACAAAAGTCAAGTGGTAAGATTCTGTGTATATATAATTCCATGTAATGAATGTTGTTAT
TTGAACACTCTTC

QA 2 674 2 674
DS 



AS 1 2

CO CL7926Contig1 696 2 2 U
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ATGGAAGGCAAAAATGTGATTCTAAGTGTGCTCATAATTAGTCTTGTCATGGCGCAGAAT
CAAGTCGAGGCAAAGAGTTGTTGCCCGAACACCACTGCCAGAAACACGTATAATGTTTGC
CGTCTTCCTGGAACCCCTAGGCCAATTTGTGCATCAATCAGTGGATGCAAAATTGTTTCT
GGGACATGTCCTCCGGGATATACAAATGAAATTCTCGAAAACTCTGGTGATGCTGTCAGT
GAATACTGCAAGTTGGGGTGTGCATTCTCTGTGTGCGGTGCCCTAAGCACTCTCCAAAAC
TCCGATGCAAGTGAAATTGTGAATAGAGCGGTTGCACAGTGCACCAACGCATGTTCTAAT
ATCTGCACCAAGCGCTCGGTTAATGCAGTTGAACCTGCCTAAAACAAGCACATTCACGAT
CTATGTACTGTATGTGTTGTTGTTCTTCCTGTTTTCAATAATTGTCGTGTATATCCACGA
TCTATGTATTGTTGTTCGTCCTGTTTTCAATAATTGTCGTGTATGTGACAAAATGCTAGA
CTCTGTTTTCTGTTTTATGTGTTGTAGAAGGTCACCGATCCCTAGGTTGTTATCCCTTCT
ACTTGCTATATCCAAATAAAGAATAATGTTCCCTTG


BQ
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BQ
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CTTGTTATGATGAGCGTCTGAAAACC

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DS 

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TTTCTCTCCGACTAATTTCTCTACTATCATAAATACTTTGGAACTTCAGATACTAAATGA
CTTTTGCACAGGTTTTACTCTTTACTGTCTAGTAGTTTTGTTTAACATGTGTAAACGAGT
TCACTTGGAAACTTTTGAATCCGCGTCTTCTAATTTTGACTTTTGGACTGAGAGTTAGTA
ATTCAATTCGCATTTATGGTGAGAAGTAGGAACTCAGTGCGCATTTGACTTTAATCCGTA
GAGATGTTACTAGAGATAATGCTAGAATAAAAATTGTAAGATTAAAAGATGCTATCCGAT
TATTAGATTATGTTTGACAAATGGATTTGTTGAATGGTTTCCCTCTATCACTTGTTATGA
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CTCAGTCGTCTGATCTTCCTCCATCACTTTGCCTATACGTTATTTCATTACCAATTTAGA
ATGAATTTACCATTGTTTAATAAAATGGAATAAGGAAATTCTCG

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

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TCAGAAAGTTGAGGCTTACATAAAAATAAAATAAGAGTTTTGCATCTCTCTTTACTCTTT
ATTTTAGGGGTATTCTTGTTCACGTCACGTGCTCGTGCTCGTGCTGACAATATTGAGTAA
AAGCAGCTAGGAGGGTATTTGAGGAATTTCGGCTTACGTCCGAACTTCAGCTCGTGTAAG
AAGAGTACGATGCAAAGAATCTTAATACGCATGACTTTGTGATATGTGAAGCGGAAACAA
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TCTCCACCTCTTCCCACTTTTGTCTTCTTTGATCTTTTGATTTTTTTTACCTTGAACAAC
TTTTGTCTTCTTATTAAGAATGGTTCTCAACTAAGCAAACGTACTCTTTTAATATTTCGT
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AACTGTTACAAATCTCTTTCGCTTTAGT


BQ
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TCTCCACCTCTTCCCACTTTTGTCTTCTTTGATCTTTTGATTTTTTTTACCTTGAACAAC
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AATGGAGT
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DS 

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TTTTACCTTGAACAACTTTTGTCTTCTTATTAAGAATGGTTCTCAACTAAGCAAACGTAC
TCTTTTAATATTTCGTTAACTTTCCATGTTTACTAAACAATCTTAATGTTTTGTAAATTA
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TCTCTATGATCTTTTTAACTGTTACAAATCTCTTTCGCTTTAGT

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

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BQ
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AA
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QA 3 612 3 612
DS 

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AACTGGTTTCATACGCAGAAAAAGATTGTAAGTGTTATTGCCTCAGTCTTCAACCTCGGT
GTTGAATATAAAACTTGGGAATGCCGTCGTCACATCCTTTAGGTAAGGAAGAGTCATATT
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GGCAAGACGAGTCC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1AK13TF U 1
AF RS1AK13JQ C 236
BS 1 785 RS1AK13TF
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AGCAAGAAGTTCATTGGAAACGCAAGTGAACTGCTGAAAGATGGATATGTAATAGCCATG
TATGCAAAAGACCTCTCGGGTCTGCATGTTTCAAGGCAAAGAACGAAAAACGGTGGTTGG
TTCCTCGATACTTTGTCAAATGTGTCCAAACGGGATCCGGCTGCACAATTCATTATCGCA
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DS 



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BQ
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AF RS1E054TF U 1
AF RS1E054JQ C 101
BS 1 657 RS1E054TF

RD RS1E054TF 657 0 0
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TCTTCATCAACAATCTTAAACCACTAGGATGTTACCCAAGCATTATAGCTCATACCGTGC
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GAACAGGACTGACTCAGTTGAAGGAAAAGTTTGCCAACACTTCTTTTTTGTACTCAGATT
ACTTCAACTTTATGTTGGGACTTAGAGGACCTTCAAGCAATCAAGTTAGCTCAAATCTCA
TGGACTCGACGAGCCCATGTTGTCCCAGTGTTTATGATGGAGGGTACATCACAAGCTGCA
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CGACTCAGCTGGCGAATTTCATGTATGCGATTGGGTGTTTCCAGGAGAGAAAAGTTTGCC
AAGTCTTGTGAGATTAAATGTGTGATTACCTAAAAGATAATAATAATTGATTTCTCC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RS1E054JQ 557 0 0
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AATATTAGGAGCAAGGAAATTCTTCATCAACAATCTTAAACCACTAGGATGTTACCCAAG
CATTATAGCTCATACCGTGCCAAGTGGAAGCTGCAACAATGGTTTAAACCTTGCGATTTC
CATTTTCAACGCCAAGCTAAGAACAGGACTGACTCAGTTGAAGGAAAAGTTTGCCAACAC
TTCTTTTTTGTACTCAGATTACTTCAACTTTATGTTGGGACTTAGAGGACCTTCAAGCAA
TCAAGTTAGCTCAAATCTCATGGACTCGACGAGCCCATGTTGTCCCAGTGTTTATGATGG
AGGGTACATCACAAGCTGCAGGCCAAATTCAATAGCGTGTAAGGTGCCAGATCCACATAT
TTTCTTTGATCCATTTCATCCGACTCAGCTGGCGAATTTCATGTATGCGATTGGGTGTTT
CCAGGAGAGAAAAGTTTGCCAAGTCTTGTGAGATTAAATGTGTGATTACCTAAAAGATAA
TAATAATTGATTTCTCC

QA 1 557 1 557
DS 



AS 1 2

CO CL7933Contig1 752 2 5 U
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CTCCATCAGATATTTGGTAGTTAACGAGTCTCTGAAGACCATCAACAATTGCGGTCTCGT
CATCTTCTTGATTAGTTGTAGAGACAATAGGTGTGTTGCTTGCACCATAAGGCATTGGAC
GATAGATGTTCTGATTGGCTAAGGCTATGGTGACGTCAGAATTACTGTTTGTGGTGGTTG
TGGTGCTACCGTCGCCAGAATATTCGGTTGAGAGCTTGTCGAGATTGTTGCTGATGTTGT
TGTTGCTGTTGTTGTTAAGGTTGTTGTCGGAATGATTAGAGGAAGATGAATGGTGTTGTT
TGTTGTTGTCTTAAGGCCAAGCGGGATGATGATGATGCTGAGTTATGATTATGATGTCTT
GTGGATAGAGAACGTGGCAAGGATGGATGATCTTCTACTACTGGCCTTTTGTACACTCGG
CACAATGATATCTCAGCCTTTTGGTATTTCTCGGTTTCATGGTGAGGGAGACGGTACTCG
TTCATAATCCAACTGGTACGAGTGCCTTTAGGGGCTTTACCGGAGTAGAAAACTAGGGTT
TTCTTTAATCCAATCGGCCGAGAAGTCTCCGATCTGATCATCCGATCAGCTCCAGTTGCT
TTCCAATACCCTGAAGTCGTTACTCGATTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AD04JQ U 27
AF RS1AD04TF C 1
BS 1 26 RS1AD04TF
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BS 497 752 RS1AD04TF

RD RS1AD04JQ 470 0 0
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ATGGTGACGTCAGAATTACTGTTTGTGGTGGTTGTGGTGCTACCGTCGCCAGAATATTCG
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TCGGAATGATTAGAGGAAGATGAATGGTGTTTTTTGTTGTTGTCTTAAGGCCAAGCGGGA
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QA 1 470 1 470
DS 

RD RS1AD04TF 752 0 0
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CATCTTCTTGATTAGTTGTAGAGACAATAGGTGTGTTGCTTGCACCATAAGGCATTGGAC
GATAGATGTTCTGATTGGCTAAGGCTATGGTGACGTCAGAATTACTGTTTGTGGTGGTTG
TGGTGCTACCGTCGCCAGAATATTCGGTTGAGAGCTTGTCGAGATTGTTGCTGATGTTGT
TGTTGCTGTTGTTGTTAAGGTTGTTGTCGGAATGATTAGAGGAAGATGAATGGTGTTGTT
*GTTGTTGTCTTAAGGCCAAGCGGGATGATGATGATGCTGAGTTATGATTATGATGTCTT
GTGGATAGAGAACGTGGCAAGGATGGATGATCTTCTACTACTGGCCTTTTGTACACTCGG
CACAATGATATCTCAGCCTTTTGGTATTTCTCGGTTTCATGGTGAGGGAGACGGTACTCG
TTCATAATCCAACTGGTACGAGTGCCTTTAGGGGCTTTACCGGAGTAGAAAACTAGGGTT
TTCTTTAATCCAATCGGCCGAGAAGTCTCCGATCTGATCATCCGATCAGCTCCAGTTGCT
TTCCAATACCCTGAAGTCGTTACTCGATTTGC

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

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TAAGTGTGGAGGAAGCTGATGCTCAGAACATTACGACGATTCAAGAGGCGGCTGATTTGA
TTAAGGATCTTGTTCAGAAGAAACCTGCGGCCTAAACTCCCCCGGTTTAACGCAAACCGG
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TATTTTTCTTCTTCTGGAAGTTAAGATCATTGGATGTTGACTATGAGAAAACTTTTGTTG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1EY42TF U 1
AF RS1BU23JQ C 291
BS 1 640 RS1EY42TF
BS 641 658 RS1BU23JQ

RD RS1EY42TF 640 0 0
TTTTTTTCTGCCCCTGACCTGTATACTGAGCTTCATCTCCTCCAATGGCTTCTTTGTCAG
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TAAGTGTGGAGGAAGCTGATGCTCAGAACATTACGACGATTCAAGAGGCGGCTGATTTGA
TTAAGGATCTTGTTCAGAAGAAACCTGCGGCCTAAACTCCCCCGGTTTAACGCAAACCGG
CTTTCTTTTCCTTTAGACCTTTCTTGGTTTCGGAGCATTTAATTAGACCGTATGTCATTT
TATTTTTCTTCTTCTGGAAGTTAAGATCATTGGATGTTGACTATGAGAAAACTTTTGTTG
GTACGTTGAGATTGATTTGATTGGTCTTTGATGACGAATA

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1BU23JQ 368 0 0
TTTTT
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TAACATAAGTGTGGAGGAAGCTGATGCTCAGAACATTACGACGATTCAAGAGGCGGCTGA
TTTGATTGAGGATTTTGTTCAGAAGAAACCTGCGGCCTAAACTCCCCCGGTTTAACGCAA
ACCGGCTTTTTTTTCCTTTAGACCTTTTTTGGTTTCGGAGCATTTAATTAGACCGTATGT
CATTTTATTTTTTTTTTTTTGGAAGTTAAGATCGTTGGATGTTGACTATGAGAAAACTTT
TGTTGGTACGTTGAGATTGATTTGATTGGTCTTTGATGACGAATATATAAACGTGATCTG
TGT

QA 6 368 6 368
DS 



AS 1 2

CO CL7935Contig1 683 2 2 U
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CTGTTATTGAGTATGTTGCTTCC


BQ
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DS 

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DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AATCAAATTCATCTTTTTTTCTCTC


BQ
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AF RS1CN30TF U 1
AF RS1CN30JQ C 666
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GTTTTTTTTCTTTCCGATCATTACAATGGGCTGCGCAAGCTCCAGGCACAAAAAGCGTTG
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TCACCATCCGGCGCAACACACCGGAGATAGCCATCACACGGTGGCTCTCACATCCTCCAC
CGTCGGATCTCTCACCCTCTGCGATTCTCCTTTCAGGCACATCGAGGAACACTTGGAAAC
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GAGTATGATGAACGAGAGGATCCCCAAGGTGGTGGTGCCTAAAACTCCGATTGTGTCGCC
TCCGGGTGAGCCAGAGACGATCAACACGTGGGAGTTGATGGAAGGTCTTGAAGATGCTAG
TCCTTTACGACCACCTGATCATCTGAGAAGCTTCTCCTTTGATGTTGTTCGTGTCCAACC
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CGTTTCCACTTTCAG*AAATCGCTTCAAGAAGTCCCTGATGATCATCCTTTTCACATCCG
GATCCCTAATGTGGATCCGGTATCCGGGTCTTCA

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DS 

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CTAATGTGGATCCGGTATCCGGGTCTTCAGACGGAGAAGAAGGGGAATTTGGAAGGAAGC
AAGACAAGGTGATAGTTTACTTCACAAGTCTTAGAGGTATAAGGAAGACATACGAAGACA
GTTGCAACGTCAGGGTGATACTAAAGAGCTTAGTAGTTCGTCTCGACGAGCGCGATGTGT
CGATGCATTCGGGTTTTAAGGATGAGCTGAAGGAGTTGTTGAGGGATGAGTTCAACGGTG
GCGTTGGAATAGCCCTGCCTAGAGTTTTCTTGGGGAACAAGTATCTTGGTGGAGTGGAAG
AGATAAAGAAGTTGAATGAAAATGGAACGCTTGAAAAGGTTGTAGATGGTTGCGAAAGGG
TCGAGGATGGGTTAACGGGTTGTGGGATTGAATGTGAGGCTTGTGGTGATGTTCGGTTTG
TGCCGTGTGAGACGTGTTCAGGAAGCTGTAAAATATACTATGACACTGAAGATGAAGATG
CAAAGGAAGAAGGAACAGAAGAAACAGAGTATGGGTTCCAAAGATGTCCACATTGTAATG
AGAATGGGTTGATCAGATGTCCTATTTGTTGTGATTAAGTCCTTTTGAACACACAAATCA
AATTCATCTTTTTTTCTCTC

QA 1 680 1 680
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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ATCTACGCCAACCAACCGCCGGATCAACACCAAGAAACGTTCGCCGCCGGTGAAACGGAG
TACTACTCTTGGTTCGACGAAGCTTCTATCCAAGACATGAACTACTTCGTCAAAACCATC
ACCGGCATCAAATCCAAAGGAATCCGACCAGACGTCATCGGCTCCATCATCGCTCATTAC
GCTTCCAAGTGGCTCCCTGACCTCTCCGGTAACGTCTCCGCCACCACGGCACCACCACCA
CCACCGACGACGGAGAGCGTTACGTCTTCCGTAATGAAGAAACGCTTTTTCGTCGAAACT
CTAACCGGAATCCTCCCTCCGGAGAAAGACTCAGTTCCATGCAACTTCCTCCTCCGTCTC
CTCAGGACAGCGAAAATGGTCGGAACCAATCAGAACTACTTAACGGAGCTTGAAAACAGA
GTGTCTTGGCAGCTCGACCAAGCTTCCCTCAAGGAGCTCATGATACCTTCGTTTAGCCAC
ACGTGCGGGACTTTGCTTGACGTTGAGCTCGTGACGCGTCTTGTGCAGAAGTTCGTTGGT
TTAGACAGTGAAGGCGTTAAGACCGGTGCCGCTCTCGTTAAAGTGGCTAAGCTTGTTGAC
TCTTACCTTGCTGAAGCTGCCATTGACGGTGGTTTGACTCTATTGGAGTTTATATCACTA
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ACGCGAGATGAATGTTCAGCAAGCGGAGATAAAGAGGCTTAGAGATGATGTGTTGAGGCT
CCAGAGTGAGTGCGGTGCCATGCATATGCAGCTGGAGAGGCTTATGGAGAAGAAGAGTGG
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TGAGAAGATGATGAACGGTGAGGAAGAAGTAGGTGATAATGGTGAAGGATTTGAGCCTGG
GACTCCTGGGAATATGAAGACAAGGTTTGTTAAAGGAAGAACAACACCTTCAAGGTGGAG
AAAATCTATGTCATGACTCATAATGTTGCATTAATAATGGAAACAACACATAAGCATAAA
TGAGCAACAATGAAAATGTCTTCT


BQ
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AF RS1F741TF U 1
AF RS1F741JQ C 730
BS 1 787 RS1F741TF
BS 788 1404 RS1F741JQ

RD RS1F741TF 787 0 0
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GCTTCCAAGTGGCTCCCTGACCTCTCCGGTAACGTCTCCGCCACCACGGCACCACCACCA
CCACCGACGACGGAGAGCGTTACGTCTTCCGTAATGAAGAAACGCTTTTTCGTCGAAACT
CTAACCGGAATCCTCCCTCCGGAGAAAGACTCAGTTCCATGCAACTTCCTCCTCCGTCTC
CTCAGGACAGCGAAAATGGTCGGAACCAATCAGAACTACTTAACGGAGCTTGAAAACAGA
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ACGTGCGGGACTTTGCTTGACGTTGAGCTCGTGACGCGTCTTGTGCAGAAGTTCGTTGGT
TTAGACAGTGAAGGCGTTAAGACCGGTGCCGCTCTCGTTAAAGTGGCTAAGCTTGTTGAC
TCTTACCTTGCTGAAGCTGCCATTGACGGTGGTTTGACTCTATTGGAGTTTATATCACTA
ATCAAGCTCTGCCTAGCCATGCTCGTACCACAGAGGATGGCTTGTACCGCGCCGTTGATA
CATATCT

QA 1 787 1 787
DS 

RD RS1F741JQ 675 0 0
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CAATCATCAGAGTGTTGTTCACTGAGCAGACAGAGCTAAGCCGTCACATTGACTGGAGTC
CATCTGGCTCACATACTCCGAGCCAGGCTCTGGACCACAGTGCTTGTCCAAACGCGAGAT
GAATGTTCAGCAAGCGGAGATAAAGAGGCTTAGAGATGATGTGTTGAGGCTCCAGAGTGA
GTGCGGTGCCATGCATATGCAGCTGGAGAGGCTTATGGAGAAGAAGAGTGGTGGTGGGAG
TAAAGGGTTTTTCCGGTGGAAGAGACCTTCCACTAGAGGAAGTGTTGGCGTTGAGAAGAT
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GAATATGAAGACAAGGTTTGTTAAAGGAAGAACAACACCTTCAAGGTGGAGAAAATCTAT
GTCATGACTCATAATGTTGCATTAATAATGGAAACAACACATAAGCATAAATGAGCAACA
ATGAAAATGTCTTCT

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

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AAATGTAATCAAATCTAGTAACGGGTTCCTTCATAATTGAAACAAACAACAACGATAAGA
AAAGAAAAAAAAAGAAGACAATAGACACCCTCACGCATTCTCTCACGGTGATTTATTCTC
GCCGTCGGTTTGCTGATGATGTAGATCCTCCACACCTCTATACTCCGTGGTGTCAACAGG
CTGCCTCACATCCTTCAGCTCTACCGCGACCTTGTCCTCCTGAATCCTGTCGCCGTTGTC
ATCATCCCCCGTAACGGCTTCGCTGATGTTCTGACCCGTTTCCCTAGCCGCTTTCCAGGC
CCCGTCCATCGCATCCTTCATGTTATCTCCCGCGTTCACAGCTGCATCGGTCGCTTTCTT
CACCCCTTCCTTTGCCTTATCTGTCACGTAACTCGCTGTGGACCTATCGTCGTGACGGTC
TCTCATGCTCTCTGTTTGTCTAAATGCGGTGAAGAGGCGGTCGAACCGGGTGGTAGCGTG
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GC74JQ U 9
AF RS1GC74TF C 1
BS 1 8 RS1GC74TF
BS 9 515 RS1GC74JQ
BS 516 660 RS1GC74TF

RD RS1GC74JQ 507 0 0
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TCAAATCTAGTAACGGGTTCCTTCATAATTGAAACAAACAACAACGATAAGAAAAGAAAA
AAAAAGAAGACAATAGACACCCTCACGCATTCTCTCACGGTGATTTATTCTCGCCGTCGG
TTTGCTGATGATGTAGATCCTCCACACCTCTATACTCCGTGGTGTCAACAGGCTGCCTCA
CATCCTTCAGCTCTACCGCGACCTTGTCCTCCTGAATCCTGTCGCCGTTGTCATCATCCC
CCGTAACGGCTTCGCTGATGTTCTGACCCGTTTCCCTAGCCGCTTTCCAGGCCCCGTCCA
TCGCATCCTTCATGTTATCTCCCGCGTTCACAGCTGCATCGGTCGCTTTCTTCACCCCTT
CCTTTGCCTTATCTGTCACGTAACTCGCTGTGGACCTATCGTCGTGACGGTCTCTCATGC
TCTCTGTTTGTCTAAATGCGGTGAAGA

QA 1 507 1 507
DS 

RD RS1GC74TF 660 0 0
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AAATGTAATCAAATCTAGTAACGGGTTCCTTCATAATTGAAACAAACAACAACGATAAGA
AAAGAAAAAAAAAGAAGACAATAGACACCCTCACGCATTCTCTCACGGTGATTTATTCTC
GCCGTCGGTTTGCTGATGATGTAGATCCTCCACACCTCTATACTCCGTGGTGTCAACAGG
CTGCCTCACATCCTTCAGCTCTACCGCGACCTTGTCCTCCTGAATCCTGTCGCCGTTGTC
ATCATCCCCCGTAACGGCTTCGCTGATGTTCTGACCCGTTTCCCTAGCCGCTTTCCAGGC
CCCGTCCATCGCATCCTTCATGTTATCTCCCGCGTTCACAGCTGCATCGGTCGCTTTCTT
CACCCCTTCCTTTGCCTTATCTGTCACGTAACTCGCTGTGGACCTATCGTCGTGACGGTC
TCTCATGCTCTCTGTTTGTCTAAATGCGGTGAAGAGGCGGTCGAACCGGGTGGTAGCGTG
TCGGAGGACATAACCGGAGATATCTCCGCCATGAGTTTTTGAAATGGTAACCGTCGTGAG
TCTCTTCATCGAAAGCCTAATCGGCATAGTTAATTTTCTTGATCTCACCTAATCTGTTCC

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL7941Contig1 778 2 2 U
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GTGATACTACAAATGGATTTTGGTAGGTTCCCTATAATCTCAATCCTCGAAGACATGCTC
GAAGTCCCTGAGGATCACAACAAGAAGAGCCGCAACAATCCATCGAGAGCGTACATGCGA
GGCGCGAAGGCGATGGCAGCCACACCAGCCGACGTGATGGAGCATCCGAACGCGTACGTT
TTCGTGGTGGACATGCCTGGGATCAAAGGAAACGAGATCAAGGTTCAGGTAGAGAACGAG
AATGTGCTTGTGGTGAGCGGAGAGAGGCAGAGAGAGAAGAACAAAGAGAACGAAGGCGTG
AAGTATGTGAGGATGGAGAGGAGATGAGTATGTGAGGAAGACTGTTGAGGTTGTATTGAC
TGACACATCCGATAAGATGCAAGTGGAAGCCTTTATATGGGCTAACAAAGATGATCCTGA
CATGTATGGAGAATGGGATTTCGAGGAATGGAAGAAGCTTCACATGGAAAAGTTCATAGA
GGCGTCAGAGAAGTTCATCGAATGGAAGAAGAATCCAAATGGGAGATCAAGGGAAGAGTT
TGCCAAATTTGTAGAAGAAGATCCGCCCGTGGCTTGAAGAATGCGTCTCCCTTTATCTTC
TTTAATTCCAAATAAATCAGTGTCACCAATAAATGATTTGTGAGTTAGAAACACAAATAA
GATCTCATATTGTATCTTATATTGTATCTCATATTGTATTATCTACTCTATTATCTAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DS05TF U 1
AF RS1DS05JQ C 132
BS 1 638 RS1DS05TF
BS 639 778 RS1DS05JQ

RD RS1DS05TF 638 0 0
GGAACTAAAGCAAACAAAGCATCAAAGAAGAACGAAAAAATCAAGAAACCAACACGACAA
GTGATACTACAAATGGATTTTGGTAGGTTCCCTATAATCTCAATCCTCGAAGACATGCTC
GAAGTCCCTGAGGATCACAACAAGAAGAGCCGCAACAATCCATCGAGAGCGTACATGCGA
GGCGCGAAGGCGATGGCAGCCACACCAGCCGACGTGATGGAGCATCCGAACGCGTACGTT
TTCGTGGTGGACATGCCTGGGATCAAAGGAAACGAGATCAAGGTTCAGGTAGAGAACGAG
AATGTGCTTGTGGTGAGCGGAGAGAGGCAGAGAGAGAAGAACAAAGAGAACGAAGGCGTG
AAGTATGTGAGGATGGAGAGGAGATGAGTATGTGAGGAAGACTGTTGAGGTTGTATTGAC
TGACACATCCGATAAGATGCAAGTGGAAGCCTTTATATGGGCTAACAAAGATGATCCTGA
CATGTATGGAGAATGGGATTTCGAGGAATGGAAGAAGCTTCACATGGAAAAGTTCATAGA
GGCGTCAGAGAAGTTCATCGAATGGAAGAAGAATCCAAATGGGAGATCAAGGGAAGAGTT
TGCCAAATTTGTAGAAGAAGATCCGCCCGTGGCTTGAA

QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1DS05JQ 647 0 0
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GGTGAGCGGAGAGAGGCAGAGAGAGAAGAACAAAGAGAACGAAGGCGTGAAGTATGTGAG
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ATAAGATGCAAGTGGAAGCCTTTATATGGGCTAACAAAGATGATCCTGACATGTATGGAG
AATGGGATTTCGAGGAATGGAAGAAGCTTCACATGGAAAAGTTCATAGAGGCGTCAGAGA
AGTTCATCGAATGGAAGAAGAATCCAAATGGGAGATCAAGGGAAGAGTTTGCCAAATTTG
TAGAAGAAGATCCGCCCGTGGCTTGAAGAATGCGTCTCCCTTTATCTTCTTTAATTCCAA
ATAAATCAGTGTCACCAATAAATGATTTGTGAGTTAGAAACACAAATAAGATCTCATATT
GTATCTTATATTGTATCTCATATTGTATTATCTACTCTATTATCTAT

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 2

CO CL7942Contig1 924 2 8 U
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GAGAAAGGCTTTTTCTTCTTCGCCTCGATCTCAGGACTTCCTTCCATGAACCGTCTGCAT
CTGCATTTGAAGATTTAAAAACGGTTCTTGAAATGATGACTGTTCCTCAAAGATTCTCAA
CTAGGTAACGAGCGTTTCGCGGATCCAATGTGGAGCTTTGCGTCAAACGTGATTGGCAGC
ATAGGTGGTCTAAAGAAAGACCACCCTCCTCCTCCTCAACCCTCTTGCTCAGACGACGAC
GAGGTTTCTAACGTTAGCAGGGACGAAGACGAGGAGGAAGAAGAAGAGCAAGGACTAGAC
TGTCCCATTTGCTTCGAATCATTCAACATCGTCTACGACGGCGTCCTCAAGTTCCCTAAG
AAGAACTTCTTCCTTCTCTGGATGGTTGAGTCTCTCAACGGTGACAGGTCCAGAAGACAT
GGTACTGGTAGTGATGATAACCACCAATACTGCAATAACAATCTGATTGCAAGGCCTGTT
GGGAGGAGCCAACCAAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGACAGCAGTTCTCGTTCCATAAGTCG
ATTGATTTCTTCATCTCCTTCACCTCCAAGTTTCCTTTTGTGGTCATTTTCCTTTTGATT
GTCTTCTTTGCTATACCTGGCAGCCTCGTCGTCCTTACTCTTTACTTCCTCCTCACCATT
CTTCTAGCGGTTCCTTCTGGTTTGGTCCTCTATTTTGCCTACCCTATTCTTGAAAGGTTG
GTTCATGAAATAACTTCATGAGAAACTTTTTTGATTTTGTTATTGATTGCAAGCTTGGGA
ATTGTAATTTGTGGTTTTTGAGTTTTTTTAAATTACTGTTATATGAGCAACTTTGGTTTT
GCAGATTTGTGACTTATTAATTGA


BQ
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AF RS1H093TF U 1
AF RS1AM80TF U 451
BS 1 546 RS1H093TF
BS 547 547 RS1AM80TF
BS 548 645 RS1H093TF
BS 646 646 RS1AM80TF
BS 647 696 RS1H093TF
BS 697 697 RS1AM80TF
BS 698 733 RS1H093TF
BS 734 924 RS1AM80TF

RD RS1H093TF 733 0 0
GGGTGCCAACTAAAAACAGACGAAAGCATCTCGGCGGAACAACGAGGGAGAGAGAGAAGA
GAGAAAGGCTTTTTCTTCTTCGCCTCGATCTCAGGACTTCCTTCCATGAACCGTCTGCAT
CTGCATTTGAAGATTTAAAAACGGTTCTTGAAATGATGACTGTTCCTCAAAGATTCTCAA
CTAGGTAACGAGCGTTTCGCGGATCCAATGTGGAGCTTTGCGTCAAACGTGATTGGCAGC
ATAGGTGGTCTAAAGAAAGACCACCCTCCTCCTCCTCAACCCTCTTGCTCAGACGACGAC
GAGGTTTCTAACGTTAGCAGGGACGAAGACGAGGAGGAAGAAGAAGAGCAAGGACTAGAC
TGTCCCATTTGCTTCGAATCATTCAACATCGTCTACGACGGCGTCCTCAAGTTCCCTAAG
AAGAACTTCTTCCTTCTCTGGATGGTTGAGTCTCTCAACGGTGACAGGTCCAGAAGACAT
GGTACTGGTAGTGATGATAACCACCAATACTGCAATAACAATCTGATTGCAAGGCCTGTT
GGGAGGGGCCAACCAAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGACAGCAGTTCTCGTTCCATAAGTCG
ATTGATTTCTTCATCTCCTTCACCTCCAAGTTTCCTTTTGTGGTCGTTTTCCTTTTGATT
GTCTTCTTTGCTATACCTGGCAGCCTCGTCGTCCTTGCTCTTTACTTCCTCCTCACCATT
CTTCTAGCGGTTC

QA 1 733 1 733
DS 

RD RS1AM80TF 474 0 0
TCTCTCAACGGTGACAGGTCCAGAAGACATGGTACTGGTAGTGATGATAACCACCAATAC
TGCAATAACAATCTGATTGCAAGGCCTGTTGGGAGGAGCCAACCAAGCAGCAGCAGCAGC
AGCAGACAGCAGTTCTCGTTCCATAAGTCGATTGATTTCTTCATCTCCTTCACCTCCAAG
TTTCCTTTTGTGGTCATTTTCCTTTTGATTGTCTTCTTTGCTATAC*TGGCAGCCTCGTC
GTCCTTACTCTTTACTTCCTCCTCACCATTCTTCTAGCGGTTCCTTCTGGTTTGGTCCTC
TATTTTGCCTACCCTATTCTTGAAAGGTTGGTTCATGAAATAACTTCATGAGAAACTTTT
TTGATTTTGTTATTGATTGCAAGCTTGGGAATTGTAATTTGTGGTTTTTGAGTTTTTTTA
AATTACTGTTATATGAGCAACTTTGGTTTTGCAGATTTGTGACTTATTAATTGA

QA 1 474 1 474
DS 



AS 1 2

CO CL7943Contig1 639 2 2 U
GGATGTCTTTCACAGTTCACAATAAATTTTCACACTTCAAATTTCGAATCTTTCTTTCCC
GAAATCTCTTTCGTTCTATATATATATATATATAGAGAGAGATGATGAGTATGAGAGGAG
AAGCTGAAGCTTGGCCGGAGATGGAAGCGATAGCTAGGAAGATGGTGGAGGAAGTTGAAA
CAGAGACTGAGTCTCCAAGATCCGTCGGACGTTGGACGGCTAAGGAGAGAGTACACAGCC
AGGTTTTGAAGATCAGAGAGGAGGATCTTTGCGTTCTCGAGAATCGTCCACATGGTCTCA
GCTTGTTCTTGATCTCGAGGCCGAGCTTGCCGTGTTCGCCTCTCAGTGGCAAAGTGAGAT
CCCTTAACGCCGTTCAGTGATTTGACTCTCTCATCGATCAAAGGTGTTCTGCTGTCCTAT
GCGTTTTTTTTTTTAGTTATCTCTGTTTTTTTTTCTTGAACGTTTTGTTTATGGAAGGGA
AAGAGAGCCTTTTTCTCTTGTCATAATGTCATGTGTATATAAACCGTGAATGTATATATG
AGCTCGTGAAACTTTATGCTCTACTTTTGTTTACATATCTTTCTCTGTATATATATGCCT
GTAATTATCAAACTATATATATTCAAATGTATCATGTGC


BQ
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AF RS1GG27TF U 1
AF RS1GG27JQ C 50
BS 1 556 RS1GG27TF
BS 557 639 RS1GG27JQ

RD RS1GG27TF 556 0 0
GGATGTCTTTCACAGTTCACAATAAATTTTCACACTTCAAATTTCGAATCTTTCTTTCCC
GAAATCTCTTTCGTTCTATATATATATATATATAGAGAGAGATGATGAGTATGAGAGGAG
AAGCTGAAGCTTGGCCGGAGATGGAAGCGATAGCTAGGAAGATGGTGGAGGAAGTTGAAA
CAGAGACTGAGTCTCCAAGATCCGTCGGACGTTGGACGGCTAAGGAGAGAGTACACAGCC
AGGTTTTGAAGATCAGAGAGGAGGATCTTTGCGTTCTCGAGAATCGTCCACATGGTCTCA
GCTTGTTCTTGATCTCGAGGCCGAGCTTGCCGTGTTCGCCTCTCAGTGGCAAAGTGAGAT
CCCTTAACGCCGTTCAGTGATTTGACTCTCTCATCGATCAAAGGTGTTCTGCTGTCCTAT
GCGTTTTTTTTTTTAGTTATCTCTGTTTTTTTTTCTTGAACGTTTTGTTTATGGAAGGGA
AAGAGAGCCTTTTTCTCTTGTCATAATGTCATGTGTATATAAACCGTGAATGTATATATG
AGCTCGTGAAACTTTA

QA 1 556 1 556
DS 

RD RS1GG27JQ 590 0 0
CTTTCTTTCCCGAAATCTCTTTCGTTCTATATATATATATATATAGAGAGAGATGATGAG
TATGAGAGGAGAAGCTGAAGCTTGGCCGGAGATGGAAGCGATAGCTAGGAAGATGGTGGA
GGAAGTTGAAACAGAGACTGAGTCTCCAAGATCCGTCGGACGTTGGACGGCTAAGGAGAG
AGTACACAGCCAGGTTTTGAAGATCAGAGAGGAGGATCTTTGCGTTCTCGAGAATCGTCC
ACATGGTCTCAGCTTGTTCTTGATCTCGAGGCCGAGCTTGCCGTGTTCGCCTCTCAGTGG
CAAAGTGAGATCCCTTAACGCCGTTCAGTGATTTGACTCTCTCATCGATCAAAGGTGTTC
TGCTGTCCTATGCGTTTTTTTTTTTAGTTATCTCTGTTTTTTTTTCTTGAACGTTTTGTT
TATGGAAGGGAAAGAGAGCCTTTTTCTCTTGTCATAATGTCATGTGTATATAAACCGTGA
ATGTATATATGAGCTCGTGAAACTTTATGCTCTACTTTTGTTTACATATCTTTCTCTGTA
TATATATGCCTGTAATTATCAAACTATATATATTCAAATGTATCATGTGC

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 2

CO CL7944Contig1 1153 2 2 U
GGGGCATCGCAATCTTCTTCGTTCGTCCATGGCATAACATGTGTATCACATGACCAAACA
CCAAACATAAAGCTTCCATACGACTGGACCACTATAGAAGAAGCCTTCTTCCTTTTTACC
GCTTTGTCGATCGCTGTTGGGAAGATCACGCGGCCTGTATCCTCTCTCGATCTCGTGCCC
TTAAACACTATTCAAGACGTAAATGGGAAAGGCTAGTGTTAACAATACTGGTTCAGACAC
CAAGAGAAATGTGGTCTCAAGTGTGTTTGATCCTGCATTCTCTAAATTCGTTGGACTCTC
TCAGAAGCTCCATGCCTGTGTTAAGTCCCAGCTGAAGAATTTGACGGCTGATAAGCATGG
GATTGGTTCTTCTTGGAGGCAAGATAATGAAATCTCATCCAACTCCATACGAATTGACCT
GGAGAAACAGTTAGATAGTTGGAGAGGAAACACTTCGCGGACTGATCAACCCCCAGTCAT
TAAGGTGAGTATTCCAAAAGGGTCGCTTTGCAATCTCAAAGCCGAGGTGAACGTTGGTTT
ACCCCCTGACGCTGTCTATAACATTGTGATTGACCCTGACAACAGAAGGGTCTTCAAGAA
TATCAAGGAGGTTCTGTCCCGGAAAATAGTGGTTGATGAAGGATTAAGGCAAGTGAAGGA
AACTGGAAAGTAAAGCCTTTGTTTGTGGACGAGCATATGTGCGATCGTCTGAAACCGAAG
ACACTGGAGGAGTATAACCAGTGCACTGGAGGTAAAGGGAGGGTCGGATCAAAGGTGACG
CTTGACCAGCTTATACAGCCGGCGATCGTTCCACCACCTCCCATTTCTTGGTACCTGAGA
GGCATCACAGCCAAGACAACAGAGATGCTCATCCATGACTTGTTGGCTGAGACCGCTAAG
ATCCGCAAGCGTTTGGCAGCCGGAGAGACGGATGATAGTCAGTCGCTGGATGAGCAACTC
ACTGTGAATCCCGGAGATATAAAAGAAAGATGGGCTGCACACAGAAGAACATCAAGGAGA
CGGCGAAACAATATGAGCTGATTCAATTCTTCCAGGAAACTGTAACCAGTCCATGATTTT
ATGTGACACAACATATATGTCTGTTGTCCTAAGATACGATATATCAATTCTTTACTGAAA
AGGTTTTACAGCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BG41TF U 1
AF RS1BG41JQ C 469
BS 1 641 RS1BG41TF
BS 642 1153 RS1BG41JQ

RD RS1BG41TF 644 0 0
GGGGCATCGCAATCTTCTTCGTTCGTCCATGGCATAACATGTGTATCACATGACCAAACA
CCAAACATAAAGCTTCCATACGACTGGACCACTATAGAAGAAGCCTTCTTCCTTTTTACC
GCTTTGTCGATCGCTGTTGGGAAGATCACGCGGCCTGTATCCTCTCTCGATCTCGTGCCC
TTAAACACTATTCAAGACGTAAATGGGAAAGGCTAGTGTTAACAATACTGGTTCAGACAC
CAAGAGAAATGTGGTCTCAAGTGTGTTTGATCCTGCATTCTCTAAATTCGTTGGACTCTC
TCAGAAGCTCCATGCCTGTGTTAAGTCCCAGCTGAAGAATTTGACGGCTGATAAGCATGG
GATTGGTTCTTCTTGGAGGCAAGATAATGAAATCTCATCCAACTCCATACGAATTGACCT
GGAGAAACAGTTAGATAGTTGGAGAGGAAACACTTCGCGGACTGATCAACCCCCAGTCAT
TAAGGTGAGTATTCCAAAAGGGTCGCTTTGCAATCTCAAAGCCGAGGTGAACGTTGGTTT
ACCCCCTGACGCTGTCTATAACATTGTGATTGACCCTGACAACAGAAGGGTCTTCAAGAA
TATCAAGGAGGTTCTGTCCCGGAAAATAGTGGTTGATGAAG
ATT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1BG41JQ 685 0 0
ACCCCCAGTCATTAAGGTGAGTATTCCAAAAGGGTCGCTTTGCAATCTCAAAGCCGAGGT
GAACGTTGGTTTACCCCCTGACGCTGTCTATAACATTGTGATTGACCCTGACAACAGAAG
GGTCTTCAAGAATATCAAGGAGGTTCTGTCCCGGAAAATAGTGGTTGATGAAGGATTAAG
GCAAGTGAAGGAAACTGGAAAGTAAAGCCTTTGTTTGTGGACGAGCATATGTGCGATCGT
CTGAAACCGAAGACACTGGAGGAGTATAACCAGTGCACTGGAGGTAAAGGGAGGGTCGGA
TCAAAGGTGACGCTTGACCAGCTTATACAGCCGGCGATCGTTCCACCACCTCCCATTTCT
TGGTACCTGAGAGGCATCACAGCCAAGACAACAGAGATGCTCATCCATGACTTGTTGGCT
GAGACCGCTAAGATCCGCAAGCGTTTGGCAGCCGGAGAGACGGATGATAGTCAGTCGCTG
GATGAGCAACTCACTGTGAATCCCGGAGATATAAAAGAAAGATGGGCTGCACACAGAAGA
ACATCAAGGAGACGGCGAAACAATATGAGCTGATTCAATTCTTCCAGGAAACTGTAACCA
GTCCATGATTTTATGTGACACAACATATATGTCTGTTGTCCTAAGATACGATATATCAAT
TCTTTACTGAAAAGGTTTTACAGCC

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL7945Contig1 506 2 1 U
GGAAACAGAGACCGACCTAATTTGCTCAAAAGAACTCCGCCTCGTCGCGCCACCGAAGAT
CCCTCTCCGTCGCCTGACGACTTTTCGAAGAATCTCCCGTCATTTCTTAAAGGGTTTGGA
AGAAGAGATGCCACACAGAACAAGGCCTCTGACGGGACTCTTGCTTTTCACTGGAATAAA
CGCTGTTTTGGTGCAAACCATCACTCCTGTCTATGACTTCGTCTGCTTCTTGCCCTACTG
GGAGAGAAGGAGAGAGCGAATCCGGAAGGAGCGTGAAGCGGTGGCTGCATCATCAAACAG
CACAACCTCAGCACAGGAAGCTACTCGAGCATCTGCTGGTTGATGAACTCCCTCGATACC
TGAGACTATCATATTTTTTTTGTCTGTAAGAAACTGTTAACCCTCAATATTACTGAATAA
TTGCGTGCAAGGACGGCATATATTTTCATCTCTGCTGAGTGGACAGCTTATTTTGACTAT
TGAGTGATCTCTCTTTTATCTAAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1F588JQ C 1
AF RS1F588TF U 1
BS 1 506 RS1F588TF

RD RS1F588JQ 506 0 0
GGAAACAGAGACCGACCTAATTTGCTCAAAAGAACTCCGCCTCGTCGCGCCACCGAAGAT
CCCTTTCCGTCGCCTGACGACTTTTCGAAGAATCTCCCGTCATTTCTTAAAGGGTTTGGA
AGAAGAGATGCCACACAGAACAAGGCCTCTGACGGGACTCTTGCTTTTCACTGGAATAAA
CGCTGTTTTGGTGCAAACCATCACTCCTGTCTATGACTTCGTCTGCTTCTTGCCCTACTG
GGAGAGAAGGAGAGAGCGAATCCGGAAGGAGCGTGAAGCGGTGGCTGCATCATCAAACAG
CACAACCTCAGCACAGGAAGCTACTCGAGCATCTGCTGGTTGATGAACTCCCTCGATACC
TGAGACTATCATATTTTTTTTGTCTGTAAGAAACTGTTAACCCTCAATATTACTGAATAA
TTGCGTGCAAGGACGGCATATATTTTCATTTCTGCTGAGTGGACAGCTTATTTTGACTAT
TGAGTGATCTCTCTTTTATCTAAACC

QA 1 506 1 506
DS 

RD RS1F588TF 506 0 0
GGAAACAGAGACCGACCTAATTTGCTCAAAAGAACTCCGCCTCGTCGCGCCACCGAAGAT
CCCTCTCCGTCGCCTGACGACTTTTCGAAGAATCTCCCGTCATTTCTTAAAGGGTTTGGA
AGAAGAGATGCCACACAGAACAAGGCCTCTGACGGGACTCTTGCTTTTCACTGGAATAAA
CGCTGTTTTGGTGCAAACCATCACTCCTGTCTATGACTTCGTCTGCTTCTTGCCCTACTG
GGAGAGAAGGAGAGAGCGAATCCGGAAGGAGCGTGAAGCGGTGGCTGCATCATCAAACAG
CACAACCTCAGCACAGGAAGCTACTCGAGCATCTGCTGGTTGATGAACTCCCTCGATACC
TGAGACTATCATATTTTTTTTGTCTGTAAGAAACTGTTAACCCTCAATATTACTGAATAA
TTGCGTGCAAGGACGGCATATATTTTCATCTCTGCTGAGTGGACAGCTTATTTTGACTAT
TGAGTGATCTCTCTTTTATCTAAACC

QA 1 506 1 506
DS 



AS 1 2

CO CL7946Contig1 891 2 6 U
GCGTGGATATTATTCTGTCGAAACTGTTGCGCTGCTAGTTGGCTTGAAAGTACGGCATCC
TCAGCGAATCACTATTCTTAGAGGAAACCATGAAAGTCGTCAGATTACTCAAGTTTATGG
ATTTTATGATGAATGCCTGCGAAAGTATGGAAATGCAAATGTTTGGAAGATATTCACGGA
CCTCTTTGACTTTTCCCACTGACAGCCTTGGTGGAGTCTGAAATATTCTGCCTTCACGGT
GGATTGTCGCCGTCTATCGAGACCCTCGACAACATTAGGAACTTCGATCGAGTTCAAGAA
GTTCCACATGAAGGGCCGATGTGTGACTTATTATGGTCTGATCCTGATGACAGATGTGGC
TGGGGAATCTCTCCTCGTGGTGCCGGATATACATTTGGTCAGGACATTTCCGAACAATTC
AACCACTCTAACAGCCTAAAACTGATAGCTCGAGCGCATCAGCTGGTTATGGAGGGATTC
AACTGGGCGCACGAGCAAAAGGTAGTTACTATTTTCAGTGCACCAAACTATTGCTATCGC
TGTGGAAACATGGCCTCTATTCTCGAGGTCGATGACTGCAGGAACCACACCTTCATTCAG
TTTGAACCGGCCCCAAGGAGAGGAGAACCAGATGTGACCCGAAGGACACCTGACTACTTC
CTTTAAACACATATCACCTCCTCTAAGCTGCAAAGTCCTGTTGGTTTTTGAAGATCTATG
CTTATTATGTTTGGTAAAACGCATTTTGTTATTTAGCCCTCTCGCTTGGATAGTGTAATG
TAGGAAACGAGGTCAATGAACTCTTAAATCCCAATGAATGCTTGTGTTTGGCTGAAATTG
TTTAGCTCCCTTCTGTATCAGAATCTTTTTCAATTGAGATTATTTTCTCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FP50TF U 1
AF RS1FP50JQ C 222
BS 1 644 RS1FP50TF
BS 645 645 RS1FP50JQ
BS 646 711 RS1FP50TF
BS 712 712 RS1FP50JQ
BS 713 746 RS1FP50TF
BS 747 891 RS1FP50JQ

RD RS1FP50TF 753 0 0
GCGTGGATATTATTCTGTCGAAACTGTTGCGCTGCTAGTTGGCTTGAAAGTACGGCATCC
TCAGCGAATCACTATTCTTAGAGGAAACCATGAAAGTCGTCAGATTACTCAAGTTTATGG
ATTTTATGATGAATGCCTGCGAAAGTATGGAAATGCAAATGTTTGGAAGATATTCACGGA
CCTCTTTGACTTTTCCCACTGACAGCCTTGGTGGAGTCTGAAATATTCTGCCTTCACGGT
GGATTGTCGCCGTCTATCGAGACCCTCGACAACATTAGGAACTTCGATCGAGTTCAAGAA
GTTCCACATGAAGGGCCGATGTGTGACTTATTATGGTCTGATCCTGATGACAGATGTGGC
TGGGGAATCTCTCCTCGTGGTGCCGGATATACATTTGGTCAGGACATTTCCGAACAATTC
AACCACTCTAACAGCCTAAAACTGATAGCTCGAGCGCATCAGCTGGTTATGGAGGGATTC
AACTGGGCGCACGAGCAAAAGGTAGTTACTATTTTCAGTGCACCAAACTATTGCTATCGC
TGTGGAAACATGGCCTCTATTCTCGAGGTCGATGACTGCAGGAACCACACCTTCATTCAG
TTTGAACCGGCCCCAAGGAGAGGAGAACCAGATGTGACCCGAAG*ACACCTGACTACTTC
CTTTAAACACATATCACCTCCTCTAAGCTGCAAAGTCCTGTTGGTTTTTGA*GATCTATG
CTTATTATGTTTGGTAAAACGCATTT
GTTATTA

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1FP50JQ 670 0 0
AATATTCTGCCTTCACGGTGGATTGTCGCCGTCTATCGAGACCCTCGACAACATTAGGAA
CTTCGATCGAGTTCAAGAAGTTCCACATGAAGGGCCGATGTGTGACTTATTATGGTCTGA
TCCTGATGACAGATGTGGCTGGGGAATCTCTCCTCGTGGTGCCGGATATACATTTGGTCA
GGACATTTCCGAACAATTCAACCACTTTAACAGCCTAAAACTGATAGCTCGAGCGCATCA
GCTGGTTATGGAGGGATTCAACTGGGCGCACGAGCAAAAGGTAGTTACTATTTTCAGTGC
ACCAAACTATTGCTATCGCTGTGGAAACATGGCCTCTATTCTCGAGGTCGATGACTGCAG
GAACCACACCTTCATTCAGTTTGAACCGGCCCCAAGGAGAGGAGAACCAGATGTGACCCG
AAGGACACCTGACTACTTCCTTTAAACACATATCACCTCCTTTAAGCTGCAAAGTCCTGT
TGGTTTTTGAAGATTTATGCTTATTATGTTTGGTAAAACGCATTTTGTTATTTAGCCCTC
TCGCTTGGATAGTGTAATGTAGGAAACGAGGTCAATGAACTCTTAAATCCCAATGAATGC
TTGTGTTTGGCTGAAATTGTTTAGCTCCCTTCTGTATCAGAATCTTTTTCAATTGAGATT
ATTTTCTCGG

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

CO CL7947Contig1 889 2 12 U
GGCATAATGTTCAGTCTTCAGCTTCTTCGTTTTGTGGACCTAAGTGCTTAGAGCTCTTCG
AAAAGTTAAAGAAGTATCTTGGTGTCAAACATGAAATAGAAGGCGGCTACTCATGGTCTC
TTATACATAGGGTGGATACGGATTCAAAATTCAACTCTCAGTTGTCGGCACAAAGGATTG
AAAACAATTCAAAACTAGCTGTTGGGCTGGCAATCATGGATGAGTGTTTTTTGCCCATTA
TTGACCGGAGGAGTGGGATCAATTTAATTCGTAATGTCCTTTATAATTGTGGATCCAATT
TCAACCGGATTAATTATACTGGCTTCTACACTGCTATCCTAGAGAGAGGAGATGAAATCA
TATGCGCGGCATCTCTCAGGTTCCATGGAATGCAATTGGCAGAGATGCCATTTATTGGAA
CCAGACATATATACAGGCGTCAAGGAATGTGCCGTCGGCTTTTTGATGCAATTGAGTCGG
CTATGCGTTCTCTCAAGGTTGAGAAATTGGTAATCCCTGCCATTCCAGACTTCTTGCATG
CGTGGACCGGTAACTTTGGATTCAGTCCTCTTGATGACTCAGTTAGGAAAGAGATGAGGT
CCCTCAACACGTTGGTATTTCCTGGAATAGACATGTTACAGAAACCTCTCCTCCTCCATG
AAGAAAGCAAATCCAAGTTCCCAGCTGAAGGTGACTGTGTTGTTGTAGCTAAGGATGTCA
TGGATTCAGAGATGGAGGAGACGGAAAAGAAATCCGAATCTGCGTCTTTTGCTGAAACTT
GTCTAAACTCCAACGGATATGTCGCTGATGATCTCGACTGCGACAAGAAAACTCCTGTTT
CTCATGAGAAAACCAGTCCTATATGTATATCAGTTGAAACAGCCCTGGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GW74TF U 1
AF RS1EP93TF U 128
BS 1 437 RS1GW74TF
BS 438 438 RS1EP93TF
BS 439 451 RS1GW74TF
BS 452 452 RS1EP93TF
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BS 549 637 RS1GW74TF
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BS 639 666 RS1GW74TF
BS 667 667 RS1EP93TF
BS 668 676 RS1GW74TF
BS 677 889 RS1EP93TF

RD RS1GW74TF 686 0 0
GGCATAATGTTCAGTCTTCAGCTTCTTCGTTTTGTGGACCTAAGTGCTTAGAGCTCTTCG
AAAAGTTAAAGAAGTATCTTGGTGTCAAACATGAAATAGAAGGCGGCTACTCATGGTCTC
TTATACATAGGGTGGATACGGATTCAAAATTCAACTCTCAGTTGTCGGCACAAAGGATTG
AAAACAATTCAAAACTAGCTGTTGGGCTGGCAATCATGGATGAGTGTTTTTTGCCCATTA
TTGACCGGAGGAGTGGGATCAATTTAATTCGTAATGTCCTTTATAATTGTGGATCCAATT
TCAACCGGATTAATTATACTGGCTTCTACACTGCTATCCTAGAGAGAGGAGATGAAATCA
TATGCGCGGCATCTCTCAGGTTCCATGGAATGCAATTGGCAGAGATGCCATTTATTGGAA
CCAGACATATATACAGGTGTCAAGGAATGTGTCGTCGGCTTTTTGATGCAATTGAGTCGG
CTATGCGTTCTCTCAAGGTTGAGAAATTGGTAATCCCTGCCATTCCAGACTTCTTGCATG
CGTGGACGGGTAACTTTGGATTCAGTCCTCTTGATGACTCAGTTAGGAAAGAGATGAGGT
CCCTCAACACGTTGGTATTTCCTGGAATAGACATGTTGCAGAAACCTCTCCTCCTCCATG
AAGAAA*CAAATCCAA
AGTCGCAGCT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1EP93TF 762 0 0
G
AGGGTGGATACGGATTCAAAATTCAACTCTCAGTTGTCGGCACAAAGGATTGAAAACAAT
TCAAAACTAGCTGTTGGGCTGGCAATCATGGATGAGTGTTTTTTGCCCATTATTGACCGG
AGGAGTGGGATCAATTTAATTCGTAATGTCCTTTATAATTGTGGATCCAATTTCAACCGG
ATTAATTATACTGGCTTCTACACTGCTATCCTAGAGAG**GAGATGAAATCATATGCTCG
GCATCTCTCAGGTTCCATGGAATGCAATTGGCAGAGATGCCATTTATTGGAACCAGACAT
ATATACAGGCGTCAAGGAATGTGCCGTCGGCTTTTTGATGCAATTGAGTCGGCTATGCGT
TCTCTCAAGGTTGAGAAATTGGTAATCCCTGCCATTCCAGACTTCTTGCATGCGTGGACC
GGTAACTTTGGATTCAGTCCTCTTGATGACTCAGTTAGGAAAGAGATGAGGTCCCTCAAC
ACGTTGGTGTTTCCTGGAATAGACATGTTACAGAAACCTCTCCTCCTCTATGAAGAAAGC
AAATCCAAGTTCCCAGCTGAAGGTGACTGTGTTGTTGTAGCTAAGGATGTCATGGATTCA
GAGATGGAGGAGACGGAAAAGAAATCCGAATCTGCGTCTTTTGCTGAAACTTGTCTAAAC
TCCAACGGATATGTCGCTGATGATCTCGACTGCGACAAGAAAACTCCTGTTTCTCATGAG
AAAACCAGTCCTATATGTATATCAGTTGAAACAGCCCTGGA

QA 2 762 2 762
DS 



AS 1 2

CO CL7948Contig1 826 2 2 U
GGGAGAGAAACCTTCGAACACCATCAGAGTGTCTGAGCAAACATGTCCCAACATCTGCTT
CTCATTCTCCTCTCGCTCCTCTTCATTCTTCTTAATCCCATTTCCGCCTCTCCAATTATC
CAAAAATTCAAAGAAGCCCCACAGTTTTACAACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCC
GGGGGGACGAAGGGTCTCTGAGCGCGAAGAAGAAGCGGCGAAGGATCAGAAGGAAGTGGA
TGCGTTGGCGGATGGGTTTCGAGTTGGGGATTTGAAGCGTTTGGTTGGTGCCGAAGCTGC
GAGCTATACGGGCGCGATCGAGGAGATGTATGAGAGGATGCTGGCGAAAGTCGAGAGCTT
GGCTTCGGAGGTTGAGAAGAGTTCTGCTAGAGTACTTGAACTGGAAAATCATAATCGGAA
GATTAGATACCGAGTTGCCAGAATCGAGCGGTGAAGCTTGTTTCTTTGCTGCCAGATCTT
TTGAAAGAGCCAGGATTGGCAGAAGTAGGGGGAACTTTTCCTTCGGAAGAACTTGTTGTG
TATTTTGAGGCGTAATCCGGGAACGGAAGATGATGGCTTGAGTTTAACTTTCTCAAGTTC
TCTGCTGGAACGTCCTTGTTCAGATAAATGTATTTTGGCGTATCATCAAATTTTAATGTT
TTTTTTCCTGTTCAGAGAGTTCCTTTTGATGGCTTTTTCAAGTTCCTCATTGCTTCTGGA
CTGGAAATGAAATGGCTTTGTGCTTATAATGTAAACTTTTCAAAGTGATTTTGATTATTT
TCCTAAAATGTAAAATAACAATGGAAAAAACTAGCTACATAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DQ94TF U 1
AF RS1DQ94JQ C 165
BS 1 671 RS1DQ94TF
BS 672 826 RS1DQ94JQ

RD RS1DQ94TF 671 0 0
GGGAGAGAAACCTTCGAACACCATCAGAGTGTCTGAGCAAACATGTCCCAACATCTGCTT
CTCATTCTCCTCTCGCTCCTCTTCATTCTTCTTAATCCCATTTCCGCCTCTCCAATTATC
CAAAAATTCAAAGAAGCCCCACAGTTTTACAACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCC
GGGGGGACGAAGGGTCTCTGAGCGCGAAGAAGAAGCGGCGAAGGATCAGAAGGAAGTGGA
TGCGTTGGCGGATGGGTTTCGAGTTGGGGATTTGAAGCGTTTGGTTGGTGCCGAAGCTGC
GAGCTATACGGGCGCGATCGAGGAGATGTATGAGAGGATGCTGGCGAAAGTCGAGAGCTT
GGCTTCGGAGGTTGAGAAGAGTTCTGCTAGAGTACTTGAACTGGAAAATCATAATCGGAA
GATTAGATACCGAGTTGCCAGAATCGAGCGGTGAAGCTTGTTTCTTTGCTGCCAGATCTT
TTGAAAGAGCCAGGATTGGCAGAAGTAGGGGGAACTTTTCCTTCGGAAGAACTTGTTGTG
TATTTTGAGGCGTAATCCGGGAACGGAAGATGATGGCTTGAGTTTAACTTTCTCAAGTTC
TCTGCTGGAACGTCCTTGTTCAGATAAATGTATTTTGGCGTATCATCAAATTTTAATGTT
TTTTTTCCTGT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1DQ94JQ 662 0 0
ACCACTGCTTACGGCCGGGGGGACGAAGGGTCTCTGAGCGCGAAGAAGAAGCGGCGAAGG
ATCAGAAGGAAGTGGATGCGTTGGCGGATGGGTTTCGAGTTGGGGATTTGAAGCGTTTGG
TTGGTGCCGAAGCTGCGAGCTATACGGGCGCGATCGAGGAGATGTATGAGAGGATGCTGG
CGAAAGTCGAGAGCTTGGCTTCGGAGGTTGAGAAGAGTTCTGCTAGAGTACTTGAACTGG
AAAATCATAATCGGAAGATTAGATACCGAGTTGCCAGAATCGAGCGGTGAAGCTTGTTTC
TTTGCTGCCAGATCTTTTGAAAGAGCCAGGATTGGCAGAAGTAGGGGGAACTTTTCCTTC
GGAAGAACTTGTTGTGTATTTTGAGGCGTAATCCGGGAACGGAAGATGATGGCTTGAGTT
TAACTTTCTCAAGTTCTCTGCTGGAACGTCCTTGTTCAGATAAATGTATTTTGGCGTATC
ATCAAATTTTAATGTTTTTTTTCCTGTTCAGAGAGTTCCTTTTGATGGCTTTTTCAAGTT
CCTCATTGCTTCTGGACTGGAAATGAAATGGCTTTGTGCTTATAATGTAAACTTTTCAAA
GTGATTTTGATTATTTTCCTAAAATGTAAAATAACAATGGAAAAAACTAGCTACATAAAA
AA

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

CO CL7949Contig1 978 2 2 U
GCAGAAGCTAGGAAAAGGAGATTGGAGAGGTATCTCCAGGAGCTATGTGACAACGAGGAC
ACCTACTCAAGTTGCAAGCCACGCTCAGAAGTACTTCATCAGACAGTCTAATGTGTCTCG
CCGCAAGCGACGTTCTAGTCTCTTTGATATGATTCCTGATGAGTTAACAGACGTTATGGT
GGATTCTTCTCAAGAACAGCAAGCCGAGGACGTTCCTATGGAAACACAAATACAGAGCAC
TGACTCTGTTCCAGCGCCATTGATCCTGGAAACAGAGGAATGTGAATCCATGAAATCCAC
CAACTCTAGTGCTGAGGAGCCGCCGACAGTAACAGCTTCTTCTTCTTCTTCTTTCACACC
AGAAGACACCATCCAAACGCAGCTACAAGTACAACCACCACCTGGTTCATTCCCAGTGAT
GTACCCGACTTACTTCTCACCATTCTACTCATTCCCCTTCCCGGTGTGGCCTGCTGCGTA
CGTCACCGAGCCGGCCAAGGAAGAGACTCACGAGATTCTCAGGCCAACAGCTGTGCACTC
GAAAGCAGCCCCGATTAATGTTGATCAGCTTCTTGGCATTTCTAAGCTCAGCCTCGGGGA
GTCCGGGCAAAACGGTGTATCGGAACAGTCTCTTACGTTGAAACTCGTTGGAGGTTCGTC
TTCGAGGCAATCGGCCTTTCATCCAAATCCAGCCAGTGGTGGTGGTGGTTCGGACATGAA
CACCGTGATTCATGCTGTCCAAAAATCTGCCTGATGCGATGGTCTCCCAGATTTTAGTTG
TAGCCAAAGTGACTCACTGTCGTTAACATTGACTATCGAGAAACAACAATTTGCAAGACA
TGTCCCGGGGCTGAGCTCTCGGATTAGTTCTTTGGCTATATTAACTTCAAGAATAAAGAT
TGTTTTAATTGGTTTGTTTTTAACTGCTTAGTTCAGCTTTGTTTATTAGGGGTTGGAGAA
GAAAGGAAGATTAATGCT


BQ
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AF RS1AO25TFB U 1
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BS 741 978 RS1AO25JQ

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ACCTACTCAAGTTGCAAGCCACGCTCAGAAGTACTTCATCAGACAGTCTAATGTGTCTCG
CCGCAAGCGACGTTCTAGTCTCTTTGATATGATTCCTGATGAGTTAACAGACGTTATGGT
GGATTCTTCTCAAGAACAGCAAGCCGAGGACGTTCCTATGGAAACACAAATACAGAGCAC
TGACTCTGTTCCAGCGCCATTGATCCTGGAAACAGAGGAATGTGAATCCATGAAATCCAC
CAACTCTAGTGCTGAGGAGCCGCCGACAGTAACAGCTTCTTCTTCTTCTTCTTTCACACC
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GTACCCGACTTACTTCTCACCATTCTACTCATTCCCCTTCCCGGTGTGGCCTGCTGCGTA
CGTCACCGAGCCGGCCAAGGAAGAGACTCACGAGATTCTCAGGCCAACAGCTGTGCACTC
GAAAGCAGCCCCGATTAATGTTGATCAGCTTCTTGGCATTTCTAAGCTCAGCCTCGGGGA
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CACCGTGATTCATGCTGTCC

QA 1 740 1 740
DS 

RD RS1AO25JQ 744 0 0
GAGCACTGACTCTGTTCCAGCGCCATTGATCCTGGAAACAGAGGAATGTGAATCCATGAA
ATCCACCAACTCTAGTGCTGAGGAGCCGCCGACAGTAACAGCTTCTTCTTCTTCTTCTTT
CACACCAGAAGACACCATCCAAACGCAGCTACAAGTACAACCACCACCTGGTTCATTCCC
AGTGATGTACCCGACTTACTTCTCACCATTCTACTCATTCCCCTTCCCGGTGTGGCCTGC
TGCGTACGTCACCGAGCCGGCCAAGGAAGAGACTCACGAGATTCTCAGGCCAACAGCTGT
GCACTCGAAAGCAGCCCCGATTAATGTTGATCAGCTTCTTGGCATTTCTAAGCTCAGCCT
CGGGGAGTCCGGGCAAAACGGTGTATCGGAACAGTCTCTTACGTTGAAACTCGTTGGAGG
TTCGTCTTCGAGGCAATCGGCCTTTCATCCAAATCCAGCCAGTGGTGGTGGTGGTTCGGA
CATGAACACCGTGATTCATGCTGTCCAAAAATCTGCCTGATGCGATGGTCTCCCAGATTT
TAGTTGTAGCCAAAGTGACTCACTGTCGTTAACATTGACTATCGAGAAACAACAATTTGC
AAGACATGTCCCGGGGCTGAGCTCTCGGATTAGTTCTTTGGCTATATTAACTTCAAGAAT
AAAGATTGTTTTAATTGGTTTGTTTTTAACTGCTTAGTTCAGCTTTGTTTATTAGGGGTT
GGAGAAGAAAGGAAGATTAATGCT

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

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GGACGTCTTCGCCGCCAAAGCTCTTCTTCATTTCATCCATGGCAATTTAGTGTTCGTTGA
GAAAATCCTTGGCTCGTCGGACCTTTCGTTTCTAACCTCGTTTTTGTCATCCTCCTCTTC
GTTCTCACACACGAAACAACGAAATCAAAGTGTTCTTCCCCAAAGAGTTTCGTCGAACGG
TTCGGTTCATTACGAAATCGACGTGTTCTTCCATCAATTTCATCTGAATCTCATGTTTCT
TCACACTGGGTATGTCTGGGGATATTGATCTCTAATCTACAAAGAGTTGCTTTACTACAG
CATACAAAAGTGCAATACGGAACAGAAACTGAATATGGTTATGCCTCGTGCCATGACCAA
GATTGATGAACGAATGAAGAAAGTGCTCACATTTTCTAACATTCTAAGTTATAGCTTTGT
GTTCCTTTTTTAAACTCTTAATCCATGCTAATGCTCGCATGCTGACTCTTTGAAGGAACT
GTATTGTTTTTCTCTCTACTCTAACTTGATGTTCGGCTATGTATTGTTCTCTGGTTTTGA
TGTTTGGCAGAAGCAAAAGAT


BQ
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AF RS1GX14TF U 1
AF RS1F343TF U 9
BS 1 410 RS1GX14TF
BS 411 411 RS1F343TF
BS 412 525 RS1GX14TF
BS 526 561 RS1F343TF

RD RS1GX14TF 525 0 0
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GAAAATCCTTGGCTCGTCGGACCTTTCGTTTCTAACCTCGTTTTTGTCATCCTCCTCTTC
GTTCTCACACACGAAACAACGAAATCAAAGTGTTCTTCCCCAAAGAGTTTCGTCGAACGG
TTCGGTTCATTACGAAATCGACGTGTTCTTCCATCAATTTCATCTGAATCTCATGTTTCT
TCACACTGGGTATGTCTGGGGATATTGATCTCTAATCTACAAAGAGTTGCTTTACTACAG
CATACAAAAGTGCAATACGGAACAGAAACTGAATATGGTTATGCCTCGTGCCATGACCAA
GATTGATGAACGAATGAAGAAAGTGCTCACATTTTCTAACATTCTAAGTTGTAGCTTTGT
GTTCCTTTTTTAAACTCTTAATCCATGCTAATGCTCGCATGCTGACTCTTTGAAGGAACT
GTATTGTTTTTCTCTCTACTCTAACTTGATGTTCGGCTATGTATT

QA 1 525 1 525
DS 

RD RS1F343TF 553 0 0
GG
GCCGCCAAAGCTCTTCTTCATTTCATCCATGGCAATTTAGTGTTCGTTGAGAAAATCCTT
GGCTCGTCGGACCTTTCGTTTCTAACCTCGTTTTTGTCATCCTCCTCTTCGTTCTCACAC
ACGAAACAACGAAATCAAAGTGTTCTTCCCCAAAGAGTTTCGTCGAACGGTTCGGTTCAT
TACGAAATCGACGTGTTCTTCCATCAATTTCATCTGAATCTCATGTTTCTTCACACTGGG
TATGTCTGGGGATATTGATCTCTAATCTACAAAGAGTTGCTTTACTACAGCATACAAAAG
TGCAATACGGAACAGAAACTGAATATGGTTATGCCTCGTGCCATGACCAAGATTGATGAA
CGAATGAAGAAAGTGCTCACATTTTCTAACATTCTAAGTTATAGCTTTGTGTTCCTTTTT
TAAACTCTTAATCCATGCTAATGCTCGCATGCTGACTCTTTGAAGGAACTGTATTGTTTT
TCTCTCTACTCTAACTTGATGTTCGGTTATGTATTGTTCTCTGGTTTTGATGTTTGGCAG
AAGCAAAAGAT

QA 3 553 3 553
DS 



AS 1 2

CO CL7951Contig1 748 2 2 U
GGCTCGTCTCCGGACTCGAAAAAAAAGAAAAACCTAGAAAAGCTCTCCGTTTCAACCCCC
CCCCCCAGAGTCAACCATGCCGCCGAAGATGGACCCGAGCCAGATCGTGGACGTCTACGT
CCGCGTGACCGGAGGAGAGGTCGGAGCGGCGAGTTCCCTAGCTCCCAAGATCGGTCCCCT
CGGTCTCGCGCCCAAGAAGATCGGAGAAGACATCGCGAAGGAAACCGCCAAGGAGTGGAA
AGGGCTCCGCGTCACGGTGAAGCTGACGGTGCAGAACCGTCAGGCGAAGGTGACGGTGGT
TCCGTCAGCGGCGGCGCTGGTGATCAAGGCGCTCAAGGAGCCGGAGAGGGACAGGAAGAA
GGTGAAGAACATTAAGCACAACGGTAACATTTCGTTTGATGACGTCATCGAGATCGCGAG
GATCATGAGGCCGAGGTCTATCGCCAAGGAGCTGAGCGGGACCGTGAGGGAGATTCTCGG
GACTTGCGTGTCCGTTGGGTGTACTGTGGATGGGAAAGATCCGAAGGATATTCAGCAGGA
GATTCAAGAGGGTGAGGTTGAGATTCCTGAGAATTAATTTAAAAAAAGAAGTTGACAAGT
GTTGTGTTCGGTTATTATTTCACTTTTGTCTTTTTTTGTGAGGTTTTAGTTTCGATGTTT
CGGATAAGAACAAGAACAAGTCAGTTTTGGTTTGTTATTTTGCCGCTTTTATTTAATCTC
ATGCTATGCTTTGGTAGTTTCGATGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FL24TF U 1
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GTTGTGTTCGGTTATTATTTCACTTT

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DS 

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CATGCTATGCTTTGGTAGTTTCGATGAGC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 2

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TGGGGATGAAGATAACGGCGGAAGAGGCGGAGCATATGGTGCGAGAAGCCGATCTTGATG
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TGTTTTCTGAGTTTGCAATTTCTAATAAAGCTTCAAATGATAAAAAAGTGGGTTTGTTTA
AGCACGTATCAACTACTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GX21TF U 1
AF RS1GX21JQ C 69
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QA 1 575 1 575
DS 

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QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 2

CO CL7953Contig1 721 2 2 U
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C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RS1FX47TF U 1
AF RS1FX47JQ C 237
BS 1 713 RS1FX47TF
BS 714 721 RS1FX47JQ

RD RS1FX47TF 713 0 0
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TCTTCAGATATTACAAATCATAAAATATTCTCAAATATAAAATTCAATAAACTACTTTAA
ATGCTTAGTCTAATACCCCAAGTTTGACTACATTTCAATGCTTGTTAATAATATAGATTT
TGAGGTAAGTCAATATATAAAAGATTATAGCTATAATATTTTATGTATATTCACAATCAA
AAATTCAATACTTTATTGTCAACTCATATCATATAATTTGATCATCTAACTTTTACTATA
TAAACAAATGAGGTGTAGTCTTCAAACTCACAACTGAAATCTGAAACAAACAAAAAGATA
TTTAATTGGAAAAATGAAAAGCGTTTCCTTTATACTTTTGCTTTTGCTATCTACCCTTCT
CGTCACCGTTAGTAAGTAAAGATGCCATACTAACAATATCATCTCCCAAAACCACTGGAA
TCATATATCTCTTCGTATCAATGATTGAGCTTGTAGCAAGATCATTCATTTAC

QA 1 713 1 713
DS 

RD RS1FX47JQ 485 0 0
TTT
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AATGCTTAGTCTAATACCCCAAGTTTGACTACATTTCAATGCTTGTTAATAATATAGATT
TTGAGGTAAGTCAATATATAAAAGATTATAGCTATAATATTTTATGTATATTCACAATCA
AAAATTCAATACTTTATTGTCAACTCATATCATATAATTTGATCATCTAACTTTTACTAT
ATAAACAAATGAGGTGTAGTCTTCAAACTCACAACTGAAATCTGAAACAAACAAAAAGAT
ATTTAATTGGAAAAATGAAAAGCGTTTCCTTTATACTTTTGCTTTTGCTATCTACCCTTC
TCGTCACCGTTAGTAAGTAAAGATGCCATACTAACAATATCATCTCCCAAAACCACTGGA
ATCATATATCTCTTCGTATCAATGATTGAGCTTGTAGCAAGATCATTCATTTACCAAGGC
CC

QA 4 485 4 485
DS 



AS 1 2

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TACCCAGACTTGGGCTTCTCAGGCGAGACTACCACCACCGAGACTCTTATCCTCGGCGTT
GCTCCGTCTATGAACTCCCAGTACGAGGCTTCCGGCGAGACTTTCTTCGCCGAGAATGAT
GGCTGCAAATGCGGATCTGACTGCAAGTGCGACAATTGCACCTGTAAATGAACAACCCCC
AAACTCTGCGTTGATACCACTGCTTACGGCCGGGGGGACTTGGACTGTCCGTTTTTGTCG
GACTGGGTCTATACTTTGGTTCCGGGGTATTCTCCAAGGATCCTGCCGTTATTCATCTCA
TAGCCATTGGAATACCGTTTGTAGCAGCAACACAGCCAATAAACTCACTCACTTTTGTAT
TGGACGGAGTAAACTTTGGAGCATCTGATTTTGCTTACACTGCATGCTCCATGGTAGGAG
TTGCGGCCGTAAGCATTGCAACAGTTATATACATGGCAAAGTTCAATGGTTTTGTTGGAA
TATGGATAGCTCTTACGATCTATATGGGTCTCCGTGCTACTACAGGAATTGGCAGGATAG
CAACAGGAACCGGCCCTTGGAAATCCTTGCGTGGACGATTATAATGAGATGCATCTTTGT
AGTCTTTCTTCGCTTTTGGTTTCTATTTCTTGTGTTTCCTCATTTGTTCGAAGACCTTTA
TCTTGTTATCTTAAACAGTCTCAAGATAGTCGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1B676TF U 1
AF RS1B676JQ C 189
BS 1 647 RS1B676TF
BS 648 815 RS1B676JQ

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GGCTGCAAATGCGGATCTGACTGCAAGTGCGACAATTGCACCTGTAAATGAACAACCCCC
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TTG

QA 1 647 1 647
DS 

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GTAAGCATTGCAACAGTTATATACATGGCAAAGTTCAATGGTTTTGTTGGAATATGGATA
GCTCTTACGATCTATATGGGTCTCCGTGCTACTACAGGAATTGGCAGGATAGCAACAGGA
ACCGGCCCTTGGAAATCCTTGCGTGGACGATTATAATGAGATGCATCTTTGTAGTCTTTC
TTCGCTTTTGGTTTCTATTTCTTGTGTTTCCTCATTTGTTCGAAGACCTTTATCTTGTTA
TCTTAAACAGTCTCAAGATAGTCGTCC

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1AV33JQ C 1
AF RS1AV33TF U 1
BS 1 512 RS1AV33TF

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QA 1 512 1 512
DS 

RD RS1AV33TF 512 0 0
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AAAAAAAATGGCCTCATCGAGATTTCAACTTGTTGCCCTTCTTGTCATCTTCTCTCTCGT
TATTACTGCCCAATCTGAAAGAGTTTCTTGAATTTTTGCAGAAAAGGAAGAAATGGACGG
ACCATGCCGCTTGAGAGGAACATGCGATGAGGACAGCGACTGCAACGCCCATTGCCACAG
AAGCACGGACATTATACCCATGAACGGCCATTGTCTCTTCGACAGACCCACCCCCGTATG
CTGCTGCCTCTTTGATTAAGTCCCATCCTTTTTTTATTCTTCAAGTTTCCATGCATGCAT
GATCCTAATTAAACTAATGATGTAAACATATACATAAATGTTCACGTCCTAACTACTTGA
AGAATAGAAGAAGCGATCTTGTGTTTCTTATACTTTTGATTTCTTGTTTACCATATGTTG
TAAGAGAATGACTATTTATGAACATATTATAC

QA 1 512 1 512
DS 



AS 1 2

CO CL7956Contig1 938 2 6 U
GGGTGTTAATTCTGATTGCAGAAAAAAAACAATAATAAAGTATTTGGATTGCTCAAAAAA
AAAAAGTATTTGGATTTCGGCGAGAGAAAAAATTGACAGTCTTTGATTTCTCTCTCGCCG
TCGTAGAATTTGGCAGCCCTGTTACATCCTCTTCCAAGTTTCATCTCAGTTGAGAGAGAA
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GCTTCAATATTTACAGGAGCTTGTGAGTCAGTTTCAGAATGCAACTGATGAACAAACTAA
AGAGCGAACTGTAGCAAACTTGGCGAACTTTTCATATGACCCTTACAACTACACCATCTT
ACGTCAGCTAAATGTCTTGGAACTATTCATAGACTGTATAACAGAGCCAAATGAGAAGCT
TGTCGAATTCGGGATAGGAGGAATTTGCAACGCTTGTGCTGATCCAAAGAACGCTGCTAC
GATTGTTGATGCTAATGGAATTCCTCTAATAATCAAATGTTTATCAAGCCCTGTCCGGAA
CACTGTGAATTACGCGCTGGGGGCTTTGTATTACATTTGTGACTATGACAGAGCAACAAG
AGAGATGATTCTGAGAGCAGAAGTACTGGATCTCATCGAGAGGTATGCAGCAGCTGAGAC
GGTCTGTGTAGGCTTTAGTAACCTGGCTAAGGCGTTTCTTGACAAGCATGTTCATGCTAG
CACATGATTGCTAATACCGAAGTTGTATAGCAAAGGGCTAAAACGTAAACACTACGATTG
GTGTTTTGAGGATTTAGCAAGTGTTTAGTTGTGTGTCTTGTGAGAATCTAGATGTGTAGT
ACTGTAGTGAGTAATTTTTAAACGTTGGACTAGATTTTGATCGTTGATTGTTTTAAATTT
TATTTGAATTTACTTTAGTATGAGCAACAAATTTATCG


BQ
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AF RS1FY65TF U 1
AF RS1FY65JQ C 248
BS 1 671 RS1FY65TF
BS 672 672 RS1FY65JQ
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BS 763 938 RS1FY65JQ

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AAAAAGTATTTGGATTTCGGCGAGAGAAAAAATTGACAGTCTTTGATTTCTCTCTCGCCG
TCGTAGAATTTGGCAGCCCTGTTACATCCTCTTCCAAGTTTCATCTCAGTTGAGAGAGAA
AGAGATGTTTACTAATAATCAAAGACAAGAAGAGCGTACTGGCAAAAGTGGAACACCAAG
GCTTCAATATTTACAGGAGCTTGTGAGTCAGTTTCAGAATGCAACTGATGAACAAACTAA
AGAGCGAACTGTAGCAAACTTGGCGAACTTTTCATATGACCCTTACAACTACACCATCTT
ACGTCAGCTAAATGTCTTGGAACTATTCATAGACTGTATAACAGAGCCAAATGAGAAGCT
TGTCGAATTCGGGATAGGAGGAATTTGCAACGCTTGTGCTGATCCAAAGAACGCTGCTAC
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CACTGTGAATTACGCGCTGGGGGCTTTGTATTACATTTGTGACTATGACAGAGCAACAAG
AGAGATGATTCTGAGAGCAGAAGTACTGGATCTCATCGAGAGGTATGCAGCAGCTGAGAC
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CGTAA

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1FY65JQ 691 0 0
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GATGCTAATGGAATTCCTCTAATAATCAAATGTTTATCAAGCCCTGTCCGGAACACTGTG
AATTACGCGCTGGGGGCTTTGTATTACATTTGTGACTATGACAGAGCAACAAGAGAGATG
ATTCTGAGAGCAGAAGTACTGGATCTCATCGAGAGGTATGCAGCAGCTGAGACGGTCTGT
GTAGGCTTTAGTAACCTGGCTAAGGCGTTTCTTGACAAGCATGTTCATGCTAGCACATGA
TTGCTAATACCGAAGTTGTATAGCAAAGGGCTAAAACGTAAACACTACGATTGGTGTTTT
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ATTTACTTTAGTATGAGCAACAAATTTATCG

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

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TAGAGTTGCTGAGAAGCCATTGAATCTGACTTACATTCATAGCAGAGCTGATAACAGAAC
AATCGTGGATGGGAGCCTTTTAATTGATCCTGCTAACAAACTCTCTGTTAATCACATGGT
GGGAACAAACAACTGTAAGCTTAAGTATACTTATGCTCACGGGAAGATTGCTACCTTCGA
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TACTATTAACCAAGTTTCCCACTCAATTTTTTGGTGTTACATACGATTAAACTAGCCCTT
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BQ
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AF RS1CQ48TF U 1
AF RS1CQ48JQ C 248
BS 1 748 RS1CQ48TF
BS 749 816 RS1CQ48JQ

RD RS1CQ48TF 748 0 0
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GCGAGACGAAATGATGAAGGCTTCAGTCAAAGGCGAGTACGACGGCGACAAGAGCACCGG
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AAGGACCTCCAAATCCACTGGATCTTTCAAGGTATGTGCGTCTGTGAATCTGGCGGAGGA
AGTGAAAACGCCCAAATTGACGGCAGAAACAACATGGAACCTTGAAATGTAATCTCATTT
TACTATTAACCAAGTTTCCCACTCAATT

QA 1 748 1 748
DS 

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TACGACTTTGCCAAAAACGCCTGGGATTTTGCCGTTTCTCGCAGAGTTTATGGTGATGAT
GTTTTCAAGGCTACTTATCAGACGTCTAGTAAGTTGCTTGGTATGGAGTGGTCAAGGACC
TCCAAATCCACTGGATCTTTCAAGGTATGTGCGTCTGTGAATCTGGCGGAGGAAGTGAAA
ACGCCCAAATTGACGGCAGAAACAACATGGAACCTTGAAATGTAATCTCATTTTACTATT
AACCAAGTTTCCCACTCAATTTTTTGGTGTTACATACGATTAAACTAGCCCTTGCGAATC
ATCTTCCCACATTTTATGGTACATTTCGC

QA 1 569 1 569
DS 



AS 1 2

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GTTCCAGAGCATCCAGAGGCACACTTACTTGAAAGGACCAATGGACAAGGTCACCTCTGT
TGCCATTCCTCTTGCCTTGGCTGCATCTTCTCTCTACATGATTGGAACAGGAGTCTACAA
CATGTCCAACGGAATTGGGAAGAAGGAATAAGCAAGCAGCTTCTTCTTCTTCTTTTTTAA
TTTTCTTTTTATTGCTTTTGAAGGGTTCTCTATGTACCCAGTGGCTGCCATATAAGACTG
AAGTTTGCACTGGTCTTTGTGATTCCGTTTTGCCAAAATAATAATCTGCTTAGTCGCAAG
ACAATGTCAGAAAGCTGAAAGATGCTTGATGTGAAAAAGTTTCAATGTTACTTTTGTTAA
CGACTAGTTGAATTCTTTTTTTCTTCCCCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CC67TF U 1
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TTTTCTTTTTATTGCTTTTGAAGGGTTCTCTATGTACCCAGTGGCTGCCATATAATACTG
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QA 1 458 1 458
DS 

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TGCCATTCCTCTTGCCTTGGCTGCATCTTCTCTCTACATGATTGGAACAGGAGTCTACAA
CATGTCCAACGGAATTGGGAAGAAGGAATAAGCAAGCAGCTTCTTCTTCTTCTTTTTTAA
TTTTCTTTTTATTGCTTTTGAAGGGTTCTCTATGTACCCAGTGGCTGCCATATAAGACTG
AAGTTTGCACTGGTCTTTGTGATTCCGTTTTGCCAAAATAATAATCTGCTTAGTCGCAAG
ACAATGTCAGAAAGCTGAAAGATGCTTGATGTGAAAAAGTTTCAATGTTACTTTTGTTAA
CGACTAGTTGAATTCTTTTTTTCTTCCCCG

QA 1 510 1 510
DS 



AS 1 2

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TCGTGTTGCCTGGTGAGTTGGCGAAACACGCTGTCTCTGAAGGTACCAAGGCGGTGACCA
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TCTTAAGTTTTTTGGTTATTTTATTAGGGTTTGTACTTTGGGAAATTAGTTTTTTTTTTT
TCTTGTAATGGAAGAAATATAAGAAGTTCTATCTATACTATTAAAGTAAAATACCTATTA
GGATTTTGCCATTAATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1F696TF U 1
AF RS1F696JQ C 107
BS 1 657 RS1F696TF
BS 658 680 RS1F696JQ

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ACATCTTCAAGGTGCCGAAGCAGGTCCACCCGGATATCGGGATCTCCAGCAAAGCCATGG
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TCGCGAGGTACAACAAGAAGCCGACGATTACTTCGAGGGAGATTCAGACGGCGGTGAGGC
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TCTTAAGTTTTTTGGTTATTTTATTAGGGTTTGTACTTTGGGAAATTAGTTTTTTTTTTT
TCTTGTAATGGAAGAAATATAAGAAGTTCTATCTATACTATTAAAGTAAAATACCTA

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DS 

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CAGCAAAGCCATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACATTTTCGAGAAGCTCGCCGG
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GACGGCGGTGAGGCTCGTGTTGCCTGGTGAGTTGGGGAAACACGCTGTTTTTGAAGGTAC
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AGTAGTTTGTTGTTTTTTAAGTTTTTTGGTTATTTTATTAGGGTTTGTACTTTGGGAAAT
TAGTTTTTTTTTTTTCTTGTAATGGAAGAAATATAAGAAGTTCTATCTATACTATTAAAG
TAAAATACCTATTAGGATTTTGCCATTAATTTCC

QA 1 574 1 574
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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AF RS1GQ59JQ C 1
AF RS1GQ59TF U 1
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TAATCCATATCTCTGGTGTTTTTTAC

QA 1 506 1 506
DS 

RD RS1GQ59TF 506 0 0
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CGGTGTGAAGCGTATCAGCGGTTTGATCTACGAGGAGACTCGCGGTGTTCTCAAGATCTT
CCTCGAGAATGTGATTCGCGACGCCGTTACTTACACGGAGCACGCTCGCAGGAAGACTGT
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AAGCTGTTGTTAGGGTTTCGTTTCGATGTTTCGTTGATTTTGAATTTAGTGAAAACGCAT
TAATCCATATCTCTGGTGTTTTTTAC

QA 1 506 1 506
DS 



AS 1 2

CO CL7962Contig1 691 2 2 U
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GTTTCTTTCCCCCCCCAATCAAGATTAGTCCTAACTAACTAGAGGAGCATTACACTTCTA
CTGTGACAAAACCATCTACTACTCCTGCTATGAGAACATTGTTACTTGTGTTAGAAGAAC
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TTATAATAAGAATTTAGAGATCTACAACCTC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C804TF U 1
AF RS1C804JQ C 165
BS 1 680 RS1C804TF
BS 681 691 RS1C804JQ

RD RS1C804TF 680 0 0
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CAACCAGCTCGGTCTCACTGTTGGTTTCCTCAGCACCACCCACTTCAGCGGTTTCTGCCA
AGATAGCACTGACATGGGCGCTGTCACCACCGTTCACGCCAACTGCTGCCGTCACATCTC
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TGTCAACACCAAGTGGAGCCCCCATGCTAAATGCTGGAGTTCATGGAATGATACCCAATA
TACCCCCAAAACCTGAGCTTCTTGTCTATTTATGGTAATGACTAATGAGATTGTGTCTAT
ATACGTACACACGACAAAATTAATTACATACATCTCTTCTTTCTTCACCTGATGGTTTTT
GTTTCTTTCCCCCCCCAATCAAGATTAGTCCTAACTAACTAGAGGAGCATTACACTTCTA
CTGTGACAAAACCATCTACTACTCCTGCTATGAGAACATTGTTACTTGTGTTAGAAGAAC
GTTGTTTATCACATCACACTTTGCCGAAAAAGTTGTTTTTTTTTATCACCTAGCAATTGG
TTATAATAAGAATTTAGAGA

QA 1 680 1 680
DS 

RD RS1C804JQ 527 0 0
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GCTGCCGTCACATTTCTGCCAAAGTCTTCGATCTCACTCTTGTTCTTCGTGACTGGAAAC
GCTACAAAGCCTCACATGTCAACACCAAGTGGAGCCCCCATGCTAAATGCTGGAGTTCAT
GGAATGATACCCAATATACCCCCAAAACCTGAGCTTCTTGTCTATTTATGGTAATGACTA
ATGAGATTGTGTCTATATACGTACACACGACAAAATTAATTACATACATTTCTTCTTTCT
TCACCTGATGGTTTTTGTTTCTTTCCCCCCCCAATCAAGATTAGTCCTAACTAACTAGAG
GAGCATTACACTTTTACTGTGACAAAACCATCTACTACTCCTGCTATGAGAACATTGTTA
CTTGTGTTAGAAGAACGTTGTTTATCACATCACACTTTGCCGAAAAAGTTGTTTTTTTTT
ATCACCTAGCAATTGGTTATAATAAGAATTTAGAGATCTACAACCTC

QA 1 527 1 527
DS 



AS 1 2

CO CL7963Contig1 740 2 1 U
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TGTGTTTGGTCTGCGTGTCCCATCACAAGAGTTTAACTTCACACTACACACTTCATCCAT
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ACAGTACTGGATGGTGATCGAAACTCTTTCTAGCCGCCTTGCAATAGATAGTACAGAGTG
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TTCTTTTGTATCCCTTAAATTGTAAACCTGAAGATGTGGAAATGCAATTTCTACCAGAGG
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TATTAGAGACGGTCTAATTGCATCAACTTATGTTTTCATATAGTCAAAACCTTTTTCACG
ATCTGGTTCCTAATCTAAACTTATAAGAAGACACACTTGGTCCCGCCACACTCACTTTTC
TAATGCGAGGGGTACAAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GN74TF U 1
AF RS1FL79TF U 1
BS 1 740 RS1FL79TF

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TGGATATTGGATTTGTTGGTGAGAAAAGTGAAATCTTTTTTAGGGCACAGCTAAAGGAAT
CTAGAAAGTGATTGGTTTAGGCTTGATGAAAGAAAGACCTCGTTCAAGTCATCGCGTGCA
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TGTGTTTGGTCTGCGTGTCCCATCACAAGAGTTTAACTTCACACTACACACTTCATCCAT
CAGTTGGCTTTTAGTTAAATGTTGCAACTCATATAAGATAAGAAATTTTGGTTGTACAAA
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TTCTTTTGTATCCCTTAAATTGTAAACCTGAAGATGTGGAAATGCAATTTCTACCAGAGG
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QA 1 504 1 504
DS 

RD RS1FL79TF 740 0 0
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CTAGAAAGTGATTGGTTTAGGCTTGATGAAAGAAAGACCTCGTTCAAGTCATCGCGTGCA
AGCTTTCATATAATATAGTAAGAGATCGAGACAAAGACTTTTCCTTCCTTTTTGGCGCTT
TGTGTTTGGTCTGCGTGTCCCATCACAAGAGTTTAACTTCACACTACACACTTCATCCAT
CAGTTGGCTTTTAGTTAAATGTTGCAACTCATATAAGATAAGAAATTTTGGTTGTACAAA
ACAGTACTGGATGGTGATCGAAACTCTTTCTAGCCGCCTTGCAATAGATAGTACAGAGTG
GGAGGAGACTCCTCCGAGGAGTTGACCTATAAGACTATTTGATAAGCAAAGCTTGGACCT
TTCTTTTGTATCCCTTAAATTGTAAACCTGAAGATGTGGAAATGCAATTTCTACCAGAGG
ACAGAGCTCTCTTTACAGCAAAAATCACATAAGGATAAACCAAACATATTCTCACCAAGG
GAAAGAGGGCTAAAGTGAGTCTGGAAACCATATTATTAACTAACATACAAATGAGAAAAT
TATTAGAGACGGTCTAATTGCATCAACTTATGTTTTCATATAGTCAAAACCTTTTTCACG
ATCTGGTTCCTAATCTAAACTTATAAGAAGACACACTTGGTCCCGCCACACTCACTTTTC
TAATGCGAGGGGTACAAAAA

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

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TCTCTTTAGCTTTTTGTTTTTGGTTTGGAGTGGGAAGAAACTGAAG


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1D864TF C 1
AF RS1D864JQ U 2
BS 1 1 RS1D864TF
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RD RS1D864TF 526 0 0
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TAACGATGCAAAGTGAGTTTTTATGGAAATGATCATCCCGACTATAAGATAGATAAACTT
AATTCTACTCGCCAGGAACTTGAACGCCTTGCTTCAGCTTCTCTTTCTTCATCTTCTTCT
TGGAAACCGGCTTCTTCTTCCTCTGAGGCAGATTCTTCTGAGCGTAGGTGGCTTGGCCCG
ATCAACAACAGTCTTCTTAGCAGAAAGATCAAGCGCCGTAGTACTCTGACTAACAGCAGA
TGCAACTCGTCCCCTTCTGGGCGCTGAAGAGGCGCTTGAGAAATCGGGAACAGGAGGCTT
CCCTTCCTTGGATCTGAGAGCAGATCTGAGAGGATACCTCAGCTTCGAGTTGATTGAGTT
CCCAGAAGTAACGGAGCTCACGCTCTTCTCCGTTGATTTCTCCATTGATGCTCTGAACTT
TCTCTTTAGCTTTTTGTTTTTGGTTTGGAGTGGGAAGAAACTGAAG

QA 1 526 1 526
DS 

RD RS1D864JQ 525 0 0
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ATTCTACTCGCCAGGAACTTGAACGCCTTGCTTCAGCTTCTCTTTCTTCATCTTCTTCTT
GGAAACCGGCTTCTTCTTCCTCTGAGGCAGATTCTTCTGAGCGTAGGTGGCTTGGCCCGA
TCAACAACAGTCTTCTTAGCAAAAAGATCAAGCGCCGTAGTACTCTGACTAACAGCAAAT
GCAACTCGTCCCCTTCTGGGCGCTGAAAAGGCGCTTGAGAAATCGGGAACAGGAGGCTTC
CCTTCCTTGGATCTGAGAGCAAATCTGAAAGGATACCTCAGCTTCGAGTTGATTGAGTTC
CCAGAAGTAACGGAGCTCACGCTCTTCTCCGTTGATTTCTCCATTGATGCTCTGAACTTT
CTCTTTAGCTTTTTGTTTTTGGTTTGGAGTGGGAAGAAACTGAAG

QA 1 525 1 525
DS 



AS 1 2

CO CL7965Contig1 774 2 4 U
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GGAAGAGAGCTACCAAAGGTGTTAGGGGAGAAATCGGTTGATAGAGTATTGTTGGATGCA
CCTTGCAGTGGGACTGGGGTCATTTCGAAAGATGAATCAGTTAAAGTTTCGAAATCCCTA
GAGGATATAAAGAAATTTGCTCACTTGCAAAAGCAACTTTTACTCGCTGCTATTGATATG
GTGGATGCCACTTCCAAAACCGGTGGATATATTGTTTACTCAACATGTTCACTTATGGTT
GCTGAGAACGAAGCCGTCATCGACTATGCTCTCAAAAAGAGGAGTGTTCAACTCGTTAAA
ACTGGACTGGACTTCGGCCAAGACGGATTTGTAAGATTTAGAGAACATCGATTTCATCCG
TCTTTAAACAAGACCAAACGTTTTTATCCTCATGTACACAACATGGATGGATTCTTTGTG
GCGAAGCTAAAGAAGATGAGTAACATGAAACAAGCTTCAGAAGGTGATGGTGATGATGAG
GCGTTGGGAACTGTAGATGAAGCTGATGTGTCCAGTGATGATGATGAAGATGATGTGTCC
AGTGATGATGATGAAGCTGAGGCCATGGAAGAGATGGAGAAACCTTCCGTTCCCAAGAAG
CAACTCGAGAAAACTAAAGATGAAGCTGAGGCGTTAGGAACTGCAGATGAAGCTGATGTG
TCCAGTGATGATGATTAAGCTGAGGCCATGGAAGAGATGGAGAAACCTTCCGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GO05TF U 1
AF RS1D696TF U 183
BS 1 268 RS1GO05TF
BS 269 269 RS1D696TF
BS 270 690 RS1GO05TF
BS 691 774 RS1D696TF

RD RS1GO05TF 693 0 0
GCGCTAAATGCCAATCTGCACCGCATGGGGGTCACAAATACCATAGTTTGTAACTATGAT
GGAAGAGAGCTACCAAAGGTGTTAGGGGAGAAATCGGTTGATAGAGTATTGTTGGATGCA
CCTTGCAGTGGGACTGGGGTCATTTCGAAAGATGAATCAGTTAAAGTTTCGAAATCCCTA
GAGGATATAAAGAAATTTGCTCACTTGCAAAAGCAACTTTTACTCGCTGCTATTGATATG
GTGGATGCCACTTCCAAAACCGGTGGATGTATTGTTTACTCAACATGTTCACTTATGGTT
GCTGAGAACGAAGCCGTCATCGACTATGCTCTCAAAAAGAGGAGTGTTCAACTCGTTAAA
ACTGGACTGGACTTCGGCCAAGACGGATTTGTAAGATTTAGAGAACATCGATTTCATCCG
TCTTTAAACAAGACCAAACGTTTTTATCCTCATGTACACAACATGGATGGATTCTTTGTG
GCGAAGCTAAAGAAGATGAGTAACATGAAACAAGCTTCAGAAGGTGATGGTGATGATGAG
GCGTTGGGAACTGTAGATGAAGCTGATGTGTCCAGTGATGATGATGAAGATGATGTGTCC
AGTGATGATGATGAAGCTGAGGCCATGGAAGAGATGGAGAAACCTTCCGTTCCCAAGAAG
CAACTCGAGAAAACTAAAGATGAAGCTGAG
CGT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1D696TF 592 0 0
GGATATAAAGAAATTTGCTCACTTGCAAAAGCAACTTTTACTCGCTGCTATTGATATGGT
GGATGCCACTTCCAAAACCGGTGGATATATTGTTTACTCAACATGTTCACTTATGGTTGC
TGAGAACGAAGCCGTCATCGACTATGCTCTCAAAAAGAGGAGTGTTCAACTCGTTAAAAC
TGGACTGGACTTCGGCCAAGACGGATTTGTAAGATTTAGAGAACATCGATTTTATCCGTC
TTTAAACAAGACCAAACGTTTTTATCCTCATGTACACAACATGGATGGATTCTTTGTGGC
GAAGCTAAAGAAGATGAGTAACATGAAACAAGCTTCAGAAGGTGATGGTGATGATGAGGC
GTTGGGAACTGTAGATGAAGCTGATGTGTCCAGTGATGATGATGAAGATGATGTGTCCAG
TGATGATGATGAAGCTGAGGCCATGGAAGAGATGGAGAAACCTTCCGTTCCCAAGAAGCA
ACTCGAGAAAACTAAAGATGAAGCTGAGGCGTTAGGAACTGCAGATGAAGCTGATGTGTC
CAGTGATGATGATTAAGCTGAGGCCATGGAAGAGATGGAGAAACCTTCCGTT

QA 1 592 1 592
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7967Contig1 844 2 2 U
GGACCGTTCGAAGCAGTAAAGTAACAATGGCGGTTCCGTCGCGCGAGGATCTTGTGTACA
TGGCTAAGCTAGCGGAGCAGGCGGAGAGGTACGAGGAGATGGTTGAATTCATGGAGAAAG
TCTCCGCCGCAACAGATGGCACAGAGCTCACAATCGAGGAGCGAAACCTCCTCTCAGTCG
CTTACAAGAACGTAATCGGCGCTCGCCGTGCCTCGTGGAGAATCATCTCGTCGATCGAGC
AGAAAGAAGAGAGCCGCGGGAACGTCGAACGCGTCAACACGATCCGTGGCTACAAGGCTA
TGATCGAGACGGAGCTCTCGGGGATCTGCGGCGGAATCCTAAAGATGCTCGAGTCCACGC
TCATCCCTTCCGCTGCTTCCGAGGAGTCCAAGGTGTTCTACCTCAAGATGAAAGGTGATT
ACTACAGGTACTTGGCCGAGTTCAAAATCGGTAAAGAGAGAGACGACGCCGCCGATAACA
CACTCTCCGCTTACGAATCCGCTCAGGAGCATGCTAAGGGGCTTGCTTCAACTCACCCAA
TCCGGCTTGGTTTGGCATTGAACTTCTCTGTGTTCTATTACGAGATCCTCGAGTCTCCTG
ACCGTGCCTGCGACCTAGCTAAAACGGCTTTTGATGCGGCCATTGCTGAGTTAGACACAC
TAGGGGAAGAGTCATACAAGATAGCACTTTGATCATGCAGCTTCTCCGTGACACCTCACT
CTCTGGACATCCGACATGCAGATGATCTGCAGACGAGATCAAGAGCAGCAGCAGCAGCTG
TGAGCAGCAGAGAGCAGAATGAAGATCTTTGTGTGAATGTACTGCTAGTGTTAGGATTGA
ACAT


BQ
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10 10 10 10 

AF RS1GL81TF U 1
AF RS1GO50TF U 1
BS 1 503 RS1GL81TF
BS 504 844 RS1GO50TF

RD RS1GL81TF 503 0 0
GGACCGTTCGAAGCAGTAAAGTAACAATGGCGGTTCCGTCGCGCGAGGATCTTGTGTACA
TGGCTAAGCTAGCGGAGCAGGCGGAGAGGTACGAGGAGATGGTTGAATTCATGGAGAAAG
TCTCCGCCGCAACAGATGGCACAGAGCTCACAATCGAGGAGCGAAACCTCCTCTCAGTCG
CTTACAAGAACGTAATCGGCGCTCGCCGTGCCTCGTGGAGAATCATCTCGTCGATCGAGC
AGAAAGAAGAGAGCCGCGGGAACGTCGAACGCGTCAACACGATCCGTGGCTACAAGGCTA
TGATCGAGACGGAGCTCTCGGGGATCTGCGGCGGAATCCTAAAGATGCTCGAGTCCACGC
TCATCCCTTCCGCTGCTTCCGAGGAGTCCAAGGTGTTCTACCTCAAGATGAAAGGTGATT
ACTACAGGTACTTGGCCGAGTTCAAAATCGGTAAAGAGAGAGACGACGCCGCCGATAACA
CACTCTCCGCTTACGAATCCGCT

QA 1 503 1 503
DS 

RD RS1GO50TF 844 0 0
GGACCGTTCGAAGCAGTAAAGTAACAATGGCGGTTCCGTCGCGCGAGGATCTTGTGTACA
TGGCTAAGCTAGCGGAGCAGGCGGAGAGGTACGAGGAGATGGTTGAATTCATGGAGAAAG
TCTCCGCCGCAACAGATGGCACAGAGCTCACAATCGAGGAGCGAAACCTCCTCTCAGTCG
CTTACAAGAACGTAATCGGCGCTCGCCGTGCCTCGTGGAGAATCATCTCGTCGATCGAGC
AGAAAGAAGAGAGCCGCGGGAACGTCGAACGCGTCAACACGATCCGTGGCTACAAGGCTA
TGATCGAGACGGAGCTCTCGGGGATCTGCGGCGGAATCCTAAAGATGCTCGAGTCCACGC
TCATCCCTTCCGCTGCTTCCGAGGAGTCCAAGGTGTTCTACCTCAAGATGAAAGGTGATT
ACTACAGGTACTTGGCCGAGTTCAAAATCGGTAAAGAGAGAGACGACGCCGCCGATAACA
CACTCTCCGCTTACGAATCCGCTCAGGAGCATGCTAAGGGGCTTGCTTCAACTCACCCAA
TCCGGCTTGGTTTGGCATTGAACTTCTCTGTGTTCTATTACGAGATCCTCGAGTCTCCTG
ACCGTGCCTGCGACCTAGCTAAAACGGCTTTTGATGCGGCCATTGCTGAGTTAGACACAC
TAGGGGAAGAGTCATACAAGATAGCACTTTGATCATGCAGCTTCTCCGTGACACCTCACT
CTCTGGACATCCGACATGCAGATGATCTGCAGACGAGATCAAGAGCAGCAGCAGCAGCTG
TGAGCAGCAGAGAGCAGAATGAAGATCTTTGTGTGAATGTACTGCTAGTGTTAGGATTGA
ACAT

QA 1 844 1 844
DS 



AS 1 2

CO CL7968Contig1 757 2 15 U
AATCCGTAATTTTAACTCTCCATTGTCAAAATGAGTGCAGTATCTTGGGGGCACCAGTGG
ATACAAAATTTTAACACCGGATATCGGAATAGTATGATGAGAAGAAGATAACTGAACACC
ACACTCTAAAACATCAATTAGGAAAAAGCTTTCTCGACATAGGAGGATACATTACATCAC
CTCAAATCTAATGTCAAACAATAGCATCTTCGTTGACTCTTCTATCAAGCTTCAACACCT
CTCATTGCCCTGCTAATGGGTTCTTGGAAGTACTGAAGTGATATAAACATCGCTTCCTCT
GTTCGAATGGGTCGGCTTCCTTGATGTGGACATGTATTCAAGTATATATTAAACGCTTAT
CGCACGTCTTTCCCCTTATACTGATTATCCTCTTCAACACTTTCTTCGAGACCAGCAAGT
CCTCCAAATGCAATCAATAAATGCCTAAATGATGGTATTTTCAGCTCTGATGAACTAATT
TTGAGTCCATGCTCGGAGGTACCAATCAAATAATCGTAACCACCCTCGAAAGGGCATTCC
CTGAATACTGAACTTAGGTGTGATGCATAACGTACTTTGTATCCCCAATACATCCCTGCT
TCTTCCCTTGGCTTAGATGGCGGAACAATCTGGCGTACCAAATCTAAATCACGGTTGGCT
CCCATGGCAACAGTGACTCTAACTCCTGGACTAAGAACTTGATCAACAACAACACTCTTG
TCTAAACCTACATCAACCAATGTACCCTCAGAGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1D454JQ U 55
AF RS1ES23JQ U 1
BS 1 84 RS1ES23JQ
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RD RS1D454JQ 566 0 0
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AAT*CCACACTCTAAAACATCAATTAGGAAAAAGCTTTCTCGACATAGGAGGATACATTA
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CCTGCTTCTTCCCTTGGCTTAGATGG

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DS 

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ATACAAAATTTTAACACCGGATATGGGAATAGTATGATGAGAAG***ATAACTGAACACC
ACACTCTAAAACATCAATTAGGAAAAATCTTTCTCGACATAGGAGGATACATTACATCAC
CTCAAATCTAATGTCAAACAATAGCATCTTCGTTGACTCTTCTATCAAGCTTCAACACCT
CTCATTGCCCTGCTAATGGGTTCTTGGAAGTACTGAAGTGATATAAACATCGCTTCCTCT
GTTCGAATGGTTCGGCTTCCTTGATGTGGACATGTATTCAAGTATATATTAAACGCTTCT
CGCACGTCTTTCCCCTTATACTGATTATCCTCTTCAACACTTTCTTCTAGACCAGCAAGT
CCTCCAAATGCAATCAATAGATGCCTAAATGATGGTATTTTCAGCTCTGATGAACTAATT
TTGAGTCCATGCTCGGAGGTACCAATCAAATAATCGTAACCACCCTCGAAAGGGCATTCC
CTGAATACTGAACTTAGGTGTGATGCATAACGTACTTTGTATCCCCAATACATCCCTGCT
TCTTCCCTTGGCTTAGATGGCGGAACAATCTGGCGTACCAAATCTAAATCACGGTTGGCT
CCCATGGCAACAGTGACTCTAACTCCTGGACTAAGAACTTGATCAACAACAACACTCTTG
TCTAAACCTACATCAACCAATGTACCCTCAGAGTTTG

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

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CAGATTGCTTTTGTTGTGAGAGAGATGGGTCAGATCCAGTACTCGGACAAATACTCTGAT
GATACTTTTGAGTACAGGCACGTCGTACTTCCTCCTGAGGTTGCTAAGCTTCTCCCAAAG
AATCGTATTCTCTCCGAAAATGAGTGGCGTGGCATAGGAGTGCAGCAAAGCCGTGGATGG
GTCCATTACGCCATTCATCGTCCTGAGCCGCACATCATGCTCTTCAGGAGGACTCTCAAC
TACCAGCACAACCCAAGCCATGGGGCTAATTAGTAGGAATTATGTTTCCCCCCCTCCCCA
TAGTTTATGTCTCTCGTAAACACTCTATGAACCACGTTATGTAAGACTCTAAATGGTCTT
TGCTAGGCTTTGTCTGGATTCACGTTATGAACCATTTTATCATTTTAAACACAGTATCGT
TTCTTTACGCAGTTTGTGGTTTTGTATTCGCATCTTTCTTCTTAGGAAGCCATGTTTCTC
TATTCATC


BQ
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AF RS1F332TF U 1
AF RS1F332JQ C 106
BS 1 608 RS1F332TF

RD RS1F332TF 608 0 0
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CAGATTGCTTTTGTTGTGAGAGAGATGGGTCAGATCCAGTACTCGGACAAATACTCTGAT
GATACTTTTGAGTACAGGCACGTCGTACTTCCTCCTGAGGTTGCTAAGCTTCTCCCAAAG
AATCGTATTCTCTCCGAAAATGAGTGGCGTGGCATAGGAGTGCAGCAAAGCCGTGGATGG
GTCCATTACGCCATTCATCGTCCTGAGCCGCACATCATGCTCTTCAGGAGGACTCTCAAC
TACCAGCACAACCCAAGCCATGGGGCTAATTAGTAGGAATTATGTTTCCCCCCCTCCCCA
TAGTTTATGTCTCTCGTAAACACTCTATGAACCACGTTATGTAAGACTCTAAATGGTCTT
TGCTAGGCTTTGTCTGGATTCACGTTATGAACCATTTTATCATTTTAAACACAGTATCGT
TTCTTTACGCAGTTTGTGGTTTTGTATTCGCATCTTTCTTCTTAGGAAGCCATGTTTCTC
TATTCATC

QA 1 608 1 608
DS 

RD RS1F332JQ 503 0 0
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GACAAATACTCTGATGATACTTTTGAGTACAGGCACGTCGTACTTCCTCCTGAGGTTGCT
AAGCTTCTCCCAAAGAATCGTATTCTCTCCGAAAATGAGTGGCGTGGCATAGGAGTGCAG
CAAAGCCGTGGATGGGTCCATTACGCCATTCATCGTCCTGAGCCGCACATCATGCTCTTC
AGGAGGACTCTCAACTACCAGCACAACCCAAGCCATGGGGCTAATTAGTAGGAATTATGT
TTCCCCCCCTCCCCATAGTTTATGTCTCTCGTAAACACTCTATGAACCACGTTATGTAAG
ACTCTAAATGGTCTTTGCTAGGCTTTGTCTGGATTCACGTTATGAACCATTTTATCATTT
TAAACACAGTATCGTTTCTTTACGCAGTTTGTGGTTTTGTATTCGCATCTTTCTTCTTAG
GAAGCCATGTTTCTCTATTCATC

QA 1 503 1 503
DS 



AS 1 2

CO CL7970Contig1 942 2 2 U
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TTTCTCAGAGTATCGGAACAATGAGTGAGGTGTTTAACGGATACGAGCGCCAATACTGCG
AGCTCTCTGCCAGTCTTTCCAAGAAATGTTCCTCTGCTGTTTCCCTTGATGGAGAACAAA
AGAAGCAGAAGCTCTCTGAAATCAAATCTGGCCTTGAACTTGCAGAAGCATTGATTAGGA
AAATGGATCTTGAGGCGAGGAGCCTCCCACCGGGTGTTAAATCCAGCCTCCTTGTCAAGT
TAAGAGAGTTCAAGTCTGATCTTAACAACTTCAAAACCGAAGTTAAGAGAATCACATCTG
GAAACTTGAACGCTGCTGCTCGAGACGAGTTGCTTGAAGCTGGTCTGGCTGACACGAAGA
CGGCTTCAGCCGATCAACGATCAAGACTGATGATGTCAACAGAACGTTTGGGCCGTACTT
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TCCTCCAAGACTTGCACGGACAGAGACAATCTCTCCTACGTGCCGGGGATACGCTTAGTG
GAGTAGACGAGAATGTTGGAAAGAGCAAGAAGATCTTGACAGGTATGACGAGGAGGATGA
ACAGGAACAAATGGACCATTGGAGCCATTATCACCGCTTTGGTTGTGGCCATTATCATCA
TCTTGTACTTCAAACTCACCAAGTAACTGACTCAAATCTTTCTCACTGAACGAAAACTAT
TGTCCTCGTTTCTGAATCTTTGATTTTTCCTAAATTTTTTCTTTTTGCTTTCCGTGTGAA
AACTTGTCTTTGCCCCCCTTTTATTATCGCCTCAAGAAAGTAAGGCCTCAGATTGTTTTG
TTGAGTTTGCAAATGCATTTGTTATATTTAGTGTATTTTTTT


BQ
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AF RS1B250TF U 1
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BS 1 660 RS1B250TF
BS 661 942 RS1B250JQ

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CATCATCAATTCAGTGCTCCTCCGATCGATTCTGACACCGTAGTTCTTCTTCCCCGTTCG
TTTCTCAGAGTATCGGAACAATGAGTGAGGTGTTTAACGGATACGAGCGCCAATACTGCG
AGCTCTCTGCCAGTCTTTCCAAGAAATGTTCCTCTGCTGTTTCCCTTGATGGAGAACAAA
AGAAGCAGAAGCTCTCTGAAATCAAATCTGGCCTTGAACTTGCAGAAGCATTGATTAGGA
AAATGGATCTTGAGGCGAGGAGCCTCCCACCGGGTGTTAAATCCAGCCTCCTTGTCAAGT
TAAGAGAGTTCAAGTCTGATCTTAACAACTTCAAAACCGAAGTTAAGAGAATCACATCTG
GAAACTTGAACGCTGCTGCTCGAGACGAGTTGCTTGAAGCTGGTCTGGCTGACACGAAGA
CGGCTTCAGCCGATCAACGATCAAGACTGATGATGTCAACAGAACGTTTGGGCCGTACTT
CAGACAGACTCAAGGACAATCGTAGAACAATGATGGAGACTGAAAAGATTGGCGTTTCAA
TCCTCCAAGACTTGCACGGACAGAGACAATCTCTCCTACGTGCCGGGGATACGCTTAGTG
GAGTAGACGAGAATGTTGGAAAGAGCAAGAAGATCTTGACAGGTATGACGAGGAGGATGA

QA 1 660 1 660
DS 

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GATGGAG
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TAGGAAAATGGATCTTGAGGCGAGGAGCCTCCCACCGGGTGTTAAATCCAGCCTCCTTGT
CAAGTTAAGAGAGTTCAAGTCTGATCTTAACAACTTCAAAACCGAAGTTAAGAGAATCAC
ATCTGGAAACTTGAACGCTGCTGCTCGAGACGAGTTGCTTGAAGCTGGTCTGGCTGACAC
GAAGACGGCTTCAGCCGATCAACGATCAAGACTGATGATGTCAACAGAACGTTTGGGCCG
TACTTCAGACAGACTCAAGGACAATCGTAGAACAATGATGGAGACTGAAAAGATTGGCGT
TTCAATCCTCCAAGACTTGCACGGACAGAGACAATCTCTCCTACGTGCCGGGGATACGCT
TAGTGGAGTAGACGAGAATGTTGGAAAGAGCAAGAAGATCTTGACAGGTATGACGAGGAG
GATGAACAGGAACAAATGGACCATTGGAGCCATTATCACCGCTTTGGTTGTGGCCATTAT
CATCATCTTGTACTTCAAACTCACCAAGTAACTGACTCAAATCTTTCTCACTGAACGAAA
ACTATTGTCCTCGTTTCTGAATCTTTGATTTTTCCTAAATTTTTTCTTTTTGCTTTCCGT
GTGAAAACTTGTCTTTGCCCCCCTTTTATTATCGCCTCAAGAAAGTAAGGCCTCAGATTG
TTTTGTTGAGTTTGCAAATGCATTTGTTATATTTAGTGTATTTTTTT

QA 8 774 8 774
DS 



AS 1 2

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GTCCGATTCGAATCTACAACAAAGCATCTACAGATCCGACGAATCTTAGAAGACGAGGAA
ACAAACGCCATCTTCGTTATGAACCATTTTCGAATCTTCCCTTATTTTTTCAAGGGGCAA
GGTCGAAATATCTTTCTTAACAGGTCTTAGTTTCTCTTTTCTTAGGGTTTAGTGTTTGTG
TAGGAAGTATTTGTTTTCTTAGGCTTTTGTAATTTCTAAGTAATCTGCGTCTGTCTTTCG
GGTTTCAATTCGGTTTTTTTAGTCCTAAGTTCCTCTGGTAAATTATAGGCTCGCTTTTGT
GTTTTCTTTTCTTTATTATCGAGTCTCTTGTTATTCCTAAAGGGTCATAGAAGTGTAGCC
TACTGGTAATTACCCTTTCGTTGTGTATGCCCAGTATTACAGTTCTATGTATTTAATAGT
AGTTGTTTAAGGTCGTCATAGAGGTGTAGCTACTGGTTAATTACCTTTGCGTTGTGTATG
CCCAGTATTACAATTCTATGTATTTAATAGTAGTTGTTTAAGGTCAGTCGAGTTTGATTT
GTAATATGAACTTATGTTTCGATGTAAGCAGTATTGCAGTTCTCTATCTATATAATATTA
TCGTTTTTCATTTCCTTTCC


BQ
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AF RS1E459TF U 1
AF RS1E459JQ C 165
BS 1 668 RS1E459TF
BS 669 680 RS1E459JQ

RD RS1E459TF 668 0 0
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ACAAACGCCATCTTCGTTATGAACCATTTTCGAATCTTCCCTTATTTTTTCAAGGGGCAA
GGTCGAAATATCTTTCTTAACAGGTCTTAGTTTCTCTTTTCTTAGGGTTTAGTGTTTGTG
TAGGAAGTATTTGTTTTCTTAGGCTTTTGTAATTTCTAAGTAATCTGCGTCTGTCTTTCG
GGTTTCAATTCGGTTTTTTTAGTCCTAAGTTCCTCTGGTAAATTATAGGCTCGCTTTTGT
GTTTTCTTTTCTTTATTATCGAGTCTCTTGTTATTCCTAAAGGGTCATAGAAGTGTAGCC
TACTGGTAATTACCCTTTCGTTGTGTATGCCCAGTATTACAGTTCTATGTATTTAATAGT
AGTTGTTTAAGGTCGTCATAGAGGTGTAGCTACTGGTTAATTACCTTTGCGTTGTGTATG
CCCAGTATTACAATTCTATGTATTTAATAGTAGTTGTTTAAGGTCAGTCGAGTTTGATTT
GTAATATGAACTTATGTTTCGATGTAAGCAGTATTGCAGTTCTCTATCTATATAATATTA
TCGTTTTT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1E459JQ 516 0 0
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GGGTTTAGTGTTTGTGTAGGAAGTATTTGTTTTCTTAGGCTTTTGTAATTTCTAAGTAAT
CTGCGTCTGTCTTTCGGGTTTCAATTCGGTTTTTTTAGTCCTAAGTTCCTCTGGTAAATT
ATAGGCTCGCTTTTGTGTTTTCTTTTCTTTATTATCGAGTCTCTTGTTATTCCTAAAGGG
TCATAGAAGTGTAGCCTACTGGTAATTACCCTTTCGTTGTGTATGCCCAGTATTACAGTT
CTATGTATTTAATAGTAGTTGTTTAAGGTCGTCATAGAGGTGTAGCTACTGGTTAATTAC
CTTTGCGTTGTGTATGCCCAGTATTACAATTCTATGTATTTAATAGTAGTTGTTTAAGGT
CAGTCGAGTTTGATTTGTAATATGAACTTATGTTTCGATGTAAGCAGTATTGCAGTTCTC
TATCTATATAATATTATCGTTTTTCATTTCCTTTCC

QA 1 516 1 516
DS 



AS 1 2

CO CL7972Contig1 905 2 2 U
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CTCCTCCTTGGCTTGGCTCTTCCAGAAAGATCTTGGAAGTCTTCGTCTCAGGGACAAGAA
TCCTAGTTTGTTGCCCGAAGCTTTAAGCTATGGCTGTCACCAAGATTTATATAGTGTACT
ATTCGCTGCACGGCCACGTGGAGACAATGGCAAGGGAAGTTCTCCGAGGAGCAAACGAAG
TTCCAGACGTGGAGGCAACGCTCTGGCAGATACCTGAGACGTTACCTGAGAAGATACTCG
AGAAAGTGCAGGCCGCTCCAAGACCAGACGATGTGCCGGAGATTCAAGGGGAGCAGCTCG
GTGAAGCCGACGGGTTCATGTTCGGTTTCCCTTCGAGGTTTGGAGTGATGGCGTCACAGG
TCATGACGTTCTTTGACAACACAAACGATCTCTGGACCTCACAGGCACTCGCCGGGAAAC
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CGGCGGTGACGAAACTGGCTCATCATGGGATGATATTTGTACCGTTAGGGTATACGTTTG
GTAAAGGGATGTATGAGATGGGAGAGGTGAAAGGTGGTTCACCTTATGGGTCAGGGACTT
ATGCAGCTGATGGGTCGCGTGAGCCGACTGAGCTGGAGATTCAGCAGGCAAATTATCATG
GTAAGTACTTTGCAGGCATAGCCAAGAAACTCAAGAAGCGGTCTCCTGTCTAGAGCGGAA
TCTACTCTGTCTCTTTTCTGTACTAATCAATCTGTAAATGCAAAGGAGAGGACTTTGAAT
AAGATGGACATAATACAATACAGAGAAGACATGTGTAAGCTAATGATCAATAAATCTTTT
ATCCC


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RS1DM03TF U 1
AF RS1DM03JQ C 126
BS 1 630 RS1DM03TF
BS 631 905 RS1DM03JQ

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ATTCGCTGCACGGCCACGTGGAGACAATGGCAAGGGAAGTTCTCCGAGGAGCAAACGAAG
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GTAAAGGGATGTATGAGATGGGAGAGGTGA

QA 1 630 1 630
DS 

RD RS1DM03JQ 780 0 0
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CTGCACGGCCACGTGGAGACAATGGCAAGGGAAGTTCTCCGAGGAGCAAACGAAGTTCCA
GACGTGGAGGCAACGCTCTGGCAGATACCTGAGACGTTACCTGAGAAGATACTCGAGAAA
GTGCAGGCCGCTCCAAGACCAGACGATGTGCCGGAGATTCAAGGGGAGCAGCTCGGTGAA
GCCGACGGGTTCATGTTCGGTTTCCCTTCGAGGTTTGGAGTGATGGCGTCACAGGTCATG
ACGTTCTTTGACAACACAAACGATCTCTGGACCTCACAGGCACTCGCCGGGAAACCCGCA
GGGATCTTCTGGAGCACGGGGTTCCACGGTGGAGGCCAAGAGCTCACTGCATTGACGGCG
GTGACGAAACTGGCTCATCATGGGATGATATTTGTACCGTTAGGGTATACGTTTGGTAAA
GGGATGTATGAGATGGGAGAGGTGAAAGGTGGTTCACCTTATGGGTCAGGGACTTATGCA
GCTGATGGGTCGCGTGAGCCGACTGAGCTGGAGATTCAGCAGGCAAATTATCATGGTAAG
TACTTTGCAGGCATAGCCAAGAAACTCAAGAAGCGGTCTCCTGTCTAGAGCGGAATCTAC
TCTGTCTCTTTTCTGTACTAATCAATCTGTAAATGCAAAGGAGAGGACTTTGAATAAGAT
GGACATAATACAATACAGAGAAGACATGTGTAAGCTAATGATCAATAAATCTTTTATCCC

QA 1 780 1 780
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7974Contig1 1031 2 6 U
GGATTTGGTGCTTGGATCAGTCAGAACACCCAACAGCCTACAAAATCTGAAAAATCTGTT
AAATCCAAGCCAATGACACAGGCAAAAACTCACGAGGAGAGAGAGGAGATGAAGGAGCAA
TTAAAACTATGGAAAGATGCAAATAAGAAGGAACAATATCACGAACCTCCTCCTACCGTG
AAGTTGCGTACAGACCATTATTCTCGCATTTCCAATATGGAAATGGAATTTACATTAGGA
TTGCCACCTCGAGCAGCTTACGACGTTTTAACTAATAAAGACAACATAACATACTCCAGA
AAAATCAAAGGCCGCCCACTTCTGAAAGCAGTATCAAGAAAAGTTATACCAGAGAAGGAC
GACGGTGATCAAGGGACTACGTTCGACGTGGAGGTTGAGAAAGGGTTGTCATGGAACTTC
CTTTTCTTTTCAGGAACTATCCCAATACGTCTAGATGTCCTCGAAGACCCAAAAGAACTT
TATGTACACTACCTGAAACAGCAAAATGGAATAAGGTTAATGGAAAATTTCGAGGGTTGG
TATACAGTGGAGCCAGTGTATGTTGATGCAGAACGCTTGTGCAATCACATGAAGCCAAAG
AGTCAAGAAGAATACAGAAAATGTAGTGGTGGAAAAGGATTAATTGCGTCCAAGGTTAAA
GTGTACAAGACATTTAGGCCTGCTTCTCCTTGGGATCTGCCGCTGCTGTCTTCGTACGTT
CGCCGGTTCACTGTCGAGACCACTAAGAAAGTCGCTGAAGATCTTCAAATGCAGGCTGGC
GATCTAGTCTCAGAACTCGTAACAAGACACAAGAAAGAAACTCTTCTTTATTAACTCTCT
TAAGAAAAGACTCAAAAACCTTAAGCTCCACAAACTCAATGACTCTAAAACGCTTAAAGA
TATGCAACATTCTTACACCTCTTTATATAGATATTTCAAATCCTAAACTCATTAGAAAAA
CACTTTCCTAAGTATATCTCAACTAGGATAAACATAACTTGTACTCCAAGTTAATCTTCA
TGTTTATCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AX35TF U 1
AF RS1AX35JQ C 245
BS 1 652 RS1AX35TF
BS 653 653 RS1AX35JQ
BS 654 758 RS1AX35TF
BS 759 759 RS1AX35JQ
BS 760 768 RS1AX35TF
BS 769 1031 RS1AX35JQ

RD RS1AX35TF 769 0 0
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TTAAAACTATGGAAAGATGCAAATAAGAAGGAACAATATCACGAACCTCCTCCTACCGTG
AAGTTGCGTACAGACCATTATTCTCGCATTTCCAATATGGAAATGGAATTTACATTAGGA
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GACGGTGATCAAGGGACTACGTTCGACGTGGAGGTTGAGAAAGGGTTGTCATGGAACTTC
CTTTTCTTTTCAGGAACTATCCCAATACGTCTAGATGTCCTCGAAGACCCAAAAGAACTT
TATGTACACTACCTGAAACAGCAAAATGGAATAAGGTTAATGGAAAATTTCGAGGGTTGG
TATACAGTGGAGCCAGTGTATGTTGATGCAGAACGCTTGTGCAATCACATGAAGCCAAAG
AGTCAAGAAGAATACAGAAAATGTAGTGGTGGAAAAGGATTAATTGCGTCCA*GGTTAAA
GTGTACAAGACATTTAGGCCTGCTTCTCCTTGGGATCTGCCGCTGCTGTCTTCGTACGTT
CGCCGGTTCACTGTCGAGACCACTAAGAAAGTCGCTGA*GATCTTCAA
T

QA 1 768 1 768
DS 

RD RS1AX35JQ 787 0 0
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TCAAAGGCCGCCCACTTCTGAAAGCAGTATCAAGAAAAGTTATACCAGAGAAGGACGACG
GTGATCAAGGGACTACGTTCGACGTGGAGGTTGAGAAAGGGTTGTCATGGAACTTCCTTT
TCTTTTCAGGAACTATCCCAATACGTCTAGATGTCCTCGAAGACCCAAAAGAACTTTATG
TACACTACCTGAAACAGCAAAATGGAATAAGGTTAATGGAAAATTTCGAGGGTTGGTATA
CAGTGGAGCCAGTGTATGTTGATGCAGAACGCTTGTGCAATCACATGAAGCCAAAGAGTC
AAGAAGAATACAGAAAATGTAGTGGTGGAAAAGGATTAATTGCGTCCAAGGTTAAAGTGT
ACAAGACATTTAGGCCTGCTTCTCCTTGGGATCTGCCGCTGCTGTCTTCGTACGTTCGCC
GGTTCACTGTCGAGACCACTAAGAAAGTCGCTGAAGATCTTCAAATGCAGGCTGGCGATC
TAGTCTCAGAACTCGTAACAAGACACAAGAAAGAAACTCTTCTTTATTAACTCTCTTAAG
AAAAGACTCAAAAACCTTAAGCTCCACAAACTCAATGACTCTAAAACGCTTAAAGATATG
CAACATTCTTACACCTCTTTATATAGATATTTCAAATCCTAAACTCATTAGAAAAACACT
TTCCTAAGTATATCTCAACTAGGATAAACATAACTTGTACTCCAAGTTAATCTTCATGTT
TATCTAC

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

CO CL7975Contig1 956 2 2 U
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TCGTTAGCTTCCCCTCCGTGTCTCCGCCTAACTCCGACGACACGTCATCACCTCCCTTCG
CGTCAATCTTCTTCCGCCTGTTACCCTCACGTTGTCTCTTCTGTAATCAAATCCAGTAGT
ACCCTATCATTCGCCTCATCCGCATCCGGTTTCGCGTCACCACTCTCCGTAGAGAAGGAG
CTACGCTTACAGACGGCTGCTGTCCGCCACGTCACTGGGTCGCTAATCAGAGGAGAAGGT
CTTAGATTCGCTATTGTTGTTGCTCGTTTCAATGAGGTTGTGACGAAGTTGCTTTTGGAA
GGAGCTATTGAGACTTTCAACAAGTACTCTGTTAGAGAAGAAGACATCGAGGTTATTTGG
GTTCCTGGTAGCTTTGAAATAGGTGTTGTTGCACAGAACCTTGGGAACTCAGGAAAGTTT
CATGCCGTTTTGTGTATCGGTGCTGTGATAAGAGGAGATACTACTCATTATGATGCTGTT
GCCAACTCTGCTGCTTCTGGAGTTCTTTCTGCTGTCATTAATTCAGGTGTTCCATGCATA
TTTGGTGTACTGACATGCGAGGACATGGATCAGGCTTTGAATCGATCTGGTGGCAAAGCT
GGAAACAAGGGAGCTGAAACTGCTTTGACGGCGCTCGAGATGGCGTCCTTGTTTGAGCCC
CCCCTAAAATAGCTGCTCGTTTCATGGATGAGCAAAATGATCACGTATGAGAACTTGTTT
CCTGTAAACCATTTGGTTACAATCCATTTAATTTTCGAAACTGTATTGTCAAAAATGTTG
TTTTTTACCTCGGTCAGTGAGATATATTTTGAACGCTTTTTGTAAGTTTTTGATCTTTTG
TTTTGAATCGTGTAATAATAGTTCCTCCGAATTTTGGGGGGGAATGGGTTATTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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BS 631 956 RS1DE75JQ

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TCGTTAGCTTCCCCTCCGTGTCTCCGCCTAACTCCGACGACACGTCATCACCTCCCTTCG
CGTCAATCTTCTTCCGCCTGTTACCCTCACGTTGTCTCTTCTGTAATCAAATCCAGTAGT
ACCCTATCATTCGCCTCATCCGCATCCGGTTTCGCGTCACCACTCTCCGTAGAGAAGGAG
CTACGCTTACAGACGGCTGCTGTCCGCCACGTCACTGGGTCGCTAATCAGAGGAGAAGGT
CTTAGATTCGCTATTGTTGTTGCTCGTTTCAATGAGGTTGTGACGAAGTTGCTTTTGGAA
GGAGCTATTGAGACTTTCAACAAGTACTCTGTTAGAGAAGAAGACATCGAGGTTATTTGG
GTTCCTGGTAGCTTTGAAATAGGTGTTGTTGCACAGAACCTTGGGAACTCAGGAAAGTTT
CATGCCGTTTTGTGTATCGGTGCTGTGATAAGAGGAGATACTACTCATTATGATGCTGTT
GCCAACTCTGCTGCTTCTGGAGTTCTTTCTGCTGTCATTAATTCAGGTGTTCCATGCATA
TTTGGTGTACTGACATGCGAGGACATGGAT

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ACCTTGGGAACTCAGGAAAGTTTCATGCCGTTTTGTGTATCGGTGCTGTGATAAGAGGAG
ATACTACTCATTATGATGCTGTTGCCAACTTTGCTGCTTCTGGAGTTCTTTCTGCTGTCA
TTAATTCAGGTGTTCCATGCATATTTGGTGTACTGACATGCGAGGACATGGATCAGGCTT
TGAATCGATCTGGTGGCAAAGCTGGAAACAAGGGAGCTGAAACTGCTTTGACGGCGCTCG
AGATGGCGTCCTTGTTTGAGCCCCCCCTAAAATAGCTGCTCGTTTCATGGATGAGCAAAA
TGATCACGTATGAGAACTTGTTTCCTGTAAACCATTTGGTTACAATCCATTTAATTTTCG
AAACTGTATTGTCAAAAATGTTGTTTTTTACCTCGGTCAGTGAGATATATTTTGAACGCT
TTTTGTAAGTTTTTGATCTTTTGTTTTGAATCGTGTAATAATAGTTCCTCCGAATTTTGG
GGGGGAATGGGTTATTATC

QA 1 559 1 559
DS 



AS 1 2

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TCCCGAAAATGTCGTTGACCACCGTCTTTCGCCGAGCCTCCTCTAGAGTGGCTACTCTCG
CCTTCCGTTCAGTTAGATCTCCGGTGAGCGTCCGCAGTGGCTCCGAGAGGCTGATTCTTC
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AAATCGATTGCGCCGTTAAGGAGGAGGCCCCTGATCAGGACGTCATGGAAGAGATGCCAG
AAGGGTTTCCTTTCAAGATCATTGATACTCCTGGTGAACGAACCGCCTTGCTTCAAAGGA
ATTTTGAGGATGAAACCATCCAAGTCGAAGTTGACTCCTCTTCACCTTATGACGATGATG
ATGATGATGAACAAGAACAAGAACAAGCTGAACAGAACGATGATAATGAAGATGACGAAC
ACTCTGTTAAAATCCGGATTCCCATGGTTGTCAGTGTCTCCAAAGGTGATGGTGTCTGTC
TTGAGTTTGGAGTCAGCGCTTTCCCTGATGAGATCGTCATTGATAGTTTATCCATCAAAC
ATCCTCAAGGTTCTGACAATGACCTTGCTTATGAAGAACCCGACTTTGATGACTTGGATG
AGAACCTGCAGAAGGCTTTCCACAGGTTCCTCGAGATCAGAGGGATCAAGCCCAGCTTCA
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BQ
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AF RS1F467TF U 1
AF RS1F467JQ C 224
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CCTTCCGTTCAGTTAGATCTCCGGTGAGCGTCCGCAGTGGCTCCGAGAGGCTGATTCTTC
TTCGTAGCCAGCAGCAGCTCAACCGCGCATCTGTGATTCCTTTCTCGAGATTTCACTCGA
CGGAAAGTGCGGTCTCGAAAACAACCGCCGACGAGAATCTGGTGGGCGTTCTCGAATCTG
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AAGGGTTTCCTTTCAAGATCATTGATACTCCTGGTGAACGAACCGCCTTGCTTCAAAGGA
ATTTTGAGGATGAAACCATCCAAGTCGAAGTTGACTCCTCTTCACCTTATGACGATGATG
ATGATGATGAACAAGAACAAGAACAAGCTGAACAGAACGATGATAATGAAGATGACGAAC
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TTGAGTTTGGAGTCAGCGCTTTCCCTGATGAGATCGTCATTGATAGTTTATCCATCAAAC
ATCCTCAAG*TTCTGACAATGACCTTGCTTATGAAGA**CCGACTTTGATGACTTGGATG
AGA*CCTGCAGAAG
CTTT

QA 1 734 1 734
DS 

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GGGCGTTCTCGAATCTGAAATCGATTGCGCCGTTAAGGAGGAGGCCCCTGATCAGGACGT
CATGGAAGAGATGCCAGAAGGGTTTCCTTTCAAGATCATTGATACTCCTGGTGAACGAAC
CGCCTTGCTTCAAAGGAATTTTGAGGATGAAACCATCCAAGTCGAAGTTGACTCCTCTTC
ACCTTATGACGATGATGATGATGATGAACAAGAACAAGAACAAGCTGAACAGAACGATGA
TAATGAAGATGACGAACACTCTGTTAAAATCCGGATTCCCATGGTTGTCAGTGTCTCCAA
AGGTGATGGTGTCTGTCTTGAGTTTGGAGTCAGCGCTTTCCCTGATGAGATCGTCATTGA
TAGTTTATCCATCAAACATCCTCAAGGTTCTGACAATGACCTTGCTTATGAAGGACCCGA
CTTTGATGACTTGGATGAGAACCTGCAGAAGGCTTTCCACAGGTTCCTCGAGATCAGAGG
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GTATCTTCAATGGCTTAAGGACGTCAAGTCTTTTGTTGAGAACTGATTACTCACTCTTTC
TTTCCATCAATAATAAGTGTCAAACTTTTAGTTGAGGTCTTTTTTTCTTTACTTCAAAAT
GTTTTGAGTTTATTTC

QA 1 736 1 736
DS 



AS 1 2

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AGACGAACGATGGAGAGAGCTACACTTTCCCCGAATCTTAATCAAAGCTACCTGCTTTCT
CCTTCACACGCCTCCACCACACGCCTCCACTCTTTCTCCTTCACTCGGAACTTATCGCCA
TCGTCTTCCTCCATCAAGGTCAACTCTTTTTCTTCCTCTGTTTCTTCAAGTTTCATCAAT
GGCGGAGTCTCCCTTACTCGTTGCAGTGCGGTCATGTCAAACTCTTCTTCCAGTAAGGGT
GTTACTGAACTAGCCGACATAGATTGGGACAACATCGGCTTCGGTATTAAGCCCACTGAT
CACATGTACGTCATGAAATGTAACCTTGGTGGTGAGTTCTCAGATGGCGAGTTGCAACGT
TTTGGGAACATTGAAGTCAGCCCATCTGCTGGTGTACTCAACTACGGACAGGGATTGTTC
GAAGGGATGAAAGCTTACAGAAAGCAAGACGGTAAGAGTATCCTCCTCTTCCGTCCTGAA
GAGAATGCAAAGCGTATGAGAAGTGGTGCTGAGAGGATGTGTATGCCTGCTCCTACCATT
GACCAGTTTGTCGAAGCTGTGAAAGCTACTGTGTTAGCAAACAAACGTTGGGTTCCACCT
CCAGGTAAAGTTCCTTGTACATCAGACCGTTGCTAATGGGAACTGGAGCTGTTCTTGGTC
TGCACCTGCACAGATATACTTTCCTGTCTACGTCTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EJ14TF U 1
AF RS1BP50TF U 20
BS 1 92 RS1EJ14TF
BS 93 93 RS1BP50TF
BS 94 176 RS1EJ14TF
BS 177 177 RS1BP50TF
BS 178 234 RS1EJ14TF
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BS 274 274 RS1BP50TF
BS 275 569 RS1EJ14TF
BS 570 756 RS1BP50TF

RD RS1EJ14TF 569 0 0
GGATAGCCTCCGTCACCCATTACAGACACCAAAAGAAGAATCTAAAACATTTTCTCTCGG
AGACGAACGATGGAGAGAGCTACACTTTCCCCTAATCTTAATCAAAGCTACCTGCTTTCT
CCTTCACACGCCTCCACCACACGCCTCCACTCTTTCTCCTTCACTCGGAACTTATCTCCA
TCGTCTTCCTCCATCAAGGTCAACTCTTTTTCTTCCTCTGTTTCTTCAAGTTTCGTCAAT
GGCGGAGTCTCCCTTACTCGTTGCAGTGCGGTCCTGTCAAACTCTTCTTCCAGTAAGGGT
GTTACTGAACTAGCCGACATAGATTGGGACAACATCGGCTTCGGTATTAAGCCCACTGAT
CACATGTACGTCATGAAATGTAACCTTGGTGGTGAGTTCTCAGATGGCGAGTTGCAACGT
TTTGGGAACATTGAAGTCAGCCCATCTGCTGGTGTACTCAACTACGGACAGGGATTGTTC
GAAGGGATGAAAGCTTACAGAAAGCAAGACGGTAAGAGTATCCTCCTCTTCCGTCCTGAA
GAGAATGCAAAGCGTATGAGAAGTGGTGC

QA 1 569 1 569
DS 

RD RS1BP50TF 737 0 0
GGAG
AGACACCAAAAGAAGAATCTAAAACATTTTCTCTCGGAGACGAACGATGGAGAGAGCTAC
ACTTTCCCCGAATCTTAATCAAAGCTACCTGCTTTCTCCTTCACGCGCCTCCACCACACG
CCTCCACTCTTTCTCCTTGGCTCGGAACTTATCGCCATCGTCTTCCTCCATCAAGGTCAA
CTCTTTTTCTTCCTCTGTTTCTTCAAGTTTCATCAATGGCGGAGTCTCCCTTACTCGTTG
CAGTGCTGTCATGTCAAACTCTTCTTCCAGTAAGGGTGTTACTGAACTAGCCGACATAGA
TTGGGACAACATCGGCTTCGGTATTAAGCCCACTGATCACATGTACGTCATGAAATGTAA
CCTTGGTGGTGAGTTCTCAGATGGCGAGTTGCAACGTTTTGGGAACATTGAAGTCAGCCC
ATCTGCTGGTGTACTCAACTACGGACAGGGATTGTTCGAAGGGATGAAAGCTTACAGAAA
GCAAGACGGTGAGAGTATCCTCCTCTTCCGTTCTGAAGAGAATGCAAAGCGTATGAGAAG
TGGTGCTGAGAGGATGTGTATGCCTGCTCCTACCATTGACCAGTTTGTCGAAGCTGTGAA
AGCTACTGTGTTAGCAAACAAACGTTGGGTTCCACCTCCAGGTAAAGTTCCTTGTACATC
AGACCGTTGCTAATGGGAACTGGAGCTGTTCTTGGTCTGCACCTGCACAGATATACTTTC
CTGTCTACGTCTC

QA 5 737 5 737
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7979Contig1 943 2 4 U
GGCCCACACCACGAAAGAAGAGGACAGTGCAGCACAAAACTCTTCTTTACCACGTTATCT
CATTTCTGAACAAAAAAATATTCGAGTGGTTCACTTATACCAGAGAGTACCTTCTCTCCA
AAAAGAATCTCAATGGAAGCTGACAGGGAGTTTCAACTGCGTAGATATCAGAGCGAGCGG
AGCTACAGTGGATCATTGCATCGTCCCAAGAGAGGTACTGTGGACGAGATGTCAGATTCC
CCGCATGTGGAGCACAAGGGACGGTTTAAGGTCACATCAGCAGATCTGAGTCCCAAGGGA
TCAACAAACTCTACATTCACACCGTTTAGCGGTGGTTCAAGCAGCCCGAGCTCCCTTACG
ACCGCCTCAATCCTCCCATCAGTTCAGTCCATTTTGCAGCAAAACACCATGCAACGGGAA
GAGATATTGAGACTCATAAAACACGTGGAGCAAACCTCTGTCAAGCAGCAACCTGGATCA
CCAGAGACAAGCGTCGATGAGCTATTGCAGACTCCGCCTGCAACTCAACGGGAGAAAGAA
CTTCAGACCCAAGTTATGCTACTGCAACAGAGCTTTTTGAGCCTAACAGAAGAATTAAAG
AAATTGAAGCAGAGAAATGGGCAGGTAGAGAATCAGTTAAATGCATTAACACAGAGAAAG
GATTGAGTCTCGTTAAGTCATGGAGACAACAAAACACAAGCTCAGGGATGAAACTGGGGA
TATCATGAGTAAAAACCCCATATTCCCTTTTGAAGACAAAGAAGAAAGAGAGATTTGTGT
GTTTATATTTATATGATTATTGGGTGTAATTTATTTGACAGGTTAAATATTATAAGACAG
CTACTACTGCAATGTTTGTCTTCGCGTTGTCCTTTTGGCCGCCTATGTTTGGTTTATGAT
GTGCTATAATATACTTACATCGTTTGTATTAATATATGTTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GD88TF U 1
AF RS1GD88JQ C 250
BS 1 734 RS1GD88TF
BS 735 735 RS1GD88JQ
BS 736 754 RS1GD88TF
BS 755 943 RS1GD88JQ

RD RS1GD88TF 766 0 0
GGCCCACACCACGAAAGAAGAGGACAGTGCAGCACAAAACTCTTCTTTACCACGTTATCT
CATTTCTGAACAAAAAAATATTCGAGTGGTTCACTTATACCAGAGAGTACCTTCTCTCCA
AAAAGAATCTCAATGGAAGCTGACAGGGAGTTTCAACTGCGTAGATATCAGAGCGAGCGG
AGCTACAGTGGATCATTGCATCGTCCCAAGAGAGGTACTGTGGACGAGATGTCAGATTCC
CCGCATGTGGAGCACAAGGGACGGTTTAAGGTCACATCAGCAGATCTGAGTCCCAAGGGA
TCAACAAACTCTACATTCACACCGTTTAGCGGTGGTTCAAGCAGCCCGAGCTCCCTTACG
ACCGCCTCAATCCTCCCATCAGTTCAGTCCATTTTGCAGCAAAACACCATGCAACGGGAA
GAGATATTGAGACTCATAAAACACGTGGAGCAAACCTCTGTCAAGCAGCAACCTGGATCA
CCAGAGACAAGCGTCGATGAGCTATTGCAGACTCCGCCTGCAACTCAACGGGAGAAAGAA
CTTCAGACCCAAGTTATGCTACTGCAACAGAGCTTTTTGAGCCTAACAGAAGAATTAAAG
AAATTGAAGCAGAGAAATGGGCAGGTAGAGAATCAGTTAAATGCATTAACACAGAGAAAG
GATTGAGTCTCGTTAAGTCATGGAGACAACAAAACACAAGCTCAGGGATGAAACTGGGGA
TATCATGAGTAAAA*CCCCATATTCCCTTTTGAA
ACAAGAAGAAAG

QA 1 754 1 754
DS 

RD RS1GD88JQ 694 0 0
GAGCACAAGGGACGGTTTAAGGTCACATCAGCAGATCTGAGTCCCAAGGGATCAACAAAC
TCTACATTCACACCGTTTAGCGGTGGTTCAAGCAGCCCGAGCTCCCTTACGACCGCCTCA
ATCCTCCCATCAGTTCAGTCCATTTTGCAGCAAAACACCATGCAACGGGAAGAGATATTG
AGACTCATAAAACACGTGGAGCAAACCTCTGTCAAGCAGCAACCTGGATCACCAGAGACA
AGCGTCGATGAGCTATTGCAGACTCCGCCTGCAACTCAACGGGAGAAAGAACTTCAGACC
CAAGTTATGCTACTGCAACAGAGCTTTTTGAGCCTAACAGAAGAATTAAAGAAATTGAAG
CAGAGAAATGGGCAGGTAGAGAATCAGTTAAATGCATTAACACAGAGAAAGGATTGAGTC
TCGTTAAGTCATGGAGACAACAAAACACAAGCTCAGGGATGAAACTGGGGATATCATGAG
TAAAAACCCCATATTCCCTTTTGAAGACAAAGAAGAAAGAGAGATTTGTGTGTTTATATT
TATATGATTATTGGGTGTAATTTATTTGACAGGTTAAATATTATAAGACAGCTACTACTG
CAATGTTTGTCTTCGCGTTGTCCTTTTGGCCGCCTATGTTTGGTTTATGATGTGCTATAA
TATACTTACATCGTTTGTATTAATATATGTTCCT

QA 1 694 1 694
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL7981Contig1 867 2 2 U
GGCAGACAATCTAATAGGTGACTTTGAGAAAGAAAACAACGGGATAAATAATGGTAACGG
AGGAAATTGAGGTAGACGTGGAGATCAAATCTCCGGCTAATATGTTCCACATGTTCGTCG
GAAGATTACAACATCTGTCCAAAGCCACTCGCTACATTCAGGGATGTGATTTGCTCGAAG
GGGACTGGGGCATGGTTGGAAGCATATTCTTGTGGAAACTACTTTTTGGTAATGGCATAA
CTATATCCTTTTTAAATTTTATTTATCAATTTGTTTTCGTCCTATTCTTCTTTGATTTAA
ATGCGAAGATCTTTTTTTGTTGTTGTTGAAAATGATGGTGAGATCATACAAGGACTTGGT
AGTTGGAACATAAGATTTTAAAGATTTTCTGTTTTGCTTGTTTCTTTGATTTCAATCACA
AGAAAACATGTTTTGGTTTAGATGGAGAGGAAATAGTGTCAAAAGATATGATCGAGGCGA
TGGATTTTGAGAAGAATGTTATTCAGTTGAGAGTGTTAGAGGGACCTCTTAAGACAGTGT
ACAACAGCCTCTTGAAAACGATGAAGGTGAGCCCTAACCATGGAGGACCAGGAAGCACGG
TAAAGTGGAACGTGAAGTACGAGAGGATTGATGAGAACGTTGCTCGCCCTGAGAGGCAGC
TCCAGTTCTTGGTCGAAGTGACTAAACAGGTCGACGGATACCTCTTATCTGAGGAATAAA
GCCTCTTCGGGTTGGCAATATCTAAATAATTAATGCTTCACATACAACATGTTTGTGTGG
AAGAGTTATTGTTACGTAATAGAGGACTCCTCTTGTGTGTTTGTATGTGTTTCTCAATAA
TGTATTAATGTGACATTTATCGGATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DH23TF U 1
AF RS1DH23JQ C 180
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BS 686 867 RS1DH23JQ

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ATGCGAAGATCTTTTTTTGTTGTTGTTGAAAATGATGGTGAGATCATACAAGGACTTGGT
AGTTGGAACATAAGATTTTAAAGATTTTCTGTTTTGCTTGTTTCTTTGATTTCAATCACA
AGAAAACATGTTTTGGTTTAGATGGAGAGGAAATAGTGTCAAAAGATATGATCGAGGCGA
TGGATTTTGAGAAGAATGTTATTCAGTTGAGAGTGTTAGAGGGACCTCTTAAGACAGTGT
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TAAAGTGGAACGTGAAGTACGAGAGGATTGATGAGAACGTTGCTCGCCCTGAGAGGCAGC
TCCAGTTCTTGGTCGAAGTGACTAA
C

QA 1 685 1 685
DS 

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ACTATATCCTTTTTAAATTTTATTTATCAATTTGTTTTCGTCCTATTCTTCTTTGATTTA
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ATGGATTTTGAGAAGAATGTTATTCAGTTGAGAGTGTTAGAGGGACCTCTTAAGACAGTG
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GAAGAGTTATTGTTACGTAATAGAGGACTCCTCTTGTGTGTTTGTATGTGTTTCTCAATA
ATGTATTAATGTGACATTTATCGGATCT

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

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GCACTGTTGATGGGAAGGATCCTAAGGATCTTCAGCAGGAGATTCAGGAGGGTGAGATTG
AGATCCCTGAGAACTGAGCATCTATCTTTGTCTTTTTCTTTTGTTTCGTCTTATCGTTTA
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TCCGTTGAAATGGTGT


BQ
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AF RS1GT93TF U 1
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BS 1 505 RS1GT93TF
BS 506 676 RS1GT93JQ

RD RS1GT93TF 505 0 0
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TCGCCAAGGAGCTGAGCGGGACCGTGAGGGGGATTCTCGGGACGTGTGTGTCTGTTGGGT
GCACTGTTGATGGGAAGGATCCTAA

QA 1 505 1 505
DS 

RD RS1GT93JQ 676 0 0
GGGGCGCCTCCTCCCACACTCATTCCACACACACGAATCACCAAACCCTAACAACAATGC
CGCCCAATTTGGACCCGACCGCGATCGTCGACGTCTACGTCCGCGTAACCGGAGGAGAAG
TCGGAGCCGCCAGCTCCCTCGCCCCCAAGATCGGTCCCCTCGGTCTCGCCCCCAAGAAGA
TCGGAGAAGACATCGCCAAGGAGACGGCCAAAGAGTGGAAAGGCCTCCGCGTCACCGTCA
AGCTAACGGTACAGAACCGTCAGGCCAAGGTCACGGTGGTCCCTTCCGCCGCGGCGCTCG
TCATCAAGGCCCTGAAGGAGCCAGAGAGGGACCGCAAGAAGGTGAAGAACATCAAGCACA
ACGGGAACATTTCGTTTGACGATGTGATCGAGATCGCGAGGATCATGAGGCCGAGGTCTA
TCGCCAAGGAGCTGAGCGGGACCGTGAGGGGGATTCTCGGGACGTGTGTGTCTGTTGGGT
GCACTGTTGATGGGAAGGATCCTAAGGATCTTCAGCAGGAGATTCAGGAGGGTGAGATTG
AGATCCCTGAGAACTGAGCATCTATCTTTGTCTTTTTCTTTTGTTTCGTCTTATCGTTTA
GATGATGCTGTCTTGTCTTAATTACAATGACTCGAGTTTTGGATTATTATTATTATTATG
TCCGTTGAAATGGTGT

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL7983Contig1 697 2 4 U
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AGCTTTTGTTGAACTCTGTCTGGTAAGTGGTAAGTACACTACTTACTTTTTTTTCTTTAC
AGAATCAGCTTCTCTTTTTGTTTGATAGGTTAGGTTA


BQ
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AF RS1EO64TF U 1
AF RS1EO64JQ C 79
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BS 658 658 RS1EO64JQ
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BS 672 697 RS1EO64JQ

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GGAAAACTTTCAATGCAGTGCAAAAGCTACTGAGCAAAACCAATGGGAAGCTTGTTGGAG
ATTTAATGACACCAGCTCCAGTTGTTGTTGAGGAAAATACCAACCTCGAAGATGCTGCTA
AAATCTTGCTCGAGACCAAATATCGCAGGCTCCCTGTGGTAGATTCCCATGGAAAATTGG
TTGGTATTATCACAAGAGGTAACGTGGTTAGAGCTGCACTTCAAATAAAGCGCACTGGTG
ATAGGAACGCTTGAATAAGATACAAACAAAAACCAAGAAAATAGGTTGTAGAGAGGAAAT
CAACATGGATCAAACATTATCCAGATAATAAGAGTGAGTGCTCAACAGTGTACCTTGTAC
TAGAATTATATTAACTTGTATTACAAGAGTTCCGCATCTTATGTCGGTCACAAGGAACTC
AGCTTTTGTTGAACTCTGTCTGGTAAGTGGTAAGTACACTACTTACTTTTTTTTCTT*AC
AGAATCAGCTT

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1EO64JQ 619 0 0
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GAAGTACAGAAAATGCCATGTTCCCTGAGGTTGACAGCACCTGGAAAACTTTCAATGCAG
TGCAAAAGCTACTGAGCAAAACCAATGGGAAGCTTGTTGGAGATTTAATGACACCAGCTC
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AATATCGCAGGCTCCCTGTGGTAGATTCCCATGGAAAATTGGTTGGTATTATCACAAGAG
GTAACGTGGTTAGAGCTGCACTTCAAATAAAGCGCACTGGTGATAGGAACGCTTGAATAA
GATACAAACAAAAACCAAGAAAATAGGTTGTAGAGAGGAAATCAACATGGATCAAACATT
ATCCAGATAATAAGAGTGAGTGCTCAACAGTGTACCTTGTACTAGAATTATATTAACTTG
TATTACAAGAGTTCCGCATCTTATGTCGGTCACAAGGAACTCAGCTTTTGTTGAACTCTG
TTTGGTAAGTGGTAAGTACACTACTTACTTTTTTTTTTTTACAGAATCAGCTTCTCTTTT
TGTTTGATAGGTTAGGTTA

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 2

CO CL7984Contig1 636 2 2 U
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TCTCCAAAGTCCTTCCAAGTCCAACCAATCTGATATTCGGACACGACCCCCTTTTTTCTC
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TTATCGTACTGGAATTTGAGAAGCTTCAGTTTACGGAAATCTTGGTCGGATGGTGTGATC
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AGATTTTGTTGGTTCTTTATGGCTGAGGTGGGAAAAGTCTTGGTTAGTGGCAAATCAAGC
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AAACCACCAAAGGCTCCTGAAAGTGGTACCGTGTTATCCCTGCAGTCTGGTTCGGAAGGG
AGTAGTAGCCCGTTTATCCGAGAGAAAGTTATGGAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1E661TF U 1
AF RS1H437TF U 1
BS 1 580 RS1E661TF
BS 581 636 RS1H437TF

RD RS1E661TF 580 0 0
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QA 1 580 1 580
DS 

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AGATTTTGTTGGTTCTTTATGGCTGAGGTGGGAAAAGTCTTGGTTAGTGGCAAATCAAGC
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AGTAGTAGCCCGTTTATCCGAGAGAAAGTTATGGAA

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

CO CL7985Contig1 580 2 1 U
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AAAAACGAACCAGAAGGGAAAACGACCCCAATGGGGAGATTACCGATTTTATAAATAAAA
AGGTGTTTATTTTATAAATAAAAAGGTGTTATACATATATACGCTGTCCTTATTGTATTG
TTAAATTGTTTGTTGCGTAATTCATGCTTGTTTCAAGAGC


BQ
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AF RS1DT84JQ C 1
AF RS1DT84TF U 1
BS 1 580 RS1DT84TF

RD RS1DT84JQ 580 0 0
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AAAAACGAACCAGAAGGGAAAACGACCCCAATGGGGAGATTACCGATTTTATAAATAAAA
AGGTGTTTATTTTATAAATAAAAAGGTGTTATACATATATACGCTGTCCTTATTGTATTG
TTAAATTGTTTGTTGCGTAATTCATGCTTGTTTCAAGAGC

QA 1 580 1 580
DS 

RD RS1DT84TF 580 0 0
GGAAGATCACACCAATCACATCATCACCACTAACACTTTTCAAAATGGAGAGACCGAGAG
AGGAGATGAAGGAAGAGGAGAAGGACTCATCATTGGCTACCGCAGCCATGGCGGTTGCGG
TGGCAGCCGCAGTGGCTGAGGAGGAGAAATTGTGGTGTAGTGGAGTAGTCGAGGAGATGA
CGTGGAGCAACGTATGGTTACCTTTTTGGGACGTTGAGTTTGTTGGAAGAAACTACAGTT
TATTGTTCAGCGACGTTGCTTGGGACGATGATATTTGGAACCTCAAGAATCTAACTCATT
CCTCATAGTCCACTTCTTTAAGAAAAGAAATAATCGGATTTATAATACCTTCTAAATAAG
TTTTCCTTATATGGGGTTGATCTGAAAGTAATTATCTAGATTTAAGAATTAGTCTGTTTT
AAAAACGAACCAGAAGGGAAAACGACCCCAATGGGGAGATTACCGATTTTATAAATAAAA
AGGTGTTTATTTTATAAATAAAAAGGTGTTATACATATATACGCTGTCCTTATTGTATTG
TTAAATTGTTTGTTGCGTAATTCATGCTTGTTTCAAGAGC

QA 1 580 1 580
DS 



AS 1 2

CO CL7986Contig1 671 2 1 U
ACGATAAAACTGTGATTAAATTGTTAATGCAACCGTAAGTTACATCATTCACAGTAACAT
ATTATTCAATTTATAGAAAAATAGCAACAATTATTCCGGAAGATAAAGGCATCAAATCTT
TGAACACAACAAGAGATCTTCTAATGTCATGCAAATGAACTCAACTCCAACTAGACAAGA
TGGTGAAACCCTTCCTCTCTAGATACCTTTCTCAAGCATCGCTCTAACTCTCATAGGAAG
CCCATAGAGACGAATAAACCCTGCTGCATCCGCTTGGTTGTAAATCTCACTCCCTTCAAA
CGAAGATATGTCCTGCCTGTACAGACTGTTCGGACTCTTACGCCCTGTCACCGACACAGA
TCCTTTGTACAGCTTCAGCGTAACGGATCCAGTGGTTTTCTCGGTCAACTTCTCCATGAA
TGCGTCCATGGACTCCTTAAGCGGATCAAACCATCTTCCCGCGTAGACCATCTCTGCGTA
TTTCAGAGCTAACGAGTCTTTCACCTGAATGCTCTCCCTGTCTAGAGTGAGCGATTCTAG
CTCCTGCACGGCTGCAAAGAGGATGGTGCCTCCCGGGGTTTCGTAGACACCGCGTGACTT
CATCCCAACCAGACGGTTCTCCACCATGTCGATCCGGCCGATGCCGTGTTTCCCTCCTAT
TGTGTTTAGCT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GO29JQ U 49
AF RS1C993JQ U 1
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G
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DS 

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TGTGTTTAGCT

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1GY90JQ C 1
AF RS1GY90TF U 1
BS 1 571 RS1GY90TF

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QA 1 571 1 571
DS 

RD RS1GY90TF 571 0 0
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AGATGTTTAGCTCAGATTCGTCCGAGTATAGAGCGCTGAGGCGCAGCTATTTGCTGCTGG
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TCGAAGATGAGAAAGTTGAGCTTTTGGACAAGCTTGTTGTAATGGAAGGTTTAGTTGATC
CTTGATGGGGTTTAAAGATAGCCAACTCTTGTGTTGTCTGATGGATCATTCGTGTGTAGT
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GTTTAGTTAATCCTTGATGCTTCTGATGGCT

QA 1 571 1 571
DS 



AS 1 2

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CG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 

AF RS1CB12TF U 1
AF RS1CB12JQ C 27
BS 1 610 RS1CB12TF
BS 611 782 RS1CB12JQ

RD RS1CB12TF 610 0 0
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ATGGTTAAATCAGGCATCTTCTGTGGGAAACCGCTTCTCCACTTGTGCGACTGTCTTCTT
TGCATCTTCA

QA 1 610 1 610
DS 

RD RS1CB12JQ 756 0 0
AACAAAAATAAACACATCCACCAAACACCTTTCCATCTAGACCATATCAACACAAGAACT
CTTCACCTCACTCCTCCCAAATTTTCAAATCCCACCTACACTACATCAGTGTGAAGTGAG
ATGGTTTATCTCTGTAAGTCTTGTTTATAAAGTTCCGCTAAGATACACGATTGTCTGATA
TTCAATGCTTGTGAGTCGACGTTCAAGTCCTTACACTAAAAGTGTTGTAGATAATTGTCA
AGGGTAGTTAGAGGGCAGAAATTAATGTTTTTGACTTCATAGAAAGTGTGTCAAAACCAC
AAAAGTGTCTTCTCGTATAAATCACAAATCCTAAAAGTGTGTGTTCTGCTGGTGAATATT
CTGTGATGAGATTGCATTTCTGAGGAGTAAAGAAAAAAAGTCACCAAAATGTATTGAGAG
CAGTAGATAGCACTGATAGAAAAGAAGATTCTTACAACCGTCAGAATCTGCATATTACCA
TTCTTAGAACACACACCAAACACTCACTCACCGGATGGTTAAATCAGGCATCTTCTGTGG
GAAACCGCTTCTCCACTTGTGCGACTGTTTTCTTTGCATCTTCAACTTCTGGACCTTCCT
TCTCTTGCAAAACCCATTTTCTGTAAGAGACAACACAGAACATGAACTCCACGGTTCCTC
TTATGTGTGTATTATTCACTGTATGTGTTCAACAAGGGGGCTTTATCATGCATGTAATTG
TGACTAATGGAGTCAAATTGCTGCTAAGTTTTCCCG

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL7989Contig1 701 2 4 U
GGCTCCTCGTTTCCAGGATCAAAAAACCCTAAACTGATTGAAGAGAAAGGAAACAAGATG
ACTGGAAGGGAGGATGACGAAGTTGGCAGAGGTAAAGAGAAAGAGGAAGAGCAAGACGAC
ATGTCCATACACTCTCCCTGTAAAGCTCCACCTTCCTCTGCTTCTTCTCTCTCCAAGGAG
CAATCACAGGTTGAACTGGAGCTCACGTTATTAGAAGCTCTTGAAATACACCCTCCAGTT
AAACTCCGAGGCATACATCGTCACTTTGTTCTTTACGGTCTGATGGAATATCTCGGTAGA
AGCTTTGATCGACAGTTCACAGCAGATGAGGTTCTGCAGCTACTGGATCGTTTCTACAAC
ATTGAGATGCTGAAATCAGATGACGACGACATTGAGATTCTTAATCACGAAGAAGACTTC
ACCTTGCCGCAGAGTTACTTTGATAAGGAAGAAACAATGGCATAAGAAGAAGGATAAGTG
GTCTTTGCTTCATTCTCAGTTCTCTTTTTGTATATGGTTGGGTTAGGTTTGTCCCCTAGT
CTTATTCTACTGTATAGTATGCACTATGCAGTAATACTAATATAGAACCATCAGAGCATT
ATTGATCTTTTCATGATGACATTTAGTGCCAGTGTTGTGTTTGTTTTGGGAGTTTCTAAT
AATACAGTTGCATTGCTTTGTGTTTTATAAATAGTCAAACA


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C979TF U 1
AF RS1BH26TF U 4
BS 1 521 RS1C979TF
BS 522 522 RS1BH26TF
BS 523 598 RS1C979TF
BS 599 701 RS1BH26TF

RD RS1C979TF 598 0 0
GGCTCCTCGTTTCCAGGATCAAAAAACCCTAAACTGATTGAAGAGAAAGGAAACAAGATG
ACTGGAAGGGAGGATGACGAAGTTGGCAGAGGTAAAGAGAAAGAGGAAGAGCAAGACGAC
ATGTCCATACACTCTCCCTGTAAAGCTCCACCTTCCTCTGCTTCTTCTCTCTCCAAGGAG
CAATCACAGGTTGAACTGGAGCTCACGTTATTAGAAGCTCTTGAAATACACCCTCCAGTT
AAACTCCGAGGCATACATCGTCACTTTGTTCTTTACGGTCTGATGGAATATCTCGGTAGA
AGCTTTGATCGACAGTTCACAGCAGATGAGGTTCTGCAGCTACTGGATCGTTTCTACAAC
ATTGAGATGCTGAAATCAGATGACGACGACATTGAGATTCTTAATCACGAAGAAGACTTC
ACCTTGCCGCAGAGTTACTTTGATAAGGAAGAAACAATGGCATAAGAAGAAGGATAAGTG
GTCTTTGCTTCATTCTCAGTTCTCTTTTTGTATATGGTTGG*TTAGGTTTGTCCCCTAGT
CTTATTCTACTGTATAGTATGCACTATGCAGTAATACTAATATAGAACCATCAGAGCA

QA 1 598 1 598
DS 

RD RS1BH26TF 698 0 0
GG
CTCGTTTCCAGGATCAAAAAACCCTAAACTGATTGAAGAGAAAGGAAACAAGATGACTGG
AAGGGAGGATGACGAAGTTGGCAGAGGTAAAGAGAAAGAGGAAGAGCAAGACGACATGTC
*ATACACTCTCCCTGTAAAGCTCCACCTTCCTCTGCTTCTTCTCTCTCCAAGGAGCAATC
ACAGGTTGAACTGGAGCTCACGTTATTAGAAGCTCTTGAAATACACCCTCCAGTTAAACT
CCGAGGCATACATCGTCACTTTGTTCTTTACGGTCTGATGGAATATCTCGGTAGAAGCTT
TGATCGACAGTTCACAGCAGATGAGGTTCTGCAGCTACTGGATCGTTTCTACTACATTGA
GATGCTGAAATCAGATGACGACGACATTGAGATTCTTAATCACGAAGAAGACTTCACCTT
GCCGCAGAGTTACTTTGATAAGGAAGAAACAATGGCATAAGAAGAAGGATAAGTGGTCTT
TGCTTCATTCTCAGTTCTCTTTTTGTATATGGTTGGGTTAGGTTTGTCCCCTAGTCTTAT
TCTACTGTATAGTATGCACTATGCAGTAATACTAATATAGAACCATCAGAGCATTATTGA
TCTTTTCATGATGACATTTAGTGCCAGTGTTGTGTTTGTTTTGGGAGTTTCTAATAATAC
AGTTGCATTGCTTTGTGTTTTATAAATAGTCAAACA

QA 3 698 3 698
DS 



AS 1 2

CO CL7990Contig1 329 2 3 U
CAGGGGGAACCATTTTTTTTATTACAATCCGAACTGTACTTAAGTGCACACCTCACATAC
ACCAAACCATTATTACATTGCTAGAGAAAACATACAGATCAAAACACACTGAATCAACAT
TATCACGTAACTGAAACTTGAGCTCAACGTTGAAGCATAGTTGCCAGGAGGTCCAAAACC
ACCAAAACCTGAACATGGATCTGGAGAGAGGGCTGTTAAAATTGTCTGGTTGGAGTAACC
AGCATAGGCGCAAGAACGAGGTCCGCAAGAGGTATTTGTCGTGTTACCTACAAACAAACT
CTCTGCTCCTTCACATCCCGGAAACGGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A142JQ U 1
AF RS1A142TR U 57
BS 1 103 RS1A142JQ
BS 104 104 RS1A142TR
BS 105 329 RS1A142JQ

RD RS1A142JQ 329 0 0
CAGGGGGAACCATTTTTTTTATTACAATCCGAACTGTACTTAAGTGCACACCTCACATAC
ACCAAACCATTATTACATTGCTAGAGAAAACATACAGATCAAAGCACACTGAATCAACAT
TATCACGTAACTGAAACTTGAGCTCAACGTTGAAGCATAGTTGCCAGGAGGTCCAAAACC
ACCAAAACCTGAACATGGATCTGGAGAGAGGGCTGTTAAAATTGTCTGGTTGGAGTAACC
AGCATAGGCGCAAGAACGAGGTCCGCAAGAGGTATTTGTCGTGTTACCTACAAACAAACT
CTCTGCTCCTTCACATCCCGGAAACGGGC

QA 1 329 1 329
DS 

RD RS1A142TR 273 0 0
ATACCCCAAACCATTATTACATTGCTAGAGAAAACATACAGATCAAAACACACTGAATCA
ACATTATCACGTAACTGAAACTTGAGCTCAACGTTGAAGCATAGTTGCCAGGAGGTCCAA
AACCACCAAAACCTGAACATGGATCTGGAGAGAGGGCTGTTAAAATTGTCTGGTTGGAGT
AACCAGCATAGGCGCAAGAACGAGGTCCGCAAGAGGTATTTGTCGTGTTACCTACAAACA
AACTCTCTGCTCCTTCACATCCCGGAAACGGGC

QA 1 273 1 273
DS 



AS 1 2

CO CL7991Contig1 645 2 1 U
GGGAGTGTGGAGAAATTAGAGAAGAAGGTGAAGAAGAAATAATCGGTGTGCTTCGATGGC
GATGACAGTAGCAGCTTCGTCCTCCGTAGCAGTCATGATGCCACGTGTCACCTCCGTATA
CACCCGCTTCTCAGCGGTTCCTTACCTTCCTCCTCGCTCTTTTGGCCGATCCTCTTTCAC
TGCTCCGGTGAAGCTACTTTCAGGGAACGGTTTACACAAGGTTGAATCGATGAAGACGAG
AGCTTCTTCATCAGAAGATACATCAGCATCTATTGACACCAACGAAATCTTCACAGACTT
GAAGGAAAAGTGGGATGGTCTTGAGAACAAGTCAACTGTAATAATATATGGAGGAGGAGC
CGTTGTTGCCGTTTGGTTATCTTCCATTGTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTCTGCT
TCCAAAGGTGATGGAACTTGTTGGTCTTGGGTACACAGGATGGTTCGTCTACAGATACCT
TCTCTTCAAGTCAAGCAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGAAGAT
CGCAGGGACCGAATAGATTCTTTCAAAAAAATATAAACCAGCTTTCTCTATGGGATTTTC
CTGTAATATGATATGTTATACAATAAATATATATTTCAAGAATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EA95TF U 1
AF RS1EA95JQ C 58
BS 1 645 RS1EA95TF

RD RS1EA95TF 645 0 0
GGGAGTGTGGAGAAATTAGAGAAGAAGGTGAAGAAGAAATAATCGGTGTGCTTCGATGGC
GATGACAGTAGCAGCTTCGTCCTCCGTAGCAGTCATGATGCCACGTGTCACCTCCGTATA
CACCCGCTTCTCAGCGGTTCCTTACCTTCCTCCTCGCTCTTTTGGCCGATCCTCTTTCAC
TGCTCCGGTGAAGCTACTTTCAGGGAACGGTTTACACAAGGTTGAATCGATGAAGACGAG
AGCTTCTTCATCAGAAGATACATCAGCATCTATTGACACCAACGAAATCTTCACAGACTT
GAAGGAAAAGTGGGATGGTCTTGAGAACAAGTCAACTGTAATAATATATGGAGGAGGAGC
CGTTGTTGCCGTTTGGTTATCTTCCATTGTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTCTGCT
TCCAAAGGTGATGGAACTTGTTGGTCTTGGGTACACAGGATGGTTCGTCTACAGATACCT
TCTCTTCAAGTCAAGCAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGAAGAT
CGCAGGGACCGAATAGATTCTTTCAAAAAAATATAAACCAGCTTTCTCTATGGGATTTTC
CTGTAATATGATATGTTATACAATAAATATATATTTCAAGAATGT

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1EA95JQ 588 0 0
GGCGATGACAGTAGCAGCTTCGTCCTCCGTAGCAGTCATGATGCCACGTGTCACCTCCGT
ATACACCCGCTTCTCAGCGGTTCCTTACCTTCCTCCTCGCTCTTTTGGCCGATCCTCTTT
CACTGCTCCGGTGAAGCTACTTTCAGGGAACGGTTTACACAAGGTTGAATCGATGAAGAC
GAGAGCTTCTTCATCAGAAGATACATCAGCATCTATTGACACCAACGAAATCTTCACAGA
CTTGAAGGAAAAGTGGGATGGTCTTGAGAACAAGTCAACTGTAATAATATATGGAGGAGG
AGCCGTTGTTGCCGTTTGGTTATCTTCCATTGTTGTTGGTGCCATCAACTCTGTTCCTCT
GCTTCCAAAGGTGATGGAACTTGTTGGTTTTGGGTACACAGGATGGTTCGTCTACAGATA
CCTTCTTTTCAAGTCAAGCAGAAAGGAGTTGGCTGAGGATATTGATTCCTTGAAGAAGAA
GATCGCAGGGACCGAATAGATTCTTTCAAAAAAATATAAACCAGCTTTCTCTATGGGATT
TTCCTGTAATATGATATGTTATACAATAAATATATATTTCAAGAATGT

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 2

CO CL7992Contig1 580 2 1 U
GCAAGACGATTACTATGACTGAGAAGTTTAGCTGCAGAGCTAAGGATTTGTACGAGATTC
TGATGGATGAGAATCGTTGGAAGGGGTTCACGCAGAGTAATGCTAAGATTAGTAAAGATG
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BQ
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AF RS1CV01TF U 1
AF RS1CV01JQ C 29
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BS 634 874 RS1CV01JQ

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CCGGTTCTCATTCACAATGGTAAGGCGGTATGTGAATCTCTCATCCAGGTCGAGTACATC
GATGAGACTTGGCCCGGTGATAACTCACTCCTTCCTTCTGATCCTTACCAAAGAGCTCAT
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GAAGCTGAGCTTGGAGACAAGCACTACTTTGGAGGTGAGACTTTCGGGTATGTGGATATA
GCTTTCATCGGGTTTTACAGCTGGTTTGGAGTCTACGACAAGTTTGGAAATATTAGCATC
GAATCAGAGTGTTCGAAGTTGATTGCGTGGGCC

QA 1 633 1 633
DS 

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TATTGTTGTTAATCAAAATTATTATGGCTCACCGCTATATCTTGATT

QA 20 846 20 846
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1B916JQ C 1
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DS 

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QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1C744JQ C 1
AF RS1C744TF U 1
BS 1 581 RS1C744TF

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QA 1 581 1 581
DS 

RD RS1C744TF 581 0 0
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TAACTTGATGAATGTTTTTTTGGTTAATTTGATGAATGCTTTTTTTTTGGTTTCTTCTCT
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CATGTTAAAAAGTGTGATCATGGGGTTCCACTCTTTCTTCC

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

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TTTATCTTT


BQ
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AAATGGAACATGGATTGATACATTTCTATTGTACCAACAATTTGACAATACGTAATGTAA
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DS 



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ATGCTTCTGATCCAGGCCAGACACCAAAAAGTTGGAGAGAAGCCTCTACTATCCCTTTCC
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CTCAGCAATCTAAAGGTCTGGTAATTGCTGTGCTACT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DK67TF U 1
AF RS1FG73TF U 121
BS 1 186 RS1DK67TF
BS 187 187 RS1FG73TF
BS 188 379 RS1DK67TF
BS 380 384 RS1FG73TF
BS 385 541 RS1DK67TF
BS 542 542 RS1FG73TF
BS 543 677 RS1DK67TF
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BS 720 720 RS1FG73TF
BS 721 742 RS1DK67TF
BS 743 877 RS1FG73TF

RD RS1DK67TF 751 0 0
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TTTTTTTTGTGTTCCTCCAAAGAAACGCAATAAAACGTGCCAGAGAATAAGAACGCACTT
TCAATCAATCAACCAACCAACCGACGGATTCATCTTACTCATATCTCTCTCTCTCTCTGT
ATATTCTTAGCATCTTCTCTAAAAGCTGAAGCTTGAGAAGAGAGCTCAAGATTCTCTTGA
GTTTCTGTAATTTAGATCTCATTGAGATAAGAGAGAGAGAGAGTATCCAATTGTGTCTGC
ATCTTACGCGGTTTAGGCGGGAGGAGGTTTTGTGCTTGTGAATGCACTGTTTGAGCTGAT
CTTACACAGGTCCATTAAG*****TCTAGAATAGTGAGGACGATGAAGAACGGGATGGCT
GAGTGCAGCGTGTGTCGTTCGAGGAGCATCAAAGCTATAGCGAGGGCTTATGATAACCGG
AAGATTAGAGTTTCCTCTAAACAACGAGCTCTCAATGTCTTTTTGGTGGTCGGTGACTGC
ATGCTAGTTGGTCTGCAGCCTGTGTTAGTGTACATGTCTAAAGTGGATGGAAAGTTCAAC
TTCAGTCCTATTAGCGTCAACTTTTTGACGGAAATTGCAAAGGTTATGTTTGCGCTTGTC
ATGCTTCTGATCCAGGC*AGACACCAAAAAGTTGGAGAGAAGCCTCTACTATCCCTTTC*
ACATTTGTCCAGGCAGCTCGGA
CATGTGCTC

QA 1 742 1 742
DS 

RD RS1FG73TF 757 0 0
GG
AATCAATCAACCAACCAACCGACGGATTCATCTTACTCATATCTCTCTCTCTCTCTGTAT
ATTCCTAGCATCTTCTCTAAAAGCTGAAGCTTGAGAAGAGAGCTCAAGATTCTCTTGAGT
TTCTGTAATTTAGATCTCATTGAGATAAGAGAGAGAGAGAGTATCCAATTGTGTCTGCAT
CTTACGCGGTTTAGGCGGGAGGAGGTTTTGTGCTTGTGAATGCACTGTTTGAGCTGATCT
TACACAGGTCCATTAAGCTCAGTCTAGAATAGTGAGGACGATGAAGAACGGGATGGCTGA
GTGCAGCGTGTGTCGTTCGAGGAGCATCAAAGCTATAGCGAGGGCTTATGATAACCGGAA
GATTAGAGTTTCCTCTAAACAACGAGCTCTCAATGTCTTTTTGGTGGTCGGTGACTGCAC
GCTAGTTGGTCTGCAGCCTGTGTTAGTGTACATGTCTAAAGTGGATGGAAAGTTCAACTT
CAGTCCTATTAGCGTCAACTTTTTGACGGAAATTGCAAAGGTTATGTTTGCGCTTGTCAT
GCTTCTGATCCAGGCCAGACACCAAAAAGTTGGAGAGAAGCCTCTACTATCCCTTTCCAC
ATTTGTCCAGGCAGCTCGGAACAATGTGCTTCTCGCTGTTCCAGCACGATTGTATGCCAT
TAATAACTATCTTAAGTTCACAATGCAGTTATATTTCAATCCTGCTACTGTGAAGATGCT
CAGCAATCTAAAGGTCTGGTAATTGCTGTGCTACT

QA 3 757 3 757
DS 



AS 1 2

CO CL7999Contig1 885 2 6 U
GGAGAAAAAAAACCCTAAACCCCCACCCACTAGATTTGCGAGTAAGAGGAAAAATGAATG
GGTTTACGCATTTCAAGAAGAAGAGAAACGCCATTGTGGCGTTCAGAAGCGGTTACTCCA
ACGCCGACATCATTCACATCAAGCTGCTGAGGAACAACACGTTCGTCACGGTTACTGATT
CCAAAGGGAACGTCAAGTGCAAGGCTACGTCGGGTAGTGTGCCTGACTTGAAAGGTGGGC
GGAAGATGACGAGTTACACGGCTGATGCTACCGCTGAGAACATTGGGAGGAGAGTTAAGG
CTATGGGTCTGAAGTCCGTGGTGGTGAAGGTGAATGGGTTTACGCATTTCAAGAAGAATC
CCTTTAGATCACGCTTACCAAACACCTTACCTTCTCACTCCGGTGAAGAAGAAGGCTTAC
CAAGCACTGGAGGAAGCGGGTTCTCTTCTGCACCCGCACCCAGCTACCAGAGCTTCACTC
AGTCTAACCTTTTCAAGGACAACTTCAGGACCGGTGGGATTTCCAAAGACCTGGACTTTG
TCAGGGGAGTGATAGAGGAGGACGAAGGACGTAGAGCCGCCACAGGGGGGCTCTTCTCTC
ACTTCCATCGCCCTAATCTGGAGACCAACGCCGACATCATTCACATCAAGCTGCTGAGGA
ATGATCAGAATCCTATTGTCTACATCGAGGACACTACTAGGAAAGCTCATAATGGTTGCA
GATTGCCAAGGAAACGTCGGGTGTGAGAGGAAAAAATGGAAAACGTGTTTGCAGATTTGC
TTTTGTTGTTCTTCTATGGTCACACTACAGAAACCATTTCTTTTTGCTAATCTTCTCTTT
GTTTCGTTATTACTTTTAAATCCTGATGAAAATCGGGTCTGAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DG17TF U 1
AF RS1DG17JQ C 127
BS 1 660 RS1DG17TF
BS 661 661 RS1DG17JQ
BS 662 700 RS1DG17TF
BS 701 702 RS1DG17JQ
BS 703 725 RS1DG17TF
BS 726 885 RS1DG17JQ

RD RS1DG17TF 725 0 0
GGAGAAAAAAAACCCTAAACCCCCACCCACTAGATTTGCGAGTAAGAGGAAAAATGAATG
GGTTTACGCATTTCAAGAAGAAGAGAAACGCCATTGTGGCGTTCAGAAGCGGTTACTCCA
ACGCCGACATCATTCACATCAAGCTGCTGAGGAACAACACGTTCGTCACGGTTACTGATT
CCAAAGGGAACGTCAAGTGCAAGGCTACGTCGGGTAGTGTGCCTGACTTGAAAGGTGGGC
GGAAGATGACGAGTTACACGGCTGATGCTACCGCTGAGAACATTGGGAGGAGAGTTAAGG
CTATGGGTCTGAAGTCCGTGGTGGTGAAGGTGAATGGGTTTACGCATTTCAAGAAGAATC
CCTTTAGATCACGCTTACCAAACACCTTACCTTCTCACTCCGGTGAAGAAGAAGGCTTAC
CAAGCACTGGAGGAAGCGGGTTCTCTTCTGCACCCGCACCCAGCTACCAGAGCTTCACTC
AGTCTAACCTTTTCAAGGACAACTTCAGGACCGGTGGGATTTCCAAAGACCTGGACTTTG
TCAGGGGAGTGATAGAGGAGGACGAAGGACGTAGAGCCGCCACAGGGGGGCTCTTCTCTC
ACTTCCATCGCCCTAATCTGGAGACCAACGCCGACATCATTCACATCAAGCTGCTGAGGA
*TGATCAGAATCCTATTGTCTACATCGAGGACACTACTAG**AAGCTCATAATGGTTGCA
GATTG

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1DG17JQ 759 0 0
ACATCATTCACATCAAGCTGCTGAGGAACAACACGTTCGTCACGGTTACTGATTCCAAAG
GGAACGTCAAGTGCAAGGCTACGTCGGGTAGTGTGCCTGACTTGAAAGGTGGGCGGAAGA
TGACGAGTTACACGGCTGATGCTACCGCTGAGAACATTGGGAGGAGAGTTAAGGCTATGG
GTCTGAAGTCCGTGGTGGTGAAGGTGAATGGGTTTACGCATTTCAAGAAGAATCCCTTTA
GATCACGCTTACCAAACACCTTACCTTCTCACTCCGGTGAAGAAGAAGGCTTACCAAGCA
CTGGAGGAAGCGGGTTTTCTTCTGCACCCGCACCCAGCTACCAGAGCTTCACTCAGTCTA
ACCTTTTCAAGGACAACTTCAGGACCGGTGGGATTTCCAAAGACCTGGACTTTGTCAGGG
GAGTGATAGAGGAGGACGAAGGACGTAGAGCCGCCACAGGGGGGCTCTTCTCTCACTTCC
ATCGCCCTAATCTGGAGACCAACGCCGACATCATTCACATCAAGCTGCTGAGGAATGATC
AGAATCCTATTGTCTACATCGAGGACACTACTAGGAAAGCTCATAATGGTTGCAGATTGC
CAAGGAAACGTCGGGTGTGAGAGGAAAAAATGGAAAACGTGTTTGCAGATTTGCTTTTGT
TGTTCTTCTATGGTCACACTACAGAAACCATTTCTTTTTGCTAATCTTCTCTTTGTTTCG
TTATTACTTTTAAATCCTGATGAAAATCGGGTCTGAATC

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 2

CO CL8000Contig1 884 2 6 U
GTATGGGGAGAGCATTGTACAGCGTAGGATTCTGGATCCGGGAAACTGGTCAAGCCCTTG
ATCGTCTCGGTTGTCGCCTCCAAGGCAAAAATCACTTCCGTGAGCAGCTCTCCAGGCACC
GCACCCTTTATGAATGTTTTTGACAAGGCCCCTATCGTCGATAAGGACGCTTTCGTTGCT
CCTAGCGCTTCTCTCATTGGCAATGTCCATCTCGGACCTGCCTCTTCCATTTGGTATGGA
TGTGTCTTGCGAGGAGATGCTAACACCATCACTGTCGGAGCTGGGACCAATATCCAAGAC
AACTCCCTTGTCCACGTTGCCAAGTCCAACTTAAACGGCAAGGTCTTGCCTACTCTCATT
GGTGACTATGTCACTATTGGTAACAGTGCTGTTTTACATGGCTGCACTCTCGAAGACGAG
TCTTACATTGGTGCTAGTGCAACCGTCTTGGATGGCGCTCATGTTGAGAAGCATGCCATC
GTTGAGTCTGGTGCTCTTGTCAGGCAGAACACTCGAATTCCCTCCGGCGAGGTTTGGGGA
GGGAATCCAGCTAGATTTCTGAGGAAGGTGACTGAAGAAGAAAGGGCCTTCTTCTCTACT
TCGGCTGCGGATTATTCCAACTTAGCTCAAGTTCACGCTGCACAAAACTCAAAGAACTTG
GACGACACTGATTTCAAGAAGCTCCTTTACAAGAAGAACGCACGGGATGCAGAATATGAT
TCACTACTCAGTGATCTACTACCCAAAGCAGCTTGAGACTACTCTTTACGAAGACCAGAA
ATTCATTTCCTGCTTCTCCAATAAAGTTTTCTTGTAACATGAAAGAAAAAGAAAAGTTGG
AACCTTTTCTTCTGATTGTTTTCTATAATAAAATTTGTTGGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BA45TF U 1
AF RS1BA45JQ C 92
BS 1 128 RS1BA45TF
BS 129 129 RS1BA45JQ
BS 130 646 RS1BA45TF
BS 647 647 RS1BA45JQ
BS 648 684 RS1BA45TF
BS 685 884 RS1BA45JQ

RD RS1BA45TF 689 0 0
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ATCGTCTCGGTTGTCGCCTCCAAGGCAAAAATCACTTCCGTGAGCAGCTCTCCAGGCACC
GCACCCTT*ATGAATGTTTTTGACAAGGCCCCTATCGTCGATAAGGACGCTTTCGTTGCT
CCTAGCGCTTCTCTCATTGGCAATGTCCATCTCGGACCTGCCTCTTCCATTTGGTATGGA
TGTGTCTTGCGAGGAGATGCTAACACCATCACTGTCGGAGCTGGGACCAATATCCAAGAC
AACTCCCTTGTCCACGTTGCCAAGTCCAACTTAAACGGCAAGGTCTTGCCTACTCTCATT
GGTGACTATGTCACTATTGGTAACAGTGCTGTTTTACATGGCTGCACTCTCGAAGACGAG
TCTTACATTGGTGCTAGTGCAACCGTCTTGGATGGCGCTCATGTTGAGAAGCATGCCATC
GTTGAGTCTGGTGCTCTTGTCAGGCAGAACACTCGAATTCCCTCCGGCGAGGTTTGGGGA
GGGAATCCAGCTAGATTTCTGAGGAAGGTGACTGAAGAAGAAAGGGCCTTCTTCTCTACT
TCGGCTGCGGATTATTCCAACTTAGCTCAAGTTCACGCTGCACAAA*CTCAAAGAACTTG
GACGACACTGATTTCAAGAAGCTC
TTTAC

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1BA45JQ 793 0 0
TCACTTCCGTGAGCAGCTCTCCAGGCACCGCACCCTTTATGAATGTTTT*GACAAGGCCC
CTATCGTCGATAAGGACGCTTTCGTTGCTCCTAGCGCTTCTCTCATTGGCAATGTCCATC
TCGGACCTGCCTCTTCCATTTGGTATGGATGTGTCTTGCGAGGAGATGCTAACACCATCA
CTGTCGGAGCTGGGACCAATATCCAAGACAACTCCCTTGTCCACGTTGCCAAGTCCAACT
TAAACGGCAAGGTCTTGCCTACTCTCATTGGTGACTATGTCACTATTGGTAACAGTGCTG
TTTTACATGGCTGCACTCTCGAAGACGAGTCTTACATTGGTGCTAGTGCAACCGTCTTGG
ATGGCGCTCATGTTGAGAAGCATGCCATCGTTGAGTCTGGTGCTCTTGTCAGGCAGAACA
CTCGAATTCCCTCCGGCGAGGTTTGGGGAGGGAATCCAGCTAGATTTCTGAGGAAGGTGA
CTGAAGAAGAAAGGGCCTTCTTCTCTACTTCGGCTGCGGATTATTCCAACTTAGCTCAAG
TTCACGCTGCACAAAACTCAAAGAACTTGGACGACACTGATTTCAAGAAGCTCCTTTACA
AGAAGAACGCACGGGATGCAGAATATGATTCACTACTCAGTGATCTACTACCCAAAGCAG
CTTGAGACTACTCTTTACGAAGACCAGAAATTCATTTCCTGCTTCTCCAATAAAGTTTTC
TTGTAACATGAAAGAAAAAGAAAAGTTGGAACCTTTTCTTCTGATTGTTTTCTATAATAA
AATTTGTTGGATC

QA 1 793 1 793
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TACCGATGCATACGATCTGTTTTGCGTTTCTTTAGTGACCAAGCTCCTTGGCCGCACCTA
CTACTTTAATCCGTTGTCAGAGAAGCCTGGCTCACTTCCTCCTGGGATGTACATCCACTT
GGTTCCTGCTTGACATTGCATTCTACAGCCAAAACTTGTTCCAAAAGGATATCTTCTCGG
CTATCGGATGGATCCCCAAGGCTAACACCATGAACGCCGTCCATGAGGTTTTCAGGATTG
CTAGGGCTCAAACTCTCATCGCGCTCTGCAGCACTGTCCCTGGTTACTGGTTCACCGTTG
CGTTTATTGATATCATGGGAAGATTTGCTATCCAGCTGATGGGATTCTTCATGATGACTG
TCTTTATGTTTGCAATTGCCTTCCCATATGACCACTGGATCAAACCGAACAACCGTATCG
GATTCGTGGTTATGTACTCTCTCACTTTCTTCTTTGCCAATTTTGGACCAAACGCAACCA
CCTCCATTGTACCTGCTGAGATCTTCCCCGCTAGACTAAGGTCTACATGTCATGGAATAT
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GTGTTGTTTTTTTTAATATATTTGCTTGCCAATCCTAACGTTTTGTGATTTTATAAGAAG
AATGTATAATGTATTGTTATCCATT


BQ
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AF RS1CH70TF U 1
AF RS1CH70JQ C 204
BS 1 543 RS1CH70TF
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RD RS1CH70TF 810 0 0
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GGTTCCTGCTTGACATTGCATTCTACAGCCAAAACTTGTTCCAAAAGGATATCTTCTCGG
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CGTTTATTGATATCATGGGAAGATTTGCTATCCAGCTGATGGGATTCTTCATGATGACTG
TCTTTATGTTTGCAATTGCCTTCCCATATGACCACTGGATCAAACCGAACAACCGTATCG
GATTCGTGGTTATGTACTCTCTCACTTTCTTCTTTGCCAATTTTGGACCAAACGCAACCA
CCTTCATTGTACCTGCTGAGATCTTCCCCGCTAGACTAAGGTCTACATGTCATGGAATAT
CAGCTGCAACAGGTAAGGCTGGAGCCATCGTCGGAGCTTTTGGGTTCCTATACGCAGCTC
AAAATCAG*ACAAGAACAAGACGGACGCAG*ATATCCACCGGGCATTGGAGTCAAGAACT
CACTGATCATGCTTGGTTGCATCAACTTCCTCGGTATGATTTTCACTTTCCTTGTCCCTG
AGCCCAAAG**AAATCCCTCGAAGA
CTCTC

QA 1 805 1 805
DS 

RD RS1CH70JQ 782 0 0
TACAGCCAAAACTTGTTCCAAAAGGATATCTTCTCGGCTATCGGATGGATCCCCAAGGCT
AACACCATGAACGCCGTCCATGAGGTTTTCAGGATTGCTAGGGCTCAAACTCTCATCGCG
CTCTGCAGCACTGTCCCTGGTTACTGGTTCACCGTTGCGTTTATTGATATCATGGGAAGA
TTTGCTATCCAGCTGATGGGATTCTTCATGATGACTGTCTTTATGTTTGCAATTGCCTTC
CCATATGACCACTGGATCAAACCGAACAACCGTATCGGATTCGTGGTTATGTACTCTCTC
ACTTTCTTCTTTGCCAATTTTGGACCAAACGCAACCACCTCCATTGTACCTGCTGAGATC
TTCCCCGCTAGACTAAGGTCTACATGTCATGGAATATCAGCTGCAACAGGTAAGGCTGGA
GCCATCGTCGGAGCTTTTGGGTTCCTATACGCAGCTCAAAATCAGGACAAGAACAAGACG
GACGCAGGATATCCACCGGGCATTGGAGTCAAGAACTCACTGATCATGCTTGGTTGCATC
AACTTCCTCGGTATGATTTTCACTTTCCTTGTCCCTGAGCCCAAAGGAAAATCCCTCGAA
GAACTCTCCGGTGAGACTGAGGCAGAGAAATGATCGCCATGAAACTACATTGTATTTCTA
TTCTTCATATTTGGTCTGAAGTGTGATGTTTGTTTTTGTGTTGTTTTTTTTAATATATTT
GCTTGCCAATCCTAACGTTTTGTGATTTTATAAGAAGAATGTATAATGTATTGTTATCCA
TT

QA 1 782 1 782
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGACATCATCTCTTCTTGCTTTTAGCTATTATGGCTTTCTCTACACCATCACTTGCCAAA
CTCTCTCTTTTGGTCGCCATTTCCGCATCAGCACTCCTCTGCTCTGCCCTTGCCCGTGAC
TTCTCCATCATTGGATACACACCTGAGCATCTGTCATCCACCGACAACCTTCTAGAGCTC
TTCGAGTCATGGATGTCAGAACATAGCAAGGCTTACCAAAGCGTTGAGGAGAAGGTGCAC
AGGTTCGAGGTGTTCAGGGATAACCTGATGCATATAGACCAGAGGAACAACGAGATCAGC
AGTTACTGGCTGGGGCTAAACGAGTTTGCAGATTTGACCCATGAAGAGTTCAAGAGGAAG
TATCTCGGACTTTCAAAGCCGCAGCAATTCTCTAGAAAGAGGCAGCCTTCCTCTGCTAGC
TTCAGGTACAGAGACGTCACAGACTTGCCTAAATCCGTTGACTGGAGGAAGAAAGGCGCT
GTGACTCCTGTCAAGAACCAGGGTTCATGTGGTAGTTGTTGGGCGTTTTCGACAGTTGCA
GCTGTTGAAGGGATCCACCAGATCACAACAGGGACCCTGAGTTCGCTTTCGGAGCAGAAC
TCATAGACTGTGACACTGCTTACAACAACGGTTGCAATGGAGGTCTAATGGACTACGCAT
TCCAGTACATCATTTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C596TF U 1
AF RS1GZ83TF U 1
BS 1 593 RS1C596TF
BS 594 677 RS1GZ83TF

RD RS1C596TF 593 0 0
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CTCTCTCTTTTGGTCGCCATTTCCGCATCAGCACTCCTCTGCTCTGCCCTTGCCCGTGAC
TTCTCCATCATTGGATACACACCTGAGCATCTGTCATCCACCGACAACCTTCTAGAGCTC
TTCGAGTCATGGATGTCAGAACATAGCAAGGCTTACCAAAGCGTTGAGGAGAAGGTGCAC
AGGTTCGAGGTGTTCAGGGATAACCTGATGCATATAGACCAGAGGAACAACGAGATCAGC
AGTTACTGGCTGGGGCTAAACGAGTTTGCAGATTTGACCCATGAAGAGTTCAAGAGGAAG
TATCTCGGACTTTCAAAGCCGCAGCAATTCTCTAGAAAGAGGCAGCCTTCCTCTGCTAGC
TTCAGGTACAGAGACGTCACAGACTTGCCTAAATCCGTTGACTGGAGGAAGAAAGGCGCT
GTGACTCCTGTCAAGAACCAGGGTTCATGTGGTAGTTGTTGGGCGTTTTCGACAGTTGCA
GCTGTTGAAGGGATCCACCAGATCACAACAGGGACCCTGAGTTCGCTTTCGGA

QA 1 593 1 593
DS 

RD RS1GZ83TF 677 0 0
GGACATCATCTCTTCTTGCTTTTAGCTATTATGGCTTTCTCTACACCATCACTTGCCAAA
CTCTCTCTTTTGGTCGCCATTTCCGCATCAGCACTCCTCTGCTCTGCCCTTGCCCGTGAC
TTCTCCATCATTGGATACACGCCTGAGCATCTGTCATCCACCGATAACCTTCTAGAGCTC
TTCGAGTCATGGATGTCAGAACATAGCAAGGCTTACCAAAGCGTTGAGGAGAAGGTGCAC
AGGTTCGAGGTGTTCAGGGATAACCTGATGCATATAGACCAGAGGAACAACGAGATCAGC
AGTTACTGGCTGGGGCTAAACGAGTTTGCAGATTTGACCCATGAAGAGTTCAAGAGGAAG
TATCTCGGACTTTCAAAGCCGCAGCAATTCTCTAGAAAGAGGCAGCCTTCCTCTGCTAGC
TTCAGGTACAGAGA*GTCACAGACTTGCCTAAATCCGTTGACTGGAGGAAGAAAGGCGCT
GTGACTCCTGTCAAGAACCAGGGTTCATGTGGTAGTTGTTGGGCGTTTTCGACAGTTGCA
GCTGTTGAAGGGATCCACCAGATCACAACAGGGACCCTGAGTTCGCTTTCGGAGCAGAAC
TCATAGACTGTGACACTGCTTACAACAACGGTTGCAATGGAGGTCTAATGGACTACGCAT
TCCAGTACATCATTTCC

QA 1 677 1 677
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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ACATTGGTGAGGAGGAAAGATCAGTTCAATTCGATTCGATTCGATTGGAAGCTAACTCTT
ATTCAGTTTGGAGAAGACGATGGAAGGAGAAGAAGAAGTGAGCATTAACGAGTTGGCTTC
GAATCTCACTACCTACAAAGAGCAGCTCCAACAGGTGAAGCAGCTTTTATCACAAGACCC
TAGAAACTCTGAATATGCTGACATGGAAAAGGAGCTCAAAGAGGTGATTGCATTGACAGA
GGAACTTCTTGCAACCGCTAAGCAAAATGAGATCCCTCTTTCAGATGCTGGAGCAACCGC
TGAATCACCCGATTTACTTGAGGGTGCTTGGCAAAAAATGGAATCAAGGAATGACCCAAT
ACACGAGGGTAAGTTCCCCATTGGAACAAAAGTTCAAGCTGTCTATAGCGAAGATGGCGA
GTGGTACGATGCGACTATTGAGGCGCATACTCTAAATGGTTATTATGTTTCGTATAATGA
GTGGGGTAACAAGGAAGAGGTTGATCCAGATAATGTGAGGGCAATAGAGACCAATGCCCT
CTTGGAAGCAGAAAGAATAGCTGAAGCTGCGAAGAATGCACTCAAAAGAAAGATTGAGCA
AGCTGCGAGTTCTGATTATCAATCCAAAACTCTACCAGCAAAGCTTAAAATCGATCCTAA
CGATCCCGAGGATGTGAAATTGCAAAGCGTAAGAGATACATGCTTTCAAGTCAAAGCGAG
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 

AF RS1D816TF U 1
AF RS1E983TF U 38
BS 1 355 RS1D816TF
BS 356 356 RS1E983TF
BS 357 471 RS1D816TF
BS 472 472 RS1E983TF
BS 473 486 RS1D816TF
BS 487 487 RS1E983TF
BS 488 536 RS1D816TF
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BS 538 641 RS1D816TF
BS 642 781 RS1E983TF

RD RS1D816TF 641 0 0
GGAGAACAATCAATAGAGCTTCGCTTCCTTCTCCTCTCTAAAATATCTTGGCGACGAATA
ACATTGGTGAGGAGGAAAGATCAGTTCAATTCGATTCGATTCGATTGGAAGCTAACTCTT
ATTCAGTTTGGAGAAGACGATGGAAGGAGAAGAAGAAGTGAGCATTAACGAGTTGGCTTC
GAATCTCACTACCTACAAAGAGCAGCTCCAACAGGTGAAGCAGCTTTTATCACAAGACCC
TAGAAACTCTGAATATGCTGACATGGAAAAGGAGCTCAAAGAGGTGATTGCATTGACAGA
GGAACTTCTTGCAACCGCTAAGCAAAATGAGATCCCTCTTTCAGATGCTGGAGCAGCCGC
TGAATCACCCGATTTACTTGAGGGTGCTTGGCAAAAAATGGAATCAAGGAATGACCCAAT
ACACGAGGGTAAGTTCCCCATTGGAACAAAAGTTCAAGCTGTCTATAGCGAGGATGGCGA
GTGGTATGATGCGACTATTGAGGCGCATACTCTAAATGGTTATTATGTTTCGTATACTGA
GTGGGGTAACAAGGAAGAGGTTGATCCAGATAATGTGAGGGCAATAGAGACCAATGCCCT
CTTGGAAGCAGAAAGAATAGCTGAAGCTGCGAAGAATGCAC

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1E983TF 744 0 0
GG
AAAATATCTTGGCGACGAATAACATTGGTGAGGAGGAAAGATCAGTTCAATTCGATTCGA
TTCGATTGGAAGCTAACTCTTATTCAGTTTGGAGAAGACGATGGAAGGAGAAGAAGAAGT
GAGCATTAACGAGTTGGCTTCGAATCTCACTACCTACAAAGAGCAGCTCCAACAGGTGAA
GCAGCTTTTATCACAAGACCCTAGAAACTCTGAATATGCTGACATGGAAAAGGAGCTCAA
AGAGGTGATTGCATTGACAGAGGAACTTCTTGCAACCGCTAAGCAAAATGAGATCCCTCT
TTCAGATGCTGGAGCAACCGCTGAATCACCCGATTTACTTGAGGGTGCTTGGCAAAAAAT
GGAATCAAGGAATGACCCAATACATGAGGGTAAGTTCCCCATTGGAACAAAAGTTCAAGC
TGTCTATAGCGAAGATGGCGAGTGGTACGATGCGACTATTGAGGCGCATACTCTAAATGG
TTATTATGTTTCGTATAATGAGTGGGGTAACAAGGAAGAGGTTGATCCAGATAATGTGAG
GGCAATAGAGACCAATGCCCTCTTGGAAGCAGAAAGAGTAGCTGAAGCTGCGAAGAATGC
ACTCAAAAGAAAGATTGAGCAAGCTGCGAGTTCTGATTATCAATCCAAAACTCTACCAGC
AAAGCTTAAAATCGATCCTAACGATCCCGAGGATGTGAAATTGCAAAGCGTAAGAGATAC
ATGCTTTCAAGTCAAAGCGAGC

QA 3 744 3 744
DS 



AS 1 2

CO CL8007Contig1 1184 2 2 U
GGGTTTGATTGCTGCTCGTCTTACCTCCTCGGAAGTTGAAACAATTACAGAAACAGAACA
CATTGGTCTTCTCTCTCCTTTCTCTTTGGTCGTTTTTTACTTACAGGTGAAGACAATCGA
ATCTAAAGCTTCTCTCTTCTCTCTAAATCTGAGTTTCTGGTTTGCCTCTGATCAAAAAGT
CTCTCATCGGTTTCATTGAAAATCTATCGATCATGGATTGTTGTTATACGGGAATGAAGT
TTGAAGAGCTTGTTGTACCTAATTATCAAGAGTCGTCGTCTAATGGTATGTGGGGTGGGT
GGAGCATGAACTCCCCTGAAGCTGCAGAGAAGTGTTTCAGTTACGATGGTGAAGAAGGAT
TGTTGTATAGTGAGATGGGTATGAGGACGAGTGAAGAAGAAGAGGAAGCTAAGAGATCAA
AGGCTTTCTACGGGGCTTCTACGCTTCATGATTTCGAAGGAATCGAACGTATGGATGATG
TTTTCTTAAGTTCAATTTTGGAGGATGTTCCAGGGATTGATGGAGATGTTCGTCGTGCTT
CCAGCAGCAATAACAGTGTCGGATCTTCCTCTATATATGGTGGTGGCAGGGATGTTCACA
TGTTCCATTGTCATGACATGCCTCTAAAGGAGGGAGCTCCATTTACAATCTCGGACCTGT
CTACTGAAGAGAACATGTTTGATTCACAGTATGGTGATGAACTGTCTTCTGAAGAACTCG
TGTTACAGGATCTGCAAAGAGCTTCTGAAAAGTTAACTGATGAGACGAGAAAGTGTTTCC
GGGATACGTTTTACAGGCTTGCAAGAAACTCACAAGAGATGTTTGATTCAGTCAACACCA
ACTCAGAAGAGTTCTATATGCAGTATGGTTATGGTGATAATACCAGGATGAGTAGAGAAG
AAGAAGAGATTGAATTTGAAACGAACTCAATCGATAGAGCCATCGCAAACCTCACATTCA
ACAAGATGGAATCCAACATAAGCAACTTTCCTCTATCAGAAAGAGTACAGTAAGCTTATG
TTTGCTGGATCATCAAAGATCAACCGTTCTCGTCTCTTCAGCTCTCCTCCCATATTGGAA
TCTTGTGTTTCCTCATGTGTATATGTGTGTGTATATTGCAAACAGTCAGTTTTGATAAGG
ATCTGGTTCTTTTTAACTTTCCTGCAGTAAGTTTCTTTGGTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1F790TF U 1
AF RS1F790JQ C 323
BS 1 724 RS1F790TF
BS 725 1184 RS1F790JQ

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CATTGGTCTTCTCTCTCCTTTCTCTTTGGTCGTTTTTTACTTACAGGTGAAGACAATCGA
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CTCTCATCGGTTTCATTGAAAATCTATCGATCATGGATTGTTGTTATACGGGAATGAAGT
TTGAAGAGCTTGTTGTACCTAATTATCAAGAGTCGTCGTCTAATGGTATGTGGGGTGGGT
GGAGCATGAACTCCCCTGAAGCTGCAGAGAAGTGTTTCAGTTACGATGGTGAAGAAGGAT
TGTTGTATAGTGAGATGGGTATGAGGACGAGTGAAGAAGAAGAGGAAGCTAAGAGATCAA
AGGCTTTCTACGGGGCTTCTACGCTTCATGATTTCGAAGGAATCGAACGTATGGATGATG
TTTTCTTAAGTTCAATTTTGGAGGATGTTCCAGGGATTGATGGAGATGTTCGTCGTGCTT
CCAGCAGCAATAACAGTGTCGGATCTTCCTCTATATATGGTGGTGGCAGGGATGTTCACA
TGTTCCATTGTCATGACATGCCTCTAAAGGAGGGAGCTCCATTTACAATCTCGGACCTGT
CTACTGAAGAGAACATGTTTGATTCACAGTATGGTGATGAACTGTCTTCTGAAGAACTCG
TGTT

QA 1 724 1 724
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GGATGTTCCAGGGATTGATGGAGATGTTCGTCGTGCTTCCAGCAGCAATAACAGTGTCGG
ATCTTCCTCTATATATGGTGGTGGCAGGGATGTTCACATGTTCCATTGTCATGACATGCC
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TTCTGAAAAGTTAACTGATGAGACGAGAAAGTGTTTCCGGGATACGTTTTACAGGCTTGC
AAGAAACTCACAAGAGATGTTTGATTCAGTCAACACCAACTCAGAAGAGTTCTATATGCA
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CAACTTTCCTCTATCAGAAAGAGTACAGTAAGCTTATGTTTGCTGGATCATCAAAGATCA
ACCGTTCTCGTCTCTTCAGCTCTCCTCCCATATTGGAATCTTGTGTTTCCTCATGTGTAT
ATGTGTGTGTATATTGCAAACAGTCAGTTTTGATAAGGATCTGGTTCTTTTTAACTTTCC
TGCAGTAAGTTTCTTTGGTTTT

QA 1 862 1 862
DS 



AS 1 2

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T


BQ
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20 

AF RS1C433TF U 1
AF RS1C433JQ C 83
BS 1 661 RS1C433TF

RD RS1C433TF 661 0 0
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CGCTAGTTTATGTTGGAACAACACTGAAAGATCTGTCTGATATCACACATGGATGGCATG
AGGTGTCAGTTTTTCGTTGGGTACTAATGATGGTTGGCATTGCTCTAGCTGTAATTCTGA
TAGTATGCATTACAAGAGTGGCGAAGTCATCATTGGAGAAAGCATTGGCTGAAAATGCAG
CAGATATATTAGATGGGAAGAAGAATGATGACACATCCATGCTACCTATAGCAGAACCAC
CACCACCACCGGATCATCTACACGAGCCTCTCGACATCAGAATCGACCCATAAGAAAAGA
ACAAACAAAAGAAACCAAACCTCTTAAGTTTGTAAATTTTTCAAAGATTTTTGTTTTACT
GAGGGAGAATATTATTAGATAACGTTCTGTATAGCCCATAATAATACATAAACTCACGTT
T

QA 1 661 1 661
DS 

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TTAAGGGCGAGGCCGTGGCTGAAGCCAGGATCTTACGCAAATGGAGATCAGTATGACTAC
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GAAGTCATCATTGGAGAAAGCATTGGCTGAAAATGCAGCAGATATATTAGATGGGAAGAA
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CGAGCCTCTCGACATCAGAATCGACCCATAAGAAAAGAACAAACAAAAGAAACCAAACCT
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CGTTCTGTATAGCCCATAATAATACATAAACTCACGTTT

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

CO CL8009Contig1 815 2 4 U
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ACAAAGGCTGCGACTGATCCAGAGACAAAGGCTGCGACTAAAACAGAGACTAAGGCTGAT
AGCATGGTTGGAGAGATTTGGATAGATGTCGATATCAAAGCTTCTGCAGAGAAGTTCCAC
CATATGTTCGCTAAAAGGCCACACCACGTGTCCAATGCCACCCCTCGCCACATTGGGGGA
GTTGAGCTGCACGAGGGAGACTGGGACAAAGTTGGAAGCATAGTCTTGTGGAACTATATT
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TATGAGAGGATTGATGAGAAGGTAGCTCATCCTGAAACTCTACTTCCATTCTTGGAATTA
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CM84TF U 1
AF RS1CM84JQ C 192
BS 1 265 RS1CM84TF
BS 266 266 RS1CM84JQ
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RD RS1CM84TF 719 0 0
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GTTGAGCTGCACGAGGGAGACTGGGGCAAAGTTGGAAGCATAGTCTTGTGGAACTATATT
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DS 

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TGATGAGAAGGTAGCTCATCCTGAAACTCTACTTCCATTCTTGGAATTAATGTCCAAAGA
GATCGATGAACACCTACTGTCCACAGAGTAGATCCAAGACTTTTTTCTGCTTGTTTAAAA
CCCTATATATGATGAGTATGGTGCATGCATGGTTTGTATGTGGTACATGCATGTATATAG
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TTTGTAATTGTAACATGTATGAGTGTGAGCTTGCCTTTTTTGTATTAAATTGTGTGGCAA
AATAAAATAAAAATCGTACTTATG

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1EE71TF U 1
AF RS1FF85TF U 1
BS 1 578 RS1EE71TF
BS 579 767 RS1FF85TF

RD RS1EE71TF 578 0 0
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QA 1 578 1 578
DS 

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GATGCGCTTGATCCAGAAGGTAACATTACAATGAAATGGGATGTCATGAGCTGGACTCCA
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QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DL66JQ C 1
AF RS1DL66TF U 1
BS 1 598 RS1DL66TF

RD RS1DL66JQ 598 0 0
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ATCATCTGTTAATGATGCTCCTGCTTAGAGTATACATTTTGAGCTCTGCCTACACTAC

QA 1 598 1 598
DS 

RD RS1DL66TF 598 0 0
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ACCCAAGACGATGACCCTGTCATGAAGAAGAAGAGGATCTTGACCTACATTAATTGTTGT
ATAAGGCCAAACTAGAGCCTTTTGTTCCACAAAGTTGCAATCCTTCTCTCGCTAGTTTGT
ATCAAAATATGTCTCTCAGTATGTAAAGACGTTAGTGTAACGTTTCTGTAATGTACGTGC
ATCATCTGTTAATGATGCTCCTGCTTAGAGTATACATTTTGAGCTCTGCCTACACTAC

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 2

CO CL8012Contig1 578 2 1 U
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GGAATTTATTATCAATAAATCCGAAATCAAACAGCTAACAAACTGGAATCAGAAAGTCCA
TTGTATTCTCCTCCATCAGAGACCTCTAGAAATCGATCTCGGGGGACTAAAGAAACATAA
TTAACTTGAAGTGATTATGTTGTTCTTGCTGTTGAATCTTATTTCTGTTATAAGGAAGGA
ACAGATGCTTTCTGAGTTGGAGAATCAAGATGAGCTTATGAGAGAATTTGAACCTATCTT
CAAGCAGATATAGTGATCTGATGACGTTGGATGGTTGGAGTCTTGGTCCACTTGGAGATG
CAGCTAGTATGATGAAACTTCAATTGCAAGCTTGCTTTTATTTTTTATGTTTTTGAATCG
ATGAACATGAACTCTTCTTTGTTGTTTTATCTTTGATACTTTGAGTTTGAGACTTGAGAG
TATGATCTCTGTTTTTTTTTTGTGTTTTGAACGGCAACTTGATCAGGTTTTAAGTTTATT
AGTTATGGTTATGGTAATTGCACTACTGCAGTTTCAGT


BQ
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AF RS1GE41JQ C 1
AF RS1GE41TF U 1
BS 1 578 RS1GE41TF

RD RS1GE41JQ 578 0 0
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ATGAACATGAACTCTTCTTTGTTGTTTTATCTTTGATACTTTGAGTTTGAGACTTGAGAG
TATGATCTCTGTTTTTTTTTTGTGTTTTGAACGGCAACTTGATCAGGTTTTAAGTTTATT
AGTTATGGTTATGGTAATTGCACTACTGCAGTTTCAGT

QA 1 578 1 578
DS 

RD RS1GE41TF 578 0 0
GGACTTTTCTTTGTATGTCGTTTCCATTCCCCGACAAAAAACGATTGAGAAAAGGAAACT
GGAATTTATTATCAATAAATCCGAAATCAAACAGCTAACAAACTGGAATCAGAAAGTCCA
TTGTATTCTCCTCCATCAGAGACCTCTAGAAATCGATCTCGGGGGACTAAAGAAACATAA
TTAACTTGAAGTGATTATGTTGTTCTTGCTGTTGAATCTTATTTCTGTTATAAGGAAGGA
ACAGATGCTTTCTGAGTTGGAGAATCAAGATGAGCTTATGAGAGAATTTGAACCTATCTT
CAAGCAGATATAGTGATCTGATGACGTTGGATGGTTGGAGTCTTGGTCCACTTGGAGATG
CAGCTAGTATGATGAAACTTCAATTGCAAGCTTGCTTTTATTTTTTATGTTTTTGAATCG
ATGAACATGAACTCTTCTTTGTTGTTTTATCTTTGATACTTTGAGTTTGAGACTTGAGAG
TATGATCTCTGTTTTTTTTTTGTGTTTTGAACGGCAACTTGATCAGGTTTTAAGTTTATT
AGTTATGGTTATGGTAATTGCACTACTGCAGTTTCAGT

QA 1 578 1 578
DS 



AS 1 2

CO CL8013Contig1 1110 2 2 U
GGAAAACAGAATCGAACCTCTGATATTCTCCAAATCACCATCCAAAATCTCGGATGGATC
CCATCACATCCCCATCGAATCAGACTCCAATTAATCCCTAACTGGAGTGAAAGGCATCGA
GTGAAGAAGAGAGCCGCTAAAAAACTCCGATACCCTTTGGAAATCTCCACCGACGATTTC
GAACCTTGACCAAACCTCCCTCTATCGGATCTCTCCTCCCCCAAGAGCCATCGAAACCAC
AGCGGAGGACGACTCTGTCGGCAAGTAACGGCGACTATGTACCTCAAAGCCAACAACTTC
CCCAAGGACAAGAAGGTTTATGTGATTGGTGGAGAAGGCATTATTGAGGAGTTCAAGCCT
GCTGGTTTTACAGGTCTTGGTGGTCCTATAAGTTGTACATTTACTACTCAGAGAGTTTGG
TTGTTCCTAAGGCATCATTGGTGTGTCTGTCTTTCCGAGCAAGCTCCCAGGAAATGATCA
GTTCCTGGAGCAAGCCATTTCCTGAGTCCCAGTTCCTCATTCTGAGACAGTTGACAAGTG
CATATGTAACATTATCTCTATGTCCATTAGTTACCATTAGGATGAATTATTATCTTGATG
AGGGCGTTTTGATTTATATGTTGCATAGGGAGAGGAGAAGTTGTCTGTCCAACGTACAAT
GCTGATGGAGAGCCGTGGTTTTACATGGAAAATCAGATGATGAAGTGTTCTGCTTGTTAT
GGAAGACGTTTGATTGCTTTTAAAGATGGATCCCGGTTCAATGTAAAGTTTCATCCCACC
TGGAGAAGATCAAGATACTTGACTACTTTCAAGTCCATGACATGGTTCGCCAAACCCCAG
GTCTTGCTCCTACTTGAAGTTCGATTCCTGTTTTAGTTTAAGAGTTTGTGATCATTTACT
CTTAGAGTTTAGTGACAATTTAATATAAAAAAAATAATTTTTTTAAGAAACCCAAATCAA
GAAACACAAAACTTATGTGATTTTTAACTAAGATCCTTAGCTTAAAATTTTATTAGTTAA
ATAGTCATTAAAGTGTACTTAAGAAACCTTATGGGTTTTTAGGGATAATCATGCTTTTAC
TACAAATATAATTTCTTATTTATTTTTGGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GI25TF U 1
AF RS1GI25JQ C 560
BS 1 629 RS1GI25TF
BS 630 1110 RS1GI25JQ

RD RS1GI25TF 629 0 0
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CCATCACATCCCCATCGAATCAGACTCCAATTAATCCCTAACTGGAGTGAAAGGCATCGA
GTGAAGAAGAGAGCCGCTAAAAAACTCCGATACCCTTTGGAAATCTCCACCGACGATTTC
GAACCTTGACCAAACCTCCCTCTATCGGATCTCTCCTCCCCCAAGAGCCATCGAAACCAC
AGCGGAGGACGACTCTGTCGGCAAGTAACGGCGACTATGTACCTCAAAGCCAACAACTTC
CCCAAGGACAAGAAGGTTTATGTGATTGGTGGAGAAGGCATTATTGAGGAGTTCAAGCCT
GCTGGTTTTACAGGTCTTGGTGGTCCTATAAGTTGTACATTTACTACTCAGAGAGTTTGG
TTGTTCCTAAGGCATCATTGGTGTGTCTGTCTTTCCGAGCAAGCTCCCAGGAAATGATCA
GTTCCTGGAGCAAGCCATTTCCTGAGTCCCAGTTCCTCATTCTGAGACAGTTGACAAGTG
CATATGTAACATTATCTCTATGTCCATTAGTTACCATTAGGATGAATTATTATCTTGATG
AGGGCGTTTTGATTTATATGTTGCATAGG

QA 1 629 1 629
DS 

RD RS1GI25JQ 551 0 0
ATGTCCATTAGTTACCATTAGGATGAATTATTATCTTGATGAGGGCGTTTTGATTTATAT
GTTGCATAGGGAGAGGAGAAGTTGTCTGTCCAACGTACAATGCTGATGGAGAGCCGTGGT
TTTACATGGAAAATCAGATGATGAAGTGTTCTGCTTGTTATGGAAGACGTTTGATTGCTT
TTAAAGATGGATCCCGGTTCAATGTAAAGTTTCATCCCACCTGGAGAAGATCAAGATACT
TGACTACTTTCAAGTCCATGACATGGTTCGCCAAACCCCAGGTCTTGCTCCTACTTGAAG
TTCGATTCCTGTTTTAGTTTAAGAGTTTGTGATCATTTACTCTTAGAGTTTAGTGACAAT
TTAATATAAAAAAAATAATTTTTTTAAGAAACCCAAATCAAGAAACACAAAACTTATGTG
ATTTTTAACTAAGATCCTTAGCTTAAAATTTTATTAGTTAAATAGTCATTAAAGTGTACT
TAAGAAACCTTATGGGTTTTTAGGGATAATCATGCTTTTACTACAAATATAATTTCTTAT
TTATTTTTGGT

QA 1 551 1 551
DS 



AS 1 2

CO CL8014Contig1 759 2 4 U
GCACTGCACTTGTTGCAAGGTCTCAGAGGGACACATCTGGTCGTACCACTAACAGTGTTA
AGGGAACTAAATGAGACTAAACGCACTTGGAGTCTTCTCTTTAGAAAAAGAGCAGAGATT
GCTTCCCCAGCTCTGGATTGGATTGAAGAGTGTAAGGTTAATACCAAATGGTGGATTCAG
CTCCAAAGCCTATCAGAGGAAACCAAAGAAACTGGACCAACCACATCAGTCAGTACTCCT
CAGTTAAATGGCCCTACATCAGAAGATCAAGTTCTCGAATGTGCACTTCTTTATCGAAAC
CTTAACATCTATGAAAAACTTGTTCTTCTTAGCAACGATGTAACTCTCAAGATCAAAGCC
AGAGCAGAGGATGTGATTTGCGAGACGCCTCATGAGTTCTACGAGAGTCTGAAGAATCCA
TTGTCCGAGAGGTTTATGTGGCCAGAGAGTTTGCCGAGAGGAAGGACTTGGAGTCATTTT
GACGATGTCATGGTGAGAGAAAATTACAACAACCGAACTTGTTTTCCTTACAGAAAGAAA
CCAACGTTCAATGGAGGACGGGAAGAGAGTGCCGCAGCAGCAGCAAAAGGTTTGAAGCTA
ATATTGCTTCTTAACTCTCATTATGGCCACAATCACTAATGATTCAACATCCATTGTTGT
TCCTTCTTTTCAAGTAAGCCAAATAAATTCAACTCGCTTATACATGGAATACTTTTTTAG
AATAATGACATTTTCCATATAATTAGTACTTTTTGATTG


BQ
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A*TAATGACATTTTCCATATAATTAGTACTTTT
GATTG

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QA 1 623 1 623
DS 



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BQ
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AF RS1CW04TF C 1
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BS 18 600 RS1CW04JQ

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AATATTATCTAAAAAAATATTTTGAAATTATTTGGGTTTTTATTTTAATGTCTCTTCCCT

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DS 

RD RS1CW04JQ 583 0 0
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ACCGTGTCATCCCACAGCTTGTGTAAGAACCCCATCCGATCAAAATATTATCTAAAAAAA
TATTTTGAAATTATTTGGGTTTTTATTTTAATGTCTCTTCCCT

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 2

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CTCTACT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DV51TF U 1
AF RS1DV51JQ C 102
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BS 634 667 RS1DV51JQ

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GCGAAGCGAAGAGCAAGAAAGCCGGAGGGCCTCCTCCTCGTCTCTGCTGCATCTGTAACG
AGAGACGACCCGTCCTCAAAAGACCCAAAACCCTTCAACAGATATGCAGAGAGTGCTTTT
ACGAGGTGTTCGAGGAGGAGATTCACCAAGCCATCGTCGAGAACCGGTTGTTCAAATCCG
GCGAGCGTGTTGCTATTGGTGCCTCCGGTGGAAAAGATTCAACGGTGCTGGCTTATGTAT
TATCAGAGCTAAACAGACGTCATAGTTACGGTCTTGACCTTTTTCTTCTCTCCATTGATG
AAGGGATCACTGGTTACCGTGATGATTCTCTCGAGACCGTTAAAAGCAGTGGTATCAACG
CAGAGTGAAGATGAACAAGAAACTGCAGCAGCTAAAAGGACCAAAGAAGAAGCGTTTGCA
AGCCACCACGGTGAGCGTGGAAGGTCGGGGTATGACCAAGTACCTGTAGAGAGGTTGCAA
CCAAGCCATGGGGCAGCGTTGGAAGGAACTGGGCTCTTCTATCTTGTAATCTTCAACTTT
GATTGGATCATTGTTTGAAGTTAAAAGACTTAA

QA 1 633 1 633
DS 

RD RS1DV51JQ 566 0 0
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ATATGCAGAGAGTGCTTTTACGAGGTGTTCGAGGAGGAGATTCACCAAGCCATCGTCGAG
AACCGGTTGTTCAAATCCGGCGAGCGTGTTGCTATTGGTGCCTCCGGTGGAAAAGATTCA
ACGGTGCTGGCTTATGTATTATCAGAGCTAAACAGACGTCATAGTTACGGTCTTGACCTT
TTTCTTCTCTCCATTGATGAAGGGATCACTGGTTACCGTGATGATTCTCTCGAGACCGTT
AAAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTGAAGATGAACAAGAAACTGCAGCAGCTAAAAGGAC
CAAAGAAGAAGCGTTTGCAAGCCACCACGGTGAGCGTGGAAGGTCGGGGTATGACCAAGT
ACCTGTAGAGAGGTTGCAACCAAGCCATGGGGCAGCGTTGGAAGGAACTGGGCTCTTCTA
TCTTGTAATCTTCAACTTTGATTGGATCATTGTTTGAAGTTAAAAGACTTAAAAGGCATT
GGGGGTATACTTATATGCTCTCTACT

QA 1 566 1 566
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8018Contig1 727 2 3 U
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CCGTTCAAACATTCCCCCAGAAACAAGTCTGTAGATCTTGAATGGAGACACCATCATCAA
CGAGGAGAGTGACGAGGTCTCAGACCCTCTCTACCATGAAAAGCTCTGCCACCAATCATC
TCCTATCATCAAAGAAACCAGAGGAGTCGAAATCAAGGCAAAGAAATGGAGCAACACCGA
AGCAAGAGAGGTCAGCGTTGTTCGACATAACAAACGACTCTCCGATAGTAGGACTGGCAA
TGCAGAGTCCATCTTCAGGAGTGGTTGGGAAGAGCAGAATAAAGAGCACTCCTGGATCTG
GTGAGGCTCTCTTGAGAGGGCAAGTCAAAAACCTGTTGCAGAAGGTCGAAGAAGGAGAAG
CACATGTTATTACAAAGATGTCAGTTGAATCTCGTCCCTTCATCCATCTCGTTACTTCTC
CCATGGGACTCCTCGCCCCGACTCCGGCCAACACCCCACAAGTTCTCGATGGAGTGCAGA
TTGTGATCGCATCTCCCGTTGTTTCGGAACAGCTGAGAGAACCAGCACCATCTTCTCAGG
TGTTTGTGGAGAAAGATGAGAGGTTGGACAAGAGTCCAAGCATAACGAGGTCATTGCTTC
TGGATTTTAGTGATAAATCAGAGCTATGGGAGAGCTCAGACTCTTCATCTGTGCTGACTC
AGAACCC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GZ04TF U 5
AF RS1BV72TF U 1
BS 1 243 RS1BV72TF
BS 244 244 RS1GZ04TF
BS 245 727 RS1BV72TF

RD RS1GZ04TF 593 0 0
G
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GAGAGGTCAGCGTTGTTCGACATAACAAACGACTCTCCGATAGTAGGACTGGCGATGCAG
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GTTATTACAAAGATGTCAGTTGAATCTCGTCCCTTCATCCATCTCGTTACTTCTCCCATG
GGACTCCTCGCCCCGACTCCGGCCAACACCCCACAAGTTCTCGATGGAGTGCAGATTGTG
ATCGCATCTCCCGTTGTTTCGGAACAGCTGAGAGAACCAGCACCATCTTCTC

QA 2 593 2 593
DS 

RD RS1BV72TF 727 0 0
GGACCCACTCGTCTACAACTCTTAACTCATATAGCATTTTTCTAATAGTATTATCCTCCC
CCGTTCAAACATTCCCCCAGAAACAAGTCTGTAGATCTTGAATGGAGACACCATCATCAA
CGAGGAGAGTGACGAGGTCTCAGACCCTCTCTACCATGAAAAGCTCTGCCACCAATCATC
TCCTATCATCAAAGAAACCAGAGGAGTCGAAATCAAGGCAAAGAAATGGAGCAACACCGA
AGCGAGAGAGGTCAGCGTTGTTCGACATAACAAACGACTCTCCGATAGTAGGACTGGCAA
TGCAGAGTCCATCTTCAGGAGTGGTTGGGAAGAGCAGAATAAAGAGCACTCCTGGATCTG
GTGAGGCTCTCTTGAGAGGGCAAGTCAAAAACCTGTTGCAGAAGGTCGAAGAAGGAGAAG
CACATGTTATTACAAAGATGTCAGTTGAATCTCGTCCCTTCATCCATCTCGTTACTTCTC
CCATGGGACTCCTCGCCCCGACTCCGGCCAACACCCCACAAGTTCTCGATGGAGTGCAGA
TTGTGATCGCATCTCCCGTTGTTTCGGAACAGCTGAGAGAACCAGCACCATCTTCTCAGG
TGTTTGTGGAGAAAGATGAGAGGTTGGACAAGAGTCCAAGCATAACGAGGTCATTGCTTC
TGGATTTTAGTGATAAATCAGAGCTATGGGAGAGCTCAGACTCTTCATCTGTGCTGACTC
AGAACCC

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

CO CL8019Contig1 802 2 4 U
GGGATCTCCTTCCCTTTTCCGATTCCGATTTCAATTTCTCATCTTCTCCGATTCGCTCTC
TAGACTGACACACACTAGGAACGGTTTCAATTTCGGATTCTCTACTTTTGCCATGGATAC
TAGTCGTAAGAGAGGACCGCCTGAAGCTGGCTCCAATGGCGGCGGCGGGTTTAAAAAGTC
TAAGCTAGGTTTGCTCTTTTCCCTCGTCCTCTTCCTTCACTATCTTCCCGAATTCTTGTT
GAATTATACACCAATCCTTTCAATTCTAGTCCTAGCTTCACTAACTCTTGATTAAAAATT
GAGATCTTTATTGCTGGATTAAAAAAAAAATCTCCCTTTTGTTTTTTTTTTTATAAATTG
GATCTGATTACAGCAAAATTAACTGTTCAAAGTAACATCCCCCAAGCTTAGATTTTTCAC
AGTTCAGTTACCGTATGGCTTTTAAGTATATATAAGCTTTGTAACATCTTATCACCGGGT
TTGCTTTGATTGAAATAATAATCCTTTAAATTTTACAATAATATGAGTCTCAAGTTTCAT
ATGTGTATAGTTTTAAAGCAAACATTACTGAACTTTAGTTAAAAAAAAAAAAGACTTTTA
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ATTGGATTAATATTCAAAATTGTTATTTTATCTGAAAGTTTGCTCGTGAAAATCAACAAG
TAAAACTGTATGCTAGTTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1B124TF U 1
AF RS1B124JQ C 73
BS 1 591 RS1B124TF
BS 592 592 RS1B124JQ
BS 593 657 RS1B124TF
BS 658 802 RS1B124JQ

RD RS1B124TF 660 0 0
GGGATCTCCTTCCCTTTTCCGATTCCGATTTCAATTTCTCATCTTCTCCGATTCGCTCTC
TAGACTGACACACACTAGGAACGGTTTCAATTTCGGATTCTCTACTTTTGCCATGGATAC
TAGTCGTAAGAGAGGACCGCCTGAAGCTGGCTCCAATGGCGGCGGCGGGTTTAAAAAGTC
TAAGCTAGGTTTGCTCTTTTCCCTCGTCCTCTTCCTTCACTATCTTCCCGAATTCTTGTT
GAATTATACACCAATCCTTTCAATTCTAGTCCTAGCTTCACTAACTCTTGATTAAAAATT
GAGATCTTTATTGCTGGATTAAAAAAAAAATCTCCCTTTTGTTTTTTTTTTTATAAATTG
GATCTGATTACAGCAAAATTAACTGTTCAAAGTAACATCCCCCAAGCTTAGATTTTTCAC
AGTTCAGTTACCGTATGGCTTTTAAGTATATATAAGCTTTGTAACATCTTATCACCGGGT
TTGCTTTGATTGAAATAATAATCCTTTAAATTTTACAATAATATGAGTCTCAAGTTTCAT
ATGTGTATAGTTTTAAAGCAAACATTACTGAACTTTAGTTAAAAAAAAAAA*GACTTTTA
ACCAAATGAACAACACTTAAAATGTTTGGAACAGAGATGGAATCAACTGGTTTAGGA
GCA

QA 1 657 1 657
DS 

RD RS1B124JQ 730 0 0
CACTAGGAACGGTTTCAATTTCGGATTCTCTACTTTTGCCATGGATACTAGTCGTAAGAG
AGGACCGCCTGAAGCTGGCTCCAATGGCGGCGGCGGGTTTAAAAAGTCTAAGCTAGGTTT
GCTCTTTTCCCTCGTCCTCTTCCTTCACTATCTTCCCGAATTCTTGTTGAATTATACACC
AATCCTTTCAATTCTAGTCCTAGCTTCACTAACTCTTGATTAAAAATTGAGATCTTTATT
GCTGGATTAAAAAAAAAATCTCCCTTTTGTTTTTTTTTTTATAAATTGGATCTGATTACA
GCAAAATTAACTGTTCAAAGTAACATCCCCCAAGCTTAGATTTTTCACAGTTCAGTTACC
GTATGGCTTTTAAGTATATATAAGCTTTGTAACATCTTATCACCGGGTTTGCTTTGATTG
AAATAATAATCCTTTAAATTTTACAATAATATGAGTCTCAAGTTTCATATGTGTATAGTT
TTAAAGCAAACATTACTGAACTTTAGTTAAAAAAAAAAAAGACTTTTAACCAAATGAACA
ACACTTAAAATGTTTGGAACAGAGATGGAATCAACTGGTTTAGGAAGCAAATCCAAGCCA
TGCACTAAATTTTTCAGGTTACTTATTAATCCTTTTTATTTTTACTTAATTGGATTAATA
TTCAAAATTGTTATTTTATCTGAAAGTTTGCTCGTGAAAATCAACAAGTAAAACTGTATG
CTAGTTGTTC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL8020Contig1 756 2 3 U
AGCTTGATCTTTGTTACAAGTTCGATACAGTAAAACGTATCAAATTGGTATCAGAGCCAG
TGACGAGCCATGGGGATGATAGAGATTCCGATCTTCTACGGTGAAGAACCAGAAGAGTGG
GTCTCATGGATGGATGCGTTTATTGCTGATCAAAGTCTTTCAGAGTTTGAGACGAGGCAG
TTTGCGTATGGTTTCATTGACGGTGAAGCACACACTTGGTACTGCAATGAGTTGTCGAGA
TCTGGCTTTGATAGCTGGGAAGATCTTAAAGTTCGGTTGGTCCGGCGGTTCAGCACGCGA
GTGGTTGAAGCAAAGGAGCAGCAGGAACAACCCAGCTTTATGGATCATATGAAGCAGCTG
GGTCGTCTTGTGCAGAGATGGAAGGAAGAAGATGAGGCGAAGAAACAACAGGAAGAAGAG
ATGATGGCTGCTGGAGATTCGAATCAGACCCTGAGCTCTGTCGAAGGGTTTGTGCAGAGT
TTCGAACCGGCTCCACCTGTGACTGTATCTGATGAGAGAGCCGATCTGATCTCTTACTCA
AACCAGCTGTTTCCAGAAGTGAAGAACGATGAATTGATTCCGAAATGTCCAGTGTTCGTA
CAAGAGAAGAATGATCCAGAGACTGAAACCCTGGTGTTCGAAGAGGATAACAGCTCAGAG
ACAGAGATGAATGTTGGTGCCTGCCAAGTGTTCGATCCAATGCCAAAGAGAAGAAAGTCA
GTGCTTGCAAAGAGGTGGATGTGGAAATTTACAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DS94TF U 27
AF RS1DS94JQ C 1
BS 1 26 RS1DS94JQ
BS 27 610 RS1DS94TF
BS 611 756 RS1DS94JQ

RD RS1DS94TF 587 0 0
ACAGTAAAACGTATCAAATTGGTATCAGAGCCAGTGACGAGCCATGGGGATGATAGAGAT
TCCGATCTTCTACGGTGAAGAACCAGAAGAGTGGGTCTCATGGATGGATGCGTTTATTGC
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TAAAGTTCGGTTGGTCCGGCGGTTCAGCACGCGAGTGGTTGAAGCAAAGGAGCAGCAGGA
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AGAAGATGAGGCGAAGAAACAACAGGAAGAAGAGATGATGGCTGCTGGAGATTCGAATCA
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ATCTGATGAGAGAGCCGATCTGATCTCTTACTCAAACCAGCTGTTTCCAGAAGTGAAGAA
CGATGAATTGATTCCGAAATGTCCAGTGTTCGTACAAGAGAAGA
TGA

QA 1 584 1 584
DS 

RD RS1DS94JQ 756 0 0
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GTCTCATGGATGGATGCGTTTATTGCTGATCAAAGTCTTTCAGAGTTTGAGACGAGGCAG
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GTGGTTGAAGCAAAGGAGCAGCAGGAACAACCCAGCTTTATGGATCATATGAAGCAGCTG
GGTCGTCTTGTGCAGAGATGGAAGGAAGAAGATGAGGCGAAGAAACAACAGGAAGAAGAG
ATGATGGCTGCTGGAGATTCGAATCAGACCCTGAGCTCTGTCGAAGGGTTTGTGCAGAGT
TTCGAACCGGCTCCACCTGTGACTGTATTTGATGAGAGAGCCGATCTGATCTCTTACTCA
AACCAGCTGTTTCCAGAAGTGAAGAACGATGAATTGATTCCGAAATGTCCAGTGTTCGTA
CAAGAGAAGAATGATCCAGAGACTGAAACCCTGGTGTTCGAAGAGGATAACAGCTCAGAG
ACAGAGATGAATGTTGGTGCCTGCCAAGTGTTCGATCCAATGCCAAAGAGAAGAAAGTCA
GTGCTTGCAAAGAGGTGGATGTGGAAATTTACAAGG

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

CO CL8021Contig1 821 2 3 U
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TTTCTTCTTATTAACAGGTATTTCCCAAAGGGGATCAATATCTACTTTGACAACGTGGGT
GGATCCATGCTTGATGCAGCGCTCCTTAACATGAAGGTCCGTGGAAAAATCGCGCTCTGT
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GCGATCCCCAAACGAGTAAGGTTAGAAGGGTTCTTGCAAAGCGATTACGTCCATATTTTC
CCGCAATTTCTTGAACACGTCAAAGAATATTACAAGGAAAGGAAGATTGTGTACATCGAA
AATATGTCAGAAGGCCTCGAGCTTGCTCCTGCTGCACTTGTCGGGTTGTTTTCTGAGAAA
AATGTTGGTAAACAGGTCGTTAGGGTTGCTAATGAGTGATTATTTTTAAAAGTATATTGC
AGTGTCAGTAACACTGTTATGTTCAGAACAGACATTTTATGAATAAAGCGGTGTTGTGCC
TAACAGTTCTTGCCGATCAGTGATCACGGTAAAAAGGTCTTGCGATATCCCGCTAGCTGA
AGAAAAGTTTTTCATGAATGTGGTATTGTAGATTTTAATGAGCTTGCTTTGCAAATAAAC
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AATTTGTGAAATTAAATAACCCACGCAGGAATAAGAAATGGGTGAACAAGAGTTTGTGGG
TTAGGGTTTTATAACAATCCCGAAACAATGTAGACCGGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GF61JQ U 41
AF RS1GF61TF C 1
BS 1 42 RS1GF61TF
BS 43 368 RS1GF61JQ
BS 369 821 RS1GF61TF

RD RS1GF61JQ 328 0 0
AA
ATGAGATCAGCTGAACTGTTTCTTCTTATTAACAGGTATTTCCCAAAGGGGATCAATATC
TACTTTGACAACGTGGGTGGATCCATGCTTGATGCAGCGCTCCTTAACATGAAGGTCCGT
GGAAAAATCGCGCTCTGTGGAATGGTGTCTTTACAAAGCCTCTCAAGCTCATCACAAGGA
ATCAACAACCTGTACAACGCGATCCCCAAACGAGTAAGGTTAGAAGGGTTCTTGCAAAGC
GATTACGTCCATATTTTCCCGCAATTTCTTGAACACGTCAAAGAATATTACAAGGAAAGG
AAGATTGTGTACATCGAAAATATGTC

QA 3 328 3 328
DS 

RD RS1GF61TF 821 0 0
ATTTAAATCGCTTGTGGTTAGGTGGGGATGCCTATGTAGAAGATGAGATCAGCTGAACTG
TTTCT*CTTAT*AACAGGTATTTCCCAGAGGG*ATCAATATCTACTTTGACAACGTGGGT
GGATCCATGCTTGATGCAGCGCTCTTTAACATGAAGGTCCGTGGAAGAATCGCGCTCTGT
GGAATGGTGTCTTTACAAAGCCTCTCAAGCTCATCACAAGGAATCAACAACCTGTACAAC
GCGATCCCCAAACGAGTAAGGTTAGAAGGGTTCTTGCAAAGCGATTACGTCCATATTTTC
CCGCAATTTCTTGAACACGTCAAAGAATATTACAAGGAAAGGAAGATTGTGTACATCGAA
GATATGTCAGAAGGCCTCGAGCTTGCTCCTGCTGCACTTGTCGGGTTGTTTTCTGAGAAA
AATGTTGGTAAACAGGTCGTTAGGGTTGCTAATGAGTGATTATTTTTAAAAGTATATTGC
AGTGTCAGTAACACTGTTATGTTCAGAACAGACATTTTATGAATAAAGCGGTGTTGTGCC
TAACAGTTCTTGCCGATCAGTGATCACGGTAAAAAGGTCTTGCGATATCCCGCTAGCTGA
AGAAAAGTTTTTCATGAATGTGGTATTGTAGATTTTAATGAGCTTGCTTTGCAAATAAAC
AAAATGGTGGGCTCAATAAACTGAAAATGTATTCATAATTTTTTGTAGTGAATTGCGTGA
AATTTGTGAAATTAAATAACCCACGCAGGAATAAGAAATGGGTGAACAAGAGTTTGTGGG
TTAGGGTTTTATAACAATCCCGAAACAATGTAGACCGGTTC

QA 1 821 1 821
DS 



AS 1 2

CO CL8022Contig1 583 2 1 U
GGGTCCCGGTGGCGATAGAGTCGGAAGATCCGTACGGAGATTTCCGGCGATCGATGGCGG
AGATGGTGAAAAAAGAAAAAAAAGATGGAGGAGATGGTGAGGAGCCACGGCGAGCTGGAG
ATGGTGAGGAGCCACGGCGAGCTGGAGATGGTGAGGAGCCACAGCGATCTACACGCCGCC
GACCGAGGAGATCAGCGTCGCGGTGGCGATGGAGTCGGAGGATCCGTACGGAGATTTCCG
GAGATCGATGGCGGAGATGGTGAAAAAAGAAAAAAAAACAAAATGGAGAAGATGGTGAGG
AACCACGGCGAGCTGGCGAATGATTGGTGGAGCTTGGCGCCGGAGCGTCGTCGGTATCTG
ACTCTCGGCTCGTTACTCAACCACCGTATCGTCTTTCTCCATCTCCATGATTATAAGGTA
AAGCTTCGAATCAAGATCTGTGTGGGAGGTGTAAAAAAGATTGTTTTGTATGAGATTCAA
AATAACTGGTTTTGTAGGACATTATTGCCAGTTTTTGTGGGCAACCGACGGTTGCAAGTT
ATCTCATCCTTCTTTTCACTTTTATACAAAAGAAATATTCAAC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AE48JQ C 1
AF RS1AE48TF U 1
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QA 1 583 1 583
DS 

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AGATGGTGAAAAAAGAAAAAAAAGATGGAGGAGATGGTGAGGAGCCACGGCGAGCTGGAG
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GACCGAGGAGATCAGCGTCGCGGTGGCGATGGAGTCGGAGGATCCGTACGGAGATTTCCG
GAGATCGATGGCGGAGATGGTGAAAAAAGAAAAAAAAACAAAATGGAGAAGATGGTGAGG
AACCACGGCGAGCTGGCGAATGATTGGTGGAGCTTGGCGCCGGAGCGTCGTCGGTATCTG
ACTCTCGGCTCGTTACTCAACCACCGTATCGTCTTTCTCCATCTCCATGATTATAAGGTA
AAGCTTCGAATCAAGATCTGTGTGGGAGGTGTAAAAAAGATTGTTTTGTATGAGATTCAA
AATAACTGGTTTTGTAGGACATTATTGCCAGTTTTTGTGGGCAACCGACGGTTGCAAGTT
ATCTCATCCTTCTTTTCACTTTTATACAAAAGAAATATTCAAC

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 2

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CTAGCTGCAACCAACTACTCTGCCAGTTCAAAATAAAAGTAATGATTATGTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DV74TF U 1
AF RS1DV74JQ C 144
BS 1 601 RS1DV74TF
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CCAGCAGCCACCTCATATGAACTTCATGCCCCCACCTCCGATGTCTCAACCTCACCATAG
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CGGGATGAAGCAGCACGGGATGCAGCACCAAGGTGAGTACGGGATGAAGCACCAAGGTGA
G

QA 1 601 1 601
DS 

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QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 2

CO CL8024Contig1 595 2 2 U
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CV03TF C 1
AF RS1CV03JQ U 8
BS 1 7 RS1CV03TF
BS 8 595 RS1CV03JQ

RD RS1CV03TF 595 0 0
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CATGCAATAATACAATGAACAAGAAACCAGACAAGTGAAGCAGCCTGAGATTGATTTAAA
CTAAAGCAAAGGATCAACTCAACTAGTTTTCATGTCTTCAAAATCTTTTCATAAGAAACA
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TTTACCACCGGTGGGCTGGCACAGAACAGTCTGACAGTTTCCACATACTACAACTGTTTG
AGAGTGGCTGAACACAGTTGTTATGTTGAAGCACCCCTGGCACTTGACGTCCATGAAGAA
AGAGTTGGGAGATTGTACAAGACGCTTGAGCTTGTGCTTTCTCTTCTCCAGCTCAGCTGG
AGGGTTGAGGAGGTCGATGTCATTTTGGAGAACCATGATTGCTTCCGGAAATGCGAAGAA
GACGACTTGGTGAAAACCCTAAATGGAGGATGCAGCTTGTTTCACTCTACGATCC

QA 1 595 1 595
DS 

RD RS1CV03JQ 588 0 0
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AAAGGATCAACTCAACTAGTTTTCATGTCTTCAAAATCTTTTCATAAAAAACATAAGAAA
CGTCACAAGACAATAACAATAACTAGAAAAACCAAACTGAACATCACAGCAACATTTTTG
AAAAGATGATGATTTCACTTTTTCCTGAAAGAGCAACCCTCAGTGAGCCTTGCTTTACCA
CCGGTGGGCTGGCACAGAACAGTCTGACAGTTTCCACATACTACAACTGTTTGAGAGTGG
CTGAACACAGTTGTTATGTTGAAGCACCCCTGGCACTTGACGTCCATGAAGAAAGAGTTG
GGAGATTGTACAAGACGCTTGAGCTTGTGCTTTCTCTTCTCCAGCTCAGCTGGAGGGTTG
AGGAGGTCGATGTCATTTTGGAAAACCATGATTGCTTCCGGAAATGCGAAGAAGACGACT
TGGTGAAAACCCTAAATGGAGGATGCAGCTTGTTTCACTCTACGATCC

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 2

CO CL8025Contig1 579 2 1 U
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CGCAGATCCTTGCTCCTCCGGCTCCTTCGACGGCGTAGCTTGCGACGGGAACCACCGCGT
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TCTCTGCACTCATGAATCCTCAAACCTGAGACCATCAATGGAAGATGTTATGCTAGAACT
GAATAAACTCGCAGCGAGTTGTTAGTTGCCGTTTAGCAAGATTTTTTTTGCTTTTGATTG
TCCTAGAATATAAAAGCTCACCAAGGTTTCAGACTATCACCATTTGAGATTGTACTCAAT
CTTATCTCCTTGTAACTGTAGCTGATGTACTTAATGTATAAACAACTGAATGAATATGTT
GTGACATTGTCTTTTATGGTTGCATAATCGTTTATCTAC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CS19JQ C 1
AF RS1CS19TF U 1
BS 1 579 RS1CS19TF

RD RS1CS19JQ 579 0 0
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GTGACATTGTCTTTTATGGTTGCATAATCGTTTATCTAC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RS1CS19TF 579 0 0
GGGACACACACACACTCTCTCTCTCTCTTCTCTTCAACCAAGCATGGTCTTCACTATCCT
CTCCTTCTTCATACTCTTTCTTTCTCCTTCGCTGTCTTTCTCCTCAGAGCTCGACATTCT
CCTCGATATCAAATCCTCTCTCGACCCTGAAAAACGCTTCCTCACTTCATGGACTCCAGA
CGCAGATCCTTGCTCCTCCGGCTCCTTCGACGGCGTAGCTTGCGACGGGAACCACCGCGT
TGCCAACATATCTCTCCAAGGAATGGGTCTAACCGGAACTATCCCTCCTTCCATCGGTCT
TCTCTGCACTCATGAATCCTCAAACCTGAGACCATCAATGGAAGATGTTATGCTAGAACT
GAATAAACTCGCAGCGAGTTGTTAGTTGCCGTTTAGCAAGATTTTTTTTGCTTTTGATTG
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CTTATCTCCTTGTAACTGTAGCTGATGTACTTAATGTATAAACAACTGAATGAATATGTT
GTGACATTGTCTTTTATGGTTGCATAATCGTTTATCTAC

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

CO CL8026Contig1 678 2 6 U
GATTAAAAACACTACCATCAAACATAGAAATATCAAAAAGCAGCAACATTTAGAACCAAA
CCCCATATGACTCTTTTCACTCTTTTTACCCATTTCTTCTCACATAAGTTTTGGTCGAAG
ATATATAATATAAAATAAAAATATCATACGGTTTCTTTTCCTCTTGTCCTCCTTAATTAA
TGCAAGCTAATGAGTCTTAATGCTCAACAGCGACCACTTCAGATACCTCCATGGACTCGG
CTCTCTCTTCATCCATCCTCGGAGATGCAACCTCATGTCTTTCTTCTGCATCTGCATTGG
CCGATACAGTCCCTTGTGCTTCCTCATCTATGGGGTTTGAAGACTGGTTCAGGGCTTCTG
CATCTTTTTCAACTTTCTTCCTTTCAGGTTTCACCTTAGCTGAGGCTGTTGCAGCTTTTG
CTGGAGCGAGTTTTCCATCAGGGAGAGCTGTTTTCTGAGATGGCAATCTCGGAAGTGACT
TGCGCAAGGGTTGCTTCTTGAGATCAACCGTTGGCACAACTCCTTTAGCAGTTGAGCTAT
CTTTAGAGGCTTTCTCATCTAAGCTCAGCCTAGCAACACGAGGGGTCTGAGTTTCTTCAG
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ACTCTGTTTTAGGCGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G537JQ U 1
AF RS1C260TF C 115
BS 1 229 RS1G537JQ
BS 230 230 RS1C260TF
BS 231 426 RS1G537JQ
BS 427 427 RS1C260TF
BS 428 629 RS1G537JQ
BS 630 678 RS1C260TF

RD RS1G537JQ 629 0 0
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CCCCATATGACTCTTTTCACTCTTTTTACCCATTTCTTCTCACATAAGTTTTGGTCGAAG
ATATATAATATAAAATAAAAATATCATACGGTTTCTTTTCCTCTTGTCCTCCTTAATTAA
TGCAAGCTAATGAGTCTTAATGCTCAACAGCGACCACTTCAGATACCTCTATGGACTCGG
CTCTCTCTTCATCCATCCTCGGAGATGCAACCTCATGTCTTTCTTCTGCATCTGCATTGG
CCGATACAGTCCCTTGTGCTTCCTCATCTATGGGGTTTGAAGACTGGTTCAGGGCTTCTG
CATCTTTTTCAACTTTCTTCCTTTCAGGTTTCACCTTAGCTGAGGCTGTTGCAGCTTTTG
CTGGAGTGAGTTTTCCATCAGGGAGAGCTGTTTTCTGAGATGGCAATCTCGGAAGTGACT
TGCGCAAGGGTTGCTTCTTGAGATCAACCGTTGGCACAACTCCTTTAGCAGTTGAGCTAT
CTTTAGAGGCTTTCTCATCTAAGCTCAGCCTAGCAACACGAGGGGTCTGAGTTTCTTCAG
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QA 1 629 1 629
DS 

RD RS1C260TF 564 0 0
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AATTAATGCAAGCTAATGAGTCTTAATGCTCAACAGCGACCACTTCAGATACCTCCATGG
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CATTGGCCGATACAGTCCCTTGTGCTTCCTCATCTATGGGGTTTGAAGACTGGTTCAGGG
CTTCTGCATCTTTTTCAACTTTCTTCCTTTCAGGTTTCACCTTAGCTGAGGCTGTTGCAG
CTTTTGCTGGAGCGAGTTTTCCATCAGGGAGAGCTGTTTTCTGAGATGGCAATCTCGGAA
GTGACTTGCGCAAGGGTTGCTTCTTGAGATCAACCGTTGGCACAACTCCTTTAGCAGTTG
AGCTATCTTTAGAGGCTTTCTCATCTAAGCTCAGCCTAGCAACACGAGGGGTCTGAGTTT
CTTCAGAGTCAGTCTTCTTCCTCCCAAGTTTTGGAGATTTGGGTCTTGTTGGTGGTATCT
TCTTTAACTCTGTTTTAGGCGGCC

QA 1 564 1 564
DS 



AS 1 2

CO CL8027Contig1 886 2 6 U
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TAGTTTTCCCTTTTATTTCTTTTTGCAATTCCTTGTTCTTCCCCAGAATTTTCTACGAAA
CCTCCTAACTTACCACGAAAAGCAAATCGGAGAGCAGATCCACTCTTACCACAAATTAAG
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GTTCTGCAAGGTTATGTGGATGCAATCCAACCTGTGCTAGTTGCCGCTGTTCCTCAACTT
AAAGAAGAGCTCACACCAAATGAACCTGTAGTTGTCGTGGATTCAGATAGTGAAGGTGGT
GTAGGCAATGATCCTGGTGTAGATGAAAGTGAAACCTCTGCCCGAGCAGACAAAGCCACC
CTTCTCCAAAACTTCAAGTAATTCCCGCACATGCTAGAGAACTAGGTCAAGTGTGTCATG
TAAACATTAATTTTTCGTTCTTAGTTAACTGTCGTTTTAGTTATAAAAGTTGTTGGATAG
CCGTGAACATAAATTTTAGTGCGACAAACATTTATATAGTCACTATTTCCTGATTTGATA
TTCCTATTTATTCTAAATTATTATTTATGTCAAACCTACATTGGATCATTTTTTTCATAG
GTCTGTGTGAAGTCTATTCTTGATGATGCTAGTGAAAACTGGGCCGAAAGAGTTGATTTT
GGCTGGCTAGATGAGATTGAAGATCCAATTGTGGATAACACGGTGAAACTCATTGGAGAG
GGATTTGTCTTTTGCAAAGAAATGTTTAAAGGTTGTTGTCTCACAGATCCTGATTTTAAT
CATTGAACCATATGTGATACGTTTGGTAGCTTGTCTTATTGAATGA


BQ
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AF RS1DE88TF U 1
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TAGTTTTCCCTTTTATTTCTTTTTGCAATTCCTTGTTCTTCCCCAGAATTTTCTACGAAA
CCTCCTAACTTACCACGAAAAGCAAATCGGAGAGCAGATCCACTCTTACCACAAATTAAG
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GTTCTGCAAGGTTATGTGGATGCAATCCAACCTGTGCTAGTTGCCGCTGTTCCTCAACTT
AAAGAAGAGCTCACACCAAATGAACCTGTAGTTGTCGTGGATTCAGATAGTGAAGGTGGT
GTAGGCAATGATCCTGGTGTAGATGAAAGTGAAACCTCTGCCCGAGCAGACAAAGCCACC
CTTCTCCAAAACTTCAAGTAATTCCCGCACATGCTAGAGAACTAGGTCAAGTGTGTCATG
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*TCTGTGTGAAGTCTATTCTTGATGATGCTAGTGAAA*CTGGGCCGAAAGAGTTGATTTT
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GTTATGTGGATGCAATCCAACCTGTGCTAGTTGCCGCTGTTCCTCAACTTAAAGAAGAGC
TCACACCAAATGAACCTGTAGTTGTCGTGGATTCAGATAGTGAAGGTGGTGTAGGCAATG
ATCCTGGTGTAGATGAAAGTGAAACCTCTGCCCGAGCAGACAAAGCCACCCTTCTCCAAA
ACTTCAAGTAATTCCCGCACATGCTAGAGAACTAGGTCAAGTGTGTCATGTAAACATTAA
TTTTTCGTTCTTAGTTAACTGTCGTTTTAGTTATAAAAGTTGTTGGATAGCCGTGAACAT
AAATTTTAGTGCGACAAACATTTATATAGTCACTATTTCCTGATTTGATATTCCTATTTA
TTCTAAATTATTATTTATGTCAAACCTACATTGGATCATTTTTTTCATAGGTCTGTGTGA
AGTCTATTCTTGATGATGCTAGTGAAAACTGGGCCGAAAGAGTTGATTTTGGCTGGCTAG
ATGAGATTGAAGATCCAATTGTGGATAACACGGTGAAACTCATTGGAGAGGGATTTGTCT
TTTGCAAAGAAATGTTTAAAGGTTGTTGTCTCACAGATCCTGATTTTAATCATTGAACCA
TATGTGATACGTTTGGTAGCTTGTCTTATTGAATGA

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1EL20TF U 1
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RD RS1EL20TF 666 0 0
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AGAAGAATTCTGATTTGACAAGCCAGGGGGTCTTAAACTCGCTCTCTTCTGGGGAAAACG
ATAACAATCAGCAACAGCAACAGCAACAGCGGAATGAACATAGAGTTGATAACGGTTTGG
CCAACAGTGTTATATAGATGTCTGACATTTGCTCGATGTTGGAGATAACGAAAGAGGAAA
GGCGTTGTTCCTACAGAGAATTTGGATTCGTTCGAGTCTCATTGTCAGGAAGGTGAAGGA
AGAAAAGGGTGAGGAAGCTCTTGCGGTGTAAATGCCTTTTTGCTTTTATAAACTGAAACC
TCTGAAAGCGTAG*AGAGTTTCGAGAATCAGTGATTGAGTTTGAGTGTGTTCCAAATACT
TTTTTTTTTGTTTCTTACTTTATCTGAATTTATCAACGAACAAAACCTTCATTAGAGCCA
GGGCTC

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DS 

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CAATGCGAGTTGTCCTCTGTGCAAGAGTGAAGTTGGGGGGAAGAATTCTGATTTGACAAG
CCAGGGGGTCTTAAACTCGCTCTCTTCTGGGGAAAACGGTAACAATCAGCAACAGCAACA
GCAACAGCGGAATGAACATAGAGTTGATAACGGTTTGGCCAACAGTGTTATATAGATGTC
TGACATTTGCTCGATGTTGGAGATAACGAAAGAGGAAAGGCGTTGTTCCTACAGAGAATT
TGGATTCGTTCGAGTCTCATTGTCAGGAAGGTGAAGGAAGAAAAGGGTGAGGAAGCTCTT
GCGGTGTAAATGCCTTTTTGCTTTTATAAACTGAAACCTCTGAAAGCGTAGGAGAGTTTC
GAGAATCAGTGATTGAGTTTGAGTGTGTTCCAAATACTTTTTTTTTTGTTTCTTACTTTA
TCTGAATTTATCAACGAACAAAACCTTCATTAGAGCCAGGGCTCTTTCAGTTCCTTTGCC
TGTGAAGGGACTCTCGGTTCAAAATCAAGATTTAGTGTAAAGAAACCTTATACTGGACCA
TG

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

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TTTCAGCTAACTTCCAAAGAGACGTTGAGATCACTTGGGGAGATGGACGTGGACAGATCA
CGAACAATGGAGAGCTTCTCACTCTTTCTCTAGACAAATCATCTGGCTCTGGTTTCCAAT
CCAAGAACGAGTACTTGTTCGGTAAAATCGACATGCAGATGAAACTTGTCCCTGGAAACT
CCGCAGGAACAGTCACAACACTCTACTTGAAATCACCAGGAACAACATGGGACGAGATTG
ACTTCGAGTTCTTAGGAAACCTAAGTGGAGATCCTTACACACTCCACACAAATGTCTACA
CACAAGGCAAAGGAGACAAAGAACAGCAGTTCAAGCTCTGGTTCGACCCAACAGCTGATT
TCCACACTTACACCATTCTATGGAACCCACAACGAATCATTTTCACCGTCGATGGAACTC
CCATTAGAGAATTCAAAAACATGGAATCTATTGGCACTCTATTTCCCAAGAACCGACCAA
TGAGAATGTACTCGAGTCTTTGGAACGCCGATGATTGGGCTACGAGAGGTGGTTTGGTCA
AAACCGATTGGTCTAAGGCTCCTTTCACTGCTTCTTACCGTGGCTTCAACCAAGAAGCTT
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CW36TF U 1
AF RS1CW36JQ C 619
BS 1 672 RS1CW36TF
BS 673 760 RS1CW36JQ

RD RS1CW36TF 672 0 0
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TCAAAATGGCAAGCAGTTGCTTCCTTCCTCTGTTTCTTTCTCTTACCGTCATCTCTTCTG
TTTCAGCTAACTTCCAAAGAGACGTTGAGATCACTTGGGGAGATGGACGTGGACAGATCA
CGAACAATGGAGAGCTTCTCACTCTTTCTCTAGACAAATCATCTGGCTCTGGTTTCCAAT
CCAAGAACGAGTACTTGTTCGGTAAAATCGACATGCAGATGAAACTTGTCCCTGGAAACT
CCGCAGGAACAGTCACAACACTCTACTTGAAATCACCAGGAACAACATGGGACGAGATTG
ACTTCGAGTTCTTAGGAAACCTAAGTGGAGATCCTTACACACTCCACACAAATGTCTACA
CACAAGGCAAAGGAGACAAAGAACAGCAGTTCAAGCTCTGGTTCGACCCAACAGCTGATT
TCCACACTTACACCATTCTATGGAACCCACAACGAATCATTTTCACCGTCGATGGAACTC
CCATTAGAGAATTCAAAAACATGGAATCTATTGGCACTCTATTTCCCAAGAACCGACCAA
TGAGAATGTACTCGAGTCTTTGGAACGCCGATGATTGGGCTACGAGAGGTGGTTTGGTCA
AAACCGATTGGT

QA 1 672 1 672
DS 

RD RS1CW36JQ 142 0 0
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CTCCTTTCACTGCTTCTTACCGTGGCTTCAACCAAGAAGCTTGTGTTTGGTCAAACGGTA
AGTCATCTTGTCCTAATGGCTC

QA 1 142 1 142
DS 



AS 1 2

CO CL8030Contig1 828 2 2 U
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CTTGGATGGCACAATCTCTGAAGCTGATTCAAACCAAGTCAACCAACAAGAGACAGAACA
TGCGGCTGAGGAGAATGATTTTGAGGCTGAGAAAATCAACACGTTTGTTGAAGACATAAT
GGTGGACCAAACTGATGGTGGTTCAGAAACTGAGCAGGAAGGAGATGATTCTGGTGCTGA
CTCGGATGGAACTATCTCTGAAGCCGATTCATACCAAGCCATACAGGGATCTGATATTGC
TGACGGAAAGAAGATGATTCTACCTGAATCAGAAGGTTCCGTAACCGCTCCAACTTCTTC
TCTTGTGCTTGAAGATGCTCTGGTAGAAACAACAGCTCCACTATCTCCATTTGTGGCGGG
GTCAGTCTCAGCTCAGTTTCCAAGACCAAACAAGTCAGCATCAAAGAACTCGGCTATGAA
GCTGGTCAATGTGGATAATACGAGCAAGGAGAACAGCATGGAGATGATGATGAATGTTGT
TAATGGAGAGAGCAAAGGTGAGGAGGCTGCAAAGAAGAATAAGAAGGTGGAGTTTGATGA
AAAGAACTTGAAAAATGTTAGCATGAGACAACTCGTGAAGTTGGTGAAGGAACTCTCTAT
AAAGAGTAGTAGCAACAGAACTGCTTTGCAGATGTTGCCTGGTAATAATCAGATTGCTGA
GTAGTGTGGTTGATCCCTGCGTTTTTATTTTATTTTTGTTGTTGCCTCAGACGGAAAAAA
AAAAACTTATAAACATGTGTTTGGTATGAATAAAATCTCAAATTAAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EM19TF U 1
AF RS1EM19JQ C 171
BS 1 741 RS1EM19TF
BS 742 828 RS1EM19JQ

RD RS1EM19TF 741 0 0
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CTTGGATGGCACAATCTCTGAAGCTGATTCAAACCAAGTCAACCAACAAGAGACAGAACA
TGCGGCTGAGGAGAATGATTTTGAGGCTGAGAAAATCAACACGTTTGTTGAAGACATAAT
GGTGGACCAAACTGATGGTGGTTCAGAAACTGAGCAGGAAGGAGATGATTCTGGTGCTGA
CTCGGATGGAACTATCTCTGAAGCCGATTCATACCAAGCCATACAGGGATCTGATATTGC
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TCTTGTGCTTGAAGATGCTCTGGTAGAAACAACAGCTCCACTATCTCCATTTGTGGCGGG
GTCAGTCTCAGCTCAGTTTCCAAGACCAAACAAGTCAGCATCAAAGAACTCGGCTATGAA
GCTGGTCAATGTGGATAATACGAGCAAGGAGAACAGCATGGAGATGATGATGAATGTTGT
TAATGGAGAGAGCAAAGGTGAGGAGGCTGCAAAGAAGAATAAGAAGGTGGAGTTTGATGA
AAAGAACTTGAAAAATGTTAGCATGAGACAACTCGTGAAGTTGGTGAAGGAACTCTCTAT
AAAGAGTAGTAGCAACAGAACTGCTTTGCAGATGTTGCCTGGTAATAATCAGATTGCTGA
GTAGTGTGGTTGATCCCTGCG

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1EM19JQ 658 0 0
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CTGGTGCTGACTCGGATGGAACTATCTCTGAAGCCGATTCATACCAAGCCATACAGGGAT
CTGATATTGCTGACGGAAAGAAGATGATTCTACCTGAATCAGAAGGTTCCGTAACCGCTC
CAACTTCTTCTCTTGTGCTTGAAGATGCTCTGGTAGAAACAACAGCTCCACTATCTCCAT
TTGTGGCGGGGTCAGTCTCAGCTCAGTTTCCAAGACCAAACAAGTCAGCATCAAAGAACT
CGGCTATGAAGCTGGTCAATGTGGATAATACGAGCAAGGAGAACAGCATGGAGATGATGA
TGAATGTTGTTAATGGAGAGAGCAAAGGTGAGGAGGCTGCAAAGAAGAATAAGAAGGTGG
AGTTTGATGAAAAGAACTTGAAAAATGTTAGCATGAGACAACTCGTGAAGTTGGTGAAGG
AACTCTCTATAAAGAGTAGTAGCAACAGAACTGCTTTGCAGATGTTGCCTGGTAATAATC
AGATTGCTGAGTAGTGTGGTTGATCCCTGCGTTTTTATTTTATTTTTGTTGTTGCCTCAG
ACGGAAAAAAAAAAACTTATAAACATGTGTTTGGTATGAATAAAATCTCAAATTAAGG

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

CO CL8031Contig1 578 2 2 U
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CATTCTCAAAAGCAAATATAACAAGACAAGGTATCGTAAGAAAACACTCCAAAAACAAAC
AAATCAAACTTCCACCTCCGAGAATTAACCCTTCTTCGAGCGGTAAACGTAAAAGACAAC
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CATGTTCTTCAACCCACTGATCATCTTCTCAGACTCATCCATCTGTCTCTCCAACTCCAC
AATCTCCGATTCCATATCCTTCACTCTCTTCTCAGACTCTCTCAACGAATCCTCAACAAC
CTTCTTCTCTGTCCTCCACTTCTCCAACTCTGCTTTCCCTTCAGTAACATTAGATTCCAA
ACCTTTGATCTTCTCCTTCAACTCATCAACCTCCTTCTCCTTGTTATCAATCCTATCCCT
CATCTCTTCCTCAGCTCTCACCTTCTTGTTCCTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GB32TF C 1
AF RS1GB32JQ U 8
BS 1 7 RS1GB32TF
BS 8 578 RS1GB32JQ

RD RS1GB32TF 578 0 0
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CATTCTCAAAAGCAAATATAACAAGACAAGGTATCGTAAGAAAACACTCCAAAAACAAAC
AAATCAAACTTCCACCTCCGAGAATTAACCCTTCTTCGAGCGGTAAACGTAAAAGACAAC
AGCTGCTCCCGCAACTGCAACCGCAACAGCAGCCAAAGCTCCACCATAACCACCACTCAC
AGCCGTCGTCGGAGACCACGACCTACTACTAACCTCCACGCCATTCACCGGCTGCTCAAC
CATGTTCTTCAACCCACTGATCATCTTCTCAGACTCATCCATCTGTCTCTCCAACTCCAC
AATCTCCGATTCCATATCCTTCACTCTCTTCTCAGACTCTCTCAACGAATCCTCAACAAC
CTTCTTCTCTGTCCTCCACTTCTCCAACTCTGCTTTCCCTTCAGTAACATTAGATTCCAA
ACCTTTGATCTTCTCCTTCAACTCATCAACCTCCTTCTCCTTGTTATCAATCCTATCCCT
CATCTCTTCCTCAGCTCTCACCTTCTTGTTCCTCTCCC

QA 1 578 1 578
DS 

RD RS1GB32JQ 571 0 0
AAACAAACACATAATATAAAGAAAAGACTCCTAAGTTGTGTGAAATCAAATCACATTCTC
AAAAGCAAATATAACAAGACAAGGTATCGTAAGAAAACACTCCAAAAACAAACAAATCAA
ACTTCCACCTCCGAGAATTAACCCTTCTTCGAGCGGTAAACGTAAAAGACAACAGCTGCT
CCCGCAACTGCAACCGCAACAGCAGCCAAAGCTCCACCATAACCACCACTCACAGCCGTC
GTCGGAGACCACGACCTACTACTAACCTCCACGCCATTCACCGGCTGCTCAACCATGTTC
TTCAACCCACTGATCATCTTCTCAGACTCATCCATCTGTCTCTCCAACTCCACAATCTCC
GATTCCATATCCTTCACTCTCTTCTCAGACTCTCTCAACGAATCCTCAACAACCTTCTTC
TCTGTCCTCCACTTCTCCAACTCTGCTTTCCCTTCAGTAACATTAGATTCCAAACCTTTG
ATCTTCTCCTTCAACTCATCAACCTCCTTCTCCTTGTTATCAATCCTATCCCTCATCTCT
TCCTCAGCTCTCACCTTCTTGTTCCTCTCCC

QA 1 571 1 571
DS 



AS 1 2

CO CL8032Contig1 595 2 2 U
CAAATCTTTAGCAATAGTGAATTGTTTGATTACAGTAGCAAAAAAGAACGTCTCAAGAAT
ACATCATTTAAGGCATAACAGTGGCTTTAGATTCACTTCGAAAGATTTCCCTGTCTTACA
TACTCTCTTCATAAGCAGCTAACGTATCTTATCTTTTAGAAAGTCTTAAAGTACTTCCTG
ATCTCGAACATTATAGACTGAATGGAGACAAGATCCTTGTTCAGACCAGATCCACCAGGT
ATCTTCTTGATGCAGTCTGTAAGCCGTGTGTAATAGAGCAACAGCTGTGTCAATGCAGCT
CTCAGGATCTCCATACCACACAGGAAGTTACTGAAGGAAGTTATGATGTCTTTGTGCATC
AACTCTATCGCTGTCTTCCACCTGCTTCCAAAGTCTTTCACCAGCGGATCCACCTCAGCA
ACTGTGATGTATCTCTCCGGATTTGAGCTTGAATCCTCAGAAGCACGAGATTTCACAAAT
TTGATTAAATCACTGAAATGCTCCACCAGCAATTCTTCCACGAATAACGAAGTGTTGCTC
TTCAGTAATTCCTCAAAATGCATTTGGATTTTACCACCTTCTGGTCCAGCTTCCC


BQ
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ATTTGGATTTTACCACCTTCTGGTCCAGCTTCCC

QA 1 574 1 574
DS 



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BQ
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AF RS1AX20JQ C 1
AF RS1AX20TF U 1
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RD RS1AX20TF 570 0 0
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TAATCTAAGAGATACTTATTATTATGATCT

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1BX90TF U 1
AF RS1BX90JQ C 583
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BS 845 1319 RS1BX90JQ

RD RS1BX90TF 844 0 0
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GGGCAACATTTTCAGGTTCCTTCAGCGGATGAGGAGCAAACGGAGCAAAGGATCGACAGG
GATGACGCTAGCGCAGCTGAGGAGAACCACTCGTCAGAGAAAGGACGCCTCTCCCCGATT
CAACCATCTCGTGACGTGAACATATCAAACATTGTGACTAGTGGACCCGATGGAGTAAGA
GTAGAAACTATATTTCACACAGAAGGTGTCTCTCATCTGTTTGAAGGAACAGAACCTAGA
AAGCCAGATCTTGGTCTTACCAAAGTAACAGGTGTGATGGACTCAGGTGAGGGAGGAGGA
CCGATTCGTGGAATTGATATTCCACCACTCCCAGTGAGTTCGTTGGAAGAAGGGACTCTA
ACGGAACCGTTAGTCAGACCAGCTGTGACAGGACCAGTGGTTGAAGGACGTAAACTGGAG
ATATTGAAAAGCATTGTATACGAGGTCTGATTGAAGCCATCACAAGCCTCGGTGTTATCT
CATCTGCCGCTGGTTCTGGTGCTTCAACATTGAACATTTTGGTATTGGGGCTTGCAAACT
TGTTTGGCGGGCTTATTCTCATTATTCATTCTCCAAGAACTTAGAGAGGAGGAACCCATA
ATAACGACGACAACAACAACAGAGGATAACCAGACTAACCTGCAAGAAGAAAGTCGGTAC
AAGCGACTCCTAG*AAGAAGAGAAAACTTCACGCTTCACGTAACTGTCGCAATCATATCC
TTCATAATCACGGGACTACTCCCTCCCATAGTCTACTACTTCTCATTCAGCAAA*CACAC
AACA

QA 1 844 1 844
DS 

RD RS1BX90JQ 737 0 0
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AGAGAGGAGGAACCCATAATAACGACGACAACAACAACAGAGGATAACCAGACTAACCTG
CAAGAAGAAGGTCGGTACAAGCGACTCCTAGGAAGAAGAGAAAACTTCACGCTTCACGTA
ACTGTCGCAATCATATCCTTCATAATCACGGGACTACTCCCTCCCATAGTCTACTACTTC
TCATTCAGCAAAACACACAACAGAGACTACAAAGTGGCATCAGTCTTTGGGGCATCTCTG
CTATGCATCGTCTTGCTGGCAATAGCCAAAGCTCACGTGAGGAGCCCGAGAGGAAGCCAC
CTGAAGAGCGTTCTGAAATACGCGATGATAGCTGTGTCGGTGTCGGGGATATCTTACGTG
GTGGGTAACTTTGTGGATCAGTTGCTTGAGAAGTACGGATGGTCTGATGGAACCGAGAAT
CCAGCGGGAGAGATGATGCTTTCACTTATGGGGAGAAAGGCTGGTAGCTTCGGATACTCA
TCATCTTACTGAACCACCCGAATCTAGTCAAACCTCATGCTACTTTTTTTCTCTTCCACT
CTGTTTTGAGAGCACTCGTTAGACTTTTTTACTTGCTTTTAAAACCAAACCTTTGTTGTG
ACTTGTGAGTGTAGAAGCCGTTTCCAAAAGTGTACTAAGCACACAAATAAATTGCGAAAA
TGTTTGCCCTTTTGTCT

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

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ACTGTGGCGTCACCTAAAGGGCACACTCAACACGAAGCAAGAGATGTGGAGTCTGGGAAA
TTCGTGTTCACTGCGGTGGAAGACGGCGATTACACAACGTGTTTTATAGCTCCTGTTTTT
AAACCTCCGGCCAAATTCGCCGTTGATTTCGAATGGAAAAGTGGCGTGGAGGCTAAAGAT
TGGGCCACCATCGCCAAGAGAGGCCAGATCAACATGCTGGAGGTGGAGATGAGGAAACTA
CTGGACGTGACGGAGTCTATACACGACGAAATGTTTCTACTCCGGGAGAGGGAACGGGAA
ATGCAGGAGCTAAACCGGTCGACCAACTCGAGAATGGCGGGTCTAAGTTTATTTTCATTG
TTGGTTACGTTTTCGGTAGCCGGCATACAA


BQ
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AF RS1F533TF U 1
AF RS1F533JQ C 8
BS 1 400 RS1F533TF
BS 401 450 RS1F533JQ

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ACTGTGGCGTCACCTAAAGGGCACACTCAACACGAAGCAAGAGATGTGGAGTCTGGGAAA
TTCGTGTTCACTGCGGTGGAAGACGGCGATTACACAACGTGTTTTATAGCTCCTGTTTTT
AAACCTCCGGCCAAATTCGCCGTTGATTTCGAATGGAAAAGTGGCGTGGAGGCTAAAGAT
TGGGCCACCATCGCCAAGAGAGGCCAGATCAACATGCTGGAGGTGGAGATGAGGAAACTA
CTGGACGTGACGGAGTCTATACACGACGAAATGTTTCTACTCCGGGAGAGGGAACGGGAA
ATGCAGGAGCTAAACCGGTCGACCAACTCGAGAATGGCGG

QA 1 400 1 400
DS 

RD RS1F533JQ 443 0 0
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CGTCACCTAAAGGGCACACTCAACACGAAGCAAGAGATGTGGAGTCTGGGAAATTCGTGT
TCACTGCGGTGGAAGACGGGGATTACACAACGTGTTTTATAGCTCCTGTTTTTAAACCTC
CGGCCAAATTCGCCGTTGATTTCGAATGGAAAAGTGGCGTGGAGGCTAAAGATTGGGCCA
CCATCGCCAAGAGAGGCCAGATCAACATGCTGGAGGTGGAGATGAGGAAACTACTGGACG
TGACGGAGTCTATACACGACGAAATGTTTCTACTCCGGGAGAGGGAACGGGAAATGCAGG
AGCTAAACCGGTCGACCAACTCGAGAATGGCGGGTCTAAGTTTATTTTCATTGTTGGTTA
CGTTTTCGGTAGCCGGCATACAA

QA 1 443 1 443
DS 



AS 1 2

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ATGAGTTCTGTAGGAGGAGGAATCGTGGCGGGACCAACAGCAGCTCCTGCAAGCGGCGGT
GGAAACGTGGAGTGGCACGTCAGACCACCCAACCCTAAAAACCCAGTCGTCTTCTTCGAC
GTCTCTATTGGTGGTATCCCCGCTGGTCGTATCAAGATGGAGCTTTTCGCCGACATTGCC
CCCAAAACTGCTGAAAACTTCAGGCAGTTCTGTACTGGTGAACTCAGAAAGGCTGGGAAG
CCACTTGGTTACAAAGAATGTCAGTTTCACAGAGTCATCAAGGATTTTATGATTCAAAGT
GGTGATTTTCTTAAGGTCTGTTTAATATTATTTACTCTACGCCTTTTTTGCATTTTTTTA
CTAGAAAGAATCTCTTTGGTTTCTTCTCTCATCTTTTAACTAAATTCTCTGCTAGAATGA
TGGTAGTGGATGCATGTCAATCTATGGCCACCAGTTCGCTGATGAGAATTTTACTGCCAA
ACATACTGGACCTGGATTGCTCTCCATGGCAAATAGTGGGCCAGACACTAATGGTTGCCA
GTTCTTCATCAGCTGTGCAAAATGCGAGTGGCTTGACAACAAGCATGTTGTCTTTGGGAG
AGTGCTGGGAGATGGGTTATTGGTGGTGCGGAAGATTGAGAACGTGGCTGTTGGACCAAA
CAACCGTCCTAAGCTTGCTGTTGTTATTACAGAGTGTGGGGAGATGTGAGAAATGCTATT
AGCCATGAGATGACTTGAAGAACATTGTCTTCTGAAGGAGGAATGTAGTGTGAGGCCAAA
GCTTTAATTTATAGTTGTAAACGTTACGCATATGTGACCTAAGCTTTAAACATTTTGTCA
TTTAGTTTTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C341TF U 1
AF RS1C341JQ C 163
BS 1 692 RS1C341TF
BS 693 693 RS1C341JQ
BS 694 722 RS1C341TF
BS 723 723 RS1C341JQ
BS 724 742 RS1C341TF
BS 743 910 RS1C341JQ

RD RS1C341TF 742 0 0
TTTTTGTTTTCTCCGAAGTCACTGAGAGAGAGAGAGAGAAGAAGAAAAGTTTGATTTCCG
ATGAGTTCTGTAGGAGGAGGAATCGTGGCGGGACCAACAGCAGCTCCTGCAAGCGGCGGT
GGAAACGTGGAGTGGCACGTCAGACCACCCAACCCTAAAAACCCAGTCGTCTTCTTCGAC
GTCTCTATTGGTGGTATCCCCGCTGGTCGTATCAAGATGGAGCTTTTCGCCGACATTGCC
CCCAAAACTGCTGAAAACTTCAGGCAGTTCTGTACTGGTGAACTCAGAAAGGCTGGGAAG
CCACTTGGTTACAAAGAATGTCAGTTTCACAGAGTCATCAAGGATTTTATGATTCAAAGT
GGTGATTTTCTTAAGGTCTGTTTAATATTATTTACTCTACGCCTTTTTTGCATTTTTTTA
CTAGAAAGAATCTCTTTGGTTTCTTCTCTCATCTTTTAACTAAATTCTCTGCTAGAATGA
TGGTAGTGGATGCATGTCAATCTATGGCCACCAGTTCGCTGATGAGAATTTTACTGCCAA
ACATACTGGACCTGGATTGCTCTCCATGGCAAATAGTGGGCCAGACACTAATGGTTGCCA
GTTCTTCATCAGCTGTGCAAAATGCGAGTGGCTTGACAACAAGCATGTTGTCTTTGGGAG
AGTGCTGGGAGATGGGTTATTGGTGGTGCGGA*GATTGAGAACGTGGCTGTTGGACCAAA
CA*CCGTCCTAAGCTTGCTGTT

QA 1 742 1 742
DS 

RD RS1C341JQ 748 0 0
CCAGTCGTCTTCTTCGACGTCTCTATTGGTGGTATCCCCGCTGGTCGTATCAAGATGGAG
CTTTTCGCCGACATTGCCCCCAAAACTGCTGAAAACTTCAGGCAGTTCTGTACTGGTGAA
CTCAGAAAGGCTGGGAAGCCACTTGGTTACAAAGAATGTCAGTTTCACAGAGTCATCAAG
GATTTTATGATTCAAAGTGGTGATTTTCTTAAGGTCTGTTTAATATTATTTACTCTACGC
CTTTTTTGCATTTTTTTACTAGAAAGAATCTCTTTGGTTTCTTCTCTCATCTTTTAACTA
AATTCTCTGCTAGAATGATGGTAGTGGATGCATGTCAATCTATGGCCACCAGTTCGCTGA
TGAGAATTTTACTGCCAAACATACTGGACCTGGATTGCTCTCCATGGCAAATAGTGGGCC
AGACACTAATGGTTGCCAGTTCTTCATCAGCTGTGCAAAATGCGAGTGGCTTGACAACAA
GCATGTTGTCTTTGGGAGAGTGCTGGGAGATGGGTTATTGGTGGTGCGGAAGATTGAGAA
CGTGGCTGTTGGACCAAACAACCGTCCTAAGCTTGCTGTTGTTATTACAGAGTGTGGGGA
GATGTGAGAAATGCTATTAGCCATGAGATGACTTGAAGAACATTGTCTTCTGAAGGAGGA
ATGTAGTGTGAGGCCAAAGCTTTAATTTATAGTTGTAAACGTTACGCATATGTGACCTAA
GCTTTAAACATTTTGTCATTTAGTTTTC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL8037Contig1 603 2 3 U
ATAGAACAATGGAAACTTTGTCACAAGAGATTTAAGTATTATTGTTATCTAATTGCCATT
TTGCTGGAAGTACAAGTGCAAGAAACAAACAAGTAATGATGAAAAATCAGACAAAATGAC
ATGGTGTCTCAGATTTTGAACCTCTTTCCGGCAACTTATTAATAGAAGAAACCTAGGACC
TGACCACCCACATTCCGCTTGATAGCCTCTTCATGGTCCAAAATGCCATCAGGAGTTGTA
ACTACAACATAACCCCACTGGCGGGTTGGAAAAGTGCGTTCGGTGTAATGCTCAATCTCT
TTAGCCTTGACGTCTTGCCTATAAGTGAGAGCTTTGCAATCATTAACCCTTCCTCGTAAG
TCAACAGTTATTCTTCCAACTCTGTGCGGATCATGGACTTGATAGTTCTTAATGTAACCT
TTCTCCTTCATGATTCTGAGGAAGGAAGACATAACGGTAGAGACAGGCTTCAACTCCACC
GAAGCTTTCCCTCGCTTCTCCGCATTCACGATCGTCCTCAACGCGTCGTTCAATATCCTC
CTCCCCATTTATCTCTCTAATTCGGTCAAACAAGAAATGAATCAAAGGATCTAAAACCCT
CCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 

AF RS1AA70JQ U 204
AF RS1AA70TF C 1
BS 1 203 RS1AA70TF
BS 204 490 RS1AA70JQ
BS 491 603 RS1AA70TF

RD RS1AA70JQ 287 0 0
AGCCTCTTCATGGTCCAAAATGCCATCAGGAGTTGTAACTACAACATAACCCCACTGGCG
GGTTGGAAAAGTGCGTTCGGTGTAATGCTCAATCTCTTTAGCCTTGACGTCTTGCCTATA
AGTGAGAGCTTTGCAATCATTAACCCTTCCTCGTAAGTCAACAGTTATTCTTCCAACTCT
GTGCGGATCATGGACTTGATAGTTCTTAATGTAACCTTTCTCCTTCATGATTCTGAGGAA
GGAAGACATAACGGTAGAGACAGGCTTCAACTCCACCGAAGCTTTCC

QA 1 287 1 287
DS 

RD RS1AA70TF 603 0 0
ATAGAACAATGGAAACTTTGTCACAAGAGATTTAAGTATTATTGTTATCTAATTGCCATT
TTGCTGGAAGTACAAGTGCAAGAAACAAACAAGTAATGATGAAAAATCAGACAAAATGAC
ATGGTGTCTCAGATTTTGAACCTCTTTCCGGCAACTTATTAATAGAAGAAACCTAGGACC
TGACCACCCACATTCCGCTTGATAGCCTCTTCATGGTCCAAAATGCCATCAGGAGTTGTA
ACTACAACATAACCCCACTGGCGGGTTGGAAGAGTGCGTTCGGTGTAATGCTCAATCTCT
TTAGCCTTGACGTCTTGCCTATAAGTGAGAGCTTTGCAATCATTAACCCTTCCTCGTAAG
TCAACAGTTATTCTTCCAACTCTGTGCGGATCATGGACTTGATAGTTCTTAATGTAACCT
TTCTCCTTCATGATTCTGAGGAAGGAAGACATAACGGTAGAGACAGGCTTCAACTCCACC
GAAGCTTTCCCTCGCTTCTCCGCATTCACGATCGTCCTCAACGCGTCGTTCAATATCCTC
CTCCCCATTTATCTCTCTAATTCGGTCAAACAAGAAATGAATCAAAGGATCTAAAACCCT
CCC

QA 1 603 1 603
DS 



AS 1 2

CO CL8038Contig1 837 2 2 U
GAGGAATATATTGATACACCTAACAATCATGGGTTAGAAGTGATGGATCCTGAGATACTT
TCAAACCTCACAATGTCAGCAGACAAGTCAGGGCTTCAGGTTGCTATCCATGCTATAGGA
GACAAAGCAAATGACATGATTCTAGACATGTACGAGTCCGTTGCTGCAGCCAATGGAGAA
CGAGATAGAAGATTTAGGATTGAGCATGCTCAACATTTAGCACCAGGATCTTCTCTTCGG
TTTGGTCAACATCACATTGTAGCCTCAGTGCAGCCAGATCATTTGCTTGACGATGCTGAT
ACTGCTCCTAAGAAGCTCGGTTTTGACAGAGCTGAAAAGGAGTCATATCTATTTCAATCT
CTCTTAAATGGGAATGCGCTTGTGGCATTTGGTTCAGACTGGCCTGTGGCAGACATTAAC
CCGTTGCACAGTATCAGAACCGCGGTGAAAAGAATACCTCCCAAGTGGGATCACGCTTGG
ATACCATCCGAATGCATCTCTTTTACCGATGCCTTGACTGCGCACACGATATCAGCAGCA
AGAGCAGCCTTTTGATCATCGCTTGGGGTCTTTATCTCCAGGGAAGCTTGCGGATTTTGT
AATATTGTCAACGAGTTCGTGGGACGAGTTCTCCAAAGACGGCTCTGCTTCGGTTTTGGC
AACGTATGTAGGAGGCAAGCAAGTTCATACATGAAATGATTGAGATCTCTGTGACGTAAA
CAAGGTTTTGTAAAACTAAGTATCTGACAAGTTAGCTCTCTGTTTTGTCTCTGATTCTTG
TGAATATATATGTATGGGGTATTTAAATAATGTTGGTAATAATAAAAACGACAGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FM09TF U 1
AF RS1FM09JQ C 169
BS 1 633 RS1FM09TF
BS 634 837 RS1FM09JQ

RD RS1FM09TF 633 0 0
GAGGAATATATTGATACACCTAACAATCATGGGTTAGAAGTGATGGATCCTGAGATACTT
TCAAACCTCACAATGTCAGCAGACAAGTCAGGGCTTCAGGTTGCTATCCATGCTATAGGA
GACAAAGCAAATGACATGATTCTAGACATGTACGAGTCCGTTGCTGCAGCCAATGGAGAA
CGAGATAGAAGATTTAGGATTGAGCATGCTCAACATTTAGCACCAGGATCTTCTCTTCGG
TTTGGTCAACATCACATTGTAGCCTCAGTGCAGCCAGATCATTTGCTTGACGATGCTGAT
ACTGCTCCTAAGAAGCTCGGTTTTGACAGAGCTGAAAAGGAGTCATATCTATTTCAATCT
CTCTTAAATGGGAATGCGCTTGTGGCATTTGGTTCAGACTGGCCTGTGGCAGACATTAAC
CCGTTGCACAGTATCAGAACCGCGGTGAAAAGAATACCTCCCAAGTGGGATCACGCTTGG
ATACCATCCGAATGCATCTCTTTTACCGATGCCTTGACTGCGCACACGATATCAGCAGCA
AGAGCAGCCTTTTGATCATCGCTTGGGGTCTTTATCTCCAGGGAAGCTTGCGGATTTTGT
AATATTGTCAACGAGTTCGTGGGACGAGTTCTC

QA 1 633 1 633
DS 

RD RS1FM09JQ 669 0 0
GCCAATGGAGAACGAGATAGAAGATTTAGGATTGAGCATGCTCAACATTTAGCACCAGGA
TCTTCTCTTCGGTTTGGTCAACATCACATTGTAGCCTCAGTGCAGCCAGATCATTTGCTT
GACGATGCTGATACTGCTCCTAAGAAGCTCGGTTTTGACAGAGCTGAAAAGGAGTCATAT
CTATTTCAATCTCTCTTAAATGGGAATGCGCTTGTGGCATTTGGTTCAGACTGGCCTGTG
GCAGACATTAACCCGTTGCACAGTATCAGAACCGCGGTGAAAAGAATACCTCCCAAGTGG
GATCACGCTTGGATACCATCCGAATGCATCTCTTTTACCGATGCCTTGACTGCGCACACG
ATATCAGCAGCAAGAGCAGCCTTTTGATCATCGCTTGGGGTCTTTATCTCCAGGGAAGCT
TGCGGATTTTGTAATATTGTCAACGAGTTCGTGGGACGAGTTCTCCAAAGACGGCTCTGC
TTCGGTTTTGGCAACGTATGTAGGAGGCAAGCAAGTTCATACATGAAATGATTGAGATCT
CTGTGACGTAAACAAGGTTTTGTAAAACTAAGTATCTGACAAGTTAGCTCTCTGTTTTGT
CTCTGATTCTTGTGAATATATATGTATGGGGTATTTAAATAATGTTGGTAATAATAAAAA
CGACAGGAC

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 2

CO CL8039Contig1 602 2 1 U
GGAGTCGATAGAGAAGCTGATTCCTCCTATGGCTGCTGCTTCACTTTCCGCGAATCTAGG
AACTTCCTTCTACGGAGGTTGGGGAAGTTCAATCTCCGGCGAGGATTACCACACCATGCT
CGCCAAAACAACTGCGCCACGGCAACACTTTGCTAAGCTGTCACGGAAGCCAATCAGAGT
ACAACCAATGATGAAGAATGTCAACGAAGGCAAAGGCTTATTCGCTCCTCTAGTCGTTGT
CACTAGGGACATAGTAGGCAAGAAGAGGTTTAATCAGCTTAGAGGCAAAGCCATTGCTTT
ACACCCTCAGGTGATTACAGAGTTCTGCAAATCGATAGGAGCTGATGCAAAACAGAGACA
GGGACTGATTAGGCTTGCTAAGAAGAATGGAGAGAAGCTTGGCTTCCTTGCTTGACATCC
CTTCCTCTCTGTATACAGATCCTCTTCTTCTTCTTCTTGTTTACTCTTAAAAAATAGAAA
CCGCATTTTCTCATTACGAATGTTGTGTGCATCATCACTCTTGAGATAACACTACTACTC
TTTTGAAACAAGATGAATCTTTTATATATATGTATATGACAAAATATCACAATCGTTCTC
GG


BQ
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20 20 

AF RS1EB26TF U 1
AF RS1EB26JQ C 31
BS 1 602 RS1EB26TF

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CACTAGGGACATAGTAGGCAAGAAGAGGTTTAATCAGCTTAGAGGCAAAGCCATTGCTTT
ACACCCTCAGGTGATTACAGAGTTCTGCAAATCGATAGGAGCTGATGCAAAACAGAGACA
GGGACTGATTAGGCTTGCTAAGAAGAATGGAGAGAAGCTTGGCTTCCTTGCTTGACATCC
CTTCCTCTCTGTATACAGATCCTCTTCTTCTTCTTCTTGTTTACTCTTAAAAAATAGAAA
CCGCATTTTCTCATTACGAATGTTGTGTGCATCATCACTCTTGAGATAACACTACTACTC
TTTTGAAACAAGATGAATCTTTTATATATATGTATATGACAAAATATCACAATCGTTCTC
GG

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DS 

RD RS1EB26JQ 572 0 0
GGCTGCTGCTTCACTTTCCGCGAATCTAGGAACTTCCTTCTACGGAGGTTGGGGAAGTTC
AATCTCCGGCGAGGATTACCACACCATGCTCGCCAAAACAACTGCGCCACGGCAACACTT
TGCTAAGCTGTCACGGAAGCCAATCAGAGTACAACCAATGATGAAGAATGTCAACGAAGG
CAAAGGCTTATTCGCTCCTCTAGTCGTTGTCACTAGGGACATAGTAGGCAAGAAGAGGTT
TAATCAGCTTAGAGGCAAAGCCATTGCTTTACACCCTCAGGTGATTACAGAGTTCTGCAA
ATCGATAGGAGCTGATGCAAAACAGAGACAGGGACTGATTAGGCTTGCTAAGAAGAATGG
AGAGAAGCTTGGCTTCCTTGCTTGACATCCCTTCCTCTCTGTATACAGATCCTCTTCTTC
TTCTTCTTGTTTACTCTTAAAAAATAGAAACCGCATTTTCTCATTACGAATGTTGTGTGC
ATCATCACTCTTGAGATAACACTACTACTCTTTTGAAACAAGATGAATCTTTTATATATA
TGTATATGACAAAATATCACAATCGTTCTCGG

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 2

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TTCTCATGGAAGCCTCACCCAATGATCGCCTTCATTTCGGAATAATGGGTTTCGGGTGCG
ACCATTACAATAGGAGATGCCAAATCAGAGCTCCATGTTGCAACGAAGTCTTCCCTTGTC
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GCAACAACCATCGCTGCGTTGAAGATTCAATGCGGCATCACTGTCCCATTTGTTACGAGT
ATCTCTTTGACTCTCTTAAAGACACAACAGTGATGAAATGCGGACACACAATGCACTGTG
AATGCTATCAGGAGATGCTCAAGCGTGACAAATTTTGCTGTCCGATTTGCTCGAGGTCAG
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CTTCAGATTATCGCGACAAGAAGTTTGGATACTGTGCAATGACTGTAACGACACAACAGA
GTATACTTCCATATA


BQ
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AF RS1H126TF U 1
AF RS1DQ65TF U 48
BS 1 100 RS1H126TF
BS 101 101 RS1DQ65TF
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BS 300 611 RS1H126TF
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BS 673 795 RS1DQ65TF

RD RS1H126TF 672 0 0
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TGATTGATATGT

QA 1 672 1 672
DS 

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GCAAGTTCTATGATGACAATACTGAAAAAGAACAGTTCCATTGTGATGACTGTGGAATTT
GCAGAGTTGGTGGGCGTGAGAACTTCTTTCATTGCAAGAAGTGTGGTTCTTGTTATGCGA
TTGGGCTGCGCAACAACCATCGCTGCGTTGAGGATTCAATGCGGCATCACTGTCCCATTT
GTTACGAGTATCTCTTTGACTCTCTTAAAGACACAACAGTGATGAAATGCGGACACACCA
TGCACTGTGAATGCTATCAGGAGATGCTCAAGCGTGACAAATTTTGCTGTCCGATTTGCT
CGAGGTCGGTGATTGATATGTCAAAAACATGGCAGAGAATGGATGAAGAGATTGAAGCTA
CTTCTATGCCTTCAGATTATCGCGACAAGAAGTTTGGATACTGTGCAATGACTGTAACGA
CACAACAGAGTATACTTCCATATA

QA 5 748 5 748
DS 



AS 1 2

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TTCATCTTCTTCCTTCGGATCGAGAATGGAGGAGAGCGTGAAGAAAACTGTGAATGATAA
CACTGTCGTTGTTTACTCCAGAACTTGGTGCCCATACTGTTCTGAAGTGAAGACATTGTT
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CTCTTTTGTAAACATTGAACCTCGTTTTTATGTTTACACATTGAACATCATTCAAATAAA
C


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1DV55TF U 1
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DS 

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GAAGCTGATGTTAGCTGAAGCCAACGGTAAAACCGAACAGACTTGAGAGGAAATGATGAA
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C

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1F442TF U 1
AF RS1F442JQ C 112
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A*TAG*TTATATATATATCATATGTTAATTAGTTAAC

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DS 

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QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

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TTTTCATTTTTATTGTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EO01TF U 1
AF RS1EO01JQ C 422
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RD RS1EO01TF 807 0 0
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TGGGTGGAGAGAGTAATGAAGGTGAGATGGGTTAATATTATGAAGATGATGAAAGTGGGA
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CTGCAGATTAGGCTGCAATGTCTATTTTTTTAATGCTTTTCTTATCCACTTTGTATTACA
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TCCATCAAGCGTCTTTTCATGTTTGGTGATTGTGGAGATGGTGTCACTGGTCAGATTGGT
CACTTTCTTGGTTGGTTCCAACAAGAAAGTGGAAAGTGTTGGAATATTGATCAGAGCTGG
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CAGCAAAGAAG*CGAGTCATAGCCGA
T

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DS 

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AATAGGTTTGATTCTCATACGAGAACTATCAGGGATAAAACAAAAACTTTTGACAGTGGT
TTGTGCTGATTGATAGTGGTTTGTGCCGAAACAAGTGGTTTCACAACCTTTTACATAAAT
TTTCATTTTTATTGTCC

QA 1 557 1 557
DS 



AS 1 2

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TGGAAGTGCTGATGT


BQ
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AF RS1G477TF U 61
AF RS1B455TF U 1
BS 1 675 RS1B455TF

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CGAATCCGAGGCTGAATCATCTCTCGAGTTTCTTCTGAACGAGTCAAACGAGGCGCTCAT
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QA 1 571 1 571
DS 

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GGGGATCGCGACTTCCTTCAACACCTCAGCTGACGTCTCGAGTCCCGGAAGAATCAGTGT
TCAAGTTAACCCGGCGTTGACACGGCGGCGGTTCTCGTCGATCGGAGCTGTACCCTCAAT
TCGCGGATCTTCCTTCCCGTCTTCTAGTGGCTTCTCTTCCGCTTATCCGCAGAGTCTGGT
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TTCTTCCACCAAATCATTTAGTCAGTTGATTGAATCTTTGATTGATCGGATTGATCTATC
CGAATCCGAGGCTGAATCATCTCTCGAGTTTCTTCTGAACGAGTCAAACGAGGCGCTCAT
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GGCTAGGGCAATGATGAAGCATGCCAGGACAGTAGAAGGATTAGTTGATGCGGTGGACAT
AGTAGGAACAGGTGGTGATGGAGCAAACACAGTCAACATATCAACTGGATCTTCAATACT
TGCTGCAGCTTGCGGTGCAAAAGTTGCCAAGCAAGGGAGTCGTTCGAGTTCCTCTGCCTG
TGGAAGTGCTGATGT

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

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ATCTGGCATGTTGCAAAGAGATTCTGGTCGGGGGCAAACCCAGCGCCTGGAAAATACCTT
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AGCTAGATAGATCTGGTCCTTTCTTCTTCATCAGTGGCACCAAGAGCAACTGTGTGGAAG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GT51TF U 1
AF RS1GT51JQ C 179
BS 1 653 RS1GT51TF
BS 654 758 RS1GT51JQ

RD RS1GT51TF 653 0 0
GATTCACAACAGATCTCACTTAAGCCACACAAGTTTCATCTTTTCTACACAACTTAACTC
TCATGGCTCGGACAACTCTAGTTCACACTTCCTGTCTGTTATTCTTCTTCTTCTTGGCTG
ATCTGGCATGTTGCAAAGAGATTCTGGTCGGGGGCAAACCCAGCGCCTGGAAAATACCTT
CGTCACCTTCTGATTCCCTCAACAAATGGGCTGAGAGTTTGCGGTTTCACGTCGGTGATT
CTCTCGTGTGGAAGTACGATGGGGGAAAAGACTCGGTTCTGCAAGTGACTAAAGAAGCCT
ACATCGATTGCAACACCACAAACCCAGCAGCCAATTACAGCAATGGAGACACCAAGGTGA
AGCTAGATAGATCTGGTCCTTTCTTCTTCATCAGTGGCACCAAGAGCAACTGTGTGGAAG
GCGAGAAGCTTCACATTGTTGTCATGTCCTCCTCTCGTGGTGGTGGCCACACCGGTGGTT
TCTTCACCGGCTCAGCTCCTTCTCCCGCTCCTTCTTCTCATGCTCTTTTGGGAGCTCCAG
CTCTTCCCCCTGCAACCGGTTCTGCTAATTCTTTGGCCAGACGAATTGGAGTTTTGGGAT
TTGTTGGATTAGCAGTTGTTTTGCACTGCCTCTGATTTTAACAGTAGAATCTG

QA 1 653 1 653
DS 

RD RS1GT51JQ 580 0 0
TTCGTCACCTTCTGATTCCCTCAACAAATGGGCTGAGAGTTTGCGGTTTCACGTCGGTGA
TTCTCTCGTGTGGAAGTACGATGGGGGAAAAGACTCGGTTCTGCAAGTGACTAAAGAAGC
CTACATCGATTGCAACACCACAAACCCAGCAGCCAATTACAGCAATGGAGACACCAAGGT
GAAGCTAGATAGATCTGGTCCTTTCTTCTTCATCAGTGGCACCAAGAGCAACTGTGTGGA
AGGCGAGAAGCTTCACATTGTTGTCATGTCCTCCTCTCGTGGTGGTGGCCACACCGGTGG
TTTCTTCACCGGCTCAGCTCCTTCTCCCGCTCCTTCTTCTCATGCTCTTTTGGGAGCTCC
AGCTCTTCCCCCTGCAACCGGTTCTGCTAATTCTTTGGCCAGACGAATTGGAGTTTTGGG
ATTTGTTGGATTAGCAGTTGTTTTGCACTGCCTCTGATTTTAACAGTAGAATCTGTTTAG
ATTTTCATCTCTGCGTTAAAGTTTTTTTTGGCCTTTTGACAATGGTGTATTTCCGAATAT
ATTAGACGAACTTGTAAGAGATTATGAAAAATCAGTTGCT

QA 1 580 1 580
DS 



AS 1 2

CO CL8046Contig1 811 2 2 U
GAGAGTTGCTACAATCCAGTGCTTGTCTGGTACTGGTTCTTTGAGAGTTGGTGCTGAGTT
CCTCAAAAAACACTACCACCAGAGTGTCATTTTCATTCCAAAACCAACTTGGGGGAACCA
TCCCAAAGTTTTCAACCTTGCTGGCTTGTCTGTTGAGTACTACCGTTACTATGATCCTGC
AACCCGTGGACTTGACTTCCAAGGCTTGCTTGAGGATCTTGGCGCTGCACCATCTGGAGC
GATTGTCTTACTTCATGCATGTGCTCACAATCCCACTGGAGTTGACCCAACCTCTGAACA
GTGGGAACAGATTCGACAACTAGTGAGATCTAAAAGCTTGTTACCGTTTTTTGACAGTGC
ATATCAGGGTTTTGCTAGTGGTAGCCTTGACACAGACGCACATTCAGTCCGCACCTTTGT
TGCTGATGGCGGTGAATGCTTGATAGCTCAAAGTTATGCCAAAAATATGGGACTTTATGG
GGAGCGTGTTGGTGCCCTTAGCATTGTCTGCAAGTCGGCAGATGTGGCTAGTAAGGTTGA
GAGCCAGGTGAAACTTGTTGTGCGACCCATGTATTCGAGTCCACCTATTCATGGAGCATC
AATTGTTGCCACCATTCTGAAAAGCAGTGATATGTATAACGACTGGACCATCGAGCTGAA
AGGAATGGCTGACCGCATTATTAGCATGCGCCAACAGCTATTTGAAGCTCTACAAGCTAA
AGGCACACCTGGTGATTGGAGTCACATTATAAAACAGATTGGGATGTTCACTTTTACTGG
ATTGAACAAGGAGCAAGTTGCCTTCATGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GS15TF U 1
AF RS1GS15JQ C 71
BS 1 642 RS1GS15TF
BS 643 811 RS1GS15JQ

RD RS1GS15TF 642 0 0
GAGAGTTGCTACAATCCAGTGCTTGTCTGGTACTGGTTCTTTGAGAGTTGGTGCTGAGTT
CCTCAAAAAACACTACCACCAGAGTGTCATTTTCATTCCAAAACCAACTTGGGGGAACCA
TCCCAAAGTTTTCAACCTTGCTGGCTTGTCTGTTGAGTACTACCGTTACTATGATCCTGC
AACCCGTGGACTTGACTTCCAAGGCTTGCTTGAGGATCTTGGCGCTGCACCATCTGGAGC
GATTGTCTTACTTCATGCATGTGCTCACAATCCCACTGGAGTTGACCCAACCTCTGAACA
GTGGGAACAGATTCGACAACTAGTGAGATCTAAAAGCTTGTTACCGTTTTTTGACAGTGC
ATATCAGGGTTTTGCTAGTGGTAGCCTTGACACAGACGCACATTCAGTCCGCACCTTTGT
TGCTGATGGCGGTGAATGCTTGATAGCTCAAAGTTATGCCAAAAATATGGGACTTTATGG
GGAGCGTGTTGGTGCCCTTAGCATTGTCTGCAAGTCGGCAGATGTGGCTAGTAAGGTTGA
GAGCCAGGTGAAACTTGTTGTGCGACCCATGTATTCGAGTCCACCTATTCATGGAGCATC
AATTGTTGCCACCATTCTGAAAAGCAGTGATATGTATAACGA

QA 1 642 1 642
DS 

RD RS1GS15JQ 741 0 0
CACTACCACCAGAGTGTCATTTTCATTCCAAAACCAACTTGGGGGAACCATCCCAAAGTT
TTCAACCTTGCTGGCTTGTCTGTTGAGTACTACCGTTACTATGATCCTGCAACCCGTGGA
CTTGACTTCCAAGGCTTGCTTGAGGATCTTGGCGCTGCACCATCTGGAGCGATTGTCTTA
CTTCATGCATGTGCTCACAATCCCACTGGAGTTGACCCAACCTCTGAACAGTGGGAACAG
ATTCGACAACTAGTGAGATCTAAAAGCTTGTTACCGTTTTTTGACAGTGCATATCAGGGT
TTTGCTAGTGGTAGCCTTGACACAGACGCACATTCAGTCCGCACCTTTGTTGCTGATGGC
GGTGAATGCTTGATAGCTCAAAGTTATGCCAAAAATATGGGACTTTATGGGGAGCGTGTT
GGTGCCCTTAGCATTGTCTGCAAGTCGGCAGATGTGGCTAGTAAGGTTGAGAGCCAGGTG
AAACTTGTTGTGCGACCCATGTATTCGAGTCCACCTATTCATGGAGCATCAATTGTTGCC
ACCATTCTGAAAAGCAGTGATATGTATAACGACTGGACCATCGAGCTGAAAGGAATGGCT
GACCGCATTATTAGCATGCGCCAACAGCTATTTGAAGCTCTACAAGCTAAAGGCACACCT
GGTGATTGGAGTCACATTATAAAACAGATTGGGATGTTCACTTTTACTGGATTGAACAAG
GAGCAAGTTGCCTTCATGACC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL8047Contig1 738 2 3 U
TCATTATTGTCACATCCACAAAGCTAGTTACAAGTCGGGTATACAATAATACATATTCAT
ATCTGGAACAAAACACGACCAAACAAAAATCAGAGGGAAGAAGAAGAAAGTTCTCAGGAT
TTGGAGAATGCGCGGAGCGTAGCATCCAAGGCCTCCCGGTCATAATCTCCCGTGAAAACG
CAGTTCCCCAGCGGACCTTTCAGGAAAATCAGCCTCAGCAGTCCATCTGCCACTTTCTTG
TCAACCGCCATTATGGACTTGAACATGTCCACGGTCATGCTCTCTGGCGGCGTTGTAGGC
AATTTGGCTCGTTTTAAGATGTTGTTCACTCTCTCCACGATTGAGTCATCTATCCAGCCA
AGACGATATGACATGTCCACTGCCATTACCGTGCCAGCTGCAACAGCTTCTCCGTGGAGC
CACTCTCCATACCCGAAGCCAGTTTCTATGGCATGGCCAAAGGTATGACCCAAATTCAGG
GTAGCTCGCAAGCCGCTTTCTTTCTCATCCTGTGGCACAACATCCGCCTTGTTTTCACAT
GATCGCTTTATAGCATAAGCTAACGCAGCCGGATCCCTAGCAAGCAGGGACTCAATGTTC
TGCTCCTGCCATTCAAAGAATTCAGCATCCCTGATAAGCCCGTACTTGATAACTTCAGCA
AGACCTGAGGCCATCTCCCTGTCTGGCAGTGTGTTCAAGGTGTCAGTGTCAACTAGGACA
CACTGTGGTTGGTAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C944JQ U 132
AF RS1C944TF C 1
BS 1 131 RS1C944TF
BS 132 707 RS1C944JQ
BS 708 738 RS1C944TF

RD RS1C944JQ 576 0 0
GCGGAGCGTAGCATCCAAGGCCTCCCGGTCATAATCTCCCGTGAAAACGCAGTTCCCCAG
CGGACCTTTCAGGAAAATCAGCCTCAGCAGTCCATCTGCCACTTTCTTGTCAACCGCCAT
TATGGACTTGAACATGTCCACGGTCATGCTCTCTGGCGGCGTTGTAGGCAATTTGGCTCG
TTTTAAGATGTTGTTCACTCTCTCCACGATTGAGTCATCTATCCAGCCAAGACGATATGA
CATGTCCACTGCCATTACCGTGCCAGCTGCAACAGCTTCTCCGTGGAGCCACTCTCCATA
CCCGAAGCCAGTTTCTATGGCATGGCCAAAGGTATGACCCAAATTCAGGGTAGCTCGCAA
GCCGCTTTCTTTCTCATCCTGTGGCACAACATCCGCCTTGTTTTCACATGATCGCTTTAT
AGCATAAGCTAACGCAGCCGGATCCCTAGCAAGCAGGGACTCAATGTTCTGCTCCTGCCA
TTCAAAGAATTCAGCATCCCTGATAAGCCCGTACTTGATAACTTCAGCAAGACCTGAGGC
CATCTCCCTGTCTGGCAGTGTGTTCAAGGTGTCAGT

QA 1 576 1 576
DS 

RD RS1C944TF 738 0 0
TCATTATTGTCACATCCACAAAGCTAGTTACAAGTCGGGTATACAATAATACATATTCAT
ATCTGGAACAAAACACGACCAAACAAAAATCAGAGGGAAGAAGAAGAAAGTTCTCAGGAT
TTGGAGAATGCGCGGAGCGTAGCATCCAAGGCCTCCCGGTCATAATCTCCCGTGAAAACG
CAGTTCCCCAGCGGACCTTTCAGGAGAATCAGCCTCAGCAGTCCATCTGCCACTTTCTTG
TCAACCGCCATTATGGACTTGAACATGTCCACGGTCATGCTCTCTGGCGGCGTTGTAGGC
AATTTGGCTCGTTTTAAGATGTTGTTCACTCTCTCCACGATTGAGTCATCTATCCAGCCA
AGACGATATGACATGTCCACTGCCATTACCGTGCCAGCTGCAACAGCTTCTCCGTGGAGC
CACTCTCCATACCCGAAGCCAGTTTCTATGGCATGGCCAAAGGTATGACCCAAATTCAGG
GTAGCTCGCAAGCCGCTTTCTTTCTCATCCTGTGGCACAACATCCGCCTTGTTTTCACAT
GATCGCTTTATAGCATAAGCTAACGCAGCCGGATCCCTAGCAAGCAGGGACTCAATGTTC
TGCTCCTGCCATTCAAAGAATTCAGCATCCCTGATAAGCCCGTACTTGATAACTTCAGCA
AGACCTGAGGCCATCTCCCTGTCTGGCAGTGTGTTCAAGGTGTCAGTGTCAACTAGGACA
CACTGTGGTTGGTAAAAA

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

CO CL8048Contig1 570 2 1 U
GGGTCGAGGTTATTGTGTCGTCTCCCGGAGATTTGCATTCAAGTCGATCGCTCCAAGTCA
AGTCAGCTGAATCTCGAGATGGTTTACATAGTTTCATGGGACGAATTCGTAGATCGATCT
GTTCAGCTTTTCAAAGCTGACCCCGAATCTACTAGGTATGTTGTCAAGTATAGACATTGT
GATGGCAAGTTGGTTCTTAAGGTTACTGATAACAAAGAGTGTCTCAAGTTCAAGACGGAC
CAAGCACAAGAAGCAAAGAAGATGGAGAAACTGAATAACATATTCTTTACCCTCATGGCC
AGAGGGCCTGATGTTGATCTTTCTGAAGTGAACGGGAAAGAACAGATGGAGACACAACCT
GTGAAGAAAGGCAGAGGAAGGAAGCAATAAGTCCCATGATTCTGTTTTTCTTTCTTTTTT
TTCTTTTTGTGGTATCAAGATTTTGATCCATTTTTGGGGGATATTTTGAGATGGGGATTG
TGATGATAGGATAATTAAATATTTGTTCTAATTTAAGCTGACTTTGGCTCTAAAAAATAC
AATTTTTATCGAAAATGCTAATTATCATCC


BQ
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AF RS1GM33JQ C 1
AF RS1GM33TF U 1
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DS 

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AATTTTTATCGAAAATGCTAATTATCATCC

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1DL39TF U 1
AF RS1AX62TF U 378
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CC

QA 1 197 1 197
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1BO75JQ C 1
AF RS1BO75TF U 1
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RD RS1BO75TF 568 0 0
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CAAATTTAGGGAATTAATAAAAATAATATTCATTAATGGTAAATATGAAAGTGGTATCAA
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AGATTGGTTTTTTTTTTGAAACTAGGGTTATTTAATGTTAATAATATATTTTTACCATAA
TTAAAAAATCAAATCGAATAATCTGTAAATGCTTACAAACTTTGGATTGACAAATAATAA
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CGTCTCAAAGTCGAGAGAGACCCTGTCC

QA 1 568 1 568
DS 



AS 1 2

CO CL8051Contig1 569 2 1 U
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TTCTACTTTCAATGGATAAGGAGTTTTTG


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AF RS1BU08JQ C 1
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TCAATCGATGGCGAAGAGAATCGGTGGAGCCGGGAAATCAGGCGGCGGAGATTCAAACAT
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QA 1 569 1 569
DS 



AS 1 2

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AF RS1B233TF U 1
AF RS1B233JQ C 106
BS 1 609 RS1B233TF
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QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1B851TF U 1
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TCAACCCACGAACTGACATTGAAAAGGAGAAACTCAAAAGGAAACCAAAAAAACTGGAGA
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DS 



AS 1 2

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GTGCC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1E174TF U 1
AF RS1C593TF U 1
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DS 

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GTGCC

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DS 



AS 1 2

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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1ET93JQ C 1
AF RS1ET93TF U 1
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DS 

RD RS1ET93TF 576 0 0
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GAACCATATGATGAACTAGAGATCCAATCTTTTTATTTACTGTTATGTAATTTCTTTGCT
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TTGTATGCATCTCTTATAATAAATCTTGTTTTCACT

QA 1 576 1 576
DS 



AS 1 2

CO CL8056Contig1 724 2 23 U
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AGCCACACGTATTGCGGTGTGTATTTGCCGTAGCCAGAGTAAGAGGAGAGGACGATGATG
TGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 

AF RS1C455JQ U 3
AF RS1BC11JQ U 1
BS 1 126 RS1BC11JQ
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RD RS1C455JQ 643 0 0
TTTTTT
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AAATTGAAAAATCCATAACCTAAACATAAAACCAAAGAAAAAAAACAAACTAAAAAAAAC
CCTGCTTTTTCAAATCACCAAATGAAACAGTCACCCCCTGTCTCCTCCTTTGGAAAAAAG
TATCTGTTATACATCATAACAAAATCAGCTGCTATGGCTTCATTGTCTTGGTTCCTATGC
CATGTGTACTGTGCGTGAGTCTTGTTCTTAATCTCGAGAAAAGCATGACCAAAACTCGAT
TCCCTATACCCTGAGTAACTCGGTTGCGGATCAGTAAAACTATTTGCGATTCCTTCAATG
TTTCCTCCATCTCCGATTGTGATGTAAATTGGAGCATTAGGATCTTTCACTGGAGTGCTC
AAGCCATTGGTGATATTATACTTAATATTGGAAACACGTTCGGATCTCTCATACCCATGG
ACATGACCAGCCAAAACCAAATCAACCTTGCTGTTAACAAACCACGACTCAAACATTACC
CTCATGCTCTCACCTTCCATGTAATGGTAGTTGACACTATTGTACCACGGAGAGTGGACC
ATAACAATCAACCATGGAGTCTCCTCTCT
GTTCACTT

QA 7 635 7 635
DS 

RD RS1BC11JQ 724 0 0
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AAAAAA*CCCTCCTTTTTCAAATCAGCAAATGAAACAGTCACGCGCTGTCTCCTCCTTTG
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TCCTATGCCATGTGTACTGTGCGTGAGTCTTGTTCTTAATCTCGAGAAGAGCATGACCAA
AACTCGATTCCCTATACGCTGAGTAACTCGGTTGCGGATCAGTAAAACTATTTGCGATTC
CTTCAATGTTTCCTCCATCTCCGATTGTGATGTAAATTGGAGCATTAGGATCTTTCACTG
GAGTGCTCAAGCCATTGGTGATATTATACTTAATATTGGAAACACGTTCGGATCTCTCAT
ACGCATGGACATGACCAGCCAAGACCAAATCAACCTTGCTGTTAACAAACCACGACTCGA
ACATCACCCTCATGCTCTCACCTTCCATGTAATGGTAGTTGACACTATTGTACCACGGAG
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AGCCACACGTATTGCGGTGTGTATTTGCCGTAGCCAGAGTAAGAGGAGAGGACGATGATG
TGAG

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

CO CL8057Contig1 949 2 4 U
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BQ
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AF RS1E190TF U 1
AF RS1E190JQ C 192
BS 1 704 RS1E190TF
BS 705 705 RS1E190JQ
BS 706 769 RS1E190TF
BS 770 949 RS1E190JQ

RD RS1E190TF 769 0 0
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GAGTCAATTGAGAAAGTTGTAATAGGAAGAAGATGGTGCTGCCGTTGATGAAGCTGGGGA
CACTACTGGTGAAAACAATAAGTAAGCCGTTGGCAAGTCAGCTGAAGCACCAGGCCAAGG
TTCATCCCAGGTTCCGTCAATCCATCATCAACTTCGCCCAGAGGAACCACAGGGTGACGA
CGCAGATACAGAGGAGGATATATGGGCACGCCACCGATGTGGAGATTCGTCCCTTGAACG
AGGAAAAGGCTGTTCAAGCTGCTGTTGACCTCATCGGAGAACTCTTCATCTTTGCCGTCG
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TGGCTGATCTCCAAAGCAAACTAGCGGAGGTTGAAGAACTTGCTAAGGCACGGGGACTGA
CCGGTATTTTTAAGGGAAGACAGCAACCCGGTACCTCCTCTACTACAAAGGGTAGCAGCG
AGAAGCCAGATGAATCATCATCATCATCTTAAATCAATGGCCAAGACTCAACCAAAGTTA
ACAATAAAATTACTGGTAATGATTCTTGAAGAGCGAGAGGAGTT*CCAAATTCTCTCCTT
CACATTCTTGTAGATGGAGCATCATAGATACAACATACATGTTTCGTCA

QA 1 769 1 769
DS 

RD RS1E190JQ 758 0 0
G
TCCGTCAATCCATCATCAACTTCGCCCAGAGGAACCACAGGGTGACGACGCAGATACAGA
GGAGGATATATGGGCACGCCACCGATGTGGAGATTCGTCCCTTGAACGAGGAAAAGGCTG
TTCAAGCTGCTGTTGACCTCATCGGAGAACTCTTCATCTTTGCCGTCGGTGGAGGTGTTG
TTATCTTTGAGGTGCAGAGAAGTTCACGTTCTGAAGCTAGAAAAGAGGAAGCCCGTAAGC
AGGAACTCGAGGAGTTGAGAAAAAAAGATGAAATACTGGAAAAGCAAATGGCTGATCTCC
AAAGCAAACTAGCGGAGGTTGAAGAACTTGCTAAGGCACGGGGACTGACCGGTATTTTTA
AGGGAAGACAGCAACCCGGTACCTCCTCTACTACAAAGGGTAGCAGCGAGAAGCCAGATG
AATCATCATCATCATCTTAAATCAATGGCCAAGACTCAACCAAGGTTAACAATAAAATTA
CTGGTAATGATTCTTGAAGAGCGAGAGGAGTTTCCAAATTCTCTCCTTCACATTCTTGTA
GATGGAGCATCATAGATACAACATACATGTTTCGTCATCATCATCATTAAAGAACAATCT
GCTTTATAACAACTATCTAGTCAAATTAGGTGACAAATAAAAAAGGTTTTGATGTTGAGG
TTTCATAGCTCCTACTTCTTTTTGTATTTTCAACATTCGTTTGCTTCGTTTTGGTATTGC
TTGTTGGCAATGCTTGGATAATGACGAATTCTTTAGG

QA 2 758 2 758
DS 



AS 1 2

CO CL8058Contig1 619 2 2 U
GGAGAAAAGTGATGTATATGCTTTTGGGGTATTCCTTTTGGAATTAGTAAGTGGGAGAGA
AGCATCAGAACCATCCCCTTCAAGCTCAACACAAACTCTTGTCGAATGGATGCAAAGCAT
AACGGATTACACTGAGATACCAGAAATGATTGATGAGAGACTAGGTGGTACATACACAGC
AGAAGGAGTGGAGGAGGTTATTACACTGACATTAACATGTCTTGATGTTTCAAGTGAGAA
TAGACCAACAATGAGTTATGTTGTGACAGAGCTGGAGAGGATATTGGATAAAGAAGTGAG
CTTAACAACAGTCATGGGTGAAGGTACTCCAACTGTTACTCTTGGAAGTCAGCTTTTTAA
ATGATCAAAAAGTATACATATATATATATTTGAGAGGAGTATGAAGGAGAAGAAGACTGA
TCAGCTGTTTCTGTTAAGTGTATAAAGAACAGCTGAGCTATTATTATTTGTTTGTTTGTT
TTTTCCCCTCCTTTTTTCTACTTCCTTTGGAGGTTATTTTCAGCAATTTTTTTTTAAACG
AGTGCAGAAAATATAACTTTGTAAAAAAACATTATTTATTGATGATATAAAAAGGAAGCA
AAGAGTGGAATGTTGTGTG


BQ
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CGT


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10 10 10 

AF RS1G053JQ C 1
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G

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BQ
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AF RS1GY07TF U 1
AF RS1GQ42TF U 1
BS 1 678 RS1GQ42TF

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TCATTACAAACAAAGCTGAGGATGGCTATACTCCGGCTACTAAGGGCAATAACTCAGGAG
CTTTCGCGTTTGGAGTTAACGGTGTCGTTTCTTCGTGTTTGTTGGGGGAACTGAAAAAGG
AGAAACTGAAGGCGAAGGAAGAAGCGGAAGACCTTACTCAAGAAATGGCTGAACTAAGGT
ACAAGATGACATGTTTGCTCGACGAGGAA

QA 1 569 1 569
DS 

RD RS1GQ42TF 678 0 0
GGGGTGGAGAGAGTATTGGTCTGATGAAAGGAACAAAGCCGAACTCGATGTCGAGGAGAT
GAAGATCGTCTGGGTTCTCGCCACGCTTTTGAGTTTCCGATCGAATCGTCCGCCTCGTCG
CCTCCGGTCCGAGGAAGAAGCAGGAGTGATTGAGTATAATACTTTGTTAAACTCACTAAA
GACTCGACGAGATTCTTTGGGTTCAAAGCTGAGTGAGCTATTGGAAGCTAAGGTTTGTGT
CACGAGAAACTCCTTGACCAGTCTCTCTCTCTATCTTTCTTTTTGTTCTGCAGAGCAACG
TAAGCTACTTAAACCATCCTTCGCCACCTATCTTTGTTGATAATTGGATTGTGGTCATCC
TCATTACAAACAAAGCTGAGGATGGCTATACTCCGGCTACTAAGGGCAATAACTCAGGAG
CTTTCGCGTTTGGAGTTAACGGTGTCGTTTCTTCGTGTTTGTTGGGGGAACTGAAAAAGG
AGAAACTGAAGGCGAAGGAAGAAGCGGAAGACCTTACTCAAGAAATGGCTGAACTAAGGT
ACAAGATGACATGTTTGCTCGACGAGGAACGCAAACGCCGTGTGTGCATAGAGCAAGCGT
CATTACAGAGAATTGCAGAACTAGAAGCACAGGCATATGCAATATTTTGGCCTTGTTTCC
TTTTTTTCTTTTTTAACT

QA 1 678 1 678
DS 



AS 1 2

CO CL8061Contig1 790 2 6 U
GGCTGCGTGACCTAGTTTTCAATTACCGCCGTTTCTCACTAAGAAGACGTAGCTATGGTG
CACGTTTGCTACTACCGCAACTATGGGAAGACGTTCAAGGGCCCGCGACGTCCTTTCGAG
AAGGAGCGTCTGGACTCGGAGCTGAAGCTGGTCGGCGAGTACGGTCTACGCAACAAGCGT
GAGCTCTGGAGAGTCCAGTACTCGCTGAGCCGGATCCGTAACGCCGCCAGGGATCTCCTG
ACCCTCGACGAGAAGAACCCCAAGAGGATCTTCGAAGGCGAGGCGCTTCTGAGGAAGATG
AATCGCTACGGACTTCTCGACGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCGCTTACC
GTGGAGAACTTTCTCGAGCGTCGTCTTCAGACCATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAG
TCGATCCATCACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAATTG
GTGAACATTCCATCGTTCATGGTGAGACTTGACTCTCAGAAACACATCGACTTTGCTCTA
ACCAGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCAGGAAGAGTAAAGAGAAGGAATGAGAAGTCTGCC
TCCAAGAAAGCCTCAGGTGGCGATGCTGACGGTGATGATGAAGAGTAAATCTTTCTTTAC
CGGGGTTTTAGCTATGCGGTTTTGGCTATTTTGTACTTCGTTTGTTGAGGATTGTTTAAT
GCCTTCTTTTTATCTTTCTTAAAGAGTTTGCGAACGTTTTGCTTATTTACTACATTTGCC
TAAATCCAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DU20TF U 1
AF RS1DU20JQ C 129
BS 1 668 RS1DU20TF
BS 669 669 RS1DU20JQ
BS 670 691 RS1DU20TF
BS 692 692 RS1DU20JQ
BS 693 706 RS1DU20TF
BS 707 790 RS1DU20JQ

RD RS1DU20TF 706 0 0
GGCTGCGTGACCTAGTTTTCAATTACCGCCGTTTCTCACTAAGAAGACGTAGCTATGGTG
CACGTTTGCTACTACCGCAACTATGGGAAGACGTTCAAGGGCCCGCGACGTCCTTTCGAG
AAGGAGCGTCTGGACTCGGAGCTGAAGCTGGTCGGCGAGTACGGTCTACGCAACAAGCGT
GAGCTCTGGAGAGTCCAGTACTCGCTGAGCCGGATCCGTAACGCCGCCAGGGATCTCCTG
ACCCTCGACGAGAAGAACCCCAAGAGGATCTTCGAAGGCGAGGCGCTTCTGAGGAAGATG
AATCGCTACGGACTTCTCGACGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCGCTTACC
GTGGAGAACTTTCTCGAGCGTCGTCTTCAGACCATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAG
TCGATCCATCACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAATTG
GTGAACATTCCATCGTTCATGGTGAGACTTGACTCTCAGAAACACATCGACTTTGCTCTA
ACCAGTCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCAGGAAGAGTAAAGAGAAGGAATGAGAAGTCTGCC
TCCAAGAAAGCCTCAGGTGGCGATGCTGACGGTGATGATGAAGAGTAAATCTTTCTTTAC
CGGGGTTT*AGCTATGCGGTTTTGGCTATTT*GTACTTCGTTTGTT

QA 1 706 1 706
DS 

RD RS1DU20JQ 662 0 0
TCTGGACTCGGAGCTGAAGCTGGTCGGCGAGTACGGTCTACGCAACAAGCGTGAGCTCTG
GAGAGTCCAGTACTCGCTGAGCCGGATCCGTAACGCCGCCAGGGATCTCCTGACCCTCGA
CGAGAAGAACCCCAAGAGGATCTTCGAAGGCGAGGCGCTTCTGAGGAAGATGAATCGCTA
CGGACTTCTCGACGAGAGCCAGAACAAGCTCGATTACGTCTTGGCGCTTACCGTGGAGAA
CTTTCTCGAGCGTCGTCTTCAGACCATTGTGTTCAAGTCTGGTATGGCTAAGTCGATCCA
TCACTCCCGTGTCCTCATCAGGCAGAGGCATATCAGGGTTGGAAAGCAATTGGTGAACAT
TCCATCGTTCATGGTGAGACTTGACTCTCAGAAACACATCGACTTTGCTCTAACCAGTCC
CTTCGGTGGTGGCCGTCCAGGAAGAGTAAAGAGAAGGAATGAGAAGTCTGCCTCCAAGAA
AGCCTCAGGTGGCGATGCTGACGGTGATGATGAAGAGTAAATCTTTCTTTACCGGGGTTT
TAGCTATGCGGTTTTGGCTATTTTGTACTTCGTTTGTTGAGGATTGTTTAATGCCTTCTT
TTTATCTTTCTTAAAGAGTTTGCGAACGTTTTGCTTATTTACTACATTTGCCTAAATCCA
GA

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

CO CL8062Contig1 698 2 2 U
GGCTCGCTCCGATACCATTTTCGAATCGAGAAGGAACCCATACCCTCTAGAGCCTCTATC
TCTCTCTCCCAGAAACCCTAAACATGGCCGAGGGACTCGTTCTGAAAGGCACTCGGGTTA
CCTCAACACTGTTGCTGTGTCGCCTGATGGTTCGCTGTGCGCGAGTGGTGGGAAAGATGG
TGTGATCTTGTTGTGGGATTTGGCTGAGGGGAAGAAGCTTTACTCGTTTGAGGGTGGGTC
AATTATTCACTCGCTTTGCTTTAGTCCGAATAGGTACTGGCTGTGTGCTGCGACTGAGAG
CAGTATTAAGATCTGGGATCTTGAGAGCAAGACCGTTGTTGATGAGTTGAAGGTTGACCT
TAAGGCGGAAGCGGAGAAGGATGGTGGTGGTGTCGGAACTGGTAACCAGAAGAAGGTGAA
CTACTGCACAAGCTTGAACTGGAGTGCAGATGGAAGTACACTGTTCAGTGGTTACACTGA
TGGAGTTGTCAGGGTCTGGGGTATTGGTCGTTACTAGAGAGACCTATGAAAAGAAGGTGG
ATGTTACCAAATCTCCTGTCGTGTTTTTGAAGTTCTCTTTTGCATTAGCCCCCTCCAAGA
ACCTCTATTTTTGTTTAATTCCAGAAAAGAAAACTAAGTCAGAAATGTTTACCCTTTAAT
TATCATTCATAATGCCAAATGTCTGGATTTTTCGTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DD89TF U 1
AF RS1DD89JQ C 100
BS 1 669 RS1DD89TF
BS 670 698 RS1DD89JQ

RD RS1DD89TF 669 0 0
GGCTCGCTCCGATACCATTTTCGAATCGAGAAGGAACCCATACCCTCTAGAGCCTCTATC
TCTCTCTCCCAGAAACCCTAAACATGGCCGAGGGACTCGTTCTGAAAGGCACTCGGGTTA
CCTCAACACTGTTGCTGTGTCGCCTGATGGTTCGCTGTGCGCGAGTGGTGGGAAAGATGG
TGTGATCTTGTTGTGGGATTTGGCTGAGGGGAAGAAGCTTTACTCGTTTGAGGGTGGGTC
AATTATTCACTCGCTTTGCTTTAGTCCGAATAGGTACTGGCTGTGTGCTGCGACTGAGAG
CAGTATTAAGATCTGGGATCTTGAGAGCAAGACCGTTGTTGATGAGTTGAAGGTTGACCT
TAAGGCGGAAGCGGAGAAGGATGGTGGTGGTGTCGGAACTGGTAACCAGAAGAAGGTGAA
CTACTGCACAAGCTTGAACTGGAGTGCAGATGGAAGTACACTGTTCAGTGGTTACACTGA
TGGAGTTGTCAGGGTCTGGGGTATTGGTCGTTACTAGAGAGACCTATGAAAAGAAGGTGG
ATGTTACCAAATCTCCTGTCGTGTTTTTGAAGTTCTCTTTTGCATTAGCCCCCTCCAAGA
ACCTCTATTTTTGTTTAATTCCAGAAAAGAAAACTAAGTCAGAAATGTTTACCCTTTAAT
TATCATTCA

QA 1 669 1 669
DS 

RD RS1DD89JQ 599 0 0
TTCTGAAAGGCACTCGGGTTACCTCAACACTGTTGCTGTGTCGCCTGATGGTTCGCTGTG
CGCGAGTGGTGGGAAAGATGGTGTGATCTTGTTGTGGGATTTGGCTGAGGGGAAGAAGCT
TTACTCGTTTGAGGGTGGGTCAATTATTCACTCGCTTTGCTTTAGTCCGAATAGGTACTG
GCTGTGTGCTGCGACTGAGAGCAGTATTAAGATCTGGGATCTTGAGAGCAAGACCGTTGT
TGATGAGTTGAAGGTTGACCTTAAGGCGGAAGCGGAGAAGGATGGTGGTGGTGTCGGAAC
TGGTAACCAGAAGAAGGTGAACTACTGCACAAGCTTGAACTGGAGTGCAGATGGAAGTAC
ACTGTTCAGTGGTTACACTGATGGAGTTGTCAGGGTCTGGGGTATTGGTCGTTACTAGAG
AGACCTATGAAAAGAAGGTGGATGTTACCAAATCTCCTGTCGTGTTTTTGAAGTTCTCTT
TTGCATTAGCCCCCTCCAAGAACCTCTATTTTTGTTTAATTCCAGAAAAGAAAACTAAGT
CAGAAATGTTTACCCTTTAATTATCATTCATAATGCCAAATGTCTGGATTTTTCGTTGC

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 2

CO CL8063Contig1 570 2 1 U
GGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAGAGAGAAGAAATGGCTGCTTCAGTGATGCTTTC
ATCGGTGATGTTGAAACCGGCGGGTTTCTCGGTGGAGAAGATGTCGGCGAGAGGATTACC
GTCGCCCGCAAGAGCTCCTTCCTCCTTCAAAATCGTCGCCAGTGGCGTTAAGAAGATCAA
GACCGACAAGCCCTTTGGAGTTAACGGCAGCATGGACTTGAGGGACGGCGTCGACGCCTC
CGGCAGAAAGGGCAAGGGTTATGGTGTTTACAAGTTTGTTGACAAGTATGGAGCCAACGT
TGATGGATACAGTCCTATCTACAACGAGGAGGAGTGGTCAGCGAGTGGTGATGTGTACAA
GGGAGGAGTCACCGGATTGGCTATTTGGGCAGTGACGCTCGCCGGAATCCTAGCCGGAGG
AGCTCTTCTTGTGTACAACACAAGTGCTTTGGCTCAGTAAATCTTTTAAAAGACATGTGT
AACTCATGTTTCTTTCTATGTTTGTGTTCTTTTCTCTGTAATGCTCAGAACATGCTTTGA
ACTTTATAAAAGAACTCTAGTATTTGTGCC


BQ
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DS 



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BQ
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AF RS1EE11TF U 1
AF RS1EE11JQ C 645
BS 1 757 RS1EE11TF
BS 758 1362 RS1EE11JQ

RD RS1EE11TF 757 0 0
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ATGATGCTCGTCTCTTGGGCTGTTGGCGTCGCTGAGACTCCCAAAACTGATTTTGATTTC
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AGCATGTCAAAGGTTGCGGTTTCCTTCACACACATCATCAAGAGTGGTGAGCCAGCGTTC
AGCGTTCTTGTCTCCAGGTTCCTTTTGGGTGAAACGTTCCCTGCTTCGGTTTACCTCTCC
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DS 

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CACTCCTGTCCAGCCCGTTAACGCTCTCGGAGCTGCCATTGCTATCCTCGGCACCTTCTT
GTATTCCCAGGCAAAGCTTTGATGGGCAATATATGGGAGTGCTCCAGTCCGATGCTGAGC
TCGTGATTTCGGTTAAAATCCGGGGGAAAAGAGCTTCACGTAGATTTTTTTTCCTTAATA
ATAATGAGATTGGAGACGACAATGTTAGTGTGACAGGCAGTTTAAAAAAAAAATTGAGCT
TTTTGGGATTTAAAGTGTTTGAATTTGGGGGAAAATTAGAAAGATTACCTCTTTGTAACT
AAAGTGGGACATACAAATTTCCCCTATAGTCTCTTTTCAAATATGAGAGAACTATTTC

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

CO CL8065Contig1 815 2 2 U
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AAAAAAACAAACACCAATATCAATATCAATATCGCAAATTCAAACACCCAAAAAACTTGG
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AACCAAGAACCAAGAACCAAGAACCAAGAACCAAGAAACAAGAAACAAGAAACAAGAATC
AAAATGGAGGAAGCAGGGCGTAAAGGAGATCCGTTTCCGGGTTTTGAGATGAGTGTTCAT
AACGACGACTGCGTTTTCCGGCGATCTCTAAGCTGTCGGCTGCAGAGACGAGCTCCATGT
CCTCTCTTATTACCACCAAGACCTCCTCCTTCTAAGGAAGCTCCTCCTTCTGCGACCGGC
GTCTCCACGTCTGCGTTATGTCAAAACAGCACAGATCCAATCCCACTATTGTCCCCACTC
GTCCCTACTTCAGTGCTTCAACCTAATCCAACCACCACCTCTCGCTGACTCTTGCTCTTT
CCAATCTCTTAGGCTTTATTTTATTTCTTGCAATGACAATGTTCTTGGAATCAAGTCATC
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TCTCATCGTTTGTCTCTATTCGGATTTACATTTTCACAAAGGCGCTGAGGATCTCGTCAT
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BQ
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DS 



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BQ
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QA 1 569 1 569
DS 



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AF RS1C704JQ C 1
AF RS1C704TF U 1
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QA 1 538 1 538
DS 



AS 1 2

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AF RS1CF69TF U 1
AF RS1CF69JQ C 262
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ACCACAGAACTTATCTCGGGAGTCCCCATTGATAAAGTAGCCTTGTTAGATCAAGAAACA
CGAGATTACGTTGGGAGGAAGATGCTTGAACTCACATTGAAAGAACTCTTTGTCTTCCGC
TTCATGCAGACAGATCCAAACTGGGGAAATTTCTTATACGATGAACCCACAAAAACAATC
AATCTTATCGATTTCGGAGCAGCTCGTGATTACCCCAAGAAGTTCGTCGATGACTATCTT
CGAATGGTGATGGCTTGTGCTGATAAAGACAGTAAAGGAGTGATTGAAATGTCGAGGAGA
CTCGGGTTCTTAACCGGAGACTAACCAGATGTGATGCTTGATGCTCACGTCCAAGCTGGT
TTCATTGTTGGTCTACCTTTTGCAGAACCTGGTGGCTATGCTTTCAGAACCAACAACATT
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QA 1 771 1 771
DS 

RD RS1CF69JQ 746 0 0
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TGGGGAAATTTCTTATACGATGAACCCACAAAAACAATCAATCTTATCGATTTCGGAGCA
GCTCGTGATTACCCCAAGAAGTTCGTCGATGACTATCTTCGAATGGTGATGGCTTGTGCT
GATAAAGACAGTAAAGGAGTGATTGAAATGTCGAGGAGACTCGGGTTCTTAACCGGAGAC
TAACCAGATGTGATGCTTGATGCTCACGTCCAAGCTGGTTTCATTGTTGGTCTACCTTTT
GCAGAACCTGGTGGCTATGCTTTCAGAACCAACAACATTACTTCTAGCGTCTCGAATTTA
GGAGCAACCATGTTGAAACATAGGCTCACACCACCGCCTGATGAAGCCTATAGTCTTCAC
CGTAAACTATCTGGTGCTTTCTTGGCTTGTATTAAGCTTGGAGCCACCGTTCGTTGCCGT
GAACTCTTGCTCCAAGTTTACGAGAAGTATCAGTTTGATGATGAGCCACAAGATCCAGTG
GTGGCTACGAGATCGGTTTCTTCGTAAACCACTCGTGCACACAAACTATGTTAGCCATTA
TTTTTCTCCCGTGTCTGGGAGTAGGAACACGATTCTTGTTTTAGTACACAATTGAGTTTA
ATTTTAGAATAAATTGGTAATATTTTTCACTAAGTTGAAATATTACAATACGCTGCAGTA
ATCAATCAACAAAGTTTTTTTTCGAC

QA 1 746 1 746
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1CW96JQ C 1
AF RS1CW96TF U 1
BS 1 505 RS1CW96TF

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AGACTTTCGGTGTTCTGTTCAGACAAGCAACTCTATGCTATGTTGGTGGACGACTTTAAC
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ACCGTCCTTGTAAGTTTATCCACTC

QA 1 505 1 505
DS 

RD RS1CW96TF 505 0 0
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GATGCTTCTCGAATGGTATCTCGTATGTCTGCTTTAACATCTCTTTCTTCAGTTCAGTTT
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AGCCCCAAAACCAGGAACCGGAGGAGCAGGAAGAAGTTCAATGGAACACAAACGAAACCG
AGACTTTCGGTGTTCTGTTCAGACAAGCAACTCTATGCTATGTTGGTGGACGACTTTAAC
AAGAAGTGTTTGTTCTGCGCTAGTACATTGCAGAAGTCTATTCGTGGTGATCCTCCATGT
ACCGTCCTTGTAAGTTTATCCACTC

QA 1 505 1 505
DS 



AS 1 2

CO CL8072Contig1 593 2 2 U
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GAAAGGATGGTTGCTCTGCGATTTCTGTAAAGGGCAGAAAACTAATGTTAAATCTGAGAA
CAATCGAATCTATCGTCGCTGTCCCACTTGTAGAGCTTGAAGCTGTGGTTATCAGGTGGG
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CGGCGAGGAGCTTTTGTTCTAAGCTCCTCTCCTTAATTCAGTGACCCTTTTTGAGTTTCA
TTTTCAGGTTCCTTTCCCTTTTTCCCATTTATTGTTAATATATATCTCCAATTTAGCCAT
TTGTATAAGCCAACATTTTGTAACTGTTAAAACATTAATTTGATAAGTGATTG


BQ
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AF RS1EP06TF U 1
AF RS1EP06JQ C 62
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BS 575 593 RS1EP06JQ

RD RS1EP06TF 574 0 0
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AGAACGCCAGCTCGAGCAGGGAGGCGAAGAAGGTGTGATAATGTGTGAGGAGTTTGAGGG
GAAAGGATGGTTGCTCTGCGATTTCTGTAAAGGGCAGAAAACTAATGTTAAATCTGAGAA
CAATCGAATCTATCGTCGCTGTCCCACTTGTAGAGCTTGAAGCTGTGGTTATCAGGTGGG
GTATGTGTTGTGCAAAAGATGTAAAGTGTTCAAGTGCGTCACTTTTCCTAATCCAGAAGA
CGGCGAGGAGCTTTTGTTCTAAGCTCCTCTCCTTAATTCAGTGACCCTTTTTGAGTTTCA
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TTGTATAAGCCAACATTTTGTAACTGTTAAAACA

QA 1 574 1 574
DS 

RD RS1EP06JQ 532 0 0
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TGGCGTCGACATCACCGTTCTCTGTATAAGCCATTTCGATGTGCTCCACTTCAACAACAA
GAACGCCAGCTCGAGCAGGGAGGCGAAGAAGGTGTGATAATGTGTGAGGAGTTTGAGGGG
AAAGGATGGTTGCTTTGCGATTTCTGTAAAGGGCAGAAAACTAATGTTAAATTTGAGAAC
AATCGAATCTATCGTCGCTGTCCCACTTGTAGAGCTTGAAGCTGTGGTTATCAGGTGGGG
TATGTGTTGTGCAAAAGATGTAAAGTGTTCAAGTGCGTCACTTTTCCTAATCCAGAAGAC
GGCGAGGAGCTTTTGTTTTAAGCTCCTCTCCTTAATTCAGTGACCCTTTTTGAGTTTCAT
TTTCAGGTTCCTTTCCCTTTTTCCCATTTATTGTTAATATATATCTCCAATTTAGCCATT
TGTATAAGCCAACATTTTGTAACTGTTAAAACATTAATTTGATAAGTGATTG

QA 1 532 1 532
DS 



AS 1 2

CO CL8073Contig1 502 2 1 U
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TATGGCTTAACCATTACCATAGTTTTGATCGTTTCTCTCTCTATGGTTGGAGCTTGGATG
TTCATGTCTTCATGGTCTGCCCCAACTGAGACTCTTCACTTTTCTTCAAGCCATACTACT
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AAGGAGTCCAGCACTGGAAGTGGGGCTTGGTCTACTCAACTAGTCGAATCGCAGAACGAG
AAGAAATCACAAGTGTCCTCCT


BQ
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AF RS1D069JQ C 1
AF RS1D069TF U 1
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QA 1 502 1 502
DS 

RD RS1D069TF 502 0 0
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QA 1 502 1 502
DS 



AS 1 2

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BQ
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BS 652 938 RS1BR46JQ

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TCTCCACCTTCCCTTATTGACGGGTTAGAGTTCATCTTCTTTCTCTTGCCGGTTCGTGCC
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TTAGGTTTGGCTGAGGTTTGGAATGTTGGTATTTTCCTTCGCTCCTCCAGCCTGTTGAAG
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TACCTTCCCGGTTTGTCTGCTTCAGCCGGTTTCAGGTTTGGAGGTTGCGAGTTCTGAAAT
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TGTTGACTTCTCTTGTGGCTTCGCCGGTTTACTTCTGTAGCTGGGATGAAG
TTAAGC

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DS 

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TAATTTGTTCTCTCTCAGAGGTGGTCGGGTCTGTGTTGACTTCTCTTGTGGCTTCGCCGG
TTTACTTCTGTAGCTGGGATGAAGGTTAAGCAAGGGACTCTTGTCTTCGTTGGTGGGTTA
CTTTTGTGACATCTGCTGTGAGAGTTGCTTATGTGTTGAAGCTGTCTGCTCCCTTAGACT
TCAGTCTTCTAGTCTTTGGTGCTGTTTTAAAGATGATGTTTCTCTAGCCAAGTGTTTGTT
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TTCTGTTTCTGCCTGCTTAGTGTCTGTATTCTTCTGTGTTCATCTTGGTTTGTTAATGAA
ATCTACCGAGG

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 2

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TACACGGACGGCTCTACGAGAACAAGGTTGTCAAAGCGGAATACGTTTCTAAAGAAGTTT
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AF RS1DS88TF U 1
AF RS1DS88JQ C 261
BS 1 639 RS1DS88TF
BS 640 640 RS1DS88JQ
BS 641 681 RS1DS88TF
BS 682 1014 RS1DS88JQ

RD RS1DS88TF 692 0 0
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GGGTGACAACAAGTTATGTGAACCGTTATCTGTTACTGCGCTTGAGACGATCACTCAAGC
AAATGAAGATCACGACTCCACTGAACAAGGAAATTGTGAAAAGCTTTTCGGGGTAAGTGA
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CGAGATGGGATAGTGGCGACA
GATGGAGAGAC

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DS 

RD RS1DS88JQ 754 0 0
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ATGTAGATAATGGAGACGTTGTCAGATCAGACAGTTCGACGGGTGACAACAAGTTATGTG
AACCGTTATCTGTTACTGCGCTTGAGACGATCACTCAAGCAAATGAAGATCACGACTCCA
CTGAACAAGGAAATTGTGAAAAGCTTTTCGGGGTAAGTGATTGTGACTCCGCAAGTAGGA
TCAACTCGTGCTCAAGACGACGCAGATATTCCACAAGAAGAAGTAGGATCAGCCCGTACT
CAAGAGGAGCCAGAGATTCCGCAAGAAGAAGTAGGATCAGCCCTTGCACAGGATGAGCCA
GAGAATCCGCAAGAAGTAGGATCAGCCCGTGCTGTCAAGACGAGATGGGATAGTGGCGAC
AAGATGGAGGAAGAACAAGACCCCAAGGATGTGTTTGAGCCAGGCTGTATCTTCATAGAG
TACGGAAGACCAGAAGCCACACGCGCTGCAGCTCATTCGTTACACGGACGGCTCTACGAG
AACAAGGTTGTCAAAGCGGAATACGTTTCTAAAGAAGTTTACAAAATCAGGTTCCCAAGT
GGGTAAAGAAAGAGTCCTGTTTCACTTCTCCCAACAAAAGAAGTGACTAGGGGTTATTGG
ATTGGGAAGTTTAATGGAACTGAATGTAATTTAAATCTAAAGTTCCAGTGTCATTGGATT
AAGATTTGATTAAAATACATCAAGATCAACTGTT

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

CO CL8076Contig1 758 2 3 U
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GGCTACTTTCTCTGTGGCCAAACCTTCTCTTCAGGGCTTCTCTGAGTTCTCAGGACTTCG
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TGTCAGTTTCCAAACTTCTGCAATGGGAAGCAATGGTGGATACAGGAAAGGAGTGACCGA
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TTGGCATGGTCGCAAAGACTCTCCTCTTGATGTCATTGCCATCAACGACACTGGTGGTGT
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CAAACCCTCCGGAGACTCTGCTCTCTCTGTTGATGGAAAGATCATCAAGATTGTATCTGA
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BQ
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AF RS1GI93TF U 1
AF RS1EI15TF U 1
BS 1 270 RS1EI15TF
BS 271 271 RS1GI93TF
BS 272 758 RS1EI15TF

RD RS1GI93TF 509 0 0
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TGTCAGTTTCCAAACTTCTGCAATGGGAAGCAATGGTGGATACAGGAAAGGAGTGACCGA
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CAAACCCTCCGGAGACTCTGCTCTCTCTGTTGATGGAAAGATCATCAAGATTGTATCTGA
TCGTAACCCATCTAATCTCCCCTGGGGG
A

QA 1 508 1 508
DS 

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GGCTACTTTCTCTGTGGCCAAACCTTCTCTTCAGGGCTTCTCTGAGTTCTCAGGACTTCG
AAACTCCTCCTCTGCTCTTCCCTTCGCCAAGAAATCTTCTTCCGATGAGTTTGTTTCCTT
TGTCAGTTTCCAAACTTCTGCAATGGGAAGCAATGGTGGATACAGGAAAGGAGTGACCGA
GGCCAAGCTAAAGGTAGCCATCAATGGGTTCGGTAGGATTGGTAGGAACTTCTTGAGGTG
TTGGCATGGTCGCAAAGACTCTCCTCTTGATGTCATTGCCATCAACGACACTGGTGGTGT
CAAACAAGCAACCCATCTCCTCAAATACGACTCTACTCTTGGAATCTTTGACGCTGACGT
CAAACCCTCCGGAGACTCTGCTCTCTCTGTTGATGGAAAGATCATCAAGATTGTATCTGA
TCGTAACCCATCTAATCTCCCCTGGGGGGAACTAGGCATTGACCTTGTCATCGAAGGAAC
CGGAGTATTTGTGGACAGAGAAGGTGCTGGAAAACACATTCAAGCTGGAGCCAAGAAGGT
CTTGATTACTGCTCCTGGTAAAGGAGACATCCCAACATATGTTGTTGGTGTCAATGCTGA
ACTTTACAGCCATGAAGATACCATCATCAGCAACGCCTCTTGTACTACTAACTGTCTCGC
TCCATTCGTCAAGTTTCTTGACAGAAGTTCGGGATCAT

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL8077Contig1 619 2 2 U
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TCTTACATCACCTCTACTCAGCTCCTTCCTCTCCATCGTCGTCCCAACATCGCCATCATA
GATGTCAGGGATGAAGAGAGGAACTATGATGGACATATAGCTGGTTCTCTACACTATGCG
AGTGGCTCTTTTGATGATAGGATCTCTCATCTTGTTCAACATGTCAAGGATAAAGACACA
CTTGTCTTCCATTGTGCTCTCAGCCAGGTTCGTGGCCCAACATGTGCAAGAAGACTCGTG
AATTATCTTGACGAGAAGAAACAAGAAACTGGAATAAAAAACATAATGATCTTGGAACGC
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CATTATTGTCATGTGTATCAAGAGATATGATGATTACTACTATTCATAAATAATTTCCTA
GGCCAATATGACTGGTTACCTCTCTCTGTTGACAAATCACAATATTAAAGAGCCCTTTCG
ATATGTATTGGGAGTCGCC


BQ
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AF RS1ES51TF U 1
AF RS1ES51JQ C 102
BS 1 605 RS1ES51TF
BS 606 619 RS1ES51JQ

RD RS1ES51TF 605 0 0
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TCTTACATCACCTCTACTCAGCTCCTTCCTCTCCATCGTCGTCCCAACATCGCCATCATA
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AGTGGCTCTTTTGATGATAGGATCTCTCATCTTGTTCAACATGTCAAGGATAAAGACACA
CTTGTCTTCCATTGTGCTCTCAGCCAGGTTCGTGGCCCAACATGTGCAAGAAGACTCGTG
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CATTATTGTCATGTGTATCAAGAGATATGATGATTACTACTATTCATAAATAATTTCCTA
GGCCAATATGACTGGTTACCTCTCTCTGTTGACAAATCACAATATTAAAGAGCCCTTTCG
ATATG

QA 1 605 1 605
DS 

RD RS1ES51JQ 518 0 0
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TGTCAAGGATAAAGACACACTTGTCTTCCATTGTGCTTTCAGCCAGGTTCGTGGCCCAAC
ATGTGCAAGAAGACTCGTGAATTATCTTGACGAGAAGAAACAAGAAACTGGAATAAAAAA
CATAATGATCTTGGAACGCGGCTTCAATGGCTGGGAAGCTGCTGGAAAACCGGTTTGCCG
CTGCGCAGACGTTCCCTGCAAAGGCGACTGCACCTAAGAAGGCCCTACTGAACCATTCGA
AACCTTAAATTGATCTCCACATTATTGTCATGTGTATCAAGAGATATGATGATTACTACT
ATTCATAAATAATTTCCTAGGCCAATATGACTGGTTACCTCTCTCTGTTGACAAATCACA
ATATTAAAGAGCCCTTTCGATATGTATTGGGAGTCGCC

QA 1 518 1 518
DS 



AS 1 2

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AAGGAGTCAGGTGGTTTGATTCAATGACTGTTGATTACGGGATCGTTCCCGACCAAGAGC
ATTACGCATGTCTGATAGATCTCCTAGGTCGTGCCGGTTGTTTTAAAGAGTTGATGAGCA
GGATGGAGAAAATGCCTTTTAAACCGGACGAGCATATCTGGAATGCTGTCCTAGGGGTAT
CCCGGATCCATGGAAACGTAGAATTGGGAAAGAAAGCAGCAGAAGAGCTAATCAGACTGG
ACCCTGAGTCGTCTGCGCCATGCATATTACTGTCAAGCATTCACGCAGATCGTGGAAACT
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AAGAAGGAGAAGCTTCAAGAACATGATCCTCTCTAACAAAAAGGGAGAATTGTACACTGT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BX09TF U 1
AF RS1BX09JQ C 375
BS 1 674 RS1BX09TF
BS 675 811 RS1BX09JQ

RD RS1BX09TF 674 0 0
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AAGAAGGAGAAGCTTCAAGAACATGATCCTCTCTAACAAAAAGGGAGAATTGTACACTGT
CAAAGCCTGCAAAA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1BX09JQ 437 0 0
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CTAGCAGAGCTAACAACTACAGTGTTCTTTTTTTTCTGTATTCCTCCAGATTTATTGTTT
AATAAAGAAGCAAATGC

QA 1 437 1 437
DS 



AS 1 2

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TAATGTGGTTTGCTCAAGGCC


BQ
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AF RS1EN90JQ C 1
AF RS1EN90TF U 1
BS 1 501 RS1EN90TF

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TGAAGCTTGGGATGGTAAAGGCGCGTTCCATAAGTAGTTTGCTTGGACAAACCAGCACAA
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CTTAATTATGATAAGTAAGTCTGTCGATCAGATATGTATATGTTTAGGTACATGATGACT
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TAATGTGGTTTGCTCAAGGCC

QA 1 501 1 501
DS 

RD RS1EN90TF 501 0 0
AAGAAGAAGAAGCTAGTAAAGGGAACAAGAAGAAGAAGAAAGGGATGAAAAAGAGCAGTA
GTGTGTTAGAGGAAGGATCAAGGTGCAGCCGCGTTAACGGTAGAGGATGGAGATGTTGTC
AGCAAACTCTTTATGGCTATTCTCTCTGTGAGCATCATCTTGGTAAAGGAAGGGTGAGGA
GCACGAACAAGAGTTCTGGCGGCCAGAAAAAGGAAGTGAAGAATAAGAAGAAGAAGAGAG
TGAAGCTTGGGATGGTAAAGGCGCGTTCCATAAGTAGTTTGCTTGGACAAACCAGCACAA
GCAGTGGAGTTGCTAATGTTGAGAGTGAGATAAGTGCACCTGCTTATGATCAGTTTAATG
CTTAATTATGATAAGTAAGTCTGTCGATCAGATATGTATATGTTTAGGTACATGATGACT
AGCTCTATGTATCAGGTGTGTGAACTGGTGAACATTGTGTGTGTAGATTGATCGAGATCT
TAATGTGGTTTGCTCAAGGCC

QA 1 501 1 501
DS 



AS 1 2

CO CL8080Contig1 998 2 2 U
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TGGAGCAGAGAGACTGCCGAGGAACAGGAGGACAGCTGGTCACTCCGGTAGCGGCGATTC
AGACTGAGTCCGAAAGGACTATTTCTATCCCTTGTCTTATCCATCTGAACTATTTATTTT
TCATGTTATTTGCTTCTGTTTGGTTTGTTTTAGCTTCCTCTGATTTATTTTCACAACCAG
GGATGGTGTGAACTAAGTCTGGGGGAGCGATTGTACTATATTCGCTTGAGTGCTTTTTGA
GTCAATCCTTGTGTCATTTTTATGTTTTTAGGATCGAGTCAGTCAAAACTATTGTGGGAA
TCAGGACCTTATTTTGTGATGCTCTTTAACCACCTCGTGCTTTAACCTTCTTATTCAGTA
ACCTTAGCAGTGATGAAAGACCCACACATGGACCTGGAACACCCTGACTTATCTCATTTG
ACACTCCAGAAGTTCTATACCGATCAGGTTACACTGGGCAGACTTAACTCCACTTTATCC
GAACCTAATCTGGACTTTAATTCTTGTTGTCATGGGCACTAGATCAGGGTAGAATGAGAA
CTACACTCAGGACTTCTTATCCGATTTTTATCCCTCTTGATGTTCCTGAGTGGCTAGCTC
ACCTTTAGCTAGTTCCCACCTTGAACCCTGACCTTTAATTCCACCCTCATGCATTTGCTT
TTCTAGTACTTTATGTGCAGATATGTGCAAAAAGGTCGGAGAGGAAAGGATCGACGCAGT
TTTTACTCATCAATGCTCACACAGTAGAAGCAGGCAGAACAATCGGAGTGCTTGTTCCGA
CACGAAAGGGAACAACCGAGGTGCCTGTTTCGATACCATGGAGAACAACGAGAAGTAAGT
GGCTAGAACAGACCAGAATGAATCACCAGTGGCATCATGTACATCACTTGTTACCTCCTT
GCTAGTCACCCCAGCATTTTGTAATTCAATACATATAT


BQ
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AF RS1C346TF U 1
AF RS1C346JQ C 230
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BS 748 998 RS1C346JQ

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TCATGTTATTTGCTTCTGTTTGGTTTGTTTTAGCTTCCTCTGATTTATTTTCACAACCAG
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TTCTAGTACTTTATGTGCAGATATGTG

QA 1 747 1 747
DS 

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TATTGTGGGAATCAGGACCTTATTTTGTGATGCTCTTTAACCACCTCGTGCTTTAACCTT
CTTATTCAGTAACCTTAGCAGTGATGAAAGACCCACACATGGACCTGGAACACCCTGACT
TATTTCATTTGACACTCCAGAAGTTCTATACCGATCAGGTTACACTGGGCAGACTTAACT
CCACTTTATCCGAACCTAATTTGGACTTTAATTCTTGTTGTCATGGGCACTAGATCAGGG
TAGAATGAGAACTACACTCAGGACTTTTTATCCGATTTTTATCCCTCTTGATGTTCCTGA
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GTTACCTCCTTGCTAGTCACCCCAGCATTTTGTAATTCAATACATATAT

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1AZ78TF U 1
AF RS1AZ78JQ C 173
BS 1 616 RS1AZ78TF
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RD RS1AZ78TF 689 0 0
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CCTTCCACTTCATTTAAGGGAAATTTAAGCGTCTTATTAGGAGCAAACCCACGTCAGATT
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TCGTCGTCTTCTCCTTCTTCTTCTCCAGCAGCTTCAGAGAGGTTCCGTCTGGATAATTTG
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GAAACAGCTGGGTTTGAAGATGGAGATGAAGTGTCACTTGAGACGTTGAAGCTTAAGGGT
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CTAAGCGTGAAGCTCA*CTTCAAAGCTCGTGCATTCTCAACATCAGCCAAAGAGAAGCTT
GA*GCTTCAG*CTGTACACTCACAGTGCT

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1AZ78JQ 718 0 0
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AGAAGCTTGAAGCTTCAGGCTGTACACTCACAGTGCTCCCCGGAAGAAAGAAATGGGTGA
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AAGCAGCAGCTTCTTCTTCAGAACCAGCTACTTCTGCTTAAACTTTTCATTTTCAAGCTT
TTCAATGTTGTAAAGATTTTGTAAAACGGTAAAAATTATTATTGAACATTTTGTTTCT

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

CO CL8082Contig1 732 2 2 U
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GAACGAAAAGCTCTTTAGCCATTTTCTTGATTCTGAACATCCTTTTCTGCACAGCAATCT
CTGCCTTCGGTAACTGCGATTGCCCTTCTCCCAAGCCAAAACCTCACCCGTCCCATAAGC
CAAAACCTAATCCTAAACCCAAACCAACCCCAACTCCAACCCCTAGCCCTGTCACAGCCA
AATGCCCTAGAGACGCTCTTAAACTAGGAGTCTGTGCCAACGTACTCAGCGGTCTACTCA
ACATCACCCTTGGGAAGCCACCGGTGAAGCCATTTTGCAACCTTATCAAAGGACTTGCTG
ATCTTGAAGCCGCGGCTTGTCTTTGCACCGCGCTTAAGGCTAACATCCTTGGGATCAACC
TGAACATCCCTATCTCTCTCAGTCTGCTTCTCAATGTTTGTAGCAAAAAGGTTCCCCCTG
GTTTCCAATGCTAATCAAAATTATAATTAGACAACCAACACTTCATGTCAACATACATAT
CTTCTTGTTTGGATAGACAAGATAATATACGTAATATATATTCTGTAATATTTTCTATGT
GTTTATGTATGCGTGTATGTGATTCCTACAACTCTAAACTTCACATTTGTTTTTATTTTG
TTCTCTTACACAGTCACTGGGGTGTTGTTGTACTGGTTGTTGTTTGAATTAATAAATCAT
GTGTTTAATACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GF60TF U 1
AF RS1GF60JQ C 143
BS 1 644 RS1GF60TF
BS 645 732 RS1GF60JQ

RD RS1GF60TF 644 0 0
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GAACGAAAAGCTCTTTAGCCATTTTCTTGATTCTGAACATCCTTTTCTGCACAGCAATCT
CTGCCTTCGGTAACTGCGATTGCCCTTCTCCCAAGCCAAAACCTCACCCGTCCCATAAGC
CAAAACCTAATCCTAAACCCAAACCAACCCCAACTCCAACCCCTAGCCCTGTCACAGCCA
AATGCCCTAGAGACGCTCTTAAACTAGGAGTCTGTGCCAACGTACTCAGCGGTCTACTCA
ACATCACCCTTGGGAAGCCACCGGTGAAGCCATTTTGCAACCTTATCAAAGGACTTGCTG
ATCTTGAAGCCGCGGCTTGTCTTTGCACCGCGCTTAAGGCTAACATCCTTGGGATCAACC
TGAACATCCCTATCTCTCTCAGTCTGCTTCTCAATGTTTGTAGCAAAAAGGTTCCCCCTG
GTTTCCAATGCTAATCAAAATTATAATTAGACAACCAACACTTCATGTCAACATACATAT
CTTCTTGTTTGGATAGACAAGATAATATACGTAATATATATTCTGTAATATTTTCTATGT
GTTTATGTATGCGTGTATGTGATTCCTACAACTCTAAACTTCAC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1GF60JQ 590 0 0
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ACCAACCCCAACTCCAACCCCTAGCCCTGTCACAGCCAAATGCCCTAGAGACGCTCTTAA
ACTAGGAGTCTGTGCCAACGTACTCAGCGGTCTACTCAACATCACCCTTGGGAAGCCACC
GGTGAAGCCATTTTGCAACCTTATCAAAGGACTTGCTGATCTTGAAGCCGCGGCTTGTCT
TTGCACCGCGCTTAAGGCTAACATCCTTGGGATCAACCTGAACATCCCTATCTCTCTCAG
TCTGCTTCTCAATGTTTGTAGCAAAAAGGTTCCCCCTGGTTTCCAATGCTAATCAAAATT
ATAATTAGACAACCAACACTTCATGTCAACATACATATCTTCTTGTTTGGATAGACAAGA
TAATATACGTAATATATATTCTGTAATATTTTCTATGTGTTTATGTATGCGTGTATGTGA
TTCCTACAACTCTAAACTTCACATTTGTTTTTATTTTGTTCTCTTACACAGTCACTGGGG
TGTTGTTGTACTGGTTGTTGTTTGAATTAATAAATCATGTGTTTAATACG

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 2

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GACCGATGAAGAAGAACCCTGCTTACAAGGGCAAGTGGAGTGCGCCTATGATAGATAACC
CTGCTTACAAGGGAATCTGGAAGCCCAGAGACATCCCTAACCCTGACTACTTCGAGCTAG
ACAGACCTGATTACGAGCCCATTGCAGCCATCGGTATTGAGATCTGGACGATGCAAGACG
GTATCCTGTTTGACAACATTTTGATAGCCAAAGACGAGAAGGTCGCTGAGAGTTACAGAC
AGACGACGTGGAAGCCTAAGTTCGATGTTGAGAAAGAGAAACAACAGGCGGAAGAGAAGG
CTGCTGAATCTGCAGATGGTCTCAAGAGCTACCAGAAGGTTGTGTTCGATCTGTTGAACA
AGGTTGCGGACCTTTCTTTCCTAAGTGCATACAAGTCTAAGATCACGGAACTGATTGAGA
AAGCCGAGGAACAACCAAACTTAACCATTGGTGTCCTAGTCTCCATTGTCGTAGTATTCT
TCTCGCTCTTCATCAAACTCATCTTCGGTGGCAAAAAGGTGGCGCCGGCGGCAACTGTGG
AGAAGAAGAAGAAACCAGAAGTAGGAGAGAGTTCAAAGAGTGGAGATGAGTCAGAGAAGA
AGGAAGAAACCGCTGCTCCCCGCAAAAGGCAACCGAGACGTGATAATTAGAAGAAAAAAA
GTGTTTTAGAATGAGAAGCAAAGCTGTTTGAAAAGAAAGATTAAGATTTTTTTTCTTCTA
G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
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10 

AF RS1CP68TF U 1
AF RS1BO57TF U 360
BS 1 469 RS1CP68TF
BS 470 470 RS1BO57TF
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BS 577 658 RS1CP68TF
BS 659 781 RS1BO57TF

RD RS1CP68TF 658 0 0
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GACCGATGAAGAAGAACCCTGCTTACAAGGGCAAGTGGAGTGCGCCTATGATAGATAACC
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ACAGACCTGATTACGAGCCCATTGCAGCCATCGGTATTGAGATCTGGACGATGCAAGACG
GTATCCTGTTTGACAACATTTTGATAGCCAAAGACGAGAAGGTCGCTGAGAGTTACAGAC
AGACGACGTGGAAGCCTAAGTTCGATGTTGAGAAAGAGAAACAACAGGCGGAAGAGAAGG
CTGCTGAATCTGCAGATGGTCTCAAGAGCTACCAGAAGGTTGTGTTCGATCTGTTGAACA
AGGTTGCGGACCTTTCTTTCCTAAGTGCATACAAGTCTAAGATCACGGAGCTGATTGAGA
AAGCTGAGGAACAACCGAACTTAACCATTGGTGTCCTAGTCTCCATTGTCGTAGTATTCT
TCTCGCTCTTCATCAAACTTATCTTCGGTGGCAA**AGGTGGCGCCGGCGGCAACTGTGG
AGAAGAAGAAGAAACCAGAAGTAGGAGAGAGTTCAAAGAGTGGAGATGAGTCAGAGAA

QA 1 658 1 658
DS 

RD RS1BO57TF 422 0 0
GCTGCTAGCTCC
GCAGATGGTCTCAAGAGCTACCAGAAGGTTGTGTTCGATCTGTTGAACAAGGTTGCGGAC
CTTTCTTTCCTAAGTGCATACAAGTCTAAGATCACGGAACTGATTGAGAAAGCCGAGGAA
CAACCAAACTTAACCATTGGTGTCCTAGTCTCCGTTGTCGTAGTATTCTTCTCGCTCTTC
ATCAAGCTCATCTTCGGTGGCAAAAAGGTGGCGCCGGCGGCAACTGTGGAGAAGAAGAAG
AAACCAGAAGTAGGAGAGAGTTCAAAGAGTGGAGATGAGTCAGAGAAGAAGGAAGAAACC
GCTGCTCCCCGCAAAAGGCAACCGAGACGTGATAATTAGAAGAAAAAAAGTGTTTTAGAA
TGAGAAGCAAAGCTGTTTGAAAAGAAAGATTAAGATTTTTTTTCTTCTAG

QA 13 422 13 422
DS 



AS 1 2

CO CL8084Contig1 503 2 1 U
GCATGAAAAGGATCAAAGCCTCAAAGACAAGGATGATGCCATAGAGGTAAATTTCTTAAC
ATGCGAGATAAAGTTACGCTCAACTTGTGAAAGGAAGTTTATATATTATTATTTTTGGTA
GATGTTAGCAAAAAAGGTTGAAACATTAACAAAAGCAATGGAGGTTGAAGCAAAGAAGAT
GAGAAGGGAAGTAGCTGCAATGGAGAAAGAGGTTGCTGCTATGCGTGTGGATAAAGATCA
GGATAACAGAGCTAAAAGATCTTCAAACACCAAGAACTCATCCAACACTGCTCAGATTCT
TGCTGGAAGGTATATAGCAATGTTGAATGTCACTTTATCCATTACTACAATCAGTTATTT
CTACAAGAGCTATTGTCATTAATATTAAAAAATTAGACTGAAACTTGGTCTTCTTCTACA
GAGCTGCTGGACGAAGTGGGTTAACTAGGAGCACACAGTGAGATGAGTGAAATGATTGGT
TCTCGTGGGCTTATCAGTTTAAG


BQ
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AF RS1AU38JQ C 1
AF RS1AU38TF U 1
BS 1 503 RS1AU38TF

RD RS1AU38JQ 503 0 0
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ATGCGAGATAAAGTTACGCTCAACTTGTGAAAGGAAGTTTATATATTATTATTTTTGGTA
GATGTTAGCAAAAAAGGTTGAAACATTAACAAAAGCAATGGAGGTTGAAGCAAAGAAGAT
GAGAAGGGAAGTAGCTGCAATGGAGAAAGAGGTTGCTGCTATGCGTGTGGATAAAGATCA
GGATAACAGAGCTAAAAGATCTTCAAACACCAAGAACTCATCCAACACTGCTCAGATTCT
TGCTGGAAGGTATATAGCAATGTTGAATGTCACTTTATCCATTACTACAATCAGTTATTT
CTACAAGAGCTATTGTCATTAATATTAAAAAATTAGACTGAAACTTGGTCTTCTTCTACA
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TCTCGTGGGCTTATCAGTTTAAG

QA 1 503 1 503
DS 

RD RS1AU38TF 503 0 0
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ATGCGAGATAAAGTTACGCTCAACTTGTGAAAGGAAGTTTATATATTATTATTTTTGGTA
GATGTTAGCAAAAAAGGTTGAAACATTAACAAAAGCAATGGAGGTTGAAGCAAAGAAGAT
GAGAAGGGAAGTAGCTGCAATGGAGAAAGAGGTTGCTGCTATGCGTGTGGATAAAGATCA
GGATAACAGAGCTAAAAGATCTTCAAACACCAAGAACTCATCCAACACTGCTCAGATTCT
TGCTGGAAGGTATATAGCAATGTTGAATGTCACTTTATCCATTACTACAATCAGTTATTT
CTACAAGAGCTATTGTCATTAATATTAAAAAATTAGACTGAAACTTGGTCTTCTTCTACA
GAGCTGCTGGACGAAGTGGGTTAACTAGGAGCACACAGTGAGATGAGTGAAATGATTGGT
TCTCGTGGGCTTATCAGTTTAAG

QA 1 503 1 503
DS 



AS 1 2

CO CL8085Contig1 859 2 4 U
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TGAGGGGAATCATGGGGGAGGTAGTGCTACACATATACGATGTGACAAACAGTGGATCGG
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GCGGCATCTTCCACAGCGCCATTCAGGTATATGGAGATGATGAGTGGTCTTATGGGTTTT
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GTGAGAAAATCGTCCTTGGGAGGACTGATTGCACCATTTTCATGGTCGATCAGATCCTGC
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ATTTCTGTGATGTACTCTGTGATGTACTTGGCGTCCCAAAGCTCCCAGGTTGGGTGAATC
GCTTTGCCCATGCTGGTGACACGGCCTTGGAAGTTGCAGGAAACACAGCGATGAGGATAA
AGCAAGCCAAAACTGAACTAGTATCAGCTAGTAAAGTGGCATATCGCTTCCTTTCCAATG
TTACATCAAACGTAACCAACGGCTCCAATGGCTCTCAGCAACGACCTGGAGGGACCCTCA
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CTTCGAAACCCTCCTCAAGTACAGAGATAGAGAACAAAGATGAAGATGCAAATCAGCAGA
GAAAGATGAGCCGTGACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AC65TF U 1
AF RS1AC65JQ C 245
BS 1 700 RS1AC65TF
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BS 757 859 RS1AC65JQ

RD RS1AC65TF 756 0 0
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GCGGCATCTTCCACAGCGCCATTCAGGTATATGGAGATGATGAGTGGTCTTATGGGTTTT
GTGAACAAGGAACTGGCGTCTTCAGCTGTCCTAGCAGCAAGAACCCTATGTATACTTATC
GTGAGAAAATCGTCCTTGGGAGGACTGATTGCACCATTTTCATGGTCGATCAGATCCTGC
GTGAGCTCAGCAGGGAGTGGCCTGGACATTCGTATGATCTCTTGTCTAAAAACTGCAATC
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CCAATTCAGAAAATGGCAACGTGAGATTGCAAGGCA

QA 1 756 1 756
DS 

RD RS1AC65JQ 615 0 0
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CTGTGATGTACTCTGTGATGTACTTGGCGTCCCAAAGCTCCCAGGTTGGGTGAATCGCTT
TGCCCATGCTGGTGACACGGCCTTGGAAGTTGCAGGAAACACAGCGATGAGGATAAAGCA
AGCCAAAACTGAACTAGTATCAGCTAGTAAAGTGGCATATCGCTTCCTTTCCAATGTTAC
ATCAAACGTAACCAACGGCTCCAATGGCTTTCAGCAACGACCTGGAGGGACCCTCACCAA
TTCAGAAAATGGCAACGTGAGATTGCAAGGCAGTTGGTTCAAAGGGTTACTCAACACTTC
GAAACCCTCCTCAAGTACAGAGATAGAGAACAAAGATGAAGATGCAAATCAGCAGAGAAA
GATGAGCCGTGACTC

QA 1 615 1 615
DS 



AS 1 2

CO CL8086Contig1 757 2 2 U
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GCTCCGTGGAGGACTGCGCTCGGATGATCGGCCCCGTGGATGCTGACGGCGATGGGAATG
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TCTAAAAAAAACTGGGAATAATAATTACTACTATGCTTTTTAGGTACCTTTTCTAAAATG
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TATTATGGTTGCTTTCTTCAAACATATCTGCTTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CI02TF U 1
AF RS1CI02JQ C 127
BS 1 579 RS1CI02TF
BS 580 757 RS1CI02JQ

RD RS1CI02TF 579 0 0
TTTTTCTCTCTCTAACTTTTACCTCTAACAGAAAAGAAAAAATGGCAAGCGCTCATCCCG
AAACCGCCAAACCCACGCCACCACCAGCACCGGTGGTTGACATGGCGAATCCCGAGGAGC
TCAAGAAGGTTTTCGACCAGTTCGACTCCAACGGCGACGGCAAGATCTCGGTGACCGAGC
TCGGAGGCGTCTTCAAGGCCATGGGGACTTCCTACACGGAGACGGAGCTCAACCGCGTCC
TGGAGGAGGTCGACACCGATCGCGACGGCTTCATCAACGTCGACGAGTTCTCCGCCCTCT
GCCGCTCCTCTTCCTCCGCTTCCGAGATCCGCGACGCCTTCGATCTGTACGACGAGGACA
GGAACGGGCTCATCTCCGCCGCCGAGCTCCACAAGGTGCTTAACCGCCTCGGGATGTCGT
GCTCCGTGGAGGACTGCGCTCGGATGATCGGCCCCGTGGATGCTGACGGCGATGGGAATG
TTAACTTCGAGGAGTTTCAGAAGATGATGACGTCGTCCTCCCTCGCTAACAACAGCAGCA
ACAACGGATCCGCGGCGGCGAACGGTGGTTCGGCCTAGG

QA 1 579 1 579
DS 

RD RS1CI02JQ 631 0 0
AGGTTTTCGACCAGTTCGACTCCAACGGCGACGGCAAGATCTCGGTGACCGAGCTCGGAG
GCGTCTTCAAGGCCATGGGGACTTCCTACACGGAGACGGAGCTCAACCGCGTCCTGGAGG
AGGTCGACACCGATCGCGACGGCTTCATCAACGTCGACGAGTTCTCCGCCCTCTGCCGCT
CCTCTTCCTCCGCTTCCGAGATCCGCGACGCCTTCGATCTGTACGACGAGGACAGGAACG
GGCTCATCTCCGCCGCCGAGCTCCACAAGGTGCTTAACCGCCTCGGGATGTCGTGCTCCG
TGGAGGACTGCGCTCGGATGATCGGCCCCGTGGATGCTGACGGCGATGGGAATGTTAACT
TCGAGGAGTTTCAGAAGATGATGACGTCGTCCTCCCTCGCTAACAACAGCAGCAACAACG
GATCCGCGGCGGCGAACGGTGGTTCGGCCTAGGGTTTTCTAGATTTGGATCCTCTCTAAA
AAAAACTGGGAATAATAATTACTACTATGCTTTTTAGGTACCTTTTCTAAAATGTGATAA
AAAAGAAAAGTCTAACTTCTATCCATCGTTGTTTGGTTATTCTTGTTAGATAATTATTAT
GGTTGCTTTCTTCAAACATATCTGCTTTTCT

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 2

CO CL8087Contig1 380 2 1 U
GGGAACTGTAAATCTCAAAATATGTACTGTCAGTCGAGCCAGATAGGGAAGCAGATGAAC
TTGACGTGTATAGCTAACGGGAGAACAGAGATGTATACGCTTGGTAGCGAGAACCAGTCT
AAGATTCAGCAAATGTGTTCCCAGCTATGCAGCTGATAGACCCACACCACTAAACATCTA
GTAATTGCTTTGTAGAGAGTAGGGAATTATCTTGGAAAGGGACAAAAGGGCGGTTCACTT
AATTTGATTATTCTTGTTGATCATATTATTGTCTGGTTCTACTTTTCTTTTTTCTTCATT
GCATATGTAAAGACCATTTTCAGATTATTTGAATTAGTAACAATGAAGCTGAGGGTAAAA
GACAACTCTCTTCGCGGTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CB84JQ C 1
AF RS1CB84TF U 1
BS 1 380 RS1CB84TF

RD RS1CB84JQ 380 0 0
GGGAACTGTAAATCTCAAAATATGTACTGTCAGTCGAGCCAGATAGGGAAGCAGATGAAC
TTGACGTGTATAGCTAACGGGAGAACAGAGATGTATACGCTTGGTAGCGAGAACCAGTCT
AAGATTCAGCAAATGTGTTCCCAGCTATGCAGCTGATAGACCCACACCACTAAACATCTA
GTAATTGCTTTGTAGAGAGTAGGGAATTATCTTGGAAAGGGACAAAAGGGCGGTTCACTT
AATTTGATTATTCTTGTTGATCATATTATTGTCTGGTTCTACTTTTCTTTTTTCTTCATT
GCATATGTAAAGACCATTTTCAGATTATTTGAATTAGTAACAATGAAGCTGAGGGTAAAA
GACAACTCTCTTCGCGGTGC

QA 1 380 1 380
DS 

RD RS1CB84TF 380 0 0
GGGAACTGTAAATCTCAAAATATGTACTGTCAGTCGAGCCAGATAGGGAAGCAGATGAAC
TTGACGTGTATAGCTAACGGGAGAACAGAGATGTATACGCTTGGTAGCGAGAACCAGTCT
AAGATTCAGCAAATGTGTTCCCAGCTATGCAGCTGATAGACCCACACCACTAAACATCTA
GTAATTGCTTTGTAGAGAGTAGGGAATTATCTTGGAAAGGGACAAAAGGGCGGTTCACTT
AATTTGATTATTCTTGTTGATCATATTATTGTCTGGTTCTACTTTTCTTTTTTCTTCATT
GCATATGTAAAGACCATTTTCAGATTATTTGAATTAGTAACAATGAAGCTGAGGGTAAAA
GACAACTCTCTTCGCGGTGC

QA 1 380 1 380
DS 



AS 1 2

CO CL8088Contig1 350 2 2 U
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GAAGGGTTGGATCTTCAGCGAAAGACAACATGAGAGCTAAGTGGAAGAAGAAGCGTATGA
GGAGGTTGAAGAGGAAGAGACGAAAGATGAGACAGCGATCTAAGTAGATTCGGAACCCGT
TTTGTCTCTTTTTATTTTAGTTCTAAACCGACATTTGTAGAGTTTTGTTGGTTTTTCTAT
CTGAATTTGAATGTTTTTGTTGGACCATTCTATCTTTTCAGTCTGAATACTTGTGTTTTA
CTACATGAAAGAATCCACGACTGGGTTCTCGATTTATCCCTTTTATTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1ED13JQ C 1
AF RS1ED13TF U 22
BS 1 21 RS1ED13JQ
BS 22 350 RS1ED13TF

RD RS1ED13JQ 350 0 0
GGAGCTAACTCCGCCGCTTCTTTCTCATTTTCTTAGATCTAAAACATCGATCAGAGGAGT
GAAGGGTTGGATCTTCAGCGAAAGACAACATGAGAGCTAAGTGGAAGAAGAAGCGTATGA
GGAGGTTGAAGAGGAAGAGACGAAAGATGAGACAGCGATCTAAGTAGATTCGGAACCCGT
TTTGTCTCTTTTTATTTTAGTTCTAAACCGACATTTGTAGAGTTTTGTTGGTTTTTCTAT
CTGAATTTGAATGTTTTTGTTGGACCATTCTATCTTTTCAGTCTGAATACTTGTGTTTTA
CTACATGAAAGAATCCCCGACTGGGTTCTCGATTTATCCCTTTTATTATC

QA 1 350 1 350
DS 

RD RS1ED13TF 329 0 0
TTCTCATTTTCTTAGATCTAAAACATCGATCAGAGGAGTGAAGGGTTGGATCTTCAGCGA
AAGACAACATGAGAGCTAAGTGGAAGAAGAAGCGTATGAGGAGGTTGAAGAGGAAGAGAC
GAAAGATGAGACAGCGATCTAAGTAGATTCGGAACCCGTTTTGTCTCTTTTTATTTTAGT
TCTAAACCGACATTTGTAGAGTTTTGTTGGTTTTTCTATCTGAATTTGAATGTTTTTGTT
GGACCATTCTATCTTTTCAGTCTGAATACTTGTGTTTTACTACATGAAAGAATCCACGAC
TGGGTTCTCGATTTATCCCTTTTATTATC

QA 1 329 1 329
DS 



AS 1 2

CO CL8089Contig1 1071 2 10 U
GGATGTGGATGACATTGATCGTTTCTTAGAGTTCAGCCAACTCCAGGATGGAGGAAACCA
GTTGAGACAGAAACGGCAAGCTTTGTTGGAAAGCCTTACAGTTTCATTGCAGCTCTTTGA
TCCCCTTGCCAAAATGGGCAAAGCCGTTCCCAGGATGATTTAATCTTTCAAGGTATCATC
TCTCTTCCAAAGGGTCGGAAACTACTTATAAGGTATGTTCAGCTTATTTTCCCAGGCAGC
GACCTAATGCGGATTGTCTGCATGGCCATTTTCCGTCATCTGAGATCATTGTTTGGAGTC
CTCTCATCTGATCCTGACATCGCCAAAACCACAAACAAGCTTGCAAACGTTGTGAACTCG
TGCATTCACAAGATGGAGTTAGGTCCCATAAGCGCCTGTTTAGCAGCGGTTTCCTGTTCC
TCTGAGCAGCCACCGCTCCGTCCTTTAGGCAGTCCTGTTGGAGACGGAGCCACCACGGTA
CTGAAATCTACACTCGACAGGGCTTCCGAGCTTCTCCGAGCTAATAACTTCAACAACGCA
GGCATGGCTCTGTGGCGCGCTTCCTTCAATGAGTTCTTCAACCTTCTGATGAGGTATTGC
ATCAGCAAATACGACGGTATTATGCAGAGTTTGAATTCGCAGTTGCCACCAGAGTTTGCT
AGCGAGATATCCGATGCAGCTGCGCAAGCCATTGTCCGTGAAATGCCCATTGAACTTCTG
CGTTCGAGTTTCCCACATATTGATGAGCAGCAAAATAGATTGCTAATGGAGTTTTTGAAA
CGGTCTATGCTTGGAAGCCAGAAAACCGAGCCGGTCTTGAGCTGATGAGATAGTATAGAA
TCAAGAAACCATACCGCAATGTCTGTATATGGAGCATAAGATGATGCGGAAACCGTAACA
GGGAAGGTAGAGAGAATCGGTTCAAACTCTCGTTTTTTTTTACTTTGCGTTAGAGAAATA
GGATTGTTCCTTCAAATGCACCAAGACTGTTTTTGTGTCTTTAGCTCTGCAGAACTTTGT
AGCCAAGGGATTGTGTGTGTTTCTGTGTTCTGTCTAGTCTTTTTTTTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AZ48TF U 1
AF RS1AZ48JQ C 311
BS 1 754 RS1AZ48TF
BS 755 755 RS1AZ48JQ
BS 756 775 RS1AZ48TF
BS 776 776 RS1AZ48JQ
BS 777 798 RS1AZ48TF
BS 799 799 RS1AZ48JQ
BS 800 806 RS1AZ48TF
BS 807 807 RS1AZ48JQ
BS 808 830 RS1AZ48TF
BS 831 1071 RS1AZ48JQ

RD RS1AZ48TF 830 0 0
GGATGTGGATGACATTGATCGTTTCTTAGAGTTCAGCCAACTCCAGGATGGAGGAAACCA
GTTGAGACAGAAACGGCAAGCTTTGTTGGAAAGCCTTACAGTTTCATTGCAGCTCTTTGA
TCCCCTTGCCAAAATGGGCAAAGCCGTTCCCAGGATGATTTAATCTTTCAAGGTATCATC
TCTCTTCCAAAGGGTCGGAAACTACTTATAAGGTATGTTCAGCTTATTTTCCCAGGCAGC
GACCTAATGCGGATTGTCTGCATGGCCATTTTCCGTCATCTGAGATCATTGTTTGGAGTC
CTCTCATCTGATCCTGACATCGCCAAAACCACAAACAAGCTTGCAAACGTTGTGAACTCG
TGCATTCACAAGATGGAGTTAGGTCCCATAAGCGCCTGTTTAGCAGCGGTTTCCTGTTCC
TCTGAGCAGCCACCGCTCCGTCCTTTAGGCAGTCCTGTTGGAGACGGAGCCACCACGGTA
CTGAAATCTACACTCGACAGGGCTTCCGAGCTTCTCCGAGCTAATAACTTCAACAACGCA
GGCATGGCTCTGTGGCGCGCTTCCTTCAATGAGTTCTTCAACCTTCTGATGAGGTATTGC
ATCAGCAAATACGACGGTATTATGCAGAGTTTGAATTCGCAGTTGCCACCAGAGTTTGCT
AGCGAGATATCCGATGCAGCTGCGCAAGCCATTGTCCGTGAAATGCCCATTGAACTTCTG
CGTTCGAGTTTCCCACATATTGATGAGCAGCAAA*TAGATTGCTAATGGAGTTTT*GAAA
CGGTCTATGCTTGGAAGC*AGAAAAC*GAGCCGGTCTTGAGCTGATGAGA

QA 1 830 1 830
DS 

RD RS1AZ48JQ 761 0 0
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AGATGGAGTTAGGTCCCATAAGCGCCTGTTTAGCAGCGGTTTCCTGTTCCTCTGAGCAGC
CACCGCTCCGTCCTTTAGGCAGTCCTGTTGGAGACGGAGCCACCACGGTACTGAAATCTA
CACTCGACAGGGCTTCCGAGCTTCTCCGAGCTAATAACTTCAACAACGCAGGCATGGCTC
TGTGGCGCGCTTCCTTCAATGAGTTCTTCAACCTTCTGATGAGGTATTGCATCAGCAAAT
ACGACGGTATTATGCAGAGTTTGAATTCGCAGTTGCCACCAGAGTTTGCTAGCGAGATAT
CCGATGCAGCTGCGCAAGCCATTGTCCGTGAAATGCCCATTGAACTTCTGCGTTCGAGTT
TCCCACATATTGATGAGCAGCAAAATAGATTGCTAATGGAGTTTTTGAAACGGTCTATGC
TTGGAAGCCAGAAAACCGAGCCGGTCTTGAGCTGATGAGATAGTATAGAATCAAGAAACC
ATACCGCAATGTCTGTATATGGAGCATAAGATGATGCGGAAACCGTAACAGGGAAGGTAG
AGAGAATCGGTTCAAACTCTCGTTTTTTTTTACTTTGCGTTAGAGAAATAGGATTGTTCC
TTCAAATGCACCAAGACTGTTTTTGTGTCTTTAGCTCTGCAGAACTTTGTAGCCAAGGGA
TTGTGTGTGTTTCTGTGTTCTGTCTAGTCTTTTTTTTTTTC

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL8090Contig1 711 2 3 U
AACTCATCAAATACTTTCATTTACCCATGATTGTTTCCATACATTTCAATGTCTGATCTA
ACTTGAAACTTAAGCCACAATGGCACAACAGAATATAACTTGGGAACACTAGACACATAA
GTGAGAGATTCCTTTGCTATTCTGTCTGCTGCCTTATTACCTCCTCTAGGATAGAACTTC
ACTTCAACCCCTTGAATCCGTGACAAAGTTGAGCGTATCACCTCGACAATTGGTTGCAGA
ATCGGCCAAACATGGTCGGCTCCATTAACCATTCTCACCAACGAAAGCGAATCAAATTCG
AAGATGACATTCCTATAGGCGAACCTTGCCATTACCTCCACACTCCATAAGAGAGCTTCA
GCTTCCGCTAGTATTGGTGATGCCACATTTGTCACCGCTTTTGCCCCAGCCCAGATTACT
CTACCGTATTCATCCCTGCAGAACCACCCCAAACCGCTGTTCTCCTTTTCCTTGCGCCAA
GCCCCATCCGTGTTGCATTTCAGCCAGTTTGGGGGTGGTGGGATCCATGAGCGAGCTTTT
CCTGTAATCTTGGGTCCTTCTACCCCCTGAACTGTTGCCTCTGATCTTTCCACCTCTTTC
CTTCTCTGCCATTCCTCCATATCCTCTTTTGCCCTCACCACAATACTCTCTGCCTCAAAT
TCCTTTCCTCTAAACCACAGTTCATTCCTATTTTTCCATAAGCGCCATAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A435JQ U 146
AF RS1A435TF C 1
BS 1 145 RS1A435TF
BS 146 659 RS1A435JQ
BS 660 711 RS1A435TF

RD RS1A435JQ 514 0 0
CTGCTGCCTTATTACCTCCTCTAGGATAGAACTTCACTTCAACCCCTTGAATCCGTGACA
AAGTTGAGCGTATCACCTCGACAATTGGTTGCAGAATCGGCCAAACATGGTCGGCTCCAT
TAACCATTCTCACCAACGAAAGCGAATCAAATTCGAAGATGACATTCCTATAGGCGAACC
TTGCCATTACCTCCACACTCCATAAGAGAGCTTCAGCTTCCGCTAGTATTGGTGATGCCA
CATTTGTCACCGCTTTTGCCCCAGCCCAGATTACTCTACCGTATTCATCCCTGCAGAACC
ACCCCAAACCGCTGTTCTCCTTTTCCTTGCGCCAAGCCCCATCCGTGTTGCATTTCAGCC
AGTTTGGGGGTGGTGGGATCCATGAGCGAGCTTTTCCTGTAATCTTGGGTCCTTCTACCC
CCTGAACTGTTGCCTCTGATCTTTCCACCTCTTTCCTTCTCTGCCATTCCTCCATATCCT
CTTTTGCCCTCACCACAATACTCTCTGCCTCAAA

QA 1 514 1 514
DS 

RD RS1A435TF 711 0 0
AACTCATCAAATACTTTCATTTACCCATGATTGTTTCCATACATTTCAATGTCTGATCTA
ACTTGAAACTTAAGCCACAATGGCACAACAGAATATAACTTGGGAACACTAGACACATAA
GTGAGAGATTCCTTTGCTATTCTGTCTGCTGCCTTATTACCTCCTCTAGGATAGAACTTC
ACTTCAACCCCTTGAATCCGTGACAAAGTTGAGCGTATCACCTCGACAATTGGTTGCAGA
ATCGGCCAAACATGGTCGGCTCCATTAACCATTCTCACCAACGAAAGCGAATCAGATTCG
AAGATGACATTCCTATAGGCGAACCTTGCCATTACCTCCACACTCCATAAGAGAGCTTCA
GCTTCCGCTAGTATTGGTGATGCCACATTTGTCACCGCTTTTGCCCCAGCCCAGATTACT
CTACCGTATTCATCCCTGCAGGTCCACCCCAAACCGCTGTTCTCCTTTTCCTTGCGCCAA
GCCCCATCCGTGTTGCATTTCAGCCAGTTTGGGGGTGGTGGGATCCATGAGCGAGCTTTT
CCTGTAATCTTGGGTCCTTCTACCCCCTGAACTGTTGCCTCTGATCTTTCCACCTCTTTC
CTTCTCTGCCATTCCTCCATATCCTCTTTTGCCCTCACCACAATACTCTCTGCCTCAAAT
TCCTTTCCTCTAAACCACAGTTCATTCCTATTTTTCCATAAGCGCCATAAT

QA 1 711 1 711
DS 



AS 1 2

CO CL8091Contig1 973 2 4 U
CGAAACCTCTCCATCTTCTTCGTCTCCGAGAAGATGATTCTGTCTCTCTCCAAGTGATTC
TTCGACGAAACGTCGATAATCCCTTTTTTCGTGGCTCGTCGATGAAACGGAATTTTCTAT
CGGTGGTTCGTAGATTGAAGAAGAAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGGAGAAGGGTTGACGGA
GGAGATTGGAGGAGCGACGGAGGAATTGAAAACGGCGTCGCATAGGAAGCAGCGGAGTTA
CACTCTGTAGTAGATTTGGTTCATCAATCAATCACGTTTTCAAACGTGAACGCCTGATTT
GATCCAAGCTATGGCAAAGAAGATTGGAGTGACGAGGAAGTTGGGAACAATGGTGTTGCT
GTGATCACCATTTCGAACCGTCCTGTTAACTCTCTGCCTAGCCCAATTGCTTCTGAGCTG
AAAGAGAAGGTTCAAGACGCGAACCAGAGGAGTGATGAAGGAGTGTATTTCTCATTGAGT
TTTGGATCATGTGCGTCTTCTGTGTTCTTTCTTTAAGTTAAAGATTGAGAGAACTTTTCA
ACTTTATTTATCTCCTCTTCCTTTTTAAATGTCGTTGATATATCACCCCACCCACAGAGT
TCGACTTTTATCTCTGTAGCCATGCTGGTATTCAGGTTAATCTTTGTATAGGAAGAAGAG
CTCTAATCAATCTTATGAAACACAGAGACAGTTCTTCAAAAGTTACAGAAGCTTTCCAGA
TAGTGAAGGTGTTGGAGTTCGTTGCAAAGAAAGAAAGTCTGCAACTGTCCCACGGTTTTA
CAGCATTACAAGTACTCTTAGATTTGCTAGAAAGTGAAAATGCGAAGACAGGGAAACTTT
GCAGATTCACCCGCAAGTGGAATATGTCAAGGCTTATGTCAACTGCTGTTTACAATGACT
AGTAAGTCTCTTTAATTACTGACTATTTCATGGTCAGGTCTTTTGGCACATATACCTTCT
CTTTGTATGGAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A678TF U 1
AF RS1A678JQ C 146
BS 1 635 RS1A678TF
BS 636 636 RS1A678JQ
BS 637 650 RS1A678TF
BS 651 973 RS1A678JQ

RD RS1A678TF 652 0 0
CGAAACCTCTCCATCTTCTTCGTCTCCGAGAAGATGATTCTGTCTCTCTCCAAGTGATTC
TTCGACGAAACGTCGATAATCCCTTTTTTCGTGGCTCGTCGATGAAACGGAATTTTCTAT
CGGTGGTTCGTAGATTGAAGAAGAAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGGAGAAGGGTTGACGGA
GGAGATTGGAGGAGCGACGGAGGAATTGAAAACGGCGTCGCATAGGAAGCAGCGGAGTTA
CACTCTGTAGTAGATTTGGTTCATCAATCAATCACGTTTTCAAACGTGAACGCCTGATTT
GATCCAAGCTATGGCAAAGAAGATTGGAGTGACGAGGAAGTTGGGAACAATGGTGTTGCT
GTGATCACCATTTCGAACCGTCCTGTTAACTCTCTGCCTAGCCCAATTGCTTCTGAGCTG
AAAGAGAAGGTTCAAGACGCGAACCAGAGGAGTGATGAAGGAGTGTATTTCTCATTGAGT
TTTGGATCATGTGCGTCTTCTGTGTTCTTTCTTTAAGTTAAAGATTGAGAGAACTTTTCA
ACTTTATTTATCTCCTCTTCCTTTTTAAATGTCGTTGATATATCACCCCACCCACAGAGT
TCGACTTTTATCTCTGTAGCCATGCTGGTATTCAG*TTAATCTTTGTATA
CG

QA 1 650 1 650
DS 

RD RS1A678JQ 828 0 0
GAGGAAGAGGAAGAGGAAGGAGAAGGGTTGACGGAGGAGATTGGAGGAGCGACGGAGGAA
TTGAAAACGGCGTCGCATAGGAAGCAGCGGAGTTACACTCTGTAGTAGATTTGGTTCATC
AATCAATCACGTTTTCAAACGTGAACGCCTGATTTGATCCAAGCTATGGCAAAGAAGATT
GGAGTGACGAGGAAGTTGGGAACAATGGTGTTGCTGTGATCACCATTTCGAACCGTCCTG
TTAACTCTCTGCCTAGCCCAATTGCTTCTGAGCTGAAAGAGAAGGTTCAAGACGCGAACC
AGAGGAGTGATGAAGGAGTGTATTTCTCATTGAGTTTTGGATCATGTGCGTCTTCTGTGT
TCTTTCTTTAAGTTAAAGATTGAGAGAACTTTTCAACTTTATTTATCTCCTCTTCCTTTT
TAAATGTCGTTGATATATCACCCCACCCACAGAGTTCGACTTTTATCTCTGTAGCCATGC
TGGTATTCAGGTTAATCTTTGTATAGGAAGAAGAGCTCTAATCAATCTTATGAAACACAG
AGACAGTTCTTCAAAAGTTACAGAAGCTTTCCAGATAGTGAAGGTGTTGGAGTTCGTTGC
AAAGAAAGAAAGTCTGCAACTGTCCCACGGTTTTACAGCATTACAAGTACTCTTAGATTT
GCTAGAAAGTGAAAATGCGAAGACAGGGAAACTTTGCAGATTCACCCGCAAGTGGAATAT
GTCAAGGCTTATGTCAACTGCTGTTTACAATGACTAGTAAGTCTCTTTAATTACTGACTA
TTTCATGGTCAGGTCTTTTGGCACATATACCTTCTCTTTGTATGGAAG

QA 1 828 1 828
DS 



AS 1 2

CO CL8092Contig1 725 2 6 U
GGGGTCTGAGATGGACGGTAGTCGTCGTTTCACACTTTCTCCGTCAACCATTCTACTTCT
CCTCTCCTCTAAAAAAGCAATGGCCTTTCGACCTCCATCATTGGCTCTTTTAAGCCTTGA
CATGAAAAGTCCATTACTTGTAATATTATAAACCATAAGTTTATTCCCGTTTCTTCTTCT
CACCACTCGTTAATCTCTTTCCTCTGTCGTCTTCCTCTCACCGCCTCTCTCCCTTGATTT
TTTTTTTTTCTTTTATATTTATCCAAACAATCATTTTTAAGATACCTTTTTTTTTTTTGG
AAAGACTATGGCTTTGTTCGTGAGCTTGATCTTAGGGATAATCGCTGGATGGTTAGCTTT
CGTTGTTGGGTTGCTCATAGGACGGGCATGGAGACCCAGATGGGCTTCTTGTTCTGATAA
GGAAAGAGTCAAACCTCAGTGTTGTGCTCCTCGATCTTTTGATTTGTCTTTACCATCGTC
TCCCTCTCCTCGTTCCGCAACTTCTCCGTTAAAGGGCTTTGGTTCTGCTCCTTGCTTGAA
AGCTCTTGTCTGCGACACGTGGACTATGGCTTTGAGACAGCAGAAAACAGTCTCCCCTGT
TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCATGTGATGATGTGATTGCTGGAGGGAAGAAAAC
AGAGGAGAGGTTGCCCAATACTGTGACAGAGTTAGATTTGAGACATCTTGTGCAGTTGGT
TGAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1FU21TF U 1
AF RS1B102TF U 64
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CACCACTCGTTAATCTCTTTCCTCTGTCGTCTTCCTCTCACCGCCTCTCTCCCTTGATTT
TTTTTTTTTCTTTTATATTTATCCAAACAATCATTTTTAAGATACCTTTTTTTTTTTTGG
AAAGACTATGGCTTTGTTCGTGAGCTTGATCTTAGGGATAATCGCTGGATGGTTAGCTTT
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GGAAAGAGTCAAACTTCAGTGTTGTGCTCCTCGATCTTTTGATTTGTCTTTACCATCGTC
TCCCTCTCCTCGTTCCGCAACTTCTCCGTTAAAGGGCTTTGGTTCTGCTCCTTGCTTGAA
AGCTCTTGTCTGCGACACGTGGACTATGGCTTTGAGACAGCAGAAAACAGTCTCCCCTGT
TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCATGTGATGATGTGATTGCTGGAGGGAAGAAAAC

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DS 

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GG
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AAAGTCCATTACTTGTAATATTATAAACCATAAGTTTATTCCCGTTTCTTCTTCTCACCA
CTCGTTAATCTCTTTCCTCTGTCGTCTTCCTCTCACCGCCTCTCTCCCTTGATTTTTTTT
T***CTTTTATATTTATCCAAACAATCATTTTTAAGATACCTTTTTTTTTTTTGGAAAGA
CTATGGCTTTGTTCGTGAGCTTGATCTTAGGGATAATCGCTGGATGGTTAGCTTTCGTTG
TTGGGTTGCTCATAGGACGGGCATGGAGACCCAGATGGGCTTCTTGTTCTGATAAGGAAA
GAGTCAAACCTCAGTGTTGTGCTCCTCGATCTTTTGATTTGTCTTTACCATCGTCTCCCT
CTCCTCGTTCCGCAACTTCTCCGTTAAAGGGCTTTGGTTCTGCTCCTTGCTTGAAAGCTC
TTGTCTGCGACACGTGGACTATGGCTTTGAGACAGCAGAAAACAGTCTCCCCTGTTTCTT
CTTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCATGTGATGATGTGATTGCTGGAGGGAAGAAAACAGAGG
AGAGGTTGCCCAATACTGTGACAGAGTTAGATTTGAGACATCTTGTGCAGTTGGTTGAGA

QA 3 662 3 662
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AAAACTAAGGTACCATTTCCCCCTCGATCCAGGTTCTGCTCGCTGAGGCTGAGGATCGTT
GTTAGAAAGAGAAGAGAAGAGATGGCCTCTCACTCTCACTCTCAGGTATTGGTGGAAGAG
AAATCGAATGTTAGAATCTTGACACTGAACAGACCAAAGCAGCTGAATGCTCTCTCCTTC
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CTTGTTATCCTTAAGGGTCAAGGAAGAGCTTTTTGTGCTGGTGGTGATGTTTCAGCTGTT
GTTCGTGACATCGAACAAGGCAATTGGAGACTCGGTGCCAAGTTCTTCTCAGATGAATAC
ATTCTCAACTATGTTATGGCCACCTTTACCAAACCTCAGGTTTCAATTTTGAATGGTATT
GTCATGGGAGGCGGAGCTGGTGTCTCTGTCCATGGTCGTTTTCGTGTTGCTACTGAGAAC
ACGGTTTTTGCCATGCCCGAGACTGTTCTTGGTCTCTTTCCCGATGTAGGCGCCTCCTAC
TTCTTGTCTAGCTCCCTGGTTTTTTTGGAGAGTATATTGGCCTC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E149TF U 7
AF RS1CU65TF U 1
BS 1 644 RS1CU65TF

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GG
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CTCTCGGTTGCTGCAACTGTTCCTTGCATATGAGGAGGACCCTAGTGTGAAACTTGTTAT
CCTTAAGGGTCAAGGAAGAGCTTTTTGTGCTGGTGGTGATGTTTCAGCTGTTGTTCGTGA
CATCGAACAAGGCAATTGGAGACTCGGTGCCAAGTTCTTCTCAGATGAATACATTCTCAA
CTATGTTATGGCCACCTTTACCAAACCTCAGGTTTCAATTTTGAATGGTATTGTCATGGG
AGGCGGAGCTGGTGTCTCTGTCCATGGTCGTTTTCGTGTTGCTACTGAGAACACGGTTTT
TGCCATGCCCGAGACTGTTCTTGGTCTCTTTCCCGAT

QA 3 579 3 579
DS 

RD RS1CU65TF 644 0 0
GGGAATCCGAAGCAAGACCTCTAGTCTAAGGCCACCGACCGCTGCGCCTGGAATCGAGAC
AAAACTAAGGTACCATTTCCCCCTCGATCCAGGTTCTGCTCGCTGAGGCTGAGGATCGTT
GTTAGAAAGAGAAGAGAAGAGATGGCCTCTCACTCTCACTCTCAGGTATTGGTGGAAGAG
AAATCGAATGTTAGAATCTTGACACTGAACAGACCAAAGCAGCTGAATGCTCTCTCCTTC
CAAATGATCTCTCGGTTGCTGCAACTGTTCCTTGCATATGAGGAGGACCCTAGTGTGAAA
CTTGTTATCCTTAAGGGTCAAGGAAGAGCTTTTTGTGCTGGTGGTGATGTTTCAGCTGTT
GTTCGTGACATCGAACAAGGCAATTGGAGACTCGGTGCCAAGTTCTTCTCAGATGAATAC
ATTCTCAACTATGTTATGGCCACCTTTACCAAACCTCAGGTTTCAATTTTGAATGGTATT
GTCATGGGAGGCGGAGCTGGTGTCTCTGTCCATGGTCGTTTTCGTGTTGCTACTGAGAAC
ACGGTTTTTGCCATGCCCGAGACTGTTCTTGGTCTCTTTCCCGATGTAGGCGCCTCCTAC
TTCTTGTCTAGCTCCCTGGTTTTTTTGGAGAGTATATTGGCCTC

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 2

CO CL8095Contig1 767 2 3 U
TTTCTCATTGAATGCACTCCTCTTCTTATACTCATTTGGACGCGCCTTTTCCGTAATGGT
TGTCTGTCAGAGAGTTGGTTCGTCGTCATCATCACCCTATCGCTTGTTTAGACTTCTTTC
CTACGACCGGTGGTTGTTTCAGCCTATATCGTCTTAGCTTCCTGTTCTTTGTGTGTGCCG
CGGAGGCCGTCCTTTTATTTGGGATGGGCTTTTATAGATTCCTTCCTTGGTTTCCAACTC
GCGAATGGACCGTCCTCCAACATATACTAAAATTTTGGAAACTCAACCAATAATATCCAA
ATTTGGATATAACCAAGAATATCTATATGGTGACGACTCGTGTACGTATAGTTGTGAGTT
TTGACAGTAGGAGTCTCAATGGGGACCAAATCATAGTATGCCCTAAATGACTAAACGTTA
CACCTACGTCCTATGATTGATTCAGAGAAGGTAAAAGAACAAAACCCTACGACTGTAGCT
TTGAACTAAAAGCAGCTCTTTAGCCCTAGCTCCGATTGAGCATTTAATTGTTCTTTGGGA
TACATATGATACAGAGAATCTGTATTGGAGAAGATGATGAATAGTAACCTTGATTAGATG
TTCATAAAACACCGAATCAACTCTCAAAGTGTGAAGAGTTTAGAAGAAGAAACCACTCTA
GAACAACAATGAGGGATTTTCCTAGAAAATTCTTAAGAAAACCATATAGTAACCACAGAG
TAAAGAAGAAGAAGACACAAATTTTCTGATATTGTTCTTGATGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AG74JQ U 74
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CCTCCAACATATACTAAAATTTTGGAAACTCAACCAATAATATCCAAATTTGGATATAAC
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DS 

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CTACGACCGGTGGTTGTTTCAGCCTATATCGTCTTAGCTTCCTGTTCTTTGTGTGTGCCG
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GCGAATGGACCGTCCTCCAACATATACTAAAATTTTGGAAACTCAACCAATAATATCCAA
ATTTGGATATAACCAAGAATATCTATATGGTGACGACTCGTGTACGTATAGTTGTGAGTT
TTGACAGTAGGAGTCTCAATGGGGACCAAATCATAGTATGCCCTAAATGACTAAACGTTA
CACCTACGTCCTATGATTGATTCAGAGAAGGTAAAAGAACAAAACCCTACGACTGTAGCT
TTGAACTAAAAGCAGCTCTTTAGCCCTAGCTCCGATTGAGCATTTAATTGTTCTTTGGGA
TACATATGATACAGAGAATCTGTATTGGAGAAGATGATGAATAGTAACCTTGATTAGATG
TTCATAAAACACCGAATCAACTCTCAAAGTGTGAAGAGTTTAGAAGAAGAAACCACTCTA
GAACAACAATGAGGGATTTTCCTAGAAAATTCTTAAGAAAACCATATAGTAACCACAGAG
TAAAGAAGAAGAAGACACAAATTTTCTGATATTGTTCTTGATGATCC

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

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AGGGTAAAATTACTAGTCTAGATGATCCGAATACAACTGCTGCGAAGGTTTCTCATGAAG
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TGTGCAGTGGAAGTCTTCCCTCTTGGTGCTACCAGTGGACTACAGCATGCCCGTTTTTGT
TTCCGTTTCAGACCCGGAGACAGTATTTCTATTCAACCGCCTTTGGGTTGTCGCGTGCAT
TGAACCGCTTGCAGCAGCAGCAAGGTGCTGACGGCAGTGGTTCTACAAACGAGCGAGAGA
TGAGGATAGGGAGATTGCAGCGCCAGAAAGTGCGTGTATCCCGAAATAGAATATTAGATT
CTGCTGCGAAAGTTATGGAGATGTATTCTAGCCAAAAAGCTGTGCTTGAAGTAGAATATT
TTGGTGAAGTTGGTACTGGTCTAGGCCCCACACTTGAGTTTTACACACTCCTAAGCCATG
ATTTGCAAAAGGTTTCCCTTGGGATGTGGAGATCAAATGCTGGTGACAAGTTATCCCTGC
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TTCACGCACCGCTTGGGTTGTTTCCTCGGCCTGGCCCTCACAGCTGACGTATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CV29TF U 1
AF RS1BR03TF U 131
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A*ACTGATAGAGATGAGATTCA

QA 1 742 1 742
DS 

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GG
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CCCGGAGACAGTATTTCTATTCAACCGCCTTTGGGTTGTCGCGTGCATTGAACCGCTTGC
AGCAGCAGCAAGGTGCTGACGGCAGTGGTTCTACGAACGAGCGAGAGATGAGGATAGGGA
GATTGCAGCGCCAGAAAGTGCGTGTATCCCGAAATAGAATATTAGATTCTGCTGCGAAAG
TTATGGAGATGTATTCTAGCCAAAAAGCTGTGCTTGAAGTAGAATATTTTGGTGAAGTTG
GTACTGGTCTAGGCCCCACACTTGAGTTTTACACACTCCTAAGCCATGATTTGCAAAAGG
TTTCCCTTGGGATGTGGAGATCAAATGCTGGTGACAAGTTATCCCTGCAGACTGATAGAG
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QA 3 704 3 704
DS 



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ATAGAACATAACAATGACACTAAAAACAGATAAGCATAAGTACACACACTTTCATGATTT
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AGTGTCACCGCCCAAATCGCCAAACCAGTGAGTCCTCCCTTGTACACGTCACCACTCGCT
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TCGATCTCTACGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DC76TF C 1
AF RS1CM37JQ U 26
BS 1 25 RS1DC76TF
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BS 73 73 RS1DC76TF
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BS 482 482 RS1DC76TF
BS 483 609 RS1CM37JQ
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RD RS1DC76TF 616 0 0
ACAAACACTAGAGGTCTTATATATTCAAAGTATGTTCTTTAAGTTACTTAACAACATTAC
ATAGAACATAACAATGACACTAAAAACAGATAAGCATAAGTACACACACTTTCATGATTT
TACTGAGCCAAAGCACTTGTGTTGTACACAAGAAGAGCCCCTCCGGCAAGAATTCCGGCT
AGTGTCACCGCCCAAATCGCCAAACCAGTGAGTCCTCCCTTGTACACGTCACCACTCGCT
GACCACTCGTCCTCGTTGTAGATAGGGCTGTATCCATCAACGTTAGCACCGTACTTGTCG
ACGAATTTGTAAACACCATATCCCTTGCCCTTTCTGCCGGAAGCGTCGACGCCGTCCCTC
AAGTCCATGCTGCCGTTAACTCCAAAGGGCTTGTCTGTCTTGATCTTCTTGACGCCACTC
GCGACGATCTTGAAGGAAGAAGGAGAAGCTCTTGTAAGCGACGGTAATCCTCTCGCCGAC
ACCTTCTCCACCGTGAAACCCGCAGGTTTCAATGTCACTGATGAAAGCATCACTGAAGCA
GCCATGTTCTCTTCCTTCTCTCACAAGATCAAACTTCTCTTCTTCTTCTCTCTCTCTCTC
TCGATCTCTACGTTCC

QA 1 616 1 616
DS 

RD RS1CM37JQ 586 0 0
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ACAGATAAGCATAAGTACACACACTTTCATGATTTTACTGAGCCAAAGCACTTGTGTTGT
ACACAAGAAGAGCCCCTCCGGCAAGAATTCCGGCTAGTGTCACCGCCCAAATCGCCAAAC
CAGTGAGTCCTCCCTTGTACACGTCACCACTCGCTGACCACTCGTCCTCGTTGTAGATAG
GGCTGTATCCATCAACGTTAGCACCGTACTTGTCGACGAATTTGTAAACACCATATCCCT
TGCCCTTTCTGCCGGAAGCGTCGACGCCGTCCCTCAAGTCCATGCTGCCGTTAACTCCAA
AGGGGTTGTCTGTCTTGATCTTCTTGACGCCACTCGCGACGATCTTGAAGGAAGAAGGAG
AAGCTCTTGTAAGCGACGGTAATCCTCTCGCCGACATCTTCTCCACCGTGAAACCCGCAG
GTTTCAATGTCACTGATGAAAGCATCACTGAAGCAGCCATGTTCTCTTCCTTCTCTCACA
AGATCAAACTTCTCTTCTTCTTCTCTCTCTCTCTCTCGATCTCT
CC

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 2

CO CL8098Contig1 572 2 1 U
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TGTCATCATCGCCTTCTCATTTCTCCTTCATCCAACCCCAACCCACATTTCAACCCTAAC
AACATGACACACGGAGCTCCTCAAGACGAGATCCGTCATGCGGGTGACCTGGGAAACATC
ATTGCCAATGCCGACGGCGTGGTAGAAACAACAGTTGTGGACAACCAGATTCCTCTGACT
GGTCCTAACTCTGTTGTCGGAAGAGCCTTTGTGGTTCACGAGCTTCAGGATGATCTCGGA
AAGGGTGGGCATGAGCTTAGTCTGACCACTGGTAATGCAGGCGGGAGACTGGCATGTGGT
GTGGTTGGTTTGACGCCGCTCTAAGTCTGGAATAAGTAAAGTACTCTTCTGTCTACTGTA
TTGTGTCTTTGTTTCTTGTCAAATAATGTTCGGCTGATTAAACTTTTGATGTTTATATTC
ATAGCATCAAAAAAAAAAACTCTCTCTTTGGATTTGTGCCTTTGTAAAACTACTCATGGA
CCAAATCTGCTTTCCAATTTATATTAGTGATA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AI37JQ C 1
AF RS1AI37TF U 1
BS 1 572 RS1AI37TF

RD RS1AI37JQ 572 0 0
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GGTCCTAACTCTGTTGTCGGAAGAGCCTTTGTGGTTCACGAGCTTCAGGATGATCTCGGA
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GTGGTTGGTTTGACGCCGCTCTAAGTCTGGAATAAGTAAAGTACTCTTCTGTCTACTGTA
TTGTGTCTTTGTTTCTTGTCAAATAATGTTCGGCTGATTAAACTTTTGATGTTTATATTC
ATAGCATCAAAAAAAAAAACTCTCTCTTTGGATTTGTGCCTTTGTAAAACTACTCATGGA
CCAAATCTGCTTTCCAATTTATATTAGTGATA

QA 1 572 1 572
DS 

RD RS1AI37TF 572 0 0
GGCCCAAAAAAGCAGCAGGAGCCAATGGCTGCTCACACCATCCTCTCCTTCTCATCTCCT
TGTCATCATCGCCTTCTCATTTCTCCTTCATCCAACCCCAACCCACATTTCAACCCTAAC
AACATGACACACGGAGCTCCTCAAGACGAGATCCGTCATGCGGGTGACCTGGGAAACATC
ATTGCCAATGCCGACGGCGTGGTAGAAACAACAGTTGTGGACAACCAGATTCCTCTGACT
GGTCCTAACTCTGTTGTCGGAAGAGCCTTTGTGGTTCACGAGCTTCAGGATGATCTCGGA
AAGGGTGGGCATGAGCTTAGTCTGACCACTGGTAATGCAGGCGGGAGACTGGCATGTGGT
GTGGTTGGTTTGACGCCGCTCTAAGTCTGGAATAAGTAAAGTACTCTTCTGTCTACTGTA
TTGTGTCTTTGTTTCTTGTCAAATAATGTTCGGCTGATTAAACTTTTGATGTTTATATTC
ATAGCATCAAAAAAAAAAACTCTCTCTTTGGATTTGTGCCTTTGTAAAACTACTCATGGA
CCAAATCTGCTTTCCAATTTATATTAGTGATA

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 2

CO CL8099Contig1 636 2 10 U
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CTCATCTACTGTAAACAAGGATCCAAGCTTACCCCTCTCCAAGGTGCGGTGGCGAGGGTG
ACATGCGAGACGGCGGACGAATACGGTTACGAGGGAGAGGATGTGACGGTGCTTAGCCAA
GCGACGGATGCTAAGGGTTATTTCCTGGCGACGCTTTCTTCATCGGAGGTGAAGGGGTTA
AAGAACAAGGTGATCAAGATTAAAGAGTGCAGAGCGTTTCTTGAGCTTTCTCCAGCTGAT
ACCTGTTCTTATCCGACCGAGATCAACCGTGGAATTAGCGGAGCCATTCTCCAGACATAT
CGTCTTATAGAAAACAAGCTTAAGATGAAGCTCTTCACCGTTGGCCCTTTCGTGTTCTCC
CCTGAAGAAACTCAGGACAAGTCTATCCCCAATGGTTACTAAATAGTTTCTATACACGCT
TTAAACGGGCCTCAATGGTACACATGATCTTGTGATCTCACAATTGTCAAACGTTGTTTT
CTTTCTTGTTTAACATCCATCACTTGCTTCGTTGTTTTGAAATCAGCAGTATCAAGTGGT
TATATAATGCATATATATATATATATTGATTTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 

AF RS1EE30TF U 1
AF RS1EE30JQ C 26
BS 1 522 RS1EE30TF
BS 523 523 RS1EE30JQ
BS 524 577 RS1EE30TF
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BS 579 600 RS1EE30TF
BS 601 601 RS1EE30JQ
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BS 632 636 RS1EE30JQ

RD RS1EE30TF 631 0 0
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CTCATCTACTGTAAACAAGGATCCAAGCTTACCCCTCTCCAAGGTGCGGTGGCGAGGGTG
ACATGCGAGACGGCGGACGAATACGGTTACGAGGGAGAGGATGTGACGGTGCTTAGCCAA
GCGACGGATGCTAAGGGTTATTTCCTGGCGACGCTTTCTTCATCGGAGGTGAAGGGGTTA
AAGAACAAGGTGATCAAGATTAAAGAGTGCAGAGCGTTTCTTGAGCTTTCTCCAGCTGAT
ACCTGTTCTTATCCGACCGAGATCAACCGTGGAATTAGCGGAGCCATTCTCCAGACATAT
CGTCTTATAGAAAACAAGCTTAAGATGAAGCTCTTCACCGTTGGCCCTTTCGTGTTCTCC
CCTGAAGAAACTCAGGACAAGTCTATCCCCAATGGTTACTAAATAGTTTCTATACACGCT
TTAAACGGGCCTCAATGGTACACATGATCTTGTGATCTCACA*TTGTCAAACGTTGTTTT
CTTTCTTGTTTAACATCCATCACTTGCTTCGTTGTTT*GAAATCAGCAGTATCAAGTGGT
*ATATA*TGCATATATATATATATATTGATT

QA 1 631 1 631
DS 

RD RS1EE30JQ 611 0 0
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AGCTTACCCCTCTCCAAGGTGCGGTGGCGAGGGTGACATGCGAGACGGCGGACGAATACG
GTTACGAGGGAGAGGATGTGACGGTGCTTAGCCAAGCGACGGATGCTAAGGGTTATTTCC
TGGGGACGCTTTTTTCATCGGAGGTGAAGGGGTTAAAGAACAAGGTGATCAAGATTAAAG
AGTGCAGAGCGTTTCTTGAGCTTTTTCCAGCTGATACCTGTTTTTATCCGACCGAGATCA
ACCGTGGAATTAGCGGAGCCATTCTCCAGACATATCGTTTTATAGAAAACAAGCTTAAGA
TGAAGCTCTTCACCGTTGGCCCTTTCGTGTTCTCCCCTGAAGAAACTCAGGACAAGTCTA
TCCCCAATGGTTACTAAATAGTTTCTATACACGCTTTAAACGGGCCTCAATGGTACACAT
GATCTTGTGATCTCACAATTGTCAAACGTTGTTTTCTTTCTTGTTTAACATCCATCACTT
GCTTCGTTGTTTTGAAATCAGCAGTATCAAGTGGTTATATAATGCATATATATATATATA
TTGATTTTCTC

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 2

CO CL8100Contig1 716 2 3 U
TAAAGAAATAACACATTTATAAAACCATAAATCGACGTGGTGCAAGTTATCACACAGAAA
CGCAAGATGAAAGTAACCCTTTCTCTACAATTAAATGAAGACAAAGAACTGAAGACAAAG
AAGAGAAATAAACTTAACAGACATACTAGAGAACAAACATAGACTTCAAAAAAGATGAAG
GTGAACGAAACCGGAAACCTGATTGATCTGAAAAACGAAAAAGGCCTACATTATTAGAAT
TGAACTAAAATCTACCAAGCTCATTTCCATAAAGAACTACGAGCAACTGATACACTTACC
ACTTCTTCGACACAAGAAGTCATGCGCCAGTGAAGACACATACAAGTTTGGCAATCAACT
ACTCCAAACCCCATGTAATTGAGCAAAAGCTCCACAACTCCTTACCAAAAATTCCGAAAA
ACCAGAAATCACACACAGCAGAAACCAGACGACACAAAAGAAAATCAACAGCCCCAAAAC
CACATCAAATAGAATCCAAACAAGGGCTTGAGACACTTCTCCATCTAAACAAGTTGCCAA
ACTAAAAAAACTCCAAAACGCCACACACCTCTTAAACTTCTTCACTTCAGTAGATTGAGA
GACAAGCTCGATAAATCGAAGATGAGATGCTGTGACTGGAGAGAAGAACTAAGAATCCTT
GGTGTCATGTTTGAGAGACTGTCAAACCAAACCCAAGTAATAAAGACCCGATTTCC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BB52JQ U 2
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BS 588 716 RS1BB52TF

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GAACTAAAATCTACCAAGCTCATTTCCATAAAGAACTACGAGCAACTGATACACTTACCA
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DS 

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AAGAGAAATAAACTTAACAGACATACTAGAGAACAAACATAGACTTCAAAAAAGATGAAG
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TGAACTAAAATCTACCAAGCTCATTTCCATAAAGAACTACGAGCAACTGATACACTTACC
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ACTCCAAACCCCATGTAATTGAGCAAAAGCTCCACAACTCCTTACCAAAAATTCCGAAAA
ACCAGAAATCACACACAGCAGAAACCAGACGACACAAAAGAAAATCAACAGCCCCAAAAC
CACATCAGATAGAATCCAAACAAGGGCTTGAGACACTTCTCCATCTAAACAAGTTGCCAA
ACTAAAAAAACTCCAAAACGCCACACACCTCTTAAACTTCTTCACTTCAGTAGATTGAGA
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GGTGTCATGTTTGAGAGACTGTCAAACCAAACCCAAGTAATAAAGACCCGATTTCC

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DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CACGGATCCATCATGGTTCGAATACCGCATTTGATCTGGTGCTGGAGGATGTTTATGGTG
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AGGATTATATTAATTTACATTGTTTAGTT


BQ
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AGGATTATATTAATTTACATTGTTTAGTT

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TTTT
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QA 5 523 5 523
DS 



AS 1 2

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CAAAATTGTGGAGGACGTGAACGAATCGTATCGCAAATATGGGGAGAGGCACAAACGTTT
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ATTTTACTGATCTTTGGACCAGTGGATGATAACCAGTATATGTACATGTTTTCAAGATC


BQ
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AF RS1AG14TF U 1
AF RS1AG14JQ C 716
BS 1 839 RS1AG14TF
BS 840 1619 RS1AG14JQ

RD RS1AG14TF 839 0 0
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CACAAGTCATCTACTGAAAAGTTGAGTAGACATGGTCAAATGAAGCCTGGAGATAGTTCA
GGTAAATCAAACAAACATTCCGATGCCTTGGGTAATGTTCGTAAATCTGACGAATATGAC
TATCTTCCGCATGAAACCCTTTCTAGTCGTTCAGGAAAGGCCTTCAGAGACAATCATAGG
GATGATGTTCATTTCAAAAATAAGTTTCCAAGGAACACAAGATGGTGAGTCCTCCATACG
ACCTTCATTACCTTCTGACAAAACCAACAGAAAACACGGTGAACCGGATGGAAGTGGGAA
GGATTTCAAGAATGTTTCAGCCTTTGGCATGGGTTCATCTCCATTGGATAGCCATAGAGC
AAGATTACCTAAGGGAAATGGATCTGTTCTCCAAAAACAAGTTTCGGACTTGGAGTTGGG
TGAACTCCCTGAGTCATATGGGATAGATACATCATCGAAGCAGCTCGAAGAGAACACTTC
TATTAGGCAGTCAAATCTAAAACCAAGCACTTCAGAAAACTTATGTATTGACTCAGATAA
ACGAAGGTCTAAAAAATCCGTCTCTAAAAAGCCAGCTCTTGCACATGCCGGCAATGGCAC
AAAGGAATCGCCCCAACTCGACGTTAATGACTCAGAAAGATCCCAAAAGTTGGCTTTGCA
GTCACATGAGCAGAACCATACAGGTACAGACACTGAAAACGGCTCACATAACAAGAACTT
AGAGGATGCAGCTTATAAATCAAGACAGAGAGATAGTAGAGCAAGGGTAGGAAGCAGTG

QA 1 839 1 839
DS 

RD RS1AG14JQ 904 0 0
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AACTTAGAGGATGCAGCTTATAAATCAAGACAGAGAGATAGTAGAGCAAGGGTAGGAAGC
AGTGTGGAAGGTTACGGAGAGACGAACAAAAAAACGCCCGTTATAGAGCAGGGCTCCAAA
CGGCCATCCACATCCCGCTCATCAAGGGAGAGCAAAAGACACAAACATGCAACTTCTATG
AATGGACACAAAGATGCATCTTTTGATGAAGAAGACTCTTCTTATTTGAAATACGAGAAA
GCCTCTCCTGACCATAAGGGGCCTATTAGGGATCATTTGCAGTATAAAGCATACATGCAG
GAATATTTGGATAAATATGATGATTACTCCTCCATTAACAAGATATTAGAGAGCTACAGA
AATGACTTTCAAAAGTTGGGGGAAGACCTTAAGCTTGCAAAAGGAAGGGACATGTTGAGA
TATAACAAAATTGTGGAGGACGTGAACGAATCGTATCGCAAATATGGGGAGAGGCACAAA
CGTTTGAAGAAAGTCTTTATTGTTCTCCATGAAGAATTGAAGCAACTGAAAGAAAGAATG
AAAGACTATGCATCATCGCACGGGAAAGATTGATGCAGTCTGGAACCGAAGCTCTCTAGA
AAAGTTGGACCTCATGCTCAGAGGTGAAAGAGGAGGCTCGATGTCCATCTCCTCTTTTGG
AGTCCAGTCATATTGTTGATTAAAAGATTTAGCTGTGTTTTCTTCTTATGAAGCTAGAAA
TGATTGATAGGCCCAGTTTTGTGTGAGTTGTTCCTTAAGAAGACCTTTCGTAGATTTTAT
GGATTATTTTACTGATCTTTGGACCAGTGGATGATAACCAGTATATGTACATGTTTTCAA
GATC

QA 1 904 1 904
DS 



AS 1 2

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CAAAAAACACAAAGGAGGGGTCGGTATTTGCATAGGTGGCGGTCTAGGACCTAGCATTGG
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GACCTAAGGGGCTTGGAGTGTACATGCGCGTAATGGTTTCTTATTCTTCAGTTAAAGAAA
AAATGATTTTTCTTCTTCAGTTAATTTAACTGTAAAGATGGTGGTGTAGAAAAGAATGAG
AGAGAAAAAGAAGATGAGAGGAAAAGAAGGAGAGGGAGATGATTTTCGTAGATGATGGTT
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GTGTGACAAATTAAAGAATGAGAGAAGTGATGTGACAAATTTTATTTTAGATATATTTTA
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TAAGTTTACATGGGCAAATGCAAAAAGTTGCCCAATTGGCTAATTTAAACTTGAGGTCGC
CCAATTCCCG


BQ
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AF RS1CJ69TF U 1
AF RS1CJ69JQ C 125
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BS 631 850 RS1CJ69JQ

RD RS1CJ69TF 630 0 0
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CTACGCTCACAGTTCTTTGTTCGGAGTAGCGACGATTGCTCAGAATGGAAAACCACTGCC
TTGTATTGAGTTATTTGGAGAGGAGCAATGCGACATTTCTTATTGTAAAACTGAATGTGC
CAAAAAACACAAAGGAGGGGTCGGTATTTGCATAGGTGGCGGTCTAGGACCTAGCATTGG
TGACGAAATGCCAAAAAACAGATTTTTTGCAGATGCACTTATCCCAGGGGTAAAAGGAAG
ACTTGTTACCCTTGATTTTTTATGGGTAACCTAGTAGGGGAGATAATAAATTTACGACAT
TTTTAACCTTTTTGTCTATTAAACTTGGCAAGCTGGCAGTGCCGTGCGAAGAGATATGGA
GACCTAAGGGGCTTGGAGTGTACATGCGCGTAATGGTTTCTTATTCTTCAGTTAAAGAAA
AAATGATTTTTCTTCTTCAGTTAATTTAACTGTAAAGATGGTGGTGTAGAAAAGAATGAG
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QA 1 630 1 630
DS 

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AAAAAGAAGATGAGAGGAAAAGAAGGAGAGGGAGATGATTTTCGTAGATGATGGTTGGTG
GTGTGGAAAAGAAGGAGAGAGAAAAAGAAGGAAAGAGAAAAAGAATGAGAGAGGTGGTGT
GACAAATTAAAGAATGAGAGAAGTGATGTGACAAATTTTATTTTAGATATATTTTAATTG
AAATGGCAAAGATGTAAATAATGAATCTGACAAAGGTCCCAAAGGATATTTAGACATAAG
TTTACATGGGCAAATGCAAAAAGTTGCCCAATTGGCTAATTTAAACTTGAGGTCGCCCAA
TTCCCG

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL8105Contig1 769 2 6 U
GGCTCTCGTCTCCTCTTCTTCTTCGCTCAGCTCCTACAATAAAGGGCGAAGAATCTCTCG
TTCCTCGAGTTTCTCCTTGCCATCTCTTCCTTTTGAGGTCAAAATGGTTGAACAGACTCA
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CGCTTCTGCTCTCCAGAGCCCCGCTATGTACCAGAGGCGTGTGGCGTACGGAAACTACTC
AAACGCTGCGTTCCAGTATCCTCTCGCCGGCGCCGCCACTTCCAGGATCGTGGCGACTAC
TTCTCCCGTGTTTGTCCAGGCTCCAGCGGAGAAAGGGTTCTCTAGCTTCGCTATTGACTT
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CAAGCTTTTGATTCAGAACCAGGATGAGATGCTCAAGGCTGGAAGGCTCTCTGAGCCTTA
CAAGGGTATTGGTGACTGTTTCGGAAGGACTATTAAGGATGAGGGTTTTGGTTCTTTGTG
GAGAGGAAACACTGCTAACGTTATCCGTTACTTCCCCACTCAGGCCTTGAACTTTGCGTT
CAAAGATTACTTCAAGAGGCTTTTCAACTTCAAGAAAGACAGGGATGGTTACTGGAAGTG
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TCTCTTGACTACGCACGTACCCGTCTTGCCAATGACTCTAAGCAGCCAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FN55TF U 1
AF RS1E040TF U 71
BS 1 508 RS1FN55TF
BS 509 509 RS1E040TF
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BS 519 579 RS1FN55TF
BS 580 769 RS1E040TF

RD RS1FN55TF 579 0 0
GGCTCTCGTCTCCTCTTCTTCTTCGCTCAGCTCCTACAATAAAGGGCGAAGAATCTCTCG
TTCCTCGAGTTTCTCCTTGCCATCTCTTCCTTTTGAGGTCAAAATGGTTGAACAGACTCA
GTTCCAGAAGGCATCAGGCCAAATCATTCGTTCGGGTGTTTCTCAGGACATTCACGGTTA
CGCTTCTGCTCTCCAGAGCCCCGCTATGTACCAGAGGCGTGTGGCGTACGGAAACTACTC
AAACGCTGCGTTCCAGTATCCTCTCGCCGGCGCCGCCACTTCCAGGATCGTGGCGACTAC
TTCTCCCGTGTTTGTCCAGGCTCCAGCGGAGAAAGGGTTCTCTAGCTTCGCTATTGACTT
CCTCATGGGTGGTGTTTCCGCCGCTGTGTCCAAGACCGCTGCTGCTCCCATCGAGCGTGT
CAAGCTTTTGATTCAGAACCAGGATGAGATGCTCAAGGCTGGAAGGCTCTCTGAGCCTTA
CAAGGGTATTGGTGACTGTTTCGGAAGGGCTATTAAG*ATGAGGGTTTTGGTTCTTTGTG
GAGAGGAAACACTGCTAACGTTATCCGTTACTTCCCCAC

QA 1 579 1 579
DS 

RD RS1E040TF 699 0 0
GG
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ATCAGGCCAAATCATTCGTTCGGGTGTTTCTCAGGACATTCACGGTTACGCTTCTGCTCT
CCAGAGCCCCGCTATGTACCAGAGGCGTGTGGCGTACGGAAACTACTCAAACGCTGCGTT
CCAGTATCCTCTCGCCGGCGCCGCCACTTCCAGGATCGTGGCGACTACTTCTCCCGTGTT
TGTCCAGGCTCCAGCGGAGAAAGGGTTCTCTAGCTTCGCTATTGACTTCCTCATGGGTGG
TGTTTCCGCCGCTGTGTCCAAGACCGCTGCTGCTCCCATCGAGCGTGTCAAGCTTTTGAT
TCAGAACCAGGATGAGATGCTCAAGGCTGGAAGGCTCTCTGAGCCTTACAAGGGTATTGG
TGACTGTTTCGGAAGGACTATTAAGGATGAGGGTTTTGGTTCTTTGTGGAGAGGAAACAC
TGCTAACGTTATCCGTTACTTCCCCACTCAGGCCTTGAACTTTGCGTTCAAAGATTACTT
CAAGAGGCTTTTCAACTTCAAGAAAGACAGGGATGGTTACTGGAAGTGGTTTGCTGGTAA
CTTGGGATCCGGAGTGCTGCTGGTGCCTCTTCCCTTCTCTTTGTGTATTCTCTTGACTAC
GCACGTACCCGTCTTGCCAATGACTCTAAGCAGCCAA

QA 3 699 3 699
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8107Contig1 886 2 4 U
GGAAGGTAAAGCTGATGATGCAGAAGCTCCATTTACCAGGATTTTAAATATATACAAGAA
GATGTACGGAGAGAAAGATGGAAGAGTTGGTATGGCCATGTGCTCCCTTGCTAATGCAAA
ATGCACAAAAGGTGATGCAGATGAAGCGTTAGATCTCTACAAGAACGCTCTACAAATTAT
CAAAGAGTCAATTATATGGACATAGACAACACTTTCTTAGAAAACATGAGGATAGATCTT
GCTGAGCTGCTTCATTTTGTTGGAAGGGGAAACGAAGGACGAGAGCTGCTAGAAGAATGC
TTATTAATAAACGAGAAGTACAGTGGGAAAAACAATCCAAGCATGGCTACACATCTTATG
AACCTTGCAGCATCTTATTCACGCTCCAAGAACTATGTGGAGGCTGAGCGATTGCTGAGA
ACTTGTTTGGACATCATGGAGAAGTCAGCTGGTTCAGAGGATCAGTCCATGACCTTCCCA
ATGCTGAATCCTGCAGTCACTCTTTCTCAGCTAAACCGTTTTGAGGAAGCCGAGCAAGTA
GCGTTGAAGGTTCTACGGATACGTGAGAAGGCATTTGGCAAAGAGTCTCTCCCTGTTGGT
GAGGCGCTGGACTGTTTGGTGTCGATCCAGGCGAGATTAGGAAGAGACGATGGAGAAGTA
CTGGGTTTGCTGAAAAGGGTGCTGATGATACAAGAGAAAGAGTTTGGTCCATCAGCTGAA
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GAGAAATTTAAGTTTAGGAGAAGGCTAGCTTTGATTAGAGAGAGATACAAGCAGAGTCTA
AGCGTCTAGAACACGTTTTCTTACTTTCTTTTTTTAAATCTTTTAT


BQ
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AF RS1H285TF U 1
AF RS1H285JQB C 244
BS 1 719 RS1H285TF
BS 720 720 RS1H285JQB
BS 721 739 RS1H285TF
BS 740 886 RS1H285JQB

RD RS1H285TF 739 0 0
GGAAGGTAAAGCTGATGATGCAGAAGCTCCATTTACCAGGATTTTAAATATATACAAGAA
GATGTACGGAGAGAAAGATGGAAGAGTTGGTATGGCCATGTGCTCCCTTGCTAATGCAAA
ATGCACAAAAGGTGATGCAGATGAAGCGTTAGATCTCTACAAGAACGCTCTACAAATTAT
CAAAGAGTCAATTATATGGACATAGACAACACTTTCTTAGAAAACATGAGGATAGATCTT
GCTGAGCTGCTTCATTTTGTTGGAAGGGGAAACGAAGGACGAGAGCTGCTAGAAGAATGC
TTATTAATAAACGAGAAGTACAGTGGGAAAAACAATCCAAGCATGGCTACACATCTTATG
AACCTTGCAGCATCTTATTCACGCTCCAAGAACTATGTGGAGGCTGAGCGATTGCTGAGA
ACTTGTTTGGACATCATGGAGAAGTCAGCTGGTTCAGAGGATCAGTCCATGACCTTCCCA
ATGCTGAATCCTGCAGTCACTCTTTCTCAGCTAAACCGTTTTGAGGAAGCCGAGCAAGTA
GCGTTGAAGGTTCTACGGATACGTGAGAAGGCATTTGGCAAAGAGTCTCTCCCTGTTGGT
GAGGCGCTGGACTGTTTGGTGTCGATCCAGGCGAGATTAGGAAGAGACGATGGAGAAGTA
CTGGGTTTGCTGAAAAGGGTGCTGATGATACAAGAGAAAGAGTTTGGTCCATCAGCTGA*
GAACTCATTGTTACTCTCC

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1H285JQB 643 0 0
GAGCTGCTTCATTTTGTTGGAAGGGGAAACGAAGGACGAGAGCTGCTAGAAGAATGCTTA
TTAATAAACGAGAAGTACAGTGGGAAAAACAATCCAAGCATGGCTACACATCTTATGAAC
CTTGCAGCATCTTATTCACGCTCCAAGAACTATGTGGAGGCTGAGCGATTGCTGAGAACT
TGTTTGGACATCATGGAGAAGTCAGCTGGTTCAGAGGATCAGTCCATGACCTTCCCAATG
CTGAATCCTGCAGTCACTCTTTTTCAGCTAAACCGTTTTGAGGAAGCCGAGCAAGTAGCG
TTGAAGGTTCTACGGATACGTGAGAAGGCATTTGGCAAAGAGTCTCTCCCTGTTGGTGAG
GCGCTGGACTGTTTGGTGTCGATCCAGGCGAGATTAGGAAGAGACGATGGAGAAGTACTG
GGTTTGCTGAAAAGGGTGCTGATGATACAAGAGAAAGAGTTTGGTCCATCAGCTGAAGAA
CTCATTGTTACTCTCCAGAAGATAGTGCATATGTTGGATAAGTTGGAGATGAAAGATGAG
AAATTTAAGTTTAGGAGAAGGCTAGCTTTGATTAGAGAGAGATACAAGCAGAGTCTAAGC
GTCTAGAACACGTTTTCTTACTTTCTTTTTTTAAATCTTTTAT

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 2

CO CL8108Contig1 845 2 3 U
GACACAACACTCACCACATCTCTCTCACTTTTCTCTCTTCTTCACATAGTACAAAGAAAC
AGAAAAGAAGAAAAACTCTTTAGAGATCAAAAGATGAACATCGCTCACACCATCTTCGGC
GTTTTCGGAAATGCAACTGCTCTGTTTCTCTTCTTGGCTCCTTCGATAACATTCAAGAGA
ATCATCAAGAGCAAATCGACTGAACAGTTCTCTGGCATCCCTTACCCTATGACTCTCCTC
AACTGCCTCCTCTCCGCCTGGTACGGACTTCCCTTTGTATCAAAGGACAACACGCTCGTG
AGCACGATCAACGGAACAGGAGCAGTGATCGAGACAATCTACGTGCTGATCTTCCTTATC
TACGCACCGAAGAAGGAGAAAGCTAAGATCTTTGGCATCTTCACCGCCGTCTTGGCCGTG
TTCGCAACGGTGGCTCTCGTCTCTCTTTTTGCCCTCCATGGTAACGCTAGAAAACTCTTC
TGTGGTATTGCAGCCACAGTTTTCTCCATCATCATGTACGCTTCTCCACTCTCAATCATG
ATTCCAAATGGATTTGGATGTGCTTTAGGAACACTTCAGCTGATTCTCTACTTCATCTAC
TGCGGAAACAAAGGCGACAAATCTGCTGAAAAAGGATGACAAGTCTCTGGAGATGAGAAT
TGAGGAGAAGAAGCAACATGCGGTTAATGGAAAGCAGCAAGAGCAGCAAGTTTAGATCTT
TCAATGACTTGTTTGTCTCTCTGTATTTCGTTTTTTAACTCTACTTGCTTAGAGCAGAGA
TTAAAAATCTATGCTGAACAAAATGTAAGATTCTTAGTGTCTTCCTAGTGATGAAACGAG
TGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 

AF RS1DG52TF U 28
AF RS1DG52JQ C 1
BS 1 28 RS1DG52JQ
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T
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TCTTCTTGGCTCCTTCGATAACATTCAAGAGAATCATCAAGAGCAAATCGACTGAACAGT
TCTCTGGCATCCCTTACCCTATGACTCTCCTCAACTGCCTCCTCTCCGCCTGGTACGGAC
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TTGCCCTCCATGGTAACGCTAGAAAACTCTTCTGTGGTATTGCAGCCACAGTTTTCTCCA
TCATCATGTACGCTTCTCCACTCTCAATCATGATTCCAAATGGATTTGGATGTGCTTTA
CG

QA 2 540 2 540
DS 

RD RS1DG52JQ 845 0 0
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AGAAAAGAAGAAAAACTCTTTAGAGATCAAAAGATGAACATCGCTCACACCATCTTCGGC
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AACTGCCTCCTCTCCGCCTGGTACGGACTTCCCTTTGTATCAAAGGACAACACGCTCGTG
AGCACGATCAACGGAACAGGAGCAGTGATCGAGACAATCTACGTGCTGATCTTCCTTATC
TACGCACCGAAGAAGGAGAAAGCTAAGATCTTTGGCATCTTCACCGCCGTCTTGGCCGTG
TTCGCAACGGTGGCTCTCGTCTCTCTTTTTGCCCTCCATGGTAACGCTAGAAAACTCTTC
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ATTCCAAATGGATTTGGATGTGCTTTAGGAACACTTCAGCTGATTCTCTACTTCATCTAC
TGCGGAAACAAAGGCGACAAATCTGCTGAAAAAGGATGACAAGTCTCTGGAGATGAGAAT
TGAGGAGAAGAAGCAACATGCGGTTAATGGAAAGCAGCAAGAGCAGCAAGTTTAGATCTT
TCAATGACTTGTTTGTCTCTCTGTATTTCGTTTTTTAACTCTACTTGCTTAGAGCAGAGA
TTAAAAATCTATGCTGAACAAAATGTAAGATTCTTAGTGTCTTCCTAGTGATGAAACGAG
TGATT

QA 1 845 1 845
DS 



AS 1 2

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TAC


BQ
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10 10 10 

AF RS1AF46JQ U 39
AF RS1AF46TF C 1
BS 1 38 RS1AF46TF
BS 39 611 RS1AF46JQ
BS 612 663 RS1AF46TF

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GAGAGGTCATCAATCAAGCCTTTCTTTCTGCCACTTCCCTAATACTATCCGTAAAACAAA
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TAAATGAATTGTTCTTTTTTTTTTAATGTAGAGAGGACCAGCAAGAATCCATATCTGAGT
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QA 1 573 1 573
DS 

RD RS1AF46TF 663 0 0
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CGGTAGTCAAGTCTTTTTGGCTTAAGACCACAAACAAAGAGAGGTCATCAATCAAGCCTT
TCTTTCTGCCACTTCCCTAATACTATCCGTAAAACAAAAGAAATAAGAATCTAAACCATC
ACAGGTAAAGAGTATCAAAGACAAAAAAGAAAAGTTTTTAAATGAATTGTTCTTTTTTTT
TTAATGTAGAGAGGACCAGCAAGAATCCATATCTGAGTTGGTTCATCCTCCTGACTTGGT
CTTGAGCATCTCTCTTCTTTTCTGTTCTTCAACTTGTATGGTGCAGTGTAGTTTAAAACG
AGGAAAGGTGTCTTTTATATAAACTAACTGACCTGTTCTCCGATCAAATCCAGACCAACA
ATCACGAAAGTGAGTCCTTGGAACAAGAGGAAGTAGAAGCGGATCCCTTGTGCAGACAAC
AAGCTTCTCACCGAGGCTGCCAAGAGGATAAAAGCCAGAGCAATCTCTGTTCTGTACAGA
CGGTTTCTTTTGGTCTTCCCTGCTTTCTTAGCTGTTCCTAGTTTGCTAAGCTCGGTTAGA
CCCGAATCAGAGGATGATCTTTGGATGCTCGTGGAGTCAACCAAAGAGCCTGACTCTGCG
TAC

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

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ATGCACATAGTGTCAGTGACAGAGACAGAATCTGAAACAGAGCATGATGAGGCAATGGTG
GTGGGGACAAGGACAGCAACGGTGGAGCGTGTGAGATTATACGAGACGCCAAGAGAATTG
TACAGAAAGATGAGGCTATCGAGAACAATGATCAATGATCATTACATGCCAATGTATAAA
AAGATGATGGAACTCTTGATTACTGAGCTCGAGTGTGACCTACACTCTTCATGAGCTTTC
CTACGCTCAGCATCAACTGTACATTGTTTAATATTTATACACAGTTTAATTTACATGCT


BQ
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AF RS1AD47TF U 1
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BS 708 959 RS1AD47JQ

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QA 1 707 1 707
DS 

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CATTACAGGAGGCAGTGACTCCTCCAACGGACAGAACCAGAGTCCGGGTTCAGTATCTTC
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AGCAACGGTGGAGCGTGTGAGATTATACGAGACGCCAAGAGAATTGTACAGAAAGATGAG
GCTATCGAGAACAATGATCAATGATCATTACATGCCAATGTATAAAAAGATGATGGAACT
CTTGATTACTGAGCTCGAGTGTGACCTACACTCTTCATGAGCTTTCCTACGCTCAGCATC
AACTGTACATTGTTTAATATTTATACACAGTTTAATTTACATGCT

QA 1 825 1 825
DS 



AS 1 2

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CGGGAAGAAATATAGAATGGAGTTTGCGTCTCTGTGGAACAAAGCTGTGGACCAGACCTT
TGAACCTGCCATTCAATACCTTAGTTCACGTAAATGGTAGAGAATGGATATGGATACTCT
ATCTCAATCCTTGCCCTGTTTCTCTACTTATTGTTGCTTATTTTTACAATTGTATGATGA
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GTTGTTGTTTTTACTGAG


BQ
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AF RS1B545TF U 1
AF RS1DF02TF U 1
BS 1 498 RS1B545TF

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GTTGTTGTTTTTACTGAG

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DS 

RD RS1DF02TF 498 0 0
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CACGCTAGGTAGCGCCTTGACAGGTTTCATCGTCCTTGAGCAGCGAAAACTCATCCGTGA
ATCCGTCGCCGATCGTAAATCTCAATCCGTGGATCAATCTCAGGTGAGAGAAGGGATATT
CGGGAAGAAATATAGAATGGAGTTTGCGTCTCTGTGGAACAAAGCTGTGGACCAGACCTT
TGAACCTGCCATTCAATACCTTAGTTCACGTAAATGGTAGAGAATGGATATGGATACTCT
ATCTCAATCCTTGCCCTGTTTCTCTACTTATTGTTGCTTATTTTTACAATTGTATGATGA
TGTTATCTTGAATACACACTAGTATTCCTGTTTTGCTCTTTACTTTTCTTTGAGCACAGT
GTTGTTGTTTTTACTGAG

QA 1 498 1 498
DS 



AS 1 2

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TGTTTAGCTTTTATATCAATGGTCACATGAATTGTATTGATGGTCCATGTT


BQ
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AF RS1H764TF U 1
AF RS1H764JQB C 293
BS 1 664 RS1H764TF
BS 665 665 RS1H764JQB
BS 666 671 RS1H764TF
BS 672 672 RS1H764JQB
BS 673 678 RS1H764TF
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BS 680 692 RS1H764TF
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RD RS1H764TF 692 0 0
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ATGTTCTTCTTAGAGCTGTGGACAGATTTACTGCCAACTACAACAAGTTTCCTGGCCAGT
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TCATCAAGCTTGTCACAAAACAGTTTGTGCCGATGTTGGGGACTTACATCTTCAACGGCA
TTGATCACAAGTCTCAGTTGTTGACACTGTAGAAGATCTCTCCTTGGACATTGGTGGCCT
GAAACAGAGAGAATAGCGTTATATTATGTTTTTTTTTCTTCACTGAGTTTTAAAAGAATC
TTTTCGCGGGTGTACCTGTTCAAGGATATGATTTTAACCGGCACAAGATTATGCCCTGAG
TGTT*AGCTTT*ATATCA*TGGTCACATGAAT

QA 1 692 1 692
DS 

RD RS1H764JQB 419 0 0
TCTTCTTGCCGACTTGGGGTGTAACGGCTCAGTGCTGCCCGATGACCTTATCAATGAGAT
GTGTCGCTTTGGTGCCTCGGAGCTTCATGTGGTTGCTGTCTTTGTTGGTGGAATCGCATT
TCAAGAAGTCATCAAGCTTGTCACAAAACAGTTTGTGCCGATGTTGGGGACTTACATTTT
CAACGGCATTGATCACAAGTTTCAGTTGTTGACACTGTAGAAGATTTTTCCTTGGACATT
GGTGGCCTGAAACAGAGAGAATAGCGTTATATTATGTTTTTTTTTTTTCACTGAGTTTTA
AAAGAATCTTTTCGCGGGTGTACCTGTTCAAGGATATGATTTTAACCGGCACAAGATTAT
GCCCTGAGTGTTTAGCTTTTATATCAATGGTCACATGAATTGTATTGATGGTCCATGTT

QA 1 419 1 419
DS 



AS 1 2

CO CL8113Contig1 757 2 13 U
CCTCTTACATTGGGAGACTATCCATATGTAATGAGAAGAAGCATTGGATCAAGACTGCCA
GATTTCTCAGAGGAAGAATCAGAGCTAGTTAAAGGCTCCTCTGACTTTATAGGAATCATT
CACTATCTTGCAGCTATTGTCACAAACACCAAACCTTATTTTCCAGGATACTCAGACTAC
TACTATGACACTGGCGTAACTTCGTCATACACTTGTAATATTACAACTTCTCAATGTTCT
GTTGCTCCATGGGCTTTAGAAGGTGTTCTGGAGTATATAAAGCAGAAGCTATGGCAACCC
CTCCTGTCTACATTCTTGAGAATGGGTAAAACGATTAAGGGGGGATTTTCAGCTGCAACT
AAAGGATACACCAAGGGATTGAGTACTTACATGTTTACATGGGTGCTGTGCTCAGTGCCG
TTAGGAATGGGTCTGACACGAGGGGATACTTTGTATGGTCACTGATGGATGTATATGAGT
TACTTGGCGGATACGGTAAAAGCTACGGATTGTACTATGTTAATTTCAGTGATGCTCATC
GCACGAGATCTCCAAAACTCTCTGCTCATTGGTACTCTGCTTTTATCAAGGGTGACGCCA
CCTTTTCTTGGTTCTCAAGGCATCTCGCAATTGCAAAGCAACTTCTCTTCTTCCTCTTTG
TAATCTTTATGTGCTTATATTTGCTTACTGAGTTGGGCATATACGCATATTAAGAAATTA
AAACTTTCATGAATACTTTTTCAGGATTAATAATTCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A252TV U 1
AF RS1A252TF U 265
BS 1 286 RS1A252TV
BS 287 287 RS1A252TF
BS 288 300 RS1A252TV
BS 301 301 RS1A252TF
BS 302 325 RS1A252TV
BS 326 326 RS1A252TF
BS 327 343 RS1A252TV
BS 344 344 RS1A252TF
BS 345 376 RS1A252TV
BS 377 377 RS1A252TF
BS 378 605 RS1A252TV
BS 606 606 RS1A252TF
BS 607 757 RS1A252TV

RD RS1A252TV 757 0 0
CCTCTTACATTGGGAGACTATCCATATGTAATGAGAAGAAGCATTGGATCAAGACTGCCA
GATTTCTCAGAGGAAGAATCAGAGCTAGTTAAAGGCTCCTCTGACTTTATAGGAATCATT
CACTATCTTGCAGCTATTGTCACAAACACCAAACCTTATTTTCCAGGATACTCAGACTAC
TACTATGACACTGGCGTAACTTCGTCATACACTTGTAATATTACAACTTCTCAATGTTCT
GTTGCTCCATGGGCTTTAGAAGGTGTTCTGGAGTATATAAAGCAGA*GCTATGGCAACCC
*TCCTGTCTACATTCTTGAGAATGG*TAAAACGATTAAGGGGG*ATTTTCAGCTGCAACT
AAAGGATACACCAAGG*ATTGAGTACTTACATGTTTACATGGGTGCTGTGCTCAGTGCCG
TTAGGAATGGGTCTGACACGAGGGGATACTTTGTATGGTCACTGATGGATGTATATGAGT
TACTTGGCGGATACGGTAAAAGCTACGGATTGTACTATGTTAATTTCAGTGATGCTCATC
GCACGAGATCTCCAAAACTCTCTGCTCATTGGTACTCTGCTTTTATCAAGGGTGACGCCA
CCTTT*CTTGGTTCTCAAGGCATCTCGCAATTGCAAAGCAACTTCTCTTCTTCCTCTTTG
TAATCTTTATGTGCTTATATTTGCTTACTGAGTTGGGCATATACGCATATTAAGAAATTA
AAACTTTCATGAATACTTTTTCAGGATTAATAATTCA

QA 1 757 1 757
DS 

RD RS1A252TF 476 0 0
TTCTG
GGAGTATATAAAGCAGAAGCTATGGCAACCCCTCCTGTCTACATTCTTGAGAATGGGTAA
AACGATTAAGGGGGGATTTTCAGCTGCAACTAAAGGATACACCAAGGGATTGAGTACTTA
CATGTTTACATGGGTGCTGTGCTCAGTGCCGTTAGGAATGGGTCTGACACGAGGGGATAC
TTTGTATGGTCACTGATGGATGTATATGAGTTACTTGGCGGATACGGTAAAAGCTACGGA
TTGTACTATGTTAATTTCAGTGATGCTCATCGCACGAGATCTCCAAAACTCTCTGCTCAT
TGGTACTCTGCTTTTATCAAGGGTGACGCCACCTTTTCTTGGTTCTCAAGGCATCTCGCA
ATTGCAAAGCAACTTCTCTTCTTCCTCTTTGTAATCTTTATGTGCTTATATTTGCTTACT
GAGTTGGGCATATACGCATATTAAGAAATTAAAACTTTCATGAATACTTTT

QA 6 476 6 476
DS 



AS 1 2

CO CL8114Contig1 922 2 4 U
GAGAGATTATCGAGGCCACTTCCAAATATGTCGCGGACAATTTTCCGGCAGTGCCTAATC
CCGCGGGAACGGATCTTACTATAATTGTTAAGATAACTGATTTTAATGAAGACGCTTTCC
GCAGAATCGATCTCGACGTCTACATGATCGAGCTCGGCGAAAACCGAAGAGGACCCATCC
CCAGTGAAGAGTATGGTGAATGCTCGGTTTGCTTTGAAGAGTTCGGGACTGGTGGAGAGC
TTAACACTTTAGTTTGTGGACATTCTTTCCATCATCACTGCGTTTTGGAATGGGTTCAAA
ACAACTTGACATGTCCATGTTGTAGGGTAGGACTTGCTTGGTCTACATGATATCCGATGT
GTTTAATTACTTTTTTTAATAATTTGTTTCATGTTATCCTCTCGAATCTTTTCTTTGATA
ATCCAAAAAAAAATATTACAAATTTGGTGTTCTATTATTAGTTACATTATGTGTTCATCG
TACATTATTCCTCATATGGAAGCAATATATGGAAGCTAATTTTAGCGGTGGGGATGACTA
TCATAAGTTTCTAAACCCCGAACTTCATATAATTTTCTAATGAATCCAAAATAAAGCAAA
AAAGCAGGAAATCTGTTGTTAGGAGGGATCGAACCCTGGACCATTACCATATACAATGAA
TACTTCACCGACAGGGCGAAGACATACTTTGTGACTCGCCGAGAGAATCAAAATCTAATC
GTGAGATGCTAGCCCATTTTTTTAATAAACGAGTTTAGAAACCCCTGCTGTGCATTAGCT
CTGCCTGCGTCAATTATTCCACTTAATATGATTTTATTATGAGTTGCCTTATATAGGAGA
TTTAGCCAACCACGAAATCATCCTTTCCAATCTTAGAATATCTCTTTAAATCCTGTATTA
AAAACAACACTCTCATTCAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EG06TF U 1
AF RS1EG06JQ C 282
BS 1 742 RS1EG06TF
BS 743 743 RS1EG06JQ
BS 744 804 RS1EG06TF
BS 805 922 RS1EG06JQ

RD RS1EG06TF 804 0 0
GAGAGATTATCGAGGCCACTTCCAAATATGTCGCGGACAATTTTCCGGCAGTGCCTAATC
CCGCGGGAACGGATCTTACTATAATTGTTAAGATAACTGATTTTAATGAAGACGCTTTCC
GCAGAATCGATCTCGACGTCTACATGATCGAGCTCGGCGAAAACCGAAGAGGACCCATCC
CCAGTGAAGAGTATGGTGAATGCTCGGTTTGCTTTGAAGAGTTCGGGACTGGTGGAGAGC
TTAACACTTTAGTTTGTGGACATTCTTTCCATCATCACTGCGTTTTGGAATGGGTTCAAA
ACAACTTGACATGTCCATGTTGTAGGGTAGGACTTGCTTGGTCTACATGATATCCGATGT
GTTTAATTACTTTTTTTAATAATTTGTTTCATGTTATCCTCTCGAATCTTTTCTTTGATA
ATCCAAAAAAAAATATTACAAATTTGGTGTTCTATTATTAGTTACATTATGTGTTCATCG
TACATTATTCCTCATATGGAAGCAATATATGGAAGCTAATTTTAGCGGTGGGGATGACTA
TCATAAGTTTCTAAACCCCGAACTTCATATAATTTTCTAATGAATCCAAAATAAAGCAAA
AAAGCAGGAAATCTGTTGTTAGGAGGGATCGAACCCTGGACCATTACCATATACAATGAA
TACTTCACCGACAGGGCGAAGACATACTTTGTGACTCGCCGAGAGAATCAAAATCTAATC
GTGAGATGCTAGCCCATTTTTT*AATAAACGAGTTTAGAAACCCCTGCTGTGCATTAGCT
CTGCCTGCGTCAATTATTCCACTT

QA 1 804 1 804
DS 

RD RS1EG06JQ 641 0 0
GTTTTGGAATGGGTTCAAAACAACTTGACATGTCCATGTTGTAGGGTAGGACTTGCTTGG
TCTACATGATATCCGATGTGTTTAATTACTTTTTTTAATAATTTGTTTCATGTTATCCTC
TCGAATCTTTTCTTTGATAATCCAAAAAAAAATATTACAAATTTGGTGTTCTATTATTAG
TTACATTATGTGTTCATCGTACATTATTCCTCATATGGAAGCAATATATGGAAGCTAATT
TTAGCGGTGGGGATGACTATCATAAGTTTCTAAACCCCGAACTTCATATAATTTTTTAAT
GAATCCAAAATAAAGCAAAAAAGCAGGAAATCTGTTGTTAGGAGGGATCGAACCCTGGAC
CATTACCATATACAATGAATACTTCACCGACAGGGGGAAGACATACTTTGTGACTCGCCG
AGAGAATCAAAATCTAATCGTGAGATGCTAGCCCATTTTTTTAATAAACGAGTTTAGAAA
CCCCTGCTGTGCATTAGCTCTGCCTGCGTCAATTATTCCACTTAATATGATTTTATTATG
AGTTGCCTTATATAGGAGATTTAGCCAACCACGAAATCATCCTTTCCAATCTTAGAATAT
CTCTTTAAATCCTGTATTAAAAACAACACTCTCATTCAACC

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

CO CL8115Contig1 729 2 1 U
GATTTATCAACTCTCATACAAAATAAGTAATCAAATAATAACAAACAATTTCTTTTTTGA
CAAACTTATCAAAAAAGCAACAAATCATTGCATTACACAACTCAACTTCATTTGTCCTTA
TTTCAATCTCCCTCCCGACTACAAAAGTTCTACACAATAAAGTTCATCCAATCTTTTTTA
TACATTCACCCCTTACTGATACGTGGAACCGATCCTCACAAAATCGGTTTGTCCATCAGC
TCGTTGTCAGCTGCGATCCTCCCCGAGCCACGGCCGGTTATCCTTCCGAACGATCCAATG
CTTGAAAGACCCATGAAACTGCTGCTTTCTTCGCCGAGGTTTATCGATCTTCTATGCTTT
CTGAGTTTTGAACAGTTTACCTCACCTGCCTCACGATCAACAACTTCATTCTGGCTCTTG
CTCTTGTCGTTGTTGTTGTTGTTCTGGGCGACGACTAACCGGACGATGACACTTCTACAG
AACGGGCACACCGGTGGTGTCACGGTTGAAGTCGTTGGGTTAGGTTTGTTGTGACAGCAC
AGTGCAAGTGCGCATTGCGCACACATTTGGTGACCACAGTCTTTGACTTCAATCGTGCAT
ACTTGCTCAAAGCAAATGCAACAGAGTTCCGAGTCACTCATCTCAGACATGTTATCATCT
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TCTCTGTTA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AF RS1EG21JQ U 1
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G
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GACTACAAAAGTTCTACACAATAAAGTTCATCCAATCTTTTTTATACATTCACCCCTTAC
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TTTCAATCTCCCTCCCGACTACAAAAGTTCTACACAATAAAGTTCATCCAATCTTTTTTA
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CTTGAAAGACCCATGAAACTGCTGCTTTCTTCGCCGAGGTTTATCGATCTTCTATGCTTT
CTGAGTTTTGAACAGTTTACCTCACCTGCCTCACGATCAACAACTTCATTCTGGCTCTTG
CTCTTGTCGTTGTTGTTGTTGTTCTGGGCGACGACTAACCGGACGATGACACTTCTACAG
AACGGGCACACCGGTGGTGTCACGGTTGAAGTCGTTGGGTTAGGTTTGTTGTGACAGCAC
AGTGCAAGTGCGCATTGCGCACACATTTGGTGACCACAGTCTTTGACTTCAATCGTGCAT
ACTTGCTCAAAGCAAATGCAACAGAGTTCCGAGTCACTCATCTCAGACATGTTATCATCT
GAGGAGAAAGATGGTGGTGGTAAGGAGTAAGCAGTTCCTTTGAAAATGGTTTCCTCTCTT
TCTCTGTTA

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DS 



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GGGATATGACAATCCCGCTCCGGCTACAATGATGATCATATCGGATGGCGCTGAGTATGT
CTTTGGAGATACTATTGCCCGGGAACAACAATTTAATAAGTACAACCTGTTTTGGGCTTA
TTCTTTTAGGCCTCTGAAAATGTCAATCCTGCTCACTTCTGCCGAGTGGCTCCGGGATAG
CTTACTTGCAGTTTCAGAGACAAGAAGACATGATTTCCTTCGGAAGTGCAGTGGAAGTAG
TATTGAAAGGGTTGGTGAATCTGCCGGAATGTTTTATTGCAAAGTGTGCTACTCTGATTT
CAAAATCCTGGATGAATTCATCAGACATCTCTGGACTTTAAATCATCTCTGTGATGAGGA
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AGTGATCAGAGTTTTCCTATGAACCTATCTTTATTTTTCTTGTTCTGGTCTTATGTTTCT
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BQ
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AF RS1E429TF U 157
AF RS1G173TF U 1
BS 1 756 RS1G173TF

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G
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AAGTACAACCTGTTTTGGGCTTATTCTTTTAGGCCTCTGAAAATGTCAATCCTGCTCACT
TCTGCCGGGTGGCTCTGGGATAGCTTACTTGCAGTTTCAGAGACAAGAAGACATGATTTC
CTTCGGAAGTGCA
TGGA

QA 2 194 2 194
DS 

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TGTTGCACATGTCATTCAGGAAGTCATATTCTCGCGCATGTCTAGAGATTTGAGGAATTG
GGGATATGACAATCCCGCTCCGGCTACAATGATGATCATATCGGATGGCGCTGAGTATGT
CTTTGGAGATACTATTGCCCGGGAACAACAATTTAATAAGTACAACCTGTTTTGGGCTTA
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CTTACTTGCAGTTTCAGAGACAAGAAGACATGATTTCCTTCGGAAGTGCAGTGGAAGTAG
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CAAAATCCTGGATGAATTCATCAGACATCTCTGGACTTTAAATCATCTCTGTGATGAGGA
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CTGCTTGAAGTACTTTATTTACTTTTCGGACTTACTTTTTTCTCGCTTGTTTAATTCACC
AAACATATAAGTTTAATCGTGTTACTGTATGTGTAT

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

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GCAGCCTAATTCGATCTACAGCTTCTCCGATGCTCCTGAAGGATCTAAACGGCTGTCTTG
GACGTTTGAGAAGGAAGGGACTAAACTCGAGTGGAGGTGGAAGTGTAAATTATCACATGA
CAGCAAGAAGATCACTGTCGGGATCTTGGATTTTCTTATGGAGGCTAACATAAGGCTAAG
CGAAGAAGTTGTGAATAAGACAAGATCTTTTGATAAGATGAAAAGTGAAGCTGAGAAATG
CCTCACGCAAGGTGAAAGACTCTGCAATGAAAAAATTGAGTTTGAGGATGCAACTTATTC
AAAGTTCATTTCTGTGTTAAATGCAAAGAAGGAAAAACTCAGAGCACTAAGAGACAAAGA
AGATTCAGGGAAAGAAGTTGCAGAGGAAGAGGAAGAGTCCACGGACAAAGGTGAAAGCTC
TGAAAGTGGAAGAAGTGATAACGAGCAGAGTGAAGCATCAAAGAAGGCAGCAACAACAAG
CAGCAGAGGCCGTGGAAGGAAGAGAGCTTCACGCAGTTGAGAGATTCCCCCTTCCTTGAG
GTTTTAGGTAAAGAAGCACCTAGTTTCGCTGTCATAAACACTTTGTGAGCACTTGACGGT
TGATACGGAAGATATTTCTCCATAAAACGACGAAACCTAGTACTGGGGGAATCATTGTTG
CCATATCTCGCTATGACCTCTTCTATAACCGGTTTCATAATTTTGTCGCAAGCACCGTGT
ACCAATGTGTTGCCATATGTTTGGCCATTGGGCGCTACTCAAACATACTTTCTTTTGGGA
AAACATGTATTCAGTCCTATGTAAAGATATCTCCTTACTTAGTCTACCGGTAAATTTATT
GTGGCTTATCACTAGTTCAAAACTTAAACCTGCAGATTTTTACTAC


BQ
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AF RS1EQ82TF U 1
AF RS1EQ82JQ C 122
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BS 656 946 RS1EQ82JQ

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GCAGCCTAATTCGATCTACAGCTTCTCCGATGCTCCTGAAGGATCTAAACGGCTGTCTTG
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CGAAGAAGTTGTGAATAAGACAAGATCTTTTGATAAGATGAAAAGTGAAGCTGAGAAATG
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AAAGTTCATTTCTGTGTTAAATGCAAAGAAGGAAAAACTCAGAGCACTAAGAGACAAAGA
AGATTCAGGGAAAGAAGTTGCAGAGGAAGAGGAAGAGTCCACGGACAAAGGTGAAAGCTC
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CAGCAGAGGCCGTGGAAGGAAGAGAGCTTCACGCAGTTGAGAGATTCCCCCTTCCTTGAG
GTTTTAGGTAAAGAAGCACCTAGTTTCGCTGTCATAAACACTTTGTGAGCACTTG

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1EQ82JQ 825 0 0
GACG
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AGAAGATCACTGTCGGGATCTTGGATTTTCTTATGGAGGCTAACATAAGGCTAAGCGAAG
AAGTTGTGAATAAGACAAGATCTTTTGATAAGATGAAAAGTGAAGCTGAGAAATGCCTCA
CGCAAGGTGAAAGACTCTGCAATGAAAAAATTGAGTTTGAGGATGCAACTTATTCAAAGT
TCATTTCTGTGTTAAATGCAAAGAAGGAAAAACTCAGAGCACTAAGAGACAAAGAAGATT
CAGGGAAAGAAGTTGCAGAGGAAGAGGAAGAGTCCACGGACAAAGGTGAAAGCTCTGAAA
GTGGAAGAAGTGATAACGAGCAGAGTGAAGCATCAAAGAAGGCAGCAACAACAAGCAGCA
GAGGCCGTGGAAGGAAGAGAGCTTCACGCAGTTGAGAGATTCCCCCTTCCTTGAGGTTTT
AGGTAAAGAAGCACCTAGTTTCGCTGTCATAAACACTTTGTGAGCACTTGACGGTTGATA
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TCTCGCTATGACCTCTTCTATAACCGGTTTCATAATTTTGTCGCAAGCACCGTGTACCAA
TGTGTTGCCATATGTTTGGCCATTGGGCGCTACTCAAACATACTTTCTTTTGGGAAAACA
TGTATTCAGTCCTATGTAAAGATATCTCCTTACTTAGTCTACCGGTAAATTTATTGTGGC
TTATCACTAGTTCAAAACTTAAACCTGCAGATTTTTACTAC

QA 5 825 5 825
DS 



AS 1 2

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TTTATTTTGGGCTTTGTTTGCCTTTCGGTTTGTTGTTTGTGTTGGACTTGTCCTTTTGGA
CTTGATCTTTTTATAAAATTCCAGATGAC


BQ
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AF RS1CY55TF U 1
AF RS1CY55JQ C 1
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TAATTCTTCCATCAGATCTGGTCAATTTTTTTTTGTTTGAGTTGTTTGTGGTCGGTGTCT
TAGTCTGTACTATTCATCTCTTACTTGGTTTGGCTAATCGAAAGGCTCTGGTTTATGTCT
CCCCATGGTTGGG

QA 1 253 1 253
DS 

RD RS1CY55JQ 689 0 0
GGAAGATGTGGTGTCGTTTGATTTCTTCGTCGATGCGGTGGCTCGCTTGATTGATTTGGC
CAGACCTGTAATTTTTTCTGGTGTACGGTGCTGGTTGATGCCGTCTCTGAGGTGGGTTGT
TAATTCTTCCATCAGATCTGGTCAATTTTTTTTTGTTTGAGTTGTTTGTGGTCGGTGTCT
TAGTCTGTACTATTCATCTCTTACTTGGTTTGGCTAATCGAAAGGCTCTGGTTTATGTCT
CCCCATGGTTGGGGCTGTTGTCTCTGAGAAGAGGTGGTTCACATAACACCATCTTCGCCA
GCTTGCCTCTCCGGGAAGAGGCGATTCCCTTACGCCATCTTCGACGGCCGGTTCCATTCT
GTTTTAGTTGATCTCCGGTTCGCGCTGTCTTATGTCTACTCTTGCGTGTTGGAAGATTAG
AGCTTTGGATTCAATCTTTCTTCTCCAGTTTGGCTTAGCTGGTGGTGGTGGTTCGACTTG
CTCTGTGAATCCGGAGTAATCTCAGGCCTGGCGTTACAGAAGTTTCGTGGTGGGAGAAGA
GGATTTCTTCCTCTTTGATTATTGTGTGGGCTTAAAGGTCTGGTTTAGTCTAATGGATGT
TTTATTTTGGGCTTTGTTTGCCTTTCGGTTTGTTGTTTGTGTTGGACTTGTCCTTTTGGA
CTTGATCTTTTTATAAAATTCCAGATGAC

QA 1 689 1 689
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AGTTTCTCTCAAACCTCCCTTCTTATCAAATACAAATCTTTCAGAAGGGAGAGTTTGATT
TTGTTTTTGTTGTGTAATACTTTCGATCAATCAGATCGACTTTTACTTTCGCTTGGCGAC
TTGTAAACCTTCGCATGGCGATTTTCTTTTTGTTTTGTTGTGTTTTAAATCAAAAACAGA
GCTGTTCTTAATGGGTTTTTGGAATCTCTGTTTTGGTAATCAGTCTCCTCTTTCGCTAAT
ATTCTAAATCCCGTTTTGGTTTGTGTTTGGGCTTTCTTCTTCTTCCGATTATGCTCTTAT
TCTTTGCTTAGGGGTATCAATCTTTGCTTGCATGTGTGAGCCAAATAGGCGTATGAGTAA
AGTTTCCTTGATGCAAAGCAATACGTGATTGTTGGATCGATCTCGTTTGGTTCGTTGGAG
GTTTAGTAGAGTCGGCATCTTTACGTTTGAAGATGGTCCGATAAAAAGTCTCCGGTTGAA
TCAAAATCGAGTTTTCCCAGTGTAATCAATTGGTGTTGAAGGAATCCCATCTATAAACGA
CGGCTGATACGAAAGTTTGGAGTTATGCGAGATCGGGAAGAAGTAACGGTGAAGCTCCAT
ATTTTTTGAAGATCGGAGTTGGTGACCATCGCGGTGAAGGAGCATAGCAGCGTCGGAGAT
GGCATGTTGAACACGTGTACAATACGCGGCGCTGATGTTTCTGAAGTGAAACACGTGTAT
TCGATGTTACCGACTTTAAGTGTTTATTTGGGCCTTATCTATTGTAAACCTGATCCGCTG
TAATATCGCCCTTTGGGCTTTAAAATCAATGAAACAAGTTGACG


BQ
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BQ
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AF RS1B026JQ C 1
AF RS1B026TF U 1
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QA 1 530 1 530
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AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AK09TF U 1
AF RS1AK09JQ C 194
BS 1 265 RS1AK09TF
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CACTG

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DS 

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CTAGA
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TTAGTTAGGTACAAAGACGGTGGCTTAGAAACTTCACCAA*GGGAACACAGGACTTGTTG
TAAGAACACTGTCAGGGGTTGCTGCTTTGCTTTTGGTTTAAAGGAGCTTTTTGGGCTTAG
CAATAATGATAGAAGCTATTACTCTTTGAGAGATACTTGGAGAGACGATTGAATGTCTTC
TGTTTGTAATATTTTTGTTTTCTAATTTATAAGATTTTTGGTCACAAAGG

QA 6 715 6 715
DS 



AS 1 2

CO CL8124Contig1 530 2 1 U
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TCATCAGAGTGGATCAGTCACCATTGATGGGTGGTTGAAGATAGCAGCACCAGCACAAAC
TGCAGCTTTGTTCAAAGAGCTTCGGTTAACCCTACATTCTATCCTCAAAGATCTTATCCG
GAAACCAGAGATATCAGGGATAGTCCACAACGAAGTGGTCAAATCTATGGTCCATCTTCT
TATAGAAGAAGGCAAACCGCAACACACATGAACTAAAAGCTAATATTAGAAAAGTGTAGT
AGCCACTGATACTACTGTGTTACTTCCATAGCTAATAATTTCAGTTTTTGGGAGGTGAAT
TCAGACATCAAGAAAAACAAGTAATAACCGTGAGCAGCTTTTAAAATATTATTCAAGTCC
CATTTGTTGGAATTATGTTAAGTTTATAGTTATGTACTACAACCCAGAACCTACTAAATG
ATATATTTTGATTACGTGAATAAGAAACCCAAATCACGATACTGATTACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1E120JQ C 1
AF RS1E120TF U 1
BS 1 530 RS1E120TF

RD RS1E120JQ 530 0 0
GGATACAACCATTGTTTCTCCTTTCTCCATTCTTCTTTTTGGCGGCTCAATCAATGTTCA
TCATCAGAGTGGATCAGTCACCATTGATGGGTGGTTGAAGATAGCAGCACCAGCACAAAC
TGCAGCTTTGTTCAAAGAGCTTCGGTTAACCCTACATTCTATCCTCAAAGATCTTATCCG
GAAACCAGAGATATCAGGGATAGTCCACAACGAAGTGGTCAAATCTATGGTCCATCTTCT
TATAGAAGAAGGCAAACCGCAACACACATGAACTAAAAGCTAATATTAGAAAAGTGTAGT
AGCCACTGATACTACTGTGTTACTTCCATAGCTAATAATTTCAGTTTTTGGGAGGTGAAT
TCAGACATCAAGAAAAACAAGTAATAACCGTGAGCAGCTTTTAAAATATTATTCAAGTCC
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QA 1 530 1 530
DS 

RD RS1E120TF 530 0 0
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TCATCAGAGTGGATCAGTCACCATTGATGGGTGGTTGAAGATAGCAGCACCAGCACAAAC
TGCAGCTTTGTTCAAAGAGCTTCGGTTAACCCTACATTCTATCCTCAAAGATCTTATCCG
GAAACCAGAGATATCAGGGATAGTCCACAACGAAGTGGTCAAATCTATGGTCCATCTTCT
TATAGAAGAAGGCAAACCGCAACACACATGAACTAAAAGCTAATATTAGAAAAGTGTAGT
AGCCACTGATACTACTGTGTTACTTCCATAGCTAATAATTTCAGTTTTTGGGAGGTGAAT
TCAGACATCAAGAAAAACAAGTAATAACCGTGAGCAGCTTTTAAAATATTATTCAAGTCC
CATTTGTTGGAATTATGTTAAGTTTATAGTTATGTACTACAACCCAGAACCTACTAAATG
ATATATTTTGATTACGTGAATAAGAAACCCAAATCACGATACTGATTACC

QA 1 530 1 530
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8126Contig1 795 2 2 U
GGGGAGGCACACACAAAAAAGGTCCGATGCTTCTCACTCTCTAAGAATCTGATTGGGATT
GCGTTTCTTGGTTCATGTCTGGCCTGTTTCAATGGCTTCTGTAACATGTCGCTTCCGCCT
TTCTATTCATCCCAGGTCTTCTTTCAAGCTTGATAGAAGCGTAGAAAGAAGGAGAGAATC
GAACGGTCAAGTTCCTAAGTCTTTTACCTGCAACAAGCGCTTAGATATATCGCGTATAGC
TCCATTACAAGCAACAATGAATAGCCCTAGAGGCTTTGGACCTCCCCCTCCTAAGAAAAC
CAAGAAAGCTAAAAAGTCAAAACCCGGAAACCAGAGTGATGAAGAAGAAGACGACCAAAA
GGAAGACGATGATGAAGATGAGCGTGAGAGAGGTGTGATTCCAGAGATAGTCACCAACAG
AATGATAAGCAGAATGGGATTCACCGTCGGCTTACCGCTCTTCGTCGGTCTCTGTTTCTT
CCCACTCTTTTACTATCTCAAAGTGGGATTGAAGATCGATGTGCCGACATGGGTTCCGTT
TATTGTTTCGTTCGTCTTCTTTGGTACGGCTTTAGCTGGTGTGAGCTACGGGATCGTGTC
ATCCAGTTGGGATCCGTCAAGAGAAGGTTCATTGTTAGGATGGAACGATGCCAAAAAGAA
CTGGCCTGTCTTTTGGCAGTCCTTTTTGAATTCCTCAAGCAAGAGATAGAAAAACAAAAC
AGCAGTTTGATCATTTCTTACAAGAAGATACTTCAAGAGTATTTCTGATAATTTTCTATA
TAATTTTCTTTATGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DI48TF U 1
AF RS1DI48JQ C 105
BS 1 635 RS1DI48TF
BS 636 795 RS1DI48JQ

RD RS1DI48TF 635 0 0
GGGGAGGCACACACAAAAAAGGTCCGATGCTTCTCACTCTCTAAGAATCTGATTGGGATT
GCGTTTCTTGGTTCATGTCTGGCCTGTTTCAATGGCTTCTGTAACATGTCGCTTCCGCCT
TTCTATTCATCCCAGGTCTTCTTTCAAGCTTGATAGAAGCGTAGAAAGAAGGAGAGAATC
GAACGGTCAAGTTCCTAAGTCTTTTACCTGCAACAAGCGCTTAGATATATCGCGTATAGC
TCCATTACAAGCAACAATGAATAGCCCTAGAGGCTTTGGACCTCCCCCTCCTAAGAAAAC
CAAGAAAGCTAAAAAGTCAAAACCCGGAAACCAGAGTGATGAAGAAGAAGACGACCAAAA
GGAAGACGATGATGAAGATGAGCGTGAGAGAGGTGTGATTCCAGAGATAGTCACCAACAG
AATGATAAGCAGAATGGGATTCACCGTCGGCTTACCGCTCTTCGTCGGTCTCTGTTTCTT
CCCACTCTTTTACTATCTCAAAGTGGGATTGAAGATCGATGTGCCGACATGGGTTCCGTT
TATTGTTTCGTTCGTCTTCTTTGGTACGGCTTTAGCTGGTGTGAGCTACGGGATCGTGTC
ATCCAGTTGGGATCCGTCAAGAGAAGGTTCATTGT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1DI48JQ 691 0 0
CATGTCGCTTCCGCCTTTCTATTCATCCCAGGTCTTCTTTCAAGCTTGATAGAAGCGTAG
AAAGAAGGAGAGAATCGAACGGTCAAGTTCCTAAGTCTTTTACCTGCAACAAGCGCTTAG
ATATATCGCGTATAGCTCCATTACAAGCAACAATGAATAGCCCTAGAGGCTTTGGACCTC
CCCCTCCTAAGAAAACCAAGAAAGCTAAAAAGTCAAAACCCGGAAACCAGAGTGATGAAG
AAGAAGACGACCAAAAGGAAGACGATGATGAAGATGAGCGTGAGAGAGGTGTGATTCCAG
AGATAGTCACCAACAGAATGATAAGCAGAATGGGATTCACCGTCGGCTTACCGCTCTTCG
TCGGTCTCTGTTTCTTCCCACTCTTTTACTATCTCAAAGTGGGATTGAAGATCGATGTGC
CGACATGGGTTCCGTTTATTGTTTCGTTCGTCTTCTTTGGTACGGCTTTAGCTGGTGTGA
GCTACGGGATCGTGTCATCCAGTTGGGATCCGTCAAGAGAAGGTTCATTGTTAGGATGGA
ACGATGCCAAAAAGAACTGGCCTGTCTTTTGGCAGTCCTTTTTGAATTCCTCAAGCAAGA
GATAGAAAAACAAAACAGCAGTTTGATCATTTCTTACAAGAAGATACTTCAAGAGTATTT
CTGATAATTTTCTATATAATTTTCTTTATGT

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

CO CL8127Contig1 1124 2 2 U
GGAGAAAATGGATTGAATGTCCAATTTATTTCTTCTTTTTTTTTTTCTTGTTTGCAGAAT
TTTGTGTTGAACTCACGAGGCATGAAGTTGTTCACTTGTGTATGGAAACCGGTCAAGCAA
GAACCAAAGGCGTTGCTCTTCTTATGCCACGGTTACGCTGCGGAGTCCAGTATCACCATG
AACAGTACAGCGACGAGGCTAGCCAAGACTGGGTTTGCAGTCTATGGAATGGACTATGAA
GGACACGGAAAATCCGAGGGATTAAGTGGTTACATCAGTAACTTTGATGATCTAGTTGAT
GATGTCTCTATTCATTACTCTACAATTTGTGAGAAAGAAGAGAATAGAGGGAAGATGAGG
TTTCTACTTGGAGAATCCATGGGAGGAGCAGTTGTGTTGCTCTTAGCTAGAAAGAAGCCT
GAATTTTGGGACGGTGCCGTTTTGGTCGCACCTATGTGTAAGTTAGTTGAAGAGGTAAAG
CCACATCCAGTAGTGATCTCAATTCTCATAAAGCTTTGCTCGTTTATTCCAACGTGGAAA
ATAGTTCCAGGCAGTGATATTCTTGACATTGCGATTAAAGAACCTCACATCAGAACCCAG
GTGAGGGAGAACGAATATTGCTACAAAGGCCGGCCTCGCCTCAAAACTGCCTACCAACTT
TTGCTGGTTAGCTTGGATCTCGAGAAGAATCTTCACGAGGTATCGATTCCTTTCATTGTT
CTTCACGGAGAAGATGATAAAGTGACGGACAAAAGCGTCAGCAAAATGCTATATGAAGTG
GCTTCAAGCTCGGACAAAACAGTCAAGCTTTACCCTAACATGTGGCATGCTTTATTGTAT
GGAGAAACTCCTGAAAATTCAGAAATCGTATTTACTGATGTCATAAAGTGGCTGGTGGAT
AGAACCTCTGAATCTAACGGACGATTAGAGAGCGAGTTAAAACATAAGCATGATGGAGTG
TTGAAGCATAAATAAGTACTGAGTAATACAGGGTGACTTATGTAATTATGTATTCATATA
TGTATTTTGCGCCCAAAAAAAGAAACATACTTACTAAATAAGGTGAAACATTTTGTTGCT
AAAACTTGTCAACAAAACCTCTACCAGACATATTTGTAGTACAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FW42TF U 1
AF RS1FW42JQ C 364
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GAATTTTGGGACGGTGCCGTTTTGGTCGCACCTATGTGTAAGTTAGTTGAAGAGGTAAAG
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CATCCAGTAGTGATCTCAATTCTCATAAAGCTTTGCTCGTTTATTCCAACGTGGAAAATA
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QA 1 761 1 761
DS 



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BQ
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AF RS1GH10JQ U 1
AF RS1GJ05JQ U 1
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RD RS1GH10JQ 560 0 0
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QA 1 560 1 560
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ACTACATGAAAACTTAGCTACATATAGGAAAACTACATTTTTATTCTCTATATTACATGT
TTGCAAATCTATGAGGAGGTTCCTAGAGCCGAGCAGCCAACTGGTTAGAAGTGTCTATCG
TTGATCCAGAAGCTGAGCCTTGAGTCCGGTTATTAGAACACAAGTAGTTCAGTGACTGTA
GCCACGAGACTAAAGAAGGCTTGCGAATCACATCGTCTGATTCAGCAACTTGACCATACA
GTTCACCAAGCACCATGTCCTGTCTTTCTTGTGGTAACATTATAATAAGTTGTGCTAATG
ACTTCATCAGATACGGTAACACCTGTATATCAACCAAAGAGACGAGCCTCAGAAGCAAGT
CAAGAATCTGATTACCAGGATCAGACTTTTTTCCTTCGGTGTTAAACGTTGAAGCCTTCT
CAACAAGGGTATGGACAGAGTAAAATATAGAAGGACTTCCTGCAGGTAGATGCCGGGTCA
AGGCTGCAACGCCTGAAGCCAAACCTTCAAATGGTGTGATCTCAGGATAGACCTCCAACG
ATCTTTCCATGTAATAGAAAAAAA

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

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TTGATGTGTCACCTCCTGTTCCATCTCATATCAAGGTGAAAAAGTGGGATTTTTCGTTTG
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ATTCTGATTGAGATCAAAATACCTTATAAGTAAGCCAAATCTCACCATCTTTACTTCCTT
ATGCCCCAACATTAAAACAGCCATTGTCCAGATTTAAGAAGAAGGGTTTAAAAATGGAAA
GCTTCTCTTCTCATGTGTGACACATTGTTCTCGTGGGATTTGTAACTGTAGAAGAAAAAG
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BQ
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AF RS1FU86TF U 1
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BS 651 943 RS1FU86JQ

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AGCACTTGAATTTCTTTACCGTCTTGGTTCTTGCTTCGGTTCCAAATCCTCTGTTTGACC
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TAATAGGAAAGGCGATCATCAAAACTCACATACAGACAATATTTATCATCTGTGTCTGTA
ATAACCAACTGCTGGACTGGATGGAGAACGAGATGATCTGGATACTTAGTCATGTCCCTG
GTTTAGCTGATGTATTACCTGGACTCATTGACAAACTCCACGCCATGAAAGAAAAGTATA
TTGATGTGTCACCTCCTGTTCCATCTCATATCAAGGTGAAAAAGTGGGATTTTTCGTTTG
CGTCGATCTGGAATGGGATAGTGTGGCTGATGCTCCTCAACTTCTTCGTCAAGATTGTGA
CCGCAACTGCACAGAGACACTTGAAGAAGAAGCAAGAGAAAGAAGTAGCTGCTTTGGCTC
ATTCTGATTGAGATCAAAATACCTTATAAGTAAGCCAAATCTCACCATCTTTACTTCCTT
ATGCCCCAACATTAAAACAGCCATTGTCCAGATTTAAGAAGAAGGGTTTA

QA 1 650 1 650
DS 

RD RS1FU86JQ 829 0 0
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TCTGTAATAACCAACTGCTGGACTGGATGGAGAACGAGATGATCTGGATACTTAGTCATG
TCCCTGGTTTAGCTGATGTATTACCTGGACTCATTGACAAACTCCACGCCATGAAAGAAA
AGTATATTGATGTGTCACCTCCTGTTCCATCTCATATCAAGGTGAAAAAGTGGGATTTTT
CGTTTGCGTCGATCTGGAATGGGATAGTGTGGCTGATGCTCCTCAACTTCTTCGTCAAGA
TTGTGACCGCAACTGCACAGAGACACTTGAAGAAGAAGCAAGAGAAAGAAGTAGCTGCTT
TGGCTCATTCTGATTGAGATCAAAATACCTTATAAGTAAGCCAAATCTCACCATCTTTAC
TTCCTTATGCCCCAACATTAAAACAGCCATTGTCCAGATTTAAGAAGAAGGGTTTAAAAA
TGGAAAGCTTCTCTTCTCATGTGTGACACATTGTTCTCGTGGGATTTGTAACTGTAGAAG
AAAAAGGATGTGTCTAGGAGGTGGAATTGGTGATTGTGAGATTGCAGTGGAGGCTTATTT
TTAATCCTGCGATTCTGCAGAGAATGTTACAAAAACAAAAACAAAAAAGCTTGTAGTTGC
TCATTTGTGTTAGTGTTAGCTTATTTAAACTGAAACTAGTGTTAAGCTATTATATTATAT
CCCCTATCCATGATAACTTTCTTTAATTTTATATTTTGATTTTTTTACG

QA 1 829 1 829
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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AF RS1CQ43TF U 1
AF RS1CQ43JQ C 161
BS 1 690 RS1CQ43TF

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GTGATAGATAAAACCAGAGAGAGACCTCATATCAATGAATGGGTTGGGTTCATGCTCACC
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GCGTGGAAGATTGTAGAGCTGGCTATGGCTTGTGTGAACCCGTCTTCTAACCAGAGACCA
ACAATGGCACACGTTGTGATGGAGCTAAACGAGTGTGTGGCCTTGGAAATTGCAAGGAGA
CAGGGTAGTCAAGAGATGTACACAAATAATTCAGTTGACTATAGTCTCTCTGCGTTTGCC
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TTGTTTTTTGTTTGTTTTGCTTTCCATTGTGAATCTCCCGGCCCGTTTATGTTTTTGCTG
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GTTGAATTAAAGACTCGGTTATGGATGTCC

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DS 

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CCTTGGAAATTGCAAGGAGACAGGGTAGTCAAGAGATGTACACAAATAATTCAGTTGACT
ATAGTCTCTCTGCGTTTGCCCCTGGAGCTAGATAACTTTCAAAAATATGTTTGATGTAAT
TTTATGGAAAACTATTTGCTTTGTTTTTTGTTTGTTTTGCTTTCCATTGTGAATCTCCCG
GCCCGTTTATGTTTTTGCTGAAGCAATGTACGTTCAATGTATTTGAAGAAATCCAGCTGG
TGTTTTGTTTTGTTATTTGTGTTGAATTAAAGACTCGGTTATGGATGTCC

QA 1 530 1 530
DS 



AS 1 2

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GTTGACTTGTCACGTACTCATGAGTAATGATGTTTAGAGAGACAAACCTGGCTCATTCGG
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TGAGCTGTATCGTAGTTCTTCTCCAGTCTAGGGTCTACAAGAAGGTCAAAACTTTCTCCA
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CTATAAATTAAGTTCAAGTTTGCAGTTATTAAAAAAAAGACACTTACCCAGTCAACTAAA
CTGAGGTTTCTGGTAGGATCTTTGGCGAAGATTGGTGGACGTCCAGTGATGAGTTCCAGA
AGCACTACTCCAAAGGAATATACATCTGATTTATCAGTTACTTTACCACTAGACGCATAC
TCTGGAGCCATGTATCTGTTTAAACCCATGCCATCACTAGTGATTATCCTCATAAAAGCT
TAACGATACAAGAATGAAGAGATATGGATGGTGTTTTACCCGAAAGTTCCTACCACTCGA
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GAGACCTGAAATATGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BT29TF U 1
AF RS1BT29JQ C 234
BS 1 654 RS1BT29TF
BS 655 916 RS1BT29JQ

RD RS1BT29TF 658 0 0
GCAATCAAATAGCTACAAATGAATGAAGTAAGACTAATCATTGCCAATAAGCTCAATAGT
GGTACGTGGTGACACTTACTACACTTTAGAACCAGTAAACTGATGTTGTTCACTGCTCGA
CTGAGAAGGATTGATTCCATACTCCGAAGTGGAACCATCGCTTGAATCCGTGTTGAATAT
CCTCTTACTTGTTCCATACGTTAGAGGGTTCCCAGAAGAGCTATACGTCTCTTCCACGTT
TCTTAGGGTCACCTCGCCTTCAAGAGCACGGATTACCTATTCAAGATTCAGGCTTGTTCA
GTTGACTTGTCACGTACTCATGAGTAATGATGTTTAGAGAGACAAACCTGGCTCATTCGG
GGACGAAGCCAAGCTGATTGGCGTATGCAAGAAGCAGCACAAGCAGCCATGTCTGCCATT
TGAGCTGTATCGTAGTTCTTCTCCAGTCTAGGGTCTACAAGAAGGTCAAAACTTTCTCCA
GAGATAGCTTTTGCAAGCAATGGCCTCGCCTGAGGAGATATCAAAATATTTTACAATAAT
CTATAAATTAAGTTCAAGTTTGCAGTTATTAAAAAAAAGACACTTACCCAGTCAACTAAA
CTGAGGTTTCTGGTAGGATCTTTGGCGAAGATTGGTGGACGTCCAGTGATGAGT
CCAG

QA 1 654 1 654
DS 

RD RS1BT29JQ 683 0 0
CCACGTTTCTTAGGGTCACCTCGCCTTCAAGAGCACGGATTACCTATTCAAGATTCAGGC
TTGTTCAGTTGACTTGTCACGTACTCATGAGTAATGATGTTTAGAGAGACAAACCTGGCT
CATTCGGGGACGAAGCCAAGCTGATTGGCGTATGCAAGAAGCAGCACAAGCAGCCATGTC
TGCCATTTGAGCTGTATCGTAGTTCTTCTCCAGTCTAGGGTCTACAAGAAGGTCAAAACT
TTCTCCAGAGATAGCTTTTGCAAGCAATGGCCTCGCCTGAGGAGATATCAAAATATTTTA
CAATAATCTATAAATTAAGTTCAAGTTTGCAGTTATTAAAAAAAAGACACTTACCCAGTC
AACTAAACTGAGGTTTCTGGTAGGATCTTTGGCGAAGATTGGTGGACGTCCAGTGATGAG
TTCCAGAAGCACTACTCCAAAGGAATATACATCTGATTTATCAGTTACTTTACCACTAGA
CGCATACTCTGGAGCCATGTATCTGTTTAAACCCATGCCATCACTAGTGATTATCCTCAT
AAAAGCTTAACGATACAAGAATGAAGAGATATGGATGGTGTTTTACCCGAAAGTTCCTAC
CACTCGAGTAGAGATATGAGTGATTGATGAATTGGTGTCTGAAAAGAACTTGGCTAGTCC
AAAGTCAGAGACCTGAAATATGC

QA 1 683 1 683
DS 



AS 1 2

CO CL8133Contig1 841 2 2 U
GTAGACAAGACACTTGAGCTGTACAGATACACAGTTGACAAACAGGCAGCTTCCTGTGTG
ATAATCAACACGGCGAGCTGTCTAGAGAGCTCGTCTCTGTCTTATCTGCAACAGCAGCTT
AACATTCCAGTATATCCTATAGGCCCTCTACACATGGTGGCTTCAGCTCCCACGAGTCTG
CTCGAAGAGGACAAGAGGTGTATCGAATGGTTGGACAAGCGAAAGAGAAACTCCGTTATA
TACGTAAGCTTGGGAAGCTTAGCTTTGATGGAAACAAACGAGGTGATGGAAATGGCTTCG
GGGTTAGACAGCAGCAAACAACACTTCTTGTGGGTGATTAAGCCAGGGTCGATACGCGGT
TCGGAGTGGATGGAGTCCTTGCCCGAGGAGTTCGGTAAGATGGTTTCGGGTCGAGGTTAC
GTGGTGAAATGGGCACCACAGAAGGAAGTGCTTGCTCATCATGCGGTGGGAGGGTTTTGG
AGCCACTGTGGATGGAACTCGACGCTAGAGAGTATTGGGGAAGGAGTTCCGGTGATCTGC
AGACCCTCTTCTAGCGATCAAAAGGTGAATGCGAGGTACTTGGATTGTGTTTGGAGGATA
GGGATTCAAGTGGAAGGTGAGGTAGAGAGAGGAGCGGTGGAGAGAGCTGTGAAGAGGGTG
ATGGTGGGTGAAGAAGGAGAGGAGATGAGGAAGAGAGCCATGTGTTTGAAGGAGAGACTG
AGAGCCTCTGTTGGAGATGGAGGTTCTTCACACAAGTCGCTCCATGAGTTTGTACACTTC
ATCAAGTCTCTGTGAAGCAGATTAAAAAATAAGTCTAGTAGTTTACTATAAATATCTTGC
C


BQ
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10 

AF RS1C435TF U 1
AF RS1C435JQ C 107
BS 1 637 RS1C435TF
BS 638 841 RS1C435JQ

RD RS1C435TF 637 0 0
GTAGACAAGACACTTGAGCTGTACAGATACACAGTTGACAAACAGGCAGCTTCCTGTGTG
ATAATCAACACGGCGAGCTGTCTAGAGAGCTCGTCTCTGTCTTATCTGCAACAGCAGCTT
AACATTCCAGTATATCCTATAGGCCCTCTACACATGGTGGCTTCAGCTCCCACGAGTCTG
CTCGAAGAGGACAAGAGGTGTATCGAATGGTTGGACAAGCGAAAGAGAAACTCCGTTATA
TACGTAAGCTTGGGAAGCTTAGCTTTGATGGAAACAAACGAGGTGATGGAAATGGCTTCG
GGGTTAGACAGCAGCAAACAACACTTCTTGTGGGTGATTAAGCCAGGGTCGATACGCGGT
TCGGAGTGGATGGAGTCCTTGCCCGAGGAGTTCGGTAAGATGGTTTCGGGTCGAGGTTAC
GTGGTGAAATGGGCACCACAGAAGGAAGTGCTTGCTCATCATGCGGTGGGAGGGTTTTGG
AGCCACTGTGGATGGAACTCGACGCTAGAGAGTATTGGGGAAGGAGTTCCGGTGATCTGC
AGACCCTCTTCTAGCGATCAAAAGGTGAATGCGAGGTACTTGGATTGTGTTTGGAGGATA
GGGATTCAAGTGGAAGGTGAGGTAGAGAGAGGAGCGG

QA 1 637 1 637
DS 

RD RS1C435JQ 735 0 0
TGCAACAGCAGCTTAACATTCCAGTATATCCTATAGGCCCTCTACACATGGTGGCTTCAG
CTCCCACGAGTCTGCTCGAAGAGGACAAGAGGTGTATCGAATGGTTGGACAAGCGAAAGA
GAAACTCCGTTATATACGTAAGCTTGGGAAGCTTAGCTTTGATGGAAACAAACGAGGTGA
TGGAAATGGCTTCGGGGTTAGACAGCAGCAAACAACACTTCTTGTGGGTGATTAAGCCAG
GGTCGATACGCGGTTCGGAGTGGATGGAGTCCTTGCCCGAGGAGTTCGGTAAGATGGTTT
CGGGTCGAGGTTACGTGGTGAAATGGGCACCACAGAAGGAAGTGCTTGCTCATCATGCGG
TGGGAGGGTTTTGGAGCCACTGTGGATGGAACTCGACGCTAGAGAGTATTGGGGAAGGAG
TTCCGGTGATCTGCAGACCCTCTTCTAGCGATCAAAAGGTGAATGCGAGGTACTTGGATT
GTGTTTGGAGGATAGGGATTCAAGTGGAAGGTGAGGTAGAGAGAGGAGCGGTGGAGAGAG
CTGTGAAGAGGGTGATGGTGGGTGAAGAAGGAGAGGAGATGAGGAAGAGAGCCATGTGTT
TGAAGGAGAGACTGAGAGCCTCTGTTGGAGATGGAGGTTCTTCACACAAGTCGCTCCATG
AGTTTGTACACTTCATCAAGTCTCTGTGAAGCAGATTAAAAAATAAGTCTAGTAGTTTAC
TATAAATATCTTGCC

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

CO CL8134Contig1 786 2 5 U
GGACACTGCTCACGTCTGTGAACTCTCGATTCGATTTCTCTTCTCTTCTTGATCGTAGCT
CTGTTCCTCTGTGCATTCCTTGATGTTGGCCTCGAGGTTTCTCTCGCGAGTTTCCCGCAG
CGCGGGCTTACGCTCCTCTCTCTCCGCCGCCGCCGCTCTTCCGCCGAGGAACCAATCTCC
TATATTCTCGAACCGGTATCACTCCCTCGCTCACAACTTCTCACAAAAGCTTGTTGCAGC
TCAAGTGTCTCTTGATTCGTTTTCACTTCAAAGGTTCTCTCTTTCTTCCTCCACTGAATC
ACATGAAAAGGAAAGCAGCAACGCCGAGTCAGCAGCCTCCAAGACAAGTGAAGAGAAAGC
TACTACATCCGAGGCAAACGAATCAGAATCCAAAGTAAAGGGGAAAGGCGCTAAACGAGC
TACTGCGGTTTCTGAATCAGACTCCGGGAGTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGA
TGAGGAGATGTCAAAGGATGATTTGATGAAGCTCGTAGCTGAGAAGGAGGAGCTGCTGTC
TGCTAAGGAGGAAGAGCTTAAGCAAATGAAAGATAAAGTTCTTCGCACTTACGCAGAGAT
GGAGAATGTAATGGACAGAACAAGACGCGATGCTGAAAACACCAAGAAGTATGCCATACA
GAATATTGCAAAGAGCCTTTTGGATGTGGCGGATAATCTCGGAGAGCTTCTTCTGTTGTC
AAAGAAAGCTTCTCAAGCTTGACGAGAAAGAAGATTCAGCTGGTGCTGCTGCTCCACTGC
TAAGAC


BQ
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15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1H159TF U 1
AF RS1E231TF U 1
BS 1 163 RS1E231TF
BS 164 164 RS1H159TF
BS 165 494 RS1E231TF
BS 495 495 RS1H159TF
BS 496 786 RS1E231TF

RD RS1H159TF 543 0 0
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CTGTTCCTCTGTGCATTCCTTGATGTTGGCCTCGAGGTTTCTCTCGCGAGTTTCCCGCAG
CGCGGGCTTACGCTCCTCTCTCTCCGCCGCCGCCGCTCTTCCGCCGAGGAACCAATCTCC
TATATTCTCGAACCGGTATCACTCCCTCGCTCACAACTTCTCACGAAAGCTTGTTGCAGC
TCAAGTGTCTCTTGATTCGTTTTCACTTCAAAGGTTCTCTCTTTCTTCCTCCACTGAATC
ACATGAAAAGGAAAGCAGCAACGCCGAGTCAGCAGCCTCCAAGACAAGTGAAGAGAAAGC
TACTACATCCGAGGCAAACGAATCAGAATCCAAAGTAAAGGGGAAAGGCGCTAAACGAGC
TACTGCGGTTTCTGAATCAGACTCCGGGAGTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGA
***GGAGATGTCAAAGGATGATTTGATGAAGCTCGTAGCTGAGAAGGAGGAGCTGCTGTC
TGC

QA 1 543 1 543
DS 

RD RS1E231TF 786 0 0
GGACACTGCTCACGTCTGTGAACTCTCGATTCGATTTCTCTTCTCTTCTTGATCGTAGCT
CTGTTCCTCTGTGCATTCCTTGATGTTGGCCTCGAGGTTTCTCTCGCGAGTTTCCCGCAG
CGCGGGCTTACGCTCCTCTCTCTCCGCCGCCGCCGCTCTTCCGTCGAGGAACCAATCTCC
TATATTCTCGAACCGGTATCACTCCCTCGCTCACAACTTCTCACAAAAGCTTGTTGCAGC
TCAAGTGTCTCTTGATTCGTTTTCACTTCAAAGGTTCTCTCTTTCTTCCTCCACTGAATC
ACATGAAAAGGAAAGCAGCAACGCCGAGTCAGCAGCCTCCAAGACAAGTGAAGAGAAAGC
TACTACATCCGAGGCAAACGAATCAGAATCCAAAGTAAAGGGGAAAGGCGCTAAACGAGC
TACTGCGGTTTCTGAATCAGACTCCGGGAGTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGA
TGAGGAGATGTCAAGGGATGATTTGATGAAGCTCGTAGCTGAGAAGGAGGAGCTGCTGTC
TGCTAAGGAGGAAGAGCTTAAGCAAATGAAAGATAAAGTTCTTCGCACTTACGCAGAGAT
GGAGAATGTAATGGACAGAACAAGACGCGATGCTGAAAACACCAAGAAGTATGCCATACA
GAATATTGCAAAGAGCCTTTTGGATGTGGCGGATAATCTCGGAGAGCTTCTTCTGTTGTC
AAAGAAAGCTTCTCAAGCTTGACGAGAAAGAAGATTCAGCTGGTGCTGCTGCTCCACTGC
TAAGAC

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

CO CL8135Contig1 811 2 2 U
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AAGAAATCCACGATGGCTCCTAAATCGAAAGAGAAACCGAAAACCCCAACATCCTCCCAG
CCTCCTCCCGCGATCGAAGATCTCTTCACCACTCTCGATAGGCACATCCAGCGATCTGAA
TACGAACAAGCCGTCAAGGTCGCTGATCAAGTTCTGTCGATCGCACCTGCCGATGAGGAC
GCGATCCGATGCAAAGTCGTGGCTCTTGTCAAAGACGATAAGATCGATGATGCTCTCTCC
CTCATTCACTCCTTCCATAAGCTTCCCATCGATCTAGGGTTTCAAAAGGCATATTGTTTA
TACCGTCAAAACAAGCTAGACGAGGCTTTTGAGTGTTTGAGAGGTCGAGAGAGACTCAGA
GACTTTGCTTTTGGAGGCTCAGATTCTCTACCGTCTGGGGAAAACAGATGCTTGCGTTGA
TGTGTATCGGAAGTTGCAGATTTTGGAGAAATGCAGCAAGTGGATAGCATATGAGACCGA
GTATAACCTGAAAAAATCTTTTGATTGTAAAGTCTAGTGTTTTGTTTGGTTAAAGTGGGT
CTTGAGGTTGTGTATTAGCTTACGGAGTGTTTTAAGGGAGTCAATTAGGATATATATAGC
CTCTAGTTTAGACCAGTTTGAAGCACATTATGTTCGTGTTGTCGTGACTTTTACTCTGTT
TTGTTGTTGTTTATAGTGTTTGGTTTTGTTTGTTGGTAGGTTCTATTAATAATATTGTGA
AACAATAATGAAGATTTTGAAGATTTATGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AQ91TFB U 1
AF RS1AQ91JQ C 118
BS 1 646 RS1AQ91TFB
BS 647 811 RS1AQ91JQ

RD RS1AQ91TFB 646 0 0
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AAGAAATCCACGATGGCTCCTAAATCGAAAGAGAAACCGAAAACCCCAACATCCTCCCAG
CCTCCTCCCGCGATCGAAGATCTCTTCACCACTCTCGATAGGCACATCCAGCGATCTGAA
TACGAACAAGCCGTCAAGGTCGCTGATCAAGTTCTGTCGATCGCACCTGCCGATGAGGAC
GCGATCCGATGCAAAGTCGTGGCTCTTGTCAAAGACGATAAGATCGATGATGCTCTCTCC
CTCATTCACTCCTTCCATAAGCTTCCCATCGATCTAGGGTTTCAAAAGGCATATTGTTTA
TACCGTCAAAACAAGCTAGACGAGGCTTTTGAGTGTTTGAGAGGTCGAGAGAGACTCAGA
GACTTTGCTTTTGGAGGCTCAGATTCTCTACCGTCTGGGGAAAACAGATGCTTGCGTTGA
TGTGTATCGGAAGTTGCAGATTTTGGAGAAATGCAGCAAGTGGATAGCATATGAGACCGA
GTATAACCTGAAAAAATCTTTTGATTGTAAAGTCTAGTGTTTTGTTTGGTTAAAGTGGGT
CTTGAGGTTGTGTATTAGCTTACGGAGTGTTTTAAGGGAGTCAATT

QA 1 646 1 646
DS 

RD RS1AQ91JQ 694 0 0
CAGCCTCCTCCCGCGATCGAAGATCTCTTCACCACTCTCGATAGGCACATCCAGCGATCT
GAATACGAACAAGCCGTCAAGGTCGCTGATCAAGTTCTGTCGATCGCACCTGCCGATGAG
GACGCGATCCGATGCAAAGTCGTGGCTCTTGTCAAAGACGATAAGATCGATGATGCTCTC
TCCCTCATTCACTCCTTCCATAAGCTTCCCATCGATCTAGGGTTTCAAAAGGCATATTGT
TTATACCGTCAAAACAAGCTAGACGAGGCTTTTGAGTGTTTGAGAGGTCGAGAGAGACTC
AGAGACTTTGCTTTTGGAGGCTCAGATTCTCTACCGTCTGGGGAAAACAGATGCTTGCGT
TGATGTGTATCGGAAGTTGCAGATTTTGGAGAAATGCAGCAAGTGGATAGCATATGAGAC
CGAGTATAACCTGAAAAAATCTTTTGATTGTAAAGTCTAGTGTTTTGTTTGGTTAAAGTG
GGTCTTGAGGTTGTGTATTAGCTTACGGAGTGTTTTAAGGGAGTCAATTAGGATATATAT
AGCCTCTAGTTTAGACCAGTTTGAAGCACATTATGTTCGTGTTGTCGTGACTTTTACTCT
GTTTTGTTGTTGTTTATAGTGTTTGGTTTTGTTTGTTGGTAGGTTCTATTAATAATATTG
TGAAACAATAATGAAGATTTTGAAGATTTATGTC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL8136Contig1 619 2 2 U
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TATGATGGGAAGGCGCCTGATATAATTGATAACGCGTACGTCATAATTGAGTTTGACAAT
GGATGCCGTGGGATGCTTGACCTTTGTATGTTCGCTGAAGGAAGCAAAAACGAGCAAGAA
ATCTCTGTTACTGGTCACATTGGCAAGGGGGAAGCACTTGTTCCAGAGGGTATAGTTAGA
TTTGGGAGCCGTGCAGAGGGAAGAGAACATGTTCAAACGATAAAAGCTGAGGATGAACGA
ATAAAATATGAAGGGTTGCATCATGGGTCGAGTTACTTGGAACACCTCTTATTTTTGTCG
GCAATCAGAGGTGAAGGACGAGCAGCTGTTGATTTGGAAGACGGATTGATGGCTGTTGCC
ATGGGAGTTGCTGCCCAGCTCTCCATTCAGGAGCGCCGCTATGTATCCATGGACGAGGTC
TTGTGAGTTGTGATATAGAAGGAAACTTGTAAATTTGGTACTATTGCTTTCATATGCAAG
ACTTAAATCTCTTTGTTGTAAGATTTGCCAAGACTGAATTTGGTTATCGTTATATTATGT
GTATATATAAGCTTCAGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 

AF RS1G166TF U 1
AF RS1G166JQ C 81
BS 1 617 RS1G166TF
BS 618 619 RS1G166JQ

RD RS1G166TF 617 0 0
GCGAATCCTGTTTCTGTGATGGCTTCTGGAGGTATGGATGTTAACCACAAGGATGAAGTT
TATGATGGGAAGGCGCCTGATATAATTGATAACGCGTACGTCATAATTGAGTTTGACAAT
GGATGCCGTGGGATGCTTGACCTTTGTATGTTCGCTGAAGGAAGCAAAAACGAGCAAGAA
ATCTCTGTTACTGGTCACATTGGCAAGGGGGAAGCACTTGTTCCAGAGGGTATAGTTAGA
TTTGGGAGCCGTGCAGAGGGAAGAGAACATGTTCAAACGATAAAAGCTGAGGATGAACGA
ATAAAATATGAAGGGTTGCATCATGGGTCGAGTTACTTGGAACACCTCTTATTTTTGTCG
GCAATCAGAGGTGAAGGACGAGCAGCTGTTGATTTGGAAGACGGATTGATGGCTGTTGCC
ATGGGAGTTGCTGCCCAGCTCTCCATTCAGGAGCGCCGCTATGTATCCATGGACGAGGTC
TTGTGAGTTGTGATATAGAAGGAAACTTGTAAATTTGGTACTATTGCTTTCATATGCAAG
ACTTAAATCTCTTTGTTGTAAGATTTGCCAAGACTGAATTTGGTTATCGTTATATTATGT
GTATATATAAGCTTCAG

QA 1 617 1 617
DS 

RD RS1G166JQ 539 0 0
TATAATTGATAACGCGTACGTCATAATTGAGTTTGACAATGGATGCCGTGGGATGCTTGA
CCTTTGTATGTTCGCTGAAGGAAGCAAAAACGAGCAAGAAATTTCTGTTACTGGTCACAT
TGGCAAGGGGGAAGCACTTGTTCCAGAGGGTATAGTTAGATTTGGGAGCCGTGCAGAGGG
AAGAGAACATGTTCAAACGATAAAAGCTGAGGATGAACGAATAAAATATGAAGGGTTGCA
TCATGGGTCGAGTTACTTGGAACACCTTTTATTTTTGTCGGCAATCAGAGGTGAAGGACG
AGCAGCTGTTGATTTGGAAGACGGATTGATGGCTGTTGCCATGGGAGTTGCTGCCCAGCT
CTCCATTCAGGAGCGCCGCTATGTATCCATGGACGAGGTCTTGTGAGTTGTGATATAGAA
GGAAACTTGTAAATTTGGTACTATTGCTTTCATATGCAAGACTTAAATCTCTTTGTTGTA
AGATTTGCCAAGACTGAATTTGGTTATCGTTATATTATGTGTATATATAAGCTTCAGCC

QA 1 539 1 539
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8138Contig1 780 2 20 U
GGAACCTCACTATCTCTGAATCAAAACCCTAACCCTAATTCCCCAAATCCGATTCGTTTC
TCTCTCTCGAGAAAAAAAAAGCTCTTCGATTTCGTGATCGTAATTGAATCACCACATCAG
CGAAGATGGTTTTAGCGGAGCTCGGCGGGCAGATTGCCAGCGCCTTACAGAAGACGAGCA
ATGCGACGATTATCGACGAGAAGGCTCTGAATGAATGTTTGAAAGAGATCACTCGCGCCC
TTCTCCACTCCGATGTCTCCTTCCCACTTGTGAGGGAGATGCAGAACAACATCAAGAAGA
TCGTCAACCTCGAGGAGCTAGCAGCTGGTCACAACAAGCGACGGATCATTGAACAGGCAA
TCTTTAGTGAACTGTGTAAGATGTTAGACCCAGGAAAGCCTGCATTTGCACCCAAAAAGG
CTAAACCAAGTGTAGCTATGTTCGTTGGGTTACAAGGTGCTGGTAAGACCACAACGTGTA
CCAAGTATGCTTATTATCATCAGAAGAAAGGGTACAAGCCTGCTCTAGTCTGTGCCGATA
CTTTCAGAGCTGGTGCTTTTGATCAGCTCAAACAGAATGCCACCAAGGCTAGGATCCCTT
TTTATGGAAGCTACACGGAATCAGATCCTGTGAAAATTGCTGTTGAGGGAGTTGATACGT
TTAAGAAAGAAAACTGTGATCTTATTATTGTTGACACCAGTGGACGCCACAAACAGAAGC
TACTCTCTTTGAAGAAATGCGTCAAGTTGCTGAGCTACAAACCAGATCTTGTTATATTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1B652TF U 1
AF RS1CH65TF U 16
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TTCTCCACTCCGATGTCTCCTTCCCACTTGTGAGGGAGATGCAGAACAACATCAAGAAGA
TCGTCAACCTCGAGGAGCTAGCAGCTGGTCACAACAAGCGACGGATCATTGAACAGGCAA
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CCAAGTATGCTTATTATCATCAGAAGAAAGGGTACAAGCCTGCTCTAGTCTGTGCCGATA
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DS 

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GG
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***GCTTTTCGATTTCTTGATCGTAGTTGAATCACCACATCAGCGAAGATGGTTTTAGCG
GAGCTCGGCGGGCAGATTGCCAGCGCCTTACAGAAGACGAGCAATGCGACGATTATCGAC
GAGAAGGCTCTTAATGAGTGTTTGAAAGAGATCACTCGCGCTCTTCTCCACTCCGATGTC
TCTTTCCCACTTGTGAGGGAGGTGCAGAACAACATCAAGAAGATCGTCAACCTCGAGGAG
CTAGCAGCTGGTCACAACAAGCGACGGATCATTGAGCAGGCAATCTTTAGTGAACTGTGT
AAGATGTTAGACCCAGGAAAGCCTGCATTTGCACCCAAAAAGGCTAAACCAAGTGTAGTT
ATGTTCGTTGGGTTACAAGGTGCTGGTAAGACCACAACGTGTACCAAGTATGCTTATTAT
CATCAGAAGAAAGGGTACAAGCCTGCTCTAGTGTGTGCCGATACTTTCAGAGCTGGTGCT
TTTGATCAGCTCAAACAGAATGCCACCAAGGCTAGGATCCCTTTTTATGGAAGTTACACG
GAATCAGATCCTGTGAAAATTGCTGTTGAGGGAGTTGATACGTTTAAGAAAGAAAACTGT
GATCTTATTATTGTTGACACCAGTGGACGCCACAAACAGAAGCTACTCTCTTTGAAGAAA
TGCGTCAAGTTGCTGAGCTACAAACCAGATCTTGTTATATTGT

QA 3 765 3 765
DS 



AS 1 2

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ATCGCTAATCTCCTTTCTCTGTTTCTGTCTTCAGATAGGAATCCACATGGAGTCTATTTC
CCCACTCACGAATCATCCAACGGCTAGCTCCGGTTATGATCAGTCGCGGCGTAAGCGGAA
GAAGAAACCAACGTCACTTTCGTCGTCTCAATCATCGGTGCAAAACTGCTGAGCCGGTTA
ATCCCCGGTTGCCGGAAACAACCGTTACCGGTGGTTTTAGAAGAAACTACTGATTACATC
GTTGCGATGGAGATGCAGATTCGTGCTTTGAATGCCATTCTCTCCGCCGTTGGCTCCAGC
TCGACTGTGCCGGGATCGTTGCCGGAGACAGGTCATGATAGCGAAGAGACACACATGCTC
GATTAGCTTGGCCCAGCTGTCTTTTTGTATTTTTTCTGTATTAAAAAAAATATTTGTTTA
TTTGATCATGATGTTTTTCTGCTATTTTAATATTTTGAATTTATGATTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CR34JQ C 1
AF RS1CR34TF U 1
BS 1 529 RS1CR34TF

RD RS1CR34JQ 529 0 0
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ATCGCTAATCTCCTTTCTCTGTTTCTGTCTTCAGATAGGAATCCACATGGAGTCTATTTC
CCCACTCACGAATCATCCAACGGCTAGCTCCGGTTATGATCAGTCGCGGCGTAAGCGGAA
GAAGAAACCAACGTCACTTTCGTCGTCTCAATCATCGGTGCAAAACTGCTGAGCCGGTTA
ATCCCCGGTTGCCGGAAACAACCGTTACCGGTGGTTTTAGAAGAAACTACTGATTACATC
GTTGCGATGGAGATGCAGATTCGTGCTTTGAATGCCATTCTCTCCGCCGTTGGCTCCAGC
TCGACTGTGCCGGGATCGTTGCCGGAGACAGGTCATGATAGCGAAGAGACACACATGCTC
GATTAGCTTGGCCCAGCTGTCTTTTTGTATTTTTTCTGTATTAAAAAAAATATTTGTTTA
TTTGATCATGATGTTTTTCTGCTATTTTAATATTTTGAATTTATGATTC

QA 1 529 1 529
DS 

RD RS1CR34TF 529 0 0
GGTCCTTCCTTAGAAAGGATTCCTCTTCCTCCACATACGTGTCTCACCTTCTCCTCTCTA
ATCGCTAATCTCCTTTCTCTGTTTCTGTCTTCAGATAGGAATCCACATGGAGTCTATTTC
CCCACTCACGAATCATCCAACGGCTAGCTCCGGTTATGATCAGTCGCGGCGTAAGCGGAA
GAAGAAACCAACGTCACTTTCGTCGTCTCAATCATCGGTGCAAAACTGCTGAGCCGGTTA
ATCCCCGGTTGCCGGAAACAACCGTTACCGGTGGTTTTAGAAGAAACTACTGATTACATC
GTTGCGATGGAGATGCAGATTCGTGCTTTGAATGCCATTCTCTCCGCCGTTGGCTCCAGC
TCGACTGTGCCGGGATCGTTGCCGGAGACAGGTCATGATAGCGAAGAGACACACATGCTC
GATTAGCTTGGCCCAGCTGTCTTTTTGTATTTTTTCTGTATTAAAAAAAATATTTGTTTA
TTTGATCATGATGTTTTTCTGCTATTTTAATATTTTGAATTTATGATTC

QA 1 529 1 529
DS 



AS 1 2

CO CL8140Contig1 668 2 19 U
GCAGAGATCAAACTTGGGTTGGAAATCATCGAAATCATCGAAAGCATCGAAAGAATCGAA
ACCAAGCAATATTTTGCAGACGAGTGATTGTCTTGGAGCAGACACTCTTATCAAGTTACT
GAAAAACTACTCAAGAAGTCATGAGTTGAAAAAATCTATTACAGTTGGTATTATCGGATT
GCCTAATGTAGGAAAGAGTAGTCTTATCAACAGTTTGAAGAGAGCTCATGTTGTCAATGT
CGGTGCCACTCCTGGACTGACTAGGTCTCTGCAAGAAGTTCACTTGGACAAAAACGTGAA
GTTGCTAGATTGTCCTGGAGTCGTGATGCTCAAATCTTCAGGAAATGATGCGTCTATAGC
TCTCCGGAACTGTAAAAGAATCGAGAAGTTGGAAGATCCAGTTAGTCCAGTTAAGGAGAT
TCTCAAGCTTTGTTCACCACAACTGCTGGTGACTCTGTACAAGATCACGAGCTTCGAGGC
AGTTGATGATTTACTTTATAAAGTAGCCACCGTTAGGGGTAAGCTTAAGAAGGGTGGTCT
TGTGGATATCGAAGCTGCTGCGAGGATTGTGTTGCATGACTGGAATGAAAGTAAAATTCC
ATTCTACACAATGCCGCCAAAGAGGGATCAAGGCGAGCACGCAGAGTCAAAGATTGTGAC
GGAGTTGG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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G
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CTGGACTGACTAGGTCTCTGCAAGAGGTTCACTTGGATAAAAACGTGAAGTTGTTGGATT
GTCCTTGAGTTGTTATGCTCAAATCTTCAGGAAATGATGCGTCTATAGCTCTCCGGAACT
GTAAAAGAATCGAGAAGTTGGAAGATCCAGTTAGTCCAGTTAAGGAGATTCTCAAGCTTT
GTTCACCACAGCTGCTGGTGACTCTGTACAAGATCACGAGCTTCGAGGCAGTTGATGATT
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AAGCTGCTGCGAGGATTGTGTTGCATGACTGGAATGAAAGTAAAATTCCATTCTACACAA
TGCCG

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DS 

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CGGTGCCACTCCTGGACTGACTAGGTCTCTGCAAGAAGTTCACTTGGACAAAAACGTGAA
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TCTCCGGAACTGTAAAAGAATCGAGAAGTTGGAAGATCCCGTTAGTCCAGTTAAGGAGAT
TCTCAAGCTTTGTTCACCACAACTGCTGGTGACTCTGTACAAGATCACGAGCTTCGAGGC
AGTTGATGATTTTCTTTATAAAGTAGCCACCGTTAGGGGTAAGCTTAAGAAGGGTGGTCT
TGTGGATATCTAAGCTGCTGCGAGGATTGTGTTGCATGACTGGAATGAAGGTAAAATTCC
ATTCTACACAATGCCGCCAAAGAGGGATCAAGGCGAGCACGCAGAGTCAAAGATTGTGAC
GGAGTTGG

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

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CATTCCATTTGTAGGATTTTTGTGTTTGTACAACTCCTTTCACAAAATAATTTGTTGTTG
GTTTTCATTATAAACAACATACAAGGAAAAATAGAGACAGTAGACACT


BQ
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AF RS1EZ78JQ C 1
AF RS1EZ78TF U 1
BS 1 528 RS1EZ78TF

RD RS1EZ78JQ 528 0 0
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QA 1 528 1 528
DS 

RD RS1EZ78TF 528 0 0
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CCACGGGATCATAACAGCTCCAATCCTATTTGCCATGGAGGAGTTTCCACAACTACGCAA
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GAAGAGTAATGGAATACAAAGGACAAGAGAGTTAGCTATGGAACGTGCTAATCTCGCAGC
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CATTCCATTTGTAGGATTTTTGTGTTTGTACAACTCCTTTCACAAAATAATTTGTTGTTG
GTTTTCATTATAAACAACATACAAGGAAAAATAGAGACAGTAGACACT

QA 1 528 1 528
DS 



AS 1 2

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GATATGAGGTACGTTCGACGATCGTTCATGACAAAATGCTTCAGATGTGGAAAGACAACT
TCGAAGTCAAAACCATACCAAGATCCAAGATGGATGGTGAATACCAAGACCCCAGCATTC
ATCTCTACCTCATGTCACAGAAATCTTCTGCGGAGAGCTCTGGAAACGCTGTCCAGGACG
AAGCTGTTGTTGCTGATACGGCTGAAACAAAGTGTGAGAAGGAAGTTTCAACCGTAGATT
CTTCTTCACCAAATCTGTTGGAAGAGGAAGACGTTGCTGCACACCGTCCTAAACTTAGAG
AAGATAGTTTGTTGATGAGACTACGAGACGGGAAGATGAGTGAATGGGAGATGAGAAGGT
ATGGTAAAGTTGCTGCACAGCTTCTACGTGACGTTAAGATAGATGTTCAGGTGAAAAAGT
GACTCTGCATAAGCCGTTGAGAGCCTTGTTCCTCAGATTCTCAACCGTTTTCCGTTTTTA
CTTTTGGTATCATAGACAATGTATACAAGTGAATCCTCCTCCAGACTCTTTGCGTTTGCT
TGTAATTCATGAACCGAGACAATGTAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C477TF U 1
AF RS1C477JQ C 452
BS 1 671 RS1C477TF
BS 672 672 RS1C477JQ
BS 673 742 RS1C477TF
BS 743 743 RS1C477JQ
BS 744 762 RS1C477TF
BS 763 1167 RS1C477JQ

RD RS1C477TF 762 0 0
GGAACTGAAACTGAAGCGCCTTTATGAAAACACTCTCCCTGCCTCTCTGGTCTAGAGAGC
ATCGATAACTAGCCGTAGTTCGTGTTTCGTCGGACGGCAAAGCAAATGGATCCCGCCAGG
GTGAATTCTCCAAGCACATGTACAGTAACTCGAAGCATCTAGGAACAACCGTGTGGGATG
CATCCATGGTGTTTGCCAAATATCTGGGGAAAAATTGCAGGAAGGGAAGGTTTAGTCCAT
CTAAACTTAAAGGGAAACGTGCTATTGAGCTAGGAGCGGGTTGCGGCGTAGCTGGATTTG
CTTTGGCGATGCTGGGATGTGATGTGGTTTCAACTGACCAAAAGGAGGTTTTGCCACTGC
TAAAGAGGAACGTAGAATGGAACACCTCCACAATCTTACAGATGAATACTACTGGATCAG
CATCATTTGGATCGCTCCGAGTTGCAGAACTTGACTGGGGAAATGAAGATCATATAAGGG
CCGTTGAGCCGCCTTTTGATTACGTCATCGGTACTGATGTTGTATACTCTGAACAGCTTC
TGGAGCCTCTGTTACACACAATACTCGCGCTGTCAGGGCCAAAGACAACAGTTATGTTGG
GATATGAGGTACGTTCGACGATCGTTCATGACAAAATGCTTCAGATGTGGAAAGACAACT
TCGAAGTCAAA*CCATACCAAGATCCAAGATGGATGGTGAATACCAAGACCCCAGCATTC
ATCTCTACCTCATGTCACAGAA*TCTTCTGCGGAGAGCTCTG

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1C477JQ 716 0 0
TGACTGGGGAAATGAAGATCATATAAGGGCCGTTGAGCCGCCTTTTGATTACGTCATCGG
TACTGATGTTGTATACTCTGAACAGCTTCTGGAGCCTCTGTTACACACAATACTCGCGCT
GTCAGGGCCAAAGACAACAGTTATGTTGGGATATGAGGTACGTTCGACGATCGTTCATGA
CAAAATGCTTCAGATGTGGAAAGACAACTTCGAAGTCAAAACCATACCAAGATCCAAGAT
GGATGGTGAATACCAAGACCCCAGCATTCATCTCTACCTCATGTCACAGAAATCTTTTGC
GGAGAGCTCTGGAAACGCTGTCCAGGACGAAGCTGTTGTTGCTGATACGGCTGAAACAAA
GTGTGAGAAGGAAGTTTCAACCGTAGATTCTTCTTCACCAAATCTGTTGGAAGAGGAAGA
CGTTGCTGCACACCGTCCTAAACTTAGAGAAGATAGTTTGTTGATGAGACTACGAGACGG
GAAGATGAGTGAATGGGAGATGAGAAGGTATGGTAAAGTTGCTGCACAGCTTCTACGTGA
CGTTAAGATAGATGTTCAGGTGAAAAAGTGACTCTGCATAAGCCGTTGAGAGCCTTGTTC
CTCAGATTCTCAACCGTTTTCCGTTTTTACTTTTGGTATCATAGACAATGTATACAAGTG
AATCCTCCTCCAGACTCTTTGCGTTTGCTTGTAATTCATGAACCGAGACAATGTAT

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

CO CL8143Contig1 635 2 2 U
GGTGAAGCGATGGATCGAGGAGGGTGCAATGAACCCGACGGATGAGGTCATCATGTCTAA
GCATCTCCTCGAATCGACTCTCATGGGTGGGTTTCTTTTCCTTGGGCTGATGATAGACAG
GCTACACCACTACATGAGAGAGCTACGCATGAGAAGGAAGACCATGGAGGTCGTAAAGAA
GGAAGGATCGGTTTTGGAAGGTGAGAAAGCCAGAGCTTCAGATGAAGTCAAAAGCTTGAA
ACAAGAAATCACATCTCTTCGGGAAAGGCAAAAGCAGCTGGAGTCTGAGATCGAGGCAAA
GACTGAAGAAATCCGTACTGAAGAAACAAGTGGAATAGCTCTACAGAAGCAATCTGAAGG
GTTCCTCATCGAGTTTAACCGCTTGTCTGAGGAAAACCAGGATCTTCGTTACCAGTTGCA
CACCGTGGATTCAAGAATTTCGCGTTCAAGCATCAAGAAGAATACTTGAGCCAGTCTTTA
CTCCAACATTTTTTTTTAGTTTAAACTTGTTTGTGATATTACGTTTGTTAATAGGGTGCT
TTGCTGCTTGGTAATTGAATCTTGTCTTTAACCATATGGAAGATGATGGGAGTAAATCAG
AGGGAATACAAAAACACAAAGATTACTTTTGTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DS16TF U 1
AF RS1DS16JQ C 59
BS 1 614 RS1DS16TF
BS 615 635 RS1DS16JQ

RD RS1DS16TF 614 0 0
GGTGAAGCGATGGATCGAGGAGGGTGCAATGAACCCGACGGATGAGGTCATCATGTCTAA
GCATCTCCTCGAATCGACTCTCATGGGTGGGTTTCTTTTCCTTGGGCTGATGATAGACAG
GCTACACCACTACATGAGAGAGCTACGCATGAGAAGGAAGACCATGGAGGTCGTAAAGAA
GGAAGGATCGGTTTTGGAAGGTGAGAAAGCCAGAGCTTCAGATGAAGTCAAAAGCTTGAA
ACAAGAAATCACATCTCTTCGGGAAAGGCAAAAGCAGCTGGAGTCTGAGATCGAGGCAAA
GACTGAAGAAATCCGTACTGAAGAAACAAGTGGAATAGCTCTACAGAAGCAATCTGAAGG
GTTCCTCATCGAGTTTAACCGCTTGTCTGAGGAAAACCAGGATCTTCGTTACCAGTTGCA
CACCGTGGATTCAAGAATTTCGCGTTCAAGCATCAAGAAGAATACTTGAGCCAGTCTTTA
CTCCAACATTTTTTTTTAGTTTAAACTTGTTTGTGATATTACGTTTGTTAATAGGGTGCT
TTGCTGCTTGGTAATTGAATCTTGTCTTTAACCATATGGAAGATGATGGGAGTAAATCAG
AGGGAATACAAAAA

QA 1 614 1 614
DS 

RD RS1DS16JQ 577 0 0
AAGCATCTCCTCGAATCGACTCTCATGGGTGGGTTTCTTTTCCTTGGGCTGATGATAGAC
AGGCTACACCACTACATGAGAGAGCTACGCATGAGAAGGAAGACCATGGAGGTCGTAAAG
AAGGAAGGATCGGTTTTGGAAGGTGAGAAAGCCAGAGCTTCAGATGAAGTCAAAAGCTTG
AAACAAGAAATCACATTTTTTCGGGAAAGGCAAAAGCAGCTGGAGTTTGAGATCGAGGCA
AAGACTGAAGAAATCCGTACTGAAGAAACAAGTGGAATAGCTCTACAGAAGCAATTTGAA
GGGTTCCTCATCGAGTTTAACCGCTTGTTTGAGGAAAACCAGGATTTTCGTTACCAGTTG
CACACCGTGGATTCAAGAATTTCGCGTTCAAGCATCAAGAAGAATACTTGAGCCAGTTTT
TACTCCAACATTTTTTTTTAGTTTAAACTTGTTTGTGATATTACGTTTGTTAATAGGGTG
CTTTGCTGCTTGGTAATTGAATCTTGTCTTTAACCATATGGAAGATGATGGGAGTAAATC
AGAGGGAATACAAAAACACAAAGATTACTTTTGTTCG

QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 2

CO CL8144Contig1 761 2 2 U
GGATGTGTCGTGACTCTTTCTCTCTCTCTCGTTTATTCGCGAAGAAGGAAGAAGGAAGAA
GAAGCCATGGCAGGAGTATGACCGATGACTCAGGATTGGAGCCTGTGGTGACTCGGACTT
TCAGCCTCGCCTCTTTCTGCCTCGACGGGTCCAAACTCACCGAGAATCCCGACGGTGGTG
ATCCCGCCCGTTTCGTCCTCTGAAACCTTCGAATCCGTTTCCGGCACTACCGCAAAGCAT
AGCAATGATTGGTTCTCTGTCTCTCTCTCTCTGCCGATTACGAAAATCGTATGCATCTGT
GTCGAATCAAGCATCTGTTTTGAGAATTGATAGATAAAAGCTTTGTTGTTTTGTGATTGT
ATTTGGATTTTTAGAAGGAAAAAAAAAAACGCTGACTTTGTTTCTTTTCGTTCTCTATCT
CTCTCTCTGTTGATCACGAAAACCGTATCCATCTGAGTCGAATCGAAAGGATGCATCTGA
GTCGAATTGAAACAGCTGAGTCAGATCGTAAGGTAAATAATTAGTGAAAGAGTGGAGCTC
TCAGGTGGTGATCACTAGCATTACTATAGGAGGCCTTCTATTGCTTATTGGAAGCCATCA
GAAAGAAAAGGTACGTTATTGGAACAACATCAAGAATGACTTTTCTAGTGAACTGATCTT
AGTGATGGTCGGTTGTGGCTTTAAGCTTCTTGTTCTGTTTTATGTAGTTTTTGTTATGAA
AAAACGTATCACGGTTTTAATGTAGTTTAAATGTTCTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FR60TF U 1
AF RS1FR60JQ C 202
BS 1 622 RS1FR60TF
BS 623 761 RS1FR60JQ

RD RS1FR60TF 622 0 0
GGATGTGTCGTGACTCTTTCTCTCTCTCTCGTTTATTCGCGAAGAAGGAAGAAGGAAGAA
GAAGCCATGGCAGGAGTATGACCGATGACTCAGGATTGGAGCCTGTGGTGACTCGGACTT
TCAGCCTCGCCTCTTTCTGCCTCGACGGGTCCAAACTCACCGAGAATCCCGACGGTGGTG
ATCCCGCCCGTTTCGTCCTCTGAAACCTTCGAATCCGTTTCCGGCACTACCGCAAAGCAT
AGCAATGATTGGTTCTCTGTCTCTCTCTCTCTGCCGATTACGAAAATCGTATGCATCTGT
GTCGAATCAAGCATCTGTTTTGAGAATTGATAGATAAAAGCTTTGTTGTTTTGTGATTGT
ATTTGGATTTTTAGAAGGAAAAAAAAAAACGCTGACTTTGTTTCTTTTCGTTCTCTATCT
CTCTCTCTGTTGATCACGAAAACCGTATCCATCTGAGTCGAATCGAAAGGATGCATCTGA
GTCGAATTGAAACAGCTGAGTCAGATCGTAAGGTAAATAATTAGTGAAAGAGTGGAGCTC
TCAGGTGGTGATCACTAGCATTACTATAGGAGGCCTTCTATTGCTTATTGGAAGCCATCA
GAAAGAAAAGGTACGTTATTGG

QA 1 622 1 622
DS 

RD RS1FR60JQ 560 0 0
GAAACCTTCGAATCCGTTTCCGGCACTACCGCAAAGCATAGCAATGATTGGTTTTCTGTC
TCTCTCTTTCTGCCGATTACGAAAATCGTATGCATCTGTGTCGAATCAAGCATCTGTTTT
GAGAATTGATAGATAAAAGCTTTGTTGTTTTGTGATTGTATTTGGATTTTTAGAAGGAAA
AAAAAAAACGCTGACTTTGTTTCTTTTCGTTCTCTATCTCTCTCTCTGTTGATCACGAAA
ACCGTATCCATTTGAGTCGAATCGAAAGGATGCATTTGAGTCGAATTGAAACAGCTGAGT
CAGATCGTAAGGTAAATAATTAGTGAAAGAGTGGAGCTCTCAGGTGGTGATCACTAGCAT
TACTATAGGAGGCCTTCTATTGCTTATTGGAAGCCATCAGAAAGAAAAGGTACGTTATTG
GAACAACATCAAGAATGACTTTTCTAGTGAACTGATCTTAGTGATGGTCGGTTGTGGCTT
TAAGCTTCTTGTTCTGTTTTATGTAGTTTTTGTTATGAAAAAACGTATCACGGTTTTAAT
GTAGTTTAAATGTTCTTGGC

QA 1 560 1 560
DS 



AS 1 2

CO CL8145Contig1 969 2 10 U
GGATCAAAACCAATCTGCATTGTCAAGAAAAATAGTTTTCAATTGAATGTTCTTATGATT
TGATTCCCACCTTTTCTGGACTCTTTTGATTCCATACAAGAAAAATTGTTTCCACCTTCG
TTTTCTTTCCTTAGGGTGAAACTGTTCCTTGAAATGCAAGAACACAAATCATCAAAAGCT
GGAAAAAATCAGAGATTTTGTTAAGGGAATGCATGTTGAGACCCAACCAATGAGACGCAA
ATCTGGATTTGATTGCGTAAAGAGTTGATGGGAAATCGCTGTTCTAGAATTCCTTGTTGT
AGAAAGTTATGGTCACGTATATGCTGCTGCTGCAGCAACATCAACAACATTAATTGTCAA
GCCCGAAGCCACCACGGTTCCAAAGGAATGGTCTATCCTGTAACCAGAATCGAAATATGG
GAAGAAAAGGTCACAGAAGCTAAAAACAATGGCAAGATTCTAGTGGTGAATTTCAACGCG
TCATGGTGTGTGCCTTGTAAAAAATTAGAACCAATATTCAGAGAACTTGCTTCTAGATAC
CCTTCAATGATATTTGTAACCATTGATGTCGAAGAGCTCGCTGAGTTTAGTAGTGAATGG
AATGTGGAAGCTACACCAACTGTAGTGTTCCTTAAAGATGGGAGACAAATGGATAAACTA
GTTGGTGCTGAGACATCAGAGCTTCAGAAGAAAACAGCTGCAGCTGCCGATCTCTAACTC
TTGAGAACCATAAAATCTTAACAACAGAAACAGAGGAGAATTAGGTTTTTTTTTCCATTG
TCTGTCAGAAATTTGTTCAGATCAACCTAACTCGCAGATGAAGTTATGAGATTCGTTAAA
CTTCATCTACTTCTCTTTTCTGTAAATTTACCAAATGGTTACAGTTATTGCCAACAACCA
GTAAACAAGTTTCTTCTTGTAAATATTTGTTTAAACTATTTACAAAAATCCTACATAATT
TTTTTTCCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CX83TF U 1
AF RS1CX83JQ C 307
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RD RS1CX83TF 745 0 0
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TGATTCCCACCTTTTCTGGACTCTTTTGATTCCATACAAGAAAAATTGTTTCCACCTTCG
TTTTCTTTCCTTAGGGTGAAACTGTTCCTTGAAATGCAAGAACACAAATCATCAAAAGCT
GGAAAAAATCAGAGATTTTGTTAAGGGAATGCATGTTGAGACCCAACCAATGAGACGCAA
ATCTGGATTTGATTGCGTAAAGAGTTGATGGGAAATCGCTGTTCTAGAATTCCTTGTTGT
AGAAAGTTATGGTCACGTATATGCTGCTGCTGCAGCAACATCAACAACATTAATTGTCAA
GCCCGAAGCCACCACGGTTCCAAAGGAATGGTCTATCCTGTAACCAGAATCGAAATATGG
GAAGAAAAGGTCACAGAAGCTAAAAACAATGGCAAGATTCTAGTGGTGAATTTCAACGCG
TCATGGTGTGTGCCTTGTAAAAAATTAGAACCAATATTCAGAGAACTTGCTTCTAGATAC
CCTTCAATGATATTTGTAACCATTGATGTCGAAGAGCTCGCTGAGTTTAGTAGTGAATGG
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GTTGGTGCTGAGACATCAGAGCTTCAGAAGAAA*CAGCTGCAGCTGCCGATCTCTA*CTC
TTGA*AACCATAAA*TCTTAACAAC

QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1CX83JQ 663 0 0
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AGCCACCACGGTTCCAAAGGAATGGTCTATCCTGTAACCAGAATCGAAATATGGGAAGAA
AAGGTCACAGAAGCTAAAAACAATGGCAAGATTCTAGTGGTGAATTTCAACGCGTCATGG
TGTGTGCCTTGTAAAAAATTAGAACCAATATTCAGAGAACTTGCTTCTAGATACCCTTCA
ATGATATTTGTAACCATTGATGTCGAAGAGCTCGCTGAGTTTAGTAGTGAATGGAATGTG
GAAGCTACACCAACTGTAGTGTTCCTTAAAGATGGGAGACAAATGGATAAACTAGTTGGT
GCTGAGACATCAGAGCTTCAGAAGAAAACAGCTGCAGCTGCCGATCTCTAACTCTTGAGA
ACCATAAAATCTTAACAACAGAAACAGAGGAGAATTAGGTTTTTTTTTCCATTGTCTGTC
AGAAATTTGTTCAGATCAACCTAACTCGCAGATGAAGTTATGAGATTCGTTAAACTTCAT
CTACTTCTCTTTTCTGTAAATTTACCAAATGGTTACAGTTATTGCCAACAACCAGTAAAC
AAGTTTCTTCTTGTAAATATTTGTTTAAACTATTTACAAAAATCCTACATAATTTTTTTT
CCG

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

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AGCAACACAACACTGAGCTGGTGGTTGGGATGGTGAGGCAACAATTTAAGAAACACATGA
ATGAGACAGACCCCGAGAAGATTCAGAAGTTAAAGGATGATGCTGCTCGTGGACTCATCA
ATCACATGTTGTTCGAGTCAGAGAAGTTAACAGGACGCAAGGTTAGCCAGAGATCCTGAT
GCAGAGACATGTTGCTGACTTTCATCGTTATACGCTCTCTCCTTCATTGTATGCTAAACA
ATGCAAGCTTGGTTAGCTTTAATAAAAGAACTTTGTAATGGGAGTAGCTTCAATGCATTC
ATAACATTGATGATTTTGGTTTCCAATTCAATGTACTTCAAATTGAATC


BQ
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AF RS1B613JQ C 1
AF RS1B613TF U 1
BS 1 529 RS1B613TF

RD RS1B613JQ 529 0 0
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GTAGTTTGAATCTCCTTGTGGAAATGCCGACTCTACAAGGCTCTCTGCCTCCTGAGCTCG
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ATCACATGTTGTTCGAGTCAGAGAAGTTAACAGGACGCAAGGTTAGCCAGAGATCCTGAT
GCAGAGACATGTTGCTGACTTTCATCGTTATACGCTCTCTCCTTCATTGTATGCTAAACA
ATGCAAGCTTGGTTAGCTTTAATAAAAGAACTTTGTAATGGGAGTAGCTTCAATGCATTC
ATAACATTGATGATTTTGGTTTCCAATTCAATGTACTTCAAATTGAATC

QA 1 529 1 529
DS 

RD RS1B613TF 529 0 0
GGATCTCAAGCTCCGTGTCATCTCGCCGGCAAAGAACTCGATCTATCTGAAAAGAAAACC
GTAGTTTGAATCTCCTTGTGGAAATGCCGACTCTACAAGGCTCTCTGCCTCCTGAGCTCG
CTAACAATGTGGTTAGGTTGTACCGTGAATGTCTTCGTAGAGCTACATTCATTGGCAAGC
AGCAACACAACACTGAGCTGGTGGTTGGGATGGTGAGGCAACAATTTAAGAAACACATGA
ATGAGACAGACCCCGAGAAGATTCAGAAGTTAAAGGATGATGCTGCTCGTGGACTCATCA
ATCACATGTTGTTCGAGTCAGAGAAGTTAACAGGACGCAAGGTTAGCCAGAGATCCTGAT
GCAGAGACATGTTGCTGACTTTCATCGTTATACGCTCTCTCCTTCATTGTATGCTAAACA
ATGCAAGCTTGGTTAGCTTTAATAAAAGAACTTTGTAATGGGAGTAGCTTCAATGCATTC
ATAACATTGATGATTTTGGTTTCCAATTCAATGTACTTCAAATTGAATC

QA 1 529 1 529
DS 



AS 1 2

CO CL8147Contig1 931 2 4 U
GCTGCAGTCACCATATATGCAATGGGCAACCTAGAATACATCTCTATTGACCTCTTGCAA
AAGATCTCTTCCTCTGGAATCATTCTTACTCACGCCCCCTGCGGTGTTCACGACTTATCT
GAATTTCTGGTCGACTGGCGTGAATGCCCACATCCTCCACATGTCATAATGGTTATATCG
GGTGATTATGATATGATTTATCCTCCGCGTTATCAGGGTTATAATAATTTTGTTGCATAT
CCAAAAGGTGTTCCCCTAGCTGCCCCTCTTGACCAGCTAACAGTGTTTGCCATGGAGTTT
GCCAGAGTGTTTGACAAAGTGTTTGTCTGGGAAACTTTATTGAGTGATAATTTGGCAAGT
GAAACTTTATTATTGAGTGACAACAACACATGTGATGAGGAACCTCTCTGCATTTGCAAC
ATATGCAATGATGCTTTCCAAGTATGTGACGAATTCATCACTCATCTCAAGAGTGATCAG
CACAGAAACCAGTCACTTAAGCAAGCAGCATGCATCGACCGCTACGGTATGCCTAAACAT
TTTTGCCAAGTTTGCAATCATCCCGTCTATGGCGACTCTAACCTCTTACTCCATAACCAA
TGTGAAGAACATAAACGCAAGCTGGTTGAGAAACATGCTCAAGAAGAGGAGGATTGCCAG
AGCAGGAAGACAAATCCAGAATTGGATCTCTTCAAGCAATCTCGCAAACAAGAAGAGGCA
GCCTAAGGAAGAAGAAGCTAGAGTGCCCTGCATCACCATGGGGTCTTTGTGTTCAAGAGT
TTACTAAATTGCTTATTACTAGATTTTCAACCCGAGTTTATTTTTAACTAGATAAAAGAC
CTAAAATAATAAACTATTTTATTATAGTTTTATGATTGTTTTTTACCTTTGTTTTGTGAG
ATTTATTTTATAGTTAAAAGACAATTATTAC


BQ
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AF RS1GU60TF U 1
AF RS1GU60JQ C 159
BS 1 665 RS1GU60TF
BS 666 666 RS1GU60JQ
BS 667 692 RS1GU60TF
BS 693 931 RS1GU60JQ

RD RS1GU60TF 692 0 0
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AAGATCTCTTCCTCTGGAATCATTCTTACTCACGCCCCCTGCGGTGTTCACGACTTATCT
GAATTTCTGGTCGACTGGCGTGAATGCCCACATCCTCCACATGTCATAATGGTTATATCG
GGTGATTATGATATGATTTATCCTCCGCGTTATCAGGGTTATAATAATTTTGTTGCATAT
CCAAAAGGTGTTCCCCTAGCTGCCCCTCTTGACCAGCTAACAGTGTTTGCCATGGAGTTT
GCCAGAGTGTTTGACAAAGTGTTTGTCTGGGAAACTTTATTGAGTGATAATTTGGCAAGT
GAAACTTTATTATTGAGTGACAACAACACATGTGATGAGGAACCTCTCTGCATTTGCAAC
ATATGCAATGATGCTTTCCAAGTATGTGACGAATTCATCACTCATCTCAAGAGTGATCAG
CACAGAAACCAGTCACTTAAGCAAGCAGCATGCATCGACCGCTACGGTATGCCTAAACAT
TTTTGCCAAGTTTGCAATCATCCCGTCTATGGCGACTCTAACCTCTTACTCCATAACCAA
TGTGAAGAACATAAACGCAAGCTGGTTGAGAAACATGCTCAAGAAGAGGAGGATTGCCAG
AGCAG*AAGACAAATCCAGAATTGGATCTCTT

QA 1 692 1 692
DS 

RD RS1GU60JQ 773 0 0
ACATGTCATAATGGTTATATCGGGTGATTATGATATGATTTATCCTCCGCGTTATCAGGG
TTATAATAATTTTGTTGCATATCCAAAAGGTGTTCCCCTAGCTGCCCCTCTTGACCAGCT
AACAGTGTTTGCCATGGAGTTTGCCAGAGTGTTTGACAAAGTGTTTGTCTGGGAAACTTT
ATTGAGTGATAATTTGGCAAGTGAAACTTTATTATTGAGTGACAACAACACATGTGATGA
GGAACCTCTCTGCATTTGCAACATATGCAATGATGCTTTCCAAGTATGTGACGAATTCAT
CACTCATCTCAAGAGTGATCAGCACAGAAACCAGTCACTTAAGCAAGCAGCATGCATCGA
CCGCTACGGTATGCCTAAACATTTTTGCCAAGTTTGCAATCATCCCGTCTATGGCGACTC
TAACCTCTTACTCCATAACCAATGTGAAGAACATAAACGCAAGCTGGTTGAGAAACATGC
TCAAGAAGAGGAGGATTGCCAGAGCAGGAAGACAAATCCAGAATTGGATCTCTTCAAGCA
ATCTCGCAAACAAGAAGAGGCAGCCTAAGGAAGAAGAAGCTAGAGTGCCCTGCATCACCA
TGGGGTCTTTGTGTTCAAGAGTTTACTAAATTGCTTATTACTAGATTTTCAACCCGAGTT
TATTTTTAACTAGATAAAAGACCTAAAATAATAAACTATTTTATTATAGTTTTATGATTG
TTTTTTACCTTTGTTTTGTGAGATTTATTTTATAGTTAAAAGACAATTATTAC

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

CO CL8148Contig1 1038 2 8 U
GGAGGGTAAAGGGATTGCCTTTCAACAAGTACGCATGGTTAACAACACACAACTCGTTTG
CAAGATTGGGGCAAGTATCAAAAACCGGTTCTGTAATTTTAGCTCCTACTAATCAACAAG
ATTCGGTCACAACCCAACTCACGAACGGTGTAAGAGGGTTTATGCTCGACATGTACGACT
TCGAAAACGATATCTGGCTTTGTCACTCTTTCGATGGAACGTGTTTTAATTTCACCGCTT
TCCAACCAGCGGTTAACGTTCTAAGGGAGATACAAGTGTTTCTAGAGAATAACAAGGATG
AAGTTGTAACGATTATTATAGAAGACTATGTGAAATCTCCCATGGGCCTCACGAAAGTGT
TTAATGCGGCAGGGCTACAAAAGTTCATGTTTCCAGTTACTAGAATGCCCAAAACTGGAG
GGGACTGGCCAACGCTTGACGACATGATAAAACAAAACCAAAGGTTGCTAGTTTTCACAT
CCGACAGAAGTAAAGAAGCAACCGAAGGAATCGCATACCAGTGGAAGTACATGGTTGAGA
ACCACTATGGAAATGGAGGGTTGAAGGAAGGAGCGTGTCCTAACAGAGCTCAATCAGCAC
CAATGAGCGATAAATCGAAATCTCTTGTACTTGTTAACCATTTTCCAGATGCTCCGGATT
TGGTAGTAGCATGTAGACAAAACTCTGCTCCACTTCTTGAATCCATCAAAGCATGTTACC
AAGCCGCAGGACAAAGATGGCCTAACTTCATAGCAGTCGATTTCTACAAGAGAAGTGATG
GTGGAGGAGCCCCGCAAGCTGTTGATGTTTCAAATGGCAATTTGATATGCGGTTGCGATA
ATTTTGCAGCTTGCAAGGCCAATGGAGAGTGTGGATAGTTAGCAAGACTGAGCCATCGGA
GGCAACTTCCATGAACAAAAGCTATGGCTGTTTACAAAAAATGTAACGTGGTGTGCCCTT
TATTTTATAACAACACATGGTTCAACTTGTTTCCTTTTACACTAGTTGCCAAATATTAGT
GAGAGTATCATTCATCCC


BQ
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AF RS1D239TF U 1
AF RS1D239JQ C 203
BS 1 681 RS1D239TF
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RD RS1D239TF 765 0 0
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CAAGATTGGGGCAAGTATCAAAAACCGGTTCTGTAATTTTAGCTCCTACTAATCAACAAG
ATTCGGTCACAACCCAACTCACGAACGGTGTAAGAGGGTTTATGCTCGACATGTACGACT
TCGAAAACGATATCTGGCTTTGTCACTCTTTCGATGGAACGTGTTTTAATTTCACCGCTT
TCCAACCAGCGGTTAACGTTCTAAGGGAGATACAAGTGTTTCTAGAGAATAACAAGGATG
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TTAATGCGGCAGGGCTACAAAAGTTCATGTTTCCAGTTACTAGAATGCCCAAAACTGGAG
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CCGACAGAAGTAAAGAAGCAACCGAAGGAATCGCATACCAGTGGAAGTACATGGTTGAGA
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CAATGAGCGATAAATCGAAATCTCTTGTACTTGTTAACCATTTTCCAGATGCTCCGGATT
TGGTAGTAGCATGTAGACAAA*CTCTGCTCCACTTCTTGAATCCATCAAAGCATGTTACC
AAGCCGCAG*ACAAAGATGGCCTA*CTTCATAGCAGTCGATTTCT

QA 1 765 1 765
DS 

RD RS1D239JQ 836 0 0
TGTCACTCTTCGAT
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TGTTTCTAGAGAATAACAAGGATGAAGTTGTAACGATTATTATAGAAGACTATGTGAAAT
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TTACTAGAATGCCCAAAACTGGAGGGGACTGGCCAACGCTTGACGACATGATAAAACAAA
ACCAAAGGTTGCTAGTTTTCACATCCGACAGAAGTAAAGAAGCAACCGAAGGAATCGCAT
ACCAGTGGAAGTACATGGTTGAGAACCACTATGGAAATGGAGGGTTGAAGGAAGGAGCGT
GTCCTAACAGAGCTCAATCAGCACCAATGAGCGATAAATCGAAATTTCTTGTACTTGTTA
ACCATTTTCCAGATGCTCCGGATTTGGTAGTAGCATGTAGACAAAACTCTGCTCCACTTC
TTGAATCCATCAAAGCATGTTACCAAGCCGCAGGACAAAGATGGCCTAACTTCATAGCAG
TCGATTTCTACAAGAGAAGTGATGGTGGAGGAGCCCCGCAAGCTGTTGATGTTTCAAATG
GCAATTTGATATGCGGTTGCGATAATTTTGCAGCTTGCAAGGCCAATGGAGAGTGTGGAT
AGTTAGCAAGACTGAGCCATCGGAGGCAACTTCCATGAACAAAAGCTATGGCTGTTTACA
AAAAATGTAACGTGGTGTGCCCTTTATTTTATAACAACACATGGTTCAACTTGTTTCCTT
TTACACTAGTTGCCAAATATTAGTGAGAGTATCATTCATCCC

QA 15 836 15 836
DS 



AS 1 2

CO CL8149Contig1 916 2 2 U
GGGGTTCTTTCTTTCTCTCCCTCAACGATTCTGTGTTTCTCTCAACCTCTCCACTTCACT
ACGCATCAAAACAACTCCCCTACAAAAACCCTAACCCCTCTCTCTCATCTCTCCTCCTCT
TCTTCGCCGAGCAGAGCAGCAGCAGCAGCAGCCATGGATGCCAAAGAAGCCTCCACCACC
GATCTGAAGTGCCCGAGAGAGGAGGACGATAACGCCGCCGCCGCTTCCATGGAGACAGAG
AACGGAGATCAGACAAAGGAGCTTGCTTGTTTCTCCTCTGTGATTCCCGGATGGTTCTCT
GAGATGAGTCCCATTGTGGCCAGGAGAGGCAAACGCTTTGAAGGTTGAGAAGGTTTTGTT
TCAAGAAGATGATCACTCATCTTCGTCCATTCATCCAACTCACGGAGAGAGACGAGTGTG
ATTATCAGGAGATGATCACTCATCTTCCTTTGTGCTCTATCCCTAACCCAAAAAGGTACA
CTGTCACACGTTCTTACCATTTATGGATCAATAGATATGAAGGTTTCAATTTGTCAATGT
CTCTGTCTCTTGTGTGGTCTCAAATGAATTGATTGTTTTTCTTGTCTGAGTTGAATAGAT
AGATTAGCTTCTCGTCTCAATTGATTCCTTGATCTATTACTCTTTTTTTTTCCTGTGTAT
TTGTCTGTTGAGTTCCATGGATCAAGGACGCTGAGGAAGGATCGTGAAAGGAGAGGATGA
CATTTACTGGATGGCATTTACTAGAGCAATATAGGTTTATTAATAGAATGGAGCATACGT
GTGGTGTTGGAGCATGCGTGTGGTGTTGGAGCATCCATTTTCTGTTGTGTTTTGTTAGTT
TCTATCACGGATTGTACTTGTTTCCTTTTATCTTGTTTGCTTTTATCACGGATTGTAGAG
TGCTTATGCTTCTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DQ89TF U 1
AF RS1DQ89JQ C 118
BS 1 646 RS1DQ89TF
BS 647 916 RS1DQ89JQ

RD RS1DQ89TF 646 0 0
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ACGCATCAAAACAACTCCCCTACAAAAACCCTAACCCCTCTCTCTCATCTCTCCTCCTCT
TCTTCGCCGAGCAGAGCAGCAGCAGCAGCAGCCATGGATGCCAAAGAAGCCTCCACCACC
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AACGGAGATCAGACAAAGGAGCTTGCTTGTTTCTCCTCTGTGATTCCCGGATGGTTCTCT
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TCAAGAAGATGATCACTCATCTTCGTCCATTCATCCAACTCACGGAGAGAGACGAGTGTG
ATTATCAGGAGATGATCACTCATCTTCCTTTGTGCTCTATCCCTAACCCAAAAAGGTACA
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CTCTGTCTCTTGTGTGGTCTCAAATGAATTGATTGTTTTTCTTGTCTGAGTTGAATAGAT
AGATTAGCTTCTCGTCTCAATTGATTCCTTGATCTATTACTCTTTT

QA 1 646 1 646
DS 

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TCTTCTTCGCCGAGCAGAGCAGCAGCAGCAGCAGCCATGGATGCCAAAGAAGCCTCCACC
ACCGATCTGAAGTGCCCGAGAGAGGAGGACGATAACGCCGCCGCCGCTTCCATGGAGACA
GAGAACGGAGATCAGACAAAGGAGCTTGCTTGTTTCTCCTCTGTGATTCCCGGATGGTTC
TCTGAGATGAGTCCCATTGTGGCCAGGAGAGGCAAACGCTTTGAAGGTTGAGAAGGTTTT
GTTTCAAGAAGATGATCACTCATCTTCGTCCATTCATCCAACTCACGGAGAGAGACGAGT
GTGATTATCAGGAGATGATCACTCATCTTCCTTTGTGCTCTATCCCTAACCCAAAAAGGT
ACACTGTCACACGTTCTTACCATTTATGGATCAATAGATATGAAGGTTTCAATTTGTCAA
TGTCTCTGTCTCTTGTGTGGTCTCAAATGAATTGATTGTTTTTCTTGTCTGAGTTGAATA
GATAGATTAGCTTCTCGTCTCAATTGATTCCTTGATCTATTACTCTTTTTTTTTCCTGTG
TATTTGTCTGTTGAGTTCCATGGATCAAGGACGCTGAGGAAGGATCGTGAAAGGAGAGGA
TGACATTTACTGGATGGCATTTACTAGAGCAATATAGGTTTATTAATAGAATGGAGCATA
CGTGTGGTGTTGGAGCATGCGTGTGGTGTTGGAGCATCCATTTTCTGTTGTGTTTTGTTA
GTTTCTATCACGGATTGTACTTGTTTCCTTTTATCTTGTTTGCTTTTATCACGGATTGTA
GAGTGCTTATGCTTCTGTC

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 2

CO CL8150Contig1 1500 2 2 U
GGATCGTTGAGAAGCAAAGCAGTTCACTTTGTCAGCGATCTCACCACCGGTCTCCTTAAT
CCCATCTCTGATAAACCCTCCTCCTCTCCTCCTCCGGATGATGAGGGAGATGAGTCCAAG
AGAGATCAACTAGAAGAGTCCATCACTGAGAAAGATTTGGTTGACGAGCCTGACACTTCT
TCCTTCTCTGCTTTCCTTGGTTCCCTCTTATCCTCAGACCCCAACAACAAACAAACCAAC
CAGGAAGAAGAAGAAGAAGAGGCTGAATCAAGCGATACATCATCATCATCGTCCTCATCC
TCTGGAACAATGAAAGGAACTACTACTACTGTTTCTGGTGGTGCAAAGAAGAGCTTGTTG
TCCAAGTATAAACAGCATTTTAAGAACTTTTACCACGCTGTTAAGTTCTCCTCCAAGGAT
CGAAAGGCAAACTTCCCTGAGGTTGTTAATAAAACTGATGATGATAAAGAAGAGACTAAA
GGATATGATGATGGCTTGGAGATGAAGCAGTTGCAGAAGAACAAAGAGGAAGCTGCAAAG
ATAGGACAACAAGCAATTGTTATACCCGAAATTTCAGAGCCTTCTTTGCTTTTAACGGAC
CAGTCTAGACGTTCCCTTTATTCTTCCCTTCCTGCTCTTGTTCAAGGCAGGAAATGGATT
TTGCTTTACAATACGTGGAGGCACGGTATATCACTCTCAACGCTGTACAGGAAAAGCCTC
CTCTGGCCTGGTCTCAGTTTACTGGTTGTTGGAGACAGGAAAGGTTCGGTTTTTGGTGGA
CTTGTGGAGGCACCTTTGATACCAACTGATAAGAAGTATCAGGTTTGGCTCCCCCCCCCC
AAAGATCCAATCCTTTTTTTTTTAAATTAAGATTTCTCTGTTTCTTTTCAGCCTCTAAAT
TGATGATGATGATCTTCCTCCTTGGTCTCTGCTTTGTTTGTGTTGTGTCAGGGAACCAAC
AGTACATTTGTTTTCACTGATAAGTCTGGACAACCCACTATATACCGTCCCACAGGAGCG
AACCGGTTTTACACTTTATGCTCCAAGGACTTTCTAGCTCTCGGTGGTGGTGGACGCTTT
GCGCTCTATCTAGATAGTGAACTGCTAAGTGGATCAAGTGCTTACTCAGAGACATACGGG
AACGCTTGTCTTGCAAACACTCAGGACTTCGATGTTAAAGAAGTGGAGCTATGGGGATTT
GTATATGGCTCAAAGTATGATGAGATTCTAGCTCTCAGCAAAACTACAGAGCCCGGTGTA
TGCAGGTGGTGATGAATGAAATATTATCATATATAATTAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAG
GTGAGAGATCTCTCTTGTAAATGTGTAGTAATATAATGATGTTGTTCTTAATCACATCTC
CAACACACTCACTTGTAACCAAGAAACCTCTTTTTCTTGTCTTGTTGTAATGATTTTGGA
GTGGAATTTTCAAGGCATAAAATTGACTCTTTAGTCAATGCAGATTGTTTGAGGTTTATT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AR70TFB U 1
AF RS1AR70JQ C 653
BS 1 760 RS1AR70TFB
BS 761 1500 RS1AR70JQ

RD RS1AR70TFB 760 0 0
GGATCGTTGAGAAGCAAAGCAGTTCACTTTGTCAGCGATCTCACCACCGGTCTCCTTAAT
CCCATCTCTGATAAACCCTCCTCCTCTCCTCCTCCGGATGATGAGGGAGATGAGTCCAAG
AGAGATCAACTAGAAGAGTCCATCACTGAGAAAGATTTGGTTGACGAGCCTGACACTTCT
TCCTTCTCTGCTTTCCTTGGTTCCCTCTTATCCTCAGACCCCAACAACAAACAAACCAAC
CAGGAAGAAGAAGAAGAAGAGGCTGAATCAAGCGATACATCATCATCATCGTCCTCATCC
TCTGGAACAATGAAAGGAACTACTACTACTGTTTCTGGTGGTGCAAAGAAGAGCTTGTTG
TCCAAGTATAAACAGCATTTTAAGAACTTTTACCACGCTGTTAAGTTCTCCTCCAAGGAT
CGAAAGGCAAACTTCCCTGAGGTTGTTAATAAAACTGATGATGATAAAGAAGAGACTAAA
GGATATGATGATGGCTTGGAGATGAAGCAGTTGCAGAAGAACAAAGAGGAAGCTGCAAAG
ATAGGACAACAAGCAATTGTTATACCCGAAATTTCAGAGCCTTCTTTGCTTTTAACGGAC
CAGTCTAGACGTTCCCTTTATTCTTCCCTTCCTGCTCTTGTTCAAGGCAGGAAATGGATT
TTGCTTTACAATACGTGGAGGCACGGTATATCACTCTCAACGCTGTACAGGAAAAGCCTC
CTCTGGCCTGGTCTCAGTTTACTGGTTGTTGGAGACAGGA

QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1AR70JQ 848 0 0
AATGGATTTTGCTTTACAATACGTGGAGGCACGGTATATCACTCTCAACGCTGTACAGGA
AAAGCCTCCTCTGGCCTGGTCTCAGTTTACTGGTTGTTGGAGACAGGAAAGGTTCGGTTT
TTGGTGGACTTGTGGAGGCACCTTTGATACCAACTGATAAGAAGTATCAGGTTTGGCTCC
CCCCCCCCAAAGATCCAATCCTTTTTTTTTTAAATTAAGATTTCTCTGTTTCTTTTCAGC
CTCTAAATTGATGATGATGATCTTCCTCCTTGGTCTCTGCTTTGTTTGTGTTGTGTCAGG
GAACCAACAGTACATTTGTTTTCACTGATAAGTCTGGACAACCCACTATATACCGTCCCA
CAGGAGCGAACCGGTTTTACACTTTATGCTCCAAGGACTTTCTAGCTCTCGGTGGTGGTG
GACGCTTTGCGCTCTATCTAGATAGTGAACTGCTAAGTGGATCAAGTGCTTACTCAGAGA
CATACGGGAACGCTTGTCTTGCAAACACTCAGGACTTCGATGTTAAAGAAGTGGAGCTAT
GGGGATTTGTATATGGCTCAAAGTATGATGAGATTCTAGCTCTCAGCAAAACTACAGAGC
CCGGTGTATGCAGGTGGTGATGAATGAAATATTATCATATATAATTAAAAAAAGAAAAAG
AAAAAGAGGTGAGAGATCTCTCTTGTAAATGTGTAGTAATATAATGATGTTGTTCTTAAT
CACATCTCCAACACACTCACTTGTAACCAAGAAACCTCTTTTTCTTGTCTTGTTGTAATG
ATTTTGGAGTGGAATTTTCAAGGCATAAAATTGACTCTTTAGTCAATGCAGATTGTTTGA
GGTTTATT

QA 1 848 1 848
DS 



AS 1 2

CO CL8151Contig1 898 2 4 U
GCCTACTTGGGTAGATGTTGTAGAAGTAGATACATGGGTCAGCAAGTCTGGAAAGAATGG
TATGCGTCGTGATTGGCTTGTTCGTGATGGCAATACTGGAGAAATTTTAACTCGAGCTTC
AAGTGTGTGGGTGATGATGAATAAAGTGACGAGAAGATTATCAAAGATTCCTGAAGAGGT
TCGAGGGGAGATAGAGCCTTACTTTGTGGATTCTGACCCAGTCATCGCCGAGGACAGCAT
AAAGTTAACGAAACTTGATGACAAGACTGCTGACTATGTCCGTTCTGGTCTCACTCCGCG
TTGGAGTGACTTGGATGTTAACCAGCACGTTAACAACGTGAAGTACATAGGGTGGATACT
GGAGAGTGCTCCGGTGGGGATGATGGAGTCTCAGAAGCTGAAAAGCATGGCTCTGGAGTA
TCGCAGGGAGTGCGGGAGGGACAGCGTGCTTCAGTCCCTCACCGCTGTTTCGGGTTGCGA
TGTCGGTAACCTCGGGACGGGCGGTGTAGTGGAATGTCAGCATCTGCTCCGACTCCAGGA
TGGGGCCGAAGTGGTGAGAGGACGAACAGAGTGGAGTACCAAAACATCAACAACGACTTG
GGACATTACACCGTGAAAGAAGAAAAAAAACAGCAAACATGGGGTCCTTTGGTTCGTTTG
TATAAACTATACTACCTGCTTGCAACCATCACCAGTTCGTTTTCCTACTCAAAACAGTTT
GGGCCACCTTTTGTATATTTTTTTTTGGTTCGTATTTTTTTTGTTTCTTCGATGGAGGAG
GTCCCTTTTATTATATTTATTTATTTTCTTTTGGGTGCCAGAGACAAAAGGCAATAACTC
TCTTATCCTGTTTATTTAAATGTATTTTATTTTGGGGGATTTGTAGCTGTTTCCACCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FO91TF U 1
AF RS1FO91JQ C 203
BS 1 629 RS1FO91TF
BS 630 630 RS1FO91JQ
BS 631 740 RS1FO91TF
BS 741 898 RS1FO91JQ

RD RS1FO91TF 740 0 0
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TATGCGTCGTGATTGGCTTGTTCGTGATGGCAATACTGGAGAAATTTTAACTCGAGCTTC
AAGTGTGTGGGTGATGATGAATAAAGTGACGAGAAGATTATCAAAGATTCCTGAAGAGGT
TCGAGGGGAGATAGAGCCTTACTTTGTGGATTCTGACCCAGTCATCGCCGAGGACAGCAT
AAAGTTAACGAAACTTGATGACAAGACTGCTGACTATGTCCGTTCTGGTCTCACTCCGCG
TTGGAGTGACTTGGATGTTAACCAGCACGTTAACAACGTGAAGTACATAGGGTGGATACT
GGAGAGTGCTCCGGTGGGGATGATGGAGTCTCAGAAGCTGAAAAGCATGGCTCTGGAGTA
TCGCAGGGAGTGCGGGAGGGACAGCGTGCTTCAGTCCCTCACCGCTGTTTCGGGTTGCGA
TGTCGGTAACCTCGGGACGGGCGGTGTAGTGGAATGTCAGCATCTGCTCCGACTCCAGGA
TGGGGCCGAAGTGGTGAGAGGACGAACAGAGTGGAGTACCAAAACATCAACAACGACTTG
GGACATTACACCGTGAAAGAAGAAAAAAA*CAGCAAACATGGGGTCCTTTGGTTCGTTTG
TATAAACTATACTACCTGCTTGCAACCATCACCAGTTCGTTTTCCTACTCAAAACAGTTT
GGGCCACCTTTTGTATATTT

QA 1 740 1 740
DS 

RD RS1FO91JQ 696 0 0
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AAGACTGCTGACTATGTCCGTTCTGGTCTCACTCCGCGTTGGAGTGACTTGGATGTTAAC
CAGCACGTTAACAACGTGAAGTACATAGGGTGGATACTGGAGAGTGCTCCGGTGGGGATG
ATGGAGTCTCAGAAGCTGAAAAGCATGGCTCTGGAGTATCGCAGGGAGTGCGGGAGGGAC
AGCGTGCTTCAGTCCCTCACCGCTGTTTCGGGTTGCGATGTCGGTAACCTCGGGACGGGC
GGTGTAGTGGAATGTCAGCATTTGCTCCGACTCCAGGATGGGGCCGAAGTGGTGAGAGGA
CGAACAGAGTGGAGTACCAAAACATCAACAACGACTTGGGACATTACACCGTGAAAGAAG
AAAAAAAACAGCAAACATGGGGTCCTTTGGTTCGTTTGTATAAACTATACTACCTGCTTG
CAACCATCACCAGTTCGTTTTCCTACTCAAAACAGTTTGGGCCACCTTTTGTATATTTTT
TTTTGGTTCGTATTTTTTTTGTTTCTTCGATGGAGGAGGTCCCTTTTATTATATTTATTT
ATTTTCTTTTGGGTGCCAGAGACAAAAGGCAATAACTCTCTTATCCTGTTTATTTAAATG
TATTTTATTTTGGGGGATTTGTAGCTGTTTCCACCT

QA 1 696 1 696
DS 



AS 1 2

CO CL8152Contig1 1278 2 8 U
GGAAGCGCGCAAAAGTCTATTAATCACTAAAACCTCATAAGCCCTAAAAACACCTGGAAC
TGGAAGCTTCCACAGATACACACAGATGGCGAGCAACGGCTCCGATTCGAATCGCGAGCA
ACCACCTCCTCCTGTGAGTATCGAAATCAAAGCCACTCAGGATCAATTTTTCGTGTGGAG
AGAGTTCGTATGGGGAGGTATAGCTGGAGCGTTTGGTGAAGGGATGATGCATCCCGTTGA
TACTCTCAAAACACGTCTTCAGAGTCAGATTATCATGAATGCGTCTCAGAGACAGAAGAG
CATTCCACAGATGCTTCGGACTGTCTGGGTTGGTGATGGATTAGAAGGCTTTTATAGGGG
AATTGCTCCTGGAGTCACTGGATCTCTTGCCACTGGAGCTACTTACTTTGGTGTCATTGA
GTCCACAAAGAAATGGATTGAAGACTCCCATCCCAACTTAGGAGGCCACTGGGTACACTT
TCTTGCCGGAGCTATTGGTGATACACTTGGTTCTTTCGTATATGTTCCTTGTGAAGTAAT
AAAGCAGCGGATGCAAATTCAAGGCACTAGTAGCTCCTGGAGCTCTTTTATTTCTAGGAA
CAGCCTTCCGGTGAAACCAAGAGGTGACATGTATGGTTACTATACTGGAATGTTCCAGGC
TGGAAGCTCAATATTGAAAGAGCAAGGACCAAAAGGACTGTATGCTGGATATTGGTCTAC
ACTAGCAAGGGATGTACCTTTTGCTGGCCTTATGGTAATGTTCTATGAAGCACTGAAGGA
TCTAACAGATCAAGGGAAGAAAAAGTTTCCACAATTTGGAGTCAACAGTTCAGTCGAGGG
GCTCGTGTTGGGAGGATTAGCTGGTGGATTAAGCGCGTATCTCACAACTCCACTGGATGT
TGTAAAAACAAGATTGCAAGTGCAAGGAACAACGATCAAGTACAAGGGTTGGCTGGATGC
AGTTGGGCAGATATGGAGGAAGGAAGGTCCAGAAGGTTTTTTCAGGGGAAGCGTCCCTAG
GGTCATGTGGTATATTCCGGCCTCGGCACTCACTTTTATGGCTGTTGAATTCCTTAGAGA
GAATTTCAGAGAGAAAGGTAGTGATAATAACAACGTTGTCTCAACCTTGAGCATAGAGAG
GAAACGATCTTCGGTACATGAGGTTAGGGAGAACTAGTGTCTATATACGGCTCAGTGTTT
TTCTTTTTTTCTTTTCGGATACAGTTTAACAAAACTCTGATATTACTCTTCAATAAGATA
CTTTCTTTTATAAAAAAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CQ89TF U 1
AF RS1CQ89JQ C 561
BS 1 695 RS1CQ89TF
BS 696 696 RS1CQ89JQ
BS 697 768 RS1CQ89TF
BS 769 769 RS1CQ89JQ
BS 770 778 RS1CQ89TF
BS 779 779 RS1CQ89JQ
BS 780 795 RS1CQ89TF
BS 796 1278 RS1CQ89JQ

RD RS1CQ89TF 796 0 0
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TGGAAGCTTCCACAGATACACACAGATGGCGAGCAACGGCTCCGATTCGAATCGCGAGCA
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AGAGTTCGTATGGGGAGGTATAGCTGGAGCGTTTGGTGAAGGGATGATGCATCCCGTTGA
TACTCTCAAAACACGTCTTCAGAGTCAGATTATCATGAATGCGTCTCAGAGACAGAAGAG
CATTCCACAGATGCTTCGGACTGTCTGGGTTGGTGATGGATTAGAAGGCTTTTATAGGGG
AATTGCTCCTGGAGTCACTGGATCTCTTGCCACTGGAGCTACTTACTTTGGTGTCATTGA
GTCCACAAAGAAATGGATTGAAGACTCCCATCCCAACTTAGGAGGCCACTGGGTACACTT
TCTTGCCGGAGCTATTGGTGATACACTTGGTTCTTTCGTATATGTTCCTTGTGAAGTAAT
AAAGCAGCGGATGCAAATTCAAGGCACTAGTAGCTCCTGGAGCTCTTTTATTTCTAGGAA
CAGCCTTCCGGTGAAACCAAGAGGTGACATGTATGGTTACTATACTGGAATGTTCCAGGC
TGGAAGCTCAATATTGAAAGAGCAAGGACCAAAAG*ACTGTATGCTGGATATTGGTCTAC
ACTAGCAAGGGATGTACCTTTTGCTGGCCTTATGGTAATGTTCTATGA*GCACTGAAG*A
TCTAACAGATCAAGG
A

QA 1 795 1 795
DS 

RD RS1CQ89JQ 718 0 0
AAGGCACTAGTAGCTCCTGGAGCTCTTTTATTTCTAGGAACAGCCTTCCGGTGAAACCAA
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AGCAAGGACCAAAAGGACTGTATGCTGGATATTGGTCTACACTAGCAAGGGATGTACCTT
TTGCTGGCCTTATGGTAATGTTCTATGAAGCACTGAAGGATCTAACAGATCAAGGGAAGA
AAAAGTTTCCACAATTTGGAGTCAACAGTTCAGTCGAGGGGCTCGTGTTGGGAGGATTAG
CTGGTGGATTAAGCGCGTATCTCACAACTCCACTGGATGTTGTAAAAACAAGATTGCAAG
TGCAAGGAACAACGATCAAGTACAAGGGTTGGCTGGATGCAGTTGGGCAGATATGGAGGA
AGGAAGGTCCAGAAGGTTTTTTCAGGGGAAGCGTCCCTAGGGTCATGTGGTATATTCCGG
CCTCGGCACTCACTTTTATGGCTGTTGAATTCCTTAGAGAGAATTTCAGAGAGAAAGGTA
GTGATAATAACAACGTTGTCTCAACCTTGAGCATAGAGAGGAAACGATCTTCGGTACATG
AGGTTAGGGAGAACTAGTGTCTATATACGGCTCAGTGTTTTTCTTTTTTTCTTTTCGGAT
ACAGTTTAACAAAACTCTGATATTACTCTTCAATAAGATACTTTCTTTTATAAAAAAA

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

CO CL8153Contig1 770 2 2 U
GGAAGCACAGAAGCGATCAGGATTTACTAAACAACAACTCCATGTTCTCAAAGCCCAGAT
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TGTTAGAGATACAGAAGTACCTTTGGCGAAGAGCCACAGCCAATTATTTCAAAACCGAGG
AAAAGAAGCTGCTTCTACTGATGCGGTTACGAAAGTGGAGCAACAAACTGATGTATTTCC
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TAACAATCTCACATTAGCATATGATATTAAAGATCTGATTAGTGAAGAAGGTGCGGAGTT
TTTTAATAAAAAAGAACAGACAGTTTGAAGAAGATAAATGGTCTACTAGC


BQ
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AF RS1E560TF U 1
AF RS1E560JQ C 31
BS 1 559 RS1E560TF
BS 560 770 RS1E560JQ

RD RS1E560TF 559 0 0
GGAAGCACAGAAGCGATCAGGATTTACTAAACAACAACTCCATGTTCTCAAAGCCCAGAT
ACTGGCATTTAGGCGTTTGAAGAAAGGAGAAGGTTCTTTGCCTCAGGAGCTTCTTCAAGC
TATTGCCCCACCACCGCTTGAACTGCAGACGCAGAGGCAAATTTCTCCTGTGAGGTTACA
AGTTCAGGATAGATCTTCAGACAAAACTGTAGAAGACCAAGCAAGGTCGCTGGAGTCTGG
CAGAGAGTCTCAGGCTGCTGCTTCTTCAAATGGACAGATTTTTTCTAAAGAGGAAGAGAA
TGTTAGAGATACAGAAGTACCTTTGGCGAAGAGCCACAGCCAATTATTTCAAAACCGAGG
AAAAGAAGCTGCTTCTACTGATGCGGTTACGAAAGTGGAGCAACAAACTGATGTATTTCC
TGTTAAGTCAGACCAAGGAGCAGAGGCTAGTACTCAAAAGACTCCTAGAAGTGATTCTAA
TGCTGATAAGGGAAAAGCTGTTGCATCTGACGGAGACCAATCTAATGTTCCGTCAGAAGA
AAACACTCCCCAGCAGCCC

QA 1 559 1 559
DS 

RD RS1E560JQ 740 0 0
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AGGTTCTTTGCCTCAGGAGCTTCTTCAAGCTATTGCCCCACCACCGCTTGAACTGCAGAC
GCAGAGGCAAATTTCTCCTGTGAGGTTACAAGTTCAGGATAGATCTTCAGACAAAACTGT
AGAAGACCAAGCAAGGTCGCTGGAGTCTGGCAGAGAGTCTCAGGCTGCTGCTTCTTCAAA
TGGACAGATTTTTTCTAAAGAGGAAGAGAATGTTAGAGATACAGAAGTACCTTTGGCGAA
GAGCCACAGCCAATTATTTCAAAACCGAGGAAAAGAAGCTGCTTCTACTGATGCGGTTAC
GAAAGTGGAGCAACAAACTGATGTATTTCCTGTTAAGTCAGACCAAGGAGCAGAGGCTAG
TACTCAAAAGACTCCTAGAAGTGATTCTAATGCTGATAAGGGAAAAGCTGTTGCATCTGA
CGGAGACCAATCTAATGTTCCGTCAGAAGAAAACACTCCCCAGCAGCCCAAGGTTACAGC
CTCTGCCAGGAAATATCATGGACCGTTGTTTGATTTTCCCTTTTTCACTCGGAAACATGA
CTCTTATGGGTCTGCAACAGCCAATGCTAATAACAATCTCACATTAGCATATGATATTAA
AGATCTGATTAGTGAAGAAGGTGCGGAGTTTTTTAATAAAAAAGAACAGACAGTTTGAAG
AAGATAAATGGTCTACTAGC

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL8154Contig1 811 2 2 U
GGGGGCGTGAGGAGAGTGGCGGAAGCAAACGGTGAGGGGAAGAAGGGTTGTATCTCCGGA
GACCTTGGAAACGAAGAGTGGCGGAAGCACATCGCTCTTCGTTCTCGGTGGAATCGGAAG
GATTGTATCGTCGACGGATCCAAAGTTGAAATCGGAGACCTTGGAAACAACTTCATGCTT
AATAACGGCGAGAGCGATGGCGATTAACGGCAAAGATCGTATCTCCGGTGACCGCCCGTA
ATGGTGACAAACGACGACGGGATAGACGCGCCTGGTCCCCGTTCTCTCGTTGGCGTCCTC
GTCTCGACCAACCTCTACGACGTTCGCGTCTGCCCTCCCGATTCGGAGAAGTCAGCTGTT
AGTCACAGTATCATATGGAGCAGACCTCTCACTGCAAAACGAGTTGAAATTGAAGGAGCT
GAGGCCTATGCTGCTTCTGGTTCTTAGTCATGTAGTTGATTGGTGTTCTCTGTTTGTTTG
TCTTTCATTGTCTCTGATTCCGAAACCCGTGACCGCTTGGATGTGATTTTTAAGGTCAGG
GAGATTCCCAACCCGTTGATGATCTTTGGAGGCTAAACCAAGCACGTAGAGGTTCTTGGT
CAACTTCTTCACGTATCAAAGATTGTTGCTGAGAAAGAAGGCATTGTGAAAGAAGTCATT
GTGTTTGAGTGAAACCATGTGTTCTTTCTTCCTCTCTTTTCACAGTGTTTGAGTGAAACC
ACAAGACTAATGCTGATGTTGTCTCTTTCTCATTGTACCAGGAAAAGACTAACAGTGGTA
AGGACATTTTTTTGTCCTACCAATAATCTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1B396TF U 1
AF RS1B396JQ C 166
BS 1 272 RS1B396TF
BS 273 811 RS1B396JQ

RD RS1B396TF 272 0 0
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GACCTTGGAAACGAAGAGTGGCGGAAGCACATCGCTCTTCGTTCTCGGTGGAATCGGAAG
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ATGGTGACAAACGACGACGGGATAGACGCGCC

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DS 

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CGGTGACCGCCCGTAATGGTGACAAACGACGACGGGATAGACGCGCCTGGTCCCCGTTCT
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TTCTCTGTTTGTTTGTCTTTCATTGTCTCTGATTCCGAAACCCGTGACCGCTTGGATGTG
ATTTTTAAGGTCAGGGAGATTCCCAACCCGTTGATGATCTTTGGAGGCTAAACCAAGCAC
GTAGAGGTTCTTGGTCAACTTCTTCACGTATCAAAGATTGTTGCTGAGAAAGAAGGCATT
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QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 2

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GCATATAAAGGGAGGTCCTGATCACGAAGGTGGGATTTTCACGGTAGAGGCTCCCCTTCA
CACCTCAAATGTCCAAGTTGTTGATCCTGTCACCGGGAGGCCTTGTAAGGTTGGTGTGAA
GTACCTAGAGGATGGTACGAAAGTAAGAGTGGCCAGAGGCACGGGCACATCTGGTTCCAT
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TAAGGACACACCAATGGAGTTTGTTTGGGAGCAGACATATGATGCTAAAACAGGAAAGGG
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TTTTTTTTTTAACATCCAAATTACAAGTTTTATTTAGTTCAGAGATTTGAGAAATGAGAT
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ATAAAAACCATATGTGGAG


BQ
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AF RS1EL09TF U 1
AF RS1EL09JQ C 132
BS 1 668 RS1EL09TF
BS 669 799 RS1EL09JQ

RD RS1EL09TF 668 0 0
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TAAGCGTGTCATCAGATCCCAGAATCGTGTCATTGTTGAAGGAAAGAATCTGATCAAGAA
GCATATAAAGGGAGGTCCTGATCACGAAGGTGGGATTTTCACGGTAGAGGCTCCCCTTCA
CACCTCAAATGTCCAAGTTGTTGATCCTGTCACCGGGAGGCCTTGTAAGGTTGGTGTGAA
GTACCTAGAGGATGGTACGAAAGTAAGAGTGGCCAGAGGCACGGGCACATCTGGTTCCAT
TATTCCTCGCCCAGAGATCCTAAAGATAAGGACAACACCAAGACCCACTACCGCTGGCCC
TAAGGACACACCAATGGAGTTTGTTTGGGAGCAGACATATGATGCTAAAACAGGAAAGGG
CATGCCTGATCTTTGAGTAATCCTGCTTCCTAAAACGTTGCTGCTCCCAGATGATTCTTC
TTTTTTTT

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1EL09JQ 668 0 0
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TCAGATCCCAGAATCGTGTCATTGTTGAAGGAAAGAATCTGATCAAGAAGCATATAAAGG
GAGGTCCTGATCACGAAGGTGGGATTTTCACGGTAGAGGCTCCCCTTCACACCTCAAATG
TCCAAGTTGTTGATCCTGTCACCGGGAGGCCTTGTAAGGTTGGTGTGAAGTACCTAGAGG
ATGGTACGAAAGTAAGAGTGGCCAGAGGCACGGGCACATCTGGTTCCATTATTCCTCGCC
CAGAGATCCTAAAGATAAGGACAACACCAAGACCCACTACCGCTGGCCCTAAGGACACAC
CAATGGAGTTTGTTTGGGAGCAGACATATGATGCTAAAACAGGAAAGGGCATGCCTGATC
TTTGAGTAATCCTGCTTCCTAAAACGTTGCTGCTCCCAGATGATTTTTTTTTTTTTTTTA
ACATCCAAATTACAAGTTTTATTTAGTTCAGAGATTTGAGAAATGAGATGCTGTCGAACA
AGCTTTGATTCCTTTTTCGTTACTCTTGTGAACGTTTTCAAAGTGCCAAATAAAAACCAT
ATGTGGAG

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL8156Contig1 529 2 1 U
GGGAGAAGAAACAGCGAGAAGAGAAAAAGTAGTAGTTTGAATCAAATATGGCTGGGAGAG
CTTCAATCCCTGCTCGCAACTCTGCCCTTATCGCTATGATCGCTGACGAGGACACTGTTG
TTGGATTCCTGATGGCTGGAGTTGGTAATGTTGACATAAGGAGGAAGACTAATTACCTTA
TTGTGGATTCAAAGACAACGGTGAGACAAATTGAGGATGCTTTCAAGGAATTCTCATCAA
GAGATGACATTGCTATCATCCTCATCAGCCAATATGTTGCCAATATGATCAGGTTCTTGG
TGGATAGCTACAACAAGCCAGTTCCTGCAATCCTGGAGATCCCTTCCAAGGACCATCCTT
ATGATCCTGCTCATGACTCTGTTCTCTCCCGTGTCAAGTACCTCTTCTCTGCTGAATCTG
TGTCACAGCGTTAAAACATATACACATCCTGCAAAGCTTGCTGAGCTTTATGTATCATTT
GTTTGGTTTTTGACATTCTTGTATTTCTCAGTTTTCAATAATGTATCTC


BQ
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AF RS1H486JQB C 1
AF RS1H486TF U 1
BS 1 529 RS1H486TF

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DS 

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ATGATCCTGCTCATGACTCTGTTCTCTCCCGTGTCAAGTACCTCTTCTCTGCTGAATCTG
TGTCACAGCGTTAAAACATATACACATCCTGCAAAGCTTGCTGAGCTTTATGTATCATTT
GTTTGGTTTTTGACATTCTTGTATTTCTCAGTTTTCAATAATGTATCTC

QA 1 529 1 529
DS 



AS 1 2

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AGTTTTAAACTTATCCATTTTGGTGAACAACTCATTTCTGTATGCGTTCGTTTTAATTCA
GTTCCATGCCTGGAAGAATTATAAC


BQ
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AF RS1AG28TF U 1
AF RS1AG28JQ C 592
BS 1 683 RS1AG28TF
BS 684 1465 RS1AG28JQ

RD RS1AG28TF 683 0 0
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AGAAGCTTAAGCAATGTTGGTCAGGTCTGCTAGTCTTGGCAGTGGTGGTGGTCGGAACCG
GAGCCGTTCCGATCACTTATCTTCAAAGCGCCGTCGCCAAGGGAGCAGTGTGTTTGGATG
GGAGTGCACCGGCTTACCATTTCGACAAAGGGTTTGGTTCTGGGGTTAACAACTGGATTG
TTCATATGGAGGGAGGCGGATGGTGTACGGACGTAGCTTCATGTAATGCGCGTAAGAATA
CAATGAAGGGTTCGTCCAAATTCATGAACAAAGACTTTGGTTTCTCCGGTATCTTAGGTG
GCAAGCAAAACACTAATCCAGATTTTTACAACTGGAATAGAATCAAAGTGCGTTATTGCG
ATGGATCGTCTTTCACCGGCAATGTAGAAGCCGTTAATCCGGCGAATAAGCTATTCTTCC
GAGGTGCACGAGTTTGGCGTGCAGTGATTGATGATCTTATGGCTAAAGGAATGAAAAACG
CTCAAAACGCGATACTCTCAGGTTGTTCAGCCGGAGCATTGGCCGCGATTCTACACTGTG
ACACTTTCCGAGCCATACTTCCCCCAACTGCTAGAGTCAAATGTGTTTCTGATGCTGGTT
ACTTTATTCATGGTAAGGATATA

QA 1 683 1 683
DS 

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ACAGGAAAGTCGTCGCACTCCACGGATCTGCAAAGACTCTTCCTGTTTCATGCACCTCAA
AAATAAAACCTGAACTCTGTTTCTTCCCGCAAAACGTTGTCCCTTCCATGCGAACACCAC
TCTTTGTCGTTAATGCTGCCTTCGATTCCTGGCAGATCAAGAATGTTTTGGCTCCAACTG
CTGTTGATAAGCGTAAGGAGTGGAAGAACTGTAAGCTTGATCTTAAGAAATGTACGGCCG
CTCAGCTCAAAACCGTCCAAGGGTTTAGGGATCAGATGATGCGTGCATTGTCTCCGGTTC
ACTCTACTCCGTCCAGAGGACTGTTCTTGGACTCGTGTCACGCTCATTGCCAAGGCGGAA
GCGCCGCCTCTTGGTCCGGTGCCAAAGGTCCCCAAGTCGCCAATTCGAAAATTTCACAAG
CATTAGGAAACTGGTTTTATGGTCGGAATGCATTCCAGAAGATAGATTGTCCGTCGCCTA
TTTGCAACCCTACTTGTCCTGCAATCTCGACTGACGAATAGTTCTCAAATCATATGGCAA
AAATGTTCATTTTTATTAATACCAAAAATTATTGCTGAGGAATAAGAGGTTAAGACAACT
GCATTAAAACTGACTAAAAGATCATATTTCTACATTCATTTAAAGACTATTCCTGTATTT
AATGTGAAAAGTTTTAAACTTATCCATTTTGGTGAACAACTCATTTCTGTATGCGTTCGT
TTTAATTCAGTTCCATGCCTGGAAGAATTATAAC

QA 1 874 1 874
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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ACCCTAAAAATGGCCGACTCATTCGAGCTCATTGTAACCAGAAAATATCCTGTTCTCGTC
TCTCCAGCCTCAGAAACTCCAAAAGGTCTCCATCACCTCTCAAATCTCGACCAAAACATA
GCCATCATCGTCAAGACATTCTACTACTTCAAATCAGACTCAAGATCCAACGAGGAATCC
TCTGACGTCATCAAAAGGTCACTCTCCGCGGTTCTTGTTCACTACTATCCTGCCGCTGGG
AGACTCGCGATCAGTCCCGAAGGAAAGATCGCCGTGAACTGCACCGGGGAAGGAGTCGTG
GTGGTGGAAGCAGAGGCTAATTGTGGGATAGAGAAGATAAAAGAGGCTATATGGGAGATT
GATCAACCGGAGACTCTTGAAAAGCTTGTTTACAACGTTCCCGGTGCCCGGAATATTCTT
GAGATTCCACCGGTGGTCGTTCAGGTTACAAATTTCAAATGTGGAGGATTCGTGTTAGGC
CTAGGCATGAACCACAATATGTTCGATGGTATCGCAGCCATGGAGTTTCTCAACTCATGG
GCCGAGACAGCTCGTGGTCTTCCACTCTCAGTCCCACCTTGCTTGGACCGCACACTTCTC
CGACCACGGACACCACCAAAGATCGAGTTCCCACACAACGAGTTCGAAGATCTTGACGAC
ATCTCCTGCACCGGAAAACTCTACTCCGACGAGAAACTCGTCTACAAATCCTT


BQ
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AF RS1E717TF U 1
AF RS1EI94TF U 1
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DS 



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BQ
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AF RS1ED90TF U 144
AF RS1FA74TF U 1
BS 1 745 RS1FA74TF

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QA 1 534 1 534
DS 

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ATGGCTTGCTCTCGGTCATCGAATCTCGGGCATGGAAAATTCGTTCACGGTTATGTGATT
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TGTGGTGAAATAAAGTTGGCTGAAACCATCTTTGCAAAGACACAGAAGGATGTAGTTGAG
TCATGGAATGTTATGGTCTCTGGTTATGTCAGTGTTGGTAACTGGTTTAAGGCTATTGGA
GTGTATGACGAAATGGTGAGTGCTGGGGTGAAGCCAGACGTGGTAACTTTCACAAGTGTT
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AATGAGAGTGCGCTCGAGACAGACGAGTTGCTGATGGGTGCTCTTCTTGACATGTATTCT
AAATGCGGCGATGTTAAAGAAGCTTCCAGAATTTTTAAAAGTATGCCAAAGAAGGATGTT
GTGTCCTGGACAGTAATGATCTCTGCGTATGGATCTCATGGTCAACCCAGAGAAGCGCTT
CACCGTTTTGATGAGATGCAGAAGTTTGGTGTAAACCTGATGGTGTTACTTTTCTTGCTA
TTTTGTCAGCTTGCAGTCATGCTGG

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 2

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TCTGAAATCAAGAGACTGGAGTTCTAATCCAGGGACATGCTTGCCTTCTGGTCCCATCCA
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BQ
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AF RS1EM81JQ U 10
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BS 560 708 RS1EM81TF

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AAAAAAACACAGAGTCTACGCAAACGGTCTAGTTATGAGGGACATCGCCTTTCTGAAATC
AAGAGACTGGAGTTCTAATCCAGGGACATGCTTGCCTTCTGGTCCCATCCAAAGACCTCC
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CTTCTTCTTCACAAACTCAAAGAACTCAGCAACCTGGCGTGCATACTGTCTCTTTGCTTC
AATATCTCGGCTGAAGTCGATATTTGGTTCACAGTCCAAAACAAGAGCAGGTACCTTCTG
GATGCTAGAATGCATATGGTTCCCTTCCAAGTAAAAGACACGGTCTTTTATGTCAGGATG
CAGAGTGTTA

QA 1 550 1 550
DS 

RD RS1EM81TF 708 0 0
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GACGGACAAAGTAAAAGCTGACCATACCTATTGACATTCATAACCGGACGATGCTCCTAA
GAGCAAACAAAAAAAACACAGAGTCTACGCAGACGGTCTAGTTATGAGGGACATCGCCTT
TCTGAAATCAAGAGACTGGAGTTCTAATCCAGGGACATGCTTGCCTTCTGGTCCCATCCA
GAGACCTCCATGTTGAGGAGGTATCAGCAACGGAGACTGACTGCTGCCGTGCTCTTGTGA
TGTTTCTTGCTTCTTCTTCACAAACTCAAAGAACTCAGCAACCTGGCGTGCATACTGTCT
CTTTGCTTCAATATCTCGGCTGAAGTCGATATTTGGTTCACAGTCCAAAACAAGAGCAGG
TACCTTCTGGATGCTAGAATGCATATGGTTCCCTTCCAAGTAAAAGACACGGTCTTTTAT
GTCAGGATGCAGAGTGTTATCCATCTGTAAAGACGGTTTGCTAACAGACAGTACCCCATG
GTTCCCACTCTCAAATGGGGGGAGCCAGCTCTCATGCTTCTCGTGTAGATCCTGGAGGTA
TTGAAGCGAGACTCCACCTTCTTCTGCTCGTTTCCTTAGCATCATTCC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

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ATACCGAAGTCTCTGGACGATGTGAAGCACCCGGAAGCTGATGTGGAGAAGATAACAAGC
GGGCAGGATACAGGGGACATGTTGTACCAAACAATAACGGGGCTTAAGGATGCTTTTCCT
AAAGTAGATGAGCAGCAAGTAAAGGTTGATGTTGAAGAGGGAAAAGAGGAACTAAAAGAA
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GGTCCTGAAGACAAAAAAGCAGCAAGGAAAGAGCACAAGAAGAAAGTGAAGGAAGAGAAG
AGGGAGGCCAGGAAGAACAAGACACCCAAATCTGTCAAGAAGAGAAAGAAGAAAATCTCT
AAACCCCACAAGACCCGTTAGTTTATTTATGTTCCAGACGGATTCTGTTTTCCACCGTTC
AAAAAAAAAAAAGTTTACTTCTCCTTTGTGAGTTTAATAGAGTTTTTTCTTATAATTTAA
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TCTTTTCTTACATGTGGTTAACAAGATTTATGAATAAAAAGGCATTTT


BQ
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AF RS1EV66TF U 1
AF RS1EV66JQ C 76
BS 1 640 RS1EV66TF
BS 641 648 RS1EV66JQ

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AAAAAAAAAAAAGTTTACTTCTCCTTTGTGAGTTTAATAGAGTTTTTTCTTATAATTTAA
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TCTTTTCTTACATGTGGTTAACAAGATTTATGAATAAAAA

QA 1 640 1 640
DS 

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GAGAACGAAGAAGAGGAAAGTGAAAGTGGGAGTGAAGAGGAGTTGGGTCCTGAAGACAAA
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TACTTTTCCTTTGTGAGTTTAATAGAGTTTTTTTTTATAATTTAATAGAGCTGTGAGAGG
ATGTGTTAAATTCTTGAATATTGAGCATAAATTATGGGATCGTTTTCTTTTTTTACATGT
GGTTAACAAGATTTATGAATAAAAAGGCATTTT

QA 1 573 1 573
DS 



AS 1 2

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CTTTGGGTTTATTGTTACTAGTCATGGTGGTGGTGTGGGTGTGACTGGTAGGGTCTATAA
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AGAGACAGTGCGGCGCGATTGGCATAAACTATCTATTGTTAACGTTGTCATTGTTCTCTT
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GAGTTAGTGACTCGACTTAAGTCTTGGCCTCTTAATTATATATACATATGTACAAGAGAG
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EN86TF U 1
AF RS1EN86JQ C 165
BS 1 704 RS1EN86TF
BS 705 1005 RS1EN86JQ

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GGGTAGGAGCAAGACAACATGCGAGCATTTCCTTCAGAAGCCACTTCTGGTCTTAGGCCT
AGCAATCCTGGTCTTGTCACTAGCTGGTCTGATAGGAGCATGCTGTGACGTGGCTTGGGT
CTTGTGGGTGTACCTCTTCTTCATGGTCTTCATCATAGTTGCGCTCATGGGGTTGACCCT
CTTTGGGTTTATTGTTACTAGTCATGGTGGTGGTGTGGGTGTGACTGGTAGGGTCTATAA
AGAGTTCAAACTTGAAGAGTATCATCCATGGCTTAAGACAAGGGTTATGGATGCTAATTA
TTGGTTGACTATAAAGACTTGTCTCTTGGGCTCACTCACTTGTTCCAAGCTCTCTTTTTG
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GTGGAACAACGCTGCGGCGGTGCTATGCCACGACTGTGACTCGTGTAGAGCTGGCGTTTT
AGAGACAGTGCGGCGCGATTGGCATAAACTATCTATTGTTAACG

QA 1 704 1 704
DS 

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ACTTCTGTCTTA
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CCCTCTTTGGGTTTATTGTTACTAGTCATGGTGGTGGTGTGGGTGTGACTGGTAGGGTCT
ATAAAGAGTTCAAACTTGAAGAGTATCATCCATGGCTTAAGACAAGGGTTATGGATGCTA
ATTATTGGTTGACTATAAAGACTTGTCTCTTGGGCTCACTCACTTGTTCCAAGCTCTCTT
TTTGGACTCCTATTGATTATCTCCAAAAGGACTTGACTCCTCTTCAGTCTGGATGCTGCA
AACCACCGACGTCGTGCGTATACAACACGGAGACGCCAATACAGCAAGATTCCGATTGTT
ACCGGTGGAACAACGCTGCGGCGGTGCTATGCCACGACTGTGACTCGTGTAGAGCTGGCG
TTTTAGAGACAGTGCGGCGCGATTGGCATAAACTATCTATTGTTAACGTTGTCATTGTTC
TCTTCCTCATCGCTATTTACTGCGTTGGCTGCTGCGCATTTAAAAACGCCAAACGCCCTC
AACATTACGGTTTTCCTTACGGACGTTACGGCATGTCCAAGTCTCGACCCGGATGGGATC
AGTCCTGGTCGAGGTGGTGGCATGGTAGAGATCGCTATTAGTGAAAAATTATGTAATTAT
TTTCGAGTTAGTGACTCGACTTAAGTCTTGGCCTCTTAATTATATATACATATGTACAAG
AGAGCCTAATTTTCACTTATGATGATATTCCAACGTTGTGTTGATGTCG

QA 13 841 13 841
DS 



AS 1 2

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ATTTTGCTTCACGCCTCCACCTATTATTACTCGTTAGCGGACCAGAAAAATACTATTCGT
TCTATTCTTTATTTACGGAAATAATATTATATCCGTTTGGAAAAGATATTTAAAACATGA
AGAACACAAGTTACTTTATTTTTCAACTATTATATTAATTAACCAATAAGATCAATGTAC
CCTAAATTAGGGTTCATCGGTTAGTCTTACGAAGATATGAATGTTTCCACTAATGTGTCT
CCTAATGGCTAATGGTATAATCATTTCCTGTAAATCAGTTTTTATCAAAATTAGTTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BQ07JQ C 1
AF RS1BQ07TF U 1
BS 1 538 RS1BQ07TF

RD RS1BQ07JQ 538 0 0
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ATTTTGCTTCACGCCTCCACCTATTATTACTCGTTAGCGGACCAGAAAAATACTATTCGT
TTTATTCTTTATTTACGGAAATAATATTATATCCGTTTGGAAAAGATATTTAAAACATGA
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CCTAATGGCTAATGGTATAATCATTTCCTGTAAATCAGTTTTTATCAAAATTAGTTGC

QA 1 538 1 538
DS 

RD RS1BQ07TF 538 0 0
GGAAAAAAAAAACTGTATAGTAATACTATCGTGTTGCTCTAAAAAAAAAGAGAGTACAGT
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AAATTAAACGCCCAAGAACCGCATTAACCCGCAGCCCACATTCATAATGTGTTTAGAACC
CGCAACTGCATTAACCAAAATGAGTCTATAATGTTTATAAACTCATTTATAAACATTTAC
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TCTATTCTTTATTTACGGAAATAATATTATATCCGTTTGGAAAAGATATTTAAAACATGA
AGAACACAAGTTACTTTATTTTTCAACTATTATATTAATTAACCAATAAGATCAATGTAC
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CCTAATGGCTAATGGTATAATCATTTCCTGTAAATCAGTTTTTATCAAAATTAGTTGC

QA 1 538 1 538
DS 



AS 1 2

CO CL8166Contig1 571 2 2 U
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AGAAAGCATGCCTTGTTGGTCAAGCTCTGGAGATCAATTACTTCAGGGGAAAGAACTACA
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AGGAGCTCCCGGAATATCTTCTTGGAACATGTCGGTTAAACCATCTAGGCGCATCTAAAT
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TCTTTGCAATCCATTGAAAGTCATATGCACGATAGGTTATTTGGTTATGTGCTTATGCAA
ACTCAGATTTATAAAGTTCTTGGTGGTAACTCTTCTGCCGAAGTTCTTTGTATAGACATA
GCGCTTGTATCTATCATTGTCCCAATACTTAGCTTCAGCGCTTGTGGATTCTACTACTAC
TATTGGGTTTATTCTCAAGTGTTTTATGAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GB33TF U 1
AF RS1GB33JQ C 363
BS 1 569 RS1GB33TF
BS 570 571 RS1GB33JQ

RD RS1GB33TF 570 0 0
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TCTTTGCAATCCATTGAAAGTCATATGCACGATAGGTTATTTGGTTATGTGCTTATGCAA
ACTCAGATTTATAAAGTTCTTGGTGGTAACTCTTCTGCCGAAGTTCTTTGTATAGACATA
GCGCTTGTATCTATCATTGTCCCAATACTTAGCTTCAGCGCTTGTGGATTCTACTACTAC
TATTGGGTTTATTCTCAAGTGTTTTATGA
T

QA 1 569 1 569
DS 

RD RS1GB33JQ 209 0 0
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TCAGATTTATAAAGTTCTTGGTGGTAACTCTTCTGCCGAAGTTCTTTGTATAGACATAGC
GCTTGTATCTATCATTGTCCCAATACTTAGCTTCAGCGCTTGTGGATTCTACTACTACTA
TTGG*TTTATTCTCAAGTGTTTTATGAGG

QA 1 209 1 209
DS 



AS 1 2

CO CL8167Contig1 742 2 3 U
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AACAGAAAATCAAACTTGCAACCCAAGCAAAGTAGCTAAAGAGACAACAGAACAGCTAAG
TTTCTGAATTCAATCAAAGAACAAAAGAACATTTTGTTTTTTTTTTAACAAGAAAGTTGT
GAAATATATTTGAAGAGGATGGAGCCTAAAGTTGGTGCATTTAGTAAAGCTTAATTCTGG
TGTGGATGGGTGCACGGCAAATAGGACACACCTTAAGGCCTGGACCGCATTCACAACATG
TCTGATGGCCGCAACCAAAGGCCATGTTTTTAGGATTGCTCAAACATATCGGGCATAGCT
GGTTGTCGTCCATACTGCTGGTCATATTCTTGCTCTCCATCGGAAAAGTAGGTACACTCG
GTTCATAACTCTGTATTGGTGACGGCTTGAAAAATGTTGCTCCACTCTGCAGTACCGCCG
GAGGTGGAAGTGGGATTCTCTCTGGGATACTCCCATTTCTTCGCCCTAAAAGGCCAAGCT
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TCTTTCGAGACTGCTCTTTGTTCTTTGACATGATCTCAGTGAAGTTCACAAATTGGAAGT
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CCCCACCCCGACTAACACTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EG35JQ U 29
AF RS1H755JQB U 1
BS 1 451 RS1H755JQB
BS 452 452 RS1EG35JQ
BS 453 742 RS1H755JQB

RD RS1EG35JQ 555 0 0
G
AGCAAAGCATCTTTCGACAGATCAATCAATCAGTAGAAAATCAAACTTGCAACCCAAGCA
AAGTAGCTAAAGAGACAACAGAACAGCTAAGTTTCTGAATTCAATCAAAGAACAAAAGAA
CATTTTGTTTTTTTTTTAACAAGAAAGTTGTGAAATATATTTGAAGAGGATGGAGCCTAA
AGTTGGTGCATTTAGTAAAGCTTAATTCTGGTGTGGATGGGTGCACGGCAAATAGGGCAC
ACCTTAAGGCCTGGACCGCATTCACAACATGTCTGATGGCCGCAACCAAAGGCCATGTTT
TTAGGATTGCTCAAACATATCGGGCATAGCTGGTTGTCGTCCATACTGCTGGTCATATTC
TTGCTCTCCATCGGAAAAGTAGGTACACTCGGTTCATAACTCTGTATTGGTGACGGCTTG
AAAAATGTTGCTCCACTCTGCAGTACCGCCGGAGGTGGAAGTGGGATTCTCTCTGGGATA
CTCCCATTTCTTCGCCCTAAAAGGCCAAGCTCGATGGTGGCTTTGTACTGTGGAGGAATC
TCCATGAGAGCAGA

QA 2 555 2 555
DS 

RD RS1H755JQB 742 0 0
GGTTGGAAATGATAGATAATACAGAAGCAAGCAAAGCATCTTTCGACAGATCAATCAATC
AACAGAAAATCAAACTTGCAACCCAAGCAAAGTAGCTAAAGAGACAACAGAACAGCTAAG
TTTCTGAATTCAATCAAAGAACAAAAGAACATTTTGTTTTTTTTTTAACAAGAAAGTTGT
GAAATATATTTGAAGAGGATGGAGCCTAAAGTTGGTGCATTTAGTAAAGCTTAATTCTGG
TGTGGATGGGTGCACGGCAAATAGGACACACCTTAAGGCCTGGACCGCATTCACAACATG
TCTGATGGCCGCAACCAAAGGCCATGTTTTTAGGATTGCTCAAACATATCGGGCATAGCT
GGTTGTCGTCCATACTGCTGGTCATATTCTTGCTCTCCATCGGAAAAGTAGGTACACTCG
GTTCATAACTCTGTATTGGTGACGGCTTGAAGAATGTTGCTCCACTCTGCAGTACCGCCG
GAGGTGGAAGTGGGATTCTCTCTGGGATACTCCCATTTCTTCGCCCTAAAAGGCCAAGCT
CGACGGTGGCTTTGTACTGTGGAGGAATCTCCATGAGAGCAGAGAGTGCGAACTCCGTCT
TCTTTCGAGACTGCTCTTTGTTCTTTGACATGATCTCAGTGAAGTTCACAAATTGGAAGT
TATCAAAAGCTCGGGAAGGTATGTTATCATCAAATTCCTGCATCATGTCCCATGGTCCAT
CCCCACCCCGACTAACACTATT

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL8168Contig1 1043 2 4 U
GAAAGAAACTCGCAACTTCTTCTCTGACGCTTCCATCTCCGATCTCCGACAGCTCCTTCT
GCGTCACCATCTTCGAAGATCATTGACGTCTTCAATTCCGAATATCCCAGCCTCATCTCG
TTTTCCTGTTTGTTGTCATGGACGAATCCTAACTCCACACCACTGTTTAAGTCACCACCA
CCTTAATCATGTTTGTTGTTCTTTGTTTTTTTTTTTTTTTAAATAAAATTGTTGTTCTTT
GTTGTTAACAGTATTTGATTGATTGCAATTTTAATTTATAAAACCCTATTTTCCCAAATC
CCCTTTTCTTCTGAAGTTGAACTTAAAAAAACTTTATATGCAGGTAAAATCGACTAAATA
TTGAATTCATAGATTAGCAATACGATATTGTTTTTCTTAATTGAAAACTTTGTACTCGCT
GTAGCCGACTGCATTGGTTGTTTATCTCAGGATAGCCTCATCTTCTGCCATCAGAATAAC
AAAGCATTATAAGTTACTATGGACGCTAAGGTGGATGCTAGAATGGGTGTACACGATTCT
GACTTACGGCAGAAGATTGCTAGACTACATGAAGAAATAAATCTTCTTAGAAACGAAGGC
TGATGTGAACATTGCTCCTGATGTGGCCAACTCCAAAGCGAATGAGGATAGTGGTTCTTT
TAGCAATGACTTGTCATGGATGGTTCAGAAATCAGTTCACAAGATGGATTGCCAAGACAG
TGTGTTGTGAAGAAAGAGAAAAAAAAGCTAAGAAGCTGATGGAGAAGGAGGATTTTGGGT
GTAATTTTGATGGTTTGAATGATCAGATTATATCACCATTGCGACTGAAGTTGGCGGCTG
ATATTTATGAGGTGGTAACTCAGACAGCTGAATAAATTGGTGTTCTATTTTGGTTGTTTG
GCTACTGGATAACGGATGTAAAAATCGCTAGTTTTTGGCTTTAGACGAATGTATAACTTT
TCTGGTTTTTAGCTTAAGTCGGATATATTAATTTCTAATTTTTGTCTTCTGAATTATGGA
TGTATAAATTACTAGCTTTGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GZ90TF U 1
AF RS1GZ90JQ C 463
BS 1 731 RS1GZ90TF
BS 732 732 RS1GZ90JQ
BS 733 745 RS1GZ90TF
BS 746 1043 RS1GZ90JQ

RD RS1GZ90TF 745 0 0
GAAAGAAACTCGCAACTTCTTCTCTGACGCTTCCATCTCCGATCTCCGACAGCTCCTTCT
GCGTCACCATCTTCGAAGATCATTGACGTCTTCAATTCCGAATATCCCAGCCTCATCTCG
TTTTCCTGTTTGTTGTCATGGACGAATCCTAACTCCACACCACTGTTTAAGTCACCACCA
CCTTAATCATGTTTGTTGTTCTTTGTTTTTTTTTTTTTTTAAATAAAATTGTTGTTCTTT
GTTGTTAACAGTATTTGATTGATTGCAATTTTAATTTATAAAACCCTATTTTCCCAAATC
CCCTTTTCTTCTGAAGTTGAACTTAAAAAAACTTTATATGCAGGTAAAATCGACTAAATA
TTGAATTCATAGATTAGCAATACGATATTGTTTTTCTTAATTGAAAACTTTGTACTCGCT
GTAGCCGACTGCATTGGTTGTTTATCTCAGGATAGCCTCATCTTCTGCCATCAGAATAAC
AAAGCATTATAAGTTACTATGGACGCTAAGGTGGATGCTAGAATGGGTGTACACGATTCT
GACTTACGGCAGAAGATTGCTAGACTACATGAAGAAATAAATCTTCTTAGAAACGAAGGC
TGATGTGAACATTGCTCCTGATGTGGCCAACTCCAAAGCGAATGAGGATAGTGGTTCTTT
TAGCAATGACTTGTCATGGATGGTTCAGAAATCAGTTCACAAGATGGATTGCCAAGACAG
TGTGTTGTGAA*AAAGAGAAAAAAA

QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1GZ90JQ 581 0 0
TTCTGCCATCAGAATAACAAAGCATTATAAGTTACTATGGACGCTAAGGTGGATGCTAGA
ATGGGTGTACACGATTCTGACTTACGGCAGAAGATTGCTAGACTACATGAAGAAATAAAT
CTTCTTAGAAACGAAGGCTGATGTGAACATTGCTCCTGATGTGGCCAACTCCAAAGCGAA
TGAGGATAGTGGTTCTTTTAGCAATGACTTGTCATGGATGGTTCAGAAATCAGTTCACAA
GATGGATTGCCAAGACAGTGTGTTGTGAAGAAAGAGAAAAAAAAGCTAAGAAGCTGATGG
AGAAGGAGGATTTTGGGTGTAATTTTGATGGTTTGAATGATCAGATTATATCACCATTGC
GACTGAAGTTGGCGGCTGATATTTATGAGGTGGTAACTCAGACAGCTGAATAAATTGGTG
TTCTATTTTGGTTGTTTGGCTACTGGATAACGGATGTAAAAATCGCTAGTTTTTGGCTTT
AGACGAATGTATAACTTTTCTGGTTTTTAGCTTAAGTCGGATATATTAATTTCTAATTTT
TGTCTTCTGAATTATGGATGTATAAATTACTAGCTTTGGCT

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

CO CL8169Contig1 747 2 2 U
GGATAACCATCTCCTTCCCACCAATAACAAAAGCATAAGGAAATATGAAGATAATAAAGA
GTTCACCTCTTTTAGCTATGCTGATCGGCTTCATTATCATAGCAGCCGCAATCTCCACCA
TCTCCGTTGAGGGTCGTAAACATCACGTCAAGAGGATCAAACCCAAACACCGCCGTCATT
CTAAAGATACCCCTATCGACTCTCCTGCACCCGCCCCTTATCCGTCCACCCATGATGGTG
TTTTCGACATCCTCTCCTTCGGTGCCAAGGGAGATGGAGTCTCCGACGATTCAAAAGTAC
GTTCATATATATTTTAATACCAACGATTTAATTTCAAAGCAAGAGACATATTAGTCAGAC
GTTGCATTTGCGTTTGTGGGTTACTTTTGAAAATACTAAATATTTCAAAAAAAAAATGAT
TACTTAAGTATATATACACTATTACATAAACGAAACAGTTTTTGTTAATTGTAAATATAA
ACAAAACATAAGCGGAAGGAGAACTATTTAGCATTAGTGTTTTCATTTTGAAAAAATATC
TTATGAAATTTGAAAATGAACTATATTCCCCAAAACAATTATAAAAGAACAATATCTTCA
TCATCAGAACGCAAATGGAGAAATTGGGCTTCTACCGTTAAGGCTTACGTATTTTTGAGT
TCGATAGTAACTTGGAAATTCCTTGTAGTCGTTTTCACTTGTTGGTACACAATCTATTCG
GTTTAATTTATTTGGTCGTAGGTGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EJ95TF U 1
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C

QA 1 661 1 661
DS 



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AAG


BQ
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20 20 20 

AF RS1A881JQ C 1
AF RS1A881TF U 1
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AAG

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AAG

QA 1 543 1 543
DS 



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BQ
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AF RS1DG10TF U 1
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QA 1 523 1 523
DS 

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CCGCTATACACATTTTGGCTTTTGGGCTAAAGCTCTCTTGTTTATGGAACATCCCATATC
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QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 2

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GTTCG


BQ
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10 10 10 10 10 

AF RS1B937TF U 1
AF RS1B937JQ C 92
BS 1 639 RS1B937TF
BS 640 905 RS1B937JQ

RD RS1B937TF 639 0 0
GGATTTCACAAACAATAACCTAAACATGGCACTCACTAAAATCTCCTTAGTCCTTCTTCT
CTGCCTTTTATGTTTATATTCTGAAACCGTCAAGTCTCAGAACTGCGGTTGTGCCTCGGG
CGTATGTTGTAGTCAGTACGGTTATTGCGGCAATGGACCAGACTACTGTGGTTCAGGTTG
CCGATCAGGTCCTTGCACTGGCACCCAAGGCGGTAGTCTTGGTACCATTGTGTCACAAGC
TTTCTTTAGCAATATCATCAACCGAGCTGATAATGGCTGCGCCGGAAAAAGATTCTACAC
ACGTGATTCTTTCATTAGTGCCGCTAATACGTTCCCCAACTTTGCTACCTCCGTTACTAG
GCGTGAAATTGCGACTATGTTTGCTCATTTCACCCAGGAGGTCGGATATTTCTGCTACAT
TGAAGAGATAAACGGAGCGTCAAGAAACTATTGCGACGACAGGAATTATCCACAATACCC
ATGTGCACCAGGCAAAACCTACTACGGTCGTGGTCCGATCCAGTTATCATGGAACTACAA
TTATGCACAGTGTGGTCAGAGTCTCGGTCTGGATCTTCTACGTCAGCCAGAGCAAGGCCA
TCAATGGAGACTTAGAGTGTAATGGTAGGAGTCCAGATA

QA 1 639 1 639
DS 

RD RS1B937JQ 814 0 0
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AATGGACCAGACTACTGTGGTTCAGGTTGCCGATCAGGTCCTTGCACTGGCACCCAAGGC
GGTAGTCTTGGTACCATTGTGTCACAAGCTTTCTTTAGCAATATCATCAACCGAGCTGAT
AATGGCTGCGCCGGAAAAAGATTCTACACACGTGATTCTTTCATTAGTGCCGCTAATACG
TTCCCCAACTTTGCTACCTCCGTTACTAGGCGTGAAATTGCGACTATGTTTGCTCATTTC
ACCCAGGAGGTCGGATATTTTTGCTACATTGAAGAGATAAACGGAGCGTCAAGAAACTAT
TGCGACGACAGGAATTATCCACAATACCCATGTGCACCAGGCAAAACCTACTACGGTCGT
GGTCCGATCCAGTTATCATGGAACTACAATTATGCACAGTGTGGTCAGAGTCTCGGTCTG
GATCTTTTACGTCAGCCAGAGCAAGGCCATCAATGGAGACTTAGAGTGTAATGGTAGGAG
TCCAGATAAGGTTAACGCAAGGATTAGCTACTACAGAGACTACTGTGGGCAGCTTGGTGT
GGACCCTGGTCCTAACCTTAGCTGCTAAAAAGCTCTTTAATTGGTGACTATTGTTGGACC
TTAGTGTTTATGCTGAAACAAATAAATGAGATGATAAAATTAAATCTCATGCATGTAATT
TGTGTTGGGTTTCAATGTTTCCTGCTCCACAAGCAAAAAAAAATTGTAGTTATCTTATGT
AAGTGAATTTTACATTAATAAATGTCTGAGTTCG

QA 1 814 1 814
DS 



AS 1 2

CO CL8173Contig1 800 2 4 U
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CGGTCATACAGAAGAGAAGGAGATAGCTATTCCAAATGAGACCACAGAGGAAAAAGTTAC
ACAGGAACTTGCTCATGCTCTCTCTCAGATTTACCACTTTGTTTCCTACCTTGCGAAAGA
AGCAACGCTGTGTGAGGAGGACACATTCTCCCAAAAAGTTCAAGAGTTGTCTGCTACTTT
GGACAAAGTATTGAGCAAGGAGAAGACTCTGGTTGACTTTTTGTTTGACCTCTCGCGAGT
TTTAGTAGAAGCTACTGAGCTGAAAATCAACGTGGTGGGACTTAAAGCATCTGAAGTGGA
GGAGATTCACAGCCCTGATTGCATTGATAAAGTCGCTCTATCAGGTGAGCATTACCAGAG
TGGTTGTTCTCAGAGCTCTGATTCCGAGATTCCAGATGATTGCATCGGCTACCAACACAA
GCTCTCACCAGTTACTCGTAAGTTTACATCAGAAGTGTTTGAAGAGTTGAAACTCGAGAA
AGAAAAGGCAGAGACCAACCTTGCAAGCTGTGAAGCAGATCTTGAAGCAACTAAGTCAAA
ACTACAAGAAACAGAGCAGATTCTTGCTGAAGTGAAGTCAGATTTGGAATCTGCTCGGAA
GTCTAATGGCATGGCCGAGGCACAGCTCAAATGCATGGTTGAATCATACAGATCTCTCGA
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AGAAGATGAGCTTCATGAGG


BQ
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AF RS1GO36TF U 1
AF RS1GO36JQ C 226
BS 1 679 RS1GO36TF
BS 680 680 RS1GO36JQ
BS 681 764 RS1GO36TF
BS 765 800 RS1GO36JQ

RD RS1GO36TF 764 0 0
GGAGAAGATTTTGGCAGAGGTACAGTGTGCCATTGAAGAAGCAGGTGGACCTAATGTAAA
CGGTCATACAGAAGAGAAGGAGATAGCTATTCCAAATGAGACCACAGAGGAAAAAGTTAC
ACAGGAACTTGCTCATGCTCTCTCTCAGATTTACCACTTTGTTTCCTACCTTGCGAAAGA
AGCAACGCTGTGTGAGGAGGACACATTCTCCCAAAAAGTTCAAGAGTTGTCTGCTACTTT
GGACAAAGTATTGAGCAAGGAGAAGACTCTGGTTGACTTTTTGTTTGACCTCTCGCGAGT
TTTAGTAGAAGCTACTGAGCTGAAAATCAACGTGGTGGGACTTAAAGCATCTGAAGTGGA
GGAGATTCACAGCCCTGATTGCATTGATAAAGTCGCTCTATCAGGTGAGCATTACCAGAG
TGGTTGTTCTCAGAGCTCTGATTCCGAGATTCCAGATGATTGCATCGGCTACCAACACAA
GCTCTCACCAGTTACTCGTAAGTTTACATCAGAAGTGTTTGAAGAGTTGAAACTCGAGAA
AGAAAAGGCAGAGACCAACCTTGCAAGCTGTGAAGCAGATCTTGAAGCAACTAAGTCAAA
ACTACAAGAAACAGAGCAGATTCTTGCTGAAGTGAAGTCAGATTTGGAATCTGCTCGGAA
GTCTAATGGCATGGCCGAG*CACAGCTCAAATGCATGGTTGAATCATACAGATCTCTCGA
AACTAGATCAGCAGAGCTGGAAGTCGAGTTGAGTTCTCTTAAAG

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1GO36JQ 575 0 0
GTTGTCTGCTACTTTGGACAAAGTATTGAGCAAGGAGAAGACTCTGGTTGACTTTTTGTT
TGACCTCTCGCGAGTTTTAGTAGAAGCTACTGAGCTGAAAATCAACGTGGTGGGACTTAA
AGCATCTGAAGTGGAGGAGATTCACAGCCCTGATTGCATTGATAAAGTCGCTCTATCAGG
TGAGCATTACCAGAGTGGTTGTTCTCAGAGCTCTGATTCCGAGATTCCAGATGATTGCAT
CGGCTACCAACACAAGCTCTCACCAGTTACTCGTAAGTTTACATCAGAAGTGTTTGAAGA
GTTGAAACTCGAGAAAGAAAAGGCAGAGACCAACCTTGCAAGCTGTGAAGCAGATCTTGA
AGCAACTAAGTCAAAACTACAAGAAACAGAGCAGATTCTTGCTGAAGTGAAGTCAGATTT
GGAATCTGCTCGGAAGTCTAATGGCATGGCCGAGGCACAGCTCAAATGCATGGTTGAATC
ATACAGATCTCTCGAAACTAGATCAGCAGAGCTGGAAGTCGAGTTGAGTTCTCTTAAAGT
CAAAATCGAAAACTTAGAAGATGAGCTTCATGAGG

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 2

CO CL8174Contig1 621 2 3 U
AAACACTAGAGAAAATATTTGTTTCCACTTTTGGTTGATTCACTTGCATATAACAATAAC
ATAGAAGGGCTACATAATAAGAGAAATTTTATGGATTAATCACCACCGACTTGACGTTTC
CACGAGTCTTCCACAATGAGTTCATCCACTCCCCATTCTTCAAAACTCCCGTCGGGTAAG
TAACGCCTGATCGTGAAAGGTATCTTACGCTGTCTAAGCTCCTTCATTGCGATCTCAAGT
GGATCAGTTTCACCCTCCAGCTCCACCATCACAGGTGCATTCATGCTTATCTGGAGAGCA
CGAGTGCCTAGTATCCTAGCCCGCTCATACTTGGTCATGAACTTGGATGTTTTACGCGGA
CGCGGCACAGCTTCCTCCTCTACCTTATCCTCTGCCTCAATAGGTTCACCATCCACATAA
TCATTTTCCTTCATATCAGCATCCTCCTCTATTCCTTCCTCAATCTCCGGCTCCGCTGGC
TCGTCCTCGTACCCCAAATCGTCGACATCTTGGTAATCGTCGTCCGCCATGGATTTGATT
TGAGATTTTCACTCGTGAAACCCTAGGTGTCGTCGCAGAGGCCGCTTTGGTGTGTGAGGA
ACTGACTGACTGGAGGATTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DU65JQ U 43
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QA 1 534 1 534
DS 

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CGCGGCACAGCTTCCTCCTCTACCTTATCCTCTGCCTCAATAGGTTCACCATCCACATAA
TCATTTTCCTTCATATCAGCATCCTCCTCTATTCCTTCCTCAATCTCCGGCTCCGCTGGC
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QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1FV09JQ C 58
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DS 

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T

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DP17JQ C 1
AF RS1DP17TF U 1
BS 1 538 RS1DP17TF

RD RS1DP17JQ 538 0 0
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QA 1 538 1 538
DS 

RD RS1DP17TF 538 0 0
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AAAATACTAAAAATCAATGGAGCCAAACACTAAGCTTGTCTTTATTACCTTGGTTCTTGC
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TTGCTGCACAGCCCTGTCTAATGCTGACTTCCAGTGTCTCTGCAAGCAGAAAACCAAAAC
TAATCCTTTCCTCAGTGGGATCGACCTCGACCTCGCTTCCAAACTCCCGGAGAAGCGTGG
ATTATCTGGTGCACCTTGCTAAGACATGTTTCCTTTTGGAAGGTTTCGCTTTGTGTTTTG
ATTTTCTTCATGAGTCCATTGTTCTTTTACTGTTTCTGTTCCTGTTGTTGTTGGTTTTGT
TGTTCTGTGTTGATCTGATGTTGTTTCCATCGTTGTTGTCTTAATTGTATTGCATTGC

QA 1 538 1 538
DS 



AS 1 2

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1FG38JQ C 1
AF RS1FG38TF U 1
BS 1 538 RS1FG38TF

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QA 1 538 1 538
DS 

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QA 1 538 1 538
DS 



AS 1 2

CO CL8178Contig1 968 2 4 U
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CGTTCCAAATCCAGTAGATGGAAGCTTGAGTTGCAAGAAGGAGGAGTCGCTGAGAGTCTC
TGCCGCGGCGTGACTGCTGGAGTTGAGTGATGATATCGTTCCAAGAGTAAGCTATTTGAA
AATCGCATCTTCCTGCAATGAATCGAAGGATCTCAGCACTAAAAGGGCATTCAAAGTACA
GATGATTTCGGCTTTCAGGATTAGCATTGCACAACAAACAACCAGCATCTACAATCAACC
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AGAGTTGTCCAAAGGGTGCCCAGTTATCATACCAAAAGTGGGTGTCCTCGCCATTGCCAA
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AGAAACTAGATTTTTGCAGACTGACCGCAAGACCCGAACGTTTCTCAAAGTCGCTTAGAA
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TCTGGGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GN46TF U 1
AF RS1GN46JQ C 145
BS 1 678 RS1GN46TF
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BS 691 968 RS1GN46JQ

RD RS1GN46TF 690 0 0
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AGAGTTGTCCAAAGGGTGCCCAGTTATCATACCAAAAGTGGGTGTCCTCGCCATTGCCAA
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TTTCAAAATGCAAGACAG*TTCCACGAGTG

QA 1 690 1 690
DS 

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TAGGACATCGATCAAGGAGAACCAGCCAGGTTAGGAAGCTGTGTCTAGGGATGCCGTAAG
AGAACCAGACGATTTTAGCCGCATTCAAGAACGTGTAGAGTTGTCCAAAGGGTGCCCAGT
TATCATACCAAAAGTGGGTGTCCTCGCCATTGCCAATTTTTTTTTTGAGCAGCGGACCCA
AACCGAGTTTGGCCGGAAGAACAACAGCCAGACTAGTTTCAAAATGCAAGACAGGTTCCA
CGAGTGGAGGTCCTTTATTCCTAAGCCACCCTGATCTTTGGTTGAGCTTCTTCGTTGTAA
GAGGGACACCCAGATAGCGCATTGGGAGAGTACCACAAGGCATTCCTGTTGAAGCTTGAA
TGGTAGAGATCTCCTGCTCTGAGAGGCCCGAAGCAAAGAAACTAGATTTTTGCAGACTGA
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CAATTAAAGTTTTTTTGAAGAAAAAAAGTTATAATATCTGGGGT

QA 1 824 1 824
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GAATAGAACAAAGATTTACACGACAAAAAAATACTTAATATTAATTATAAAAAAAAGTTA
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AAAAATAGTTGGGTTTTAAATTTTTGAATGTCTGTTTTGTTTGAAAAATAATATATAATA
AAATTTG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CD43JQ C 1
AF RS1CD43TF U 1
BS 1 427 RS1CD43TF

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AAATTTG

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DS 

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GAATAGAACAAAGATTTACACGACAAAAAAATACTTAATATTAATTATAAAAAAAAGTTA
TTTGGGTTTGATTATTTAGAATTATTATTGAATTATGGAATTTAGTGATTGTCTTCCAGT
ACACTAAATGAGCTTTTTTTTTCAAGAAATAGTATTATAATCGATATTTTTTTTTACATA
TGAAGTGAAGAAATTTAATAAAATTTTTTCTAATATAATCTATCAGTATAGATTAATTAA
ATGAGCACTCTCATACGGATTTAAAACGTTAAATACAAAAAATTTTTCAAGAAAAAGGTA
AAAAATAGTTGGGTTTTAAATTTTTGAATGTCTGTTTTGTTTGAAAAATAATATATAATA
AAATTTG

QA 1 427 1 427
DS 



AS 1 2

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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1GW43TF U 1
AF RS1FN07TF U 42
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GTCCTCAAGATGTGCACGACTC

QA 1 622 1 622
DS 

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G
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QA 2 638 2 638
DS 



AS 1 2

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CAAAACAACGAGGACCACCACAAGATTTGCAATTGGGAACCTCAAATTTAGAGACTCGAC
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CAGGAGCTTTGTCTACACGTTGCTGGAAGTTAACCCAACTATTCCTATCAGCATCTCCCT
CAAAATCCTTCATCACAAATTTCATTTGGTCGTCCACTTCTCTCTTTGAGACCACCAAAG
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CCCCATTATCCACAGGGTTTGAGTCAGATGTTTCAAGAACCGCACGAAGCTGTTGACATT
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FD75JQ U 19
AF RS1FD40JQ U 1
BS 1 220 RS1FD40JQ
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RD RS1FD75JQ 598 0 0
GG
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GAGTTCTCACAAGTGTACACAACTATTGTTGCCCAATCAAGTGATTCCCTGTCGTTGCTC
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CAAGATTTGCAATTGGGAACCTCAGATTTAGAGACTCGACCACTTGCCATTGGCCAGAGG
GGTTTTGCTTCAGAGCTCCGGCAATATCTTACAACTTGTTCAGGAGCTTTGTCTACACGT
TGCTGGAAGTTAACCCAACTATTCCTATCAGCATCTCCCTCAAAATCCTTCATCACAGAT
TTCATTTGGTCGTCTACTTCTCTCTTTGAGACCACCAAAGGTTGAGCAACTTCATCAGTT
TCTGACATCTCTGTATCATACTCACTTTCATCCACATTGATCAATACAAACTCTTT

QA 3 598 3 598
DS 

RD RS1FD40JQ 758 0 0
AATGTCTAATCCTTTTATAACCAAACGAAACGAGCAAGGGTATATAACACATGGGAATTC
TACAAATATTAAAGTCCGGTCTGATCCGGTTAGGAACAAAACTTTTGCGGCAACAGAAAA
AACAGAAAATGCTCTAAGTAGTTTGACTGTAAACTTGAACCCAAACAAACTCTTCATTGT
AACTTAAGCTCGTGTCGCACGAGTTCTCACAAGTGTACACCACTATTGTTGCCCAATCAA
GTGATTCCCTGGCGTTGCTCCCACCGAAAAAAAACAGTAGCTGCGGCATCGCCTGAAACT
CAAAACGACGAGGACCACCACAAGATTTGCAATTGGGAACCTCAAATTTAGAGACTCGAC
CACTTGCCATTGGCCAAAGGGGTTTTGCTTCAAAGCTCCGGCAATATCTTACAACTTGTT
CAGGAGCTTTGTCTACACGTTGCTGGAAGTTAACCCAACTATTCTTATCAGCATCTCCCT
CAAAATCCTTCATCACAAATTTCATTTGGTCGTCCACTTCTCTCTTTGAGACCACCAAAG
GTTGAGCAACTTCATCAGTTTCTGACATCTCAGTATCATACTCACTTTCATCCACATTGA
TCAATACAAACTCTTTCCATAGACTCTTACTCGCAGCTCTCTGCACTGGAGTCAGAAAAA
CCCCATTATCCACAGGGTTTGAGTCAGATGTTTCAAGAACCGCACGAAGCTGTTGACATT
CTGCTTTATGAGCCCTGTGCCAATGCAGAGACTGGTGT

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL8183Contig1 532 2 1 U
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ATTCTTGGAGCGTAAACACTCTTCACATCTTCATCATTGAAGATGGTCTTGCACAAAGCT
GTCTTCCCCACACCGTATTCTCCTACGACCACAAGACTCTTGAACTCATTGTAGACCTTG
TGGTCCAGCAAGAAGTTCTTCAAGGACTTGATCTCGTTGTCGAAACCATGGATTTTATGG
CCTGGAAGTTCAGAATTGGTTTCCACGCGATCATTTTCATCTGGCTCCCCCTTTCTCTTG
TTCAAAGCTCCTGCAGAGAGATAGTTTCTTTTGGGAACATCTTCATGGTTTATGTTGCGG
TTATTGACCCAGTCTTCATATTTTTGAGTGAAGCAGGTTATGAAGGCTTCTCCTTGCTTT
GGAATTTCTGGAGTCATATTCAAGAGGGGATAGATAGCGTATAAACAGCTAAATGAAAAG
AAAGAAGATGAACAAGTAAAGAGACAGAGAGAGTAATTGAAAACCTTTTGTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1EQ09JQ C 1
AF RS1EQ09TF U 1
BS 1 532 RS1EQ09TF

RD RS1EQ09JQ 532 0 0
GCAGATATCTTCCCATCAAGTCTCTCTTCAGACCGTTCAATGCTATGCATAGACACCCAG
ATTCTTGGAGCGTAAACACTCTTCACATCTTCATCATTGAAGATGGTCTTGCACAAAGCT
GTCTTCCCCACACCGTATTCTCCTACGACCACAAGACTCTTGAACTCATTGTAGACCTTG
TGGTCCAGCAAGAAGTTCTTCAAGGACTTGATCTCGTTGTCGAAACCATGGATTTTATGG
CCTGGAAGTTCAGAATTGGTTTCCACGCGATCATTTTCATCTGGCTCCCCCTTTCTCTTG
TTCAAAGCTCCTGCAGAGAGATAGTTTCTTTTGGGAACATCTTCATGGTTTATGTTGCGG
TTATTGACCCAGTCTTCATATTTTTGAGTGAAGCAGGTTATGAAGGCTTCTCCTTGCTTT
GGAATTTCTGGAGTCATATTCAAGAGGGGATAGATAGCGTATAAACAGCTAAATGAAAAG
AAAGAAGATGAACAAGTAAAGAGACAGAGAGAGTAATTGAAAACCTTTTGTC

QA 1 532 1 532
DS 

RD RS1EQ09TF 532 0 0
GCAGATATCTTCCCATCAAGTCTCTCTTCAGACCGTTCAATGCTATGCATAGACACCCAG
ATTCTTGGAGCGTAAACACTCTTCACATCTTCATCATTGAAGATGGTCTTGCACAAAGCT
GTCTTCCCCACACCGTATTCTCCTACGACCACAAGACTCTTGAACTCATTGTAGACCTTG
TGGTCCAGCAAGAAGTTCTTCAAGGACTTGATCTCGTTGTCGAAACCATGGATTTTATGG
CCTGGAAGTTCAGAATTGGTTTCCACGCGATCATTTTCATCTGGCTCCCCCTTTCTCTTG
TTCAAAGCTCCTGCAGAGAGATAGTTTCTTTTGGGAACATCTTCATGGTTTATGTTGCGG
TTATTGACCCAGTCTTCATATTTTTGAGTGAAGCAGGTTATGAAGGCTTCTCCTTGCTTT
GGAATTTCTGGAGTCATATTCAAGAGGGGATAGATAGCGTATAAACAGCTAAATGAAAAG
AAAGAAGATGAACAAGTAAAGAGACAGAGAGAGTAATTGAAAACCTTTTGTC

QA 1 532 1 532
DS 



AS 1 2

CO CL8184Contig1 890 2 2 U
GAAGTTTACTGGAAGCTTGCCACCAAGTTACTTTGTGGATTGGAAAGCATCGTCATTTAC
CATGAAAGAAGATGCTGAAGATCTATATATGGTACACGGGCAAATTAGCTCTGGGGGATT
TTACTATTACACTGTGGAGACTATAGATTTGCAATACAAAGGTCTATTGATGGAGCAACA
GAGGATCATTACCTCATACGCGGCTATTGATTTTTCAGGGAATAAAATTGAAGGACAAAT
TCCTGAATCAATTGGTCTCGTGAAAGGACTGATTGCACTCAACTTATCAAACAACGCCTT
CACAGGCCATATTCCTCTGTCTTTCTCCAATCTAAGCAAGCTCGAGTCACTTGACCTATC
AAGCAACCAACTCTCAGGGACCATTCCAAGTGCACTCGGGACCCTCTCCTTTTTGGAGTA
CATAAATGTGTCTCATAACCAACTCAAAGGGGAGATACCACAAGGAACACAGATTACGGG
CCAAGCTAAATCTTCATTTGAAGGGAATGCAGGCCTTTGTGGCCTTCCTCTCCAGGAAAC
TTGCTTTGAGACTGATGCGCCACCAGCACACCAACTTCCGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA
AGAAGAAGAGGAAGAAGTTTTGAACTGGAAAACTGTGGCAATAGGGTATGGACCTGGAGT
GTTACTTGGACTTGCAATAGCACAATTCATCGCTACATACAAACCGGAGTGGCTCGTCAA
GATAGTTGGTCTCAAAAAGCGCAGAAATCGTTAGGATTGTATGTATGTCAAGTGGTTGAT
GAGATTCCTCTTGTGTGGAAGCATCTCTTTTATGTTTGCTGTACCATTCTCCGATGCTTT
GTTTCTATATTTTGTTTTCTATAAAGTAAGAAGGGTGGATGTTTTGGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GU77TF U 1
AF RS1GU77JQ C 43
BS 1 580 RS1GU77TF
BS 581 890 RS1GU77JQ

RD RS1GU77TF 580 0 0
GAAGTTTACTGGAAGCTTGCCACCAAGTTACTTTGTGGATTGGAAAGCATCGTCATTTAC
CATGAAAGAAGATGCTGAAGATCTATATATGGTACACGGGCAAATTAGCTCTGGGGGATT
TTACTATTACACTGTGGAGACTATAGATTTGCAATACAAAGGTCTATTGATGGAGCAACA
GAGGATCATTACCTCATACGCGGCTATTGATTTTTCAGGGAATAAAATTGAAGGACAAAT
TCCTGAATCAATTGGTCTCGTGAAAGGACTGATTGCACTCAACTTATCAAACAACGCCTT
CACAGGCCATATTCCTCTGTCTTTCTCCAATCTAAGCAAGCTCGAGTCACTTGACCTATC
AAGCAACCAACTCTCAGGGACCATTCCAAGTGCACTCGGGACCCTCTCCTTTTTGGAGTA
CATAAATGTGTCTCATAACCAACTCAAAGGGGAGATACCACAAGGAACACAGATTACGGG
CCAAGCTAAATCTTCATTTGAAGGGAATGCAGGCCTTTGTGGCCTTCCTCTCCAGGAAAC
TTGCTTTGAGACTGATGCGCCACCAGCACACCAACTTCCG

QA 1 580 1 580
DS 

RD RS1GU77JQ 848 0 0
GG
AAGCATCGTCATTTACCATGAAAGAAGATGCTGAAGATCTATATATG*TACACGGGCAAA
TTAGCTCTGGGGGATTTTACTATTACACTGTGGAGACTATAGATTTGCAATACAAAGGTC
TATTGATGGAGCAACAGAGGATCATTACCTCATACGCGGCTATTGATTTTTCAGGGAATA
AAATTGAAGGACAAATTCCTGAATCAATTGGTCTCGTGAAAGGACTGATTGCACTCAACT
TATCAAACAACGCCTTCACAGGCCATATTCCTCTGTCTTTCTCCAATCTAAGCAAGCTCG
AGTCACTTGACCTATCAAGCAACCAACTCTCAGGGACCATTCCAAGTGCACTCGGGACCC
TCTCCTTTTTGGAGTACATAAATGTGTCTCATAACCAACTCAAAGGGGAGATACCACAAG
GAACACAGATTACGGGCCAAGCTAAATCTTCATTTGAAGGGAATGCAGGCCTTTGTGGCC
TTCCTCTCCAGGAAACTTGCTTTGAGACTGATGCGCCACCAGCACACCAACTTCCGGAAG
AAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAAGTTTTGAACTGGAAAACTGTGGCAATAG
GGTATGGACCTGGAGTGTTACTTGGACTTGCAATAGCACAATTCATCGCTACATACAAAC
CGGAGTGGCTCGTCAAGATAGTTGGTCTCAAAAAGCGCAGAAATCGTTAGGATTGTATGT
ATGTCAAGTGGTTGATGAGATTCCTCTTGTGTGGAAGCATCTCTTTTATGTTTGCTGTAC
CATTCTCCGATGCTTTGTTTCTATATTTTGTTTTCTATAAAGTAAGAAGGGTGGATGTTT
TGGAGT

QA 3 848 3 848
DS 



AS 1 2

CO CL8185Contig1 1171 2 6 U
GGGTCTGTAATCTCTGCCTCCCCCGAGAAACTGATTATCCTAACGACGACAATGGCGGAA
GGACTCGTTCTGAAGGGCACCATGCGTGCACACACCGACATGGTCACCGCGATCGCCACC
CCAATCGACAACTCGGACACAATCGTCTCAGCTTCCCGTGACAAATCCATCATCGTATGG
AAACTCACCAAGGACGACAAATCCTACGGCGTCGCTCAGAGACGTCTCACAGGGCACTCC
CACTTCGTCGAAGACGTCGTCCTCTCCTCAGACGGCCAATTCGCGCTTTCCGGAAGCTGG
GACGGCGAGCTTCGCCTCTGGGACCTCGCCGCCGGTGTCTCGACTCGCCGATTCGTCGGA
CACACGAAAGACGTGCTCTCCGTCGCTTTCTCACTCGACAACCGTCAGATCGTATCGGCC
TCTCGTGACCGTACGATCAAGCTGTGGAACACTCTGGGTGAGTGTAAGTACACTATCGCC
GAAGGAGGCGGTGAGGGACACGGCGAGTGGGTTAGCTGCGTTAGGTTCAGTCCCAACACG
CTCCAGCCGACGATTGTGTCGGCGTCGTGGGACAAGACGGTGAAAGTGTGGAACTTGTCC
AACTGCAAGCTCAGATCGACTCTCGCTGGTCACACTGGGAATGTCAACACGGTGGCTGTG
TCACCTGATGGCTCTCTCTGCGCCAGTGGAGGCAAAGATGGTGTGGTTTTGCTGTGGGAT
TTGGCTGAGGGGAAGAAGCTTTACTCTCTTGAAGCTAACTCTGTCATTCATGCTCTTACC
TTTAGCCCTAATAGGTATTGGCTATGTGCTGCGACTGAGCAGGGTATTAAGATTTGGGAT
CTTGAGAGTAAGAGTGTTGTTGAGGACTTGAAGGTTGATCTCAAGGCTGAGGCTGAGAAG
TCTGATGGAAGTGGTAGTGCTGCCACCAGAAGGAAGGTTATCTACTGCACCAGCCTGAAC
TGGAGTGCGGATGGAAGCACCTTGTTCAGTGGATATACCGATGGAGTTATCAGAGTTTGG
GGTATTGGACGTTACTAGTTTATCCCATCTCTTTGCTCTGTCTCTCTCCTTGGTTGTGGT
TTTATCTCTCTCTTTTCTTTTGTCAACAAACACAGATTTTGCAATAATGTTTGGTTTTAT
GTCAACTCTAGGTTTGGATCTTTTTATATCG


BQ
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AF RS1AG80TF U 1
AF RS1AG80JQ C 282
BS 1 731 RS1AG80TF
BS 732 732 RS1AG80JQ
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BS 796 821 RS1AG80TF
BS 822 1171 RS1AG80JQ

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AACTGCAAGCTCAGATCGACTCTCGCTGGTCACACTGGGAATGTCAACACGGTGGCTGTG
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TTTAGCCCTAATAG*TATTGGCTATGTGCTGCGACTGAGCA
C

QA 1 821 1 821
DS 

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GACTCGCCGATTCGTCGGACACACGAAAGACGTGCTCTCCGTCGCTTTCTCACTCGACAA
CCGTCAGATCGTATCGGCCTCTCGTGACCGTACGATCAAGCTGTGGAACACTCTGGGTGA
GTGTAAGTACACTATCGCCGAAGGAGGCGGTGAGGGACACGGCGAGTGGGTTAGCTGCGT
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GAAAGTGTGGAACTTGTCCAACTGCAAGCTCAGATCGACTCTCGCTGGTCACACTGGGAA
TGTCAACACGGTGGCTGTGTCACCTGATGGCTCTCTCTGCGCCAGTGGAGGCAAAGATGG
TGTGGTTTTGCTGTGGGATTTGGCTGAGGGGAAGAAGCTTTACTCTCTTGAAGCTAACTC
TGTCATTCATGCTCTTACCTTTAGCCCTAATAGGTATTGGCTATGTGCTGCGACTGAGCA
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CTACTGCACCAGCCTGAACTGGAGTGCGGATGGAAGCACCTTGTTCAGTGGATATACCGA
TGGAGTTATCAGAGTTTGGGGTATTGGACGTTACTAGTTTATCCCATCTCTTTGCTCTGT
CTCTCTCCTTGGTTGTGGTTTTATCTCTCTCTTTTCTTTTGTCAACAAACACAGATTTTG
CAATAATGTTTGGTTTTATGTCAACTCTAGGTTTGGATCTTTTTATATCG

QA 1 890 1 890
DS 



AS 1 2

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TGGATAAGTATAGGAGCTCGTCACAATGTCACGGAACAAGGGTTTGGCGGAGCAAGATCT
TAGTAAACTGGATGTAACTGTGCTTCATCCTCTGTCTCCTGAGGTTATTTCTCGACAAGC
TACAATAAACATTGGAACCATTGGGCATGTCGCTCACGGAAAGTCCACTGTTGTCAAATC
TATATCTGGTGTCCAGACTGTCCGTTTTAAGAATGAGTTGGAGCGTAACATCACCATCAA
GCTTGGTTATGCAAATGCCAATATTTACAAATGCGAGGATGACAAATGCCCTAACCTATG
TGCTATAAGGCATATGGAAGTGGAAAAGAAGACAGCCCACATTGTGATGAAACTATTGAG
GCATGTGTCGTTCGTGGATTGCCCGGGACATGATATTCCATGGCGACTATGCTCAACGGA
GCAGCCATCATGGATGGTGCACTGCTTCTTATCGCTGCAAATGAAAGTTGTCCACAACCA
CAAACATCCGAACATCTTGCCGCTGTTGAGATTATGCAGCTCAAGCATATCATAATCCTC
CAGAACAAGATTGATCTTAGTCAAGAGAACGTTGCCATTAACCAGCACGAAACCATTCAG
AAATTTATAATGAACACTGTCGCAGATGGTGCGCCAATAGTCCCTGTATCAGCCCAGCTG
AAATACAACATTGATGTTGTATGCGAGTACATTGTCAAGAAGATCCCAATCCCTAAGAGG
AATTTCATTTCACCACCAAATATGATAGTGATTCGGTCTTTTGATGTCAACAAAAACCAG
GGTTTGAGGTGGAGTTGCAGGTGGAAAGTATCCTACGGGGTGTTTTGAAAGTGAACCAAT
TAATTGAGATCCGACCTGGAATTGTTGTGAAAAGACGAGCGTGGCAACCCAAAATGCACA
CCGATATACTCACGCATTATCTCACTATACGCGGAACAGAACGAGCTACAGTACGCAGTG
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TTTGGTCGGTCAAGTCCTTGGTGAAATAGGCTCCCTTCCTGATGTCTTTGTTGAACTCTG
ATGTTCCTTTGTCGATGTACATAAACATTTTTTCAAAAAGAAAAATTGGATATACTTCTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H213TF U 1
AF RS1H213JQB C 512
BS 1 757 RS1H213TF
BS 758 1200 RS1H213JQB

RD RS1H213TF 757 0 0
GGGACATAGATCAGTCGGGATCTAATTGTAAACTTGTAGATTGGGAAATCCAATTGGTTT
TGGATAAGTATAGGAGCTCGTCACAATGTCACGGAACAAGGGTTTGGCGGAGCAAGATCT
TAGTAAACTGGATGTAACTGTGCTTCATCCTCTGTCTCCTGAGGTTATTTCTCGACAAGC
TACAATAAACATTGGAACCATTGGGCATGTCGCTCACGGAAAGTCCACTGTTGTCAAATC
TATATCTGGTGTCCAGACTGTCCGTTTTAAGAATGAGTTGGAGCGTAACATCACCATCAA
GCTTGGTTATGCAAATGCCAATATTTACAAATGCGAGGATGACAAATGCCCTAACCTATG
TGCTATAAGGCATATGGAAGTGGAAAAGAAGACAGCCCACATTGTGATGAAACTATTGAG
GCATGTGTCGTTCGTGGATTGCCCGGGACATGATATTCCATGGCGACTATGCTCAACGGA
GCAGCCATCATGGATGGTGCACTGCTTCTTATCGCTGCAAATGAAAGTTGTCCACAACCA
CAAACATCCGAACATCTTGCCGCTGTTGAGATTATGCAGCTCAAGCATATCATAATCCTC
CAGAACAAGATTGATCTTAGTCAAGAGAACGTTGCCATTAACCAGCACGAAACCATTCAG
AAATTTATAATGAACACTGTCGCAGATGGTGCGCCAATAGTCCCTGTATCAGCCCAGCTG
AAATACAACATTGATGTTGTATGCGAGTACATTGTCA

QA 1 757 1 757
DS 

RD RS1H213JQB 689 0 0
TCGCTGCAAATGAAAGTTGTCCACAACCACAAACATCCGAACATCTTGCCGCTGTTGAGA
TTATGCAGCTCAAGCATATCATAATCCTCCAGAACAAGATTGATCTTAGTCAAGAGAACG
TTGCCATTAACCAGCACGAAACCATTCAGAAATTTATAATGAACACTGTCGCAGATGGTG
CGCCAATAGTCCCTGTATCAGCCCAGCTGAAATACAACATTGATGTTGTATGCGAGTACA
TTGTCAAGAAGATCCCAATCCCTAAGAGGAATTTCATTTCACCACCAAATATGATAGTGA
TTCGGTCTTTTGATGTCAACAAAAACCAGGGTTTGAGGTGGAGTTGCAGGTGGAAAGTAT
CCTACGGGGTGTTTTGAAAGTGAACCAATTAATTGAGATCCGACCTGGAATTGTTGTGAA
AAGACGAGCGTGGCAACCCAAAATGCACACCGATATACTCACGCATTATCTCACTATACG
CGGAACAGAACGAGCTACAGTACGCAGTGCCTGGAGGCCTAATAGGAAGTAGGAACAACA
ATGGACCCAACTCTAACTCGTACTGATCGTTTGGTCGGTCAAGTCCTTGGTGAAATAGGC
TCCCTTCCTGATGTCTTTGTTGAACTCTGATGTTCCTTTGTCGATGTACATAAACATTTT
TTCAAAAAGAAAAATTGGATATACTTCTC

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 2

CO CL8187Contig1 907 2 2 U
AGGGGAACACTCATCTCTCTGATGAAGACCATAGAGCTTTTCTCTCTCTCATCCATCCTC
CTTCTCCTTGGGCTCTCCTTCACAAGTCCCATTCTCTCCATCTCTGATCAGCCATTATTA
ATCTCATCTGTTGTTCATGATGAAGAAGAAAGCTGCCCTTACACCGTGATTGTCACCACG
AGCTGTTTCTCTCCTGATTTGTCAAGGGATCAGATCACTCTCGCTTTGGGTGACGCCGAC
GGTAACAAGGTGGTCGCACCGAGACTAGACGAACCGTTAGGTGGTGGAGGAGGTTTCGAG
AAATGTTCATCTGACACATTCCAAGTCAAAGGTCAGTGTCTAGACACTATCTGCTCTCTC
TACATCTACCGTTCCGGTCCCGACGGTTGGATCCCAGAGACCGTGGAGATCTACGAGGAA
GGTTCTAATTCCGTGAAATTCGACTTCAACAAAAACGTCCCTGAGAACACTTGGTACGGC
CACAACTATTGCAACAACACCGGTTTGCCACCACCTTCGCCGGATAAACCTCCTCCGTTT
AAACCCACAGTCCCACCGCCCCACCCACCTCATTCTCCTCCCGACAAACCTTCTATCCCA
CCACCAGCACCACCCCATGCACCACCCCATCCACCATCATCTGCGGCCTCTGGACGTGGA
GGTGGTGAGAGTTTGGTTGTTGCGTCTGCTGCGATTCTGATTGCGTTAGCGGCTGTGGTG
GTTTGAGTTTCTAGTTAAGAGTTGCTTTAATGACTAATAAGTATGGTGTAGTGACTTTCG
TTTTCTGTTTGTAGTAGTTGGAGATCCTGGAGACCTTGATTAGTGAATGTATCGAGCCAT
GAAGTACTAGTAATCAATATAAATTAATGAAACATGCACCAGTGTGTTGCATGTGATTTA
TAATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CM09TF U 1
AF RS1CM09JQ C 198
BS 1 729 RS1CM09TF
BS 730 907 RS1CM09JQ

RD RS1CM09TF 729 0 0
AGGGGAACACTCATCTCTCTGATGAAGACCATAGAGCTTTTCTCTCTCTCATCCATCCTC
CTTCTCCTTGGGCTCTCCTTCACAAGTCCCATTCTCTCCATCTCTGATCAGCCATTATTA
ATCTCATCTGTTGTTCATGATGAAGAAGAAAGCTGCCCTTACACCGTGATTGTCACCACG
AGCTGTTTCTCTCCTGATTTGTCAAGGGATCAGATCACTCTCGCTTTGGGTGACGCCGAC
GGTAACAAGGTGGTCGCACCGAGACTAGACGAACCGTTAGGTGGTGGAGGAGGTTTCGAG
AAATGTTCATCTGACACATTCCAAGTCAAAGGTCAGTGTCTAGACACTATCTGCTCTCTC
TACATCTACCGTTCCGGTCCCGACGGTTGGATCCCAGAGACCGTGGAGATCTACGAGGAA
GGTTCTAATTCCGTGAAATTCGACTTCAACAAAAACGTCCCTGAGAACACTTGGTACGGC
CACAACTATTGCAACAACACCGGTTTGCCACCACCTTCGCCGGATAAACCTCCTCCGTTT
AAACCCACAGTCCCACCGCCCCACCCACCTCATTCTCCTCCCGACAAACCTTCTATCCCA
CCACCAGCACCACCCCATGCACCACCCCATCCACCATCATCTGCGGCCTCTGGACGTGGA
GGTGGTGAGAGTTTGGTTGTTGCGTCTGCTGCGATTCTGATTGCGTTAGCGGCTGTGGTG
GTTTGAGTT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RS1CM09JQ 710 0 0
TTTGTCAAGGGATCAGATCACTCTCGCTTTGGGTGACGCCGACGGTAACAAGGTGGTCGC
ACCGAGACTAGACGAACCGTTAGGTGGTGGAGGAGGTTTCGAGAAATGTTCATCTGACAC
ATTCCAAGTCAAAGGTCAGTGTCTAGACACTATCTGCTCTCTCTACATCTACCGTTCCGG
TCCCGACGGTTGGATCCCAGAGACCGTGGAGATCTACGAGGAAGGTTCTAATTCCGTGAA
ATTCGACTTCAACAAAAACGTCCCTGAGAACACTTGGTACGGCCACAACTATTGCAACAA
CACCGGTTTGCCACCACCTTCGCCGGATAAACCTCCTCCGTTTAAACCCACAGTCCCACC
GCCCCACCCACCTCATTCTCCTCCCGACAAACCTTCTATCCCACCACCAGCACCACCCCA
TGCACCACCCCATCCACCATCATCTGCGGCCTCTGGACGTGGAGGTGGTGAGAGTTTGGT
TGTTGCGTCTGCTGCGATTCTGATTGCGTTAGCGGCTGTGGTGGTTTGAGTTTCTAGTTA
AGAGTTGCTTTAATGACTAATAAGTATGGTGTAGTGACTTTCGTTTTCTGTTTGTAGTAG
TTGGAGATCCTGGAGACCTTGATTAGTGAATGTATCGAGCCATGAAGTACTAGTAATCAA
TATAAATTAATGAAACATGCACCAGTGTGTTGCATGTGATTTATAATTCC

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL8188Contig1 1008 2 6 U
GGGGATCATCCACTAGCTCTTGTCTGAACTGGTAAAAAAGAAAGAAGAAGAAGACAACTT
TTGAAATGGGTCATTGCATTTCATCCCTTTCCTCTTCTTCCATAACAGGTCTCCACAGTC
ATGCCTCTACGAACAACCACAGTAATGGAACAGGTTTCTCGTCATCAACGACCACCACCC
TCGCGACAACAAACAGCAGCGTCGGACCACAAAGCCAATTCTCTGAAGCGGCTAGCGAAT
ATTCCGGTGGGATTGTTGGTGATTCTGGTCTAATATTGGAATCACCAAATCTCAAAATCT
ACAGCTTCCAGGATCTAACGACGGCGACCAAGAACTTCAGGCCGGACTCCATGTTGGGTC
AAGGAGGTTTTGGTAAAGTTTACAGAGGTTGGATCGATACCAAGACTCTTGCTCCTTCTA
AAGCTGGTTCCGGTATGATCGCCGCCGTTAAAAGATTGAATTCAGAGAGTGTTCAAGTAT
TCGCAGAGTGGCGAGTAAGATCTAAACTCTAGTTTTGATATAATAATTATTTCGATCTTG
ATTACTTCTTTGACGGGATAAAAAACGACCTCGACTTCCTGTTGCACGTCTTGCTGAATG
ATTAAAAGAAATATTAATTTATTTATACTAATAAATTAAACATTTGTACCAAGACGTAGG
TCATCAATAGTTTTAAATTTGGGCGTTTATGACTCTCATTGGTGGAGTTCTAAAAAAATA
TTCTTATTGAATATTAGTCCCTCTGTTCCACTTTAATTGAAGTTTTAAGATTTTTATTTT
GGTTCATAATATGTGATGTTTTCACTATCTATCTTATTAAAACAGAAACATTACAACTTC
TTCTAGGTGGATTTTTAAATTGGACATCACATTATTATTCATACCTTAACCTTTCATTTA
AATATTTCCTTAAATAACTATATATCAACCAACTATGTGACATCTTACACTCGATGTATA
ATAATTTAACTATATTGACACTATACATTATATTATACATCTATTCGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BG77TF U 1
AF RS1BG77JQ C 242
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RD RS1BG77TF 782 0 0
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AAGCTGGTTCCGGTATGATCGCCGCCGTTAAAAGATTGAATTCAGAGAGTGTTCAAGTAT
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ATTACTTCTTTGACGGGATAAAAAACGACCTCGACTTCCTGTTGCACGTCTTGCTGAATG
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TCATCAATAGTTTTAAATTTGGGCGTTTATGACTCTCATTGGTGGAGTTCTAAAAAA*TA
TTCTTATTGAATATTAGTCCCTCTGTTCCACTTTAATTGAAGTTTTAAGATTTTTATTTT
GG

QA 1 782 1 782
DS 

RD RS1BG77JQ 767 0 0
A
TCCGGTGGGATTGTTGGTGATTCTGGTCTAATATTGGAATCACCAAATCTCAAAATCTAC
AGCTTCCAGGATCTAACGACGGCGACCAAGAACTTCAGGCCGGACTCCATGTTGGGTCAA
GGAGGTTTTGGTAAAGTTTACAGAGGTTGGATCGATACCAAGACTCTTGCTCCTTCTAAA
GCTGGTTCCGGTATGATCGCCGCCGTTAAAAGATTGAATTCAGAGAGTGTTCAAGTATTC
GCAGAGTGGCGAGTAAGATCTAAACTCTAGTTTTGATATAATAATTATTTCGATCTTGAT
TACTTCTTTGACGGGATAAAAAACGACCTCGACTTCCTGTTGCACGTCTTGCTGAATGAT
TAAAAGAAATATTAATTTATTTATACTAATAAATTAAACATTTGTACCAAGACGTAGGTC
ATCAATAGTTTTAAATTTGGGCGTTTATGACTCTCATTGGTGGAGTTCTAAAAAAATATT
CTTATTGAATATTAGTCCCTCTGTTCCACTTTAATTGAAGTTTTAAGATTTTTATTTTGG
TTCATAATATGTGATGTTTTCACTATCTATCTTATTAAAACAGAAACATTACAACTTCTT
CTAGGTGGATTTTTAAATTGGACATCACATTATTATTCATACCTTAACCTTTCATTTAAA
TATTTCCTTAAATAACTATATATCAACCAACTATGTGACATCTTACACTCGATGTATAAT
AATTTAACTATATTGACACTATACATTATATTATACATCTATTCGT

QA 2 767 2 767
DS 



AS 1 2

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AAAGGTCTTTCTTTTACTACCCAATCTCTTATTTATTTTCGCCGCCATGAGTTCTGTTAC
CGCGATCGTGGATGAGCAGCAAGTGGTCGACGGTATCCAGCATATGACTCTTCAAGCTCA
GGGCGAAGAGAAGATCCAGGAAGAGATCCACGAGCTCAATTTCGGAAACCATGGCGGCTG
TTGTGCGATATGCTTGAGTGAAATTCCTCTTCAAGAGACTGCCATGGTTAAAGGCTGTGA
ACATACTTACTGTGTGACATGCATACTTCGTTGGGCGAGTTGCAAAGAGAGTCCTACATG
CCCGCAATGTAAGCATCCGTTTGATTTCCTCAGTGTCCACCGGACTCTTGACGGCAGGAT
TGAAGATTTTTTGTTTGAGGAGAGTGTGTGCCTTCTCCTGAGAGCCTCATGGTTTATACC
GTTGGATGTGATGGTGGAACAGGCGTCACACAGCTACGGCTACCATGATGATTTCGACAC
TCTCTGTGACTACGATGATGGAGATGATTACCTTGACGAGTTTTATCTGCACGGGTCAGG
TCTTCGCATAGGAAACCGGAGATGGGGTGACAATGGTTTTGTCAGATCCGGGCGTCAAGA
AGCCAGGCCAGTCAAGAAACACAGTTGTTCTGGTTCGAGTTCTAGTTCCAGTTCCAGTTC
CAGTTCTGGGTCATCTTCATGTGAGCCTAAAGATAAGCAGGTGAAGACTACAAACACAAC
GGGAAGACGTGCAAAGAGGGCGATGAAGCGGGAAGCTGCTAACAAAGCAGCTGAAGTAGC
TTCAGCAGCAAAGCACGAAGCCCATTTGGTTAGGTTGGGAAGGAAGTGAGGTGTGGATGC
TCCTCTCTGTAAGTAAAACCGCGCTATTAAAAAGCTACCACCCACTTCCATTTCTTAGTT
TCACCATCTGTACAGCAACTACTTTTTAATGTTGTGTTAAAATCCCTAATCACCACTGTA
TGGAGTACACAGTTGTTTGGGGGGTTTGGAGAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AP77TFB U 1
AF RS1AP77JQ C 213
BS 1 756 RS1AP77TFB
BS 757 1053 RS1AP77JQ

RD RS1AP77TFB 756 0 0
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TGAAGATTTTTTGTTTGAGGAGAGTGTGTGCCTTCTCCTGAGAGCCTCATGGTTTATACC
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TCTTCGCATAGGAAACCGGAGATGGGGTGACAATGGTTTTGTCAGATCCGGGCGTCAAGA
AGCCAGGCCAGTCAAGAAACACAGTTGTTCTGGTTCGAGTTCTAGTTCCAGTTCCAGTTC
CAGTTCTGGGTCATCTTCATGTGAGCCTAAAGATAA

QA 1 756 1 756
DS 

RD RS1AP77JQ 841 0 0
GAGCTCAA
TTCGGAAACCATGGCGGCTGTTGTGCGATATGCTTGAGTGAAATTCCTCTTCAAGAGACT
GCCATGGTTAAAGGCTGTGAACATACTTACTGTGTGACATGCATACTTCGTTGGGCGAGT
TGCAAAGAGAGTCCTACATGCCCGCAATGTAAGCATCCGTTTGATTTCCTCAGTGTCCAC
CGGACTCTTGACGGCAGGATTGAAGATTTTTTGTTTGAGGAGAGTGTGTGCCTTCTCCTG
AGAGCCTCATGGTTTATACCGTTGGATGTGATGGTGGAACAGGCGTCACACAGTTACGGC
TACCATGATGATTTCGACACTCTCTGTGACTACGATGATGGAGATGATTACCTTGACGAG
TTTTATCTGCACGGGTCAGGTCTTCGCATAGGAAACCGGAGATGGGGTGACAATGGTTTT
GTCAGATCCGGGCGTCAAGAAGCCAGGCCAGTCAAGAAACACAGTTGTTCTGGTTCGAGT
TCTAGTTCCAGTTCCAGTTCCAGTTCTGGGTCATCTTCATGTGAGCCTAAGGATAAGCAG
GTGAAGACTACAAACACAACGGGAAGACGTGCAAAGAGGGCGATGAAGCGGGAAGCTGCT
AACAAAGCAGCTGAAGTAGCTTCAGCAGCAAAGCACGAAGCCCATTTGGTTAGGTTGGGA
AGGAAGTGAGGTGTGGATGCTCCTCTCTGTAAGTAAAACCGCGCTATTAAAAAGCTACCA
CCCACTTCCATTTCTTAGTTTCACCATCTGTACAGCAACTACTTTTTAATGTTGTGTTAA
AATCCCTAATCACCACTGTATGGAGTACACAGTTGTTTGGGGGGTTTGGAGAA

QA 9 841 9 841
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

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AAAACTGATTTGATGGATGAGCTAGACAAGGAGGTTAAATCATTGGAACAAGACAGTTGG
ATGTTCCAAGGTCCTCGTTCTCGTATCCATCTTATCTCCAGAAGAGGTAACTTTCTCAGG
CGAGACGGTGAGGCTGTGTTAAAATCAAACATTGTTCAGCTGCCCAGATGATCAGAAGAA
GGAAAATTCAGAAAAAAAAAAGAGTCGAGAAAGCTTTGATTGATACATCTCTTTGGTTAC
AAATGCCTCCCTTTCCTAGTACTATTTTTTTTTGTTAAAATAGTCTCTGCCTTCATGCCA
AAAAGAAGAAGCTACTGTATCTGTAATTGATTGTTGAGTCTAAAAGTAAAATCTCAAGCC
C


BQ
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20 

AF RS1FN43JQ C 1
AF RS1FN43TF U 1
BS 1 541 RS1FN43TF

RD RS1FN43JQ 541 0 0
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AAAACTGATTTGATGGATGAGCTAGACAAGGAGGTTAAATCATTGGAACAAGACAGTTGG
ATGTTCCAAGGTCCTCGTTTTCGTATCCATCTTATCTCCAGAAGAGGTAACTTTTTCAGG
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GGAAAATTCAGAAAAAAAAAAGAGTCGAGAAAGCTTTGATTGATACATCTCTTTGGTTAC
AAATGCCTCCCTTTCCTAGTACTATTTTTTTTTGTTAAAATAGTCTCTGCCTTCATGCCA
AAAAGAAGAAGCTACTGTATCTGTAATTGATTGTTGAGTCTAAAAGTAAAATCTCAAGCC
C

QA 1 541 1 541
DS 

RD RS1FN43TF 541 0 0
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ACAACAGCCGTAGCAGGAGGCGGTGGAAGCAGCGGAGCCGCAGCTGGACTAGACGATTTC
CCTTTTCCACCCGATATTCCTTCTATGCAGGACCGAAAGGACGATGCCATGCGAGTTTTG
AAAACTGATTTGATGGATGAGCTAGACAAGGAGGTTAAATCATTGGAACAAGACAGTTGG
ATGTTCCAAGGTCCTCGTTCTCGTATCCATCTTATCTCCAGAAGAGGTAACTTTCTCAGG
CGAGACGGTGAGGCTGTGTTAAAATCAAACATTGTTCAGCTGCCCAGATGATCAGAAGAA
GGAAAATTCAGAAAAAAAAAAGAGTCGAGAAAGCTTTGATTGATACATCTCTTTGGTTAC
AAATGCCTCCCTTTCCTAGTACTATTTTTTTTTGTTAAAATAGTCTCTGCCTTCATGCCA
AAAAGAAGAAGCTACTGTATCTGTAATTGATTGTTGAGTCTAAAAGTAAAATCTCAAGCC
C

QA 1 541 1 541
DS 



AS 1 2

CO CL8193Contig1 1033 2 2 U
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CAAGAATCCGCCGCACCTGTCGTCGTAGAGACCACCGTCGTGGTCGCCGAGGCGGAGCCT
GTGGAGCCAGAGGAAGTCTCCATATACGGAGTTCCCCTCCTCCAAGACGAGAGATCCGAC
GTGATCCTCCTTAAGTTCCTCCGGGCGAGAGACTTCAAGGTCAAGGAAGCCTTGACGATG
CTGAAAAACTCGGCAAGAGAGCCCTGTGGCAGTTCATCAGACGTGCCGTCAAGCAGTTCG
AAGACAACTATCCCGAGTTCGCCACTAGAGAGTTGTTCATTAATGTCCCATTGTTAAACC
AGCAGCTAAATACACCATAGAGTTGCCTGCTTCTGAGGCTTGCACACTCTCGTGGGAGCT
TAGGGTTTTGGGTGCAGATGTGAGCTATGGGGCTCAGTTTGAACCGACCGCAGAGGGAAG
CTATGTTGTGATTGTTTCTAAAAACCGTAAGATTGGGTTAACTGATGAGCCGGTGATAAC
CGATTCATTTAAGGTGGGTGAACCAGGGAAAATTGTGATCACAATCGATAACCAGACTTC
CAAGAAGAAGAAAGTGCTTTACAGGTTCAAAACGCAACCAAGGTCTGATCTTTGAAATCA
TATCCGAGACCATATATCACTTGCCACAACCCAAATCTAACGAGGAAGTTTTTGGGAGAA
CAAATTTTTAATTAATTTAATTAGTTTCTTATTTGATATGTAATTTTGAAATCTCAAAAG
CTGGTTGTGTGTTTGCTGGAATTGTTTGCTTTGTTTTCAGTATTGGGATTGTTTTGAGTG
TGGAGAATATGTGATTAAAATCCAAAAGCAAAAGAAAAAATAAACTTTGTTTCATTACTT
TACCTTTCACTTTCTTTTACCCTTTTTATTGTACAATCTGTGTAAATCTTAATGTATTTA
ATATTTTTTTGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E647TF U 1
AF RS1E647JQ C 363
BS 1 609 RS1E647TF
BS 610 1033 RS1E647JQ

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GTGATCCTCCTTAAGTTCCTCCGGGCGAGAGACTTCAAGGTCAAGGAAGCCTTGACGATG
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AAGACAACTATCCCGAGTTCGCCACTAGAGAGTTGTTCATTAATGTCCCATTGTTAAACC
AGCAGCTAAATACACCATAGAGTTGCCTGCTTCTGAGGCTTGCACACTCTCGTGGGAGCT
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CTATGTTGTGATTGTTTCTAAAAACCGTAAGATTGGGTTAACTGATGAGCCGGTGATAAC
CGATTCATT

QA 1 609 1 609
DS 

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ATGTTGTGATTGTTTCTAAAAACCGTAAGATTGGGTTAACTGATGAGCCGGTGATAACCG
ATTCATTTAAGGTGGGTGAACCAGGGAAAATTGTGATCACAATCGATAACCAGACTTCCA
AGAAGAAGAAAGTGCTTTACAGGTTCAAAACGCAACCAAGGTCTGATCTTTGAAATCATA
TCCGAGACCATATATCACTTGCCACAACCCAAATCTAACGAGGAAGTTTTTGGGAGAACA
AATTTTTAATTAATTTAATTAGTTTCTTATTTGATATGTAATTTTGAAATCTCAAAAGCT
GGTTGTGTGTTTGCTGGAATTGTTTGCTTTGTTTTCAGTATTGGGATTGTTTTGAGTGTG
GAGAATATGTGATTAAAATCCAAAAGCAAAAGAAAAAATAAACTTTGTTTCATTACTTTA
CCTTTCACTTTCTTTTACCCTTTTTATTGTACAATCTGTGTAAATCTTAATGTATTTAAT
ATTTTTTTGAC

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 2

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TCAATGAGCTTATCAGGAGGATGAATTAGAAGAGATGTCTGTCGTATTATCTATGAACTT
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TCGGAGCTTTCTCTGCTATTATTGTGTTTGGATTTTAGCGGTTGATGAACTTTTTTTTTC
TACGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 

AF RS1BQ01JQ C 1
AF RS1BQ01TF U 1
BS 1 545 RS1BQ01TF

RD RS1BQ01JQ 545 0 0
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TTTTTTCGCTTCTCATGTCGTTTGCTCCGGCCACCGTGAGGGTTTACGCCACAGGCAAGG
AAACTTCAGGGAGCCCCAAGGAAGAGAAGAATCCCCTCGACTTTGTGCTGGGTTATTTGA
CAAAGCAAGATCAGTTTTACGAGACTGATCCAATTCTCAAGAAGGTGGAGGAGAAAGGCG
GCACCACTACTGGAGGCCGAGGAACCGTTCGCGGCGGTAAAAGCTCGGCTCCGGTGCCTG
TTGCCCCCAAGAGGAATCACTACGTTGAAGGTGGTGATGCCGGCAACCGTGAAAACTTCA
TCAATGAGCTTATCAGGAGGATGAATTAGAAGAGATGTCTGTCGTATTATCTATGAACTT
GACTACTTCACCATGTGTTTGCTTCTGGATTTTGATATTTTCTCTTATGTTAAAAGACAT
TCGGAGCTTTTTCTGCTATTATTGTGTTTGGATTTTAGCGGTTGATGAACTTTTTTTTTC
TACGC

QA 1 545 1 545
DS 

RD RS1BQ01TF 545 0 0
GGAAGACATAACACATTAACACACACAGAGAAGAGAGGAAAGGAGAGATAACAAGAATGG
TTTCTTCGCTTCTCATGTCGTTTGCTCCGGCCACCGTGAGGGTTTACGCCACAGGCAAGG
AAACTTCAGGGAGCCCCAAGGAAGAGAAGAATCCCCTCGACTTTGTGCTGGGTTATTTGA
CAAAGCAAGATCAGTTCTACGAGACTGATCCAATTCTCAAGAAGGTGGAGGAGAAAGGCG
GCACCACTACTGGAGGCCGAGGAACCGTTCGCGGCGGTAAAAGCTCGGCTCCGGTGCCTG
TTGCCCCCAAGAGGAATCACTACGTTGAAGGTGGTGATGCCGGCAACCGTGAAAACTTCA
TCAATGAGCTTATCAGGAGGATGAATTAGAAGAGATGTCTGTCGTATTATCTATGAACTT
GACTACTTCACCATGTGTTTGCTTCTGGATTTTGATATTTTCTCTTATGTTAAAAGACAT
TCGGAGCTTTCTCTGCTATTATTGTGTTTGGATTTTAGCGGTTGATGAACTTTTTTTTTC
TACGC

QA 1 545 1 545
DS 



AS 1 2

CO CL8195Contig1 706 2 2 U
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AAGCAGAAACTGAACAAGGAAGCATAGACGTTGCTGCGACCTTAAACAATGTCGAGGAGA
AAGACGAGAGACCCCAAGGAGGAGACAGTAACACTTGGACCAGCTGTTCGTGATGGAGAG
CAAGTCTTCGGTGTTGTCCACATCTTCGCTTCCTTCAACGACACTTTCATTCACGTTACT
GATCTGTCTGGACGTGAAACCCTTGTCCGCATCACTGGTGGAATGAAGGTGAAAGCTGAC
AGGGATGAGTCCTCACCTTACGCAGCTATGCTTGCTGCACAAGATGTTGCTCAGCGATGC
AAGGAGCTTGGAATCACCGCTATGCACGTTAAGCTCCGTGCCACGGGTGGTAACAAGACC
AAGACACCTGGTCCTGGTGCCCAATCCGCTCTCAGAGCTCTTGCTCGTTCCGGCATGAAA
ATTGGCCGCATCGAGGATGTTTTCCGATCCCAACGGACAGTACCCGCCGAAAGGGTGGTA
GGAGAGGAAGGAGGCTCTGAGATTTTTTTTTTGGCTATTTAGCTCATGTGTTTCGTTTTA
TCAGAACAATGTTTCTTCGAGTTTTGTTAAAAGGGATTTAAAGTTTAATCTTTTTGGTTA
ATTTGAATAACATTTTTCTACTATGATTACTCACTATGGCCTTTGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C871TF U 1
AF RS1C871JQ C 1
BS 1 537 RS1C871TF
BS 538 706 RS1C871JQ

RD RS1C871TF 537 0 0
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AGGGATGAGTCCTCACCTTACGCAGCTATGCTTGCTGCACAAGATGTTGCTCAGCGATGC
AAGGAGCTTGGAATCACCGCTATGCACGTTAAGCTCCGTGCCACGGGTGGTAACAAGACC
AAGACACCTGGTCCTGGTGCCCAATCCGCTCTCAGAGCTCTTGCTCGTTCCGGCATGAAA
ATTGGCCGCATCGAGGATGTTTTCCGATCCCAACGGACAGTACCCGCCGAAAGGGTG

QA 1 537 1 537
DS 

RD RS1C871JQ 706 0 0
GGAGAAACCCTAATTATAAAAGTCAATTTCTGTTTATTCTGCATCTTCTTCATCTTAGCC
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CAAGTCTTCGGTGTTGTCCACATTTTCGCTTCCTTCAACGACACTTTCATTCACGTTACT
GATCTGTCTGGACGTGAAACCCTTGTCCGCATCACTGGTGGAATGAAGGTGAAAGCTGAC
AGGGATGAGTCCTCACCTTACGCAGCTATGCTTGCTGCACAAGATGTTGCTCAGCGATGC
AAGGAGCTTGGAATCACCGCTATGCACGTTAAGCTCCGTGCCACGGGTGGTAACAAGACC
AAGACACCTGGTCCTGGTGCCCAATCCGCTCTCAGAGCTCTTGCTCGTTCCGGCATGAAA
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GGAGAGGAAGGAGGCTCTGAGATTTTTTTTTTGGCTATTTAGCTCATGTGTTTCGTTTTA
TCAGAACAATGTTTCTTCGAGTTTTGTTAAAAGGGATTTAAAGTTTAATCTTTTTGGTTA
ATTTGAATAACATTTTTCTACTATGATTACTCACTATGGCCTTTGC

QA 1 706 1 706
DS 



AS 1 2

CO CL8196Contig1 966 2 6 U
GGAGCTGGAAAATACGCTTCGTCTTCTCTCCTCTCCTGAAATTCGTCTGAACGTGTAAGT
TCCCACGATCAGTGCGTGGTGGCTCTATCAGCACCGGCACTGGTCCCAGTCTCTATCAGC
AGCGGCGCCGATCCCAATCTATGTCCTTCTTCCTATGTGCTTGGTTGTAGTTTGATTCAT
GACCGATACTTCAATTTGAGAGATATGCTTCGAGCAAATCAACGAAATTCCAGATTTATT
GCAGATTTTTAATAAAAAGGTTCGGATCTGGTGATTAACAGGGTGGCCTAGCTACAAAGC
TTTTGTTATACAAATCTCACTCTAGATCTGGTTAGTTTTGTTGTGTTGCATATCTCTGGA
CTTCTTGTGTGGATCTCTCTATTTTAGGTTTAACTAAATGGGTAGAGGTTTCTATGGATT
CCTACTATCCGTCTTCATGCCGGCCGTTGCCTTTGTTCATTGTGCTCCAGATTAAGTGGA
TGTAGCTCCTAGTTGCTTGTTCAGATCTTGTGAAGATTTGATTTCGTTGTGGCTTCGTTC
ATTAGCGTTTATCAGTCGTATACGACTCAGCCGTGTGTCCGAAAGTTGACAGAATCTGAA
GGATTCTTCCCTGCCTATTTGTGAAGTTTGTGTTACTTGGCTCTGAGGTGTTTCCTCGTT
GTACTAGGAATGAGTGGTTTTTCGGTGGTTTGGCGAGGGGAATCCACGTTAAACAATTTT
CATAGATTTTCTATCATTTGGATTTCTCTGTTTTGTTGAGAAGACTACCAATTGTCTACG
AATCTTGTTGCTTAGTTTGTTTGTCCGTATAGTTGTTCTGGTTTGTTGTTGTTTGGGGTT
TATGTATCCTTTTATGGGTTTTAGGTTCCGGAGATATTGTGTTGTCTGCCGGCTTAGTTA
ACCATGGACATTCCTTCGTCTGATGGTTATGTATCAGTTTCATCTCATCTATATAATCAG
TTGACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1D012TF U 1
AF RS1D012JQ C 157
BS 1 647 RS1D012TF
BS 648 648 RS1D012JQ
BS 649 684 RS1D012TF
BS 685 685 RS1D012JQ
BS 686 697 RS1D012TF
BS 698 966 RS1D012JQ

RD RS1D012TF 697 0 0
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TCCCACGATCAGTGCGTGGTGGCTCTATCAGCACCGGCACTGGTCCCAGTCTCTATCAGC
AGCGGCGCCGATCCCAATCTATGTCCTTCTTCCTATGTGCTTGGTTGTAGTTTGATTCAT
GACCGATACTTCAATTTGAGAGATATGCTTCGAGCAAATCAACGAAATTCCAGATTTATT
GCAGATTTTTAATAAAAAGGTTCGGATCTGGTGATTAACAGGGTGGCCTAGCTACAAAGC
TTTTGTTATACAAATCTCACTCTAGATCTGGTTAGTTTTGTTGTGTTGCATATCTCTGGA
CTTCTTGTGTGGATCTCTCTATTTTAGGTTTAACTAAATGGGTAGAGGTTTCTATGGATT
CCTACTATCCGTCTTCATGCCGGCCGTTGCCTTTGTTCATTGTGCTCCAGATTAAGTGGA
TGTAGCTCCTAGTTGCTTGTTCAGATCTTGTGAAGATTTGATTTCGTTGTGGCTTCGTTC
ATTAGCGTTTATCAGTCGTATACGACTCAGCCGTGTGTCCGAAAGTTGACAGAATCTGAA
GGATTCTTCCCTGCCTATTTGTGAAGTTTGTGTTACTTGGCTCTGAG*TGTTTCCTCGTT
GTACTAGGAATGAGTGGTTTTTCG*TGGTTTGGCGAG

QA 1 697 1 697
DS 

RD RS1D012JQ 810 0 0
GTGCTTGGTTGTAGTTTGATTCATGACCGATACTTCAATTTGAGAGATATGCTTCGAGCA
AATCAACGAAATTCCAGATTTATTGCAGATTTTTAATAAAAAGGTTCGGATCTGGTGATT
AACAGGGTGGCCTAGCTACAAAGCTTTTGTTATACAAATCTCACTCTAGATCTGGTTAGT
TTTGTTGTGTTGCATATCTCTGGACTTCTTGTGTGGATCTCTCTATTTTAGGTTTAACTA
AATGGGTAGAGGTTTCTATGGATTCCTACTATCCGTCTTCATGCCGGCCGTTGCCTTTGT
TCATTGTGCTCCAGATTAAGTGGATGTAGCTCCTAGTTGCTTGTTCAGATCTTGTGAAGA
TTTGATTTCGTTGTGGCTTCGTTCATTAGCGTTTATCAGTCGTATACGACTCAGCCGTGT
GTCCGAAGGTTGACAGAATCTGAAGGATTCTTCCCTGCCTATTTGTGAAGTTTGTGTTAC
TTGGCTCTGAGGTGTTTCCTCGTTGTACTAGGAATGAGTGGTTTTTCGGTGGTTTGGCGA
GGGGAATCCACGTTAAACAATTTTCATAGATTTTCTATCATTTGGATTTCTCTGTTTTGT
TGAGAAGACTACCAATTGTCTACGAATCTTGTTGCTTAGTTTGTTTGTCCGTATAGTTGT
TCTGGTTTGTTGTTGTTTGGGGTTTATGTATCCTTTTATGGGTTTTAGGTTCCGGAGATA
TTGTGTTGTCTGCCGGCTTAGTTAACCATGGACATTCCTTCGTCTGATGGTTATGTATCA
GTTTCATCTCATCTATATAATCAGTTGACG

QA 1 810 1 810
DS 



AS 1 2

CO CL8197Contig1 881 2 4 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGAGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGATACCAAC
AACAAGAAAGCCTCTTGAGAAAAAAAAATGGATTACTAGTGTTTTTGCTAGAGACAATGG
AGTGAACCAAGAGAAGCCTCCACCGCGAGTGTGTCCAAGGTGTAACTCAACCAACACTAA
GTTCTGTTACTACAACAACTATAGGGTGTCTCAACCGCGCTACAAGTGCAAGGACTGTCT
CCGCCACTGGACTCATGGTGGAGAGCTAAGGAACATACCGATTGGTGGAAGTGGTCGTAA
TATCAATCATACAAGGATAGATCAACCTCTTGTTTCTCAGGCAGTTTCTGCTGGGATCCA
ACAAATAGGTTCTTTTCCTGAAATTCATAGCGATGTGGTGCTTCCACTTCCACCAATGGA
TCACTCTTATTTCCATGATGGATTGTTTCAACAGGATTACTACAACATTGAGTCCAATGC
TTTGATTGTTACATTAATCAAGAGGATCAAAACAAGTGGAACCAGAGATTCAACAATACT
ATGAACCTGAATCATAATGCCAGCACCAGTGGAAGCAGAGTATCTTTGGAGAGTGATCAC
ATGAACAAGAACAACGGCAACATCAAAAACAACTGTGTGTGTAAGTCCTCTTACCATTTG
GAGAAGCATGGTCCTTGAATCTTAGCCGTATTCCTTTAATGTTTTTTGTTGTTTTTCCCT
TCTAAGTGATGAAAGTTTCCGTTGTTCTTTCCCAAAGATTCAGACATAAGTTGATTGTAT
AAATAATATATGTATATGAATATCTATATATGATAGCCGTTTGCTGTAAAGAAAAAAAGA
ATATCTATATATAATCAGTCCGTTATTTGTTTTGCAATCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1A024TF U 1
AF RS1A024TV U 250
BS 1 706 RS1A024TF
BS 707 707 RS1A024TV
BS 708 787 RS1A024TF
BS 788 881 RS1A024TV

RD RS1A024TF 787 0 0
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AACAAGAAAGCCTCTTGAGAAAAAAAAATGGATTACTAGTGTTTTTGCTAGAGACAATGG
AGTGAACCAAGAGAAGCCTCCACCGCGAGTGTGTCCAAGGTGTAACTCAACCAACACTAA
GTTCTGTTACTACAACAACTATAGGGTGTCTCAACCGCGCTACAAGTGCAAGGACTGTCT
CCGCCACTGGACTCATGGTGGAGAGCTAAGGAACATACCGATTGGTGGAAGTGGTCGTAA
TATCAATCATACAAGGATAGATCAACCTCTTGTTTCTCAGGCAGTTTCTGCTGGGATCCA
ACAAATAGGTTCTTTTCCTGAAATTCATAGCGATGTGGTGCTTCCACTTCCACCAATGGA
TCACTCTTATTTCCATGATGGATTGTTTCAACAGGATTACTACAACATTGAGTCCAATGC
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ATGAACCTGAATCATAATGCCAGCACCAGTGGAAGCAGAGTATCTTTGGAGAGTGATCAC
ATGAACAAGAACAACGGCAACATCAAAAACAACTGTGTGTGTAAGTCCTCTTACCATTTG
GAGAAGCATGGTCCTTGAATCTTAGCCGTATTCCTTTAATGTTTTT*GTTGTTTTTCCCT
TCTAAGTGATGAAAGTTTCCGTTGTTCTTTCCCAAAGATTCAGACATAAGTTGATTGTAT
AAATAAT

QA 1 787 1 787
DS 

RD RS1A024TV 632 0 0
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TACAAGGATAGATCAACCTCTTGTTTCTCAGGCAGTTTCTGCTGGGATCCAACAAATAGG
TTCTTTTCCTGAAATTCATAGCGATGTGGTGCTTCCACTTCCACCAATGGATCACTCTTA
TTTCCATGATGGATTGTTTCAACAGGATTACTACAACATTGAGTCCAATGCTTTGATTGT
TACATTAATCAAGAGGATCAAAACAAGTGGAACCAGAGATTCAACAATACTATGAACCTG
AATCATAATGCCAGCACCAGTGGAAGCAGAGTATCTTTGGAGAGTGATCACATGAACAAG
AACAACGGCAACATCAAAAACAACTGTGTGTGTAAGTCCTCTTACCATTTGGAGAAGCAT
GGTCCTTGAATCTTAGCCGTATTCCTTTAATGTTTTTTGTTGTTTTTCCCTTCTAAGTGA
TGAAAGTTTCCGTTGTTCTTTCCCAAAGATTCAGACATAAGTTGATTGTATAAATAATAT
ATGTATATGAATATCTATATATGATAGCCGTTTGCTGTAAAGAAAAAAAGAATATCTATA
TATAATCAGTCCGTTATTTGTTTTGCAATCTG

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 2

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AAGGTAGGGAAAGAAAGAAAGATCATATCCCCCATGAGTTCAATTTTTTTTTGGAGATGA
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ATGTATATATTATTTATTTTGGAAGGTGTTTTTCTCTGTGTGTTTGTCTCTCTCAAAATC
ATTAAGACTTTATTTTGAGAATGTTTGTTATCAGTCACACATGTCTTTGAAGC


BQ
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AF RS1BO13JQ C 1
AF RS1BO13TF U 1
BS 1 533 RS1BO13TF

RD RS1BO13JQ 533 0 0
GGATAAGATAGAAGTTGGAGAGATGCTGCAAGTGGCTTTACTCTGCACTCAGTTCCTTCC
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TATTACCTCTACTGATGCTAATGGAGACAACCAAACCAAACATCTGTTTGGATCCTCAGG
GTTTGATGATGAAGATGATAATCATGCATTAGATTCTTTTGCCATGGAACTATCTGGTCC
AAGGTAGGGAAAGAAAGAAAGATCATATCCCCCATGAGTTCAATTTTTTTTTGGAGATGA
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ATGTATATATTATTTATTTTGGAAGGTGTTTTTCTCTGTGTGTTTGTCTCTCTCAAAATC
ATTAAGACTTTATTTTGAGAATGTTTGTTATCAGTCACACATGTCTTTGAAGC

QA 1 533 1 533
DS 

RD RS1BO13TF 533 0 0
GGATAAGATAGAAGTTGGAGAGATGCTGCAAGTGGCTTTACTCTGCACTCAGTTCCTTCC
AGCGCACAGACCGAAAATGTCTGAAGTGGTTCAGATGCTTGAAGGAGATGGATTAGCTGA
GAGATGGGCTGCTTCACATAACCATTCACATTTCTACCACGCCAACATGTCTTACAGGAG
TATTACCTCTACTGATGCTAATGGAGACAACCAAACCAAACATCTGTTTGGATCCTCAGG
GTTTGATGATGAAGATGATAATCATGCATTAGATTCTTTTGCCATGGAACTATCTGGTCC
AAGGTAGGGAAAGAAAGAAAGATCATATCCCCCATGAGTTCAATTTTTTTTTGGAGATGA
TATAGACATGTAAATTGTATGGAAGTTTGAGATTATGGGGTCTAATGTTTACTATTTTGG
ATGTATATATTATTTATTTTGGAAGGTGTTTTTCTCTGTGTGTTTGTCTCTCTCAAAATC
ATTAAGACTTTATTTTGAGAATGTTTGTTATCAGTCACACATGTCTTTGAAGC

QA 1 533 1 533
DS 



AS 1 2

CO CL8199Contig1 958 2 4 U
GTCCAAAGTTTCGCAGTTTCTGATGTTCTATGCATGTTCACTGGATCCTGAAAACTGTGG
TGTGAAATTTGCGAGTAAGCTGATGGACATTTTTCTCTCCACCAACAAGCCTTGACCTAC
TAGGATGAGTGCGATTGCTTATCTAGCGAGCTACTTGGCACGTGGAAAGTTTTTGCCAGT
TTCCTATGTGGCTACCATGTTAAAAAGGTTGGTAGATGAGTGTGCAGATTACTGTAGAGC
TTGCAATGATGATGTTAGTAGGCCTGAAGCACATCAGATTTTCTATTCCGGATGCCAGGC
GATCATGTATGTGCTCTGCTTCCGGATGAGATCCATCCTAAACGTTCCTCTCTTTCGGTC
CCAGCTTATACCATTGGAGTCAATCTTAATGCACAAACTAAATCCGTTGATGGTATGCCT
TCCATCCGTAGTTGCAGAGTTCCTTAAACAAGCTAAAGCAGGTGGCATGTTCGTCGTCTC
AGACGCCTTCATTTTTGATGACTTACTTGAGTCTGAGCTTTCTCGTGCTTTCGGCGGGTG
TGAGAGGCTTGATACATTCTTCCCCTTTGACCCTTGCTTGCTGAAAAGCTCTAACAGCTA
TATCTCCCCGAATTTCATCTACTGGTCGATGGTGAGACCGACATATGAGGAAGATGACGA
TGATGATGAGGACGATGCTGAGATAATTGTGAACGGGGATGAGGAGAGTGATGAAGAGGA
GGAGGGTGATGTTGAGTACGCCATGAACAAGATGTCCATAACGCCTAAGCACTCTTTCAA
GAACAAGATGGAAAGAGAAAGACTTCTGAAAATGCCTTCCATGATCAGACCTTCCATTAG
TCCTCCTCAATCCTTTTGAGCTTTCTTTTTGGATGGTGGTGAGGGTCTCTCTCAATACGC
ATTTTTGTAGCAATATCTAAACGTGATTGACTCGGAACTTTCTAATATATGAAAACCA


BQ
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AF RS1AM02TF U 1
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BS 1 721 RS1AM02TF
BS 722 722 RS1AM02JQ
BS 723 855 RS1AM02TF
BS 856 958 RS1AM02JQ

RD RS1AM02TF 855 0 0
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TTCCTATGTGGCTACCATGTTAAAAAGGTTGGTAGATGAGTGTGCAGATTACTGTAGAGC
TTGCAATGATGATGTTAGTAGGCCTGAAGCACATCAGATTTTCTATTCCGGATGCCAGGC
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CCAGCTTATACCATTGGAGTCAATCTTAATGCACAAACTAAATCCGTTGATGGTATGCCT
TCCATCCGTAGTTGCAGAGTTCCTTAAACAAGCTAAAGCAGGTGGCATGTTCGTCGTCTC
AGACGCCTTCATTTTTGATGACTTACTTGAGTCTGAGCTTTCTCGTGCTTTCGGCGGGTG
TGAGAGGCTTGATACATTCTTCCCCTTTGACCCTTGCTTGCTGAAAAGCTCTAACAGCTA
TATCTCCCCGAATTTCATCTACTGGTCGATGGTGAGACCGACATATGAGGAAGATGACGA
TGATGATGAGGACGATGCTGAGATAATTGTGAACGGGGATGAGGAGAGTGATGAAGAGGA
G*AGGGTGATGTTGAGTACGCCATGAACAAGATGTCCATAACGCCTAAGCACTCTTTCAA
GAACAAGATGGAAAGAGAAAGACTTCTGAAAATGCCTTCCATGATCAGACCTTCCATTAG
TCCTCCTCAATCCTT

QA 1 855 1 855
DS 

RD RS1AM02JQ 641 0 0
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AGTTCCTTAAACAAGCTAAAGCAGGTGGCATGTTCGTCGTCTCAGACGCCTTCATTTTTG
ATGACTTACTTGAGTCTGAGCTTTCTCGTGCTTTCGGCGGGTGTGAGAGGCTTGATACAT
TCTTCCCCTTTGACCCTTGCTTGCTGAAAAGCTCTAACAGCTATATCTCCCCGAATTTCA
TCTACTGGTCGATGGTGAGACCGACATATGAGGAAGATGACGATGATGATGAGGACGATG
CTGAGATAATTGTGAACGGGGATGAGGAGAGTGATGAAGAGGAGGAGGGTGATGTTGAGT
ACGCCATGAACAAGATGTCCATAACGCCTAAGCACTCTTTCAAGAACAAGATGGAAAGAG
AAAGACTTCTGAAAATGCCTTCCATGATCAGACCTTCCATTAGTCCTCCTCAATCCTTTT
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TAAACGTGATTGACTCGGAACTTTCTAATATATGAAAACCA

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

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AG


BQ
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10 10 

AF RS1GX59TF U 63
AF RS1GB96TF U 1
BS 1 179 RS1GB96TF
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BS 330 330 RS1GX59TF
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GG
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TGCATCTCCGCTTCGGATTTGTCCCCGTGGTCGTGATCTCATCAAAAGAAGCAGCAGAGG
AAGTGCTCAAGACTCACGACCTTGAGTGTTGTAACCGACCAGAGACTGCTGGGATCAGAA
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GG

QA 3 285 3 285
DS 

RD RS1GB96TF 662 0 0
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GTAGTGCATCTCCGCTTCGGATTTGTCCCCATGGTCGTGATCTCATCAAAAGAAGCAGCA
GAGGAAGTGCTCAAGACTCACGACCTTGAGTGTTGTAACCGACCAGAGACTGCCGGGATC
AGAATGATCTCTTACAACGCTAAAGACATTGGGTTTGCGCCTTACGGCGAGGAGTGGAGG
GCCATGAGAAAGCTCTCGGTGGTGGAGCTTTTCAGCTCGAAAAAGATTCAGTCCTTTAGG
TATGTTAGAGAAGAGGAGAATGACTTGTTAGTCAAGAAACTTTCTGAATCTGCTTCGGAG
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GTCGGGCTAGGGCAAACTCTCCATGAGTGTGAGTTCATCGATGAAGATGGTATAGCTGAT
CTTGTGCAAAAGTCTGAGTTGCTCACGAGAACTTCTATGTTCTCTGACTTGTTTCCTGGA
AG

QA 1 662 1 662
DS 



AS 1 2

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AGGACCACACGAACAAAGGAGCTTGGACTAAAGAAGAAGACGATATGCTCGTCTATTACA
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GCGGCAAAAGCTGCCGTCTTCGGTGGATTAACTATCTCCGTCCTGATCTCAAGAGAGGCA
ACTTCACCCTCGAAGAAGACGACCTCATCATCAAACTCCATAGCCTCCTCGGGAACAAAT
GGTCTCTTATTGCGACGAGATTGCCGGGAAGAACGGATAACGAGATTAAGAACTATTGGA
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ACCATGACGAGACCAGACTCCGGTTTGGGAGAGAGAAGTTTAAGTGCACTGCATGCCGTT
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TGGGTTTAAACACTAGTGTTTTGGATTTTTGTAGTTTGGAAATGAACTGAACTGAAATGT
AATGAAAAAATATTACGAATTATGG


BQ
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AF RS1FJ81TF U 1
AF RS1FJ81JQ C 253
BS 1 732 RS1FJ81TF
BS 733 733 RS1FJ81JQ
BS 734 757 RS1FJ81TF
BS 758 925 RS1FJ81JQ

RD RS1FJ81TF 757 0 0
GGAACTTCATCGTCACAAGATCATCATCATCAGATATGGGGAGGTCTCCTTGCTGCGAGA
AGGACCACACGAACAAAGGAGCTTGGACTAAAGAAGAAGACGATATGCTCGTCTATTACA
TCAAGTCTCACGGCGAAGGCTGTTGGCGTTCTCTTCCAAGATCCGCCGGCCTTCTCCGTT
GCGGCAAAAGCTGCCGTCTTCGGTGGATTAACTATCTCCGTCCTGATCTCAAGAGAGGCA
ACTTCACCCTCGAAGAAGACGACCTCATCATCAAACTCCATAGCCTCCTCGGGAACAAAT
GGTCTCTTATTGCGACGAGATTGCCGGGAAGAACGGATAACGAGATTAAGAACTATTGGA
ATACACATGTGAAGAGGAAGCTTTTGAGAGGAGGGATTGATCCCACTACTCATAGGCCAA
TCAACGAGAGCAAAGCTCCTCGTGATTCCTCTGAGCCTAGAGATACAGAGGACTCGCTTG
TAAAGTTTCTCTCTTCCAGTCGTCAGTTGGAGATAAAGGAAAGTTGTGGGGATAAGAGAA
ACAATCAGGAAGAACTGATTTGCAAAGAAGAGAGAGTTGAGTATTCTGTTGTTGAAGAAA
GGTGCTTAGATTTGAATCTCGAGCTTAGAATCAGCCCGCCATGGCAAGACCAACAGCAGC
ACCATGACGAGACCAGACTCCGGTTTGGGAGAGAGAAGTTTAAGTGCACTGCATGCCGTT
TTGGGTTGGGCA*CGGCGACGAGTGCAGCTGCCATAA

QA 1 757 1 757
DS 

RD RS1FJ81JQ 673 0 0
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CGACGAGATTGCCGGGAAGAACGGATAACGAGATTAAGAACTATTGGAATACACATGTGA
AGAGGAAGCTTTTGAGAGGAGGGATTGATCCCACTACTCATAGGCCAATCAACGAGAGCA
AAGCTCCTCGTGATTCCTTTGAGCCTAGAGATACAGAGGACTCGCTTGTAAAGTTTCTCT
CTTCCAGTCGTCAGTTGGAGATAAAGGAAAGTTGTGGGGATAAGAGAAACAATCAGGAAG
AACTGATTTGCAAAGAAGAGAGAGTTGAGTATTCTGTTGTTGAAGAAAGGTGCTTAGATT
TGAATCTCGAGCTTAGAATCAGCCCGCCATGGCAAGACCAACAGCAGCACCATGACGAGA
CCAGACTCCGGTTTGGGAGAGAGAAGTTTAAGTGCACTGCATGCCGTTTTGGGTTGGGCA
ACGGCGACGAGTGCAGCTGCCATAATGTTAAATGTCAGGTCGAAGACAGTACTAGTAGCA
GCTATTTTTCGAGCGACATTAGTTGTAGTGGGGTTGGTTATGACTTCTTGGGTTTAAACA
CTAGTGTTTTGGATTTTTGTAGTTTGGAAATGAACTGAACTGAAATGTAATGAAAAAATA
TTACGAATTATGG

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

CO CL8202Contig1 346 2 1 U
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TATGGCATCACAGTCGTGTAAGGAGATACCTAACACCTGAGAACTGGGCAGTTCCAGAGG
CAAAGGGTAAAGCGTGGTACGGACTGCTGATGCTACTGAGGAAATACCCAGAGCACTTCG
TTATCAACACTAGGTCAAAGGGCAGGGTCGCTCATGAGTTTGTTTCCCTTGTCTCGCTTC
TCTCCTGAAACCACATCCCTTTTATTTTACTTTTTTTTTTCCCTGAACATCAAGTGATAC
CACATCCCATGATAGATTATAAAAATCATGTGCTTGTTAGTGCAGG


BQ
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AF RS1DE53JQ C 1
AF RS1DE53TF U 1
BS 1 346 RS1DE53TF

RD RS1DE53JQ 346 0 0
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CAAAGGGTAAAGCGTGGTACGGACTGCTGATGCTACTGAGGAAATACCCAGAGCACTTCG
TTATCAACACTAGGTCAAAGGGCAGGGTCGCTCATGAGTTTGTTTCCCTTGTCTCGCTTT
TCTCCTGAAACCACATCCCTTTTATTTTACTTTTTTTTTTCCCTGAACATCAAGTGATAC
CACATCCCATGATAGATTATAAAAATCATGTGCTTGTTAGTGCAGG

QA 1 346 1 346
DS 

RD RS1DE53TF 346 0 0
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TATGGCATCACAGTCGTGTAAGGAGATACCTAACACCTGAGAACTGGGCAGTTCCAGAGG
CAAAGGGTAAAGCGTGGTACGGACTGCTGATGCTACTGAGGAAATACCCAGAGCACTTCG
TTATCAACACTAGGTCAAAGGGCAGGGTCGCTCATGAGTTTGTTTCCCTTGTCTCGCTTC
TCTCCTGAAACCACATCCCTTTTATTTTACTTTTTTTTTTCCCTGAACATCAAGTGATAC
CACATCCCATGATAGATTATAAAAATCATGTGCTTGTTAGTGCAGG

QA 1 346 1 346
DS 



AS 1 2

CO CL8203Contig1 523 2 1 U
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ATCACCGGACTCAAGTTCGTTCGACACCGGATTGAAAAGCGCCGCCGGTCTCATCAAAAG
CTCGACCTTTTTATTATATTTTTTTGTTTTTGAGTTAATTGTATTTTGTATTTTTTGTTA
AAACTCATTTTGTTATGTTTCTATTTATTGTATTTTGAGTTAATTGTATTGTATTTGATG
ATTAATTAATTTTTAGGATAATATAATTAATATTTTTTGTATT


BQ
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AF RS1D202JQ C 1
AF RS1D202TF U 1
BS 1 523 RS1D202TF

RD RS1D202JQ 523 0 0
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CCATCACGTTTTGCTTCGGTCTCCAAGAGTCCAAGACTACCATTTCCGACGATCTGAGAA
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GGAGGCTACGGCGTGACGGATTGCTTGCTCATCTCATGACTGGCTTGATCTCGTAAAGGT
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ATCACCGGACTCAAGTTCGTTCGACACCGGATTGAAAAGCGCCGCCGGTCTCATCAAAAG
CTCGACCTTTTTATTATATTTTTTTGTTTTTGAGTTAATTGTATTTTGTATTTTTTGTTA
AAACTCATTTTGTTATGTTTCTATTTATTGTATTTTGAGTTAATTGTATTGTATTTGATG
ATTAATTAATTTTTAGGATAATATAATTAATATTTTTTGTATT

QA 1 523 1 523
DS 

RD RS1D202TF 523 0 0
GGGATGCCTCAGAGTCTCAGACCATCAATTGAAAGGGTAAAAAACATCAAACACCAACTC
CCATCACGTTTTGCTTCGGTCTCCAAGAGTCCAAGACTACCATTTCCGACGATCTGAGAA
ATCGATGGTGTGAAGGAGAAGTGGTGACGCTGACGTGATTAAGCGGAGGCGTGATGAATC
GGAGGCTACGGCGTGACGGATTGCTTGCTCATCTCATGACTGGCTTGATCTCGTAAAGGT
CTCAAGCTCCTCGCTGGAGTCAAGCTCGTCAGTGGTTTCAAGGTCGTTGATGGTCACCTC
ATCACCGGACTCAAGTTCGTTCGACACCGGATTGAAAAGCGCCGCCGGTCTCATCAAAAG
CTCGACCTTTTTATTATATTTTTTTGTTTTTGAGTTAATTGTATTTTGTATTTTTTGTTA
AAACTCATTTTGTTATGTTTCTATTTATTGTATTTTGAGTTAATTGTATTGTATTTGATG
ATTAATTAATTTTTAGGATAATATAATTAATATTTTTTGTATT

QA 1 523 1 523
DS 



AS 1 2

CO CL8204Contig1 683 2 6 U
CGCAGGTAAAAGCAATCTCATGGTGAAGCTTTCAACTTTCTTGACTCTTTCACAATTTTG
TTTCCCCCTCATTCTAGAAACTAAACATGAAAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAAAA
CAAGAAAACCACTGTTCAACTGCATGCAATACCATTGGCTGAAACATAACCTCTAGCAAA
GGCAATTAGCAATTTAAATCGCACCATATGTTCTTTCACTTGGTCTCTGCGTTGGTGCTT
GAGTAAAAAACATGGAAAAGCGGTCCCATGAAACTTCATTGGCAAAGGCATTGTTGATCT
CTTCAGTTCTTGAGTAGCTTTGTCCACTTCCACTCACAGTTTCAAGTAAGCCTGATAAAA
GTGACATGCCCGGCAATGCATCAATCCCACGCACGCGTTCTACTCTTGTTTTGTAAATAA
ATCCTCCACAGCAAAAAAGTGTAAATGCAACGAGGGATACCCAGGAAAATACTCCAAATA
TAGCCCATCCTTTCGCTGATCCTCCTTCAGCACCTTGGTTGTATTCACAGAGTTTTGTGA
GGAAAAACTGAACAGGATCATAACCATCCACTGGGATAGTGACATTGACTTCATACGGAG
TCTTACGAAATTTCTCACAGTTCCAATCCAGCACTAAAGTTGAAGGTGATAACGTTGTTG
GATGATTCCCAGTCAAGGAAGAA


BQ
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15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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TCTTA

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DS 

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AAAAAAA***GTAAAACAAGAAAACCACTGTTCAACTGCATGCAATACCATTGGCTGAAA
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CTCTGCGTTGGTGCTTGAGTAAAAAACATGGAAGAGCGGTCCCATGAAACTTCATTGGCA
AAGGCATTGTTGATCTCTTCAGTTCTTGAGTAGCTTTGTCCACTTCCACTCACAGTTTCA
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CTTGTTTTGTAAATAAATCCTCCACAGCAAAAAAGTGTAAATGCAACGAGGGATACGCAG
GAAAATACTCCAAATATAGCCCATCCTTTCGCTGATCCTCCTTCAGCACCTTGGTTGTAT
TCACAGAGTTTTGTGAGGAAAAACTGAACAGGATCATAACCATCCACTGGGATAGTGACA
TTGACTTCATACGGAGTCTTACGAAATTTCTCACAGTTCCAATCCAGCACTAAAGTTGAA
GGTGATAACGTTGTTGGATGATTCCCAGTCAAGGAAGAA

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DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TTCTCTCTCTCAAATCAAATGGCGGCTCAAACCCTCTTCCAAACGCCGCCTCGATATAGA
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GCCTGAGCTTCAAGCTCGCTTGCTTTCTCTTCTTCAGCTTCTCCAAGAGGGTTTACCAGT
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CTGCCCAAGTGGTTGAGTTCAGAACCTGAATTGTTCTTCGTCGACCTCGAACAAGATCCT
CCACAGATGGTAGAGCAAAGCAAGGAAAGCGATCTAGGGATGCAGCTTAGGTCTATTCAG
AAGCTATTCTCTTCCACATTTCCTTTAGATGGCAGCAACAACGATACCACTACAGCACTT
GATGAAGCCAAGTCTTCTTTATTCATTGATCTTAGCTGTTGTTTACAAGACACTAAGGTT
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TTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RS1FK84TF U 1
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QA 1 766 1 766
DS 

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AAGTTCTAGTACAAAGGAACGGTACAACCGGAGAAGACTCTCATTTAGAAGAGCTAACAA
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TAACAGTTGTTCAGTAGGCTGCTTGGTAACCAGTTTTTATTCATAAGGTAACAGAATCAA
ATCAGTTCC

QA 1 729 1 729
DS 



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GATGTCATCGCGTCGTATCAGTAGAAACGTTATATAATAAGCTGAAATAATTAAATAAAG
TTTGTAATAATAACTGCCGTTACGTTCTAATAAGGTTTGTAATGTGATGACATGAGCGAC
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CGTTACATTTACGGTTTGTGGTATTGTTATTCTCTTTTTTTTGTGGAAAATATATCATGC
TGTAAATACAAAAGTTGTAATCAAATTATAATTAAAGTAGTTATATATAAAAATAATCAT
TTTGTTTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DX31TF U 1
AF RS1DX31JQ C 101
BS 1 626 RS1DX31TF
BS 627 848 RS1DX31JQ

RD RS1DX31TF 626 0 0
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GAAGAGGAAGAACGTTTACAGGGGGATACGTAAGCGACCGTGGGGAAAATGGGCGTCAGA
GATTCGAGATCCAAGAAAAGGCGCAAGAGTCTGGCTCGGGACGTTTAACACGGCGGAGGA
AGCCGCCATGGCTTACGACGTTGCGGCGAAGCGGATCCGCGGCCATAAAGCCAAACTCAA
CCTCCCCGACCATCCTCCTCCTACTCCTAGTCCTGCTACTCCTCTAGCATCGTCTCCAGT
GTCAGAAGTTCAGCCTCCGGCGAAGAAGCTCTGCGTTGTATCTGAGAGCGAGTTGACGAC
TCAGCCGAGCTTCCCGGTGGAGTGCGGTGGATTCGGGAGCGGGGACGAGTTTCAGCTGGA
CTACGATCTGAAACAGCAGATATCGAGCTTGGAGTCTTTCCTTGAGCTGGATGTGACACG
GTGGAGCAACCGGGTCAGTTGGATGAGTCCGTCTCCGAGGTGGATATGTGGATGATTGAT
GATGTCATCGCGTCGTATCAGTAGAAACGTTATATAATAAGCTGAAATAATTAAATAAAG
TTTGTAATAATAACTGCCGTTACGTT

QA 1 626 1 626
DS 

RD RS1DX31JQ 748 0 0
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ACGTTTAACACGGCGGAGGAAGCCGCCATGGCTTACGACGTTGCGGCGAAGCGGATCCGC
GGCCATAAAGCCAAACTCAACTTCCCCGACCATCCTCCTCCTACTCCTAGTCCTGCTACT
CCTCTAGCATCGTCTCCAGTGTCAGAAGTTCAGCCTCCGGCGAAGAAGCTCTGCGTTGTA
TCTGAGAGCGAGTTGACGACTCAGCCGAGCTTCCCGGTGGAGTGCGGTGGATTCGGGAGC
GGGGACGAGTTTCAGCTGGACTACGATCTGAAACAGCAGATATCGAGCTTGGAGTCTTTC
CTTGAGCTGGATGTGACACGGTGGAGCAACCGGGTCAGTTGGATGAGTCCGTCTCCGAGG
TGGATATGTGGATGATTGATGATGTCATCGCGTCGTATCAGTAGAAACGTTATATAATAA
GCTGAAATAATTAAATAAAGTTTGTAATAATAACTGCCGTTACGTTCTAATAAGGTTTGT
AATGTGATGACATGAGCGACTGATGTTATTAATCTGTTTGTCGTTTGTAGTGTGTGGGCG
TTCTTGTGACTCATTTCGAGCGTTACATTTACGGTTTGTGGTATTGTTATTCTCTTTTTT
TTGTGGAAAATATATCATGCTGTAAATACAAAAGTTGTAATCAAATTATAATTAAAGTAG
TTATATATAAAAATAATCATTTTGTTTC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL8208Contig1 677 2 16 U
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ATAAATAAACAAAAGCTCTCTCTCTCTTTCTTTCTGATTGATTGATTGTTTGGTGGGTTC
GACGAAAGCTTTGATCTTTTGCATAAAATGGCGTCTCTTTTAAGCAGATTCTGTCGGAAA
CTGGCTGTTCCGGGCTCAGCTCACGGAGCAAGGATGGTTTCCACGACGACGTCGTGTGGA
TCAGAAACCGTGAAGTCGTTGAACCTCTACTCTGCTATCAACCAAGCTCTTCACATCGCC
TTGGAAACCGATCCTCGCTCTTATGTATTTGGGGAAGATGTTGGGTTTGGTGGAGTCTTC
CGCTGCACAACAGGATTAGCTGAACGGTTCGGCAAAAACCGTGTCTTCAACACTCCTCTT
TGTGAACAAGGCATCGTTGGATTTGGTATTGGTCTAGCAGCAATGGGGAATCGAGCAGTT
GTAGAAATTCAATTTGCAGACTATATTTATCCTGCTTTTGATCAGATTGTTAATGAAGCT
GCAAAGTTCAGATACCGAAGTGGTAACCAATTCAACTGTGGAGGACTTACAACAAGAGCA
CCGTATGGGGCGGTTGGTCATGGTGGACATTACCATTCACAATCCCCTGAGGCTTTCTTC
TGCCATGTCCCTGGCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CY80TF U 1
AF RS1E958TF U 62
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BS 671 677 RS1E958TF

RD RS1CY80TF 675 0 0
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GACGAAAGCTTTGATCTTTTGCATAAAATGGCGTCTCTTTTAAGCAGATTCTGTCGGAAA
CTGGCTGTTCCGGGCTCAGCTCACGGAGCAAGGATGGTTTCCACGACGACGTCGTGTGGA
TCAGAAACCGTGAAGTCGTTGAACCTGTACTCTGCTATCAACCAAGCTCTTCACATCGCC
TTGGAAACCGATCCTCGCTCTTATGTCTTTGGGGAAGATGTTGGGTTTGGTGGAGTCTTC
CGCTGCACAACAGGATTAGCTGAACGGTTCGGGAAAAACCGTGTCTTCAACACTCCTCTT
TGTGAACAAGGCATCGTTGGATTTGGTATTGGTCTAGCAGCAATGGGGAATCGAGCAGTT
GTAGAAATTCAATTTGCAGACTATATTTATCCTGCTTTTGATCAGATTGTTAATGAAGCT
GCAAAGTTCAGATACCGAAGTGGTAACCAATTCAACTGTGGAGGACTTACAATAAGAGCA
CCGTATGGGGCGGTTGGTCATGGTGGACATTACCATTCCCAATCCCCTGAG*CTTTCTTC
TGCCATGTCC
TGGTA

QA 1 670 1 670
DS 

RD RS1E958TF 616 0 0
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TGAACCTCTACTCTGCTATCAACCAAGCTCTTCACATCGCCTTGGAAACCGATCCTCGGT
CTTATGTATTTGGGGAAGGTGTTGGGTTTGGTGGAGTCTTCCGCTGCACAACAGGATTAG
CTGAACGGTTTGGCAAAAACCGTGTCTTCAACACTCCTCTTTGTGAGCA*GGCATTGTTG
GATTTGGTATTGGTCTAGCAGCAATGGGGAATCGAGCAGTTGTAGAAATTCAATTTGCAG
ACTATATTTATCCTGCTTTTGATCAGATTGTTAATGAAGCTGCAAAGTTCAGATACCGAA
GTGGTAACCAGTTCAACTGTGGAGGACTTACAACAAGAGCACCGTATGGGGCGGTTGGTC
ATGGTGGACATTACCATTCACAATCCCCTGAGGCTTTCTTCTGCCATGTCCCTGGCAT

QA 19 616 19 616
DS 



AS 1 2

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GGATCGTTGTTTTTGCTACTTGCTAGTGGTGTTTATGTCTGATCCTTCTTCCTCAAATAC
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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1GL48JQ C 1
AF RS1GL48TF U 1
BS 1 468 RS1GL48TF

RD RS1GL48JQ 468 0 0
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ACACCGATTGCGAGTCCGATTGCGGTGGCGATGTACCCGACTTTATCGGTGTTCACTCTG
GCCATTGGCCTCGTCATTACCGCTTTTTTCTTCATCTATGAAGCTACATCATCCAGGAAA
AACCGTAGTCTCGGGATGGAGCTTGCGACCGCGGCAGTAGCATCTGTTTTCTTGGGATTT
GGATCGTTGTTTTTGCTACTTGCTAGTGGTGTTTATGTCTGATCCTTCTTCCTCAAATAC
TATTCCCAGCTAGTTTCAATGAACAAAAGAAAAAAAAACAGACTTTTATTTTCTGTCCAA
CTTAAATTCAGAGTTATGAATGTTAAAGACTCTTGATTGTCTTTGTTTTAACGCTAAACG
TAGTTTTGATGTGGCCGCTATTATAACAGCGTTTTGCGTCAGTTAAGC

QA 1 468 1 468
DS 

RD RS1GL48TF 468 0 0
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ACACCGATTGCGAGTCCGATTGCGGTGGCGATGTACCCGACTTTATCGGTGTTCACTCTG
GCCATTGGCCTCGTCATTACCGCTTTCTTCTTCATCTATGAAGCTACATCATCCAGGAAA
AACCGTAGTCTCGGGATGGAGCTTGCGACCGCGGCAGTAGCATCTGTTTTCTTGGGATTT
GGATCGTTGTTTTTGCTACTTGCTAGTGGTGTTTATGTCTGATCCTTCTTCCTCAAATAC
TATTCCCAGCTAGTTTCAATGAACAAAAGAAAAAAAAACAGACTTTTATTTTCTGTCCAA
CTTAAATTCAGAGTTATGAATGTTAAAGACTCTTGATTGTCTTTGTTTTAACGCTAAACG
TAGTTTTGATGTGGCCGCTATTATAACAGCGTTTTGCGTCAGTTAAGC

QA 1 468 1 468
DS 



AS 1 2

CO CL8210Contig1 664 2 7 U
GAACAAAAACATAGAAACTTTATTGAATTTTATCATAATGTCGATGAAAATGCTTATACA
AAATACTCATCACATGTTTTACTTTTAACGCTCGATTTGTATAGTGACATGACTGAAATT
ATACTCCCTGCGGATGTAATCAATAACCTTGTTGAGCACCATATCAGCATCTGCTTCTGG
TGTGATATTAACATGGCAAGCAAGCAGCACTTTCCCCACAGTGATAGCCCAAATGTGAAG
CTCATGAACAGCCACCACCTCTTCCATCTCCAGCAAACCCTTTTCCAGCTTCGTGGCGTC
AATCTCTCTCGGTGTACTCTCCATCAACACCTCAAGAATGCTTCTGATCATGTTGATGGT
TGTCCCCAAGACAATAACGGAAAAGACAAGCGTGCAGATGAGATCAACTATCTTCCACTC
CGGTTTGTACCAAATGACAGCTCCACCGATCATAACACCAACGCTCTGGATGGAGTCTCC
GAGGACATGGAGATAAGCTCCTTGGACATTGATGTTCCTCTTCCTCTTCTCTGATTTGTC
CAGCAACTGCTCAGTCACATCCCCATGAGCGTGATGATGCTTGTCCTCTCCATGACTATG
ACCATGATCATGACCATGATGATGAGTTGTAACCGTCACCCCACGACTGTGATGGTCATG
ACCG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 

AF RS1FW21JQ U 55
AF RS1CY95JQ U 1
BS 1 68 RS1CY95JQ
BS 69 69 RS1FW21JQ
BS 70 114 RS1CY95JQ
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BS 116 116 RS1CY95JQ
BS 117 117 RS1FW21JQ
BS 118 664 RS1CY95JQ

RD RS1FW21JQ 208 0 0
TATACAAAATACTCATCACATGTTTTACTTTTAACGCTCGATTTGTATAGTGACATGACT
GAAATTATACTCCCTGCGGATGTAATCAATAACCTTGTTGAGCACCATATCAGCATCTGC
TTCTGGTGTGATATTAACATGGCAAGCAAGTAGCACTTTCCCCACAGTGATAGCCCAAAT
GTGAAGCTCATGAACAGCCACCAC
TTCT

QA 1 204 1 204
DS 

RD RS1CY95JQ 664 0 0
GAACAAAAACATAGAAACTTTATTGAATTTTATCATAATGTCGATGAAAATGCTTATACA
AAATACTCTTCACATGTTTTACTTTTAACGCTCGATTTGTATAGTGACATGACTTATATT
ATACTCCCTGCGGATGTAATCAATAACCTTGTTGAGCACCATATCAGCATCTGCTTCTGG
TGTGATATTAACATGGCAAGCAAGCAGCACTTTCCCCACAGTGATAGCCCAAATGTGAAG
CTCATGAACAGCCACCACCTCTTCCATCTCCAGCAAACCCTTTTCCAGCTTCGTGGCGTC
AATCTCTCTCGGTGTACTCTCCATCAACACCTCAAGAATGCTTCTGATCATGTTGATGGT
TGTCCCCAAGACAATAACGGAAAAGACAAGCGTGCAGATGAGATCAACTATCTTCCACTC
CGGTTTGTACCAAATGACAGCTCCACCGATCATAACACCAACGCTCTGGATGGAGTCTCC
GAGGACATGGAGATAAGCTCCTTGGACATTGATGTTCCTCTTCCTCTTCTCTGATTTGTC
CAGCAACTGCTCAGTCACATCCCCATGAGCGTGATGATGCTTGTCCTCTCCATGACTATG
ACCATGATCATGACCATGATGATGAGTTGTAACCGTCACCCCACGACTGTGATGGTCATG
ACCG

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

CO CL8211Contig1 939 2 2 U
GGCTATATTGAAGCTAATGGATGCTGTTGATGAATACATTCCCGACCCTGTTCGTGTGCT
CGACAAACCTTTCTTGATGCCTATCGAAGATGTTTTCTCGATTCAAGGACGTGGAACTGT
TGCGACGGGTCGTATTGAACAAGGAGTCATCAAAGTGGGTGAAGAAGTTGAGATATTGGG
TTTAAAAGACGGACCTCCAATGAAATCAACTGTAACTGGGGTTGAGATGTTCAAGAAGAT
TTTGGATAATGGACAGGCTGGTGATAATGTAGGACTTCTTCTGCGTGGGCTAAAGAGAGA
AGACATCCAGCGTGGAATGGTGAAGCTTAGGCATCCTTATTACGACTAGTGTGTGATTGA
ATATGAGAACCCTAATACTTGCTTCACTCTCTATATGGTTTACATTTTAGGTGATTGCTA
AGCCCGTTTCATGCAAGACATACAAGAAGTTTGAAGCAGAGATTTATGTGCTCACAAAGG
ACGAAGGTGGGCGTCACACTGCTTTTTTGTCCAACTACAGGCCTCAGTTTTACTTGAGGA
CTGCAGATATCACTGGAAGGGTAGAGTTACCGGAAGAAGTGAAGATGGTTATGCCTGGTG
ACAATGTCACTGCGGTTTTCGAGCTTATCATGCCTGTCCCACTCGAAATAGGTCAAAGAT
TTGCCCTGAGGGAAGGAGGTAGAACAGCTGGAGCTGGTGTTGTATCTAAAGTGATGACTT
GAGAGTTCTCAAAAGGCACATTCTTACGTTTTCTCTAGGAACCCATCAGTGATGTGTTTT
GTTTCCTTTTGGTTTCACTGCTTTGAAATAAAACATAAACATATTTTAAGTTACCAACGA
GAAGATTAGTATTTTCTGCAATTGTTTAGTATTTTAATATGTTTTGAGTTTTAACTATTC
CATTTTTTTCTAATTTCCTCTATACACGTGATTATATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AT66TF U 1
AF RS1AT66JQ C 101
BS 1 643 RS1AT66TF
BS 644 939 RS1AT66JQ

RD RS1AT66TF 643 0 0
GGCTATATTGAAGCTAATGGATGCTGTTGATGAATACATTCCCGACCCTGTTCGTGTGCT
CGACAAACCTTTCTTGATGCCTATCGAAGATGTTTTCTCGATTCAAGGACGTGGAACTGT
TGCGACGGGTCGTATTGAACAAGGAGTCATCAAAGTGGGTGAAGAAGTTGAGATATTGGG
TTTAAAAGACGGACCTCCAATGAAATCAACTGTAACTGGGGTTGAGATGTTCAAGAAGAT
TTTGGATAATGGACAGGCTGGTGATAATGTAGGACTTCTTCTGCGTGGGCTAAAGAGAGA
AGACATCCAGCGTGGAATGGTGAAGCTTAGGCATCCTTATTACGACTAGTGTGTGATTGA
ATATGAGAACCCTAATACTTGCTTCACTCTCTATATGGTTTACATTTTAGGTGATTGCTA
AGCCCGTTTCATGCAAGACATACAAGAAGTTTGAAGCAGAGATTTATGTGCTCACAAAGG
ACGAAGGTGGGCGTCACACTGCTTTTTTGTCCAACTACAGGCCTCAGTTTTACTTGAGGA
CTGCAGATATCACTGGAAGGGTAGAGTTACCGGAAGAAGTGAAGATGGTTATGCCTGGTG
ACAATGTCACTGCGGTTTTCGAGCTTATCATGCCTGTCCCACT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RS1AT66JQ 839 0 0
CGATCAA
GACGTGGAACTGTTGCGACGG*TCGTAT*GAACA*GGAGTCATCAAAGTGGGTGAAGAAG
TTGAGATATTGGGTTTAAAAGACGGACCTCCAATGAAATCAACTGTAACTGGGGTTGAGA
TGTTCAAGAAGATTTTGGATAATGGACAGGCTGGTGATAATGTAGGACTTCTTCTGCGTG
GGCTAAAGAGAGAAGACATCCAGCGTGGAATGGTGAAGCTTAGGCATCCTTATTACGACT
AGTGTGTGATTGAATATGAGAACCCTAATACTTGCTTCACTCTCTATATGGTTTACATTT
TAGGTGATTGCTAAGCCCGTTTCATGCAAGACATACAAGAAGTTTGAAGCAGAGATTTAT
GTGCTCACAAAGGACGAAGGTGGGCGTCACACTGCTTTTTTGTCCAACTACAGGCCTCAG
TTTTACTTGAGGACTGCAGATATCACTGGAAGGGTAGAGTTACCGGAAGAAGTGAAGATG
GTTATGCCTGGTGACAATGTCACTGCGGTTTTCGAGCTTATCATGCCTGTCCCACTCGAA
ATAGGTCAAAGATTTGCCCTGAGGGAAGGAGGTAGAACAGCTGGAGCTGGTGTTGTATCT
AAAGTGATGACTTGAGAGTTCTCAAAAGGCACATTCTTACGTTTTCTCTAGGAACCCATC
AGTGATGTGTTTTGTTTCCTTTTGGTTTCACTGCTTTGAAATAAAACATAAACATATTTT
AAGTTACCAACGAGAAGATTAGTATTTTCTGCAATTGTTTAGTATTTTAATATGTTTTGA
GTTTTAACTATTCCATTTTTTTCTAATTTCCTCTATACACGTGATTATATAC

QA 8 839 8 839
DS 



AS 1 2

CO CL8212Contig1 846 2 2 U
GATTGACGACGAACCAACAAGAATCGAGGTTGAGGGAAGAGCAGAGGTCATGTACGGATC
ATCTAGAGGGGGCATGATGTTTGGGAGCGGGGTGGGCTCAAAGAGACAAAGAATGATGCA
ATCAAATCCCTCCTACTTGGCAGTTGGCACATTCCCTGTCGTTCGCCTCCGTGGTCTTCC
CTTCAACTGCGCTGACATGGACATCTTCAACTTCTTTACCGGCCTCAACATTGTCGATGT
CTTGCTCGTCACCAAAAACGGCAAATTCTCCGGGGAGGCCTTTGTCGTCTTTGCTGGTCC
AATGCAAGTCGAGATTGCACTCCAGAGGGACAGGCAGAATATGGGTAGGAGATACGTGGA
AGTTTTCCGATGCTATAAGCAGGATTACTACAACGCGGTTGCCGCTGAGGAGGGCGCAGC
ATATGAATACAATCTTAGCCCTCCTCCCGCTAGATCACAACAGAGGTTTAGCGAGAAAGA
GAAGCTCGAGTACACTGAGGTTTTGAAGATGCGAGGCCTCCCCTACTCTGCCAACAAGCC
TCAAATCATTGAGTTTTTCAGCGGGTACAAGGTTATTGAAGGAAGGGTACATGTTGTGTG
TCGACCTGATGGTAAAGCCACGGGTGAGGCCTATGTTGAGTTTGAGACAGCTGAGGAGGC
AAGGAGGGCCATGGCTAAAGACAAAATGTCCATTGGCCCAAGGTACGTGGAGCTATTTCC
AACTACTCGTGAAGAGGCTCGAAGAGCTGAGCCGAGGTCTAGGCGATGATGATGACGACA
TTGTCCTTTACTATTATGATGTATCATTATTATATATCCTGTGGACTAATTTTGCTAGGT
AAAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1CU47TF U 1
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BS 699 846 RS1CU47JQ

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ATCAAATCCCTCCTACTTGGCAGTTGGCACATTCCCTGTCGTTCGCCTCCGTGGTCTTCC
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CTTGCTCGTCACCAAAAACGGCAAATTCTCCGGGGAGGCCTTTGTCGTCTTTGCTGGTCC
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AAGGAGGGCCATGGCTAAAGACAAAATGTCCATTGGCC

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DS 

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GTCG
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GGGTAGGAGATACGTGGAAGTTTTCCGATGCTATAAGCAGGATTACTACAACGCGGTTGC
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CTACTCTGCCAACAAGCCTCAAATCATTGAGTTTTTCAGCGGGTACAAGGTTATTGAAGG
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GGACTAATTTTGCTAGGTAAAACC

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DS 



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TAATGATTTTACG


BQ
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AF RS1F125TF U 1
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BS 1 631 RS1F125TF
BS 632 733 RS1F125JQ

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AAGGGTGTTGCTACGTCTCTTGCTCCAGGTGGACCATGTAGCTTCAACGGACTGTAGCAG
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AAATAAAGTGTTGTATTTATCATGTCGTTCC

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TTGATTTGAGTAAATAATATAATCGTAATGATTTTACG

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

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GCCGCCGTTTTTATGATAAGTATCCCTTGGAATAAACTACGTATGGATGATCATGTGTGC
TCGATGATATAAATTATTAGTATTTTATGGAAGTTTAATAAAATATATCTCGTGTTAGTG
TAACTCAATGTTGATCTAATAAATAAAGTATCTATTTGAGTTCT


BQ
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AF RS1F204JQ C 1
AF RS1F204TF U 1
BS 1 524 RS1F204TF

RD RS1F204JQ 524 0 0
GGGGAGAAAGAAGCATACAAGAAAGGAAAAAACACATAAACAAATGACTTCTTCAGTAAC
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CCACCTCAGTGATCAGAAGCCTGCCGATGAAATGAAATACCTGTTTCCACCTGGATTGCC
TTTCACCGGGGTTCCTCCGTTACCGACACTTTTTCCTCCGTTCCCCGGAAACGTTCCACG
TTTTCCGTTTCCGTTTCCATCGCAGTCATCACCTCCGGCATCTCTTCCCGGTTTACCTGG
CGTTACCCTTCCTCCCCTGCCGTTCCTCACGCCGCCACCTGAGTGATTCTATAGGTTATC
GCCGCCGTTTTTATGATAAGTATCCCTTGGAATAAACTACGTATGGATGATCATGTGTGC
TCGATGATATAAATTATTAGTATTTTATGGAAGTTTAATAAAATATATCTCGTGTTAGTG
TAACTCAATGTTGATCTAATAAATAAAGTATCTATTTGAGTTCT

QA 1 524 1 524
DS 

RD RS1F204TF 524 0 0
GGGGAGAAAGAAGCATACAAGAAAGGAAAAAACACATAAACAAATGACTTCTTCAGTAAC
CACTTTAGCCCTAACCCTAGTTCTGATCTTCCACCTCACGCCGGAAACAACCGCAGCTCG
CCACCTCAGTGATCAGAAGCCTGCCGATGAAATGAAATACCTGTTTCCACCTGGATTGCC
TTTCACCGGGGTTCCTCCGTTACCGACACTTTTTCCTCCGTTCCCCGGAAACGTTCCACG
TTTTCCGTTTCCGTTTCCATCGCAGTCATCACCTCCGGCATCTCTTCCCGGTTTACCTGG
CGTTACCCTTCCTCCCCTGCCGTTCCTCACGCCGCCACCTGAGTGATTCTATAGGTTATC
GCCGCCGTTTTTATGATAAGTATCCCTTGGAATAAACTACGTATGGATGATCATGTGTGC
TCGATGATATAAATTATTAGTATTTTATGGAAGTTTAATAAAATATATCTCGTGTTAGTG
TAACTCAATGTTGATCTAATAAATAAAGTATCTATTTGAGTTCT

QA 1 524 1 524
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8216Contig1 606 2 2 U
GGAACGAACGAGAACGACTTTGACACGGTGTTTCTCTGTTTAGCTCCCAAATCGCCAAGA
GTCCATCCTTCGTCTCTCTCCAGTCCACCGCCGAGAGTCGATCAAGAGTTCGATCTCCGT
TGATCACACATGGCTATGACCATCGAAGTACTTGCTGGACTTGCTTTCATGTTTTCATCT
AGTATCCTTCTCCAGATCCTGGCGTGTGCTTTATATAGTAACTGGTGGCCAATGCTTTCA
GCACTCATGTATGTGGTAGTGCCTATGCCTTGTATGTTCTTTGGAGGAGGCTCGACGCAG
TTCTTAATTAGTCGAGATGGTGGAGGGTGGATAGATGCAGCAAAGTTCTTGACAGGAGCA
TCAACAGTAGGAAGCCTGGCGATTCCAATCATATTAAGGCATGCAGGAATGATCGAGACG
GGTGCAATGCTCATAGAGTTCACATCGTTCTTCGTATTCATCTGCACTGTCATGTGTTTT
CACCGGGCTAGCCTCGATGATTATGATTGGTAACTAACAGCTAAGTTGTTGGTGGTGATT
TACTAATTGATCTTATATCCCTCCTTTGTATCAATCAGTGTCTGTAAAAAAAGTTTTTTA
TTCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 

AF RS1EX86TF U 1
AF RS1EX86JQ C 80
BS 1 603 RS1EX86TF
BS 604 606 RS1EX86JQ

RD RS1EX86TF 606 0 0
GGAACGAACGAGAACGACTTTGACACGGTGTTTCTCTGTTTAGCTCCCAAATCGCCAAGA
GTCCATCCTTCGTCTCTCTCCAGTCCACCGCCGAGAGTCGATCAAGAGTTCGATCTCCGT
TGATCACACATGGCTATGACCATCGAAGTACTTGCTGGACTTGCTTTCATGTTTTCATCT
AGTATCCTTCTCCAGATCCTGGCGTGTGCTTTATATAGTAACTGGTGGCCAATGCTTTCA
GCACTCATGTATGTGGTAGTGCCTATGCCTTGTATGTTCTTTGGAGGAGGCTCGACGCAG
TTCTTAATTAGTCGAGATGGTGGAGGGTGGATAGATGCAGCAAAGTTCTTGACAGGAGCA
TCAACAGTAGGAAGCCTGGCGATTCCAATCATATTAAGGCATGCAGGAATGATCGAGACG
GGTGCAATGCTCATAGAGTTCACATCGTTCTTCGTATTCATCTGCACTGTCATGTGTTTT
CACCGGGCTAGCCTCGATGATTATGATTGGTAACTAACAGCTAAGTTGTTGGTGGTGATT
TACTAATTGATCTTATATCCCTCCTTTGTATCAATCAGTGTCTGTAAAAAAAGTTTTTTA
TTC
ACC

QA 1 603 1 603
DS 

RD RS1EX86JQ 527 0 0
CCAGTCCACCGCCGAGAGTCGATCAAGAGTTCGATCTCCGTTGATCACACATGGCTATGA
CCATCGAAGTACTTGCTGGACTTGCTTTCATGTTTTCATCTAGTATCCTTCTCCAGATCC
TGGCGTGTGCTTTATATAGTAACTGGTGGCCAATGCTTTCAGCACTCATGTATGTGGTAG
TGCCTATGCCTTGTATGTTCTTTGGAGGAGGCTCGACGCAGTTCTTAATTAGTCGAGATG
GTGGAGGGTGGATAGATGCAGCAAAGTTCTTGACAGGAGCATCAACAGTAGGAAGCCTGG
CGATTCCAATCATATTAAGGCATGCAGGAATGATCGAGACGGGTGCAATGCTCATAGAGT
TCACATCGTTCTTCGTATTCATCTGCACTGTCATGTGTTTTCACCGGGCTAGCCTCGATG
ATTATGATTGGTAACTAACAGCTAAGTTGTTGGTGGTGATTTACTAATTGATCTTATATC
CCTCCTTTGTATCAATCAGTGTCTGTAAAAAAAGTTTTTTATTCCCC

QA 1 527 1 527
DS 



AS 1 2

CO CL8217Contig1 771 2 1 U
GATATGTGTGAATAGATCACATAGTATTATCAATACTAATCTCATGGAGTCATCAGATGT
TACAAAACCAGCTTATATGATATTATAAATCATGTCTCTGACCTCTGAAACCCCCATAAC
TACTACATGCATTATTGCTGTGACTTTCTTCTGTTGAATCCAGACATAGCACTATGATCT
ATAAATCTAGAGTCCTTCATAGAGCTACAAAGAATATGTTACCCTGATGCCAACAAAAAA
TCAGCAAGGTTCCGACCGCCTGCGTGATGAATCTGAACCTATCGTAATGTTTAACAGATA
TGTATGTCATTTCACTTGATGCCGAGGAACTCTAGTCCAACTGCGGTTGGAGTCAACCCG
TAAAGAGCCAAGTACTGAGGGTCATGAAACTTGTTTAGATGCCTCATTCCGCTATCGCAA
AGAATGGTGACAATTGTGTGACCAGGACCAAGAGATTGAGCCACCCTCACTGCCCCCACA
CAGTTCATAGCTGAGGAGCTTCCAACAAAGAGCCCATCTTTCTTCAGAAGAAACCTAGAC
ATCTCAACGGCTTCTTTATCAGTACCACGGAAACCACCATCAATTTTCGCCATCAGGAAA
TTCTGAGTAAGCCTATTGATTCCAATACCTTCTGTAATTGTATCAAATGGGTTTTTCAGA
CGACGTCCTTCAGCTTCCTCTCTTGTGTACATCACTCCCCTTGTTACTTTGTTGTACAGA
CCAGACCCAGGAGGATCGATCAGGAAGGTTTTAACCTTTTCATTCTTTTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F994JQ U 1
AF RS1F506JQ U 1
BS 1 771 RS1F506JQ

RD RS1F994JQ 523 0 0
GATATGTGTGAATAGATCACATAGTATTATCAATACTAATCTCATGGAGTCATCAGATGT
TACAAAACCAGCTTATATGATATTATAAATCATGTCTCTGACCTCTGAAACCCCCATAAC
TACTACATGCATTATTGCTGTGACTTTCTTCTGTTGAATCCAGACATAGCACTATGATCT
ATAAATCTAGAGTCCTTCATAGAGCTACAAAGAATATGTTACCCTGATGCCAACAAAAAA
TCAGCAAGGTTCCGACCGCCTGCGTGATGAATCTGAACCTATCGTAATGTTTAACAGATA
TGTATGTCATTTCACTTGATGCCGAGGAACTCTAGTCCAACTGCGGTTGGAGTCAACCCG
TAAAGAGCCAAGTACTGAGGGTCATGAAACTTGTTTAGATGCCTCATTCCGCTATCGCAA
AGAATGGTGACAATTGTGTGACCAGGACCAAGAGATTGAGCCACCCTCACTGCCCCCACA
CAGTTCATAGCTGAGGAGCTTCCAACAAAGAGCCCATCTTTCT

QA 1 523 1 523
DS 

RD RS1F506JQ 771 0 0
GATATGTGTGAATAGATCACATAGTATTATCAATACTAATCTCATGGAGTCATCAGATGT
TACAAAACCAGCTTATATGATATTATAAATCATGTCTCTGACCTCTGAAACCCCCATAAC
TACTACATGCATTATTGCTGTGACTTTCTTCTGTTGAATCCAGACATAGCACTATGATCT
ATAAATCTAGAGTCCTTCATAGAGCTACAAAGAATATGTTACCCTGATGCCAACAAAAAA
TCAGCAAGGTTCCGACCGCCTGCGTGATGAATCTGAACCTATCGTAATGTTTAACAGATA
TGTATGTCATTTCACTTGATGCCGAGGAACTCTAGTCCAACTGCGGTTGGAGTCAACCCG
TAAAGAGCCAAGTACTGAGGGTCATGAAACTTGTTTAGATGCCTCATTCCGCTATCGCAA
AGAATGGTGACAATTGTGTGACCAGGACCAAGAGATTGAGCCACCCTCACTGCCCCCACA
CAGTTCATAGCTGAGGAGCTTCCAACAAAGAGCCCATCTTTCTTCAGAAGAAACCTAGAC
ATCTCAACGGCTTCTTTATCAGTACCACGGAAACCACCATCAATTTTCGCCATCAGGAAA
TTCTGAGTAAGCCTATTGATTCCAATACCTTCTGTAATTGTATCAAATGGGTTTTTCAGA
CGACGTCCTTCAGCTTCCTCTCTTGTGTACATCACTCCCCTTGTTACTTTGTTGTACAGA
CCAGACCCAGGAGGATCGATCAGGAAGGTTTTAACCTTTTCATTCTTTTCC

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 2

CO CL8218Contig1 1024 2 10 U
GAGAAACTCTTTTGCTCCAAGCCATGGTAGCAAGGACGAGTACGAGACAGAGACCCACAG
TATGAGCAGTTTCAGCAGTCCAAGTCACGCTCACGAGGCTGTCTCGCTTAGTCCTCTCCC
TCAGTATCATACTGCTGGCCCCCGCTTTGCTGCAGGGGCCTCATCGAATGCTCCAAGGCC
ACCTCTCAATTCAGCAACCAGTCACATGATCCACTCAACCTTTGATGAAAAGATAATGCA
GAAAGGAAACAAGGCAGATCCATTGTTACACCCTGCTCCTGCTCCTGCAGCTTCTCTTCT
GATAGATGTGAGAAGAACATCAGTTGTTTGGGACCAAGAAGCAGGTAGATACGTATCAGT
ACCTGCTACAACATCTGAGGCAAGAACCAGATTAACTTCACATCACCAGCCAATTCCTAG
CTCACACACTCAGAATCCAAGATCCGTTCTTCCACCTCAAGATTCTTCTTCATCAGGGAA
AGCTCCTCCTCATCCTCCCCTTCCACCTCAGCAAGGAGAGAGACTGATGTATACAGGTGA
CTCTATCTTCTTTGGAGGTCCGCTGGTATATATCCCGAACAGAGATGGCCTAAGAAACGA
AGGTGACTCGGGAAGAGAAGGGCAAGACAGAATGACATTGGCGTTACCTCGGGAAGCTTG
ATTCAAAAGAGACACAACCTCAAACCAGCTTCCAGTGTTTGCCCTTTGGGTACCCGCAAG
TAGACACCAATAACTATTTCAAGGAGTATGTTCTCATCGATCTGCGACTGTCAGGGTAAG
AGGACATGTAGCTGTTTTGACAGTCAAAACTCATGGAGTTCGCTCAGCAGTTGCAGGAAA
GTTTAATGGGGGTTGATTGAATCTTTTGAGTATTTGATTATTGAGAGGTGTGCGGAGGAC
TTTATGAGGTAGAAAGTAGAAATCCTTTGTGAACATTTTTTCCACGGGTTTAAGCCTTAT
CTTACTTCATTGCGTCGTATTTTTCGCTTTAAGGACCAGTTTGTTGTATGACTCCATCAA
TCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 

AF RS1F826TF U 1
AF RS1F826JQ C 278
BS 1 727 RS1F826TF
BS 728 728 RS1F826JQ
BS 729 774 RS1F826TF
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BS 799 808 RS1F826TF
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BS 810 834 RS1F826TF
BS 835 1024 RS1F826JQ

RD RS1F826TF 834 0 0
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QA 1 834 1 834
DS 

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TCCTGCT
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CTTCTTCATCAGGGAAAGCTCCTCCTCATCCTCCCCTTCCACCTCAGCAAGGAGAGAGAC
TGATGTATACAGGTGACTCTATCTTCTTTGGAGGTCCGCTGGTATATATCCCGAACAGAG
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TACCTCGGGAAGCTTGATTCAAAAGAGACACAACCTCAAACCAGCTTCCAGTGTTTGCCC
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CAGCAGTTGCAGGAAAGTTTAATGGGGGTTGATTGAATCTTTTGAGTATTTGATTATTGA
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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1H609TF U 1
AF RS1H609JQB C 182
BS 1 689 RS1H609TF
BS 690 703 RS1H609JQB

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ATTCCCTTTCAACATCGACAGACAACACTGGGTTGGAGTTTGCATCGATGCTAAAGCATG
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GCTTAACCCAATTGCTAACCTCATCCCATATGTTCTTAAGTACAATGGCTATCCCGAAAA
CAACGCGGGGTTGAAGGCTTTTGCAGTGACCAGGTGCAAGGATATACCTCAGACTTCCAG
TAAGATAGATGCAGCAGTCATGACTGTTCTTCTGATCGAAGCTCATGCTGCGGATGGTCT
GGATGGTTGCAAGGCTATCACTCCTCGTCTGCTTCCCGATGCATCCAAGCAATTGGCCGT
CAAATACATCGAGTCCCTCTCTCGTTAATGTTTTTTCCTCCTTATCTCTTTGACTTATTT
CGGTATTCAGAAGCTTATGTGCTTTTGTGTTTTAGTACTTTGTTTTTAAGACCCACAACT
CTATGGAACTTACTTATCTAATGCCTAAA

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1H609JQB 522 0 0
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ATGATTTATGTGCTGCACTGCAACACCTCCCTTAGAAGCGACAGCATGGTGAAGAAAGAG
CTTAACCCAATTGCTAACCTCATCCCATATGTTCTTAAGTACAATGGCTATCCCGAAAAC
AACGCGGGGTTGAAGGCTTTTGCAGTGACCAGGTGCAAGGATATACCTCAGACTTCCAGT
AAGATAGATGCAGCAGTCATGACTGTTCTTCTGATCGAAGCTCATGCTGCGGATGGTCTG
GATGGTTGCAAGGCTATCACTCCTCGTCTGCTTCCCGATGCATCCAAGCAATTGGCCGTC
AAATACATCGAGTCCCTCTCTCGTTAATGTTTTTTCCTCCTTATCTCTTTGACTTATTTC
GGTATTCAGAAGCTTATGTGCTTTTGTGTTTTAGTACTTTGTTTTTAAGACCCACAACTC
TATGGAACTTACTTATCTAATGCCTAAACTAAAAATTTTCCT

QA 1 522 1 522
DS 



AS 1 2

CO CL8220Contig1 1203 2 4 U
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ATAGTTCCGTACGATCCAAAAGAAAGAGAGAGAGATGGCCGAGGAGAAGAAAGTAGCACC
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TGCAGCTAGTGTGACCTCGACCATGTTGAAGAATGAAGGTATCGGTGCCTTCTACAAGGG
ATTATCAGCTGGTTTGCTGAGGCAAGCAACTTACACCACAGCCCGTCTTGGATCATTCAA
GATGCTGACTGCGAAAGCAAGTGAGGCTAATGATGGGAAACCACTACCGCTGTATCAGAA
GGCTCTATGTGGTCTGACAGCTGGTGCAATCGGTGCCTGCGTTGGTAGTCCAGCGGATCT
AGCGCTTATCAGAATGCAAGCTGATAACACTCTGCCCTTAGCTCAGCGCAGGAATTACAC
CAACGCCTTCCACGCGCTTTACCGTATCAGCGCTGATTAAGGAGTTTTGGCGCTTTGGAA
AGGTTGTGGGCCGACGGTGGTCAGAGCTATGGCTTTGAACATGGGGATGCTTGCGTCTTA
TGATCAGAGTGTTGAATACATGAGAGATAATCTTGGTCTTGGGGAGACATCCACTGTCGT
AGGAGCAAGTGCTGTTTCTGGACTTTGCGCTGCGGCTTGCAGTCTACCATTTGACTTTGT
CAAAACTCAGATCCAGAAAATGCAACCCGACGCTCAGGGGAAATATCCGTACACTGGTTC
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CCCTGTTTACTGCGTCATGATCGCCCCTCACGTCATGATGACTTGGATCTTTTTGAACCA
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AAAAGATGAGGAGAATTCATTTGCTTTTTTAATTATAGATACTACATGATTAGATGCATT
AAAGCATTATTATTTTAGCTGCTCGAGACTTCACTTTTTTTTTTGGTTAAGGGCCGTTGA
TTGGCCCGGCAAACTTACAAAATTTTCAGAGAATTTTTAAAGATTTATGACTATAAATTT
ATT


BQ
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10 10 10 

AF RS1CU67TF U 1
AF RS1CU67JQ C 520
BS 1 602 RS1CU67TF
BS 603 603 RS1CU67JQ
BS 604 701 RS1CU67TF
BS 702 1203 RS1CU67JQ

RD RS1CU67TF 701 0 0
GGTCTCCACCACCAAGTGAGTGAATCTCTCTCTCCGCCTTTCTCTTTCTCTGCGTTTGAG
ATAGTTCCGTACGATCCAAAAGAAAGAGAGAGAGATGGCCGAGGAGAAGAAAGTAGCACC
AATTGGTATCTGGACCGCTGTGAAGCCTTTCGTCAATGGCGGTGCCTCTGGTATGCTCGC
CACCTGCGTTATCCAGCCCATTGACATGATCAAGGTGAGGATTCAACTAGGTCAGGGATC
TGCAGCTAGTGTGACCTCGACCATGTTGAAGAATGAAGGTATCGGTGCCTTCTACAAGGG
ATTATCAGCTGGTTTGCTGAGGCAAGCAACTTACACCACAGCCCGTCTTGGATCATTCAA
GATGCTGACTGCGAAAGCAAGTGAGGCTAATGATGGGAAACCACTACCGCTGTATCAGAA
GGCTCTATGTGGTCTGACAGCTGGTGCAATCGGTGCCTGCGTTGGTAGTCCAGCGGATCT
AGCGCTTATCAGAATGCAAGCTGATAACACTCTGCCCTTAGCTCAGCGCAGGAATTACAC
CAACGCCTTCCACGCGCTTTACCGTATCAGCGCTGATTAAGGAGTTTTGGCGCTTTGGAA
AG*TTGTGGGCCGACGGTGGTCAGAGCTATGGCTTTGAACATGGGGATGCTTGCGTCTTA
TGATCAGAGTGTTGAATACATGAGAGATAATCTTGGTCTTG

QA 1 701 1 701
DS 

RD RS1CU67JQ 684 0 0
AGCTCAGCGCAGGAATTACACCAACGCCTTCCACGCGCTTTACCGTATCAGCGCTGATTA
AGGAGTTTTGGCGCTTTGGAAAGGTTGTGGGCCGACGGTGGTCAGAGCTATGGCTTTGAA
CATGGGGATGCTTGCGTCTTATGATCAGAGTGTTGAATACATGAGAGATAATCTTGGTCT
TGGGGAGACATCCACTGTCGTAGGAGCAAGTGCTGTTTCTGGACTTTGCGCTGCGGCTTG
CAGTCTACCATTTGACTTTGTCAAAACTCAGATCCAGAAAATGCAACCCGACGCTCAGGG
GAAATATCCGTACACTGGTTCGCTTGACTGTGCGATGCAGACCTTAAAATCAGGAGGACC
TCTTAAATTCTACACAGGTTTCCCTGTTTACTGCGTCATGATCGCCCCTCACGTCATGAT
GACTTGGATCTTTTTGAACCAGATTACAAAGTTCCAAAAGAACATTGGGATGTGATCTTA
TGAAAGTGCGCGGCAAAAAAAAAAAGATGAGGAGAATTCATTTGCTTTTTTAATTATAGA
TACTACATGATTAGATGCATTAAAGCATTATTATTTTAGCTGCTCGAGACTTCACTTTTT
TTTTTGGTTAAGGGCCGTTGATTGGCCCGGCAAACTTACAAAATTTTCAGAGAATTTTTA
AAGATTTATGACTATAAATTTATT

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL8221Contig1 603 2 2 U
GCATAGGACCGATCGTAGCAGCCGGGTGGGATTTCTTCGAGGCGCTCTACTTTGGAGGGA
CGTTGACGGAAGGGTTCTTGCGTGGGTCAGGGACTTTGGTCGGTGCTTATGCGGGAGGGT
ATGTTGGGGAGCAGAGGTTTGGGAGGTTTGGGTATCTTGTGGGAAGTCACTTGGGGAATT
GGATCGGTGCGAGGGTTGGACTGATGGTTTATGATGTTGTGAATGGGGTGAATTTCTTCT
ACGAGACTTATCAATCTGGAGAGAGTTTTGAGGATCAGTCTACTTATAAAACTGAGGAGA
CTGAGTCTACATATGAAACTTCTCAGGAGGATCAGTCTACATATGAGACTTCTGAGGATC
AGTCTACGTACGAAACTCCAAATTACGAGCTCTAGAAGCTTTTGAGGATGAATAGAATTG
GAAAGCTCAAGAAGATTCTGGAATGTGAGTTTGTGATACGTTTGACATAGTTGTATAGAC
TCAAAAGAGTTTCAACATTACTGATGTATGAATGATTGATTTAAAGTTACAATTTGTTCC
TGTTTGACTCGATTTTCCGTTCAGTATATTTTATATGGAACTGGTTTCAAAGTTAATTGT
GTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 

AF RS1FE14JQ C 1
AF RS1FE14TF U 81
BS 1 80 RS1FE14JQ
BS 81 603 RS1FE14TF

RD RS1FE14JQ 603 0 0
GCATAGGACCGATCGTAGCAGCCGGGTGGGATTTCTTCGAGGCGCTCTACTTTGGAGGGA
CGTTGACGGAAGGGTTCTTGCGTGGGTCAGGGACTTTGGTCGGTGCTTATGCGGGAGGGT
ATGTTGGGGAGCAGAGGTTTGGGAGGTTTGGGTATCTTGTGGGAAGTCACTTGGGGAATT
GGATCGGTGCGAGGGTTGGACTGATGGTTTATGATGTTGTGAATGGGGTGAATTTCTTCT
ACGAGACTTATCAATCTGGAGAGAGTTTTGAGGATCAGTCTACTTATAAAACTGAGGAGA
CTGAGTCTACATATGAAACTTCTCAGGAGGATCAGTCTACATATGAGACTTCTGAGGATC
AGTCTACGTACGAAACTCCAAATTACGAGCTCTAGAAGCTTTTGAGGATGAATAGAATTG
GAAAGCTCAAGAAGATTCTGGAATGTGAGTTTGTGATACGTTTGACATAGTTGTATAGAC
TCAAAAGAGTTTCAACATTACTGATGTATGAATGATTGATTTAAAGTTACAATTTGTTCC
TGTTTGACTCGATTTTCCGTTCAGTATATTTTATATGGAACTGGTTTCAAAGTTAATTGT
GTT

QA 1 603 1 603
DS 

RD RS1FE14TF 523 0 0
CGTGGGTCAGGGACTTTGGTCGGTGCTTATGCGGGAGGGTATGTTGGGGAGCAGAGGTTT
GGGAGGTTTGGGTATCTTGTGGGAAGTCACTTGGGGAATTGGATCGGTGCGAGGGTTGGA
CTGATGGTTTATGATGTTGTGAATGGGGTGAATTTCTTCTACGAGACTTATCAATCTGGA
GAGAGTTTTGAGGATCAGTCTACTTATAAAACTGAGGAGACTGAGTCTACATATGAAACT
TCTCAGGAGGATCAGTCTACATATGAGACTTCTGAGGATCAGTCTACGTACGAAACTCCA
AATTACGAGCTCTAGAAGCTTTTGAGGATGAATAGAATTGGAAAGCTCAAGAAGATTCTG
GAATGTGAGTTTGTGATACGTTTGACATAGTTGTATAGACTCAAAAGAGTTTCAACATTA
CTGATGTATGAATGATTGATTTAAAGTTACAATTTGTTCCTGTTTGACTCGATTTTCCGT
TCAGTATATTTTATATGGAACTGGTTTCAAAGTTAATTGTGTT

QA 1 523 1 523
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8223Contig1 762 2 4 U
GGATTCAGGTTCTCCTCTTTCTCTCTCTCCTCATGCTTTCTGTCTCCTCATCTCTTACAG
TGAGTCCTTTACAGGTTCAGCTTCAGTTTCGAGTAGATATGGAAGTGGTTGCCGCTAGGT
CAATGGAGGAGACGCAGAGACAGCAGACATGGGCTTGTTCTGCCCCTGAGACGCTTTTCA
TCCTCCTTGGAAGGAACCTGGCTTGTCTGCTCCTTGCGGCGGAATCTTTGCTGATTGGGT
TGATTGCTGAAGATCAGAGGCTTTCTGTGAAGGAGGGTTACAAAAAAGGACGCCCTGATG
AGGAAAACAAAGATGGCAGCGACTCTGATGATAATGATGACGACGATGATGAAGACGCTG
ACGCTGATGATGATGATGACGACGATGATGCTAATGATGAAAATTTCTCTGGGGATGAAG
GGGAGGAGGAAGCTGATCCTGAGGACGACCCAGCACCCAATGGTGGAGCAGGAAGCGATG
ATGATGACGATGATGATGAGAGCGACAGTGATGATGATGATGACGACGAGGATGAGGAGG
ACGAAGATGATGAGGAGGAAGATGACGAAGATGTTCGCCAGCCACCTGCTAAGAAGAGGA
AATGAAACATGGGATTAAGTGGGGGAGTGTTTATGTGTGGGTGGTTAAAGACTTGAAGAG
GATCTCGTATGTGTTATGGTTTTAAGTAGTTCAGTGAAAACCTCCTCTTTATTCAGTTTC
ATCTTGTTGTGTTACTACCATTTGTTTGTTATTTCAGACTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DS18TF U 1
AF RS1DS18JQ C 191
BS 1 699 RS1DS18TF
BS 700 700 RS1DS18JQ
BS 701 715 RS1DS18TF
BS 716 762 RS1DS18JQ

RD RS1DS18TF 715 0 0
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QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1DS18JQ 572 0 0
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GTTACTACCATTTGTTTGTTATTTCAGACTTT

QA 1 572 1 572
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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AF RS1BZ13JQ C 1
AF RS1BZ13TF U 17
BS 1 16 RS1BZ13JQ
BS 17 537 RS1BZ13TF

RD RS1BZ13JQ 537 0 0
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TTATGCTGAGGAGGAAGGGGTTAATGAAATGGCTGAAGAGTCTGATGGAGATTCTGAGGA
TAACTGTAGGGAAGTTCGATGCATAGAAACAGAGATGTCAGATGTCACTAGACATCCAGA
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QA 1 537 1 537
DS 

RD RS1BZ13TF 521 0 0
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GGGGTTAATGAAATGGCTGAAGAGTCTGATGGAGATTCTGAGGATAACTGTAGGGAAGTT
CGATGCATAGAAACAGAGATGTCAGATGTCACTAGACATCCAGAGGAAGATATTCCGCAG
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GTGACGGAGCCAAAGAACATACAACCACCAATTGAAAAGGT

QA 1 521 1 521
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1FL58JQ C 1
AF RS1FL58TF U 1
BS 1 525 RS1FL58TF

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CAATCAATCAATCAATCAATCTGATCGGCATGGGTTGTTTCAGTTGCATCAACGGAACGC
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AATATTCTGTGGATTGTTCAAGCTTTTAGTTCATCATCTTGAGCC

QA 1 525 1 525
DS 

RD RS1FL58TF 525 0 0
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CAATCAATCAATCAATCAATCTGATCGGCATGGGTTGTTTCAGTTGCATCAACGGAACGC
AAAAGAAGCAGCGTAAGGAAGAAGATAGACAAGCCTCCGCCGAAGCTCGCGCCAGAGCCG
CCGAAGCTGCCATGCGACGAGAAGAAGATTTTAAGAAGTCTGCACATGGAAGGGCTGCAC
AAGCTCAGTTGCAGCAAATGGCTAAACAATCTGCTAATACTAACAAAGGAGAGCCTGTTC
TTAAGTGGCAAATGACATAGTGATGGGACCGGCCTAATCTCTACTTCAATCATCTGATTT
ATTTTCTGAATTCGCTAAAAAGAACAGAAAACAGAGCAACAAGTTTGTATATGTATAGTA
GTAATAAAAAGTTAAGATCAACTCTCCGAGCTTTACAATAAAGTGTGTATTTTTCATTTA
AATATTCTGTGGATTGTTCAAGCTTTTAGTTCATCATCTTGAGCC

QA 1 525 1 525
DS 



AS 1 2

CO CL8227Contig1 771 2 2 U
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TCAGAAAAAAAACATGGTTACTATTTCAGATATTAAGTCGACGGTGGAGACTACGGCGGC
GGCGAACTGTCTGATGCTCTTATCAAGGGTCGGACAAGAAAACGTTGACGGTGGGAGCGC
AAAACGCGTTTTCACATGTAAAACGTGTTTGAAGGAGTTTCATTCGTTTCAAGCCTTGGG
AGGTCACCGTGCGAGTCACAAGAAGCCTAACAGTGAGAATCTCTCTGGTTTGATGAAGAA
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GGCTCTAGGAGGTCACATGAGGAGACACAGGAACGAGAGTGGCGGCGCCGGCGCGTTGGT
TACACGCGAGTTATTGCCGGAGGCGGCGTTGATGACGTTGAAGAAATCAAGCAGTGGGAG
GTTGGCTTGTCTGGATCTGAGTTTGGGGATGGTGGAGAATTTGAATCTCAAGTCGGAACT
TGGAAGACCTGTTTGTTGATTTGTCTTTCTTTTTCTGGATATATTAATTAGTTTCCATCA
TTCTTTGATTTGTTTCCTTATTTTAGATTTATATACATATACATCTGCAGATTTAGGAAA
CTTTCATAGGCCGGGTGTAATATTTTCTTTCCTTTCGTGGTGAAAATATTCTTTACTTGC
TTGAGATTTGTTATATATATCTTTCAGTTTAAACTTTAAAGCGTTACGTCT


BQ
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TGCCGGAGGCGGCGTTGATGACGTTGAAGAAATCAAGCAGTGGGAGGTTGGCTTGTCTGG
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GTTGATTTGTCTTTCTTTTTCTGGATATATTAATTAGTTTCCATCATTCTTTGATTTGTT
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ATATATCTTTCAGTTTAAACTTTAAAGCGTTACGTCT

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AF RS1D986JQ U 1
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TTTGATGCATCTGCTGAGATACAAGTCACTTTCACCCAAATCATCACTTTAGTTTTCTAG
CCTTCCACCTCAGCTAGCTTTCCTTTCTCCAGGTAACCCGTCACCGTTGTCGAAAACCGC
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AACCACTTGGTACCTCC

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CGGGGATGAAGACAGTCAACTTACCCGTCTCTTCGTTGAACTCGTAGTTCGTGGCGTCCT
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DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CTGACGTCGTCTTTGGATTTTCTTCAACTCTAGCTCTTTTGCTGCTCATCGTTTCTGCAA
GAAGTTTAATTCTCGGTGAGTCGTTGTGTCGATTGGATGTTTCTATGTGCGCTTGAAGGT
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GTTTGTGGCTTTGTCTAATTGGTTCGGGTTGGTGGGGAGTGTTTTGTTTCTTTGGGCTTT
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CAACTTGTTTCGGTTGCTGTTGTGCCCCATGGTTGTTGGGCTTTAGTTTTCCTTCTTATG
GGATTTAGCTTCCCTTCCTATGGGATTTAGTTGCTAAAGATATTTCTTTTGCTTCAGTTT
ATGTATTAAAGACGTTGTATTCCACTTTATCCTAATATAATCCAATTTGGCC


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AF RS1GB25TF U 1
AF RS1GB25JQ C 505
BS 1 531 RS1GB25TF
BS 532 532 RS1GB25JQ
BS 533 654 RS1GB25TF
BS 655 1252 RS1GB25JQ

RD RS1GB25TF 654 0 0
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AGGGAGGATCTCCTCCTCCTCTTTAGTTTAATCTAAGTTTTATTTGGATTGTTGTTCTTT
TGGTGTTTCTCAGCCTCTTTCGAGTTTTAGGGTTCGCGTTGATAAGGTTGTTCGGACTTG
GAGTTCTCTGGGGTTGAATCAGTGCTTGTTTCTCTGTTGTATCTGTCGATTTGATGAGCC
GTTGTGGAGGAGACCTCTGTGGTGGTAGCTGGTGCCTAGTCGTTCTGGGTTTCTTGGCTC
CCCTTCGTGCCTCCTCTTGACTGTGTTCTGCTTCTGGAGTGGGGTTCCAGCTCTCTTGTT
TGTTTCAGGTGAAGCTTTGGTTCGGAGAGTTGGGTTCAGTGACGAGTCTGGCGCCAGATC
TCAGGTCGAGGACCTGTTGACGGTGCGGTGTAGCTGCTGGGAGCAGTGCAG*TGCTTTCG
CTGACGTCGTCTTTGGATTTTCTTCAACTCTAGCTCTTTTGCTGCTCATCGTTTCTGCAA
GAAGTTTAATTCTCGGTGAGTCGTTGTGTCGATTGGATGTTTCTATGTGCGCTT

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DS 

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CAACTCTAGCTCTTTTGCTGCTCATCGTTTCTGCAAGAAGTTTAATTCTCGGTGAGTCGT
TGTGTCGATTGGATGTTTCTATGTGCGCTTGAAGGTGCCTATATCCCGAGTTTGGTATCC
TGTCTCCAGTGTTGGTTCTTCAGTTGGTGCTTTCTTGTTTGTGGCTTTGTCTAATTGGTT
CGGGTTGGTGGGGAGTGTTTTGTTTCTTTGGGCTTTTTCCTGCAACGGTGAAGCGTCCCG
AGGATCCCTGATTTGCTTTTGACTTCTCTCTGGTGAAAAGGTCTGTATTGAGGTTATGTT
CCTCATTCTGCTGTGTGTTTGGCGGGTGGGCCTGTTTCTATTGTTTGGTTTGGTTGTCAA
GCAGTTCAGGTGGTGGTGGTCTGTCCTTATGGAGGCCTATCCTCGTTTCGTCTGGCTGTC
CCTTTGTAAGCTTCCGGTGGTTCTAAGTCTCTTGGTTACTTTCTTCTCCTTCCTATCTTG
AACTTTCAGTTACTCAGGGATTTAAGTTTTGAACTTCAACTTGTTTCGGTTGCTGTTGTG
CCCCATGGTTGTTGGGCTTTAGTTTTCCTTCTTATGGGATTTAGCTTCCCTTCCTATGGG
ATTTAGTTGCTAAAGATATTTCTTTTGCTTCAGTTTATGTATTAAAGACGTTGTATTCCA
CTTTATCCTAATATAATCCAATTTGGCC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

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GGACTTCCCCTTCCAAAGAAGTAAAAAAAAAAAAAACTAAAGCCCTAAAAAATTTCCAGC
CGCCGTCGTTCTCGTCGTCCCACACGCTCCGCTGCAACCTCACCGTCACTCCACAATCGA
CAAATCCCCCTACCACAGAAACCTCAGTCTTTTTTTTTCCGAATGGAGTTTTCCTTACAA
GACGACGAATTTGGCGGGGATTTTCCCGCTACTAATGCCACCATAGCTTCAGGTAGTAAA
AGAAGCTTCGATGATCTCGAAGACGACGAAGATAACATCTTCGGATCCAAAAAGGGTCGT
ACAAACGCAGAGGTAGCTGCCCCTGGTGCTACCACTTGCGTGATTTTGCAACTCCGAGAG
AGTCTTAAGAATTGTCAAGACGAGCTTGCTTCATGCCAAGATGAGCTTGAATCAGCCAAA
GCAGAGATTAATAAGTGGAATTCAGCGTTTCAGAACGAGTCCTTTGTACCGGCGGGAAAA
TCTCCTGAACCTAGATTTTTGATCGACTACATCCAGAATTTGAAGTCTTCTGAGAGATCT
TTGAAAGAACAGTTAGAAATTGCGAAGAGAAAAGAAGCTTCATGCATTGTGCAATATGCG
AAACGGGAACAAGAAATGGCAGAACTGAAGTCAGCTGTTCGCGATTTGAAATCTCAACTC
AAGCCGGCGTCAATGCAGGCGAGGAGGTTGTTACTGGATCCAGCCATTCATGAAGAATTT
TCACGTCTGAAGAATCTAGTTGAGGAAAAAGACAAGAAGATCAAATAACTCCAGGATAGT
TATACAGCAGTTACTTTCACCCCTCTGGGCGTAAAGGGCAAGATGCTTATGGAAAAGTGC
AAAACCCTGCAAGAGGAAAACGAGGAGATTGGACGCCAAGCTACTGAAGGGAAGATTCAT
GAACTAGCAATGAAGCTTTCAGTGCAGAAGTCTCAAAACGCGGAACTTAGAAAGCAATTT
GAAGGACTGTTCAAACACATGGAAGGATTAACTAATGATGTTGAGCGATCAAACGAAATG
GTGATAATATTGCAAGATAAACTGGATGAGAAGGACAAAGAGTTAGAGAGAGTAAAGAAA
GAGATGGAGGAGGTTGTTGTGGCTGATGATGTAGGTGACAAGAAAGATGATGAAGCTCAT
GATGATGATGAAGATCCAAAAGAAATTGATGATGGAGAACAAAAGATGTTATGCACATTT
TGAGAGTTTATTGCAATTTTTCTTTCTTATATATCTCTCAGTATTTTGTCTTTTCTCACT
AAAGTGTTTAATTTCATGTACTAATTAACAATAAGTTTTAACTTCAGGAGGTAGTGTATT
TTCATTTCAATTCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AS49TF U 1
AF RS1AS49JQ C 496
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BS 594 1334 RS1AS49JQ

RD RS1AS49TF 593 0 0
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CGCCGTCGTTCTCGTCGTCCCACACGCTCCGCTGCAACCTCACCGTCACTCCACAATCGA
CAAATCCCCCTACCACAGAAACCTCAGTCTTTTTTTTTCCGAATGGAGTTTTCCTTACAA
GACGACGAATTTGGCGGGGATTTTCCCGCTACTAATGCCACCATAGCTTCAGGTAGTAAA
AGAAGCTTCGATGATCTCGAAGACGACGAAGATAACATCTTCGGATCCAAAAAGGGTCGT
ACAAACGCAGAGGTAGCTGCCCCTGGTGCTACCACTTGCGTGATTTTGCAACTCCGAGAG
AGTCTTAAGAATTGTCAAGACGAGCTTGCTTCATGCCAAGATGAGCTTGAATCAGCCAAA
GCAGAGATTAATAAGTGGAATTCAGCGTTTCAGAACGAGTCCTTTGTACCGGCGGGAAAA
TCTCCTGAACCTAGATTTTTGATCGACTACATCCAGAATTTGAAGTCTTCTGAGAGATCT
TTGAAAGAACAGTTAGAAATTGCGAAGAGAAAAGAAGCTTCATGCATTGTGCA

QA 1 593 1 593
DS 

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A
TTTTGATCGACTACATCCAGAATTTGAAGTCTTCTGAGAGATCTTTGAAAGAACAGTTAG
AAATTGCGAAGAGAAAAGAAGCTTCATGCATTGTGCAATATGCGAAACGGGAACAAGAAA
TGGCAGAACTGAAGTCAGCTGTTCGCGATTTGAAATCTCAACTCAAGCCGGCGTCAATGC
AGGCGAGGAGGTTGTTACTGGATCCAGCCATTCATGAAGAATTTTCACGTCTGAAGAATC
TAGTTGAGGAAAAAGACAAGAAGATCAAATAACTCCAGGATAGTTATACAGCAGTTACTT
TCACCCCTCTGGGCGTAAAGGGCAAGATGCTTATGGAAAAGTGCAAAACCCTGCAAGAGG
AAAACGAGGAGATTGGACGCCAAGCTACTGAAGGGAAGATTCATGAACTAGCAATGAAGC
TTTCAGTGCAGAAGTCTCAAAACGCGGAACTTAGAAAGCAATTTGAAGGACTGTTCAAAC
ACATGGAAGGATTAACTAATGATGTTGAGCGATCAAACGAAATGGTGATAATATTGCAAG
ATAAACTGGATGAGAAGGACAAAGAGTTAGAGAGAGTAAAGAAAGAGATGGAGGAGGTTG
TTGTGGCTGATGATGTAGGTGACAAGAAAGATGATGAAGCTCATGATGATGATGAAGATC
CAAAAGAAATTGATGATGGAGAACAAAAGATGTTATGCACATTTTGAGAGTTTATTGCAA
TTTTTCTTTCTTATATATCTCTCAGTATTTTGTCTTTTCTCACTAAAGTGTTTAATTTCA
TGTACTAATTAACAATAAGTTTTAACTTCAGGAGGTAGTGTATTTTCATTTCAATTCG

QA 2 839 2 839
DS 



AS 1 2

CO CL8232Contig1 786 2 2 U
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GGTGTTGCACCAACTGATTTCGAACAGGAAGTTGCTCAGGCTTTCTTTGACCTTGAAAAC
ATCAACCAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAAGCTGTTCAGATG
GATGTTTCTGGCAACCGCAAGGCTATTGTGATCTACGTTCCATTCAGATTGAGGAAAGCA
TTCCGCAAGATCCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTCGAGAAGAAGTTCAGTGGCAAAGAT
GTTATCTTTGTTGCCACTAGAAGAATCATGCGTCCACCGAAGAAAGGCTCTGCTGTTCAG
AGACCACGCAACAGGACTCTCACTTCCGTCCATGAAGCTATGCTTGAGGATGTTGCTTAC
CCTGCTGAGATTGTCGGAAAGCGTACCAGATACCGTGTTGATGGCACCAAGATCATGAAG
GTGTTTTTGGAGCCCAAGGAAAGGAACAACACTGAGTACAAGCTTGAGACAATGGTCGGT
GTGTACAGGAAACTTACAGGGAGAGATGTAGTTTTCGAGTACCCAGTCACAGAAGCTTGA
AGAGATGAATGATTGTTCTATTCTTTGTTTTTTTTGTCGACTAGAGAGCTTTTGATTTTG
GTTTGTTTCCGAGTACAAGTTACTTCAGTCTTCCTCAAATTTCTATTTAACAAAACCTTT
TTGCTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1DX66TF U 1
AF RS1DX66JQ C 96
BS 1 615 RS1DX66TF
BS 616 786 RS1DX66JQ

RD RS1DX66TF 615 0 0
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ATCAACCAGGAGTTGAAAAGTGACTTGAAAGATCTCTACATTAACCAAGCTGTTCAGATG
GATGTTTCTGGCAACCGCAAGGCTATTGTGATCTACGTTCCATTCAGATTGAGGAAAGCA
TTCCGCAAGATCCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCTCGAGAAGAAGTTCAGTGGCAAAGAT
GTTATCTTTGTTGCCACTAGAAGAATCATGCGTCCACCGAAGAAAGGCTCTGCTGTTCAG
AGACCACGCAACAGGACTCTCACTTCCGTCCATGAAGCTATGCTTGAGGATGTTGCTTAC
CCTGCTGAGATTGTCGGAAAGCGTACCAGATACCGTGTTGATGGCACCAAGATCATGAAG
GTGTTTTTGGAGCCCAAGGAAAGGAACAACACTGAGTACAAGCTTGAGACAATGGTCGGT
GTGTACAGGAAACTT

QA 1 615 1 615
DS 

RD RS1DX66JQ 691 0 0
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CTACATTAACCAAGCTGTTCAGATGGATGTTTCTGGCAACCGCAAGGCTATTGTGATCTA
CGTTCCATTCAGATTGAGGAAAGCATTCCGCAAGATCCATCCTCGTCTTGTCAGAGAGCT
CGAGAAGAAGTTCAGTGGCAAAGATGTTATCTTTGTTGCCACTAGAAGAATCATGCGTCC
ACCGAAGAAAGGCTCTGCTGTTCAGAGACCACGCAACAGGACTCTCACTTCCGTCCATGA
AGCTATGCTTGAGGATGTTGCTTACCCTGCTGAGATTGTCGGAAAGCGTACCAGATACCG
TGTTGATGGCACCAAGATCATGAAGGTGTTTTTGGAGCCCAAGGAAAGGAACAACACTGA
GTACAAGCTTGAGACAATGGTCGGTGTGTACAGGAAACTTACAGGGAGAGATGTAGTTTT
CGAGTACCCAGTCACAGAAGCTTGAAGAGATGAATGATTGTTCTATTCTTTGTTTTTTTT
GTCGACTAGAGAGCTTTTGATTTTGGTTTGTTTCCGAGTACAAGTTACTTCAGTCTTCCT
CAAATTTCTATTTAACAAAACCTTTTTGCTG

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

CO CL8233Contig1 909 2 2 U
GTGGATATGGTGGCAAACGCGATGATCACGGCTACAGCTACACATGCTGGAGGTTCAGGG
GTTCACATGGTGTACCATGTTGGTTCATCACACCGGAACCCAGTGACATTTGGAGAGATT
CATGAGATTTCCGTTCGTTACTTTACCAAAAACCCTTTGCGTAGTCGCAGTGGCTCGCCC
ATAGCCGTCTCAAAAGTGAGGCTTATATCAAATAGGGCTTTGTTCAGCCTCTACATGACC
CTACGTTTCAGACTACCTTTACAGGTACTAATATCATATAATTTTAATTTTTTTAAAAGC
ATTATGAAACACTAACATCTTGTTTTACGTCTCGCGATATCATTTAGTTTTTATAGAGAT
ATTATTTATGCATTGTGTATATTGATGTATAGTTAATATTTCTCTCTTTTTTTCTTTTTC
TTTTTTTAAATCAGTTGTTGAAATTAATTGACATAATATATCCCACGTAGAGGAGAAGTG
GGTCTTAACGCTGATGAGATTCAGAGGTTTGAGGATCTTGGGTATGTGATGAGTGGGAGT
AGGCATCAGAGGATGAATGCTATTCGTATCAGGAAGGAGAACCAGGTTTACAGTGCTGAA
GACAAGCGGGCGTTGGCCATGTTTAACTACGAGGAGAAGGCTAAGCGCGAGGCTAAGGTT
ATGGCTGATCTTTCGAGGCTTGTGCAGCGCCATATGGGAGAAGAGTTGGGTCCGAATCAT
GACCCTTTTGGTGCTGGAAAGACCGATGGAGCTGATGATTGATTTGCTTTGCTTTTCTTC
TACTACTTGTGTTGGTACTTATCTTATGCGTTTGTTACTTGTAAACTTTTCCTTATTGCA
TCGTAGCTACTCTTTGTTTACTACTTGCCCGTTAATGGGTTTTAACAGTTTCAATTTGCT
ATGCGTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FS79TF U 1
AF RS1FS79JQ C 115
BS 1 635 RS1FS79TF
BS 636 909 RS1FS79JQ

RD RS1FS79TF 635 0 0
GTGGATATGGTGGCAAACGCGATGATCACGGCTACAGCTACACATGCTGGAGGTTCAGGG
GTTCACATGGTGTACCATGTTGGTTCATCACACCGGAACCCAGTGACATTTGGAGAGATT
CATGAGATTTCCGTTCGTTACTTTACCAAAAACCCTTTGCGTAGTCGCAGTGGCTCGCCC
ATAGCCGTCTCAAAAGTGAGGCTTATATCAAATAGGGCTTTGTTCAGCCTCTACATGACC
CTACGTTTCAGACTACCTTTACAGGTACTAATATCATATAATTTTAATTTTTTTAAAAGC
ATTATGAAACACTAACATCTTGTTTTACGTCTCGCGATATCATTTAGTTTTTATAGAGAT
ATTATTTATGCATTGTGTATATTGATGTATAGTTAATATTTCTCTCTTTTTTTCTTTTTC
TTTTTTTAAATCAGTTGTTGAAATTAATTGACATAATATATCCCACGTAGAGGAGAAGTG
GGTCTTAACGCTGATGAGATTCAGAGGTTTGAGGATCTTGGGTATGTGATGAGTGGGAGT
AGGCATCAGAGGATGAATGCTATTCGTATCAGGAAGGAGAACCAGGTTTACAGTGCTGAA
GACAAGCGGGCGTTGGCCATGTTTAACTACGAGGA

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1FS79JQ 795 0 0
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TCGCCCATAGCCGTCTCAAAAGTGAGGCTTATATCAAATAGGGCTTTGTTCAGCCTCTAC
ATGACCCTACGTTTCAGACTACCTTTACAGGTACTAATATCATATAATTTTAATTTTTTT
AAAAGCATTATGAAACACTAACATCTTGTTTTACGTCTCGCGATATCATTTAGTTTTTAT
AGAGATATTATTTATGCATTGTGTATATTGATGTATAGTTAATATTTCTCTCTTTTTTTC
TTTTTCTTTTTTTAAATCAGTTGTTGAAATTAATTGACATAATATATCCCACGTAGAGGA
GAAGTGGGTCTTAACGCTGATGAGATTCAGAGGTTTGAGGATCTTGGGTATGTGATGAGT
GGGAGTAGGCATCAGAGGATGAATGCTATTCGTATCAGGAAGGAGAACCAGGTTTACAGT
GCTGAAGACAAGCGGGCGTTGGCCATGTTTAACTACGAGGAGAAGGCTAAGCGCGAGGCT
AAGGTTATGGCTGATCTTTCGAGGCTTGTGCAGCGCCATATGGGAGAAGAGTTGGGTCCG
AATCATGACCCTTTTGGTGCTGGAAAGACCGATGGAGCTGATGATTGATTTGCTTTGCTT
TTCTTCTACTACTTGTGTTGGTACTTATCTTATGCGTTTGTTACTTGTAAACTTTTCCTT
ATTGCATCGTAGCTACTCTTTGTTTACTACTTGCCCGTTAATGGGTTTTAACAGTTTCAA
TTTGCTATGCGTGTC

QA 1 795 1 795
DS 



AS 1 2

CO CL8234Contig1 817 2 4 U
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CCAGAAGAAGAAAGAAGAAGATGGCTTCGCCGTGCAAACGCCGAGAGATGGACATGATGA
AATTGATGATGAGTGATTACAAGGTCGATACAATCAACGACGATTTGCATATGTTCTATG
TCACTTTCCATGGCCCCACTGACAGTCTTTACGAAGGAGGTGTATGGAAGATCAAAGTCG
AACTTCCTGATGCTTATCCTTACAAATCTCCTTCTGTTGGTTTCGTTAACAAGATTTATC
ACCCCAATGTTGATGAATCTTCTGGCGCAGTTTGCTTAGATGTAATAAACCAGACATGGA
GTCCAATGTTTGATCTTATCAATGTCTTCGAGTCATTCCTTCCTCAGTTGCTTCTATATC
CAAACCCATCTGATCCCTTCAATGGTGAAGCTGCCTCTCTCTTGATGCGAGACCGCCCTG
CCTATGAGCTCAAGGTCAAAGAATATTGCAAGAGATATGCTAAACCAGAGGATATAGGAG
CACCTGAGGAGATCTCAAGTGATGATGACGATGATGATGATGATAGCATGAGCGAACGTG
GTTCAGACTCTGATGACAACGATGAAATTGCTGGAAAAGCTGATCCTTGATGACTTCGTC
ACAAATCAAATCTCTCTTTGTACTTTGATTTATTAGTCCATTTCCAAAAATATAAACCAT
TGATGTTCATTGCATGGGAGGAGTAAGAACTTTCCTCTGTAAATGTGTAAAGACTTGTGT
TAATTCTTTTAGGATCATTGAAACTTTCATTTGCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BU74TF U 1
AF RS1BU74JQ C 163
BS 1 364 RS1BU74TF
BS 365 365 RS1BU74JQ
BS 366 584 RS1BU74TF
BS 585 817 RS1BU74JQ

RD RS1BU74TF 584 0 0
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AATTGATGATGAGTGATTACAAGGTCGATACAATCAACGACGATTTGCATATGTTCTATG
TCACTTTCCATGGCCCCACTGACAGTCTTTACGAAGGAGGTGTATGGAAGATCAAAGTCG
AACTTCCTGATGCTTATCCTTACAAATCTCCTTCTGTTGGTTTCGTTAACAAGATTTATC
ACCCCAATGTTGATGAATCTTCTGGCGCAGTTTGCTTAGATGTAATAAACCAGACATGGA
GTCCGATGTTTGATCTTATCAATGTCTTCGAGTCATTCCTTCCTCAGTTGCTTCTATATC
CAAACCCATCTGATCCCTTCAATGGTGAAGCTGCCTCTCTCTTGATGCGAGACCGCCCTG
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CACCTGAGGAGATCTCAAGTGATGATGACGATGATGATGATGAT

QA 1 584 1 584
DS 

RD RS1BU74JQ 655 0 0
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TATGGAAGATCAAAGTCGAACTTCCTGATGCTTATCCTTACAAATCTCCTTCTGTTGGTT
TCGTTAACAAGATTTATCACCCCAATGTTGATGAATCTTCTGGCGCAGTTTGCTTAGATG
TAATAAACCAGACATGGAGTCCAATGTTTGATCTTATCAATGTCTTCGAGTCATTCCTTC
CTCAGTTGCTTCTATATCCAAACCCATCTGATCCCTTCAATGGTGAAGCTGCCTCTCTCT
TGATGCGAGACCGCCCTGCCTATGAGCTCAAGGTCAAAGAATATTGCAAGAGATATGCTA
AACCAGAGGATATAGGAGCACCTGAGGAGATCTCAAGTGATGATGACGATGATGATGATG
ATAGCATGAGCGAACGTGGTTCAGACTCTGATGACAACGATGAAATTGCTGGAAAAGCTG
ATCCTTGATGACTTCGTCACAAATCAAATCTCTCTTTGTACTTTGATTTATTAGTCCATT
TCCAAAAATATAAACCATTGATGTTCATTGCATGGGAGGAGTAAGAACTTTCCTCTGTAA
ATGTGTAAAGACTTGTGTTAATTCTTTTAGGATCATTGAAACTTTCATTTGCTCC

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 2

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AGAAAAGGAAGACAAATATAAAAAAAAGTCGTCAAAGAAAGAGCCATGGACGCCATCGAT
TCCGTCGTTGATCCTCTCAGAGACTTTGCAAAGGACAGCATTCGCCTCGTTAAGCGTTGT
CACAAACCAGATCGCAAAGAATTCACGAAAGTGGCGTTCCGTACAGCGATCGGGTTTGTA
GTAATGGGATTCGTGGGATTCTTTGTGAAGCTCATTTTTATTCCCATCAACAACATCATC
GTCGGTGCCACCTAGATAACCAGCGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGGTAGAAACAGCTT
TCTTGTTTCAAGAAAACAATTTCACAGTTTTTTGTTTTGTTCAGATACTCAGAAAGAGGA
AACATATGTTAACCACACATTTGAGATCAGTTTCCAGTAATTGCATTCTATTTTATACGT
TACTGTTTATTTCGCTATACCCCTAGAATTTGCCGTTAGATATGGTGACAAAACCCACAA
AGATAATGAATCAATCAGGTTCAATTTTATTTTAGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A015TF U 1
AF RS1A015TV U 56
BS 1 577 RS1A015TF

RD RS1A015TF 577 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGGCCCAAACC
AGAAAAGGAAGACAAATATAAAAAAAAGTCGTCAAAGAAAGAGCCATGGACGCCATCGAT
TCCGTCGTTGATCCTCTCAGAGACTTTGCAAAGGACAGCATTCGCCTCGTTAAGCGTTGT
CACAAACCAGATCGCAAAGAATTCACGAAAGTGGCGTTCCGTACAGCGATCGGGTTTGTA
GTAATGGGATTCGTGGGATTCTTTGTGAAGCTCATTTTTATTCCCATCAACAACATCATC
GTCGGTGCCACCTAGATAACCAGCGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGGTAGAAACAGCTT
TCTTGTTTCAAGAAAACAATTTCACAGTTTTTTGTTTTGTTCAGATACTCAGAAAGAGGA
AACATATGTTAACCACACATTTGAGATCAGTTTCCAGTAATTGCATTCTATTTTATACGT
TACTGTTTATTTCGCTATACCCCTAGAATTTGCCGTTAGATATGGTGACAAAACCCACAA
AGATAATGAATCAATCAGGTTCAATTTTATTTTAGAG

QA 1 577 1 577
DS 

RD RS1A015TV 522 0 0
AAACCAGAAAAGGAAGACAAATATAAAAAAAAGTCGTCAAAGAAAGAGCCATGGACGCCA
TCGATTCCGTCGTTGATCCTCTCAGAGACTTTGCAAAGGACAGCATTCGCCTCGTTAAGC
GTTGTCACAAACCAGATCGCAAAGAATTCACGAAAGTGGCGTTCCGTACAGCGATCGGGT
TTGTAGTAATGGGATTCGTGGGATTCTTTGTGAAGCTCATTTTTATTCCCATCAACAACA
TCATCGTCGGTGCCACCTAGATAACCAGCGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGGTAGAAAC
AGCTTTCTTGTTTCAAGAAAACAATTTCACAGTTTTTTGTTTTGTTCAGATACTCAGAAA
GAGGAAACATATGTTAACCACACATTTGAGATCAGTTTCCAGTAATTGCATTCTATTTTA
TACGTTACTGTTTATTTCGCTATACCCCTAGAATTTGCCGTTAGATATGGTGACAAAACC
CACAAAGATAATGAATCAATCAGGTTCAATTTTATTTTAGAG

QA 1 522 1 522
DS 



AS 1 2

CO CL8236Contig1 526 2 1 U
GGGAACATAGCTTGTACTTGTGAAGCTACAAAAAAAAGATTGGGAGAATCTCAGAGCTTT
ATGTGGTGTTTTAAAGACTTTGTTTACTTTATTCATAGTCTTTACTCTTTTTCACAGCTT
CTAAGCTCAAGCTGTTCCTCCTGCTGGTTCGTTGGTTAAGCACTTGTCCTCGGTTCTCAA
GTGGACTACAGGATCATCATCCTCTAAAACATCCTCCCAACCAGGGTCAGTGAAAGCTGA
AAGCTAACACCAGCAAAGAGTTTGGAGACCATGGTCCTTTGTAAAGGTATGACACTTGTA
TCAAATAGTTGTAGCTATTCCAGAATTGTGTACAAACGAATATATTCAAGGGACTAACGG
TAGAATACAGTTCCTATTGAACAAAAAATAAAATAAAGGGCCCTACCGGATTCGAACCGG
TGACCTCTTGATCTGCAGTCAAATGCTCTACCACTGAGCTAAGGACCCTTTTTGTCGTTT
TCAGTAATAATTTACATTACTATTAATTACTTAGAATTTCACCTAG


BQ
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AF RS1AT84JQ C 1
AF RS1AT84TF U 1
BS 1 526 RS1AT84TF

RD RS1AT84JQ 526 0 0
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GTGGACTACAGGATCATCATCCTTTAAAACATCCTCCCAACCAGGGTCAGTGAAAGCTGA
AAGCTAACACCAGCAAAGAGTTTGGAGACCATGGTCCTTTGTAAAGGTATGACACTTGTA
TCAAATAGTTGTAGCTATTCCAGAATTGTGTACAAACGAATATATTCAAGGGACTAACGG
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TCAGTAATAATTTACATTACTATTAATTACTTAGAATTTCACCTAG

QA 1 526 1 526
DS 

RD RS1AT84TF 526 0 0
GGGAACATAGCTTGTACTTGTGAAGCTACAAAAAAAAGATTGGGAGAATCTCAGAGCTTT
ATGTGGTGTTTTAAAGACTTTGTTTACTTTATTCATAGTCTTTACTCTTTTTCACAGCTT
CTAAGCTCAAGCTGTTCCTCCTGCTGGTTCGTTGGTTAAGCACTTGTCCTCGGTTCTCAA
GTGGACTACAGGATCATCATCCTCTAAAACATCCTCCCAACCAGGGTCAGTGAAAGCTGA
AAGCTAACACCAGCAAAGAGTTTGGAGACCATGGTCCTTTGTAAAGGTATGACACTTGTA
TCAAATAGTTGTAGCTATTCCAGAATTGTGTACAAACGAATATATTCAAGGGACTAACGG
TAGAATACAGTTCCTATTGAACAAAAAATAAAATAAAGGGCCCTACCGGATTCGAACCGG
TGACCTCTTGATCTGCAGTCAAATGCTCTACCACTGAGCTAAGGACCCTTTTTGTCGTTT
TCAGTAATAATTTACATTACTATTAATTACTTAGAATTTCACCTAG

QA 1 526 1 526
DS 



AS 1 2

CO CL8237Contig1 661 2 1 U
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TCTTGATGTTCCCAACAAAGACTATGGAGGTGACTTGTACATCGAAGGAAAGGTGATACC
AAGACCACAGTACAGGTTCACTGAACAGCGTCAAATTAGAAATCGGTCTAGCCTAGTATG
A


BQ
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10 

AF RS1CE19TF U 1
AF RS1BI63TF U 1
BS 1 661 RS1BI63TF

RD RS1CE19TF 542 0 0
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QA 1 527 1 527
DS 

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CTTCTCGTTCTCGATTCGCTTTCCCTTTACTCGACAAAGTCTCCTCGAACCGAACCGGAT
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AAGAGCTTTCTTGCAAACCAAAGGCTTACCTGGTGTTCTCTGGGTTTTACCAGATTCTTA
TCTTGATGTTCCCAACAAAGACTATGGAGGTGACTTGTACATCGAAGGAAAGGTGATACC
AAGACCACAGTACAGGTTCACTGAACAGCGTCAAATTAGAAATCGGTCTAGCCTAGTATG
A

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 2

CO CL8238Contig1 1020 2 2 U
GGATATAGCTCGATTTGACAAATTCATTTGGATATGGCAGCAGCAGCAGCGATATCTATT
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GCTCGATATCGAAGTTGGAGTTCAATCTTCCCTTTCAATCGGAAGAGATTCTTCTCCCCT
AATAAAACTATGGCCGATTTAGTCAAAACCCACGCTTGGAGAGACGGCGACGGGGAAGAA
CGGTTTCAGGCGTTGGAGCAAGAGGCTTTTATGAATAATCCCTCCAACGATTTGGTCTCA
GGGATCAACGCCGTCGCTAATCGTCTGAGCAAATGGGTTGTCGCTGCTCTGTTTGGATCG
GTTCTGCTTCTACGACATGATGGTGCAGCCTTGTGGGCTGTCATTGGCTCCGTTTCCAAT
TCCGCACTTTCCGTAGCTCTCAAGCGCATCCTTAACCAAGAGAGACCTGTTGCAACACTT
CGTTCTGACCCTGGCATGCCTTCTTCTCATGCTCAATCCATTTCTTTCATCTCTGCCTTT
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ACCTGGAACTCACTTGTTCTCCAAGCTTTTGCCTCGTCATTCTCCGTACAAATAGCTGTC
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TTGTTTCCCATTTCACTCAATACTGTTTGAGCTGTATAGCAATCAATATTACCACACTTG
TATTCTGTTTCTTGACACCAAAACAGTAACTTTTTAAGTATAGTATACAGTGTTTAAGAT


BQ
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AF RS1A482JQ C 270
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GCTCGATATCGAAGTTGGAGTTCAATCTTCCCTTTCAATCGGAAGAGATTCTTCTCCCCT
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CGGTTTCAGGCGTTGGAGCAAGAGGCTTTTATGAATAATCCCTCCAACGATTTGGTCTCA
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GTTCTGCTTCTACGACATGATGGTGCAGCCTTGTGGGCTGTCATTGGCTCCGTTTCCAAT
TCCGCACTTTCCGTAGCTCTCAAGCGCATCCTTAACCAAGAGAGACCTGTTGCAACACTT
CGTTCTGACCCTGGCATGCCTTCTTCTCATGCTCAATCCATTTCTTTCATCTCTGCCTTT
ACCCTCTTCTCTCTCATTGAGTGGCTTGGAACCAATGAACTCTCTCTTTTCCTCACCACC
CTCATCCTCGCTTTGGCTTCTTACTTTACATGGTTAAGGGTTTCCCAGAAGCTTCACACG
CCCAGTCAAGTGGTGGTAGGTGCAATCGTGGGCTCTCTTTACTCCACCTTGTGGTACATT
ACCTGGAACTCACTTGTTCTCCAAGCTTTTGCCTCGTCATTCTCCGTACAAATAGCTGTC
TTTACAGCTGC

QA 1 791 1 791
DS 

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CAAATGGGTTGTCGCTGCTCTGTTTGGATCGGTTCTGCTTCTACGACATGATGGTGCAGC
CTTGTGGGCTGTCATTGGCTCCGTTTCCAATTCCGCACTTTCCGTAGCTCTCAAGCGCAT
CCTTAACCAAGAGAGACCTGTTGCAACACTTCGTTCTGACCCTGGCATGCCTTCTTCTCA
TGCTCAATCCATTTCTTTCATCTCTGCCTTTACCCTCTTCTCTCTCATTGAGTGGCTTGG
AACCAATGAACTCTCTCTTTTCCTCACCACCCTCATCCTCGCTTTGGCTTCTTACTTTAC
ATGGTTAAGGGTTTCCCAGAAGCTTCACACGCCCAGTCAAGTGGTGGTAGGTGCAATCGT
GGGCTCTCTTTACTCCACCTTGTGGTACATTACCTGGAACTCACTTGTTCTCCAAGCTTT
TGCCTCGTCATTCTCCGTACAAATAGCTGTCTTTACAGCTGCTGCTGCGTCTGCTCTAGG
TTTTGCAGTTTATGTGCTACTTAACTGGTTCAAAGATGACAGATAGACAAACAAAATATA
GTTAGAGGGTTGGGTTGTAAAACTATTCCTTTTGTTTCCCATTTCACTCAATACTGTTTG
AGCTGTATAGCAATCAATATTACCACACTTGTATTCTGTTTCTTGACACCAAAACAGTAA
CTTTTTAAGTATAGTATACAGTGTTTAAGAT

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

CO CL8239Contig1 934 2 6 U
GTTATCTCATGTGGGATTTATAAGTGTGCCATTTCTTAGGTGTCACAACCACAATTCACC
TCACAACATTTTTGAAAAAACCCTCTTCAATCTAGGCTAATTACATATCATGCCATTACA
ATTAATATATAGTATAAGTTTCATTTTATGCATATTCAATAAAGACGAACAAATGAAATT
TAATGAGTTGCTAAATAAGGAAAATGTCAATATTGTCACTAATTATATTCTTCGGTTATT
ATTTAACCATTTTTTTAAAAAAATTGGATACTCGAGATCAATAAAACAAAATGAATTAGT
TGTGGGTGTCTTTTCTGTTTCTTTCAAAAAATGTTTTAAAACAATGGAAACTTTGGATCG
ATTTCCGAAACGTGAAATTTATTGTTTATATGATATACAATATTTTGAGTACTCTAATCG
TTGAGAGTTTGAGTTTACACTATTTTATAAAATGTTAAGTCAATGTATAATGTTTTCAGA
ACCATGATTACAAAGATAACTTTAAAACCAAAATAATATTCGTAAATTATTAACATTTAT
AATCGTCAGCCACTTTTCGGATTTCAATTATGTTTGAGTCAATGAATTATATTTACGTGA
ATCAAAAATAAACTTAATGAAGTAAATCTTGGTGTCAAGTCAAATATTAGTCATAAAATT
TGAGTCAATCAATCATATATGAGATTTCAATTATGTTTAGTCTATATTGTATTCTTTCCT
ATTTTAGAGCTAGACTGATGTAGAAACGTAAATCACATGCTGAAAATGATCACAATAACA
ACAACAACATTATGACAAGCTTTCACAGTAAAGTAATTTTTATCAATCAATTATATTCGG
TATTTCAATTATGGTAGTCTATTATATTCTTACCAATTTTAGATGAAAATATAAGGATTG
ATTGTGATACATGATAGTAACCTAATAAATTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FK73TF U 1
AF RS1FK73JQ C 258
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BS 767 783 RS1FK73TF
BS 784 934 RS1FK73JQ

RD RS1FK73TF 794 0 0
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TCACAACATTTTTGAAAAAACCCTCTTCAATCTAGGCTAATTACATATCATGCCATTACA
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TAATGAGTTGCTAAATAAGGAAAATGTCAATATTGTCACTAATTATATTCTTCGGTTATT
ATTTAACCATTTTTTTAAAAAAATTGGATACTCGAGATCAATAAAACAAAATGAATTAGT
TGTGGGTGTCTTTTCTGTTTCTTTCAAAAAATGTTTTAAAACAATGGAAACTTTGGATCG
ATTTCCGAAACGTGAAATTTATTGTTTATATGATATACAATATTTTGAGTACTCTAATCG
TTGAGAGTTTGAGTTTACACTATTTTATAAAATGTTAAGTCAATGTATAATGTTTTCAGA
ACCATGATTACAAAGATAACTTTAAAACCAAAATAATATTCGTAAATTATTAACATTTAT
AATCGTCAGCCACTTTTCGGATTTCAATTATGTTTGAGTCAATGAATTATATTTACGTGA
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TGAGTCAATCAATCATATATGAGATTTCAATTATGTTTAGTCTATATTGTATTCTTTCCT
ATTT*AGAGCTAGACTGATGTAGAAACGTAAATCACATGCTGAAA*TGATCACAATAACA
ACA
CACATTATGAC

QA 1 783 1 783
DS 

RD RS1FK73JQ 677 0 0
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TTTCTTTCAAAAAATGTTTTAAAACAATGGAAACTTTGGATCGATTTCCGAAACGTGAAA
TTTATTGTTTATATGATATACAATATTTTGAGTACTCTAATCGTTGAGAGTTTGAGTTTA
CACTATTTTATAAAATGTTAAGTCAATGTATAATGTTTTCAGAACCATGATTACAAAGAT
AACTTTAAAACCAAAATAATATTCGTAAATTATTAACATTTATAATCGTCAGCCACTTTT
CGGATTTCAATTATGTTTGAGTCAATGAATTATATTTACGTGAATCAAAAATAAACTTAA
TGAAGTAAATCTTGGTGTCAAGTCAAATATTAGTCATAAAATTTGAGTCAATCAATCATA
TATGAGATTTCAATTATGTTTAGTCTATATTGTATTCTTTCCTATTTTAGAGCTAGACTG
ATGTAGAAACGTAAATCACATGCTGAAAATGATCACAATAACAACAACAACATTATGACA
AGCTTTCACAGTAAAGTAATTTTTATCAATCAATTATATTCGGTATTTCAATTATGGTAG
TCTATTATATTCTTACCAATTTTAGATGAAAATATAAGGATTGATTGTGATACATGATAG
TAACCTAATAAATTTTC

QA 1 677 1 677
DS 



AS 1 2

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TCAGCTTTTGCTTTTTGTGGGCGTTTCATTAGTAGGCACTTCGAGAAGAAACGTACTGTT
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CTCGCCATGAGAAAGCGTGCCAGGATTGAAAGGATGAAAAATTCACTCAGAAGAATCAAA
GCAGCCAAGTCATCCTCATCATCATCCCCTTATTCATGCTTTAGCATCTTCTCAGTTGTA
GTCACGCTTCTGTTCTTCGCCTTTCTACTCTTTCAAGGATTGTTTGCAGGCAATATGACT
ATGAGTTCAGACAACTCACCTGCGCCAATTGGTTCACCTAACAACCAACTCATCTCTGTT
CATTTCTACAACGATTTTGCTCCCGTTGAGCAAACCGATCCCAGCCCTACCACCTCGTAC
AGATACGCGAGGAAGCGAGTTTCGGGTGCAGAAGAAGACTAGAGATGAGATGAGATGTCA
TGTCACCGAGAAGCGTCTTCTGTGTTTGGTATTAGTCTCTCCTTGTTTCGAGTTTTGTTC
CTGTCTTGTCCCCCCTTGTATATCTGTGTTGTTAACTGTGTCTCTCTGTCGAAGTTAGGT
CTTGTAAAACGACTGCGTTCTAAATAATGATGATGATGTAACTTGAACCC


BQ
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AF RS1EV11TF U 1
AF RS1EV11JQ C 208
BS 1 748 RS1EV11TF
BS 749 950 RS1EV11JQ

RD RS1EV11TF 748 0 0
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TCAGCTTTTGCTTTTTGTGGGCGTTTCATTAGTAGGCACTTCGAGAAGAAACGTACTGTT
AGTAGGATGGATCAATTGGTTTCGGGAGAACAAGACATCGAAGCTGGATTAGCTCATGCC
ACCCAAGAATCCACATCAGATACTACTGTTAGTGGGGTCCAGAGTGACGATGATGATGAT
GATCTAAACTATCCCCTGATGGGAACAGAGACAAGCAGCCAAAGTTTAGATCTTTCGGGT
GTAAAAAGCAATGATATTGTTAAAGTTAAGAAGTCGAGTAAGGCTTCGAAGCCGCCTAGA
CCTCCAAAAGGCCCTTCTTTCACTGCTAACGACCATAAGGTGATGAAGGAAATTGCTGAG
CTCGCCATGAGAAAGCGTGCCAGGATTGAAAGGATGAAAAATTCACTCAGAAGAATCAAA
GCAGCCAAGTCATCCTCATCATCATCCCCTTATTCATGCTTTAGCATCTTCTCAGTTGTA
GTCACGCTTCTGTTCTTCGCCTTTCTACTCTTTCAAGGATTGTTTGCAGGCAATATGACT
ATGAGTTCAGACAACTCACCTGCGCCAATTGGTTCACCTAACAACCAACTCATCTCTGTT
CATTTCTACAACGATTTTGCTCCCGTTGAGCAAACCGATCCCAGCCCTACCACCTCGTAC
AGATACGCGAGGAAGCGAGTTTCGGGTG

QA 1 748 1 748
DS 

RD RS1EV11JQ 743 0 0
GTTAGTGGGGTCCAGAGTGACGATGATGATGATGATCTAAACTATCCCCTGATGGGAACA
GAGACAAGCAGCCAAAGTTTAGATCTTTCGGGTGTAAAAAGCAATGATATTGTTAAAGTT
AAGAAGTCGAGTAAGGCTTCGAAGCCGCCTAGACCTCCAAAAGGCCCTTCTTTCACTGCT
AACGACCATAAGGTGATGAAGGAAATTGCTGAGCTCGCCATGAGAAAGCGTGCCAGGATT
GAAAGGATGAAAAATTCACTCAGAAGAATCAAAGCAGCCAAGTCATCCTCATCATCATCC
CCTTATTCATGCTTTAGCATCTTTTCAGTTGTAGTCACGCTTCTGTTTTTCGCCTTTTTA
CTCTTTCAAGGATTGTTTGCAGGCAATATGACTATGAGTTCAGACAACTCACCTGCGCCA
ATTGGTTCACCTAACAACCAACTCATTTCTGTTCATTTTTACAACGATTTTGCTCCCGTT
GAGCAAACCGATCCCAGCCCTACCACCTCGTACAGATACGCGAGGAAGCGAGTTTCGGGT
GCAGAAGAAGACTAGAGATGAGATGAGATGTCATGTCACCGAGAAGCGTCTTCTGTGTTT
GGTATTAGTCTCTCCTTGTTTCGAGTTTTGTTCCTGTCTTGTCCCCCCTTGTATATCTGT
GTTGTTAACTGTGTCTCTCTGTCGAAGTTAGGTCTTGTAAAACGACTGCGTTCTAAATAA
TGATGATGATGTAACTTGAACCC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

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GGGACAGACGGGGGAAATCTCAATCCAGATTAACGCCCCAGAAAAGGGTTTGAATATCTA
TGAAGAAGAGCCGAGGAAAAAAGGATGCGTTTGCTGTGGAGCGTGAAGGATAGAAATCGA
AGAAGCGCAGAACACACTCTGATGGTGATGATAATGGTAAGAGAGAAACGGGAAAGAGAG
AGAGAGTAGTTGATTATTGTGATTTAGAAGCTCAAGAAAAGTCCAACATGAAGAAGAAGA
AGAAGAAGAAACCAACTTATGAGGAGCCTCTCTGGAAGCAGAGTCAGGATACTTATGAGG
AGAGGTTTGTATCGAAAGCTACTTGGGAGCAACTCCGATCCACACATTCTGTGGTGGCCT
GGTCCAACATAGTTTGGTTTCCTCAAGCTCTTCCTCGACAGGCGTTCATCACCTGGTAGC
GTGTAGAAACAGACTGGACACCGGAGATCGAATGAGACAATGGGGCCACACGCAGATCTG
TCTATTGTGTGGCGAACCTGATGAAACGCGTGATCACCTATTTTTTGCTTGTCCCTTCAC
CTACACGATTTGGACGATGTTGATGGCACCTTTCCTAGCTGGCCGCATTAACCCTGACTG
GTCCAGGACTATTGCGAGTCTCAGAAACAACAGACTCCCCAAAATAGATACACAGATAGT
GAAGATGACTTTCCAAGCTTCGATTTATTGGACTTGGCGCGAAAGAAATGGACGTCGTTA
TCTTAATCCTCCTCACTCGGCAGTGTACATTGCTCGGTCTGTCTACCGCGAAATGCAGAA
TCGATTGATAGCGCTGCATCATGGAAAAGGGGATGGGGTATTGAATGAAGGACTGAATAG
ATGGAACACCAAGACTGTGCTACGCTAGCTTTGACTCCACCATAACAGAAGAGATCTCTC
CCACTTATCTATTTCTGTTGCTTTTCCATTTGTTTCAACTTCAAAGTAGAGCATTCTTGT
GCTCAAAGCTCATCTCATTGTTTTCTCTTCTCCTGATCCCCTAGTTTAGGATCATGAGAT
TGTACAACCTTTTTTTGTTGTTATAAAGTTAACATTTCAACG


BQ
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AF RS1AS27TF U 1
AF RS1AS27JQ C 257
BS 1 685 RS1AS27TF
BS 686 686 RS1AS27JQ
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RD RS1AS27TF 801 0 0
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AGAGAGTAGTTGATTATTGTGATTTAGAAGCTCAAGAAAAGTCCAACATGAAGAAGAAGA
AGAAGAAGAAACCAACTTATGAGGAGCCTCTCTGGAAGCAGAGTCAGGATACTTATGAGG
AGAGGTTTGTATCGAAAGCTACTTGGGAGCAACTCCGATCCACACATTCTGTGGTGGCCT
GGTCCAACATAGTTTGGTTTCCTCAAGCTCTTCCTCGACAGGCGTTCATCACCTGGTAGC
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GAAGATGACTTTCCAAGCTTCGATT*ATTGGACTTGGCGCGAA*GAAATGGACGTCGTTA
TCTTA*TCCTCCTCACTCGGCAGTGTACATTGCTCGGTCTGTCTACCGCGAA*TGCAGAA
TCGATTGATAGCGCTGCATCA

QA 1 801 1 801
DS 

RD RS1AS27JQ 806 0 0
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GTTTCCTCAAGCTCTTCCTCGACAGGCGTTCATCACCTGGTAGCGTGTAGAAACAGACTG
GACACCGGAGATCGAATGAGACAATGGGGCCACACGCAGATCTGTCTATTGTGTGGCGAA
CCTGATGAAACGCGTGATCACCTATTTTTTGCTTGTCCCTTCACCTACACGATTTGGACG
ATGTTGATGGCACCTTTCCTAGCTGGCCGCATTAACCCTGACTGGTCCAGGACTATTGCG
AGTCTCAGAAACAACAGACTCCCCAAAATAGATACACAGATAGTGAAGATGACTTTCCAA
GCTTCGATTTATTGGACTTGGCGCGAAAGAAATGGACGTCGTTATCTTAATCCTCCTCAC
TCGGCAGTGTACATTGCTCGGTCTGTCTACCGCGAAATGCAGAATCGATTGATAGCGCTG
CATCATGGAAAAGGGGATGGGGTATTGAATGAAGGACTGAATAGATGGAACACCAAGACT
GTGCTACGCTAGCTTTGACTCCACCATAACAGAAGAGATCTCTCCCACTTATCTATTTCT
GTTGCTTTTCCATTTGTTTCAACTTCAAAGTAGAGCATTCTTGTGCTCAAAGCTCATCTC
ATTGTTTTCTCTTCTCCTGATCCCCTAGTTTAGGATCATGAGATTGTACAACCTTTTTTT
GTTGTTATAAAGTTAACATTTCAACG

QA 1 806 1 806
DS 



AS 1 2

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GAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATCGAGAAGGAGCCCAAGTTTTTGAAGAACGG
TGATGCTGGTATGGTGAAAATGACTCCGACCAAGCCCATGGTTGTTGAGACCTTCTCTGA
GTACCCACCCCCTGGACGTTTCGCTGTGAGGGACATGAGGCAGACTGTTGCAGTCGGTGT
CATCAAGAGCGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAGGTGACCAAGGCTGCCGCCTA
GAAGGGTGCCAAGTGAACTATCATAATCGAGACTCTATCATCATCAACCGCAGATGAACT
AAAGAACTTTGTGTGTTTTCTTACTTCAGTTTCGTTTGTTGTTGCTTGTTTGTGTTACAG
CTTCGTCCCTCCTCCTTCAGAACGTCATTCTCGTAATTGGGTTCTTGATCGGAGGTGGCG
GAGCTACGTCGCACAAAAGCTTCGTTGATTTTTGCGTTTTATTTGTTGTCTGATTTTTCA
GACTTTTTGGATATTATGTTATGATATTACATTCCTGCGGGC


BQ
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AF RS1AT80JQ C 1
AF RS1AT80TF U 1
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DS 

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CATCAAGAGCGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAGGTGACCAAGGCTGCCGCCTA
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GAGCTACGTCGCACAAAAGCTTCGTTGATTTTTGCGTTTTATTTGTTGTCTGATTTTTCA
GACTTTTTGGATATTATGTTATGATATTACATTCCTGCGGGC

QA 1 522 1 522
DS 



AS 1 2

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GAGTTATCATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EZ18TF C 1
AF RS1EZ18JQ U 37
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DS 

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AGCACAAAGGCCATGCGATCCGTCGAGTTATCATGC

QA 1 396 1 396
DS 



AS 1 2

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AGAGTGATTTCTATCTCCTTTTAACTATAATCTATCTTATTAAAACAGAAATATTCTGTG
GACCTAATATTTATTTTGTAAGTTTTTAAATTAAATACACCTTTATACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AN19TF U 1
AF RS1AN19JQ C 338
BS 1 817 RS1AN19TF
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RD RS1AN19TF 886 0 0
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TTAATACA*GCTGAGG*AGTAGTCAGTCTTAAGCAGTTT
AGACTCT

QA 1 879 1 879
DS 

RD RS1AN19JQ 732 0 0
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CAACAACAATGGCATTGGGACAACAAGTGCTACTAGTCCTAGGCCTGAAGATCTTTGCTT
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TTTAGACTCTTTTTAATTATTTGTTTTCTGGGTGTTTTTAATCAAAGCTTGTGATGCATT
ACTTTAATGTTTTCACTGAATTTAGAGTGATTTCTATCTCCTTTTAACTATAATCTATCT
TATTAAAACAGAAATATTCTGTGGACCTAATATTTATTTTGTAAGTTTTTAAATTAAATA
CACCTTTATACC

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL8245Contig1 1167 2 4 U
GGATGCTCGATCTTTCGTGAGAGAGAAAGAAAATGTTGTCCAAGATCAATCTGATTCTGA
GCAGGAGATGGAAACTGTCCAAGATCAATCTTATCCGAGTAAGACAGACTCTGAGGAGGA
GGAGCTATTGCAGCTAGATGGAAAGAGTATATCCGAATGGCTGGGCGAGCTAGATGCAAT
CTCCAAAGAAGTAGAGGCGGAACTAGTCTCACGAGACATCGGCTGCCACTCGGTTCAACT
CCTCGAAGCTGTAAATACAGTTCTCTTCGACACCAGAGGCTTCGAGAGGACATCAAAAAG
CTTGACTTTAGACCCCAAGTTCTCCTACCTACACTCTGTACTTAACTCTAGATGCGGCAC
TGCATTCTTGTTTAGTGTAATATACATTGAAGTTTGTCAGCGTCTCGGTTTGCCTATTGT
GGGAGCTCGAGTTGGGGAAGAGTTTTTGATTTGGCCTAAGACGGAGAATCCTGAAGAACT
CTTCAAAGTGACTTCAGGGCAGAGCTTGTTTGCTATTATCAATGGAAGGTGCGTCGATGA
TCCTGGTTCAATGGCATCAGATTTAACCGGAAAGTCACTTTTAGACCTTGATGTTGCTAC
AAACAGAGACATTATAGGGATTGCTCTCGCCAACTTGATTAGGGTTCACTGGAGACGTGC
TTCGAAGCCATCACCTGGACTAATGCTGACTTCTCCTCTTAGTCAACTTAACAACATCAG
TGTTTCTAATTTTCCATTGTTGCGACCTCAAGATCTTAGGTTGGCTATTGCGGCTGCTGA
AAGGCTGTTGATTTTGGAACCTCTTAACTGGCGACTTCGAAGAGACCTTGGTATGATGCA
CTATTACGCCAGGCAAAGTAGAGAGGCGATTCAAGAGCTTAGCATATGTATAGCCTTTGC
ATTTGATGAAAAGAAGCAAAAGTGTTGACGCTTTTTGTTGAGAAACTTCATCTACTGTCT
TCGTTGAAGTCGTCGCCCTTTGGCTCTGATCGCTTGGCCGTTCGTTGAAAACTCTCTCTG
TTTCTCTACTTCACTTGTAAATACTCTTTTCTATCTCTCTGTTGTGTTTGGATCATAAAA
CCCTTTTGTGGGATACATGTAACTTTTGTTGTGTGTAACTCTTTTACTTTCTTCTGGTCA
GAGTAATAATTGATTCCCCCATGGGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EL04TF U 1
AF RS1AX25JQ C 496
BS 1 759 RS1EL04TF
BS 760 760 RS1AX25JQ
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AAGGCTGTTGATTT

QA 1 794 1 794
DS 

RD RS1AX25JQ 672 0 0
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GGAACCTCTTAACTGGCGACTTCGAAGAGACCTTGGTATGATGCACTATTACGCCAGGCA
AAGTAGAGAGGCGATTCAAGAGCTTAGCATATGTATAGCCTTTGCATTTGATGAAAAGAA
GCAAAAGTGTTGACGCTTTTTGTTGAGAAACTTCATCTACTGTCTTCGTTGAAGTCGTCG
CCCTTTGGCTCTGATCGCTTGGCCGTTCGTTGAAAACTCTCTCTGTTTCTCTACTTCACT
TGTAAATACTCTTTTCTATCTCTCTGTTGTGTTTGGATCATAAAACCCTTTTGTGGGATA
CATGTAACTTTTGTTGTGTGTAACTCTTTTACTTTCTTCTGGTCAGAGTAATAATTGATT
CCCCCATGGGAC

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

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ACTCAGATCGGCGTTTTTCTTCCGCCGCAGACGCTTTTTCCGTCTCCTTCATTTACACCA
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ATTGTATAATCTCCGTTAATCAGATGATTAGTAAGCTTAATCGAAGTTTTAGAATT


BQ
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AF RS1DA11JQ C 1
AF RS1DA11TF U 1
BS 1 527 RS1DA11TF
BS 528 536 RS1DA11JQ

RD RS1DA11JQ 536 0 0
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CCAGTTCTCCAGGAAACAGAGCTTCAGGGAGAAGGTTACTAGATCTGTTAGGAGAGTGAA
GAGGTTTGTGTGGACACAGCTGAGATCAACGAGGAAGTTGAAACGCGTTTTCTGGTCTCG
ACTCAGATCGGCGTTTTTCTTCCGCCGCAGACGCTTTTTCCGTCTCCTTCATTTACACCA
AGACGAACCTTATTACAACTGCTTCTAAAAAGGTTTTAGAGAGATTTGGGAAAACGCTTG
AGTCAGTTGTGTGATTGTTCCGTTCTTTGATTATGTTTTTGCTTTTTGCTCAAATAAATC
ATTGTATAATCTCCGTTAATCAGATGATTAGTAAGCTTAATCGAAGTTTTAGAATT

QA 1 536 1 536
DS 

RD RS1DA11TF 527 0 0
GGAAAACTTGGAAACATAAAGATCCCTAAAAAGAAAAGAAAAAAACCCCATTTCTCAGCC
TCCATTGAATATGAGTGAGAAGCTCGTTTTCAGAAGCAACGGTGGTGGTGGTGGCGGCGG
CGGAGACCGTTACTTCCATGGAGAGTATCTGGAGAAGAGACAGCTGTTTCTCAGGAGCTA
CCAGTTCTCCAGGAAACAGAGCTTCAGGGAGAAGGTTACTAGATCTGTTAGGAGAGTGAA
GAGGTTTGTGTGGACACAGCTGAGATCAACGAGGAAGTTGAAACGCGTTTTCTGGTCTCG
ACTCAGATCGGCGTTTTTCTTCCGCCGCAGACGCTTTTTCCGTCTCCTTCATTTACACCA
AGACGAACCTTATTACAACTGCTTCTAAAAAGGTTTTAGAGAGATTTGGGAAAACGCTTG
AGTCAGTTGTGTGATTGTTCCGTTCTTTGATTATGTTTTTGCTTTTTGCTCAAATAAATC
ATTGTATAATCTCCGTTAATCAGATGATTAGTAAGCTTAATCGAAGT

QA 1 527 1 527
DS 



AS 1 2

CO CL8247Contig1 1245 2 2 U
GGCGTTAAGTTGTTCGTCTTCGATCTACACCGCCTTCAGTCGCAACGCAGGAATTAGGGA
ACATGGAAACTAGTCAAAGAGATGAGCTTTCTAGCTTCTTAACTGTTCTCCCCCCTGTGG
ATTTCTGTTGTGTTTATGGTTCTACGCTGCACCCAAATAACCAAGATAAGTCTAAAATGG
TGGACTACATCCTTGGCGTCTCTGATCCCTTGCAATGGCACTCTGAGAATCTGAAGATGA
ATTCAGATCACTATGCTTCATGGATGGTTCACCTTGGTGGAGCCAGGCTGATCACGGAAG
TTGCGGATAAAGTAGGTGTTGGAGTTCACTTCAACCCATTTGTCAGCTGGAACGACAGGA
AGCTCAAGTATGGGGTTGTTCGGATGAATGACCTAGTACAGGACATACTGGACTGGAACA
GATTCTACTTGAGTGGCCGTTTACAGAAACCGGTTCACTTGCTTGTTGATAATCTGGACA
TAGAAGACGTGAACTCTGTTAATAAGAGAGCCGCAGTATCTGCAGCCCTTCTTCTCTTGC
CATCAAAATTCACCGAGGAAGATCTGTACGCCAAAATATGCAGCCTTTCTTACATGGGAG
ACTTGCGAATGCTTTTTGCTGAGGACACTAATAAGGTGAACAAGATTGTGAAGGGGCAAT
TTGATCTTTTCCAGTCAATGTATAAGCCTTTTCTTGAAGACTGCCAGACCAAAAACTTGC
TGAGATTCTCATCTGCTGAAACTAATTTAGTTCAGGACTCAAGCCTTTCAGCATCACGCT
CTCTGGTCTCTTCTCTCCCTGCATCAGTAAGAAGCCAAATGGGGAAGTTACTTGGGGAAA
AGAAAATCTTGAGCGAGACCGGTAGAGTTTCAGGGGAAGTTTGTATAGGTTCAAGAGAAG
TAGCAGCGAGATGTATGGAGAAGGTAATGAAGCGAAGGGTAATGGTTTCAAGTGCCAGAC
AGGCTGTGTCTGGTTTCTTGGCTGCTGGAGCTATTAATGCAACAATGTATCTTTCCCAGA
AAATGCGCAAAGCTTGGAATTCTCGGTCATGAAAGGGTTTTAGATGAACTGTTAGTTGAA
GAAAGTAGATCTTGCCACCATTAAGTTGATGATCATTCTTTCTTTTTCTTCTTCTTTTTT
GGTTTTGAAGTAACAACTTTTCTTTTTGTGTTGATGGTTATGTCTTCTGATGTCATAGAT
GAGAGAAATATAGAAGCAAACACATCAATCTACTATCATTTTATC


BQ
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DS 



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GATGATGATGAGTCTGGCGAGGAGGATGATTCTGAAGAGGATGGATCCGACTCTGAGAAA
GGAATGGATGTTGACGAGGATGATTCAGAGGATGAAGATGATTCTGAGGATGAAGATGAT
GAGACCCCTAAGAAGCCTGAGGTGGTGTCCAACAAAAAGAGGCCGAATGAATCTGCTGCT
TCCAAAGCAGCTATTTCAGCAAAGAAAGCAAAACCAGCTACACCACACCCAGCTAAAAAG
GGTGGAAAGAGTCCTGTGAATGCTAACCAGAGCCCTAAATCTGGAGGTCAATCACCC

QA 1 657 1 657
DS 

RD RS1BC35JQ 783 0 0
GA
TAGCTTCGATCTCGTCTTTGAGAAAGAGTTTGAGCTTTCCCACAGTT*GGAGAGCGGGAG
TGTCCACTTTGTCGGGTACAAATCCCCCAACATGCCCGAAGACGAGGAGGACTTCTCTGA
TTCAGAAGAGGAGGAGGTAGCGGCTGCAGTTCCTGCAGCTGTCACTGTCAAGGCTGATGC
GAAGCCAAAGGTCAAGCCTGCCGAGGAAGTGAAGCCTGAATCAGATGATGATGATGATGA
TGATGAGTCTGGCGAGGAGGATGATTCTGAAGAGGATGGATCCGACTCTGAGAAAGGAAT
GGATGTTGACGAGGATGATTCAGAGGATGAAGATGATTCTGAGGATGAAGATGATGAGAC
CCCTAAGAAGCCTGAGGTGGTGTCCAACAAAAAGAGGCCGAATGAATCTGCTGCTTCCAA
AGCAGCTATTTCAGCAAAGAAAGCAAAACCAGCTACACCACACCCAGCTAAAAAGGGTGG
AAAGAGTCCTGTGAATGCTAACCAGAGCCCTAAATCTGGAGGTCAATCACCCTCCGGTGG
TGGTGCTAACAAGAATCAATTCAATTCTGGCAAGCAATTTGGTTCTAACAACAAGGGCAA
AGGAAAAGGAAAGGGCAGAGCCTAAGTTTTGAAGTTGGGAGTTTTGGATGAAAGAAACCG
GTTTTTGTTTTTATTTTTATTTTTTGTTGTCTTAAGATTTTTATCTAAATTGCAATTTTA
TAACTATTATGTAATTTCAGTATGAAAAGTGCTGGATTGAGAAAGAATACTTTTTTGAAC
C

QA 3 783 3 783
DS 



AS 1 2

CO CL8249Contig1 783 2 2 U
GGGTCCTCTTCTCTAATCTCAACAAAGAAAACGATTCAAAAGGAGAAGAAAGACAAATCT
TGTAACTTAGTCAATCAAATGGCAACCAAGGCTATCTTCTTCTTTGTCTCCGCCTTGTGC
CTGTCGTCTCTAGCCGGCAAGGCTATGGCCGATGCCGATGACTTTGACAGTTTCAAAATT
CAGGGATCGGTTTACTGTGACACATGCCGTGTCCAATTCGTTACCCGTCTCAGCAAATTC
CTTGAAGGAGCGAAAGTGAAGCTAGAGTGCAGGAGCAGAACAAACGGAACCGTTGCGTTG
ACAAAAGAAGCGGTGACCGACAAAACAGGCAGCTACACAATGGAAGTGACCGGTGACCAC
GAGGAGGAAGTCTGCGAGCTCGTTCTCCTCCAGTCACCTGACAGTGCTTGCAGTGACGTC
AGCCAAGATGCTTACTTACGTAACGCCGCTAAGGTTAGCCTGACGGCAAATGACGGTATC
GTCTCTCACGAGACACGTATCGTTAACCCTCTCGGTTTCATGGTTAAGACGCCGTCAGCT
GAATGTCCCGCCGCTTTTAAGGAGCTCGGAATCGTTCCTGACGTCACCTTCTAAATATGA
TTACGACTTCTATCTCAGAGATCGTTATTTTACTGCATCATCAATTGTTTGTTTTCTTAT
ATATAAAAGTGTAATATGATAAAATACAAAAATGGGTAATTAAAATAATTAATTATAACT
TTCCGAGCAAATTAAACTAATGTCATTATATAGAGAAATGATGCAGATCTTGTCTCTTTT
TAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1DA96TF U 1
AF RS1DA96JQ C 14
BS 1 539 RS1DA96TF
BS 540 783 RS1DA96JQ

RD RS1DA96TF 539 0 0
GGGTCCTCTTCTCTAATCTCAACAAAGAAAACGATTCAAAAGGAGAAGAAAGACAAATCT
TGTAACTTAGTCAATCAAATGGCAACCAAGGCTATCTTCTTCTTTGTCTCCGCCTTGTGC
CTGTCGTCTCTAGCCGGCAAGGCTATGGCCGATGCCGATGACTTTGACAGTTTCAAAATT
CAGGGATCGGTTTACTGTGACACATGCCGTGTCCAATTCGTTACCCGTCTCAGCAAATTC
CTTGAAGGAGCGAAAGTGAAGCTAGAGTGCAGGAGCAGAACAAACGGAACCGTTGCGTTG
ACAAAAGAAGCGGTGACCGACAAAACAGGCAGCTACACAATGGAAGTGACCGGTGACCAC
GAGGAGGAAGTCTGCGAGCTCGTTCTCCTCCAGTCACCTGACAGTGCTTGCAGTGACGTC
AGCCAAGATGCTTACTTACGTAACGCCGCTAAGGTTAGCCTGACGGCAAATGACGGTATC
GTCTCTCACGAGACACGTATCGTTAACCCTCTCGGTTTCATGGTTAAGACGCCGTCAGC

QA 1 539 1 539
DS 

RD RS1DA96JQ 770 0 0
TAATCTCAACAAAGAAAACGATTCAAAAGGAGAAGAAAGACAAATCTTGTAACTTAGTCA
ATCAAATGGCAACCAAGGCTATCTTCTTCTTTGTCTCCGCCTTGTGCCTGTCGTCTCTAG
CCGGCAAGGCTATGGCCGATGCCGATGACTTTGACAGTTTCAAAATTCAGGGATCGGTTT
ACTGTGACACATGCCGTGTCCAATTCGTTACCCGTCTCAGCAAATTCCTTGAAGGAGCGA
AAGTGAAGCTAGAGTGCAGGAGCAGAACAAACGGAACCGTTGCGTTGACAAAAGAAGCGG
TGACCGACAAAACAGGCAGCTACACAATGGAAGTGACCGGTGACCACGAGGAGGAAGTCT
GCGAGCTCGTTCTCCTCCAGTCACCTGACAGTGCTTGCAGTGACGTCAGCCAAGATGCTT
ACTTACGTAACGCCGCTAAGGTTAGCCTGACGGCAAATGACGGTATCGTCTCTCACGAGA
CACGTATCGTTAACCCTCTCGGTTTCATGGTTAAGACGCCGTCAGCTGAATGTCCCGCCG
CTTTTAAGGAGCTCGGAATCGTTCCTGACGTCACCTTCTAAATATGATTACGACTTCTAT
CTCAGAGATCGTTATTTTACTGCATCATCAATTGTTTGTTTTCTTATATATAAAAGTGTA
ATATGATAAAATACAAAAATGGGTAATTAAAATAATTAATTATAACTTTCCGAGCAAATT
AAACTAATGTCATTATATAGAGAAATGATGCAGATCTTGTCTCTTTTTAC

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 2

CO CL8250Contig1 810 2 2 U
GCATTCACCAAAGCAAAGTTCTTTGTGATCAAGTCGTACAGCGAAGACGATGTTCACAAC
AGTATAAAGTATGGTGTGTGGTCGAGCACGCCAACTGGTAACAAGAAGTTGAATGCTGCG
TATCAAGAGAGCTCTCCAGATTGTCCTGTGTATCTTCTGTTCTCGGTGAATGCAAGTGGG
CAGTTTGTTGGTGTTGCGGAGATGACAGGTCCTGTTGATTTCAACAAGGCAATGGAGTAT
TGGCGGCAAGATAAATGGATTGGTTGCTTCCCTGTAAAGTGGCATATCATCAAAGACGTA
CCAAACAGTCTAATGAGGCACATTACGCTTGCGAATAACGAGAACAAGCCTGTCACTAAC
AGCAGAGACACTCAAGAGGTTAAGCTGGAAGATGGAACCAGAATCATAAAGATCTTCAAG
GAGTATATGAGCAAGACATGTATACTTGATGATTTCAAGTTTTACGAGACTAGGCAGAAG
ATAATCAGAGATAAGAGGATCAAGCAGAAGAAGCAGGTCCTTGATGGAGCTTCTGTGGAA
ACGATTCACTGAAGTCAATGGGAGGAAAGATGATGACTTTTTAATTGAAAAACAGTTTGA
ATTATGTTTTTTTTAATCTTCAGGCTTTGGAGAACCTAATACACCATTATATGTGGTTTT
CAATGCTTTTTTCTAGACAAGGTTACATTGTGTTTTGTTCCTTTGTATAAGGAGGACGCA
CATTTGATAAAACAAAACTCATGATTTGTTCTTCTTCCCTTCAGAGATTCATCTGATAAG
ATTCTTGGTTTTATTTACTTATTAGTTCCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G249TF U 1
AF RS1G249JQ C 67
BS 1 592 RS1G249TF
BS 593 810 RS1G249JQ

RD RS1G249TF 592 0 0
GCATTCACCAAAGCAAAGTTCTTTGTGATCAAGTCGTACAGCGAAGACGATGTTCACAAC
AGTATAAAGTATGGTGTGTGGTCGAGCACGCCAACTGGTAACAAGAAGTTGAATGCTGCG
TATCAAGAGAGCTCTCCAGATTGTCCTGTGTATCTTCTGTTCTCGGTGAATGCAAGTGGG
CAGTTTGTTGGTGTTGCGGAGATGACAGGTCCTGTTGATTTCAACAAGGCAATGGAGTAT
TGGCGGCAAGATAAATGGATTGGTTGCTTCCCTGTAAAGTGGCATATCATCAAAGACGTA
CCAAACAGTCTAATGAGGCACATTACGCTTGCGAATAACGAGAACAAGCCTGTCACTAAC
AGCAGAGACACTCAAGAGGTTAAGCTGGAAGATGGAACCAGAATCATAAAGATCTTCAAG
GAGTATATGAGCAAGACATGTATACTTGATGATTTCAAGTTTTACGAGACTAGGCAGAAG
ATAATCAGAGATAAGAGGATCAAGCAGAAGAAGCAGGTCCTTGATGGAGCTTCTGTGGAA
ACGATTCACTGAAGTCAATGGGAGGAAAGATGATGACTTTTTAATTGAAAAA

QA 1 592 1 592
DS 

RD RS1G249JQ 744 0 0
AAGTATGGTGTGTGGTCGAGCACGCCAACTGGTAACAAGAAGTTGAATGCTGCGTATCAA
GAGAGCTCTCCAGATTGTCCTGTGTATCTTCTGTTCTCGGTGAATGCAAGTGGGCAGTTT
GTTGGTGTTGCGGAGATGACAGGTCCTGTTGATTTCAACAAGGCAATGGAGTATTGGCGG
CAAGATAAATGGATTGGTTGCTTCCCTGTAAAGTGGCATATCATCAAAGACGTACCAAAC
AGTCTAATGAGGCACATTACGCTTGCGAATAACGAGAACAAGCCTGTCACTAACAGCAGA
GACACTCAAGAGGTTAAGCTGGAAGATGGAACCAGAATCATAAAGATCTTCAAGGAGTAT
ATGAGCAAGACATGTATACTTGATGATTTCAAGTTTTACGAGACTAGGCAGAAGATAATC
AGAGATAAGAGGATCAAGCAGAAGAAGCAGGTCCTTGATGGAGCTTCTGTGGAAACGATT
CACTGAAGTCAATGGGAGGAAAGATGATGACTTTTTAATTGAAAAACAGTTTGAATTATG
TTTTTTTTAATCTTCAGGCTTTGGAGAACCTAATACACCATTATATGTGGTTTTCAATGC
TTTTTTCTAGACAAGGTTACATTGTGTTTTGTTCCTTTGTATAAGGAGGACGCACATTTG
ATAAAACAAAACTCATGATTTGTTCTTCTTCCCTTCAGAGATTCATCTGATAAGATTCTT
GGTTTTATTTACTTATTAGTTCCT

QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

CO CL8251Contig1 1122 2 2 U
GGATCATCTCTCCATTTCCTGAATCTCAAGAATCAAGATGCACACCAATGCAGCAGACTC
AGAGGTAACAAGCCTCTCTGCTTCATCGCCCACTAGATCTCCCCGTCGACCAGCCTACTT
CGTGCAATCTCCTTCGCGTGACTCGCACGATGGAGAGAAAACCACAACATCGTTCCACTC
AACTCCCGTCCTCAGCCCGATGGGATCTCCTCCGCACTCTCACTCCTCCTCCAGCCGTTT
CTCCAAGATCAACGGCTCCAAGCGCAAACCGCTCGGTGGAGACAGGAAGTTCGCAATGAT
CGAAGAGGAAGGTTTGCTCCATGATGGTGACAGAGAAGATAAAGGTTTGTCTCGTCGTTG
CTATGTCTTAGCATTCGTTGTTGGATTCTCCTTGCTCTTCGCTTTCTTCTCTTTGATCCT
TTATGCAGCTGCTAAGCCTCAGAAGCCTAAGATCTTAGTCAAGAGTATAACATTTGAGGA
ACTTAAGGTCCAAGCTGGACAAGATGCGGGAGGTATAGGAACCGACATGATCACGATGAA
CGCGACTTTGAGAATGATGTACCGTAACACGGGGACATTCTTTGGTGTTCATGTTACTTC
TTCTCCCATCGATCTGAGTTTCTCTCAGATCACTATTGGTTCTGGAACTATTAAGAAATT
TTACCAATCAAGAAAAAGCCAAAGAACAGTGATAGTAAATATGATTGGAGACAAGACTCC
TCTCTACGGAAGTGGTTCTACCTTAGTGCCACCACCACCTCCTGCACCGATTCCAATAAA
GAGCAGCAAGAAGAAGAAAGGACCCATCGTGATCGTCGAGCCACCGGCACCTCCTGCTCC
CGTGCCGATGAGGTTAAACTTCACCGTTAAATCTCATGCTTACGTGTTGGGAAAATTGGT
TCATCCCAAGTTCTACAAGAGAATCGTGTGTTTGATTAACTTCGAACACAAGAAACTCAA
TAAACACATTGCACTCACGAACAACTGCACCGTCACTTCTGTTTGACAATAAAGACAACC
CTTGACAGTGCAAGAATCGTATTGAGCAACGTGTCAAAATTATTGTCGGTGGGTTTAATA
TGTTCTTTAATTTATGTGAGTGGACTACGATCAATGGAGAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AJ88TF U 1
AF RS1AJ88JQ C 263
BS 1 788 RS1AJ88TF
BS 789 1122 RS1AJ88JQ

RD RS1AJ88TF 788 0 0
GGATCATCTCTCCATTTCCTGAATCTCAAGAATCAAGATGCACACCAATGCAGCAGACTC
AGAGGTAACAAGCCTCTCTGCTTCATCGCCCACTAGATCTCCCCGTCGACCAGCCTACTT
CGTGCAATCTCCTTCGCGTGACTCGCACGATGGAGAGAAAACCACAACATCGTTCCACTC
AACTCCCGTCCTCAGCCCGATGGGATCTCCTCCGCACTCTCACTCCTCCTCCAGCCGTTT
CTCCAAGATCAACGGCTCCAAGCGCAAACCGCTCGGTGGAGACAGGAAGTTCGCAATGAT
CGAAGAGGAAGGTTTGCTCCATGATGGTGACAGAGAAGATAAAGGTTTGTCTCGTCGTTG
CTATGTCTTAGCATTCGTTGTTGGATTCTCCTTGCTCTTCGCTTTCTTCTCTTTGATCCT
TTATGCAGCTGCTAAGCCTCAGAAGCCTAAGATCTTAGTCAAGAGTATAACATTTGAGGA
ACTTAAGGTCCAAGCTGGACAAGATGCGGGAGGTATAGGAACCGACATGATCACGATGAA
CGCGACTTTGAGAATGATGTACCGTAACACGGGGACATTCTTTGGTGTTCATGTTACTTC
TTCTCCCATCGATCTGAGTTTCTCTCAGATCACTATTGGTTCTGGAACTATTAAGAAATT
TTACCAATCAAGAAAAAGCCAAAGAACAGTGATAGTAAATATGATTGGAGACAAGACTCC
TCTCTACGGAAGTGGTTCTACCTTAGTGCCACCACCACCTCCTGCACCGATTCCAATAAA
GAGCAGCA

QA 1 788 1 788
DS 

RD RS1AJ88JQ 860 0 0
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GATGGTGACAGAGAAGATAAAGGTTTGTCTCGTCGTTGCTATGTCTTAGCATTCGTTGTT
GGATTCTCCTTGCTCTTCGCTTTCTTCTCTTTGATCCTTTATGCAGCTGCTAAGCCTCAG
AAGCCTAAGATCTTAGTCAAGAGTATAACATTTGAGGAACTTAAGGTCCAAGCTGGACAA
GATGCGGGAGGTATAGGAACCGACATGATCACGATGAACGCGACTTTGAGAATGATGTAC
CGTAACACGGGGACATTCTTTGGTGTTCATGTTACTTCTTCTCCCATCGATCTGAGTTTC
TCTCAGATCACTATTGGTTCTGGAACTATTAAGAAATTTTACCAATCAAGAAAAAGCCAA
AGAACAGTGATAGTAAATATGATTGGAGACAAGACTCCTCTCTACGGAAGTGGTTCTACC
TTAGTGCCACCACCACCTCCTGCACCGATTCCAATAAAGAGCAGCAAGAAGAAGAAAGGA
CCCATCGTGATCGTCGAGCCACCGGCACCTCCTGCTCCCGTGCCGATGAGGTTAAACTTC
ACCGTTAAATCTCATGCTTACGTGTTGGGAAAATTGGTTCATCCCAAGTTCTACAAGAGA
ATCGTGTGTTTGATTAACTTCGAACACAAGAAACTCAATAAACACATTGCACTCACGAAC
AACTGCACCGTCACTTCTGTTTGACAATAAAGACAACCCTTGACAGTGCAAGAATCGTAT
TGAGCAACGTGTCAAAATTATTGTCGGTGGGTTTAATATGTTCTTTAATTTATGTGAGTG
GACTACGATCAATGGAGAGT

QA 1 860 1 860
DS 



AS 1 2

CO CL8252Contig1 534 2 1 U
TTCAATTTCTCCAGCTAAACTTTTATAGAGATAAAGAGGGAGATGGTGATTCCACCGGCA
GTTAGACCACCACGCCTCTTCGACTACCTCAAACCTTACGTCCTGAAAATGCACTTCACG
AACAAGTTTGTTCACGCCCAAGTCATCCACTCGCCGACAGCCACAGTGGCTTGCTCAGCT
AGCTCGCAGGAGAAAGCATTGAGGGAAACGATGGGCGTCACACGCGACGTGGCCGCTGCT
TCAAAGATTGGTAAGATCCTTGGGGAAAGGCTCTTGATGAAAGATATCCCAGCTGTTGCT
ATCCACATGAAGAAAGAGCAGAGGTATCATGGTAAAGTCAAGGCCGTGATCGATTCCGTC
AGGGAAGCTGGCGTCAAGTTACTCTGAGTATTACAATCCAAAAAAAATCAAATTCCAATG
TTGTTGATTTCGGACATTGTTTGCTTCTTCATCTTCAGGGTTTTGAAGAAACCTGTTCCA
AAAGAGAATGAATGTTAAGCTTTGGCTATTGAAATAATAGGACTATATAATACC


BQ
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AF RS1FA19JQ C 1
AF RS1FA19TF U 1
BS 1 534 RS1FA19TF

RD RS1FA19JQ 534 0 0
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GTTAGACCACCACGCCTTTTCGACTACCTCAAACCTTACGTCCTGAAAATGCACTTCACG
AACAAGTTTGTTCACGCCCAAGTCATCCACTCGCCGACAGCCACAGTGGCTTGTTCAGCT
AGCTCGCAGGAGAAAGCATTGAGGGAAACGATGGGCGTCACACGCGACGTGGCCGCTGCT
TCAAAGATTGGTAAGATCCTTGGGGAAAGGCTCTTGATGAAAGATATCCCAGCTGTTGCT
ATCCACATGAAGAAAGAGCAGAGGTATCATGGTAAAGTCAAGGCCGTGATCGATTCCGTC
AGGGAAGCTGGCGTCAAGTTACTCTGAGTATTACAATCCAAAAAAAATCAAATTCCAATG
TTGTTGATTTCGGACATTGTTTGCTTCTTCATCTTCAGGGTTTTGAAGAAACCTGTTCCA
AAAGAGAATGAATGTTAAGCTTTGGCTATTGAAATAATAGGACTATATAATACC

QA 1 534 1 534
DS 

RD RS1FA19TF 534 0 0
TTCAATTTCTCCAGCTAAACTTTTATAGAGATAAAGAGGGAGATGGTGATTCCACCGGCA
GTTAGACCACCACGCCTCTTCGACTACCTCAAACCTTACGTCCTGAAAATGCACTTCACG
AACAAGTTTGTTCACGCCCAAGTCATCCACTCGCCGACAGCCACAGTGGCTTGCTCAGCT
AGCTCGCAGGAGAAAGCATTGAGGGAAACGATGGGCGTCACACGCGACGTGGCCGCTGCT
TCAAAGATTGGTAAGATCCTTGGGGAAAGGCTCTTGATGAAAGATATCCCAGCTGTTGCT
ATCCACATGAAGAAAGAGCAGAGGTATCATGGTAAAGTCAAGGCCGTGATCGATTCCGTC
AGGGAAGCTGGCGTCAAGTTACTCTGAGTATTACAATCCAAAAAAAATCAAATTCCAATG
TTGTTGATTTCGGACATTGTTTGCTTCTTCATCTTCAGGGTTTTGAAGAAACCTGTTCCA
AAAGAGAATGAATGTTAAGCTTTGGCTATTGAAATAATAGGACTATATAATACC

QA 1 534 1 534
DS 



AS 1 2

CO CL8253Contig1 555 2 2 U
GGACCCATAAGAAAATCGTCAGCCTCCATCTATTACTCTTAGGATCGATTTGAAGCTTAA
AAGTCTCTCCTTTCAGATGGATGCTGATTACAAGAGACTCTTGTCTACGCTTCGATCCCG
ATCTGAGGTTTTAATGGGCTTTGAAGAAATAGATGGTGATGATGATTTCCATGAGGAGTT
TGCCTGCCCGTTCTGCGCAGAATCGTATGATATCATCGCCTTGTGCTGTCACATAGACGA
TGAACATAATCTAGAGTCAAAGAACGCGGTATGCCCTGTTTGCTCTCTAAGAGTGGGAAT
TGATATCGTAGCGCACATTACACTTCATCATGGGAGTTTATTCAAGATGCAGCGAAAGAG
GAAATCACGAAAAACTGGTTCACTTTCTCTTCTTCGGAAAGAGCTAAGAGAAGGAGATCT
ACAAAAGTTGTTAGGAATTTCTTCTCGCATTGGTTCTACTACTGCATCTAGTGGAACTCC
TGATCCTCTTCTTTCGTCATTTATCTCACCTACACGATCACATTTATTTCCGGTGACTCG
GCAAACGGAAAAAGT


BQ
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QA 1 526 1 526
DS 

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AAGTCTCTCCTTTCAGATGGATGCTGATTACAAGAGACTCTTGTCTACGCTTCGATCCCG
ATCTGAGGTTTTAATGGGCTTTGAAGAAATAGATGGTGATGATGATTTCCATGAGGAGTT
TGCCTGCCCGTTCTGCGCAGAATCGTATGATATCATCGCCTTGTGCTGTCACATAGACGA
TGAACATAATCTAGAGTCAAAGAACGCGGTATGCCCTGTTTGCTCTCTAAGAGTGGGAAT
TGATATCGTAGCGCACATTACACTTCATCATGGGAGTTTATTCAAGATGCAGCGAAAGAG
GAAATCACGAAAAACTGGTTCACTTTCTCTTCTTCGGAAAGAGCTAAGAGAAGGAGATCT
ACAAAAGTTGTTAGGAATTTCTTCTCGCATTGGTTCTACTACTGCATCTAGTGGAACTCC
TGATCCTCTTCTTTCGTCATTTATCTCACCTACACGATCACATTTATTTCCGGTGACTCG
GCAAACGGAAAAAGT

QA 1 555 1 555
DS 



AS 1 2

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ATTCTATGGGAGATCACTTCCAAATCCGCCGGAAAATTAAACACTCTGATCCTCCGTCAC
TGTCTTAGGATCACCGACATGGGGCTTCGACGTGTTGTGGACGCAAATCCTCTCATAAGA
AAGATAATTGTGCCAGGATGCACTGAACTGACTCCAGAAGGAATCATTGGATGTGTTGAA
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GTGTGCCTAGGATCAGACACCGAGATTCAAGAGGCAGCCTGCGGTGGCGACAGTCTGTGT
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TTTTGTTATGTCCAAACCTTTGATTATGAAATATATTATGAGACATGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FG93TF U 1
AF RS1FG93JQ C 223
BS 1 753 RS1FG93TF
BS 754 1008 RS1FG93JQ

RD RS1FG93TF 753 0 0
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TTCGAGCTTCTCTCCATGACCGGCGTTTCACGGTCCTTAAGAGACGCGATCAGAGACGAA
ACTGCGTTATGGACAAAGATCGTTGTTGAACAACCACTAAGCTCTCGTCTAACCGATGAT
ATTCTATGGGAGATCACTTCCAAATCCGCCGGAAAATTAAACACTCTGATCCTCCGTCAC
TGTCTTAGGATCACCGACATGGGGCTTCGACGTGTTGTGGACGCAAATCCTCTCATAAGA
AAGATAATTGTGCCAGGATGCACTGAACTGACTCCAGAAGGAATCATTGGATGTGTTGAA
AGCTTAACAAAGATGGAGACACTTCACATCAACGGCGTCCACCGCTTCACTAAAGACCAT
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AAATGCGACCAAGTCATGATGATTCCCTCTTGCTCAAGAGCGTCATGTAACCGTGGGAGA
AGACAAGAACGGAAGTGCAGGGGATGCTGGTTCTGCGTCCCTAGATGCACGGAGTGTTCG
GTGTGCCTAGGATCAGACACCGAGATTCAAGAGGCAGCCTGCGGTGGCGACAGTCTGTGT
CTTGAATGTTGGCCTGTGCTTCCGAAGTGCAGG

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1FG93JQ 786 0 0
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ACTCTGATCCTCCGTCACTGTCTTAGGATCACCGACATGGGGCTTCGACGTGTTGTGGAC
GCAAATCCTCTCATAAGAAAGATAATTGTGCCAGGATGCACTGAACTGACTCCAGAAGGA
ATCATTGGATGTGTTGAAAGCTTAACAAAGATGGAGACACTTCACATCAACGGCGTCCAC
CGCTTCACTAAAGACCATCTTTCAGCACTCTCCACTCACCTTCCTCACGAGGGAGCCGTA
GATGTCGAGGTTTGTCCCAAATGCGACCAAGTCATGATGATTCCCTCTTGCTCAAGAGCG
TCATGTAACCGTGGGAGAAGACAAGAACGGAAGTGCAGGGGATGCTGGTTCTGCGTCCCT
AGATGCACGGAGTGTTCGGTGTGCCTAGGATCAGACACCGAGATTCAAGAGGCAGCCTGC
GGTGGCGACAGTCTGTGTCTTGAATGTTGGCCTGTGCTTCCGAAGTGCAGGTTCTGCAAT
AAACCTTATTGCTCAAGTCACAGCAGTTTAAGGCATGATATTGTGACCGCTGATCATTCT
GCTCAGCCTATGTTTGAGTGCCAAGCTTGTCACTACAGGGCTGGTACTACAAACCCTTAT
GACGCTTTCGACTATCAAATTTAAACAAACATGTTGCTTTAGCACCAAGCTTATTTCATA
CTTATTCTTCTCTATATCTTTTGTTATGTCCAAACCTTTGATTATGAAATATATTATGAG
ACATGC

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

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AGAAAGCTGATGGATCAAAGGTCTGAAGGATACCACCATGTGGGATTTTTCCGCAGAGAC
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CGAAGATTCTGTTATGGCTCAGATCCAGCGAAAGTATGCTCCTCGCGAACTTAACCTTGG
AGAGATCGAACTGAAACATGTTTCTTGACAGATCCACTCGTATTGTTGTTTTGTTCCGTC
CGAAAAACATCGAACCATCTCCTATGAAACCATTTCCCGACAGATCTACTGCGTTGAAGT
CGTATTTTGACAACGATTCCGGTATTTTCCCTGCAAGACAAATTTATACTAAAAAAACTA
CTTTATCTAAAGATTTGAAACCATATAAAATTATTTTTTCTGTAATTTATTAATTTTCTA
TACAAGTGTCTGTAGCTTGATCTTTAAAAATTATTAAAAAAAACTCAAGTT


BQ
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AF RS1EN40JQ C 1
AF RS1EN40TF U 1
BS 1 531 RS1EN40TF

RD RS1EN40JQ 531 0 0
GGGGACTAAACAAAATTTAACAAGCCTTAAGAGGGGTCCCACAAAGACAGAGGTTGTGAG
AGAAAGCTGATGGATCAAAGGTCTGAAGGATACCACCATGTGGGATTTTTCCGCAGAGAC
GATTGTAACTAACGTTGAAATGCTGGAGGCGTAGCTTGCCCAGCTCCCGAGGCAACTTCC
CGAAGATTCTGTTATGGCTCAGATCCAGCGAAAGTATGCTCCTCGCGAACTTAACCTTGG
AGAGATCGAACTGAAACATGTTTCTTGACAGATCCACTCGTATTGTTGTTTTGTTCCGTC
CGAAAAACATCGAACCATCTCCTATGAAACCATTTCCCGACAGATTTACTGCGTTGAAGT
CGTATTTTGACAACGATTCCGGTATTTTCCCTGCAAGACAAATTTATACTAAAAAAACTA
CTTTATCTAAAGATTTGAAACCATATAAAATTATTTTTTCTGTAATTTATTAATTTTCTA
TACAAGTGTCTGTAGCTTGATCTTTAAAAATTATTAAAAAAAACTCAAGTT

QA 1 531 1 531
DS 

RD RS1EN40TF 531 0 0
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AGAAAGCTGATGGATCAAAGGTCTGAAGGATACCACCATGTGGGATTTTTCCGCAGAGAC
GATTGTAACTAACGTTGAAATGCTGGAGGCGTAGCTTGCCCAGCTCCCGAGGCAACTTCC
CGAAGATTCTGTTATGGCTCAGATCCAGCGAAAGTATGCTCCTCGCGAACTTAACCTTGG
AGAGATCGAACTGAAACATGTTTCTTGACAGATCCACTCGTATTGTTGTTTTGTTCCGTC
CGAAAAACATCGAACCATCTCCTATGAAACCATTTCCCGACAGATCTACTGCGTTGAAGT
CGTATTTTGACAACGATTCCGGTATTTTCCCTGCAAGACAAATTTATACTAAAAAAACTA
CTTTATCTAAAGATTTGAAACCATATAAAATTATTTTTTCTGTAATTTATTAATTTTCTA
TACAAGTGTCTGTAGCTTGATCTTTAAAAATTATTAAAAAAAACTCAAGTT

QA 1 531 1 531
DS 



AS 1 2

CO CL8256Contig1 880 2 4 U
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CATCCACTATTATGATTCTTTTCTGCAACCCTAAAAGATACAACATGGCTTTCTTAAGTA
AAGTTGGAGGGATATTTAGGCAGACTAGCACTCATCATGTCACTGCCTCTAACTTGATGA
TGCTCCGTTGCATGTCTTCTTCAAAAACCTTTGGTGTCTCTCACTCGATTCTACCGTTCA
TCCGTAGCTTCTCTTCTTCAAAAATCTTTGTTGGAGGTATCTCCTACCGCACTGATGAGG
TTGGCTTGAGAGAAGCTTTTAGCCATTTTGGTCAAATTGTTGATGCCGAAATTGTTGTGG
ACCGTGAAACTGGTAGATCGAGGGGTTTTGCTTTCGTGACATTTACTTCTAACGAGGATG
CTTGTAATGCCACAGATATGGATGGAGAGTACCTTCATGGTCGAAGACTTAGGGTGAACT
ACGCTACTGAAAGAGGAAGTGGGTTTGGAGGCGGTGGTGGTTACAGAGGCCGCCGTCATG
TTTTTTATGATGATCTTCTACCTTGGGGTTGCGAAGAAAGCTTTTCTGTTTGGTCGCAGT
GACAATCAGTTTGGTGGTTCAGAGAAAGGGTCAAACAGAGGTTGGTCCAGATGGAATTTG
ATCAGACTGACGATGGTGATGTTGCCAAGAGAGCTTAATCTCTCAATAATGTTGAGAACC
GCTGCAGTTTCAGCATAAACATATGGAAGTTTCTTAACGTTTGGGGTTTTGCTTATCATG
TAGAAACCTCTATTGTTGGTTGTTTTAAATGTTTTGACATTTGAGGCTCATAAATAAATA
AAAACAGTAATACCTTATAACAGAATTTTAGTTTTTTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1G903TF U 1
AF RS1G903JQ C 486
BS 1 565 RS1G903TF
BS 566 566 RS1G903JQ
BS 567 636 RS1G903TF
BS 637 880 RS1G903JQ

RD RS1G903TF 636 0 0
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TGCTCCGTTGCATGTCTTCTTCAAAAACCTTTGGTGTCTCTCACTCGATTCTACCGTTCA
TCCGTAGCTTCTCTTCTTCAAAAATCTTTGTTGGAGGTATCTCCTACCGCACTGATGAGG
TTGGCTTGAGAGAAGCTTTTAGCCATTTTGGTCAAATTGTTGATGCCGAAATTGTTGTGG
ACCGTGAAACTGGTAGATCGAGGGGTTTTGCTTTCGTGACATTTACTTCTAACGAGGATG
CTTGTAATGCCACAGATATGGATGGAGAGTACCTTCATGGTCGAAGACTTAGGGTGAACT
ACGCTACTGAAAGAGGAAGTGGGTTTGGAGGCGGTGGTGGTTACAGAGGCCGCCGTCATG
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GACAATCAGTTTGGTGGTTCAGAGAAAGGGTCAAAC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RS1G903JQ 395 0 0
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AGTTTCAGCATAAACATATGGAAGTTTCTTAACGTTTGGGGTTTTGCTTATCATGTAGAA
ACCTCTATTGTTGGTTGTTTTAAATGTTTTGACATTTGAGGCTCATAAATAAATAAAAAC
AGTAATACCTTATAACAGAATTTTAGTTTTTTTCT

QA 1 395 1 395
DS 



AS 1 2

CO CL8257Contig1 598 2 9 U
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CGCTGGGTTTTCAAGTTATGAAGAGCCACACTTTTTGGAATCTTGCTCTCTTTGCCGTAA
ACACCTTCCTCGTAACTCAGACATCTTCATGTACAGAGGAGACAAGGCGTTTTGTAGCAA
TGAGTGCAGAGAAGAACAGATTGAGTCTGATGAAGCCAAGGAGAAAAGCTGGAAAATTTC
TTCGAGATCCCTCCGTAAAAAATCGTCCGAAGCATCAAAAGATTGCAAAACCGTTCGGAC
AGGAACCCTCGTGGTGGCTTAGTTAAAAAAAAAGAAAAAAGAAAAACTTTTATTACATAA
AAGCAAATAGCTTTTTTCCATATATATCCTTCGAAAGCCCTTCTTAAGCAAATAGTTGTT
CAAAAAAAAAAAGAAGAAACAACCTGCTTAGATTTGCTCTGTGTCTCTCTATGTATCTGG
ATCGGAGATGATTAGGGATCTGGGGTAAAGCTGTAAAGATCTGGTTCTTCGTAAATGA


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DD86TF U 5
AF RS1D906TF U 1
BS 1 70 RS1D906TF
BS 71 71 RS1DD86TF
BS 72 246 RS1D906TF
BS 247 247 RS1DD86TF
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BS 393 393 RS1DD86TF
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BS 439 439 RS1DD86TF
BS 440 598 RS1D906TF

RD RS1DD86TF 477 0 0
GG
CTCTCTAAGCTGAATCTTGATTCTTGAATCTGCTTCTGCAGTTGATTCTCTTCCTTTATT
CCAAAGTCTCGTTATTTTTTCAAGAGATTAGTATAAGCAAATGGCTTCATACTACGCTGG
GTTTTCAAGTTATGAAGAGCCACACTTTTTGGAATCTTGCTCTCTTTGCCGTAAACACCT
TCCTCGTAACTCAGACATCTTCATGTACAGAGGAGACAAGGCGTTTTGTAGCAATGAGTG
CAGAGAAGAACAGATTGAGTCTGATGAAGCCAAGGAGAAAAGCTGGAAAATTTCTTCGAG
ATCTCTCCGTAAAAAATCGTCCGAAGCATCAAAAGATTGCAAAACCGTTCGGACAGGAAC
CCTCGTGGTGGCTTAGTTAAAAAAAAAGAAAAAAGAAAAACTTTTATTACATAAAAGCAA
ATAGCTTTTTTCCGTATATATCCTTCGAAAGCCCTTCTTAAGCAAATAGTTGTTC

QA 3 477 3 477
DS 

RD RS1D906TF 598 0 0
GGCTCCCTCTCTAAGCTGAATCTTGATTCTTGAATCTGCTTCTGCAGTTGATTCTCTTCC
TTTATTCCAACGTCTCGTTATTTTTTCAAGAGATTAGTATAAGCAAATGGCTTCATACTA
CGCTGGGTTTTCAAGTTATGAAGAGCCACACTTTTTGGAATCTTGCTCTCTTTGCCGTAA
ACACCTTCCTCGTAACTCAGACATCTTCATGTACAGAGGAGACAAGGCGTTTTGTAGCAA
TGAGTGTAGAGAAGAACAGATTGAGTCTGATGAAGCCAAGGAGAAAAGCTGGAAAATTTC
TTCGAGATCCCTCCGTAAAAAATCGTCCGAAGCATCAAAAGATTGCAAAACCGTTCGGAC
AGGAACCCTCGTGGTGGCTTAGTTAAAAAAAA*GAAAAAAGAAAAACTTTTATTACATAA
AAGCAAATAGCTTTTTTCTATATATATCCTTCGAAAGCCCTTCTTAAGCAAATAGTTGTT
CAAAAAAAAAAAGAAGAAACAACCTGCTTAGATTTGCTCTGTGTCTCTCTATGTATCTGG
ATCGGAGATGATTAGGGATCTGGGGTAAAGCTGTAAAGATCTGGTTCTTCGTAAATGA

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 2

CO CL8258Contig1 786 2 6 U
GGACAGAAACACAACAGCAGTTTCTCTCCTTCTCCAAGCTAATCAATCTCTCAAGAACCA
CATGGCCAACTTCGATGGACCAGGATTCTCAATAGTTGACAAATCTTGGATCCAAACGAA
AGCCATTGACGTTGAACCCTCAACCGACATCTCCCCTCACCTTTCCCGCATCCTAGAAGA
CACCGTCTGGAACGGAAACAGAGCCATCGTCTTCGACGTCTACTGGGACGTCGAGTCCGT
TCACACAAAGTCCACGCTGCGTCTTTCCTCCGTGAAGCTAAGCACCAAGAACTTCTGTCT
CTTCCTCCGTCTACCAAACCAGTTCACCGACAGCCTCAAGGACCTCTACCGCTTCTTTGC
TTCCAAGTTCGTCACATTCGTCGGCGTCCAGATCCAAGAAGACCTTGTTCTGCTCAAAGA
GAATCACGGGATTGTGATCAGAAGCTCTCTGGAGATTGGGAAGTTGGCTGCTGTGGCTAG
AGGAACTCCTATCGTTGAGTTTCTTGGGGCTAGAGAGTTGGCTCATAAAATACTTTCGTG
CGATATGAGTCGACTTGATTCGATTCAGTCTAAGTGGGATGAAGCTGGGGGTAATAATCG
GCTCGAAGCTGCAGCTACTGAAGGTTGGCTTGTTTACAATGTCTATGATCAGTTGCAGCA
GTGAAAGGATGTTCTTATATGTGACAACTAACATTTTATTTCTTGATCAAAATTGATCTG
TGAGATTGTGCATTTTGATCTGTTTGTTGTTGCTATGAGTGAACAAAAATCATGTTTGAA
TAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1E732TF U 1
AF RS1E732JQ C 212
BS 1 711 RS1E732TF
BS 712 712 RS1E732JQ
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CATGGCCAACTTCGATGGACCAGGATTCTCAATAGTTGACAAATCTTGGATCCAAACGAA
AGCCATTGACGTTGAACCCTCAACCGACATCTCCCCTCACCTTTCCCGCATCCTAGAAGA
CACCGTCTGGAACGGAAACAGAGCCATCGTCTTCGACGTCTACTGGGACGTCGAGTCCGT
TCACACAAAGTCCACGCTGCGTCTTTCCTCCGTGAAGCTAAGCACCAAGAACTTCTGTCT
CTTCCTCCGTCTACCAAACCAGTTCACCGACAGCCTCAAGGACCTCTACCGCTTCTTTGC
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GAATCACGGGATTGTGATCAGAAGCTCTCTGGAGATTGGGAAGTTGGCTGCTGTGGCTAG
AGGAACTCCTATCGTTGAGTTTCTTGGGGCTAGAGAGTTGGCTCATAAAATACTTTCGTG
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GTGAAAGGATGTTCTTATATGTGACAACTAACATTTTATTTCTTGATCAAA*TTGATCTG
TGAGAT*GTGCATTTTGATCTGTTTGTTGTTGCTATGAGT

QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1E732JQ 575 0 0
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GAGATTGGGAAGTTGGCTGCTGTGGCTAGAGGAACTCCTATCGTTGAGTTTCTTGGGGCT
AGAGAGTTGGCTCATAAAATACTTTCGTGCGATATGAGTCGACTTGATTCGATTCAGTCT
AAGTGGGATGAAGCTGGGGGTAATAATCGGCTCGAAGCTGCAGCTACTGAAGGTTGGCTT
GTTTACAATGTCTATGATCAGTTGCAGCAGTGAAAGGATGTTTTTATATGTGACAACTAA
CATTTTATTTCTTGATCAAAATTGATCTGTGAGATTGTGCATTTTGATCTGTTTGTTGTT
GCTATGAGTGAACAAAAATCATGTTTGAATAAAAA

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 2

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CAAAGACGGCGATGGTTGCATCACTACGAAAGAGCTGGGAACTGTTATGCGTTCCCTAGG
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CGGAACCATCGACTTTCCGGAGTTCCTGAACCTGGTGGCTAAGAAGATGAAGGACACTGA
CTCTGAGGAAGAGCTGAAAGAAGCATTCAGGGTTTTCGACAAAGACCAGAACGGTTTCAT
CTCCGCTGCTGAGCTACGCCATGTGATGACTAATCTAGGTGAGAAGCTTACCGATGAGGA
AGTGGAAGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGAGATGGTCAGATTAACTATGAAGA
GTTTGTCAAGATTATGATGGCTAAGTGATGTATCATTATGACCTCTTATTATCTACTTAC
TGCTTCTAGGATTTTAACCAAGATATATTTGCATGATTGTCTAGAAATGGGTTTTAAAAA
TACTGAGATTATGAGAC


BQ
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AF RS1BK15JQ C 1
AF RS1BK15TF U 90
BS 1 89 RS1BK15JQ
BS 90 617 RS1BK15TF

RD RS1BK15JQ 617 0 0
GGGACTGAGAAGCAATAATACGTAAGCGAAAGAGGAAGAAGGCGATTTGCTGGAAGCAAT
GGCGGACCAACTGATAGACGAGCAGATCTCCGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGA
CAAAGACGGCGATGGTTGCATCACTACGAAAGAGCTGGGAACTGTTATGCGTTCCCTAGG
GCAAAACCCAACAGAGGCGGAGCTCCAAGGCATGATCAACGAGGTGGACGCAGATGGAAA
CGGAACCATCGACTTTCCGGAGTTCCTGAACCTGGTGGCTAAGAAGATGAAGGACACTGA
CTCTGAGGAAGAGCTGAAAGAAGCATTCAGGGTTTTCGACAAAGACCAGAACGGTTTCAT
CTCCGCTGCTGAGCTACGCCATGTGATGACTAATCTAGGTGAGAAGCTTACCGATGAGGA
AGTGGAAGAGATGATCCGTGAAGCTGATGTTGATGGAGATGGTCAGATTAACTATGAAGA
GTTTGTCAAGATTATGATGGCTAAGTGATGTATCATTATGACCTCTTATTATCTACTTAC
TGCTTCTAGGATTTTAACCAAGATATATTTGCATGATTGTCTAGAAATGGGTTTTAAAAA
TACTGAGATTATGAGAC

QA 1 617 1 617
DS 

RD RS1BK15TF 528 0 0
CCGAGTTCAAGGAAGCCTTTAGCCTCTTCGACAAAGACGGCGATGGTTGCATCACTACGA
AAGAGCTGGGAACTGTTATGCGTTCCCTAGGGCAAAACCCAACAGAGGCGGAGCTCCAAG
GCATGATCAACGAGGTGGACGCAGATGGAAACGGAACCATCGACTTTCCGGAGTTCCTGA
ACCTGGTGGCTAAGAAGATGAAGGACACTGACTCTGAGGAAGAGCTGAAAGAAGCATTCA
GGGTTTTCGACAAAGACCAGAACGGTTTCATCTCCGCTGCTGAGCTACGCCATGTGATGA
CTAATCTAGGTGAGAAGCTTACCGATGAGGAAGTGGAAGAGATGATCCGTGAAGCTGATG
TTGATGGAGATGGTCAGATTAACTATGAAGAGTTTGTCAAGATTATGATGGCTAAGTGAT
GTATCATTATGACCTCTTATTATCTACTTACTGCTTCTAGGATTTTAACCAAGATATATT
TGCATGATTGTCTAGAAATGGGTTTTAAAAATACTGAGATTATGAGAC

QA 1 528 1 528
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8261Contig1 883 2 12 U
GGGGAGATGCAATCATCGTCATCGGATCATCATGAAGCTCCCGGCACTTCCTCCCAGTGA
CGGTGCTCCTCGCCAGGATCACGCCATTGGCTATGTGCGTGAGTGAGTCTCAGAGTTATT
CTCTGTGTTTGCAAACTAAGTACCGCGGCTGTTTCGACTTTCGACGAAGGTCCTCCATTT
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CTCTCAAAGCTTGCTCTTGCTTTAGAAAAGCTCCCACCGAGTACTGCAACCAGAACAACT
CTAAGGAAGACGGCAATGAAAGCTGAACCGCAGTTGGTGAATCATCGGTTCTTGTCGTTT
GACGAGCAAGTCTCTTGATGGAGAAATGGACCAAGAAAATGTTACTGAAGAGTCAAAGGC
TGACGATGTCAAGATTGAAGCCAATGTGGCCAAGATTCCTGCAGCGCGAAGCACAAGAAA
GGCTTCGGCAGCAGAAAAGTTCAGGAGAGCAAGAAGGGTGAAATGGTTCAGTCTGCGTAC
AGCACGAGGAAATCAACCAGGCTGTTGGAGAAATGTATGGCTGGCCTGAGTTTGATAACA
GAAGAAAAAGTATCTGCAAAGGAGAAGAATCCAGCTGGTTCAGAGGAGAGGAGTAAGGAA
GCTGAAGTTATCCCAGGTAGAGATTTAAGTGCTTCCATGGAGAAAGAATGGGAGGTGTTG
TATTGCTTCTGAGTTACAATGTTTAGTTGTTAAAGAACTGCTTGTTGTCCACACGTTTAG
TTGTTTTACGTTTAGGCAAGAGAACCGCTTGACATCTTTTCATTTAGTGTAAGATTGATT
TCTTGGACCATTTTGAGTTTTGTGTGATGAAATATTAAGCAGT


BQ
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AF RS1C488TF U 1
AF RS1C488JQ C 224
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RD RS1C488TF 776 0 0
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CGGTGCTCCTCGCCAGGATCACGCCATTGGCTATGTGCGTGAGTGAGTCTCAGAGTTATT
CTCTGTGTTTGCAAACTAAGTACCGCGGCTGTTTCGACTTTCGACGAAGGTCCTCCATTT
ACATTTACACTGCAGAGACTCTGTGAGATCCTTTTGGCCGCAAGGAGTATCTACCCAAAG
CTCTCAAAGCTTGCTCTTGCTTTAGAAAAGCTCCCACCGAGTACTGCAACCAGAACAACT
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AGCACGAGGAAATCAACCAGGCTGTTGGAGAAATGTATGGCTGGCCTGAGTTTGATAACA
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TATTGCTTCTGAGT*ACAATGTTTAGTTGTTAA*GAACTGCTTGTTGTC
ACACGTT

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DS 

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CTGCAACCAGAACAACTCTAAGGAAGACGGCAATGAAAGCTGAACCGCAGTTGGTGAATC
ATCGGTTCTTGTCGTTTGACGAGCAAGTCTCTTGATGGAGAAATGGACCAAGAAAATGTT
ACTGAAGAGTCAAAGGCTGACGATGTCAAGATTGAAGCCAATGTGGCCAAGATTCCTGCA
GCGCGAAGCACAAGAAAGGCTTCGGCAGCAGAAAAGTTCAGGAGAGCAAGAAGGGTGAAA
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GCCTGAGTTTGATAACAGAAGAAAAAGTATCTGCAAAGGAGAAGAATCCAGCTGGTTCAG
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AAGAATGGGAGGTGTTGTATTGCTTCTGAGTTACAATGTTTAGTTGTTAAAGAACTGCTT
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TTAGTGTAAGATTGATTTCTTGGACCATTTTGAGTTTTGTGTGATGAAATATTAAGCAGT

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

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CTGGTTTCACGATGGCAAATCCTCTGTTTACAAGTCCGAAGAGAAGAAACTCGAGCTAAA
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ACCAAAAGACAAATCTATCCTCTCTCTCGCTGCCAACCACTTCTCTTCTCCTTCTTCCAC
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GGTGAAAAGGCTGCGT


BQ
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AF RS1A544TF U 1
AF RS1A544JQ C 497
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TCCGGTTAGATCATTCAGGAAGAACTTAACAAATGGAAGCTCTTCAAAGCTTGGAAACGA
GTCCACCTCCAATGATGTTGTCCTCAAGAACCAGAAGTGTGATGATGATAATGGCCGAGA
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TGTAGACAAGCTCTTTAGAGGTCTTCTTGCAGCCCAAAAAGAGTCATCATCATTTGGAGA
AGAAGAGAAACCAATCACTGGGTTGTTGGATGGGAATGGAGAATATACTCTTACTTACGA
GGACAATGAAG*AGACA*GATGCTTGTAGGAGATGTCCCATGGCATATGTTTGTATCTT

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DS 

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AGAGGTCTTCTTGCAGCCCAAAAAGAGTCATCATCATTTGGAGAAGAAGAGAAACCAATC
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AAGATGCTTGTAGGAGATGTCCCATGGCATATGTTTGTATCTTCGGTGAAAAGGCTGCGT

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DS 



AS 1 2

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CTCTGGCCTTTCTACTGTGAATGTCGTTCTAAACGAGAAATGCCGTCTTTGTATCCACAA
GCAAAGGGTATAGTGAGTGCTCTGAAAGCGAAAGGAATTCAAATGGCGATTGCTTCCAGA
TCTCCCACTTCAGACATCGCCAACACTTTCATTGACAAATTGAATATTAAGTCCATGTTC
GTCGCCAAGGAAATATTCTCGAGTTGGACTCACAAGACGGAGCATTTTCAAAAGATACAC
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AAATCAGTTTCTAAAATGGGAGTGACAAGCATCTTGGTGGGTGATGGGGTTACACTTGGA
GCACTCAGACAAGGGCTTACTGAATTTTCTCATAACCATAACACTATCGAGAAGAACAAA
CAGGTTTGGCGCAACAAGTATTCCGGAAAGGCTGCCTCATCTGGGACCGACAAAGACTGA
CACTTCCGGTTTTTTTCCGGAATTGTATAACCCATTATACCATTCTATGGTGATCATTCC
ACCATTATTTACTGTATAAATAAATTGCATGGATACGTGAAAGTTTTGTGTTGAAGATTT
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CTATGAAACTCACTGAAAATGGTGGTGCTTGTGCGT


BQ
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AF RS1FR42TF U 1
AF RS1FR42JQ C 205
BS 1 732 RS1FR42TF
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CTCTGGCCTTTCTACTGTGAATGTCGTTCTAAACGAGAAATGCCGTCTTTGTATCCACAA
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AAATCAGTTTCTAAAATGGGAGTGACAAGCATCTTGGTGGGTGATGGGGTTACACTTGGA
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CAGGTTTGGCGCAACAAGTATTCCGGAAAGGCTGCCTCATCTGGGACCGACAAAGACTGA
CACTTCCGGTTTTTTTCCGGAATTGTATAACCCATTATACCATTCTATGGTGATCATTCC
ACCATTATTTACTGTATAAATAAATTGCATGGATACGTGAAAGTTTTGTGTTGAAGATTT
CTAACTCTCTCA*TACTGGCTTTGT*GTTACATGGATGT
CCTTA

QA 1 759 1 759
DS 

RD RS1FR42JQ 612 0 0
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TGGACTCACAAGACGGAGCATTTTCAAAAGATACACACAAGGACAGGGGTGCCGTTTACT
GACATGCTTTTTTTCGATGATGATGACAGAAGCATTAAATCAGTTTTTAAAATGGGAGTG
ACAAGCATCTTGGTGGGTGATGGGGTTACACTTGGAGCACTCAGACAAGGGCTTACTGAA
TTTTTTCATAACCATAACACTATCGAGAAGAACAAACAGGTTTGGCGCAACAAGTATTCC
GGAAAGGCTGCCTCATCTGGGACCGACAAAGACTGACACTTCCGGTTTTTTTCCGGAATT
GTATAACCCATTATACCATTTTATGGTGATCATTCCACCATTATTTACTGTATAAATAAA
TTGCATGGATACGTGAAAGTTTTGTGTTGAAGATTTCTAACTCTCTCAATACTGGCTTTG
TTGTTACATGGATGTTCCTTATGTAACTGTGTTTTCCTATGAAACTCACTGAAAATGGTG
GTGCTTGTGCGT

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 2

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CGTTCTCATCAACTCAGAGATAATTCATGTACCACGAACGCAGAATATGCAGGCGGACAA
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GGCTTGGTTTTCCGAATCTATATGAGAGTTTTGTTTACGCTGATGAC


BQ
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AF RS1AJ66JQ C 1
AF RS1AJ66TF U 1
BS 1 527 RS1AJ66TF

RD RS1AJ66JQ 527 0 0
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GGCTTGGTTTTCCGAATCTATATGAGAGTTTTGTTTACGCTGATGAC

QA 1 527 1 527
DS 

RD RS1AJ66TF 527 0 0
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TCTCTCTCCCCTTCATGCTGAAGTCGAGGCGATGATATGGGCAATGGAATGTATGAAAAA
TTTACGTCAGTTCAGGGTTACGTTTGCAACGGATTGTTTCCAATTGGTGAAGATGGTTTC
GGAACCAGAGGAATGGCCAGCTTTTGTAAGTTATCTGGAAGACATAAAGACCCTTAAAGA
CGTTCTCATCAACTCAGAGATAATTCATGTACCACGAACGCAGAATATGCAGGCGGACAA
ACTAGCACGAAGTGTTAGGATTCAACCGTCTTTTGTTGTTCACATGGATGCAGAGTTGCC
GGCTTGGTTTTCCGAATCTATATGAGAGTTTTGTTTACGCTGATGAC

QA 1 527 1 527
DS 



AS 1 2

CO CL8265Contig1 688 2 2 U
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GACGGCGGCTTCCTCCCTCGTCCAAATCCTCAGGCGATACATCAAGAAGCCATGGGAGAT
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CGGAGGCTACGAGTGACGAAACAGGTTTTTTCTCCTGTAATCTGCTTTGGTGGGAGACAG
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ATCCAATAATAAGGTTTGTAGAGGCTTTACAAAACACTTTATGAGTTTGTTCCTCCACAA
GAACTTGGATTGTTGTGCTGTTGTATTCCCTTTGTTTTACAGACATGACAATTATATGTT
TTTGTTTCCTATGGTGAGTGAACTCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CK09TF U 1
AF RS1CK09JQ C 50
BS 1 575 RS1CK09TF
BS 576 688 RS1CK09JQ

RD RS1CK09TF 575 0 0
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GACGGCGGCTTCCTCCCTCGTCCAAATCCTCAGGCGATACATCAAGAAGCCATGGGAGAT
CACTGGACCCTGCGCTCACCCGGAGTACCTCGAATCTGTGCCCAAGGCGACGGAGTATCG
CATCCGATGCCCCGCCACGATCGATGAAGAGGCGATCGTGCCCACCGCGGATCCAGAGAA
CGTGTACAACATCTTGTACCACGCGAGGGATCAGCGCCGAAACCGCCCGCCGATCAGGCG
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GTCGGACTTTCCTAGGGTTTACTTGACAACCACCGTCGAGGAGGATGAGAATGCTCGCGG
CGGAGGCTACGAGTGACGAAACAGGTTTTTTCTCCTGTAATCTGCTTTGGTGGGAGACAG
ACTGCGTGTGATATTAATCTCACTACCGAGAAGAATTCTCACTAGTTTTCCATTATTATT
ATCCAATAATAAGGTTTGTAGAGGCTTTACAAAAC

QA 1 575 1 575
DS 

RD RS1CK09JQ 639 0 0
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CCGATCAGGCGATACGTGTGGAAGAAGGAGGACGTGGTTCAGATGATGAACGAGAAGAAG
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AATGCTCGCGGCGGAGGCTACGAGTGACGAAACAGGTTTTTTCTCCTGTAATCTGCTTTG
GTGGGAGACAGACTGCGTGTGATATTAATCTCACTACCGAGAAGAATTCTCACTAGTTTT
CCATTATTATTATCCAATAATAAGGTTTGTAGAGGCTTTACAAAACACTTTATGAGTTTG
TTCCTCCACAAGAACTTGGATTGTTGTGCTGTTGTATTCCCTTTGTTTTACAGACATGAC
AATTATATGTTTTTGTTTCCTATGGTGAGTGAACTCATC

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 2

CO CL8266Contig1 708 2 2 U
GAAGGGACTTACCATTGTCACCACATCCTTTGACGGTTACATGTATCTCATAGATGGGCC
CACCTCGTGCGCTGACGTTGTTGATATTGGTGAAACTTCATACAGCATGGTCTTGGCTGA
TAATGTTGACGGTGGAGATGATCTTGATCTCATCGTCTCAACTATGAACGGGAACGTCTT
TTGCTTCTCCACGCCTTCTCCTCACCATCCCCTCAAGGCCTGGAGATCGACTGATCAAGG
GATGAACAATAAGGCTATCCGTTACGATCGTGAAGGTGTTTTTGTCACGCATTCAACCAG
AGGCTTCCGTGATGAGGAAGGCAAAAACTTCTGGGCTGAGATTGAGATTGTTGATAACTA
CAGATACCCATCTGGTTCACAAGCGCCCTATAACGTTACAACGACGCTGTTGGTACCAGG
CAATTACCAGGGAGATAGGAGGATAAAGCAGAGCCAGATCTATGACCGACCAGGAAAATA
CAGAATAAAACTACCAACCGTTGGAGGTGGAGGTGGAGGGGGTGGCGGAATCGGACATCA
CTAAGCTGAAACCCATGACGTTGCATTGAATGCATGCCTCACGCACACTTGAGTTTACAA
GCCTTGAGCATTTCCAAATATACTTAGCTTTATGTACTTTGAATTACGACGAGGAATGAG
TTTCGCTATACGCATTTCAATAATATAGATTATATCATGTTGAACACC


BQ
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AF RS1DE16TF U 1
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DS 

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QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

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CACCGCAACAACAACCCTACGGATCCTCCGGCAATCCACCACCGCCTCAACCTTACGGAT
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AF RS1C048TF U 1
AF RS1C048JQ C 213
BS 1 737 RS1C048TF
BS 738 806 RS1C048JQ

RD RS1C048TF 737 0 0
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TCATCATGTCTGGTTACCCTCCTTCGAGCCAAGGCTACGGTTACGGCGGCAATCCACCAC
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ACGGCTCTCAGCATGAGAACTGTTCATCTCCTCATGTACCTCTTCACCAACAGCAACGTC
AGAAAGATCGGACCGAAAGAGTTTACTTCACTTTTCTACAGTCTTCAGAGTTGGAGGACA
ATATTCGAGAGGTTTGATAAGGACAGAAGTGGGAGAATCGATACAAACGAGCTGAGAGAT
GCACTCTTGAGCCTCGGGTTTTCAGTGTCTCCTGTGGTTTTGGATCTGCTGGTTTCTAAG
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TTGACAGTAAAGGGGCTGACTGAGAAGTTTAAGGAGAAGGATACGGCGTTATCAGGATCA
GCCACTTTCAACTACGAGGCCTTCATGCTCACTGTTCTACCATTCCTCGTCGCTTAAGTT
CGTTGCCCTTATGGAGCTTTTGGGAATAATTTGTTTGTAGTTGAATTCTGAGGAGTTTTG
CTCTTTTACCTTTCTTA

QA 1 737 1 737
DS 

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CATGTACCTCTTCACCAACAGCAACGTCAGAAAGATCGGACCGAAAGAGTTTACTTCACT
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GAGAATCGATACAAACGAGCTGAGAGATGCACTCTTGAGCCTCGGGTTTTCAGTGTCTCC
TGTGGTTTTGGATCTGCTGGTTTCTAAGTTTGATAAAAGTGGAGGCAGGAACAGAGCTAT
TGAATATGACAACTTCATCGAGTGTTGTTTGACAGTAAAGGGGCTGACTGAGAAGTTTAA
GGAGAAGGATACGGCGTTATCAGGATCAGCCACTTTCAACTACGAGGCCTTCATGCTCAC
TGTTCTACCATTCCTCGTCGCTTAAGTTCGTTGCCCTTATGGAGCTTTTGGGAATAATTT
GTTTGTAGTTGAATTCTGAGGAGTTTTGCTCTTTTACCTTTCTTATCGACTTTGCTTTTG
TAAGATTTGGAAGTGGCTCTCTCTGTATGAGCATTTAAACAAGTGTTTTGTGGG

QA 1 594 1 594
DS 



AS 1 2

CO CL8268Contig1 1114 2 2 U
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TGGAGCGATCACAACAAAAGCTTCATCGTCAAGAACCCCGCCTAGTTTTCAAAAGACCTC
CTTCCAAGGTTCTTCAAACACAAGAACTTCTCCAGCTTCATCCGTCAGCTCAACACATAC
GGTTTCAGAAAAATCGATCCGGAGAAATGGGAGTTCGCAAACGAGGACTTTGTCAGAGGC
CAGCCTTACCTAATGAAGAACATCCACAGGAGAAAACCTGTCCACAGCCACTCGTTACAG
AACCTACAAGCGCAGAGTCCTTTGTCCGATTCAGAAAGACAGAGCATGAAGGATCAGATC
GAGAGGCTGAAAAGGGAGAAAGAAGTCCTTCTCGCGGATTTACAGAGCCAAGAGCTCGAG
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CGTCAGAGATCTATAGTGACGTTCGTTTCGCAGGTTTTGGAGAAACCGGGGATTTCTCTA
AACCTAGAAACCCACGAGAGAAGGAAAAGAAAGCTGCAAGAGACGACTTCTTCTCTTCTT
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AATCTTGCCATGGAATCGTGTGATAAGAGTATGGATATCGATGTGAACGAGTCAACCAGC
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AGAGATGTTGATGCGAATAAGATTGGGGGTGGAAGGACGTTTTGGTGGAATGCTAAGAAT
GTAAATGATATTGCAGAGAGAGTTTGACTTTGATATTTGAAGGTCTTTTGTAAATTAGAT
TATTTTTATTTTTTTCTATACTTCTGGACACAACCTATTGACTTGTGGTTCATTGTTTAC
TCTGTTTCTGTAAGCTTATTGTTTTGAGACAAGA


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AF RS1AP18TFB U 1
AF RS1AP18JQ C 282
BS 1 811 RS1AP18TFB
BS 812 1114 RS1AP18JQ

RD RS1AP18TFB 811 0 0
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TGGAGCGATCACAACAAAAGCTTCATCGTCAAGAACCCCGCCTAGTTTTCAAAAGACCTC
CTTCCAAGGTTCTTCAAACACAAGAACTTCTCCAGCTTCATCCGTCAGCTCAACACATAC
GGTTTCAGAAAAATCGATCCGGAGAAATGGGAGTTCGCAAACGAGGACTTTGTCAGAGGC
CAGCCTTACCTAATGAAGAACATCCACAGGAGAAAACCTGTCCACAGCCACTCGTTACAG
AACCTACAAGCGCAGAGTCCTTTGTCCGATTCAGAAAGACAGAGCATGAAGGATCAGATC
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CGTAAAGGGTTCGAGCTGCAAGTAACAGCGCTGAAAGATCGGTTGCAGCATATGGAGCAG
CGTCAGAGATCTATAGTGACGTTCGTTTCGCAGGTTTTGGAGAAACCGGGGATTTCTCTA
AACCTAGAAACCCACGAGAGAAGGAAAAGAAAGCTGCAAGAGACGACTTCTTCTCTTCTT
CCGAGCAGGTCGCATGCTGAGCAGGTGGAGAAGTTGGAGTCTTCTTTAACGTTCTTAGAG
AATCTTGCCATGGAATCGTGTGATAAGAGTATGGATATCGATGTGAACGAGTCAACCAGC
TTTGCGGAGAGTCTAAGTAATGGGGATAACAGACCAAAGTCAGCAAAGATTGATATGAAC
GCAGAGCCTGTTACTACCATTGCTGCTGCTC

QA 1 811 1 811
DS 

RD RS1AP18JQ 833 0 0
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GAGCATGAAGGATCAGATCGAGAGGCTGAAAAGGGAGAAAGAAGTCCTTCTCGCGGATTT
ACAGAGCCAAGAGCTCGAGCGTAAAGGGTTCGAGCTGCAAGTAACAGCGCTGAAAGATCG
GTTGCAGCATATGGAGCAGCGTCAGAGATCTATAGTGACGTTCGTTTCGCAGGTTTTGGA
GAAACCGGGGATTTCTCTAAACCTAGAAACCCACGAGAGAAGGAAAAGAAAGCTGCAAGA
GACGACTTCTTCTCTTCTTCCGAGCAGGTCGCATGCTGAGCAGGTGGAGAAGTTGGAGTC
TTCTTTAACGTTCTTAGAGAATCTTGCCATGGAATCGTGTGATAAGAGTATGGATATCGA
TGTGAACGAGTCAACCAGCTTTGCGGAGAGTCTAAGTAATGGGGATAACAGACCAAAGTC
AGCAAAGATTGATATGAACGCAGAGCCTGTTACTACCATTGCTGCTGCTCCGAAGACAGG
GGTTAACGATGTGTTTTGGGAGCAGTGTTTGACAGAGAATCCAGGATCGATTGAACAGCA
GGAAGTTCAGTCAGAGAGGAGAGATGTTGATGCGAATAAGATTGGGGGTGGAAGGACGTT
TTGGTGGAATGCTAAGAATGTAAATGATATTGCAGAGAGAGTTTGACTTTGATATTTGAA
GGTCTTTTGTAAATTAGATTATTTTTATTTTTTTCTATACTTCTGGACACAACCTATTGA
CTTGTGGTTCATTGTTTACTCTGTTTCTGTAAGCTTATTGTTTTGAGACAAGA

QA 1 833 1 833
DS 



AS 1 2

CO CL8269Contig1 1023 2 6 U
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TTCTAGGACTCTCAAATCAACTAAGAAAAATGGCTTTTTGGTCTGCTGAGAATGCTACTA
AAGCCTATCTTAGTACATTGAAAACGGATCAAAGAACAAAAGAACCAAACGTGGTTGAAT
TTATATCGGCTCTAGCCGCCGGAAACAACGCCAGAAAGATCACCGTGGCTTTTGCCGGAG
CAGCAAACGCTGACATACTCCTTGCCTTGATCGCTGCCGCTAATCAAACGCGTGGTCAAG
TGGTATGTGTTTTACGTGGCATTGAAGAACTGATCATATCCAAAAAAATGTTGGAACCAT
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TCATTTCGGAGAAGCTGACTTCGTCCTCTTCAATTGTAACCTCGAGAACCACCAAGATAT
CGTTACAAAGATCGTTAATCATCATGAAGAAAACGCAAGAACCAGAGGTGGAAGCGGTGT
GGCGGTTGTGGTGGGTTATAACGCGTTTTCGAGAGGGTCTTGGATATTTAGCGATGGGAG
GAAAACACAGTTTTTACCTATAGGTGGAGGGTTGCTTGTGACGAGGGTCAACGATAATGG
TAATTATAATCAGAAAATGATGATGAGCAAGAACAATCACCATCATCATCACCATGACCG
TGTAAGAAAGAGTCATTGGGTGGTGAAAGTTGATAAGTGCACAGGAGAGGAGCATGTGTT
TAGGGTTAGGGTTCCACGAGGAGAAGCCATTATTGAAGCTTAATCTAAACCTTATAATAT
TATTGGGTAATGGGTACTTTAGAGCAAAAGTCACCTCTGTGATGGTTCAGACGAGTGAGA
GTAGTAAGAAGAATAGTTATCTTTATAAGTGATTAGAAGGATTTTTGATTGGTGTTGGAG
TGTTTTGTTTGTATGAAGTTTTTTATTTAAAAACTTATTTTTCTTGTAAGTGTGAATATG
AAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 

AF RS1DJ16TF U 1
AF RS1DJ16JQ C 239
BS 1 728 RS1DJ16TF
BS 729 729 RS1DJ16JQ
BS 730 764 RS1DJ16TF
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BS 766 781 RS1DJ16TF
BS 782 1023 RS1DJ16JQ

RD RS1DJ16TF 781 0 0
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TTCTAGGACTCTCAAATCAACTAAGAAAAATGGCTTTTTGGTCTGCTGAGAATGCTACTA
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TTATATCGGCTCTAGCCGCCGGAAACAACGCCAGAAAGATCACCGTGGCTTTTGCCGGAG
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GGCGGTTGTGGTGGGTTATAACGCGTTTTCGAGAGGGTCTTGGATATTTAGCGATGGGAG
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TAATTATAATCAGAAAATGATGATGAGCAAGAACAATCACCATCATCATCACCATGACCG
TGTAAGAA*GAGTCATTGGGTGGTGAAAGTTGATAAGTGCACAG*AGAGGAGCATGTGTT
T

QA 1 781 1 781
DS 

RD RS1DJ16JQ 785 0 0
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AGTGGTATGTGTTTTACGTGGCATTGAAGAACTGATCATATCCAAAAAAATGTTGGAACC
ATCAGAGATTCATCAGATACATTTCGTAGTGGGGAATCTAGCGACGAGACTTTAATTAAT
GATCATTTCGGAGAAGCTGACTTCGTCCTCTTCAATTGTAACCTCGAGAACCACCAAGAT
ATCGTTACAAAGATCGTTAATCATCATGAAGAAAACGCAAGAACCAGAGGTGGAAGCGGT
GTGGCGGTTGTGGTGGGTTATAACGCGTTTTCGAGAGGGTCTTGGATATTTAGCGATGGG
AGGAAAACACAGTTTTTACCTATAGGTGGAGGGTTGCTTGTGACGAGGGTCAACGATAAT
GGTAATTATAATCAGAAAATGATGATGAGCAAGAACAATCACCATCATCATCACCATGAC
CGTGTAAGAAAGAGTCATTGGGTGGTGAAAGTTGATAAGTGCACAGGAGAGGAGCATGTG
TTTAGGGTTAGGGTTCCACGAGGAGAAGCCATTATTGAAGCTTAATCTAAACCTTATAAT
ATTATTGGGTAATGGGTACTTTAGAGCAAAAGTCACCTCTGTGATGGTTCAGACGAGTGA
GAGTAGTAAGAAGAATAGTTATCTTTATAAGTGATTAGAAGGATTTTTGATTGGTGTTGG
AGTGTTTTGTTTGTATGAAGTTTTTTATTTAAAAACTTATTTTTCTTGTAAGTGTGAATA
TGAAG

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

CO CL8270Contig1 838 2 2 U
GGACGCGTCCTCTCTGTAACTCTCTCTCTTAGTTGTCAATTACTCTCTCTCAAGCAATCA
GAATTCAAGTTTTGTTTTTCTTTTTGTTGGTAGTTTTAACCTAAAAAGATTCGAAAGAAA
AACTCAAATGGGTCTTTGCGTATCTGTTGGTCGTAGCGACTGCGATTCTTCTCCGGCGGC
TAAAATCGTGACTGTTAACGGCGATCTCCGGGAATACAATGTCCCCGTGTTAGCTTCACA
GGTTCTTGAATCGGAATCAATGGCTTCCTCGTCTTCCTCCTCCTCTCGGTCTTCTTCTTA
TTTTCTATGTAATTCGGATTCTCTCTATTACGACGACTTCATCCCGGCGATCGAACCGGA
GGAGATTCTTCTAGCGGATCAAATCTACTTCGTTCTCCCTATCCCTAAACGTCGGTACCG
TCTCACGGCGTCCGACATGGCGGCTCTGGCGGTGAAAGCCAGCGTCGCGATGGAGAAAGC
TGCGAAGAATAAGAACCGCCGTCGTAAGAGCGGGAGGATCTCTCCGGTGATGGGGATGAA
TCAGCCTAACGAACGGATCGTCGCCGTTAATAGAAGTTCGACGACGGTGATGCAAATTAA
GGGAAACCTACCGATTAAAACGACGCAGTTTAGGAGTACTAATACAATCGGTTATTCCCG
GTCCGGTTCGGTACGGCAATTGAAAAGATACGCGTCTGGGCGAGCTAGGAAGCTTGCGGA
TCGGTCGATTAAAAGAGTGCTCTCAACAATCCACGAAGAAAACATTTTTTAGATTTCTAA
GAATACAATTTTTCTTTTATTTTTTGTTGTTGTTATACGGAAATTATTGTTAATGTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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BS 1 629 RS1CZ58TF
BS 630 838 RS1CZ58JQ

RD RS1CZ58TF 629 0 0
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GAATTCAAGTTTTGTTTTTCTTTTTGTTGGTAGTTTTAACCTAAAAAGATTCGAAAGAAA
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GGTTCTTGAATCGGAATCAATGGCTTCCTCGTCTTCCTCCTCCTCTCGGTCTTCTTCTTA
TTTTCTATGTAATTCGGATTCTCTCTATTACGACGACTTCATCCCGGCGATCGAACCGGA
GGAGATTCTTCTAGCGGATCAAATCTACTTCGTTCTCCCTATCCCTAAACGTCGGTACCG
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CGGTGATGCAAATTAAGGGAAACCTACCGATTAAAACGACGCAGTTTAGGAGTACTAATA
CAATCGGTTATTCCCGGTCCGGTTCGGTACGGCAATTGAAAAGATACGCGTCTGGGCGAG
CTAGGAAGCTTGCGGATCGGTCGATTAAAAGAGTGCTCTCAACAATCCACGAAGAAAACA
TTTTTTAGATTTCTAAGAATACAATTTTTCTTTTATTTTTTGTTGTTGTTATACGGAAAT
TATTGTTAATGTTT

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

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GTACATGTTCGTGAACTGTAGAGCCGTGTCTCCCTTCGAGTGGCATCCTTTCTCCATCAC
ATCTGCTCCAGGAGACGACTACCTAAGCGTACACATCCGCACGCTAGGTGACTGGACTCG
CAAGCTCAGAACCGTCTTCTCTGAAGTATGCAAACCTCCTACCGCTGGTAAAAGCGGTCT
GCTCAGAGCAGAAGGAGAAGACTCCGTGGCGTTCCCAAAGGTTCTTATCGACGGTCCCTA
TGGTGCTCCCGCACAAGACTACAAGAAGTACGACGTGGTACTCCTAGTAGGTCTTGGCAT
CGGAGCCACGCCTATGATCAGCATCGTCAAGGACATCATCAACAACATGAAAACTGATGC
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ACACGCTGAACGGTGTTGATGTCGTCTCCGGGACACGTGTCAAGTCCCATTTCGCTAAAC
CTAACTGGAGACAAGTCTACAAGAGGATCGCAGTTCAGCATCCCGGCAAACGAATCGGAG
TCTTCTATTGTGGGGCACCGGGATTGACAAAGGAACTAAAAAATCTGGCTTTGGATTTCT
CTCGCAAGACAACCACCAAGTTTGACTTCCACAAAGAGAACTTCTAATCTGAATTATATA
AGTTGGGGGTCAATTAAGTAGAAAAATAAGACAAGAAACTGCATATAGATATTAAATTTT
AAAATTCTTTTCCTTTCAT


BQ
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AF RS1CG47TF U 1
AF RS1CG47JQ C 223
BS 1 746 RS1CG47TF
BS 747 979 RS1CG47JQ

RD RS1CG47TF 746 0 0
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GCTCAGAGCAGAAGGAGAAGACTCCGTGGCGTTCCCAAAGGTTCTTATCGACGGTCCCTA
TGGTGCTCCCGCACAAGACTACAAGAAGTACGACGTGGTACTCCTAGTAGGTCTTGGCAT
CGGAGCCACGCCTATGATCAGCATCGTCAAGGACATCATCAACAACATGAAAACTGATGC
CCGCGACAGCGACATCGAGAACAACAATAGTAATGGGAATAGCAAAGGGTTTAGGACGAG
GAAAGCTTATTTCTACTGGGTGACAAGAGAGCAAGGATCGTTCGAGTGGTTTAAGGGAAT
AATGGACGAGGTTTCTGAGCTGGACGAGGAAGGTATCATCGAGCTCCATAATTATTGCAC
GAGCGTGTACGAGGATGGTGACGCTAGGGTTGCTCTTATTGCCATGCTTCAGTCGTTGCA
ACACGCTGAACGGTGTTGATGTCGTCTCCGGGACACGTGTCAAGTCCCATTTCGCTAAAC
CTAACTGGAGACAAGTCTACAAGAGG

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1CG47JQ 757 0 0
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TCTTATCGACGGTCCCTATGGTGCTCCCGCACAAGACTACAAGAAGTACGACGTGGTACT
CCTAGTAGGTCTTGGCATCGGAGCCACGCCTATGATCAGCATCGTCAAGGACATCATCAA
CAACATGAAAACTGATGCCCGCGACAGCGACATCGAGAACAACAATAGTAATGGGAATAG
CAAAGGGTTTAGGACGAGGAAAGCTTATTTCTACTGGGTGACAAGAGAGCAAGGATCGTT
CGAGTGGTTTAAGGGAATAATGGACGAGGTTTCTGAGCTGGACGAGGAAGGTATCATCGA
GCTCCATAATTATTGCACGAGCGTGTACGAGGATGGTGACGCTAGGGTTGCTCTTATTGC
CATGCTTCAGTCGTTGCAACACGCTGAACGGTGTTGATGTCGTCTCCGGGACACGTGTCA
AGTCCCATTTCGCTAAACCTAACTGGAGACAAGTCTACAAGAGGATCGCAGTTCAGCATC
CCGGCAAACGAATCGGAGTCTTCTATTGTGGGGCACCGGGATTGACAAAGGAACTAAAAA
ATCTGGCTTTGGATTTCTCTCGCAAGACAACCACCAAGTTTGACTTCCACAAAGAGAACT
TCTAATCTGAATTATATAAGTTGGGGGTCAATTAAGTAGAAAAATAAGACAAGAAACTGC
ATATAGATATTAAATTTTAAAATTCTTTTCCTTTCAT

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

CO CL8272Contig1 694 2 2 U
GGAACGCTTGACCAAAGATTTCTGGAGGGAAGCACAGATACTCTCAAATCTTCATCACCC
AAATGTTGTTGCATTCTATGGTATAGTCCCTGATGGAGCTGGAGGAACATTAGCGACTGT
TACTGAGTTCATGGTGAATGGGTCACTAAGGCATGCTCTTGTCAAGAGAGACAGGTTGCT
CGACGCTCGGAAAAAGATAATAATAGCAATGGATGCTGCTTTTGGCATGGAGTATTTGCA
CTTGAAGAACATTGTCCACTTTGATCTCAAATGTGAGAACTTGCTCGTCAATCTAAGGGA
TCCACAACGGCCTATATGCAAGGTGGGAGATCTTGGCTTATCTAGAATCAAACGTAACAC
TTTGGTATCTGGGGGAGTGAGAGGAACACTTCCATGGATGGCACCAGAACTCTTGAACGG
AAGCAGCACCCGGGTTTCAGAGAAAGTTGATGTATTTTCATATGGGATCTGCCTATGGGA
GATTCTAACAGGAGAGGAGCCCTATGCAGATATGCATTGCGGAGCAATCATTGGTGGGAT
AGTGAAGAACACGCTTCGGCCTCCCATACCGAAAACATGTTCTGCGGAATGGAAAAAGCT
GATGGAACAATGCTGGGACATAGACCCGGATGCTCGTCCCGCCTTCACCGAGATAACAAG
CAGACTTCGATCCACGTCAATGGAACTCGTCACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G909TF U 1
AF RS1G909JQ C 121
BS 1 644 RS1G909TF
BS 645 694 RS1G909JQ

RD RS1G909TF 644 0 0
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AAATGTTGTTGCATTCTATGGTATAGTCCCTGATGGAGCTGGAGGAACATTAGCGACTGT
TACTGAGTTCATGGTGAATGGGTCACTAAGGCATGCTCTTGTCAAGAGAGACAGGTTGCT
CGACGCTCGGAAAAAGATAATAATAGCAATGGATGCTGCTTTTGGCATGGAGTATTTGCA
CTTGAAGAACATTGTCCACTTTGATCTCAAATGTGAGAACTTGCTCGTCAATCTAAGGGA
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TTTGGTATCTGGGGGAGTGAGAGGAACACTTCCATGGATGGCACCAGAACTCTTGAACGG
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QA 1 644 1 644
DS 

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CGACGCTCGGAAAAAGATAATAATAGCAATGGATGCTGCTTTTGGCATGGAGTATTTGCA
CTTGAAGAACATTGTCCACTTTGATCTCAAATGTGAGAACTTGCTCGTCAATCTAAGGGA
TCCACAACGGCCTATATGCAAGGTGGGAGATCTTGGCTTATCTAGAATCAAACGTAACAC
TTTGGTATCTGGGGGAGTGAGAGGAACACTTCCATGGATGGCACCAGAACTCTTGAACGG
AAGCAGCACCCGGGTTTCAGAGAAAGTTGATGTATTTTCATATGGGATCTGCCTATGGGA
GATTCTAACAGGAGAGGAGCCCTATGCAGATATGCATTGCGGAGCAATCATTGGTGGGAT
AGTGAAGAACACGCTTCGGCCTCCCATACCGAAAACATGTTCTGCGGAATGGAAAAAGCT
GATGGAACAATGCTGGGACATAGACCCGGATGCTCGTCCCGCCTTCACCGAGATAACAAG
CAGACTTCGATCCACGTCAATGGAACTCGTCACT

QA 1 574 1 574
DS 



AS 1 2

CO CL8273Contig1 822 2 4 U
GGGGTCGTCACTTCCAACTATTTCGACATTGGACTCCACAACCGAACATCACCAAAAGTC
AGCAAACCCAAACCCAAAAAACAAAAACATAAACCTCAAATCAAAACAATGAGATGCTAC
AAAGGATCATCCATTCTCGCCACCAGTCATTACCCATTCCTCTATAAACGACCAGTCTCC
TCTCTACCCGCTTCTTTCCCTTCTTCTACCCTCTCATACCCAACCCGAAACCGGTTCGTA
TCAACCCGGATCCAAGCCCGGCTCATTCACGACGACCCGGTAAAACAATCGGAGGATTTG
AGCTTCTACGATCTCCTCGGCGTCACCGAATCCGTTAGCCTCCCGGAAATCAAACAGGCG
TATAAACAGCTTGCTCGAAAGTATCATCCCGATGTTTCGCCGCCGGATCGGGTCGAGGAA
TACACAGATCGGTTTATCAGGGTTCAAGAAGCTTACGAGACTCTCTCGGATCCTAGCCGG
AGAGTTCTCTACGACAGAGATTTGTCTATGGGATTCTCATTTTCGTTCTCAGGACGACGC
CGGAATCGATACGATGAGGAAATTGTGGAAGAGAAGAGTGAGTGGAAGAAAAAATGGCAA
ACTCAGCTCTCAGGGCTCAAGAAAAGAAGCAATCAAAAAGAAAACAACGCAATGTCTTGG
GCTGCTAGAATGCGCCGTCAACATCACATGTCTGAAGATTCTACTTCTTAACACACAACC
ACCATATCTGGCCTCCTTAATTTACTATAGGTTTTTAGCGTAACTACCTGCAAATCTGTA
TATATTGTATAATATAAAATTATAAATCCTTTTGTGTGTCAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GC83TF U 1
AF RS1GC83JQ C 185
BS 1 695 RS1GC83TF
BS 696 696 RS1GC83JQ
BS 697 737 RS1GC83TF
BS 738 822 RS1GC83JQ

RD RS1GC83TF 737 0 0
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AGCAAACCCAAACCCAAAAAACAAAAACATAAACCTCAAATCAAAACAATGAGATGCTAC
AAAGGATCATCCATTCTCGCCACCAGTCATTACCCATTCCTCTATAAACGACCAGTCTCC
TCTCTACCCGCTTCTTTCCCTTCTTCTACCCTCTCATACCCAACCCGAAACCGGTTCGTA
TCAACCCGGATCCAAGCCCGGCTCATTCACGACGACCCGGTAAAACAATCGGAGGATTTG
AGCTTCTACGATCTCCTCGGCGTCACCGAATCCGTTAGCCTCCCGGAAATCAAACAGGCG
TATAAACAGCTTGCTCGAAAGTATCATCCCGATGTTTCGCCGCCGGATCGGGTCGAGGAA
TACACAGATCGGTTTATCAGGGTTCAAGAAGCTTACGAGACTCTCTCGGATCCTAGCCGG
AGAGTTCTCTACGACAGAGATTTGTCTATGGGATTCTCATTTTCGTTCTCAGGACGACGC
CGGAATCGATACGATGAGGAAATTGTGGAAGAGAAGAGTGAGTGGAAGAAAAAATGGCAA
ACTCAGCTCTCAGGGCTCAAGAAAAGAAGCAATCAAAAAGAAAACAACGCAATGTCTTGG
GCTGCTAGAATGCGCCGTCAACATCACATGTCTGA*GATTCTACTTCTTAACACACAACC
ACCATATCTGGCCTCCT

QA 1 737 1 737
DS 

RD RS1GC83JQ 638 0 0
TACCCGCTTCTTTCCCTTCTTCTACCCTCTCATACCCAACCCGAAACCGGTTCGTATCAA
CCCGGATCCAAGCCCGGCTCATTCACGACGACCCGGTAAAACAATCGGAGGATTTGAGCT
TTTACGATCTCCTCGGCGTCACCGAATCCGTTAGCCTCCCGGAAATCAAACAGGCGTATA
AACAGCTTGCTCGAAAGTATCATCCCGATGTTTCGCCGCCGGATCGGGTCGAGGAATACA
CAGATCGGTTTATCAGGGTTCAAGAAGCTTACGAGACTCTCTCGGATCCTAGCCGGAGAG
TTCTTTACGACAGAGATTTGTTTATGGGATTTTCATTTTCGTTCTCAGGACGACGCCGGA
ATCGATACGATGAGGAAATTGTGGAAGAGAAGAGTGAGTGGAAGAAAAAATGGCAAACTC
AGCTCTCAGGGCTCAAGAAAAGAAGCAATCAAAAAGAAAACAACGCAATGTCTTGGGCTG
CTAGAATGCGCCGTCAACATCACATGTTTGAAGATTTTACTTCTTAACACACAACCACCA
TATCTGGCCTCCTTAATTTACTATAGGTTTTTAGCGTAACTACCTGCAAATCTGTATATA
TTGTATAATATAAAATTATAAATCCTTTTGTGTGTCAG

QA 1 638 1 638
DS 



AS 1 2

CO CL8274Contig1 897 2 2 U
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TGGATGTTGGTTGTGGGATCGGAGGAAGCTCAAGGTATATTGCCTCTAAATTTGGTGCCG
AATGCATTGGCATCACACTCAGTCCCGTTCAAGCCAAGAGAGCCAATGATCTCGCCGCCG
CTCAATCACTCTCTCAGAAGGTTTCCTTCCAGGTTGCAGATGCGCTGGAACAACCATTTG
AAGATGGTATGTTCGATCTTGTGTGGTCAATGGAAAGCGGTGAGCATATGCCTGACAAGG
CCAAGTTCGTGAAGGAATTGGTACGTGTGGCGGCTCCAGGAGGAAGGATAATAATAGTGA
CATGGTGCCACAGAAATCTACCCCCAGGGGAAGAAGCTTTGCAGCCATGGGAGCAGAACC
TCTTAGACAGAATCTGCAAAACATTTTATCTCCCGGCCTGGTGCTCCACCTCTGATTATG
TCGATTTGCTTCAATCCCTCTCGCTCCAGGATATTAAGTGTGCAGATTGGTCAGAGAACG
TAGCTCCTTTCTGGCCGGCGGTTATACGAACCGCATTAACATGGAAGGGCCTTGTGTCTC
TGCTTCGTAGTGGTATGAAGAGTATAAAAGGAGCATTGACAATGCCATTGATGATCGAAG
GGTACAAGAAAGGTGTCATTAAGTTTGGCATCATCACTTGCCAGAAGCCTCTCTAAGTTT
AAGATAAACAATAAAATTGTCGTATAAGTGATCTTCAGTGAATTGGTTTTATATCTATTA
TATAGGAGATTGAATAAGAGACGTGAGAAATGTGGATGCATGAGATCCTTAACGTCATTA
ATGTTCATTCTTCGCTCCGTTGTTTATTTTAGATAAATATAATTTATCTAAGAAGAT


BQ
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BQ
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QA 1 532 1 532
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AT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 

AF RS1DR47TF U 1
AF RS1EV76TF U 1
BS 1 524 RS1DR47TF
BS 525 525 RS1EV76TF
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GTACCATCGCCGTCTGGACTATTCCTACTCATTTTGCGTTTGCCTTCTATTTT

QA 1 533 1 533
DS 

RD RS1EV76TF 782 0 0
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TTCCTTTACTGAGGGATTAATATGAAGAAGGAGACATAAAGAGAGAGACATGGATGGAAA
CAAAGAAGCTATGGCGTATCGTTGGACCGGCCATATTCACTAGATTCTCGACCTTTTCGA
TCTTCGTCATCGCTCAGGCCTTCGCCGGCCACCTTGGGGAGCTTGAACTCGCCTCCATCT
CCATCGTCCACAACGTCATCATTGGCTTTAACATCGGCCTCCTTCTAGGAATGGCGAGTG
CGTTGGAAACACTGTGTGGGCAAGCGTTTGGAGCAAAGAAGTATGAGATGTTGGGAGTGT
ATATGCAGCGATCTTGGATCGTTCTCTTCTTATTCTGCACCATGCTCCTCCCCATGTACT
TGTTTGCATCTCCGATTCTTAAATTCCTCGGCCAGCCTGAAGATATTGCCGAGCTATCCG
GTACCATCGCCGTCTGGACTATTCCTACTCATTTTGCGTTTGCCCTCTATTTTCTCTCAG
CCGATTCTTCCAGTGCCAGCTCAAGAATAGGGTGGTTGCAATTTCCTCCGTAGTGGCACT
TGTAGTTCACATATTTGTCTGCTGGCTTTTTGTGTACGGTCTCAAACTTGGAGTCGTAGG
GACAATGGCTACTGTTAGCGTGTCGTGGTGGCTCAATGTTTTCATCCTATTTGCTTACGC
CACTTGCGGCCGTTGTCCGCTCACTTGGACTGGTTTCTCCCTAGAAGCTTTCGCTAAACT
AT

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

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AAAAATTTGAAACGCGCGGAGAAAGCTAGGATCCTTATCAGCAAAATTCCTGTGCCTGAG
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GTTAAAGATGGTTCGACTTCTACCGATAATAAGCAGATGAAATTGACGTCTCTTGCAGAA
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GTTACTGGCCACATCATTTCTACTACTATTGGAGGCAAAAACGGTGAACCTAAACAGATC
AAGTGCTCTGCTGAACCTGAGTCTGAAGGAAAAGTTAAAGATGGTTCGTCTTCTCCCGAT
AATAAGCGGATGAAATTGACGCCTCTTGCAGATGCAAGCAACCCAATCATGGCTCAGGAT
ATGTCTGCTGCTGTTATAGAGGGGAATGATGCTGTTACTGGCCACATCATTTCTACTACT
ATTGGAGGCAAAAACGGTGAACCTAAACAGTTCCTGTTGTTGGTGGCTCAAAAGAATCAC
AACACCAAGTTTTTCATGACAAACTCTCCTGACAACGTTCCTTCAGTTGAACCGATCTGC
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GTCTGCGTTTTCTTATTTTAAGATGTAGTTGCTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D584TF U 1
AF RS1D584JQ C 405
BS 1 640 RS1D584TF
BS 641 996 RS1D584JQ

RD RS1D584TF 640 0 0
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GTTACTGGCCACATCATTTCTACTACTATTGGAGGCAAAAACGGTGAACCTAAACAGATC
AAGTGCTCTGCTGAACCTGAGTCTGAAGGAAAAGTTAAAGATGGTTCGTCTTCTCCCGAT
AATAAGCGGATGAAATTGACGCCTCTTGCAGATGCAAGCAACCCAATCATGGCTCAGGAT
ATGTCTGCTGCTGTTATAGAGGGGAATGATGCTGTTACTGGCCACATCATTTCTACTACT
ATTGGAGGCAAAAACGGTGAACCTAAACAGTTCCTGTTGTTGGTGGCTCAAAAGAATCAC
AACACCAAGTTTTTCATGACAAACTCTCCTGACAACGTTC

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1D584JQ 592 0 0
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AATCATGGCTCAGGATATGTCTGCTGCTGTTATAGAGGGGAATGATGCTGTTACTGGCCA
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GGCTCAAAAGAATCACAACACCAAGTTTTTCATGACAAACTCTCCTGACAACGTTCCTTC
AGTTGAACCGATCTGCTTTGCTCACTTGGCAGCTGCTCAGCTAGGAACGTTCATGAAGTT
TGAAGATCAGTTTGAGACGTCCTCAAGCCATGGTGGGGTGACAGCTCCAGGACCAATCTC
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ATCGTTGGGATCTTTTCTTTTGAAGTGGTTAAAAGGCAACTAAACAATAGGCAACTATAA
TTCACGTTCAACTTTTGTCTGCGTTTTCTTATTTTAAGATGTAGTTGCTGCC

QA 1 592 1 592
DS 



AS 1 2

CO CL8278Contig1 467 2 1 U
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ATTGTGAAAATGCTCATCAAGTATGTTACCACTACAGGAGCATGATCCCTCAATATAGTT
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TGTGATGACAAACTATAACGATTTGAAATGAATAAAGCTGTTGGCAG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1G473JQ C 1
AF RS1G473TF U 1
BS 1 467 RS1G473TF

RD RS1G473JQ 467 0 0
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ATTGTGAAAATGCTCATCAAGTATGTTACCACTACAGGAGCATGATCCCTCAATATAGTT
CTCCTTATTTTTGTTGTTATGTTACCTTTTTATTTTTTTGATAAGTTTTTTCTATTGCAA
TGTGATGACAAACTATAACGATTTGAAATGAATAAAGCTGTTGGCAG

QA 1 467 1 467
DS 

RD RS1G473TF 467 0 0
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GAAGAGTATCAGACACAAATCTCTGGGACAGAACAAGAAGCAGCTGCAAAACGTTTAGAA
GAGGAGACAGACGGCAGGATCCAGAACCTTAAGGAGTCTAGTTCAAAGGTCTCTAAGGAG
ATTGTGAAAATGCTCATCAAGTATGTTACCACTACAGGAGCATGATCCCTCAATATAGTT
CTCCTTATTTTTGTTGTTATGTTACCTTTTTATTTTTTTGATAAGTTTTTTCTATTGCAA
TGTGATGACAAACTATAACGATTTGAAATGAATAAAGCTGTTGGCAG

QA 1 467 1 467
DS 



AS 1 2

CO CL8279Contig1 951 2 6 U
GAGGAAACTTTTTTTACTTATTTGTGGTGTTTCCTATTTTACAGTTTACTCACAGCAAGA
GAGGAGGTCTCTATCTCTGGCTCATATATCAAACCAATAACGGCTGTGTAGTCAGATGCT
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GAATGGTGTAGTTGAAGCTACTAATGTTCCGGAAGTAACACTGGTCACTTCCAACATAGT
TATACACTTGTTGTGTGCCCCCATATCCACTAACCACCAAATTATCCTTCACCACTATAA
CCCCTTGCGCTTCCTGCTTATTCTCCACCTTGCTCTTAAACATTCCCATCGATCCATCAT
CACTCCATGATCTCTCCTCATTGAATCCCATCGTGACATTCGCAACCTCCCGAGACGTGT
GATTCTGTCCCTCCAAATAGTCAGAGTATAGGTAAAAAGGAAAGCTCTTGATGGATCTCG
CCGCGTAGAGTTCTCTTGACTCTCTCTTGGCGTGAACACGGTCATCAGCTTGGATCAACT
GATCTATGATCTGGAAGTTCCCATCTTTTCCTAAAACCATTTTGTTTACATAGGTGAACT
CCTGACTCGCATTGGTTATAATGTCACCATGAGAGGACTTCACCAACCCTATCGAACGCA
CCGATCTTTTCGCCTTGGTTGTGAAGTTACCATTCAAACCTTTAAAGTCCGAAACAGAGC
TAATCTCAAGAGAGCTTCCCCCAACCTCCAACACCTTCCCTTCAACCACCTCCTTCTCCT
TATCCAACCAAAGATGCAAATTCGCGTCAACGTACCAAACATTCAACGCGTTAGTCACAC
TAAACTCCACCTTATGACCCTCTCCATCTAACAACCTCCCCAAGAAAGGCGTCACCTCGA
TATCATAGCTCGGCAAATCAAAAGAGCCGATAGCTGTGATCGGTCTCCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GZ02JQ U 1
AF RS1C264TF C 318
BS 1 339 RS1GZ02JQ
BS 340 340 RS1C264TF
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BS 347 662 RS1GZ02JQ
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RD RS1GZ02JQ 662 0 0
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GAGGAGGTCTCTATCTCTGGCTCATATATCAAACCAATAACGGCTGTGTAGTCAGATGCT
CAACCCGTGGCGGCAGCTCCAATGTTTTCTTCTTGCAAACAGTTTCAACCTTGTCATATA
GAATGGTGTAGTTGAAGCTACTAATGTTCCGGAAGTAACACTGGTCACTTCCAACATAGT
TATACACTTGTTGTGTGCCCCCATATCCACTAACCACCAAATTATCCTTCACCACTATAA
CCCCTTGCGCTTCCTGCTTATTCTCCACCTTGCTCTTAAGCATTCTCATCGATCCATCAT
CACTCCATGATCTCTCCTCATTGAATCCCATCGTGACATTCGCAACCTCCCGAGACGTGT
GATTCTGTCCCTCCAAATAGTCAGAGTATAGGTAAAAAGGAAAGCTCTTGATGGATCTCG
CCGCGTAGAGTTCTCTTGACTCTCTCTTGGCGTGAACACGGTCATCAGCTTGGATCAACT
GATCTATGATCTGGAAGTTCCCATCTTTTCCTAAAACCATTTTGTTTACATAGGTGAACT
CCTGACTCGCATTGGTTATAATGTCACCATGAGAGGACTTCACCAACCCTATCGAACGCA
CC

QA 1 662 1 662
DS 

RD RS1C264TF 634 0 0
TTATTCTCCACCTTGCTCTTAAACATTCCCATCGATCCATCATCACTCCATGATCTCTCC
TCATTGAATCCCATCGTGACATTCGCAACCTCCCGAGACGTGTGATTCTGTCCCTCCAAA
TAGTCAGAGTATAGGTAAAAAGGAAAGCTCTTGATGGATCTCGCCGCGTAGAGTTCTCTT
GACTCTCTCTTGGTGTGAACACGGTCATCAGCTTGGATCAACTGATCTATGATCTGGAAG
TTCCCATCTTTTCCTAAAACCATTTTGTTTACATAGGTGAACTCCTGACTCGCATTGGTT
ATAATGTCACCATGAGAGGACTTCACCAACCCTATCGAACGCACCGATCTTTTCGCCTTG
GTTGTGAAGTTACCATTCAAACCTTTAAAGTCCGAAACAGAGCTAATCTCAAGAGAGCTT
CCCCCAACCTCCAACACCTTCCCTTCAACCACCTCCTTCTCCTTATCCAACCAAAGATGC
AAATTCGCGTCAACGTACCAAACATTCAACGCGTTAGTCACACTAAACTCCACCTTATGA
CCCTCTCCATCTAACAACCTCCCCAAGAAAGGCGTCACCTCGATATCATAGCTCGGCAAA
TCAAAAGAGCCGATAGCTGTGATCGGTCTCCACC

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 2

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GTCTGGACCAAGTATTTCAATCAAATATTGACGGTTGCTCTTGAAGTGGTCGAGGACGAA
GATTTTTCAGTCAGAGAAGTTGCTCTTTCGCTGATTTCTGAAATGCTAAAGAGCCAGAAA
GATGCAATGGAAGATTCTGTAGAGATAGTGATTGAGAAGCTGCTTCATGTCTCGAAGGAC
TTTGTTCCAAAAGTTTCCAGTGAAGCTGAGGAATGCTTGACCACAGTTTTGTCCCAATAC
GATCCTTTCAGATGCTTAAGTGTTATTGTCCCACTATTGGTAACAGAAGATGAAAAAACC
CTCGTCGCTTGCATCAGTTGTTTAACTAAGCTTGTGGGTAGGCTCTCGCAAGAGGAATTA
ACGGATCAATTGTCTTCTTTTTTGCCTGCCGTCTTTGAAGCATTTGGGAGCCAAAGCGCA
GATGTTCGAAAGACAGTGGTGTTCTGTCTGGTAGACATATACATAATGCTTGGGAAAGCG
TTCTTGCCGCATTTGGAAGGTCTAAACAGTACACAGGTTCGGTTAGTGACCATCTACGCA
AACAGGATCTCACAGGCTAGAACTGGTGCCCCTATAGACTCAAACACGTGACAGAGACAC
TTGTGGTCGTGGTTGTTTGGTTTTCTCCCTTGTGTCTTTGGGGTTATTATTCTTTATTGT
TCATTTTGTATATGGGTTATATCTGTGTGTCTTGTGATACTTTTTGGTGTAATTTTGTAA
CTTTTGAGTTTTTCTTCTATTCATTTTGTTAGTGTGTGATCTATTTTACTCTTTTTTTTT
GGTGGGAGTGTGTTATTAGTTATTACTCTGCTCTCGTATTCAGTTGCATCTTCTAAATTC
CCCTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GR02TF U 1
AF RS1GR02JQ C 438
BS 1 707 RS1GR02TF
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GTCTGGACCAAGTATTTCAATCAAATATTGACGGTTGCTCTTGAAGTGGTCGAGGACGAA
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GATGCAATGGAAGATTCTGTAGAGATAGTGATTGAGAAGCTGCTTCATGTCTCGAAGGAC
TTTGTTCCAAAAGTTTCCAGTGAAGCTGAGGAATGCTTGACCACAGTTTTGTCCCAATAC
GATCCTTTCAGATGCTTAAGTGTTATTGTCCCACTATTGGTAACAGAAGATGAAAAAACC
CTCGTCGCTTGCATCAGTTGTTTAACTAAGCTTGTGGGTAGGCTCTCGCAAGAGGAATTA
ACGGATCAATTGTCTTCTTTTTTGCCTGCCGTCTTTGAAGCATTTGGGAGCCAAAGCGCA
GATGTTCGAAAGACAGTGGTGTTCTGTCTGGTAGACATATACATAATGCTTGGGAAAGCG
TTCTTGCCGCATTTGGAAGGTCTAAACAGTACACAGGTTCGGTTAGTGACCATCTACGCA
AACAGGATCTCACAGGCTAGAACTGGTGCCCCTATAGACTCAAACACGTGACAGAGACAC
TTGTGGTCGTGGTTGTTTGGTTTTCTCCCTTGTGTCTTTGGGGTTAT*ATTCTTTATTGT
TCATTTTGTATATGGGTTATATCTGTGTGTCTTGTGATACTTTT
GG

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1GR02JQ 470 0 0
TTTTTTGCCTGCCGTCTTTGAAGCATTTGGGAGCCAAAGCGCAGATGTTCGAAAGACAGT
GGTGTTCTGTCTGGTAGACATATACATAATGCTTGGGAAAGCGTTCTTGCCGCATTTGGA
AGGTCTAAACAGTACACAGGTTCGGTTAGTGACCATCTACGCAAACAGGATCTCACAGGC
TAGAACTGGTGCCCCTATAGACTCAAACACGTGACAGAGACACTTGTGGTCGTGGTTGTT
TGGTTTTCTCCCTTGTGTCTTTGGGGTTATTATTCTTTATTGTTCATTTTGTATATGGGT
TATATCTGTGTGTCTTGTGATACTTTTTGGTGTAATTTTGTAACTTTTGAGTTTTTCTTC
TATTCATTTTGTTAGTGTGTGATCTATTTTACTCTTTTTTTTTGGTGGGAGTGTGTTATT
AGTTATTACTCTGCTCTCGTATTCAGTTGCATCTTCTAAATTCCCCTGTT

QA 1 470 1 470
DS 



AS 1 2

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AAAAACTTTTAAAATCAATGATTCAATACATCCCCCTTAGTATACATAGGTCACACTGCC
CACTCATATTAACTGATCTGAATAAAGAATGTCACCGTCTGTAACCTTGAGATATCAAGA
CAAAAAACGTTATACAGTACTAAGACATTAACTTATAGGTAGCTACCCGAAAAAGAGCTT
ATACGTATTTTGGTCATTTTATACTTTGAGGGAGAGAGAGAGAGGCGTTTTTTTCTTTTC
TCGTTCCTCTATTTTCTAGAGAGAGAGAAAATTAATGAGGGATCAAGTGATTCAATCGAT
GAAGAAAACAATGGGAGTGAATGTGAATCGATGGACTCGGTGATTAAAGATTTTAAAGCT
CAGATTTCTGTTTATGATTTTTGAATTTGGATTATCAAAAAAAAAAGGAAACTATGGACG
GTGCCTCCTCCTCCTCCACCGCGGCTAGTAGTGGCACTCCTTCGTCTTTAGAGTGGAGAT
TCTCTCAGGTCTTCGGTGAGCGAACCGCCGGAGAAGAAGTTCAGGAAGGTACTTATTGCG
TTAGAGATTGTGAAATGTTTATTTTTGATGAGTTTTAGATCCGGAGGGTGTTTGAAGACT
TAAGGATTTGGTTAGTGATTTGTTTCATTGATCAATCTTCTCCAGTTGACATCATTTCAG
CCATTGAGTTTGATAAAAGTGGAGGCCCCCTTGCAACTGGTGACCGTGGGGGCCGAGTTC
TTTTTGAGAGGACTGATACTAAAGATGTGTGTTTCTTTTTTTACTTCCATCCTTCCGTTT
CGTTTCTCT


BQ
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AF RS1CV19TF U 1
AF RS1CV19JQ C 99
BS 1 624 RS1CV19TF
BS 625 849 RS1CV19JQ

RD RS1CV19TF 624 0 0
TGATTTGAAAATAAATTTTAAAATCTTTAGTTGAATAACATGGGATTTTAAAACAACCCC
AAAAACTTTTAAAATCAATGATTCAATACATCCCCCTTAGTATACATAGGTCACACTGCC
CACTCATATTAACTGATCTGAATAAAGAATGTCACCGTCTGTAACCTTGAGATATCAAGA
CAAAAAACGTTATACAGTACTAAGACATTAACTTATAGGTAGCTACCCGAAAAAGAGCTT
ATACGTATTTTGGTCATTTTATACTTTGAGGGAGAGAGAGAGAGGCGTTTTTTTCTTTTC
TCGTTCCTCTATTTTCTAGAGAGAGAGAAAATTAATGAGGGATCAAGTGATTCAATCGAT
GAAGAAAACAATGGGAGTGAATGTGAATCGATGGACTCGGTGATTAAAGATTTTAAAGCT
CAGATTTCTGTTTATGATTTTTGAATTTGGATTATCAAAAAAAAAAGGAAACTATGGACG
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TCTCTCAGGTCTTCGGTGAGCGAACCGCCGGAGAAGAAGTTCAGGAAGGTACTTATTGCG
TTAGAGATTGTGAAATGTTTATTT

QA 1 624 1 624
DS 

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CTGTAACCTTGAGATATCAAGACAAAAAACGTTATACAGTACTAAGACATTAACTTATAG
GTAGCTACCCGAAAAAGAGCTTATACGTATTTTGGTCATTTTATACTTTGAGGGAGAGAG
AGAGAGGCGTTTTTTTCTTTTCTCGTTCCTCTATTTTCTAGAGAGAGAGAAAATTAATGA
GGGATCAAGTGATTCAATCGATGAAGAAAACAATGGGAGTGAATGTGAATCGATGGACTC
GGTGATTAAAGATTTTAAAGCTCAGATTTCTGTTTATGATTTTTGAATTTGGATTATCAA
AAAAAAAAGGAAACTATGGACGGTGCCTCCTCCTCCTCCACCGCGGCTAGTAGTGGCACT
CCTTCGTCTTTAGAGTGGAGATTCTCTCAGGTCTTCGGTGAGCGAACCGCCGGAGAAGAA
GTTCAGGAAGGTACTTATTGCGTTAGAGATTGTGAAATGTTTATTTTTGATGAGTTTTAG
ATCCGGAGGGTGTTTGAAGACTTAAGGATTTGGTTAGTGATTTGTTTCATTGATCAATCT
TCTCCAGTTGACATCATTTCAGCCATTGAGTTTGATAAAAGTGGAGGCCCCCTTGCAACT
GGTGACCGTGGGGGCCGAGTTCTTTTTGAGAGGACTGATACTAAAGATGTGTGTTTCTTT
TTTTACTTCCATCCTTCCGTTTCGTTTCTCT

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

CO CL8282Contig1 525 2 1 U
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GTTTACTCCCGTTAATAGCGTTCTTTACTCCTTAGATCTACGCCACCTACGATCTTTCAT
TCAATACTTCTGATATATCTTACAGACGGTGAAACTCCACCTATAAAGTGTTTTTGTTTC
GTTGATCGACTGTATGAAGTTTCAACTTGGTGTTTGTGGTTACAACGTTAGAAGAAAGAA
CAAGCGCTCTTCGGTGGCGTGTCTTCAGGTGTTGGCTGAAGAACACAGGTCTTAAAAGTG
AAAACTATGAGATGGTGTCAATTAATGGAAGGATGCAGGAATATACATCGAGAAACTATG
AACTCAAATGTTCTCCTACAGGGTATGCCATGAGAATACCTTTTGAACTGAGGTTTATTC
ATATGTAATGTATTTTTATTATTTTGTCTTATACAGTATATTATCTTAAAGAATAATCAT
TGAAACATTGTCAAAACAACATGCTTATGGTATTTCCTTACTTCG


BQ
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AF RS1C806JQ C 1
AF RS1C806TF U 1
BS 1 525 RS1C806TF

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GTTTACTCCCGTTAATAGCGTTCTTTACTCCTTAGATCTACGCCACCTACGATCTTTCAT
TCAATACTTCTGATATATCTTACAGACGGTGAAACTCCACCTATAAAGTGTTTTTGTTTC
GTTGATCGACTGTATGAAGTTTCAACTTGGTGTTTGTGGTTACAACGTTAGAAGAAAGAA
CAAGCGCTCTTCGGTGGCGTGTCTTCAGGTGTTGGCTGAAGAACACAGGTCTTAAAAGTG
AAAACTATGAGATGGTGTCAATTAATGGAAGGATGCAGGAATATACATCGAGAAACTATG
AACTCAAATGTTCTCCTACAGGGTATGCCATGAGAATACCTTTTGAACTGAGGTTTATTC
ATATGTAATGTATTTTTATTATTTTGTCTTATACAGTATATTATCTTAAAGAATAATCAT
TGAAACATTGTCAAAACAACATGCTTATGGTATTTCCTTACTTCG

QA 1 525 1 525
DS 

RD RS1C806TF 525 0 0
GACGGCGATGACGATTCGGTGGTATCTTATTCTCGCCATCTGGAACGGTCATGGCTTTGT
GTTTACTCCCGTTAATAGCGTTCTTTACTCCTTAGATCTACGCCACCTACGATCTTTCAT
TCAATACTTCTGATATATCTTACAGACGGTGAAACTCCACCTATAAAGTGTTTTTGTTTC
GTTGATCGACTGTATGAAGTTTCAACTTGGTGTTTGTGGTTACAACGTTAGAAGAAAGAA
CAAGCGCTCTTCGGTGGCGTGTCTTCAGGTGTTGGCTGAAGAACACAGGTCTTAAAAGTG
AAAACTATGAGATGGTGTCAATTAATGGAAGGATGCAGGAATATACATCGAGAAACTATG
AACTCAAATGTTCTCCTACAGGGTATGCCATGAGAATACCTTTTGAACTGAGGTTTATTC
ATATGTAATGTATTTTTATTATTTTGTCTTATACAGTATATTATCTTAAAGAATAATCAT
TGAAACATTGTCAAAACAACATGCTTATGGTATTTCCTTACTTCG

QA 1 525 1 525
DS 



AS 1 2

CO CL8283Contig1 880 2 2 U
CTCTCGATCGTTGATTTGGGAATTTAGGGTTTTTTTTTCTCTGGAAGATGACGACTGCAG
CTAGGCCAACGTGGGCTCCGGCGAAGGGAGGTAACGAGCAGGGTGGTGCTCGTATTTTCG
GCGCCTCTCAGAAGTATTCGTCTCGCGATGTCGCCGCTCACACAACTCTAAAACCAAGGA
GGGAAGGGCAACACACGCAAGAGGAAGTGGAGAAGAAGAATCTTCGTGATGAGCTTGAGG
AGCGTGAGAGGAGACACTTCTCTTCCAAAGACAAATCTTTTAGTGATGATAGAGATCGCA
GGAGAGGGAATCAGCTACTCCTGGAAGGATCTAAAAGGGACCCTGAAGATCGGATTGTTC
CTCGCAGTGTAGATGCCGATGATTCTGATGTTGATATCAAAAGTGATGATGATAGTGATG
ACGAAAGTGATGATGATGACGAGGACGACACTGAAGCTCTCATGGCTGAACTCGACCAGA
TTAAGAAAGAAAGAGTGGAGGAGAGGCTCAGGAAGGAAAAGCAACAGCAGATGGAGGAGC
TAAACGCCAAAGAAGAAGAACTTCTCAAAGGAAACCCACTGCTTAATAACAATACTCCAA
CCTCGTTTAGTGTCAAAAGGAGGTGGGATGATGATGTGGTATTCAAGAATCAGGCTCGTG
GTGAAATGAAGGCACCTAAGCGCTTCATCAATGATACAATAAGGAATGACTTCCACAGAA
AATTCCTGCACAGATACATGAAGTGATTGAACAAGTGTTGTTACTTGTCTGTATTATGAA
TGAATGATCTCTAAGGCTTTTATTCCGTCTCTTGTACTAATACAGAAGCCAACCAACAAC
TGTTTTATGTTTTATGTCAAAAGCTCATTCACTTGACTCC


BQ
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AF RS1E306TF U 1
AF RS1E306JQ C 129
BS 1 653 RS1E306TF
BS 654 880 RS1E306JQ

RD RS1E306TF 654 0 0
CTCTCGATCGTTGATTTGGGAATTTAGGGTTTTTTTTTCTCTGGAAGATGACGACTGCAG
CTAGGCCAACGTGGGCTCCGGCGAAGGGAGGTAACGAGCAGGGTGGTGCTCGTATTTTCG
GCGCCTCTCAGAAGTATTCGTCTCGCGATGTCGCCGCTCACACAACTCTAAAACCAAGGA
GGGAAGGGCAACACACGCAAGAGGAAGTGGAGAAGAAGAATCTTCGTGATGAGCTTGAGG
AGCGTGAGAGGAGACACTTCTCTTCCAAAGACAAATCTTTTAGTGATGATAGAGATCGCA
GGAGAGGGAATCAGCTACTCCTGGAAGGATCTAAAAGGGACCCTGAAGATCGGATTGTTC
CTCGCAGTGTAGATGCCGATGATTCTGATGTTGATATCAAAAGTGATGATGATAGTGATG
ACGAAAGTGATGATGATGACGAGGACGACACTGAAGCTCTCATGGCTGAACTCGACCAGA
TTAAGAAAGAAAGAGTGGAGGAGAGGCTCAGGAAGGAAAAGCAACAGCAGATGGAGGAGC
TAAACGCCAAAGAAGAAGAACTTCTCAAAGGAAACCCACTGCTTAATAACAATACTCCAA
CCTCGTTTAGTGTCAAAAGGAGGTGGGATGATGATGTGGTATTCAAGAATCAG
C

QA 1 653 1 653
DS 

RD RS1E306JQ 752 0 0
CAGAAGTATTCGTCTCGCGATGTCGCCGCTCACACAACTCTAAAACCAAGGAGGGAAGGG
CAACACACGCAAGAGGAAGTGGAGAAGAAGAATCTTCGTGATGAGCTTGAGGAGCGTGAG
AGGAGACACTTCTCTTCCAAAGACAAATCTTTTAGTGATGATAGAGATCGCAGGAGAGGG
AATCAGCTACTCCTGGAAGGATCTAAAAGGGACCCTGAAGATCGGATTGTTCCTCGCAGT
GTAGATGCCGATGATTCTGATGTTGATATCAAAAGTGATGATGATAGTGATGACGAAAGT
GATGATGATGACGAGGACGACACTGAAGCTCTCATGGCTGAACTCGACCAGATTAAGAAA
GAAAGAGTGGAGGAGAGGCTCAGGAAGGAAAAGCAACAGCAGATGGAGGAGCTAAACGCC
AAAGAAGAAGAACTTCTCAAAGGAAACCCACTGCTTAATAACAATACTCCAACCTCGTTT
AGTGTCAAAAGGAGGTGGGATGATGATGTGGTATTCAAGAATCAGGCTCGTGGTGAAATG
AAGGCACCTAAGCGCTTCATCAATGATACAATAAGGAATGACTTCCACAGAAAATTCCTG
CACAGATACATGAAGTGATTGAACAAGTGTTGTTACTTGTCTGTATTATGAATGAATGAT
CTCTAAGGCTTTTATTCCGTCTCTTGTACTAATACAGAAGCCAACCAACAACTGTTTTAT
GTTTTATGTCAAAAGCTCATTCACTTGACTCC

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

CO CL8284Contig1 896 2 6 U
GATGATAATAAAACACATAGACGGAGGACAATAAATGATATATATCTAAAACAAAGATTA
CGTAATAAGATCATCCGATTACCAATGTAAAATGATCCATTGGCACAAATTACAATGCTC
TGAACTAACTACTGTTAGTGTTTATTTTATCATTATTATCAGTTTTTTTTTCTTCTAAAA
TTATTATCATCAGTTGACTATATAATTTTTTATTATGTTCAAAGGGGATTAACTGTCGAA
TCTCGTCTCAGGCTGATTAGCAATTTAGCATTATGCAAAACAGAAATAAGAAAAATGATA
ATAAGCAAACAATTTTAATTTTGTGTTTACTATAATTTTCAATTGTAATTGTAACAGTTT
AAAAAGAAAATCAACGTACGCACAAAAGCTTACTGTACACGGTAAAAAGTGAGCTCATAA
AAACTTGCGGTCAGAATGTCAATAATTGCATCAGTTTCATGCGAGTTACAAATACTACGA
AATTTGAGCTTCAAGTTACTATAGAATCATGATGTGATTAGAAATTAACTGATAGATGTA
AAAGAAAGTCTCCATATGCAATACCTACATACCTATACTAGTGAAGGAAAAACATCTCCT
TCACAAATTTTTTAGTAAGATTAAAAAATTCAGTTACCTTAATTTGTTTAATATAGAATA
ATGTTCTCATCTGGAGTTTGCATCCGCCCTCGGATAAGATAAACCGGCGATTTGGTCACT
AGTTTGATTCTGATACAATGCCAGATCAGCTAATATGAAACCTACTGTTAACATTAAAAA
AACCCAATAAAATTTGAATTAACCCATGATCAGGCAAGTATGCTTAAACCCTTTTTTTTT
GTATGCTTAAACCCTTGATGTCTTAAAATGTAGATTCTGTTATACAGTTTGCTGAC


BQ
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AF RS1FP33TF U 1
AF RS1FP33JQ C 240
BS 1 759 RS1FP33TF
BS 760 760 RS1FP33JQ
BS 761 770 RS1FP33TF
BS 771 771 RS1FP33JQ
BS 772 781 RS1FP33TF
BS 782 896 RS1FP33JQ

RD RS1FP33TF 781 0 0
GATGATAATAAAACACATAGACGGAGGACAATAAATGATATATATCTAAAACAAAGATTA
CGTAATAAGATCATCCGATTACCAATGTAAAATGATCCATTGGCACAAATTACAATGCTC
TGAACTAACTACTGTTAGTGTTTATTTTATCATTATTATCAGTTTTTTTTTCTTCTAAAA
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ATAAGCAAACAATTTTAATTTTGTGTTTACTATAATTTTCAATTGTAATTGTAACAGTTT
AAAAAGAAAATCAACGTACGCACAAAAGCTTACTGTACACGGTAAAAAGTGAGCTCATAA
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AATTTGAGCTTCAAGTTACTATAGAATCATGATGTGATTAGAAATTAACTGATAGATGTA
AAAGAAAGTCTCCATATGCAATACCTACATACCTATACTAGTGAAGGAAAAACATCTCCT
TCACAAATTTTTTAGTAAGATTAAAAAATTCAGTTACCTTAATTTGTTTAATATAGAATA
ATGTTCTCATCTGGAGTTTGCATCCGCCCTCGGATAAGATAAACCGGCGATTTGGTCACT
AGTTTGATTCTGATACAATGCCAGATCAGCTAATATGAA*CCTACTGTTA*CATTAAAAA
A

QA 1 781 1 781
DS 

RD RS1FP33JQ 657 0 0
ATCTCGTCTCAGGCTGATTAGCAATTTAGCATTATGCAAAACAGAAATAAGAAAAATGAT
AATAAGCAAACAATTTTAATTTTGTGTTTACTATAATTTTCAATTGTAATTGTAACAGTT
TAAAAAGAAAATCAACGTACGCACAAAAGCTTACTGTACACGGTAAAAAGTGAGCTCATA
AAAACTTGCGGTCAGAATGTCAATAATTGCATCAGTTTCATGCGAGTTACAAATACTACG
AAATTTGAGCTTCAAGTTACTATAGAATCATGATGTGATTAGAAATTAACTGATAGATGT
AAAAGAAAGTCTCCATATGCAATACCTACATACCTATACTAGTGAAGGAAAAACATCTCC
TTCACAAATTTTTTAGTAAGATTAAAAAATTCAGTTACCTTAATTTGTTTAATATAGAAT
AATGTTTTCATCTGGAGTTTGCATCCGCCCTCGGATAAGATAAACCGGCGATTTGGTCAC
TAGTTTGATTTTGATACAATGCCAGATCAGCTAATATGAAACCTACTGTTAACATTAAAA
AAACCCAATAAAATTTGAATTAACCCATGATCAGGCAAGTATGCTTAAACCCTTTTTTTT
TGTATGCTTAAACCCTTGATGTCTTAAAATGTAGATTCTGTTATACAGTTTGCTGAC

QA 1 657 1 657
DS 



AS 1 2

CO CL8285Contig1 782 2 2 U
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CTATAGTGTAATCAGTTAAATAGACCAATGAAGATACATCGTGCCATAATCCTGGTGACG
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GTGTTCGACAGTTTCATGCCGTGCATGGGCTTCGTCGAGGGAATCTTCCAGCAACCTTCT
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TCGAGGAAGAATGAGCAGGGGAGTGGAGAGCTAGAGAGAGTATGTGAATGCATTGAGATA
ATGGGAAAAGCAGATCATCTTCCTTTTCTGGCATCTGCCATCAACAATCTTCCACCCCTT
TGTTCGCTTAGTCTCAGTTTCCCTATATCTGTTGGAATGGACTGTTCTCAGTTCAGAAAC
ATGAAGGAACTCGATGCTGAAAAGCTAAATTAGTTACAAGTATGTATGAATAGTGGAAAT
GGAAGACTTGTAATAGCTATGCATGATATATAATCGAACTTATTGTATTAGTGACCAGTG
TGACAAAAAGTAATACGAATTAGTCAAGAAAGAGCGGATAACACTTGATCAATAACTCTT
CCATTGATATTTGACAGCATAAAAGAATATGAATTAGTCAAGAAAGAGCACTTGATCGAT
AGCTCTTTCACTAATATTTGTATGTGTATGGTTGTATATCAACGACGAAAACTGTTGATT
GG


BQ
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10 10 

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BS 1 764 RS1E121TF
BS 765 782 RS1E121JQ

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CTATAGTGTAATCAGTTAAATAGACCAATGAAGATACATCGTGCCATAATCCTGGTGACG
CTCTTGGCCTTGATCAAGACTGCGGTTTCCCAACTTCAATCGATTGAGCAGTGCAGAGAG
GTGTTCGACAGTTTCATGCCGTGCATGGGCTTCGTCGAGGGAATCTTCCAGCAACCTTCT
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TCGAGGAAGAATGAGCAGGGGAGTGGAGAGCTAGAGAGAGTATGTGAATGCATTGAGATA
ATGGGAAAAGCAGATCATCTTCCTTTTCTGGCATCTGCCATCAACAATCTTCCACCCCTT
TGTTCGCTTAGTCTCAGTTTCCCTATATCTGTTGGAATGGACTGTTCTCAGTTCAGAAAC
ATGAAGGAACTCGATGCTGAAAAGCTAAATTAGTTACAAGTATGTATGAATAGTGGAAAT
GGAAGACTTGTAATAGCTATGCATGATATATAATCGAACTTATTGTATTAGTGACCAGTG
TGACAAAAAGTAATACGAATTAGTCAAGAAAGAGCGGATAACACTTGATCAATAACTCTT
CCATTGATATTTGACAGCATAAAAGAATATGAATTAGTCAAGAAAGAGCACTTGATCGAT
AGCTCTTTCACTAATATTTGTATGTGTATGGTTGTATATCAACG

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DS 

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GTCAAGTTCAAGACTCCAGGATCGAGGAAGAATGAGCAGGGGAGTGGAGAGCTAGAGAGA
GTATGTGAATGCATTGAGATAATGGGAAAAGCAGATCATTTTCCTTTTTTGGCATTTGCC
ATCAACAATCTTCCACCCCTTTGTTCGCTTAGTTTCAGTTTCCCTATATCTGTTGGAATG
GACTGTTTTCAGTTCAGAAACATGAAGGAACTCGATGCTGAAAAGCTAAATTAGTTACAA
GTATGTATGAATAGTGGAAATGGAAGACTTGTAATAGCTATGCATGATATATAATCGAAC
TTATTGTATTAGTGACCAGTGTGACAAAAAGTAATACGAATTAGTCAAGAAAGAGCGGAT
AACACTTGATCAATAACTCTTCCATTGATATTTGACAGCATAAAAGAATATGAATTAGTC
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CAACGACGAAAACTGTTGATTGG

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DS 



AS 0 0

AS 1 2

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ATGCGAAATGCGGGTCGATAGGAGACGCTTGGGGGGTGTTCTGTGGAGCAAACGTTGAGG
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TCGACGTGCTTTCCCGTGCCGGTCTAGTTAAAGACGCGTACGGTTTTATATCCGAAATGC
CGATGGAACCCACCGGTTCGATGTTGGGTGCTTTGGTCAACGGGTGTATTAACCATGGAA
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GACGGTATGTCGGGTTAGCTAACGTTTATGCGATAAACCAGCGGTTTGGCGCGGCTCGAT
CTATGAGAGAAGCAATGGAGAAGAGAGGAGTGAAGAAAGTTGCAGGACACAGTATAATTG
AATTGAATGGAACACCGCCTAGGTTCATAGCTCATGACAAAACGCATTTAGACAGTGAGA
AGATCTACGCAGCGTTACATCTGGTTAGTATTTGGATGGATCTCGACGTCGACAATGACG
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CTTATCATTCAGTAGGATTTTTTTTATTACTCAATATAAAGAAGATTATCACCCAATTCT
TGTAGTGCAAGTTATCATTTGACAAAGGTCTAATATAATATTTTGTAGTGAAATTGCAAA
ACAATTTCGATTTATTC


BQ
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AF RS1B993TF U 1
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TTTTTATTACTCAATATAAAGAAGATTATCACCCAATTCTTGTAGTGCAAGTTATCATTT
GACAAAGGTCTAATATAATATTTTGTAGTGAAATTGCAAAACAATTTCGATTTATTC

QA 1 777 1 777
DS 



AS 1 2

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TCTCGTCAAATCTACCGCCTCGTGCTTCTTCTCTTTCACCGCGGCTCCGGGACCACGAGC
TCCACCAGCTTCTCCTTCCGTCGTCATCTCCTCTCGCCTCCATCCGTCGTCGTTTGCACC
TCTTGTCTCTCGGATATCATCATCTCCGGCGTGATTCATATCCCGACCACTGCATTCTCA
GAAATCGATTCATCTTCTTCGTCTTGTTCGAGATTGTGTTTGTCAATAACGATCGTCCTT
GTTGTTAGTTTCTGTATCAGATGCAGTATCTCCTCCGCCCAGTTCCTTGTTGTTGGTGGA
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GAAAGGAGAGAGAGATCCCGGTGTTGGACAGGGAGAGCGCTGGGGAGAAGAGCTCGGGGT
GGGAGACGACTTGGTGGCGTCGAGAGCTCGGTGTTGTGCTTCAGTGCCGTTGATGATGCT
TACGCGACAGGATATAGGGGCAGGTGTAGACGTTGTGGCTGAGCTGGGCGGAGGGAAAGG
GAGGGGAGAGAGGAAGAAGAGAATGGTTGGTGGATAGGGGGTATTAGTATTAGTGTCATA
AAATTTTAAGAACAGTTTCTAAGAACATCTCCGATATATTTTGTTATTTTCATCTCTAAA
ATAAGGGAACTCTATAATAAAGGTGAGATATGCTCCAATGTATTTCCTTAAAATAGCAAT
CTTTAAAATATAGAGT


BQ
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QA 1 753 1 753
DS 



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AAAAAAGGTTATGGTTGAGTTTGGGTTTTC


BQ
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AAAAAAGGTTATGGTTGAGTTTGGGTTTTC

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AAAAAA

QA 1 546 1 546
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CACAGCCG


BQ
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AF RS1CW24JQ U 122
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QA 1 567 1 567
DS 

RD RS1GT20TF 728 0 0
AGATTGAATGAAACTATTCAATAACTGGTAACACAAGAGTAAGGACAAAGGAGACATGTA
GTAATGGAAAACAACTAGGGCTTATTACAGAACACCAGCTAACAAAAGACCAACCAGATA
ATACTGAAACAGAGAGTAAAGAGATGA**CTCTCCCTCAAGTGAAGGAGCCAAATGACAG
GATTGGCTCAAGTGAATTTGCTCTTTAAATGCATCTCATAGCAAATACCAACTTGAAAAC
GCCATGTCTTCACAAAAAAGCCTGCTTCAGTTCAGCCTCGGGTTTGGCGAGTGTTGTATG
ATTTGCAGTCCGGACATTTCTGAGCCACCACATGGTACTGCACCTCCGATTTTTTCCCAC
AGTCGTTGCAGAGGATCTGAACCATTCTGTTCTGGTATGGTTCTGGCATTGGTGTAGCAG
CAATCTCCACGTCAAATTTCTCCCACACCTTTGACATGTCGCATACAGATTTTGAGCATA
GCGGGCACGCGTATTGGTAATGTTCTCTCATTTCCTCCAGGCACTTCTGATGGATGGTGT
GTCCACAGGGCAGTACAGTTACATCGTTCCGTGATTCAAAGAGGTACTCGAAACAAATGG
GACAGTCGTGATGCATTGCTCCTTCAACACAAGGGTGACTGTTCTTGAGAAGGATTGAGT
AACAACAGCCACACTTGTGACAGTGAAAGAAATTTTCATGTCCGCCGATTCTGCAAATTC
CACAGCCG

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL8292Contig1 908 2 14 U
GCAGGAGAGATCTGTCATGGCAGAAGTGGACTTACAAGGTTGGTCTCAGAGGAGAGAGTC
TAAGTCTTCATTCACTCAGTGGTAGCTCATCGGTTGAGTGGGCAGAAGGTGCATTTGTGG
CTCAAAAGCAGCCACTTACTTGGTACAAGACGACATTCTCTGCTCCGGCTGGCGACTCAC
CATTGGCTGTGGACATGGGAAGCATGGGGAAAGGCCAGATATGGATAAATGGGCAGAGCG
TGGGACGTCACTGGCCTGCATACAAAGCAGTTGGTTCTTGCAGCGAGTGTTCTTACACCG
GGACATTCAACGAGAACAAGTGCTTGAGAAACTGTGGAGAGGCTTCTCAGAGATGGTACC
ACGTTCCAAGGTCATGGCTGAAACCGACAGGCAATCTATTGGTTGTCTTTGAGGAGTGGG
GAGGTGATCCTAACGGAATCTCGTTGGTCAGAAGAGAAGTGGACAGCGTCTGTGCAGATA
TCTATGAGTGGCAATCGACGCTTGTGAACTACCAGCTGCATGCTTCTGGAAAAGTTAATA
AACCGCTGCATCCCAAAGTGCATTTACAGTGTGGGCCTGGACAGAAGATCACCACTGTTA
AGTTCGCTAGCTTTGGGACGCCTGAAGGAACTTGTGGTAGCTACCGTCAAGGAAGTTGTC
ATGCTCATCATTCTTATGATGCTTTCAACAGACTTTGTGTTGGGCAGAACTGGTGTTCTG
TAACTGTAGCACCGGCCATGTTTGGTGGTGATCCTTGTCCAAATGTGATGAAGAAACTCG
CAGTAGAAGCGGTTTGTGGTTAAACCAGAAGCAGCAGCAGCAGCAATTTCACATTCTTAC
ACGTTTTTATTTTATTTCTGATGGTATTAGTATGTTTGTGGCTATTTTACAGCGGTGGAA
GTTGTACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B692TF U 1
AF RS1CI38TF U 197
BS 1 282 RS1B692TF
BS 283 283 RS1CI38TF
BS 284 351 RS1B692TF
BS 352 352 RS1CI38TF
BS 353 377 RS1B692TF
BS 378 378 RS1CI38TF
BS 379 393 RS1B692TF
BS 394 394 RS1CI38TF
BS 395 486 RS1B692TF
BS 487 487 RS1CI38TF
BS 488 736 RS1B692TF
BS 737 737 RS1CI38TF
BS 738 762 RS1B692TF
BS 763 908 RS1CI38TF

RD RS1B692TF 776 0 0
GCAGGAGAGATCTGTCATGGCAGAAGTGGACTTACAAGGTTGGTCTCAGAGGAGAGAGTC
TAAGTCTTCATTCACTCAGTGGTAGCTCATCGGTTGAGTGGGCAGAAGGTGCATTTGTGG
CTCAAAAGCAGCCACTTACTTGGTACAAGACGACATTCTCTGCTCCGGCTGGCGACTCAC
CATTGGCTGTGGACATGGGAAGCATGGGGAAAGGCCAGATATGGATAAATGGGCAGAGCG
TGGGACGTCACTGGCCTGCATACAAAGCAGTTGGTTCTTGCATCGAGTGTTCTTACACCG
GGACATTCAACGAGAACAAGTGCTTGAGAAACTGTGGAGAGGCTTCTCAGATATGGTACC
ACGTTCCAAGGTCATGGTTGAAACCGACAGGCAGTCTATTGGTTGTCTTTGAGGAGTGGG
GAGGTGATCCTAACGGAATCTCGTTGGTCAGAAGAGAAGTGGACAGCGTCTGTGCAGATA
TCTATGGGTGGCAATCGACGCTTGTGAACTACCAGCTGCATGCTTCTGGAAAAGTTAATA
AACCGCTGCATCCCAAAGTGCATTTACAGTGTGGGCCTGGACAGAAGATCACCACTGTTA
AGTTCGCTAGCTTTGGGACGCCTGAAGGAACTTGTGGTAGCTACCGTCAAGGAAGTTGTC
ATGCTCATCATTCTTATGATGCTTTCAACAGACTTTGTGTTGGGCAGAACTGGTGTTCTG
TAACTGTAGCACCGGC*ATGTTTGGTGGTGATCCTTGTCCAA
TGTGATGATGAACT

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1CI38TF 712 0 0
GGGAAGCATGGGGAAAGGCCAGATATGGATAAATGGGCAGAGCGTGGGACGTCACTGGCC
TGCATACAAAGCAGTTGGTTCTTGCAGCGAGTGTTCTTACACCGGGACATTCAACGAGAA
CAAGTGCTTGAGAAACTGTGGAGAGGCTTCTCAGAGATGGTACCACGTTCCAAGGTCATG
GCTGAAACCGACAGGCAATCTATTGGTTGTCTTTGAGGAGTGGGGAGGTGATCCTAACGG
AATCTCGTTGGTCAGAAGAGAAGTGGACAGCGTCTGTGCAGATATCTATGAGTGGCAATC
GACGCTTGTGAACTACCAGCTGCATGCTTCTGGAAAAGTTAATAAACCGCTGCATCCCAA
AGTGCATTTACAGTGTGGGCCTGGACAGAAGATCACCACTGTTAAGTTCGCTAGCTTTGG
GACGCCTGAAGGAACTTGTGGTAGCTACCGTCAAGGAAGTTGTCATGCTCATCATTCTTA
TGATGCTTTCAACAGACTTTGTGTTGGGCAGAACTGGTGTTCTGTAACTGTAGCACCGGC
CATGTTTGGTGGTGATCCTTGTCCAAATGTGATGAAGAAACTCGCAGTAGAAGCGGTTTG
TGGTTAAACCAGAAGCAGCAGCAGCAGCAATTTCACATTCTTACACGTTTTTATTTTATT
TCTGATGGTATTAGTATGTTTGTGGCTATTTTACAGCGGTGGAAGTTGTACA

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 2

CO CL8293Contig1 783 2 5 U
GGATATTTTCCTCTTCATATTCCTAACCTTTCTCCCCAACTTCTCTGTTCATCGTTTTCT
CTCTCTCTAGTTATAATAAATATCTTCACATAGCATTCATCTCTAAAAAAACCCATTCAA
GATCAAATAAAGGGTTTAATTAAGGTTTCTTGAAGGGAGAAAAAATGGAGACGTTTTGTG
GTTTTCAGAAGGAAGAAGAGCAGATGGATTTACCTCCAGGGTTCAGGTTTCATCCAACAG
ATGAAGAACTCATAAGTCACTATCTCCACAAGAAGGTTCTTGACATCAGCTTCTCAGCCA
AAGCTATTGGTGAAGTTGACTTGAACAAATCTGAACCATGGGAGTTACCATGGATGGCAA
AAATGGGCGAGAAAGAATGGTACTTCTTCTGTGTGAGGGACAGAAAGTATCCAACCGGTT
TGAGGACTAACCGAGCTACTGAAGCCGGTTATTGGAAAGCAACCGGGAAGGATAAGGAGA
TTTACCGTGGTAAATCCCTTGTCGGGATGAAGAAGACACTTGTTTTTTATAGAGGCAGGG
CTCCCAAAGGTCAGAAAACAAACTGGGTGATGCATGAGTATAGGCTTGAAGGCAAACTCT
CTGCCCATAATTTACCTAAAACCGCAAAGAATGAGTGGGTGATATGTAGGGTGTTCCAGA
AGAGTGCTGGAGGGAAGAAGATCCCTATTTCGAGTCTAATCCGTATCGGTACACTGGGAA
CCGACTTTAGCCCTTCCCTTATGCCTTCTTTAACCGATGCTTCACCTTTCACGATAAAAC
AAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1FL18TF U 120
AF RS1H506TF U 1
BS 1 188 RS1H506TF
BS 189 189 RS1FL18TF
BS 190 324 RS1H506TF
BS 325 325 RS1FL18TF
BS 326 783 RS1H506TF

RD RS1FL18TF 562 0 0
G
GATCAAATAAAGGGTTTAATTAAGGTTTCTTGAAGGGAGAAAAAATGGAGACGTTTTGTG
GTTTTCAGAAGGAAGAAGAGCAGATGGATTTACCTCCAGGGTTCAGGTTTCATCCAACAG
ATGAAGAACTCATAAGTCACTATCTCCACAAGAAGGTTCTTGACATCAGCTTCTCAGCCA
AAGCTATTGGTGAAGTTGACTTGAACAAATCTGAACCATGGGAGTTACCATGGATGGCAA
AAATGGGCGAGAAAGGATGGTACTTCTTCTGTGTGAGGGACAGAAAGTATCCAACCGGTT
TGAGGACTAACCGGGCTACTGAAGCCGGTTATTGGAAAGCAACCGGGAAGGATAAGGAGA
TTTACCGTGGTAAATCCCTTGTCGGGATGAAGAAGACACTTGTTTTTTATAGAGGCAGGG
CTCCCAAAGGTCAGAAAACAAACTGGGTGATGCATGAGTATAGGCTTGAAGGCAAACTCT
CTGCCCATAATTTACCTAAAACCGCAAAGAATGAGTGGGTGATATGTAGGGTGTTCCAGA
AGAGTGCTGGAGGGAAGAAGA

QA 2 562 2 562
DS 

RD RS1H506TF 783 0 0
GGATATTTTCCTCTTCATATTCCTAACCTTTCTCCCCAACTTCTCTGTTCATCGTTTTCT
CTCTCTCTAGTTATAATAAATATCTTCACATAGCATTCATCTCTAAAAAAACCCATTCAA
GATCAAATAAAGGGTTTAATTAAGGTTTCTTGAAGGGAGAAAAAATGGAGACGTTTTGTG
GTTTTCAGGAGGAAGAAGAGCAGATGGATTTACCTCCAGGGTTCAGGTTTCATCCAACAG
ATGAAGAACTCATAAGTCACTATCTCCACAAGAAGGTTCTTGACATCAGCTTCTCAGCCA
AAGCTATTGGTGAAGTTGACTTGACCAAATCTGAACCATGGGAGTTACCATGGATGGCAA
AAATGGGCGAGAAAGAATGGTACTTCTTCTGTGTGAGGGACAGAAAGTATCCAACCGGTT
TGAGGACTAACCGAGCTACTGAAGCCGGTTATTGGAAAGCAACCGGGAAGGATAAGGAGA
TTTACCGTGGTAAATCCCTTGTCGGGATGAAGAAGACACTTGTTTTTTATAGAGGCAGGG
CTCCCAAAGGTCAGAAAACAAACTGGGTGATGCATGAGTATAGGCTTGAAGGCAAACTCT
CTGCCCATAATTTACCTAAAACCGCAAAGAATGAGTGGGTGATATGTAGGGTGTTCCAGA
AGAGTGCTGGAGGGAAGAAGATCCCTATTTCGAGTCTAATCCGTATCGGTACACTGGGAA
CCGACTTTAGCCCTTCCCTTATGCCTTCTTTAACCGATGCTTCACCTTTCACGATAAAAC
AAA

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 2

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GATAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 

AF RS1BP68JQ C 1
AF RS1BP68TF U 1
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QA 1 546 1 546
DS 

RD RS1BP68TF 546 0 0
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GAGTGGTCTTTCGTGGCGGCATCTGGTATTCTTCACTTCGTCTGTTCTGCACTTTGTCCT
AGGTCTTTCAGGTGATACCAATACCACAAATAAAGAAGTTAAGACAGAGTCTCACAATAC
TTCTAGCAGAAGAGGCGCAAAAGTAATACTCATACTAGTCGGATTTGTGGCTGTAGCAAT
GTTCTCCTTCTTTCTATACAAGCTATGGCAGAAGAAGAAAAGAGACGAGCAGTATGCCCG
GCTGTTGAAGCTCTTTGAGGAAGATGATGAACTCGAGGTTGAATTAGGCCTTCGAGATTA
AAATCAAATTTAGAAATTTGTTATCAAATTGCCCTGGGCCGTGTTTGTTTGTGTTGGCTT
GTTTTATTGTTATGTAAGATATATAGAAGAATCAGAGCACGTCTATGGTTAAAACGTTAC
TTTTCCCAGTGAGATCTTATGTTTGCTATTGGCAGGTGTTTATATTTTATATATCCATTT
GATAGC

QA 1 546 1 546
DS 



AS 1 2

CO CL8295Contig1 688 2 5 U
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CCTAATAATCAAAAACAATCTTTCCGAACCTAAATCCCACCGTTCCACAGAGCACAAAAT
CTGAAAATAGAACACCTCAACCAAACAACCAGCTTGAATAGACAAAAAAATAGAGTGAGT
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TAATCCAAATCGGTCGACATTTCACCTGATTGGGTCTCTGTTCCACTTCCAACTCTTCGG
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CCACCACCAAGTCCACCGTAATGGTTGCTGACTGCATACAGCTCATATAAGTATGAATGG
CCATTCTTGTTTTTCACGTACTTGCTCAAGTCAAGATCGTTAATTGGGAAGTTCACAAAC
GTATCAATCTTGTTCTTGAGATATCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CG08JQ U 9
AF RS1CG08TF C 1
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BS 9 113 RS1CG08JQ
BS 114 114 RS1CG08TF
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BS 538 688 RS1CG08TF

RD RS1CG08JQ 529 0 0
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TGCATCTTTGTACCAATGCAGCAACTTCTTGATGTGCCCATTATGAGTTGACTAATCCAA
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QA 1 529 1 529
DS 

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TAGACCAATGCATCTTTGTACCAATGCAGCAACTTCTTGATGTGCCCATTATGAGTTGAC
TAATCCAAATCGGTCGACATTTCACCTGATTGGGTCTCTGTTCCACTTCCAACTCTTCGG
TAGAACAAAACATATGCTGCTGAGCTTTTTATTTCAGATTCATTTACGGATGAAACATGA
CTGTCATCGAAATGATACCATTTGTTGTCATCAATCAACTTAGCGTAGGCAGTGTAGTGG
CCACCACCAAGTCCACCGTAATGGTTGCTGACTGCATACAGCTCATATAAGTATGAATGG
CCATTCTTGTTTTTCACGTACTTGCTCAAGTCAAGATCGTTAATTGGGAAGTTCACAAAC
GTATCAATCTTGTTCTTGAGATATCTGC

QA 1 688 1 688
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8297Contig1 583 2 2 U
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AATATTCCAGTGCAGCTCAGTTTGGTTCAGTTTCATTTTGCCACAAGGAGTGCTAATAAG
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ATCCAATTTCTCGAAATGTACAATCCTATCTCTAATCTTCATCATCTCTACTTCTACAAT
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AACAGCTCTCTCCGAGTCGTTACCATCGATCTCTTGTCGATTTGGGTCTCCACCAGTGTT
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TGCAACTTTTGTGCCAGCCAAAGCTGAAAGAAAAGCAGCCTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BJ34TF C 1
AF RS1BJ34JQ U 33
BS 1 32 RS1BJ34TF
BS 33 583 RS1BJ34JQ

RD RS1BJ34TF 583 0 0
CCATTAAACTGTTCGTCATACTTCTTAGTTCTTATGACAAATAAAACCATCACATTAAAT
AATATTCCAGTGCAGCTCAGTTTGGTTCAGTTTCATTTTGCCACAAGGAGTGCTAATAAG
TAAACTACAAACACAGGAAGAGATCAAAGTTTGAAACTCAAAAGTGCATTCTAACTTCTA
ACACTCTGATCTATCTTCAGCTTTCCTAGATCTTCTTGTGTGGAAGTAGATGTTTAATTG
ATCAGTAAACAGCAGGTTCTTCATCTCCTCCAACTGTTTCCGGCTTCTCTCCATTTCCAA
ATCCAATTTCTCGAAATGTACAATCCTATCTCTAATCTTCATCATCTCTACTTCTACAAT
CTCTCTGATGGCTCCTTCTACTTCTTTCTCTTCCTTCTCAACCAGAGATTTAGCTTCAGC
AACAGCTCTCTCCGAGTCGTTACCATCGATCTCTTGTCGATTTGGGTCTCCACCAGTGTT
TTTGTCCGCCTCGTGGTCTACATCAGATAGAGCTGTCACTGCAGCTCGAGCTGCTGCTTC
TGCAACTTTTGTGCCAGCCAAAGCTGAAAGAAAAGCAGCCTGC

QA 1 583 1 583
DS 

RD RS1BJ34JQ 551 0 0
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TCATTTTGCCACAAGGAGTGCTAATAAGTAAACTACAAACACAGGAAGAGATCAAAGTTT
GAAACTCAAAAGTGCATTCTAACTTCTAACACTCTGATCTATCTTCAGCTTTCCTAGATC
TTCTTGTGTGGAAGTAGATGTTTAATTGATCAGTAAACAGCAGGTTCTTCATCTCCTCCA
ACTGTTTCCGGCTTCTCTCCATTTCCAAATCCAATTTCTCGAAATGTACAATCCTATCTC
TAATCTTCATCATCTCTACTTCTACAATCTCTCTGATGGCTCCTTCTACTTCTTTCTCTT
CCTTCTCAACCAGAGATTTAGCTTCAGCAACAGCTCTCTCCGAGTCGTTACCATCGATCT
CTTGTCGATTTGGGTCTCCACCAGTGTTTTTGTCCGCCTCGTGGTCTACATCAAATAGAG
CTGTCACTGCAGCTCGAGCTGCTGCTTCTGCAACTTTTGTGCCAGCCAAAGCTGAAAGAA
AAGCAGCCTGC

QA 1 551 1 551
DS 



AS 1 2

CO CL8298Contig1 1011 2 2 U
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CCTCTCTCTCGTGATCTCTCCCGATGGTCTCTCCTCGAAATCAATCCGACGCCGCTCACC
TCTCAGTTCGAATCCGCCGGCAAACAAGTCCCCAATTTCGACTATATCGCCACCGTTTCT
CAAGCCAAGCCACAGGCCGCACCAATGGTCGCCAACGATTTCCGCCACCGTTTCTTTCTG
TTATACTATCTCTGCCACCATGAACAGATCAGCTCAGTCTTAATACATTTTAGATAATAT
ATGTATTGTTGGAGCAATGAATGAAGCCAGATGAAAGTTAAATTGATGTATATGTTTGGG
GGAATGAGGCGAGAGTGGCTCACTTTCAGATAAGTGCAGATAAGCTTACAATATATGTAT
TGTATTGTAAGCTTTTGGCGTGTTCTCAAATCAGAAGTGCATAATGTATATGCTTACGAT
TCTCTCTCTCTCGGAGGCTCCTCGACAAAACGGAAACAGACCGTTTTGTTTGCTCTCTCT
GTGATTATTGAATCTGAGAAGGTGTTGCAGCTGTTGCACTTGCACGAAAGTGGATGAAAA
AGGTGTTGCACTTGCACGAAAGTGGATGAAAAAGAGAGTGTTTGCTTTGATGTATACACT
TTAACCTGCTTGCTTTGTCTCTCTCTGTGGCAGTCTTCAGAGCTGTAAAGATGAGCTTGC
TTCATGTCAAAGTGAGCTTGAATCAGCAAAAGCAGAGATTGATAAGTGGAACTCAGCATT
TAAGAAAGAGTCCTTTGTACCTGCTAGAAAATCTCCTGAACCTGAATTTGTGATTGACTA
CATCCAAACTCTAAGATCTTCCGAGAAGTCTTTGAAAGAGGAGGTTGTCATTTGGCTAAT
AAGTTTTGTGTTCTTTACTTCCTTTTTTCTTCAGTTGGAAATTGCACAAATGAAGGTAAA
AGTCTTAATAAGTTCATTGTACAATGTTCATACATATTCAATGATGTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DH13TF U 1
AF RS1DH13JQ C 244
BS 1 791 RS1DH13TF
BS 792 1011 RS1DH13JQ

RD RS1DH13TF 791 0 0
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CAAGCCAAGCCACAGGCCGCACCAATGGTCGCCAACGATTTCCGCCACCGTTTCTTTCTG
TTATACTATCTCTGCCACCATGAACAGATCAGCTCAGTCTTAATACATTTTAGATAATAT
ATGTATTGTTGGAGCAATGAATGAAGCCAGATGAAAGTTAAATTGATGTATATGTTTGGG
GGAATGAGGCGAGAGTGGCTCACTTTCAGATAAGTGCAGATAAGCTTACAATATATGTAT
TGTATTGTAAGCTTTTGGCGTGTTCTCAAATCAGAAGTGCATAATGTATATGCTTACGAT
TCTCTCTCTCTCGGAGGCTCCTCGACAAAACGGAAACAGACCGTTTTGTTTGCTCTCTCT
GTGATTATTGAATCTGAGAAGGTGTTGCAGCTGTTGCACTTGCACGAAAGTGGATGAAAA
AGGTGTTGCACTTGCACGAAAGTGGATGAAAAAGAGAGTGTTTGCTTTGATGTATACACT
TTAACCTGCTTGCTTTGTCTCTCTCTGTGGCAGTCTTCAGAGCTGTAAAGATGAGCTTGC
TTCATGTCAAAGTGAGCTTGAATCAGCAAAAGCAGAGATTGATAAGTGGAACTCAGCATT
TAAGAAAGAGT

QA 1 791 1 791
DS 

RD RS1DH13JQ 768 0 0
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TATTGTTGGAGCAATGAATGAAGCCAGATGAAAGTTAAATTGATGTATATGTTTGGGGGA
ATGAGGCGAGAGTGGCTCACTTTCAGATAAGTGCAGATAAGCTTACAATATATGTATTGT
ATTGTAAGCTTTTGGCGTGTTCTCAAATCAGAAGTGCATAATGTATATGCTTACGATTCT
CTCTCTCTCGGAGGCTCCTCGACAAAACGGAAACAGACCGTTTTGTTTGCTCTCTCTGTG
ATTATTGAATCTGAGAAGGTGTTGCAGCTGTTGCACTTGCACGAAAGTGGATGAAAAAGG
TGTTGCACTTGCACGAAAGTGGATGAAAAAGAGAGTGTTTGCTTTGATGTATACACTTTA
ACCTGCTTGCTTTGTCTCTCTCTGTGGCAGTCTTCAGAGCTGTAAAGATGAGCTTGCTTC
ATGTCAAAGTGAGCTTGAATCAGCAAAAGCAGAGATTGATAAGTGGAACTCAGCATTTAA
GAAAGAGTCCTTTGTACCTGCTAGAAAATCTCCTGAACCTGAATTTGTGATTGACTACAT
CCAAACTCTAAGATCTTCCGAGAAGTCTTTGAAAGAGGAGGTTGTCATTTGGCTAATAAG
TTTTGTGTTCTTTACTTCCTTTTTTCTTCAGTTGGAAATTGCACAAATGAAGGTAAAAGT
CTTAATAAGTTCATTGTACAATGTTCATACATATTCAATGATGTTTGC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL8299Contig1 1243 2 2 U
GCACTCTATCCTAAAGCCAAAGATCTAGTGCGAATCACGCTTCTGGAGGCCGCGGACCAC
ATCCTGACCATGTTTGACAAGAGAATCACTGAGTTTGCCGAGGAAAAGTTCAGCAGGGAT
GGTATTGATGTGAAACTTGGCTCCATGGTGACAAAAGTCAACGAGAAGGATATATCTGCT
AAAACCAAGGCTGGGGAGGTTTCCACGATTCCTTATGGAATGATTGTCTGGTCAACTGGT
ATTGGAACTCGTCCTGTGATCAAAGATTTTATGAAGCAGATTGGTCAGGGTAACAGACGT
GCTCTGGCCACTGATGAATGGCTACGCGTGGAAGGGTGTGATAACATATATGCCCTTGGT
GACTGCGCAACAATTAACCAGCGTAAAGTCATGGAAGATGTTTCTGCGATCTTTAGCAAA
GCAGACAAAGACAATTCTGGGACGCTGACTCTGAAAGAGTTTCAGGAAGCAATGGATGAC
ATATGTGTTAGATACCCTCAAGTGGAGCTCTACTTGAAGAGTAAACGTATGCGTGGCATT
GCGGATCTTCTAAAAGAAGCCGAAGCTGATGATGGATCCAAGAAAAACATTGAGTTGAAG
ATCGAAGAGTTCAAATCGGCTCTTTCTCAGGTTGACTCGCAAGTGAAGTTTCTTCCAGCA
ACAGCACAGTTGCTGCGCAGCAAGGCACATACCTTGCTAAATGCTTTGATCGAATGGAAG
AGTGTGAGAAGAATCCAGAAGGCCCCATTAGGATGAGAGGAGAAGGTCGTCACCGTTTCC
GCCCCTTCAGGTATAGGCATTTGGGATCATTTGCACCATTGGGAGGGGAACAAACGGCCC
AGAACTTCCAGGAGATTGGGTTTCTATTGGACATAGCAGCCAGTGGCTCTGGTATTCCGT
CTACGTCAGTAAGCAAGTGAGCTGGCGTACGAGAGTCCTTGTGGTTTCTGATTGGATGAG
GCGTTTCATCTTTGGTAGAGACTCCAGTAGCATCTGAGTATAAATAACATCACCAAAAGG
TCCAAACTATCCACACATCTCTCTGTCTCTCTCCCCTTAATGCTGCCAACCAGCTTACAC
TTTTAACTTTTCTTTTTCATGTGAAAAGAAAGTTTTGATTTTTGTTGTTTTTCATTTCGG
CTCTGCACTTGTAATAAAAATCACTACAAAGATGCGAAGAGATTGCTTCGTTCCTTGGTC
GTACTGAGAGCTTGCTCTATGTCTTTTTAAAAATATATTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FF23TF U 1
AF RS1FF23JQ C 668
BS 1 734 RS1FF23TF
BS 735 1243 RS1FF23JQ

RD RS1FF23TF 734 0 0
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ATCCTGACCATGTTTGACAAGAGAATCACTGAGTTTGCCGAGGAAAAGTTCAGCAGGGAT
GGTATTGATGTGAAACTTGGCTCCATGGTGACAAAAGTCAACGAGAAGGATATATCTGCT
AAAACCAAGGCTGGGGAGGTTTCCACGATTCCTTATGGAATGATTGTCTGGTCAACTGGT
ATTGGAACTCGTCCTGTGATCAAAGATTTTATGAAGCAGATTGGTCAGGGTAACAGACGT
GCTCTGGCCACTGATGAATGGCTACGCGTGGAAGGGTGTGATAACATATATGCCCTTGGT
GACTGCGCAACAATTAACCAGCGTAAAGTCATGGAAGATGTTTCTGCGATCTTTAGCAAA
GCAGACAAAGACAATTCTGGGACGCTGACTCTGAAAGAGTTTCAGGAAGCAATGGATGAC
ATATGTGTTAGATACCCTCAAGTGGAGCTCTACTTGAAGAGTAAACGTATGCGTGGCATT
GCGGATCTTCTAAAAGAAGCCGAAGCTGATGATGGATCCAAGAAAAACATTGAGTTGAAG
ATCGAAGAGTTCAAATCGGCTCTTTCTCAGGTTGACTCGCAAGTGAAGTTTCTTCCAGCA
ACAGCACAGTTGCTGCGCAGCAAGGCACATACCTTGCTAAATGCTTTGATCGAATGGAAG
AGTGTGAGAAGAAT

QA 1 734 1 734
DS 

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G
GTTGCTGCGCAGCAAGGCACATACCTTGCTAAATGCTTTGATCGAATGGAAGAGTGTGAG
AAGAATCCAGAAGGCCCCATTAGGATGAGAGGAGAAGGTCGTCACCGTTTCCGCCCCTTC
AGGTATAGGCATTTGGGATCATTTGCACCATTGGGAGGGGAACAAACGGCCCAGAACTTC
CAGGAGATTGGGTTTCTATTGGACATAGCAGCCAGTGGCTCTGGTATTCCGTCTACGTCA
GTAAGCAAGTGAGCTGGCGTACGAGAGTCCTTGTGGTTTCTGATTGGATGAGGCGTTTCA
TCTTTGGTAGAGACTCCAGTAGCATCTGAGTATAAATAACATCACCAAAAGGTCCAAACT
ATCCACACATCTCTCTGTCTCTCTCCCCTTAATGCTGCCAACCAGCTTACACTTTTAACT
TTTCTTTTTCATGTGAAAAGAAAGTTTTGATTTTTGTTGTTTTTCATTTCGGCTCTGCAC
TTGTAATAAAAATCACTACAAAGATGCGAAGAGATTGCTTCGTTCCTTGGTCGTACTGAG
AGCTTGCTCTATGTCTTTTTAAAAATATATTTTGC

QA 2 576 2 576
DS 



AS 1 2

CO CL8300Contig1 688 2 2 U
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GAGGAGTTCAGCGGGAAGTTATCTTTGCAATGCGTTCCTTTTGCGTTCCATGAGCTGGTG
AGTGGTGTAGACGACGCGGTGGCGTTTCGTGCTGTTGATTTCGGAGCTGTGAGGCAGAGA
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GTGGAGGAAGATGTGCTTCAGAGAATCTTGAGTGGAGTGTGGTTAGGTGACATGGAGTTA
GAGGAGTGGGTTGAGAAGGCGATTGTTCCGGTTCTGAGCCAGCTCAAGGCTCGTTTGTCG
TCTTCCGGTACTTACGGTGACCGTACAGTTGCTCGGCTTGAGCTAGATGAAGATTCCGGT
GAACGGAGCGGTGGTGAATTACTGCCGACTAGTGTTACGTTGGCTGTTTGAGGAAGAAAA
CAGAGATGGAGTTTTTGTTATTATTATTGGAATGGTAGAAAAGTAAATATGTCTCAACTG
GTTTTGGCGGGGATGGTAAAAACAGTATAAAAAAGGTGTTAATAGTTTTTTTTGTTCTTT
TTATTTACTTATAGTTTTTGTGTTTATGTACGCGGTACGGGAGGGGTGATTTCTGTAGCA
AATTATAGCGATTTATTTGATAGATAAA


BQ
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BS 1 276 RS1E626TF
BS 277 688 RS1E626JQ

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GAGGAGTTCAGCGGGAAGTTATCTTTGCAATGCGTTCCTTTTGCGTTCCATGAGCTGGTG
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GTTTCGGACACGTTGTCGGAGAGGTTCGCTACGGTTGTAGGTGAATCTTTATCGATAGAA
GTGGAGGAAGATGTGCTTCAGAGAATCTTGAGTGGA
TG

QA 1 276 1 276
DS 

RD RS1E626JQ 688 0 0
GCGGCTGATGATGGTTCGAACAATACCAATACGAGCGAGCTAACAGATAACAACGATCAA
GAGGAGTTCAGCGGGAAGTTATCTTTGCAATGCGTTCCTTTTGCGTTCCATGAGCTGGTG
AGTGGTGTAGACGACGCGGTGGCGTTTCGTGCTGTTGATTTCGGAGCTGTGAGGCAGAGA
GTTTCGGACACGTTGTCGGAGAGGTTCGCTACGGTTGTAGGTGAATCTTTATCGATAGAA
GTGGAGGAAGATGTGCTTCAGAGAATCTTGAGTGGAGTGTGGTTAGGTGACATGGAGTTA
GAGGAGTGGGTTGAGAAGGCGATTGTTCCGGTTCTGAGCCAGCTCAAGGCTCGTTTGTCG
TCTTCCGGTACTTACGGTGACCGTACAGTTGCTCGGCTTGAGCTAGATGAAGATTCCGGT
GAACGGAGCGGTGGTGAATTACTGCCGACTAGTGTTACGTTGGCTGTTTGAGGAAGAAAA
CAGAGATGGAGTTTTTGTTATTATTATTGGAATGGTAGAAAAGTAAATATGTCTCAACTG
GTTTTGGCGGGGATGGTAAAAACAGTATAAAAAAGGTGTTAATAGTTTTTTTTGTTCTTT
TTATTTACTTATAGTTTTTGTGTTTATGTACGCGGTACGGGAGGGGTGATTTCTGTAGCA
AATTATAGCGATTTATTTGATAGATAAA

QA 1 688 1 688
DS 



AS 1 2

CO CL8301Contig1 825 2 2 U
GATATGGGTGATCATGGAAAGACTCATCAAGTTTACCCATATCCTAGTGATTAAGAAAAC
AAATGGAGCTGATCAGTTGGCACAAATTTGCATTAGAGAGATTGTGAGGTTGCATGGAGT
TCTTGTAAGTATTGTATCAGATCATGATGCAAAAGTTCACATCGACATTTTGGAGAGCTT
TTCAGAAGACACTTGGTACAAAATTTCACATGAGTACAACTTATCATTTGCAGACATATG
AGCAGACAGAGAGGACTATTCAGACTTTGGAAGATACCTTTAGGACTTGTATTTTGGATT
GAGAAAGGAGCTGCAAAAAGTATCTACCTTTAGCAGAATTTGCCTACAACAACATCTATC
ATTCGAGTATGAGATGGCACCAGATGAGGCAGTTTATGGTAGGCCTTGTCGTACAGCACT
TTTTGGACAAAAGTGTGGGAGAGTCAAGATTTGAATCAGCAAAGTTCAGGAGATGGTAGA
GCAAGTTGGGGTGCTCAAGGTTCGGCTTAAGGAAGCCCATGACCGTCAAAAGAGTTATGC
AAATCAGCACAATAAAGATTTTGAGTTTTAGGTGCGAGACTTAGTATATATGAAAATGAG
GCCATTTCAGGAAGGATTTAAGACTCGAAAGCTAAAGAAGTTTAAACCAAGTTATATGAA
ACCATACCCTATTTGGAGTGGATTGGAGTAGTGGCTTATAGTTTAAAGTTATCAGCAGAG
TTGTCAGGGTTTCAAGACGTAATCCATATGTCAGTTTTGAGGAAGGTCAGGAGAGAGAAA
GAGAAAAAAGAACTCATTTTGCAGCTGCTGCCAAGTGATCATGGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EJ43TF U 1
AF RS1EJ43JQ C 58
BS 1 605 RS1EJ43TF
BS 606 825 RS1EJ43JQ

RD RS1EJ43TF 607 0 0
GATATGGGTGATCATGGAAAGACTCATCAAGTTTACCCATATCCTAGTGATTAAGAAAAC
AAATGGAGCTGATCAGTTGGCACAAATTTGCATTAGAGAGATTGTGAGGTTGCATGGAGT
TCTTGTAAGTATTGTATCAGATCATGATGCAAAAGTTCACATCGACATTTTGGAGAGCTT
TTCAGAAGACACTTGGTACAAAATTTCACATGAGTACAACTTATCATTTGCAGACATATG
AGCAGACAGAGAGGACTATTCAGACTTTGGAAGATACCTTTAGGACTTGTATTTTGGATT
GAGAAAGGAGCTGCAAAAAGTATCTACCTTTAGCAGAATTTGCCTACAACAACATCTATC
ATTCGAGTATGAGATGGCACCAGATGAGGCAGTTTATGGTAGGCCTTGTCGTACAGCACT
TTTTGGACAAAAGTGTGGGAGAGTCAAGATTTGAATCAGCAAAGTTCAGGAGATGGTAGA
GCAAGTTGGGGTGCTCAAGGTTCGGCTTAAGGAAGCCCATGACCGTCAAAAGAGTTATGC
AAATCAGCACAATAAAGATTTTGAGTTTTAGGTGCGAGACTTAGTATATATGAAAATGAG
GCCAT
CT

QA 1 605 1 605
DS 

RD RS1EJ43JQ 768 0 0
AACAAATGGAGCTGATCAGTTGGCACAAATTTGCATTAGAGAGATTGTGAGGTTGCATGG
AGTTCTTGTAAGTATTGTATCAGATCATGATGCAAAAGTTCACATCGACATTTTGGAGAG
CTTTTCAGAAGACACTTGGTACAAAATTTCACATGAGTACAACTTATCATTTGCAGACAT
ATGAGCAGACAGAGAGGACTATTCAGACTTTGGAAGATACCTTTAGGACTTGTATTTTGG
ATTGAGAAAGGAGCTGCAAAAAGTATCTACCTTTAGCAGAATTTGCCTACAACAACATCT
ATCATTCGAGTATGAGATGGCACCAGATGAGGCAGTTTATGGTAGGCCTTGTCGTACAGC
ACTTTTTGGACAAAAGTGTGGGAGAGTCAAGATTTGAATCAGCAAAGTTCAGGAGATGGT
AGAGCAAGTTGGGGTGCTCAAGGTTCGGCTTAAGGAAGCCCATGACCGTCAAAAGAGTTA
TGCAAATCAGCACAATAAAGATTTTGAGTTTTAGGTGCGAGACTTAGTATATATGAAAAT
GAGGCCATTTCAGGAAGGATTTAAGACTCGAAAGCTAAAGAAGTTTAAACCAAGTTATAT
GAAACCATACCCTATTTGGAGTGGATTGGAGTAGTGGCTTATAGTTTAAAGTTATCAGCA
GAGTTGTCAGGGTTTCAAGACGTAATCCATATGTCAGTTTTGAGGAAGGTCAGGAGAGAG
AAAGAGAAAAAAGAACTCATTTTGCAGCTGCTGCCAAGTGATCATGGT

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL8302Contig1 687 2 2 U
GGGATTTCCGTAGTTTCTTTCTTCATAAAAAATAAAAATAAAAATCTCTCGATAAATCGA
GTCCTCCAAAAGTCGCAGAAACGGAAAATTCATGAACATTGTCAGATTAGGTTTCGCGTT
GTTTTGTGCTCTTTGGATTCCGCCTGAAAATGATCCGATTGATTGGGTTTCTCGCTCGTC
GTCGAGATCGAGGATCCAAGAAGAGAGAACCTGTTTGGTTTTGCTACCCAAACTGGATCA
CATACATACGGTGTCCCTTTCTCTCTCTGTCACTGCTGATTCCGATGGTGGTCAAGAGGA
TCATAGCAGAAAAGTAGTTCAGATAGCCTCCCCCCCTAAGGAGAAAGAGTCTGACGAGAA
AGATGCAAGAGATGAAAGTGATGAAGCAATTTGCTGGGATCTTGGTTACGTTTTGAATCC
TGACTCCGCGTGAAACCGCCTTTTTAAGGTTTGTGCTTCAGGAGGTGTTCAAATGGTTAG
ACTCTGAGGAGATTACAAGTCTGGCATACTTCCGTGACAGGTATTATGCTTCTCACAAAT
CTCTTTGTAATAAATTGAGTATTACGCAGATATATATTTTGTAGGCAGAGAGGCTTCTGC
AGTTTATTTGACTATTGAATCTATTTGTTTGTGTTATCTGCTACCCCTTTGACGATCATT
CTAAATATAGGAAATGACGTTCATATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GY72TF U 1
AF RS1GY72JQ C 65
BS 1 612 RS1GY72TF
BS 613 687 RS1GY72JQ

RD RS1GY72TF 612 0 0
GGGATTTCCGTAGTTTCTTTCTTCATAAAAAATAAAAATAAAAATCTCTCGATAAATCGA
GTCCTCCAAAAGTCGCAGAAACGGAAAATTCATGAACATTGTCAGATTAGGTTTCGCGTT
GTTTTGTGCTCTTTGGATTCCGCCTGAAAATGATCCGATTGATTGGGTTTCTCGCTCGTC
GTCGAGATCGAGGATCCAAGAAGAGAGAACCTGTTTGGTTTTGCTACCCAAACTGGATCA
CATACATACGGTGTCCCTTTCTCTCTCTGTCACTGCTGATTCCGATGGTGGTCAAGAGGA
TCATAGCAGAAAAGTAGTTCAGATAGCCTCCCCCCCTAAGGAGAAAGAGTCTGACGAGAA
AGATGCAAGAGATGAAAGTGATGAAGCAATTTGCTGGGATCTTGGTTACGTTTTGAATCC
TGACTCCGCGTGAAACCGCCTTTTTAAGGTTTGTGCTTCAGGAGGTGTTCAAATGGTTAG
ACTCTGAGGAGATTACAAGTCTGGCATACTTCCGTGACAGGTATTATGCTTCTCACAAAT
CTCTTTGTAATAAATTGAGTATTACGCAGATATATATTTTGTAGGCAGAGAGGCTTCTGC
AGTTTATTTGAC

QA 1 612 1 612
DS 

RD RS1GY72JQ 623 0 0
TCCAAAAGTCGCAGAAACGGAAAATTCATGAACATTGTCAGATTAGGTTTCGCGTTGTTT
TGTGCTCTTTGGATTCCGCCTGAAAATGATCCGATTGATTGGGTTTCTCGCTCGTCGTCG
AGATCGAGGATCCAAGAAGAGAGAACCTGTTTGGTTTTGCTACCCAAACTGGATCACATA
CATACGGTGTCCCTTTCTCTCTCTGTCACTGCTGATTCCGATGGTGGTCAAGAGGATCAT
AGCAGAAAAGTAGTTCAGATAGCCTCCCCCCCTAAGGAGAAAGAGTCTGACGAGAAAGAT
GCAAGAGATGAAAGTGATGAAGCAATTTGCTGGGATCTTGGTTACGTTTTGAATCCTGAC
TCCGCGTGAAACCGCCTTTTTAAGGTTTGTGCTTCAGGAGGTGTTCAAATGGTTAGACTC
TGAGGAGATTACAAGTCTGGCATACTTCCGTGACAGGTATTATGCTTCTCACAAATCTCT
TTGTAATAAATTGAGTATTACGCAGATATATATTTTGTAGGCAGAGAGGCTTCTGCAGTT
TATTTGACTATTGAATCTATTTGTTTGTGTTATCTGCTACCCCTTTGACGATCATTCTAA
ATATAGGAAATGACGTTCATATC

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 2

CO CL8303Contig1 883 2 2 U
TTTTTTTCTCTCTGTGTATGATCTCTCTCGTCTAACTTCAAAGAAGCAAAAAAAATGAGA
AAGAAGGTAAGTAATAGTGGTGAAGAAGGAAACAATGAGTACAAGAAAGGTCTGTGGACC
GTAGAAGAAGACAAGATCCTCATGGATTATGTCAAAGCTCATGGCAAAGGCCACTGGAAT
CGTATTGCCAAAAAGACTGGTTTAAAGAGATGTGGAAAGAGTTGTAGATTGAGGTGGATG
AACTATCTCAGCCCAAATGTGAAGAGAGGCAATTTCACCGACCAAGAAGAAGATCTTATC
ATTCGGCTCCACAAGTTGCTTGGTAATAGGTGGTCTTTGATCGCTAAAAGAGTCCCGGGA
CGGACCGACAATCAAGTGAAGAATTACTGGAACACGCATCTTAGTAAGAAACTCGGAATC
AAAGATCCAAAAAACAAGCCGAGTAATGGTGATATTGTTTATCAGATCAATCTCACAAAT
CCTACTGAAACATTAGAAGAAACAAAAATCTCGATATTAACGACAACGACAACGATGAAA
TTCAAGAGGATCGTCACGGAAGTAATTATCTGAGTTCACTTTGGGTTCACGATGATGCGT
TTGAGCTAAGTACACTCACCAACATGATGGACTTTCTAGACGGACACTGCTTTTGATGTG
TTTTCGAATCGGTTTTCTTTTCGTCTTGTTATAATCTTCGTAGCTGATCAAACACTAATA
CATCAACGATCTTAAGCTAAAAGTTGTTGATGTGGTAGTGTATGATTGGCTAAGTCTTTT
AATTAGGTTAACTTTCTTGTGTTATATATATGCTTGAAACTCGATGCATCAATATATCTA
ATCTATTAATTTAGGGATTATCTACTATTTGAAGTTCTATTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CU48TF U 1
AF RS1CU48JQ C 143
BS 1 689 RS1CU48TF
BS 690 883 RS1CU48JQ

RD RS1CU48TF 689 0 0
TTTTTTTCTCTCTGTGTATGATCTCTCTCGTCTAACTTCAAAGAAGCAAAAAAAATGAGA
AAGAAGGTAAGTAATAGTGGTGAAGAAGGAAACAATGAGTACAAGAAAGGTCTGTGGACC
GTAGAAGAAGACAAGATCCTCATGGATTATGTCAAAGCTCATGGCAAAGGCCACTGGAAT
CGTATTGCCAAAAAGACTGGTTTAAAGAGATGTGGAAAGAGTTGTAGATTGAGGTGGATG
AACTATCTCAGCCCAAATGTGAAGAGAGGCAATTTCACCGACCAAGAAGAAGATCTTATC
ATTCGGCTCCACAAGTTGCTTGGTAATAGGTGGTCTTTGATCGCTAAAAGAGTCCCGGGA
CGGACCGACAATCAAGTGAAGAATTACTGGAACACGCATCTTAGTAAGAAACTCGGAATC
AAAGATCCAAAAAACAAGCCGAGTAATGGTGATATTGTTTATCAGATCAATCTCACAAAT
CCTACTGAAACATTAGAAGAAACAAAAATCTCGATATTAACGACAACGACAACGATGAAA
TTCAAGAGGATCGTCACGGAAGTAATTATCTGAGTTCACTTTGGGTTCACGATGATGCGT
TTGAGCTAAGTACACTCACCAACATGATGGACTTTCTAGACGGACACTGCTTTTGATGTG
TTTTCGAATCGGTTTTCTTTTCGTCTTGT

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1CU48JQ 741 0 0
TGGATTATGTCAAAGCTCATGGCAAAGGCCACTGGAATCGTATTGCCAAAAAGACTGGTT
TAAAGAGATGTGGAAAGAGTTGTAGATTGAGGTGGATGAACTATCTCAGCCCAAATGTGA
AGAGAGGCAATTTCACCGACCAAGAAGAAGATCTTATCATTCGGCTCCACAAGTTGCTTG
GTAATAGGTGGTCTTTGATCGCTAAAAGAGTCCCGGGACGGACCGACAATCAAGTGAAGA
ATTACTGGAACACGCATCTTAGTAAGAAACTCGGAATCAAAGATCCAAAAAACAAGCCGA
GTAATGGTGATATTGTTTATCAGATCAATCTCACAAATCCTACTGAAACATTAGAAGAAA
CAAAAATCTCGATATTAACGACAACGACAACGATGAAATTCAAGAGGATCGTCACGGAAG
TAATTATCTGAGTTCACTTTGGGTTCACGATGATGCGTTTGAGCTAAGTACACTCACCAA
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TACTATTTGAAGTTCTATTTT

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

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TCTATAT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1D451JQ C 1
AF RS1D451TF U 1
BS 1 547 RS1D451TF

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QA 1 547 1 547
DS 

RD RS1D451TF 547 0 0
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TCTATAT

QA 1 547 1 547
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1FI11TF U 1
AF RS1FI11JQ C 165
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QA 1 711 1 711
DS 

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TCAATATAATTTCGTATATATATGATTTGACTATACCTAGCCAGGATAAAAACACAAAAT
AATTAGCCACGAATATCGATTGAGTATCAAGTTAGAATATATCCCAATGATCTAACAGTA
AAAATTCCTAGTAATTAGAAAAATGTTTAGTGAATGCACATGTATAACTAAGAAAAAAAC
TACTCGAACCTTTTTC

QA 1 736 1 736
DS 



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AGATGAATCTTTAGGTTCACCAACC


BQ
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E943TF U 1
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RD RS1E943TF 730 0 0
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AACATCTGAAACTTTACCGAGACTCCCTCGAACCGGTTCGGTTCAGGTCCGGACTAACCA
CAACCATGATTTCCCGGAAGGATTTGATGGTTATCCCGGTCCAGCGATCATGTTACTATC
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CGCAGAAGCTGCCGGCAAAACTGACGTAGCCACCGATATCATCCGTCGTGTTTTACAGCT
ACGTTAAGTTAAGGTCGGCGATGTTACAAAAAAATAAAGCCCGTGGGCTTGGGTCTGTCT
TGTTTTTAAAAGTGATAGAACTCTCTCCTTTTGTGTGATTGGCTAAGCCATAACTTTTTT
TAAAAGGCTATGTTGGCACAAAGTATAAGTCTTGCCGGATTACATTTCTTTCAAGTTATT
TCCTTCTATAAGATTATTATTACCAATACTAATCAGACTTATTCTTGGGTTCACCTCCTA
*GATGAATCT

QA 1 730 1 730
DS 

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AAGAGCAACATCTGAAACTTTACCGAGACTCCCTCGAACCGGTTCGGTTCAGGTCCGGAC
TAACCACAACCATGATTTCCCGGAAGGATTTGATGGTTATCCCGGTCCAGCGATCATGTT
ACTATCTCCTCCGCCGTGTAGTTTGCCCATGCCTAGGTTTTCGATCAAACCGAAGCTCAG
TTGCAACGCAGAAGCTGCCGGCAAAACTGACGTAGCCACCGATATCATCCGTCGTGTTTT
ACAGCTACGTTAAGTTAAGGTCGGCGATGTTACAAAAAAATAAAGCCCGTGGGCTTGGGT
CTGTCTTGTTTTTAAAAGTGATAGAACTCTCTCCTTTTGTGTGATTGGCTAAGCCATAAC
TTTTTTTAAAAGGCTATGTTGGCACAAAGTATAAGTCTTGCCGGATTACATTTCTTTCAA
GTTATTTCCTTCTATAAGATTATTATTACCAATACTAATCAGACTTATTCTTGGGTTCAC
CTCCTAAGATGAATCTTTAGGTTCACCAACC

QA 1 571 1 571
DS 



AS 1 2

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CTCATGGTCTTCTCCATCAAAAACCGGAATTTTCATCTCCATACCTACCTGCAAGATGAA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BT43JQ U 12
AF RS1BT43TF C 1
BS 1 11 RS1BT43TF
BS 12 563 RS1BT43JQ
BS 564 694 RS1BT43TF

RD RS1BT43JQ 552 0 0
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GCCGGATGTCATCGGTCTCTCCAAATTCTTCCTTGAGAATCTCCCACGCTTGCTTTGACG
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CCCACAGGTCACGAGCCATCAAAAGAGTCCTCATCTTTATACTCCAAATCTCATGGTCTT
CTCCATCAAAAA

QA 1 552 1 552
DS 

RD RS1BT43TF 694 0 0
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CAGAAACGGCAGACCCATAGAACTTGAGCTGATTCACAACCTCCATCAACTTTTAGTATA
ATCAACAAAGCTTTCCTCCTCCTCCATCACCATTCCTCTAAACTTGACCCTAAGAATGTT
AGCTTTCCTACGCCGGATGTCATCGGTCTCTCCAAATTCTTCCTTGAGAATCTCCCACGC
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CAGCATATGAAGAGCCGTCATGTCCTTTGTTTTCAGATTTTTCTCTACAGAGACTCCACT
CTCTACAACGTCCCACAGGTCACGAGCCATCAAAAGAGTCCTCATCTTTATACTCCAAAT
CTCATGGTCTTCTCCATCAAAAACCGGAATTTTCATCTCCATACCTACCTGCAAGATGAA
GGCAAGAACCTGACCTCGTAAACCTTTGCAAGAATAGGAGATGATCCCCGAGAAGAGATA
AAAGTTTCGTTCTTTTGTTTTATGTTTTTCTTCC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

CO CL8308Contig1 624 2 2 U
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GGTAATCATATGGTTCAGCCTGTTCAAATGCCGGGTCAGTATCTTCCACAATACCATCAT
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TCTTAACGTGTTGAGGAGAAATGAGAAAATAATCATCGTCCTTGGAGGCGTGTCTATGTG
TGAACCGTGTATTACATTTTTTCTACTTTATTTTAATTTTCCATTTTTTGGTGTAATTGT
GTCAAACTTTTATTACAACTACAATGAAACCCAATATAAACCATATAGTTTATAAATAAT
GAAGTATATTCGTGATTTGTTACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BA43TF U 1
AF RS1BA43JQ C 1
BS 1 549 RS1BA43TF
BS 550 624 RS1BA43JQ

RD RS1BA43TF 549 0 0
GGAGCACATGTTCATTACCAGCAACCCGTTTATTATGTTCCTAGTTCGGTTCAACCAGGG
AATCATATGGTTCAACCGGGCAACCAAATGGTTCAACAGGGTAACCATATGGTTCAACAG
GGTAATCATATGGTTCAGCCTGTTCAAATGCCGGGTCAGTATCTTCCACAATACCATCAT
GTACCTATGGGATACCACCACCAACCTCAGACTCATCAGATTCATGGTCCTGGTATGGGT
CAAGTATATGGTGGAACTGTTAGGCCGGTTATGATGGCAGTTGATGGAGTTAACCTGGCA
ACTTATTATGATATGAAAACGCCCGGTTCGGTTCAGATGTATCACCATCACCCTGGCATG
GTTGTTCCTGGTGTGGAAGGACAATACAGAACCGAAACGGATTCTGATCCGGGTCGGGCT
TCTTAACGTGTTGAGGAGAAATGAGAAAATAATCATCGTCCTTGGAGGCGTGTCTATGTG
TGAACCGTGTATTACATTTTTTCTACTTTATTTTAATTTTCCATTTTTTGGTGTAATTGT
GTCAAACTT

QA 1 549 1 549
DS 

RD RS1BA43JQ 624 0 0
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AATCATATGGTTCAACCGGGCAACCAAATGGTTCAACAGGGTAACCATATGGTTCAACAG
GGTAATCATATGGTTCAGCCTGTTCAAATGCCGGGTCAGTATCTTCCACAATACCATCAT
GTACCTATGGGATACCACCACCAACCTCAGACTCATCAGATTCATGGTCCTGGTATGGGT
CAAGTATATGGTGGAACTGTTAGGCCGGTTATGATGGCAGTTGATGGAGTTAACCTGGCA
ACTTATTATGATATGAAAACGCCCGGTTCGGTTCAGATGTATCACCATCACCCTGGCATG
GTTGTTCCTGGTGTGGAAGGACAATACAGAACCGAAACGGATTCTGATCCGGGTCGGGCT
TCTTAACGTGTTGAGGAGAAATGAGAAAATAATCATCGTCCTTGGAGGCGTGTCTATGTG
TGAACCGTGTATTACATTTTTTTTACTTTATTTTAATTTTCCATTTTTTGGTGTAATTGT
GTCAAACTTTTATTACAACTACAATGAAACCCAATATAAACCATATAGTTTATAAATAAT
GAAGTATATTCGTGATTTGTTACC

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

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AAGCAACGGCGGCGATGGAAACATTGGCGGTGGAGAAGCAGCCGGAGACGACAGTGGCTG
AAGCACCGGCAGTGACAATAACAAAGAGGATGATGGTTGCTATCGACGAGAGTGATTCGA
GCTTCTATGCTCTTCAATGGGTTATTGACCATTTCTCTAACCTCTTAATGACCACTGAGG
CGGCTCAAGCGGAAGGTGGCTTGCTCACGGTGGTTCATGTGCAGTCTCCGTCCCATCACT
TTGCTGCTTTTCCGGCTGGACCCGGCGGCGCAACAGTCTACGCATCTTCGTCGATGATAG
AGTCAGTGAAAAAAGCACAACAGGAGGCCTCTGCAGCCCTTCTCTCGCGTGCACTCCAGA
TGTGCCGAGTCAAGCAGATACGTACTGAGACTATGGTGCTTGAAGGCGACGCAAAGGACA
TGATTTGCCAGGCGGTTGAGCAAATGCACGTTGATCTTCTCGTTGTGGGTAGTCGTGGCC
TTGGAAAGATCAGAAGAGCGTTTATTGGGAGCGTTAGCGACTACTGTGCTCATCACGCCA
ACTGTCCCATCCTTATTGTGAAGCCACCAAGGGAGATAAACTAATTAAGTAACAAGCACT
ACATGTTTGGTGTGATCATGTCTTTATAAATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DE24TF U 1
AF RS1DE24JQ C 80
BS 1 627 RS1DE24TF
BS 628 693 RS1DE24JQ

RD RS1DE24TF 627 0 0
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GCTTCTATGCTCTTCAATGGGTTATTGACCATTTCTCTAACCTCTTAATGACCACTGAGG
CGGCTCAAGCGGAAGGTGGCTTGCTCACGGTGGTTCATGTGCAGTCTCCGTCCCATCACT
TTGCTGCTTTTCCGGCTGGACCCGGCGGCGCAACAGTCTACGCATCTTCGTCGATGATAG
AGTCAGTGAAAAAAGCACAACAGGAGGCCTCTGCAGCCCTTCTCTCGCGTGCACTCCAGA
TGTGCCGAGTCAAGCAGATACGTACTGAGACTATGGTGCTTGAAGGCGACGCAAAGGACA
TGATTTGCCAGGCGGTTGAGCAAATGCACGTTGATCTTCTCGTTGTGGGTAGTCGTGGCC
TTGGAAAGATCAGAAGAGCGTTTATTGGGAGCGTTAGCGACTACTGTGCTCATCACGCCA
ACTGTCCCATCCTTATTGTGAAGCCAC

QA 1 627 1 627
DS 

RD RS1DE24JQ 614 0 0
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CTTGCTCACGGTGGTTCATGTGCAGTCTCCGTCCCATCACTTTGCTGCTTTTCCGGCTGG
ACCCGGCGGCGCAACAGTCTACGCATTTTCGTCGATGATAGAGTCAGTGAAAAAAGCACA
ACAGGAGGCCTCTGCAGCCCTTCTCTCGCGTGCACTCCAGATGTGCCGAGTCAAGCAGAT
ACGTACTGAGACTATGGTGCTTGAAGGCGACGCAAAGGACATGATTTGCCAGGCGGTTGA
GCAAATGCACGTTGATCTTCTCGTTGTGGGTAGTCGTGGCCTTGGAAAGATCAGAAGAGC
GTTTATTGGGAGCGTTAGCGACTACTGTGCTCATCACGCCAACTGTCCCATCCTTATTGT
GAAGCCACCAAGGGAGATAAACTAATTAAGTAACAAGCACTACATGTTTGGTGTGATCAT
GTCTTTATAAATTG

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 2

CO CL8310Contig1 644 2 2 U
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AAGTAAAACTAATCAATCGCAAGTAGATCTGTGTGGTCATCATATACATTCCTAAACAAA
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AATCGTTAGTTAATAACAATATTTGATAACCTTTAAATATTTTTTTTAGTTTTTGGATAA
TTAACTGAGTAAATAAAGTAAAATCTTAGTTGAACCTTTGACCTAGTATGAATATTCTGA
CAAACACGTGGTTAGAAATATCGCCGCTTCTCTTTCTCTATCTAAATCTCTCTCTCTCTC
TCTCTATCCTGTCTTGTCGCTCTGGCGCTGACGGTATTATTATATAAACTCCAGCGCTGA
AGAGTTTTGTAACTTGCGACTTGTGAGCTTCATCTTCTCCTTCTCACTCCAAGAAAAGAA
AAACAAGAACAAAGAAACCTCACGAATCATCCTCTCAAGAACATACGAGATTCAAAAGAA
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ACCGTATATTCGAGGTACTTATTCATCTCCACCACGACTTGACC


BQ
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AF RS1DQ96TF U 1
AF RS1DQ96JQ C 1
BS 1 120 RS1DQ96TF
BS 121 644 RS1DQ96JQ

RD RS1DQ96TF 120 0 0
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AAGTAAAACTAATCAATCGCAAGTAGATCTGTGTGGTCATCATATACATTCCTAAACAAA

QA 1 120 1 120
DS 

RD RS1DQ96JQ 644 0 0
GGGTCACGACTTAACATTATTATTATTTTATAAAATAAAAATTATCTGTAAAAAATGATT
AAGTAAAACTAATCAATCGCAAGTAGATCTGTGTGGTCATCATATACATTCCTAAACAAA
ATAGAAGTTACATTAGTCTCTAAAATATTTTTTCAGTAAGTTATTATTTTCTGTAAATAT
AATCGTTAGTTAATAACAATATTTGATAACCTTTAAATATTTTTTTTAGTTTTTGGATAA
TTAACTGAGTAAATAAAGTAAAATCTTAGTTGAACCTTTGACCTAGTATGAATATTCTGA
CAAACACGTGGTTAGAAATATCGCCGCTTCTCTTTCTCTATCTAAATCTCTCTCTCTCTC
TCTCTATCCTGTCTTGTCGCTCTGGCGCTGACGGTATTATTATATAAACTCCAGCGCTGA
AGAGTTTTGTAACTTGCGACTTGTGAGCTTCATCTTCTCCTTCTCACTCCAAGAAAAGAA
AAACAAGAACAAAGAAACCTCACGAATCATCCTCTCAAGAACATACGAGATTCAAAAGAA
GATTCAAGAAGAGTTAACAGAAAGTTTCAAGATTCCTTAAACGAGCTTTTTCAAGTGCCG
ACCGTATATTCGAGGTACTTATTCATCTCCACCACGACTTGACC

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 2

CO CL8311Contig1 548 2 1 U
GGGGATCCCATCTTTCTTCATTTCTTTCATCGCTTTGCCTTTAGCCACCAACTCAAGTGA
AGCCGTCTCTGCTATCATCTTCGCCTCTCGCAAAAAGATCAGAACAGCTTCCTTGACTTT
CTCCGAGCTATGTGGCGGAGTGACAATGAACAACATTCTATGTCTCTCCGTGTTCCTAGC
AATCGTTTACCTTAGAGGATTAACATGGAACTTCTCATCAGAAGTGTTGGTGATTCTCAT
AGTTTGTCTGGTGATGGGAGGTTTCGCTAGCTTCCGCACAACGTATCCTCTTTGGACATG
TTTCATAGCATACTTGCTTTACCCGTTCTCTTTGGGTCTGGTCTATATTCTCGACTACTG
GTTTGGCTGGTCGTAGTTCAAAGGGTTTGTTCCCATGAGTGAGCTTGCTCTTTGCGTGTT
TCCTTTTCTCTCTTTATATTATGTATGTAAGAGTGTATAAACTGAAGTAAAAGTTCTGAG
ATTGTGAGTGATGATGTGTTTGAAACACTCTTGTCAAAGCTAATAAATACATGTCTTGTT
TCTTTGGT


BQ
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TCTTTGGT

QA 1 548 1 548
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1AI12TF U 1
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BS 788 1069 RS1AI12JQ

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TTTTTATGGGTGTTCTAGAATTGTTTTGGGCCCTATGCTAAATTTTATTGGTTGCAGTTG
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QA 1 827 1 827
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1D569TF U 1
AF RS1D569JQ C 25
BS 1 568 RS1D569TF
BS 569 645 RS1D569JQ

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GGGAAGTTGAGGGAGTTTCCTGTGACGGAAGACGCTCTTCTTCCCGTTGGTACTGAGCTC
GGTGTGCGTCATTTTGTGCCTGGGCAGTATGTTGATGTCACTGGGATCACTCGCGGGAAA
GGTTTTCAGGGAGTTATGAAAAGATGGAAGTTCAAAGGAGGGCCGGCATCACATGGTTGT
TCAAAGGCACATCGAAAAGGTGGTTCCACTGGTCAAAGAGATGATCCTGGAAAGGTGTTC
AAGGGAAGAAGGATGCCTGGGAGGATGGGTGCAGAGCAGAGGACAGTAAAGAACGTTTGG
GTTTACAAGATTGATCCTGCCAGGAACCTCATCTGGGTGAGAGGACAAGTTCCTGGAGCG
GAAGGAAACTTTGTGTTTATTAAAGATGCGTTCTACAAGAAGCCAGACATCTCAAAGCTT
CCATTTCCAACCTACTTAGCACCAGAAGACGAGGATCCATCAGAACTAGAACCCTTGGTC
GCAGATCTAGGAGAAGTCGACCCATTTATGTTGGCAGAGTGATGAAAAACGCCATGGCCC
TTTTTCATTTTTTTTTTGTTTTTAAAAA

QA 1 568 1 568
DS 

RD RS1D569JQ 621 0 0
ACGGAAGACGCTCTTCTTCCCGTTGGTACTGAGCTCGGTGTGCGTCATTTTGTGCCTGGG
CAGTATGTTGATGTCACTGGGATCACTCGCGGGAAAGGTTTTCAGGGAGTTATGAAAAGA
TGGAAGTTCAAAGGAGGGCCGGCATCACATGGTTGTTCAAAGGCACATCGAAAAGGTGGT
TCCACTGGTCAAAGAGATGATCCTGGAAAGGTGTTCAAGGGAAGAAGGATGCCTGGGAGG
ATGGGTGCAGAGCAGAGGACAGTAAAGAACGTTTGGGTTTACAAGATTGATCCTGCCAGG
AACCTCATCTGGGTGAGAGGACAAGTTCCTGGAGCGGAAGGAAACTTTGTGTTTATTAAA
GATGCGTTCTACAAGAAGCCAGACATCTCAAAGCTTCCATTTCCAACCTACTTAGCACCA
GAAGACGAGGATCCATCAGAACTAGAACCCTTGGTCGCAGATCTAGGAGAAGTCGACCCA
TTTATGTTGGCAGAGTGATGAAAAACGCCATGGCCCTTTTTCATTTTTTTTTTGTTTTTA
AAAACGTTTGTGCAAGACAAGAAGCCGATGAAACGGAGGAAAGGTTGTATTTTTTTGTTA
CTTAGTTGTTTTGGTTTGGAT

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 2

CO CL8314Contig1 548 2 3 U
GGGCAGCTTAAAACTTCTCAAATGGGAGAAGAGTGAGATTTGGGATCACAGTAAAATCAG
TCGACAGTAGCTGCTTGCTTCTCATCCGATCCGTTTAGAGATCGAAAGGAGGTTTTGATG
GCGAAGGAGCAACACTTGAGGCCTTGGTTTCTGGATCTCGTACCGGCTTTGGTTATCTTG
CTTGCCGCAGCTCATGTCATCGCCTTGGGATACTGGATTTACAGATTGGCAACTGATCGT
CGTGCTCAGAGTCAGAGAGGCAAATTTCACTGAGGAAAAGAGTAGGTTCTCGTAAGCTGC
ATAGTTTTGCTTCCGATCTGGTGTTTTGTGATCGTTTGATTTTGTAGCTTATGATTGTCG
TTAGGTGGATCATATCTTGTTAACTAGTTCGTTTATCACCTATGTTTGTAGCTTCGACTT
TTTTATTCAATTTGCTTTTTTTTGGGTTGTTCTAAATAGATTTTGTAACACTTCTCGACG
TTCTTTTCATTACACTGTTATACTTTGGTGTATGTAACCAGTAAATTTGAAACGATGGTT
TAATTCGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DG40JQ C 1
AF RS1DG40TF U 1
BS 1 531 RS1DG40TF
BS 532 532 RS1DG40JQ
BS 533 548 RS1DG40TF

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TCGACAGTAGCTGCTTGCTTCTCATCCGATCCGTTTAGAGATCGAAAGGAGGTTTTGATG
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ATAGTTTTGCTTCCGATCTGGTGTTTTGTGATCGTTTGATTTTGTAGCTTATGATTGTCG
TTAGGTGGATCATATCTTGTTAACTAGTTCGTTTATCACCTATGTTTGTAGCTTCGACTT
TTTTATTCAATTTGCTTTTTTTTGGGTTGTTCTAAATAGATTTTGTAACACTTCTCGACG
TTCTTTTCATTACACTGTTATACTTTGGTGTATGTAACCAGTAAATTTGAAACGATGGTT
TAATTCGT

QA 1 548 1 548
DS 

RD RS1DG40TF 548 0 0
GGGCAGCTTAAAACTTCTCAAATGGGAGAAGAGTGAGATTTGGGATCACAGTAAAATCAG
TCGACAGTAGCTGCTTGCTTCTCATCCGATCCGTTTAGAGATCGAAAGGAGGTTTTGATG
GCGAAGGAGCAACACTTGAGGCCTTGGTTTCTGGATCTCGTACCGGCTTTGGTTATCTTG
CTTGCCGCAGCTCATGTCATCGCCTTGGGATACTGGATTTACAGATTGGCAACTGATCGT
CGTGCTCAGAGTCAGAGAGGCAAATTTCACTGAGGAAAAGAGTAGGTTCTCGTAAGCTGC
ATAGTTTTGCTTCCGATCTGGTGTTTTGTGATCGTTTGATTTTGTAGCTTATGATTGTCG
TTAGGTGGATCATATCTTGTTAACTAGTTCGTTTATCACCTATGTTTGTAGCTTCGACTT
TTTTATTCAATTTGCTTTTTTTTGGGTTGTTCTAAATAGATTTTGTAACACTTCTCGACG
TTCTTTTCATTACACTGTTATACTTTGGTGTATGTAACCAGTAAATTTGAA*CGATGGTT
TAATTCGT

QA 1 548 1 548
DS 



AS 1 2

CO CL8315Contig1 543 2 1 U
GGCCACACCTTGCTACGAGAAGCAGAAGTAGAGATGCCGTCGGGGAAATACTACTGCGAC
TACTGCGAGAAGGAGTTTCAAGACACACAAGTCGCTAGAAAACGACATCTTCAGAGCAAT
CCTCATCTTCGAGCTAAATCACTTTGGTACAGCAGCTCTACCACCTCAGAACCTTTGCCC
ATTCGGAGATTCTTGCAGATACTTTCACCCTAACAACGTTCCAGGAAACACAGGATACAC
CAATAATAACAATACACAATCTCTTGCTGGCTTGCCTAACCAACACATCCAATCAACTGG
TTTAAACCGTGATTTCTTTAGCGGGAGAGGAGAAGGAACCGGTTGGTTCGATCTTCCACC
GTCTCTGAGACCGCCTCCGGAGCAAGGCTATCCTCAACTTCCCTCCATTGACTGGGGATA
GAAGTTTTTTTTCCTTTCTCTGCATAGTAATTGCTAAGATGCAACTTTTGTTCTTTTTTA
TACCTCATTTCAACATTTTACACCATTTCTGATAGAAAAAAGGCAGTTGAATTTCATTTG
CTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 

AF RS1DM18JQ C 1
AF RS1DM18TF U 1
BS 1 543 RS1DM18TF

RD RS1DM18JQ 543 0 0
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TACTGCGAGAAGGAGTTTCAAGACACACAAGTCGCTAGAAAACGACATCTTCAGAGCAAT
CCTCATCTTCGAGCTAAATCACTTTGGTACAGCAGCTCTACCACCTCAGAACCTTTGCCC
ATTCGGAGATTCTTGCAGATACTTTCACCCTAACAACGTTCCAGGAAACACAGGATACAC
CAATAATAACAATACACAATCTCTTGCTGGCTTGCCTAACCAACACATCCAATCAACTGG
TTTAAACCGTGATTTCTTTAGCGGGAGAGGAGAAGGAACCGGTTGGTTCGATCTTCCACC
GTCTCTGAGACCGCCTCCGGAGCAAGGCTATCCTCAACTTCCCTCCATTGACTGGGGATA
GAAGTTTTTTTTCCTTTCTCTGCATAGTAATTGCTAAGATGCAACTTTTGTTCTTTTTTA
TACCTCATTTCAACATTTTACACCATTTCTGATAGAAAAAAGGCAGTTGAATTTCATTTG
CTC

QA 1 543 1 543
DS 

RD RS1DM18TF 543 0 0
GGCCACACCTTGCTACGAGAAGCAGAAGTAGAGATGCCGTCGGGGAAATACTACTGCGAC
TACTGCGAGAAGGAGTTTCAAGACACACAAGTCGCTAGAAAACGACATCTTCAGAGCAAT
CCTCATCTTCGAGCTAAATCACTTTGGTACAGCAGCTCTACCACCTCAGAACCTTTGCCC
ATTCGGAGATTCTTGCAGATACTTTCACCCTAACAACGTTCCAGGAAACACAGGATACAC
CAATAATAACAATACACAATCTCTTGCTGGCTTGCCTAACCAACACATCCAATCAACTGG
TTTAAACCGTGATTTCTTTAGCGGGAGAGGAGAAGGAACCGGTTGGTTCGATCTTCCACC
GTCTCTGAGACCGCCTCCGGAGCAAGGCTATCCTCAACTTCCCTCCATTGACTGGGGATA
GAAGTTTTTTTTCCTTTCTCTGCATAGTAATTGCTAAGATGCAACTTTTGTTCTTTTTTA
TACCTCATTTCAACATTTTACACCATTTCTGATAGAAAAAAGGCAGTTGAATTTCATTTG
CTC

QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 2

CO CL8316Contig1 814 2 3 U
GTGCACTCACCCAAAACATATCAGCCATCATCAAAATTCATTCAACATGCGACATCGAGT
AACAACTTTCCTGAACTCATCCAAGCTTAGCTTTCCATCTTTATCAAAGTCAAAGCAACG
AATCATGTCTTGTAATTCCTCGTCTGACCAAGTGAAATCATGCACAGTGGCCATTGTCCC
CACATCTCTCAAAATAATGAAACCTTTTCCCGCTTTATCAAACTGAAAAAAGTATAAAAC
CAATTCATCCCCAGTCATCTGCATCTTGCTCATGCTCAAGTCCAAATTATTCTTCTTAAA
AAATGCTGACGCTTGGCCGTTTCTACAAGGGCCTACTCCTGCTACTACAACAGAGCCTAG
AGAAAGCGCTATTGCCTTGTTTAAGTCGTCATCGTTATCCTCTCCAAGTGGGTCTGATCT
AACAAATGCTTCTTCCTCTTTGGCGTGGAGGCGGTCTTGTTCTTGTTTCTTTTACGAGAA
ACGGAGCTTGATTTCTCCAGAAACTCCTCCTCTTCATATTCACTCTCGTCTATTTCATCT
CCGGGTCTATAATCGTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCACCGGAATTAGGTTTTCTCATA
GATGATGGAGGCACAAGGGCCTTGGCGGCTTTAGAGATGCCGAGAGCTTCTAATCTCGCT
CTGTTCTCGGCGATCCTTGTCAACCTCTTCTTCTCATACTCCGACATCTTATCACCCTTT
CCTTCTTCTTCTTCGATTGGGTCTCTCGTTTCTTCTTCCGACTCCGATTCTTCGCCGCCG
GACCTCGACCTCTCTCCTTCACCCATTTGTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AJ27JQ U 27
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BS 344 814 RS1AJ27TF

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TTAGCTTTCCATCTTTATCAAAGTCAAAGCAACGAATCATGTCTTGTAATTCCTCGTCTG
ACCAAGTGAAATCATGCACAGTGGCCATTGTCCCCACATCTCTCAAAATAATGAAACCTT
TTCCCGCTTTATCAAACTGAAAAAAGTATAAAACCAATTCATCCCCAGTCATCTGCATCT
TGCTCATGCTCAAGTCCAAATTATTCTTCTTAAAAAATGCTGACGCTTGGCCGTTTCTAC
AAGGGCCTACTCCTGCT

QA 1 317 1 317
DS 

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AACAACTTTCCTGAACTCATCCAAGCTTAGCTTTCCATCTTTATCAAAGTCAAAGCAACG
AATCATGTCTTGTAATTCCTCGTCTGACCAAGTGAAATCATGCACAGTGGCCATTGTCGC
CACATCTCTCAGAGTAATGAAACCTTTTCCCGCTTTATCAAACTGAAAGAAGTATAAGAC
CAATTCATCCCCAGTCATCTGCATCTTGCTCATGCTCAAGTCCGAATTATTCTTCTTAAA
AGATGCTGACGCTTGGCCGTTTCTACGAGGGCCTACTCCTGCTACTACAACAGAGCCTAG
AGAAAGCGCTATTGCCTTGTTTAAGTCGTCATCGTTATCCTCTCCAAGTGGGTCTGATCT
AACAAATGCTTCTTCCTCTTTGGCGTGGAGGCGGTCTTGTTCTTGTTTCTTTTACGAGAA
ACGGAGCTTGATTTCTCCAGAAACTCCTCCTCTTCATATTCACTCTCGTCTATTTCATCT
CCGGGTCTATAATCGTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCACCGGAATTAGGTTTTCTCATA
GATGATGGAGGCACAAGGGCCTTGGCGGCTTTAGAGATGCCGAGAGCTTCTAATCTCGCT
CTGTTCTCGGCGATCCTTGTCAACCTCTTCTTCTCATACTCCGACATCTTATCACCCTTT
CCTTCTTCTTCTTCGATTGGGTCTCTCGTTTCTTCTTCCGACTCCGATTCTTCGCCGCCG
GACCTCGACCTCTCTCCTTCACCCATTTGTTTCC

QA 1 814 1 814
DS 



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AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

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CTCCTCCTCCTCGCCGTTACGGCGGAGTTAAGCGTAACGAGATTCTCCGCCGGAGCCGTG
GGCGTGAACTGGGGGACGGAAGCTTCGCACCCTCTTCCGCCTTCAAAGGTCGTAGAGCTT
CTGAAATCCAACGGCATTGCGAAAGTGAAGCTCTTCGATGCCGACCCGAAGGTTCTCCGA
GCTCTCTCCGGTTCAAACATCGGCGTCACCGTAGGAATCCCTAATTCTATTATTAAGAGC
TTGAATGCGTCTAGAAAGGTAGCAGAGAGCTGGGTCCATGACAATGTCACTCGTTACTTC
GACGGTGGAAACAGAGTCCGAATCGAATACGTGGCAGTTGGAGACGAGCCGTTTCTCCAG
AGCTATGGCAATCAGTATAGGCCTTATGTCATTGGAGCAGCGATGAACATCCAAAATGCT
TTAGCTAAAGCGAGCTTGGGAAGTGAAGTGAAAGTCGTTGTCCCTTCCAGCTTCGACTCC
TTTCTTTCTGAATCTGGTCGACCTTCATCAGGACACTTTAGAGCTGACCTCAACAAGACG
ATGATCGAGCTCCTCTCCTTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GQ94TF U 1
AF RS1DV68TF U 72
BS 1 603 RS1GQ94TF
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GACGGTGGAAACAGAGTCCGAATCGAATACGTGGCAGTTGGAGACGAGCCGTTTCTCCAG
AGCTATGGCAATCAGTATAGGCCTTATGTCATTGGAGCAGCGATGAACATCCAAAATGCT
TTAGCTAAAGCGAGCTTGGGAAGTGAAGTGAAAGTCGTTGTCCCTTCCAGCTTCGACTCC
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ATGTTCGAGCTCCTCTCCTTTCTC

QA 1 624 1 624
DS 

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CGGCATTGCGAAAGTGAAGCTCTTTGATGCCGACCCGAAGGTTCTCCGAGCTCTCTCCGG
TTCAAACATCGGCGTCACCGTAGGAATCCCTAATTCTATTATTAAGAGCTTGAATGCGTC
TAGAAAGGTAGCAGAGAGCTGGGTCCATGACAATGTCACTCGTTACTTCGACGGTGGAAA
CAGAGTCCGAATCGAATACGTGGCAGTTGGAGACGAGCCGTTTCTCCAGAGCTATGGCAA
TCAGTATAGGCCTTATGTCATTGGAGCAGCGATGAACATCCAAAATGCTTTAGCTAAAGC
GAGCTTGGGAAGTGAAGTGAAAGTCGTTGTCCCTTCCAGCTTCGACTCCTTTCTTTCTGA
ATCTGGTCGACCTTCATCAGGACACTTTAGAGCTGACCTCAACAAGACGATGATCGAGCT
CCTCTCCTTTCTC

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 2

CO CL8321Contig1 996 2 2 U
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ACTCATACCAATCTGGCTCTGCACCATCCTCTACTCTGTGGTTTTCACTCAGATGGCTTC
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GTTTCTAGACCCACTCTTTGCAATGCTTAACAAAACAGAACCCAACAAAGGTCTCACTGA
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AGTGGAGATATACAGACTGAAATACAAAGAAACTGCTTCGAACTCAAGCTCATTGAGCAT
ATTCTGGCAAGTACCTCAGTACATGATGATAGGTGCATCAGAAGTATTCATGTACGTTGG
TCAGCTCGAGTTCTTCAACAGCCAAGCTCCAACTGGGTTAAAGAGCTTTGCAAGCGCCCT
ATGTATGGCTTCAATATCGCTTGGGAACTATGTAAGTAGTCTGCTAGTTTCCATCGTCAT
GAGCATCTCTACAAGAGATGATCTGCCTGGTTGGATCCCTGGGAACCTCAACAAAGGACA
CTTGGACAGATTCTACTTCCTTTTGGCCGGTCTAACAGCAGCTGATTTTGTGGTTTACCT
GGTTTGTGCTAAATGGTATAAGTATATTAAGTCTGAAGCAAGTTTCTGTGAGTCCACATC
TGAAGAAGAGGTCTGAGTCAGAGGCTTAAGAGTTTTGGGGGTTTACGCTGTGAAGCTATG
GACAGTAAAATGTCCAAAGCTGGGCTTGTTATGTCATATATTGGTCTTGTGGTTTTCTTT
TTGGGATACTCTTTTGTGCAAAGTTTTGTTCATGTTTCTAAATAAAGACAAGTTTGTACA
ATTTTTTCTCACATAATAATAATATGTTGGCTGCAC


BQ
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AF RS1EV71TF U 1
AF RS1EV71JQ C 224
BS 1 768 RS1EV71TF
BS 769 996 RS1EV71JQ

RD RS1EV71TF 768 0 0
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ACTCATACCAATCTGGCTCTGCACCATCCTCTACTCTGTGGTTTTCACTCAGATGGCTTC
ACTGTTCGTTGAGCAAGGCGCAGCGATGAAGACAAACATCAAAGACTTCAAGATCCCAGC
TTCAAGCATGTCTAGCTTCGACATTCTCAGCGTCGCCCTGTTCATCTTCGCTTACAGGAG
GTTTCTAGACCCACTCTTTGCAATGCTTAACAAAACAGAACCCAACAAAGGTCTCACTGA
GCTTCAGAGGATGGGGATAGGTCTCGTGATCGCGATAATGGCGATGATATCAGCAGGAGT
AGTGGAGATATACAGACTGAAATACAAAGAAACTGCTTCGAACTCAAGCTCATTGAGCAT
ATTCTGGCAAGTACCTCAGTACATGATGATAGGTGCATCAGAAGTATTCATGTACGTTGG
TCAGCTCGAGTTCTTCAACAGCCAAGCTCCAACTGGGTTAAAGAGCTTTGCAAGCGCCCT
ATGTATGGCTTCAATATCGCTTGGGAACTATGTAAGTAGTCTGCTAGTTTCCATCGTCAT
GAGCATCTCTACAAGAGATGATCTGCCTGGTTGGATCCCTGGGAACCTCAACAAAGGACA
CTTGGACAGATTCTACTTCCTTTTGGCCGGTCTAACAGCAGCTGATTTTGTGGTTTACCT
GGTTTGTGCTAAATGGTATAAGTATATTAAGTCTGAAGCAAGTTTCTG

QA 1 768 1 768
DS 

RD RS1EV71JQ 773 0 0
ATCTTCGCTTACAGGAGGTTTCTAGACCCACTCTTTGCAATGCTTAACAAAACAGAACCC
AACAAAGGTCTCACTGAGCTTCAGAGGATGGGGATAGGTCTCGTGATCGCGATAATGGCG
ATGATATCAGCAGGAGTAGTGGAGATATACAGACTGAAATACAAAGAAACTGCTTCGAAC
TCAAGCTCATTGAGCATATTCTGGCAAGTACCTCAGTACATGATGATAGGTGCATCAGAA
GTATTCATGTACGTTGGTCAGCTCGAGTTCTTCAACAGCCAAGCTCCAACTGGGTTAAAG
AGCTTTGCAAGCGCCCTATGTATGGCTTCAATATCGCTTGGGAACTATGTAAGTAGTCTG
CTAGTTTCCATCGTCATGAGCATCTCTACAAGAGATGATCTGCCTGGTTGGATCCCTGGG
AACCTCAACAAAGGACACTTGGACAGATTCTACTTCCTTTTGGCCGGTCTAACAGCAGCT
GATTTTGTGGTTTACCTGGTTTGTGCTAAATGGTATAAGTATATTAAGTCTGAAGCAAGT
TTCTGTGAGTCCACATCTGAAGAAGAGGTCTGAGTCAGAGGCTTAAGAGTTTTGGGGGTT
TACGCTGTGAAGCTATGGACAGTAAAATGTCCAAAGCTGGGCTTGTTATGTCATATATTG
GTCTTGTGGTTTTCTTTTTGGGATACTCTTTTGTGCAAAGTTTTGTTCATGTTTCTAAAT
AAAGACAAGTTTGTACAATTTTTTCTCACATAATAATAATATGTTGGCTGCAC

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

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CCTTCCGTTTAATCGCTTCCTCGTCACGCAACCTTTTTTGATCCACCCCCGGAGACAGCT
ATGAAGATCACAGCCTTGCTTGTTCTGAAGGCCGCTCCCGAAGCCACGGATCCCGTCATC
CTCGCCAACGCTTCCGACGTCTCTCACTTCGGCTATTTCCAGCGATCTAGCGTCAAGGAG
TTCGTCGTCTTTGTCGGTCGCACCGTCGCCAGCCGCACCCCTCCCTCCCAGCGCCAGTCC
GCCCAGCACGAAGAGTACAAGGTTCACGCTTACAATAGAAATGGACTTTGCGCTGTTGGA
TTCATGGACGATCATTACCCCGAAGATCGGAGACGGGGTGTTGATCGGAGCTGGGACGTG
TATTTTGGGGAATATCACGATCGGTGAAGGGGCGAAGATCGGTGCTGGGTCGGTGGTTTT
GAAGGATGTGCCGCCGAGGACGACGGCTGTGGGGAATCCGGCGAGGTTGCTTGGTGGGAA
AGATAATCCCAAGAGGCATGACAAGGATCCTGGTCTGACTATGGACCAAACTTCGCATAT
ATCCGAGTGGTCGGATTATGTAATTTGAATTGTGTTTTTGTTGTTTTATTGTAATCAGAT
CATTTGTCTCTCTGTAAGAAGATACTATTTGTCTGATTAAGATGGGATTTGGAACTAAAA
CTCGGAAACTCTAAACGTTTGTTTGAGTTTCATGTGGTTGGTTTCTGATTAGCAGAGACT
GTTTAAGAATATGTTTAGTATGTTGTAAGTGTGTTTTGGGAATAAACCGAAAGTTTTATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DO46TF U 1
AF RS1DO46JQ C 101
BS 1 653 RS1DO46TF
BS 654 840 RS1DO46JQ

RD RS1DO46TF 653 0 0
TTTTTCTTTAACCACCGGACTTGAGTTTTTTTTTGTTCTTCCCGACGCCCCTTCTCCTCT
CCTTCCGTTTAATCGCTTCCTCGTCACGCAACCTTTTTTGATCCACCCCCGGAGACAGCT
ATGAAGATCACAGCCTTGCTTGTTCTGAAGGCCGCTCCCGAAGCCACGGATCCCGTCATC
CTCGCCAACGCTTCCGACGTCTCTCACTTCGGCTATTTCCAGCGATCTAGCGTCAAGGAG
TTCGTCGTCTTTGTCGGTCGCACCGTCGCCAGCCGCACCCCTCCCTCCCAGCGCCAGTCC
GCCCAGCACGAAGAGTACAAGGTTCACGCTTACAATAGAAATGGACTTTGCGCTGTTGGA
TTCATGGACGATCATTACCCCGAAGATCGGAGACGGGGTGTTGATCGGAGCTGGGACGTG
TATTTTGGGGAATATCACGATCGGTGAAGGGGCGAAGATCGGTGCTGGGTCGGTGGTTTT
GAAGGATGTGCCGCCGAGGACGACGGCTGTGGGGAATCCGGCGAGGTTGCTTGGTGGGAA
AGATAATCCCAAGAGGCATGACAAGGATCCTGGTCTGACTATGGACCAAACTTCGCATAT
ATCCGAGTGGTCGGATTATGTAATTTGAATTGTGTTTTTGTTGTTTTATTGTA

QA 1 653 1 653
DS 

RD RS1DO46JQ 740 0 0
GATCCA
CCCCGGAGACAGCTATGAAGATCACAGC*TTGCTTGTTCTGAAGGCCGCTCCCGAAGCCA
CGGATCCCGTCATCCTCGCCAACGCTTCCGACGTCTCTCACTTCGGCTATTTCCAGCGAT
CTAGCGTCAAGGAGTTCGTCGTCTTTGTCGGTCGCACCGTCGCCAGCCGCACCCCTCCCT
CCCAGCGCCAGTCCGCCCAGCACGAAGAGTACAAGGTTCACGCTTACAATAGAAATGGAC
TTTGCGCTGTTGGATTCATGGACGATCATTACCCCGAAGATCGGAGACGGGGTGTTGATC
GGAGCTGGGACGTGTATTTTGGGGAATATCACGATCGGTGAAGGGGCGAAGATCGGTGCT
GGGTCGGTGGTTTTGAAGGATGTGCCGCCGAGGACGACGGCTGTGGGGAATCCGGCGAGG
TTGCTTGGTGGGAAAGATAATCCCAAGAGGCATGACAAGGATCCTGGTCTGACTATGGAC
CAAACTTCGCATATATCCGAGTGGTCGGATTATGTAATTTGAATTGTGTTTTTGTTGTTT
TATTGTAATCAGATCATTTGTCTCTCTGTAAGAAGATACTATTTGTCTGATTAAGATGGG
ATTTGGAACTAAAACTCGGAAACTCTAAACGTTTGTTTGAGTTTCATGTGGTTGGTTTCT
GATTAGCAGAGACTGTTTAAGAATATGTTTAGTATGTTGTAAGTGTGTTTTGGGAATAAA
CCGAAAGTTTTATC

QA 7 740 7 740
DS 



AS 1 2

CO CL8323Contig1 930 2 4 U
GGACTCGGGCCTCGACGAGAAAGAAGATCGATTGGCTTGTAACCATGAGCTCCTTCAATG
GAAGCAGCAACATGGATAACCTTCTACTCCAAACCCTACTCGGACGCCTCCATATTCGTC
CCCCTAATTCTTCTCCTCAATCCCTAGACAACAGCGACGGCGATGACGACGACGACGACG
GAGATTCTCGGAACAGCCTCGATCGGGAAGAATCCAGGCTGGAGAAGGAGCTGATCCGCG
TCATCGTCTCGGGTCGAATCGATTCCCTGAAGCCGAATTCAGGGCAGGCTGTGACGGTTA
ACGAGCACCACATCTGCGTTGGGTTCCATGAGGATGAGGAGTCGGATTATCGTGTGTGGG
AGTGGCACGGACATATCATGCTCTTCGACGAAGAGAATGGGTACACGCCTGAGTATATCT
ACGGTAATTACTTCGAGAGGTTGCCGGTGAAGCTGCCGAAGAAGAAGGAAGCGAAACAGA
AAGAGGAAGCTGAGGAGGTTGAGAATTTGGGTCTGAGAGAGCTGATTGATGGTGGAGGTG
ATGCTGCTCGTGGCAGGGTTATTCACAGGAACATCAACATCGGTTCCTCAAGGGCCTAAG
TGTTACTTGGAGCGACTTGGCAGTAGATGTTACATTGCTCATGAAGATTTCAAGATGTGT
GGAGTGAGGACAACAAAACATAACGCGTTGGTGGGGTTTACAGCTTCTGTTCTGTTCTAT
TTAAACCAGTAAACCCATGGGTGAATCAGTTTCCTTTAAAACAACCACCTGAAGTTGTTT
TTGATCCAAATTTACAATACATGCTGATGAACAGAGCCAGCAAAAATTACATGATTATGG
TCATTAAAACTTTTCCCTTGTTTTGTGTATTTTATGTTCTTAGTTTGAAAACCACTCATT
TCCCAATATTGATACAGCAGTATTGTAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EZ88TF U 1
AF RS1EZ88JQ C 244
BS 1 677 RS1EZ88TF
BS 678 678 RS1EZ88JQ
BS 679 748 RS1EZ88TF
BS 749 930 RS1EZ88JQ

RD RS1EZ88TF 748 0 0
GGACTCGGGCCTCGACGAGAAAGAAGATCGATTGGCTTGTAACCATGAGCTCCTTCAATG
GAAGCAGCAACATGGATAACCTTCTACTCCAAACCCTACTCGGACGCCTCCATATTCGTC
CCCCTAATTCTTCTCCTCAATCCCTAGACAACAGCGACGGCGATGACGACGACGACGACG
GAGATTCTCGGAACAGCCTCGATCGGGAAGAATCCAGGCTGGAGAAGGAGCTGATCCGCG
TCATCGTCTCGGGTCGAATCGATTCCCTGAAGCCGAATTCAGGGCAGGCTGTGACGGTTA
ACGAGCACCACATCTGCGTTGGGTTCCATGAGGATGAGGAGTCGGATTATCGTGTGTGGG
AGTGGCACGGACATATCATGCTCTTCGACGAAGAGAATGGGTACACGCCTGAGTATATCT
ACGGTAATTACTTCGAGAGGTTGCCGGTGAAGCTGCCGAAGAAGAAGGAAGCGAAACAGA
AAGAGGAAGCTGAGGAGGTTGAGAATTTGGGTCTGAGAGAGCTGATTGATGGTGGAGGTG
ATGCTGCTCGTGGCAGGGTTATTCACAGGAACATCAACATCGGTTCCTCAAGGGCCTAAG
TGTTACTTGGAGCGACTTGGCAGTAGATGTTACATTGCTCATGAAGATTTCAAGATGTGT
GGAGTGAGGACAACAAA*CATAACGCGTTGGTGGGGTTTACAGCTTCTGTTCTGTTCTAT
TTAAACCAGTAAACCCATGGGTGAATCA

QA 1 748 1 748
DS 

RD RS1EZ88JQ 687 0 0
TCGTCTCGGGTCGAATCGATTCCCTGAAGCCGAATTCAGGGCAGGCTGTGACGGTTAACG
AGCACCACATCTGCGTTGGGTTCCATGAGGATGAGGAGTCGGATTATCGTGTGTGGGAGT
GGCACGGACATATCATGCTTTTCGACGAAGAGAATGGGTACACGCCTGAGTATATTTACG
GTAATTACTTCGAGAGGTTGCCGGTGAAGCTGCCGAAGAAGAAGGAAGCGAAACAGAAAG
AGGAAGCTGAGGAGGTTGAGAATTTGGGTCTGAGAGAGCTGATTGATGGTGGAGGTGATG
CTGCTCGTGGCAGGGTTATTCACAGGAACATCAACATCGGTTCCTCAAGGGCCTAAGTGT
TACTTGGAGCGACTTGGCAGTAGATGTTACATTGCTCATGAAGATTTCAAGATGTGTGGA
GTGAGGACAACAAAACATAACGCGTTGGTGGGGTTTACGGCTTCTGTTCTGTTCTATTTA
AACCAGTAAACCCATGGGTGAATCAGTTTCCTTTAAAACAACCACCTGAAGTTGTTTTTG
ATCCAAATTTACAATACATGCTGATGAACAGAGCCAGCAAAAATTACATGATTATGGTCA
TTAAAACTTTTCCCTTGTTTTGTGTATTTTATGTTCTTAGTTTGAAAACCACTCATTTCC
CAATATTGATACAGCAGTATTGTAACC

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

CO CL8324Contig1 545 2 1 U
GGAACAACTAGCAAGAGGGAAGCCAAAAATATGACGACAATGGCGACGCAGGGTGCTTTT
CTCCGATTACGAACGACCTCATCCTCAAAGTCCGTCGCTAAGCCAACGGAGCTCGGGTTC
CTCAGCTCCCAGCTCAGTGGCTTAAGAATCTCGCATGGTCCCTCCAATGACGTCATCAAC
CGCATCTCCCTCCCTTCCTTTCCCGGTACTCTTCAGCCAATCGTCGCCCGGAGAATCTGT
CCTTTTACTGGGAAGAAAGCAAACAGAGCCAACAAAGTGTCCTTCTCTAACCACAAGACC
AAGAAGTTGCAGTTCGTCAACTTACAGTACAAGAAGGTTTGGTGGGAAGCTGGCAAACGC
TTCGTCAAGCTCCGTTTATCAACAAAGGCCTTGAAGACCATTGAGAAGAATGGTCTCGAC
GCTGTTGCCAAGAAAGCTGGCATCGATCTTCGCAAGAAATAGATATGATTTGATTGATAT
GCCATTTTCTTGCTGTTAATTTCTTTTCTTAATACATTTCCTTCAATGGAACGTTTATGA
GTTTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 

AF RS1G046JQ C 1
AF RS1G046TF U 1
BS 1 545 RS1G046TF

RD RS1G046JQ 545 0 0
GGAACAACTAGCAAGAGGGAAGCCAAAAATATGACGACAATGGCGACGCAGGGTGCTTTT
CTCCGATTACGAACGACCTCATCCTCAAAGTCCGTCGCTAAGCCAACGGAGCTCGGGTTC
CTCAGCTCCCAGCTCAGTGGCTTAAGAATCTCGCATGGTCCCTCCAATGACGTCATCAAC
CGCATCTCCCTCCCTTCCTTTCCCGGTACTCTTCAGCCAATCGTCGCCCGGAGAATCTGT
CCTTTTACTGGGAAGAAAGCAAACAGAGCCAACAAAGTGTCCTTCTCTAACCACAAGACC
AAGAAGTTGCAGTTCGTCAACTTACAGTACAAGAAGGTTTGGTGGGAAGCTGGCAAACGC
TTCGTCAAGCTCCGTTTATCAACAAAGGCCTTGAAGACCATTGAGAAGAATGGTCTCGAC
GCTGTTGCCAAGAAAGCTGGCATCGATCTTCGCAAGAAATAGATATGATTTGATTGATAT
GCCATTTTCTTGCTGTTAATTTCTTTTCTTAATACATTTCCTTCAATGGAACGTTTATGA
GTTTG

QA 1 545 1 545
DS 

RD RS1G046TF 545 0 0
GGAACAACTAGCAAGAGGGAAGCCAAAAATATGACGACAATGGCGACGCAGGGTGCTTTT
CTCCGATTACGAACGACCTCATCCTCAAAGTCCGTCGCTAAGCCAACGGAGCTCGGGTTC
CTCAGCTCCCAGCTCAGTGGCTTAAGAATCTCGCATGGTCCCTCCAATGACGTCATCAAC
CGCATCTCCCTCCCTTCCTTTCCCGGTACTCTTCAGCCAATCGTCGCCCGGAGAATCTGT
CCTTTTACTGGGAAGAAAGCAAACAGAGCCAACAAAGTGTCCTTCTCTAACCACAAGACC
AAGAAGTTGCAGTTCGTCAACTTACAGTACAAGAAGGTTTGGTGGGAAGCTGGCAAACGC
TTCGTCAAGCTCCGTTTATCAACAAAGGCCTTGAAGACCATTGAGAAGAATGGTCTCGAC
GCTGTTGCCAAGAAAGCTGGCATCGATCTTCGCAAGAAATAGATATGATTTGATTGATAT
GCCATTTTCTTGCTGTTAATTTCTTTTCTTAATACATTTCCTTCAATGGAACGTTTATGA
GTTTG

QA 1 545 1 545
DS 



AS 1 2

CO CL8325Contig1 901 2 2 U
GGATATCTCTTCTCTAAGCTCATGATCATCTGCTTGATCATAAAGCCTATTATCCTCTCT
TTCAGTAAAAGTAGCTTTTTGATTTTCTTCATCATACTCTTCCATCATAGATTCAGCTTC
TGAACCTAATTGTTCCAGGTTATTACAAAGCCAAGTTCATCATATCAAATCTTCTTGAGA
TCTTGAATTCCTTAGAACATGGAGAAGCTTCTTAATCCATCTGAAAAGCAGTACATGAAA
ATGGTTATGCTTAAACATGAAGAAACTTTCAAGCAGCAGGTATATGAACTTCATAGGTTA
TATCAAGTCCAGAAGATATTGATGAAGAGCATGCAGGTCAACAAAGTCAATGATGTAAAT
CCAGGACTAGGATCATTCGTCAGAAGAGTTGACGGGCCGGAGAACTTTGCCCACGGAGGA
GAATCCGGTGGTAATGATATAGAAATTATGGACGAGAGTGAGATCGAGCTAACGCTTGGA
CCGTCGTGTTACGGTGGTGATCTGATGAGAATGAACAAAGAAAAAGAATAATTCTTCGCT
GGAGATGATGGATGGAAATTTAAATTCCGGTCGCCGGAGTTTCTCATCTTCTTCCACAGG
CTCAAGCAATAATAATCATAACAATCTTGAAGATCAAGTGAGACAAGAGAGATTGATGAA
ACATCAGAAGCAGAAGCCTTGGCTTCAAGCATTGACCTTGGATGTTATTTGATAATAATA
AATAATATTCATTTTAACTATATTCTGAAATAGATTGCATTTCCCTTTTGATGTTTTATC
ATGCCTCTTATCAGGTGATCTTTTAAAGATGATTATCAGTAATTTTCTTCTTTAGCAGTT
CTTCTTAGGTTTCTTGTAAATAAAAGCATTACTATGGATGTTTTACTTTGTTTATGAAGA
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RS1AF91TF U 1
AF RS1AF91JQ C 96
BS 1 640 RS1AF91TF
BS 641 901 RS1AF91JQ

RD RS1AF91TF 640 0 0
GGATATCTCTTCTCTAAGCTCATGATCATCTGCTTGATCATAAAGCCTATTATCCTCTCT
TTCAGTAAAAGTAGCTTTTTGATTTTCTTCATCATACTCTTCCATCATAGATTCAGCTTC
TGAACCTAATTGTTCCAGGTTATTACAAAGCCAAGTTCATCATATCAAATCTTCTTGAGA
TCTTGAATTCCTTAGAACATGGAGAAGCTTCTTAATCCATCTGAAAAGCAGTACATGAAA
ATGGTTATGCTTAAACATGAAGAAACTTTCAAGCAGCAGGTATATGAACTTCATAGGTTA
TATCAAGTCCAGAAGATATTGATGAAGAGCATGCAGGTCAACAAAGTCAATGATGTAAAT
CCAGGACTAGGATCATTCGTCAGAAGAGTTGACGGGCCGGAGAACTTTGCCCACGGAGGA
GAATCCGGTGGTAATGATATAGAAATTATGGACGAGAGTGAGATCGAGCTAACGCTTGGA
CCGTCGTGTTACGGTGGTGATCTGATGAGAATGAACAAAGAAAAAGAATAATTCTTCGCT
GGAGATGATGGATGGAAATTTAAATTCCGGTCGCCGGAGTTTCTCATCTTCTTCCACAGG
CTCAAGCAATAATAATCATAACAATCTTGAAGATCAAGTG

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1AF91JQ 806 0 0
ACTCTTCCATCATAGATTCAGCTTCTGAACCTAATTGTTCCAGGTTATTACAAAGCCAAG
TTCATCATATCAAATCTTCTTGAGATCTTGAATTCCTTAGAACATGGAGAAGCTTCTTAA
TCCATCTGAAAAGCAGTACATGAAAATGGTTATGCTTAAACATGAAGAAACTTTCAAGCA
GCAGGTATATGAACTTCATAGGTTATATCAAGTCCAGAAGATATTGATGAAGAGCATGCA
GGTCAACAAAGTCAATGATGTAAATCCAGGACTAGGATCATTCGTCAGAAGAGTTGACGG
GCCGGAGAACTTTGCCCACGGAGGAGAATCCGGTGGTAATGATATAGAAATTATGGACGA
GAGTGAGATCGAGCTAACGCTTGGACCGTCGTGTTACGGTGGTGATCTGATGAGAATGAA
CAAAGAAAAAGAATAATTCTTCGCTGGAGATGATGGATGGAAATTTAAATTCCGGTCGCC
GGAGTTTCTCATCTTCTTCCACAGGCTCAAGCAATAATAATCATAACAATCTTGAAGATC
AAGTGAGACAAGAGAGATTGATGAAACATCAGAAGCAGAAGCCTTGGCTTCAAGCATTGA
CCTTGGATGTTATTTGATAATAATAAATAATATTCATTTTAACTATATTCTGAAATAGAT
TGCATTTCCCTTTTGATGTTTTATCATGCCTCTTATCAGGTGATCTTTTAAAGATGATTA
TCAGTAATTTTCTTCTTTAGCAGTTCTTCTTAGGTTTCTTGTAAATAAAAGCATTACTAT
GGATGTTTTACTTTGTTTATGAAGAT

QA 1 806 1 806
DS 



AS 1 2

CO CL8326Contig1 589 2 3 U
CAGGAGCGGTTATCCAGCTAAGAACTAAAAACCAAAATAAAAAGGGATGATGCCAAAAGA
GGCAGCAAGCATCGAAACATCATGACACCAGCGACAAATAAACGTGTCAACAACAACAGT
GAAAACATTGAGGAATATTTTATAGATTTCTGATCTGCAGTTTTACAAAGAAGAAACATC
TCAGTGAGATCTCAGAGAGTTTTTGGGCTTCTTCTCTTAGGCAGCTTTAGCTGTGTGAGA
AGAAAAGCTCCATGACCCTAGATCTTGGAATAAAGCAACTAGATCTCTAACATCTTCACT
GTCTCCCATCTCTTGGAGCCATAATAGATCATGGAATCTCTCCACACCCATTTCTTCTTC
TGCACCATGCCTCATGGACTCACCTTTACCTTCCAATCTCCTTATCTTCTTCTTCATCAC
CTTCCTTCTCTTGTCATGATCTGCCATTTCTTTGGAGAGAGATAACGGCTGAGAGATCCC
AGAGATGCAGAGGGGGAAGCCATAGTTGCCACTAAGAGTTGTCGAAAGCATTTTCTTTTT
CTCTGTAGATTCAGAATTTGGGAGAGAGCTAAAGAAAGAGAAACAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FH08JQ U 200
AF RS1FH08TF C 1
BS 1 199 RS1FH08TF
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BS 470 589 RS1FH08TF

RD RS1FH08JQ 270 0 0
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AGATCTTGGAATAAAGCAACTAGATCTCTAACATCTTCACTGTCTCCCATCTCTTGGAGC
CATAATAGATCATGGAATCTCTCCACACCCATTTCTTCTTCTGCACCATGCCTCATGGAC
TCACCTTTACCTTCCAATCTCCTTATCTTCTTCTTCATCACCTTCCTTCTCTTGTCATGA
TCTGCCATTTCTTTGGAGAGAGATAACGGC

QA 1 270 1 270
DS 

RD RS1FH08TF 589 0 0
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GAAAACATTGAGGAATATTTTATAGATTTCTGATCTGCAGTTTTACAAAGAAGAAACATC
TCAGTGAGATCTCAGAGAGTTTTTGGGCTTCTTCTCTTAGGCAGCTTTAGCTGTGTGAGA
AGAAAAGCTCCATGACCCTAGATCTTGGAATAAAGCAACTAGATCTTTAACATCTTCACT
GTCTCCCATTTCTTGGAGCCATAATAGATCATGGAATCTCTCCACACCCATTTCTTCTTC
TGCACCATGCCTCATGGACTCACCTTTACCTTCCGATCTCCTTATCTTCTTCTTCATCAC
CTTCCTTCTCTTGTCATGATCTGCCATTTCTTTGGAGAGAGATAACGGCTGAGAGATCCC
AGAGATGCAGAGGGGGAAGCCATAGTTGCCACTAAGAGTTGTCGAAAGCATTTTCTTTTT
CTCTGTAGATTCAGAATTTGGGAGAGAGCTAAAGAAAGAGAAACAAAAA

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 2

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CTTATGTCCTTTTCGGTTGGTTGTTTGTTTTGTAAGGGGATTTTGTTGTTTCGACGCAGA
GTCATTCGGTGATGCTTTCGATCTGTAGTTCAATTCAGTTTTCCTTTGCATGCACACCGT
TTGATCTCAGTTTTAACAGTGATGTCTTTATGGTGATTGTTTCTAATCTTGATCTGCATG
GCCTTGTTCTCCGTGGTTTCTTTGGATCTTGCCGGATTCGATCCTTCCTAATCTTGTTCT
CGTGAGATTGGTTTGTTCGGTCAAGATCGTAACCGCTCCATGTCATTACCAATGGGATCT
GGTCGTGATCTCGCTCCTTTGACTCACTTCTCATTAGGCGCTCCACCGTCGCTCTCTGTC
GACTTCGCCGTTCGGAAGTTTGATCTCGAACCGTAATCGGTTCTTTCCTTCCGGTTTGGA
AGCCATGCTTGATTATTCTACGCTTATTCACTATAGGTGGGTTACGTTATCAACACAGTT
TTGGTAACTCTTGTCAAAGCCA


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G266TF U 1
AF RS1EH43TF U 4
BS 1 116 RS1G266TF
BS 117 120 RS1EH43TF
BS 121 399 RS1G266TF
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BS 401 469 RS1G266TF
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RD RS1G266TF 600 0 0
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ATCTTAATCTCTGTTCATCGGCTCCGGTGGCTCTTTTAGCACCGGAGCCGGTATCC****
CTTATGTCCTTTTCGGTTGGTTGTTTGTTTTGTAAGGGGATTTTGTTGTTTCGACGCAGA
GTCATTCGGTGATGCTTTCGATCTGTAGTTCAATTCAGTTTTCCTTTGCATGCACACCGT
TTGATCTCAGTTTTAACAGTGATGTCTTTATGGTGATTGTTTCTAATCTTGATCTGCATG
GCCTTGTTCTCCGTGGTTTCTTTGGATCTTGCCGGATTCGATCCTTCCTAATCTTGTTCT
CGTGAGATTGGTTTGTTCGGTCAAGATCGTAACCGCTCCTTGTCATTACCAATGGGATCT
GGTCGTGATCTCGCTCCTTTGACTCACTTCTCATTAGGCGCTCCACCGT*GCTCTCTGTC
GACTTCGCCGTTCGGAAGTTTGATCTCGAACCGTAATCGGTTCTTTCCTTCCGGTTTGGA
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ATT

QA 1 597 1 597
DS 

RD RS1EH43TF 619 0 0
GG
AATTCTCTCTCTTCTCTATTTTCTCTCCCTTCTCTCTAAAATCTTCTGTTCTCAGATCTT
AATCTCTGTTCATCGGCTCCGGTGGCTCTTTTAGCACCGGAGCCGGTATCCCTTTCTTAT
GTCTTTTTCGGTTGGTTGTTTGTTTTGTAAGGGGATTTTGTTGTTTCGACGCAGAGTCAT
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CTCAGTTTTAACAGTGATGTCTTTATGGTGATTGTTTCTAATCTTGATCTGCATGGCCTT
GTTCTCCGTGGTTTCTTTGGATCTTGCCGGATTCGATCCTTCCTAATCTTGTTCTCGTGA
TATTGGTTTGTTCGGTCAAGATCGTAACCGCTCCATGTCATTACCAATGGGATCTGGTCG
TGATCTCGCTCCTTTGACTCGCTTCTCATTAGGCGCTCCACCGTCGCTCTCTGTCGACTT
CGCCGTTCGGAAGTTTGATCTCGAACCGTAATCGGTTCTTTCCTTTCGGTTTGGAAGCCA
TGCTTGATTATTCTACGCTTATTCACTATAGGTGGGTTACGTTATCAACACAGTTTTGGT
AACTCTTGTCAAAGCCA

QA 3 619 3 619
DS 



AS 1 2

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TTTCACCGGAGGAAGAACGTCGGTGACGACGACGGTGCGAAAAAAAAATCGATCTATAGC
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AAAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 

AF RS1F087TF U 1
AF RS1G969TF U 1
BS 1 545 RS1F087TF

RD RS1F087TF 545 0 0
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TTTGAATCTTTCTCAAAGAAGAATGATAATGAGGATAAAAACGTTGACTCCTCACTGAAC
TCGAGACCCTTTTCACAAGGTGATAGTGATACTGAAAGAAGCTCGAATCTGTCGTATCCA
TGGAGTTTAAAACCTCTGATTACAAGAAAATTTGAAGCTAGCAGCGCTCTACGTATACAT
GCTCCTAGCAAAGAAGGAGACATAATGTATTCCCAACATTTGAAGTCGTTTACGTTAGAT
GAGCTAAAGAATGCTACAGGAAACTTCTGTCCGGAGAGTCTAATTGGAGAAGGAGGGTTC
GGGTTTGTTTACAAGGGTTGTGTTAATGGTGGACCAGGAATCGACCTCGCTGTTGCTGTA
AAAAA

QA 1 545 1 545
DS 

RD RS1G969TF 545 0 0
GGATCGATTTGGAATCCAAACACATTTCGATCCCACCAACTCTCATCTCTGCGTTCTTCC
TTTCACCGGAGGAAGAACGTCGGTGACGACGACGGTGCGAAAAAAAAATCGATCTATAGC
GTTTTACATTTGTCCAAGGGTTTTATATAATTAGACCATAGGATTAACATGGGGAATTGC
TTTGAATCTTTCTCAAAGAAGAATGATAATGAGGATAAAAACGTTGACTCCTCACTGAAC
TCGAGACCCTTTTCACAAGGTGATAGTGATACTGAAAGAAGCTCGAATCTGTCGTATCCA
TGGAGTTTAAAACCTCTGATTACAAGAAAATTTGAAGCTAGCAGCGCTCTACGTATACAT
GCTCCTAGCAAAGAAGGAGACATAATGTATTCCCAACATTTGAAGTCGTTTACGTTAGAT
GAGCTAAAGAATGCTACAGGAAACTTCTGTCCGGAGAGTCTAATTGGAGAAGGAGGGTTC
GGGTTTGTTTACAAGGGTTGTGTTAATGGTGGACCAGGAATCGACCTCGCTGTTGCTGTA
AAAAA

QA 1 545 1 545
DS 



AS 1 2

CO CL8329Contig1 924 2 6 U
GGAACAGTGTCAGAGCCGAAACAACGTAACCAAAAAAAAAAAAAAAACAGAGCAAAATGT
CTGTCTTCTTACGCGGAGGAATCGCGGGAGGATTTCTTATCCATAGTCGTGACACCTCAG
CCGTCATCACAAAACAACGACGAATCTCATCCGTTGGAGCCGTAACAGGACCAAGCGTCA
ATCCAACGGCAGCCATTGAACAACGTGCCACATGGCTACCTGGTCTCGAACCTCCACCTT
ACCTCGACGGAAAGTTAGCTGGAGACTACGGGTTTGACCCGCTCGGGTTAGGAGAAGATC
CGAAAAGCTTGAAATGGTATGTTCAAGCAGAGCTTGTCCATGCTCGTTTCGCCATGCTTG
GTGTTGCCGGAATACTCTTCACGGATCTACTTCGTACCACAGGGATTAGCAACTTACCGG
TTTGGTACGATGCCGGAGCAACGAAATTTGATTTTGCCAGCACAAAGACTCTCATTGTTG
TACAGTTTCTACTCATGGGGTTTGCTGAGACCAAAAGGTATATGGACTTCGTCTCACCAG
GATCTCAAGCCGCAGAAGGTTCTTTCTTTGGACTTGAAGCAGCACTCGAAGGGCTCGAGC
CCGGATATCCTGGAGGGCCGCTCCTGAATCCACTAGGATTTGCGAAGGATATCAAGAACG
CTAATGACTGGAAGCTTAAGGAGATCAAGAATGGTCGTCTAGCAATGATGGCGATGCTAG
GGTTCTTCGTCCAAGCCTCTGTCACTCACACTGGTCCTATCGATAACCTTGTCGAGCATC
TCTTCTAATCCGTGGCATAAGACCATCATTCAAACCCTCTTCACCTCTACTTCTTAGTTA
CATTTCATGTAGCAAGTTCAATATACTGCTGGAGAAGTGCATCAATTACCTTTAAAAAGT
ACAACAAATCTAACCACTCTTTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1EO11TF U 1
AF RS1EO11JQ C 244
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RD RS1EO11TF 801 0 0
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ACCTCGACGGAAAGTTAGCTGGAGACTACGGGTTTGACCCGCTCGGGTTAGGAGAAGATC
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TTTTCTAATCCGTGGCATAAG

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DS 

RD RS1EO11JQ 681 0 0
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AGTTTCTACTCATGGGGTTTGCTGAGACCAAAAGGTATATGGACTTCGTCTCACCAGGAT
CTCAAGCCGCAGAAGGTTCTTTCTTTGGACTTGAAGCAGCACTCGAAGGGCTCGAGCCCG
GATATCCTGGAGGGCCGCTCCTGAATCCACTAGGATTTGCGAAGGATATCAAGAACGCTA
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TCTTCGTCCAAGCCTCTGTCACTCACACTGGTCCTATCGATAACCTTGTCGAGCATCTCT
*CTAATCCGTGGCATAAGACCATCATTCAAACCCTCTTCACCTCTACTTCTTAGTTACAT
TTCATGTAGCAAGTTCAATATACTGCTGGAGAAGTGCATCAATTACCTTTAAAAAGTACA
ACAAATCTAACCACTCTTTTT

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

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CTAATTTTTTTTTTCCATTTCTTATTTATTTACTTCATTGAAAGTGTGTTTTTAACTTTC
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BQ
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AF RS1B103TF U 1
AF RS1B103JQ C 175
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RD RS1B103TF 747 0 0
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C

QA 1 746 1 746
DS 

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TCTAACCAATGACCACTTGCTTACTTGTTACCGTCACATTCCTTGCACTCTCCTCAGTAC
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QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL8331Contig1 550 2 1 U
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AGATCGAGTCGGTTAGTGATGCTTCTTTGCCTTCGCTGCGGTTTGTTGGAAACGGACGGA
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TTTCTTGTCATCAAGGTACTAGATGAAGACAGACTTGAGGGTTGGTAACCAAGTGAAGAG
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GCATGCTACC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EB73JQ C 1
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TTTCTTGTCATCAAGGTACTAGATGAAGACAGACTTGAGGGTTGGTAACCAAGTGAAGAG
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GCATGCTACC

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DS 

RD RS1EB73TF 550 0 0
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TCTCCTGGGGTTTGATTGGTGGGATGAACAACTACTGGGCGGTTACCATGCTTGGTTGGA
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AGATCGAGTCGGTTAGTGATGCTTCTTTGCCTTCGCTGCGGTTTGTTGGAAACGGACGGA
CTTTGCAAGCCAGTGCGGTTCCTCTTAGTGGGGTGGAAGTTATATGAAGATCTATTGTAT
TTTCTTGTCATCAAGGTACTAGATGAAGACAGACTTGAGGGTTGGTAACCAAGTGAAGAG
ATCATTAAGGCTTTGCGTGAACTGCTGCATGTATAATCAAGTTAGTGTTGTTTAAGCATA
TCATTACAGATGAATAGGACAGTCTTATGTTTGATGTATAGTTGCCAAAAAGGGTCCCCT
GTCTTTACCGTAAGATTACATTCACTACTAGACCTTCACATTTATTTAACTATGAAAAAA
GCATGCTACC

QA 1 550 1 550
DS 



AS 1 2

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TTCTAGCCGACGGATTGACTTTTTATGCCATCGCCGGTCCGGCCAGTGTGTCGCTTTTGT
CTTTCTCTCTTTTCTGTCTAGTTGCATGTCCTTGGTTTGACTTGATAATTTTTAGAGAGC
TTTTTTTAGATCTAGAATTTCAGATCTGGTAGATCAGTTGAGGTTTCTGTAGGTGGGTTG
GCTGTGTGGTGTGGTTCCTCAGTTCCATCTCTACTTCAATTTTTAGGGCTCAGATGACGG
GTCTCTGGAGTTTTAGCTCCTTCGTGCTTGTGGTCTCGATCTCAGTTCTGCATGTGATTT
TCTCGGTCGCCTCTGGCTTTGTTCCCGTTGAGGTTTGATGGTTATGCTTTTCTTTGATCT
TGGTAGCGACGGAATAAATTTTGTTGGTGATTGGTTCTTTTTGTGGCTCGAGTTGGTTTC
TCCGGCTTGATTTCAAGGAAGAGGGGGTTCGGCCTTTATCATTGTGTCGTCGGTGGTTGA
AGCTTAAATGGCGTGTCTCTTCTCCCCTTGGGATAGATTCTCAGCTGCTTGTCTCATGGC
TTCTGGTTTGTTTCCGAAGCAAATAGAGTGAGTTGCGGTCTCGGTTCTTCCCAAATAAAG
CTCGGATTTCAATGTTTCTCTATCCATTCCTTTTTCTTCAACAGTTCATTTGTTAGGATG
TTTATGGGTTGATCTTGTTTTGGTTCTCTATCTTATTCAAGTTAATTGTGTTATGTAAGG
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GCTCTTGTTAGCTTTAAGCCCTGAGAGAGTACTTGTTACTTGTCAGCTTAGTATCTCAAA
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EV05TF U 1
AF RS1EV05JQ C 195
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TCTCGGTCGCCTCTGGCTTTGTTCCCGTTGAGGTTTGATGGTTATGCTTTTCTTTGATCT
TGGTAGCGACGGAATAAATTTTGTTGGTGATTGGTTCTTTTTGTGGCTCGAGTTGGTTTC
TCCGGCTTGATTTCAAGGAAGAGGGGGTTCGGCCTTTATCATTGTGTCGTCGGTGGTTGA
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TTCTGGTTTGTTTCCGAAGCAAATAGAGTGAGTTGCGGTCTCGGTTCTTCCCAAATAAAG
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TT*ATGGGTTGATCTTGTTTTGGTTCTCTATCTTAT
CAGTAATTGTGTAT

QA 1 756 1 756
DS 

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TAAATTTTGTTGGTGATTGGTTCTTTTTGTGGCTCGAGTTGGTTTCTCCGGCTTGATTTC
AAGGAAGAGGGGGTTCGGCCTTTATCATTGTGTCGTCGGTGGTTGAAGCTTAAATGGCGT
GTCTCTTCTCCCCTTGGGATAGATTCTCAGCTGCTTGTCTCATGGCTTCTGGTTTGTTTC
CGAAGCAAATAGAGTGAGTTGCGGTCTCGGTTCTTCCCAAATAAAGCTCGGATTTCAATG
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QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

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CCTCAGCACCAACAGCGTCACTATTGAATCTCAAGGAACCGCTTTGAAATTTCATTTCAA
AGATGTTTATGCCTATAGATACATGTTCTCAGCCGCCATCATCGGACTAGTTTACGCTGT
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TGTTATGAAACTCATGTCTTAATGTTGGATAAAGAGAAAAGATAGTTTAGTTTGTTTATA
CTCAATGGAAGTTTGGATTTGTGATTATATCTATACGTTGGAGTTCAAGT


BQ
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AF RS1BE20TF U 1
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TGGATTTGGAGTGAGCAAAGACTTGAAAGATGCACTTCTAGCATTAGTTGCATTAGATTC
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TGTTATGAA
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QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

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GATGTTTTAG


BQ
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AF RS1H540JQB C 1
AF RS1H540TF U 1
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GATGTTTTAG

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DS 

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TGATCTGCCTAACCAACACACTAAGAAAGAAGGTAGGCTTTGCGGAGCTTGTAAGCGTAA
ACAAAGTTGAACCACCCAAGAAACCCGAGGAGAAAAAACCAGAGCCATGTTATCAACCAT
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ATAACGGAAAGGGCTATACCGAGGAACCCGTCTACAATCACGAACCCAATTGCAATATCA
TGTGAGAAGACTAATGGAAGAGACAACACAGTGTTCTTTAGTACTTGCATATTATGATAT
TTAAAATAATATATTATACATTTTTAGTAAATTGTTATACTCCCTCCATTTCAAATATAT
GATGTTTTAG

QA 1 550 1 550
DS 



AS 1 2

CO CL8335Contig1 934 2 2 U
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BQ
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AF RS1EV36TF U 1
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BS 715 934 RS1EV36JQ

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TGTTGTCTGTTTACCTTTATATACCTAATATTGTTGGGTACATGAGAGTTCTCTTGAACT
GTGTTGCGTTTGCTGTCTGTTTCTCCAACAAAACACTTTTCTCCCTCCTCTATTTCTTTA
GCTTTTGTTGTGATGCTGTGGATGGCTGGTGCGCTCGTAGATTCAACCAAGTTTCAACAT
TTGGAGCTGTTCTCGACATGGTGACAGATAGAGTTAGCACAGCCTGTCTACTCGTGATTC
TCTCTCAAGTCTACAGGCCTAGCTTGGTCTTCCTTTCGTTGCTTGCTTTAGATATTGCTA
GTCATTGGCTTCAGATGTACAGTACGTTTCTAGCAGGGAAGAGCAGCCATAAGGATGTCA
AAGACAGCACTAGCTGGCTTTTCAGACTCTACTATGGAAACCGTATCTTTATGTGTTACT
GTTGTGTTTCTTGCGAGGTTCTGTATATCATCCTCCTTCTCATTGCAAAGAACCAAACCG
AAAATCTCATCAATGTGGTAGTTTCCACTTTAACTCAGATCTCACCCCTCTCTTTTCTAT
TGGCTTTGACATTGTTCGGTTGGTCGATGAAACAGACAGTCAACATCATTCAGA

QA 1 714 1 714
DS 

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AACTGTGTTGCGTTTGCTGTCTGTTTCTCCAACAAAACACTTTTCTCCCTCCTCTATTTC
TTTAGCTTTTGTTGTGATGCTGTGGATGGCTGGTGCGCTCGTAGATTCAACCAAGTTTCA
ACATTTGGAGCTGTTCTCGACATGGTGACAGATAGAGTTAGCACAGCCTGTCTACTCGTG
ATTCTCTCTCAAGTCTACAGGCCTAGCTTGGTCTTCCTTTCGTTGCTTGCTTTAGATATT
GCTAGTCATTGGCTTCAGATGTACAGTACGTTTCTAGCAGGGAAGAGCAGCCATAAGGAT
GTCAAAGACAGCACTAGCTGGCTTTTCAGACTCTACTATGGAAACCGTATCTTTATGTGT
TACTGTTGTGTTTCTTGCGAGGTTCTGTATATCATCCTCCTTCTCATTGCAAAGAACCAA
ACCGAAAATCTCATCAATGTGGTAGTTTCCACTTTAACTCAGATCTCACCCCTCTCTTTT
CTATTGGCTTTGACATTGTTCGGTTGGTCGATGAAACAGACAGTCAACATCATTCAGATG
AAAACAGCTGCAGACGTCTGTGTACTGTATGATATAGAGAAGCAGCAGAAGAAACCTTGG
CCTTTCTTCCTTATTCTGAACCTGCAACACTTTATGTTTCTTAATGTCTGTAGAAACATC
TTCCTATGGTTTTTAAACAATATTGATTTTGCCTTTTTGACATAATTTCTGTTTGTAAAT
ATAATCTGATTATTACAAGTTTGTATTTCCTCTGTTCC

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

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GCAACTCACATGAACACGATCAATCATTTGTCGACAACCTGTAAAACATCCAATCTCATC
TGCTCCAATCACAGTTTGGCTCCTCAACCTTTTCATCGTAAACCCAAATCGTTTCCTCAG
TTGCTTCCCCTAAATGGCTCCTCCTTCTCCTCTCGCTCTCCTTCGTCTTCCGTCAATCGA
AGATCGAGACTCAACACTCGCAACAAACGCTTCTCTGTTTCCATGGAGTGGCAAGACTGC
ACAGTGAAGATGGAAGTAGATATACCAGTGTCAGTAGCGTATAACTTCTACTTGGATCGT
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GATCTATCACGTTGGTCACTCAAGTACAATGCTTTTGGCCAAGACATTAAGTATTCTTGG
CTTGCTCGCAATCTTCAGCCTACTCCTAATCAGAAAATCCACTGGAGATCTCTTGAAGGT
CCTCCTAATAAAGGCAGCGTTCGGTTCTTCCCTAAAGGTCCTTCATCTTGCCTCGTTGAG
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TTTTTAGAAAGCTTGCTTAGAGGTGGACTTGAAAGATTTGCAACCTTGGCTAAAACCACT
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GAATATATCTTTGGTATATAAATGGTCTGGAACTCGATTTGTCCCCCATGATTAAG


BQ
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AF RS1BH58TF U 1
AF RS1BH58JQ C 180
BS 1 731 RS1BH58TF
BS 732 836 RS1BH58JQ

RD RS1BH58TF 731 0 0
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TTTTTAGAAAGCTTGCTTAGAGGTGGACTTGAAAGATTTGCAACCTTGGCTAAAACCACT
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QA 1 731 1 731
DS 

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AG
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CAGTGAAGATGGAAGTAGATATACCAGTGTCAGTAGCGTATAACTTCTACTTGGATCGTG
AATCTTTCCCTAAGTGGATGCCTTTCATTTCATCCGTTGAGGTGTTAAAGGACAAACCTG
ATCTATCACGTTGGTCACTCAAGTACAATGCTTTTGGCCAAGACATTAAGTATTCTTGGC
TTGCTCGCAATCTTCAGCCTACTCCTAATCAGAAAATCCACTGGAGATCTCTTGAAGGTC
CTCCTAATAAAGGCAGCGTTCGGTTCTTCCCTAAAGGTCCTTCATCTTGCCTCGTTGAGC
TAACTGTATCATATGAAGTCCCTGCGCTTTTGACCCCTGTGGCATCGGCGCTCCGGCCCT
TTTTAGAAAGCTTGCTTAGAGGTGGACTTGAAAGATTTGCAACCTTGGCTAAAACCACTT
GAAAGAAAGAAAAAAAAGGAATCTGTGTGTAATGCATCTCTGTGATTCTGGACTTTTAAG
AATATATCTTTGGTATATAAATGGTCTGGAACTCGATTTGTCCCCCATGATTAAG

QA 3 657 3 657
DS 



AS 1 2

CO CL8337Contig1 908 2 2 U
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CTCGTCAGACCATTTACGCTTGGAATGCTGCTCCGGCTAGCTGGAGCGCTGGCAAGACCT
ACAACTCTTACACTAATTTCAGCTGATTGTTAAAATCTTTAATGTGAACTACGGTTTTAC
CCCTCATTTTTGAGGTGCCGGTCTAACATTTTAGACTGCCCTAATCCAACTTTAAATTAT
GTTTTTCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G818TF U 1
AF RS1G818JQ C 127
BS 1 681 RS1G818TF
BS 682 908 RS1G818JQ

RD RS1G818TF 681 0 0
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TGGTTATTTTGTCGGTAATGGGGATGATCGGAACATCATCTGCGGCATATGCTGGGAGTC
CGTGGCGTCGTGCATCAGCCACCTTCTACGGGGACGAAACCGCCGGCGAATCCATGGGTG
GGGCTTGTGGCTATGGCAACCTATGGGACAGCGGCTATGGTGCGGCCACGTCGGCAATAA
GTACAGTGCTGTTCAACGACGGTTACTCATGCGGTCAGTGTTTCCAAATAAGATGTGTGT
CGTCGCCTAACTGCTACTACGGTTCACCAGCCACCGTGGTTACTGCGACCAACATATGTC
CACCGAATTGGGGTCAAAACTCCAACAACGGTGGATGGTGTAATCCGCCACGTGCCCATT
TTGATCTGACTAAACCAGCTTTCATGAAAATCGCAGATTGGAAGGCTGGTATCATCCCTG
TCTCATACCGAAGAGTGGCATGCAGAAGGAGTGGAGGAATAAAGTTCAAATTTGAAGGAA
ATGGATATTGGCTTTTAGTGTACGTGATGAACGTAGGTGGTGCGGGTGACATTAGGAACA
TGGCCGTTAAAGGTAGCCGTACGAACTGGATCGACATGAGCCACAACTGGGGAGCTTCTT
ACCAAGCTTTCTCTTCTCTCT

QA 1 681 1 681
DS 

RD RS1G818JQ 782 0 0
GTCGTGCATCAGCCAC*TTCTACGGGGACGAAACCGCCGGCGAATCCATGGGTGGGGCTT
GTGGCTATGGCAACCTATGGGACAGCGGCTATGGTGCGGCCACGTCGGCAATAAGTACAG
TGCTGTTCAACGACGGTTACTCATGCGGTCAGTGTTTCCAAATAAGATGTGTGTCGTCGC
CTAACTGCTACTACGGTTCACCAGCCACCGTGGTTACTGCGACCAACATATGTCCACCGA
ATTGGGGTCAAAACTCCAACAACGGTGGATGGTGTAATCCGCCACGTGCCCATTTTGATC
TGACTAAACCAGCTTTCATGAAAATCGCAGATTGGAAGGCTGGTATCATCCCTGTCTCAT
ACCGAAGAGTGGCATGCAGAAGGAGTGGAGGAATAAAGTTCAAATTTGAAGGAAATGGAT
ATTGGCTTTTAGTGTACGTGATGAACGTAGGTGGTGCGGGTGACATTAGGAACATGGCCG
TTAAAGGTAGCCGTACGAACTGGATCGACATGAGCCACAACTGGGGAGCTTCTTACCAAG
CTTTCTCTTCTCTCTATGGCCAATCTCTCTCGTTCCGACTAACCTCCTACACCACTCGTC
AGACCATTTACGCTTGGAATGCTGCTCCGGCTAGCTGGAGCGCTGGCAAGACCTACAACT
CTTACACTAATTTCAGCTGATTGTTAAAATCTTTAATGTGAACTACGGTTTTACCCCTCA
TTTTTGAGGTGCCGGTCTAACATTTTAGACTGCCCTAATCCAACTTTAAATTATGTTTTT
CG

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

CO CL8338Contig1 1129 2 2 U
GAAGTATGTCATCACCAAGGCATTGACTAAGTCACCAGAAGCTTATCCAGATTCCAAAAG
CCAACCACACGTTCAAGTCGCACTCAGAATGAGGCAACATGGTTATAAAGAAGGTTTCAA
TGCTAAGGACACTGTACCATATATAATCTGCTATGAACAGGGTAATACTAGCTCTGCCAG
CTCAGCAGGGATTGCCGAACGTGCTAGGCATCCTGATGAAGTGAAATCAAAAGACAGCAA
ATAGTTGGTTGACATAGATTACTACTTGGCACAGCAGATTCATCCTGTGGTGTCTCGTTT
ATGCGCAGAGATTCAGGGCACAAGTCCTGAGAGGTTAGCCGAGTGTTTAGGACTTGACCC
ATCAAAGTACCGAAGCAGATCAAACGATGCTACTGGTAGTGATCCTTCTACAGCACTCTT
GTTTGCTACAAGCGATGAAGAAAGATACAAAAGCTGCGAGCCTTTAGCATTAGCATGCCC
CAGCTGCTCCGCTGCTTTCAACTGTCCATCTATTATTAGCTCAGTTTGTGCGTCGATCAG
TAAGAAATCTGAAACAGAGGAATCTGATTCTACATTCTGGCTTAAGCTGCAATGCCCGAA
ATGTGAGCCAGGTGGTAGCACGGGAAGAATATCCCCTGCAATGATAGCTAACCAGGTGAA
AAGGCAGATCGATGGGTTTGTGTCTATGTACTACAAAGGCATAATGATGTGTGACGATGA
GTCTTGCAAGCACACGACTCGCACCCCCAACTTCCGTCTGCTTGGTGACCGTGAACGAGG
AACAGTTTGTCCAAACTATCCTAATTGTAATGGAACCCTCTTAAGAAAGTACACTGAAGC
AGACTTGTACAAGCAGCTGTCATACTTCTGCCACATATTAGACACACAATGCACTCTAGA
AAAGATGGATGTTGGTGTCAGAATTCAAGTAGAGAAAGCAATGACGAAGATAAGACCTGC
GGTCCAGTCAGCAGCATCCATGGCTCGAAGTATCCGAGACCGGTGTGCATACGGATGGCT
GCAACTCACAGACATAGCCATTTGATAGTTGTAATAACCATCTCATGTAGTTAAATTTAT
ATCAATCTTTTTTGTGACATCATTATAATCAAGCTACTCAGTTTTGTTC


BQ
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AF RS1BT37TF U 1
AF RS1BT37JQ C 409
BS 1 631 RS1BT37TF
BS 632 1129 RS1BT37JQ

RD RS1BT37TF 631 0 0
GAAGTATGTCATCACCAAGGCATTGACTAAGTCACCAGAAGCTTATCCAGATTCCAAAAG
CCAACCACACGTTCAAGTCGCACTCAGAATGAGGCAACATGGTTATAAAGAAGGTTTCAA
TGCTAAGGACACTGTACCATATATAATCTGCTATGAACAGGGTAATACTAGCTCTGCCAG
CTCAGCAGGGATTGCCGAACGTGCTAGGCATCCTGATGAAGTGAAATCAAAAGACAGCAA
ATAGTTGGTTGACATAGATTACTACTTGGCACAGCAGATTCATCCTGTGGTGTCTCGTTT
ATGCGCAGAGATTCAGGGCACAAGTCCTGAGAGGTTAGCCGAGTGTTTAGGACTTGACCC
ATCAAAGTACCGAAGCAGATCAAACGATGCTACTGGTAGTGATCCTTCTACAGCACTCTT
GTTTGCTACAAGCGATGAAGAAAGATACAAAAGCTGCGAGCCTTTAGCATTAGCATGCCC
CAGCTGCTCCGCTGCTTTCAACTGTCCATCTATTATTAGCTCAGTTTGTGCGTCGATCAG
TAAGAAATCTGAAACAGAGGAATCTGATTCTACATTCTGGCTTAAGCTGCAATGCCCGAA
ATGTGAGCCAGGTGGTAGCACGGGAAGAATA

QA 1 631 1 631
DS 

RD RS1BT37JQ 721 0 0
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ATTAGCATGCCCCAGCTGCTCCGCTGCTTTCAACTGTCCATCTATTATTAGCTCAGTTTG
TGCGTCGATCAGTAAGAAATCTGAAACAGAGGAATCTGATTCTACATTCTGGCTTAAGCT
GCAATGCCCGAAATGTGAGCCAGGTGGTAGCACGGGAAGAATATCCCCTGCAATGATAGC
TAACCAGGTGAAAAGGCAGATCGATGGGTTTGTGTCTATGTACTACAAAGGCATAATGAT
GTGTGACGATGAGTCTTGCAAGCACACGACTCGCACCCCCAACTTCCGTCTGCTTGGTGA
CCGTGAACGAGGAACAGTTTGTCCAAACTATCCTAATTGTAATGGAACCCTCTTAAGAAA
GTACACTGAAGCAGACTTGTACAAGCAGCTGTCATACTTCTGCCACATATTAGACACACA
ATGCACTCTAGAAAAGATGGATGTTGGTGTCAGAATTCAAGTAGAGAAAGCAATGACGAA
GATAAGACCTGCGGTCCAGTCAGCAGCATCCATGGCTCGAAGTATCCGAGACCGGTGTGC
ATACGGATGGCTGCAACTCACAGACATAGCCATTTGATAGTTGTAATAACCATCTCATGT
AGTTAAATTTATATCAATCTTTTTTGTGACATCATTATAATCAAGCTACTCAGTTTTGTT
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL8339Contig1 1362 2 2 U
GGATCTTTCTTATATTATTATCTTTCGTTGATCTGTCTGTACAAGATCATACTTTCCCTT
TAGTCCTCTGTTGAGAATCATCCAATTGAATCTTACGAAAATTTTAAGAAGATGAGGTCT
CTTCAATCACCGATTGTTTGCCCTAGTGTTCGTCCCAGACAAGTGAGTGTGTCTGCTTCG
CTCGTCAACTCCACTGTTTCGAGACCTAGGCTTCTCAGGAACCGGTTTTGGGGTCATCAG
ACCAAAAACGTCAAGTCCCAGGTTGCTACAGTGATAGTACGGAGTTGTAAGGGTATACAG
TGTCTTTTCAGCTCTCATTCAGATGGTAACGGAAGCACAGCAGAGAATTTCAACGAGAAC
GATGAAGATTATGTCAAGTCTAGTGTACTTGAATCTGCTGAGGTAAGAAGTGGACCAGAT
GGTTTTGTGGTGAAGATGAGAGACGGTAGGCAACTTCGTTGTGTTCACAATAATCCTCAG
GGTGGGAATCTTCCGAGTTATGCTCCACACTCTGCTATTGTGCTGAAGATGGAAGATGGA
ACTGGTCTTCTTCTTCCTATTATCGTCTTGGAGATGTCAAGTGTATTACTGATGGCAGCA
TTGACTAATGTGAAAATAGCAAGGCCAACTATGTATGAAGTGGTGATGGAGATGGTAGAA
AAAATGGGATACGAGGTTAGGCTTGTTCGAGTTACCACAAGAGTTCACGAGGCGTATTAC
GCACAGTTATTTCTTTCAAAGGTGGGTGATAAGTCGGACTGTGTCAGCTTCGATCTTCGT
CCTTCTGATGCTATTAATATAGCTGTCAGGTGCAAGGTACCCATCCAAGTGAACAAGTTT
CTAGCTTATAGCGATGGAATGAGAGTCATCGAGTCTGGAAAGCTGTCAAAGCAAACACCT
GCTTCAGATGGTTTATTACATACTGAACTAGACCGGCCAAATGGTCAGCCTTGTCTTGAT
ACAAAAGAGTTTGATTTCCTGAACAACATGATGCAAGCCGTTAATGAAGAACGGTATGAT
GAAGCAGCTGAGTGGAGAGACAAGCTTGGCCAGTTTCAAGCGAAACGCAAGCTAAGGAAA
TACACATGATCGACAGAGCAGTTCCGAGACAAATGTATTTATAAAAGTAGTAGTATTATT
GTAAATAATAAAGAAGCCATTGCTTAGAAGCTGCGATCAAAGTGATGGACATGGACGCTT
CCAACCTTGCAAAAGAAATAATATATCTCGTGTGATGGAGAATACTCGTCTATCATACAC
ATGTGCACGTTGTTAGTAAGTTCCTCGAAGATAAAAGACATAAAATCTTGTATGTAGTGT
TATCGTGTGAAACCTAATCAGTGATGTGTACATACATAATCA


BQ
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AF RS1AB26TF U 1
AF RS1AB26JQ C 570
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BS 791 1362 RS1AB26JQ

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TAGTCCTCTGTTGAGAATCATCCAATTGAATCTTACGAAAATTTTAAGAAGATGAGGTCT
CTTCAATCACCGATTGTTTGCCCTAGTGTTCGTCCCAGACAAGTGAGTGTGTCTGCTTCG
CTCGTCAACTCCACTGTTTCGAGACCTAGGCTTCTCAGGAACCGGTTTTGGGGTCATCAG
ACCAAAAACGTCAAGTCCCAGGTTGCTACAGTGATAGTACGGAGTTGTAAGGGTATACAG
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GGTTTTGTGGTGAAGATGAGAGACGGTAGGCAACTTCGTTGTGTTCACAATAATCCTCAG
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TTGACTAATGTGAAAATAGCAAGGCCAACTATGTATGAAGTGGTGATGGAGATGGTAGAA
AAAATGGGATACGAGGTTAGGCTTGTTCGAGTTACCACAAGAGTTCACGAGGCGTATTAC
GCACAGTTATTTCTTTCAAAGGTGGGTGATAAGTCGGACTGTGTCAGCTTCGATCTTCGT
CCTTCTGATG

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DS 

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TATGTATGAAGTGGTGATGGAGATGGTAGAAAAAATGGGATACGAGGTTAGGCTTGTTCG
AGTTACCACAAGAGTTCACGAGGCGTATTACGCACAGTTATTTCTTTCAAAGGTGGGTGA
TAAGTCGGACTGTGTCAGCTTCGATCTTCGTCCTTCTGATGCTATTAATATAGCTGTCAG
GTGCAAGGTACCCATCCAAGTGAACAAGTTTCTAGCTTATAGCGATGGAATGAGAGTCAT
CGAGTCTGGAAAGCTGTCAAAGCAAACACCTGCTTCAGATGGTTTATTACATACTGAACT
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GATGCAAGCCGTTAATGAAGAACGGTATGATGAAGCAGCTGAGTGGAGAGACAAGCTTGG
CCAGTTTCAAGCGAAACGCAAGCTAAGGAAATACACATGATCGACAGAGCAGTTCCGAGA
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GTGTGATGGAGAATACTCGTCTATCATACACATGTGCACGTTGTTAGTAAGTTCCTCGAA
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ACATACATAATCA

QA 1 793 1 793
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TGCATTTATTTCTTGGCTAGCAGTGAGCCC


BQ
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AF RS1FH24JQ U 6
AF RS1FH24TF C 1
BS 1 5 RS1FH24TF
BS 6 556 RS1FH24JQ
BS 557 630 RS1FH24TF

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TATTTTAACCAACTAGACCGAACATTCTTATCTAAATATGGTCTTTCACTTACCAATTCT
TTTCTGGCAGCCTAAAAGCTAAAGGATGAAGTATATAGAAGAAGGAGATGGTGTTTGTCT
TTCATTGTTGCTTGTATGTTGCAAATGATGTTCCTGTTGGGAAGTATGAATAGAAAGGAA
ACTATACTAGAAAAAAGAGAATTAGATGGCGACCTACCGGTCGATGAACCAAAAGGGATG
CTCATCCACGAGTTAATCAATGCAAGACGTCGATGGAGGACACGATTCTATGGAGGTCTG
GGTCAGATGCGTAAAACTCCTGGTCTTCATTTTCTAAAACATAGGAGCAGATCCGATTGC
ATAAAGAAAAA

QA 1 551 1 551
DS 

RD RS1FH24TF 630 0 0
TTTTTGTCACTTGTAAATCAAATATACTCAGTCACTTGTATAGTTTATACATTTCAAAGA
GAGCCTAAAGTTTAAAAATAAACTTTAAAAGGCTTGTATTACTTTTTTTTCTAAGAAGAA
ACCAAAGCCAACCATACAGTCTCATCTCAGTATAGTGGTTAGAAAATAGAAAGTAAGATC
ATAAATATTTTAACCAACTAGACCGAACATTCTTATCTAAATATGGTCTTTCACTTACCA
ATTCTTTTCTGGCAGCCTAAAAGCTAAAGGATGAAGTATATAGAAGAAGGAGATGGTGTT
TGTCTTTCATTGTTGCTTGTATGTTGCAAATGATGTTCCTGTTGGGAAGTATGAATAGAA
AGGAAACTATACTAGAAAAAAGAGAATTAGATGGCGACCTACCGGTCGATGAACCAAAAG
GGATGCTCATCCACGAGTTAATCAATGCAAGACGTCGATGGAGGACACGATTCTATGGAG
GTCTGGGTCAGATGCGTAAAACTCCTGGTCTTCATTTTCTAAAACATAGGAGCAGATCCG
ATTGCATAAAGAAAAACACAGAGGGAGCAAGGTGGTTTTTGTTCAGGGGGTGCCTAGATT
TGCATTTATTTCTTGGCTAGCAGTGAGCCC

QA 1 630 1 630
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8343Contig1 820 2 2 U
GGACCGCTCCTTCCCATCCCAGATCTCTGATTCCTCTGCTCTCATTTCTCTTCGATTCGT
TGCCACCGCCAGCTGCCAAACCCTAGATTCAAAGACGGTTAAATTCGAGAGGTAGAGAGA
AGATGGCTACAACGACGACAACGAGTGGTGTGTATATCCACGTCATCGAGGACGTCGTCA
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TTCAAGGAATTTGGGAGACGAAGATGATGCAAGCTGGAGTCTTGTCTGGACCAATTGACA
GGTCATCGGGTCAGAGGTCAACACCTGGAGGTCCACTGACTCATGATCTGAATGCTCCTT
ATGAAGGTACTGAGGAGTACGAGACTCCCACTGCTGAAATGCTCTTCCCTCCGACACCGT
TGCAGACCCCACTTCCAACGCCGCTTCCGGGGACTGCTGATAACTCATCCATGTATAACA
TCCCCACTGGCTCCAGTGATTATCCAACTCCTGGATCTGAGAATGGAATCCATGCTGATG
TCAAAGCAAGACCCAGTCCTTATATGCAACCTCCATCTCCATGGACAAATCCAAGGCCTG
ATGTCAATGTTGCTTATGTGGATGGCCGTGATGAGCCTGAGAGAGGGGACTCTAGTCAGC
AGTTCACGCAGACCTATATTTACCACCTTCCGGCAAACGAAAGCGTGATGATTCTTCTTC
TACACATATCAAAATGGTCGGTCTATACCACAACAGATGGTGCAAGCGATGATATGCCTC
AGTAACCTTGAGGTGATCATTCTGCATAACCTTTGTTAGT


BQ
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AF RS1EG36TF U 1
AF RS1GD55TF U 1
BS 1 551 RS1EG36TF
BS 552 820 RS1GD55TF

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QA 1 551 1 551
DS 

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AGATGGCTACAACGACGACAACGAGTGGTGTGTATATCCACGTCATCGAGGACGTCGTCA
GCAAAGTCCGCGAGGAGTTCGTTAACAACGGAGGTCCTGGCGAGAGTGTTCTCTCCGAGC
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ATGAAGGTACTGAGGAGTACGAGACTCCCACTGCTGAAATGCTCTTCCCTCCGACACCGT
TGCAGACCCCACTTCCAACGCCGCTTCCGGGGACTGCTGATAACTCATCCATGTATAACA
TCCCCACTGGCTCCAGTGATTATCCAACTCCTGGATCTGAGAATGGAATCCATGCTGATG
TCAAAGCAAGACCCAGTCCTTATATGCAACCTCCATCTCCATGGACAAATCCAAGGCCTG
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TACACATATCAAAATGGTCGGTCTATACCACAACAGATGGTGCAAGCGATGATATGCCTC
AGTAACCTTGAGGTGATCATTCTGCATAACCTTTGTTAGT

QA 1 820 1 820
DS 



AS 1 2

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GATACCCTCAGCAGGGGTATCCTCAGCAAGGCTATCCTCCTCCTTACGCCCCGCAGTATC
CTCCTCCCCCGCAGCATCAGCAGCAACAGAGCGGACCTGGTGTTCTAGAAGGATGTCTGG
CTGCTCTCTGCTGTTGCTGTCTCTTGGATACTTGTTTCTGATGATTGGAGTACCTGCTTT
TGGAGCCGGTGATTTGATTGCAACAGAGTGTTTGGCAACTTTAATTAAGTAATGGGCATT
GTAATGGAATTGCTGGATACATTCTCTTGTCTATTCCTCTTTTTCCGGTTTATGTTCTTG
AATTCATAAACAACTTATTCAATGGCTTGGTTTGGATTTGAGACGTTAAAATGGGAATGT
AAATTTGCGTGG


BQ
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AF RS1A784JQ C 1
AF RS1A784TF U 1
BS 1 552 RS1A784TF

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CTGCTCTCTGCTGTTGCTGTCTCTTGGATACTTGTTTCTGATGATTGGAGTACCTGCTTT
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GTAATGGAATTGCTGGATACATTCTCTTGTCTATTCCTCTTTTTCCGGTTTATGTTCTTG
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AAATTTGCGTGG

QA 1 552 1 552
DS 

RD RS1A784TF 552 0 0
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TGAGTCAGTACAATCAACCTCCCGTCGGCGTTCCTCCTCCTCAAGGCTATCCACCGGAGG
GATACCCGAAGGATGCGTATCCACCGCAGGGGTATCCTCCTCAGGGGTATCCGCCTCAGG
GATACCCTCAGCAGGGGTATCCTCAGCAAGGCTATCCTCCTCCTTACGCCCCGCAGTATC
CTCCTCCCCCGCAGCATCAGCAGCAACAGAGCGGACCTGGTGTTCTAGAAGGATGTCTGG
CTGCTCTCTGCTGTTGCTGTCTCTTGGATACTTGTTTCTGATGATTGGAGTACCTGCTTT
TGGAGCCGGTGATTTGATTGCAACAGAGTGTTTGGCAACTTTAATTAAGTAATGGGCATT
GTAATGGAATTGCTGGATACATTCTCTTGTCTATTCCTCTTTTTCCGGTTTATGTTCTTG
AATTCATAAACAACTTATTCAATGGCTTGGTTTGGATTTGAGACGTTAAAATGGGAATGT
AAATTTGCGTGG

QA 1 552 1 552
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8346Contig1 1010 2 2 U
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GGAATCAACGGCATCTGTTTCTACACAAGCTCTATATTTGAGCAAGCAGGTTTCCCACCA
AGACTTGGGATGATAATATATGCTGTTCTTCAGGTTGTAATCACTGCGCTTAATGCACCT
ATAGTTGACAAAGCCGGAAGAAAGCCATTGCTACTGGTTTCTGCAACAGGGTTAGTGATA
GGCTGTTTGATCACAGCGGTCTCCTTCTATCTCAAGGTTCACGACATGGCACAGAAAGCA
GTCCCTGTCCTGGCTGTTGTTGGTATAATGGTGTACATAGCATCGTTCTCAGCTGGAATG
GGAGCAATGCCGTGGGTTGTCATGTCTGAGATATTTCCTATAAATATTAAAGGAGTAGCA
GGAGGCATGGCTACGCTGGTGAACTGGTTTGGAGCATGGGCCGTTTCTTACACTTTCAAC
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GCCATTGTCTTTGTCATTGCCGTGGTGCCTGAAACCAAAGGGAAGACATTGGAGCAGATA
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ATCAATTTTGAATGCTTTTAAGACTCTTATCTTAATGAACACTTCTGACC


BQ
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CTGACC

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BQ
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TATTTTAGGGGTTTCACAGCTTCTTTCTGATTATTCTTCTCACAATCATGCATTTATACC
CGGCTACAGTTAATAATCTATCAGACCAAACCAGACTAAAATAAAAAATGCTTAGACTAA
ACATTTTGTAAATG

QA 1 554 1 554
DS 



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TCAACCACCTCAATCTCAAGATTGGCAGGTTATCTACTGGTGACTCCTTGGATATGTCCA
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ATCTCATCGACGGTGATAAACCGACGGCAGAAGAATTCTTGAAGAACTTGGCACTTGTGA
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BI93TF U 1
AF RS1BI93JQ C 165
BS 1 672 RS1BI93TF
BS 673 673 RS1BI93JQ
BS 674 686 RS1BI93TF
BS 687 687 RS1BI93JQ
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BS 706 706 RS1BI93JQ
BS 707 728 RS1BI93TF
BS 729 915 RS1BI93JQ

RD RS1BI93TF 728 0 0
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CCGAAACTACTTGTGATAATTCTCCGCTTGGTGGTAGTAAAGGATTGCCGTGGGTTGTGT
ATCAAGGTTTTCATAGACATCTTCGTATCTATGTTGTCTGCCCCGGCAAGGATCCTTCTT
TAGGGATTGATTGTGTTGGAACTGTTCCTTCTTCTCTCGTTACCTTTGCTTCTATCCAAG
CCTTACACCCTGACATTCTTATCAATGCCGGTACCTGCGGTGCCTTTAAGGTTAAAGGAG
CCAACATAGGCGATGTATTTCTTGCATCTGATGCTGTCTTCCATGATCGTAGAATACCTA
TCCCTATGTTTGATCTATATGGAGTTGGTCTTCGTCAGGCATTCTCAACCCCCAATCTCC
TCAACCACCTCAATCTCAAGATTGGCAGGTTATCTACTGGTGACTCCTTGGATATGTCCA
CCCAAGATGAATCACTCATCATTGCCAATGATGCAACGCTTAAGGACATGGAGGGTGCTG
CTGTGGCTTACGTTGCTGAGCTTCTGAAAGTACCAGTAATTTTCTTAAAAGCAGTGACCG
ATCTCATCGACG*TGATAAACCGACG*CAGAAGAATTCTTGAAGA*CTTGGCACTTGTGA
CCTCTGCG

QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1BI93JQ 751 0 0
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TTTAAGGTTAAAGGAGCCAACATAGGCGATGTATTTCTTGCATCTGATGCTGTCTTCCAT
GATCGTAGAATACCTATCCCTATGTTTGATCTATATGGAGTTGGTCTTCGTCAGGCATTC
TCAACCCCCAATCTCCTCAACCACCTCAATCTCAAGATTGGCAGGTTATCTACTGGTGAC
TCCTTGGATATGTCCACCCAAGATGAATCACTCATCATTGCCAATGATGCAACGCTTAAG
GACATGGAGGGTGCTGCTGTGGCTTACGTTGCTGAGCTTCTGAAAGTACCAGTAATTTTC
TTAAAAGCAGTGACCGATCTCATCGACGGTGATAAACCGACGGCAGAAGAATTCTTGAAG
AACTTGGCACTTGTGACCTCTGCGCTAGAGGAAACTGCCACTAATGTCATCAACTTCATC
AATGGCAAAACCCTCTCAGACCTTTAACTATCATATCTACTTGTGTTTCTCTTAACCAAC
CTTAAGTTGCGTTCCAACATCGTTTGCAGTATAAACTCATTTCTGGTGATTACATTACTC
CACAATAGTGGCTTCAGTTTTTGAGACGTTT

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

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AGTTTATGTTT


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DF27JQ C 1
AF RS1DF27TF U 1
BS 1 551 RS1DF27TF

RD RS1DF27JQ 551 0 0
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AGTTTATGTTT

QA 1 551 1 551
DS 

RD RS1DF27TF 551 0 0
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GAACAGGCTCTCTTCTTCGTCCGTCACCGCTGTTGCCGCCGGTAAGGATGGTGACAAGGC
GAAACAAGCCGAGGAGTCTCTCAGGACGGTCATGTACCTGAGCTGTTGGGGTCCTAATTA
ATTAAGACAAATGGATAGAGATTTTTTCTGCCGCCGATTGGATCCGACAGGTTGTATCAA
TGTCGGGGAGCTGTGAAAATCGGATTGTACAGAACGCAATGAGTTTTTGGGGTTTTAACG
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AGTTTATGTTT

QA 1 551 1 551
DS 



AS 1 2

CO CL8350Contig1 719 2 2 U
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CTGTGCCACGTGTCCCCCTACCCTCCTCAGCATTTTTCATCCACAGCACGAGCTCCGATT
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ATCCTGCCATTTAATTTATGTCCCTTATTTCTCTATCTTTTCTGTTCGCTTTCTTTTTTT
CGTTTTATGCAATGTAATTTTTTTTTGTCAACTGTGTTTTATACAAATATAATTTTGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GN62TF U 1
AF RS1GN62JQ C 96
BS 1 657 RS1GN62TF
BS 658 719 RS1GN62JQ

RD RS1GN62TF 657 0 0
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ATCCTGCCATTTAATTTATGTCCCTTATTTCTCTATCTTTTCTGTTCGCTTTCTTTT

QA 1 657 1 657
DS 

RD RS1GN62JQ 624 0 0
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AAACAACCAACGGACTGTTTTACCAATGCAAGCTTTGCGACTTCGACGTCCATCCACTTT
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CCCGCGAGGCTGAACAAGTACCCGATCCGGATAGAACGAGAAAAAGGGATGTAATGTATA
TTGGCGCTCGAGTTGCCTTGGCTTGTATGATGGGGGATGTCTCTGGGGTCATTTTTGCAT
TGTTTTGAAATGGCATGTTACTAACATCCTGCCATTTAATTTATGTCCCTTATTTCTCTA
TCTTTTCTGTTCGCTTTCTTTTTTTCGTTTTATGCAATGTAATTTTTTTTTGTCAACTGT
GTTTTATACAAATATAATTTTGTT

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

CO CL8351Contig1 737 2 6 U
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TTCTTGCCAATAAAACATTCTTGGTTTAGGAAATAAATCTCCTGATAATAAGAAGAAAAA
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CACCATCCCTGCCCTAGTATTCTCAGACGATGAGACTATCTATGAGATCCTCCAGGAGAA
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GGGACGGTTCTCGATTTATTTGAACCAGTCTTGTGATGCTAAATACGAGACAGAGCTGCA
TTACGACGTGAATATTACAGGGAAGATAAGTTATGGTGAGATTAAGGACTTGTCTGGAAT
CTTGGCGCAAGATCTGTTCCTTTGGTTTCCGGTTAAAGGGATACGAGTCGACGTGCCGAG
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TGAGACGCCGAGGGATTGTGTAGCTGTTCATGGTGAAAACAAGGTTATATCTTCTGTGTT
GCCATTGTATCAAGTAAATCAAACTCTCGGGAAAGATGTTGTTTAGCCAGAGTTTGAAAG
GACTGATGTTATAATATGCAAGAAAGATAGACAGATGCTCTCATCAATTTTTAAAGATTT
TTAACCTTTTTGGTCTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CH43TF U 1
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CACCATCCCTGCCCTAGTATTCTCAGACGATGAGACTATCTATGAGATCCTCCAGGAGAA
CGGGTTACCGTTGGGGATATTTCCAAAAGGCGTTAAAGATTTCAGCTTCAACGGCGAAAC
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DS 

RD RS1CH43JQ 227 0 0
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QA 1 227 1 227
DS 



AS 1 2

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TTGGATGATTATCCGCGGGCTTCTCACCCAACTGAAGATGAGAGGCATGTAGACCTCAGG
TGCTGGATGTATCTTGCAGCAGATTGCATGAACTCCATCATAGAGTTTCTTGGGAAAATA
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CTGAATCAGATGCACTATGACCATGATCTTGGGGCTTACCTCGACTTTGGTAATCATACA
GAAGATGTTCGGTTAGTCTGGAAAGAGGTAACTGGAGAGGATGGTCGTGTGTCCCGAGAG
CTGGTAAGGGAGACATTTGGGAAGCCAGAGCTAAGATTGGTACCTCACAATGGTTACGTC
AGCTTCTTTCCCTTCATGTTTAGAATCATCCCACCAGCTTCTTCAATCCTCGAGAAACAG
CTTGATCTCATTTCAAGCAGGAGCACTGTATGGAGTGACTATGGATTACTTTCACTTGGC
AAAACTAGTTCTTTGTACATGAAGTATAACACTGAGCACGAAGCGCCCTATTGGAGAGGT
CCGATATGGATGAACATGAACTACATGATTCTTTCTTCCCTGCACCATTACTCTATAGTG
GATGGACCGTACATGGCCAAGGCAAGAAGCATTTACGAGCAACTAAGGAGTAACCTAATA
AGGAACGTGGTTAGAAACTATGATCAGACTGGATATATCTGGGAACACTACGACCAAACA
AAAGGAACCGGAGAAGGTGTACGCGTTTTCACTGGCTGGTCTGCTCTTATCCTCTTAATC
ATGTCCGAAGATTACCCTCTATTTTAGTAATCGAATTTGATTACTAACCTTTGCAAACTT
TGAACTTCAAATCTTACCATGCGTGTTTGTGAACAAAATAATGAAGTTTCTTCCAAAGAT
TTTAATAAACCTTGATCATCAGCGCGGAGGTGTTTTTCTCTTTTATGTTTGAACATGTGT
TCCTTATTCATACTGTGTCTGAGTGTTACAGTAATTAAATTAATATATTTTCCTCGACC


BQ
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AF RS1EE68TF U 1
AF RS1EE68JQ C 309
BS 1 705 RS1EE68TF
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BS 813 1139 RS1EE68JQ

RD RS1EE68TF 812 0 0
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TGCTGGATGTATCTTGCAGCAGATTGCATGAACTCCATCATAGAGTTTCTTGGGAAAATA
GACAGACCTGCGTCGGTGGACTATCGCTCAACTGTCAAGCTGCTCGCAGATTTCAATCTC
CTGAATCAGATGCACTATGACCATGATCTTGGGGCTTACCTCGACTTTGGTAATCATACA
GAAGATGTTCGGTTAGTCTGGAAAGAGGTAACTGGAGAGGATGGTCGTGTGTCCCGAGAG
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AAAACTAGTTCTTTGTACATGAAGTATAACACTGAGCACGAAGCGCCCTATTGGAGAGGT
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AGGA*CGTGGTTAGAAACTATGATCAGACTGG

QA 1 812 1 812
DS 

RD RS1EE68JQ 831 0 0
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TCGGTTAGTCTGGAAAGAGGTAACTGGAGAGGATGGTCGTGTGTCCCGAGAGCTGGTAAG
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TCCCTTCATGTTTAGAATCATCCCACCAGCTTCTTCAATCCTCGAGAAACAGCTTGATCT
CATTTCAAGCAGGAGCACTGTATGGAGTGACTATGGATTACTTTCACTTGGCAAAACTAG
TTCTTTGTACATGAAGTATAACACTGAGCACGAAGCGCCCTATTGGAGAGGTCCGATATG
GATGAACATGAACTACATGATTCTTTTTTCCCTGCACCATTACTCTATAGTGGATGGACC
GTACATGGCCAAGGCAAGAAGCATTTACGAGCAACTAAGGAGTAACCTAATAAGGAACGT
GGTTAGAAACTATGATCAGACTGGATATATCTGGGAACACTACGACCAAACAAAAGGAAC
CGGAGAAGGTGTACGCGTTTTCACTGGCTGGTCTGCTCTTATCCTCTTAATCATGTCCGA
AGATTACCCTCTATTTTAGTAATCGAATTTGATTACTAACCTTTGCAAACTTTGAACTTC
AAATCTTACCATGCGTGTTTGTGAACAAAATAATGAAGTTTCTTCCAAAGATTTTAATAA
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CATACTGTGTCTGAGTGTTACAGTAATTAAATTAATATATTTTCCTCGACC

QA 1 831 1 831
DS 



AS 1 2

CO CL8353Contig1 746 2 2 U
GGACAGCTTCATAATGCTCAGCCATCTCCTCAATCGCTCTCCCAATCCATCTCTTGTCTT
CTCCAGAACCTTCTCCTCTACTACACTTTTCGTCAAAGGCACCTCTTTCTCAAGCACAGA
AGAAACATTAACACAAGCTTTTTCTCAATATGGTCGTGTTCTTGGTGTGAATGTTGTGAT
GGACAAAGTCAGATGCAGACCAAAAGGGTTTGCTTATGTCAAATTCTCTTCCAAAGAAGA
AGCCGACGAAGCTTTATTACAACTTAACGGACAGTTGGTAGACGGGCGGGTGGTGGTCCT
CGACACAACAAAAACCGTAAAACAGAAAGACCAACCAGACTGCAAGCCTAAGCATGCAGT
GGAAGGAGTTCCCAGCTGCCAGAACAAGGTTATTCCAGAAAATTAGGCAAGAAGGTTTGA
TGTGGAGTTTGCTAGATCTACCGGTTCTTTCTACTAAAAAGATCTCATTTCTGGAAGACC
GCATGGGTATTTGAACAGAGTTGGCTGGTGATGGTTGCTGTATGCAAAAAGGTCTTACAA
TTTTCTACTCTCTCTATCTCCAACTCTTGTCTCTTTGTCCTTTAGATTTGTACCCCCCCT
CGTAGTACCTGTGATTCTCTTTACTTTCTTTTTGGCTGTTTTCTCTTTCGCCTTCCAGCG
ACGCCACGGTTTGGATTACCTTGTCTTGTAGGCAATTCTTTTGTGTTTTTGTCCTTTTCC
CTCGGAAACAAAGCTCTTTCTCAAGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G436TF U 1
AF RS1G436JQ C 139
BS 1 686 RS1G436TF
BS 687 746 RS1G436JQ

RD RS1G436TF 686 0 0
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CTCCAGAACCTTCTCCTCTACTACACTTTTCGTCAAAGGCACCTCTTTCTCAAGCACAGA
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GGACAAAGTCAGATGCAGACCAAAAGGGTTTGCTTATGTCAAATTCTCTTCCAAAGAAGA
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CGACACAACAAAAACCGTAAAACAGAAAGACCAACCAGACTGCAAGCCTAAGCATGCAGT
GGAAGGAGTTCCCAGCTGCCAGAACAAGGTTATTCCAGAAAATTAGGCAAGAAGGTTTGA
TGTGGAGTTTGCTAGATCTACCGGTTCTTTCTACTAAAAAGATCTCATTTCTGGAAGACC
GCATGGGTATTTGAACAGAGTTGGCTGGTGATGGTTGCTGTATGCAAAAAGGTCTTACAA
TTTTCTACTCTCTCTATCTCCAACTCTTGTCTCTTTGTCCTTTAGATTTGTACCCCCCCT
CGTAGTACCTGTGATTCTCTTTACTTTCTTTTTGGCTGTTTTCTCTTTCGCCTTCCAGCG
ACGCCACGGTTTGGATTACCTTGTCT

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1G436JQ 608 0 0
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ACCAAAAGGGTTTGCTTATGTCAAATTCTCTTCCAAAGAAGAAGCCGACGAAGCTTTATT
ACAACTTAACGGACAGTTGGTAGACGGGCGGGTGGTGGTCCTCGACACAACAAAAACCGT
AAAACAGAAAGACCAACCAGACTGCAAGCCTAAGCATGCAGTGGAAGGAGTTCCCAGCTG
CCAGAACAAGGTTATTCCAGAAAATTAGGCAAGAAGGTTTGATGTGGAGTTTGCTAGATC
TACCGGTTCTTTCTACTAAAAAGATCTCATTTCTGGAAGACCGCATGGGTATTTGAACAG
AGTTGGCTGGTGATGGTTGCTGTATGCAAAAAGGTCTTACAATTTTCTACTCTCTCTATC
TCCAACTCTTGTCTCTTTGTCCTTTAGATTTGTACCCCCCCTCGTAGTACCTGTGATTCT
CTTTACTTTCTTTTTGGCTGTTTTCTCTTTCGCCTTCCAGCGACGCCACGGTTTGGATTA
CCTTGTCTTGTAGGCAATTCTTTTGTGTTTTTGTCCTTTTCCCTCGGAAACAAAGCTCTT
TCTCAAGT

QA 1 608 1 608
DS 



AS 1 2

CO CL8354Contig1 907 2 2 U
GACTGGATTTTGTCTTCCCCATACTGATCTCCATTTCATGATGAACGGTCGAGACAGAAT
CCAAAACGAACGCACCAATTCTTCTCCAGTTCATAGCATCCCATTTCAGTACTGTACCGC
GCGTACCGCCCGTACGACCAGTTTGGAGCTTCACCAAAACCCACGACCAAACGACCGAAT
CTCCCGAACTGGATCTCGGCTTTCCCGTACTGTTTGTCATTTTAAGAAGATTGGTCGTGG
CAGAATTGGATTTGGTCGAGTGGATTTGAAGATAGACCACGACACTTCATTTCTGGCCAC
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CCTGGACAGAAAAATTTGAAGGGTTCAACTGCAGTCAATGTTAAATTTCGTGCCTTGACC
AGATCTGGTCAAGTTTGCATTTTCTATGTCTTGTTTTCATCATTTTTCTTTATTTCTTTT
GACTAGAAACACTATAAAATGTAACTCTTTGTCATTGCAACATCATCAACGAATTTTCTT
TATTTTTATGAGTTTTTACTCTTTGTTCTTTGTTTAGAACATTTCTAGTTTCTTGGTGAG
GTTATCTCCAAGTCTCGATCCTTCCTTTGTTGGACCGGTGCGTCACATCCGGCAACATTT
GAAGTCTGGTAGTATCATTGGGCCTTTCCGCATCCCATTGTGTCACCATTCATCCCACCA
GTTCTCTATCCTTCCGGACCAGAGTCCATATCAACCTTACCGAAAGAGTGATCCCGATTT
TGGTTCTATCAAGTGGTATCAGAGCCACTCTTCCGGTAATTCTTTTTCTATCCATCTTTC
TCATCTCTCCATTTCTTCTAAACACTTCTTATCTACCTATCTTGAACCCGGGCCCCTCAT
TACCCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AG92TF U 1
AF RS1AG92JQ C 264
BS 1 811 RS1AG92TF
BS 812 907 RS1AG92JQ

RD RS1AG92TF 811 0 0
GACTGGATTTTGTCTTCCCCATACTGATCTCCATTTCATGATGAACGGTCGAGACAGAAT
CCAAAACGAACGCACCAATTCTTCTCCAGTTCATAGCATCCCATTTCAGTACTGTACCGC
GCGTACCGCCCGTACGACCAGTTTGGAGCTTCACCAAAACCCACGACCAAACGACCGAAT
CTCCCGAACTGGATCTCGGCTTTCCCGTACTGTTTGTCATTTTAAGAAGATTGGTCGTGG
CAGAATTGGATTTGGTCGAGTGGATTTGAAGATAGACCACGACACTTCATTTCTGGCCAC
TTTGGACTGTCCTGCGTGTGTACTGGGCCAGTCCGCAGTTCACGCTTCAGGTTCATTGAA
CCTGGACAGAAAAATTTGAAGGGTTCAACTGCAGTCAATGTTAAATTTCGTGCCTTGACC
AGATCTGGTCAAGTTTGCATTTTCTATGTCTTGTTTTCATCATTTTTCTTTATTTCTTTT
GACTAGAAACACTATAAAATGTAACTCTTTGTCATTGCAACATCATCAACGAATTTTCTT
TATTTTTATGAGTTTTTACTCTTTGTTCTTTGTTTAGAACATTTCTAGTTTCTTGGTGAG
GTTATCTCCAAGTCTCGATCCTTCCTTTGTTGGACCGGTGCGTCACATCCGGCAACATTT
GAAGTCTGGTAGTATCATTGGGCCTTTCCGCATCCCATTGTGTCACCATTCATCCCACCA
GTTCTCTATCCTTCCGGACCAGAGTCCATATCAACCTTACCGAAAGAGTGATCCCGATTT
TGGTTCTATCAAGTGGTATCAGAGCCACTCT

QA 1 811 1 811
DS 

RD RS1AG92JQ 644 0 0
ATTTGAAGATAGACCACGACACTTCATTTCTGGCCACTTTGGACTGTCCTGCGTGTGTAC
TGGGCCAGTCCGCAGTTCACGCTTCAGGTTCATTGAACCTGGACAGAAAAATTTGAAGGG
TTCAACTGCAGTCAATGTTAAATTTCGTGCCTTGACCAGATCTGGTCAAGTTTGCATTTT
CTATGTCTTGTTTTCATCATTTTTCTTTATTTCTTTTGACTAGAAACACTATAAAATGTA
ACTCTTTGTCATTGCAACATCATCAACGAATTTTCTTTATTTTTATGAGTTTTTACTCTT
TGTTCTTTGTTTAGAACATTTCTAGTTTCTTGGTGAGGTTATCTCCAAGTCTCGATCCTT
CCTTTGTTGGACCGGTGCGTCACATCCGGCAACATTTGAAGTCTGGTAGTATCATTGGGC
CTTTCCGCATCCCATTGTGTCACCATTCATCCCACCAGTTCTCTATCCTTCCGGACCAGA
GTCCATATCAACCTTACCGAAAGAGTGATCCCGATTTTGGTTCTATCAAGTGGTATCAGA
GCCACTCTTCCGGTAATTCTTTTTCTATCCATCTTTCTCATCTCTCCATTTCTTCTAAAC
ACTTCTTATCTACCTATCTTGAACCCGGGCCCCTCATTACCCCC

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 2

CO CL8355Contig1 549 2 1 U
GGCCCCTGTTCTGTCTCTCAAACAGAGTTCAACCTTGCCATCACAGCTCTTCCATCTATT
ACGGTGGCCCTGATGTCTATATCCAGCCTCAGAATTCCGGCGTCAATTCTACGAAGAAGA
AAGAGGGAGGCGAAGATGATTCCGGAAGTGCTTCCAGAGGAAATTGGTGGCAAGGGTCTC
TGTATTACTAAGTAGAGTTGTTGCTACTTAAGCCAGTGTTATACTACAAAAGCAGCCAGG
GTATATAGGATGGAAGGGAAAAAAGTAGAGTAGCAGTGGATCCGTTGGTATTAGTAAAAC
TTCTCTATCTTATTATTACAAAAAAAAGTATGGAAGAAGTTTGTAAGGGTTGGTTAGATG
CAAAGACGCCAGGAAAGCTTGTCTGAGGGGTTTTTTTTGGTCGTGGTTTAGTAATTAACC
CGACCGCTTCAGATTTAGCTTTCGTAGTATGTATAATGGATAAAAACAATGATATGGTTT
TGTAAGAAAACTACTCTAGTAAGTTTCTACATTTACAAGCATTGAAATAAATCACAACCT
GTTGTTGCT


BQ
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AF RS1CF25JQ C 1
AF RS1CF25TF U 1
BS 1 549 RS1CF25TF

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GTTGTTGCT

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DS 

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AAGAGGGAGGCGAAGATGATTCCGGAAGTGCTTCCAGAGGAAATTGGTGGCAAGGGTCTC
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GTATATAGGATGGAAGGGAAAAAAGTAGAGTAGCAGTGGATCCGTTGGTATTAGTAAAAC
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CAAAGACGCCAGGAAAGCTTGTCTGAGGGGTTTTTTTTGGTCGTGGTTTAGTAATTAACC
CGACCGCTTCAGATTTAGCTTTCGTAGTATGTATAATGGATAAAAACAATGATATGGTTT
TGTAAGAAAACTACTCTAGTAAGTTTCTACATTTACAAGCATTGAAATAAATCACAACCT
GTTGTTGCT

QA 1 549 1 549
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1H782TF U 1
AF RS1H782JQB C 242
BS 1 750 RS1H782TF
BS 751 1015 RS1H782JQB

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TACTGCTCGAGTGTATGTATGTGATTACCAACTTACGGAAGGGTTTTATGATACACTAAA
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AAAAGAAGTACTCATGCTTACTGATGATGTTTATTGTCGGAAGCGTCAGCAAGTTCTTGA
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GGTTTTGGTCGCTCTGCACATGTTGCACACTTGATGCAGATGACATTTGACTCGTAAAAG
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CAATCAGATTTAAATAAAGAACGTGATTGTGTTGGATATGATAAATGTAACCGAACGTGA
TTGTTTGTGTTTTCTTGACAAAAATGATCTGTAATGCAGTTAAAAGTATTTTAT

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

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TTGATTGATGGATCTCG


BQ
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GTCGGACTTGCGAGAAGGCGAGCTCCAGTCACAACTGCGGCGGCTAGGGTCTGCTGGGTC
TAATGGCTCTGCCTATATCTTCTCTACTCCTCTCCAACTGTCTGATAAAGATCTGAAACT
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DS 



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BQ
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TGGATGATTTTGTTTTCTTGCCTGTTTCCTAACATTAAGTGACGGTTTGTTTTTGTCTTG
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GCCAAAAAAAAAAAAGAAACTAGGGCACTAAAAAATTGCTTTGCTTTGTTTCATTTCGTT
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DS 

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ATGATTTTGTTTTCTTGCCTGTTTCCTAACATTAAGTGACGGTTTGTTTTTGTCTTGTCC
CCAGATAACAAGCTGCAACAGAAAAGCCAGATAAATTTACAAAACAAGAAGAAGAAAGCT
CATCAGAATAAGATAACTGGTTTCCAGGTAATGAGAGAGAGTCTCACTTCTTCCGGAGCC
AAAAAAAAAAAAGAAACTAGGGCACTAAAAAATTGCTTTGCTTTGTTTCATTTCGTTTAA
CCATAGTTTGTGCCTGGAAGCTCATCTGAAGTGCTCGTCACATCATCCGACTCTCGGATC
CGCGTTGTTGATGGGACTGATCTAGTCACCAAACTCAAAGGTTCAAGCTTTGTCTTCTGT
TACTTCATCCGCAAACAAA

QA 1 559 1 559
DS 



AS 1 2

CO CL8359Contig1 891 2 2 U
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GATGGAGCCGATTTGGTTCGCTTGGCTTCTCGTTGTTTGCAGTATGAAGCTCGTGAAAGG
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TCCTATGTCTTACTGGGGATTCCACATGGAGCTGCTTCTCCAGAGGAAGCAACCTCGCTG
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AAAGTGGGTTACAAAGACGATGAGGGCATAGCAAATGAGCTCTCGTTCCAAGTGTGGACC
GACCAGCTTCAGGAGAGTTTAAACTCAAAGAAACAAGGAGATGCTGCGTTCAAAGGAAAA
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CAGGCTGCTGCGCTCTTCAGCCTTGGAATGGATAAAGACGCCTGTGAAACCCTGAAAGAT
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AACTCAAATGTGAGTCGAAATTGAATCAAGAAAAGAGGATCTTTCTCATTG


BQ
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AF RS1GA23TF U 1
AF RS1GA23JQ C 264
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GATGGAGCCGATTTGGTTCGCTTGGCTTCTCGTTGTTTGCAGTATGAAGCTCGTGAAAGG
CCTAATGTGAAATCTCTTGTCACCTCACTCGCTCCTCTTCAGAAGGAAACTGATGTTCCT
TCCTATGTCTTACTGGGGATTCCACATGGAGCTGCTTCTCCAGAGGAAGCAACCTCGCTG
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GACCAGCTTCAGGAGAGTTTAAACTCAAAGAAACAAGGAGATGCTGCGTTCAAAGGAAAA
GACTTTGTCACTGCCATTGAATGTTACACGCAGTTCATAGAAGATGGCACAATGGTATC

QA 1 479 1 479
DS 

RD RS1GA23JQ 628 0 0
AAGACTTGACCTCACTGCGATTCATGAGATTCTTGAGAAAGTGGGTTACAAAGACGATGA
GGGCATAGCAAATGAGCTCTCGTTCCAAGTGTGGACCGACCAGCTTCAGGAGAGTTTAAA
CTCAAAGAAACAAGGAGATGCTGCGTTCAAAGGAAAAGACTTTGTCACTGCCATTGAATG
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TTTGTGTTATCTGTTGAGCAACATGCCTCAAGAAGCTCTTGGTGATGCAATGCAGGCGCA
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TGGAATGGATAAAGACGCCTGTGAAACCCTGAAAGATGGAACTTCCTTGGAAGCCAAGAA
ACAGAGTAAAAGAAACTGAAAACTTTTCAAGTGTATAGGTTTTTTCTCTCTCTCGTCTTT
TGAAGAAAAGCCTCATTTTTTTTTGTTTTTTTTTTATCAAGCATTTGAGCTAACTCGTGC
TTAAAATTGTGAGTTCCAAGTTGAAGAGATGATTCAAAACTCAAATGTGAGTCGAAATTG
AATCAAGAAAAGAGGATCTTTCTCATTG

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 2

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AAGAAACACAAGAAGCGTGTGAAGTTAATGAATGGACCTGCGCCACACTCACAACTCGAT
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TTCCAGAC


BQ
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TTCCAGAC

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DS 

RD RS1BF21TF 548 0 0
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CGTCGTGACAAATTCGAAGTCAAAGGCGACGATTTAGTGTACACTGAGCTGCGCAAACCA
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TGCCTACACTGCGATCGGTACTTCTCTAATGCGTCTGTGCGAGATGATCATTTTAAGACT
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TGTTGTTGTAAGATGTCCCTTAGTATTATTAACACTATAAGTTAAATGCTATAAGTTTTT
TTCCAGAC

QA 1 548 1 548
DS 



AS 1 2

CO CL8361Contig1 692 2 1 U
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CAAGATCAAGTTCTATTCGTCATACGAAGACAGGTTTAAGCCACTGAATGATGGTACCAT
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BQ
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AF RS1BW91JQ C 145
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DS 

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CCACAACGCACACTTGAAGTCAAAGAAATCAAAGCGTAGATTGAGACAGCCTGGACTAGT
CCCACCAGCATATGCCAAAGTCATGAAGAAACTCAATTTCTGCAATTGAGAGATTAAGTA
TAAGAAACAGTTCAGTCTCTTCCAGTTTTACTTGATAATACTCACCTGATACGTGGTACC
CAAAGATTTAATCAAACTTCATTTCTTTTGTTGTTGTTTCAGTTTCAACCTTATCTCAAG
TAATAAAT

QA 1 548 1 548
DS 



AS 1 2

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TTAACTATG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AV68JQ C 1
AF RS1AV68TF U 1
BS 1 549 RS1AV68TF

RD RS1AV68JQ 549 0 0
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AAGAATGACACTTGGAAACTACTCTAACCACAAATCTCATCATAATCCTCGTTACCATCA
TCACCGGGACTCCACCAAGGAGTTTCGAGTTTCCTTTGCCGCTGAAGAACCTATCCATGT
CTTGGAGTGTGCAGATACGAGGAGGACGAAGAGGGAGGCTACAAAAGAAGTGGATGTTGA
CAAGGAGGCAGATGAATTCATCAAGTTTGAGCATAGGAAGTTCTGTAAGTGGACGACGAC
TAATTAAGAGCGTCTAGAGCCGTCTAGACTCTAGTCCATTGTGGATGAAAATTAAAAAAT
AAAAACAATAAGGATATATACCATATTTTATAAAGATTGTATTAAACGGTATTTGATATG
TTGTGCTCGTCTTCTTCCTTCTTTTCTGTATTAAACCATCTTCTGGTTTTTACTGTGGTT
GTAAGAAATGGATATTGTTTGTTTCCTTTACCTAAAAGGATGCATGGAAATAAAAATTTA
TTAACTATG

QA 1 549 1 549
DS 

RD RS1AV68TF 549 0 0
GGACTAACAAAACCATACTCAAGAACAAACAAAAAAGAGCTAAAAAGTTTTCATTTGAAG
AAGAATGACACTTGGAAACTACTCTAACCACAAATCTCATCATAATCCTCGTTACCATCA
TCACCGGGACTCCACCAAGGAGTTTCGAGTTTCCTTTGCCGCTGAAGAACCTATCCATGT
CTTGGAGTGTGCAGATACGAGGAGGACGAAGAGGGAGGCTACAAAAGAAGTGGATGTTGA
CAAGGAGGCAGATGAATTCATCAAGTTTGAGCATAGGAAGTTCTGTAAGTGGACGACGAC
TAATTAAGAGCGTCTAGAGCCGTCTAGACTCTAGTCCATTGTGGATGAAAATTAAAAAAT
AAAAACAATAAGGATATATACCATATTTTATAAAGATTGTATTAAACGGTATTTGATATG
TTGTGCTCGTCTTCTTCCTTCTTTTCTGTATTAAACCATCTTCTGGTTTTTACTGTGGTT
GTAAGAAATGGATATTGTTTGTTTCCTTTACCTAAAAGGATGCATGGAAATAAAAATTTA
TTAACTATG

QA 1 549 1 549
DS 



AS 1 2

CO CL8363Contig1 885 2 2 U
GAAAAGAAGAGTGGATTGAAACACTTGATGAAACATCTGGTCATAAGTATTACTACAATA
CAAAGACACATGTGTCCCAATGGGAACCTCCAGCTTCTTTAAAGAAGCTCTCTGCCACAA
ACACTAACAACGCTGCCACCCAAAGTACTGCTAACGGGAAGAAGGAGATTACGGCCTCTG
AGCTGCCGAGATGCAGCGGATGTGGTGGCTGGGGTGTGGGCCTTGTCCAGAGCTGGGGTC
ACTGTGCTCACTGTACCAGAGTTTTCAATCTCCCAGAGCAGCAGTACTTGGCATACGTCA
CAAATGCAAGAAACTCTGGCCAAAACGATCCAACCCAGCGGTCAAATTCAAAACCTCCGG
CGAAAAAGGGAGCAGGCAAAAAACGTGCGCATGCGGAGGATGATGAGGTTGATCCAATGG
ACCCAAGCTCGTACTCAGATGCTCCACGTGGTGGCTGGGTTGTTGGACTGAAGGGAATGC
AACCGCGAGCCGCTGATACAACTGCCACAGGTCCTCTGTTTCAACAGCGACCGTATCCAT
CGCCTGGAGCTGTTCTGAGGAGAAACGCTGAGACGGCGTCGTCGCAGAAGAAGAAACCAA
GCTCTCATTTCACGGAGATCACAAAGAGAGGCGATGGAAAAGATGGTCTTGGTGATGCAG
ATTGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATTCTTCCCCTGTATGTTACTTTTCTCCACA
TACAAGTATGGTCTTGAGGAGAGTAGTTTGTTTACTGGTCTAGTGAATACACGTAACCAT
ACCTAAAGTGTGAACTAGGAATGCATTCATTCCTTAATCTGTAGCAAACTTATTTTCAGG
ATCTTTTCTATCTTCAACAGTAGGCCTGCCTGTTCGGTTTTGGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CG73TF U 1
AF RS1CG73JQ C 144
BS 1 692 RS1CG73TF
BS 693 885 RS1CG73JQ

RD RS1CG73TF 692 0 0
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CAAATGCAAGAAACTCTGGCCAAAACGATCCAACCCAGCGGTCAAATTCAAAACCTCCGG
CGAAAAAGGGAGCAGGCAAAAAACGTGCGCATGCGGAGGATGATGAGGTTGATCCAATGG
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AACCGCGAGCCGCTGATACAACTGCCACAGGTCCTCTGTTTCAACAGCGACCGTATCCAT
CGCCTGGAGCTGTTCTGAGGAGAAACGCTGAGACGGCGTCGTCGCAGAAGAAGAAACCAA
GCTCTCATTTCACGGAGATCACAAAGAGAGGCGATGGAAAAGATGGTCTTGGTGATGCAG
ATTGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATT

QA 1 692 1 692
DS 

RD RS1CG73JQ 742 0 0
AGTACTGCTAACGGGAAGAAGGAGATTACGGCCTCTGAGCTGCCGAGATGCAGCGGATGT
GGTGGCTGGGGTGTGGGCCTTGTCCAGAGCTGGGGTCACTGTGCTCACTGTACCAGAGTT
TTCAATCTCCCAGAGCAGCAGTACTTGGCATACGTCACAAATGCAAGAAACTCTGGCCAA
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CGTGCGCATGCGGAGGATGATGAGGTTGATCCAATGGACCCAAGCTCGTACTCAGATGCT
CCACGTGGTGGCTGGGTTGTTGGACTGAAGGGAATGCAACCGCGAGCCGCTGATACAACT
GCCACAGGTCCTCTGTTTCAACAGCGACCGTATCCATCGCCTGGAGCTGTTCTGAGGAGA
AACGCTGAGACGGCGTCGTCGCAGAAGAAGAAACCAAGCTCTCATTTCACGGAGATCACA
AAGAGAGGCGATGGAAAAGATGGTCTTGGTGATGCAGATTGAGAAAGAGAGAGAGAGAGA
GAGCTTATTCTTCCCCTGTATGTTACTTTTCTCCACATACAAGTATGGTCTTGAGGAGAG
TAGTTTGTTTACTGGTCTAGTGAATACACGTAACCATACCTAAAGTGTGAACTAGGAATG
CATTCATTCCTTAATCTGTAGCAAACTTATTTTCAGGATCTTTTCTATCTTCAACAGTAG
GCCTGCCTGTTCGGTTTTGGAT

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

CO CL8364Contig1 561 2 1 U
GGGTTCACTGGAGGGGTTGCTCATTCGTTTACTGGAAGTGCATTGGACCGTGATAAGCTT
CTTTCTTTCGATAATATGTACATTGGTGTGAATGGCTGCTCGCGAAAACAGCTGAGAATC
TTGATGTAATGAAAGGGATACCGGTAGAGAGGATGATGATCGAAACCGACTCTCCTTATT
GTGATATCAAGAACACACACGCCGGGATGAAGTTTGTAAAGTCGACCTGGCCTTCTAAGA
AAAAGGAAAAGTATGATCAAGAGTGCATTGTCAAAGGCCGTAACGAGCCTTGCTTGGTTC
GGCAAGTTCTTGAGGTGGTGGCTGGCCATAAAGGAATTGGCGATATAAATCAACTTAGCT
CAACCTTGTACCACAACACTTGCAGAGTTTTCTTCCCCCAGGACTTGGATTCTGCTGCAG
ATGCTCTACTTTCCGGTCACCACAATACCAACTAGCTGAAGTCACTACAAAAATATTTTG
CCTTTCTAATGAGATAGAAAGATTATACATCAAACCATTTAATGGAAGAAACATTTTTGA
ATAAAGATGACAGTCAATCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1FY44JQ C 1
AF RS1FY44TF U 1
BS 1 561 RS1FY44TF

RD RS1FY44JQ 561 0 0
GGGTTCACTGGAGGGGTTGCTCATTCGTTTACTGGAAGTGCATTGGACCGTGATAAGCTT
CTTTCTTTCGATAATATGTACATTGGTGTGAATGGCTGCTCGCGAAAACAGCTGAGAATC
TTGATGTAATGAAAGGGATACCGGTAGAGAGGATGATGATCGAAACCGACTCTCCTTATT
GTGATATCAAGAACACACACGCCGGGATGAAGTTTGTAAAGTCGACCTGGCCTTTTAAGA
AAAAGGAAAAGTATGATCAAGAGTGCATTGTCAAAGGCCGTAACGAGCCTTGCTTGGTTC
GGCAAGTTCTTGAGGTGGTGGCTGGCCATAAAGGAATTGGCGATATAAATCAACTTAGCT
CAACCTTGTACCACAACACTTGCAGAGTTTTCTTCCCCCAGGACTTGGATTCTGCTGCAG
ATGCTTTACTTTCCGGTCACCACAATACCAACTAGCTGAAGTCACTACAAAAATATTTTG
CCTTTTTAATGAGATAGAAAGATTATACATCAAACCATTTAATGGAAGAAACATTTTTGA
ATAAAGATGACAGTCAATCCC

QA 1 561 1 561
DS 

RD RS1FY44TF 561 0 0
GGGTTCACTGGAGGGGTTGCTCATTCGTTTACTGGAAGTGCATTGGACCGTGATAAGCTT
CTTTCTTTCGATAATATGTACATTGGTGTGAATGGCTGCTCGCGAAAACAGCTGAGAATC
TTGATGTAATGAAAGGGATACCGGTAGAGAGGATGATGATCGAAACCGACTCTCCTTATT
GTGATATCAAGAACACACACGCCGGGATGAAGTTTGTAAAGTCGACCTGGCCTTCTAAGA
AAAAGGAAAAGTATGATCAAGAGTGCATTGTCAAAGGCCGTAACGAGCCTTGCTTGGTTC
GGCAAGTTCTTGAGGTGGTGGCTGGCCATAAAGGAATTGGCGATATAAATCAACTTAGCT
CAACCTTGTACCACAACACTTGCAGAGTTTTCTTCCCCCAGGACTTGGATTCTGCTGCAG
ATGCTCTACTTTCCGGTCACCACAATACCAACTAGCTGAAGTCACTACAAAAATATTTTG
CCTTTCTAATGAGATAGAAAGATTATACATCAAACCATTTAATGGAAGAAACATTTTTGA
ATAAAGATGACAGTCAATCCC

QA 1 561 1 561
DS 



AS 1 2

CO CL8365Contig1 834 2 14 U
GGTTGGCTAAATGGGCTCGTTCAGCCAAGGAGAACATGGGAGAAGAAGATTTTGCGAAGA
TGTCACAAGATTTCGGGGAAATGTGGCTAAGGCTTGTTCAAGGACTAAGAAAAGTGTGTT
TAGACCAGAGAGAGGATGTCCGAAACCACGCCTTACAGTCATTACAAAAGTGTTTGGGCG
GAGTAGACGGGATCAGTCTAGCTCATAGCATGTGGTCTCAATGCTTTGACAAAGTAATCT
TCACGGTTTTAGACGACTTACTCGAGATCGCTTCAGGGTCACAGAAAGACTACCGGAACA
TGGAAGGCACGTTGCTTCTGGCAATAAAACTCCTCTCCAAAGTGTTTCTTCAGCTACTCC
AAGAGCTATCTCAGTTATCAACCTTCTGCAAGCTATGGCTGGGCGTCCTGACCCGGATGG
AGAAATACATGAAAGTGAAAGTAAGGGGCAAGAAAAGCGAGAAGCTACAAGAAACCGTGC
CAGAGCTTCTCAAGAACATATTGCTCGTGATGAAGACGAAAGGAGTGCTTTTGCAGAGAA
GTGCTCTTGGCGGAGATAGCTTATGGGAGTTAACATGGCTTCACGTTAACAACATCGCTC
CGTCTATGAGGCTGGAGCTATTCCCTGATCAAGAATCTGCAGAGCCTTGCGATGATGAGA
GCAATGGCTTAGGTTCTGCTTAAGCTGGAGCGACATAACTGGTTAGTGTGACCTTCATAA
ATGACGATCATTAGGTGAAGTTGCTAAAGTCTTTGTTTGGAACAATTGTGAAAGTGAACT
CTATTTTTGTATAATGTCGCTTACGTTTTATTTTTGTAATATATACGTGTTTCT


BQ
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AF RS1FM59TF U 1
AF RS1FM59JQ C 211
BS 1 672 RS1FM59TF
BS 673 673 RS1FM59JQ
BS 674 734 RS1FM59TF
BS 735 735 RS1FM59JQ
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BS 765 777 RS1FM59TF
BS 778 778 RS1FM59JQ
BS 779 787 RS1FM59TF
BS 788 788 RS1FM59JQ
BS 789 803 RS1FM59TF
BS 804 834 RS1FM59JQ

RD RS1FM59TF 803 0 0
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TGTCACAAGATTTCGGGGAAATGTGGCTAAGGCTTGTTCAAGGACTAAGAAAAGTGTGTT
TAGACCAGAGAGAGGATGTCCGAAACCACGCCTTACAGTCATTACAAAAGTGTTTGGGCG
GAGTAGACGGGATCAGTCTAGCTCATAGCATGTGGTCTCAATGCTTTGACAAAGTAATCT
TCACGGTTTTAGACGACTTACTCGAGATCGCTTCAGGGTCACAGAAAGACTACCGGAACA
TGGAAGGCACGTTGCTTCTGGCAATAAAACTCCTCTCCAAAGTGTTTCTTCAGCTACTCC
AAGAGCTATCTCAGTTATCAACCTTCTGCAAGCTATGGCTGGGCGTCCTGACCCGGATGG
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GTGCTCTTGGCGGAGATAGCTTATGGGAGTTAACATGGCTTCACGTTAACAACATCGCTC
CGTCTATGAGGCTGGAGCTATTCCCTGATCAAGAATCTGCAGAGCCTTGCGATGATGAGA
GCAATGGCTTAG*TTCTGCTTAAGCTGGAGCGACATAACTGGTTAGTGTGACCTTCATAA
ATGACGATCATTAG*TGA*GTTGCTAAAGTCTTTGTTTGGAC**ATTGTGAAAGTGA*CT
CTATTTT*GTATAATGTCGCTTA

QA 1 803 1 803
DS 

RD RS1FM59JQ 624 0 0
TGTGGTCTCAATGCTTTGACAAAGTAATCTTCACGGTTTTAGACGACTTACTCGAGATCG
CTTCAGGGTCACAGAAAGACTACCGGAACATGGAAGGCACGTTGCTTCTGGCAATAAAAC
TCCTCTCCAAAGTGTTTCTTCAGCTACTCCAAGAGCTATCTCAGTTATCAACCTTCTGCA
AGCTATGGCTGGGCGTCCTGACCCGGATGGAGAAATACATGAAAGTGAAAGTAAGGGGCA
AGAAAAGCGAGAAGCTACAAGAAACCGTGCCAGAGCTTTTCAAGAACATATTGCTCGTGA
TGAAGACGAAAGGAGTGCTTTTGCAGAGAAGTGCTCTTGGCGGAGATAGCTTATGGGAGT
TAACATGGCTTCACGTTAACAACATCGCTCCGTCTATGAGGCTGGAGCTATTCCCTGATC
AAGAATTTGCAGAGCCTTGCGATGATGAGAGCAATGGCTTAGGTTTTGCTTAAGCTGGAG
CGACATAACTGGTTAGTGTGACCTTCATAAATGACGATCATTAGGTGAAGTTGCTAAAGT
CTTTGTTTGGAACAATTGTGAAAGTGAACTCTATTTTTGTATAATGTCGCTTACGTTTTA
TTTTTGTAATATATACGTGTTTCT

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

CO CL8366Contig1 1041 2 8 U
GGAGGCCCTGTACAACACACCCAAAGTGAGCTTGTCTAGAAGGTGGTTAAGGGTTTAGAT
CCACAGCTTTCAGAAAGAGGTGGTGGAAGAGCTGAAACTTAGTCAACTTTGCTCCACAGA
ACCTTCTAGGAAGCTACCTCACTAGACAAGCTTTTCTAGACAGTGGTGAACAATATGCTT
CTATAGAAGGGGGTGTTAACAGCAGGAGATGGCCTTTCACTCGGAGGACGACAAGAGCGA
AGACTACCTCTTTAAGATTGTTCTAATAGGTGACTCTGCAGTTGGGAAGTCAAACTTGCT
GGCAAGGTTTGCTAGAGATGAGTTTTATCCCAACTCAAAGTCTACCATTGGAGTGGAGTT
TCAGACGCAGAAGATTGATATCAATGGCAAGGAGATCAAAGCTCAGATATGGGACACTGC
GGGTCAAGAACGTTTCAGAGCAGTCACTTCTGCTTATTACAGAGGTGCTGTTGGAGCTCT
TCTGGTTTACGACATCAGCAGAAAGCAGACTTTTCACAGCATTGGTAGATGGCTCAACGA
GCTTCACACACACTCTGATATGAACGTTGTGACGATATTGGTGGGGAACAAGTCGGATCT
GAAGGAGATAAGAGAAGTGCCAACAGCGGAAGGGAAGGCGTTAGCGGAAGCTCAAGGGCT
TTTCTTTATGGAGACATCGGCTCTCGACTCGTCAAACGTGGTGGCTGCGTTCGAGACGGT
TGTGAAGGAGATATACAACATACTGAGCAGGAAAGTGATGAGCTCACAGGAGCTAAGCAA
GCAAGATCCTGCTTCGCTTAGCAATGGCAAGAAAGTTGTGATTGAATTTGAGGCACAGGG
CGAGTCCAAGAAAGGTGGGTGTTGTTCTTCGTGATTAGAAACTGAAAGTGTAGAGTGCTT
AAAAGAAAGAAAGATTGATTGATTTTGGTATGTTTGATTGTTTCTTTGATCCATGTGTTT
AGGTGTAGCAATCTGTAAATTCTCCATTGAAGAAACTTTATGTAAAACCAAAACTCCCCT
TTATAAAGTTTTTACCCCTTT


BQ
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AF RS1CD41TF U 1
AF RS1CD41JQ C 292
BS 1 727 RS1CD41TF
BS 728 728 RS1CD41JQ
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BS 799 1041 RS1CD41JQ

RD RS1CD41TF 801 0 0
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CCACAGCTTTCAGAAAGAGGTGGTGGAAGAGCTGAAACTTAGTCAACTTTGCTCCACAGA
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AGACTACCTCTTTAAGATTGTTCTAATAGGTGACTCTGCAGTTGGGAAGTCAAACTTGCT
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GAAGGAGATAAGAGAAGTGCCAACAGCGGAAGGGAAGGCGTTAGCGGAAGCTCAAGGGCT
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TGTGAAG*AGATATACAACATACTGAGCAGGAA*GTGATGAGCTCACAG*AGCTAAGCAA
GCAAGATCCTGCTTCGCT
ACA

QA 1 798 1 798
DS 

RD RS1CD41JQ 750 0 0
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GGACACTGCGGGTCAAGAACGTTTCAGAGCAGTCACTTCTGCTTATTACAGAGGTGCTGT
TGGAGCTCTTCTGGTTTACGACATCAGCAGAAAGCAGACTTTTCACAGCATTGGTAGATG
GCTCAACGAGCTTCACACACACTCTGATATGAACGTTGTGACGATATTGGTGGGGAACAA
GTCGGATCTGAAGGAGATAAGAGAAGTGCCAACAGCGGAAGGGAAGGCGTTAGCGGAAGC
TCAAGGGCTTTTCTTTATGGAGACATCGGCTCTCGACTCGTCAAACGTGGTGGCTGCGTT
CGAGACGGTTGTGAAGGAGATATACAACATACTGAGCAGGAAAGTGATGAGCTCACAGGA
GCTAAGCAAGCAAGATCCTGCTTCGCTTAGCAATGGCAAGAAAGTTGTGATTGAATTTGA
GGCACAGGGCGAGTCCAAGAAAGGTGGGTGTTGTTCTTCGTGATTAGAAACTGAAAGTGT
AGAGTGCTTAAAAGAAAGAAAGATTGATTGATTTTGGTATGTTTGATTGTTTCTTTGATC
CATGTGTTTAGGTGTAGCAATCTGTAAATTCTCCATTGAAGAAACTTTATGTAAAACCAA
AACTCCCCTTTATAAAGTTTTTACCCCTTT

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL8367Contig1 549 2 1 U
GGAAAAACCCTAAGCAGAGATCGAAGCTAAGAAGAACACACAGAAGAGAAGCGATTTGTT
TCCTCTCCCACTCTCCGTTCCATCACTCATGGCTACCATACCAGTAAACCCGAAGCCGTT
CTTGAACAATTTGACCGGAAAGACGGTTATTGTTAAGCTCAAATGGGGAATGGAATACAA
AGGTTTCCTCGCCTCTGTTGACTCCTACATGAACTTGCAGCTTGGGAACACTGAAGAATA
CATTGATGGACAGTTGACAGGGAACCTCGGAGAGATCTTGATCAGATGCAACAACGTTTT
GTATGTCCGAGGTGTGCCATAAGATGAAGAACTCGGAGACGCTGAACAAGACTAGCCTGT
GCCGGTTGGATGGACTTTTGTATTCTATGAGCATCTTAACTCAACTTGTGAGATTTCAGC
TTTTTTTTGGCTGTTGTTGAATCTTTTGATACCCTTGAAACTAAAGAAATCCCCACAAGC
CTTTTACTCTTTTAGATTTGTTATAAACCAAACTCCTCGCCGGTTTATGAGTAATATATT
GAATTGACC


BQ
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AF RS1DV48TF U 1
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GAATTGACC

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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1GT72TF U 1
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QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

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TAAGTAAGCTTCAACTCGAATCAAGTAGGATCAATATTTTCATAATTTTTGTTTCAAGAG
GGAGAAACACACAATACTTTTTAGTTTTTTTTTTTTGAACAACTTACACTTTTTAGTCAA
AACCGTAATTTTGTAGGCTTGTTGTCGCTAATAAATCAAGATGATGATAAAACTGCTCTT
CAGGTGAAGAACTTGGCCGGTAGTTGGATATCAGTTACTCCGATCCCTGGATCATTTATT
TGCAACATCGGTGACATGTTAAAGATACTTTCAAATGGAGTATATGAATCCACAATTCAT
AGAGTGATCAATAACTCTCCTCGATACCGTGTATGCGTCGGATTCTTCTACGAGTTCAAC
TTTGATGCGATGGCTGAACCATTGGATATCTTCAAAGGCCCGGGAAATAAAAGATCTCAA
GTTTCCAAAAGAGTTGTCTATGGAGAGCATCTGGTTAA

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DS 

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AATTTTTTCAGTGGGCTCACACTGACTATGGTAAGTAAGCTTCAACTCGAATCAAGTAGG
ATCAATATTTTCATAATTTTTGTTTCAAGAGGGAGAAACACACAATACTTTTTAGTTTTT
TTTTTTTGAACAACTTACACTTTTTAGTCAAAACCGTAATTTTGTAGGCTTGTTGTCGCT
AATAAATCAAGATGATGATAAAACTGCTCTTCAGGTGAAGAACTTGGCCGGTAGTTGGAT
ATCAGTTACTCCGATCCCTGGATCATTTATTTGCAACATCGGTGACATGTTAAAGATACT
TTCAAATGGAGTATATGAATCCACAATTCATAGAGTGATCAATAACTCTCCTCGATACCG
TGTATGCGTCGGATTCTTCTACGAGTTCAACTTTGATGCGATGGCTGAACCATTGGATAT
CTTCAAAGGCCCGGGAAATAAAAGATCTCAAGTTTCCAAAAGAGTTGTCTATGGAGAGCA
TCTGGTTAACAAACTCCAGGCTACCTTCGCAAATTCAATGGAAAACATTTAGTTTGATTG
GTTGGGCTTTCAATTGCAATT

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 2

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GGAACTCGTGTTTCTCAAATCTCAAACAAAAACTCAACAAACTTTCTCCGACAATGGGTT
GCGCTTCCTCCCAACTCCTGAATCAAAGCGATGACTTCTCTCAACTCGCCGGCTGTCACC
ACCACTTCGTCCAGCTTACTTCCTCCACTTACGGCCTTCTCAATCTCGACCCTCCGCCTC
CTCCTCCTTCCTCCTCCTCCGTTATCTCCGCACCAGCAACACCCATGACTCCGCCTGAGA
GGTTCGCCTTCGTCGGTAAGGATCCAGTAACCGTCAAGTCAGAGCCGGAGGTTGTTAACT
TCTGGGAGCTAATGTCTGGTCTCGACGCGTTCTCTCCTCTTCCGGTGAAACGAAATGTCT
CCTCCGGCGGAGTGAACAAAGAGAACTCGGATCCTAATTGGAGAAACCCTAGAAACCAAT
CCAACAACGAAGGCGTGCTGAAACCGCTAGATCCGAGATTCGCGGAGGAGGAATCGGAGA
AGCTGTGTCCTCCTGGCGGCGGAGTAGATAATAACCGCGTTGTGATCTACACGACGTCGT
TACGCGGCGTGAGGAGGACATTCGAGGCGTGTAACGCCGTGAGAGCTGCGTTAGAGAGCT
TCGGTGTAGTAGTCTGCGAGAGGGACGTTTCCATGGACAGAGGGTTCAGAGAAGAGCTCG
CGAGTCTTATGGCCGGAGAGGGAGACGGAGAGCCTGTGCTGCCGCCTAGGGTTTTTGTGA
AGTGGAAGTATATTGGTGGGGCAGAGGAGGTGATGAGATTGGTGGAAGAAGGTAGGCTCG
GAGATTTGCTCAGAGGGATTCCGAGGAAGAAAGATCGAGGGGGTGGTTGCGACGGATGCG
GCGGTTTAAGGTTCTTGCCGTGTTTTGATTGTAATGGAAGCTGCAAAGTGGTGGAAGGAT
GGGGAAGCGACGTTGTAGTGGTGAGATGTAATAAGTGTAACGAGAATGGTCTTGTTCTTT
GTCCGATTTGCAGCTAAATATAGTAATAATCTCTCAAACAGGAATCGTTAGCTAGTACTA
CTTCTGTAAGAAAACTTTTCACTCTCTCTTCTTCAAGATTAAGCTGGATCAAGGCAAAGA
TCTTGGTCCGGTAGAGATACTTTCTTGTTAGAATCAATACAAAAGCCTTTTGCCTC


BQ
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AF RS1DQ22TF U 1
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BS 618 1136 RS1DQ22JQ

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GCGCTTCCTCCCAACTCCTGAATCAAAGCGATGACTTCTCTCAACTCGCCGGCTGTCACC
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TCTGGGAGCTAATGTCTGGTCTCGACGCGTTCTCTCCTCTTCCGGTGAAACGAAATGTCT
CCTCCGGCGGAGTGAACAAAGAGAACTCGGATCCTAATTGGAGAAACCCTAGAAACCAAT
CCAACAACGAAGGCGTGCTGAAACCGCTAGATCCGAGATTCGCGGAGGAGGAATCGGAGA
AGCTGTGTCCTCCTGGCGGCGGAGTAGATAATAACCGCGTTGTGATCTACACGACGTCGT
TACGCGGCGTGAGGAGGACATTCGAGGCGTGTAACGCCGTGAGAGCTGCGTTAGAGAGCT
TCGGTGTAGTAGTCTGC

QA 1 617 1 617
DS 

RD RS1DQ22JQ 739 0 0
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ATTGGTGGAAGAAGGTAGGCTCGGAGATTTGCTCAGAGGGATTCCGAGGAAGAAAGATCG
AGGGGGTGGTTGCGACGGATGCGGCGGTTTAAGGTTCTTGCCGTGTTTTGATTGTAATGG
AAGCTGCAAAGTGGTGGAAGGATGGGGAAGCGACGTTGTAGTGGTGAGATGTAATAAGTG
TAACGAGAATGGTCTTGTTCTTTGTCCGATTTGCAGCTAAATATAGTAATAATCTCTCAA
ACAGGAATCGTTAGCTAGTACTACTTCTGTAAGAAAACTTTTCACTCTCTCTTCTTCAAG
ATTAAGCTGGATCAAGGCAAAGATCTTGGTCCGGTAGAGATACTTTCTTGTTAGAATCAA
TACAAAAGCCTTTTGCCTC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

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GCTCGAGATGATGGAACCTTGCTCCAGTGTCAAAGACAGGATTGGTTTTAGCATGATTTC
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TGGAAACACCGGAGTTGGGTTAGCCTTCACGGCTGCTGCCAAGGGCTACAAGCTTATCAT
TACCATGCCAGCTTCAATGAGTGTGGAGAGGAGGATCATTCTCTTAGCCTTTGGTGTTGA
GTTGATCTTAACTGACCCTGCTAAGGGCATGAAAGGCGCCATCGCCAAAGCTGAAGAGAT
TTTGTCCAAAACACCTAACGGTTACATGCTCCAACAGTTTGAGAACCCTGCCAACCCAAA
GATACACTATGAGACTACTGGACCTGAGATATGGAAAGGCACTGGTGGTAAAATCGATGG
ATTTGTTTCTGGGATTGGTACTGGTGGTACCATCACAGGTGCAGGGAAGTATCTCAAGGA
ACAGAACCCTAACGTCAAGCTGTATGGTGTGGAGCCAATTGAAAGTGCTATTCTCTCCGG
TGGGAAGCCAGGCCCTCACAAGATTCAAGGGATAGGTGCTGGTTTTATACCAAGCGTGGA
GGTTGATCTTATAGATGAAGTTGTTCAAGTTTCAAGTGATGAATCCATCGACATGGCAAG
GCTTCTTGCTCTTAAAGAAGGTCTTCTTGTGGGAATATCATCTGGTGCAGCAGCAGCCGC
AGCAATCAAACTTGCAAAGAGGCCAGAAAATGCCGGGAAGCTTTTCGTGGCTGTGTTCCC
AAGTTTTGGGGAGAGGTACCTGTCCTCTGTACTATTCGATGCCACAAGGAAAGAAGCAGA
ATCAATGACCTTCGAGGCTTGAATTGTCTCACCTGAAAATTTCATTTCTCTGTTTCTTTT
CATTTGAGACGCCAAAAATAAAAAAGAGAGATGTTCAGTTTTCTCCTGAAGAGAATCTCT
TCATCTTCAGCTTCAGTGCGTCTTTGTGTTTGTGTTTCTGTATCTTTCTTTTGTGTGAGA
ATAAAAAAACAATTTAGATTTTCTCTGTTTTTCTCTTTTGAAGAACACTTTGCTGTCAAT
AAGTGTGAGTCTACTTTAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C576TF U 1
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BS 1 634 RS1C576TF
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CTTGTTTGCTTGAATCATGGCCTCTCGTATTGCTAAAGATGTTACCGAATTGATTGGGAA
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GCTCGAGATGATGGAACCTTGCTCCAGTGTCAAAGACAGGATTGGTTTTAGCATGATTTC
TGATGCAGAGAAAAAGGGTCTGATTAAACCAGGAGAGAGTGTGCTGATTGAGCCAACGAG
TGGAAACACCGGAGTTGGGTTAGCCTTCACGGCTGCTGCCAAGGGCTACAAGCTTATCAT
TACCATGCCAGCTTCAATGAGTGTGGAGAGGAGGATCATTCTCTTAGCCTTTGGTGTTGA
GTTGATCTTAACTGACCCTGCTAAGGGCATGAAAGGCGCCATCGCCAAAGCTGAAGAGAT
TTTGTCCAAAACACCTAACGGTTACATGCTCCAACAGTTTGAGAACCCTGCCAACCCAAA
GATACACTATGAGACTACTGGACCTGAGATATGGAAAGGCACTGGTGGTAAAATCGATGG
ATTTGTTTCTGGGATTGGTACTGGTGGTACCATC

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CCAATTGAAAGTGCTATTCTCTCCGGTGGGAAGCCAGGCCCTCACAAGATTCAAGGGATA
GGTGCTGGTTTTATACCAAGCGTGGAGGTTGATCTTATAGATGAAGTTGTTCAAGTTTCA
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ATATCATCTGGTGCAGCAGCAGCCGCAGCAATCAAACTTGCAAAGAGGCCAGAAAATGCC
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GAAAATTTCATTTCTCTGTTTCTTTTCATTTGAGACGCCAAAAATAAAAAAGAGAGATGT
TCAGTTTTCTCCTGAAGAGAATCTCTTCATCTTCAGCTTCAGTGCGTCTTTGTGTTTGTG
TTTCTGTATCTTTCTTTTGTGTGAGAATAAAAAAACAATTTAGATTTTCTCTGTTTTTCT
CTTTTGAAGAACACTTTGCTGTCAATAAGTGTGAGTCTACTTTAC

QA 1 765 1 765
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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AF RS1FI04TF U 1
AF RS1FI04JQ C 131
BS 1 649 RS1FI04TF
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BS 651 686 RS1FI04TF
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RD RS1FI04TF 706 0 0
CTGCAGACATGGCAAGGGGATTGAAGAAACATCTCAAGAGGCTAAATGCCCCAAAGCATT
GGATGCTTGACAAACTTGGTGGTGCCTTTGCCCCCAAGCCATCTTCTGGACCACACAAGT
CCAGGGAGTGCCTTCCCCTTGTCCTTATCATCCGTAATAGGTTGAAGTATGCTTTGACAT
ACCGTGAGGTGATTTCTATCTTGATGCAAAGGCATATCCAAGTTGATGGGAAAGTCAGAA
CTGACAAGACATACCCTGCTGGTTTCATGGATGTTGTGTCTATCCCAAAGACAAATGAGA
ACTTCCGTCTTCTGTATGACACCAAGGGACGCTTCCGTCTTCACTCCATCAGAGACGAGG
AAGCAAAGTTCAAGCTGTGCAAAGTGAGAACTATCTAGCTTGGTCAGAAGGGAATCCCTT
ACCTGAACACATACGACGGTCGCACTATCCGTTACCCCGACCCGCTCATCAAGAACCGGG
AGAAACATAAGGGAAGCTTCGAGACCATCCACATTCAAGACTCTACTGGACATGAGTTTG
CAACGAGGTTAGGGAATGTGTTCACGCTTGGGAAAGGAACAAAGCCGTGGGTGTCTCTTC
CAAAGGGTAAAGGTATTAAGCTTACCATCATTGAGGAAGCTAGGAAGAG*CTTTCTGCTC
AACAAGCTGCTTGAAACTGTTTTTTT*CTTTTTGTTTC
TCTGTTTC

QA 1 698 1 698
DS 

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GATTTCTATCTTGATGCAAAGGCATATCCAAGTTGATGGGAAAGTCAGAACTGACAAGAC
ATACCCTGCTGGTTTCATGGATGTTGTGTCTATCCCAAAGACAAATGAGAACTTCCGTTT
TCTGTATGACACCAAGGGACGCTTCCGTTTTCACTCCATCAGAGACGAGGAAGCAAAGTT
CAAGCTGTGCAAAGTGAGAACTATCTAGCTTGGTCAGAAGGGAATCCCTTACCTGAACAC
ATACGACGGTCGCACTATCCGTTACCCCGACCCGCTCATCAAGAACCGGGAGAAACATAA
GGGAAGCTTCGAGACCATCCACATTCAAGACTTTACTGGACATGAGTTTGCAACGAGGTT
AGGGAATGTGTTCACGCTTGGGAAAGGAACAAAGCCGTGGGTGTTTCTTCCAAAGGGTAA
AGGTATTAAGCTTACCATCATTGAGGAAGCTAGGAAGAGGCTTTTTGCTCAACAAGCTGC
TTGAAACTGTTTTTTTTCTTTTTGTTTCCTCTGTTTCAGAAAACCTATGTTCTGTTTTTT
TGTATCTTGCTATTGAGTTCCTTGTTCTTATTAGACTTTCATGGC

QA 1 645 1 645
DS 



AS 1 2

CO CL8374Contig1 810 2 2 U
GGCCCCTCACCCATATCTTTTACGTAAGCTCCTTTCATGAATTTTTCATTTTCTGCTGAA
AGCCTGAAACTTATGATAAGGATTCAATTCAAACTTTTTCAGTATGGTGCCAACAAATCA
CTCCATAGCTTTTGATGATTACCCTCCGGTCAGTCTTTGTCTTTACAACAATTGAGTGAC
ATGGAGAGAGTACACGTTAAGGTAAAGATCATGCATGAGCTTGCTTCCGCATCTTTCTCA
TCTCTCGCTCGCTCTATATCTTCGGTTTAGCTTATTGGTGGATTTTTAAGCTTTCTTGAT
TGGATCAGTTTCTGAGACGATGGCTAGCTTTGCATCAACAGCCTGGAGACCACAGAGGTG
TACCTATAAAATCTGTGTCTATACTCCGCGCTTGGCCATTTATATCAAAAGGAATCAGAC
AAAATCATTGTTGCGAAGCAGACTTCCTCAGGGTCATTAAGATGCTTAACAGTTAACTAG
ACAACAGGGTGGTGCTCGAGTATATGAAAGATGGAAAGGAAAATGGAAAGACTCAAAGAA
GAGAGGAAATGATCTTCTTGCTTCTGTGCGAGTGATTAGAATGTACATATAAACTGTCTT
TGTTCTAAGAAATTGCCGTTCAATTTCTTTTCTTTTTTAAATGTCTTCTCATTTCCTGTC
AAAAGAATTTACATTCTACATTGGTGAATTTTCTGCTTATGTGATTGTTATTTTCTGTTT
TAGTAAGTTTTGAGTATTCCTTATGGAAGAACATTGATAGTCTCTCTCACATTAGCTCTC
ACTGAACATTGATAATCCAGGTTAGTTCGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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TCTCTCGCTCGCTCTATATCTTCGGTTTAGCTTATTGGTGGATTTTTAAGCTTTCTTGAT
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QA 1 716 1 716
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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AF RS1GI56TF U 1
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BS 1 537 RS1GI56TF
BS 538 658 RS1GI56JQ

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CCCCGCCGCGAAAACCTCGTGCACTGCCTTCAAAACCGTCGCCAACAGCGGCTCTGATGA
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QA 1 537 1 537
DS 

RD RS1GI56JQ 658 0 0
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CCCCATCTAAAACCTCTAAAGACAACAAAGACGGCGATGATGACAACGACGAGGGTTTTA
GCTGCAGCACACCCACATCTCAAGAACACAAGATTCCTTCTGTCCACGATTCTCCACCTC
CCCCGCCGCGAAAACCTCGTGCACTGCCTTCAAAACCGTCGCCAACAGCGGCTCTGATGA
TCAGATCGTGTAAGAGGAAGCTCTTAGTGTCCACTCCTGAGATTATCATGAACAAGGAAG
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GACGTTATCTTTGTTGTGCGCGAAGATGAGCCTTTAGTTCAAGATTTACATTTCTCTACA
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TTTTTAATTTTATAAAATGGATGGATAATTTTCTGCAGCCGCATATTAATTCCGCATGGA
GGGGTCGTTGTTGTAAATTCCGTAATAAATGAAAATTTAATTCCGTTTGCCAAGTTTC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

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AATCTTATGATGAATAAATTGTGAGGGTTTTTT


BQ
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AF RS1FL32TF U 1
AF RS1FL32JQ C 511
BS 1 633 RS1FL32TF
BS 634 1293 RS1FL32JQ

RD RS1FL32TF 633 0 0
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AACATCTTCAAGAACCCGTAACCACTAACCCTAATCAGGTTTTAAACAAAGAAGAACAAG
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CTATGGTTCTTAAAGCCGCCTTGGAGCTCGGCGTCATCGACACCATCGCTGCTGCAGGCA
ACGGCGCGTGGCTTTCACCCTCCGAGATAACGGTTAGTCTCCCAACCAAACCAATGAACC
CAGAGGCACCGGTTTTGCTGGACCGGATGCTGCGGTTACTCGTCAGCCACTCGATGTTGA
AGTGCCGTATGGTAAAAAGCAGAGAAAACGGTCGAACCGGAAAGATGGAAAGGGTATATG
CAGCCGAACCGGTTTGCAAGTATTTCTTGAAAGATAGTGACGGTTCTGGTTCTCTCGCGT
CTTTGCTCGTCATGTTCCATGACCAAGTCATTTTTAAGACTTGGACAAAGCTCAAGGATG
TGATACTGGAAAGAAGAGATGCGTTCAGCAATGCACACGGCATGAGACTATTTGAATACA
TTAAGTTGGACGAACGGGTCGGTGAGCTATTTC

QA 1 633 1 633
DS 

RD RS1FL32JQ 783 0 0
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ATGCACACGGCATGAGACTATTTGAATACATTAAGTTGGACGAACGGTTCGGTGAGCTAT
TTCACCAGGCGATGTCAGAATCTTCCACTATGGTCATGAAGAAGGTCTTAGAACTTTTCA
AAGGTTTTGAAGGTGTTAACACTCTAGTGGATGTAGGAGGAGCAAATGGCACCATATTAG
GTTTAATCACATCCAAGTATCCTCATATCAAGGGTATTAATTTGGACCTAGCTGAGGTTT
TAACACATGCTCCATTTTATCCAGGAGTCGAGCATGTCTCTGGAGACATGTTTAAAGAAG
TTCCAAGGGGAGATGCCGTCTTTATGAAATGGATACTACATGACTGGACGGACGAACATT
GTATAAAGATTCTAAAGAATTGTTGGAAGAGTCTGCCGGAAAAGGGAAAAGTGATAATTG
TAGAGAGGATTACACCAGAAGAACCAAAGAGTGGTGACCTTTTATCTGACACTGTGTTCG
CCATGGACCTGCTAATGCTGACACAGTGTTCGGGAGGTAAAGAGAGATCTCTTTCACAAT
TTGAGAACTTAGCATTCAGTCATGTTTCATTCGATGTGAAGTCATTTGTTTTGCGTATTC
ATATTCTGTTATCGAGTTCCATAAATAGATGTGGCAATTGGAAAATAAACTATGATTGGG
TTGATAGTCTGAAATCAACATTACGAGCTAAATCTTATGATGAATAAATTGTGAGGGTTT
TTT

QA 1 783 1 783
DS 



AS 1 2

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AAGCTAGTAACCTTAAGGGGTCCACAACAAGGTATGGGAAGCTTTACTCGAAACTCGCAA
AGAGCTATATAGAAAAAGGTTCAGGCTATGCTACAAAAGAAGTCGAGCGGCTTGGACGCG
TCCTTGGCAAGTCGATAAGTCCAGTGAAAGCTGATGAATTAACTCTCAAGAGAAATATCT
TGACCACGTTCGTTGCTTCAGCTTAAAAGGCAAAGCCCTGAGAGTGTATAGGAGTCGACA
GACTCTCTATATTAAACTGATACAGTTTGTAGAGTCGGTGTTTTGTGGACTTCTTTTATG
TCTGTTGTTATTTCTGTTTAGTTCCTTATACATTATCGATTTAGTTTTTGCTTTATATGG
ATCCAGTTTCAGGCTTTTCACCTACAAAAGAAAGAAATAAGAATATCTCTACTAGATG


BQ
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AF RS1AW87JQ C 1
AF RS1AW87TF U 1
BS 1 538 RS1AW87TF

RD RS1AW87JQ 538 0 0
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AGGAGCTAGTTGCAGCCAGTGAAGATGAGAAAAAGGCAATCTTGTCTCGCATCGAAGAGG
AAGCTAGTAACCTTAAGGGGTCCACAACAAGGTATGGGAAGCTTTACTCGAAACTCGCAA
AGAGCTATATAGAAAAAGGTTCAGGCTATGCTACAAAAGAAGTCGAGCGGCTTGGACGCG
TCCTTGGCAAGTCGATAAGTCCAGTGAAAGCTGATGAATTAACTCTCAAGAGAAATATCT
TGACCACGTTCGTTGCTTCAGCTTAAAAGGCAAAGCCCTGAGAGTGTATAGGAGTCGACA
GACTCTCTATATTAAACTGATACAGTTTGTAGAGTCGGTGTTTTGTGGACTTCTTTTATG
TCTGTTGTTATTTCTGTTTAGTTCCTTATACATTATCGATTTAGTTTTTGCTTTATATGG
ATCCAGTTTCAGGCTTTTCACCTACAAAAGAAAGAAATAAGAATATCTCTACTAGATG

QA 1 538 1 538
DS 

RD RS1AW87TF 538 0 0
GCAGTCAAGGGCAGCTTACTTCAAAGGCTGGTATAGTTGAAAGCTTAGATGCGTTGGTAA
AGGAGCTAGTTGCAGCCAGTGAAGATGAGAAAAAGGCAATCTTGTCTCGCATCGAAGAGG
AAGCTAGTAACCTTAAGGGGTCCACAACAAGGTATGGGAAGCTTTACTCGAAACTCGCAA
AGAGCTATATAGAAAAAGGTTCAGGCTATGCTACAAAAGAAGTCGAGCGGCTTGGACGCG
TCCTTGGCAAGTCGATAAGTCCAGTGAAAGCTGATGAATTAACTCTCAAGAGAAATATCT
TGACCACGTTCGTTGCTTCAGCTTAAAAGGCAAAGCCCTGAGAGTGTATAGGAGTCGACA
GACTCTCTATATTAAACTGATACAGTTTGTAGAGTCGGTGTTTTGTGGACTTCTTTTATG
TCTGTTGTTATTTCTGTTTAGTTCCTTATACATTATCGATTTAGTTTTTGCTTTATATGG
ATCCAGTTTCAGGCTTTTCACCTACAAAAGAAAGAAATAAGAATATCTCTACTAGATG

QA 1 538 1 538
DS 



AS 1 2

CO CL8379Contig1 746 2 4 U
ATAACTATCCGTCGTGATCCCAATCGGAATCTGCCGGAGACGACGAAGATTGTAGCGGGT
GCTGAACTATGCAGATACTGAGGTGCTGCCCACACAGCTTCATTCAGTTTCTCTTCATCA
CCGCTTTTGTAATTGGATTATTTGAGTGGGGTGCATCTGTACCCGTCCCGGATTCGAACT
GCTACGCTCTCGACAATTCAAGTCGTCTTGTCGACTTTAGCAGCTGGATCGGTCAACCAT
TTGAATATGATGGCAAGGAGTTCGATTTGGTGGTTAGATTTTGCAAGGATGTTGAATCAA
GAGGCCAGGCGGGTTATGTTGATTTTGGAAGGTTTGACCCGTTGAGCTACTTTGTTTCTG
GCTCTGGAAGTTTTGATTTTGTTCAAGGGTTTTACCACGGTGACCTGACGAATTGTGAGC
ATAGTTACGACAAACTTGGACGTACATCACAGGTCAATATTATTTGTGGGAACTGTGTTG
ATGGACGCTGTAAAGGTGGACTTGGATGCATATGTAGTGTCACTCAAGATTCAACTTGCA
GAGTTACTGTCGAGTTGGCTATTCCGTGTGAGAAACCTGGCCCTCTTGTCTTTAAAGGAT
TCACGGTCGGTTTGCATCCTCGCTCATGGGAAATTATTTATAATGGGATGACACAGTTTG
GATTCGATAAGCCCCGTCGTGAATTTAGCTTCAGACAGAGCAGACTCATCTTACTCTCTA
CATGACTGCAGTTGCTCTCTCTCAAC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1E508TF U 1
AF RS1CA50TF U 39
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CCGCTTTTGTAATTGGATTATTTGAGTGGGGTGCATCTGTACCCGTCCCGGATTCGAACT
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TTGAATATGATGGCAAGGAGTTCGATTTGGTGGTTAGATTTTGCAAGGATGTTGAATCAA
GAGGCCAGGCGGGTTATGTTGATTTTGGAAGGTTTGACCCGTTGAGCTACTTTGTTTCTG
GCTCTGGAAGTTTTGATTTTGTTCAAGGGTTTTACCACGGTGACCTGACGAATTGTGAGC
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ATGGACGCTGTAAAGGTGGACTTGGATGCATATGTAGTGTCACTCAAGATTCAACTTGCA
GAGTTACTGTCGAGTTGGCTATTCCGTGTGAGAAACCTG

QA 1 579 1 579
DS 

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GTACCCGTCCCGGATTCGAACTGCTACGCTCTCGACAATTCAAGTCGTCTTGTCGACTTT
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GGTGACCTGACGAATTGTGAGCATAGTTACGACAAACTTGGACGTACATCACAGGTCAAT
ATTATTTGTGGGAACTGTGTTGATGGACGCTGTAAAGGTGGACTTGGATGCATATGTAGT
GTCACTCAAGATTCAACTTGCAGAGTTACTGTCGAGTTGGCTATTCCGTGTGAGAAACCT
GGCCCTCTTGTCTTTAAAGGATTCACGGTCGGTTTGCATCCTCGCTCATGGGAAATTATT
TATAATGGGATGACACAGTTTGGATTCGATAAGCCCCGTCGTGAATTTAGCTTCAGACAG
AGCAGACTCATCTTACTCTCTACATGACTGCAGTTGCTCTCTCTCAAC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AV71JQ U 26
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BS 26 590 RS1AV71JQ
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QA 1 565 1 565
DS 

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GGAGGACGGCTTCCGTTCCTCTTGCTTCCTCCATAGATCCTACGGAAGCCACCCACTCCA
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GGGTCATAAGGAGCAAGCTCCTTGAGTTTACCAGTCTTCACTATGTCTGTCCACGGTGGC
AGCTCAATCTTGCCGGAGCGTTTGAGATGGGCAGCGTAAGCCTTGACGAACTCGTGTGGA
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TGCGGAACTAGGGTTTTTTCAGGAGTTTCTGTCC

QA 1 694 1 694
DS 



AS 1 2

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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1B750JQ C 1
AF RS1B750TF U 1
BS 1 537 RS1B750TF

RD RS1B750JQ 537 0 0
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QA 1 537 1 537
DS 

RD RS1B750TF 537 0 0
GACACAACAAAATAGTCATAAGAAAGATTGAAACATGGCTACTCACAAAAATATTTTCTT
TCTATGTTTCTTAATAGGTTTAGGGTTATGTTCTGCAAGACGAGTACTTCTCTCCTCCTA
TGAACCCGAGGATGAAGTCGCTGGCTATGGTGAGAAAAGTAGTTTGCATGTTGGTTATGG
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CACCGAGACGCCTAAAGAAACTGTTCAAGCTGATGGCTCCGAGACAGCTCCAGTTAAAGA
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GGAGGAGAAAACTGGTGAAGTCAAGACAGTGTAATAAACTGCTTCTTAAACCTATAACGT
TTCTTGTGTTTATTTTGTGTGTTGCATCCTATGTTTACGAAATATTGGATAATGATGAGC
TTGGGATAATAATAAAACACTTCAGGTGCGAGTATGATTATTGTAATGTTTAATTAA

QA 1 537 1 537
DS 



AS 1 2

CO CL8382Contig1 869 2 8 U
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GATCCGAACCGAAGATCAGGACCGGACTCCGACAGTGATTCCGATGGTCCTCAAGAGTAC
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GAGCGTCCTCCCAGTTCCAGCAGAAGCTTCACTGGAACCGGGAGATTGCTTTCAGGAGAA
AGCGTGCCAACCGCTCTTCAACCGCCCGAGCCTGTGATTCACAGTATCGTTTTCTGGTCT
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TTTCTCGACAGCATTCGAAAGTCTGAATGTCCTAAAGAGCTTGAGCCTGCTGATAAAAGA
GCTCCTGTACATGTTAATCTTATGAGAAGAGATGAGATATGCCCCCGAACGTGAGAAACC
TACGGTTGCATTTCAAGGAGTGGGAAGGACACTAGGGAGGTGGGGGCTAGCTCATCAACC
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CGCATGGTGGCTAAGTTCAATAACCATCACACGTCAACGACATTCGTGCTTTTATTGACT
TTTCTCGACCAGGGATCCAATCAACTACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GL63TF U 1
AF RS1AJ45TF U 10
BS 1 124 RS1GL63TF
BS 125 125 RS1AJ45TF
BS 126 272 RS1GL63TF
BS 273 273 RS1AJ45TF
BS 274 550 RS1GL63TF
BS 551 551 RS1AJ45TF
BS 552 572 RS1GL63TF
BS 573 869 RS1AJ45TF

RD RS1GL63TF 572 0 0
GGCTCTCGATCAAGCCGGAGAAAAAAGAAAGCATCAGAGAGAGAGAGAGAGATGTCTTCA
AAGGACAAGCAACCGTCGAAGCCGTCTGGTGGTCGGACCAGTGGTATCCGTACACTTTCC
GATCTGAACCGAAGATCAGGACCGGACTCCGACAGTGATTCCGATGGTCCTCAAGAGTAC
TACACCGGCGGAGAGAAAAGTGGTATGCTAGTTCAGGATCCTTCGAAAGAACCAAAACAC
GACGATGTTGATGAGATATTCAACCAAGCAAGGCAACTAGGAGCGGTGGAAGGACCTCTT
GAGCGTCCTCCCAGTTCCAGCAGAAGCTTCACTGGAACCGGGAGATTGCTTTCAGGAGAA
AGCGTGCCAACCGCTCTTCAACCGCCCGAGCCTGTGATTCACAGTATCGTTTTCTGGTCT
AACGGTTTCACTGTTGATGATGGACCTTTGAGGAAGTTGGATGATCCAGAGAACGAGTCC
TTTCTCGACAGCATTCGAAAGTCTGAATGTCCTAAAGAGCTTGAGCCTGCTGATAAAAGA
GCTCCTGTACTTGTTAATCTTATGAGAAGAGA

QA 1 572 1 572
DS 

RD RS1AJ45TF 860 0 0
GG
AAGCCGGAGAAAAAAGAAAGCATCAGAGAGAGAGAGAGAGATGTCTTCAAAGGACAAGCA
ACCGTCGAAGCCGTCTGGTGGTCGGACCAGTGGTATCCGTACACTTTCCGATCCGAACCG
AAGATCAGGACCGGACTCCGACAGTGATTCCGATGGTCCTCAAGAGTACTACACCGGCGG
AGAGAAAAGTGGTATGCTTGTTCAGGATCCTTCGAAAGAACCAAAACACGACGATGTTGA
TGAGATATTCAACCAAGCAAGACAACTAGGAGCGGTGGAAGGACCTCTTGAGCGTCCTCC
TAGTTCCAGCAGAAGCTTCACTGGAACCGGGAGATTGCTTTCAGGAGAAAGCGTGCCAAC
CGCTCTTCAACCTCCCGAGCCTGTGATTCACAGTATCGTTTTCTGGTCTAACGGTTTCAC
TGTTGATGATGGACCTTTGAGGAAGTTGGATGATCCAGAGAACGAGTCCTTTCTCGACAG
CATTCGAAAGTCTGAATGTCCTAAAGAGCTTGAGCCTGCTGATAAAAGAGCTCCTGTACA
TGTTAATCTTATGAGAAGAGATGAGATATGCCCCCGAACGTGAGAAACCTACGGTTGCAT
TTCAAGGAGTGGGAAGGACACTAGGGAGGTGGGGGCTAGCTCATCAACCCCTCAAAGCCT
AAGCAACCCAACCGATGTAGCCGCGGCTCCATCCCCGTCACAGAGTCCTGTTGTAGTTGA
TGAAACTCTTCCATCTACGTCTATCCAGCTTAGACTCTCTGACGGGACACGCATGGTGGC
TAAGTTCAATAACCATCACACGTCAACGACATTCGTGCTTTTATTGACTTTTCTCGACCA
GGGATCCAATCAACTACA

QA 3 860 3 860
DS 



AS 1 2

CO CL8383Contig1 831 2 12 U
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TCACACTGGTCACCTGGTCGGTAGTGCACTTTCAGATCCGTATCTGTCATTTGCAGCTGC
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CTGGAAAACACTAAACAGTGGCAAGGTTGTTCCTGGATATGGACATGGTGTTCTTCGCAA
AACTGATCCAAGATATGTATGCCAAAGAGAGTTTGCGTTGAAGCACTTACCTGATGACCC
TCTTTTCCAGCTGGTCTCAAAGCTTTATGAAGTTGTGCCTCCTGTTCTCACCGAACTCGG
AAAGGTGAAGAACCCATGGCCAAATGTTGATGCTCACAGTGGAGTGTTGCTCAACCATTA
TGGTCTAACCGAAGCAAGGTACTACACGGTGCTCTTTGGTGTCTCGAGGAGTCTTGGTAT
CTGCTCTCAGCTAATATGGGACAGAGCTCTTGGACTTGCACTTGAGAGGCCAAAGAGTGT
TACAATGGACTGGCTTGAAGCCCACTGTAAGAAAGCTATAGCTTCATCTGCTTAAACATT
ACCGCGTCCTGAGGCTTCTCATGCTATTTATGCTCCGTTCTCTTCCACACAGAAGAAAAG
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CTTTTCTGCACCTGAGAAACACTTGCAGTTTGCAAATTTGCATTCCGGAAA


BQ
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AF RS1FR13TF U 1
AF RS1GG72TF U 223
BS 1 431 RS1FR13TF
BS 432 432 RS1GG72TF
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BS 720 736 RS1FR13TF
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BS 777 777 RS1GG72TF
BS 778 791 RS1FR13TF
BS 792 831 RS1GG72TF

RD RS1FR13TF 794 0 0
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TCACACTGGTCACCTGGTCGGTAGTGCACTTTCAGATCCGTATCTGTCATTTGCAGCTGC
ATTAAACGGTTTAGCTGGGCCACTCCATGGTTTGGCTAATCAGGAAGTATTGCTTTGGAT
CAAATCAGTTGTGGAGGAATGTGGAGAAAACATATCGAAAGACCAGTTGAAAGAATATGT
CTGGAAAACACTAAACAGTGGCAAGGTTGTTCCTGGATATGGACATGGTGTTCTTCGCAA
AACTGATCCAAGATATGTATGCCAAAGAGAGTTTGCGTTGAAGCACTTACCTGATGACCC
TCTTTTCCAGCTGGTCTCAAAGCTTTATGAAGTTGTGCCTCCTGTTCTCACCGAACTCGG
AAAGGTGAAGACCCCATGGCCAAGTGTTGATGCTCACAGTGGAGTGTTGCTCAACCATTA
TGGTCTAACCGAAGCAAGGTACTACACGGTGCTCTTTGGTGTCTCGAGGAGTCTTGGTAT
CTGCTCTCAGCTAATATGGGACAGAGCTCTTGGACTTGCACTTGAGAGGCCAAAGAGTGT
TACAATGGACTGGCTTGAAGCCCACTGTAAGAAAGCTATAGCTTCATCTGCTTAAACATT
ACCGCGTCCTGAGGCTTCTCATGCTATTTATGCTCCGTTCTCTTCCACACAGAAGAAA*G
TTTATATATTGACAGA**GAAAACGTTGTTCGTGTAGAAATTGTTTCGTTTGAGAT*ATA
CTTTTCTGCAC
TGA

QA 1 791 1 791
DS 

RD RS1GG72TF 609 0 0
GG
AGTTGAAAGAATATGTCTGGAAAACACTAAACAGTGGCAAGGTTGTTCCTGGATATGGAC
ATGGTGTTCTTCGCAAAACTGATCCAAGATATGTATGCCAAAGAGAGTTTGCGTTGAAGC
ACTTACCTGATGACCCTCTTTTCCAGCTGGTCTCAAAGCTTTATGAAGTTGTGCCTCCTG
TTCTCACCGAACTCGGAAAGGTGAAGAACCCATGGCCAAATGTTGATGCTCACAGTGGAG
TGTTGCTCAACCATTATGGTCTAACCGAAGCAAGGTACTACACGGTGCTCTTTGGTGTCT
CGAGGAGTCTTGGTATCTGCTCTCAGCTAATATGGGACAGGGCTCTTGGACTTGCACTTG
AGAGGCCAAAGAGTGTTACAATGGACTGGCTTGAAGCCCACTGTAAGAAAGCTATAGCTT
CATCTGCTTAAACATTACCGCGTCCTGAGGCTTCTCATGCTATTTATGCTCCGTTCTCTT
CCACACAGAAGAAAAGTTTATATATTGACAGAAGAAAAACGTTGTTCGTGTAGAAATTGT
TTCGTTTGAGATTATACTTTTCTGCACCTGAGAAACACTTGCAGTTTGCAAATTTGCATT
CCGGAAA

QA 3 609 3 609
DS 



AS 1 2

CO CL8384Contig1 609 2 1 U
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAGAGGAAAA
GTTGTGGATGCTGATGATGTGGGTGAGAGTGCAAGGAAGCTCAAGTTTAGAAGAGGGAGA
GATCTTGGTGAAGACAAAGCGCAAGATGCACAAGGAAGAAGAAGCTTTAAGAAGAGGGAA
GATGTCAAAGATGACGAAGAAGAAGACGAAGATGGTGAAAAAGTTGTGTTGAGGCATCAA
GATGTTCAGGAGAAAGATGCACAGGGACTACTCAACAATGTCATTGAAGAAACAGCGAGT
AAACTTGTTGAAGCTAGAAAAAGCAAAGTTAAAGCTTTGGTTGGTGCTTTCGAAACTGTC
ATCTCTCTTCAAGAATCTAAACCTCCTGCCGCTAACTCTGAAACTGTTAACTCGAGCCCG
GTTTGATGTGGAACTTCAAGAAAGATTGCTTAATGCATTCATATTAAGGATATGATGTCT
GATGTCTCAGCCAAATATTGATATGGTGCTTTGTGAATAATACTCTGATGGATTGTGTTA
TGTGTTTAGTTTTGGTTCTTCTGAACCAGTTTGTTGGTCTCATTTGGATGTGTTCGGTTT
TGTACAGAC


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A078TV U 1
AF RS1A078TF U 72
BS 1 609 RS1A078TV

RD RS1A078TV 609 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGGAGAGGAAAA
GTTGTGGATGCTGATGATGTGGGTGAGAGTGCAAGGAAGCTCAAGTTTAGAAGAGGGAGA
GATCTTGGTGAAGACAAAGCGCAAGATGCACAAGGAAGAAGAAGCTTTAAGAAGAGGGAA
GATGTCAAAGATGACGAAGAAGAAGACGAAGATGGTGAAAAAGTTGTGTTGAGGCATCAA
GATGTTCAGGAGAAAGATGCACAGGGACTACTCAACAATGTCATTGAAGAAACAGCGAGT
AAACTTGTTGAAGCTAGAAAAAGCAAAGTTAAAGCTTTGGTTGGTGCTTTCGAAACTGTC
ATCTCTCTTCAAGAATCTAAACCTCCTGCCGCTAACTCTGAAACTGTTAACTCGAGCCCG
GTTTGATGTGGAACTTCAAGAAAGATTGCTTAATGCATTCATATTAAGGATATGATGTCT
GATGTCTCAGCCAAATATTGATATGGTGCTTTGTGAATAATACTCTGATGGATTGTGTTA
TGTGTTTAGTTTTGGTTCTTCTGAACCAGTTTGTTGGTCTCATTTGGATGTGTTCGGTTT
TGTACAGAC

QA 1 609 1 609
DS 

RD RS1A078TF 538 0 0
TGATGATGTGGGTGAGAGTGCAAGGAAGCTCAAGTTTAGAAGAGGGAGAGATCTTGGTGA
AGACAAAGCGCAAGATGCACAAGGAAGAAGAAGCTTTAAGAAGAGGGAAGATGTCAAAGA
TGACGAAGAAGAAGACGAAGATGGTGAAAAAGTTGTGTTGAGGCATCAAGATGTTCAGGA
GAAAGATGCACAGGGACTACTCAACAATGTCATTGAAGAAACAGCGAGTAAACTTGTTGA
AGCTAGAAAAAGCAAAGTTAAAGCTTTGGTTGGTGCTTTCGAAACTGTCATCTCTCTTCA
AGAATCTAAACCTCCTGCCGCTAACTCTGAAACTGTTAACTCGAGCCCGGTTTGATGTGG
AACTTCAAGAAAGATTGCTTAATGCATTCATATTAAGGATATGATGTCTGATGTCTCAGC
CAAATATTGATATGGTGCTTTGTGAATAATACTCTGATGGATTGTGTTATGTGTTTAGTT
TTGGTTCTTCTGAACCAGTTTGTTGGTCTCATTTGGATGTGTTCGGTTTTGTACAGAC

QA 1 538 1 538
DS 



AS 1 2

CO CL8385Contig1 758 2 6 U
GCAACAAACCAGTAACCTATTCTCACCCGAAGCTGGTCATCCTTCACATGAACATGGCAC
TCCACGTTTACGAGGACATCATGCGAATGACAGAGAATCTCAGCGAGAAGTACATCATTG
GCCACGGAGCATCGAGCACCGTATACAAATGCGTCCTAAAAAACTGCAAACCGGTTGCGA
TCAAGCGTCTCTATTCCCACAACAACCCACAGTCGGTTAAACATTTCGAGACCGAGCTCG
AGATGCTCAGCAGCATCAAACACAGAAACCTCGTGAGCCTGCAAGCCTACTCCCTTTCTC
CCTTGGGAAGCCTTCTCTTCTACGACTACATGGACAACGGTAGCCTATGGGACCTTCTTC
ACGGCCCTGCGACCAAGAAGAAGACTCTTCTTGATTGGGACGCACGGCTTAAGATAGCGT
ACGGTGCTGCGCAAGGGCTAGCGTATCTGCACCACGACTGTAGTCCGAGGATCATACACC
GAGACGTCAAGTCTTCTAATATTCTTTTGGACAAGGACTTGGAGGCTCGTCTGACGGATT
TCGGAATCGCGAAAAGCTTGTGCGTCTCCAAGTCTCATACTTCGACTTACATCATGGGCA
CAATTGGTTACATAGACCCCGAATACGCACGCACTTCGCGTCTCACCGAGAAGTCTGATG
TCTACAGCTATGGGATAGTGCTGCTCGAGTTGTTGACCTCAAGGAAAGCCGTTGATGATG
AGTTCAACCTCCACCATCTGATATGTCCAGACGTGACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 
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AF RS1G701TF U 1
AF RS1GZ92TF U 55
BS 1 371 RS1G701TF
BS 372 372 RS1GZ92TF
BS 373 543 RS1G701TF
BS 544 544 RS1GZ92TF
BS 545 609 RS1G701TF
BS 610 758 RS1GZ92TF

RD RS1G701TF 609 0 0
GCAACAAACCAGTAACCTATTCTCACCCGAAGCTGGTCATCCTTCACATGAACATGGCAC
TCCACGTTTACGAGGACATCATGCGAATGACAGAGAATCTCAGCGAGAAGTACATCATTG
GCCACGGAGCATCGAGCACCGTATACAAATGCGTCCTAAAAAACTGCAAACCGGTTGCGA
TCAAGCGTCTCTATTCCCACAACAACCCACAGTCGGTTAAACATTTCGAGACCGAGCTCG
AGATGCTCAGCAGCATCAAACACAGAAACCTCGTGAGCCTGCAAGCCTACTCCCTTTCTC
CCTTGGGAAGCCTTCTCTTCTACGACTACATGGACAACGGTAGCCTATGGGACCTTCTTC
ACGGCCCTGCGGCCAAGAAGAAGACTCTTCTTGATTGGGACGCACGGCTTAAGATAGCGT
ACGGTGCTGCGCAAGGGCTAGCGTATCTGCACCACGACTGTAGTCCGAGGATCATACACC
GAGACGTCAAGTCTTCTAATATTCTTTTGGACAAGGACTTGGAGGCTCGTCTGACGGATT
TCGTAATCGCGAAAAGCTTGTGCGTCTCCAAGTCTCATACTTCGACTTACATCATGGGCA
CAATTGGTT

QA 1 609 1 609
DS 

RD RS1GZ92TF 704 0 0
G
GGCACTCCACGTTTACGAGGACATCATGCGAATGACAGAGAATCTCAGCGAGAAGTACAT
CATTGGCCACGGAGCATCGAGCACCGTATACAAATGCGTTCTAAAAAACTGCAAACCGGT
TGCGATCAAGCGTCTCTATTCCCACAACAACCCACAGTCGGTTAAACATTTCGAGACCGA
GCTCGAGATGCTCAGCAGCATCAAACACAGAAACCTCGTGAGCCTGCAAGCCTACTCCCT
TTCTCCCTTGGGAAGCCTTCTCTTCTACGACTACATGGACAACGGTAGCCTATGGGACCT
TCTTCACGGCCCTGCGACCAAGAAGAAGACTCTTCTTGATTGGGACGCACGGCTTAAGAT
AGCGTACGGTGCTGCGCAAGGGCTAGCGTATCTGCACCACGACTGTAGTCCGAGGATCAT
ACACTGAGACGTCAAGTCTTCTAATATTCTTTTGGACAAGGACTTGGAGGCTCGTCTGAC
GGATTTCGGAATCGCGAAAAGCTTGTGCGTCTCCAAGTCTCATACTTCGACTTACATCAT
GGGCACAATTGGTTACATAGACCCCGAATACGCACGCACTTCGCGTCTCACCGAGAAGTC
TGATGTCTACAGCTATGGGATAGTGCTGCTCGAGTTGTTGACCTCAAGGAAAGCCGTTGA
TGATGAGTTCAACCTCCACCATCTGATATGTCCAGACGTGACA

QA 2 704 2 704
DS 



AS 1 2

CO CL8386Contig1 1024 2 6 U
GGGTTCAGTTTCTGTAATCACGTTCCTTGTCTTTTTTTCCTTTTTGTTTCTGGGTTTTGT
TCGGACAGCAAAGAGCTCAAGGACCCAGAAGAGATCAATGTTGTTCATCCTCTCGATGCT
CAGAGAGGAATCTCTGTCGAAGATTTGAGACTCATTAAGCTTCATATGTCTAATTATATA
TCGAAGCTGGCGCAACACATTAAGATTAGGCAAAGGGTTGTTGCAACTGCTATAACCTAT
ATGCGCCGTGTTTACACAAGGAAGAGTTTGACAGAGTATGAGCCTAGGCTTGTTGCTCCC
ACCTGCTTGTATCTGGCTTGCAAAGCAGAGGAGAGTGTGGTCCATGCCAAGATTCTTGTC
TTCTACATCAGAAAATTGTGTAATTTAGCTTAAAACTTTCTTTGATTTGCTCAAGCTTTT
TACCTTAACTTCTGATGGAATTGGTTCTCTCTCGGTAGATGCTGATGAGAAGTTCAGGTA
TGAGATTAAAGATATTCTTGAGATGGAGATGAAGATCTTGGAAGCTTTGAACTTCTATCT
TGTTGTATTCCACCCTTACCGATCTCTCCCTGAGTTCTTGCAGGATTCTGGACTCAATGA
CACAAGTATGACCCACTTAACTTGGGGTATTGTCAACGACACTTACAGAATGGATCTCAT
CCTTACACACCCGCCTTATCTCATCACCCTCGCTTGCATTTACGTTGCTTCTGTGTACAA
AGAGAAAGACATAAAGACATGGTTTGAAGAGCTCTCTGTGGACATGAACATTGTGAAGAA
TATCGCAATGGAGATATTAGATTTTTATGAGAACCACAGAATGTTCACTGAAGAGAGAGT
TCACGCCGCCTTCAACAAGCTTGCTACAAGTCCCTAAGAGTTTTTGTTTTTGTTTCTTTG
AGAATAATATGTTTTGCCAGCAGTTTCTCTCATGAGGGATCACTTGTACATTGGTTTTGC
TAGTCTTGGTTTTAAGCATGTCTTTGACTATGCACAAATATGAAATTGGTGTGCAAATTT
GCAG


BQ
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0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RS1F086TF U 1
AF RS1F086JQ C 224
BS 1 720 RS1F086TF
BS 721 721 RS1F086JQ
BS 722 726 RS1F086TF
BS 727 727 RS1F086JQ
BS 728 774 RS1F086TF
BS 775 1024 RS1F086JQ

RD RS1F086TF 774 0 0
GGGTTCAGTTTCTGTAATCACGTTCCTTGTCTTTTTTTCCTTTTTGTTTCTGGGTTTTGT
TCGGACAGCAAAGAGCTCAAGGACCCAGAAGAGATCAATGTTGTTCATCCTCTCGATGCT
CAGAGAGGAATCTCTGTCGAAGATTTGAGACTCATTAAGCTTCATATGTCTAATTATATA
TCGAAGCTGGCGCAACACATTAAGATTAGGCAAAGGGTTGTTGCAACTGCTATAACCTAT
ATGCGCCGTGTTTACACAAGGAAGAGTTTGACAGAGTATGAGCCTAGGCTTGTTGCTCCC
ACCTGCTTGTATCTGGCTTGCAAAGCAGAGGAGAGTGTGGTCCATGCCAAGATTCTTGTC
TTCTACATCAGAAAATTGTGTAATTTAGCTTAAAACTTTCTTTGATTTGCTCAAGCTTTT
TACCTTAACTTCTGATGGAATTGGTTCTCTCTCGGTAGATGCTGATGAGAAGTTCAGGTA
TGAGATTAAAGATATTCTTGAGATGGAGATGAAGATCTTGGAAGCTTTGAACTTCTATCT
TGTTGTATTCCACCCTTACCGATCTCTCCCTGAGTTCTTGCAGGATTCTGGACTCAATGA
CACAAGTATGACCCACTTAACTTGGGGTATTGTCAACGACACTTACAGAATGGATCTCAT
CCTTACACACCCGCCTTATCTCATCACCCTCGCTTGCATTTACGTTGCTTCTGTGTACAA
*GAGAA*GACATAAAGACATGGTTTGAAGAGCTCTCTGTGGACATGAACATTGT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RS1F086JQ 801 0 0
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CTAGGCTTGTTGCTCCCACCTGCTTGTATCTGGCTTGCAAAGCAGAGGAGAGTGTGGTCC
ATGCCAAGATTCTTGTCTTCTACATCAGAAAATTGTGTAATTTAGCTTAAAACTTTCTTT
GATTTGCTCAAGCTTTTTACCTTAACTTCTGATGGAATTGGTTCTCTCTCGGTAGATGCT
GATGAGAAGTTCAGGTATGAGATTAAAGATATTCTTGAGATGGAGATGAAGATCTTGGAA
GCTTTGAACTTCTATCTTGTTGTATTCCACCCTTACCGATCTCTCCCTGAGTTCTTGCAG
GATTCTGGACTCAATGACACAAGTATGACCCACTTAACTTGGGGTATTGTCAACGACACT
TACAGAATGGATTTCATCCTTACACACCCGCCTTATCTCATCACCCTCGCTTGCATTTAC
GTTGCTTCTGTGTACAAAGAGAAAGACATAAAGACATGGTTTGAAGAGCTCTCTGTGGAC
ATGAACATTGTGAAGAATATCGCAATGGAGATATTAGATTTTTATGAGAACCACAGAATG
TTCACTGAAGAGAGAGTTCACGCCGCCTTCAACAAGCTTGCTACAAGTCCCTAAGAGTTT
TTGTTTTTGTTTCTTTGAGAATAATATGTTTTGCCAGCAGTTTCTCTCATGAGGGATCAC
TTGTACATTGGTTTTGCTAGTCTTGGTTTTAAGCATGTCTTTGACTATGCACAAATATGA
AATTGGTGTGCAAATTTGCAG

QA 1 801 1 801
DS 



AS 1 2

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ACGTGTTTACCCCGCGATTCTACCAGCTCAAGGCGATAAAGTCTCTGGCAAGGTACTTTG
GGATCACAGATGATGAACTTTACATTTTAGATGAGTTTGAAGATATCGAGTATGAAAGAG
ACAACGTCCATGTTTTTCTTACAGATAGCTCAGAGAAACTGGAAACAAAGACATACATCT
GGGCCAACAAAGATGATCCTGATCTCTACGGTTCATGGGATTTCGAGGAGTGGAAGGAAG
TTCACATGGAAGGTTTCTTGAAGATGACCACAGAATTTTCACAAGAGATGAAGTTCCCAG
AATCATCTGAGACATTATTTGAATCAGTAGGATGAGATTCGGTATTGTTTCATCTTGAAA
TGGAAAGCGCTGGAACTGTGTTGATATATTATTATGGGAAGGATTAATATTCTTCGTCAT
GAATACAATACATAGTGTGTAAGGAATAAGAGTCTTCTTTACTGTGGTGTATGGTCATCA
ATACTCATGCATATATGTTAGACCTTTG


BQ
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AF RS1FL95TF U 1
AF RS1FL95JQ C 123
BS 1 688 RS1FL95TF

RD RS1FL95TF 688 0 0
GGATAGTCGAAGAAGGCTCTCTGGATCAAAGTCAGCGATGAGTGGTGGTACAGTGGCACT
GCACAGTGTGTTCGTCTACGGCAGCCTCATGGCGGACGACGTCGTTCGCCTGCTCCTCAA
CCGCGTCCCTTCCACAGCCTCCGCGACCCTCCCTGATTTCCATAGATTTAGCATCAAAGG
ACGTGTTTACCCCGCGATTCTACCAGCTCAAGGCGATAAAGTCTCTGGCAAGGTACTTTG
GGATCACAGATGATGAACTTTACATTTTAGATGAGTTTGAAGATATCGAGTATGAAAGAG
ACAACGTCCATGTTTTTCTTACAGATAGCTCAGAGAAACTGGAAACAAAGACATACATCT
GGGCCAACAAAGATGATCCTGATCTCTACGGTTCATGGGATTTCGAGGAGTGGAAGGAAG
TTCACATGGAAGGTTTCTTGAAGATGACCACAGAATTTTCACAAGAGATGAAGTTCCCAG
AATCATCTGAGACATTATTTGAATCAGTAGGATGAGATTCGGTATTGTTTCATCTTGAAA
TGGAAAGCGCTGGAACTGTGTTGATATATTATTATGGGAAGGATTAATATTCTTCGTCAT
GAATACAATACATAGTGTGTAAGGAATAAGAGTCTTCTTTACTGTGGTGTATGGTCATCA
ATACTCATGCATATATGTTAGACCTTTG

QA 1 688 1 688
DS 

RD RS1FL95JQ 566 0 0
GCGTCCCTTCCACAGCCTCCGCGACCCTCCCTGATTTCCATAGATTTAGCATCAAAGGAC
GTGTTTACCCCGCGATTCTACCAGCTCAAGGCGATAAAGTTTCTGGCAAGGTACTTTGGG
ATCACAGATGATGAACTTTACATTTTAGATGAGTTTGAAGATATCGAGTATGAAAGAGAC
AACGTCCATGTTTTTTTTACAGATAGCTCAGAGAAACTGGAAACAAAGACATACATTTGG
GCCAACAAAGATGATCCTGATCTTTACGGTTCATGGGATTTCGAGGAGTGGAAGGAAGTT
CACATGGAAGGTTTCTTGAAGATGACCACAGAATTTTCACAAGAGATGAAGTTCCCAGAA
TCATTTGAGACATTATTTGAATCAGTAGGATGAGATTCGGTATTGTTTCATCTTGAAATG
GAAAGCGCTGGAACTGTGTTGATATATTATTATGGGAAGGATTAATATTTTTCGTCATGA
ATACAATACATAGTGTGTAAGGAATAAGAGTTTTCTTTACTGTGGTGTATGGTCATCAAT
ACTCATGCATATATGTTAGACCTTTG

QA 1 566 1 566
DS 



AS 1 2

CO CL8388Contig1 799 2 2 U
GGGCTGTCTTTATAATTTATCAGAATCGCCGATTGATCGATAGAGAACAACGACCATCCG
TTAATGCCGACGGAGAAATCGTGGCCGTCTAAATTAGGCGAAGAAGATCCAATTCCGATT
TATAGAAGAATCAATCTTTAAGAGATGGGGAAGAAGAGAAAAGCTACAGCGACGAGCCTA
GATGAGGTAGATCGGACTGTTTACGCCTCGTTTCGAACCGCCGCGAACTCGTTATCTCAG
CTTTATACTCAGTCCATGAACCACCAGAAATTATCTTTCCAAGCCGGTGAACGCCATGGT
CTCGAGAAATTGTACCAATGGATATGGAGACAACAAGAAGGAGGGTCAAGAGTGACGTCT
ATGGATATAATCAATTACATTCAGAACGAGCTAGAGTGCTGCCCAGAGGAGCCCCCAATT
TCCCCAAGAGCGCCGCCAACACAACCAGCAATGAATGCCGGGCTCATGGCCTCTTCAGGC
ACGTCTTGCCCAACAGCTGTTCCAGTGGTTCGGTCTGAGCAATGCGAAAACCAGGTGAAG
AACTCGGTTTTCTCAAACGCCCTTTCAAGCCCCATACGCCGTAGCCTTCAAAACTACCAA
ATTCCGCAGGGAGGCTACATATCTGGCGCAACCAGAAGCAGTGAACTGAACAGGGGATCT
AACTCTCCAGGCTCTTTTGATTCCTCAATGGACATGCATGCAGACTAATAACTATGATGT
AATACACTCTCGTTTGATGATGTTTGCTTTATACAAAACTGGTTTTATTCTTCATAATGT
ATCAATTGGTTCTTATCTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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ATTCCGC

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CTCGTTTGATGATGTTTGCTTTATACAAAACTGGTTTTATTCTTCATAATGTATCAATTG
GTTCTTATCTC

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

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TTGGACATTGGGTTCTAATTCAATTCTAATTCAAACATGTCAACTTCTGTTCC


BQ
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A
TAGAAGAAAATGAAAAA

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DS 

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AAAATGGCTGATAATTGTTTGGCACTTTCTACCATCGTTAAACTATGATTTATTAAGGAG
AACGGGGAATTTCGGGGCAAAAAATACTATATATATATCATTTGATTGTACGGGTTTATT
TATTTGTATTTTTTCTTCAGTTTGATTTATTTCACATTAGTTTAAAGAAAAAATAGAAGG
AAAAATGAAAAAAGAGGACGGAGATCTTGTGTATATGTAGATGGAAAACGTTTGGACATT
GGGTTCTAATTCAATTCTAATTCAAACATGTCAACTTCTGTTCC

QA 1 644 1 644
DS 



AS 1 2

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TACATGGTTATCACAATCTCCAAGAATATACAGTGGTTGAGGTGAGACCGGTGAGAGAGC
ATGACGTTCCTTGCTGTGGCTTTGGCATGGGCTGGTTCTTGTTTCTTATGGGCTTCTTAT
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GCGAGAAGGCTGGCTACGTTGCATGTTCTATCGCGTCCGTTGTGTATTTGATTGCCGTCA
TGCTCGGGATGGCTGGGAATATTAACATCATCTGGTGATTTTTACATATCAAATTTCAAT
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TGTAATATATTGTCTGATAAGCGTTGAT


BQ
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AF RS1FW43TF U 1
AF RS1FS02TF U 442
BS 1 464 RS1FW43TF
BS 465 465 RS1FS02TF
BS 466 580 RS1FW43TF
BS 581 748 RS1FS02TF

RD RS1FW43TF 580 0 0
GGGAATTTCTCCTCCTTTCAATCGTCTCCTCTCGCTTCCTCAACTCTTTTCTTTTCATCG
CCGATCAATCCGCCGTCAGCCATCCGTAAAAGCGGCGGAATAATTGGACAATCCTCTGGT
TGATCGGCATCTGAATCATGGACGAGGAGGCAGCAGCAAAAGCTAGAGACACCGCCACCG
TAAACCAGCAACAGCAATACTATTACGGAACGTTTCAAGGCGTCGCAAGCTATCCTCCTC
CCGCTCCGCTACGGCTTCCGCAACAACCTATTGTCACGAGTCCCTTGCTTCCTCCTCCTA
TACATGGTTATCACAATCTCCAAGAATATACAGTGGTTGAGGTGAGACCGGTGAGAGAGC
ATGACGTTCCTTGCTGTGGCTTTGGCATGGGCTGGTTCTTGTTTCTTATGGGCTTCTTAT
TCGGTGGGATCCCTTGGTATCTCGGTGCAGTTATTATTCTGTTCGCCTCTGTTGATCACC
GCGAGAAGGCTGGCTACGTTGCATGTTCTATCGCGTCCGTTGTGTATTTGATTGCCGTCA
TGCTCGGGATGGCTGGGAATATTAACATCATCTGGTGATT

QA 1 580 1 580
DS 

RD RS1FS02TF 307 0 0
G
CGGTGCAGTTATTATTCTGTTCACCTCTGTTGATCACCGCGAGAAGGCTGGCTACGTTGC
ATGTTCTATCGCGTCCGTTGTGTATTTGATTGCCGTCATGCTCGGGATGGCTGGGAATAT
TAACATCATCTGGTGATTTTTACATATCAAATTTCAATAACGTATATGCATCATCATAGC
ATGGTGATTTACAAAAGCAACTGTTGTTATTTTGTGCTGTATTTATTTGTTTACAACTAT
GATGAAATATGTTCTTGATTCCTTTGATGGCATCTTCGTGTAATATATTGTCTGATAAGC
GTTGAT

QA 2 307 2 307
DS 



AS 1 2

CO CL8391Contig1 726 2 2 U
GGAAGAGTCTTGAGACATCGATTGTTTGTCCGTTTTAACAAGAGAAACCGAGAAAATTTG
TCTGTAGAAAACAGAGCAAGGGGTTGAAGATGGAGGAACTTGCAGGGCTTCTGAGGATCC
GAGTGAAGAAAGGGATCAATCTCGCTAGACGTGACTCTCTAAGCAGCGATCCTTTTGTCG
TCATAACCATGGGAACACAGAAACTGAAGGGTCGTACTGTGGAAAACAACTGCAACCCTG
AGTGGAATGAAGAGTTAACACTTGCCCTCAAACATCCCAATGAACATGTGATTCTGATTG
TGTATGATAAAGATACATTCACATCTCACGACAAGATGGGAGATGCGCAGATCGACATCA
AGCCGTTTCTAGAGGTTCATAAACTTGGTTTGCAAGAACTTCCTGATGGGACGGTGATCA
AGAGTGTTTTGCCCACCAAAGAAAACTGCTTGTCTGAAGAGAGTAGAATCGTCTACCATA
ATGGCAAGATCGTGCAGGACATGATTCTTGTCTTGAGGAATGTCGAATGCGGTGAAGTGG
AGATTCAGCTTGAGTGGGTTGAAATTCCAGGTGGTAGAGGACTCTGAAAACACACAGTTG
AAAATGTTTTCATGTTCCTAATATGTGTGTGTATGTGTGTGTTTGTAATAAAAGCCACAG
GTTCTGTAATAAAATCACACTTTGTTTTGCGTAGCATATGAATTAGCTCACGCACATCGG
ATTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1F037TF U 1
AF RS1F037JQ C 148
BS 1 684 RS1F037TF
BS 685 726 RS1F037JQ

RD RS1F037TF 684 0 0
GGAAGAGTCTTGAGACATCGATTGTTTGTCCGTTTTAACAAGAGAAACCGAGAAAATTTG
TCTGTAGAAAACAGAGCAAGGGGTTGAAGATGGAGGAACTTGCAGGGCTTCTGAGGATCC
GAGTGAAGAAAGGGATCAATCTCGCTAGACGTGACTCTCTAAGCAGCGATCCTTTTGTCG
TCATAACCATGGGAACACAGAAACTGAAGGGTCGTACTGTGGAAAACAACTGCAACCCTG
AGTGGAATGAAGAGTTAACACTTGCCCTCAAACATCCCAATGAACATGTGATTCTGATTG
TGTATGATAAAGATACATTCACATCTCACGACAAGATGGGAGATGCGCAGATCGACATCA
AGCCGTTTCTAGAGGTTCATAAACTTGGTTTGCAAGAACTTCCTGATGGGACGGTGATCA
AGAGTGTTTTGCCCACCAAAGAAAACTGCTTGTCTGAAGAGAGTAGAATCGTCTACCATA
ATGGCAAGATCGTGCAGGACATGATTCTTGTCTTGAGGAATGTCGAATGCGGTGAAGTGG
AGATTCAGCTTGAGTGGGTTGAAATTCCAGGTGGTAGAGGACTCTGAAAACACACAGTTG
AAAATGTTTTCATGTTCCTAATATGTGTGTGTATGTGTGTGTTTGTAATAAAAGCCACAG
GTTCTGTAATAAAATCACACTTTG

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1F037JQ 579 0 0
GACGTGACTCTTTAAGCAGCGATCCTTTTGTCGTCATAACCATGGGAACACAGAAACTGA
AGGGTCGTACTGTGGAAAACAACTGCAACCCTGAGTGGAATGAAGAGTTAACACTTGCCC
TCAAACATCCCAATGAACATGTGATTTTGATTGTGTATGATAAAGATACATTCACATCTC
ACGACAAGATGGGAGATGCGCAGATCGACATCAAGCCGTTTCTAGAGGTTCATAAACTTG
GTTTGCAAGAACTTCCTGATGGGACGGTGATCAAGAGTGTTTTGCCCACCAAAGAAAACT
GCTTGTCTGAAGAGAGTAGAATCGTCTACCATAATGGCAAGATCGTGCAGGACATGATTC
TTGTCTTGAGGAATGTCGAATGCGGTGAAGTGGAGATTCAGCTTGAGTGGGTTGAAATTC
CAGGTGGTAGAGGACTCTGAAAACACACAGTTGAAAATGTTTTCATGTTCCTAATATGTG
TGTGTATGTGTGTGTTTGTAATAAAAGCCACAGGTTCTGTAATAAAATCACACTTTGTTT
TGCGTAGCATATGAATTAGCTCACGCACATCGGATTTCC

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

CO CL8392Contig1 751 2 2 U
GGGTACAAGACGGAGGAGTACTCACACACGGCGGTGAACAAGTTTAACGTGATGCCGGAC
TCGATACCTGACTGGGTTTTCGACTTCATGCCTCTCCGTGGAGGGTACTTTGTCGGGAAT
GTAAGCCCGGCCCGTATGGACTTCAGGTGGTTTTCATTAGGAAACTGTGTGGCCATCCTC
TCTTCTCTGGCCACTCCGGATCAGTCAATGGCCATCATGGACCTTCTTGAGCACCGTTGG
GAGGAGCTGGTTGGTGAGATGCCGCTCAAGATATGCTACCCTTGCATCGAGAGCCATGAG
TGGCGGATCGTCACCGGTTGTGATCCTAAGAACACTCGTTGGAGCTACCACAATGGCGGA
TCTTGGCCTGTTTTGCTGTGGATGCTGACCGCTGCGTGCATCAAGACCGGTCGGCCTCAA
ATAGCCAGACGGGCCATCGACCTAATTGAGTCACGGCTTCACAGAGATTGCTGGCCAGAG
TACTACGACGGTAAGCTAGGAAGGTACGTTGGAAAACAAGCAAGAAAATACCAGACTTGG
TCAATCGCAGGTTACTTGGTTGCTAAGATGATGCTTGAAGATCCTTCACATATTGGAATG
ATCTCTCTTGAAGAAGACAAACAGATGAATCCTGTTATCAAGAGATCTGCTTCGTGGACT
TGCTGATTTTAACCTTTTTTCTTGTATTATATTAATGTCATTTGAGACTTGTCCTTTATT
CGAGATTAAAGGAATGCAAAAACCTTTCGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B214TF U 1
AF RS1B214JQ C 191
BS 1 726 RS1B214TF
BS 727 751 RS1B214JQ

RD RS1B214TF 732 0 0
GGGTACAAGACGGAGGAGTACTCACACACGGCGGTGAACAAGTTTAACGTGATGCCGGAC
TCGATACCTGACTGGGTTTTCGACTTCATGCCTCTCCGTGGAGGGTACTTTGTCGGGAAT
GTAAGCCCGGCCCGTATGGACTTCAGGTGGTTTTCATTAGGAAACTGTGTGGCCATCCTC
TCTTCTCTGGCCACTCCGGATCAGTCAATGGCCATCATGGACCTTCTTGAGCACCGTTGG
GAGGAGCTGGTTGGTGAGATGCCGCTCAAGATATGCTACCCTTGCATCGAGAGCCATGAG
TGGCGGATCGTCACCGGTTGTGATCCTAAGAACACTCGTTGGAGCTACCACAATGGCGGA
TCTTGGCCTGTTTTGCTGTGGATGCTGACCGCTGCGTGCATCAAGACCGGTCGGCCTCAA
ATAGCCAGACGGGCCATCGACCTAATTGAGTCACGGCTTCACAGAGATTGCTGGCCAGAG
TACTACGACGGTAAGCTAGGAAGGTACGTTGGAAAACAAGCAAGAAAATACCAGACTTGG
TCAATCGCAGGTTACTTGGTTGCTAAGATGATGCTTGAAGATCCTTCACATATTGGAATG
ATCTCTCTTGAAGAAGACAAACAGATGAATCCTGTTATCAAGAGATCTGCTTCGTGGACT
TGCTGATTTTAACCTTTTTTCTTGTATTATATTAATGTCATTTGAGACTTGTCCTTTATT
CGAGAT
AAAGGA

QA 1 726 1 726
DS 

RD RS1B214JQ 561 0 0
CCACTCCGGATCAGTCAATGGCCATCATGGACCTTCTTGAGCACCGTTGGGAGGAGCTGG
TTGGTGAGATGCCGCTCAAGATATGCTACCCTTGCATCGAGAGCCATGAGTGGCGGATCG
TCACCGGTTGTGATCCTAAGAACACTCGTTGGAGCTACCACAATGGCGGATCTTGGCCTG
TTTTGCTGTGGATGCTGACCGCTGCGTGCATCAAGACCGGTCGGCCTCAAATAGCCAGAC
GGGCCATCGACCTAATTGAGTCACGGCTTCACAGAGATTGCTGGCCAGAGTACTACGACG
GTAAGCTAGGAAGGTACGTTGGAAAACAAGCAAGAAAATACCAGACTTGGTCAATCGCAG
GTTACTTGGTTGCTAAGATGATGCTTGAAGATCCTTCACATATTGGAATGATCTCTCTTG
AAGAAGACAAACAGATGAATCCTGTTATCAAGAGATCTGCTTCGTGGACTTGCTGATTTT
AACCTTTTTTCTTGTATTATATTAATGTCATTTGAGACTTGTCCTTTATTCGAGATTAAA
GGAATGCAAAAACCTTTCGTC

QA 1 561 1 561
DS 



AS 1 2

CO CL8393Contig1 670 2 2 U
GTATTGGAGCCTCGACGGATACTGTTGAGGAGAGCCGGAGATACGGGACCGCGGGGAAAT
TGTCGGCGAGCATGGAGGGGAGGATAGTGGATCCGGTTACGGGTCGGGTTCTTGGACCAA
ACCGTACCGGTGAGCTGTGGCTTAAGGGTCCTTCCATAATGAAAGGTTATTTTAGTAATG
AGGAAGCTACGAGCTCTACTCTTGATTCTGAAGGATGGTTAAGAACTGGAGATCTCTGCT
ATATCGATGAAGATGGATTTATCTTTGTTGTTGATCGGTTAAAGGAACTCATCAAGTACA
AAGGCTACCAGGTCCCTCCAGCTGAGCTAGAGGCGTTGTTGCTCACTCATCCTGAAATCG
CTGATGCCGCAGTTATCCCGTTTCCGGACAAAGAAGTAGGGCAGTTTCCGATGGCGTACG
TTGTAAGGAAACCAGGAAGCTTGTTATCTGAGAAGTCAGTGATGGAGTTTGTAGCAAAAC
AAGTGGCACCGTACAAGAGGGTACGAAAGGTGGCTTTTGTATCCTCCATACCAAAAAATC
CTTCAGGAAAGATTCTGCGCAAGGATCTCATCAAGCTCGCAACGTCCAACTCCAAACTTT
GAGTCTTGTGCTGTGAGCCAATCTCCGAGCATTATTGTTACTTTGTGTTGTAGTAACTCT
TGTCAATTCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1F411TF U 1
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BQ
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AF RS1EF90TF U 1
AF RS1FY05TF U 1
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1C082JQ C 1
AF RS1C082TF U 1
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QA 1 549 1 549
DS 

RD RS1C082TF 549 0 0
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GACGATATGAGTGTCGGGGGGTTTGATGAGTAGTTTCGGGATGCAATCAAATATTGGATT
CGAATTGTATAAGGCAAAATGGTACTTGTACAGAACTCAGGGATGAATATAGAAGTTTAT
GTTCATGTT

QA 1 549 1 549
DS 



AS 1 2

CO CL8396Contig1 752 2 7 U
GGATATTTCTCAATCAAGATTGCCTTACTCAAATCTTTCAAAGACTCAAATCTACAGAGA
TCTTGATCCTATTAGCCTGACTCTTTGTTTCTAAAAATGGGTAGCGAGATTCATTCATCC
GGCGAGACCGTACGGTTCTTGATTCATTTTTTCAATGGAAGATGGTTCATGGTGTTCGCT
TCGTTCCTCATCATGGCATGCGCTGGAGCCACTTACCTCCTCGGGACTTACTCTAAAGAT
ATCAAATCCACCCTCGGTTACGACCAGACGACGTTGAACATGTTAGGTTTCTTTAAAGAC
CTGGGAGCTAACGTAGGAGTCATGTCCGGACTCATAGCCGAAGTCACCCCGACTTGGTTC
GTCCTCGTCATCGGCTCCGCCATGAACTTCGTCGGCTACTTCATGATCTGGCTCACCGTA
ACAGGGAGAGTAGCGAAACCGAAAGTGTGGCAGATGTGTCTCTACATTTGCATCGGAGCT
AACTCCCAGAACTTTGCAAACACGGGAGCTTTGGTTATTTGCGTCAAGAACTTCCCTGAG
AGCAGAGGAGTCATGCTCGGTTTGCTCAAAGGTTACGTTGGGTTGAGTGGAGCGATATTC
ACGCAGCTTTACTTCGCTATTTACGTAACGATTCCAGTCTTTGATTCTGCTGATCGCTTG
GCTACCCGCTCTGTCTCCTTGTGTTGTGTATCATAGAGAGAGAAGTGTGAGCAGAGAACG
AGATCACGTGTCTACACTCTCTACATCTCATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EX62TF U 70
AF RS1F016TF U 1
BS 1 219 RS1F016TF
BS 220 220 RS1EX62TF
BS 221 299 RS1F016TF
BS 300 300 RS1EX62TF
BS 301 571 RS1F016TF
BS 572 572 RS1EX62TF
BS 573 752 RS1F016TF

RD RS1EX62TF 552 0 0
TATTAGCCTGACTCTTTGTTTCTAAAAATGGGTAGCGAGATTCATTCATCCGGCGAGACC
GTACGGTTCTTGATTCATTTTTTCAATGGAAGATGGTTCATGGTGTTCGCTTCGTTCCTC
ATCATGGCATGCGCTGGAGCCACTTACCTCCTCGGGACTTACTCTAAAGATATCAAATCC
ACCCTCGGTTACGACCGGACGACGTTGAACATGTTAGGTTTCTTTAAAGACCTGGGAGCT
AACGTAGGAGTCATGTCCGGACTCATAGCCGAAGTCACCCCGACTTGGTTCGTCCTCGTC
ATCGGCTCCGCCATGAACTTCGTCGGCTACTTCATGATCTGGCTCACCGTAACAGGGAGA
GTAGCGAAACCGAAAGTGTGGCAGATGTGTCTCTACATTTGCATCGGAGCTAACTCCCAG
AACTTTGCAAACACGGGAGCTTTGGTTATTTGCGTCAAGAACTTCCCTGAGAGCAGAGGA
GTCATGCTCGGTTTGCTCAAAGGTTACGTTGGGTTGAGTGGAGCGATATTCACGCAGCTT
TACTTCGCTATT

QA 1 552 1 552
DS 

RD RS1F016TF 752 0 0
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TCTTGATCCTATTAGCCTGACTCTTTGTTTCTAAAAATGGGTAGCGAGATTCATTCATCC
GGCGAGACCGTACGGTTCTTGATTCATTTTTTCAATGGAAGATGGTTCATGGTGTTCGCT
TCGTTCCTCATCATGGCATGCGCTGGAGCCACTTACCTCTTCGGGACTTACTCTAAAGAT
ATCAAATCCACCCTCGGTTACGACCAGACGACGTTGAACATGTTAGGTTTCTTTAAAGAT
CTGGGAGCTAACGTAGGAGTCATGTCCGGACTCATAGCCGAAGTCACCCCGACTTGGTTC
GTCCTCGTCATCGGCTCCGCCATGAACTTCGTCGGCTACTTCATGATCTGGCTCACCGTA
ACAGGGAGAGTAGCGAAACCGAAAGTGTGGCAGATGTGTCTCTACATTTGCATCGGAGCT
AACTCCCAGAACTTTGCAAACACGGGAGCTTTGGTTATTTGCGTCAAGAACTTCCCTGAG
AGCAGAGGAGTCATGCTCGGTTTGCTCAAAG*TTACGTTGGGTTGAGTGGAGCGATATTC
ACGCAGCTTTACTTCGCTATTTACGTAACGATTCCAGTCTTTGATTCTGCTGATCGCTTG
GCTACCCGCTCTGTCTCCTTGTGTTGTGTATCATAGAGAGAGAAGTGTGAGCAGAGAACG
AGATCACGTGTCTACACTCTCTACATCTCATC

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

CO CL8397Contig1 453 2 7 U
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AGTTTTGTAAACCAGTGGCAAATATTTGGCGCAAAAAAGAAGGTCTTAGGAAACGTATAA
CAAGCTTTTCAGACACAAAGCTGGTTTCTTTTTAGCGCTGAAAAATGAATAAGAAAAATT
GATAACCGGGATGGGGAGACATAACCTCCCCCCTGCTTTATTGTAAAGAGAGAAAAACTC
GTTTAATGATGAGCATTGGCTTCAACCTTGTGAGGCTTCGTCATCTTCAAGAACTTGAGC
TTCATGCTCCCGTAGACGAGACCCAGGCTAAAAGCCGAAGCACGAGCCACAAGAGCAAGA
GAGCTGGTGCCGGAGTAAAGTCCTGGAGGCAGCGTCATCGTCGATTCCTATGTCGTAGTC
TTCGCAGAAACAAAAACCCTAAATTCCCAAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CH53JQ U 149
AF RS1BD26TF C 1
BS 1 148 RS1BD26TF
BS 149 259 RS1CH53JQ
BS 260 260 RS1BD26TF
BS 261 288 RS1CH53JQ
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BS 290 302 RS1CH53JQ
BS 303 453 RS1BD26TF

RD RS1CH53JQ 154 0 0
TTTTTAGCGCTGAAAAATGAATAAGAAAAATTGATAACCGGGATGGGGAGACATAACCTC
CCCCCTGCTTTATTGTAAAGAGAGAAAAACTCGTTTAATGATGAGCATTGGTTTCAACCT
TGTGAGGCTTCGTCATCTTCCAGAACTTGAGCTT

QA 1 154 1 154
DS 

RD RS1BD26TF 453 0 0
TATTTAAGAGGTGAAGTGAATTGGGATGGTGATAACAAAGGTAAATATCCTCTTGACTCG
AGTTTTGTAAACCAGTGGCAAATATTTGGCGCAAAAAAGAAGGTCTTAGGAAACGTATAA
CAAGCTTTTCAGACACAAAGCTGGTTTCTTTTTAGCGCTGAAAAATGAATAAGAAAAATT
GATAACCGGGATGGGGAGACATAACCTCCCCCCTGCTTTATTGTAAAGAGAGAAAAACTC
GTTTAATGATGAGCATTGGCTTCAACCTTGTGAGGCTTCGTCATCTTCAAGAACTTGAGC
TTCATGCTCCCGTAGACGAGACCCAGGCTAAAAGCCGAAGCACGAGCCACAAGAGCAAGA
GAGCTGGTGCCGGAGTAAAGTCCTGGAGGCAGCGTCATCGTCGATTCCTATGTCGTAGTC
TTCGCAGAAACAAAAACCCTAAATTCCCAAATC

QA 1 453 1 453
DS 



AS 1 2

CO CL8398Contig1 535 2 1 U
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CTATCCGAGAGATACTAGAAAAAGAAAAGAAGGAGAGAAGTGTGGCTAAAGCTGAAAACC
GACCAACGCCGCAGTTATATAATAGTACAAACATCAGGCCTTTGAACATGAATGATTTCA
AGACCGCCCATGAACAGGTTTGTGCGAGTGTGTCGACCGATTCATCAAACATGAACGAGC
TGCAGCAATGGAACGAGCTATATGGAGAAGGAGGGTCAAGGAAGAAGACGTCACTCAGCT
ACTTCATGTAAAAGAAAAACTCTCTTTGATCCTTTAAGAGAGAGAAGAGTCCCTCTTGAA
TGATCTAAAAAACTGTTTTGTTCACTTAATTATTTTTTTGCTCTTCTGGAAAAACAATGC
CTCAAGAAAAAAGAGAAATATCCGGATGTGTAATCTATTTACATGCTTAATGATGTACTC
TCAACTATGTATATAGGGAGAATTTTAGATATTTTATTAGTAATTTTAGTTATTT


BQ
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AF RS1GT70JQ C 1
AF RS1GT70TF U 1
BS 1 535 RS1GT70TF

RD RS1GT70JQ 535 0 0
GGACAGATGGGTACTCAGGGAGTGACTTAAATAATCTTTGCGTGACCGCAGCGCATCTAC
CTATCCGAGAGATACTAGAAAAAGAAAAGAAGGAGAGAAGTGTGGCTAAAGCTGAAAACC
GACCAACGCCGCAGTTATATAATAGTACAAACATCAGGCCTTTGAACATGAATGATTTCA
AGACCGCCCATGAACAGGTTTGTGCGAGTGTGTCGACCGATTCATCAAACATGAACGAGC
TGCAGCAATGGAACGAGCTATATGGAGAAGGAGGGTCAAGGAAGAAGACGTCACTCAGCT
ACTTCATGTAAAAGAAAAACTCTCTTTGATCCTTTAAGAGAGAGAAGAGTCCCTCTTGAA
TGATCTAAAAAACTGTTTTGTTCACTTAATTATTTTTTTGCTCTTCTGGAAAAACAATGC
CTCAAGAAAAAAGAGAAATATCCGGATGTGTAATCTATTTACATGCTTAATGATGTACTC
TCAACTATGTATATAGGGAGAATTTTAGATATTTTATTAGTAATTTTAGTTATTT

QA 1 535 1 535
DS 

RD RS1GT70TF 535 0 0
GGACAGATGGGTACTCAGGGAGTGACTTAAATAATCTTTGCGTGACCGCAGCGCATCTAC
CTATCCGAGAGATACTAGAAAAAGAAAAGAAGGAGAGAAGTGTGGCTAAAGCTGAAAACC
GACCAACGCCGCAGTTATATAATAGTACAAACATCAGGCCTTTGAACATGAATGATTTCA
AGACCGCCCATGAACAGGTTTGTGCGAGTGTGTCGACCGATTCATCAAACATGAACGAGC
TGCAGCAATGGAACGAGCTATATGGAGAAGGAGGGTCAAGGAAGAAGACGTCACTCAGCT
ACTTCATGTAAAAGAAAAACTCTCTTTGATCCTTTAAGAGAGAGAAGAGTCCCTCTTGAA
TGATCTAAAAAACTGTTTTGTTCACTTAATTATTTTTTTGCTCTTCTGGAAAAACAATGC
CTCAAGAAAAAAGAGAAATATCCGGATGTGTAATCTATTTACATGCTTAATGATGTACTC
TCAACTATGTATATAGGGAGAATTTTAGATATTTTATTAGTAATTTTAGTTATTT

QA 1 535 1 535
DS 



AS 1 2

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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CAGAAGTAGCTAAGTTGCTTAGTCGACCAAACTTAATTTTTGGTTCTTGGAAAATAATAG
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QA 1 536 1 536
DS 



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BQ
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AF RS1AU40JQ C 1
AF RS1AU40TF U 1
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DS 

RD RS1AU40TF 540 0 0
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QA 1 540 1 540
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FJ29TF U 1
AF RS1FJ29JQ C 320
BS 1 694 RS1FJ29TF
BS 695 720 RS1FJ29JQ

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CCATGTGATTCTGTTTTCATGGAGTACCTGATCAAATTGATCGATCTACGAATGGATGGA
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TTACAAAAAGAACAACTGTTTGTATTTTAGAGAATCAGTATGTGGCATTTTTTGTATTTG
TAAAGATATTTAAGATTAGATAGGCTTTATTCAGATATTCAACCCACGTCTCCATAAGCA
TTGTTCCATCAAAATCAATTTTCATTGTAAACAATGACAGATGAATTCGTTTTGTATACT
CAAAACTGTTTCTCTACTGAAAGTTTCAGTCAAA
GT

QA 1 694 1 694
DS 

RD RS1FJ29JQ 401 0 0
AAGAAGAATTCGGCCTCCCAACCAGTGGACCAATCACCTTGCCATGTGATTCTGTTTTCA
TGGAGTACCTGATCAAATTGATCGATTTACGAATGGATGGAGACACAGAAAGAGCTCTAT
TAATGTCAATCCCTACGGCTAGGTGTTTTTATCCATGCTCTTTACAAAAAGAACAACTGT
TTGTATTTTAGAGAATCAGTATGTGGCATTTTTTGTATTTGTAAAGATATTTAAGATTAG
ATAGGCTTTATTCAGATATTCAACCCACGTCTCCATAAGCATTGTTCCATCAAAATCAAT
TTTCATTGTAAACAATGACAGATGAATTCGTTTTGTATACTCAAAACTGTTTCTTTACTG
AAAGTTTCAGTCAAAAGTTTTCAATACACGTCATTCTTTGC

QA 1 401 1 401
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8403Contig1 592 2 6 U
GGCTCTTCTATTTAACTTATCATTTTGCGCCGCTCACCCCCGAAAGGGCTTCTCTTCCTG
TAAATCCGGCTAGCAGCGACACTTCACGGCGTTGAGAAGATGGTAGCGGCGAAGAAGACG
AAGAAGTCCCATGAGGGAATCAACAGCAGATTAGCTCTTGTGATGAAGAGTGGAAAGTAC
ACCCTTGGCTACAAATCAGTTCTCAAGTCCCTTCGCAGCTCCAAAGGCAAGTTGATTCTT
ATCTCGAGCAACTGCCCTCCGTTGAGGAGATCAGAGATCGAGTATTACGCCATGCTTGCT
AAAGTCGGCGTTCATCACTACAACGGGAACAATGTCGATTTGGGAACTGCTTGCGGGAAG
TATTTCCGGGTTTCTTGCCTCAGCATCGTTGACCCAGGTGACTCCGACATCATCAAGTCG
CTTCCTGGAGACCAGTGATTTGTTATGAGTTTGCCATGTTTTGTCTGCTTTTTTATGGAA
TGTGTTCTGGAAAGACATCATGTTTGGTTTCTGAACTCCTTATGCTTAATTACACTTTCG
TCTCTCGGATCCATTTTGCATGAATGGAAAGACTTATTTTAGGTTATTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1BU89TF U 1
AF RS1AR32TFB U 36
BS 1 178 RS1BU89TF
BS 179 179 RS1AR32TFB
BS 180 569 RS1BU89TF
BS 570 570 RS1AR32TFB
BS 571 579 RS1BU89TF
BS 580 592 RS1AR32TFB

RD RS1BU89TF 579 0 0
GGCTCTTCTATTTAACTTATCATTTTGCGCCGCTCACCCCCGAAAGGGCTTCTCTTCCTG
TAAATCCGGCTAGCAGCGACACTTCACGGCGTTGAGAAGATGGTAGCGGCGAAGAAGACG
AAGAAGTCCCATGAGGGAATCAACAGCAGATTAGCTCTTGTGATGAAGAGTGGAAAGTGC
ACCCTTGGCTACAAATCAGTTCTCAAGTCCCTTCGCAGCTCCAAAGGCAAGTTGATTCTT
ATCTCGAGCAACTGCCCTCCGTTGAGGAGATCAGAGATCGAGTATTACGCCATGCTTGCT
AAAGTCGGCGTTCATCACTACAACGGGAACAATGTCGATTTGGGAACTGCTTGCGGGAAG
TATTTCCGGGTTTCTTGCCTCAGCATCGTTGACCCAGGTGACTCCGACATCATCAAGTCG
CTTCCTGGAGACCAGTGATTTGTTATGAGTTTGCCATGTTTTGTCTGCTTTTTTATGGAA
TGTGTTCTGGAAAGACATCATGTTTGGTTTCTGAACTCCTTATGCTTAATTACACTTTCG
TCTCTCGGATCCATTTTGCATGAATGGAA*GACTTATTT

QA 1 579 1 579
DS 

RD RS1AR32TFB 557 0 0
ACCCCCGAAAGGGCTTCTCTTCCTGTAAATCCGGCTAGCAGCGACACTTCACGGCGTTGA
GAAGATGGTAGCGGCGAAGAAGACGAAGAAGTCCCATGAGGGAATCAACAGCAGATTAGC
TCTTGTGATGAAGAGTGGAAAGTACACCCTTGGCTACAAATCAGTTCTCAAGTCCCTTCG
CAGCTCCAAAGGCAAGTTGATTCTTATCTCGAGCAACTGCCCTCCGTTGAGGAGATCAGA
GATCGAGTATTACGCCATGCTTGCTAAAGTCGGCGTTCATCACTACAACGGGAACAATGT
CGATTTGGGAACTGCTTGCGGGAAGTATTTCCGGGTTTCTTGCCTCAGCATCGTTGACCC
AGGTGACTCCGACATCATCAAGTCGCTTCCTGGAGACCAGTGATTTGTTATGAGTTTGCC
ATGTTTTGTCTGCTTTTTTATGGAATGTGTTCTGGAAAGACATCATGTTTGGTTTCTGAA
CTCCTTATGCTTAATTACACTTTCGTCTCTCGGATCCATTTTGCATGAATGGAAAGACTT
ATTTTAGGTTATTTACC

QA 1 557 1 557
DS 



AS 1 2

CO CL8404Contig1 654 2 2 U
GTAGTGAAGCAACTCAGAGAAGAAACAGGAGCAGGAATGATGGACTGCAAGAATGCACTC
TTGGAGAACGAGGGCGATATGGTGAAAGCTCAAGAGTACCTCCGCAAGAAGGGACTATCT
AGCGCAGACAAGAAAGCCAGCAGAGCCACAGCCGAGGGGAGAATCGGTTCGTATATCCAT
GACAGCAGAATCGGTGTCCTCTTGGAGGTTAATTGCGAGACAGACTTTGTCTCACGCGGT
GACATTTTCAAGGAACTGGTTGATGATCTGGCGATGCAGGTGGCTGCGTGCCCTCAAGTA
GAGTACCTTGTACCTGAAGATGTTTCCGAAGAAATTGTTGAAGGAAGGATCTCAAAGAGG
CTGGGAGAAATGGCATTGCTTGAGCAGCCTTTCATTAAAGATGATAGCGTTCTGGTAAAG
GATCTTGTGAAGCAGACGGTGGCTACTCTTGGTGAAAACATCAAAGTCAGGAGGTTTGTT
AAGTTTACTCTTGGAGAAGACAACTGAGGATGGATGGAAAAACATATAAGGAGTTCGTGA
GTTTAAAGCAAAGTCTTACTCTTTTGTTTTGTAGACAAAATCTTCAGTATTCAAACCCCT
TTTGATTAGAGTTTTTAATCAAAAAGCTGTAAACTTTTTTTGGTTCATGAAAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1FZ45TF U 1
AF RS1FZ45JQ C 85
BS 1 619 RS1FZ45TF
BS 620 654 RS1FZ45JQ

RD RS1FZ45TF 619 0 0
GTAGTGAAGCAACTCAGAGAAGAAACAGGAGCAGGAATGATGGACTGCAAGAATGCACTC
TTGGAGAACGAGGGCGATATGGTGAAAGCTCAAGAGTACCTCCGCAAGAAGGGACTATCT
AGCGCAGACAAGAAAGCCAGCAGAGCCACAGCCGAGGGGAGAATCGGTTCGTATATCCAT
GACAGCAGAATCGGTGTCCTCTTGGAGGTTAATTGCGAGACAGACTTTGTCTCACGCGGT
GACATTTTCAAGGAACTGGTTGATGATCTGGCGATGCAGGTGGCTGCGTGCCCTCAAGTA
GAGTACCTTGTACCTGAAGATGTTTCCGAAGAAATTGTTGAAGGAAGGATCTCAAAGAGG
CTGGGAGAAATGGCATTGCTTGAGCAGCCTTTCATTAAAGATGATAGCGTTCTGGTAAAG
GATCTTGTGAAGCAGACGGTGGCTACTCTTGGTGAAAACATCAAAGTCAGGAGGTTTGTT
AAGTTTACTCTTGGAGAAGACAACTGAGGATGGATGGAAAAACATATAAGGAGTTCGTGA
GTTTAAAGCAAAGTCTTACTCTTTTGTTTTGTAGACAAAATCTTCAGTATTCAAACCCCT
TTTGATTAGAGTTTTTAAT

QA 1 619 1 619
DS 

RD RS1FZ45JQ 570 0 0
AAAGCTCAAGAGTACCTCCGCAAGAAGGGACTATCTAGCGCAGACAAGAAAGCCAGCAGA
GCCACAGCCGAGGGGAGAATCGGTTCGTATATCCATGACAGCAGAATCGGTGTCCTCTTG
GAGGTTAATTGCGAGACAGACTTTGTCTCACGCGGTGACATTTTCAAGGAACTGGTTGAT
GATCTGGCGATGCAGGTGGCTGCGTGCCCTCAAGTAGAGTACCTTGTACCTGAAGATGTT
TCCGAAGAAATTGTTGAAGGAAGGATCTCAAAGAGGCTGGGAGAAATGGCATTGCTTGAG
CAGCCTTTCATTAAAGATGATAGCGTTCTGGTAAAGGATCTTGTGAAGCAGACGGTGGCT
ACTCTTGGTGAAAACATCAAAGTCAGGAGGTTTGTTAAGTTTACTCTTGGAGAAGACAAC
TGAGGATGGATGGAAAAACATATAAGGAGTTCGTGAGTTTAAAGCAAAGTCTTACTCTTT
TGTTTTGTAGACAAAATCTTCAGTATTCAAACCCCTTTTGATTAGAGTTTTTAATCAAAA
AGCTGTAAACTTTTTTTGGTTCATGAAAAT

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 2

CO CL8405Contig1 744 2 2 U
GGGGGAAAAAAACACAAAAGGATTTCTTAGGGTTTGTTTGATTGATCCAAGCGGAAGAGA
AAATCGAAAGAGAGAGAAGGCATGGAAGAAGCGTTGATGAGCGCCTCAACAATCGCAGAC
CAGCGTCAGAAGATCGAACAGTACAAACTCATCCTCTCATCTGTTCTCTCCTCCAACGAT
CTTCTCCAATCCAAACACTTCATCGATCACATTCTGTCGGATGATGTGCCGTTGGTAGTT
TCGAGGCAGCTTTTGCAGTCTTTCGCACAAGAGGTCGGGAGGCTGGAACCAGAGACCCAG
AAGGAGATTGCTCTCTTCACACTCACCCAGATTCAGCCCAGAGTTGTCTCTTTCGAGGAA
CAGGCACTTGTTATTAGAGAAAAGCTTGCGGCTTTGTACGAATCAGAGCAGGAATGGTCT
AGAGCTGCCCAGATGTTGAGTGGCATTGATCTTGACTCTGGAATGAGGGCTGTTGACGAA
AACTTCAAGCTCTCAAAGTGTATCCAAATTGCTCGTTTGTATCTCGAGGATGATGATGCT
GTAAATGCAGAGACCTATATAAATAAAGCTTCTTTCTTGGTGAACAGCAGTCAGAATGAA
GTTTTAAATTTGCAGTACAAGGTCTGCCATGCTAGAATTCTGGACATGAAAAGAAAGTTC
TTAGACGCTGCACTTCGGTATTACAGCATATCTCAGATTGAAAAACGCCAAATAGGGGAT
GAAGAGATTGATGAGAATGCACTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1B216TF U 1
AF RS1FT92TF U 38
BS 1 582 RS1B216TF
BS 583 744 RS1FT92TF

RD RS1B216TF 582 0 0
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AAATCGAAAGAGAGAGAAGGCATGGAAGAAGCGTTGATGAGCGCCTCAACAATCGCAGAC
CAGCGTCAGAAGATCGAACAGTACAAACTCATCCTCTCATCTGTTCTCTCCTCCAACGAT
CTTCTCCAATCCAAACACTTCATCGATCACATTCTGTCGGATGATGTGCCGTTGGTAGTT
TCGAGGCAGCTTTTGCAGTCTTTCGCACAAGAGGTCGGGAGGCTGGAACCAGAGACCCAG
AAGGAGATTGCTCTCTTCACACTCACCCAGATTCAGCCCAGAGTTGTCTCTTTCGAGGAA
CAGGCACTTGTTATTAGAGAAAAGCTTGCGGCTTTGTACGAATCAGAGCAGGAATGGTCT
AGAGCTGCCCAGATGTTGAGTGGCATTGATCTTGACTCTGGAATGAGGGCTGTTGACGAA
AACTTCAAGCTCTCAAAGTGTATCCAAATTGCTCGTTTGTATCTCGAGGATGATGATGCT
GTAAATGCAGAGACCTATATAAATAAAGCTTCTTTCTTGGTG

QA 1 582 1 582
DS 

RD RS1FT92TF 707 0 0
GG
GATTGATCCAAGCGGAAGAGAAAATCGAAAGAGAGAGAAGGCATGGAAGAAGCGTTGATG
AGCGCCTCAACAATCGCATACCAGCGTCAGAAGATCGAACAGTACAAACTCATCCTCTCA
TCTGTTCTCTCCTCCAACGATCTTCTCCAATCCAAACACTTCATCGATCACATTCTGTCG
GATGATGTGCCGTTGGTAGTTTCGAGGCAGCTTTTGCAGTCTTTCGCACAAGAGGTCGGG
AGGCTGGAACCAGAGACCCAGAAGGAGATTGCTCTCTTCACACTCACCCAGATTCAGCCC
AGAGTTGTCTCTTTCGAGGAACAGGCACTTGTTATTAGAGAAAAGCTTGCGGCTTTGTAT
GAATCAGAGCAGGAATGGTCTAGAGCTGCCCAGATGTTGAGTGGCATTGATCTTGACTCT
GGAATGAGGGCTGTTGACGAAAACTTCAAGCTCTCAAAGTGTATCCAAATTGCTCGTTTG
TATCTCGAGGATGATGATGCTGTAAATGCAGAGACCTATATAAATAAAGCTTCTTTCTTG
GTGAACAGCAGTCAGAATGAAGTTTTAAATTTGCAGTACAAGGTCTGCCATGCTAGAATT
CTGGACATGAAAAGAAAGTTCTTAGACGCTGCACTTCGGTATTACAGCATATCTCAGATT
GAAAAACGCCAAATAGGGGATGAAGAGATTGATGAGAATGCACTA

QA 3 707 3 707
DS 



AS 1 2

CO CL8406Contig1 704 2 2 U
GTCCATGATATTTGGTGTGTTCGTGATCCCGAAAGCCTCGCTGGCTGTAATTTTTGTGGA
TGGGGAAGACGACCACTCCCATTGGTTTCTGCTGCTGGAGTTTCCATTGCGTCCTTGCTT
ATTGGGGTCTGCTTCACGTTACAGGAAATGAATATTATTCCTGAACTGACTGGTGTGTTC
ATCTTCATATTCATTCTGGCCTACTTTGGATGTTTTGCCATCGGTGTGGGAGGGCTGCCC
TGGGTCATTATGTCCGAGATTTTTCCAATCAATATTAAAGTTTCAGCGGGGACAATAGTA
GCATTAACCTCATGGACCAGTGGGTGGTTCGTGAGTTACGCTTTCAACTTTATGTTTGAA
TGGAGCGCACAAGGAACATTTTACATCTTTGGGGTTGTCGGAGGGGCATCATTGGTTTTT
ATTTGGTTTCTCGTCCCGGAAACCAAAGGACAGTCACTGGAAGAATTACAAGCTTCACTT
ACGGGGACAACTTAAACACATATTTATGTCGTAATTGCTATTAAATTTGTTTTTAGCAAC
CTTATAGTGATCCAAGTGGCTTTATACAAAATATTTTGCTTGCACTTATTACAAGCATAA
TGCTTGATAGTATACCCTCTTCTTCTAAAAGGGTACAACTTGTATTGTTAATTACAAAGT
TCATTTTTGTGAAAGGGTTTGTAATAACAAATTTAATCGTGCAC


BQ
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AF RS1EI62TF U 1
AF RS1EI62JQ C 133
BS 1 672 RS1EI62TF
BS 673 704 RS1EI62JQ

RD RS1EI62TF 672 0 0
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TGGGGAAGACGACCACTCCCATTGGTTTCTGCTGCTGGAGTTTCCATTGCGTCCTTGCTT
ATTGGGGTCTGCTTCACGTTACAGGAAATGAATATTATTCCTGAACTGACTGGTGTGTTC
ATCTTCATATTCATTCTGGCCTACTTTGGATGTTTTGCCATCGGTGTGGGAGGGCTGCCC
TGGGTCATTATGTCCGAGATTTTTCCAATCAATATTAAAGTTTCAGCGGGGACAATAGTA
GCATTAACCTCATGGACCAGTGGGTGGTTCGTGAGTTACGCTTTCAACTTTATGTTTGAA
TGGAGCGCACAAGGAACATTTTACATCTTTGGGGTTGTCGGAGGGGCATCATTGGTTTTT
ATTTGGTTTCTCGTCCCGGAAACCAAAGGACAGTCACTGGAAGAATTACAAGCTTCACTT
ACGGGGACAACTTAAACACATATTTATGTCGTAATTGCTATTAAATTTGTTTTTAGCAAC
CTTATAGTGATCCAAGTGGCTTTATACAAAATATTTTGCTTGCACTTATTACAAGCATAA
TGCTTGATAGTATACCCTCTTCTTCTAAAAGGGTACAACTTGTATTGTTAATTACAAAGT
TCATTTTTGTGA

QA 1 672 1 672
DS 

RD RS1EI62JQ 572 0 0
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ATTCTGGCCTACTTTGGATGTTTTGCCATCGGTGTGGGAGGGCTGCCCTGGGTCATTATG
TCCGAGATTTTTCCAATCAATATTAAAGTTTCAGCGGGGACAATAGTAGCATTAACCTCA
TGGACCAGTGGGTGGTTCGTGAGTTACGCTTTCAACTTTATGTTTGAATGGAGCGCACAA
GGAACATTTTACATCTTTGGGGTTGTCGGAGGGGCATCATTGGTTTTTATTTGGTTTTTC
GTCCCGGAAACCAAAGGACAGTCACTGGAAGAATTACAAGCTTCACTTACGGGGACAACT
TAAACACATATTTATGTCGTAATTGCTATTAAATTTGTTTTTAGCAACCTTATAGTGATC
CAAGTGGCTTTATACAAAATATTTTGCTTGCACTTATTACAAGCATAATGCTTGATAGTA
TACCCTCTTCTTCTAAAAGGGTACAACTTGTATTGTTAATTACAAAGTTCATTTTTGTGA
AAGGGTTTGTAATAACAAATTTAATCGTGCAC

QA 1 572 1 572
DS 



AS 1 2

CO CL8407Contig1 979 2 2 U
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GTCATCGACTCCCCGGAAAGGTTAAAAGAATGGGACCTATTCTGGGACATACAATGCATT
ACAGACGTATGATCATTACGCTTCAACCGGGTTATTCTATTCCACCTCTTAGAAAGAAAA
GAACTTAAATCAAAATACTTAATAGCATGGCGATACATTTATACAAAACTTCTACCCCGA
GCACACGCAATGGAGCCGTAGACAGTCAAGTGAAATCCAATCCACGAAATAATTTGATCT
ATGGGCAGCATCATTGTGGTAAAGGTCGTAATGCCAGAGGAATCATTACCGTAAGGCATA
GAGGGGGAGGTCATAAGCGTCTATACCGTAAAATAGATTTTCGACGAAATACAAAAGACA
TATATGGTAGAATCGTAACCATAGAATACGACCCTAATCGAAATGCATACATTTGTCTCA
TACACTATGGGGATGGTGAGAAGAGATATATTTTACATCCCAGAGGGGCTATAATTGGAG
ATACCATTGTTTCTGGTACAGAAGTTCCTATAAAAATGGGAAATGCCCTACCTTTGACCG
ATATGCCCTTAGGCACGGCCATACATAATATAGAAATCACACTTAGAAAGGGTGGACAAT
TAGCTAGAGCAGCGGGTGCTGTAGCGAAACTGATTGCAAAAGAGGGGAAATCGGCCACAT
TAAAATTACCTTTTGGAGAGGTCCGTTTGATATCCAAAAACTGCTCAGCAACAGTCGGAC
AAGTGGGAAATGTTGGGGTAGACCAGAAAAGTTTGGGTAGAGCCGGATCGAAATGTTGGC
TAGGTAAACGTCCTGTAGTAAGAGGAGTAGTTATGAACCCTGTCGACCACCCCCATGGAG
GTGGTGAAGGGAGGGCTCCAATTGGTAGAAAAAAACCCGTAACCCCCTGGGGTTATCCTG
CGCTTGGAAGAAGAACTAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G421TF U 1
AF RS1G421JQ C 481
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BS 613 979 RS1G421JQ

RD RS1G421TF 617 0 0
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GTCATCGACTCCCCGGAAAGGTTAAAAGAATGGGACCTATTCTGGGACATACAATGCATT
ACAGACGTATGATCATTACGCTTCAACCGGGTTATTCTATTCCACCTCTTAGAAAGAAAA
GAACTTAAATCAAAATACTTAATAGCATGGCGATACATTTATACAAAACTTCTACCCCGA
GCACACGCAATGGAGCCGTAGACAGTCAAGTGAAATCCAATCCACGAAATAATTTGATCT
ATGGGCAGCATCATTGTGGTAAAGGTCGTAATGCCAGAGGAATCATTACCGTAAGGCATA
GAGGGGGAGGTCATAAGCGTCTATACCGTAAAATAGATTTTCGACGAAATACAAAAGACA
TATATGGTAGAATCGTAACCATAGAATACGACCCTAATCGAAATGCATACATTTGTCTCA
TACACTATGGGGATGGTGAGAAGAGATATATTTTACATCCCAGAGGGGCTATAATTGGAG
ATACCATTGTTTCTGGTACAGAAGTTCCTATAAAAATGGGAAATGCCCTACCTTTGACCG
ATATGCCCTTAG
CACGG

QA 1 612 1 612
DS 

RD RS1G421JQ 499 0 0
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ATACCATTGTTTTTGGTACAGAAGTTCCTATAAAAATGGGAAATGCCCTACCTTTGACCG
ATATGCCCTTAGGCACGGCCATACATAATATAGAAATCACACTTAGAAAGGGTGGACAAT
TAGCTAGAGCAGCGGGTGCTGTAGCGAAACTGATTGCAAAAGAGGGGAAATCGGCCACAT
TAAAATTACCTTTTGGAGAGGTCCGTTTGATATCCAAAAACTGCTCAGCAACAGTCGGAC
AAGTGGGAAATGTTGGGGTAGACCAGAAAAGTTTGGGTAGAGCCGGATCGAAATGTTGGC
TAGGTAAACGTCCTGTAGTAAGAGGAGTAGTTATGAACCCTGTCGACCACCCCCATGGAG
GTGGTGAAGGGAGGGCTCCAATTGGTAGAAAAAAACCCGTAACCCCCTGGGGTTATCCTG
CGCTTGGAAGAAGAACTAG

QA 1 499 1 499
DS 



AS 1 2

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ATACCACATGTCGTGACTCCACGCGCCGCCCCGTTTCATAAGAATCCAAAGCCCAACAAA
CAAAAACAACCATGGGCTGCGCAGCGTCGAAGCTCGACAACGAAGACACCTACGCGTTTT
GCGATGAGTGGAAGCTTACTCTAGACCGAGTCCCGGACACAGTGGCTTCAGAAGCAATCA
AGAGCTTCATCAACGTTGTCCACGTGATATCCGCGAAACAATCAGAGGAGCTAAAGATAA
AGAAACGAACTGAATCAGCATCAAAGGAGCTTGAGAAGAAAGCTTCGTCGCTTAGGAACA
TCGAAAGGAAATACTACCAGTCATACTCCACAGTCGGGTTTGGTCTCCCTGAATCAGGAC
CAGACAACGGGCACGGGCTAGACGCTCGTGACCCGCTCACGGAGAAAAAGTTAGAGCTAG
GAGCATGTCAGAGAAGAGTGGAGGAAGAGATGCTGAAACATTCAAAGGCAATAGAAGTGA
CAAGAGCCATGACTTTGAATAATTTGCAGACGGGTTTGCCAGGTGTGTTCCAAGCTTTAA
CCAGTTTCTCAGCTCTGTTCACGGAGTCCTTACAAACGGTATGCACTCGCTCATACTCCA
TCAAATAGCACCACTATATTATTACTATATAGTTTTAAGAAGATACAAATACTATATAGT
TAAAAGTTTTTGATGAGGTAAAAGGGCTCCCATGGTTATGTCTCTTATTATTTCGGGCTG
GTTGTTTGGATAATGTTTATTTCTGAAGAGAAAATGTATATATTATGGAGTCTATATTTA
AAAAAAGTTCTAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D505TF U 1
AF RS1D505JQ C 22
BS 1 568 RS1D505TF
BS 569 854 RS1D505JQ

RD RS1D505TF 568 0 0
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CAAAAACAACCATGGGCTGCGCAGCGTCGAAGCTCGACAACGAAGACACCTACGCGTTTT
GCGATGAGTGGAAGCTTACTCTAGACCGAGTCCCGGACACAGTGGCTTCAGAAGCAATCA
AGAGCTTCATCAACGTTGTCCACGTGATATCCGCGAAACAATCAGAGGAGCTAAAGATAA
AGAAACGAACTGAATCAGCATCAAAGGAGCTTGAGAAGAAAGCTTCGTCGCTTAGGAACA
TCGAAAGGAAATACTACCAGTCATACTCCACAGTCGGGTTTGGTCTCCCTGAATCAGGAC
CAGACAACGGGCACGGGCTAGACGCTCGTGACCCGCTCACGGAGAAAAAGTTAGAGCTAG
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CAAGAGCCATGACTTTGAATAATTTGCA

QA 1 568 1 568
DS 

RD RS1D505JQ 833 0 0
TTTCCTGA
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCCAAAATGGCATACCACATGTCGTGACTCCACGCGCCGC
CCCGTTTCATAAGAATCCAAAGCCCAACAAACAAAAACAACCATGGGCTGCGCAGCGTCG
AAGCTCGACAACGAAGACACCTACGCGTTTTGCGATGAGTGGAAGCTTACTCTAGACCGA
GTCCCGGACACAGTGGCTTCAGAAGCAATCAAGAGCTTCATCAACGTTGTCCACGTGATA
TCCGCGAAACAATCAGAGGAGCTAAAGATAAAGAAACGAACTGAATCAGCATCAAAGGAG
CTTGAGAAGAAAGCTTCGTCGCTTAGGAACATCGAAAGGAAATACTACCAGTCATACTCC
ACAGTCGGGTTTGGTCTCCCTGATTCAGGACCAGACAACGGGCACGGGCTAGACGCTCGT
GACCCGCTCACGGAGAAAAAGTTAGAGCTAGGAGCATGTCAGAGAAGAGTGGAGGAAGAG
ATGCTGAAACATTCAAAGGCAATAGAAGTGACAAGAGCCATGACTTTGAATAATTTGCAG
ACGGGTTTGCCAGGTGTGTTCCAAGCTTTAACCAGTTTCTCAGCTCTGTTCACGGAGTCC
TTACAAACGGTATGCACTCGCTCATACTCCATCAAATAGCACCACTATATTATTACTATA
TAGTTTTAAGAAGATACAAATACTATATAGTTAAAAGTTTTTGATGAGGTAAAAGGGCTC
CCATGGTTATGTCTCTTATTATTTCGGGCTGGTTGTTTGGATAATGTTTATTTCTGAAGA
GAAAATGTATATATTATGGAGTCTATATTTAAAAAAAGTTCTAGG

QA 9 833 9 833
DS 



AS 1 2

CO CL8409Contig1 616 2 4 U
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AGGAAAGGTTAGGTAGAAAACGCGAAGCACGCAAGGGGGTCTGACATAATAATAATATGC
TCTCACTCACTTAGGCTAAGAATCTATCCATCTGCCTACGGATTAGGGTTTCCATCGATT
TCAATCTCTTCCTTGGGCTTCAGAGATTCTCATCGTCTCCGTCTTTATATATAACACACA
CTACACATTCTTCGTCTTTGTGTTTGTTTCTTATCTTGTGAGGGGCTGCGATAAGAAGGT
CTTCCCGTTCAGATAAAAATCGATGGATTCGCAGATGCTCGTGGCGCTTGGTCTATCCCT
TGTGGGTGGATTAAGTACTTCTTTAGGTGCGCTTTTCGTAGTTCTTAGCGAGACTCCCAA
TATGAAGATGCTTGGACTTCTTCAGGGTTTTGCGGCAGGTCTCATGTTGAGCATATCCTT
CCTTGATTTGGCTCATAATGCTATCAACTCCATTGGCTTCTTAAAAGGCAATCTCTGGTT
TTTCGGTGGTGTGATATTCTTTGCGTGTATTGCCAAATTCATACCCGAACCAACACTTGC
TCCTTCTACTGATGTG


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G308TF U 1
AF RS1GK21TF U 3
BS 1 334 RS1G308TF
BS 335 335 RS1GK21TF
BS 336 548 RS1G308TF
BS 549 616 RS1GK21TF

RD RS1G308TF 548 0 0
GGGAGATAAATCGGGGCCAACATAAACCAGGGGAACAGGCAAAGGAGAAAGAAGATGAAG
AGGAAAGGTTAGGTAGAAAACGCGAAGCACGCAAGGGGGTCTGACATAATAATAATATGC
TCTCACTCACTTAGGCTAAGAATCTATCCATCTGCCTACGGATTAGGGTTTCCATCGATT
TCAATCTCTTCCTTGGGCTTCAGAGATTCTCATCGTCTCCGTCTTTATATATAACACACA
CTACACATTCTTCGTCTTTGTGTTTGTTTCTTATCTTGTGAGGGGCTGCGATAAGAAGGT
CTTCCCGTTCAGATAAAAATCGATGGATTCGCAGGTGCTCGTGGCGCTTGGTCTATCCCT
TGTGGGTGGATTAAGTACTTCTTTAGGTGCGCTTTTCGTAGTTCTTAGCGAGACTCCCAA
TATGAAGATGCTTGGACTTCTTCAGGGTTTTGCGGCAGGTCTCATGTTGAGCATATCCTT
CCTTGATTTGGCTCATAATGCTATCAACTCCATTGGCTTCTTAAAAGGCAATCTCTGGTT
TTTCGGTG

QA 1 548 1 548
DS 

RD RS1GK21TF 614 0 0
GG
GATAAATCGGGGCCAACATAAACCAGGGGAACAGGCAAAGGAGAAAGAAGATGAAGAGGA
AAGGTTAGGTAGAAAACGCGAAGCACGCAAGGGGGTCTGACATAATAATAATATGCTCTC
ACTCACTTAGGCTAAGAATCTATCCATCTGCCTACGGATTAGGGTTTCCATCGATTTCAA
TCTCTTCCTTGGGCTTCAGAGATTCTCATCGTCTCCGTCTTTATATATAACACACACTAC
ACATTCTTCGTCTTTGTGTTTGTTTCTTATCTTGTGAGGGGCTGCGATAAGAAGGTCTTC
CCGTTCAGATAAAAATCGATGGATTCGCAGATGCTCGTGGCGCTTGGTCTATCCCTTGTG
GGTGGATTAAGTACTTCTTTAGGTGCGCTTTTCGTAGTTCTTAGCGAGACTCCCAATATG
AAGATGCTTGGACTTCTTCAGGGTTTTGCGGCAGGTCTCATGTTGAGCATATCCTTCCTT
GATTTGGCTCATAATGCTATCAACTCTATTGGCTTCTTAAAAGGCAATCTCTGGTTTTTC
GGTGGTGTGATATTCTTTGCGTGTATTGCCAAATTCATACCCGAACCAACACTTGCTCCT
TCTACTGATGTG

QA 3 614 3 614
DS 



AS 1 2

CO CL8410Contig1 778 2 6 U
GTAAGAGGCTACAAGCCTACAACTACATTTGACACTGAAAGTTAATGTCCTCTTCATTGT
ATTCAAAGATTCAAGTCTATGATAATTTTAAATTTGTGTTGTCACAAGTCTAATAAAAAA
AACAGAAATATGTCGATAGTCTCTATCTTCTTGTCATCGCTTCACCTCCTCAGTTGTCTT
CTTCCCAAAGAAAAAGTCTTCTTAGGAATGTAGACCTTGTAACTCACCTGAACCATTTCT
CCACCCCTCATCACGGTCATTGTTTTCTGCTCGTACTGTGACTCACCTTTTGTTTCATCG
TTTGTCTTCTGTTCAGACTGAGACTCTTCTTTGTTTTCATCTAATGTCTCAGTCTCAGCA
TGAGAAAAAAACCTAGCGCTAACTTTTCTCGGTTCAATGCTTTCCGGTCCATTCTTTGTT
GCCAGAGCTAAAGAAGTTTCTGGACAACTCTTGCCATTGATGCTCTCTGCTTCAGCACCT
TGACAACCATCGGCTTCTTTCTTGCTAGCCAGATTTAAACTTCCCTGTCTCAATACCGGT
CTAATCAACTTCCTTTTGGTTGTTGTACACGAGCTAATCTCAGGACCAGCTTTGACCATG
GCAGTATCACCACCAGACTGTTGAGAGGGAAGATCAGCCAACCCTGTTCCAGATTCCTTC
ACATTATCGACTTGTGTAGTCTCAAGATCTTTGTCTCCCTCTGAAACACAGAGCTTCTGC
TTCGTGACAGGGCACTCTTTTGACTCTTCAATTTTTTCAGATTCAGTCTGAAGAGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1BJ87JQ U 1
AF RS1EC12JQ U 37
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CTTCCCAAAGAAAAAGTCTTCTTAGGAATGTAGACCTTGTAACTCACCTGAACCATTTCT
CCACCCCTCGTCACGGTCATTGTTTTCTGCTCGTACTGTGACTCACCTTTTGTTTCATCG
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G

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DS 

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AAACTTCCCTGTCTCAATACCGGTCTAATCAACTTCCTTTTGGTTGTTGTACACGAGCTA
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GCCAACCCTGTTCCAGATTCCTTCACATTATCGACTTGTGTAGTCTCAAGATCTTTGTCT
CCCTCTGAAACACAGAGCTTCTGCTTCGTGACAGGGCACTCTTTTGACTCTTCAATTTTT
TCAGATTCAGTCTGAAGAGTTT

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1D152JQ C 1
AF RS1D152TF U 1
BS 1 537 RS1D152TF

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CTCACGTCACGGACTCAGAATTCGATCTTTTGTTTTGTTGTAAATCTTTCGTTTTTAACT
TCTTTTTTTCTTTCTTTTCGGATGATTTATGCTATCTGTGTTCTTTGTTGTATTGTGTTT
GTGTTGTTTAGCTTCTTGTGGTAGAAAGGCCAAAGACATGAGAATCAATGTTTTGATGTG
TAGAAGAAAAACAAGGACCTTTGCTGTAATGATGTTGTAATATTCTTTTGTCGGCCG

QA 1 537 1 537
DS 

RD RS1D152TF 537 0 0
GGGATGGAAATGGGTACATTTTGCCCCAAGAGCTTTGTGAAGCCTTAAAGGAAGATGGAG
GGGATGACTGTGTGAATGTCGCCAATGATATATTCCAAGAAGTTGACACAGACAAGGATG
GGAGAATAAGCTACGAAGAGTTTGCGGCAATGATGAAAACAGGAACGGATTGGAGAAAGG
CGTCTCGACATTACTCGAGAGGGAGATTCAATAGCCTAAGCATCAAGCTTGAAGGACGGA
TCTTTGAACCTAGGCAACGAATAGCAGTAAGCCCGAATTAGATTTTTGTAGAGTTTGTCT
CTCACGTCACGGACTCAGAATTCGATCTTTTGTTTTGTTGTAAATCTTTCGTTTTTAACT
TCTTTTTTTCTTTCTTTTCGGATGATTTATGCTATCTGTGTTCTTTGTTGTATTGTGTTT
GTGTTGTTTAGCTTCTTGTGGTAGAAAGGCCAAAGACATGAGAATCAATGTTTTGATGTG
TAGAAGAAAAACAAGGACCTTTGCTGTAATGATGTTGTAATATTCTTTTGTCGGCCG

QA 1 537 1 537
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8413Contig1 807 2 12 U
GGACCACACCAACATCTTCATCCCCCAACTCGGTTATGATGGCCAACGACCATTATCATC
ATCAACATCATCCTCTTCTGCATCATCATCATCATGCTGTTACCATGCATAGGCCCGCTT
CGGTCAATATTAAGCTTGACCAAGAAAATCATCTCCTTCATCAGAACATATCATATCCCA
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GCCATCTCTATGGATCTATGGAACAAGATTATTCAGTGAGCTACAACAACTTAGGCGGAG
GATGGACAAACATGGATCATAATCATCATTACTCAGCTCCAGCTTACAACTTCTTCGATA
GACCAAAGCCTCTGTCTGGACTAAAAGATCACGAAGAAGAAGGAGAATATGGTGGCGATG
CTTATCTGGAACATAGACGTACACTTTCTCTCTTCCCTATGCACGGTGAGGATCACATCA
ACGGCAGTGGTGATGCCTTTTTGAAGTACGGACAGTCGGACGAGCGTGATTATTATGGTA
GAGGGCCTTGTGCTTCTCTTAAGTTATGTCTAAACTCCTACGCAGGCGTCTCACCGGATT
AAAGCTCTCTTTCGCTATCTTTGTCTCTCTGATGTTTCGGTACTGACTAATGATGCAGTA
ATCATATAATAATAGTATCTCTCGTACTTAGTTTAGTTATCTGTAATTACTATCGTCTCT
CGGGTTAGCTTTCATTGAGTGCGTTTTTCTCCTTTCTTTTTAATGTAAGACGTTGAACTT
ATATTAGTATTTACAAATAAGAACTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BJ70TF U 1
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TCGGTACTGACTAATGATGCAGTAATCATATAATAATAGTATCTCTCGTACTTAGTTTAG
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QA 1 711 1 711
DS 



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BQ
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AF RS1DW04JQ C 1
AF RS1DW04TF U 1
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QA 1 536 1 536
DS 

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QA 1 536 1 536
DS 



AS 1 2

CO CL8415Contig1 948 2 10 U
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AGATGGACTGTCAATCATATTATTTGGGAAATAAAATTCAGCTTTACT


BQ
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AF RS1BD23TF U 1
AF RS1BD23JQ C 228
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RD RS1BD23TF 793 0 0
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CGTATTTGGGCTAGAACAGGCTGTGATTTCACTTCAAATTGGAATCAAGCTTGTGAAACG
GGTGATTGTGATGGACGTTTGGAGTGTAACGGGCTGATCGGAAAACCACCGGCAACACTT
ATCGAAATTGCGGTACAAGCAGACAAATCGAAACTCAATTTCTATGATGTTAGTCTTGTG
GACGGTTATAACCTCCCGGTCACAGTGACCTCGAAGCCCATGTCATCCAAATGCACCATC
TTTGGTTGCCATAGAGATCTCAAAACCACATGTCCCGAAGAATTACAGGTTGTGAACAAA
GAAGGACGAGTGGTGGCATGCAAGAGTGCTTGCTTAGCGTTTGATAACGACAGGTTTTGC
TGTCGGAATGCGTACGGAACGCCGGAAAAGTGCAAAAGGACTACATACTCTATGTTGTTT
AAAGAGGCTTGTCCCAGTTATTACAGTTATGCCTACGACACACCTCCTCCCTTGGTCAGT
TGCTCCGCAAA**GATACATCATCACGTTT*GTCCGTCAA*TTGGGGTCACA*TTCAGCG
TAAAAG
CTCAACG

QA 1 786 1 786
DS 

RD RS1BD23JQ 721 0 0
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AGCTTGTGAAACGGGTGATTGTGATGGACGTTTGGAGTGTAACGGGCTGATCGGAAAACC
ACCGGCAACACTTATCGAAATTGCGGTACAAGCAGACAAATCGAAACTCAATTTCTATGA
TGTTAGTCTTGTGGACGGTTATAACCTCCCGGTCACAGTGACCTCGAAGCCCATGTCATC
CAAATGCACCATCTTTGGTTGCCATAGAGATCTCAAAACCACATGTCCCGAAGAATTACA
GGTTGTGAACAAAGAAGGACGAGTGGTGGCATGCAAGAGTGCTTGCTTAGCGTTTGATAA
CGACAGGTTTTGCTGTCGGAATGCGTACGGAACGCCGGAAAAGTGCAAAAGGACTACATA
CTCTATGTTGTTTAAAGAGGCTTGTCCCAGTTATTACAGTTATGCCTACGACACACCTCC
TCCCTTGGTCAGTTGCTCCGCAAAAGAATACATCATCACGTTTTGTCCGTCAAATTGGGG
TCACAATTCAGCGTAAAAGGCTCCAAACGAAAAGCATCTTTATGTACTCATGAACGTGTG
ATTTATATATCTCGCTTAGGTTTGGTTACGTTTCCTTTATCGGGGGCGTAATAACGACCG
ATTGCGAGATGTGAGATGGACTGTCAATCATATTATTTGGGAAATAAAATTCAGCTTTAC
T

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL8416Contig1 769 2 2 U
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AGTCCCTCTTCTCATTCTTCCTACTAGTTATACTCTTTTCCGATACTGTTTTTTCGTCCC
GCAAAACATTTGATCAGAGAAAGCCCTGCAAACATTTCTCCTTCTACTTTCATGACATCC
TCTACGATGGTGACAATGTAGCAAACGCAACCTCAGCCGCTATCGTGAGCCCTCCAGGAT
TAGGAAACTTCAAGTTCGGTAAGTTTGTGATCTTTGATGGCCCTATAACAATGGACAAGA
ACTATCTCTCAGAACCCCTGGCTCGCGCACAAGGCTTCTATTTCTATGACATGAAAATGG
ACTTCAATGCGTGGTTTTGCTACACCTTGGTGTTTAACTCGACACAGCACAAAGGGACAT
TGAATATAATGGGTGCAGATTTGATGATGGAGCCGACAAGAGATCTATCGGTCGTCGGTG
GGACGGGTGATTTCTTCATGGCTCGTGGGATCGCTACCTTCGTAACAAATATATTTCAAG
GGGCTAAGTATTTCCGTGTTAAGATGGATGTTAAACTCTATGAATGTTACTAACTGACTA
CATGTGTTTGCTTGTTAAAGTTTGTGTGTTGGTTGACAGTACACATAAATAAAATGTGTT
ACTAAGAATAAATTATGTTTCTTTCTTTTTTTTAAATAGTTTTTGTGTCTGTTTGTTTGT
GATTTATAATTCTCGTTGTCCCAGATCCCCGTTTTCAGAAGCCGTAATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G248TF U 1
AF RS1G248JQ C 110
BS 1 645 RS1G248TF
BS 646 769 RS1G248JQ

RD RS1G248TF 645 0 0
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GCAAAACATTTGATCAGAGAAAGCCCTGCAAACATTTCTCCTTCTACTTTCATGACATCC
TCTACGATGGTGACAATGTAGCAAACGCAACCTCAGCCGCTATCGTGAGCCCTCCAGGAT
TAGGAAACTTCAAGTTCGGTAAGTTTGTGATCTTTGATGGCCCTATAACAATGGACAAGA
ACTATCTCTCAGAACCCCTGGCTCGCGCACAAGGCTTCTATTTCTATGACATGAAAATGG
ACTTCAATGCGTGGTTTTGCTACACCTTGGTGTTTAACTCGACACAGCACAAAGGGACAT
TGAATATAATGGGTGCAGATTTGATGATGGAGCCGACAAGAGATCTATCGGTCGTCGGTG
GGACGGGTGATTTCTTCATGGCTCGTGGGATCGCTACCTTCGTAACAAATATATTTCAAG
GGGCTAAGTATTTCCGTGTTAAGATGGATGTTAAACTCTATGAATGTTACTAACTGACTA
CATGTGTTTGCTTGTTAAAGTTTGTGTGTTGGTTGACAGTACACA

QA 1 645 1 645
DS 

RD RS1G248JQ 660 0 0
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TCATGACATCCTCTACGATGGTGACAATGTAGCAAACGCAACCTCAGCCGCTATCGTGAG
CCCTCCAGGATTAGGAAACTTCAAGTTCGGTAAGTTTGTGATCTTTGATGGCCCTATAAC
AATGGACAAGAACTATCTCTCAGAACCCCTGGCTCGCGCACAAGGCTTCTATTTCTATGA
CATGAAAATGGACTTCAATGCGTGGTTTTGCTACACCTTGGTGTTTAACTCGACACAGCA
CAAAGGGACATTGAATATAATGGGTGCAGATTTGATGATGGAGCCGACAAGAGATCTATC
GGTCGTCGGTGGGACGGGTGATTTCTTCATGGCTCGTGGGATCGCTACCTTCGTAACAAA
TATATTTCAAGGGGCTAAGTATTTCCGTGTTAAGATGGATGTTAAACTCTATGAATGTTA
CTAACTGACTACATGTGTTTGCTTGTTAAAGTTTGTGTGTTGGTTGACAGTACACATAAA
TAAAATGTGTTACTAAGAATAAATTATGTTTCTTTCTTTTTTTTAAATAGTTTTTGTGTC
TGTTTGTTTGTGATTTATAATTCTCGTTGTCCCAGATCCCCGTTTTCAGAAGCCGTAATG

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL8417Contig1 542 2 1 U
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TCATCACAGTTCTTGCGATGGTTTTAACGGCAACGATGATGATCCAAGAAGCTAAGAGCA
TTCCCCTATGTAAGGTCAACACAAATGACTTGCAGAAATGTCGTCCAGCTGTCACTGGAA
ACTACCCGCCACCACCGACTCCCGCCTGCTGCACAGTGGCCAAAACAGCGAATCTTGAAT
GTCTCTGCCCGTACCTCTCCAGGTCCGGGCTTGACCAATCAAAACTCAAAGCTCTGTTTG
CCAAGTGTGGCGTTAACAATCCCTCCTGTTTACCATGATTGAAGAACTGAGGTGGACTGG
GCTTAAGCTTGCCTGCGGCATACTTTGCCACCACCTGAAAATTAAGTCCCTAAGTTTATA
AATTTTATGGTGTTTCTATTCAAATAAATCAACAAATTCTGCAGTTATTTTTCAGTCACC
TTTTCTATCTACAAGAACCGTATTCTATACATTAATGAAAACAATAAAGTACTGTTTTCG
CC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 

AF RS1CY18JQ C 1
AF RS1CY18TF U 1
BS 1 542 RS1CY18TF

RD RS1CY18JQ 542 0 0
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TCATCACAGTTCTTGCGATGGTTTTAACGGCAACGATGATGATCCAAGAAGCTAAGAGCA
TTCCCCTATGTAAGGTCAACACAAATGACTTGCAGAAATGTCGTCCAGCTGTCACTGGAA
ACTACCCGCCACCACCGACTCCCGCCTGCTGCACAGTGGCCAAAACAGCGAATCTTGAAT
GTCTCTGCCCGTACCTCTCCAGGTCCGGGCTTGACCAATCAAAACTCAAAGCTCTGTTTG
CCAAGTGTGGCGTTAACAATCCCTCCTGTTTACCATGATTGAAGAACTGAGGTGGACTGG
GCTTAAGCTTGCCTGCGGCATACTTTGCCACCACCTGAAAATTAAGTCCCTAAGTTTATA
AATTTTATGGTGTTTCTATTCAAATAAATCAACAAATTCTGCAGTTATTTTTCAGTCACC
TTTTCTATCTACAAGAACCGTATTCTATACATTAATGAAAACAATAAAGTACTGTTTTCG
CC

QA 1 542 1 542
DS 

RD RS1CY18TF 542 0 0
GGAGAGTTGAGAAAGTGAAGATTAAAATACCAGTGATGGGTAAGAAAAGCACAAAATGCC
TCATCACAGTTCTTGCGATGGTTTTAACGGCAACGATGATGATCCAAGAAGCTAAGAGCA
TTCCCCTATGTAAGGTCAACACAAATGACTTGCAGAAATGTCGTCCAGCTGTCACTGGAA
ACTACCCGCCACCACCGACTCCCGCCTGCTGCACAGTGGCCAAAACAGCGAATCTTGAAT
GTCTCTGCCCGTACCTCTCCAGGTCCGGGCTTGACCAATCAAAACTCAAAGCTCTGTTTG
CCAAGTGTGGCGTTAACAATCCCTCCTGTTTACCATGATTGAAGAACTGAGGTGGACTGG
GCTTAAGCTTGCCTGCGGCATACTTTGCCACCACCTGAAAATTAAGTCCCTAAGTTTATA
AATTTTATGGTGTTTCTATTCAAATAAATCAACAAATTCTGCAGTTATTTTTCAGTCACC
TTTTCTATCTACAAGAACCGTATTCTATACATTAATGAAAACAATAAAGTACTGTTTTCG
CC

QA 1 542 1 542
DS 



AS 1 2

CO CL8418Contig1 784 2 4 U
GCCTGCTGCTGTGAACTGGATCGAGGGACGTGGCAAATCAGTTGTTTGCGAGGCGGTTAT
CAGAGGAGAGACCGTGAACAAGGTGTTGAAAACGAGCGTGGCTTCTTTGGTGGAGCTCAA
TATGCTCAAGAACCTTACGGGCTCTGCTATTGCTGGCTCTCTAGGTGGATTCAACGCTCA
CGCCAGCAACATTGTCTCTGCTGTGTTCTTAGCAACTGGTCAAGATCCAGCTCAAAACGT
TGAGAGCTCTCAGTGTATCACAATGATGGAAGCCATTAATGACGGGAAAGATATCCATAT
CTCGGTCACTATGCCATCTATTGAGGTGGGGACAGTGGGAGGAGGAACACAGCTTGCGTC
GCAGTCAGCGTGTTTGAACTTACTCGGAGTTAAAGGAGCGAGCAAGGAGTCGCCGGGGAT
GAACTCAAGGAGGCTAGCGACGATAGTGGCAGGAGCAGTTTTGGCAGGAGAGTTATCACT
TATGTCAGCAATAGCAGCTGGACAACTTGTGAGGAGTCACATGAAATACAATAGATCCAG
CAGAGACATCTCTGGAGCGACGACAACAACATGATCTGAATCATCATCATCTCTGTCTGG
CCCAAAACTCGAAGGAGGACAAAAATGTAAAAGAAGGCAGGCTTTTTACAACTCATATTC
ACTCATAACTCTGTGATGGACAACACACTTAGCCATGTGCGTGCCTTTGCCTTCTTTTGT
TCAATAAAACTTAAAATTGTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTTTTGTTTGACTTGTAAAC
TCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1AB47TF U 1
AF RS1CP62TF U 229
BS 1 675 RS1AB47TF
BS 676 676 RS1CP62TF
BS 677 774 RS1AB47TF
BS 775 784 RS1CP62TF

RD RS1AB47TF 774 0 0
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TATGCTCAAGAACCTTACGGGCTCTGCTATTGCTGGCTCTCTAGGTGGATTCAACGCTCA
CGCCAGCAACATTGTCTCTGCTGTGTTCTTAGCAACTGGTCAAGATCCAGCTCAAAACGT
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CTCGGTCACTATGCCATCTATTGAGGTGGGGACAGTGGGAGGAGGAACACAGCTTGCGTC
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CAGAGACATCTCTGGAGCGACGACAACAACATGATCTGAATCATCATCATCTCTGTCTGG
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ACTCATAACTCTGTGGTGGACAACACACTTAGCCATGTGCGTGCCTTTGCCTTCTTTTGT
TCAATAAAACTTAAAATTGTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTTTTGTTTGACTT

QA 1 774 1 774
DS 

RD RS1CP62TF 556 0 0
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AGATATCCATATCTCGGTCACTATGCCATCTATTGAGGTGGGGACAGTGGGAGGAGGAAC
ACAGCTTGCGTCGCAGTCAGCGTGTTTGAACTTACTCGGAGTTAAAGGAGCGAGCAAGGA
GTCGCCGGGGATGAACTCAAGGAGGCTAGCGACGATAGTGGCAGGAGCAGTTTTGGCAGG
AGAGTTATCACTTATGTCAGCAATAGCAGCTGGACAACTTGTGAGGAGTCACATGAAATA
CAATAGATCCAGCAGAGACATCTCTGGAGCGACGACAACAACATGATCTGAATCATCATC
ATCTCTGTCTGGCCCAAAACTCGAAGGAGGACAAAAATGTAAAAGAAGGCAGGCTTTTTA
CAACTCATATTCACTCATAACTCTGTGATGGACAACACACTTAGCCATGTGCGTGCCTTT
GCCTTCTTTTGTTCAATAAAACTTAAAATTGTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTTTTGTT
TGACTTGTAAACTCTT

QA 1 556 1 556
DS 



AS 1 2

CO CL8419Contig1 542 2 1 U
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CTCCACCATCACCGGCGTTTCCGTCACCGTCGGCTACCTATCAGGGATTAAGCCTGGGAT
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TTCGAAAATGAACTCTTTTTATTACTTTGCTACTCCTTTTTGTTTGTTTGAGGATAATGT
TTGCCTCTGTTTGTTACAACTTATGATGATGATGATGATCAATAAAAGATTTGAGCTTGC
TC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 

AF RS1BP73JQ C 1
AF RS1BP73TF U 1
BS 1 542 RS1BP73TF

RD RS1BP73JQ 542 0 0
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ATCGAAGAAGATGAACACTGACATCACTGCCTTAGAGAAGCCCCAATACCCCGTCGTCGA
TCGGAATCCACCATTCACTAAAGTCGTCGGAAACTTCAGCGTACTCGATTACCTCCGTTT
CTCCACCATCACCGGCGTTTCCGTCACCGTCGGCTACCTATCAGGGATTAAGCCTGGGAT
CAAAGGACCGTCAATGGTGACGGGAGGACTGATCGGACTCATGGGTGGGTTCATGTATGC
GTACCAGAACTCGGCGGGGAGGCTCATGGGTTTCTTCCCTAACGAAGGCGAGGTTGCTAG
TTACCAGAAGCGCGGTGGGTTCTCCAAATGAGAGTCTATTGCTGGATCTCTGGGTTCCAA
TTCGAAAATGAACTCTTTTTATTACTTTGCTACTCCTTTTTGTTTGTTTGAGGATAATGT
TTGCCTCTGTTTGTTACAACTTATGATGATGATGATGATCAATAAAAGATTTGAGCTTGC
TC

QA 1 542 1 542
DS 

RD RS1BP73TF 542 0 0
GGGAGAGAGGAAGCAGAAGAAGATAGATAGATTCGATTCAGACCAGAGAATCGTAGATTG
ATCGAAGAAGATGAACACTGACATCACTGCCTTAGAGAAGCCCCAATACCCCGTCGTCGA
TCGGAATCCACCATTCACTAAAGTCGTCGGAAACTTCAGCGTACTCGATTACCTCCGTTT
CTCCACCATCACCGGCGTTTCCGTCACCGTCGGCTACCTATCAGGGATTAAGCCTGGGAT
CAAAGGACCGTCAATGGTGACGGGAGGACTGATCGGACTCATGGGTGGGTTCATGTATGC
GTACCAGAACTCGGCGGGGAGGCTCATGGGTTTCTTCCCTAACGAAGGCGAGGTTGCTAG
TTACCAGAAGCGCGGTGGGTTCTCCAAATGAGAGTCTATTGCTGGATCTCTGGGTTCCAA
TTCGAAAATGAACTCTTTTTATTACTTTGCTACTCCTTTTTGTTTGTTTGAGGATAATGT
TTGCCTCTGTTTGTTACAACTTATGATGATGATGATGATCAATAAAAGATTTGAGCTTGC
TC

QA 1 542 1 542
DS 



AS 1 2

CO CL8420Contig1 629 2 9 U
CCACGTGGCACTTCCGCTCTCGTACCGCTGCTTACTACCAACAAGGTGCTCGTTTCGCCA
AATGGCGTACTGTTGTGAGCATTCCAAATGGACCATCTGCTTTGGCTGTTAAAGAAGCAG
CCTGGGGACTTGCCCGCTACGCCGCTATTTCTCAGGACAGCGGTCTGGTACCGATTGTGG
AGCCGGAGATTATGTTGGACGGAGAACACTGCATTGACAGGACATATGAGGTTGCAGAGA
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TCCTGAAGCCGAGCATGGTTACTCCTGGTGCTGAGTCCAAAGACAGAGCTACTCCCGAGC
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TCATGTTCCTGTCTGGAGGTCAGTCCGAGTTGGAGGCGACCTTGAACCTGAACGCAATGA
ACCAAGGACCGAACCCATGGCACGTGTCCTTCTCCTATGCACGTGCCTTGCAGAACACTT
GCTCGAAGACATGGGGAGGCAGAGAAGAGAACGTGAAGGCGGCTCAGGACACTCTCTTGA
CCCGAGCCAAAGCCAACTCGCTGGCTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AV85TF U 20
AF RS1AV85JQ C 1
BS 1 19 RS1AV85JQ
BS 20 455 RS1AV85TF
BS 456 456 RS1AV85JQ
BS 457 514 RS1AV85TF
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RD RS1AV85TF 525 0 0
TCGTACCGCTGCTTACTACCAACAAGGTGCTCGTTTCGCCAAATGGCGTACTGTTGTGAG
CATTCCAAATGGACCATCTGCTTTGGCTGTTAAAGAAGCAGCCTGGGGACTTGCCCGCTA
CGCCGCTATTTCTCAGGACAGCGGTCTGGTACCGATTGTGGAGCCGGAGATTATGTTGGA
CGGAGAACACTGCATTGACAGGACATATGAGGTTGCAGAGAAGGTCTGGTCTGAGGTCTT
CTTCTATCTCGCTCAGAACAACGTCATGTTCGAAGGTATCCTCCTGAAGCCGAGCATGGT
TACTCCTGGTGCTGAGTCCAAAGACAGAGCTACTCCCGAGCAAGTTGCTTCCTACACTCT
CAAGCTTCTTTCCAACAGAGTTCCTCCCGCTGTACCCGGAATCATGTTCCTGTCTGGAGG
TCAGTCCGAGTTGGAG*CGACCTTGAACCTGAACGCAATGAACCAAGGACCGAACCCATG
GCACGTGTCCTTCTC*TATGCACGTGCCTTGCAGA*CACTTGCTC

QA 1 525 1 525
DS 

RD RS1AV85JQ 629 0 0
CCACGTGGCACTTCCGCTCTCGTACCGCTGCTTACTACCAACAAGGTGCTCGTTTCGCCA
AATGGCGTACTGTTGTGAGCATTCCAAATGGACCATCTGCTTTGGCTGTTAAAGAAGCAG
CCTGGGGACTTGCCCGCTACGCCGCTATTTCTCAGGACAGCGGTCTGGTACCGATTGTGG
AGCCGGAGATTATGTTGGACGGAGAACACTGCATTGACAGGACATATGAGGTTGCAGAGA
AGGTCTGGTCTGAGGTCTTCTTCTATCTCGCTCAGAACAACGTCATGTTCGAAGGTATCC
TCCTGAAGCCGAGCATGGTTACTCCTGGTGCTGAGTCCAAAGACAGAGCTACTCCCGAGC
AAGTTGCTTCCTACACTCTCAAGCTTCTTTCCAACAGAGTTCCTCCCGCTGTACCCGGAA
TCATGTTCCTGTCTGGAGGTCAGTCCGAGTTGGAGGCGACCTTGAACCTGAACGCAATGA
ACCAAGGACCGAACCCATGGCACGTGTCCTTCTCCTATGCACGTGCCTTGCAGAACACTT
GCTCGAAGACATGGGGAGGCAGAGAAGAGAACGTGAAGGCGGCTCAGGACACTCTCTTGA
CCCGAGCCAAAGCCAACTCGCTGGCTCAG

QA 1 629 1 629
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8422Contig1 541 2 1 U
GGGACTACCGAACCTCAATATCTATCTGTAGCCGGAGACTTGATTCACCGAGAAAGAGAG
GAGAAGAGTTTAGAGCAATGGAGGGAGCAGAAGAAGCTGGAGCGGAGATCATGGTCGATT
CAAAGGACTTACAGCAACAAAGCAAAGCTCTCGACAAGCTTACCGATCGCGTCGAGGATC
GCCAGCTCGATTCTAATCGTGTTCAATCAGCTATGGCTTCGATTGGTGCTTCTAGGGAGG
CTGATCTTAATGCTAAGAGATTGAGGGAGAAGGAATTGGCTTCTGTTAAAATCAATCCCG
CTGATGTTGAACTCATTGTTAACGAACTTGAGCTGGAGAAGAATGTTGTGGAGAGAACTC
TAAGGGAGCACAAAGGCGATGCAGTTGCTGCAACTAGGGAGCTGCTTTCACGATATCCTC
TATGATCGACCACCACTACGATCAAGTTCTTTTGTGTGCGTGAGGTTTGAGACACGTGAG
ATTATGTATCCAAATATTTTCAACTGAGTTTTGAAATTTCATTTCTGAATCACTTTCTTC
C


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 

AF RS1FP66JQ C 1
AF RS1FP66TF U 1
BS 1 541 RS1FP66TF

RD RS1FP66JQ 541 0 0
GGGACTACCGAACCTCAATATCTATCTGTAGCCGGAGACTTGATTCACCGAGAAAGAGAG
GAGAAGAGTTTAGAGCAATGGAGGGAGCAGAAGAAGCTGGAGCGGAGATCATGGTCGATT
CAAAGGACTTACAGCAACAAAGCAAAGCTCTCGACAAGCTTACCGATCGCGTCGAGGATC
GCCAGCTCGATTCTAATCGTGTTCAATCAGCTATGGCTTCGATTGGTGCTTCTAGGGAGG
CTGATCTTAATGCTAAGAGATTGAGGGAGAAGGAATTGGCTTCTGTTAAAATCAATCCCG
CTGATGTTGAACTCATTGTTAACGAACTTGAGCTGGAGAAGAATGTTGTGGAGAGAACTC
TAAGGGAGCACAAAGGCGATGCAGTTGCTGCAACTAGGGAGCTGCTTTCACGATATCCTC
TATGATCGACCACCACTACGATCAAGTTCTTTTGTGTGCGTGAGGTTTGAGACACGTGAG
ATTATGTATCCAAATATTTTCAACTGAGTTTTGAAATTTCATTTCTGAATCACTTTCTTC
C

QA 1 541 1 541
DS 

RD RS1FP66TF 541 0 0
GGGACTACCGAACCTCAATATCTATCTGTAGCCGGAGACTTGATTCACCGAGAAAGAGAG
GAGAAGAGTTTAGAGCAATGGAGGGAGCAGAAGAAGCTGGAGCGGAGATCATGGTCGATT
CAAAGGACTTACAGCAACAAAGCAAAGCTCTCGACAAGCTTACCGATCGCGTCGAGGATC
GCCAGCTCGATTCTAATCGTGTTCAATCAGCTATGGCTTCGATTGGTGCTTCTAGGGAGG
CTGATCTTAATGCTAAGAGATTGAGGGAGAAGGAATTGGCTTCTGTTAAAATCAATCCCG
CTGATGTTGAACTCATTGTTAACGAACTTGAGCTGGAGAAGAATGTTGTGGAGAGAACTC
TAAGGGAGCACAAAGGCGATGCAGTTGCTGCAACTAGGGAGCTGCTTTCACGATATCCTC
TATGATCGACCACCACTACGATCAAGTTCTTTTGTGTGCGTGAGGTTTGAGACACGTGAG
ATTATGTATCCAAATATTTTCAACTGAGTTTTGAAATTTCATTTCTGAATCACTTTCTTC
C

QA 1 541 1 541
DS 



AS 1 2

CO CL8423Contig1 466 2 1 U
GACATTACGAGAAATCAGCCAATGAACTCAATGAACGAAGAATCAAACGAGCAGCCTCTC
TGTCTTTTAGCGAATCCTACTCCTCCTTTCTATGTCATGCTCGCCGTCCCACCACACCAT
GTTTCGATCCTCTTTCTCTTTGTTGGGTTTCGAATCTTATCTCATATCGATCTGTCGAAT
ATGATTCTCAGCATAAAAGACTTCTCCTTTATCCTTTCTTCGATGATTAACGTTGCGTTT
GCTTTCATTTTTTTTTCATCAGGCGTTGAAAGTTGAAAGCTTGAAGATGGTGTGGCTTCC
AGCTGGTTTTAGAGTGACGAGATTTTCTGTTCAAATGATTTTTAATCAGGGGGGTTCATA
TCACCTCCTCTTGATTATTACTTCTTTTTGTATATCTTCCTTTATTCTTCATTGTTCATG
CTAGATTGATAGGACTTGGCTGCCTTGATTTGAATTCTTGCTTTGT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1AE59TF U 1
AF RS1DZ79TF U 1
BS 1 466 RS1AE59TF

RD RS1AE59TF 466 0 0
GACATTACGAGAAATCAGCCAATGAACTCAATGAACGAAGAATCAAACGAGCAGCCTCTC
TGTCTTTTAGCGAATCCTACTCCTCCTTTCTATGTCATGCTCGCCGTCCCACCACACCAT
GTTTCGATCCTCTTTCTCTTTGTTGGGTTTCGAATCTTATCTCATATCGATCTGTCGAAT
ATGATTCTCAGCATAAAAGACTTCTCCTTTATCCTTTCTTCGATGATTAACGTTGCGTTT
GCTTTCATTTTTTTTTCATCAGGCGTTGAAAGTTGAAAGCTTGAAGATGGTGTGGCTTCC
AGCTGGTTTTAGAGTGACGAGATTTTCTGTTCAAATGATTTTTAATCAGGGGGGTTCATA
TCACCTCCTCTTGATTATTACTTCTTTTTGTATATCTTCCTTTATTCTTCATTGTTCATG
CTAGATTGATAGGACTTGGCTGCCTTGATTTGAATTCTTGCTTTGT

QA 1 466 1 466
DS 

RD RS1DZ79TF 466 0 0
GACATTACGAGAAATCAGCCAATGAACTCAATGAACGAAGAATCAAACGAGCAGCCTCTC
TGTCTTTTAGCGAATCCTACTCCTCCTTTCTATGTCATGCTCGCCGTCCCACCACACCAT
GTTTCGATCCTCTTTCTCTTTGTTGGGTTTCGAATCTTATCTCATATCGATCTGTCGAAT
ATGATTCTCAGCATAAAAGACTTCTCCTTTATCCTTTCTTCGATGATTAACGTTGCGTTT
GCTTTCATTTTTTTTTCATCAGGCGTTGAAAGTTGAAAGCTTGAAGATGGTGTGGCTTCC
AGCTGGTTTTAGAGTGACGAGATTTTCTGTTCAAATGATTTTTAATCAGGGGGGTTCATA
TCACCTCCTCTTGATTATTACTTCTTTTTGTATATCTTCCTTTATTCTTCATTGTTCATG
CTAGATTGATAGGACTTGGCTGCCTTGATTTGAATTCTTGCTTTGT

QA 1 466 1 466
DS 



AS 1 2

CO CL8424Contig1 753 2 8 U
GGGGAGGGTGTGATTGCTGTGTTCGATCTTGGTGGTGGAACCTTTGATGTTTCTATTCTG
GAGATCTCTAGTGGTGTTTTTGAGGTTAAAGCAACGAATGGAGATACTTTTTGGGAGGAG
AAGACTTCGACAACACTTTGTTGGAGTATCTGGTCTCTGAGTTCAAGAGATCAGACAACA
TTGATCTGACCAAGGACAAGCTCGCCCTCCAGAGGCTGAGAGAAGCTGCAGAGAAGGCCA
AGATCGAGCTTTCTTCCACATCTCAGACCGAGATCAACCTGCCTTTCATCACCGCGGACG
CTTCCGGAGCTAAGCACTTGAACATCACCTTGACCAGGTCCAAGTTTGAAGCTTTGGTCG
GCAAGTTGATTGAGAGAACAAGATCCCCGTGCCAGAACTGTTTAAAGGACGCTGGCGTCT
CGGTTAAGGAAGTCGATGAGGTTCTCCTCGTCGGTGGAATGACACGTGTTCCCAAAGTGC
AGGAGATAGTCGCTGAGATCTTTGGAAAGAGCCCTTGCAAAGGTGTGAACCCTGACGAAG
CGGTTGCTATGGGAGCTGCTATCCAAGGTGGTATCCTCCGTGGTGATGTCAAGGAGTTGC
TTCTTTTGGATGTGACTCCTCTCTCGCTCGGCATCGAGACGCTTGGTGGGATCTTCACGA
GGTTGATCAACAGAAACACCACCATCCCTACAAAGAAGTCTCAGGTTTTCTCCACAGCTG
CAGACAACCAGACGCAAGTGGGAATCAAAGTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F195TF U 1
AF RS1DU70TF U 98
BS 1 151 RS1F195TF
BS 152 152 RS1DU70TF
BS 153 480 RS1F195TF
BS 481 481 RS1DU70TF
BS 482 631 RS1F195TF
BS 632 632 RS1DU70TF
BS 633 671 RS1F195TF
BS 672 753 RS1DU70TF

RD RS1F195TF 671 0 0
GGGGAGGGTGTGATTGCTGTGTTCGATCTTGGTGGTGGAACCTTTGATGTTTCTATTCTG
GAGATCTCTAGTGGTGTTTTTGAGGTTAAAGCAACGAATGGAGATACTTTTTGGGAGGAG
AAGACTTCGACAACACTTTGTTGGAGTATCTTGTCTCTGAGTTCAAGAGATCAGACAACA
TTGATCTGACCAAGGACAAGCTCGCCCTCCAGAGGCTGAGAGAAGCTGCAGAGAAGGCCA
AGATCGAGCTTTCTTCCACATCTCAGACCGAGATCAACCTGCCTTTCATCACCGCGGACG
CTTCCGGAGCTAAGCACTTGAACATCACCTTGACCAGGTCCAAGTTTGAAGCTTTGGTCG
GCAAGTTGATTGAGAGAACAAGATCCCCGTGCCAGAACTGTTTAAAGGACGCTGGCGTCT
CGGTTAAGGAAGTCGATGAGGTTCTCCTCGTCGGTGGAATGACACGTGTTCCCAAAGTGC
CGGAGATAGTCGCTGAGATCTTTGGAAAGAGCCCTTGCAAAGGTGTGAACCCTGACGAAG
CGGTTGCTATGGGAGCTGCTATCCAAGGTGGTATCCTCCGTGGTGATGTCAAGGAGTTGC
TTCTTTTGGATGTGACTCCTCTCTCGCTCGGTATCGAGACGCTTGGTGGGATCTTCACGA
GGTTGATCAAC

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1DU70TF 656 0 0
TGGAGATACCTTC
TTGGGGGGAGAAGACTTCGACAACACTTTGTTGGAGTATCTGGTCTCTGAGTTCAAGAGA
TCAGACAACATTGATCTGACCAAGGACAAGCTCGCCCTCCAGAGGCTGAGAGAAGCTGCA
GAGAAGGCCAAGATCGAGCTTTCTTCCACATCTCAGACCGAGATCAACCTGCCTTTCATC
ACCGCGGACGCTTCCGGAGCTAAGCACTTGAACATCACCTTGACCAGGTCCAAGTTTGAA
GCTTTGGTCGGCAAGTTGATTGAGAGAACAAGATCCCCGTGCCAGAACTGTTTAAAGGAC
GCTGGCGTCTCGGTTAAGGAAGTCGATGAGGTTCTCCTCGTCGGTGGAATGACACGTGTT
CCCAAAGTGCAGGAGATAGTCGCTGAGATCTTTGGAAAGAGCCCTTGCAAAGGTGTGAAC
CCTGATGAAGCGGTTGCTATGGGAGCTGCTATCCAAGGTGGTATCCTCCGTGGTGATGTC
AAGGAGTTGCTTCTTTTGGATGTGACTCCTCTCTCGCTCGGCATCGAGACGCTTGGTGGG
ATCTTCACTAGGTTGATCAACAGAAACACCACCATCCCTACAAAGAAGTCTCAGGTTTTC
TCCACAGCTGCAGACAACCAGACGCAAGTGGGAATCAAAGTCT

QA 14 656 14 656
DS 



AS 1 2

CO CL8425Contig1 814 2 14 U
GCAAAAGCTGTTATTGGGTCATATGTATTAAATTGAAAGTTATGGATACATAGACACTCA
TGTAGCTTTTTAAGCAATACAATATTTTCATTTGGATTTTAGACACCAAACAGTTACAAA
GAAAATACCAAACTATTACATTTTCTTACTCTCATGGATCCCAAATTCACTCATGGATAG
TTCGGAAAGGCTTGTATGTCTTGACACTACTTATGAGTCCTGCGATGGAACCAGCTGCAG
CTAAAAGGGAGACGATCAAGCAAACCCAGCACAACATTTTCAGCCCAATCCATCTAGGGG
AGTACTTCTTAACCTTAGTTTGTGCTATGTGCATCTCCACAGGGAAATAAACCGTTAAAG
GCCAGAAAGAAGCGGCTCCAATAAGACCCAAGATCGCGTTGAAAAAAGGGAATATCATAG
CTACCAAAGTTGCTATAACCACATAAGCTGTCCTCCACACCAATCTGAAGAAGTTGATGT
TGAATTTTCCAAGGAATGGAATGTTTACTGAATATTCAGATGTGATGAACTTGTTGTCAG
GCCAGTTTCTATTGCATTTCTTCTCAACAAACTGGAATATGGGCTGGGCGAACACCTGAT
AGGCACCAATGAGATGGAAAGCAATGCAAGCGTTTGCAAAGTCAATGAGCCAAAATGGCT
CGTAGAATCCAAAATCAGTGAGGAAATCTCCAGGGGCTTTGTTTCCAAATGCAGCATAGC
CGAGACAACCACATAAGATGTAGAAGAAAGTGGTGGTTGATACTCCAACAAAGCTTGCTC
TTTTCATAGCTTTGTTCTCTGCTGGGCTAGATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G742JQ U 1
AF RS1AE26JQ U 18
BS 1 160 RS1G742JQ
BS 161 161 RS1AE26JQ
BS 162 367 RS1G742JQ
BS 368 368 RS1AE26JQ
BS 369 373 RS1G742JQ
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BS 375 403 RS1G742JQ
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BS 433 433 RS1AE26JQ
BS 434 499 RS1G742JQ
BS 500 500 RS1AE26JQ
BS 501 598 RS1G742JQ
BS 599 814 RS1AE26JQ

RD RS1G742JQ 598 0 0
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TGTAGCTTTTTAAGCAATACAATATTTTCATTTGGATTTTAGACACCAAACAGTTACAAA
GAAAATACCAAACTATTACATTTTCTTACTCTCATGGATCTCAAATTCACTCATGGATAG
TTCGGAAAGGCTTGTATGTCTTGACACTACTTATGAGTCCTGCGATGGAACCAGCTGCAG
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GCCAGAAGGAAGCTGCTCCAATAAGACCCAAGATCGCGTTGAAGAAAGGGAATATCATAG
CTACCAAAGTTGTTATAACCACATAAGCTGTCCTCCACACCAATCTGAAGAAGTTGATGT
TGAATTTTCCAAGGAATGGTATGTTTACTGAATATTCAGATGTGATGAACTTGTTGTCAG
GCCAGTTTCTATTGCATTTCTTCTCAACAAACTGGAATATGGGCTGGGCGAACACCTG

QA 1 598 1 598
DS 

RD RS1AE26JQ 797 0 0
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TACAATATTTTCATTTGGATTTTAGACACCAAACAGTTACAAAGAAAATACCAAACTATT
ACATTTTCTTACTCTCATGGATCCCAAATTCACTCATGGATAGTTCGGAAAGGCTTGTAT
GTCTTGACACTACTTATGAGTCCTGCGATGGAACCAGCTGCAGCTAAAAGGGAGACGATC
AAGCAAACCCAGCACAACATTTTCAGCCCAATCCATCTGGGGGAGTACTTCTTAACCTTA
GTTTGTGCTATGTGCATCTCCACAGGGAAATAAACCGTTAAAGGCCAGAAAGAAGCGGCT
CCAATAAGACCCAAGATCGCGTTGAAAAAAGGGAATATCATAGCTACCAAAGTTGCTATA
ACCACATAAGCTGTCCTCCACACCACTCTGAAGAGGTTGATGTTGAATTTTCCAAGGAAT
GGAATGTTTACTGAATATTCAGATGTGATGAACTTGTTGTCAGGCCAGTTTCTATTGCAT
TTCTTCTCAACAAACTGGAATATGGGCTGGGCGAACACCTGATAGGCACCAATGAGATGG
AAAGCAATGCAAGCGTTTGCAAAGTCAATGAGCCAAAATGGCTCGTAGAATCCAAAATCA
GTGAGGAAATCTCCAGGGGCTTTGTTTCCAAATGCAGCATAGCCGAGACAACCACATAAG
ATGTAGAAGAAAGTGGTGGTTGATACTCCAACAAAGCTTGCTCTTTTCATAGCTTTGTTC
TCTGCTGGGCTAGATCT

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 2

CO CL8426Contig1 744 2 2 U
GATCCCATCCCCGCGTCTCCACTTCTTCATGGTTGGATTCGCTCCCCTCACCTCTCGTGG
CTCTCAGCAGTACCGTAACCTCACCGTCCCGGAACTGACTCAGCAAATGTGGGATGCCAA
GAACATGATGTGCGCTGCTGACCCGAGACACGGCCGCTACCTCACTGCCTCAGCTATGTT
CCGCGGCAAAATGAGCACCAAGGAAGTTGACGAGCAGATGCTGAACGTTCAGAACAAGAA
CTCCTCCTACTTCGTCGAGTGGATCCCCAACAATGTCAAGTCAACCGTCTGTGACATTCC
ACCAACCGGTTTGAAGATGGCTTCCACGTTCATTGGTAACTCGACTTCGATCCAAGAGAT
GTTCAGGAGAGTCAGCGAGCAGTTCACTGCTATGTTCAGGAGGAAAGCTTTCTTGCATTG
GTACACAGGTGAAGGAATGGATGAGATGGAGTTCACCGAAGCTGAGAGCAACATGAACGA
TCTTGTCTCGGAGTACCAGCAGTACCAAGATGCCACGGCTGATGAAGAAGGAGAGTATGA
AGATGAAGAGGCTGAGTACGAGCAAGAGGAAGGCTATTGAAGAGACCAAAAACACAAGAA
TCTCAACTTCAACTTCCTGTTGCTGTTTTACTTTTCAAAATTTCTACTAAGTTTCGTTTT
TATATAGTTTCTGTATCGGTTTCATTAGTAGTTATGTACTCGGCGTAGACTGGCTAAGGG
ATTATCAAGATTTATTAAACAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H218TF U 1
AF RS1H218JQB C 172
BS 1 712 RS1H218TF
BS 713 744 RS1H218JQB

RD RS1H218TF 712 0 0
GATCCCATCCCCGCGTCTCCACTTCTTCATGGTTGGATTCGCTCCCCTCACCTCTCGTGG
CTCTCAGCAGTACCGTAACCTCACCGTCCCGGAACTGACTCAGCAAATGTGGGATGCCAA
GAACATGATGTGCGCTGCTGACCCGAGACACGGCCGCTACCTCACTGCCTCAGCTATGTT
CCGCGGCAAAATGAGCACCAAGGAAGTTGACGAGCAGATGCTGAACGTTCAGAACAAGAA
CTCCTCCTACTTCGTCGAGTGGATCCCCAACAATGTCAAGTCAACCGTCTGTGACATTCC
ACCAACCGGTTTGAAGATGGCTTCCACGTTCATTGGTAACTCGACTTCGATCCAAGAGAT
GTTCAGGAGAGTCAGCGAGCAGTTCACTGCTATGTTCAGGAGGAAAGCTTTCTTGCATTG
GTACACAGGTGAAGGAATGGATGAGATGGAGTTCACCGAAGCTGAGAGCAACATGAACGA
TCTTGTCTCGGAGTACCAGCAGTACCAAGATGCCACGGCTGATGAAGAAGGAGAGTATGA
AGATGAAGAGGCTGAGTACGAGCAAGAGGAAGGCTATTGAAGAGACCAAAAACACAAGAA
TCTCAACTTCAACTTCCTGTTGCTGTTTTACTTTTCAAAATTTCTACTAAGTTTCGTTTT
TATATAGTTTCTGTATCGGTTTCATTAGTAGTTATGTACTCGGCGTAGACTG

QA 1 712 1 712
DS 

RD RS1H218JQB 573 0 0
AGCTATGTTCCGCGGCAAAATGAGCACCAAGGAAGTTGACGAGCAGATGCTGAACGTTCA
GAACAAGAACTCCTCCTACTTCGTCGAGTGGATCCCCAACAATGTCAAGTCAACCGTCTG
TGACATTCCACCAACCGGTTTGAAGATGGCTTCCACGTTCATTGGTAACTCGACTTCGAT
CCAAGAGATGTTCAGGAGAGTCAGCGAGCAGTTCACTGCTATGTTCAGGAGGAAAGCTTT
CTTGCATTGGTACACAGGTGAAGGAATGGATGAGATGGAGTTCACCGAAGCTGAGAGCAA
CATGAACGATCTTGTCTCGGAGTACCAGCAGTACCAAGATGCCACGGCTGATGAAGAAGG
AGAGTATGAAGATGAAGAGGCTGAGTACGAGCAAGAGGAAGGCTATTGAAGAGACCAAAA
ACACAAGAATCTCAACTTCAACTTCCTGTTGCTGTTTTACTTTTCAAAATTTCTACTAAG
TTTCGTTTTTATATAGTTTCTGTATCGGTTTCATTAGTAGTTATGTACTCGGCGTAGACT
GGCTAAGGGATTATCAAGATTTATTAAACAACC

QA 1 573 1 573
DS 



AS 1 2

CO CL8427Contig1 1022 2 4 U
CTTACCAATCAATTCTCCATCTGAGTTTGTGTGAGACAGAGAGAGGTTGCTACAATGCGT
TATTCACAGCTTGTTATTGGCCCAGCAGGCAGCGGAAAGTCAACTTATTGCTCATCTTTA
CACCAACACTGTGAAACTATCAGACGAACAATGCACATAGTTAACTTGGATCCTGCTGCA
GAAGTCTTTAACTATCCTGTGGCAATGGATATCCGAGAGCTTGTTCCGTTGATGTTGTTA
TGGAGGAGCTCAAGTGTGGTCCCAATGCTGCTCTCATCCGTTGTATGGAGCACCTTGAGG
ACAGTCTTTATAATTGGTTGGATGAAGAATTGGAGAACTTCACAGACGATGACTACTTAG
TCTTTGACTGTCCAGGCCAGATAGAGATTTTCACACATGTACCTGTGCTCAAAAACTTTG
TGGAGCATTTGAAGAAAATAGCTTCAATGTCTGTGCTGTGTATTTGCTTGACTCACAGTT
TGTAACAGATGTAACCAAGTTTATCAGCGGATGTATGGTTTCTCTTTCTGCAATGATCCA
GCTTGAGCTGCCTCATGTTAACATCCTCTCTAAGATGGATCTCTTACAGGACAAAAGCAA
CATTGATGAATACTTGGATCCGGAGCCACACACAATGCTGGCTGGGTTAAACCAAAGGAT
GGCTCCTCAATATGCAAAACTGAACAAAGCCTTGATTGAATTGGTCGAACAGTACAGCAT
GGTGAGATTCACGCCGCTTGATTTGAGGAAAGAAAGGAGCATACAATTTGTACTCTCTGA
AATCGACAAGTGCATTCAGTTTGGTGAAGACGCAGAGGTCAAGATCAAAGAACTTGATGA
AGACATGGATCAACTAGAGCTCTAGAAGAAAATTTGGAAGTTAACTTCTTTGTGAAGGAA
GAGTAATGGGTAGTCAGTCAGTAGTGACATTATGTGTTTGTTCATTACTCTTTTAACTTT
TTATATTTCAGAAATTGATGCTAAAACTCGAGTTAAAGACAATTGCAAATTCAAGATTTT
AC


BQ
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10 10 

AF RS1FD22TF U 1
AF RS1FD22JQ C 302
BS 1 678 RS1FD22TF
BS 679 679 RS1FD22JQ
BS 680 730 RS1FD22TF
BS 731 1022 RS1FD22JQ

RD RS1FD22TF 730 0 0
CTTACCAATCAATTCTCCATCTGAGTTTGTGTGAGACAGAGAGAGGTTGCTACAATGCGT
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GAAGTCTTTAACTATCCTGTGGCAATGGATATCCGAGAGCTTGTTCCGTTGATGTTGTTA
TGGAGGAGCTCAAGTGTGGTCCCAATGCTGCTCTCATCCGTTGTATGGAGCACCTTGAGG
ACAGTCTTTATAATTGGTTGGATGAAGAATTGGAGAACTTCACAGACGATGACTACTTAG
TCTTTGACTGTCCAGGCCAGATAGAGATTTTCACACATGTACCTGTGCTCAAAAACTTTG
TGGAGCATTTGAAGAAAATAGCTTCAATGTCTGTGCTGTGTATTTGCTTGACTCACAGTT
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GCTTGAGCTGCCTCATGTTAACATCCTCTCTAAGATGGATCTCTTACAGGACAAAAGCAA
CATTGATGAATACTTGGATCCGGAGCCACACACAATGCTGGCTGGGTTAAACCAAAGGAT
GGCTCCTCAATATGCAAA*CTGAACAAAGCCTTGATTGAATTGGTCGAACAGTACAGCAT
GGTGAGATTC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RS1FD22JQ 721 0 0
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CTTTGACTGTCCAGGCCAGATAGAGATTTTCACACATGTACCTGTGCTCAAAAACTTTGT
GGAGCATTTGAAGAAAATAGCTTCAATGTCTGTGCTGTGTATTTGCTTGACTCACAGTTT
GTAACAGATGTAACCAAGTTTATCAGCGGATGTATGGTTTCTCTTTCTGCAATGATCCAG
CTTGAGCTGCCTCATGTTAACATCCTCTCTAAGATGGATCTCTTACAGGACAAAAGCAAC
ATTGATGAATACTTGGATCCGGAGCCACACACAATGCTGGCTGGGTTAAACCAAAGGATG
GCTCCTCAATATGCAAAACTGAACAAAGCCTTGATTGAATTGGTCGAACAGTACAGCATG
GTGAGATTCACGCCGCTTGATTTGAGGAAAGAAAGGAGCATACAATTTGTACTCTCTGAA
ATCGACAAGTGCATTCAGTTTGGTGAAGACGCAGAGGTCAAGATCAAAGAACTTGATGAA
GACATGGATCAACTAGAGCTCTAGAAGAAAATTTGGAAGTTAACTTCTTTGTGAAGGAAG
AGTAATGGGTAGTCAGTCAGTAGTGACATTATGTGTTTGTTCATTACTCTTTTAACTTTT
TATATTTCAGAAATTGATGCTAAAACTCGAGTTAAAGACAATTGCAAATTCAAGATTTTA
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

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GGTTCCAACTCACAAATGGTCCGAATCAACGGAGCTGCAAACATCAATGCTGTTCAAGCT
GCTGCACAAGGAGGTGTGAAGAGATTTGTGTATATATCAGCTGCGGATTTTGGTGTCATA
AATAACTTGATTCGAGGCTATTTTCAAGGGAAGAGAGCAACTGAAGCTGAGATTTTTGAT
AAATTCGGAAACAGAGGAACGGTTCTAAGGCCAGGATTCATACATGGGACTCGTCAGGTC
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TTTCCAAAAGAAGTGACGAAAATTCCTGTGATCGGACCGCTTTTAATACCTCCGGTTAAT
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CGGTCTCTGGTTCTGCAACCAATAAACTATGTATTTTCTTTTGGATACTACAAAAAGGGA
GAGAAAATAATAAATTTTG


BQ
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AF RS1BJ09TF U 1
AF RS1BJ09JQ C 190
BS 1 730 RS1BJ09TF
BS 731 859 RS1BJ09JQ

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GGTTCCAACTCACAAATGGTCCGAATCAACGGAGCTGCAAACATCAATGCTGTTCAAGCT
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AAATTCGGAAACAGAGGAACGGTTCTAAGGCCAGGATTCATACATGGGACTCGTCAGGTC
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TTTCCAAAAGAAGTGACGAAAATTCCTGTGATCGGACCGCTTTTAATACCTCCGGTTAAT
GTCAAGTCCGTGGCGGGAACAGCGGTAAAAGCTGCAGTTGATCCCGAGTTTGCTTCTGGA
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TCCTAGCTTC
TACGAC

QA 1 730 1 730
DS 

RD RS1BJ09JQ 670 0 0
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ATTCGAGGCTATTTTCAAGGGAAGAGAGCAACTGAAGCTGAGATTTTTGATAAATTCGGA
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GAAGTGACGAAAATTCCTGTGATCGGACCGCTTTTAATACCTCCGGTTAATGTCAAGTCC
GTGGCGGGAACAGCGGTAAAAGCTGCAGTTGATCCCGAGTTTGCTTCTGGAGTCGTCGAT
GTTTACCAGATTCTTCAACACAAAACGACTCCATCTTAAAACAATGACTGGTCCTAGCTT
CCTACGACGGATTTAACTGTTTGAGAATTGGAATCGAATGTAACCAAACCACGGTCTCTG
GTTCTGCAACCAATAAACTATGTATTTTCTTTTGGATACTACAAAAAGGGAGAGAAAATA
ATAAATTTTG

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

CO CL8429Contig1 886 2 4 U
GGACTACTACTTTGTCTTCTTCCCTTAATCTCTTTCCAAGAAGCTTCCTTATCCAGACCC
CTTTAAATCCGAGAAAGCCTGCACCTTTAAGGTGCGTGAGCTCACTAACGATGGAACCAC
CGAAACCCATTCTCGATTTCGAAAAGCTCGACGATGGGTTTGTTCAGAAACTGGTCTACG
ATGCTCTCGTTTGGTCTTCCCTTCACGGACTTGTCGTCGGTGACAAAACTCATCAGAAAT
CAGGAACGGTTCCAGGGGTTGGGATGATGCACGCCCCTATTGCATTGCTACCGACTCCAT
TCCCTGAAAGTTACTGGAACCAAGCTTGTGAAGTTGCTCCCATCTTCAACGAGTTAGTTG
ATCGTATCAGCTTGGATGGCAAATTCATTCAAGACAGTCTCTCCAGAACGAAAAAAGCTG
ATGTCTTTACATCTAGACTTCTTGACATTCACTCCAAGATGCTAGAAAGCAACAAGAGAG
AGGACATTCGTTTGGGTTTACACCGGTCAGATTACATGCTTGACGAGCAAACAAAATCGC
TTCTTCAGATAGAGATGAACACTATTTCGTGTTCCTTTCCAGGCTTTGGTCCTCTTGTTA
CCAAGCTACACCAGTCATTGCTAAGATCTTATGGGGATCATCTTGGGCTAGACTCTGAAC
GTGTACCTAAAAATGCATCAACAATCCAGTTTGCTGACGCAATGGCTAGAACTTGGTTGG
AGTACAATAACCCAAGAGCGGTTGTTATGGTCGTTGTGCAGCCTGATGAGCGCAACATGT
ACGATCAACATTGGCTAAGCAGTGTATTGAGAGAAAGCACAATATAGTAACCATCAGAAG
TCTTTAGCAGAAGTTGAAAATGAAGGCGTGTACATGAGGACGGTAC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 0 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1C709TF U 1
AF RS1FD73TF U 101
BS 1 118 RS1C709TF
BS 119 119 RS1FD73TF
BS 120 277 RS1C709TF
BS 278 886 RS1FD73TF

RD RS1C709TF 281 0 0
GGACTACTACTTTGTCTTCTTCCCTTAATCTCTTTCCAAGAAGCTTCCTTATCCAGACCC
CTTTAAATCCGAGAAAGCCTGCACCTTTAAGGTGCGTGAGCTCACTAACGATGGAACC*C
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ATGCTCTCGTTTGGTCTTCCCTTCACGGACTTGTCGTCGGTGACAAAACTCATCAGAAAT
CAGGAACGGTTCCAGGGGTTGGGATGATGCACGCCCC
CATT

QA 1 277 1 277
DS 

RD RS1FD73TF 786 0 0
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TGTTCAGAAACTGGTCTACGATGCTCTCGTTTGGTCTTCCCTTCACGGCCTTGTCGTCGG
TGACAAAACTCATCAGAAATCAGGAACGGTTCCAGGGGTTGGGATGATGCACGCCCCTAT
TGCATTGCTACCGACTCCATTCCCTGAAAGTTACTGGAACCAAGCTTGTGAAGTTGCTCC
CATCTTCAACGAGTTAGTTGATCGTATCAGCTTGGATGGCAAATTCATTCAAGACAGTCT
CTCCAGAACGAAAAAAGCTGATGTCTTTACATCTAGACTTCTTGACATTCACTCCAAGAT
GCTAGAAAGCAACAAGAGAGAGGACATTCGTTTGGGTTTACACCGGTCAGATTACATGCT
TGACGAGCAAACAAAATCGCTTCTTCAGATAGAGATGAACACTATTTCGTGTTCCTTTCC
AGGCTTTGGTCCTCTTGTTACCAAGCTACACCAGTCATTGCTAAGATCTTATGGGGATCA
TCTTGGGCTAGACTCTGAACGTGTACCTAAAAATGCATCAACAATCCAGTTTGCTGACGC
AATGGCTAGAACTTGGTTGGAGTACAATAACCCAAGAGCGGTTGTTATGGTCGTTGTGCA
GCCTGATGAGCGCAACATGTACGATCAACATTGGCTAAGCAGTGTATTGAGAGAAAGCAC
AATATAGTAACCATCAGAAGTCTTTAGCAGAAGTTGAAAATGAAGGCGTGTACATGAGGA
CGGTAC

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

CO CL8430Contig1 1108 2 2 U
GCAACAACCAACGGCTACCAAATACCTAAAAGCTGCAGAAAGAAATGATGTCTAGATCTT
CGGTAAGAAGCTGAAGAAAATAAATTTCTCTCTTGATTACTTTTAAAAATCTCAATTTTT
TTCTTCTGTGTTTGAACATGTTTTACAACTTTACAAACACACACACATATATGTATATAT
TATATTATCTATACATATCGCAACCAATGTGTGTGTGTGTGTGTTGTCTTTTTTCTTTGA
CGGATTAGGGCATTGGTTACAATGAAATGGAAACTATTGTGTATTTGATTTTAGCTTGTG
TATTAATGTGGATATGTATAAAGTTCTGCGATATCTGAACTGTATTTTAAGATGTGGTAT
TCTTCAGTCCCCAATTGAATCACACGATGTTGACCACAAATCGGATACTTGTGTCATTTC
AAAAGTTTTTGATATTTATTCTAAACTGATTGTCCGGAAATTTTATAGTCTCAGTTTCAC
AACACAATTGTAGTAACATTTATTTAATAGGTTTGCAATTTCTATTTCTGAGCTATCATT
TGAACCTAATTCTCTGTTATTGTTCTAATTTGAAGTATTAGAAAATATGGTTTGTGTGCC
AAATCAAATCAAACATTGTGGAGTGTTGTACATTGTACCATAAATTTGTTTTCAAGTGGC
TCAAGAGAAAGATTTGTCCCTTCGCTTTCTATCTAAATAACTATAAAAGAAAATAAAAGA
GTGCATGTGAACTATCTCATTACGCATAAATATTAAATTTTGTATGAAAAACTCAAAAAA
GTTTCAATCAAAAGGATTCGAGTAAGTCAGTACATCAAGAGTGGTGCGAGTCATCAACAA
GAGAGGTATAGAAAGTTAGAGATAATATATGTGTACACAGTACACGCCATATATAAAGTA
TCCCATATATAGACTATTAGTCGAAACATATACACTTCTATACCATGTGGTGCATCAATT
TAAATGATTGATGATATCCCACGTATACAAGGATACTATTACAGATAAGACCTAATCATT
CATTAGCTAAACTTTGAAAAGAGATACACCACAACTTGATATATGCTATCGTATCGGCGT
AACATTAATCGAATTGATATTGGTTCCC


BQ
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AF RS1DF38TF U 1
AF RS1DF38JQ C 550
BS 1 681 RS1DF38TF
BS 682 1108 RS1DF38JQ

RD RS1DF38TF 681 0 0
GCAACAACCAACGGCTACCAAATACCTAAAAGCTGCAGAAAGAAATGATGTCTAGATCTT
CGGTAAGAAGCTGAAGAAAATAAATTTCTCTCTTGATTACTTTTAAAAATCTCAATTTTT
TTCTTCTGTGTTTGAACATGTTTTACAACTTTACAAACACACACACATATATGTATATAT
TATATTATCTATACATATCGCAACCAATGTGTGTGTGTGTGTGTTGTCTTTTTTCTTTGA
CGGATTAGGGCATTGGTTACAATGAAATGGAAACTATTGTGTATTTGATTTTAGCTTGTG
TATTAATGTGGATATGTATAAAGTTCTGCGATATCTGAACTGTATTTTAAGATGTGGTAT
TCTTCAGTCCCCAATTGAATCACACGATGTTGACCACAAATCGGATACTTGTGTCATTTC
AAAAGTTTTTGATATTTATTCTAAACTGATTGTCCGGAAATTTTATAGTCTCAGTTTCAC
AACACAATTGTAGTAACATTTATTTAATAGGTTTGCAATTTCTATTTCTGAGCTATCATT
TGAACCTAATTCTCTGTTATTGTTCTAATTTGAAGTATTAGAAAATATGGTTTGTGTGCC
AAATCAAATCAAACATTGTGGAGTGTTGTACATTGTACCATAAATTTGTTTTCAAGTGGC
TCAAGAGAAAGATTTGTCCCT

QA 1 681 1 681
DS 

RD RS1DF38JQ 559 0 0
TTCTCTGTTATTGTTCTAATTTGAAGTATTAGAAAATATGGTTTGTGTGCCAAATCAAAT
CAAACATTGTGGAGTGTTGTACATTGTACCATAAATTTGTTTTCAAGTGGCTCAAGAGAA
AGATTTGTCCCTTCGCTTTCTATCTAAATAACTATAAAAGAAAATAAAAGAGTGCATGTG
AACTATCTCATTACGCATAAATATTAAATTTTGTATGAAAAACTCAAAAAAGTTTCAATC
AAAAGGATTCGAGTAAGTCAGTACATCAAGAGTGGTGCGAGTCATCAACAAGAGAGGTAT
AGAAAGTTAGAGATAATATATGTGTACACAGTACACGCCATATATAAAGTATCCCATATA
TAGACTATTAGTCGAAACATATACACTTCTATACCATGTGGTGCATCAATTTAAATGATT
GATGATATCCCACGTATACAAGGATACTATTACAGATAAGACCTAATCATTCATTAGCTA
AACTTTGAAAAGAGATACACCACAACTTGATATATGCTATCGTATCGGCGTAACATTAAT
CGAATTGATATTGGTTCCC

QA 1 559 1 559
DS 



AS 1 2

CO CL8431Contig1 543 2 1 U
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CCT


BQ
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20 20 20 

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CCT

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TCC

QA 1 543 1 543
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BQ
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AF RS1AN64TF U 1
AF RS1AN64JQ C 299
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BS 655 879 RS1AN64JQ

RD RS1AN64TF 657 0 0
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TCAGCCGTCTTGGCCGCAGCTTCTGCCGCCAATGCTCTACCAGGCAAAGCAGTCGTAGAC
ATAGCAGGACATCCAGTTCAGTCCAATGTCCAATACTACATAATACCGGCTAAGATCGGA
GCCGGAAGTGGTCTTATCCCTTCAAGCCGAAATGTAAACACACAAGACTCGTGTCTGAAT
CTTGACATCGTACAGTCATCATCTCCTTTCTTCTCAGGCCTTCCAGTAACTTTCTCTCCG
CTCAACACAAAAGCCAAGGATGTCCAGCTCTCAGCTAGCCTCAGCCTCGAGTTTGATTCC
ACGGTTTGGCTATGCCCTGAATCTAAAGTGTGGAGAATCGACCACTCTGTGCAACTCAGG
AAGAGCTTTGTGAGCATTGGTGGTGAGAAGGGTAAAGGGAATAGCTTGTTTCAGATTCAA
GAAGATGGAGATGCTTACAAGCTTATGTATTGTCCGGTTATCTCCTCTGTTTCGTGTATC
AACGTGGGTCTAGAGATCGATGATCTTGGAGTGCGACGTTTGGTTCTTAGCAATGATCAA
TCTTTTGCTGTGAAGTTTCAAAGGGCGTATGATGATTCGAACTCCAACTGTCAT
CTC

QA 1 654 1 654
DS 

RD RS1AN64JQ 581 0 0
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CCACGGTTTGGCTATGCCCTGAATTTAAAGTGTGGAGAATCGACCACTCTGTGCAACTCA
GGAAGAGCTTTGTGAGCATTGGTGGTGAGAAGGGTAAAGGGAATAGCTTGTTTCAGATTC
AAGAAGATGGAGATGCTTACAAGCTTATGTATTGTCCGGTTATTTCCTTTGTTTCGTGTA
TCAACGTGGGTTTAGAGATCGATGATCTTGGAGTGGGACGTTTGGTTTTTAGCAATGATC
AATTTTTTGCTGTGAAGTTTCAAAGGGCGTATGATGATTCGAACTCCAACTGTCATTTCA
GGCCTCGTTGGAGGATGTTCCCTTTGTTTTAAATTGTGAAATAATTGTATCTTGTATTAT
GGTTGGAGAATGCTTGTGATCATACCAAAGTTGTGATGTAACCAACGGTTTATATGAAAT
AAGACATGTGGTTATTGTATGTATGTTAAGAATCCTTGTGACAACACCAAGTTTGTGATG
TAACCAACGGTTTATAATGGAATTAAACATACGGTTATTGT

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

CO CL8434Contig1 836 2 4 U
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GGCGTCATCGGTTCTCGTACCCTACCCGATCTCGCTTCTGGCCCAGGTGGGAAGTTTCCG
TCGCCGTGTAACCGAATAGAGTGTCCAACCTACGAGTTGGTCAGCTCCGAAAACGGCTAC
GAGATTCGCCGTTACAATACGTCCGTGTGGATTTCAACAGAGCCCATTAAAGACACCTCT
CTCGTCAAAGCTTCACGAAACGGTTTTAGCCAATTGTTTTATTACATTCACGGGAACAAC
GATAAAAGTCAGACGATAGAGATGACAGCTCCAGTTATCACTCAAGTCTCTCCGAGCGAC
GGTCCGTCAAGTGAATCCAACTTCACTCTATCATATTATGTTCCTAAAAAAAACCAAGCT
GATCCACCTCCGGCGAAGAACGTACACGTACAGAGATGGGACACGAGGTATGTTGCCGTG
AAGCAATTCGGCGGATACGTGTCGGATGACAATGCCGCCAAAGAAGCGGCGGAGCTGGAG
GAGAGCCTAAAAGGTACCGACTGGGGCAAGGCAATTGCTAAAAGCCGAGAAACAGGTGGT
GTCGGATTTAGTTCGGCTTACACGGTGGCTCAATACAACGCACCGTACGAGTTGTTGTTT
CGGGTTAATGAGATTTGGATGTCTTTTCAGGTGGACAAATGAAAGCAAAACTATTAATAA
CGTTTCTCAGTGAACAAGAATAAACAGTTTCATTTGAATAAATTACCCTTTTCATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CI04TF U 1
AF RS1CI04JQ C 107
BS 1 633 RS1CI04TF
BS 634 634 RS1CI04JQ
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BS 654 836 RS1CI04JQ

RD RS1CI04TF 653 0 0
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GGCGTCATCGGTTCTCGTACCCTACCCGATCTCGCTTCTGGCCCAGGTGGGAAGTTTCCG
TCGCCGTGTAACCGAATAGAGTGTCCAACCTACGAGTTGGTCAGCTCCGAAAACGGCTAC
GAGATTCGCCGTTACAATACGTCCGTGTGGATTTCAACAGAGCCCATTAAAGACACCTCT
CTCGTCAAAGCTTCACGAAACGGTTTTAGCCAATTGTTTTATTACATTCACGGGAACAAC
GATAAAAGTCAGACGATAGAGATGACAGCTCCAGTTATCACTCAAGTCTCTCCGAGCGAC
GGTCCGTCAAGTGAATCCAACTTCACTCTATCATATTATGTTCCTAAAAAAAACCAAGCT
GATCCACCTCCGGCGAAGAACGTACACGTACAGAGATGGGACACGAGGTATGTTGCCGTG
AAGCAATTCGGCGGATACGTGTCGGATGACAATGCCGCCAAAGAAGCGGCGGAGCTGGAG
GAGAGCCTAAAAGGTACCGACTGGGGCAAGGCA*TTGCTAAAAGCCGAGAAAC

QA 1 653 1 653
DS 

RD RS1CI04JQ 730 0 0
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GTGGGAAGTTTCCGTCGCCGTGTAACCGAATAGAGTGTCCAACCTACGAGTTGGTCAGCT
CCGAAAACGGCTACGAGATTCGCCGTTACAATACGTCCGTGTGGATTTCAACAGAGCCCA
TTAAAGACACCTCTCTCGTCAAAGCTTCACGAAACGGTTTTAGCCAATTGTTTTATTACA
TTCACGGGAACAACGATAAAAGTCAGACGATAGAGATGACAGCTCCAGTTATCACTCAAG
TCTCTCCGAGCGACGGTCCGTCAAGTGAATCCAACTTCACTCTATCATATTATGTTCCTA
AAAAAAACCAAGCTGATCCACCTCCGGCGAAGAACGTACACGTACAGAGATGGGACACGA
GGTATGTTGCCGTGAAGCAATTCGGCGGATACGTGTCGGATGACAATGCCGCCAAAGAAG
CGGCGGAGCTGGAGGAGAGCCTAAAAGGTACCGACTGGGGCAAGGCAATTGCTAAAAGCC
GAGAAACAGGTGGTGTCGGATTTAGTTCGGCTTACACGGTGGCTCAATACAACGCACCGT
ACGAGTTGTTGTTTCGGGTTAATGAGATTTGGATGTCTTTTCAGGTGGACAAATGAAAGC
AAAACTATTAATAACGTTTCTCAGTGAACAAGAATAAACAGTTTCATTTGAATAAATTAC
CCTTTTCATG

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL8435Contig1 593 2 3 U
TTTTTTTCAGTAACATGAACATAAACCTTTATATTCATCTTTACATTCTGTACAATTCGA
ATCCGTCATTAATTGCATCCCCAAAACAATCCATCAAAACCCCCAAGACTCATAGCGTCT
AGATAAGGTTCTTACTTCTTAGGCTTTCGATTTCACCGACAGATACAACCTATCCCAACC
AATCGATATATGGCAAAGATAATAAAAAATCTTAGATCTGTCTTCATCAATTAGGACCCC
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CCTTACCGGCGGCAACGGCGGCAGCGGACAAAGAAAAAAACCTGTTCGCCTGAGTAGCGG
ATCTCACATTGTTTCGGATACGTTGATTCACCGACCGGATCGTGTAGTTCCACCTGCATA
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TGCTCCTTGAACTCATCTTTTCTCTCTGTTTTTTTTTTTCTTAATTGCAAAAACTCTTAG
CTTTGTTTTTTTGTTTGTAAAATGGAGAATTGCTTTGTGAAAATTGTTGATCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1ET84TF C 1
AF RS1ET84JQ U 8
BS 1 7 RS1ET84TF
BS 8 565 RS1ET84JQ
BS 566 593 RS1ET84TF

RD RS1ET84TF 593 0 0
TTTTTTTCAGTAACATGAACATAAACCTTTATATTCATCTTTACATTCTGTACAATTCGA
ATCCGTCATTAATTGCATCCCCAAAACAATCCATCAGAACCCCCAAGACTCATAGCGTCT
AGATAAGGTTCTTACTTCTTAGGCTTTCGATTTCACCGACAGATACAACCTATCCCAACC
AATCGATATATGGCAAAGATAATAAAAAATCTTAGATCTGTCTTCATCAATTAGGACCCC
AACAGCTCAAGTACATGACCGTTCTGAGAGACTCCTCGGCTTGTTTCGCCTTGTCACCAT
CCTTACCGGCGGCAACGGCGGCAGCGGACAAAGAAGAGAACCTGTTCGCCTGAGTAGCGG
ATCTCACATTGTTTCGGATACGTTGATTCACCGACCGGATCGTGTAGTTCCACCTGCATA
GACCTAGTTGGTCTTTTGAGGCCTCCACGGCTCCAATGGTTGCTGCCACTAACCATGCTT
TGCTCCTTGAACTCATCTTTTCTCTCTGTTTTTTTTTTTCTTAATTGCAGAAACTCTTAG
CTTTGTTTTTTTGTTTGTAAAATGGAGAATTGCTTTGTGAAAATTGTTGATCC

QA 1 593 1 593
DS 

RD RS1ET84JQ 558 0 0
CAGTAACATGAACATAAACCTTTATATTCATCTTTACATTCTGTACAATTCGAATCCGTC
ATTAATTGCATCCCCAAAACAATCCATCAAAACCCCCAAGACTCATAGCGTCTAGATAAG
GTTCTTACTTCTTAGGCTTTCGATTTCACCGACAGATACAACCTATCCCAACCAATCGAT
ATATGGCAAAGATAATAAAAAATCTTAGATCTGTCTTCATCAATTAGGACCCCAACAGCT
CAAGTACATGACCGTTCTGAGAGACTCCTCGGCTTGTTTCGCCTTGTCACCATCCTTACC
GGCGGCAACGGCGGCAGCGGACAAAGAAAAAAACCTGTTCGCCTGAGTAGCGGATCTCAC
ATTGTTTCGGATACGTTGATTCACCGACCGGATCGTGTAGTTCCACCTGCATAGACCTAG
TTGGTCTTTTGAGGCCTCCACGGCTCCAATGGTTGCTGCCACTAACCATGCTTTGCTCCT
TGAACTCATCTTTTCTCTCTGTTTTTTTTTTTCTTAATTGCAAAAACTCTTAGCTTTGTT
TTTTTGTTTGTAAAATGG

QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 2

CO CL8436Contig1 547 2 1 U
GCTGGTGGAGGAGGATCTTAGGCCTGCTCTGGGAGATGTAGTCTGGGTTTGGCAAGGTGA
TAAGGAGAAGGAAGAGCAGCAGCTAAAGCGTGGTTTGCAGGATCAACAAGAAGTAGAACA
ACAAAATCTTGAACCGTCGTAGCAGAGAACATGAAGAAAAAAGAAGAAACTCTATTAAAC
TTGAGCATCAAGAACAGTCACTCTAAGGTGACAAACGAAAGGAAAAGAGGTAGAAAGAGG
GAACAGTTACATAACTTGATTCTTTACAATAGCAGAGATAGTTCACCCTTTTGTTTACTT
GAGCTTCCTATATAACTTTCTTAAGGTTTTGTCAGCACAGCAGCAAGAATGTGCGTACGT
GTTGTGTAAAGCAAATCCTTGTTTTAAGTGTATAAAACAAGCAAAATCTTATACAGCTGT
TGTTTTCAGAACTCCATGAGAGGATTTTGAGAAGTCAATAGACAGTTGCATGTAAACACT
GGGGATTAAACACACACAATAAACAATGTGCATTTGACTTTGTTTTAAACATTCTGTGAT
TGAAAGG


BQ
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AF RS1AV03JQ C 1
AF RS1AV03TF U 1
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DS 

RD RS1AV03TF 547 0 0
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TTGAGCATCAAGAACAGTCACTCTAAGGTGACAAACGAAAGGAAAAGAGGTAGAAAGAGG
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GAGCTTCCTATATAACTTTCTTAAGGTTTTGTCAGCACAGCAGCAAGAATGTGCGTACGT
GTTGTGTAAAGCAAATCCTTGTTTTAAGTGTATAAAACAAGCAAAATCTTATACAGCTGT
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GGGGATTAAACACACACAATAAACAATGTGCATTTGACTTTGTTTTAAACATTCTGTGAT
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QA 1 547 1 547
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CAAAGCAAGGACTTTGCCGGGACCTGTCAAGGATCCATCGGAGTTACCGAAATGGAACTA
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GCGTCACAAGGAACACATCTCTGCTTATGGTGAAGGCAACGAGCGTCGTCTCACTGGCAA
ACACGATACCGCCGATATCAACACTTTCTTATGGGGTGTGGCCAACCGTGGGGCATCCAT
TAGGGTTGGTCGCGACACTGAGCAAGCTGGGAAAGGATACTTTGAAGATCGTAGGCCAGC
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GTTCTTCTATTGTCTCGTTCTCATGGCTCCTTTGTTTAAGTAATGTTTGATTTAAACTCT
TAAAACCTGTTCTAGTTCTATATCGAATCTCTATGTTATTAC


BQ
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AF RS1AC25TF U 1
AF RS1AC25JQ C 384
BS 1 652 RS1AC25TF
BS 653 1242 RS1AC25JQ

RD RS1AC25TF 652 0 0
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TGATGGTTCAAGCACTGGCCAAGCTCCCGGCGAGGACAGTGAAGTCATCATTTACCCTCA
AGCTATCTTCAAAGACCCCTTCAGAAGAGGCAACAACATCCTTGTGATGTGTGACGCATA
TACACCTGCCGGTGAGCCGATCCCGACGAACAAAAGGCATGCTGCGGCCAAGATCTTTAG
CGATCCCAGCGTTGCCGCCGAAGAAACATGGTATGGAATTGAGCAAGAGTATACTTTGCT
ACAAAAGGATATTAAATGGCCGGTAGGTTGGCCTGTCGGCGGCTTCCCAGGTTCTCAGGG
ACCGTACTACTGCGGAGTTGGAGCAGACAAAGCCTTTGGAAGAGACATAGTAGATTCTCA
TTACAAAGCCTGTCTTTACGCTGGAATCAATGTCAGTGGCACTAACGGAGAAGTCATGCC
CGGACAGTGGGAGTTCCAAGTCGGTCCAACCGTTGGAATCGCTGCCGCTGAT

QA 1 652 1 652
DS 

RD RS1AC25JQ 859 0 0
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CTTTCTTATGGGGTGTGGCCAACCGTGGGGCATCCATTAGGGTTGGTCGCGACACTGAGC
AAGCTGGGAAAGGATACTTTGAAGATCGTAGGCCAGCGTCCAACATGGATCCGTACACTG
TGACCTCCATGATTGCTGAAACCACAATCCTCTGGAAACCATGAAGAAAGAAAACTTGAC
CTTCAAGGAATTACACATCTAGTATCAGTCCATGTTCGTTCTTCTATTGTCTCGTTCTCA
TGGCTCCTTTGTTTAAGTAATGTTTGATTTAAACTCTTAAAACCTGTTCTAGTTCTATAT
CGAATCTCTATGTTATTAC

QA 1 859 1 859
DS 



AS 1 2

CO CL8439Contig1 702 2 3 U
TTACTCACAAATTAAGAAAGAAAAATGGAGACGCAAAGCTACTGCGACTTGGAACTTCGC
CTTCTTCCTCCTTCTTATGAATCAAACAGCTCTGAAATTCCACAACCGAAGCAAGAACCT
CAGGTCTGTGTTTCTTCAGATCTTATCCATCTCCAGGCAACAGCTATACTATCGCTAGCG
AGAAGAGATAGGGAAGAGAGATCACTGTCACTGGAAAGTTCAGACGGCTCAGATCCTTCA
GTAATTCCAAGCAATTTGTATCGAGTTCATCATCAGAACGCCTCTACGAAGAGATCTCTT
CGTAGCTTTCTTCAGAAACGGAATGTTCGGATTCAGGCTTCTTCTCCTTACCGCCGATTC
CCAATAAATTTGTTTATGTGATTTCATGGGAGCCATTGGGTCCGGGACTGGAATTCTATT
GGCGGTGACAATCATATATCAGTATTTTCGAGACATTCGAGAAGGAGAAAGCAAGTGAAC
TTGGCTTCTTCGGGTTCTAAGTTAGCGTAAAAGTTGTAAACTCTGCAGAGTCTCAAAGGC
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GACCATTTTTTTTTCTTTTTGTTGTTTAAACAAAATTTTCGCTTGGTAGTTTTTCTTGTA
ATACAGTTTTATGCTTTTTATAATGTATGTTTCTAGTTATTC


BQ
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QA 1 702 1 702
DS 



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AF RS1C946TF U 1
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QA 1 646 1 646
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TACAGAGTAGCAAACAGCCAAGCAAGAAAGCAGTTATAGCACACACAAAAAAGAGCAGTC
AGATATATGAGGAAAGACATATACTTTGACTCACTCGGAGTGCAAGCAGAGAACATGGAA
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GACGCCATCCCTTGCCTACGTTGCAACACCTAATCATT

QA 1 818 1 818
DS 



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20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FZ94JQ C 1
AF RS1FZ94TF U 1
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TTTTCTTTTAATGTTATCATTTAAATTTTTGTTGAAACTAGTTTTGAGAATGGTTTTGTC
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TTCTTTCCCT

QA 1 550 1 550
DS 

RD RS1FZ94TF 543 0 0
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GAACAATCTCCAACATGAACACTTCTCAAAACCAAACGTTTCTCTCTGCAGTGACTCCAC
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TGGGTGAGCTCAAGAAGAAGCTGAAAGAGAATTTTACCATTCTACGAGGCATTAAAGAGG
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TTTTCTTTTAATGTTATCATTTAAATTTTTGTTGAAACTAGTTTTGAGAATGGTTTTGTC
GAAGTGGATTTTCAGTACTTCTCTATATAATATTTTAGTAATAAATTCTACTAGTTTGTT
TTC

QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 2

CO CL8442Contig1 1004 2 2 U
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ATAGCACCAGCAGCAAAAGATATGTTCTCTTTCCTAAGAGACACAGATGAAGTTCCTCAG
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TCGGCCGCCGCTGAAGCTTGGTGGTTCCTTTTCGGGTCGTTTCTCAGGTCCTTTCCGTTT
GTGGATTGAAGTTAAGTTTGGTTTGGTAGCGTTTTGTGTTAGCGGCAAGATTGTGTTTCA
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GTGGGCGTAAGTGCGCTGCATCCATATCCGAAGGTGTGTGGACCGAGAAGTGATCTTTAT
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CGATAAGTCGTGGTGTATTGGGTTCTAGAGGTGGAGGTTATCGGGTGGCGATATGTGATT
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EB07TF U 1
AF RS1EB07JQ C 192
BS 1 730 RS1EB07TF
BS 731 1004 RS1EB07JQ

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CGATAAGTCGTGGTGTATTGGGTTCTAGAGGTGGAGGTTATCGGGTGGCGATATGTGATT
TGCAGCGATA
TTCC

QA 1 730 1 730
DS 

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AGTGTAGTTGTTAATCGTTCTTCCTTGGTTTAGATGTGGTTCGAGTTATTATGCTTTTTA
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TCGAGTATCTAATGGAATGAATTTCAATTTGGG

QA 1 813 1 813
DS 



AS 1 2

CO CL8443Contig1 749 2 4 U
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GGCGGCGGCGGCGAGGGGGTGAATATGATGGAGTACGTGGCGGCTCAGCCTTGCTATGAG
TCAGCGTATTACCCGGGTGGGCCATACGGATATTATCCGGTTCAAGCCCACGCGCCTCAG
ATGTTCAGTGATGAGAATCCGAATGCTTGCGTCGTTATGTGATGGTAGAGTTGTAAATAT
GCTTTTAATCTTTGGGGTATTTTCGGGAAAGACGAGTACTTTTGTTTAACTTTCTTTTTT
TTTGGTTTTTTACTATAGTTTCAGTTTTG


BQ
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TATTTTCGGGAAAGACGAGTACTTTTGTTTAACTTTCTTTTTTTTTGGTTTTTTACTATA
GTTTCAGTTTTG

QA 1 732 1 732
DS 



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BQ
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AF RS1D885JQ C 1
AF RS1D885TF U 1
BS 1 539 RS1D885TF

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QA 1 539 1 539
DS 



AS 1 2

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C


BQ
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10 

AF RS1H039TF U 1
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ATTCGATAGTAGAAGCA

QA 1 677 1 677
DS 

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CCGTTCGTGGTGCTTTAGGACCGTTTGGATTCTCGGTTCTCGCCGATGAGAGCTTGTCGG
AGCAAACTCCCGTTTACTTCTATGTGGCTAAAGGAAAAGATTTTAAGCTCAAAACATTTT
TCTGTACAGACAGCTCAAGGTCATCTTTTGCAAACGATGTCGTTAAACCGGTTTACGGTA
GTTCTGTACCGGTTCTGAAAGGGGAGAAACTGACCATGAGAATATTGGTGGATCATTCGA
TAGTAGAAGCATTCGGACAAGGCGGAAGAACATGCATAACGTCAAGGGTGTATCCAACAA
AAGCAATCTATGGAGCAGCCAAGCTTTTCTTGTTCAACAATGCCATTGATGCGACTATTA
CGGCATCGTTTAATGTGTGGCAGATGAACAGTGCTTTTATTCATCCTTACTCTGAGGAGG
CCGTCCGTGCTCTCTCTCGTACCTGATTATACACCCACCGCCAGCAATTTTTTTTGTAGA
TTTACTTGTAATAAATTATGTTTTTGTGTTCCTTTTCCAATTTAATCGTTTAACC

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 2

CO CL8446Contig1 1048 2 4 U
GGGTTTCAAGCTGTCACCAAAATGTCGTCTTCTTCTTCTCCTTCTCCTTCTCCCTCCTCT
GCTTAAACCCATTAGTTTAATAATCTCTCTCTCTGATAACGAACAAAACAGATCAGCAGA
AGCAAAAACAAGTGGTCCTCCTCCAACGCTATGATTCGTATCCTCCAAATCTCGATCCTC
TGCTCCCTTCTCCTCGCCGGGATCTCGATCCCCGCCGTGATCTCGTCCGAGAGCGAGACA
ATATACGAGATCCTCCAGCGGAACGGGCTGCCGTCGGGGATATTCCCGAAAGGCGTGACG
GAATTCGCCTTCGACGGCGACACGGGACGCTTCTCCGTCTACTTGAACCAGTCCTGCGAC
GCCAAGTACGAGACGGAGCTCCGTTACGACACGAACATCACCGGGACGATAGGCTCTGCC
AACACCGGAGATTTGTCGGGGATATCGGCTCAGGAGCTGTTCCTTTGGTTTCCGGTTAAA
GGGATTCGGGTCGATGTGCCGAGCTCGGGGCTTATATACTTCGATGTCGGCGTTGTTCGC
AAGCAGTACTCTCTGTCTTTGTTCGAGACGCCGAGGGATTGCGTCGCGGTTCGTGGCGAA
AACGAGGTTGAATCTTCGGTGTTGTCATTGCATCAAGTAGATCAAACTCTTGGGAGAAAC
GTTATATAGCCCGGAGGGTTTAAAAAAAAGAAATGTTGTTATACTATACCCACCACAAAG
ATAGACAGATGTTCTCATCAAAATTCTTGAAGATACTTGTGTTACTGTTCTTTTTGGTCT
CAAATTCAAAATGGTTCAACTCTTTTCCCCTCCTCATTCCAGTTTTGTTTCTGTATTGCA
TTCTTTGTTCCTGAGGAGGAGTTAGATGGAAAAGAAACAAGATCTGGTTTGTTTTGGAGA
AAAAAAAAAGGTGTTGGAAGGAATGGTCCATATTTTGGTTCAAGTGATTGATGATAACAG
TGATGTGAGGTGATGAATGTTGTATTATTTTTGTTGTCTATTGTTTAAACAGATATTATT
ATCCTATATATAGCCAAATAAGTCTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CR14TF U 1
AF RS1CR14JQ C 231
BS 1 688 RS1CR14TF
BS 689 689 RS1CR14JQ
BS 690 783 RS1CR14TF
BS 784 1048 RS1CR14JQ

RD RS1CR14TF 784 0 0
GGGTTTCAAGCTGTCACCAAAATGTCGTCTTCTTCTTCTCCTTCTCCTTCTCCCTCCTCT
GCTTAAACCCATTAGTTTAATAATCTCTCTCTCTGATAACGAACAAAACAGATCAGCAGA
AGCAAAAACAAGTGGTCCTCCTCCAACGCTATGATTCGTATCCTCCAAATCTCGATCCTC
TGCTCCCTTCTCCTCGCCGGGATCTCGATCCCCGCCGTGATCTCGTCCGAGAGCGAGACA
ATATACGAGATCCTCCAGCGGAACGGGCTGCCGTCGGGGATATTCCCGAAAGGCGTGACG
GAATTCGCCTTCGACGGCGACACGGGACGCTTCTCCGTCTACTTGAACCAGTCCTGCGAC
GCCAAGTACGAGACGGAGCTCCGTTACGACACGAACATCACCGGGACGATAGGCTCTGCC
AACACCGGAGATTTGTCGGGGATATCGGCTCAGGAGCTGTTCCTTTGGTTTCCGGTTAAA
GGGATTCGGGTCGATGTGCCGAGCTCGGGGCTTATATACTTCGATGTCGGCGTTGTTCGC
AAGCAGTACTCTCTGTCTTTGTTCGAGACGCCGAGGGATTGCGTCGCGGTTCGTGGCGAA
AACGAGGTTGAATCTTCGGTGTTGTCATTGCATCAAGTAGATCAAACTCTTGGGAGAAAC
GTTATATAGCCCGGAGGGTTTAAAAAAA*GAAATGTTGTTATACTATACCCACCACAAAG
ATAGACAGATGTTCTCATCAAAATTCTTGAAGATACTTGTGTTACTGTTCTTTTTGGTCT
CAA
T

QA 1 783 1 783
DS 

RD RS1CR14JQ 818 0 0
GAGCGAGACAATATACGAGATCCTCCAGCGGAACGGGCTGCCGTCGGGGATAT*CCCGAA
AGGCGTGACGGAATTCGC*TTCGACGGCGACACGGGACGCTTCTCCGTCTACTTGAACCA
GTCCTGCGACGCCAAGTACGAGACGGAGCTCCGTTACGACACGAACATCACCGGGACGAT
AGGCTCTGCCAACACCGGAGATTTGTCGGGGATATCGGCTCAGGAGCTGTTCCTTTGGTT
TCCGGTTAAAGGGATTCGGGTCGATGTGCCGAGCTCGGGGCTTATATACTTCGATGTCGG
CGTTGTTCGCAAGCAGTACTCTCTGTCTTTGTTCGAGACGCCGAGGGATTGCGTCGCGGT
TCGTGGCGAAAACGAGGTTGAATCTTCGGTGTTGTCATTGCATCAAGTAGATCAAACTCT
TGGGAGAAACGTTATATAGCCCGGAGGGTTTAAAAAAAAGAAATGTTGTTATACTATACC
CACCACAAAGATAGACAGATGTTCTCATCAAAATTCTTGAAGATACTTGTGTTACTGTTC
TTTTTGGTCTCAAATTCAAAATGGTTCAACTCTTTTCCCCTCCTCATTCCAGTTTTGTTT
CTGTATTGCATTCTTTGTTCCTGAGGAGGAGTTAGATGGAAAAGAAACAAGATCTGGTTT
GTTTTGGAGAAAAAAAAAAGGTGTTGGAAGGAATGGTCCATATTTTGGTTCAAGTGATTG
ATGATAACAGTGATGTGAGGTGATGAATGTTGTATTATTTTTGTTGTCTATTGTTTAAAC
AGATATTATTATCCTATATATAGCCAAATAAGTCTCAT

QA 1 818 1 818
DS 



AS 1 2

CO CL8447Contig1 1314 2 2 U
GGAGTGCCGCCGAGAGAAGAGAGAGAGCCTTAGAGCTAAGAAGCTATGACGACGATTGTT
CCCACTTCCGAAGAAGATCCGTTCCTCGCCGTTGTCCAGTTTACTTCCCAGCTCGCCTGG
GCTGATGCTGGTCCCGAGGCTGCAGAGCCAGAGATCACCAGGCTGTGTAGAGAAGCTGAG
GAATCGATAGTAGCAGGAAAGTGGTTGGAGTTGGCTTCCTTAATGGTTACTTCTGCTGAA
TTGGTATCTTCCAAGATGTCTGTCAAAGATCTTGAGTGTACCTACACCATCATTTGCAGC
CTTGTTAAGAACGCCAATAGCCCTGAAGATGTCCTTGAAATGGTGAAAGCTATCTCTTCT
AAGGTTGTTCAACAGCCGAATGACAAAGCTTCTCTTCGTTTGAAGATCCTATTCAATCTC
TATAACCTTCTGGACCACCCTTAAGTTCCTGACGAAGTATCTAGCGACTTTCTCAAGTGA
GGATGCTAAGGTCCTGGAGGAAGCTAAGGAGGAGGCTGTGCGTGCAGTTATTGAATTTGT
CAAGGCTTCCAGCATCTTCCAGTGTGATTTATTGGAATTGCCAGCCGTAGCACAACTAGA
GAAGGATGCTAAGTATGCCCCGGTTTACCAGCTACTAAAGATCTTTCTTACTCAGAGGCT
TAATGCTTACACTGACTTCCGAACTGCAAATTCAGAATGCCTGCAATGCTATGGACTTGT
TGATGAAGATTGTGTAACGAAGATGAGATTGTTGTCACTAGTGGACTTAGCGTCAGATGA
GTCTGGCAAAATACCGTACACCTCAATCAAAGACACTCTACAGGTAAAGGAAGAGGAGGT
TGAACTATGGATCGTGAAGGCAATAACTGCGAAGCTGATCGATTGTAAGATGGATCAGAT
GAACCAAGTTGTCATTGTCAGCCGCTGTTCCGAGCGGGAATTCGGGTCAAAGCAATGGCA
ATCACTTCGAACTAAGCTCGCAACCTGGCGGGATAACATTGGAAATGTCATAAGTACAAT
CGAGTCGAACAAAGTAACCGAGGAAGGTTCTCAGGCATCATCAGCATCTGCTGCAGCAAT
TCAAGGGTTGACTGTTCGTTGAAAAGCTATCAAGACAGAAAAACCTTTTTCATCTCCAGA
AAATCTCTCAAAATCTATAACCAACGTTGAATATCTTTTGTTGTCTTAGAAGCTTTCTTT
CCTCTGTGTATTTTGTTGCAGAGTTTCTTTATCTTTGAAATTTTTTGTCCCTGAAATAAT
TTGGAAACTTCTGCTATACATTAACATTTCTTGTTTTGAGGATACTTATTTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1C865TF U 1
AF RS1C865JQ C 542
BS 1 600 RS1C865TF
BS 601 1314 RS1C865JQ

RD RS1C865TF 600 0 0
GGAGTGCCGCCGAGAGAAGAGAGAGAGCCTTAGAGCTAAGAAGCTATGACGACGATTGTT
CCCACTTCCGAAGAAGATCCGTTCCTCGCCGTTGTCCAGTTTACTTCCCAGCTCGCCTGG
GCTGATGCTGGTCCCGAGGCTGCAGAGCCAGAGATCACCAGGCTGTGTAGAGAAGCTGAG
GAATCGATAGTAGCAGGAAAGTGGTTGGAGTTGGCTTCCTTAATGGTTACTTCTGCTGAA
TTGGTATCTTCCAAGATGTCTGTCAAAGATCTTGAGTGTACCTACACCATCATTTGCAGC
CTTGTTAAGAACGCCAATAGCCCTGAAGATGTCCTTGAAATGGTGAAAGCTATCTCTTCT
AAGGTTGTTCAACAGCCGAATGACAAAGCTTCTCTTCGTTTGAAGATCCTATTCAATCTC
TATAACCTTCTGGACCACCCTTAAGTTCCTGACGAAGTATCTAGCGACTTTCTCAAGTGA
GGATGCTAAGGTCCTGGAGGAAGCTAAGGAGGAGGCTGTGCGTGCAGTTATTGAATTTGT
CAAGGCTTCCAGCATCTTCCAGTGTGATTTATTGGAATTGCCAGCCGTAGCACAACTAGA

QA 1 600 1 600
DS 

RD RS1C865JQ 773 0 0
AAGGCTTCCAGCATCTTCCAGTGTGATTTATTGGAATTGCCAGCCGTAGCACAACTAGAG
AAGGATGCTAAGTATGCCCCGGTTTACCAGCTACTAAAGATCTTTCTTACTCAGAGGCTT
AATGCTTACACTGACTTCCGAACTGCAAATTCAGAATGCCTGCAATGCTATGGACTTGTT
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TCTGGCAAAATACCGTACACCTCAATCAAAGACACTCTACAGGTAAAGGAAGAGGAGGTT
GAACTATGGATCGTGAAGGCAATAACTGCGAAGCTGATCGATTGTAAGATGGATCAGATG
AACCAAGTTGTCATTGTCAGCCGCTGTTCCGAGCGGGAATTCGGGTCAAAGCAATGGCAA
TCACTTCGAACTAAGCTCGCAACCTGGCGGGATAACATTGGAAATGTCATAAGTACAATC
GAGTCGAACAAAGTAACCGAGGAAGGTTCTCAGGCATCATCAGCATCTGCTGCAGCAATT
CAAGGGTTGACTGTTCGTTGAAAAGCTATCAAGACAGAAAAACCTTTTTCATCTCCAGAA
AATCTCTCAAAATCTATAACCAACGTTGAATATCTTTTGTTGTCTTAGAAGCTTTCTTTC
CTCTGTGTATTTTGTTGCAGAGTTTCTTTATCTTTGAAATTTTTTGTCCCTGAAATAATT
TGGAAACTTCTGCTATACATTAACATTTCTTGTTTTGAGGATACTTATTTGCT

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

CO CL8448Contig1 1232 2 2 U
GTATTGGTAACGGGGTTTTGTCTCCAGCTATTCCAGTTCTGTCTTCCATGTCAGGTTTGC
AAGCTACAGAGAAGAAATGGACTGACGGCCAACTTCTGCTTCTTACCTGTGTCATACTAG
TTGGATTGTTTGCTTTCCAACACTCTGGTACTCACAGGGTGGCTTTTATGTTTTCACCCA
TTGTCATCATCTGGCTTATTTCACTCCTCTCCCTCGGTTTTTATAACATCATACACTGGA
ATCCCAAGATCATCTATGCAATTTCCCCGCTTTATATCATCAAGTTTTTCAGAGTCACTG
GTCAAGATGGCTGGATTTCTCTTGGAGGGATTCTTCTTTCTGTAACTGGTACTGAAGCTA
TGTTTTCAAATCTTGGCCATTTCACCTCTGTCTCAATCAGACTTGCTTTCGCCTTCCTTG
TGTACCCATGTCTGGTTGTACAATACATGGGCCAGGCAGCTTTCTTATCAAAGAACCTCG
GGTCTATTCCCAACAGTTTTTACAGTTCAGTCCCAGATCCTGTTTTCTGGCCTGTGTTTG
TTATTGCTGCACTTGCAGCCATTGTTGGCAGTCAGGCTGCGATAACCTCCACATTTTCAA
TAATCAAACAATGCCATGCTCTTGGATGCTTCCCACGCGTCAAACTAGTCCATACTTCAA
AACATGGACACATGTATATCCCGGAGATCAACTGGATCCTCATGATCCTGACTCTTGCAG
TAACTATAGGCTTCCGGGACACAATTTTGATTGGAAATGCCTACGGACTCGCCTTCATGA
TAGTAACGTTCATCACAACGTTTCTCATGGCTCTTGTCATAGTCGTGGTATGGGAGAAGA
GTTGTTTTCTGGGGGCTTTGTTCCTTGGAAGTCTATGGATAGTCGAAGGTGCCTATCTCT
CAGCGGCGCTCATGAAACTTCCACAGGGTGGTTGGGTGCCTTTGGTGCTGGCTTGCATAT
CAATGACCGCTATGTATGTGTGGCACTATGGTACTCGAAGGAAATACAGCTTTGATCTCC
ATAACAAAGTTTCACTGAAGTGGTTGCTGGGACTAGGACCTAGTCTTGGGATTGTCCGTG
TGCCCGGAATAGGACTTGTATACTCAGAACTTGCAACAGGAGTTCCTGCAATTTTCTCAC
ACTTTGTGACCAACATCCCGGCATTCCATAAAGTTGTGGTGTTTGTTTGTGTGAAATCAG
TGCCAGTGCCTCATGTATATCCTGAAGACGCT


BQ
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AF RS1A453TF U 1
AF RS1CX40TF U 597
BS 1 768 RS1A453TF
BS 769 1232 RS1CX40TF

RD RS1A453TF 768 0 0
GTATTGGTAACGGGGTTTTGTCTCCAGCTATTCCAGTTCTGTCTTCCATGTCAGGTTTGC
AAGCTACAGAGAAGAAATGGACTGACGGCCAACTTCTGCTTCTTACCTGTGTCATACTAG
TTGGATTGTTTGCTTTCCAACACTCTGGTACTCACAGGGTGGCTTTTATGTTTTCACCCA
TTGTCATCATCTGGCTTATTTCACTCCTCTCCCTCGGTTTTTATAACATCATACACTGGA
ATCCCAAGATCATCTATGCAATTTCCCCGCTTTATATCATCAAGTTTTTCAGAGTCACTG
GTCAAGATGGCTGGATTTCTCTTGGAGGGATTCTTCTTTCTGTAACTGGTACTGAAGCTA
TGTTTTCAAATCTTGGCCATTTCACCTCTGTCTCAATCAGACTTGCTTTCGCCTTCCTTG
TGTACCCATGTCTGGTTGTACAATACATGGGCCAGGCAGCTTTCTTATCAAAGAACCTCG
GGTCTATTCCCAACAGTTTTTACAGTTCAGTCCCAGATCCTGTTTTCTGGCCTGTGTTTG
TTATTGCTGCACTTGCAGCCATTGTTGGCAGTCAGGCTGCGATAACCTCCACATTTTCAA
TAATCAAACAATGCCATGCTCTTGGATGCTTCCCACGCGTCAAACTAGTCCATACTTCAA
AACATGGACACATGTATATCCCGGAGATCAACTGGATCCTCATGATCCTGACTCTTGCAG
TAACTATAGGCTTCCGGGACACAATTTTGATTGGAAATGCCTACGGAC

QA 1 768 1 768
DS 

RD RS1CX40TF 636 0 0
G
CAATAATCAAACAATGCCATGCTCTTGGATGCTTCCCACGCGTCAAATTAGTCCATACTT
CAAAACATGGACACATGTATATCCCGGAGATCAACTGGATCCTCATGATCCTGACTCTTG
CAGTAACTATAGGCTTCCGGGACACAATTTTTATTGGAAATGCCTACGGACTCGCCTTCA
TGATAGTAACGTTCATCACAACGTTTCTCATGGCTCTTGTCATAGTCGTGGTATGGGAGA
AGAGTTGTTTTCTGGGGGCTTTGTTCCTTGGAAGTCTATGGATAGTCGAAGGTGCCTATC
TCTCAGCGGCGCTCATGAAACTTCCACAGGGTGGTTGGGTGCCTTTGGTGCTGGCTTGCA
TATCAATGACCGCTATGTATGTGTGGCACTATGGTACTCGAAGGAAATACAGCTTTGATC
TCCATAACAAAGTTTCACTGAAGTGGTTGCTGGGACTAGGACCTAGTCTTGGGATTGTCC
GTGTGCCCGGAATAGGACTTGTATACTCAGAACTTGCAACAGGAGTTCCTGCAATTTTCT
CACACTTTGTGACCAACATCCCGGCATTCCATAAAGTTGTGGTGTTTGTTTGTGTGAAAT
CAGTGCCAGTGCCTCATGTATATCCTGAAGACGCT

QA 2 636 2 636
DS 



AS 1 2

CO CL8449Contig1 555 2 1 U
GGATTACACGTCTCCAGAAACCTGATATAGCTTTCCGCCGCCTCCTGCGAGATCCTCCCA
TCATCATCCGCTAAAATGAAGGTTGTCGCCGCGTTCTTGCTCGCCGTTCTGAGCGGAAAA
GCTTGCCCAACCAGTGCTGATATCAAGGGTATCCTCAACTCAGTTGGTGCTGAAACAGAG
GATTCTCAGATTGAGCTTTTGTTGAAGGAAGTCAACGGGAAAGACGTGGCTGAGCTGATT
GCTGTCGGAAGGGAGAAGTTGGCTTCAGTACCAAGCGGTGGTGGTGTTGCCATGGCTTCT
GCTCCATCTGCTGGTGGTGGAGGAGGTGCCGCTCCTGCTGCTGAGTCCAAGAAAGAAGAG
AAGAAAGAGGAGAAGGAAGAATCCGATGATGACATGGGTTTCAGCCTGTTCGAGTAAGGC
GCGTTTGCTTGGATGTTATCTGTTTTTGTAACGTTTTGGGACCTCTTTGAAACCTATATG
CTGTTGTTTTCTAGTTTGTTCTCGGTCAGTATCTTTGACATTCCTGAAATTCTCAAGAGA
TTTTACACAAACATG


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AF RS1FO32TF U 1
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QA 1 555 1 555
DS 



AS 1 2

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AF RS1C678TF U 1
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QA 1 670 1 670
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CAAACAAAACTTTTTATTAAAGACCATTGTAACACTTTCCGGAAAATCGTTTATTGTTTT
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QA 1 745 1 745
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AS 1 2

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10 10 10 10 10 

AF RS1H135TF U 1
AF RS1H135JQB C 1
BS 1 552 RS1H135TF
BS 553 665 RS1H135JQB

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CCAGCTGATCCT

QA 1 552 1 552
DS 

RD RS1H135JQB 665 0 0
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TCTGCTCATTTGAAAGCCGGTGATTTCTGTGGAGATCTTCTCACTTGGGCACTGGATCCC
AACACTTCTCACTTGCCTATCTCTACTAGAACCGTTCAAGTTCAGACAGAAGTCGAAGGC
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AAGCAATTACGACACACGTACAGGTGTTATTCAGTGCAGTGGCAGACATGGGCAGCATGT
TTCATACAAGCAGCATGGAAGAGATACTGTAGAAGGAAGGTCTCAAGGGCCTTACGTGAA
GAAGAAGAAAGACTACAATACTCTCTTCAGACAGATGATTCATCAGGAGGCAATAAACTT
AACTTAGGTGCTGCGATTTATGCGTCGAGGTTCGCTTCTCATGCCCTGAGGAATGTAAGG
GCGAATGCAGCCGCACGCAACTCCATGCTTCCTCATATGCTATCTTTGTTGCCTCAGAAG
CCAGCTGATCCTGAGTTTCCTATGGATGAAACCTAATAATGTTGTGTATATATAAAAAGA
AAGAATGTCCCTAGTGATGATTTTAAATAGTTATGTAAACAGTTTCTTTATTAATTGTGC
CTACA

QA 1 665 1 665
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8453Contig1 540 2 1 U
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TCAGAGTTTAACTATTTTGTTCATCAGTTGACATTTCTCTGTTTTTGGTTTCAGTTATCA
TTACTTATGTCTTCATCTTCTTTATCCTCCATGAATAGTAAACTTGGCTGGAGGAAGATG
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GTAGGGATTCGTAAGCAGATGAGCTCCGACGAAGAACAGTGATGAAACTAATAAGCAGGG
GAGGAGCTTCGGGGTGGCTTGCCGAAGAAGAAGCTTCGGTAGCAATTGCATATACATACT
TGTATATTTGTTTTTAATATACTTGTAAATGTTTCTTAATGATATTTTGAATGATTTAGC


BQ
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AF RS1CL62JQ C 1
AF RS1CL62TF U 1
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GAGGAGCTTCGGGGTGGCTTGCCGAAGAAGAAGCTTCGGTAGCAATTGCATATACATACT
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QA 1 540 1 540
DS 

RD RS1CL62TF 540 0 0
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TCAGAGTTTAACTATTTTGTTCATCAGTTGACATTTCTCTGTTTTTGGTTTCAGTTATCA
TTACTTATGTCTTCATCTTCTTTATCCTCCATGAATAGTAAACTTGGCTGGAGGAAGATG
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GAAGACGACGACAACGAAGCTCGGGGCTGGAGACAGAAGACGAAGGAAAAACTCATGGCT
GTAGGGATTCGTAAGCAGATGAGCTCCGACGAAGAACAGTGATGAAACTAATAAGCAGGG
GAGGAGCTTCGGGGTGGCTTGCCGAAGAAGAAGCTTCGGTAGCAATTGCATATACATACT
TGTATATTTGTTTTTAATATACTTGTAAATGTTTCTTAATGATATTTTGAATGATTTAGC

QA 1 540 1 540
DS 



AS 1 2

CO CL8454Contig1 639 2 3 U
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ATTAATCCCAAGTAATCATGTGCTCGTCTCCAAACCCTTGCATCAGATATCCTAAACCTA
ACCACCTTTCCCAAGGCAACACGAGCTCTTGGCAACAGTTCACGGTGATAAGTTGCGAGC
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TTCCCGGATTCTTGCCTCAGACCTAGACGGCTTGATGAGAGATTCTCATAGAGAAGCAAC
TCTAAGCTTTCAAAGAGCTCTCGAGCAGCTTCCTTGTGC


BQ
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AF RS1AR78JQ U 11
AF RS1AR78TFB C 1
BS 1 10 RS1AR78TFB
BS 11 558 RS1AR78JQ
BS 559 639 RS1AR78TFB

RD RS1AR78JQ 548 0 0
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TGTGTGCAACCATTTTGTCCCCACCCTCGCTCCAGTTAACCGTACCAGGAAACCTTTTTT
CCGAAACACGTGAAGGTCCTAACACGGACCAACAGATTCCTGGCTCGTTCATTAATCCCA
AGTAATCATGTGCTCGTCTCCAAACCCTTGCATCAGATATCCTAAACCTAACCACCTTTC
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CCGTCACCACAAAACACAACAGCCTTGACTGTGTTGTTCTTCTGGATGCATTCCCGGATT
CTTGCCTC

QA 1 548 1 548
DS 

RD RS1AR78TFB 639 0 0
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TTTTGGTCCAAACCGGTTACAAACCGAGAATGGTTAGTGGTTACAATGGTACAAATCAAA
CAAAACAAAACCGGAACGGTACAAACCGAATCCAAGAGACTTTTCTGTGATCAGTTTTGG
GGGATGACATCAGAGAGAGCAAAGTCATGGAACGGTGGACCTCCTTGTTCACTTAGAATG
TGAAACGGAATGTGTGCAACCATTTTGTCCCCACCCTCGCTCCAGTTAACCGTACCAGGA
AACCTTTTTTCCGAAACACGTGAAGGTCCTAACACGGACCAACAGATTCCTGGCTCGTTC
ATTAGTCCCAAGTAATCATGTGCTCGTCTCCAAACCCTTGCATCAGATATCCTAGACCTA
ACCACCTTTCCCAAGGCAACACGAGCTCTTGGCAACAGTTCACGGTGATAAGTTGCGAGC
TTTGCGATAGCCGTCACCACAAAACACAACAGCCTTGACTGTGTTGTTCTTCTGGATGCA
TTCCCGGATTCTTGCCTCAGACCTAGACGGCTTGATGAGAGATTCTCATAGAGAAGCAAC
TCTAAGCTTTCAAAGAGCTCTCGAGCAGCTTCCTTGTGC

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 2

CO CL8455Contig1 654 2 3 U
GCTCAAAGTCATTGCAATTGGGTACAAGGACAAACCAAACAAAATATCAAGATACAACGC
TAATCAGTTCTTCAAACTAAAAATAGTATGAAAGAAGTCTTTACATATAAAAACGCTTAC
AGAGATATTCATTACCACATACACACACAAGAGTGAGTGTAAATAACCCTAAACCCAGCA
TCATTCAGTTCTTCATCCATGCCTTAGTAACGGTCATAAGTACCAGACGATGGATAACCA
CTAGCACCAGCACCACCACCACTGCTTCGGCTCGGCCTCTCATACGGACCACTGGCTCTG
CTTCTAAACCCTCTTCCCTCGTCTGCTCCACGAATAGGCCCACCAGCTAAGCATCATCGG
CTTGGTCAGCCTTTACCTAACCAACTACCTAATACTACGCAGGCTCATCAAACAGCGCTT
TCTAGCTTTCTTCGGGATTTAGCCCGAACTGTTCGGCAGATTCCCACGCCTTACGCACCC
GTTCGCCACTTTGTTCACAACTCTTCCCACCTCTTGGGTGAGACAAGCTACCTTGAGCTA
GGAGCCTCCATTCCTTCTGACTAGCTCCCAGGGAACAACGTTCGACTTGCATGTGTTAAG
CATATAGCTAGCGTTCCTTCTGAGCCAGGATCAAACTCTTCTTTTGACTATGAC


BQ
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AF RS1AR55JQ U 23
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CCCGAACTGTTCGGCAGATTCCCACGCCTTACGCACCCGTTCGCCACTTTGTTCACAACT
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QA 1 528 1 528
DS 

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CTTCTAAACCCTCTTCCCTCGTCTGCTCCACGAATAGGCCCACCAGCTAAGCATCATCGG
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QA 1 654 1 654
DS 



AS 1 2

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TCTTGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B440TF U 1
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BS 1 610 RS1B440TF
BS 611 788 RS1B440JQ

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TAAAATGCGA
TA

QA 1 610 1 610
DS 

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TCAAGAAATTATATACTCGTAAATTACATACTTTTATCTAGCATATATTTCGACCTAAAA
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ATC

QA 1 723 1 723
DS 



AS 1 2

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GTCTTCTCATCTACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AATACTTAGTGATGTCTATGGATGTGATCTCCAGACACCATGACCATCTGTGGGACAGAA
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ATCTTTCCACTCAGCCTTGAATTCATGTAAGTACTTCAAACGTAAGATCTCAACGCCACA
TTTGTTTTCTGTATTTAAAGGTTCGTCACTGAATTTGCTAAGGTTTCCTCCTTTGATCGA
GAGCTTTGTAAGATTGTCAAGTGTTTTGGGATTTAACCAAACTGGAGGTTTCTTTTGAGG
GTAACATTCTAGCTCCAACTTCTTCAAGCTAGAAGGAAGCTTAAAGGTATACCTATCCCC
GAATCTTCTTGACTTCCCTTCCCCAGTTTCTTGGTTTCAGTTCTTGTCCTAATGAAAAGT
TTTGATGTTCTTGATCC

QA 1 557 1 557
DS 

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GCACTAAAGAAGTTAGAAAGGCTTTTTGCCCTTTAATGAATCATGAGAAATAAATAAGTG
TTACTGGAAATACTTAGTGATGTCTATGGATGTGATCTCCAGACACCATGACCATCTGTG
GGACAGAATGCGACTTTCGGGCATTTAAATTTCTCCAACAGCTTCAGTCGTGGAAACAGT
GTCTGCAGATCTTTCCACTCAGCCTTGAATTCATGTAAGTACTTCAAACGTAAGATCTCA
ACGCCACATTTGTTTTCTGTATTTAAAGGTTCGTCACTGAATTTGCTAAGGTTTCCTCCT
TTGATCGAGAGCTTTGTAAGATTGTCAAGTGTTTTGGGATTTAACCAAACTGGAGGTTTC
TTTTGAGGGTAACATTCTAGCTCCAACTTCTTCAAGCTAGAAGGAAGCTTAGAGGTATAC
CTATCCCCGAATCTTCTTGACTTCCCTTCCCCAGTTTCTTGGTTTCAGTTCTTGTCCTAG
TGAAAAGTTTTGATGTTCTTGATCCAGATTCCTTGGTAGCCTGCTTCTTCTCCACGGGAT
CTCTCGGTTCTTCTGAAAAGCTTACTTTCTTACTAAGCTTGTTCTTATCTAACTTCCGAG
TCCTTCCTTCTCCTTCATCAGGCTTCTTTAAAGCAGCCTTGATCTCCTCCATCTTTATTG
TTTTCTTTGTGATCATCTTCCTTGCTGTGGATCGTGTCTTTGGATTGTTGAGCTAGACTT
GTCTTCTCATCTACCC

QA 1 796 1 796
DS 



AS 1 2

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AACAGCTCTCTGATTGCCATTGTTGCATAACAAGAAGATGGAAGAGTAAGAGCCATTTTG
AGCGCCAACTGTGTCTGCTCAGCATCTTTCAAATCGGTTTCACATGATTCTGGTTGGTTG
CTATCGGTTTTCATCGATTCAGTTTCTTCAGCAGATCCAACTTTATCCACCGGCTTTTCC
ATGGTTATCCTGTCCAGGTCCGCCTCTGCCAATGGTTTATTGCTGTCAGTGTAAGTCAGT
AACTCCCATTCAAAGTCAATTGGCTTCTGGAAAACACGTCTATAACCACCAGTCATGCTA
GTTATTGAGAATTCCTTTACACCGTGAATGCTCTCTGTTAGGCTGATACCGTCCTTCTTT
GCTAAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BX57TF C 1
AF RS1BX57JQ U 9
BS 1 8 RS1BX57TF
BS 9 548 RS1BX57JQ

RD RS1BX57TF 389 0 0
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TAGCAGTGTGTTAATCACTAGTTTAGTGTCTTATGATATGCAACAGAAGTTGACGTCTTT
AACAGCTCTCTGATTGCCATTGTTGCATAACAAGAAGATGGAAGAGTAAGAGCCATTTTG
AGCGCCAACTGTGTCTGCTCAGCATCTTTCAAATCGGTTTCACATGATTCTGGTTGGTTG
CTATCGGTTTTCATCGATTCAGTTTCTTCAGCAGGTCCAACTTTATCCACCGGCTTTTCC
ATGGTTATCCTGTCCAGGTCCGCCTCTGC

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DS 

RD RS1BX57JQ 540 0 0
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TCTGATTGCCATTGTTGCATAACAAGAAGATGGAAGAGTAAGAGCCATTTTGAGCGCCAA
CTGTGTCTGCTCAGCATCTTTCAAATCGGTTTCACATGATTCTGGTTGGTTGCTATCGGT
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QA 1 540 1 540
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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ATGCCACCGTCTAAGGATCAGCCTGCGACGGAATCAACAGCCGGAGAGGAGAAAACAACG
ACGCCAGAGGGTGGTCAAGGTCAGCCGGATCTACTCGATCTCTGAGAGCAGTAAAAAACT
AAAAATTAGGGTTGAGATTTGGTTTGTTAATCACTTATTTTCCCATGTTTAGTCCGGTTT
GTGCTTTTGTCCGGTTAAGTGGTATTTTTATTTTGACTCCTTTGATTTTAAGTGTGTTTC
ATTTTACTCGGCTTTCGCATTTATCGTAATTTGGTTCAGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FY76TF U 1
AF RS1FY76JQ C 65
BS 1 653 RS1FY76TF
BS 654 761 RS1FY76JQ

RD RS1FY76TF 653 0 0
GGACTGTTCTCCGCTGATTGTTCATAGAGATGTTAAGTCGAACAACATCCTCCTCGATTC
CAGCTTCGAAGCTCATGTCGCTGACGTTGGTCTCGCCAAGTTCTTACAAGACTCCGGTAC
TTCTGAATGCATGTCTGCCATCGCTGGATCTTACGGCTACATAGCTCCAGAATATGCGTA
TACGTTGAAGGTGGATGAGAAGAGCGATGTGTACAGTTTCGGTGTGGTTCTTCTAGAGCT
AGTCACCGGGAGAAAACCCGTCGGTGAGTTCGGTGACGGTGTCGATATCGTGCAGTGTTT
CGTAAAATGACTGATTCGAACAAGGACTCTGTTCTCAAAGTGTTGGATCCGAGGCTTTCT
TCGATTCCTATTCACGAAGTGACGCACGTTTTCTACGTTGCTATGCTCTGTGTCGAAGAA
CAAGCCGTTGAGAGACCTACGATGAGAGAAGTCGTTCAGATTCTCACTGAGGTGCCGAAG
ATGCCACCGTCTAAGGATCAGCCTGCGACGGAATCAACAGCCGGAGAGGAGAAAACAACG
ACGCCAGAGGGTGGTCAAGGTCAGCCGGATCTACTCGATCTCTGAGAGCAGTAAAAAACT
AAAAATTAGGGTTGAGATTTGGTTTGTTAATCACTTATTTTCCCATGTTTAGT

QA 1 653 1 653
DS 

RD RS1FY76JQ 697 0 0
TTCGAAGCTCATGTCGCTGACGTTGGTCTCGCCAAGTTCTTACAAGACTCCGGTACTTCT
GAATGCATGTCTGCCATCGCTGGATCTTACGGCTACATAGCTCCAGAATATGCGTATACG
TTGAAGGTGGATGAGAAGAGCGATGTGTACAGTTTCGGTGTGGTTCTTCTAGAGCTAGTC
ACCGGGAGAAAACCCGTCGGTGAGTTCGGTGACGGTGTCGATATCGTGCAGTGTTTCGTA
AAATGACTGATTCGAACAAGGACTCTGTTCTCAAAGTGTTGGATCCGAGGCTTTCTTCGA
TTCCTATTCACGAAGTGACGCACGTTTTCTACGTTGCTATGCTCTGTGTCGAAGAACAAG
CCGTTGAGAGACCTACGATGAGAGAAGTCGTTCAGATTCTCACTGAGGTGCCGAAGATGC
CCCCGTTTAAGGATCAGCCTGCGACGGAATCAACAGCCGGAGAGGAGAAAACAACGACGC
CAGAGGGTGGTCAAGGTCAGCCGGATCTACTCGATCTCTGAGAGCAGTAAAAAACTAAAA
ATTAGGGTTGAGATTTGGTTTGTTAATCACTTATTTTCCCATGTTTAGTCCGGTTTGTGC
TTTTGTCCGGTTAAGTGGTATTTTTATTTTGACTCCTTTGATTTTAAGTGTGTTTCATTT
TACTCGGCTTTCGCATTTATCGTAATTTGGTTCAGTC

QA 1 697 1 697
DS 



AS 1 2

CO CL8461Contig1 844 2 2 U
GGGACTCTCTCTTTCCCACCGCAAACGATAACAATGGGCGCTAAAGCTAAGAAAGCTCTG
AAGAAGAACATGAAGAAGATCTCAGCTTCGGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTCCCTCTCAG
CTTGCTGTTCCCCAGAACCAGAAACCATCTGCTGATTTTTTGCCACTAGGAGGAGGTCCA
GCTCGAAAAGCACCAGTGAGCAAACCTGTTGAAAGTAAAGCCACAGTGCTATACATCGGT
CGTCTCCCTCATGGCTTCTACGAGACTGAGATTGAAGCTTTCTTCACGCAGTTTGGAACA
GTCAAGAGAGTTAGAGTCGCCCGAAACAAAAAGACTGGGAAGTCAAAGCATTTTGGGTTC
ATACAGTTTGAGGACCCTGAGGTGGCGGAAATTGCAGCGGGTGCAATGAATGACTATCTG
CTCGAGCACATGCTTCAAGTCCGTGTCATTCCACCTGAGCATGTTAAACCCAATCTGTGG
AAAGGGTTTAAAAGTCAGTACAAACCAGTGGATTGGGTTCAGATCGAGCGTAAACAACAT
AACAAGGAAAGGACATTGGAAGAGCATAGGAAAATGTTGCACAAGGTTGTGAAACGGGAT
CAGAAAAGGAGAAAGAGAATTGAAGCTGCTGGAATACAATATCAATGCCCTGAGCTTGTT
GGAAATACACAGCCATTACCTAATAAGATCAAGTTTAGTGAAACTAGCTAGGAACCTCAG
AAGCTGTGGGACACACATTTTCGATAAGATAATTTTGGAATAGGATCTTGTTTTGTTGTA
CTTTTGACATGGGATCCAAATCTAAACTTTTTTTAAAGCATCTATTATTGCAATTAAAAT
TTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 

AF RS1DH55TF U 1
AF RS1DH55JQ C 166
BS 1 746 RS1DH55TF
BS 747 844 RS1DH55JQ

RD RS1DH55TF 746 0 0
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AAGAAGAACATGAAGAAGATCTCAGCTTCGGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTCCCTCTCAG
CTTGCTGTTCCCCAGAACCAGAAACCATCTGCTGATTTTTTGCCACTAGGAGGAGGTCCA
GCTCGAAAAGCACCAGTGAGCAAACCTGTTGAAAGTAAAGCCACAGTGCTATACATCGGT
CGTCTCCCTCATGGCTTCTACGAGACTGAGATTGAAGCTTTCTTCACGCAGTTTGGAACA
GTCAAGAGAGTTAGAGTCGCCCGAAACAAAAAGACTGGGAAGTCAAAGCATTTTGGGTTC
ATACAGTTTGAGGACCCTGAGGTGGCGGAAATTGCAGCGGGTGCAATGAATGACTATCTG
CTCGAGCACATGCTTCAAGTCCGTGTCATTCCACCTGAGCATGTTAAACCCAATCTGTGG
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AACAAGGAAAGGACATTGGAAGAGCATAGGAAAATGTTGCACAAGGTTGTGAAACGGGAT
CAGAAAAGGAGAAAGAGAATTGAAGCTGCTGGAATACAATATCAATGCCCTGAGCTTGTT
GGAAATACACAGCCATTACCTAATAAGATCAAGTTTAGTGAAACTAGCTAGGAACCTCAG
AAGCTGTGGGACACACATTTTCGATA

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1DH55JQ 679 0 0
CTAGGAGGAGGTCCAGCTCGAAAAGCACCAGTGAGCAAACCTGTTGAAAGTAAAGCCACA
GTGCTATACATCGGTCGTCTCCCTCATGGCTTCTACGAGACTGAGATTGAAGCTTTCTTC
ACGCAGTTTGGAACAGTCAAGAGAGTTAGAGTCGCCCGAAACAAAAAGACTGGGAAGTCA
AAGCATTTTGGGTTCATACAGTTTGAGGACCCTGAGGTGGCGGAAATTGCAGCGGGTGCA
ATGAATGACTATTTGCTCGAGCACATGCTTCAAGTCCGTGTCATTCCACCTGAGCATGTT
AAACCCAATCTGTGGAAAGGGTTTAAAAGTCAGTACAAACCAGTGGATTGGGTTCAGATC
GAGCGTAAACAACATAACAAGGAAAGGACATTGGAAGAGCATAGGAAAATGTTGCACAAG
GTTGTGAAACGGGATCAGAAAAGGAGAAAGAGAATTGAAGCTGCTGGAATACAATATCAA
TGCCCTGAGCTTGTTGGAAATACACAGCCATTACCTAATAAGATCAAGTTTAGTGAAACT
AGCTAGGAACCTCAGAAGCTGTGGGACACACATTTTCGATAAGATAATTTTGGAATAGGA
TCTTGTTTTGTTGTACTTTTGACATGGGATCCAAATCTAAACTTTTTTTAAAGCATCTAT
TATTGCAATTAAAATTTCG

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

CO CL8462Contig1 1416 2 2 U
GTAACCTGCTGAGAAGGTGGGTGAGGTAAGTTGGTTTCCTGCCTCCAAGGTTGGGCATAA
GACGGAAGAGGCTGTCCATTTGAAGCAGGCATTTCATTAGTACCACCAGAAACTGGAAAG
CTCTGACTAACTGCACTAGTGGCAGGCAATTTTTCTGTTCCGGGGGCACATGGGACTTCT
GTTTGACTGTAATAATCTGACCACTGTTGGTAGTTCTGTTGATAATGTACAGGTGTCGTG
GTTGCACTTGCAACAGTGGAGGTATGAGTGCTAGCAGCGTCAGGAGTATAATTTTGATAA
GGGTTTGTTGAATAGTTTCCCTGGTTTGATGTAGGAGTCTGATTGCTGTAGTTTGCACTT
TGGTAACCACCACCTGTTTGGTTGTTATAATTTGTCGTTTGGTAACCTCCTCCAGTAGTC
TGATAATCAGCAGGAGGATTGTAGTAAGTTGCAGAATAACTTGGAGTCCCAGCATAAGAT
CCTGGATTCTGAAATGAGGAAATAGGCTGATAAGGAGCACCTGTGTTTTGATACGCCCCT
GCAGGCTGAGGAGGATATGACTGGCTAGGTTGCTGCTGTTGGTAGCCACTGTAGTAACTG
GAATATCCCGTGTTTGAGTAGTTTTGGGGTGGATCAGAAGAAGTCTGGTATGGCGTGTTA
TATCCACTATAATCCTGAGCCACATTTGCAGTTCCGGAGGTCGATGAGGTAGTGAAGGGT
GCTGCAGTAATGGGTGTGTCTTGCACATTATTCCCTGTTGCTGGTGGCACTGTAGGCTGT
TGTGGATGGTAGTAGTTTGAATTGGAATAGTTCCCATTCTGCACAACCTGATTTTCTACC
CTAGGTGGTGCAGTCCATGAGGCACCGTCAGACACAGTTGAGTACTGATAAGGAGATATC
TGCACTTGGCTTCCATCAACACCATATCGGTTCTGCGAGAAAAAAAAGTTAATAGTGGCA
ACACTAAATACTAATCCACCACACACACAAAAAAAAAAAGTCTAAAAGTGAAAAGAATGA
TATAAGACAAACAAACAAGAAACGAAAAAAAGTCATCCCAAATCTCAAGACTATATCTAC
AACTTGAGATGCTACAAAAACGTCAAACATGACAATGACAATACTCGCAAAAGTTTAACT
TTACAAGATTATTGAGGAGATAATGATTTTACCTCAATGGAGTTAGGGTCAAGTGGTGGC
GCCACGGTCTGAGTATTCCCTCCTTGATTCATCCTTCTACCATAAACCTCCTCCTCTCCT
GCCAAATAATCAAACAAACTCTCACTTTCGATAATAAACAGAAAAACAAAGATAAAGCAC
AAACAATTTGTAATACCAGAGTGATGCTTCTCTTCTTCTTCTTCGTTCCGGTGAAGAATC
GAATTGAAATAGTAAACGTAGAGCAGAGATTTGAGA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AR07TFB U 1
AF RS1AR07JQ C 620
BS 1 695 RS1AR07TFB
BS 696 1416 RS1AR07JQ

RD RS1AR07TFB 695 0 0
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GACGGAAGAGGCTGTCCATTTGAAGCAGGCATTTCATTAGTACCACCAGAAACTGGAAAG
CTCTGACTAACTGCACTAGTGGCAGGCAATTTTTCTGTTCCGGGGGCACATGGGACTTCT
GTTTGACTGTAATAATCTGACCACTGTTGGTAGTTCTGTTGATAATGTACAGGTGTCGTG
GTTGCACTTGCAACAGTGGAGGTATGAGTGCTAGCAGCGTCAGGAGTATAATTTTGATAA
GGGTTTGTTGAATAGTTTCCCTGGTTTGATGTAGGAGTCTGATTGCTGTAGTTTGCACTT
TGGTAACCACCACCTGTTTGGTTGTTATAATTTGTCGTTTGGTAACCTCCTCCAGTAGTC
TGATAATCAGCAGGAGGATTGTAGTAAGTTGCAGAATAACTTGGAGTCCCAGCATAAGAT
CCTGGATTCTGAAATGAGGAAATAGGCTGATAAGGAGCACCTGTGTTTTGATACGCCCCT
GCAGGCTGAGGAGGATATGACTGGCTAGGTTGCTGCTGTTGGTAGCCACTGTAGTAACTG
GAATATCCCGTGTTTGAGTAGTTTTGGGGTGGATCAGAAGAAGTCTGGTATGGCGTGTTA
TATCCACTATAATCCTGAGCCACATTTGCAGTTCC

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1AR07JQ 797 0 0
AGTTTTGGGGTGGATCAGAAGAAGTCTGGTATGGCGTGTTATATCCACTATAATC*TGAG
CCACATTTGCAGTTCCGGAGGTCGATGAGGTAGTGAAGGGTGCTGCAGTAATGGGTGTGT
CTTGCACATTATTCCCTGTTGCTGGTGGCACTGTAGGCTGTTGTGGATGGTAGTAGTTTG
AATTGGAATAGTTCCCATTCTGCACAACCTGATTTTCTACCCTAGGTGGTGCAGTCCATG
AGGCACCGTCAGACACAGTTGAGTACTGATAAGGAGATATCTGCACTTGGCTTCCATCAA
CACCATATCGGTTCTGCGAGAAAAAAAAGTTAATAGTGGCAACACTAAATACTAATCCAC
CACACACACAAAAAAAAAAAGTCTAAAAGTGAAAAGAATGATATAAGACAAACAAACAAG
AAACGAAAAAAAGTCATCCCAAATCTCAAGACTATATCTACAACTTGAGATGCTACAAAA
ACGTCAAACATGACAATGACAATACTCGCAAAAGTTTAACTTTACAAGATTATTGAGGAG
ATAATGATTTTACCTCAATGGAGTTAGGGTCAAGTGGTGGCGCCACGGTCTGAGTATTCC
CTCCTTGATTCATCCTTCTACCATAAACCTCCTCCTCTCCTGCCAAATAATCAAACAAAC
TCTCACTTTCGATAATAAACAGAAAAACAAAGATAAAGCACAAACAATTTGTAATACCAG
AGTGATGCTTCTCTTCTTCTTCTTCGTTCCGGTGAAGAATCGAATTGAAATAGTAAACGT
AGAGCAGAGATTTGAGA

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 2

CO CL8463Contig1 879 2 6 U
TTTCTAAAATTATTTATTGAGTAATTTTAGTAGAAAGGTACAAGAGTCCATATCTTAAGT
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ATTAAAGAGCTCAATTATTCATCTTCAGAGGCCTCTCCATGCTCCATGCATCGAGACTCT
CTACGTTCACAGTTTGTGTTCCATTGTTAAACACATACAAATGCGCATTCTCTTTCACTG
CTTTCACAGGATACACTCTCGACGTTATGACTGTCTTCCCCAATGCTCCGAAGCTCTCTA
CTAACGAGTGATCAATCAAACTCCTTAAAGAGATCCTTCCACCAGATAGATCAACATCAA
CAAAACCAGCAAATGATGGTTTGTACATCCTATCTTATTTGAGTGGACCCCTGTCTTGCT
TCAACGATGAAGGTCTAGCATCGGAGCACATGAGAACCTTAGGCTTATATGTAGAGGTGT
CTTTGAAGACTCTAAAGAAGACAGGAGTGTACTCTTCCAAATCAGGAGTGGCCAATGTGA
TCAGACCAAAAGGTCCAACACCACCTGTCACATTCGAGCCTTTTATTTTACACAAATCAA
ACGGTTTGAATGTGAAGCTCGGGTCGAATGCCTCAGCTTTCTCTAGACATTGTCCCACGT
TGAATGTCACTTCCACATCGGCCTGAGCAGGAGTGATTCCTTCAACTTCTAAGCGTTGAC
CCATCGTTATGTTTTTGTTGTTCATTCGGACGTAGTTACTTCTTAGTGACTCTATTTCTT
CAATAGGCCAAAACACTAGTTGCTTCTTGTTTGCGTCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
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AF RS1FY37TF C 1
AF RS1AB27JQ U 62
BS 1 61 RS1FY37TF
BS 62 401 RS1AB27JQ
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BS 420 879 RS1AB27JQ

RD RS1FY37TF 667 0 0
TTTCTAAAATTATTTATTGAGTAATTTTAGTAGAAAGGTACAAGAGTCCATATCTTAAGT
GCGGACATGCACTAATCATATTGATAAACACACAGAAAATCACAAAGTTTTTCTTTCTAA
TGTCATCAAATCATCTCGTAGTTACTAACCAACATTATAAGAAAGGATAAATGAGAGTTA
ATTAAAGAGCTCCATTATTCATCTTCAGAGGCCTCTCCATGCTCCATGCATCGAGACTCT
CTACGTTCACAGTTTGTGTTCCATTGTTAAACACATACAAATGCGCATTCTCTTTCACTG
CTTTCACTGGATACACTCTCGACGTTATGACTGTCTTCCCCAATGCTCCGAAGCTCTCTA
CTACCGAGTGATCAATCAAACTCCTTAAAGAGATCCTTCCACCAGATAGATCAACATCAA
CAAAACCAGCAAATGATGGTTTGTACATCCTATCTTGTTTGAGTGGACCCCTGTCTTGCT
TCAACGATGAAGGTCTAGCATCGGGGCACATGAGAACCTTAGGCTTATATGTAGAGGTGT
CTTTGAAGACTCTAAAGAAGACAGGAGTGTACTCTTCCAAATCAGGAGTGGCCAATGTGA
TCAGACCAAAAGGTCCAACACCACCTGTCACATTCGAGCCTTTTATTTTACACAAATCAA
ACGGTT
C

QA 1 666 1 666
DS 

RD RS1AB27JQ 818 0 0
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TTAAAGAGCTCAATTATTCATCTTCAGAGGCCTCTCCATGCTCCATGCATCGAGACTCTC
TACGTTCACAGTTTGTGTTCCATTGTTAAACACATACAAATGCGCATTCTCTTTCACTGC
TTTCACAGGATACACTCTCGACGTTATGACTGTCTTCCCCAATGCTCCGAAGCTCTCTAC
TAACGAGTGATCAATCAAACTCCTTAAAGAGATCCTTCCATCAGATAGATCAACATCCAC
AAAACCAGCAAATGATGGTTTGTACATCCTATCTTATTTGAGTGGACCCCTGTCTTGCTT
CAACGATGAAGGTCTAGCATCGGAGCACATGAGAACCTTAGGCTTATATGTAGAGGTGTC
TTTGAAGACTCTAAAGAAGACAGGAGTGTACTCTTCCAAATCAGGAGTGGCCAATGTGAT
CAGACCAAAAGGTCCAACACCACCTGTCACATTCGAGCCTTTTATTTTACACAAATCAAA
CGGTTTGAATGTGAAGCTCGGGTCGAATGCCTCAGCTTTCTCTAGACATTGTCCCACGTT
GAATGTCACTTCCACATCGGCCTGAGCAGGAGTGATTCCTTCAACTTCTAAGCGTTGACC
CATCGTTATGTTTTTGTTGTTCATTCGGACGTAGTTACTTCTTAGTGACTCTATTTCTTC
AATAGGCCAAAACACTAGTTGCTTCTTGTTTGCGTCAA

QA 1 818 1 818
DS 



AS 1 2

CO CL8464Contig1 604 2 2 U
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GAGGGATCCGTAAGCCGCATGGCGTTGCTTTTTGGAAGCTCTGACTCAATGCAGGGCAGA
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TTAAGACGTATGCACCCTAAGCGTCGCCCGTTTACCAATCGAATGAGGATTATTCTCAGG
CGGCGTATGGAAGGCTTAGAGCCTTTACCATCCGACTTTGAAACTGAAACTGAAACTGAG
GAAAAGTTGTCTCTCGAGGCTACTACCTCCACGACGCTTCCTTCATCAAGCGTGCAAGAA
CAAGAACAGGATCTGCAAGCAGATGCTCCTCCGCTCAAGCTGGAAGGTGTGATTCCTCCT
CCTACACAAGCTTCTTCTTCTAGAAACAAGAAGAAAAGAAACAAGAAGAAGAAGAAGCTC
GTCAGCAAAACCACACCACCACCTAACTAAGGCTGCCTCTTTTCATTTCCTAGCTTTGAA
TCTTTGTACTTCTCTAGCCTATAATAAACTCGTATCTTTTCTTTATTCAACTCCTGCTTG
CCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 

AF RS1GW27TF U 1
AF RS1GW27JQ C 1
BS 1 508 RS1GW27TF
BS 509 604 RS1GW27JQ

RD RS1GW27TF 508 0 0
GGACCGTCTCTAAACGTGTAAGCTTTCGGTATGTCGTACCTTCGCCGAAATGCGAGGATC
GAGGGATCCGTAAGCCGCATGGCGTTGCTTTTTGGAAGCTCTGACTCAATGCAGGGCAGA
AGCAGGTCGGTAGTTTTTGGCCCGCTTCCAACTCGTCCACACGATGCTATAAGAACTGCA
TTAAGACGTATGCACCCTAAGCGTCGCCCGTTTACCAATCGAATGAGGATTATTCTCAGG
CGGCGTATGGAAGGCTTAGAGCCTTTACCATCCGACTTTGAAACTGAAACTGAAACTGAG
GAAAAGTTGTCTCTCGAGGCTACTACCTCCACGACGCTTCCTTCATCAAGCGTGCAAGAA
CAAGAACAGGATCTGCAAGCAGATGCTCCTCCGCTCAAGCTGGAAGGTGTGATTCCTCCT
CCTACACAAGCTTCTTCTTCTAGAAACAAGAAGAAAAGAAACAAGAAGAAGAAGAAGCTC
GTCAGCAAAACCACACCACCACCTAACT

QA 1 508 1 508
DS 

RD RS1GW27JQ 604 0 0
GGACCGTCTCTAAACGTGTAAGCTTTCGGTATGTCGTACCTTCGCCGAAATGCGAGGATC
GAGGGATCCGTAAGCCGCATGGCGTTGCTTTTTGGAAGCTCTGACTCAATGCAGGGCAGA
AGCAGGTCGGTAGTTTTTGGCCCGCTTCCAACTCGTCCACACGATGCTATAAGAACTGCA
TTAAGACGTATGCACCCTAAGCGTCGCCCGTTTACCAATCGAATGAGGATTATTCTCAGG
CGGCGTATGGAAGGCTTAGAGCCTTTACCATCCGACTTTGAAACTGAAACTGAAACTGAG
GAAAAGTTGTCTCTCGAGGCTACTACCTCCACGACGCTTCCTTCATCAAGCGTGCAAGAA
CAAGAACAGGATCTGCAAGCAGATGCTCCTCCGCTCAAGCTGGAAGGTGTGATTCCTCCT
CCTACACAAGCTTCTTCTTCTAGAAACAAGAAGAAAAGAAACAAGAAGAAGAAGAAGCTC
GTCAGCAAAACCACACCACCACCTAACTAAGGCTGCCTCTTTTCATTTCCTAGCTTTGAA
TCTTTGTACTTCTCTAGCCTATAATAAACTCGTATCTTTTCTTTATTCAACTCCTGCTTG
CCCC

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 2

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AGACTCAGGGGTCTTTACTCCGATGATGATATGGTGAAGTCAATGGATCTTGACATGGGT
GATCCAGAACCAGTCAAGCAAATCTGGGGTCAATCTCCTGTTTCATACCAACCAAGCAAC
ACAATCAGTAGCAATTTGTCTGATGTCTTGCAACCAAAGCCTTCAGAGAAGAGTATGCTT
GCGCAAATGTACCCTGACCGTGTATGCCTGAGCACTGTCTTTGAAGAAGAAGAGGTCGAA
GAAGATGAAGAGAAAGTGATAATCGAGGATAAAAGCATCTGCTCGATAACAACAACACCA
GTGCCTAGTTTAAACTTTGGAGGTATGGGTGAAGAGAATAGCTTCAACATTACAGACGAC
AAAGAATCAGAAATGTCTAGAAAGTTGAGAATTCAAAACATATTCACCCTTTGTGGCAAT
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AAGGGCGAGGCTCTAGCAGTAGAAGACGCAAAGGAAAACAGTATCTCAGTTGATGAAAGT
AACAGCGGACAGATAGATATCTACGTGAAGTGGGAAGCAACTACTGATACCCCTCGGAAG
CAGCTCATAACAACACTAAAAGTTACGAAGGATGCAACACTGGCTGACTTGAGGAAGCTT
ATTGAGATCTACCTTGGATCTGATAACCAAGCTTTCACGTTCCTCAAGCTCGGGGAACCA
TGTGGAGCTCAAGTGGCAAAGGAGAAAGAATCATCAGTTCAAGCTACGAGTCTGCCTTTC
TGTAACGGACACGCTTACCTGGCTACTCTGAGACCGGGAAAGAGCTCACAACTTCAAAGT
CTTACAGCAGCGAGTCCACTTCCACTAACTCCCATAGAAAACAAGATGCAATTTACTACG
CCCATCTCAAAAGTTACACAAAACCACCAGGTTGATGAACTTTCATCATCACCCATTGCA
GCTCATTTCAGCTCCACTCCTTTCATCACTCTCCGCAGACATTAGCCCGCTATGTCTGTT
CAAAGACGGCCTTAGAGATGTAAACCTTTGTCTCAGAGGATATATGTCTCCTTCCTTTAT
CTGTTCAAGTAGTCTTAGAGATGTAAACCTTTGTCTTGTTTTCAGTGTTGGAAAAGAACT
TATATAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1D826TF U 1
AF RS1D826JQ C 534
BS 1 685 RS1D826TF
BS 686 1207 RS1D826JQ

RD RS1D826TF 685 0 0
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AGACTCAGGGGTCTTTACTCCGATGATGATATGGTGAAGTCAATGGATCTTGACATGGGT
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GCGCAAATGTACCCTGACCGTGTATGCCTGAGCACTGTCTTTGAAGAAGAAGAGGTCGAA
GAAGATGAAGAGAAAGTGATAATCGAGGATAAAAGCATCTGCTCGATAACAACAACACCA
GTGCCTAGTTTAAACTTTGGAGGTATGGGTGAAGAGAATAGCTTCAACATTACAGACGAC
AAAGAATCAGAAATGTCTAGAAAGTTGAGAATTCAAAACATATTCACCCTTTGTGGCAAT
CAGAGAGAGATGTCCCAACACACTGGCCAAGAGAATGATCAGTTGCTTCCTACGACGAAT
AAGGGCGAGGCTCTAGCAGTAGAAGACGCAAAGGAAAACAGTATCTCAGTTGATGAAAGT
AACAGCGGACAGATAGATATCTACGTGAAGTGGGAAGCAACTACTGATACCCCTCGGAAG
CAGCTCATAACAACACTAAAAGTTA

QA 1 685 1 685
DS 

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GACGAATAAGGGCGAGGCTCTAGCAGTAGAAGACGCAAAGGAAAACAGTATCTCAGTTGA
TGAAAGTAACAGCGGACAGATAGATATCTACGTGAAGTGGGAAGCAACTACTGATACCCC
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GAAGCTTATTGAGATCTACCTTGGATCTGATAACCAAGCTTTCACGTTCCTCAAGCTCGG
GGAACCATGTGGAGCTCAAGTGGCAAAGGAGAAAGAATCATCAGTTCAAGCTACGAGTCT
GCCTTTCTGTAACGGACACGCTTACCTGGCTACTCTGAGACCGGGAAAGAGCTCACAACT
TCAAAGTCTTACAGCAGCGAGTCCACTTCCACTAACTCCCATAGAAAACAAGATGCAATT
TACTACGCCCATCTCAAAAGTTACACAAAACCACCAGGTTGATGAACTTTCATCATCACC
CATTGCAGCTCATTTCAGCTCCACTCCTTTCATCACTCTCCGCAGACATTAGCCCGCTAT
GTCTGTTCAAAGACGGCCTTAGAGATGTAAACCTTTGTCTCAGAGGATATATGTCTCCTT
CCTTTATCTGTTCAAGTAGTCTTAGAGATGTAAACCTTTGTCTTGTTTTCAGTGTTGGAA
AAGAACTTATATAC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

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GGACAAACAAAAAGACAAACACTTCAGTGAGAGAAAATTACAATGTCTTTGACAGAGCGA
GTTTATAATCATCTTTCGCTCTTTGATGTATCTCTCGCGCTGTTAGGGCTGTTTTGTCTT
CTGTTGCTTGCGTGAAAAGTTAACCAACAAGCACGGCCCAATGCTATGGCCAGTGTTCGG
AATCACTCCAGAGTTTTTCTTTCACATAAACGATGTCTATGGATGGGTCACGAAGTCTTT
GAGAAAATGCCAAGGCACGTTTGTTTACCGTGGATTCTGGCTTGATGGATCTTATGGAGC
CGTGACTTGTGTCCCTGCTAATGTCGAGTACATGCTCAAGACGAACTTCAAGAACTTCCC
AAAAGGTGAAAGTGAATAATCATGGAAGAACTATGCTTCTGATGAAACACTCAAAAAGGT
TTCGGCTTATGAGACTGGTGTGAAAATCCAAGTATCATGCGCCAGACCACACATATTTCG
GACCCAGCGAAACTTAAAGTTGGGAGAGTGGGGTGTGATTGAAAACTCTAAAGTATCCGG
TGTTGGTAAAAGGAAATACCGACCAACAACTAATCAGTATAAGATGATTATTACCAGAGA
AATTTATATATTTTAAATTACTTCAGGTCTTTTTATTACCAGAGAAAGCTAAATTTACCT
TTTTAGGGATTTGGAGAAGGTTATATATTTTAAATTGCTTCAAGTCTTCCTCACACAAAT
CGAATCCATTCCAATACATTTACTAAACGTAAACAAAAAATAATTCAGTTTCTTTGTGCT
AAGCAATGTAAACGTAATTCAAGTTAAAGATGAGGACCAATATTACTGACCG


BQ
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AF RS1GB15TF U 1
AF RS1GB15JQ C 81
BS 1 626 RS1GB15TF
BS 627 627 RS1GB15JQ
BS 628 661 RS1GB15TF
BS 662 832 RS1GB15JQ

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AATCACTCCAGAGTTTTTCTTTCACATAAACGATGTCTATGGATGGGTCACGAAGTCTTT
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CGTGACTTGTGTCCCTGCTAATGTCGAGTACATGCTCAAGACGAACTTCAAGAACTTCCC
AAAAGGTGAAAGTGAATAATCATGGAAGAACTATGCTTCTGATGAAACACTCAAAAAGGT
TTCGGCTTATGAGACTGGTGTGAAAATCCAAGTATCATGCGCCAGACCACACATATTTCG
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TGTTGGTAAAAGGAAATACCGACCAACAACTAATCAGTATAAGATGATTATTACCAGAGA
AATTTATATATTTTAAATTACTTCAG*TCTTTTTATTACCAGAGAAAGCTAAATTTACCT
T

QA 1 661 1 661
DS 

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TGGGAGAGTGGGGTGTGATTGAAAACTCTAAAGTATCCGGTGTTGGTAAAAGGAAATACC
GACCAACAACTAATCAGTATAAGATGATTATTACCAGAGAAATTTATATATTTTAAATTA
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TTATATATTTTAAATTGCTTCAAGTCTTCCTCACACAAATCGAATCCATTCCAATACATT
TACTAAACGTAAACAAAAAATAATTCAGTTTCTTTGTGCTAAGCAATGTAAACGTAATTC
AAGTTAAAGATGAGGACCAATATTACTGACCG

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

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BQ
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QA 1 576 1 576
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1CE65JQ C 1
AF RS1CE65TF U 1
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DS 

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TAATCATCTTGAAATGGTAGTAGCTCCATTGGGTCT

QA 1 576 1 576
DS 



AS 1 2

CO CL8469Contig1 727 2 4 U
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TGATCGAGTTCAGATTGTTTGGGGCTAAATTGCAATTTATTAAATAGTTTATACGCATTT
CCCCCACCTTTTTATTTTCTTCTTTGTACGTGTTCTAGTGTGGTCGTTAATTATTGAGCC
TCAAATTGAGATGAGACTATTCAGATTTTTTTCCTTTATATTTTTCATAATTTTAAAAAA
TGTTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GV75TF U 1
AF RS1GV75JQ C 131
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RD RS1GV75TF 719 0 0
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TCTCTTGTCTAGCTCCTATGAAGCTAAGGTCTCTGATTACGGTCTAGCGCCTATTATCAG
CTCCACATCTGCGCCTAACCGTATAGATGGCTACCGTGCGCCTGAAGTCACCGATGCGCG
CAAAATCTCTCAGAAAGCTGATGTTTACAGCTTTGGTGTCTTGATACTTGAGCTACTAAC
AGGGAAGTCTCCAACACATCAGCAACTGAACGAAGAAGGTGTAGATTTGCCGAGATGGGT
CCAGTCCATTACTGATCAACAATCACCGTCTGATGTGTTTGATCCAGAGCTCACAAGGTA
CGAGTCCGAGGGCAATGAGAACACTATCCGGCTCTTTAAGATCGGTATGAGTTGTACGGC
TCAGTACCCTGATAGTCGTCCTACCATGGCCGATGTAACCAGACTCATCGAGGAGGTTTC
GCATTCATCATCAGGCTCTCCAAACCCGGTATCTGACTGATTTTAGTTGGGGGTCTAAAT
TGATCGAGTTCAGATTGTTTGGGGCTAAATTGCAATTTATTAAATAGTTTATACGCATTT
CCCCCACCTTTTTATTTTCTTCTTTGTACGTGTTCTAGTGTGGTCGTTAATTATTGAGCC
TCAAATTGAGATGAGACTATTCAGATTTTTT**CTTTATATTTTTCATAATTTTAAAAA

QA 1 719 1 719
DS 

RD RS1GV75JQ 597 0 0
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GGCAATGAGAACACTATCCGGCTCTTTAAGATCGGTATGAGTTGTACGGCTCAGTACCCT
GATAGTCGTCCTACCATGGCCGATGTAACCAGACTCATCGAGGAGGTTTCGCATTCATCA
TCAGGCTCTCCAAACCCGGTATCTGACTGATTTTAGTTGGGGGTCTAAATTGATCGAGTT
CAGATTGTTTGGGGCTAAATTGCAATTTATTAAATAGTTTATACGCATTTCCCCCACCTT
TTTATTTTCTTCTTTGTACGTGTTCTAGTGTGGTCGTTAATTATTGAGCCTCAAATTGAG
ATGAGACTATTCAGATTTTTTTCTTTTATATTTTTCATAATTTTAAAAAATGTTCAC

QA 1 597 1 597
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CCAGTCCATTCTTCTAAATTATTTCCAGAAAAAATCAGGGATAGGAGTAGCAAGGGCTTT
TCAGTTATTCGCCGTTTTGAGAACCGGCTCCACTGTCGAAGTGCGTCACCTGAGGATTTT
GGGAGGCTCGAGGCGGCGAGCTTGGATCTCTACATGCGACCCCTCAACTGAAATAATCCT
GAGAAATCCCTCACGGCTCTCCTGAAAAGGCGAAGAGCAAAGAAACTGCACACTAGCTTC
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BQ
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AF RS1CQ79JQ C 1
AF RS1CQ79TF U 1
BS 1 577 RS1CQ79TF

RD RS1CQ79JQ 577 0 0
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GGGAGGCTCGAGGCGGCGAGCTTGGATCTCTACATGCGACCCCTCAACTGAAATAATCCT
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TTAGATTTAATCGTTTTTATTTAATTTGGTTCTCACC

QA 1 577 1 577
DS 

RD RS1CQ79TF 577 0 0
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CATGCATCTTCATTAAGGCTAGCATTTACACTGATTCCCCTCTCCTTACATGATTTCCGA
TTCAATTAACATCATCATTCAGTGAGCTATAAATATGTGAGTCACCTTCCATGAATTTTA
CCAGTCCATTCTTCTAAATTATTTCCAGAAAAAATCAGGGATAGGAGTAGCAAGGGCTTT
TCAGTTATTCGCCGTTTTGAGAACCGGCTCCACTGTCGAAGTGCGTCACCTGAGGATTTT
GGGAGGCTCGAGGCGGCGAGCTTGGATCTCTACATGCGACCCCTCAACTGAAATAATCCT
GAGAAATCCCTCACGGCTCTCCTGAAAAGGCGAAGAGCAAAGAAACTGCACACTAGCTTC
TTTTTTCTTTCAGTCTAAAGAATGGTGTCTCTTTTGGGCATCTTGACCTGTTTTTAGTTT
GGTATTTTTTCTGAGGCATTCTTGAATTAAAGCTTAGAATCCATGTCTTTACTTCTCTTT
TTAGATTTAATCGTTTTTATTTAATTTGGTTCTCACC

QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 2

CO CL8472Contig1 614 2 4 U
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CTTCACGTTCGCTACTGTATGCGGCGTCATTCCTGGAATAATCGGCTATGGAGTTATGCA
GGTCACCAATTCCACTAACCCGGAGCTCGAGGCCCGCCTCCGACAATCCGCCCGACCCGA
AACCACCATGATGGGTAAAGTAAACCAAGAGAGGCTAGCTGAATATCTCGGGGAGTTGAA
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TCTTCGTGACCTTCATGCTTTTCTTCTTCTTTTTGAATCTGGCATGCTTTGTGGTTTTTA
AACTGGTGCAAAATTCAGTCACTTCAAACATTTTTGTGACAGTGAATAAAAAAGTAAAAA
CCCATGTTTTGTAC


BQ
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AF RS1EE09JQ C 1
AF RS1EE09TF U 10
BS 1 9 RS1EE09JQ
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RD RS1EE09JQ 614 0 0
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ACAGTAATGATGATCACTTCTTAGGAGGAGCTATTGTAATGGATGCAAAGATGGCATGTT
TTTTCGTGACCTTCATGCTTTTTTTTTTCTTTTTGAATCTGGCATGCTTTGTGGTTTTTA
AACTGGTGCAAAATTCAGTCACTTCAAACATTTTTGTGACAGTGAATAAAAAAGTAAAAA
CCCATGTTTTGTAC

QA 1 614 1 614
DS 

RD RS1EE09TF 605 0 0
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CGCTACTGTATGCGGCGTCATTCCTGGAATAATCGGCTATGGAGTTATGCAGGTCACCAA
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AAGATTCAGTCACTTCAAACATTTTTGTGACAGTGAATAAAAAAGTAAAAACCCATGTTT
TGTAC

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 2

CO CL8473Contig1 889 2 10 U
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TGATCTGGTCTCACAGGTTGGATCTGGAAATACTGACGATGGAAGTACGGATCCTAATGA
CCATTACTGCTGGATGCGGCCTGAGGACATGGACTACAAAAGGCCTGTGACTACCTGTAA
TGGTGGATGCTCGGATCTCGCCGCGGAGATGGCGGCTGCTCTGGCTTCTGCTTCCATTGT
CTTCAAGGACAACAAGGATTATTCTAAGAAGCTTGTACACGGTGCTAAGACGGTGTATCA
GTTTGGAAGGACCAGGAGAGGCAGATACAGTGCAGGCACTGCGGAATCAGCCAAGTTCTA
CAACTCAAGCATGTATTGGGATGAGTTTATTTGGGGCGGTGCTTGGTTGTACTACGCTAC
AGGAAACGTGACTTATCTCGATCTGATCACAAAACCAACTATGGCGAAGCATGCTGGTGC
ATTCTGGGGTGGCCCGTACTATGGTGTGTTTAGCTGGGACAACAAGCTTGCTGGTGCTCA
GTTACTGCTGAGCCGGTTGAGGCTGTTTTTGAGTCCTGGATATCCATATGAAGAAATTCT
CAGAACCTTCCATAATCAGACAAGCATAGTCATGTGCTCATACCTGCCTTATTTCAACAA
ATTTAACAGAACCAGTGGAGGTTTGATAGAGTTAAATCATGGAGACCCACAGCCTCTGCA
GTATGCTGCAAATGCAGCCTTCTTAGCGACATTGTACAGTGACTATCTTGATGCTGCTGA
TACTCCTGGATGGTACTGTGGACCTAATTTCTATTCAACCAATGTCCTACGAGAGTTTGC
GAGGACTCAGATTGATTATATACTCGGTAAAACCCTCGGAAATGAGTTA


BQ
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1F157TF U 1
AF RS1FB57TF U 200
BS 1 240 RS1F157TF
BS 241 241 RS1FB57TF
BS 242 396 RS1F157TF
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BS 398 603 RS1F157TF
BS 604 604 RS1FB57TF
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BS 706 706 RS1FB57TF
BS 707 803 RS1F157TF
BS 804 889 RS1FB57TF

RD RS1F157TF 803 0 0
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TGATCTGGTCTCACAGGTTGGATCTGGAAATACTGACGATGGAAGTACGGATCCTAATGA
CCATTACTGCTGGATGCGGCCTGAGGACATGGACTACAAAAGGCCTGTGACTACCTGTAA
TGGTGGATGCTCGGATCTCGCCGCGGAGATGGCGGCTGCTCTGGCTTCTGCTTCCATTGT
TTTCAAGGACAACAAGGATTATTCTAAGAAGCTTGTACACGGTGCTAAGACGGTGTATCA
GTTTGGAAGGACCAGGAGAGGCAGATACAGTGCAGGCACTGCGGAATCAGCCAAGTTCTA
CAACTCAAGCATGTATTGGGATGAGTTTATTTGGGGTGGTGCTTGGTTGTACTACGCTAC
AGGAAACGTGACTTATCTCGATCTGATCACAAAACCAACTATGGCGAAGCATGCTGGTGC
ATTCTGGGGTGGCCCGTACTATGGTGTGTTTAGCTGGGACAACAAGCTTGCTGGTGCTCA
GTTACTGCTGAGCCGGTTGAGGCTGTTTTTGAGTCCTGGATATCCATATGAAGAAATTCT
CAGGACCTTCCATAATCAGACAAGCATAGTCATGTGCTCATACCTGCCTTATTTCAACAA
ATTTAACAGAACCAGTGGAGGTTTGATAGAGTTAAATCATGGAGATCCACAGCCTCTGCA
GTATGCTGCAAATGCAGCCTTCTTAGCGACATTGTACAGTGACTATCTTGATGCTGCTGA
TACTCCTGGATGGTACTGTGGAC

QA 1 803 1 803
DS 

RD RS1FB57TF 690 0 0
GCT
GCGGAGATGGCGGCTGCTCTGGCTTCTGCTTCCATTGTCTTCAAGGACAACAAGGATTAT
TCTAAGAAGCTTGTACATGGTGCTAAGACGGTGTATCAGTTTGGAAGGACCAGGAGAGGC
AGATACAGTGCAGGCACTGCGGAATCAGCCAAGTTCTACAACTCAAGCATGTATTGGGAT
GAGTTTATTTGGGGCGGTGCTTGGTTGTACTACGCTACAGGAAACGTGACTTATCTCGAT
CTGATCACAAAACCAACTATGGCGAAGCATGCTGGTGCATTCTGGGGTGGCCCGTACTAT
GGTGTGTTTAGCTGGGACAACAAGCTTGCTGGTGCTCAGTTACTGCTGAGCCGGTTGAGG
CTGTTTTTGAGTCCTGGATATCCATATGAAGAAATTCTCAGAACCTTCCATAATCAGACC
AGCATAGTCATGTGCTCATACCTGCCTTATTTCAACAAATTTAACAGAACCAGTGGAGGT
TTGATAGAGTTAAATCATGGAGACCCACAGCCTCTGCAGTATGCTGCAAATGCAGCCTTC
TTAGCGACATTGTACAGTGACTATCTTGATGCTGCTGATACTCCTGGATGGTACTGTGGA
CCTAATTTCTATTCAACCAATGTCCTACGAGAGTTTGCGAGGACTCAGATTGATTATATA
CTCGGTAAAACCCTCGGAAATGAGTTA

QA 4 690 4 690
DS 



AS 1 2

CO CL8474Contig1 704 2 2 U
GTATGTTGGGGATAGTAAGAGGGCTATGGACGAGTACACCTCCGAGATATTCATGGGGGG
GAAGAACACAATTGTTATGCATAACACCTGTGAGGATTCTCTTTTGGCGGCTCCAATCAT
CTTGGATCTTGTTCTTCTCGCTGAACTCAGCACCAGAATCCAATTCAAAGCCGAAGGAGG
GGGGAAGTTCCACTCTTTCCACCCAGTAGCTACCATACTCAGTTACCTCACAAAAGCACC
TCTTGTACCACCCGGGACGCCAGTGGTGAACGCTCTATCTAAGCAGAGGGCTATGTTGGA
GAACATCCTCAGGGCCTGCGTTGGGCTTGCACCAGAGAACAACATGATCTTGGAGTACAA
GTGACAAGGAAGAAATAAAAGCAGAGGGACCTGAGACGCTTGTTATATTTTTAATGCTTC
ATTGTTTCTGTTTTATATGTAATAATTGCGTGAGAGAGAAACATATCAAGAAGTTTAAGG
TTAATTTGAGTGATAGTGATCCTTGGCAGTTTACTATGTGAGAAGATTAGCTAAGCTTCT
GGATCAAATGTGTAATAGATGTCAGATTTCAAAGTAGTTATGTCTGTCCCTCCTTGTCTT
ATGATCTATTAAAATGGGTTTCTGTAGTTCTGTTTCATGTGTCGTGTAACTTCTTCACCA
AACAGAGACATCAATAAAGAACATAACAAGGCATGAAAACTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DV03TF U 1
AF RS1DV03JQ C 44
BS 1 620 RS1DV03TF
BS 621 704 RS1DV03JQ

RD RS1DV03TF 620 0 0
GTATGTTGGGGATAGTAAGAGGGCTATGGACGAGTACACCTCCGAGATATTCATGGGGGG
GAAGAACACAATTGTTATGCATAACACCTGTGAGGATTCTCTTTTGGCGGCTCCAATCAT
CTTGGATCTTGTTCTTCTCGCTGAACTCAGCACCAGAATCCAATTCAAAGCCGAAGGAGG
GGGGAAGTTCCACTCTTTCCACCCAGTAGCTACCATACTCAGTTACCTCACAAAAGCACC
TCTTGTACCACCCGGGACGCCAGTGGTGAACGCTCTATCTAAGCAGAGGGCTATGTTGGA
GAACATCCTCAGGGCCTGCGTTGGGCTTGCACCAGAGAACAACATGATCTTGGAGTACAA
GTGACAAGGAAGAAATAAAAGCAGAGGGACCTGAGACGCTTGTTATATTTTTAATGCTTC
ATTGTTTCTGTTTTATATGTAATAATTGCGTGAGAGAGAAACATATCAAGAAGTTTAAGG
TTAATTTGAGTGATAGTGATCCTTGGCAGTTTACTATGTGAGAAGATTAGCTAAGCTTCT
GGATCAAATGTGTAATAGATGTCAGATTTCAAAGTAGTTATGTCTGTCCCTCCTTGTCTT
ATGATCTATTAAAATGGGTT

QA 1 620 1 620
DS 

RD RS1DV03JQ 661 0 0
GAGATATTCATGGGGGGGAAGAACACAATTGTTATGCATAACACCTGTGAGGATTCTCTT
TTGGCGGCTCCAATCATCTTGGATCTTGTTCTTCTCGCTGAACTCAGCACCAGAATCCAA
TTCAAAGCCGAAGGAGGGGGGAAGTTCCACTCTTTCCACCCAGTAGCTACCATACTCAGT
TACCTCACAAAAGCACCTCTTGTACCACCCGGGACGCCAGTGGTGAACGCTCTATCTAAG
CAGAGGGCTATGTTGGAGAACATCCTCAGGGCCTGCGTTGGGCTTGCACCAGAGAACAAC
ATGATCTTGGAGTACAAGTGACAAGGAAGAAATAAAAGCAGAGGGACCTGAGACGCTTGT
TATATTTTTAATGCTTCATTGTTTCTGTTTTATATGTAATAATTGCGTGAGAGAGAAACA
TATCAAGAAGTTTAAGGTTAATTTGAGTGATAGTGATCCTTGGCAGTTTACTATGTGAGA
AGATTAGCTAAGCTTCTGGATCAAATGTGTAATAGATGTCAGATTTCAAAGTAGTTATGT
CTGTCCCTCCTTGTCTTATGATCTATTAAAATGGGTTTCTGTAGTTCTGTTTCATGTGTC
GTGTAACTTCTTCACCAAACAGAGACATCAATAAAGAACATAACAAGGCATGAAAACTTC
G

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 2

CO CL8475Contig1 903 2 8 U
GGGAACCATACGCCTCAACCATGTGCACGTTAGAGAAGCGCGGCAACCTCTTCCTCCTAA
CCCTAACCGGCGACAACGAGCACAGATTCAACCCGGACACAATCGCCACGATCCTCTCCC
TCCTCGGCCAAGCCAAATCCCAAGCCAACCGCGGATCCGTACTCATCACCACGGCCCACG
GAAAGTTCTTCTCCAACGGGTTCGATCTCGCGTGGGCCCAATCCTCCGGATCCTTATCCG
TCGCCGCGGAGCGGCTTCACGACATGGTCGAATCGTTCAAACCCGTGGTCGCGGCCCTCC
TCGACCTCCCTATGCCGACGATCGCCGCCCTGAACGGCCACGCCGCCGCCGCGGGGCTGA
TGCTGGCGCTGAGCCACGACTATATCTACATGAGGAGAGACCGCGGGGTCCTGTACATGA
GCGAGGTGGACATCGGGCTCTCGATGCCGGACTACTTCGCGGCGATGGTGAGGTGTAAGA
TCGGGACGAGCGCGGCGAGGCGGGAGGTGTTGTTGAGCGGGAAGAAGATTAAGGGAGAAG
AGGCGGTGGGTTTTGGGATCGTTGACTCGGCTGCGCATGATAGCGCGGAAGGGGTTGTGG
AGGCTACTGTGGGCCTTGCGGAGAAGCTTTCGGCTAAGAAGTGGAAAGGTGATGTGTATG
CGTCGATCAGGAAGAGTTTGTATCCGGAGCTTTGTGAGATTCTTGGTTTAAAGGCGACCA
TCTTTGCTACACCCAAGCTCTAAAGACACTTTTGAGTGCGATTGTTTTTTTTACGTTTTA
AATCAAAACCAGTTTCTTTATGGGGCAAAGCAAAACACATGTTGAAGTTAGAATTATGAT
CACAGAAACAAGAAAGATGTTCAGTTTTTTGTCTGTTATAATAAATTAGCCGTGTTGTGT
CGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 

AF RS1DL48TF U 1
AF RS1DL48JQ C 173
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DS 

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AGAGACGAGACGTGAGACAGACAGAGATTTTTTTC


BQ
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AF RS1E547TF U 1
AF RS1E547JQ C 97
BS 1 673 RS1E547TF
BS 674 755 RS1E547JQ

RD RS1E547TF 673 0 0
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CAAAATAAAATTGCGTTTAGTAAATAGTGATTGCCCAATCTAAATTAACCCGACCCAACT
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ATAAAACCAAATTGGCGTTAAATTAAAATCAAGGTTTTTGTTGTTCTGAACCAGAAGAAC
AACGACGAAGAACAAGAACAGAGATACAGAGAGAGAGACGAAGAGGAACAGAGAGAGAGA
CAGAGAGAGGAACAGAGAGAGAGAGGAACATAGAGAGAGAGAGACGAGAGAGGAACATAG
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GAGACAGAGAGGA

QA 1 673 1 673
DS 

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CGAGAGGAACAGAGAGAGAGACGAGAGACAGAGAGGAACAGAGGAGAGACGAGAGGAACA
GAGAGAGAGACGAGAGAGAGGAACAGAGACGAGACGTGAGACAGACAGAGATTTTTTTC

QA 1 659 1 659
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1EP94TF U 1
AF RS1EP94JQ C 345
BS 1 715 RS1EP94TF
BS 716 1188 RS1EP94JQ

RD RS1EP94TF 715 0 0
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CTTCGCTCTCAACCTTCTCCCATCTCCAAACCTCTGTAAACCCATCGCCAAACGCGAATT
TATCTCCCCGAAACGAGACCCATCTCGCCCAATCTCCCTCCGATGCTCCTCCGTCTCCAC
GCCGCCGCTAACAACGGCGACCAACCACCACCTCTCCGCGTCGTCGAGCCACAAGCCCTT
TCCGGCGAGGTTTCGAGGAGCATCATGGAGCTTTCCTCCGTCGGAACCCTCTCCACTCTG
ACCCACGACGGGTGGCCGCTCGGCGTCGGCGTTCGGTTCGCCGTTGACGGAGACGGCACT
CCTGTTCTCTGCCTCAATCGCGCCTTGTCTCCTGACAAGAGGTCTGCTCTTCACGTTCAG
TTGGAGCAATGTGGATTGAGGACTCCTCAGTGTACGATTCAAGGTAGCATTGCTCGACCT
GGTGATGACCATGTTGTAAAGCGTCTTAGTGCTACATGGAGGAAAAAGTTTGGAGAAGAA
GTTGAGGAAGACAGTTTATATGTTGTTGCTGTTGACCGTGTGCTTCAGATGGAAGACTTC
ATGGAGGATGGAGTTTGGGTGGCGTCAGCAGATTATAAAAATGCAAGCCCTGATCCTCTT
CGAGGTGTTGCAGAAGACATTGTCAACCAGATTAACGCTAACAACATGGAAGACA

QA 1 715 1 715
DS 

RD RS1EP94JQ 844 0 0
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AAAGTTTGGAGAAGAAGTTGAGGAAGACAGTTTATATGTTGTTGCTGTTGACCGTGTGCT
TCAGATGGAAGACTTCATGGAGGATGGAGTTTGGGTGGCGTCAGCAGATTATAAAAATGC
AAGCCCTGATCCTCTTCGAGGTGTTGCAGAAGACATTGTCAACCAGATTAACGCTAACAA
CATGGAAGACATTTTCCGTTTTTGCAACGTATACGTTGATCTTGACTTTGTGGTTTCAGA
GACAAAGATGATATGGATGGATAGGCTTGGATTCGACCTGCGAGTGTGGTCTCCACGAGG
TGTATACGATGTCAGGATTCCATTTCCAATGGAAGTGACAGATGAAAAAGGAGCCAAATC
ATCGTTTAATGGAATGTCACAGCTCGCTTGGGAAGTAGAGAAAAGTTATTGCCCTGCAGA
TTTCAACAAGGTTAAACTACTTAAGCAAGTAGTTGGATCATCACACAAGGGTGGACAATA
GCCGTTTCATTATTAACTCATCTTTTTTGTTCACATTCTTTACCAGTGGATGCCAAAATA
TGGCATTGGTCTCTGTTATATCTCTTGGATTAGTATATTTTCTGAGTAATAGTGCTTGTA
CCCACCACTTGAAGTAAGATTTGTCATCTATTTTGGTTATTACCTTCGAGCAAATGGTTC
AGTT

QA 1 844 1 844
DS 



AS 1 2

CO CL8478Contig1 581 2 1 U
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TACTTTGCACAGATCCTGGAGCCATAAAGCTAGGAAGAATCACAAACCCTTGTAGGGTTC
ATGTACCGCAGCTTGCTGGAAGCCGATCCACCTTCGCTTCTGGTTCTCCTCTATTGCCAT
TGAACTTGAGAGTGACTCGTGGAAGAGTAGGAAGTGGAAGCAGAGGAGGAGCTTCAGTTT
CCATCAGAAGCGAGCAAAGTTCAGAAGGAGGCAGCGGTTTGGACATATGGCTTGGTCGTG
GCCCTATGATTGGTTTTGCTGTCGCCATTTCTGTTGAGATCGCTACCGGTAAAGGACTTC
TTGAGAACTTTGGGGTAGCAAGTCCATTGCCTACCGTTGCTTTGGCTGTTACAGCATTGG
TTGGTGTTCTGACTGCGGTTTTCATCTTCCAGTCTTCTTCCAAAAACTGATAAAAGCTCC
CCCCCCCCCCATATGTTTATTGTCATCATTTTGTTGTATCTAAGATTCTTCGCTCATAAA
AACTCTACTTTCATCAGAATGAAATCCCTCATTAGTTTTCC


BQ
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AF RS1CR45JQ C 1
AF RS1CR45TF U 1
BS 1 581 RS1CR45TF

RD RS1CR45JQ 581 0 0
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TGAACTTGAGAGTGACTCGTGGAAGAGTAGGAAGTGGAAGCAGAGGAGGAGCTTCAGTTT
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GCCCTATGATTGGTTTTGCTGTCGCCATTTCTGTTGAGATCGCTACCGGTAAAGGACTTC
TTGAGAACTTTGGGGTAGCAAGTCCATTGCCTACCGTTGCTTTGGCTGTTACAGCATTGG
TTGGTGTTCTGACTGCGGTTTTCATCTTCCAGTCTTCTTCCAAAAACTGATAAAAGCTCC
CCCCCCCCCCATATGTTTATTGTCATCATTTTGTTGTATCTAAGATTCTTCGCTCATAAA
AACTCTACTTTCATCAGAATGAAATCCCTCATTAGTTTTCC

QA 1 581 1 581
DS 

RD RS1CR45TF 581 0 0
GGACGCTTCTTCTTCTAATACTAGCCTCTGTATCATGTGTTTGACTAGTTTCGGATTTTA
TACTTTGCACAGATCCTGGAGCCATAAAGCTAGGAAGAATCACAAACCCTTGTAGGGTTC
ATGTACCGCAGCTTGCTGGAAGCCGATCCACCTTCGCTTCTGGTTCTCCTCTATTGCCAT
TGAACTTGAGAGTGACTCGTGGAAGAGTAGGAAGTGGAAGCAGAGGAGGAGCTTCAGTTT
CCATCAGAAGCGAGCAAAGTTCAGAAGGAGGCAGCGGTTTGGACATATGGCTTGGTCGTG
GCCCTATGATTGGTTTTGCTGTCGCCATTTCTGTTGAGATCGCTACCGGTAAAGGACTTC
TTGAGAACTTTGGGGTAGCAAGTCCATTGCCTACCGTTGCTTTGGCTGTTACAGCATTGG
TTGGTGTTCTGACTGCGGTTTTCATCTTCCAGTCTTCTTCCAAAAACTGATAAAAGCTCC
CCCCCCCCCCATATGTTTATTGTCATCATTTTGTTGTATCTAAGATTCTTCGCTCATAAA
AACTCTACTTTCATCAGAATGAAATCCCTCATTAGTTTTCC

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

CO CL8479Contig1 707 2 3 U
TTTTTTTTTGGCATGTATTAATTTTTTTTAAAACACCATTTTGACATGTCACATGCATTA
AAATTATTACATTTCATAGAAGGATAGGTCTTATTAGACCAACAAAATCATATAGTGGTC
TAACATTTTTCCCACAATTTAAACATCGGTAGACAGGTTCACTAATACATCAAGACCATA
TGGATAAGGGTATGGTCGCATGAACATCAATACTTCCATCTTCAACTCCTCTAAATACTA
CGAGGGAGACACCAAAACCATTATTTGGTTCGGCTCGAACCGCAATTGGTTTTCCCCAAC
CGAAATCGTTGTCGTATACTTCAAACCATGGAGAGCTTGTGACCACCAGATAAGAATCAG
CCTTTCTAAGTCCACCACTTATCGTTGGTTGTGGGAGCTTAACATTCCTGACCCAAGTCT
CCGCAAAAGTCTTGTAGTTTTCACTTGTTAGCGACCTCACTTGCTCATTTATTTGTAAAG
AAGCCCAGCCTAGCCCGTGATCCAACATATCTCCCACCCTTGCTGTAGCCATTGCTTGGT
GTGTCACATTACCAAAGCACGCTGTGTCAAGAGGTGGGTTCAACCTTCGTCTCATATCAG
CAGCTACTATAATATGAGACTCTTCTTCACGGTTTAGACCACTCTGTTTAATAATGGATA
GCCATATATGTGCTAAAACCGCTTGAAGAGACGAGACTTTTAGATCC


BQ
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AF RS1BU04JQ U 21
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T
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GAACATCAATACTTCCATCTTCAACTCCTCTAAATACTACGAGGGAGACACCAAAACCAT
TATTTGGTTCGGCTCGAACCGCAATTGGTTTTCCCCAACCGAAATCGTTGTCGTATACTT
CAAACCATGGAGAGCTTGTGACCACCAGATAAGAATCAGCCTTTCTAAGTCCACCACTTA
TCGTTGGTTGTGGGAGCTTAACATTCCTGACCCAAGTCTCCGCAAAAGTCTTGTAGTTTT
CACTTGTTAGCGACCTCACTTGCTCATTTATTTGTAAAGAAGCCCAGCCTAGCCCGTGAT
CCAACATATCTCCCACCCTTGCTGTAGCCATTGCTTGGTGTGTCACATTACCAAAGCACG
CTGTGTCAAGAGGTGGGTTCAACCTTCGTCTCATATC

QA 2 578 2 578
DS 

RD RS1BU04TF 707 0 0
TTTTTTTTTGGCATGTATTAATTTTTTTTAAAACACCATTTTGACATGTCACATGCATTA
AAATTATTACATTTCATAGAAGGATAGGTCTTATTAGACCAACAAAATCATATAGTGGTC
TAACATTTTTCCCACAATTTAAACATCGGTAGACAGGTTCACTAATACATCAAGACCATA
TGGATAAGGGTATGGTCGCATGAACATCAATACTTCCATCTTCAACTCCTCTAAATACTA
CGAGGGAGACACCAAAACCATTATTTGGTTCGGCTCGAACCGCAATTGGTTTTCCCCAAC
CGAAATCGTTGTCGTATACTTCAAACCATGGAGAGCTTGTGACCACCAGATAAGAATCAG
CCTTTCTAAGTCCACCACTTATCGTTGGTTGTGGGAGCTTAACATTCCTGACCCAAGTCT
CCGCAAAAGTCTTGTAGTTTTCACTTGTTAGCGACCTCACTTGCTCATTTATTTGTAAAG
AAGCCCAGCCTAGCCCGTGATCCAACATATCTCCCACCCTTGCTGTAGCCATTGCTTGGT
GTGTCACATTACCAAAGCACGCTGTGTCAAGAGGTGGGTTCAACCTTCGTCTCATATCAG
CAGCTACTATAATATGAGACTCTTCTTCACGGTTTAGACCACTCTGTTTAATAATGGATA
GCCATATATGTGCTAAAACCGCTTGAAGAGACGAGACTTTTAGATCC

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 2

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TTGGTCATGAGGCTGCAGGGATAGTGGAGAGCGTAGGGGAAGGAGTGGAAGATATGAAGG
CAGGGGATCATGTGATCCCTATTTTCACAGGAGAATGTGGTGATTGCAGAGTCTGCAAAC
GAGACGGAGCCAATCTGTGCGAGAGATACCGAGTGGATCCAATGAAGAAAGTGATGGCAG
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ACACATCCACCTTCTCCGAGTACACGGTCATAGACTCGGCATGTGTGGTCAAGGTGGACC
CTCGGTTTCCTCTAGAGAAGATGAGCCTCCTCAGCTGCGGTGTCTCAACCGGAGTCGGTG
CGGCCTGGAACGTGGCTAATATTCAGCCTGGCTCCACCGTGGCTATCTTTGGGCTGGGTG
CTGTTGGGCTTGCGGTAGCTGAACGTGCAAAAGCAAGGGGGCCTCAAAATAATTGGGATT
GACATCACCCTGACAGTCCCATTAGGAGAGAGTAGAATCAGTGAGTCA


BQ
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AF RS1F136TF U 1
AF RS1H628TF U 1
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CGGCCTGGAACGTGGCTAATATTCAGCCTGGCTCCAC

QA 1 637 1 637
DS 

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TCACTTGCAGAGCGGCTGTGGCATGGGGAGCAGGAGACGCTCTAGTGATGGAGGATGTAA
AAGTGGATCCTCCTCAGAGATTGGAAGTTAGACTACGAATCCTCTTCACTTCTATCTGTC
ACACTGATCTTAGCGCATGGAAAGGCGAGAACGAGGCCCAGCAAGCATACCCTCGAATCC
TTGGTCATGAGGCTGCAGGGATAGTGGAGAGCGTAGGGGAAGGAGTGGAAGATATGAAGG
CAGGGGATCATGTGATCCCTATTTTCACAGGAGAATGTGGTGATTGCAGAGTCTGCAAAC
GAGACGGAGCCAATCTGTGCGAGAGATACCGAGTGGATCCAATGAAGAAGGTGATGGCAG
GTGATGGGAAGACCAGATTCTTCACCAGCAAAGACAACAAACCCATCTACCATTTTCTTA
ACACATCCACCTTCTCCGAGTACACGGTCATAGACTCGGCATGTGTGGTCAAGGTGGACC
CTCGGTTTCCTCTAGAGAAGATGAGCCTCCTCAGCTGCGGTGTCTCAACCGGAGTGGGTG
CGGCCTGGAACGTGGCTAATATTCAGCCTGGCTCCACCGTGGCTATCTTTGGGCTGGGTG
CTGTTGGGCTTGCGGTAGCTGAACGTGCAAAAGCAAGGGGGCCTCAAAATAATTGGGATT
GACATCACCCTGACAGTCCCATTAGGAGAGAGTAGAATCAGTGAGTCA

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

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TATCTGTTACTTCCAAGGCACAAGTTCTCTACATCATCTCCGATCTTGGTTACTTCGTCG
TTCCTCCGCCATCTCAGAATTTTGAGATGCTACAGAAGCGTCTTTGCACAGCAAGCCTAT
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CATATATGCATGAATCTCGGCATTTGCATGCGATAAACCGGCTAAGAGGATGTGGAGGCC
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CTCCTAATGGTAGATCTTGAGTACAAGGCCATGCACAACAACCACATGTTTAGTTTTATA
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TAGGTTATTTATTGCTTGGAACAGATAAGGTATGTATCAGTCTATATGAAGATGATTCAT
TATCTGGCTTGGCCGGTTTTGATCTCATAGTTTTTTGGTTCGTCTTAAAATGCAGTAAAT
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BQ
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AF RS1BG18TF U 1
AF RS1BG18JQ C 658
BS 1 747 RS1BG18TF
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BS 773 1378 RS1BG18JQ

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CAATCAATACTCGGTCCACTCTTATTCATTAAATTTCCTTCTTTATTCCTTTCATTCTGT
AGTCGATTTTTTTCTCCAACCTCAGCCAAATAGAAAACTCTTCATCTTTCCCTCCCCATA
TCTTCACTATATAAGTCCATTGCAACCTTTCAATAACGAAAGGTTCCTCACACCGTTTGA
TATCTGTTACTTCCAAGGCACAAGTTCTCTACATCATCTCCGATCTTGGTTACTTCGTCG
TTCCTCCGCCATCTCAGAATTTTGAGATGCTACAGAAGCGTCTTTGCACAGCAAGCCTAT
CTTCTACATCCATTTCCTGGGGTTCAAATGCAGTTAATGGGAATGCATCAACAAGTGGTT
CCATTACAATATGATGCAGTCGAGGAGCCTGTTTTTGTTAACGCAAAGCAATACCACAGT
ATACTCAGGCGTAAGTAATACCACGGTATACTCGGAACAGAGCCGTGAAGTCAAAGAAGC
CATATATGCATGAATCTCGGCATTTGCATGCGATAAACCGGCTAAGAGGATGTGGAGGCC
GGTTTCTCAATGCCAAGAAGAAGAATGGAGGCCGTAAGGATGAAGAGGAGGAGGATACAA
CCTCTAATGAGAACACTTCAGAAGCAAGTTCCAGCCTCAGATCTGAGAAGTCAGCCATCG
CTCCTAATGGTAGATCTTGAGTACAAG*CCATGCACAACAACCACATGTTTA

QA 1 772 1 772
DS 

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TCGCTCCTAATGGTAGATCTTGAGTACAAGGCCATGCACAACAACCACATGTTTAGTTTT
ATATTTTGGGTGGATGTTTGTATCAGTAAAGAACTGTTTTGGACTCTCTCTGTAGACTGT
GTATAGGTTATTTATTGCTTGGAACAGATAAGGTATGTATCAGTCTATATGAAGATGATT
CATTATCTGGCTTGGCCGGTTTTGATCTCATAGTTTTTTGGTTCGTCTTAAAATGCAGTA
AATGGTGTTTCCTCTGCTGCAGTTGGTCTTCACTCAAAGGAGTCACGTGGTACTGGACCT
GTTGATAAATCACACAGCCTTTTTGAGCCAGAGTACGGTGATGGCGGCTGTCACTTCCTT
ACTCAGTTATGGAATACACATTGGGGTTTTAGTCCGAGGGAAGAAGGTTAGAGATGAGAA
CAAGTCACAACTCTCTATCACAGAGTGGTCGTTCATGTAGAGAAAATCAAGGCAACCTAG
GCTTCACCTTGGAGCTTTGTCCCGGAAAAATGTATGTACCTCTGAAGATCTTATCATTTC
TAATCCAACTGATTCCACAAGGAGAATTGGAGTGTTACAAGCTTTGTACGAAATTTGGTT
TATTATTGTTGTTAGGAAAAACAAGCTAATATAGTAAAAGTTTTTCAATGTTTTTGTTAC
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL8482Contig1 969 2 2 U
GCCATCTCAGAAGCTCCGGTCTGGTTTCCATGATTTGAGCTTGAGGCCAACTGATTCTCT
CACTTTAGGGACCCGGTCTTTCAGTTTAAAACCCCCTCCTCTCCTTCAGCTTAACCACCA
GGCAATGCCTTCTTCAACAACTATGTTCCCAGAACATCAACAAAAGCAGTTACATGAACG
GTTGCAGGCTCACCATCTACATCAGCAGCAGCAGCAGCAACAAAGACATCATCAAGCTGA
GATTATGCTAAGGAAGTGCAACGGTGGAGGGATAAGTTTGAGCTTCGACAACTCTAGCTG
CACACCAACCATGTCATCAACTAGGTCCTTTGTTTCATCGCTTAGCATAGATGGTAGCGT
GGCTAATGCAGAAGGGAGAAACTCCTTTCAATTGATAGGGGATCAGAGTTTACCACATTC
CAAGAGAAAATGCCTCTTGAAAGGAGACGAGCATGGAAGCCGATGTCACTGCTCTAAGAA
GAGGAAACATAGGGTTAGGAGATCGATCAGAGTGCCTGCTATAAGTAACAAGGTTGCAGA
CATACCTCCTGATGATTATTCGTGGCGAAAATATGGTCAAAAACCCATCAAGGGCTCTCC
TTATCCCAGGGGATATTACAAGTGCAGTAGCATGAGAGGTTGTCCAGCAAGGAAGCATGT
AGAGAGATGTGTGGAGGATCCAGCGATGCTTATTGTTACTTATGAAGCAGAGCATAATCA
CCCGAAACTGCCATCTCAAGCCGTAACAACATAACCTTCATTTATCATCATCATGTGTTC
TCTCTCTCTCACTTTGAATCTCCTCCAATATTGTGTGATGAAATGATGGGCTTTTAGTTT
GGGGGGTATGGATTTGCTTGTGACTTGTGAGAGAGTTTACTGCAGTTGTTGGGGTTTGGT
TTTTAAGGGGTAAACGTAGGATTTGTCGAAGACCTTTTGTTCTTATTTCTATATAAGTGT
ACTGCTCCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F475TF U 1
AF RS1F475JQ C 140
BS 1 719 RS1F475TF
BS 720 969 RS1F475JQ

RD RS1F475TF 719 0 0
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CACTTTAGGGACCCGGTCTTTCAGTTTAAAACCCCCTCCTCTCCTTCAGCTTAACCACCA
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CACACCAACCATGTCATCAACTAGGTCCTTTGTTTCATCGCTTAGCATAGATGGTAGCGT
GGCTAATGCAGAAGGGAGAAACTCCTTTCAATTGATAGGGGATCAGAGTTTACCACATTC
CAAGAGAAAATGCCTCTTGAAAGGAGACGAGCATGGAAGCCGATGTCACTGCTCTAAGAA
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CATACCTCCTGATGATTATTCGTGGCGAAAATATGGTCAAAAACCCATCAAGGGCTCTCC
TTATCCCAGGGGATATTACAAGTGCAGTAGCATGAGAGGTTGTCCAGCAAGGAAGCATGT
AGAGAGATGTGTGGAGGATCCAGCGATGCTTATTGTTACTTATGAAGCAGAGCATAATC

QA 1 719 1 719
DS 

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AACTATG
TCCCAGAACATCAACAAAAGCAGTTACATGAACGGTTGCAGGCTCACCATCTACATCAGC
AGCAGCAGCAGCAACAAAGACATCATCAAGCTGAGATTATGCTAAGGAAGTGCAACGGTG
GAGGGATAAGTTTGAGCTTCGACAACTCTAGCTGCACACCAACCATGTCATCAACTAGGT
CCTTTGTTTCATCGCTTAGCATAGATGGTAGCGTGGCTAATGCAGAAGGGAGAAACTCCT
TTCAATTGATAGGGGATCAGAGTTTACCACATTCCAAGAGAAAATGCCTCTTGAAAGGAG
ACGAGCATGGAAGCCGATGTCACTGCTCTAAGAAGAGGAAACATAGGGTTAGGAGATCGA
TCAGAGTGCCTGCTATAAGTAACAAGGTTGCAGACATACCTCCTGATGATTATTCGTGGC
GAAAATATGGTCAAAAACCCATCAAGGGCTCTCCTTATCCCAGGGGATATTACAAGTGCA
GTAGCATGAGAGGTTGTCCAGCAAGGAAGCATGTAGAGAGATGTGTGGAGGATCCAGCGA
TGCTTATTGTTACTTATGAAGCAGAGCATAATCACCCGAAACTGCCATCTCAAGCCGTAA
CAACATAACCTTCATTTATCATCATCATGTGTTCTCTCTCTCTCACTTTGAATCTCCTCC
AATATTGTGTGATGAAATGATGGGCTTTTAGTTTGGGGGGTATGGATTTGCTTGTGACTT
GTGAGAGAGTTTACTGCAGTTGTTGGGGTTTGGTTTTTAAGGGGTAAACGTAGGATTTGT
CGAAGACCTTTTGTTCTTATTTCTATATAAGTGTACTGCTCCC

QA 8 830 8 830
DS 



AS 1 2

CO CL8483Contig1 634 2 2 U
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TGAAAATTTCTGTTTCTTTCTATCCATGGAATCTCCATCATTATAGAGCTTAACTCTGTT
TCTTCTCTGCTTCCTCTTCCTCGTATCTGCTTCTTCTATCTCATTTGACTCACAACCACA
AGCTTCATCCATCTCTCCTCCTCCGCCGCTTCAATCATTAACTCCACCGCCGCCGCCGCC
TCCTCCGGTAAAGGTCGGGATAGGTAACAAGGCGATGCACGAGAAGCACCACCGAAGAAA
GAAATGGAAGCAGAGAAGGAACCAGAACCAAAAGCAGAAGCAGAAGAAGCTGAACACGGG
GAAGACGGTGGGGCTCTTCTTCGCCGGTGCAGCTGCAGCTTTGCAAGTAGTTGTTGCTGC
TTTCTTGCTTCTCAAAAGAAGACAGCTTCTCCTCAAAATCAACGATAACAGACACTGATT
CAAATGCCCCTCACTTTGGATCTGTTTGTATCTTTTGCAGTTATGGAGTTAAGTCATCTC
AATTTTGGTCCCTCTTTTGTCTGTAAAGTTTTTAAGTCTTTTTTTTTTTTACTTTTTCCC
CTGAGTAATCCAATGGAAAAAAAAATTAGTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1H753TF U 1
AF RS1H753JQB C 198
BS 1 617 RS1H753TF
BS 618 634 RS1H753JQB

RD RS1H753TF 617 0 0
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TGAAAATTTCTGTTTCTTTCTATCCATGGAATCTCCATCATTATAGAGCTTAACTCTGTT
TCTTCTCTGCTTCCTCTTCCTCGTATCTGCTTCTTCTATCTCATTTGACTCACAACCACA
AGCTTCATCCATCTCTCCTCCTCCGCCGCTTCAATCATTAACTCCACCGCCGCCGCCGCC
TCCTCCGGTAAAGGTCGGGATAGGTAACAAGGCGATGCACGAGAAGCACCACCGAAGAAA
GAAATGGAAGCAGAGAAGGAACCAGAACCAAAAGCAGAAGCAGAAGAAGCTGAACACGGG
GAAGACGGTGGGGCTCTTCTTCGCCGGTGCAGCTGCAGCTTTGCAAGTAGTTGTTGCTGC
TTTCTTGCTTCTCAAAAGAAGACAGCTTCTCCTCAAAATCAACGATAACAGACACTGATT
CAAATGCCCCTCACTTTGGATCTGTTTGTATCTTTTGCAGTTATGGAGTTAAGTCATCTC
AATTTTGGTCCCTCTTTTGTCTGTAAAGTTTTTAAGTCTTTTTTTTTTTTACTTTTTCCC
CTGAGTAATCCAATGGA

QA 1 617 1 617
DS 

RD RS1H753JQB 437 0 0
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GGATAGGTAACAAGGCGATGCACGAGAAGCACCACCGAAGAAAGAAATGGAAGCAGAGAA
GGAACCAGAACCAAAAGCAGAAGCAGAAGAAGCTGAACACGGGGAAGACGGTGGGGCTCT
TCTTCGCCGGTGCAGCTGCAGCTTTGCAAGTAGTTGTTGCTGCTTTCTTGCTTCTCAAAA
GAAGACAGCTTCTCCTCAAAATCAACGATAACAGACACTGATTCAAATGCCCCTCACTTT
GGATCTGTTTGTATCTTTTGCAGTTATGGAGTTAAGTCATCTCAATTTTGGTCCCTCTTT
TGTCTGTAAAGTTTTTAAGTCTTTTTTTTTTTTACTTTTTCCCCTGAGTAATCCAATGGA
AAAAAAAATTAGTTTGC

QA 1 437 1 437
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8485Contig1 989 2 2 U
GGACCCGTTTTCTCTTTCCTCTAATCTTCTCTCTTCTGCCTTTCCTCTATCTTCTCCTCC
CGTACTCACTCGTCTTCCTTTTGCTCATACTTCCCTCACCTGCCTCCGATTCGTCTTGCT
TTTAGGGTCTGGTGCTCGCTCTTGGGTTCCGACGACGATTCTTCTCTCTCTGGTCTCTAA
CGGGCGTGGGGGAGGTTGTAGTCGGCGTTTAGGTTGAAATTTTTTATTTTGTACTCAGAT
TGCTCCTGGTTCTGAGTCTTCTCCGTCGGCCTTGGTTTGGTTCAGCGGGTCGTCTGGCAG
TGGCGGTGAGTGCTTTGGTCTCTCTGTGGTGTCATGGAAGGTCGGCGCTCCTGAGTTCAT
TTCCTTCTCTCTGTCGACTCCAGAGAGTACTCTCTCTCATGCTCTGGTTGCAGTGATAAT
TTCCAAGGTGATGAACCTCCAGAATCTCTTTGTTTATGAAAGAATTGAAGAGACGAGGTA
TGACTCCTACATCGTTGCTTCAAGACTATGAAGTTGATGTAGATGAGATCAAAACAACCG
GTAAAGAAAGCTCTAAAACGACTGCAACTACTACTCCTCCAATTCGACCAGAGTTTGTTA
AACCAGAGAGAGCGATCGTTAGCTTTGAACAGCGAAGGGCTTGAGGGATTGATTCCACGT
GTTAAGATCTTGCTGACGACTGGAGGGACTTTCTTCTTGGGTTTTGGTCCTTGATAGTCT
TAACTCTTGGCGCCTTCTCCGCCCTTTACCTTTACTTTGGAGCAGATTTCGTTCATGATG
GAAGCAGGAATCCGGTTTCACCACCACCCCCGTACATCGATCCATATGCTCTGTTGGAGG
ATGAGAGGATATCTGGGATCAATTCTCGTCTAAATTAGCACCACCAACTTGTTCTTTCAC
AAGTAGTAGTTACTATATTGTATATTGTTTGCACTCAAGTATATTACTTCATAAATAACC
AGATCTAATGCACATAAATCATTTCGTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GJ13TF U 1
AF RS1GJ13JQ C 450
BS 1 634 RS1GJ13TF
BS 635 989 RS1GJ13JQ

RD RS1GJ13TF 634 0 0
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CGTACTCACTCGTCTTCCTTTTGCTCATACTTCCCTCACCTGCCTCCGATTCGTCTTGCT
TTTAGGGTCTGGTGCTCGCTCTTGGGTTCCGACGACGATTCTTCTCTCTCTGGTCTCTAA
CGGGCGTGGGGGAGGTTGTAGTCGGCGTTTAGGTTGAAATTTTTTATTTTGTACTCAGAT
TGCTCCTGGTTCTGAGTCTTCTCCGTCGGCCTTGGTTTGGTTCAGCGGGTCGTCTGGCAG
TGGCGGTGAGTGCTTTGGTCTCTCTGTGGTGTCATGGAAGGTCGGCGCTCCTGAGTTCAT
TTCCTTCTCTCTGTCGACTCCAGAGAGTACTCTCTCTCATGCTCTGGTTGCAGTGATAAT
TTCCAAGGTGATGAACCTCCAGAATCTCTTTGTTTATGAAAGAATTGAAGAGACGAGGTA
TGACTCCTACATCGTTGCTTCAAGACTATGAAGTTGATGTAGATGAGATCAAAACAACCG
GTAAAGAAAGCTCTAAAACGACTGCAACTACTACTCCTCCAATTCGACCAGAGTTTGTTA
AACCAGAGAGAGCGATCGTTAGCTTTGAACAGCG

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1GJ13JQ 540 0 0
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GAAGTTGATGTAGATGAGATCAAAACAACCGGTAAAGAAAGCTCTAAAACGACTGCAACT
ACTACTCCTCCAATTCGACCAGAGTTTGTTAAACCAGAGAGAGCGATCGTTAGCTTTGAA
CAGCGAAGGGCTTGAGGGATTGATTCCACGTGTTAAGATCTTGCTGACGACTGGAGGGAC
TTTCTTCTTGGGTTTTGGTCCTTGATAGTCTTAACTCTTGGCGCCTTCTCCGCCCTTTAC
CTTTACTTTGGAGCAGATTTCGTTCATGATGGAAGCAGGAATCCGGTTTCACCACCACCC
CCGTACATCGATCCATATGCTCTGTTGGAGGATGAGAGGATATCTGGGATCAATTCTCGT
CTAAATTAGCACCACCAACTTGTTCTTTCACAAGTAGTAGTTACTATATTGTATATTGTT
TGCACTCAAGTATATTACTTCATAAATAACCAGATCTAATGCACATAAATCATTTCGTAC

QA 1 540 1 540
DS 



AS 1 2

CO CL8486Contig1 933 2 2 U
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AGAAGCTGCTGAAATCCACCGCGCCCTTCATCGTGTTCCAATAAGAGAGGTCGAGATATG
ATAACCGGACTAGTTCCGATATAAACTCCCCCGGGATGGGCCCGTTCAAACTGTTCCCTC
CAAGGGTTAAAGTGTCGAGTTTATACGGTGAAGAAGAAGATATATTATTACCAATCTCAA
GAGGACCGGTGAAGCAGTTTTTCTCCAGGTTAAGAAGAACCAACGAAGGGATCATGAAAA
GAGACGGTGGAATAGTTCCGGTCATCGAGTTCGAACCGATATCGAAATGCTCCAGTTTGG
AGAGGCGGCTCATGTTAGATGGGAGGTTACCTTCGAGATGGTTATTACGAAGGTCGAGCC
ACGTAAGCTCGCTCAGATTGAGCAGCGCGTGGTGGAAGTTCCCGGTGAGTTTGCTCGTGG
AAAGCAGCAGCTTCGTTAGTTTGTTTAGTTTGCCCATCGTTTCCGGTAGCTCACCGGTGA
AGCCGTTACCTTCGAGATCGAGATGAGTGAGTTGAGAAAGGTTTCCGATGGAAGAAGGGA
TCTTCCCAAAGAAACCGCATCCGTAAAGTTTCAAGACCCTCAAGTGTCTGAGGTCGCCGA
TGGAGTCCGGTAGAGTGCCCGCGAGGTTATTGGAGCTAAGGTTAAGGCTCTGAAGATGTT
GTAGTTTAAAGAGACCGCTGTTGGATCTCAAAGAGCCGTTGAGAGAACTGCCCCAGAGAT
TTAGACCAATGACGTTCCCCGTCTTGAGATCACAAGAGATACCATTCCAGAAACAACAGT
CAGTGTTGTTGTTTATTATCCACCTCTGTGTGTTCACGTTAGGAGCTATCCCACTGAAGT
GAAACTCACTCTTGAACTCCCAAAGAGCATCCC


BQ
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AF RS1EQ25TF U 1
AF RS1EQ25JQ C 643
BS 1 696 RS1EQ25TF
BS 697 933 RS1EQ25JQ

RD RS1EQ25TF 696 0 0
GGAAGTACTTTCGATATCTAAATCTACAGAGGTCGAGTAGCACGAGTGACTTGAGACGCA
AGAAGCTGCTGAAATCCACCGCGCCCTTCATCGTGTTCCAATAAGAGAGGTCGAGATATG
ATAACCGGACTAGTTCCGATATAAACTCCCCCGGGATGGGCCCGTTCAAACTGTTCCCTC
CAAGGGTTAAAGTGTCGAGTTTATACGGTGAAGAAGAAGATATATTATTACCAATCTCAA
GAGGACCGGTGAAGCAGTTTTTCTCCAGGTTAAGAAGAACCAACGAAGGGATCATGAAAA
GAGACGGTGGAATAGTTCCGGTCATCGAGTTCGAACCGATATCGAAATGCTCCAGTTTGG
AGAGGCGGCTCATGTTAGATGGGAGGTTACCTTCGAGATGGTTATTACGAAGGTCGAGCC
ACGTAAGCTCGCTCAGATTGAGCAGCGCGTGGTGGAAGTTCCCGGTGAGTTTGCTCGTGG
AAAGCAGCAGCTTCGTTAGTTTGTTTAGTTTGCCCATCGTTTCCGGTAGCTCACCGGTGA
AGCCGTTACCTTCGAGATCGAGATGAGTGAGTTGAGAAAGGTTTCCGATGGAAGAAGGGA
TCTTCCCAAAGAAACCGCATCCGTAAAGTTTCAAGACCCTCAAGTGTCTGAGGTCGCCGA
TGGAGTCCGGTAGAGTGCCCGCGAGGTTATTGGAGC

QA 1 696 1 696
DS 

RD RS1EQ25JQ 291 0 0
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TAAGGCTCTGAAGATGTTGTAGTTTAAAGAGACCGCTGTTGGATCTCAAAGAGCCGTTGA
GAGAACTGCCCCAGAGATTTAGACCAATGACGTTCCCCGTCTTGAGATCACAAGAGATAC
CATTCCAGAAACAACAGTCAGTGTTGTTGTTTATTATCCACCTCTGTGTGTTCACGTTAG
GAGCTATCCCACTGAAGTGAAACTCACTCTTGAACTCCCAAAGAGCATCCC

QA 1 291 1 291
DS 



AS 1 2

CO CL8487Contig1 771 2 3 U
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ATCGCTTTCTTGAACTTCGTTGAAACCACATTTGTATCTACTAAACCATTACCATAGAGA
ACTTATCTGAAACCCAAAACCAAACTTAGTGTTTTTTTTTCTGAGCTTGGGATATCTCTT
CTTATCTAGGAGGGGGACCTGGTCTCTGGTTAGCTTCTCTATCTCTACGTCTCCTACCCG
ATCGTCCTAGTAAAACCCGTCCTTGTCGCCTCATTCGACTTGCCAGAGAGGTACTCTGCC
TATCTTCCCCTTCCTCTTCTCCAGAGAAAGTCATCTCATCTGCTGTTCCACGGTTGATCG
TCGTCAAGTCGCTCGAATCAGAATCAGAGCGTCTTGTCTGACTCCTCGACGCCCCAACAG
CATGCATCATAAGGATAACATTTAAAAAATTCCTACCAAACCCAGCATCCATCATCCCTG
AACCGTTGTAATGAACACCACCACCACCCTCGTCTGAGTCAGAACCGTTGCCTCCATCAT
CATCATCGTCATCGTTCCTTTCCATAACGTAATCCCCAAACACTGTCGCCCCAGGTATCA
ACGACCTAATCGTGCTGAAACCATCATCCCGGTCATGCTCAATCTCAGAAATTACAACTT
TAGGGATTGAAGATTAGGGTTTCTGAAGCAGATAACGAAAGGGACGACGACGAAGAAGAA
GAAGCAGAGGAGAGAGAGCACTTCGACCACTGCTCCACCAATTAGCTCTCC


BQ
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AF RS1BH51JQ U 121
AF RS1BH51TF C 1
BS 1 120 RS1BH51TF
BS 121 228 RS1BH51JQ
BS 229 771 RS1BH51TF

RD RS1BH51JQ 108 0 0
ACTTATCTGAAACCCAAAACCAAACTTAGTGTTTTTTTTTCTGAGCTTGGGATATCTCTT
CTTATCTAGGAGGGGGACCTGGTCTCTGGTTAGCTTCTCTATCTCTAC

QA 1 108 1 108
DS 

RD RS1BH51TF 771 0 0
CTTCGACAACCAGGAGCAAATCTGAGTCAAATTCAGCAGAAAAAAAGGGTTCACAGGTCA
ATCGCTTTCTTGAACTTCGTTGAAACCACATTTGTATCTACTAAACCATTACCATAGAGA
ACTTATCTGAAACCCAAAACCAAACTTAGTGTTTTTTTT*CTGAGCTTGTGATATCTCTT
CTTATCTAGGAGGGGGACCTGGTCTCTGGTTAGCTTCTCTATCTCTACGTCTCCTACCCG
ATCGTCCTAGTAAAACCCGTCCTTGTCGCCTCATTCGACTTGCCAGAGAGGTACTCTGCC
TATCTTCCCCTTCCTCTTCTCCAGAGAAAGTCATCTCATCTGCTGTTCCACGGTTGATCG
TCGTCAAGTCGCTCGAATCAGAATCAGAGCGTCTTGTCTGACTCCTCGACGCCCCAACAG
CATGCATCATAAGGATAACATTTAAAAAATTCCTACCAAACCCAGCATCCATCATCCCTG
AACCGTTGTAATGAACACCACCACCACCCTCGTCTGAGTCAGAACCGTTGCCTCCATCAT
CATCATCGTCATCGTTCCTTTCCATAACGTAATCCCCAAACACTGTCGCCCCAGGTATCA
ACGACCTAATCGTGCTGAAACCATCATCCCGGTCATGCTCAATCTCAGAAATTACAACTT
TAGGGATTGAAGATTAGGGTTTCTGAAGCAGATAACGAAAGGGACGACGACGAAGAAGAA
GAAGCAGAGGAGAGAGAGCACTTCGACCACTGCTCCACCAATTAGCTCTCC

QA 1 771 1 771
DS 



AS 1 2

CO CL8488Contig1 618 2 2 U
GGAGTTGATTTTGATTATCTCTCTCTCTCCTCTGTAGGAACAAGCCAAAAGCAAAGGATA
AAAAAAGAGAGATGGAGTCTAGCAGAGGTCAAGGTGGGATCCAGCAGTTGCTTGCTGCTG
AACAAGAAGCTCAACACATCGTCAATGCTGCAAGGACCGCAAAGATGGGAAGGCTGAAGC
AAGCAAAGGAAGAGGCTGAGAAGGAGATAGCTGAATACAAAGCGAAAACAGAGCAAGACT
TCCAGAGGAAACTTGAGGAGACAAGTGGAGACTCGGGTGCGAATGTGGAGAGGCTGGAGC
AAGAGACTGATGAGAAGATCGTGCAGCTCAAAAGCGAAGCACCCAGGATTTCCAACGATG
TTGTGGAGATGCTCCTCAAACATGTCACCACTGTCAAGAACTGAGAGAGAGATTCCTGTA
ATAATAATAAAAAAAAATGTCATTTATGAGTGTTTATGCTCCTCCTATGTTTCTCCTTCT
TTTTCATTCACGCGTGTGGTGTTACTGGATGGGGATCTCAGTGGACTCAATGTGTTGTTT
TTGTAATTTATTCTCTACCATCTTCTTCTGGTTGTTGTTGTGGTTGTATTCATCATTTCC
CTTTTGAGGGAGGATTGT


BQ
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AF RS1G805TF U 1
AF RS1G805JQ C 117
BS 1 578 RS1G805TF
BS 579 618 RS1G805JQ

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AAGAGACTGATGAGAAGATCGTGCAGCTCAAAAGCGAAGCACCCAGGATTTCCAACGATG
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ATAATAATAAAAAAAAATGTCATTTATGAGTGTTTATGCTCCTCCTATGTTTCTCCTTCT
TTTTCATTCACGCGTGTGGTGTTACTGGATGGGGATCTCAGTGGACTCAATGTGTTGTTT
TTGTAATTTATTCTCTACCATCTTCTTCTGGTTGTTGT

QA 1 578 1 578
DS 

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GATGTTGTGGAGATGCTCCTCAAACATGTCACCACTGTCAAGAACTGAGAGAGAGATTCC
TGTAATAATAATAAAAAAAAATGTCATTTATGAGTGTTTATGCTCCTCCTATGTTTCTCC
TTCTTTTTCATTCACGCGTGTGGTGTTACTGGATGGGGATCTCAGTGGACTCAATGTGTT
GTTTTTGTAATTTATTCTCTACCATCTTCTTCTGGTTGTTGTTGTGGTTGTATTCATCAT
TTCCCTTTTGAGGGAGGATTGT

QA 1 502 1 502
DS 



AS 1 2

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CACAACACAACCATGAAGAAGATCGACTTAGGGAACCACCGCGAGGTGGCTCAGCCGGAC
TGCATCAAAGCTCTCATTGTCGAATTCATCACCACCTTCTTCTTTGTTTTCGCCGGCGTC
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AATTAGTATAGTAAAATACCTACATGTTAGGATGAACACTAATACAAATACAAATTGTAA
TGCAATAATCCATATGTAACATGGTTTTATTCTTT


BQ
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AF RS1D533JQ C 1
AF RS1D533TF U 1
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QA 1 575 1 575
DS 

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CACAACACAACCATGAAGAAGATCGACTTAGGGAACCACCGCGAGGTGGCTCAGCCGGAC
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CACCTCAACCCCGCTGTTACCATCGGCCTACTTTTCGGAGGTCACATCAGCGTCTTCCGC
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TCCCTCACCGGAGGAATGGTACGTATTCTAATTTTATATTACCAAATTCAATTAATCATT
AATTAGTATAGTAAAATACCTACATGTTAGGATGAACACTAATACAAATACAAATTGTAA
TGCAATAATCCATATGTAACATGGTTTTATTCTTT

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1B325JQ C 1
AF RS1B325TF U 1
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QA 1 349 1 349
DS 

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TGACCTTTGAAGCATCTAAGATGAAATCTCCAGATTTCTATACCTTTATATATACTGTGA
AATTATCTGATCTGATAGGGACCTTATCTTAGATTAGTTTATTGTTGCC

QA 1 349 1 349
DS 



AS 1 2

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TTTATGGATGACCCACCAGTCTCGTACGTCATATATATTTGTATAAAGTTGAGAATCCTG
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BQ
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AF RS1DN30TF U 1
AF RS1DN30JQ C 40
BS 1 614 RS1DN30TF
BS 615 824 RS1DN30JQ

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TTGTGAGATTCCGGGAGGATCATCCGAAGACGAGTGGTCTGCTAAGGTTTTGAGTAGAAG
TCAGGAGGGCATGGGGTTGGTTGGAGTCCTATTATCCCTTACGCCTTCTCTGTTCCTCAA
GATTGGAACGAGGTACCTGTGTCGATAGCTGATCTCGGTGGCACTGAGATTGACTTGAGA
TTCGCTAGTCCTAAAGAAGGCCGCTTGTCTGTAATTGTCGCTCCCGTTCTTAGATTTGCA
GATAACCTTGGGGACAACGTGAAGATTGAAAACATTGGAACACCAGCGAAGGTGATCAAC
GCCTTTGGACCAGAAGTTATCGGAGAAAACGTTGAAGGGAAGGTGTTAAGTTCTAACGTA
GCGGAACACGAGGGTAGGCTCTATTACCAGTTCGAGCTAGAGCCACCTCATGTACTCATC
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TGGAAGAGATACTA

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DS 

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CGCTGCTCATCACAGAGCCAGTTGTGAGATTCCGGGAGGATCATCCGAAGACGAGTGGTC
TGCTAAGGTTTTGAGTAGAAGTCAGGAGGGCATGGGGTTGGTTGGAGTCCTATTATCCCT
TACGCCTTCTCTGTTCCTCAAGATTGGAACGAGGTACCTGTGTCGATAGCTGATCTCGGT
GGCACTGAGATTGACTTGAGATTCGCTAGTCCTAAAGAAGGCCGCTTGTCTGTAATTGTC
GCTCCCGTTCTTAGATTTGCAGATAACCTTGGGGACAACGTGAAGATTGAAAACATTGGA
ACACCAGCGAAGGTGATCAACGCCTTTGGACCAGAAGTTATCGGAGAAAACGTTGAAGGG
AAGGTGTTAAGTTCTAACGTAGCGGAACACGAGGGTAGGCTCTATTACCAGTTCGAGCTA
GAGCCACCTCATGTACTCATCACTGCGACAGCTGCTGGGAACCGCCTTTACTTGTTCAGT
GTCACCGGAAACGGGCTTCAATGGAAGAGATACTACAAGGATCTGAAGAAGATAGCTTTC
TTTCCGCGTTGTTTAGAGACATTTGCAAAAAGTTTTCTTTTTGATTCATGCATGGGTTCT
TCTACAAGTGAACTCAAATAGTTTATGGATGACCCACCAGTCTCGTACGTCATATATATT
TGTATAAAGTTGAGAATCCTGTAACTTTACAGTAAACCAAATCCAAGCAGTACATTAAGT
CTGAC

QA 1 785 1 785
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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AF RS1EG16TF U 1
AF RS1EG16JQ C 20
BS 1 594 RS1EG16TF

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GTTTCAGATTTAGACCAAGTGTTATAGTTGTATCAGCGAAGACTAGAGATGTAAGGGAGA
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CCTTAGTGTTGCCCGAAATTTTACAGTGCATTTATTAAAACTAGCAATTTATCT

QA 1 594 1 594
DS 

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CTGTTGGGACTTGGATCCGGCTGCAATCCCCGAGGAGCTGCTTCAAGTCGGAGCAGACGC
CTGATTGATGATTCCAGTGACTATCCTGCAGGAGAAGCAAGGTTTCAGATTTAGACCAAG
TGTTATAGTTGTATCAGCGAAGACTAGAGATGTAAGGGAGAGACTGTTGACACGCAAAAG
ATTACTGTTTGGTCACTAAAGCTGTTGTATTAGGTGATGTCCAACTGAGTAAACAAAGCG
TAGTTGTTTTTTTGTTTGCTCTTCTTTTCCTTCTTTATTGACCTTAGTGTTGCCCGAAAT
TTTACAGTGCATTTATTAAAACTAGCAATTTATCT

QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 2

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CCTTGAAGAAAGAATATTATTATATGCTTATTCCTATTGCAAATGCCTCTGCAGTTTTTT
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CTATGTTTCTTCCTCATTTTAGAAGTTTGTAAACCGGTAATTTCTTAGGCCGGTCCTGGT
GCTGTAGTGTGACGAAAAGCCTATGTTTTTTTCTCTTGGCAATGGGCTAGTGTATGAATG
AATATATGAAACATTAATCTAAGCTTTCAGATTCGCATATTAACC


BQ
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AF RS1F975JQ C 1
AF RS1F975TF U 1
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CCTTGAAGAAAGAATATTATTATATGCTTATTCCTATTGCAAATGCCTCTGCAGTTTTTT
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QA 1 465 1 465
DS 

RD RS1F975TF 465 0 0
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CAACTTGAACTACAGAGCAAAGGATTCTGATTCCCGTCTCTCTTTTTAGAATCCCCCCAT
CCTTGAAGAAAGAATATTATTATATGCTTATTCCTATTGCAAATGCCTCTGCAGTTTTTT
TGTACTGCAACATCGGAAAAAAAGCAGAATCATCATCATCCTTCTTTCTAGTTTCATTGC
CTATGTTTCTTCCTCATTTTAGAAGTTTGTAAACCGGTAATTTCTTAGGCCGGTCCTGGT
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AATATATGAAACATTAATCTAAGCTTTCAGATTCGCATATTAACC

QA 1 465 1 465
DS 



AS 1 2

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TCACGTGGAGTAGAGCCTGAAGTTGACAAGTATCTCTTCTTGTTCTTGAAGTTTATGGCA
TCGGTTGTTCCAACAATCGAGTATGATTACACAATGGACTTTGATCTCGGTAGCTCAAGC
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TGGAGTGGGCTCTTCACTGTGTATAATATGGAGTCCTCGTTTTTTTTTTCTTTTCAAGTT
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BQ
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ATTTTCTATATTAAAAAGTGTTTTCTACC

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AS 1 2

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BQ
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GAGTTTCCACGAAGGTCAAAAAACTGAGGTTTAGAACAAGCTTTGGAGATCCGGTCCGGA
AATTAGATGAGTTGGAACTGCCATATAGACAATGTTCCGATAAGATTATGTGCTCGTTTC
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GAAGATTGAAGGAACGAAGAACATGCAAACAGCCTCAAGTGATCGGAGATGAAGATGGAT
GGATTACCGGGCAGTTATCCGGCACCGTCTTTCTTCCTTCTCGACAAAGGAGTTACACCA
CGAGTCCTCACATGCGTCACTTAGCATGTAATCGTTATCTGTTGATGTTTTGGGCTCTAT
TTGGTCAAAATTGAGTCTATTTGTAATCTTTATCCAATGGGCTTCTGGTTAATAAAACCA
CAAGTTGACAAAAAAATAAAATTTCTTTGTGTGTT

QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

CO CL8497Contig1 534 2 1 U
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AAAGAACGCGGTTTGAATTCAAAACTACTAACATTACTCTCAATCTATTGGCAATATATG
ACTTTTGTGATAACTTATATGGTTTAACTATGTATCACCATGATGTTTTTTTTTTTGGGT
CTTCAGGTTCTTGATGAATGTAAGAAAGTCGAGAGGTGGCTCCAGGAGAGAACCACGGAA
CAAGAATCACATAGCCATCCGGAGCTGAAATCTGGTGAAATCAGGAGAAAGGCCGATGCT
CTTAACGCGACGTGCAAGTACATTGGGAAGTCAAACTCTCCCCCCACGAAATCGGAACAC
AATGGATCCCACGGACGTCGAAACTCGGATGATATGGAGCTTGATTGATTTTTCACTTTT
TGTTCTTTGATATTAATTTTGTTGAACAAAAGAATAAGACGAAAGTCTCATTATTACTTC
TCACATAAACAATTATGTTCATTTTTGTCAAACGGTTTGAAAACGATTATTCTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DV17JQ C 1
AF RS1DV17TF U 1
BS 1 534 RS1DV17TF

RD RS1DV17JQ 534 0 0
GGATCTTGCGAAAACTATAGCAGATAATAGAATGGCTGCAGAGTCTCTTCCTCCTCCAAG
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CTTCAGGTTCTTGATGAATGTAAGAAAGTCGAGAGGTGGCTCCAGGAGAGAACCACGGAA
CAAGAATCACATAGCCATCCGGAGCTGAAATCTGGTGAAATCAGGAGAAAGGCCGATGCT
CTTAACGCGACGTGCAAGTACATTGGGAAGTCAAACTCTCCCCCCACGAAATCGGAACAC
AATGGATCCCACGGACGTCGAAACTCGGATGATATGGAGCTTGATTGATTTTTCACTTTT
TGTTCTTTGATATTAATTTTGTTGAACAAAAGAATAAGACGAAAGTCTCATTATTACTTC
TCACATAAACAATTATGTTCATTTTTGTCAAACGGTTTGAAAACGATTATTCTC

QA 1 534 1 534
DS 

RD RS1DV17TF 534 0 0
GGATCTTGCGAAAACTATAGCAGATAATAGAATGGCTGCAGAGTCTCTTCCTCCTCCAAG
AAAGAACGCGGTTTGAATTCAAAACTACTAACATTACTCTCAATCTATTGGCAATATATG
ACTTTTGTGATAACTTATATGGTTTAACTATGTATCACCATGATGTTTTTTTTTTTGGGT
CTTCAGGTTCTTGATGAATGTAAGAAAGTCGAGAGGTGGCTCCAGGAGAGAACCACGGAA
CAAGAATCACATAGCCATCCGGAGCTGAAATCTGGTGAAATCAGGAGAAAGGCCGATGCT
CTTAACGCGACGTGCAAGTACATTGGGAAGTCAAACTCTCCCCCCACGAAATCGGAACAC
AATGGATCCCACGGACGTCGAAACTCGGATGATATGGAGCTTGATTGATTTTTCACTTTT
TGTTCTTTGATATTAATTTTGTTGAACAAAAGAATAAGACGAAAGTCTCATTATTACTTC
TCACATAAACAATTATGTTCATTTTTGTCAAACGGTTTGAAAACGATTATTCTC

QA 1 534 1 534
DS 



AS 1 2

CO CL8498Contig1 778 2 24 U
GATTCTCAAATGTAATTACCAAAAATAAGATCTCAAAAAGGGAACTACATTGTGATGGAG
TTTCGTTCTCTCAACTGTAAATCAAAGCTCAAATCAAACCAATCCACAGAAACATGAACA
GTCATAGCCTATTTTTTTCTTTTATTACCAATAAGAAACAGAGCAAAGAGAATGCAAGTG
CTCGCTCTTACACGACTAACAATGTCTTGCTTGAAGAGAAATTAAAAAAAAAATGAAGGA
GATGAGAGATGGAACAGACCTCACTCTTCCTGACATAATTCATCGAGCAGCTTCTCTGTT
GCTTTATCAACCTTCACCTTCTCCATCTTCAGGCGCTGGCGCATAGCAGGATGGCTCTTT
CCAGCTGCTGCATATGTTCTTATCAATGATTCAAACGTCTCCGCGGCTACATCATCCGTA
CCCTTCTTTAAAATCTACACCAAACTCTCAGCTCCGTTAACATCTTTCTTTTCCTCGAAC
TGACTCATCAAACTTCTGACTGCTTCCTCTGACGGTAGCCACTTACCACCATCTCCTTTC
CCGATAGAAGCTGCCTTAGTCATACACTCAAGTGCTTGAGCCGTATCACCGCTCTTTACA
TAGTAATCCATAAAGAGCTCCCATGTTTTAGCATTGAGCTTTCCACCTCTTCTTGGAGAT
TTCTCCTTGAGCTCATTTGCCTTTTCGATGAGACCCTCTCTGGCATAAGCTCCAATCATC
ACATTTACAACCCGGATGTCGTAAGCGGAACAGTTCGCTTGCCATTCCTTGAACAGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EY80JQ U 1
AF RS1E104JQ U 90
BS 1 150 RS1EY80JQ
BS 151 151 RS1E104JQ
BS 152 159 RS1EY80JQ
BS 160 160 RS1E104JQ
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BS 212 212 RS1E104JQ
BS 213 216 RS1EY80JQ
BS 217 217 RS1E104JQ
BS 218 419 RS1EY80JQ
BS 420 420 RS1E104JQ
BS 421 455 RS1EY80JQ
BS 456 456 RS1E104JQ
BS 457 482 RS1EY80JQ
BS 483 483 RS1E104JQ
BS 484 502 RS1EY80JQ
BS 503 503 RS1E104JQ
BS 504 611 RS1EY80JQ
BS 612 612 RS1E104JQ
BS 613 680 RS1EY80JQ
BS 681 681 RS1E104JQ
BS 682 695 RS1EY80JQ
BS 696 696 RS1E104JQ
BS 697 741 RS1EY80JQ
BS 742 778 RS1E104JQ

RD RS1EY80JQ 741 0 0
GATTCTCAAATGTAATTACCAAAAATAAGATCTCAAAAAGGGAACTACATTGTGATGGAG
TTTCGTTCTCTCAACTGTAAATCAAAGCTCAAATCAAACCAATCCACAGAAACATGAACA
GTCATAGCCTATTTTTTTCTTTTATTACCAGTAAGAAACGGAGCAAAGAGAATGCAAGTG
CTCGCTCTTACACGACTAACAATGTCTTGCT*GAAGGGAAATTAAAAAAAAAATGAAGGA
GATGAGAGATGGAACAGACCTCACTCTTCCTGACATAATTCATCGAGCAGCTTCTCTGTT
GCTTTATCAACCTTCACCTTCTCCATCTTCAGGCGCTGGCGCATAGCAGGATGGCTCTTT
CCAGCTGCTGCATATGTTCTTATCAATGATTCAAACGTCTCCGCGGCTACATCATCCGTT
CCCTTCTTTAAAATCTACACCAAACTCTCAGCTCCTTTAACATCTTTCTTTTCCTCGAAC
TGGCTCATCAAACTTCTGACTGTTTCCTCTGACGGTAGCCACTTACCACCATCTCCTTTC
CCGATAGAAGCTGCCTTAGTCATACACTCAAGTGCTTGAGCCGTATCACCGCTCTTTACA
TAGTAATCCATGAAGAGCTCCCATGTTTTAGCATTGAGCTTTCCACCTCTTCTTGGAGAT
TTCTCCTTGAGCTCATTTGCTTTTTCGATGAGACCTTCTCTGGCATAAGCTCCAATCATC
ACATTTACAACCCGGATGTCG

QA 1 741 1 741
DS 

RD RS1E104JQ 689 0 0
CAG
ATCAAACCAATTCACAGAAACATGAACAGTCATATCCTATTTTTTTCTTTTATTACCAAT
AAGAAACAGAGCAGAGAGAATGCAAGTGCTCGCTCTTACACGACTAACAATGTCTTGCTT
GAAGAGAAATTAAAAAAAAAATGAAGGAGATGAGAGATGGAACAGACCTCACTCTTCCTG
ACATAATTCATCGAGCAGCTTCTCTGTTGCTTTATCAACCTTCACCTTCTCCATCTTCAG
GCGCTGGCGCATAGCAGGATGGCTCTTTCCAGCTGCTGCATATGTTCTTATCAATGATTC
AAACGTCTCTGCGGCTACATCATCCGTACCCTTCTTTAAAATCTCCACCAAACTCTCAGC
TCCGTTAACATCTTTCTTTTCCTCGAACTGACTCATCAAACTTCTGACTGCTTCCTGTGA
CGGTAGCCACTTACCACCATCTCCTTTGCCGATAGAAGCTGCCTTAGTCATACACTCAAG
TGCTTGAGCCGTATCACCGCTCTTTACATAGTAATCCATAAAGAGCTCCCATGTTTTAGC
ATTGAGCTTTCCACCTCTTCTTGGAGATTTCTCCTTGAGCTCATTTGCCTTTTCGATGAG
ACCCTCTCTGGCATAAGCTCCAATCATCACATTTACAACCCGGATGTCGTAAGCGGAACA
GTTCGCTTGCCATTCCTTGAACAGTG

QA 4 689 4 689
DS 



AS 1 2

CO CL8499Contig1 899 2 4 U
GATGACCCGTAATAGTTGACTTAGCGACGGTGATGGCGATATTTTTCTAGGGCCTCATGC
GGTTTCAAGGATGGGATCCGGGAATTCTTGGAGACATAAGGATTCGGGTCGATCCTTTAC
ATGATGAGTTTCTCATAATACAGATCTCGTCATTATTTGTCGAGCTTCTCTCATGGGTCA
AAGGGAGATCGTAGGTTTCCATGATTCAATAATGGAAAAGGAAGGTTGTAATCTGGGTGG
ATCTGAGAAGGTTTCTCGAATCGGAGAGTTAATGGAGTTAATCGGGGTACATGGTTGGCT
TAATTCTTATCTGGTGGAGACTTCTGGAAGATGTCCCTCTGAGGTGTTTCTTTGGTCTGA
GTGGATACATACAAGATCTGAGGTGTTCCTTACCGTTCTGGAGATGGAAAAGACAACATG
TAAGAAAATTCTTGAGCAAGGGTTGTATGCTATCTAACGGGGTGTTCGATATATTTGCAT
CAGAGGAGCTTGGTTTCCAGGTGGTATTATCGGACCTTGATTGGGAATGGGATTATAATA
GGATCTTTAAGACAGGAGATCAACCTGACGGGTGCTTCTGGGCGATCATGTTTGTTCTTG
GAATCCATAATTGGATGTATCAGGAAGCTGACGATAATTGTTACTTTAAATGGTGTCTGG
AAATATTTATTGTTGGGTGGAGTTTTTGGTTTCTGTTGTTCAATGAAACCACGGACTTCG
GCAGGAATAATGGCTTTTGTGCTTTCCATGATAATTGTGGTAATTTTAGTGAATTTATAT
GGAGTTTAAGGTACTGGAGTTTGGAACATCTTGTAATTTGGAAATATCATGATACCATTG
AATCTGTATCTCCTAGCTCAGATGGATCTTATTCAAGAATTTGTTATTTTTCTGTGTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 0 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1D425TF U 1
AF RS1D425JQ C 14
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DS 

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ATGGATCTTATTCAAGAATTTGTTATTTTTCTGTGTAC

QA 9 886 9 886
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1BE51JQ C 1
AF RS1BE51TF U 1
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DS 

RD RS1BE51TF 579 0 0
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TAAGCTGCAGAAGAGGAAACTGAGCGAGGCAGGTGAATCCATAGAGTACAGATGCCTTAT
TCGAGCTACTGATGCCAAGAAAACTATTTCTACTTCGGTTGGGGCTAAGGATCACCAGAG
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GAGGAAAGACCGTAAGAAATCAACAGAGGCAGACAAGAAAGAAAGCACTTCAACCTCTAT
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QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

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CTATATAAAACAATTAAAAAATCAGAGAGTTTGTTTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BJ23JQ C 1
AF RS1BJ23TF U 12
BS 1 11 RS1BJ23JQ
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RD RS1BJ23JQ 460 0 0
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TATTTTGTACTACTAGTAAAAACACTTACGGAGGAGTCCTGAAAACGACACCAAAGACCT
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CTATATAAAACAATTAAAAAATCAGAGAGTTTGTTTTTTC

QA 1 460 1 460
DS 

RD RS1BJ23TF 449 0 0
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TCTTGACCTATATACATTTTCATCAAAACCATATATAGATGTAATTTTTCTATATAAAAC
AATTAAAAAATCAGAGAGTTTGTTTTTTC

QA 1 449 1 449
DS 



AS 1 2

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CATTTACCGAGACTGGCAAAGCATTGGCAGAAAAACTCTGCGAGAAATCTGAAGACAAAG
CTTTTTGCATTTCGAGCCTAACCTCGCGTCACGAAGCAGAAACCGCGTCCGCACCAAAAC
TAGGCGTGATTGCATTAAGCGTTGCATCTACAAATGCTTCAGACACATCTTTCTACATCA
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CTAAGAATTACTTAGACGCAGTCGCACAACTCGATGATTCTCTTGCCGCTTTACTCGCGA
ATGCGTACATTGACGTCGATATTTGGCTCAACACGGCTATTAGCGATGGAGAGGCTTGTG
AAGACGCTTTGAGCGAACGTACGTGCTGGTAATGACGCTGAGCTTGCTCGTAGGAACACT
AACTTCTTGAAGCTTTGCAAGGACGCTCTTCTTATC


BQ
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AF RS1CU62JQ C 1
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AACTTCTTGAAGCTTTGCAAGGACGCTCTTCTTATC

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TTCTCTTTTTCCTCTCCATCGTCGTCACAGTTGTCATCGCTGGAAAAGCTCCACCACCAA
CATTTACCGAGACTGGCAAAGCATTGGCAGAAAAACTCTGCGAGAAATCTGAAGACAAAG
CTTTTTGCATTTCGAGCCTAACCTCGCGTCACGAAGCAGAAACCGCGTCCGCACCAAAAC
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AACTTCTTGAAGCTTTGCAAGGACGCTCTTCTTATC

QA 1 576 1 576
DS 



AS 1 2

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CCACTTCTTCTCTTCCGCTTCCTACAGCCGCACCAGATCAGAGATCTTCGCCGGCGATGG
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CCAACTACTACAAGATGCGTCTCCTTGTTAAGAATCTTCGCCCTCACTTTCTCGAGGTAC
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TTCAAGCTGACGCAGAGGTAGAGGCTCAACACCACCATAACACCCAATTATAAAGGTTTC
TGTTGGCCTTCCTGCTGTTAATGTTGTTTGTTTAAATATTTACATGGACTCTTGGTGTCC
GTACGTCCCATTATGTTGTATCAACTGAAAACCAATGGGAGTAGCTTCTACTCTTACCAT
GAATGTTTAATTAGTACAATACTACAATGTTTAACG


BQ
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GCACCGATGCTGTTTACTGTGGACTCTCCAAGGAAGAATACAGAACCTCTCACCCTATTA
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TCAGAAACTGCAAGGCAGCATTCGAAATTCAAGAGAAGATAAAGCTTTTGCTTCAACTGC
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CCAACGGCAAGGCACTCAATCAAACACCTGAGGCAAGCTCTGTTGTTGGTGACAACAAGG
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ACTGTGGACTCTCCAAGGAAGAATACAGAACCTCTCACCCTATTATTCAAGCTGACGCAG
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ACAATACTACAATGTTTAACG

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

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TTAGGTTAACATTAATTAGTTGGTTTAGTTAGGGTTAGAGTAATAATTTATGTATTATTG
GTTTAGTGTTGTAAACCAAAATTTATTGTAAACCGAATTTAATTTATAA


BQ
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AF RS1E482TF U 1
AF RS1E482JQ C 1
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QA 1 234 1 234
DS 

RD RS1E482JQ 529 0 0
GTTTACATTTTACATCACTCCCTTATTGTATTTACTCCAGTCGATAAGATAACATTATTT
ACATTTTACATCACTCCTTTATTGTATTTACTCCAGTCAATAAGGCAAACCAAATAAAAA
GGTTATTTTTTTTTTTTTTTGAAAGAATGTTAAATTGTATTCCTCAAAAAAAGCCTTTGT
ACAAAATGTTTTTGCTACCCCAAATTAAACAGGAAAACTACACAATCTGAAAAACCAGAT
AGAAAACATCACACTCTGCGTTGATACCACTGCTTAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTGG
TTTGTTGGTGGTTCGTGGATGGTGGCTGAAGTTTTCTGAAGGTGGCGATGGTGGCTAAAG
CTTTGTGAAGATGGAGGATGGTGGCTGAAACGTAGATTTAGGTTTAGTTAACTGGTTTAA
TTAGGTTAACATTAATTAGTTGGTTTAGTTAGGGTTAGAGTAATAATTTATGTATTATTG
GTTTAGTGTTGTAAACCAAAATTTATTGTAAACCGAATTTAATTTATAA

QA 1 529 1 529
DS 



AS 1 2

CO CL8505Contig1 1066 2 2 U
TCTTTATTGTTTTCCCTCTACTGCTTCATCTTCTTGTTAATGCATGTCCAAGACTCTCCG
GTAATGAAAGAGATCTCACGGCGGAGCAAGAAGACTTCTGTTGATGATAAAACAGGAGAT
GAGCCATCTGCATCATCAGTAGTCCCTAAAACTAAACGAAAACGCCGATCGCAACCGCGA
GACGCTCCTCCACAACGCAGCTCTATGCATAGAGGAGTCACCAGGCATAGATGGACTGGG
TGGTACGAAGCGCATTTGTGGGATAAGAATAGTTGGAACGAGACACAGAGCAAGAAAGGA
AGACAAGTATATTTAGGTGCGTATGACGAGGAAGATGCAGCAGCACGTGCCTACGACTTA
GCAGCATTGAAATATTGGGGACGCGACACAGTCTTGAACTTCCCTCTGTGTAATTATGAA
GAAGACATCAAAGACATGGAAAGCCAGTCGAAGGAAGAGTATATTGGATCTCTAAGAAGG
AAAAGTAGTGGGTTTTCACGTGGTGTGTCAAAATACAGAGGCGTTGCAAAGCATCACCAT
AATGGGAGATGGGAAGCTCGAATTGGAAGAGTGTTCGGCAATAAGTATTTATACCTCGGA
ACTTATGCTACACAAGAAGAAGCGGCCATTGCGTATGACGTGGCAGCAATCGAGTACCGT
GGACTTAACGCCGTTACTAACTTCGACATAAGCCGTTATCTCAAATTGCCGGCGCCGGAG
AACCCCATCGACGCCGCGAATACTCCGCATTCCGATCCGAGCCCCTTTATAAACCCCGAC
CACCACGACTCGTCGGCATTGTCGCAGAGCCAATCCTCGTCCGACGACAACGACGATGAC
CGGAAAACAAAGTTGTTAAAGTTTTTTTCGCCTTGCTCGAACGCAGAGGAGGTGATCGGA
CCAGCGACGCCGCCGGAGATCGCTCCGTCTCGCCGGAGCTTCCCGGACGATATACAGACG
TATTTCGGGTGTCAAGACTCCGGCAAGGTGGGGGACGATGACGTCATATTCGGTGGTTTA
GATTCTTTCCTCACGCCTGATTTTTACAGCGAGTTTAATGATTGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EJ61TF U 1
AF RS1EJ61JQ C 278
BS 1 704 RS1EJ61TF
BS 705 1066 RS1EJ61JQ

RD RS1EJ61TF 704 0 0
TCTTTATTGTTTTCCCTCTACTGCTTCATCTTCTTGTTAATGCATGTCCAAGACTCTCCG
GTAATGAAAGAGATCTCACGGCGGAGCAAGAAGACTTCTGTTGATGATAAAACAGGAGAT
GAGCCATCTGCATCATCAGTAGTCCCTAAAACTAAACGAAAACGCCGATCGCAACCGCGA
GACGCTCCTCCACAACGCAGCTCTATGCATAGAGGAGTCACCAGGCATAGATGGACTGGG
TGGTACGAAGCGCATTTGTGGGATAAGAATAGTTGGAACGAGACACAGAGCAAGAAAGGA
AGACAAGTATATTTAGGTGCGTATGACGAGGAAGATGCAGCAGCACGTGCCTACGACTTA
GCAGCATTGAAATATTGGGGACGCGACACAGTCTTGAACTTCCCTCTGTGTAATTATGAA
GAAGACATCAAAGACATGGAAAGCCAGTCGAAGGAAGAGTATATTGGATCTCTAAGAAGG
AAAAGTAGTGGGTTTTCACGTGGTGTGTCAAAATACAGAGGCGTTGCAAAGCATCACCAT
AATGGGAGATGGGAAGCTCGAATTGGAAGAGTGTTCGGCAATAAGTATTTATACCTCGGA
ACTTATGCTACACAAGAAGAAGCGGCCATTGCGTATGACGTGGCAGCAATCGAGTACCGT
GGACTTAACGCCGTTACTAACTTCGACATAAGCCGTTATCTCAA

QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1EJ61JQ 789 0 0
ACGAGACACAGAGCAAGAAAGGAAGACAAGTATATTTAGGTGCGTATGACGAGGAAGATG
CAGCAGCACGTGCCTACGACTTAGCAGCATTGAAATATTGGGGACGCGACACAGTCTTGA
ACTTCCCTCTGTGTAATTATGAAGAAGACATCAAAGACATGGAAAGCCAGTCGAAGGAAG
AGTATATTGGATCTCTAAGAAGGAAAAGTAGTGGGTTTTCACGTGGTGTGTCAAAATACA
GAGGCGTTGCAAAGCATCACCATAATGGGAGATGGGAAGCTCGAATTGGAAGAGTGTTCG
GCAATAAGTATTTATACCTCGGAACTTATGCTACACAAGAAGAAGCGGCCATTGCGTATG
ACGTGGCAGCAATCGAGTACCGTGGACTTAACGCCGTTACTAACTTCGACATAAGCCGTT
ATCTCAAATTGCCGGCGCCGGAGAACCCCATCGACGCCGCGAATACTCCGCATTCCGATC
CGAGCCCCTTTATAAACCCCGACCACCACGACTCGTCGGCATTGTCGCAGAGCCAATCCT
CGTCCGACGACAACGACGATGACCGGAAAACAAAGTTGTTAAAGTTTTTTTCGCCTTGCT
CGAACGCAGAGGAGGTGATCGGACCAGCGACGCCGCCGGAGATCGCTCCGTCTCGCCGGA
GCTTCCCGGACGATATACAGACGTATTTCGGGTGTCAAGACTCCGGCAAGGTGGGGGACG
ATGACGTCATATTCGGTGGTTTAGATTCTTTCCTCACGCCTGATTTTTACAGCGAGTTTA
ATGATTGCT

QA 1 789 1 789
DS 



AS 1 2

CO CL8506Contig1 618 2 1 U
GATGGATGTTAACAGAGAGAACTACGAGTTGGGTCTACCGATCATCGAGGAAGCTGGCGT
TGCTCACAAGATCGACTTCAGGGAAGGCCCTGCTCTTCCTGTTCTTGATGAACTCGTTGC
TGACGAGAAGAACCATGGAACATATGACTTTATATTCGTCGATGCTGACAAAGACAACTA
CATCAACTACCATAAACGTTTGATTGATCTTGTGAAAGTTGGAGGAGTGATCGGCTACGA
CAACACTCTTTGGAACGGCTCCGTTGTGGCCCCTCCTGATGCACCGATGAGGAAGTACGT
TCGTTACTACCGAGACTTTGTTCTTGAGCTTAACAAGGCTCTCGCTGCTGACCCTAGGAT
CGAGATTTGCATGCTTCCCGTTGGTGATGGGATCACTATCTGTCGTCGGATCAATTGATT
GATATCACACTTTTGAGTGTGGGTGGATTAACTTTCCTCCCTCTGTTTTTCAAATTGCTC
TTATCACCACCATTCACCAACCAACCAAAATGGACCGCTTTTATGTATTTTGTTTAGTAT
CTCCCCATTGTTCATTTGTGTTTTGCTTTCTTTGTGAACAGATAAATAATGTTCTCAACC
TTATATGATAAAACATCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1F018JQ C 1
AF RS1F018TF U 1
BS 1 618 RS1F018TF

RD RS1F018JQ 618 0 0
GATGGATGTTAACAGAGAGAACTACGAGTTGGGTCTACCGATCATCGAGGAAGCTGGCGT
TGCTCACAAGATCGACTTCAGGGAAGGCCCTGCTCTTCCTGTTCTTGATGAACTCGTTGC
TGACGAGAAGAACCATGGAACATATGACTTTATATTCGTCGATGCTGACAAAGACAACTA
CATCAACTACCATAAACGTTTGATTGATCTTGTGAAAGTTGGAGGAGTGATCGGCTACGA
CAACACTCTTTGGAACGGCTCCGTTGTGGCCCCTCCTGATGCACCGATGAGGAAGTACGT
TCGTTACTACCGAGACTTTGTTCTTGAGCTTAACAAGGCTCTCGCTGCTGACCCTAGGAT
CGAGATTTGCATGCTTCCCGTTGGTGATGGGATCACTATCTGTCGTCGGATCAATTGATT
GATATCACACTTTTGAGTGTGGGTGGATTAACTTTCCTCCCTCTGTTTTTCAAATTGCTC
TTATCACCACCATTCACCAACCAACCAAAATGGACCGCTTTTATGTATTTTGTTTAGTAT
CTCCCCATTGTTCATTTGTGTTTTGCTTTCTTTGTGAACAGATAAATAATGTTCTCAACC
TTATATGATAAAACATCT

QA 1 618 1 618
DS 

RD RS1F018TF 618 0 0
GATGGATGTTAACAGAGAGAACTACGAGTTGGGTCTACCGATCATCGAGGAAGCTGGCGT
TGCTCACAAGATCGACTTCAGGGAAGGCCCTGCTCTTCCTGTTCTTGATGAACTCGTTGC
TGACGAGAAGAACCATGGAACATATGACTTTATATTCGTCGATGCTGACAAAGACAACTA
CATCAACTACCATAAACGTTTGATTGATCTTGTGAAAGTTGGAGGAGTGATCGGCTACGA
CAACACTCTTTGGAACGGCTCCGTTGTGGCCCCTCCTGATGCACCGATGAGGAAGTACGT
TCGTTACTACCGAGACTTTGTTCTTGAGCTTAACAAGGCTCTCGCTGCTGACCCTAGGAT
CGAGATTTGCATGCTTCCCGTTGGTGATGGGATCACTATCTGTCGTCGGATCAATTGATT
GATATCACACTTTTGAGTGTGGGTGGATTAACTTTCCTCCCTCTGTTTTTCAAATTGCTC
TTATCACCACCATTCACCAACCAACCAAAATGGACCGCTTTTATGTATTTTGTTTAGTAT
CTCCCCATTGTTCATTTGTGTTTTGCTTTCTTTGTGAACAGATAAATAATGTTCTCAACC
TTATATGATAAAACATCT

QA 1 618 1 618
DS 



AS 1 2

CO CL8507Contig1 758 2 6 U
GGAGGGTACTTCACCGGATCCAAGCTATTCAGGTATGGAAGTGGTTGCTCTCAGGTCAAT
GGAGACGCAGAGACAACAGTCATGGACTGAGACGCTTCTCTTCCTCGTTGGAAGGAATCT
GGCTTGTCTGCTCCTCGCGGCAGAATCTTTGCTGATAGGGTTGATTACTGAAGATCAGAG
GCTTTCTGTGAAGGAGGGCTACAAAAAAGGACGCCGAGATGAGGAAAACAAAGATACCAG
TGACTCTGGTGATGATGACGATGATGATGAAGACAACGTTGATGAAGACGATGATGATGA
TGATGCTAATGATGAAGATTTTTCAGGGGATGAAGGAGAGGAAGGTGATCCGGAGGATGA
CCCCGTGACCAATGGTGGAGGAGGTAAGGATGATAATGACGATGATGATAACGACGGTGA
TGAGAGTGAAGATGACGATGAAGATGATGATGATGGAGATGAGGACGACGAAGATGAGGA
TGAGGATGATGAGGATGAAGATGTCCCCCAGCCCCCTGCTAAGAAGAGAAAATGAAACAT
GAGAAAGAGGAGAGTGTCAAAGACTTGAAGAGGACCATACGTGTGTGTTTAAGTAGTGTA
GGGAAACTTATGCTTCATGTTGTGTACTATCTGTTGTCGGGTGTGACTTTTCAACTTGGA
TTTAGTTATCTTCTCTGTGTAGACTGTTGGTCTTTTCTTTTTGTTTTTGCGTCTACCTAT
GACTATGATTCGCCGTGCTTAACATTTTCTTTGTTGTT


BQ
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AF RS1F395TF U 1
AF RS1F395JQ C 135
BS 1 506 RS1F395TF
BS 507 507 RS1F395JQ
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RD RS1F395TF 697 0 0
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GGAGACGCAGAGACAACAGTCATGGACTGAGACGCTTCTCTTCCTCGTTGGAAGGAATCT
GGCTTGTCTGCTCCTCGCGGCAGAATCTTTGCTGATAGGGTTGATTACTGAAGATCAGAG
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GGGAAACTTATGCTTCATGTTGTGTACTATCTGTTGTCGGGTGTGACTTTTCAACTTGGA
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CTTC

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AGGGCTACAAAAAAGGACGCCGAGATGAGGAAAACAAAGATACCAGTGACTCTGGTGATG
ATGACGATGATGATGAAGACAACGTTGATGAAGACGATGATGATGATGATGCTAATGATG
AAGATTTTTCAGGGGATGAAGGAGAGGAAGGTGATCCGGAGGATGACCCCGTGACCAATG
GTGGAGGAGGTAAGGATGATAATGACGATGATGATAACGACGGTGATGAGAGTGAAGATG
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TGTCAAAGACTTGAAGAGGACCATACGTGTGTGTTTAAGTAGTGTAGGGAAACTTATGCT
TCATGTTGTGTACTATCTGTTGTCGGGTGTGACTTTTCAACTTGGATTTAGTTATCTTCT
CTGTGTAGACTGTTGGTCTTTTCTTTTTGTTTTTGCGTCTACCTATGACTATGATTCGCC
GTGCTTAACATTTTCTTTGTTGTT

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

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TAATGTCTGTAGTATACC


BQ
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AF RS1DJ46JQ C 1
AF RS1DJ46TF U 1
BS 1 618 RS1DJ46TF

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GAAACGGTTGAGCTGAAGGAAGGACCTCTAGAACAGTTCACACATGAGATGGAACCCTTT
CTTAGGAAGCAGGGTATGCCTGTTCGTCTTAACAAAGGTACGGTGGAGTTACTCTCCGAC
TTTGTAGTTTGTGAAGAAGGGAAACCTCTTTCGCCAGAATCTTCTCGCATTTTGCGTCTG
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TTTGAGCTTTACAGAGAAGGCTTGGATCTCTCTGATGTTGAAACCTCTTGAAAAAGCCAA
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TTGTTCTATTTGGTTCTCTGGTTTGCACTTGGATGCTTTTATGTCAAAGTTTTGTTGCTT
TAATGTCTGTAGTATACC

QA 1 618 1 618
DS 

RD RS1DJ46TF 618 0 0
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CTAAATCAAAGAGAGACAGACCAGTTACTTTGTCAAAGACAAAGAAGAAAGGAAGAGGTC
GAAAGCTTATTTAACGCTTATGAGGATTCAGACTTTTCAAGAACCGGAAGCACTGCTGTA
GAAACGGTTGAGCTGAAGGAAGGACCTCTAGAACAGTTCACACATGAGATGGAACCCTTT
CTTAGGAAGCAGGGTATGCCTGTTCGTCTTAACAAAGGTACGGTGGAGTTACTCTCCGAC
TTTGTAGTTTGTGAAGAAGGGAAACCTCTTTCGCCAGAATCTTCTCGCATTTTGCGTCTG
TTGGGAATCAAGTTGGCTACTTTCAAACTCAACTTAGTCTGCAGATGGAGCCCTAGTGAC
TTTGAGCTTTACAGAGAAGGCTTGGATCTCTCTGATGTTGAAACCTCTTGAAAAAGCCAA
GATTTTGATGATCAACTCTTTTAAGTTTCTGAATATCGTATTATTCACATGCGTTCTGCT
TTGTTCTATTTGGTTCTCTGGTTTGCACTTGGATGCTTTTATGTCAAAGTTTTGTTGCTT
TAATGTCTGTAGTATACC

QA 1 618 1 618
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8510Contig1 982 2 2 U
GTAATATTCAAAGAGAACAGAAATATTTAATTAAAGAATAATTTGAAAACAAATCTTTGT
TTCTCACGACCAAAGAACAAAACAAATACTAGACCACAGCTTCTTTCTTTCTTCTTCTTC
TTCATCTATATCTACAACACATTCTTGCAAAAAGTAACAAATGTAAACCCTTTTTTCTTT
TCTTGTCATTATGTAATGAACACAGTGAAGGAGTCTTAAGAGGAGGTATATAACCATCTC
TTGATCCGTGGGAACCAAACCTTTTTCACCAACCGATCTCACAAGCAGTCCAAACCGCAG
ATCTCAAGAACAGGACCACCTTTCGCCACAAACGGATTAACTCTAACCCAAAGAAGTGTA
AGAATAGAAGCAATGAGGATGGACCAGACGATGATAATGGTCGGCATTCTATCTTGTTTC
CCAAGCAAACCTTTAAGGAAAGGGTAAAGATGAATGACCACCCAAAGTGCAAAGAACAAT
CTCCCAAAAAGAGGTCCCCATGAGTCGTATCCATTGCTTATAGCATCAGAGATTCCGACC
ACGATTCCAATCATGTTTATGATGAGGAGAGTCGTTGGAGGGATGAGAAGCGAAGTCCAT
TTGAAGAGGTAAAGGTCTGAGAACTCTCCGTCATCAGCTGCTTTTGACGTGACCGTGAAG
TTAGTGTCCACACCAGCAAGAACCTTGAGAAGACCTTGGAAGAGAGCAAAGAGATGCGCA
GAGACACCTCCTATGACCCAAAACTGTTCATTTCTCCACCAATCATCGATCCCAACTTTG
CCCCATTGCATCTCCAGGATACCCGCTATAGCAATGGACGAGAAGAGGGCCATGAAGAGG
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GGGAGAGAACAGTAAACGATGAGAGGGAGAGAGGTCCATGGATAAACCACAGAGTTGATG
TATGACAACCTCTCAAGCCGCT


BQ
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AF RS1FU47JQ U 1
AF RS1BP32JQ U 185
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BS 803 982 RS1BP32JQ

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TTGATCCGTGGGAACCAAACCTTTTTCACCAACCGATCTCACAAGCAGTCCAAACCGCAG
ATCTCAAGAACAGGACCACCTTTCGCCACAAACGGATTAACTCTAACCCAAAGAAGTGTA
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CCAAGCAAACCTTTAAGGAAAGGGTAAAGATGAATGACCACCCAAAGTGCAAAGAACAAT
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CCCCATTGCATCTCCAGGATAC

QA 1 802 1 802
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TCCGTGGGAACCAAACCTTTTTCACCAACCGATCTCACAAGCAGTCCAAACCGCAGATCT
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GCAAACCTTTAAGGAAAGGGTAAAGATGAATGACCACCCAAAGTGCAAAGAACAATCTCC
CAAAAAGAGGTCCCCATGAGTCGTATCCATTGCTTATAGCATCAGAGATTCCGACCACGA
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ACAACCTCTCAAGCCGCT

QA 1 798 1 798
DS 



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TTTCTCTTATGTGTTCTCTCTCTCTCATC


BQ
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AF RS1F243TF U 1
AF RS1F243JQ C 69
BS 1 660 RS1F243TF
BS 661 661 RS1F243JQ
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CCCGCCTTGTACATCTTGCTTACAATCTCAGAGAACTCGACATATCTAGAAGCAGATGGG
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TAACCTCAATCTCTTTATGGGGCATGACCGCCATTACTGATTCTGGCGTTGTTCAACTGG
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CCCTTTTCGCCATTGCGGAACGCTGCCATCATCTCAAGACAATCAGCATGTGGTGTTGCC
GCCATGTGACAGAGAGAGGCCTTCTTGTTCTTGTCAACAAATGCAGAAAACTAGAATCTC
TCAACTTGTGGGGAACTAGAGTTCCTGTGGATTGCTTCATTGCTTTGCTTACCATCAGTC
CTGCACTTCAGATCAAACCCATTCAACTCCTCCTCAATGCTCAGAATCCACCACCTTTGT
*GCATGCTCTCTAGTCTTT**GTGCTTTGTATATAGTA
TCATAAACTGGATCT

QA 1 698 1 698
DS 

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GTAACTGATAATGGTCTTTACCAAATAGCTTCCGCTAGATGTGTAGCCAATTTAACCTCA
ATCTCTTTATGGGGCATGACCGCCATTACTGATTCTGGCGTTGTTCAACTGGTATCAAGA
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GCCATTGCGGAACGCTGCCATCATCTCAAGACAATCAGCATGTGGTGTTGCCGCCATGTG
ACAGAGAGAGGCCTTCTTGTTCTTGTCAACAAATGCAGAAAACTAGAATCTCTCAACTTG
TGGGGAACTAGAGTTCCTGTGGATTGCTTCATTGCTTTGCTTACCATCAGTCCTGCACTT
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CTCTAGTCTTTTGTTGCTTTGTATATAGTAATTCATAAAACTGGAATCTCCATTTCTCTT
ATGTGTTCTCTCTCTCTCATC

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

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TTTGTTTCTTGGTGTACCACCACCACCACCTCTTGCGGATGATGGTGTGTTTGGTTGTGT
TGTGTTCTTGCGGTTTATAGATTTTGTGACCGAGGCAGCATTGTCGTTGTTTTGTTCTTT
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CR22JQ U 226
AF RS1CR22TF C 1
BS 1 225 RS1CR22TF
BS 226 331 RS1CR22JQ
BS 332 707 RS1CR22TF

RD RS1CR22JQ 106 0 0
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GGTACCACCACCACCACTTGATGGACTCTGCGGCTTGACTCTGGCT

QA 1 106 1 106
DS 

RD RS1CR22TF 707 0 0
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AAATAAATAAATGACAGGCGCTTACAAATGCTGCACAAATGAATTAAAATAGTAAATACC
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GAACCGTCTTGGTTTAGGCAATGCAGGTGAATTCGTCGTATAAGAGAGGCGTTTCTTAGC
CGATGATCCCTCCTTGTCTGCAAAGCCATCGCTCTCCTGCTGTGTGGTACCACCACCACC
ACTTGATGGACTCTGCGGCTTGACTCTGGCTCTAGCTGATTTAGTCGGAACCATATAGCT
CGGGAGAGTCTGCGAGCAGGTAAGGCTCTCGTCGTCTCTTACTGACGAACCAGCGATGCT
GTGTCTACGGTTCCTCTCGGACAGAACCGAGATTGTGCTTTTGGCGTCGTCGTCCTCGTC
TTTAGATTTTCCGGAGGAAGGGTTTAGTCTCGAGGGAGTTGGAGGAGAGAAGAAACTGTT
TTTGTTTCTTGGTGTACCACCACCACCACCTCTTGCGGATGATGGTGTGTTTGGTTGTGT
TGTGTTCTTGCGGTTTATAGATTTTGTGACCGAGGCAGCATTGTCGTTGTTTTGTTCTTT
CTCGGAACTGTTGTTGTCTAATGGCCGACCAGCCATCCATCTCTCTA

QA 1 707 1 707
DS 



AS 1 2

CO CL8513Contig1 698 2 5 U
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AAAACATTTTCTGGTCTTGTTACAAAAAAAGCATTTTCAAATCACCAGACTGAGATGAAC
ACAAGAACAAGAATAGTGAGTGATAGCGTAGAGAGAGAAGCCAAGCTTCTTCTTGCAGAG
TTTGGTAGAAAAGGGTAAGAATCTGGTGAAGGTAACATACACTCATCGCCATTAAAGTAA
ACTTTCCTCGGAAAAGCCCAACCTTGCTTGAAAGTAAATGTCCTCTGATCTTTCTGCAGC
AACACCTCTGATTGCACATTCCCTGAAGGCCCCGCTTCCATCAAAAGATCATTATAAAAC
TTAGTTCCAAAGAACATTCCAGTATCATTTATGGATCCATAAGGAGCAACTGATTTGTAA
TCAAAGCTGAAAACTTGAGTCACGTTGTTGAGATTCGGGTGCTGAACTGCTAAAGTCCAC
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TTGTAATTAGTTTTAACGTGCCAGTGAACTCTGATCGGGCACATGTGGTGTGTACATTGT
AGCAACGGAGCGTTGTCTTTTCTCGGTGTGTTGAGTCC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EM04JQ U 1
AF RS1DX82JQ U 1
BS 1 213 RS1DX82JQ
BS 214 214 RS1EM04JQ
BS 215 573 RS1DX82JQ
BS 574 574 RS1EM04JQ
BS 575 698 RS1DX82JQ

RD RS1EM04JQ 635 0 0
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AAAACATTTTCTGGTCTTGTTACAAAAAAAGCATTTTCAAATCACCAGACTGAGATGAAC
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TTTGGTA*AAAAGGGTAAGAATCTGGTGAAGGTAACATACACTCATCGCCATTAAAGTAA
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AACACCTCTGATTGCACATTCCCTGAAGGCCCCGCTTCCATCAAAAGATCATTATAAAAC
TTAGTTCCAAAGAACATTCCAGTATCATTTATGGATCCATAAGGAGCAACTGATTTGTAA
TCAAAGCTGAAAACTTGAGTCACGTTGTTGAGATTCGGGTGCTGAACTGCTAAAGTCCAC
AGCGTATGATTCATCCGGTAATTAAAGTTTGTTATAGCGATTTTCACGCGCCAATAGTCT
TTGTAATTAGTTTTAACGTGCCAGTGAACTCTGAT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1DX82JQ 698 0 0
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AACAAGAGTACAGAACGGTTCTGTCAGAACCATTACACATCTATAAACACAGTTACAAAA
AAAACATTTTCTGGTCTTGTTACAAAAAAAGCATTTTCAAATCACCAGACTGAGATGAAC
ACAAGAACAAGAATAGTGAGTGATAGCGTAGAGGGAGAAGCCAAGCTTCTTCTTGCAGAG
TTTGGTAGAAAAGGGTAAGAATCTGGTGAAGGTAACATACACTCATCGCCATTAAAGTAA
ACTTTCCTCGGAAAAGCCCAACCTTGCTTGAAAGTAAATGTCCTCTGATCTTTCTGCAGC
AACACCTCTGATTGCACATTCCCTGAAGGCCCCGCTTCCATCAAAAGATCATTATAAAAC
TTAGTTCCAAAGAACATTCCAGTATCATTTATGGATCCATAAGGAGCAACTGATTTGTAA
TCAAAGCTGAAAACTTGAGTCACGTTGTTGAGATTCGGGTGCTGAACTGCTAAAGTCCAC
AGCGTATGATTCATCCGGTAATTAAAGTTTGTTGTAGCGATTTTCACGCGCCAATAGTCT
TTGTAATTAGTTTTAACGTGCCAGTGAACTCTGATCGGGCACATGTGGTGTGTACATTGT
AGCAACGGAGCGTTGTCTTTTCTCGGTGTGTTGAGTCC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

CO CL8514Contig1 895 2 4 U
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TTCTTCGATTTCGCATCTCTCAGGTTGGAGCTATAGAGCGTGAGATCTATCCCGCAAAGA
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CGAACTGCTGCTTCTTCGTTGAACAGCCTTGTTCGTCCAGCATTTCGCAGTCTCTCTACA
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ATCATCCACAACATCGAGATGAACCCTGGCCAAGGCGCCAAGCTAGTCCGAGCTGCAGGA
ACAAACGCCAAGATCCTTAAGGAGCCTGCTTCAGGGAGATGCTTGATAAAGCTTCCATCA
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TCTCATGGAGTGAAGAAGCTGTATAAAGCAGGGCAGAGTAGGTGGCTGGGGATAAGGCCT
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GGAGGTTACAAGTCAGCTAGTGTCAAGAAGAAGAAGAAGAGATTGGCAGCTAGAGAAGCC
AAGATGTGATTCGTTTGATGAAGGGATGGTTTTAACTCTCAGGATTGTTTTAATGACATT
GTTGAATCTGTGAGAGTTTTAAGTTTAATAAATTCAGAACAATCGTTGATCCGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CQ25TF U 1
AF RS1CQ25JQ C 131
BS 1 724 RS1CQ25TF
BS 725 725 RS1CQ25JQ
BS 726 754 RS1CQ25TF
BS 755 895 RS1CQ25JQ

RD RS1CQ25TF 754 0 0
GGCTCTTCGATCAGAGCCGCGTCTTCTCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGAATCAAATT
TTCTTCGATTTCGCATCTCTCAGGTTGGAGCTATAGAGCGTGAGATCTATCCCGCAAAGA
CCCTACCTTTTTTATTACACTGCACTCCTAATGTCGGCCCTTGTGGCGCTATGCAGAGCT
CGAACTGCTGCTTCTTCGTTGAACAGCCTTGTTCGTCCAGCATTTCGCAGTCTCTCTACA
GGTTTTGGTGATGTGCAGAACAAAACACTTGTGGCAGAAATGGAAGAAAAGATGCTCCAC
ATGGACATCAACTCAATGATCGGAAGTTCCATACCACTAGGTATGATGCGCATAGGAACA
ATCATCCACAACATCGAGATGAACCCTGGCCAAGGCGCCAAGCTAGTCCGAGCTGCAGGA
ACAAACGCCAAGATCCTTAAGGAGCCTGCTTCAGGGAGATGCTTGATAAAGCTTCCATCA
GGGGACACCTGGTGGATCAACGCCAGATGCCGTGCTACTATCGGTACAGTGTCGAACCCG
TCTCATGGAGTGAAGAAGCTGTATAAAGCAGGGCAGAGTAGGTGGCTGGGGATAAGGCCT
AAAGTGAGAGGTGTGGCGATGAATCCTTGTGATCATCCACACGGTGGTGGTGAAGGGAAG
GGCAAAAGTAGTGGAAGCAGAGGAAGGACTTCGGTTAGCCCTTGGGGGAAACCGTGCAAA
GGAG*TTACAAGTCAGCTAGTGTCAAGAAGAAGA

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DS 

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ACTCAATGATCGGAAGTTCCATACCACTAGGTATGATGCGCATAGGAACAATCATCCACA
ACATCGAGATGAACCCTGGCCAAGGCGCCAAGCTAGTCCGAGCTGCAGGAACAAACGCCA
AGATCCTTAAGGAGCCTGCTTCAGGGAGATGCTTGATAAAGCTTCCATCAGGGGACACCT
GGTGGATCAACGCCAGATGCCGTGCTACTATCGGTACAGTGTCGAACCCGTCTCATGGAG
TGAAGAAGCTGTATAAAGCAGGGCAGAGTAGGTGGCTGGGGATAAGGCCTAAAGTGAGAG
GTGTGGCGATGAATCCTTGTGATCATCCACACGGTGGTGGTGAAGGGAAGGGCAAAAGTA
GTGGAAGCAGAGGAAGGACTTCGGTTAGCCCTTGGGGGAAACCGTGCAAAGGAGGTTACA
AGTCAGCTAGTGTCAAGAAGAAGAAGAAGAGATTGGCAGCTAGAGAAGCCAAGATGTGAT
TCGTTTGATGAAGGGATGGTTTTAACTCTCAGGATTGTTTTAATGACATTGTTGAATCTG
TGAGAGTTTTAAGTTTAATAAATTCAGAACAATCGTTGATCCGCT

QA 1 765 1 765
DS 



AS 1 2

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TCATAGGATACGCTGGAAACCATGTTCACGTCTCTCTCACCTCCTTCTTCATTGTCTTTC
TCTTTACTCGCCGTTAAAACTCCTCCGGTCGCCGCCGGGCATATCATTCCCCGTCGTGAT
ATCGTCTCTATGCGCATCAGGGCTAGCAAGAATGATTCTTCCGATCACTGTTTTCACGAA
AAGCTCAAATCTTTCGCCAAATCAGCGATTCTAATCGGCGCTGCTGTTTCCATGACCGGA
AAGTTCGCAACTTTACCGGCGATAGCGGAATCTCCGGTCGCGACGACCACCGAGGAAGTG
ACAGAAGAGAACACTTCGTCTGAGATTGAACCCACTTCGCCGTTGTCCGAGCTTCTAGAA
TCCACCCCAGAGGCGGTCAGAACGCTGAGATCGCTACTTCAGCAGAAGCTAGAGAACGGA
GAAGACGAAGAAGCTCTCAAGATCTTAGAGAGACTCGTAACCGCACAGCCAGATGAAACT
AACTGGATGTTTTTAATGGCGAGGCTATTGGGTGAGATGGGTCGTACCGAGAACGCACGT
CAAGTGTTCGAGGAAATTCTCCAGCGAAACCCGCTTTCGTTCGAGGCTTTGTTCGAGAAC
GCATTGCTCATGGACAGGTCCGGGGAAGGAGACGCGGTGCTGCAGAGGCTGGAAGATGCT
TTGGCTGTAGCTGAAGCTGAGAATATGGTGAAGGAGATTAGAGACGTGAGGCTGATCATT
GCGCAGATACAGTTCTTGCAGAAGAATGTGGATGAAGCGTTGAAGAGCTACGAGCAGCTG
ACGAGAGAGGATCCGAAGGATTTCAGACCGTATTTCTGTAGAGGTATGATATATAGTTTA
CTTGACAAGAATGTTGAAGCTAAGGAGCAGTTTGCTAAGTACAGAGAGCTTTCTCCAAAG
AAGTTTGAAGTTGAAGGGTATTTGAGGACGCCACTTTCTAAGATGAAGCTCTTTGGTAAT
GATGGAGATAACTGAGTGAAGTTAGGACAATAGCTCTTATATCTGAAGAATAAGACAAGG
AAGACAGAGATTGTTTTCCTGAGAGATTACGTTGGAGTTACTTATAAAGCGAAATGTTCT
TTTATGTTAAGTTAAAACTTATGAATTTGTGGTTTATTTTTTTTTATCCTGATTCTTATT
TGGTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DN16TF U 1
AF RS1DN16JQ C 360
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BS 616 616 RS1DN16JQ
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BS 658 1207 RS1DN16JQ

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TCTTTACTCGCCGTTAAAACTCCTCCGGTCGCCGCCGGGCATATCATTCCCCGTCGTGAT
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AAGTTCGCAACTTTACCGGCGATAGCGGAATCTCCGGTCGCGACGACCACCGAGGAAGTG
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TCCACCCCAGAGGCGGTCAGAACGCTGAGATCGCTACTTCAGCAGAAGCTAGAGAACGGA
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AACTGGATGTTTTTAATGGCGAGGCTATTGGGTGAGATGGGTCGTACCGAGAACGCACGT
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QA 1 657 1 657
DS 

RD RS1DN16JQ 848 0 0
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ATCCACCCCAGAGGCGGTCAGAACGCTGAGATCGCTACTTCAGCAGAAGCTAGAGAACGG
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TAACTGGATGTTTTTAATGGCGAGGCTATTGGGTGAGATGGGTCGTACCGAGAACGCACG
TCAAGTGTTCGAGGAAATTCTCCAGCGAAACCCGCTTTCGTTCGAGGCTTTGTTCGAGAA
CGCATTGCTCATGGACAGGTCCGGGGAAGGAGACGCGGTGCTGCAGAGGCTGGAAGATGC
TTTGGCTGTAGCTGAAGCTGAGAATATGGTGAAGGAGATTAGAGACGTGAGGCTGATCAT
TGCGCAGATACAGTTCTTGCAGAAGAATGTGGATGAAGCGTTGAAGAGCTACGAGCAGCT
GACGAGAGAGGATCCGAAGGATTTCAGACCGTATTTCTGTAGAGGTATGATATATAGTTT
ACTTGACAAGAATGTTGAAGCTAAGGAGCAGTTTGCTAAGTACAGAGAGCTTTCTCCAAA
GAAGTTTGAAGTTGAAGGGTATTTGAGGACGCCACTTTCTAAGATGAAGCTCTTTGGTAA
TGATGGAGATAACTGAGTGAAGTTAGGACAATAGCTCTTATATCTGAAGAATAAGACAAG
GAAGACAGAGATTGTTTTCCTGAGAGATTACGTTGGAGTTACTTATAAAGCGAAATGTTC
TTTTATGTTAAGTTAAAACTTATGAATTTGTGGTTTATTTTTTTTTATCCTGATTCTTAT
TTGGTACT

QA 1 848 1 848
DS 



AS 1 2

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AGCATACTATGAGCTTTGGTTTAGGCATCTCAACCAGCAACCGGTTTTCTATTTTATTTT
AATTTTATTCTGGTTTAAGACTTTGGGCATTTGTCAGCCTTTTATTTTATTTGAGAGTTG
GCCATTTGTTTAGGCCTTTTTGCCATCTTGAAACCCAATAAAGGGATGGCTATAAAACCT
TGTGATGGTGGCGATTTTGAGCTGTTTAAGTCTTTTATGAAATTGTTTTTGCCTTTGCAA
AGAAAACCCTAAGTCTTTCTAGTGTGAGAAGCAAGAGAGAGCAGCCTGAATCTTATCAAG
CTCCAACCACCAAGCTTGTGGCGATTCTTCATCCCATCAACCACCCATCGATTTGCCTTG
AGAGTGATACACATCCAGCAAGGCCAATCCCATCTCCTACTCATCATCCATCCACTGATC
TGTTGAGAGAGACACACATCCAGCAACAGATTCCATCACAATCTCTATCCCTTTTTATTT
CTCTTGTTTTTATTTCTGTTTGCATCTTTTGTTTGATTCATTTTTATAAATCTAAAATCC
ATAAAAAATCATCTCTGTTTCTGTTCTTATTTTATTTTCATAGTTTTACTTCCTGTTCTT
CATTTTTATAAAACTATAAAACTCATAAAAAGTTTCTTTTGTTTCAGGTACAGTTTTGGG
CAGTTTTGATCCAAGCATCAAGTCCTTTCAAAACCAGTACCAAAATCGACCAGAATCTTA
TCATCAAAGCCACTATTTTGCAGCCTGGTTCCCAGCCTATAACATTTGGTATCAGAGCTA
AAGGCTCCAAAAGATTTGGTTATTCCTATCCTTTAGTTCATTTTGTTGTCTGTTTTGCAT
TTGCATCTTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AATTTTATTCTGGTTTAAGACTTTGGGCATTTGTCAGCCTTTTATTTTATTTGAGAGTTG
GCCATTTGTTTAGGCCTTTTTGCCATCTTGAAACCCAATAAAGGGATGGCTATAAAACCT
TGTGATGGTGGCGATTTTGAGCTGTTTAAGTCTTTTATGAAATTGTTTTTGCCTTTGCAA
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CTCCAACCACCAAGCTTGTGGCGATTCTTCATCCCATCAACCACCCATCGATTTGCCTTG
AGAGTGATACACATCCAGCAAGGCCAATCCCATCTCCTACTCATCATCCATCCACTGATC
TGTTGAGAGAGACACACATCCAGCAACAGATTCCATCACAATCTCTATCCCTTTTTATTT
CTCTTGTTTTTATTTCTGTTTGCATCTTTTGTTTGATTCATTTTTATAAATCTAAAATCC
ATAAAAAATCATCTCTGTTTCTGTTCTTATTTTATTTTCATAGTTTTACTTCCTGTTCTT
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CAGTTTTGATCCAAGC

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DS 

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GCCAATCCCATCTCCTACTCATCATCCATCCACTGATCTGTTGAGAGAGACACACATCCA
GCAACAGATTCCATCACAATCTCTATCCCTTTTTATTTCTCTTGTTTTTATTTCTGTTTG
CATCTTTTGTTTGATTCATTTTTATAAATCTAAAATCCATAAAAAATCATCTCTGTTTCT
GTTCTTATTTTATTTTCATAGTTTTACTTCCTGTTCTTCATTTTTATAAAACTATAAAAC
TCATAAAAAGTTTCTTTTGTTTCAGGTACAGTTTTGGGCAGTTTTGATCCAAGCATCAAG
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TTCCTATCCTTTAGTTCATTTTGTTGTCTGTTTTGCATTTGCATCTTTCG

QA 1 590 1 590
DS 



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BQ
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AF RS1C221JQ C 1
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BS 620 654 RS1C221JQ

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ACACAGATGCAAAGTCTGTTAGGGAACGCACTCAAGCCCGAGCACTTGGAGCCGCCGAGA
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AATGTGACTTGGCACAAAGGCCCGAGAATCGCAGTTTCTGTTTTGGATGAGATCTTTGCG
ACACAGATGCAAAGTCTGTTAGGGAACGCACTCAAGCCCGAGCACTTGGAGCCGCCGAGA
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TACAACTACTAGTATCAGGGAACGTGAACCGGTGAAGAATCTGGTTTCTTACGGTTTTTG
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DS 



AS 1 2

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ACAAGCCTTGAACTGAAACTAGTCCCCTCTTCACCATCATCACCACCAGCATCATCATCA
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ATAAATTAGGGGTTTAATTG


BQ
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AF RS1GS62TF U 1
AF RS1GS62JQ C 56
BS 1 674 RS1GS62TF
BS 675 860 RS1GS62JQ

RD RS1GS62TF 678 0 0
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TCCATTGGACAAGGATCGTCGGTGGCGCTCATGACTCGTGATCTCCTCGGAAGCGGCAGT
TGTCGAGGAGGAGGAGGCGATCAGTCGCTGGAGGTTGACCTCGACCTGCAAGTCCCCAAC
GGCTGGGAAAAGCGTCTCGACTTAAAGTCGGGAAAAGTGTATATGCAACAACGCAACTCA
ACGAGTTCGTCTCATCATCATCGTCGCGCAGAACAATCCAACCAAACTTTTCAAAGGCTT
CAAGATTTAAATTTTCCTAGCATATCTCCGGCGAGACCATTGTTAAGCCTCTTCGACGAC
ACAAGCCTTGAACTGAAACTAGTCCCCTCTTCACCATCATCACCACCAGCATCATCATCA
TCATCTTCTTCTCTGTATGGTGTATCATCAACCAGTTCGAGTTTTCAGAGCGTTTGCACA
CTCGACAAGGTGAAGTCCGCTCTTGAGAGGGCGGGGAGAGTCTCATCCGGGACGTTAAAG
AAACGCAAATCGTCAGAAGAGGAGGACGTTTGCGATCAAACCGCTTCCGCTGCCGCGTCG
TGTCCCGTGGCGGTTGGATGTCCAGGGTGCTTATCGTATGTATTGGTGATGAAGAATAAT
CCGAAATGTCCGAG
TGTC

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1GS62JQ 805 0 0
AAGATTCCATTGGACAAGGATCGTCGGTGGCGCTCATGACTCGTGATCTCCTCGGAAGCG
GCAGTTGTCGAGGAGGAGGAGGCGATCAGTCGCTGGAGGTTGACCTCGACCTGCAAGTCC
CCAACGGCTGGGAAAAGCGTCTCGACTTAAAGTCGGGAAAAGTGTATATGCAACAACGCA
ACTCAACGAGTTCGTCTCATCATCATCGTCGCGCAGAACAATCCAACCAAACTTTTCAAA
GGCTTCAAGATTTAAATTTTCCTAGCATATCTCCGGCGAGACCATTGTTAAGCCTCTTCG
ACGACACAAGCCTTGAACTGAAACTAGTCCCCTCTTCACCATCATCACCACCAGCATCAT
CATCATCATCTTCTTCTCTGTATGGTGTATCATCAACCAGTTCGAGTTTTCAGAGCGTTT
GCACACTCGACAAGGTGAAGTCCGCTCTTGAGAGGGCGGGGAGAGTCTCATCCGGGACGT
TAAAGAAACGCAAATCGTCAGAAGAGGAGGACGTTTGCGATCAAACCGCTTCCGCTGCCG
CGTCGTGTCCCGTGGCGGTTGGATGTCCAGGGTGCTTATCGTATGTATTGGTGATGAAGA
ATAATCCGAAATGTCCGAGGTGTCATACGGTTGTTGCTTTGCCTGCCGTGAAAAGGCCTA
AAATTGATCTCAACATATCGGTTTGAATGTTGTTCAAAAGAAAAAAAAAGACATATCGGT
TTGAATGGCCTGGGGGGGAAGATTGAATGTTTCTATTTTGTAGGTTCGAATTCTGTAAAT
CATATATAAATTAGGGGTTTAATTG

QA 1 805 1 805
DS 



AS 1 2

CO CL8519Contig1 1131 2 4 U
GGGTACAGGTGCACAGTTGGCTTTGCTTGTTCTTCTTGTCATATTAATGGCAATCATTGG
GACACTTTATGTTGGGAGAGGAGCTATTGTCACAACTTTTATAGTTTGCTATGCTCTGAC
GTCATTTATCTCTGGTTATGTGAGCGGTGGAATGTACTCAAGAAGTGGGGGTAAACACTG
GATCAAGTGCATGATCCTCACGGCTTCTCTCTTCCCATTCTTGTGCTTTGGGATCGGATT
CCTCCTAAACACAATCGCCATATTCTATGGATCTCTTGCTGCTATTCCCTTCGGAACAAT
GGTGGTCGTTTTCGTAATTTGGGGTTTCATTTCGTTCCCTCTTGCCCTCCTCGGGACGGT
CGTCGGTAGAAACTGGAGTGGTGCGCCAAACAATCCATGCCGAGTGAAGACAATCCCACG
TCCAATCCCTGAGAAAAAGTGGTACCTGACTCCATCAGTAGTCTCTCTTATGGGAGGTCT
CTTACCCTTTGGCAGCATCTTCATCGAAATGTACTTCGTTTTCACATCCTTCTGGAACTA
CAAGGTATACTATGTGTACGGGTTCATGCTGCTTGTCTTTTTGATTCTTGTTGTGGTGAC
CGTCTGTGTGACGATCGTGGGAACATACTTCTTGCTTAATGCCGAAAACTATCACTGGCA
ATGGACATCGTTCTTCTCAGCTGCTTCTACCGCAGTTTACGTCTACTTGTATTCCATCTA
TTACTACTACGTAAAGACAAAGATGTTTGGGTTTTTCCAGACCAGCTTCTACTTCGGATA
CACCTTGATGTTCTGTCTCGGCCTCGGAATCCTTTGCGGAGCTGTTGGATTCTTAGGATC
AAATCTGTTTGTTAGAAGGATCTATAGAAACATCAAGTGCGACTAGAGACATAAGGAACC
AGGAAAGAAAAAATGGAGTAAAGATGGATCGTGGAATGTTGTTGGTGGCAGTTGAGTCTG
AATTTTCTTACAAATTTAGATTATTAGACACATGGGAAAGTGGGATCAATGGAGGAGGTT
GTATGGTAATTGAAAATATTATATTTTTATTTGGCTTCTTTTTTTTTTTTTGCTCATGTC
CCTTTTTGGTAAAGTTGGATCTGCTATATTTTATTTAGGATTCAGAGAGAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BC07TF U 1
AF RS1BC07JQ C 450
BS 1 740 RS1BC07TF
BS 741 741 RS1BC07JQ
BS 742 755 RS1BC07TF
BS 756 1131 RS1BC07JQ

RD RS1BC07TF 770 0 0
GGGTACAGGTGCACAGTTGGCTTTGCTTGTTCTTCTTGTCATATTAATGGCAATCATTGG
GACACTTTATGTTGGGAGAGGAGCTATTGTCACAACTTTTATAGTTTGCTATGCTCTGAC
GTCATTTATCTCTGGTTATGTGAGCGGTGGAATGTACTCAAGAAGTGGGGGTAAACACTG
GATCAAGTGCATGATCCTCACGGCTTCTCTCTTCCCATTCTTGTGCTTTGGGATCGGATT
CCTCCTAAACACAATCGCCATATTCTATGGATCTCTTGCTGCTATTCCCTTCGGAACAAT
GGTGGTCGTTTTCGTAATTTGGGGTTTCATTTCGTTCCCTCTTGCCCTCCTCGGGACGGT
CGTCGGTAGAAACTGGAGTGGTGCGCCAAACAATCCATGCCGAGTGAAGACAATCCCACG
TCCAATCCCTGAGAAAAAGTGGTACCTGACTCCATCAGTAGTCTCTCTTATGGGAGGTCT
CTTACCCTTTGGCAGCATCTTCATCGAAATGTACTTCGTTTTCACATCCTTCTGGAACTA
CAAGGTATACTATGTGTACGGGTTCATGCTGCTTGTCTTTTTGATTCTTGTTGTGGTGAC
CGTCTGTGTGACGATCGTGGGAACATACTTCTTGCTTAATGCCGAAAACTATCACTGGCA
ATGGACATCGTTCTTCTCAGCTGCTTCTACCGCAGTTTACGTCTACTTGTATTCCATCTA
TTACTACTACGTAAAGACAA*GATGTTTGGGTTTT
CCAGACAGCTTCTAC

QA 1 755 1 755
DS 

RD RS1BC07JQ 682 0 0
CTCCATCAGTAGTCTCTCTTATGGGAGGTCTCTTACCCTTTGGCAGCATCTTCATCGAAA
TGTACTTCGTTTTCACATCCTTCTGGAACTACAAGGTATACTATGTGTACGGGTTCATGC
TGCTTGTCTTTTTGATTCTTGTTGTGGTGACCGTCTGTGTGACGATCGTGGGAACATACT
TCTTGCTTAATGCCGAAAACTATCACTGGCAATGGACATCGTTCTTTTCAGCTGCTTCTA
CCGCAGTTTACGTCTACTTGTATTCCATCTATTACTACTACGTAAAGACAAAGATGTTTG
GGTTTTTCCAGACCAGCTTCTACTTCGGATACACCTTGATGTTCTGTCTCGGCCTCGGAA
TCCTTTGCGGAGCTGTTGGATTCTTAGGATCAAATCTGTTTGTTAGAAGGATCTATAGAA
ACATCAAGTGCGACTAGAGACATAAGGAACCAGGAAAGAAAAAATGGAGTAAAGATGGAT
CGTGGAATGTTGTTGGTGGCAGTTGAGTCTGAATTTTCTTACAAATTTAGATTATTAGAC
ACATGGGAAAGTGGGATCAATGGAGGAGGTTGTATGGTAATTGAAAATATTATATTTTTA
TTTGGCTTCTTTTTTTTTTTTTGCTCATGTCCCTTTTTGGTAAAGTTGGATCTGCTATAT
TTTATTTAGGATTCAGAGAGAT

QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 2

CO CL8520Contig1 895 2 2 U
GCCGTGCCATCATGTCTGACGCTATGCGTGCTGCTGTTAAAGATGTTGCCAAGTACTTCC
CAACAGCAATTATTAGTGGTAGAAGCCGTGACAAGGTTTACGAATTGGTAGGACTAACCG
AACTCTATTACGCCGGTAGTCATGGGATGGACATCATGACTCCTGCAAATGCTAATGGCT
CCTCCCCTGAAGACACCAACTCTGACCAACAGGGTGAATAGGTAAACCTCTTTCAACCTG
CTAAAGAGTTCATACCGGTCATCGAAGAGGTTTATAGACCTCTCGTGGAGCTAACTAAAG
GTATCAAAGGTGCAAAAGTGGAGAACCACAAGTTCTGCGCTTCTGTGCATTACCGTAACG
TTGATGAGAAAGACTGGCCACTCGTTGCTCAACGTGTTCATGGCCACCTCAAATAATACC
CTCGTCTGCGTCTAACTCACGGCAGAAAGGTTTTAGAGGTTCGTCCTGTGATCGAATGGA
ACAAAGGGAAAGCAGTTGAGTTTCTGTTGGAATCTCTAGGATTAAGCAACGATGATGATT
TTCTTCCAATCTTCATAGGAGATGACAAGACTGATGAGGATGCGTTCAAGGTACTAAGGG
AGAAGAAGCAGGGATTTGGAATCTTGGTATCCTCTGTACCAAAAGAAAGCAATGCGTTCT
ACTCTCTTAGAGACCCCTCAGAGGTGAAGAAGTTTCTCAAGACTTTGGTGAAATGGAGAA
AGATGGAAGACACTACAAGTCATTGATGATTGTGTAGGAGTATCAGAAGAGCATCATTCA
AACTCTGCTTTCTATTTTTTTTTATCACATTTTAGTTTTTATGTCTTTAATAGTCTCTGC
TATTATATCTTTAATTGATCATTTTTCCATCTTTTCCATGAATTTAAGCTGTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BV70TF U 1
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CCTCCCCTGAAGACACCAACTCTGACCAACAGGGTGAATAGGTAAACCTCTTTCAACCTG
CTAAAGAGTTCATACCGGTCATCGAAGAGGTTTATAGACCTCTCGTGGAGCTAACTAAAG
GTATCAAAGGTGCAAAAGTGGAGAACCACAAGTTCTGCGCTTCTGTGCATTACCGTAACG
TTGATGAGAAAGACTGGCCACTCGTTGCTCAACGTGTTCATGGCCACCTCAAATAATACC
CTCGTCTGCGTCTAACTCACGGCAGAAAGGTTTTAGAGGTTCGTCCTGTGATCGAATGGA
ACAAAGGGAAAGCAGTTGAGTTTCTGTTGGAATCTCTAGGATTAAGCAACGATGATGATT
TTCTTCCAATCTTCATAGGAGATGACAAGACTGATGAGGATGCGTTCAAGGTACTAAGGG
AGAAGAAGCAGGGATTTGGAATCTTGGTATCCTCTGTACCAAAAGAAAGCAATGCGTTCT
ACTCTCTTAGAGACCCCTCAGAGGTGAAGAAGTTTCTCAAGACTTTGGTGAAATGGAGAA
AGATGGAAGACACTACAAGTC

QA 1 741 1 741
DS 

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TCCCCTGAAGACACCAACTCTGACCAACAGGGTGAATAGGTAAACCTCTTTCAACCTGCT
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ATCAAAGGTGCAAAAGTGGAGAACCACAAGTTCTGCGCTTCTGTGCATTACCGTAACGTT
GATGAGAAAGACTGGCCACTCGTTGCTCAACGTGTTCATGGCCACCTCAAATAATACCCT
CGTCTGCGTCTAACTCACGGCAGAAAGGTTTTAGAGGTTCGTCCTGTGATCGAATGGAAC
AAAGGGAAAGCAGTTGAGTTTCTGTTGGAATCTCTAGGATTAAGCAACGATGATGATTTT
CTTCCAATCTTCATAGGAGATGACAAGACTGATGAGGATGCGTTCAAGGTACTAAGGGAG
AAGAAGCAGGGATTTGGAATCTTGGTATCCTCTGTACCAAAAGAAAGCAATGCGTTCTAC
TCTCTTAGAGACCCCTCAGAGGTGAAGAAGTTTCTCAAGACTTTGGTGAAATGGAGAAAG
ATGGAAGACACTACAAGTCATTGATGATTGTGTAGGAGTATCAGAAGAGCATCATTCAAA
CTCTGCTTTCTATTTTTTTTTATCACATTTTAGTTTTTATGTCTTTAATAGTCTCTGCTA
TTATATCTTTAATTGATCATTTTTCCATCTTTTCCATGAATTTAAGCTGTATT

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

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TAAAAAAGAGATTTCGGGT


BQ
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AF RS1AS50JQ C 1
AF RS1AS50TF U 1
BS 1 619 RS1AS50TF

RD RS1AS50JQ 619 0 0
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TAAAAAAGAGATTTCGGGT

QA 1 619 1 619
DS 

RD RS1AS50TF 619 0 0
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TATCAATGCAACAGCTATGTTAGATTGCGAGAAACATATAGTCATCAAACCAAGTGCCCT
GGTTCTGTGCTAAACAATGTTGAATCATCCAGAAGGATCCCAAGACCAGCAGAAGGAGAT
GGAAACGGCAGGAGGAGAAGAGACGGGAACGGTTTTTCTAACAAAAGGCTTTTCTTCACT
ATAGCGATAACTGGAATAGCTGTCTTGATAGGATCTCTGTTCTTCCAGAGGAAGCCTGAG
ACGAACTAAGCAGAGAGTTAGCTCGTGTGTAGTTCTGTAAATTTGCTACAAATACTCCCT
TCGGACAGATTTGAAGGAAGGGTTTTATACATTTTAGTGCTTACCGAGACAAGAGATGTT
GCTCCCAAAAGATTGTTTTAAGCTGATCATCATGAGACTTTCTTTTATATTTGATTTCAA
TAAAAAAGAGATTTCGGGT

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 2

CO CL8522Contig1 1165 2 2 U
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AATCTCTTATTAGTTTCAATTTCAACAGGTTTCTATGCCACAAAGGTCATCTAGTCCTTC
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TTTGGTAATTTACCTATCCCTCGTTTCCACAATGTGTGATCATCCTTGAGATTTAGAATA
CTGGGGTCTCAGGAGACACTCCTACCCCTCTGCCTCTCAAGAAATCATTTCAATCTTTTA
TAATATAACTTAGATTTTGAGACGCTGAAGAGAGAAAAGGAAGGGAACCAGAAACACACA
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AATCTAGAATGGTGCTAAAGAGTGGTTAGACAATCAATTATAAATCTATATCAATGTTTC
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AACACATATTAGTAAACTCCTCCCAGACTTAAATTACACTGTCCCAGTGTAACATAGCCG
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CTGATCGACAAGGTGTCGATCAATTCGTAGTGGTATACATCGATCGTTAGGAATGGTCGT
GTGGTGTCGAGCGATATGAATGGTGAATGTCGGTCGACGGAATCATCATTCTACTTGGAT
TTAATAAAACTGCAAAACAAATCCG


BQ
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AF RS1EM49TF U 1
AF RS1EM49JQ C 340
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BS 474 1165 RS1EM49JQ

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AAAAGTGCAGGCTTTACCTTGGGGGTATCGATTAAAGGACATATGGATTCAACTCAAACA
AGTATCTGAACACACAGGTAGTCTTCTCTGGTCCCTTTCTCCCCTCATCTCTCTTCTCTG
AATCTCTTATTAGTTTCAATTTCAACAGGTTTCTATGCCACAAAGGTCATCTAGTCCTTC
TCATTGACATTTGCATTGTAACTCATACATTTTTGACAAAGTGTAGCGAATAATGGGGTC
TTTGGTAATTTACCTATCCCTCGTTTCCACAATGTGTGATCATCCTTGAGATT

QA 1 473 1 473
DS 

RD RS1EM49JQ 826 0 0
ACAAAGGTCATCTAGTCCTTCTCATTGACATTTGCATTGTAACTCATACATTTT*GACAA
AGTGTAGCGAATAATGGGGTCTTTGGTAATTTACCTATCCCTCGTTTCCACAATGTGTGA
TCATCCTTGAGATTTAGAATACTGGGGTCTCAGGAGACACTCCTACCCCTCTGCCTCTCA
AGAAATCATTTCAATCTTTTATAATATAACTTAGATTTTGAGACGCTGAAGAGAGAAAAG
GAAGGGAACCAGAAACACACAGACTTTTTACCTTCCAGACTTGTAAGAGGATTCCGATCC
AGTGATTTCCAAGCCCCAAGACAAGCAAATAAGTCAGTATTAGCATTGGAGGTCAGCTTT
GGTTCCTTCAAACAATCTTTAGCTAGTGAATATAGATGACAGGTTGATCCACTTTAGCAT
CTTAGTACTATCTCAATCAGTAATCTAGAATGGTGCTAAAGAGTGGTTAGACAATCAATT
ATAAATCTATATCAATGTTTCTATTTAATACTTATGCGAAAAATAATTTTGAAAAACAAT
TTAAATAAAAACCAAAATAAAAACACATATTAGTAAACTCCTCCCAGACTTAAATTACAC
TGTCCCAGTGTAACATAGCCGGTGGTAAGGTAAAGAAAATAAATCATAATTAATAAGTAT
AACAAGTTAGAATGAATAAACCTGATCGACAAGGTGTCGATCAATTCGTAGTGGTATACA
TCGATCGTTAGGAATGGTCGTGTGGTGTCGAGCGATATGAATGGTGAATGTCGGTCGACG
GAATCATCATTCTACTTGGATTTAATAAAACTGCAAAACAAATCCG

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 2

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ATTTTGGAAAGAGGATCCGATCGTTTGGCCTTTATCACTGGTCAGATCAACAACGTCCCT
CTTCCTCCATCTCCTTCTTCCGATCCCACTTCTCTTTCTCAATCTCATCTACTCACAGAC
GACACGGTTCCGCCTCCTCGTGACCATATACGTACTACTGATCGAGAAACAGCTTTCACA
AGTCATCAAGAAAACATATCCGATGCTTCGATGGTTGATAATGTGGATCATACCATCCAT
CAAAGCAGAGCAGAACCACTTCAGCCTCGGAAGTATACTAAGACATTTGGAGAAGCCTCC
GCTTCAGACCCTAGAGATACCACACTACAACCGTCTCCTGCTACATCAACCATTCAAACC
CCATCAGTGGTAGATGTGGGTGCTTCTCAAGCATTTACTCCTCTAGTCAGTTTTGCAAAC
ACCATCACTCCGAATCACATTGGAGCCGCCATCGATGCTTCAGAATACGCACGGATGTTC
TCATCTCTCGTGATCGCACTCCTTGTCATACTCTCTCATCTCGGGTTCTCTTCCCTAGGC
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GGACGTGTTCTGCTGAGCCATCATGGAGCTCCTTCCTCAGTCTCAAGGCGAGAAAACTCG
GGACAAGGCATAGCGGACCAAGTGGGCAACGCGCTGGAGACAGTCACGATGATTAAGAAG
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TTGTTCACACAAATCATCTTTGCTTAAGTTATTGTTTCTCCCAAGTAGTGATCAGTATAC
ACTCATAACACATTGCCAGTATTGCCACGTTCTCAAACATCTCATATTCATATTTATCTC
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BQ
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AF RS1AS59TF U 1
AF RS1AS59JQ C 200
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RD RS1AS59TF 719 0 0
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GACACGGTTCCGCCTCCTCGTGACCATATACGTACTACTGATCGAGAAACAGCTTTCACA
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CAAAGCAGAGCAGAACCACTTCAGCCTCGGAAGTATACTAAGACATTTGGAGAAGCCTCC
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CCATCAGTGGTAGATGTGGGTGCTTCTCAAGCATTTACTCCTCTAGTCAGTTTTGCAAAC
ACCATCACTCCGAATCACATTGGAGCCGCCATCGATGCTTCAGAATACGCACGGATGTTC
TCATCTCTCGTGATCGCACTCCTTGTCATACTCTCTCATCTCGGGTTCTCTTCCCTAG*C
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GGACGTGTTCTGCTGAGCCATCATGGAGCTCCTTCCTCAGTCTCAAG
CGAGAAACTCGG

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1AS59JQ 779 0 0
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CCACACTACAACCGTCTCCTGCTACATCAACCATTCAAACCCCATCAGTGGTAGATGTGG
GTGCTTCTCAAGCATTTACTCCTCTAGTCAGTTTTGCAAACACCATCACTCCGAATCACA
TTGGAGCCGCCATCGATGCTTCAGAATACGCACGGATGTTCTCATCTCTCGTGATCGCAC
TCCTTGTCATACTCTCTCATCTCGGGTTCTCTTCCCTAGGCAGCATAGTAAGCTTCAGAC
CCGTTCTCTTGCTTCTCTTGACCGACGTCACAATCGTGCTCGGACGTGTTCTGCTGAGCC
ATCATGGAGCTCCTTCCTCAGTCTCAAGGCGAGAAAACTCGGGACAAGGCATAGCGGACC
AAGTGGGCAACGCGCTGGAGACAGTCACGATGATTAAGAAGATAATGAACGCCATCTCTA
TGGATTTTAGCTTGTACGCTGTGATTCTCGTATGTGGCCTTTTGTTCACACAAATCATCT
TTGCTTAAGTTATTGTTTCTCCCAAGTAGTGATCAGTATACACTCATAACACATTGCCAG
TATTGCCACGTTCTCAAACATCTCATATTCATATTTATCTCAGTATTGGTTTTGATAGT

QA 1 779 1 779
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GCGATCATACCTTCAAATCTACTACGCCGAATCAAAAAATCACTCTATCGTTTCAATGGC
TGCGACGTCTCTCTCTTCGTCTACGATTCCATCGCTGAATCCTAACTCATCGTCTACTGT
TTCTCCTCTCGCTCCGCGCTCTGTCTCCGCCGTCAAATTCCAGTTTCCACTTCGTCGGAT
TCGAATCGGAGACTTGAAGCTCTCCTCCCTATCTTCATCAAATCGATCCACTCCTCGCGC
TATTGAAGCAAAGAAGCAGACATATGACTCGTTTGATGATCTGCTTGTGAACTCTGATAA
ACCTGTTCTTGTAGACTTCTATGCGACCTGGTGTGGTCCCTGTCAGTTTATGGTTCCTAT
TCTCAGTGAAGTGAGTGTAACACTGAAAGACAAGATCCGGGTGGTGAAGATTGATACTGA
GAAGTATCCGAGTATTGCTAATAAATACAAGATCGAAGCACTTCCTACGTTTATCCTATT
CAAAGATGGGGAACCTTGTGACCGTTTTGAGGGTGCTTTGGCGGCCAAACAACTTGTCCA
ACGGATTGAAGATTCTCTTGAAGTGAAGCCTTAGTTATGGATCCTGATCTCTTTTTATTG
TTGGTATGCTTTTTTTGTTTTGTTTTCTACTGTCCCTGACCTGATCAGGCTTAGTTAACC
ATATTTTCCAGTTATTGTTCGTGATTAACAGATGTGTGGATTGAGAA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1H451TF U 1
AF RS1E615TF U 1
BS 1 767 RS1E615TF

RD RS1H451TF 618 0 0
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DS 

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QA 1 767 1 767
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CGTTTTTTAGATAATTAAACGACTTTTGTTTAGAGATGACATAAAATATTCCAGATAATA
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CTTTCATTTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DV21TF U 1
AF RS1DV21JQ C 195
BS 1 697 RS1DV21TF
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RD RS1DV21TF 714 0 0
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CGTTTTTTAGATAATTAAACGACTTTTGTTTAGAGATGACATAAAATATTCCAGATAATA
TTACTCGAGTTTTGTTGTTATAAACAAAGTTTTCGAA*TAATCTGAGATTT
AAT

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DS 

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QA 1 537 1 537
DS 



AS 1 2

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TTAAATATGCTTAACGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FT68JQ C 1
AF RS1FT68TF U 1
BS 1 617 RS1FT68TF

RD RS1FT68JQ 617 0 0
GAACGGAGAGATAGGGAACGTTGATTGGTACGGATTGATCGGAGTTAGGCGCGGATGCAC
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AGTTATGTATCTATTCATATATGCATGTAATAAAATTCCGCTAGAATTTTTTTTGTCAAT
TTAAATATGCTTAACGT

QA 1 617 1 617
DS 

RD RS1FT68TF 617 0 0
GAACGGAGAGATAGGGAACGTTGATTGGTACGGATTGATCGGAGTTAGGCGCGGATGCAC
CAGATCGGAGCTTGATCGAGCTAATGTCTTGTTGACTTTCAGACACAAGCCTGATAAGGC
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TCGAGCGAGTATGGCTTCGTTGCTGCTTTACCGTTTGATTCAAAGAGGTTACTCTGTCTT
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ACTATCTAGGACCGGTTTTAACCAACCGATTCCGGTGAAATACGAAGCACTCAGTTGTTA
AATTTTTAACCGGGAAATTCACGAACCAAACGATTCCGTTCCCGGGCGATTTTAAAAATC
AGTTATGTATCTATTCATATATGCATGTAATAAAATTCCGCTAGAATTTTTTTTGTCAAT
TTAAATATGCTTAACGT

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 2

CO CL8529Contig1 910 2 2 U
GGATTTCTCTTTGGGTCTAATTTTGTTGATGGAAGAGCGAAACGGTTTTTCTCTAGGCCG
GCCAAACGGAGGATACGGCGGAGGAGGAGAGAGAGGGCCGTCGAGGTTGAAGCCGGAGCT
GAGATTTTCCGGCGGTAGTAGTAGTAGTCATCAAGAGCATAGCCCTCTACCACGAATCAC
AGAGGTGGAAGCGGCTGCGGCGGCTGTAAAAGGTGTCGCATCGACGAGTATGACTTTTGG
AAATGATCACAACAACTGGGACAACTCGTCTTCTCATATCAGTTTCACCATTGATGAACC
CGGAAAACGGTCCAAGACCACCGACTTTTTCACCTTAGAAACACAGTTTAGTATGCCGCA
AACGTCTCTGGAAGTGGCGAGAATGGAGAGTATGGAACATACCAGAGGATTCGGTGCCTT
GTAGGGCTAGGGCCAAGCGTGGCTGTGCTACTCACCCGCGCAGTATCGCTGAAAGGGAGA
GAAGAACGAGAATAAGCGGGAAGCTGAAGAAGCTACAAGAACTGGTGCCCAATATGGACA
AACAAACGAGCTATGCAGACATGTTGGATTTGGCTGTTGAGCATATCAAAGGTCTTCAAC
ACCAAGTAGAGTCGCTGAAAAAGGGGATGGAGAGATGCACTTGTGGGGCATGCAAGAAGC
GATGATGAAATGATATGTGTTTCCAAGCATGATCCAAGAAAGTATAGAAGAAAAAGAGAT
CAATGAATCAAAATCCAAACAGAAAAGAGCAGCAAAAGGTCTTTAATGATATATACTTGT
GATTTTGGAGGTCTAAAGAAAGTGATGGTGGTCAGTCTATTAATGAAGTCTTGTTTTGAC
ACGTTCTCAAAGTCGTCACCGTAGTGACAACTTATAACAACTTCAATTAATTCGATCAAT
CAAACTTAAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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BS 618 910 RS1AE12JQ

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AGAGGTGGAAGCGGCTGCGGCGGCTGTAAAAGGTGTCGCATCGACGAGTATGACTTTTGG
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CGGAAAACGGTCCAAGACCACCGACTTTTTCACCTTAGAAACACAGTTTAGTATGCCGCA
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GTAGGGCTAGGGCCAAGCGTGGCTGTGCTACTCACCCGCGCAGTATCGCTGAAAGGGAGA
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ACCAAGTAGAGTCGCTG

QA 1 617 1 617
DS 

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TGGCTGTGCTACTCACCCGCGCAGTATCGCTGAAAGGGAGAGAAGAACGAGAATAAGCGG
GAAGCTGAAGAAGCTACAAGAACTGGTGCCCAATATGGACAAACAAACGAGCTATGCAGA
CATGTTGGATTTGGCTGTTGAGCATATCAAAGGTCTTCAACACCAAGTAGAGTCGCTGAA
AAAGGGGATGGAGAGATGCACTTGTGGGGCATGCAAGAAGCGATGATGAAATGATATGTG
TTTCCAAGCATGATCCAAGAAAGTATAGAAGAAAAAGAGATCAATGAATCAAAATCCAAA
CAGAAAAGAGCAGCAAAAGGTCTTTAATGATATATACTTGTGATTTTGGAGGTCTAAAGA
AAGTGATGGTGGTCAGTCTATTAATGAAGTCTTGTTTTGACACGTTCTCAAAGTCGTCAC
CGTAGTGACAACTTATAACAACTTCAATTAATTCGATCAATCAAACTTAAC

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 2

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ACAACACCAGTCGTCCCTTCGCTTTCCCTCCCAAAGACACAGATCAAGAACCTGAATCGT
CTATGGTACCCTTTGGAGAGCGAGAGCGTTGAGTATTTCAGGTTAAGTGATTTTTGGGAT
TGTTTCGACGAGTGGAGCGCATACGGTGCAGGTGTTCCCATCTTGTCTGAAACTGGCGAG
ACATTGGTCCAATACTACGTTCCTTACCTCTCTGCAATCCAGATTTTCACCTCTCATTCT
GCCCTTATTGCCCTAAGGGATGAGACTGAATCTGGGGATTCAGGGAGCGAGACGTGTAGC
GATGAATGGAGATGGGAAGGATGGTTCGTCAGAGGAAGGAGTGGATCATCAAGAACCTCT
CGATCGTCTCGGTTACTCTTACTTGCAGTATTTCGAGAGATGTACTCCTTATTCTCGAGC
CCCTCTCATGGATAAGATCAAAGGGTTGGGAGAAAGGTATGCAGGCTTGAGGTCATTGAG
GAGTGTTGATCTGTCTCCTGCGAGTTGGATGGCTGTTGCTTGGTATCCAATCTATCAAAT
CCCCATGAACCGAAGCATAAAGGATTTGTCTACTTGCTTCCTCACTTACCACACACTTTT
TTCATCTTTTCAAGATGTGCAGAAAGAGAAGAGGGAAAGGATAAGTGTTGGTGCATTTGG
GATGGCCACTTACAAAACGCAAGGGAGACTATGGGACAATGATAGATTGCTTTCCCTTTT
GGGGGTAGCAGATTTTTGGTTAAAGCAGCTAAGGGTCCCCCCCCATGACTTCACCTACTT
CACCACTACTCCTTATCACCTTTGATAACAGCATAGTGTTTTTATAGATTGAGTTTTGGT
TAACAATTTATTTAGTTTTGTGTGGTTAAGAGTAGCTAGAGATATCAATAAACGTTGAAT
AACATTTGGAAGTTTTAGAGAAGAACAGGCACTGACTTTTTTTTCAAAATGTTTTTTTTT
TAGATTTGGTTTTGGGTGTGATGGATGATGGGCCTAACGCATTTATTTTTTTTTAATGTT
TTGTGGCTTTTCTGTTTGTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DX25JQ C 559
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BS 692 1101 RS1DX25JQ

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ACAACACCAGTCGTCCCTTCGCTTTCCCTCCCAAAGACACAGATCAAGAACCTGAATCGT
CTATGGTACCCTTTGGAGAGCGAGAGCGTTGAGTATTTCAGGTTAAGTGATTTTTGGGAT
TGTTTCGACGAGTGGAGCGCATACGGTGCAGGTGTTCCCATCTTGTCTGAAACTGGCGAG
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GCCCTTATTGCCCTAAGGGATGAGACTGAATCTGGGGATTCAGGGAGCGAGACGTGTAGC
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QA 1 543 1 543
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 

AF RS1E556TF U 1
AF RS1E556JQ C 684
BS 1 740 RS1E556TF
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CGTGTCGGAGTAGGATAGGCTATGTGATCTTTTGTGTTTGGTTTTGCGGGAAAAAAAAAT
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TGGGGATTTCTTTGATTTAGGGTTTCTAAAAGTTTCGGGTTTTCAATTGGTTTGGGGATC
TTTTGGTTTGTAGTTAGGGTTTCAATTGGTTTTCGGTTTCAATCGATTTTGGGATCTTCT
TGTTTGTTCTTACGGTTTCGAAACACCTTTTTGTTTTCAATCGATTTCAACGTCGATTTA
TTTTCTTAATACTCGGGTTTATATGTGTTTACTTTTTTGGTGTTGCTTATCTTGTTTGGT
GTATCGTTTTCAAACTCATTACTCGGGTTTATATGTGTTTGCTGTTGGTGTGCTTTTCTT
GTTTGGTGTTTCGCTTATCT*GTTTGGTGTT
CGCTTCACATCTG

QA 1 751 1 751
DS 

RD RS1E556JQ 820 0 0
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TTGGTGTTTCGCTTTCAACATCTGTATGGTTTGGTGTTACTTATCTTGTTTTCTATTTAG
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ATAAATTATATATTGGAGTTGCTTTATGTCAATTATATAGGTGTAGCTAGGCTGTGTGTT
AGCTCTGTTAGCTTAAGGTGTAGCTAATTAACTGTTTAGTTGCTTATCATGTTATCTGTT
TAGGTGTAGCTAGGCTGAGTGTTAGCTCTGTGTTCTTTAGTCGCTTTTGTTGCTCTGAGT
TCTCAAACTTTAGTCTTTCTTCTTGAGAGTGACATAGTATCTGTTTTTTTTTGCAGGTAG
CCGAACGATGGGACAAGACTATAGCTACACTCAGCCTTCATCATCAGAGGAGTTTGACAT
GACCTCTTTACTTCAAGAAGAAGCTGATCTCTACGCGGATGAAGCTGATCTTATTGATTA
AAAAAACAAAAACTTACACATAATTTGATCTTGTAAATACAAAAAAATAAAACTTATACA
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TTAAAAAATAACTTATAGATAATTTGATCTTGGTGTTCAAAAAAAAAGATAATTTGATCT
TATTGATTAAAAAAAAAACTTATACAAAATTTGATCTTCT

QA 1 820 1 820
DS 



AS 1 2

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TGCGCTGGGACCACGGTCTATTCCCCTATGAAGTATCACGGGCTCCTCGGGCCGGGT


BQ
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AF RS1DV36TF U 1
AF RS1C249TF U 4
BS 1 597 RS1DV36TF

RD RS1DV36TF 597 0 0
GGAGTACCATCACTCAGAGAAAAATTCTCAGCCCTATTCTCTTATTATTTACCCATAATG
GGAGAGGTTGTGAAGACGGAGGCGTACGGATTGGCTGTAAAAGACGAATCTGGAGTTCTC
TCGCCTTTCAGTTTCTCAAGAAGGGAGACGGGAGAGAAGGATGTGAGGTTCAAAGTGTTG
TTCTGTGGAATTTGCCACACTGACTTGAGCATGGCAAAAAACGAGTGGGGGTTTACTACT
TATCCTCTCGTCCCCGGTCATGAAATAGTGGGCGTGGTGACTGAAGTCGGAGCCAAAGTG
ACTAAATTCAACGCCGGAGACAAAGTCGGAGTTGGTTATATGGTCAGCTCGTGCCGGTCA
TGTGAAACCTGCTCCAATGACCAAGAGAACTACTGTCCAAAAATGATCCTAACATCCGGA
GGCAAGTACTACGATGACACTATAACATATGGTGGTTACTCCGACCACATGGTTTGTGAA
GAGGACTACATCATCCGTATTCCAGAAAATCTTCCGTTAGACGCTACCGCGCCGCTACTC
TGCGCTGGGACCACGGTCTATTCCCCTATGAAGTATCACGGGCTCCTCGGGCCGGGT

QA 1 597 1 597
DS 

RD RS1C249TF 594 0 0
GGAT
CATCACTCAGAGAAAAATTCTCAGCCCTATTCTCTTATTATTTATCCATAATGGGAGAGG
TTGTGAAGACGGAGGCGTACGGATTGGCTGTAAAAGACGAATCTGGAGTTCTCTCGCCTT
TCAGTTTCTCAAGAAGGGAGACGGGAGGGAAGGATGTGAGGTTCAAAGTGTTGTTCTGTG
GAATTTGCCACACTGACTTGAGCATGGCAAAAAACGAGTGGGGGTTTACTACTTATCCTC
TCGTCCCCGGTCATGAAATAGTGGGCGTGGTGAC*GAAGTCGGAGCCAAAGTGACTAAAT
TCAACGCCGGAGACAAAGTCGGAGTTGGTTATATGGTCAGCTCGTGCCGGTCATGTGAAA
CCTGCTCCAATGACCAAGAGAACTACTGTCCAAAAATGATCCTAACATCCGGAGGCAAGT
ACTACGATGACACTATAACATATGGTGGTTACTCCGACCACATGGTTTGTGAAGAGGACT
ACATCATCCGTATTCCAGAAAATCTTCCGTTAGACGCTACCGCGCCGCTACTCTGCGCTG
GGACCACGGTCTATTCCCCTATGAAGTATCACGGGCTCCTCGGGCCGGGT

QA 5 594 5 594
DS 



AS 1 2

CO CL8533Contig1 851 2 2 U
ACCCATTCTCATAATAACTTCTCATCTTCTCTCAAAGCATTACATTTACGGTTTGAAATG
ACGAGTCCAGTGGTCGATCAAGAGAATATTCCTCCTCCTGTGGACGGAATCAACACGACG
GTTACGACGGAGCCTGCTGTGAAGAAAGGCAAGACGACGAAGAAAGCTAAGGAAGTGAAG
GGGAAGAAGAAGCCTGCTACTGCTGCGGCCGCGAAGAAGAAGTCTGTTTCAACTCATCCT
ACTTACGAAGAGATGATCAAGGATGCGATTGTATCGTTGAAGGAGAGGACTGGATCTAGC
CAATACGCGATTCAGAAGTTCATCGAGGAGAAGCACAAGGTGCTCTCGCCTTCGTTCAGG
AAGCTCCTGCTTCTCAACCTCAAGAGACTCGTGGCCTCCGAGAAGCTCGTGAAGGTGAAA
GCCTCGTTTAAGATTCCGTCTGCTGCTGCTAAGCCGAAGCCGAAGGCGACTGTTGCCCCC
AAGAGGAAAGCTGTTGCTGCTGCTGCGAAGCCCAAGGCTAAGGCGGCTAAGACATCGACG
GTGACATCTCCGAGTAAAAAGGCGGCTGCAGCTAAGAAGAAGGCTACGAAGGTGGTGGCG
ACGAAGAAGAAGACTCCAGTGAAGAAGGTTGTGAAGCCAAAGACGGTGAAGTCTCCAGCG
AAGAGGGCTTCGAAGAGGGCGGTGAAGTGAAAACTAGGGTTTTAGGAATACATGCTTGTA
GCTTTCTCTGTCGTGTAGGTGGTAGTGTTGTATAATCCGATCTTTCCTGTTGTTTGCTAT
GATGTTCTTGTAATCCATGGTTTACTTGAGAACTATCCTTTGAATCATATATAATAGCTT
AATCTCTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BF72TF U 1
AF RS1BF72JQ C 55
BS 1 636 RS1BF72TF
BS 637 851 RS1BF72JQ

RD RS1BF72TF 636 0 0
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ACTTACGAAGAGATGATCAAGGATGCGATTGTATCGTTGAAGGAGAGGACTGGATCTAGC
CAATACGCGATTCAGAAGTTCATCGAGGAGAAGCACAAGGTGCTCTCGCCTTCGTTCAGG
AAGCTCCTGCTTCTCAACCTCAAGAGACTCGTGGCCTCCGAGAAGCTCGTGAAGGTGAAA
GCCTCGTTTAAGATTCCGTCTGCTGCTGCTAAGCCGAAGCCGAAGGCGACTGTTGCCCCC
AAGAGGAAAGCTGTTGCTGCTGCTGCGAAGCCCAAGGCTAAGGCGGCTAAGACATCGACG
GTGACATCTCCGAGTAAAAAGGCGGCTGCAGCTAAGAAGAAGGCTACGAAGGTGGTGGCG
ACGAAGAAGAAGACTCCAGTGAAGAAGGTTGTGAAG

QA 1 636 1 636
DS 

RD RS1BF72JQ 797 0 0
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ACGACGGTTACGACGGAGCCTGCTGTGAAGAAAGGCAAGACGACGAAGAAAGCTAAGGAA
GTGAAGGGGAAGAAGAAGCCTGCTACTGCTGCGGCCGCGAAGAAGAAGTCTGTTTCAACT
CATCCTACTTACGAAGAGATGATCAAGGATGCGATTGTATCGTTGAAGGAGAGGACTGGA
TCTAGCCAATACGCGATTCAGAAGTTCATCGAGGAGAAGCACAAGGTGCTCTCGCCTTCG
TTCAGGAAGCTCCTGCTTCTCAACCTCAAGAGACTCGTGGCCTCCGAGAAGCTCGTGAAG
GTGAAAGCCTCGTTTAAGATTCCGTCTGCTGCTGCTAAGCCGAAGCCGAAGGCGACTGTT
GCCCCCAAGAGGAAAGCTGTTGCTGCTGCTGCGAAGCCCAAGGCTAAGGCGGCTAAGACA
TCGACGGTGACATCTCCGAGTAAAAAGGCGGCTGCAGCTAAGAAGAAGGCTACGAAGGTG
GTGGCGACGAAGAAGAAGACTCCAGTGAAGAAGGTTGTGAAGCCAAAGACGGTGAAGTCT
CCAGCGAAGAGGGCTTCGAAGAGGGCGGTGAAGTGAAAACTAGGGTTTTAGGAATACATG
CTTGTAGCTTTCTCTGTCGTGTAGGTGGTAGTGTTGTATAATCCGATCTTTCCTGTTGTT
TGCTATGATGTTCTTGTAATCCATGGTTTACTTGAGAACTATCCTTTGAATCATATATAA
TAGCTTAATCTCTTTTC

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 2

CO CL8534Contig1 1021 2 2 U
GCTATCGTCTAAGATGGCGGAGTTGTGCGGTGGGTCCCCCGTAACCATACGGTGTCAGCT
CCCGACGGAAGATCTCGACGCGCTCGTGTCCGTCACGTGCGACGAAGATCTAGCGAATCT
AATCGAGGAGTACGACCTCGTTTCCTCCTCAATGAAGATCAGAGTCTTCCTAAACCCGCC
GAGATCCGTTAGATCATCAACGACGGTCTCGCCTCCTCCGTTGGCTTTGCCGTCGTCATC
ATCTTCCACCACTTCCTCTAACTCATCGAGTCCTAGATCTCCCTCGATTTCAAAACCACC
GCTACCTCCGTCTCCACCGAGGTTAACGACGACGGCGAAGAATCAGTGCTACGGTTGCTA
CGTCCACCACCGTAGTTCGAGGAATATGTACCTCGTCCACAACGGCAATCACTGGCAATA
ACCCCAAGCCACAATCAGATTAAATAAAAAACAAAAATAAATATGAAAAATCGAATCTAT
ACTTGAAAGAAAAATCTTCTTGATATGTGTAAAAAAAGAGAGATATAAAGGTGTACGTGA
TCTCTCTCTGTGACGATGACCGTCGCCATTAATGAAATCATCCTAAAAGCTCTTTTTTTT
TCTTGGGTGAGTTGGTTTAATTCCTTCCTTTTTTTTACCCAATTGCTTCCGTTTATCGGT
ACTCCGTCAACTTTAACCGGTTTTGGTGAACTCGTGGCCGTCCCGACATATGTCATCCCT
ACCTTATCTACTCTGCCGTTGCATTATTCTGTTTTGTTGCACCGTCACCGTTTAGCGGAT
GTCATTACACCTGTTGTCCGTTTCCGTGAATTACTTTTTCTTCAAACGAACACTTTTTTT
TAAGGTTTTTCTTTTTATGGTTTTCTTTTGATTATTATTTTTTAATATTTTTTTATTTCT
CGAGTTTTCCCACTTGCTTTTTTTGTGTGGTTTATTTTTTTTAATATTTTGTTGGTATAT
TATAATTTCTGTTGAACTAACCTCTTTAATCACCCTTTTTCATCTGCAGGTAATCTTCTA
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RS1CZ21TF U 1
AF RS1CZ21JQ C 338
BS 1 517 RS1CZ21TF
BS 518 1021 RS1CZ21JQ

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CCCGACGGAAGATCTCGACGCGCTCGTGTCCGTCACGTGCGACGAAGATCTAGCGAATCT
AATCGAGGAGTACGACCTCGTTTCCTCCTCAATGAAGATCAGAGTCTTCCTAAACCCGCC
GAGATCCGTTAGATCATCAACGACGGTCTCGCCTCCTCCGTTGGCTTTGCCGTCGTCATC
ATCTTCCACCACTTCCTCTAACTCATCGAGTCCTAGATCTCCCTCGATTTCAAAACCACC
GCTACCTCCGTCTCCACCGAGGTTAACGACGACGGCGAAGAATCAGTGCTACGGTTGCTA
CGTCCACCACCGTAGTTCGAGGAATATGTACCTCGTCCACAACGGCAATCACTGGCAATA
ACCCCAAGCCACAATCAGATTAAATAAAAAACAAAAATAAATATGAAAAATCGAATCTAT
ACTTGAAAGAAAAATCTTCTTGATATGTGTAAAAAAA

QA 1 517 1 517
DS 

RD RS1CZ21JQ 684 0 0
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CACAACGGCAATCACTGGCAATAACCCCAAGCCACAATCAGATTAAATAAAAAACAAAAA
TAAATATGAAAAATCGAATCTATACTTGAAAGAAAAATCTTCTTGATATGTGTAAAAAAA
GAGAGATATAAAGGTGTACGTGATCTCTCTCTGTGACGATGACCGTCGCCATTAATGAAA
TCATCCTAAAAGCTCTTTTTTTTTCTTGGGTGAGTTGGTTTAATTCCTTCCTTTTTTTTA
CCCAATTGCTTCCGTTTATCGGTACTCCGTCAACTTTAACCGGTTTTGGTGAACTCGTGG
CCGTCCCGACATATGTCATCCCTACCTTATCTACTCTGCCGTTGCATTATTCTGTTTTGT
TGCACCGTCACCGTTTAGCGGATGTCATTACACCTGTTGTCCGTTTCCGTGAATTACTTT
TTCTTCAAACGAACACTTTTTTTTAAGGTTTTTCTTTTTATGGTTTTCTTTTGATTATTA
TTTTTTAATATTTTTTTATTTCTCGAGTTTTCCCACTTGCTTTTTTTGTGTGGTTTATTT
TTTTTAATATTTTGTTGGTATATTATAATTTCTGTTGAACTAACCTCTTTAATCACCCTT
TTTCATCTGCAGGTAATCTTCTAC

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

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TAGCTTCTCTCTCGGTTCGCCACTCTGCTTCTTACTCGTCTTCATCATCATCAGCAGCTT
CAGCTGAAGCAGAAAGGACGATTCGGGAAGGTCCGAGGAATGACTGGAGTAGAGATGAAA
TCAAGGCTGTTTATGATTCTCCTCTTCTTGACCTCCTCTTCCATGGCGCTCAGGTTCATA
GACGTGTTCATAACTTCAGGGAAGTGCAGCAATGTACTCTCCTCTCCATAAAGACTGGTG
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CCCAAAGACTCATGTCCAAGGACGCTGTCATTGAAGCAGCAAAGAAGGCAAAAGAAGCTG
GTAGCACTCGTTTTTGCATGGGTGCTGCTTGGAGAGATACCATAGGACGGAAAACCAATT
TCAACCAGATACTTGATTACATCAAAGAGATAAGAGGCATGGGGGATGGAGGTTTGCTGC
ACATTGGGAATGATTGAGAAGCAGCAAGCGTTAAACCTAAAGAAGGCCGGCCTCACTGCT
TATAACCATAATCTTGATACTTCAAGAGAGTATTACCCTAACGTCATCACTACTAGAAGT
TACGACGACCGACTTGAGACTCTTGACCATGTTCGTGAAGCTGGAATCAATGTCTGTTCA
GGAGGAATCATAGGGCTTGGAGAGGCAGAGGAAGACAGAGTAGGATTATTACACACACTG
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ACTCCTCTTGAAGACCAGAAGCCGGTTGAGATATGGGAGATGATCAGGATGATTGGAACA
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ATGCCAGAGCAAGCCTTGTGTTTCCTTGCTGGTGCAAACTCCATCTTCACTGGAGAGAAG
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GTTGCTTCTGCTTCTCACTAATGTCTGGACACTCTTTGAAGTAGCCACCTTTTTACTATG
TAGCATTACAGTATCAGTTTCAGCGACGCTAATAATGACCAAGATTAAACTTGTCAC


BQ
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AF RS1BB33TF U 1
AF RS1BB33JQ C 657
BS 1 717 RS1BB33TF
BS 718 1257 RS1BB33JQ

RD RS1BB33TF 717 0 0
GGAGATCAGTAGATCGAGATAAAATGATGCTTGCTCGATTTGTATTTCGATCTCAACTGA
TAGCTTCTCTCTCGGTTCGCCACTCTGCTTCTTACTCGTCTTCATCATCATCAGCAGCTT
CAGCTGAAGCAGAAAGGACGATTCGGGAAGGTCCGAGGAATGACTGGAGTAGAGATGAAA
TCAAGGCTGTTTATGATTCTCCTCTTCTTGACCTCCTCTTCCATGGCGCTCAGGTTCATA
GACGTGTTCATAACTTCAGGGAAGTGCAGCAATGTACTCTCCTCTCCATAAAGACTGGTG
GGTGCAGTGAAGACTGTTCGTATTGTCCTCAGTCCTCCAGATATAGCACTGGAGTCAAGG
CCCAAAGACTCATGTCCAAGGACGCTGTCATTGAAGCAGCAAAGAAGGCAAAAGAAGCTG
GTAGCACTCGTTTTTGCATGGGTGCTGCTTGGAGAGATACCATAGGACGGAAAACCAATT
TCAACCAGATACTTGATTACATCAAAGAGATAAGAGGCATGGGGGATGGAGGTTTGCTGC
ACATTGGGAATGATTGAGAAGCAGCAAGCGTTAAACCTAAAGAAGGCCGGCCTCACTGCT
TATAACCATAATCTTGATACTTCAAGAGAGTATTACCCTAACGTCATCACTACTAGAAGT
TACGACGACCGACTTGAGACTCTTGACCATGTTCGTGAAGCTGGAATCAATGTCTGT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1BB33JQ 601 0 0
AAGTTACGACGACCGACTTGAGACTCTTGACCATGTTCGTGAAGCTGGAATCAATGTCTG
TTCAGGAGGAATCATAGGGCTTGGAGAGGCAGAGGAAGACAGAGTAGGATTATTACACAC
ACTGGCAACACTTCCTTCTCACCCTGAGAGTGTTCCTATCAATGCTCTGCTTGCAGTGAA
AGGCACTCCTCTTGAAGACCAGAAGCCGGTTGAGATATGGGAGATGATCAGGATGATTGG
AACAGCAAGAATTGTGATGCCAAAAGCAATGGTGAGGCTATCTGCTGGCAGAGTCCGTTT
CACCATGCCAGAGCAAGCCTTGTGTTTCCTTGCTGGTGCAAACTCCATCTTCACTGGAGA
GAAGCTGTTAACAACACCAAACAATGACTTTGACGCCGACCAGCTCATGTTCAAGACTTT
AGGACTCACTCCTAAACCCCCAAGCTTCTCTGAAGATGATTCTGAATCAGAAAATTGCGA
GAAAGTTGCTTCTGCTTCTCACTAATGTCTGGACACTCTTTGAAGTAGCCACCTTTTTAC
TATGTAGCATTACAGTATCAGTTTCAGCGACGCTAATAATGACCAAGATTAAACTTGTCA
C

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 2

CO CL8536Contig1 649 2 3 U
TTTTTTTCGGAAAATGAGTTTTAGATAATCATCAAATACATAGGCATAACACAAAGAGAT
CCATCCTAAACAAAGAGCTCTCTCACTAGCGTCTCTTCTTTTATCAAACACAGACTCTCT
CTCGAGAGAGATACTTAAAAGAAACAGAGAAGTAAGGGCGAGTGGTTAAGAATCTATTAT
TCCTTGGCGGATTTGTTGATGAGAGACTTGTGGATGTGAGGGATAACACCAACACCAGCT
ATAGTTCCTTTGATGAGAGTATCGAGCTCTTCATCTCCACGAATCGCTAGCTGCAAGTGC
CTCGGGGAGATACGTTTCACCTTGAGATCCTTGCTAGCGTTACCAGCCAACTCCAAAACT
TCTGCGGTCAGATACTCAAGTATCGCTGCGGTGTAAACAGCCGCAGTTGCTCCAACCCTT
CCGTGAGCAGTGGACCTTGTCTTCAACAGCCTATGCACCCTTCCTACAGGGAACTGAAGA
CCAGCTCGAGCAGAACGGGTGATGGGTTGTTTCTTCTTGTCCTTATCCTTCTCGCTACCG
CTGGGTTTCCCCATTATCAATCCTTTAGCTCCTTTCCCCGACATCTTTCCCGCCAAAAGT
CTCACAATTTGGTGCGCTGATAGAGAGAAGAGGAGAGAGATCGCAGCCC


BQ
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BQ
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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T

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DS 

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G
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GCAACTCTACAGATGGGTGAATATGTCCCCAATGTGTCAAACGGAGTCGATACATATAGT
CTTAGGGAGCCATTAGGTGTCTGTGCTGGCATTTGTCCTTTCAACTTTCCTGCTATGATT
CCTTTATGGATGTTTCCCATTGCGGTGACGTGTGGCAATACCTTTGTCTTAAAGCCATCG
GAGAAGGATCCTGGTTCTTCTGTAATGCTTGCGGAGTTCGCAATGGAAGCTGGACTACCT
GACGGGGTTCTTAATATCGTTCACGGTACCAATGATACTGTGAATGCTATCTGTGATGAT
GATGATATCAGGGCTGTCTCCTTTGTTGGCTCAAACACTGCTGGAATGCATATATATGCA
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GTCCTGCCTGATGCCAACGTCGACGCTACTTTGAATGCGCTACTTGCTGCTGGATTTGGT
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GATGCAGACCTGGGTCCTGTGATTAGTGTACAGCCAAAGA

QA 2 701 2 701
DS 



AS 1 2

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GCTTCCGCCACCGCCACTAGCTCTCATCGTTCCACCAGACCCGATTTTGTCCAAAGGCTT
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TCCCTTCTCTTGGTTGAAGAGTCGTTGATCATACATAACTTCGCCGCCTTTGCCTCCTCC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1A812JQ U 1
AF RS1FD95JQ U 18
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RD RS1A812JQ 673 0 0
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ACCACTGCGTTCGAAATTGATCTTGGTACGACCAGAACCACCATAGTCATCACGAGAAGA
GCTTCCGCCACCGCCACTAGCTCTCATCGTTCCACCAGACCCGATTTTGTCCAAAGGCTT
CTTACCTTTCTTCACATCGGACACGAA*CGGTCCAGACCGAAAGGATCTTGTTCATCTTC
CTTCTCGAACTCCACAGGTCGTTCTCTCTTGCCCGACCGCTCGGAAGCACCGGTGAAAGC
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ATACATTTCTTCATCTGTGTCCTTCTTAGGTTTGTAGAGCGTTGAGAGAGTGGGCTGTGC
GGTGAACAAGCCTTTGTCGTACACGTTGTACTGGTCGTCGGTAGCGAAACCTGAATCCAT
TCCCTTCTCTTGGTTGAAGAGTCGTTGATCATACATAACTTCGTCGCCTTTGCCTCCTCC
TGTAGAGGCCATT

QA 1 673 1 673
DS 

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CTGAATCAAAAGCAAACTGTTTCCACATAACCAAATAAGAAGCCAAACAGCAACAAACCA
TGTATTTGGAATCGAAACATCAGATTGATGAGACTTTCTAACGACCACTGCGTTCGAAAT
TGATCTTGGTACGACCAGAACCACCATAGTCATCACGAGAAGAGCTTCCGCCACCGCCAC
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CGGACACGAAACGGTCCAGACCGAAAGGATCTTGTTCATCTTCCTTCTCGAACTCCACAG
GTAGTTCTCTCTTGCCCGACCGCTCGGAAGCACCGGTGAAAGC***GTCTGGTTTGAACC
TCTCGGTGTTCTTGAGCTTATCGAGCTGCTCGTCTGCGTTTCCGTACATTTCTTCATCTG
TGTCCTTCTTAGGTTTGTAGAGCGTTGAGAGAGCGGGCTGTGCGGTGAACAAGCCTTTGT
CGTACACGTTGTACTGGTCGTCGGTAGCGAAACCTGAATCCATTCCCTTCTCTTGGTTGA
AGAGTCGTTGATCATACATAACTTCGCCGCCTTTGCCTCCTCCTGTAGAGGCCATTCCAA
GAGCGAC

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 2

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GTTCTCTCCGACAAAATCCACCGCCTCTAGAGTCAGAGCCACGCCGTCTAGACTCCGCTT
GTCCGTCGTGAAAGCGACGCCGGATAAGGGAAGCAGCGGAAATGCTCCCGAGGAAGATGA
TCCATCTTTCAACCCGTTTGGCTTCGTCACGGACAATCCATCTAGCCGGAGCGCAATCCA
GCTGCCGGAGTCTCCGGCCGAGGACGGTAACGTCGGTCAGATGCTCTACAGGACAGAAGA
TAAGGGAAGAGAGTTTGGCTCCACCATCAAATCAGGGAAGCTTAGATGGTTTGTTAGAGA
AACTGGTACAAAGGAGAGTCGTAGAGGAACAGTTGTATTTCTTCATGGAGCTCCAACTCA
GTCTTTTAGTTACCGTACTGTCATGTCTGAGATGTCAGAAGCTGGGTTTCATTGCTATGC
ACCTGATTGGATAGGATTCGGATTCAGTGACAAACCTCAGCCAGGATATGGTTTTAATTA
CACAGAGAAAGAGTACCATGAGGCGTTTGATAAACTGCTGGACACGTTGGAGATCAAATC
TCCTTTCTTTCTCGTTGTTCAGGGCTTTCTTGTGGGTACTTACGTTTAACATGGGCACTG
AAAATCCAAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FN86TF U 1
AF RS1FO59TF U 9
BS 1 139 RS1FN86TF
BS 140 140 RS1FO59TF
BS 141 641 RS1FN86TF
BS 642 670 RS1FO59TF

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GTTCTCTCCGACAAAATCCACCGCCTCTAGAGTCAGAGCCACGCCGTCTAGACTCCGCTT
GTCCGTCGTGAAAGCGACGTCGGATAAGGGAAGCAGCGGAAATGCTCCCGAGGAAGATGA
TCCATCTTTCAACCCGTTTGGCTTCGTCACGGACAATCCATCTAGCCGGAGCGCAATCCA
GCTGCCGGAGTCTCCGGCCGAGGACGGTAACGTCGGTCAGATGCTCTACAGGACAGAAGA
TAAGGGAAGAGAGTTTGGCTCCACCATCAAATCAGGGAAGCTTAGATGGTTTGTTAGAGA
AACTGGTACAAAGGAGAGTCGTAGAGGAACAGTTGTATTTCTTCATGGAGCTCCAACTCA
GTCTTTTAGTTACCGTACTGTCATGTCTGAGATGTCAGAAGCTGGGTTTCATTGCTATGC
ACCTGATTGGATAGGATTCGGATTCAGTGACAAACCTCAGCCAGGATATGGTTTTAATTA
CACAGAGAAAGAGTACCATGAGGCGTTTGATAAACTGCTGGACACGTTGGAGATCAAATC
TCCTTTCTTTCTCGTTGTTCAGGGCTTTCTTGTGGGTACTT

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1FO59TF 662 0 0
GGG
AAAGGAAAATGCCTTTGTCTCTGCTCTCTCCTCTTCCTCTGCTCCACTCGTTCTCTCCGA
CAAAATCCACCGCCTCTAGAGTCAGAGCCACGCCGTCTAGACTCCGCTTGTCCGTCGTGA
AAGTGACGCCGGATAAGGGAAGCAGCGGAAATGCTTCCGAGGAAGATGATCCATCTTTCA
ACCCGTTTGGCTTCGTCACGGACAATCCATCTAGCCGGAGCGCAATCCAGCTGCCGGAGT
CTCCGGCCGAGGACGGTAACGTCGGTCAGATGCTCTACAGGACAGAAGATAAGGGAAGAG
AGTTTGGCTCCACCATCAAATCAGGGAAGCTTAGATGGTTTGTTAGAGAAACTGGTACAA
AGGAGAGTCGTAGAGGAACAGTTGTATTTCTTCATGGAGCTCCAACTCAGTCTTTTAGTT
ACCGTACTGTCATGTCTGAGATGTCAGAAGCTGGGTTTCATTGCTATGCACCTGATTGGA
TAGGATTCGGATTCAGTGACAAACCTCAGCCAGGATATGGTTTTAATTACACAGAGAAAG
AGTACCATGAGGCGTTTGATAAACTGCTGGACACGTTGGAGATCAAATCTCCTTTCTTTC
TCGTTGTTCAGGGCTTTCTTGTGGGTACTTACGTTTAACATGGGCACTGAAAATCCAAG

QA 4 662 4 662
DS 



AS 1 2

CO CL8541Contig1 690 2 2 U
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TCAGGTTTACAATGCTTTTGACCTTCTGCGAACCGAACCATCCGTCCAGAGAATGGTAAT
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GCTCAAGACTTCGGTCTTGCTCTCCATCGTGGTCATGCTGGTCGTTATGGTCTCCCGTGC
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GGACACTGTTTGTTTAAGCTTTTCTTTCAAGTCATGTTGTGGTTTGTTTTGGTGATCTCT
GGTTTTGCACTCCATTTGTTGGCGTTGTAGACGATGTACTCAGTTGTGTTTTTCTATCAT
AAGTAACTCTGAATATCAGAGTTTGCTTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GV62TF U 1
AF RS1GV62JQ C 1
BS 1 618 RS1GV62TF
BS 619 690 RS1GV62JQ

RD RS1GV62TF 618 0 0
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QA 1 618 1 618
DS 

RD RS1GV62JQ 690 0 0
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ATCATTGTCATCTGACAAAGCAGTGTGGGATGCAGTGATGAACAATGAGGTGGTGCGTGA
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CGGGGAGAATAACGCAGCAGTGGATTTCATAAAATGGGTATTTGACAACACAATGGTTAA
GGCCAATGAAGTGTTTAAGAAAATAACGAGGCTCGTGATAGAGCTCTTGAATAGTCACAA
TGACGACGGTGTTAACAAGAAGGGGAAAGACGCCAAATTCAACAATTGGCTCGAAGAAAA
GCTCAAGACTTCGGTCTTGCTCTCCATCGTGGTCATGCTGGTCGTTATGGTCTCCCGTGC
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GGACACTGTTTGTTTAAGCTTTTCTTTCAAGTCATGTTGTGGTTTGTTTTGGTGATCTCT
GGTTTTGCACTCCATTTGTTGGCGTTGTAGACGATGTACTCAGTTGTGTTTTTCTATCAT
AAGTAACTCTGAATATCAGAGTTTGCTTTT

QA 1 690 1 690
DS 



AS 1 2

CO CL8542Contig1 738 2 2 U
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GTCATAATGAGTTTCTGC


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DO94TF U 1
AF RS1DO94JQ C 2
BS 1 618 RS1DO94TF
BS 619 738 RS1DO94JQ

RD RS1DO94TF 618 0 0
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TATGATGCGTTGAAGAGTTCACTATAATCGCCTCCCATTTGTTATTTGTAGTCTCTCCTT
TTCATTGATGTGTATATA

QA 1 618 1 618
DS 

RD RS1DO94JQ 737 0 0
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AATGGCGATGAGGACAAGAACAGAGACTTAGAGGCTGTCTTTGCTTACATGGACGCAAAT
AGAGACGGTAGAATATCTCCACATGAGCTTCAGAAGAGTTTCATGACATTAGGAGAGGAG
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AGCTTGAAGATGATGTTAAAGAAGCTAGGTGAGACAAGAAGCACTGATGCCTGTAGAGTT
ATGATTCGTGCTTTTGATCTCAATGCTGATGGTGTTTTGAGCTTTGATGAGTTTGCTCTT
ATGATGCGTTGAAGAGTTCACTATAATCGCCTCCCATTTGTTATTTGTAGTCTCTCCTTT
TCATTGATGTGTATATATACGGCTTGTGACGCAATAAACACGATTGTTATTAGATTAAAA
TCCATTTATAAATCTTTCTTATACTTATTGAGATTTGTTATTGTAGCTTCTCCTTTTGTG
TCATAATGAGTTTCTGC

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

CO CL8543Contig1 842 2 4 U
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GAGAAATACTCAAATTTCAGCGCCATGAGTGACCTCTTCACCAAAACCAAGCTCACTACA
CTCATAAGCAAATACCAAACCATAACCCTTCTCGCTGTTAACAACAGCGCCATCGGTTCT
ATCACTAACAAATCCGCCATTGAGCTCAAGAACATCCTCATGACTCATGTCATTCTTGAC
TACTACGACGAGCTCAAGCTCAAGGGGATGAAGGAGACGAGCATGATGCTCACTACCTTG
TACCAAACAACCGGTTTGGGTGAAGAGATGAACGGTTTCCTCAACTGTACCAAATCTAAA
GGAAGAGTTTACTTTGGATCCGGAGTAAAGGGCTCGCCTCTAAACGCTGAGTATGTTACC
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GGTGCAACCCCTTCAGCTCCAGCTCCTGGACCAGGGGATGAGACATGTCTCAGATAGTAA
TAATCCAAACTTACACCTGAGCAGAGACACTGAGCAGAGACACCTGAGTGATCTCTGCAC
TACTCCAGCGCTGATATGAGAGATGAGCTGCTGATAAGCTGGGAAGACCTCTTCTGCTTG
TA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 

AF RS1DF45TF U 1
AF RS1DZ26TF U 1
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DS 

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TA

QA 1 842 1 842
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1GE71JQ C 1
AF RS1GE71TF U 1
BS 1 617 RS1GE71TF

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QA 1 617 1 617
DS 

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TATATGTTTATTTTGAAAGTTTTAAAATATATTATATGTAGAAAAAATCTTTGTTTTTAT
TATGTAAAATATAAAGTTCAGTAATTGTTCTAACAGAAGTTAAAAGCAATTAAAAGTAAA
AGGGGAAACATATTTGT

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 2

CO CL8545Contig1 808 2 14 U
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BQ
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AF RS1CH02TF U 1
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BS 783 793 RS1CH02TF
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RD RS1CH02TF 796 0 0
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TGTGCGACCCTCAATTCCAAATTCAAAGTCCTTTCTCTTAAGGGAGCTTCTTCTTCGTCG
TCATCATCTCCAACTTCTTCTTCCTTGTCCACTCGTCGTGGTGCGTCGGCGACTGTCTGC
TCCTCCCTTGGCTTCTCTCAGAGTGTTTCTCAATGTGTCGCTTTCTCCTCCGGGAATCTA
TGGGTGCAGAAGAATCCAGCGAGGCAATTGATTGTGTGTGAAGCAGCTCCGACGAAGAAA
GCTGATTCAGCTGCAAAGAGAGCTCGCCAAGCCGAGAAGAGGCGTGTTTACAGCAAGTCT
AAGAAATCTGAAGCCCGTACTCGTATGAAGAAGGTTTTGGAAGCACTCGATGGGCTCAAG
AAGAAACCAGATGCGCAACCTGACGAGATTGTTACCGTAGAGAAACTCATCGGAGAGGCT
TATTCTGCAATAGACAAAGCAGTGAAGGTTAGAGCGCTACACAAGAACACTGGTGCGCGT
AGGAAGTCTCGCTTGGCTAGGAGGAAAAAGGCAGTTGAGATCCACCACGGTTGGTACGTG
CCAGACACAGCAGCAGCAGCAGCAACAGAAGCTGTGACCATGGCTGCGTGACAGAGATAA
TGGAAAATTCGTTTTTCTTATAAGAGATCATATTGAAAA*GATGTGAAA*TTGCTTTCAA
A*TCAA*TATGTTTATTTCATGTATA*TTCATTTCGACTTCAGTTTCTTCTTCTGTACTG
T*GAGCCTCAGCT
GTG

QA 1 793 1 793
DS 

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CTCAATGTGTCGCTTTCTCCTCCGGGAATCTATGGGTGCAGAAGAATCCAGCGAGGCAAT
TGATTGTGTGTGAAGCAGCTCCGACGAAGAAAGCTGATTCAGCTGCAAAGAGAGCTCGCC
AAGCCGAGAAGAGGCGTGTTTACAGCAAGTCTAAGAAATCTGAAGCCCGTACTCGTATGA
AGAAGGTTTTGGAAGCACTCGATGGGCTCAAGAAGAAACCAGATGCGCAACCTGACGAGA
TTGTTACCGTAGAGAAACTCATCGGAGAGGCTTATTCTGCAATAGACAAAGCAGTGAAGG
TTAGAGCGCTACACAAGAACACTGGTGCGCGTAGGAAGTCTCGCTTGGCTAGGAGGAAAA
AGGCAGTTGAGATCCACCACGGTTGGTACGTGCCAGACACAGCAGCAGCAGCAGCAACAG
AAGCTGTGACCATGGCTGCGTGACAGAGATAATGGAAAATTCGTTTTTCTTATAAGAGAT
CATATTGAAAAAGATGTGAAAATTGCTTTCAAAATCAAATATGTTTATTTCATGTATAAT
TCATTTCGACTTCAGTTTCTTCTTCTGTACTGTTGAGCCTCAGCTTGTTGTCTTCTTCTT

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

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TTATGTAGATGATGGAATGGATCCAGTTTTGAAGGAAATGCTTGATAGGGAAGTAGAGGA
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AGCTTTTTCTCAGGGTTGATCTATGCAACACAAAGGTGATGTTGAACTGAATGACTTATC
ATATCGAGTGTTGGATATTTAGCTATAGATGACTGATGGGAGAGATAGTTCAGTTTGCCT
TCCATTTTGAACATTGAAGGTCCAGCTGCAGGACACAAATGAAGCTGATAACTCCTAAGC
CCAATGGCTGGAACAGTTTTGGTGATCCCCCACATTTAGATTGTAAGCAATTAGAGAGAG
AGTGGTGTTCTTTCATGGGTGTCCCCTCCTGTAATATATTTGCTTTGTTATTCTCATAAA
CTGTTAATCTTTCGTTGATCCGAGAGTTTAGGATGCAGTTTTGCTTTTCTTTTGATCAAC
CTTTGTATACCACCCTTTTTTAATTATTTATTGGTTACCTTTCTGTATTTTCTTAAACTA
AAGAATAATTACATGAGGAGGATGAGTCC


BQ
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AF RS1E089TF U 1
AF RS1E089JQ C 218
BS 1 631 RS1E089TF
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BS 633 646 RS1E089TF
BS 647 749 RS1E089JQ

RD RS1E089TF 648 0 0
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TTATGTAGATGATGGAATGGATCCAGTTTTGAAGGAAATGCTTGATAGGGAAGTAGAGGA
TTTTGCTCGGAGGTTGAACTCAAGTTGGGTTCTATCTTCAGGACAAGAAAGACAGCCTGT
GCACTTTTCCATAAACGGCAATGGGGCAACAAGGCGATTAACAGGTACACACACACCACA
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ATATCGAGTGTTGGATATTTAGCTATAGATGACTGATGGGAGAGATAGTTCAGTTTGCCT
TCCATTTTGAACATTGAAGGTCCAGCTGCAGGACACAAATGAAGCTGATAACTCCTAAGC
CCAATGGCTGGAACAGTTTTGGTGATCCCCCACATTTAGATTGTAAGCAATTAGAGAGAG
AGTGGTGTTCTTTCATGGGTGTCCCCTCCTGTAATATATTTGCTTTGTTATTCTCATAAA
CTGTTAATCTTTCGTTGATCCGAGAGTTTAG*ATGCAGTTTTGCTT
CT

QA 1 646 1 646
DS 

RD RS1E089JQ 532 0 0
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GATGTTGAACTGAATGACTTATCATATCGAGTGTTGGATATTTAGCTATAGATGACTGAT
GGGAGAGATAGTTCAGTTTGCCTTCCATTTTGAACATTGAAGGTCCAGCTGCAGGACACA
AATGAAGCTGATAACTCCTAAGCCCAATGGCTGGAACAGTTTTGGTGATCCCCCACATTT
AGATTGTAAGCAATTAGAGAGAGAGTGGTGTTCTTTCATGGGTGTCCCCTCCTGTAATAT
ATTTGCTTTGTTATTTTCATAAACTGTTAATCTTTCGTTGATCCGAGAGTTTAGGATGCA
GTTTTGCTTTTCTTTTGATCAACCTTTGTATACCACCCTTTTTTAATTATTTATTGGTTA
CCTTTCTGTATTTTCTTAAACTAAAGAATAATTACATGAGGAGGATGAGTCC

QA 1 532 1 532
DS 



AS 1 2

CO CL8547Contig1 809 2 10 U
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CTCTGATGCGTGCTCTTCTCTTTCCTTTAAGATTCTTTGGCTCAGATCAGTCACAGAGCC
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ACACTGAAACTTTTTTTGCAATAGAGATGGCAGAAGTTGATAATCAACTAGAGATCAAGT
TTAGGTTAACTGATGGTTCTGATATCGGCCCTAAAGCATTTCCTGATGCTACAACTGTTG
CTGCATTGAAGGAAACTGTTATTTCTCAATGGCCTAGAGAAAAGGAAAATGGGCCGAAGA
CAGTGAAAGAGGTGAAGTTGATAAGCGCAGGGAAAGTTTTGGACAACAACAAGACTGTTA
AAGACTACCGAAGCCCCGTCTCTAATCTCGTTGGCGCTGTCACCACAATGCACGTTATCA
TCCAACCTCTGATTACTGAAAAAGAAATGAAGCCTAAAGGTGATGATCCAAAGATGAACA
AATGTGTCTGCTCAGTCATGTAAGACAAACGCAAAATCTCAACAGAGGCAGGTTACTGCT
CTGTTCCCTCATGTGGTTTGGTATAGATTGTTTACTGATGCATAACCATAAGTGTTGAAC
CTTTTTTTTTAAAGTATAAATCAAATCTCTATTTACTAAGCTTGTTCCAAAGATCACAGA
TAGAGTGAACCATTGATGTAGTAGTGATTCAGAACTTGTTGAAACACAACACACAAAGAG
ACTCTGCTTTTACCTCTGTTTTCAGAACC


BQ
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AF RS1FF94TF U 1
AF RS1FF94JQ C 197
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AATGTGTCTGCTCAGTCATGTAAGACAAACGCAAAATCTCAACAGAGGCAGGTTACTGCT
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CTTTTTTTT*AAAGTATAAATCAAATCTCTATTTACTAAGCTTGTTCCAA*GATCACAGA
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TGTTTTCAGAACC

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DS 



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ATATGATACAGCTATGTTTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DP85TF U 1
AF RS1DP85JQ C 124
BS 1 643 RS1DP85TF
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GTGTCTTTGCCACTTGTC

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1DP85JQ 679 0 0
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QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1FI48TF U 1
AF RS1FK78TF U 2
BS 1 385 RS1FI48TF
BS 386 386 RS1FK78TF
BS 387 629 RS1FI48TF
BS 630 738 RS1FK78TF

RD RS1FI48TF 629 0 0
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CGAATTGGTGCATCTTCGATCCCATTCTTCAAAGATCTCACAATCATGCTTTCTTTATCC
TCTTCTTCTTCTTCTTCTTTGCTTCGTCCAAGTTTACACTTCCATTCTTCTCCCGACCAA
TCCGTTGCTATGTCTAGAAGGAGTATTAGCTCGTTCCGTCGGAAAGTCCCTTGCTGTTCC
ATAGCCACTAAATTCGATAGTCTATCAAAGTCAGGAGGAGGTTTGCGAGAGCCTGGGGAT
GATTCTGATGTTCTTATAGAATGTCGAGATGTCTACAAATCATTTGGGGATAAACATATC
TTGAAAGGTGTTTCCTTTAAGATTAGACGTGGCGAGGCTGTTGGGGTGATTGGTCCTTCT
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AAATGTTGGCTTTCTACTCTATGAAAATT

QA 1 629 1 629
DS 

RD RS1FK78TF 737 0 0
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CTTCTTCTTCTTCTTCTTTGCTTCGTCCAAGTTTACACTTCCATTCTTCTCCCGACCAAT
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ATTCTGATGTTCTTATAGAATGTCGAGATGTCTACAAATCATTTGGGGATAAACATATCT
TGAAAGGTGTTTCCTTTAAGATTACA**TGGCGAGGCTGTTGGGGTGATTGGTCCTTCTG
GGACTGGAAAATCAACCATTTTAAAGATCATGGCTGGTCTTCTTGCTCCCGACAAGGGAG
AGGTTTATATACGAGGAAAAAAA*CGAGCTGGTTTGATAAGTGATGAGGAGATATCAGGG
CTTCGTATTGGCCTTGTTTTTCAGAGTGCAGCTCTCTTTGATTCTCTTACAGTTCGTGAA
AATGTTGGCTTTCTACTCTATGAAAATTCTAAAATGTCTGAGAATCAAATATCTGAGCTT
GTGACACAGACCTTGGCAGCTGTTGGTTTGAAGGTGTTGAGATCGACTACCTTCTGAGCT
ATCTGGTGGGATGAAGA

QA 1 737 1 737
DS 



AS 1 2

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AATAAAGCACCTTCAATGGATAAAGATTCAATGGTGGAGGTGAAGAATAGATTCAAGAAA
ATGAGCGTGGTTCCAGATGAAAATTGTTTTGCTAATGCCATCCTCAATCTCAAGGAACAC
CAGAAACCAGCCATTGTCATCCGGAATACCAGTTTCTGTGATGTCCGTTTTTCCTACCTG
AGAAAACTTAGGCTCGCACGGTCATGCATTCAGGCTAAGCTCTCTACGGTTATCCAAGAG
TTTAAGATCATCAATGAACCTGTGTGCATAGACTATTTCGAGCACTACTTCGATGACTTG
GACCTTGCTCTAGTGCAGCTCAAGTATGCACGTCAATTGCTCATGAAAATCGTCAGGTAT
TTTATCCAGCTTATGGAAAAGGATGATTGTAAGACCCTGGACCGGTGCAAGTATCTGAAA
GTGAATGCTGTTGGTTGTATGTATACCATTGCAATGAGATGCCTCCCTATTTTGGCTTAT
ATCGAAAAGGTCAGGCAACACATGCTGGCTCAGGACGTTGATGCCACTCCCGACTTTGTT
TTAGCTAAGGAAGACTGCACAATCCCCCACATATCTGCCTTTAAGGTTGAAAAGGCTACC
GACTTTGTTCATCAAGACACTTTGCGTTGGCTTGAAGATTTGGAAGAGAAACATGGCTTT
AGGCTCCACGATTCTGCTCACAAGCTTCATGATTGTGCTCAGCTTTCCTGCAACCCATTA
GTAGCATGAGAGCTCGTTTGCTCTGTTGAATAATTTAAGGTTTCTCGGCCTTCTGTTTAA
TTTATGTTTTCTGACATTAGCTATGCTTGTTTTGGACCCTCCTTTTGCTGTCTTTTATCT
TAAGAACATATTTTCTCTTTAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1EJ07TF U 1
AF RS1EJ07JQ C 243
BS 1 566 RS1EJ07TF
BS 567 923 RS1EJ07JQ

RD RS1EJ07TF 566 0 0
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ATCGAAAAGGTCAGGCAACACATGCT

QA 1 566 1 566
DS 

RD RS1EJ07JQ 681 0 0
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GAATGCTGTTGGTTGTATGTATACCATTGCAATGAGATGCCTCCCTATTTTGGCTTATAT
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AGCTAAGGAAGACTGCACAATCCCCCACATATCTGCCTTTAAGGTTGAAAAGGCTACCGA
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TATGTTTTCTGACATTAGCTATGCTTGTTTTGGACCCTCCTTTTGCTGTCTTTTATCTTA
AGAACATATTTTCTCTTTAAT

QA 1 681 1 681
DS 



AS 1 2

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BQ
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20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1EG47JQ C 1
AF RS1EG47TF U 1
BS 1 289 RS1EG47TF

RD RS1EG47JQ 289 0 0
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CTCCGATTCATGCACCGGTTACACCTCCGGCGAGCAACCTCATCATATCAGCAACAACGG
CCGCAGAAACTCAAAAGAAGAACAGGATTCAAGTTTCTAACACCAAGAAACCCTTGTTTT
TTTACGTTAATCTCGCCAAGGTAAGTGCAAAACTATTCGTTAATTATCACAACAATTTTC
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QA 1 289 1 289
DS 

RD RS1EG47TF 289 0 0
GGGTTAAACTCAAAAGATCGTGATATCGCAGTTGAGATTAAATGGCGATGGAAATAGCAA
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CCGCAGAAACTCAAAAGAAGAACAGGATTCAAGTTTCTAACACCAAGAAACCCTTGTTCT
TCTACGTTAATCTCGCCAAGGTAAGTGCAAAACTATTCGTTAATTATCACAACAATTTTC
TTGGACGTCAAGTAATTAACCCAATTTATATATGAATCTAGTGAATGGC

QA 1 289 1 289
DS 



AS 1 2

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GGACCACAATCTTCCAATGTCTCATCTTGCAACAGGTGATCGTTCTGGTTCTCGCCAGAC
CGATGTTTCTTGTTGCGATTCTTCTCCTGCCGTGGCAAGAACCTGGCGACATCAGAAGCA
AGCGCTTTGATGGAGCTCGAAACCTCTTTGGTAGGCAAAGCTTCGAGCTTCTCTAGCCAG
ATTCCACATGTTGCGTAAATGGGGGGACCATGGTTCCTCGGAGAGATTTCTGGCACGCGC
CTTTTCCGCTTGGAGGATCTTTGTGGTAAGGTGACACATTTCTCCAGCCATTCGTTTATA
GCTTTAATGTACGATCTTTGACCTGTGATCCACTTTGTGAAGCTTGAAGCCAACCCCCTG
AGTTCATCTTCTAGGTGACATGTTACTTGTCTGTGCAACTCTGACTGCATGTTGAGTTTA
ATGTTACCGCCT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ES96TF U 1
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DS 

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QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EQ05TF U 1
AF RS1EQ05JQ C 45
BS 1 670 RS1EQ05TF
BS 671 788 RS1EQ05JQ

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QA 1 670 1 670
DS 

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QA 1 744 1 744
DS 



AS 1 2

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TGCCTTTCGTTTTACTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EB39JQ C 1
AF RS1EB39TF U 1
BS 1 618 RS1EB39TF

RD RS1EB39JQ 618 0 0
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TGCCTTTCGTTTTACTTC

QA 1 618 1 618
DS 

RD RS1EB39TF 618 0 0
TTTTTAATTGAAAAAACTCAATATAGATTAGTTATAAATCTATTTCTAATGATTTTCTTA
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TCGGAGTTGAAAAAAAAAAACAAGAGAAAATTTGAATCTAGTACAAATAATTTTGGCGGC
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GATAGGCAGAGAGGGAATTAAATTAATAGTTTTGGAAAGGACCTAAGATACTTTGGATAT
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TGCCTTTCGTTTTACTTC

QA 1 618 1 618
DS 



AS 1 2

CO CL8555Contig1 741 2 2 U
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GATTTTGCTTTTCCGGCGAAACCGAGTTTTGTTGGCGGAAGAACTCGACGCGTGATCGCT
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AGTCGTGGTTTTGTCCTCGTTTTACTTGTTTTTGCCACTTTTATGTGTCGTGTCTTTCTC
TCATCTTGTCGCAGGATCCTTCTTTTGTCAGTTCCATATATAGATTTGTGTTCTTGTAAT
GATGTAATCCACAGTTTTGTAAAAGGCTCGGTTCATCTTCTGTGGTTAAATAAAAAATTG
TATCCTAAACGGATGTGACCG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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QA 1 758 1 758
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TAATATTTTAAAATC


BQ
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AF RS1A428JQ C 1
AF RS1A428TF U 1
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DS 

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QA 1 615 1 615
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AS 1 2

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BQ
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AF RS1BC06TF U 1
AF RS1BC06JQ C 135
BS 1 722 RS1BC06TF
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RD RS1BC06TF 754 0 0
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CCGAAGATCGAATCACCCTGTGATAACTCTGGAAGTCGAGTGGCTTCTGGTTGATGGAAT
CA*TGAT*GTACTCCTAAGTATGGTGTTTAGTAG

QA 1 754 1 754
DS 

RD RS1BC06JQ 764 0 0
CTTTCGGGATATGGATACAATGCTGAAACGGCTGATCATAAACAAAGAGAACAACAACAG
CTTTTGCTTTGTTCTTCTTCACATGAAACGTGTTGTGTTGCGGAAAGATGAATCTATGAG
GAGCGAACTTGAGAGACTTCAGCTTGCTATTGAGAGACTGAAGGGTAAGGAGCTTGAGGG
TATGAGTTTCTCGGATCTTATTCCTCTTGAAAACCAGTTGAATGATAGCTTGCACAGTGT
CAAGAATCAAAAGACACAACTCTTGCTCAGCCAGGTGGAAAGATCCAGGTTACAGGAGAG
AAGGGCATTGGAAGAGAATCAACTCTTGCGCAAACAGGTAGAGATGTTGGGGAGAGGTTC
ATCAGGACCAAAAGGGTTGAGTTAAATACCTCAATTCTCTAGCCCACAAGCGGAGCACGA
GAGCTCTTCTTCAGATGATGACGATAATGACAATGAGGAGCACTATTCCGACACTTCCTT
GCAGCTGGGGTTGTCATGGTCGGGGTATTCTAGAAAGATAAAGAAGCCGAAGATCGAATC
ACCCTGTGATAACTCTGGAAGTCGAGTGGCTTCTGGTTGATGGAATCAATGATTGTACTC
CTAAGTATGGTGTTTAGTAGAGGTTTTATTGTGTATTATCCTTGTTCCTGGCTGTTCTTT
TGGTTTTACATGGTACCAATTAGAGTTTGCTTTATGTTTTAGGTGAACCGTTTACCTTGA
ATCAAAAAGGGTTTGATTGATCAAATAACATCTGTTTTTAGTTC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL8560Contig1 644 2 1 U
GGACATCAAAACTCATTCTCTGAACAAGAAAAGAGTAAACTTTCGTTCATTTCTCAACCT
CAAATGGCTCGTACCAAGCAAACGGCAAGAAAATCCACCGGAGGAAAGGCTCCGAGGAAG
CAGCTGGCGACGAAAGCGGCGAGGAAAACTGCTCCGGCCACCGGAGGAGTGAAGAAGCCG
CACAGATTCCGTCCCGGAACTGTCGCATTGAGAGAGATCAGGAAGTACCAGAAGAGCACC
GAGCTTCTGATCCGCAAGCTTCCCTTCCAGCGTCTTGTCCGTGAGATCGCTCAGGATTTC
AAGACGGATCTGAGGTTCCAGAGCAGCGCCGTCGCGGCTCTCCAGGAGGCGGCGGAGGTT
TACCTCGTTGGGCTGTTCGAGGACACGAACCTTTGTGCGATTCACGCGAAGAGGGTCACC
ATCATGCCTAAAGATATCCAGCTCGCGAGGAGGATCAGGGGTGAGAGGGCTTGAAGCGGA
GATGATGAAGAAGAAAGAGAAGAACAATGGTTTCTTAAATTTGCTTTTAACTACTTTGGT
TTGTTTAAATCAGTTCGTGTAAATCTTTTTATTAAAAGTGTTTTTCAAGTCTTTTGATTT
GATGAATGTCTCTACATGAATATCAATCTAGTGTTATTTTATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1F253TF U 1
AF RS1F253JQ C 22
BS 1 644 RS1F253TF

RD RS1F253TF 644 0 0
GGACATCAAAACTCATTCTCTGAACAAGAAAAGAGTAAACTTTCGTTCATTTCTCAACCT
CAAATGGCTCGTACCAAGCAAACGGCAAGAAAATCCACCGGAGGAAAGGCTCCGAGGAAG
CAGCTGGCGACGAAAGCGGCGAGGAAAACTGCTCCGGCCACCGGAGGAGTGAAGAAGCCG
CACAGATTCCGTCCCGGAACTGTCGCATTGAGAGAGATCAGGAAGTACCAGAAGAGCACC
GAGCTTCTGATCCGCAAGCTTCCCTTCCAGCGTCTTGTCCGTGAGATCGCTCAGGATTTC
AAGACGGATCTGAGGTTCCAGAGCAGCGCCGTCGCGGCTCTCCAGGAGGCGGCGGAGGTT
TACCTCGTTGGGCTGTTCGAGGACACGAACCTTTGTGCGATTCACGCGAAGAGGGTCACC
ATCATGCCTAAAGATATCCAGCTCGCGAGGAGGATCAGGGGTGAGAGGGCTTGAAGCGGA
GATGATGAAGAAGAAAGAGAAGAACAATGGTTTCTTAAATTTGCTTTTAACTACTTTGGT
TTGTTTAAATCAGTTCGTGTAAATCTTTTTATTAAAAGTGTTTTTCAAGTCTTTTGATTT
GATGAATGTCTCTACATGAATATCAATCTAGTGTTATTTTATCG

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1F253JQ 623 0 0
GAACAAGAAAAGAGTAAACTTTCGTTCATTTCTCAACCTCAAATGGCTCGTACCAAGCAA
ACGGCAAGAAAATCCACCGGAGGAAAGGCTCCGAGGAAGCAGCTGGCGACGAAAGCGGCG
AGGAAAACTGCTCCGGCCACCGGAGGAGTGAAGAAGCCGCACAGATTCCGTCCCGGAACT
GTCGCATTGAGAGAGATCAGGAAGTACCAGAAGAGCACCGAGCTTTTGATCCGCAAGCTT
CCCTTCCAGCGTCTTGTCCGTGAGATCGCTCAGGATTTCAAGACGGATTTGAGGTTCCAG
AGCAGCGCCGTCGCGGCTCTCCAGGAGGCGGCGGAGGTTTACCTCGTTGGGCTGTTCGAG
GACACGAACCTTTGTGCGATTCACGCGAAGAGGGTCACCATCATGCCTAAAGATATCCAG
CTCGCGAGGAGGATCAGGGGTGAGAGGGCTTGAAGCGGAGATGATGAAGAAGAAGGAGAA
GAACAATGGTTTCTTAAATTTGCTTTTAACTACTTTGGTTTGTTTAAATCAGTTCGTGTA
AATCTTTTTATTAAAAGTGTTTTTCAAGTCTTTTGATTTGATGAATGTCTCTACATGAAT
ATCAATCTAGTGTTATTTTATCG

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 2

CO CL8561Contig1 813 2 24 U
ACTGAATTTTTATTCTTGCAAGTTTCTATAAATGGCAACCTTCATTTGCCTTCTCATACA
AGAAAATACATTATAACCCTAAATAAACCGTCACCTTATACATATCTTTTGAATAAAAAT
CAAAACACACCAAAAGACAGTATTTTTTTTAGTTTTTGAAAATAAAACCCCACACACACT
TCATTTCTTGTAATAATAATAATAATAATCCATTCATCTACCGCTGACGAACGCTTATAA
GCTTAACATCATCGATCACAGGCCCACACAAAGACGAAAAATCATCGCTCCTCATGGAAT
AGAAAGTGCTGTAAAACATAACTCTAGTTCTCGTCGAAACCGCCACGAACCGTATCGAAG
CACGTTTAAACCCTCCAGTGCCACGCGACTCGTAAGGAACCTTGAGCGTATCTCTCCCCG
CGAAAGCCTCGACCACCATCGATCCTATGCAAGCGTTGTTGGCGTCTCCGACCGCGAACG
AAAGGACGTAAGTCTTCCCGATGATGGTCCTAGCCACTTGAGCGATGGCGCTCTCTTTGC
CCGCTACCAGCTCGATGGCTCGGCGACCTTGCGGGACTGAGAAGTGTTCCGTGTCCACGT
ACTTGACGGCTTTGAGTGACTCCACCATCCATCCGGGTAAAGGAGTGTGGTCGTCTTCTA
TGAACGGTGGGATTAAAACTCCTGTGGCTGAGCCTGGTAGTACTAGTGGACCTTCTTCAA
ATCCTCCGTTCTTCAAAATGTTCTTGTTTGTTGGTCGTGGAGGGTAAAGAGCTCTCATGG
CAACACCATCAATGAGAGGACACAAGCTGGATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GN29JQ U 1
AF RS1D633JQ U 48
BS 1 69 RS1GN29JQ
BS 70 70 RS1D633JQ
BS 71 159 RS1GN29JQ
BS 160 160 RS1D633JQ
BS 161 205 RS1GN29JQ
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BS 209 247 RS1GN29JQ
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BS 272 272 RS1D633JQ
BS 273 319 RS1GN29JQ
BS 320 320 RS1D633JQ
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BS 590 590 RS1D633JQ
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BS 731 731 RS1D633JQ
BS 732 764 RS1GN29JQ
BS 765 813 RS1D633JQ

RD RS1GN29JQ 764 0 0
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AGAAAATACGTTATAACCCTAAATAAACCGTCACCTTATACATATCTTTTGAATAAAAAT
CAAAACACACCAAAAGACAGTATTTTTTTTAGTTTTTGAGAATAAAACCCCACACACACT
TCATTTCTTGTAATAATAATAATAA***TCCATTCATCTACCGCTGACGAACGCTTATAA
GCTTAACGTCGTCGATCACAGGCCCACACAAGGACGAAAAATCATCGCTCCTCATGGAAT
AGAAAGTGCTGTAAAACATGACTCTAGTTCTCGTCGAAACCGCCACGAACCGTATCGAAG
CCCGTTTAAACCCTCCAGTGCCACGCGACTCGTAAGGAACCTTGAGCGTATCTCTCCCCG
CGAAAGCCTCGACCACCATCGATCCTATGCAGGCGTTGTTGGCGTCTCCGACCGCGAACG
AAAGGACGTAAGTCTTCCCGATGATGGTCCTAGCCACTTGAGCGATGGCGCTCTCTTTGC
CCGCTACCAGCTCGATGGCTCGGCGACCTTGCGGGACTGAGAAGTGTTCTGTGTCCACGT
ACTTGACGGCTTTGAGTGACTCCACCATCCATCCGGGTAAAGGAGTGTGGTCGTCTTCTA
TGAACGGTGGGATTAAAACTCCTGTGGCTGAGCCTGGTAGTACTAGTGGACCTTCTTCAA
ATCCTCCGTTTTTCAAAATGTTCTTGTTTGTTGGTCGTGGAGGG

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1D633JQ 766 0 0
GCCTTCTCATACAAGAAAATACATTATAACCCTAAATAAACCGTCACCTTATACATATCT
TTTGAATAAAAATCAAAACACACCAAAAGACAGTATTTTTTTTAGTTTTTGAAAATAAAA
CCCCACACACACTTCATTTCTTGTAATAATAATAATAATAATTCATTCATCTACCGCTGA
CGAACGCTTATAAGCTTAACATCATCGATCACAGGCCCACACAGAGACGAGAAATCATCG
CTCCTCATGGCATAGAAAGTGCTGTAAAACATAACTCTAGTTCTGGTCGAAACCGCCACG
AACCGTATCGAAGCACGTTTAAACCCTCCAGTGCCACGCGACTCGTAAGGAACCTTGAGC
GTATCTCTTCCCGCGAAAGCCTCGACCACCATCGATCCTTTGCAAGCGTTGTTGGCGTCT
CCGACCGCGAACGAAAGGACGTAAGTCTTCCCGATGATGGTCCTCGCCACTTGAGCGATG
GCGCTCTCTTTGCCCGCTACCAGCTCGATGGCTCGGCGACCTTGTGGGACTGAGAAGTGT
TCCGTGTCTACGTACTTGACGGCTTTGAGTGACTCCACCATCCATCCGGGTAAGGGAGTG
TGGTCGTCTTCTATGAACGGTGGGATTAAAACTCCTGTGGTTGAGCCTGGTAGTACTAGT
GGACCTTCTTCAAATCCTCCGTTCTTCAAAATGTTTTTGTTTGTTGGTCGTGGAGGGTAA
AGAGCTCTCATGGCAACACCATCAATGAGAGGACACAAGCTGGATC

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

CO CL8562Contig1 612 2 1 U
GGATTGTCCCATATTATCTCAAACAGAGAGAGAACTCAAAGATTCAGCAAGTAGTACGTT
ATTATCATCGGTGGAGGTAGAAGATGTTGGGAATTTTCAGCGGAGCCATAGTATCGCTAC
CGGAAGAGCTGGTTGCGGCCGGCAGTCGGACTCCTTCTCCAAAGACAACCGGGTCGGCTC
TAGTTAACAAGTTCGTCGAGAAAAACCCATCCGCTGTGTCCGTACAAGTCGGCGACTATG
TGCAGCTTGCGTATACCCACCACAAAGAGAGTCCTCTCCGGCCAAGGTCATTTGGGGCTA
AGGATGATCTTGAGTTGCTAAAAGGGGCTTGTGGAAAATCTCTTGCTTCTTTCCCTCAAG
GATGCTTTTATTCAACTGCGTTAGGTGGGCTTAGGAGCTTTGAGAACTCTAAGAATAAGA
TCACTGCCATTCCTGCTAAAGAGGAAGAAATTTGGGGAGCCACTTTCAAGGTGGAAGGAG
CAACAGTTCTTGCAGATTGAGAATGAGAACTCTTTAACAGCAAAAAGAAATAATGATGTA
GAAAAAACAAGCTGTCCTATGAGTTTCTTTAAAGCTATCAATGGTTGGTGATGAAGTGTT
TAGTGTTGTAGC


BQ
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AF RS1C667JQ C 1
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ATTATCATCGGTGGAGGTAGAAGATGTTGGGAATTTTCAGCGGAGCCATAGTATCGCTAC
CGGAAGAGCTGGTTGCGGCCGGCAGTCGGACTCCTTCTCCAAAGACAACCGGGTCGGCTC
TAGTTAACAAGTTCGTCGAGAAAAACCCATCCGCTGTGTCCGTACAAGTCGGCGACTATG
TGCAGCTTGCGTATACCCACCACAAAGAGAGTCCTCTCCGGCCAAGGTCATTTGGGGCTA
AGGATGATCTTGAGTTGCTAAAAGGGGCTTGTGGAAAATCTCTTGCTTCTTTCCCTCAAG
GATGCTTTTATTCAACTGCGTTAGGTGGGCTTAGGAGCTTTGAGAACTCTAAGAATAAGA
TCACTGCCATTCCTGCTAAAGAGGAAGAAATTTGGGGAGCCACTTTCAAGGTGGAAGGAG
CAACAGTTCTTGCAGATTGAGAATGAGAACTCTTTAACAGCAAAAAGAAATAATGATGTA
GAAAAAACAAGCTGTCCTATGAGTTTCTTTAAAGCTATCAATGGTTGGTGATGAAGTGTT
TAGTGTTGTAGC

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 2

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CACCATGTTTAAGTCTATCTCTCTTCTCTCTTTCCGTTTGTTGTACTTTCTGATGTGTAA
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BQ
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AF RS1H086TF U 1
AF RS1AD19TF U 5
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CACCATGTTTAAGTCTATCTCTCTTCTCTCTTTCCGTTTGTTGTACTTTCTGATGTGTAA
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DS 

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GGG
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QA 4 528 4 528
DS 



AS 1 2

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ACATCGGAGCTCACTCCAAATCTTCGTCCGTGTTTATTCCTCACGGTCCCGGCGCCGTCG
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ATCTCTCACTGTATTTGGTTGTCAAAGTATACGTGTGTTATTGTGTGGCCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GN54TF U 1
AF RS1GN54JQ C 484
BS 1 675 RS1GN54TF
BS 676 676 RS1GN54JQ
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BS 733 799 RS1GN54TF
BS 800 1191 RS1GN54JQ

RD RS1GN54TF 800 0 0
GGAACTCATTCTTGTTCTTATCCTAACAAGACTAAGTAATGGGTAACCTTTTGTGCTGCG
TGCTGGTGAAGCAATCGGATGTGGCGATCAAGGAGAGATTTGGCAAGTTTCAAAAAGTGC
TTAATCCAGGTCTCCAGTTTGTGCCCTGGGTCATAGGTGATTATGTCGCCGGTCAACTCA
CCCTCCGTCTCCAACAACTCGATGTTCAATGCGAAACCAAGACAAAGGGCAATGTGTTTG
TGACGGTGGATGCATCCATACAATACAGAGTCTTGGTTGACAAGGCAAGTGATGCTTTCT
ACAGACTTAGCAATCCAACATCACAAATCAAAGCCTATGTCTTTGATATGATCAGAGCAT
GTGTACCGAAACTGAACTTGGACGACGTGTTCGAGCAGAAGAATGAAATAGCCAAATCCG
TGGAAGAAGAGCTAGACAAAGCCATGACTGCTTATGGTTATGAGATCCTTCAAACCCTTA
TCATCGACATCGAGCCTGATCAACAGGTCAAACGCGCCATGAACGAAATCAACGCCGCGG
CGAGGATGAGAGTGGCGGCGAACGAGAAAGCAGAGGCGGAGAAAATCATTCAGATAAAGA
GAGCAGAAGGTGAAGCTGAGTCCAAGTACCTTTCTGGTCTCGGTATCGCTCGCCAGAGAC
AAGCTATCGTGGACG*TCTCAGAGACAGTGTTCTCGGTT*CGCTGGAA*CGTGCCGGGGA
CGTCAGCTAAG*ATGTGTTGGACATGGTGATGATGACTCAGTACTTTGACACGATGAGAG
ACATCGGAGCTCACTCCAA
T

QA 1 799 1 799
DS 

RD RS1GN54JQ 708 0 0
TCGACATCGAGCCTGATCAACAGGTCAAACGCGCCATGAACGAAATCAACGCCGCGGCGA
GGATGAGAGTGGCGGCGAACGAGAAAGCAGAGGCGGAGAAAATCATTCAGATAAAGAGAG
CAGAAGGTGAAGCTGAGTCCAAGTACCTTTCTGGTCTCGGTATCGCTCGCCAGAGACAAG
CTATCGTGGACGGTCTCAGAGACAGTGTTCTCGGTTTCGCTGGAAACGTGCCGGGGACGT
CAGCTAAGGATGTGTTGGACATGGTGATGATGACTCAGTACTTTGACACGATGAGAGACA
TCGGAGCTCACTCCAAATCTTCGTCCGTGTTTATTCCTCACGGTCCCGGCGCCGTCGCTG
ACGTGGCAACACAGATTCGAAATGGATTACTTCAGGCCCACCAGACCAATCCCTAAAATG
GCTCTGTCAAGAGTCAACTCTCTAAAAGTCTTCTTCCCACTAAATATTTATGATATGATA
TATACATATTTTTTCATCGTGATTGTGGTTTTATATTTTCTTTTGCCATATTTAATAATT
CTGTCTGTCTTTTTTTTTTGGTCGAAATAGTTGTGTCCGTCTGTCTTTGTGATTTTGTAA
TTATATTGCCAATTAAGTTTGTATAAAAGTTAAAAAAAGATGTAAGTATATAACTGTATC
TCTCACTGTATTTGGTTGTCAAAGTATACGTGTGTTATTGTGTGGCCC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

CO CL8565Contig1 865 2 3 U
TGGCATCTACTCTTCTCTCTTCACTTCACACTGAGCTGTTCACCACTGAAGATGTCGCAG
ATGGTTTCGTCATGCTCCTAGAGTCTGCAGAAGACACAGCTCTTGACATCCTGGATGCTT
CCAACGAACTTGCTCTCTTCCTAGCTAGAGCTGTGATCGATGATGTTTTATCACCTTTTA
GCCTCGAGGAGATCTCTAGCAGACTGCCACCAAACTCAAGCGGGACTGAAACCGTGAAGA
TGGCTAGGTCACTTATCTTTGCACGCCACGCAGGGGAGAGGCTTCTGCGTTGCTGGGGAG
GTGGAACAGGATGGGCAGTGGAAGACGCTAAAGACAAGACCTTGAATCTTCTAGAGGAAT
ATGAAAGCTCAGGGCTCGTATCAGAAGCTTGCAAATGCATCCGTGAGCTAGGCATGCCTT
TCTTCAACCACGAGGTGGTGAAAAAGGCGCTGGTCATGGCCATGGAGAAGAAGAAGGACA
AGATTGTGCTTGAGCTTCTCCAGGAGAGTTTCGGTGAAGGGCTCATAACCACAAACCAGA
TGACCAAAGGGTTTACTAGAGTCAAAGACGGGCTTGAAGATCTTGCCTTGGACATCCCAA
ACGCAAAAGAGAAGTTCAGTGAGTATGTGGAGCATGCAAAGAAGAGTGGTTGGGTCTCCT
CCTCGTTTGTAACTTCACTTACCGAAGATGCTAAGCTAGCCTAAACCAATGTACAAGTTT
GTTGAGCATCATCCCTTTTGTTGTTTCTTTGCACTTTTATGCTTTGAGAATTCTACAAGG
GAGAGAGCTATAATCTTTTCACGGATGATTAAAAACGTTTGTTTCTTCAGGGACCAGTTT
TTAAAAATAAAGAACTTTTGGGGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BY74TF U 81
AF RS1E530JQ C 1
BS 1 80 RS1E530JQ
BS 81 715 RS1BY74TF
BS 716 865 RS1E530JQ

RD RS1BY74TF 635 0 0
GAGTCTGCAGAAGACACAGCTCTTGACATCCTGGATGCTTCCAACGAACTTGCTCTCTTC
CTAGCTAGAGCTGTGATCGATGATGTTTTATCACCTTTTAGCCTCGAGGAGATCTCTAGC
AGACTGCCACCAAACTCAAGCGGGACTGAAACCGTGAAGATGGCTAGGTCACTTATCTTT
GCACGCCACGCAGGGGAGAGGCTTCTGCGTTGCTGGGGAGGTGGAACAGGATGGGCAGTG
GAAGACGCTAAAGACAAGACCTTGAATCTTCTAGAGGAATATGAAAGCTCAGGGCTCGTA
TCAGAAGCTTGCAAATGCATCCGTGAGCTAGGCATGCCTTTCTTCAACCACGAGGTGGTG
AAAAAGGCGCTGGTCATGGCCATGGAGAAGAAGAAGGACAAGATTGTGCTTGAGCTTCTC
CAGGAGAGTTTCGGTGAAGGGCTCATAACCACAAACCAGATGACCAAAGGGTTTACTAGA
GTCAAAGACGGGCTTGAAGATCTTGCCTTGGACATCCCAAACGCAAAAGAGAAGTTCAGT
GAGTATGTGGAGCATGCAAAGAAGAGTGGTTGGGTCTCCTCCTCGTTTGTAACTTCACTT
ACCGAAGATGCTAAGCTAGCCTAAACCAATGTACA

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1E530JQ 865 0 0
TGGCATCTACTCTTCTCTCTTCACTTCACACTGAGCTGTTCACCACTGAAGATGTCGCAG
ATGGTTTCGTCATGCTCCTAGAGTCTGCAGAAGACACAGCTCTTGACATCCTGGATGCTT
CCAACGAACTTGCTCTCTTCCTAGCTAGAGCTGTGATCGATGATGTTTTATCACCTTTTA
GCCTCGAGGAGATCTCTAGCAGACTGCCACCAAACTCAAGCGGGACTGAGACCGTGAAGA
TGGCTAGGTCACTTATCTTTGCACGCCACGCAGGGGATAGGCTTCTGCGTTGCTGGGGAG
GTGGAACAGGATGGGCAGTGGAAGACGCTAAAGACAAGATCTTGAATCTTCTAGAGGAAT
ATGAAAGTTCAGGGCTCGTATCAGAAGCTTGCAAATGCATCCGTGAGCTAGGCATGCCTT
TCTTCAACCACGAGGTGGTGAAAAAGGCGCTGGTCATGGCCATGGAGAAGAAGAAGGACA
AGATTGTGCTTGAGCTTCTCCAGGAGAGTTTCGGTGAAGGGCTCATAACCACAAACCAGA
TGACCAAAGGGTTTACTAGAGTCAAAGACGGGCTTGAAGATCTTGCCTTGGACATCCCAA
ACGCAAAGGAGAAGTTCAGTGAGTATGTGGAGCATGCAAAGAAGGGTGGTTGGGTCTCCT
CCTCGTTTGTAACTTCACTTACCGAAGATGCTAAGCTAGCCTAAACCAATGTACAAGTTT
GTTGAGCATCATCCCTTTTGTTGTTTCTTTGCACTTTTATGCTTTGAGAATTCTACAAGG
GAGAGAGCTATAATCTTTTCACGGATGATTAAAAACGTTTGTTTCTTCAGGGACCAGTTT
TTAAAAATAAAGAACTTTTGGGGCG

QA 1 865 1 865
DS 



AS 1 2

CO CL8566Contig1 1076 2 16 U
GGCACATAACGAAGCTATTAAATCATTTGACGCTCAGCATTTTGGAAGACAGCATGCAAA
GAAATCTGTGGATCAGTTGGATGATCAAATGCAAGAGGTATATAAGAACTTTGTTCTTGC
AAATGAGTACCAATCGTCAAAGCTCTGCGAAGCGCTATACACAAAGTGTGAAGACGACAT
GGACCGCTTACAAGCTCTCCGGCTCCCTTCCATGGCGAAATTCAACGCAGGGTTCGTGTA
CTGCAACCAGAGTTTTGAACAACAATGTGTCGGTCCATCGAAACAAAACTATGAGCAGAG
GTTAACCAAGATGATGGGGAAGGCACGGTCATTGTTCATCAAAGAATACAATAACAGTCT
GTTCAACTGGCTGGTTGCCTTCTCTCTGGTAATGGTAGTGGTGGGACGGTTCATTATAAA
ATTCATTTTGTTGGAAATGGCGGCATGGATACTCTTCATATTCTTGGAGACGTACACAAG
GATGTTCTGGACAGCTGAATCTCTTTTCTACAACCCGGTCTGGCATTTCATCGTCGGGAC
TTGGGAGACTCTTGTGTATAGTCCCGTTCTCGACTTGGACAGATGGGCGATTCCTATAGT
CTGTATAATTGCATTGTGTGTGTTATATTGGCGGTGTTATGGAAAGAGGAAACACGGTTC
TAGTTGGCTTCTTCCGATGTACAACAAGAATGGTCGGAGCAGGGAACGGCCAGAGTAAAA
ACACATTGCTCCTCCTTCCTTCCCCTTATAACTTATACATAGCATCTTCTCGGGCATGCT
CGTTGCTTTTGTCATCCGAAGCTCTCTGCCCGTTACAACCAATTTTTGGGACGCAGAAGA
AAATTTCAGTTAAGAAGTGAAGAAAGAATAGAGATATGATGATTTGATTGATCCATGTTG
GTTTTGCTTTGATGCCTATATACACTGCACTCTGTACCATTTACATACAGTTACATTCAC
CATGTTTTAACTTTTATATATAGAGTTCTAGGATGCGTAAGAGATTATTTGGGCTGCAGT
TGTTTGAAATGGTTTGGTTACACATGATTGGTTGAATATTTATTCTGAGGTGGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B504TF U 1
AF RS1B504JQ C 376
BS 1 703 RS1B504TF
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BS 801 809 RS1B504TF
BS 810 1076 RS1B504JQ

RD RS1B504TF 817 0 0
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GTTCAACTGGCTGGTTGCCTTCTCTCTGGTAATGGTAGTGGTGGGACGGTTCATTATAAA
ATTCATTTTGTTGGAAATGGCGGCATGGATACTCTTCATATTCTTGGAGACGTACACAAG
GATGTTCTGGACAGCTGAATCTCTTTTCTACAACCCGGTCTGGCATTTCATCGTCGGGAC
TTGGGAGACTCTTGTGTATAGTCCCGTTCTCGACTTGGACAGATGGGCGATTCCTATAGT
CTGTATAATTGCATTGTGTGTGTTATATTGGCGGTGTTATGGAAAGAGGAAACACGGTTC
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*CACATTGCTCCTCCTTCCTTCCC*TTATA*CTTATACATAGCATCT*CTCGGGCATGCT
CGTTGCTTT*GTCATCCGA*GCTCTCTGC
TCGTACAC

QA 1 809 1 809
DS 

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TTG
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GGCGGCATGGATACTCTTCATATTCTTGGAGACGTACACAAGGATGTTCTGGACAGCTGA
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TAGTCCCGTTCTCGACTTGGACAGATGGGCGATTCCTATAGTCTGTATAATTGCATTGTG
TGTGTTATATTGGCGGTGTTATGGAAAGAGGAAACACGGTTCTAGTTGGCTTCTTCCGAT
GTACAACAAGAATGGTCGGAGCAGGGAACGGCCAGAGTAAAAACACATTGCTCCTCCTTC
CTTCCCCTTATAACTTATACATAGCATCTTCTCGGGCATGCTCGTTGCTTTTGTCATCCG
AAGCTCTCTGCCCGTTACAACCAATTTTTGGGACGCAGAAGAAAATTTCAGTTAAGAAGT
GAAGAAAGAATAGAGATATGATGATTTGATTGATCCATGTTGGTTTTGCTTTGATGCCTA
TATACACTGCACTCTGTACCATTTACATACAGTTACATTCACCATGTTTTAACTTTTATA
TATAGAGTTCTAGGATGCGTAAGAGATTATTTGGGCTGCAGTTGTTTGAAATGGTTTGGT
TACACATGATTGGTTGAATATTTATTCTGAGGTGGCTT

QA 4 701 4 701
DS 



AS 1 2

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ACCAGGTTTGGTTTGATCCGGTAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AX80JQ C 1
AF RS1DA28TF U 93
BS 1 103 RS1AX80JQ
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BS 739 745 RS1AX80JQ

RD RS1AX80JQ 745 0 0
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TATATAAACATCAACTTAAGCAACAATAATAACACAAAATAAACTAACAAAAGAAAAGAA
GAAAAAAAAAGACTAACAAAATGGCCAGGCCTTTTAGTCTGTTTCCAACCCTTATGATAC
TCAGTTTCTTCATAATCTCTTCCCCTTTGATCCAAGCCGGCTTCACCTATGACATGGACG
GTCTGGAATGGGCCACGAACGGTGTCCATGACCACTCCTCAGGCTGCCACGGTTCAATAG
CAGATTGTATCGGGGCAGAGGAAGAGGAAATGGACACAGAGATCAGCAGAAGAATATTGC
CGACAACAAAGTACATAAGCTATCAATCTTTGAAGCGTAACAGTGTGCCATGTTCGAGAA
GAGGAGCGTCATATTATAATTGTCAGAACGGAGCTCAGGCTAATCCTTATAGTCGTGGTT
GCAGCTCAATTGCTCGTTGCAGGAGTTAGCGCTCCACAAAGAAGTTCTCCTTCTTTCTTC
ATTTTGCTGTCTTATAATTAATTATACGGTACTCACATAAGTTGGATTTGGATGTGAATG
ACCTTTGTTTGTTCCATGATGATCCATGACGTGATTAGTGTTTCTTTAAGCTTTTGAATA
TTTCATGTGTATATTCTCTGTATCTCTTGCACAGTAATACTAAAAATAAGTTTGATCAAG
ACCAGGTTTGGTTTGATCCGGTAAA

QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1DA28TF 646 0 0
GGAAAATAAAC
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TCCAACCCTTATGATACTCAGTTTCTTCATAATCTCTTCCCCTTTGATCCGAGCCGGCTT
CACCAATGACATGGACGGTCTGGAATGGGCCACGAACGGTGTCCATGACCACTCCTCAGG
CTGCCACGGTTCAATAGCAGATTGTATCGGGGCAGAGGAAGAGGAAATGGACACAGAGAT
CAGCAGAAGAATATTGGCGACAACAAAGTACATAAGCTATCAATCTTTGAAGCGGAACAG
TGTGCCATGTTCGAGAAGAGGAGCGTCATATTATAATTGTCAGAACGGAGCTCAGGCTAA
TCCTTATAGTCGTGGTTGCAGCTCAATTGCTCGTTGCAGGAGTTAGCGCTCCACAAAGAA
GTTCTCCTTCTTTCTTCATTTTGCTGTCTTATAATTAATTATACGGTACTCACATAAGTT
GGATTTGGATGTGAATGACCTTTGTTTGTTCCGTGATGATCCATGACGTGATTAGTGTTT
CTTTAAGCTTTTGGATATTTCATGTGTATATTCTCTGTATCTCTTGCACAGTAATACTAA
AAATAAGTTTGATCAAGACCAGGTTTGGTTTGATC

QA 12 646 12 646
DS 



AS 1 2

CO CL8568Contig1 746 2 2 U
GGACCTCTTGTGCTTTTCTTCCAGACCAAAGCCTCTCGGGTTTCTCAAGCCCAAACAGAT
CTGGACATAGCGTTTTCTTCCTCGAGCTCGAAGCCAAGATGGAGACAGCAATGGAGGTAT
ACAATGACGTTGAGATGAGCTCACCACCGATCAAGCGACGCAAGAAGAAGTCAAAGGTGT
GGGAGCACTTCACCATCGGTGTCACAGAGCCAGGCTGCAGAAGGGCTTTCTGCAAAGGCT
GTAACCAGAGCTTTGCTTACAGCAGCGGCACCAAAGTGGCTGGGACTAGCCATCTCAAGC
GTCACATCGACAAAGGGACATGCCCTGCGCTTCTTCATCACCACACCCACCATGACAACA
ACGACAACGACAACAACAGCAGCCAACAGATGATGACGACTCCCAAGAGCGACCACACTC
CCAGGAGGCGTTACCGAACACAGAACACTTACGTCCCGTTTGATCAAGACAAGTGTCGCC
ACGAGGTTGCTAAGATGATCATCAAGCATGACTACCCTCTTCACATGGTCGAGCATCCAG
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TGCAAGGGGACTGCGTGGCGACTTACCTCTCAGAGAAGCAGAATGTTATCAAGTCTCTGG
AAGGGATCCCTGGACGCTTGTGTCTCACGCTGGACATGTGGACGTCAAAGCTGACTCCTG
GCTACGTGTTTATCACGGGTCACTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C560TF U 1
AF RS1FV63TF U 45
BS 1 661 RS1C560TF
BS 662 746 RS1FV63TF

RD RS1C560TF 661 0 0
GGACCTCTTGTGCTTTTCTTCCAGACCAAAGCCTCTCGGGTTTCTCAAGCCCAAACAGAT
CTGGACATAGCGTTTTCTTCCTCGAGCTCGAAGCCAAGATGGAGACAGCAATGGAGGTAT
ACAATGACGTTGAGATGAGCTCACCACCGATCAAGCGACGCAAGAAGAAGTCAAAGGTGT
GGGAGCACTTCACCATCGGTGTCACAGAGCCAGGCTGCAGAAGGGCTTTCTGCAAAGGCT
GTAACCAGAGCTTTGCTTACAGCAGCGGCACCAAAGTGGCTGGGACTAGCCATCTCAAGC
GTCACATCGACAAAGGGACATGCCCTGCGCTTCTTCATCACCACACCCACCATGACAACA
ACGACAACGACAACAACAGCAGCCAACAGATGATGACGACTCCCAAGAGCGACCACACTC
CCAGGAGGCGTTACCGAACACAGAACACTTACGTCCCGTTTGATCAAGACAAGTGTCGCC
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GGTTCGTCTCCTTCGTGCAGGCGCTTCACCCTCAGTTCGACAATCTGAGCTTCAACAACG
TGCAAGGGGACTGCGTGGCGACTTACCTCTCAGAGAAGCAGAATGTTATCAAGTCTCTGG
A

QA 1 661 1 661
DS 

RD RS1FV63TF 702 0 0
GG
AAGCCCAAACAGATCTGGACATAGCGTTTTCTTCCTCGAGCTCGAAGCCAAGATGGAGAC
AGCAATGGAGGTATACAATGACGTTGAGATGAGCTCACCACCGATCAAGCGACGCAAGAA
GAAGTCAAAGGTGTGGGAGCACTTCGCCATCGGTGTCACAGAGCCAGGCTGCAGAAGGGC
TTTCTGCAAAGGCTGTAACCAGAGCTTTGCTTACAGCAGCGGCACCAAAGTGGCTGGGAC
TAGCCATCTCAAGCGTCACATCGACAAAGGGACATGCCCTGCGCTTCTTCATCACCACAC
CCACCATGACAACAACGACAACGACAACAACAGCAGCCAACAGATGATGACGACTCCCAA
GAGCGACCACACTCCCAGGAGGCGTTACCGAACACAGAACACTTACGTCCCGTTTGATCA
AGACAAGTGTCGCCACGAGGTTGCTAAGATGATCATCAAGCATGACTACCCTCTTCACAT
GGTCGAGCATCCAGGGTTCGTCTCCTTCGTGCAGGCGCTTCACCCTCAGTTCGACAATCT
GAGCTTCAACAACGTGCAAGGGGACTGCGTGGCGACTTACCTCTCAGAGAAGCAGAATGT
TATCAAGTCTCTGGAAGGGATCCCTGGACGCTTGTGTCTCACGCTGGACATGTGGACGTC
AAAGCTGACTCCTGGCTACGTGTTTATCACGGGTCACTTC

QA 3 702 3 702
DS 



AS 1 2

CO CL8569Contig1 1236 2 4 U
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GTGAAGCTTTTGTTTCCGCGGGGAATTCCGGTTTGGTTCTCGTCGGAATCTCAAATTCGC
CGGCGACATGGCTTCCAATATCCCGATGAGTCCTCAATTGGAGCAGATCCACGGTGAAAT
CCGTGACCATTTCCGTGCCATCGCGAATGGTTTCCAGAATTTGGATAAGATCAAGGATTC
AACTAGACAAAGCAAGCAACTTGAGGAACTTACTGACAAGATGAGAGACTGTAAAAGGTT
GGTGAAGGATTTCGACCGTGAGCTCAAGGATGAGGAAGCTAGCAATTCTCCTCAAGTAAT
TAAGCAATTGAACGATGAGAAACAATCTATGATCAAGGAACTTAACTCTTACATTGCACT
AAGAAAAACGTATATGAGTACACTTGGAAACAAGAAAGTTGAACTATTTGATATGGGAGC
TGGAGTCAGTGGCGAGCCCACCGCTGAAGAAAACGTTCAAGTGGCTTCATCGATGTCAAA
CCAGGAGCTCGTTGACGCTGGAATGAAAAGAATGGATGAGACTGATCAAGCCATTGAGCG
CTCAAAACACGTGGTGGAGCAAACAATCGAAGTTGGAACTCAAACTGCATCTACCTTAAA
GGGACAGACGGATCAAATGGGGCGCGTGGTTAACCACTTGGACACGATTCAGTTCTCTAT
AAAGAAGGCTTCCCAGCTAGTGAAAGAGATAGGAAGACAGGTGGCTACCGATAAATGCAT
AATGATGTTCCTGTTTCTCATTGTCTGCGGTGTTGTAGCCATTATCATAGTGAAGATTGT
ACACCCAAATAACAAAGACATAAGGGACATACCAGGATTAGCTCCTCCAGCTCAATCAAG
GAAGCTATTGTACTTGAGGAATCCAGAGTACATGTGAAAATAGAACTATCTGTATGTATA
TTTTATTCACGTTGAAATGAGGAAATTGCATTTCTATATAATTCATCTGTTTTGCTTTTT
TTTCATTTGTTTACGGAGTGACATTGTGTACTTTGATAGTTGCCAAGGCTTGTTGGGGGG
TTTATTCATGCTCATGTTCCTCTGTTTTTGTTTTTGTTTCACATAGTCATTTGAATCTTG
GTTTTGATTAGAGGGTGTGTATATTGACATCTTTGTTCTCTTCTCTCTTGTAGCAACTTT
ACCATTTCTTTTGTATAAAATTCAGACCGAATGTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FB66TF U 1
AF RS1FB66JQ C 375
BS 1 676 RS1FB66TF
BS 677 677 RS1FB66JQ
BS 678 686 RS1FB66TF
BS 687 1236 RS1FB66JQ

RD RS1FB66TF 686 0 0
TTTTTAGTTTTCGTCAAGCTAGGGGTTTTGTTTTGCCTTGGGGAGGTTGTTTTGGACACG
GTGAAGCTTTTGTTTCCGCGGGGAATTCCGGTTTGGTTCTCGTCGGAATCTCAAATTCGC
CGGCGACATGGCTTCCAATATCCCGATGAGTCCTCAATTGGAGCAGATCCACGGTGAAAT
CCGTGACCATTTCCGTGCCATCGCGAATGGTTTCCAGAATTTGGATAAGATCAAGGATTC
AACTAGACAAAGCAAGCAACTTGAGGAACTTACTGACAAGATGAGAGACTGTAAAAGGTT
GGTGAAGGATTTCGACCGTGAGCTCAAGGATGAGGAAGCTAGCAATTCTCCTCAAGTAAT
TAAGCAATTGAACGATGAGAAACAATCTATGATCAAGGAACTTAACTCTTACATTGCACT
AAGAAAAACGTATATGAGTACACTTGGAAACAAGAAAGTTGAACTATTTGATATGGGAGC
TGGAGTCAGTGGCGAGCCCACCGCTGAAGAAAACGTTCAAGTGGCTTCATCGATGTCAAA
CCAGGAGCTCGTTGACGCTGGAATGAAAAGAATGGATGAGACTGATCAAGCCATTGAGCG
CTCAAAACACGTGGTGGAGCAAACAATCGAAGTTGGAACTCAAACTGCATCTACCTTAAA
GGGACAGACGGATCAA*TGGGGCGCG

QA 1 686 1 686
DS 

RD RS1FB66JQ 862 0 0
ATGAGAAACA*TCTATGATCAAGGAACTTAACTCTTACATTGCACTAAGAAAAACGTATA
TGAGTACACTTGGAAACAAGAAAGTTGAACTATTTGATATGGGAGCTGGAGTCAGTGGCG
AGCCCACCGCTGAAGAAAACGTTCAAGTGGCTTCATCGATGTCAAACCAGGAGCTCGTTG
ACGCTGGAATGAAAAGAATGGATGAGACTGATCAAGCCATTGAGCGCTCAAAACAGGTGG
TGGAGCAAACAATCGAAGTTGGAACTCAAACTGCATCTACCTTAAAGGGACAGACGGATC
AAATGGGGCGCGTGGTTAACCACTTGGACACGATTCAGTTCTCTATAAAGAAGGCTTCCC
AGCTAGTGAAAGAGATAGGAAGACAGGTGGCTACCGATAAATGCATAATGATGTTCCTGT
TTCTCATTGTCTGCGGTGTTGTAGCCATTATCATAGTGAAGATTGTACACCCAAATAACA
AAGACATAAGGGACATACCAGGATTAGCTCCTCCAGCTCAATCAAGGAAGCTATTGTACT
TGAGGAATCCAGAGTACATGTGAAAATAGAACTATCTGTATGTATATTTTATTCACGTTG
AAATGAGGAAATTGCATTTCTATATAATTCATCTGTTTTGCTTTTTTTTCATTTGTTTAC
GGAGTGACATTGTGTACTTTGATAGTTGCCAAGGCTTGTTGGGGGGTTTATTCATGCTCA
TGTTCCTCTGTTTTTGTTTTTGTTTCACATAGTCATTTGAATCTTGGTTTTGATTAGAGG
GTGTGTATATTGACATCTTTGTTCTCTTCTCTCTTGTAGCAACTTTACCATTTCTTTTGT
ATAAAATTCAGACCGAATGTGC

QA 1 862 1 862
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8571Contig1 609 2 1 U
GGGCACATCAAACACATTCTCTCCCAAAGCAAATAGCAAATCTAGAAATCACAAATGGCT
CGTACCAAGCAAACCGCCAGGAAATCCACCGGAGGCAAAGCCCCAAGGAAGCAGCTCGCG
ACGAAAGCGGCGAGGAATTCGGCTCCGGCCACCGGAGGAGTGAAGAAGCCGCACAGATTC
CGTCCCGGAACCGTCGCGCTGAGGGAGATCAGGAAGTACCAGAAGAGCACGGAGCTTCTG
ATCCGCAAGCTCCCCTTCCAGCGTCTGGTCCGCGAGATCGCCCAGGACTTCAAGACGGAT
CTGAGGTTCCAGAGCAGCGCCGTCGCGGCTCTCCAGGAGGCGGCGGAGGCTTACCTCGTC
GGGTTGTTCGAAGACACGAACCTGTGCGCGATTCACGCCAAGAGGGTCACGATCATGCCG
AAGGATATCCAGCTCGGTAGGAGAATCAGGGGAGGGAGGGCTTAAGAGTCTTTATCGGAT
CTGTATATCGTCTTTTAATCTTCCTCGTTTTAGATCTGGTTTCGAGTGTTGTAGTCTTCT
TTTAGAATTGTCGTTAACGTGTTCGATGAAATTCCCTAATGAACATCAAATCCACTTTTT
TTTTTAACC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CN82JQ C 1
AF RS1CN82TF U 1
BS 1 609 RS1CN82TF

RD RS1CN82JQ 609 0 0
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CGTACCAAGCAAACCGCCAGGAAATCCACCGGAGGCAAAGCCCCAAGGAAGCAGCTCGCG
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CGTCCCGGAACCGTCGCGCTGAGGGAGATCAGGAAGTACCAGAAGAGCACGGAGCTTCTG
ATCCGCAAGCTCCCCTTCCAGCGTCTGGTCCGCGAGATCGCCCAGGACTTCAAGACGGAT
CTGAGGTTCCAGAGCAGCGCCGTCGCGGCTCTCCAGGAGGCGGCGGAGGCTTACCTCGTC
GGGTTGTTCGAAGACACGAACCTGTGCGCGATTCACGCCAAGAGGGTCACGATCATGCCG
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CTGTATATCGTCTTTTAATCTTCCTCGTTTTAGATCTGGTTTCGAGTGTTGTAGTCTTCT
TTTAGAATTGTCGTTAACGTGTTCGATGAAATTCCCTAATGAACATCAAATCCACTTTTT
TTTTTAACC

QA 1 609 1 609
DS 

RD RS1CN82TF 609 0 0
GGGCACATCAAACACATTCTCTCCCAAAGCAAATAGCAAATCTAGAAATCACAAATGGCT
CGTACCAAGCAAACCGCCAGGAAATCCACCGGAGGCAAAGCCCCAAGGAAGCAGCTCGCG
ACGAAAGCGGCGAGGAATTCGGCTCCGGCCACCGGAGGAGTGAAGAAGCCGCACAGATTC
CGTCCCGGAACCGTCGCGCTGAGGGAGATCAGGAAGTACCAGAAGAGCACGGAGCTTCTG
ATCCGCAAGCTCCCCTTCCAGCGTCTGGTCCGCGAGATCGCCCAGGACTTCAAGACGGAT
CTGAGGTTCCAGAGCAGCGCCGTCGCGGCTCTCCAGGAGGCGGCGGAGGCTTACCTCGTC
GGGTTGTTCGAAGACACGAACCTGTGCGCGATTCACGCCAAGAGGGTCACGATCATGCCG
AAGGATATCCAGCTCGGTAGGAGAATCAGGGGAGGGAGGGCTTAAGAGTCTTTATCGGAT
CTGTATATCGTCTTTTAATCTTCCTCGTTTTAGATCTGGTTTCGAGTGTTGTAGTCTTCT
TTTAGAATTGTCGTTAACGTGTTCGATGAAATTCCCTAATGAACATCAAATCCACTTTTT
TTTTTAACC

QA 1 609 1 609
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8573Contig1 807 2 2 U
GAGCTTTGGAAAGGAACGATGGTGGAGAGCATTTTCCAGTATATGCAATTTGCTTAGGAT
TCGAGCTCCTTACAATGATCATAAGTCAGAACAGAGACATTTTGGAAAGAACTCTGCATC
AAGTCTCCAGTTCGTTGAAAACGTTAGCACCCAAGGCACCGTATTCCAAAGATTTCCTCA
AGACCTGTTGAAAAAACTCACTACAGACTGTTTGGTTATGCAAAACCATCAGTTTGGTAT
CTCGCCTGATAACTTTGAAGGCAATATTGCTCTGTCTCGTTTCTTTAAGATCGTCACAAC
ATGTCTTGATGGAAACCGCAAGGCTTATGTTTCAACCGTTCAATCGAAAACATATCCTGT
AACCGGCTTCCAGTGGCATCCTGAGCTTCTATAAAAGAAAAAGCTCCGTGCAATACTCTG
CAGAAAAATGCATTCGAGTGGGGATCATCCAAAATTCCACACTCTGAGGACGCGGTCCAT
GTGACTCAGCTCACTGCCAATTACCTTGTCAGTGAAGCTAGGAAGTCACAGAACAGACCA
CCTCCTGAGAAAGTGCTGAGCAATCTCATTTATAACTACAAGCCTACGTACTGTGGATAC
GAAGGGAGAGGTTACGACGAGGTTTACATTTTCACACAACAACGATCCCTTCTCTAAGAA
CAAACGTCCTCCCGTGTGACTGTTCGATTGAACCAGTGATGCTTCTTCAACTCTGTTAGT
ATCTGTGTGAACTTGTAACTCTGATGATGTTTATGGCTTGTATTTGTGAAATTGTGAAGT
GTATTCTTCACTTGAAAGAAATGTTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EU24TF U 1
AF RS1EU24JQ C 140
BS 1 752 RS1EU24TF
BS 753 807 RS1EU24JQ

RD RS1EU24TF 752 0 0
GAGCTTTGGAAAGGAACGATGGTGGAGAGCATTTTCCAGTATATGCAATTTGCTTAGGAT
TCGAGCTCCTTACAATGATCATAAGTCAGAACAGAGACATTTTGGAAAGAACTCTGCATC
AAGTCTCCAGTTCGTTGAAAACGTTAGCACCCAAGGCACCGTATTCCAAAGATTTCCTCA
AGACCTGTTGAAAAAACTCACTACAGACTGTTTGGTTATGCAAAACCATCAGTTTGGTAT
CTCGCCTGATAACTTTGAAGGCAATATTGCTCTGTCTCGTTTCTTTAAGATCGTCACAAC
ATGTCTTGATGGAAACCGCAAGGCTTATGTTTCAACCGTTCAATCGAAAACATATCCTGT
AACCGGCTTCCAGTGGCATCCTGAGCTTCTATAAAAGAAAAAGCTCCGTGCAATACTCTG
CAGAAAAATGCATTCGAGTGGGGATCATCCAAAATTCCACACTCTGAGGACGCGGTCCAT
GTGACTCAGCTCACTGCCAATTACCTTGTCAGTGAAGCTAGGAAGTCACAGAACAGACCA
CCTCCTGAGAAAGTGCTGAGCAATCTCATTTATAACTACAAGCCTACGTACTGTGGATAC
GAAGGGAGAGGTTACGACGAGGTTTACATTTTCACACAACAACGATCCCTTCTCTAAGAA
CAAACGTCCTCCCGTGTGACTGTTCGATTGAACCAGTGATGCTTCTTCAACTCTGTTAGT
ATCTGTGTGAACTTGTAACTCTGATGATGTTT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RS1EU24JQ 668 0 0
AACGTTAGCACCCAAGGCACCGTATTCCAAAGATTTCCTCAAGACCTGTTGAAAAAACTC
ACTACAGACTGTTTGGTTATGCAAAACCATCAGTTTGGTATCTCGCCTGATAACTTTGAA
GGCAATATTGCTCTGTCTCGTTTCTTTAAGATCGTCACAACATGTCTTGATGGAAACCGC
AAGGCTTATGTTTCAACCGTTCAATCGAAAACATATCCTGTAACCGGCTTCCAGTGGCAT
CCTGAGCTTCTATAAAAGAAAAAGCTCCGTGCAATACTCTGCAGAAAAATGCATTCGAGT
GGGGATCATCCAAAATTCCACACTCTGAGGACGCGGTCCATGTGACTCAGCTCACTGCCA
ATTACCTTGTCAGTGAAGCTAGGAAGTCACAGAACAGACCACCTCCTGAGAAAGTGCTGA
GCAATCTCATTTATAACTACAAGCCTACGTACTGTGGATACGAAGGGAGAGGTTACGACG
AGGTTTACATTTTCACACAACAACGATCCCTTCTCTAAGAACAAACGTCCTCCCGTGTGA
CTGTTCGATTGAACCAGTGATGCTTTTTCAACTCTGTTAGTATCTGTGTGAACTTGTAAC
TCTGATGATGTTTATGGCTTGTATTTGTGAAATTGTGAAGTGTATTCTTCACTTGAAAGA
AATGTTCG

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL8574Contig1 664 2 2 U
GGATAGCCAGAGGAAGAAGAAGTCTTCTCCTCATAAAGACAAGTGCTGCAAGCAAGAAGC
TTCACCAGAAAAAGCGGTTCATCATCACAGACTCGACAGTAGAAAGAACAGTAAAGACAA
GTGCAAGCAAGAAGCTTTACCAGAGAAGGCGATGATTCATCGTAATGTCGGTAGAAAGAA
TAAGAAGAAGAAGTCTGATCAGAAGAAAGAAGGTGGTGGTGGTGACGATGAGATAAGTGA
ATGTCCTATTTGTTCTGAAGAGATGGATGCAACGGATCTAAGCTTCTTACCATGTCCTTG
CGGCTTTCGGCTATGTCTCTTCTGCCATAAGCAGATCAACGAAAACGATGGACGTTGCCC
AGCTTGCAGGAACAAGTATGAGCAGACGAGTAGTAACAGCGGTGAAGTTAGTTTCCAGCA
ACGTGGCCGTGGCACAGTTCGTTTGTCTCCTTCGTTTAAAGGACTTGACATAGCTTAAGA
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TGTTTACTTTAGTATCTCACAGTTTCTCATCAGGAACAACAGTTTTGTTTAGATTGTCAT
CTCAGCAATAAAGGAGTGTGGATTGGTTTAGGTATGCAACTATGGAAAGCTGCATTCTTT
TTAC


BQ
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10 10 10 10 

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TTAC

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DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AL76TF U 1
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BS 1 789 RS1AL76TF
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GA

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QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1BB35JQ C 1
AF RS1BB35TF U 1
BS 1 573 RS1BB35TF

RD RS1BB35JQ 573 0 0
GGGTCGCGATCTTCTCCCCGGCTACCTGCTTTCTGGCGTGAAATCATAAGCGCCAGCGAA
TCCTCTTTTCTATATCTTCTTCCTTATCCTCTGTTTTCTCTTCTCCTCTGTATCCTCTTT
GTGGCTGTACCAAATCACTGCGTTCTTCTCTCCGCCCCCAAAAAAGTCCTCCATCAGCGT
CGGAACAAGAGAATCCTCGGCGGTTGTGACCAAAATCTCTACTCCTTTTATTTGTTTGTT
TCAATATTGATTATCGATTTAGATTTAAGTTGCGCATGATGTTGATTGTATTTGGTTAAA
TTTCTGTTGTGAATAGACATGTAATCATGTGCTTTTGTGGTTTACATGAATGGAAATTGT
GATTCCAAAATGCATAGCTGCAAAGATCCCGAGCTGATGCTGCGAATGTCAAAAGTACAC
ACCTCCGAAGACAAGAACTTCTAATGTTGTGGAGATTGTTTAGTTCATTTAATCTTTATG
ATACTATTGGGTGTTGTCATGTATTTTCGTTAGTCTTATTGTGCTGAGACATTATCTGAG
TTTTATACTTAAGAAACCATCAACTTTAGCTGC

QA 1 573 1 573
DS 

RD RS1BB35TF 573 0 0
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TCCTCTTTTCTATATCTTCTTCCTTATCCTCTGTTTTCTCTTCTCCTCTGTATCCTCTTT
GTGGCTGTACCAAATCACTGCGTTCTTCTCTCCGCCCCCAAAAAAGTCCTCCATCAGCGT
CGGAACAAGAGAATCCTCGGCGGTTGTGACCAAAATCTCTACTCCTTTTATTTGTTTGTT
TCAATATTGATTATCGATTTAGATTTAAGTTGCGCATGATGTTGATTGTATTTGGTTAAA
TTTCTGTTGTGAATAGACATGTAATCATGTGCTTTTGTGGTTTACATGAATGGAAATTGT
GATTCCAAAATGCATAGCTGCAAAGATCCCGAGCTGATGCTGCGAATGTCAAAAGTACAC
ACCTCCGAAGACAAGAACTTCTAATGTTGTGGAGATTGTTTAGTTCATTTAATCTTTATG
ATACTATTGGGTGTTGTCATGTATTTTCGTTAGTCTTATTGTGCTGAGACATTATCTGAG
TTTTATACTTAAGAAACCATCAACTTTAGCTGC

QA 1 573 1 573
DS 



AS 1 2

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TGTAGGAGACAACAGCAACAACATCAACAAAAAAACCAAACTTCTGTTCCTCCAATTAAT
CAATTTCTCATTGACTATCTTTTTTTTGCTATCTGAATTCAGGAACGGCGTCTGGTTAAT
GCCTGGAAGCCGCGGGGAGATCACGGTGGTTGAACAGAACAGAGTCGTTAACAACAACAA
CAAGACAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAAGATGATGATGTTGAGAACAGGAATCAATT
AGTAACGCCATCAGTTTCAAAACCCAGGAAGCAGTTAACAGACAAATTCAGAAAGAAACA
CAAATCAGGTTCTGGGTCGTGTAAAGGAGGATGCTTTTCTGTGATGAGACCTCGCAGAAC
AGAGGAGGAGGGTTCTCCTTCTTCTGACCCTAACGATGAAATGCTGAGAGTTATGTTGGA
GAACAATGATTTCTTCTCTGACCAATGCAATCCACATCGATGATTTTGTGTAAGCTTTGA
TGATCATTGGTTGGAGGTTTGTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTCAATCTGTATATCTGT
TTAAGCCAATCAATATTCAATGCCTATGAGTGTTTTTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1D730TF U 1
AF RS1D730JQ C 24
BS 1 640 RS1D730TF

RD RS1D730TF 640 0 0
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GCCTGGAAGCCGCGGGGAGATCACGGTGGTTGAACAGAACAGAGTCGTTAACAACAACAA
CAAGACAAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAAGATGATGATGTTGAGAACAGGAATCAATT
AGTAACGCCATCAGTTTCAAAACCCAGGAAGCAGTTAACAGACAAATTCAGAAAGAAACA
CAAATCAGGTTCTGGGTCGTGTAAAGGAGGATGCTTTTCTGTGATGAGACCTCGCAGAAC
AGAGGAGGAGGGTTCTCCTTCTTCTGACCCTAACGATGAAATGCTGAGAGTTATGTTGGA
GAACAATGATTTCTTCTCTGACCAATGCAATCCACATCGATGATTTTGTGTAAGCTTTGA
TGATCATTGGTTGGAGGTTTGTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTCAATCTGTATATCTGT
TTAAGCCAATCAATATTCAATGCCTATGAGTGTTTTTCTC

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1D730JQ 617 0 0
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TTTTGCTATCTGAATTCAGGAACGGCGTTTGGTTAATGCCTGGAAGCCGCGGGGAGATCA
CGGTGGTTGAACAGAACAGAGTCGTTAACAACAACAACAAGACAAGGAAGAAGAAGAAGA
AGAAGGAAGATGATGATGTTGAGAACAGGAATCAATTAGTAACGCCATCAGTTTCAAAAC
CCAGGAAGCAGTTAACAGACAAATTCAGAAAGAAACACAAATCAGGTTCTGGGTCGTGTA
AAGGAGGATGCTTTTCTGTGATGAGACCTCGCAGAACAGAGGAGGAGGGTTCTCCTTCTT
CTGACCCTAACGATGAAATGCTGAGAGTTATGTTGGAGAACAATGATTTTTTCTCTGACC
AATGCAATCCACATCGATGATTTTGTGTAAGCTTTGATGATCATTGGTTGGAGGTTTGTT
CTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTCAATCTGTATATCTGTTTAAGCCAATCAATATTCAATGC
CTATGAGTGTTTTTCTC

QA 1 617 1 617
DS 



AS 1 2

CO CL8578Contig1 732 2 3 U
TTGTTTTTGGTTTGAAATGAACAAAGAAGAATGTATCATTCTGATTAATTTTTGAAAAGC
TCACATCGTAAAATGTTACAGATAAAACAACAGTAGTTTATGAATCAGAAACAAATTATA
GAGCAAATGAATGACACAAACTGCTTCTTCTTGTTCATCAAAGGCAGGCATGAGGAGAGG
TTTATGAATCAGAACAACTTGAAGATATCATCATGCACTGGGAGGTTTGTAGAGCTTCTC
AACCATCTTCCTATACTCTCCCAAAAGGCTCTGAATGGATAGTAGGATTGTCCTCACATC
ATATGCAGAAAACCATTTATCCTGGAGAATGTCCAAGCAGATGTTGCCATAAAGATCAAC
ATTGGGGTGGAAGCAACAAGTGTGGAACTTGATCTTTGGAGGTTTGAAAGGATAGTCATT
GGAGAAAGAAAGCGAGAGTCTGTAATCAGTTCCTTCAAAGACAGTATCTTTGCTTCCTGT
TATTGTCCCTTTCCAACAGAAGATGTTGTCTTCCTCTGGGAATGCCGATATTCCCGGGTC
ACCGCCCATCATCAAGCCCATTAGTTCAGATTGCAGCCTTTTGAGAACAGATTGGCTGTC
AACAGTCTTAGTCGGAGGCGCAGATTGCTTTGACCCGTTTGACGCCGGAGGATCCGCCGG
AGTGTTTCCTTGGTACCCATTTACGGCAGCCATCACTTTCGTTTTCTTATACTCAGGAAG
GAGAGCGAAGAT


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FU18JQ U 6
AF RS1FU18TF C 1
BS 1 5 RS1FU18TF
BS 6 501 RS1FU18JQ
BS 502 732 RS1FU18TF

RD RS1FU18JQ 496 0 0
TTTGGTTTGAAATGAACAAAGAAGAATGTATCATTCTGATTAATTTTTGAAAAGCTCACA
TCGTAAAATGTTACAGATAAAACAACAGTAGTTTATGAATCAGAAACAAATTATAGAGCA
AATGAATGACACAAACTGCTTCTTCTTGTTCATCAAAGGCAGGCATGAGGAGAGGTTTAT
GAATCAGAACAACTTGAAGATATCATCATGCACTGGGAGGTTTGTAGAGCTTCTCAACCA
TCTTCCTATACTCTCCCAAAAGGCTCTGAATGGATAGTAGGATTGTCCTCACATCATATG
CAGAAAACCATTTATCCTGGAGAATGTCCAAGCAGATGTTGCCATAAAGATCAACATTGG
GGTGGAAGCAACAAGTGTGGAACTTGATCTTTGGAGGTTTGAAAGGATAGTCATTGGAGA
AAGAAAGCGAGAGTCTGTAATCAGTTCCTTCAAAGACAGTATCTTTGCTTCCTGTTATTG
TCCCTTTCCAACAGAA

QA 1 496 1 496
DS 

RD RS1FU18TF 732 0 0
TTGTTTTTGGTTTGAAATGAACAAAGAAGAATGTATCATTCTGATTAATTTTTGAAAAGC
TCACATCGTAAAATGTTACAGATAAAACAACAGTAGTTTATGAATCAGAAACAAATTATA
GAGCAAATGAATGACACAAACTGCTTCTTCTTGTTCATCAAAGGCAGGCATGAGGAGAGG
TTTATGAATCAGAACAACTTGAAGATATCATCATGCACTGGGAGGTTTGTAGAGCTTCTC
AACCATCTTCCTATACTCTCCCAAAAGGCTCTGAATGGATAGTAGGATTGTCCTCACATC
ATATGCAGAAGACCATTTATCCTGGAGAATGTCCAAGCAGATGTTGCCATAGAGATCAAC
ATTGGGGTGGAAGCAACAAGTGTGGAACTTGATCTTTGGAGGTTTGAAAGGATAGTCATT
GGAGAAAGAGAGCGAGAGTCTGTAATCAGTTCCTTCAAAGACAGTATCTTTGCTTCCTGT
TATTGTCCCTTTCCAACAGAAGATGTTGTCTTCCTCTGGGAATGCCGATATTCCCGGGTC
ACCGCCCATCATCAAGCCCATTAGTTCAGATTGCAGCCTTTTGAGAACAGATTGGCTGTC
AACAGTCTTAGTCGGAGGCGCAGATTGCTTTGACCCGTTTGACGCCGGAGGATCCGCCGG
AGTGTTTCCTTGGTACCCATTTACGGCAGCCATCACTTTCGTTTTCTTATACTCAGGAAG
GAGAGCGAAGAT

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL8579Contig1 668 2 3 U
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TATGTTAACATCAATGCAACACAGAGAAGAAACCAAAAAAACAAAAGAGAGAGAATCAGA
CACAAAAGCAAACAGCTTCTCAGACATAGTGGAAGCAGCTTCTTTTTTACTCAAAAGCGT
CATCTGCTTCGCCTTCACCTGCCTGTTCTTCACGTCCACCTTGTTCCCGCACAAAACAAT
GGGGATGTTCTCGCACACACGGCAGAGGTCTCGGTGCCACGTGGGGACGTTCTTGTACGT
TAGACGCGCCGTCACGTCGAACATGATCACCGCGCATTGACCGTGGATGTAGTAACCATC
TCTAAGGCCACCGAACTTCTCTTGACCGGCGGTATCCCAGCAGTAGAAACGGATCTTGCC
GCAGTTTGTGAAGAAATCTAGAGGGTGAACCTCCACACCAATTGTAGGTTCATACTTCTT
CTCAAACTCTCCGGTAAGACGTCTCTTGACAAAAGTTGTTTTTCCTGTGCCTCCGTCACC
AACGATAACGAGCTTGAAGCTAGGGTAATCGACGGTTTGCTGGTTAGGTAGAGCCATGTT
GTCGGGATCGAGAGAATTGGGCGATGTATTTGTGTGTGCGTGGAGATTGATGGTGATGAT
GTTTATCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

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A
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DS 



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BQ
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AF RS1H076JQB C 1
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QA 1 629 1 629
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AB69TF U 1
AF RS1G156TF U 44
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TCTTG

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1G156TF 748 0 0
TTTTTTCCTTCAGATTGGGCTGGAAGTTAGATTCGTGATCAGAGGTCTACCATGGCTGAC
TTTGATGAATATATGGCTGATGAGTACGACATGGATGACCTGGAGGATGAGATGAATGCG
GAGTTTGATGCTAGAGACATCGATGCATCTGATTCAGAAGTTGAAGATTTAGAACAATTG
AACAAGGCTGCGGATACTTCTGCAGCTCAAGCTCGGAACGGGAAGGACATTCAGGGTATA
CCGTGGGATAGACTTAGCGTTACTAGAAAAGACTACAGAAAAACTAGGCTTGAACAGTAT
AAGAACTATGAGAATGTCCCCCATTCCGGAGAGGAAGCTGGGAAGCATTGCACGGATACC
GAGAAAGGCAGCTCTTTCTATACGTTCAGGAGCAATTCTCGATCAGTGAGATCAACCATT
CTTCATTTCCAGTTGAGGAATTTGGTCTGGGCTACATCGAAACATGATGTTTACCTCTTG
TCCAATTACTCTATCAGCCACTGGTCTTCTTTGACTGGTTCCAGGAATGAAATTCTCAAC
GTTAAAGGTCATGTAGCTCCTTCTGAGAAACATCCGGAGAGTTTGTTGGAAGGATTTACA
GAAACTCAAGTTAGCACTCTTGCAGTAAAAGAAACGCTGCTAGTTGCTGGTGGGTTTCAA
GGAGAGCTCATTTGCAAGCATCTTGATAGACCTGGTGTGAGTTTCTGCTCACGCACAACT
TACACGAAAACGCTATCACCAACGCAGT

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL8582Contig1 931 2 10 U
GCGTCATGAGCGAGCTCTTCGGGAAAGTCACCGGTTGCTGCAGAGGCCAAGGTGGATCCA
TGCACATGTTCTCTAAAGAGCACAACATACTCGGCGGGTTCGCTTTTATCGGGGAAGGCA
TCCCTGTCGCCACCGGTGCTGCATTCACTTCCAAGTACAAGAGAGAAGTCTTGAAACAGA
GCTGCGAAGACGTCACTGTTGCCTTCTTCGGAGATGGGACTTGTAACAACGGGCAGTTCT
ACGAGTGTCTCAACATGGCTGCGCTCTATAAGTTGCCTATTATCTTCGTCGTTGAGAATA
ACTTGTGGGCCATCGGGATGTCTCATTTGAGGTCCACTTCTGATCCCGAGATATGGAAGA
AAGGACCTGCGTTTGGGATGCCGGGTGTTCATGTTGACGGTATGGATGTGTTGAAGGTGA
GGGAAGTGGCGTAAGAGGCGGTGATGAGAGCTAGAAGAGGAGAAGGTCCGACCTTGGTGG
AGTGTGAGACTTACAGGTTCAGAGGACACTCCTTGGCTGATCCTGATGAGCTCCGTGATG
CTGCTGAGAAAGCCAAGTACGCGGCTAGAGATCCGATCACAGCACTGAAGAAGTACTTGA
TGGAGAACAAGCTAGCGAACGAAGGGGAGCTTAAGATGATAGAGAAGAAGATAGACGAGT
TGGTGGAGGAAGCGGTGGAGTTTGCAGACGCGAGTCCGCAGCCAGGTCGAAGTCAGTTGC
TAGAGAACGTGTTTGCTGATCCCAAAGGGTTGGGAATAGGACCTGATGGACGTTACAGAT
GTGAGGATCCCAAGTTTACTGAAGGCACTGCTCAAGTCTGAAACAAATGACTTCTGCTAT
CTTTGGCTTCTGTTTAATGTTTTTTTTTACTTGTCATTAAGTTAAAAATGCTACAGAGAC
ACAGTTTGGATATCGTATTTTTCTTTCGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B886TF U 1
AF RS1B886JQ C 145
BS 1 726 RS1B886TF
BS 727 727 RS1B886JQ
BS 728 755 RS1B886TF
BS 756 756 RS1B886JQ
BS 757 759 RS1B886TF
BS 760 760 RS1B886JQ
BS 761 773 RS1B886TF
BS 774 774 RS1B886JQ
BS 775 785 RS1B886TF
BS 786 931 RS1B886JQ

RD RS1B886TF 785 0 0
GCGTCATGAGCGAGCTCTTCGGGAAAGTCACCGGTTGCTGCAGAGGCCAAGGTGGATCCA
TGCACATGTTCTCTAAAGAGCACAACATACTCGGCGGGTTCGCTTTTATCGGGGAAGGCA
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GCTGCGAAGACGTCACTGTTGCCTTCTTCGGAGATGGGACTTGTAACAACGGGCAGTTCT
ACGAGTGTCTCAACATGGCTGCGCTCTATAAGTTGCCTATTATCTTCGTCGTTGAGAATA
ACTTGTGGGCCATCGGGATGTCTCATTTGAGGTCCACTTCTGATCCCGAGATATGGAAGA
AAGGACCTGCGTTTGGGATGCCGGGTGTTCATGTTGACGGTATGGATGTGTTGAAGGTGA
GGGAAGTGGCGTAAGAGGCGGTGATGAGAGCTAGAAGAGGAGAAGGTCCGACCTTGGTGG
AGTGTGAGACTTACAGGTTCAGAGGACACTCCTTGGCTGATCCTGATGAGCTCCGTGATG
CTGCTGAGAAAGCCAAGTACGCGGCTAGAGATCCGATCACAGCACTGAAGAAGTACTTGA
TGGAGAACAAGCTAGCGAACGAAGGGGAGCTTAAGATGATAGAGAAGAAGATAGACGAGT
TGGTGGAGGAAGCGGTGGAGTTTGCAGACGCGAGTCCGCAGCCAGGTCGAAGTCAGTTGC
TAGAGA*CGTGTTTGCTGATCCCAAAGGGTTGGGA*TAG*ACCTGATGGACGT*ACAGAT
GTGAG

QA 1 785 1 785
DS 

RD RS1B886JQ 787 0 0
ATCACTCCC
AGTACAAGAGAGAAGTCTTGAAACAGAGCTGCGAAGACGTCACTGTTGCCTTCTTCGGAG
ATGGGACTTGTAACAACGGGCAGTTCTACGAGTGTCTCAACATGGCTGCGCTCTATAAGT
TGCCTATTATCTTCGTCGTTGAGAATAACTTGTGGGCCATCGGGATGTCTCATTTGAGGT
CCACTTCTGATCCCGAGATATGGAAGAAAGGACCTGCGTTTGGGATGCCGGGTGTTCATG
TTGACGGTATGGATGTGTTGAAGGTGAGGGAAGTGGCGTAAGAGGCGGTGATGAGAGCTA
GAAGAGGAGAAGGTCCGACCTTGGTGGAGTGTGAGACTTACAGGTTCAGAGGACACTCCT
TGGCTGATCCTGATGAGCTCCGTGATGCTGCTGAGAAAGCCAAGTACGCGGCTAGAGATC
CGATCACAGCACTGAAGAAGTACTTGATGGAGAACAAGCTAGCGAACGAAGGGGAGCTTA
AGATGATAGAGAAGAAGATAGACGAGTTGGTGGAGGAAGCGGTGGAGTTTGCAGACGCGA
GTCCGCAGCCAGGTCGAAGTCAGTTGCTAGAGAACGTGTTTGCTGATCCCAAAGGGTTTG
GAATAGGACCTGATGGACGTTACAGATGTGAGGATCCCAAGTTTACTGAAGGCACTGCTC
AAGTCTGAAACAAATGACTTCTGCTATCTTTGGCTTCTGTTTAATGTTTTTTTTTACTTG
TCATTAAGTTAAAAATGCTACAGAGACACAGTTTGGATATCGTATTTTTCTTTCGTTC

QA 10 787 10 787
DS 



AS 1 2

CO CL8583Contig1 880 2 2 U
GGAGGCAAAACAATCCTTCATCAAATGTTGAAAAACAAGAAAACAGACAACTCCATCTCT
CGAGATACAACTCAAATCAAGAAAAGACAAAAAACAGAGATGGCTCAGAATGGTTCGAAC
GGTACCGTGAAGCTTATCGGTACATGGTCAAGCCCATTCGCCTTGAGGGCTCGGATCGCT
TTACACCTCAAGTCAGTAGAGTACGAGTACATAGAAGAAGCCGATGTTCTGAATTCCAAG
AGCGATCTTCTTATTAAATCCAACCCAATCCACAAGAAAGTCCCTGTCCTTATCCATGGT
GATGACTCAATATGTGAGTCTCTCAACATCGTCCAGTACGTGGACGAAGCCTGGCCTTCT
AAGCCTTCTATCCTCCCTTCCAATCCCAAAGAACGTGCTTCTGCTCGTTTCTGGGCTCAC
TTCGTTGATGGAAAGGGCTTTGAATCTCTCGCAGCGTTGGAGGAGGCGTTTCAGAAGAGC
AGCAAAGGCGGAGAGTTCTTTGGAGGCGAAAACATTGGCTACGTCGACATCGCATGTGGA
GCCATAGTGGGCCCATTATCAGTCATCGAGGCGTTTTCAGGTGTGAAGTTTTTGAGTCCA
GATACAACACCGGGATTGGTCCAATGGGCCGAGAGATTTAGAGCCCATGAAGCTGTGAAA
CCGTACATGCCTACCGTTGCTGAGTTCGTCGAGTTTGCCAAACAGAAGTTCAATGTTCAG
TAAGATCACAGATGACTTTAAAAGGAAAGTCTTTAATATGTTTGAATCTGATTTATGTTT
TGCCAAAAACACTGTTGTTTGTAAGAGTTACTATTTGCGTGATATGTAATAATAATTCAT
TATACCGAATACAATAAACATTATCCTTAGGTTGCTTACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G354TF U 1
AF RS1G354JQ C 166
BS 1 740 RS1G354TF
BS 741 880 RS1G354JQ

RD RS1G354TF 740 0 0
GGAGGCAAAACAATCCTTCATCAAATGTTGAAAAACAAGAAAACAGACAACTCCATCTCT
CGAGATACAACTCAAATCAAGAAAAGACAAAAAACAGAGATGGCTCAGAATGGTTCGAAC
GGTACCGTGAAGCTTATCGGTACATGGTCAAGCCCATTCGCCTTGAGGGCTCGGATCGCT
TTACACCTCAAGTCAGTAGAGTACGAGTACATAGAAGAAGCCGATGTTCTGAATTCCAAG
AGCGATCTTCTTATTAAATCCAACCCAATCCACAAGAAAGTCCCTGTCCTTATCCATGGT
GATGACTCAATATGTGAGTCTCTCAACATCGTCCAGTACGTGGACGAAGCCTGGCCTTCT
AAGCCTTCTATCCTCCCTTCCAATCCCAAAGAACGTGCTTCTGCTCGTTTCTGGGCTCAC
TTCGTTGATGGAAAGGGCTTTGAATCTCTCGCAGCGTTGGAGGAGGCGTTTCAGAAGAGC
AGCAAAGGCGGAGAGTTCTTTGGAGGCGAAAACATTGGCTACGTCGACATCGCATGTGGA
GCCATAGTGGGCCCATTATCAGTCATCGAGGCGTTTTCAGGTGTGAAGTTTTTGAGTCCA
GATACAACACCGGGATTGGTCCAATGGGCCGAGAGATTTAGAGCCCATGAAGCTGTGAAA
CCGTACATGCCTACCGTTGCTGAGTTCGTCGAGTTTGCCAAACAGAAGTTCAATGTTCAG
TAAGATCACAGATGACTTTA

QA 1 740 1 740
DS 

RD RS1G354JQ 715 0 0
AGGGCTCGGATCGCTTTACACCTCAAGTCAGTAGAGTACGAGTACATAGAAGAAGCCGAT
GTTCTGAATTCCAAGAGCGATCTTCTTATTAAATCCAACCCAATCCACAAGAAAGTCCCT
GTCCTTATCCATGGTGATGACTCAATATGTGAGTCTCTCAACATCGTCCAGTACGTGGAC
GAAGCCTGGCCTTCTAAGCCTTCTATCCTCCCTTCCAATCCCAAAGAACGTGCTTCTGCT
CGTTTCTGGGCTCACTTCGTTGATGGAAAGGGCTTTGAATCTCTCGCAGCGTTGGAGGAG
GCGTTTCAGAAGAGCAGCAAAGGCGGAGAGTTCTTTGGAGGCGAAAACATTGGCTACGTC
GACATCGCATGTGGAGCCATAGTGGGCCCATTATCAGTCATCGAGGCGTTTTCAGGTGTG
AAGTTTTTGAGTCCAGATACAACACCGGGATTGGTCCAATGGGCCGAGAGATTTAGAGCC
CATGAAGCTGTGAAACCGTACATGCCTACCGTTGCTGAGTTCGTCGAGTTTGCCAAACAG
AAGTTCAATGTTCAGTAAGATCACAGATGACTTTAAAAGGAAAGTCTTTAATATGTTTGA
ATCTGATTTATGTTTTGCCAAAAACACTGTTGTTTGTAAGAGTTACTATTTGCGTGATAT
GTAATAATAATTCATTATACCGAATACAATAAACATTATCCTTAGGTTGCTTACT

QA 1 715 1 715
DS 



AS 1 2

CO CL8584Contig1 582 2 7 U
TTATGGATTCTTTCAAAACAAAGAGGCAAAGATGAAGTGTATACTCTTACGATGCGATGT
TATCGGATTTTTTCCTTTTTGGATAAAGAGAAACAGAAGGAGCTAAGTAGGGAATGTGAT
TGTGAAAAGACCAAACAGGAATATCAGAGATACAACATAAATAGAGGGAACTGGGAATGT
AGCTCAGAGTTGGGGAGGCATGTCTATCTATCCATGAATCTTGTGCAGAGTCTTCAGTGC
TGTCATTGCTAGGTAAACCGAATATCCTGAGATTACGGTCCATTGAACCGACTGCTACGT
ATTTGGCGTCGGGACCAAACTTAACACATGTTGCTCTACCTGTACCGGATAGATCAGGAA
GTGTCTTGACTGGGTTCCATTCGGCTTTTACACTGGCCGTTTGGAATACTCTTATATCTG
AAGCAGCAATGCCAAGATAAGATCCGCTATGGTCAAATTCCACCGAGTTTGCATTTGGAA
AGTCGAATGTTCGGAAGTTCTTTAGCTTGCGCAGGTCCCACAGTCTAACACCATCCAGCG
CAGATGTCGCGAGGAAATAACCATTTTCAGAAAATGATACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DU38JQ U 40
AF RS1GB95TF C 1
BS 1 39 RS1GB95TF
BS 40 125 RS1DU38JQ
BS 126 126 RS1GB95TF
BS 127 142 RS1DU38JQ
BS 143 143 RS1GB95TF
BS 144 538 RS1DU38JQ
BS 539 582 RS1GB95TF

RD RS1DU38JQ 499 0 0
TATACTCTTACGATGCGATGTTATCGGATTTTTTCCTTTTTGGATAAAGAGAAACAGAAG
GAGCTAAGTAGGGAATGTGATTGTGATAAGACCAAACAGGAATTTCAGAGATACAACATA
AATAGAGGGAACTGGGAATGTAGCTCAGAGTTGGGGAGGCATGTCTATCTATCCATGAAT
CTTGTGCAGAGTCTTCAGTGCTGTCATTGCTAGGTAAACCGAATATCCTGAGATTACGGT
CCATTGAACCGACTGCTACGTATTTGGCGTCGGGACCAAACTTAACACATGTTGCTCTAC
CTGTACCGGATAGATCAGGAAGTGTCTTGACTGGGTTCCATTCGGCTTTTACACTGGCCG
TTTGGAATACTCTTATATCTGAAGCAGCAATGCCAAGATAAGATCCGCTATGGTCAAATT
CCACCGAGTTTGCATTTGGAAAGTCGAATGTTCGGAAGTTCTTTAGCTTGCGCAGGTCCC
ACAGTCTAACACCATCCAG

QA 1 499 1 499
DS 

RD RS1GB95TF 582 0 0
TTATGGATTCTTTCAAAACAAAGAGGCAAAGATGAAGTGTATACTCTTACGATGCGATGT
TATCGGATTTTTTCCTTTTTGGATAAAGAGAAACAGAAGGAGCTAAGTAGGGAATGTGAT
TGTGAAAAGACCAAACAGGAATATCAGAGATACAACATAAATAGAGGGAACTGGGAATGT
AGCTCAGAGTTGGGGAGGCATGTCTATCTATTCATGAATCTTGTGCAGAGTCTTCAGTGC
TGTCATTGCTAGGTAAACCGAATATCCTGAGATTACGGTCCATTGAACCGACTGCTACGT
ATTTGGCGTCGGGACCAAACTTAACACATGTTGCTCTACCTGTACCGGATAGATCAGGAA
GTGTCTTGACTGGGTTCCATTCGGCTTTTACACTGGCCGTTTGGAATACTCTTATATCTG
AAGCAGCAATGCCAAGATAAGATCCGCTATGGTCAAATTCCACCGAGTTTGCATTTGGAA
AGTCGAATGTTCGGAAGTTCTTTAGCTTGCGCAGGTCCCACAGTCTAACACCATCCAGCG
CAGATGTCGCGAGGAAATAACCATTTTCAGAAAATGATACAC

QA 1 582 1 582
DS 



AS 1 2

CO CL8585Contig1 610 2 1 U
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AGAGAACCACCGTTCCAGTAGACACCGGAGCAGCAGCCGCTGCCGCCGACCAGATCAGCA
CTATCGCCGCCAGCTCGGTAGGACCGTTCTCAGAGTTCTTTGCTTTTCCTCAATACTCGT
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CGGCATCGATACAGAGCCTAAAGCTTACTGTTCTTCATCTCAACGTCACCACTCGTGACG
ACTCTGTCCTCTATTCCATCAGCCTAAAGGTTGAAGAAGGGAGCCAGTTGAACACAGTGG
AAGATATTGCAGCAGGCATGAATCAAATCATAAGGAGGATTGAAGAAGAGTCGTCTTGAG
CTAATATAGTTGGATTTTAGTTATGACACATTTAGAGGAACTCTAATTTTTCATGTGTTA
TCTTTCATATCCTTTTTCATATTAAAATAGATAAAAATAAATTTGATTGGTCTTTGTGTC
TTTTCTTTTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CK42JQ C 1
AF RS1CK42TF U 1
BS 1 610 RS1CK42TF

RD RS1CK42JQ 610 0 0
GGGCCATTAACTACTTAAAGGAGCTTGAGCATCATTTACAATCAATTGAGCCCCCGTTAA
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CTATCGCCGCCAGCTCGGTAGGACCGTTCTCAGAGTTCTTTGCTTTTCCTCAATACTCGT
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AGAGCCATGCGAGTGTGAAGATACTCGCCAAGAAGAGACCGAAACAGCTTCTTAAACTGG
CGGCATCGATACAGAGCCTAAAGCTTACTGTTCTTCATCTCAACGTCACCACTCGTGACG
ACTCTGTCCTCTATTCCATCAGCCTAAAGGTTGAAGAAGGGAGCCAGTTGAACACAGTGG
AAGATATTGCAGCAGGCATGAATCAAATCATAAGGAGGATTGAAGAAGAGTCGTCTTGAG
CTAATATAGTTGGATTTTAGTTATGACACATTTAGAGGAACTCTAATTTTTCATGTGTTA
TCTTTCATATCCTTTTTCATATTAAAATAGATAAAAATAAATTTGATTGGTCTTTGTGTC
TTTTCTTTTC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RS1CK42TF 610 0 0
GGGCCATTAACTACTTAAAGGAGCTTGAGCATCATTTACAATCAATTGAGCCCCCGTTAA
AGAGAACCACCGTTCCAGTAGACACCGGAGCAGCAGCCGCTGCCGCCGACCAGATCAGCA
CTATCGCCGCCAGCTCGGTAGGACCGTTCTCAGAGTTCTTTGCTTTTCCTCAATACTCGT
GCCGACCTTCTTCATCGTCTGTGGCTGAAGGGATGGCTGAGATAGAGGTGACGATGGTGG
AGAGCCATGCGAGTGTGAAGATACTCGCCAAGAAGAGACCGAAACAGCTTCTTAAACTGG
CGGCATCGATACAGAGCCTAAAGCTTACTGTTCTTCATCTCAACGTCACCACTCGTGACG
ACTCTGTCCTCTATTCCATCAGCCTAAAGGTTGAAGAAGGGAGCCAGTTGAACACAGTGG
AAGATATTGCAGCAGGCATGAATCAAATCATAAGGAGGATTGAAGAAGAGTCGTCTTGAG
CTAATATAGTTGGATTTTAGTTATGACACATTTAGAGGAACTCTAATTTTTCATGTGTTA
TCTTTCATATCCTTTTTCATATTAAAATAGATAAAAATAAATTTGATTGGTCTTTGTGTC
TTTTCTTTTC

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 2

CO CL8586Contig1 461 2 1 U
GGATCTTCCTAACAACCGTGAGCTCTACATCCATCGTATTGGAAGATCTGGTCGTTTCGG
ACGTAAGGGTGTTGCGATCAACTTTGTTAAAAGCGACGACATCAAGATCCTCAGGGACAT
TGAGCAGTACTACAGTACCCAGATTGACGAGATGCCAATGAATGTAGCTGATCTTATCTA
AAAAGACCTTGTCCGACATTTTTGTGATGGTCTTTTTGCTTTCAATGTGAAGATTATTGT
TTTATCTTTTGATGCTTCACTGAATACCTCTACCCGCTTTGATGTTTCTTTGGGTTCTTT
CGAACACTCGTGTGGTAAATGTTTAATGACTTGTGAAGCGATTTCGGTAGAGTTTAGTCT
TCTCTCCCTTGTAATTTGTTTTGCTTTGTTTCTCAAATCTCCAACTTTCATTACTTTGTA
AGGCTACGATCAACAGTTGAAAAAGGTTCAGTGTTTCAAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1EK47JQ C 1
AF RS1EK47TF U 1
BS 1 461 RS1EK47TF

RD RS1EK47JQ 461 0 0
GGATCTTCCTAACAACCGTGAGCTCTACATCCATCGTATTGGAAGATCTGGTCGTTTCGG
ACGTAAGGGTGTTGCGATCAACTTTGTTAAAAGCGACGACATCAAGATCCTCAGGGACAT
TGAGCAGTACTACAGTACCCAGATTGACGAGATGCCAATGAATGTAGCTGATCTTATCTA
AAAAGACCTTGTCCGACATTTTTGTGATGGTCTTTTTGCTTTCAATGTGAAGATTATTGT
TTTATCTTTTGATGCTTCACTGAATACCTCTACCCGCTTTGATGTTTCTTTGGGTTCTTT
CGAACACTCGTGTGGTAAATGTTTAATGACTTGTGAAGCGATTTCGGTAGAGTTTAGTCT
TCTCTCCCTTGTAATTTGTTTTGCTTTGTTTCTCAAATCTCCAACTTTCATTACTTTGTA
AGGCTACGATCAACAGTTGAAAAAGGTTCAGTGTTTCAAGC

QA 1 461 1 461
DS 

RD RS1EK47TF 461 0 0
GGATCTTCCTAACAACCGTGAGCTCTACATCCATCGTATTGGAAGATCTGGTCGTTTCGG
ACGTAAGGGTGTTGCGATCAACTTTGTTAAAAGCGACGACATCAAGATCCTCAGGGACAT
TGAGCAGTACTACAGTACCCAGATTGACGAGATGCCAATGAATGTAGCTGATCTTATCTA
AAAAGACCTTGTCCGACATTTTTGTGATGGTCTTTTTGCTTTCAATGTGAAGATTATTGT
TTTATCTTTTGATGCTTCACTGAATACCTCTACCCGCTTTGATGTTTCTTTGGGTTCTTT
CGAACACTCGTGTGGTAAATGTTTAATGACTTGTGAAGCGATTTCGGTAGAGTTTAGTCT
TCTCTCCCTTGTAATTTGTTTTGCTTTGTTTCTCAAATCTCCAACTTTCATTACTTTGTA
AGGCTACGATCAACAGTTGAAAAAGGTTCAGTGTTTCAAGC

QA 1 461 1 461
DS 



AS 1 2

CO CL8587Contig1 583 2 3 U
TTTTTTTTTGGCGAACTTGCAAGTTTCTGGAATTATTGAAAAGGTTTTTCCATCATATAT
TTTGAACTAAGATCGATTTTGTTATTAATATGTACAAAAACAGACAAACGTGCAGAAACA
CTGGTGGGGAAACAAGATGGAAGTGGGAACCTCATCATCAGGCTTGGTCAAGGCCAAATC
TGAGACACTATCAGAAGCTCTCAAGTCTAGTTCACTTGATTTCAGTAGTAATGGTGGCGG
CAGTAGCCACGGGAGAAAGCACCATGTGAGAGCATCGTCATCACCAAGCCAAAGTGGCAG
CAGTAACAAACAGAGCAACAGAAGGAACACACACATTAGGAAGGCCAAAAGTGCACACCC
TGCTCTTGACCTTAGTCGTCTCACTGGTGGTGCGGCTCTTAGCCGAGCCTCTAGTACTTC
CCTTGGACTTTCCTTCTCTTTTACAGGCTTCGCTGTGCCGCATGAAGAAGATATCATTCC
TTCAGAGCGATCATGCAGCAATGATGATAACTTGTAAGGATCCATGGTGAAGAAGAAGCC
CTGATGATCCCCAAATATAACTGTTGAGGTTTTGGTTTAGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G280JQ U 10
AF RS1G280TF C 1
BS 1 9 RS1G280TF
BS 10 533 RS1G280JQ
BS 534 583 RS1G280TF

RD RS1G280JQ 524 0 0
GGCGAACTTGCAAGTTTCTGGAATTATTGAAAAGGTTTTTCCATCATATATTTTGAACTA
AGATCGATTTTGTTATTAATATGTACAAAAACAGACAAACGTGCAGAAACACTGGTGGGG
AAACAAGATGGAAGTGGGAACCTCATCATCAGGCTTGGTCAAGGCCAAATCTGAGACACT
ATCAGAAGCTCTCAAGTCTAGTTCACTTGATTTCAGTAGTAATGGTGGCGGCAGTAGCCA
CGGGAGAAAGCACCATGTGAGAGCATCGTCATCACCAAGCCAAAGTGGCAGCAGTAACAA
ACAGAGCAACAGAAGGAACACACACATTAGGAAGGCCAAAAGTGCACACCCTGCTCTTGA
CCTTAGTCGTCTCACTGGTGGTGCGGCTCTTAGCCGAGCCTCTAGTACTTCCCTTGGACT
TTCCTTCTCTTTTACAGGCTTCGCTGTGCCGCATGAAGAAGATATCATTCCTTCAGAGCG
ATCATGCAGCAATGATGATAACTTGTAAGGATCCATGGTGAAGA

QA 1 524 1 524
DS 

RD RS1G280TF 583 0 0
TTTTTTTTTGGCGAACTTGCAAGTTTCTGGAATTATTGAAAAGGTTTTTCCATCATATAT
TTTGAACTAAGATCGATTTTGTTATTAATATGTACAAAAACAGACAAACGTGCAGAAACA
CTGGTGGGGAAACAAGATGGAAGTGGGAACCTCATCATCAGGCTTGGTCAAGGCCAAATC
TGAGACACTATCAGAAGCTCTCAAGTCTAGTTCACTTGATTTCAGTAGTAATGGTGGCGG
CAGTAGCCACGGGAGAAAGCACCATGTGAGAGCATCGTCATCACCAAGCCAAAGTGGCAG
CAGTAACAAACAGAGCAACAGAAGGAACACACACATTAGGAAGGCCAAAAGTGCACACCC
TGCTCTTGACCTTAGTCGTCTCACTGGTGGTGCGGCTCTTAGCCGAGCCTCTAGTACTTC
CCTTGGACTTTCCTTCTCTTTTACAGGCTTCGCTGTGCCGCATGAAGAAGATATCATTCC
TTCAGAGCGATCATGCAGCAATGATGATAACTTGTAAGGATCCATGGTGAAGAAGAAGCC
CTGATGATCCCCAAATATAACTGTTGAGGTTTTGGTTTAGTCC

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 2

CO CL8588Contig1 1023 2 2 U
TTGTGCTTTCTTCCATTGACACATGGCGACGCCTTCCCCGACACCTTCTCCTCCTTCCGA
CTCAAACCCTAATCACGCCGCTACTCCGCCGCATCAAAATCCACCACCCTCGAACTCCAC
GGCGATTCAAACCCCTCCGTCGCCGCAAACCACCGTGGTCGCCTTAGCCGCATCGACCTC
CGCCGTCGCCAGAAAGACCCAACCGGTGCTATGGACCGAAGACGAGACTCTCCTCCTGGT
CGACTCCTACAAGCAGAAGTGGTACGCGGTTGGTAGAGGTCCTCTCAGATCAAACCAGTG
GGAAGAGATCTCGGTCGCCGTCTCAGGTCGCTCCGGCGTCGAGCGCTCGGCGACGCAGTG
TCGGCACAAGATGGAGAAGTTGCGGAAAAGATTCAAAGCGGAGAGGCAGAGCATGGGACC
TATCTCGATTTGGCCTTTCTATTCTCAGATGGATGAGTCGGATTGCAATCCAGCTCCGAT
CTCAGCTCGTCCCCTCACACGACTTCCTCCAAGTAATCACTACGATGAAGAAGACGAAGA
CGAAGAAGAAGATGAGAGACGAAACAAATCGAGGAGTATCAATCACATAGTGAGAAGACC
TGGGACGGTTAACAGATTCGCAGGGGTTGGTGGAGGATTGTTGCAGTGGGGACAAAAGGA
GAGATCGAAGAGGAAGAGGACATATGAAGGAGGAGGAGGTGGTGAGAGGAGGATGAAGGG
AGCGAGAGCAGTAGCTTATGAGATCAGGGCATTCGCTGAGAAAACAATGGTGACGGAGAA
GAAGAAGAAGCTGCGTAGAGAGATGGAGATCAAACGGCTTAAATTGATTCAGACTTCTCA
GGCTCAGCTTCTTCAGTTTCTAAACACTTCCTTTGCTTATTTCTAACCTTTTTCATCAGA
GGTTAACCAATAAAGATGGTGACAATGTTGTTGTTATTCTTCTTCTACTTCCATCTTTTT
CATTTCTAAGATGTAACATAGTTAACTATGTAAAACTAATGTCGAGAACTTTTTCTTTTT
ATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1C108TF U 1
AF RS1C108JQ C 251
BS 1 752 RS1C108TF
BS 753 1023 RS1C108JQ

RD RS1C108TF 752 0 0
TTGTGCTTTCTTCCATTGACACATGGCGACGCCTTCCCCGACACCTTCTCCTCCTTCCGA
CTCAAACCCTAATCACGCCGCTACTCCGCCGCATCAAAATCCACCACCCTCGAACTCCAC
GGCGATTCAAACCCCTCCGTCGCCGCAAACCACCGTGGTCGCCTTAGCCGCATCGACCTC
CGCCGTCGCCAGAAAGACCCAACCGGTGCTATGGACCGAAGACGAGACTCTCCTCCTGGT
CGACTCCTACAAGCAGAAGTGGTACGCGGTTGGTAGAGGTCCTCTCAGATCAAACCAGTG
GGAAGAGATCTCGGTCGCCGTCTCAGGTCGCTCCGGCGTCGAGCGCTCGGCGACGCAGTG
TCGGCACAAGATGGAGAAGTTGCGGAAAAGATTCAAAGCGGAGAGGCAGAGCATGGGACC
TATCTCGATTTGGCCTTTCTATTCTCAGATGGATGAGTCGGATTGCAATCCAGCTCCGAT
CTCAGCTCGTCCCCTCACACGACTTCCTCCAAGTAATCACTACGATGAAGAAGACGAAGA
CGAAGAAGAAGATGAGAGACGAAACAAATCGAGGAGTATCAATCACATAGTGAGAAGACC
TGGGACGGTTAACAGATTCGCAGGGGTTGGTGGAGGATTGTTGCAGTGGGGACAAAAGGA
GAGATCGAAGAGGAAGAGGACATATGAAGGAGGAGGAGGTGGTGAGAGGAGGATGAAGGG
AGCGAGAGCAGTAGCTTATGAGATCAGGGCAT

QA 1 752 1 752
DS 

RD RS1C108JQ 773 0 0
AAGCAGAAGTGGTACGCGGTTGGTAGAGGTCCTCTCAGATCAAACCAGTGGGAAGAGATC
TCGGTCGCCGTCTCAGGTCGCTCCGGCGTCGAGCGCTCGGCGACGCAGTGTCGGCACAAG
ATGGAGAAGTTGCGGAAAAGATTCAAAGCGGAGAGGCAGAGCATGGGACCTATCTCGATT
TGGCCTTTCTATTCTCAGATGGATGAGTCGGATTGCAATCCAGCTCCGATCTCAGCTCGT
CCCCTCACACGACTTCCTCCAAGTAATCACTACGATGAAGAAGACGAAGACGAAGAAGAA
GATGAGAGACGAAACAAATCGAGGAGTATCAATCACATAGTGAGAAGACCTGGGACGGTT
AACAGATTCGCAGGGGTTGGTGGAGGATTGTTGCAGTGGGGACAAAAGGAGAGATCGAAG
AGGAAGAGGACATATGAAGGAGGAGGAGGTGGTGAGAGGAGGATGAAGGGAGCGAGAGCA
GTAGCTTATGAGATCAGGGCATTCGCTGAGAAAACAATGGTGACGGAGAAGAAGAAGAAG
CTGCGTAGAGAGATGGAGATCAAACGGCTTAAATTGATTCAGACTTCTCAGGCTCAGCTT
CTTCAGTTTCTAAACACTTCCTTTGCTTATTTCTAACCTTTTTCATCAGAGGTTAACCAA
TAAAGATGGTGACAATGTTGTTGTTATTCTTCTTCTACTTCCATCTTTTTCATTTCTAAG
ATGTAACATAGTTAACTATGTAAAACTAATGTCGAGAACTTTTTCTTTTTATG

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

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GCTTCACAAATCAAACAAACACAACACAAACTAGCAAAAACAAAAAAACTTTAAAAGGAT
TATATTCTCTCCAAACACATCTTAAGAAAACATGAAAATGGGAATGAGTTTAGTGTTGCT
TACAGTTTTCATGGCTGTGATGTCTTCTACAAGAGTCCTTGCTCAGTCGAGTTGCACAAC
TGCTTTGATCAGTATGTCGCCGTGTCTCAACTACATAACCGGAAACACTACATCTCCATC
TCAGCAATGCTGCAGTCAGTTGGGTAACGTAGTCCGGTCTTCTCCAGATTGTTTGTGTCA
AGTCCTCAACGGTGGTGGCTCTCAGCTCGGGATCAACGTTAACCAAACACAGGCTCTTGC
TTTGCCTAGGGCTTGTAATGTTCAGACTCCTCCTGTCAGTCGCTGTAACAACGGAGGTGG
TTCTACTGCTGACTCTCCTGCAGACTCACCAAACTCCTCAGGACCAGGAAATGGATCGAA
AACTGTACCAGTAGGAGAAGGAGAAGGGGAAGGACCATCGTCAGACGGAAGCTCTATCAA
GTTCTCATATCCTCTTCTTACCTTCCTTTCCGCGGCTTCCTACATGGCAATCTTCTTGCA
ATACTGAGTTTCTCCATCCACGGTTCTCCTGAAACCTATGAAGCTTTTATCATACCACTC
AGATTGCATTCTTTATTTTTCCTTATTTGTTCACATTTCCTTGTGACTTCATGTATTGTA
CTGTAGTTATTATGTGCTCCCTGAGTCCCTTCTCTCCGGGTGATATTGGATCGCTTTACC
TTTTATAATAAACACTATCTTTCAGAAC


BQ
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AF RS1A706JQ C 1
AF RS1A706TF U 171
BS 1 170 RS1A706JQ
BS 171 759 RS1A706TF
BS 760 760 RS1A706JQ
BS 761 783 RS1A706TF
BS 784 808 RS1A706JQ

RD RS1A706JQ 808 0 0
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TATATTCTCTCCAAACACATCTTAAGAAAACATGAAAATGGGAATGAGTTTAGTGTTGCT
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TTCTACTGCTGACTCTCCTGCAGACTCACCAAACTCCTCAGGACCAGGAAATGGATCGAA
AACTGTACCAGTAGGAGAAGGAGAAGGGGAAGGACCATCGTCAGACGGAAGCTCTATCAA
GTTCTCATATCCTCTTCTTACCTTCCTTTCCGCGGCTTCCTACATGGCAATCTTCTTGCA
ATACTGAGTTTCTCCATCCACGGTTCTCCTGAAACCTATGAAGCTTTTATCATACCACTC
AGATTGCATTCTTTATTTTTCCTTATTTGTTCACATTTCCTTGTGACTTCATGTATTGTA
CTGTAGTTATTATGTGCTCCCTGAGTCCCTTCTCTCCGGGTGATATTGGATCGCTTTACC
TTTTATAATAAACACTATCTTTCAGAAC

QA 1 808 1 808
DS 

RD RS1A706TF 618 0 0
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CATCTCCATCTCAGCAATGCTGCAGTCAGTTGGGTAACGTAGTCCGGTCTTCTCCAGATT
GTTTGTGTCAAGTCCTCAACGGTGGTGGCTCTCAGCTCGGGATCAACGTTAACCAAACAC
AGGCTCTTGCTTTGCCTAGGGCTTGTAATGTTCAGACTCCTCCTGTCAGTCGCTGTAACA
ACGGAGGTGGTTCTACTGCTGACTCTCCTGCAGACTCACCAAACTCCTCAGGACCAGGAA
ATGGATCGAAAACTGTACCAGTAGGAGAAGGAGAAGGGGAAGGACCATCGTCAGACGGAA
GCTCTATCAAGTTCTCATATCCTCTTCTTACCTTCCTTTCCGCGGCTTCCTACATGGCAA
TCTTCTTGCAATACTGAGTTTCTCCATCCACGGTTCTCCTGAAACCTATGAAGCTTTTAT
CATACCACTCAGATTGCATTCTTTATTTTTCCTTATTTGTTCACATTTCCTTGTGACTTC
ATGTATTGTACTGTAGTTATTATGTGCTCCCTGAGTCCCTTCTCTCCGG*TGATATTGGA
TCGCTTTACCTTT
ATAAT

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1BL13JQ C 1
AF RS1BL13TF U 108
BS 1 107 RS1BL13JQ
BS 108 717 RS1BL13TF

RD RS1BL13JQ 717 0 0
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TGTTATTCTAGGGAGCATTCTTGAAAAGTGCTCTTTCCCTGTGGATCACTCAGGTATTGC
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GAGATTTGTGGACGAAATAAGAGTTATGCCTGTGATTTGGCACCAGTCTCTTCTTACTTT
TGTGCAACGGTACAAGTATGAACTACTTAAGGAAGACAAAGAGCATTTACAAACTCTTCT
CAATAGGCAAAAGCACCATCTTGTTACTCCTGAGATTGTGAGAGAGCTTCAGGGTAGCAG
AAACCGTGGAGAGAAAGATGATCCTATGTTGACTAATTCTTTTTCAGTTACTACAATCAA
CAACCCGATCAAAGAAGACAGGTTTGACATTCCTGAAGTGCCAATGGAAGAGGACTGATT
CTTTTTCTTTTAGTGTTTTTTTTTGGAAAGACGAATAGTAACTCCGAAAGTTCAGTTTTG
TCATGGTTATTTAATTAATTTTAAGTCAGAATCAATTGTGATCCGATCCTTTTAAATATG
TTTTATAACCCTCTTTGTATAATACAAAGTTCGTAATGATCTTTTCATGTTTAGGCC

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1BL13TF 610 0 0
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CTCTTCTTACTTTTGTGCAACGGTACAAGTATGAACTACTTAAGGAAGACAAAGAGCATT
TACAAACTCTTCTCAATAGGCAAAAGCACCATCTTGTTACTCCTGAGATTGTGAGAGAGC
TTCAGGGTAGCAGAAACCGTGGAGAGAAAGATGATCCTATGTTGACTAATTCTTTTTCAG
TTACTACAATCAACAACCCGATCAAAGAAGACAGGTTTGACATTCCTGAAGTGCCAATGG
AAGAGGACTGATTCTTTTTCTTTTAGTGTTTTTTTTTGGAAAGACGAATAGTAACTCCGA
AAGTTCAGTTTTGTCATGGTTATTTAATTAATTTTAAGTCAGAATCAATTGTGATCCGAT
CCTTTTAAATATGTTTTATAACCCTCTTTGTATAATACAAAGTTCGTAATGATCTTTTCA
TGTTTAGGCC

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 2

CO CL8591Contig1 646 2 2 U
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GCTAGAGAAGATTGAAGAAGTGAGAGAGATGATGAGACAAGGGAAGGATGGTGGTGAAGG
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ATAAAAATTGAATATATGTCAATGTGTCTTTTTAGTTTATGTAGGTAGAAGCAATTTGTT
TGCTCTAGAGTGAAAAAAAAAACGAAGAAGAACGTGTTTTGAAACG


BQ
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AF RS1DX12JQ C 1
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QA 1 646 1 646
DS 

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ATCCATGTTTGATTCGATACTGGCGGGTTGCATCCCTGTGTTCTTCCATCCGGGGACAGC
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GGTTAAGGATGTGAAGGAGTGGGATATCAAGATCAAGGAGAGGTTGCTTGAGATTTCAGA
GGAAAGAGTGGTGAGATTGAGAGAAGAGGTGATTAAGTTGATACCGAGTGTGGTTTACGC
TAATCCGAGTTATGGATCGGAAGGGAATGAAGATGCATTTGAGCTGGCTGTAAAGGGAAT
GCTAGAGAAGATTGAAGAAGTGAGAGAGATGATGAGACAAGGGAAGGATGGTGGTGAAGG
GTTTGATGATAGGGATGATTACAAGTATACATTTTCTCCATATGAAGCTCAAGTTTTGAC
ATAAAAATTGAATATATGTCAATGTGTCTTTTTAGTTTATGTAGGTAGAAGCAATTTGTT
TGCTCTAGAGTGAA

QA 1 614 1 614
DS 



AS 1 2

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CTTCTCTTCCACCGGTAAGTCAAAGAACTGTGTTGCTGCATCTAAAGCACCTTCAATCAC
TGATGGGGGTATCCCATGGTTTATAACCTGTAGAGAAATAAAAGTTATGGCTTATCTCTT
ATTTTGTGAATAAGTAAGGAAAAAAATGCATGCATCCAATTTGTGCTCTCATTTAAGACT
TAGATTGAGGATTTTGTCTTTTCTTTTCTTTCTTTCATGATTAAGGACTTTGTTCCTTGT
GACATACATGCAAGAAGACAACAGCCATCTTTCTAAGTCATATAACGTGTAAGAACATCA
AACTTGCTGGTTATTTGATAACGCATGACTTATTTACATGTAACAATTACCTGAAAGAAA
CCAAATTCCTTGCAGGCCATGTTGATCTCATGGATAACGCTGGATCTAAGCAAAGGTTGG
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AAATCTGGCCTTTGCGATGGGGGAAGAACGTAACGGTCAGGCACTTGAGGCACACCTGAG
TTGGTAAGTGTCATTGCACTTTCAAAAGAATCATCAAGCAAACTCTTTTTTGTTTCCTCC
ATTCTGTTCTGTTTGCTTAGAGTGGAAAAATATATGTTATTACCCTGACTTACTGAAGAG
TATGCAACATGCATAGTGTATTTATACATGTATGTTATACGGTTAAAGTCTTCTAGAAGA
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TTTGCTTACGATTTTGGAAACCCCCCTGCTGCTTCTCTCATCATCTTTACATTAAATGAA
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GACGAATTTTTTTTTTCCATCTATTACAATACTATTAAAGGTCAAGACCCAAAAAATGAG
TCCAACCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BQ83TF U 1
AF RS1BQ83JQ C 457
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CGATAGAGGATGAGAGTAATGTTTAATAAAATCTCTCCAGTAATGAACTCTGTCTTTTGA
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CTTCTCTTCCACCGGTAAGTCAAAGAACTGTGTTGCTGCATCTAAAGCACCTTCAATCAC
TGATGGGGGTATCCCATGGTTTATAACCTGTAGAGAAATAAAAGTTATGGCTTATCTCTT
ATTTTGTGAATAAGTAAGGAAAAAAATGCATGCATCCAATTTGTGCTCTCATTTAAGACT
TAGATTGAGGATTTTGTCTTTTCTTTTCTTTCTTTCATGATTAAGGACTTTGTTCCTTGT
GACATACATGCAAGAAGACAACAGCCATCTTTCTAAGTCATATAACGTGTAAGAACATCA
AACTTGCTGGTTATTTGATAACGCATGACTTATTTACATGTAACAATTACCTGAAAGAAA
CCAAATTCCTTGCAGGCCATGTTGATCTCATGGATAACGCTGGATCTAAGCAAAGGTTGG
TGCAAAAGAAAGAGATCAAGGACTGGAAGTGTTGTCTCTCTGATGCCTATGCTTGAACCA
AGATCTGGCCTTTGCGATGGGGGAAGAACGT

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DS 

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TCAGGCACTTGAGGCACACCTGAGTTGGTAAGTGTCATTGCACTTTCAAAAGAATCATCA
AGCAAACTCTTTTTTGTTTCCTCCATTCTGTTCTGTTTGCTTAGAGTGGAAAAATATATG
TTATTACCCTGACTTACTGAAGAGTATGCAACATGCATAGTGTATTTATACATGTATGTT
ATACGGTTAAAGTCTTCTAGAAGACAATTTTAATTAAATTTCCGTTGAAAGAAACATTTT
ATTCTTTTCTTTTTTTTTTTCTCATTTGCTTACGATTTTGGAAACCCCCCTGCTGCTTCT
CTCATCATCTTTACATTAAATGAAGTGAGAGATGTCAAATTATAGATGTCAATTTTAAAG
TGAATTGCATATAGAGATATGTATGACGAATTTTTTTTTTCCATCTATTACAATACTATT
AAAGGTCAAGACCCAAAAAATGAGTCCAACCC

QA 1 692 1 692
DS 



AS 1 2

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TCTCAACCTCTCTATCTACGAAAGCAACAAAGAGCTGATCATGCTTGCGGGTGCGGTCAC
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GCTCTTTAGCCCCTCGTTAGCCGATGAGAACAAGATCATAATAGGCGCTTCTGGTGCGAT
ACCTGCTTTGGTGAATCTCCTTGAGAACGGTAGCGTGAGAGGGAAGAAAGACGCTGCGAC
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AATAGCTCTTTAACAAAAAATAAAATAAAGATTGGAA


BQ
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1EL94TF U 71
AF RS1E522JQ C 1
BS 1 71 RS1E522JQ
BS 72 191 RS1EL94TF
BS 192 192 RS1E522JQ
BS 193 709 RS1EL94TF
BS 710 757 RS1E522JQ

RD RS1EL94TF 639 0 0
G
CTATCTACGAAAGCAACAAAGAGCTGATCATGCTTGCGGGTGCGGTCACGTCAATAGTGC
AAGTCCTGAGAGCTGGGACCGCGGAAGCTAAAGAAAACGCTGCAGCAACGCTCTTTAGCC
TCTCGTTAGCCGATGAGAACAAGATCATAATAGGCGCTTCTGGTGCGATACCTGCTTTGG
TGAATCTCCTTGAGAACGGTAGCGTGAGAGGGAAGAAAGACGCTGCGACTGCTCTGTTCA
ACTTGTGTATATACGAAGGGAACAAAGGAAGAGCGGTTAGAGCTGGTGTCGTGAGCCCAT
TGGTGAAAATGCTTAACGACACTTCGAGTCATAGGATGGTGACTGAAGCTTTGACGATAC
TCTCGGTTCTAGCTAGTAACCAAGACGCTAAAACCGCGGTTGTGAGGGCGAATGCAATAC
CGTCTTTGATAGTGTTGTTGCAGAAGGATCAGACTAGAAACAGAGAGAACGCAGCGGCGA
TATTGTTTGCTCTTTGCAAGAGAGATACTGAGAAGCTGATCCTCATTGGTAAACTAGGAG
CTGTTGTTCCGTTGATGGAACTGTCGAGAGATGACACAGAGAGAGCTAAGAGGAAAGCTA
ATTCTTTGCTTGAGCAGCTCCGCAAATCATCTCAAAAA

QA 2 639 2 639
DS 

RD RS1E522JQ 757 0 0
TTTTGGTGACCTCTTGACATCGGAGGACGTCGAGACGCAGGAGAAGGCAGTCACTTGCGT
TCTCAACCTCTCTATCTACGAAAGCAACAAAGAGCTGATCATGCTTGCGGGTGCGGTCAC
TTCAATAGTGCAAGTCCTGAGAGCTGGGACCGCGGAAGCTAAAGAAAGCGCTGCAGCAAC
GCTCTTTAGCCCCTCGTTAGCCGATGAGAACAAGATCATAATAGGCGCTTCTGGTGCGAT
ACCTGCTTTGGTGAATCTCCTTGAGAACGGTAGCGTGAGAGGGAAGAAAGACGCTGCGAC
TGCTCTGTTCAACTTGTGTATATACGAAGGGAACAAAGGAAGAGCGGTTAGAGCTGGTGT
CGTGAGCCCATTGGTGAAAATGCTTAACGACACTTCGAGTCATAGGATGGTGACTGAAGC
TTTGACGATACTCTCGGTTCTAGCTAGTAACCAAGACGCTAAAATCGCGGTTGTGAGGGC
GAATGCAATACCGTCTTTGATAGTGTTGTTGCAGAAGGATCAGCCTAGAAACAGAGAGAA
CGCAGCGGCGATATTGTTTGCTCTTTGCAAGAGAGATACTGAGAAGCTGATCCTCATTGG
TAAACTAGGAGCTGTTGTTCCGTTGATGGAACTGTCGAGAGATGGCACAGAGAGAGCTAA
GAGGAAAGCTAATTCTTTGCTTGAGCAGCTCCGCAAATCATCTCAAAAATTATGCTAATT
AATAGCTCTTTAACAAAAAATAAAATAAAGATTGGAA

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

CO CL8594Contig1 927 2 2 U
GGGCAAGCCTCGGCTTTGCGAATATACTGGTCAATTGTTTTGTTCTTCCTGCCATACGAA
TGACATGTCTGTCCTGCCAGCGAGAGTACTACATCATTGGGATTTTAATCCTTATCCAGT
TTCTCAACTGGCAAAATCATATCTGGACTCCATACATGAGCAGCCTATGCTATGTGTCAG
TGCGGTCAATCCTTTTCTGTCCTCCAAGGTCCCTGCACTGAACCATATTATGAGCATCCG
GAAAAGAATAACCATTATGCTTCCATATGTACACTGTCCATTCCGCAAGACACTCAACAA
AGGACTCAGCACTCGGAGACACCTTCTTGAGAGCACTGATTTTTTTGCTTTAAGAGATCT
AATTGATCTTTCTAAAGGGCCATTTGCAGCACTTCCTGCAATTGTGGAGACGGTTAGGAA
GAAAATTCTGGAGCATATAACAGAACGGTGCCTTGTTTGTTGCGATGTGGGGGTTCCCTG
TAACGCCAGACAAGCTTGTGACGACACATCCTCTTTAATATTTCCATTCCAGCAGGAAGA
TGAGGTTAAGAAATGCCGGTCGTGCGGCTTGGTTTACCACAAGAGATGTTTCTCGAGACT
GTCAAACTGCCATTGCGGAACACAACTTAAGCCAAACAAGAGCTTTGCAGAGCTGCAAGT
TTCAGAGAAGAAATCAGATTCCACGTCTGTCTTGCCTTTGAGATTCCTCTCGGGTTTATT
TGGAAAGACAAAAAAAGACTCAGAAACCACTATTTTAATGGGTTCGCTTCCAACCAATGA
TCTATAAACTATAGGTCCGATTTTTAATGTATTTGTATGTCTGTGTTTATGTAAACCTTT
GCCATCTGTAACGTAAGCCTCATGTGTTAATCCTAATTTCTTTTACATTTTCTTGTAAAG
AAAAGGATAATAAAGTTCTGTCTAGTG


BQ
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AF RS1F241TF U 1
AF RS1F241JQ C 370
BS 1 531 RS1F241TF
BS 532 927 RS1F241JQ

RD RS1F241TF 531 0 0
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TGACATGTCTGTCCTGCCAGCGAGAGTACTACATCATTGGGATTTTAATCCTTATCCAGT
TTCTCAACTGGCAAAATCATATCTGGACTCCATACATGAGCAGCCTATGCTATGTGTCAG
TGCGGTCAATCCTTTTCTGTCCTCCAAGGTCCCTGCACTGAACCATATTATGAGCATCCG
GAAAAGAATAACCATTATGCTTCCATATGTACACTGTCCATTCCGCAAGACACTCAACAA
AGGACTCAGCACTCGGAGACACCTTCTTGAGAGCACTGATTTTTTTGCTTTAAGAGATCT
AATTGATCTTTCTAAAGGGCCATTTGCAGCACTTCCTGCAATTGTGGAGACGGTTAGGAA
GAAAATTCTGGAGCATATAACAGAACGGTGCCTTGTTTGTTGCGATGTGGGGGTTCCCTG
TAACGCCAGACAAGCTTGTGACGACACATCCTCTTTAATATTTCCATTCCA

QA 1 531 1 531
DS 

RD RS1F241JQ 558 0 0
TTCTAAAGGGCCATTTGCAGCACTTCCTGCAATTGTGGAGACGGTTAGGAAGAAAATTTT
GGAGCATATAACAGAACGGTGCCTTGTTTGTTGCGATGTGGGGGTTCCCTGTAACGCCAG
ACAAGCTTGTGACGACACATCCTCTTTAATATTTCCATTCCAGCAGGAAGATGAGGTTAA
GAAATGCCGGTCGTGCGGCTTGGTTTACCACAAGAGATGTTTCTCGAGACTGTCAAACTG
CCATTGCGGAACACAACTTAAGCCAAACAAGAGCTTTGCAGAGCTGCAAGTTTCAGAGAA
GAAATCAGATTCCACGTCTGTCTTGCCTTTGAGATTCCTCTCGGGTTTATTTGGAAAGAC
AAAAAAAGACTCAGAAACCACTATTTTAATGGGTTCGCTTCCAACCAATGATCTATAAAC
TATAGGTCCGATTTTTAATGTATTTGTATGTCTGTGTTTATGTAAACCTTTGCCATCTGT
AACGTAAGCCTCATGTGTTAATCCTAATTTCTTTTACATTTTCTTGTAAAGAAAAGGATA
ATAAAGTTCTGTCTAGTG

QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 2

CO CL8595Contig1 1296 2 2 U
GCGAAGCTTCAGGTCTTAAAGGTATGCTTGTGTACGGCGTGGAACATGCCGATGACGCTG
CCACTTGTGATGATAACATGCAACACTTCCTTCGAACTATCGAAGCTGCAAAATCCTTAC
CAACATCTCACTTTAGCTCAGTGGTCGTGAAGATAACCGCGATTTGTCCCATCAGTCTCC
TAAAACGAGTGAGCGATCTACTTCGATGGGAATACAAAAGTCAAAATTTTAAACTCTCGT
GGAAGCTCAAGTCGTTCCCGGTTTTCTCCGATTCAAGTCCTCTCTACCACACAAACTCAG
AACCGGAACCGTTAACCGCCGAAGAAGAACGGGAGCTCGAAGCAGCCCACGTAAGGATCC
AAGAAATCTGTCGAAGACGCCAAGAGTCCAATGTACCTTTGCTGGTCGATGCTGAAGACA
CAATCCTCCAACCGGCGATCGATTACATGGCTTATTCATCAGCTATCATATTCAACACGG
ACAAAGACAGACCCATCATTTACAACACCATTCAGGCCTACTTGAGAGACGCTGGTGAGA
GGTTGCACTTGGCCGTTCAAGAAGCCGAGAGAGAAGGTGTTCCTATGGGTTTTAAGTTGG
TGAGAGGCGCTTATATGTCTAGCGAAGCTACATTAGCAGATTCCCTGGGGCACAAGTCAC
CGGTCCACGACACAATTCAGAACACGCACGCTTGCTACAATGACTGCCTGACCTTCCTAA
TGGAGAAAGCATCCAACGGATCGGGTTTTGGTGTCGTTCTTGCAACACACAACGCTGATT
CAGGAAGACTTGCATCAAGGAAGGCGAGTGAGCTCAACATCAATAAAAAGGACGGGAAGA
TAGAGTTTGCGCAGCTATACGGTATGTCAGATGCATTGTCCTTCGGTTTAAAGAGAGCCG
GTTTCAATGTAAGCAAATACATGCCATATGGACCGGTTGAAACCGCTATACCGTATCTTT
TCCGACGTGCTTATGAGAACCGCGGAATGATGGCCACGGGAGCCAATGACCGTCAACTCA
TGAGGATGGAACTTAAGAGGAGACTAATTGCCGGGATTGCGTGAAGAGAAGAGTCTATGT
CCTTATGGATGGAGCCAGTAAATGGAATTGGGAAATGTAGATCAATAAATTTCTTCTATA
TATGTAGATTATAAGAGAGAAAAAAAATATTTTAAAAAATGGAGTAGGGATGAACATTTC
ATTTCATGTGGCTTTGTCGTAACAGGACTATACATATTTCACTTTTTGGGTCACATAATT
ATGTATTTAATTATTTCATTATTATTCACCAATGTA


BQ
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AF RS1CB03TF U 1
AF RS1CB03JQ C 559
BS 1 705 RS1CB03TF
BS 706 1296 RS1CB03JQ

RD RS1CB03TF 705 0 0
GCGAAGCTTCAGGTCTTAAAGGTATGCTTGTGTACGGCGTGGAACATGCCGATGACGCTG
CCACTTGTGATGATAACATGCAACACTTCCTTCGAACTATCGAAGCTGCAAAATCCTTAC
CAACATCTCACTTTAGCTCAGTGGTCGTGAAGATAACCGCGATTTGTCCCATCAGTCTCC
TAAAACGAGTGAGCGATCTACTTCGATGGGAATACAAAAGTCAAAATTTTAAACTCTCGT
GGAAGCTCAAGTCGTTCCCGGTTTTCTCCGATTCAAGTCCTCTCTACCACACAAACTCAG
AACCGGAACCGTTAACCGCCGAAGAAGAACGGGAGCTCGAAGCAGCCCACGTAAGGATCC
AAGAAATCTGTCGAAGACGCCAAGAGTCCAATGTACCTTTGCTGGTCGATGCTGAAGACA
CAATCCTCCAACCGGCGATCGATTACATGGCTTATTCATCAGCTATCATATTCAACACGG
ACAAAGACAGACCCATCATTTACAACACCATTCAGGCCTACTTGAGAGACGCTGGTGAGA
GGTTGCACTTGGCCGTTCAAGAAGCCGAGAGAGAAGGTGTTCCTATGGGTTTTAAGTTGG
TGAGAGGCGCTTATATGTCTAGCGAAGCTACATTAGCAGATTCCCTGGGGCACAAGTCAC
CGGTCCACGACACAATTCAGAACACGCACGCTTGCTACAATGACT

QA 1 705 1 705
DS 

RD RS1CB03JQ 738 0 0
CAAGAAG
CGAGAGAGAAGGTGTTC*TATGGGTTTTAAGTTGGTGAGAGGCGCTTATATGTCTAGCGA
AGCTACATTAGCAGATTCCCTGGGGCACAAGTCACCGGTCCACGACACAATTCAGAACAC
GCACGCTTGCTACAATGACTGCCTGACCTTCCTAATGGAGAAAGCATCCAACGGATCGGG
TTTTGGTGTCGTTCTTGCAACACACAACGCTGATTCAGGAAGACTTGCATCAAGGAAGGC
GAGTGAGCTCAACATCAATAAAAAGGACGGGAAGATAGAGTTTGCGCAGCTATACGGTAT
GTCAGATGCATTGTCCTTCGGTTTAAAGAGAGCCGGTTTCAATGTAAGCAAATACATGCC
ATATGGACCGGTTGAAACCGCTATACCGTATCTTTTCCGACGTGCTTATGAGAACCGCGG
AATGATGGCCACGGGAGCCAATGACCGTCAACTCATGAGGATGGAACTTAAGAGGAGACT
AATTGCCGGGATTGCGTGAAGAGAAGAGTCTATGTCCTTATGGATGGAGCCAGTAAATGG
AATTGGGAAATGTAGATCAATAAATTTCTTCTATATATGTAGATTATAAGAGAGAAAAAA
AATATTTTAAAAAATGGAGTAGGGATGAACATTTCATTTCATGTGGCTTTGTCGTAACAG
GACTATACATATTTCACTTTTTGGGTCACATAATTATGTATTTAATTATTTCATTATTAT
TCACCAATGTA

QA 8 738 8 738
DS 



AS 1 2

CO CL8596Contig1 740 2 3 U
TTTTTTTCTTGTGCAAAATCGAATCAGTTTCCTTTTTCCTTTGAGAGTTTCTGCGTCTTC
AATTGTTATATATAGATATCAAGAGGCGGAAGAAATCTGTAATCTCAGGACAGAACGAGG
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AAGGAGGTTTGGGTTAAAGACGTGGGTTGTCTTTGAGATGAAGAAGATGTCTGATCTCCC
AAAGGATATGGCTGAGGAGGTTCTCTGTCGAATTCCAGTGACATCTCTGAGACCTGTCCG
ATCTACTTGCAAAAAGTGGAACAAGTTGTCCAGATGTGGCGTATTCGCTAAGAAGCACAT
CGATCGTCTAGGAGAAGAAGCAAAGGAGGGCCGTCTTGTGGTCATGATGATGGATTATAG
GGTTTTCTTGATGAGATTCAATCTTTCCAACAAATCATCATGTGTAGTAGAGCGTGAAGC
TAAGCTTATTGGCCCAGACGGTTCAGATCAAATCGATGTGCGTGAAATCTTTCATTGCGA
CGGTTTATTGTTATGTATTCTCAAAGATGATCACTCCAGGCTCGTGGTTTGGAACCCTTA
TTGGGGGCAAACCAGGTGGATCGAGCAGACACACGACTGCCACTTAGTGGACCAGTATAC
GTATGCTATCGGTTACGACAGTAACAGTAAGTCCCATAAAGTCTTGAGATTTATTGATTT
TATATCTAGTTTTGTCGAGT


BQ
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AF RS1GY08TF U 41
AF RS1BO47TF U 1
BS 1 144 RS1BO47TF
BS 145 145 RS1GY08TF
BS 146 740 RS1BO47TF

RD RS1GY08TF 634 0 0
GG
GAGAGTTTCTGCGTCTTCAATTGTTATATATAGATATCAAGAGGCGGAAGAAATCTGTAA
TCTCGGGACAGAACGAGGACAAGTAAGTTGCTTTGTTTTTTTTGTTTAATTGAAGGTTGA
CTTAACTTGTTAACAAGGAAGGAGGTTTGGGTTAAAGACGTGGGTTGTCTTTGAGATGAA
GAAGATGTCTGATCTCCCAAAGGATATGGCTGAGGAGGTTCTCTGTCGAATTCCAGTGAC
ATCTCTGAGACCTGTCCGATCTACTTGCAAAAAGTGGAACAAGTTGTCCAGATGTGGCGT
ATTCGCTAAGAAGCACATTGATCGTCTAGGAGAAGAAGCAAAGGAGGGCCGTCTTGTGGT
CATGATGATGGATTATAGGGTTTTCTTGATGAGATTCAATCTTTCCAACAAATCATCATG
TGTAGTAGAGCGTGAAGCTAAGCTTATTGGCCCAGACGGTTCAGATCAAATCGATGTGCG
TGAAATCTTTCATTGCGACGGTTTATTGTTATGTATTCTCAAAGATGATCACTCCAGGCT
CGTGGTTTGGAACCCTTATTGGGGGCAAACCAG*TGGATCGAGCAGACACACGACTGCCA
CTTAGTGGACCAGTATACGTATGCTATCGGT
A

QA 3 633 3 633
DS 

RD RS1BO47TF 740 0 0
TTTTTTTCTTGTGCAAAATCGAATCAGTTTCCTTTTTCCTTTGAGAGTTTCTGCGTCTTC
AATTGTTATATATAGATATCAAGAGGCGGAAGAAATCTGTAATCTCAGGACAGAACGAGG
ACAAGTAAGTTGCTTTGTTTTTTT*GTTTAATTGAAGGTTGACTTAACTTGTTAACAAGG
AAGGAGGTTTGGGTTAAAGACGTGGGTTGTCTTTGAGATGAAGAAGATGTCTGATCTCCC
AAAGGATATGGCTGAGGAGGTTCTCTGTCGAATTCCAGTGACATCTCTGAGACCTGTCCG
ATCTACTTGCAAAAAGTGGAACAAGTTGTCCAGATGTGGCGTATTCGCTAAGAAGCACAT
CGATCGTCTAGGAGAAGAAGCAAAGGAGGGCCGTCTTGTGGTCATGATGATGGATTATAG
GGTTTTCTTGATGAGATTCAATCTTTCCAACAAATCATCATGTGTAGTAGAGCGTGAAGC
TAAGCTTATTGGCCCAGACGGTTCAGATCAAATCGATGTGCGTGAAATCTTTCATTGCGA
CGGTTTATTGTTATGTATTCTCAAAGATGATCACTCCAGGCTCGTGGTTTGGAACCCTTA
TTGGGGGCAAACCAGGTGGATCGAGCAGACACACGACTGCCACTTAGTGGACCAGTATAC
GTATGCTATCGGTTACGACAGTAACAGTAAGTCCCATAAAGTCTTGAGATTTATTGATTT
TATATCTAGTTTTGTCGAGT

QA 1 740 1 740
DS 



AS 1 2

CO CL8597Contig1 938 2 4 U
GAACCAAATCTCCAACAACTGTGGAATGCTTCACTACACATCTGGTGGTCAGTTCACTAT
CCCTGTCGTCATCCGTGGTCCCGGTGGAGTGGGACGCCAGCTCGGCGCTGAGCATTCTCA
GCGGCTAGAATCTTACTTCCAGTCCATCCCTGGGATCCAGATGGTTGCTTGCTCAACTCC
TTACAATGCTAAAGGCTTGATGAAGGCTGCCATAAGAAGTGAGAACCCTGTGATTCTGTT
TGAGCACGTTCTGCTTTACAATCTCAAGGAGAAGATCCCTGACGAAGAATACATCTGTAA
CCTTGAAGAAGCTGAGATGGTTAGACCTGGAGAGCATATTACCATCCTCACTTACTCCCG
GATGAGGTACCATGTGATGCAGGCGGCTAAAACGCTGGTGAACAAAGGGTATGACCCTGA
GGTTATCGACATCAGGTCGTTGAAACCGTTTGATCTTTACACGATTGGGAACTCGGTGAA
GAAAACGCACAGGGTTTTGATAGTGGAGGAGTGTATGAGAACCGGTGGGATTGGAGCTAG
TCTTACGGCTGCCATTAATGAGAACTTCCATGACTATTTGGATGCTCCGGTGATGTGTTT
GTCTTCTCAGGATGTTCCTACACCTTATGCTGGTACTCTTGAAGAGTGGACCGTGGTTCA
ACCGGCTCAGATCGTGACAGCCGTCGAGCAGCTTTGCCAGTGAAATTTAAATTGTTATCC
GGTGAACACCCATTATTTACCCATTTACTTCTCAGTTTCCTTTCTCTTATCTTTTAACTT
AGTTCGTTAAAATTTGTCTAAGTGGTTTGGTTTTGTTAAATCTTTGTTGTCCCTTTTGTT
GCGTCTTGAAATTTGTTTTCGTTTTCGTTTAATTTATCTCCCACATTTGTTTTTTAACCT
CAGGTTTTTCTTTGCCTTTAGCTATAAACACAAGTTGC


BQ
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AF RS1D726TF U 1
AF RS1D726JQ C 148
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CCCTGTCGTCATCCGTGGTCCCGGTGGAGTGGGACGCCAGCTCGGCGCTGAGCATTCTCA
GCGGCTAGAATCTTACTTCCAGTCCATCCCTGGGATCCAGATGGTTGCTTGCTCAACTCC
TTACAATGCTAAAGGCTTGATGAAGGCTGCCATAAGAAGTGAGAACCCTGTGATTCTGTT
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CCTTGAAGAAGCTGAGATGGTTAGACCTGGAGAGCATATTACCATCCTCACTTACTCCCG
GATGAGGTACCATGTGATGCAGGCGGCTAAAACGCTGGTGAACAAAGGGTATGACCCTGA
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TCTTACGGCTGCCATTAATGAGAACTTCCATGACTATTTGGATGCTCCGGTGATGTGTTT
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ACCGGCTCAGATCGTGACAGCCGTCGAGCAGCTTTGCCAGTGAAATTTAAATTGTTATCC
GGTGA*CACCCATTATTTACCCATTTACTTCTCAGTTTCCTT

QA 1 762 1 762
DS 

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TGCCATAAGAAGTGAGAACCCTGTGATTCTGTTTGAGCACGTTCTGCTTTACAATCTCAA
GGAGAAGATCCCTGACGAAGAATACATCTGTAACCTTGAAGAAGCTGAGATGGTTAGACC
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TAAAACGCTGGTGAACAAAGGGTATGACCCTGAGGTTATCGACATCAGGTCGTTGAAACC
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GGAGTGTATGAGAACCGGTGGGATTGGAGCTAGTCTTACGGCTGCCATTAATGAGAACTT
CCATGACTATTTGGATGCTCCGGTGATGTGTTTGTCTTCTCAGGATGTTCCTACACCTTA
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GCAGCTTTGCCAGTGAAATTTAAATTGTTATCCGGTGAACACCCATTATTTACCCATTTA
CTTTTCAGTTTCCTTTCTCTTATCTTTTAACTTAGTTCGTTAAAATTTGTCTAAGTGGTT
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TTTAATTTATCTCCCACATTTGTTTTTTAACCTCAGGTTTTTCTTTGCCTTTAGCTATAA
ACACAAGTTGC

QA 1 791 1 791
DS 



AS 1 2

CO CL8598Contig1 618 2 1 U
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GCAAATTTTCCTTTAAGTTTTTCAAATCTTTCCTTGACTTCTTCATATTGTTTCTTATAC
TTCGTTATTTCTCTTTCTTTCCTTCATCGTTCATAGGTTCTTTCTTTTTAAATCCGATAT
TTGTATTAACTTCTGGGATCTCAGCCTTCTCTTTTCTTCTGTTCAAAAGATTTCAGCCAT
TCTTTTTTACTTCCCTACGCGTTAATTGTCTTCTCTTCACCTTTAATTTTTTTTTTGGTT
TAAAGCTTTTCTTCTCATCTGCTTGTTTCAGATCTGACACTTTGGAGAAGACAAGCAAGG
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CAGTTGTTTACAAGAAAAAAGAATTATATTCAGTTTTAATTTTTGGCTTTAATAAATATT
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TTTTTTAAATAAATTTTC


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AF RS1CW84JQ C 1
AF RS1CW84TF U 1
BS 1 618 RS1CW84TF

RD RS1CW84JQ 618 0 0
TTTTTCCTTAACTTCTTTTATTTTCTTCTCTGTTTCCTTTCCTTTTCTTACTCTTCTTCT
GCAAATTTTCCTTTAAGTTTTTCAAATCTTTCCTTGACTTCTTCATATTGTTTCTTATAC
TTCGTTATTTCTCTTTCTTTCCTTCATCGTTCATAGGTTCTTTCTTTTTAAATCCGATAT
TTGTATTAACTTCTGGGATCTCAGCCTTCTCTTTTCTTCTGTTCAAAAGATTTCAGCCAT
TCTTTTTTACTTCCCTACGCGTTAATTGTCTTCTCTTCACCTTTAATTTTTTTTTTGGTT
TAAAGCTTTTCTTCTCATCTGCTTGTTTCAGATCTGACACTTTGGAGAAGACAAGCAAGG
ATTTATTGATGATGTTTGACTGAACACCATCGTTTCTTTCGGCCACCACCATTGCCATTT
CTCCACCACCGCCATCACCGCTATCACCACCGTAGCTACTTCCACCGACACAAGTATATT
CAGTTGTTTACAAGAAAAAAGAATTATATTCAGTTTTAATTTTTGGCTTTAATAAATATT
GAGTAATACATTTAAATCAATTTTTATTTTATTTTATAGTTTCATTTTAGCATTTATTTT
TTTTTTAAATAAATTTTC

QA 1 618 1 618
DS 

RD RS1CW84TF 618 0 0
TTTTTCCTTAACTTCTTTTATTTTCTTCTCTGTTTCCTTTCCTTTTCTTACTCTTCTTCT
GCAAATTTTCCTTTAAGTTTTTCAAATCTTTCCTTGACTTCTTCATATTGTTTCTTATAC
TTCGTTATTTCTCTTTCTTTCCTTCATCGTTCATAGGTTCTTTCTTTTTAAATCCGATAT
TTGTATTAACTTCTGGGATCTCAGCCTTCTCTTTTCTTCTGTTCAAAAGATTTCAGCCAT
TCTTTTTTACTTCCCTACGCGTTAATTGTCTTCTCTTCACCTTTAATTTTTTTTTTGGTT
TAAAGCTTTTCTTCTCATCTGCTTGTTTCAGATCTGACACTTTGGAGAAGACAAGCAAGG
ATTTATTGATGATGTTTGACTGAACACCATCGTTTCTTTCGGCCACCACCATTGCCATTT
CTCCACCACCGCCATCACCGCTATCACCACCGTAGCTACTTCCACCGACACAAGTATATT
CAGTTGTTTACAAGAAAAAAGAATTATATTCAGTTTTAATTTTTGGCTTTAATAAATATT
GAGTAATACATTTAAATCAATTTCTATTTTATTTTATAGTTTCATTTTAGCATTTATTTT
TTTTTTAAATAAATTTTC

QA 1 618 1 618
DS 



AS 1 2

CO CL8599Contig1 641 2 2 U
GGGTTCTTGGCTCTAAAAGATTATTTATCCGATTTAGCGATCAGAGAATGGCGGCACCGT
TCACGTTGAGGAAGATCGGAGTTCCGCCGAACTCAGCGAACCTGACGGAAGCTCGCCGAC
GTGTGTTCGATTTCTTCAGAGCTGCGTGTAGATCGATCCCCACCGTAATGGACATTTACA
ATCTTCAAGACGTCGTCGCGCCTTCTCAGCTCCGTTTCGCGATCTCCGCTCAGATTCGTA
ATAACGCTCACGTCACCGACCCTAAGGTGATTGATCTTCTCCTATTCAAGGGAATGGAAG
AGCTGACTGACATTGTCGATCACGCAAAGCAGCGTCACCACATCATCGGTCAGTACGTGG
TGGGTGAAGGGCTCGTGCAAAATACTGGAAGCAAGGATCAAGGAAAATCTGATTTTCTCA
AGAATTTCTATACCAGCAACTACTTTTGAGAACTGGTGATTGTTTTCCTCTTACTTGTTT
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TTCTTCCTAAAAAAATAATTAGACCTCTTCATTTGTGGGAGTCCTCTCTAAAGCTTATTT
GTCTTTTTGACTTAATGATCATCATACAATTCAAGTTCCCG


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TTCTTCCTAAAAAAA

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DS 

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TCACGTTGAGGAAGATCGGAGTTCCGCCGAACTCAGCGAACCTGACGGAAGCTCGCCGAC
GTGTGTTCGATTTCTTCAGAGCTGCGTGTAGATCGATCCCCACCGTAATGGACATTTACA
ATCTTCAAGACGTCGTCGCGCCTTCTCAGCTCCGTTTCGCGATCTCCGCTCAGATTCGTA
ATAACGCTCACGTCACCGACCCTAAGGTGATTGATCTTCTCCTATTCAAGGGAATGGAAG
AGCTGACTGACATTGTCGATCACGCAAAGCAGCGTCACCACATCATCGGTCAGTACGTGG
TGGGTGAAGGGCTCGTGCAAAATACTGGAAGCAAGGATCAAGGAAAATCTGATTTTCTCA
AGAATTTCTATACCAGCAACTACTTTTGAGAACTGGTGATTGTTTTCCTCTTACTTGTTT
TTTTGTTTTTTGTCAAGTCTCTTTCCAGTATTGTATTTTCGAACCTTAAGGAAGATAGTC
TTCTTCCTAAAAAAATAATTAGACCTCTTCATTTGTGGGAGTCCTCTCTAAAGCTTATTT
GTCTTTTTGACTTAATGATCATCATACAATTCAAGTTCCCG

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

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GCCATTAGTGGTGGACCTATCTACGTTAGTGATGCTCCTGGAAAACACAACTTTGATCTT
CTAAGAAAGCTTGTGTTGCCTGATGGATCCATCCTTCGTGCTAGATTGCCTGGTAGACCA
ACACGTGACTGTTTGTTCACAGATCCTGCTCGTGATGGTGTCAGCTTGCTAAAGATATGG
AACATGAACAAGTACACTGGAGTTCTTGGCGTGTATAACTGTCAAGGAGCAGCTTGGAGT
AGCACAGAAAGAAAAAACATATTCCACTAGACGAATACTGATTGCATCACTGGCTCCATT
CGTGGTCGTGATGTGCATTTAATCTCCGAGGCCTCCACTGATCCAGCAACATGGAATGGA
GACTGTGCTGTTTACTCTCAGAGCAGAGGGGAACTTAACGTTATTCCATACAACGTGTCT
CTCCCGATCTCACTGAAGATCCGTGAGCATGAGATCTTCACTGTGAGCCCTATTTGTCAT
CTGGCTACTACCGATGGTGTCTCATTTGCTCCGCTTGGTCTTGTGAACATGTACAACTCG
GGAGGAGCTGTCGAGGGACTTAGATATGATGCTGAGAAGATGAAAGTGGTGATGGAAGTT
AAAGGATGTGGTAAATTCGGAGCTTACTCATCGGTGAAGCCTAAGAGATGCGTTGTTGAG
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AAGATGCCTTCAGAGACCAAAACATTACATGTGGTCGAAGTTCAGTTATGAAAGTCATAG
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TCAATAAGTTTTAAGATGAG


BQ
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BS 720 980 RS1GT11JQ

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AGCACAGAAAGAAAAAACATATTCCACTAGACGAATACTGATTGCATCACTGGCTCCATT
CGTGGTCGTGATGTGCATTTAATCTCCGAGGCCTCCACTGATCCAGCAACATGGAATGGA
GACTGTGCTGTTTACTCTCAGAGCAGAGGGGAACTTAACGTTATTCCATACAACGTGTCT
CTCCCGATCTCACTGAAGATCCGTGAGCATGAGATCTTCACTGTGAGCCCTATTTGTCAT
CTGGCTACTACCGATGGTGTCTCATTTGCTCCGCTTGGTCTTGTGAACATGTACAACTCG
GGAGGAGCTGTCGAGGGACTTAGATATGATGCTGAGAAGATGAAAGTGGTGATGGAAGTT
AAAGGATGTGGTAAATTCGGAGCTTACTCATCGGTGAAGCCTAAGAGATGCGTTGTTGA

QA 1 719 1 719
DS 

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CATTTAATCTCCGAGGCCTCCACTGATCCAGCAACATGGAATGGAGACTGTGCTGTTTAC
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AAGATCCGTGAGCATGAGATCTTCACTGTGAGCCCTATTTGTCATCTGGCTACTACCGAT
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TTCGGAGCTTACTCATCGGTGAAGCCTAAGAGATGCGTTGTTGAGTCAAGTGAGATCGCG
TTTGAGTATGATGTCTCCTCTGGTTTAGTCACTTTTGAGTTGGACAAGATGCCTTCAGAG
ACCAAAACATTACATGTGGTCGAAGTTCAGTTATGAAAGTCATAGCTTGTAACTTGTAAG
AGTTGATTCAAACAGTATTCATTACATTACATGTACAACGGTTTGATTATTGTTGTAGCT
ACTTTTGGTGTTGTATTAAATCTAGCTATTGAAGCAATTTGATTTTCAATAAGTTTTAAG
ATGAG

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

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CGTTGCGTACAGTACAAGTCACGAGATTGTTCAGGCTATTAGAGAATCTTGTGTGAGGAA
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TACATCAATTGTTCCTGATCCGGATCTTGTAATAAGATCAGGAGGAATAGATCGGCTGAG
TGATTTCATGACTTGGCAGAGTTCAAGGTCTCTTCTTCATACCACGGCAGCTCTCTGGCC
CGGAGTTAGGTCTTTGGCATTTGGTTTGGGCCATTCTTAAATTCCAGAGGATGCACGATT
ACTTGCAGAGGAAGCAAAAGCTCGACTAAATAGGTTTAAGTTAAACCCTAGCAGAACGGA
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GAAATTTAGGAATTAAGACGAATGTTTCATTAGGTTAGAGCAGCGGTCTCCAGCCGCAGC
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BQ
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AE31TF U 1
AF RS1AE31JQ C 257
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BS 702 702 RS1AE31JQ
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AAAAGATTTGAAAGTGATATTTGCTGGTGATTTGAATCTGGTAAACGAGCGTCTTAAAGC
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TACATCAATTGTTCCTGATCCGGATCTTGTAATAAGATCAG*AGGAATAGATCGGCTGAG
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CGGAGTTAG*TCTTTGGCATTTGGTTTGGGCCATTCTTAAATTCCAGAG*ATGCACGATT
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DS 

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GACGAATGTTTCATTAGGTTAGAGCAGCGGTCTCCAGCCGCAGCATGAACTCTTACAATC
TATGTTGGAGTTACATGTTTCTTGTGG

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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1BO83TF U 1
AF RS1BO83JQ C 71
BS 1 644 RS1BO83TF

RD RS1BO83TF 644 0 0
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ATATCTCCTTGTTGCTGACACTTGGTACGCCTCACTTACCACCACCGAGAGGACTATCAG
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AGGATACAAGCAAGTATGTGGAAGAGCTGATGTGTGGGGTGATGGAGTGGTCCCTGAGGT
TTCAGCTCATCTTGAAGGTGCACTTAACGTTAGCTTCGACGGTGTTTACCATTCGCCTGT
TGGTTCAGACGATGAAACCAGACCTTGGTATGGTTCACCAGTTATTGTAAAAGACTGGAT
TCACCACCTCCTTGAGTGAGTTTTCAGGTTACTGTAAAAACATTCATCAGAATCTCAAGA
ACTTGTTATCTTCCGTTGTCTCTATCTCTTCACTCCAAATACTCAAAATTCTAATCACAC
TATGTATTTATACTCTTCAACTTTTTGAAGCCGTCAAGTGTACC

QA 1 644 1 644
DS 

RD RS1BO83JQ 574 0 0
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GGCTGGAGGATGGCTTGCTAGAGTTTACATGGAAGAATACGGAACCGCTGATATCTCCTT
GTTGCTGACACTTGGTACGCCTCACTTACCACCACCGAGAGGACTATCAGGGGTTATTGA
TCAAACAAGAGGTCTTCAGGGCCTAGTTTCCGTGCTCGTTTTGTAGGGCAAGGATACAAG
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CTTGAAGGTGCACTTAACGTTAGCTTCGACGGTGTTTACCATTCGCCTGTTGGTTCAGAC
GATGAAACCAGACCTTGGTATGGTTCACCAGTTATTGTAAAAGACTGGATTCACCACCTC
CTTGAGTGAGTTTTCAGGTTACTGTAAAAACATTCATCAGAATCTCAAGAACTTGTTATC
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TACTCTTCAACTTTTTGAAGCCGTCAAGTGTACC

QA 1 574 1 574
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8604Contig1 731 2 3 U
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ATTTTGGTACGAGTAAAAGTCCTCCGTTTGGTTCAATGGCTTATGCAAGCTCCATGATCG
TACCAGGTTGCCTATTAAGAAACGCACTACCACCTTCGGTAACCCAACAAAGGAACACGA
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TTAGCTCTTTGGTACTGAATATTTTAGATAAAGTAAACGAGAAGCGGCCAGGTCTAATGG
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CGGTTATTGTAATGTCTGCGTTACTGATACCCGTAATCGGCAATGGGGAGATCTTCACAG
TCTCCACATTAACGCGATAGTTTTCATAACTTCCATTGCACGTTCTGAAGTTTGTTCCGC
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TGTGTTTGTCC


BQ
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TGTGTTTGTCC

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BQ
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QA 1 575 1 575
DS 



AS 1 2

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BQ
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AGCTCCAGGTGTTCAGACTCCAGTCATTGTTCGTTTCTCCACTGTCATCCATGAGCGTGG
AAGTCCCGAGACCTTGAGAGACCCTCGTGGCTTTGCAGTCAAGTTCTACACCAGAGAGGG
GAACTTTGATCTTGTCGGAAACAACTTCCCTGTCTTCTTCATCCGTGACGGGATGAAATT
CCCTGACATGGTCCACGCTCTCAAGCCAAACCCCAAATCTCACATCCAAGAGAACTGGAG
AGTCCTTGACTTCTTCTCCCACCACCCTGAGAGCCTCAACATGTTCACTTTCCTCTTTGA
TGACATTGGTATCCCACAAGACTACAG*CACATGGAAG*TTCAG*TGTCAACACATACAT
GTTGATCAACAAATCCGGCAAAGCACACTACGTGAAGT

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1CH79TF 767 0 0
G
CCAGCGAGTTCATACAACTCTCCATTCTTCACCACCAACTCTGGTGCTCCTGTATGGAAC
AACAACTCCTCTATGACCGTTGGACCCAGAGGTCCTATCCTTCTTGAGGATTACCATCTC
GTCGAGAAGCTTGCTAACTTCGACAGGGAGCGTATTCCAGAGCGTGTGGTTCATGCTAGA
GGAGCCAGTGCAAAGGGTTTCTTCGAGGTCACTCATGATATATCTAACCTCACGTGTGCT
GACTTCCTCAGAGCTCCAGGTGTTCAGACCCCAGTCATTGTTCGTTTCTCCACTGTCATC
CATGAGCGTGGAAGTCCCGAGACCTTGAGAGACCCTCGTGGCTTTGCAGTCAAGTTCTAC
ACCAGAGAGGGAAACTTTGATCTTGTCGGAAACAACTTCCCTGTCTTCTTCATCCGCGAC
GGTATGAAGTTCCCTGACATGGTCCACGCTCTCAAGCCAAACCCAAAATCTCACATCCAA
GAGAACTGGAGAGTCCTTGACTTCTTCTCCCACCACCCTGAGAGCCTCAACATGTTCACT
TTCCTCTTTGATGACATTGGTATCCCACAGGACTACAGACACATGGAAGGTTCAGGTGTC
AACACATACATGCTCATCAACAAATCCGGCAAAGCTCACTACGTGAAGTTCCACTGGAAC
CCAACTTGTGGAGTCAAGTCTCTGTTAGAAGAGATGCAATCCGCGTCGTGGAACCAACCA
CAGCCACGCAACTCAGACTTGTACGACTCCATTGCCGCTGGTACTA

QA 2 767 2 767
DS 



AS 1 2

CO CL8607Contig1 800 2 3 U
GGTTTCTCAGGGTTCATAGACTTGATCAACACAGTTTCTCAAACTTTTCAGTTTAAATAC
TTCACTGACAATCTGGCAAATCTCAGTTGGTCTTGGTGGTGCAGCGAGGTAAGTACATTG
GTAACCATATAACATAATCTTACTATTCCAAACTATGGTTCTGTTACACTTGTTTGTTCT
TTAACTTGCAGCATACGAGTCTCCAACGAGTTAGGAGCAGGGAATCCACAAGTGGCAAAA
CTGGCTGTATATGTCATTGTAGGCATAGCAGTAGCCCAGGGGATCGTGGTGGTGACGGTT
TTGTTGTCGGTTCGAAAGGTCCTAGGCCGAGCTTTTAGCAGTGACCCGAAAATCATCTCT
TATGCTGCATCGATGATACCTATTGTCGCATGTGGAAACTTTCTTGATGGTCTCCAATGC
GTTCTCTCAGGTTCTTGCACACTCATCCATAAGCTCTAGGAAACATAAAAATATTGGTTT
TGATTCATGGCTTGTATATGTCAAGTTTATCCTGGTTTGTTTTTTGGTTTAAGGGTTGCT
AGAGGATGTGGATGGCAGAAAATTGGAGCGTGTGTAAATCTCGGTTCGTACTATCTTGTT
GGAGTTCCGTTAGGCTTATTACTTGGTTTCCATTTCCACATTGGTGGTCGGGTAATAATC
TTTAAACTTCTGTCATAACCAAGACTAGTTTTAATAGAATCTATTAACATGTGTGGTGCT
ATGTCATTTTTTGTTTAGGGACTTTGGCTTGGAATTGTAACAGCTCTAGCTGTTCAAGTG
CTTTGTCTATCCTTGGTCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A851JQ U 102
AF RS1A851TF C 1
BS 1 101 RS1A851TF
BS 102 679 RS1A851JQ
BS 680 800 RS1A851TF

RD RS1A851JQ 578 0 0
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TGTTACACTTGTTTGTTCTTTAACTTGCAGCATACGAGTCTCCAACGAGTTAGGAGCAGG
GAATCCACAAGTGGCAAAACTGGCTGTATATGTCATTGTAGGCATAGCAGTAGCCCAGGG
GATCGTGGTGGTGACGGTTTTGTTGTCGGTTCGAAAGGTCCTAGGCCGAGCTTTTAGCAG
TGACCCGAAAATCATCTCTTATGCTGCATCGATGATACCTATTGTCGCATGTGGAAACTT
TCTTGATGGTCTCCAATGCGTTCTCTCAGGTTCTTGCACACTCATCCATAAGCTCTAGGA
AACATAAAAATATTGGTTTTGATTCATGGCTTGTATATGTCAAGTTTATCCTGGTTTGTT
TTTTGGTTTAAGGGTTGCTAGAGGATGTGGATGGCAGAAAATTGGAGCGTGTGTAAATCT
CGGTTCGTACTATCTTGTTGGAGTTCCGTTAGGCTTATTACTTGGTTTCCATTTCCACAT
TGGTGGTCGGGTAATAATCTTTAAACTTCTGTCATAAC

QA 1 578 1 578
DS 

RD RS1A851TF 800 0 0
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TTCACTGACAATCTGGCAAATCTCAGTTGGTCTTGGTGGTGCAGCGAGGTAAGTACATTG
GTAACCATATAACATAATCTTACTATTCCAAACTATGGTTCTGTTACACTTGTTTGTTCT
TTAACTTGCAGCATACGAGTCTCCAACGAGTTAGGAGCAGGGAATCCACAAGTGGCAAAA
CTGGCTGTATATGTCATTGTAGGCATAGCAGTAGCCCAGGGGATCGTGGTGGTGACGGTT
TTGTTGTCGGTTCGAAAGGTCCTAGGCCGAGCTTTTAGCAGTGACCCGAAAATCATCTCT
TATGCTGCATCGATGATACCTATTGTCGCATGTGGAAACTTTCTTGATGGTCTCCAATGC
GTTCTCTCAGGTTCTTGCACACTCATCCATAAGCTCTAGGAAACATAAAAATATTGGTTT
TGATTCATGGCTTGTATATGTCAAGTTTATCCTGGTTTGTTTTTTGGTTTAGGGGTTGCT
AGAGGATGTGGATGGCAGAAAATTGGAGCGTGTGTAAATCTCGGTTCGTACTATCTTGTT
GGAGTTCCGTTAGGCTTATTACTTGGTTTCCATTTCCACATTGGTGGTCGGGTAATAATC
TTTAAACTTCTGTCATAACCAAGACTAGTTTTAATAGAATCTATTAACATGTGTGGTGCT
ATGTCATTTTTTGTTTAGGGACTTTGGCTTGGAATTGTAACAGCTCTAGCTGTTCAAGTG
CTTTGTCTATCCTTGGTCAC

QA 1 800 1 800
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8609Contig1 1200 2 2 U
GGAAGATGAAGAGCATTGTGACTTATGTTGAATCCACGGATAACTCTGATCAAAACGGTG
TGAAAGCGAATAGAAAACGTAAAGATCAGTTTGAAGAGGTGGTGGAAGAAGAAGATGAAG
AAAGAGGGAACGAAAACGATGATCCAACGGCTCAAAAGAAGCCACGTGTGCTCTGGACGC
GTGAGCTGCACAATAAGTTCTTAGCAGCTGTTGATCACTTGGGCGTTGAGAAAGCTCAAC
CGAAAAAGATTCTTGAGCTGATGAATGTTGACAAGCTCACAAGAGAGAATGTTGCTAGCC
ATCTTCAGAAGTTTCGTTCCGCGTTGAAGAAGATAACAAATGAAGCTAATCAACAAGCTA
ACATGGCGGCTATAGACTCACACTTCATGCAGATGAGTTCTCTCAAAGGGCTTGGCGGCT
TCCACCACCACCAAAGGCAGATACCTCTTGGATCCGGTCAGTTCCATGGTGGAGCTGCAG
CAACCATGAGGCATTTTCCTCTTGGTCGCCTAAACTCCTTTGGGAGGAGTGTTCCCACAT
GTCTCATCATCGCTTCCTCGTAACCACGGTGATGGAGGTTACATACTTCAGGGAATGCCG
ATTCCGCCTTTAGATGATCTTCATATCAACAGCAACAATAACAACAAGGCTTTTCCGAGC
TTTAGTTCACAACAAACCTCTCTAATGGTTGCTCCCAATAATCAGCTGGTTCTCCAGCAG
CCATCATATGCATCCTTAAACCCTGGGGGGTTCTCTCCTCACTTGGAGATCAACAAGCGT
CTTGAAGATTGGTCAAACACTTTATTGTCAACCAACATCCCACAGAGTGATGTTCATTCA
AAACCAGACGCCTTGGAATGGAACCACTTCTGCAACTCAGATGCTGCACAAGCAGGCTTT
TCTGGTGCAAACAACTTAGGTCCAGTTACTGATGCTCAACTGTTGAGAAGTAGCAGTCCA
AGTGAAGGTTTATTTGTGGGACAACAGAAGCTAGAGAATGGTTCAATGCCTTCAGATGCT
GGTTCCTTGGATGATATTGTCAACTCCATGATGCCAAAGGAGCAGAGCCAGGCTGAGTTC
TTTGAAGGAGATTTGGGGTTTGGATGGCATAATAGCTCACTCAGAACATGCATATGAGAA
TCTGTTTTTTTATGTTTTCTTTGTAACTTGGTCAACATGAGAAAGAGTGTTTTAATCAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AAAGAGGGAACGAAAACGATGATCCAACGGCTCAAAAGAAGCCACGTGTGCTCTGGACGC
GTGAGCTGCACAATAAGTTCTTAGCAGCTGTTGATCACTTGGGCGTTGAGAAAGCTCAAC
CGAAAAAGATTCTTGAGCTGATGAATGTTGACAAGCTCACAAGAGAGAATGTTGCTAGCC
ATCTTCAGAAGTTTCGTTCCGCGTTGAAGAAGATAACAAATGAAGCTAATCAACAAGCTA
ACATGGCGGCTATAGACTCACACTTCATGCAGATGAGTTCTCTCAAAGGGCTTGGCGGCT
TCCACCACCACCAAAGGCAGATACCTCTTGGATCCGGTCAGTTCCATGGTGGAGCTGCAG
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GTCTCATCATCGCTTCCTCGTAACCACGGTGATGGAGGTTACATACTTCAGGGAATGCCG
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TAACCACGGTGATGGAGGTTACATACTTCAGGGAATGCCGATTCCGCCTTTAGATGATCT
TCATATCAACAGCAACAATAACAACAAGGCTTTTCCGAGCTTTAGTTCACAACAAACCTC
TCTAATGGTTGCTCCCAATAATCAGCTGGTTCTCCAGCAGCCATCATATGCATCCTTAAA
CCCTGGGGGGTTCTCTCCTCACTTGGAGATCAACAAGCGTCTTGAAGATTGGTCAAACAC
TTTATTGTCAACCAACATCCCACAGAGTGATGTTCATTCAAAACCAGACGCCTTGGAATG
GAACCACTTCTGCAACTCAGATGCTGCACAAGCAGGCTTTTCTGGTGCAAACAACTTAGG
TCCAGTTACTGATGCTCAACTGTTGAGAAGTAGCAGTCCAAGTGAAGGTTTATTTGTGGG
ACAACAGAAGCTAGAGAATGGTTCAATGCCTTCAGATGCTGGTTCCTTGGATGATATTGT
CAACTCCATGATGCCAAAGGAGCAGAGCCAGGCTGAGTTCTTTGAAGGAGATTTGGGGTT
TGGATGGCATAATAGCTCACTCAGAACATGCATATGAGAATCTGTTTTTTTATGTTTTCT
TTGTAACTTGGTCAACATGAGAAAGAGTGTTTTAATCAGA

QA 1 700 1 700
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGGAGCAAAACCCTAGAAACGGAAAAAAAACCCAACAATGGCGATCATCTCCGAGGTTGA
AGATGAAAGCAGCACTCGACCCTCGATCTTACCGTTTAGGGCGACACTCGATTCTTCGAA
CCCATTAGTTTTCTTACAGAAAGTCTTCGACTTTCTCGGCGAACATAGCGATTTTCTCGA
GAAACCCTCCGCGGAGGAGGAGATCGCCGCCGCAGTCAGGGCGGCGAAGGAGAGGCTGCT
GAGAAAGCCGGAGAAGAATAAAGAGAGTGTTGAGAAGAAGAAGCCTGTGGTGAAGGAGAA
GCCAACCATGGCTGCTTCAACCTCAGAGCCAATTAAAGTGGAGGAGAAGAAACAAGAAGC
TAGTCCCATTGCTCCTAACAAGGGTAATGGTTATGATCTTGAGAGCTACTCATGGGTCCA
GACTCTCCAGGAGGTCACTGTTAACATTCCAGTTCCTACTGGTACTAAAGCACGGTCTGT
TGTATACGAGATTAAGAATAACCGTCTCAAGCTTGGTCTTAAAGGCCAGGATCCAATCAT
TGATGGAGAGCTCTACCGATCTGTGAAGCCTGATGACTGCTACTGGAACATCGAGGATCA
AAAGATGATTTCGATTCTGTTGACTAAGCAAGATCAGATGGAGTGGTGGAAATGCTGTGT
GAAAGGTGAACCTGAGATCGATACACAGAAGGTTGAACCAGAGAACAGTAAATTAGCTGA
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AATGGGTCTTCCAACAAGGGACGAGCTACAAAAGCAAGACATTCTCAAGAAGTTCATGTC
TCAGCATCCAGAGATGGACTTCACAAACGCAAAGATAAACTGATGTTCCTGTTGTCTGGT
CTTTCTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F945TF U 1
AF RS1F945JQ C 167
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GACTCTCCAGGAGGTCACTGTTAACATTCCAGTTCCTACTGGTACTAAAGCACGGTCTGT
TGTATACGAGATTAAGAATAACCGTCTCAAGCTTGGTCTTAAAGGCCAGGATCCAATCAT
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AAAGATGATTTCGATTCTGTTGACTAAGCAAGATCAGATGGAGTGGTGGAAATGCTGTGT
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GCAATGGTCTT

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DS 

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AAGAAACAAGAAGCTAGTCCCATTGCTCCTAACAAGGGTAATGGTTATGATCTTGAGAGC
TACTCATGGGTCCAGACTCTCCAGGAGGTCACTGTTAACATTCCAGTTCCTACTGGTACT
AAAGCACGGTCTGTTGTATACGAGATTAAGAATAACCGTCTCAAGCTTGGTCTTAAAGGC
CAGGATCCAATCATTGATGGAGAGCTCTACCGATCTGTGAAGCCTGATGACTGCTACTGG
AACATCGAGGATCAAAAGATGATTTCGATTCTGTTGACTAAGCAAGATCAGATGGAGTGG
TGGAAATGCTGTGTGAAAGGTGAACCTGAGATCGATACACAGAAGGTTGAACCAGAGAAC
AGTAAATTAGCTGACCTTGACCCTGAAACTCGCTCCACTGTTGAGAAGATGATGTTTGAT
CAAAGGCAAAAGCAAATGGGTCTTCCAACAAGGGACGAGCTACAAAAGCAAGACATTCTC
AAGAAGTTCATGTCTCAGCATCCAGAGATGGACTTCACAAACGCAAAGATAAACTGATGT
TCCTGTTGTCTGGTCTTTCTGCC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

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CCTCTGGTTCTAGCCTCCTTTGCCAAAGCATCCGCACGACCATTCCTACTACGAGGAATA
TGACGCAGGGTCACATCCTCGAATTCCTCCTGTAGTCGTAAACTATTGCATTCACAAACT
TATGCATTCAGAAGACACATCCAACCATTCAAGATAGTTATACATCCTCTTACCATGCAC
CAATAACCATTGGATAAAGATAATTTTCATTCACACCAACTTTCCTTTTATGGGTGCGCT
ATGGCTATTAAACCACCAACAGCTACTTACTCAACCATGCTCTATTTTCATTGGATTATC
TGGCATAAAAAATATTCTAAGGAAGTCACTTACCCCTTCAAACAGTCCAGATAGAAGAGA
TATACCATCTTCACTCATTTAGACAACATTCTCTTCATTAAACCTCTAACGGCTAGTTTT
TGTTTAACTCCACAAAAATTTCTTTCCATTCTTAGTTTAAGAACGTTGTATTCAGTATAT
AATCTTTTCTTTCTCTTCATTGTAAACCACCCAGAAATTAATCATTAAAGTATTTTTTTT
CTTTTGCCATTGCAAAAAAACTCAATACCAATTTTCTTAACACTTGTGTGTGATTCCTTG
TGTTAGATTTTCTTGACTTATCAAAGCTTCCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FY20TF U 1
AF RS1FY20JQ C 126
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TATGCATTCAGAAGACACATCCAACCATTCAAGATAGTTATACATCCTCTTACCATGCAC
CAATAACCATTGGATAAAGATAATTTTCATTCACACCAACTTTCCTTTTATGGGTGCGCT
ATGGCTATTAAACCACCAACAGCTACTTACTCAACCATGCTCTATTTTCATTGGATTATC
TGGCATAAAAAATATTCTAAGGAAGTCACTTACCCCTTCAAACAGTCCAGATAGAAGAGA
TATACCATCTTCACTCATTTAGACAACATTCTCTTCATTAAACCTCTAACGGCTAGTTTT
TGTTTAACTCCACAAAAATTTCTTTCCATTCTTAGTTTAAGAACGTTGTATTCAGTATAT
AATCTTTTCTTTCTCTTCATTGTAAACCACCCAGAAATTAATCATTAAAGTATTTTTTTT
CTTTTGCC

QA 1 608 1 608
DS 

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ATTCAGAAGACACATCCAACCATTCAAGATAGTTATACATCCTCTTACCATGCACCAATA
ACCATTGGATAAAGATAATTTTCATTCACACCAACTTTCCTTTTATGGGTGCGCTATGGC
TATTAAACCACCAACAGCTACTTACTCAACCATGCTCTATTTTCATTGGATTATCTGGCA
TAAAAAATATTCTAAGGAAGTCACTTACCCCTTCAAACAGTCCAGATAGAAGAGATATAC
CATCTTCACTCATTTAGACAACATTCTCTTCATTAAACCTCTAACGGCTAGTTTTTGTTT
AACTCCACAAAAATTTCTTTCCATTCTTAGTTTAAGAACGTTGTATTCAGTATATAATCT
TTTCTTTCTCTTCATTGTAAACCACCCAGAAATTAATCATTAAAGTATTTTTTTTCTTTT
GCCATTGCAAAAAAACTCAATACCAATTTTCTTAACACTTGTGTGTGATTCCTTGTGTTA
GATTTTCTTGACTTATCAAAGCTTCCTTCC

QA 1 570 1 570
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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CACCACAACGACAATATTCATTTCATCTTTATTTGAAGAAAACATACACAAATAAATTTT
CTTTCAAAGTTCTATACTCTCGCGATCAAAATGGCGAGCGAGGAAGTCGTGGTGGTTGAA
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GAGCTTCTAGAGGAGCTAGGGTTTCCAAAAGGTGTTATGCCTTTGAAGAACCTCGTGGAG
TGTGGAAGAGTTAGAGCCACCGGTTTCGTGTGGATGAAGCAAAACACTCCATACGAACAT
TTCTTTGAAGCCACCAACACTCGCGTTTCTTACGCTGTTGAGGTCACCGCCTATATCGAC
AAGTGTTGTATGAAGAAGATGACAGGTACTATATACATACTAATTCAAGTAATTATACAT
ATTGATTCATAGCTTTATTTAGTTAGGTATATGTATTTGTGTGTGTATTATGTATAGGCG
TGAAGAGTAAGCAGATGTTTTTGTGGGTGCCGATTGTGGAGATGAGTATGGAGGAGCCTA
AAAGCAAGAAGATTTACTTCAAGACTCCTATGGGAATCGGCAAGTCTTTTCACGTTACCG
CATTCATGGACGAGGAAGAGAAACGCAACTACTACTTGGAGAATCCTAAAAAATAAATCG
TTTAAGTATTAGTATTATTAATTTATTATATTTTGGTTGTCTTTGTTTTTATTTTAATAG
TTGTACTCTTGTAAGGTTGCTTCATTGCGAATTACTGAATTTTTATTTTTTATGATTATA
AAGTGGAATAAGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CB51TF U 1
AF RS1CB51JQ C 126
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BS 671 853 RS1CB51JQ

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GAGCTTCTAGAGGAGCTAGGGTTTCCAAAAGGTGTTATGCCTTTGAAGAACCTCGTGGAG
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ATTGATTCATAGCTTTATTTAGTTAGGTATATGTATTTGTGTGTGTATTATGTATAGGCG
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AAAGCAAGAAGATTTACTTCAAGACTCCTATGGGAATCGGCAAGTCTTTTCACGTTACCG
CATTCATGGA

QA 1 670 1 670
DS 

RD RS1CB51JQ 728 0 0
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AAGAGTTAGAGCCACCGGTTTCGTGTGGATGAAGCAAAACACTCCATACGAACATTTCTT
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CTCTTGTAAGGTTGCTTCATTGCGAATTACTGAATTTTTATTTTTTATGATTATAAAGTG
GAATAAGA

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

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GACAGATAAAAAGTTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 

AF RS1E011JQ C 1
AF RS1E011TF U 1
BS 1 612 RS1E011TF
BS 613 616 RS1E011JQ

RD RS1E011JQ 616 0 0
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ACCATTGTTTTCGAGTTTTTCTTCTCTCTTTCTTTTAAATAATATACTATATTGTTTTTC
TCCCTCTTTTGTTTCCAATGGAGAACATTGTTACCATTTCTTCTACATTGCTATCATCTT
GACAGATAAAAAGTTT

QA 1 616 1 616
DS 

RD RS1E011TF 612 0 0
GCTCCATCATTGCTCTCATCGTCTGCATTCCTCCTGCCATCATCGTTGAAGGGCCTCAGC
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ATCTCTTCTGGGTTGGAATGTTTTACCATCTCTACAATCAGTTGGCTACTAATACCTTGG
AGAGGGTTGCACCATTGACTCATGCTGTTGGAAACGTTTTGAAACGCGTGTTTGTGATCG
GGTTCTCCATCGTTATCTTCGGAAACAAGATATCGACGCAGACAGGTATCGGAACTGGAA
TAGCCATTGCTGGTGTTGCACTCTACTCTATCATTAAGGCCAAGATCGAAGAAGATAAAA
AGAAAGGAAAGACGGCGTAGAGAGCGGCGGTCAACGGTTGCATAAACAATTCTTCCGGTG
GATAATATATTTATATAATAAAAAGAACCAAAATGCAATAGTATGTTGTATGTACAATCA
ACCATTGTTTTCGAGTTTTTCTTCTCTCTTTCTTTTAAATAATATACTATATTGTTTTTC
TCCCTCTTTTGTTTCCAATGGAGAACATTGTTACCATTTCTTCTACATTGCTATCATCTT
GACAGATAAAAA

QA 1 612 1 612
DS 



AS 1 2

CO CL8616Contig1 797 2 3 U
ATTACGGCCGGGGGATTAGAAAAAGGGATAATTGGAAAGAAACAAAGAAACATTCCACCA
CAAAGCGTGTTCCAATCTCTCCCGCTCTCTCTTCTCTCTACACACACCACACCTGGCTGA
GTTAGTATGCCGGATCCTAATTTGTCTCTTCCTCTCATCACATCCGATCAACCAGAGGTC
CTCATCTCAATCGATGACGACGACGGAGAAGACTCTGTACTCGATCATCAAGACCAAAAC
CCCCACCCTCGTGGTCTCGAATTCGACCATCTCAATCCGGTTAACCCTTTCCGGTTTCTC
AGCGACGCCGAGCCCTCCGTTTCAAAATCCCACGACGGTCGATCCGTTTCGGAACGACAC
ACCAAGAGTGTACGGACTCTACGAAGCGGTCAAGATCGTGATTTGCCTCCCGCTTGCTTT
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GCTTGCAGGGTGGAGAGACAGACACAACCCTATGCCTCGGTGGAGATGCAGAATCATGTG
GGTTACTCGCTTCTGTTCCAGATGCATCCTCTTCTCTTTCGGTTATCAGTGGATACGACG
AAAAGGGAAGCCTGCTGGGAGGGAGATTGCTCCCATCGTTGTCTCAAACCATGTTTCTTA
TATTGAACCTATCTTCTACTTCTATGAGCTATCACCCACCATTGTTGCATCCGAGTCCCA
TGATTCACTTCCTCTTGTTGGAACTATTATCAGAGCTATGCACGTGATATATGTTGATAG
ATTCTCACAGGCATCAA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A054TF U 130
AF RS1A054TV U 1
BS 1 314 RS1A054TV
BS 315 315 RS1A054TF
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GAGCCCTCCGTTTCAAAATCCCACGACGGTCGATCCGTTTCGGAACGACACACCAAGAGT
GTACGGACTCTACGAAGCGGTCAAGATCGTGATTTGCCTCCCGCTTGCTTTGGCTCGGCT
TGTTCTCTTCGGTGTTAGCTTGGCTGTTGGTTACTTGGCCACGAAGGTAGCGCTTGCAGG
GTGGAGAGACAGACACAACCCTATGCCTCGGTGGAGATGCAGAATCATGTGGGTTACTCG
CTTCTGTTCCAGATGCATCCTCTTCTCTTTCGGTTATCAGTGGATACGACGAAAAGGGAA
GCCTGCTGGGAGGGAGATTGCTCCCATCGTTGTCTCAAACCATGTTTCTTATATTGAACC
TATCTTCTACTTCTATGAGCTATCACCCACCATTGTTGCATCCGAGTCCCATGATTCACT
TCCTCTTGTTGGAACTAT

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DS 

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GTTAGTATGCCGGATCCTAATTTGTCTCTTCCTCTCATCACATCCGATCAACCAGAGGTC
CTCATCTCAATCGATGACGACGACGGAGAAGACTCTGTACTCGATCATCAAGACCAAAAC
CCCCACCCTCGTGGTCTCGAATTCGACCATCTCAATCCGGTTAACCCTTTCCGGTTTCTC
AGCGACGCCGAGCC*TCCGTTTCAAAATCCCACGACGGTCGATCCGTTTCGGAACGACAC
ACCAAGAGTGTACGGACTCTACGAAGCGGTCAAGATCGTGATTTGCCTCCCGCTTGCTTT
GGCTCGGCTTGTTCTCTTCGGTGTTAGCTTGGCTGTTGGTTACTTGGCCACGAAGGTAGC
GCTTGCAGGGTGGAGAGACAGACACAACCCTATGCCTCGGTGGAGATGCAGAATCATGTG
GGTTACTCGCTTCTGTTCCAGATGCATCCTCTTCTCTTTCGGTTATCAGTGGATACGACG
AAAAGGGAAGCCTGCTGGGAGGGAGATTGCTCCCATCGTTGTCTCAAACCATGTTTCTTA
TATTGAACCTATCTTCTACTTCTATGAGCTATCACCCACCATTGTTGCATCCGAGTCCCA
TGATTCACTTCCTCTTGTTGGAACTATTATCAGAGCTATGCACGTGATATATGTTGATAG
ATTCTCACAGGCATCAA

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 2

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CGTCGCTTCAGGGATGGGTCCAGTCACCGTGGAGGCACGCACGTGTGAGTCGAAGAGCCA
TAAGTTCAGGGGTCCTTGTGTGAGCAGACACAATTGCGCAAATGTGTGCCACAACGAAGG
TTTTCATGGAGGTAAATGCCGTGGGTTCCGTCGTCGTTGCTACTGTACCAGACACTGCTG
ATTTATCCATCTCAATCGATTCTCATAACTCGAATCTTCAATCCGCCGTCTCGTCTCGTC
TCTTCTCATCGTGTTTGTTTCTATTTTCTTCTTTTCGAAAATTTTCTCGTGTTTGTTTCT
TTCTGTCTAATATTTCTTACAGTGCCATGGTGTACTGTGTCTGTGTGTGTGTTTAATGTG
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TTTTTTAAAGAAAATCC


BQ
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AF RS1C734TF U 1
AF RS1BZ21TF U 93
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RD RS1C734TF 553 0 0
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TAAGTTCAGGGGTCCTTGTGTGAGCAGACACAATTGCGCAAATGTGTGCCACAACGAAGG
TTTTCATGGAGGTAAATGCCGTGGGTTCCGTCGTCGTTGCTACTGTACCAGACACTGCTG
ATTTATTCATCTCAATCGATTCTCATAACTCGAATCTTCAATCCGCCGTCTCGTCTCGTC
TCTTCTCATCGTGTTTGTTTCTATTTTCTTCTTTTCGAAAATTTTCTCGTGTTTGTTTCT
TTCTGTCTAATATTTCTTACAGTGCCATGGTGTACTGTGTCTGTGTGTGTGTTTAATGTG
TTTTCGAATAAGTCTTTGTTTTGTGTGTTTTTCGTTTTATTGTAATGTTAAATTCTAATG
TTTTTTAAAGAAA

QA 1 553 1 553
DS 

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AGGCACGCACGTGTGAGTCGAAGAGCCATAAGTTCAGGGGTCCTTGTGTGAGCAGACACA
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GTCGTTGCTACTGTACCAGACACTGCTGATTTATCCATCTCAATCGATTCTCATAACTCG
AATCTTCAATCCGCCGTCTCGTCTCGTCTCTTCTCATCGTGTTTGTTTCTTTTTTCTTCT
TTTCGAAAATTTTCTCGTGTTTGTTTCTTTCTGTCTAATATTTCTTACAGTGCCATGTTG
TACTGTGTCTGTGTGTGTGTTTAATGTGTTTTCGAATAAGTCTTTGTTTTGTGTGTTTTT
CGTTTTATTGTAATGTTAAATTCTAATGTTTTTTAAAGAAAATCC

QA 1 465 1 465
DS 



AS 1 2

CO CL8618Contig1 919 2 6 U
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TTACTCTAATGCAAGCACTAGTGAAGGCAGACTTCTGGTTGATTTTCACCTCCTTGCTCC
TAGGTGGTGGTTCTGGTTTGACTGTGATTGACAATCTTGGTCAGATGAGTCAGTCTCTTG
GTTATAACAACACTCATGTGTTTGTGTCTATGATTAGCATTTGGAACTTCCTTGGATGTA
TCTCCGGCGGTTATTTCTCTGAGCTCGTTGTCAGAGACTATGCGTATCCAAGGCCAGTAG
CATTAGCAGTGGCTCAGGTAGTAATGGCGATAGGAAACGTCTTCTTTGCGTTTGGATGGC
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TCTTGACTCTAGCCAATCCGGCTGGGTCCCTGGTCTTCTCTGGTATGATTGCAAGCACTA
TATACGACATGGAAGCAGAGAGACAAGCGCACGGGTCCGTTTTTAATCCGGATGACGTTC
TTAAATGCGATGGTTACATATGCTACTTCTTGACGTCACTCATAATGTCTGGTTTCTGCA
TCGTCGCTTGCATCTTGAGTTTGATTCTGGTGCGTCGTACCAAACCTGTTTACACTCATC
TCTATGGCAAGACTCGCACCTGATGATCTGTTCATTTGTTTTGTATCTATGTATTGTATG
ATCATGCTCTTAGCTTCTTTATTCTTTGGTTTGGTGTTTGCTGATACAGATGTTTTTATT
CTGTGTCGATTTTTGTTGTTGGTGTCAATTTTTGTTTGTTGATTTCTTTTTTAAATAAAT
AAAAATAAATAAATTGAGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B587TF U 1
AF RS1B587JQ C 52
BS 1 73 RS1B587TF
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BS 670 685 RS1B587TF
BS 686 919 RS1B587JQ

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TTACTCTAATGCAGGCACTAGTGAAGGCAGACTTCTGGTTGATTTTCACCTCCTTGCTCC
TAGGTGGTGGTTCTGGTTTGACTGTGATTGACAATCTTGGTCAGATGAGTCAGTCTCTTG
GTTATAACAACACTCATGTGTTTGTGTCTATGATTAGCATTTGGAACTTCCTTGGATGTA
TCTCCGGCGGTTATTTCTCTGAGCTCGTTGTCAGAGACTATGCGTATCCAAGGCCAGTAG
CATTAGCAGTGGCTCAGGTAGTAATGGCGATAGGAAACGTCTTCTTTGCGTTTGGATGGC
CTGGAGCAATGTACATTGGCACACTCTTGATAGGACTAGGGTACGGTGCTCACTGGGCTA
TTGTACCAGCTACTGCCTCTGAGCTCTTTGGTCTGAAAAACTTTGGAGCTTTATACAACT
TCTTGACTCTAGCCAATCCGGCTGGGTCCCTGGTCTTCTCTGGTATGATTGCAAGCACTA
TATACGACATGGAAGCAGAGAGACAAGCGCACGGGTCCGTTTTTAATCCGGATGACGTTC
TTAAATGCGATGGTTACATATGCTACTTCTTGACGTCACTCATAATGTCTGGTTTCTGCA
TCGTCGCT*GCATCTTGAGTTTGAT

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DS 

RD RS1B587JQ 868 0 0
GAGAGAAGATTTACTCT
ATGCAAGCACTAGTGAAGGCAGACTTCTGGTTGATTT*CACCTCCTTGCTCCTAGGTGGT
GGTTCTGGTTTGACTGTGATTGACAATCTTGGTCAGATGAGTCAGTCTCTTGGTTATAAC
AACACTCATGTGTTTGTGTCTATGATTAGCATTTGGAACTTCCTTGGATGTATCTCCGGC
GGTTATTTCTCTGAGCTCGTTGTCAGAGACTATGCGTATCCAAGGCCAGTAGCATTAGCA
GTGGCTCAGGTAGTAATGGCGATAGGAAACGTCTTCTTTGCGTTTGGATGGCCTGGAGCA
ATGTACATTGGCACACTCTTGATAGGACTAGGGTACGGTGCTCACTGGGCTATTGTACCA
GCTACTGCCTCTGAGCTCTTTGGTCTGAAAAACTTTGGAGCTTTATACAACTTCTTGACT
CTAGCCAATCCGGCTGGGTCCCTGGTCTTCTCTGGTATGATTGCAAGCACTATATACGAC
ATGGAAGCAGAGAGACAAGCGCACGGGTCCGTTTTTAATCCGGATGACGTTCTTAAATGC
GATGGTTACATATGCTACTTCTTGACGTCACTCATAATGTCTGGTTTCTGCATCGTCGCT
TGCATCTTGAGTTTGATTCTGGTGCGTCGTACCAAACCTGTTTACACTCATCTCTATGGC
AAGACTCGCACCTGATGATCTGTTCATTTGTTTTGTATCTATGTATTGTATGATCATGCT
CTTAGCTTCTTTATTCTTTGGTTTGGTGTTTGCTGATACAGATGTTTTTATTCTGTGTCG
ATTTTTGTTGTTGGTGTCAATTTTTGTTTGTTGATTTCTTTTTTAAATAAATAAAAATAA
ATAAATTGAGG

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DS 



AS 1 2

CO CL8619Contig1 903 2 4 U
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ATAACGGGTTGGAGTCCTCAGGCTATGATACTCTCTCATGGCTCGACCGGAGGGTTCTTG
ACTCATTGCGGTTGGAACTCGGCGAGCGAAGGGGTGTCTTTTGGTGTACCAATGATCACA
TGGCCGATGTTCGCTGAACAGTTTCTCAATGAGAAACTCGTAGTGGAGGTGTTGAAGGTT
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CAAGATGTCTTGGAGAAATTGAGTCTTGAATAGAAAATTCTAATTAAGGTACTATAAGCT
AATATGTAAAAGAATATGTTAAACTTGTTTAAAACAAGTTAGTATCATGAAAATGCTACT
TTATTAGTGATATGATTATTATGAAGCTTTTTAAAAATGTAAGTTGGAATAATGATGAAA
ATGTATTCATATAAGAGGTCTATGATAATTTCAAACTTCTAGAAATGTAAGAAGCATACA
TAGTTATGAAAATTTATTCATTGGAGATTAAAAAAGAGGTATATGATAATTTTGAAGTTT
CTG


BQ
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10 10 10 

AF RS1C677TF U 1
AF RS1C677JQ C 119
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RD RS1C677TF 735 0 0
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GAAGAATCTGGAAAGCCCTTTATTTGGGTGGTCAAAACCGATGAAAAACACATGAATGTG
CTAAAAGAATGGCTAAAACTTGAAATGTTCGAAGAGAGAGTTAAAGGTAGAGGGATAGTG
ATAACGGGTTGGAGTCCTCAGGCTATGATACTCTCTCATGGCTCGACCGGAGGGTTCTTG
ACTCATTGCGGTTGGAACTCGGCGAGCGAAGGGGTGTCTTTTGGTGTACCAATGATCACA
TGGCCGATGTTCGCTGAACAGTTTCTCAATGAGAAACTCGTAGTGGAGGTGTTGAAGGTT
GGGGTTAGGGTTGGTGCGGAGATTCCTGTGAGATGGGGAGACGAGGAAAGAGTTGGAGTG
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AGTGGAAATGAGGATGGTGAGTTCTTGGGACGAGGGAAACGCATTCAGGAACTTTCAGTA
ATGGCGAGAGAGGCTGTGGAATTGAAAGGATCCTCGAGTACTAACGTTTCATTGTTTATC
CAAGATGTCTTGGAGAAATTGAGTCTTGAATAGAAAATTCTAATTAAGGTACTATAAGCT
AATATGTAAAAGAATATGTTAAACTTGTTTAAAACAAGTTAGTATCATGAAA*TGCTACT
TTATTAGTGATATGA

QA 1 735 1 735
DS 

RD RS1C677JQ 785 0 0
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TGATAACGGGTTGGAGTCCTCAGGCTATGATACTCTCTCATGGCTCGACCGGAGGGTTCT
TGACTCATTGCGGTTGGAACTCGGCGAGCGAAGGGGTGTCTTTTGGTGTACCAATGATCA
CATGGCCGATGTTCGCTGAACAGTTTCTCAATGAGAAACTCGTAGTGGAGGTGTTGAAGG
TTGGGGTTAGGGTTGGTGCGGAGATTCCTGTGAGATGGGGAGACGAGGAAAGAGTTGGAG
TGTTGGTCAAGAAACATAGTGTTGTGAAAGCTATAAAGCTTTTGATGGATGATGATTGCC
AAAGTGGAAATGAGGATGGTGAGTTCTTGGGACGAGGGAAACGCATTCAGGAACTTTCAG
TAATGGCGAGAGAGGCTGTGGAATTGAAAGGATCCTCGAGTACTAACGTTTCATTGTTTA
TCCAAGATGTCTTGGAGAAATTGAGTCTTGAATAGAAAATTCTAATTAAGGTACTATAAG
CTAATATGTAAAAGAATATGTTAAACTTGTTTAAAACAAGTTAGTATCATGAAAATGCTA
CTTTATTAGTGATATGATTATTATGAAGCTTTTTAAAAATGTAAGTTGGAATAATGATGA
AAATGTATTCATATAAGAGGTCTATGATAATTTCAAACTTCTAGAAATGTAAGAAGCATA
CATAGTTATGAAAATTTATTCATTGGAGATTAAAAAAGAGGTATATGATAATTTTGAAGT
TTCTG

QA 1 785 1 785
DS 



AS 1 2

CO CL8620Contig1 903 2 2 U
GGGTTCAAATGCTGAGTTACCTACTGCTGCTATAGCTTCCAGGCATCATCAGACCATCGG
TTCGTTCCTGGATTCACGAGGGGCATCTGAACTGGATGCTACAGTGGACTCTCCTGCTTT
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ATGGGGAGCTGCTCAGAAACGCCTTGGTGCTGGTAATAATCAATCTCAGAGCCAGTGCCA
GCAGGATGTGACTAAAGGGTTGAAAAGGCTGTTGAATTTTGGAAGGAAGAACCGTGCGGC
TGAGAATTTGGCTGACTGGATATCTGCTACAACCTCTGAAGGGGATGATGATACTGAAGA
CGGACGAGATCTTGCAAATCGATCATCAGAAGACTTGAGGAAGTCGAGAATGGGATTTTT
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AACCCAAAGATTCATAGGATCTAAGCGAATGAAAGATAAAAAGAAAAAAAGATTCACATC
ACAGGCAGTGGCCACACGAGTGAAATGATCTTTGAGATATTACGTGCTGTGAATGTATCA
TTGAGAATAGTTTCTCTTGTATTCATAATCATCCCCTGTTTACATTTGTAAATTCGTATC
AAACCGGAAACATATGTCCTTATCGGTTTGGAATCCATGTGATTTTGGTAGTACAAAACA
AAAGGATGGCAATGTTTATTTAACAAGTTTATATATTGTTGAAAGATCATTTCATTCTAT
ACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 

AF RS1DJ52TF U 1
AF RS1DJ52JQ C 143
BS 1 509 RS1DJ52TF
BS 510 903 RS1DJ52JQ

RD RS1DJ52TF 509 0 0
GGGTTCAAATGCTGAGTTACCTACTGCTGCTATAGCTTCCAGGCATCATCAGACCATCGG
TTCGTTCCTGGATTCACGAGGGGCATCTGAACTGGATGCTACAGTGGACTCTCCTGCTTT
CTGGAACTTGTCTTCCCTTAACCAACCAGAGAATAATGAGACAAGTCAGATGAGGAAGAA
ATGGGGAGCTGCTCAGAAACGCCTTGGTGCTGGTAATAATCAATCTCAGAGCCAGTGCCA
GCAGGATGTGACTAAAGGGTTGAAAAGGCTGTTGAATTTTGGAAGGAAGAACCGTGCGGC
TGAGAATTTGGCTGACTGGATATCTGCTACAACCTCTGAAGGGGATGATGATACTGAAGA
CGGACGAGATCTTGCAAATCGATCATCAGAAGACTTGAGGAAGTCGAGAATGGGATTTTT
GCAGACACAGGCCTCTGATGATAGCTTCAACGAGAGTGAGCTATACAATGAACAAGCCCA
AAACACAAGTGCACCTTTAAGCTTTAAAC

QA 1 509 1 509
DS 

RD RS1DJ52JQ 761 0 0
CAACCAGAGAATAATGAGACAAGTCAGATGAGGAAGAAATGGGGAGCTGCTCAGAAACGC
CTTGGTGCTGGTAATAATCAATCTCAGAGCCAGTGCCAGCAGGATGTGACTAAAGGGTTG
AAAAGGCTGTTGAATTTTGGAAGGAAGAACCGTGCGGCTGAGAATTTGGCTGACTGGATA
TCTGCTACAACCTCTGAAGGGGATGATGATACTGAAGACGGACGAGATCTTGCAAATCGA
TCATCAGAAGACTTGAGGAAGTCGAGAATGGGATTTTTGCAGACACAGGCCTCTGATGAT
AGCTTCAACGAGAGTGAGCTATACAATGAACAAGCCCAAAACACAAGTGCACCTTTAAGC
TTTAAACTGAAGGAGGATCAGGTGTCCGGAGCTTCTGTAAAAGCACCAAGGTCATTCTTT
TCACTCTCCAATTTTCGTAGCAAAGGAAAATGATTCTAAACCCAAAGATTCATAGGATCT
AAGCGAATGAAAGATAAAAAGAAAAAAAGATTCACATCACAGGCAGTGGCCACACGAGTG
AAATGATCTTTGAGATATTACGTGCTGTGAATGTATCATTGAGAATAGTTTCTCTTGTAT
TCATAATCATCCCCTGTTTACATTTGTAAATTCGTATCAAACCGGAAACATATGTCCTTA
TCGGTTTGGAATCCATGTGATTTTGGTAGTACAAAACAAAAGGATGGCAATGTTTATTTA
ACAAGTTTATATATTGTTGAAAGATCATTTCATTCTATACG

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL8621Contig1 878 2 2 U
TACTTTCTCAGAAGAATGTGCATGCCATGACTTACAAACTTGAACAAAAGAAAAACAGGA
AAGAACAATTCTTACAAGAACAGAGAACACAAGGGAAGATTACTACCTTGGTTGGTAGGT
CAAACACAGCACAGTGGGTGTGGTGTTCACTTGAAAGTGGAGAGACGGGGAAGCTTGTCC
CTCAGGTAGCAAAGCCTTGCTCTTCTCACTTTTCTGTGACTCACCACTTTTATCTCTTTG
ATGTTGGGAGAGTATAAGGGAAACACGATTTCAACACCGATACCAGCAATAATCCTGCGA
ATACGAATGGTAGTGTGTATGCCAGCGTTTTGTCTAGACATCACAATGCCTTTGTAGATA
GACAACCTACGTCTGTTCTCAGGAACTTCCAGTTTGATCTCAACGATATCTCCAGTCCTG
ATTTCAGGAACAGGTCTCACTTTCTCTGATACCTCAATTGCTTTCTGGTTCAGTATCCCC
ATTACGTCTCCCAGCTTGACTCTCGGCTTTCTTGGAGCTTTGGCTTCATCAGATTCTACT
ACATCTTCCACATTATCCTCAGTAGCAGCGTTAGCATCAACAGCTTCACCTTCACCTTCA
CCTTCACCTTCACCTTCACCTTCACCTTCTGCTCTAACTAGAACCTCTCGTCTCGCCTTA
GTATCGAGCGAGAAGCTAGATTTGGAGTGGCTCAGTGAAAGCCTTGAGATCGATAGAATG
GGATTCATCGAAGGTGCGCATGATAGAAACGACGAAAACCCTAGTTTCTTCGATGGCTGC
GTCAGTATCATATGCAATGCCTGAGGAGGAAGAAGAAGATGAGAGCTCGTCGCCATGGTT
ATCACTCTCTCTCAGTTGGTCGGAGGAGTTGGAGATCC


BQ
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AF RS1CT19JQ U 1
AF RS1AQ82TFB C 111
BS 1 730 RS1CT19JQ
BS 731 878 RS1AQ82TFB

RD RS1CT19JQ 730 0 0
TACTTTCTCAGAAGAATGTGCATGCCATGACTTACAAACTTGAACAAAAGAAAAACAGGA
AAGAACAATTCTTACAAGAACAGAGAACACAAGGGAAGATTACTACCTTGGTTGGTAGGT
CAAACACAGCACAGTGGGTGTGGTGTTCACTTGAAAGTGGAGAGACGGGGAAGCTTGTCC
CTCAGGTAGCAAAGCCTTGCTCTTCTCACTTTTCTGTGACTCACCACTTTTATCTCTTTG
ATGTTGGGAGAGTATAAGGGAAACACGATTTCAACACCGATACCAGCAATAATCCTGCGA
ATACGAATGGTAGTGTGTATGCCAGCGTTTTGTCTAGACATCACAATGCCTTTGTAGATA
GACAACCTACGTCTGTTCTCAGGAACTTCCAGTTTGATCTCAACGATATCTCCAGTCCTG
ATTTCAGGAACAGGTCTCACTTTCTCTGATACCTCAATTGCTTTCTGGTTCAGTATCCCC
ATTACGTCTCCCAGCTTGACTCTCGGCTTTCTTGGAGCTTTGGCTTCATCAGATTCTACT
ACATCTTCCACATTATCCTCAGTAGCAGCGTTAGCATCAACAGCTTCACCTTCACCTTCA
CCTTCACCTTCACCTTCACCTTCACCTTCTGCTCTAACTAGAACCTCTCGTCTCGCCTTA
GTATCGAGCGAGAAGCTAGATTTGGAGTGGCTCAGTGAAAGCCTTGAGATCGATAGAATG
GGATTCATCG

QA 1 730 1 730
DS 

RD RS1AQ82TFB 768 0 0
GTTGGTAGGTCAAACACAGCACAGTGGGTGTGGTGTTCACTTGAAAGTGGAGAGACGGGG
AAGCTTGTCCCTCAGGTAGTAAAGCTTTGCTCTTCTCACTTTTCTGTGACTCACCACTTT
TATCTCTTTGATGTTGGGAGAGTATAAGGGAAACACGATTTCAACACCGATACCAGCAAT
AATCCTGCGAATACGAATGGTAGTGTGTATGCCAGCGTTTTGTCTAGACATCACAATGCC
TTTGTAGATAGACAACCTACGTCTGTTCTCAGGAACTTCCAGTTTGATCTCAACGATATC
TCCAGTCCTGATTTCAGGAACAGGTCTCACTTTCTCTGATACCTCAATTGCTTTCTGGTT
CAGTATCCCCATTACGTCTCCCAGCTTGACTCTCGGCTTTCTTGGAGCTTTGGCTTCATC
AGATTCTACTACATCTTCCACATTATCCTCAGTAGCAGCGTTAGCATCAACAGCTTCACC
TTCACCTTCACCTTCACCTTCACCTTCACCTTCACCTTCTGCTCTAACTAGAACCTCTCG
TCTCGCCTTAGTATCGAGCGAGAAGCTAGATTTGGAGTGGCTCAGTGAAAGCCTTGAGAT
CGATAGAATGGGATTCATCGAAGGTGCGCATGATAGAAACGACGAAAACCCTAGTTTCTT
CGATGGCTGCGTCAGTATCATATGCAATGCCTGAGGAGGAAGAAGAAGATGAGAGCTCGT
CGCCATGGTTATCACTCTCTCTCAGTTGGTCGGAGGAGTTGGAGATCC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL8622Contig1 702 2 3 U
GGACACAAGCAAACATCCTCTCTCACTTTCCTCCTCTCTCACTCAATGGCAGGCCAGTAT
ATTTTAACGAGTGTTCTAGGGGTAGTTTTGGTATTGACGCTGCTACACAACCCGCTCACC
GTCTCCGGTCAAAATATCCCGGCGGTGGCTTTGTTCACGTTCGGTGACTCCAACTTCGAC
GTAGGAAACAAACAGACTCTCACCACAGCAAACGTTCCCCAAGGTTTCTGGCCGTACGGT
AAATCCAGAGATGATCCTAATGGCAAATTCTCCGACGGTTTCATCGCTCCTGACTTCGTC
GCAAAATTCATGGGGATACCAATCCCAATCCCGGCGGCGCTTAAACCGAACGTCAATGTC
TCACGTGGAGCTAGTTTCACCGTTGCTGATGCTACTCTTCTCGGAGCTCCGGTTGAATCT
TTGACTCTAAATCAACAAGTGCGGAAATTTAATCAAATGAAAGCAGCAAATTGGGATGAT
GACTTCATCAAGAAGTCAGTGTTTATGATATACGTTGGTGCTAACGACTACTTGAATTTC
ACCAAGAACAACCCGAGCGCCGATGCATCTGCTCAACAAGCTTTCGTCACTTCGGTGACC
AACAAGTTAAAGAATGATATCGGCTTGTTGTATTCATCAGAGCTAGTAAATTTGTGATCC
AAACCTTAGCACCATTAGGTGCTTACCTATAGTCAGACAGAT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1GF69TF U 1
AF RS1B177TF U 1
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BS 59 59 RS1GF69TF
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GTAGGAAACAAACAGACTCTCACCACAGCAAACGTTCCCCAAGGTTTCTGGCCGTACGGT
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GCAAAATTCATGGGGATACCAATCCCAATCCCGGCGGCGCTTAAACCGAACGTCAATGTC
TCACGTGGAGCTAGTTTCACCGTTGCTGATGCTACTCTTCTCGGAGCTCCGGTTGAATCT
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GACTTCATCAAGAAGTCAGTGTTTATGATATACGTTGGTGCTAACGACTACTTGAATTTC
ACCAAGAACAACCCGAGCGCCGATGCATCTGCTCAACAAGCTTTCGTCACTTCGGTGACC
AACAAGTTAAAGAATGATATCGGCTTGTTGTATTCATCAGAGCTAGTAAATTTGTGATCC
AAACCTTAGCACCATTAGGTGCTTACCTATAGTCAGACAGAT

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 2

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AAAGGAAGATAACCTCTGATGATATGGAGAAGACAGTGTGTAGAGATAACACAGAGAGAT
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CTGTTTTTTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DF63TF U 1
AF RS1DF63JQ C 36
BS 1 652 RS1DF63TF
BS 653 793 RS1DF63JQ

RD RS1DF63TF 652 0 0
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TGGTGGAAGTAAGGAATGATGAGAAGAAACAGAGCAAACCTGTGCGTTTGAAGGATTCTC
ATCTTGAGAATACACGAGGATCACGTCTCTGGATATTTCCTGATGAGGCAAAGGATGTGT
TACAGAAGAAGACAGAAGAATCCAAGAAGGAAAACACCGAGGGGATTGAGCTGCAGAAGC
ATTGAGAAAATGAATATCAACAACAAGTGGAAGAGCATTGAGAGATCGAAGAAACAGAAG
CCTCAGACTTCATCTGCAGATTCAGAAAGTTCAAGAGGACCTGTTGGACAGGTGATGCGT
GCATTGATTGTGGTGGGTTTTGCAGGCTTGGTGTTTTTGACACGTAAATGAACTTGAATA
ATGAAGCTTTCTGTATTTTTTCTCCATTTTCTTGTTATGGAAAGAACTCAAA

QA 1 652 1 652
DS 

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GTGTGTAGAGATAACACAGAGAGATGTGATGATTTAGTAATACTTTCAAGAGAGGAAAGG
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AAGCAGAGGTTAAAGAGAAGCTCAGTGGTGGAAGTAAGGAATGATGAGAAGAAACAGAGC
AAACCTGTGCGTTTGAAGGATTCTCATCTTGAGAATACACGAGGATCACGTCTCTGGATA
TTTCCTGATGAGGCAAAGGATGTGTTACAGAAGAAGACAGAAGAATCCAAGAAGGAAAAC
ACCGAGGGGATTGAGCTGCAGAAGCATTGAGAAAATGAATATCAACAACAAGTGGAAGAG
CATTGAGAGATCGAAGAAACAGAAGCCTCAGACTTCATCTGCAGATTCAGAAAGTTCAAG
AGGACCTGTTGGACAGGTGATGCGTGCATTGATTGTGGTGGGTTTTGCAGGCTTGGTGTT
TTTGACACGTAAATGAACTTGAATAATGAAGCTTTCTGTATTTTTTCTCCATTTTCTTGT
TATGGAAGGAACTCAAAATAGGTTCCTTGTGCTATAGGCTTCACCCTTTTTTCTCTCTGT
CGATACATTATCAGATGAGCCAAACCTGCATTTTGAGATTGTATTATAGGAACAGTTCTT
TTAAAACCAGACTGTATAAGATATACTGTTTTTTGACC

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL8624Contig1 621 2 1 U
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TGCAGCTACGCAATCTCTGGCGCTAGCTCAGTAGAGCTAAACCAGAAAGTGGGTTTGGTG
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TACCTTGAGAAGAGCAAAGCCAACAAGGAACTGAATGATAAGAAGAGATTGGCAACAAGC
GGAGCAAACTTTGCGAGAGCATTCACTGTCCAGTTCGGAAGCTGCAAGTTCCCTGAGAAT
TTCACTGGTTGCCAAGATCTTGCCAAGCAAAAGAAAGTGCCATTTATCTCAGAAGATTTG
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TGATCATGTTCTGTTTTGTCCTTTTAATCCATTCTTGTATAAACTGATCTATCTATCAAA
GTTCTCATATCCATTTGAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DZ35JQ C 1
AF RS1DZ35TF U 1
BS 1 621 RS1DZ35TF

RD RS1DZ35JQ 621 0 0
GGAAGAAGCAACAGAGAGAGAGATCTCTAAATGGCGGCCATGAACTCGAGTGTTCTCACC
TGCAGTTACGCAATTTCTGGCGCTAGCTCAGTAGAGCTAAACCAGAAAGTGGGTTTGGTG
AACTCATCGTCGGTTGGGTTTGGTCATAAGAAACAGACGGTTCCTGTGATCAAAGCAGCT
CAACAAGTTGGTGGTGATGATGATGTTAATGGAAGAAGACCCGCCATGGTGTTCTTAGCT
GCTACACTCTTCTCCACTGCTGCTGTGTCTGCTTCTGCTAATGCTAGCGTCTTCGATGAG
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GCTACACTCTTCTCCACTGCTGCTGTGTCTGCTTCTGCTAATGCTAGCGTCTTCGATGAG
TACCTTGAGAAGAGCAAAGCCAACAAGGAACTGAATGATAAGAAGAGATTGGCAACAAGC
GGAGCAAACTTTGCGAGAGCATTCACTGTCCAGTTCGGAAGCTGCAAGTTCCCTGAGAAT
TTCACTGGTTGCCAAGATCTTGCCAAGCAAAAGAAAGTGCCATTTATCTCAGAAGATTTG
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TGATCATGTTCTGTTTTGTCCTTTTAATCCATTCTTGTATAAACTGATCTATCTATCAAA
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QA 1 621 1 621
DS 



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CTCTGTTTCAGAGCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

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QA 1 613 1 613
DS 



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AACTTTTTTGCGG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1D340JQ C 1
AF RS1D340TF U 1
BS 1 613 RS1D340TF

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AACTTTTTTGCGG

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DS 

RD RS1D340TF 613 0 0
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GGTCTGTTGATGATGAACTTTGCTACCGGTTGTATATTTGAGTATGACGCTGCACATCCA
GAAGGTTCAGGGATCGGCTTTAAGGAAGAAGACAAACCGAACTTCTTCGGTTCCTTCTAC
TCAAAAACAAAGGCAATGGTGGAAGAGCTTCTAAGAGAATTCGACAACGTATGCACCTTG
AGAGTGAGGATGCCGATCTCATCCGACTTGAACAACCCATAAGCAGTGGTATCAACGCAG
AGTCAAAGCAGATTCTTCTGAACATCAATCATCCAACGGTCGGTCCAATTTTCCTTCGGT
CTATTTTTTTTTTGTATTCTTCTACTGTATTCTAAATGTATGTATTTATGTTATTTTTAT
ACGGAAGAGAAAAGAGAAATGACTATGATAAGACTATGTTGTATGTAAATATAAAATTTT
AACTTTTTTGCGG

QA 1 613 1 613
DS 



AS 1 2

CO CL8627Contig1 732 2 5 U
CCAAAATATTAGTTTGATTTTCGTTTTCAAAGTCTAAGACAAGCTTCAACGGTCCAAATC
TCACAAGAACAACATGTGAAGCCAATGCCCACTATAACTTCTTACACAAAAAGCATGGTC
TTTGCACGGATCAAACCGAATGATTTTAACTACTGGTGGGGTGATCCATCTTCAATCTTT
GATCAAAGCAACGACTTTCTCTATGATGCTCTTAAGCGCAGGTGCGCTAACAGAACACTT
GTTGTCACCCTCGAAACACGACTTCCCCTGTTCGGCCGCTCTGCAAAGCTGTGGATCCAA
AGGAACACTCCCAAGAAACGGCACTCCCATCTCCCTACACATTCTCTCCGCACCACCTCC
GCTACGGTCAAACACTTCGCTGTAAGCCAATACGTTGACGAGCTCCGGTGCGTTCTTTCT
TAAACAAGAGATCACTTCCTCTGTCACGTCAACAACGGAGGATCCAAACTTCTTGAACTT
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B540JQ U 10
AF RS1FF82JQ U 1
BS 1 106 RS1FF82JQ
BS 107 107 RS1B540JQ
BS 108 322 RS1FF82JQ
BS 323 323 RS1B540JQ
BS 324 732 RS1FF82JQ

RD RS1B540JQ 605 0 0
TAGTTTGATTTTCGTTTTCAAAGTCTAAGACAAGCTTCAACGGTCCAAATCTCACAAGAA
CAACATGTGAAGCCAATGCCCACTATAACTTCTTACACAAAAAGCATGGTCTTTGCACGG
ATCAAACCGAATGATTTTAACTACTGGTGGGGTGATCCATCTTCAATCTTTGATCAAAGC
AACGACTTTCTCTATGATGCTCTTAAGCGCAGGTGCGCTAACAGAACACTTGTTGTCACC
CTCGAAACACGACTTCCCCTGTTCGGCCGCTCTGCAAAGCTGTGGATCCAAAGGAACACT
CCCAAGAAACGGCACTCCCATCTCCCTACACATTCTCTCCGCACCACCTCCGCTACGGTC
AAACACTTCGCTGTAAGCCAATACGTTGACGAGCTCCGGTGCGTTCTTTCTTAAACAAGA
GATCACTTCCTCTGTCACGTCAGCAACGGAGGATCCAAACTTCTTGAACTTGACATCCGC
TAACGGTTGACACAAACCGCTCATGTTCTCCACTACTCCTAGCACCGGGACCCCGACTTT
CTTGCAAAAGCTCACTTCTTTTCTCACATCGATCAATGAGACTTCCTGCGGGGTCGTGAC
GATGA

QA 1 605 1 605
DS 

RD RS1FF82JQ 732 0 0
CCAAAATATTAGTTTGATTTTCGTTTTCAAAGTCTAAGACAAGCTTCAACGGTCCAAATC
TCACAAGAACAACATGTGAAGCCAATGCCCACTATAACTTCTTACATAAAAAGCATGGTC
TTTGCACGGATCAAACCGAATGATTTTAACTACTGGTGGGGTGATCCATCTTCAATCTTT
GATCAAAGCAACGACTTTCTCTATGATGCTCTTAAGCGCAGGTGCGCTAACAGAACACTT
GTTGTCACCCTCGAAACACGACTTCCCCTGTTCGGCCGCTCTGCAAAGCTGTGGATCCAA
AGGAACACTCCCAAGAAACGGCGCTCCCATCTCCCTACACATTCTCTCCGCACCACCTCC
GCTACGGTCAAACACTTCGCTGTAAGCCAATACGTTGACGAGCTCCGGTGCGTTCTTTCT
TAAACAAGAGATCACTTCCTCTGTCACGTCAACAACGGAGGATCCAAACTTCTTGAACTT
GACATCCGCTAACGGTTGACACAAACCGCTCATGTTCTCCACTACTCCTAGCACCGGGAC
CCCGACTTTCTTGCAAAAGCTCACTTCTTTTCTCACATCGATCAATGAGACTTCCTGCGG
GGTCGTGACGATGATCGCACCGTCGATCCCAGTGGCTTGGAGGTACTGAACTATTGAGAT
GTGCTCGTCTGATGTTCCTGGTGGGGCATCAACCACGAGGTAATCGATCTCTCCCCAGTA
AACGTCTTTCAA

QA 1 732 1 732
DS 



AS 1 2

CO CL8628Contig1 916 2 2 U
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TGGACGCGTACGACATCCTGAGATCCGAGAGGGAAGAGTTCGAGAGTGAGGCTGCTGAAA
AAGCCTTTGCCGACAGGATCAGTGGCAAGCCCCGAGCTTTGATTTCTGTGGCGGGATACA
ACCCTAATCTGCCTGAGGATGATATCAAGAAGGAACTGATTGATATCTTCAGTTCATGTG
GCGACGTTACAAGGGTTATTGTTCCCAAAGACCCTGATCATAGCCCTAATCTCGACAGAC
GTGCTTTAGTTATTCTTTTTGGAGATGGGGCAGAAGAGAAGGCCTTGCAACTTAATGGAA
CTAACGTTGGAGGATGGAATGCTCTTGTTAAGGTTGAATCGGATGAAGAAGATGAGGAGG
CAGCACGCTATAGATCCTATCTGATTAACGAACTAATGAATGACCCAAAATTTTGGTATG
GCGTTTCGGTTAGGGGATATGACACTAACCTCCCTGTAGACGAAGTCGAGACGGTTTTGA
AAGAAGGAGAAGCTAGGGCGCTGGCTCTTGATGGAATTAGAGTGGGAGAATTCGAATTAG
GTATTTCTGGCGTACCTTCAGTCCTGAATAACCTTCCCAGTCCCCCCTTTGACAACGGTG
AAATTTATTTTGGCTATACTGTCCCAGCTCATATGATTGAGTTTGCCAACAAGGACGACG
ACGAGATCGAGAACAAGGTCATTGCTTTCAAGAAGCAGAGGAGGTCTAGCTCTATCGTGT
GATGATAATACCATGCAACCTTGGGTCTTTTTTTACTGTTTAATCTCAAAGCTTTATGCA
TGACGTCGTTTGTGTGTGTGTGTCTTGATGATGAACGCACTCTTAATAATTATTATTATT
ACTATTATCAGCTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DN58TF U 1
AF RS1DN58JQ C 197
BS 1 598 RS1DN58TF
BS 599 916 RS1DN58JQ

RD RS1DN58TF 598 0 0
GGCCCTAAAACAGGAAGCACATCGTAAAGCGGCGGTTTAGGGTTATTTGCCTCTTCACCA
TGGACGCGTACGACATCCTGAGATCCGAGAGGGAAGAGTTCGAGAGTGAGGCTGCTGAAA
AAGCCTTTGCCGACAGGATCAGTGGCAAGCCCCGAGCTTTGATTTCTGTGGCGGGATACA
ACCCTAATCTGCCTGAGGATGATATCAAGAAGGAACTGATTGATATCTTCAGTTCATGTG
GCGACGTTACAAGGGTTATTGTTCCCAAAGACCCTGATCATAGCCCTAATCTCGACAGAC
GTGCTTTAGTTATTCTTTTTGGAGATGGGGCAGAAGAGAAGGCCTTGCAACTTAATGGAA
CTAACGTTGGAGGATGGAATGCTCTTGTTAAGGTTGAATCGGATGAAGAAGATGAGGAGG
CAGCACGCTATAGATCCTATCTGATTAACGAACTAATGAATGACCCAAAATTTTGGTATG
GCGTTTCGGTTAGGGGATATGACACTAACCTCCCTGTAGACGAAGTCGAGACGGTTTTGA
AAGAAGGAGAAGCTAGGGCGCTGGCTCTTGATGGAATTAGAGTGGGAGAATTCGAATT

QA 1 598 1 598
DS 

RD RS1DN58JQ 720 0 0
GGATGATATCAAGAAGGAACTGATTGATATCTTCAGTTCATGTGGCGACGTTACAAGGGT
TATTGTTCCCAAAGACCCTGATCATAGCCCTAATCTCGACAGACGTGCTTTAGTTATTCT
TTTTGGAGATGGGGCAGAAGAGAAGGCCTTGCAACTTAATGGAACTAACGTTGGAGGATG
GAATGCTCTTGTTAAGGTTGAATCGGATGAAGAAGATGAGGAGGCAGCACGCTATAGATC
CTATCTGATTAACGAACTAATGAATGACCCAAAATTTTGGTATGGCGTTTCGGTTAGGGG
ATATGACACTAACCTCCCTGTAGACGAAGTCGAGACGGTTTTGAAAGAAGGAGAAGCTAG
GGCGCTGGCTCTTGATGGAATTAGAGTGGGAGAATTCGAATTAGGTATTTCTGGCGTACC
TTCAGTCCTGAATAACCTTCCCAGTCCCCCCTTTGACAACGGTGAAATTTATTTTGGCTA
TACTGTCCCAGCTCATATGATTGAGTTTGCCAACAAGGACGACGACGAGATCGAGAACAA
GGTCATTGCTTTCAAGAAGCAGAGGAGGTCTAGCTCTATCGTGTGATGATAATACCATGC
AACCTTGGGTCTTTTTTTACTGTTTAATCTCAAAGCTTTATGCATGACGTCGTTTGTGTG
TGTGTGTCTTGATGATGAACGCACTCTTAATAATTATTATTATTACTATTATCAGCTCTC

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL8629Contig1 340 2 1 U
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TCTTCTTCTTCTTCAGATATTGAAGAAGCAACGCCACAGC


BQ
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AF RS1AE15JQ C 1
AF RS1AE15TF U 1
BS 1 340 RS1AE15TF

RD RS1AE15JQ 340 0 0
AAACGTTCTTTTTAAAAAAAAAAATCTGAAATCAAATTGAAGTTTTTTTTCTCTTAAAGA
GACAAAAGAGGAAGGAGTTTTGTTTTTTTTTTCTTCCTTGTGTTTGTTATTACTTCCTCA
AAAGAAGGCATGTGGCTACCAAGAGCAAACAATGCAGGAAGGAAAGAGACAGGAAGTTGT
TCAGTTGCAGTTGCAATAGACAAAGACAAGGGAAGCCAACATGCTCTTAAATGGACCATC
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TCTTCTTCTTCTTCAGATATTGAAGAAGCAACGCCACAGC

QA 1 340 1 340
DS 

RD RS1AE15TF 340 0 0
AAACGTTCTTTTTAAAAAAAAAAATCTGAAATCAAATTGAAGTTTTTTTTCTCTTAAAGA
GACAAAAGAGGAAGGAGTTTTGTTTTTTTTTTCTTCCTTGTGTTTGTTATTACTTCCTCA
AAAGAAGGCATGTGGCTACCAAGAGCAAACAATGCAGGAAGGAAAGAGACAGGAAGTTGT
TCAGTTGCAGTTGCAATAGACAAAGACAAGGGAAGCCAACATGCTCTTAAATGGACCATC
GAGAATCTTGCTTCTCGTGGCCAAACCATTTCTCTCATTCATGTCCTCTCCAAATCACAT
TCTTCTTCTTCTTCAGATATTGAAGAAGCAACGCCACAGC

QA 1 340 1 340
DS 



AS 1 2

CO CL8630Contig1 568 2 1 U
GGAAGTTTCTTGGGCAAATAAAGTGATTCAATCCTTACTACCCACAATAAGACTGAAGCA
AACACAGAATATGTACCGATCCTACGAGCCAGGAGGTAACAAAGAAAGAGAAGTCACGTG
CCAAGTTTGCTGAAAATGCTGTTCACACAATCCCATTTGTTCTTCTCGCTTGTGCTCTAG
TCCTTTGGTTTTTCTCTAATCCAAATGTGGATGTTGGGGTAAAAGAGGAATCCATTGCGG
CTAGGATCAAAGGATTGACGATTGAAGGAGACATTGACAACGACAGCGACGGAACTCAGA
CCGGATTCTTAGGCATTGCCGCAGAAGTGGGAGGTTCATACAAGTCGAAGCTAAAACGCG
ACGTTAATAAGCGTCATCGGAGGATACAAACTTCAAGGAAAGTGGTGAAAGGGTTTTATT
AGTTTTTTGGGTAAAAAAGGAGTTCCCTACATTAGTCAACACCTTAATCGATTTTTATTT
CCTAGTTTCCCGTATTTTGATTGAGATGTGTTACTTTGGTTACGTTTTGCTTTATGTTTT
CTCAAATAATGTTCACCAGAATTAAATC


BQ
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AF RS1FS70JQ C 1
AF RS1FS70TF U 1
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DS 

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CTCAAATAATGTTCACCAGAATTAAATC

QA 1 568 1 568
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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AF RS1DL80TF U 1
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TACCC

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1FP72TF U 1
AF RS1FP72JQ C 396
BS 1 708 RS1FP72TF
BS 709 709 RS1FP72JQ
BS 710 768 RS1FP72TF
BS 769 1198 RS1FP72JQ

RD RS1FP72TF 768 0 0
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TCTCCCTCCCACAATCTTCCACTCGTTTCACAACCCCGCCTTCACCTCCCTCCCATCGCC
GCCGCGCACCTCCGTCGCCGCTACCACTTACCAACAACATCAAAAGCTTCACACTTTCCT
CAACCTCCGAGCTCAATTCATCAAAAGCCTCAACCTTTCGCCCACCCACCTTCTCAAAAT
CTCGTATCGCTTGCAGGTTCAGCCAGTCCGACATAACGCCACAGTTTGAGCTTAGTAAAG
GAGGAGATAAACAGAAGCCACAAAAGAGAGCCAATGGCATATTCTGGATCATACTCATCA
ATCTTGGCATCTATGTAGCAGATCACTTCTTTCAGGTTCGCAGCATCAAGTCTCTCTATC
TCTATCACAACTTTCCAGCGTGGTACCAGTTTGTCACTGCAACGTTCTGTCATGCTAGCT
GGAACCATCTCTCCAGCAACCTTTTCTTCCTCTACATCTTTGGAAAGCTCGTTGAAGAAG
AGGAAGGGAGCTTTGGTTTGTGGCTGTCTTACTTGTTCACTGGTGTTGGAGCTAACCTTG
TTTCTTGGTCAGTTTTGCCGAGAAATGCTGTTTCCGTTGGAGCCTCTGGAGCTGTTTTTG
GGTTGTTTGCTATTAGCGTCCTCGTCAAGGTGTCTTGGGATTGGAGGA*GATCCTTGAAG
TTCTTATATTGGGTCAGTTCGTTATTGAGAGGGTAATGGAAGCAGCTC

QA 1 768 1 768
DS 

RD RS1FP72JQ 803 0 0
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ACTGCAACGTTCTGTCATGCTAGCTGGAACCATCTCTCCAGCAACCTTTTCTTCCTCTAC
ATCTTTGGAAAGCTCGTTGAAGAAGAGGAAGGGAGCTTTGGTTTGTGGCTGTCTTACTTG
TTCACTGGTGTTGGAGCTAACCTTGTTTCTTGGTCAGTTTTGCCGAGAAATGCTGTTTCC
GTTGGAGCCTCTGGAGCTGTTTTTGGGTTGTTTGCTATTAGCGTCCTCGTCAAGGTGTCT
TGGGATTGGAGGAAGATCCTTGAAGTTCTTATATTGGGTCAGTTCGTTATTGAGAGGGTA
ATGGAAGCAGCTCAGGCTTCAGCTGGAGTATCAGGAACTATATATGGTGGCTATTCTTTG
CAGACTGTTAATCACATTGCGCATCTCTCTGGTGCTCTTGTCGGTGTTGTGTTGGTTTGG
CTACTCAGCAAATTTCCCTCGGAAACTGTGGATCAAGAGGTTCAAAAGTCCTCCAAAAAG
TGATGAAATATAATCAGTGTAACATTACTATCTCAGGTACATAGTAGCTGTCAGATGAAG
TTATAAGACTGATGAAGTTACTTGTATAAACTGAAAGACAGGCTCTAGTACAAGTTTATG
TTTATACCAATTCTTTTGCAGCAGAATTTATATACAATGGATTTGTTCATCTTTTAAGCA
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AAGATCATTCTGTTGTAATGTAC

QA 1 803 1 803
DS 



AS 1 2

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AAGGCTCTGAGCTTAACTTGGGTCAAAAGCTACCACATCCACCTTGCCTACCAAATCTCC
AAACGCTGATATCGCTTCTTTTGTGTAATGATTCACTGGAATATTCCGAAGTTGAACCCA
TACCAGTAGATACTTTAGGTAATCTTCTGGTGGTTTCTCCACCCATCGGCCAATAACTAT
GCTACACACTCATTAAAAGTCCACACTCACTTCCTCAAGGTAATGTTCATACTTGAATAT
GAACTGGAACGTTGTTGTTAATAAAGCCACTCCTCGAACTATGTCCTACACTTGCCACTT
CCTTGACATGTCCATGATTAGATCTTTAATTCTATGGCATTCCGGATGAGAGTTCTGCCC
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GAGACAAAACTCGACCCACTTCTCTGTTCTTAGTGTTTTAGAGAAACCGCTGATAAGAAC
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TTTCTGCTAACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H310TF U 1
AF RS1H310JQB C 90
BS 1 721 RS1H310TF
BS 722 793 RS1H310JQB

RD RS1H310TF 721 0 0
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CTTTTGCAGCCTCTCAAAGTCGTATCGAATTGTCACAGAATTTCCACCCGGGAGGTTTAT
AACCTTCGTTTTCCTCAATGGTCTTGATACATCAAAGAAAGCCCTCACTCTAAAATAGTC
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AAACGCTGATATCGCTTCTTTTGTGTAATGATTCACTGGAATATTCCGAAGTTGAACCCA
TACCAGTAGATACTTTAGGTAATCTTCTGGTGGTTTCTCCACCCATCGGCCAATAACTAT
GCTACACACTCATTAAAAGTCCACACTCACTTCCTCAAGGTAATGTTCATACTTGAATAT
GAACTGGAACGTTGTTGTTAATAAAGCCACTCCTCGAACTATGTCCTACACTTGCCACTT
CCTTGACATGTCCATGATTAGATCTTTAATTCTATGGCATTCCGGATGAGAGTTCTGCCC
ATAATATTCATCTTATTACTCTCCACGGCACTATAATGAGGTAAATCCGGCAAATGAACG
GAACTTCCTCTTCTTCCAAATACAGTCTCAAAAACTTTGTTGATATTCATTCTTCCCACA
GAGACAAAACTCGACCCACTTCTCTGTTCTTAGTGTTTTAGAGAAACCGCTGATAAGAAC
C

QA 1 721 1 721
DS 

RD RS1H310JQB 704 0 0
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CTACCACATCCACCTTGCCTACCAAATCTCCAAACGCTGATATCGCTTCTTTTGTGTAAT
GATTCACTGGAATATTCCGAAGTTGAACCCATACCAGTAGATACTTTAGGTAATCTTCTG
GTGGTTTCTCCACCCATCGGCCAATAACTATGCTACACACTCATTAAAAGTCCACACTCA
CTTCCTCAAGGTAATGTTCATACTTGAATATGAACTGGAACGTTGTTGTTAATAAAGCCA
CTCCTCGAACTATGTCCTACACTTGCCACTTCCTTGACATGTCCATGATTAGATCTTTAA
TTTTATGGCATTCCGGATGAGAGTTCTGCCCATAATATTCATCTTATTACTCTCCACGGC
ACTATAATGAGGTAAATCCGGCAAATGAACGGAACTTCCTCTTCTTCCAAATACAGTCTC
AAAAACTTTGTTGATATTCATTCTTCCCACAGAGACAAAACTCGACCCACTTCTCTGTTC
TTAGTGTTTTAGAGAAACCGCTGATAAGAACCCAAGGATAATCAATAAAAACCACTTTAA
GAGTCTAAGATTTATATCCAAATAACGAGATTTTCTGCTAACAC

QA 1 704 1 704
DS 



AS 1 2

CO CL8635Contig1 816 2 4 U
GGACTCTCTTCCTTCAACAAAAAAAAAAAACACACCAATAGAGATCCAAGAAAGGAGAGG
CCATTAAAGAGAGAGAGAGAGAAATGGGAAGGTCACCTTGTTGCGAGAAAGCTCACATGA
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GCGAAGGTTGCTGGCGATCTCTCCCTCGAGCCGCCGGATTACAAAGATGTGGTAAGAGTT
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AAGAAGACGAACTCATCATCAAACTCCATAGCTTACTCGGTAACAAATGGTCGTTGATTG
CTGGGAGATTAGCAGGAAGAACAGACAACGAGATCAAAAACTATTGGAACACTCACATCA
AGAGGAAGCTTGTCAGCCGTGGGATTGATCCAAACACCCATCGTCCGATCAACGTAATCC
CTCCTTCAAAAACAACAACACCATCACTTCTAAACGACGAGCCTGTACAATTCGATTTGG
CCGGACCGGATCAGCATCAGACGGTTAAACCGGAACCGATGGCGCTAGACCGGGAAGAGG
TTAATAATGATATCAACAATAATAACTCCACGAGCAGTGGAACGACGTCGGACGACGATT
GTGTACTCATAATGAGTCCTGTCGTAATTGTCGTGTTTCGGATGCTCGAACCATCTGGGA
ATCGAAAATTCTTTAGGAATATTTTATATATTAGTTAATTTGTATTTTTGTTTTGTTTTG
TTATGTTTCTTCTTGTAATGAATGCATCAAGTAACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CD22TF U 1
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TTCTTTAGAATAT

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ACAAAGATGTGGTAAGAGTTGTAGGTTGAGATGGATGAATTATCTAAGACCAGATCTCAA
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TAACAAATGGTCGTTGATTGCTGGGAGATTAGCAGGAAGAACAGACAACGAGATCAAAAA
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GCCTGTACAATTCGATTTGGCCGGACCGGATCAGCATCAGACGGTTAAACCGGAACCGAT
GGCGCTAGACCGGGAAGAGGTTAATAATGATATCAACAATAATAACTCCACGAGCAGTGG
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GATGCTCGAACCATCTGGGAATCGAAAATTCTTTAGGAATATTTTATATATTAGTTAATT
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QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

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AAGAAGGATTTGTGAAGAGCCTCAACGCATCCTTCTGCTTCATCATCATTTACTATAAGA
AAGATGTTTACCTTGGATGCTCCTTGTGATATCATCTGGACATTGATACCTTTTGTCCGA
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ATC


BQ
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20 20 20 

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BS 28 663 RS1H601JQB

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AAGAAGGATTTGTGAAGAGCCTCAACGCATCCTTCTGCTTCATCATCATTTACTATAAGA
GAGATGTTTACCTTGGATGCTCCTTGTGATATCATCTGGACATTGATACCTTTTGTCCGA
AGAACATGAAACGCCCTCTCTAAAATCAGGGAGGAGTGCTGAACATTCCCAATTAAAGAG
ATTATAGCTCTTCCTTTTGAGAGATTCACAACTGCAATTTTCTCAAGTTCCTCAACTACG
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GATAAGCTGACTTCACTAGTGGCAACAACGTCTACGGATATTTCAAGTTCCTCAAATATC
GAAAATACCTTTGCAAGAAAACCAACTTGACCAAGCATTCGGGTGCTTGCTATATCAAGC
ATC

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DS 

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ACGTCTACGGATATTTCAAGTTCCTCAAATATCGAAAATACCTTTGCAAGAAAACCAACT
TGACCAAGCATTCGGGTGCTTGCTATATCAAGCATC

QA 1 636 1 636
DS 



AS 1 2

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ACAACAAAAATCTCCCTTTCAATCAAAAAACCCATATAAAATCGAAGCTGACGGATTTTT
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TGCTCAGAACTGGGCATCTCGCGGCCACAACTTACGACAAGCAACTCGATCATACGCAAG
TGGAGGTCGTAAAGACTACAATCTCCTTGGTAGTAATGTGAAACCAGGGGATGCTGATTT
TAGAAAAGCTTGGGAGAAAGATATTAAGGATGATGATGATGATGATGACACTTTATGGTC
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TATACAGCGTTTGGTCTGGAAGCGACGAGGAGAAAACGTTATGGACCGGCGATGAAGGTG
ATGACGACGACGATATTCCGACAGAACCACACCCGAACGAAGCATCTGATAAGTACTTGG
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BQ
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AF RS1AN41TF U 1
AF RS1AN41JQ C 677
BS 1 765 RS1AN41TF
BS 766 766 RS1AN41JQ
BS 767 773 RS1AN41TF
BS 774 774 RS1AN41JQ
BS 775 816 RS1AN41TF
BS 817 817 RS1AN41JQ
BS 818 829 RS1AN41TF
BS 830 1245 RS1AN41JQ

RD RS1AN41TF 848 0 0
GGGTTCTCTATCATAGCCAAAAGGTTGGGTTCCAGTCTGAGAGTGTAACTCAATAGAGCG
ACAACAAAAATCTCCCTTTCAATCAAAAAACCCATATAAAATCGAAGCTGACGGATTTTT
TGCTTATTGTTAAATTTGTAGATCACAAAGTCGCTTCCTTTCGAGTCCTGCGCCTAACTC
TGCTCAGAACTGGGCATCTCGCGGCCACAACTTACGACAAGCAACTCGATCATACGCAAG
TGGAGGTCGTAAAGACTACAATCTCCTTGGTAGTAATGTGAAACCAGGGGATGCTGATTT
TAGAAAAGCTTGGGAGAAAGATATTAAGGATGATGATGATGATGATGACACTTTATGGTC
AGGAAGTGAAGACGAAAGCGATGATGATAAAGGAAAACCGTCTTGAGAACGAGGTTAAGA
AAGCTAGGCAACAAGCTAAAGACACCTCTGATCTAATCGATGCAGACGACAGTGACGAGT
TATACAGCGTTTGGTCTGGAAGCGACGAGGAGAAAACGTTATGGACCGGCGATGAAGGTG
ATGACGACGACGATATTCCGACAGAACCACACCCGAACGAAGCATCTGATAAGTACTTGG
ACAAGCTGTTTGAGTTCGAAGAGAAACCGAAGTACAGGACGATCTCTGAGCTGTTGAAAT
CCGAAAACGAGCCTGAGGAGCTTTCACCAGGTAAACAGGCGAGGAAGCTTGCTGTTGAGA
ACGCGTTGAAGAAACTGAACAAAGGGCCTGACGGGCGCTACACAA*CGTGTGGGAAGTGA
TGAGTGATGTCGACATTCTGATTGGAGCGTTCGAGA*CATCATCTCAGG
CCTGATATGAGAGCTGAGA

QA 1 829 1 829
DS 

RD RS1AN41JQ 569 0 0
GGAGCTTTCACCAGGTAAACAGGCGAGGAAGCTTGCTGTTGAGAACGCGTTGAAGAAACT
GAACAAAGGGCCTGACGGGCGCTACACAAACGTGTGGAAAGTGATGAGTGATGTCGACAT
TCTGATTGGAGCGTTCGAGAACATCATCTCAGGGCCTGAATATGAAGAGCTGAGGAAAGG
TGGACCCAAGAGGTTGAACATGCAGTTCTTCAAGGATATACAAACTCGCATGAGATATCC
CAACTTCAAATTCACGCCTGAGATTAAGTTGAAGCCCAAGAGTAAACTAGTGCCTAGGAA
GAAATGGCAGAAGGCCCAGTCCAGGAGAAGGAAAGCTCAGAAGCGGTAAAAAAAGCTCCT
TGCCTGCCTCTTCAAAGATCCTATAATAGATTTTAACAGGGTTAGAAGAATGCCAGAGCT
TCAACAAGAATGACTGTTTAATCTCCTGTAAAGAATGGGTGCTGTGATTGAACATCTTTC
CTTTGGAGTGATTCTGGGGGAGACTTTATATTCCTTCTACTAAAGAAAGAAGCTTTTGAA
GGAAAAGCTAAAGATGCTTTGTCCCTATT

QA 1 569 1 569
DS 



AS 1 2

CO CL8638Contig1 879 2 2 U
ACTCCATGGAGAACAACGACGGAGCAATGACTAACGGCGTCATAGTCGAGCACACGTCAG
CAAAAGGACCTCTCAACGCCGTGAAGAAACCACCGACCAAGGACCGGCACAGCAAAGTCG
ACGGGAGAGGGAGGAGAATCCGTATGCCGATCATATGCGCAGCTCGAGTCTTCCAGCTGA
CCAGAGAGCTAGGCCACAAATCCGACGGCCAGACCATCGAGTGGCTCCTCCGTCAAGCCG
AGCCTTCCATCATAGCCGCCACGGGAACTGGAACGACTCCCGCGAGTTTCTCCACCGCTT
CTCTCTCCACCACTTCTTCCACCCCCTTCACGCTCGGAAAGCGCGTGAGAGCGGAGGAGG
GAGGAGAATCAGGCCCCGGAGGTGGGGAGTTGACAGTTGGACCTACGATGGGAGCTTCGG
TAATGAGTGGTGGTGGTTTCTGGGCGGTTCCGGCGAGGCAGGATTTCGGACAAGTGTGGA
GCTTTGCCGCCGGAGCTACGCCGGAGATGTTGTTTACGCAGCAGCAGCAAGCAGCTACAC
TCTTTGTCCGTCAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAACAGCATGCTTCAGCAGCTGTAGCTG
CAATGGGTGAGGCTTCAGCGGCTAGAGTTGGGAACTATCTCCCGGGTCATCATCTCAATC
TGCTGGCTTCTTTGTCGGGTGGGAGTCCCGGGTCGGGTCGGAGGGAAGAGGATGACTCAC
GTTGAAAAAAAGGTTTCATCTTTTGTGCTCTCTTTCTTTAGGAATGATTGGGTAATGTAT
AGAAAATTATTATTAATGTCATCTAAAGTGGTCAGAGACTACTTAGTTTGTGTTCTTTGT
GCTCAATTTTTAGTTAATTTTAAGATTATTGCTTGTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BI20TF U 1
AF RS1BI20JQ C 99
BS 1 726 RS1BI20TF
BS 727 879 RS1BI20JQ

RD RS1BI20TF 726 0 0
ACTCCATGGAGAACAACGACGGAGCAATGACTAACGGCGTCATAGTCGAGCACACGTCAG
CAAAAGGACCTCTCAACGCCGTGAAGAAACCACCGACCAAGGACCGGCACAGCAAAGTCG
ACGGGAGAGGGAGGAGAATCCGTATGCCGATCATATGCGCAGCTCGAGTCTTCCAGCTGA
CCAGAGAGCTAGGCCACAAATCCGACGGCCAGACCATCGAGTGGCTCCTCCGTCAAGCCG
AGCCTTCCATCATAGCCGCCACGGGAACTGGAACGACTCCCGCGAGTTTCTCCACCGCTT
CTCTCTCCACCACTTCTTCCACCCCCTTCACGCTCGGAAAGCGCGTGAGAGCGGAGGAGG
GAGGAGAATCAGGCCCCGGAGGTGGGGAGTTGACAGTTGGACCTACGATGGGAGCTTCGG
TAATGAGTGGTGGTGGTTTCTGGGCGGTTCCGGCGAGGCAGGATTTCGGACAAGTGTGGA
GCTTTGCCGCCGGAGCTACGCCGGAGATGTTGTTTACGCAGCAGCAGCAAGCAGCTACAC
TCTTTGTCCGTCAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAACAGCATGCTTCAGCAGCTGTAGCTG
CAATGGGTGAGGCTTCAGCGGCTAGAGTTGGGAACTATCTCCCGGGTCATCATCTCAATC
TGCTGGCTTCTTTGTCGGGTGGGAGTCCCGGGTCGGGTCGGAGGGAAGAGGATGACTCAC
GTTGAA

QA 1 726 1 726
DS 

RD RS1BI20JQ 781 0 0
AAGGACCGGCACAGCAAAGTCGACGGGAGAGGGAGGAGAATCCGTATGCCGATCATATGC
GCAGCTCGAGTCTTCCAGCTGACCAGAGAGCTAGGCCACAAATCCGACGGCCAGACCATC
GAGTGGCTCCTCCGTCAAGCCGAGCCTTCCATCATAGCCGCCACGGGAACTGGAACGACT
CCCGCGAGTTTCTCCACCGCTTCTCTCTCCACCACTTCTTCCACCCCCTTCACGCTCGGA
AAGCGCGTGAGAGCGGAGGAGGGAGGAGAATCAGGCCCCGGAGGTGGGGAGTTGACAGTT
GGACCTACGATGGGAGCTTCGGTAATGAGTGGTGGTGGTTTCTGGGCGGTTCCGGCGAGG
CAGGATTTCGGACAAGTGTGGAGCTTTGCCGCCGGAGCTACGCCGGAGATGTTGTTTACG
CAGCAGCAGCAAGCAGCTACACTCTTTGTCCGTCAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAACAG
CATGCTTCAGCAGCTGTAGCTGCAATGGGTGAGGCTTCAGCGGCTAGAGTTGGGAACTAT
CTCCCGGGTCATCATCTCAATCTGCTGGCTTCTTTGTCGGGTGGGAGTCCCGGGTCGGGT
CGGAGGGAAGAGGATGACTCACGTTGAAAAAAAGGTTTCATCTTTTGTGCTCTCTTTCTT
TAGGAATGATTGGGTAATGTATAGAAAATTATTATTAATGTCATCTAAAGTGGTCAGAGA
CTACTTAGTTTGTGTTCTTTGTGCTCAATTTTTAGTTAATTTTAAGATTATTGCTTGTTC
C

QA 1 781 1 781
DS 



AS 1 2

CO CL8639Contig1 868 2 4 U
GATCCAAGAAGTACTCGGTTTACATACCGGACCTCCTCTTTTTCGGTGGTCCCTACTCCG
ATAACTCTGACCGGTCTCCGGCGTTTCAAGCCAACTGTTTGGTCAAGGGGCTTCGTATCC
TCGGCGTGGATAAATTTGTCCCCGGACATGGTTAGAGCAATGGTTGTGTCTGGTTCGATA
CTCGCGATGACCGACTCCATTAGTGAGTCGAGCTTGAACCGGTTAGGGTTTAGTTCTTCC
AAAGATCTCTTGTTACCGACTTCGGTTAAGGAACTTAAGGCCCTCTTCACCATTGCCGTG
CATAAACCTTTGTGGTTTCCTAATCGATTGTTCAAAGATTTCATTAAGGTTATGTTCAAC
AACAGGAAAGAAAGAGCCGAGTTATTAGAGGCTGTTGAAGTCAGTAACAAGGACGTGACA
ATCCCTCATTTCCCATGGAAAATACATTTATTGTGGGGTGAAAGTGATCAAATCTTTGAC
TTCGAGTTAGCTAAAAACATGAAAACACAACTAGGTGAGAACGCAACAATAGAAAGCATA
AAGAAGGCAGGTCATTTGGTGCAACTGGAAAGGCCTTGTGTTTACAATAGGCGCCTCAAA
AAGTTTCTTGCATCCATTCATTCTGAAGATAGAATAATACACTAAATACAACATATAATG
AGTTATATTTAATCTTGATATACATATGTGAATTTTTATGTCAAAAATTAATAATCATTT
GGTTTATTTTGTGTGATTTCTTTTTATTGCTACAATTTTTCTTTTGAAACATTTTCCTCC
GTACGATCAATATGCGCAATATTTGGTGGAATTCGTGTCAGATTTTGTAAAGATTGTTAT
CATTTTTATCAAATAATTTATCTTTAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B808TF U 1
AF RS1B808JQ C 122
BS 1 706 RS1B808TF
BS 707 707 RS1B808JQ
BS 708 754 RS1B808TF
BS 755 868 RS1B808JQ

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ATAACTCTGACCGGTCTCCGGCGTTTCAAGCCAACTGTTTGGTCAAGGGGCTTCGTATCC
TCGGCGTGGATAAATTTGTCCCCGGACATGGTTAGAGCAATGGTTGTGTCTGGTTCGATA
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AAGTTTCTTGCATCCATTCATTCTGAAGATAGAATAATACACTAAATACAACATATAATG
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GGTTTATTTTGTGTGATTTCTTTTTATTGCTACA

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DS 

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TCGCGATGACCGACTCCATTAGTGAGTCGAGCTTGAACCGGTTAGGGTTTAGTTCTTCCA
AAGATCTCTTGTTACCGACTTCGGTTAAGGAACTTAAGGCCCTCTTCACCATTGCCGTGC
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ACAGGAAAGAAAGAGCCGAGTTATTAGAGGCTGTTGAAGTCAGTAACAAGGACGTGACAA
TCCCTCATTTCCCATGGAAAATACATTTATTGTGGGGTGAAAGTGATCAAATCTTTGACT
TCGAGTTAGCTAAAAACATGAAAACACAACTAGGTGAGAACGCAACAATAGAAAGCATAA
AGAAGGCAGGTCATTTGGTGCAACTGGAAAGGCCTTGTGTTTACAATAGGCGCCTCAAAA
AGTTTCTTGCATCCATTCATTCTGAAGATAGAATAATACACTAAATACAACATATAATGA
GTTATATTTAATCTTGATATACATATGTGAATTTTTATGTCAAAAATTAATAATCATTTG
GTTTATTTTGTGTGATTTCTTTTTATTGCTACAATTTTTCTTTTGAAACATTTTCCTCCG
TACGATCAATATGCGCAATATTTGGTGGAATTCGTGTCAGATTTTGTAAAGATTGTTATC
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QA 1 747 1 747
DS 



AS 1 2

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AACACTGAGCTTCAATGA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FQ35TF C 1
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BS 1 107 RS1FQ35TF
BS 108 798 RS1AH16JQ

RD RS1FQ35TF 570 0 0
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ATCAAGTTACATCCTCGAACAATGTAGTTTCCTCCACAATCTCGGCCATATCACCGGTAC
TTGTACCCAACATTCTACTACTTTCTTGATCTTTCCATCTAAAATCTCCACCAGTGTAAA
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TTCAACCCTCGAGACTATTGCACCATTCACATAAACAATCTCGTTGTCACTATCTTGCAC
AACCATTTTTCGGTTTCCTTTCCCACCGTCAAGCTCCTTATGCATGTGTCCAAACACAAC
TAAAGGAACAGACAACTCCGTTGTCTCTTTCAACTGGCGTAACGCCTGCTCTAGATCTGG
ATCACCATGGTCACCGCCTTCGACAAACC
C

QA 1 569 1 569
DS 

RD RS1AH16JQ 692 0 0
C
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GTGCCCTTGATAAATCAAGTTACATCCTCGAACAATGTAGTTTCCTCCACAATCTCGGCC
ATATCACCGGTACTTGTACCCAACATTCTACTACTTTCTTGATCTTTCCATCTAAAATCT
CCACCAGTGTAAAAGCTCTTACTGTGCCGCCACTCTCAAACTCCGCTGCTCCAACCGGTG
TTTCGTTTGTCTCTTCAACCCTCGAGACTATTGCACCATTCACATAAACAATCTCGTTGT
CACTATCTTGCACAACCATTTTTCGGTTTCCTTTCCCACCGTCAAGCTCCTTATGCATGT
GTCCAAACACAACTAAAGGAACAGACAACTCCGTTGTCTCTTTCAACTGGCGTAACGCCT
GCTCTAGATCTGGATCACCATGGTCACCGCCTTCGACAAACCAGTCTCTTTCACATATAT
CATCTGCCTGAGAACCAAGACCTGTTGGTCCGTTATGCGCAAGAATTATAACCACATGAT
CTTCTGGTGTTCCAAGTGCAGCTCGACAAATACTCTCAGCACTGGCATTCATATCACCAA
CTCCATACCTCTTGGCAAGCAGGTTTTCACGATGCAGTTGATCTCCCCCATGTGAAAAGG
GCCGACCACCAACAACACTGAGCTTCAATGA

QA 2 692 2 692
DS 



AS 1 2

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TTCCTGATTGGGTGATTGTTCCAGGTGGCAATCTCGGTAACATCTACGCTTTCTACAAAG
GCTTCAAGATGTGTCAAGAGCTTGGACTCGTTGATAGGATCCCGAGGATGGTTTGTGCTC
AAGCGGCTAATGCGAATCCTCTTTACTTGCATTACAAGTCTGGCTGGAAGGACTTCAAGC
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AGCTGATGGATGCGATGGCTCAGGCTGATTCTACTGGGATGTTTATCTGTCCTCATACGG
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GGACTGTGGTTGTGAGTACTGCTCATGGGTTGAAGTTTACTCAGTCGAAGATTGATTATC
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CAGATTTCGGAGCTGTTATGGATGTTCTCAAGAGTTACTTAGGAAGCCAGACACTTAGGT
CATAAGAAACAGACCAATCTTCTTTCGTTTTGTCTTTTTTTTTTAAACTGTTAGTTGTTG
TGTACTCATAAACTGCTCGTTATCTCAGTTTTATAATAAGCTCTCAAGCAAAGTTTGAAC
C


BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 

AF RS1BD75TF U 1
AF RS1BD75JQ C 2
BS 1 638 RS1BD75TF
BS 639 781 RS1BD75JQ

RD RS1BD75TF 638 0 0
GGAGGCTAGAAGGGCAGAAGACTGCAGCGATTGAGATTCTTCAGCAGTTTGATTGGCAAG
TTCCTGATTGGGTGATTGTTCCAGGTGGCAATCTCGGTAACATCTACGCTTTCTACAAAG
GCTTCAAGATGTGTCAAGAGCTTGGACTCGTTGATAGGATCCCGAGGATGGTTTGTGCTC
AAGCGGCTAATGCGAATCCTCTTTACTTGCATTACAAGTCTGGCTGGAAGGACTTCAAGC
CCATGACTGCAAGTACCACTTTCGCCTCTGCGATTCAGATTGGTGACCCTGTGTCTATCG
ATAGAGCTGTGTACGCGCTCAAGAAGTGTGACGGGATTGTGGAGGAAGCGACGGAGGAGG
AGCTGATGGATGCGATGGCTCAGGCTGATTCTACTGGGATGTTTATCTGTCCTCATACGG
GTGTGGCTTTGACAGCTCTGTTTAAGCTGAGGAACAGAGGAGTGATTGCGCCGACTGATA
GGACTGTGGTTGTGAGTACTGCTCATGGGTTGAAGTTTACTCAGTCGAAGATTGATTATC
ACTCCAAAGCCATCCCTGACATGGCATGCAGATTCTCTAATCCTCCTGTTGAAGTGAAAG
CAGATTTCGGAGCTGTTATGGATGTTCTCAAGAGTTAC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1BD75JQ 780 0 0
GAGGCTAGAAGG*CAGAAGACTGCAGCGATTGAGAT*CTTCAGCAGTTTGATTGGCAAGT
TCCTGATTGGGTGATTGTTCCAGGTGGCAATCTCGGTAACATCTACGCTTTCTACAAAGG
CTTCAAGATGTGTCAAGAGCTTGGACTCGTTGATAGGATCCCGAGGATGGTTTGTGCTCA
AGCGGCTAATGCGAATCCTCTTTACTTGCATTACAAGTCTGGCTGGAAGGACTTCAAGCC
CATGACTGCAAGTACCACTTTCGCCTCTGCGATTCAGATTGGTGACCCTGTGTCTATCGA
TAGAGCTGTGTACGCGCTCAAGAAGTGTGACGGGATTGTGGAGGAAGCGACGGAGGAGGA
GCTGATGGATGCGATGGCTCAGGCTGATTCTACTGGGATGTTTATCTGTCCTCATACGGG
TGTGGCTTTGACAGCTCTGTTTAAGCTGAGGAACAGAGGAGTGATTGCGCCGACTGATAG
GACTGTGGTTGTGAGTACTGCTCATGGGTTGAAGTTTACTCAGTCGAAGATTGATTATCA
CTCCAAAGCCATCCCTGACATGGCATGCAGATTCTCTAATCCTCCTGTTGAAGTGAAAGC
AGATTTCGGAGCTGTTATGGATGTTCTCAAGAGTTACTTAGGAAGCCAGACACTTAGGTC
ATAAGAAACAGACCAATCTTCTTTCGTTTTGTCTTTTTTTTTTAAACTGTTAGTTGTTGT
GTACTCATAAACTGCTCGTTATCTCAGTTTTATAATAAGCTCTCAAGCAAAGTTTGAACC

QA 1 780 1 780
DS 



AS 1 2

CO CL8642Contig1 892 2 2 U
GGAAGAGAGCCAAATAACCACCAAAACTCCAAGCTTCATCCATGGAAACCTCTTTGGTCT
CTCATAATCTTCCAAAAGAGGCAACTTCACACTCTCCATCTTCTCATCTTCTTCTCCGAT
GACCATACTCGCCTCTCTGACCTTCACCATCTCCGACTCCAACCTCCAGTAATAAACCCC
GTTTCCAAACGTCTTCACCGTCGACCACGCAAGAAACACGGCGAAGAGACTCGTTATAAG
CCAGTTTGGGAACACGAGGTTGCATATCACTCCGACACTAACTCCAAGAAGCATACACGG
TTCAAGAAGCAGAGCTAAGTCGAAGTCTATCATCGTCTTGCCTCCAGCTTTAGGGTTTCT
GACGAAAAGATTGCACCCCACGTTTGCTATGGATCCTCCTGTTACCATGAAAGCAGAGAA
GCTTGAAGCTGTTTTCAGGTCGAGTCCGGCGACGATAGTCATTATAGGAACGTATAACCC
TCCTCCGCCGATACCGCCGGCGCTTGAGATAGTTGCGGCGAGGAAAGAGAGTACAACGGC
GATGAGTGTTGATGCGGTTAGTTCGATCTTTGGTTGGTTGAATTTGGTCGGAAAGTCGAG
CCATGAGCTGGTTGTGTTGAGGAGTTGATGGATGGGGAGGAAGATAAAGGAAGGTTCTGG
TTCTGCCATTGATGGAGTTAAAAGCATGGTGATGGTGAGGAAGGAGAGAGTTAGAGGGAC
GAGATTGTTTCTCATTTTTATGTTTGGGGTTGTTTTCTAATTTTAAAAGTTTTGGGGTTT
TTAGAAGATGTTGAGATTTTTATGTGTGTGTGACATTTCTGTTTAGAAGTTTAAATAGGA
GAAGCAATTCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTTATGCATGTCATTGTCAAGTAG


BQ
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AF RS1F227TF U 1
AF RS1F227JQ C 365
BS 1 653 RS1F227TF
BS 654 892 RS1F227JQ

RD RS1F227TF 653 0 0
GGAAGAGAGCCAAATAACCACCAAAACTCCAAGCTTCATCCATGGAAACCTCTTTGGTCT
CTCATAATCTTCCAAAAGAGGCAACTTCACACTCTCCATCTTCTCATCTTCTTCTCCGAT
GACCATACTCGCCTCTCTGACCTTCACCATCTCCGACTCCAACCTCCAGTAATAAACCCC
GTTTCCAAACGTCTTCACCGTCGACCACGCAAGAAACACGGCGAAGAGACTCGTTATAAG
CCAGTTTGGGAACACGAGGTTGCATATCACTCCGACACTAACTCCAAGAAGCATACACGG
TTCAAGAAGCAGAGCTAAGTCGAAGTCTATCATCGTCTTGCCTCCAGCTTTAGGGTTTCT
GACGAAAAGATTGCACCCCACGTTTGCTATGGATCCTCCTGTTACCATGAAAGCAGAGAA
GCTTGAAGCTGTTTTCAGGTCGAGTCCGGCGACGATAGTCATTATAGGAACGTATAACCC
TCCTCCGCCGATACCGCCGGCGCTTGAGATAGTTGCGGCGAGGAAAGAGAGTACAACGGC
GATGAGTGTTGATGCGGTTAGTTCGATCTTTGGTTGGTTGAATTTGGTCGGAAAGTCGAG
CCATGAGCTGGTTGTGTTGAGGAGTTGATGGATGGGGAGGAAGATAAAGGAAG

QA 1 653 1 653
DS 

RD RS1F227JQ 528 0 0
AAAAGATTGCACCCCACGTTTGCTATGGATCCTCCTGTTACCATGAAAGCAGAGAAGCTT
GAAGCTGTTTTCAGGTCGAGTCCGGCGACGATAGTCATTATAGGAACGTATAACCCTCCT
CCGCCGATACCGCCGGCGCTTGAGATAGTTGCGGCGAGGAAAGAGAGTACAACGGCGATG
AGTGTTGATGCGGTTAGTTCGATCTTTGGTTGGTTGAATTTGGTCGGAAAGTCGAGCCAT
GAGCTGGTTGTGTTGAGGAGTTGATGGATGGGGAGGAAGATAAAGGAAGGTTCTGGTTCT
GCCATTGATGGAGTTAAAAGCATGGTGATGGTGAGGAAGGAGAGAGTTAGAGGGACGAGA
TTGTTTCTCATTTTTATGTTTGGGGTTGTTTTCTAATTTTAAAAGTTTTGGGGTTTTTAG
AAGATGTTGAGATTTTTATGTGTGTGTGACATTTCTGTTTAGAAGTTTAAATAGGAGAAG
CAATTCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTTATGCATGTCATTGTCAAGTAG

QA 1 528 1 528
DS 



AS 1 2

CO CL8643Contig1 331 2 1 U
GCAACTGAATGTTGTGCCGGGCTGAATTCACTCACAAGGAGAGAGACGAGAGGCTCAACA
CAGCGGGCTGCAGCAACCGTAGACCTAATCCTTGTATTTGCAAACAGAACATAGCACAAT
TCTGCTGCATCCCCCTTCAGTTCCATCGAACAGTTTGAAGAAAGGATCCTGCAGAGAACA
TCCACCGCATTCATCTCCACATCCGCGACTGCCAGTGCCCGAGATGGGTTATCACTCAAC
AGCCTAACAAGTGCAGCAATAGCAGCATGTTGCTCCCTCTCTGAACCAGTACTGAGAATT
TCTACCAATGGCTGAACAGCTTGTCTAGAAG


BQ
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AF RS1GM49JQ C 1
AF RS1GM49TF U 1
BS 1 331 RS1GM49TF

RD RS1GM49JQ 331 0 0
GCAACTGAATGTTGTGCCGGGCTGAATTCACTCACAAGGAGAGAGACGAGAGGCTCAACA
CAGCGGGCTGCAGCAACCGTAGACCTAATCCTTGTATTTGCAAACAGAACATAGCACAAT
TCTGCTGCATCCCCCTTCAGTTCCATCGAACAGTTTGAAGAAAGGATCCTGCAGAGAACA
TCCACCGCATTCATCTCCACATCCGCGACTGCCAGTGCCCGAGATGGGTTATCACTCAAC
AGCCTAACAAGTGCAGCAATAGCAGCATGTTGCTCCCTCTCTGAACCAGTACTGAGAATT
TCTACCAATGGCTGAACAGCTTGTCTAGAAG

QA 1 331 1 331
DS 

RD RS1GM49TF 331 0 0
GCAACTGAATGTTGTGCCGGGCTGAATTCACTCACAAGGAGAGAGACGAGAGGCTCAACA
CAGCGGGCTGCAGCAACCGTAGACCTAATCCTTGTATTTGCAAACAGAACATAGCACAAT
TCTGCTGCATCCCCCTTCAGTTCCATCGAACAGTTTGAAGAAAGGATCCTGCAGAGAACA
TCCACCGCATTCATCTCCACATCCGCGACTGCCAGTGCCCGAGATGGGTTATCACTCAAC
AGCCTAACAAGTGCAGCAATAGCAGCATGTTGCTCCCTCTCTGAACCAGTACTGAGAATT
TCTACCAATGGCTGAACAGCTTGTCTAGAAG

QA 1 331 1 331
DS 



AS 1 2

CO CL8644Contig1 633 2 2 U
GGAAAAGGGCAACACAACATGTAGAGGTTCTAAATTTACCGGTAATCCCAGGTCGCTGGT
GTTTCACCGACGGTTCTTGGAAAGAAAATGATTTCTTTTCTGGTCAAGGATGGTATAGTA
CTTTAGAGGGCTTCCACGGTTTGATGGGTGCAAAAAAATGTCAGGAATAGTCTATCTCCT
CTTCACTCAGAGGTGGAAGCGCTAATCAGGGTAATGGAGTGTATGAAAAATTTACGCCAG
TTTCGGATCAAGTTTGCAACCAATTATTCTCAATTGGTGAAGATGGTTTTTGGCACCAGA
AGAATGGCATGCTTTTGCAACTTATTTAGAAGATATCAAGACCCTCAGAGGAATTTTTCA
TAGCTCAGAGATCATTCATGTACCCGGGACGAAGAATGTGAAGGCGTATAGTCTAACACC
CAGTGCAAGAAATGGCAGTCTTTCGTCGTTCATATAGATGCATAGCTACCAGTGTGGTTT
ACGGAGTCTATATGAGTCTATTTTATGTTGATGACAAAAAGATTGTAAAATTGTTTAAAA
TATTTCATAGATGGCTAAAATGTTTATTTTATTTACATGCTTTTCTTTTCTTGTCAATAT
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FM56JQ C 1
AF RS1FM56TF U 1
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QA 1 642 1 642
DS 

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TCACCTGATACGCTTCCACTCATATACGAACGTGGTTTGTTTGGAATCTACCATGACTGG
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TCTTCACTGAAGAAGGGGTGCAACTTGGTGTCGGTAATGGCTGAAGTGGACAGGATTCTT
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ATGGTGAAATCTCTGCAATGGAATGTAAAACTGACACAATCCAAAGATGGAGAAGGAGTG
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ATTGTATACA*GACACTAGTCTCAGTAGTGTAAGCTTTTATG

QA 1 642 1 642
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8648Contig1 830 2 6 U
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DU52TF U 1
AF RS1DU52JQ C 92
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TTAGAACTTAGAT

QA 1 733 1 733
DS 

RD RS1DU52JQ 739 0 0
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CGATTGGGACTAGAGTGTTTGGTCCTGTTCCTCACGAGCTTCGCAAGAAGAAACATCTCA
AGATCCTTGCTTTGGCTCAACACATTTCTTGAGACAACCAACATAAAACCCTTAACCACG
TAGTGTCTTTTTTTTTAATGTTATTCTCTTCCGTAAACTCTCATCCATAACTTTTTTCTT
GAGTTCAAGAGGCACAACTTTTATTTATGTTAGAACTTAGATTAGAGGTTTAAACTTTAA
AAGAGTGCACACTCCTCATGTTTATGTCCTTTTTTTCACGAAATATAGAACTCATAATAA
AAACCGGTAATATTTCACC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

CO CL8649Contig1 769 2 13 U
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CGGCACATCCGAAGGTGGTCCTAACGGTCGACACTGGGTCTTGGACCCCATTGATGGCAC
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AAGTAGTGTTAGGTGTGCTCGCTTGTCCAAACTTGCCATTGGCTTCCATAGCACGAGACA
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ATCGGTCAGGACATACATGCAGCCTTTGGATCGAAACTGATCCAGTCAA


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1DZ52TF U 8
AF RS1FJ03TF U 1
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BS 661 661 RS1DZ52TF
BS 662 769 RS1FJ03TF

RD RS1DZ52TF 674 0 0
GG
AGACATTTGTATCAATTTCGAGATCAAGAGATTCATCGAACCGTATCGTGTCTGTATCCG
GAAGAAAGCCGTCTCCTTTATCTGTTACTCTCAGATCATAGTTTCACCGATGGCTTACGA
GAAAGATCTTGATGCCGCTAAGAAAGCCGCTTCACTAGCAGCTCGCCTCTGTCAGAAAGT
TCAAAAGACTTTGTTGCAGTCTGATGTTCAATCAAAATCTGATAAAAGTCCAGTCACCGT
TGCTGATTATGGTTCACAAGCAGTTGTTAGTTTACTCTTACAAAGAGAACTCAGTTCTGA
ACCCTTTTCATTGGTAGCTGAAGAGGACTCAGCTGATCTACGCAAGGATGGTTCTCAGGA
TATTCTTGAGCGCATCACTAAACTCGTCAACGACACTTTAGCTAATGAGGATCCACTCAA
ACCCATTGACTCTGCTTTGTCAACAGAAGATCTTCTCAGAGCCATTGACTGCGGCACATC
CGAAGGTGGTCCTAACGGTCGACACTGGGTCTTGGACCCCATTGATGGCACTAAAGGATT
TTTGAGGGG*AGATCAGTATGCGGTAGCGCTAGGGTTGCTAGAGGAAGGGAAAGTAGTGT
TAGGTG**CTCGCTTGTCCAAACTTGCCATTGGCTTCCATAGCACGAGACAACAACAAGG
ACTCTTCTTCAT

QA 3 674 3 674
DS 

RD RS1FJ03TF 769 0 0
GGATCTTTCAGACATTTGTATCAATTTCGAGATCAAGAGATTCATCGAACCGTATCGTGT
CTGTATCCGGAAGAAAGCCGTCTCCTTTATCTGTTGCTCTCAGATCATAGTTTCACCGAT
GGCTTACGAGAAAGAGCTTGATGCCGCTAAGAAAGCCGCTTCACTAGCAGCTCGCCTCTG
TCAGAAAGTTCAAAAGGCTTTGTTGCAGTCTGATGTTCAATCAAAATCTGATAAAAGTCC
AGTCACCGTTGCTGATTATGGTTCACAAGCAGTTGTTAGTTTACTCTTACAAAGAGAACT
CAGTTCTGAACCCTTTTCATTGGTAGCTGAAGAGGACTCAGCTGATCTACGCAAGGATGG
TTCTCAGGATATTCTTGAGCGCATCACTAAACTCGTCAACGACACTTTAGCTAATGAGGA
TCCACTCAAACCCATTGACTCTGCTTTGTCAACAGAAGATCTTCTCAGAGCCATTGACTG
CGGCACATCCGAAGGTGGTCCTAACGGTCGACACTGGGTCTTGGACCCCATTGATGGCAC
TAAAGGATTTTTGGGGGGGAGATCAGTATGCGGTAGCGCTAGGGTTGCTAGAGGAAGGGA
AAGTAGTGTTAGGTGTGCTTGCTTGTCCAAACTTGCCATTGGCTTCCATAGCA*GAGACA
*CAACAAGGACTCTTCTTCATCTTCTTCTTCAGAGGAAAAGATGTCTCTTCTATGCTACA
ATCGGTCAGGACATACATGCAGCCTTTGGATCGAAACTGATCCAGTCAA

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

CO CL8650Contig1 808 2 20 U
GGAAGAATCCCTCTCAGCTTCTTTTGTCTCTGTTCCTAAGGCTCTAAACAAGTCCTTATG
ACGATGGAAAAGATAAGCTCTATTAAGAGCAGAGGACTTAAATTACCACCCGGTTTCAGA
TTTCATCCAACCGATGAAGAGCTAGTGGTTCAGTATCTATGTCGAAAGGTGACCGGTTTA
CCCTTACCAGCTTCTGTTATACCGGAAATTGATATCTGTAAAGCTGATCCATGGGATTTA
CCAGGTGATTGTGAGTCAGAGAGGTATTTTTTTAGCACAAGGGAAGCTAAATACCCAAAC
GGAAACAGGTCCAACCGATCAACCTGTTCGGGTTACTGGAAAGCCACTGGAATCGATAAG
CAAATAGGGGGAAAGAAGCTTGTTGGGATGAAGAAAACTCTGGTTTTCTATAAAGGGAAA
CCGCCAAACGGGACAAGAACCAATTGGGTTCTTCATGAGTATCGTCTTCTTGATTCTCAG
CAAGAATCACATGGAGAGAACACGGACTGGGTCTTGTGCAGAGTGTTTTTGAAAAAGACG
AGCAATGCTAATAGTAATAAGAGGAAAGAAGATGAGAAAGAGAGGAAGGAAGAGAAAGAA
AGTGGCAAAGACGACAACAAGAGTGCTTGTCCGATATTCTATGACTTTTTGAGAAAAGAC
AAGAAGAGAAAAAGATGCTGCGATTTGAATGTGACTCCGACGTGTTGTTGTTGTTCTGCT
TCAGCGTCTTCGTCGGTGTGCTCAAGTGCTTTAACACAGACATCTACTCATAATGACTCT
GATTATCATGAAGAAATTACTTGTCGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GW70TF U 1
AF RS1GW70JQ C 125
BS 1 535 RS1GW70TF
BS 536 536 RS1GW70JQ
BS 537 656 RS1GW70TF
BS 657 657 RS1GW70JQ
BS 658 672 RS1GW70TF
BS 673 673 RS1GW70JQ
BS 674 688 RS1GW70TF
BS 689 689 RS1GW70JQ
BS 690 714 RS1GW70TF
BS 715 715 RS1GW70JQ
BS 716 744 RS1GW70TF
BS 745 745 RS1GW70JQ
BS 746 753 RS1GW70TF
BS 754 754 RS1GW70JQ
BS 755 772 RS1GW70TF
BS 773 773 RS1GW70JQ
BS 774 783 RS1GW70TF
BS 784 784 RS1GW70JQ
BS 785 797 RS1GW70TF
BS 798 808 RS1GW70JQ

RD RS1GW70TF 797 0 0
GGAAGAATCCCTCTCAGCTTCTTTTGTCTCTGTTCCTAAGGCTCTAAACAAGTCCTTATG
ACGATGGAAAAGATAAGCTCTATTAAGAGCAGAGGACTTAAATTACCACCCGGTTTCAGA
TTTCATCCAACCGATGAAGAGCTAGTGGTTCAGTATCTATGTCGAAAGGTGACCGGTTTA
CCCTTACCAGCTTCTGTTATACCGGAAATTGATATCTGTAAAGCTGATCCATGGGATTTA
CCAGGTGATTGTGAGTCAGAGAGGTATTTTTTTAGCACAAGGGAAGCTAAATACCCAAAC
GGAAACAGGTCCAACCGATCAACCTGTTCGGGTTACTGGAAAGCCACTGGAATCGATAAG
CAAATAGGGGGAAAGAAGCTTGTTGGGATGAAGAAAACTCTGGTTTTCTATAAAGGGAAA
CCGCCAAACGGGACAAGAACCAATTGGGTTCTTCATGAGTATCGTCTTCTTGATTCTCAG
CAAGAATCACATGGAGAGAACACGGACTGGGTCTTGTGCAGAGTGTTTTTGAAAA*GACG
AGCAATGCTAATAGTAATAAGAGGAAAGAAGATGAGAAAGAGAGGAAGGAAGAGAAAGAA
AGTGGCAAAGACGACAACAAGAGTGCTTGTCCGATATTCTATGACTTTTTGAGAAA*GAC
AAGAAGAGAAAA*GATGCTGCGATTTGA*TGTGACTCCGACGTGTTGTTGTTGT*CTGCT
TCAGCGTCTTCGTCGGTGTGCTCA*GTGCTTTA*CACAGACATCTACTCATA*TGACTCT
GAT*ATCATGAAGAAAT

QA 1 797 1 797
DS 

RD RS1GW70JQ 684 0 0
ATCCAACCGATGAAGAGCTAGTGGTTCAGTATCTATGTCGAAAGGTGACCGGTTTACCCT
TACCAGCTTCTGTTATACCGGAAATTGATATCTGTAAAGCTGATCCATGGGATTTACCAG
GTGATTGTGAGTCAGAGAGGTATTTTTTTAGCACAAGGGAAGCTAAATACCCAAACGGAA
ACAGGTCCAACCGATCAACCTGTTCGGGTTACTGGAAAGCCACTGGAATCGATAAGCAAA
TAGGGGGAAAGAAGCTTGTTGGGATGAAGAAAACTCTGGTTTTCTATAAAGGGAAACCGC
CAAACGGGACAAGAACCAATTGGGTTCTTCATGAGTATCGTCTTCTTGATTCTCAGCAAG
AATCACATGGAGAGAACACGGACTGGGTCTTGTGCAGAGTGTTTTTGAAAAAGACGAGCA
ATGCTAATAGTAATAAGAGGAAAGAAGATGAGAAAGAGAGGAAGGAAGAGAAAGAAAGTG
GCAAAGACGACAACAAGAGTGCTTGTCCGATATTCTATGACTTTTTGAGAAAAGACAAGA
AGAGAAAAAGATGCTGCGATTTGAATGTGACTCCGACGTGTTGTTGTTGTTCTGCTTCAG
CGTCTTCGTCGGTTTGCTCAAGTGCTTTAACACAGACATCTACTCATAATGACTCTGATT
ATCATGAAGAAATTACTTGTCGAG

QA 1 684 1 684
DS 



AS 1 2

CO CL8651Contig1 669 2 2 U
GGACAGCTACGGATAAGCCTCTCGCTTCACTCTCTGCTTTCCCTCATCCTCATTTCAATG
GCGACAACCTCAGCTCTCTCCTCTCTCTTCACTCTCCCTCCACAACACAACCTCTCGCAT
CACCACCTCCTCCTCGAGACCCACCATCTCCTTCTCCTTCCTCAAACGACCCACCTCCCT
CACCCCACTCTGCGTTGATACCACTGCTTAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTCGACAAAC
GAAGGGCTAGAGGCAGTGGGACATGCTTTTGGGACAGCCTGGGCTGCTTTCAAAATCAGA
AAGGCTATTAATCCTAAGAGCGTTCTCAAACCTTCCTCTCTTGCAAAATCAGCCATTAAA
TCGGCAGCTTCACAGAAGAAAGCCTAGTAAAGGGCTCCTTGTTGAAGCATAAACAGGAAT
ATTGATGCATGTTTGTTTGTATAGTCTCTTGTCTTTGGTTCAAATGTAAAACTGAAAAGA
GGTTTGGTGCGTTTGGATTAGTTGTTGTGAAGTGTTTCTCTGACTGAGAATCATGTGATG
TAATGAATATGCGATGTATTTGCAAGTAGTGGGAGCTCTTAAAATTTATCATCCGAGGCT
ATTGAGCCAATAATGTCTGTTATAGTTTTGCAATATGTCAAAGCTTCCCATGCTTAATCT
CGTGGATAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FL07TF U 1
AF RS1CU88JQ C 470
BS 1 557 RS1FL07TF
BS 558 669 RS1CU88JQ

RD RS1FL07TF 561 0 0
GGACAGCTACGGATAAGCCTCTCGCTTCACTCTCTGCTTTCCCTCATCCTCATTTCAATG
GCGACAACCTCAGCTCTCTCCTCTCTCTTCACTCTCCCTCCACAACACAACCTCTCGCAT
CACCACCTCCTCCTCGAGACCCACCATCTCCTTCTCCTTCCTCAAACGACCCACCTCCCT
CACCCCACTCTGCGTTGATACCACTGCTTAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTCGACAAAC
GAAGGGCTAGAGGCAGTGGGACATGCTTTTGGGACAGCCTGGGCTGCTTTCAAAATCAGA
AAGGCTATTAATCCTAAGAGCGTTCTCAAACCTTCCTCTCTTGCAAAATCAGCCATTAAA
TCGGCAGCTTCACAGAAGAAAGCCTAGTAAAGGGCTCCTTGTTGAAGCATAAACAGGAAT
ATTGATGCATGTTTGTTTGTATAGTCTCTTGTCTTTGGTTCAAATGTAAAACTGAAAAGA
GGTTTGGTGCGTTTGGATTAGTTGTTGTGAAGTGTTTCTCTGACTGAGAATCATGTGATG
TAATGAATATGCGATGT
GTTT

QA 1 557 1 557
DS 

RD RS1CU88JQ 200 0 0
AACTGAAAAGAGGTTTGGTGCGTTTGGATTAGTTGTTGTGAAGTGTTTCTCTGACTGAGA
ATCATGTGATGTAATGAATATGCGATGTATTTGCAAGTAGTGGGAGCTCTTAAAATTTAT
CATCCGAGGCTATTGAGCCAATAATGTCTGTTATAGTTTTGCAATATGTCAAAGCTTCCC
ATGCTTAATCTCGTGGATAA

QA 1 200 1 200
DS 



AS 1 2

CO CL8652Contig1 692 2 1 U
GGACGCAGCACAGAGAAGGAAGCAGCTAACGAAGAGGAAGATGAAGGCGTTAGGGTATTG
GCTAATGGTGGTTGGTTCACTGAGATTAGCCTCAGTTTGGTTTGGTTTCTTCAACATTTG
GGCTCTTCGTCTCGCTGTCTTCTCTCAGACCACCATGAGTGAAGTTCATGGACGTACGTT
CGGAGTATGGACACTCCTGACATGCACCCTCTGCTTTCTTTGCGCATTCAACCCCGGGAA
CAAACCGTTATGCCTGGCTACGTTTCTCTCATTCATCTACGCCTTGGGCCATTTTCTGAC
TGAGTACCTCTTCTACCATACAATGACCGTCGCCAACCTCTCAACCGTGGCCTTCTTTGC
AGGCACGTCGATTGTGTGGATGCTCTGGGAGTGGAACTCCCTTGAACAACCGCACTCTAA
ACTTTCTTGATGTTTTTTCAAGAAGACATGTAACTGATTATTTCCTCTTTGAAACTTTTT
TCTAAGAGTTGAAATCATCTCCTCCGGCTTTTTGCTCGGATTCCTAAAGCTGTTGATTTA
TATTTCATCTTCCATCTTTGATAAGAGTCTTAAGGAGACTTGTAGGACTTGTCATCTTCT
ATGGCTCAAAGTTGTCAAATCATGTATTGTATGACATCTACTGCAGCTGAACTGATTGTT
TTCACTTGTAATGTTTTCCAATTGTGAGCGAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1H040JQB C 311
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TTCACTTGTAATGTTTTCCAATTGTGAGCGAC

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DS 

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TTT
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GTCAAATCATGTATTGTATGACATCTACTGCAGCTGAACTGATTGTTTTCACTTGTAATG
TTTTCCAATTGTGAGCGAC

QA 4 382 4 382
DS 



AS 1 2

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AAAGTAAAATGATTCGACATTATAATAACAACCAAACGCAAAAGACAAATGCCATCAAAA
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TAAGTCCTGTCAC


BQ
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AF RS1DK70JQ U 1
AF RS1B631TF C 2
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RD RS1DK70JQ 581 0 0
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CTTCAGTAGGTGTAGCCTTTGACGAGCATACCCTCCTTAGCGTCTTCAGACTCACCTTCT
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QA 1 581 1 581
DS 

RD RS1B631TF 672 0 0
A
CTTCAATATATTAAAGCTTTATTATTAAAAAGGAGTAGCTAATACAAGTTTAGTAGAGAA
AGTAAAATGATTCGACATTATAATAACAACCAAACGCAAAAGACAAATGCCATCAAAACA
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GGTGTATTTTCCGAGCTGAGCCAAAGAGTTGGCCTTGGCACGAGCCAAGAGAGTGGTCTG
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AGGGATCCTGTTGCGGAGGAGCTTAAGGGTGTAGGAGGCAACTTGTTCAGGAGTAGCTCT
GTCTTTAGACTCGGCTCCTGGAGTCACCATGCTCGGCTTCAGGAGGATACCTTCAAACAT
GACATTGTTCTGAGCAAGGTAAAAGAAAACCTCAGCCCAAACCTTCTCGGCTACGTCGTA
AGTCCTGTCAC

QA 2 672 2 672
DS 



AS 1 2

CO CL8654Contig1 634 2 2 U
TTTTTTGTCTAGTAAAGATAGAACCGAATGTCTCCAACAACAACAAGAAGCTTAGCTTAG
CAACGAGTCCCCATAAAAGCCTTTGAGAAGACTGTACAAACATAAGTAAAAGCAAGAAGC
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GTCAATGGTCCTTGAGTACTTAGCGAGCTTCATTGGAGCTCCGGGACAAGTATCCGCCGG
AACAGTTTCTGCAACCCGCGAAGGAGGAGGTGTCTTGCAGCAATCAAAACACCAAACCTC
AGCACTGACCTCTTGTAGTTGCAGTGAGAGAATGATTAACAAGAGACTCTGATAGACAGA
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AATGGAATCTGGGTCATCGGCGGTTGGAGCTTTAGGCTTTAAAAAAGCCTTTTACTTCAA
AATCACATGGATTTCCTCCTTCTTGGTCCATTGGATTCACGAGATCTAGACTGAGAGTGA
GAGAGAGAGAAAGTCTCTGAGAGTGGCTGACTCC


BQ
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AF RS1F428TF C 1
AF RS1F428JQ U 7
BS 1 6 RS1F428TF
BS 7 634 RS1F428JQ

RD RS1F428TF 634 0 0
TTTTTTGTCTAGTAAAGATAGAACCGAATGTCTCCAACAACAACAAGAAGCTTAGCTTAG
CAACGAGTCCCCATAAAAGCCTTTGAGAAGACTGTACAAACATAAGTAAAAGCAAGAAGC
TAGAGTTAAAAGAGAGTTAAAATTACAATCCCTAAAAGCTCTACCAGCTAAAGCTAACAT
TATGTCACAACATCAATTCAACATTAGTCAGATTCAGAAGAGCTTCCTTCTGAGTCCAGA
GTCAATGGTCCTTGAGTACTTAGCGAGCTTCATTGGAGCTCCGGGACAAGTATCCGCCGG
AACAGTTTCTGCAACCCGCGAAGGAGGAGGTGTCTTGCAGCAATCAAAACACCAAACCTC
AGCACTGACCTCTTGTAGTTGCAGTGAGAGAATGATTAACAAGAGACTCTGATAGACAGA
CTCGATTATTTCTTCATCGGATAACTGTTGAGACATAGACGGGTCTGACTGTAATGGAGA
AATGGAATCTGGGTCATCGGCGGTTGGAGCTTTAGGCTTTAAAAAAGCCTTTTACTTCAA
AATCACATGGATTTCCTCCTTCTTGGTCCATTGGATTCACGAGATCTAGACTGAGAGTGA
GAGAGAGAGAAAGTCTCTGAGAGTGGCTGACTCC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1F428JQ 628 0 0
GTCTAGTAAAGATAGAACCGAATGTCTCCAACAACAACAAGAAGCTTAGCTTAGCAACGA
GTCCCCATAAAAGCCTTTGAGAAGACTGTACAAACATAAGTAAAAGCAAGAAGCTAGAGT
TAAAAGAGAGTTAAAATTACAATCCCTAAAAGCTCTACCAGCTAAAGCTAACATTATGTC
ACAACATCAATTCAACATTAGTCAGATTCAGAAGAGCTTCCTTCTGAGTCCAGAGTCAAT
GGTCCTTGAGTACTTAGCGAGCTTCATTGGAGCTCCGGGACAAGTATCCGCCGGAACAGT
TTCTGCAACCCGCGAAGGAGGAGGTGTCTTGCAGCAATCAAAACACCAAACCTCAGCACT
GACCTCTTGTAGTTGCAGTGAGAGAATGATTAACAAGAGACTCTGATAGACAGACTCGAT
TATTTCTTCATCGGATAACTGTTGAGACATAGACGGGTCTGACTGTAATGGAGAAATGGA
ATCTGGGTCATCGGCGGTTGGAGCTTTAGGCTTTAAAAAAGCCTTTTACTTCAAAATCAC
ATGGATTTCCTCCTTCTTGGTCCATTGGATTCACGAGATCTAGACTGAGAGTGAGAGAGA
GAGAAAGTCTCTGAGAGTGGCTGACTCC

QA 1 628 1 628
DS 



AS 1 2

CO CL8655Contig1 627 2 1 U
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TCATCATCATCCACCCGAGCCTCTTGATTTCTTCATCTGGACTGTTGAGGATGTTGGATC
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TGGAGAATATCTAGAAAGCATGTCTGTGTTTACAACCGAACAGATCCTTCATTTCATAAG
GAGGCATCACATGAAATGGGGAGACTTCATCACCCTCTGCAAAGAACTCAGAAGGATCAA
AGTGGCTTGCTTGAAAGGCGAGCAGAGAGTTCGAAGGCCATGGTGGGCACCGTCTTGTCT
CTCTGTAGTCTTTGTTAAGGCGGCTAAGCGCAACCGACAGTCTCGAGTTGTATCTCTAAA
GCTTGAATCTTGACAATTACACGTTGGCTCTCTCTTTATGTACCTACTTGTCTCTCTTCT
CATCCCTTTCTTTTCCTTTTTCTTTTTTTGGGTTGAGTTTGTTTGTAGAGATAAAAGCTA
TATATGCACTATGAAAAAAACAAACTGGAGCCAAAATGCTGTTTGGCTTGTTAAAATCTT
GCAAGGAGGGAAAAAATATAGTTTTCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FG58JQ C 1
AF RS1FG58TF U 1
BS 1 627 RS1FG58TF

RD RS1FG58JQ 627 0 0
GGAGATCTTTAACAGCTGTCTCCTCGAGGAGACGACTACTATGAGCAGCAGAGATCATCA
TCATCATCATCCACCCGAGCCTCTTGATTTCTTCATCTGGACTGTTGAGGATGTTGGATC
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GAGGCATCACATGAAATGGGGAGACTTCATCACCCTCTGCAAAGAACTCAGAAGGATCAA
AGTGGCTTGCTTGAAAGGCGAGCAGAGAGTTCGAAGGCCATGGTGGGCACCGTCTTGTCT
CTCTGTAGTCTTTGTTAAGGCGGCTAAGCGCAACCGACAGTCTCGAGTTGTATCTCTAAA
GCTTGAATCTTGACAATTACACGTTGGCTCTCTCTTTATGTACCTACTTGTCTCTCTTCT
CATCCCTTTCTTTTCCTTTTTCTTTTTTTGGGTTGAGTTTGTTTGTAGAGATAAAAGCTA
TATATGCACTATGAAAAAAACAAACTGGAGCCAAAATGCTGTTTGGCTTGTTAAAATCTT
GCAAGGAGGGAAAAAATATAGTTTTCT

QA 1 627 1 627
DS 

RD RS1FG58TF 627 0 0
GGAGATCTTTAACAGCTGTCTCCTCGAGGAGACGACTACTATGAGCAGCAGAGATCATCA
TCATCATCATCCACCCGAGCCTCTTGATTTCTTCATCTGGACTGTTGAGGATGTTGGATC
TTGGCTTGAGGAAATCAACCTTGGGAGCTACCGCTTGATTTTCAAAGAAAACGGCGTCAA
TGGAGAATATCTAGAAAGCATGTCTGTGTTTACAACCGAACAGATCCTTCATTTCATAAG
GAGGCATCACATGAAATGGGGAGACTTCATCACCCTCTGCAAAGAACTCAGAAGGATCAA
AGTGGCTTGCTTGAAAGGCGAGCAGAGAGTTCGAAGGCCATGGTGGGCACCGTCTTGTCT
CTCTGTAGTCTTTGTTAAGGCGGCTAAGCGCAACCGACAGTCTCGAGTTGTATCTCTAAA
GCTTGAATCTTGACAATTACACGTTGGCTCTCTCTTTATGTACCTACTTGTCTCTCTTCT
CATCCCTTTCTTTTCCTTTTTCTTTTTTTGGGTTGAGTTTGTTTGTAGAGATAAAAGCTA
TATATGCACTATGAAAAAAACAAACTGGAGCCAAAATGCTGTTTGGCTTGTTAAAATCTT
GCAAGGAGGGAAAAAATATAGTTTTCT

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL8656Contig1 727 2 3 U
TTTTTTTTGGACAACTGGAAAAGTATTACTAACAAATAATAATCCAAATCACATAATAAT
TACAGTCTAGTTCATGAGACACAGGCAGAAGTCCCTTGTGTCGTTGTCGGTTCCGGACCA
AATAAGTTCATTGCGACATCACCCCTCAGCAACACTTTCTCCAACAGCCAATATGTAACA
TAACAGTAGCTAAACTCAGTACGTCGCGCATCAATACAGAATATGAGGGCATGTGGAGAT
AAGTCTCAATGCCCTTGTCCAGGCGAAGCATTTGATGGCAGTTGCTGCCGTTGCTGAATC
TGTTGAAGAAGGCTAGCCGCAAGCTGTAGAGTAGACTGATATTGCTGGCTCTTATCAACC
TCACCATCTGATGTACCTGGACCAGCTCCGGTGAGCAAAGTCTGGTGCTGCTGTTGTGCT
TGGTTAGACGCATTGGGTAGTGGTGGCATTGCAGTTTGAGAATGGGAAGGATATTCGTTA
TAAGCTTGATTATTTGCCAGACCGTGATAATTACCTTGCTGATAACCAAGCAAACCAGGG
TTCTCAGCTCCAGGGACCGGTATGTAGTTTCGGTTAAGCATGGGAGCTTCATGCTGATAC
TGAGCTTGATGTGAATCTTGAGAGTAAATGGAATAGTTATTCGATGGAGGTGGAGGTAAC
GGCGCCTGTTCAGGCATACTAACGTATGGCGCTTGGTATTGACTACCACCAAGTACCATT
CCACCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BT31JQ U 9
AF RS1BT31TF C 1
BS 1 8 RS1BT31TF
BS 9 639 RS1BT31JQ
BS 640 727 RS1BT31TF

RD RS1BT31JQ 631 0 0
GGACAACTGGAAAAGTATTACTAACAAATAATAATCCAAATCACATAATAATTACAGTCT
AGTTCATGAGACACAGGCAGAAGTCCCTTGTGTCGTTGTCGGTTCCGGACCAAATAAGTT
CATTGCGACATCACCCCTCAGCAACACTTTCTCCAACAGCCAATATGTAACATAACAGTA
GCTAAACTCAGTACGTCGCGCATCAATACAGAATATGAGGGCATGTGGAGATAAGTCTCA
ATGCCCTTGTCCAGGCGAAGCATTTGATGGCAGTTGCTGCCGTTGCTGAATCTGTTGAAG
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ATTATTTGCCAGACCGTGATAATTACCTTGCTGATAACCAAGCAAACCAGGGTTCTCAGC
TCCAGGGACCGGTATGTAGTTTCGGTTAAGCATGGGAGCTTCATGCTGATACTGAGCTTG
ATGTGAATCTTGAGAGTAAATGGAATAGTTA

QA 1 631 1 631
DS 

RD RS1BT31TF 727 0 0
TTTTTTTTGGACAACTGGAAAAGTAT*ACTAACAAATAATAATCCAAATCACATAATAAT
TACAGTCTAGTTCATGAGACACAGGCAGAAGTCCCTTGTGTCGTTGTCGGTTCCGGACCA
AATAAGTTCATTGCGACATCACCCCTCAGCAACACTTTCTCCAACAGCCAATATGTAACA
TAACAGTAGCTAAACTCAGTACGTCGCGCATCAATACAGAATATGAGGGCATGTGGAGAT
AAGTCTCAATGCCCTTGTCCAGGCGAAGCATTTGATGGCAGTTGCTGCCGTTGCTGAATC
TGTTGAAGAAGGCTAGCCGCAAGCTGTAGAGTAGACTGATATTGCTGGCTCTTATCAACC
TCACCATCTGATGTACCTGGACCAGCTCCGGTGAGCAAAGTCTGGTGCTGCTGTTGTGCT
TGGTTAGACGCATTGGGTAGTGGTGGCATTGCAGTTTGAGAATGGGAAGGATATTCGTTA
TAAGCTTGATTATTTGCCAGACCGTGATAATTACCTTGCTGATAACCAAGCAAACCAGGG
TTCTCAGCTCCAGGGACCGGTATGTAGTTTCGGTTAAGCATGGGAGCTTCATGCTGATAC
TGAGCTTGATGTGAATCTTGAGAGTAAATGGAATAGTTATTCGATGGAGGTGGAGGTAAC
GGCGCCTGTTCAGGCATACTAACGTATGGCGCTTGGTATTGACTACCACCAAGTACCATT
CCACCAC

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

CO CL8657Contig1 792 2 4 U
GGAAAGGGTCAAGAAGAGAGCTTCTGAAGTGAAGAGAGAGATGGCTTCCATTGTGTCACC
GACCACTAGCTTATACCTCCATAAGCAACGGATAAAGCTTCCCTCCGATGGTCGTCGTCT
TCGTATAACCGCTTCTATACCAGACTCTTCAGATGAAAAACATCCCAAGTTAATTGCTCG
AAGAGAGATGATTCTCAGGAGCAGTGAACTCAATGATCGGAGCCATTTTCCAGCTCAGTG
GGAAGAAACCAGATTATATTGGAGTACAGAAGAACGAGAGATTGGCTCTATGTCCTGCTA
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GGAACTATAATGGTGGAAGGAAGACGCCTGTGAGTAGAGAAGTTGCAATGAAGGAGCTTG
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ATGACTATGTTCATGTCGAGTATGAAAGTCCAATCTTAGGTTTGGTAGATGATGTTGAGT
TCTTGTTCTCTCCTGGGAAGAACTCGACGGTGGAGTATCGGTCTGCATCACGTAAAGGGA
ACTTCGACTTTGATGTGAACAGAAAGCGAATCAAGGCATTGCGACAGGAGCTGGAGAAAA
AGGGATGGGAATCAGAGAACAGCTTCTGATTATGATTCTATTCTTGTTATTCAATTAAGA
TTTTTCAAGACTCGAATGTTATTAAAAACTCTTCAAAAGAACTTCTGTCATAAATAAGAG
AGAGGTTAACAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1ER60TF U 1
AF RS1ER60JQ C 118
BS 1 660 RS1ER60TF
BS 661 661 RS1ER60JQ
BS 662 747 RS1ER60TF
BS 748 792 RS1ER60JQ

RD RS1ER60TF 751 0 0
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GACCACTAGCTTATACCTCCATAAGCAACGGATAAAGCTTCCCTCCGATGGTCGTCGTCT
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CAAACAACTGTATATCTACTTCTGAGAGTGTCAGCGATCGAGTCCACTATGCTCCACCAT
GGAACTATAATGGTGGAAGGAAGACGCCTGTGAGTAGAGAAGTTGCAATGAAGGAGCTTG
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*GGGATGGGAATCAGAGAACAGCTTCTGATTATGATTCTATTCTTGTTATTCAATTAAGA
TTTTTCAAGACTCGAATGTTATTAAAA
CTCT

QA 1 747 1 747
DS 

RD RS1ER60JQ 675 0 0
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TCGAAGAGAGATGATTCTCAGGAGCAGTGAACTCAATGATCGGAGCCATTTTCCAGCTCA
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CATGGAACTATAATGGTGGAAGGAAGACGCCTGTGAGTAGAGAAGTTGCAATGAAGGAGC
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AGTTCTTGTTCTCTCCTGGGAAGAACTCGACGGTGGAGTATCGGTCTGCATCACGTAAAG
GGAACTTCGACTTTGATGTGAACAGAAAGCGAATCAAGGCATTGCGACAGGAGCTGGAGA
AAAAGGGATGGGAATCAGAGAACAGCTTCTGATTATGATTCTATTCTTGTTATTCAATTA
AGATTTTTCAAGACTCGAATGTTATTAAAAACTCTTCAAAAGAACTTCTGTCATAAATAA
GAGAGAGGTTAACAC

QA 1 675 1 675
DS 



AS 1 2

CO CL8658Contig1 1052 2 2 U
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GTAGCTAACATTGCAAAGGCTAATCGGTCTGAACTCCGTCATGTCTCATGGTTTCTTCTT
TTTAGGGATAAGGCAAATATTCGTCTGATTTAACACCATCACCTAGTTGTTTTACCGCAA
AAAAATATCATTATTGGCCTTTTACTTACAATCCAAATCCATCTGTTTGAACAAGTGCAA
AAGAAGAAAAAAACAGATCAAAACGCTCATTTGAATCGCTACACAACACACTCGCAAGAT
GTGGTACTCTACTTGCATAACAATCTTACATAATAATATGTATTTGAGTTTCTGGTTCTG
ATGTTGACAGATACTTATAAATCTACTCTTCTAAGCCTCAGACTGCTAACTTAGTTGCAT
CCACCGGTTTCTCAACTCCTCCACTTGTAGGGCTACATTTGTATAATCACACTGGGTTAG
ATGTCAATCAGAGCTGAAAGATATGGATTTTTTTTTCCTTCCGATATGGAAATCTGGAGA
GAAGACTACTTACAATCCACTCAAGACTTTGATGGCGTCATAAAAGAACCATTGCAAGGT
TATGACAGGCCCCACGATGCTGATTCGAACAGGAAGACTTCTAGTGAAGAGACCAACAAC
CCCAATGTTCCTCACAGCCTGAAATCTCAGCAAGCAGTGAGCAACGTCAATCAACGGTGG
AATGGATTTTCAAAATTGATTTATTAATGATTGGTTCAGAGTCTACTCTACCTGCAACAC
GTTATTGGCTTTGTTGTTGTAGAGAGACGAAACAACCACATCTGCAGGGTTAGAGATGAT
TGTACCAACGGCTCCAGCAGTGTAGCCAGCAAGACATGTGACACCGAGTTGCTGAGCTTT
GGAGCAATCTTGCTTCCTTTTCTGGATGATGTTCTGATATATAAACTCCACCGACTGCTC
AAACGTTGAGAACATCACCATAGAAACTGAAACCAACATAGGAGAGACAATACATACATA
ATCAAAACAAGATATGGTTTTGGCAGAGAGAA


BQ
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AF RS1BM67TF U 1
AF RS1BM67JQ C 508
BS 1 594 RS1BM67TF
BS 595 1052 RS1BM67JQ

RD RS1BM67TF 594 0 0
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GTAGCTAACATTGCAAAGGCTAATCGGTCTGAACTCCGTCATGTCTCATGGTTTCTTCTT
TTTAGGGATAAGGCAAATATTCGTCTGATTTAACACCATCACCTAGTTGTTTTACCGCAA
AAAAATATCATTATTGGCCTTTTACTTACAATCCAAATCCATCTGTTTGAACAAGTGCAA
AAGAAGAAAAAAACAGATCAAAACGCTCATTTGAATCGCTACACAACACACTCGCAAGAT
GTGGTACTCTACTTGCATAACAATCTTACATAATAATATGTATTTGAGTTTCTGGTTCTG
ATGTTGACAGATACTTATAAATCTACTCTTCTAAGCCTCAGACTGCTAACTTAGTTGCAT
CCACCGGTTTCTCAACTCCTCCACTTGTAGGGCTACATTTGTATAATCACACTGGGTTAG
ATGTCAATCAGAGCTGAAAGATATGGATTTTTTTTTCCTTCCGATATGGAAATCTGGAGA
GAAGACTACTTACAATCCACTCAAGACTTTGATGGCGTCATAAAAGAACCATTG

QA 1 594 1 594
DS 

RD RS1BM67JQ 545 0 0
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TTTGATGGCGTCATAAAAGAACCATTGCAAGGTTATGACAGGCCCCACGATGCTGATTCG
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TGATTGGTTCAGAGTCTACTCTACCTGCAACACGTTATTGGCTTTGTTGTTGTAGAGAGA
CGAAACAACCACATCTGCAGGGTTAGAGATGATTGTACCAACGGCTCCAGCAGTGTAGCC
AGCAAGACATGTGACACCGAGTTGCTGAGCTTTGGAGCAATCTTGCTTCCTTTTCTGGAT
GATGTTCTGATATATAAACTCCACCGACTGCTCAAACGTTGAGAACATCACCATAGAAAC
TGAAACCAACATAGGAGAGACAATACATACATAATCAAAACAAGATATGGTTTTGGCAGA
GAGAA

QA 1 545 1 545
DS 



AS 1 2

CO CL8659Contig1 626 2 1 U
TCATCAACTCAGCGGCTCCTATCTTCTGTCTTCTCTGGTTAAGGAACTTGAAAAGAAAAG
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AGTGAGGATGCCAACCAAAGTTCTCAAGATTACCACAAGGAAAGCTCCTTGTGGTGAAGG
AACCAACACATGGGACATATTTGAGCTCCGTGTGCACAAGCGTGTGATCGATCTGTTCAG
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GGTCACCATTGCTGATTCTTAGATTCATGCTTTTTTTTAATCTACAAAACCTGTCTTTGA
ATTCCAGCGACTTCTCAGCTTTTTGTTTGTTTCAGACTTTTGTTTTGTTCCTATATATGT
TATCCTTTTGAGTTTGTTTTTGTTGAACATCTTATTCTGTTTTGCTAAATCCTTGGGCCT
TAATATTATTTAGACATTTGAATTAT


BQ
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AF RS1BF05JQ C 1
AF RS1BF05TF U 1
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DS 

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TAGAAGATAGCTATGGCATACGCACCACCAATGAAGCAAGGAAAGGCAGGATTTGAGGAG
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AGTGAGGATGCCAACCAAAGTTCTCAAGATTACCACAAGGAAAGCTCCTTGTGGTGAAGG
AACCAACACATGGGACATATTTGAGCTCCGTGTGCACAAGCGTGTGATCGATCTGTTCAG
CTCTCCTGATGTGGTGAAGCAGATCACTTCCATCACCATTGAGCCTGGTGTTGAGGTCGA
GGTCACCATTGCTGATTCTTAGATTCATGCTTTTTTTTAATCTACAAAACCTGTCTTTGA
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TATCCTTTTGAGTTTGTTTTTGTTGAACATCTTATTCTGTTTTGCTAAATCCTTGGGCCT
TAATATTATTTAGACATTTGAATTAT

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 2

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TTAAAATTATGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AQ18TFB U 1
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BS 1 674 RS1AQ18TFB

RD RS1AQ18TFB 674 0 0
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QA 1 674 1 674
DS 

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GTAAGATCAATGGATATTAAAATTATGAGC

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 2

CO CL8661Contig1 799 2 3 U
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TATAGCACATGGTTATAGTATAGACTCCATTCAATTTGAGTATGACAAGAATGGTAGCTC
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AAATCTATGTATCCGGTCGGTTAGCTTTGAGAGTAACCGCAAAAAATATGGACCATTTGG
TGTTGAGTCAGGTACATACTTCACTATGCCAAAATCAGACTCAAAGATTGTTGGGTTCTA
CGGGAAGGCTGGTTGGTATTTGGATGCTATTGGTGTTTACCTTCAACCAATCCCTAAAGA
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BQ
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AF RS1DX13TF U 1
AF RS1D717TF U 1
BS 1 35 RS1D717TF
BS 36 36 RS1DX13TF
BS 37 799 RS1D717TF

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TTGAGATCATCTTAGTCTGAGAATGAGTGTTCAAGGAAAGCCCGCTTCAGTTGGCCCATG
GGGAGGCCAAAGTGGTCATGCATGGGATGATGGAACGTTCACCACCGTAAGGCAAATAGT
TATAGCACATGGTTATAGTATAGACTCCATTCAATTTGAGTATGACAAGAATGGTAGCTC
GGTTTGGTGTGAAAAACGTGGAGGAAAAGGAGGCATTAAGTTTGATAAGGTCATACTTGA
TTACCCACATGAGTATCTGACTTCAGTCAAGGGAACCTATAGTGCATTTGATGTCTGGGG
AAATCTATGTATCCGGTCGGTTAGCTTTGAGAGTAACCGCAAAAAATATGGACCATTTGG
TGTTGAGTCAGGTACATACTTCACTATGCCAAAATCAGACTCAAAGATTGTTGGGTTCTA
CGGGAAGGCTGGTTGGTATTTGGATGCTATTGGTGTTTACCTTCAACCAATCCCTAAAGA
GACTAATCCCACGTCGAAAATTGTTTTGCTCCCACCTCAAAATGTCCCCCAAGGTGATAA
GAAACTCGAGCACTCAGTGATTCATGGAAATGCA*GTGCTGAGATCACAAA

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1D717TF 799 0 0
GGGTCGCAGTAGTCAGCTATCTCTTCACTTCACGAGCTTCTTACACTTGCTTTGAGTCTT
TTGAGATCATCTTAGTCTAAGAATGAGTGTTCAAGGAAAGCCCGCTTCAGTTGGCCCATG
GGGAGGCCAAAGTGGTCATGCATGGAATGATGGAACGTTCACCACCATAAGGCAAATAGT
TATAGCACATGGTTATAGTATAGACTCCATTCAATTTGAGTATGACAAGAATGGTAGCTC
GGTTTGGTGTGAAAAACGTGGAGGAAAAGGAGGCATTAAGTTTGATAAGGTCATACTTGA
TTACCCACATGAGTATCTGACTTCAGTCAAGGGAACCTATAGTGCATTTGATGTCTGGGG
AAATCTATGTATCCGGTCGGTTAGCTTTGAGAGTAACCGCAAAAAATATGGACCATTTGG
TGTTGAGTCAGGTACATACTTCACTATGCCAAAATCAGACTCAAAGATTGTTGGGTTCTA
CGGGAAGGCTGGTTGGTATTTGGATGCTATTGGTGTTTACCTTCAACCAATCCCTAAAGA
GACTAATCCCACGTCGAAAATTGTTTTGCTCCCACCTCAAAATGTCCCCCAAGGTGATAA
GAAACTCGAGCACTCAGTGATTCATGGAAATGCACGTGCTGAGATCACAAAACATAAGTT
GGTGACAGATACTGAGAAGTTGCAGCCAAAGCTGGAGTGGTGTGAAAATACATGGACCAT
GGGGTGGTATCGGTGGTATCATGTTTGACGATGGGATATATACCGGTGTTCGACAGATCA
TTTGTCACGCAGTGTTGGG

QA 1 799 1 799
DS 



AS 1 2

CO CL8662Contig1 655 2 1 U
GGGAACATAACATATCATAACTCAGAAAGAAAAGTTTAAGAGAGAAGAAGAAGATGTCGT
GGCAAACTTACGTTGATGAACATTTGATGTGTGATGTCGGAGATGGTCAGGGTCATCACC
TAGCCGCAGCCGCAATCCTCGGTCATGACGGTAGTGTTTGGGCTCAGAGCGCCAACTTCC
CTCAGTTCAAGGGAGAAGAGTTCGCCAACATAATGAAAGATTTTGATGAACCGGGCCACT
TAGCACCCACAGGGTTATTTCTAGCAGGAGCCAAATACATGGTGATCCAAGGTGAGCCTG
GCGCTGTGATCCGTGGCAAGAAGGGAGCAGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACAGT
CGTGTGTGTTTGGGCTCTACGAAGAGCCTGTGACACCAGGACAGTGCAACATGGTCGTCG
AGAGGTTGGGTGATTACCTCATCGAACAGGATCTCTAGATCCTCACATTCTCAAAACCTA
TTAGAATGTTTCACCTTCCACATTTTTATTTATAAACTTATATTTGGTATTGGGTTTGTG
AAGCCTGATTGAGAGACTGATTTTTGAGAAATTTTTGTGTGTTTCCTCTTTTTTGTTTTC
TTTGGTTTGCTTCATGTTTTGTCAACCATGTTTAATTAATTTGACACTTTTGGTT


BQ
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AF RS1AT50TF U 1
AF RS1AT50JQ C 22
BS 1 655 RS1AT50TF

RD RS1AT50TF 655 0 0
GGGAACATAACATATCATAACTCAGAAAGAAAAGTTTAAGAGAGAAGAAGAAGATGTCGT
GGCAAACTTACGTTGATGAACATTTGATGTGTGATGTCGGAGATGGTCAGGGTCATCACC
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CTCAGTTCAAGGGAGAAGAGTTCGCCAACATAATGAAAGATTTTGATGAACCGGGCCACT
TAGCACCCACAGGGTTATTTCTAGCAGGAGCCAAATACATGGTGATCCAAGGTGAGCCTG
GCGCTGTGATCCGTGGCAAGAAGGGAGCAGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACAGT
CGTGTGTGTTTGGGCTCTACGAAGAGCCTGTGACACCAGGACAGTGCAACATGGTCGTCG
AGAGGTTGGGTGATTACCTCATCGAACAGGATCTCTAGATCCTCACATTCTCAAAACCTA
TTAGAATGTTTCACCTTCCACATTTTTATTTATAAACTTATATTTGGTATTGGGTTTGTG
AAGCCTGATTGAGAGACTGATTTTTGAGAAATTTTTGTGTGTTTCCTCTTTTTTGTTTTC
TTTGGTTTGCTTCATGTTTTGTCAACCATGTTTAATTAATTTGACACTTTTGGTT

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1AT50JQ 634 0 0
TCAGAAAGAAAAGTTTAAGAGAGAAGAAGAAGATGTCGTGGCAAACTTACGTTGATGAAC
ATTTGATGTGTGATGTCGGAGATGGTCAGGGTCATCACCTAGCCGCAGCCGCAATCCTCG
GTCATGACGGTAGTGTTTGGGCTCAGAGCGCCAACTTCCCTCAGTTCAAGGGAGAAGAGT
TCGCCAACATAATGAAAGATTTTGATGAACCGGGCCACTTAGCACCCACAGGGTTATTTT
TAGCAGGAGCCAAATACATGGTGATCCAAGGTGAGCCTGGCGCTGTGATCCGTGGCAAGA
AGGGAGCAGGAGGCATAACCATAAAGAAAACAGGACAGTCGTGTGTGTTTGGGCTTTACG
AAGAGCCTGTGACACCAGGACAGTGCAACATGGTCGTCGAGAGGTTGGGTGATTACCTCA
TCGAACAGGATCTCTAGATCCTCACATTCTCAAAACCTATTAGAATGTTTCACCTTCCAC
ATTTTTATTTATAAACTTATATTTGGTATTGGGTTTGTGAAGCCTGATTGAGAGACTGAT
TTTTGAGAAATTTTTGTGTGTTTCCTCTTTTTTGTTTTCTTTGGTTTGCTTCATGTTTTG
TCAACCATGTTTAATTAATTTGACACTTTTGGTT

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 2

CO CL8663Contig1 1139 2 4 U
GGAGAGTGAATATTACGACGTCTTAGGTGTCAAGACTGATGCCTCAGCTGCTGACATTAA
GAAAGCTTATTATATCAAAGCAAGGCAAGTTCATCCAGACAAGAACCCTAATGATCCTCA
AGCTGCTAAAAACTTTCAGACACTAGGTGAAGCTTACCAGGTTCTTAGCGATCCCGAGAA
GCGAACTGCTTATGATAAATTTGGCAAAGACGGCGTTCAACAGGATGCAATGGTTGATCC
TGCAGCTGTGTTTGGAATGCTCTTTGGCAGCGAGTTGTTTGAGGACTATATTGGCCAACT
TGCTCTCGCTTCCATTGCATCGCTCGACGCTGAAGTAGAATCCCATGAGCCTGAGATTAG
GAAAAAGTTGCTCCAAGACAAGATCAAAGCGATGCAAAAGGAAAGGGAAGACAAGCTTGT
CACTACACTGAAGAACAAACTCGAACCATTCGTGGAAGGACGAACCGATGATTTTGTGAA
TTGGGCTACCGCTGAGGCAAGGCGACTCTCAACTGCTGGTTTTGGGGAAGCAATGCTGCA
CACTGTGGGCTACATTTACACTAGAAAAACTGCGAAAGAACTCGGGAAGGACAAACGTCT
CATGAAAGTACCCTTCTTAGCTGAATGGGCGCGTGACAAAGGCCACCTCATCAAATCTCA
AGTCATGGCTGCTTCTGGTGCGGTTTCGTTACTTGTGTTGCAGGACGAAGTGAGCAAGCT
GAACCAGGGAGAGAACAAAGAGGAGCACATTCAGAAGGCGATTGAAGCTAAAAAAGATGC
AATGCTTCAGTCCCTTTGGCAAATCAACTTGCTTGACATCGAATCAACCTTATCTCGTGT
CTGCCAAGCGGTGCTTAAAGATCCGAGTGTTTCAAAAGATGTTCTTCGAACTAGAGCAAG
AGGGTTGAGGAAGCTCGGAAACATTTTCCAGGGTTCTAAGAAACCATACTCTAGGGAAAA
TAGCTTGCGCCACGAAAATTCCGCCGTGAAACTTGACGCCGGAGATTCCTCGAAACCGGC
GAGTTAAAAGAAGAAAACCGAAGTGATGGTTTCGTCTTTAAATTCCATTCCCTTTCTTTA
TTGAATCTGTTTACCTTCTTCCGTGTTGGGTTTCACAAAACTCTGGGTCGCGTGTTCTG


BQ
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AF RS1DP87TF U 1
AF RS1ET61TF U 447
BS 1 629 RS1DP87TF
BS 630 630 RS1ET61TF
BS 631 637 RS1DP87TF
BS 638 1139 RS1ET61TF

RD RS1DP87TF 637 0 0
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GCGAACTGCTTATGATAAATTTGGCAAAGACGGCGTTCAACAGGATGCAATGGTTGATCC
TGCAGCTGTGTTTGGAATGCTCTTTGGCAGCGAGTTGTTTGAGGACTATATTGGCCAACT
TGCTCTCGCTTCCATTGCATCGCTCGACGCTGAAGTAGAATCCCATGAGCCTGAGATTAG
GAAAAAGTTGCTCCAAGACAAGATCAAAGCGATGCAAAAGGAAAGGGAAGACAAGCTTGT
CACTACACTGAAGAACAAACTCGAACCATTCGTGGAAGGACGAACCGATGATTTTGTGAA
TTGGGCTACCGCTGAGGCAAGGCGACTCTCAACTGCTGGTTTTGGGGAAGCAATGCTGCA
CACTGTGGGCTACATTTACACTAGAAAAACTGCGAAAGAACTCGGGAAGGACAAACGTCT
CATGAAAGTACCCTTCTTAGCTGAATGGGTGCGTGAC

QA 1 637 1 637
DS 

RD RS1ET61TF 693 0 0
G
ATTCGTGGAAGGACGAACCGATGATTTTGTGAATTGGGCTACCGCTGAGGCAAGGCGACT
CTCAACTGCTGGTTTTGGGGAAGCAATGCTGCACACTGTGGGCTACATTTACACTAGAAA
AGCTGCGAAAGAACTCGGGAAGGACAAACGTCTCATGAAAGTACCCTTCTTAGCTGAATG
GGCGCGTGACAAAGGCCACCTCATCAAATCTCAAGTCATGGCTGCTTCTGGTGCGGTTTC
GTTACTTGTGTTGCAGGACGAAGTGAGCAAGCTGAACCAGGGAGAGAACAAAGAGGAGCA
CATTCAGAAGGCGATTGAAGCTAAAAAAGATGCAATGCTTCAGTCCCTTTGGCAAATCAA
CTTGCTTGACATCGAATCAACCTTATCTCGTGTCTGCCAAGCGGTGCTTAAAGATCCGAG
TGTTTCAAAAGATGTTCTTCGAACTAGAGCAAGAGGGTTGAGGAAGCTCGGAAACATTTT
CCAGGGTTCTAAGAAACCATACTCTAGGGAAAATAGCTTGCGCCACGAAAATTCCGCCGT
GAAACTTGACGCCGGAGATTCCTCGAAACCGGCGAGTTAAAAGAAGAAAACCGAAGTGAT
GGTTTCGTCTTTAAATTCCATTCCCTTTCTTTATTGAATCTGTTTACCTTCTTCCGTGTT
GGGTTTCACAAAACTCTGGGTCGCGTGTTCTG

QA 2 693 2 693
DS 



AS 1 2

CO CL8664Contig1 1303 2 2 U
GGAGATTCCAACTTTCTTTCTGTATCGGAGAAGATGACAGACAACGGAGATGAGGCCAGG
GTTCCTCCAAGCGATTCGGCTACAGCGAACGATGATGCTTCTCGAACGAGGCCAAGGAGA
AAGAGAAAGTGGGATCAGCCAGCGGAGCAGCTTGTTGCAGCTGGACTTGTGCTTCCTCCT
TTATTACCCAATGCTTTCAATGTTGTTCCTCATCCACTTCCTAAACTTATTCAAGATGAG
CTGACCATAGCTAGAGAAATCGTTATCAACGATGCTGAGCCTTCTCTTCGGCACAAGCTT
ACTAAACGCTCTACTCAAGAAGAAATTCAGAGGTCTACTGGTGCTGTGGTGATTACTAGG
GGCAAGTATCGTCCTCCAATTGCACTTCCTGATGGCGAAAAGCCGTTATATCTTCACATT
TCTGCTGCTGCCCATCTAAAAGAGACTACAGAGCGAGTTTTAGCAGTTGATCGTGCAGCA
GCTATGATTGAGGAGATGATGAAACAGAAAACAAACTCACAGGTCGGGTTGGTTGGTTCT
CAGACGGTCAAGATGCTGAACACATGCGTTTATTTGGGTTTTGAAGCTGACCCATCATCT
AATGTTGCTGCTCGTATTCGTGGTCCTAATGATCAGTATATAAATCACATTATGAATGAA
ACAGGGGCAACCGTCGTACTAAGAGGGCGTGGTTCAGGGAGCCTTGAGAACCAACATGGT
GAAGAAGCACAGCAACCATTGCATCTGTTATTGTCTAGTAGCAATCCGAAGAGCATTGAC
GATGCAAAATGTTTAGCTGAGAATCTTATGGATACAATCAGTGTAGAATTCGGGGCTTCA
AGGGTTTCCTCAAGCAAGGTGTATGGTGCTGTACCACCACCACAGCAACTGCTTGCTGGA
GCTCCGAATCCTGAAAACGCGCAAAAGCCAAATCCTATCATACCAACGCCAAATGCTGTT
TATCAGTTTCCCCTTCCTCCAGCAACAACTGTTTACCCTCAGTTTCCAGTGTTGCAGCAG
CCTTCAGGGATCTCAAATAGTGGCCATTTGCGACCAAGTCCAGTCAGTTACTTACAACCT
GTGGCTGGAGGAACTAGCTATAGTGGGTATGCAGGAATATACCCTCAAGCCACTCCACTG
CAACAAGTTGCTCAAGTCCTTAAGCAATCTGTTTCTCCTGTTATCTCCACCGTGCCTCCT
ACTTTGTTGACAGCTGCGTCCTTATCAAAGCCAAGTGATATAAAGTTTTAAGACATTAAC
TACACTTGTCTTGCAAGCTATTACTATGCCTGACCTTTTTGTT


BQ
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AF RS1DA88TF U 1
AF RS1DA88JQ C 584
BS 1 663 RS1DA88TF
BS 664 1303 RS1DA88JQ

RD RS1DA88TF 666 0 0
GGAGATTCCAACTTTCTTTCTGTATCGGAGAAGATGACAGACAACGGAGATGAGGCCAGG
GTTCCTCCAAGCGATTCGGCTACAGCGAACGATGATGCTTCTCGAACGAGGCCAAGGAGA
AAGAGAAAGTGGGATCAGCCAGCGGAGCAGCTTGTTGCAGCTGGACTTGTGCTTCCTCCT
TTATTACCCAATGCTTTCAATGTTGTTCCTCATCCACTTCCTAAACTTATTCAAGATGAG
CTGACCATAGCTAGAGAAATCGTTATCAACGATGCTGAGCCTTCTCTTCGGCACAAGCTT
ACTAAACGCTCTACTCAAGAAGAAATTCAGAGGTCTACTGGTGCTGTGGTGATTACTAGG
GGCAAGTATCGTCCTCCAATTGCACTTCCTGATGGCGAAAAGCCGTTATATCTTCACATT
TCTGCTGCTGCCCATCTAAAAGAGACTACAGAGCGAGTTTTAGCAGTTGATCGTGCAGCA
GCTATGATTGAGGAGATGATGAAACAGAAAACAAACTCACAGGTCGGGTTGGTTGGTTCT
CAGACGGTCAAGATGCTGAACACATGCGTTTATTTGGGTTTTGAAGCTGACCCATCATCT
AATGTTGCTGCTCGTATTCGTGGTCCTAATGATCAGTATATAAATCACATTATGAATGAA
ACA
CGG

QA 1 663 1 663
DS 

RD RS1DA88JQ 720 0 0
AAGCTGACCCATCATCTAATGTTGCTGCTCGTATTCGTGGTC*TAATGATCAGTATATAA
ATCACATTATGAATGAAACAGGGGCAACCGTCGTACTAAGAGGGCGTGGTTCAGGGAGCC
TTGAGAACCAACATGGTGAAGAAGCACAGCAACCATTGCATCTGTTATTGTCTAGTAGCA
ATCCGAAGAGCATTGACGATGCAAAATGTTTAGCTGAGAATCTTATGGATACAATCAGTG
TAGAATTCGGGGCTTCAAGGGTTTCCTCAAGCAAGGTGTATGGTGCTGTACCACCACCAC
AGCAACTGCTTGCTGGAGCTCCGAATCCTGAAAACGCGCAAAAGCCAAATCCTATCATAC
CAACGCCAAATGCTGTTTATCAGTTTCCCCTTCCTCCAGCAACAACTGTTTACCCTCAGT
TTCCAGTGTTGCAGCAGCCTTCAGGGATCTCAAATAGTGGCCATTTGCGACCAAGTCCAG
TCAGTTACTTACAACCTGTGGCTGGAGGAACTAGCTATAGTGGGTATGCAGGAATATACC
CTCAAGCCACTCCACTGCAACAAGTTGCTCAAGTCCTTAAGCAATCTGTTTCTCCTGTTA
TCTCCACCGTGCCTCCTACTTTGTTGACAGCTGCGTCCTTATCAAAGCCAAGTGATATAA
AGTTTTAAGACATTAACTACACTTGTCTTGCAAGCTATTACTATGCCTGACCTTTTTGTT

QA 1 720 1 720
DS 



AS 1 2

CO CL8665Contig1 810 2 1 U
GCAGTGTATTGAAGATGACTTTACCGCTTGGCGAGAAGCATTGTGGCCAGAGTTAGATAC
AATACTGAGGGAAGAAGGTGACACAGCTGTTACACCATACACTGCAGCTGTTTTAGAGTA
CAGAGTTTCTATCCACAAATCTGGAGACGCATTGAATGAGAAAAACTTGGCCAATGGGAA
TGGCCATGTTGTGTTTGATGCTCAGCATCCTTACAGGGCAAATGTTGCTGTGAGAAGAGA
GCTTCACACTCCAGAGTCTGACCGTTCCTGCACTCATCTTGAATTTGATATTGCCGGAAG
TGGACTAACATATGAAACTGGAGATCATGTTGGTGTACTGAGTGATAATTTGAAGGAAAC
TGTAGAGGAAGCGCTTAGGTTGCTGGATATGTCACCTGATACTTATTTCTCCCTTCACTC
TGATAAAGAAGATGGCACACCGATCAGCAGCTCGCTTCCTCCTACATTCCCACCTTGCAG
CTTGAGAACAGCGCTTACACGATATGCATGTCTTTTGAGTTCTCCTAAGAAGTCCGCTTT
ACTTGCTTTGGCTGCTCATGCATCTGATCCTACCGAAGCAGAGCGATTAAAACACCTTGC
TTCACCCGCTGGAAAGGATGAGTATTCAAAGTGGGTAGTAGAGAGTCAAAGAAGTCTACT
CGAGGTGATGGCAGAGTTTCCTTCAGCCAAGCCGCCACTTGGTGTCTTCTTTGCTGCTGT
CGCTCCAAGGTGCAGCCTAGTTCTACTCATATCATCATCTCCCAGATTGCTGAAACTAGA
ATCATGTACATGTGCACTTGTCTATGAGAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FI96TF U 1
AF RS1ER33TF U 1
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DS 



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TGC


BQ
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10 10 10 

AF RS1EZ55TF U 1
AF RS1FH17TF U 1
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BS 391 656 RS1EZ55TF
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RD RS1EZ55TF 656 0 0
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TGC

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DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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AF RS1F310JQ C 1
AF RS1F310TF U 1
BS 1 416 RS1F310TF

RD RS1F310JQ 416 0 0
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GAGACTCATGGAAGAAGCTTCCAAGTTCAAATCAATAACTTGGTCTGATCCATAAGAGAG
TTTGCGATCTTGATTTGAAACTTCGAAGATACGTTCAAACCAAGCTTCAAATAGACTTAC
CTTTTGTACCAAGACCCTCTTTTTTTATAAAGCAATACTTTGCATTTGTGTTACAG

QA 1 416 1 416
DS 

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CCGAACGTTTCGCTATTTCCTCTGATATGAAAGAGAAATTCGGAGCTCTGGAATCTAGGG
TTTCAGGTCTGGAGTCTAGCTCCGGTCACGACAACCCGAGTCCAGCTCAGGTTGAGAGTT
GAGACTCATGGAAGAAGCTTCCAAGTTCAAATCAATAACTTGGTCTGATCCATAAGAGAG
TTTGCGATCTTGATTTGAAACTTCGAAGATACGTTCAAACCAAGCTTCAAATAGACTTAC
CTTTTGTACCAAGACCCTCTTTTTTTATAAAGCAATACTTTGCATTTGTGTTACAG

QA 1 416 1 416
DS 



AS 1 2

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CAAACCCATTAGATGATGTATAATGATCTTAGCATAGATAGATCCTTAAGTCAGACACTT
AAAAACCTTAACCATATTAGAAGGTGTCATATTTTCATCAAATTCATTTGTATTTTATTA
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TACCTATCACCTTGGTATAATACCCAAACCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1E564JQ C 1
AF RS1E564TF U 1
BS 1 631 RS1E564TF

RD RS1E564JQ 631 0 0
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TACCTATCACCTTGGTATAATACCCAAACCG

QA 1 631 1 631
DS 

RD RS1E564TF 631 0 0
GAAAACATATTATTTATTCCAAACAAAACCACCGAATTATTAGGCTATAAAATGATTTAG
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CCATAGATCTCTTCGACATCTGCTTAGTTATACATTCAACAAATCGAACAGTAAACAAGC
TACCTATCACCTTGGTATAATACCCAAACCG

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 2

CO CL8670Contig1 849 2 8 U
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ATGGTCCAAGAATGTGTATTGATGATGGACGTGTTGTCAGCAACTTCGTTGCGCAGGCAC
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AGGGACTCCCTCTCATGGTCAAAGACTTCCGTCAACGTGTATTTGGTGACCAGAAGGAAG
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GCGGTTGTTTAAAGGTTTATATCCAAAAAGACAAAGGCGTTGCTTGCAGCTACAACGTTG
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TATTATATTCTGTGTAACTTAGAGTAAGAGTTTGGTACCATCACTACTTATTCATGGACC
TCACTACAGTTTAAGAAAACACTTTTGTCTTTCGCAATTACAAAGTTTAGTAGCAACTAC
TTAGAGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DP18TF U 1
AF RS1DP18JQ C 123
BS 1 683 RS1DP18TF
BS 684 684 RS1DP18JQ
BS 685 689 RS1DP18TF
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RD RS1DP18TF 766 0 0
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CCATGGACTATCACCGTGGAGCCAACGTTGAGTTCAGGATTGCTAGGATCTTCAACACCT
ATGGTCCAAGAATGTGTATTGATGATGGACGTGTTGTCAGCAACTTCGTTGCGCAGGCAC
TAAGGAAAGAACCTTTGACTGTTTATGGTGATGGGAAGCAGACGAGAAGTTTCCAGTTTG
TTTCTGACCTGGTCGAAGGTCTGATGAGGTTGATGGAAGGAGAACATGTCGGGCCATTTA
ACCTCGGTAACCCTGGTGAATTCACCATGCTCGAGCTAGCTAAGGTGGTGCAAGAGACTA
TTGATCCAAACGCAAACATAGAGTTCAGACCAAACACAGAAGATGACCCTCACAAGAGAA
AGCCTGACATCACAAAGGCCAAGGAGCTTCTTGGTTGGGAACCAAAGGTGTCTCTTCGTC
AGGGACTCCCTCTCATGGTCAAAGACTTCCGTCAACGTGTATTTGGTGACCAGAAGGAAG
GCTCCTCCATGGCTACAACTACCTCAGCTTGAGCAAACGCAGATGCAAGTAGCAGCCATT
GCGGTTGTTTAAAGGTTTATATCCAAAAAGACAAAGGCGTTGCTTGCAGCTACAACGTTG
AGAGGAGAGAGCTTCGTTTTTTT*CTAAA*TTTATTTTGTTTTTGGTTTTTCTATTATGA
TATTATATTCTGTGTA*CTTAGAGTAAGAGTTTGGTAC
ATCACTAC

QA 1 758 1 758
DS 

RD RS1DP18JQ 727 0 0
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TCTGACCTGGTCGAAGGTCTGATGAGGTTGATGGAAGGAGAACATGTCGGGCCATTTAAC
CTCGGTAACCCTGGTGAATTCACCATGCTCGAGCTAGCTAAGGTGGTGCAAGAGACTATT
GATCCAAACGCAAACATAGAGTTCAGACCAAACACAGAAGATGACCCTCACAAGAGAAAG
CCTGACATCACAAAGGCCAAGGAGCTTCTTGGTTGGGAACCAAAGGTGTCTCTTCGTCAG
GGACTCCCTCTCATGGTCAAAGACTTCCGTCAACGTGTATTTGGTGACCAGAAGGAAGGC
TCCTCCATGGCTACAACTACCTCAGCTTGAGCAAACGCAGATGCAAGTAGCAGCCATTGC
GGTTGTTTAAAGGTTTATATCCAAAAAGACAAAGGCGTTGCTTGCAGCTACAACGTTGAG
AGGAGAGAGCTTCGTTTTTTTTCTAAAATTTATTTTGTTTTTGGTTTTTCTATTATGATA
TTATATTCTGTGTAACTTAGAGTAAGAGTTTGGTACCATCACTACTTATTCATGGACCTC
ACTACAGTTTAAGAAAACACTTTTGTCTTTCGCAATTACAAAGTTTAGTAGCAACTACTT
AGAGTCG

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

CO CL8671Contig1 735 2 2 U
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GTGGGCGAGATTTGTTTGGAATCAGGCTATTATTCCCAAATTCAAGATTACTTCCTGGTT
GTTTTTGCTTAATCGCAATCCAACTATGGATCGTTTGATCTCTTGGGGTCTGGATTTGGA
GAATTGTTGTCTTCTTTGTGGAACTGCTCCAGAATCTAGAGACCATTTGTTTTTTCTATG
TCCTTACTCCACTCTGGTTTGGAAAACAGTTACTGGAGCGCTTGGTATCACCACCCCTCC
TCTTCGGTGGGATTCGGTTCTTCAATGGTTCGATGTAGTTACAACCAATCCCGATCGGTT
GATTGCTATACTTCAAATATGGCACGGAACCATATATGCGTTATGGCAAGAGCGTAATGC
ACGGTATCATGATGGTCTTACTAAAGCTCATTGGATGTTATCTCGAGAAGTCATCAAACA
AGCAAAGGACAAATCTACAGCTATGTGTAACTGTGGATCAGAACTTGGCTTGAGATTGGT
GACTTTCTGGCCTGCGATTTAAGAAATGCAGCAAGGCTATTGCTGTGCTCATTCAATTCA
CTTCCGTGGTGTCCAAAGCCATTGTGACCTTCTTCTTTTTCTTCTGTTTAAATTCCCTTG
CATCTCTGTTTTAGTTTGCTGTTTGTTTCCCCCATTGTAAACTCTGTTTTAATTATTTCA
ATATGAAGGCCAGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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BQ
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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1A637TF U 1
AF RS1A637JQ C 51
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DS 

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ACTCTGTTCTTTTTATCTTTCTTGATTAAATGTTCAATCAAAACAAAACTCTAAACT

QA 1 837 1 837
DS 



AS 1 2

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BQ
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AY73TF U 1
AF RS1AY73JQ C 2
BS 1 637 RS1AY73TF
BS 638 780 RS1AY73JQ

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CATGTAGTAGCACTAACAACAATAACTGTGATGATGA

QA 1 637 1 637
DS 

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GAAGAAGGAAATAAGAGACACTGTTCAATCCGTTTACGCTACATTATCAAACCCTGGAGG
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TGTTATTTGCGTAAGAAAGATAAATAGCACCAAAACTCAAATCTTGTAAGAACAACCAA

QA 1 779 1 779
DS 



AS 1 2

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BL29JQ C 1
AF RS1BL29TF U 1
BS 1 627 RS1BL29TF

RD RS1BL29JQ 627 0 0
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GCTGCCAAATCTGCTTGATAAACCCTAGCAGCCATTCTATTTCTCTGTTGATGTTACTCT
CTGTTGCTGGAAACCATATGCTATTTTGTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTGTTGGTGTAA
AAACTTTGTTCATTAAGCAGTTTACAT

QA 1 627 1 627
DS 

RD RS1BL29TF 627 0 0
GATCCTCAAAACTCGCGAGTGAACTCTCATCTTCTTCTTTCGCCCATAGCTACAATGCTT
AGCCTCTCAATTGCCTCGCCGGGGACGGCGGTGACTTTCCTCCGAGGAAACACTTCGACC
TCTTCTTCGTTCCACGGCGTCAGAATCTCGCACAAAGCTTCGGCTCGCGTGCCCGCGGCG
GCGATTTCTTCGTACGGGAAACCTTCGGTGGTGATGATGTCGAAAAGAGAGGCGGAGTTG
AAAGATATCAGGGCGAAGACGACGGAGGAGCTGAACGAGTTCAAATCGAGCGAGTTTCGC
CGTATGAAGAAACAAGTAGCTCGGATATTGACGGTGAGAAGAGAGAGGGAGATAGAAGAA
GGGATAGGGAAGAGGTTGTCGAGGAAACTTGACAGGCAATGGAAGAAAAGCATTGTTGTC
AGACCACCTCCTTCTCTCAAGAAGCTTCAAGAGGAAGAAGCTGCTGAAGAGGCTGCTGAA
GCTGCCAAATCTGCTTGATAAACCCTAGCAGCCATTCTATTTCTCTGTTGATGTTACTCT
CTGTTGCTGGAAACCATATGCTATTTTGTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTGTTGGTGTAA
AAACTTTGTTCATTAAGCAGTTTACAT

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL8676Contig1 673 2 2 U
GGTTCCATGTGATGAGGAAGCCAGCTTAACACTTGCTGGTAGCTCTTCCGTGGCAGAGGA
TGATTATAAAGCAACAGAGTTGAAAATAAAATCGTTTTTGGATGAAAAGGCTCAAGATTT
GAAAAGGCTGCATACTCCACTGCTTGAGGAATTCCACAACGCTATGAATCCAGGAATACC
ACAAGGTGCACTTGGAGACACCACCAACAACTACAAATTACCAAACCTACCAACTATAAG
CAAGTCACCTAAACGACTTCCGAGCAGACGTCTCTCAGCTATCAGTGACGCAATGCCCAG
CCCATTCAAAAGCTCAAAACGTACACTGAACACAAGCAGGGCGATGCAGCCAGGAACCGA
GTCAACTCAAGTCAACGAGTCGTCCAAGAAGGCAGTAACTAATAGCCGTTGTTTTTCAGA
GATACGAAGGGAGTGGGAAGAAGAACTCTATGAAGAGCTTGAAAGGCATCGAGAGAATCT
AAGACATGGTGGTGCAGGAGGGAAGTCTCCATTATCAGCTCATAAAGGACAGAGAGAACG
AACGGTTAAGAGAAATCATTGTATGTTTCTCTTTTTTGGTTAATCCCAAATTACTCTGTT
CTTTTTGGTGGGGGGGTTTTGTCACTATTATGATATTTGATCTATATATGTGTAGTTACT
TCTTAAATGGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GK82TF U 1
AF RS1GK82JQ C 95
BS 1 654 RS1GK82TF
BS 655 673 RS1GK82JQ

RD RS1GK82TF 654 0 0
GGTTCCATGTGATGAGGAAGCCAGCTTAACACTTGCTGGTAGCTCTTCCGTGGCAGAGGA
TGATTATAAAGCAACAGAGTTGAAAATAAAATCGTTTTTGGATGAAAAGGCTCAAGATTT
GAAAAGGCTGCATACTCCACTGCTTGAGGAATTCCACAACGCTATGAATCCAGGAATACC
ACAAGGTGCACTTGGAGACACCACCAACAACTACAAATTACCAAACCTACCAACTATAAG
CAAGTCACCTAAACGACTTCCGAGCAGACGTCTCTCAGCTATCAGTGACGCAATGCCCAG
CCCATTCAAAAGCTCAAAACGTACACTGAACACAAGCAGGGCGATGCAGCCAGGAACCGA
GTCAACTCAAGTCAACGAGTCGTCCAAGAAGGCAGTAACTAATAGCCGTTGTTTTTCAGA
GATACGAAGGGAGTGGGAAGAAGAACTCTATGAAGAGCTTGAAAGGCATCGAGAGAATCT
AAGACATGGTGGTGCAGGAGGGAAGTCTCCATTATCAGCTCATAAAGGACAGAGAGAACG
AACGGTTAAGAGAAATCATTGTATGTTTCTCTTTTTTGGTTAATCCCAAATTACTCTGTT
CTTTTTGGTGGGGGGGTTTTGTCACTATTATGATATTTGATCTATATATGTGTA

QA 1 654 1 654
DS 

RD RS1GK82JQ 579 0 0
TTTTTGGATGAAAAGGCTCAAGATTTGAAAAGGCTGCATACTCCACTGCTTGAGGAATTC
CACAACGCTATGAATCCAGGAATACCACAAGGTGCACTTGGAGACACCACCAACAACTAC
AAATTACCAAACCTACCAACTATAAGCAAGTCACCTAAACGACTTCCGAGCAGACGTCTT
TCAGCTATCAGTGACGCAATGCCCAGCCCATTCAAAAGCTCAAAACGTACACTGAACACA
AGCAGGGCGATGCAGCCAGGAACCGAGTCAACTCAAGTCAACGAGTCGTCCAAGAAGGCA
GTAACTAATAGCCGTTGTTTTTCAGAGATACGAAGGGAGTGGGAAGAAGAACTTTATGAA
GAGCTTGAAAGGCATCGAGAGAATTTAAGACATGGTGGTGCAGGAGGGAAGTCTCCATTA
TCAGCTCATAAAGGACAGAGAGAACGAACGGTTAAGAGAAATCATTGTATGTTTTTCTTT
TTTGGTTAATCCCAAATTACTCTGTTCTTTTTGGTGGGGTGGTTTTGTCACTATTATGAT
ATTTGATCTATATATGTGTAGTTACTTCTTAAATGGTTC

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

CO CL8677Contig1 652 2 3 U
TTAAAAGAAAAGACATTCAAACAAAACGTTTTACTACTTGCATAATCACATACACAAGTG
CTGACTTTGATTTTGTCTAGTTACTCGAAAGCAGATACATCAGAGTTAAATATGCTTCAA
ACTAAACGAGGTTTACATGAGAAATGATTGTAGATTTTAAAACTGAAACGAACCGTAACT
CAAGAAACTACTTCCACTCTTTCTAAATGCAACAGTGTAAAATGATTTTGGTGGAAGAGT
CTTAACTCGTTTTGTAATGAGCCTGTGTGTTCTCTTCAAACTTTGGTTACTGTGTTCACA
TCTGTTGTTGGTACTTCTTCTTTCGCAGCCTCCACGAATATCAATCTGCCATCAACAATC
TTGCCATCCAAAGCCTTCATCGCCTTTTGCGCATCAACCTCGGACTCAAAAGTGACAAAG
CCGAATCCTTTAGGTCTCTGTGTTTGCGAATCCTTAATAAGACGAGCTTCTCTAATCTGA
CCAAAGGGTGAAAACAGCTGCCTTAGCGATTGATCTGTGGTGTAACCAGAGAGTCTGCTG
ACAAAGAGCTGTGTTGTGAACCTCTTAGCCATCGTGATTACACAGGAAGAAATTCCTGGT
GCGAGCATAAGCTACAAGGAAAACGGCTAAAAAGATGATTAGCCTGTAGGGT


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CD61TF C 1
AF RS1CD61JQ U 3
BS 1 2 RS1CD61TF
BS 3 633 RS1CD61JQ
BS 634 652 RS1CD61TF

RD RS1CD61TF 652 0 0
TTAAAAGAAAAGACATTCAAACAAAACGTTTTACTACTTGCATAATCACATACACAAGTG
CTGACTTTGATTTTGTCTAGTTACTCGAAAGCAGATACATCAGAGTTAAATATGCTTCAA
ACTAAACGAGGTTTACATGAGAAATGATTGTAGATTTTAAAACTGAAACGAACCGTAACT
CAAGAAACTACTTCCACTCTTTCTAAATGCAACAGTGTAAAATGATTTTGGTGGAAGAGT
CTTAACTCGTTTTGTAATGAGCCTGTGTGTTCTCTTCAAACTTTGGTTACTGTGTTCACA
TCTGTTGTTGGTACTTCTTCTTTCGCAGCCTCCACGAATATCAATCTGCCATCAACAATC
TTGCCATCCAAAGCCTTCATCGCCTTTTGCGCATCAACCTCGGACTCAAAAGTGACAAAG
CCGAATCCTTTAGGTCTCTGTGTTTGCGAATCCTTAATAAGACGAGCTTCTCTAATCTGA
CCAAAGGGTGAAAACAGCTGCCTTAGCGATTGATCTGTGGTGTAACCAGAGAGTCTGCTG
ACAAAGAGCTGTGTTGTGAACCTCTTAGCCATCGTGATTACACAGGAAGAAATTCCTGGT
GCGAGCATAAGCTACAAGGAAAACGGCTAAAAAGATGATTAGCCTGTAGGGT

QA 1 652 1 652
DS 

RD RS1CD61JQ 631 0 0
AAAAGAAAAGACATTCAAACAAAACGTTTTACTACTTGCATAATCACATACACAAGTGCT
GACTTTGATTTTGTCTAGTTACTCGAAAGCAGATACATCAGAGTTAAATATGCTTCAAAC
TAAACGAGGTTTACATGAGAAATGATTGTAGATTTTAAAACTGAAACGAACCGTAACTCA
AGAAACTACTTCCACTCTTTCTAAATGCAACAGTGTAAAATGATTTTGGTGGAAGAGTCT
TAACTCGTTTTGTAATGAGCCTGTGTGTTCTCTTCAAACTTTGGTTACTGTGTTCACATC
TGTTGTTGGTACTTCTTCTTTCGCAGCCTCCACGAATATCAATCTGCCATCAACAATCTT
GCCATCCAAAGCCTTCATCGCCTTTTGCGCATCAACCTCGGACTCAAAAGTGACAAAGCC
GAATCCTTTAGGTCTCTGTGTTTGCGAATCCTTAATAAGACGAGCTTCTCTAATCTGACC
AAAGGGTGAAAACAGCTGCCTTAGCGATTGATCTGTGGTGTAACCAGAGAGTCTGCTGAC
AAAGAGCTGTGTTGTGAACCTCTTAGCCATCGTGATTACACAGGAAGAAATTCCTGGTGC
GAGCATAAGCTACAAGGAAAACGGCTAAAAA

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 2

CO CL8678Contig1 889 2 6 U
TCATCCATAGGGATCTAAAACCATCTAACATCCTTCTTGGTGATGACATGCGTGCTAAAG
TCTCTGACTTTGGGTTAGTCCGCTTAGCCCCTGAAGGCAAATACTCCATCGAGACGAGAG
TCGCTGGGACCTTCGGTTACCTTGCTCCAGAATATGCAGTGACGGGAAGAGTGACGACTA
AGGTAGACATATTCAGCCTCGGGGTCATACTTATGGAGCTAATCACTGGTCGTAAAGCCT
TAGATGAGACGCAACCTGAGGACAGCGTCCATCTAGTGACATGGTTCCGTCGTGTGGCAG
CAAGCAAAGACAAAGACGAGAACGCCTTCAAAAACGCAATAGACCCGAACATCAAGCTGG
ACGAAGACACCTTAGCTAGCGTTGAAAAAGTTTGGGAGCTTGCTGGTCATTGCTGTGCAC
GTGAGCCTTACCAAAGACCTGACATGTCTCACATCGTTAACGTACTTTCTTCTCTCACTG
TCCAATGGAAACCCACTGAGGTCGATCCTGATGACCTTTACGGTATAGACTATGATCTTC
CGCTTCCGCAGGCGGTTAAGAAATGGCAAGCTTCTGAAGGGCTTAGCCAAACGGGAGATG
ACTCTGGTTCTTCCTCCTCTGTTTATGGAAGCAAAGATAATACACAGACAAGTATCCCAA
CACGCCCGTCTGGATTTGCTGACTCGTTCACATCTGTGGATGGACGTTGAAGAAAATAAA
AGACTGCGTTTCTCAGTTTCGTTAAAAACGTTTTTAGTAGTATAGAAGTAGTAGATGAAG
AATCCTTGTGTGAAAAAAAGTTCCTATTTTCTTGTTCTTTGTTTTTGTCTGAAGCATTTA
CTTGTGACATCCATTTTTCATGAAAACTTTTGGTTTAAGTGTAAAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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DS 



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BQ
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AF RS1DG67TF C 1
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BS 10 653 RS1DG67JQ

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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1FQ31TF U 1
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RD RS1FQ31TF 814 0 0
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CTGTTTCAAAGTGAGTAGAGTGTAAGCTTTGACAATTATTAATGGAAGGTAAAGGACGAA
TTGCATCATCAACTTCTTCTTCTTTAACCACCGAACTCTTCGGCTCCAGAGATCCGTCGC
CGCCATCTTCTTCCTCTGGAATCTTCTCCTCCATTTTCCCTCATCCCTCCAAGGTTATAT
TACCTTCCTTTTCTTCCAGTTTTGTGTCTTGGGTAATCGGAATGATTCTTGAGGGTTAAA
CTTCGGTTTCTTGATTCGATTTCTCCGGGCGTTACAAGAGATGGTCAAAGCTCCAAACAT
GGCTCACAAGCTCAACGTAGAGAATCTTCAAATGTACAAGACAGAGTTGAGCCATGCAAT
CTAAGCTCTTCTCTTTACTACGGTGGTCAAGACGTATACCCTCGATCCACCACCAACCAA
AGTTACCCTACAGTTAAAAACGAGGGTCCAAGAAGCCAGGAAAACGATGCTAATGGACAG
AACTCACAAGATGTTTCAAGAGGGAACTGGTGGCAAGGTTCTCTTTATTACTAAAGAACC
AGTTTCTTTAGTTTCTTTGTATATCTTTGATGAAGCTCAAGCCAACGTACTAATTATCTA
CTAAACCAAAACTTTTGTATAAATAAGTTTATGCATAACAAA*GATAATACACTGTATTA
GACGATAT*ATTGAAAGAGATCTCCTAGTAAAG*TGTGTTGATA*TGAACTGTATCAGTA
TTTACTCTGCTTT*CTTTTTCTCATGT
CAAAAAA

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DS 

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TCTTCTTTAACCACCGAACTCTTCGGCTCCAGAGATCCGTCGCCGCCATCTTCTTCCTCT
GGAATCTTCTCCTCCATTTTCCCTCATCCCTCCAAGGTTATATTACCTTCCTTTTCTTCC
AGTTTTGTGTCTTGGGTAATCGGAATGATTCTTGAGGGTTAAACTTCGGTTTCTTGATTC
GATTTCTCCGGGCGTTACAAGAGATGGTCAAAGCTCCAAACATGGCTCACAAGCTCAACG
TAGAGAATCTTCAAATGTACAAGACAGAGTTGAGCCATGCAATTTAAGCTCTTCTCTTTA
CTACGGTGGTCAAGACGTATACCCTCGATCCACCACCAACCAAAGTTACCCTACAGTTAA
AAACGAGGGTCCAAGAAGCCAGGAAAACGATGCTAATGGACAGAACTCACAAGATGTTTC
AAGAGGGAACTGGTGGCAAGGTTCTCTTTATTACTAAAGAACCAGTTTCTTTAGTTTCTT
TGTATATCTTTGATGAAGCTCAAGCCAACGTACTAATTATTTACTAAACCAAAACTTTTG
TATAAATAAGTTTATGCATAACAAAAGATAATACACTGTATTAGACGATATTATTGAAAG
AGATCTCCTAGTAAAGGTGTGTTGATAATGAACTGTATCAGTATTTACTTTGCTTTTCTC
TTTCTCATGTTCAACAAAAAGATGAAATATGTAAGCAGTTTTTTTTTTTTTTGTTC

QA 1 716 1 716
DS 



AS 1 2

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TTTTTGAAGAAATGGCTCAAGAGGGTCTAGTTCCGGACAGAACAGCATACACATCGTTAA
TGGATGGGAACTTGAAGCAGGGGAATGTGCTAGAGGGTTTGGCTTTACGAGACAAAATGG
CTGAGATTGGTATGAAGCTTGATTTGCTTGCTTACACTTCGTTAGTCTGGGGGTTATCTC
AGTGCAATCAGTTGCAGAAAGCGAGATCCTTCCTTGAGGAAATGATTGGGGAAGGGATTC
TACCTGACGAGGTTTTGTGTATCAGTGTCTTGAAGAAACACTATGAGGTTGGATGTATAG
AGGAAGCTGTAGAGTTGCAGAGTTATTTGATGAAGCATCAGCTTTTGAATACACCACATC
CAGACATGTGAAACTCTGGAAGATGCAATCTTTCTGCTCTTATCAGACCGATTCAGGTAT
TTGGATCCAAGCCTTGTTTCTCGTGGAGAAAATGAGGAAACAAGAAACCAGAGTGTTGAA
TCTTCAGCCTTAGCTTCTCCTGAGAATCTATCGGCTAATCATCCGAGGAGAAGCTGCAAG
AGCTTAGATATGAAAACAAATCCAGTGATGGGGTTTTGTGGTATTAAACTCTTGAGTTGC
GTCTGTGATAAGTCTTTTTGTTGCAGACTTTAAGCTCTGCTCTGAAGTGTTGAACTATCC
AAAAGATGAGAGAAAAGAGCGAATATGGTTATATTAAGTGATTTGCTTACAGATAGTTTG
AAGGCTTTGAAGGTTCTTCATTGTTTTTTGTATTTGTTGCTTTGAGGAACCAATCAGAAG
TCCTAATTTTTGTTGTGTACATTTCTTTTTTTTTTTTACCCCAGAATGTAATTTCTTTTA
TTGACG


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1DY18TF U 1
AF RS1DY18JQ C 75
BS 1 663 RS1DY18TF
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BS 719 846 RS1DY18JQ

RD RS1DY18TF 718 0 0
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TGGATGGGAACTTGAAGCAGGGGAATGTGCTAGAGGGTTTGGCTTTACGAGACAAAATGG
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AGTGCAATCAGTTGCAGAAAGCGAGATCCTTCCTTGAGGAAATGATTGGGGAAGGGATTC
TACCTGACGAGGTTTTGTGTATCAGTGTCTTGAAGAAACACTATGAGGTTGGATGTATAG
AGGAAGCTGTAGAGTTGCAGAGTTATTTGATGAAGCATCAGCTTTTGAATACACCACATC
CAGACATGTGAAACTCTGGAAGATGCAATCTTTCTGCTCTTATCAGACCGATTCAGGTAT
TTGGATCCAAGCCTTGTTTCTCGTGGAGAAAATGAGGAAACAAGAAACCAGAGTGTTGAA
TCTTCAGCCTTAGCTTCTCCTGAGAATCTATCGGCTAATCATCCGAGGAGAAGCTGCAAG
AGCTTAGATATGAAAACAAATCCAGTGATGGGGTTTTGTGGTATTAAACTCTTGAGTTGC
GTCTGTGATAAGTCTTTTTGTTGCAGACTTTAAGCTCTGCTCTGAAGTGTTGAACTATCC
AAA*GATGAGAGAAA*GAGCGAATATGGTTATATTAAGTGATTTGCTTACAGATAGTT

QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1DY18JQ 772 0 0
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AAGCTTGATTTGCTTGCTTACACTTCGTTAGTCTGGGGGTTATCTCAGTGCAATCAGTTG
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TTGTGTATCAGTGTCTTGAAGAAACACTATGAGGTTGGATGTATAGAGGAAGCTGTAGAG
TTGCAGAGTTATTTGATGAAGCATCAGCTTTTGAATACACCACATCCAGACATGTGAAAC
TCTGGAAGATGCAATCTTTCTGCTCTTATCAGACCGATTCAGGTATTTGGATCCAAGCCT
TGTTTCTCGTGGAGAAAATGAGGAAACAAGAAACCAGAGTGTTGAATCTTCAGCCTTAGC
TTCTCCTGAGAATCTATCGGCTAATCATCCGAGGAGAAGCTGCAAGAGCTTAGATATGAA
AACAAATCCAGTGATGGGGTTTTGTGGTATTAAACTCTTGAGTTGCGTCTGTGATAAGTC
TTTTTGTTGCAGACTTTAAGCTTTGCTCTGAAGTGTTGAACTATCCAAAAGATGAGAGAA
AAGAGCGAATATGGTTATATTAAGTGATTTGCTTACAGATAGTTTGAAGGCTTTGAAGGT
TCTTCATTGTTTTTTGTATTTGTTGCTTTGAGGAACCAATCAGAAGTCCTAATTTTTGTT
GTGTACATTTCTTTTTTTTTTTTACCCCAGAATGTAATTTCTTTTATTGACG

QA 1 772 1 772
DS 



AS 1 2

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GGCTACTAACAACAACCATAACCTCTCGGATCAACAACCTCCTTCCGACGATTTCTTCGA
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CCCCGGAGGGTTAAGCGGACCGCCGCCGATGATGCTTCAGCTCGGTTCCGGGGAAGAAGG
GAGTCATAATAACCATATGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGGCCTCTAGGGTTTCACAACGG
GATGTTTCCGTTGGGGTTGAGTCTCGATCAAGGGAAAGGAGGAGGACAAGGCTTTCTTAA
ACCCGATGGAAGTGGTGGGAAACGTTTCCAAGATGATGTTGTTGGTGTTGATAATCGATG
TTCCTCCATCAAACCTGTTTTCCATGGGCAGCCAATGTCACAGCCACCTCCACCAATGCC
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TTATGTGAAGTTTCTCAGGCTCCAAGTTAAGGTCTTGAGCATGAGTCGTCTTGGTGGGGC
CGGTGCTGTTGCTCCACTAGTCACTGAAATGCCATTGTCTTCATCAGTTGAGGATGAGAC
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GGAAGAAAACGTTGGAGCAGCGATGCAGCTTTTGCAGTCAAAGGCGCTTTGCATAATGCC
AGTCTCATTGGCGATGGCGATTTACCATTTTCAGCCACCTGACACGTTTTCTTCAGTCGT
GAAACCGGAGATGAATCCTCCTCAGTAGATCTTTGCATCTAATTGGTCGTCGTCAGCTTC
TTTGTTCCTTTTCCCTCCCCCACTACTACTACCACTTTTGTGACTGATGAATTCGAGATG
GAATTAAATTAGGATTTGTGCAGTAAGAGGTAAAAAAAAAAGGAAAAGGGCTCTCACTTG
TTTGGCCAAATATTTTTATCATTCTGATGAAAGTAACTTTGTTTTGGCTGAAAGTAACTT
TAATGAGAGTTCGGAGAAGAAAGGCTTTTAAGGGTAGTAGTCTAGCTCCAGACCTAGTAG
TGTAATGTTTGTAATGAAATGTATGGGAAGGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EW71TF U 1
AF RS1EW71JQ C 575
BS 1 601 RS1EW71TF
BS 602 602 RS1EW71JQ
BS 603 672 RS1EW71TF
BS 673 1292 RS1EW71JQ

RD RS1EW71TF 672 0 0
GGGCGGAGCTCTTTCTTCTTCGAGGTCTCCCAAGCTCTCTCTCACCTACCTAACTGCCAT
GGCTACTAACAACAACCATAACCTCTCGGATCAACAACCTCCTTCCGACGATTTCTTCGA
GCAGATCCTCGGAATCTCCAACTTCTCCGCGTCTTCCAGCTCCGGTGGTCTCTCTGCACT
CCCCGGAGGGTTAAGCGGACCGCCGCCGATGATGCTTCAGCTCGGTTCCGGGGAAGAAGG
GAGTCATAATAACCATATGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGGCCTCTAGGGTTTCACAACGG
GATGTTTCCGTTGGGGTTGAGTCTCGATCAAGGGAAAGGAGGAGGACAAGGCTTTCTTAA
ACCCGATGGAAGTGGTGGGAAACGTTTCCAAGATGATGTTGTTGGTGTTGATAATCGATG
TTCCTCCATCAAACCTGTTTTCCATGGGCAGCCAATGTCACAGCCACCTCCACCAATGCC
GCATCAACAATCTTCAATCCGGCCTAGAGTTAGGGCTAGGCGAGGTCAGGCCACTGATCC
TCATAGCATCGCTGAGCGGCTGCGTAGGGAAAGAATAGCAGAACGGATCAGGGCGTTGCA
G*AACTTGTACCTACCGTCAACAAGACTGATAGGGCTGCTATGATCGATGAGATTGTCGA
TTATGTGAAGTT

QA 1 672 1 672
DS 

RD RS1EW71JQ 718 0 0
ATAGCAGAACGGATCAGGGCGTTGCAGGAACTTGTACCTACCGTCAACAAGACTGATAGG
GCTGCTATGATCGATGAGATTGTCGATTATGTGAAGTTTCTCAGGCTCCAAGTTAAGGTC
TTGAGCATGAGTCGTCTTGGTGGGGCCGGTGCTGTTGCTCCACTAGTCACTGAAATGCCA
TTGTCTTCATCAGTTGAGGATGAGACACAAGCAGTGTGGGAGAAATGGTCAGACGATGGG
ACAGAGCGTCAAGTGGCTAAGCTGATGGAAGAAAACGTTGGAGCAGCGATGCAGCTTTTG
CAGTCAAAGGCGCTTTGCATAATGCCAGTCTCATTGGCGATGGCGATTTACCATTTTCAG
CCACCTGACACGTTTTCTTCAGTCGTGAAACCGGAGATGAATCCTCCTCAGTAGATCTTT
GCATCTAATTGGTCGTCGTCAGCTTCTTTGTTCCTTTTCCCTCCCCCACTACTACTACCA
CTTTTGTGACTGATGAATTCGAGATGGAATTAAATTAGGATTTGTGCAGTAAGAGGTAAA
AAAAAAAGGAAAAGGGCTCTCACTTGTTTGGCCAAATATTTTTATCATTCTGATGAAAGT
AACTTTGTTTTGGCTGAAAGTAACTTTAATGAGAGTTCGGAGAAGAAAGGCTTTTAAGGG
TAGTAGTCTAGCTCCAGACCTAGTAGTGTAATGTTTGTAATGAAATGTATGGGAAGGT

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

CO CL8683Contig1 874 2 2 U
GTATTGGTAGGGTGTGATGGTGTGAAATCAGTGGTTGGTAAGTGGCTAGGGTTCAAGAAT
CCGGTTAAAACTGCCAGGTTAGCAATCAGAGGACTCACACATTATCCACAAGGCCACGGA
TTTGGGAAAAAGTTCTTCCAGTTTTATGGCAACGGTGTTCGCTCGGGTTTTATCCCCTGT
GATCCCAACACTGTCTACTGGTTCCTAACCCACACTTGTACTGAATTAGATAAGGAGAAA
AATCCCGAAAACCTCAAAGAGTTTGTGCTGAACAAGCTCAAAGACTTGCCTGAAAACATT
AAGAGTGTCGTGGAGACCACAGATCTTGATAGCATGGTGATGTCTCGACTCAAGTACCGA
CCCCCATGGCAACTCTTATGGGCAAACATAGCAAAAGACAACGTATGTGTTGCAGGGGAT
GCACTTCACCCAATGACTCCTGATATCGGACAGGGCGGTTGCTCGGCAATGGAGGATGGA
GTGATCCTGGCTCGTTGTCTGGGTGAAGCATTGAAAGCTGCTAAAGGTGAAAGAGAGGAT
GAGTATAAGAGGATTGAACAAGGATTAAAGAAGTATGCAGGAGAAAGGAAATGGAGAAGC
ATAGATCTGATAACAACGGCATATACAGTAGGATTCATACAGCAGAGCACAGGGAAGTGG
ATGAACCTGTTAAGAGACAAGTTCTTGTCCTCTTTCCTTTTTCGGTTGCTGCTGAAAAAG
GCTCATTTCGACTGCGGAAGCCTACTTGTCCCATGATGAGAAAGCAAAGCAGGAATGCTT
TGCTGTGTGTGTGTTTATTTTTTTTTTATAAATCCGTGTTGATAGAATAGTCTGAATCAA
CTAAATAAAGTCTGCAAAGGCAAAGGTTGTGTAG


BQ
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AF RS1F171TF U 1
AF RS1F171JQ C 66
BS 1 689 RS1F171TF
BS 690 874 RS1F171JQ

RD RS1F171TF 689 0 0
GTATTGGTAGGGTGTGATGGTGTGAAATCAGTGGTTGGTAAGTGGCTAGGGTTCAAGAAT
CCGGTTAAAACTGCCAGGTTAGCAATCAGAGGACTCACACATTATCCACAAGGCCACGGA
TTTGGGAAAAAGTTCTTCCAGTTTTATGGCAACGGTGTTCGCTCGGGTTTTATCCCCTGT
GATCCCAACACTGTCTACTGGTTCCTAACCCACACTTGTACTGAATTAGATAAGGAGAAA
AATCCCGAAAACCTCAAAGAGTTTGTGCTGAACAAGCTCAAAGACTTGCCTGAAAACATT
AAGAGTGTCGTGGAGACCACAGATCTTGATAGCATGGTGATGTCTCGACTCAAGTACCGA
CCCCCATGGCAACTCTTATGGGCAAACATAGCAAAAGACAACGTATGTGTTGCAGGGGAT
GCACTTCACCCAATGACTCCTGATATCGGACAGGGCGGTTGCTCGGCAATGGAGGATGGA
GTGATCCTGGCTCGTTGTCTGGGTGAAGCATTGAAAGCTGCTAAAGGTGAAAGAGAGGAT
GAGTATAAGAGGATTGAACAAGGATTAAAGAAGTATGCAGGAGAAAGGAAATGGAGAAGC
ATAGATCTGATAACAACGGCATATACAGTAGGATTCATACAGCAGAGCACAGGGAAGTGG
ATGAACCTGTTAAGAGACAAGTTCTTGTC

QA 1 689 1 689
DS 

RD RS1F171JQ 809 0 0
TAAAACTGCCAGGTTAGCAATCAGAGGACTCACACATTATCCACAAGGCCACGGATTTGG
GAAAAAGTTCTTCCAGTTTTATGGCAACGGTGTTCGCTCGGGTTTTATCCCCTGTGATCC
CAACACTGTCTACTGGTTCCTAACCCACACTTGTACTGAATTAGATAAGGAGAAAAATCC
CGAAAACCTCAAAGAGTTTGTGCTGAACAAGCTCAAAGACTTGCCTGAAAACATTAAGAG
TGTCGTGGAGACCACAGATCTTGATAGCATGGTGATGTCTCGACTCAAGTACCGACCCCC
ATGGCAACTCTTATGGGCAAACATAGCAAAAGACAACGTATGTGTTGCAGGGGATGCACT
TCACCCAATGACTCCTGATATCGGACAGGGCGGTTGCTCGGCAATGGAGGATGGAGTGAT
CCTGGCTCGTTGTTTGGGTGAAGCATTGAAAGCTGCTAAAGGTGAAAGAGAGGATGAGTA
TAAGAGGATTGAACAAGGATTAAAGAAGTATGCAGGAGAAAGGAAATGGAGAAGCATAGA
TTTGATAACAACGGCATATACAGTAGGATTCATACAGCAGAGCACAGGGAAGTGGATGAA
CCTGTTAAGAGACAAGTTCTTGTCCTCTTTCCTTTTTCGGTTGCTGCTGAAAAAGGCTCA
TTTCGACTGCGGAAGCCTACTTGTCCCATGATGAGAAAGCAAAGCAGGAATGCTTTGCTG
TGTGTGTGTTTATTTTTTTTTTATAAATCCGTGTTGATAGAATAGTCTGAATCAACTAAA
TAAAGTCTGCAAAGGCAAAGGTTGTGTAG

QA 1 809 1 809
DS 



AS 1 2

CO CL8684Contig1 1201 2 4 U
GCATTGGGGGGGAATAAAAAACATTTATGGAGAACAAGCCTATGCAAACCCCATTATCCT
AAATCTAATGGAATATGCATTGATGGTGTTTTGTATTATTCAGCTGGGTTTGATTGGGGG
ACAAGGGTTTCCATGATAGTCTGCTTTGATGTTAGGTCCGAGAAGTTCAGCTTTATCAAC
ATAGATCGATCCATTTTGATGACTTGCGCCTGTACTTTGATCAACTACAAGGGTAAGTTA
GGTGCGCTCCAGTTTACATTGTCGTATCCAAGATGTCTCGTGTTCTGGGCTCTTGAAGAT
GCAGGAAAATGTAAATGGTCCAAGTGTATGTACACAATACCTCCTTTGTGGAACAACATA
GTTGGTCGTTCTGACTTGGACATTGTTGGAGTGACATCTGGAGGTGAAGTTGTGTTGGCG
GCGAGGCATCTACTTGATCCGTTTTACATTTATTACTACAATCCCAAGGGCAACACTTTC
GTAAGGGTTCTAATCCGAGGTCTGGAAGGGTTTGTACGTGCGAGAGTTCACACTTGTCTA
GACTATATTGAGAATTTGAAGCTTATGAGGGAATATGACAAAGGAGTTAGCACAAACATT
TCCTCTTAATACGGAGGCTATTTCAAGTTGAATATGGAATTTGAGCAAGCAAGATTCGTT
GAAATTCAATAATGATGCATGTGCTAAGATCAACTCCATGATCATCCCATGCTGTGAAGA
CTTGACAGAGCCCAAGAGTGATCACAGTCGCAAGGTCGTAGAGATCACAAACAGCGCATG
GAAATATCGTCTTGATGAAAACTTAGTGGATAAACCTTCGTTTTCAACGCCCATGAAAAG
ACCAAACGACATACCAAGCATTGAGTCCATTGAGGAACTAAGCATCTGAGACTTACTGAG
AGCGTTTCAACTTTCAAGATGGGTAACTGTTGAAGCAGGCCAGTGGTGATGCAAAGCATC
ACCGAAAGCAACAACACCTTATACGTGCTTCCTCTGTTTACGAAGCAGCTGCTGTGTCGG
ACTCAAGATCTCCCCTCTCTCTCTTGTTAACTGAGACCAAAGGTTATTATTGTGTCACAC
TCGACAGAGAGAGTATTTTTGCATACATGTCAACTTATTTTCTTCGTGGAGGTAGTTTGA
GGATTTTACAAAGTCTTTATTTGGTTAGTTAAGATTTGTATTGTTTATTAGTTGGTAGCA
A


BQ
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10 

AF RS1CB91TF U 1
AF RS1CB91JQ C 435
BS 1 663 RS1CB91TF
BS 664 664 RS1CB91JQ
BS 665 739 RS1CB91TF
BS 740 1201 RS1CB91JQ

RD RS1CB91TF 739 0 0
GCATTGGGGGGGAATAAAAAACATTTATGGAGAACAAGCCTATGCAAACCCCATTATCCT
AAATCTAATGGAATATGCATTGATGGTGTTTTGTATTATTCAGCTGGGTTTGATTGGGGG
ACAAGGGTTTCCATGATAGTCTGCTTTGATGTTAGGTCCGAGAAGTTCAGCTTTATCAAC
ATAGATCGATCCATTTTGATGACTTGCGCCTGTACTTTGATCAACTACAAGGGTAAGTTA
GGTGCGCTCCAGTTTACATTGTCGTATCCAAGATGTCTCGTGTTCTGGGCTCTTGAAGAT
GCAGGAAAATGTAAATGGTCCAAGTGTATGTACACAATACCTCCTTTGTGGAACAACATA
GTTGGTCGTTCTGACTTGGACATTGTTGGAGTGACATCTGGAGGTGAAGTTGTGTTGGCG
GCGAGGCATCTACTTGATCCGTTTTACATTTATTACTACAATCCCAAGGGCAACACTTTC
GTAAGGGTTCTAATCCGAGGTCTGGAAGGGTTTGTACGTGCGAGAGTTCACACTTGTCTA
GACTATATTGAGAATTTGAAGCTTATGAGGGAATATGACAAAGGAGTTAGCACAAACATT
TCCTCTTAATACGGAGGCTATTTCAAGTTGAATATGGAATTTGAGCAAGCAAGATTCGTT
GAA*TTCAATAATGATGCATGTGCTAAGATCAACTCCATGATCATCCCATGCTGTGAAGA
CTTGACAGAGCCCAAGAGT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1CB91JQ 767 0 0
TGATCCGTTTTACATTTATTACTACAATCCCAAGGGCAACACTTTCGTAAGGGTTCTAAT
CCGAGGTCTGGAAGGGTTTGTACGTGCGAGAGTTCACACTTGTCTAGACTATATTGAGAA
TTTGAAGCTTATGAGGGAATATGACAAAGGAGTTAGCACAAACATTTCCTCTTAATACGG
AGGCTATTTCAAGTTGAATATGGAATTTGAGCAAGCAAGATTCGTTGAAATTCAATAATG
ATGCATGTGCTAAGATCAACTCCATGATCATCCCATGCTGTGAAGACTTGACAGAGCCCA
AGAGTGATCACAGTCGCAAGGTCGTAGAGATCACAAACAGCGCATGGAAATATCGTCTTG
ATGAAAACTTAGTGGATAAACCTTCGTTTTCAACGCCCATGAAAAGACCAAACGACATAC
CAAGCATTGAGTCCATTGAGGAACTAAGCATCTGAGACTTACTGAGAGCGTTTCAACTTT
CAAGATGGGTAACTGTTGAAGCAGGCCAGTGGTGATGCAAAGCATCACCGAAAGCAACAA
CACCTTATACGTGCTTCCTCTGTTTACGAAGCAGCTGCTGTGTCGGACTCAAGATCTCCC
CTCTCTCTCTTGTTAACTGAGACCAAAGGTTATTATTGTGTCACACTCGACAGAGAGAGT
ATTTTTGCATACATGTCAACTTATTTTCTTCGTGGAGGTAGTTTGAGGATTTTACAAAGT
CTTTATTTGGTTAGTTAAGATTTGTATTGTTTATTAGTTGGTAGCAA

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

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GGATTCGAGCCGGGAAAATCCAGAAGAACCCTCTTCGCAAACGCTCCGTCGTCTCTTGAT
CGCTGATCGGTTTGCTAGATTCAAGCAAGCAAGCTTCGAAACCCTAAATTCCTTACTCAT
TGCCTATCGGTACTAGCTCAACTTCAGATTGCAGGAGGTAATTTTGAGCAATATCAAGTG
AATCTTCGTCAGTGATCATCATCAGATACAATGTCAGCGTTGTTCAACTTCCATTCGTTT
TTGACGGTGGTGCTGCTTGTGATATGCACGTGCACTTATCTCAAGATGCAGTTCCCTGCC
ATTCTCGAGCAGAAAACTGGGTTTCGTGGATTCTTTTGGAAGGCTGCTAGAATAGGTGAG
CGTTTGAGCCCTTGGATGTCTGTCGGATGCTTCATGATGGGTGTCTCCATCATTTTCTTC
TGAGTGTCTTCATTGAGATACTCAGTTTTCTGTATGGAAACGATTCTAAGTTTTTTTTTT
TTGATGAAACTGAAAGAGTAGATTATATTCTTTTTGGATTATGGTTTTGGTCTTGTATTT
GTCGTGTTGTTTTGATGTGAAAACTAAGCCCCAACTGTGAACATTGCCACACCTAAAGAA
GATTATATTGGTGGAATATATCCAGGGGGTCTCTATAAAAGTGTTTTTATTATCAAGTAT
TATTTGGCCTTT


BQ
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AF RS1D866TF U 1
AF RS1CA34TF U 5
BS 1 481 RS1D866TF
BS 482 482 RS1CA34TF
BS 483 651 RS1D866TF
BS 652 672 RS1CA34TF

RD RS1D866TF 651 0 0
GGATTCGAGCCGGGAAAATCCAGAAGAACCCTCTTCGCAAACGCTCCGTCGTCTCTTGAT
CGCTGATCGGTTTGCTAGATTCAAGCAAGCAAGCTTCGAAACCCTAAATTCCTTACTCAT
TGCCTATCGGTACTAGCTCAACTTCAGATTGCAGGAGGTAATTTTGAGCAATATCAAGTG
AATCTTCGTCAGTGATCATCATCAGATACAATGTCAGCGTTGTTCAACTTCCATTCGTTT
TTGACGGTGGTGCTGCTTGTGATATGCACGTGCACTTATCTCAAGATGCAGTTCCCTGCC
ATTCTCGAGCAGAAAACTGGGTTTCGTGGATTCTTTTGGAAGGCTGCTAGAATAGGTGAG
CGTTTGAGCCCTTGGATGTCTGTCGGATGCTTCATGATGGGTGTCTCCATCATTTTCTTC
TGAGTGTCTTCATTGAGATACTCAGTTTTCTGTATGGAAACGATTCTAAGTTTTTTTTTT
T*GATGAAACTGAAAGAGTAGATTATATTCTTTTTGGATTATGGTTTTGGTCTTGTATTT
GTCGTGTTGTTTTGATGTGAAAACTAAGCCCCAACTGTGAACATTGCCACACCTAAAGAA
GATTATATTGGTGGAATATATCCAGGGGGTCTCTATAAAAGTGTTTTTATT

QA 1 651 1 651
DS 

RD RS1CA34TF 668 0 0
GG
GAGCCGGGAAAATCCAGAAGAACCCTCTTCGCAAACGCTCCGTCGTCTCTTGATCGCTGA
TCGGTTTGCTAGATTCAAGCAAGCAAGCTTCGAAACCCTAAATTCCTTACTCATTGCCTA
TCGGTACTAGCTCAACTTCA**TTGCAGGAGGTAATTTTGAGCAATATCAAGTGAATCTT
CGTCAGTGATCATCATCAGATACAATGTCAGCGTTGTTCAACTTCCATTCGTTTTTGACG
GTGGTGCTGCTTGTGATATGCACGTGCACTTATCTCAAGATGCAGTTCCCTGCCATTCTC
GAGCAGAAAACTGGGTTTCGTGGATTCTTTTGGAAGGCTGCTAGAATAGGTGAGCGTTTG
AGCCCTTGGATGTCTGTCGGATGCTTCATGATGGGTGTCTCCATCATTTTCTTCTGAGTG
TCTTCATTGAGATACTCAGTTTTCTGTATGGAAACGATTCTAAGTTTTTTTTTTTTGATG
AAACTGAAAGAGTAGATTATATTCTTTTTGGATTATGGTTTTGGTCTTGTATTTGTCGTG
TTGTTTTGATGTGAAAACTAAGCCCCAACTGTGAACATTGCCACACCTAAAGAAGATTAT
ATTGGTGGAATATATCCAGGGGGTCTCTATAAAAGTGTTTTTATTATCAAGTATTATTTG
GCCTTT

QA 3 668 3 668
DS 



AS 1 2

CO CL8686Contig1 716 2 3 U
GGGGAGAAAAGACCCTTTTTATAGATTTTGTTGGCAAAACATTACGCTCATAAAATTTTA
CATCAGAAAAGTTTAGCAAAAGCATGAATAAGCCAAATGGTTCTTCTTTGAGATGTATGG
AGAGATGTAATCAGTAGAAAGACCAGACGTTCCTGAGATCTCAGCTGGAACTAGAACTTG
AGGCTTCCCTAAAGCTATCCTTTTCCCAACCGTATTAGCGTAAAACAAACCAGGAATGGC
TGGCACAAACACACCACTCCTTGAACTTATGTAGAAGTCAATAACGTTTTCATACTCTGA
GTTCTCTAACTCAAGGTACTTAGACTTCTTCTCTGCAGGCATTATCGCCTCCTTAGTAAA
CGTTTTAGGGAAGATGTCCTTAAGAATATTGAGGCTGCTATCCCATCTAGGCTGAGTCAG
GTATATAGTTGTGCCACCATCAAATCCAAGCTTCCTCAAGAACACTGCGATCTCTTGCGC
GTTGTAACATGTTTTGGACCCCCCTGCACCTGTCTCATGGCAGTTTTTCTTCTCAAGTAT
CTCAACTCTCAAGTCTATGGCTATGAAGCGTCCACCAGAGCTCTTGCTCTTCAGCCTCTG
AACCATCGACTCCACCAGTTCATTCACTCCAGGTTGCAACTCCAAGGAACCAAACATCGC
CAAAACAAGAGACAGGGTCGGTCTCACCATCCAGAGAAGACTTCCTCAAGTTCACG


BQ
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AGAGATGTAATCAGTAGAAAGACCAGACGTTCCTGAGATCTCAGCTGGAACTAGAACTTG
AGGCTTCCCTAAAGCTATCCTTTTCCCAACCGTATTAGCGTAAAACAAACCAGGAATGGC
TGGCACAAACACACCACTCCTTGAACTTATGTAGAAGTCAATAACGTTTTCATACTCTGA
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CGTTTTAGGGAAGATGTCCTTAAGAATATTGAGGCTGCTATCCCATCTAGGCTGAGTCAG
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CTCAACTCTCAAGTCTATGGCTATGAAGCGTCCACCAGAGCTCTTGCTCTTCAGCCTCTG
AACCATCGACTCCACCAGTTCATTCACTCCAGGTTGCAACTCCAAGGAACCAAACATCGC
CAAAACAAGAGACAGGGTCGGTCTCACCATCCAGAGAAGACTTCCTCAAGTTCACG

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CTGCAGGCATTATCGCCTCCTTAGTAAACGTTTTAGGGAAGATGTCCTTAAGAATATTGA
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AF RS1D064JQ C 1
AF RS1D064TF U 1
BS 1 599 RS1D064TF

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GTTGAGTTTGGGTAGAAAAGATCATCTTGAAAAAAACGTGTTAGGAATCTCACGCCATTA
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TGAATCATTTTGTTACTTTTAAATAAATATATCTTTCAATAACAAAAGTTTCTAAATTC

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GCAGGGAAGCTAGTTCAGTAGCTGCCAGTTAAGTAGTAACTGAAGTGTTCGTAGACTTAG
TCTGAAGGCTAAGGTGAGAAGCCAAGTTATCTCGAATGGTGTGGGAGAAAGAATTGTCTT
GTAAGATTACGACGAAGGACGCTGAGGAAATCCCTATGTGAACCAGGATATGCAGTTGAG
CCGAAGAAAATATCAGAGTCCGTTTTCTAAGGGATGGTTCCTGACTAGTTGAAACACTTG
TATGACATCACACTTCCGTGAAGAAACATGGGAGACCTTGGGTGGTAAGACCCTTTGGAC
ATGTTGACCCCAAGAAGTTTAAATTGGATATCTACAGATGATCGAAAATCTGTTTTTGAA
GAAGGGATAAAGCCATAAACTGATAAGATACTGAAGATGTTTCACGTGGAAATCTGTATA
TGAATCATTTTGTTACTTTTAAATAAATATATCTTTCAATAACAAAAGTTTCTAAATTC

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 2

CO CL8688Contig1 1152 2 4 U
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CTCCTCCCTCCTAAACCTCCGAGCTTCCTTCCGGTTCTTCTTCTCGAAGCAGCAGATCAA
TCCGAAGAACGACCCTACTAGTCATGGCCAAAGCTTCCTCCGAACCTTCCGACTCCCTCT
CAGTCTCCACCAAATTCACCGCACCTCCGGGGTTCAAGCCTCCCGAGCCGAAGCGGTTCG
CCGTTAAACCGGGGAAGCTATTAGATGTGTTGGGTGCAGCTATCGGAGTGCTTCTCCGAT
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ACATGATTCTCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AW05TF U 1
AF RS1AW05JQ C 431
BS 1 737 RS1AW05TF
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BS 739 754 RS1AW05TF
BS 755 1152 RS1AW05JQ

RD RS1AW05TF 754 0 0
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CTCCTCCCTCCTAAACCTCCGAGCTTCCTTCCGGTTCTTCTTCTCGAAGCAGCAGATCAA
TCCGAAGAACGACCCTACTAGTCATGGCCAAAGCTTCCTCCGAACCTTCCGACTCCCTCT
CAGTCTCCACCAAATTCACCGCACCTCCGGGGTTCAAGCCTCCCGAGCCGAAGCGGTTCG
CCGTTAAACCGGGGAAGCTATTAGATGTGTTGGGTGCAGCTATCGGAGTGCTTCTCCGAT
TCGGCACTGGAGTGTTCGTTTCTGGGTACTCTGCTTCTTTCGTGTCCAAGGACGTGATCC
CAGCTGGTCAGTATGCGTTGCGAATTGGCGGGATCACGGTGAAGGAAACGTCGAAGATCG
GGCCTCGTCCTCAGAAACCCATTGAGATATATGAGTTTGAAGGCTGTCCCTTTTGCCGGA
AGGTCAGGGAGATGGTCACAGTGTTGGATCTTGATATTCTCTACTATCCTTGCCCAAGAG
GGAGTCCTAATTTTCGCCCCATGGTTAACCAGATGGGTGGCAAACTACAGTTTCCCCACA
CGGTTGATCCAAACACCGGAGTGTCCATGTATGAATCAGATGGAATCATCAAATATCTAT
CCGAGAAATATGGAGATGGAACAGTTCCTTTAAGCCTATCACTTGGTCCATTAACGGCTA
TAACAGCTGCCTTGGCA*CGATTGGACGTCTAGG

QA 1 754 1 754
DS 

RD RS1AW05JQ 722 0 0
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TTTTCGCCCCATGGTTAACCAGATGGGTGGCAAACTACAGTTTCCCCACACGGTTGATCC
AAACACCGGAGTGTCCATGTATGAATCAGATGGAATCATCAAATATCTATCCGAGAAATA
TGGAGATGGAACAGTTCCTTTAAGCCTATCACTTGGTCCATTAACGGCTATAACAGCTGC
CTTGGCAACGATTGGACGTCTAGGAAAGGGTAACTTGTACACACCAGCAAAACTACCACC
TAATCCACTCGTATTCTGGGCATACGAGGGTTCTCCGTTTTGCAAGCTTGTACGCGAAGT
TCTTGTGGAACTCGAGTTGCCACACATTCAACGCAGCTGTGCTCGTGGTAGTCCCAAACG
GCAGGAATTGCTTATGAAAGCTGGTCACTTTCAGGTGCCTTACCTGGAAGATCCAAACAC
TGGAGTAAATATGTTTGAGAGTGCAGAAATCATAGAGTATCTGAAGCAAACTTATGCTGC
TTAGTTCAGCTACTTTCGTTTAATAATCTCAACTTAGTTATGAGTAAGTAAGTGCAGGGT
TTAATGATCAAGAAATGTATCTATATATACAAACCAAATATTATCGTGTGACATGATTCT
CC

QA 1 722 1 722
DS 



AS 1 2

CO CL8689Contig1 569 2 13 U
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TTGGCGAGCATTATTTTTTTGTATTGTTGGCAAAAATGGTCAAATAACAACAGTAGGCTC
AATTGAGCTGTGACTGAAAATTGGAGGCTACTGCATCAATGAACTCTTCTGGGTTCAAGT
ACACATCCCTACTCAACTTGGGACCATGGACTAAAAAAACAAGATCCTTGGTCATTTTCC
CTGTCTCAACAGTGTTTACACACGACGACTCGAGCTTCTTGACAAAATCCATCAATTTCT
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GGCCTAATGAGCCAAACCCTTGGGCAAGA


BQ
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AF RS1GM54JQ U 134
AF RS1DL06JQ U 1
BS 1 152 RS1DL06JQ
BS 153 153 RS1GM54JQ
BS 154 162 RS1DL06JQ
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BS 164 198 RS1DL06JQ
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BS 200 231 RS1DL06JQ
BS 232 232 RS1GM54JQ
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BS 279 279 RS1GM54JQ
BS 280 569 RS1DL06JQ

RD RS1GM54JQ 187 0 0
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CTGAAAATTGGAGGCTACTGCATCAATGAACTCTTCTGGGTTCAAGTACACATCCCTACT
CAACTTGGGACCATGGACTAAAAAAACAAGATCCTTGGTCATTTTCCCTGTCTCAACAGT
GTTTACA

QA 1 187 1 187
DS 

RD RS1DL06JQ 569 0 0
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ACTTTCAAAAGGAAAACAATCATTGGACCCGCCAACACTAGTTTTTTCTGTGTGTTCACT
TTGGCGAGCATTATTTTTTTGTATTGTTGGCAGAAATGGTCAGATAACAACAGTAGGCTC
AATTGAGCTGTGACTGAAGATTGGAGGCTACTGCATCAATGAACTCTTCTGTGTTCAAGT
ACACATCCCTACTCAACTTGGGACCATGGACTAAAAGAGCAAGATCCTTGGTCATTTTCC
CTGTCTCAACAGTGTTTACACACGACGACTCGAGCTTCTTGACAAAATCCATCAATTTCT
CGTTCTTATCGAGTTTTGCCCTGTGTTCTAAGCCGCGTGTCCATGCAAATATAGAGGCTA
TGCTGTTAGTACTGGTCTCTTGTCCCTTTTGGTGCAGTCGGAAATGTCGTGTTACGGTTC
CATGAGCCGCCTCTGACTCGAGTGTTTTCCCATCGGCGGATAACAAAACGGAGGTCATGA
GGCCTAATGAGCCAAACCCTTGGGCAAGA

QA 1 569 1 569
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGAGAATTCTCTGAAACAAAATTTCCACCAATTTCAAATCACTTTCGGTGGCCGGTGGCG
TTATACTGCCGGTCATCAACCTTTCTTTTGTTTTATGTTTCCTTGTGTAAGATAGTTTCA
GTAAAATAGTTTTGATCGACTTTCTAGTTCGCTTGGCGATCTTCACTTCGTGTTGGCGAT
TATCCTTCGTTAGACGATTTTTATTGTGTGTTATTTGCTTTTTATTTTAAATCGGTTTTC
TCTATCCTACGCAAATCAATATTCTGTTTGATTTTGTAAGATTCTAATCAGCTAGTTAGT
TATGCTTGATTTTTTTCCTATAAAAGGTACAATCTTCGCATACAGAGTTTTATGGCGGAG
TATCCTTAGCGGGTTTGAGATTAAGTTATTTGATTAAGCAAAGAGAGAGGATGCAGGTTC
AGATTAGCTGGAGTTTCCTCATCGGAAATGTTCTGGCAAGACCCCGCCTTAATCTCTCCA
AATCTTTTCACTGGAACTCACTTCAATCAAGTGGATGAAGAATCGAGCAAGATTGACGGC
GAACAGGGATAAGAGGAGCGGTCAAGTAGATTCAACTACTCAAGGAAAGCTGCTGAAGGT
TTCCTGTCCCGGCAAGTTTCCGGCGAAGCCAACGGAGCTGCTCTTTGACTCCAGAAATGT
CGAGACTCATCTATCTGTACATGTGCTGTTCATTTTCTGTAGTTGTATTATTATTGAACA
CGTGTTTTCCTTAATCTTATCTTTTGTTTGTTTGGATTTCGATATGGGCTGAATGTATAT
TAGGATAGTTGTTTCTACTTGTTTTTCATGGCCTAAAAGACTTAATAAAATATG


BQ
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AF RS1BV06TF U 1
AF RS1BV06JQ C 106
BS 1 708 RS1BV06TF
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RD RS1BV06TF 746 0 0
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TTATACTGCCGGTCATCAACCTTTCTTTTGTTTTATGTTTCCTTGTGTAAGATAGTTTCA
GTAAAATAGTTTTGATCGACTTTCTAGTTCGCTTGGCGATCTTCACTTCGTGTTGGCGAT
TATCCTTCGTTAGACGATTTTTATTGTGTGTTATTTGCTTTTTATTTTAAATCGGTTTTC
TCTATCCTACGCAAATCAATATTCTGTTTGATTTTGTAAGATTCTAATCAGCTAGTTAGT
TATGCTTGATTTTTTTCCTATAAAAGGTACAATCTTCGCATACAGAGTTTTATGGCGGAG
TATCCTTAGCGGGTTTGAGATTAAGTTATTTGATTAAGCAAAGAGAGAGGATGCAGGTTC
AGATTAGCTGGAGTTTCCTCATCGGAAATGTTCTGGCAAGACCCCGCCTTAATCTCTCCA
AATCTTTTCACTGGAACTCACTTCAATCAAGTGGATGAAGAATCGAGCAAGATTGACGGC
GAACAGGGATAAGAGGAGCGGTCAAGTAGATTCAACTACTCAAGGAAAGCTGCTGAAGGT
TTCCTGTCCCGGCAAGTTTCCGGCGAAGCCAACGGAGCTGCTCTTTGACTCCAGAAATGT
CGAGACTCATCTATCTGTACATGTGCTGTTCATTTTCTGTAGTTGTAT*ATTATTGAACA
CGTGTTTTCCTTA*TCTTATCTTTTG

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1BV06JQ 729 0 0
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CTTCGTGTTGGCGATTATCCTTCGTTAGACGATTTTTATTGTGTGTTATTTGCTTTTTAT
TTTAAATCGGTTTTCTCTATCCTACGCAAATCAATATTCTGTTTGATTTTGTAAGATTCT
AATCAGCTAGTTAGTTATGCTTGATTTTTTTCCTATAAAAGGTACAATCTTCGCATACAG
AGTTTTATGGCGGAGTATCCTTAGCGGGTTTGAGATTAAGTTATTTGATTAAGCAAAGAG
AGAGGATGCAGGTTCAGATTAGCTGGAGTTTCCTCATCGGAAATGTTCTGGCAAGACCCC
GCCTTAATCTCTCCAAATCTTTTCACTGGAACTCACTTCAATCAAGTGGATGAAGAATCG
AGCAAGATTGACGGCGAACAGGGATAAGAGGAGCGGTCAAGTAGATTCAACTACTCAAGG
AAAGCTGCTGAAGGTTTCCTGTCCCGGCAAGTTTCCGGCGAAGCCAACGGAGCTGCTCTT
TGACTCCAGAAATGTCGAGACTCATCTATCTGTACATGTGCTGTTCATTTTCTGTAGTTG
TATTATTATTGAACACGTGTTTTCCTTAATCTTATCTTTTGTTTGTTTGGATTTCGATAT
GGGCTGAATGTATATTAGGATAGTTGTTTCTACTTGTTTTTCATGGCCTAAAAGACTTAA
TAAAATATG

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

CO CL8692Contig1 965 2 2 U
GCTTGAAGATCCGTATCAACATGCCTTCTTCCCCCATGAATCCAACAAAACCTTTCTCAT
GAATCTCTCAAAATATTATCCTCTCTCTCTCTCTCTCTGAAAGAAAAATATTTTAATTGC
AAAAAGACTCTCTTCTTCGTTCCCATCATCACCATGACGCTGGATAGTTACAACGGCGAT
GTTCACACCGTACCTCAATCGGAGAACTCGCCGATCGACACCGACAAAGATAGAGAGCTG
TTCGTGCCGCCGCTCAACTTCGCCATGGTTGATAACGGAATCTTCCGCTCCGGTTTTCCT
GAACCGGTTAGTTTCAGCTTCCTCCAGTCCCTGCGACTCCGATCCATCATATACTTGTGC
CCTGAGCCATACCCAGAGGTGAATGTAGAGTTTGCGAAGTCCAATGGGATCCACGTGTTT
CAGTTTGGAATCGAAAGATGCAAGGAGCCCTTTGTTAATATACCGGACCAAGTTATCCGA
GAAGCATTACAAGTACTCCTAGATACAGAGAATCATCCTGTCTTAATCCATTGCAGAAGT
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TCTTCCATCTTCGACGAGTACCAGAGATTTGCAGCTTCCAAAGCTAGAATCTCTGACCAG
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TCTTGAAAAGTCTCTTTAGCTAGATGAAAAATCATTCAAATAAAAAAAACCCTTTCATTG
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TTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 

AF RS1CB56TF U 1
AF RS1CB56JQ C 254
BS 1 654 RS1CB56TF
BS 655 965 RS1CB56JQ

RD RS1CB56TF 654 0 0
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GTTCACACCGTACCTCAATCGGAGAACTCGCCGATCGACACCGACAAAGATAGAGAGCTG
TTCGTGCCGCCGCTCAACTTCGCCATGGTTGATAACGGAATCTTCCGCTCCGGTTTTCCT
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CCTGAGCCATACCCAGAGGTGAATGTAGAGTTTGCGAAGTCCAATGGGATCCACGTGTTT
CAGTTTGGAATCGAAAGATGCAAGGAGCCCTTTGTTAATATACCGGACCAAGTTATCCGA
GAAGCATTACAAGTACTCCTAGATACAGAGAATCATCCTGTCTTAATCCATTGCAGAAGT
GGCAAGCATCGGACTGGATGTCTAGTGGGGTGTGTGAGGAAGATACAGAGATGGTGTTTG
TCTTCCATCTTCGACGAGTACCAGAGATTTGCAGCTTCCAAAGCTAGAATCTCT

QA 1 654 1 654
DS 

RD RS1CB56JQ 712 0 0
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TACTCCTAGATACAGAGAATCATCCTGTCTTAATCCATTGCAGAAGTGGCAAGCATCGGA
CTGGATGTCTAGTGGGGTGTGTGAGGAAGATACAGAGATGGTGTTTGTCTTCCATTTTCG
ACGAGTACCAGAGATTTGCAGCTTCCAAAGCTAGAATCTCTGACCAGAGATTCATGGAGC
TCTTTGACATCTCCAATTTAAGACATTCACCACTCTCCTTCTCATGCTCCAAGAGGTGTT
GATCACTGTAAACGAAACCTACAACTTAAATAAATAGTTGTTGAATGTCTTGAAAAGTCT
CTTTAGCTAGATGAAAAATCATTCAAATAAAAAAAACCCTTTCATTGCAATGTAAATAAA
TAAACATTGTAGGGTTTTTCTAGAGAGAAAATTTTTATAGGCTTGGTTACAAGACTCTCC
ATTTAAACGCTATCATCATGTAGAACAAGTTTTATCATAAAGTCTTTTTACC

QA 1 712 1 712
DS 



AS 1 2

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GCCTGAAACATGTCAAGACACAAAGTTCAGATGGGTTTAGGTATCATTGGAGGTTTAATG
AATCTAATTGCTGGATCTTAAATCTATATCGGTATTGGTAAAAAATGTATTTGATCAGAC
AATACCTCTGAGCTTGAAGTTTCTTCGTCTGTAAGTATTATACATGTGTTTGACTTCCCA
GAAAGTCGAAGCTTCTCCTGCAAAGGTCCGGGGACAAGATGAAAACAGTTGAGAGGTGAT
AATGGCAGTAGATAATTGCAAGGGAGCTAAGTGAATGTTCAATTCATATGTTTCTACTCT
TCACCAAAGAATAATACTTACCTGCATCATAATATCAGGCATCTTGTGATTTTCTCCTCC
CATAGAGTCGCACAGATGCATTAAACCCATATTCGCAATATCCTGCTCCCATGAAGAAGG
ACAAAAACAGCAGCAAAATAAGTAAACTAGCTCCACAGTGATCCTTACAAATGGCATTTG
AGTTAATAATATTCAGAACATTTATAAGGAGCAAGAATGGACCTGCTTGTACTCAATACT
ATCTAATGTTCCACCCTGAAAGAAACGGGAATAGGATGGAATCAGTGCACTATTACACCA
GTAAGGTTTATTATAAGTAAATAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAGTCTCATTGGTGGGTGGG
TCACGTACCATACCACCAAACATGTTATGCATTGCATAAAAATCATCTCCAATCTTAGCC
ATATCCTCTAGAGTCAAACCCACCTGTTTCCATTAAACTTATCAATACCACAGTAGAAAA
TAGATCAGTTTTTTGAAACTAGTTTATATGATCACAATAAAATTCGTACATCGTCCTGGA
GTCCCTTTAAGAGATCCTTCTGCGATTCCAGCTTATCGTCCGTCTTCTTAAGCCTCTCGG
ACAAGTGCTTCTTAGCATTCTGACCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AS74TF U 1
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AATACCTCTGAGCTTGAAGTTTCTTCGTCTGTAAGTATTATACATGTGTTTGACTTCCCA
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AATGGCAGTAGATAATTGCAAGGGAGCTAAGTGAATGTTCAATTCATATGTTTCTACTCT
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CATAGAGTCGCACAGATGCATTAAACCCATATTCGCAATATCCTGCTCCCATGAAGAAGG
ACAAAAACAGCAGCAAAATAAGTAAACTAGCTCCACAGTGATCCTTACAAATGGCATTTG
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ATCTAATGTTCCACCCTGAAAGAAACGGGAATAGGATGGAATCAGTGCACTATTACACCA
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TCACGTACCATACCACCAAACATGTTATGCATTGCATAAAA*TCATCTCCAATCTTAGC*
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TACACAGTAG

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DS 

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AATGT
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TGAGAGGTGATAATGGCAGTAGATAATTGCAAGGGAGCTAAGTGAATGTTCAATTCATAT
GTTTCTACTCTTCACCAAAGAATAATACTTACCTGCATCATAATATCAGGCATCTTGTGA
TTTTCTCCTCCCATAGAGTCGCACAGATGCATTAAACCCATATTCGCAATATCCTGCTCC
CATGAAGAAGGACAAAAACAGCAGCAAAATAAGTAAACTAGCTCCACAGTGATCCTTACA
AATGGCATTTGAGTTAATAATATTCAGAACATTTATAAGGAGCAAGAATGGACCTGCTTG
TACTCAATACTATCTAATGTTCCACCCTGAAAGAAACGGGAATAGGATGGAATCAGTGCA
CTATTACACCAGTAAGGTTTATTATAAGTAAATAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAGTCTCAT
TGGTGGGTGGGTCACGTACCATACCACCAAACATGTTATGCATTGCATAAAAATCATCTC
CAATCTTAGCCATATCCTCTAGAGTCAAACCCACCTGTTTCCATTAAACTTATCAATACC
ACAGTAGAAAATAGATCAGTTTTTTGAAACTAGTTTATATGATCACAATAAAATTCGTAC
ATCGTCCTGGAGTCCCTTTAAGAGATCCTTCTGCGATTCCAGCTTATCGTCCGTCTTCTT
AAGCCTCTCGGACAAGTGCTTCTTAGCATTCTGACCC

QA 6 822 6 822
DS 



AS 1 2

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AGCGATA


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AM60TF U 1
AF RS1B903TF U 1
BS 1 631 RS1AM60TF
BS 632 727 RS1B903TF

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GGGAGTATCTACTTACCCTCTCGTCCCCGGGCATGAGATTGTTGGTGTGGTGACTGAAGT
GGGAAGCAAAGTGACTAAATTCAAAACTGGATACAAAGTGGTAGTCGGGTGCATGGTCTG
CTCGTGCGGATCATGTGACAGCTGCACCGAAGGTCTCGAGAACTACTGTCCAAAAACGAT
CCAAACGTACGGTTTTAAGTATTACGACGACACAATAAGCTATGGTGGTTACTCAGACAA
CATGGTCTGCGACGAAGGTTTCATCATCCGTATTCCCGAAAATCTCCCACTGGACGCTGC
TGCGCCGCTACTATGCGCGGGGATCGCGGTCTACTCCCCGCTGAAATACCACGGGCTCGA
CAAGCCTGGTATGCACATTGGTGTGGTTGGACTAGGCGGTTTGGGCCATGTGGCGGTGAA
ATTTGCTAGGCTATGGGTCTTAGGTTACGGTTATAGCACTTCGGATAGTAAGAGAGATGA
AGCGATA

QA 1 727 1 727
DS 



AS 1 2

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GAGCTTCTCGGAGTCACAGTAGTGGTGGCGCGTGAGTAAGAGTGAACTCTCTCTCTCTGT
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TATGCAGCAGCGATAAGTCGTGTGGTGTTGGTGTTAGAGGTGGAGGTTATCGTGTGGTGT
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CTGCGGGTTTGTTGTTTTAAGCTCTGGTTTAGTCGTTTATTTGAGGTTCGGTTTTCTTAA
GTTTTTTTCTAGTAAGTTGCCCGGTGTGGGTTTAAGTTGATTTCTTTCAGTCTCGAGTGT
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AGTTGCCCCGGAGTGGGTTCTAGTTGCTGCTTCCATATGGGCTCTTGTTTCTGGGGTTGT
TTCATTAAACCGCCAAGCTTATATTTAAACTCTTGTGTTTCACTTTGGAATGAATATCAA
AACCTTTGAGGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AY41TF U 1
AF RS1AY41JQ C 509
BS 1 695 RS1AY41TF
BS 696 1332 RS1AY41JQ

RD RS1AY41TF 705 0 0
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GAAGACGACCATAGCTCTTCCTCCATAGCTCCGGCGCGTGACTACCCGTGCGTCGCCGGA
CGCAGCTTCTCTCTCTCATTTCTCATTTTTCTTTGCTCACCTCTCCCTCCTTTTTGTAGC
TGTCGTCTTGTTTGGGTCCCTGGTGGTGGTCTCGATGTTAGGGTTCCTAGATCTGTTCCG
GAAAGACTAGATCAGGCGGATGAGTCTTGCTTCTGGTGTCCAAACGCGGCGGCAAGGGTG
GTTGTGGAAGGTGGGTCGGCGTTTAGAGCGTGGCTTTGAGGGTTCTGTTTTCTCTTTTCT
GAGCTTCTCGGAGTCACAGTAGTGGTGGCGCGTGAGTAAGAGTGAACTCTCTCTCTCTGT
TCTTCTAGATTCTCATTCCGGCTTATTGTTCAGCGTAGAGTGAAGCGGCGGGTTTCCCTG
ATTCGAGGCTTGGCGTCTTGCTTTGATTCTTGGTTTTGCTAGCTCTTAAAGGAGGGCTTC
AGATGTGCTAGTGAAAGCTGTGTCTGGCGTGTTTGAAGGCTCGTGCTCGGTTCATCGTGT
TGCCGTGCGGCAGCAGCTCGTTATTTGGGTTTCTTCACTTGCTTTAGCAGACTTTTCTCC
ATGGTAATTGAGCTCAGTGATTGCTTGCCGTGTGT
CACTCTTCTT

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1AY41JQ 824 0 0
TCTTGG
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TCACTTGCTTTAGCAGACTTTTCTCCATGGTAATTGAGCTCAGTGATTGCTTGCCGTGTG
TTCACTCTTCCTTGAGTGCGTCAGGAGAGGTTGATTGGCAAGACTTCATTATTGTGGCTT
TTGGATAGAGCTTCTATCGAGGGTTAGTGGACGCTATGAGTGCGTCGCATACATCCGTAT
CCGAAGGTGGTGACCGAGTGAGTGTTCCCCTTGTCGGGTTATGAAGTTTCTAGTTTGGTT
CCTTGGACGTTATCGATTGGCGGGCGTATGCAGCAGCGATAAGTCGTGTGGTGTTGGTGT
TAGAGGTGGAGGTTATCGTGTGGTGTGGCGACGGATTGGCAGCAACGATATTTCCCCAAT
CATTGGTCTTTACTTGGTTCGAAAGTCTGCGGGTTTGTTGTTTTAAGCTCTGGTTTAGTC
GTTTATTTGAGGTTCGGTTTTCTTAAGTTTTTTTCTAGTAAGTTGCCCGGTGTGGGTTTA
AGTTGATTTCTTTCAGTCTCGAGTGTAGTAGTTAATGGTTGTCTTGGGTTTAGTTGCGGT
TTCTAGTTGTTATGATGTGTTTCTTAAGTTGCCCCGGAGTGGGTTCTAGTTGCTGCTTCC
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GTGTTTCACTTTGGAATGAATATCAAAACCTTTGAGGC

QA 7 824 7 824
DS 



AS 1 2

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ATAGTTATTGGAGTAATCTTATGGGGTGTGAGCTTTATTCTCACCAGAAGAATCTTCTCA
AGCTACTCCTTCGACTTCAGCAACCGTCTTCTCTCAACTGTTCACGCGACAGTCGCTGTC
ACGTTAGCAACTCTCTCTGTTCAAGATTGGTCTTGCCGTTTGTCCCCGTGCTTCTAAGCC
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TATGTTGCCAGTTCGATCAAGTGATCAGCATTGACAATGCGGTTCATCATTTTGTCAGCA
TTCTTGGTTTTGTTGCTGGACTTGCCTACCAAAAGTCTGGATCTGAGATCATAGCTACAC
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ATATCCATCGTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CS46TF U 1
AF RS1CS46JQ C 43
BS 1 248 RS1CS46TF
BS 249 249 RS1CS46JQ
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RD RS1CS46TF 692 0 0
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ATAGTTATTGGAGTAATCTTATGGGGTGTGAGCTTTATTCTCACCAGAAGAATCTTCTCA
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ACGTTAGCAACTCTCTCTGTTCAAGATTGGTCTTGCCGTTTGTCCCCGTGCTTCTAAGCC
ATCTCCCC*AACAGATGGATACAATGGCGTTTTCATTGTCGTACATGATATACGATCTCA
TATGTTGCCAGTTCGATCAAGTGATCAGCATTGACAATGCGGTTCATCATTTTGTCAGCA
TTCTTGGTTTTGTTGCTGGACTTGCCTACCAAAAGTCTGGATCTGAGATCATAGCTACAC
TGTGGATAGCAGAGATATCTAGTCCTTTTTACCATTTAAGGGAGATTCTTAAAGAGATTG
GATACAGAGACACCAGCGTCAACCTAGCAGCTGATGTGTGTTTTGCTACTATCTTCACAT
TGGCGAGAATTGTGTGTGGACCCTTTCTCGTTTACGTAAGTCTAACGGCTGATAATCCCA
TCTTCATCAAG*CAATGGGATCCGGATTACAACTCGTGAGTATATTTTGGTTCTATAAA*
TCTTTGGGATGATGAGATATAAACTATTTAAG

QA 1 692 1 692
DS 

RD RS1CS46JQ 750 0 0
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TCCCCGTGCTTCTAAGCCATCTCCCCCAACAGATGGATACAATGGCGTTTTCATTGTCGT
ACATGATATACGATCTCATATGTTGCCAGTTCGATCAAGTGATCAGCATTGACAATGCGG
TTCATCATTTTGTCAGCATTCTTGGTTTTGTTGCTGGACTTGCCTACCAAAAGTCTGGAT
CTGAGATCATAGCTACACTGTGGATAGCAGAGATATCTAGTCCTTTTTACCATTTAAGGG
AGATTCTTAAAGAGATTGGATACAGAGACACCAGCGTCAACCTAGCAGCTGATGTGTGTT
TTGCTACTATCTTCACATTGGCGAGAATTGTGTGTGGACCCTTTCTCGTTTACGTAAGTC
TAACGGCTGATAATCCCATCTTCATCAAGGCAATGGGATCCGGATTACAACTCGTGAGTA
TATTTTGGTTCTATAAAATCTTTGGGATGATGAGATATAAACTATTTAAGAAGCCAAAGT
CAAACAAAAAGGCTACCTAGGCAGAGACGCAGAAGTTGATTCATACAGTTGTTTTCTTTC
TTCTCTTGTATTTATTAAATATCCATCGTT

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

CO CL8697Contig1 741 2 3 U
GTAAAGCACTGATAATATCTCATCAGTATAATATATTAAGCTATAATAGATAAATCCATA
CAAACATTCGAATTAACTGATAAGCAACGACACAACATAGATAGATAGACAATAACGTAA
ATAATATGCAGAAGTGTCTGTTTGGTTGGGTAAATAGGATAACTCCAATTTAAGCAGGTT
CCTTGACAGGTTCAGGAATCTTGACGTATCCCAGCTTCTTCAAGCTAGCTGCGTCAGACT
CCTCGTTCTCGTAATCATCTTCCTCTTCCTCGAAACTGTACCCGCGGCGATTGACAACCA
GAGCCCAAACGAGGTACATAGTCGCGGCGGTCAAGGCGCCGCACCCGACTCCAAACAAGA
GAGCCATCACGACGCTGAGAATGTCCCTCGTGCGATCTTTGACGTTCTCCGAGACGTAAG
GGAAAGACAGCTGATGAGAAGGACGATTCTCCTCCTCCTGCTGGATCTGATGAGGAGGCT
GCTTCTTCTCGAATCCGTGGCGGTTGACGAAGAAAGGGACGATCGGGCTGGGGTTGAGGC
GGCGGATCGTGAAGACAGTGACGAATCGGGTCGAGGAGAGATCGGATTGGGGATCGAGGG
TGGGGTTTTGCGGAGTTATTGAGAGGGAGTATGAGGAGATGAGGAAGGTTTTGCAGGGAC
GTGCGGAGGTGGGGGAGATTGAAAGGGAAGAGACGGTGATCGCGACGAGGAGGAGGAGGA
GATGGGAGAGGAGGAGGACGA


BQ
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BQ
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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1B576TF U 1
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BS 635 637 RS1B576JQ

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AGTATGACTGCCTTACCAATCGTCGAGACCCAGTCAGGAGATGTTTCAGCTTATATTCCT
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GGAATTAGACCTGCTATTAATGTAGGGATTTCTGTCTCGAGAGTAGGATCTGCCGCTCAA
ATTAAAGCTATGAAACAGGTAGCTGGAAAATTAAAATTGGAATTGGCTCAATTCGCGGAA
TTAGAAGCCTTTGCCCAATTTTTTTCTGATCTCGATAAAGCTACTCGGAATCAATTGGCA
AGAGGTCAACGATTGCGTGAGTTACTGAAACAATCCCAATCAGCCCCTCTCACAGTGGAA
GAACAGATAATGACCATTTATACCGGAACAAATGGTTATCTGGATGGATTAGAAATTGGA
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CAAGAAATAATAGCCTCTACCAAGACATTAACCGCTGAAGCAGAAAGCTTTTTGAAAGAA
GGTATTAAAGAGCAACTGGAACGTTTTCTACTTCAGG

QA 1 637 1 637
DS 

RD RS1B576TF 634 0 0
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AGTATGACTGCCTTACCAATCGTCGAGACCCAGTCAGGAGATGTTTCAGCTTATATTCCT
ACTAATGTAATTTCCATTACAGATGGACAAATATTCTTATCCGCTGATCTTTTTAATACA
GGAATTAGACCTGCTATTAATGTAGGGATTTCTGTCTCGAGAGTAGGATCTGCCGCTCAA
ATTAAAGCTATGAAACAGGTAGCTGGAAAATTAAAATTGGAATTGGCTCAATTCGCGGAA
TTAGAAGCCTTTGCCCAATTTTCTTCTGATCTCGATAAAGCTACTCGGAATCAATTGGCA
AGAGGTCAACGATTGCGTGAGTTACTGAAACAATCCCAATCAGCCCCTCTCACAGTGGAA
GAACAGATAATGACCATTTATACCGGAACAAATGGTTATCTGGATGGATTAGAAATTGGA
CAAGTAAGAAAATTTCTCGTTCAGCTACGCACTTATTTAAAAACAAATAAACCTGAGTTC
CAAGAAATAATAGCCTCTACCAAGACATTAACCGCTGAAGCAGAAAGCTTTTTGAAAGAA
GGTATTAAAGAGCAACTGGAACGTTTTCTACTTC

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 2

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TCCATCTCACATCAAGCCGGTCCATTGATTCTTCTATCTATCCAGCCAGCTTGAGAAGGT
CCCTCTTGGTGCCTGTATCATTTTGGTATCAGAGCTAAAAGCTCCTATCAGGTTATCTCT
TTCCTTTTCATAGATCTTTTCATTGTTTAAAAAAAAAGTTTTGTTTTATTTCTGTTCTTG
TTATTTGATTTTCAGAAAATTGAAAACCATAAAAAAAATGTGTTTCTAGTATTGCTGTTG
TTTATTTGATTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAGTTTGATACTTGTTCATTTCTGTTTATTGC
AGTTTTTGTTATTTTGTGTTCTTGATCATTTTAAATTGAAAACCAGAAAAAAAGGAGGTT
GGAGAAAGATTGATTTCGCGGTAGATCATTTAGGAATTCAAAATAGTTTATTTTCTAGTT
TGCATTCACTTCCCCAGCTCCCCTTGCCATATTTAGATTTTGCATACCATAAGCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1D078TF U 1
AF RS1D078JQ C 153
BS 1 573 RS1D078TF
BS 574 574 RS1D078JQ
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RD RS1D078TF 656 0 0
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CCCTCTTGGTGCCTGTATCATTTTGGTATCAGAGCTAAAAGCTCCTATCAGGTTATCTCT
TTCCTTTTCATAGATCTTTTCATTGTTTAAAAAAAAAGTTTTGTTTTATTTCTGTTCTTG
TTATTTGATTTTCAGAAAATTGAAAACCATAAAAAAAATGTGTTTCTAGTATTGCTGTTG
TTTATTTGATTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAGTTTGATACTTGTTCATTTCTGTTTATTGC
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QA 1 656 1 656
DS 

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TCTATCTATCCAGCCAGCTTGAGAAGGTCCCTCTTGGTGCCTGTATCATTTTGGTATCAG
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AAAAAATGTGTTTCTAGTATTGCTGTTGTTTATTTGATTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAGT
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AAATTGAAAACCAGAAAAAAAGGAGGTTGGAGAAAGATTGATTTCGCGGTAGATCATTTA
GGAATTCAAAATAGTTTATTTTCTAGTTTGCATTCACTTCCCCAGCTCCCCTTGCCATAT
TTAGATTTTGCATACCATAAGCTC

QA 1 504 1 504
DS 



AS 1 2

CO CL8701Contig1 577 2 1 U
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GTCGGTCACAGTCGCCCACGAACTTCTTCAAGCCGGCCACCGCTATTTGGACGTCAGGAC
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AGGGATGTCAAAGAATCCTAACTTCTTGGAACAAGTCTCCTCCCATTTCGGTAAAGCCGA
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TGCTGCTGGTTTCACGGGAGTCAAAGATATCTCCGGTGGCTACTCTGCCTGGACCCAGAA
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GTTAATTGCATCGATATGTCCTATTGTATTTATATAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CB19JQ C 1
AF RS1CB19TF U 1
BS 1 577 RS1CB19TF

RD RS1CB19JQ 577 0 0
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TGCTGCTGGTTTCACGGGAGTCAAAGATATCTCCGGTGGCTACTCTGCCTGGACCCAGAA
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GTTAATTGCATCGATATGTCCTATTGTATTTATATAT

QA 1 577 1 577
DS 

RD RS1CB19TF 577 0 0
GGAGTGTGTTGAGTCCGTCCAGTTATATAATATTATGGCGGAGGGAGTCCCATCATCGGT
GTCGGTCACAGTCGCCCACGAACTTCTTCAAGCCGGCCACCGCTATTTGGACGTCAGGAC
TCCAGAAGAGTTCAGCCAGGGACATGCCTCTGGCGCTATCAACTTTCCTTACTTGAACCG
AGGGATGTCAAAGAATCCTAACTTCTTGGAACAAGTCTCCTCCCATTTCGGTAAAGCCGA
TGAAGTCGTTGTTGGTTGCCAGAGCGGGGGTAGATCTTTGAAAGCCACCGCTGAGCTTCT
TGCTGCTGGTTTCACGGGAGTCAAAGATATCTCCGGTGGCTACTCTGCCTGGACCCAGAA
TGGTCTTCCTACACAATACTGATGATGATGACCCACCACTCACCACCATAATGTCTTTTG
TCTTTTTCTTTGATAATAAATACATCAGGAGTGCGTTTTCCGGATGTAAAATGAACTACT
TTCTCTCTTCCATTGTGTACTTGCAGCTGTTGTACCCACAACTTATGAGTGGGGTGTTGT
GTTAATTGCATCGATATGTCCTATTGTATTTATATAT

QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 2

CO CL8702Contig1 730 2 3 U
TTTTTTATTCAAAGATCAAATTTTATTTATTAATTCATATCAGTATACAAAGAAAAGAAA
ACAATGACCAATCGATAACATTAAACCAAAAACTAATAAAAATTTAAACCAAAATCTAAC
TAACCAAAATCTAATAACTAACCAAAACATGATTAAGCTTAACCTAAACCTAATCTACTG
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CTTACTCCAGCCTCCACAGCCTCTATTCTCCTCAGCCTCCACGGCACCCGCCTGAAGCCA
CGGTTCTCTTACTCCAACCTCCACAACCTCTATTTTCTTACTCATGTCGCACATGTCCTT
GGATCTGTGGTGGTGGTGTCAAACGATCTTCTTCATCCTCGTTGAAGCTCTTGTCGTTGT
TGACCCAAGCTATCGTCTTTTTCTGGTCCTTCATCATCTTTGTAGATTGGTGAAGGACTC
ATTGCTACTTCTCCTGGAGTAAAAGAACCGTGGAGAAATCTACAGAAAAAAGATAAGTTT
GCCAGTCTACAGAAAATAAAGGAGATAGAGTGAAAAAAATAAGTTTGCCAATCTACAGAA
AAATGTAATTTTTGAGAGAAACCTGTAAGATCTGGAAAAGAAGAGACATAAAAAAATAAC
AACTTGCAGATGGAGAGAGATGAGCAGAAGGATATAATTTTCTTAGCCATTGGATCATAG
TTAATGAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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DS 



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BQ
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BQ
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AF RS1FY50JQ C 1
AF RS1FY50TF U 1
BS 1 629 RS1FY50TF

RD RS1FY50JQ 629 0 0
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AGCGTCTTTGAACGCGAAGCTCTTTAAGTACATAGCCGAGTGCTTCAATTCGGAAAAAAG
GAAAAGAAATGGAACAAATGGTGTATATAGTCTCTGTTGTTTTCACTTGTCTTGCTCTTC
TTATCATCCCTGTTATCTTCGTAACTCGGCGTCTAAGTGTTCATCTCTCCTTCAAAAACA
TCCTCAGATTCATTAAACTCGTAGCTTCTCAACTCGATGATGAGGAAGAGAATAACGAGA
AAGGGTACGTCTGCTTTTGTTAATCATATTTTTTACGTGTTAAGAGCTCCTTAATAATTA
ATTATAGTATAGTTTGTGGTAAATTGAACAGTCTCCTTGAGTCTAATCTGAAATATTTAA
CTAACCACCCCTGTATTTTGGAGTAGCAAATTATGTATGTTCTTCTACCAACCTAATTAA
GAAAACTATTTGATTTATCCAATTTTTTTTGACAGTTTTCGTCTTATTGTAGAGTGTGAG
TCCATATTGATAGAACTACGTGGTTATTTGTCCTTAAAATCAATGCCGATACATCTTACT
CAAATAAAATCCCTCACATTTCAAGTTGC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RS1FY50TF 629 0 0
GGGTAGCATCTAGAGGAGCCAGAGAGCGAGAGAGAGAGAGAAACCATTACATTGATCATG
AGCGTCTTTGAACGCGAAGCTCTTTAAGTACATAGCCGAGTGCTTCAATTCGGAAAAAAG
GAAAAGAAATGGAACAAATGGTGTATATAGTCTCTGTTGTTTTCACTTGTCTTGCTCTTC
TTATCATCCCTGTTATCTTCGTAACTCGGCGTCTAAGTGTTCATCTCTCCTTCAAAAACA
TCCTCAGATTCATTAAACTCGTAGCTTCTCAACTCGATGATGAGGAAGAGAATAACGAGA
AAGGGTACGTCTGCTTTTGTTAATCATATTTTTTACGTGTTAAGAGCTCCTTAATAATTA
ATTATAGTATAGTTTGTGGTAAATTGAACAGTCTCCTTGAGTCTAATCTGAAATATTTAA
CTAACCACCCCTGTATTTTGGAGTAGCAAATTATGTATGTTCTTCTACCAACCTAATTAA
GAAAACTATTTGATTTATCCAATTTTTTTTGACAGTTTTCGTCTTATTGTAGAGTGTGAG
TCCATATTGATAGAACTACGTGGTTATTTGTCCTTAAAATCAATGCCGATACATCTTACT
CAAATAAAATCCCTCACATTTCAAGTTGC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 2

CO CL8705Contig1 684 2 1 U
GGAAGACCACCTTCGTAAACGTAGACATTACGTATAAGCAAAAAAAAAGAGAAAAAAAAT
ACACAAAACTCTTTATTCGATTCTTAAAACAATTCTCAACATGCCGGCGACTTCTCACCG
TTTGAAACCTCTCGTTGTCGCTATCTTCATCGCGATCGCGTTTCCGATGATGATCAACGC
ATTGGATTCTCCAGCCGCAAGAAAACTCGATGAGGAACCAATAAAGTGCACGCCATGTCT
CCAAAAGCCTCCCCCTCCTCCGTCACCTCCACCACCGTCTCCTTCTTGTCCTCCTCCACC
ACGGCCTCCTTCTCCCCCGAAGAAGTCTTACTGTCCGCCTCCTCCGTCGACTTACATATA
CATGACGGGTCCACCAGGAGAGTTGTATCCCGTTGACCAACAGTTTGGAGAGGCTGCTGC
AAAGAGCTTAGGGGTCGTGAAGATCTCTGGCCTGATCGCGTTTGGAGTTATGGGGTTCTT
GATGATCATGATTTGATGGATTTTCCATTGTTTAATCGTCTCATAGATTCGTTTTGCTTG
AACGGATCGGTATAATTATGTTCCTGATAACTCATAGTTATTTCCGGTGAAATTAACGAT
TTGGATTATGTTTTTATCTCAAGTTAGGACCGATTTATCATTTTTCGTTGTATCAACAAT
TCTAATGTATATGCTTATTCAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EZ82TF U 1
AF RS1EZ82JQ C 48
BS 1 684 RS1EZ82TF

RD RS1EZ82TF 684 0 0
GGAAGACCACCTTCGTAAACGTAGACATTACGTATAAGCAAAAAAAAAGAGAAAAAAAAT
ACACAAAACTCTTTATTCGATTCTTAAAACAATTCTCAACATGCCGGCGACTTCTCACCG
TTTGAAACCTCTCGTTGTCGCTATCTTCATCGCGATCGCGTTTCCGATGATGATCAACGC
ATTGGATTCTCCAGCCGCAAGAAAACTCGATGAGGAACCAATAAAGTGCACGCCATGTCT
CCAAAAGCCTCCCCCTCCTCCGTCACCTCCACCACCGTCTCCTTCTTGTCCTCCTCCACC
ACGGCCTCCTTCTCCCCCGAAGAAGTCTTACTGTCCGCCTCCTCCGTCGACTTACATATA
CATGACGGGTCCACCAGGAGAGTTGTATCCCGTTGACCAACAGTTTGGAGAGGCTGCTGC
AAAGAGCTTAGGGGTCGTGAAGATCTCTGGCCTGATCGCGTTTGGAGTTATGGGGTTCTT
GATGATCATGATTTGATGGATTTTCCATTGTTTAATCGTCTCATAGATTCGTTTTGCTTG
AACGGATCGGTATAATTATGTTCCTGATAACTCATAGTTATTTCCGGTGAAATTAACGAT
TTGGATTATGTTTTTATCTCAAGTTAGGACCGATTTATCATTTTTCGTTGTATCAACAAT
TCTAATGTATATGCTTATTCAATT

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1EZ82JQ 637 0 0
AGAGAAAAAAAATACACAAAACTCTTTATTCGATTCTTAAAACAATTCTCAACATGCCGG
CGACTTCTCACCGTTTGAAACCTCTCGTTGTCGCTATCTTCATCGCGATCGCGTTTCCGA
TGATGATCAACGCATTGGATTCTCCAGCCGCAAGAAAACTCGATGAGGAACCAATAAAGT
GCACGCCATGTCTCCAAAAGCCTCCCCCTCCTCCGTCACCTCCACCACCGTTTCCTTTTT
GTCCTCCTCCACCACGGCCTCCTTCTCCCCCGAAGAAGTCTTACTGTCCGCCTCCTCCGT
CGACTTACATATACATGACGGGTCCACCAGGAGAGTTGTATCCCGTTGACCAACAGTTTG
GAGAGGCTGCTGCAAAGAGCTTAGGGGTCGTGAAGATCTCTGGCCTGATCGCGTTTGGAG
TTATGGGGTTCTTGATGATCATGATTTGATGGATTTTCCATTGTTTAATCGTCTCATAGA
TTCGTTTTGCTTGAACGGATCGGTATAATTATGTTCCTGATAACTCATAGTTATTTCCGG
TGAAATTAACGATTTGGATTATGTTTTTATCTCAAGTTAGGACCGATTTATCATTTTTCG
TTGTATCAACAATTCTAATGTATATGCTTATTCAATT

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 2

CO CL8706Contig1 600 2 2 U
CGATAAAAACACTATCAAATCTTAGAGGTCAAGATCGAAACTTTACAGGTAGGATAAATT
CAAAACTTGTGATGAACATTAGTAGTATCATCAATCACATGAAAGAGAAACTAACTTAGA
GGCCAAGTTCGAAACTTTACAATCACCAAACACCAAAATCTGCAAGCTTGAGCACTCAGT
TTCTTAATCTCCCTCCCCAATAGAGAAATCATCCCCTTTTGAACCTTTCTTCTTATGTTT
CTTGCATCTCGGATCATCGCAGCTGCAGAAGAAAAAGACATGACGATGACAATTGTGGGA
GTGTTACAGATTGCGGCAGTGGCGTTGAGTGAAAAAGAGTGAGAAGAGATTAGAATTTGC
CATTAGCGCAACGTTTAGAGTAGATCTGGTGTTCTTGAGAGCTATGGCGTAAATAGAGTA
TGTGGTAACGCTTCTTCGTTCTCAATCTTGGACTGAGCACAAATCATCTTCTTCCTTGCT
CTCTGTAAGTCAAGCGCTCTCTCTCACCATTATTTTTTTCCGATATGTCTGAAATACGAG
AGAGGAGATATCTAATACTAATAGATCAATGGGAAAGTTTTTTTGGTTTTTTGAGATTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CU66TF C 1
AF RS1CU66JQ U 50
BS 1 49 RS1CU66TF
BS 50 600 RS1CU66JQ

RD RS1CU66TF 600 0 0
CGATAAAAACACTATCAAATCTTAGAGGTCAAGATCGAAACTTTACAGGTAGGATAAATT
CAAAACTTGTGATGAACATTAGTAGTATCATCAATCACATGAAAGAGAAACTAACTTAGA
GGCCAAGTTCGAAACTTTACAATCACCAAACACCAAAATCTGCAAGCTTGAGCACTCAGT
TTCTTAATCTCCCTCCCCAATAGAGAAATCATCCCCTTTTGAACCTTTCTTCTTATGTTT
CTTGCATCTCGGATCATCGCAGCTGCAGAAGAAAAAGACATGACGATGACAATTGTGGGA
GTGTTACAGATTGCGGCAGTGGCGTTGAGTGAAAAAGAGTGAGAAGAGATTAGAATTTGC
CATTAGCGCAACGTTTAGAGTAGATCTGGTGTTCTTGAGAGCTATGGCGTAAATAGAGTA
TGTGGTAACGCTTCTTCGTTCTCAATCTTGGACTGAGCACAAATCATCTTCTTCCTTGCT
CTCTGTAAGTCAAGCGCTCTCTCTCACCATTATTTTTTTCCGATATGTCTGAAATACGAG
AGAGGAGATATCTAATACTAATAGATCAATGGGAAAGTTTTTTTGGTTTTTTGAGATTCC

QA 1 600 1 600
DS 

RD RS1CU66JQ 551 0 0
TAGGATAAATTCAAAACTTGTGATGAACATTAGTAGTATCATCAATCACATGAAAGAGAA
ACTAACTTAGAGGCCAAGTTCGAAACTTTACAATCACCAAACACCAAAATCTGCAAGCTT
GAGCACTCAGTTTCTTAATCTCCCTCCCCAATAGAGAAATCATCCCCTTTTGAACCTTTC
TTCTTATGTTTCTTGCATCTCGGATCATCGCAGCTGCAGAAGAAAAAGACATGACGATGA
CAATTGTGGGAGTGTTACAGATTGCGGCAGTGGCGTTGAGTGAAAAAGAGTGAGAAGAGA
TTAGAATTTGCCATTAGCGCAACGTTTAGAGTAGATCTGGTGTTCTTGAGAGCTATGGCG
TAAATAGAGTATGTGGTAACGCTTCTTCGTTCTCAATCTTGGACTGAGCACAAATCATCT
TCTTCCTTGCTCTCTGTAAGTCAAGCGCTCTCTCTCACCATTATTTTTTTCCGATATGTC
TGAAATACGAGAGAGGAGATATCTAATACTAATAGATCAATGGGAAAGTTTTTTTGGTTT
TTTGAGATTCC

QA 1 551 1 551
DS 



AS 1 2

CO CL8707Contig1 808 2 2 U
GGAATTGAATCGGGGGAGAGAATCGTCGATTCGGGAAGCGAAGAACTAGCGAGCTAGAAT
CGATAGTCATCCCGCGAAATTAGTGATTTTCCTCTGTTGTTTCTGTAGACTTTCCCATGG
CGGATGGGTACTGGAACCATCCTCCAGGTCCAGGTGGTGGTTTTGATCCATTAGATTCTG
TTGACAGGCGTAGTAACAACCGTGAGCCGCTTCCTCTCCCTCCAGATGCCTCCAACACTC
TCTACGTTGAAGGTCTTCCTTCTAATTGCTCTAGGAGGGAAGTTTCTCATATCTTTCGAC
CTTTTGTAGGATATAGAGAAGCCAGGCTTGTGACCAAAGACTCCAAACACCGCAACGGAG
ATCCTGTTGTTCTTTGCTTTGTTGATTTTACAAGCCCTGCCTGTGCAGCAACTGCTCTTA
GCACCTTACAAGGCTACCGAATGGATGAAAACGACCCTGGTTCCAAGTTCTTACGGCTTC
AGTTTTCAAGAAAACCAACTTCAAGACCGGGACAACGAGTAAGGAGGTGATGATGCCCTA
CATCAAAACCAAATGGTTATTTATTGTCTCTGCGTGTCTGCTAAGTTTTAGCGAGAAGAG
ACATATACCTACTTCAATGAAACCGAACATTACATCACTCGTTTGTATCATTGTATTGTT
AACACAACCGGAGTCCAAGAGAAACAAATATGGAGTGTAGAATCTGTGATAGAAACTTAA
AAAGGCTATTTATTATATTTGGTTCCTTTCCAAGATTTCGAACTCGTCTTGTTATAAAGT
TGTGTTGTTGGTATCAAATGTTCATAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

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BQ
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QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1FF68JQ C 1
AF RS1FF68TF U 1
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QA 1 630 1 630
DS 

RD RS1FF68TF 630 0 0
GAAACACAAAAAGAATCATTTAGTTTGCATCATTTGCACTTCTAGGAGAGTCTAGAGCAT
ATAGGTTGTATTCATTTGCATTGGGAGCAATGATTTAAAATGCCTTGTAGAGAGCACTGT
CTAGCCTTGTATAGTTCATGCACCTCTCTTGAAAACCTTGTAAGCTTCGTGCCTTGAAAG
CTCTCCCTGAAACTCAATCTCTTAAGCCAACTACAACCTTGAATGAACTGAATGAACCTA
ATTTCTTGCTCATGGTCCCTTGTGTGCTAAGTCATGGATATACACACTAGAATTGTCGCG
CCTTTTATGCCGATCTTTTTGACAATCTCTAGTGGCACTCCACTCCCTAAAACCCTCTCC
TCCTTTTAAGCCTTAATTGATTGTTGAGTGAGGCCTTTTTCGGAAAGTCTTACATGTGCA
TAATCTTGAGAGTATTGGGAACGACAATGCTCAGTCTTCATCCTTGCTAGATTGGATACC
ATATTGTCTAGCCATAGGTGGGGGGTGAGTGTTGTAAAGTTTTACTTGGGAACTTGAAAG
TTGAATGGGAATGAATGAACTCTTGTGCTTAATTGTCTTATTGGGAATTGTATAAACCTC
TAGCTCAAAGTTATGAAAGTCTTGGCCCCC

QA 1 630 1 630
DS 



AS 1 2

CO CL8710Contig1 734 2 14 U
GATATGAAGACAAAAACCGTGCTGATAGATCCGGAGCTGTGAGTGCCATTGAGAAGGAAA
CTCGTGCAGCTAAACCAACATTTTCGAAAACTGGGCCACCGAAAATGGAACTTCAAATGG
GTCGCAAGTGGGCTGTTGAGAACCAAATAGGGAAGAAGGACTTGGTTATCAGCGAGTGTG
ATTCCAAACAGTCTGTCTATGTATTTGGTGCAAAGATTCTGTCTTGCAGATACAAGGAAA
AGTTAATAACATCACCATTGACAAATGCACCAAATTGGGTGTTGTCTTCACGGATGTTGT
TGCTGCATTTGAGATTGTGAATTGCACCAACGTAGAAGTACAATGTCAGGGTTCAGCTCC
CACGGTTTCTGTGGACAACACAACTGGCTGTCAGTTATACCTAAACAAAGACTCATTAGA
AACAGCTATAACAACAGCCAAGTCGAGTGAGATCAACGTAATGGTCCCTGGTACTTCCCC
TGATGGAGATTGGGTGGAACATGCACTGCCGCAACAGTACAACCATGTGTTCACTGAAGG
GAAGTTCGAGACGACACCGGTCTCGCACTCAGGTGCCTAAGTTAAAAGGGAATCTCTCTC
TCTCTTTTCAGTTTGGATTTTGCTTAAATATCACGTTTTTTTTAACTTGTTTTTTTCAGA
TTATAATAGAGCAGAATCTGTTTGTTTGTGGTTCTGTGTCTATATTTTGGAATGGAGGTT
CTTTTGGTTGTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GX81TF U 1
AF RS1GX81JQ C 221
BS 1 243 RS1GX81TF
BS 244 244 RS1GX81JQ
BS 245 300 RS1GX81TF
BS 301 301 RS1GX81JQ
BS 302 337 RS1GX81TF
BS 338 338 RS1GX81JQ
BS 339 352 RS1GX81TF
BS 353 353 RS1GX81JQ
BS 354 393 RS1GX81TF
BS 394 394 RS1GX81JQ
BS 395 418 RS1GX81TF
BS 419 419 RS1GX81JQ
BS 420 438 RS1GX81TF
BS 439 734 RS1GX81JQ

RD RS1GX81TF 438 0 0
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GTCGCAAGTGGGCTGTTGAGAACCAAATAGGGAAGAAGGACTTGGTTATCAGCGAGTGTG
ATTCCAAACAGTCTGTCTATGTATTTGGTGCAAAGATTCTGTCTTGCAGATACAAGGAAA
AGT*AATAACATCACCATTGACAAATGCACCAAATTGGGTGTTGTCTTCACGGATGTTGT
*GCTGCATTTGAGATTGTGAATTGCACCAACGTAGAA*TACAATGTCAGGGT*CAGCTCC
CACGGTTTCTGTGGACAACACAACTGGCTGTCA*TTATACCTAAACAAAGACTCATTA*A
AACAGCTATAACAACAGC

QA 1 438 1 438
DS 

RD RS1GX81JQ 514 0 0
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GTTGTCTTCACGGATGTTGTTGCTGCATTTGAGATTGTGAATTGCACCAACGTAGAAGTA
CAATGTCAGGGTTCAGCTCCCACGGTTTCTGTGGACAACACAACTGGCTGTCAGTTATAC
CTAAACAAAGACTCATTAGAAACAGCTATAACAACAGCCAAGTCGAGTGAGATCAACGTA
ATGGTCCCTGGTACTTCCCCTGATGGAGATTGGGTGGAACATGCACTGCCGCAACAGTAC
AACCATGTGTTCACTGAAGGGAAGTTCGAGACGACACCGGTCTCGCACTCAGGTGCCTAA
GTTAAAAGGGAATCTCTCTCTCTCTTTTCAGTTTGGATTTTGCTTAAATATCACGTTTTT
TTTAACTTGTTTTTTTCAGATTATAATAGAGCAGAATCTGTTTGTTTGTGGTTCTGTGTC
TATATTTTGGAATGGAGGTTCTTTTGGTTGTTTG

QA 1 514 1 514
DS 



AS 1 2

CO CL8711Contig1 634 2 1 U
GGCTCTAAGACCAAACAAAGAGCTTCTGCGATTTTCCTGTTCCGTAATCTCGCAGTGATT
TTTTGGGAAGGAGATGGGTTTCATAATGGAGTTTGCGGAGAATCTGGTGCTGAGGTTGAT
GGAGGATCCGGAGGTGAGAGACAGGAAAGCGAGGGAGCACATATATGAGATGCACGAGAG
GTGCAAGAAGATTAAGGAGATGTGGGCTTTGCCTATTCGTCCTTATGGTTTCTGGACTTT
TGAGCGTCACAACGCTCAGCTTCGTTGGGATCCTCAGATCAGTCAGGTTGCTGGTCGTAG
GGACCCTTATGATGATCTCCTTCAGGACCACCCTTCTTCCTCAAACTAATCATTCAATGG
CAGAAGATGTGTTGTGATGATGTCTGGATAGATGCATGTGTCTCTGTTTCAGTTCCCGAT
TGTACTCCCTTCGTTGCTTTTTTCTTTCAGGTGTTTTGAAGCGTGGTACAAACTCAATAA
TAATCACTGTAGACTTGTTTACAAATGAGAGAGGAGTATACTCTTATTGTTTCTTAGTAA
AGTTGTTTTGATTTTCCATTTGCATCTTTGAATATGAATATACTTTCTGAAATGTGATGA
GATTTTTTTCATGTTATGTATATTTTTGTTACCC


BQ
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AF RS1G238JQ C 1
AF RS1G238TF U 1
BS 1 634 RS1G238TF

RD RS1G238JQ 634 0 0
GGCTCTAAGACCAAACAAAGAGCTTCTGCGATTTTCCTGTTCCGTAATCTCGCAGTGATT
TTTTGGGAAGGAGATGGGTTTCATAATGGAGTTTGCGGAGAATCTGGTGCTGAGGTTGAT
GGAGGATCCGGAGGTGAGAGACAGGAAAGCGAGGGAGCACATATATGAGATGCACGAGAG
GTGCAAGAAGATTAAGGAGATGTGGGCTTTGCCTATTCGTCCTTATGGTTTCTGGACTTT
TGAGCGTCACAACGCTCAGCTTCGTTGGGATCCTCAGATCAGTCAGGTTGCTGGTCGTAG
GGACCCTTATGATGATCTCCTTCAGGACCACCCTTTTTCCTCAAACTAATCATTCAATGG
CAGAAGATGTGTTGTGATGATGTCTGGATAGATGCATGTGTCTCTGTTTCAGTTCCCGAT
TGTACTCCCTTCGTTGCTTTTTTCTTTCAGGTGTTTTGAAGCGTGGTACAAACTCAATAA
TAATCACTGTAGACTTGTTTACAAATGAGAGAGGAGTATACTCTTATTGTTTCTTAGTAA
AGTTGTTTTGATTTTCCATTTGCATCTTTGAATATGAATATACTTTCTGAAATGTGATGA
GATTTTTTTCATGTTATGTATATTTTTGTTACCC

QA 1 634 1 634
DS 

RD RS1G238TF 634 0 0
GGCTCTAAGACCAAACAAAGAGCTTCTGCGATTTTCCTGTTCCGTAATCTCGCAGTGATT
TTTTGGGAAGGAGATGGGTTTCATAATGGAGTTTGCGGAGAATCTGGTGCTGAGGTTGAT
GGAGGATCCGGAGGTGAGAGACAGGAAAGCGAGGGAGCACATATATGAGATGCACGAGAG
GTGCAAGAAGATTAAGGAGATGTGGGCTTTGCCTATTCGTCCTTATGGTTTCTGGACTTT
TGAGCGTCACAACGCTCAGCTTCGTTGGGATCCTCAGATCAGTCAGGTTGCTGGTCGTAG
GGACCCTTATGATGATCTCCTTCAGGACCACCCTTCTTCCTCAAACTAATCATTCAATGG
CAGAAGATGTGTTGTGATGATGTCTGGATAGATGCATGTGTCTCTGTTTCAGTTCCCGAT
TGTACTCCCTTCGTTGCTTTTTTCTTTCAGGTGTTTTGAAGCGTGGTACAAACTCAATAA
TAATCACTGTAGACTTGTTTACAAATGAGAGAGGAGTATACTCTTATTGTTTCTTAGTAA
AGTTGTTTTGATTTTCCATTTGCATCTTTGAATATGAATATACTTTCTGAAATGTGATGA
GATTTTTTTCATGTTATGTATATTTTTGTTACCC

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 2

CO CL8712Contig1 903 2 16 U
GAACCTTATCTACTTCATCTTCATCTTCATCATCATCATCATCCTCGTCGTCATCTTCAT
CCTCATCTGAAACGTTCTGCAACAAGAAAGAACTATATATAAAAAATAACTTGACGTATG
GAAACGAACATGATGTGTTGCTTCACATACCTTGTCACCACCTGAAGTGTTCCCTTTCTC
CAAAACATGCTCATGTTTTGATTCCTTATACTCTTTGGGAGGTTTGGTTGAAATGAGAAT
ACGTTTTTTCAAAAACTCTGGCGATGGGAGTTCCTTCAAGCATTCTCCAGAAGGAGGAGC
AAACAGCATGTCTCCAAATGTTTCAGTAAGCATCTAAGATTAATACAACAAAAGAAAAAA
ATAAGACCATCTAATATTATCACAGAAACGGAAAATAATCTCTCACACACACCCACCTCA
GCAACTTTAGCCTGGAGTTGTGGAGTAAGATGATCTTCAAGAGTTACAACAACGGGATAA
TCAGATACATCGAAGGCGTGCGTTTTAATAGCTCTTAGACATTTGATCAGCTCCACAGGT
GACGTGAGAGTCCTGAATGAAATAGGTACAATACATATTAATTGATATACAAGAAGAGAA
CAATAAACACTTAACCCTGATTCATTGACCAATCAATGAAATGTTATTTTTTTTGACAAA
GGGCTTTTATGCAATCAATGAAATGTTTCAGTTGCATTATACCTTCCATGAACAACATCA
ATACCGTCTTCATCAGAGTTTGGCCAAAGATCCAATTCAATGACCTTAACACCTTTTTGC
AATGCTTCTATTATAGGTACTTCACTGCAGTCACTACTCAGCTGGTTACCCGTTAAATAC
GAATTATGCCCTGTGAATATGAAATAATGTGACAATGGATCATTCATGTCTTGATGCACC
TGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 

AF RS1D126TF U 1
AF RS1D126JQ C 166
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BS 798 826 RS1D126TF
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RD RS1D126TF 829 0 0
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GAAACGAACATGATGTGTTGCTTCACATACCTTGTCACCACCTGAAGTGTTCCCTTTCTC
CAAAACATGCTCATGTTTTGATTCCTTATACTCTTTGGGAGGTTTGGTTGAAATGAGAAT
ACGTTTTTTCAAAAACTCTGGCGATGGGAGTTCCTTCAAGCATTCTCCAGAAGGAGGAGC
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ATAAGACCATCTAATATTATCACAGAAACGGAAAATAATCTCTCACACACACCCACCTCA
GCAACTTTAGCCTGGAGTTGTGGAGTAAGATGATCTTCAAGAGTTACAACAACGGGATAA
TCAGATACATCGAAGGCGTGCGTTTTAATAGCTCTTAGACATTTGATCAGCTCCACAGGT
GACGTGAGAGTCCTGAATGAAATAGGTACAATACATATTAATTGATATACAAGAAGAGAA
CAATAAACACTTAACCCTGATTCATTGACCAATCAATGAAATGTTATTTTTTT*GACAAA
GGGCTTTTATGCAATCAATGAAATGTTTCAGTTGCATTATACCTTCCATGAACAACATCA
ATACCGTCTTCATCAGAGTTTGGCCAA*GATCCAATTCA*TGAC*TTTACACCTTTTTGC
A*TGCTTCTATTATAG*TACTTCACTGCAGTCACTACTCAGCTGGT
ACC

QA 1 826 1 826
DS 

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GGTTGAAATGAGAATACGTTTTTTCAAAAACTCTGGCGATGGGAGTTCCTTCAAGCATTC
TCCAGAAGGAGGAGCAAACAGCATGTCTCCAAATGTTTCAGTAAGCATCTAAGATTAATA
CAACAAAAGAAAAAAATAAGACCATCTAATATTATCACAGAAACGGAAAATAATCTCTCA
CACACACCCACCTCAGCAACTTTAGCCTGGAGTTGTGGAGTAAGATGATCTTCAAGAGTT
ACAACAACGGGATAATCAGATACATCGAAGGCGTGCGTTTTAATAGCTCTTAGACATTTG
ATCAGCTCCACAGGTGACGTGAGAGTCCTGAATGAAATAGGTACAATACATATTAATTGA
TATACAAGAAGAGAACAATAAACACTTAACCCTGATTCATTGACCAATCAATGAAATGTT
ATTTTTTTTGACAAAGGGCTTTTATGCAATCAATGAAATGTTTCAGTTGCATTATACCTT
CCATGAACAACATCAATACCGTCTTCATCAGAGTTTGGCCAAAGATCCAATTCAATGACC
TTAACACCTTTTTGCAATGCTTCTATTATAGGTACTTCACTGCAGTCACTACTCAGCTGG
TTACCCGTTAAATACGAATTATGCCCTGTGAATATGAAATAATGTGACAATGGATCATTC
ATGTCTTGATGCACCTGC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

CO CL8713Contig1 847 2 8 U
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CTCAAATCTCCCAAATGGCCAATATGGGTCGTTGGCAGCGAGTCACATTACACCGTGCTA
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AGAAGAGCTTTTGATGCAAGAGACCAGAGCGGAGGGGGAGGTTTCATCAGCGTGGAGGTC
TTTCAACAAGTTGTTCAGGAAACAAACATTAGACTGCCAACTGAGAAGATGAATGAGATA
TGCGCCATGGGGTTCATTGTGTGGAGCGAGTTATGGCAAGTGATGTTGGAGTTAGACAGA
AACTTGGGAGGGATCAAAGATTCATCAGGGATGATGGGAAAGAAAGTGTTTGATGTTTAT
CACTTCAATGGGATTGCTAAATCAGATATAAACGGTGGTGGTCAAGCTATGGCTGTGGAA
GGTGGGACGGTTCCTATGCAAAGGCCAAGGCTCACGAAACTAAACGTCTCTGTTCCTCCT
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CCTAAGCCGCCACAGCATGCACCATTGGTGGATTGTATCAGAACTCGGTGGTCACGAGCC
ACTTGTAGTTGGGCTGGGGATCCTCCAAGTATTGTCTGAAGAATGTTATATTATGGGAAA
AAACCGGGAAACTGCTGATTTGATTTGGTGGTTTAGACGCGTTTGAACTTTCTGTGCGTT
GTCCGTTTTTCCTTTTGTTGTATTAAATATAGAACTTTTGTTATTTGTTGAGATTAAACA
TTATTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FW64TF U 1
AF RS1FW64JQ C 138
BS 1 699 RS1FW64TF
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RD RS1FW64TF 795 0 0
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CTCAAATCTCCCAAATGGCCAATATGGGTCGTTGGCAGCGAGTCACATTACACCGTGCTA
TTTGCACTCGATCCGTCTGTCCAGGAAGAAAACGAACTTGAGCTGAGAGAGTCTCAGATA
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TTTCAACAAGTTGTTCAGGAAACAAACATTAGACTGCCAACTGAGAAGATGAATGAGATA
TGCGCCATGGGGTTCATTGTGTGGAGCGAGTTATGGCAAGTGATGTTGGAGTTAGACAGA
AACTTGGGAGGGATCAAAGATTCATCAGGGATGATGGGAAAGAAAGTGTTTGATGTTTAT
CACTTCAATGGGATTGCTAAATCAGATATAAACGGTGGTGGTCAAGCTATGGCTGTGGAA
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CCTAAGCCGCCACAGCATGCACCATTGGTGGATTGTATCAGAACTCGGTGGTCACGAGCC
ACTTGTAGTTGGGCTGGGGATCCTCCAAGTATTGTCTGA*GAATGTTATATTATGGGAAA
AA*CCGGGAAACTGCTGATTTGATTTGGTGGTTTAGACGCGTTTGA*CTTTCTGTGCGT
GTCGTTTTCCTTTTGT

QA 1 779 1 779
DS 

RD RS1FW64JQ 710 0 0
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TGTGTGGAGCGAGTTATGGCAAGTGATGTTGGAGTTAGACAGAAACTTGGGAGGGATCAA
AGATTCATCAGGGATGATGGGAAAGAAAGTGTTTGATGTTTATCACTTCAATGGGATTGC
TAAATCAGATATAAACGGTGGTGGTCAAGCTATGGCTGTGGAAGGTGGGACGGTTCCTAT
GCAAAGGCCAAGGCTCACGAAACTAAACGTTTCTGTTCCTCCTAAATGGACACCAGAAGA
GTACATGACCAGCAGCTCTGAGAAGGACTCAGAAGTTAACCAGCCTAAGCCGCCACAGCA
TGCACCATTGGTGGATTGTATCAGAACTCGGTGGTCACGAGCCACTTGTAGTTGGGCTGG
GGATCCTCCAAGTATTGTCTGAAGAATGTTATATTATGGGAAAAAACCGGGAAACTGCTG
ATTTGATTTGGTGGTTTAGACGCGTTTGAACTTTCTGTGCGTTGTCCGTTTTTCCTTTTG
TTGTATTAAATATAGAACTTTTGTTATTTGTTGAGATTAAACATTATTTG

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

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GGATGCTCATCGAACTGCAAAAGATAAAAATAAAAAATAAAAAAAAATAACAAGAAGAGA
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GTGAGTAATGTGGCTGCGAGAGATGGTGTGATTCTTTGGCAGAGATAAAGAGGAGAAGAC
TTTCATAGGAGGTGGAAAGGGCTTTGGAGGAGCTTTTGGTAAAGGAGGTGGGATAGGCAA
AGGTGGAGGCATTCTTGGCGGCGGCATTGGTAAAGGCGGTGGCTTCGGAAAAGGAGGAGG
AGTTGGCTTTGGAAAAGGTGATGGCTTCGGTGGTGGAATAGGCAAAGGTGGTGGTTTTGG
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CGGTGGTGGAATAGGCAAAGGCTTTGCCTTCGGCGGTGGTTTTGGCGGAGGAATAGGCAA
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AGCTTTTGCACTACCTATCTATCTATGCTTGTTTCATTTTTATCATGAATCTTATTCCCT
CACAAAAGAATCAAAAGCTACACTTTTTTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FQ22TF U 1
AF RS1FQ22JQ C 93
BS 1 722 RS1FQ22TF
BS 723 752 RS1FQ22JQ

RD RS1FQ22TF 722 0 0
GGATGCTCATCGAACTGCAAAAGATAAAAATAAAAAATAAAAAAAAATAACAAGAAGAGA
CATGGGGCGTCTCGTAAACGGAGCTGGCCTCTTGGTTTTGTTATGTTTCAATGTTTTGTG
GTGAGTAATGTGGCTGCGAGAGATGGTGTGATTCTTTGGCAGAGATAAAGAGGAGAAGAC
TTTCATAGGAGGTGGAAAGGGCTTTGGAGGAGCTTTTGGTAAAGGAGGTGGGATAGGCAA
AGGTGGAGGCATTCTTGGCGGCGGCATTGGTAAAGGCGGTGGCTTCGGAAAAGGAGGAGG
AGTTGGCTTTGGAAAAGGTGATGGCTTCGGTGGTGGAATAGGCAAAGGTGGTGGTTTTGG
CGGTGGGTTCGGAAAAGGAGGAATAGGCAAAGGTGGTGGCTTTGGAAAAGGTGGTGGCAT
CGGTGGTGGAATAGGCAAAGGCTTTGCCTTCGGCGGTGGTTTTGGCGGAGGAATAGGCAA
AGGCGGTGGCTTTGGTAAAGGAGGTGGCTTCGGTGGAGGGATAGGCAAAGGCTTTGGCGG
TGGTAAGATTGGACACCACTGACATAAAACAAGAAGAATGACTAGTTGCACTGCATGAGC
GACTTGGGGAATAAAATAGCTTAGCTTCCACGTATCTGTCTAATTATAAGTTTTCATATG
AGCTTTTGCACTACCTATCTATCTATGCTTGTTTCATTTTTATCATGAATCTTATTCCCT
CA

QA 1 722 1 722
DS 

RD RS1FQ22JQ 660 0 0
TGGTTTTGTTATGTTTCAATGTTTTGTGGTGAGTAATGTGGCTGCGAGAGATGGTGTGAT
TCTTTGGCAGAGATAAAGAGGAGAAGACTTTCATAGGAGGTGGAAAGGGCTTTGGAGGAG
CTTTTGGTAAAGGAGGTGGGATAGGCAAAGGTGGAGGCATTCTTGGCGGCGGCATTGGTA
AAGGCGGTGGCTTCGGAAAAGGAGGAGGAGTTGGCTTTGGAAAAGGTGATGGCTTCGGTG
GTGGAATAGGCAAAGGTGGTGGTTTTGGCGGTGGGTTCGGAAAAGGAGGAATAGGCAAAG
GTGGTGGCTTTGGAAAAGGTGGTGGCATCGGTGGTGGAATAGGCAAAGGCTTTGCCTTCG
GCGGTGGTTTTGGCGGAGGAATAGGCAAAGGCGGTGGCTTTGGTAAAGGAGGTGGCTTCG
GTGGAGGGATAGGCAAAGGCTTTGGCGGTGGTAAGATTGGACACCACTGACATAAAACAA
GAAGAATGACTAGTTGCACTGCATGAGCGACTTGGGGAATAAAATAGCTTAGCTTCCACG
TATCTGTCTAATTATAAGTTTTCATATGAGCTTTTGCACTACCTATCTATCTATGCTTGT
TTCATTTTTATCATGAATCTTATTCCCTCACAAAAGAATCAAAAGCTACACTTTTTTACC

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL8715Contig1 804 2 6 U
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TCTTCCACGGGACATGGAAGAGGAGGTGCTCTCTAAGCTTCCGATGACATCTCTGAGAAG
AGCTCGATTCACCTGCAAAAGGTGGAACAACTCTTTATCAAAAAATCTAAGCTTTACAAA
AAAGTACAAAAACGAAGCAGCAAAGAGGAAGGAGGAGTATCAGGTGGTGATGATGCTCGA
ATACAAGGTTTACTTGATGAGCGTAAATCTCCTCAATCCATCTCCATCTATCGAGCCTAT
TGGTAAACTCTTTAGCCTAGACGACGCTACTCATGATGGAGTCGACATAGGTAAAATATT
TCACTGCGATGGTTTGTTGTTATGCGTTACCAAAGACAGAACTAGGCTTGTTGTTTGGAA
CCCTTTCAATGGGCAGACGAGGTGGATCCAACCCAGAGATACTTACCACAGCTGTGACAG
GTACGCTCTCGGATACGAGAATACGACCAAGTACTCGCGCCGTAGCCACAAAGTCTTGAG
ATTTGTGGATGATTACGACCACAGCTTAAAGCGCCGAGTATGTGAGTTTGAAATCTTTAA
TTTAAACACTAGTTCTTGGAAGGTTGTTGATTTCAATCCAGGCTGGATGATGATACAGTA
TTTTTACCGCGGCTTGTCTCTCAAGGGCAATACTTACTGGTTTGCCGAAGAGAATCTTGT
TGGCAAAATAGGAAGAGTTTTTTTACTCTGTTTCAACTTTACAACAGAGAGTTTTGGACC
GCGTCTGCCTCTGCCTTTTCGCGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H443TF U 1
AF RS1GZ15TF U 124
BS 1 264 RS1H443TF
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RD RS1H443TF 682 0 0
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TCTTCCACGGGACATGGAAGAGGAGGTGCTCTCTAAGCTTCCGATGACATCTCTGAGAAG
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AAAGTACAAAAACGAAGCAGCAAAGAGGAAGGAGGAGTATCAGGTGGTGATGATGCTCGA
ATACAAGGTTTACTTGATGAGCGTCAATCTCCTCAATCCATCTCCATCTATCGAGCCTAT
TGGTAAACTCTTTAGCCTAGACGACGCTACTCATGATGGAGTCGACATAGGTAAAATATT
TCACTGCGATGGTTTGTTGTTATGCGTTACCAAAGACAGAACTAGGCTTGTTGTTTGGAA
CCCTTTCAATGGGCAGACGAGGTGGATCCAACCCAGAGATACTTACCACAGCTGTGACAG
GTACGCTCTCGGATACGAGAATACGACCAAGTACTCGCGCCGTAGCCACAAAGTCTTGAG
ATTTGTGGATGATTACGACCACAGCTTAA*GCGCCGAGTATGTGAGTTTGAAATCTTTAA
TTTAAACACTAGTTCTTGGAAGGTTGTTGATTTCAATCCAGGCTGGATGATGATACAGTA
TTTTTACCGCGGCTTGTCTCTC

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1GZ15TF 681 0 0
GG
GATTCACCTGCAAAAGGTGGAACAACTCTTTATCAAAAAATCTAAGCTTTACAAAAAAGT
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AGGTTTACTTGATGAGCGTAAATCTCCTCAATCCATCTCCATCTATCGAGCCTATTGGTA
AACTCTTTAGCCTAGACGACGCTACTCATGATGGAGTCGACATAGGTAAAATATTTCACT
GCGATGGTTTGTTGTTATGCGTTACCAAAGACAGAACTAGGCTTGTTGTTTGGAACCCTT
TCAATGGGCAGACGAGGTGGATCCAACCCAGAGATACTTACCACAGCTGTGACAGGTACG
CTCTCGGATACGAGAATACGACCAAGTACTCGCGCCGTAGCCACAAAGTCTTGAGATTTG
TGGATGATTACGACCACAGCTTAAAGCGCCGAGTATGTGAGTTTGAAATCTTTAATTTAA
ACACTAGTTCTTGGAAGGTTGTTGATTTCAATCCAGGCTGGATGATGATACAGTATTTTT
ACCGCGGCTTGTCTCTCAAGGGCAATACTTACTGGTTTGCCGAAGAGAATCTTGTTGGCA
AAATAGGAAGAGTTTTTTTACTCTGTTTCAACTTTACAACAGAGAGTTTTGGACCGCGTC
TGCCTCTGCCTTTTCGCGG

QA 3 681 3 681
DS 



AS 1 2

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GGGAGAAAGAAGAACACAGAGAAAGAAAGAACGGAGAGAAAGAGAAGTGAGAAGACTCTC
TAGTTTATCCCGAAGGTTTAAGATAAATCATGGACGCTTTTGATGCGATTCCTAACCACG
TTATCATCGACATTTTGAACAGAGTTGGTGACGTCAAAACGCTGATACGATGTCGTTCCG
TCTCGAGACGATTCAACTCGCTCGCTACTCAGTCAGACTCCCTCCTTCTCCAGCTCGATC
AGATCCTCGGCGCCGGTGAGTCGGAACCAGATATCAATTCTCCGGTGTCTAGCTTCTTCC
GTTCGATCTTCAAATCCATCAACGGACTCCTCCCGATCTTCTCCAGATCCGCTATACCGG
CGGAAACACCGAAATCTCCGGCTCAGATTCTCGCCGGATTCAACCGGATCCGGAGTCTTG
ACGTGGAGCTATACGGCGGCGACGCCAATCTCGAGAAAGGTGCCGCCGTTAAGTGGAAGG
CGGAGTTCGGAGAAACTCTCAAGAGCTCCGTCATCGTCGCTTTCCGATCGGCGACGGTCA
ACGAATCCGCCACGGAGTCTCCGGTCAACGCCGCAGAGACAGATTCGGAGTTCGTCTGCG
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ACCTGATGAGAGATGTGGTGAAGGAGCACAGGGAGATGGAGAGGCTAACCGTGCGCGACA
GAGAGGGGGAAGGCACGGTGGTGATGGACGCGGCGGGGATGAAAGAGTACAGAGAGACGG
AGGCGCGTGCGGACGAGAAGGGTTTCGAGCGCGTGAAGGAGCGCACGGAGGTGCCTAACG
TGAGGATGAGTATGAGGCACGCGCCGTTGCTGAAGCTGAAGAGCGGGATCTGTCTCGAGG
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TGGCGACGGAGGCGTTCGCCGCCGATTGTATGTACGGAGAAGCCGTTACGGCATTGCTGA
AACGTAGTAGAAATGTGTTAGAAATGAATTCCTTCTAGAATGCATGATAAGGCCCAATGG
GCTTTTATTTGTTTGGCCC


BQ
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AF RS1GD09TF U 1
AF RS1GD09JQ C 409
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BS 684 1099 RS1GD09JQ

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GTTCGATCTTCAAATCCATCAACGGACTCCTCCCGATCTTCTCCAGATCCGCTATACCGG
CGGAAACACCGAAATCTCCGGCTCAGATTCTCGCCGGATTCAACCGGATCCGGAGTCTTG
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ACGAATCCGCCACGGAGTCTCCGGTCAACGCCGCAGAGACAGATTCGGAGTTCGTCTGCG
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ACCTGATGAGAGATGTGGTGAAG
AGC

QA 1 683 1 683
DS 

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AAGGCCCAATGGGCTTTTATTTGTTTGGCCC

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

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GGGCCACCGCCACCTCCTGGACCCATTGCGGGTAATCCTTC


BQ
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AF RS1FK23TF C 1
AF RS1FK23JQ U 8
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BS 8 12 RS1FK23JQ
BS 13 13 RS1FK23TF
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RD RS1FK23TF 641 0 0
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CGTTTGATTTTATATATTGATTCTATAAGTTACTTAAGAACTATCACAAATTAAATAGAA
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ACCCCTAACCATCAAGAAAAAACCCCATTTCCATGTATAATCACAGACCGGACGGATACA
CAAACTATGGCAGCTTGATGTTGTTGTTTTTTTGCTCACATAATGTTGCAGCTTGATGTG
TTCTCATCATTGAAGTAATGAGAATACTGATCACTACCATGAGGCGGATATTGGTATGGA
TACGGATACGGGTATGGATGTTGTTGGTACGGTTCAGGTGGCAAGTAGTTGACAGCGGGA
GGTGGTCGAGCGTACATCATCGGCTGGAACCGTTCGTTGCCCATGGCTCGTTGCTGGTTC
ATAACTGCCGCCAAGTATTGTTGTTGCTGCTGTTGCAAGTAGGGATTTCCAGGCACCGAG
TCTTGGCCACCACCGTTGCTTCCATGGCCTTGGAAATATCCTGGCGGGGCTCCTACGGAT
GGGCCACCGCCACCTCCTGGACCCATTGCGGGTAATCCTTC

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1FK23JQ 634 0 0
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TTTTATATATTGATTCTATAAGTTACTTAAGAACTATCACAAATTAAATAGAAAGGAAAC
CCTAATATAACTTAGGATTTGATCCGTTGGAGTTTAGAAGAAGGATTGTAAGAACCCCTA
ACCATCAAGAAAAAACCCCATTTCCATGTATAATCACAGACCGGACGGATACACAAACTA
TGGCAGCTTGATGTTGTTGTTTTTTTGCTCACATAATGTTGCAGCTTGATGTGTTCTCAT
CATTGAAGTAATGAGAATACTGATCACTACCATGAGGCGGATATTGGTATGGATACGGAT
ACGGGTATGGATGTTGTTGGTACGGTTCAGGTGGCAAGTAGTTGACAGCGGGAGGTGGTC
GAGCGTACATCATCGGCTGGAACCGTTCGTTGCCCATGGCTCGTTGCTGGTTCATAACTG
CCGCCAAGTATTGTTGTTGCTGCTGTTGCAAGTAGGGATTTCCAGGCACCGAGTCTTGGC
CACCACCGTTGCTTCCATGGCCTTGGAAATATCCTGGCGGGGCTCCTACGGATGGGCCAC
CGCCACCTCCTGGACCCATTGCGGGTAATCCTTC

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 2

CO CL8718Contig1 703 2 2 U
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CTTTCACTCTGTTTTCATTTTAATCCCGTTTGATTACACTCAGATATTTTTCTTCACTGT
CCACTTGAATATCTTTCTTAGAGAATCAGACTCTGCCTTATTATTAGGCCCTCATGGCGT
TTTGGTAAAGCATCTCGATGAAAAAAAGATTATGTTCGATGGATTTATTGAGTCATATTT
GAAGCGGATTCATGAGAGTTGGCGCCTTTGAAGCAGTACAAAAAGTCCTTTACTATGACT
TATGTTTCCTATGGAATACTTCACGGTGAAGCAAAACCTCTCTGTTCATGTAGTCGTGGC
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TGGTTTGGCTGAAGAGACTTGCCGGTGATTTGCTTTCTCCATGGCGGTGGAATCAAAGTG
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ACGTTTTATTTGTTCTGTATTATTTAGTTATGGACTGGGTATCAATACCATTAAAACAGG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GM89TF U 1
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TGAATGTTTTAAATTTTCC

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AT08TF U 1
AF RS1AT08JQ C 104
BS 1 719 RS1AT08TF
BS 720 733 RS1AT08JQ

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QA 1 630 1 630
DS 



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BQ
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AF RS1BB74JQ C 1
AF RS1BB74TF U 1
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QA 1 585 1 585
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CTTTGTCTTTATCGTCTTTCTTCTTCTGTATATTAGTTTTGATTT

QA 1 585 1 585
DS 



AS 1 2

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CTTCTGCTGCGGATCCGAATCGAAAAAATGAATCGTCATCACGATCCCAATCCTTTCGAT
GAAGAAGAAGACGAGATCGTCAATCCCTTCTCGAAAGGAGGTGGCGGCGGTGGAAGGCCT
GTGGCATCTAGGCCGTTTAACGTTGATGCTACCGTCGATATTCCATTGGATACGGTGAAT
GACTCTTCAAAGAAACAGAGGGAGCTTTCTGATTGGGAATCTGAGCTTAAGAAGAGAGAA
ATGGATATTAAAAGAAGAGAAGATGCTGTTGCTAAATCTGGCGTGAAGACAAGCAATAAA
AACTGGCCACCTTTTTTCCCTATTATACACCACGACATTGCTAATGAGATACCAGTCCAT
GCTCAGAAACTGCAATATCTGGCATTTGCTAGTTGGTTGGGCATAGTTTTGTGTCTCGTA
TTCAATGTCATTGCAGTGATAGTCTGCTGGATTAAAGGCGGAGGTGTCAAAATCTTTTAT
CTTGCCACGATCTATGCGCTGCTTGGATGTCCAATTTCATATCTATTGTGGTATAGGCCT
CTCTACCGAGCTATGAGGACTGACAGCGCTCTGAAGTTCGGTTGGTTTTTCTTCTTCTAC
CTGATTCACATTGGCTTCTGCATCTTTGCCGCCATTGCTCCTCCGATCTTTTTCCGCGGC
TTATCATTAACGGGTGTGCTGGCAGCAATTGATGTAATCAGAGCCAGTTTACTAGCCGGG
ATCTTCTACTTTGTCGGCTTCGGTCTGTTCTGCTTGGAGGCGCTTCTCAGTGTGTGGGTT
CTCCAGAAAATATACATCTACTTCAGGGGAAACAAGTAAACAATGCATATACACTAGAGC
AAAAGGTCATACTTCTCCAACGATACCGCTCTCTTAGAAGGTTTGAGTATAGTACTATAC
TATCTTGCTACTAATGTAATTACCATTTGTGCACTTGTCTGGGATAATACTCTGTTGTGA
TGTGTTTGTATTTTGTTTTATTGTGTGGTGCTGTCTTCGTTTAGTAGTTGCAGCGGCAAA
ATAAATACTCTATGTTCTGTTATTACGTTGAGGATTGACATTTTTGGGGTTGCAAAAGAG
TATAGATTTATCTAAATTC


BQ
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QA 1 749 1 749
DS 

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CTGCTGGATTAAAGGCGGAGGTGTCAAAATCTTTTATCTTGCCACGATCTATGCGCTGCT
TGGATGTCCAATTTCATATCTATTGTGGTATAGGCCTCTCTACCGAGCTATGAGGACTGA
CAGCGCTCTGAAGTTCGGTTGGTTTTTCTTCTTCTACCTGATTCACATTGGCTTCTGCAT
CTTTGCCGCCATTGCTCCTCCGATCTTTTTCCGCGGCTTATCATTAACGGGTGTGCTGGC
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TCTGTTCTGCTTGGAGGCGCTTCTCAGTGTGTGGGTTCTCCAGAAAATATACATCTACTT
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TACCGCTCTCTTAGAAGGTTTGAGTATAGTACTATACTATCTTGCTACTAATGTAATTAC
CATTTGTGCACTTGTCTGGGATAATACTCTGTTGTGATGTGTTTGTATTTTGTTTTATTG
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TACGTTGAGGATTGACATTTTTGGGGTTGCAAAAGAGTATAGATTTATCTAAATTC

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

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CACCAACTTGGAGCTCCGTTCTGCTTATAAGAAGCTCGCTCTTAGATGGCATCCAGATCG
TTGCTCGTCAATGGGGAACTTGGAGTTTATAGATGAATCCAAGAAGAAGTTTCAGGGCAT
CCAAGAAGCCTACTCTGTTCTATCCGACTCCAACAAGAGGTTCCTCTATGACGTTGGAGC
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GCACTCACCCTTTGAGACAACAACAAGTCCTATGGGGTTTAATAATCCTTTCGCATTCGA
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GAACAATGGTGGGAGAAGAAACACGAGGAAGAACAATGCTCAATCTGCTGCTCAGGAACA
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TTTCTGTTAACTCATCTCGCAT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A068TF U 85
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TTATAAGAAGCTCGCTCTTAGATGGCATCCAGATCGTTGCTCGTCAATGGGGAACTTGGA
GTTTATAGATGAATCCAAGAAGAAGTTTCAGGGCATCCAAGAAGCCTACTCTGTTCTATC
CGACTCCAACAAGAGGTTCCTCTATGACGTTGGAGCTTATAATAGTAATGATGATGATTC
TGACCAAAACGGAATGGGAGATTTCTTAAGCGAAATGGCGACGATGATGAATCAATCAAA
GCCTAGTGAGAAGAGTTCAGGAGGGGATAGTTTTGGACAGTTACAAGATCTGTTTCATGA
GATGCTTCAAGGAGACGCATTCGCCTCATCATCACCGCCTTACTCTGCTTCAACTTTCAC
TTCCTCTTGTAGCTTTGTGTTTGACACAAATACTCAGCACTCACCCTTTGAGACAACAAC
AAGTCCTATGGGGTTTAATAATCCTTTCGCATTCGACTCCACAGCTCACTCCTTCTCTTT
AGGGGTGGAGCATCAGCAG
ATTTCAA

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DS 

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CACCAACTTGGAGCTCCGTTCTGCTTATAAGAAGCTCGCTCTTAGATGGCATCCAGATCG
TTGCTCGTCAATGGGGAACTTGGAGTTTATAGATGAATCCAAGAAGAAGTTTCAGGGCAT
CCAAGAAGCCTACTCTGTTCTATCCGACTCCAACAAGAGGTTCCTCTATGACGTTGGAGC
TTATAATAGTAATGATGATGATTCTGACCAAAACGGAATGGGAGATTTCTTAAGCGAAAT
GGCGACGATGATGAATCAATCAAAGCCTAGTGAGAAGAGTTCAGGAGGGGATAGTTTTGG
ACAGTTACAAGATCTGTTTCATGAGATGCTTCAAGGAGACGCATTCGCCTCATCATCACC
GCCTTACTCTGCTTCAACTTTCACTTCCTCTTGTAGCTTTGTGTTTGACACAAATACTCA
GCACTCACCCTTTGAGACAACAACAAGTCCTATGGGGTTTAATAATCCTTTCGCATTCGA
CTCCACAGCTCACTCCTTCTCTTTAGGGGTGGAGCATCAGCAGGATTTCAAGAAGGGGAA
GAACAATGGTGGGAGAAGAAACACGAGGAAGAACAATGCTCAATCTGCTGCTCAGGAACA
ACAACACCATCGTCAAACAACTGTGGAGTCCCACTTCATAGACTCTTCAGAGAGTCCATG
TTTCTGTTAACTCATCTCGCAT

QA 1 862 1 862
DS 



AS 1 2

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GAAGAGGAAGGCTATCGTCGAGAGAGCTTCTCAGCTTGATATTGTTGTCACCAACAGGCT
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BQ
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AF RS1D038JQ C 1
AF RS1D038TF U 1
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DS 

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CCCGCCATTATCTCCCAATGGGTTCAAGAAGTTCGTTGTGCACAACACGAGTGACCTCGA
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GAAGAGGAAGGCTATCGTCGAGAGAGCTTCTCAGCTTGATATTGTTGTCACCAACAGGCT
TGCTAGGCTCCGTAGCCAAGAAGACGAGTGAAGATAACGAAGAAGCTACTTGAGATATTT
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GTTTGCTGTCAAAACAGACAAGAGTTTTGGTTTAAGACAGACTATGTTGAGATGGTTCGT
AAACTATTTCAGCTTCAGTATTTCTC

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 2

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AAAGTCGTGTCATTTTGAAAAAATATGAAAGCTTTGCCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AV20JQ C 1
AF RS1AV20TF U 1
BS 1 622 RS1AV20TF
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BS 624 639 RS1AV20TF

RD RS1AV20JQ 639 0 0
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TGAATCTTTTTCCCTTTTTAATATTTTTTCACTTATTTCGAAGTCTCTTTTGTAATTTGG
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DS 

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TTTTCTCTCTATTGGAGGGATCTTGTGTTTTCTACATGCCCTCTTTTGTGTCGCTTATTA
CGTTTCTGCCACTGCGGCTAAAGACGAAGCTGCTAAGTGATGGATGAACAGAGGTGGGGT
CCTTGTACTTGACTATAAATTCCAATGGGTTGTGTAACATTTTCATATCTATTAACAATT
TGAATCTTTTTCCCTTTTTAATATTTTTTCACTTATTTCGAAGTCTCTTTTGTAATTTGG
AAAGTCGTGTCATTTTGAAAAA*TATGAAAGCTTTGCCC

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 2

CO CL8725Contig1 650 2 2 U
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CGAAGAGACAGCTGGTTACATAATGTCTCTACAATGTCAGATCAAAAGCATTAAAGTCCT
CACTTCATTTCTCCAACGCTTAGATAAACAAGACATGAAGTTCGGAGGTTGAAGATGATG
ATGGCACCAAGATTGCTCTTCTTTATATTTAATTTAATTTTAGTTCTTCTTTTTCCTTTT
TTAATATGGCTTTTAGCTTTGATATATGGGGAAAGAGATCTCAGCATTTTTTTTCTTCGA
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DM91TF U 1
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BS 1 627 RS1DM91TF
BS 628 650 RS1DM91JQ

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AACTCTAGCAACTCCCGACAACACTAGATCTGTTTCAGTGTTGTGCTCAGCCGCCGTGAA
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CGTGCGTGTGTCTGGTGAAGAAGATGAAGAAGAAGAAGAAAAAGAAGAGGTAAAGGAGAA
GATCGAGGCGTTGAAGAGGATAATTCCAGGAGGAACGGCGCTTGGTGTGGACGAGCTATT
CGAAGAGACAGCTGGTTACATAATGTCTCTACAATGTCAGATCAAAAGCATTAAAGTCCT
CACTTCATTTCTCCAACGCTTAGATAAACAAGACATGAAGTTCGGAGGTTGAAGATGATG
ATGGCACCAAGATTGCTCTTCTTTATATTTAATTTAATTTTAGTTCTTCTTTTTCCTTTT
TTAATATGGCTTTTAGCTTTGATATATGGGGAAAGAGATCTCAGCATTTTTTTTCTTCGA
AATCTTTTTCTTTACCAAGACTTTAAAGTTATGATTTATTCAAGCCGGTTCGTAGTTATG
ACAAGTGTTGATTGGGATATTACATTA

QA 1 627 1 627
DS 

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CAACACTAGATCTGTTTCAGTGTTGTGCTCAGCCGCCGTGAAAACACGCTTTGGTGGTTT
CGAGCGCAGAACCAAACGGAGATTGTCGCAGACGAAGGCAAGCGTGCGTGTGTTTGGTGA
AGAAGATGAAGAAGAAGAAGAAAAAGAAGAGGTAAAGGAGAAGATCGAGGCGTTGAAGAG
GATAATTCCAGGAGGAACGGCGCTTGGTGTGGACGAGCTATTCGAAGAGACAGCTGGTTA
CATAATGTCTTTACAATGTCAGATCAAAAGCATTAAAGTCCTCACTTCATTTTTCCAACG
CTTAGATAAACAAGACATGAAGTTCGGAGGTTGAAGATGATGATGGCACCAAGATTGCTC
TTCTTTATATTTAATTTAATTTTAGTTCTTCTTTTTCCTTTTTTAATATGGCTTTTAGCT
TTGATATATGGGGAAAGAGATCTCAGCATTTTTTTTTTTCGAAATCTTTTTCTTTACCAA
GACTTTAAAGTTATGATTTATTCAAGCCGGTTCGTAGTTATGACAAGTGTTGATTGGGAT
ATTACATTAGTAAGTAGGAGTATATATTAACG

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 2

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TGGAGCTTGACAATCTCTTGAAGGAAGAGAGGCTTGCTGGGTCATCTTTACTGATACTGG
CAAATAAGCAGGACATTCAAGGTGCTCTTACACCTCAAGAGATTGGTAAGGTGCTAAACC
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BQ
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AF RS1BG42TF U 1
AF RS1BG42JQ C 101
BS 1 713 RS1BG42TF
BS 714 799 RS1BG42JQ

RD RS1BG42TF 713 0 0
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TATGGGATGTGGGTGGGCAAAAGACTATAAGATCTTACTGGAGGAACTACTTTGAGCAGA
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TGGAGCTTGACAATCTCTTGAAGGAAGAGAGGCTTGCTGGGTCATCTTTACTGATACTGG
CAAATAAGCAGGACATTCAAGGTGCTCTTACACCTCAAGAGATTGGTAAGGTGCTAAACC
TAGAGTCCATGGATAAAAGCAGGCACTGTAAGATTGTGGGTTGCAGTGCATACACAGGTG
AAGGTTTGTTGGAAGGATTCGACTGGTTGGTTCAAGACATTGCCTCCAGAATTTACATGC
TTGACTAATCTCTCCACTACTGGCATTGCGCAATGGAATGTTATGCTCGACCATTTACAG
CCGAAGATTCAGTTTCACAGACGCACCACATTGTGCATATCAAACCTGCTCTT

QA 1 713 1 713
DS 

RD RS1BG42JQ 699 0 0
TGCGTA
TCTTATTGTTGGACTCGATAACTCAGGGAAGACGACGATTGTTCTGAAGATGAACGGTGA
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AGATGATTGCAAGATGGAGCTTGACAATCTCTTGAAGGAAGAGAGGCTTGCTGGGTCATC
TTTACTGATACTGGCAAATAAGCAGGACATTCAAGGTGCTCTTACACCTCAAGAGATTGG
TAAGGTGCTAAACCTAGAGTCCATGGATAAAAGCAGGCACTGTAAGATTGTGGGTTGCAG
TGCATACACAGGTGAAGGTTTGTTGGAAGGATTCGACTGGTTGGTTCAAGACATTGCCTC
CAGAATTTACATGCTTGACTAATCTCTCCACTACTGGCATTGCGCAATGGAATGTTATGC
TCGACCATTTACAGCCGAAGATTCAGTTTCACAGACGCACCACATTGTGCATATCAAACC
TGCTCTTTTGTTACCATTATCTTTATTCGGCTCAAGTGACTTTCATATCTGCACTTTAGC
CTTTCTTTTATTGTAACAATGATTCAACAAAAA

QA 7 699 7 699
DS 



AS 1 2

CO CL8727Contig1 1095 2 2 U
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GATCCGGGAACTTCGTCAAGATGGTGCACAACGGGATCGAGTACGGAGACATGCAGCTCA
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AGATTTTCGCGGAGTGGAACCGAGGTGAGCTGGAGAGTTTCTTGGTTGAGATTACTTCGG
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AGACTGGGATGAAAGGTACGGGGAAGTGGACTGTTCAGCAGGCGGCGGAGCTCTCTGTTG
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GGGAGAATGCTGCTAGAGTGTTGAGAGAAGCTGGGTTGAAGGAAGAGATTGGTACTGCTG
GGTCAGGTGGGATTGATAAGAAGAGGTTGGTTGATGATGTTAGACAAGCTCTGTACGCGT
CGAAGATCTGTAGTTACGCTCAAGGGATGAATCTGCTTAGAGCTAAGAGCTTGGAGAAGA
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TGGGTTTGGCTGTCTCCGCTGGGATTAGCACCCCTGGAATGTGTGCGAGTCTTGCGTATT
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AGCTTGCCAGGAAGAGCAATTGAGGTTTTTTGTATTCTTGGAAACCGTTCTCTTTGATTA
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TGCACTACATTGACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G374TF U 1
AF RS1G374JQ C 244
BS 1 701 RS1G374TF
BS 702 1095 RS1G374JQ

RD RS1G374TF 701 0 0
GGGAGAAAGTCGCGGCCCAGGTTGAAGATGGGCCTTGCGTTACTTACATCGGAGAAGGCG
GATCCGGGAACTTCGTCAAGATGGTGCACAACGGGATCGAGTACGGAGACATGCAGCTCA
TCTCCGAGGCGTACGACGTGTTGAAGAACGTTGGCGGGTTGAGCAACGAGGAGCTCGCGG
AGATTTTCGCGGAGTGGAACCGAGGTGAGCTGGAGAGTTTCTTGGTTGAGATTACTTCGG
ATATTTTTAGGGTTAGGGATGAGTTCGGTGGTGGAGAGTTGGTGGATAAGATTTTGGATA
AGACTGGGATGAAAGGTACGGGGAAGTGGACTGTTCAGCAGGCGGCGGAGCTCTCTGTTG
CGGCTCCGACGATTGCCGCTTCGTTGGATTGTCGGTACTTGAGCGGGTTGAAAGAAGAGA
GGGAGAATGCTGCTAGAGTGTTGAGAGAAGCTGGGTTGAAGGAAGAGATTGGTACTGCTG
GGTCAGGTGGGATTGATAAGAAGAGGTTGGTTGATGATGTTAGACAAGCTCTGTACGCGT
CGAAGATCTGTAGTTACGCTCAAGGGATGAATCTGCTTAGAGCTAAGAGCTTGGAGAAGA
GCTGGGAGTTGAATTTCGGTGAGCTTGTTAGGATTTGGAAAGGAGGGTGTATCATAAGAG
CGGTGTTCTTGGATAGGATCAAGAAAGCTTACCAGAGGAAT

QA 1 701 1 701
DS 

RD RS1G374JQ 852 0 0
TTTTTAGGGTTAGGGATGAGTTCGGTGGTGGAGAGTTGGTGGATAAGATTTTGGATAAGA
CTGGGATGAAAGGTACGGGGAAGTGGACTGTTCAGCAGGCGGCGGAGCTCTCTGTTGCGG
CTCCGACGATTGCCGCTTCGTTGGATTGTCGGTACTTGAGCGGGTTGAAAGAAGAGAGGG
AGAATGCTGCTAGAGTGTTGAGAGAAGCTGGGTTGAAGGAAGAGATTGGTACTGCTGGGT
CAGGTGGGATTGATAAGAAGAGGTTGGTTGATGATGTTAGACAAGCTCTGTACGCGTCGA
AGATCTGTAGTTACGCTCAAGGGATGAATCTGCTTAGAGCTAAGAGCTTGGAGAAGAGCT
GGGAGTTGAATTTCGGTGAGCTTGTTAGGATTTGGAAAGGAGGGTGTATCATAAGAGCGG
TGTTCTTGGATAGGATCAAGAAAGCTTACCAGAGGAATCCGGATTTGGCGAGCCTTGTGG
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GTTTGGCTGTCTCCGCTGGGATTAGCACCCCTGGAATGTGTGCGAGTCTTGCGTATTTTG
ATACGTATAGGCGTGCGAGATTGCCGGCGAATCTGGTGCAGGCGCAGAGAGATCTGTTTG
GAGCTCATACTTACGAGAGGATTGATCGTTCTGGTGCGTACCACACGGAGTGGACTAAGC
TTGCCAGGAAGAGCAATTGAGGTTTTTTGTATTCTTGGAAACCGTTCTCTTTGATTATGG
CTTTTTTAAACCCAAATTGTTTCAAGAGCATTTTGTTAAGATTTCAAAAATAAGAAATGC
ACTACATTGACC

QA 1 852 1 852
DS 



AS 1 2

CO CL8728Contig1 835 2 2 U
CCTCTCTCTCTCTCTCACTCTTTCTCAAAGTGTCCAGTCACGGGAAGTTATCTCTCACAC
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CTTCAAAGCCATGGTGTGATTACCTCTGACGAGGTCGCTAAAGCTATGGAGGCTGTCGAC
AGAGGCCTCTTTGTACCAGACCGTTCCTATGCTTACGTCGACAGTCCCTTGTCTATTGGC
TACAACGTCACCATATCAGCTCCTCACATGCACGCAATGTGCCTTGAGCTCCTCGAAAAG
AATCTGAAACCAGGGATGCGTGTTCTTGATGTCGGCTCTGGAACCGGGTACTTAACAGCT
TGCTTTGCGTTTATGGTTGGTTCCGAAGGTCGTGCTATTGGTGTGGAGCACATCCCTGAA
TTGGTGGCTTCTTCCATCAAGAACATTGAAGCGAGTGCTGCTGCTTCGCCATTGCTGAAA
CAAGGATCTCTGGCTATTCATGTTGGAGATGGAAGGCAAGGATGGGGGTGAGTTTGCACC
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ATTGAAACCTGGTGGGAGACTGGTGATCCCGGTTGGCAACTTATTCCAAGATCTGCAAGT
GGTGGATAAGAACTCTGATGGCTCGGTTAGCATCAGGAGCGAAACATCAGTTCGTTATGT
TCCTTTAACTAGCCGTGAAGCCCAATTGAGAGGCGAGTGATGATTTGCTTGTTATACAGT
ACAATGGATCATGTATGCTTCACTTGGTTTTATAAATCAACCTTGTTACTAGTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BU62TF U 1
AF RS1BU62JQ C 67
BS 1 692 RS1BU62TF
BS 693 835 RS1BU62JQ

RD RS1BU62TF 692 0 0
CCTCTCTCTCTCTCTCACTCTTTCTCAAAGTGTCCAGTCACGGGAAGTTATCTCTCACAC
AACATGAAGCAATTCTGGAGCCCAAACAGTATCAACAAGAACAAAGCTATGGTGGAGAAT
CTTCAAAGCCATGGTGTGATTACCTCTGACGAGGTCGCTAAAGCTATGGAGGCTGTCGAC
AGAGGCCTCTTTGTACCAGACCGTTCCTATGCTTACGTCGACAGTCCCTTGTCTATTGGC
TACAACGTCACCATATCAGCTCCTCACATGCACGCAATGTGCCTTGAGCTCCTCGAAAAG
AATCTGAAACCAGGGATGCGTGTTCTTGATGTCGGCTCTGGAACCGGGTACTTAACAGCT
TGCTTTGCGTTTATGGTTGGTTCCGAAGGTCGTGCTATTGGTGTGGAGCACATCCCTGAA
TTGGTGGCTTCTTCCATCAAGAACATTGAAGCGAGTGCTGCTGCTTCGCCATTGCTGAAA
CAAGGATCTCTGGCTATTCATGTTGGAGATGGAAGGCAAGGATGGGGGTGAGTTTGCACC
TTATGATGCTATTCATGTGGGAGCAGCGGCACCGGAGATCCCAGAGGCATTGATTGATCA
ATTGAAACCTGGTGGGAGACTGGTGATCCCGGTTGGCAACTTATTCCAAGATCTGCAAGT
GGTGGATAAGAACTCTGATGGCTCGGTTAGCA

QA 1 692 1 692
DS 

RD RS1BU62JQ 769 0 0
AAGCAATTCTGGAGCCCAAACAGTATCAACAAGAACAAAGCTATGGTGGAGAATCTTCAA
AGCCATGGTGTGATTACCTCTGACGAGGTCGCTAAAGCTATGGAGGCTGTCGACAGAGGC
CTCTTTGTACCAGACCGTTCCTATGCTTACGTCGACAGTCCCTTGTCTATTGGCTACAAC
GTCACCATATCAGCTCCTCACATGCACGCAATGTGCCTTGAGCTCCTCGAAAAGAATCTG
AAACCAGGGATGCGTGTTCTTGATGTCGGCTCTGGAACCGGGTACTTAACAGCTTGCTTT
GCGTTTATGGTTGGTTCCGAAGGTCGTGCTATTGGTGTGGAGCACATCCCTGAATTGGTG
GCTTCTTCCATCAAGAACATTGAAGCGAGTGCTGCTGCTTCGCCATTGCTGAAACAAGGA
TCTCTGGCTATTCATGTTGGAGATGGAAGGCAAGGATGGGG*TGAGTTTGCACCTTATGA
TGCTATTCATGTGGGAGCAGCGGCACCGGAGATCCCAGAGGCATTGATTGATCAATTGAA
ACCTGGTGGGAGACTGGTGATCCCGGTTGGCAACTTATTCCAAGATCTGCAAGTGGTGGA
TAAGAACTCTGATGGCTCGGTTAGCATCAGGAGCGAAACATCAGTTCGTTATGTTCCTTT
AACTAGCCGTGAAGCCCAATTGAGAGGCGAGTGATGATTTGCTTGTTATACAGTACAATG
GATCATGTATGCTTCACTTGGTTTTATAAATCAACCTTGTTACTAGTAA

QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

CO CL8729Contig1 671 2 3 U
GATTTATAAATCTGTATATTTGAAACTTTATTGATTTAGCAGTTTTGTATATTCCATAAG
TAAAACAGGAGAAAAGCTTTGAAGAAGCTCATCCTCTAAAACCTTAACCATTTCTCTTTG
AGGAAGAGTGATCATAACCACTCGGCTCATTGGCCCCTCGCTGGGCGATGAAGGAAGCAC
TATGACCTGTCCACCTCCAGCTACAGGCCCTTCAACATAGCAAGAGACATGGCTCAATAT
CAAATCTTCCTCGAACATCATGGGACGCGAATTCGCCATGTTCTCTAGATTAGTACACAC
GAGATCCGAACCGTTGGATATCGGATTGTTATTGTTGCTACTGAGCCACTCGACCAAGTC
CATGACCGTGTCGTAATCTAGTCCCTTGGTCACGTTATGCATCTCTTTAACAACGTAACA
TAATAATAACAATCTATCTTTCGTTGTAACTGGCTTGGAGTAGTGAACTTTGTGATAGAC
CATGCAATTACCAAAGTAACTTTGGTCTAAACGCAATAGCTTCCTAACGTCTAGGCACAA
GGACATGTCCGTGAGCTCGTTCCTCTTCCCTTTGGCTCGACTCACACAGACACAAAGGAG
TCCAGACAATATCTCAAATGGTGAAATCCCTTGCTCGTTCTCGCCCGCTTGGACCATGGG
ATCCGGGAACA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 

AF RS1ES13JQ U 1
AF RS1DE49JQ U 35
BS 1 375 RS1ES13JQ
BS 376 376 RS1DE49JQ
BS 377 671 RS1ES13JQ

RD RS1ES13JQ 671 0 0
GATTTATAAATCTGTATATTTGAAACTTTATTGATTTAGCAGTTTTGTATATTCCATAAG
TAAAACAGGAGAAAAGCTTTGAAGAAGCTCATCCTCTAAAACCTTAACCATTTCTCTTTG
AGGAAGAGTGATCATAACCACTCGGCTCATTGGCCCCTCGCTGGGCGATGAAGGAAGCAC
TATGACCTGTCCACCTCCAGCTACAGGCCCTTCAACATAGCAAGAGACATGGCTCAATAT
CAAATCTTCCTCGAACATCATGGGACGCGAATTCGCCATGTTCTCTAGATTAGTACACAC
GAGATCCGAACCGTTGGATATCGGATTGTTATTGTTGCTACTGAGCCACTCGACCAAGTC
CATGACCGTGTCGTAGTCTAGTCCCTTGGTCACGTTATGCATCTCTTTAACAACGTAACA
TAATAATAACAATCTATCTTTCGTTGTAACTGGCTTGGAGTAGTGAACTTTGTGATAGAC
CATGCAATTACCAAAGTAACTTTGGTCTAAACGCAATAGCTTCCTAACGTCTAGGCACAA
GGACATGTCCGTGAGCTCGTTCCTCTTCCCTTTGGCTCGACTCACACAGACACAAAGGAG
TCCAGACAATATCTCAAATGGTGAAATCCCTTGCTCGTTCTCGCCCGCTTGGACCATGGG
ATCCGGGAACA

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1DE49JQ 634 0 0
TTTAGCAGTTTTGTATATTCCATAAGTAAAACAGGAGAAAAGCTTTGAAGAAGCTCATCC
TCTAAAACCTTAACCATTTCTCTTTGAGGAAGAGTGATCATAACCACTCGGCTCATTGGT
CCCTCGCTGGGCGATGAAGGAAGCACTATGACCTGTCCACCTCCAGCTACAGGCCCTTCA
ACATAGCAAGAGACATGGCTCAATATCAAATCTTCCTCGAACATCATGGGACGCGAATTC
GCCATGTTCTCTAGATTAGTACACACGAGATCCGAACCGTTGGATATCGGATTGTTATTG
TTGCTACTGAGCCACTCGACCAAGTCCATGACCGTGTCGTAATCTAGTCCCTTGGTCACG
TTATGCATCTCTTTAACAACGTAACATAATAATAACAATCTATCTTTCGTTGTAACTGGT
TTGGAGTAGTGAACTTTGTGATAGACCATGCAATTACCAAAGTAACTTTGGTCTAAACGC
AATAGCTTCCTAACGTCTAGGCACAAGGACATGTCCGTGAGCTCGTTCCTCTTCCCTTTG
GCTCGACTCACACAGACACAAAGGAGTCCAGACAATATCTCAAATGGTGAAATCCCTTGC
TCGTTCTCGCCCGCTTGGACCATGGGATCCGGGA

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 2

CO CL8730Contig1 819 2 14 U
GGGATCTCTCTCATCTCCACGTGTCGTCTCAGAAACCCCTCCTTCACCACCAGAGCCACC
TTTACTCGCCGCAAGAAAGATCACGAACGCGCATCTCTGATCTCTTCAGGGACGATGCCT
CCTGCGATTGAATTCGATCAGTTCATTCTAGCAACGTTCTTCGCTTCTCTGTTCGCGTTC
GTGCTTGTGTACGTTTTGCGTCGGAGTAGTCGTAGTAGAGATGATGCGAGTTCGAATCGG
GGTAAGAAGAATCGTGGCCTCGTTCAGAACGATGATGCCGTATCTAGGAATGTTGCTGAT
TCCGGAATCGATGTTATAATCGTCGGAGCTGGTGTTGCTGGTGCCGCTCTTGCTCATACT
CTCGGCAAGGAAGGACGACGAGCTCACGTTATAGAAAGAGACTTGTCTGAGCAAGACAGG
ATCGTTGGTGAATTGCTTCAACCTGGTGGTTACTTGAAGCTAATTGAACTCGGCCTCGAG
GATTGTGTGAAAGAGATAGATGCTCAACGAGTTCTTGGTTATGCTCTCTTCAAAGACGGG
AAGCACACCAAACTTTCTTACCCCTTGGACGCGTTTGATTCGGATGTCTCCGGGAGAAGC
TTCCACAATGGGAGGATTTGTGCAGAGAATGCGAGACAAAGCCGCTACTCTTTCAAATGT
ACGATTGGAGCAAGGAACAGTTACGTCTCTTCTTCAAGAGAACGGGAATGTCAAAGGGGT
CCAATACAAGACTAAAGAGGGCAATGAGCTTAGATTGTATGCTCCTCTCACTGTTGTATG
TGATGGTTGTTTCTCCAACTTGCGTCGCTCTCTCTGCAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CN59TF U 1
AF RS1DN47TF U 91
BS 1 183 RS1CN59TF
BS 184 184 RS1DN47TF
BS 185 337 RS1CN59TF
BS 338 338 RS1DN47TF
BS 339 612 RS1CN59TF
BS 613 613 RS1DN47TF
BS 614 696 RS1CN59TF
BS 697 697 RS1DN47TF
BS 698 714 RS1CN59TF
BS 715 716 RS1DN47TF
BS 717 743 RS1CN59TF
BS 744 744 RS1DN47TF
BS 745 753 RS1CN59TF
BS 754 819 RS1DN47TF

RD RS1CN59TF 753 0 0
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TTTACTCGCCGCAAGAAAGATCACGAACGCGCATCTCTGATCTCTTCAGGGACGATGCCT
CCTGCGATTGAATTCGATCAGTTCATTCTAGCAACGTTCTTCGCTTCTCTGTTCGCGTTC
GTGGTTGTGTACGTTTTGCGTCGGAGTAGTCGTAGTAGAGATGATGCGAGTTCGAATCGG
GGTAAGAAGAATCGTGGCCTCGTTCAGAACGATGATGCCGTATCTAGGAATGTTGCTGAT
TCCGGAATCGATGTTATAATCGTCGGAGCTGGTGTTGTTGGTGCCGCTCTTGCTCATACT
CTCGGCAAGGAAGGACGACGAGCTCACGTTATAGAAAGAGACTTGTCTGAGCAAGACAGG
ATCGTTGGTGAATTGCTTCAACCTGGTGGTTACTTGAAGCTAATTGAACTCGGCCTCGAG
GATTGTGTGAAAGAGATAGATGCTCAACGAGTTCTTGGTTATGCTCTCTTCAAAGACGGG
AAGCACACCAAACTTTCTTACCCCTTGGACGCGTTTGATTCGGATGTCTCCGGGAGAAGC
TTCCACAATGGGGGGATTTGTGCAGAGAATGCGAGACAAAGCCGCTACTCTTTCAAATGT
ACGATTGGAGCAAGGAACAGTTACGTCTCTTCTTCA*GAGAACGGGAATGTCAA**GGGT
CCAATACAAGACTAAAGAGGGCA*TGAGCTTAG

QA 1 753 1 753
DS 

RD RS1DN47TF 729 0 0
GG
ATCTCTGATCTCTTCAGGGACGATGCCTCCTGCGATTGAATTCGATCAGTTCATTCTAGC
AACGTTCTTCGCTTCTCTGTTCGCGTTCGTGCTTGTGTACGTTTTGCGTCGGAGTAGTCG
TAGTAGAGATGATGCGAGTTCGAATCGGGGTAAGAAGAATCGTGGCCTCGTTCAGAACGA
TGATGCCGTATCTAGGAATGTTGCTGATTCCGGAATCGATGTTATAATCGTCGGAGCTGG
TGTTGCTGGTGCCGCTCTTGCTCATACTCTCGGCAAGGAAGGACGACGAGTTCACGTTAT
AGAAAGAGACTTGTCTGAGCAAGACAGGATCGTTGGTGAATTGCTTCAACCTGGTGGTTA
CTTGAAGCTAATTGAACTCGGCCTCGAGGATTGTGTGAAAGAGATAGATGCTCAACGAGT
TCTTGGTTATGCTCTCTTCAAAGACGGGAAGCACACCAAACTTTCTTACCCCTTGGACGC
GTTTGATTCGGATGTCTCCGGGAGAAGCTTCCACAATGGGAG*ATTTGTGCAGAGAATGC
GAGACAAAGCCGCTACTCTTTCAAATGTACGATTGGAGCAAGGAACAGTTACGTCTCTTC
TTCAAGAGAACGGGAATGTCAAAGGGGTCCAATACAAGACTAAAGAGGGCAATGAGCTTA
GATTGTATGCTCCTCTCACTGTTGTATGTGATGGTTGTTTCTCCAACTTGCGTCGCTCTC
TCTGCAA

QA 3 729 3 729
DS 



AS 1 2

CO CL8731Contig1 640 2 2 U
GGAGGATTCGTGGACGGCATCATCGTGTATAGCATCTGTGACGGCAGTGACGGAGGAGTC
GTGGACGGCACCATCACAGTGAGAAAGAACGGCCAAAACGGTTGAAGGAAATATCATTCC
TTGAGAACAGAGGGGAGGAACTTCAAGATGGAGGTAGGAAAGGCTTCAATTGTACCTGAA
CAGACGACGGAGCTCCACAGTTGCAGAGATGGCCCGATTTGATGCTGAGAATTTTTAGGG
TTACAGAGTCCTTCGAATGCGATTTGGGAGAAGCGCGTGAGTACACGCACTTTTTTTAAC
AGATTTTTGTTCTGAAATCTATTACACAAAAAAAAGGTGAAAAGGATTTTAGGATGTTGC
TAAAAAAAAGGTGAAAAGGTTAGGGTTCTCAGCAAATTACAAAGATGGTAACGTGTTCTT
TAAGGTAACGTGTAACATTTCAATCATTTTCCAACGAAACTAGCTTCCATCTCACGACTC
AAGGTTCTTACACTTTTGTCTTAACGTAAGAAAAAAGGGGAAATTCTTGTATGTCGTTCG
ACCAACGAATTAGAAGAAGAAAGAAAAAAACCTAAATTCTAACGACATAAGAGCACTATT
ATCGGTGCTTCTAAGAAAAATCCTAATGCATTATTTGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BK75JQ C 1
AF RS1BK75TF U 15
BS 1 14 RS1BK75JQ
BS 15 640 RS1BK75TF

RD RS1BK75JQ 640 0 0
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TTACAGAGTCCTTCGAATGCGATTTGGGAGAAGCGCGTGAGTACACGCACTTTTTTTAAC
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TAAAAAAAAGGTGAAAAGGTTAGGGTTCTCAGCAAATTACAAAGATGGTAACGTGTTCTT
TAAGGTAACGTGTAACATTTCAATCATTTTCCAACGAAACTAGCTTCCATCTCACGACTC
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ACCAACGAATTAGAAGAAGAAAGAAAAAAACCTAAATTCTAACGACATAAGAGCACTATT
ATCGGTGCTTCTAAGAAAAATCCTAATGCATTATTTGGCC

QA 1 640 1 640
DS 

RD RS1BK75TF 626 0 0
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AAAGGTTAGGGTTCTCAGCAAATTACAAAGATGGTAACGTGTTCTTTAAGGTAACGTGTA
ACATTTCAATCATTTTCCAACGAAACTAGCTTCCATCTCACGACTCAAGGTTCTTACACT
TTTGTCTTAACGTAAGAAAAAAGGGGAAATTCTTGTATGTCGTTCGACCAACGAATTAGA
AGAAGAAAGAAAAAAACCTAAATTCTAACGACATAAGAGCACTATTATCGGTGCTTCTAA
GAAAAATCCTAATGCATTATTTGGCC

QA 1 626 1 626
DS 



AS 1 2

CO CL8732Contig1 765 2 2 U
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DA44TF U 1
AF RS1DA44JQ C 84
BS 1 587 RS1DA44TF
BS 588 765 RS1DA44JQ

RD RS1DA44TF 587 0 0
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QA 1 587 1 587
DS 

RD RS1DA44JQ 682 0 0
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QA 1 682 1 682
DS 



AS 1 2

CO CL8733Contig1 815 2 4 U
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BO88TF U 1
AF RS1BO88JQ C 68
BS 1 654 RS1BO88TF
BS 655 655 RS1BO88JQ
BS 656 691 RS1BO88TF
BS 692 815 RS1BO88JQ

RD RS1BO88TF 708 0 0
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AAATCTGCTCTGATGAAAATGGCTACAGACGCAATGAAGGATTCACGTGTACCTGAATTC
TTAGCACAACTGAGTGCTCTCCAATATAGAAGAATGGACTTTGAAGAGTTTTGTGCAGCA
GCATTGAGTGTTCATCAGCTAGAAGCTCTTGATAGATGGGAACAACACGCTCGTTGTGCT
TATGAGCTTTTCGAAAAGGAAGGAAACAGACCCATCATGATAGATGAACTCGCTTCGGAA
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GATGGAAAGCTTAGTTTTCTTGGGTTTGTGAAATTGTTACATGGTGTGTCTAGCCGCACT
ATCAAAGCTCATTAGGAGTTCAGAATATGTATGAGATATCTTCTCTGCCAAGAG*TTTAG
ACCAATTGGGTTATAATATGGCTTTGTCTTT
GTGAGAAAGCTGAGAGA

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1BO88JQ 748 0 0
TGGATATTCTTGTTT*CAAACTTATGAGAGCTTATTTACGATCGTCCTCTCTCCGTAAAG
CTGCGTTAAGAGCTTTGTCAAAAACGCTTACGGTTGATGAACTGTTTTACTTGAGGGAGC
AGTTTGCTTTACTTGAACCTAGCAAGAACGGGACAATAAGTCTAGAAAACATCAAATCTG
CTCTGATGAAAATGGCTACAGACGCAATGAAGGATTCACGTGTACCTGAATTCTTAGCAC
AACTGAGTGCTCTCCAATATAGAAGAATGGACTTTGAAGAGTTTTGTGCAGCAGCATTGA
GTGTTCATCAGCTAGAAGCTCTTGATAGATGGGAACAACACGCTCGTTGTGCTTATGAGC
TTTTCGAAAAGGAAGGAAACAGACCCATCATGATAGATGAACTCGCTTCGGAACTTGGTC
TTGGTCCTTCTGTACCGGTCCATGCAGTGCTTCACGACTGGCTTAGGCATACCGATGGAA
AGCTTAGTTTTCTTGGGTTTGTGAAATTGTTACATGGTGTGTCTAGCCGCACTATCAAAG
CTCATTAGGAGTTCAGAATATGTATGAGATATCTTCTCTGCCAAGAGGTTTAGACCAATT
GGGTTATAATATGGCTTTGTCTTTTGTGAAGAAAGCTGAGGAAGAAACAGGGAGAGTGTA
GTTTAAAAAGAGAAGTGTGTGTTAGTTTGTAAAGGATGGGGATAGTTTCTAAATTTGGTA
ATTTATGATGATTGATGATGTTTCTGAC

QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

CO CL8734Contig1 628 2 2 U
TTTGAACTGCAATTCTTACTCTTTCAAAAACATGAACATAAACCAGCGTTTTGATAATCC
AAAACGTTACACCATTTTGTCAGAATCACATCAACTTAAAACCCTACTCATTCATTCGCC
AAAACCTTACAATCTACCGAAGAAAAAAAAAAAGATTCCAGACAAAGACAGCGACATTAC
ACAGACACATCTGTAGAGAAACTACTACAACCTCGTTTGACTTCAAAACCAACAAATCTC
CCGTCACTTTTTATCTTCACCGAAAAGACGACGGAGTCGAGAAGCAAATACACCGGTAGA
GTCAATCGACGCTTGATGCAGAAGATCACTCTTGATTTTACTCATACGATCCGTCAAACT
ATCACTCTCCTTCTTGAGAACAGCCGTGTCTTCCTCAAGGTCGTGGATTCGATACTTCTG
ACTTACCGATCGGAAGCTCAGAAGCAAAATCCCAGTCATCGCGAAGAACTGGAAGAAGCT
CTGCTTGTTTTTCTTCACGTTATCGAAGAATCCAGACGCTACAGCTGTTAACGCCTTCGC
TGGATCTTTCCCTGTGAGAGGATCAACAGATCCCTGTGGCGCAGACGAAGAAGCCATTTG
AGTGTCGAATGAACGAACGCGAGAGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1BQ68TF C 1
AF RS1BQ68JQ U 3
BS 1 6 RS1BQ68TF
BS 7 628 RS1BQ68JQ

RD RS1BQ68TF 628 0 0
TTTGAACTGCAATTCTTACTCTTTCAAAAACATGAACATAAACCAGCGTTTTGATAATCC
AAAACGTTACACCATTTTGTCAGAATCACATCAACTTAAAACCCTACTCATTCATTCGCC
AAAACCTTACAATCTACCGAAGAAAAAAAAAAAGATTCCAGACAAAGACAGCGACATTAC
ACAGACACATCTGTAGAGAAACTACTACAACCTCGTTTGACTTCAAAACCAACAAATCTC
CCGTCACTTTTTATCTTCACCGAAAAGACGACGGAGTCGAGAAGCAAATACACCGGTAGA
GTCAATCGACGCTTGATGCAGAAGATCACTCTTGATTTTACTCATACGATCCGTCAAACT
ATCACTCTCCTTCTTGAGAACAGCCGTGTCTTCCTCAAGGTCGTGGATTCGATACTTCTG
ACTTACCGATCGGAAGCTCAGAAGCAAAATCCCAGTCATCGCGAAGAACTGGAAGAAGCT
CTGCTTGTTTTTCTTCACGTTATCGAAGAATCCAGACGCTACAGCTGTTAACGCCTTCGC
TGGATCTTTCCCTGTGAGAGGATCAACAGATCCCTGTGGCGCAGACGAAGAAGCCATTTG
AGTGTCGAATGAACGAACGCGAGAGGCC

QA 1 628 1 628
DS 

RD RS1BQ68JQ 626 0 0
GAAC
CTGCAATTCTTACTCTTTCAAAAACATGAACATAAACCAGCGTTTTGATAATCCAAAACG
TTACACCATTTTGTCAGAATCACATCAACTTAAAACCCTACTCATTCATTCGCCAAAACC
TTACAATCTACCGAAGAAAAAAAAAAAGATTCCAGACAAAGACAGCGACATTACACAGAC
ACATCTGTAGAGAAACTACTACAACCTCGTTTGACTTCAAAACCAACAAATCTCCCGTCA
CTTTTTATCTTCACCGAAAAGACGACGGAGTCGAGAAGCAAATACACCGGTAGAGTCAAT
CGACGCTTGATGCAGAAGATCACTCTTGATTTTACTCATACGATCCGTCAAACTATCACT
CTCCTTCTTGAGAACAGCCGTGTCTTCCTCAAGGTCGTGGATTCGATACTTCTGACTTAC
CGATCGGAAGCTCAGAAGCAAAATCCCAGTCATCGCGAAGAACTGGAAGAAGCTCTGCTT
GTTTTTCTTCACGTTATCGAAGAATCCAGACGCTACAGCTGTTAACGCCTTCGCTGGATC
TTTCCCTGTGAGAGGATCAACAGATCCCTGTGGCGCAGACGAAGAAGCCATTTGAGTGTC
GAATGAACGAACGCGAGAGGCC

QA 5 626 5 626
DS 



AS 1 2

CO CL8735Contig1 750 2 6 U
AATTTGGTTGAATGCAGTGGGGACTTTGCTAGGAGCCTTGACAGGGGCTTTGATTGGCCA
AGAAACAGAGACCGGTTTCATCAGAGGAGCAGCCGTTGGTGCTATTACTGGCGCTGTCCT
CTCCATCGATGTCCTTGAGTCTTCCCTTCTCCTCTGGCAATCCGATGACTCTGGTATTGC
TTGCCTTCTCTACTTGATTGACGTCATTGTCAGCCTTTTGAGCGGGAGGCTAGTTCGCGA
GCGTATTGGTCCTGCAATGCTTAATGCTGTCCAGAGTCAGATGGGAGCTATGGAGTCACA
GTTCCAAGACCAAACTCATGATATCTTCGCCACTCCCATTTCAAAAGGTCTCACTGGGGA
TTCTCTCGACAGGATCCCAAAGGTCCTCATTACAGACACCTCTGGGGAGATGATGGTCTC
TTGCTCCGTATGCCTTCAGGACTTTCAGGTGGGAGAGACTGTTAGAAGTTTGCCGCATTG
CCATCATATGTTCCACCTACCGTGCATCGACAAGTGGCTTGAAGGGCACGCTTCTTGTCC
CTTGTGCAGAAGAGACCTTTGAATTCTAACCTCTCATCTTATTTATAAATGAGGTATTAT
TAAACCCATTCACACTACTAGTTGGTGTTCCTTGATTATTTAGGTTACACATCAATCATT
GTAATTTGACTCATCTCTCTGATTTTATTTTAATGTATAACTTATTCTTGGCTTTGGCTA
GATATTCAATTTGTAGAAGAAAGTTTTGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B245TF U 1
AF RS1B245JQ C 41
BS 1 539 RS1B245TF
BS 540 540 RS1B245JQ
BS 541 643 RS1B245TF
BS 644 644 RS1B245JQ
BS 645 672 RS1B245TF
BS 673 750 RS1B245JQ

RD RS1B245TF 672 0 0
AATTTGGTTGAATGCAGTGGGGACTTTGCTAGGAGCCTTGACAGGGGCTTTGATTGGCCA
AGAAACAGAGACCGGTTTCATCAGAGGAGCAGCCGTTGGTGCTATTACTGGCGCTGTCCT
CTCCATCGATGTCCTTGAGTCTTCCCTTCTCCTCTGGCAATCCGATGACTCTGGTATTGC
TTGCCTTCTCTACTTGATTGACGTCATTGTCAGCCTTTTGAGCGGGAGGCTAGTTCGCGA
GCGTATTGGTCCTGCAATGCTTAATGCTGTCCAGAGTCAGATGGGAGCTATGGAGTCACA
GTTCCAAGACCAAACTCATGATATCTTCGCCACTCCCATTTCAAAAGGTCTCACTGGGGA
TTCTCTCGACAGGATCCCAAAGGTCCTCATTACAGACACCTCTGGGGAGATGATGGTCTC
TTGCTCCGTATGCCTTCAGGACTTTCAGGTGGGAGAGACTGTTAGAAGTTTGCCGCATTG
CCATCATATGTTCCACCTACCGTGCATCGACAAGTGGCTTGAAGGGCACGCTTCTTGTCT
CTTGTGCAGAAGAGACCTTTGAATTCTAACCTCTCATCTTATTTATAAATGAGGTATTAT
TAAACCCATTCACACTACTAGTTGGTGTTCCTTGATTATTTAG*TTACACATCAATCATT
GTAATTTGACTC

QA 1 672 1 672
DS 

RD RS1B245JQ 710 0 0
ACAGGGGCTTTGATTGGCCAAGAAACAGAGACCGGTTTCATCAGAGGAGCAGCCGTTGGT
GCTATTACTGGCGCTGTCCTCTCCATCGATGTCCTTGAGTCTTCCCTTCTCCTCTGGCAA
TCCGATGACTCTGGTATTGCTTGCCTTCTCTACTTGATTGACGTCATTGTCAGCCTTTTG
AGCGGGAGGCTAGTTCGCGAGCGTATTGGTCCTGCAATGCTTAATGCTGTCCAGAGTCAG
ATGGGAGCTATGGAGTCACAGTTCCAAGACCAAACTCATGATATCTTCGCCACTCCCATT
TCAAAAGGTCTCACTGGGGATTCTCTCGACAGGATCCCAAAGGTCCTCATTACAGACACC
TCTGGGGAGATGATGGTCTCTTGCTCCGTATGCCTTCAGGACTTTCAGGTGGGAGAGACT
GTTAGAAGTTTGCCGCATTGCCATCATATGTTCCACCTACCGTGCATCGACAAGTGGCTT
GAAGGGCACGCTTCTTGTCCCTTGTGCAGAAGAGACCTTTGAATTCTAACCTCTCATCTT
ATTTATAAATGAGGTATTATTAAACCCATTCACACTACTAGTTGGTGTTCCTTGATTATT
TAGGTTACACATCAATCATTGTAATTTGACTCATCTCTCTGATTTTATTTTAATGTATAA
CTTATTCTTGGCTTTGGCTAGATATTCAATTTGTAGAAGAAAGTTTTGGG

QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

CO CL8736Contig1 1386 2 2 U
GGAAAGGAAAGACCTTCGGAGTTTCTGAGAGAGATAATTGACGGGAGGAGGCATGGCAGG
AGTATCGCTAAAGTGTGGTGATTGTGGCGCGTTGCTGAAGTCAGTGGAGGAGGCTCAGGA
GCATGCGGAGATCACCTCTCACTCCAATTTCGCCGAGTCCACCGAGGCCGTGCTCAATCT
CGTCTGCACTACTTGCAGCAAGCCTTGCCGCTCTAAAACCGAAAGCGATTTGCATACGAA
AAGGACAGAGCATACTGAGTTTGTGGATAAGACAATGGAGACTGTGAAACCCATCAGCTT
GGAAGCTCCCAAGGCTGCTGTGGAGATTGACAACCCCGATGGTTCCAGTGGTAGTGGAGT
TGCTGCTGAAGTAGAGATGGTTGTTCCAGAGGTTGACAAAAACATTCTCGAGGAACTTGA
AGCGATGGGCTTCCCTAAAGCTCGTGCTACTCGAGCACTCCACTATTCTGGTAATGCCAG
TCTCGAGGCTGCGGTTAATTGGGTGGTGGAGCATGAGAATGATCCTGACGTAGACGAAAT
GCCAAAGGTACCTGCTAACTCTAATGCTGGACCTCCTAAACCTGCTCTTACGCCAGAAGA
AGTCAAGATAAAAGCACAAGAACTAAGGGAACGTGCACGGAAGAAGAAAGAAGAGGAAGA
AAAACGGATGGAACGTGAAAGAGAGAAGGAGCGAATTAGGATTGGCAAGGAACTCCTAGA
AGCAAAGCGGATAGAAGAAGATAACGAAAGAAAACGTATAATCTTTTTGCGTAAAGCCGA
GAAAGAAGAAGAGAGACGGGCTAGGGAAAAGATCCGTCAAAAAGTTGAAGAAGACAAGGC
TGAAAGAAGGCGTAAACTAGGACTGCCTGCAGAAGATCCTGCGGCTGCTGCAAAACCCTC
AGTGCCAGTTGTGGAAGAGAAGAAGAGTTCATTGCCTATTAGACCCGCCACTAAGACTGA
ACAAATGAGAGAATGCTTGAGGTCGCTTAAGCAAGCCCGCAAGAAGGATGATGCTAAAGT
GAAGAGAGCGTTCCAGACACTCCTGACTTATATGGGAAATGTCGCCAAGAATCCAGATGA
AGAGAAATTCCGAAAAATTAGACTTACCAACCAAACATTTCAGGAGAGGGTTGGTTCACT
GAGAGGAGGCATAGAGTTCATGGAGCTATGTGGGTTTGAGAAAATGGAAGGAGGAGAGTT
CTTGTTCTTGCCAAGGGACAAGATAGATTCAGCTGTTATCAACTCAGCTGGAACAGAGCT
CAATTCCGCTATCAACAACCCTTTCTTTGGTGTTCTTTAAACCGTTGCATTGTCTTCTTC
TTCTTTCTCTTTGGTATTGTGTCAAATGATGAAACTAATAAAATTTCCATCTATTAAATA
AAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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BQ
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AACTCGTCATCTTAGATTGGTGTGCCGATATATACAGCAGAACTGAAGTAAAACCTGCAG
ATATAGCTAAG

QA 1 731 1 731
DS 

RD RS1A166TV 718 0 0
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CTGGTCTTGTCGGAAACGCTGTCGAAGCCGCCGCTAAGATCGGCTATCGCCACATTGATT
GTGCTCAAATCTATGGCAACGAAAAGGAGGTAGAGCATTAATATGTTTTGAAGCTGTTGA
AGATGTCATGACTAAGGAGAATATTGCTGAGCCAATGAAGGATATCAGAAGAGCTCTCCT
TGAAGCATATGTGAGCCTTCCTGTTGTTAGAAAGTTTGTTCAATCTGTAAGTGACCAAGC
CGTTCGAATGGGTGTCATTCGAGGATTCAAACCAGATCAGCAGTTGGTCAAGATTGTACA
TGATGAGCTAGTGAAGGTGATGGGTGGAGAAGTATCTGAGATACAGTTTGTAAAGTCAGG
TCCTACAGTTATATTGCTTGCTGGACTCCAAGGAGTTGGGAAGACAACAGTTTGCGCTAA
ACTCGCTTATTACCTAAAGAAGCAGGGAAAATCGTGTATGCTAATTGCTGGAGATGTGTA
CAGACCTGCTGCCATTGATCAACTCGTCATCTTAGATTGGTGTGCCGATATATACAGCAG
AACTGAAGTAAAACCTGCAGATATAGCTAAGCAAGGTCTAAAAGAACTAAAATAAATAAT
GTCAATGTAGTCATCATGGATACTGCAGAAGGCTTCAGTAGACAAAGGGATGATGGAT

QA 1 718 1 718
DS 



AS 1 2

CO CL8739Contig1 460 2 1 U
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TGTCCAAATCAGGCAATGAGAAGAGCAGCTTGGAAGAGAGACAGAGAGCAGAGAAGAGAA
CACGTCAAGAGAAGGAGCAAAGCTTTACTCCCAAGTGGTTTGATATAACAGAGGAAGTCA
CTCCTACACCGTGGGGGGATCTTGAAGTTTACCAGTTCAATGGAAAGTACTTAGAACACC
GGGAAGCAGCTGATAAGTCTGAAGATAACACCGACCCTAAGTCAATCCCATTCAACCCAT
GGCAGTTCCAAGACATGTCTACTTGAAATGAATGGCTCCAGAAGACAAAAAGTGATCAAA
TCTTTTGGTAACATTTGTTGTAATTCTTATTCTCTCGTAGTTTCAACAAACTATGCTAGC
TTTCTCAAGTTTTAGTTTACAACATTTGTTTTCTTTTTCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1F653TF U 1
AF RS1GE60TF U 1
BS 1 460 RS1F653TF

RD RS1F653TF 460 0 0
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TGTCCAAATCAGGCAATGAGAAGAGCAGCTTGGAAGAGAGACAGAGAGCAGAGAAGAGAA
CACGTCAAGAGAAGGAGCAAAGCTTTACTCCCAAGTGGTTTGATATAACAGAGGAAGTCA
CTCCTACACCGTGGGGGGATCTTGAAGTTTACCAGTTCAATGGAAAGTACTTAGAACACC
GGGAAGCAGCTGATAAGTCTGAAGATAACACCGACCCTAAGTCAATCCCATTCAACCCAT
GGCAGTTCCAAGACATGTCTACTTGAAATGAATGGCTCCAGAAGACAAAAAGTGATCAAA
TCTTTTGGTAACATTTGTTGTAATTCTTATTCTCTCGTAGTTTCAACAAACTATGCTAGC
TTTCTCAAGTTTTAGTTTACAACATTTGTTTTCTTTTTCT

QA 1 460 1 460
DS 

RD RS1GE60TF 460 0 0
GCCTCTTGCCCTCTGATTCACGGTTACGCCCTGATAGATACGCACTAGAGATGGGCGACA
TGTCCAAATCAGGCAATGAGAAGAGCAGCTTGGAAGAGAGACAGAGAGCAGAGAAGAGAA
CACGTCAAGAGAAGGAGCAAAGCTTTACTCCCAAGTGGTTTGATATAACAGAGGAAGTCA
CTCCTACACCGTGGGGGGATCTTGAAGTTTACCAGTTCAATGGAAAGTACTTAGAACACC
GGGAAGCAGCTGATAAGTCTGAAGATAACACCGACCCTAAGTCAATCCCATTCAACCCAT
GGCAGTTCCAAGACATGTCTACTTGAAATGAATGGCTCCAGAAGACAAAAAGTGATCAAA
TCTTTTGGTAACATTTGTTGTAATTCTTATTCTCTCGTAGTTTCAACAAACTATGCTAGC
TTTCTCAAGTTTTAGTTTACAACATTTGTTTTCTTTTTCT

QA 1 460 1 460
DS 



AS 1 2

CO CL8740Contig1 708 2 2 U
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AGGGTCCGAATATTTTACTGGATGACACGCTCCCAACTGAGGTTGACAAGAACTTGATGA
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AAGACTCGCCGTAGAAAGGGAATGAGTGAGGACGTAAGCGGGAACAAGTTCTTCGATGAA
GCCATGATGGTAGAGCTAGCGCAGCAGACGGGTGATATGCATCTCCAAATGATGTGAGAT
CGTATCTTCTTGTCCAACTCGTGAGCTTATATGCAGGACTAGTAGTATCTTTGACTCTTA
TATTTGTGAATGGGAGTACACAAGAAATAACAAAATCCAATCTCTCCGACACTAAAGTTC
ATGTATCATTGCATGCTACTAGTACACTTGTTTTACCGGCCACGTGAAATTTCTCTTGTA
ATGTCTGTTATCAATCAAGTTGTTCAATGAACATGTCTAAAGGTTTCACGTGAGTTGATT
TCTTCATGCTGATGAGTGATGACGCAATATTTGAAAGAAGTTACTATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FL36TF U 1
AF RS1FL36JQ C 1
BS 1 585 RS1FL36TF
BS 586 708 RS1FL36JQ

RD RS1FL36TF 585 0 0
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TGGCAGTGAAAGACTCCATTGTTCAAGGGTTCCAGTGGGGGGCGCGAGAAGGGCCACTGT
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CATTGCACCGAGGATCTGGTCAGATGATTCCAACAGCACCTAGCTCGTGAGTTCATGGTC
AAGACTCGCCGTAGAAAGGGAATGAGTGAGGACGTAAGCGGGAACAAGTTCTTCGATGAA
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CGTATCTTCTTGTCCAACTCGTGAGCTTATATGCAGGACTAGTAGTATCTTTGACTCTTA
TATTTGTGAATGGGAGTACACAAGAAATAACAAAATCCAATCTCTCCGACACTAAAGTTC
ATGTATCATTGCATGCTACTAGTACACTTGTTTTACCGGCCACGT

QA 1 585 1 585
DS 

RD RS1FL36JQ 708 0 0
CGAAATATGACTGGGATTTACTTGCAGCACGTTCCATTTGGGCGTTTGGCCCTGACAAAC
AGGGTCCGAATATTTTACTGGATGACACGCTCCCAACTGAGGTTGACAAGAACTTGATGA
TGGCAGTGAAAGACTCCATTGTTCAAGGGTTCCAGTGGGGGGCGCGAGAAGGGCCACTGT
GTGATGAGCCCATCAGGAATGTCAAGTTCAAGATTGTTGATTCCTGGATAGCACCAGAGC
CATTGCACCGAGGATCTGGTCAGATGATTCCAACAGCACCTAGCTCGTGAGTTCATGGTC
AAGACTCGCCGTAGAAAGGGAATGAGTGAGGACGTAAGCGGGAACAAGTTTTTCGATGAA
GCCATGATGGTAGAGCTAGCGCAGCAGACGGGTGATATGCATCTCCAAATGATGTGAGAT
CGTATCTTCTTGTCCAACTCGTGAGCTTATATGCAGGACTAGTAGTATCTTTGACTCTTA
TATTTGTGAATGGGAGTACACAAGAAATAACAAAATCCAATCTTTCCGACACTAAAGTTC
ATGTATCATTGCATGCTACTAGTACACTTGTTTTACCGGCCACGTGAAATTTCTCTTGTA
ATGTCTGTTATCAATCAAGTTGTTCAATGAACATGTCTAAAGGTTTCACGTGAGTTGATT
TCTTCATGCTGATGAGTGATGACGCAATATTTGAAAGAAGTTACTATC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

CO CL8741Contig1 1009 2 4 U
GGAGAAAGAGTGGTCTTACTACCTGAGAACCGTTCAGTGTAAATTTGGTTTGACATGTAG
ATTCAACCATCCAGTTCCTCAGCAGCAGCCGCAGCCGCAGCCTCAACCTCAGCTACACAC
TATTTATCCAACGCTTCAGTCTCAGCCCTCTCAACAATATGGTTTAGTTTTGGCAAGGCC
TTCTCTTCTACCTGGTTCGTATCTTCCAAGCCCATACGGCCCACCAATGGTTCTGCCTCC
AGGAATGGTTACATACCCTGGTTGGAGTCCTTACCAGGCTTCTTTAACTGCAATGCCTTC
CTTGACTACCTCAAAAGAAGAGTCGTTTCCTCAGCGACCTGATCAACCTGAGTGTCAATA
CTTTATGAGAACCGGAGACTGTAAATTCGGATCTTCATGCAGATACCATCATCCTCTAGA
TGCTGTTCAACCTAAAACCGGTGTTCTCTTCAGCTCCATTGGCCTTCCACTTCGTCCAGG
CGTGGCACAATGCACTCACTTTGCACAGCACGGAATCTGCAAGTTTGGGCCAGCGTGTAA
GTTCGATCACTCGATGAGCTCTCCGCTTAGCTACAGCCCGTCTGCTTCTTCGCTAACGGA
TATGCCAGTGGCTCCATACCCAATCGGATCATCATCACTCAGCGGCGCATCAGCTCCAGT
AAGCTCGAGTGATGTACCAACCACCACACAGGCTGTGACTGCTGCAGCTTCGGCTCCTAT
GGTCAGTGGGCTAAGCAGTCAAGAGCCAGCGGAGACTAGTGGTGACTCGGCTAGCGTCAG
TGGCAGCGTAGAAGCTAAGACTTCTTCAAGTTAAGTAAAGGAAAAGATTAATGAACTAAA
AACAACATTAAGGAAAGAGAAAAAGAAGATTATTTTTGGGGTTTGAGATTTGATGGGAAG
CAGAGAGAGACCAAACCAAAGCTTCTGTCATTTACCACTTGTCAATATATAATACGTTTT
TTTCATACGGCCATCTTTCTGTCTTGAACAATGTTTACTACTTAATAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1C555TF U 1
AF RS1C555JQ C 586
BS 1 677 RS1C555TF
BS 678 678 RS1C555JQ
BS 679 687 RS1C555TF
BS 688 1009 RS1C555JQ

RD RS1C555TF 687 0 0
GGAGAAAGAGTGGTCTTACTACCTGAGAACCGTTCAGTGTAAATTTGGTTTGACATGTAG
ATTCAACCATCCAGTTCCTCAGCAGCAGCCGCAGCCGCAGCCTCAACCTCAGCTACACAC
TATTTATCCAACGCTTCAGTCTCAGCCCTCTCAACAATATGGTTTAGTTTTGGCAAGGCC
TTCTCTTCTACCTGGTTCGTATCTTCCAAGCCCATACGGCCCACCAATGGTTCTGCCTCC
AGGAATGGTTACATACCCTGGTTGGAGTCCTTACCAGGCTTCTTTAACTGCAATGCCTTC
CTTGACTACCTCAAAAGAAGAGTCGTTTCCTCAGCGACCTGATCAACCTGAGTGTCAATA
CTTTATGAGAACCGGAGACTGTAAATTCGGATCTTCATGCAGATACCATCATCCTCTAGA
TGCTGTTCAACCTAAAACCGGTGTTCTCTTCAGCTCCATTGGCCTTCCACTTCGTCCAGG
CGTGGCACAATGCACTCACTTTGCACAGCACGGAATCTGCAAGTTTGGGCCAGCGTGTAA
GTTCGATCACTCGATGAGCTCTCCGCTTAGCTACAGCCCGTCTGCTTCTTCGCTAACGGA
TATGCCAGTGGCTCCATACCCAATCGGATCATCATCACTCAGCGGCGCATCAGCTCCAGT
AAGCTCGAGTGATGTAC*AACCACCAC

QA 1 687 1 687
DS 

RD RS1C555JQ 424 0 0
TTT
TTCGCTAACGGATATGCCAGTGGCTCCATACCCAATCGGATCATCATCATTCAGGGGCGC
ATCAGCTCCAGTAAGCTCGAGTGATGTACCAACCACCACACAGGCTGTGACTGCTGCAGC
TTCGGCTCCTATGGTCAGTGGGCTAAGCAGTCAAGAGCCAGCGGAGACTAGTGGTGACTC
GGCTAGCGTCAGTGGCAGCGTAGAAGCTAAGACTTCTTCAAGTTAAGTAAAGGAAAAGAT
TAATGAACTAAAAACAACATTAAGGAAAGAGAAAAAGAAGATTATTTTTGGGGTTTGAGA
TTTGATGGGAAGCAGAGAGAGACCAAACCAAAGCTTCTGTCATTTACCACTTGTCAATAT
ATAATACGTTTTTTTCATACGGCCATCTTTCTGTCTTGAACAATGTTTACTACTTAATAA
A

QA 4 424 4 424
DS 



AS 1 2

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AACGTGCTTCCATCACTTTCTCGATTAATGAAGAGTGCTATTGGTGAGGGAATGACTCGC
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CAAGCCATGAAAGCTGTGGTTGGAGAAGAAGCTCTTTCTTCTGAGGATCTGCTGTACCTA
GAGTACCTGGACAAATTTGAGAGGAAGTTTGTGATGCAAGGCGCATACGATACAAGAAAC
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CACCGTATTCCTGCCAAAACACTTGATCAGTTCTACAGCCGCGATGCCACAAGCTAAGCC
TTTTATACAGCCTCTATATTACTCTATCCTCCCCTTATTTGGAACTTGAATTATGTTGAG
AGAAGAAAAAGATTTGCGTGAAAAAGAAAACACAAAAACTCAGAGAATTGTGGAATTTGG
TTTATTCGTTTGTTTGTTTCATCTGTGTAATAAAGGTTTGTGTGGTTGGTTGGGAAACTA
CGCACGAAAACGCTATTTATAAGCCTTACAAACTGGTGAATCATGTCTTTTTTTTTTGTT
GTGTAATAATAATCTATTTCCTTC


BQ
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AF RS1CJ62TF U 1
AF RS1CJ62JQ C 66
BS 1 691 RS1CJ62TF
BS 692 804 RS1CJ62JQ

RD RS1CJ62TF 691 0 0
GCTATTTATGAGCGTGCAGGGCGTATTGAAGGAAGAAAGGGTTCCATCACCCAAATCCCT
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AACGTGCTTCCATCACTTTCTCGATTAATGAAGAGTGCTATTGGTGAGGGAATGACTCGC
CGAGACCATTCTGATGTGTCCAACCAGCTCTACGCAAACTATGCAATCGGGAAGGATGTT
CAAGCCATGAAAGCTGTGGTTGGAGAAGAAGCTCTTTCTTCTGAGGATCTGCTGTACCTA
GAGTACCTGGACAAATTTGAGAGGAAGTTTGTGATGCAAGGCGCATACGATACAAGAAAC
ATCTTTCAGTCACTTGATTTGGCTTGGACACTGCTCCGTATCTTCCCGCGTGAACTTCTT
CACCGTATTCCTGCCAAAACACTTGATCAGTTCTACAGCCGCGATGCCACAAGCTAAGCC
TTTTATACAGCCTCTATATTACTCTATCCTCCCCTTATTTGGAACTTGAATTATGTTGAG
AGAAGAAAAAGATTTGCGTGAAAAAGAAAACACAAAAACTCAGAGAATTGTGGAATTTGG
TTTATTCGTTTGTTTGTTTCATCTGTGTAAT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1CJ62JQ 739 0 0
CACTATGCCCAATGATGACATCACTCACC*TACTCCGGATCTTACTGGTTACATTACCGA
GGGTCAGATATACATTGACAGGCAACTTCACAACAGACAGATTTATCCACCCATTAACGT
GCTTCCATCACTTTCTCGATTAATGAAGAGTGCTATTGGTGAGGGAATGACTCGCCGAGA
CCATTCTGATGTGTCCAACCAGCTCTACGCAAACTATGCAATCGGGAAGGATGTTCAAGC
CATGAAAGCTGTGGTTGGAGAAGAAGCTCTTTCTTCTGAGGATCTGCTGTACCTAGAGTA
CCTGGACAAATTTGAGAGGAAGTTTGTGATGCAAGGCGCATACGATACAAGAAACATCTT
TCAGTCACTTGATTTGGCTTGGACACTGCTCCGTATCTTCCCGCGTGAACTTCTTCACCG
TATTCCTGCCAAAACACTTGATCAGTTCTACAGCCGCGATGCCACAAGCTAAGCCTTTTA
TACAGCCTCTATATTACTCTATCCTCCCCTTATTTGGAACTTGAATTATGTTGAGAGAAG
AAAAAGATTTGCGTGAAAAAGAAAACACAAAAACTCAGAGAATTGTGGAATTTGGTTTAT
TCGTTTGTTTGTTTCATCTGTGTAATAAAGGTTTGTGTGGTTGGTTGGGAAACTACGCAC
GAAAACGCTATTTATAAGCCTTACAAACTGGTGAATCATGTCTTTTTTTTTTGTTGTGTA
ATAATAATCTATTTCCTTC

QA 1 739 1 739
DS 



AS 1 2

CO CL8743Contig1 628 2 2 U
GCTTTGTTCCGTTGTTTGACTTTGTTTCCAAAGTTAGTTTCACATCAACTGGCGTTTGCT
GCGGCTGGTTTTTGTTGTTACTTGTGGTTGACGCAACGCCTTTTTCCAAGGAATCTTGAA
CAGCCAAAGTATTTGCATGAACATTTTTAGCTTTGTTTGCTTCTTCTTCTTCTTTCATTT
TTTCCAATGTGTCTTCCTCAGCGACAAAGGAAGTTGTGACGCTCACAATTGGGAATATCG
TGATTCTAGAAGCTTGTTGGAATATCGCAATGGATACTCCAACCGCTGCTAGCTCAACCG
CTCCTAAATGTCCGATAAAAGCAGTGTCAATCAGAGAGGCTACTGGATCAGAAGCTAAAG
CCAAAGCCGCCGGAAACGCCATGCTTAGTAATTCTCGCCCAATTGCATCCATACTGAATA
CATGTGTTATATCTTTGAAAATAACAAGAAATGGAATCGGCCTCATCACGTTGGCGGGAA
CGGGAGTAAGATCACCAGCTTCTGTCATGATCGATCTTCTCCTTAGAGACGTCTCTTACT
TAATTTGTCGTGTCTGTAAATATCGTAAGTGTTTTCCAAGAACTGAATAAGCAAAGGGAG
CGTTTATATTACCGACTATGTACAAAAA


BQ
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AF RS1BO68TF C 1
AF RS1BO68JQ U 9
BS 1 8 RS1BO68TF
BS 9 628 RS1BO68JQ

RD RS1BO68TF 628 0 0
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GCGGCTGGTTTTTGTTGTTACTTGTGGTTGACGCAACGCCTTTTTCCAAGGAATCTTGAA
CAGCCAAAGTATTTGCATGAACATTTTTAGCTTTGTTTGCTTCTTCTTCTTCTTTCATTT
TTTCCAATGTGTCTTCCTCAGCGACAAAGGAAGTTGTGACGCTCACAATTGGGAATATCG
TGATTCTAGAAGCTTGTTGGAATATCGCAATGGATACTCCAACCGCTGCTAGCTCAACCG
CTCCTAAATGTCCGATAAAAGCAGTGTCAATCAGAGAGGCTACTGGATCAGAAGCTAAAG
CCAAAGCCGCCGGAAACGCCATGCTTAGTAATTCTCGCCCAATTGCATCCATACTGAATA
CATGTGTTATATCTTTGAAAATAACAAGAAATGGAATCGGCCTCATCACGTTGGCGGGAA
CGGGAGTAAGATCACCAGCTTCTGTCATGATCGATCTTCTCCTTAGAGACGTCTCTTACT
TAATTTGTCGTGTCTGTAAATATCGTAAGTGTTTTCCAAGAACTGAATAAGCAAAGGGAG
CGTTTATATTACCGACTATGTACAAAAA

QA 1 628 1 628
DS 

RD RS1BO68JQ 620 0 0
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TTTTTGTTGTTACTTGTGGTTGACGCAACGCCTTTTTCCAAGGAATCTTGAACAGCCAAA
GTATTTGCATGAACATTTTTAGCTTTGTTTGCTTCTTCTTCTTCTTTCATTTTTTCCAAT
GTGTCTTCCTCAGCGACAAAGGAAGTTGTGACGCTCACAATTGGGAATATCGTGATTCTA
GAAGCTTGTTGGAATATCGCAATGGATACTCCAACCGCTGCTAGCTCAACCGCTCCTAAA
TGTCCGATAAAAGCAGTGTCAATCAGAGAGGCTACTGGATCAGAAGCTAAAGCCAAAGCC
GCCGGAAACGCCATGCTTAGTAATTCTCGCCCAATTGCATCCATACTGAATACATGTGTT
ATATCTTTGAAAATAACAAGAAATGGAATCGGCCTCATCACGTTGGCGGGAACGGGAGTA
AGATCACCAGCTTCTGTCATGATCGATCTTCTCCTTAGAGACGTCTCTTACTTAATTTGT
CGTGTCTGTAAATATCGTAAGTGTTTTCCAAGAACTGAATAAGCAAAGGGAGCGTTTATA
TTACCGACTATGTACAAAAA

QA 1 620 1 620
DS 



AS 1 2

CO CL8744Contig1 592 2 1 U
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AAGATCAAATCGGCACTTACACTTACTTCGCTTCCACGTCGATGCACCGAGCTAGTGGTG
CTTTTGGTGCTCTCAACAAACCAGAGATCTGTTATTACCACTCCTTATCCTCAACCCGAT
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CGGCTTGACGCAGGCTATGCACTTCCTCTTCCTGATGCTCTTCTCATCAATGGTGTTTCC
AAGGGTTTAATCTTTACTGGTGAACAAGGTAAAACATACAAGTTTCGGGTATCGAATGTC
GGTATAGCAACATCGATAAACTTTAGAATTCAAGACCACACAATGAGCCTCATTGAAGTA
GAAGGCGCTCACACTCTTCAAGAAAGCTATGAGTCGCTTGACGTCCACGTTGGTCAGTCC
GTGACCGTCCTAGTCACTTTGAAAGCTTCAGTGAGAGACTATTACATCGTGGCTTCGACC
CGGTTTACTAAACCCATACTAACCACGACCGCGAGTCTTCGTTACCTAGCTC


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1G746TF U 1
AF RS1G737TF U 1
BS 1 592 RS1G737TF

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QA 1 163 1 163
DS 

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GTGACCGTCCTAGTCACTTTGAAAGCTTCAGTGAGAGACTATTACATCGTGGCTTCGACC
CGGTTTACTAAACCCATACTAACCACGACCGCGAGTCTTCGTTACCTAGCTC

QA 1 592 1 592
DS 



AS 1 2

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AATAGAGCTAGACACATGTCTTTCT


BQ
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AF RS1BP04JQ C 1
AF RS1BP04TF U 1
BS 1 582 RS1BP04TF
BS 583 583 RS1BP04JQ
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RD RS1BP04JQ 625 0 0
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AGGGAGACCATATAAAGAAAGGAGACGAGCTTGGTTACTTCTCATTTGGTGGAAGCACAG
TTATATGCGTCTTTGAAAAGGACTCGATTAAGATCGATGAGGATCTCTTATCTAACAGCG
CTAGGTCCTTGGAGACTTTAGTTACTGTCGGAATGCAACTAGGTGTCTCATTTCCAAAGC
TGGAAAACTGTTTCTTGAATCCTGAACTGCCTCAAACTAGTCAAAACTACGAATGATGTA
CTTCGGTTTGGTTTGATTTGTTTTAGTTTTCTTTTTTTTCCTTCAGAAACTCAAATTCTC
TTTTGTTTGATACACGATGACTTTGCTCTGTATATATAAACACCAGTATGTCCAGGCATT
GGTACTTGTTAATATTTACTGTGTTTCGTTGTTTTCTGCTAGGTGACAATTTTACATGCA
AATAGAGCTAGACACATGTCTTTCT

QA 1 625 1 625
DS 

RD RS1BP04TF 625 0 0
GGGTCGACGTTCCTGGAAGCTTATATACAGTTAATCCGATTGCAGTCAATAGCAAGTACT
GCAATGTATTCACTGAGAATAAACGGACCGTCGTAATGATATCAACTGCAGAGTTTGGAA
AGGTCGCATTTGTTGCGATTGGAGCCACAATGGTTGGTAGCATCAGCTTTGTTAGAAAAG
AGGGAGACCATATAAAGAAAGGAGACGAGCTTGGTTACTTCTCATTTGGTGGAAGCACAG
TTATATGCGTCTTTGAAAAGGACTCGATTAAGATCGATGAGGATCTCTTATCTAACAGCG
CTAGGTCCTTGGAGACTTTAGTTACTGTCGGAATGCAACTAGGTGTCTCATTTCCAAAGC
TGGAAAACTGTTTCTTGAATCCTGAACTGCCTCAAACTAGTCAAAACTACGAATGATGTA
CTTCGGTTTGGTTTGATTTGTTTTAGTTTTCTTTTTTTTCCTTCAGAAACTCAAATTCTC
TTTTGTTTGATACACGATGACTTTGCTCTGTATATATAAACACCAGTATGTCCAGGCATT
GGTACTTGTTAATATTTACTGTGTTTCGTTGTTTTCTGCTAG*TGACAATTTTACATGCA
AATAGAGCTAGACACATGTCTTTCT

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 2

CO CL8746Contig1 595 2 1 U
GGAATCACCCATTGTTAGCCACAACAACAGAGAATAGTGATCAAACCTCATGGCGTCTCT
TGCAACCGTCGCCGCCGTGAAACCATCCGTCGCCGTAAAAGGTCTTGGCGGCAACTCACT
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GGGAAACACAACAGGTCAATGGGATCTCTACGACTCTGATGCTCCTTCTCCTTACAACCC
TCTTCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTCGCTGCACCATTCACAAAGAGAGGATTGCTCCT
CAAGTTCTTGATCATCGGAGGAGGATCTTTGCTTACTTATGTCAGCGCTTCCTCCACCGG
AGATGTTCTTCCCATCAAGAGAGGTCCTCAGGAGAAGCCTAAGCTCGGTCCTCGCGGCAA
ACTCTGATTTAGATTTTCATGCATATGTTTTGTTACCTTCTTTCCCCCTCTTTATAATCC
CATAAACATTTCTCAATACCGCAAACTCTTTTAAGTGATTTTGATTTTATTGTAT


BQ
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AF RS1AM18JQ C 1
AF RS1AM18TF U 1
BS 1 595 RS1AM18TF

RD RS1AM18JQ 595 0 0
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QA 1 595 1 595
DS 

RD RS1AM18TF 595 0 0
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TGCAACCGTCGCCGCCGTGAAACCATCCGTCGCCGTAAAAGGTCTTGGCGGCAACTCACT
CGCCGGAGCCAAGCTCTCCTTCAAGCCTTCCCGCTTAAGCATCAAAACCAAATCAATTCG
GTCTGGTGGTGTGGTGGCTAAGTATGGTGACAAAAGTGTCTACTTTGATTTAGAAGACTT
GGGAAACACAACAGGTCAATGGGATCTCTACGACTCTGATGCTCCTTCTCCTTACAACCC
TCTTCAGAGCAAGTTCTTTGAGACATTCGCTGCACCATTCACAAAGAGAGGATTGCTCCT
CAAGTTCTTGATCATCGGAGGAGGATCTTTGCTTACTTATGTCAGCGCTTCCTCCACCGG
AGATGTTCTTCCCATCAAGAGAGGTCCTCAGGAGAAGCCTAAGCTCGGTCCTCGCGGCAA
ACTCTGATTTAGATTTTCATGCATATGTTTTGTTACCTTCTTTCCCCCTCTTTATAATCC
CATAAACATTTCTCAATACCGCAAACTCTTTTAAGTGATTTTGATTTTATTGTAT

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 2

CO CL8747Contig1 606 2 1 U
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GGTTTGGTCGGAGAAACCATAGATATACTATTCTTGCACAGGAGAAGTCGATGTTTTGAC
AAAAGGTGACAATAACTATGGAGATGATAGACTTCTCTATGCTGAAGGGCAGCAGTGGCT
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CGTTATAACGTCCAAAGATTGATTGACTTCTTTGGAAAGGCATGGGACTCTCGTTTATCA
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AAGCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 

AF RS1FK08TF U 1
AF RS1FK08JQ C 86
BS 1 606 RS1FK08TF

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TCATCGACATCATATAATGGGTCGTGCGGTTGGGTTCTTGCCTTACGTTGGATGGGTGAC
TATCATTATGACAGAAAAGCCTATCATCAAGTACATTCTCATAGGAGCACTGGGTTTACT
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AAGCCC

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DS 

RD RS1FK08JQ 521 0 0
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ATCAAGTACATTTTCATAGGAGCACTGGGTTTACTCGTTATAACGTCCAAAGATTGATTG
ACTTCTTTGGAAAGGCATGGGACTCTCGTTTATCACCCTTGTTGTTTTAAGAAGAAAATA
CAATTTAAAAGACTGGTCATTTTGTGGTTTAGATCACTTTAAACAGTAGAATCAGAAGCT
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AACTCAAGAGTAGAAGTAAGAATAGAGTCAGCGGTAAGCCC

QA 1 521 1 521
DS 



AS 1 2

CO CL8748Contig1 554 2 2 U
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TGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAGGAAGCCTATCGTTCAGAAGCGTAGGG
CTAGCCTCAATGACTTCGACAGGTTCAAGATCATGTTGGCCAAAATCAAGAAAGCTGGTG
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ATGTTAGTTTCAGTTTTGAAACCTTTACAACTTTCATCTTTCGTTTAATGTCAAAGATCC
TTTACGACTTTAAC


BQ
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AF RS1AH57JQ C 1
AF RS1AH57TF U 242
BS 1 241 RS1AH57JQ
BS 242 554 RS1AH57TF

RD RS1AH57JQ 554 0 0
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AAGGCTTTGATCGAGGCTATGGAGAAAGCTGGTGAGTGTTTGCTCTTTGATATTGCAATG
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TGAAGAACAAGTGGGAGAAGAGCTCATGGGGTAGGAAGCTTATCGTTCAGAAGCGTAGGG
CTAGCCTCAATGACTTCGACAGGTTCAAGATCATGTTGGCCAAAATCAAGAAAGCTGGTG
TTGTCAGGCAAGAACTTGCGAAGCTCAAGAAGGAGATCACTGCTTGAGTTACTATCTGCG
AATCGTTTTTTGTATTTTGGATTTACTAGCGTTTTGCAATTTATCAACTCTGTTGAATGG
ATGTTAGTTTCAGTTTTGAAACCTTTACAACTTTCATCTTTCGTTTAATGTCAAAGATCC
TTTACGACTTTAAC

QA 1 554 1 554
DS 

RD RS1AH57TF 313 0 0
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TGTTAGTTTCAGTTTTGAAACCTTTACAACTTTCATCTTTCGTTTAATGTCAAAGATCCT
TTACGACTTTAAC

QA 1 313 1 313
DS 



AS 1 2

CO CL8749Contig1 779 2 24 U
ATAAAATCTTTGATGTATTATTATTTGTAAATAACAGCATGAGACAAAACCAAGGTTACA
CAACACAACAAAAGTTTTTGTTTTGGTCTTAAAACAAATAATACTACAACACAACACACA
AGATCCACATGATGAAGATTATACCAGGGCACATCTGATCTCTTCCCATCTTTCTTCTCT
TGCCTATTAAAACCACACAACGACCAATCAAGAATCTTGTTCACTCGTTTTAGATGCTTG
GTCTCACGTTCAGACGGCTTGCCAGCTTCTGTCCCAGTGACTTATCAGCCTGAGACCAGT
AAGAAATCCAGATACTGCGGATTTCATGTGTGATCCGAGGGTCTGATAGAGCATCAATCC
ATCTACCGATGAAACGTTCTTGCCTCTCTGGTGTAAAGGAACGGTATCTCTCTCCAGGCT
CCTTGAAGTTGTTCTCTTTCTCAATAATACACCTCTCACGCTTCCCAGAGCAGACTGCTG
GTGGAGTTGGATACTTCTCAGCATGGCGAACCGGGTCATACCTCGAAGGGAAGTAGTTAA
CCTCCTCGTCCCTGTGCATGAAATTCATGAAGCCCTCATGGTGGTTGTTGTGGTGAGCAC
ATTTCGGAGCATTCACCGGTAACTGAAGGTAGTTAGGTCCAAGACGGTGTCTCTGAGTAT
CCGCATAGGAGAAGACACGTGTTTGAAGCAGCTTGTCATCAGAGTAGTGTATCCCCGGAA
CAATGATAGCAGGACAGAAAGCAAGCTGCTCATTCTCCGCAAAGAAGTTATCAATGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1CH79JQ U 1
AF RS1ES03JQ U 31
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QA 1 733 1 733
DS 

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ACATCTGATCTCTTCCCATCTTTCTTCTCTTGCCTATTAAAACCACACAACGACCAATCA
AGAATCTTGTTCACTCGTTTTAGATGCTTGGTCTCACGTTCAGACGGCTTGCCAGCTTCT
GTCCCAGTGACTTATCAGCCTGAGACCAGTAAGAAATCCAGATGCTGCGGATTTCATGTG
TGATCCGAGGGTCTGATAGAGCATCAATCCATCTACCGATGAAACGTTCTTGCCTCTCTG
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DS 



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BQ
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AF RS1G068TF U 1
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BS 591 695 RS1G068JQ

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AGGCAGCTTCCGCGTTTTACGACGAGCATTCGTCGAGGAGCTTTTTCCCTGATCTTGTTT
CTTACATGACAAGTGGTCCGGTGTTGGCGATGGTGTTGGAGAAGAGAGACGCGGTTTCTG
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GCATCAGAGCATTATGTGGTAAGGACTCGCAAAGAAACTGTGTGCACGGATCGGATTCAA
CATCATCAGCTGAGAGAGATAAAGTTTTTCTTCGAGGATGTGGTTTCAGTTGACATCGCT
TCCCAACATGATGAACTTTAGAAAACACCAAAACGTGTTCTCTTTGTAATCTTGTACCTG
TTGTTTAATCTATATATAGTTACATATACTGTTTCATAACAAATGTTCAT

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DS 

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TCGATTCCGGTTTCAGTATCGTCAATGAGAGGCTTACTCAGCTTGACAAGGAGGCAGCTT
CCGCGTTTTACGACGAGCATTCGTCGAGGAGCTTTTTCCCTGATCTTGTTTCTTACATGA
CAAGTGGTCCGGTGTTGGCGATGGTGTTGGAGAAGAGAGACGCGGTTTCTGACTGGCGTG
GTTTAATCGGGCCTACGGATGCGCAAAAGGCTAAGATATCTCATCCTCACAGCATCAGAG
CATTATGTGGTAAGGACTCGCAAAGAAACTGTGTGCACGGATCGGATTCAACATCATCAG
CTGAGAGAGATAAAGTTTTTCTTCGAGGATGTGGTTTCAGTTGACATCGCTTCCCAACAT
GATGAACTTTAGAAAACACCAAAACGTGTTCTCTTTGTAATCTTGTACCTGTTGTTTAAT
CTATATATAGTTACATATACTGTTTCATAACAAATGTTCATTAATTTCGATTGAACTTTA
TGAATTTTGGGAACAGTTGTATTATTACCACCCAGATTACATAGGATTAGACATCCAAAG
CTTTATGCATACAATGTTTGTTTTCT

QA 1 686 1 686
DS 



AS 1 2

CO CL8751Contig1 925 2 4 U
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ACTGTGACTATCCAAACTCCTGTTGGTTTCAAGCGTTCTATTCGGATCAAACGAACCGGT
AATGAGGTTTGGTTGGAAAAGGGTTGGAGTGAGTTTGCAGAGGCTCATTCTATTAACGAA
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GTGTCTGCTTCTGAGATTGATTATCCAATGGACAAAGTTCATGTCATTGAGAGTGATGAT
GATGAGGATATGATGGAAGCTATGGATACTGATGATGAAGAAGAAGGGTTTACCAGGGTT
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AAGAAACCAAGAGTTAGTGTCAAATCTGAGACGATTACTATTGATTAATGTTGAAGAGAC
TAATTCTATGGAGGAGAGACTCAAGAAGATAAGAGGGCCTTGAGGAGGAGTAAGAGAAGT
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CAGGGTAGCTATCGGTTTCTAGTTTCTTAAACAGGCTTGCATGTTTAATTTTAGTTACAT
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TGAAGTGAATCTGCCCCCCCTTTAT


BQ
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AF RS1A512TF U 1
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GATGAGGATATGATGGAAGCTATGGATACTGATGATGAAGAAGAAGGGTTTACCAGGGTT
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CTATGGAGGAGAGACTCAAGAAGATAAGAGGGCCTTGAGGAGGAGTAAGAGAAGTCCTTA
AAACTTGTGTTTTTCTGTTTTTTTTCCCCTTCAAATGTTCCGCAGTTTCTAACCGCAGGG
TAGCTATCGGTTTCTAGTTTCTTAAACAGGCTTGCATGTTTAATTTTAGTTACATAATGT
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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1EM64TF U 1
AF RS1FM20TF U 1
BS 1 649 RS1EM64TF

RD RS1EM64TF 649 0 0
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TGTTCCACCATGCCGAAGCATTACAGACCAGCGGGAAAGAAGAAGGAAGGAAATGCGGCG
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AGACTATGTATTGTGAAAGGAATATTCCCCAGAGAACCGAAGAAGAAGGTGAAGGGAAAC
CACCACACTTACTACCATGTGAAGGACATTTCTTTCCTTCAGCACGAGCCTCTTCTCGAG
AAGTTCAGGGAAATCAAAACCTACCAAAAGAAGGTTCAGAAGGCCAAAGCCAAGAAGAAC
GAGGAGCTCGCGCGCCTTTTGCTTACCCGCCAACCTACTTGCAAGCTTGATAGATTGATC
CGTGAAAGGTATCCCACATTCATTGATGCACTGCGTGACTTGGATGACTGTCTTACGATG
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GGAAAGTGTTCGTGTCTGT

QA 1 619 1 619
DS 



AS 1 2

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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EP10TF U 1
AF RS1EP10JQ C 67
BS 1 670 RS1EP10TF
BS 671 671 RS1EP10JQ
BS 672 687 RS1EP10TF
BS 688 688 RS1EP10JQ
BS 689 707 RS1EP10TF
BS 708 797 RS1EP10JQ

RD RS1EP10TF 707 0 0
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AGGAGATTTCAAACGAAGTGAATCTGGATTTGAATCTAGGTCCTGCCCCTGACGTAAGTC
TCGAGCCAGTAACGGATCCTTCTGCTGCGTATTGGGCTAATGGAACATTTAATGCAGGCA
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GATGCTTATTTGATGACGCATGCATTTGATGAGCAACTCAACGTCGTTCCTGGTGTTGGT
GCTGAAGACAGAGATTCGTTCTCAAGTATAATAGGGGTAATGAACTCGGAGAGTCAAGTT
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CCACATGAGAATGGTTCAAGGGTCTCTGATGTAGACAGTGCAGACTCTCGTCCTCTGAGG
AGGAGGAGATTGGGTTAGAGTGGTTTCTGACTTCCATGGCTGGTGGTGGAAGAAGAAAGA
GGGAGCTTAG*ATCGTCTGTAGTTGAA*TCTGCGGTTTAGTTTCTCT

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1EP10JQ 731 0 0
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TTTCAAACGAAGTGAATCTGGATTTGAATTTAGGTCCTGCCCCTGACGTAAGTCTCGAGC
CAGTAACGGATCCTTCTGCTGCGTATTGGGCTAATGGAACATTTAATGCAGGCAGAAGTA
AGAGGTTTGAGGGTGCCGTTTTCTCCTGTGTTGACCGCTGCTGAAAGATTAGAGGATGCT
TATTTGATGACGCATGCATTTGATGAGCAACTCAACGTCGTTCCTGGTGTTGGTGCTGAA
GACAGAGATTCGTTCTCAAGTATAATAGGGGTAATGAACTCGGAGAGTCAAGTTGATACT
GCAGCCGAGATTGATTCTATGGTGACTGTTTCTACTTCTTCCTCTGTGAGAAGACCACAT
GAGAATGGTTCAAGGGTTTTTGATGTAGACAGTGCAGACTCTCGTCCTCTGAGGAGGAGG
AGATTGGGTTAGAGTGGTTTCTGACTTCCATGGCTGGTGGTGGAAGAAGAAAGAGGGAGC
TTAGGATCGTCTGTAGTTGAAATCTGCGGTTTAGTTTCTCTTCTTCTTTTTTTGGATTTT
GGATTTTGATTTTTTGGTTTTTGCTTAGGGATGGTTATTGAGTCAAAAATTAATAATATA
TTCAGTTGCTC

QA 1 731 1 731
DS 



AS 1 2

CO CL8754Contig1 659 2 1 U
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GTCGATTCTCTTCCTCAATTTCAAAGCTTTCGTCATTTTTTTCAAGATTAGTGTTAGCAA
TGGCGTCGCATTACAATAGCTTCTTCGGCAGCAGCGAAGAGCCACACTTTCTGGAATCTT
GCTCTCTCTGCCGTAAACACCTCGCTCTCAACTCAGATATCTTCATGTACAGAGGAGACA
AGGCGTTTTGTAGCAAAGAGTGTAGAGAAGAACAGATCGAGCACGATGAAGCCAAAGAGA
AAAGCTGGAGACTTTCCGCTAGATCTCTCCGCAAGAAATCTTCCGAAGCAGCTAAAGATT
CCGCCGCCGGAAAAACCGTACGGACAGGAACTCTCGTGGTGGCCTAGTTGTGTTTTTATT
ACATAAGCAGATAGTTTTTTCTTTATATATTACCCTCTTTAAGAAAAAAGAAAAAAAAAA
CATGCAAAGTTTTGCTCTGTTTCTATCTTTATCTTGTTTCCGATGTCGGAATCTGAGAAA
AGTGTTAGATCTGGTTTTTATGTAAATGAATGTGTTGATAGTTTTTTTTTTTGTTTATCT
GGGGGGTTTAAATTTTGTTCCGACAATAAACAGAGCATACTATGTTCTAAATTCAATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1C168TF U 1
AF RS1C168JQ C 63
BS 1 659 RS1C168TF

RD RS1C168TF 659 0 0
GGCCCCTCCTCCTTCCTTCTCCTTCCTCTCTGAGTTGAATCTCAAATCTCTGCTTCTGCA
GTCGATTCTCTTCCTCAATTTCAAAGCTTTCGTCATTTTTTTCAAGATTAGTGTTAGCAA
TGGCGTCGCATTACAATAGCTTCTTCGGCAGCAGCGAAGAGCCACACTTTCTGGAATCTT
GCTCTCTCTGCCGTAAACACCTCGCTCTCAACTCAGATATCTTCATGTACAGAGGAGACA
AGGCGTTTTGTAGCAAAGAGTGTAGAGAAGAACAGATCGAGCACGATGAAGCCAAAGAGA
AAAGCTGGAGACTTTCCGCTAGATCTCTCCGCAAGAAATCTTCCGAAGCAGCTAAAGATT
CCGCCGCCGGAAAAACCGTACGGACAGGAACTCTCGTGGTGGCCTAGTTGTGTTTTTATT
ACATAAGCAGATAGTTTTTTCTTTATATATTACCCTCTTTAAGAAAAAAGAAAAAAAAAA
CATGCAAAGTTTTGCTCTGTTTCTATCTTTATCTTGTTTCCGATGTCGGAATCTGAGAAA
AGTGTTAGATCTGGTTTTTATGTAAATGAATGTGTTGATAGTTTTTTTTTTTGTTTATCT
GGGGGGTTTAAATTTTGTTCCGACAATAAACAGAGCATACTATGTTCTAAATTCAATTT

QA 1 659 1 659
DS 

RD RS1C168JQ 597 0 0
CGATTCTCTTCCTCAATTTCAAAGCTTTCGTCATTTTTTTCAAGATTAGTGTTAGCAATG
GCGTCGCATTACAATAGCTTTTTCGGCAGCAGGGAAGAGCCACACTTTCTGGAATCTTGC
TCTTTTTGCCGTAAACACCTCGCTCTCAACTCAGATATCTTCATGTACAGAGGAGACAAG
GCGTTTTGTAGCAAAGAGTGTAGAGAAGAACAGATCGAGCACGATGAAGCCAAAGAGAAA
AGCTGGAGACTTTCCGCTAGATCTCTCCGCAAGAAATCTTCCGAAGCAGCTAAAGATTCC
GCCGCCGGAAAAACCGTACGGACAGGAACTCTCGTGGTGGCCTAGTTGTGTTTTTATTAC
ATAAGCAGATAGTTTTTTCTTTATATATTACCCTCTTTAAGAAAAAAGAAAAAAAAAACA
TGCAAAGTTTTGCTCTGTTTCTATCTTTATCTTGTTTCCGATGTCGGAATCTGAGAAAAG
TGTTAGATCTGGTTTTTATGTAAATGAATGTGTTGATAGTTTTTTTTTTTGTTTATCTGG
GGGGTTTAAATTTTGTTCCGACAATAAACAGAGCATACTATGTTCTAAATTCAATTT

QA 1 597 1 597
DS 



AS 1 2

CO CL8755Contig1 628 2 2 U
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TGGTTACAACGTTAGAAGAAAGAACAAGCGCTCTTCGGTGGCGTGTCTTCAGGTGTTGGC
TGAAGAACACAGGTCTTAAAAGTGAAAACTATGAGATGGTGTCAATTAATGGAAGGATGC
AGGAATATACATCGAGAAACTATGAACTCAAATGTTCTCCTACAGGGTATGCCATGAGAA
TACCTTTTGAACTGAGGTTTATTCATATGTAATGTATTTTTATTATTTTGTCTTATACAG
TATATTATCTTAAAGAATAATCATTGAAACATTGTCAAAACAACATGCTTATGGTATTTC
CTTACTTCGAATAAATCGTATTACAAGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1FY23JQ C 1
AF RS1FY23TF U 1
BS 1 609 RS1FY23TF
BS 610 628 RS1FY23JQ

RD RS1FY23JQ 628 0 0
GGATGACTCTCTTCTTCGTACGGCGATGACGATTCGGTGGTATCTTATTCTCGCCATCTG
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ATTTTCTTTTGCAGTTTTTGTTTCGTTGATCGACTGTATGAAGTTTCAACTTGGTGTTTG
TGGTTACAACGTTAGAAGAAAGAACAAGCGCTCTTCGGTGGCGTGTCTTCAGGTGTTGGC
TGAAGAACACAGGTCTTAAAAGTGAAAACTATGAGATGGTGTCAATTAATGGAAGGATGC
AGGAATATACATCGAGAAACTATGAACTCAAATGTTCTCCTACAGGGTATGCCATGAGAA
TACCTTTTGAACTGAGGTTTATTCATATGTAATGTATTTTTATTATTTTGTCTTATACAG
TATATTATCTTAAAGAATAATCATTGAAACATTGTCAAAACAACATGCTTATGGTATTTC
CTTACTTCGAATAAATCGTATTACAAGG

QA 1 628 1 628
DS 

RD RS1FY23TF 609 0 0
GGATGACTCTCTTCTTCGTACGGCGATGACGATTCGGTGGTATCTTATTCTCGCCATCTG
GAACGGTATGGCTTTGTGTTTACTCCCGTTAATAGCGTTCTTTACTCCTTAGATCTACGC
CACCTACGATCTTTCATTCAATACTTCTGATATATCTTACAGACGGTGAAACTCCACCTA
TAAAGTGGTATGTGTTCTTCCCATATACATCATCCTACGGTATCTTTGTGATATTTGTTC
ATTTTCTTTTGCAGTTTTTGTTTCGTTGATCGACTGTATGAAGTTTCAACTTGGTGTTTG
TGGTTACAACGTTAGAAGAAAGAACAAGCGCTCTTCGGTGGCGTGTCTTCAGGTGTTGGC
TGAAGAACACAGGTCTTAAAAGTGAAAACTATGAGATGGTGTCAATTAATGGAAGGATGC
AGGAATATACATCGAGAAACTATGAACTCAAATGTTCTCCTACAGGGTATGCCATGAGAA
TACCTTTTGAACTGAGGTTTATTCATATGTAATGTATTTTTATTATTTTGTCTTATACAG
TATATTATCTTAAAGAATAATCATTGAAACATTGTCAAAACAACATGCTTATGGTATTTC
CTTACTTCG

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 2

CO CL8756Contig1 823 2 1 U
GGGAACCAAAACAAAATCTCGTTACCGTCTCTCCAAGCAAGCAAGAAGAAGAAGAAGCCT
CTCAGTTCCCACAGAAAACAAAGATGCTCACAGTAAGCGTGAAGTGGCAGAAGAAGGTGT
TTGAAGGCATCGAGATTGATCCCACTCTGCCTCCTTACGTTTTCAAGGCTCAGCTGTATG
ATTTGACTGGAGTTCCTCCAGAGAGGCAAAAGATCATGGTCAAAGGTGGCCTCTTGAAGG
ATGATGCAGATTGGTCCGCCATTGGAGTGAAAGATGGTCAGAAGCTGATGATGATGGGAA
CTGCAGATGAGATTGTGAAAGCTCCTGAAAAGGCTATTGTTTTTGCTGAGGATCTACCTG
AAGAAGAGCAAGCCACTCATTTGGGTTACAGTGCAGGCCTTGTCAACCTTGGCAACACAT
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AGTTCTGGATGACATTACGAAAAAAGTTCCCTCAGTTTAGTCAGTTGCAGAATGGAATGC
ACATGCAGCAGATGCTGAAGAATGTTGGACACAACTGTTGTACACTCTTTCACAGTCCCT
GAAAGCACCAACTTCCAGCGAGGATTCTGATGCAGTGAAAGCTCTCTTTGGTGTCAATCT
TCGGAGCAGGTGCATTGTCAAGAAAGTGGCGAAGAAGCTCAGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1H226TF U 1
AF RS1AO55TFB U 1
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QA 1 625 1 625
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QA 1 823 1 823
DS 



AS 1 2

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CATCATATGTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTGTTTGATGTGTGTGTTGAAAGAGAAATTTC
GGAGATGTATTGATGCTTGTTAAATCCCGAAAAA


BQ
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AF RS1BK71JQ C 1
AF RS1BK71TF U 1
BS 1 621 RS1BK71TF
BS 622 634 RS1BK71JQ

RD RS1BK71JQ 634 0 0
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CATCATATGTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTGTTTGATGTGTGTGTTGAAAGAGAAATTTC
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QA 1 634 1 634
DS 

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AAAGAAGTGATCACCAAGCAAAGCGATTAGACCGAAATGGCCCACAAGATGAGGAGGGTT
TGAGAGATTAAACCCTAAATTGAAGACTTCTTTGTCCGTTTTCTTCTCTCGGTGATCTGG
TGGGTATCGATGGCGAGTCGGCTAAAGGAGATAGTGAAGAAGTACGGGAAAGTAGCGCTG
GGGGTGCATTTCTCAGTCTCCGGAGTCTCGATAAGTGGATTCTACATAGCCATCAAGAAC
AACGTGGATGTGGAGTCGCTCCTGGACAAGTACCAAATCCCCTGGTTCTCGTCCGACGAG
AAAGCTTCGGCGGAAGAAAAGAGCCGACAGCTGGCGAAATCAGCAGGGGGAGCCCTGGCT
TTGGCGGTTCTATGCAATAAGGCGCTGTTTCCGATAAGGGTGCCGATCACGATGGCGTTG
ACTCCTCCGATAGCTAGATTCCTCAGGCAGAGAAAGATCGTCGGTTGAATTAAACATTTT
CATCATATGTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTGTTTGATGTGTGTGTTGAAAGAGAAATTTC
GGAGATGTATTGATGCTTGTT

QA 1 621 1 621
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8759Contig1 725 2 4 U
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AATTGGAGAATAAATTGCATGGAAAGCTTCTCTCTCCTCCATGCATTGTTTTGTGATTTC
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CTCCA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 

AF RS1CS93TF U 1
AF RS1CS93JQ C 9
BS 1 553 RS1CS93TF
BS 554 554 RS1CS93JQ
BS 555 636 RS1CS93TF
BS 637 725 RS1CS93JQ

RD RS1CS93TF 636 0 0
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CAGTATCTAATTGAGCGATGGAAGATTTGGGTCCTTTAGAAACAAAGCCATTCACGAAAT
TGAAGATCGCTCTTTCTGTTTCTTTCTTTAGTTCCGATCAGTGTAGCTCTTTTAATTACA
CGCGTATCAAAAATTGAAGAATCGTGACTCTGACCATTCTCTTCGGATACTGGACGGGAG
AGAAATATGAGTCTATAAATCAATTGAAACAGGCTTTACCTATTTTGAAGCAGGAAGAGA
AATGGCATAGGGAGATGACTCACACAGACAGAAGAGATCACAGAAGAGACCATTACATTT
TCGCTCGCATAGCGATAATAATCAAGCCAGTGTTTGCGGCACCTATCCATCAAAAACAAC
ATGCAGCAGCTAAAATGAGAATTCTATTATTCATCTTTCCAAGCCCATTTTTATCAAGTT
CCAAGCCCAAGAAGATCCAAAATCAAGTGGTTTCCTTGCTGTCTAAAAAAGAGTGACGAT
AATTGGAGAATAAATTGCATGGAAAGCTTCTCTCTC

QA 1 636 1 636
DS 

RD RS1CS93JQ 717 0 0
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CTTATTTCTTCCATCAAATGATATCTCTTCCATGTCTTCTGTTGATACATTTCAGTATCT
AATTGAGCGATGGAAGATTTGGGTCCTTTAGAAACAAAGCCATTCACGAAATTGAAGATC
GCTCTTTCTGTTTCTTTCTTTAGTTCCGATCAGTGTAGCTCTTTTAATTACACGCGTATC
AAAAATTGAAGAATCGTGACTCTGACCATTTTCTTCGGATACTGGACGGGAGAGAAATAT
GAGTCTATAAATCAATTGAAACAGGCTTTACCTATTTTGAAGCAGGAAGAGAAATGGCAT
AGGGAGATGACTCACACAGACAGAAGAGATCACAGAAGAGACCATTACATTTTCGCTCGC
ATAGCGATAATAATCAAGCCAGTGTTTGCGGCACCTATCCATCAAAAACAACATGCAGCA
GCTAAAATGAGAATTCTATTATTCATCTTTCCAAGCCCATTTTTATCAAGTTCCAAGCCC
AAGAAAATCCAAAATCAAGTGGTTTCCTTGCTGTCTAAAAAAGAGTGACGATAATTGGAG
AATAAATTGCATGGAAAGCTTCTCTCTCCTCCATGCATTGTTTTGTGATTTCCTAAACTA
TTAAATATCTAGCTTTGTGAGCAAGTTTAGTTTCCTATAAATAATTTGTAATCTCCA

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1FP80TF U 1
AF RS1FL63TF U 25
BS 1 644 RS1FP80TF
BS 645 777 RS1FL63TF

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DS 

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AAATCCAGTGGAGAAGTTAAACTTAATGAGCTGTCTGATCTTGCCGAGACCGGAAAGCGT
AACACTTATAGACCAAGCACAAGCAGTGATATCAGTGACGAGAGCACATGCAGCGGTTTA
AGTACCAACAAGCCTCACAAGGCGAATGACGTGAGATGGGAAGCGATACAAGTTGTTCGA
GCGAAACATGGCTCTTTGGGTTTGAACCATTTTAGGCTCTTGAAGAGGGTAGGTGGTGGA
GATATCGGAACTGTCCACCTTGCTGAGCTGCACGGGACAAGGTGTTATTTCGCAATGAAG
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GATATGCAGTCTCTTGACCCCCTTTCTCCCACT

QA 1 753 1 753
DS 



AS 1 2

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AATACGAAGAAGAAAGATGAAAAGAGCGTTGTCCCTTTCTGCAGCCGAATTGCCTGTAGT
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GGCCGGCCTGGGAAGGAGATTGTTGGGAGCTCATCTCGAACTCCGGGTGGATTTGGATAC
TTAAGAAAGCCAGCCATAGGTACTGGCAGGAGACAGCCTTCTTCTAATCTGGACACAGGT
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AGAGGTGGTCTGAGCGGCAAGAATGGATTGAGAAACTTGAGTGCAACAACTCTGTATCTG
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BQ
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AF RS1F433TF U 1
AF RS1FK54TF U 1
BS 1 620 RS1F433TF
BS 621 770 RS1FK54TF

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TTAAGAAAGCCAGCCATAGGTACTGGCAGGAGACAGCCTTCTTCTAATCTGGACACAGGT
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ACTCGAGAGACTCTGATGGG

QA 1 620 1 620
DS 

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AATACGAAGAAGAAAGATGAAAAGAGCGTTGTCCCTTTCTGCAGCCGAATTGCCTGTAGT
GCAAAGGTAACTTCCACCAAGGGAACCAGGATTGGCTCTACGGATAGCAATACAAAAGTT
GGCCGGCCTGGGAAGGAGATTGTTGGGAGCTCATCTCGAACTCCGGGTGGATTTGGATAC
TTAAGAAAGCCAGCCATAGGTACTGGCAGGAGACAGCCTTCTTCTAATCTGGACACAGGT
TCTTCAGAGACGAGCAGTATTCATGATGATCATCCAGCTGCAGTTAAGCCTACCCTTCCT
CGTCTAAAAACTAAGAGAGGCGCAATCAATGTTCAGTCTCAAAGCACCGTCTCTGGAGAA
GTCGTAGGAAGCTCAAGTAGAGGAACCATTAGAAGCAGTCATCATAAATCTGTCTTGCGT
ACTCGAGAGACTCTGATGGGGCCCTCTGTTTCTTCATCTTCTGGTAGCGACCACACTCTA
AGAGGTGGTCTGAGCGGCAAGAATGGATTGAGAAACTTGAGTGCAACAACTCTGTATCTG
ATGTTCTTCCAGCTAAATCAAGCTCTGGACAAAGTCAGCGTGACTAAAAG

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 2

CO CL8762Contig1 871 2 4 U
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ACAATGACCAAAAGTACAAGCCATGTCGTAGTGGATGAGAAGAAAAAGAAAGGCTTTGTG
GCAGCCGCTGCAGGAGGCGGCTACAGGAGAGGTTTGGCCGTATTCGATTTCCTCCTCCGT
TTGGCGGCCATAGGAATCACTATCGGGTCTTCCCCTGTCATGTTTACCGCCGAGGAGACA
CTTCCCTTCTTCACTCAGTTCTTACAGTTCCAAGCCGGTTACGATGACTTTCCCACATTT
CAGTTCTTTGTGATAGCAATAGCCATTGTCGCCAGCTATCTTGTCCTATCACTTCCATTC
TCTATCGTAACTATTGTCCGCCCACTTGCGGTTGCACCCCGGCTCATCCTGCTCATCTCC
GACACTGTTGTTTTAACGCTTACCACAGCAGCAGCTGCTGCCGCAGCATCAATTGTCTAC
CTTGCACATAACGGCAACACAAACACCAATTGGCTCCCCATTTGTCAGCAATTTGGAGAC
TTCTGCCAAACCGCGAGTACTGCTGTTGTAGCCGCCTCTATCTCCGTTGTCTTCTTCGTC
CTTCTTATTGTCATCTCAGCCATTGCCCTAAAAAGGCATTGATTTGATATTTTCCGCGTG
TCAAGATGGAAAAGGGATCTAGTGTCTTCATGTATATGTGTGTAGTGTGTGCTTTGTGTA
ACATGAGATTGTAAGTATATGGTATCATTATGGTGTGGAAAATGTAACCGGAGTTCACAT
GTTTTAAGAAGATTTGTCTTGGTTCAGCTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GU82TF U 1
AF RS1GU82JQ C 92
BS 1 693 RS1GU82TF
BS 694 695 RS1GU82JQ
BS 696 730 RS1GU82TF
BS 731 871 RS1GU82JQ

RD RS1GU82TF 730 0 0
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GCAGCCGCTGCAGGAGGCGGCTACAGGAGAGGTTTGGCCGTATTCGATTTCCTCCTCCGT
TTGGCGGCCATAGGAATCACTATCGGGTCTTCCCCTGTCATGTTTACCGCCGAGGAGACA
CTTCCCTTCTTCACTCAGTTCTTACAGTTCCAAGCCGGTTACGATGACTTTCCCACATTT
CAGTTCTTTGTGATAGCAATAGCCATTGTCGCCAGCTATCTTGTCCTATCACTTCCATTC
TCTATCGTAACTATTGTCCGCCCACTTGCGGTTGCACCCCGGCTCATCCTGCTCATCTCC
GACACTGTTGTTTTAACGCTTACCACAGCAGCAGCTGCTGCCGCAGCATCAATTGTCTAC
CTTGCACATAACGGCAACACAAACACCAATTGGCTCCCCATTTGTCAGCAATTTGGAGAC
TTCTGCCAAACCGCGAGTACTGCTGTTGTAGCCGCCTCTATCTCCGTTGTCTTCTTCGTC
CTTCTTATTGTCATCTCAGCCATTGCCCTAAAA**GCATTGATTTGATATTTTCCGCGTG
TCAAGATGGA

QA 1 730 1 730
DS 

RD RS1GU82JQ 780 0 0
CCCCCC
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AGAAGAAAAAGAAAGGCTTTGTGGCAGCCGCTGCAGGAGGCGGCTACAGGAGAGGTTTGG
CCGTATTCGATTTCCTCCTCCGTTTGGCGGCCATAGGAATCACTATCGGGTCTTCCCCTG
TCATGTTTACCGCCGAGGAGACACTTCCCTTCTTCACTCAGTTCTTACAGTTCCAAGCCG
GTTACGATGACTTTCCCACATTTCAGTTCTTTGTGATAGCAATAGCCATTGTCGCCAGCT
ATCTTGTCCTATCACTTCCATTCTCTATCGTAACTATTGTCCGCCCACTTGCGGTTGCAC
CCCGGCTCATCCTGCTCATTTCCGACACTGTTGTTTTAACGCTTACCACAGCAGCAGCTG
CTGCCGCAGCATCAATTGTCTACCTTGCACATAACGGCAACACAAACACCAATTGGCTCC
CCATTTGTCAGCAATTTGGAGACTTCTGCCAAACCGCGAGTACTGCTGTTGTAGCCGCCT
CTATCTCCGTTGTCTTCTTCGTCCTTCTTATTGTCATCTCAGCCATTGCCCTAAAAAGGC
ATTGATTTGATATTTTCCGCGTGTCAAGATGGAAAAGGGATCTAGTGTCTTCATGTATAT
GTGTGTAGTGTGTGCTTTGTGTAACATGAGATTGTAAGTATATGGTATCATTATGGTGTG
GAAAATGTAACCGGAGTTCACATGTTTTAAGAAGATTTGTCTTGGTTCAGCTCG

QA 7 780 7 780
DS 



AS 1 2

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CAGTGATAGCCGTTGTTGTCGTGGCCTTAATCGCAGTGCTAGCTTTGCCAGTTCGCAGCC
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CTTTTAACATTCCGATTAACCGTACAACCGCCGTCTCTCTTCCACGTGCTTGTAACATGC
CTAGTGTTCCTCTTCAATGCAACGCCAATATTTCTCCAGCTGCTGCTCCTGGACCTGCTG
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CTCCAGCAGCTCAGACACCACAGTCTGATACAACTAGACCTTTTACACCAACCGTGAACG
GTGCTGCTCCTACATCTGATGACGGAGGAAGCACCAGTCGACCTTCTGTTACTCCTTCCT
CCTCCTACGCTCTCTCACCATCCCCTCTCTTCCTTATCGCCAGCCTCGTAGCTCTCAAAT
TCTACTGATTTCATTGTTTCTTTATTTTCCTCTGTCTTCATTCTCATGTGATTTGATTTA
CTCAAACCATTTGTTGGTCATTTGCTTTTTATATTTCTTTTTTGTGTGAGAATTTTTTTA
CTTTGTATACTGCCTGAAGTAATATATCATTTGCTTGATGTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EP60TF U 1
AF RS1EP60JQ C 166
BS 1 762 RS1EP60TF
BS 763 763 RS1EP60JQ
BS 764 778 RS1EP60TF
BS 779 779 RS1EP60JQ
BS 780 798 RS1EP60TF
BS 799 823 RS1EP60JQ

RD RS1EP60TF 798 0 0
GGACTTCAAACACAAACCTCACAAAAAAAAACTTAATTCGATCAACAATGTTGAAGATCC
CAGTGATAGCCGTTGTTGTCGTGGCCTTAATCGCAGTGCTAGCTTTGCCAGTTCGCAGCC
AGCAACCGCCGCTTAGCCAATGTACACCGTCTATGATGACCACCGTGGGACCTTGTATGA
GCATTTTAACCAACAGCAGTACCAACGGAACTTCACCTTCCTCTGATTGTTGTAACTCGC
TGAGGTCTTTGACTACGGGAGGAATGGGATGTCTATGTCTTATTGTCACCGGAAGTGTTC
CTTTTAACATTCCGATTAACCGTACAACCGCCGTCTCTCTTCCACGTGCTTGTAACATGC
CTAGTGTTCCTCTTCAATGCAACGCCAATATTTCTCCAGCTGCTGCTCCTGGACCTGCTG
GTACATTTGGACCGGCCATGTCTCCAAGTCCAGCAACAACTCCAATTGTTCCAGAGCCGA
CTCCAGCAGCTCAGACACCACAGTCTGATACAACTAGACCTTTTACACCAACCGTGAACG
GTGCTGCTCCTACATCTGATGACGGAGGAAGCACCAGTCGACCTTCTGTTACTCCTTCCT
CCTCCTACGCTCTCTCACCATCCCCTCTCTTCCTTATCGCCAGCCTCGTAGCTCTCAAAT
TCTACTGATTTCATTGTTTCTTTATTTTCCTCTGTCTTCATTCTCATGTGATTTGATTTA
CTCAAACCATTTGTTGGTCATTTGCTTTTTATATTTCTTTTT*GTGTGAGAATTTTTT*A
CTTTGTATACTGCCTGAA

QA 1 798 1 798
DS 

RD RS1EP60JQ 658 0 0
TGGGACCTTGTATGAGCATTTTAACCAACAGCAGTACCAACGGAACTTCACCTTCCTCTG
ATTGTTGTAACTCGCTGAGGTCTTTGACTACGGGAGGAATGGGATGTCTATGTCTTATTG
TCACCGGAAGTGTTCCTTTTAACATTCCGATTAACCGTACAACCGCCGTCTCTCTTCCAC
GTGCTTGTAACATGCCTAGTGTTCCTCTTCAATGCAACGCCAATATTTCTCCAGCTGCTG
CTCCTGGACCTGCTGGTACATTTGGACCGGCCATGTCTCCAAGTCCAGCAACAACTCCAA
TTGTTCCAGAGCCGACTCCAGCAGCTCAGACACCACAGTTTGATACAACTAGACCTTTTA
CACCAACCGTGAACGGTGCTGCTCCTACATCTGATGACGGAGGAAGCACCAGTCGACCTT
CTGTTACTCCTTCCTCCTCCTACGCTCTCTCACCATCCCCTCTCTTCCTTATCGCCAGCC
TCGTAGCTCTCAAATTCTACTGATTTCATTGTTTCTTTATTTTCCTCTGTCTTCATTCTC
ATGTGATTTGATTTACTCAAACCATTTGTTGGTCATTTGCTTTTTATATTTCTTTTTTGT
GTGAGAATTTTTTTACTTTGTATACTGCCTGAAGTAATATATCATTTGCTTGATGTTC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 1 2

CO CL8764Contig1 629 2 1 U
GGACCGTTTTCTGAGGAAGGTGAAGGAAGCAAGGTATGTCACTGGTAGACTACGACGATT
CTTCATCCGACGAAGATGTCTTACCTGCGGCGGCGGTGCACAAGGAAGCTCTGCCACAAA
CACCGCAACAAAAACCCTCTCCCCCGAAATCACGGAGGAGGTCTTTAAATGAGAAGGTAG
ATAGTGAGGTACTTCCTCAGCTACCAGATGCTTTGCTTCTTCTGGAGTCACCAACGCTTA
CACACGTGAGTGGCGGCGGTGGTGACCATGCTTCCGTTGTTGCAGCTGCAATGCGGAAAC
GAGACTTAAATGGCAACTCTTCTTCTCTTCCTCGTCGTCCCAAGGTGCCAAGAGGAGCTT
TGCCTCATTCCAAGAATACTCCAGACACTATGGGTAATCTGCTTGTGCCTCCTCAGCTCA
AAGGAAGGAGCAATGTTGCCACAGAAGATATGAGCAAGCTTTTTGTGAAGAAACGGCAAG
AGTCCTCCAAGGCAACATCTCCTTATAAGGATTAGTTTCTTCAATTTTGAATGCAACCTA
TAGTGTTGGTATCTTAGGTTGTGGGGAAATAAAAACAGAGCATGTAACTTTACTTTCTTT
CGTTTATTTATTACATGATTTCTGTTGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1D827JQ C 1
AF RS1D827TF U 1
BS 1 629 RS1D827TF

RD RS1D827JQ 629 0 0
GGACCGTTTTCTGAGGAAGGTGAAGGAAGCAAGGTATGTCACTGGTAGACTACGACGATT
CTTCATCCGACGAAGATGTCTTACCTGCGGCGGCGGTGCACAAGGAAGCTCTGCCACAAA
CACCGCAACAAAAACCCTCTCCCCCGAAATCACGGAGGAGGTCTTTAAATGAGAAGGTAG
ATAGTGAGGTACTTCCTCAGCTACCAGATGCTTTGCTTCTTCTGGAGTCACCAACGCTTA
CACACGTGAGTGGCGGCGGTGGTGACCATGCTTCCGTTGTTGCAGCTGCAATGCGGAAAC
GAGACTTAAATGGCAACTCTTCTTTTCTTCCTCGTCGTCCCAAGGTGCCAAGAGGAGCTT
TGCCTCATTCCAAGAATACTCCAGACACTATGGGTAATCTGCTTGTGCCTCCTCAGCTCA
AAGGAAGGAGCAATGTTGCCACAGAAGATATGAGCAAGCTTTTTGTGAAGAAACGGCAAG
AGTCCTCCAAGGCAACATCTCCTTATAAGGATTAGTTTCTTCAATTTTGAATGCAACCTA
TAGTGTTGGTATCTTAGGTTGTGGGGAAATAAAAACAGAGCATGTAACTTTACTTTCTTT
CGTTTATTTATTACATGATTTCTGTTGCC

QA 1 629 1 629
DS 

RD RS1D827TF 629 0 0
GGACCGTTTTCTGAGGAAGGTGAAGGAAGCAAGGTATGTCACTGGTAGACTACGACGATT
CTTCATCCGACGAAGATGTCTTACCTGCGGCGGCGGTGCACAAGGAAGCTCTGCCACAAA
CACCGCAACAAAAACCCTCTCCCCCGAAATCACGGAGGAGGTCTTTAAATGAGAAGGTAG
ATAGTGAGGTACTTCCTCAGCTACCAGATGCTTTGCTTCTTCTGGAGTCACCAACGCTTA
CACACGTGAGTGGCGGCGGTGGTGACCATGCTTCCGTTGTTGCAGCTGCAATGCGGAAAC
GAGACTTAAATGGCAACTCTTCTTCTCTTCCTCGTCGTCCCAAGGTGCCAAGAGGAGCTT
TGCCTCATTCCAAGAATACTCCAGACACTATGGGTAATCTGCTTGTGCCTCCTCAGCTCA
AAGGAAGGAGCAATGTTGCCACAGAAGATATGAGCAAGCTTTTTGTGAAGAAACGGCAAG
AGTCCTCCAAGGCAACATCTCCTTATAAGGATTAGTTTCTTCAATTTTGAATGCAACCTA
TAGTGTTGGTATCTTAGGTTGTGGGGAAATAAAAACAGAGCATGTAACTTTACTTTCTTT
CGTTTATTTATTACATGATTTCTGTTGCC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 2

CO CL8765Contig1 880 2 4 U
GGGCCACGCCACTGAGAGTTCAATCGCAGAGAACACAGAGTAACAGAGAAAATGCCGGCG
GCTAAGCAGAGGACCCCCAAAGTAAGCCGGAACCCCGATCTGATCAGGGGCGTCGGCAAA
TACTCTCGCTCCCAAATGTACCACAAGAGAGGTTTGTGGGCAATCAAGGCCAAAAACGGC
GGCGTTTTCCCCCGTCACGACGCTAAGTCCAAGGTCGAAGCTCCGGTTGAGAAGCCGGCC
AAGTTTTACCCGGCGGAAGACGTTAAGAAGCCGCTCGCCAACAGACGCAAGCCTAAGCCT
ACAAAGCTTAAAGCAAGCATTACTCCAGGAACTGTGTTGATCATCCTTGCTGGTAGATTC
AAGGGCAAGAGAGTTGTCTTTCTCAAGCAACTCACTTCTGGTTTGCTTTTGGTTACTGGA
CCATTCAAGATCAACGGTGTTCCGTTGAGACGTGTTAACCAGTCGTACGTGATTGGAACC
TCCACGAAGGTTGACATTTCTGGAGTTAACACTGAGAAATTCGATGACAAGTACTTCGGA
AAGGTTGCTGAGAAGAAGACGAAGAAAGGAGAAGGCGAGTTCTTTGAAGCTGACAAACAG
GAGAAGAAAGAGATCCCTCAAGAGAAGAAGGAAGACCAGAAAACCGTAGACGCAGCTCTG
ATCAAATCCATTGAAGCAGTCCCAGAGCTCAAGACTTACCTCGGCGCCAGGTTCTCTCTG
TCACAAGGAATGAAACCGCATGAGCTTGTCTTCTAGATTTCATCATCTTATCGTCTTGTT
TCCCTTCATGTTTCAACATCTGTTTTCCCCTGAGAGTTTTTGTCCCTGGATCTTAAAAAA
ATACACTATTTTCTCTGATTTATATATCAACGTTCTATCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BR89TF U 1
AF RS1BR89JQ C 93
BS 1 630 RS1BR89TF
BS 631 631 RS1BR89JQ
BS 632 723 RS1BR89TF
BS 724 880 RS1BR89JQ

RD RS1BR89TF 723 0 0
GGGCCACGCCACTGAGAGTTCAATCGCAGAGAACACAGAGTAACAGAGAAAATGCCGGCG
GCTAAGCAGAGGACCCCCAAAGTAAGCCGGAACCCCGATCTGATCAGGGGCGTCGGCAAA
TACTCTCGCTCCCAAATGTACCACAAGAGAGGTTTGTGGGCAATCAAGGCCAAAAACGGC
GGCGTTTTCCCCCGTCACGACGCTAAGTCCAAGGTCGAAGCTCCGGTTGAGAAGCCGGCC
AAGTTTTACCCGGCGGAAGACGTTAAGAAGCCGCTCGCCAACAGACGCAAGCCTAAGCCT
ACAAAGCTTAAAGCAAGCATTACTCCAGGAACTGTGTTGATCATCCTTGCTGGTAGATTC
AAGGGCAAGAGAGTTGTCTTTCTCAAGCAACTCACTTCTGGTTTGCTTTTGGTTACTGGA
CCATTCAAGATCAACGGTGTTCCGTTGAGACGTGTTAACCAGTCGTACGTGATTGGAACC
TCCACGAAGGTTGACATTTCTGGAGTTAACACTGAGAAATTCGATGACAAGTACTTCGGA
AAGGTTGCTGAGAAGAAGACGAAGAAAGGAGAAGGCGAGTTCTTTGAAGCTGACAAACAG
GAGAAGAAAGAGATCCCTCAAGAGAAGAAG*AAGACCAGAAAACCGTAGACGCAGCTCTG
ATCAAATCCATTGAAGCAGTCCCAGAGCTCAAGACTTACCTCGGCGCCAGGTTCTCTCTG
TCA

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1BR89JQ 788 0 0
A
CCCGATCTGATCAGGGGCGTCGGCAAATACTCTCGCTCCCAAATGTACCACAAGAGAGGT
TTGTGGGCAATCAAGGCCAAAAACGGCGGCGTTTTCCCCCGTCACGACGCTAAGTCCAAG
GTCGAAGCTCCGGTTGAGAAGCCGGCCAAGTTTTACCCGGCGGAAGACGTTAAGAAGCCG
CTCGCCAACAGACGCAAGCCTAAGCCTACAAAGCTTAAAGCAAGCATTACTCCAGGAACT
GTGTTGATCATCCTTGCTGGTAGATTCAAGGGCAAGAGAGTTGTCTTTCTCAAGCAACTC
ACTTCTGGTTTGCTTTTGGTTACTGGACCATTCAAGATCAACGGTGTTCCGTTGAGACGT
GTTAACCAGTCGTACGTGATTGGAACCTCCACGAAGGTTGACATTTCTGGAGTTAACACT
GAGAAATTCGATGACAAGTACTTCGGAAAGGTTGCTGAGAAGAAGACGAAGAAAGGAGAA
GGCGAGTTCTTTGAAGCTGACAAACAGGAGAAGAAAGAGATCCCTCAAGAGAAGAAGGAA
GACCAGAAAACCGTAGACGCAGCTCTGATCAAATCCATTGAAGCAGTCCCAGAGCTCAAG
ACTTACCTCGGCGCCAGGTTCTCTCTGTCACAAGGAATGAAACCGCATGAGCTTGTCTTC
TAGATTTCATCATCTTATCGTCTTGTTTCCCTTCATGTTTCAACATCTGTTTTCCCCTGA
GAGTTTTTGTCCCTGGATCTTAAAAAAATACACTATTTTCTCTGATTTATATATCAACGT
TCTATCG

QA 2 788 2 788
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8767Contig1 558 2 1 U
GTTCATCCCAGCGGAAAAATCCTGTAGCCTCATCTCTCACGTCGTGCAATTCCTTAAACC
TCAAGCAGTTCAAGTCTCAGCAGCAGATAAGAACACACGGACAGACTCAGATTTCTTTTG
AAGCACCATCAAAGTCGCAACAGGGAAGATCTGGTGGTGGTGGCTCTTTTTCTGTAGCCA
CAGGGTCTGCTCCACATGAAAAATCAGGAAACCCTAAGGTCAACAACAGCAAAGCCTTGC
CGTTATCACCTTTTCTTTCTTCAGCTGCACACGCACAGGACCAGGCAGAGAATTCAGCTT
CTGGGTCGACGCAAAAAAATTCTCCAGTTTGTGGGAGGAACGTGCCACCGATCATAACTT
CTTGCCCTGGTCACCTTTCCGAGCTAAAGTACTAGTTTCATCGAAGCTGGACGTATGAAG
TGGCCATTTTTGCAGTGTCTAGCTTCTGAATTAAGCTAATGGTAGGTGTTTGTTCTCAAT
ATTATAATTATTGAATAATCATTAGAATTATTAAAGTTTAACTTTAAATTTATAAACAAA
AATTTCATATTTATTTTT


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CTGGGTCGACGCAAAAAAATTCTCCAGTTTGTGGGAGGAACGTGCCACCGATCATAACTT
CTTGCCCTGGTCACCTTTCCGAGCTAAAGTACTAGTTTCATCGAAGCTGGACGTATGAAG
TGGCCATTTTTGCAGTGTCTAGCTTCTGAATTAAGCTAATGGTAGGTGTTTGTTCTCAAT
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QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 2

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AF RS1E637TF U 1
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QA 1 712 1 712
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1E201TF U 1
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BS 773 789 RS1E201TF
BS 790 802 RS1E201JQ

RD RS1E201TF 789 0 0
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ATTGAAGTTGATACTGTCTCTCCGGAAGAGGATAAAGAGGCATCAGAGTCACTTAATCAG
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GGTGATGATTTGAGCTCTTCAAATGTTGATCTCTCGGCAATGGAAGGCACAAGCTCGTCT
ACAGAAGATGGTACTGAGCTAAATACAGACAACTCTCTTGGTGATCATCAAGAACCTGAA
CAGGAGGAGTCAGAAACAACTGAAGATATCAACAGACGAAGCGTAGAGAGAGTTTTGAAT
ATGATGAAACAAGCTGTAGAGAGCGGGGCAGCGTTGGTGTTAGACGCTGCTGATCTTGAC
GCTGACACAGTCTTCGCAAAAGCCGTGGCCTTCTCGAGTGTAGCTACACCAGGACCAGTT
TTCCAGCATGGCTTAAGGAAGCAACCAGCGGTTAAGAAAGAGGAGAAACGAGAATTTGGA
TACAAAAACTTGGAGGCAAAGACAAGTAGTGATGTGGTTCCTGGGAGAAAAGAAGTTGCA
GTGAGGGTGGAGAGATATAAGAAGAAAGAGAAGGAAGGAATTGAAAAGAAAATTGATGAG
CTTGATGAAGATTACAGAGAAGTGATACCTCATGGGACACTGAAAGTAGATGAACTAGCT
AAACTACTTGCCTAATGTTGTTATCTGTATTTTATTTGTCCTTTGTTGAGT*AGTGTATA
ATGTAGTCT

QA 1 789 1 789
DS 

RD RS1E201JQ 646 0 0
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GCAATGGAAGGCACAAGCTCGTCTACAGAAGATGGTACTGAGCTAAATACAGACAACTCT
CTTGGTGATCATCAAGAACCTGAACAGGAGGAGTCAGAAACAACTGAAGATATCAACAGA
CGAAGCGTAGAGAGAGTTTTGAATATGATGAAACAAGCTGTAGAGAGCGGGGCAGCGTTG
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AAAGAGGAGAAACGAGAATTTGGATACAAAAACTTGGAGGCAAAGACAAGTAGTGATGTG
GTTCCTGGGAGAAAAGAAGTTGCAGTGAGGGTGGAGAGATATAAGAAGAAGGAGAAGGAA
GGAATTGAAAAGAAAATTGATGAGCTTGATGAAGATTACAGAGAAGTGATACCTCATGGG
ACACTGAAAGTAGATGAACTAGCTAAACTACTTGCCTAATGTTGTTATCTGTATTTTATT
TGTCCTTTGTTGAGTTAGTGTATAATGTAGTCTAGTTATCATTATC

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 2

CO CL8770Contig1 624 2 1 U
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TGACGTTTTGGCTTAGGAACGTCGACGGTGTGGACAAACCTGATCCTGACCATCGTTTTC
CTAAATGAAACAAAAAAGTATAACTATGACTGAGTGACTTAATAACCATAGTGAGACTAT
ACTATGAAATTATAACAAAATAATCCCGAGGAATGGTGTGTATCCACGTTTTATTATGAT
AATAATGTATGATGGTTCAATAGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1C674JQ C 1
AF RS1C674TF U 1
BS 1 624 RS1C674TF

RD RS1C674JQ 624 0 0
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CACCAATGCTGCTGTTAAGGAGTTGGAAGCAAGTTCAAGGATGTGCAGGGATAAGCAGCA
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TAGAGGTCAACTCTGGCGGGGAAGAGGAATGGGTCCCACACCCACGTACCGGAATATTCT
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TGACGTTTTGGCTTAGGAACGTCGACGGTGTGGACAAACCTGATCCTGACCATCGTTTTC
CTAAATGAAACAAAAAAGTATAACTATGACTGAGTGACTTAATAACCATAGTGAGACTAT
ACTATGAAATTATAACAAAATAATCCCGAGGAATGGTGTGTATCCACGTTTTATTATGAT
AATAATGTATGATGGTTCAATAGC

QA 1 624 1 624
DS 

RD RS1C674TF 624 0 0
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TATAAGTAAATACACTAATTCCATATAACATTATAAAGACTATTTTTGTCATTTTCTAAG
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CACCAATGCTGCTGTTAAGGAGTTGGAAGCAAGTTCAAGGATGTGCAGGGATAAGCAGCA
AAGCTGCAAAACAAAAGCCGATGGTCATCGACTACTCTGAAGATATCTCCTATCATAAAC
TAGAGGTCAACTCTGGCGGGGAAGAGGAATGGGTCCCACACCCACGTACCGGAATATTCT
TTCCGCCGGGACAAGAGTGGGTGATGTATGGTGTCCCTGACGGTGCTGCTTCCTTTGACA
TGACGTTTTGGCTTAGGAACGTCGACGGTGTGGACAAACCTGATCCTGACCATCGTTTTC
CTAAATGAAACAAAAAAGTATAACTATGACTGAGTGACTTAATAACCATAGTGAGACTAT
ACTATGAAATTATAACAAAATAATCCCGAGGAATGGTGTGTATCCACGTTTTATTATGAT
AATAATGTATGATGGTTCAATAGC

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

CO CL8771Contig1 340 2 1 U
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CCGACAAAAGCCATTACTACTCTGATCTGCACCACTGTCTTCTCAGAAAAAAACAAAACA
AAACCCAGATGTAAAGTAATGATTTTGATTCACTGGATCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EQ62JQ C 1
AF RS1EQ62TF U 1
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TAACCGAGCTTTTGAGCTGTCTTTAGAGCAGATGAGTAAGCTTGAGAGGCTCTTGATTCT
CCGACAAAAGCCATTACTACTCTGATCTGCACCACTGTCTTCTCAGAAAAAAACAAAACA
AAACCCAGATGTAAAGTAATGATTTTGATTCACTGGATCG

QA 1 340 1 340
DS 

RD RS1EQ62TF 340 0 0
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CCACCGTTGGTCAAATGGTGGCGGACGAGATAGCCACCGTACCAGAGCAAGAGAGCGTAG
CAACAGAAGACGACGAAGTAAGTAGCGCCGAGCCCCATTCCTTTAGCGAAACCTGTTTTG
TAACCGAGCTTCTGAGCTGTCTTTAGAGCAGATGAGTAAGCTTGAGAGGCTCTTGATTCT
CCGACAAAAGCCATTACTACTCTGATCTGCACCACTGTCTTCTCAGAAAAAAACAAAACA
AAACCCAGATGTAAAGTAATGATTTTGATTCACTGGATCG

QA 1 340 1 340
DS 



AS 1 2

CO CL8772Contig1 715 2 4 U
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AACCACACTTGATCACCCACCAATACAGGAATTGACTTAGGAAGATGTGCTATCCTCAAA
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CCACGTACCACGGTTCAGCTTAACAAACTTGGGTCCTGAAAACCTGAAGACGCGCACCTC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1H187JQB U 1
AF RS1C605TF C 68
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BS 248 578 RS1H187JQB
BS 579 715 RS1C605TF

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GTTGCTGAGCTCTAAGTTGTAGAAGTCCATGGAACTCTCACTGAAAAGCGGTCCAGCATG
CCACGTGCCACGGTTCAGCTTAACAAACTTGGGTCCTGAAAACCTGAAGACGCGCACCTC
CTCAACCGCAGGAGGAGCGTACAGGTGACCACCGGACCCTGACTCTACATTATTATCACC
AACTCTTTCTCTATCAACAACATCTTCGATAAGAGATGGCTTAACTACTCCTAGATACAA
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ATCTAATTGAGCATCGTTAGGACCGAAGTGATCACCGT

QA 1 578 1 578
DS 

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AGCTCTAAGTTGTAGAAGTCCATGGAACTCTCACTGAAAAGCGGTCCAGCATGCCACGTA
CCACGGTTCAGCTTAACAAACTTGGGTCCTGAAAACCTGAAGACGCGCACCTCCTCAACC
GCAGGAGGAGCGTACAGGTGACCACCGGACCCTGACTCTACATTATTATCACCAACTCTT
TCTCTATCAACAACATCTTCGATAAGAGATGGCTTAGCTACTCCTAGATACCAAACGTGA
CCTCCTATTGATCCCAGACACTGTGTCACGTTCGCGTGGTGAGTGATCGTGGAGAAGCCA
AAGGATCGATCTTTGAGACGCATGATATAGAAACGTGGGATTCCTTTGGAGAGATCTAAT
TGAGCATCGTTAGGACCGAAGTGATCACCGTCGGAGGAGGCTTCGATGGCTTGACCATAA
TCTCCGAAGCTTTCAGGTGTGGCTTCGATCGGGATCAGGTTGACTTCAACCGGAGATTCA
GATTCCGCCATTGTTGCCTTGTTTCTCTCACCCACAAGATAAACGGCC

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 2

CO CL8773Contig1 1563 2 2 U
GGAGGAAACATTCATCATTGTACCCAACAATCACTTTCATCCTTTAGAATCAAAAACTTC
AGCTTCCTTCCTTCTTCTTCTTCCTTTCATTTACATTTACACTCATACATATATACATAC
GACACGTATACATGCATACATACATACTCCCACTCTCTATATAACCTTTTGATTCTCCTC
TTTCCCTTTTCCCTCTCCTCCAATTTCCTCACTTCTCTCTCTCTTAAGATCTTTACAATT
TGATCATCGACCGACCAAAGAAAGAAACAAGTTAAAAAATCAGATCTTTCTAACATGGAT
CCGTCCTCTGCAAGCTCAGTGAACGGATACTACTCATTTCTAAACAGATCAATGGATGAT
CTCGAGAGGGTTTATCTCTCAAACAACTTCATGTCCCTACACTTCTTACAGAGAGCTCTC
TGTCTCCTCCGCACCTCTCACTCCCATCTCACTCTCCTCGTCCAGAAACTCAACCTCCCC
GTCGGAGACAAATGGCTCGATGAGTATATGGACGAAAGCTCCAAGCTTTGGGAAGCTTGC
CTCGTCATCAAGTCCGCCGTTTCTTCCATCGAGAACTTCTCCTCCGCCGGAATTTCGATC
GCCTCCACCCTCGACGGTCACTATCACCACCGTCGCCTCTCCCCTCAGCTTTCTCGTCAG
GTGATAAGAGCGATCACGGGGTGCAGGAGAGAGGCGATTGGGATAGAGGCGGAGAACAGA
GCGTTGGTGGAGAATCGAGTTCAAAGTTTCCGTTTTGGTCGGAGCAGACGGCGGCGACGG
TGATGGAGTCGTCGACGAAGCTGCAGAACGGTTTCAGTGGTTTCCGCGGCGTACTGTACG
CGACGAGGAACATGAGCTCGCTTCTGCTCATGGTTCTGATGAACGGTCTCGTCTACTGTG
TTCCCAGCGACGCAACAACGCTGTCGCAAACGCAAACGCAGACGACGCAGAATCAGGTCG
GCGGATTCGCCGGAGCGATGGGGCGGTTGCAGCAGAGAGTTGCGGCTGAGGTGGGGAGGA
CGGGGATGAGGAAGGGGATACTGATGCATGAGTACAGGAGGAGCAAGGCGGCGTTGGAAG
AGCTGAAGGCGGAGCTTGAGCGGAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGGGAAAGCGAGGAGGAGG
GAGAGAGGGAGTTGAGAGAGAGAGTGGAGAATCTGAGAGGGTATTTTGGTAATTTGAGGA
ACGGGACAGAGAGTATAGTGTCGCAAATCGATGATTTCTTTGATGAAATTGTTGAAGGGA
GGAAAAAGCTTTTGGATTTCTGCAGCCATAGATGAAAATATCAAAAGCTGACATTTTTCA
GTTTCATAAAGATGGAAAAATCAAGAAAAAAAAAGAAGAAGAAGAAAACTGGGTAGACTC
TAGGCTTTCGACGAATCATTTGGTAGGAGTTGTTGTAAGTTGTGACACTTTTTTATGAAA
ACAAAAATGTTAATTCGTCAATCTGCTCTATTTTAGTATTTTGATGTTTATTTTTATAAT
TCTAGAAATGGAGTTTATTCTCTGAATCATAGCTAAAGTAAATGTCTGCTTTTCAGTTTT
GGT


BQ
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10 10 10 

AF RS1AN09TF U 1
AF RS1AN09JQ C 788
BS 1 864 RS1AN09TF
BS 865 1563 RS1AN09JQ

RD RS1AN09TF 864 0 0
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AGCTTCCTTCCTTCTTCTTCTTCCTTTCATTTACATTTACACTCATACATATATACATAC
GACACGTATACATGCATACATACATACTCCCACTCTCTATATAACCTTTTGATTCTCCTC
TTTCCCTTTTCCCTCTCCTCCAATTTCCTCACTTCTCTCTCTCTTAAGATCTTTACAATT
TGATCATCGACCGACCAAAGAAAGAAACAAGTTAAAAAATCAGATCTTTCTAACATGGAT
CCGTCCTCTGCAAGCTCAGTGAACGGATACTACTCATTTCTAAACAGATCAATGGATGAT
CTCGAGAGGGTTTATCTCTCAAACAACTTCATGTCCCTACACTTCTTACAGAGAGCTCTC
TGTCTCCTCCGCACCTCTCACTCCCATCTCACTCTCCTCGTCCAGAAACTCAACCTCCCC
GTCGGAGACAAATGGCTCGATGAGTATATGGACGAAAGCTCCAAGCTTTGGGAAGCTTGC
CTCGTCATCAAGTCCGCCGTTTCTTCCATCGAGAACTTCTCCTCCGCCGGAATTTCGATC
GCCTCCACCCTCGACGGTCACTATCACCACCGTCGCCTCTCCCCTCAGCTTTCTCGTCAG
GTGATAAGAGCGATCACGGGGTGCAGGAGAGAGGCGATTGGGATAGAGGCGGAGAACAGA
GCGTTGGTGGAGAATCGAGTTCAAAGTTTCCGTTTTGGTCGGAGCAGACGGCGGCGACGG
TGATGGAGTCGTCGACGAAGCTGCAGAACGGTTTCAGTGGTTTCCGCGGCGTACTGTACG
CGACGAGGAACATGAGCTCGCTTC

QA 1 864 1 864
DS 

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GTCGTCGACGAAGCTGCAGAACG*TTTCAGTGGTTTCCGCGGCGTACTGTACGCGACGAG
GAACATGAGCTCGCTTCTGCTCATGGTTCTGATGAACGGTCTCGTCTACTGTGTTCCCAG
CGACGCAACAACGCTGTCGCAAACGCAAACGCAGACGACGCAGAATCAGGTCGGCGGATT
CGCCGGAGCGATGGGGCGGTTGCAGCAGAGAGTTGCGGCTGAGGTGGGGAGGACGGGGAT
GAGGAAGGGGATACTGATGCATGAGTACAGGAGGAGCAAGGCGGCGTTGGAAGAGCTGAA
GGCGGAGCTTGAGCGGAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGGGAAAGCGAGGAGGAGGGAGAGAG
GGAGTTGAGAGAGAGAGTGGAGAATCTGAGAGGGTATTTTGGTAATTTGAGGAACGGGAC
AGAGAGTATAGTGTCGCAAATCGATGATTTCTTTGATGAAATTGTTGAAGGGAGGAAAAA
GCTTTTGGATTTCTGCAGCCATAGATGAAAATATCAAAAGCTGACATTTTTCAGTTTCAT
AAAGATGGAAAAATCAAGAAAAAAAAAGAAGAAGAAGAAAACTGGGTAGACTCTAGGCTT
TCGACGAATCATTTGGTAGGAGTTGTTGTAAGTTGTGACACTTTTTTATGAAAACAAAAA
TGTTAATTCGTCAATCTGCTCTATTTTAGTATTTTGATGTTTATTTTTATAATTCTAGAA
ATGGAGTTTATTCTCTGAATCATAGCTAAAGTAAATGTCTGCTTTTCAGTTTTGGT

QA 1 776 1 776
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8775Contig1 702 2 1 U
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CATAGAGCAACAATGAAAAGACACATCACTATTGCCCATTGCATTACTTCTTCTTCGAGA
TTATTTCTGTGCGTTCTCTTTATGGTGTTGTTATCTGAGACAACCACAAACGCTTTGGTG
AAACTGCCGCCAAACAAAACGATTCCGGCGATAATAGTGTTTGGAGATTCGATTGTTGAT
GCTGGAAATAACGATGACATTACGACAACGTTGGCTAGATGCAATTATCCTCCTTATGGA
ATTGATTTTGACGGTGGAATACCTACCGGAAGGTTTTCCAACGGCAAAGTTCCGACTGAC
TTTATAGCGGAGGAATTCGGAATTAAATCAAATCTACCGGCATACCGAGATCCAAATTTG
AAACCGAAGGATCTCTTAACCGGTGTAACATTTGCGTCTGGTGGTGCTGGTTACGTTCCT
TTCACAACCCAATTATCAGGAGGAATATCACTATCGCAGCAATTAAAATTGTTCGAAGAG
TATATAGAGAAACTGAAGGAGATGGTTGGGGAAGAGAGAACAAAGTTCATCATAGAAAAT
AGTTTATTCATGGTCATATGTGGTAGTAATGATATAATCAATACATACTTTGCCCTTCCT
TCTGTGCAACGCCAATACGATGTCGCCTCCTTTACCACTCTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H155TF U 1
AF RS1E783TF U 1
BS 1 702 RS1E783TF

RD RS1H155TF 625 0 0
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TTATTTCTGTGCGTTCTCTTTATGGTGTTGTTATCTGAGACAACCACAAACGCTTTGGTG
AAACTGCCGCCAAACAAAACGATTCCGGCGATAATAGTGTTTGGAGATTCGATTGTTGAT
GCTGGAAATAACGATGACATTACGACAACGTTGGCTAGATGCAATTATCCTCCTTATGGA
ATTGATTTTGACGGTGGAATACCTACCGGAAGGTTTTCCAACGGCAAAGTTCCGACTGAC
TTTATAGCGGAGGAATTCGGAATTAAATCAAATCTACCGGCATACCGAGATCCAAATTTG
AAACCGAAGGATCTCTTAACCGGTGTAACATTTGCGTCTGGTGGTGCTGGTTACGTTCCT
TTCACAACCCAATTATCAGGAGGAATATCACTATCGCAGCAATTAAAATTGTTCGAAGAG
TATATAGAGAAACTGAAGGAGATGGTTGGGGAAGAGAGAACAAAGTTCATCATAGAAAAT
AGTTTATTCATGGTCATATGTGGTA

QA 1 625 1 625
DS 

RD RS1E783TF 702 0 0
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CATAGAGCAACAATGAAAAGACACATCACTATTGCCCATTGCATTACTTCTTCTTCGAGA
TTATTTCTGTGCGTTCTCTTTATGGTGTTGTTATCTGAGACAACCACAAACGCTTTGGTG
AAACTGCCGCCAAACAAAACGATTCCGGCGATAATAGTGTTTGGAGATTCGATTGTTGAT
GCTGGAAATAACGATGACATTACGACAACGTTGGCTAGATGCAATTATCCTCCTTATGGA
ATTGATTTTGACGGTGGAATACCTACCGGAAGGTTTTCCAACGGCAAAGTTCCGACTGAC
TTTATAGCGGAGGAATTCGGAATTAAATCAAATCTACCGGCATACCGAGATCCAAATTTG
AAACCGAAGGATCTCTTAACCGGTGTAACATTTGCGTCTGGTGGTGCTGGTTACGTTCCT
TTCACAACCCAATTATCAGGAGGAATATCACTATCGCAGCAATTAAAATTGTTCGAAGAG
TATATAGAGAAACTGAAGGAGATGGTTGGGGAAGAGAGAACAAAGTTCATCATAGAAAAT
AGTTTATTCATGGTCATATGTGGTAGTAATGATATAATCAATACATACTTTGCCCTTCCT
TCTGTGCAACGCCAATACGATGTCGCCTCCTTTACCACTCTT

QA 1 702 1 702
DS 



AS 1 2

CO CL8776Contig1 931 2 2 U
GGGGGGGACTTATGGCAAGAGTCGTGGAGTCTGACACGGTTCCTGGAGGTTCCGATGTAC
AACAGCTAAGTCTTGACTCGATCAGGGAATCGTTGATCAGGCAAGAAGACACCATCGTCT
TCAGCTTGATCGAGAGAGCTAAGTTTCCACTCAATTCACCTGCTTTCGAGGACTCCTCCT
CTCTGACTGAGTTCTTTGTCAGAGATATCGAAACCATCCAAGCTAAGGTAGGAAGATACG
AAAATCCAGAAGAGAATCCTTTCTTCCTTGATACCATTCCGCACTCTGTTTTTCCTACCC
ACAAATATCCACAGGTTCTGCACCCTAAGGCTTCATCTGTTAACATAAACAAACGGCTTT
GGGATGTTTACTTTAAAGAACTGCTTCCTTTGTTTGTTAAACCTGGTGATGATGGTAACT
ACGCATCAACTGCTGCTTCTGATCTCGCTTGTTTACATGCTCTTTCGAGAAGGATTCACT
ATGGTAAGTTTGTTGCTGAGATCAAATTCAGAGATTCTCCTCATGACTATGAGCCTGCTA
TTCGCTCTAAGGATACGGAGGCATTGATGAAGCTTTTGACGTTCGAGAAAGTAGAAGAAA
TGGTTAAGAGAGTCGAGAAGAAAGCAGAAACGTTTGGACAGGAGGTGAAGTGCGTCTCTG
GTGGTGACGAGAGTGAGAAGAAGAAGTATAAAGTGGATCCATATCTAGTCTCTCGCATCT
ATGGAGAATGGCTTATCCCTCTTACTAAAGACGTCGAGGTTGAGTATCTTCTACGTCGTC
TCGACTGAATCTCGAGACATCATTAAACAAGATGATGAGTCCATTGTCTTTTCCACAAAC
CTCTTGCAAGATTTGTTTTTTCATTACAGACTTATAATCAATCAAACACATTGAAGCTTG
TCCAATATGAATAAACCAAACCGATTTGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1E686TF U 1
AF RS1E686JQ C 164
BS 1 792 RS1E686TF
BS 793 931 RS1E686JQ

RD RS1E686TF 792 0 0
GGGGGGGACTTATGGCAAGAGTCGTGGAGTCTGACACGGTTCCTGGAGGTTCCGATGTAC
AACAGCTAAGTCTTGACTCGATCAGGGAATCGTTGATCAGGCAAGAAGACACCATCGTCT
TCAGCTTGATCGAGAGAGCTAAGTTTCCACTCAATTCACCTGCTTTCGAGGACTCCTCCT
CTCTGACTGAGTTCTTTGTCAGAGATATCGAAACCATCCAAGCTAAGGTAGGAAGATACG
AAAATCCAGAAGAGAATCCTTTCTTCCTTGATACCATTCCGCACTCTGTTTTTCCTACCC
ACAAATATCCACAGGTTCTGCACCCTAAGGCTTCATCTGTTAACATAAACAAACGGCTTT
GGGATGTTTACTTTAAAGAACTGCTTCCTTTGTTTGTTAAACCTGGTGATGATGGTAACT
ACGCATCAACTGCTGCTTCTGATCTCGCTTGTTTACATGCTCTTTCGAGAAGGATTCACT
ATGGTAAGTTTGTTGCTGAGATCAAATTCAGAGATTCTCCTCATGACTATGAGCCTGCTA
TTCGCTCTAAGGATACGGAGGCATTGATGAAGCTTTTGACGTTCGAGAAAGTAGAAGAAA
TGGTTAAGAGAGTCGAGAAGAAAGCAGAAACGTTTGGACAGGAGGTGAAGTGCGTCTCTG
GTGGTGACGAGAGTGAGAAGAAGAAGTATAAAGTGGATCCATATCTAGTCTCTCGCATCT
ATGGAGAATGGCTTATCCCTCTTACTAAAGACGTCGAGGTTGAGTATCTTCTACGTCGTC
TCGACTGAATCT

QA 1 792 1 792
DS 

RD RS1E686JQ 768 0 0
TTTCGAGGACTCCTCCTCTCTGACTGAGTTCTTTGTCAGAGATATCGAAACCATCCAAGC
TAAGGTAGGAAGATACGAAAATCCAGAAGAGAATCCTTTCTTCCTTGATACCATTCCGCA
CTCTGTTTTTCCTACCCACAAATATCCACAGGTTCTGCACCCTAAGGCTTCATCTGTTAA
CATAAACAAACGGCTTTGGGATGTTTACTTTAAAGAACTGCTTCCTTTGTTTGTTAAACC
TGGTGATGATGGTAACTACGCATCAACTGCTGCTTCTGATCTCGCTTGTTTACATGCTCT
TTCGAGAAGGATTCACTATGGTAAGTTTGTTGCTGAGATCAAATTCAGAGATTCTCCTCA
TGACTATGAGCCTGCTATTCGCTCTAAGGATACGGAGGCATTGATGAAGCTTTTGACGTT
CGAGAAAGTAGAAGAAATGGTTAAGAGAGTCGAGAAGAAAGCAGAAACGTTTGGACAGGA
GGTGAAGTGCGTCTCTGGTGGTGACGAGAGTGAGAAGAAGAAGTATAAAGTGGATCCATA
TCTAGTCTCTCGCATCTATGGAGAATGGCTTATCCCTCTTACTAAAGACGTCGAGGTTGA
GTATCTTTTACGTCGTCTCGACTGAATCTCGAGACATCATTAAACAAGATGATGAGTCCA
TTGTCTTTTCCACAAACCTCTTGCAAGATTTGTTTTTTCATTACAGACTTATAATCAATC
AAACACATTGAAGCTTGTCCAATATGAATAAACCAAACCGATTTGACC

QA 1 768 1 768
DS 



AS 1 2

CO CL8777Contig1 629 2 1 U
GGGGATCTGCCCGGAGGTGTGATCTCTCATTTAAGTGCAGTGGAGACTGATTTAGCTCAC
ATGCAAAAAGAAGGGGATGAAGAGGTGTCAGAGCTGAGTAAGCCCGATAATGCAAGTAGT
TCCAGTAGAAATAATATTCAATGCGCATCTGCTTCAGGCTATGTTGGCGATCCTGGTTTG
GGTAGATCAAGTGAAACACAGGGGAAGAATCTGCTTGCTGGCGTTATACACAAGGGTTTA
ACATTTAAACCTCACGCGTACATTAATCACTACACACTGGAAGCAAACAGTGCTGTACCT
TGAAGATGTGTTAACCATATGCGAGGGCGAAATGATCACAGGAAGCATGACCATTGCACC
TAACAAGAAGAATCCAAGAGATGTCGACATAGAGCTCAGTTATTCTTTGAATGGCCAGCA
TTGCAAGATCTCAAGAACCCAACTCTACAAAATGCGGTAAAACCTATCTCAAAAGGAAGC
AGTAGTAGTTTCATTCATCATCTCGAGGCTGAGAAAGAAAATGCTGATTTCTAGTTTTAT
TATTTCCATTGTTTTTCAATGTTTCAGAACACGAAAACATAAATTTCTTTCTCTTGATGA
GATATTAAAAGTTTATCTCTGTACCTGAG


BQ
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AF RS1F254JQ C 1
AF RS1F254TF U 1
BS 1 629 RS1F254TF

RD RS1F254JQ 629 0 0
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TTGCAAGATCTCAAGAACCCAACTCTACAAAATGCGGTAAAACCTATCTCAAAAGGAAGC
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GATATTAAAAGTTTATCTCTGTACCTGAG

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DS 

RD RS1F254TF 629 0 0
GGGGATCTGCCCGGAGGTGTGATCTCTCATTTAAGTGCAGTGGAGACTGATTTAGCTCAC
ATGCAAAAAGAAGGGGATGAAGAGGTGTCAGAGCTGAGTAAGCCCGATAATGCAAGTAGT
TCCAGTAGAAATAATATTCAATGCGCATCTGCTTCAGGCTATGTTGGCGATCCTGGTTTG
GGTAGATCAAGTGAAACACAGGGGAAGAATCTGCTTGCTGGCGTTATACACAAGGGTTTA
ACATTTAAACCTCACGCGTACATTAATCACTACACACTGGAAGCAAACAGTGCTGTACCT
TGAAGATGTGTTAACCATATGCGAGGGCGAAATGATCACAGGAAGCATGACCATTGCACC
TAACAAGAAGAATCCAAGAGATGTCGACATAGAGCTCAGTTATTCTTTGAATGGCCAGCA
TTGCAAGATCTCAAGAACCCAACTCTACAAAATGCGGTAAAACCTATCTCAAAAGGAAGC
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TATTTCCATTGTTTTTCAATGTTTCAGAACACGAAAACATAAATTTCTTTCTCTTGATGA
GATATTAAAAGTTTATCTCTGTACCTGAG

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 2

CO CL8778Contig1 868 2 6 U
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AAGCTTCCTCGGAGAAGTTCCATCACATGTTCACCGCGAAACCACACCATGTTTCCAAAG
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CTATCATCTTCTGGAACTACTTTCGTGATGGAGAGGCAAAGGTGGCAAAGGACAGGATCG
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AAGAGTACAAAAGCTTCTTGGCCACGATCCAGGTGACCCCTAAGCATGGTGGGACAGGGA
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AGTGTATACTGAGATCGTTTTACGTTGG


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AF RS1BV43TF U 1
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BS 1 659 RS1BV43TF
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ACGCCAGTGACCGTGGCACCAACTAAGACGGTGGAGGCTACAAGTGCCGAAGCAGCGGAG
ATCAAGGTGACGGTGGCACCTCCTGAAAAGGTTGATGCTAAAGTAAACCGGCGAAAGAGG
AGGTGAAGACAACGGAGACGTCTAGCTTGTTGGGTAAGCTTGAGGCATACGTGGAGATCA
AAGCTTCCTCGGAGAAGTTCCATCACATGTTCACCGCGAAACCACACCATGTTTCCAAAG
CATCTCCAAGAAACATTCAGGGCTGTGAATTGCACGAAGGAGATTGGGGCAAACCAGGCT
CTATCATCTTCTGGAACTACTTTCGTGATGGAGAGGCAAAGGTGGCAAAGGACAGGATCG
AAGCGGTTGATCCCGAGAAGAACATGTTAATGTTAAGGGTTATAGAAGGTGATCTGATGA
AAGAGTACAAAAGCTTCTTGGCCACGATCCAGGTGACCCCTAAGCATGGTGGGACAGGGA
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CTCTTCTCCAGTTATGTGTCGAAATGTCCAAAGAGATCGACGAACATCTCTTGTCCGAG*
AATAAAATGTGTGTGCCTTACGTTCTGTATTCTATT

QA 1 756 1 756
DS 

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AGATCAAGGTGACGGTGGCACCTCCTGAAAAGGTTGATGCTAAAGTAAACCGGCGAAAGA
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CAAAGCTTCCTCGGAGAAGTTCCATCACATGTTCACCGCGAAACCACACCATGTTTCCAA
AGCATCTCCAAGAAACATTCAGGGCTGTGAATTGCACGAAGGAGATTGGGGCAAACCAGG
CTCTATCATTTTCTGGAACTACTTTCGTGATGGAGAGGCAAAGGTGGCAAAGGACAGGAT
CGAAGCGGTTGATCCCGAGAAGAACATGTTAATGTTAAGGGTTATAGAAGGTGATCTGAT
GAAAGAGTACAAAAGCTTCTTGGCCACGATCCAGGTGACCCCTAAGCATGGTGGGACAGG
GAGTATCGTACACTGGCACCTTGAGTACGAGAAAATTAGCGAGGAGGTTGCGCATCCCGA
AACTCTTCTCCAGTTATGTGTCGAAATGTCCAAAGAGATCGACGAACATCTCTTGTCCGA
GGAATAAAATGTGTGTGCCTTACGTTCTGTATTCTATTTAAAATTCAATAAAGGACTAAG
GAGCCGTGTTTGTGAGAGATTATAAATGATGAGAGTGTGCCGTGATATTATGTGCGTGAA
TAAGTGTATACTGAGATCGTTTTACGTTGG

QA 1 750 1 750
DS 



AS 1 2

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GTCCTCCCTCGCTCGCCGTCTCCCCGCTCGTTTTTCTCCTCCGATCGGTTCGAGAATCGC
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AGCTTACTTGTTCCCTCCCGAGAAGAAGCCTGCTCGTCTTCCAGGCTTTCACACTTGCGT
TGGAGGTGGTGGAGAGAGGCAAACACCTGATTGGTACAAGGAGAAAGGCATTGAGATGAT
ATATCAAGATCCAGTGACTGGAGCTGATTTTGAAAAGCAAACCCTCACAACTAACACTGG
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CAGATAAAATTGGTGGGAACTTGCCTGGAGTTCACTATATTCGGAGGTTGCAGATGCTGA
TTCA


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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 

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G
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AGTTCGAAGACTCATGGCGTTAGCATCCACCACGTTGCCAGCGAAGAGCGGATTGTCTCT
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CGAGTTTGTGATAATAGGGGGAGGTAATGCGGCGGGTTATGCAGCAAGGACCTTTGTTGA
AAATGGAATGGCCGATGGTCGCCTTTGCATTGTCACCAAAGAGGCGTACGCACCTTATGA
GAGACCTGCCTTGACAAAAGCTTACTTGTTCCCTCCCGAGAAGAAGCCTGCTCGTCTTCC
AGGCTTTCACACTTGCGTTGGAGGTGGTGGAGAGAGGCAAACACCTGATTGGTACAAGGA
GAAAGGCATTGAGATGATATATCAAGATCCAGTGACTGGAGCTGATTTTGAAAAGCAAAC
CCTCACAACTAACACTGGGGAAGCAGTTAAAATATGGATCCCTTATTATCGCTACTGGCT
GTACTGCCTCTAGGTTCCCAGATAAAATTGGTGG

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CGCTTCAATAATTTAATTATTTCATTCTTATAAAATGTCTCCAGTTCGAAGACTCATGGC
GTTAGCATCCACCACGTTGCCAGCGAAGAGCGGATTGTCTCTTTGGTGTCCGACTTCTCC
GTCCTCCCTCGCTCGCCGTCTCCCCGCTCGTTTTTCTCCTCCGATCGGTTCGAGAATCGC
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GGGAGGTAATGCGGCGGGTTATGCAGCAAGGACCTTTGTTGAAAATGGAATGGCCGATGG
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AGCTTACTTGTTCCCTCCCGAGAAGAAGCCTGCTCGTCTTCCAGGCTTTCACACTTGTGT
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ATATCAAGATCCAGTGACTGGAGCTGATTTTGAAAAGCAAACCCTCACAACTAACACTGG
G*AAGCAGTTAAAATATGGATCCCTTATTATCGCTACTGGCTGTACTGCCTCTAGGTTCC
CAGATAAAATTGGTGGGAACTTGCCTGGAGTTCACTATATTCGGAGGTTGCAGATGCTGA
TTCA

QA 1 724 1 724
DS 



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ACATGATTTAAGATAATTAAAAAGAGAGACACTTGAGTAAGTAAGCATCTCTAATTTGCA
ATAGCTTCTTTAGCCACTGCAGGCTTCTCAACCTCAGGAACCACAAAAGCTGTAACAGGG
AAAGTCCTGGACAATCCGGTCGGTGTCCTGAAATTGATCTTCCCAGAACTTGTTGGCTGC
TCCAAGACAAGCTCATTGAGAGTGACCCAGATAAGAAGCTCCTTGGCCTTAACACCGGTA
AGCTTCTTGATCTTTCCGACTTCCACCACGGCAGTGACCTCAGTGCCGTAAGAGACAAGT
TTCCCAATAGATTCAAACTTGTGAGTGATGCTCTTCTTCTGCTTCAGCCACACAACACCG
GTTTCTCTGTCGTATCCAACCTCTTCAATGTCCTTCAGTGGCAATAACCCATTAGGCATA
TCAACTTCCTTGAGGAACTCCTTGGTCTTCTCGCGGCATAGCTCATCTCCTGTGTATTTC
TCTGCCCTAGCTCTCACTTCATCTGTAACAAAACCCATCTCCCTGGTTTTTTTTGCTTCT
TTGTTTTTGAGATCTCTGTCTTTTGTGTTTTTCC


BQ
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AF RS1FG43TF C 1
AF RS1FG43JQ U 6
BS 1 5 RS1FG43TF
BS 6 634 RS1FG43JQ

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AAAGTCCTGGACAATCCGGTCGGTGTCCTGAAATTGATCTTCCCAGAACTTGTTGGCTGC
TCCAAGACAAGCTCATTGAGAGTGACCCAGATAAGAAGCTCCTTGGCCTTAACACCGGTA
AGCTTCTTGATCTTTCCGACTTCCACCACGGCAGTGACCTCAGTGCCGTAAGAGACAAGT
TTCCCAATAGATTCAAACTTGTGAGTGATGCTCTTCTTCTGCTTCAGCCACACAACACCG
GTTTCTCTGTCGTATCCAACCTCTTCAATGTCCTTCAGTGGCAATAACCCATTAGGCATA
TCAACTTCCTTGAGGAACTCCTTGGTCTTCTCGCGGCATAGCTCATCTCCTGTGTATTTC
TCTGCCCTAGCTCTCACTTCATCTGTAACAAAACCCATCTCCCTGTTTTTTTTTGCTTCT
TTGTTTTTGAGATCTCTGTCTTTTGTGTTTTTCC

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DS 

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ATTTAAGATAATTAAAAAGAGAGACACTTGAGTAAGTAAGCATCTCTAATTTGCAATAGC
TTCTTTAGCCACTGCAGGCTTCTCAACCTCAGGAACCACAAAAGCTGTAACAGGGAAAGT
CCTGGACAATCCGGTCGGTGTCCTGAAATTGATCTTCCCAGAACTTGTTGGCTGCTCCAA
GACAAGCTCATTGAGAGTGACCCAGATAAGAAGCTCCTTGGCCTTAACACCGGTAAGCTT
CTTGATCTTTCCGACTTCCACCACGGCAGTGACCTCAGTGCCGTAAGAGACAAGTTTCCC
AATAGATTCAAACTTGTGAGTGATGCTCTTCTTCTGCTTCAGCCACACAACACCGGTTTC
TCTGTCGTATCCAACCTCTTCAATGTCCTTCAGTGGCAATAACCCATTAGGCATATCAAC
TTCCTTGAGGAACTCCTTGGTCTTCTCGCGGCATAGCTCATCTCCTGTGTATTTCTCTGC
CCTAGCTCTCACTTCATCTGTAACAAAACCCATCTCCCTGGTTTTTTTTGCTTCTTTGTT
TTTGAGATCTCTGTCTTTTGTGTTTTTCC

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 2

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GCGACTAGATTGGTATCTCTAACTCTGTTGTGGGTAGTCGTCCTCTTCGTCACACTTGCT
CTCATCCAGATGAAATTGACTGATGTTGCTGATCCTATGGGGAATGAGAAGATTGCTGAT
CCTATGGTAGGAGGAGAGGATTTAGAAGGAGTTACCCACAAAGTTTACTTTGATATTCAG
ATCAATGGTTCACCTGCAGGGAGGATTCTCATTGGGCTTTTTGGGAATATAGTTCCTAAA
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CCACTTTATTTCAAAGGAAGTAGCTTCCATAGGATCATTCCTAGCTTCATGATTCAAGGT
GGGGATTTTACACGAGGCGATGGACGAGGTGGAGAGTCCATCTATGGCGATAAGTTTGCA
GATGAGAACTTCAAACTCAAACACACCGGGCCAGGAGTCTTATCAATGGCAAACTCTGGA
CCAGACTCCAACGGTTCACAGTTCTTTATCACAACAGTCACCACGGGTTGGTTGGACGGA
CATCACGTTGTGTTTGGGAAGGTATTGTCAGGCATGGAAGTAGTGCGGAAGATCGAAGCT
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TCTTTGTAATATTTATCTTTCTTCCACTTTAAGAAACTTCTAAGAACTTAATGTTTTTCA
TCGTTATGAACACACACAAAGATCAAGTGTTACACG


BQ
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AF RS1E628TF U 1
AF RS1E628JQ C 3
BS 1 598 RS1E628TF
BS 599 599 RS1E628JQ
BS 600 621 RS1E628TF
BS 622 622 RS1E628JQ
BS 623 631 RS1E628TF
BS 632 632 RS1E628JQ
BS 633 646 RS1E628TF
BS 647 816 RS1E628JQ

RD RS1E628TF 646 0 0
GGAAAATGAAACATAAATTGATTTGATATCCCCTGACAAATCGTAGGAATGGCGATAACG
GCGACTAGATTGGTATCTCTAACTCTGTTGTGGGTAGTCGTCCTCTTCGTCACACTTGCT
CTCATCCAGATGAAATTGACTGATGTTGCTGATCCTATGGGGAATGAGAAGATTGCTGAT
CCTATGGTAGGAGGAGAGGATTTAGAAGGAGTTACCCACAAAGTTTACTTTGATATTCAG
ATCAATGGTTCACCTGCAGGGAGGATTCTCATTGGGCTTTTTGGGAATATAGTTCCTAAA
ACCGCAGAGAACTTTCGAGCGCTTTGCACGGGAGAGAAAGGAGTTGGGAACATGGGGAGA
CCACTTTATTTCAAAGGAAGTAGCTTCCATAGGATCATTCCTAGCTTCATGATTCAAGGT
GGGGATTTTACACGAGGCGATGGACGAGGTGGAGAGTCCATCTATGGCGATAAGTTTGCA
GATGAGAACTTCAAACTCAAACACACCGGGCCAGGAGTCTTATCAATGGCAAACTCTGGA
CCAGACTCCAACGGTTCACAGTTCTTTATCACAACAGTCACCACGGGTTGGTTGGACG*A
CATCACGTTGTGTTTGGGAAG*TATTGTCAG*CATGGAAGTAGTGC

QA 1 646 1 646
DS 

RD RS1E628JQ 814 0 0
G
AAATGAAACATAAATTGATTTGATATCCC*TGACAAATCGTAGGAATGGCGATAACGGCG
ACTAGATTGGTATCTCTAACTCTGTTGTGGGTAGTCGTCCTCTTCGTCACACTTGCTCTC
ATCCAGATGAAATTGACTGATGTTGCTGATCCTATGGGGAATGAGAAGATTGCTGATCCT
ATGGTAGGAGGAGAGGATTTAGAAGGAGTTACCCACAAAGTTTACTTTGATATTCAGATC
AATGGTTCACCTGCAGGGAGGATTCTCATTGGGCTTTTTGGGAATATAGTTCCTAAAACC
GCAGAGAACTTTCGAGCGCTTTGCACGGGAGAGAAAGGAGTTGGGAACATGGGGAGACCA
CTTTATTTCAAAGGAAGTAGCTTCCATAGGATCATTCCTAGCTTCATGATTCAAGGTGGG
GATTTTACACGAGGCGATGGACGAGGTGGAGAGTCCATCTATGGCGATAAGTTTGCAGAT
GAGAACTTCAAACTCAAACACACCGGGCCAGGAGTCTTATCAATGGCAAACTCTGGACCA
GACTCCAACGGTTCACAGTTCTTTATCACAACAGTCACCACGGGTTGGTTGGACGGACAT
CACGTTGTGTTTGGGAAGGTATTGTCAGGCATGGAAGTAGTGCGGAAGATCGAAGCTCAA
GGACAAAGCAGTGGAGAGCCCAAAGGAAAAGTTGTCATTTTGGACAGTGGAGAAGTTTCT
TTGTAATATTTATCTTTCTTCCACTTTAAGAAACTTCTAAGAACTTAATGTTTTTCATCG
TTATGAACACACACAAAGATCAAGTGTTACACG

QA 2 814 2 814
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8783Contig1 978 2 2 U
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TGTCACTTCTTCCTCAACTGCCATCTCTGGTTCCAGTTTCTCACGCTCCGGACCTTCTTT
GGATCCTAAAGCTCTTCAAATCTGTTCGTTTAGGTTATCTGATCTATCCCAAGTCTCTCA
AAGACGTTACTCTATCAGATCCCTAAAGGCTGAGTCACATACACGCAACGACTCTATGGT
TACTCGTGCTTCGACCCTAATCACTGAAGTGGAAGAGAAAGAAGAAAAGGGAACATTAAG
AAGGAAGATGACGACTCCACCACGGATTTAGCACCTGCTATTGTGCATGATATATTCGAG
AGCAACGATGTGGTTTCATTGACCAGAGGAGGGATTGAGAATCTGTTGAAGCTTGGTAAT
AACCGTAAAGAGCCGTGGTTGGTTGTGCTTTACGCTCCTTGGTGTCCGTTTTGCCAGGCT
ATGGAGGCATCTTACGTGGAATTGGCTGAGAAACTAGCGGTGAAAGGGATTAAGGTGGCG
AAATTCCGTGCGGATGGTGACCAGAAGGAGTTTGCTAAGCAAGAGCTTCAATTAGGAAGC
TTCCCGACCATCCTGCTCTTTCCGAAAAGCGCTCCACGGGCGATTAAGTACCCGTCAGAG
CATAGAGATGTTGATTCGCTTATGTCATTTGTGAATCTTCTCCGGTGAGTTGGGAGATTG
GGAAGTTAAAACAGTGTGATGAAGAATGAAGAAAACTGAGATGAAGGAATGATTTCATCT
TGGGATTGTGGATCTAGAAGAATAAGCAAAAGCTATGTGTTCTATATGGTGTTGTAGGGT
TTATAGACTCTTTTTCTGTCTTCTTGTCGTTAAATATGTTTTTGTTCTTTCTTTTTTGAG
TTTTACTTGAGAAGGAAAGGATACATGTAATGGGATTTTCTTGATTATGTTTTTCTAGAT
ATGTGAATTTTCTACGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A524TF U 1
AF RS1A524JQ C 166
BS 1 762 RS1A524TF
BS 763 978 RS1A524JQ

RD RS1A524TF 762 0 0
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TGTCACTTCTTCCTCAACTGCCATCTCTGGTTCCAGTTTCTCACGCTCCGGACCTTCTTT
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AAGACGTTACTCTATCAGATCCCTAAAGGCTGAGTCACATACACGCAACGACTCTATGGT
TACTCGTGCTTCGACCCTAATCACTGAAGTGGAAGAGAAAGAAGAAAAGGGAACATTAAG
AAGGAAGATGACGACTCCACCACGGATTTAGCACCTGCTATTGTGCATGATATATTCGAG
AGCAACGATGTGGTTTCATTGACCAGAGGAGGGATTGAGAATCTGTTGAAGCTTGGTAAT
AACCGTAAAGAGCCGTGGTTGGTTGTGCTTTACGCTCCTTGGTGTCCGTTTTGCCAGGCT
ATGGAGGCATCTTACGTGGAATTGGCTGAGAAACTAGCGGTGAAAGGGATTAAGGTGGCG
AAATTCCGTGCGGATGGTGACCAGAAGGAGTTTGCTAAGCAAGAGCTTCAATTAGGAAGC
TTCCCGACCATCCTGCTCTTTCCGAAAAGCGCTCCACGGGCGATTAAGTACCCGTCAGAG
CATAGAGATGTTGATTCGCTTATGTCATTTGTGAATCTTCTCCGGTGAGTTGGGAGATTG
GGAAGTTAAAACAGTGTGATGAAGAATGAAGAAAACTGAGAT

QA 1 762 1 762
DS 

RD RS1A524JQ 813 0 0
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CAACGACTCTATGGTTACTCGTGCTTCGACCCTAATCACTGAAGTGGAAGAGAAAGAAGA
AAAGGGAACATTAAGAAGGAAGATGACGACTCCACCACGGATTTAGCACCTGCTATTGTG
CATGATATATTCGAGAGCAACGATGTGGTTTCATTGACCAGAGGAGGGATTGAGAATCTG
TTGAAGCTTGGTAATAACCGTAAAGAGCCGTGGTTGGTTGTGCTTTACGCTCCTTGGTGT
CCGTTTTGCCAGGCTATGGAGGCATCTTACGTGGAATTGGCTGAGAAACTAGCGGTGAAA
GGGATTAAGGTGGCGAAATTCCGTGCGGATGGTGACCAGAAGGAGTTTGCTAAGCAAGAG
CTTCAATTAGGAAGCTTCCCGACCATCCTGCTCTTTCCGAAAAGCGCTCCACGGGCGATT
AAGTACCCGTCAGAGCATAGAGATGTTGATTCGCTTATGTCATTTGTGAATCTTCTCCGG
TGAGTTGGGAGATTGGGAAGTTAAAACAGTGTGATGAAGAATGAAGAAAACTGAGATGAA
GGAATGATTTCATCTTGGGATTGTGGATCTAGAAGAATAAGCAAAAGCTATGTGTTCTAT
ATGGTGTTGTAGGGTTTATAGACTCTTTTTCTGTCTTCTTGTCGTTAAATATGTTTTTGT
TCTTTCTTTTTTGAGTTTTACTTGAGAAGGAAAGGATACATGTAATGGGATTTTCTTGAT
TATGTTTTTCTAGATATGTGAATTTTCTACGGC

QA 1 813 1 813
DS 



AS 1 2

CO CL8784Contig1 920 2 2 U
GGAACATTGTAGATCGAACTTGGCGCTTCTTTGCTTTCTTGAATCCGAAGAACCGAGCTA
AGTACAAGAAGCTGTGGAACATGTCGATGCGAAGAAGAAGTTTGCTTAAGGTTATTGTCC
TTGGAGACAGCGGGGTTGGCAAAACATCGTTGATGAATCAATATGTAAATAATAAGTTTA
GTCAACAGTACAAAGCCACGATTGGAGCTGATTTTGTCACCAAGGAGCTTCAAATCGATG
ACAGGCTCGTCACACTCCAAATTTGGGACACTGCTGGGCAAGAGAGGTTCCAGAGTCTTG
GTGTTGCTTTCTATAGAGGTGCAGATTGTTGTGTGCTTGCTTATGATGTTAACTACCTCA
AGTCATTTGATTCTCTGGACAATTGGCACGAGGAGTTTCTTAAGCAGGCTAGCCCACGGG
ATCCAACCGCGTTCCCGTTCATATTGCTTGGTAACAAGATTGATATTGATGGAGGAAACA
GTCGAGTGGTATCAGAGAAGAAAGCTAGAGAATGGTGTGCTCAAAAGGGAAACATATGCT
ATTACGAGACATCTGCTAAAGAAGATTACAACGTAGATGAATCGTTCTTGTGCATCACAA
AACTTGCCCTTGCCAATGAGCGCGACCAAGATATATATTTTCAGGGGATTCCAGAGTCTG
GTTCAGAGCCTGAGCAAAGAGGAGGATGTGCTTGCTGAAGAAAAACATCTGTTTTAGCTA
TGTTTGATTTGTGCCATTAGTCATGTTTGTTCTCTCGTTTTCAGCTTTGGCACGAGCCTG
GTCGTTGTCGTGCAGCTATTCCGTCTCTCTTTTGATCTAAAACCTAAAAAGAACGTTAGT
TTAAGACGATAGATTAATATAGATACTAAAATGTAGCTTATCAAATATCAACATACTTCT
TATAATTCTTGTTACATTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AC01TF U 1
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GTTC

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BR12JQ C 65
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QA 1 688 1 688
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QA 1 624 1 624
DS 



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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FL49JQ C 1
AF RS1FL49TF U 1
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DS 

RD RS1FL49TF 631 0 0
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CAAACCATCTATTGTCCAGTTTGACAACTTTTTAATGTTGATTTCAGAATATTCTGCAGA
ATTCTTATTATCTCCAAGTTTTTTGGTGCCT

QA 1 631 1 631
DS 



AS 1 2

CO CL8787Contig1 691 2 1 U
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TTTAAAGCATCTAATATACTCCTTGAGAACAACTTCAACGCCAAAGTTGCAGATTTTGGA
CTAGCCAAACAAGCTCCTGAAGGCAGGGGTAATCACTTATCTACACGTGTAATGGGCACA
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TATAGTTACGGTGTTGTACTTCTCGAGTTGCTTACTGGTAGAAAGCCTGTGGATATGTCA
CAACCTTCAGGCCAAGAAAACCTCGTCACTTGGACAAGGCCAGTTCTTAGAGATAAAGAC
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BQ
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AF RS1GI23TF U 1
AF RS1ER22TF U 1
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TTTAAAGCATCTAATATACTCCTTGAGAACAACTTCAACGCCAAAGTTGCAGATTTTGGA
CTAGCCAAACAAGCTCCTGAAGGCAGGGGTAATCACTTATCTACACGTGTAATGGGCACA
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TATAGTTACGGTGTTGTACTTCTCGAGTTGCTTACTGGTAGAAAGCCTGTGGATATGTCA
CAACCTTCAGGCCAAGAAAACCTCGTCACTTGGACAAGGCCAGTTCTTAGAGATAAAGAC
CGTTTAGAAGAACTAGTTGATTCAAGACTAGAAGGAAAATACCCAAAAGAAGATTTTGCA
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AAACGCTTCAAACAAAGCTCGTCCTAACCGTAGACAGTCATCAGCTACGATGGAATCAGA
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DS 



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BQ
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GGAGATGAGAGGAAAGGTCCAATGTCACTCCCTCAGCCTTACACTTTCAAGCCGTTCCCT
TCTTCTTAGACCCCTTCCTTTCCTGGAAGAGGAAGATGACTGAGTAATCCCTTGGTAGCA
CTTACCGTTCCTGAAGCATTAGGACTCATTTTCTTTGCCGACTTTTTTTTTTATATATCC
CTTAAAGTCTCTCTTGTCTTTATTTGAGTTGTAAGCCTACAACATGGGAATAAAGGTGTT
TGTGCTTTTGAAGGAACGTGGTTCTTGCCTATTGTCTTATTTCTCACAATCTGCAAGCAT
TTAGTATTACAGTATGCTGATATATAT

QA 1 627 1 627
DS 



AS 1 2

CO CL8789Contig1 773 2 13 U
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CATCTTCTCCGCTGAGATCGGGAGGCACTCGACTTTGGATCGACAATGGGAAGTTTATAG
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EI63TF U 49
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RD RS1EI63TF 635 0 0
G
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AAGGTGAAAGGCTATAGGAACCTGGACTTGTTTGTTAGAGGCACGGATGGGAAGAAGATA
GCTGACCCGAAACATCAAGACAGCTTCTGCTCTCGTCTTAAGGAGGAGATATCGTGTCCT
TTGAGAGTGATAATCGTGAACCGAGGACCGGACTCTGAGCTATTAGTAGCCAACCCTGTG
GAGCTATCTGGCAAAGGAAGACCACGAGTGTTCTACGATGTCACACTCGCTTTGAAGTCG
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GAAGTTTATAGGTTTCTTTTGGAGGAGCGTCGTGAGTCCCCGTTGGCTAGCCTCCGTGCT
AGGAATCAGGTAGTGGATAAAGTGACAAAGACACTTATGGGTTGGTGAAAGTGAACGAGA
GAGGCTTTAAC**TGTATCATATACTCGAGGGGCCTTAAGAAACCGAGTCTTGGCTCGAT
GAATGGAAGGGTCAAGTAAAGAGGTTTTGTTTCAATGATTGGTTGGTTGGTTGCTTTTAT
GTTGAGCTTAGCTGAGTTGCATTGTAAGATTTGG

QA 2 635 2 635
DS 

RD RS1FL43JQ 773 0 0
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GACTTCTAAAGACTGCGACGTCCATATTGCTTACGGTAGATTCTCGTCGAAGGTGAAAGG
CTATAGGAACCTGGACTTGTTTGTTAGAGGCACGGATGGGAAGAAGATAGCTGACCCGAA
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AATCGTGAACCGAGGACCGGACTCTGAGCTATTAGTAGCCAACCCTGTGGAGCTATCTGG
CAAAGGAAGACCACGAGTGCTCTACGATGTCACACTCGCTTTGAAGTCGCTCGGGATCTG
CATCTTCTCCGCTGAGATCGGGAGGCACTCGACTTTGGATCGACAATGGGAAGTTTATAG
GTTTCTTTTGGAGGAGCGTCGTGAGTCCCCGTTGGCTAGCCTCCGTGCTAGGAATCAGGT
AGTGGATAAAGTGACAAAGACACTTATGGGTTGGTGAAAGTGAACGAGAGAGGCTTTAAC
GCTGTATCATATACTCGAGGGGCCTTAAGAAACCGAGTCTCGGCTCGATGAATGGAAGGG
TCAAGTAAAGAGGTTTTGTTTCAATGATTGGTTGGTTGGTTGCTTTTATGTTGAGCTTAG
CTGAGTTGCATTGTAAGATTTGGAAAATTGTATAAAAAGGATAGTGCAAATTGCAATGAA
TGCTTTGTAACACTTTGGTCTAATCGAATCATACGGACCTGCTGTTTTGAGTC

QA 1 773 1 773
DS 



AS 1 2

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ATACATAAATAGTATAAACTAGGGTTGCATGAACACCACAACATTTTATTTTAAAAAGGA
AATCCATCACAATTCACGACAACCAATCATAACAAAAGTTTTTTTTTTTCAACTCAACCC
CTAATAATAACAACTTGGCTGCAAGGGACATATGAGTGAGACATACGTAATGACGCGTGG
TGCTGAGGGGTCGAAATTTATAAAATTAGGAGCAGCCGGGCTTGCGACAGACACAAGCGT
GGGAGTTAGAGGCGGGGTGTGAGACGCACTCCCCTTTTGCGGCTCCTTCGTTGATGCAAA
AGTCGTTGCAAAGTTTGTGTCCGGCAGTACCCAACCAACACTTGAAGTTTGGAAGACCCT
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AGAATACGAGGAAAAGGGTAGAGAGGTTGATGATGATCTTCCCCATTTTTTCTTTGTTTG
TTGCTTATTAGCTATAGTTCAATGAAAATGAGCTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DY36JQ U 1
AF RS1BH27TF C 20
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RD RS1DY36JQ 577 0 0
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TGCTGAGGGGTTGAAATTTATAAAATTAGGAGCAGCCGGGCTTGCGACAGACACAAGCGT
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QA 1 577 1 577
DS 

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CAATGAAAATGAGCTTCC

QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 2

CO CL8791Contig1 596 2 1 U
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TATGTAACTTTGTATGATCAAAGACATCACATCTATGTTAACGTTATTAATATGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1F129JQ C 1
AF RS1F129TF U 1
BS 1 596 RS1F129TF

RD RS1F129JQ 596 0 0
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QA 1 596 1 596
DS 

RD RS1F129TF 596 0 0
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TGTGGCAAGTGTTATATTAGTATGACTACTCATGGCGGTCGACCTAAGTGTCCGTGATGA
GCTTATATATGTTTCGTGTAATTTTGTATGATCAAGTGTTTGATGTCACATATGTGTTTG
CGTATTTTGTTATTTTCTGAGTAGTCGACCTGAGTGTCCTTGATCCGCTTATATATGGTT
TATGTAACTTTGTATGATCAAAGACATCACATCTATGTTAACGTTATTAATATGCC

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 2

CO CL8792Contig1 733 2 5 U
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TAACATTTTACCACCCACCAAAAAACAGAGAGAGAGATGAGAGGGCATGAGCCACGGTCA
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AGTCGACTACTTAGTGCCCATAATAATGCTGGTGGTGGTGATGTCAACAACAACAACAAC
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TACTTGTTTGATATTGGACAGCCTCCTTTTGTATAGGCCTCTCTTTATCTCTTTTATCCA
CTGTATTTGCAATTGCTAATAAGTCATCTTCACTAATGTATTATTAAATCCTAATATGCA
AAATCATTTGCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CS74TF U 48
AF RS1A726TF U 1
BS 1 133 RS1A726TF
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BS 135 247 RS1A726TF
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BS 250 733 RS1A726TF

RD RS1CS74TF 635 0 0
GG
AAACCATAGCCTAACATTTTACCACCCACCAAAAAACAGAGAGAGAGATGAGAGGGCATG
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CTTGCATCTTCGCTCCTCATTTCCGCTCGACCGACCAGATGACTTTCGCCAAAGTCCATA
AAGTCTTTGGAGCCAGCAACGTCAGTAAGCTTCTCAGCGAGGTTCCCGAAGAACAGAGAC
AAGAAACCGTCAACTCCTTGGCTTACGAAGCTGACGTCCGTCTCAAGGATCCTGTTTACG
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TTGCTGCTTTTCTTGATCTTGTACCTTCTTATAGTGACTTGATGTTGCTTGATGGGTCTG
GTCTTGATGCTTACTTGTTTGATATTGGACAGCCTCCTTTTGTATAGGCCTCTCTTTATC
TCTTTTATCCACTGTATTTGCAATTGCTAA
AAA

QA 3 632 3 632
DS 

RD RS1A726TF 733 0 0
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TAACATTTTACCACCCACCAAAAAACAGAGAGAGAGATGAGAGGGCATGAGCCACGGTCA
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GCCAGCAT*GTCAGTAAGCTTCTCAGCGAGGTTCCCGAAGAACAGAGACAAGAAACCGTC
AACTCCTTGGCTTACGAAGCTGACGTCCGTCTCAAGGATCCTGTTTACGGTTGTATTGGA
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AGTCGACTACTTAGTGCCCATAATAATGCTGGTGGTGGTGATGTCAACAACAACAACAAC
AGCAACCACGTGTCGTCATCCCCTTTGGTAGATGATTCTTCTCCTCAGCTTGCTGCTTTT
CTTGATCTTGTACCTTCTTATAGTGACTTGATGTTGCTTGATGGGTCTGGTCTTGATGCT
TACTTGTTTGATATTGGACAGCCTCCTTTTGTATAGGCCTCTCTTTATCTCTTTTATCCA
CTGTATTTGCAATTGCTAATAAGTCATCTTCACTAATGTATTATTAAATCCTAATATGCA
AAATCATTTGCTT

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 2

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CTGGTGCTTGCCTGGCCTGCCTGATACTTGGAATGAGATTCTTTATACATATATCATCTC
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GTAACACAGCCTATGTTCACAAAAAAAATATAGGGGAAATGTATTTGTT


BQ
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AF RS1E357TF U 1
AF RS1E357JQ C 326
BS 1 676 RS1E357TF
BS 677 709 RS1E357JQ

RD RS1E357TF 676 0 0
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TCCTCTACGTACGACTGTTTTCTTCATGAGCATGTCTCCATTACACATTAGGAGTACGGA
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CATGGTGTTCAACGTTGGGACGAAGTACAGGCTGTTTTCGGAGATAGGAACGGACTACAG
ACTGTTCTCATCTTTTGAAAACGTCACGCAGTCTGTGAAAGTTCCTATACGTTTCCTCAA
CATCACTGGGTTGTCTGAGTATCGTAAAGATGCACATACTTCAGTTTACACGATCAAGCA
AGGTAAACTGCTGACGCAGGAACAGCAAAACGATCCAGCCACTTACGCGGACTGTATCCA
CTGGTGCTTGCCTGGCCTGCCTGATACTTGGAATGAGATTCTTTATACATATATCATCTC
AAAATCGTCATGACCCAATGGAACGAACCGCTCATCCTTTTTTATTGTTTTAAAAAATTC
TTGTGATGTATTTTTTTTTTATCAAATTCTTGTGATGTATATAGGATACAAACCTAAAGG
GATTTGACGTGATCCAAAGATGCCACATCATGTTTTGATATATGCAAAGCGGTCTTATAT
GTAACACAGCCTATGT

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1E357JQ 384 0 0
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CAAAACGATCCAGCCACTTACGCGGACTGTATCCACTGGTGCTTGCCTGGCCTGCCTGAT
ACTTGGAATGAGATTCTTTATACATATATCATTTCAAAATCGTCATGACCCAATGGAACG
AACCGCTCATCCTTTTTTATTGTTTTAAAAAATTCTTGTGATGTATTTTTTTTTTATCAA
ATTCTTGTGATGTATATAGGATACAAACCTAAAGGGATTTGACGTGATCCAAAGATGCCA
CATCATGTTTTGATATATGCAAAGCGGTTTTATATGTAACACAGCCTATGTTCACAAAAA
AAATATAGGGGAAATGTATTTGTT

QA 1 384 1 384
DS 



AS 1 2

CO CL8794Contig1 776 2 2 U
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AACCCTAAATTTACTTGAAAGGGCTCTCGTAAGTCTAGTAGCTTGCAGGTAACTTTTAAG
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ATGGTATTCAGTTTGTCCGTAACGATGCTAAGATTTTTCGGTTCTGTAGGTCTAAATGCC
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CTGCACACGGAAAGGACATGACTCAGGATAAAACATTTGAGTTTGAGAAGAAGAGAAACA
GACCTGAGAGATATGATAGGAACGTTACAGAGGATACTCTCGAGGCCATTAAGAAGATTG
ATAAGATCAGAAGTTCAAGAGAAGCTGATCACATCAATAAGAGGTTGAAGCCAAACAAAC
AGAAGATATTCAAGAGTGCAGTCAAGGAGATAGATCAGCACATTAGTTTGATCAAAGCAC
CAGGTTCTCACCAACAAGATTCAGAGAAGATGAAAGTTTCGGTCTCCACAAACAAGTCTG
TTCAGAACGAAGCCATGGAAGAGTGATTCTGTGGAAACTCTTCGAAAAATATCACTTCAG
TAAAAAAATATCCCTTTTTCAAGAAAAAAAGAGAGTTTAAGATTGTTTTCATTTGCAATG
TATTGTTTATTACCTGGAACATCATTTTCATTTATTCCGATTTTGTGCTTTGTTTT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F133TF U 1
AF RS1F133JQ C 57
BS 1 667 RS1F133TF
BS 668 776 RS1F133JQ

RD RS1F133TF 667 0 0
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AACCCTAAATTTACTTGAAAGGGCTCTCGTAAGTCTAGTAGCTTGCAGGTAACTTTTAAG
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ATGGTATTCAGTTTGTCCGTAACGATGCTAAGATTTTTCGGTTCTGTAGGTCTAAATGCC
ACAAGAACTTCAAGATGAAGAGGAACCCTCGTAAAGTGAAGTGGACTAAAGCCTACAGAG
CTGCACACGGAAAGGACATGACTCAGGATAAAACATTTGAGTTTGAGAAGAAGAGAAACA
GACCTGAGAGATATGATAGGAACGTTACAGAGGATACTCTCGAGGCCATTAAGAAGATTG
ATAAGATCAGAAGTTCAAGAGAAGCTGATCACATCAATAAGAGGTTGAAGCCAAACAAAC
AGAAGATATTCAAGAGTGCAGTCAAGGAGATAGATCAGCACATTAGTTTGATCAAAGCAC
CAGGTTCTCACCAACAAGATTCAGAGAAGATGAAAGTTTCGGTCTCCACAAACAAGTCTG
TTCAGAACGAAGCCATGGAAGAGTGATTCTGTGGAAACTCTTCGAAAAATATCACTTCAG
TAAAAAA

QA 1 667 1 667
DS 

RD RS1F133JQ 720 0 0
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TAAGAACGAGACAAGATGAGATTGGTCAAGTGTTGGTTCTGCTCTTCTACGATATATCCA
GGACATGGTATTCAGTTTGTCCGTAACGATGCTAAGATTTTTCGGTTCTGTAGGTCTAAA
TGCCACAAGAACTTCAAGATGAAGAGGAACCCTCGTAAAGTGAAGTGGACTAAAGCCTAC
AGAGCTGCACACGGAAAGGACATGACTCAGGATAAAACATTTGAGTTTGAGAAGAAGAGA
AACAGACCTGAGAGATATGATAGGAACGTTACAGAGGATACTCTCGAGGCCATTAAGAAG
ATTGATAAGATCAGAAGTTCAAGAGAAGCTGATCACATCAATAAGAGGTTGAAGCCAAAC
AAACAGAAGATATTCAAGAGTGCAGTCAAGGAGATAGATCAGCACATTAGTTTGATCAAA
GCACCAGGTTCTCACCAACAAGATTCAGAGAAGATGAAAGTTTCGGTCTCCACAAACAAG
TCTGTTCAGAACGAAGCCATGGAAGAGTGATTCTGTGGAAACTCTTCGAAAAATATCACT
TCAGTAAAAAAATATCCCTTTTTCAAGAAAAAAAGAGAGTTTAAGATTGTTTTCATTTGC
AATGTATTGTTTATTACCTGGAACATCATTTTCATTTATTCCGATTTTGTGCTTTGTTTT

QA 1 720 1 720
DS 



AS 0 0

AS 0 0

AS 1 2

CO CL8797Contig1 800 2 6 U
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AGAAAGCGATCAGAAAATGAATCTCGTTGAAGGAGAGAAATCATCAATAAAAGACAAATG
GGCTCCGGCTATGGCAGTTGTGGTAGCAAACGTAGTGACGGGTTCAGTGAATGCCGTTGT
GAAGAAGGCTCTTGATGGTGGTGTTAACCATATGGTCATTGGTGCTTATCGTCTGGCTAT
TTCTGCTTTCATTTTGGCTCCTCTCGCTTATTTCTTGGAAAGGAAAACAAGACCGAAGAT
GACGTATAGGCTATTGATCGATCATTTCATCAGCGGTTTGGCTGGAGCGAGTTTGGTACA
ATTTTTCTTTATGCTTGGTCTGTCGTACACATCAGCAACTACTTCGGGTGCTTTTCTGAG
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TACGTCTGGATGGCGCACGGAGAAGGGCTTCTTCTCTTCTCCTGACATAAGGGGCAGGAG
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AAAAAACAAAACTTTTAAATTTAAACTTGAAATGGAGACAAAACCGAAAGCAAAAAATGT
AAACATGTAAATCGAAATTG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DG29TF U 1
AF RS1DG29JQ C 1
BS 1 546 RS1DG29TF
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RD RS1DG29TF 637 0 0
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GAAGAAGGCTCTTGATGGTGGTGTTAACCATATGGTCATTGGTGCTTATCGTCTGGCTAT
TTCTGCTTTCATTTTGGCTCCTCTCGCTTATTTCTTGGAAAGGAAAACAAGACCGAAGAT
GACGTATAGGCTATTGATCGATCATTTCATCAGCGGTTTGGCTGGAGCGAGTTTGGTACA
ATTTTTCTTTATGCTTGGTCTGTCGTACACATCAGCAACTACTTCGGGTGCTTTTCTGAG
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TACGTCTGGATGGCGCACGGAGAAGGGCTTCTTCTCTTCTCCTGACATAAGGGGCAGGAG
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CTCCAGGAGGAACAGCTCCAGGAG*TACAACTCCAGG

QA 1 637 1 637
DS 

RD RS1DG29JQ 800 0 0
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GGCTCCGGCTATGGCAGTTGTGGTAGCAAACGTAGTGACGGGTTCAGTGAATGCCGTTGT
GAAGAAGGCTCTTGATGGTGGTGTTAACCATATGGTCATTGGTGCTTATCGTCTGGCTAT
TTCTGCTTTCATTTTGGCTCCTCTCGCTTATTTCTTGGAAAGGAAAACAAGACCGAAGAT
GACGTATAGGCTATTGATCGATCATTTCATCAGCGGTTTGGCTGGAGCGAGTTTGGTACA
ATTTTTCTTTATGCTTGGTCTGTCGTACACATCAGCAACTACTTCGGGTGCTTTTCTGAG
CATGATCCCTGCGATTACCTTTGTTTTATCCCTTATTTTAAGGATGAAGGTGTGGCTGGT
TACGTCTGGATGGCGCACGGAGAAGGGCTTTTTCTCTTCTCCTGACATAAGGGGCAGGAG
CCGCAGGCACTGCGCTTGAAGAACCGACAGAAGCGTGAGGTACAGCTCCAGGAGGTACAG
CTCCAGGAGGAACAGCTCCAGGAGGTACAACTCCAGGAGGAGGAGGAGAAGGGGCCATGG
CAGAAGGCTCAGATAAGGTCAATTGAGGTCTCCCTTGCCGCATATCTGTAAGACAGAAAA
AAAAAACAAAACTTTTAAATTTAAACTTGAAATGGAGACAAAACCGAAAGCAAAAAATGT
AAACATGTAAATCGAAATTG

QA 1 800 1 800
DS 



AS 1 2

CO CL8798Contig1 623 2 1 U
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TTGTGTTTTTAGCTTGTTTTAATCTCCCCTAATATTAGTAGGAGTTGTCTTATGTGATTG
AGAACTTTGCTAGGTCTCTTTATGATGTTTCTACAATGTCATATATTATCATCTAGTCTT
TTGAGTCAAGAACTCTTTTAACC


BQ
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AF RS1GV34JQ C 1
AF RS1GV34TF U 1
BS 1 623 RS1GV34TF

RD RS1GV34JQ 623 0 0
GATTGTGATGAAGGTGAGCGTCCTCCTGCTGTATGCGTTCTCAACAAAGAAGCTCCGTTA
CCTCTCGTCCAATACAAACGTAGACGCCAAAACGAGTCTAGCAACAACGACTCAAGCAGG
ACCCCAGAGGATTACTGCTCGTCCACAACAACAACCGTCGACAACACCAACAGCGCCATC
TCTGCATTGCTCGAGTTCTCTCTCATGGGTATCTCCAAGAAGAAAGAAAACCTGCAGCAG
ACAGTACGTCCTCACAAGGAAGCTACAACACTTAAGGAGAAGCTAAATGATCTCCAGAAG
GAGATTGAGAAGATGTCTGATGAGAGAAAAACTTTCAAGCTTGAGATGATGGGTGCAGAG
GCTATGATCAGTATTCTCCAGTCGAGGATCGATGCTCTGCGCCAGGAGAACGATGAGCTT
AAGAAGAACAGCAGCACCAAAGAAGTGCTCTAATAACCATCGCTCTAGGTTTCTTCTTCT
TTGTGTTTTTAGCTTGTTTTAATCTCCCCTAATATTAGTAGGAGTTGTCTTATGTGATTG
AGAACTTTGCTAGGTCTCTTTATGATGTTTCTACAATGTCATATATTATCATCTAGTCTT
TTGAGTCAAGAACTCTTTTAACC

QA 1 623 1 623
DS 

RD RS1GV34TF 623 0 0
GATTGTGATGAAGGTGAGCGTCCTCCTGCTGTATGCGTTCTCAACAAAGAAGCTCCGTTA
CCTCTCGTCCAATACAAACGTAGACGCCAAAACGAGTCTAGCAACAACGACTCAAGCAGG
ACCCCAGAGGATTACTGCTCGTCCACAACAACAACCGTCGACAACACCAACAGCGCCATC
TCTGCATTGCTCGAGTTCTCTCTCATGGGTATCTCCAAGAAGAAAGAAAACCTGCAGCAG
ACAGTACGTCCTCACAAGGAAGCTACAACACTTAAGGAGAAGCTAAATGATCTCCAGAAG
GAGATTGAGAAGATGTCTGATGAGAGAAAAACTTTCAAGCTTGAGATGATGGGTGCAGAG
GCTATGATCAGTATTCTCCAGTCGAGGATCGATGCTCTGCGCCAGGAGAACGATGAGCTT
AAGAAGAACAGCAGCACCAAAGAAGTGCTCTAATAACCATCGCTCTAGGTTTCTTCTTCT
TTGTGTTTTTAGCTTGTTTTAATCTCCCCTAATATTAGTAGGAGTTGTCTTATGTGATTG
AGAACTTTGCTAGGTCTCTTTATGATGTTTCTACAATGTCATATATTATCATCTAGTCTT
TTGAGTCAAGAACTCTTTTAACC

QA 1 623 1 623
DS 



AS 1 2

CO CL8799Contig1 694 2 1 U
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AATAAGGTTCTTTGGTTTTGTTTCCCAAGAAAATATAATCTTTATTTCATCTCTGCGAAT
TTCCAGAGCTTGTTCTTTTCTGCTTATAGAGGAACAAGATCAATCAAGATTTGAGCTTAA
TGGAATCAAGAATGGAAGGAGATATGTATTCCGGATATGGAGAGAGATACCAGATGGATG
GCAAAGTACTGCAGAGTTTCCAGAAGAGATTTGTTCAGGTTCAATACATTTTGGAACAGA
ACCGGCTTTTGATCAACGAGATCAATCAGAACCATGCGTCCAAACAAGTAGATCACTTGG
GTCGAAATGTTGGTTTGATAAGAGAGCTCAATAACAATATCAGAACTGTGGCAAGTCTAT
ATGGTGAACTCTCTCATTCTTTCGCCCGATCGGTTGATGCTTCATCAGAAGGAGAATCCA
CTGGGACCTTGAAATCTAACGGGAAGGCCAACAACCAAAAGAGGTTTAGATCAGGGTAAT
GTTCTGTAGATTCAATGCTAATTTGAGTGTGGATTTAAGGAATGACTTGTTGTTGTTCAA
CAAAAAAAAAGACATTAATAGTTGTGTATTGCTTCAGTGTCTTCAACAACTTGTGTAACT
TCTGTTGAAATGAGTTCATGTCTTTAATTCTGAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DG51TF U 1
AF RS1DG51JQ C 71
BS 1 694 RS1DG51TF

RD RS1DG51TF 694 0 0
GGGAGGCCAAGTAGATTCGCTTTTCCAGCATCCAATAATTGTCATATAGTTTTCTCGAGA
AATAAGGTTCTTTGGTTTTGTTTCCCAAGAAAATATAATCTTTATTTCATCTCTGCGAAT
TTCCAGAGCTTGTTCTTTTCTGCTTATAGAGGAACAAGATCAATCAAGATTTGAGCTTAA
TGGAATCAAGAATGGAAGGAGATATGTATTCCGGATATGGAGAGAGATACCAGATGGATG
GCAAAGTACTGCAGAGTTTCCAGAAGAGATTTGTTCAGGTTCAATACATTTTGGAACAGA
ACCGGCTTTTGATCAACGAGATCAATCAGAACCATGCGTCCAAACAAGTAGATCACTTGG
GTCGAAATGTTGGTTTGATAAGAGAGCTCAATAACAATATCAGAACTGTGGCAAGTCTAT
ATGGTGAACTCTCTCATTCTTTCGCCCGATCGGTTGATGCTTCATCAGAAGGAGAATCCA
CTGGGACCTTGAAATCTAACGGGAAGGCCAACAACCAAAAGAGGTTTAGATCAGGGTAAT
GTTCTGTAGATTCAATGCTAATTTGAGTGTGGATTTAAGGAATGACTTGTTGTTGTTCAA
CAAAAAAAAAGACATTAATAGTTGTGTATTGCTTCAGTGTCTTCAACAACTTGTGTAACT
TCTGTTGAAATGAGTTCATGTCTTTAATTCTGAG

QA 1 694 1 694
DS 

RD RS1DG51JQ 624 0 0
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TGTTCTTTTCTGCTTATAGAGGAACAAGATCAATCAAGATTTGAGCTTAATGGAATCAAG
AATGGAAGGAGATATGTATTCCGGATATGGAGAGAGATACCAGATGGATGGCAAAGTACT
GCAGAGTTTCCAGAAGAGATTTGTTCAGGTTCAATACATTTTGGAACAGAACCGGCTTTT
GATCAACGAGATCAATCAGAACCATGCGTCCAAACAAGTAGATCACTTGGGTCGAAATGT
TGGTTTGATAAGAGAGCTCAATAACAATATCAGAACTGTGGCAAGTCTATATGGTGAACT
CTCTCATTCTTTCGCCCGATCGGTTGATGCTTCATCAGAAGGAGAATCCACTGGGACCTT
GAAATCTAACGGGAAGGCCAACAACCAAAAGAGGTTTAGATCAGGGTAATGTTCTGTAGA
TTCAATGCTAATTTGAGTGTGGATTTAAGGAATGACTTGTTGTTGTTCAACAAAAAAAAA
GACATTAATAGTTGTGTATTGCTTCAGTGTCTTCAACAACTTGTGTAACTTCTGTTGAAA
TGAGTTCATGTCTTTAATTCTGAG

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

CO CL8800Contig1 816 2 2 U
GGAACCAACCCTAATTTTCATCGATGGGGAACTTGGAGTTTGTAGACGAAGCAAAGAAGA
AATTTCAGGCTATCCAAGAAGCCTACTCTGTTCTGTCCGACTCCAACAAGAGGTTCCTCT
ATGATGTTGGAGCTTATAATAGTGATGATGATGAAGCTGACCAAAACGGAATGGGTGATT
TTTTGAATGAAATGGCTGCCATGATGAATCAATCCAAGCCTAATGAGAATAATTCAGGAG
ACAGTTTCGAACAGCTACAGGATCTGTTTAACGAGATGTTTCAAGGAGACCCTACAGCAT
TCCCACCCTCATCATCTTCAACTTTCACTTCGTCTTGTAGCTTTGTCTTTGACACGAATG
GTCAGCAGTCACCGTTTGAGACGAGCTCGATGATGGGGAGAAGTGATCCTTTCGGATTTG
ACTCAAGATCTCACACTTTCTCTCTAGGGGTGGAACATCAGCAGGATTTCAAGAAAGGGA
CGAAGAACAATGGTGGAAGAAGAAGCAGACGGAAGAACAATTCTCAAACGTCTAACAACT
ATGGAGTCTCCTCCACTTCATAGGCCCTTTTTTTCAGAACCGTATTTTTTTGATTTGTCG
ACTAGTCACACACTCACACACAAGAGGACTACTGGTTCTGGTCCTTCTCAACGGCGATGC
CCATCACAAAAAAAATTCTTAAAATACATTTTCTCGAAGCTTCTTTTCTTTTTCCCCTCT
CCAATTGTTGTCTCCTGAGCAAAGAGTCGTTAAGATCATTGAGATTGATGAAGTCAACTG
GTTTGTGATGATCGAATACACATCGTATGTCTCTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1GK03TF U 1
AF RS1GK03JQ C 87
BS 1 674 RS1GK03TF
BS 675 816 RS1GK03JQ

RD RS1GK03TF 674 0 0
GGAACCAACCCTAATTTTCATCGATGGGGAACTTGGAGTTTGTAGACGAAGCAAAGAAGA
AATTTCAGGCTATCCAAGAAGCCTACTCTGTTCTGTCCGACTCCAACAAGAGGTTCCTCT
ATGATGTTGGAGCTTATAATAGTGATGATGATGAAGCTGACCAAAACGGAATGGGTGATT
TTTTGAATGAAATGGCTGCCATGATGAATCAATCCAAGCCTAATGAGAATAATTCAGGAG
ACAGTTTCGAACAGCTACAGGATCTGTTTAACGAGATGTTTCAAGGAGACCCTACAGCAT
TCCCACCCTCATCATCTTCAACTTTCACTTCGTCTTGTAGCTTTGTCTTTGACACGAATG
GTCAGCAGTCACCGTTTGAGACGAGCTCGATGATGGGGAGAAGTGATCCTTTCGGATTTG
ACTCAAGATCTCACACTTTCTCTCTAGGGGTGGAACATCAGCAGGATTTCAAGAAAGGGA
CGAAGAACAATGGTGGAAGAAGAAGCAGACGGAAGAACAATTCTCAAACGTCTAACAACT
ATGGAGTCTCCTCCACTTCATAGGCCCTTTTTTTCAGAACCGTATTTTTTTGATTTGTCG
ACTAGTCACACACTCACACACAAGAGGACTACTGGTTCTGGTCCTTCTCAACGGCGATGC
CCATCACAAAAAAA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1GK03JQ 730 0 0
TCTGTTCTGTCCGACTCCAACAAGAGGTTCCTCTATGATGTTGGAGCTTATAATAGTGAT
GATGATGAAGCTGACCAAAACGGAATGGGTGATTTTTTGAATGAAATGGCTGCCATGATG
AATCAATCCAAGCCTAATGAGAATAATTCAGGAGACAGTTTCGAACAGCTACAGGATCTG
TTTAACGAGATGTTTCAAGGAGACCCTACAGCATTCCCACCCTCATCATCTTCAACTTTC
ACTTCGTCTTGTAGCTTTGTCTTTGACACGAATGGTCAGCAGTCACCGTTTGAGACGAGC
TCGATGATGGGGAGAAGTGATCCTTTCGGATTTGACTCAAGATCTCACACTTTCTCTCTA
GGGGTGGAACATCAGCAGGATTTCAAGAAAGGGACGAAGAACAATGGTGGAAGAAGAAGC
AGACGGAAGAACAATTCTCAAACGTCTAACAACTATGGAGTCTCCTCCACTTCATAGGCC
CTTTTTTTCAGAACCGTATTTTTTTGATTTGTCGACTAGTCACACACTCACACACAAGAG
GACTACTGGTTCTGGTCCTTCTCAACGGCGATGCCCATCACAAAAAAAATTCTTAAAATA
CATTTTCTCGAAGCTTCTTTTCTTTTTCCCCTCTCCAATTGTTGTCTCCTGAGCAAAGAG
TCGTTAAGATCATTGAGATTGATGAAGTCAACTGGTTTGTGATGATCGAATACACATCGT
ATGTCTCTCG

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL8801Contig1 695 2 1 U
GGCATTTGAGCGTTTCCCTGGATATGCTGCTTAAGCTGGTTAGAATGTACGGATCACCAA
TTTACTCATCGCTGTCAGCTCCAGCATCTGTTGGTGTAGATATCGAAGCCGAGCAAAGAA
TCGAGCGCTACAGTCGTTGCTTTGTGGAGCTAGAGAAAGCTAAAGCCTGCCTTCCCTCGC
TGTCAAGAAGAGGAGGTTTGGTGGCCAAGTCTGTGATTGAACTCAACTTAGCATTTCAGG
AAGTTTCATCATAATCAATTCCGAATCCTAGAAAAGCACAGAGCAAAGCCCGTCTTCTTA
GTGGCATCTTCCCAATCCTGTGCTTGTTTTCTTTTTTTAATGTGGATTTGGTTCCAAAGG
GAGTCTAACAAAAAGAAAAAAAACTAAAGCTGATGATGATACGCTTACTAAGTTAACCAA
AAGAGTTTGGAATGCTATAATCACTCCCGAGTTAACTGCATCTGTGACCACTCCATGACT
TTTTTATCATCCAGCTACTAATCTTTGTCTTTGCTTTGGGGGAAGTGTATTGCTCTAACT
GCGGTGTGTGTAGAAACAGAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCCATATGGG
CTGTGTATTGCTCTCCTAGCTAATATTACATGAATACTAAGAATTTTAGTGTTCTTTTCT
CAACTCTGCTAGAGAGTATTTTCATGTTTTCTTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D386TF U 1
AF RS1D386JQ C 72
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AAGTTTCATCATAATCAATTCCGAATCCTAGAAAAGCACAGAGCAAAGCCCGTCTTCTTA
GTGGCATCTTCCCAATCCTGTGCTTGTTTTCTTTTTTTAATGTGGATTTGGTTCCAAAGG
GAGTCTAACAAAAAGAAAAAAAACTAAAGCTGATGATGATACGCTTACTAAGTTAACCAA
AAGAGTTTGGAATGCTATAATCACTCCCGAGTTAACTGCATCTGTGACCACTCCATGACT
TTTTTATCATCCAGCTACTAATCTTTGTCTTTGCTTTGGGGGAAGTGTATTGCTCTAACT
GCGGTGTGTGTAGAAACAGAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCCATATGGG
CTGTGTATTGCTCTCCTAGCTAATATTACATGAATACTAAGAATTTTAGTGTTCTTTTCT
CAACTCTGCTAGAGAGTATTTTCATGTTTTCTTGG

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GGAGGTTTGGTGGCCAAGTCTGTGATTGAACTCAACTTAGCATTTCAGGAAGTTTCATCA
TAATCAATTCCGAATCCTAGAAAAGCACAGAGCAAAGCCCGTCTTCTTAGTGGCATCTTC
CCAATCCTGTGCTTGTTTTCTTTTTTTAATGTGGATTTGGTTCCAAAGGGAGTCTAACAA
AAAGAAAAAAAACTAAAGCTGATGATGATACGCTTACTAAGTTAACCAAAAGAGTTTGGA
ATGCTATAATCACTCCCGAGTTAACTGCATCTGTGACCACTCCATGACTTTTTTATCATC
CAGCTACTAATCTTTGTCTTTGCTTTGGGGGAAGTGTATTGCTCTAACTGCGGTGTGTGT
AGAAACAGAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCCATATGGGCTGTGTATTGC
TCTCCTAGCTAATATTACATGAATACTAAGAATTTTAGTGTTCTTTTCTCAACTCTGCTA
GAGAGTATTTTCATGTTTTCTTGG

QA 1 624 1 624
DS 



AS 1 2

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TGTATAGAAGAGTCGAGACAGAGATCTTAAAACGGCAAGCAAGTCCTGCCATGAAGCTGC
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BQ
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AF RS1E223TF U 1
AF RS1F193TF U 1
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GAAAGATTGAAGAGTACCGTGAAATCGGCTTGAGGTTGAAGGAATTTCCTGAGCAAGACT
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GAATTGAAGAAGCAGCTGAGAAAGGAGAACTGGACGAGCTTGTTCTCATGATCATATGGA
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DS 

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TTACAGAGCCCTCAGTAAAATTGGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATGCTCGGGGAAAG
AAGAAGTGCTTCTAGAAGGAATGCCACCGGAGTATTATGATGATGAATGGCAAGCTCGGC
AGAGGGAGAAGACGAGAGAACTGAGGCGGATGCAGCGGGAGGAAGAAGAAGAAGAAGATA
GAAAGATTGAAGAGTACCGTGAAGTCGGCTTGAGGTTGAAGGAATTTCCTGAGCAAGACT
TGAGGAAAGCTAGAAAGCTCGTCTCCACCTTCATCACTGCTGCTGAGGAAGTCGAAGAGA
GAATTGAAGAAGCAGCTGAGAAAGGAGAACTGGACGAGCTTGTTCTCATGATCATATGGA
ACCGCCTTGACCTTGCTCGCCGTGATGACGAGAAGGACGCTATAAGAAGTCTTGATCTCT
TGTATAGAAGAGTCGAGACAGAGGTCTTAAAACGGCAAGCAAGTCCTGCCATGAAGCTGC
TGAATGATCTTCTAAACATGCATGATGGCTTTGGAGACGATGCTTGGC

QA 1 648 1 648
DS 



AS 1 2

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CACAAAACTCGACATGAAGCTGAACGATGCGCTTCCAAACATCACCGTGGACCCAGAGAC
ATACGTTGTCACGGCAGACGGTGAGGTACTTGCGTGTGCGCCAGCCACTTCAGTCCCTCT
CTCCCGGAACTATTTCCTCTTTTAAGGGTTGTTGAAATTCTCAGTTACTTTGTGAGTTGT
AGGCATTGCTAACTAAGTTGAGACAGCAACACCTCAACCACTATATCAAGCATACAGGTA
GGTGTTGGAATTGTAATAATAATAGCTTCTTTGACCATTTTTTTACCTAAAAAGGTGAGA
GAAGCAAATATAAATTGGAGGGCAATTTTTGGATTGGTTGAAACAACTTTTTGCTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GY16TF U 1
AF RS1GY16JQ C 24
BS 1 650 RS1GY16TF
BS 651 657 RS1GY16JQ

RD RS1GY16TF 650 0 0
GATTGGCTCTGTTGAGGAGAAGAAGCTAGCTGATCTCGTTTTGTGGAAACCAGCTTTCTT
CGGAGCAAAACCAGAGATGATTATTAAAGGTGGAAATATAGCTTGGGCTAATATGGGCGA
TGCAAATGCTAGCATACCCACTCCTGAGCCGGTCATATCAAGACCTATGTTTGGTGCTTT
TGGAAAGGCTGGAAGTGAAAACTCTGTTGCATTTGTCAGCAAGGCTGCCTTGAGAAACGG
GGTAAAGGAAGTATATGGGCTGAAGAAGAGGGTTGTAGCGGTATCCAACGTGAGGCAGCT
CACAAAACTCGACATGAAGCTGAACGATGCGCTTCCAAACATCACCGTGGACCCAGAGAC
ATACGTTGTCACGGCAGACGGTGAGGTACTTGCGTGTGCGCCAGCCACTTCAGTCCCTCT
CTCCCGGAACTATTTCCTCTTTTAAGGGTTGTTGAAATTCTCAGTTACTTTGTGAGTTGT
AGGCATTGCTAACTAAGTTGAGACAGCAACACCTCAACCACTATATCAAGCATACAGGTA
GGTGTTGGAATTGTAATAATAATAGCTTCTTTGACCATTTTTTTACCTAAAAAGGTGAGA
GAAGCAAATATAAATTGGAGGGCAATTTTTGGATTGGTTGAAACAACTTT

QA 1 650 1 650
DS 

RD RS1GY16JQ 634 0 0
AGCTAGCTGATCTCGTTTTGTGGAAACCAGCTTTCTTCGGAGCAAAACCAGAGATGATTA
TTAAAGGTGGAAATATAGCTTGGGCTAATATGGGCGATGCAAATGCTAGCATACCCACTC
CTGAGCCGGTCATATCAAGACCTATGTTTGGTGCTTTTGGAAAGGCTGGAAGTGAAAACT
CTGTTGCATTTGTCAGCAAGGCTGCCTTGAGAAACGGGGTAAAGGAAGTATATGGGCTGA
AGAAGAGGGTTGTAGCGGTATCCAACGTGAGGCAGCTCACAAAACTCGACATGAAGCTGA
ACGATGCGCTTCCAAACATCACCGTGGACCCAGAGACATACGTTGTCACGGCAGACGGTG
AGGTACTTGCGTGTGCGCCAGCCACTTCAGTCCCTCTCTCCCGGAACTATTTCCTCTTTT
AAGGGTTGTTGAAATTTTCAGTTACTTTGTGAGTTGTAGGCATTGCTAACTAAGTTGAGA
CAGCAACACCTCAACCACTATATCAAGCATACAGGTAGGTGTTGGAATTGTAATAATAAT
AGCTTCTTTGACCATTTTTTTACCTAAAAAGGTGAGAGAAGCAAATATAAATTGGAGGGC
AATTTTTGGATTGGTTGAAACAACTTTTTGCTAC

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 2

CO CL8804Contig1 615 2 2 U
GGGCTGAATTGATAAAGCGGTAATAAAGCCACCAAGGAGAGGATAAAAAAAAGGGGCCCG
TTACTGCGCGTGGATTCTCAGCCGTCCGTTTCGTAATCGTAGTATCCACGCGCCTCTCGG
TGATTTTTTTCGCAGTTGTTGTTTGTTTGTATGGCGGTGATAAACAAAAAAATATCTTTG
CAATAATAATTGACGGGAAGGAAAAAAAGTGAGCAACAAAAATAAATATCCAATTAATTT
ATTTTTTCCTCGGAAGATTTGTCGTGTTCCTTGTTTCGAGAGTGTGTGTGTTTTATATAA
TGAGAAGAGATCTGTGATCTGTTTTGAAGCTTCTCTATAGAGTCTCTTCTCCTGCTGGTT
AAACAAAGGGGGCAGACTTTTATTTATTTTTCTCATAATTGAGTTAATTTTCATTAACTT
GCTCTAACGGTTCGGTCAGAATCAAGATTCTAGCTTATCTCGTTTGAAGGAGGGAAGGAA
AAGGTAAGAAAAGGAGAAAATGGTGATGTCTTGTGTTGATGATCTTCAACAACAATCCTT
GAAAGCTGCCGCTGATTCTTCTTCTGTACCGATCCCTCCACCTCTTCCCTCAAAATCTGA
TGGGGACCAGAAAAG


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GG79TF U 1
AF RS1GI88TF U 1
BS 1 608 RS1GG79TF
BS 609 615 RS1GI88TF

RD RS1GG79TF 608 0 0
GGGCTGAATTGATAAAGCGGTAATAAAGCCACCAAGGAGAGGATAAAAAAAAGGGGCCCG
TTACTGCGCGTGGATTCTCAGCCGTCCGTTTCGTAATCGTAGTATCCACGCGCCTCTCGG
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CAATAATAATTGACGGGAAGGAAAAAAAGTGAGCAACAAAAATAAATATCCAATTAATTT
ATTTTTTCCTCGGAAGATTTGTCGTGTTCCTTGTTTCGAGAGTGTGTGTGTTTTATATAA
TGAGAAGAGATCTGTGATCTGTTTTGAAGCTTCTCTATAGAGTCTCTTCTCCTGCTGGTT
AAACAAAGGGGGCAGACTTTTATTTATTTTTCTCATAATTGAGTTAATTTTCATTAACTT
GCTCTAACGGTTCGGTCAGAATCAAGATTCTAGCTTATCTCGTTTGAAGGAGGGAAGGAA
AAGGTAAGAAAAGGAGAAAATGGTGATGTCTTGTGTTGATGATCTTCAACAACAATCCTT
GAAAGCTGCCGCTGATTCTTCTTCTGTACCGATCCCTCCACCTCTTCCCTCAAAATCTGA
TGGGGACC

QA 1 608 1 608
DS 

RD RS1GI88TF 615 0 0
GGGCTGAATTGATAAAGCGGTAATAAAGCCACCAAGGAGAGGATAAAAAAAAGGGGCCCG
TTACTGCGCGTGGATTCTCAGCCGTCCGTTTCGTAATCGTAGTATCCACGCGCCTCTCGG
TGATTTTTTTCGCAGTTGTTGTTTGTTTGTATGGCGGTGATAAACAAAAAAATATCTTTG
CAATAATAATTGACGGGAAGGAAAAAAAGTGAGCAACAAAAATAAATATCCAATTAATTT
ATTTTTTCCTCGGAAGATTTGTCGTGTTCCTTGTTTCGAGAGTGTGTGTGTTTTATATAA
TGAGAAGAGATCTGTGATCTGTTTTGAAGCTTCTCTATAGAGTCTCTTCTCCTGCTGGTT
AAACAAAGGGGGCAGACTTTTATTTATTTTTCTCATAATTGAGTTAATTTTCATTAACTT
GCTCTAACGGTTCGGTCAGAATCAAGATTCTAGCTTATCTCGTTTGAAGGAGGGAAGGAA
AAGGTAAGAAAAGGAGAAAATGGTGATGTCTTGTGTTGATGATCTTCAACAACAATCCTT
GAAAGCTGCCGCTGATTCTTCTTCTGTACCGATCCCTCCACCTCTTCCCTCAAAATCTGA
TGGGGACCAGAAAAG

QA 1 615 1 615
DS 



AS 1 2

CO CL8805Contig1 729 2 2 U
GGAAATCATATATCTTTTAGAGAATAGAGGATGACATGAGTTCGGTTCCCGAGTGATCGG
GCTCCCTTCCAGAAAAGATGGCTTCTTCAGTATCGTTTACCGGTTCTTGACTCTGTCATT
GCTCCTTATCCCTTGGTGTAGACGGTTGACTCTTTACTGGTTCATCCGGCGTTTATATTT
CTGCTGTTTTATTTTTCTTTTTGTTTTTTATATTTTCTTCTCCACTCCTAACCTCCATGT
TTAACCTCTAGATTCAGTTGGGTTTCGATTTTCATCGGAATGGTCTTTCCTTCCCCAGTT
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TTGGCCGCTTTGGCTTCCGGTGAGGACTTTCAAGGCGACGTATGTAGTCGATGTATTCCT
CTTTCGAAGCAGAGAGACGTGTCTCTCTTTCGTCTCATCAGAACATGTGGTGTTGTGGAG
TTGAGCTGGATAAGATTATTGGGCTTTCTTCTTGGACTTTTTTGGCTGGGCCTTTTTTAG
TTTTTGTAGTTTTCTTTTGTCTGTTTACCTTTCTAATGGGATTTCTAGTAAATTTTGACT
TTGTTTCAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GG09TF U 1
AF RS1GG09JQ C 1
BS 1 623 RS1GG09TF
BS 624 729 RS1GG09JQ

RD RS1GG09TF 623 0 0
GGAAATCATATATCTTTTAGAGAATAGAGGATGACATGAGTTCGGTTCCCGAGTGATCGG
GCTCCCTTCCAGAAAAGATGGCTTCTTCAGTATCGTTTACCGGTTCTTGACTCTGTCATT
GCTCCTTATCCCTTGGTGTAGACGGTTGACTCTTTACTGGTTCATCCGGCGTTTATATTT
CTGCTGTTTTATTTTTCTTTTTGTTTTTTATATTTTCTTCTCCACTCCTAACCTCCATGT
TTAACCTCTAGATTCAGTTGGGTTTCGATTTTCATCGGAATGGTCTTTCCTTCCCCAGTT
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TTTCTGATGAATCGGATCGATTTCATGCAACTAAATCACCTTCTTCTTTGAAGTGATGGC
GGTCTTGCCCTCTTTTTCTGCTTGTGTTGTTACTCGGTGAGTGACATTCAGTTTCGTTGG
TTGGCCGCTTTGGCTTCCGGTGAGGACTTTCAAGGCGACGTATGTAGTCGATGTATTCCT
CTTTCGAAGCAGAGAGACGTGTCTCTCTTTCGTCTCATCAGAACATGTGGTGTTGTGGAG
TTGAGCTGGATAAGATTATTGGG

QA 1 623 1 623
DS 

RD RS1GG09JQ 729 0 0
GGAAATCATATATCTTTTAGAGAATAGAGGATGACATGAGTTCGGTTCCCGAGTGATCGG
GCTCCCTTCCAGAAAAGATGGCTTCTTCAGTATCGTTTACCGGTTCTTGACTCTGTCATT
GCTCCTTATCCCTTGGTGTAGACGGTTGACTCTTTACTGGTTCATCCGGCGTTTATATTT
CTGCTGTTTTATTTTTCTTTTTGTTTTTTATATTTTCTTCTCCACTCCTAACCTCCATGT
TTAACCTCTAGATTCAGTTGGGTTTCGATTTTCATCGGAATGGTCTTTCCTTCCCCAGTT
GTGGGCTGGTTCATCTTCGAACTTATCTGCATCAATAAAGATGATCATTTTGATTAGGAA
TTTCTGATGAATCGGATCGATTTCATGCAACTAAATCACCTTCTTCTTTGAAGTGATGGC
GGTCTTGCCCTCTTTTTCTGCTTGTGTTGTTACTCGGTGAGTGACATTCAGTTTCGTTGG
TTGGCCGCTTTGGCTTCCGGTGAGGACTTTCAAGGCGACGTATGTAGTCGATGTATTCCT
CTTTCGAAGCAGAGAGACGTGTCTCTCTTTCGTCTCATCAGAACATGTGGTGTTGTGGAG
TTGAGCTGGATAAGATTATTGGGCTTTCTTCTTGGACTTTTTTGGCTGGGCCTTTTTTAG
TTTTTGTAGTTTTCTTTTGTCTGTTTACCTTTCTAATGGGATTTCTAGTAAATTTTGACT
TTGTTTCAT

QA 1 729 1 729
DS 



AS 1 2

CO CL8806Contig1 972 2 8 U
CACACCTGGACACTTAAAAAGTGGATGGCGTTTAAGAAACTTGGTCTAAATCATTTGAAG
ATTTTGGTTTTCGATGAGGCTGACCATATGCTTGCTACGGATGGCTTTAGGGATGATTCC
TTGAGGATAATGAAAGACATTGAGAGAGTTAATCCCAATTACCAGGTTCTTCTCTTCTCG
GCAACTTTTAACGACAATGTCAAAGATTTTGTTCAGAGGACATTGAAGAAGAGCCCCAAC
CAACTCTTTGTAAAAAGAGAGGATCTAGCTTTAGACTCAGTTAAACAGTACAAAGTGGTT
TGCCCAAAGGAGCAAGACAAGATTGAAGTGATCAAGGATCAGATCATGGAGCTGGGGGAT
ATTGGCCAGACCATAATATTTGTGAAAACGAAGGTGTCAGCAAGCAAAGTGCACAAAGCT
CTTGCGGAAATGGGGTATGACGTCACAAGTGTTCATGGTAGCATGACTCAAGAGGAGAGA
GATAAGATAGTGAAGGAGTTCAAAGACTGCCTTACTCAAGTCCTCATTGCAACTGATGTC
CTTGCAAGAGGTTTTGACCAGCAACGGGTGAATTTGGTTGTCAACTATAACATGCCTACT
AAATATGAAACCGGGGAGCCAGATTATGAGGTTTACCTTCACAGAGTTGGAAGAGCTGGT
CGGTTTGGTCGTAAAGGGGCTGTGTTCAACCTCCTTCTTGAGAATGGGGATGATAAAGAG
GTGATGGAGAAGATAGAGCGCTACTTTGGAGCGCAAGTTAAGGAGATTAAGTCTTGGAAC
TCAGAGGAAGAGTACAAGAGTGCCCTCAAGGAAGCTGGCCTGCTTGATGAGTGAAAAGAA
TGAAGACAGACAGATGTTATTTAGAAAACGTTTAAGGGGCTTTTGGCTTTTTGTTGTCTA
AGATTTGCTGTTGTAATTTCATTTATCAGATTACAGAGAATTCAAACTTTGGTGTAGTTT
TGTTTTTGTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AG66TF U 1
AF RS1AG66JQ C 172
BS 1 550 RS1AG66TF
BS 551 551 RS1AG66JQ
BS 552 630 RS1AG66TF
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BS 653 665 RS1AG66TF
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RD RS1AG66TF 671 0 0
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TTGAGGATAATGAAAGACATTGAGAGAGTTAATCCCAATTACCAGGTTCTTCTCTTCTCG
GCAACTTTTAACGACAATGTCAAAGATTTTGTTCAGAGGACATTGAAGAAGAGCCCCAAC
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CTTGCAAGAG*TTTTGACCAGCAACGGGTGAATTTGGTTGTCAACTATAACATGCCTACT
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CGGTT
GGTCGT

QA 1 665 1 665
DS 

RD RS1AG66JQ 801 0 0
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AAAGTGGTTTGCCCAAAGGAGCAAGACAAGATTGAAGTGATCAAGGATCAGATCATGGAG
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CACAAAGCTCTTGCGGAAATGGGGTATGACGTCACAAGTGTTCATGGTAGCATGACTCAA
GAGGAGAGAGATAAGATAGTGAAGGAGTTCAAAGACTGCCTTACTCAAGTCCTCATTGCA
ACTGATGTCCTTGCAAGAGGTTTTGACCAGCAACGGGTGAATTTGGTTGTCAACTATAAC
ATGCCTACTAAATATGAAACCGGGGAGCCAGATTATGAGGTTTACCTTCACAGAGTTGGA
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GATAAAGAGGTGATGGAGAAGATAGAGCGCTACTTTGGAGCGCAAGTTAAGGAGATTAAG
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TGTTGTCTAAGATTTGCTGTTGTAATTTCATTTATCAGATTACAGAGAATTCAAACTTTG
GTGTAGTTTTGTTTTTGTCTT

QA 1 801 1 801
DS 



AS 1 2

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TGCTTCTACATCTGGCTCGGATGATATGATTGATATCCTCACTAATGATCCACAAGGGAT
TGGATTATCGTCGTGGAATACGTTAATCGATGCAAGTGGACAGACTCCATTTAGCTATGC
TGCAATGAGGAACAACCACAGTTACAACACCTTGGTGGCTCGCAAAATTGCAGACAAAAG
AAACGGTCAAATATCTCTAAACATCGAGAACGGGATCGATCAGATTGGTGTAGTGAGTAA
GAGGCTAAACTCAGAGATGAGATCTTGCAACACGTGTGCAAGCATGGCCCTTAAGTATCA
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TGTAGCATTTTTTTGTATAATTAAGTGTTGATTATTGCAAGAGAGTACAGAGAAGAAAAC
ATGTTGGGGGTCAAGAGTAGACATAGCTTCTCAACATCTGTGTTTTAAAAAAAAAATATA
TATATATTTTGGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DI64TF U 1
AF RS1DI64JQ C 94
BS 1 662 RS1DI64TF
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BS 664 706 RS1DI64TF
BS 707 854 RS1DI64JQ

RD RS1DI64TF 706 0 0
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GAGGCTAAACTCAGAGATGAGATCTTGCAACACGTGTGCAAGCATGGCCCTTAAGTATCA
GAAGAAGGTGTCAGGCACACGACGCTTGTTTCCAACTAGGATCATCCATTCGATGGTTGC
TGTTGCCACCGTTTGTGTCTGTGTTTGCGTGTTTATGCATGCTTTCCCTATCGTCAGACA
AG*CTCACACTTCAGTTGGGGAGGTCTTGATTATGGCTCGGTCTAA

QA 1 706 1 706
DS 

RD RS1DI64JQ 761 0 0
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TGGTGATATCACACCTCTGCATCTGGCTGCTTCTACATCTGGCTCGGATGATATGATTGA
TATCCTCACTAATGATCCACAAGGGATTGGATTATCGTCGTGGAATACGTTAATCGATGC
AAGTGGACAGACTCCATTTAGCTATGCTGCAATGAGGAACAACCACAGTTACAACACCTT
GGTGGCTCGCAAAATTGCAGACAAAAGAAACGGTCAAATATCTCTAAACATCGAGAACGG
GATCGATCAGATTGGTGTAGTGAGTAAGAGGCTAAACTCAGAGATGAGATCTTGCAACAC
GTGTGCAAGCATGGCCCTTAAGTATCAGAAGAAGGTGTCAGGCACACGACGCTTGTTTCC
AACTAGGATCATCCATTCGATGGTTGCTGTTGCCACCGTTTGTGTCTGTGTTTGCGTGTT
TATGCATGCTTTCCCTATCGTCAGACAAGGCTCACACTTCAGTTGGGGAGGTCTTGATTA
TGGCTCGGTCTAAAAAAAAGGCTACATTGTAGCATTTTTTTGTATAATTAAGTGTTGATT
ATTGCAAGAGAGTACAGAGAAGAAAACATGTTGGGGGTCAAGAGTAGACATAGCTTCTCA
ACATCTGTGTTTTAAAAAAAAAATATATATATATTTTGGCT

QA 1 761 1 761
DS 



AS 1 2

CO CL8808Contig1 809 2 1 U
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAACCAGTTCATTTTTGTGTTCATATAACGGCTTCC
TCTGAATCCACTGTGAAATTTGTTCCAGAAGAAGATAATTTCTTGCAGAGACATGTCGCC
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GCAATTGGATGTGGATATCTCTTGTCGGCATTCGCTTCTTTGTTCATCAACATGGGTCTT
AGCAGCAAAACTCGTCCGGGAAAAGGTTTCTCGCTCTCTTTTCCGATAGAGATTAAGAAT
ATCCACCTTGGCAAACATGGTAGCGATTCAGGCGTTTACGACAAGGATGGGAGGTTTGTG
GAATCGAAGTTCGAGGAGATATTTGCGAAGCATTCACATACACATCCCGATGCTTTGACG
GGCAAAGAACTCCAAGAACTCCTCGACTCAAACAAAGAAGCTAATGATCGTAAAGGAGCG
ATTGCTGCCTATACGGAGTGGAAAATCTTGCAATATTTATGCAAAGACAAGAACGGTTTG
TTGCACAAAGAAACAGTGAGAGCTGTCTACGATGGTTCTCTTTTTGAGAAACTCGAGAAA
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TGAATCTGTTTATTTATAAAACTTTGTACAAGTGAATTATGCTGTGAAGATTGCAATGTG
TTTGATTCTTTAAAAAATTATAGTTTTCTGTGTGTATTTGATTGAATATATACGTCAAAT
TAAAGATAATCATATTTCAATTTTCATAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
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AF RS1CR13TF U 1
AF RS1CR13JQ C 204
BS 1 809 RS1CR13TF

RD RS1CR13TF 809 0 0
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TCTGAATCCACTGTGAAATTTGTTCCAGAAGAAGATAATTTCTTGCAGAGACATGTCGCC
TTCTTCGACAGGAACAAAGATGGTATCGTTTATCCTTCAGAGACATTTCAAGGGTTTAGA
GCAATTGGATGTGGATATCTCTTGTCGGCATTCGCTTCTTTGTTCATCAACATGGGTCTT
AGCAGCAAAACTCGTCCGGGAAAAGGTTTCTCGCTCTCTTTTCCGATAGAGATTAAGAAT
ATCCACCTTGGCAAACATGGTAGCGATTCAGGCGTTTACGACAAGGATGGGAGGTTTGTG
GAATCGAAGTTCGAGGAGATATTTGCGAAGCATTCACATACACATCCCGATGCTTTGACG
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TTGCACAAAGAAACAGTGAGAGCTGTCTACGATGGTTCTCTTTTTGAGAAACTCGAGAAA
CAAACAGCCTCTAAGAAACATCCATGAAACACACCATTTTAAAACAAACTTGCACACCTG
TGAATCTGTTTATTTATAAAACTTTGTACAAGTGAATTATGCTGTGAAGATTGCAATGTG
TTTGATTCTTTAAAAAATTATAGTTTTCTGTGTGTATTTGATTGAATATATACGTCAAAT
TAAAGATAATCATATTTCAATTTTCATAG

QA 1 809 1 809
DS 

RD RS1CR13JQ 606 0 0
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AGGTTTCTCGCTCTCTTTTCCGATAGAGATTAAGAATATCCACCTTGGCAAACATGGTAG
CGATTCAGGCGTTTACGACAAGGATGGGAGGTTTGTGGAATCGAAGTTCGAGGAGATATT
TGCGAAGCATTCACATACACATCCCGATGCTTTGACGGGCAAAGAACTCCAAGAACTCCT
CGACTCAAACAAAGAAGCTAATGATCGTAAAGGAGCGATTGCTGCCTATACGGAGTGGAA
AATCTTGCAATATTTATGCAAAGACAAGAACGGTTTGTTGCACAAAGAAACAGTGAGAGC
TGTTTACGATGGTTTTCTTTTTGAGAAACTCGAGAAACAAACAGCCTTTAAGAAACATCC
ATGAAACACACCATTTTAAAACAAACTTGCACACCTGTGAATCTGTTTATTTATAAAACT
TTGTACAAGTGAATTATGCTGTGAAGATTGCAATGTGTTTGATTCTTTAAAAAATTATAG
TTTTCTGTGTGTATTTGATTGAATATATACGTCAAATTAAAGATAATCATATTTCAATTT
TCATAG

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 2

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CTTGAGTGGGAAGATGGATGAGAAGGCGAGTGAATTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1C764TF C 1
AF RS1C764JQ U 55
BS 1 54 RS1C764TF
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RD RS1C764TF 339 0 0
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TTCCTATAAACTCGAAATCGAAAATGAAGGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGCGTA
CTTGAGTGGGAAGATGGATGAGAAGGCGAGTGAATTCCC

QA 1 339 1 339
DS 

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TAATAGTAATTTTTTCACTAAAATAATAAATTTCATTGGGACAATATTTGACATCAACAA
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CAGTTCTTCCTATAAACTCGAAATCGAAAATGAAGGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGAG
AGCGTACTTGAG

QA 1 252 1 252
DS 



AS 1 2

CO CL8810Contig1 790 2 2 U
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TCTCCCTTTTTGCATCTACTCTTCTGTCTACACTTTGTTCTGCCTTGTTTGCTATGGTTC
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AAGTTTGTGAATCAACCACAATAAGTTTTTGAGTTGTTTCGTTTGGGTTATCCAAATCCA
ATTTTATTTTAACTAAATTTGAACAATTCAATTCAGATCATAACATTGTTGGGGAATAAA
TATTTTTATTTAGAACCAAAATACTTTTTGGATTTTCTCATATTTTAGGATTATTTTTTC
CTTTTTATTTTAATTAATGTTATTTATTATAATAATTTTTTTTTCAATAAAAATAAATTA
TACTTGGTCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FI75TF U 1
AF RS1FI75JQ C 102
BS 1 708 RS1FI75TF
BS 709 790 RS1FI75JQ

RD RS1FI75TF 719 0 0
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AGAAATATGACCAACATTAATGTTGCTGCCACGAAACCTTCTACCGCAAAGGTCCACCAA
TCTCCTAGCCTCCTACGTTCATGGTGGACAAACAATAACCTACGATACGATGCAGCTATG
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CCCTTGCCTGGATATTTTCTGGCATATTTTGGTTCGTTCTATTGTCTTTTCTGCCTGTGT
AGTTGCACGCTTTGGATTTTGGCAATCACAATTGTGTCATTATGCGAAGAAGCCCACATC
ATGGGACGATTTGGTCACAGCTTCGGGTTGCTTGTTTTCCTCTACCTCATCTACTGTATT
TCTCCCTTTTTGCATCTACTCTTCTGTCTACACTTTGTTCTGCCTTGTTTGCTATGGTTC
GTAGCCCGCTGGTTTGGACCTTGTCTCATTCAAGGAATGAAAGCAACACGAGATTGGTGG
AAGTTTGTGAATCAACCACAATAAGTTTTTGAGTTGTTTCGTTTGGGTTATCCAAATCCA
ATTTTATTTTAACTAAATTTGAACAATTCAATTCAGATCATAACATTGTTGGGGAATAAA
TATTTTTATTTAGAACCAAAATACTTTTTGGATTTTCTCATATTTTAG
ATTATTTCTCC

QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1FI75JQ 689 0 0
TACCGCAAAGGTCCACCAATCTCCTAGCCTCCTACGTTCATGGTGGACAAACAATAACCT
ACGATACGATGCAGCTATGAGCAGCCTTTTTATAATTCTCAACGCTGAGGCGATCTTGTA
TATGACAACCCACAAGATTCCCTTGCCTGGATATTTTCTGGCATATTTTGGTTCGTTCTA
TTGTCTTTTCTGCCTGTGTAGTTGCACGCTTTGGATTTTGGCAATCACAATTGTGTCATT
ATGCGAAGAAGCCCACATCATGGGACGATTTGGTCACAGCTTCGGGTTGCTTGTTTTCCT
CTACCTCATTTACTGTATTTCTCCCTTTTTGCATCTACTTTTCTGTCTACACTTTGTTTT
GCCTTGTTTGCTATGGTTCGTAGCCCGCTGGTTTGGACCTTGTTTCATTCAAGGAATGAA
AGCAACACGAGATTGGTGGAAGTTTGTGAATCAACCACAATAAGTTTTTGAGTTGTTTCG
TTTGGGTTATCCAAATCCAATTTTATTTTAACTAAATTTGAACAATTCAATTCAGATCAT
AACATTGTTGGGGAATAAATATTTTTATTTAGAACCAAAATACTTTTTGGATTTTTTCAT
ATTTTAGGATTATTTTTTCCTTTTTATTTTAATTAATGTTATTTATTATAATAATTTTTT
TTTCAATAAAAATAAATTATACTTGGTCG

QA 1 689 1 689
DS 



AS 1 2

CO CL8811Contig1 654 2 1 U
GGGAAAGGCTTAGAAATGGTGGTGACGTATTTCTCTTCAACTCCGCCTATCTTCTTCTTC
TCCTTTGGAGCTAATTCTCAGCTTTCATCTTCCAATCTCCATGGAGCATCACGATCCCTT
TGGCTTCCTCTTCCTCTTCTCTACTAAATGGACTAAGAAGACACCAAGATGCAAAGTTGG
TGGGAACAAGGGCCAGAGGTGGAGCAGTTCGTGTCCTAGCAAATCCAAATGGATCATCAT
CTCCTCCTCCAGGGAAAGTAAAGGCCAAAAAAGAAGTAATCATGGTAGACCCTCTTGAGG
CTAAGCGGCTAGCTGGTAAGCAAATGGAAGAGATCAAAGGCAGAGAGAGGCAACAGCGAA
GGCGTGAAATAGAGGCTATAAACGGAGCCTGGGCAATCATAGGCCTCCTGATAGGGCTTG
TGATCGAAGCTCAAACAGGAAAGGGTATTCTGGCTCAGTTGTCTGGCTATTGGTCTTCGG
CTCTGCATCTATTCCCTTCATCAACACAGAATCTCCCACCACAGTAAACAAAAAACCTTA
GACTATGTTTTGTTGAGTTTCATTTTGGTTTATTGCACTCTCTACTGTGATGAAAATTGA
TGTTGTTTATGTTAAGTTATTAACAGTGTCTTCTCCTTGGCAAGCGCATTCAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BH44TF U 1
AF RS1BH44JQ C 64
BS 1 654 RS1BH44TF

RD RS1BH44TF 654 0 0
GGGAAAGGCTTAGAAATGGTGGTGACGTATTTCTCTTCAACTCCGCCTATCTTCTTCTTC
TCCTTTGGAGCTAATTCTCAGCTTTCATCTTCCAATCTCCATGGAGCATCACGATCCCTT
TGGCTTCCTCTTCCTCTTCTCTACTAAATGGACTAAGAAGACACCAAGATGCAAAGTTGG
TGGGAACAAGGGCCAGAGGTGGAGCAGTTCGTGTCCTAGCAAATCCAAATGGATCATCAT
CTCCTCCTCCAGGGAAAGTAAAGGCCAAAAAAGAAGTAATCATGGTAGACCCTCTTGAGG
CTAAGCGGCTAGCTGGTAAGCAAATGGAAGAGATCAAAGGCAGAGAGAGGCAACAGCGAA
GGCGTGAAATAGAGGCTATAAACGGAGCCTGGGCAATCATAGGCCTCCTGATAGGGCTTG
TGATCGAAGCTCAAACAGGAAAGGGTATTCTGGCTCAGTTGTCTGGCTATTGGTCTTCGG
CTCTGCATCTATTCCCTTCATCAACACAGAATCTCCCACCACAGTAAACAAAAAACCTTA
GACTATGTTTTGTTGAGTTTCATTTTGGTTTATTGCACTCTCTACTGTGATGAAAATTGA
TGTTGTTTATGTTAAGTTATTAACAGTGTCTTCTCCTTGGCAAGCGCATTCAGC

QA 1 654 1 654
DS 

RD RS1BH44JQ 591 0 0
TTTGGAGCTAATTCTCAGCTTTCATCTTCCAATCTCCATGGAGCATCACGATCCCTTTGG
CTTCCTCTTCCTCTTCTCTACTAAATGGACTAAGAAGACACCAAGATGCAAAGTTGGTGG
GAACAAGGGCCAGAGGTGGAGCAGTTCGTGTCCTAGCAAATCCAAATGGATCATCATCTC
CTCCTCCAGGGAAAGTAAAGGCCAAAAAAGAAGTAATCATGGTAGACCCTCTTGAGGCTA
AGCGGCTAGCTGGTAAGCAAATGGAAGAGATCAAAGGCAGAGAGAGGCAACAGCGAAGGC
GTGAAATAGAGGCTATAAACGGAGCCTGGGCAATCATAGGCCTCCTGATAGGGCTTGTGA
TCGAAGCTCAAACAGGAAAGGGTATTCTGGCTCAGTTGTCTGGCTATTGGTCTTCGGCTC
TGCATCTATTCCCTTCATCAACACAGAATCTCCCACCACAGTAAACAAAAAACCTTAGAC
TATGTTTTGTTGAGTTTCATTTTGGTTTATTGCACTCTCTACTGTGATGAAAATTGATGT
TGTTTATGTTAAGTTATTAACAGTGTCTTCTCCTTGGCAAGCGCATTCAGC

QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 2

CO CL8812Contig1 821 2 4 U
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TTAGCCTTCACTTCTAATCCCGAAACGCTTCGAGTTACAGAGTCATTGCCTTTATCGCCT
TCTTACCTCCATAGACCGACGTGAACATGATCTGACATTAAATGCGACTTAACCCTCTGC
AAGTCGGTGTATTTTCACTTATAAAAGAAGTCCGGCTGCTGCTCCTCCTCCTTCCAGATA
AGAGGAGATCTAGATGTTGTGAACATATTTGTTGGCTTTCAGGTCTAAATGAGAGGAGAT
CGAGGAGAAGAAGATGGAGGTGTAGAAGAAGAGACCCAACGATTGGTGAGGATTGGGAGA
AGGAACTTTCAGTGTTGCAGGAACAGTTTAACCTCTCGACTGCCGAGAAGAACGAAGATG
GGAACGCCGTGGAGATACTCAGTCACTTCTCAAAGTTTCTAGATACTGCTGACGAAGAGA
AGGTTCAGCATGAGGATGCAATCAAGGAGCTTCGTGGGATTATCAGTGGGAAGGACGAGT
AGATTGCTCATCTCACCACAAAGATCTCAGAGCTTTTTTCGTCACAGAACGAGGACCAAT
TTGAGGCTGCAACTGATAGGATTCTGCTTTCTTTTAGTAATATGTTTGGGCAAAGACAGC
CGCAGAATGGCTCTTCTGTCTCTGAAAAAGATTTGCTCATCTGGAGAGTGGAGTTGCTTT
TTTAAGTGCTAAGTACACTGAGTTTTATTACGGTGCTTCAATAAGATAACACTTAATCTC
CTAATATTTATATGAACAAAAATTTACATTGCTCATCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FG83TF U 1
AF RS1FG83JQ C 233
BS 1 371 RS1FG83TF
BS 372 372 RS1FG83JQ
BS 373 415 RS1FG83TF
BS 416 821 RS1FG83JQ

RD RS1FG83TF 415 0 0
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TTAGCCTTCACTTCTAATCCCGAAACGCTTCGAGTTACAGAGTCATTGCCTTTATCGCCT
TCTTACCTCCATAGACCGACGTGAACATGATCTGACATTAAATGCGACTTAACCCTCTGC
AAGTCGGTGTATTTTCACTTATAAAAGAAGTCCGGCTGCTGCTCCTCCTCCTTCCAGATA
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CGAGGAGAAGAAGATGGAGGTGTAGAAGAAGAGACCCAACGATTGGTGAGGATTGGGAGA
AGGAACTTTCATTGTTGCAGGAACAGTTTAACCTCTCGACTGCCGAGAAGAACGA

QA 1 415 1 415
DS 

RD RS1FG83JQ 589 0 0
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GAGGAGATCGAGGAGAAGAAGATGGAGGTGTAGAAGAAGAGACCCAACGATTGGTGAGGA
TTGGGAGAAGGAACTTTCAGTGTTGCAGGAACAGTTTAACCTCTCGACTGCCGAGAAGAA
CGAAGATGGGAACGCCGTGGAGATACTCAGTCACTTCTCAAAGTTTCTAGATACTGCTGA
CGAAGAGAAGGTTCAGCATGAGGATGCAATCAAGGAGCTTCGTGGGATTATCAGTGGGAA
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GGACCAATTTGAGGCTGCAACTGATAGGATTCTGCTTTCTTTTAGTAATATGTTTGGGCA
AAGACAGCCGCAGAATGGCTCTTCTGTCTCTGAAAAAGATTTGCTCATCTGGAGAGTGGA
GTTGCTTTTTTAAGTGCTAAGTACACTGAGTTTTATTACGGTGCTTCAATAAGATAACAC
TTAATCTCCTAATATTTATATGAACAAAAATTTACATTGCTCATCTCCC

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 2

CO CL8813Contig1 913 2 4 U
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GACCACAGGGCTCAGTGGCTCAGGAAAAAGCACGTTGGCTTGCTCGCTAAGTAGAGAATT
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AGCCAAACTCTTTGCTGATGCTGGTTTGATCTGCATTGCCAGCCTCATATCTCCATACAG
GAAAGACCGTGATGCATGTAGGGAAATGATGCAGGGTTCATCTTTTATCGAGGTTTACAT
GAACATGTCTCTACAGCTATGTGAAGCAAGAGACCCTAAAGGCTTATACAAGCTTGCACG
TGCAGGAAAGATCAAAGGCTTTACAGGGATTGATGATCCATATGAATCTCCCTTGAATTG
TGAGATAGAGCTGAAAGAGAAGGAAGGAGAGTGTCCTTCACCTGTAGCAATGGCAGAGGA
AGTCATCGCTTATTTAGAAGACAAAGGCTTCCTTCAAAACCAGTAGTAGTAACCCCTCCA
CCACCATGAATCCAACAAAGTCACATTTGATTTGATTTTATTTATGTTTCTTTCACTCTC
CTGAAATAATGCATATCATAAAGAAGTTTGAACTATGAAAGACATGTTGTAGCTTTCTTC
CTTTGCAACTTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AF08TF U 1
AF RS1AF08JQ C 151
BS 1 682 RS1AF08TF
BS 683 683 RS1AF08JQ
BS 684 746 RS1AF08TF
BS 747 913 RS1AF08JQ

RD RS1AF08TF 752 0 0
GGAAAACAAAGGAACCAACTTATTCTTTGGGAAATTTCAAGAAGACTGGTCATGTTAATT
GTTTTTGAACGTGTGTTTGCCGATTAATAGCAGTTTCTAGTGTTAGATCAGATCAGATCA
GATCATCAGGGAAAGGTTTTATTTTTTTTTGAGAATGTCGACAAACATATTCTGGCAAGA
ATCACCCATTGGGAAAACTGAGAGGCAGAAGCTGATAAACCAGAAGGGTTGTGTGGTGTG
GACCACAGGGCTCAGTGGCTCAGGAAAAAGCACGTTGGCTTGCTCGCTAAGTAGAGAATT
GTACACCCGGGGAAAGCTATCATACATTCTTGACGGGGATAATCTTCGTCATGGTTTGAA
CAAAGATCTTGGTTTCAAGGCAGAGGATAGAGTGGAAAACATACGCAGAGTCGGAGAAGT
AGCCAAACTCTTTGCTGATGCTGGTTTGATCTGCATTGCCAGCCTCATATCTCCATACAG
GAAAGACCGTGATGCATGTAGGGAAATGATGCAGGGTTCATCTTTTATCGAGGTTTACAT
GAACATGTCTCTACAGCTATGTGAAGCAAGAGACCCTAAAGGCTTATACAAGCTTGCACG
TGCAGGAAAGATCAAAGGCTTTACAGGGATTGATGATCCATATGAATCTCCCTTGAATTG
TGAGATAGAGCTGAAAGAGAAG*AAGGAGAGTGTCCTTCACCTGTAGCAATGGCAGAGGA
AGTCATCGCTTATTTAGAAGACAAAG
CTTCCT

QA 1 746 1 746
DS 

RD RS1AF08JQ 763 0 0
GAGAATGTCGACAAACATATTCTGGCAAGAATCACCCATTGGGAAAACTGAGAGGCAGAA
GCTGATAAACCAGAAGGGTTGTGTGGTGTGGATCACAGGGCTCAGTGGCTCAGGAAAAAG
CACGTTGGCTTGCTCGCTAAGTAGAGAATTGTACACCCGGGGAAAGCTATCATACATTCT
TGACGGGGATAATCTTCGTCATGGTTTGAACAAAGATCTTGGTTTCAAGGCAGAGGATAG
AGTGGAAAACATACGCAGAGTCGGAGAAGTAGCCAAACTCTTTGCTGATGCTGGTTTGAT
CTGCATTGCCAGCCTCATATCTCCATACAGGAAAGACCGTGATGCATGTAGGGAAATGAT
GCAGGGTTCATCTTTTATCGAGGTTTACATGAACATGTCTCTACAGCTATGTGAAGCAAG
AGACCCTAAAGGCTTATACAAGCTTGCACGTGCAGGAAAGATCAAAGGCTTTACAGGGAT
TGATGATCCATATGAATCTCCCTTGAATTGTGAGATAGAGCTGAAAGAGAAGGAAGGAGA
GTGTCCTTCACCTGTAGCAATGGCAGAGGAAGTCATCGCTTATTTAGAAGACAAAGGCTT
CCTTCAAAACCAGTAGTAGTAACCCCTCCACCACCATGAATCCAACAAAGTCACATTTGA
TTTGATTTTATTTATGTTTCTTTCACTCTCCTGAAATAATGCATATCATAAAGAAGTTTG
AACTATGAAAGACATGTTGTAGCTTTCTTCCTTTGCAACTTAC

QA 1 763 1 763
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8815Contig1 910 2 6 U
GGAAGAAAACTCCGCTTATAGTCGTTTCTCATTGAACATTTTCTGACTCCGTCTTCCTCC
ACACCAAACACCAAACCATGGCGGCTTCTTCTCTGCAATCCCTAAAACCTACATTCCCCC
AAACCCTATCTTCTCCCAACACCTCTCCTCCCTTCCGATCTCCCTTCCTCAGATTCAACT
CCCCTCTCACTCCCAAACCCCTCGTCTCCCGCTCCTCCTCCTTCACCACCCGCTCCGCCG
CCGAGCCGCAGGAGAGAAAAACCTTCCACGGCCTCTGCTACGTCGTCGGCGACAACATCG
ACACGGACCAGATCATCCCCGCGGAGTACCTCACCCTCGTCCCCTCCAACCCCGACGAGT
ACGAGAAACTCGGCTCCTACGCCCTTATCGGTCTCCCTACCTCCTACTCGGACCGGTTCG
TCGAGCCCGGGGAGACGAAGACGAAGTACTCGATCATCATCGGCGGGGAGAACTTCGGGT
GCGGCTCGTCTCGCGAGCACGCGCCGGTGTGCTTGGGGGCGGCGGGGGCGAAGGCGGTTG
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CGCTTGATTCGGAGGTTAGGGTTTGCGATGAGTGTAGGACGGGTGACGTGGCGACGGTGG
AGTTGAGGGAAGGGGATAGTGTTTTGATTAATCATACGTCCGGGAAGGAGTATAAGCTGA
AGCCTATTGGTGACGCTGGGCCGGTGATTGACGCTGGTGGGTTCTTTGCTTATGCTAGGA
AAGCTGGCATGATTCCTTCTGCTGCTGCTGCTGCTCCTTGATTTGATTTGATTTCTCCCC
CCAGAGGGGGTAAATGCATATGTTTATGAGAGTTAATCTGCAAGGGTAGAGTAATTTTCT
GCCTCCATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A920TF U 1
AF RS1A920JQ C 183
BS 1 571 RS1A920TF
BS 572 572 RS1A920JQ
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BS 639 656 RS1A920TF
BS 657 910 RS1A920JQ

RD RS1A920TF 662 0 0
GGAAGAAAACTCCGCTTATAGTCGTTTCTCATTGAACATTTTCTGACTCCGTCTTCCTCC
ACACCAAACACCAAACCATGGCGGCTTCTTCTCTGCAATCCCTAAAACCTACATTCCCCC
AAACCCTATCTTCTCCCAACACCTCTCCTCCCTTCCGATCTCCCTTCCTCAGATTCAACT
CCCCTCTCACTCCCAAACCCCTCGTCTCCCGCTCCTCCTCCTTCACCACCCGCTCCGCCG
CCGAGCCGCAGGAGAGAAAAACCTTCCACGGCCTCTGCTACGTCGTCGGCGACAACATCG
ACACGGACCAGATCATCCCCGCGGAGTACCTCACCCTCGTCCCCTCCAACCCCGACGAGT
ACGAGAAACTCGGCTCCTACGCCCTTATCGGTCTCCCTACCTCCTACTCGGACCGGTTCG
TCGAGCCCGGGGAGACGAAGACGAAGTACTCGATCATCATCGGCGGGGAGAACTTCGGGT
GCGGCTCGTCTCGCGAGCACGCGCCGGTGTGCTTGGGGGCGGCGGGGGCGAAGGCGGTTG
TGGCGCAGTCGTACGCGAGGATCTTTTTCAG*AACTCGGTGGCGACGGGGGAGGTTTATC
CGCTTGATTCGGAGGTTAGGGTTTGCGATGAGTGTAG*ACGGGTGACGTGGCGACG
TGGAGT

QA 1 656 1 656
DS 

RD RS1A920JQ 728 0 0
CCTCTCACTCCCAAACCC*TCGTCTCCCGCTCCTCCTCCTTCACCACCCGCTCCGCCGCC
GAGCCGCAGGAGAGAAAAACCTTCCACGGCCTCTGCTACGTCGTCGGCGACAACATCGAC
ACGGACCAGATCATCCCCGCGGAGTACCTCACCCTCGTCCCCTCCAACCCCGACGAGTAC
GAGAAACTCGGCTCCTACGCCCTTATCGGTCTCCCTACCTCCTACTCGGACCGGTTCGTC
GAGCCCGGGGAGACGAAGACGAAGTACTCGATCATCATCGGCGGGGAGAACTTCGGGTGC
GGCTCGTCTCGCGAGCACGCGCCGGTGTGCTTGGGGGCGGCGGGGGCGAAGGCGGTTGTG
GCGCAGTCGTACGCGAGGATCTTTTTCAGGAACTCGGTGGCGACGGGGGAGGTTTATCCG
CTTGATTCGGAGGTTAGGGTTTGCGATGAGTGTAGGACGGGTGACGTGGCGACGGTGGAG
TTGAGGGAAGGGGATAGTGTTTTGATTAATCATACGTCCGGGAAGGAGTATAAGCTGAAG
CCTATTGGTGACGCTGGGCCGGTGATTGACGCTGGTGGGTTCTTTGCTTATGCTAGGAAA
GCTGGCATGATTCCTTCTGCTGCTGCTGCTGCTCCTTGATTTGATTTGATTTCTCCCCCC
AGAGGGGGTAAATGCATATGTTTATGAGAGTTAATCTGCAAGGGTAGAGTAATTTTCTGC
CTCCATTT

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

CO CL8816Contig1 1030 2 2 U
GGGAGATCCTTCTCCTTCGTCGTCTCAAGGCGATTCATATTCCTGCGTAACCATTTCCTA
ACTCGATCTCTTTGAACCCACTTTCTCTTCCGATGAAACACCTCCCCTTCCTGTAACGCC
TTAACTCTGTGATTCACACGTTCATTGGCAGATGTTGTGGGTTAAATACTCTCTGTGCAG
GGGTCTGATCTCAAGAAGAATGCCGCAACCACCAAAGTTGTGGTACATCTCTTAATTGAA
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CAGAACCAAACGAATCACCAACTGTGCTCAAATCAATGAGATGTTGACTGATGCTGCTTG
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TGAGGTTTTGGAACAAGAGATATTAAAGTTAAGCAATCAGATGCTTAAGTATAAGTTAGA
ATGTGAAAGGCTAAAAACACAACTGGAAGAAGAGAGAGGAAAACAGAAGGACAGGAGCAA
CTCCAGTTTACACCTGCAATTAAAAGGTAATCCACTCCATCAACTGCTGCAACCACGCTT
GCATTCAAACACTCTGGTGTCAATACTGGCTGGTGTCTAGCTCATGAATACTCATGAAAA
TTAGAACGAGGTGGAAGATCTCAAAAGTCAGATTGGGTTGCTAACCAATGAAAAGGACAG
TCTGCAGGTAAAATTCAACGAACAAGTTTTTCAGAACAACAAACTTATGGGAGAGATATC
TGAGCTCGAAGAAGGAACGCTTGTGAATGTTGTTCTTTTTTTCCTCTTAACATGTTAATC
GGGTATTTTACGAGTATGATGAATATAGTATGAATATAGTACGATGGTAATATTTAGGTA
ATGATTTTTTTCTCCTTGATCCGTCCATCACTTTTTTGGGGTAAACGTATAGTGATCAAG
TTTAACAACC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CR68TF U 1
AF RS1CR68JQ C 218
BS 1 782 RS1CR68TF
BS 783 1030 RS1CR68JQ

RD RS1CR68TF 782 0 0
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TTAACTCTGTGATTCACACGTTCATTGGCAGATGTTGTGGGTTAAATACTCTCTGTGCAG
GGGTCTGATCTCAAGAAGAATGCCGCAACCACCAAAGTTGTGGTACATCTCTTAATTGAA
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AAAATTTTCTTTTTGTCAGCATCATATTGAGGAATCAAAAGGAACTCTCCAATTTGCAAG
CAGAACCAAACGAATCACCAACTGTGCTCAAATCAATGAGATGTTGACTGATGCTGCTTG
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TGAGGTTTTGGAACAAGAGATATTAAAGTTAAGCAATCAGATGCTTAAGTATAAGTTAGA
ATGTGAAAGGCTAAAAACACAACTGGAAGAAGAGAGAGGAAAACAGAAGGACAGGAGCAA
CTCCAGTTTACACCTGCAATTAAAAGGTAATCCACTCCATCAACTGCTGCAACCACGCTT
GCATTCAAACACTCTGGTGTCAATACTGGCTGGTGTCTAGCTCATGAATACTCATGAAAA
TTAGAACGAGGTGGAAGATCTCAAAAGTCAGATTGGGTTGCTAACCAATGAAAAGGACAG
TC

QA 1 782 1 782
DS 

RD RS1CR68JQ 813 0 0
GTTGT
GTACATCTCTTAATTGAACCGTTGGTGTTA*TGAGAAGACTTGCATTATATGCACCATCG
CACTAGAAGAGGTGCAAGAAAATTTTCTTTTTGTCAGCATCATATTGAGGAATCAAAAGG
AACTCTCCAATTTGCAAGCAGAACCAAACGAATCACCAACTGTGCTCAAATCAATGAGAT
GTTGACTGATGCTGCTTGGTTAAAACGCCAAAAATTAGAGATAGAAGAACTACGGATGAA
GCTTCAGGGATCCCATGCTGAGGTTTTGGAACAAGAGATATTAAAGTTAAGCAATCAGAT
GCTTAAGTATAAGTTAGAATGTGAAAGGCTAAAAACACAACTGGAAGAAGAGAGAGGAAA
ACAGAAGGACAGGAGCAACTCCAGTTTACACCTGCAATTAAAAGGTAATCCACTCCATCA
ACTGCTGCAACCACGCTTGCATTCAAACACTCTGGTGTCAATACTGGCTGGTGTCTAGCT
CATGAATACTCATGAAAATTAGAACGAGGTGGAAGATCTCAAAAGTCAGATTGGGTTGCT
AACCAATGAAAAGGACAGTCTGCAGGTAAAATTCAACGAACAAGTTTTTCAGAACAACAA
ACTTATGGGAGAGATATCTGAGCTCGAAGAAGGAACGCTTGTGAATGTTGTTCTTTTTTT
CCTCTTAACATGTTAATCGGGTATTTTACGAGTATGATGAATATAGTATGAATATAGTAC
GATGGTAATATTTAGGTAATGATTTTTTTCTCCTTGATCCGTCCATCACTTTTTTGGGGT
AAACGTATAGTGATCAAGTTTAACAACC

QA 6 813 6 813
DS 



AS 1 2

CO CL8817Contig1 934 2 2 U
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TGACTCAGGAGCTTAAGGAGCTTGATTCCAGCAACTCTGACGCCGTTGAACGTATCAAAT
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ATCTCACATATTGAATTTCCAACCTGGAGAAGCCTTTGTTGTCAGAAACATTGCAAACAT
GGTTCCACCTTTCGACCAGAAGAGACATTCTGGCGTTGGTGCCGCCGTTGAATACGCAGT
TGTACATCTCAAGGTGGAGAATATTCTGGTGATAGGCCATAGCCGTTGCGGTGGGATTAA
GGGACTCATGTCCATTGAAGATGATGCTGCACCAACTAAGAGCGACTTTATAGAAAATTG
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TGAAGCTAAATGCACCGAGTGTGAGAAGGAAGCTGTGAATGTGTCGCTTGGAAACTTGCT
TTCATACCCATTTGTGAGAGCTGAAGTAGTGAAGAACACATTGGCGATAAGAGGAGCTCA
CTACAATTTCGTCAAAGGAACCTTCGATCTCTGGGAGCTCGATTTCAAGATCACTCCTGC
TTATGCCTTCTCTTGAAACATAATCTTGTGAGATTTGCGCGCTTTTGTCTCACAAAAGCT
TTGACTGCATCCTTTCTTTCTTCTCATGTTGATTCTGTTCTCAACTTTTTTTTTATCATT
TCCTTATTTCAGATTTTCAACTTTGCTGCTTCTGTTTCAAAAAGCTGTAAACAATAATAC
TCTGAACAACCTCTTAAGTTTTGTTATTTCGGCT


BQ
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AF RS1CG02TF U 1
AF RS1CG02JQ C 222
BS 1 674 RS1CG02TF
BS 675 934 RS1CG02JQ

RD RS1CG02TF 674 0 0
GGGATCTTCTCAGTAAGAAGGCAGATCTAGGGAACGTGGCCGCGGAGAAGATCAAAGAGT
TGACTCAGGAGCTTAAGGAGCTTGATTCCAGCAACTCTGACGCCGTTGAACGTATCAAAT
CCGGTTTCACCCACTTCAAAACTCAGAAATACTTGAAAGATAGTGCTCGGTTCAATGATC
TCGCCAAGGGTCAGAGCCCAAAGTTTCTGGTATTCGCCTGTTCTATTCTCGAGTGTGTCC
ATCTCACATATTGAATTTCCAACCTGGAGAAGCCTTTGTTGTCAGAAACATTGCAAACAT
GGTTCCACCTTTCGACCAGAAGAGACATTCTGGCGTTGGTGCCGCCGTTGAATACGCAGT
TGTACATCTCAAGGTGGAGAATATTCTGGTGATAGGCCATAGCCGTTGCGGTGGGATTAA
GGGACTCATGTCCATTGAAGATGATGCTGCACCAACTAAGAGCGACTTTATAGAAAATTG
GGTGAAGATCGGTGCATCAGCAAGGAACAAGATCAAGGAGGAACATCAAGGCCTAGATGA
TGAAGCTAAATGCACCGAGTGTGAGAAGGAAGCTGTGAATGTGTCGCTTGGAAACTTGCT
TTCATACCCATTTGTGAGAGCTGAAGTAGTGAAGAACACATTGGCGATAAGAGGAGCTCA
CTACAATTTCGTCA

QA 1 674 1 674
DS 

RD RS1CG02JQ 713 0 0
TCTATTCTCGAGTGTGTCCATCTCACATATTGAATTTCCAACCTGGAGAAGCCTTTGTTG
TCAGAAACATTGCAAACATGGTTCCACCTTTCGACCAGAAGAGACATTCTGGCGTTGGTG
CCGCCGTTGAATACGCAGTTGTACATCTCAAGGTGGAGAATATTCTGGTGATAGGCCATA
GCCGTTGCGGTGGGATTAAGGGACTCATGTCCATTGAAGATGATGCTGCACCAACTAAGA
GCGACTTTATAGAAAATTGGGTGAAGATCGGTGCATCAGCAAGGAACAAGATCAAGGAGG
AACATCAAGGCCTAGATGATGAAGCTAAATGCACCGAGTGTGAGAAGGAAGCTGTGAATG
TGTCGCTTGGAAACTTGCTTTCATACCCATTTGTGAGAGCTGAAGTAGTGAAGAACACAT
TGGCGATAAGAGGAGCTCACTACAATTTCGTCAAAGGAACCTTCGATCTCTGGGAGCTCG
ATTTCAAGATCACTCCTGCTTATGCCTTCTCTTGAAACATAATCTTGTGAGATTTGCGCG
CTTTTGTCTCACAAAAGCTTTGACTGCATCCTTTCTTTCTTCTCATGTTGATTCTGTTCT
CAACTTTTTTTTTATCATTTCCTTATTTCAGATTTTCAACTTTGCTGCTTCTGTTTCAAA
AAGCTGTAAACAATAATACTCTGAACAACCTCTTAAGTTTTGTTATTTCGGCT

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

CO CL8818Contig1 912 2 4 U
GGAGGACACGCCTATTGGAGCTATGCCCGGTTGCTACAGGCTTGGCTGGAGGCATGGCCT
TTTACAAGAGGTTGCAAAGGCTAGAGCTGTTGGTGTCAACAGCATCGTGTTGTTTCCCAA
AGTCCCCGAGGCTTTGAAGAATCCTACAGGGGATGAGGCATACAACGACAATGGTCTTGT
GCCTAGAACAATCCGTCTTCTCAAAGACAAGTATCCTGATCTTATTATCTACACTGATGT
TGCTCTGGATCCTTACTCATCCGACGGTCACGATGGTATAGTCAGAGAAGATGGTGTAAT
AATGAACGATGAAACTGTTCATCAGCTATGTAAGCAAGCTGTTTCTCAGGCCCGAGCTGG
AGCGGATGTTGTTAGTCCGAGTGATATGATGGATGGTCGAGTAGGCGCGATCCGTGCAGC
TCTCGATGCTGAAGGCTTTCAGAACGTCTCCATCATGTCTTACACCGCAAAGTACGCAAG
TTCGTTCTACGGGCCCTACCGTGAAGCTTTGGACAAATCTCCCTTGCCTATTGCTGCATA
CCAAGTGTCTGGGGAGTACTCGATGATCAAAGCTGGGGGAGTCCTGAAGATGATCGATGA
GGAGAAAGTGATGATGGAGTCGCTCATGTGCTTACGCAGAGCTGGTGCTGACATCATCCT
CACCTACTTTGCTCTTCGAGCTGCTACTTACCTATGCAACCAGAGGCGGTAGTAGAAGAG
ACAGAGAGAGATAAGAGAGTTTACTGGTTTGCATTTGAGTATTAACCATTTGAGCAATCA
TGATTTTTTGCCTTGTACTACTTTTCCCTTGCAAATCTCATGTCCTTATCCAACTTTGTT
TGGTCATGTTTCTTTGTATCACAAATGTGTTCCTCATTGATTTTTATTTAGAAGCATTGT
TTTGAGTTTTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A539TF U 1
AF RS1A539JQ C 244
BS 1 814 RS1A539TF
BS 815 815 RS1A539JQ
BS 816 867 RS1A539TF
BS 868 912 RS1A539JQ

RD RS1A539TF 867 0 0
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TTTACAAGAGGTTGCAAAGGCTAGAGCTGTTGGTGTCAACAGCATCGTGTTGTTTCCCAA
AGTCCCCGAGGCTTTGAAGAATCCTACAGGGGATGAGGCATACAACGACAATGGTCTTGT
GCCTAGAACAATCCGTCTTCTCAAAGACAAGTATCCTGATCTTATTATCTACACTGATGT
TGCTCTGGATCCTTACTCATCCGACGGTCACGATGGTATAGTCAGAGAAGATGGTGTAAT
AATGAACGATGAAACTGTTCATCAGCTATGTAAGCAAGCTGTTTCTCAGGCCCGAGCTGG
AGCGGATGTTGTTAGTCCGAGTGATATGATGGATGGTCGAGTAGGCGCGATCCGTGCAGC
TCTCGATGCTGAAGGCTTTCAGAACGTCTCCATCATGTCTTACACCGCAAAGTACGCAAG
TTCGTTCTACGGGCCCTACCGTGAAGCTTTGGACAAATCTCCCTTGCCTATTGCTGCATA
CCAAGTGTCTGGGGAGTACTCGATGATCAAAGCTGGGGGAGTCCTGAAGATGATCGATGA
GGAGAAAGTGATGATGGAGTCGCTCATGTGCTTACGCAGAGCTGGTGCTGACATCATCCT
CACCTACTTTGCTCTTCGAGCTGCTACTTACCTATGCAACCAGAGGCGGTAGTAGAAGAG
ACAGAGAGAGATAAGAGAGTTTACTGGTTTGCATTTGAGTATTAACCATTTGAGCAATCA
TGATTTTTTGCCTTGTACTACTTTTCCCTTGCAA*TCTCATGTCCTTATCCAACTTTGTT
TGGTCATGTTTCTTTGTATCACAAATG

QA 1 867 1 867
DS 

RD RS1A539JQ 669 0 0
TCTGGATCCTTACTCATCCGACGGTCACGATGGTATAGTCAGAGAAGATGGTGTAATAAT
GAACGATGAAACTGTTCATCAGCTATGTAAGCAAGCTGTTTCTCAGGCCCGAGCTGGAGC
GGATGTTGTTAGTCCGAGTGATATGATGGATGGTCGAGTAGGCGCGATCCGTGCAGCTCT
CGATGCTGAAGGCTTTCAGAACGTTTCCATCATGTTTTACACCGCAAAGTACGCAAGTTC
GTTTTACGGGCCCTACCGTGAAGCTTTGGACAAATTTCCCTTGCCTATTGCTGCATACCA
AGTGTTTGGGGAGTACTCGATGATCAAAGCTGGGGGAGTCCTGAAGATGATCGATGAGGA
GAAAGTGATGATGGAGTCGCTCATGTGCTTACGCAGAGCTGGTGCTGACATCATCCTCAC
CTACTTTGCTTTTCGAGCTGCTACTTACCTATGCAACCAGAGGCGGTAGTAGAAGAGACA
GAGAGAGATAAGAGAGTTTACTGGTTTGCATTTGAGTATTAACCATTTGAGCAATCATGA
TTTTTTGCCTTGTACTACTTTTCCCTTGCAAATTTCATGTCCTTATCCAACTTTGTTTGG
TCATGTTTCTTTGTATCACAAATGTGTTCCTCATTGATTTTTATTTAGAAGCATTGTTTT
GAGTTTTGT

QA 1 669 1 669
DS 



AS 1 2

CO CL8819Contig1 785 2 2 U
GGTGAAAAAGGAGTTTGGGCAGACTTGTGATTGGATAAAGAAACGATTGGGTGATAAGGT
TGCCAGAGTTCAAATTTCGAGCCGTCTGAGTTCATCTCCCTGTGTTCTTGTTTCTGGTAA
ATTTGGTTGGTCAGCCAACATGGAGAGGCTAATGAAGGCACAATCAGCTGGTGGTGACAC
AACAAGCCTAGAGTTCATGAAAGGGAGAAGAGTGTTTGAGATCAATCCTGAACACTCGAT
TATCAAGAGCATAAATGCTGCTTACAGGAGTAACCCAAATGATGAAGATGCCATGAGAGC
CATAGATCTTATGTATGATGCAGCACTGGTTTCTAGTGGGTTCACGCCTGAGAATCCAGC
AGAGCTCGGCGGGAAGATATATGAGATGATGGGTATTGCTCTTTCCGGGAAATGGTCAAG
CCCCGAGGTTCAGCAGCATATGGCACATTCTCACAATGCAGAACTCTTAGAAGCTGAAGT
GGTTGAGCCAGTGGAAGTAGATGGGAAGAGATGAACAGAAGCCTAATGTCCCCCGTCCTG
CAACGATTCTCAGTTTCTCATACCAGCATATTCTTTTTCTTTTAGTAGCAGCAGTATAAG
AACTCTAGAGTTTTACATTTTAGCATCAATAGGCAATAAGCCAATGGTATTATTCTCTAG
CTATTGTTGGACAGATTGAGAATGTTGAGCTTGCTGTTGAGTTTTCCCTAATAACCTAAT
TAGCGTTAACTGACTCGAGAGGACAAATCTTTTCTGTTTAAATAAAAAAATTGGGGTTTT
ACTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1DT36TF U 1
AF RS1DT36JQ C 131
BS 1 721 RS1DT36TF
BS 722 785 RS1DT36JQ

RD RS1DT36TF 721 0 0
GGTGAAAAAGGAGTTTGGGCAGACTTGTGATTGGATAAAGAAACGATTGGGTGATAAGGT
TGCCAGAGTTCAAATTTCGAGCCGTCTGAGTTCATCTCCCTGTGTTCTTGTTTCTGGTAA
ATTTGGTTGGTCAGCCAACATGGAGAGGCTAATGAAGGCACAATCAGCTGGTGGTGACAC
AACAAGCCTAGAGTTCATGAAAGGGAGAAGAGTGTTTGAGATCAATCCTGAACACTCGAT
TATCAAGAGCATAAATGCTGCTTACAGGAGTAACCCAAATGATGAAGATGCCATGAGAGC
CATAGATCTTATGTATGATGCAGCACTGGTTTCTAGTGGGTTCACGCCTGAGAATCCAGC
AGAGCTCGGCGGGAAGATATATGAGATGATGGGTATTGCTCTTTCCGGGAAATGGTCAAG
CCCCGAGGTTCAGCAGCATATGGCACATTCTCACAATGCAGAACTCTTAGAAGCTGAAGT
GGTTGAGCCAGTGGAAGTAGATGGGAAGAGATGAACAGAAGCCTAATGTCCCCCGTCCTG
CAACGATTCTCAGTTTCTCATACCAGCATATTCTTTTTCTTTTAGTAGCAGCAGTATAAG
AACTCTAGAGTTTTACATTTTAGCATCAATAGGCAATAAGCCAATGGTATTATTCTCTAG
CTATTGTTGGACAGATTGAGAATGTTGAGCTTGCTGTTGAGTTTTCCCTAATAACCTAAT
T

QA 1 721 1 721
DS 

RD RS1DT36JQ 655 0 0
TCAGCCAACATGGAGAGGCTAATGAAGGCACAATCAGCTGGTGGTGACACAACAAGCCTA
GAGTTCATGAAAGGGAGAAGAGTGTTTGAGATCAATCCTGAACACTCGATTATCAAGAGC
ATAAATGCTGCTTACAGGAGTAACCCAAATGATGAAGATGCCATGAGAGCCATAGATCTT
ATGTATGATGCAGCACTGGTTTCTAGTGGGTTCACGCCTGAGAATCCAGCAGAGCTCGGC
GGGAAGATATATGAGATGATGGGTATTGCTCTTTCCGGGAAATGGTCAAGCCCCGAGGTT
CAGCAGCATATGGCACATTCTCACAATGCAGAACTCTTAGAAGCTGAAGTGGTTGAGCCA
GTGGAAGTAGATGGGAAGAGATGAACAGAAGCCTAATGTCCCCCGTCCTGCAACGATTCT
CAGTTTCTCATACCAGCATATTCTTTTTCTTTTAGTAGCAGCAGTATAAGAACTCTAGAG
TTTTACATTTTAGCATCAATAGGCAATAAGCCAATGGTATTATTCTCTAGCTATTGTTGG
ACAGATTGAGAATGTTGAGCTTGCTGTTGAGTTTTCCCTAATAACCTAATTAGCGTTAAC
TGACTCGAGAGGACAAATCTTTTCTGTTTAAATAAAAAAATTGGGGTTTTACTAC

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 2

CO CL8820Contig1 850 2 4 U
GAACTCCAGCAATTTTATCATCTATTATTGTATCCAACACTCTAGAACTTCCAACATCAA
ATGCTCGGCGAAACACAAAGTCTGCTGACTTGACTTCTTCATCTGTGGGTTGTGGATTCC
TTCTGTCCTTTGAAATGCAAACAACAGAGCATTTTCCACAGATTGCTTCCTAGTGGAACA
AAGTCTTATCAGCAATGGTACAGAGGTCAACCATAGAAAAGAAGGAGCAATCAAGTTACC
AATGGGTTGACATTAGCGAGACCAGGACCTTCACCAGAAGCCAAAAACACTTCCTTTGCA
AGCACATCAGGGACTCTTTCAAGCAAATGCGGCGAGATCTCTGAAGGTCTGAAGAACCAG
AGAAGCTTGACTTGCCTCGGGTACTTCGCACGCTTATTAGCGTGTTCCCAAATTTTGATG
ATCTTGGCAACAAAGAGCTCGTGAGAGTCTGGTTCGTTGGGATCGCCAACTAAGACAGAG
TCGTAAAGAGAGTATTGAACACCGTCAAAGGTGAAAGATTCGTAGAACTGGACATCTTTA
TTTTTACCACCGACTCTTCTCTTTTTGCCCCACTTAAATTCTAAGCTTTCATCTCCCGCT
GCCTCTTCCATCTTTAAAGCAAGCAGTTTTGTACCTGGAACAAGCAGCAGAGTAGGAACT
ATGTGTCTTAGCTTTTGACAATAGGTACAAAAGCTAATCTATCTCAACAGTCAACAGACT
AAGCCATGATCATTAGCTTGGTGCATTAAACAAAACCATGCAATACACTGGAACAATGTG
CCATGACCAAACCATAAGTATTCAGGGCTCAAGACTAGTGTAAACCAAGGAATAAAGATG
CCAAATTGAG


BQ
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AF RS1EX07TF U 1
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AF RS1BA42JQ C 1
AF RS1BA42TF U 1
BS 1 595 RS1BA42TF

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QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 2

CO CL8822Contig1 854 2 4 U
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BQ
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AF RS1BF77TF U 1
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ATTGATCTACTTAACTCGTATAGAAACAGTTGTTAAGTCAAATCTCTGATTTATGTGTTA
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ATCCCAACATGGAAGAAGATTGTACAATGACATGTTCTATTTGAAAAAGTAATGATGAAA
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G*TCTGAGTTTGCTTGA

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AGAAACAGTTGTTAAGTCAAATCTCTGATTTATGTGTTACAGAAAAAAAGAGAGAGTCAA
ATCTCTGATTCTGTGAAGCCTTTTCTTTTCTCAGACCAAATCCCAACATGGAAGAAGATT
GTACAATGACATGTTCTATTTGAAAAAGTAATGATGAAACATGAAAGCTGGATCGTTGTT
GTTCTCGCTTTTTCTTTTACGTGGTGCCGTGGTGGTAAAGATGATCACTATCATTAGATC
AAATTATCTGTGGATAATTTTCATTTATTCTTTAAAGAAGGTCTGAGTTTGCTTGAGATG
AAGAAGAATAAATTGTTCCTTTACATTATAATTAGTCTTTACATTTCGTTACTCATTTCT
CATGTCATATTCTTTTTTTTTGGTGCAACTCATGTCATATTAAGCCCTTTCTC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1F001TF U 1
AF RS1F001JQ C 13
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DS 

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AGAATTTTTACCCGGTTTTGGGCAGGATCTATATATAATT

QA 1 640 1 640
DS 



AS 1 2

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BQ
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GGT
ACATCGTACTACTTGCTCC

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TTTGACTTGGTATGTTCTAATGACATGTTTGGTG

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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1AS44JQ C 1
AF RS1AS44TF U 1
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DS 

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QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 2

CO CL8826Contig1 855 2 2 U
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TGTGATAAGACCAGT


BQ
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AF RS1D896TF U 1
AF RS1D896JQ C 92
BS 1 682 RS1D896TF
BS 683 855 RS1D896JQ

RD RS1D896TF 682 0 0
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TCGAGAGGGTTTACGAGGAGTTGAAGAAAGGTGATGAGTCCGCGTTCAGCGAGGTTAGCA
TCGACGAGTTGAGGGCCTACGCTAGGGACGTGATGGAGAGAGAGATCGAAAAGCATGCCG
CTGATGGGCTCGGTAGAGTGGTGGGTTCGTGATGCAGCATTCGGATCCGTTTCTTGTTGG
GAAAGGGAGTAACTGGTTTGCGACAGCTAGTAGTAGACGTGCTCATACCGATGCGGTTAA
GATGTTGTCTCCGAGTTTCGGGGAGCCTGGACAGTGTTTTGCTCTGAAAGGTAGTAGTGG
CTATGTTCAAATCAGGCTGAGGGGACCGATTGTGCCTGAGGCTTTCACCTTGGAGCATGT
AGCTAAGAACGTGGCGTACGACAGATCGAGTGCTCCAAAAGATTGTGTCGTGTCAGGATG
GCTGCAAGGGAAAGGACAGGAATCCTCAGAGGAGACAGAGAAGATGCAACTTCTAGCGGA
GTTCACTTACGACCTAGACAGGTCAAACGCACAGACATTCAACGTCTTGGACTCATCAGA
CTCTGGTCTGGTGGATACTGTCAGGCTAGACTTCACCTCCAACCACGGAAGCGACTCTCA
TACTTGCATCTACCGGTTTAGG

QA 1 682 1 682
DS 

RD RS1D896JQ 764 0 0
TGATGAGTCCGCGTTCAGCGAGGTTAGCATCGACGAGTTGAGGGCCTACGCTAGGGACGT
GATGGAGAGAGAGATCGAAAAGCATGCCGCTGATGGGCTCGGTAGAGTGGTGGGTTCGTG
ATGCAGCATTCGGATCCGTTTCTTGTTGGGAAAGGGAGTAACTGGTTTGCGACAGCTAGT
AGTAGACGTGCTCATACCGATGCGGTTAAGATGTTGTCTCCGAGTTTCGGGGAGCCTGGA
CAGTGTTTTGCTCTGAAAGGTAGTAGTGGCTATGTTCAAATCAGGCTGAGGGGACCGATT
GTGCCTGAGGCTTTCACCTTGGAGCATGTAGCTAAGAACGTGGCGTACGACAGATCGAGT
GCTCCAAAAGATTGTGTCGTGTCAGGATGGCTGCAAGGGAAAGGACAGGAATCCTCAGAG
GAGACAGAGAAGATGCAACTTCTAGCGGAGTTCACTTACGACCTAGACAGGTCAAACGCA
CAGACATTCAACGTCTTGGACTCATCAGACTCTGGTCTGGTGGATACTGTCAGGCTAGAC
TTCACCTCCAACCACGGAAGCGACTCTCATACTTGCATCTACCGGTTTAGGGTTCATGGC
CGTGCGCCAGACCCAGCCTCTGTTGTGGAAACACAGCCTTGATTCACTGGAAGTGGATGA
ACCTCTTGTGTTTTTTGTAACATTCTCTTTTGTGCACATCTCTTTTGTTACCTGGTTTTT
TGGAAGAAAGGAAAGGAAGTATCAGAGTCTGTGATAAGACCAGT

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

CO CL8827Contig1 841 2 4 U
GCATGACATTCAAATCTCTGTCAGAACATACAAAATAATATGTCGATACGAAAATCTGAG
ACAACACATATAGTGATAACAATCTCATGCACAAACTTGCTCAAACATGAGAAGAGAAAA
GATGAACAACATCCCAATGCAAAACTGTATATCTTCAGTTTTGCATTGAATATAAAAGGG
TGCAACAAATACCTGTGGAAGATGCATACTTCAGCAATATATTGCAAGCGTTCATCAAAT
GCAGATAAATCCGAAAAATCTCCAGACAGCTGAATCTTCCTAGCCTCATCTGCTATTTCC
TTCATCTCCTTGTTCATTGACTTGTGCCAAAGCTTAATCTCATCAATTGGGTGCATCTGG
GCATCAAAAGAATCATGACTTGTAAGCTCTTGGTACTTTCTCTTCCCGACCTTGGATCCC
TCACATGCGCACTGTGCTCTACTAGTTTCGCAAGGAAGCATGCTGCTAGAAGAATCTATA
CAGCACTGGAACAGAGAATCTTCAATGCGACAACAAGCCGCAGTATCGCTTTTCCTTCCC
AACCAGGTGAAAATAACCTTCAAGAATGACCAAAAAAAACATCACACCACAACTCCAAAA
GCCACTCAACTTTTTAAAGTCGGATCTTTAGTTCAAAAACTTACCTGCTGAAGGAGCTTC
TCGTCTGGAACAATCTTGCTTAAACACGACTGCATCTCCTTGCTTTCATCGACTGAAATG
GAGGAAGCAAGCCACGGAAGAAAAACGGCAAGCATGTTCACAGGAATGCTGCAGAGAAAC
CGCCAGACTATGTAAGCTTGCTCCTCATGCTTAAATTTCTCAATAAGTAACGGGAACACC
T


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RS1E630TF U 1
AF RS1E630JQ C 295
BS 1 653 RS1E630TF
BS 654 654 RS1E630JQ
BS 655 718 RS1E630TF
BS 719 841 RS1E630JQ

RD RS1E630TF 718 0 0
GCATGACATTCAAATCTCTGTCAGAACATACAAAATAATATGTCGATACGAAAATCTGAG
ACAACACATATAGTGATAACAATCTCATGCACAAACTTGCTCAAACATGAGAAGAGAAAA
GATGAACAACATCCCAATGCAAAACTGTATATCTTCAGTTTTGCATTGAATATAAAAGGG
TGCAACAAATACCTGTGGAAGATGCATACTTCAGCAATATATTGCAAGCGTTCATCAAAT
GCAGATAAATCCGAAAAATCTCCAGACAGCTGAATCTTCCTAGCCTCATCTGCTATTTCC
TTCATCTCCTTGTTCATTGACTTGTGCCAAAGCTTAATCTCATCAATTGGGTGCATCTGG
GCATCAAAAGAATCATGACTTGTAAGCTCTTGGTACTTTCTCTTCCCGACCTTGGATCCC
TCACATGCGCACTGTGCTCTACTAGTTTCGCAAGGAAGCATGCTGCTAGAAGAATCTATA
CAGCACTGGAACAGAGAATCTTCAATGCGACAACAAGCCGCAGTATCGCTTTTCCTTCCC
AACCAGGTGAAAATAACCTTCAAGAATGACCAAAAAAAACATCACACCACAACTCCAAAA
GCCACTCAACTTTTTAAAGTCGGATCTTTAGTTCAAAAACTTACCTGCTGAAG*AGCTTC
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QA 1 718 1 718
DS 

RD RS1E630JQ 547 0 0
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ATCTGGGCATCAAAAGAATCATGACTTGTAGGCTCTTGGTACTTTTTTTTCCCGACCTTG
GATCCCTCACATGCGCACTGTGCTTTACTAGTTTCGCAAGGAAGCATGCTGCTAGAAGAA
TCTATACAGCACTGGAACAGAGAATTTTCAATGGGACAACAAGCCGCAGTATCGCTTTTC
CTTCCCAACCAGGTGAAAATAACCTTCAAGAATGACCAAAAAAAACATCACACCACAACT
CCAAAAGCCACTCAACTTTTTAAAGTCGGATCTTTAGTTCAAAAACTTACCTGCTGAAGG
AGCTTTTCGTCTGGAACAATCTTGCTTAAACACGACTGCATCTCCTTGCTTTCATCGACT
GAAATGGAGGAAGCAAGCCACGGAAGAAAAACGGCAAGCATGTTCACAGGAATGCTGCAG
AGAAACCGCCAGACTATGTAAGCTTGCTCCTCATGCTTAAATTTCTCAATAAGTAACGGG
AACACCT

QA 1 547 1 547
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8829Contig1 1141 2 4 U
GGACATCAACTCAGATCTCTCTTTGTATCTACTCCTCCACCAGATTTGACCTCAAGTTCG
GTCTCCTAGCTAGAAAAAAAAAGCTTATCTTACAGTGTCACTAACTCCGATAATCTAGAC
ACCATTAAAGCCCCAAGAATCAGATTCTCTCTCACGAGAATTCAAAAACTTGGATCCGAG
AGCAAGTGAGGTAGCTTAGCTTAAGCTGCAATGGCTGGATTCACTATGAGCTTGAATCTA
CTTCTACTAGTAGCTATGGTAGCTACCAACATCCTCTCTCTCTACCACCTCTCCTCCACC
ACCAACTTCTTCCAATCCACCCTCAAATCCTCACCCTCCTCCGTCCCCACTGTCCCCGAC
CACCTCCTCCGCCAGCTCCACACCATCCGCGCCGCCATCAACCACCTCACAAACCACCCG
GACAAATCATCAACCTCAGCCGCCTCCACCGTCTCCTCCTCCTCCTCCTCAGCTCCGCCG
AAAGATCTCCTCCTCTACTCCAAGCTCTCCCCGATAGCCTCCGCTTGCCACAACCACCCC
GACCTCCTCCACCAGTACATGAACTACGCTCCTTACTCCCTCTGCCCCTTCGACGGGGTG
GTGGATTTGGTGAGGTGCGGGAGGGCGGTGAACCGGTGGATCCCGGTTACGGTTATGGAG
TTTTTCTTGTTCGATTTGGACCGGGTTTTGAGAGGCGGGGGTTATCTCTGGTTGGATCGG
TTCTTTAGCAAGAAGGTTGATCTTGAGAATGTGTATGGGCCGATGATCGGGAAGCTGGGG
TACAAGAAGGTGAAATGGGCTGTGGCGAACAAGGTGGATTCGAAGCATGGTGAAGTTTTC
TTGACGGCTCTGCTTCAGAAACCTGTTGCAAGATGATGAACAAGGGCAATTTCCTCGAAC
GTGTATGTTTGTACTTTGTAGCAAACAGCTTACTGTTGTTGAAGATTTGGGAAAGAAGAT
TCTTGGAACGAACAATTACAGATAATGAAGCTTTTTCCAGCTGTAAGCACTTCTGCAAAA
CAGTAGTGATTTTAATATGTTTTTTTTTAATCTATTGTGTAACAGGTACTGATTAGTTAT
ACATAACTTATGGCTTCTTTCTGTCATAGCTTATATCATTATATGCATTCATATTATTCG
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RS1GG04TF U 1
AF RS1GG04JQ C 568
BS 1 651 RS1GG04TF
BS 652 652 RS1GG04JQ
BS 653 688 RS1GG04TF
BS 689 1141 RS1GG04JQ

RD RS1GG04TF 691 0 0
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GTCTCCTAGCTAGAAAAAAAAAGCTTATCTTACAGTGTCACTAACTCCGATAATCTAGAC
ACCATTAAAGCCCCAAGAATCAGATTCTCTCTCACGAGAATTCAAAAACTTGGATCCGAG
AGCAAGTGAGGTAGCTTAGCTTAAGCTGCAATGGCTGGATTCACTATGAGCTTGAATCTA
CTTCTACTAGTAGCTATGGTAGCTACCAACATCCTCTCTCTCTACCACCTCTCCTCCACC
ACCAACTTCTTCCAATCCACCCTCAAATCCTCACCCTCCTCCGTCCCCACTGTCCCCGAC
CACCTCCTCCGCCAGCTCCACACCATCCGCGCCGCCATCAACCACCTCACAAACCACCCG
GACAAATCATCAACCTCAGCCGCCTCCACCGTCTCCTCCTCCTCCTCCTCAGCTCCGCCG
AAAGATCTCCTCCTCTACTCCAAGCTCTCCCCGATAGCCTCCGCTTGCCACAACCACCCC
GACCTCCTCCACCAGTACATGAACTACGCTCCTTACTCCCTCTGCCCCTTCGACGGGGTG
GTGGATTTGGTGAGGTGCGGGAGGGCGGTGAACCGGTGGATCCCGGTTACG*TTATGGAG
TTTTTCTTGTTCGATTTGGACCGGGTTT
GAG

QA 1 688 1 688
DS 

RD RS1GG04JQ 574 0 0
GCTCCTTACTCCTTCTGCCCCTTCGACGGGGTGGTGGATTTGGTGAGGTGCGGGAGGGCG
GTGAACCGGTGGATCCCGGTTACGGTTATGGAGTTTTTCTTGTTCGATTTGGACCGGGTT
TTGAGAGGCGGGGGTTATCTCTGGTTGGATCGGTTCTTTAGCAAGAAGGTTGATCTTGAG
AATGTGTATGGGCCGATGATCGGGAAGCTGGGGTACAAGAAGGTGAAATGGGCTGTGGCG
AACAAGGTGGATTCGAAGCATGGTGAAGTTTTCTTGACGGCTCTGCTTCAGAAACCTGTT
GCAAGATGATGAACAAGGGCAATTTCCTCGAACGTGTATGTTTGTACTTTGTAGCAAACA
GCTTACTGTTGTTGAAGATTTGGGAAAGAAGATTCTTGGAACGAACAATTACAGATAATG
AAGCTTTTTCCAGCTGTAAGCACTTCTGCAAAACAGTAGTGATTTTAATATGTTTTTTTT
TAATCTATTGTGTAACAGGTACTGATTAGTTATACATAACTTATGGCTTCTTTCTGTCAT
AGCTTATATCATTATATGCATTCATATTATTCGC

QA 1 574 1 574
DS 



AS 1 2

CO CL8830Contig1 1198 2 6 U
TTTTTGAGGGGATATGCTTCGACTATCATCTCTGAAATCGACTACACTCGTTTTCATCTT
CGTCTCTCCGGCGGCAAGAGAGAGGCTTCCTCCCTCAAGATATTCAGGCGGCAGAGATGA
CCGCGATGACGAATTCGGGGTTTGAAGGAGTTGAGAAGCGGTTGGAGATCGTCTTCAAGA
AACAGGCGATAGGAGAGTCATCATTACGGGCGATGTTAACCGAAGATGTTTAACATGTTA
TACTGAAGCCGGTGGACTGCAAGATCGAGTACAACCTGCTTTCTCCAAGTGTTGATACAT
ACCTTCTCTCTGCCTCTAGCTTGTTCGTGTTTTGATGATTGGGTGGTTATTAAGACATGC
GGTAATACGGAGATATTCAAAGCTATCTATTTGATTCTGTTACACTACAGGCCAAATCCA
GTTGCGGTCAAATTCACCCGAGGAACCTATATCTGGCCAGAGCACCAACCCTTTCCCCAC
CAGAGTTTTGAAACAGAAGTATTCAAGTTGCGCGAACTCTTGCCTCTCGAAGATGTAATG
ACAGAGAAATTGGGCTGTCCCAGAAATATATTTCATGTTATTGCTGCTGCTGCACCATGG
CTGATCTTTCACTTTCCTCCCCTCCCAGCCTTCGTTCAACGGTGGAGATCTTGATGACGA
GTTTAGACAAATCCAAGTCATCCGTCTTCTTTCAAGAGAGCCTACGTGGACCCATGATCA
CCGCGTCTGGTATAGACAGACTTTTTCCCGGATCCAAAATTTCAGACATGGAGTTCCCGG
GCTGTGGCTATTCAATGAATGGTATTGTCGGTGGTGGATCTGTGTATACGATTCATGTTG
CTCCTGAAGAAGGGTTCAGCTTTGCCAGCTTTGAACTTTGTCAATATCAGCATGATGATG
TGGACCTCGGTTTATTGGTGGAATCCGTGGTCTTTTGCTTTGATCCTGCTCACTTCACGG
TTGCCGTCGTGGGCTCTTCTAAGTTTTCTGGAGAGTTGATTCTCAAGAATAGAGTTGTTC
GATGCAAAGAGATCAAAGTTAGGTGCTTGGGGCACAGTTGATTATTACTTTTTCTGATAT
GCTAGTAATTATATGATTGATGTTCTTGCTCTTATATAATGATATGATGATTTTTCCCTC
TGTCTCTCTCTCAAAACTGTTGTATGCCATTTTGTGATATATACGCACTGAACTGGCC


BQ
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AF RS1H631TF U 1
AF RS1H631JQB C 617
BS 1 694 RS1H631TF
BS 695 695 RS1H631JQB
BS 696 712 RS1H631TF
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BS 714 745 RS1H631TF
BS 746 1198 RS1H631JQB

RD RS1H631TF 753 0 0
TTTTTGAGGGGATATGCTTCGACTATCATCTCTGAAATCGACTACACTCGTTTTCATCTT
CGTCTCTCCGGCGGCAAGAGAGAGGCTTCCTCCCTCAAGATATTCAGGCGGCAGAGATGA
CCGCGATGACGAATTCGGGGTTTGAAGGAGTTGAGAAGCGGTTGGAGATCGTCTTCAAGA
AACAGGCGATAGGAGAGTCATCATTACGGGCGATGTTAACCGAAGATGTTTAACATGTTA
TACTGAAGCCGGTGGACTGCAAGATCGAGTACAACCTGCTTTCTCCAAGTGTTGATACAT
ACCTTCTCTCTGCCTCTAGCTTGTTCGTGTTTTGATGATTGGGTGGTTATTAAGACATGC
GGTAATACGGAGATATTCAAAGCTATCTATTTGATTCTGTTACACTACAGGCCAAATCCA
GTTGCGGTCAAATTCACCCGAGGAACCTATATCTGGCCAGAGCACCAACCCTTTCCCCAC
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ACAGAGAAATTGGGCTGTCCCAGAAATATATTTCATGTTATTGCTGCTGCTGCACCATGG
CTGATCTTTCACTTTCCTCCCCTCCCAGCCTTCGTTCAACGGTGGAGATCTTGATGACGA
GTTTAGACAAATCCAAGTCATCCGTCTTCTTTCA*GAGAGCCTACGTGGACC*ATGATCA
CCGCGTCTGGTATAGACAGACTTTT
CCCGGATC

QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1H631JQB 582 0 0
CTCCCCTCCCAGCCTTCGTTCAACGGTGGAGATCTTGATGACGAGTTTAGACAAATCCAA
GTCATCCGTCTTCTTTCAAGAGAGCCTACGTGGACCCATGATCACCGCGTCTGGTATAGA
CAGACTTTTTCCCGGATCCAAAATTTCAGACATGGAGTTCCCGGGCTGTGGCTATTCAAT
GAATGGTATTGTCGGTGGTGGATCTGTGTATACGATTCATGTTGCTCCTGAAGAAGGGTT
CAGCTTTGCCAGCTTTGAACTTTGTCAATATCAGCATGATGATGTGGACCTCGGTTTATT
GGTGGAATCCGTGGTCTTTTGCTTTGATCCTGCTCACTTCACGGTTGCCGTCGTGGGCTC
TTCTAAGTTTTCTGGAGAGTTGATTCTCAAGAATAGAGTTGTTCGATGCAAAGAGATCAA
AGTTAGGTGCTTGGGGCACAGTTGATTATTACTTTTTCTGATATGCTAGTAATTATATGA
TTGATGTTCTTGCTCTTATATAATGATATGATGATTTTTCCCTCTGTCTCTCTCTCAAAA
CTGTTGTATGCCATTTTGTGATATATACGCACTGAACTGGCC

QA 1 582 1 582
DS 



AS 1 2

CO CL8831Contig1 612 2 2 U
CGTTGGAGTTTCTGTTGATGGACAAAAACTTGCTGAACATCTTCTTAGGTCGGCCAGGGA
TTGCACAGAAAGCCTTAAACCGAGATGGAGTTCTTCCTCCTCCTTGGTTCATAAACCTCT
CGTCTATCTCTTCATCTTCAGCTAACTTGCTTCTCAGTGTCCCTGAGAGCTTTGACTTGG
GAGATTTGAGAACAGACACGCTCCACTGATCTTCCGGTCCTGCCATGCTTGTGGTCGTGC
TGAAAGCTGCTGCACTTGGATTAGAAGGATCAATGTTGTGTGCCGCAAGGAGCGCTTTGA
TGTTGCTTGGAAGCTCGGTCATTTTGACTTCACCGTTGTTGGTAGCTGCAGCGGCTCGCG
CCTGCTCATAGAAAAGGACTTGAACCACAACTCTCAGCGGAAGCATCTCGTTCTGCGCCG
CGTGCATACACGCTTCCATCGATAGTTTCTTGCAGTCCAAGACTCTGCAAATTCTTTTTC
TTTCTGATTTATTCAGACTCTTGTGAGCCTTGAGATATATGTCAATGGCTCTGTAGAGAT
CATCATGATCAAGCCTAGAAAACTCAGGGACACTCTCAGCTAAACTAACAAACTTTGAGA
GCGGTAGGCTCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CB62TF C 1
AF RS1CB62JQ U 21
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DS 

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TGAACCACAACTCTCAGCGGAAGCATCTCGTTCTGCGCCGCGTGCATACACGCTTCCATC
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QA 1 592 1 592
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GA32TF U 1
AF RS1GA32JQ C 86
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DS 

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QA 1 755 1 755
DS 



AS 1 2

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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1C115JQ U 1
AF RS1GB22JQ U 20
BS 1 396 RS1C115JQ
BS 397 397 RS1GB22JQ
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RD RS1C115JQ 655 0 0
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TATGTTCAAACACTCTTGTCCATCGGAGTTTCTCTTGGTCTTAACCAGCTCGCGATCTTT
AAACTCCGTGAGATGAGAGTTGAGAGTCACTTGACTGCTCACAAAGAAGCGTTCACGTGA
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TAT**TGGCGGTTTGGGCCGTGCTTCCCTGTGCAAGAACCAATGGGAAGAGCACGCCTTC
CACCTTGTATGGTGCGAATGTTGGAACGTGGTGCCATAGCCAGTTAAACTGTTTGTGCAC
CATTTTCTTGTCCCACAATAATGGAGCGTTGACATGGTCAATGGAGGCAATAATGCGTAT
GTGCGAGAAGGAAGCAAGGTGGGCGAGAGTTTGCTGTGATTCAGGATCCCTTAGA

QA 1 655 1 655
DS 

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GTTCAAGCAAAAAGATAAATCATATCACAGACAATTTGATACAACTGAGGCTACTGACTG
AGATCAAGCAAGAGCTGTCGAAGTGCATCCGGAGAGAGAGGTATGTTCAAACACTCTTGT
CCATCGGAGTTTCTCTTGGTCTTAACCAGCTCGTGATCTTTAAACTCCGTGAGATGAGAG
TTGAGAGTCACTTGACTGCTCACAAAGAAGCGTTCACGTGAGGCTGAATAAAGATCTTCA
GTGGGCATACCGTCTTCGTCCGGGTGAGCAAGTTGGTAGTCAGCGAGAATCTTGAAGACG
TTCTGAGCGTTTGGTGTGAGACTCTGTAAGACAATGGCCGCTGTTTTGGCGGTTTGGGCC
GTGCTTCCCTGTGCAAGAACCAATGGGAAGAACACGCCTTCGACCTTGTATGGTGCGAAT
GTTGGAACGTGGTGCCATAGCCAGTTAAACTGTTTGTGCACCATTTTCTTGTCCCACAAT
AATGGAGCGTTGACATGGTCAATGGAGGCAATAATGCGTATGTGCGAGAAGGAAGCAAGG
TGGGCGAGAGTTTGCTGTGAT

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 2

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CTACAGAATGATGAGGAGTTCATTGGCTTTATATTCTTCATTGATTATGTTCCTTCCCTT
ATTACTCGCCTTTACCATTTTCATCTGAAAATCATGGAAACACAGCCCAAACGTTTATGA
TGACATCCTGGAGACAGAGTTTTTCACAAAACCGCGACGCTCTTCGAATTTTCATTAGGA
AAGGTGGTGGTGGTGGTGTTGGTAAGGGCCTTCGCGTCCATACATCGGCTTCCACTCGGC
CTTCTCTTTCCGTAACATTTGGTTTCGGTTCCACGGTCACGAGCTTGATGTTGTTGATGT
TCTTCTCCTTCTAGTTTGAAAATTTTTGAGCTTCAATTCAAGCGTTGTGAAGTTTTTATA
CATTGTAACGGTGTATTAATTGTTTTTTTTCTAATCATATGGGCTGATCATTGTAAAATC
CGGAAACACATAAAAGTTACCGTGGTAGCTTCTATATATGTAATTGTTAAATTTTTCCAA
ATTTTTTCGTAATCAACCGAAACTGCCAAGTGGCGGTACGTTAATACC


BQ
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AF RS1B882JQ C 1
AF RS1B882TF U 1
BS 1 588 RS1B882TF

RD RS1B882JQ 588 0 0
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ATTACTCGCCTTTACCATTTTCATCTGAAAATCATGGAAACACAGCCCAAACGTTTATGA
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AAGGTGGTGGTGGTGGTGTTGGTAAGGGCCTTCGCGTCCATACATCGGCTTCCACTCGGC
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TCTTCTCCTTCTAGTTTGAAAATTTTTGAGCTTCAATTCAAGCGTTGTGAAGTTTTTATA
CATTGTAACGGTGTATTAATTGTTTTTTTTCTAATCATATGGGCTGATCATTGTAAAATC
CGGAAACACATAAAAGTTACCGTGGTAGCTTCTATATATGTAATTGTTAAATTTTTCCAA
ATTTTTTCGTAATCAACCGAAACTGCCAAGTGGCGGTACGTTAATACC

QA 1 588 1 588
DS 

RD RS1B882TF 588 0 0
GGAACTCAATTCATTTTGTAGAATAAAATCCCATTTTGTTCTCCGATTTGTTTGGATCAA
CTACAGAATGATGAGGAGTTCATTGGCTTTATATTCTTCATTGATTATGTTCCTTCCCTT
ATTACTCGCCTTTACCATTTTCATCTGAAAATCATGGAAACACAGCCCAAACGTTTATGA
TGACATCCTGGAGACAGAGTTTTTCACAAAACCGCGACGCTCTTCGAATTTTCATTAGGA
AAGGTGGTGGTGGTGGTGTTGGTAAGGGCCTTCGCGTCCATACATCGGCTTCCACTCGGC
CTTCTCTTTCCGTAACATTTGGTTTCGGTTCCACGGTCACGAGCTTGATGTTGTTGATGT
TCTTCTCCTTCTAGTTTGAAAATTTTTGAGCTTCAATTCAAGCGTTGTGAAGTTTTTATA
CATTGTAACGGTGTATTAATTGTTTTTTTTCTAATCATATGGGCTGATCATTGTAAAATC
CGGAAACACATAAAAGTTACCGTGGTAGCTTCTATATATGTAATTGTTAAATTTTTCCAA
ATTTTTTCGTAATCAACCGAAACTGCCAAGTGGCGGTACGTTAATACC

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 2

CO CL8835Contig1 696 2 4 U
GGCATTTGCTTCTTATCCAAATTTTATTCTTTCAAAACTACTTCGCTTTTTTGTTTTCAT
ATCAAGAACAATAAGTTTGATGGTCCGAGAAACAGTAATTAATAAGTAAACGTTGTTTTG
TGATTCCACAGGAAAATGGAAGATTCAACTTTCACGGATTTGATGATCGATACTGATGAG
TATCTGGTTGATGATTGGGAACAAGAGTTCCCGGTGATACCCGGAGAAACTACTGATCAT
CAGAGCACAAAACCGGGTTGTGAATCCGAATACGGGTTCAGTTTGATACCCGAGATCAGG
CCAACAAAGCAAATGAAAGTCAACTCAACATCTTCCTCTTCTCTATCATCATCTTCTTCT
TCTTGTGGTACGCTCACAGCAGCACAAGTGATTTCGTTCGGTTCTCAAGACCCGAAGATG
AACGTGGTCGAGGCATCATTTAACTTCTCCAACGAAGCAAACATGGAACAGAACGTGAGG
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GCTCTTCTTCCTGGCCTCAAAAAGGTGGACAAAGCAAGTGTTCTTGAAGACGCGATCAAA
CATTTGAAGAAACTTCAAGAACGTGTAAAGAAGTTG


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AS78TF U 1
AF RS1EA82TF U 31
BS 1 613 RS1AS78TF
BS 614 614 RS1EA82TF
BS 615 622 RS1AS78TF
BS 623 696 RS1EA82TF

RD RS1AS78TF 628 0 0
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ATCAAGAACAATAAGTTTGATGGTCCGAGAAACAGTAATTAATAAGTAAACGTTGTTTTG
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TATCTGGTTGATGATTGGGAACAAGAGTTCCCGGTGATACCCGGAGAAACTACTGATCAT
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TCTTGTGGTACGCTCACAGCAGCACAAGTGATTTCGTTCGGTTCTCAAGACCCGAAGATG
AACGTGGTCGAGGCATCATTTAACTTCTCCAACGAAGCAAACATGGAACAGAACGTGAGG
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GCTCTTCTTCCTGTCCTCAAAA
GGCGGA

QA 1 622 1 622
DS 

RD RS1EA82TF 666 0 0
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AACAGTAATTAATAAGTAAACGTTGTTTTGTGATTCCACAGGAAAATGGAAGATTCAACT
TTCACGGATTTGATGATCGATACTGATGAGTATCTGGTTGATGATTGGGAACAAGAGTTC
CCGGTGATACCCGGAGAAACTACTGATCATCAGAGCACAAAACCGGGTTGTGAATCCGAA
TACGGGTTCAGTTTGATACCCGAGATCAGGCCAACAAAGCAAATGAAAGTCAACTCAACA
TCTTCCTCTTCTCTATCATCATCTTCTTCTTCTTGTGGTACGCTCACAGCAGCACAAGTG
ATTTCGTTCGGTTCTCAAGACCCGAAGATGAACGTGGTCGAGGCATCATTTAACTTCTCC
AACGAAGCAAACATGGAACAGAACGTGAGGTCCAAAAGAAAAGAGTGTGGTAATAATGGA
GGAAAAAGAGAGCCACATCTATTGAAAGAACATGTTTTGGCTGAACGTAAACGTAGACAA
AAGCTCAACGAACGTTTAATTGCTCTCTCTGCTCTTCTTCCTGGCCTCAAAAAGGTGGAC
AAAGCAAGTGTTCTTGAAGACGCGATCAAACATTTGAAGAAACTTCAAGAACGTGTAAAG
AAGTTG

QA 1 666 1 666
DS 



AS 1 2

CO CL8836Contig1 657 2 1 U
GGCATTTCAACAAAGCAACACCAATCAGAAGAAGAGTGTCATCATCTTTCTTTCAGACAA
TGGCTTCCACTGCTCTCTCCAGCGCCATCGTAAGCACATCATTCCTCCGCCGCAAGCAGA
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CCTCCTCCTTCACCGCTCGCGTCACAGCCATGGCCGCCTACAAGGTCAAGTTCATCACAC
CGGATGGAGATAAGGAAGTGGAGTGCGACAAAAGCGAATACGTCCTCGACGCGGCGGAGG
AGTCCGGAATCTATTTGCCGTACTCGTGCCGTGCGGGAGCCTGCTCGAGCTGCGCCGGGA
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CCGAGGGTTTTGTTCTCACGTGCATCGCTCGTCCAACTTCTGATGTCGTTATTCGAACCC
ACCAGGAAGAAGCCATGGCTTAAATAACTCAAAAAGTATTTCACTTTCTATCTATCATCA
CACTAGAGAGAATATGTTGATGATGTAATAAGAAAGAATAAGACTCATGTCAATTCTTTT
TCGATACTCTGTTTCAGTGTTACAGTATTTTAACGTGGATGTCAAGTAATTACAACT


BQ
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AF RS1GE55TF U 1
AF RS1GE55JQ C 71
BS 1 657 RS1GE55TF

RD RS1GE55TF 657 0 0
GGCATTTCAACAAAGCAACACCAATCAGAAGAAGAGTGTCATCATCTTTCTTTCAGACAA
TGGCTTCCACTGCTCTCTCCAGCGCCATCGTAAGCACATCATTCCTCCGCCGCAAGCAGA
CACCGATCAGCCTCAGATCTCTCCCGGCGGGCAACACACAATCCCTCTTCGGCCTCAAAT
CCTCCTCCTTCACCGCTCGCGTCACAGCCATGGCCGCCTACAAGGTCAAGTTCATCACAC
CGGATGGAGATAAGGAAGTGGAGTGCGACAAAAGCGAATACGTCCTCGACGCGGCGGAGG
AGTCCGGAATCTATTTGCCGTACTCGTGCCGTGCGGGAGCCTGCTCGAGCTGCGCCGGGA
AAGTAGTCTCCGGCTCGGTTGACCAGTCGGACCAGAGCTTCTTAGACGACGACCAGGTCG
CCGAGGGTTTTGTTCTCACGTGCATCGCTCGTCCAACTTCTGATGTCGTTATTCGAACCC
ACCAGGAAGAAGCCATGGCTTAAATAACTCAAAAAGTATTTCACTTTCTATCTATCATCA
CACTAGAGAGAATATGTTGATGATGTAATAAGAAAGAATAAGACTCATGTCAATTCTTTT
TCGATACTCTGTTTCAGTGTTACAGTATTTTAACGTGGATGTCAAGTAATTACAACT

QA 1 657 1 657
DS 

RD RS1GE55JQ 587 0 0
TGCTCTCTCCAGCGCCATCGTAAGCACATCATTCCTCCGCCGCAAGCAGACACCGATCAG
CCTCAGATCTCTCCCGGCGGGCAACACACAATCCCTCTTCGGCCTCAAATCCTCCTCCTT
CACCGCTCGCGTCACAGCCATGGCCGCCTACAAGGTCAAGTTCATCACACCGGATGGAGA
TAAGGAAGTGGAGTGCGACAAAAGCGAATACGTCCTCGACGCGGCGGAGGAGTCCGGAAT
CTATTTGCCGTACTCGTGCCGTGCGGGAGCCTGCTCGAGCTGCGCCGGGAAAGTAGTCTC
CGGCTCGGTTGACCAGTCGGACCAGAGCTTCTTAGACGACGACCAGGTCGCCGAGGGTTT
TGTTCTCACGTGCATCGCTCGTCCAACTTCTGATGTCGTTATTCGAACCCACCAGGAAGA
AGCCATGGCTTAAATAACTCAAAAAGTATTTCACTTTCTATCTATCATCACACTAGAGAG
AATATGTTGATGATGTAATAAGAAAGAATAAGACTCATGTCAATTCTTTTTCGATACTCT
GTTTCAGTGTTACAGTATTTTAACGTGGATGTCAAGTAATTACAACT

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 2

CO CL8837Contig1 804 2 2 U
GATAGCTCTCCACCGCCACCATACTATTCACCATCCCCTAAAGTTCTTTACAAATCTCCA
CCACACCCACATGCATGTGTCTGCCCACCACCTCCTCCATGTTATGCTCCTTCACCAAAA
GTAATATACAAGTCTCCTCCTCCACCATATGTTTACAACTCTCCGCCACCACCATATTAC
TCACCTTCTCCTAAAGTGTACTACAAGTCTCCTCCACCACCATATGTCTACAACTCTCCA
CCTCCACCACCATACTACTCTCCATCCCCTAAAGTAGACTACAAGTCTCCTCCACCTCCA
TATGTTTACAGTTCTCCACCACCACCATACTACTCACCTTCCCCTAAGGTGTACTACAAG
TCTCCTCCACCACCATATGTCTACAACTCTCCACCACCACCATATTACTCACCTTCCCCT
AAGGTTTACTACAAGTCTCCTCCACCACCATATGTCTACAACTCTCCACCCCCACCACTA
TACTACTCTCCATCCCCTAAAGTAGACTACAAGTCTCCTCCACCTCCATATGTCTACAAT
TCTCCACCACCACCTTATTATTCTCCTTCTCCAAAAGTTGAATATAAATCTCCACCACCA
CCAGCTACATATTACTGAAAACCAGTAAATGTGACCCTTAAATGAGCAATTGAATGTTAT
TTGATTTCATATTTGATTTCTTTTCTTGTTGTAACATGCATGTATGCAATCAATTTCAAT
TTTCTTGGAATATCTTAATAATTTGGTTACAAGTCCTTCATATGGTTTTGTGTGTGTTAT
TTATCTACATAGTGAACTTTTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CL49TF U 1
AF RS1CL49JQ C 257
BS 1 690 RS1CL49TF
BS 691 804 RS1CL49JQ

RD RS1CL49TF 690 0 0
GATAGCTCTCCACCGCCACCATACTATTCACCATCCCCTAAAGTTCTTTACAAATCTCCA
CCACACCCACATGCATGTGTCTGCCCACCACCTCCTCCATGTTATGCTCCTTCACCAAAA
GTAATATACAAGTCTCCTCCTCCACCATATGTTTACAACTCTCCGCCACCACCATATTAC
TCACCTTCTCCTAAAGTGTACTACAAGTCTCCTCCACCACCATATGTCTACAACTCTCCA
CCTCCACCACCATACTACTCTCCATCCCCTAAAGTAGACTACAAGTCTCCTCCACCTCCA
TATGTTTACAGTTCTCCACCACCACCATACTACTCACCTTCCCCTAAGGTGTACTACAAG
TCTCCTCCACCACCATATGTCTACAACTCTCCACCACCACCATATTACTCACCTTCCCCT
AAGGTTTACTACAAGTCTCCTCCACCACCATATGTCTACAACTCTCCACCCCCACCACTA
TACTACTCTCCATCCCCTAAAGTAGACTACAAGTCTCCTCCACCTCCATATGTCTACAAT
TCTCCACCACCACCTTATTATTCTCCTTCTCCAAAAGTTGAATATAAATCTCCACCACCA
CCAGCTACATATTACTGAAAACCAGTAAATGTGACCCTTAAATGAGCAATTGAATGTTAT
TTGATTTCATATTTGATTTCTTTTCTTGTT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1CL49JQ 548 0 0
ACTCTCCATCCCCTAAAGTAGACTACAAGTCTCCTCCACCTCCATATGTTTACAGTTCTC
CACCACCACCATACTACTCACCTTCCCCTAAGGTGTACTACAAGTCTCCTCCACCACCAT
ATGTCTACAACTCTCCACCACCACCATATTACTCACCTTCCCCTAAGGTTTACTACAAGT
CTCCTCCACCACCATATGTCTACAACTCTCCACCCCCACCACTATACTACTCTCCATCCC
CTAAAGTAGACTACAAGTTTCCTCCACCTCCATATGTCTACAATTCTCCACCACCACCTT
ATTATTCTCCTTTTCCAAAAGTTGAATATAAATCTCCACCACCACCAGCTACATATTACT
GAAAACCAGTAAATGTGACCCTTAAATGAGCAATTGAATGTTATTTGATTTCATATTTGA
TTTCTTTTCTTGTTGTAACATGCATGTATGCAATCAATTTCAATTTTCTTGGAATATCTT
AATAATTTGGTTACAAGTCCTTCATATGGTTTTGTGTGTGTTATTTATCTACATAGTGAA
CTTTTCAG

QA 1 548 1 548
DS 



AS 1 2

CO CL8838Contig1 853 2 4 U
GGCCTTACCAGAAATTGCGCAGAGAGAAAGATATTTCAGGAACTAGGAAGGTCTTTGTCG
AGAAAACAGATATGAGGGCAAAAAGAATGGCAAGGAAAGCTGGAGCCCTGGTTATATTCG
TGGTTGACGCAAGTGGCAGCATGGCGTTGAATCGTATGCAAAACGCCAAAGGTGCTGCAC
TCAAACTGCTTGCAGAGAGCTATACAAGCAGGGATCAGGTAGCGATTATTCCATTCAGAG
GAGATGCTGCGGAAGTGCTATTGCCCCCATCTAGATCAATTGCAATGGCAAGAAATCGTC
TTGAGAGACTTCCTTGTGGTGGTGGTTCTCCTCTTGCCCATGGTCTAACAACGGCGGTAA
GAGTGGGACTTAACGCAGAGAAGAGTGGTGATGTGGGGCGTATAATGATTGTTGCAATAA
CCGATGGTCGAGCCAACATTACGCTGAAAAGATCAACTGATCCAGAGGGTATTGCCCCAG
ATGCTCCTAGACCCTCCTCACAAGAATTGAAGGATGAGATTCTGGAAGTTGCAGGGAAGA
TATACAAGGCTGGGATGTCTCTACTAGTGATAGATACAGAGAACAAGTTTGTCTCAACTG
GTTTTGCCAAGGAGATTGCAAGAGTTGCTCAAGGAAAATATTATTACTTGCCAAATGCTT
CAGATGCAGTCATCTCGGCTACCACTAAAGATGCTTTATCAGCTCTGAAGAACTCTTAGA
CCTTCACTTTGTCTGCAATACTTGGTTTATGATTCCGGTTTACATTTTGTACATTCTAAT
TTCCTTTTTTGACCCAACTAAACCAACATTTCATTCATCAAATATGGAAACGATATAGAG
TGAAATGAAATGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GC82TF U 1
AF RS1GC82JQ C 163
BS 1 708 RS1GC82TF
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RD RS1GC82TF 725 0 0
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TCAAACTGCTTGCAGAGAGCTATACAAGCAGGGATCAGGTAGCGATTATTCCATTCAGAG
GAGATGCTGCGGAAGTGCTATTGCCCCCATCTAGATCAATTGCAATGGCAAGAAATCGTC
TTGAGAGACTTCCTTGTGGTGGTGGTTCTCCTCTTGCCCATGGTCTAACAACGGCGGTAA
GAGTGGGACTTAACGCAGAGAAGAGTGGTGATGTGGGGCGTATAATGATTGTTGCAATAA
CCGATGGTCGAGCCAACATTACGCTGAAAAGATCAACTGATCCAGAGGGTATTGCCCCAG
ATGCTCCTAGACCCTCCTCACAAGAATTGAAGGATGAGATTCTGGAAGTTGCAGGGAAGA
TATACAAGGCTGGGATGTCTCTACTAGTGATAGATACAGAGAACAAGTTTGTCTCAACTG
GTTTTGCCAAGGAGATTGCAAGAGTTGCTCAAGGAAAATATTATTACTTGCCAAATGCTT
CAGATGCAGTCATCTCGGCTACCACTAAAGATGCTTTATCAGCTCTGA*GAACTCTTAGA
CCTTC

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1GC82JQ 691 0 0
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CGATTATTCCATTCAGAGGAGATGCTGCGGAAGTGCTATTGCCCCCATCTAGATCAATTG
CAATGGCAAGAAATCGTCTTGAGAGACTTCCTTGTGGTGGTGGTTCTCCTCTTGCCCATG
GTCTAACAACGGCGGTAAGAGTGGGACTTAACGCAGAGAAGAGTGGTGATGTGGGGCGTA
TAATGATTGTTGCAATAACCGATGGTCGAGCCAACATTACGCTGAAAAGATCAACTGATC
CAGAGGGTATTGCCCCAGATGCTCCTAGACCCTCCTCACAAGAATTGAAGGATGAGATTC
TGGAAGTTGCAGGGAAGATATACAAGGCTGGGATGTCTCTACTAGTGATAGATACAGAGA
ACAAGTTTGTCTCAACTGGTTTTGCCAAGGAGATTGCAAGAGTTGCTCAAGGAAAATATT
ATTACTTGCCAAATGCTTCAGATGCAGTCATCTCGGCTACCACTAAAGATGCTTTATCAG
CTCTGAAGAACTCTTAGACCTTCACTTTGTCTGCAATACTTGGTTTATGATTCCGGTTTA
CATTTTGTACATTCTAATTTCCTTTTTTGACCCAACTAAACCAACATTTCATTCATCAAA
TATGGAAACGATATAGAGTGAAATGAAATGT

QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

CO CL8839Contig1 925 2 12 U
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CTTGAGTGAAGCAGATGAAAGGGCTGTCAAAGAATTACAAGAAACAGAAAGTAAACTCTC
AACGGAGGAAAGGAATTGTGGATTACCTGCCGATGCAAATAAGTATCATGCATTAAGGCA
CTTAGTCGTTCAGCTGTTGCTTCAAATACTTCTCCATCCGGGAGAGTTCTCTGAAGCTGC
AAGTGAACTTTCAGTATGCTGTGTCAAAGCTTTCAGTTCCTCTACTGATCTTTTGAGTAG
TGATGGCGAAGGTGAGGCTGACGGTGAAGAAGAACCAGCAGTCATGGATGTCCTCGTGGA
CACATTACTTTCTCTCTTGCCACATTCTTCAGCTCCAATGCGATCTTCCATTGAGCAGGT
TTTCAAGTACTTTTGTCAAGATGTTACCGATGATGGGCTGCTGAGAATGCTACGTGTGAT
CAAGAAAGATCTAAAACCGGCTAGACATCAGGAGGACCAAGACTCTGAGGATCTTGACGA
TGATGAAGATCTTCTAGCTATCGAAGAGGAAGAAGAAGAAGAAAATGATGAAATGGGTGA
GACTGGTGAGAGCGACGATCCAACCGATGACTCTGAAACAGTTGCTGGCGTTGCCCGAAT
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TGATGATGGTATGGATGACGATGCAATGTTCCGTATGGACACTTATTTGGCACAGATATT
CAAGGAGAAGAGGAATCAAGCTGGCGGCGAAACTGCTCAGTCCCAGCTTGTTTTGTTTAA
ACTACGTGTCCTCTCTCTTCTCGAAATCTACCTTCATGAAAATCCAGGTAATCCTCAAGT
TATGACAGTGTACTTAAACTTAGCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DQ92TF U 1
AF RS1AK21TF U 218
BS 1 251 RS1DQ92TF
BS 252 252 RS1AK21TF
BS 253 267 RS1DQ92TF
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BS 269 567 RS1DQ92TF
BS 568 568 RS1AK21TF
BS 569 583 RS1DQ92TF
BS 584 584 RS1AK21TF
BS 585 636 RS1DQ92TF
BS 637 637 RS1AK21TF
BS 638 711 RS1DQ92TF
BS 712 925 RS1AK21TF

RD RS1DQ92TF 713 0 0
GTACTTCATGAAGTTCCTTAGCACGCTGCAGAGCATTCCCTCGGTTTCTCTCTTCCGTTC
CTTGAGTGAAGCAGATGAAAGGGCTGTCAAAGAATTACAAGAAACAGAAAGTAAACTCTC
AACGGAGGAAAGGAATTGTGGATTACCTGCCGATGCAAATAAGTATCATGCATTAAGGCA
CTTAGTCGTTCAGCTGTTGCTTCAAATACTTCTCCATCCGGGAGAGTTCTCTGAAGCTGC
AAGTGAACTTTTAGTATGCTGTGTCAA*GCTTTCAGTTCCTCTACTGATCTTTTGAGTAG
TGATGGCGAAGGTGAGGCTGACGGTGAAGAAGAACCAGCAGTCATGGATGTCCTCGTGGA
CACATTACTTTCTCTCTTGCCACATTCTTCAGCTCCAATGCGATCTTCCATTGAGCAGGT
TTTCAAGTACTTTTGTCAAGATGTTACCGATGATGGGCTGCTGAGAATGCTACGTGTGAT
CAAGAAAGATCTAAAACCGGCTAGACATCAGGAGGACCAAGACTCTGAGGATCTTGACGA
TGATGAAGATCTTCTAGCTATCGAAGATGAAGAAGAAGAAGAAGATGATGAAATGGGTGA
GACTGGTGAGAGCGACGATCCAACCGATGACTCTGATACAGTTGCTGGCGTTGCCCGAAT
GGCAGTTGACAGAGAGGTTCCTGAAAATTCGGATGCTTCTGATGACTCTGA
GA

QA 1 711 1 711
DS 

RD RS1AK21TF 708 0 0
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CTGCTGAGAATGCTACGTGTGATCAAGAAAGATCTAAAACCGGCTAGACATCAGGAGGAC
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ACAGTTGCTGGCGTTGCCCGAATGGCAGTTGACAGAGAGGTTCCTGAAAATTCGGATGCT
TCTGATGACTCTGAAGAAGAAGATGATGATGGTATGGATGACGATGCAATGTTCCGTATG
GACACTTATTTGGCACAGATATTCAAGGAGAAGAGGAATCAAGCTGGCGGCGAAACTGCT
CAGTCCCAGCTTGTTTTGTTTAAACTACGTGTCCTCTCTCTTCTCGAAATCTACCTTCAT
GAAAATCCAGGTAATCCTCAAGTTATGACAGTGTACTTAAACTTAGCT

QA 1 708 1 708
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8841Contig1 553 2 1 U
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AACTCATGGCAAGTGCTCGTCGTCACCACCACCAGCAACATCTTCACCATCGCCGCGAAA
CCCAAGATGATGACCCTGTCATGAAGAAGAAGAGGATCTTGACCTACATCAATTGCTGTA
TCAGGCCAAACTAGAGTCTTTGTTCCACAAAATTGAAATCTCAGTGATGTTAAAATACGT
CTCAAAAACATCATTGTTCTGTAATCTATATGTGTCATCGGTTAAGACACTCCTGATTGA
TGTATACATTTTGAGTTTCTGTATTCACTTCTGATATATATGAGAGTAAGATAACGTGAA
TCATATATTTGTC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1FX87JQ C 1
AF RS1FX87TF U 1
BS 1 553 RS1FX87TF

RD RS1FX87JQ 553 0 0
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AACTCATGGCAAGTGCTCGTCGTCACCACCACCAGCAACATCTTCACCATCGCCGCGAAA
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TCAGGCCAAACTAGAGTCTTTGTTCCACAAAATTGAAATCTCAGTGATGTTAAAATACGT
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TGTATACATTTTGAGTTTCTGTATTCACTTCTGATATATATGAGAGTAAGATAACGTGAA
TCATATATTTGTC

QA 1 553 1 553
DS 

RD RS1FX87TF 553 0 0
GGGTCCCTCACCATGATGAACGAATTCATCAATGTTTAAGAACCTCTTTCTTCTAAACCA
AGCAATATCTATTTATGGAAAAGAGGAGAGAGAATGCTGGATGGACTCCAGTTCCCCAGT
TCGGAGGTTGGGACCAAAAAGGAATAGACGCAACAGACTACTCGGTTGTGTTTAAAAAGG
CTCGCGCAAACAGGAAGCTGAACAAAGCTGATGTCACACATTCTTTGGGAAGTGAACAAG
AACTCATGGCAAGTGCTCGTCGTCACCACCACCAGCAACATCTTCACCATCGCCGCGAAA
CCCAAGATGATGACCCTGTCATGAAGAAGAAGAGGATCTTGACCTACATCAATTGCTGTA
TCAGGCCAAACTAGAGTCTTTGTTCCACAAAATTGAAATCTCAGTGATGTTAAAATACGT
CTCAAAAACATCATTGTTCTGTAATCTATATGTGTCATCGGTTAAGACACTCCTGATTGA
TGTATACATTTTGAGTTTCTGTATTCACTTCTGATATATATGAGAGTAAGATAACGTGAA
TCATATATTTGTC

QA 1 553 1 553
DS 



AS 1 2

CO CL8842Contig1 707 2 6 U
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TGCGACGCCGACCACATTCGTTTCCGCTTCTTCGCATTGATTGAAACGGTCTTAGTAAAT
GCTTTGTGATCAATCCGAATGGTTCTCTCCCCCACTATGTCATCTTCAATGCTTTTCCGA
TCTGAAAGGCGGTGGTGTTTGGGTATAAATATGGGCCAGGAACGTTTGATGCGGTGGTAA
ACTCAGGGAGTGAATATGCTCTTATTGGATTGACAGGTACATTTCGGCAGCTGCACACTA
TTTCCTCTTACGCCTCTTAAACGGTGTCTCATGTAGCTGCATCGGCGGTTTGCGTATGCA
CTACCCAATGTCAGCTGGAGAGAAGAAAATCCAAGAGAGCCATGTTGAAGCAGATCACAT
CGACATTATAGCTTTTGCCAAATCTGCACGTAATACTCTTAAGTCCTATATCATACACAA
ATTTAGAGACATAAAAAGAGGTCGTGCTTTTCTTTCTCTCTGTGTATACACTTGAATATG
CAATAGGAGGAATTAAAAATATTTTTGTGTTGTTATTCTATGTTATCAGAAAATACAGAA
CTCTGAGCAAATAGTTGTTCTTCTTCTTTGATGTAGTTGAACACAGTTTTGTATTTTTGA
AATGACTTTTACGGCCAATATCATAAATACAACTTGCAATGAGTATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1A651TF U 1
AF RS1D822TF U 45
BS 1 215 RS1A651TF
BS 216 220 RS1D822TF
BS 221 304 RS1A651TF
BS 305 305 RS1D822TF
BS 306 662 RS1A651TF
BS 663 707 RS1D822TF

RD RS1A651TF 662 0 0
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TGCGACGCCGACCACATTCGTTTCCGCTTCTTCGCATTGATTGAAACGGTCTTAGTAAAT
GCTTTGTGATCAATCCGAATGGTTCTCTCCCCCACTATGTCATCTTCAATGCTTTTCCGA
TCTGAAAGGCGGTGGTGTTTGGGTATAAATATGGG*****AACGTTTGATGCGGTGGTAA
ACTCAGGGAGTGAATATGCTCTTATTGGATTGACAGGTACATTTCGGCAGCTGCACACTA
TTTCTTCTTACGCCTCTTAAACGGTGTCTCATGTAGCTGCATCGGCGGTTTGCGTATGCA
CTACCCAATGTCAGCTGGAGAGAAGAAAATCCAAGAGAGCCATGTTGAAGCAGATCACAT
CGACATTATAGCTTTTGCCAAATCTGCACGTAATACTCTTAAGTCCTATATCATACACAA
ATTTAGAGACATAAAAAGAGGTCGTGCTTTTCTTTCTCTCTGTGTATACACTTGAATATG
CAATAGGAGGAATTAAAAATATTTTTGTGTTGTTATTCTATGTTATCAGAAAATACAGAA
CTCTGAGCAAATAGTTGTTCTTCTTCTTTGATGTAGTTGAACACAGTTTTGTATTTTTGA
AA

QA 1 662 1 662
DS 

RD RS1D822TF 663 0 0
GG
CTCTTCCTTTATCATGCGACGCCGACCACATTCGTTTCCGCTTCTTCGCATTGATTGAAA
CGGTCTTAGTAAATGCTTTGTGATCAATCCGAATGGTTCTCTCCCCCACTATGTCATCTT
CAATGCTTTTCCGATCTGAAAGGCGGTGGTGTTTGGGTATAAATATGGGCCAGGAACGTT
TGATGCGGTGGTAAACTCAGGGAGTGAATATGCTCTTATTGGATTGACAGGTACATTTCG
GCAGCTGCACACTATTTCCTCTTACGCCTCTTAAACGGTGTCTCATGTAGCTGCATCGGC
GGTTTGCGTATGCACTACCCAATGTCAGCTGGAGAGAAGAAAATCCAAGAGAGCCATGTT
GAAGCAGATCACATCGACATTATAGCTTTTGCCAAATCTGCACGTAATACTCTTAAGTCC
TATATCATACACAAATTTAGAGACATAAAAAGAGGTCGTGCTTTTCTTTCTCTCTGTGTA
TACACTTGAATATGCAATAGGAGGAATTAAAAATATTTTTGTGTTGTTATTCTATGTTAT
CAGAAAATACAGAACTCTGAGCAAATAGTTGTTCTTCTTCTTTGATGTAGTTGAACACAG
TTTTGTATTTTTGAAATGACTTTTACGGCCAATATCATAAATACAACTTGCAATGAGTAT
T

QA 3 663 3 663
DS 



AS 1 2

CO CL8843Contig1 341 2 1 U
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AACTGGCGAGTGATAAAGAAATAGTTAGCATAGTAATTACG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1FK34JQ C 1
AF RS1FK34TF U 1
BS 1 341 RS1FK34TF

RD RS1FK34JQ 341 0 0
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CTTCCATCCCTCTCTCTGCCCACTCACTCTCAGGGACTTGTGTTAATTTTTCTTCAAGTT
TGTTTCTGCAAAGTAAGATCACATTCACAGACAGACGTCTAGTTTGTTTTCAACGTGAAT
CAAAGGTTATTGTCAAAAAAGAATAATTTTGAATGCTGATACAGTACTTGTTCATTTTGT
GTAAAGAGTCGAGTAATAGCAAACATGAAATGGGTATATATGTAATCCGAAAATGTATGC
AACTGGCGAGTGATAAAGAAATAGTTAGCATAGTAATTACG

QA 1 341 1 341
DS 

RD RS1FK34TF 341 0 0
CCAAGTATCGATGCGATGAAATTAGGTCACAGTACCATCCCTCACGATCACATTTATATA
CTTCCATCCCTCTCTCTGCCCACTCACTCTCAGGGACTTGTGTTAATTTTTCTTCAAGTT
TGTTTCTGCAAAGTAAGATCACATTCACAGACAGACGTCTAGTTTGTTTTCAACGTGAAT
CAAAGGTTATTGTCAAAAAAGAATAATTTTGAATGCTGATACAGTACTTGTTCATTTTGT
GTAAAGAGTCGAGTAATAGCAAACATGAAATGGGTATATATGTAATCCGAAAATGTATGC
AACTGGCGAGTGATAAAGAAATAGTTAGCATAGTAATTACG

QA 1 341 1 341
DS 



AS 1 2

CO CL8844Contig1 850 2 2 U
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GCCGTTCCAATCTCGTCACATTGGTTCCGTGAAGAATGGTGGAGAATTCAGTAAAACCAT
CCTCAAAAGACACACTGGCATCTAGACCAATGGCTAGAAAACTAAAAGGTGTTGGTGATC
TTGCAGAGGACTTATCTCATATCAGTGATGCTGAGTCTCTGTAACACACATCAAATTGGT
TCCTGGATTGTGACAAGCCACTTCTGTTGTTACACATGTTGCTGGTTATCTGAATACTAA
ACAAGAGTCTCTTCTGATGAAGATGGCGTGGGAGATGATGAACCCTGATTACAAAAAGGG
AACGCAGAGGAAACCTACTACAGTGAAAAAGAAAGATCCTATTAGTAGTAAGACTGCTGC
TCCTCCTCCTGGTAAGAAAACTTCTGCAACCACAACACAAACCAATGCAGAAAGTGAAAA
GAAAAAGAGACTGAGTTCATATATCAACTTGGATGTCTTGGATAAGCTATTTGATGATGA
GGAGAACTCTCCAAAGAGGACTAAGTTAGGGGACGCAGTCGTTGTCAGTGACCAGATGGA
AAATTTACAGCAAAGGAGTGAAGAACGCCTTTTGGAACCTGAGGATTCTGAAGAAGGTGA
ACCATTCTGGAACGAGGATTACAGTAATGAGGATGCTAATGGAGGACATGACGAGTTCTA
TGGTGACGCTGATCTTGAATATGAAGATGAAGGAGAAGATAATGAAGATATTATTTGGTG
ATCTCATCATACATTGTGAAGTGATCTCAACATATCTTACTCAACAACATTGAATTATTA
TTTTTTTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GV26TF U 1
AF RS1GV26JQ C 53
BS 1 643 RS1GV26TF
BS 644 850 RS1GV26JQ

RD RS1GV26TF 648 0 0
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GCCGTTCCAATCTCGTCACATTGGTTCCGTGAAGAATGGTGGAGAATTCAGTAAAACCAT
CCTCAAAAGACACACTGGCATCTAGACCAATGGCTAGAAAACTAAAAGGTGTTGGTGATC
TTGCAGAGGACTTATCTCATATCAGTGATGCTGAGTCTCTGTAACACACATCAAATTGGT
TCCTGGATTGTGACAAGCCACTTCTGTTGTTACACATGTTGCTGGTTATCTGAATACTAA
ACAAGAGTCTCTTCTGATGAAGATGGCGTGGGAGATGATGAACCCTGATTACAAAAAGGG
AACGCAGAGGAAACCTACTACAGTGAAAAAGAAAGATCCTATTAGTAGTAAGACTGCTGC
TCCTCCTCCTGGTAAGAAAACTTCTGCAACCACAACACAAACCAATGCAGAAAGTGAAAA
GAAAAAGAGACTGAGTTCATATATCAACTTGGATGTCTTGGATAAGCTATTTGATGATGA
GGAGAACTCTCCAAAGAGGACTAAGTTAGGGGACGCAGTCGTTGTCAGTGACCAGATGGA
AAATTTACAGCAAAGGAGTGAAGAACGCCTTTTGGAACCTGAG
ATTCT

QA 1 643 1 643
DS 

RD RS1GV26JQ 798 0 0
CTCA
CTCCGCCGTTCCAATCTCGTCACATTGGTTCCGTGAAGAATGGTGGAGAATTCAGTAAAA
CCATCCTCAAAAGACACACTGGCATCTAGACCAATGGCTAGAAAACTAAAAGGTGTTGGT
GATCTTGCAGAGGACTTATCTCATATCAGTGATGCTGAGTCTCTGTAACACACATCAAAT
TGGTTCCTGGATTGTGACAAGCCACTTCTGTTGTTACACATGTTGCTGGTTATCTGAATA
CTAAACAAGAGTCTCTTCTGATGAAGATGGCGTGGGAGATGATGAACCCTGATTACAAAA
AGGGAACGCAGAGGAAACCTACTACAGTGAAAAAGAAAGATCCTATTAGTAGTAAGACTG
CTGCTCCTCCTCCTGGTAAGAAAACTTCTGCAACCACAACACAAACCAATGCAGAAAGTG
AAAAGAAAAAGAGACTGAGTTCATATATCAACTTGGATGTCTTGGATAAGCTATTTGATG
ATGAGGAGAACTCTCCAAAGAGGACTAAGTTAGGGGACGCAGTCGTTGTCAGTGACCAGA
TGGAAAATTTACAGCAAAGGAGTGAAGAACGCCTTTTGGAACCTGAGGATTCTGAAGAAG
GTGAACCATTCTGGAACGAGGATTACAGTAATGAGGATGCTAATGGAGGACATGACGAGT
TCTATGGTGACGCTGATCTTGAATATGAAGATGAAGGAGAAGATAATGAAGATATTATTT
GGTGATCTCATCATACATTGTGAAGTGATCTCAACATATCTTACTCAACAACATTGAATT
ATTATTTTTTTTTG

QA 5 798 5 798
DS 



AS 1 2

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GCTGTTGGTGCCCCTGACGCTCTTGGCGACTGCCCGTTCAGCCAACGGATCCTTCTCACC
CTAGAGGAGAAGAATCAGCCCTACAAAATACATCTCATTAACCTCTCCGACAAACCTCAG
TGGTTCTTAGACATTAATCCTCAAGGGAAAAGTACCAGTCCTTAAGATGGACGACAAGTG
GGTGCCTGATTCTGACATCATCGTCAACATCCTCGACGACAAGTATCCTGACCCATCTCT
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CATCAAGAGCAAAGACTCCAATGACGGAACCGAAAAGGCCTTGCTTGATGAGCTACAAGC
TCTGGAAGATCATCTCAACCCTCATGACGGTCCTTTCATCGCAGGGGGAAGAGTGACGGC
GGTGGATCTTAGCTTAGCACCCAAGCTTCACTATCTCGAGGTCGCTCTTGGCCATTTCAA
AACCTGGTCTGTGCCCGGGACCTTACCACATGTCCGTACTTACATGAAGGCTTTGTTCTC
TCTTGACTCCTTTGAGAAAACAAAGACCGAGGAGAAGTATGTGATCTCTGGATGGGCCCC
CAAGGTCAACCCCTGAAAGAACTGTAGCTCCGAAGTCTCTTTAATAAGAAAATGAAAATA
ATAATAATGTTCTTGGAGCTGGTATTGAATCAATGAAATGAAATATTTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GO15TF U 1
AF RS1GO15JQ C 137
BS 1 210 RS1GO15TF
BS 211 211 RS1GO15JQ
BS 212 664 RS1GO15TF
BS 665 665 RS1GO15JQ
BS 666 711 RS1GO15TF
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BS 713 717 RS1GO15TF
BS 718 718 RS1GO15JQ
BS 719 726 RS1GO15TF
BS 727 727 RS1GO15JQ
BS 728 748 RS1GO15TF
BS 749 771 RS1GO15JQ

RD RS1GO15TF 753 0 0
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GCTGTTGGTGCCCCTGACGCTCTTGGCGACTGCCCGTTCAGCCAACGGATCCTTCTCACC
CTAGAGGAGAAGAATCAGCCCTACAAAATACATCTCATTAACCTCTCCGACAAACCTCAG
TGGTTCTTAGACATTAATCCTCAAGGGAAA*GTACCAGTCCTTAAGATGGACGACAAGTG
GGTGCCTGATTCTGACATCATCGTCAACATCCTCGACGACAAGTATCCTGACCCATCTCT
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CATCAAGAGCAAAGACTCCAATGACGGAACCGAAAAGGCCTTGCTTGATGAGCTACAAGC
TCTGGAAGATCATCTCAACCCTCATGACGGTCCTTTCATCGCAGGGGGAAGAGTGACGGC
GGTGGATCTTAGCTTAGCACCCAAGCTTCACTATCTCGAGGTCGCTCTTGGCCATTTCAA
AACCTGGTCTGTGCCCGGGACCTTACCACATGTCCGTACTTACATGAAGGCTTTGTTCTC
TCTTGACTCCTTTGAGAAAACAAAGACCGAGGAGAAGTATGTGATCTCTGGATGGGCCCC
CAAG*TCAACCCCTGAAAGAACTGTAGCTCCGAAGTCTCTTTAATAAGAAA*TGAAA*TA
ATAATA*TGTTCTTGGAGCTGGTATTGA
TCATG

QA 1 748 1 748
DS 

RD RS1GO15JQ 635 0 0
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ATCCTCAAGGGAAAAGTACCAGTCCTTAAGATGGACGACAAGTGGGTGCCTGATTCTGAC
ATCATCGTCAACATCCTCGACGACAAGTATCCTGACCCATCTCTCAAGACCCCACCTCAG
TTTGCCTCTGTTGGATCCAGCATCTTCAGCACCTTCGTGAGTTTCATCAAGAGCAAAGAC
TCCAATGACGGAACCGAAAAGGCCTTGCTTGATGAGCTACAAGCTCTGGAAGATCATCTC
AACCCTCATGACGGTCCTTTCATCGCAGGGGGAAGAGTGACGGCGGTGGATCTTAGCTTA
GCACCCAAGCTTCACTATCTCGAGGTCGCTCTTGGCCATTTCAAAACCTGGTCTGTGCCC
GGGACCTTACCACATGTCCGTACTTACATGAAGGCTTTGTTCTCTCTTGACTCCTTTGAG
AAAACAAAGACCGAGGAGAAGTATGTGATCTCTGGATGGGCCCCCAAGGTCAACCCCTGA
AAGAACTGTAGCTCCGAAGTCTCTTTAATAAGAAAATGAAAATAATAATAATGTTCTTGG
AGCTGGTATTGAATCAATGAAATGAAATATTTTAT

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

CO CL8846Contig1 1024 2 2 U
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GGCAGCTACTATGATTATTCGTCGATCGTTAAATATGGCGATGATGATAGTAAGAAGAAG
CAGATGTTTCTAAGCGTTTCTGTGAAAGCAATGAAGGAAGAAGGTAACGGAAGTGGAAGC
ATGAGTTTCTCTGGACAAAGCTGGGATCCTAGCTCCGAGATACAAGTTCCTTCCGACCAA
AGACCTGTGAATGAGTATTCGGCTTTGAAGGAAGGGACGTTGTATTCATGGGGAGAACTG
AGTCCAACCCAATTCTTTCTTCGTATAGGTGGTCTTTGGTTGGTCACTTTCACTGTTCTT
GGAGTTCCCATCGCTGCTGCTAGCTTTAATCCTTCCAGAGAACCTTTGAGGTTTGTTATG
GCTGCAGGGACAGGAACTTTATTCCTGGTTTCATTGATTGTCTTGAGAATTTACCTGGGA
TGGAGCTATGTTGGAGATAGACTACTCTCTGCTGTTATTCCATACGAAGAGAGCGGATGG
TATGATGGCCAAATGTGGGTTAAGCCACCTGAGGTATTGGCTCGGGACAGGTTGTTAGGT
TCGTACAAGGTGAAGCCGGTAATCAAGATGCTGAAACAAACATTAGTTGGAACAGGAGCT
TTGCTCGTTTCAGCATTCGTCCTATTCGTTTTTGCAACACCTGTTGAGGATTTTGTTAAA
ACCACTCTAAGATCAAATGGTAACCAACCAGAGGTTTTTATTTCAAGAACCAACAACAAG
TTCAATATGAGAAAAGAACAATTGCTTCGGTTGCCCACAGATGTTGTGACAGATGATGAC
TTAGCAGCGGCCGCAGCTGAGGCTGCTGATGGAAGACCGGTCTATTGTAGAGACCGTTAC
TATCGTGCATTGGCCGGTGGCCAATACTGCAAATGGGAAGATCTTGTTAAATAATTGTCA
TACTAGAAATACAACAACACACATGCATTATGTACTCTTTTTCAGTTTTGATTATAATGC
CTGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1EI61TF U 1
AF RS1EI61JQ C 239
BS 1 569 RS1EI61TF
BS 570 1024 RS1EI61JQ

RD RS1EI61TF 569 0 0
AACGTTAATTACCCTTTGCTTCCGAAGATACCACCCAATCGCGTTTGTAACAGAAAGCTC
GGCAGCTACTATGATTATTCGTCGATCGTTAAATATGGCGATGATGATAGTAAGAAGAAG
CAGATGTTTCTAAGCGTTTCTGTGAAAGCAATGAAGGAAGAAGGTAACGGAAGTGGAAGC
ATGAGTTTCTCTGGACAAAGCTGGGATCCTAGCTCCGAGATACAAGTTCCTTCCGACCAA
AGACCTGTGAATGAGTATTCGGCTTTGAAGGAAGGGACGTTGTATTCATGGGGAGAACTG
AGTCCAACCCAATTCTTTCTTCGTATAGGTGGTCTTTGGTTGGTCACTTTCACTGTTCTT
GGAGTTCCCATCGCTGCTGCTAGCTTTAATCCTTCCAGAGAACCTTTGAGGTTTGTTATG
GCTGCAGGGACAGGAACTTTATTCCTGGTTTCATTGATTGTCTTGAGAATTTACCTGGGA
TGGAGCTATGTTGGAGATAGACTACTCTCTGCTGTTATTCCATACGAAGAGAGCGGATGG
TATGATGGCCAAATGTGGGTTAAGCCACC

QA 1 569 1 569
DS 

RD RS1EI61JQ 786 0 0
AAAGACCTGTGAATGAGTATTCGGCTT*GAAGGAAGGGACGTTGTATTCATGGGGAGAAC
TGAGTCCAACCCAATTCTTTCTTCGTATAGGTGGTCTTTGGTTGGTCACTTTCACTGTTC
TTGGAGTTCCCATCGCTGCTGCTAGCTTTAATCCTTCCAGAGAACCTTTGAGGTTTGTTA
TGGCTGCAGGGACAGGAACTTTATTCCTGGTTTCATTGATTGTCTTGAGAATTTACCTGG
GATGGAGCTATGTTGGAGATAGACTACTCTCTGCTGTTATTCCATACGAAGAGAGCGGAT
GGTATGATGGCCAAATGTGGGTTAAGCCACCTGAGGTATTGGCTCGGGACAGGTTGTTAG
GTTCGTACAAGGTGAAGCCGGTAATCAAGATGCTGAAACAAACATTAGTTGGAACAGGAG
CTTTGCTCGTTTCAGCATTCGTCCTATTCGTTTTTGCAACACCTGTTGAGGATTTTGTTA
AAACCACTCTAAGATCAAATGGTAACCAACCAGAGGTTTTTATTTCAAGAACCAACAACA
AGTTCAATATGAGAAAAGAACAATTGCTTCGGTTGCCCACAGATGTTGTGACAGATGATG
ACTTAGCAGCGGCCGCAGCTGAGGCTGCTGATGGAAGACCGGTCTATTGTAGAGACCGTT
ACTATCGTGCATTGGCCGGTGGCCAATACTGCAAATGGGAAGATCTTGTTAAATAATTGT
CATACTAGAAATACAACAACACACATGCATTATGTACTCTTTTTCAGTTTTGATTATAAT
GCCTGT

QA 1 786 1 786
DS 



AS 1 2

CO CL8847Contig1 1007 2 8 U
GGATCACACGAAACCCTCTTACTTCTCCACATTGACAGAAATATCCATCTGCTTCTGTTC
ACTTCTTTTTTCCTTCTCCTTTTGCATGTTGTAATTGTTTTGCTTCATCATGGGGGTTTT
AGTAATCTCGGCTCTCCTACTCCATGTGCTATCGTTTTCTGTTTGCGTTCAAGGCTTCTA
CCGTCGTGGCGGCCACCATCCCGGCGGCCACATGGGACCTTGGATCAATGCTCATGCCAC
ATTCTACGGTGGCGGTGATGCTTCTGCACTATGGGTGGAGCTTGCGGGTACGGGAATCTA
TACGGCCAAGGCTATGGAACAGAGACTGCCGCGCTGAGCACGGCGTTATTCGATAACGGA
CTTAGCTGTGGTGCCTGCTTCGAGCTTAAGTGTGTCAACGATCCTCAGTGGTGCATACAA
GGCCGGTCCATTGTGGTCACTGCCACTAACTTTTGTCCTCCTGGTGGCGCCTGCGATCCT
CCTAACCACCATTTCGATCTTTCTCAGCCCATCTACGAGCACATCGCTATTTACAAGTCC
GGTATCATTCCGGTTATGTACAGAAGGGTACGGTGCAGGAGAAGCGGTGGGATAAGGTTC
ACGATCAACGGTCACTCATACTTTAACTTGGTGCTGGTCACAAATTTCGGTGGAGCCGGG
GATGTACACTCTGTGTCAATGAAAGGGTCGAGGTCAAAATGGCAATTAATGTCAAGAAAC
TGGGGGCAAAACTGGCAGAGCAACTCTTATCTCAATGGTCAGAGTCTGTCGTTTGTTGTC
ACCACAAGTGATCGCCGAAGTGTCGTGTCGTTCAATGTTGCTCCTCCCGGTTGGTCCTTT
GGCCAGACCTACACCGGAGGGCAGTTTCGGTACTAACTTATATAAAAGTGGTTTATATAG
TAAACCGGTTTGGTTCGCTTGGTTTTAGTAATTGCATCTTTTTGTAATTTTTGGTTCCAA
GTTGGGGACCTTTTTTTTGGGGGTAACCAATTAATATCAGGACTGGT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EP24TF U 1
AF RS1EP24JQ C 405
BS 1 698 RS1EP24TF
BS 699 699 RS1EP24JQ
BS 700 730 RS1EP24TF
BS 731 731 RS1EP24JQ
BS 732 754 RS1EP24TF
BS 755 755 RS1EP24JQ
BS 756 768 RS1EP24TF
BS 769 1007 RS1EP24JQ

RD RS1EP24TF 768 0 0
GGATCACACGAAACCCTCTTACTTCTCCACATTGACAGAAATATCCATCTGCTTCTGTTC
ACTTCTTTTTTCCTTCTCCTTTTGCATGTTGTAATTGTTTTGCTTCATCATGGGGGTTTT
AGTAATCTCGGCTCTCCTACTCCATGTGCTATCGTTTTCTGTTTGCGTTCAAGGCTTCTA
CCGTCGTGGCGGCCACCATCCCGGCGGCCACATGGGACCTTGGATCAATGCTCATGCCAC
ATTCTACGGTGGCGGTGATGCTTCTGCACTATGGGTGGAGCTTGCGGGTACGGGAATCTA
TACGGCCAAGGCTATGGAACAGAGACTGCCGCGCTGAGCACGGCGTTATTCGATAACGGA
CTTAGCTGTGGTGCCTGCTTCGAGCTTAAGTGTGTCAACGATCCTCAGTGGTGCATACAA
GGCCGGTCCATTGTGGTCACTGCCACTAACTTTTGTCCTCCTGGTGGCGCCTGCGATCCT
CCTAACCACCATTTCGATCTTTCTCAGCCCATCTACGAGCACATCGCTATTTACAAGTCC
GGTATCATTCCGGTTATGTACAGAAGGGTACGGTGCAGGAGAAGCGGTGGGATAAGGTTC
ACGATCAACGGTCACTCATACTTTAACTTGGTGCTGGTCACAAATTTCGGTGGAGCCGGG
GATGTACACTCTGTGTCAATGAAAGGGTCGAGGTCAAA*TGGCAATTAATGTCAAGAAAC
TGGGGGCAAA*CTGGCAGAGCAACTCTTATCTCA*TGGTCAGAGTCTG

QA 1 768 1 768
DS 

RD RS1EP24JQ 603 0 0
TCAGTGGTGCATACAAGGCCGGTCCATTGTGGTCACTGCCACTAACTTTTGTCCTCCTGG
TGGCGCCTGCGATCCTCCTAACCACCATTTCGATCTTTCTCAGCCCATCTACGAGCACAT
CGCTATTTACAAGTCCGGTATCATTCCGGTTATGTACAGAAGGGTACGGTGCAGGAGAAG
CGGTGGGATAAGGTTCACGATCAACGGTCACTCATACTTTAACTTGGTGCTGGTCACAAA
TTTCGGTGGAGCCGGGGATGTACACTCTGTGTCAATGAAAGGGTCGAGGTCAAAATGGCA
ATTAATGTCAAGAAACTGGGGGCAAAACTGGCAGAGCAACTCTTATCTCAATGGTCAGAG
TCTGTCGTTTGTTGTCACCACAAGTGATCGCCGAAGTGTCGTGTCGTTCAATGTTGCTCC
TCCCGGTTGGTCCTTTGGCCAGACCTACACCGGAGGGCAGTTTCGGTACTAACTTATATA
AAAGTGGTTTATATAGTAAACCGGTTTGGTTCGCTTGGTTTTAGTAATTGCATCTTTTTG
TAATTTTTGGTTCCAAGTTGGGGACCTTTTTTTTGGGGGTAACCAATTAATATCAGGACT
GGT

QA 1 603 1 603
DS 



AS 1 2

CO CL8848Contig1 564 2 1 U
GGTTGGCTTTACCGGTCAAGCCATAGCAGGAGGAGTGGCTAGCGCCTAAAGTGACAGCAA
AGTAAAGATAAACAGTGCAGAGAAAGGCCAAAAGAAGCAAAGCAGTCAAGAGATATCGAT
GCCTGTTGACAACGGTGGAGCAGCTACCCAAATCTTCCCACTGCTTCTTTAGAGACTGTG
TTCTCCTTGATGGTGAAGACACCATCCCGTCAAGAACCATGGCTTTTTGATAGATAATCA
AACACCTACAAAATTGATACGAGGAGAAAGATCCATGTAAATTGTCAATCATAAAGCCAT
TTTATAGAGCTACCAATAATTTCGAATTTCTAGATCATTTTAATGTCAATGAGAAACAGC
AAGCTAGCGAAATCGAACGAACATATCAAATCTATGATCTATCTATCCCCCGGGAGATTA
ATCAATTTGGAAAAGAGATTAGCATCACGGGTACAAACCAAGCTTGAATCAATCAATCCT
TGGCTATCGATCAAAACAACGAGCGCCAATGAACATTGGATAAAGAGAGATTCTAGGAGA
CGAGGCGATCAAATATAAGCATTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DR32JQ C 1
AF RS1DR32TF U 1
BS 1 564 RS1DR32TF

RD RS1DR32JQ 564 0 0
GGTTGGCTTTACCGGTCAAGCCATAGCAGGAGGAGTGGCTAGCGCCTAAAGTGACAGCAA
AGTAAAGATAAACAGTGCAGAGAAAGGCCAAAAGAAGCAAAGCAGTCAAGAGATATCGAT
GCCTGTTGACAACGGTGGAGCAGCTACCCAAATCTTCCCACTGCTTCTTTAGAGACTGTG
TTCTCCTTGATGGTGAAGACACCATCCCGTCAAGAACCATGGCTTTTTGATAGATAATCA
AACACCTACAAAATTGATACGAGGAGAAAGATCCATGTAAATTGTCAATCATAAAGCCAT
TTTATAGAGCTACCAATAATTTCGAATTTCTAGATCATTTTAATGTCAATGAGAAACAGC
AAGCTAGCGAAATCGAACGAACATATCAAATCTATGATCTATCTATCCCCCGGGAGATTA
ATCAATTTGGAAAAGAGATTAGCATCACGGGTACAAACCAAGCTTGAATCAATCAATCCT
TGGCTATCGATCAAAACAACGAGCGCCAATGAACATTGGATAAAGAGAGATTCTAGGAGA
CGAGGCGATCAAATATAAGCATTC

QA 1 564 1 564
DS 

RD RS1DR32TF 564 0 0
GGTTGGCTTTACCGGTCAAGCCATAGCAGGAGGAGTGGCTAGCGCCTAAAGTGACAGCAA
AGTAAAGATAAACAGTGCAGAGAAAGGCCAAAAGAAGCAAAGCAGTCAAGAGATATCGAT
GCCTGTTGACAACGGTGGAGCAGCTACCCAAATCTTCCCACTGCTTCTTTAGAGACTGTG
TTCTCCTTGATGGTGAAGACACCATCCCGTCAAGAACCATGGCTTTTTGATAGATAATCA
AACACCTACAAAATTGATACGAGGAGAAAGATCCATGTAAATTGTCAATCATAAAGCCAT
TTTATAGAGCTACCAATAATTTCGAATTTCTAGATCATTTTAATGTCAATGAGAAACAGC
AAGCTAGCGAAATCGAACGAACATATCAAATCTATGATCTATCTATCCCCCGGGAGATTA
ATCAATTTGGAAAAGAGATTAGCATCACGGGTACAAACCAAGCTTGAATCAATCAATCCT
TGGCTATCGATCAAAACAACGAGCGCCAATGAACATTGGATAAAGAGAGATTCTAGGAGA
CGAGGCGATCAAATATAAGCATTC

QA 1 564 1 564
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8850Contig1 588 2 1 U
GGGCTCAACTGGATACTGATCGATCCGGTGAAGAAACGTGCGGCGAATATATCGATCAGG
GACGCAGTTTCGGCTAAGCGGAACTGGTTGACCGGAGATTTGGAGATTAGATTTTCGAGG
GTGGTGGTGATGGGGAAGAGAGCGGTGGAGGTAGCGACGGTTGTGTCGTATGGATCGGCG
GAGACGTGGAAAGAACTGGACGAGGAAGTTGGAGGGGAAGTGGACGTGAGGGAGGTGAGG
TTGCAAGTAGAGGACATAGAAGGAAAGTGTCTGAAAGGAAGGGAGAGTGTGGTCATATTA
CAAGGGTTGTTGGAAGGGAGGAGAAGTTGTAAAGATGAGTGTGGTAAAGGAAGGTATGAG
GAATACGTGGAGATGAAGACACTGTGGAAAGGGAAAAAAGAGAGGAGAGAAAAGACTCAA
GACACGATTTGTATGGTTTTTGGCTTCTCTTTGTTTGTGCTTTTGTGGAGTTTTATTTTG
TTAAGGTAAAAATTGCTAAGAAAAAGGTGAAACACAACATAAGATTTACGATACACACGT
CTTTCATTATCACTGTTCTGTTTGTAATAAATAAAAATTTACGGATAT


BQ
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AF RS1FY28JQ C 1
AF RS1FY28TF U 1
BS 1 588 RS1FY28TF

RD RS1FY28JQ 588 0 0
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GACGCAGTTTCGGCTAAGCGGAACTGGTTGACCGGAGATTTGGAGATTAGATTTTCGAGG
GTGGTGGTGATGGGGAAGAGAGCGGTGGAGGTAGCGACGGTTGTGTCGTATGGATCGGCG
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CAAGGGTTGTTGGAAGGGAGGAGAAGTTGTAAAGATGAGTGTGGTAAAGGAAGGTATGAG
GAATACGTGGAGATGAAGACACTGTGGAAAGGGAAAAAAGAGAGGAGAGAAAAGACTCAA
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TTAAGGTAAAAATTGCTAAGAAAAAGGTGAAACACAACATAAGATTTACGATACACACGT
CTTTCATTATCACTGTTCTGTTTGTAATAAATAAAAATTTACGGATAT

QA 1 588 1 588
DS 



AS 1 2

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AF RS1C436JQ C 186
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BS 643 959 RS1C436JQ

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TTCGGTGACCGATGGAATCAACGGGTCGTACATTGGAGCCAAAGGAGAGGCCATATACAT
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QA 1 642 1 642
DS 

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QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

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TAAGACGGCTAAACATATGCCCCGGTGCCTTAATACCCACATCCAACATCTCATTGAAAT
ACTCACACGCCTCATCCAACTTGTTCTCATTACACAAAGCTGTGATCAAACTAGAGAACA
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AF RS1FZ91JQ U 1
AF RS1FW58JQ U 48
BS 1 393 RS1FZ91JQ
BS 394 394 RS1FW58JQ
BS 395 648 RS1FZ91JQ
BS 649 712 RS1FW58JQ

RD RS1FZ91JQ 648 0 0
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GATCATAGGTCATAACAATCCAATAGTCGAAAAACATGAAATAAAGTGTAGTAAGAAGAC
ACGAGCAAGAAGGAAAAACCTAGTCATATCAGCCAAGGAGTTGAGTTTTTCTCAGCCTAT
CCATCTTCACAGCCAATTCGGCCACTTTATCTTTCCGACCTTCATCGAGAAGCGCTTGTT
TAAGACGGCTAAACATATGCCCCGGTGCCTTAATACCCACATCCAACATCTCATTGAAAT
ACTCACACGCCTCATCCAACTTGTTCTCATTACACAAAGCTGTGATCAAACTAGAGAACA
TGTGCATCCCAGGAAGAACACCTTTCCCTTTCATCTCATCCCAAATCTTGACCGCCATGT
CCAATCTCTCTTTATTACAGAACATCCTCACCATGATCTCGTAAGTACTCACCGTCGGCT
CACAGCTCATCCTCTGATAAACCTCATACGCTTCTTTCGTCCGCTGCATACGGATCAAAT
GATGGAGTATTATATCATAAGTCCTAGCATTCGGCCCAACCCCTTTTAACCTCATCTCTT
CCACTACCTTAAACGCGTCTTCAACTCTCTGTGACCAGCAGTAAGCTC

QA 1 648 1 648
DS 

RD RS1FW58JQ 665 0 0
GAAAATTTGGATAGATCATAGGTCATAACAATCCAATAGTCGAAAAACATGAAATAAAGT
GTAGTAAGAAGACACGAGCAAGAAGGAAAAACCTAGTCATATCAGCCAAGGAGTTGAGTT
TTTCTCAGCCTATCCATCTTCACAGCCAATTCGGCCACTTTATCTTTCCGACCTTCATCG
AGAAGCGCTTGTTTAAGACGGCTAAACATATGCCCCGGTGCCTTAATACCCACATCCAAC
ATCTCATTGAAATACTCACACGCCTCATCCAACTTGTTCTCATTACACAAAGCTGTGATC
AAACTAGAGAACATGTGCATCCCAGGAAGAACACCTTTCCCTTTTACCTCATCCCAAATC
TTGACCGCCATGTCCAATCTCTCTTTATTACAGAACATCCTCACCATGATCTCGTAAGTA
CTCACCGTCGGCTCACAGCTCATCCTCTGATAAACCTCATACGCTTCTTTCGTCCGCTGC
ATACGGATCAAATGATGGAGTATTATATCATAAGTCCTAGCATTCGGCCCAACCCCTTTT
AACCTCATCTCTTCCACTACCTTAAACGCGTCTTCAACTCTCTGTGACCAGCAGTAAGCT
CCTACCAACGCATTGTAAGTAGGAGTTTCAAGCAGAAACCCCGAACTCCTCGACCGCTCG
AAAAA

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

CO CL8853Contig1 743 2 9 U
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GAAAATCCAGCAAGAACTCGCTAAACCAGGTGTTCTCCAGAGGTTTATGGACAACAAAGA
TGACATAGCTAAGCTGAGGAAATGCTTTGCTGGGCTTTGGAGCTTGGACGATCAAGAAAT
CATCAAGAAAGCTATTGAAAAACCGGAGTTGTTTGTCATGAAGCCTCAGAGAGAAGGAGG
AGGTAACAATATCTATGGAGATGATGTGAGGGAGAATCTTCTGAGGTTGCAGAGAGAAGG
AGAGGAAGAAAACGCTGCATACATCCTAATGCAGAGGATCTTCCCAAAAGTGTCAAACGT
GTTCTTGCTGCGAGACGGTGTTTACCATAAAGATCAAGCTATATCAGAACTTGGAGTCTA
TGGGGCTTACCTCAGGAACAAGGAGAGAGTCATAATAAACGAGCAGAGTGGTTATCTGAT
GCGCACTAAGGTCTCTTCATCAGATGAAGGTGGTGTTGCGGCTGGTTATGCTGTATTGGA
CAGCATTTATCTGAATTGAGATGGGATCACATTCAATAATCATCCTGATTAATTCATGTT
TATGCTGGTTCATTTTCTTTTTTTTCCTTAGTCTTCCTGCTTGCTTGTTTAAGATTTGTG
TACTGATTCATGAAGATCTATAAAACAAGATTAGACAGAGCTCTTTAAAATTATTTGAAC
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BQ
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AF RS1AX26TF U 80
AF RS1C709JQ C 1
BS 1 79 RS1C709JQ
BS 80 197 RS1AX26TF
BS 198 198 RS1C709JQ
BS 199 450 RS1AX26TF
BS 451 451 RS1C709JQ
BS 452 623 RS1AX26TF
BS 624 625 RS1C709JQ
BS 626 706 RS1AX26TF
BS 707 743 RS1C709JQ

RD RS1AX26TF 627 0 0
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TCAGATGAAGGTGGTGTTGCGGCTGGTTATGCTGTATTGGACAGCATTTATCTGAATTGA
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TTTT**CCTTAGTCTTCCTGCTTGCTTGTTTAAGATTTGTGTACTGATTCATGAAGATCT
ATAAAACAAGATTAGACAGAGCTCTTT

QA 1 627 1 627
DS 

RD RS1C709JQ 743 0 0
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GAAAATCCAGCAAGAACTCGCTAAACCAGGTGTTCTCGAGAGGTTTATGGACAACAAAGA
TGACATAGCTAAGCTGAGGAAATGCTTTGCTGGGCTTTGGAGCTTGGACGATCAAGAAAT
CATCAAGAAAGCTATTGAAAAACCGGAGTTGTTTGTCATGAAGCCTCAGAGAGAAGGAGG
AGGTAACAATATCTATGGAGATGATGTGAGGGAGAATCTTCTGAGGTTGCAGAGAGAAGG
AGAGGAAGAAAACGCTGCATACATCCTAATGCAGAGGATCTTCCCAAAAGTGTCAAACGT
GTTCTTGCTGCGAGACGGTGTTTACCATAAAGATCAAGCTATATCAGAACTTGGAGTCTA
TGGGGCTTACCTCAGGAACAAGGAGAGAGTCATAATAAACGAGCAGAGTGGTTATCTGAT
GCGCACTAAGGTCTCTTCATCAGATGAAGGTGGTGTTGCGGCTGGTTATGCTGTATTGGA
CAGCATTTATCTGAATTGAGATGGGATCACATTCACTAATCATCCTGATTGATTCATGTT
TATGCTGGTTCATTTTCTTTTTTTTCTTTAGTCTTCCTGCTTGCTTGTTTAAGATTTGTG
TACTGATTCATGAAGATCTATAAAACAAGATTAGACAGAGCTCTTTAAAATTATTTGAAC
AAAGCATATAGAAATGCTTCTAC

QA 1 743 1 743
DS 



AS 1 2

CO CL8854Contig1 709 2 2 U
GATCGATCTATCATAATATCAACAGTCATGTTCACCCTCATCGCCCGATGCGCTCTCGCC
TTTCCCGGTGGCCCACGTGCTTCACCCACCACCGTTCCTTTGTAATATATATCGGTTGTA
GTGTTTGAATACCTAAACGAAGCAGAGTTCGGATTCTTGACCGACACGTCGACGATCATC
GAGATGTTTGTTCCCAACAGTTGGATCTGAGTCCCCGTGGTTGAGTCTAGACCGTTGACT
GTTACGCCGTTCATTTTTATGATGGGGTCTTTGACTCGGAACACCGTGAAGACTAAAGTC
AACACGATCGTGATGAGAATAAGAGATGTTACAGTGACGCAGATTAAGCACTTTAACCGG
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GTCGCTGGAGCCAGTGGACGAACATGTTCTGGTTCGGTCATGGTGGTTCTTTTGTGTGTG
TGTGTGTGAAGGGGAGTCGGATTTTTTACTTCTGGTCATGTGAATTATATAAACCAATAA
GTGATGGAGAATGTTGACTTTTATATGTACTTCGGTGTTTCATGTGTCGTTATTACTTTA
AGAGAAAATAAGAACATTAATGTAATGGGCCTAACTACTAACAAAGTTGGGATCAATTAT
TGCAGTGGAAAGATGAGAATGGTATTAAATTGGCTTTGATTTAACGGTC


BQ
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BS 692 709 RS1DH36JQ

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TTTCCCGGTGGCCCACGTGCTTCACCCACCACCGTTCCTTTGTAATATATATCGGTTGTA
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GTCGCTGGAGCCAGTGGACGAACATGTTCTGGTTCGGTCATGGTGGTTCTTTTGTGTGTG
TGTGTGTGAAGGGGAGTCGGATTTTTTACTTCTGGTCATGTGAATTATATAAACCAATAA
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AGAGAAAATAAGAACATTAATGTAATGGGCCTAACTACTAACAAAGTTGGGATCAATTAT
TGCAGTGGAAAGATGAGAATGGTATTAAATT

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DS 

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TTCTTGACCGACACGTCGACGATCATCGAGATGTTTGTTCCCAACAGTTGGATCTGAGTC
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TCGGTCATGGTGGTTCTTTTGTGTGTGTGTGTGTGAAGGGGAGTCGGATTTTTTACTTCT
GGTCATGTGAATTATATAAACCAATAAGTGATGGAGAATGTTGACTTTTATATGTACTTC
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ACTACTAACAAAGTTGGGATCAATTATTGCAGTGGAAAGATGAGAATGGTATTAAATTGG
CTTTGATTTAACGGTC

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 2

CO CL8855Contig1 1200 2 4 U
GGACGTGAGCATTTGGTCCTCTGCTATCAAATTAGAGATTTCCGGTGAAATCCAATTTCA
GCAAGACCAGGACCAATGTCGATTCTTCCATCCTCTTGTTTTCCGGTGGCATATGCCAAT
CTCGGCCGACCAACTGCGTCGTTTCCGGCACGGACGTTTCGTCCTGGTCGATTCCCCGAG
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GAGTCGAAAGCTGATGAAGAAGAAACTTCGTCTAGTGAAAGCACTACGAGCGGAAGCTTC
TTGTCTCTTCTCTGTCCCTTGCTTAAACTCTTCTCTGGAGGTGACCCTTCTCAGCAACGG
AATCATGCTCTTGAGGTCGCAACTTCTTCTTTAGCATCTATTGCAAGACTTCCTTGGGGA
TCTCGAGTGTCATCCGTGAGTGAAGATGTTTCTTTTACTCCACCTTTGCGATTGAAGCTT
TTTGAATTTGAGGCATGTCCCTTTTGCCGGAGGGTGCGCGAAGCATGACTGAGCTAGACC
TCTCTGTAGAAGTTTATCCTTGTCCTAAAGGATCTGCAAGACACAGGGAAATGGTTAGAA
GATCCGGTGGAAAAGAGATGTTTCCCTTCCTCATTGACCCCAATACTGATACTTCCATGT
ACGAGAGTGGTGACATCGTAAAGTACCTATATAATCAATATGCACCTTGTTCACAGGGTG
GATGCCAACACTTCTCCGAGCTGGTAGAGGCATGTCATTATAGGACAAGGCTTCATCAGA
TCCACCACCTGAAATGCTCCAGCTCTTTTCTTACGAAAACAACTCGTATGCACGGTTGGT
GCGTGAAGCACTGTGTGAGTTAGAGCTCCCTTATGTATTACACAACATTGGAGAAGGGTC
CACACGGATGAGATCACTTCTAAATGTTTCGGGATCCGATAAGGTTCCATTCTTGATTGA
TCCAAACACTGGTGTCCAGTTAGGTGATTACCAGAAGATTCTGTCTTACCTCTTCAAGAC
TTATTCTTCAGCAGCATCTGTATAGTTCATAATCTGACATATACACCATTATCCTCAACT
TGACAACAGCAAGGTACAAGCTTTTAGCACCACATGTTTTGATAAAATACTGAGAAACTA
TTCATCATGGAAGAACATGGTCATTCTTGGGGAACTAAAAATAAAATCTGAACTTTTGGT


BQ
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AF RS1D971TF U 1
AF RS1D971JQ C 567
BS 1 717 RS1D971TF
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BS 719 761 RS1D971TF
BS 762 1200 RS1D971JQ

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CAGCGAATTTCAGGAAACGGGGCCTGGATTCGCGAAAGAGGAAGAGTATACGTGAAATCA
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TTGTCTCTTCTCTGTCCCTTGCTTAAACTCTTCTCTGGAGGTGACCCTTCTCAGCAACGG
AATCATGCTCTTGAGGTCGCAACTTCTTCTTTAGCATCTATTGCAAGACTTCCTTGGGGA
TCTCGAGTGTCATCCGTGAGTGAAGATGTTTCTTTTACTCCACCTTTGCGATTGAAGCTT
TTTGAATTTGAGGCATGTCCCTTTTGCCGGAGGGTGCGCGAAGCATGACTGAGCTAGACC
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ACGAGAGTGGTGACATCGTAAAGTACCTATATAATCAATATGCACCTTGTTCACAGG*TG
GATGCCAACACTTCTCCGAGCTGGTAGAGGCATGTCATTAT

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DS 

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AAAGGATCTGCAAGACACAGGGAAATGGTTAGAAGATCCGGTGGAAAAGAGATGTTTCCC
TTCCTCATTGACCCCAATACTGATACTTCCATGTACGAGAGTGGTGACATCGTAAAGTAC
CTATATAATCAATATGCACCTTGTTCACAGGGTGGATGCCAACACTTCTCCGAGCTGGTA
GAGGCATGTCATTATAGGACAAGGCTTCATCAGATCCACCACCTGAAATGCTCCAGCTCT
TTTCTTACGAAAACAACTCGTATGCACGGTTGGTGCGTGAAGCACTGTGTGAGTTAGAGC
TCCCTTATGTATTACACAACATTGGAGAAGGGTCCACACGGATGAGATCACTTCTAAATG
TTTCGGGATCCGATAAGGTTCCATTCTTGATTGATCCAAACACTGGTGTCCAGTTAGGTG
ATTACCAGAAGATTCTGTCTTACCTCTTCAAGACTTATTCTTCAGCAGCATCTGTATAGT
TCATAATCTGACATATACACCATTATCCTCAACTTGACAACAGCAAGGTACAAGCTTTTA
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TTGGGGAACTAAAAATAAAATCTGAACTTTTGGT

QA 1 634 1 634
DS 



AS 1 2

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TGTAAACTAAAATGATCGACTTGTATTGGGACATTTGTGCAGAGGAGACGACTACTATGA
GCAGCAGCAGAGATCATCATCATCATCCACCCGAGCCTCTTGATTTCTTCATCTGGACTG
TTGAGGATGTTGGATCTTGGCTTGAGGAGATCAACCTTGGGAGCTACCGCCTGATTTTCA
AAGAAAACGGCGTCAATGGAGAATATCTAGAAAGCATGTCTGTGTTTACAACCGAACAGA
TCCTTCATTTCATAAGGAGGCATCACATGAAATGGGGAGATTTCATCACTCTCTGTAAAG
AACTCAGAAGGATCAAAGTGGCTTGCTTGAAAGGCGAGCAGAGAGTTCGAAGGCCTTGGT
GGGCACCGTCTTGCCTCTCTGTAGTCTTTGTTAAGGCCGCTAAGCGCAACCGACAGTCTC
GAGTTGTATCTCTAAAGCTTGAATCTTGACAATTACACGCTGGCTCTCTCTTTATGTACC
TACTTGTCTCTCTTCTCATCCCTTTCTTTTCCTTTTTCTTTTTTTGGGTTGAGTTTGTTT
GTAGAGATAAAAGCTATATGCACTATGGAAAAAAAAACAAATTGGAGCCAAAAAGCTGTT
TTGGCTTGTTAAAGTCTTGCAAGAAGGGAAAAATTATAGTTTTCTACTTTGGTTGTATAC
AGAGCTTGCTCTCAGATGTTTAAGC


BQ
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AATTACACGCTGGCTCTCTCTTTATGTACCTACTTGTCTCTCTTCTCATCCCTTTCTTTT
CCTTTTTCTTTTTTTGGGTTGAGTTTGTTTGTAGAGATAAAAGCTATATGCACTATGGAA
AA

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DS 

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TTGAGGATGTTGGATCTTGGCTTGAGGAGATCACCCTTGGGAGCTACCGCCTGATTTTCA
AAGAAAACGGCGTCAATGGAGAATATCTAGAAAGCATGTCTGTGTTTACAACCGAACAGA
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AACTCAGAAGGATCAAAGTGGCTTGCTTGAAAGGCGAGCAGAGAGTTCGAAGGCCTTGGT
GGGCACCGTCTTGCCTCTCTGTAGTCTTTGTTAAGGCCGCTAAGCGCAACCGACAGTCTC
GAGTTGTATCTCTAAAGCTTGAATCTTGACAATTACACGCTGGCTCTCTCTTTATGTACC
TACTTGTCTCTCTTCTCATCCCTTTCTTTTCCTTTTTCTTTTTTTGGGTTGAGTTTGTTT
GTAGAGATAAAAGCTATATGCACTATGGAAAAAAAAACAAATTGGAGCCAAAAAGCTGTT
TTGGCTTGTTAAAGTCTTGCAAGAAGGGAAAAATTATAGTTTTCTACTTTGGTTGTATAC
AGAGCTTGCTCTCAGATGTTTAAGC

QA 1 745 1 745
DS 



AS 1 2

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TCTCTGAAACAGAGGAACACAAAATGGTTTCTGCATCGTCCAAGACCAAAGCTTTAGACC
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TCGCCGAAGCATCTCCTGTGAGTACAGGAAAGACTATTCAGGTTTGGGAAGTTAAGCTGT
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GGGTGATGATAAGCTC


BQ
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GGGTGATGATAAGCTC

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TGTAAATCTCAAAAAGCTTCTTTTTCTCTGTCTCTGTTATTGATTGTGTTTTTCTTGATA
ATGCCTTTTATTTCCACTTGTATGTATCGTCTTCTAAACATATTTACCCTTTCTGGGTGA
TGATAAGCTC

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DS 



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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CR16TF U 1
AF RS1CR16JQ C 182
BS 1 787 RS1CR16TF
BS 788 848 RS1CR16JQ

RD RS1CR16TF 787 0 0
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CAACCATGTATACTCGGTTGATACAAGGTTATGAAGCAATGGATCTAGAAACGAAGGAGT
CAAGCGCTTTTGCCGCGCAGAAGCTTCGCCTAATGATGTCTGGCTCCTCTGCTCTTCCTA
GACCGGTCATGCACCAGTGGGAAAGTATCACAGGTCATCGTCTTTTGGAACGATATGGCA
TGACTGAGTTTGTAATGGCAATATCAAACCCTCTACTGGGTGCAAGGAAAGCAGGAACTG
TAGGCAAACCGCTTCCCGGTGTGGAGGCTAAGATTGTACAAGATGAAAATGATGCGGATG
GAGTGGGTGAGATTTGTGTAAAGAGCCCATCTTTGTTCAAGGAGTACTGGAATCTTCCAG
AAGTGACTAAAGAATCATTCACGGAAGATGGATACTTCAAGACGGGAGATGCTGGTAGAG
TGGATGAGGAAGGATATTACGTGATTCTAGGACGTACTAGCGCTGATATTATGAAGGTTG
GAGGATACAAGTTGTCTGCCTTAGAAATCGAATCTACCCTACTTGAGCACCCTACGGTTG
CAGAATGTTGTGTGTTGGGGGTTACCAGACAAAGATTATGGGGGAAGCGGTTACAGCGAT
AATTGTAGTAGAGACTGGAGCAAAGAGGAAAAAAGAAGATGAGTCAAAACCTGTGATGAC
CTTAGAAGAACTCTGCGGTTGGGCTAAAGACAAGCTTGCTCCTTACAAGCTGCCAACACG
TTTGCTG

QA 1 787 1 787
DS 

RD RS1CR16JQ 667 0 0
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GACTGAGTTTGTAATGGCAATATCAAACCCTCTACTGGGTGCAAGGAAAGCAGGAACTGT
AGGCAAACCGCTTCCCGGTGTGGAGGCTAAGATTGTACAAGATGAAAATGATGCGGATGG
AGTGGGTGAGATTTGTGTAAAGAGCCCATCTTTGTTCAAGGAGTACTGGAATCTTCCAGA
AGTGACTAAAGAATCATTCACGGAAGATGGATACTTCAAGACGGGAGATGCTGGTAGAGT
GGATGAGGAAGGATATTACGTGATTTTAGGACGTACTAGCGCTGATATTATGAAGGTTGG
AGGATACAAGTTGTCTGCCTTAGAAATCGAATCTACCCTACTTGAGCACCCTACGGTTGC
AGAATGTTGTGTGTTGGGG*TTACCAGACAAAGATTATGGGG*AAGCGGTTACAGCGATA
ATTGTAGTAGAGACTGGAGCAAAGAGGAAAAAAGAAGATGAGTCAAAACCTGTGATGACC
TTAGAAGAACTCTGCGGTTGGGCTAAAGACAAGCTTGCTCCTTACAAGCTGCCAACACGT
TTGCTGATATGGGAGAGCTTGCCCCGCAACGCCATGGGAAAGGTGAACAAGAAAGAGCTA
AAGAAAT

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 2

CO CL8859Contig1 601 2 1 U
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AGATCTTCAAGCTAGCAAAGGGTTTCAGGGGAAGAGCGAAGAACTGCATAAGAATCGCGA
GGGAGAGAGTGGAGAAAGCTCTTCAGTACTCTTACAGAGACAGGCGCAACAAGAAACGTG
AGATGCGAGGTCTCTGGATCGAGCGTATCAACGCCGGCTCTCGTCAGCACGGTGTGAACT
ACGGTAACTTTATCCACGGACTGATGAAGGAGAACATCCAGCTGAACCGTAAAGTCCTCT
CTGAGTTGTCTATGCACGAACCTTACAGCTTCAAAGCACTCGTTGACGTCTCCCGCAACT
CCTTCCCTGGAAACAAGAACGTTGTCCAAGCCCCTCGGAAAGTAGACATTTCTTCCATTA
ATGCCTAGTTATTATGAACATGTCTCTCCTTTCTTGTTCTCTTTCAAACAAAGAACACAT
ACCGTTTAGTTATTTGTTTGAATCACATGAACACAAACAAGAGCTTCACAATCTTTGAGC
CAATGTATTTCTGTCTTCTTATTTCGTTTACCAGTTCTAAATCCATTGATTTGTTTACTA
G


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 

AF RS1GW79JQ C 1
AF RS1GW79TF U 1
BS 1 601 RS1GW79TF

RD RS1GW79JQ 601 0 0
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ATGCCTAGTTATTATGAACATGTCTCTCCTTTCTTGTTCTCTTTCAAACAAAGAACACAT
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CAATGTATTTCTGTCTTCTTATTTCGTTTACCAGTTCTAAATCCATTGATTTGTTTACTA
G

QA 1 601 1 601
DS 

RD RS1GW79TF 601 0 0
GGGGCGTTAAACAGTGAGAGAGACAAGGAAGAGGAAGAGGAATAAAGATGAACAAGAAGG
AGATCTTCAAGCTAGCAAAGGGTTTCAGGGGAAGAGCGAAGAACTGCATAAGAATCGCGA
GGGAGAGAGTGGAGAAAGCTCTTCAGTACTCTTACAGAGACAGGCGCAACAAGAAACGTG
AGATGCGAGGTCTCTGGATCGAGCGTATCAACGCCGGCTCTCGTCAGCACGGTGTGAACT
ACGGTAACTTTATCCACGGACTGATGAAGGAGAACATCCAGCTGAACCGTAAAGTCCTCT
CTGAGTTGTCTATGCACGAACCTTACAGCTTCAAAGCACTCGTTGACGTCTCCCGCAACT
CCTTCCCTGGAAACAAGAACGTTGTCCAAGCCCCTCGGAAAGTAGACATTTCTTCCATTA
ATGCCTAGTTATTATGAACATGTCTCTCCTTTCTTGTTCTCTTTCAAACAAAGAACACAT
ACCGTTTAGTTATTTGTTTGAATCACATGAACACAAACAAGAGCTTCACAATCTTTGAGC
CAATGTATTTCTGTCTTCTTATTTCGTTTACCAGTTCTAAATCCATTGATTTGTTTACTA
G

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 2

CO CL8860Contig1 875 2 2 U
CTAATCCCAAAAAACTCGTTGATCATAACATGCCGGGAAGTTATCACCGCCGGGGATCCG
ACGTGTCAGTCATCATTTTGATGATCGCGTTACTGACGTGTCCAGTAATCATCAACGCTT
CATCATCATCATCATCATCGGTAGCCAACACGAGGAAGCTCGACGAGGTAGATCCCATAA
AGTGCTCTCCAAGCTGCATCCAAAACCCTCCTCCGCCGTCTCCTCCACCACCATCTCCAC
CGCCTCCGGCATGTCCTCCTCCGCCGGCTCTCCCTCCACCGCCTAAGAAAGTTTCACCCA
ACTGTCCACCGCCTCCCCCGGCTAATTTCTTGTACATAACGGGTCCGCCGGGAAATCTCT
ACCCCGTTGATGAGCAATTCGGAGCGGCCGCCGGAAAAAGCTTTACGGTGTTGAAGCTGT
CCGGTCTAATCGGGTTTGGACTTATGGGGTTGTTGGTTCTTTGAAGCATGAACGGATCAA
AAGAAAAAGTTGAAGATTTGGTGGTATGTTGGAATACTTTTTAATTAGTTTTTTTTTAAG
AGATCGAAAAACGTTATTGATCGTTGGTTGATAAATAATCTATCTATCTAGGATTATATA
TGTTTCAACATATTTTCCTATATCCAAAATTTCTAATGGGGTTTTTAAACCAAATAAATA
CGGTGCGAATATGTAAATTCTATAATGTTATCTCTTTAAGTGATATGTTTTTCTCTTTGT
CAACTTGGCGTTCCAATTGATTCTTGGAATTGGAAAATTGTACTTTATGGAGAATATTTT
TATGAGAAAGCAAATTCTACTTATAAAAGTTAAGAGATGTAAAGTTGAATTTATCCATAA
ATGTAAACTGAAAAGGTTAAAAGGCAAAATTGGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1F694TF U 1
AF RS1F694JQ C 50
BS 1 658 RS1F694TF
BS 659 875 RS1F694JQ

RD RS1F694TF 658 0 0
CTAATCCCAAAAAACTCGTTGATCATAACATGCCGGGAAGTTATCACCGCCGGGGATCCG
ACGTGTCAGTCATCATTTTGATGATCGCGTTACTGACGTGTCCAGTAATCATCAACGCTT
CATCATCATCATCATCATCGGTAGCCAACACGAGGAAGCTCGACGAGGTAGATCCCATAA
AGTGCTCTCCAAGCTGCATCCAAAACCCTCCTCCGCCGTCTCCTCCACCACCATCTCCAC
CGCCTCCGGCATGTCCTCCTCCGCCGGCTCTCCCTCCACCGCCTAAGAAAGTTTCACCCA
ACTGTCCACCGCCTCCCCCGGCTAATTTCTTGTACATAACGGGTCCGCCGGGAAATCTCT
ACCCCGTTGATGAGCAATTCGGAGCGGCCGCCGGAAAAAGCTTTACGGTGTTGAAGCTGT
CCGGTCTAATCGGGTTTGGACTTATGGGGTTGTTGGTTCTTTGAAGCATGAACGGATCAA
AAGAAAAAGTTGAAGATTTGGTGGTATGTTGGAATACTTTTTAATTAGTTTTTTTTTAAG
AGATCGAAAAACGTTATTGATCGTTGGTTGATAAATAATCTATCTATCTAGGATTATATA
TGTTTCAACATATTTTCCTATATCCAAAATTTCTAATGGGGTTTTTAAACCAAATAAA

QA 1 658 1 658
DS 

RD RS1F694JQ 826 0 0
CCGGGGATCCGACGTGTCAGTCATCATTTTGATGATCGCGTTACTGACGTGTCCAGTAAT
CATCAACGCTTCATCATCATCATCATCATCGGTAGCCAACACGAGGAAGCTCGACGAGGT
AGATCCCATAAAGTGCTCTCCAAGCTGCATCCAAAACCCTCTTCCGCCGTCTCCTCCACC
ACCATCTCCACCGCCTCCGGCATGTCCTCCTCCGCCGGCTCTCCCTCCACCGCCTAAGAA
AGTTTCACCCAACTGTCCACCGCCTCCCCCGGCTAATTTTTTGTACATAACGGGTCCGCC
GGGAAATCTTTACCCCGTTGATGAGCAATTCGGAGCGGCCGCCGGAAAAAGCTTTACGGT
GTTGAAGCTGTCCGGTCTAATCGGGTTTGGACTTATGGGGTTGTTGGTTCTTTGAAGCAT
GAACGGATCAAAAGAAAAAGTTGAAGATTTGGTGGTATGTTGGAATACTTTTTAATTAGT
TTTTTTTTAAGAGATCGAAAAACGTTATTGATCGTTGGTTGATAAATAATCTATCTATCT
AGGATTATATATGTTTCAACATATTTTCCTATATCCAAAATTTTTAATGGGGTTTTTAAA
CCAAATAAATACGGTGCGAATATGTAAATTCTATAATGTTATCTCTTTAAGTGATATGTT
TTTCTCTTTGTCAACTTGGCGTTCCAATTGATTCTTGGAATTGGAAAATTGTACTTTATG
GAGAATATTTTTATGAGAAAGCAAATTCTACTTATAAAAGTTAAGAGATGTAAAGTTGAA
TTTATCCATAAATGTAAACTGAAAAGGTTAAAAGGCAAAATTGGTG

QA 1 826 1 826
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8862Contig1 835 2 2 U
GACTCATCGCTTGTCATATTCTTCCTAAACATAGGAATCATCTACTCTCAGGCCTTCAGA
GCAGGTGGCCAAACAGCTGACATGGACGCTGTCGGCACAACCATGTTCACTTGCATTATA
TGGGCAGTCAATGTTCAAATAGCACTAACCATGTCCCATTTCACTTGGATCCAACACGTT
TTGATCTGGGGAAGCATTGGGTTATGGTATCTCTTTGTAGCACTCTATGGGATGATGCCA
TCAAGCCTCTCTGGAAACGTTTACAGGATTCTTGAAGAGGTTCTTGCACCTGCACCCATC
TACTGGATGGCTACCTTGCTGGTCACGGTAACTGCGGTTCTTCCTTACGTTACTCACATA
GCTTACCAGAGATTCTTGCATCCGATGGATCATCATATCATACAAGAGATCAAGTACTAC
AAGAGAGATGTGGAGGATGCGAGGTTGTGGACCAGAGAGCGTACAAAGGCACGAGAGGAG
ACCAAGATTGGTTTCACAGCTAGAGTTGATGCGAAGATCAGACATCTAAGGACGAAACTG
AGCAAGAAGCAGTCGAATCTATCTCATTGTTCAGCTCAAGATGCAATGACACCTAGATCA
TTGTAGCATGTATAGGTTTGTTCAAATTCTCTGATGCGTCAAGACTTTGGAAATGGTTCT
TGATGCTGTTTCTCTTTTTGTGGAGAGGTTTTAGGAGTGAGATCGATGTAAAGAGTAGTT
GCTGATGTGTTTTTTTAATTGCTTGGTTCTCATTTTTTTAACATGCTTTTGTTTCCTTTG
TACAAAACTTAGGTTTTGTGGATATGCTTACTTAGGACACAGAATGCTAAAGCCT


BQ
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AF RS1EY65TF U 1
AF RS1EY65JQ C 88
BS 1 689 RS1EY65TF
BS 690 835 RS1EY65JQ

RD RS1EY65TF 689 0 0
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DS 

RD RS1EY65JQ 748 0 0
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ACCATGTCCCATTTCACTTGGATCCAACACGTTTTGATCTGGGGAAGCATTGGGTTATGG
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QA 1 748 1 748
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1E563TF U 1
AF RS1E117TF U 1
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CCC


BQ
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10 10 10 

AF RS1FW02JQ U 50
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BS 1 49 RS1FW02TF
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BS 341 663 RS1FW02TF

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ATTAAAAGAACAAATAAATAGAAACACAAAAAGGCAAAATACGAATTTGAATCACTTTCC
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QA 1 291 1 291
DS 

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AAATAAATAGAAACACAAAAAGGCAAAATACGAATTTGAATCACTTTCCAAATTCAACGC
CTGCACCTTGTGATGGTGCTGCATCCACGGCGGTAAGGATTCGCCTGAGCGCCACGCTGG
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TCCTCTTCCTCGGCGATACACTCAGCGATGGACCCTTTGCATCCGGAGAAGAGAGAAGAA
GATCCGGTTCGCACGAAGTCAAGCGAACCTCCGAAGTCGCCGACGCTTGCTTGTGCGGTT
GAGATTACGATCGTGAGGATGGCGATGACAGCGTAGATCGCCCGAGAGTTCATCGTATTC
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TTGTGTTTTCCTCTTTCTCTCTCTGTCTGTCTGAAACTTGATTCTGTACTTAGCTGAAGA
CCC

QA 1 663 1 663
DS 



AS 1 2

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CGTGCGCTCCGCTTCGCTAATTTGCAGCTCCAGCTCGATCACTGCTTGTTCAAGGAAGCT
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BQ
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AF RS1AG09TF U 1
AF RS1AG09JQ C 139
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BS 733 1020 RS1AG09JQ

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GGTTATGGAGTGTAGGCTATAGACCATCCTGGTTTTGGCCTATCTGATGGTCTTATCCTT
GTGGCTCCCATGTGTAAGATCGCAGAAGATGTAAAGCCTCCTAAGCTAGTCTTGAACGCG
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ATGCAAGTTTAT

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DS 

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GAGGCCGGAGTTAAAATCAAAGCGGCGGTGTTTTTCTGTCATGGCTATGGCAGTACTTGC
ACTTTCTTCTTCGATGGTATAGCAAAGCAAATAGCAGGTTCTGGTTATGGAGTGTAGGCT
ATAGACCATCCTGGTTTTGGCCTATCTGATGGTCTTATCCTTGTGGCTCCCATGTGTAAG
ATCGCAGAAGATGTAAAGCCTCCTAAGCTAGTCTTGAACGCGTTGATCATGATGTCAACA
CTGTTTCCCAAAGCAAAGCTCTTTCCAAAGAAAGACATGAGCGAGCTCTTCTTCAGAGAC
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AAAACTGCTGTTGAGCTTCTAAAAGCGACAAGAGACATTGAGATGCAAGTTTATAAGGTC
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AAGTTCCTTCACGACCAAGCAATCAGCCAAGACAAAACTCTGAAGCTCTATCCAGTTGGC
TACCATTGTATTCTAGAAGGTGATACAGACGAAAATATTTTCACAGTACTCAACGACATA
GTTGCTTGGCTCGATGCTCGTACAACTCCCAAGTAAACTTAGAAAATCATATATTTATTG
CTGTCTTATGGAACTCTCTGCGATTAATTACATGAGGAAAAT

QA 1 882 1 882
DS 



AS 1 2

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ATTATATGGTCCATTATATATTTTATCTATCTGTTCATCGTCATATTTGGGCTAATGGAC
TTTCTTATTAATTCTTCTGCGACGAGTAATGAAACACAGACGTTTTATAGAGTAGTTAAT
AAGAAATTTCAGTCGGTTTAGGTTTATGTCATTAATTTAACTTGGTTAAATCATAAACCA
TTAGAACCAACAATCATGTGAAATTATAATCAAATGAGGGAATTTTGGTTTTTAACTTTT
GGGATAAAAACACGGTTAAAAAATTATGCAGATTGTTGTGTAAGATGCTAGTTAGGGAAA
AATGTGGGGTTTCCAACAGATTATGTAAAAAGATGCATGAACTAATGAAAAGATTATAAT
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GAAATGTAAAACTGGGAATTTCACAATTGG


BQ
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ATTATATGGTCCATTATATATTTTATCTATCTGTTCATCGTCATATTTGGGCTAATGGAC
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DS 



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GCC


BQ
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10 10 10 

AF RS1FJ87TF U 1
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DS 



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BQ
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AF RS1H080TF U 1
AF RS1H080JQB C 173
BS 1 771 RS1H080TF
BS 772 815 RS1H080JQB

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CACTCTCCTCTCTCTCCCTCTTTAATACCCTTTATTAAAGTTTGGATCTTTTAGGGTTTT
TCTCGTATCTGTTCGTAAGGATCGTGATCGTTCTCGTTTATGCTCTGTTTAGGAAATCTA
AAGGTTGAAACTTTATAGAGGTTTTGTTAACAATGTTTTCTCTCTATAACCCCAATTAGT
TTCAGTTGTTGTCGGATGTATCTATGTTTCGTTGCTGATCGATTGAAGTTCTGATCGATT
GTAGAGACAGGGAGAGGAGAATGGAGATGGTGGCTCGAAGCATGGTTTGGTCGGAGAGGG
TATTGATTTGATTTTTCTCACTAGGAACTTGATTTAACTTCAAAAGGTTTGATTGTATTT
TGACATATTCTGTATCCCATTGAAGTTATCAGTGGGGACTTGTGGTGTCGCTTCAATTCT
TGTTTTATAACTGTCATTATACTGGCTAAACCCAGCAATGTACATGTCATTATCATATAC
TCTCTTTTCTTTTGTTTCTTTGGCAAAGATGTAATAACCACAAACCCCTGC

QA 1 771 1 771
DS 

RD RS1H080JQB 643 0 0
TCGCCAAGCACATCGAGGAGAACTATCGCAAGCCCAAGAAGGACGACGTTGAATGATTCG
GTACCCACCACTCTCCTCTCTCTCCCTCTTTAATACCCTTTATTAAAGTTTGGATCTTTT
AGGGTTTTTCTCGTATCTGTTCGTAAGGATCGTGATCGTTCTCGTTTATGCTCTGTTTAG
GAAATCTAAAGGTTGAAACTTTATAGAGGTTTTGTTAACAATGTTTTCTCTCTATAACCC
CAATTAGTTTCAGTTGTTGTCGGATGTATCTATGTTTCGTTGCTGATCGATTGAAGTTCT
GATCGATTGTAGAGACAGGGAGAGGAGAATGGAGATGGTGGCTCGAAGCATGGTTTGGTC
GGAGAGGGTATTGATTTGATTTTTCTCACTAGGAACTTGATTTAACTTCAAAAGGTTTGA
TTGTATTTTGACATATTCTGTATCCCATTGAAGTTATCAGTGGG*ACTTGTGGTGTCGCT
TCAATTCTTGTTTTATAACTGTCATTATACTGGCTAAACCCAGCAATGTACATGTCATTA
TCATATACTCTCTTTTCTTTTGTTTCTTTGGCAAAGATGTAATAACCACAAACCCCTGCT
AATATCTTGTTTGATTAAAGGATTATTTATAGTTTTTTTAGCT

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 2

CO CL8869Contig1 1045 2 2 U
GGAAAAGATGATTGTTCGTCTCCAAGCCCTTTTAGGCAACAGATGGGCAGCCATCGCATC
ATACCTTCCAGAAAGGACAGACAATGATATAAAGAATTATTGGAACACTCACTTGAAGAG
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CACTGTTTCACAAAAGCAACATCAAAGCTCAAACAAAGGTCAATGGGAGAAAAGACTTCA
GACAGATATAAACATGGCAAAGCAAGCTCTATGCGAGGCTTTATCTTTAGACAAAAAACC
ATCATCAAAACTTTCTCTATCTTCATCATCATTGTCAATCATACCACAAAACATCCCTGG
TTCTTCTTCCGCTTCCACAACCACAATCACCACTACAAGCAACACCACTACTCAATTCCT
ATCAGGGGTATATGCGTCAAGTGCTGAGAATATTGCTCGGTTGCTTCAAGATTTCATGAA
AGACCCACCAAAAACATTAACTCTTACATCCTCATCATCACCGGTTTCAGAGACCGGTCC
ACTTGTTTCAGCAGCTACCGAAGAAAGCGGAGAAGGGTTTGAACAATCTTTTTTTAGCTT
CAATTCCATGGAACAAACTCAGAATTTGACTCAGGAGGAAAGCTTCTTCCATGACCAAGT
GAGCAAACCGGAGATAACAATGGAGCAAGACTCTGGTTTGATATCGCAAGGATCTTTATC
GTTGTTTGAGAAATGGTTATTTGATGAGAACATGGTTGGCATGTCGTTAGAAGGACAGGA
AGCGATGTGCTAGAACTAAATCAAGTGGAATATTTCTAGAATATGAGGGTTAATTAGTTA
TAACCTATAGTATGTATGTTTATTATTGCATTAGGGTTTTAGAGTCTTTAGGAGCTTTTA
GCTCTACAACACTCTTTTCCCCTTTTGGCGATATAATCTATTTTTCTTTTTTATTGTATC
TTTCAGAACGTAACACAAAGGGTGTACGTGTACCCGTCTTTATTAATGTAATGTGTTTTG
TACTATATGGCTCATATGGTTTATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D177TF U 1
AF RS1D177JQ C 287
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BS 573 1045 RS1D177JQ

RD RS1D177TF 572 0 0
GGAAAAGATGATTGTTCGTCTCCAAGCCCTTTTAGGCAACAGATGGGCAGCCATCGCATC
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GACAGATATAAACATGGCAAAGCAAGCTCTATGCGAGGCTTTATCTTTAGACAAAAAACC
ATCATCAAAACTTTCTCTATCTTCATCATCATTGTCAATCATACCACAAAACATCCCTGG
TTCTTCTTCCGCTTCCACAACCACAATCACCACTACAAGCAACACCACTACTCAATTCCT
ATCAGGGGTATATGCGTCAAGTGCTGAGAATATTGCTCGGTTGCTTCAAGATTTCATGAA
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ACTTGTTTCAGCAGCTACCGAAGAAAGCGGAG

QA 1 572 1 572
DS 

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ACTACTCAATTCCTATCAGGGGTATATGCGTCAAGTGCTGAGAATATTGCTCGGTTGCTT
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TTCCATGACCAAGTGAGCAAACCGGAGATAACAATGGAGCAAGACTCTGGTTTGATATCG
CAAGGATCTTTATCGTTGTTTGAGAAATGGTTATTTGATGAGAACATGGTTGGCATGTCG
TTAGAAGGACAGGAAGCGATGTGCTAGAACTAAATCAAGTGGAATATTTCTAGAATATGA
GGGTTAATTAGTTATAACCTATAGTATGTATGTTTATTATTGCATTAGGGTTTTAGAGTC
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TTTTTTATTGTATCTTTCAGAACGTAACACAAAGGGTGTACGTGTACCCGTCTTTATTAA
TGTAATGTGTTTTGTACTATATGGCTCATATGGTTTATG

QA 1 759 1 759
DS 



AS 1 2

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GGATCTTCCCGAGGAGTGGGACTCGCCGTACGTGTTGCATTACACGGAGTATGATGGGAA
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AGCTAACTCTAGAGTTGCCAAGTCTATCGGTGCTGGAGACTACGACTATGCCATCGCTTT
TCAGGAGAGAATCAGAATCCCAGATGATAAGATGACGTACTACGAGGATCTAGCTGAGAT
GTACGTCGGTGATGACGTGTCGCCGGACTTTTACGGATGGGTGTTCCCCAAATGCGACCA
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CCCTATTCCTGAACACCCGAGACCGCGCAGGCTCTCCAAGCGCGTCGCTCTTGTTGGTGA
TGCTGCAGGGTACGTGACTAAATGCTCCGGCGAAGGGATCTACTTCGCTGCAAAGAGTGG
AAGGATGTGTGCTGAAGCCATCGTTGAAGGTTCACAGAACGGTAAGAAGATGATCGATGA
AAGTGATTTGAGGAAGTACTTGGAGAAATGGGACAAGACGTACTTGCCTACGTACAGGGT
GCTTGATGTGTTGCAGAAAGTGTTTACAGAT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 0 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1E506TF U 5
AF RS1F630TF U 1
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GGA
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CCTGAACACCCGCGACCGCGCAGGCTCTCCAAGCGTGTGGCTCTTGTTGGTGATGCTGCA
GGGTACGTGACTAAATGCTCCGGCGAAGGGATCTACTTCGCTGCAAAGAGTGGAAGGATG
TGTGCTGAAGCCATCGTTGAAGGTTCACAGAACGGTAAGAAGATTATCGATGAAAGTGAT
TTGAGGAAGTACTTGGAGAA
TG

QA 4 683 4 683
DS 

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AACGGGAGCTACGGGACAGAAGAAGACGATGGAGGTTGACGCCGTTATCGGAGCTGACGG
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GCTTGATGTGTTGCAGAAAGTGTTTACAGAT

QA 1 751 1 751
DS 



AS 1 2

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TTCGGTTCCCTGAACCGGAAGAGCTCCTTCAGACATTTAAAACTCAGCAGAAGAGTGTAA
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TTTGTTTTTTTCTTTTTTCTTTATATGATGGTTTTTTATGTTGAATTTTGATTATGTGAG
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1F871TF U 1
AF RS1F871JQ C 73
BS 1 660 RS1F871TF
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RD RS1F871TF 691 0 0
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*CTCTTCGGATCAGTCGGGTAAGTCTAAGAA

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DS 

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CTAGTATTGTATCCGAATATATAAAGTTATTTCGAC

QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1F304JQ C 1
AF RS1F304TF U 1
BS 1 597 RS1F304TF

RD RS1F304JQ 597 0 0
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CTTTTCTCTTCTCTTCTTTATGGTTTCTTATAATTTGTACGGTACACATATAAGTTGGAG
GATTTGGATAATCTTGGTTGTTGTATGATCCATTAAGTGTTTAGTTGTGCTATAAGCCTA
TAAGCTTTGAATATTTCATGTGTACTCTCTTGCACAAATAATACAAGGCGTCAAGGC

QA 1 597 1 597
DS 

RD RS1F304TF 597 0 0
GGAGAAACCTAAAGAAAGAAGAAAGACAGGAAAAAATGGCGAAGTATTTTTCTCTGTTTC
CAACCCTTATGATACTCAGCTTCTTCTTTATCATCTCTTCACCTCTGATCCAAGCCGGCT
TCACCGATGACCTCAAGGGTCTAGAATGGTCATCTACGGGAGGCCATGGCTCCTCAGGCT
GCCACGGTTCCATAGCAGACTGTATCGGAGCAGAGGAAGAGGAAATGGACTCAGAGATCA
ACAGAAGAATATTGGCGACAACAAAATACATAAGCTATCAATCTTTGAAGCGGAACAGTG
TGCCTTGTTCGAGAAGGGGCGCGTCTTATTACAATTGCCAGAACGGAGCTCAGGCTAATC
CTTATAGTCGTGGTTGCAGCGCTATTGCTCGTTGCAGGAGTTAGGTGTCAAGAACAAGCT
CTTTTCTCTTCTCTTCTTTATGGTTTCTTATAATTTGTACGGTACACATATAAGTTGGAG
GATTTGGATAATCTTGGTTGTTGTATGATCCATTAAGTGTTTAGTTGTGCTATAAGCCTA
TAAGCTTTGAATATTTCATGTGTACTCTCTTGCACAAATAATACAAGGCGTCAAGGC

QA 1 597 1 597
DS 



AS 1 2

CO CL8873Contig1 570 2 1 U
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GCCGTCGACAAATCTCTAAACCCTAGCAAACCCGAAACCAAACCACCGAAGCAGAGCCTT
GAAACCGCTTCCCACGAGCCATCCACTAGCGTTGGAGTTGGAGAAGATTCCTCCACCGTA
GCTTCCTCAGCAGGTCCGCGGAGATGCTTGAGCTGTAACAAGAAAGTGGGCGTGACGGGG
TTCAAGTGCAGGTGCGGGAGTACTTTCTGTGGAGCCCACAGGTACCCGGAGAGCCACGAC
TGCGAGTTTGATTTCAAAGGAGCGGCTAGAGAAGCTATTGCTAAGGCCAATCCTGTGGTG
ATAGCTGATAAGGTTAAGAAGATATGATTTATTTGAAGATGAAAATCTGTCTTTTCTTGG
TGTTTGCTTCTTTTTTTTTTTTCTCTTCTTTGGTTTGCTTTTTAAGTGTTTCTTATTAGG
AAAAAGAAGTGTTTAGGATTCTGCTTTTGTGATTTCATGATTTATTGTTCTGTAATAAAA
AAAAAGTTTGAATCATTGGAAGTTGTGGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AJ04JQ C 1
AF RS1AJ04TF U 1
BS 1 570 RS1AJ04TF

RD RS1AJ04JQ 570 0 0
TGCTCCAAGTGCTACCGAGACATCCGAGCCACGGAGGAGCAAGCCGCCTCTGCTAGATCC
GCCGTCGACAAATCTTTAAACCCTAGCAAACCCGAAACCAAACCACCGAAGCAGAGCCTT
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TGTTTGCTTCTTTTTTTTTTTTCTCTTCTTTGGTTTGCTTTTTAAGTGTTTCTTATTAGG
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AAAAAGTTTGAATCATTGGAAGTTGTGGCC

QA 1 570 1 570
DS 

RD RS1AJ04TF 570 0 0
TGCTCCAAGTGCTACCGAGACATCCGAGCCACGGAGGAGCAAGCCGCCTCTGCTAGATCC
GCCGTCGACAAATCTCTAAACCCTAGCAAACCCGAAACCAAACCACCGAAGCAGAGCCTT
GAAACCGCTTCCCACGAGCCATCCACTAGCGTTGGAGTTGGAGAAGATTCCTCCACCGTA
GCTTCCTCAGCAGGTCCGCGGAGATGCTTGAGCTGTAACAAGAAAGTGGGCGTGACGGGG
TTCAAGTGCAGGTGCGGGAGTACTTTCTGTGGAGCCCACAGGTACCCGGAGAGCCACGAC
TGCGAGTTTGATTTCAAAGGAGCGGCTAGAGAAGCTATTGCTAAGGCCAATCCTGTGGTG
ATAGCTGATAAGGTTAAGAAGATATGATTTATTTGAAGATGAAAATCTGTCTTTTCTTGG
TGTTTGCTTCTTTTTTTTTTTTCTCTTCTTTGGTTTGCTTTTTAAGTGTTTCTTATTAGG
AAAAAGAAGTGTTTAGGATTCTGCTTTTGTGATTTCATGATTTATTGTTCTGTAATAAAA
AAAAAGTTTGAATCATTGGAAGTTGTGGCC

QA 1 570 1 570
DS 



AS 1 2

CO CL8874Contig1 668 2 3 U
TTTTTTTGCGTAGAAGGTGTGTCATCACCAGAGAAGAGTTGAACAAATTGGTCCCGTTAC
ATATAGTTTTTATACATAACATGTAACTTTACATTTGGTCAAGTGCCTGGGAAAGAGCTA
GGTGTGGTGCTTGATACGATGATGAATGCACAAACAACAGAAAGAGAGAAAACAGAGACC
CAAGTATTCTCAGTATACATCTCCATCGCGTCTGTTAACGACAACCTCGTCCGGTTCTCT
GCCCAGTTCCTTAGTCTGTCTGCTTCCGCTGCATATAACGCCCGTCCTTGGTCGTCAAAC
CACCGGCCTCTCCTGAGCCAGGAAGTGACGATAGCTAGCAATATCCTTGGAGGAGTTAGG
TAATTGACTGATTTCCCTGAACCTTTGACAACACGCATTCGTGGTACTAGCGTTCTAGCT
ACCGTCTCGGGAAGCTCGCAGATTATGTTAAACATCTGCTTGTTTTTTATACTCGAACCA
CTGAGAAGAAGTTCGGTGAGAACCATGCCCGGGGAAGCAGTGTGCAAGCCAACTTTTGTC
TTTTGGGATTCTTTCACAACAGAACCATGAAATTGCCTAAGTCCACATTTTGTTGACCCA
TATATAGCCGTGAGAGGAGTGTTAGAGCCTCCAGAACCAGCACCATCCATGTTAAAGATG
TGTCGACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1H610JQB U 8
AF RS1H610TF C 1
BS 1 7 RS1H610TF
BS 8 599 RS1H610JQB
BS 600 668 RS1H610TF

RD RS1H610JQB 592 0 0
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TTTTATACATAACATGTAACTTTACATTTGGTCAAGTGCCTGGGAAAGAGCTAGGTGTGG
TGCTTGATACGATGATGAATGCACAAACAACAGAAAGAGAGAAAACAGAGACCCAAGTAT
TCTCAGTATACATCTCCATCGCGTCTGTTAACGACAACCTCGTCCGGTTCTCTGCCCAGT
TCCTTAGTCTGTCTGCTTCCGCTGCATATAACGCCCGTCCTTGGTCGTCAAACCACCGGC
CTCTCCTGAGCCAGGAAGTGACGATAGCTAGCAATATCCTTGGAGGAGTTAGGTAATTGA
CTGATTTCCCTGAACCTTTGACAACACGCATTCGTGGTACTAGCGTTCTAGCTACCGTCT
CGGGAAGCTCGCAGATTATGTTAAACATCTGCTTGTTTTTTATACTCGAACCACTGAGAA
GAAGTTCGGTGAGAACCATGCCCGGGGAAGCAGTGTGCAAGCCAACTTTTGTCTTTTGGG
ATTCTTTCACAACAGAACCATGAAATTGCCTAAGTCCACATTTTGTTGACCC

QA 1 592 1 592
DS 

RD RS1H610TF 668 0 0
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ATATAGTTTTTATACATAACATGTAACTTTACATTTGGTCAAGTGCCTGGGAAAGAGCTA
GGTGTGGTGCTTGATACGATGATGAATGCACAAACAACAGAAAGAGAGAAAACAGAGACC
CAAGTATTCTCAGTATACATCTCCATCGCGTCTGTTAACGACAACCTCGTCCGGTTCTCT
GCCCAGTTCCTTAGTCTGTCTGCTTCCGCTGCATATAACGCCCGTCCTTGGTCGTCAAAC
CACCGGCCTCTCCTGAGCCAGGAAGTGACGATAGCTAGCAATATCCTTGGAGGAGTTAGG
TAATTGACTGATTTCCCTGAACCTTTGACAACACGCATTCGTGGTACTAGCGTTCTAGCT
ACCGTCTCGGGAAGCTCGCAGATTATGTTAAACATCTGCTTGTTTTTTATACTCGAACCA
CTGAGAAGAAGTTCGGTGAGAACCATGCCCGGGGAAGCAGTGTGCAAGCCAACTTTTGTC
TTTTGGGATTCTTTCACAACAGAACCATGAAATTGCCTAAGTCCACATTTTGTTGACCCA
TATATAGCCGTGAGAGGAGTGTTAGAGCCTCCAGAACCAGCACCATCCATGTTAAAGATG
TGTCGACC

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL8875Contig1 968 2 2 U
GGGCTTTCTCTTCACTCAAAATAAGCTCTGACGTAATCTCTTTACTCCCACAACACGCAG
AGATATAAAACTTTCTCCGAGAGAGAGAGATTTCAAGTCGGTCGGTTCTGTTATTTTTTT
TTTTTAAACTCTGAAACTAAACTCGGTTAATTCCGGTTTAAGCGCGAATTTTCCTCATAA
TGGATCATCTGACCCAAGGGTTGTGCCGAGAAGCGGTGACCGGACTTGAATCGCTCAGTT
TCAGCGACGAAATTCAGCAGCTGGTGATGATGCCGCCGGAGAACACCGGTTCCTTCACGT
CTTTGCTCGAGATGCCGGCGACTCAGGCCATGGAGCTTTTCGCCGGATATATCGCTCGCT
TCTCGGTGGTTGCTGCTGAAGACCAAAACGGAAACTTCTCCGGCGAGTCCGCACCTTCGA
GTTCGACAGGTAGAGTCAAGTCCGAGCCTTGTGAGAACGATTCATCTCAGCGGCTCGTGT
CTTATCCAACGGCTGAGAACCAGAATCAGAATCAGAACAAGAGGAAAGAGCGTGGGAAGA
AGGTCAAAAGCTCGATGAAGAAGAACAAGAGCTCTGATGAAGCAGAGAAGCTTCCGTATG
TTCACGTTAGAGCTCGTCGTGGTCAAGCTACTGATAACCATAGCTTAGCTGAGAGAGCAA
GAAGGGAGAAGAATCTTATCATCAGCTGCAACAGTGGACTCTCGATAGCTACCTCCCGTT
GGAGTGGGGGGAGAAGAGGTTCATCATGAAGCCAATTTCTTGATGAGTTCAGCTACTTTG
CACCCAAATCAGATGAAAATGGAGCTATAAGTTTCCAAACGAGTTGACATGCTTTTGTAT
ATATAAGAGAGATATCATCTCCTGAGGTTTCGGTTGTTGTTTTTTAGGTAGAAAATGAGT
ATGAACTTACGACCATGGCTTTCTGTATAATTCAGAATGTTTCTTCAACAACTTTCACAT
GGAACCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

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BS 797 968 RS1BW33JQ

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AGATATAAAACTTTCTCCGAGAGAGAGAGATTTCAAGTCGGTCGGTTCTGTTATTTTTTT
TTTTTAAACTCTGAAACTAAACTCGGTTAATTCCGGTTTAAGCGCGAATTTTCCTCATAA
TGGATCATCTGACCCAAGGGTTGTGCCGAGAAGCGGTGACCGGACTTGAATCGCTCAGTT
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TCTCGGTGGTTGCTGCTGAAGACCAAAACGGAAACTTCTCCGGCGAGTCCGCACCTTCGA
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CTTATCCAACGGCTGAGAACCAGAATCAGAATCAGAACAAGAGGAAAGAGCGTGGGAAGA
AGGTCAAAAGCTCGATGAAGAAGAACAAGAGCTCTGATGAAGCAGAGAAGCTTCCGTATG
TTCACGTTAGAGCTCGTCGTGGTCAAGCTACTGATAACCATAGCTTAGCTGAGAGAGCAA
GAAGGGAGAAGAATCTTATCATCAGCTGCAACAGTGGACTCTCGATAGCTACCTCCCGTT
GGAGTGGGGGGAGAAGAGGTTCATCATGAAGCCAATTTCTTGATGAGTTCAGCTACTTTG
CACCCAAATCAGATGA

QA 1 796 1 796
DS 

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CGGTTCCTTCACGTCTTTGCTCGAGATGCCGGCGACTCAGGCCATGGAGCTTTTCGCCGG
ATATATCGCTCGCTTCTCGGTGGTTGCTGCTGAAGACCAAAACGGAAACTTCTCCGGCGA
GTCCGCACCTTCGAGTTCGACAGGTAGAGTCAAGTCCGAGCCTTGTGAGAACGATTCATC
TCAGCGGCTCGTGTCTTATCCAACGGCTGAGAACCAGAATCAGAATCAGAACAAGAGGAA
AGAGCGTGGGAAGAAGGTCAAAAGCTCGATGAAGAAGAACAAGAGCTCTGATGAAGCAGA
GAAGCTTCCGTATGTTCACGTTAGAGCTCGTCGTGGTCAAGCTACTGATAACCATAGCTT
AGCTGAGAGAGCAAGAAGGGAGAAGAATCTTATCATCAGCTGCAACAGTGGACTCTCGAT
AGCTACCTCCCGTTGGAGTGGGGG*AGAAGAGGTTCATCATGAAGCCAATTTCTTGATGA
GTTCAGCTACTTTGCACCCAAATCAGATGAAAATGGAGCTATAAGTTTCCAAACGAGTTG
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GGTAGAAAATGAGTATGAACTTACGACCATGGCTTTCTGTATAATTCAGAATGTTTCTTC
AACAACTTTCACATGGAACCAT

QA 1 742 1 742
DS 



AS 1 2

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CGATGTTGTCGGCTGTTATGAAGCCCTTACTCTCTCCGTCACCGTCGCTGTTTCGCCTTC
CTCCCCTTTCTTCATTTTCCTCTTCTCTCTCACTCTTCTTTCCCTTTCACTCTCCTCACC
CCTTTACGCCTCTCCGTTCCTCCCGCCGCAACTACACTCGCCGCCACGCGTCTCTCTCCG
ACCACCACCTCTCATGTTGCGGTTGTACATCTAGAGGAAGACGACCAAGGTCTAGCTGCT
GGACAGTTTGCAGCTTTCTATGAAGGAACCATTTGCATTGGTTCTGGCGTTATCCCGGAA
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GACAAAACCAAACTTGGGAAACCTGTCAAAATCATGACCATGCCAGTTACCACATCTGTT
GAGGCTGTGCCAGGAGAAGAAAAGCTTGTAACAAAGGAAATGGTGTAGTAGTCTGAAGAA
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TATTGTTTAGGAAAAAGACTTGTAAGTTGTGACATTTGATAGTTTGGTTATGTCTTTTTA
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CTTGTAAGTTGTGACATTTGATAGTTTGGTTATGTTTTTTTATGTATGGTATGGCTTCAA
GCTACTTCACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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BS 1 723 RS1C683TF
BS 724 792 RS1C683JQ

RD RS1C683TF 723 0 0
GGGGTTTATAATTTTATTGCGAAATAGAGCGCCGGCTACAAGAACTCATCATCGGTTTGG
CGATGTTGTCGGCTGTTATGAAGCCCTTACTCTCTCCGTCACCGTCGCTGTTTCGCCTTC
CTCCCCTTTCTTCATTTTCCTCTTCTCTCTCACTCTTCTTTCCCTTTCACTCTCCTCACC
CCTTTACGCCTCTCCGTTCCTCCCGCCGCAACTACACTCGCCGCCACGCGTCTCTCTCCG
ACCACCACCTCTCATGTTGCGGTTGTACATCTAGAGGAAGACGACCAAGGTCTAGCTGCT
GGACAGTTTGCAGCTTTCTATGAAGGAACCATTTGCATTGGTTCTGGCGTTATCCCGGAA
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GACAAAACCAAACTTGGGAAACCTGTCAAAATCATGACCATGCCAGTTACCACATCTGTT
GAGGCTGTGCCAGGAGAAGAAAAGCTTGTAACAAAGGAAATGGTGTAGTAGTCTGAAGAA
GCTACTTGAAGAGCTGAAAAAAATTGAGAAGCAGATGTTGCTAGAGGATAAGATTACTAA
TATTGTTTAGGAAAAAGACTTGTAAGTTGTGACATTTGATAGTTTGGTTATGTCTTTTTA
TGTATGGTATGGCTTCAAGCTACTTCAATGGCTCTCAGTGGTGGCCTCATGGGAGATCAT
CTT

QA 1 723 1 723
DS 

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TCATTTTCCTCTTCTCTCTCACTCTTCTTTCCCTTTCACTCTCCTCACCCCTTTACGCCT
CTCCGTTCCTCCCGCCGCAACTACACTCGCCGCCACGCGTCTCTCTCCGACCACCACCTC
TCATGTTGCGGTTGTACATCTAGAGGAAGACGACCAAGGTCTAGCTGCTGGACAGTTTGC
AGCTTTCTATGAAGGAACCATTTGCATTGGTTCTGGCGTTATCCCGGAATCATGGACGAT
CAGTGTTTCCCTGTCTGTGAAAAAAGCTCTTCAACTAGCAGCTGTGGAAGACAAAACCAA
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AGGAGAAGAAAAGCTTGTAACAAAGGAAATGGTGTAGTAGTCTGAAGAAGCTACTTGAAG
AGCTGAAAAAAATTGAGAAGCAGATGTTGCTAGAGGATAAGATTACTAATATTGTTTAGG
AAAAAGACTTGTAAGTTGTGACATTTGATAGTTTGGTTATGTCTTTTTATGTATGGTATG
GCTTCAAGCTACTTCAATGGCTCTCAGTGGTGGCCTCATGGGAGATCATCTTGTAAGTTG
TGACATTTGATAGTTTGGTTATGTTTTTTTATGTATGGTATGGCTTCAAGCTACTTCACT
C

QA 1 661 1 661
DS 



AS 1 2

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TATCTCGTTGAAAACTCTTTCAAAATATTTTGCGGACATAATCTTGTACGTCTTCTCGGG
GGGATGAAAACTATCCCAAAACACATAATCATGTCGATTCGGACATACGTCAGCAGTGAA
ATTGTTACATAACACAGCAACTTCAATTAGTCCAGTTCCACAACACCCTCTATCAACCAC
CTGAAATCCATATTGTTGAGGATTTAGAATAATATCAAGAAGAGAATCATATATATCGAT
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AACATTGTAAAGCTTTGTTGCATCATTGAATCTAGAAACACAATTCCTCGTTGGTCCTCC
TGCCACGGTTCTCTGTGAAGGCACACATCCTAGTGGCGGTACACCGAATACTTGTATTCT
TCTCGCTCCATATTCAAGTAATTTTTGAGCAAAAGATCGAGCCTTGTCAACCATAAAAGT
GGTAAAGGAGGCGACATCGTATTGGCGTTGCACAGAA


BQ
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AF RS1E783JQ U 37
AF RS1H155JQB U 1
BS 1 71 RS1H155JQB
BS 72 72 RS1E783JQ
BS 73 577 RS1H155JQB

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QA 1 231 1 231
DS 

RD RS1H155JQB 577 0 0
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ATTGTTACATAACACAGCAACTTCAATTAGTCCAGTTCCACAACACCCTCTATCAACCAC
CTGAAATCCATATTGTTGAGGATTTAGAATAATATCAAGAAGAGAATCATATATATCGAT
GTAGATTAGCGCACTGTCACGTAAAGTTATTGACAGAAAATCTAAGTTTGCAGAAAGCTT
AACATTGTAAAGCTTTGTTGCATCATTGAATCTAGAAACACAATTCCTCGTTGGTCCTCC
TGCCACGGTTCTCTGTGAAGGCACACATCCTAGTGGCGGTACACCGAATACTTGTATTCT
TCTCGCTCCATATTCAAGTAATTTTTGAGCAAAAGATCGAGCCTTGTCAACCATAAAAGT
GGTAAAGGAGGCGACATCGTATTGGCGTTGCACAGAA

QA 1 577 1 577
DS 



AS 1 2

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AAAGCATACTTGAAATCTTCTTCTTTGCGCAAAGCTGCTTTGATGGCTCTGTCCAAGACA
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AATGGCCTCATCACCTTGGATAACATCAGATCGGCACTTGCTTCAAATGCGACAGAAGCA
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ATGGATTTTGGGAGAGTTTTGCGCAGCTTCGATTAGTGTTCATCAGCATGAGTCACTTTG
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CCATTCTACATGACTGGATTAGACACACTGATGGGAAACTAAGCTTCTTGGGTTTTGTCA
AACTGTTGCACGGTGTCTCTACTCGACAACAGCCTTTAGCTAAAACACGGTGATGGATGA
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TCAAAAACTTTACTGATCTTTTGTTATGGAATTGAAAAAAACTGGAATTGTATTGACTCT
CACTCATTCCCATATTTATAAAGAAATGCAAAAGTTTTCAACTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BY77TF U 1
AF RS1BY77JQ C 207
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BS 776 776 RS1BY77JQ
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BS 794 808 RS1BY77TF
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BS 815 830 RS1BY77TF
BS 831 1004 RS1BY77JQ

RD RS1BY77TF 830 0 0
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A*CTGTTGCACG*TGTCTCTACTCGACA*CAGC*TTTAGCTAAAACACGG

QA 1 830 1 830
DS 

RD RS1BY77JQ 798 0 0
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TCTTGCATTGTTAAATGGACTTGAATGCAAAGGGATGGATTTTGG*AGAGTTTTGCGCAG
CTTCGATTAGTGTTCATCAGCATGAGTCACTT*GATTGTTGGGAGCAGAGCGTTCGCCAT
GCTTATGAGCTCTTTGAGATGAATGGAAACCGAGTTATCGTCATCGAAGAACTCGCTTCC
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TGCAAAAGTTTTCAACTG

QA 1 798 1 798
DS 



AS 1 2

CO CL8879Contig1 420 2 1 U
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TTTCTGCAAAACAGAACAGTTTGTGTCTTCTTGTATTTGTCTTGAAGCTCATGTGTCTCA
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BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EQ48JQ U 1
AF RS1FF75JQ U 1
BS 1 420 RS1EQ48JQ

RD RS1EQ48JQ 420 0 0
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AAGTGGTATTTAATTTCTTTTCTCTTACAAACAACAATAAAAAATAAAGAAAATTTTTCT
ATGTTTTCTGCAAAAACTCTGACAAGCTTGTGTGTGTTTCAAACAATTGCCCAAAACTTC
TTTCTGCAAAACAGAACAGTTTGTGTCTTCTTGTATTTGTCTTGAAGCTCATGTGTCTCA
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CTAATAATGATGAATCCCTGAGGGCGTATGATGCGGTCCATCTCAAGCATGATGTCCTCT
AGTAAACAACCTTCACCGTGGTTTTGATAGTGTGACAAGAGTTTGTCCGCGTGTAGCAGA

QA 1 420 1 420
DS 

RD RS1FF75JQ 414 0 0
GT
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GTTTTCTGCAAAAACTCTGACAAGCTTGTGTGTGTTTCAAACAATTGCCCAGAACTTCTT
TCTGCAAAACAGAACAGTTTGTGTCTTCTTGTATTTGTCTTGAAGCTCATGTGTCTCAAC
TTCCCAAAGGAACTTAGGAGCCAAGTCTTGTACTTTTGAGATGATCGATTCCTCGTCTCT
AATAATGATGAATCCCTGAGGGCGTATGATGCGGTCCATCTCAAGCATGATGTCCTCTAG
TAAACAACCTTCACCGTGGTTTTGATAGTGTGACAAGAGTTTGTCCGCGTGT

QA 3 414 3 414
DS 



AS 1 2

CO CL8880Contig1 757 2 2 U
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TGTGTTTCGGTTCTGTCTGAACGGTCATTCATCATCATCGTCGTCTCCATTACTCCATTA
AACCTTTTTCTTGAATCATTACTTGCTTGTGAACGATGAGAAGCCAACAGAGAGATCAAG
ACTCGAGGGCTTTCTACGATCTCTCGGCTCTTGTCCTGAGCCTCCTCCGCTCTCCTCCTG
TCCCGATTTCTCTCCCCGATCATCATCATCACTTCCTTTTGCTGCCGTGGGTCCTGGCTC
TCATCGTGGTTCTTTATGTTGCTGGGATCGTGTCTCTCATTTCCATGGCTGGGAGGTCCA
TCCTCTCTTACCTCTTGACGCCGCCTCCTTCTTTTTCATCCATGAAGGAGATTTCTGAAT
GGAAGCTGTTGTGAAGCGTGACGAACAAACTTCTTGAAATGGCTCTCCTTTGTTAATCCG
GAAGCAGAGGACAAAGAAGATGGATTAAATATATCAACGCAAAATCCAATTAGAGTTTTT
CTATATATGTTCTTTTATCTGTATTTTGGGGGGTGGGGATTATGTGTGGATATATTTGGG
AGTTTCTATAGATTTTTTTTTACTTTCTAAAAAATATTTTCTATTTTATTGTTAGAGAAA
TGGGAAAAGCCTGAGTTTGTGCTTTTTTCCATGGATGGTTTTATTGTTATGTGATATTAT
TTCTTTTAGAAAAAATAATCATACAAAAGATTATAGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

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BQ
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QA 1 632 1 632
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FN44JQ C 1
AF RS1FN44TF U 1
BS 1 608 RS1FN44TF
BS 609 632 RS1FN44JQ

RD RS1FN44JQ 632 0 0
GGTGGATCACGGAAGAAGAGAAATGAGCTACGAGAGAGTTCCACCGGAATCGTATCCTCC
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ATATCCTCCGCCGCATCACGAAGGATATCCTCCACCTCAGCCTCACGGATATCCACCGTA
CCCGCCACCGCGTCCTTACGAAGGCGGTTGTCAAGGCTACTTCGCCGGTAACTATCCTCC
TTTTCCACCTCCGCCGCAACAGTGCAATCACTACCAGCACGATCACCACCATTACCCGGG
TTCGAGCTTTGATGGCTCCTCTTTCCTCCGTGGCTGTCTTGCTGCTCTGTGCTGTTGCTG
TTTGTTGGAGGAATGCTTCTGAAAATGCCCTTCCTTCTCCCCGGATCATCTCTTGTTACT
ATCGTCATTTACAGTCAACATTATATGTTAAATCAAATCCAAGCCATGCCATAACTTCTT
TATGTCTTTATGTACTGTGAAATGTTTCATTGTCTGTTAATGCTTTTCCTCTTTGTTTAA
AAGTGGAACGTGGATCAGAAGAATCCTATGTATGTTCTTTGTAATTTGTTTGAATTATTT
GGAAAAAATATATACTCAGTTTGCTATTTGAT

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1FN44TF 608 0 0
GGTGGATCACGGAAGAAGAGAAATGAGCTACGAGAGAGTTCCACCGGAATCGTATCCTCC
TCCAGGATACCAATCTCATTATCCGCCTCCTGGTTATCCATCGGCGCCTCCGCCTCCGGG
ATATCCTCCGCCGCATCACGAAGGATATCCTCCACCTCAGCCTCACGGATATCCACCGTA
CCCGCCACCGCGTCCTTACGAAGGCGGTTGTCAAGGCTACTTCGCCGGTAACTATCCTCC
TCTTCCACCTCCGCCGCAACAGTGCAATCACTACCAGCACGATCACCACCATTACCCGGG
TTCGAGCTCTGATGGCTCCTCTTTCCTCCGTGGCTGTCTTGCTGCTCTGTGCTGTTGCTG
TTTGTTGGAGGAATGCTTCTGAAAATGCCCTTCCTTCTCCCCGGATCATCTCTTGTTACT
ATCGTCATTTACAGTCAACATTATATGTTAAATCAAATCCAAGCCATGCCATAACTTCTC
TATGTCTTTATGTACTGTGAAATGTTTCATTGTCTGTTAATGCTTTTCCTCTTTGTTTAA
AAGTGGAACGTGGATCAGAAGAATCCTATGTATGTTCTTTGTAATTTGTCTGAATTATTT
GGAAAAAA

QA 1 608 1 608
DS 



AS 1 2

CO CL8884Contig1 755 2 2 U
GGTGTGCTCTTTTCCTTGCTCTTGGTTTTGTCCCACGAGGTTTTCCCGGCGCAAGGTTTT
TAACGAGGCCACAGCTAGCTTAACACATCACCTATATGCATCTCGGTCCAAGACTAAAGA
AGACTCATTGCTTCTTTCTTTCCTTATTTTAACCTTAGTCTATTTTAAGTATTTATTTTG
CGTAACAAGGAGTTTGTTCCTTGAGTCTTTATATTGTTTGGCGAAACAATTTGGAGAGTT
ACACTTGATATTTTATAAAACTTTTCTTTCAAAGAAAACCTAGAGCTCTCAACTGAACTC
GCAGCCGCCTCCTTGCCTTGTGAGACCAGTACCTCCACGGCTTGAAGGTTCCCTTGTGTT
GTATCACGAGCCTTCCATCTCTCGTGTGGTGCACTTCAATCCACCTTGTTCTTAGTCCAC
GGTTTCTCTTGGTTGATTAGATCAAACAATAGAACCACCTCTTGATCTAGAACGGCTCCA
TCTCTCTTGCTTGGATCATACAGCCTTTGTCAGCCTAGGCTTGTATCATTTCTGGTATCA
GAGCTGAAGTTCCTTCAGCATCAGGTTGTATCTATCCTCTCTACTTGTTTTAAAATCGTG
TTAGTTCATCTTTTCATTCAAAAAAAAAAGTAAATCGTTTGATCCCTTTTCATCTAGTTA
GAGTTGCATATTCATATTTGAAAACCCATAAAAAGTGTGTTCTTCGTTAGTGCATCATTA
GATCGAGTTATTTTGATTAGCTAGATCATCTTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CC96TF U 1
AF RS1CC96JQ C 69
BS 1 610 RS1CC96TF
BS 611 755 RS1CC96JQ

RD RS1CC96TF 610 0 0
GGTGTGCTCTTTTCCTTGCTCTTGGTTTTGTCCCACGAGGTTTTCCCGGCGCAAGGTTTT
TAACGAGGCCACAGCTAGCTTAACACATCACCTATATGCATCTCGGTCCAAGACTAAAGA
AGACTCATTGCTTCTTTCTTTCCTTATTTTAACCTTAGTCTATTTTAAGTATTTATTTTG
CGTAACAAGGAGTTTGTTCCTTGAGTCTTTATATTGTTTGGCGAAACAATTTGGAGAGTT
ACACTTGATATTTTATAAAACTTTTCTTTCAAAGAAAACCTAGAGCTCTCAACTGAACTC
GCAGCCGCCTCCTTGCCTTGTGAGACCAGTACCTCCACGGCTTGAAGGTTCCCTTGTGTT
GTATCACGAGCCTTCCATCTCTCGTGTGGTGCACTTCAATCCACCTTGTTCTTAGTCCAC
GGTTTCTCTTGGTTGATTAGATCAAACAATAGAACCACCTCTTGATCTAGAACGGCTCCA
TCTCTCTTGCTTGGATCATACAGCCTTTGTCAGCCTAGGCTTGTATCATTTCTGGTATCA
GAGCTGAAGTTCCTTCAGCATCAGGTTGTATCTATCCTCTCTACTTGTTTTAAAATCGTG
TTAGTTCATC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RS1CC96JQ 687 0 0
CCACAGCTAGCTTAACACATCACCTATATGCATCTCGGTCCAAGACTAAAGAAGACTCAT
TGCTTCTTTCTTTCCTTATTTTAACCTTAGTCTATTTTAAGTATTTATTTTGCGTAACAA
GGAGTTTGTTCCTTGAGTCTTTATATTGTTTGGCGAAACAATTTGGAGAGTTACACTTGA
TATTTTATAAAACTTTTCTTTCAAAGAAAACCTAGAGCTCTCAACTGAACTCGCAGCCGC
CTCCTTGCCTTGTGAGACCAGTACCTCCACGGCTTGAAGGTTCCCTTGTGTTGTATCACG
AGCCTTCCATCTCTCGTGTGGTGCACTTCAATCCACCTTGTTCTTAGTCCACGGTTTCTC
TTGGTTGATTAGATCAAACAATAGAACCACCTCTTGATCTAGAACGGCTCCATCTCTCTT
GCTTGGATCATACAGCCTTTGTCAGCCTAGGCTTGTATCATTTCTGGTATCAGAGCTGAA
GTTCCTTCAGCATCAGGTTGTATCTATCCTCTCTACTTGTTTTAAAATCGTGTTAGTTCA
TCTTTTCATTCAAAAAAAAAAGTAAATCGTTTGATCCCTTTTCATCTAGTTAGAGTTGCA
TATTCATATTTGAAAACCCATAAAAAGTGTGTTCTTCGTTAGTGCATCATTAGATCGAGT
TATTTTGATTAGCTAGATCATCTTTTC

QA 1 687 1 687
DS 



AS 1 2

CO CL8885Contig1 664 2 3 U
TTTTAGCAGTAATACATGTAGATAGATAGCACTCGAATAATAATCTCGGGTTTAATTAAG
TCAAATAAACGTAATTAAATACGGTTTACTACACGATACATTGAAATCGAACGGAACACT
ACAAACAGAGTTCGTTGATACGAAAATACCAAAACACCCATGGATAATGCAGCAAAGTCT
TTTCATCTAGTTATCTCCGGCATCTAGTGATCGACGAGCAGCCTCGACTGTACGGATGCA
CCGGACCTCTGGCTCTGAAGCAGTTGTGAGTGTAGTACGATCTCCCAAATCTTGGAGGAC
AGGGGACTCTGTTCGCCGACAATGCACCGTACGAAATGTAGTATCTCTTCCTGTGCCAGT
ACAATGACCGTCTATCTCCGACACCGACGTCATCGCCATCTTCGAGGCTTTCTCCTTCTT
CGTCTGTGTCGGATGCGTCGATACGAGAGATCGGCCAGTCGAATCCGTCGTCCTGAAGAT
TGAGGGATGGGTTCACGGGGAGAGATTCAGATCTCGGGAGTGAAATGAAGAGAACAGAGA
GAGCGATGAGGAGAACAAGAGACGGAGCTGCCATGGCAATGCTGGAGACGAAAGCAAAGA
AGAAGGAAAAATAACAATGGAAGAGAGTAAAGCAACTACTAGCAAGTAACATACCAAGAG
GTCC


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1B225JQ U 5
AF RS1B225TF C 1
BS 1 4 RS1B225TF
BS 5 507 RS1B225JQ
BS 508 664 RS1B225TF

RD RS1B225JQ 503 0 0
AGCAGTAATACATGTAGATAGATAGCACTCGAATAATAATCTCGGGTTTAATTAAGTCAA
ATAAACGTAATTAAATACGGTTTACTACACGATACATTGAAATCGAACGGAACACTACAA
ACAGAGTTCGTTGATACGAAAATACCAAAACACCCATGGATAATGCAGCAAAGTCTTTTC
ATCTAGTTATCTCCGGCATCTAGTGATCGACGAGCAGCCTCGACTGTACGGATGCACCGG
ACCTCTGGCTCTGAAGCAGTTGTGAGTGTAGTACGATCTCCCAAATCTTGGAGGACAGGG
GACTCTGTTCGCCGACAATGCACCGTACGAAATGTAGTATCTCTTCCTGTGCCAGTACAA
TGACCGTCTATCTCCGACACCGACGTCATCGCCATCTTCGAGGCTTTCTCCTTCTTCGTC
TGTGTCGGATGCGTCGATACGAGAGATCGGCCAGTCGAATCCGTCGTCCTGAAGATTGAG
GGATGGGTTCACGGGGAGAGATT

QA 1 503 1 503
DS 

RD RS1B225TF 664 0 0
TTTTAGCAGTAATACATGTAGATAGATAGCACTCGAATAATAATCTCGGGTTTAATTAAG
TCAAATAAACGTAATTAAATACGGTTTACTACACGATACATTGAAATCGAACGGAACACT
ACAAACAGAGTTCGTTGATACGAAAATACCAAAACACCCATGGATAATGCAGCAAAGTCT
TTTCATCTAGTTATCTCCGGCATCTAGTGATCGACGAGCAGCCTCGACTGTACGGATGCA
CCGGACCTCTGGCTCTGAAGCAGTTGTGAGTGTAGTACGATCTCCCAGATCTTGGAGGAC
AGGGGACTCTGTTCGCCGACAATGCACCGTACGAGATGTAGTATCTCTTCCTGTGCCAGT
ACAATGACCGTCTATCTCCGACACCGACGTCATCGCCATCTTCGAGGCTTTCTCCTTCTT
CGTCTGTGTCGGATGCGTCGATACGAGAGATCGGCCAGTCGAATCCGTCGTCCTGAAGAT
TGAGGGATGGGTTCACGGGGAGAGATTCAGATCTCGGGAGTGAAATGAAGAGAACAGAGA
GAGCGATGAGGAGAACAAGAGACGGAGCTGCCATGGCAATGCTGGAGACGAAAGCAAAGA
AGAAGGAAAAATAACAATGGAAGAGAGTAAAGCAACTACTAGCAAGTAACATACCAAGAG
GTCC

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

CO CL8886Contig1 844 2 2 U
GGCCTCCCTCTCGTACCATTCATTCATTCATTATAGTTGAGAGACTCTCGCATGCATCTT
TCTTTCTCTCTTAATCTCCACTTTTTATCAGTATTTGAGCTTTAAAAAAGCGATCAGTGT
CCAATCTCTCTTATCGTCTCCAAAAGTTTCTAATTATTTCATTCTCAGTTTTCTCTCTTA
AATCTCATAGACAATCTTCTTTTGCATCTCTCCCCCTCTGTGCAATGAAGAAAATTGTGT
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TCCCAGGAATCGATTCGATTACAATGGATATGAAGGAGAAGAAACTAACTGTGATCGGAA
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TACTAGTTGGACCTGCAAAAGAGCCGGAAAAGGAGAAGAAGGAAGAGCCAAAGAAGGAAG
GTGGTGGCGAGCCGCCGAAGAAAGAAGGGGAAGCTCCAAAGGAAGAAGGGAAAAAGGAAG
GAGAAGCGCCAAAGAAGGAAGAGGAGAAGAAAGAAGGCGGCGATAAGAAGGAAGGAGAGA
AGAAAGATCAACCGCAGCCTCAGCCTCAACCTCAACCTCAGCCTCAACCTCAGCCTCAGC
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CTCATCTTACAACGTATTACTACGCCCCAAGCATGGAAGAGAACCCTAACGCTTGCGTTA
TATGTTGAAAAAAAACATGTATGATATAATATAATTGTAAAATAGCGAAAGAGATGGACA
GACC


BQ
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10 10 10 10 

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AF RS1H212JQB C 82
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QA 1 763 1 763
DS 



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TTGGCTAGGCGTATTCGTGGATAGCGTGCTTAGAAGAATGAATCTCAAGTGCTTTCGATT
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ATATATGGATTTGGTTGTTATGTTATGAGCTAATGACAAATTGTTTGTTAACT


BQ
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AF RS1BV56TF U 1
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RD RS1BV56TF 593 0 0
GGAAAGCCCTTCGTTGCGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGCAATGGCTCGTACGAAGCA
GACCGCTAGAAAATCAACCGGAGGTAAAGCTCCCAGGAAGCAGCTCGCCACCAAGGCGGC
GAGGAAATCGGCGCCGACCACCGGAGGTTCAAGAAGCCTCACCGTTACCGTCCCGGAACC
GTCGCTCTCCGTGAGATTCGTAAGTACCAGAAGAGCACTGAGCTGTTGATCCGTAAGCTT
CCGTTTCAGCGTCTTGTTCGTGAAATCGCACAGGATTTCAAGACGGATCTGAGGTTCCAG
AGCCACGCGGTGTTGGCGCTTCGGGAAGCAGCGGAGGCTTACTTGGTGGGTTTGTTTGAA
GACACGAATCTGTGTGCTATTCACGCCAAGAGAGTCACCATCATGCCCAAGGATATTCAG
TTGGCTAGGCGTATTCGTGGATAGCGTGCTTAGAAGAATGAATCTCAAGTGCTTTCGATT
TCTTTTTTTTTGTCTTGATGCTTTTTTGGTGTTATAAAAACTCTCTTTGAAGCTAAGAAC
ATATATGGATTTGGTTGTTATGTTATGAGCTAATGACAAATTGTTTGTTAACT

QA 1 593 1 593
DS 



AS 1 2

CO CL8888Contig1 514 2 2 U
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ATACAATGACGTTAGTGTCTACAGACCCAGTAGCTACCATCTTGTTGTTTGGTGACCATG
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ATGTAAGACGATTCCAACATAAAATGGCCGTACC


BQ
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AF RS1AP09TFB C 1
AF RS1AP09JQ U 32
BS 1 31 RS1AP09TFB
BS 32 514 RS1AP09JQ

RD RS1AP09TFB 514 0 0
GCAGTACAAACAAGCGACTTTTCTATTTAGAATAGAGACTACAACTTTAAAGGATGATAC
TGAAAAGATGTAATAAGAAGTCTGGTTTGGGTCATTGAGGCTCAATATGCCACATACGAA
CCGAAGCATCTTCACCGGAACTTGCTACGGTGCACTCATCAACAAAGGCGACTGCGTTAA
CTCCACCGAGATGAGCGTGTCTTACGGTTATGCGACTCGAAGCTGGCTTGTCCACTTCAT
ATACAATGACGTTAGTGTCTACAGACCCAGTAGCTACCATCTTGTTGTTTGGTGACCATG
CCAAACTGTTTATACGAGCAGTGTGGAACAACATGTTGTTTAGCTTCACCTACGAAACAT
AAAACCAACCCTCCTAAATTAGCTTAACCAATGACTTGGTAAAACACAACAAGCAAATGA
ACCCTCCTAGATTAGCTTAACCAATGACTTGGTAAAACACAACAAGCAAATGTATATATT
ATGTAAGACGATTCCAACATAAAATGGCCGTACC

QA 1 514 1 514
DS 

RD RS1AP09JQ 483 0 0
ATAGAGACTACAACTTTAAAGGATGATACTGAAAAGATGTAATAAGAAGTCTGGTTTGGG
TCATTGAGGCTCAATATGCCACATACGAACCGAAGCATCTTCACCGGAACTTGCTACGGT
GCACTCATCAACAAAGGCGACTGCGTTAACTCCACCGAGATGAGCGTGTCTTACGGTTAT
GCGACTCGAAGCTGGCTTGTCCACTTCATATACAATGACGTTAGTGTCTACAGACCCAGT
AGCTACCATCTTGTTGTTTGGTGACCATGCCAAACTGTTTATACGAGCAGTGTGGAACAA
CATGTTGTTTAGCTTCACCTACGAAACATAAAACCAACCCTCCTAAATTAGCTTAACCAA
TGACTTGGTAAAACACAACAAGCAAATGAACCCTCCTAGATTAGCTTAACCAATGACTTG
GTAAAACACAACAAGCAAATGTATATATTATGTAAGACGATTCCAACATAAAATGGCCGT
ACC

QA 1 483 1 483
DS 



AS 1 2

CO CL8889Contig1 936 2 8 U
GCCCTAACTGGTTCTCTGCAAGTGCCAAGAAGCTAATCAAAAGAATTCTGGATCCCAATC
CAGCAACGAGGATTACATTTACTGAAGTAATTGAAAACGAGTGGTTTAATAAAGGGTATA
AAGCACCCAAATATGAAAATGCAAATGTCAGCCTTGATGATGTTGATGCCATTTTTGATG
AATCAGGGGAGTCCGAGAACCTTGTTGTGGAGAGGCGAGAAGAAGGAGTTAGAACACCAC
CAGTAACTATGAATGCTTTTGAGCTCATCTCAAAATCCAAAGGTCTCAATCTCGGTTCAC
TTTTCGAAAAGCAAATGGGGCTTGTTAAACGGAAAACTCAGTTTACTTCAAAATATCCTG
CTAATGAGATAGTCACAAAAATTGAGGCAGCAGCAGCACCTATGGGATTTGATGTCAAGA
AAAACAACTACAAGATGAAGCTTCTAGGAGAGAAATCAGGCCGCAAGGGTCAATTAGCAA
TCACGACTGAGGTTTTTCAAGTTGCTCCATCGCTATATATGGTTGAAATGAGGAAATCAG
GGGGTGATACCTTGGAATTCCACAAGTTTTACAAGAACCTCACCACGGGTCTTAAGGACA
TTGTTTGGAAAACAATCGACGTAGAGAAAGAGGAAGAAACCCAAGTTTCAGGTGGTACTA
GTGGTGCCGTGGTTGCTTCTTGATACCAGACAAAATTGTCTACGTATGCTTCTAATTATT
AGATATTGTTCTGTATAAAATTTGCTTTGGGGTGTTTCGAGTGTGGTTTTGAAGTTATTA
TACAAAAGGAAGCGTCAAGAAGTGGAGCAAAAGCAGCAAACTGGAAACTACATTTGGGGG
ATATTTTTTTTTAATCTTTTGTTTGATTCCACTGGAATGTTGTGAATAACGTATAGATTG
AATCTGAATAAACCGTAAATCAAAAGCTTTTTACAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FS55TF U 1
AF RS1FS55JQ C 179
BS 1 651 RS1FS55TF
BS 652 652 RS1FS55JQ
BS 653 694 RS1FS55TF
BS 695 695 RS1FS55JQ
BS 696 739 RS1FS55TF
BS 740 740 RS1FS55JQ
BS 741 784 RS1FS55TF
BS 785 936 RS1FS55JQ

RD RS1FS55TF 784 0 0
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AAGCACCCAAATATGAAAATGCAAATGTCAGCCTTGATGATGTTGATGCCATTTTTGATG
AATCAGGGGAGTCCGAGAACCTTGTTGTGGAGAGGCGAGAAGAAGGAGTTAGAACACCAC
CAGTAACTATGAATGCTTTTGAGCTCATCTCAAAATCCAAAGGTCTCAATCTCGGTTCAC
TTTTCGAAAAGCAAATGGGGCTTGTTAAACGGAAAACTCAGTTTACTTCAAAATATCCTG
CTAATGAGATAGTCACAAAAATTGAGGCAGCAGCAGCACCTATGGGATTTGATGTCAAGA
AAAACAACTACAAGATGAAGCTTCTAGGAGAGAAATCAGGCCGCAAGGGTCAATTAGCAA
TCACGACTGAGGTTTTTCAAGTTGCTCCATCGCTATATATGGTTGAAATGAGGAAATCAG
GGGGTGATACCTTGGAATTCCACAAGTTTTACAAGAACCTCACCACGGGTCTTAAGGACA
TTGTTTGGAAAACAATCGACGTAGAGAAAGAGGAAGAAACCCAAGTTTCAG*TGGTACTA
GTGGTGCCGTGGTTGCTTCTTGATACCAGACAAA*TTGTCTACGTATGCTTCTAATTATT
AGATATTGTTCTGTATAAA*TTTGCTTTGGGGTGTTTCGAGTGTGGTTTTGAAGTTATTA
TACA

QA 1 784 1 784
DS 

RD RS1FS55JQ 758 0 0
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ACTTTTCGAAAAGCAAATGGGGCTTGTTAAACGGAAAACTCAGTTTACTTCAAAATATCC
TGCTAATGAGATAGTCACAAAAATTGAGGCAGCAGCAGCACCTATGGGATTTGATGTCAA
GAAAAACAACTACAAGATGAAGCTTCTAGGAGAGAAATCAGGCCGCAAGGGTCAATTAGC
AATCACGACTGAGGTTTTTCAAGTTGCTCCATCGCTATATATGGTTGAAATGAGGAAATC
AGGGGGTGATACCTTGGAATTCCACAAGTTTTACAAGAACCTCACCACGGGTCTTAAGGA
CATTGTTTGGAAAACAATCGACGTAGAGAAAGAGGAAGAAACCCAAGTTTCAGGTGGTAC
TAGTGGTGCCGTGGTTGCTTCTTGATACCAGACAAAATTGTCTACGTATGCTTCTAATTA
TTAGATATTGTTCTGTATAAAATTTGCTTTGGGGTGTTTCGAGTGTGGTTTTGAAGTTAT
TATACAAAAGGAAGCGTCAAGAAGTGGAGCAAAAGCAGCAAACTGGAAACTACATTTGGG
GGATATTTTTTTTTAATCTTTTGTTTGATTCCACTGGAATGTTGTGAATAACGTATAGAT
TGAATCTGAATAAACCGTAAATCAAAAGCTTTTTACAG

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL8890Contig1 694 2 2 U
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AAGACCAAATCTGTCTCGAAATCGATCAAAGCCGGTCTCCAATTCCCCGTCGGGAGAATC
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ATGGCCGCCGTTCTCGAGTACCTCGCCGCCGAAGTAAGCCTCTAATACACACCCAGATCT
GGCTTCTCACAGCGAAAATCATTTTTTTCTGATATTTGAAATTTTGTTGGTTCAGGTTCT
GGAGCTCGCTGGTAACGCTGCGAGGGACAACAAGAAGTCGAGGATCATCCCGAGGCATCT
TCTTTTGGCGATCAGGAACGACGAAGAGTTGGGGAAGCTACTGAGTGGAGTCACGATCGC
TCACGGTGGTGTGTTGCCGAACATCAACTCTGTTCTTTTGCCTAAGAAGTCTGCTAAATC
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TCATTCACCAGTTTAGTTATATGTGTTGGGTGTTTTGTGTTTAGAATTGGTGAACGTATA
TGTAGAAAAATCTAGTTTTTTTTAATTATGTAATTCGGATCCGAATTCTCTTCAGATCCA
ACTTTCTCTAAGTAACGACTTATAAAATATTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EV89TF U 1
AF RS1EV89JQ C 19
BS 1 610 RS1EV89TF
BS 611 694 RS1EV89JQ

RD RS1EV89TF 610 0 0
GCAATGGAGACTACCGGAAAAGTGAAGAAAGCCTTCGGAGGAAGAAAAGCCGGCGGCCCG
AAGACCAAATCTGTCTCGAAATCGATCAAAGCCGGTCTCCAATTCCCCGTCGGGAGAATC
ACTCGTTTCCTGAAGAAGGGACGGTACGCTCAGAGACTCGGTGGTGGAGCTCCGGTTTAC
ATGGCCGCCGTTCTCGAGTACCTCGCCGCCGAAGTAAGCCTCTAATACACACCCAGATCT
GGCTTCTCACAGCGAAAATCATTTTTTTCTGATATTTGAAATTTTGTTGGTTCAGGTTCT
GGAGCTCGCTGGTAACGCTGCGAGGGACAACAAGAAGTCGAGGATCATCCCGAGGCATCT
TCTTTTGGCGATCAGGAACGACGAAGAGTTGGGGAAGCTACTGAGTGGAGTCACGATCGC
TCACGGTGGTGTGTTGCCGAACATCAACTCTGTTCTTTTGCCTAAGAAGTCTGCTAAATC
GACTGGGGAAGTTGCGTCCAAGTCGCCAGCTAAATCTCCTAAGAAAGCTTAATTTTAGTT
TCATTCACCAGTTTAGTTATATGTGTTGGGTGTTTTGTGTTTAGAATTGGTGAACGTATA
TGTAGAAAAA

QA 1 610 1 610
DS 

RD RS1EV89JQ 676 0 0
AAAGTGAAGAAAGCCTTCGGAGGAAGAAAAGCCGGCGGCCCGAAGACCAAATCTGTCTCG
AAATCGATCAAAGCCGGTCTCCAATTCCCCGTCGGGAGAATCACTCGTTTCCTGAAGAAG
GGACGGTACGCTCAGAGACTCGGTGGTGGAGCTCCGGTTTACATGGCCGCCGTTCTCGAG
TACCTCGCCGCCGAAGTAAGCCTCTAATACACACCCAGATCTGGCTTCTCACAGCGAAAA
TCATTTTTTTCTGATATTTGAAATTTTGTTGGTTCAGGTTCTGGAGCTCGCTGGTAACGC
TGCGAGGGACAACAAGAAGTCGAGGATCATCCCGAGGCATCTTCTTTTGGCGATCAGGAA
CGACGAAGAGTTGGGGAAGCTACTGAGTGGAGTCACGATCGCTCACGGTGGTGTGTTGCC
GAACATCAACTCTGTTCTTTTGCCTAAGAAGTCTGCTAAATCGACTGGGGAAGTTGCGTC
CAAGTCGCCAGCTAAATCTCCTAAGAAAGCTTAATTTTAGTTTCATTCACCAGTTTAGTT
ATATGTGTTGGGTGTTTTGTGTTTAGAATTGGTGAACGTATATGTAGAAAAATCTAGTTT
TTTTTAATTATGTAATTCGGATCCGAATTCTCTTCAGATCCAACTTTCTCTAAGTAACGA
CTTATAAAATATTTGC

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL8891Contig1 1334 2 2 U
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ATCGAGATATCCTCTGCGAAATTGGAGGAATGTTTGCTGTTGCAAATAAAGTGGATAGCA
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AAGATGGTCATCACTGGTCTTCTCTCCACAACTGGGTGATGCCAACTCCGTCTTTCCTCG
AGTTTGTCATGTTCTCACGGATGTTCTCAGAGTCTCTAGATGCATTGCACAACAATCCTA
ACGACTCCAAAAGCTGCTCATTAGCTTCATCGCAGCTCGAGAGAAAGCACTGTTACTGCC
GGGTCTTGGAACTGTTGGTTAATGTGTGGGCATACCACAGCGGGAGAAAGATGGTTTACA
TAAACCCGAGAGACGGTTCACTCGAGGAACAACATCCGTTACCGCAACGAAGAGGTTTAA
TGTGGGCTAAGTACTTTAACTTCACGTTACTGAAAAGCATGGACGAGGACTTAGCAGAAG
CAGCAGATGATAACGACCATCCAAGAGAGAGATGGTTATGGCCACTAACCGGAGAGGTGC
ATTGGAAAGGCGTTTACGAGAGGGAACGTGAAGAAAGATACCGATTCAAAATGGACAAGA
AACGTAAAACTAAGGAGAAACTTTACGATAGGATCAAGAACGGTTACAAGCAGAAATCAC
TCGGAAGATGAAAACAGAGAACTGCTTTTTGCGGTGCATTGAAAGAAGCTCAACGTGTGC
TCTCAGTCTCGACAACACATGAGATTTACACGAAAGAATATCATGGAAAGCAAAGAGACC
ACTCTTTGCCATTTTCTGGAGATTATAGGAGAAGAGAGTTTAGATTTAGAACCTATTCTT
CACCCCCAGTAAAAGTAAAGGTTTCCTTTGTTATTATTTTCTTTGCTGCCATAAAGCAAT
TTTGATATTGATGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DJ71TF U 1
AF RS1DJ71JQ C 601
BS 1 719 RS1DJ71TF
BS 720 1334 RS1DJ71JQ

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AAGATGGTCATCACTGGTCTTCTCTCCACAACTGGGTGATGCCAACTCCGTCTTTCCTCG
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DS 

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TAAACCCGAGAGACGGTTCACTCGAGGAACAACATCCGTTACCGCAACGAAGAGGTTTAA
TGTGGGCTAAGTACTTTAACTTCACGTTACTGAAAAGCATGGACGAGGACTTAGCAGAAG
CAGCAGATGATAACGACCATCCAAGAGAGAGATGGTTATGGCCACTAACCGGAGAGGTGC
ATTGGAAAGGCGTTTACGAGAGGGAACGTGAAGAAAGATACCGATTCAAAATGGACAAGA
AACGTAAAACTAAGGAGAAACTTTACGATAGGATCAAGAACGGTTACAAGCAGAAATCAC
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CACCCCCAGTAAAAGTAAAGGTTTCCTTTGTTATTATTTTCTTTGCTGCCATAAAGCAAT
TTTGATATTGATGC

QA 1 734 1 734
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AGGAGGAGATAAGGGGAAATCAGTGGCGGTGGCTACGTCGACAAGGCAGACACGAAGCAT
GGATCGGCAGACTCGGAGCCAAACTCAAGGACGCAGGGGTAACTCGCCGTCGTCGAAGCT
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ACACAAATCATTCACGGAGAGAGCCAACGAGGTGAAGGAAGGTCTGGAGATAGCTGTTCC
TGGCATCATTGTCACTGTCAATCCTGATAAGCCAAGGCGTGGATGCTTTGAGATTCGAGA
GGAAGGCGGCGAAACATTCGTCAGTCTTTTGGATATGAAGAAACCATTCACACCCATGAC
GGAACTTGATATGGAGGAGGTCGTTGCTAACATCGTAGAGAAGATTAAATGAGAGAAGCT
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TTTAGAGCTCTGTTTAGTCATTTTGTTGTGGTTACTCGGATATGTCCAGTTTCTGGATGC
TAAAAATTCATGATATGTTTGGTGG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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AAGGAAGGTCTGGAGATAGCTGTTCCTGGCATCATTGTCACTGTCAATCCTGATAAGCCA
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TTTAGAGCTCTGTTTAGTCATTTTGTTGTGGTTACTCGGATATGTCCAGTTTCTGGATGC
TAAAAATTCATGATATGTTTGGTGG

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DS 



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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GU36JQ C 1
AF RS1GU36TF U 1
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DS 

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CGAAGAAACGGTTTAGGACAAAGTTCCCGACGGAGCAGAAGGAGAGGATGATGGAGTTTG
CGGAGAAGCTAGGGTGGAGGATGAACAAGCAAGACGAAGAGGAGCTCAAGGGTTCTGTAA
TGAGATCGGAGTTAAGAGACAAGTGTTCAAAGTGTGGATGCATAACAACAAGAACAATGC
CAAGAAACCATCAACTCCAGGAACTCTCTAATGATGTAATGATTAAGTACTTAATCAAGT
GATTATGTCAGAGTTTTTATCTTTTAATCTACTGTTGTTTTTTTTTTAATGTTATCTAGG
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GTTTTTTTTTAATTTGGTTTACTTTTTATTATTTTTCTGTGTTTTTG

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 2

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TCGCTTCCTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B856TF U 1
AF RS1B856JQ C 139
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BS 727 738 RS1B856TF
BS 739 912 RS1B856JQ

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TCTTCCCCAACCTATTCCCCCCGTTTCCAGCCTTGGAGTTGATGGCTCAGCTGGTAATTC
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GGAGTTGGGTGCAATTTTGGAACCAGGGAATCCTCCTAAAACAGACAAGGCTGCAATCCT
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QA 1 738 1 738
DS 

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CCCCGTTTCCAGCCTTGGAGTTGATGGCTCAGCTGGTAATTCAGAAGCCACCAAAGAACC
TGGCTCTAAAAAGAGGACGAGATGTGAATCGTCCTCTGCAGCAACTAGCTCCAAAGCCTG
TAGAGAGAAGCAGCGACGTGACAGGCTGAATGACAAGTTTATGGAGTTGGGTGCAATTTT
GGAACCAGGGAATCCTCCTAAAACAGACAAGGCTGCAATCCTGGTCGATGCTGTCCGCTT
GGTTACACAACTTCGTGGCGAGGCACAGAAGTTGAAGGACTCCAATTCAAGTTTTCAAGA
CAAAATCAAGGAGTTGAAGACGGAGAAGAACGAGCTGCGAGATGAGAAGCAGAGGCTGAA
GACAGAGAAAGAGAATTTGGAGCAACAGCTGAAAGCCATGAATGCTCCTCAACCAAGCTT
CTTCCCAGCCCCACCTATGATGCCAACTGCTTTTGCTTTTGCGCAAGGCCAAGCTCCCGG
AAACAAGATGGTGCCAGTCATCAGTTACCCAGGAGTTGCCATGTGGCAGTTCATGCCCCC
TGCTTCAGTCGATACTTTTCAGGATCACGTCCTTCGTCCACCAGTTGCTTAACTGGGAGT
AACAAAGAAAACCCTCAAGAAAATCATCAACTGGTTTGCTTCTCGCTTCCTTTG

QA 1 774 1 774
DS 



AS 1 2

CO CL8896Contig1 772 2 2 U
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GTCTTCTCAAGTTCTAAACAAACCAACGGTCGAGATTGGAGGAGATGACCTCAGAAATTT
CTACACTTTGGTTATGGTGGATCCAGATGTGCCAAGTCCAAGCAACCCGTACCTCCGAGG
ATATCTCCATTGGTTGGTGACAGATATACCTGCCACAACTGGAACAGCTTTTGGCAATGA
GCTGGTGTGCTACGAGAATCCATGTCCCACTTCAGGAATTCACCGAGTCGCATTGATATT
GTTCCGACAACTCGGAAGACAAACGGTTTATGCACCCCAGTAGCGCCAAAGGTTCAACAC
TCGTGAGTTCGCTGAGAACTACAATCTTGGTCTCCCCGTGGCTGCGTTTACTTCGACTGT
CAAAGAGAGAATGGCTGCGGAGGAAGAAGAACCTCGTAGATATATATATGCCTCCATCTC
AAGTAACCTAATTAGATGTTTATCTAGAGGTTCTTGTAATAAATATATTAAGAATCTGAT
TAGATAAACAAAAAGAGGTGATGCATCATGCATGTTGACATCTAAATAAAGTTCTTTTAT
ATGAATAGTTGAGAGGGAGGAATAAAATTATAAGAATGAAAATGTTATTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CX48TF U 1
AF RS1CX48JQ C 86
BS 1 668 RS1CX48TF
BS 669 772 RS1CX48JQ

RD RS1CX48TF 668 0 0
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GTCTTCTCAAGTTCTAAACAAACCAACGGTCGAGATTGGAGGAGATGACCTCAGAAATTT
CTACACTTTGGTTATGGTGGATCCAGATGTGCCAAGTCCAAGCAACCCGTACCTCCGAGG
ATATCTCCATTGGTTGGTGACAGATATACCTGCCACAACTGGAACAGCTTTTGGCAATGA
GCTGGTGTGCTACGAGAATCCATGTCCCACTTCAGGAATTCACCGAGTCGCATTGATATT
GTTCCGACAACTCGGAAGACAAACGGTTTATGCACCCCAGTAGCGCCAAAGGTTCAACAC
TCGTGAGTTCGCTGAGAACTACAATCTTGGTCTCCCCGTGGCTGCGTTTACTTCGACTGT
CAAAGAGAGAATGGCTGCGGAGGAAGAAGAACCTCGTAGATATATATATGCCTCCATCTC
AAGTAACCTAATTAGATGTTTATCTAGAGGTTCTTGTAATAAATATATTAAGAATCTGAT
TAGATAAA

QA 1 668 1 668
DS 

RD RS1CX48JQ 687 0 0
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GGCCAAAGAGAGGTTTCTAATGGAATGGACTTAAGGTCTTCTCAAGTTCTAAACAAACCA
ACGGTCGAGATTGGAGGAGATGACCTCAGAAATTTCTACACTTTGGTTATGGTGGATCCA
GATGTGCCAAGTCCAAGCAACCCGTACCTCCGAGGATATCTCCATTGGTTGGTGACAGAT
ATACCTGCCACAACTGGAACAGCTTTTGGCAATGAGCTGGTGTGCTACGAGAATCCATGT
CCCACTTCAGGAATTCACCGAGTCGCATTGATATTGTTCCGACAACTCGGAAGACAAACG
GTTTATGCACCCCAGTAGCGCCAAAGGTTCAACACTCGTGAGTTCGCTGAGAACTACAAT
CTTGGTCTCCCCGTGGCTGCGTTTACTTCGACTGTCAAAGAGAGAATGGCTGCGGAGGAA
GAAGAACCTCGTAGATATATATATGCCTCCATCTCAAGTAACCTAATTAGATGTTTATCT
AGAGGTTCTTGTAATAAATATATTAAGAATCTGATTAGATAAACAAAAAGAGGTGATGCA
TCATGCATGTTGACATCTAAATAAAGTTCTTTTATATGAATAGTTGAGAGGGAGGAATAA
AATTATAAGAATGAAAATGTTATTACG

QA 1 687 1 687
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8898Contig1 700 2 2 U
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TTGTGGTCAACCCGTAACCAAACGGATACAACGGGTCGTAATACTTATCGCCAACATTCA
TCGGCAGCTGCTTCACCGACTTGAACCACGTCCTGGCCAACTTTCCAGTGAAACCGTAAT
CACCAAACAGAGCATCAGCCACTCCTTGACCTTCAGTTCCCGGAAGCCAAGACGCCACAA
GAGCATCTATCTTCGAGACGTAAGGCTCCATCACCACAGGACGTCCAGAGACCACTACCA
CCACACACTTCACTGATCCGCACACGTTCCCTATCGTGCTAGGACCAGGTTCGCTTATCG
TCAGGTTCGTGCTGTCCCCAAACATCTCGGCATACGGCGGCTCTCCCACGACCACAACGG
CGTAGTCGAATTTACCGGACTTCACGAAGTTTGCGTCGGGGTTTTCGTTGTAGACGACTT
GTGTTGTCGGAGCTACTGTGTTCTTCACAGCGGTGAGGATCGTTGTACCAACGGTGAGGC
CGTTGCCGTTAAGGCCTTGCCATGTGATGGTCCAGCCACCACATTGGTATCCCAAGTTAT
CAGCGTGCCCTCCCGCCACAAGGATCTTTCCTGTCTTCTTAGGCAGAGGAAGCAAAGGTT
TATCGCCCTTCTTCTTACCGTTCTTGAGCAGCACCAGGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GE07JQ U 1
AF RS1FX78TF C 31
BS 1 621 RS1GE07JQ
BS 622 700 RS1FX78TF

RD RS1GE07JQ 621 0 0
GCTCAACAACAAAAACTTATTTGCCTCCGGAACCAGACAAGTCTTACAACTTGTTTGGCT
TTGTGGTCAACCCGTAACCAAACGGATACAACGGGTCGTAATACTTATCGCCAACATTCA
TCGGCAGCTGCTTCACCGACTTGAACCACGTCCTGGCCAACTTTCCAGTGAAACCGTAAT
CACCAAACAGAGCATCAGCCACTCCTTGACCTTCAGTTCCCGGAAGCCAAGACGCCACAA
GAGCATCTATCTTCGAGACGTAAGGCTCCATCACCACAGGACGTCCAGAGACCACTACCA
CCACACACTTCACTGATCCGCACACGTTCCCTATCGTGCTAGGACCAGGTTCGCTTATCG
TCAGGTTCGTGCTGTCCCCAAACATCTCGGCATACGGCGGCTCTCCCACGACCACAACGG
CGTAGTCGAATTTACCGGACTTCACGAAGTTTGCGTCGGGGTTTTCGTTGTAGACGACTT
GTGTTGTCGGAGCTACTGTGTTCTTCACAGCGGTGAGGATCGTTGTACCAACGGTGAGGC
CGTTGCCGTTAAGGCCTTGCCATGTGATGGTCCAGCCACCACATTGGTATCCCAAGTTAT
CAGCGTGCCCTCCCGCCACAA

QA 1 621 1 621
DS 

RD RS1FX78TF 670 0 0
AACCAGACAAGTCTTACAACTTGTTTGGCTTTGTGGTCAACCCGTAACCAAACGGATACA
ACGGGTCGTAATACTTATCGCCAACATTCATCGGCAGCTGCTTCACCGACTTGAACCACG
TCCTGGCCAACTTTCCAGTGAAACCGTAATCACCAAACAGAGCATCAGCCACTCCTTGAC
CTTCAGTTCCCGGAAGCCAAGCCGCCACAAGAGCATCTATCTTCGAGACGTAAGGCTCCA
TCACCACAGGACGTCCAGAGACCACTACCACCACACACTTCACTGATCCGCACACGTTCC
CTATCGTGCTAGGACCAGGTTCGCTTATCGTCAGGTTCGTGCTGTCCCCAAACATCTCGG
CATACGGCGGCTCTCCCACGACCACAACGGCGTAGTCGAATTTACCGGACTTCACGAAGT
TTGCGTCGGGGTTTTCGTTGTAGACGACTTGTGTTGTCGGAGCTACTGTGTTCTTCACAG
CGGTGAGGATCGTTGTACCAACGGTGAGGTCGTTGCCGTTAAGGCCTTGCCATGTGATGG
TCCAGCCACCACATTGGTATCCCAAGTTATCAGCGTGCCCTCCCGCCACAAGGATCTTTC
CTGTCTTCTTAGGCAGAGGAAGCAAAGGTTTATCGCCCTTCTTCTTACCGTTCTTGAGCA
GCACCAGGGC

QA 1 670 1 670
DS 



AS 1 2

CO CL8899Contig1 937 2 4 U
GGAAAGTTCGAAATTCGAAACAAAAAAATTTGAAAACAAAATTGGAAGTTCTCACCATCG
TCACTTTCATCAACAGCATGGATTCGACGATCACTGAGTCGGGAGAGAAGAAATCGATCA
GTGTTTTCAGTGTCTCGTCTTCTCAGCAGTCGCTCAGTGAAGAAGATCTCAGCGGACTCT
CAGCGCTCCAGAACAAGGAAGGAAGCAGCTCGGATGATGATTGTTTCCTCACATCATCAC
ACGAACTAAGACTTGGAAACATCCAAAACGCTCTAAGGGAGCTTAGCGTTGATCACTCAT
CCTTGGCTTCTCTCCTCAGCAAGCGACTGGATATTACCTGGAACTCCATGGTGAAAGCCA
AGGAGAGTTACACCAGCAAGGAGTGGGATGCTGTTCTTAAGCATACTAGCGATGCAATTG
AGCAAGGGGTGGACCTCTGCACAGAACTTTACTTGCACAGAGCCGAAGCTTACCTTGCTT
CCAACCTGGTTGAAGACACTGTCACAGAGCTTTCAAGTGCGGTCCTCTGCCTCCTGAAGA
CTCATGGCTTCAAGGCACCAGACAAGAAGGAAGTCGACCACCAAAACTTTGTTCATGCTA
TCGTGGATATCACCCAAGACCAGGTTGAGAAGCTGTTGAAAGTTGAAGAAGAGGAGCTCC
AACTGCTTAAAGAGGAACTAAGTGAGCGTTTAATGGGACTTGAAGCAGCTGTTCTGCTCA
TCAAGGATTTTTACGAGCCACTTATCAATGAGAGGGCAGATCGCATTCAGCTTTTGAAGA
ACAAACAGGCAAATGGGGGTGCAAGAGTCGTTTAGCTGGAGGAGGAGGAGGCAAACGGGC
TTTGCTTGCACTTTTACCTACTATGAAACCTTATGTGTCTTTTGAACCCTTGCATTTGAA
TTTGGGCAAATAAGGGGACAAAAGCCCTTTACTTGCG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FA58TF U 1
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T

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QA 1 792 1 792
DS 



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BQ
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AF RS1CP53TF U 1
AF RS1CP53JQ C 130
BS 1 716 RS1CP53TF

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TACCATGAGGGTGTCCAGCAAGTTATGCAGAGCAAAGAAGAAGAGTCTCAAGTCCCTAAA
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GGATTCATTTGGTGTTGCTTTGCTAGATCTTGGATTCCTTTAATTGTACCACAAGGATCC
AGAGATTTCTATCTACGACGTAGTCCTTTGTGCAAAATGTAGCCTATTTGTGATGCAACA
TCTAGAAAGAACATATATATATGTTTATTTATCTAGCTTGAAAATATTCAGTTTTC

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DS 

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TCTGACAACTCTAGAAAGACTACATGAGATTTACTTAAACTCCAGAATCTTGGATTCATT
TGGTGTTGCTTTGCTAGATCTTGGATTCCTTTAATTGTACCACAAGGATCCAGAGATTTC
TATTTACGACGTAGTCCTTTGTGCAAAATGTAGCCTATTTGTGATGCAACATCTAGAAAG
AACATATATATATGTTTATTTATCTAGCTTGAAAATATTCAGTTTTC

QA 1 587 1 587
DS 



AS 1 2

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ATTAGTTTCAAAACTGGTGGAAGACGATGATTTATCTCGACAACATCATTTCACAGACCT
TATATGTATTTATTCATCTTGCATCTTTGTTTTACTTTTTGAG


BQ
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AF RS1A906JQ C 1
AF RS1A906TF U 1
BS 1 583 RS1A906TF

RD RS1A906JQ 583 0 0
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GTCGCCTTCGCTGGATTTCAACTCCTCGATCTTTACTGGAAGAGTGAGCATAGACTAATG
TGCTCATCTGAGGTTTGCACTGCCACCGAGCGTGATCGCTACGAGAAATCAATATACAAG
GCTCAGCGGAATGTGGTTCTGTGTATGGCTGGGATCCTTCTCTACTGGTGTATTTTCCGC
ATCTGCAAGTACAATAAAGACCTTGAGCATTTGGAGGAGCTAGAGAAGAGTTACAAGGCA
GAGTAGTAGTCTCCCCCCCAAAGTCTGGTTCTTCTGTTATAAATATAACATCGTCTTGTG
ATTAGTTTCAAAACTGGTGGAAGACGATGATTTATCTCGACAACATCATTTCACAGACCT
TATATGTATTTATTCATCTTGCATCTTTGTTTTACTTTTTGAG

QA 1 583 1 583
DS 

RD RS1A906TF 583 0 0
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TCGTACGTGGTTGCTGCCGAGGTAGCGATCGCAGTCATTTTGACTCTACCTTACCCTATG
CTCGTGAAGAAACGCATCGTGTCACTTGTCTCGCTCATACTCCAGCCTGCCGCCTCCATC
GTCGCCTTCGCTGGATTTCAACTCCTCGATCTTTACTGGAAGAGTGAGCATAGACTAATG
TGCTCATCTGAGGTTTGCACTGCCACCGAGCGTGATCGCTACGAGAAATCAATATACAAG
GCTCAGCGGAATGTGGTTCTGTGTATGGCTGGGATCCTTCTCTACTGGTGTATTTTCCGC
ATCTGCAAGTACAATAAAGACCTTGAGCATTTGGAGGAGCTAGAGAAGAGTTACAAGGCA
GAGTAGTAGTCTCCCCCCCAAAGTCTGGTTCTTCTGTTATAAATATAACATCGTCTTGTG
ATTAGTTTCAAAACTGGTGGAAGACGATGATTTATCTCGACAACATCATTTCACAGACCT
TATATGTATTTATTCATCTTGCATCTTTGTTTTACTTTTTGAG

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 2

CO CL8902Contig1 630 2 2 U
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AAAACCTCTGATTTAGTACAATACAACATCATAACACAACACAATGGAGCTAAGCTAATA
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GATGGTTCGTTACAAACATTTTACAAGCTCAACCTTCATTTTCTTGCACCCGTAGACCCT
TTAAACAGCTCGTTGATACGCGTCTCTATGTCCTCAACTCCATACCTGATGTACTTGTCC
GCGTTTTTCCCTTTCCCTAAATCTCCAAGGTTCTGAAACCTCCCTATGAAGTTCCCGTAC
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GCATTGTGTTTCCTGATCCAGTCCTCTCCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1C817TF C 1
AF RS1C817JQ U 48
BS 1 47 RS1C817TF
BS 48 630 RS1C817JQ

RD RS1C817TF 630 0 0
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AAAACCTCTGATTTAGTACAATACAACATCATAACACAACACAATGGAGCTAAGCTAATA
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GATGGTTCGTTACAAACATTTTACAAGCTCAACCTTCATTTTCTTGCACCCGTAGACCCT
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GCATTGTGTTTCCTGATCCAGTCCTCTCCC

QA 1 630 1 630
DS 

RD RS1C817JQ 583 0 0
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GATGTACTTGTCCGCGTTTTTCCCTTTCCCTAAATCTCCAAGGTTCTGAAACCTCCCTAT
GAAGTTCCCGTACGCCGGCAACAGCAGCCTCGCCAGCGAGATTCTCAGCTCCTCTCTGAG
CTGCTCGTCGAACACAACCCACGTCGAGTGCACTTTACACGTCTCGTCGAACTGACTATT
GAACTGCTTCAGCTTCTCCTTCATGGTTTTCCCTAACCCGTTCATTCCCGCAGCTGTGTT
GTCCACCTTCAGCAAGCCCAGCATCTTATTCCACGCGCTCCTCTGATAACTCGAATGATA
CTGTCTCACTTTAGCATTGTGTTTCCTGATCCAGTCCTCTCCC

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 2

CO CL8903Contig1 736 2 2 U
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TGAATGTTTTTTCTGGCTTTTGTTAGTCGGTTTAAGGTTCGGTTTAGAATCCGGTTTTAC
CAAGTCTTCTTGCTTTTGTCTCTTTATAGTTTTTAGACTTTTCTTGTTTAGTAAACATCC
TCATACCTCATTATGGATTTTACCTATTGATCTTTAGCCGATTTTCAGTTATGGTAATAC
ACAAGATTATAAGTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1CP70JQ C 1
AF RS1CP70TF U 154
BS 1 153 RS1CP70JQ
BS 154 736 RS1CP70TF

RD RS1CP70JQ 736 0 0
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GGAGATGAGAACCGAGACTGTGGTTTCCAAGATTTGATGTGGTAGTTGCTGAGGTGATGA
ATTTAATTGGTGATGTAAGAGGGAAGGTGGCAGTAATGGTTGATGATATGATTGATACCG
CTGGAACCATTGTGAAAGGAGCAGCTTTGTTACACCAGGAGGGTGCTCGGGAGGTTTATG
CGTGCTGCACTCACGCTGTTTTCAGCCCGCCTGCGATAGGGAGATTATCAGGAGGTTTGC
TTCAAGAAGTGATAGTGACAAACACATTACCAGTGGCTGAGAAGAACTACTTCCCGCAGC
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GCTCCGTCAGTAGCATTTTCCTTTGAGCTTACTCATCCTCTGTCTCATTTGGCATCATTT
TGAATGTTTTTTCTGGCTTTTGTTAGTCGGTTTAAGGTTCGGTTTAGAATCCGGTTTTAC
CAAGTCTTCTTGCTTTTGTCTCTTTATAGTTTTTAGACTTTTCTTGTTTAGTAAACATCC
TCATACCTCATTATGGATTTTACCTATTGATCTTTAGCCGATTTTCAGTTATGGTAATAC
ACAAGATTATAAGTTG

QA 1 736 1 736
DS 

RD RS1CP70TF 583 0 0
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CGATAGGGAGATTATCAGGAGGTTTGCTTCAAGAAGTGATAGTGACAAACACATTACCAG
TGGCTGAGAAGAACTACTTCCCGCAGCTGACAATTTTGTCCGTGGCTAATCTTCTTGGCG
AGACGATTTGGCGTGTCCATGATGATAGCTCCGTCAGTAGCATTTTCCTTTGAGCTTACT
CATCCTCTGTCTCATTTGGCATCATTTTGAATGTTTTTTCTGGCTTTTGTTAGTCGGTTT
AAGGTTCGGTTTAGAATCCGGTTTTACCAAGTCTTCTTGCTTTTGTCTCTTTATAGTTTT
TAGACTTTTCTTGTTTAGTAAACATCCTCATACCTCATTATGGATTTTACCTATTGATCT
TTAGCCGATTTTCAGTTATGGTAATACACAAGATTATAAGTTG

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 2

CO CL8904Contig1 884 2 4 U
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TGCGGTGGATGTCTCAAGAAGTACGGGGTTACGTTGAAGCTGTTCTAAACAGCCTTGCTG
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ATCAGCTCTACAGTTCTATCAGCGCTATAGGTAATGAGAGGATTGAATCGTTGATTCAAG
AGGACCAGAACGTCAAAAGAAAAAGAGAGCGTTACGAGAAGCAGTCATCTCTTCTTTCAA
AGCTCACAAGACAGCTTAGCATTCACGATAACCGAGCAGCTGCTGCTTCAAGCTGGTCTG
ACAGCGGCACTGAAAGCAGCCCGAAAACCAATGGAGGGTCTAAGGGGGAGGATTGGATGA
ATGCGTTTAACGCTGCTGCCAGTGGACAGGACTCATTGAAGAGGTATGGATCTGGTGGTC
ATAGCCGACGGTACAGTGATCCAGCTCAGAATGGTGAGGATGATTCTTCTGGATCTGGTG
GGAACAACCGTCGCACCACACCAAACAGGCTCCCACCGGCACCTCCACAGTCTGGTGGGT
CATCTTACAGGTATTAGTAGAACCTGTTTGATTTTACAAATTTGTTATTGGAGAAACCAT
AATCACATTCTTTTCTTTTTACTTTTTTGGGATTGGTCCCATTTCTGGGTCTAGTTTTTT
TACTCATGTCTTCCTTAGTTTTTTCCTTTAAAAGAACACGATTATGATATGATATGATGA
TGATGTACTTGCGTGTGCGTGTAGATAAAGATATTGTTAAGGAGTTTCGTCTCAGTTGGT
CAAAACTTTGTGTTTTTTCTCTTCATCAGATGAATGTTTTTCTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CC88TF U 1
AF RS1CC88JQ C 151
BS 1 720 RS1CC88TF
BS 721 721 RS1CC88JQ
BS 722 738 RS1CC88TF
BS 739 884 RS1CC88JQ

RD RS1CC88TF 738 0 0
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TGCGGTGGATGTCTCAAGAAGTACGGGGTTACGTTGAAGCTGTTCTAAACAGCCTTGCTG
CAAATGTTCCAAAGGCCGTTGTTCTTTGTCAAGTGGAGAAATCAAAGGAAGACATGCTGA
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AGGACCAGAACGTCAAAAGAAAAAGAGAGCGTTACGAGAAGCAGTCATCTCTTCTTTCAA
AGCTCACAAGACAGCTTAGCATTCACGATAACCGAGCAGCTGCTGCTTCAAGCTGGTCTG
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GGAACAACCGTCGCACCACACCAAACAGGCTCCCACCGGCACCTCCACAGTCTGGTGGGT
CATCTTACAGGTATTAGTAGAACCTGTTTGATTTTACAAATTTGTTATTGGAGAAACCAT
AATCACATTCTTTTCTTTTTACTTTTTTGGGATTGGTCCCATTTCTGGGTCTAGTTTTTT
*ACTCATGTCTTCCTTAG

QA 1 738 1 738
DS 

RD RS1CC88JQ 734 0 0
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GTAATGAGAGGATTGAATCGTTGATTCAAGAGGACCAGAACGTCAAAAGAAAAAGAGAGC
GTTACGAGAAGCAGTCATCTCTTCTTTCAAAGCTCACAAGACAGCTTAGCATTCACGATA
ACCGAGCAGCTGCTGCTTCAAGCTGGTCTGACAGCGGCACTGAAAGCAGCCCGAAAACCA
ATGGAGGGTCTAAGGGGGAGGATTGGATGAATGCGTTTAACGCTGCTGCCAGTGGACAGG
ACTCATTGAAGAGGTATGGATCTGGTGGTCATAGCCGACGGTACAGTGATCCAGCTCAGA
ATGGTGAGGATGATTCTTCTGGATCTGGTGGGAACAACCGTCGCACCACACCAAACAGGC
TCCCACCGGCACCTCCACAGTCTGGTGGGTCATCTTACAGGTATTAGTAGAACCTGTTTG
ATTTTACAAATTTGTTATTGGAGAAACCATAATCACATTCTTTTCTTTTTACTTTTTTGG
GATTGGTCCCATTTCTGGGTCTAGTTTTTTTACTCATGTCTTCCTTAGTTTTTTCCTTTA
AAAGAACACGATTATGATATGATATGATGATGATGTACTTGCGTGTGCGTGTAGATAAAG
ATATTGTTAAGGAGTTTCGTCTCAGTTGGTCAAAACTTTGTGTTTTTTCTCTTCATCAGA
TGAATGTTTTTCTT

QA 1 734 1 734
DS 



AS 1 2

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CCCGGGGAAAAAATTATCGAAAAATGGGAAAGGACGGTCTGAGCGACGACCAGGTCTCGT
CGATGAAGGAGGCTTTCATGCTCTTCGACACAGACGGCGACGGCAAAATCGCGCCTTCCG
AGCTCGGGATCCTGATGCGATCCCTGGGCGGGAACCCGACCCAAGCCCAGCTGAAATCGA
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CGAAGCACCTGAAGACGGAGCCCTTCGATCGCCAGCTCCGCGACGCCTTCAAGGTGCTCG
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TAAAGTGTCACTCTTTATGCTCTTGTGGTGGTTTTGGATCAATTAATCTGATTGATACCA
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TGGTGATTCCTACTTTTTTTTTATTCCAAGGATGTTTAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1H756TF U 1
AF RS1H756JQB C 144
BS 1 698 RS1H756TF
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BS 700 727 RS1H756TF
BS 728 761 RS1H756JQB

RD RS1H756TF 734 0 0
TGTACAGAAGAGCTCTTTATTCCAAAAGAGAGAGAAAGGAGAAAAAACCCGACCCGACAA
CCCGGGGAAAAAATTATCGAAAAATGGGAAAGGACGGTCTGAGCGACGACCAGGTCTCGT
CGATGAAGGAGGCTTTCATGCTCTTCGACACAGACGGCGACGGCAAAATCGCGCCTTCCG
AGCTCGGGATCCTGATGCGATCCCTGGGCGGGAACCCGACCCAAGCCCAGCTGAAATCGA
TCACCGCCTCCGAGAGCCTGACCGCCCCGTTCGATTTCAACCGATTCCTGGATCTCATGG
CGAAGCACCTGAAGACGGAGCCCTTCGATCGCCAGCTCCGCGACGCCTTCAAGGTGCTCG
ACAAGGAAGGAACCGGGTTCGTCGCCGTGGCGGATCTGAGGCATATCCTCACCAGCATCG
GGGAGAAGCTGGAGCCTAACGAGTTCGATGAGTGGATCAAGGAGGTGGATGTTGGATCCG
ATGGGAAGATCCGGTATGAGGATTTCATTGCCAGGATGGTCGCCAAGTGAGATCTGCTTT
TTTTGTTTTCGAAGTTTGAATTTTTATTTCAAGTATGTTTTTTTTTAATTTTTTTTTACA
TAAAGTGTCACTCTTTATGCTCTTGTGGTGGTTTTGGATCAATTAATCTGATTGATACCA
ATATGTTTTTACTGTTTGTTCTTTTTGTTATTTTGTTT*ACTAACTCTATTGTTGTGTGG
TGGTGAT
CCTACTT

QA 1 727 1 727
DS 

RD RS1H756JQB 618 0 0
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CTGGGCGGGAACCCGACCCAAGCCCAGCTGAAATCGATCACCGCCTCCGAGAGCCTGACC
GCCCCGTTCGATTTCAACCGATTCCTGGATCTCATGGCGAAGCACCTGAAGACGGAGCCC
TTCGATCGCCAGCTCCGCGACGCCTTCAAGGTGCTCGACAAGGAAGGAACCGGGTTCGTC
GCCGTGGCGGATCTGAGGCATATCCTCACCAGCATCGGGGAGAAGCTGGAGCCTAACGAG
TTCGATGAGTGGATCAAGGAGGTGGATGTTGGATCCGATGGGAAGATCCGGTATGAGGAT
TTCATTGCCAGGATGGTCGCCAAGTGAGATCTGCTTTTTTTGTTTTCGAAGTTTGAATTT
TTATTTCAAGTATGTTTTTTTTTAATTTTTTTTTACATAAAGTGTCACTCTTTATGCTCT
TGTGGTGGTTTTGGATCAATTAATCTGATTGATACCAATATGTTTTTACTGTTTGTTCTT
TTTGTTATTTTGTTTTACTAACTCTATTGTTGTGTGGTGGTGATTCCTACTTTTTTTTTA
TTCCAAGGATGTTTAATC

QA 1 618 1 618
DS 



AS 1 2

CO CL8906Contig1 912 2 4 U
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ATGCCGGTGAGAGTTGTGGAGAGCAACGCGCCTGCTCAGGTTTCAGGGAGTGATCCTGGG
AATCGATCACCACTTCCGCCTAGCTCACTTCTTGCCGCCGGCCAGGCGTTTTCTGGTACG
CAGAATGTCTCTAATCAACAGAAGGAGGAAGCTTGGAGAGTCAACGTCCAGATACAGGGT
GTTGACCTTGAACATGGCTATCTTTGTGGCACTATGGAAGCTCTAAACGTTCCCATGGCT
GACACTCCTGTCATAACATTCTGGGAAGGGGAAATCGTTGATGGAAAGAACTACACTTTC
TACACCGGAAAATGGGAAGCCACGAGGGAAGATGATATGAGACATTGGTCAAAGTTCCCA
TCTTTTGCACCTCTTCAGGGACAAGTTGAATCTGACGGTGGGAGGCAATTGGATCTTACC
AATTACCCTTACATATTTATGAGATGGAAAGAGCAGTACTTTGTAAATGTTGGCACAGAT
TGTGGACTAACAATAGCTGGATTCTACTACGTATGCTTCTCCTGCAGCGACGGATCCATC
AGCGGTTTCTACTATGATCCTAACAGCAGTCCGTTTCAGAAGCTGGAGCTGAAAACAGTT
AACGAAAGAAGATCTGGTTTCAGCTTCTCTTCTTACGAGTTGCAATGATCATAGCCAAAA
AGAAAAAAAAGCAGCAGACAGTGCTCCCTCGTGGGCACATGGGAGGCACGTGATCCGGTA
ACACTGTGATAGTAGCACGTAGCAGACTGGACCAGTAAAAACTAAAATACTATTTTGTCA
TCATGGTATGAGACTACTAGCTAAACATTTCAAGACATTACCACATTTTCCAAAATAATG
ATATTATCCAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CZ06TF U 1
AF RS1CZ06JQ C 180
BS 1 720 RS1CZ06TF
BS 721 723 RS1CZ06JQ
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BS 777 912 RS1CZ06JQ

RD RS1CZ06TF 776 0 0
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TACACCGGAAAATGGGAAGCCACGAGGGAAGATGATATGAGACATTGGTCAAAGTTCCCA
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AATTACCCTTACATATTTATGAGATGGAAAGAGCAGTACTTTGTAAATGTTGGCACAGAT
TGTGGACTAACAATAGCTGGATTCTACTACGTATGCTTCTCCTGCAGCGACGGATCCATC
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AACGAAAGAAGATCTGGTTTCAGCTTCTCTTCTTACGAGTTGCAATGATCATAGCCAAAA
**GAAAAAAAGCAGCAGACAGTGCTCCCTCGTGGGCACATGGGAGGCACGTGATCC

QA 1 776 1 776
DS 

RD RS1CZ06JQ 733 0 0
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TGTTGACCTTGAACATGGCTATCTTTGTGGCACTATGGAAGCTCTAAACGTTCCCATGGC
TGACACTCCTGTCATAACATTCTGGGAAGGGGAAATCGTTGATGGAAAGAACTACACTTT
CTACACCGGAAAATGGGAAGCCACGAGGGAAGATGATATGAGACATTGGTCAAAGTTCCC
ATCTTTTGCACCTCTTCAGGGACAAGTTGAATCTGACGGTGGGAGGCAATTGGATCTTAC
CAATTACCCTTACATATTTATGAGATGGAAAGAGCAGTACTTTGTAAATGTTGGCACAGA
TTGTGGACTAACAATAGCTGGATTCTACTACGTATGCTTCTCCTGCAGCGACGGATCCAT
CAGCGGTTTCTACTATGATCCTAACAGCAGTCCGTTTCAGAAGCTGGAGCTGAAAACAGT
TAACGAAGGAAGATCTGGTTTCAGCTTCTCTTCTTACGAGTTGCAATGATCATAGCCAAA
AAGAAAAAAAAGCAGCAGACAGTGCTCCCTCGTGGGCACATGGGAGGCACGTGATCCGGT
AACACTGTGATAGTAGCACGTAGCAGACTGGACCAGTAAAAACTAAAATACTATTTTGTC
ATCATGGTATGAGACTACTAGCTAAACATTTCAAGACATTACCACATTTTCCAAAATAAT
GATATTATCCAAA

QA 1 733 1 733
DS 



AS 1 2

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CTTCGAACTTGGTGAATTATTTGACAACAAGACTACACGAAGACACTATCTCTTCGGTTA
GAAATGTGAATAATTGGTCCGGTGCCGTCTGGATCACCCCGATCGCCGGAGCTTACATCG
CTGACTCATACATCGGCCGCTTCTGGACTTTTACTGCTTCCTCTCTCATCTACGTCCTGG
TATTTCCACTCTCTCCTTCTTTCTTTTATTTTGGGATATTAAATTGCGACTTAAATTAAC
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TTATACAGTCTCTATTTTGCTTATGACAATTTAAGTTTCTATTTTTTGTATTTTTTGGTA
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TTTTTTTGAAGTCTTATCTTCTCTTAAGAATGGTATGTGTTTTGTCAAAAAAAATGGTAT
GTTTCTGATTTTCCTTCCATTTTTATATTTACTTATGAAAATTTGTTTTGCTTCGTTAGT
CC


BQ
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10 10 

AF RS1BA69TF U 1
AF RS1BA69JQ C 135
BS 1 704 RS1BA69TF
BS 705 705 RS1BA69JQ
BS 706 723 RS1BA69TF
BS 724 842 RS1BA69JQ

RD RS1BA69TF 723 0 0
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ATTATCAAAACTTTAAAAAATATTTAATAAAATTAATGGAGGCTGCAAAAGTCTACACAC
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AGGCTTGCTCATTCCTCCTCGGGTATGAAGCGTTTGAGCGGATGGCGTTTTACGGAATAG
CTTCGAACTTGGTGAATTATTTGACAACAAGACTACACGAAGACACTATCTCTTCGGTTA
GAAATGTGAATAATTGGTCCGGTGCCGTCTGGATCACCCCGATCGCCGGAGCTTACATCG
CTGACTCATACATCGGCCGCTTCTGGACTTTTACTGCTTCCTCTCTCATCTACGTCCTGG
TATTTCCACTCTCTCCTTCTTTCTTTTATTTTGGGATATTAAATTGCGACTTAAATTAAC
TAAACTCTATATAGTAACGATTTGACAACGTTCAGAAAGAAAGAAAACATATATATGCAG
TTATACAGTCTCTATTTTGCTTATGACAATTTAAGTTTCTATTTTTTGTATTTTTTGGTA
TTAATGTTAAGAGTTTCTATTTTAGTTAACTGACAATTTAAAGTTAAATTGTCCCAAATC
TTCTACGAGTACAGTGGTGTGTTCTTGAACTTTTAAATTTCTGA*GTCTTATCTTTTTTT
TTT

QA 1 723 1 723
DS 

RD RS1BA69JQ 708 0 0
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CTCCTCGGGTATGAAGCGTTTGAGCGGATGGCGTTTTACGGAATAGCTTCGAACTTGGTG
AATTATTTGACAACAAGACTACACGAAGACACTATCTCTTCGGTTAGAAATGTGAATAAT
TGGTCCGGTGCCGTCTGGATCACCCCGATCGCCGGAGCTTACATCGCTGACTCATACATC
GGCCGCTTCTGGACTTTTACTGCTTCCTCTCTCATCTACGTCCTGGTATTTCCACTCTCT
CCTTCTTTCTTTTATTTTGGGATATTAAATTGCGACTTAAATTAACTAAACTCTATATAG
TAACGATTTGACAACGTTCAGAAAGAAAGAAAACATATATATGCAGTTATACAGTCTCTA
TTTTGCTTATGACAATTTAAGTTTCTATTTTTTGTATTTTTTGGTATTAATGTTAAGAGT
TTCTATTTTAGTTAACTGACAATTTAAAGTTAAATTGTCCCAAATCTTCTACGAGTACAG
TGGTGTGTTCTTGAACTTTTAAATTTCTGAAGTCTTATCTTTTTTTTTTTTTTGAAGTCT
TATCTTCTCTTAAGAATGGTATGTGTTTTGTCAAAAAAAATGGTATGTTTCTGATTTTCC
TTCCATTTTTATATTTACTTATGAAAATTTGTTTTGCTTCGTTAGTCC

QA 1 708 1 708
DS 



AS 1 2

CO CL8908Contig1 630 2 2 U
GGATGGCGAGACTCTTGGTCTCTATCCCTACGCAACCCACACAAACGGCCTTGACGGCGT
TTGCTCAGCCGTCATTTCCGCCGCCGGCGAAAAATTTAGTGTCTCGGGGTGGAGTAGGAG
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GGCCGAGCACGAGTAGCTACTTGCTCGCGTTCGCAATTCCAGCTACTCTTATCGCCGCCA
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TATGTTGTGTTTGTATAAGGTTGTATGCTTGTAGTAGCAGTCTTCCTTGTTTACATATAT
ATAGTTGTAGCTACTGAAAATTTCCAGAATATTATTTGTATAATAATCATATGATGATGA
ATCAAAGACCTCATTTGAAGGTTCTTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GQ31TF U 1
AF RS1GQ31JQ C 34
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BS 618 630 RS1GQ31JQ

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GGGCGGGGAGATTATGTATTAACCGGAGAAACAGAGAGTGTTCCTACGTGGCGAGAGCAG
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CCGTCTTCACTTCAGCCAAAATCGCTGATAAGCTTGACGATGATTTCCTTGAGGATATTG
CGTTGAACCAAGCGATAAAAGCAGCTGAAGAGGGAGAGAATGCTGAAGTTGAAATGTCGC
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TTTAGCCAAAACACACACACACATATATATAAGCTTCTTAATGAGTCTCCAATGTTGTAA
TATGTTGTGTTTGTATAAGGTTGTATGCTTGTAGTAGCAGTCTTCCTTGTTTACATATAT
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ATCAAAGACCTCATTTG

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DS 

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ATTTAGTGTCTCGGGGTGGAGTAGGAGGGGCGGGGAGATTATGTATTAACCGGAGAAACA
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CAATTCCAGCTACTCTTATCGCCGCCACCGTCTTCACTTCAGCCAAAATCGCTGATAAGC
TTGACGATGATTTCCTTGAGGATATTGCGTTGAACCAAGCGATAAAAGCAGCTGAAGAGG
GAGAGAATGCTGAAGTTGAAATGTCGCTGGACGATGTGATTAAAGAACCTGTGCTTCAAC
GAACCCGTAAACGTCCTAAGCGTGAAGTTTAGCCAAAACACACACACACATATATATAAG
CTTCTTAATGAGTCTCCAATGTTGTAATATGTTGTGTTTGTATAAGGTTGTATGCTTGTA
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ATTTGTATAATAATCATATGATGATGAATCAAAGACCTCATTTGAAGGTTCTTTGCC

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DS 



AS 1 2

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GAGGACGCTCTCGTCACTAAGAACTTGGTTCCTGGTGAAGCTGTTTACAACGAGAAGAGA
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AAATACAGAATGCTTGTTGGCATGGTTGATGTTGTCTTCTCTGATGTTGCTCAGCCTGAT
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TTTGAGCGTGACCATGCCTGTGTCGTCGTACCTACCGTGCGCCTAAGAAGAACAAGTTGC
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BQ
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AF RS1GF45TF U 49
AF RS1EP81TF U 1
BS 1 228 RS1EP81TF
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RD RS1GF45TF 636 0 0
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AATCCTTTCCGTTCTAAGTTGGCTGCTGCTATTCTCGGTGGTGTTGATCACATTCACATC
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TCTGACATTGTTGGACCTGAGGGATGTGTTTACGCTGTTGAGTTCTCTCACCGAAGTGGT
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AGACACCCTGCTAAATACAGAATGCTTGTTGGCATGGTTGATGTTGTCTTCTCTGGTGTT
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GTGTTCCAGAGTGAAGTTAAGAAGCTGCAACAGGAGCAGTTCAAGCCAGCGGAGCAAGTG
ACGCTTGAGCCATTTGAGCGTGACCATGCCTGTGTC

QA 1 636 1 636
DS 

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GAGGACGCTCTCGTCACTAAGAACTTGGTTCCTGGTGAAGCTGTTTACAACGAGAAGAGA
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TCTAAGTTGGCTGCTGCTATTCTCGGTGGTGTTGATCACATTCACATCGAACCTGGTGCT
AAAGTTCTATACCTTGGCGCTGCTTCTGGAACAACAGTCTCTCATGTCTCTGACATTGTT
GGACCTGAGGGATGTGTTTACGCTGTTGAGTTCTCTCACCGAAGTGGTAGAGATTTGGTG
AACATGGCGAAGAAGAGAACTAATGTTATTCCAATCATCGAGGATGCTAGACACCCTGCT
AAATACAGAATGCTTGTTGGCATGGTTGATGTTGTCTTCTCTGATGTTTCTCAGCCTGAT
CAGGCTAGGATCGTGGCTTTGAACTCAAGCTTCTTCCTCAAAACAGGAGGTCACTTTGTT
ATCTCCATCAAGGCAAACTGTATTGACTCGACAGTTCCAGCAGAGGCAGTGTTTCAGAGT
GAAGTGAAGAAGCTGCAACAGGAGCAGTTCAAGCCAGCTGAGCAAGTGACGCTTGAGCCA
TTTGAGCGTGACCATGCCTGTGTCGTCGTACCTACCGTGCGCCTAAGAAGAACAAGTTGC
TGCTTAGAAGTTTCATGTGTTGGGATTTGGTTCTTTGGATTTTCGTTAGGGTTTAT

QA 1 776 1 776
DS 



AS 1 2

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GGAGAAGGTTTCGGATTTGAGGAGAAGTATGAGATTGTTTAAGCTTAAGAAGGAGCCTGG
TTGCAGTTGGGTTGAGCTCAAAGATGAGCTTCACGTGTTTTTCATTGCAGATAAGGCTCA
TCCTAGATGGGAAGAGATCTACCAAGAGATTGGTTTGATTTATAGTGAAATGAAATCGTT
TGATGATTCTTCTTTGGTGCCTGAGGTTGAAGTACAAGACCAATGGTACTACTGTTAAAT
GTGTTGTATGGAGTGGAGCTCACTATGACCGAAGAAACTAGTGGTTTCTGAATGTAGTTC
ATTTGTACGAGCAAGTTAACTGTAGACGATTTAATTATTCATTTGTGTAACTTTTTAGCA
TACAATGTATAGTTTGGTGGGTTTTTGTTCTGAATGAATACTGATGTTTCTAC


BQ
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AF RS1C938JQ C 1
AF RS1C938TF U 1
BS 1 593 RS1C938TF

RD RS1C938JQ 593 0 0
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TACAATGTATAGTTTGT**GGTTTTTGTTCTGAATGAATACTGATGTTTCTAC

QA 1 593 1 593
DS 

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GATACATAGAAACAACGTGGAGATTGCAGAGGAAGCAACAGCTGCTCTGTTGAGACTGGA
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TTGCAGTTGGGTTGAGCTCAAAGATGAGCTTCACGTGTTTTTCATTGCAGATAAGGCTCA
TCCTAGATGGGAAGAGATCTACCAAGAGATTGGTTTGATTTATAGTGAAATGAAATCGTT
TGATGATTCTTCTTTGGTGCCTGAGGTTGAAGTACAAGACCAATGGTACTACTGTTAAAT
GTGTTGTATGGAGTGGAGCTCACTATGACCGAAGAAACTAGTGGTTTCTGAATGTAGTTC
ATTTGTACGAGCAAGTTAACTGTAGACGATTTAATTATTCATTTGTGTAACTTTTTAGCA
TACAATGTATAGTTTGGTGGGTTTTTGTTCTGAATGAATACTGATGTTTCTAC

QA 1 593 1 593
DS 



AS 1 2

CO CL8911Contig1 819 2 2 U
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TTGTTCTTAGATTGGTACAGTTAAGAGTGAGTAGAGACCATTCATTATCCAACAACACCA
CACATTTTGTGTAAATTATTAATCGAGTAAAACATTTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BV67TF U 1
AF RS1BV67JQ C 103
BS 1 693 RS1BV67TF
BS 694 819 RS1BV67JQ

RD RS1BV67TF 693 0 0
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AATCTGTTAGATGGGGCTAGGCAGACGGAGACTAAGATGGTGGAGATGCCTGCGTTGAAC
CACCTGATGGCAACTCATGTTCTGCAACAAGCCCAACAGATTGAGGTTTTATATGACCAG
GCGGTAGAAGCAACGAAGAACGTGGAGCTTGGAAACAGAGAGTTTTCTCAAGCAATCCAA
CGTAACAGTAGCAGCAGAACCTTTCTCTTACTG

QA 1 693 1 693
DS 

RD RS1BV67JQ 717 0 0
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GTGCTTACTTTCTCTGTTTTGTTCTTAGATTGGTACAGTTAAGAGTGAGTAGAGACCATT
CATTATCCAACAACACCACACATTTTGTGTAAATTATTAATCGAGTAAAACATTTTT

QA 1 717 1 717
DS 



AS 1 2

CO CL8912Contig1 629 2 2 U
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TTAATGAAAATGACAGTAAATTTGAGAGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GH39TF U 1
AF RS1GH39JQ C 1
BS 1 552 RS1GH39TF
BS 553 629 RS1GH39JQ

RD RS1GH39TF 552 0 0
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TCTCTCTGAGGCTACGAGTAGTTCGGTTGATCACATGGGTTGCTTCGGAGATGCAGCTGG
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CCTCAGATTGAACGAGGAAATTAAAGGCGTTGAGAATCTGGCGGCTAGGCTAAAGCACCT
GAGGAGAAATGTGGATGTTCTTGACACGGCTGTGAGCAAGCTTCTCCGTCCTCAGTAAAA
TTTCATATTATCTTTCACGGACTTTGGATCACTTAACTTCTCGTAACAGATTTTGATTAT
AACTCGGTGTGT

QA 1 552 1 552
DS 

RD RS1GH39JQ 629 0 0
GGACCGGAATTAAATTAACTAGCGGGAAAATGGATGCCGGAGCTGAAGCTGATGCGATCG
TTCGGTGGATGGAGACTCTTCTGCGGCGGAGGAATCCGGATCGAATCAATTCAGCGGCGG
AAGATCGGAGCCGTCGTCGTTGAAGCAAGGGGATATATTGAGAACACTAGCGACGGTGGA
GAAGGATTCGCAGGCAATAGCGGAGAGCTTCGCGTCTCTCTTTGTCTCCCTCCGATCGAC
TCTCTCTGAGGCTACGAGTAGTTCGGTTGATCACATGGGTTGCTTCGGAGATGCAGCTGG
ACGGCTTCAGGAAAGTGCTTTAGATGCTTCTACTAAAGGGAACCGTTACATCAACTCTTG
CCTCAGATTGAACGAGGAAATTAAAGGCGTTGAGAATCTGGCGGCTAGGCTAAAGCACCT
GAGGAGAAATGTGGATGTTCTTGACACGGCTGTGAGCAAGCTTCTCCGTCCTCAGTAAAA
TTTCATATTATCTTTCACGGACTTTGGATCACTTAACTTCTCGTAACAGATTTTGATTAT
AACTCGGTGTGTTTCAATTTTGTAACACAAGGTTATTTGTTAAAACGTTTTCAAGTTTGA
TTAATGAAAATGACAGTAAATTTGAGAGG

QA 1 629 1 629
DS 



AS 1 2

CO CL8913Contig1 650 2 3 U
GTTCTAAGAGAATTCAAAAGTTGCTGTTGGTTCAACTAAAGAGATGTATGTTAAATGCAG
GTGTGGTCCATGTAAAGTGATTGCTCCTAAGTACAAAGCTTTATCAGAGAAATATGAGGA
CGTTGTGTTTCTTAAGCTTGACTGCAACCCTGAAAACAGGGTTTGTCTTCTGCCTCCTTT
AAGATCTCATTTCTCCACACCAGTGTCTTGCTGTTGTTGCTGCTTAGCTATAATAACTTT
GGTTTGGTGCAGCCATTAGCAAAGGAACTAGGAATAAGAGTGGTTCCAACTTTTAAAATA
TTGAAGGATAACCAAGTGGTGAAGGAAGTTACGGGTGCCAAATATGATGATCTAGTTGCA
GCCATTGAAACAGCAAGGTCTGCTAGTTCTTCGGGATGAGCCAATCAACCTCCATGTCTT
TACTTGTAATATGGCTGTATCAATGTAACAAGCTTTCTGTTGGTGCTCTTATTGTGACTC
TGCTTTTGTATGTGTAAATGTTTTCAAGCAATATGATGATCAAATATAATTTCATTTGCT
GTGCAAAAGCCTCTGCAGAGAGAAAAGTAAGCTGTGCAGTTTCGACCGTTAACTGTGTCT
GCAGCTGCCAATATCAACTGCCCCTGCCTTCATGATCTGTTCAGCGGTAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1EW48JQ C 1
AF RS1EW48TF U 66
BS 1 65 RS1EW48JQ
BS 66 648 RS1EW48TF
BS 649 650 RS1EW48JQ

RD RS1EW48JQ 650 0 0
GTTCTAAGAGAATTCAAAAGTTGCTGTTGGTTCAACTAAAGAGATGTATGTTAAATGCAG
GTGTGGTCCATGTAAAGTGATTGCTCCTAAGTACAAAGCTTTATCAGAGAAATATGAGGA
CGTTGTGTTTCTTAAGCTTGACTGCAACCCTGAAAACAGGGTTTGTCTTCTGCCTCCTTT
AAGATCTCATTTCTCCACACCAGTGTCTTGCTGTTGTTGCTGCTTAGCTATAATAACTTT
GGTTTGGTGCAGCCATTAGCAAAGGAACTAGGAATAAGAGTGGTTCCAACTTTTAAAATA
TTGAAGGATAACCAAGTGGTGAAGGAAGTTACGGGTGCCAAATATGATGATCTAGTTGCA
GCCATTGAAACAGCAAGGTCTGCTAGTTCTTCGGGATGAGCCAATCAACCTCCATGTCTT
TACTTGTAATATGGCTGTATCAATGTAACAAGCTTTCTGTTGGTGCTCTTATTGTGACTC
TGCTTTTGTATGTGTAAATGTTTTCAAGCAATATGATGATCAAATATAATTTCATTTGCT
GTGCAAAAGCCTCTGCAGAGAGAAAAGTAAGCTGTGCAGTTTCGACCGTTAACTGTGTCT
GCAGCTGCCAATATCAACTGCCCCTGCCTTCATGATCTGTTCAGCGGTAA

QA 1 650 1 650
DS 

RD RS1EW48TF 583 0 0
GTCCATGTAAAGTGATTGCTCCTAAGTACAAAGCTTTATCAGAGAAATATGAGGACGTTG
TGTTTCTTAAGCTTGACTGCAACCCTGAAAACAGGGTTTGTCTTCTGCCTCCTTTAAGAT
CTCATTTCTCCACACCAGTGTCTTGCTGTTGTTGCTGCTTAGCTATAATAACTTTGGTTT
GGTGCAGCCATTAGCAAAGGAACTAGGAATAAGAGTGGTTCCAACTTTTAAAATATTGAA
GGATAACCAAGTGGTGAAGGAAGTTACGGGTGCCAAATATGATGATCTAGTTGCAGCCAT
TGAAACAGCAAGGTCTGCTAGTTCTTCGGGATGAGCCAATCAACCTCCATGTCTTTACTT
GTAATATGGCTGTATCAATGTAACAAGCTTTCTGTTGGTGCTCTTATTGTGACTCTGCTT
TTGTATGTGTAAATGTTTTCAAGCAATATGATGATCAAATATAATTTCATTTGCTGTGCA
AAAGCCTCTGCAGAGAGAAAAGTAAGCTGTGCAGTTTCGACCGTTAACTGTGTCTGCAGC
TGCCAATATCAACTGCCCCTGCCTTCATGATCTGTTCAGCGGT

QA 1 583 1 583
DS 



AS 1 2

CO CL8914Contig1 956 2 8 U
GGGAGCTATTCTCAGCGGTGAAGGAAACGAGAAGGTCCAAGATCTTCTCTTGCTTGATGT
CACTCCTCTCTCACTCGGTCTTGAAACCGCCGGTGGTGTCATGACCACTTTGATCGCAAG
GAACACCACCATTCCCACCAAAAAGGAGCAAGTGTTCTCAACCTACTCAGACAACCAGCC
CGGTGTGTTGATCCAGGTGTTCGAGGGTGAGAGAGCCAGAACCAAGGACAACAACCTCCT
CGGGAAGTTTGAGCTATCTGGAATCCCTCCAGCCCCCACGTGGTGTCCCTCAGATCACTG
TCTGCTTTGACATCGACGCCAATGGTATCCTCAACGTGTCTGCTGAGGACAAGACCACCG
GACAGAAGAACAAGATCACCATCACCAACGACAAGGGTCGTTTGTCCAAGGACGATATTG
AGAAGATGGTCCAGGAGGCTGAGAAGTACAAGTCTGAGGATGAGGAGCACAAGAAGAAGG
TGGAAGCCAAGAACGCTCTCGAGAACTACGCTTACAACATGAGGAACACCATCCAGGACG
AGAAGATTGGTGAGAAGCTACCGGCTGCAGACAAGAAGAAGATCGAGGACTCGATTGAGC
AGGCGATTCAGTGGCTAGAGAATAACCAGTTGGGTGAGGCTGATGAGTTTGAGGACAAGA
TGAAAGAGTTGGAGAGCATCTGCAACCCAATCATTGCCAAGATGTATCAAGGAGCTGGCG
GTGAAGCTGCAGGGATGGACGATGATGCTCCTCCTGCCTCAGGCGGTGCTGGCCCTAAGA
TTGAAGAGGTCGACTAATCTGTTGATTTGTGATGTTTCAGTGCTTATTTCGATTTCTTAA
GAACTTTTTCTATGTTTGGCCTTTTTGATAGGCTCGTTTTGGTATTATTTTTGTTACAAG
TTTTGAACTCTGGATTTTCTATTCAGCTATGATGACGGATAAGTAAACGTTTTGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C334TF U 1
AF RS1C334JQ C 144
BS 1 276 RS1C334TF
BS 277 277 RS1C334JQ
BS 278 724 RS1C334TF
BS 725 725 RS1C334JQ
BS 726 733 RS1C334TF
BS 734 734 RS1C334JQ
BS 735 751 RS1C334TF
BS 752 956 RS1C334JQ

RD RS1C334TF 757 0 0
GGGAGCTATTCTCAGCGGTGAAGGAAACGAGAAGGTCCAAGATCTTCTCTTGCTTGATGT
CACTCCTCTCTCACTCGGTCTTGAAACCGCCGGTGGTGTCATGACCACTTTGATCGCAAG
GAACACCACCATTCCCACCAAAAAGGAGCAAGTGTTCTCAACCTACTCAGACAACCAGCC
CGGTGTGTTGATCCAGGTGTTCGAGGGTGAGAGAGCCAGAACCAAGGACAACAACCTCCT
CGGGAAGTTTGAGCTATCTGGAATCCCTCCAGCCCC*ACGTGGTGTCCCTCAGATCACTG
TCTGCTTTGACATCGACGCCAATGGTATCCTCAACGTGTCTGCTGAGGACAAGACCACCG
GACAGAAGAACAAGATCACCATCACCAACGACAAGGGTCGTTTGTCCAAGGACGATATTG
AGAAGATGGTCCAGGAGGCTGAGAAGTACAAGTCTGAGGATGAGGAGCACAAGAAGAAGG
TGGAAGCCAAGAACGCTCTCGAGAACTACGCTTACAACATGAGGAACACCATCCAGGACG
AGAAGATTGGTGAGAAGCTACCGGCTGCAGACAAGAAGAAGATCGAGGACTCGATTGAGC
AGGCGATTCAGTGGCTAGAGAATAACCAGTTGGGTGAGGCTGATGAGTTTGAGGACAAGA
TGAAAGAGTTGGAGAGCATCTGCAACCCAATCATTGCCAAGATGTATCAAGGAGCTGGCG
GTGA*GCTGCAGG*ATGGACGATGATGCTCC
CCTGCC

QA 1 751 1 751
DS 

RD RS1C334JQ 813 0 0
AGGAGCAAGTGTTCTCAAC*TACTCAGACAACCAGCCCGGTGTGT*GATCCAGGTGTTCG
AGGGTGAGAGAGCCAGAACCAAGGACAACAACCTCCTCGGGAAGTTTGAGCTATCTGGAA
TCCCTCCAGCCCCCACGTGGTGTCCCTCAGATCACTGTCTGCTTTGACATCGACGCCAAT
GGTATCCTCAACGTGTCTGCTGAGGACAAGACCACCGGACAGAAGAACAAGATCACCATC
ACCAACGACAAGGGTCGTTTGTCCAAGGACGATATTGAGAAGATGGTCCAGGAGGCTGAG
AAGTACAAGTCTGAGGATGAGGAGCACAAGAAGAAGGTGGAAGCCAAGAACGCTCTCGAG
AACTACGCTTACAACATGAGGAACACCATCCAGGACGAGAAGATTGGTGAGAAGCTACCG
GCTGCAGACAAGAAGAAGATCGAGGACTCGATTGAGCAGGCGATTCAGTGGCTAGAGAAT
AACCAGTTGGGTGAGGCTGATGAGTTTGAGGACAAGATGAAGGAGTTGGAGAGCATCTGC
AACCCAATCATTGCCAAGATGTATCAAGGAGCTGGCGGTGAAGCTGCAGGGATGGACGAT
GATGCTCCTCCTGCCTCAGGCGGTGCTGGCCCTAAGATTGAAGAGGTCGACTAATCTGTT
GATTTGTGATGTTTCAGTGCTTATTTCGATTTCTTAAGAACTTTTTCTATGTTTGGCCTT
TTTGATAGGCTCGTTTTGGTATTATTTTTGTTACAAGTTTTGAACTCTGGATTTTCTATT
CAGCTATGATGACGGATAAGTAAACGTTTTGGC

QA 1 813 1 813
DS 



AS 1 2

CO CL8915Contig1 608 2 1 U
CCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGATTCCGGAGACAAAATCATTT
CATCACGAGTACAGTTCCAAGGCATGCACCGTTGAAATTGCAGAAGACGTACATGGTGCT
ATAGATCATATTCACCAACATGGGAGTGCACACACGGATTGCATAGTGACAGAAGATAAA
GAAGTCGCAGAGATATTCCTCCGCCAAGTGGACAGTGCTGCTGTTTTCCACAATGCAAGC
ACAAGATTCTGTGATGGTTTTCGATTTGGACTTGGTGCTGAGGTGGGAATAAGCACAAGC
AGGATCCATGCCCGTGGTCCAGTTGGATAGAAGGATTATTGACAACGAGATGGATAATGA
GAGGAAAAGGACAAGTGGTGGATGGAGACAATGGAGTCGTTTACACCCATAAGGACCTTC
CTGTCTTAAAAGGGACAAAGGCAGTGCAGAACGGGCATTAGTTCTATGCTAATGTCATGA
AATATTTTACTCTTTTCTTATGATTGAAGTTTTTTTTTTTTTAACTTTTGTTTACTAGGA
TTGATATAGTGTTGTGGATTTGCAATAATATAAGAAGGGTCCCTCTACCTTGGTGGTCTT
TTGATAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A124TF U 1
AF RS1A124TV U 25
BS 1 608 RS1A124TF

RD RS1A124TF 608 0 0
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CATCACGAGTACAGTTCCAAGGCATGCACCGTTGAAATTGCAGAAGACGTACATGGTGCT
ATAGATCATATTCACCAACATGGGAGTGCACACACGGATTGCATAGTGACAGAAGATAAA
GAAGTCGCAGAGATATTCCTCCGCCAAGTGGACAGTGCTGCTGTTTTCCACAATGCAAGC
ACAAGATTCTGTGATGGTTTTCGATTTGGACTTGGTGCTGAGGTGGGAATAAGCACAAGC
AGGATCCATGCCCGTGGTCCAGTTGGATAGAAGGATTATTGACAACGAGATGGATAATGA
GAGGAAAAGGACAAGTGGTGGATGGAGACAATGGAGTCGTTTACACCCATAAGGACCTTC
CTGTCTTAAAAGGGACAAAGGCAGTGCAGAACGGGCATTAGTTCTATGCTAATGTCATGA
AATATTTTACTCTTTTCTTATGATTGAAGTTTTTTTTTTTTTAACTTTTGTTTACTAGGA
TTGATATAGTGTTGTGGATTTGCAATAATATAAGAAGGGTCCCTCTACCTTGGTGGTCTT
TTGATAAT

QA 1 608 1 608
DS 

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CCATTACGGCCGGGGATTCCGGAGACAAAATCATTTCATCACGAGTACAGTTCCAAGGCA
TGCACCGTTGAAATTGCAGAAGACGTACATGGTGCTATAGATCATATTCACCAACATGGG
AGTGCACACACGGATTGCATAGTGACAGAAGATAAAGAAGTCGCAGAGATATTCCTCCGC
CAAGTGGACAGTGCTGCTGTTTTCCACAATGCAAGCACAAGATTCTGTGATGGTTTTCGA
TTTGGACTTGGTGCTGAGGTGGGAATAAGCACAAGCAGGATCCATGCCCGTGGTCCAGTT
GGATAGAAGGATTATTGACAACGAGATGGATAATGAGAGGAAAAGGACAAGTGGTGGATG
GAGACAATGGAGTCGTTTACACCCATAAGGACCTTCCTGTCTTAAAAGGGACAAAGGCAG
TGCAGAACGGGCATTAGTTCTATGCTAATGTCATGAAATATTTTACTCTTTTCTTATGAT
TGAAGTTTTTTTTTTTTTAACTTTTGTTTACTAGGATTGATATAGTGTTGTGGATTTGCA
ATAATATAAGAAGGGTCCCTCTACCTTGGTGGTCTTTTGATAAT

QA 1 584 1 584
DS 



AS 1 2

CO CL8916Contig1 782 2 4 U
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ATAGAAAGCTTCCTAAAATGTCATCACTTCTCAACATCTTCCTCCTCTTAGCGGTCTTCA
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TAACCATGTCCAAAGCCGAAAACAAAACCTGTCCTAAGAGTGTTATCCAAGATCAAAACG
AACTCTCTAACGGCATGCCGTTGACATTCTCACCATCAGACAAATCAAAAGTGATCCGTG
TTTCAACTGATCCGAACTTCAAATTCTCAACTACATCGATCTGGAACTTGGACAATGTCG
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CAACTGTTGGTAACTGGTTCAAGATTGACAAGTATGAAGACCACAACAAGATCGTGTTTT
GTCCTTCTGTATGCGATATCTGCAGAGTCATGTGTAGAGACATTGGTGTGCTTGTGCAAG
ATGGGATGAGAAGACTTGTTCTGAGTGATGTTCCACTAAAAGTTGGGTTCCGAAGAGCAT
AGATTACATATAAATTCCACAATATGTACAATGTTTTTACACCACCTTAAATAATAAATA
AA


BQ
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10 10 

AF RS1D136TF U 1
AF RS1D136JQ C 104
BS 1 599 RS1D136TF
BS 600 600 RS1D136JQ
BS 601 691 RS1D136TF
BS 692 782 RS1D136JQ

RD RS1D136TF 691 0 0
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CCAGCCACCGTGGAGCCACCACCGAAGCGGTTGAACCAGTAACCGACATCTACGGCCAAC
GTCTCACATCAGGCACCAAATACTACATCTTGCCTGTAGTTCGCGGTCGCGGCGGCGGAC
TAACCATGTCCAAAGCCGAAAACAAAACCTGTCCTAAGAGTGTTATCCAAGATCAAAACG
AACTCTCTAACGGCATGCCGTTGACATTCTCACCATCAGACAAATCAAAAGTGATCCGTG
TTTCAACTGATCCGAACTTCAAATTCTCAACTACATCGATCTGGAACTTGGACAATGTCG
ACGAGAAGACGAATCAATGGTTCATTGGAACTTGTGGCGTTGAAGTGAATCCAGGCAGGA
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GTCCTTCTGTATGCGATATCTGCAGAGTCATGTGTAGAGACATTGGTGTGCTTGTGCAAG
ATGGGATGAGAAGACTTGTTCTGAGTGATGT

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DS 

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CGACATCTACGGCCAACGTCTCACATCAGGCACCAAATACTACATCTTGCCTGTAGTTCG
CGGTCGCGGCGGCGGACTAACCATGTCCAAAGCCGAAAACAAAACCTGTCCTAAGAGTGT
TATCCAAGATCAAAACGAACTCTCTAACGGCATGCCGTTGACATTCTCACCATCAGACAA
ATCAAAAGTGATCCGTGTTTCAACTGATCCGAACTTCAAATTCTCAACTACATCGATCTG
GAACTTGGACAATGTCGACGAGAAGACGAATCAATGGTTCATTGGAACTTGTGGCGTTGA
AGTGAATCCAGGCAGGACAACTGTTGGTAACTGGTTCAAGATTGACAAGTATGAAGACCA
CAACAAGATCGTGTTTTGTCCTTCTGTATGCGATATCTGCAGAGTCATGTGTAGAGACAT
TGGTGTGCTTGTGCAAGATGGGATGAGAAGACTTGTTCTGAGTGATGTTCCACTAAAAGT
TGGGTTCCGAAGAGCATAGATTACATATAAATTCCACAATATGTACAATGTTTTTACACC
ACCTTAAATAATAAATAAA

QA 1 679 1 679
DS 



AS 1 2

CO CL8917Contig1 815 2 2 U
GGGAGAAAAAATCGCGATCGGCTTCTCCAGCCTCATCCGACCATAGTGCGGTCACACAAT
CGCTGTCGCGTTTTCTGCCCGATTCCCGGCAACGTTCTCCGTTTCTGTCTTTCTTCCGCG
TCCCAATTCCCGCCGGAGTTTATGAGATTTAAGATGAGGGCGAAAGCAGTGTGGGAGCCT
GAGTACCACAGAGTGTTTCTTGATCTATGCGTGGAGCAGACCGTGTTAGGGAACAAACCA
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AAGATCTGGTGCAGGCTTGTTCAAACTGGTTATATGAGTTGGGATCCTGAGACCAACACG
TTTGGTGCTAGTGCTGAAGAGTGGGCTTACTATTTACAGGGGAATCCTGATGCAGAGCAG
TATCGGTTGAATGTTCCACAAGATTTAGAGAAACTAGAGATTATCTTTGCGGGTAGTAAT
AATAATGTTGAGGGCAGAGATGATGATGATGAAGTCTTGAGGGTAAGGAAGAGGCGAAGA
AGTGGTCATGAAGAAGAAGATGAAGAAGATAACCGAAGCATGTGTAGTTCTTCTAATCCT
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GAGACTCTGAAAGGAAACAGACCGGACACGCATTTTAACAAGAAAGGTGGAGACGATTTT
CGAGACGATTAATGAAGACGGGACTCGGTTACACA


BQ
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15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1C842TF U 1
AF RS1D880TF U 90
BS 1 664 RS1C842TF
BS 665 815 RS1D880TF

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CGCTGTCGCGTTTTCTGCCCGATTCCCGGCAACGTTCTCCGTTTCTGTCTTTCTTCCGCG
TCCCAATTCCCGCCGGAGTTTATGAGATTTAAGATGAGGGCGAAAGCAGTGTGGGAGCCT
GAGTACCACAGAGTGTTTCTTGATCTATGCGTGGAGCAGACCGTGTTAGGGAACAAACCA
GGGACGCATTTCTCGAAAGAAGGGTGGAGGAATATACTGAGTTCGTTTCAGGAGCAGACG
GGGGCTATGTACGATAGGATGCAGCTTAAGAACCATTGGGATACGATGAGCAGGCAGTGG
AAGATCTGGTGCAGGCTTGTTCAAACTGGTTATATGAGTTGGGATCCTGAGACCAACACG
TTTGGTGCTAGTGCTGAAGAGTGGGCTTACTATTTACAGGGGAATCCTGATGCAGAGCAG
TATCGGTTGAATGTTCCACAAGATTTAGAGAAACTAGAGATTATCTTTGCGGGTAGTAAT
AATAATGTTGAGGGCAGAGATGATGATGATGAAGTCTTGAGGGTAAGGAAGAGGCGAAGA
AGTGGTCATGAAGAAGAAGATGAAGAAGATAACCGAAGCATGTGTAGTTCTTCTAATCCT
CAGA

QA 1 664 1 664
DS 

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TAAGATGAGGGCGAAAGCAGTGTGGGAGCCTGAGTACCACAGAGTGTTTCTTGATCTATG
CGTGGAGCAGACCGTGTTAGGGAACAAACCAGGGACGCATTTCTCGAAAGAAGGGTGGAG
GAATATACTGAGTTCGTTTCAGGAGCAGACGGGGGCTATGTACGATAGGATGCAGCTTAA
GAACCATTGGGATACGATGAGCAGGCAGTGGAAGATCTGGTGCAGGCTTGTTCAAACTGG
TTATATGAGTTGGGATCCTGAGACCAACACGTTTGGTGCTAGTGCTGAAGAGTGGGCTTA
CTATTTACAGGGGAATCCTGATGCAGGGCAGTATCGGTTGAATGTTCCACAAGATTTAGA
GAAACTAGAGATTATCTTTGCGGGTAGTAATAATAATGTTGAGGGCAGAGATGATGATGA
TGAAGTCTTGAGGGTAAGGAAGAGGCGAAGAAGTGGTCATGAAGAAGAAGATGAAGAAGA
TAACCGAAGCATGTGTAGTTCTTCTAATCCTCAGACAAAAGGGTACTGGTCTCCGTCTAC
ACATGAGCTGTTTGTTGATCTGTTGGTGCAAGAGACTCTGAAAGGAAACAGACCGGACAC
GCATTTTAACAAGAAAGGTGGAGACGATTTTCGAGACGATTAATGAAGACGGGACTCGGT
TACACA

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

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GCTACTGTTGTTGGATCTCTCGTGTTATTCCCATAACTTTGC


BQ
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AF RS1D742JQ C 1
AF RS1D742TF U 1
BS 1 582 RS1D742TF

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DS 

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TTAAAATTACTGAACATGAACACATAGAAGGAGAAAACGAAGAAGCATTGGGTAAATTGA
TTGAAGGAGGAGAAGAAGAAGATGGGGAGGGTAGGAGTGGAAAGGAGGATGGAAAAGTGC
AACCTGATGATGATGATCTGTTAACGCCTGCAGAAAGACGGTACATAGAGCAGAAGCAGA
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GTTAAATCAACTTCTTCCTTGTCTCTCTCTCTGCTTATTTCAGTTTGGCATTGTCGAACA
GCTACTGTTGTTGGATCTCTCGTGTTATTCCCATAACTTTGC

QA 1 582 1 582
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1EP50TF U 1
AF RS1BR56TF U 1
BS 1 368 RS1BR56TF
BS 369 369 RS1EP50TF
BS 370 637 RS1BR56TF

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DS 

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CAAAGTATATCACTGCGATGGGTTGGTGTTATGCGTGGCTAAGGACAAGAAGGAGGAACC
GAAGCTGGTGTTGTGGAACCCTTATCTGTGTCAAACAAGGTGGATCGAACCGAGAGAAGA
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AGACTCGCTGCGCAACCACAAAATCATGAGTTTAGCGGATACCTTTGGACCAGAACGCAA
ACACGAGCTTGTGTGCGAAATCTATGAAATTAGGTCTAATTCATGGAGGGTTCTCGAGGT
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QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 2

CO CL8920Contig1 683 2 2 U
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AATACAGCTAACAAGAGATATCAAAACAACGACAAGAACAAACGACATGAGATAGCTACA
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CTTTGGTTTTATCGCCACCGCCATTCTCATCTCAATGTTCATCGTCATGGCCATCTTCGA
AAATCTTATTTGAACCACCACTAATAACTCACATTCTTCTCCGGGACAGGTCCTTTCGGG
TCTAGAGTCACGGGTGGGGCTCAATGGCCTTGCATTTTCTAAGTTTGGTTGCGAATCTCC
CAAGATAGGGGTGTACTCAAAAGGGGTCTCGGTGTTAATGCCAGGAGACAATGTACCCAC
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TTCCAGCGCAAACTCCATTCAAGAATGTTAACAATTCTATATTTGCATTATTAAGTGTTT
TGTTCTCTGTAGCTTCATCGCTTAGATTACTGGACGTTGTTATGAGTATATATCTCGTCT
TATATATGTATTTATGATTTGCC


BQ
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DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1AN82TF U 1
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CCAAGATTGATCCTCACGCTCCTTTGGACAAAGTCTGCCTTCTTGGTTGTGGTGTTCCCA
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QA 1 728 1 728
DS 

RD RS1AN82JQ 764 0 0
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ACCGTGGGGCTTGCTGTTGCTGAGGGTGCGAAAACAGCTGGTGCTACAAGGATCATTGGC
ATTGATATCGACAGCAAGAAGTATGAAACTGCAAAGAAGTTTGGTGTTAATGAGTTTGTG
AACCCAAAGGACCACCAAAAGCCAATTCAGGAAGTGATTGTTGATCTCACTGATGGCGGT
GTTGACTACAGCTTTGAGTGTATTGGGAATGTCTCCGTGATGAGAGCCGCATTGGAGTGC
TGTCACAAGGGATGGGGAACTTCGGTTATAGTTGGTGTTGCAGCATCAGGACAAGAGATA
TCAACCCGACCGTTCCAACTCGTGACTGGCCGTGTATGGAAAGGAACAGCTTTTGGTGGT
TTCAAGAGTCGAACCCAAGTTCCTTGGCTTGTGGAGAAGTATATGAACAAGGAGATAAAA
GTGGATGAGTACATAACGCACAACATGACCTTGGGAGAGATCAACAAGGCTTTTGACCTG
TTGCATGAAGGTACTTGCCTTCGTTGTGTCCTCAGTACCAGCGACTGATAAACCAATGGT
TTTTATCTTTCATGTATTTTGCGTCTTTCCTGAGCAACGGACTCAAGTCGTGTGTGTCCT
GTCTTATCCTTCGGTAAAATTTGGTTAAAGACCGAGCATCATCATTAATAATAAGCGACC
ATGTTTATGGAGATTATTAACCATGTTTATGGAGATTATTAACC

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

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AGAAGATCGTGTTGAAGAGCTCTGATGGCGAGTCTTTCGAGGTTGACGAGGCCGTGGCTC
GCGAGTCCCAGACCTTAGCTCACCTGGTCGAAGACGACTGCATCGAGAACGGTATCCCTC
TCCCCAACGTCACGAGCAAGATCCTCGCCAAGGTGATCGAGTACTGCAAGAAGCACGTCG
ACGCCGCTGCTGCCAAGACCGAGGCCGTCGATGGCGGTGCTTCCTCCGACGATGACCTCA
AGGCGTGGGACGTTGAGTTCATGAAGATCGACCAAGCTACCCTCTTCGAACTCATCCTGG
CTGCTAATTATCTGAACATCAAGAACCTTCTTGACCTTACGTGCCAGACGGTGGCTGATA
TGATCAAAGGCAAGACTCCAGAGGAGATTCGCGCGACCTTCAACATCAAGAACGACTTCA
CACCCGAGGAGGAAGAGGAGATGCGCAGGGAGAACCAGTGGGCTTTTGAATGAAGACAAA
GAGAGCCTTGTTGAAGCAAACCCACCAAGCTTCTTTCTTTTATCTTATTTTCGTTTTTTT
ATGCTCTTAGAAAAAATTAATAACTTGTGTTGGTCCTACTAGTGCTTTTCTATTTGCGAT
TAAGAACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DE21TF U 1
AF RS1DE21JQ C 136
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BS 616 668 RS1DE21JQ

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ATGCTCTTAGAAAAA

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DS 

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ATTAATAACTTGTGTTGGTCCTACTAGTGCTTTTCTATTTGCGATTAAGAACC

QA 1 533 1 533
DS 



AS 1 2

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BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1B790JQ C 1
AF RS1B790TF U 1
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TTTAAATCAATTCGCAATTTTGGTATCAATTTTTGAATCAATTCATAATTTTCATTTATT
TAGGAATTTAAATGTATCAGGTTAATTCCATCAATTATGGGCATACAAAAAGAGTATCGT
TCGGATTTTTGTAAATTTTAGTATGGTTCCAGTTTCATATTTTTGGTTATGTTCTATTTA
GATTAATTAGTATATTTATATATTTTATAGCATACTAATATAATGTGTCAAATATTTTTT
TACAGAAAATTATGTTAAATTTATGAATATGTCAAGTAAATATATTAGGTGTTTAAAAAA
ATTATATAACTTCAGTTTATAAATAAAGAAATGAAGTTGTGTGTATAGTATTTGTAAG

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DS 

RD RS1B790TF 478 0 0
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TTGATTTTGGTAATCAATTTACAGTTTTGGTTCCTTATATTTCAAAACGTGAATAGAACG
TTTAAATCAATTCGCAATTTTGGTATCAATTTCTGAATCAATTCATAATTTTCATTTATT
TAGGAATTTAAATGTATCAGGTTAATTCCATCAATTATGGGCATACAAAAAGAGTATCGT
TCGGATTTTTGTAAATTTTAGTATGGTTCCAGTTTCATATTTTTGGTTATGTTCTATTTA
GATTAATTAGTATATTTATATATTTTATAGCATACTAATATAATGTGTCAAATATTTTTT
TACAGAAAATTATGTTAAATTTATGAATATGTCAAGTAAATATATTAGGTGTTTAAAAAA
ATTATATAACTTCAGTTTATAAATAAAGAAATGAAGTTGTGTGTATAGTATTTGTAAG

QA 1 478 1 478
DS 



AS 1 2

CO CL8924Contig1 617 2 1 U
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CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGAGATACACTCGGCTCAGATCAAACAGTCATGAAT
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TCGGGTCCATTGCTGGCTCAGCCAAGAAAAGTGGATCAGATGCTGGAAGAACACGACCGG
CAGCTCCAGGAGTTCACCAGACAGAAAGCAAAACATTCCAGAAGCTGATAGCGTAATGTA
TCTTGAATGATTTGCTTATTTTGCCGGGAATGGACAAAAAAAAGAGAACCAGATGGAGTC
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GTACCCATGATAAGAGTTTGATCTGTGTAGTACATATATGTATGTACATTTCTTCATATA
TTACATTATATGTGTAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 

AF RS1A360TF U 1
AF RS1A360TV U 37
BS 1 617 RS1A360TF

RD RS1A360TF 617 0 0
CATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATCAGTCGACGGTACCGGACATATGCC
CGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGAGATACACTCGGCTCAGATCAAACAGTCATGAAT
CAGAAAAGGATGAATTTGAGAGCATTCAACAGAGCTGACACTATGGATAATAGTAAGAGG
CAAATCAAAATCCCAAATGACCCATCTTGGTATGATGCTGGGGATAACAAAATGTACATG
TCGGGTCCATTGCTGGCTCAGCCAAGAAAAGTGGATCAGATGCTGGAAGAACACGACCGG
CAGCTCCAGGAGTTCACCAGACAGAAAGCAAAACATTCCAGAAGCTGATAGCGTAATGTA
TCTTGAATGATTTGCTTATTTTGCCGGGAATGGACAAAAAAAAGAGAACCAGATGGAGTC
TTGTTGTATCAAAGAAGAGTCTGATGAGCTTTTTGAAAGAAAAAAAAAATGTCATAGAGA
TTTAAGGTTGTTTGCGTTATAAATAGGCGCAGCTCTGTGATTACATAGAACATGTATACA
GTACCCATGATAAGAGTTTGATCTGTGTAGTACATATATGTATGTACATTTCTTCATATA
TTACATTATATGTGTAC

QA 1 617 1 617
DS 

RD RS1A360TV 581 0 0
AGTCGACGGTACCGGACATATGCCCGGGAATTCGGCCATTACGGCCGGGGAGATACACTC
GGCTCAGATCAAACAGTCATGAATCAGAAAAGGATGAATTTGAGAGCATTCAACAGAGCT
GACACTATGGATAATAGTAAGAGGCAAATCAAAATCCCAAATGACCCATCTTGGTATGAT
GCTGGGGATAACAAAATGTACATGTCGGGTCCATTGCTGGCTCAGCCAAGAAAAGTGGAT
CAGATGCTGGAAGAACACGACCGGCAGCTCCAGGAGTTCACCAGACAGAAAGCAAAACAT
TCCAGAAGCTGATAGCGTAATGTATCTTGAATGATTTGCTTATTTTGCCGGGAATGGACA
AAAAAAAGAGAACCAGATGGAGTCTTGTTGTATCAAAGAAGAGTCTGATGAGCTTTTTGA
AAGAAAAAAAAAATGTCATAGAGATTTAAGGTTGTTTGCGTTATAAATAGGCGCAGCTCT
GTGATTACATAGAACATGTATACAGTACCCATGATAAGAGTTTGATCTGTGTAGTACATA
TATGTATGTACATTTCTTCATATATTACATTATATGTGTAC

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

CO CL8925Contig1 843 2 2 U
GTAACAAGATATCAATATTGACGACATATAATGGGCAGAAGCTCTTAATCCGTGATGTTA
TCAACCGTCGATGTGTTCCCTATCCATTCATCGGCCCACCTAGCAAGGTGACTACAGTGG
ACAAGTTCCAAGGACAACAGAATGACTTCATTTTGCTGTCTCTTGTACGAACACGCTTTG
TTGGACATCTACGTGATGTGAGAAGGTTGGTAGTTGCAATGTCACGTGCTAGGCTCGGTC
TGTATGTGTTCTGCCGCCGCTCCCTCTTTGAACAATGCTATGAACTGCAACCAACGTTTC
AACTTCTTCTGAAAAGACCCGATCGGCTCGGGCTCAACCTGAGCGAGAACACAGCAGCTT
ATACAGATCGTGCGGTGGATGAAGTTGGAAATCCTTATTTTGTTCATGATGCTGAAGAGA
TGGCACACATAGTTCACGACAGGATGAACGAGTTCTACAAGGCACAAGGCGTGTATGAGC
AATACCAGAATAACATGCCACAAATCGAAGACGGCAACCAAGACATGGAGGAGAGTGATT
CAGTTGTAGGTGAAGATGGTGAATCTGAGAAGACGATACAGCCAGAGTTGGTTGATGGAA
CATCGACGGAGATGGAGGTGGACAATGGAGTTAGCGGTGAGAATGGAAAGGCTGATGAGA
ATTAGATGTTACGAGGTTCGAATGGGATAAAAGAGGGATGAGCTCAATTTGTTTGCTTAT
GTAGAATATCTTCTTAAATTGTACTGAGTAAATTCTGGTGAAGTAGTAAACTAAACTTGG
ATGGCTTCCCCACCGACTGTCTTTGTCACACTTGTATTTGAGTTTTCATTTCGTTGGTTT
TCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 

AF RS1CG60TF U 1
AF RS1CG60JQ C 90
BS 1 671 RS1CG60TF
BS 672 843 RS1CG60JQ

RD RS1CG60TF 671 0 0
GTAACAAGATATCAATATTGACGACATATAATGGGCAGAAGCTCTTAATCCGTGATGTTA
TCAACCGTCGATGTGTTCCCTATCCATTCATCGGCCCACCTAGCAAGGTGACTACAGTGG
ACAAGTTCCAAGGACAACAGAATGACTTCATTTTGCTGTCTCTTGTACGAACACGCTTTG
TTGGACATCTACGTGATGTGAGAAGGTTGGTAGTTGCAATGTCACGTGCTAGGCTCGGTC
TGTATGTGTTCTGCCGCCGCTCCCTCTTTGAACAATGCTATGAACTGCAACCAACGTTTC
AACTTCTTCTGAAAAGACCCGATCGGCTCGGGCTCAACCTGAGCGAGAACACAGCAGCTT
ATACAGATCGTGCGGTGGATGAAGTTGGAAATCCTTATTTTGTTCATGATGCTGAAGAGA
TGGCACACATAGTTCACGACAGGATGAACGAGTTCTACAAGGCACAAGGCGTGTATGAGC
AATACCAGAATAACATGCCACAAATCGAAGACGGCAACCAAGACATGGAGGAGAGTGATT
CAGTTGTAGGTGAAGATGGTGAATCTGAGAAGACGATACAGCCAGAGTTGGTTGATGGAA
CATCGACGGAGATGGAGGTGGACAATGGAGTTAGCGGTGAGAATGGAAAGGCTGATGAGA
ATTAGATGTTA

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1CG60JQ 754 0 0
ATCGGCCCACCTAGCAAGGTGACTACAGTGGACAAGTTCCAAGGACAACAGAATGACTTC
ATTTTGCTGTCTCTTGTACGAACACGCTTTGTTGGACATCTACGTGATGTGAGAAGGTTG
GTAGTTGCAATGTCACGTGCTAGGCTCGGTCTGTATGTGTTCTGCCGCCGCTCCCTCTTT
GAACAATGCTATGAACTGCAACCAACGTTTCAACTTCTTCTGAAAAGACCCGATCGGCTC
GGGCTCAACCTGAGCGAGAACACAGCAGCTTATACAGATCGTGCGGTGGATGAAGTTGGA
AATCCTTATTTTGTTCATGATGCTGAAGAGATGGCACACATAGTTCACGACAGGATGAAC
GAGTTCTACAAGGCACAAGGCGTGTATGAGCAATACCAGAATAACATGCCACAAATCGAA
GACGGCAACCAAGACATGGAGGAGAGTGATTCAGTTGTAGGTGAAGATGGTGAATCTGAG
AAGACGATACAGCCAGAGTTGGTTGATGGAACATCGACGGAGATGGAGGTGGACAATGGA
GTTAGCGGTGAGAATGGAAAGGCTGATGAGAATTAGATGTTACGAGGTTCGAATGGGATA
AAAGAGGGATGAGCTCAATTTGTTTGCTTATGTAGAATATCTTCTTAAATTGTACTGAGT
AAATTCTGGTGAAGTAGTAAACTAAACTTGGATGGCTTCCCCACCGACTGTCTTTGTCAC
ACTTGTATTTGAGTTTTCATTTCGTTGGTTTTCT

QA 1 754 1 754
DS 



AS 1 2

CO CL8926Contig1 588 2 2 U
TTTTTTTAGCTAAATTAATTTGCGTTTTAAGTAAACATAAATGAGTCTGCTATTACCATG
CTTATAAAAAAAATCATTTAAGAGAAACAAACATCTTTGATACATGTCAATCGTCAAGTG
CAAGAGTTGTTTTAGAAAGAGGTCAAAGCAGGTAACATCTATAAGATCGTCATGGCTGCT
GATGATGATGCATGAGGAAGGGTCTAAGCTCCGTCAGCTAAAGGTGTGTTCACCGTACTG
ATGTAAAGAACATTGTTTCCACGGATAAAGGCATCACCGTATTTGTTCTTGAGCTGCACG
TTAACATACTCTTCTGTCTGCTCCATTGCTATGTTCATGTACCCATCAAGACAAGCAAGG
ATGCCACGATAATCAACACCAGAGTTGATCTTGACGACAACAGGTCTCCCACGGATGGAT
TTGAGGAAATCAGCAGGTGTCTTTGTCGTTCCTCCAGAAACTTTATTGTCTCCACTCCCA
CTCATCTTATCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCAAAGCACGATCCTTTAACGTAACTGA
CCTACTCGAGTCGACGACAGGGAGAGAGAGAGAGAGGGGGTAACCTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1GB63TF C 1
AF RS1GB63JQ U 8
BS 1 7 RS1GB63TF
BS 8 588 RS1GB63JQ

RD RS1GB63TF 588 0 0
TTTTTTTAGCTAAATTAATTTGCGTTTTAAGTAAACATAAATGAGTCTGCTATTACCATG
CTTATAAAAAAAATCATTTAAGAGAAACAAACATCTTTGATACATGTCAATCGTCAAGTG
CAAGAGTTGTTTTAGAAAGAGGTCAAAGCAGGTAACATCTATAAGATCGTCATGGCTGCT
GATGATGATGCATGAGGAAGGGTCTAAGCTCCGTCAGCTAAAGGTGTGTTCACCGTACTG
ATGTAAAGAACATTGTTTCCACGGATAAAGGCATCACCGTATTTGTTCTTGAGCTGCACG
TTAACATACTCTTCTGTCTGCTCCATTGCTATGTTCATGTACCCATCAAGACAAGCAAGG
ATGCCACGATAATCAACACCAGAGTTGATCTTGACGACAACAGGTCTCCCACGGATGGAT
TTGAGGAAATCAGCAGGTGTCTTTGTCGTTCCTCCAGAAACTTTATTGTCTCCACTCCCA
CTCATCTTATCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCAAAGCACGATCCTTTAACGTAACTGA
CCTACTCGAGTCGACGACAGGGAGAGAGAGAGAGAGGGGGTAACCTCC

QA 1 588 1 588
DS 

RD RS1GB63JQ 581 0 0
AGCTAAATTAATTTGCGTTTTAAGTAAACATAAATGAGTCTGCTATTACCATGCTTATAA
AAAAAATCATTTAAGAGAAACAAACATCTTTGATACATGTCAATCGTCAAGTGCAAGAGT
TGTTTTAGAAAGAGGTCAAAGCAGGTAACATCTATAAGATCGTCATGGCTGCTGATGATG
ATGCATGAGGAAGGGTCTAAGCTCCGTCAGCTAAAGGTGTGTTCACCGTACTGATGTAAA
GAACATTGTTTCCACGGATAAAGGCATCACCGTATTTGTTCTTGAGCTGCACGTTAACAT
ACTCTTCTGTCTGCTCCATTGCTATGTTCATGTACCCATCAAGACAAGCAAGGATGCCAC
GATAATCAACACCAGAGTTGATCTTGACGACAACAGGTCTCCCACGGATGGATTTGAGGA
AATCAGCAGGTGTCTTTGTCGTTCCTCCAGAAACTTTATTGTCTCCACTCCCACTCATCT
TATCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCAAAGCACGATCCTTTAACGTAACTGACCTACTC
GAGTCGACGACAGGGAGAGAGAGAGAGAGGGGGTAACCTCC

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

CO CL8927Contig1 582 2 1 U
GTATCCTCTAGTGTCCCCAACCGCTGCGAGTGTAAACCTTGGGTTGATTAACTCAGCTGC
CTCCCTCTATCAGACCCTTGCTCAACCCACGCTAGGAGCGCTTACAGCAACTTATCCCCA
AAGGCCTGGACAACCAGAATGTGACTACTACATGAAGACAGGGGAGTGCAAGTTTGGAGA
GAGGTGCAGGTTCCATCACCCAGCAGATAGGTTAAATGCAACAAGCAAACAAGCTCCTCA
ACAGCCGAATGTAAAGCTGAGTCTTGCAGGGTATCCTAGAAGAGAGGGTGCGCAAAACTG
CCCGTACTACATGAAGACAGGGACTTGCAAGTATGGGGCAACGTGTAAGTTTGACCATCC
TCCTCCAGGTGAAGTTATGGCTAAAACCGCTTCAGAAGCTGATGCTGCTCCTCCTGGTGA
AGGAACTGACACGACGACTCAGTGAGTAGGCAGCTATGTGTAAGATAAGATGATAAGCGT
GTTGTAATCTTGTTTTACTTGCTATGTTCTCTGCATTTGTTTCTCCTTTCTCAAATCCCT
TTTATCATATCCTAAAACCAAAAGAAGAGATTGATTGAGTCT


BQ
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AF RS1DE02JQ C 1
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TCCTCCAGGTGAAGTTATGGCTAAAACCGCTTCAGAAGCTGATGCTGCTCCTCCTGGTGA
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QA 1 582 1 582
DS 



AS 1 2

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BQ
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DS 

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QA 1 582 1 582
DS 



AS 1 2

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CTCATTTTGTTGTACTGGTAGTTTGTGAAATATAGTCTCTTT


BQ
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AF RS1F752TF U 1
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QA 1 582 1 582
DS 

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CTCATTTTGTTGTACTGGTAGTTTGTGAAATATAGTCTCTTT

QA 1 582 1 582
DS 



AS 1 2

CO CL8930Contig1 721 2 2 U
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CATTAAAATCAGTGTTAGCAAATGTCACAGACGAGTTTATTGTGGAAGATGTCTTTTAGA
T


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10 

AF RS1G367TF U 1
AF RS1G367JQ C 23
BS 1 604 RS1G367TF
BS 605 721 RS1G367JQ

RD RS1G367TF 604 0 0
GCGGATATCAACTACCGCCGTCTCACTGAAAGAGATCAGTTCATTATTCTAGCCACAGAT
GGGGTCTGGGATGTTTTGTCGAACAAAGAGGCTGTTGATATTGTGGCTTCAGCTCCAAGT
CGAAGCACTGCAGCTCGTGCTTTAGTATGCACTGCTGTTCGAGCGTGGAGGCTCAAGTAT
CCTACTTCCAAGAACGATGACTGCGCTGTAGTATGTCTCTTTCTCGAAGATTCCTCGGCG
GAAGCATCCATGGAAGCTTCGGAAACCGTTGTTCATTCACGCAAAGAGTCTATAGAGAGT
GTCACCATCACATCAAGCAAAGATGGAGAGAAGAAAGAAGAGGCTTTACCAGAGACCGAT
GAGATTGTACCTGTTTTAGAGATCAAGGAAGAAAAAACGTCTGAGAGGATTGAGTCCAAG
AAGACAACACTTGCCGAATGTATATCTGTCAAGGATGATGAAGAGTGGTCGGCGTTGGAA
GGCTTGACAAGAGTCAACAGTCTCTTGAGCATTCCTAGGTTCTTGTCTGGTGAGCTAAGA
TCAGGTAGCTGGAGAAAATGGTTGTGAGTATGCATGCAACACTCAGAGAAGTGATCAAAC
AAAC

QA 1 604 1 604
DS 

RD RS1G367JQ 699 0 0
TCACTGAAAGAGATCAGTTCATTATTCTAGCCACAGATGGGGTCTGGGATGTTTTGTCGA
ACAAAGAGGCTGTTGATATTGTGGCTTCAGCTCCAAGTCGAAGCACTGCAGCTCGTGCTT
TAGTATGCACTGCTGTTCGAGCGTGGAGGCTCAAGTATCCTACTTCCAAGAACGATGACT
GCGCTGTAGTATGTCTCTTTCTCGAAGATTCCTCGGCGGAAGCATCCATGGAAGCTTCGG
AAACCGTTGTTCATTCACGCAAAGAGTCTATAGAGAGTGTCACCATCACATCAAGCAAAG
ATGGAGAGAAGAAAGAAGAGGCTTTACCAGAGACCGATGAGATTGTACCTGTTTTAGAGA
TCAAGGAAGAAAAAACGTCTGAGAGGATTGAGTCCAAGAAGACAACACTTGCCGAATGTA
TATCTGTCAAGGATGATGAAGAGTGGTCGGCGTTGGAAGGCTTGACAAGAGTCAACAGTC
TCTTGAGCATTCCTAGGTTCTTGTCTGGTGAGCTAAGATCAGGTAGCTGGAGAAAATGGT
TGTGAGTATGCATGCAACACTCAGAGAAGTGATCAAACAAACAAACAAACAATCACTGAT
TTTCATTTCATGATTGGTTTTTTCTTTTCCAATGATGACATTAAAATCAGTGTTAGCAAA
TGTCACAGACGAGTTTATTGTGGAAGATGTCTTTTAGAT

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 2

CO CL8931Contig1 780 2 3 U
GGAATCCAAATCTCTGACAATGGAAGCAAACCAGTTATACGGTTTGTCTCTACTTGTTGT
TCTGCTGCTGTCAGTGACTTCGACAGTGACATCGGACGAGATTGTTTCTTGTACAATGTG
TTCTTCCTGCGACAATCCTTGTAATCCCGTCCAATCATATCCTCCTCCTCCACCACCATC
TCGTCCACCACCGTCACCGTCAACCACCACCGCATGTCCTCCGCCTCCTTCTCCTCCGAG
CTCCCCGGCGGTGGTGGTGGCAGCTCTTACTATTACCCACCTCCTTCACAGTCCGGTGGC
GGTAAATACCCTCCTCCGTACGGTGACGGTGGTCAAGGTTACTACTACCCTCCGCCGTTT
TCAGGAAACTATCCTACGCCGCCTCCGCCGAACCCGATCGTCCCTTATTTCCCCTTTTAC
TATCATACGCCACCACCAGGTTCTGGTTCATATCGGTTTATGAGTTCTTATTCTATTATG
TTTGCTCTTTTCGCCATCTTCCTATGTTTAGTGTGACAAAAAATACATCGGAGTTCGCTG
GAAAATTACGAAGAAACATCAGAATAATGTGGCAGATCGGTAGATCTACAATAGTCTTTG
AAAGTATTAGATATTTTTAATCGTGGAAACCATATTTTGGATCAAATGATTATCTTTTAC
TTTCTTCGATCTGTCAAACCCTTTTTTTCTTTTCTTGACAATTTGTATTTGTATTTACAA
TTTTCTTGTTAATTAACATTTTAGTTACTCGCTATTCAGAAATAAAATAATTGTTACTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AI28TF U 1
AF RS1AI28JQ C 184
BS 1 244 RS1AI28TF
BS 245 246 RS1AI28JQ
BS 247 780 RS1AI28TF

RD RS1AI28TF 780 0 0
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TCTGCTGCTGTCAGTGACTTCGACAGTGACATCGGACGAGATTGTTTCTTGTACAATGTG
TTCTTCCTGCGACAATCCTTGTAATCCCGTCCAATCATATCCTCCTCCTCCACCACCATC
TCGTCCACCACCGTCACCGTCAACCACCACCGCATGTCCTCCGCCTCCTTCTCCTCCGAG
CTCC**GGCGGTGGTGGTGGCAGCTCTTACTATTACCCACCTCCTTCACAGTCCGGTGGC
GGTAAATACCCTCCTCCGTACGGTGACGGTGGTCAAGGTTACTACTACCCTCCGCCGTTT
TCAGGAAACTATCCTACGCCGCCTCCGCCGAACCCGATCGTCCCTTATTTCCCCTTTTAC
TATCATACGCCACCACCAGGTTCTGGTTCATATCGGTTTATGAGTTCTTATTCTATTATG
TTTGCTCTTTTCGCCATCTTCCTATGTTTAGTGTGACAAAAAATACATCGGAGTTCGCTG
GAAAATTACGAAGAAACATCAGAATAATGTGGCAGATCGGTAGATCTACAATAGTCTTTG
AAAGTATTAGATATTTTTAATCGTGGAAACCATATTTTGGATCAAATGATTATCTTTTAC
TTTCTTCGATCTGTCAAACCCTTTTTTTCTTTTCTTGACAATTTGTATTTGTATTTACAA
TTTTCTTGTTAATTAACATTTTAGTTACTCGCTATTCAGAAATAAAATAATTGTTACTTT

QA 1 780 1 780
DS 

RD RS1AI28JQ 597 0 0
TCCACCACCGTCACCGTCAACCACCACCGCATGTCCTCCGCCTCCTTCTCCTCCGAGCTC
CCCGGCGGTGGTGGTGGCAGCTCTTACTATTACCCACCTCCTTCACAGTCCGGTGGCGGT
AAATACCCTCCTCCGTACGGTGACGGTGGTCAAGGTTACTACTACCCTCCGCCGTTTTCA
GGAAACTATCCTACGCCGCCTCCGCCGAACCCGATCGTCCCTTATTTCCCCTTTTACTAT
CATACGCCACCACCAGGTTCTGGTTCATATCGGTTTATGAGTTCTTATTCTATTATGTTT
GCTCTTTTCGCCATCTTCCTATGTTTAGTGTGACAAAAAATACATCGGAGTTCGCTGGAA
AATTACGAAGAAACATCAGAATAATGTGGCAGATCGGTAGATCTACAATAGTCTTTGAAA
GTATTAGATATTTTTAATCGTGGAAACCATATTTTGGATCAAATGATTATCTTTTACTTT
CTTCGATCTGTCAAACCCTTTTTT*CTTTTCTTGACAATTTGTATTTGTATTTACAATTT
TCTTGTTAATTAACATTTTAGTTACTCGCTATTCAGAAATAAAATAATTGTTACTTT

QA 1 597 1 597
DS 



AS 1 2

CO CL8932Contig1 1086 2 10 U
TTTTTTATCCTCCACTCCATTATCCCTAGAGAGAAAAGGTTCTCTCAACAAGAAAGACAA
CCTAAAAGAGAAAAAGGAGGTCGGGAAAATTTCTGTGACGTCTACGGTGGAGGAGAACCA
CCGGAAAGATCCTTCATCGCCGGAGAAAGCGGCTGAGAAGAGTAAACGTAAATGGGTGTT
TTGGGAAAGAAAGTGGAGGAGATTAGATTATTTCAAACTTACAGCTTCAGTGTTTGTGCA
TTCTATGGCTCTTTTGGCTCCGTTTTATTTCAGCTGGTCGGCTCTTTGGGTTACCTTTTT
GTTTTATACCATTGGTGGTCTCGGTATTACGGTATCGTATCACCGGAACTTGGCTCATCG
GAGTTTCAAAGTCCCTAAATGGCTTGAGTATCTCTTAGCCTATTGTGCCCTTCTCGCTAT
TCAGGGAGATCCGATTGATTGGGTGAGTACTCATCGGTATCATCATCAGTTTACTGATTC
AGAACGAGATCCACATAGCCCTAAGGAAGGTTTTTGGTTTAGTCATCTTCTGTGGATTTA
TGATTCTGCATATCTCGTTAAAAAGTGTGGAAGAAGAACAAACGTTGAGGATTTGAAGAG
GCAATGGTTCTATAGGTTTCTTCAAAAAACGGTGCTGTTTCACATTCTAGGACTTGGTAT
CATTCTCTTCTATTTTGGTGGCATGTCCTTCGTAACTTGGGGGATGGGGATAGGAGCAGC
ACTAGAGGTGCACGTGACTTGTTTCATAAACTCGCTTTGCCATATTTGGGGCACTCGAAC
TTGGAAGACCAATGATACTTCTCGTAATGTTTGGTGGTTATCGGTGTTTTCATTTGGAGA
AAGTTGGCACAACAATCACCATGCGTTCGAGTCGTCGGCGAGACAGGGGCTTGAATGGTG
GCAAATCGACATATCTTGGTACATTATTAGGTTTCTTGAGATTATTGGTTTAGCATATGA
CGTGAAACTGCCAATGGAATCTCAACGCCGTCGTATGGCTATGAAGACCACACAAACAGA
GATCTAGTCCTATGTACCTAGAATAATTTATAATCCTAAAAGAGTTTATTGATTGTTTTT
TCTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EY74TF U 1
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BQ
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AF RS1GI34TF U 1
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BS 469 535 RS1GI34JQ

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TTTATGACCCTAGTTTCCTTATGAGTTCGTCGAACCCTTGGTTTCGACTTCAGTGTTTGT
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BQ
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AF RS1G802TF U 1
AF RS1G802JQ C 106
BS 1 691 RS1G802TF
BS 692 692 RS1G802JQ

RD RS1G802TF 691 0 0
GGGACGTGTCATCCTACGCTTGTCTCTTTCTCTCCCTCGGCGAAACCGCGTCGCCGACGA
CTCCAGTTCTCTCTTTCTCTCCGTAAACTACTCCCCAAATCTCCTTCCCCGGTTTCCCCT
CTGCTCTCAGCTGGTTTTCGATTCTCCTCATCTCCGATCAAGTTTATAGAGGTTCGAAAG
GGTTTTGAAAGGATGGCACAACACAATGGCAACGATGAAGTTATGGCCAGTGCTATGGTT
GAGATCAATATCAAGATGACTTTGGATTCTCAAACCCACACCTTATGTGTCGATAAATGT
GTCCCTGTTCCCGCTTTGAAGGAGCAAATTGCTTCCGCTACTGGGGTTGTTACAGAACAA
CAACGCTTGATATGTCGAGGACAAGTAATGAAGGATGATCAACTCCTCTCAGCCTATCGT
ATCCTTCCTTCTCTTCTTTTCACCACTTTGCCTTGCTTCTTTCTTAGAGCTTTTGTTTTA
TTTATGACCCTAGTTTCCTTATGAGTTCGTCGAACCCTTGGTTTCGACTTCAGTGTTTGT
GGTCTCAGATGAATTAACCGTCTGTTGTTGTATGTATTTGATTAGATGATATTAGGTTGG
TGTTTGGTTGTCTCATTTCTATGTTTAGGACTGTTGTATGTATTTGATCAGATGAATTAA
GAACCCCTAAATAAGATATTTGCATTGGAGG

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1G802JQ 587 0 0
TCCCCGGTTTCCCCTCTGCTCTCAGCTGGTTTTCGATTCTCCTCATCTCCGATCAAGTTT
ATAGAGGTTCGAAAGGGTTTTGAAAGGATGGCACAACACAATGGCAACGATGAAGTTATG
GCCAGTGCTATGGTTGAGATCAATATCAAGATGACTTTGGATTCTCAAACCCACCCCTTA
TGTGTCGATAAATGTGTCCCTGTTCCCGCTTTGAAGGAGCAAATTGCTTCCGCTACTGGG
GTTGTTACAGAACAACAACGCTTGATATGTCGAGGACAAGTAATGAAGGATGATCAACTC
CTCTCAGCCTATCGTATCCTTCCTTCTCTTCTTTTCACCACTTTGCCTTGCTTCTTTCTT
AGAGCTTTTGTTTTATTTATGACCCTAGTTTCCTTATGAGTTCGTCGAACCCTTGGTTTC
GACTTCAGTGTTTGTGGTCTCAGATGAATTAACCGTCTGTTGTTGTATGTATTTGATTAG
ATGATATTAGGTTGGTGTTTGGTTGTCTCATTTCTATGTTTAGGACTGTTGTATGTATTT
GATCAGATGAATTAAGAACCCCTAAATAAGATATTTGCATTGGAGGC

QA 1 587 1 587
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8936Contig1 764 2 6 U
GGTAGAAGCAGCGTGTTCAAAAATAATAAAAAAACACGAAGGGTGTTCAGAAACTGTCAA
CCGCCGATAACATGAGGTCAGAGGAGAAAGAACAATGGCGACCAGAATTGGTGCACAAGA
TGCTAATGGTTGTATTTCCCTATCTTCACTCATTGTACGAGCTCCTATCCATGTCCGGCG
TTACTCCGGCGTTTAGAAACGCCATTAGAGAACAAACCCTTTTGTGGGAAAAGGTGGTTG
TTGAACAACCCTTGAGTTCTCGTCTAACCGACGATATTCTATGGGAGTTCACTTCAAAAT
CCGCGGGAAAGTTGAACACGTTGATTCTCCGAAAACGTAGTGGAGTCACCAACCAAGGGC
TTCGCCGTGTGGTTGACGCAAACCCTTTGATTAAAAAGTTGATTGTGACGGGATACACGG
AGTTCGCTCCAGAAGGAATCATTGCATGTGTTGAAAGCTTGACGAAGAAAGATCATAAGT
TGGAGACACTTCACATCAATGGCGTCCCTGGATTCACTAATGACCATCTCTCAGCACTTT
CGACTTACCTTCCTCAAGAGGGAGCAATCGACCTCGAGGTGTGTCCCCAATGCGACCAAG
TCAGGATGATTCCTCCTTGCTCAAGAGAATCATGTAAACGTGAGGGAAGCAACGAACGGG
AGTGCAGGGATGCTGGTATTGCGTCACTAGATGCATGGGGTGTGCAGTGTGTCTCGGACC
AGACATGAGCTGAGTAGCAGCGTGTGGGGGAGAGGTTTGTGTCT


BQ
10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EX91TF U 1
AF RS1FH20TF U 3
BS 1 414 RS1EX91TF
BS 415 415 RS1FH20TF
BS 416 469 RS1EX91TF
BS 470 470 RS1FH20TF
BS 471 603 RS1EX91TF
BS 604 764 RS1FH20TF

RD RS1EX91TF 605 0 0
GGTAGAAGCAGCGTGTTCAAAAATAATAAAAAAACACGAAGGGTGTTCAGAAACTGTCAA
CCGCCGATAACATGAGGTCAGAGGAGAAAGAACAATGGCGACCAGAATTGGTGCACAAGA
TGCTAATGGTTGTATTTCCCTATCTTCACTCATTGTACGAGCTCCTATCCATGTCCGGCG
TTACTCCGGCGTTTAGAAACGCCATTAGAGAACAAACCCTTTTGTGGGAAAAGGTGGTTG
TTGAACAACCCTTGAGTTCTCGTCTAACCGACGATATTCTATGGGAGTTCACTTCAAAAT
CCGCGGGAAAGTTGAACACGTTGATTCTCCGAAAACGTAGTGGAGTCACCAACCAAGGGC
TTCGCCGTGTGGTTGACGCAAACCCTTTGATTAAAAAGTTGATTGTGACGGGATGCACGG
AGTTCGCTCCAGAAGGAATCATTGCATGTGTTGAAAGCTTGACGAAGAA*GATCATAAGT
TGGAGACACTTCACATCAATGGCGTCCCTGGATTCACTAATGACCATCTCTCAGCACTTT
CGACTTACCTTCCTCAAGAGGGAGCAATCGACCTCGAGGTGTGTCCCCAATGCGACCAAG
TCA
CG

QA 1 603 1 603
DS 

RD RS1FH20TF 762 0 0
GG
GAAGCAGCGTGTTCAAAAATAATAAAAAA*CACGAAGGGTGTTCAGAAACTGTCAACCGC
CGATAACATGAGGTCAGAGGAGAAAGAACAATGGCGACCAGAATTGGTGCACAAGATGCT
AATGGTTGTATTTCCCTATCTTCACTCATTGTACGAGCTCCTATCCATGTCCGGCGTTAC
TCCGGCGTTTAGAAACGCCATTAGAGAACAAACCCTTTTGTGGGAAAAGGTGGTTGTTGA
ACAACCCTTGAGTTCTCGTCTAACCGACGATATTCTATGGGAGTTCACTTCAAAATCCGC
GGGAAAGTTGAACACGTTGATTCTCCGAAAATGTAGTGGAGTCACCAACCAAGGGCTTCG
CCGTGTGGTTGACGCAAACCCTTTGATTAAAAAGTTGATTGTGACGGGATACACGGAGTT
CGCTCCAGAAGGAATCATTGCATGTGTTGAAAGCTTGACGAAGAAAGATCATAAGTTGGA
GACACTTCACATCAATGGCGTCCCTGGATTCACTAATGACCATCTCTCAGCACTTTCGAC
TTACCTTCCTCAAGAGGGAGCAATCGACCTCGAGGTGTGTCCCCAATGCGACCAAGTCAG
GATGATTCCTCCTTGCTCAAGAGAATCATGTAAACGTGAGGGAAGCAACGAACGGGAGTG
CAGGGATGCTGGTATTGCGTCACTAGATGCATGGGGTGTGCAGTGTGTCTCGGACCAGAC
ATGAGCTGAGTAGCAGCGTGTGGGGGAGAGGTTTGTGTCT

QA 3 762 3 762
DS 



AS 1 2

CO CL8937Contig1 1242 2 2 U
GGCCGAAAGCCTCGCGAGAGAGAGAGAGGAGAGAGATGGCGGGGTATGTGAACTTGTATA
TGTCTCCGCACGTGACTCTCTGCTCGCCACGTGCCTCTCTTTTCCGGGAACCAACCAAAA
ATCTCCGACGATCGCCGTCAATCGTCGCCCCCAGGCTTCAGGTTATGGCGGCGGACCAGA
CGCCTCTGAAAATAATGATATCAGGAGCTCCTGCTTCGGGTAAAGGTACACAATGCCAGC
TCATCACTCAGAAATATGGTTTGGTGCACGTCTCTGCTGGAGATTTGCTGAGAGCTGAAA
TCGTTTCTGGGAGTGAAAACGGAAGACTGGCAAAAGAATACATGGAGAAAGGGCAGTTAG
TCCCTGTTGAAATAGTTGGGATGATGGTCAAAGATCGTTTGTCACAGACGGATTCTGAGC
AAAACGGATGGCTTTTAGATGGATATCCTAGAAGCTCCTCGCAGGCTACAGCTCTTCAGG
GATTCGGATTCCACCCTGATCTTTTCATTCTCCTCGAAGTTCCTGAAGATATTCTAGTTG
AAAGAGTCGTTGGGCGTAGACTAGATCCTCTCACGGGAAAAATCTACCACTTGAAGTATT
CTCCTCCAGAGACAGAAGAGATCGCTGCTAGGCTCACCCAACGTTTTGATGATACCGAAG
AGAAGGTAAAACTGCGGCTGAAGACTCATAACCAAGATGTGAGCGATGTGCTCTCTATGT
ACGACGACATAACTATAAAGATAAAAGGAAACCGTCCCAAGAAAGAAGTGTTTACCCAGA
TTGACACAGCTCTTTCCGAAATGCTTCAACAGAGGAACACAGCTCCAAGTTCACATTTTT
AAGTTGAATCCTTGGTACGGATCTGAGGAAGTGTTTTGACCAGATCGATACTGCTCTCTC
TGTCTAAACAAGCTTCAACAGAAGGGAGCACTGCCAAGTTCACTTTTAAGTTGAATCATT
CTTGGCACAGATCTAACCGGCGGTAAATAATCCCCTATGTCATTTATCGCATTCCATTGA
TACCTCCTGAATTGCAATAAAGGATCTGTTTGTCTCCAGTAAGATGATGTTTGTCTTTCT
ACCCCAATCCGCAAGATTATGCTACCTTCTGCTTTACACTCTGTAGAGTTACTGAACATA
ACTCCATTGTGTTTTTCTTGTTGCAATCATATAGAATGGCATTCTCTTTTTTACCAATCT
TGACAAGGGTGATATAAGCTATTCACATGATTTTTCGGCTAC


BQ
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AF RS1H024TF U 1
AF RS1H024JQB C 527
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QA 1 716 1 716
DS 



AS 0 0

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BQ
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AF RS1F863JQ C 1
AF RS1F863TF U 1
BS 1 598 RS1F863TF

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QA 1 598 1 598
DS 

RD RS1F863TF 598 0 0
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CGAAGCGTGCTAAGAAGGATGAAACCAAAGGTGGATCTCTGGAAGAAGAAACCAAAGGTG
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TGCCTATCCCTTGAGCAAAGCTTTCTGTCTGAACCCTTTCTTTTTGTTTGTGATTCCTTT
GGATATGAAGCTATAAATGTGTTGATTTTTATCAAATTATGATAAATACGACTATTTT

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1FS74TF U 1
AF RS1FS74JQ C 28
BS 1 638 RS1FS74TF

RD RS1FS74TF 638 0 0
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GAACAATAATTTATAATTCCAGTTTCGTTTTATTTTCC

QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1FS74JQ 611 0 0
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CTCAGATTCAGCAGCTTAAGGATGCTATCGAGAAGCTTTTCATCTAGGTTTTTGTGTGGG
GATATGAATGAATGAATAGTCTACTCCATTTAATGGAGAAGGCTTTGAAGTTTAGCTAAT
GAAGAAACGATGATTCTACTATGAGTTTTT*GAAGTTTGTAATGTTTTTTTTAAATTTCA
GATTGTGTTACTGCCTAATGCTTCTTTGAACAAGAACAATAATTTATAATTCCAGTTTCG
TTTTATTTTCC

QA 1 611 1 611
DS 



AS 1 2

CO CL8941Contig1 1195 2 10 U
GAAACACATCCATAAAAAGGTAATATTGAAAATGGTGAGAAGCAAAAGTCACAGAAGATG
AACCTGCACAATCTCTTTCTTTTTGTGAACCTCTCCCTTGGGAAGTGGAACATATTCTTC
TGCTTCCAGGTCGAACTCAGTGGCAAAAGCATCACTTCTACCCACCCGCTTGACAGCTCC
ACTGTTTGCTTCAATGTATATAACATCCCCCACAGCTACCTGAGAGTCAAACAGTAAAGA
CACGAACTTCAGGACACAATGATCTGGTAGGCAAAAGATGTTTTGTTTTCACCAGGGAAC
CAAACAGATGAAAACAATAATACATGGTGTGCAAAGAAGTCAAAACAACTTACTTTTTCT
TTAATCAAGGCATCGTAGATAGTGGGATCCAACTTAAGTTGTTTGGTTCCTTTGACTGTC
TTGAGTCCAATGATAACATGACTGATGCTTTTGCCATAACCTCCGGTAAGACTTTCAGTT
TCTTCTGGGGACAGCTCCGTAACCTAGAACTCAAGGATACCATTCTTAAGAATCTGACGA
CAAAAAGACATGCTACGAAACTGAAAAATTAGCAGACACACACACCTCTCCTTCGTAGAC
GTCTTTGGTTTCCTTGATACGTAGACCAATGGCACGTCTAAAATTCTCCATAAGAACCTC
AGTTTTCTTAACCTCCGATGAGTAAACCTCAGATCCAACCATTGGACAAAAGGGAACCTG
CAAAACAACATAAGACAGAATTGTCTTTCACACCATGTACACCAAATCATGGCACAAAAA
AAGGTGGAAAGATAAAAGACATCGTGATCACCTTACTTCCCAGCTCTTGGGATATTCCAA
GAGCCAGAGCTGTTTTCCCGGTTCCGGGAGGTCCAGCGAGCAAAAGAGCCTTGCCAGCCA
TTTTTTTCTGTTTGATCATGTCAACAACAAGACCAGCTGCCTCTCTAGCCTCGAGTTGAC
CGACAAATCCAGCCGCCAACGGTATAGGAATCCCGGTTGGCTAGAAAAAAGGAGACGCCG
GATTAGCAATGGAAATAACACTTGAAAGCAATAGAAAAAGACATCACACTAATCCTAGAG
AAATGATTTTCAGCAAAAGAACCACAGCTAGTTAGTAATAACACAGTGAATGCAAGGCTT
ACGGGTCTTAAAACATACTTCAGCACAATATATGCAATAACGATTGAATCTTTGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FX88TF U 1
AF RS1FX88JQ C 604
BS 1 685 RS1FX88TF
BS 686 686 RS1FX88JQ
BS 687 713 RS1FX88TF
BS 714 714 RS1FX88JQ
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BS 755 775 RS1FX88TF
BS 776 1195 RS1FX88JQ

RD RS1FX88TF 775 0 0
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AACCTGCACAATCTCTTTCTTTTTGTGAACCTCTCCCTTGGGAAGTGGAACATATTCTTC
TGCTTCCAGGTCGAACTCAGTGGCAAAAGCATCACTTCTACCCACCCGCTTGACAGCTCC
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CACGAACTTCAGGACACAATGATCTGGTAGGCAAAAGATGTTTTGTTTTCACCAGGGAAC
CAAACAGATGAAAACAATAATACATGGTGTGCAAAGAAGTCAAAACAACTTACTTTTTCT
TTAATCAAGGCATCGTAGATAGTGGGATCCAACTTAAGTTGTTTGGTTCCTTTGACTGTC
TTGAGTCCAATGATAACATGACTGATGCTTTTGCCATAACCTCCGGTAAGACTTTCAGTT
TCTTCTGGGGACAGCTCCGTAACCTAGAACTCAAGGATACCATTCTTAAGAATCTGACGA
CAAAAAGACATGCTACGAAACTGAAAAATTAGCAGACACACACACCTCTCCTTCGTAGAC
GTCTTTGGTTTCCTTGATACGTAGACCAATGGCACGTCTAAAATTCTCCATAAGAACCTC
AGTTTTCTTAACCTCCGATGAGTAA*CCTCAGATCCAACCATTGGACAAAAGG*AACCTG
CAAA*CAACATAAGACAGAATTGTCTTTCACAC*ATGTACACCAAATCATGGCAC

QA 1 775 1 775
DS 

RD RS1FX88JQ 592 0 0
TTTGGTTTCCTTGATACGTAGACCAATGGCACGTCTAAAATTCTCCATAAGAACCTCAGT
TTTCTTAACCTCCGATGAGTAAACCTCAGATCCAACCATTGGACAAAAGGGAACCTGCAA
AACAACATAAGACAGAATTGTCTTTCACACCATGTACACCAAATCATGGCACAAAAAAAG
GTGGAAAGATAAAAGACATCGTGATCACCTTACTTCCCAGCTCTTGGGATATTCCAAGAG
CCAGAGCTGTTTTCCCGGTTCCGGGAGGTCCAGCGAGCAAAAGAGCCTTGCCAGCCATTT
TTTTCTGTTTGATCATGTCAACAACAAGACCAGCTGCCTCTCTAGCCTCGAGTTGACCGA
CAAATCCAGCCGCCAACGGTATAGGAATCCCGGTTGGCTAGAAAAAAGGAGACGCCGGAT
TAGCAATGGAAATAACACTTGAAAGCAATAGAAAAAGACATCACACTAATCCTAGAGAAA
TGATTTTCAGCAAAAGAACCACAGCTAGTTAGTAATAACACAGTGAATGCAAGGCTTACG
GGTCTTAAAACATACTTCAGCACAATATATGCAATAACGATTGAATCTTTGC

QA 1 592 1 592
DS 



AS 1 2

CO CL8942Contig1 625 2 7 U
TTGACAAGCAAGGAACTAGATTCAAGCGATTAATCAAGGATCAGAATGACCACTCTGATC
TTGAAGAAGGCATCAGAAGATTGGTACTTTGCTCCGGAAAGGTTTATTACGAGCTTGATG
ATGAGAGGAAGAAGGTTGGAGCAAGCGATGTGGCTATTTGTAGAGTGGAACAGCTTTGTC
CTTTCCCATATGATCTCATTCAGCGTGAGCTCAAGAGATATCCAAATGCGGAGATAGTTT
GGTGCCAAGAAGAGGCGATGAACATGGGAGCATTCAGCTACATAACTCCAAGACTATGGA
CAGCGATGAGAAGCTTAGGCAGAGGAGATATGGAAGACATTAAGTACGTTGGTCGTGGAC
CTTCTGCTGCTACTGCCACTGGTTTCTACACTTTCCATGTCAAAGAGCAAGCCGAGCTCG
TTCAGAAAGCCATTGGAAAGGAACCCATCAGTTAAAAACCAAACTTCATTTTTTGAATGA
ATTCTTTAAATAAGAACTTTGGGTGAATCAAAGTGATAAACAACACTGACAAAATCATCA
TGTATTTGCTTTATTTGGCCCCTTTGATTTTTTTTTTTGAGCCTGTCTTGTGTTGCAGGT
TAATACGGATCATACTCATTTTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FP88JQ C 1
AF RS1FH29TF U 35
BS 1 37 RS1FP88JQ
BS 38 163 RS1FH29TF
BS 164 164 RS1FP88JQ
BS 165 577 RS1FH29TF
BS 578 578 RS1FP88JQ
BS 579 617 RS1FH29TF
BS 618 625 RS1FP88JQ

RD RS1FP88JQ 625 0 0
TTGACAAGCAAGGAACTAGATTCAAGCGATTAATCAAGGATCAGAATGACCACTCTGATC
TTGAAGAAGGCATCAGAAGATTGGTACTTTGCTCCGGAAAGGTTTATTACGAGCTTGATG
ATGAGAGGAAGAAGGTTGGAGCAAGCGATGTGGCTATTTGTAGAGTGGAACAGCTTTGTC
CTTTCCCATATGATCTCATTCAGCGTGAGCTCAAGAGATATCCAAATGCGGAGATAGTTT
GGTGCCAAGAAGAGGCGATGAACATGGGAGCATTCAGCTACATAACTCCAAGGCTATGGA
CAGCGATGAGAAGCTTAGGCAGAGGAGATATGGAAGACATTAAGTACGTTGGTCGTGGAC
CTTCTGCTGCTACTGCCACTGGTTTCTACACTTTCCATGTCAAAGAGCAAGCCGAGCTCG
TTCAGAAAGCCATTGGAAAGGAACCCATCAGTTAAAAACCAAACTTCATTTTTTGAATGA
ATTCTTTAAATAAGAACTTTGGGTGAATCAAAGTGATAAACAACACTGACAAAATCATCA
TGTATTTGCTTTATTTGGCCCCTTTGATTTTTTTTTTTGAGCCTGTCTTGTGTTGCAGGT
TAATACGGATCATACTCATTTTCAT

QA 1 625 1 625
DS 

RD RS1FH29TF 583 0 0
GGG
GGATCAGAATGACCACTCTGATCTTGAAGAAGGCATCAGAAGATTGGTACTTTGCTCCGG
AAAGGTTTATTACGAGCTTGATGATGAGAGGAAGAAGGTTGGAGCAAGCGATGTGGCTAT
TTGTAGGGTGGAACAGCTTTGTCCTTTCCCATATGATCTCATTCAGCGTGAGCTCAAGAG
ATATCCAAATGCGGAGATAGTTTGGTGCCAAGAAGAGGCGATGAACATGGGAGCATTCAG
CTACATAACTCCAAGACTATGGACAGCGATGAGAAGCTTAGGCAGAGGAGATATGGAAGA
CATTAAGTACGTTGGTCGTGGACCTTCTGCTGCTACTGCCACTGGTTTCTACACTTTCCA
TGTCAAAGAGCAAGCCGAGCTCGTTCAGAAAGCCATTGGAAAGGAACCCATCAGTTAAAA
ACCAAACTTCATTTTTTGAATGAATTCTTTAAATAAGAACTTTGGGTGAATCAAAGTGAT
AAACAACACTGACAAAATCATCATGTATTTGCTTTATTTGGCCCCTTTGATTTTTTTTTT
*GAGCCTGTCTTGTGTTGCAGGTTAATACGGATCATACTC

QA 4 583 4 583
DS 



AS 1 2

CO CL8943Contig1 908 2 4 U
GAGAAATTAAAAAAAAAATTGTTACTAATGCTTCTTAAAAATAACCATGTAAATTAAATC
TAATATAAAATTGAAGCAAAATCTTAAAAATTCACAAAAATTTATAAGAACACAATCAAA
CCAAAGTTAACTAAAGTAAATAAAAAAATAAAAATCTCAACATCGTTAATAAAGTTATTA
ATAACTTTAATGATAGGATTTTAGTATATTGTTTATTGATAGTATGTTTAATTCAAATAG
TAACAAAAACAATTGGTTTCTTGATTTGGTTTAACTTTGTTGGTTCGTATTGGTTTCGGT
TCAATTTGTTTGGGTTGGAAAAATCCTAAACCAAACTATTTGATAATAGACTTTTGTTTG
GTTTAGATTGATTTCGGTTCAATTGGTCCTGTTTGACTCAGTTTGGTTAGGATTTTTTTG
CTCGCCTTTACTCAAAAGTGGGAGTGGTAGAACAACAACTCCGAGTGTCTTGGGGAAATG
GCACTGATAAAATAAATCAATACCATTGGTCATTTGGTATAACTTGGTCTAGTTGTAATC
TCATGATCTCAATTTATGTGAACCGGTTTGTCGGTTATCGGTTTACTAAACATTATTTAT
AAGCGTTTGCCTATTTGGGATTTCATTAATCAAGAATACACCTTTGGATATGACTGGTAA
AAGTTGGAGTAATTGAGAAGAATAAAACTTGGTGGAAATGAATGAAAATGAAAGGGTTGA
CATCATTAATCCCCCCCTGTACTACTCAAACTCACACACAATCTCCTGATTTTTAATACT
CATCAATCAACTACCTAAATTAATTAAAATAAGAAAATGTCATTTGAATCATCCATTTTC
AAATTTATTTCAAACAAAGCACCAAATTTATTCCATTTTCCGCCAAAATCTAAAATGTAT
CTTCCGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FH59TF U 1
AF RS1FH59JQ C 138
BS 1 715 RS1FH59TF
BS 716 716 RS1FH59JQ
BS 717 731 RS1FH59TF
BS 732 908 RS1FH59JQ

RD RS1FH59TF 731 0 0
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TAATATAAAATTGAAGCAAAATCTTAAAAATTCACAAAAATTTATAAGAACACAATCAAA
CCAAAGTTAACTAAAGTAAATAAAAAAATAAAAATCTCAACATCGTTAATAAAGTTATTA
ATAACTTTAATGATAGGATTTTAGTATATTGTTTATTGATAGTATGTTTAATTCAAATAG
TAACAAAAACAATTGGTTTCTTGATTTGGTTTAACTTTGTTGGTTCGTATTGGTTTCGGT
TCAATTTGTTTGGGTTGGAAAAATCCTAAACCAAACTATTTGATAATAGACTTTTGTTTG
GTTTAGATTGATTTCGGTTCAATTGGTCCTGTTTGACTCAGTTTGGTTAGGATTTTTTTG
CTCGCCTTTACTCAAAAGTGGGAGTGGTAGAACAACAACTCCGAGTGTCTTGGGGAAATG
GCACTGATAAAATAAATCAATACCATTGGTCATTTGGTATAACTTGGTCTAGTTGTAATC
TCATGATCTCAATTTATGTGAACCGGTTTGTCGGTTATCGGTTTACTAAACATTATTTAT
AAGCGTTTGCCTATTTGGGATTTCATTAATCAAGAATACACCTTTGGATATGACTGGTAA
AAGTTGGAGTAATTGAGAAGAATAAAACTTGGTGGAAATGAATGAAAATGAAAGG*TTGA
CATCATTAATC

QA 1 731 1 731
DS 

RD RS1FH59JQ 771 0 0
TAAAT
AAAAAATAAAAATCTCAACATCGTTAATAAAGTTATTAATAACTTTAATGATAGGATTTT
AGTATATTGTTTATTGATAGTATGTTTAATTCAAATAGTAACAAAAACAATTGGTTTCTT
GATTTGGTTTAACTTTGTTGGTTCGTATTGGTTTCGGTTCAATTTGTTTGGGTTGGAAAA
ATCCTAAACCAAACTATTTGATAATAGACTTTTGTTTGGTTTAGATTGATTTCGGTTCAA
TTGGTCCTGTTTGACTCAGTTTGGTTAGGATTTTTTTGCTCGCCTTTACTCAAAAGTGGG
AGTGGTAGAACAACAACTCCGAGTGTCTTGGGGAAATGGCACTGATAAAATAAATCAATA
CCATTGGTCATTTGGTATAACTTGGTCTAGTTGTAATCTCATGATCTCAATTTATGTGAA
CCGGTTTGTCGGTTATCGGTTTACTAAACATTATTTATAAGCGTTTGCCTATTTGGGATT
TCATTAATCAAGAATACACCTTTGGATATGACTGGTAAAAGTTGGAGTAATTGAGAAGAA
TAAAACTTGGTGGAAATGAATGAAAATGAAAGGGTTGACATCATTAATCCCCCCCTGTAC
TACTCAAACTCACACACAATCTCCTGATTTTTAATACTCATCAATCAACTACCTAAATTA
ATTAAAATAAGAAAATGTCATTTGAATCATCCATTTTCAAATTTATTTCAAACAAAGCAC
CAAATTTATTCCATTTTCCGCCAAAATCTAAAATGTATCTTCCGTC

QA 6 771 6 771
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL8945Contig1 872 2 6 U
GCAAGACCGGGGATCTCGGTCCCCATTCTCCGCGACTGCTCCTTTCGGATTCCTTCTGGA
CAGTTATGGATGCTTCTTGGTCCCAATGGCTGTGGCAAATCTACCCTTCTCAAGATTTTA
GCTGGTGTAGTGAATCCAACAAGTGGCAATATCTTTGTGGAAAAGCCCAAGAATTTTGTG
TTTCAGAATCCTGATCATCAGGTAGTGATGCCTACTGTGGAAGCTGATGTAGCGTTTGGT
CTTGGCAAGTATCCTGACATTAGTCTAGAAGAAGTCAAGTCTAGGGTGATTACTGCTTTG
GATGCTGTTGGTATGCGTGATTACATGCAGAGACCGATTCAAACTCTCAGTGGTGGTCAG
AAACAAAGAGTGGCCATTGCTGGTGCTTTAGCTGAAGCTTGCAAAGTGCTGCTGTTGGAT
GAGTTCACTACCTTCCTAGATGAGTCTGACCAGTTGGGTGTGATCAAAGCTGTGAAAGAG
TTAATAAATGCAAAGAAAGGAGGAGACGTGACTGCGTTGTGGGTGACACATCGGTTAGAG
GAGCTGGAGTATGCGGATGGAGCTGTGTATATGGAGAATGGGAGAGTGGTCAGGCATGGT
GATGCAGCCACCGTACTAGATTTCATTAAGGCCAAACAATCGTCTTACATTGATCAAATC
GGTTTTTAAATTTTACTGTCACCGATTTGCCCACTCTCAGTGTTTATCCAGAGACTGGTT
CAAACTCTCAGTTTTAGTCAAAAGTTGTAGCATATATAGAGGTTTGTAGAGGCAATGAAA
GCTGGAGATTTACTAAGCTTTTGTAAAAGACTGTGATGTACTTCTGCAGACGGTATAAGC
TATTCTAATCAACAGAGCAAAGTTGATCAGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 0 0 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DM87TF U 1
AF RS1DM87JQ C 110
BS 1 630 RS1DM87TF
BS 631 631 RS1DM87JQ
BS 632 666 RS1DM87TF
BS 667 668 RS1DM87JQ
BS 669 704 RS1DM87TF
BS 705 872 RS1DM87JQ

RD RS1DM87TF 716 0 0
GCAAGACCGGGGATCTCGGTCCCCATTCTCCGCGACTGCTCCTTTCGGATTCCTTCTGGA
CAGTTATGGATGCTTCTTGGTCCCAATGGCTGTGGCAAATCTACCCTTCTCAAGATTTTA
GCTGGTGTAGTGAATCCAACAAGTGGCAATATCTTTGTGGAAAAGCCCAAGAATTTTGTG
TTTCAGAATCCTGATCATCAGGTAGTGATGCCTACTGTGGAAGCTGATGTAGCGTTTGGT
CTTGGCAAGTATCCTGACATTAGTCTAGAAGAAGTCAAGTCTAGGGTGATTACTGCTTTG
GATGCTGTTGGTATGCGTGATTACATGCAGAGACCGATTCAAACTCTCAGTGGTGGTCAG
AAACAAAGAGTGGCCATTGCTGGTGCTTTAGCTGAAGCTTGCAAAGTGCTGCTGTTGGAT
GAGTTCACTACCTTCCTAGATGAGTCTGACCAGTTGGGTGTGATCAAAGCTGTGAAAGAG
TTAATAAATGCAAAGAAAGGAGGAGACGTGACTGCGTTGTGGGTGACACATCGGTTAGAG
GAGCTGGAGTATGCGGATGGAGCTGTGTATATGGAGAATGGGAGAGTGGTCAGGCATGGT
GATGCAGCCACCGTACTAGATTTCATTAAG*CCAAACAATCGTCTTACATTGATCAAATC
GGTTTT**AATTTTACTGTCACCGATTTGCCCACTCTCAGTGTT
ATCAGAGACTGG

QA 1 704 1 704
DS 

RD RS1DM87JQ 763 0 0
TCAAGATTTTAGCTGGTGTAGTGAATCCAACAAGTGGCAATATCTTTGTGGAAAAGCCCA
AGAATTTTGTGTTTCAGAATCCTGATCATCAGGTAGTGATGCCTACTGTGGAAGCTGATG
TAGCGTTTGGTCTTGGCAAGTATCCTGACATTAGTCTAGAAGAAGTCAAGTCTAGGGTGA
TTACTGCTTTGGATGCTGTTGGTATGCGTGATTACATGCAGAGACCGATTCAAACTCTCA
GTGGTGGTCAGAAACAAAGAGTGGCCATTGCTGGTGCTTTAGCTGAAGCTTGCAAAGTGC
TGCTGTTGGATGAGTTCACTACCTTCCTAGATGAGTCTGACCAGTTGGGTGTGATCAAAG
CTGTGAAAGAGTTAATAAATGCAAAGAAAGGAGGAGACGTGACTGCGTTGTGGGTGACAC
ATCGGTTAGAGGAGCTGGAGTATGCGGATGGAGCTGTGTATATGGAGAATGGGAGAGTGG
TCAGGCATGGTGATGCAGCCACCGTACTAGATTTCATTAAGGCCAAACAATCGTCTTACA
TTGATCAAATCGGTTTTTAATTTTTACTGTCACCGATTTGCCCACTCTCAGTGTTTATCC
AGAGACTGGTTCAAACTCTCAGTTTTAGTCAAAAGTTGTAGCATATATAGAGGTTTGTAG
AGGCAATGAAAGCTGGAGATTTACTAAGCTTTTGTAAAAGACTGTGATGTACTTCTGCAG
ACGGTATAAGCTATTCTAATCAACAGAGCAAAGTTGATCAGTG

QA 1 763 1 763
DS 



AS 1 2

CO CL8946Contig1 747 2 6 U
GTAAAACATATTCATTTATTTAACTTAATAGTTGATACAAACTTATTTTACATTCAAGAT
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ATAAGAAACATTTCTTTGCTCTCCTTCATTTTCTCAATGTCTCCTTTGATCTTCTCATCA
ATGGTTATGGTGTCTTCCATGTCGGCACTGTCCTGTGGCACCAAAGTTCTCATTTGTGAG
GAACAAACCATCGAACTAAGCCTCACGACATCAACAACATGGTCAGATATTTCCTGGAGG
TTAATCACAGGCGGTTCCAAAACCTTAGTTCCAGGTTTCTTGTATATTAAGTAAAGTATC
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CCATGAAGCAGAAAGTATGTCAGGAAGAAGATAAGGCCGAAGGCAAAAACATCCACAAAG
AGGACGAATTTCACCGTTAGAGTCTTT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1GX32JQ U 34
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CCATGAAGCA
AAAA

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DS 

RD RS1GX32JQ 714 0 0
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QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

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ACCATCCAGGTCTTGGAGGCCAAGACCAAACTGGCTCTGGCTGAGGCGGCTAGGTACAAG
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GCGAACGCGAGGAAAAGCATAAGGAAACGTGATGTGATGGCGCTTAACACGTTTTTGACT
GCGGCTGTATCTGATTATGGTGTATGTGTCGAAGGGTTTATTGATGCGAATCAAGTTAAT
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BQ
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AF RS1G326JQ C 1
AF RS1G326TF U 1
BS 1 590 RS1G326TF

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GACACCTTGCAGCTACATGTTGTGGTTGTCGTGGTATCCGTCACCATATTAACCTTCTTT
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CCCTCTTTATGCCAACCTCTGGTGAGACGTATCACGAACCCAAGACGAGCCACGCACCGA
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DS 

RD RS1G326TF 590 0 0
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GACACCTTGCAGCTACATGTTGTGGTTGTCGTGGTATCCGTCACCATATTAACCTTCTTT
ATGTTCGGTCAAGTTGCGGAGGCATCACGTGTGATGAACTTGTGCTCTCACACCGCATAT
CCCTCTCTATGCCAACCTCTGGTGAGACGTATCACGAACCCAAGACGAGCCACGCACCGA
ACCATCCAGGTCTTGGAGGCCAAGACCAAACTGGCTCTGGCTGAGGCGGCTAGGTACAAG
AACGGTAACCAACCGATCGCCACGTGTTACGCGACGCTCGGTGATGCGGTTTACAATCTG
GCGAACGCGAGGAAAAGCATAAGGAAACGTGATGTGATGGCGCTTAACACGTTTTTGACT
GCGGCTGTATCTGATTATGGTGTATGTGTCGAAGGGTTTATTGATGCGAATCAAGTTAAT
ACGGTCCAGAATGTAGCGGTTGACTTGAGGAAAATTAGTAGTAATTGCTTGACGTTGTCT
ACATTGATTTAGATGATTGATTACAAATAACATTCATTCATTTTTTTGTT

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 2

CO CL8948Contig1 591 2 1 U
AGGGGGGATAATAAAAACAATAAAACGAAAGACACAGGCCTCGTCTGTATCAACCAACTA
TATTATTATATAAACCAACAACCCTTTCTCAGCTCCTCAGCTTATTCTTCTTTCTCTTTG
ATCATTTCTATAAGATTCATAAACAATTAGTGCATATTTTAAAACAAAGTTCCAGGTGGG
GAAGAACACAATCCGACCTGCCTGAACCAGCGACTTATATGTACATTACTAATTTACTAT
AGTCCTTCGTTGTTCCAGCTAAAGGTCGGTTGCTTAACCTTTGCTTTTCTATTGGTTAAT
TTTTTTGTTCTGTTTTTTTTTGTCAACATTTTTTTGTTCTGTTTATTTCCTTTTACTTTG
TTATATACTTATATTAGATATCAAATTATTTTTTTGATGGTTTCTTTTTATATTTCATTT
TGAACGTTTGGAAGGAAAGAGAGAATAAAATCGACATTTCTATTTTTACCCTGATATTAA
TAAAAGATAATGAAAGATTTTGAAGTGTTTAAGTACGAAAGTTTTTTTTTGGGATAAAAA
AGTATGAAAGTTTGCTTGATAAAAAAAGTATGAAAGTTCATACACTGGTTT


BQ
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QA 1 591 1 591
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1BH04JQ U 1
AF RS1DU54JQ U 50
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RD RS1BH04JQ 693 0 0
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QA 1 693 1 693
DS 

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QA 1 710 1 710
DS 



AS 1 2

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BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AS52JQ C 1
AF RS1AS52TF U 1
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QA 1 516 1 516
DS 

RD RS1AS52TF 516 0 0
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CAGAGAATAGTATCAGCTCAAGATTCTGTCAAAGACTTCTTCTTTCCTTCATCAAAGCAC
AAGTAACAAGCGCGACAGACTATCTGAAGCAAAGATGTTTGCTGAACATCAAAAACACCA
ACTTTCATCAGTCTTTTGTTCTTTTCTTTGTCTCGTTTTCAGAATTTACTCTTGCTCTCT
CCACTCTACTCTTTAACGACTATAAGATATAATGTTCATAATAACATGTCGTATGTGGAT
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QA 1 516 1 516
DS 



AS 1 2

CO CL8951Contig1 1100 2 8 U
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ATGGGCAACGTGAACGCGAGAGACGAAGCGAACAGTAGCCACCACCACCACAACAACAAC
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TTCATCGTTGATGGGCAGTGGGGGCATGCCCCTGAGCTCCCTCTCGCTCGTGATGACGCT
GGCAACACTTTCAACCTCTTAGACCTCCAGGACTATGTACCAGAAGACATTGAAAGCATA
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AACCATCTTTACATGCAGAAAGGCAAAAGCGGTCCGTCTGTGTTTGCTCTTGGTTCCACT
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GTTTTATCATCATCACAGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1F426TF U 1
AF RS1F426JQ C 363
BS 1 780 RS1F426TF
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RD RS1F426TF 814 0 0
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AACAACAACAACAACAACAACGCATCTCCACTCGAAGACAACAACGACGGTGAGATTCAT
CAACCCATGTCTTCTTCCGACACCACCGCACCTCCTCCTCCTGAGCTCATGGGTCAATCT
CCTCCTCAATCACCTCGCGCCACTCAATCTCCTCTCATGTTTGCTCCTCAGGTTCCGGTG
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TCCTACGAAGAGGCTTGTAACGAGCAAGGTATCCCCACCATGATCACTTGGTGCCATGGT
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TTCATCGTTGATGGGCAGTGGGGGCATGCCCCTGAGCTCCCTCTCGCTCGTGATGACGCT
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GAGGACTACTCCAAAGAACCGCCTCTGGTTCCGCCGCATTTGCAGATGACACTGCTGAAC
*TGC*TTCAGCAAGCCCTGACATTC
ATCACGCTG

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DS 

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TAAGGAGATTGCTGTCGAAGGTTCTTGGGATAATTGGAAGACAAGAAGTCGGCTTCAGAG
ATCTGGGAAAGACTTCACTATAATGAAAGTCCTACCTTCAGGTGTCTATGAGTACAGGTT
CATCGTTGATGGGCAGTGGGGGCATGCCCCTGAGCTCCCTCTCGCTCGTGATGACGCTGG
CAACACTTTCAACCTCTTAGACCTCCAGGACTATGTACCAGAAGACATTGAAAGCATATC
TGGTTTTGAGCCACCGCAATCACCAGAAGCTAGTTACAGCAGCTTGCTTTTAGGAGCTGA
GGACTACTCCAAAGAACCGCCTCTGGTTCCGCCGCATTTGCAGATGACACTGCTGAACCT
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CCATCTTTACATGCAGAAAGGCAAAAGCGGTCCGTCTGTGTTTGCTCTTGGTTCCACTCA
CCGTTTTCTGGCCAAGTATGTCACTGTGGTGCTCTACAAGTCCCTCCAGAGGTGAGAAAA
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TCATGGAGAATGAATGAATGTGAGGCTATAATAGGATATGCGAAGAAGAGGAAGAAGAGT
TTTATCATCATCACAGGC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

CO CL8952Contig1 882 2 2 U
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TCAGGTTCGATTCTCAGGTTGAAGAGTTGTCTCAAGGCCCTAAAATCAAGACATTGCAGC
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TTCTAGTTTGCTATTGTTGAAGCTAAAATTCTTGTAGGAAGTTTGGTTGAAGAAGATGTA
AATAGAGAGCGCAGGAGAATATATAATGCATAAAGTAAGAGG


BQ
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AF RS1BH52TF U 1
AF RS1BH52JQ C 154
BS 1 748 RS1BH52TF
BS 749 882 RS1BH52JQ

RD RS1BH52TF 748 0 0
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GAGAGAAAAAGATCGATGGAGAAGACTGTTTCATCCTCAAGCTATGTGCAGACCCGGCAA
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TCAGCCAAAAGACCGGTCTCCTTGTTCACTTAGAAGACTCGCAGCTAACCAGGATCCAAA
ACATTGGAGGCGAAGCGGTTTACTGGGAGACGACCATCAACTCGTACTTAGAAGACTACA
AGCCTGTCGAAGGTATCGTGATAGCTCACTCCGGTAGATCAGTGGCGACGCTGCTAAGGT
TCGGAGATATGTCTTCGGGACATAACACTAAGACCACGATGCAAGAAGCGTGGGTCATCG
ATGAGATTGCGTTCAATGTCCCTGGTTTGTCTATGGATTGCTTCATTCCACCTTCTGAGC
TCAGGTTCGATTCTCAGGTTGAAGAGTTGTCTCAAGGCCCTAAAATCAAGACATTGCAGC
AGGGTTCGGTAGCTACACGACATAATTATGGCTGATGCCAGGTTTATAGTGAAGCCTTGG
GTTGCAGGAGATGAATGTGTATAAAAAA

QA 1 748 1 748
DS 

RD RS1BH52JQ 729 0 0
AATATG
TTGCGAGTGCAAGGTGCATAGGAGAGAAAAAGATCGATGGAGAAGACTGTTTCATCCTCA
AGCTATGTGCAGACCCGGCAACGCTCAAAGCTAGAAGCGAAGGTGCATCAGAGACTATAA
GACATACTCTGTTCGGTTACTTCAGCCAAAAGACCGGTCTCCTTGTTCACTTAGAAGACT
CGCAGCTAACCAGGATCCAAAACATTGGAGGCGAAGCGGTTTACTGGGAGACGACCATCA
ACTCGTACTTAGAAGACTACAAGCCTGTCGAAGGTATCGTGATAGCTCACTCCGGTAGAT
CAGTGGCGACGCTGCTAAGGTTCGGAGATATGTCTTCGGGACATAACACTAAGACCACGA
TGCAAGAAGCGTGGGTCATCGATGAGATTGCGTTCAATGTCCCTGGTTTGTCTATGGATT
GCTTCATTCCCCCTTCTGAGCTCAGGTTCGATTCTCAGGTTGAAGAGTTGTCTCAAGGCC
CTAAAATCAAGACATTGCAGCAGGGTTCGGTAGCTACACGACATAATTATGGCTGATGCC
AGGTTTATAGTGAAGCCTTGGGTTGCAGGAGATGAATGTGTATAAAAAACATTTCAAATG
AAATATTTAGATGGATTATTCTTCTAGTTTGCTATTGTTGAAGCTAAAATTCTTGTAGGA
AGTTTGGTTGAAGAAGATGTAAATAGAGAGCGCAGGAGAATATATAATGCATAAAGTAAG
AGG

QA 7 729 7 729
DS 



AS 1 2

CO CL8953Contig1 762 2 2 U
GGACACGTCAACTGCAGAGTCAGGATCTGATGCCGAAGATATCGGATCTCCAAAGGCAAT
AAAGAGTTTCTCCCATCTCCGCTTGACGCCTGTTCGTGAAGAGGCAAAGATAACGGGTGA
AACGAGCTTGGCCGGTGGTCTTCTGGGCTATGATGAGTATGTACCGATGGTTGACAAAGC
CGTTGATGCAACCTGGAAAGTGAAACCCGCCTTCCAGAGAGTTGCCTCAAAAGGGGATTT
AATGTCTCCAACCGCTCCAAAGGACCCTGAAGGCATCCGAGCTCGAGTCCTAGTAATGAT
CATAGCATACGTGATGGCAGTTTTCACATTCTTCCGAGCAGTACCTTTCCGTGTGATCAA
GAAACTTCCTGCTTCCCAACCACAAACCGAAGTAAACGCAACAGAACTACTCGGTTCTAA
CTGTGAAGTAGCAACAACTCAAGAGGAGTCTCGCCCTCCTTCTCCAGTACCAGATCTCAC
AGAGACGGAGCTCCTAACTTCAGTGATGAAGAAACTAAACGAGCTAGAGGGAAAAATCGG
GACGCTCCAAACAAAGCCGAATGAGATGCCTTGCGAGAAAGAGGAACTATTAAACGCAGC
TGTGTGCAGAGTGGATGCACTTGAAGCAGAGCTCATAGCTACTAAGAAAGCGCTTTACGA
AGCTCTGATGAGGCAAGAAGAGTTGCTTGCTTACATTGACCGTCAAGAAGAAGCTCAATT
CCAGAGATGAAGAAGAGAAGCATCTCTTTGCTTTAGAGCAAA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FN79TF U 1
AF RS1GK74TF U 1
BS 1 587 RS1FN79TF
BS 588 762 RS1GK74TF

RD RS1FN79TF 587 0 0
GGACACGTCAACTGCAGAGTCAGGATCTGATGCCGAAGATATCGGATCTCCAAAGGCAAT
AAAGAGTTTCTCCCATCTCCGCTTGACGCCTGTTCGTGAAGAGGCAAAGATAACGGGTGA
AACGAGCTTGGCCGGTGGTCTTCTGGGCTATGATGAGTATGTACCGATGGTTGACAAAGC
CGTTGATGCAACCTGGAAAGTGAAACCCGCCTTCCAGAGAGTTGCCTCAAAAGGGGATTT
AATGTCTCCAACCGCTCCAAAGGACCCTGAAGGCATCCGAGCTCGAGTCCTAGTAATGAT
CATAGCATACGTGATGGCAGTTTTCACATTCTTCCGAGCAGTACCTTTCCGTGTGATCAA
GAAACTTCCTGCTTCCCAACCACAAACCGAAGTAAACGCAACAGAACTACTCGGTTCTAA
CTGTGAAGTAGCAACAACTCAAGAGGAGTCTCGCCCTCCTTCTCCAGTACCAGATCTCAC
AGAGACGGAGCTCCTAACTTCAGTGATGAAGAAACTAAACGAGCTAGAGGGAAAAATCGG
GACGCTCCAAACAAAGCCGAATGAGATGCCTTGCGAGAAAGAGGAAC

QA 1 587 1 587
DS 

RD RS1GK74TF 762 0 0
GGACACGTCAACTGCAGAGTCAGGATCTGATGCCGAAGATATCGGATCTCCAAAGGCAAT
AAAGAGTTTCTCCCATCTCCGCTTGACGCCTGTTCGTGAAGAGGCAAAGATAACGGGTGA
AACGAGCTTGGCCGGTGGTCTTCTGGGCTATGATGAGTATGTACCGATGGTTGACAAAGC
CGTTGATGCAACCTGGAAAGTGAAACCCGCCTTCCAGAGAGTTGCCTCAAAAGGGGATTT
AATGTCTCCAACCGCTCCAAAGGACCCTGAAGGCATCCGAGCTCGAGTCCTAGTAATGAT
CATAGCATACGTGATGGCAGTTTTCACATTCTTCCGAGCAGTACCTTTCCGTGTGATCAA
GAAACTTCCTGCTTCCCAACCACAAACCGAAGTAAACGCAACAGAACTACTCGGTTCTAA
CTGTGAAGTAGCAACAACTCAAGAGGAGTCTCGCCCTCCTTCTCCAGTACCAGATCTCAC
AGAGACGGAGCTCCTAACTTCAGTGATGAAGAAACTAAACGAGCTAGAGGGAAAAATCGG
GACGCTCCAAACAAAGCCGAATGAGATGCCTTGCGAGAAAGAGGAACTATTAAACGCAGC
TGTGTGCAGAGTGGATGCACTTGAAGCAGAGCTCATAGCTACTAAGAAAGCGCTTTACGA
AGCTCTGATGAGGCAAGAAGAGTTGCTTGCTTACATTGACCGTCAAGAAGAAGCTCAATT
CCAGAGATGAAGAAGAGAAGCATCTCTTTGCTTTAGAGCAAA

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

CO CL8954Contig1 947 2 2 U
GAGAAATGGGAGGAGATGAGAAATGGAGAAGATGAGGTTGAGCTAGATGTACACAAAGAG
ATACACAGTTTGTCTGCAGATATGTTATCAAGAACAGCTTTTGGTAACAACGTGGAAGAA
GGGAAACGAATCTTTGCCTTGCAGGAGCGTATGGTGCGTCTCTTCTATCTTGTTCGGTGG
AGCGTGTATATCCCCGGGTTCAGGTAAGTCTTCTAGGGAACACTCTCCACTAGTTCTTAG
TTTGTAACAAGAACCTTAAATGCTTCTGGTTTTAGATTCTTGCCTTCCAAGACTAACAGA
GAGATATGGAGGATTGAGAGAGAAATCCGCGGTTCTATCCTGGGACTCATCAGAAAAACA
AAACAAGAGACGCGGAGAAGGCAGGAACTCTGCTTCAGGCTTTTATGTCTCCTTACGTCA
AAACATTAGGTATGATAATCAATGAGACACTCCGGCTCTACCCTCCAGCGATGACACTAA
ACCGTGACACGCTTAGGAAAGCTAAGCTTGGAAACCTAGAGATTCCTGCAGGAACTCAGC
TCTATCTATCGGTTATCGCCATGCACCACGACAGAGAGGCATGGGGAGAAGACGCGGAGG
AGTTTAACCCGGGTAGGTTTGAAGATACCAGGAAAGAATCAGCTCTGCTAGTGCCGTTTG
GGTTAAGGGCTAGGACTTGCGTGGGGCAGAATCTGGCAGTGGTTGAGGCCAAAACGGTTC
TTGCTACGATCTTGAGGCATTACAGTTTCAGGTTGTCTCCAAGTTATGTCCATGCCCCTG
TTTTGTTTGTGACCTTGGAGCCTCAAAAGGGTGCTCATCTTCTCTTTAGTAGGATTTAAA
GTTCTTAAAATGTACGGTTTGTAACTCGGTTTAGTATTTTGACTCCTTTGAACCTTCATA
AAAAGGTACACTGTTGAGCGTTGATTCCTTTGAATCTTCCTTAGAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1AE76TF U 1
AF RS1AE76JQ C 78
BS 1 664 RS1AE76TF
BS 665 947 RS1AE76JQ

RD RS1AE76TF 664 0 0
GAGAAATGGGAGGAGATGAGAAATGGAGAAGATGAGGTTGAGCTAGATGTACACAAAGAG
ATACACAGTTTGTCTGCAGATATGTTATCAAGAACAGCTTTTGGTAACAACGTGGAAGAA
GGGAAACGAATCTTTGCCTTGCAGGAGCGTATGGTGCGTCTCTTCTATCTTGTTCGGTGG
AGCGTGTATATCCCCGGGTTCAGGTAAGTCTTCTAGGGAACACTCTCCACTAGTTCTTAG
TTTGTAACAAGAACCTTAAATGCTTCTGGTTTTAGATTCTTGCCTTCCAAGACTAACAGA
GAGATATGGAGGATTGAGAGAGAAATCCGCGGTTCTATCCTGGGACTCATCAGAAAAACA
AAACAAGAGACGCGGAGAAGGCAGGAACTCTGCTTCAGGCTTTTATGTCTCCTTACGTCA
AAACATTAGGTATGATAATCAATGAGACACTCCGGCTCTACCCTCCAGCGATGACACTAA
ACCGTGACACGCTTAGGAAAGCTAAGCTTGGAAACCTAGAGATTCCTGCAGGAACTCAGC
TCTATCTATCGGTTATCGCCATGCACCACGACAGAGAGGCATGGGGAGAAGACGCGGAGG
AGTTTAACCCGGGTAGGTTTGAAGATACCAGGAAAGAATCAGCTCTGCTAGTGCCGTTTG
GGTT

QA 1 664 1 664
DS 

RD RS1AE76JQ 870 0 0
AGATATGTTATCAAGAACAGCTTTTGGTAACAACGTGGAAGAAGGGAAACGAATCTTTGC
CTTGCAGGAGCGTATGGTGCGTCTCTTCTATCTTGTTCGGTGGAGCGTGTATATCCCCGG
GTTCAGGTAAGTCTTCTAGGGAACACTCTCCACTAGTTCTTAGTTTGTAACAAGAACCTT
AAATGCTTCTGGTTTTAGATTCTTGCCTTCCAAGACTAACAGAGAGATATGGAGGATTGA
GAGAGAAATCCGCGGTTCTATCCTGGGACTCATCAGAAAAACAAAACAAGAGACGCGGAG
AAGGCAGGAACTCTGCTTCAGGCTTTTATGTCTCCTTACGTCAAAACATTAGGTATGATA
ATCAATGAGACACTCCGGCTCTACCCTCCAGCGATGACACTAAACCGTGACACGCTTAGG
AAAGCTAAGCTTGGAAACCTAGAGATTCCTGCAGGAACTCAGCTCTATCTATCGGTTATC
GCCATGCACCACGACAGAGAGGCATGGGGAGAAGACGCGGAGGAGTTTAACCCGGGTAGG
TTTGAAGATACCAGGAAAGAATCAGCTCTGCTAGTGCCGTTTGGGTTAAGGGCTAGGACT
TGCGTGGGGCAGAATCTGGCAGTGGTTGAGGCCAAAACGGTTCTTGCTACGATCTTGAGG
CATTACAGTTTCAGGTTGTCTCCAAGTTATGTCCATGCCCCTGTTTTGTTTGTGACCTTG
GAGCCTCAAAAGGGTGCTCATCTTCTCTTTAGTAGGATTTAAAGTTCTTAAAATGTACGG
TTTGTAACTCGGTTTAGTATTTTGACTCCTTTGAACCTTCATAAAAAGGTACACTGTTGA
GCGTTGATTCCTTTGAATCTTCCTTAGAGC

QA 1 870 1 870
DS 



AS 1 2

CO CL8955Contig1 595 2 1 U
CTCATAATCACATATTGGATGGCTGGTTTAAACCCTAAACCTGTAAACTTCTTTCTGACC
CTCCTGGTCCTCCTCGTCCACGTCCTTGTCTCTGGTGGGCTAGGACTAGCCCTAGGTGCC
ATGGTGATGGATCAGAAGACAGCTACGACACTCGGGTCAGTTCTAATGCTCGCGTTTTTG
TTAGCAGGAGGATACTTCGTTCGACATGTCCCAGCCTTCATCGCTTGGATTAAATACGTA
TCAATAAGTTACTATACCTATAAACTACTGATATTGGGTCAGTACACGGAGAGTGAGTGG
TATCCTTGTGGTGAAAATGGGAACTCCAAGTGTTATGTTGGTGATTTTGAAGGTATTAAG
CTTATAGGGTTTCACAGTGGGTTGGCCTCTTCCTTTGCGTTGGCTGTGATGCTTGTTGGC
TATAGAGTTGTTGCCTATATTGCTTTGATGAGAATTGGTAAGACCAAGGCTGGCTAATAT
TTAGCTATATCCGCCATATTTTTTTGGGTTTTGGGATTTTTTGAGTATGATCGAATGTAT
AATAACTCCAATAAGTTCTTATTGCATTACTGTTTTTCATTAGAATCTTTAATAT


BQ
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CTTATAGGGTTTCACAGTGGGTTGGCCTCTTCCTTTGCGTTGGCTGTGATGCTTGTTGGC
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AATAACTCCAATAAGTTCTTATTGCATTACTGTTTTTCATTAGAATCTTTAATAT

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 2

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BQ
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AGA

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DS 



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BQ
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10 10 10 10 10 

AF RS1GT84TF U 1
AF RS1FZ52TF U 1
BS 1 665 RS1FZ52TF

RD RS1GT84TF 592 0 0
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TTTATCTACGAAGCTGAAACACGAGAAGTGGGCCACATGGGCGAGCCTCAGGTTTCATCA
GTTCCTAATTGTGGAGATGGTTGCGTTTGGAGAGCTGATTTGATTGTGAGCTTTGGAGTT
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CGGACACCGATGACACCGTGCTTCTGCCTTCAGATTCCGGCAAGCCACCAAAGAGCGAGT
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QA 1 592 1 592
DS 

RD RS1FZ52TF 665 0 0
GCTCCGATAAATATAGACAACAACAACGCTGCTTCTACCGTCGATGCAGAGGCTAAGCTC
CTTCAGTCGTTCAGGAACTGTATACTAAAGCTTATTAAACTGGAAGGATCAGAATGGTTG
TTTGGGCAAAGCGATGGAGTCGATGAAGAACTGATTGACAAGGTAGCTGCAAGAGAAAAG
TTTATCTACGAAGCTGAAACACGAGAAGTGGGCCACATGGGCGAGCCTCAGGTTTCATCA
GTTCCTAATTGTGGAGATGGTTGCGTTTGGAGAGCTGATTTGATTGTGAGCTTTGGAGTT
TGGTGCATTCACCGTGTCCTTGACTTGTCTCTCATGGAGAGTCGTCCTGAGCTCTGGGGA
AAGTACACTTACGTTCTCAACCGCCTTCAGGGAGTTATAGACCCGGCGTTCTCAAAGCTT
CGGACACCGATGACACCGTGCTTCTGCCTTCAGATTCCGGCAAGCCACCAAAGAGCGAGT
CCGCCTTCAGCTTCAAACGGAATGTTACCTCCGGCTGCAAGACCAGCCAAAGGCAAATGC
ACAACAGCAGTCACACTTCTTGAGCTAATCAAAGACGTTGAAATATCAATCTCTTGTAGG
AAAGGCCGGACCGGTACAGCTGCTGGAGACGTGGCTTTCCCAAAAGGGAAAGAGAATTTG
GCATC

QA 1 665 1 665
DS 



AS 1 2

CO CL8958Contig1 1055 2 10 U
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AAGATCGAGGAAGATGAATGGAGGTGGTCGCCAAGATTCGACGCAAGCCGTCGCTTCCGG
TATCTTCCAGATCAACACCGGTGTCTCCACCTTTCAGCGGCTCGTTAACACGCTCGGTAC
TCCCAAAGATACCCCCGAGCTCCGTGACAAGCTGCACAAGACACGGTTGCATATTGGTCA
GCTTGTGAAGGACACTTCTGCTAAGCTTAAAGAAGCTAGTGAAACTGATCATCGAACCCG
TGTCAATGCAAGTAAGAAGATTGCAGATGCTAAGCTTGCAAAGGACTTTCAAGCTGTGCT
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CCTCCCTCCTTCTTCTCTTCCCTCTAGCTATACAGCGAGTGAAGTAGACAATATTCCTGA
ACAGAGGGCACAAGTTATGGAATCAAAAAGGCAGGAACTTGTGTTGTTAGACAACGAGAT
TGCATTCAACGAAGCTGTGATTGAAGAAAGAGAGCAAGGGATACAAGAAATCCACACTCA
AATTGGAGAGGTTAACGAAATTTTCAAAGATCTTGCGGTTCTTGTTAACGATCAAGGAGT
CATGATAGATGATATTGGTACCCACATTGACAACTCTCGAGCTGCAACTGCTCAAGGAAA
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CTTGGTGATATTTGGCATTGTACTCCTGATCGTGATCATCGTACTCGCAGCTTGATTTTG
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TAAAATATAAATTTGCAGACAAAAGCGTAGAAGATGGGTTTTGTATTGGTTCGGTTTGAG
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CTATTTGTTGCGAGATATTGATTTAATTTTTTTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DS69TF U 1
AF RS1DS69JQ C 191
BS 1 656 RS1DS69TF
BS 657 657 RS1DS69JQ
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RD RS1DS69TF 806 0 0
GGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAAGATGAGTTTTCAAGATTTAGAAGCAGGGAAAGGAGG
AAGATCGAGGAAGATGAATGGAGGTGGTCGCCAAGATTCGACGCAAGCCGTCGCTTCCGG
TATCTTCCAGATCAACACCGGTGTCTCCACCTTTCAGCGGCTCGTTAACACGCTCGGTAC
TCCCAAAGATACCCCCGAGCTCCGTGACAAGCTGCACAAGACACGGTTGCATATTGGTCA
GCTTGTGAAGGACACTTCTGCTAAGCTTAAAGAAGCTAGTGAAACTGATCATCGAACCCG
TGTCAATGCAAGTAAGAAGATTGCAGATGCTAAGCTTGCAAAGGACTTTCAAGCTGTGCT
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CCTCCCTCCTTCTTCTCTTCCCTCTAGCTATACAGCGAGTGAAGTAGACAATATTCCTGA
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TGCATTCAACGAAGCTGTGATTGAAGAAAGAGAGCAAGGGATACAAGAAATCCACACTCA
AATTGGAGAGGTTAACGAAATTTTCAAAGATCTTGCGGTTCTTGTTAACGATCAAG*AGT
CATGATAGATGATATTGGTACCCACATTGACAACTCTCGAGCTGCAACTGCTCAAGGAAA
*TCTCAGCTCGCTCA*GCCTCCAAAACACAAAGATCAAACTCATCTCTGACATGCTTGCT
CTTGGTGATATT*GGCATTGTACTCC

QA 1 806 1 806
DS 

RD RS1DS69JQ 865 0 0
TA
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CACT*CTGCTAAGCTTAAAGAAGCTAGTGAAACTGATCATCGAACCCGTGTCAATGCAAG
TAAGAAGATTGCAGATGCTAAGCTTGCAAAGGACTTTCAAGCTGTGCTGAAAGAGTTTCA
GAAAGCTCAACAGACTGCTGCTGAAAGAGAAACCGCTTATGCTCCTCTCCTCCCTCCTTC
TTCTCTTCCCTCTAGCTATACAGCGAGTGAAGTAGACAATATTCCTGAACAGAGGGCACA
AGTTATGGAATCAAAAAGGCAGGAACTTGTGTTGTTAGACAACGAGATTGCATTCAACGA
AGCTGTGATTGAAGAAAGAGAGCAAGGGATACAAGAAATCCACACTCAAATTGGAGAGGT
TAACGAAATTTTCAAAGATCTTGCGGTTCTTGTTAACGATCAAGGAGTCATGATAGATGA
TATTGGTACCCACATTGACAACTCTCGAGCTGCAACTGCTCAAGGAAAATCTCAGCTCGC
TCAAGCCTCCAAAACACAAAGATCAAACTCATTTCTGACATGCTTGCTCTTGGTGATATT
TGGCATTGTACTCCTGATCGTGATCATCGTACTCGCAGCTTGATTTTGGAAAAAGCAAGA
ACAAGTCTTTCAATGTGTTCAACGAGTGAGTGCGACTACTTTGGTATATAAAATATAAAT
TTGCAGACAAAAGCGTAGAAGATGGGTTTTGTATTGGTTCGGTTTGAGGATTTATTGGTG
AATGTAACAGAGTGCGTGTGTGTGTGTTGGTTTTCTTTGTGGTGCAAACTATTTGTTGCG
AGATATTGATTTAATTTTTTTCC

QA 3 865 3 865
DS 



AS 1 2

CO CL8959Contig1 886 2 4 U
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TGCGATTTCTTCCTTTCAACTCATCCTCTCTTTGATTCTCTCGCATTCATCCTGAAAAAG
GTTTAGATTTGATAAAAGTGTGATTCATTCTCAGGTCGAATTGAAACTTGGTGGAGGGTA
AGAGAGAGAGAGATACAGAGGGATGCTCACGTGTATAACTTGGTGAAGATGACAGAGTTC
TTGGAACACCCAGGTCTGAGCAAGCCGTTAAGTCCCTGACGTCACAGCTAAAAGACATGG
CAGTAAAAGCCTCAGGTGCTTACAAAAGCTGCAAACCGTGTTCGGGGTCTTCTAACCGGA
ACCACCACCGTGATTCAGATGCTGCATCAGCTTCTAGGAGGTTCCATTATGCGTACAAGA
GACCTGGAAGAAGCGGTTGCTCTACCAAAGATTCTAGGGAAAGATATGGAATCAACGTTA
AAAGGTCTCTTGAGTGGTGAAGGAACACCTGAATCCCTGAGTTGGAGCCTACAGTGTACT
TGGAGGAAGAAGAAGACCCTAAAGAATTGGTTGCTCAAGTGGAGCCTGGTGTCCTCATCA
CGTTTGTTTCATTGCCTGAGGGAAGGCAATGATCTCAAGCGTATTCGTTTCAGGTAATCT
ACTGAAATGAACTTAATCCATTATGTTCTTGATTAGATTTTTGGAGTTAGAGAATGTGTG
TGTTTCTTGGGGGCAAGCTATGAGAAGTACAATCGATATTAAAGATGTTATCTTATGTTT
TTGGAAACTTGCGTTTAGTGATAATTCATTTCGTAGGTGGGACATGCTTCATGTATGATC
TAACTAACTCTCTTCAATGGCTTTCATCAAAGAAAGACACTTTGCC


BQ
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AF RS1C825TF U 1
AF RS1C825JQ C 117
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QA 1 707 1 707
DS 

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GATCTAACTAACTCTCTTCAATGGCTTTCATCAAAGAAAGACACTTTGCC

QA 1 770 1 770
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1GV65JQ C 1
AF RS1GV65TF U 1
BS 1 579 RS1GV65TF
BS 580 581 RS1GV65JQ

RD RS1GV65JQ 581 0 0
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QA 1 581 1 581
DS 

RD RS1GV65TF 579 0 0
AAATACTTTGCGAGAAGATGTCAGGAAGAGGGAAAGGAGGAAAGGGATTGGGAAAGGGAG
GAGCCAAGAGGCACAGGAAGGTGCTGAGGGATAACATCCAAGGTATCACCAAGCCTGCTA
TCCGTCGTCTTGCTCGCCGAGGTGGAGTCAAGCGTATAAGCGGTCTGATCTACGAAGATA
CAAGAGGAGTCCCCAAGATCTTCCTCGAGAATGTCATCCGCGACGCCGTCACCTACACCG
AGCACGCCAGGAGGAAAACCGTCACCGCCATGGATGTGGTCTATGCGTTGAAGAGGCAGG
GACGCACTCTCTACGGTTTCGGCGGTTAAATTGAATCGACGGAGTTGGGGATTAGGGTTT
GAAAATTTGGGGATCTGAAAATTTCTTTGTTTCTGATTTAGCTGAAGTAAATCCACGACT
ATTGTGTATCGTTTTATGCTATGTTGTTAGCCAACGTTATGTTAAATGAATCTTATCAAA
ACTTATGATGAGAATTTCTAATTAGAATGTTTTATATTGAAATCATCTTGTATAAATCCC
AATCTGCAGGCGTTAATCAAACCTGCAAAATTAGTGTGC

QA 1 579 1 579
DS 



AS 1 2

CO CL8961Contig1 704 2 1 U
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CTATAATGGTAACTTTGACATCCTCAACGAGCAAAACCGAGGACCAAGGGCTTCAAAGCC
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CAGTCCAAAGGAGGTTGAGGACTCCAAGAACAACAACAACAAGAATCTTGATTTTGTCAC
GGACTACAATAACGCTAAACTCTTCATAATCAAGTCTTACAGTGAAGACAACGTTCACAA
GAGCATCAAGTACAATGTATGGGCTAGCACCGCCAACGGCAACAAAAAGCTTGATGCTGC
TTATCGTGAGGCCAAGGACGAGAAAGAATCTTGTCCAGTGTTTCCTCTCTTCTCTGTAAA
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CGTTGATTACTGGCAACAAGACAAATGGAGTGGACAGTTCCCAGTGAAGTGGCACATTAT
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AGTGACTAACAGTCGTGACACACAAGAAGTGAAACTGGAGCAGCATCGAGATGCTGAGAT
TTCAGAGCTACGATGCTGACACGTCAATCTGGATGATTTGAGTT


BQ
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AF RS1GA62TF U 1
AF RS1E933TF U 1
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QA 1 704 1 704
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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AF RS1DZ31TF U 1
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TG

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1A513JQ C 1
AF RS1A513TF U 1
BS 1 585 RS1A513TF

RD RS1A513JQ 585 0 0
GGGTAAAACAAAGAGAACAAAGCTTAAAAATGGCTAAAGAGAAATCATATGTAATTGCTC
TTCTTCTTCTTCTTCTTCTATCTTTGCTCCTATGTCTTTCTTCTCAAGTTGGTGTTGCCG
AGACCATACGCCACACAATTAAAGCCGGGTATTCAGATTCTCGATGTGCCTATAAATTTC
CAGCAACTCCACCACCAGGCTACAAACCTAAACCGCCGATACTCGCTCCTAGATCTTCGT
CACCCAGAGGAAAAGGTCCATAACTCCATAAGTGCTGAAAAGTTTCAAGAAGTGATAGGG
AGTGAAGAAACACATATATATCATGGGATGTGCAAGAAGAGTAACCCATTATTAATGTAT
AACTCGTATCTCGAATTTTATCCTAGAAAGACAAGATTATCATAGAGAGTAGAAGACGTT
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ATATATATTTGTTGGCGTTCATTTAAAGTGTTGAGTAACTACGGTTAAATGTAATATGCT
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GTGTTAGATTAAAGGATTTCTAATGGAGTTAGAACTTGCCGTTTC

QA 1 585 1 585
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BQ
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AF RS1GY11TF U 1
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DS 



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BQ
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AF RS1GO71JQ U 4
AF RS1GO71TF C 1
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BS 588 757 RS1GO71TF

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QA 1 584 1 584
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AS 1 2

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BQ
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DS 



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BQ
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T

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BQ
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AF RS1DL52TF U 1
AF RS1DL52JQ C 169
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TACATCTTGACAGCTCCGTAGCTAGAAGCTCGTTTCTGAGTTCAAGCTCCATCAGTTTCA
TCGATTCCACAAGCCGTTTGTAGAGATGTCTTTAACTCGCGTGCCTTCAATAATCCCCGA
GGAGCCAACTCGGACGTTTGTTTCTTCTCCACCGCAAAGATAAGTTCTTTTATTAAACCT
TTTCTTTTGGGCAACTGAAATTGATTAAAGGAAAGAGAGTTTAGCAAGGCCCTCACTAAA
CTCTCGTTCTTTTATTAAACTATATATCACATGCTTTAATGACTTTTAAATTACGCATTT
GAGTGTGAAAGATGTTAGATCTGAGAGTTATAAGCCATGGCAGAAATTGCAGAAAGCTTA
ATCGATAACTAAAGGAAGAAGAAGAAGTATTTACAGTTTTGCCATTCTGTAAGAGAAAAC
ATTTTAAAAGGACAAAATGCAATACTGCGTGTGGAACACGTGATTCTATGATCACACTAT
AGCTATTTATTTACAAAACTGAAAAAAAAACTTATTTGTTTCCTTTTACAAAAAATAGTG
ATTTTCAATGATTTTTCTATCAAAGATTTTCAATGATTTAACATTTGTTTTGCATAGAGA
TCAAATAGTCTCAGATTATCATTCCAGACTACTTGGTCAAACCACTTGCACTCTCTATCT
AAG*TGAAA*TGTATCCAAAA*CTTATT**ATTACATACCTTATGCATATCGTAT

QA 1 775 1 775
DS 

RD RS1DL52JQ 762 0 0
AATAATCCCCGAGGAGCCAACTCGGACGTTTGTTTCTTCTCCACCGCAAAGATAAGTTCT
TTTATTAAACCTTTTCTTTTGGGCAACTGAAATTGATTAAAGGAAAGAGAGTTTAGCAAG
GCCCTCACTAAACTCTCGTTCTTTTATTAAACTATATATCACATGCTTTAATGACTTTTA
AATTACGCATTTGAGTGTGAAAGATGTTAGATCTGAGAGTTATAAGCCATGGCAGAAATT
GCAGAAAGCTTAATCGATAACTAAAGGAAGAAGAAGAAGTATTTACAGTTTTGCCATTCT
GTAAGAGAAAACATTTTAAAAGGACAAAATGCAATACTGCGTGTGGAACACGTGATTCTA
TGATCACACTATAGCTATTTATTTACAAAACTGAAAAAAAAACTTATTTGTTTCCTTTTA
CAAAAAATAGTGATTTTCAATGATTTTTCTATCAAAGATTTTCAATGATTTAACATTTGT
TTTGCATAGAGATCAAATAGTCTCAGATTATCATTCCAGACTACTTGGTCAAACCACTTG
CACTCTCTATCTAAGGTGAAAATGTATCCAAAAACTTATTTATTTACATACCTTATGCAT
ATCGTATACATTTGCAAATTGAAAATTAATAATGCTGAAAATTTTATTTGTTATTTTTTA
CAGAAAATAAATATGCAAATGGACAATTAATCAAATTGTATACAAAACATGATTATAAAT
ATATTCAATACATATAAATTTAATTTAAAACTATAAAGATTT

QA 1 762 1 762
DS 



AS 1 2

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ACGCGGCGGCGTAGATTTCACGGCGAAAACGGGAACAAACAGATTGAGATTGAGCAAGAG
CGTTGTAGGGTTACATTATCGATTCGCCTTCTTTGACCTCTCGATCTATTCTCTTAATCT
TCATTCATCTTCATTCATCATCTCTCCCACCTCCATTCTAGGGTTTCTTGATCCGTCTCG
CGACGTTTCCTTACCCTCCCGGTAAGCTTCAAATTGGTTGTCTCGTCTCCTCTAATTTCA
TCAATCGGCCCTGTAGGGTTTTGAGATTCTCGCTCTCCTCTTCCCCCTTTGCAGGTTGTT
GAGTGGGCGGTGGATTCTGAAGCATGAGTGTTAAAGAAGGGGAGGAGGCTTAAGGAAGGT
TTGGGTAGAGGAAGAATTTGTGGAGTTTCCCATGAGCGATGGGGGTGTAGCATGCATGCC
TCTACTCAATATCATGGAGACGACGCTTTGTGGAGGCAACAGTGATACCAAGATTGCTGA
AAATGGTCACACATCAATCTCAGCTAATAATGATAAGCTTCCGCCAGCT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1A663JQ C 1
AF RS1A663TF U 1
BS 1 589 RS1A663TF

RD RS1A663JQ 589 0 0
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ACGCGGCGGCGTAGATTTCACGGCGAAAACGGGAACAAACAGATTGAGATTGAGCAAGAG
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TCATTCATCTTCATTCATCATCTCTCCCACCTCCATTCTAGGGTTTCTTGATCCGTCTCG
CGACGTTTCCTTACCCTCCCGGTAAGCTTCAAATTGGTTGTCTCGTCTCCTCTAATTTCA
TCAATCGGCCCTGTAGGGTTTTGAGATTCTCGCTCTCCTCTTCCCCCTTTGCAGGTTGTT
GAGTGGGCGGTGGATTTTGAAGCATGAGTGTTAAAGAAGGGGAGGAGGCTTAAGGAAGGT
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QA 1 589 1 589
DS 

RD RS1A663TF 589 0 0
GGGAGAGAGAGAGATACAGAAGAGAAGCGAAGGTCGCAGAGAGAGAGAGAGAACAAACAC
ACGCGGCGGCGTAGATTTCACGGCGAAAACGGGAACAAACAGATTGAGATTGAGCAAGAG
CGTTGTAGGGTTACATTATCGATTCGCCTTCTTTGACCTCTCGATCTATTCTCTTAATCT
TCATTCATCTTCATTCATCATCTCTCCCACCTCCATTCTAGGGTTTCTTGATCCGTCTCG
CGACGTTTCCTTACCCTCCCGGTAAGCTTCAAATTGGTTGTCTCGTCTCCTCTAATTTCA
TCAATCGGCCCTGTAGGGTTTTGAGATTCTCGCTCTCCTCTTCCCCCTTTGCAGGTTGTT
GAGTGGGCGGTGGATTCTGAAGCATGAGTGTTAAAGAAGGGGAGGAGGCTTAAGGAAGGT
TTGGGTAGAGGAAGAATTTGTGGAGTTTCCCATGAGCGATGGGGGTGTAGCATGCATGCC
TCTACTCAATATCATGGAGACGACGCTTTGTGGAGGCAACAGTGATACCAAGATTGCTGA
AAATGGTCACACATCAATCTCAGCTAATAATGATAAGCTTCCGCCAGCT

QA 1 589 1 589
DS 



AS 1 2

CO CL8971Contig1 986 2 4 U
GGACTTTTGTCTTTCTTTAGTCAGGTAAAAGAAAAGAAAAAGAAAAAACCAGTTTCTTGT
TCTTGATTTTCTCCGATGGAAGTTCCACGCCGCTCTTTGGCTGCTTCTATCTCTCCTCTC
CGCCTCATCGATGGTCTCCCTCGCCGGAGGAGTTTTAATTATAACCAGATGCCCGAGGAG
CCTATCAAACTCACTGTTCTCAAACTTGATGGATCTTCCTTTGATATTCAAGTGATGAAG
ACAGCTACAGTATGGGAGCTCAAGATGGCTGTAGAAGCTGCCTTTTCTCACTTGCCCATC
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GATCACATATTGCTTAACGAGGCTAACTACCTCATCGAGTTCGGCATTAAAGACGGAGAC
CAGCTTCGGTTCATCCGCCATATATCAAACTACTGCACCATGATGGTGAACCATAATAGC
AAGACACCACATGTTTCTTCTTTGAAACAACTCAAACTACCATCTAGGTTCTCACTAAAA
ACCAAAACCCGGGAAAAGAAAGCAACACAAGGACAAGAAGACGGTGTTGAATCCATCACT
AAGACACAACCAGGCTTTCTCTCGACTGTATTCCTGGGAGGTTGGCTCTCTTACAAGTCA
ACACCAAGTCAACGAGGAACTAAACACAGAAACGTGACTGCTTCTTCTACGACGAGTCAC
CTCAGAGCTTTTAACAACCTCATCGCAAGGTTTCGTTTCACGTGTTACTCGGACAAGGAT
GTCTGGAACAGGAAGAAACTCATCTCTGAAAACATGAAATAAGACTCATTACTACTCTGT
CTGCTAAACATTCTTCTCGTTTGGTTCTTGTAGAGATTTTTATTTTCCCAATCTTCATGT
TTATATGTTTGGAGGCCTGACCAGCACTTTGTAAGAAACGAATGATAAGACGAGTCTTTG
GTTTTTTATAAAGATGATGTTATATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AJ12TF U 1
AF RS1AJ12JQ C 186
BS 1 777 RS1AJ12TF
BS 778 778 RS1AJ12JQ
BS 779 787 RS1AJ12TF
BS 788 986 RS1AJ12JQ

RD RS1AJ12TF 787 0 0
GGACTTTTGTCTTTCTTTAGTCAGGTAAAAGAAAAGAAAAAGAAAAAACCAGTTTCTTGT
TCTTGATTTTCTCCGATGGAAGTTCCACGCCGCTCTTTGGCTGCTTCTATCTCTCCTCTC
CGCCTCATCGATGGTCTCCCTCGCCGGAGGAGTTTTAATTATAACCAGATGCCCGAGGAG
CCTATCAAACTCACTGTTCTCAAACTTGATGGATCTTCCTTTGATATTCAAGTGATGAAG
ACAGCTACAGTATGGGAGCTCAAGATGGCTGTAGAAGCTGCCTTTTCTCACTTGCCCATC
ACTGGCGTTGGCAAAGTCTCTTGGCCGCATGTTTGGGCACAGTTCTGCTTATCCTATGGA
GATCACATATTGCTTAACGAGGCTAACTACCTCATCGAGTTCGGCATTAAAGACGGAGAC
CAGCTTCGGTTCATCCGCCATATATCAAACTACTGCACCATGATGGTGAACCATAATAGC
AAGACACCACATGTTTCTTCTTTGAAACAACTCAAACTACCATCTAGGTTCTCACTAAAA
ACCAAAACCCGGGAAAAGAAAGCAACACAAGGACAAGAAGACGGTGTTGAATCCATCACT
AAGACACAACCAGGCTTTCTCTCGACTGTATTCCTGGGAGGTTGGCTCTCTTACAAGTCA
ACACCAAGTCAACGAGGAACTAAACACAGAAACGTGACTGCTTCTTCTACGACGAGTCAC
CTCAGAGCTTTTAACAACCTCATCGCAAGGTTTCGTTTCACGTGTTACTCGGACAAG*AT
GTCTGGA

QA 1 787 1 787
DS 

RD RS1AJ12JQ 801 0 0
CAAACTCACTGTTCTCAAACTTGATGGATCTTCCTTTGATATTCAAGTGATGAAGACAGC
TACAGTATGGGAGCTCAAGATGGCTGTAGAAGCTGCCTTTTCTCACTTGCCCATCACTGG
CGTTGGCAAAGTCTCTTGGCCGCATGTTTGGGCACAGTTCTGCTTATCCTATGGAGATCA
CATATTGCTTAACGAGGCTAACTACCTCATCGAGTTCGGCATTAAAGACGGAGACCAGCT
TCGGTTCATCCGCCATATATCAAACTACTGCACCATGATGGTGAACCATAATAGCAAGAC
ACCACATGTTTCTTCTTTGAAACAACTCAAACTACCATCTAGGTTCTCACTAAAAACCAA
AACCCGGGAAAAGAAAGCAACACAAGGACAAGAAGACGGTGTTGAATCCATCACTAAGAC
ACAACCAGGCTTTCTCTCGACTGTATTCCTGGGAGGTTGGCTCTCTTACAAGTCAACACC
AAGTCAACGAGGAACTAAACACAGAAACGTGACTGCTTTTTTTACGACGAGTCACCTCAG
AGCTTTTAACAACCTCATCGCAAGGTTTCGTTTCAGGTGTTACTCGGACAAGGATGTCTG
GAACAGGAAGAAACTCATCTCTGAAAACATGAAATAAGACTCATTACTACTCTGTCTGCT
AAACATTCTTCTCGTTTGGTTCTTGTAGAGATTTTTATTTTCCCAATCTTCATGTTTATA
TGTTTGGAGGCCTGACCAGCACTTTGTAAGAAACGAATGATAAGACGAGTCTTTGGTTTT
TTATAAAGATGATGTTATATG

QA 1 801 1 801
DS 



AS 1 2

CO CL8972Contig1 942 2 2 U
TAGCCACAATGTATCTTAGACTTCTCTGTCTTCTCCTCCTCCTAACTTCTTGCTTGACAC
ATCAAGCTTTTGGCCGTGGCTGTAACCGGCCACCTAAGGAAGTAAGCTCGTATCCTTCAT
CAAGCATCACAGTCGTCGGAGTTGTCTACTGTGACACTTGTTCAAGCAACACTTTCTCAA
GACAAAGCTATTTCTTACAAGGAGTGGATGTTCATGTCAGCTGTAGATTCAAAGCGAGCT
CACCAAGGACAACAGAGGAAGTGAACATATCAGTAAACAGAACAACAAACAGAAGCGGCG
TTTACAAGCTCGAGATCCCTCACGTCGACGGGATAGATTGCGTGGACGGAATCGCCATAG
CTTCTCAGTGCAGCGCCAAGCTACTCAGCCCTTCCAACATCAACATCGGCTGCAACATCC
CTGTTTTTCAGACAGCAACCAACGAAGTATCCATCAAGTCAAAGCAAGATCGTGTCTGCA
TCTACAGCTTAAGCGCACTCAGCTACAAACCATCCCACAAAAACACCACACTTTGCAGCG
GCGGAAAGAGACAACATCACGGGCGAGAGAAGGAGGAAGAGAAGGTGGAGAAGAAGTTTA
AAGACTCCAAGTTCTTCTGGCCTTACATGCCACCGTACTGGTTCCCTTGGCCGTACTCCA
CTCTCCCACCGTTGCCTACTCTGCCTCCTCTTCCTTCCTTTCCTTTCCCTTTTCTTCCTT
TAGCAAACCCTAATCCAGCATTGCCCGCGTTTGACTGGAAAGATCCCACCACTTGGATAC
CTTATTTTCCACGTTTCCCTCCTAGTGATCACAATCCTTAGGGATCACTTTACCTCCTAC
ATTTGGCTTTTTTCTTCTCTCTGTTTTGGCTTTCTGCTTCTCTATGTTTTTTTTTTTGTT
TGATCTCTTTTGCTTGTGTTTGTGTGTGATTGATTTACTTAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FU26TF U 1
AF RS1FU26JQ C 122
BS 1 722 RS1FU26TF
BS 723 942 RS1FU26JQ

RD RS1FU26TF 722 0 0
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GCGGAAAGAGACAACATCACGGGCGAGAGAAGGAGGAAGAGAAGGTGGAGAAGAAGTTTA
AAGACTCCAAGTTCTTCTGGCCTTACATGCCACCGTACTGGTTCCCTTGGCCGTACTCCA
CTCTCCCACCGTTGCCTACTCTGCCTCCTCTTCCTTCCTTTCCTTTCCCTTTTCTTCCTT
TA

QA 1 722 1 722
DS 

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AAGCATCACAGTCGTCGGAGTTGTCTACTGTGACACTTGTTCAAGCAACACTTTCTCAAG
ACAAAGCTATTTCTTACAAGGAGTGGATGTTCATGTCAGCTGTAGATTCAAAGCGAGCTC
ACCAAGGACAACAGAGGAAGTGAACATATCAGTAAACAGAACAACAAACAGAAGCGGCGT
TTACAAGCTCGAGATCCCTCACGTCGACGGGATAGATTGCGTGGACGGAATCGCCATAGC
TTCTCAGTGCAGCGCCAAGCTACTCAGCCCTTCCAACATCAACATCGGCTGCAACATCCC
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TTACAGCTTAAGCGCACTCAGCTACAAACCATCCCACAAAAACACCACACTTTGCAGCGG
CGGAAAGAGACAACATCACGGGCGAGAGAAGGAGGAAGAGAAGGTGGAGAAGAAGTTTAA
AGACTCCAAGTTTTTCTGGCCTTACATGCCACCGTACTGGTTCCCTTGGCCGTACTCCAC
TCTCCCACCGTTGCCTACTTTGCCTCCTCTTCCTTCCTTTCCTTTCCCTTTTCTTCCTTT
AGCAAACCCTAATCCAGCATTGCCCGCGTTTGACTGGAAAGATCCCACCACTTGGATACC
TTATTTTCCACGTTTCCCTCCTAGTGATCACAATCCTTAGGGATCACTTTACCTCCTACA
TTTGGCTTTTTTCTTCTCTCTGTTTTGGCTTTCTGCTTCTCTATGTTTTTTTTTTTGTTT
GATCTCTTTTGCTTGTGTTTGTGTGTGATTGATTTACTTAT

QA 1 821 1 821
DS 



AS 1 2

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AATGCATGAACGGTTCGGATCCCCCTGTGACTAACTATCCCGGAAAAATACCTTCCGGAG
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AAAGTTGATTCCTTGACATTGACACTGAGATGGCCTCTTTGTGATCATATTTTGGGATTC
AAGAATTTGTTATTCCTTGACGGATCTTTTAAGAATACTAGGATATTAACCCGCACTTTA
AAAAGCACGAAATTATTATTTATTGAAAAATGTTATTAACATGCATGCATGTTTGTTCAT
TAATATATTGGGGATGAACATTTGGTTTTCGTCTCGCTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DK86TF U 1
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BS 1 632 RS1DK86TF
BS 633 761 RS1DK86JQ

RD RS1DK86TF 632 0 0
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AAAGTGAGATATCTTCACATTTCGCTAACTGTGAGCTTCGTTCGGTAGTTCTTGTGGATA
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AAGATCTTCCGAGTGATCTTGCTGATGAGAAGTAGTTGGAGATACGAAAGTGATGAGAAA
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AAAGTTGATTCCTTGACATTGACACTGAGATGGCCTCTTTGTGATCATATTTTGGGATTC
AAGAATTTGTTATTCCTTGACGGATCTTTTAA

QA 1 632 1 632
DS 

RD RS1DK86JQ 722 0 0
GTTCAT
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CATTGGTAGAAACTGACGAAGATGTCTTGTGGAAGCCTGAGATCAGAGAGGAGGACAAAG
ATCTCGCAGCCAGAGGCGTGAAATTCATGAACTGGTTGAGTACAAGGAAAGAAAAGGAAA
TTGCAGTTGTTACTCATAGTGGGTTCTTGTATCATACATTAAACTCTTTTGGAAACGATT
GTGTTCCAACCGTGAAAAGTGAGATATCTTCACATTTCGCTAACTGTGAGCTTCGTTCGG
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AAATACCTTCCGGAGAAGATCTTCCGAGTGATCTTGCTGATGAGAAGTAGTTGGAGATAC
GAAAGTGATGAGAAATATGTTAAACCTTATTATGAGCCTCGAGAGTTTTATTAATGCTTT
TAAAAATAAACTAACAAAGTTGATTCCTTGACATTGACACTGAGATGGCCTCTTTGTGAT
CATATTTTGGGATTCAAGAATTTGTTATTCCTTGACGGATCTTTTAAGAATACTAGGATA
TTAACCCGCACTTTAAAAAGCACGAAATTATTATTTATTGAAAAATGTTATTAACATGCA
TGCATGTTTGTTCATTAATATATTGGGGATGAACATTTGGTTTTCGTCTCGCTTTC

QA 7 722 7 722
DS 



AS 1 2

CO CL8974Contig1 746 2 2 U
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CAGTACTGGACTTTACGAGCAGAGGAGATACCTGAGGAAGAGAAGAATATTGGTCCCGGT
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TTCGGGGAGCCGTTCTTTCAGGTAATCCACGAAGGTGAAACTTTAGAAGAAATCAAGCCC
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TTCTCAATGGGACGTCCCGACTACTTGCAGGACACAGATATCGTTTATGATCGCTTTCAG
AGAAGAGATGTATATGGTGCGTGGGAGCAGTATCTTGGGTTGGAGCACATTGATAATGCT
CCTAAAAGGGCTTATGCTGCAAATCAGAATCGACACGCTTATGAGAAGCCGGTGAAAATA
TACAATTAGGAGGAGCAAGAGAGACAGAGAGAGGATACGTGGCTATCCATGGAGGAAGAT
CATTAAAGGGTGGTTTTGGTAATGAGTAGTAGGGATGTAGAGAGGGGTCCTCACTTTAGA
TTTTCTTGATAACCAAAAATTAAATATATCTTTTTAAGGAAAAGGGTTTTTATTTTGGGC
CCTGACGGTAGTAAGTGTGGTGCTCTATCTGGCTTCCAAGTACTATTTTGGTGTTGATAT
TGATATTTCTTTGAGACTATACTCAA


BQ
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AF RS1FP29TF U 1
AF RS1FP29JQ C 96
BS 1 619 RS1FP29TF
BS 620 746 RS1FP29JQ

RD RS1FP29TF 619 0 0
TTTTTCCACAAGATTTACAAGATCTTTACATCTACGGAAAGAATTGAGAATATCAATGAC
CAGTACTGGACTTTACGAGCAGAGGAGATACCTGAGGAAGAGAAGAATATTGGTCCCGGT
GATCGATTAGTCCATGTGTACCATTTTACTAAAGAACAAAACCAATCGCAAGTACAAAAT
TTCGGGGAGCCGTTCTTTCAGGTAATCCACGAAGGTGAAACTTTAGAAGAAATCAAGCCC
CGTATCCAAAAGAAACTCCATGTACCTGATGAGGACTTCGCCAAGTGGAAGTTTGCTTCT
TTCTCAATGGGACGTCCCGACTACTTGCAGGACACAGATATCGTTTATGATCGCTTTCAG
AGAAGAGATGTATATGGTGCGTGGGAGCAGTATCTTGGGTTGGAGCACATTGATAATGCT
CCTAAAAGGGCTTATGCTGCAAATCAGAATCGACACGCTTATGAGAAGCCGGTGAAAATA
TACAATTAGGAGGAGCAAGAGAGACAGAGAGAGGATACGTGGCTATCCATGGAGGAAGAT
CATTAAAGGGTGGTTTTGGTAATGAGTAGTAGGGATGTAGAGAGGGGTCCTCACTTTAGA
TTTTCTTGATAACCAAAAA

QA 1 619 1 619
DS 

RD RS1FP29JQ 651 0 0
GGAAGAGAAGAATATTGGTCCCGGTGATCGATTAGTCCATGTGTACCATTTTACTAAAGA
ACAAAACCAATCGCAAGTACAAAATTTCGGGGAGCCGTTCTTTCAGGTAATCCACGAAGG
TGAAACTTTAGAAGAAATCAAGCCCCGTATCCAAAAGAAACTCCATGTACCTGATGAGGA
CTTCGCCAAGTGGAAGTTTGCTTCTTTCTCAATGGGACGTCCCGACTACTTGCAGGACAC
AGATATCGTTTATGATCGCTTTCAGAGAAGAGATGTATATGGTGCGTGGGAGCAGTATCT
TGGGTTGGAGCACATTGATAATGCTCCTAAAAGGGCTTATGCTGCAAATCAGAATCGACA
CGCTTATGAGAAGCCGGTGAAAATATACAATTAGGAGGAGCAAGAGAGACAGAGAGAGGA
TACGTGGCTATCCATGGAGGAAGATCATTAAAGGGTGGTTTTGGTAATGAGTAGTAGGGA
TGTAGAGAGGGGTCCTCACTTTAGATTTTCTTGATAACCAAAAATTAAATATATCTTTTT
AAGGAAAAGGGTTTTTATTTTGGGCCCTGACGGTAGTAAGTGTGGTGCTCTATCTGGCTT
CCAAGTACTATTTTGGTGTTGATATTGATATTTCTTTGAGACTATACTCAA

QA 1 651 1 651
DS 



AS 1 2

CO CL8975Contig1 826 2 12 U
GGAGGTTCAGAGCCAAATCAAGCTTGAGAGAATGGGATCTGGTGCTGGAAATTTCATCAA
GGTTCTTTTGAGGAACTTCGATGTTCTTGCTGGGCAATGTTCTAATCTAGTATCCCCTTC
TCAAAGTTTCTTTTTGCAGAGTAGCTTCTGCTCAGTCCATCACACACAGCCTGTTGTTAG
CCTCGTTTATCCACTACATGCCTCAGTGAGGGCGATTGAAACTCAATCTCACGCTGATGA
CAAACAATGGCTCACTTATTGGGTCCTTTACTCCTTACTTACACTCTTCGAGCTCACATT
CGCCAAACTCATCGAATGGATACCAATATGGTCCTACTTGAAGCTGATCTTGACTTGCTG
ACTTGTGATTCCCTACTTCAGCGGCGCTTCTTATGTCTACGAACATTTTGTGAGGCCTTT
GTTTGTTAACCCACAGAGTATTAACATTTGGTATGTGCCAAAGAAGATGGATATCTTCAG
AAAGCCAGACGATGTGTTGACAGCTGCTGAGAAGTACATTGCAGAGAATGGACCTGGTGC
CTTCGAGAAGATCTTAAGCCGCTCTGACAAATCAAGAAGATATACGCAGCATGAGACCAT
GTATGGGGAAGAGTATCAGTACTAAGGGGACTACAAAAGCTTTTAGTTTTAGACTTGTGA
GGCAAGTTTCATGTCTTTGATGTTGTTGCTTTTGCTTCTTTGTGTGTGGATCTCTGCTCT
GTAAGAAACGTTTTAAGAAACTTTATTGAAACTTGTTCAGTTCCGTATTGTCTGAACAAC
AATAACCCCACAGAGACAATGAAAAGAACATATAGACTCTCTTGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EB65TF U 1
AF RS1EB65JQ C 160
BS 1 628 RS1EB65TF
BS 629 629 RS1EB65JQ
BS 630 661 RS1EB65TF
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BS 741 775 RS1EB65TF
BS 776 826 RS1EB65JQ

RD RS1EB65TF 779 0 0
GGAGGTTCAGAGCCAAATCAAGCTTGAGAGAATGGGATCTGGTGCTGGAAATTTCATCAA
GGTTCTTTTGAGGAACTTCGATGTTCTTGCTGGGCAATGTTCTAATCTAGTATCCCCTTC
TCAAAGTTTCTTTTTGCAGAGTAGCTTCTGCTCAGTCCATCACACACAGCCTGTTGTTAG
CCTCGTTTATCCACTACATGCCTCAGTGAGGGCGATTGAAACTCAATCTCACGCTGATGA
CAAACAATGGCTCACTTATTGGGTCCTTTACTCCTTACTTACACTCTTCGAGCTCACATT
CGCCAAACTCATCGAATGGATACCAATATGGTCCTACTTGAAGCTGATCTTGACTTGCTG
ACTTGTGATTCCCTACTTCAGCGGCGCTTCTTATGTCTACGAACATTTTGTGAGGCCTTT
GTTTGTTAACCCACAGAGTATTAACATTTGGTATGTGCCAAAGAAGATGGATATCTTCAG
AAAGCCAGACGATGTGTTGACAGCTGCTGAGAAGTACATTGCAGAGAATGGACCTGGTGC
CTTCGAGAAGATCTTAAGCCGCTCTGACAAATCAAGAAGATATACGCAGCATGAGACCAT
GTATGGGGAAGAGTATCAGTACTAAGGG*ACTACAAAAGCTTTTAGTTTTAGACTTGTGA
G*CAAGTTTCATGTCTTTGATGTTGTTGCTTT*GCTTCTTTGTGTGTGGATCTCTGCTCT
GTAG**AACGTTTTAAGAA*CTTTATTGAAACTTGTTCAGTTCCGTATTGTCTGA
CACA

QA 1 775 1 775
DS 

RD RS1EB65JQ 667 0 0
TCACACACAGCCTGTTGTTAGCCTCGTTTATCCACTACATGCCTCAGTGAGGGCGATTGA
AACTCAATCTCACGCTGATGACAAACAATGGCTCACTTATTGGGTCCTTTACTCCTTACT
TACACTCTTCGAGCTCACATTCGCCAAACTCATCGAATGGATACCAATATGGTCCTACTT
GAAGCTGATCTTGACTTGCTGACTTGTGATTCCCTACTTCAGCGGCGCTTCTTATGTCTA
CGAACATTTTGTGAGGCCTTTGTTTGTTAACCCACAGAGTATTAACATTTGGTATGTGCC
AAAGAAGATGGATATCTTCAGAAAGCCAGACGATGTGTTGACAGCTGCTGAGAAGTACAT
TGCAGAGAATGGACCTGGTGCCTTCGAGAAGATCTTAAGCCGTTCTGACAAATCAAGAAG
ATATACGCAGCATGAGACCATGTATGGGGAAGAGTATCAGTACTAAGGGGACTACAAAAG
CTTTTAGTTTTAGACTTGTGAGGCAAGTTTCATGTCTTTGATGTTGTTGCTTTTGCTTCT
TTGTGTGTGGATCTCTGCTCTGTAAGAAACGTTTTAAGAAACTTTATTGAAACTTGTTCA
GTTCCGTATTGTCTGAACAACAATAACCCCACAGAGACAATGAAAAGAACATATAGACTC
TCTTGCC

QA 1 667 1 667
DS 



AS 1 2

CO CL8976Contig1 988 2 4 U
GGCTTGACGGCATGACCGCTCTTGTCACTGGCGGATCCAAAGGCCTCGGAAAAGCTGTGG
TGGGGGAACTGTCTATGTTGGGAGCAAGAGTCCACACATGTGCCAGAGACGAAACTCAGC
TTCAGGAAAGCTTATGTGAATGGCAAGCAAAAGGGTTTCAGGTCACCACTTCTGCTTGCG
ACGTTTCTTCTCGTGCCAAACGAGAAAAACTCATGGAAACCGTTTCGACTATGTTCCAAG
GAAATCTTACCATCCTCGTAAACAACGTGGGAACGTGTATAACGAAGCCAACAACAGAGT
TTACAGAAGAAGACATGTCGTTTATGATGGCTACAAATCTTGAGTCAGCTTTCCATCTCT
CGCAGCTCGCGCATCCTTTGTTAAAAGCTTCTGGTTCAGGGAGCATGGTGTTCATGTCTT
CCACTGCTGGAATTGTGCATATCAATGTTGGATCCATCTATGGAGCAACCAAAGGAGCTT
TGAATCAACTAACAAGAAACTTAGCATGCGAGTGGGCAAGTGACAGCATAAGGGTTAACT
CTGTGTGTCCATGGTACATAGCCACTGATAATGCCAACGCTTATCTCAGTGACGAAGAGT
TAAAAAAAGAAGTCGAGTGTAGGACACCGATGGGACGTGTAGGAGAACCAAAGGAAGTAT
CATCGCTTGTGGTTTTTCTCTGTCTTCCTGCAGCTTCTTATATCACAGGTCAAGCTATTT
GCGTTGATGGAGGTGCCTCTATCAACAGCTTCTCTTTCAAGCAAGGCCGGTCCAACATAT
CTGGATGCCCCGCGCAAAATTAAAAAGTTGTGCCGTTTGCATTCATTTTTGTTAATGAAA
TTTCTTTCCCCGTAAAATTCGTCTTTTGAAAATGTGAGATCGAAAACCGTTATTTCACTT
GACTATTCGCTCGATGAGACTTGCTTTCATGTCATGCCTTGAGTTGACGATTGTTTGTTT
CTGTTCGCATTTATATAACTCATTTTCT


BQ
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AF RS1AJ91TF U 1
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TGAATCAACTAACAAGAAACTTAGCATGCGAGTGGGCAAGTGACAGCATAAGGGTTAACT
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TAAAAAAAGAAGTCGAGTGTAGGACACCGATGGGACGTGTAGGAGAACCAAAGGAAGTAT
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QA 1 761 1 761
DS 

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TCCATCTCTCGCAGCTCGCGCATCCTTTGTTAAAAGCTTCTGGTTCAGGGAGCATGGTGT
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AAGCTATTTGCGTTGATGGAGGTGCCTCTATCAACAGCTTCTCTTTCAAGCAAGGCCGGT
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DS 



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TCATTAAACATTTTCGTGTAGTTTTTTTGTTTGTTCTCTTTTGCAGTAAACTAAAAACAT
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TTCATCATGCGTTTGGTGCATTATTTTGCTTGAGCC


BQ
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AF RS1D155TF C 1
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TCATTAGACATTTTCGTGTAGTTTTTTTGTTTGTTCTCTTTTGCAGTAAACTAGAAACAT
GAAAAATTGGTTTTTACAAGGTTTATAGATTATGTTCCGTAAAGGTAAGTAAACTTGATA
TTCATCATGCGTTTGGTGCATTATTTTGCTTGAGCC

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TTTCTTCTCTTCCTCTTCTTCTTCGTCTTCTGCTGGAGGATCATAAGGCATGGGCGGAAA
TGCGATCTAGCAATGACATTACAGAGTTTTCATTAAACATTTTCGTGTAGTTTTTTTGTT
TGTTCTCTTTTGCAGTAAACTAAAAACATGAAAAATTGGTTTTTACAAGGTTTATAGATT
ATGTTCCGTAAAGGTAAGTAAACTTGATATTCATCATGCGTTTGGTGCATTATTTTGCTT
GAGCC

QA 1 305 1 305
DS 



AS 1 2

CO CL8978Contig1 1011 2 4 U
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TTACCATCTGAAGATCAGCAGCTTGGTCTACCCGTCGGGAAGCACATCTTCCTCTGCGCC
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GGATATATCGACCTAGTCATCAAGGTTTACTTCAAGAACGTCCATCCGAGATTCCCCAAC
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TCCGTTAGGACATATTGAGTACAAAGGCAAAGGCGACTTCATGGTCAACGGTAAACCAAA
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TCTGGCCTTGGCGTGTGGACCACCGCCTATGATTCAGTTTGCGTTGCAGCCTAATCTCGT
GAAGATGGGTTACAATGTGAAGGAAGATCTCTTGATCTTCTAAGAATTTGTTCAAGATTT
ATATATATTTGTATTGAAACTTGAAAGTTAATAACAAATTAAAGCTTATGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CD01TF U 1
AF RS1CD01JQ C 352
BS 1 701 RS1CD01TF
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BS 703 717 RS1CD01TF
BS 718 1011 RS1CD01JQ

RD RS1CD01TF 717 0 0
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TACGACTCTTCACCGAACGTCTCGGTCCATGGTGGCTCGAGTGTAATGTCTCTGTTAGCT
CCAATCAGAGAGCTAGCTCCTGCTAAGAACATAGCCTTGGTCAACCCACGGGAGAAAGTC
CCGGTCAAACTCATCGAGAAGACTTCGATCTCTCACGACGTGCGTAGATTCAGATTCGCG
TTACCATCTGAAGATCAGCAGCTTGGTCTACCCGTCGGGAAGCACATCTTCCTCTGCGCC
ACCATAAACGACAAGCTCTGTCTTAGAGCCTATACTCCGGCCAGCGCGGTCGACGCGGTT
GGATATATCGACCTAGTCATCAAGGTTTACTTCAAGAACGTCCATCCGAGATTCCCCAAC
GTGGCTCATGTCGCAGCACCTAGACTCGTTACCGATAGGTGCGGTCCTAGACATCAAAGG
TCCGTTAGGACATATTGAGTACAAAGGCAAAGGCGACTTCATGGTCAACGGTAAACCAAA
GTTTGCCAAGAAACTAGCCATGCTTGCTGGAGGAACCGGTATAACTCCAATCTACCAAAT
CATTCAATCGATACTAAGTGACCCGGAGGACGAAACCGAGATGTTTGTGGTTTATGCAAA
CCGAACCGAGGATGATATTCTTGTGAGAGAAGAGCTAGAAG*ATGGGCTAGTAAGTT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1CD01JQ 660 0 0
GACGCGGTTGGATATATCGACCTAGTCATCAAGGTTTACTTCAAGAACGTCCATCCGAGA
TTCCCCAACGTGGCTCATGTCGCAGCACCTAGACTCGTTACCGATAGGTGCGGTCCTAGA
CATCAAAGGTCCGTTAGGACATATTGAGTACAAAGGCAAAGGCGACTTCATGGTCAACGG
TAAACCAAAGTTTGCCAAGAAACTAGCCATGCTTGCTGGAGGAACCGGTATAACTCCAAT
CTACCAAATCATTCAATCGATACTAAGTGACCCGGAGGACGAAACCGAGATGTTTGTGGT
TTATGCAAACCGAACCGAGGATGATATTCTTGTGAGAGAAGAGCTAGAAGGATGGGCTAG
TAAGTTTGAGGACAGGCTAAAGATTTGGTACGTTGTTGAAATTGCAAAAGAAGGTTGGGA
GTATAGCACAGGGTTTATCACCGAAGCTGTGCTTAGAGAACATGTCCCTGACGGTTTAGA
AGGTGGCTCTCTGGCCTTGGCGTGTGGACCACCGCCTATGATTCAGTTTGCGTTGCAGCC
TAATCTCGTGAAGATGGGTTACAATGTGAAGGAAGATCTCTTGATCTTCTAAGAATTTGT
TCAAGATTTATATATATTTGTATTGAAACTTGAAAGTTAATAACAAATTAAAGCTTATGT

QA 1 660 1 660
DS 



AS 1 2

CO CL8979Contig1 806 2 4 U
GGGGCTAGGATGAAACTAATGTCGTTTCAGTTACCGAAAGACGAACGTTGTGCTGTTTTA
GTTCTCGGTGCTACAACAGAAGCATTATACAGAAGAAACATTCTCTTCATACGCGGAACG
AAGTAGAAGAACGTCAAAGAGAGCCATCGTCTCCTCTCCCTTAGTTGGATTATCAAGTTT
TGTTACAGGCAGGAGAGATGGATCAGATAATGAACAAGGTGGGGTCTTATTGGCTAGGAC
AAAAGGCAAACAAAGAGTTCAACTCGGTCGGTGACGACTTCAATTCATTGTCTAGCAGTA
TTGAAGGAGGTACCAAGTGGTTGGTCAAAACTCAAAGGAAAATGCAGAAGCCATTGCCTG
AGCTGCTGAAGGAGTTTGGTTTACCTGTTGGGATCTTTCCACAGGACGCCACAAACTATG
AGTTCAACGAAGAGACGGGTAAGTTGACTGTCTTCATCCCTGAGACCTGCGAGGTTGGGT
ACAGGGACTCATCGGTCCTGCGGTTTTCAACCACGGTAACTGGTTACCTGGAGAAAGGGA
AGCTAGCTGAAGTGGAAGGCTTGAAAACAAAGGTGATGATTTGGGTGAAAGTGAGTTGTA
TCTCAGCAGATGCGTCAAAGGTATATTTCACAGCTGGGATGAAGAAAAGCAGGAGCAGAG
ATGCTTATGAGGTTATACGGCCCGGTGTTACTGTTGATAAATTCTAACTTATGGATGCTT
TGCCAAGTTGTTTTTTGTATGTATGTATGTATGTATGTTTTTTAACTCCTTGTGTCAAAA
GTAAGCTCTGATGAAGCAAACCTTTA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1C728TF U 1
AF RS1C728JQ C 82
BS 1 652 RS1C728TF
BS 653 653 RS1C728JQ
BS 654 671 RS1C728TF
BS 672 806 RS1C728JQ

RD RS1C728TF 674 0 0
GGGGCTAGGATGAAACTAATGTCGTTTCAGTTACCGAAAGACGAACGTTGTGCTGTTTTA
GTTCTCGGTGCTACAACAGAAGCATTATACAGAAGAAACATTCTCTTCATACGCGGAACG
AAGTAGAAGAACGTCAAAGAGAGCCATCGTCTCCTCTCCCTTAGTTGGATTATCAAGTTT
TGTTACAGGCAGGAGAGATGGATCAGATAATGAACAAGGTGGGGTCTTATTGGCTAGGAC
AAAAGGCAAACAAAGAGTTCAACTCGGTCGGTGACGACTTCAATTCATTGTCTAGCAGTA
TTGAAGGAGGTACCAAGTGGTTGGTCAAAACTCAAAGGAAAATGCAGAAGCCATTGCCTG
AGCTGCTGAAGGAGTTTGGTTTACCTGTTGGGATCTTTCCACAGGACGCCACAAACTATG
AGTTCAACGAAGAGACGGGTAAGTTGACTGTCTTCATCCCTGAGACCTGCGAGGTTGGGT
ACAGGGACTCATCGGTCCTGCGGTTTTCAACCACGGTAACTGGTTACCTGGAGAAAGGGA
AGCTAGCTGAAGTGGAAGGCTTGAAAACAAAGGTGATGATTTGGGTGAAAGTGAGTTGTA
TCTCAGCAGATGCGTCAAAGGTATATTTCACAGCTGGGATGAAGAAAAGCAG*AGCAGAG
ATGCTTATGAG
TTA

QA 1 671 1 671
DS 

RD RS1C728JQ 725 0 0
GCATTATACAGAAGAAACATTCTCTTCATACGCGGAACGAAGTAGAAGAACGTCAAAGAG
AGCCATCGTCTCCTCTCCCTTAGTTGGATTATCAAGTTTTGTTACAGGCAGGAGAGATGG
ATCAGATAATGAACAAGGTGGGGTCTTATTGGCTAGGACAAAAGGCAAACAAAGAGTTCA
ACTCGGTCGGTGACGACTTCAATTCATTGTCTAGCAGTATTGAAGGAGGTACCAAGTGGT
TGGTCAAAACTCAAAGGAAAATGCAGAAGCCATTGCCTGAGCTGCTGAAGGAGTTTGGTT
TACCTGTTGGGATCTTTCCACAGGACGCCACAAACTATGAGTTCAACGAAGAGACGGGTA
AGTTGACTGTCTTCATCCCTGAGACCTGCGAGGTTGGGTACAGGGACTCATCGGTCCTGC
GGTTTTCAACCACGGTAACTGGTTACCTGGAGAAAGGGAAGCTAGCTGAAGTGGAAGGCT
TGAAAACAAAGGTGATGATTTGGGTGAAAGTGAGTTGTATCTCAGCAGATGCGTCAAAGG
TATATTTCACAGCTGGGATGAAGAAAAGCAGGAGCAGAGATGCTTATGAGGTTATACGGC
CCGGTGTTACTGTTGATAAATTCTAACTTATGGATGCTTTGCCAAGTTGTTTTTTGTATG
TATGTATGTATGTATGTTTTTTAACTCCTTGTGTCAAAAGTAAGCTCTGATGAAGCAAAC
CTTTA

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL8980Contig1 593 2 1 U
GTACATTATGGAGAATGGGATGGACGAGATCGACAACGGAACCAAGACTTTAGCCGAAGC
CACAAACGACTACGGGAGAAAAGAATTTATCAAGAGTCACATCTTGATCATGGGTAAAGC
CATCAGGCTGCACAATGTGAGGTTAAAGGGCTACTACATATGGTCGTTAATGGACAACTT
CGAGTGGGAGAGAGGGTACAAAATGAGGTTTGGACTCTATTATGTAGATTTCAATGATAA
CTTGAAACGACACATGAGGTCATCTGGAAAATGGCTAAGCGAGTTTCTTGATCCGAAAGA
GTCTCTCCACAAATGCTACTTCGAAGGCCATCGTGAGAAAGGTTATGCTCCCAAGCTGTT
CGATACTGAGTATTTGGATCCTGATAACTGGCGTCTAAGCTACGCAAGCGACATCTAAAG
AAATTGTGAGAGTATAATCATCCGGTCCACGCTTTCCGGTTAACTTATATGTATAACTAG
TGTGATGAATAAAAAGCTGAGATGGTCAATATCTATGTTTTTTCTATGTCGTGTATTTGT
GTGGCCAGTCTAGTCTGTATACACGTGCTAAAATAATAAAAAAACTATTACGC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DR81JQ C 1
AF RS1DR81TF U 1
BS 1 593 RS1DR81TF

RD RS1DR81JQ 593 0 0
GTACATTATGGAGAATGGGATGGACGAGATCGACAACGGAACCAAGACTTTAGCCGAAGC
CACAAACGACTACGGGAGAAAAGAATTTATCAAGAGTCACATCTTGATCATGGGTAAAGC
CATCAGGCTGCACAATGTGAGGTTAAAGGGCTACTACATATGGTCGTTAATGGACAACTT
CGAGTGGGAGAGAGGGTACAAAATGAGGTTTGGACTCTATTATGTAGATTTCAATGATAA
CTTGAAACGACACATGAGGTCATCTGGAAAATGGCTAAGCGAGTTTCTTGATCCGAAAGA
GTCTCTCCACAAATGCTACTTCGAAGGCCATCGTGAGAAAGGTTATGCTCCCAAGCTGTT
CGATACTGAGTATTTGGATCCTGATAACTGGCGTTTAAGCTACGCAAGCGACATCTAAAG
AAATTGTGAGAGTATAATCATCCGGTCCACGCTTTCCGGTTAACTTATATGTATAACTAG
TGTGATGAATAAAAAGCTGAGATGGTCAATATCTATGTTTTTTCTATGTCGTGTATTTGT
GTGGCCAGTTTAGTCTGTATACACGTGCTAAAATAATAAAAAAACTATTACGC

QA 1 593 1 593
DS 

RD RS1DR81TF 593 0 0
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CACAAACGACTACGGGAGAAAAGAATTTATCAAGAGTCACATCTTGATCATGGGTAAAGC
CATCAGGCTGCACAATGTGAGGTTAAAGGGCTACTACATATGGTCGTTAATGGACAACTT
CGAGTGGGAGAGAGGGTACAAAATGAGGTTTGGACTCTATTATGTAGATTTCAATGATAA
CTTGAAACGACACATGAGGTCATCTGGAAAATGGCTAAGCGAGTTTCTTGATCCGAAAGA
GTCTCTCCACAAATGCTACTTCGAAGGCCATCGTGAGAAAGGTTATGCTCCCAAGCTGTT
CGATACTGAGTATTTGGATCCTGATAACTGGCGTCTAAGCTACGCAAGCGACATCTAAAG
AAATTGTGAGAGTATAATCATCCGGTCCACGCTTTCCGGTTAACTTATATGTATAACTAG
TGTGATGAATAAAAAGCTGAGATGGTCAATATCTATGTTTTTTCTATGTCGTGTATTTGT
GTGGCCAGTCTAGTCTGTATACACGTGCTAAAATAATAAAAAAACTATTACGC

QA 1 593 1 593
DS 



AS 1 2

CO CL8981Contig1 476 2 1 U
GGGTCACAGATCTGTCGTTTATCTCTCTTTCTTCTATGTCTCAGATCTCACCGATTAAAC
GATCTGTATTTTCTTTCTCACAACCATCGTTCTATCTCTTCAGCATCGACATCTCAGATT
AATCAATTTCTTTTTGTTTCTCACAGATCTGAAAAAATGAAACAGAAGTGATGAAACGGA
AGGAGAAGTGGTAGTGTGATGTGCATAACAAATCGGAGGCACGAAACAGAAGCATGACAA
AGGACTTCTTCAGGTATAGCCATCGCTTCAGTAACTAAGCTGGTGGCGTAGTGTGGAAGT
GCCAGTGGCGGAGCATGGAAGATCTGGCAAAAGTGCGTGGAGGAGCCGGTGACGGAGCGT
GGAGGAGCGGCGTGTGTGGAGCGCGTGATACATCCCTAATATGTATATATATGTAACATA
TGTATAAACCATATTTGTATTTTAGTTTTGATAAATTAACTAGAAAATATTTTGCG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1E890JQ C 1
AF RS1E890TF U 1
BS 1 476 RS1E890TF

RD RS1E890JQ 476 0 0
GGGTCACAGATCTGTCGTTTATCTCTCTTTCTTCTATGTCTCAGATCTCACCGATTAAAC
GATCTGTATTTTCTTTCTCACAACCATCGTTCTATCTCTTCAGCATCGACATCTCAGATT
AATCAATTTCTTTTTGTTTCTCACAGATCTGAAAAAATGAAACAGAAGTGATGAAACGGA
AGGAGAAGTGGTAGTGTGATGTGCATAACAAATCGGAGGCACGAAACAGAAGCATGACAA
AGGACTTCTTCAGGTATAGCCATCGCTTCAGTAACTAAGCTGGTGGCGTAGTGTGGAAGT
GCCAGTGGCGGAGCATGGAAGATCTGGCAAAAGTGCGTGGAGGAGCCGGTGACGGAGCGT
GGAGGAGCGGCGTGTGTGGAGCGCGTGATACATCCCTAATATGTATATATATGTAACATA
TGTATAAACCATATTTGTATTTTAGTTTTGATAAATTAACTAGAAAATATTTTGCG

QA 1 476 1 476
DS 

RD RS1E890TF 476 0 0
GGGTCACAGATCTGTCGTTTATCTCTCTTTCTTCTATGTCTCAGATCTCACCGATTAAAC
GATCTGTATTTTCTTTCTCACAACCATCGTTCTATCTCTTCAGCATCGACATCTCAGATT
AATCAATTTCTTTTTGTTTCTCACAGATCTGAAAAAATGAAACAGAAGTGATGAAACGGA
AGGAGAAGTGGTAGTGTGATGTGCATAACAAATCGGAGGCACGAAACAGAAGCATGACAA
AGGACTTCTTCAGGTATAGCCATCGCTTCAGTAACTAAGCTGGTGGCGTAGTGTGGAAGT
GCCAGTGGCGGAGCATGGAAGATCTGGCAAAAGTGCGTGGAGGAGCCGGTGACGGAGCGT
GGAGGAGCGGCGTGTGTGGAGCGCGTGATACATCCCTAATATGTATATATATGTAACATA
TGTATAAACCATATTTGTATTTTAGTTTTGATAAATTAACTAGAAAATATTTTGCG

QA 1 476 1 476
DS 



AS 1 2

CO CL8982Contig1 898 2 18 U
GGGTCTCCGATCTCTTTATACATGAACATGGGACAAAAGAGATGGATGTTCTTCCTGGCA
ATTTTTGCTGTTCTTCTGTCCTTCTCAAGTGGAAGAGTTCTCAAGTTGAAGAGCGATGAT
GGTCAACATGTTTACAACCATACGCTTACTCTAACACTTGTGGAGTACGCTTCTGCGGTC
TATGTGTCTGATTTGACAGGATCACACATGAGCATGATATGGTTCCTCATTTGCCTCCTT
TCTATAATATTTTTCCTCAAAAAACATACCACACTTCCCAACAGAGGTGTGGGTGAGAGA
TCTCGGTTATTCGAATCTTGTCCTTGCTAGTGTGGAGAAAGTTTGTGACAACACCGGTGA
GGATCCTACATGCAGCAGATCGGTGGTGGGGAATAGCATTTCAGGCCACTTAAAGTACTT
CGGGATAGACCTGAGGTGTGCGACGTGGAGACAGTGCACGATAGTGATGAGCCCTGAGAT
GGATAGATACAGCAGGAAAGATTCAAAGGGTAACCTAGTAATGTCACGGACACTTCCTTC
CACGAATGTTAACGAGACAAATACTCTCCTCGAAAATGGGACTGTTTGAGTCTAAGAGGT
GTCGGTGGACTTTAAGTCAAAAGCTTTGAAAGGGAAGGTGCATATGTGGAGAAAGAAGAA
TGGGTCGTTGATTCTTTGTGGGCTCCGGTAAGAAAGAAAGGAAGAAAGTGGGGAAGAAAG
TGTGTAGATAATAACAAAAGACTTCTGTAAATAAGTCGTAGGTTAAACAGCGCATGTATA
GTTGGAACTTGTAACTAAGTCATAGGTTTAAATTTCTGTTCACATTCCAATTATGTAAAA
ATGTATATGGATATTGTGACATCTGGCTGATAACTGTATAGTTTTGATGTGATCACTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DW26TF U 1
AF RS1DW26JQ C 150
BS 1 636 RS1DW26TF
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BS 766 786 RS1DW26TF
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RD RS1DW26TF 799 0 0
GGGTCTCCGATCTCTTTATACATGAACATGGGACAAAAGAGATGGATGTTCTTCCTGGCA
ATTTTTGCTGTTCTTCTGTCCTTCTCAAGTGGAAGAGTTCTCAAGTTGAAGAGCGATGAT
GGTCAACATGTTTACAACCATACGCTTACTCTAACACTTGTGGAGTACGCTTCTGCGGTC
TATGTGTCTGATTTGACAGGATCACACATGAGCATGATATGGTTCCTCATTTGCCTCCTT
TCTATAATATTTTTCCTCAAAAAACATACCACACTTCCCAACAGAGGTGTGGGTGAGAGA
TCTCGGTTATTCGAATCTTGTCCTTGCTAGTGTGGAGAAAGTTTGTGACAACACCGGTGA
GGATCCTACATGCAGCAGATCGGTGGTGGGGAATAGCATTTCAGGCCACTTAAAGTACTT
CGGGATAGACCTGAGGTGTGCGACGTGGAGACAGTGCACGATAGTGATGAGCCCTGAGAT
GGATAGATACAGCAGGAAAGATTCAAAGGGTAACCTAGTAATGTCACGGACACTTCCTTC
CACGAATGTTAACGAGACAAATACTCTCCTCGAAAATGGGACTGTTTGAGTCTAAGAGGT
GTCGGTGGACTTTAAGTCAAAAGCTTTGAAAGGGAATGTGCATATGTGGAGAAAGAAGAA
TGGGTCGTTGATTCTTTGTGGGCTCCGGTAAGAAAGAAAGGA*GAAAGTGGGGAAGAA*G
TGTGTAGATA*TAACAAA*GACTTCTGTAA*TAAGTCGTAGTT**AACAGCGCATGTATA
GTTGGA
CTTGTACTAAGTC

QA 1 786 1 786
DS 

RD RS1DW26JQ 749 0 0
TCTAACACTTGTGGAGTACGCTTCTGCGGTCTATGTGTCTGATTTGACAGGATCACACAT
GAGCATGATATGGTTCCTCATTTGCCTCCTTTCTATAATATTTTTCCTCAAAAAACATAC
CACACTTCCCAACAGAGGTGTGGGTGAGAGATCTCGGTTATTCGAATCTTGTCCTTGCTA
GTGTGGAGAAAGTTTGTGACAACACCGGTGAGGATCCTACATGCAGCAGATCGGTGGTGG
GGAATAGCATTTCAGGCCACTTAAAGTACTTCGGGATAGACCTGAGGTGTGCGACGTGGA
GACAGTGCACGATAGTGATGAGCCCTGAGATGGATAGATACAGCAGGAAAGATTCAAAGG
GTAACCTAGTAATGTCACGGACACTTCCTTCCACGAATGTTAACGAGACAAATACTCTCC
TCGAAAATGGGACTGTTTGAGTTTAAGAGGTGTCGGTGGACTTTAAGTCAAAAGCTTTGA
AAGGGAAGGTGCATATGTGGAGAAAGAAGAATGGGTCGTTGATTCTTTGTGGGCTCCGGT
AAGAAAGAAAGGAAGAAAGTGGGGAAGAAAGTGTGTAGATAATAACAAAAGACTTCTGTA
AATAAGTCGTAGGTTAAACAGCGCATGTATAGTTGGAACTTGTAACTAAGTCATAGGTTT
AAATTTCTGTTCACATTCCAATTATGTAAAAATGTATATGGATATTGTGACATCTGGCTG
ATAACTGTATAGTTTTGATGTGATCACTT

QA 1 749 1 749
DS 



AS 1 2

CO CL8983Contig1 773 2 2 U
GGAGAGACATTACTTCTCAACTCTCCGATATTTTCTCCAAAGAGAAATCTAAATTTGCAG
TTCCTTTTCACTAGTTCTCGATGCTTTAGAATTGAAGAGTGAGAGAGAGATAGATAGATC
GTTGGAGACGCGGCTGTGACTGAAACAGAGGAGAGATCCGAAAAATGGAAGCTGGAGGAT
CCAACGTTAGATCTAGCTACTACAACGTCCTCGGTATTCGGAAAGATGCCTCTTTTCCGA
TGTCCGCGCTGCTTACCGTAAGCTCGCCATGAAATGGCATCCGGATAGATACGCGAGGAA
TCCTGGTGTCGCCGGAGAAGCCAAACGTCGATTTCAGCAAATCCAAGAAGCCTATTCTGT
TTTGAATGACGAGAATAAGCGCTCGATGTATGACGCTGGACTCTACGATCCCCACGAAGA
TGACGACGATGACTTCTGCGACTTCATGCAAGTGATGATCTCAATGATGAACAATGTCAA
AGGCGAGGGAGATAGCTTGGAGGACTTGCAACGGATGTTCACGGATTTGGTTGGTGGAGA
TGGCGTGATCTTTGACTGTAACAACAATCCAAGGGACAGCAAAAGACCACGTGTTAATAT
CTCACGGAGTAGTGCTGCGATGCGTTAGCGCTCTTGTTCTCTTTTGTGTTTGTGTCGTGT
CGTTTCGCGTTGAACTGTCTCATGCTAAGAAGTCTCAATTGTCATTTCGTGTTTTATTTT
CTAGTGTCAATTCTGAAGGCTATAAAATAAAATATATCTGAAGTCTAACTAGG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1EA09TF U 1
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BS 1 729 RS1EA09TF
BS 730 773 RS1EA09JQ

RD RS1EA09TF 731 0 0
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GTTGGAGACGCGGCTGTGACTGAAACAGAGGAGAGATCCGAAAAATGGAAGCTGGAGGAT
CCAACGTTAGATCTAGCTACTACAACGTCCTCGGTATTCGGAAAGATGCCTCTTTTCCGA
TGTCCGCGCTGCTTACCGTAAGCTCGCCATGAAATGGCATCCGGATAGATACGCGAGGAA
TCCTGGTGTCGCCGGAGAAGCCAAACGTCGATTTCAGCAAATCCAAGAAGCCTATTCTGT
TTTGAATGACGAGAATAAGCGCTCGATGTATGACGCTGGACTCTACGATCCCCACGAAGA
TGACGACGATGACTTCTGCGACTTCATGCAAGTGATGATCTCAATGATGAACAATGTCAA
AGGCGAGGGAGATAGCTTGGAGGACTTGCAACGGATGTTCACGGATTTGGTTGGTGGAGA
TGGCGTGATCTTTGACTGTAACAACAATCCAAGGGACAGCAAAAGACCACGTGTTAATAT
CTCACGGAGTAGTGCTGCGATGCGTTAGCGCTCTTGTTCTCTTTTGTGTTTGTGTCGTGT
CGTTTCGCGTTGAACTGTCTCATGCTAAGAAGTCTCAATTGTCATTTCGTGTTTTATTTT
CTAGTGTCA
TT

QA 1 729 1 729
DS 

RD RS1EA09JQ 647 0 0
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TTAGATCTAGCTACTACAACGTCCTCGGTATTCGGAAAGATGCCTCTTTTCCGATGTCCG
CGCTGCTTACCGTAAGCTCGCCATGAAATGGCATCCGGATAGATACGCGAGGAATCCTGG
TGTCGCCGGAGAAGCCAAACGTCGATTTCAGCAAATCCAAGAAGCCTATTCTGTTTTGAA
TGACGAGAATAAGCGCTCGATGTATGACGCTGGACTCTACGATCCCCACGAAGATGACGA
CGATGACTTCTGCGACTTCATGCAAGTGATGATCTCAATGATGAACAATGTCAAAGGCGA
GGGAGATAGCTTGGAGGACTTGCAACGGATGTTCACGGATTTGGTTGGTGGAGATGGCGT
GATCTTTGACTGTAACAACAATCCAAGGGACAGCAAAAGACCACGTGTTAATATCTCACG
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GCGTTGAACTGTCTCATGCTAAGAAGTCTCAATTGTCATTTCGTGTTTTATTTTCTAGTG
TCAATTCTGAAGGCTATAAAATAAAATATATCTGAAGTCTAACTAGG

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 2

CO CL8984Contig1 609 2 3 U
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TCTCTTTCGGAGGCTCCTCGACGAAACGGAATCAGACCTCTCTCTCGGTGTTGCAGCTGT
TGCACTTGCACGAAAGTGGATGAAGAAAGTGTTGCAGCTGCGATGATTTTGTCACCACTG
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CCACACACTTCGGAAAGTCCAGAGTTCAGGTTGCAGATTGTGATAGGAGAGAGTATACAG
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CTGTTAAGGACAATGGAGAAGATGATGACGATGGTGATGGAGAGTCTGTGTTGTATCTAA
AAGACTGGCACTTTGTCAAGGAGTATCCAGACTATACAGCCTACAAGACGGCACAATTGT
TTTCTGATGATTGGTGTAATATGTATTTAGACCTATTACCAAATGCATGAAGATAGAGAG
AGTTTCCAG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AB16JQ C 1
AF RS1AB16TF U 1
BS 1 573 RS1AB16TF
BS 574 574 RS1AB16JQ
BS 575 609 RS1AB16TF

RD RS1AB16JQ 609 0 0
GCTTCTGTTTTTTTTCCAGCGACTCTCTCTCTCCCTGGCCCTCGACTGCTGGTGATTCTT
TCTCTTTCGGAGGCTCCTCGACGAAACGGAATCAGACCTCTCTCTCGGTGTTGCAGCTGT
TGCACTTGCACGAAAGTGGATGAAGAAAGTGTTGCAGCTGCGATGATTTTGTCACCACTG
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CCACACACTTCGGAAAGTCCAGAGTTCAGGTTGCAGATTGTGATAGGAGAGAGTATACAG
ATCAGAAGAGATTAGAAATGTCTGTTTTGTAGTTTGTTGAGCAATGGGCTAATAAGGATT
CTGTTAAGGACAATGGAGAAGATGATGACGATGGTGATGGAGAGTCTGTGTTGTATCTAA
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TTTCTGATGATTGGTGTAATATGTATTTAGACCTATTACCAAATGCATGAAGATAGAGAG
AGTTTCCAG

QA 1 609 1 609
DS 

RD RS1AB16TF 609 0 0
GCTTCTGTTTTTTTTCCAGCGACTCTCTCTCTCCCTGGCCCTCGACTGCTGGTGATTCTT
TCTCTTTCGGAGGCTCCTCGACGAAACGGAATCAGACCTCTCTCTCGGTGTTGCAGCTGT
TGCACTTGCACGAAAGTGGATGAAGAAAGTGTTGCAGCTGCGATGATTTTGTCACCACTG
AGAGTCTTCAGAGCTGTAAAGATGAGCTTGCTTCATGTCAAAGTGAGCTTCTTACCGAAG
ATTGGCGAGCTAGAGAAGATTGGGTCGCTGAGAATGGACTCCCTAATCTCAATTTCTTCG
CCACACACTTCGGAAAGTCCAGAGTTCAGGTTGCAGATTGTGATAGGAGAGAGTATACAG
ATCAGAAGAGATTAGAAATGTCTGTTTTGTAGTTTGTTGAGCAATGGGCTAATAAGGATT
CTGTTAAGGACAATGGAGAAGATGATGACGATGGTGATGGAGAGTCTGTGTTGTATCTAA
AAGACTGGCACTTTGTCAAGGAGTATCCAGACTATACAGCCTACAAGACGGCACAATTGT
TTTCTGATGATTGGTGTAATATGTATTTAGACC*ATTACCAAATGCATGAAGATAGAGAG
AGTTTCCAG

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 2

CO CL8985Contig1 384 2 4 U
GGTGACAAAGATAAGAGCTCTCGAGACGCGGAAAACATAGAGAGAAGAAACACGCATACC
TCAAAAGCGCAATACACAAAAAGAAAAAGTACATCTTTAGTTTTCTCCTACAAATTAAAC
ACAATATGGTGTCTCAAAAGCGGGAGATCTGCATCGAGTTAGTGAAGACTGCCGTCTCTT
TTGTAGCCACCGTGGCTGAAACAGTGGAAGAAGCTTTCCGTAAGCCTCCACCGGCGCTTC
CGGTAGCTCATGATGGTCGCCGGAACAGTTACGCCGACGTTCCCATTCCTCTTGTTGGAT
TCATGTGATGAGCTTTTTGTGTTTGTTAAACTTTTATTCTTTAGTTTTGGCCTCGTTTGG
CTCTCGTGCCATGAGGCGTTTTGG


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DU60TF U 1
AF RS1DU60JQ C 1
BS 1 218 RS1DU60TF
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BS 324 384 RS1DU60JQ

RD RS1DU60TF 323 0 0
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ACAATATGGTGTCTCAAAAGCGGGAGATCTGCATCGAGTTAGTGAAGACTGCCGTCTCTT
TTGTAGCCACCGTGGCTGAAACAGTGGAAGAAGCTTTCGGTAAGCCTCCACCGGCGCTTC
CGGTAGCTCATGATGGTCGCCGGAACAGTTACGCCGACGTTCCCATTCCTCTTGTTGGAT
TCATGTGATGAGCTTTTTGTGTT

QA 1 323 1 323
DS 

RD RS1DU60JQ 384 0 0
GGTGACAAAGATAAGAGCTCTCGAGACGCGGAAAACATAGAGAGAAGAAACACGCATACC
TCAAAAGCGCAATACACAAAAAGAAAAAGTACATCTTTAGTTTTCTCCTACAAATTAAAC
ACAATATGGTGTCTCAAAAGCTGGAGATCTGCATCGAGTTAGTGAAGACTGCCGTCTCTT
TTGTAGCCACCGTGGCTGAAACAGTGGAAGAAGCTTTCCGTAAGCCTCCACCGGCGCTTC
CGGTAGCTCATGATGGTCGCCGGAACAGTTACGCCGACGTTCCCATTCCTCTTGTTGGAT
TCATGTGATGAGCTTTTTGTGTTTGTTAAACTTTTATTCTTTAGTTTTGGCCTCGTTTGG
CTCTCGTGCCATGAGGCGTTTTGG

QA 1 384 1 384
DS 



AS 1 2

CO CL8986Contig1 665 2 2 U
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CCTCCTCCTCAATCATCCTTCTTACGTTCCAGCCGATCCAAAGTATTGTATCAGTTTAAG
CAGCAGAAACTACCGGCTTGTAAGCCAGTCTTAACTCCAACCTCGGTTATAACAGTGTTT
ATGTTGATGGGTTTTGTTTTCATTCCCATTGGCTTTGTTACTCTCCATGCTTCTCGTCAT
GCTATTGAAATTGTTGACCGGTATGATGTTGAGTGTATTCCTGAAGAATATAGACCCAAC
AAACTCTCTTACATTACAGACTCATCCATCTCTAAGTGACCAAGAGGACTTTATTGTGTG
GATGCGAGCAGCTGCTCTACTAAGCTTCAGGAAACTATACGGAAGAATCGAAGAGGACTT
GGAACCAGGGAGCGTTGTTGTGGTGAATTTGTTCAACAACTACAACACTTATAGCTTTAG
TGGGCAGAAGAAGCTTATTCTCTCCACGTCGAGTTGGTTAGGAGGAAGAAACGACTTCCT
CGGCATCACATATATCGTCGTTGGTGCCTCTTCCATAGTCATATCCATCATCTTCATATT
GCTCCATTTAAAAAATCCGAGGCCTTATGGAGACAATTCTTGGAACAAGAAAAGCCTTTC
GAGCG


BQ
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AF RS1H340TF U 1
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CCTCCTCCTCAATCATCCTTCTTACGTTCCAGCCGATCCAAAGTATTGTATCAGTTTAAG
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ATGTTGATGGGTTTTGTTTTCATTCCCATTGGCTTTGTTACTCTCCATGCTTCTCGTCAT
GCTATTGAAATTGTTGACCGGTATGATGTTGAGTGTATTCCTGAAGAATATAGACCCAAC
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GAGCG

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DS 



AS 1 2

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BQ
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TTGGTAAGCCAGTATTGTAATGTTTTTTTGTGTATAAACAAAATACCTTTTCAAGTGCG

QA 1 719 1 719
DS 



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BQ
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AF RS1FR68JQ U 1
AF RS1BL07JQ U 132
BS 1 405 RS1FR68JQ
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TCCGACCATTCTGCTTCCCTTCAATCCTCACTCTACTCTCGCTCTTCCTCACATCGAACT
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CGCGAATCTCATCTCTCTCTTCTCCTCTTTCTTCTTCTCCTCGAACAACGGCGAGAGATC
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TGCCTCTCCTACAACGCCTGGCTCGTTCTTGGACCTAGCTGAGTGTTTCTTGAACCAAGC
GGAGTCCATAACCTTATCGATGGTGATTCGGGTA

QA 1 754 1 754
DS 

RD RS1BL07JQ 767 0 0
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CACGAACCGAATCTAGAATCCAACAATACTTTTTTTTTCAGACAGGAACATAAACACGCA
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CTGCAAAAGTTATTGTACTCAAGTGTGTCACCATGATCTTTCTTCACCTCCACGACAACA
AACGACGGAGCCACCGCGAATATCTCCGCCTCCAACGCCAACTTCCCTTTCCGACCATTC
TGCTTCCCTTCAATCCTCACTCTACTCTCGCTCTTCCTCACATCGAACTTATCCCAACTC
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QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1E623TF U 1
AF RS1EP46TF U 1
BS 1 603 RS1E623TF
BS 604 691 RS1EP46TF

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TATTTGGATGGACAAGAGGAACTCAGGAGTTTTTGATTTTTCTGAAGTTAAAGAAGTGAA
ACATAAAGTAGAAGAAGAAGACAAACATGGAGATTATTATGAACCGGATCTACTCTACCT
TGTACATTCTTGCTTACTTCTTCACCAGTAAGCTTGACGGTGGATTTGTGCTATGTGCTG
ATT

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CCTCTGCTTCGTAGATCCTCTGTGTTCGAGCTCCATCGCCGCTTGTACCGGGGTTTCATT
CGAGCGAGAAGAAAAGGAAGAAGATGGATTTGGTCCACAGACACGGGAAGAGACAACCTG
CCTCTTGAGCTTCCAATCTAAGGAGACATAGGAGATGGAGACAGAGAGAAGCAGAAGTAG
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TATTTGGATGGACAAGAGGAACTCAGGAGTTTTTGATTTTTCTGAAGTTAAAGAAGTGAA
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QA 1 691 1 691
DS 



AS 1 2

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BQ
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DS 



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BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

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ACATCT

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DS 



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TATC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 

AF RS1GA08JQ C 1
AF RS1GA08TF U 1
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QA 1 604 1 604
DS 

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TATC

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 2

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AAGACAAGGATAACGATGATGATGGTTACAATAGCGATTAAGTCTCTTAAAGCTTCTCTG
TTTGTCTCTGTTGGTTATGTTTGTTGCCTTTGTGACTGGTAAACAAGAGTGCTGTCTCTA
TTTGTGTTGTACTGCTTTTCCACAACTATTTCATTCTCAAATTTCAAATCCATTCATTGA
AATCTCAAATTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F122TF U 1
AF RS1F122JQ C 155
BS 1 634 RS1F122TF
BS 635 635 RS1F122JQ
BS 636 698 RS1F122TF
BS 699 699 RS1F122JQ
BS 700 746 RS1F122TF
BS 747 747 RS1F122JQ
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BS 762 776 RS1F122TF
BS 777 972 RS1F122JQ

RD RS1F122TF 778 0 0
GGGCGATCACAGGTGCAAAAGGCTAACGGAGAACATCTGAAGCTTTTACGATGGCTGATT
ATCACTTCGTCTACAAGGACGTGGAGGGAACGTCGACGCAATGGGACGATATCCAACGGA
AGCTAGGGAATCTCCCGGAGAAGGCTCCGGCGTTCAAACCGCCGGCTTACACTCCGGCAC
ATGACGAGGCTTCAGCTCCAAAGGACAAAGCTTGGTTCGATGGGAAAACAGAGGAGGAGC
TTGAGGATCTCGAGGACAACAAAGATCTCGACGACGATCGCTTCCTCGAAGAATACAGGA
AGAAGAGGTTGACTGAGCTGAGAGAAGCTGCTAAAGTTAGGAGGTATGGATCAGTGACTC
CCATCTCTAGCTCTGATTTCGTGAGGGAGGTTACGCAAGCTTCTGCTGAAGTTTGGGTTG
TTGTGTGTCTCTACAAAGATGGTTTTGCAGAGTGTGGATTGTTACTGGGTTGTCTAGAGG
AACTGGCTGGCAGATACCCGGGAACGAAGTTTGTTAAGATTGTATCAACTGATTGTATTC
CCAACTACCCTGATTGCAATCTCCCTACCTTGCTTGTGTACCATCATGGTGCTGTTAAAG
GAACTCATGTTGGCTTGAAGAGCGTTGGCCGTAG*TGCACCCCTGAGAGTGTAGCCTTAG
TTTTGTGTCAGTCAGAGCCAGTTCTTAACGATGGCAAA*GTGGAGACGATGACTCCTCAA
GGGAAGCTGTGATGGCTGGCGTCCGA*GACAGTTCATAGA*CGAGTGGTCATAGAC
AT

QA 1 776 1 776
DS 

RD RS1F122JQ 818 0 0
CAAACCGCCGGCTTACACTCCGGCACATGACGAGGCTTCAGCTCCAAAGGACAAAGCTTG
GTTCGATGGGAAAACAGAGGAGGAGCTTGAGGATCTCGAGGACAACAAAGATCTCGACGA
CGATCGCTTCCTCGAAGAATACAGGAAGAAGAGGTTGACTGAGCTGAGAGAAGCTGCTAA
AGTTAGGAGGTATGGATCAGTGACTCCCATCTCTAGCTCTGATTTCGTGAGGGAGGTTAC
GCAAGCTTCTGCTGAAGTTTGGGTTGTTGTGTGTCTCTACAAAGATGGTTTTGCAGAGTG
TGGATTGTTACTGGGTTGTCTAGAGGAACTGGCTGGCAGATACCCGGGAACGAAGTTTGT
TAAGATTGTATCAACTGATTGTATTCCCAACTACCCTGATTGCAATCTCCCTACCTTGCT
TGTGTACCATCATGGTGCTGTTAAAGGAACTCATGTTGGCTTGAAGAGCGTTGGCCGTAG
GTGCACCCCTGAGAGTGTAGCCTTAGTTTTGTGTCAGTCAGAGCCAGTTCTTAACGATGG
CAAAAGTGGAGACGATGACTCCTCAAGGGAAGCTGTGATGGCTGGCGTCCGAAGACAGTT
CATAGAACGAGTGGTCATAGACCATGAAGACAAGGATAACGATGATGATGGTTACAATAG
CGATTAAGTCTCTTAAAGCTTCTCTGTTTGTCTCTGTTGGTTATGTTTGTTGCCTTTGTG
ACTGGTAAACAAGAGTGCTGTCTCTATTTGTGTTGTACTGCTTTTCCACAACTATTTCAT
TCTCAAATTTCAAATCCATTCATTGAAATCTCAAATTT

QA 1 818 1 818
DS 



AS 1 2

CO CL8994Contig1 713 2 2 U
GGATAGACATTTTGCATTAGGGTTTTGCCTCTTGGCTGCTGCAGGTAAAGCACCGAATCT
TTCAACCCCAACCATGGCGACTCAACAAGCTAAAGCATCCGTGCAATGCTTCGGAAGGAA
GAAGGGCCGTCGCCGTCACCCACTGCAAACGCGGATGCGGCCTGATCAAGCTCAACGGCT
CTCCGATCGAGCTATTCAACCCAGAGATCCTCCGGTTCAAGATCTTCGAGCCTGTCTTTC
TCCTCGGGAAGCACCGTTTCGCGGGCGTCGACATGAGGATCAGTGTCAACGGTGGTGGTC
ACACTTCCCAGGTCTACGCGTTTCGTCAGAGCATTGCTAAGGCGCTTGTGGCGTTCTACC
AGAAGTATGTTGATGAGCAGTCGAAGAAGGAGGTCAAGGACATTCTGATCCGTTACGATA
GGACTCTGTTCGTGGCGGATCCGAGGAGGTGCGAGCCGAAGAAGTTTGGTGGTCGTGGCG
CTCGTTCGCGTTTCCAGAAGAGTTACCGTTAAGCGAATCTGGTTTGTGTTTACTTTCTTA
TCTCAACCGTTTTGAGAAATGAGTTGTTGGAGTATCATCTTTTGAGTTTTGTCTTTATGG
TTATTATGGATAATGTTTTGACAATGTCTTGATCGTTTACTTTTGAAGAACTTCTCAAGT
TTTGAATTTTGAATCTCTTATATGTTCTGTCTGGTTTATGGAGCATAAGCTTC


BQ
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AF RS1EF24TF U 1
AF RS1EF24JQ C 1
BS 1 604 RS1EF24TF
BS 605 713 RS1EF24JQ

RD RS1EF24TF 604 0 0
GGATAGACATTTTGCATTAGGGTTTTGCCTCTTGGCTGCTGCAGGTAAAGCACCGAATCT
TTCAACCCCAACCATGGCGACTCAACAAGCTAAAGCATCCGTGCAATGCTTCGGAAGGAA
GAAGGGCCGTCGCCGTCACCCACTGCAAACGCGGATGCGGCCTGATCAAGCTCAACGGCT
CTCCGATCGAGCTATTCAACCCAGAGATCCTCCGGTTCAAGATCTTCGAGCCTGTCTTTC
TCCTCGGGAAGCACCGTTTCGCGGGCGTCGACATGAGGATCAGTGTCAACGGTGGTGGTC
ACACTTCCCAGGTCTACGCGTTTCGTCAGAGCATTGCTAAGGCGCTTGTGGCGTTCTACC
AGAAGTATGTTGATGAGCAGTCGAAGAAGGAGGTCAAGGACATTCTGATCCGTTACGATA
GGACTCTGTTCGTGGCGGATCCGAGGAGGTGCGAGCCGAAGAAGTTTGGTGGTCGTGGCG
CTCGTTCGCGTTTCCAGAAGAGTTACCGTTAAGCGAATCTGGTTTGTGTTTACTTTCTTA
TCTCAACCGTTTTGAGAAATGAGTTGTTGGAGTATCATCTTTTGAGTTTTGTCTTTATGG
TTAT

QA 1 604 1 604
DS 

RD RS1EF24JQ 713 0 0
GGATAGACATTTTGCATTAGGGTTTTGCCTCTTGGCTGCTGCAGGTAAAGCACCGAATCT
TTCAACCCCAACCATGGCGACTCAACAAGCTAAAGCATCCGTGCAATGCTTCGGAAGGAA
GAAGGGCCGTCGCCGTCACCCACTGCAAACGCGGATGCGGCCTGATCAAGCTCAACGGCT
CTCCGATCGAGCTATTCAACCCAGAGATCCTCCGGTTCAAGATCTTCGAGCCTGTCTTTC
TCCTCGGGAAGCACCGTTTCGCGGGCGTCGACATGAGGATCAGTGTCAACGGTGGTGGTC
ACACTTCCCAGGTCTACGCGTTTCGTCAGAGCATTGCTAAGGCGCTTGTGGCGTTCTACC
AGAAGTATGTTGATGAGCAGTCGAAGAAGGAGGTCAAGGACATTCTGATCCGTTACGATA
GGACTCTGTTCGTGGCGGATCCGAGGAGGTGCGAGCCGAAGAAGTTTGGTGGTCGTGGCG
CTCGTTCGCGTTTCCAGAAGAGTTACCGTTAAGCGAATCTGGTTTGTGTTTACTTTCTTA
TCTCAACCGTTTTGAGAAATGAGTTGTTGGAGTATCATCTTTTGAGTTTTGTCTTTATGG
TTATTATGGATAATGTTTTGACAATGTCTTGATCGTTTACTTTTGAAGAACTTCTCAAGT
TTTGAATTTTGAATCTCTTATATGTTCTGTCTGGTTTATGGAGCATAAGCTTC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

CO CL8995Contig1 963 2 2 U
GATTATGGATCCTCTCTCCCTCTTTTCTCTCTCAAGCTTTCTTCTTCTTCTTCCTCATAA
AAGAGAAGACATAAGCCAAAATCAAATCAACAAAAGAAAATACAAATGACGATTAGGAAT
ACGTTGATCTGGAGAAATCTTCTTTTCTGGTCCATCGCACACACGTTGATTCCAGGATCT
GTTAGATCACAATCCATCACACTGGACTCCATAGAGATATTCACGAAGCATGACTGGTTT
AAACTCAAGCACACGGTCTACTTTCAATGCAAAGGAGAGAACAAGACAGTTCTTCCTGAT
GTTACCAAAGCCGGTATCGTGTATACTTTTCGCGGTCAAGAATCATGGCAGCCAATGACA
GAGATCAGTGGGGAAAAGTGTAAGCGATGCGGAATCTATGAGCAAGGCAGTCTGATATCA
GACAAAGAGTTTGATGAATGGGAGCTTTGTCCTTCAGATTTCTCTGCTAGCCAAATCTAT
ATGCACTTTAAAGAAAAAGAGATCAATGCTACTTTTGTCTGCCACGGTTGTGCCAAGCTC
GACTCCGTATCTGCTGGAGCAGCGACGGGTTCAAGTTCAAAAGAGGAAGGAGATAATGGG
TCAAAGGTTGTGATAGCGATTTTAGCAGGGGTCTTGTGTGCAACTATTGTAGTGGTTGGA
GGGGTTTTCATGTTTAGGCACTCTAAGAGGATGAAGCTTCAGCGAGATCAAGCCAGGTTT
ATGAAGCTTTTTGAAGAAAATGATGATGAACCTGAAGATGAACTTGGACTTGAACCTGTG
CTATGACATGGCCTTTGAGCCGATTACTTTTTTTTTGTTTTTGCACAGGGACTTTTTTGT
GTTTCATGAATTTTTGCAGCTTATATTAGGGAAGAGGATTGACAGTAGGTCTCAGTTTTT
GGCCATCTAGTTTCTCTTCCCCCGCAATTTTAAAGCCAGTGAAAATAATCACCAAAAATT
TCC


BQ
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10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 

AF RS1EV82TF U 1
AF RS1EV82JQ C 182
BS 1 785 RS1EV82TF
BS 786 963 RS1EV82JQ

RD RS1EV82TF 785 0 0
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GTTAGATCACAATCCATCACACTGGACTCCATAGAGATATTCACGAAGCATGACTGGTTT
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GTTACCAAAGCCGGTATCGTGTATACTTTTCGCGGTCAAGAATCATGGCAGCCAATGACA
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ATGCACTTTAAAGAAAAAGAGATCAATGCTACTTTTGTCTGCCACGGTTGTGCCAAGCTC
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CTATG

QA 1 785 1 785
DS 

RD RS1EV82JQ 782 0 0
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AACTCAAGCACACGGTCTACTTTCAATGCAAAGGAGAGAACAAGACAGTTCTTCCTGATG
TTACCAAAGCCGGTATCGTGTATACTTTTCGCGGTCAAGAATCATGGCAGCCAATGACAG
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ACAAAGAGTTTGATGAATGGGAGCTTTGTCCTTCAGATTTCTCTGCTAGCCAAATCTATA
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GGGTTTTCATGTTTAGGCACTCTAAGAGGATGAAGCTTCAGCGAGATCAAGCCAGGTTTA
TGAAGCTTTTTGAAGAAAATGATGATGAACCTGAAGATGAACTTGGACTTGAACCTGTGC
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TTTCATGAATTTTTGCAGCTTATATTAGGGAAGAGGATTGACAGTAGGTCTCAGTTTTTG
GCCATCTAGTTTCTCTTCCCCCGCAATTTTAAAGCCAGTGAAAATAATCACCAAAAATTT
CC

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

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C


BQ
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10 

AF RS1E031JQ U 10
AF RS1E031TF C 1
BS 1 10 RS1E031TF
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BS 129 628 RS1E031JQ
BS 629 721 RS1E031TF

RD RS1E031JQ 619 0 0
A
AAACACATATATTATAAATAAACATTATGAAAAATACAAAAAAAAGAAGTGAAATTAAAT
GACTAGGAAGTCTCAAACCCCTT*GAACGATATAAGACATTAAATACGGGTAAAAAA*GC
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AGACGATAAGGACCATCGCCCATGTAATGACCATCCATGTATAGAGCTGCGTGGTGCGGG
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CTTTGGTTTATGAACCAATTGTTGATCTGTTTCTGATCTAACCCCGTTGATTCCGCCAAC
GCGACCTTCTCTGATTCAGAAGGATATGGCCACTTGTAATGCAATTCCCACCACGTGAGA
AGCTTCTGCCTTGCTTCTTTGGGAAGTTTACCTTTCTTTTTTTTCTTGGAGAGTTCTTGC
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TCCGCCCTGGGGTCTATT

QA 2 619 2 619
DS 

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TAAAAAAAGCTATAGGTAGCAAACTTGTGAAGGAAAGTTGAAACCATAAACTGTAAACGA
GAGAGCAACAAAAGGTTGTTATTATATGGCTAACCCTTCTGGATATCTGCAAGCGGTCTC
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GTGGTGCGGGTGCTGTAGACCATCCATCACCATAAACTGCATGTCTTCGGATGGTTTCCA
GTGACGTTTTCTTTGGTTTATGAACCAATTGTTGATCTGTTTCTGATCTAACCCCGTTGA
TTCCGCCAACGCGACCTTCTCTGATTCAGAAGGATATGGCCACTTGTAATGCAATTCCCA
CCACGTGAGAAGCTTCTGCCTTGCTTCTTTGGGAAGTTTACCTTTCTTTTTTTTCTTGGA
GAGTTCTTGCTTTAGACTGCTCAAGTATCCACTATACTTCTTCAGCAAGTGATTCTTGAG
TTCCCGATCTTCCGCCCTGGGGTCTATTTCCGGTAATTCTGCTTCCCCTCCACTGTTATT
ATTCTCTTGCTCTTCGTCTGATGATTCCATTCCTTCACTTTTCCCATCAGGATTGTTGAG
C

QA 1 721 1 721
DS 



AS 1 2

CO CL8997Contig1 853 2 3 U
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GTTCTTACTCAACCGCTGAAGCCGCTGCTCGAGCCTACGATGCTGCGCTTCTCTGTCTCA
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GGAATTTTTGTTGATTCTGCTTTAATTATATGATCATACCTTATTTTTTACAGTCATCAA
AACAAAAGATTATTTGTTTCGATATATATCAGTTATGTAACTGATACATTGTGTTATATC
ATTTTTTCCTTACCGATTCTCACATCCTGAATATGTGGTTTGCAATATATGTTGTAGAGA
AACTTTATGTGGG


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1A690TF U 1
AF RS1A690JQ C 359
BS 1 824 RS1A690TF
BS 825 825 RS1A690JQ
BS 826 853 RS1A690TF

RD RS1A690TF 853 0 0
GGAACTTCCTCCTCAATTACAATACCCTTTACGTTATTAACTTACTATCAATGGTGAAAG
CTCTTCAGAATACGACAAAGCGAATGTCTCCATCACCATCATCTTCATCTTCATTATCAA
CATCATCATCCATAAGCAAGAGTAACATGGCCAAGAAGTACAAAGGTGTGAGAATGAGAA
GTTGGGGTTCATGGGTTTCAGAGATCAGAGCTCCTAATCAAAAGACAAGGATCTGGCTCG
GTTCTTACTCAACCGCTGAAGCCGCTGCTCGAGCCTACGATGCTGCGCTTCTCTGTCTCA
AAGGATCTTCGGCTAATAATCTCAACTTCCCAGAGATCTCATCTTCTCTCTACAATACCA
ACAATGGTGACAACAAAAACACTATTAACATGTCTCCTAAGTACATACAGAGAGTGGCTG
CTGCTGCAGCTAACGCAGATCCTTCTTCCTCATCTGTCTCTACGTCATCTCCATTACTTT
CCTCATCTCCATCTGAAGATCTCTATGATGTGGTCTCCATGTCTCAGTATGACCAGCAAG
TAGTCTCCTTATCTGAATCATCATGGTACAACTGCTTTGATGGTAATGATCAGTTCATGT
TACCGTATTTGACAACACCACTTGCTGATGATTTCTTTGAGGAAGGAGATATCAGATTAT
GGAATTTTTGTTGATTCTGCTTTAATTATATGATCATACCTTATTTTTTACAGTCATCAA
AACAAAAGATTATTTGTTTCGATATATATCAGTTATGTAACTGATACATTGTGTTATATC
ATTTTTTCCTTACCGATTCTCACATCCTGAATATGTGGTTTGCA*TATATGTTGTAGAGA
AACTTTATGTGGG

QA 1 853 1 853
DS 

RD RS1A690JQ 495 0 0
CAACAATGGTGACAACAAAAACACTATTAACATGTTTCCTAAGTACATACAGAGAGTGGC
TGCTGCTGCAGCTAACGCAGATCCTTCTTCCTCATCTGTCTTTACGTCATCTCCATTACT
TTCCTCATCTCCATTTGAAGATCTCTATGATGTGGTCTCCATGTCTCAGTATGACCAGCA
AGTAGTCTCCTTATTTGAATCATCATGGTACAACTGCTTTGATGGTAATGATCAGTTCAT
GTTACCGTATTTGACAACACCACTTGCTGATGATTTCTTTGAGGAAGGAGATATCAGATT
ATGGAATTTTTGTTGATTTTGCTTTAATTATATGATCATACCTTATTTTTTACAGTCATC
AAAACAAAAGATTATTTGTTTCGATATATATCAGTTATGTAACTGATACATTGTGTTATA
TCATTTTTTCCTTACCGATTCTCACATCCTGAATATGTGGTTTGCAATATATGTTGTAGA
GAAACTTTATGTGGG

QA 1 495 1 495
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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AATGGGAAACAAAAATCTTAAGGCGACGTTGCTCCTCTTCACCACCTTTCTCTTCATTTC
CCGATCAACCTCAGCCGCTCATTCTCCTCCACGACTAAACGCAACAACCAACGATCTAAC
TTTCATCCGAACAAGCTGCAACGCAACTCTATATCCAGACCTCTGCTTCAACTCTCTCGC
TGGCTACGCCTCTGCCGTTCAAAACAGTCCCGCGAGGCTAGCCAAACTAGCTATCGGAGT
AACCATTTCAAAAGCTAAATCAACGGCTCTTTTTCTTACCAAGTTCTCGCGCTCAGCAAC
CAAAGCCAAAGACTGTGCTTCTTACCTTAAAGACGCACTCGACGAGATGAGAGATTCTCT
CCGAACACTACGCAACATTAGCCGCGGAGTAGGCATTGATGCGGCTCCGTCATCGGTGGA
GATGTTTAGATTCAAGATGAGTGACGTGCAGACGTACATGAGTGCAGCTTTGACGTATGA
GGATACGTGTACGGACGAATATGATGAAACGGATGAAGTGGGAGGGACCAAGACCGCTGT
TTATGATCGGGTGAACAATCTGAAGAGGTTAACTAGTAATGCTCTTGCGCTTGTTAACAG
TTATGCCAACTATGGAGCTCCTTGAGATGAGATCATGAAAGCGTTTTTTAACCTTTAATT
TAAATGTTTCTTCTGATATTTATTTTTACTTTGTTAAATATTTCTTTTGAAAATTTAGTA
TGATGTTTTATAAACTTTTAATTCT


BQ
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AF RS1BB91TF U 1
AF RS1BB91JQ C 132
BS 1 702 RS1BB91TF
BS 703 805 RS1BB91JQ

RD RS1BB91TF 702 0 0
GGGCCGGAGCAAGAAGAAAAGAAAACCAAAGAAACTTAAAAAAAAAAAAACAGTGAACAT
AATGGGAAACAAAAATCTTAAGGCGACGTTGCTCCTCTTCACCACCTTTCTCTTCATTTC
CCGATCAACCTCAGCCGCTCATTCTCCTCCACGACTAAACGCAACAACCAACGATCTAAC
TTTCATCCGAACAAGCTGCAACGCAACTCTATATCCAGACCTCTGCTTCAACTCTCTCGC
TGGCTACGCCTCTGCCGTTCAAAACAGTCCCGCGAGGCTAGCCAAACTAGCTATCGGAGT
AACCATTTCAAAAGCTAAATCAACGGCTCTTTTTCTTACCAAGTTCTCGCGCTCAGCAAC
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CCGAACACTACGCAACATTAGCCGCGGAGTAGGCATTGATGCGGCTCCGTCATCGGTGGA
GATGTTTAGATTCAAGATGAGTGACGTGCAGACGTACATGAGTGCAGCTTTGACGTATGA
GGATACGTGTACGGACGAATATGATGAAACGGATGAAGTGGGAGGGACCAAGACCGCTGT
TTATGATCGGGTGAACAATCTGAAGAGGTTAACTAGTAATGCTCTTGCGCTTGTTAACAG
TTATGCCAACTATGGAGCTCCTTGAGATGAGATCATGAAAGC

QA 1 702 1 702
DS 

RD RS1BB91JQ 674 0 0
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CAAGCTGCAACGCAACTCTATATCCAGACCTCTGCTTCAACTCTCTCGCTGGCTACGCCT
CTGCCGTTCAAAACAGTCCCGCGAGGCTAGCCAAACTAGCTATCGGAGTAACCATTTCAA
AAGCTAAATCAACGGCTCTTTTTCTTACCAAGTTCTCGCGCTCAGCAACCAAAGCCAAAG
ACTGTGCTTCTTACCTTAAAGACGCACTCGACGAGATGAGAGATTCTCTCCGAACACTAC
GCAACATTAGCCGCGGAGTAGGCATTGATGCGGCTCCGTCATCGGTGGAGATGTTTAGAT
TCAAGATGAGTGACGTGCAGACGTACATGAGTGCAGCTTTGACGTATGAGGATACGTGTA
CGGACGAATATGATGAAACGGATGAAGTGGGAGGGACCAAGACCGCTGTTTATGATCGGG
TGAACAATCTGAAGAGGTTAACTAGTAATGCTCTTGCGCTTGTTAACAGTTATGCCAACT
ATGGAGCTCCTTGAGATGAGATCATGAAAGCGTTTTTTAACCTTTAATTTAAATGTTTCT
TCTGATATTTATTTTTACTTTGTTAAATATTTCTTTTGAAAATTTAGTATGATGTTTTAT
AAACTTTTAATTCT

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

CO CL9000Contig1 1017 2 2 U
GTTGTATTTCAACCAGGTAAGTTAATCAGTTCTTTTTTGCTTGGTTGTCACTAGCGACAA
CATACGCTTCTTTCTTATCTCTTGTATATCTACTACCTCTTTTCCAGATTGGATGGCCTT
CCTCCTTGCCAACCAATGAGAAAGGGACTTTTGTAAAAAGTGTATTGCGAGAAAAGGTTG
CACTCTTTCTTTGAACATGACGTTTTCTTTTCAGCTAAGCATTATTCTCTTGGTAGTTAA
GGTCTGATAACTTCAACTTGTTTTGCTGGCAGAAAAATGCCATGGATGAGTTTCTGATGT
CGAAAAGCTTACCTCTCAGATCTGGAGTCCAAGAGTGAGTCTCTTTAGATATGCCTCTTT
CAGACTGATTTAGAGACTTCACTTCTCTTGTGGCTTAATCTCTTTGCGGTGTAGGTTTAT
CGATAATGCACACACTGAGAAAGTACCCGTTGCTATCGTAACAGCCTACTTCAAGAGTGG
AGACAAAGTAGCCTTGTAAGCTCCCAAAGAAATTCTTTTTGAAATTTTAGTTAAGTTAGT
TAGTAGCCTTTTTTTACAAAACAGTCCAATAGCATAAACACAATCCTACATAGAGTTTCT
CTCTGTTTTGTTGATTTCTCCTTGTCTTCTTGATGCGGGTATTTAACAGATCCATTGTCG
AGATGCTTGGAGAAGAAAGACTTCCCAATGTGAAAGTTATTGGAGACAATGAGGTGGAAC
AGAGTATGTATGGACAACTTGTTCTTGGCAAGGGAGTTTCTTCAAGTCTAGAGGAGCAAC
TAGTCAAGGAAGTCAAAAAAGCAGGTATAGAGCTCGGAGAACAGTTTGCAAGTACTCTTG
ATCTAAGATCTTGTCTTGTAAATGCACTTAAAAATCTCATCCTATTAAACTTTTTTTTTT
GTGACTAGCATCCGCTGAGAAACAGAGGATAGCAGAAGAAGTTGCATCGATGCTAAAGCT
AAGTGTGGACATTGACACAAGCTCATCTGAGAGGTCTAATTTTCTCTTCTTCTCTAC


BQ
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TTCTTCTCTAC

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BQ
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AF RS1GQ46JQ C 10
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TCACTTTATCCTTTCATTTTCTGGTGGATTTTATTCGTTAGTTTTCTTTACAAATGTTCA
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TATCGAGTAAACCAAGTTCGGTTCGAGTTCTGATTTACGTTTAACCCCCAATTTTTATCA
CTCGGTTTACATC

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TCTATATCTTAACCGGGTTGGATTTGGTTCGGTTTTCTGTGGGTTTATCCTTCACTTTAT
CCTTTCATTTTCTGGTGGATTTTATTCGTTAGTTTTCTTTACAAATGTTCAGATTCGGGC
TTAGGCCTGATCCGTAATAATACTTCTACATTCACTCTACTCATTTTGGTTTATCGAGTA
AACCAAGTTCGGTTCGAGTTCTGATTTACGTTTAACCCCCAATTTTTATCACTCGGTTTA
CATC

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 2

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TGGGTCTAGTGAAAGTTGAAGACCTTGAAAACAAAACAGAGAGAGGCTAGGGCTGGGAAA
TATCCCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DL41TF C 1
AF RS1DL41JQ U 5
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BS 5 607 RS1DL41JQ

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TCAAACTAGAGGATGATGAAGTTTTAAGGGTTATAAAAATGGCCATTGCAGTGGCATTTC
CAGTCCATGGGCTTGTAGTTAGAATACTGACCAAGAACGGTGGTTACGGAGGAAGGAGGC
CTTACGAAACTGCCGGGAAACGGGTTATCTCGGGAACGACCCGGGAGAGTGGGAATTTGA
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AGTCTTGCTTTATCTTCGACCAAAGCCACTTGAGAAGAACTCGGAGGCTGGACTGGTTTA
AGAGAGGATGAGACTTGTGGAGAGATGAAAACAAGGAGGAGAAGAAAGGTAAGATTGTAA
ATAGTGATCATGTTGGTTTTCTAATTCAGGAGTTCTCACCATACAGTAGAAACTTTCATG
TGGGTCTAGTGAAAGTTGAAGACCTTGAAAACAAAACAGAGAGAGGCTAGGGCTGGGAAA
TATCCCC

QA 1 607 1 607
DS 

RD RS1DL41JQ 603 0 0
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AAAGTACAATTCTACTGTCAATAATTCAAAATCAATTCTAAGCAACTAAAAAATGATCAA
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TTGCTTTATCTTCGACCAAAGCCACTTGAGAAGAACTCGGAGGCTGGACTGGTTTAAGAG
AGGATGAGACTTGTGGAGAGATGAAAACAAGGAGGAGAAGAAAGGTAAGATTGTAAATAG
TGATCATGTTGGTTTTCTAATTCAGGAGTTCTCACCATACAGTAGAAACTTTCATGTGGG
TCTAGTGAAAGTTGAAGACCTTGAAAACAAAACAGAGAGAGGCTAGGGCTGGGAAATATC
CCC

QA 1 603 1 603
DS 



AS 1 2

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TGTGGATATGCTCCTCAAACATGTCACCACTGTCAAGAACTGAGAGTCATTTATCACTTT
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TGTTGCTATGAGTTATTTATTATCTGCTTTCTTTTTTTTTTTTGTTGCTATTAATATCTC
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GA


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 

AF RS1BS19JQ C 1
AF RS1BS19TF U 1
BS 1 602 RS1BS19TF

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GA

QA 1 602 1 602
DS 

RD RS1BS19TF 602 0 0
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AACAATGGAATCCAGCAGAGGAGGAGGAGGAGGTGGAATCCAGCAGTTGCTTGCTGCTGA
ACAAGAAGCTCAACACATTGTCAATGCTGCTAGGACCGCAAAGATGGCAAGGCTGAAGCA
AGCCAAGGAAGAGGCTGAGAAAGAGATTGCCGAATACAAGGCTAAGACAGAGCAAGACTT
CCAGAGGAAACTTGAAGAGACAAGTGGAGACTCGGGTGCGAATGTGAAGAGGCTGGAGCA
AGAGACTGATGCCAAAATCGAACAGCTCAAGAACGAAGCTTCCAGGATTTCCAATGATGT
TGTGGATATGCTCCTCAAACATGTCACCACTGTCAAGAACTGAGAGTCATTTATCACTTT
GAGTTTCTGCTCCCTGTTTCTGGATGGATTGAAGAGACTTGATAAATCTCATATTGTATT
TGTTGCTATGAGTTATTTATTATCTGCTTTCTTTTTTTTTTTTGTTGCTATTAATATCTC
TTGTTGTTGTATTCATAACAATTGTCTTTTGGGTTGTAATGAACTCGTTTATTTATATAA
GA

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 2

CO CL9004Contig1 638 2 6 U
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BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AP11TFB U 1
AF RS1GE35TF U 2
BS 1 51 RS1AP11TFB
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QA 1 624 1 624
DS 

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AGGTCGATGAGAAACCTACCGAAGATTACAATGACATTGGAGGACTGGAGAAGCAGATAC
AAGAGCTTGTAGAGGCGATCGTGCTCCCCATGACCCA

QA 1 637 1 637
DS 



AS 1 2

CO CL9005Contig1 766 2 8 U
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GAGGCACAAAGAGTGTTTGGGAATAGATGGACTGAGATAGCAAAAGTGGTTTCAGGCAGA
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BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G826TF U 1
AF RS1CZ85TF U 4
BS 1 117 RS1G826TF
BS 118 118 RS1CZ85TF
BS 119 390 RS1G826TF
BS 391 391 RS1CZ85TF
BS 392 597 RS1G826TF
BS 598 598 RS1CZ85TF
BS 599 628 RS1G826TF
BS 629 766 RS1CZ85TF

RD RS1G826TF 628 0 0
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AAGAAGAATATTAGTAACGAAGATTCAAAGAAGAAGGAACGTCATATTGTTACTTGGGCA
GCAGAGGAGGATGTTATACTAAGAGACCAGATTACTCTTCATGGAACTGAAAATTGGGCG
ATCATTGCATCAAAGTTTAAGGATAAAAGCACAAGACAATGCAGAAGAAGATGGTATACA
TATTTAAACTCTGATTTCAAGAGAGGAGGTTGGTCTCCTGAAGAAGATATGCTTTTGTGT
GAGGCACAAAGAGTGTTTGGGAATAGATGGACTGAGATAGCAAAAGTGGTTTCAGGCAGA
ACGGATAATGCTGTGAAGAACAGGTTTACAGCACTTTGTAAGAAGAGAGCCAAGCACGAA
GCTATGGCTAACTCGAACAACTCAAACAACAAGAGAATGTTGTTCTTAGACGGTATTAGT
ACACCCCAAAAAGCCGATAATGAAGCTCCGATTGCCAAGAGAACAAGGAGAAGTCACATT
CTAGAGCATACAGAGATGAGTAACTATGGAAAAGTTGAGTCTTGTCTGAATCAGCAG*CA
AGATCTCCATTCTCGGTATTGGCACGCA

QA 1 628 1 628
DS 

RD RS1CZ85TF 763 0 0
GG
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GAATATTAGTAACGAAGATTCAAAGAAGAAGGAACGTCATATTGTTACTTGGACAGCAGA
GGAGGATGTTATACTAAGAGACCAGATTACTCTTCATGGAACTGAAAATTGGGCGATCAT
TGCATCAAAGTTTAAGGATAAAAGCACAAGACAATGCAGAAGAAGATGGTATACATATTT
AAACTCTGATTTCAAGAGAGGAGGTTGGTCTCCTGAAGAAGATATGCTTTTGTGTGAGGC
ACAAAGAGTGTTTGGGAATAGATGGACTGAGATAGCAAAAGTGGTTTCAGGCAGAACGGA
TAATGCTGTGAAGAACAGGTTTACAACACTTTGTAAGAAGAGAGCCAAGCATGAAGCTAT
GGCTAACTCGAACAACTCAAACAACAAGAGAATGTTGTTCTTAGACGGTATTAGTACACC
CCAAAAAGCCGATAATGAAGCTCCGATTGCCAAGAGAACAAGGAGAAGTCACATTCTAGA
GCATACAGAGATGAGTAACTATGGAAAAGTTGAGTCTTGTCTGAATCAGCAGGCAAGATC
TCCATTCTCG*TATTGGCACGCAATGCCACAGGTATTGATAGCTTGGAAGAACAGTATCA
AACAAGTAATGTGAAGGAGAGTGATGGTGGTGAAGGGATGTTTCTTAAGAGGATGATCCT
AAAGTCACAGCTCTGATGCAACAAGCTGAACTCTTAACCTC

QA 3 763 3 763
DS 



AS 1 2

CO CL9006Contig1 783 2 2 U
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CTCTCCGTCTGCCAAAGTTGCTAACAACGATGAGGAGATGCCTTTCCAAACTCACTCCCC
GGCAAATGGGTTTCACCACTTCCAACTCTTTCTTGCAGGTTGAGTCAAGAACCATTACTA
GTACTACTAGTGACCGTTCATTAAGCAGCAATGCAGCTCAAGTTGATCAGACAAAACACA
ACCCTCTCTCAGACATGTTGGTTGATTCATTTGGTCGGTTTCATACCTACTTGAGGATCT
CCTTGACAGAGCGTTGTAACCTCAGGTGTCAGTACTGCATGCCCTCCGAAGGCGTGGAGC
TTACTCCTACGCCTCAGCTGCTCTCACAGTCCGAGATCGTTAGGTTAGCTGGTCTCTTCG
TTTCTTCCGGTGTTAACAAGATTAGATTAACCGGTGGCGAGCCTACCGTGAGGAAAGACA
TCGAAGAGATCTGTATGCAGTTGTCCAGCTTAAAAGGGTTGAAGAACTTAGCTATTACTA
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AAGTCAACTGTGTTGTCATGAGGGGATTGATGATGATGAGGTTTGTGATTTTGTGGAATT
GAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 

AF RS1BP81TF U 1
AF RS1AM24TF U 43
BS 1 661 RS1BP81TF
BS 662 783 RS1AM24TF

RD RS1BP81TF 665 0 0
TTTTTGTACCATAGAAAGAAGAATCCAAATTTGTTTCGTTTTACCAGAACAAAGAAGACT
CTCTCCGTCTGCCAAAGTTGCTAACAACGATGAGGAGATGCCTTTCCAAACTCACTCCCC
GGCAAATGGGTTTCACCACTTCCAACTCTTTCTTGCAGGTTGAGTCAAGAACCATTACTA
GTACTACTAGTGACCGTTCATTAAGCAGCAATGCAGCTCAAGTTGATCAGACAAAACACA
ACCCTCTCTCAGACATGTTGGTTGATTCATTTGGTCGGTTTCATACCTACTTGAGGATCT
CCTTGACAGAGCGTTGTAACCTCAGGTGTCAGTACTGCATGCCCTCCGAAGGCGTGGAGC
TTACTCCTACGCCTCAGCTGCTCTCACAGTCCGAGATCGTTAGGTTAGCTGGTCTCTTCG
TTTCTTCCGGTGTTAACAAGATTAGATTAACCGGTGGCGAGCCTACCGTGAGGAAAGACA
TCGAAGAGATCTGTATGCAGTTGTCCAGCTTAAAAGGGTTGAAGAACTTAGCTATTACTA
CTAATGGCATCACTCTAGCTAGAAAGCTACCGAAGCTTAAAGAATGTGGGCTTGATTCCA
TCAACATCAGCTTGGACACTCTTGTCCCTGCGAAGTTCGAGTTTCTGACTAGACGTAAAG
G
CACG

QA 1 661 1 661
DS 

RD RS1AM24TF 741 0 0
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TTTCCAAACTCACTCCCCGGCAAATGGGTTTCACCACTTCCAACTCTTTCTTG***GTTG
AGTCAAGAACCATTACTAGTACTACTAGTGACCGTTCATTAAGCAGCAATGCAGCTCAAG
TTGATCAGACAAAACACAACCCTCTCTCAGACATGTTGGTTGATTCATTTGGTCGGTTTC
ATACCTACTTGAGGATCTCCTTGACAGAGCGTTGTTACCTCAGGTGTCAGTACTGCATGC
CCTCCGAAGGCGTGGAGCTTACTCCTACGCCTCAGCTGCTCTCACAGTCCGAGATCGTTA
GGTTAGCTGGTCTCTTCGTTTCTTCCGGTGTTAACAAGATTAGATTAACCGGTGGCGAGC
CTACCGTGAGGAAAGACATCGAAGAGATCTGTATGCAGTTGTCCAGCTTAAAAGGGTTGA
AGAACTTAGCTATTACTACTAATGGCATCACTCTAGCTAGAAAGCTACCGAAGCTTAAAG
AATGTGGGCTTGATTCCATCAACATCAGCTTGGACACTCTTGTCCCTGCGAAGTTCGAGT
TTCTGACTAGACGTAAAGGGCACGAGAGGGTTATGCAATCAATTGATTCCGCTATCGCTC
TTGGATACAATCCTGTGAAAGTCAACTGTGTTGTCATGAGGGGATTGATGATGATGAGGT
TTGTGATTTTGTGGAATTGAC

QA 1 741 1 741
DS 



AS 1 2

CO CL9007Contig1 702 2 2 U
GATTTAAGAGGCTGGAGGATCAAAAGTCAACCAGGGGAAGAAACCAGGATGCGCTTTTGG
CTGCCTGCTTGTACATTTCATGTAGACAAGAGGACAAGCCACGAACTATTAAGGAAATCT
GCTCTGTTGCTAATGGAGCGACAAAGAAGGAAATGGGAAGAGCAAAAGACTTTATAGTTA
AGACATTGGGTCTGGAGACTGGTCACTCTGTGAAATGGGCGCTATACACGCTGGTGATTT
CATGAAAAGGTTCTGCTCTAACCTTGGAATGTCTCATCAAGCGGTTAGAGCTGCTGAAGA
AGCTGTGAAAAAATCTGAGGAATTCGATATAAGGAGGAGTCCTATATCAATAGCAGCAGT
AGTTATCTATATCATAACCCAGCTTTCTGATGACAAGAAGCCTCTCAAAGATATAGCTAT
AGCGACAGGAGTAGCAGAAGGAACAATAAGGAACTCATACAAAGACTTGTATCCTCATCT
TCAGAAGATAGCTCCGAGTTGGTATGCTAAGGAAGAGGATCTTAAGAACCTCTCAAGTCC
TTGAAATGATTTCTTTATTCTTCTTCTATAGAAACTTATTATATATCTGTATCGACGAGG
ATACAAAGCAGTTGGTTCTCTCGATTAGAGAGGCTTTTGTTTTTTTTTTCTACAATTCTT
TTTTTTTGAAGTCTTTTTGTTAAGAAGTTTTAAAAGAAATAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DI82TF U 1
AF RS1DI82JQ C 35
BS 1 652 RS1DI82TF
BS 653 702 RS1DI82JQ

RD RS1DI82TF 652 0 0
GATTTAAGAGGCTGGAGGATCAAAAGTCAACCAGGGGAAGAAACCAGGATGCGCTTTTGG
CTGCCTGCTTGTACATTTCATGTAGACAAGAGGACAAGCCACGAACTATTAAGGAAATCT
GCTCTGTTGCTAATGGAGCGACAAAGAAGGAAATGGGAAGAGCAAAAGACTTTATAGTTA
AGACATTGGGTCTGGAGACTGGTCACTCTGTGAAATGGGCGCTATACACGCTGGTGATTT
CATGAAAAGGTTCTGCTCTAACCTTGGAATGTCTCATCAAGCGGTTAGAGCTGCTGAAGA
AGCTGTGAAAAAATCTGAGGAATTCGATATAAGGAGGAGTCCTATATCAATAGCAGCAGT
AGTTATCTATATCATAACCCAGCTTTCTGATGACAAGAAGCCTCTCAAAGATATAGCTAT
AGCGACAGGAGTAGCAGAAGGAACAATAAGGAACTCATACAAAGACTTGTATCCTCATCT
TCAGAAGATAGCTCCGAGTTGGTATGCTAAGGAAGAGGATCTTAAGAACCTCTCAAGTCC
TTGAAATGATTTCTTTATTCTTCTTCTATAGAAACTTATTATATATCTGTATCGACGAGG
ATACAAAGCAGTTGGTTCTCTCGATTAGAGAGGCTTTTGTTTTTTTTTTCTA

QA 1 652 1 652
DS 

RD RS1DI82JQ 668 0 0
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CAAGCCACGAACTATTAAGGAAATTTGCTCTGTTGCTAATGGAGCGACAAAGAAGGAAAT
GGGAAGAGCAAAAGACTTTATAGTTAAGACATTGGGTCTGGAGACTGGTCACTCTGTGAA
ATGGGCGCTATACACGCTGGTGATTTCATGAAAAGGTTTTGCTCTAACCTTGGAATGTCT
CATCAAGCGGTTAGAGCTGCTGAAGAAGCTGTGAAAAAATTTGAGGAATTCGATATAAGG
AGGAGTCCTATATCAATAGCAGCAGTAGTTATCTATATCATAACCCAGCTTTTTGATGAC
AAGAAGCCTCTCAAAGATATAGCTATAGCGACAGGAGTAGCAGAAGGAACAATAAGGAAC
TCATACAAAGACTTGTATCCTCATCTTCAGAAGATAGCTCCGAGTTGGTATGCTAAGGAA
GAGGATCTTAAGAACCTCTCAAGTCCTTGAAATGATTTCTTTATTCTTCTTCTATAGAAA
CTTATTATATATCTGTATCGACGAGGATACAAAGCAGTTGGTTCTCTCGATTAGAGAGGC
TTTTGTTTTTTTTTTCTACAATTCTTTTTTTTTGAAGTCTTTTTGTTAAGAAGTTTTAAA
AGAAATAT

QA 1 668 1 668
DS 



AS 1 2

CO CL9008Contig1 614 2 2 U
GGACACTTAAAATCAACAAAATACAAAAAATGGTCTCAAAGAGCTCAAACACCATTAGCC
TCATCATCATCTTCCTCATCTTCAGCCTCGCTGAGGCTGACCTCTTGCTCTCGCCTTCGC
AGGGCTTTGGTACGTGTCCTAGAGACCCATTGCAACTTGGTGTATGCGCCAATGTCCTTG
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TTTTCGGTATCGATAAGGCCGTTAGAACAATATTTTTCGCTTGTAATATGGTTTTTCCTA
TTGGCTTTCAGTGTCCACCACCACCAGTATCTAGCCCTTAATCTCACCTGATTAAGAACA
AGAACCCTATCCAGTAACTACTTACAACGCAAGTATGCTTACTTATTCATGTTATACAGT
GTTGATGTGTGTTTCGTTGTTAAACAGGGCGTAATAGTGACTATATATGTTGTTATGTGT
ACGAAGAATAATACTTGAATAAATATGTCGTGTGCGAATATTAATATATAATTAAGTGTT
ACTTTAAAAAAAAA


BQ
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20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CS17JQ C 1
AF RS1CS17TF U 1
BS 1 605 RS1CS17TF
BS 606 614 RS1CS17JQ

RD RS1CS17JQ 614 0 0
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GCCTTCCGAACGTCCAAGTAGCCGATTGCCTTTGCTTTGTCTTCAGGCCACTTCCTTTGG
TTTTCGGTATCGATAAGGCCGTTAGAACAATATTTTTCGCTTGTAATATGGTTTTTCCTA
TTGGCTTTCAGTGTCCACCACCACCAGTATCTAGCCCTTAATCTCACCTGATTAAGAACA
AGAACCCTATCCAGTAACTACTTACAACGCAAGTATGCTTACTTATTCATGTTATACAGT
GTTGATGTGTGTTTCGTTGTTAAACAGGGCGTAATAGTGACTATATATGTTGTTATGTGT
ACGAAGAATAATACTTGAATAAATATGTCGTGTGCGAATATTAATATATAATTAAGTGTT
ACTTTAAAAAAAAA

QA 1 614 1 614
DS 

RD RS1CS17TF 605 0 0
GGACACTTAAAATCAACAAAATACAAAAAATGGTCTCAAAGAGCTCAAACACCATTAGCC
TCATCATCATCTTCCTCATCTTCAGCCTCGCTGAGGCTGACCTCTTGCTCTCGCCTTCGC
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GCCTAGGCAATGTCATTGCTGGCGACACCAGAGCACGGCCGTGCTGCAGTGCTATCACTG
GCCTTCCGAACGTCCAAGTAGCCGATTGCCTCTGCTTTGTCTTCAGGCCACTTCCTTTGG
TTTTCGGTATCGATAAGGCCGTTAGAACAATATTTTTCGCTTGTAATATGGTTTTTCCTA
TTGGCTTTCAGTGTCCACCACCACCAGTATCTAGCCCTTAATCTCACCTGATTAAGAACA
AGAACCCTATCCAGTAACTACTTACAACGCAAGTATGCTTACTTATTCATGTTATACAGT
GTTGATGTGTGTTTCGTTGTTAAACAGGGCGTAATAGTGACTATATATGTTGTTATGTGT
ACGAAGAATAATACTTGAATAAATATGTCGTGTGCGAATATTAATATATAATTAAGTGTT
ACTTT

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 2

CO CL9009Contig1 1024 2 4 U
GCAAGTCGAATATCTTGCTCCCCAGTCTCGTCTATCCTCTCTACTATAGTCGCGCTATAT
ATAGCCAAGTCGAGATTCGCAAGTATGATCTCGTCCCTGACCAAGACTGGGAGATAGATC
TCCAAGGCATTGAAGCCATTGCAGATGATAATACAATCGCTATGGTGATATCTAACCCTC
ACAACCCATGTGGAAATGTGTACATATATCATCATCTAAAGAAGGTGGCTGAGATGGCGA
AGAAGCTAGGGATAATGGTTATTTCTGATGAAGTTTATAAGCACACAATATATGGAGAGA
ATCCATTTGTCCCGATGGGGATGTTCGCATCGATTGTTCCTGTGGTTACACTCGGATCCA
TTTCCAAGGGGTGGCTCGTCCCTGGCTGGAGAATAGGTTGGATGGCGATGCATGATCCAA
ATAATGTTTTCAAAACCACTGGGGTCGTTGAATCCATCAAGGAATTTCTTAACATAAGTC
CAGATCCATCGACAATTCTACAGTTTGCACTTCCAAATATCTTGGAGAATACAAAGAAAG
ATTTCTTTGAGAAGAAAAACCTGACATTTAAGCAAAACGTAGACATGATGTTCGATGCCC
TCAAGGAGATTCCTTGCCTCGTTTGCCCTAAGAAACCTGAGTCGTGTACCTACTTAGTGA
CAAAATTGGACCTATCACTCTTGGAGGACATCACAGACGATGTTGATTTCTGCATGAAGC
TGGCCCGAGAGGAGAGTCTCGTCCTTTTACCTGGAGAGGCATTAGGCAAGAAGAATTGGG
TGAGAATCTCGATTGGAGTCGAGAAATCAATGCTAGAAGACGCTTTCGTGAGGCTCAAAG
TCTTCTACGCTCGCCATGTCAAATCACAAACCACTTAAGAACGATCAGCTTCATTGTCCC
TATCTTTCTACTGTTTTTGTATTTTCTCTATTCAATAAATTTCTCGATAATGTTCGAGAG
ACTTTGGGTTGTTGTTGTGTGCGCACGTGTGTTTAAGTAGCTATCTATGATTGTCCATTT
GTCG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1CO81TF U 1
AF RS1CO81JQ C 199
BS 1 765 RS1CO81TF
BS 766 766 RS1CO81JQ
BS 767 804 RS1CO81TF
BS 805 1024 RS1CO81JQ

RD RS1CO81TF 804 0 0
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ATAGCCAAGTCGAGATTCGCAAGTATGATCTCGTCCCTGACCAAGACTGGGAGATAGATC
TCCAAGGCATTGAAGCCATTGCAGATGATAATACAATCGCTATGGTGATATCTAACCCTC
ACAACCCATGTGGAAATGTGTACATATATCATCATCTAAAGAAGGTGGCTGAGATGGCGA
AGAAGCTAGGGATAATGGTTATTTCTGATGAAGTTTATAAGCACACAATATATGGAGAGA
ATCCATTTGTCCCGATGGGGATGTTCGCATCGATTGTTCCTGTGGTTACACTCGGATCCA
TTTCCAAGGGGTGGCTCGTCCCTGGCTGGAGAATAGGTTGGATGGCGATGCATGATCCAA
ATAATGTTTTCAAAACCACTGGGGTCGTTGAATCCATCAAGGAATTTCTTAACATAAGTC
CAGATCCATCGACAATTCTACAGTTTGCACTTCCAAATATCTTGGAGAATACAAAGAAAG
ATTTCTTTGAGAAGAAAAACCTGACATTTAAGCAAAACGTAGACATGATGTTCGATGCCC
TCAAGGAGATTCCTTGCCTCGTTTGCCCTAAGAAACCTGAGTCGTGTACCTACTTAGTGA
CAAAATTGGACCTATCACTCTTGGAGGACATCACAGACGATGTTGATTTCTGCATGAAGC
TGGCCCGAGAGGAGAGTCTCGTCCTTTTACCTGGAGAGGCATTAG*CAAGAAGAATTGGG
TGAGAATCTCGATTGGAGTCGAGA

QA 1 804 1 804
DS 

RD RS1CO81JQ 826 0 0
TGTACATATATCATCATCTAAAGAAGGTGGCTGAGATGGCGAAGAAGCTAGGGATAATGG
TTATTTCTGATGAAGTTTATAAGCACACAATATATGGAGAGAATCCATTTGTCCCGATGG
GGATGTTCGCATCGATTGTTCCTGTGGTTACACTCGGATCCATTTCCAAGGGGTGGCTCG
TCCCTGGCTGGAGAATAGGTTGGATGGCGATGCATGATCCAAATAATGTTTTCAAAACCA
CTGGGGTCGTTGAATCCATCAAGGAATTTCTTAACATAAGTCCAGATCCATCGACAATTC
TACAGTTTGCACTTCCAAATATCTTGGAGAATACAAAGAAAGATTTCTTTGAGAAGAAAA
ACCTGACATTTAAGCAAAACGTAGACATGATGTTCGATGCCCTCAAGGAGATTCCTTGCC
TCGTTTGCCCTAAGAAACCTGAGTCGTGTACCTACTTAGTGACAAAATTGGACCTATCAC
TCTTGGAGGACATCACAGACGATGTTGATTTCTGCATGAAGCTGGCCCGAGAGGAGAGTC
TCGTCCTTTTACCTGGAGAGGCATTAGGCAAGAAGAATTGGGTGAGAATCTCGATTGGAG
TCGAGAAATCAATGCTAGAAGACGCTTTCGTGAGGCTCAAAGTCTTCTACGCTCGCCATG
TCAAATCACAAACCACTTAAGAACGATCAGCTTCATTGTCCCTATCTTTCTACTGTTTTT
GTATTTTCTCTATTCAATAAATTTCTCGATAATGTTCGAGAGACTTTGGGTTGTTGTTGT
GTGCGCACGTGTGTTTAAGTAGCTATCTATGATTGTCCATTTGTCG

QA 1 826 1 826
DS 



AS 1 2

CO CL9010Contig1 457 2 1 U
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AAGCAGCTGAAAAAGACGGTGGTGGTGAAAGCGGTGGTAGTGGCGGCGGTGGGGAGGAAG
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CGCCCCGTGTGGCTGTTCCGCCTATGGAAATGCCGTCGTATGCTTATCCGCATGCATATC
CGCCGCAACTATTCAGCGACGAGAATCCAAACGCATGTTCCATAATGTAACGAAGAAAAC
CGCAGACGCTAAATGGTTTATATGGGGAATATTTGAACATTTTTGATTCAGTGGATACAT
GCTGTCTCTTTGCAAGTAGTTTTCTTTTTTACTGTGGTTGTGCAGCTCTTTTTAATGGGC
TATATATAATCAATAAAATATATAGATTACAATAGTT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1EW84JQ C 1
AF RS1EW84TF U 1
BS 1 457 RS1EW84TF

RD RS1EW84JQ 457 0 0
GGGAAAAAGCAAAGACGGACGAAGAGAAGAAAGAAGGGGATGCCGGCAAGGGAGAAGGTG
AAGCAGCTGAAAAAGACGGTGGTGGTGAAAGCGGTGGTAGTGGCGGCGGTGGGGAGGAAG
AGGCAAAAGTTGTGGAGGTGAGGAAGATAGAGAATCCCTATTACTACTATCTTTACCAAC
CGCCCCGTGTGGCTGTTCCGCCTATGGAAATGCCGTCGTATGCTTATCCGCATGCATATC
CGCCGCAACTATTCAGCGACGAGAATCCAAACGCATGTTCCATAATGTAACGAAGAAAAC
CGCAGACGCTAAATGGTTTATATGGGGAATATTTGAACATTTTTGATTCAGTGGATACAT
GCTGTCTCTTTGCAAGTAGTTTTCTTTTTTACTGTGGTTGTGCAGCTCTTTTTAATGGGC
TATATATAATCAATAAAATATATAGATTACAATAGTT

QA 1 457 1 457
DS 

RD RS1EW84TF 457 0 0
GGGAAAAAGCAAAGACGGACGAAGAGAAGAAAGAAGGGGATGCCGGCAAGGGAGAAGGTG
AAGCAGCTGAAAAAGACGGTGGTGGTGAAAGCGGTGGTAGTGGCGGCGGTGGGGAGGAAG
AGGCAAAAGTTGTGGAGGTGAGGAAGATAGAGAATCCCTATTACTACTATCTTTACCAAC
CGCCCCGTGTGGCTGTTCCGCCTATGGAAATGCCGTCGTATGCTTATCCGCATGCATATC
CGCCGCAACTATTCAGCGACGAGAATCCAAACGCATGTTCCATAATGTAACGAAGAAAAC
CGCAGACGCTAAATGGTTTATATGGGGAATATTTGAACATTTTTGATTCAGTGGATACAT
GCTGTCTCTTTGCAAGTAGTTTTCTTTTTTACTGTGGTTGTGCAGCTCTTTTTAATGGGC
TATATATAATCAATAAAATATATAGATTACAATAGTT

QA 1 457 1 457
DS 



AS 1 2

CO CL9011Contig1 757 2 4 U
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TGTGGTTAACTGCCTTACTTCTTGGAGCTGCACTTGGATATTACATCAGCACTCTACGAC
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TTTTGGTAGCGAGGAATGATCTTAAAATGGGTAAAGGCAAGATTGCAGCTCAATGCAGTC
ATGCAACTTTGGGTTTATACAAGAAACTCCTTCGACGAGCGCCAAAAGCCTTGAACTGAT
GGGAGAATTCTGCACAGGCAAAAGTTGTTGTCAAAATCGAGAGTGAGGAAGAGATGCTAG
CTTTGCGAGAGGGAGCAAAGTCCCTTAAACTGCCAACCCATATCACCATCGATGCAGGAA
AAACACAGATCGCTCCGGATTCAAGGACAGTAATGGCTATTCTTGGACCGGTGGATGTTG
TTGATGATGTAACAGGTGGATTAAAGCTTATGTAACAACTCTTAGATTCATTATTCAGAC
AATCTAGCACAAAGGAGAGAATGTTAGTGACAATTTTTTTTCTTTCTTCTTAACTATTTT
TGGCAATTTTCAATTTAATTACTCGATTTTACATGAATTTGTACAATTACCTTACTTAGA
AGATAGTCATATGATAATAATTGTTGTTTATCCCACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GI16TF U 1
AF RS1GI16JQ C 1
BS 1 555 RS1GI16TF
BS 556 556 RS1GI16JQ
BS 557 610 RS1GI16TF
BS 611 757 RS1GI16JQ

RD RS1GI16TF 610 0 0
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TGTGGTTAACTGCCTTACTTCTTGGAGCTGCACTTGGATATTACATCAGCACTCTACGAC
GCCGTATCTTAGCCCCCTCCTCCAAATCTGTGGCCGAGTCTAGTGGAAACAAGAAGACTA
AGTCCAAGGAACCCCTAGAGATTGAGAAACTGACTGACTCCCGCAAAAGATTCAAAATGG
TTTTGGTAGCGAGGAATGATCTTAAAATGGGTAAAGGCAAGATTGCAGCTCAATGCAGTC
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GGGAGAATTCTGCACAGGCAAAAGTTGTTGTCAAAATCGAGAGTGAGGAAGAGATGCTAG
CTTTGCGAGAGGGAGCAAAGTCCCTTAAACTGCCAACCCATATCACCATCGATGCAGGAA
AAACACAGATCGCTCCGGATTCAAGGACAGTAATGGCTATTCTTGGACCGGTGGATGTTG
TTGATGATGTAACAG*TGGATTAAAGCTTATGTAACAACTCTTAGATTCATTATTCAGAC
AATCTAGCAC

QA 1 610 1 610
DS 

RD RS1GI16JQ 757 0 0
GGAAAGAACACTGTTTAACCGTTGCTCAGCCGCCGGGGAGATTAAGGATGATGGATTTGA
TGTGGTTAACTGCCTTACTTCTTGGAGCTGCACTTGGATATTACATCAGCACTCTACGAC
GCCGTATCTTAGCCCCCTCCTCCAAATCTGTGGCCGAGTTTAGTGGAAACAAGAAGACTA
AGTCCAAGGAACCCCTAGAGATTGAGAAACTGACTGACTCCCGCAAAAGATTCAAAATGG
TTTTGGTAGCGAGGAATGATCTTAAAATGGGTAAAGGCAAGATTGCAGCTCAATGCAGTC
ATGCAACTTTGGGTTTATACAAGAAACTCCTTCGACGAGCGCCAAAAGCCTTGAACTGAT
GGGAGAATTCTGCACAGGCAAAAGTTGTTGTCAAAATCGAGAGTGAGGAAGAGATGCTAG
CTTTGCGAGAGGGAGCAAAGTCCCTTAAACTGCCAACCCATATCACCATCGATGCAGGAA
AAACACAGATCGCTCCGGATTCAAGGACAGTAATGGCTATTCTTGGACCGGTGGATGTTG
TTGATGATGTAACAGGTGGATTAAAGCTTATGTAACAACTCTTAGATTCATTATTCAGAC
AATCTAGCACAAAGGAGAGAATGTTAGTGACAATTTTTTTTCTTTCTTCTTAACTATTTT
TGGCAATTTTCAATTTAATTACTCGATTTTACATGAATTTGTACAATTACCTTACTTAGA
AGATAGTCATATGATAATAATTGTTGTTTATCCCACC

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

CO CL9012Contig1 905 2 4 U
CTTCTAAGTGAATTCCAGTGGCCGCCAAAGTCAGAGACACAACAAGAAGAGGAGGAGGAG
GCGACGAAGAAGCAGCTGTTTCTGAAGTGTAAAACGTTCCGGTTACATGGAAGTATGGAG
CAGGAGGATAGAAGATCTGCGTTTGCCAACTTCAAAGCAGAGAGACAAGCCCTTCTCTTG
AGTACTGATGTCGCTGCCAGAGGATTGGACTTCCCAAAAGTAAGATGTATTGTTCAATAC
GACTGTCCCGGGGAAGCTACCGAGTATGTGCATAGAGTGGGTAGAACAGCTCGTATTGGT
GAAAAGGGAGAAGCGTTGTTGTTTCTACAGCCGGTTGAGATAGACTATCTTAAGGACCTT
AAGAAACATGGTGCGACACTTGCAGAGTATCCTCTTCTGAAAGTACTTGATAAGTTTCCT
CTGCTCCGCAACATGCCTCGCGTCAAGAAGGTTATATCCCTTGAATCACATCCCTGGGTC
ATATCTCTGCAGAGAGGTCTTGAGTTCTTTACTTACTCTGATGCGAAGATGAAGAACCTG
GCGAAGAACGCGTTTGTCTCTTGGGTCAGGGGATATGCAGCTCACAAGGGAGAGCTCAAG
AGCATCTTTGTGGTGAAGAAGCTTCACTGGGGTCATGTCGCCAAGAGCTTTGCTCTTAAA
GAGCAGCCTTCTTTGGTTGGGAAATCACACCATAAGGAAACTATGAAGAGGAAGAGAGAC
GAACGCCACAAGGGGCAACACCCAAAGAAGAGAAAGAAGATGAGTGGCAATAGAAGTACA
ACAAAAACTTGATCAAAAGTCCCTTTTGCCTACCACAAACCATGACATGAGTTTTGTAAC
GAGAGAACAGTTTTGTTCATTGAAAATTTTGAAGTATTTTAAAAAGTTTGGAAACTTACC
GAAAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 

AF RS1BB23TF U 1
AF RS1BB23JQ C 119
BS 1 699 RS1BB23TF
BS 700 700 RS1BB23JQ
BS 701 722 RS1BB23TF
BS 723 905 RS1BB23JQ

RD RS1BB23TF 727 0 0
CTTCTAAGTGAATTCCAGTGGCCGCCAAAGTCAGAGACACAACAAGAAGAGGAGGAGGAG
GCGACGAAGAAGCAGCTGTTTCTGAAGTGTAAAACGTTCCGGTTACATGGAAGTATGGAG
CAGGAGGATAGAAGATCTGCGTTTGCCAACTTCAAAGCAGAGAGACAAGCCCTTCTCTTG
AGTACTGATGTCGCTGCCAGAGGATTGGACTTCCCAAAAGTAAGATGTATTGTTCAATAC
GACTGTCCCGGGGAAGCTACCGAGTATGTGCATAGAGTGGGTAGAACAGCTCGTATTGGT
GAAAAGGGAGAAGCGTTGTTGTTTCTACAGCCGGTTGAGATAGACTATCTTAAGGACCTT
AAGAAACATGGTGCGACACTTGCAGAGTATCCTCTTCTGAAAGTACTTGATAAGTTTCCT
CTGCTCCGCAACATGCCTCGCGTCAAGAAGGTTATATCCCTTGAATCACATCCCTGGGTC
ATATCTCTGCAGAGAGGTCTTGAGTTCTTTACTTACTCTGATGCGAAGATGAAGAACCTG
GCGAAGAACGCGTTTGTCTCTTGGGTCAGGGGATATGCAGCTCACAAGGGAGAGCTCAAG
AGCATCTTTGTGGTGAAGAAGCTTCACTGGGGTCATGTCGCCAAGAGCTTTGCTCTTAAA
GAGCAGCCTTCTTTGGTTGGGAAATCACACCATAAGGAA*CTATGAAGAGGAAGAGAGAC
GA
CGCCA

QA 1 722 1 722
DS 

RD RS1BB23JQ 787 0 0
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TGAGTACTGATGTCGCTGCCAGAGGATTGGACTTCCCAAAAGTAAGATGTATTGTTCAAT
ACGACTGTCCCGGGGAAGCTACCGAGTATGTGCATAGAGTGGGTAGAACAGCTCGTATTG
GTGAAAAGGGAGAAGCGTTGTTGTTTCTACAGCCGGTTGAGATAGACTATCTTAAGGACC
TTAAGAAACATGGTGCGACACTTGCAGAGTATCCTCTTCTGAAAGTACTTGATAAGTTTC
CTCTGCTCCGCAACATGCCTCGCGTCAAGAAGGTTATATCCCTTGAATCACATCCCTGGG
TCATATCTCTGCAGAGAGGTCTTGAGTTCTTTACTTACTCTGATGCGAAGATGAAGAACC
TGGCGAAGAACGCGTTTGTCTCTTGGGTCAGGGGATATGCAGCTCACAAGGGAGAGCTCA
AGAGCATCTTTGTGGTGAAGAAGCTTCACTGGGGTCATGTCGCCAAGAGCTTTGCTCTTA
AAGAGCAGCCTTCTTTGGTTGGGAAATCACACCATAAGGAAACTATGAAGAGGAAGAGAG
ACGAACGCCACAAGGGGCAACACCCAAAGAAGAGAAAGAAGATGAGTGGCAATAGAAGTA
CAACAAAAACTTGATCAAAAGTCCCTTTTGCCTACCACAAACCATGACATGAGTTTTGTA
ACGAGAGAACAGTTTTGTTCATTGAAAATTTTGAAGTATTTTAAAAAGTTTGGAAACTTA
CCGAAAG

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

CO CL9013Contig1 365 2 1 U
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GGTGTATCGGCGGCTGTGGCATCTGCAGAAGACATTGATGCTGCTAACAATGCACGCTCC
AACTTTTTCGAGGTCAAGAAAGCTCTCTAAAGTGAGAAGTTCCTCACTAATAAGACTGAG
AATCTCATTACATTTTTGGCTTGATTTCTCTACTGGAGTGAATGTCTTTGGCAAAGCTTA
AATATTAAATGAGTTTTCACAGTAAAAGAAGCATTTTTTTCGCTTTTACTTGCTCGTTTT
CTCCCTGTCCAAACTTGCTATGTGATAAAGTCTTATTACAGTTTATGAAACTCAACGCGT
TACAT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 

AF RS1EN25JQ C 1
AF RS1EN25TF U 1
BS 1 365 RS1EN25TF

RD RS1EN25JQ 365 0 0
GCAACAAGTTTGAAGGACTTCAAGGATTTCGCAGAGGCAATAGATGTGGTTAGAGACAAA
GGTGTATCGGCGGCTGTGGCATCTGCAGAAGACATTGATGCTGCTAACAATGCACGCTCC
AACTTTTTCGAGGTCAAGAAAGCTCTCTAAAGTGAGAAGTTCCTCACTAATAAGACTGAG
AATCTCATTACATTTTTGGCTTGATTTCTCTACTGGAGTGAATGTCTTTGGCAAAGCTTA
AATATTAAATGAGTTTTCACAGTAAAAGAAGCATTTTTTTCGCTTTTACTTGCTCGTTTT
CTCCCTGTCCAAACTTGCTATGTGATAAAGTCTTATTACAGTTTATGAAACTCAACGCGT
TACAT

QA 1 365 1 365
DS 

RD RS1EN25TF 365 0 0
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GGTGTATCGGCGGCTGTGGCATCTGCAGAAGACATTGATGCTGCTAACAATGCACGCTCC
AACTTTTTCGAGGTCAAGAAAGCTCTCTAAAGTGAGAAGTTCCTCACTAATAAGACTGAG
AATCTCATTACATTTTTGGCTTGATTTCTCTACTGGAGTGAATGTCTTTGGCAAAGCTTA
AATATTAAATGAGTTTTCACAGTAAAAGAAGCATTTTTTTCGCTTTTACTTGCTCGTTTT
CTCCCTGTCCAAACTTGCTATGTGATAAAGTCTTATTACAGTTTATGAAACTCAACGCGT
TACAT

QA 1 365 1 365
DS 



AS 1 2

CO CL9014Contig1 602 2 1 U
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AAGGTGATTGCAAACACTCGTCATTTGTGCTCCAGATGGTTGAATGGGCAAGATGGGTTG
TGACCTGGCATTGCGAAACCATGAGCAAAGACAGATCTTCGATCTGCTCTACTGAGCCCT
TGTGCAGTTTCCCGTCTCACGCAGAAGACTGTCCGTTTTCTTATAAGCCTAATGGTAACC
AA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 

AF RS1GA75TF U 1
AF RS1GA87TF U 1
BS 1 602 RS1GA75TF

RD RS1GA75TF 602 0 0
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TGACCTGGCATTGCGAAACCATGAGCAAAGACAGATCTTCGATCTGCTCTACTGAGCCCT
TGTGCAGTTTCCCGTCTCACGCAGAAGACTGTCCGTTTTCTTATAAGCCTAATGGTAACC
AA

QA 1 602 1 602
DS 

RD RS1GA87TF 602 0 0
GCGAGGACTCGTTTGATGAAGCTATGATTACATCCGCGATTGAGAAAATGGAGTAGGCGC
TTAAGAAAGAAGGCATTGCTTATCATGTTCTCTCTGGACGGCACAAGAGCTTGTATAGTA
TCTACTGCAAGATGTTGAAGAAGAAGCTAACGGTGGATGAAATTCATGACATTCATGGGT
TACGTTTGATTGTTGACAATGAGAAAGATTGTTACAAAGCCTTAGGAGTAGTTCACAAGC
TATGGTCTGAAGTTCCTGGAAAGCTCAAGGATTACATAACTCATCCCAAGTTCAATGGGT
ACAAGTCTTTGCATACCGTAGTGATGGGCGATGGAACCATCCCACTTGAAGTTCAGATAA
GGACAAAAGAGATGCATTTGCAAGCTGAGTTTGGGTTTGCAGCTCATTGGAGGTACAAGG
AAGGTGATTGCAAACACTCGTCATTTGTGCTCCAGATGGTTGAATGGGCAAGATGGGTTG
TGACCTGGCATTGCGAAACCATGAGCAAAGACAGATCTTCGATCTGCTCTACTGAGCCCT
TGTGCAGTTTCCCGTCTCACGCAGAAGACTGTCCGTTTTCTTATAAGCCTAATGGTAACC
AA

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 2

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TT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 

AF RS1DV81JQ C 1
AF RS1DV81TF U 1
BS 1 602 RS1DV81TF

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TT

QA 1 602 1 602
DS 

RD RS1DV81TF 602 0 0
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CAAGAATCGATTCCCATCACAGGAAGGAGTAAACTTGGACAAGAACGAGCAAGAACCAGA
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CGTAATGGTGCGTGAGAAAATGCTCTCTTCTTTAACAAGTGTATATTTTATTTTCAGTGT
TT

QA 1 602 1 602
DS 



AS 1 2

CO CL9016Contig1 820 2 2 U
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CTGTTGCAAGATCTCCGGTTACAGCGCCGCCTGGATTTTCAGTCACAAGTCGACCTCCTC
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AAAGTCAAAACAGGTTCCAGAATGAGAGATTTATTGGGTCAACTAATCGGATGAGTGGTT
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ATCTTAGCTTCTGGTTGCTTTGAAACTGAGCCAAAAGAGAGGTGGTTGTAAAAAATCTTT
AGGAGGTTTATTATGCTTTTCTTTATTAACATTTCATTTGGTTTTGGAATATGTCAAATA
TGATTTTCCATTATGATACTACATAAAGATTTTGTCTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1BE94TF U 1
AF RS1BE94JQ C 86
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BS 685 820 RS1BE94JQ

RD RS1BE94TF 695 0 0
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TTCCAATTGAAAACAATGGTGGTGTCAGGGACGTTGAGTCTCTGGATCCTGCGATTTTGG
CTGTTGGCCAAGGCATTGAGAATCCAAGCCTAGATTACAGATCAAACTTTCAAGGAAACA
CAAACATGTTTTCAAACGAGACAAAGCTTCAACAACATCATCTGGGAATGCAGAGCCCCT
TGTCTTCACATCAAAACTGTAGACTCACTGATTCTTTGGGGATGGCATCAAGGTTTATGG
ATCAATCTAGAAATGTGGCATTGCCTAATGGCCACTGGGATGGGTTGAGTAACGAGATTC
AAAGTCAAAACAGGTTCCAGAATGAGAGATTTATTGGGTCAACTAATCGGATGAGTGGTT
ACAATGGGACTTTCAGGATTTAGCACCATTTGCCAGCGCTTAGATCGCCTCGACCTTTGA
ATCTTAGCTTCTGGTTGCTTTGAA
CTGAGCAAAAG

QA 1 684 1 684
DS 

RD RS1BE94JQ 735 0 0
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GAGAGAACAGCAGACATTGAATGGCTTTTCAGGTGTAGGGAACCATCGTTATTCTGAATC
ACCAGTGTACAACACCACCCCATATCATCAGTCACTTCCAATTGAAAACAATGGTGGTGT
CAGGGACGTTGAGTCTCTGGATCCTGCGATTTTGGCTGTTGGCCAAGGCATTGAGAATCC
AAGCCTAGATTACAGATCAAACTTTCAAGGAAACACAAACATGTTTTCAAACGAGACAAA
GCTTCAACAACATCATCTGGGAATGCAGAGCCCCTTGTCTTCACATCAAAACTGTAGACT
CACTGATTCTTTGGGGATGGCATCAAGGTTTATGGATCAATCTAGAAATGTGGCATTGCC
TAATGGCCACTGGGATGGGTTGAGTAACGAGATTCAAAGTCAAAACAGGTTCCAGAATGA
GAGATTTATTGGGTCAACTAATCGGATGAGTGGTTACAATGGGACTTTCAGGATTTAGCA
CCATTTGCCAGCGCTTAGATCGCCTCGACCTTTGAATCTTAGCTTCTGGTTGCTTTGAAA
CTGAGCCAAAAGAGAGGTGGTTGTAAAAAATCTTTAGGAGGTTTATTATGCTTTTCTTTA
TTAACATTTCATTTGGTTTTGGAATATGTCAAATATGATTTTCCATTATGATACTACATA
AAGATTTTGTCTTTC

QA 1 735 1 735
DS 



AS 1 2

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TGGTCCTGTGGTGATGCTGCTTTATCCGTTATATGCGTCGGTGCTAGCAATAGAGAGCCC
ATCAAAAGCAGATGATGAGCAGTGGCTTGCCTATTGGATTCTCTACTCTTTCTTAACTCT
CTCGGAACTCATCCTTCAGTCTCTCCTAGAGTGGATACCGATATGGTACACGGCGAAGCT
AATGTTGGTGGCATGGTTGGTTTTGCCGCAATTCAGAGGAGCTGCTTTCATATACAACAG
AGTCGTGAGGGAACAGTTTAGGAAGTATGGCATCCTCAAACCGAAGGTACAACACCAGAC
TCAGTGACTAAAAAGAGAATGCACAGGACACAAAGAGGCTTCAGTGTTGGTTCCTTCAAT
TTCTAATCTTTGATGCTTTCCTTTTGTCTTTCTTTCCTTTTTAATTTACGAAAACTGCGT
TTACAAGTTGACGATATGATTGTAATTTCGTTTTTTATGAGCCGTCTGCTTGAACCTATG
TGAAAAGAAGTTCACTCTGACGTCAAAAGTATTATATTTAATATATTACTAGTTTAAATT
GTT


BQ
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20 20 20 

AF RS1ER55JQ C 1
AF RS1ER55TF U 1
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TCAGTGACTAAAAAGAGAATGCACAGGACACAAAGAGGCTTCAGTGTTGGTTCCTTCAAT
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GTT

QA 1 603 1 603
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DV37JQ U 39
AF RS1DV37TF C 1
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QA 1 586 1 586
DS 

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DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1EU14TF U 1
AF RS1EU14JQ C 63
BS 1 628 RS1EU14TF
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RD RS1EU14TF 669 0 0
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ATAATTCTT

QA 1 669 1 669
DS 

RD RS1EU14JQ 685 0 0
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ACGGAGTTCGGTGACTCGGTCGGCTGGTCTTGGTACGAATATCGGATCCAGATTCGCTCG
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CATCTCTGATTCAGAATGGCAAACACAGGTTCTCGAGTCAGACGTACCAGTATTGGTCGA
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CAAGGATTTCGCAGGCAAGTTCAAATTCTACAAAATCAACACCGACGAGAGCCCAAACAC
AGCCAACCGTTACGGTATACGCAGCGTTCCCACGGTGATCATATTCAAAGACGGTGAGAA
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CGTGGTCGAGTAACTAAACAAAAAAAACAACAAATTTCACTCATGTCTTCTGTGTTGTAT
AATTCTTCGTAAGGTTTCTTTTGACTATTTATGTTTCCATTCGCCTACTTGTCTTGTTTA
GTATAATGAAAAAAAGGGAATAACG

QA 1 685 1 685
DS 



AS 1 2

CO CL9020Contig1 870 2 2 U
GGATCACTTAAACAAGCCAGCTGTGACCGCAAGCAACGAGAGAGAAAGAAAAATGGTGCT
AAAGGTGTACGGACCTCACTTTGCCTCACCGAAGCGAGCTCTGGTAACGCTCATCGAGAA
GGGCGTTGCCTTTGAGACCGTCCCCGTCGATCTCATGAAAGGAGAACACAAGCAGCCTGC
TTATCTCGCCTTGCAGCCTTTCGGTACCGTCCCTGCTGTTGTCGACGGAGACTACAAACT
CTTCGAGTCACGTGCCGTCATGAGGTACGTTGCTGAGAAGTACAGGTCACAAGGACCTGA
CCTTTTGGGGAAAACCGTGGAAGAAAGAGGACAAGTTGAGCAATGGCTTGACGCGGAGGC
GACCACTTACCACCCACCGCTACTGAACCTTACACTTCACATAATGTTCGCGTCAGTCAT
GGGATTCCCATCCGATGAGAAGCTGATCAAGGAGAGCGAAGAGAAACTCTCGGCTGTTCT
CGATGTGTACGAGGCACATCTCTCAAAGAGCAAGTACTTGGCCGGTGACTTTGTGAGTTT
GGCTGATTTGGCTCACCTCCCCTTCACTGATTACTTGGTCGGTCCGATCGGGAAAGCTTA
CATGATCAAAGATAGGAAGCACGTGAACGCGTGGTGGAACGAGATCAGCAGCCGTCCTGC
GTGGAAGCAGACTCTTGAGAAGTATTCATTCCCGGCTTAAGGACAATGATGTTCTTGATG
TTGTTGTCTTTTGTATGCGTTTATATGAGGTTTTAATAACTGTATGTCTCCTCTTATGTT
ATGTTACCTCTCTGTTCTGTTTCCCTTTGTAACTCCAACTCTTTTGTGTGGTTTCAGTGA
GGCTTTTAATTAGAGGAACTTAATTATCAC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EQ69TF U 1
AF RS1EQ69JQ C 224
BS 1 690 RS1EQ69TF
BS 691 870 RS1EQ69JQ

RD RS1EQ69TF 690 0 0
GGATCACTTAAACAAGCCAGCTGTGACCGCAAGCAACGAGAGAGAAAGAAAAATGGTGCT
AAAGGTGTACGGACCTCACTTTGCCTCACCGAAGCGAGCTCTGGTAACGCTCATCGAGAA
GGGCGTTGCCTTTGAGACCGTCCCCGTCGATCTCATGAAAGGAGAACACAAGCAGCCTGC
TTATCTCGCCTTGCAGCCTTTCGGTACCGTCCCTGCTGTTGTCGACGGAGACTACAAACT
CTTCGAGTCACGTGCCGTCATGAGGTACGTTGCTGAGAAGTACAGGTCACAAGGACCTGA
CCTTTTGGGGAAAACCGTGGAAGAAAGAGGACAAGTTGAGCAATGGCTTGACGCGGAGGC
GACCACTTACCACCCACCGCTACTGAACCTTACACTTCACATAATGTTCGCGTCAGTCAT
GGGATTCCCATCCGATGAGAAGCTGATCAAGGAGAGCGAAGAGAAACTCTCGGCTGTTCT
CGATGTGTACGAGGCACATCTCTCAAAGAGCAAGTACTTGGCCGGTGACTTTGTGAGTTT
GGCTGATTTGGCTCACCTCCCCTTCACTGATTACTTGGTCGGTCCGATCGGGAAAGCTTA
CATGATCAAAGATAGGAAGCACGTGAACGCGTGGTGGAACGAGATCAGCAGCCGTCCTGC
GTGGAAGCAGACTCTTGAGAAGTATTCATT

QA 1 690 1 690
DS 

RD RS1EQ69JQ 647 0 0
GACGGAGACTACAAACTCTTCGAGTCACGTGCCGTCATGAGGTACGTTGCTGAGAAGTAC
AGGTCACAAGGACCTGACCTTTTGGGGAAAACCGTGGAAGAAAGAGGACAAGTTGAGCAA
TGGCTTGACGCGGAGGCGACCACTTACCACCCACCGCTACTGAACCTTACACTTCACATA
ATGTTCGCGTCAGTCATGGGATTCCCATCCGATGAGAAGCTGATCAAGGAGAGCGAAGAG
AAACTTTCGGCTGTTCTCGATGTGTACGAGGCACATCTCTCAAAGAGCAAGTACTTGGCC
GGTGACTTTGTGAGTTTGGCTGATTTGGCTCACCTCCCCTTCACTGATTACTTGGTCGGT
CCGATCGGGAAGGCTTACATGATCAAAGATAGGAAGCACGTGAACGCGTGGTGGAACGAG
ATCAGCAGCCGTCCTGCGTGGAAGCAGACTCTTGAGAAGTATTCATTCCCGGCTTAAGGA
CAATGATGTTCTTGATGTTGTTGTCTTTTGTATGCGTTTATATGAGGTTTTAATAACTGT
ATGTCTCCTCTTATGTTATGTTACCTCTCTGTTCTGTTTCCCTTTGTAACTCCAACTCTT
TTGTGTGGTTTCAGTGAGGCTTTTAATTAGAGGAACTTAATTATCAC

QA 1 647 1 647
DS 



AS 1 2

CO CL9021Contig1 643 2 4 U
GGACCTTTGAACGCATTCTCCTTGACTTCCTTTCTCAGAATCTTCTACTATAAAAAGGTA
TTTTCTACCTTGAGAAATTCATCAGTTCAATTCTCAATCATTAGCTTTTCTCCAGTATCG
AAACGGCCTTACCTCATAGCCGATTTGAAGGTTGGTCAAAGTTATCTTCTTCTGAGAGAT
TCAGGGCTTTGTTCTATATTGTATAGAGACATGTAACATGGATGATGAATGCGTTAATGC
GATGTTTTGGTATAGAAGAAAAGATGAGGGACCACTATGAACTGTGGAGGAACGATTGGA
GCATGTTGTGTGGCATCCAGGTGTCTTCTTGATAGCATCTCCGTTCTGTTTCTCAAATTC
ACCTCTTCATTTTCTTGGCCATCTCTTGAGCACAATCTCTTCCTTTGGTATTCATTTTAG
TACTCAAGCGATGTTTGTAATGAAATATAAACACTTGGGTTGATCTTATCTAACGCTGAG
AAGATGGAGATGGTGCCAAGGAAGAAGGATTAGGGTTCTTGAAGAAGTTGTTTAGAGAAA
ATTGTGAACAGAAAAATAATGTATTGCCTTTTAATTAACGAGGAAAAACAATGAATAAAA
CCAATGATATAAAGTTTTTTTTAGAGCTTTTGTCTTTGTACGG


BQ
10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EC80JQ C 1
AF RS1EC80TF U 5
BS 1 4 RS1EC80JQ
BS 5 621 RS1EC80TF
BS 622 622 RS1EC80JQ
BS 623 643 RS1EC80TF

RD RS1EC80JQ 643 0 0
GGACCTTTGAATGCATTCTCCTTGACTTCCTTTCTCAGAATCTTTTACTATAAAAAGGTA
TTTTCTACCTTGAGAAATTCATCAGTTCAATTCTCAATCATTAGCTTTTCTCCAGTATCG
AAACGGCCTTACCTCCTAGCCGATTTGAAGGTTGGTCAAAGTTATCTTTTTTTGAGAGAT
TCAGGGCTTTGTTTTATATTGTATAGAGACATGTAACATGGATGATGAATGCGTTAATGC
GATGTTTTGGTATAGAAGAAAAGATGAGGGACCACTATGAACTGTGGAGGAACGATTGGA
GCATGTTGTGTGGCATCCAGGTGTTTTCTTGATAGCATCTCCGTTCTGTTTCTCAAATTC
ACCTCTTCATTTTCTTGGCCATCTCTTGAGCACAATCTCTTCCTTTGGTATTCATTTTAG
TACTCAAGCGATGTTTGTAATGAAATATAAACACTTGGGTTGATCTTATCTAACGCTGAG
AAGATGGAGATGGTGCCAAGGAAGAAGGATTAGGGTTCTTGAAGAAGTTGTTTAGAGAAA
ATTGTGAACAGAAAA*TAATGTATTGCCTTTTAATTAACGAGGAAAAACAATGAATAAAA
CCAATGATATAAAGTTTTTTTTAGAGCTTTTGTCTTTGTACGG

QA 1 643 1 643
DS 

RD RS1EC80TF 639 0 0
CTTTGAACGCATTCTCCTTGACTTCCTTTCTCAGAATCTTCTACTATAAAAAGGTATTTT
CTACCTTGAGAAATTCATCAGTTCAATTCTCAATCATTAGCTTTTCTCCAGTATCGAAAC
GGCCTTACCTCATAGCCGATTTGAAGGTTGGTCAAAGTTATCTTCTTCTGAGAGATTCAG
GGCTTTGTTCTATATTGTATAGAGACATGTAACATGGATGATGAATGCGTTAATGCGATG
TTTTGGTATAGAAGAAAAGATGAGGGACCACTATGAACTGTGGAGGAACGATTGGAGCAT
GTTGTGTGGCATCCAGGTGTCTTCTTGATAGCATCTCCGTTCTGTTTCTCAAATTCACCT
CTTCATTTTCTTGGCCATCTCTTGAGCACAATCTCTTCCTTTGGTATTCATTTTAGTACT
CAAGCGATGTTTGTAATGAAATATAAACACTTGGGTTGATCTTATCTAACGCTGAGAAGA
TGGAGATGGTGCCAAGGAAGAAGGATTAGGGTTCTTGAAGAAGTTGTTTAGAGAAAATTG
TGAACAGAAAAATAATGTATTGCCTTTTAATTAACGAGGAAAAACAATGAATAAAACCAA
TGATATAAAGTTTTTTT*AGAGCTTTTGTCTTTGTACGG

QA 1 639 1 639
DS 



AS 1 2

CO CL9022Contig1 818 2 2 U
GGAACACAAACACATTTTCCTTCTCAACATCTTAAGTAGACGCAGGACCAAGTTTCTAAA
CAGACACACTCGTCGACTGCTCTCTCTCCCTCTTTCGCTCTCTCGTAGAGAAGTCATGAA
AGGACAAAACCAAAGCTCAACATCTTCTTGTAACATCCATCCAATAGATTTTGTTGAAGG
TGTGTGTCCTATCTGTCTCAACGAGAGGCTTCTAGTATTGGCTTATTTACAGAGAAGACA
TGCTCCATCTCCTTCTCCTTCTCCTTCCTACCATACCATCCAAGGACAGAAAGTCAGTTC
CCAAAAATCTTCCAAGAATAAAAACATCAGACTCTTCTCGTTCCTTCGCTCCTTCCAACT
GCGAGAGCAAAAGTCTAATCAGCGAACCAACTCCATCATCAGTCCAGAAGATTCATTCAT
TTCGATTAATTTCAAAAACAACGGAACAACTTCATGGGAAAAGGAAAAGGAAAGTTACCA
ACTTGAACACTCCAAGGCTTCACGCGATCATCGATATCAACATATCACAAAGAAGAAAGA
GATTTTTCCTCGGCTCATGCAACGGCCTCTGTTGACGTGGAGCAAACAGATTGGCAGAAT
CATACACGTCATCAGTTTCAGGAGGCAGTCTAGCGCGAAGATTAAAGGGGATGATGATGG
CTTGAGTAGAAGTAGCTTGAAGCCTTCGCCCCTAACCAAAAAGAAAACGCACAGTCTGGA
ATCTTCTGTATAATCATTTTTGTTACAACAGCGGCGGACCGAGCAAAAAAATTATGTGAG
ATCGTATTATAAATAAAATTGTGTAAATCTGATTTTTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1H667TF U 1
AF RS1H667JQB C 94
BS 1 695 RS1H667TF
BS 696 818 RS1H667JQB

RD RS1H667TF 695 0 0
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CAGACACACTCGTCGACTGCTCTCTCTCCCTCTTTCGCTCTCTCGTAGAGAAGTCATGAA
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TGTGTGTCCTATCTGTCTCAACGAGAGGCTTCTAGTATTGGCTTATTTACAGAGAAGACA
TGCTCCATCTCCTTCTCCTTCTCCTTCCTACCATACCATCCAAGGACAGAAAGTCAGTTC
CCAAAAATCTTCCAAGAATAAAAACATCAGACTCTTCTCGTTCCTTCGCTCCTTCCAACT
GCGAGAGCAAAAGTCTAATCAGCGAACCAACTCCATCATCAGTCCAGAAGATTCATTCAT
TTCGATTAATTTCAAAAACAACGGAACAACTTCATGGGAAAAGGAAAAGGAAAGTTACCA
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GATTTTTCCTCGGCTCATGCAACGGCCTCTGTTGACGTGGAGCAAACAGATTGGCAGAAT
CATACACGTCATCAGTTTCAGGAGGCAGTCTAGCGCGAAGATTAAAGGGGATGATGATGG
CTTGAGTAGAAGTAGCTTGAAGCCTTCGCCCCTAA

QA 1 695 1 695
DS 

RD RS1H667JQB 725 0 0
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CATCCATCCAATAGATTTTGTTGAAGGTGTGTGTCCTATCTGTCTCAACGAGAGGCTTCT
AGTATTGGCTTATTTACAGAGAAGACATGCTCCATCTCCTTCTCCTTCTCCTTCCTACCA
TACCATCCAAGGACAGAAAGTCAGTTCCCAAAAATCTTCCAAGAATAAAAACATCAGACT
CTTCTCGTTCCTTCGCTCCTTCCAACTGCGAGAGCAAAAGTCTAATCAGCGAACCAACTC
CATCATCAGTCCAGAAGATTCATTCATTTCGATTAATTTCAAAAACAACGGAACAACTTC
ATGGGAAAAGGAAAAGGAAAGTTACCAACTTGAACACTCCAAGGCTTCACGCGATCATCG
ATATCAACATATCACAAAGAAGAAAGAGATTTTTCCTCGGCTCATGCAACGGCCTCTGTT
GACGTGGAGCAAACAGATTGGCAGAATCATACACGTCATCAGTTTCAGGAGGCAGTCTAG
CGCGAAGATTAAAGGGGATGATGATGGCTTGAGTAGAAGTAGCTTGAAGCCTTCGCCCCT
AACCAAAAAGAAAACGCACAGTCTGGAATCTTCTGTATAATCATTTTTGTTACAACAGCG
GCGGACCGAGCAAAAAAATTATGTGAGATCGTATTATAAATAAAATTGTGTAAATCTGAT
TTTTG

QA 1 725 1 725
DS 



AS 1 2

CO CL9023Contig1 815 2 7 U
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TGTCTCTGTTTTTGAAGCAGTCTTCAAAAGAAAACATTTCAGGTATGTTTTATTGGAAGT
GGATGAGCCTCGGTGTTGAAAACAAACTTATCCAATGGAATCACCGAATCATCTCCAAAG
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CGAGGAGGCACTTCCGTTACATCATCCAATGATGTGTACCCACCTGTCTTCACCTTTGTG
TACTTATCAAACGCTTCAAAAATCTGCCAACCTTGATCTCTGTATTTTGTGTCTTTCGTG
ATACGGTAGAGGACGAAGAGTGATTCAACAGTTTCAGGGCGCAGTAGATTATGTCGATCA
GCCTGGTGTATGATTATGTCTTTTGCATACATTGAACTCTTATTCCCACCTTCAAGACCA
TCCTCAGAGTATTCCCCTGTGTGGAAGTAAGCAATTTCTGGAGCGAGGCCAGTGGCAGTT
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ACAAGCAAATGCCTGACCCCTTTCATGGCCTCAGT


BQ
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AF RS1CL96JQ U 3
AF RS1DJ02JQ U 1
BS 1 65 RS1DJ02JQ
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TCTCTGTTTTTGAAGCAGTCTTCAAAAGAAAACATTTCAGGTATGTTTTATTGGAAGTGG
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CAAGTATAAGTACTTCAACGTTTCACCAAGGAAAAAAGTCTCCATCTTATCTCTCCTACG
AGGAGGCACTTCCGTTACATCATCCAATGATGTGTACCCACCTGTCTTCACCTTTGTGTA
CTTCTCAAACGCTTCAAAGATCTGCCAACCTTGATCTCTGTATTTTGTGTCTTTTGTGAT
ACGGTAGAGGACGAAGAGTGATTCAACAGTTTCAGGGCGCAGTAGATTATGTCGATCAGC
CTGGTGTATGATTATGTCTTTTGCATACATTGAACTCTTATTCCCACCTTCAAGACCATC
CTCAGAGTATTCCCCTGTGTGGAAGTAAGCAATTTCTGGAGCGAGGCCAGTGGCAGTTAC
TTCATACATCTCAAAGCATGCTTTCGCTAGCTCTTCCGCAAGTTTCAAGTTTTCCAGGTC
CTCAAAGGATAAAAGATTTTCCGCCAGGGCCTTCTCCTTTGTGAGTCCCTTGGT
AGCA

QA 1 654 1 654
DS 

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GGATGAGCCTCGGTGTTGAAAACAAACTTATCCAATGGAATCACCGAATCATCTCCAAAG
AGCAAGTATAAGTACTTCAACGTTTCACCAAGGAAAAAAGTCTCCATCTTATCTCTCCTA
CGAGGAGGCACTTCCGTTACATCATCCAATGGTGTGTACCCACCTGTCTTCACCTTTGTG
TACTTATCAAACGCTTCAAAAATCTGCCAACCTTGATCTCTGTATTTTGTGTCTTTCGTG
ATACGGTAGAGGACGAAGAGTGATTCAACAGTTTCAGGGCGCAGTAGATTATGTCGATCA
GCCTGGTGTATGATTATGTCTTTTGCATACATTGAACTCTTATTCCCACCTTCAAGACCA
TCCTCAGAGTATTCCCCTGTGTGGAAGTAAGCAATTTCTGGAGCGAGGCCAGTGGCAGTT
ACTTCATACATCTCAAAGCATGCTTTCGCTAGCTCTTCTGCAAGTCTCAAATTCTCCAAA
TCCTCAAAGGATAAAAGATTTTCCGCCAGGGCCTTCTCCTTTGTGAGTCCCTTGGTCGCA
CCAAGAGCAAGAGTACCAGGCAAGAAGCAAACCAGATGATCCATTTTTGGACTGAACTCT
CCCTTTGACCCATAAGGTAACTCTCCTACGAAGACAAGACCTTTTGGAACTGATTTGCGG
ACAAGCAAATGCCTGACCCCTTTCATGGCCTCAGT

QA 1 815 1 815
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL9025Contig1 768 2 1 U
CAAAATTGTGGTCGTGGAAGCAATAAGATCGTTGTGCGTGAAATTCCCACTGAAGTATAG
ATCCCTGATGACCTTCTTAAGCAACATTCTTAGGGAAGAAGGTGGATTTGAATATAAAAG
AGCTATAGTAGATTCTATTGTGACCATTATCAGAGATATCCCTGATGCGAAGGAAAGTGG
ATTGCTTCATCTTTGTGAGTTCATCGAAGATTGTGAATTCACTTATCTTTCAACACAGAT
CCTTCATTTTCTGGGAATTGAGGGGCCTAACACCTCCGATCCAAGCAAGTATATACGATA
TATTTATAATCGTGTGCATCTGGAAAATGCCACTGTCCGGGCTGCTGCTGTTTCTACACT
TGCAAAGTTTGGATTTATGGTTGATTCCTTGAAGCCCCGTATTACCATTCTGTTGAAGCG
CTGCATCTATGACAGTGATGATGAGGTCCGTGATAGAGCAACACTATTTTTGAGCGTCCT
TGGTGGTGATGGTACTATTGACACTGAGAAAGATAGCAAGGAGTTTCTATTTGGTTCCCT
TGAGGTTCCTCTGGTCAACATGGAAACTAGTCTGAAGAATTATGATCCCTCTGAAGAAGC
TTTTGACATCAACTCTGTGCCTAGGGAAGTAAAATCCCAGCCCCTTGCAGAGAAGAAAGC
CCAGGGTAAAAGCCCACTGGTCTCGGTGCGCACCAACTGCACTACTTCTGGATTTGATGG
CTATGAAAGACTCTCTCATCTATCCTGAGTTGCGCTTTGGAAACTTTC


BQ
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AF RS1GJ40TF U 1
AF RS1DN78TF U 1
BS 1 768 RS1DN78TF

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TATTTATAATCGTGTGCATCTGGAAAATGCCACTGTCCGGGCTGCTGCTGTTTCTACACT
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DS 

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ATCCCTGATGACCTTCTTAAGCAACATTCTTAGGGAAGAAGGTGGATTTGAATATAAAAG
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ATTGCTTCATCTTTGTGAGTTCATCGAAGATTGTGAATTCACTTATCTTTCAACACAGAT
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TATTTATAATCGTGTGCATCTGGAAAATGCCACTGTCCGGGCTGCTGCTGTTTCTACACT
TGCAAAGTTTGGATTTATGGTTGATTCCTTGAAGCCCCGTATTACCATTCTGTTGAAGCG
CTGCATCTATGACAGTGATGATGAGGTCCGTGATAGAGCAACACTATTTTTGAGCGTCCT
TGGTGGTGATGGTACTATTGACACTGAGAAAGATAGCAAGGAGTTTCTATTTGGTTCCCT
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CTATGAAAGACTCTCTCATCTATCCTGAGTTGCGCTTTGGAAACTTTC

QA 1 768 1 768
DS 



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TTACCATGACCACAATCACTTTTGTGTGTTAGCCCCATAATAATCTCAAAAGAAAGCGAT
TTCTGTG


BQ
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AF RS1E988JQ C 1
AF RS1E988TF U 1
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TTCTGTG

QA 1 607 1 607
DS 

RD RS1E988TF 607 0 0
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CATGCTAACAAATTCGAAGGAAAGCTGGAGAAGACGCTACGAGAGGTTGGCGAAATGTTT
GTAGACCGAACAGAGTCTAAGCTTCGTTCCTCCGGGAAACCGGTTTTGATGTTTACACTT
CAATGGATACTTCCTATATGGATTGTGTCTCTGCTTTTCGCTTGTGGAATCATCAAACTT
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TTACCATGACCACAATCACTTTTGTGTGTTAGCCCCATAATAATCTCAAAAGAAAGCGAT
TTCTGTG

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 2

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TTCCGTTTATTAACTATTTTTAGGATAATATCATATATATAATTTTCAAATTTGATTTTC
TTTT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RS1CX78TF U 1
AF RS1CX78JQ C 79
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BS 689 707 RS1CX78TF
BS 708 724 RS1CX78JQ

RD RS1CX78TF 707 0 0
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CACAATCTAGATTAGATTAGTCAACGACAGAGTGGGCCCTGCACTGTACTTTCTTATATT
CTTGCTTTTTGCTTTATTTTGCTTTTTAAAAATGGGGAAAATAGAGGGCAAAGATAGAGA
CGAGAGAAGAACGTTGTGGATCTTGACTCTTGATGGAACTTGA*TCATGTGAATGTCCTT
TTCCGTTTATTAACTATTTTTAGGATA*TATCATATATATAATTTTC

QA 1 707 1 707
DS 

RD RS1CX78JQ 646 0 0
GTGTAGTTCAACCCCCTCAGGGCGTTGCCATTGTACCAAGAAAAGGAAATCTAGAGTGAA
AAGAGTGATTAGAGTTCCTGCGGTAAGCAGCAAGATGGCTGATATTCCTTCAGATGAGTT
TTCATGGAGAAAATATGGTCAAAAACCCATCAAAGGCTCTCCTCACCCTCGGGGCTATTA
CAAGTGCAGCAGCATGAGAGGTTGTCCGGCGCGTAAGCATGTGGAGCGTGCACCGGACGA
CGCGATGATGCTTATCGTGACGTATGAAGGAGACCACAACCATGCTATGGTGCTCGAGAC
GCATCATGACAAAACTCTTTAATTTCGGTCGTTGCCGGCGTGAAATTTGAACCGTTCGAT
CTAAGTTTGAAGTGAACCCAACTGTAGTTGTGTCTGTCTGTGCACAATCTAGATTAGATT
AGTCAACGACAGAGTGGGCCCTGCACTGTACTTTTTTATATTCTTGCTTTTTGCTTTATT
TTGCTTTTTAAAAATGGGGAAAATAGAGGGCAAAGATAGAGACGAGAGAAGAACGTTGTG
GATCTTGACTCTTGATGGAACTTGAATCATGTGAATGTCCTTTTCCGTTTATTAACTATT
TTTAGGATAATATCATATATATAATTTTCAAATTTGATTTTCTTTT

QA 1 646 1 646
DS 



AS 1 2

CO CL9028Contig1 781 2 3 U
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TGGACCACTCTGCATACTTTGATTTGATCAAACAAAACAAACGACAAATATATAGAAATG
AAATTGATCCCCAACGAAAAGACCATCTAACATTTTTCACAAAAAGATATTTGTATATAA
AAAAACAATTTCAGAGATGAAAAACAATAAACTATTTAATTATTTACATAAGACTTTTTT
ATAATAATAATTTGAAGAGTAGGTGAGACCAGAAAACTTAGTACCGTTCGCCACCAGCCT
CACTTCTCATAGGCGAGTTCAGTCCATTTCTCAAAGTTGTCCGGTGGTTTCCTCCGCCGG
GCGACTTAGGTGTTGGAGACTTAGTCCTAGGAGAGTTAGCTGTTGGCGATAATCGATGAT
GATGATTGTTTTCTCGATGATGATGACTCTTACGAGGCTTATTACTTTCCCTAACACGAC
CTTCGTCTTCTCTATTATCGGAAACTGACTTCTCGGGAGTGTTCGGAACCGTGTAAGTGA
ATGTCCCCATGGGAATATCATTATAGTCCTTAAGATCGTTGAGGATAGAGACGACCGTGC
CCATACAAGGACGGTTCTTGGGTCGATGGCTTAAGCACAGGTAAGCCAAAGCCGCTGCTT
TCTTTGCACCTGCCTCTGAGTATTGACCTTCAAGCCTCGGGTCCATGATCCTATCAAGTT
TACGAGCGTCCTTTAGCATTGGACGAGCCCAATCCACAAGATTTTGTTCCCTTGAAGATC
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1FQ46JQ U 9
AF RS1FQ46TF C 1
BS 1 8 RS1FQ46TF
BS 9 605 RS1FQ46JQ
BS 606 781 RS1FQ46TF

RD RS1FQ46JQ 597 0 0
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TTTCAGAGATGAAAAACAATAAACTATTTAATTATTTACATAAGACTTTTTTATAATAAT
AATTTGAAGAGTAGGTGAGACCAGAAAACTTAGTACCGTTCGCCACCAGCCTCACTTCTC
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GGTGTTGGAGACTTAGTCCTAGGAGAGTTAGCTGTTGGCGATAATCGATGATGATGATTG
TTTTCTCGATGATGATGACTCTTACGAGGCTTATTACTTTCCCTAACACGACCTTCGTCT
TCTCTATTATCGGAAACTGACTTCTCGGGAGTGTTCGGAACCGTGTAAGTGAATGTCCCC
ATGGGAATATCATTATAGTCCTTAAGATCGTTGAGGATAGAGACGACCGTGCCCATA

QA 1 597 1 597
DS 

RD RS1FQ46TF 781 0 0
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AAATTGATCCCCAACGAAAAGACCATCTAACATTTTTCACAAAAAGATATTTGTATATAA
AAAAACAATTTCAGAGATGAAAAACAATAAACTATTTAATTATTTACATAAGACTTTTTT
ATAATAATAATTTGAAGAGTAGGTGAGACCAGAAAACTTAGTACCGTTCGCCACCAGCCT
CACTTCTCATAGGCGAGTTCAGTCCATTTCTCAAAGTTGTCCGGTGGTTTCCTCCGCCGG
GCGACTTAGGTGTTGGAGACTTAGTCCTAGGAGAGTTAGCTGTTGGCGATAATCGATGAT
GATGATTGTTTTCTCGATGATGATGACTCTTACGAGGCTTATTACTTTCCCTAACACGAC
CTTCGTCTTCTCTATTATCGGAAACTGACTTCTCGGGAGTGTTCGGAACCGTGTAAGTGA
ATGTCCCCATGGGAATATCATTATAGTCCTTAAGATCGTTGAGGATAGAGACGACCGTGC
CCATACAAGGACGGTTCTTGGGTCGATGGCTTAAGCACAGGTAAGCCAAAGCCGCTGCTT
TCTTTGCACCTGCCTCTGAGTATTGACCTTCAAGCCTCGGGTCCATGATCCTATCAAGTT
TACGAGCGTCCTTTAGCATTGGACGAGCCCAATCCACAAGATTTTGTTCCCTTGAAGATC
C

QA 1 781 1 781
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AR11TFB U 1
AF RS1AR11JQ C 109
BS 1 572 RS1AR11TFB

RD RS1AR11TFB 572 0 0
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TCGTCGCTCAGCGCAAGAAGTCGTTGATCTACGCCGATAAAGGTGACGGGAACATTCTTG
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CGTTGAAAGATGGCGAGAAAGCAAAAGACTACGTTACTGAGAAGAACGTTGAAGCCAAAG
ACACTGCATTGGATGAAGCTCAGAAAGTTTTGGATTATGTGAAGGAAAAAGGAAACGAAG
GGGAGGCTAAGGACACCACAAAGGCATGATGATTCAACCACTTAACTAGTATATATATTA
TATATGTATCAATCCTTCAGGTTTCATGTTAAATATTTTACAACACGATCAGTTTGTCTA
TTTCACTATTTGAAATAAAAGATATGTTACTT

QA 1 572 1 572
DS 

RD RS1AR11JQ 464 0 0
CTTTCCCCAGCGGAGCAGCCAAGCAGAGCGGCGTTGGAGCCGTCGGTTTTGGCCGGAAAA
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GGAACATTCTTGATGACCTCAACGAGGCCACAAAGAGAGCTTCGGATTATGTGACAGAGA
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AAGGAAACGAAGGGGAGGCTAAGGACACCACAAAGGCATGATGATTCAACCACTTAACTA
GTATATATATTATATATGTATCAATCCTTCAGGTTTCATGTTAAATATTTTACAACACGA
TCAGTTTGTCTATTTCACTATTTGAAATAAAAGATATGTTACTT

QA 1 464 1 464
DS 



AS 1 2

CO CL9031Contig1 800 2 14 U
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TAAAATCGAAATGGAGTGTGTGTTCGGTTTAGTAGGGGACGGATTCGCGATCGTAGCGGC
GGATACATCGGCGGTTCACAGCATACTCCTCCACAAAAACAACGAGGACAAGATCATGCT
TCTTGACTCTCACAAGCTCGTTGCTGCCAGCGGCGAGCCTGGCGACCGGGTTCAGTTTAC
GGAGTACGTTCAGAAGAACGTGTCCTTGTACAAGTTCCGCAACGGCATCCCTTTGACTAC
TGCCGCCGCCGCCAACTTCACTCGCGGCGAGCTCGCCACTGCTTTGAGAAAGAATCCGTA
CTCCGTGAATATCTTGATGGCTGGCTACGACAATGAGAGTGGCGCATCCCTTTACTACAT
CGACTACATTGCAACCCTTCACAAAGTTGACAAGGGAGCTTTCGGCTACGGCTCTTACTT
CTCCCTCTCCACCATGGACAGGCATTACCGCAGCGACATGTCTGTTGAAGAAGCCATCGA
ACTGGTCGACAAATGCATACTTGAGATCCGATCAAGACTGGTCGTTGCGCCTCCTAACTT
TGTGATCAAGATTGTTGACAAAGACGGAGCTCGTGATTACGCTTGGCACCAGTCCGTACA
GGACGTCACTACTGCTGCTGTCTGAGTTAGTTTGCTTTATGCTGTTACATTTGCTTTTAT
TTTGGAGACTATGTTTCCGACTTCTTTATTTAGTTTGAGAATCAAACATTGAGCATCAAG
CAAATGATATATTTCTTCAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1FQ78TF U 1
AF RS1BM52TF U 75
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TAAAATCGAAATGGAGTGTGTGTTCGGTTTAGTGGGGGACGGATTCGCGATCGTGGCGGC
GGATACATCGGCGGTTCACAGCATACTCCTCCACAAAAACAACGAGGACAAGATCATGCT
TCTTGACTCTCACAAGCTCGTTGCTGCCAGCGGCGAGCCTGGCGACCGGGTTCAGTTTAC
GGAGTACGTTCAGAAGAACGTGTCCTTGTACAAGTTCCGCAACGGCATCCCTTTGACTAC
TGCCGCCGCCGCCAACTTCACTCGCGGCGAGCTCGCCACTGCTTTGAGAAAGAATCCGTA
CTCCGTGAATATCTTGATGGCTGGCTACGACAATGAGAGTGGCGCATCCCTTTACTACAT
CGACTACATTGCAACCCTTCACAAAGTTGACAAGGGAGCTTTCGGCTACGGCTCTTACTT
CTCCCTCTCCACCATGGACAGGCATTACCGCAGCGACATGTCTGTTGAAGAGGCCATCGA
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TGTGATCAAGATTGTTGACAAAGACGGAGCTCGTGATTACGCTTGGCGCCAGTCCGTACA
GGACGTCACTACTGCTGCTGTCTGAGTTTGTTTG*TTTATGCTGTTACATTTGCTTT
ATTT

QA 1 717 1 717
DS 

RD RS1BM52TF 726 0 0
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TTCACAGCATACTCCTCCACAAAAACAACGAGGACAAGATCATGCTTCTTGACTCTCACA
AGCTCGTTGCTGCCAGCGGCGAGCCTGGCGACCGGGTTCAGTTTACGGAGTACGTTCAGA
AGAACGTGTCCTTGTACAAGTTCCGCAACGGCATCCCTTTGACTACTGCTGCCGCCGCCA
ACTTCACTCGCGGCGAGCTCGCCACTGCTTTGAGAAAGAATCCGTATTCCGTGAATATCT
TGATGGCTGGCTACGACAATGAGAGTGGCGCATCCCTTTACTACATCGACTACATTGCAA
CCCTTCACAAAGTTGACAAGGGAGCTTTCGGCTACGGCTCTTACTTCTCCCTCTCCACCA
TGGACAGGCATTACCGCAGCGACATGTCTGTTGAAGAAGCCATCGAACTGGTCGACAAAT
GCATACTTGAGATCCTATCAAGACTGGTCGTTGCGCCTCCTAACTTTGTGATCAAGATTG
TTGACAAAGACGGAGCTCGTGATTACGCTTGGCACCAGTCCGTACAGGACGTCACTACTG
CTGCTGTCTGAGTTAGTTTGCTTTATGCTGTTACATTTGCTTTTATTTTGGAGACTATGT
TTCCGACTTCTTTATTTAGTTTGAGAATCAAACATTGAGCATCAAGCAAATGATATATTT
CTTCAG

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

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TGTCGTTATGTGGAAGTTGAAAATAGGAGAGGGAAATGGGGAAGACCCTTACTTGCTCAG
CAGCAACAACTTTGTCGGACGTCAAACATGGAATTTTGATCCCAAAGCCGGCACGTCAGA
GGAACGAGGCGCCGTCGAAGAAGCTCGCCGGCATTTCTTGATCAACCGTCCTCGTGTAAA
AGGCTGCAGTGATATCTTGTGGAGAATGCAATTTCTGAAAGATGCAAAATTCGAGCAAGC
CATCCCGCCGGTGAAGATCGACGGCGACGAAGGCGTAACTTACGAGAAAGCGACGGATGC
GTTACGGAGAGGAATTTCTTTCTTCTCGGCTCTGCAAGCCTCCGACGGTCACTGGCCTGG
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TTCATGGGGGAAAATATGGCTATCGATACTTGGAATCTATGATTGGTCAGGAACCAATCC
GATGCCTCCTGAGATCTGGTTGCTACCTTCGTGTCTTCCAATACACTTAGCGAAAACTTT
GTGCTATTGCCGGATGGTTTACATGCCGATGTCGTATCTATATGGGAAGAGGTTTGTTGG
TCCTGTAACACCTCTTATCCTGCAACTGCGTGACGAACTCCATTTGCAACCTTACG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1E964TF U 1
AF RS1E964JQ C 170
BS 1 641 RS1E964TF
BS 642 642 RS1E964JQ
BS 643 670 RS1E964TF
BS 671 956 RS1E964JQ

RD RS1E964TF 670 0 0
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TGTCGTTATGTGGAAGTTGAAAATAGGAGAGGGAAATGGGGAAGACCCTTACTTGCTCAG
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GGAACGAGGCGCCGTCGAAGAAGCTCGCCGGCATTTCTTGATCAACCGTCCTCGTGTAAA
AGGCTGCAGTGATATCTTGTGGAGAATGCAATTTCTGAAAGATGCAAAATTCGAGCAAGC
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GTTACGGAGAGGAATTTCTTTCTTCTCGGCTCTGCAAGCCTCCGACGGTCACTGGCCTGG
AGAAATCACCGGACCTCTCTTCTTCCTTCCTCCGTTGGTATTTTGTTTGTACATCACAGG
ACACCTTGAGAAAGTATTCGATGAAGAACACCGCAAAGAGATGCTTCGTCATGTCTATTG
TCATCAGAACGAAGATGGTGGATGGGGACTACACATCGAAGGTAGGAGCATTATGTTCTG
CACCGCGCTGAATTACATTTGCTTGCGTATGCTCGGAGAAG*TCCCAATGGGGGACGAGA
GAACGCGTGT

QA 1 670 1 670
DS 

RD RS1E964JQ 787 0 0
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CCTCGTGTAAAAGGCTGCAGTGATATCTTGTGGAGAATGCAATTTCTGAAAGATGCAAAA
TTCGAGCAAGCCATCCCGCCGGTGAAGATCGACGGCGACGAAGGCGTAACTTACGAGAAA
GCGACGGATGCGTTACGGAGAGGAATTTCTTTCTTCTCGGCTCTGCAAGCCTCCGACGGT
CACTGGCCTGGAGAAATCACCGGACCTCTCTTCTTCCTTCCTCCGTTGGTATTTTGTTTG
TACATCACAGGACACCTTGAGAAAGTATTCGATGAAGAACACCGCAAAGAGATGCTTCGT
CATGTCTATTGTCATCAGAACGAAGATGGTGGATGGGGACTACACATCGAAGGTAGGAGC
ATTATGTTTTGCACCGCGCTGAATTACATTTGCTTGCGTATGCTCGGAGAAGGTCCCAAT
GGGGGACGAGAGAACGCGTGTAAACGGGCAAGACAGTGGATTCTTGACCGTGGTGGTGTC
ACTTATGTTCCTTCATGGGGGAAAATATGGCTATCGATACTTGGAATCTATGATTGGTCA
GGAACCAATCCGATGCCTCCTGAGATCTGGTTGCTACCTTCGTGTCTTCCAATACACTTA
GCGAAAACTTTGTGCTATTGCCGGATGGTTTACATGCCGATGTCGTATCTATATGGGAAG
AGGTTTGTTGGTCCTGTAACACCTCTTATCCTGCAACTGCGTGACGAACTCCATTTGCAA
CCTTACG

QA 1 787 1 787
DS 



AS 1 2

CO CL9033Contig1 620 2 2 U
TTTTAGCCCAATCGACTGTGTTAAAGACTCCGAACATAAATGTCAACAAACCTAAGAAAG
AAGTAAAATCTATTCTCGAACTTCGTAAATCGAAACCAAAAGAAAAGAGTAGTAGTCAAT
TCAAAAGTTTCTCATACAAAGAGTAAGCCACTCTCTATTTATTATAGGAACTAGGAAGCC
ATTCCAAAGTCCAGCAATCTACTACCCTTTCTTCACTCTTGAGCCTCTGGCTGCTGCTTC
TTTCCGCCTGATTTCATGTACCAACCAATGGCACCAACGACAGCCACCACACCCGCCACA
ACCGCATAGTTTCTGTCCTTGTCTTCTGACACCTTTGGTCCCGCGGATTCAGCTGATGAA
GTTCCACCACAACTAGCCTGGGCTGAACCTGCTGCTTGTTCTCCCGGACCCTGTCGAGCT
ATCTTCTCAAGCTTCTCCTGCTCCATTTTCTTGATGAAAACATTCTCAGCAGCCTTTTCC
TCTTCGCTAAAAACTTTGCCACTGGAGAACCTGCGAGTCACAAATCTGATAGCGCTTCTT
GTTGCTGCCATTATGTATGATCAAGTTATCCTCGTTGCGTTGCAGAGCGTCCGGCTGCAG
ATGAAAACAAATGACACTCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DH52TF C 1
AF RS1DH52JQ U 5
BS 1 4 RS1DH52TF
BS 5 620 RS1DH52JQ

RD RS1DH52TF 620 0 0
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AAGTAAAATCTATTCTCGAACTTCGTAAATCGAAACCAAAAGAAAAGAGTAGTAGTCAAT
TCAAAAGTTTCTCATACAAAGAGTAAGCCACTCTCTATTTATTATAGGAACTAGGAAGCC
ATTCCAAAGTCCAGCAATCTACTACCCTTTCTTCACTCTTGAGCCTCTGGCTGCTGCTTC
TTTCCGCCTGATTTCATGTACCAACCAATGGCACCAACGACAGCCACCACACCCGCCACA
ACCGCATAGTTTCTGTCCTTGTCTTCTGACACCTTTGGTCCCGCGGATTCAGCTGATGAA
GTTCCACCACAACTAGCCTGGGCTGAACCTGCTGCTTGTTCTCCCGGACCCTGTCGAGCT
ATCTTCTCAAGCTTCTCCTGCTCCATTTTCTTGATGAAAACATTCTCAGCAGCCTTTTCC
TCTTCGCTAAGAACTTTGCCACTGGAGAACCTGCGAGTCACAAATCTGATAGCGCTTCTT
GTTGCTGCCATTATGTATGATCAAGTTATCCTCGTTGCGTTGCAGAGCGTCCGGCTGCAG
ATGAAAACAAATGACACTCC

QA 1 620 1 620
DS 

RD RS1DH52JQ 616 0 0
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AAAATCTATTCTCGAACTTCGTAAATCGAAACCAAAAGAAAAGAGTAGTAGTCAATTCAA
AAGTTTCTCATACAAAGAGTAAGCCACTCTCTATTTATTATAGGAACTAGGAAGCCATTC
CAAAGTCCAGCAATCTACTACCCTTTCTTCACTCTTGAGCCTCTGGCTGCTGCTTCTTTC
CGCCTGATTTCATGTACCAACCAATGGCACCAACGACAGCCACCACACCCGCCACAACCG
CATAGTTTCTGTCCTTGTCTTCTGACACCTTTGGTCCCGCGGATTCAGCTGATGAAGTTC
CACCACAACTAGCCTGGGCTGAACCTGCTGCTTGTTCTCCCGGACCCTGTCGAGCTATCT
TCTCAAGCTTCTCCTGCTCCATTTTCTTGATGAAAACATTCTCAGCAGCCTTTTCCTCTT
CGCTAAAAACTTTGCCACTGGAGAACCTGCGAGTCACAAATCTGATAGCGCTTCTTGTTG
CTGCCATTATGTATGATCAAGTTATCCTCGTTGCGTTGCAGAGCGTCCGGCTGCAGATGA
AAACAAATGACACTCC

QA 1 616 1 616
DS 



AS 1 2

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AATAAAAACAAAAAACAAAAAACAAAAATGACATCCAAAGCCTTTTTCTACTCTTTCTTT
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GTTAAGACACCGTCAGCTGACTGTCCCGCTGCTTTCAAGGAGCTCGGTATTGTCCCTGAC
GTTACTTTCTAAACGAAGATAGAAAATATTTATATATGAAATGGGAGATTTGATTTTCTA
TTTGCTTCATTTT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AZ43TF U 1
AF RS1AX72TF U 1
BS 1 16 RS1AX72TF
BS 17 17 RS1AZ43TF
BS 18 109 RS1AX72TF
BS 110 110 RS1AZ43TF
BS 111 577 RS1AX72TF
BS 578 578 RS1AZ43TF
BS 579 673 RS1AX72TF

RD RS1AZ43TF 629 0 0
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TTAGACCGTTTCCAGATTCAAGGATCAGTTTATTGTGACACTTGCCGTGTCCAATTCGTT
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TATT

QA 1 625 1 625
DS 

RD RS1AX72TF 673 0 0
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AATAAAAACAAAAAACAAAAAACAAAAATGACATCCAAAGCCTTTTTCTTCTCTTTCTTT
GTCGTCTCCTTCGTGTGTTTGTCCTCTCTGGCCGGATTTTCCGCCGCCGATGCTGATGAT
TTAGACCGTTTCCAGATTCAAGGATCAGTTTATTGTGACACTTGCCGTGTCCAATTCGTT
ACCCGTCTCAGCAAATTCCTTGAAGGAGCGAAAGTGAAGTTGGAATGCAGGAGCAGAACA
AACGGAACCCTAGCATTGACCAAAGAAGCCGTTACCGACAAAACGGGAAGCTACAAGATG
GAAGTAACCGGCGACCACGAAGAAGAAGTTTGCGAGCTCGTGTTGGTGCAATCCCCAGAC
AGTGGTTGCAGTGACGTCAGCAAAGATGCATACTTACGTAACGCCGCTAAGATCAGTCTA
ACAGCGAATGACGGTATCGTCTCTCACGAGACACGTATCGTTAACCCTCTCGGTTTCATG
GTTAAGACACCGTCAGCTGACTGTCCCGCTGCTTTCA*GGAGCTCGGTATTGTCCCTGAC
GTTACTTTCTAAACGAAGATAGAAAATATTTATATATGAAATGGGAGATTTGATTTTCTA
TTTGCTTCATTTT

QA 1 673 1 673
DS 



AS 1 2

CO CL9035Contig1 721 2 2 U
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TATCAGGGCCGAGCTTGAGAAGAAGAAGCTTAAAAAGCTAGAGGAGCAAATAAGATTGGA
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ATTGTACTGCCAAACTCAATCTTTTTACAGGCGGAGGAAGAAACGGCTTCTTTCCTCATG
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CATATGAGCTTTTTGCGAGGGGGTGGGACAACAGTAACATGGGAATATCGGCTGATTTGA
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TCTTCAATGGGATGATCAGGCGATAACTGTAGCACCATAGTCCCAGAGAATTAGTATTAG
TTCTATATATGAATTTGTATTTATCACCTCCCATCCTTCACTTCCAAAATGATTGAAAGA
CTTTGAAAAACAACATAAAGCGTATTATTTTTTTATTAGAATCTAAATGATTATTTCATG
C


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 

AF RS1H511TF U 1
AF RS1H511JQB C 48
BS 1 655 RS1H511TF
BS 656 721 RS1H511JQB

RD RS1H511TF 655 0 0
AGGGCAAGAAGCTGAAGAAGATGAAGACAGCTTGGCTAATAAGAAGAAGGAGAAAGACGA
GCTGGAGCGTATCAAACAAGCGGAGAAGAAAAAGATTCGTCTCATTGCTGCTTCTGCAGC
TATCAGGGCCGAGCTTGAGAAGAAGAAGCTTAAAAAGCTAGAGGAGCAAATAAGATTGGA
TGAGGAAGGTGCTGCTATTGCGGAAGCTGCTGCTCTGCATGTCTTACTTGGCGAGGAGGA
GGACTGTGATGATTCGTGTCGGACCATGCCAAACCAAGAAACGTTTCAAGCCGCCGTGGG
ATTGTACTGCCAAACTCAATCTTTTTACAGGCGGAGGAAGAAACGGCTTCTTTCCTCATG
AACGCTGCTCGAGCCCTGCGGTTCACAGAAGCAGAGTAAGGGACTGTGACTGGTCAGTCT
CATATGAGCTTTTTGCGAGGGGGTGGGACAACAGTAACATGGGAATATCGGCTGATTTGA
TTGCTGCTCAAGGTGTGTCGTCACTGCAAATTTCTGAAAATGCTCGGGTGGACGCACTTG
TCTTCAATGGGATGATCAGGCGATAACTGTAGCACCATAGTCCCAGAGAATTAGTATTAG
TTCTATATATGAATTTGTATTTATCACCTCCCATCCTTCACTTCCAAAATGATTG

QA 1 655 1 655
DS 

RD RS1H511JQB 674 0 0
AGGAGAAAGACGAGCTGGAGCGTATCAAACAAGCGGAGAAGAAAAAGATTCGTCTCATTG
CTGCTTCTGCAGCTATCAGGGCCGAGCTTGAGAAGAAGAAGCTTAAAAAGCTAGAGGAGC
AAATAAGATTGGATGAGGAAGGTGCTGCTATTGCGGAAGCTGCTGCTCTGCATGTCTTAC
TTGGCGAGGAGGAGGACTGTGATGATTCGTGTCGGACCATGCCAAACCAAGAAACGTTTC
AAGCCGCCGTGGGATTGTACTGCCAAACTCAATCTTTTTACAGGCGGAGGAAGAAACGGC
TTCTTTCCTCATGAACGCTGCTCGAGCCCTGCGGTTCACAGAAGCAGAGTAAGGGACTGT
GACTGGTCAGTCTCATATGAGCTTTTTGCGAGGGGGTGGGACAACAGTAACATGGGAATA
TCGGCTGATTTGATTGCTGCTCAAGGTGTGTCGTCACTGCAAATTTCTGAAAATGCTCGG
GTGGACGCACTTGTCTTCAATGGGATGATCAGGCGATAACTGTAGCACCATAGTCCCAGA
GAATTAGTATTAGTTCTATATATGAATTTGTATTTATCACCTCCCATCCTTCACTTCCAA
AATGATTGAAAGACTTTGAAAAACAACATAAAGCGTATTATTTTTTTATTAGAATCTAAA
TGATTATTTCATGC

QA 1 674 1 674
DS 



AS 1 2

CO CL9036Contig1 957 2 8 U
AGGACTCAAAGTTCACTCCGGGAACAAGAAATTCGAGGGTGGTGTTTCACTAGAAGTAAT
AGCCATGAGAACGCCTGGATTCAGTGGAGCTGATCTTGCGAACCTCTTAAACGAAGCTGC
CATATTGGCTGGACGACGTGGGAAGACGGCGATATCGTCTAAAGAGATTGATGATTCGAT
TGATAGGATTGTAGCTGGGATGGAAGGAACTGTGATGACAGATGGGAAGAGCAGGAGCTT
GGTTGCTTACCATGAAGTTGGACATGCCGTCTGTGGAACGTTGACTCCAGGACATGATGC
TGTACAAAAGGTCACATTGATTCCAAGAGGACAAGCGAGAGGTCTGACTTGGTTCATTCC
CTCAGATGATCCAACTCTAATCTCCAAACAGCAACTATTTGCGAGGATCGTTGGTGGGCT
CGGTGGTAGAGCTGCTGAAGAAGTCATCTTTGGTGAGCCGGAGGTGACTACTGGTGCAGT
TGGTGACTTGCAACAGATCACCGGTTTGGCTAAACAGATGGTGACAACATTTGGGATGTC
TGAAATTGGACCATGGTCGTTGATGGACTCATCAGCTCAGAGCGATGTGATCATGAGGAT
GATGGCAAGAAACCCAATGTCTGAGAAGCTTGCAAACGACATCGATTCAGCGGTCAAGAC
GCTATCGGACAATGCGTACGAGATAGCTTTGGGGCACATAAGGAACAACCGTGAAGCCAT
GGACAAGATTGTTGAAGTTCTTTTGGAGAAAGAGACGATGTCAGGGGATGAGTTCAGAGC
AATCTTGTCTGAGTTTACAGAAATCCCACCTGAAAACCGTGTTGCCTCTTCAACCTCAAC
ATCAACACCAACACCAGCTCCTGTCTGAGTAAAAAGAGATCTCTGTGTATATCTTTGAGA
TACTCTTCCCCCATACTGTGTAACAAGTATATATATAGAAAGAACTTTTTCAAACTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DP80TF U 1
AF RS1DP80JQ C 122
BS 1 702 RS1DP80TF
BS 703 703 RS1DP80JQ
BS 704 725 RS1DP80TF
BS 726 726 RS1DP80JQ
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BS 752 760 RS1DP80TF
BS 761 957 RS1DP80JQ

RD RS1DP80TF 760 0 0
AGGACTCAAAGTTCACTCCGGGAACAAGAAATTCGAGGGTGGTGTTTCACTAGAAGTAAT
AGCCATGAGAACGCCTGGATTCAGTGGAGCTGATCTTGCGAACCTCTTAAACGAAGCTGC
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TGATAGGATTGTAGCTGGGATGGAAGGAACTGTGATGACAGATGGGAAGAGCAGGAGCTT
GGTTGCTTACCATGAAGTTGGACATGCCGTCTGTGGAACGTTGACTCCAGGACATGATGC
TGTACAAAAGGTCACATTGATTCCAAGAGGACAAGCGAGAGGTCTGACTTGGTTCATTCC
CTCAGATGATCCAACTCTAATCTCCAAACAGCAACTATTTGCGAGGATCGTTGGTGGGCT
CGGTGGTAGAGCTGCTGAAGAAGTCATCTTTGGTGAGCCGGAGGTGACTACTGGTGCAGT
TGGTGACTTGCAACAGATCACCGGTTTGGCTAAACAGATGGTGACAACATTTGGGATGTC
TGAAATTGGACCATGGTCGTTGATGGACTCATCAGCTCAGAGCGATGTGATCATGAGGAT
GATGGCAAGAAACCCAATGTCTGAGAAGCTTGCAAACGACATCGATTCAGCGGTCAAGAC
GCTATCGGACAATGCGTACGAGATAGCTTTGGGGCACATAAG*AACAACCGTGAAGCCAT
GGACA*GATTGTTGAAGTTCTTTTGGAGAA*GAGACGATG

QA 1 760 1 760
DS 

RD RS1DP80JQ 836 0 0
CATA
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GGATTGTAGCTGGGATGGAAGGAACTGTGATGACAGATGGGAAGAGCAGGAGCTTGGTTG
CTTACCATGAAGTTGGACATGCCGTCTGTGGAACGTTGACTCCAGGACATGATGCTGTAC
AAAAGGTCACATTGATTCCAAGAGGACAAGCGAGAGGTCTGACTTGGTTCATTCCCTCAG
ATGATCCAACTCTAATCTCCAAACAGCAACTATTTGCGAGGATCGTTGGTGGGCTCGGTG
GTAGAGCTGCTGAAGAAGTCATCTTTGGTGAGCCGGAGGTGACTACTGGTGCAGTTGGTG
ACTTGCAACAGATCACCGGTTTGGCTAAACAGATGGTGACAACATTTGGGATGTCTGAAA
TTGGACCATGGTCGTTGATGGACTCATCAGCTCAGAGCGATGTGATCATGAGGATGATGG
CAAGAAACCCAATGTCTGAGAAGCTTGCAAACGACATCGATTCAGCGGTCAAGACGCTAT
CGGACAATGCGTACGAGATAGCTTTGGGGCACATAAGGAACAACCGTGAAGCCATGGACA
AGATTGTTGAAGTTCTTTTGGAGAAAGAGACGATGTCAGGGGATGAGTTCAGAGCAATCT
TGTCTGAGTTTACAGAAATCCCACCTGAAAACCGTGTTGCCTCTTCAACCTCAACATCAA
CACCAACACCAGCTCCTGTCTGAGTAAAAAGAGATCTCTGTGTATATCTTTGAGATACTC
TTCCCCCATACTGTGTAACAAGTATATATATAGAAAGAACTTTTTCAAACTC

QA 5 836 5 836
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL9038Contig1 708 2 4 U
GGGACAGGAACATTGGAAATGGAAGAGAGAATGATAATGGAGAAAATAAGAGAGCATCTT
CAGCTGAGCGAAGACGTTGACGTCGGCGACGCACCGCGAAAAGTAGAGAAAGGAAGAAGC
TTCTACGAGGATTTCAGCCTCAGAGGCATCCGAGTCAACCGAGTCGACCCTGGTTTCGTT
TCCTGCTCTTTCAAGGTTCCTCTCCGTTTGACGGACAGAGAAGGGTATCTAGCAAATGGT
GCAATTGCAAATCTTGTTGACGAAGTTGGTGGAGCAGTTGTTCATGTAGAAGGTTTACCT
ATGAATGTTTCGGTGGACATGTCCATTGCTTTCCTTTCAAAAGCTAAGCTTGGTGAGGAG
CTGGAGATAACATCGAGAGTGATGGGAGAGAGAGGAGGTTATAAAGGAACGATCGTTGTT
GTGAGAAACAAGGTGACCGGAGAGATTATTGCTGAAGGTCGCCATTCTTTGTTTGGCCGA
CAACCTAGTAAGCTCTGAGCTCGAATCTTTCTCTCTTGGTATTACTTTGTAAAAGATTAT
CTTAAAACTTGTTTCCCCTTTTGTGTTGGGTTATTTTCTCTTTTTTTTTTTTTCTTTTTT
TTTCGGATTGTGAAAATGAAACCTTTGTATGTAGATAGTTTATAAAAGCTAAAACCTTTG
TGGACTTGTTGAATCATCTTATAAAGTAGAATAATTTGTGTTGCGTCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AQ61TFB U 1
AF RS1AQ61JQ C 8
BS 1 604 RS1AQ61TFB
BS 605 605 RS1AQ61JQ
BS 606 619 RS1AQ61TFB
BS 620 708 RS1AQ61JQ

RD RS1AQ61TFB 619 0 0
GGGACAGGAACATTGGAAATGGAAGAGAGAATGATAATGGAGAAAATAAGAGAGCATCTT
CAGCTGAGCGAAGACGTTGACGTCGGCGACGCACCGCGAAAAGTAGAGAAAGGAAGAAGC
TTCTACGAGGATTTCAGCCTCAGAGGCATCCGAGTCAACCGAGTCGACCCTGGTTTCGTT
TCCTGCTCTTTCAAGGTTCCTCTCCGTTTGACGGACAGAGAAGGGTATCTAGCAAATGGT
GCAATTGCAAATCTTGTTGACGAAGTTGGTGGAGCAGTTGTTCATGTAGAAGGTTTACCT
ATGAATGTTTCGGTGGACATGTCCATTGCTTTCCTTTCAAAAGCTAAGCTTGGTGAGGAG
CTGGAGATAACATCGAGAGTGATGGGAGAGAGAGGAGGTTATAAAGGAACGATCGTTGTT
GTGAGAAACAAGGTGACCGGAGAGATTATTGCTGAAGGTCGCCATTCTTTGTTTGGCCGA
CAACCTAGTAAGCTCTGAGCTCGAATCTTTCTCTCTTGGTATTACTTTGTAAAAGATTAT
CTTAAAACTTGTTTCCCCTTTTGTGTTGGGTTATTTTCTCTTTTTTTTTTTTTCTTTTTT
TTTCTGATTGTGAAAATGA

QA 1 619 1 619
DS 

RD RS1AQ61JQ 701 0 0
GAACATTGGAAATGGAAGAGAGAATGATAATGGAGAAAATAAGAGAGCATCTTCAGCTGA
GCGAAGACGTTGACGTCGGCGACGCACCGCGAAAAGTAGAGAAAGGAAGAAGCTTCTACG
AGGATTTCAGCCTCAGAGGCATCCGAGTCAACCGAGTCGACCCTGGTTTCGTTTCCTGCT
CTTTCAAGGTTCCTCTCCGTTTGACGGACAGAGAAGGGTATCTAGCAAATGGTGCAATTG
CAAATCTTGTTGACGAAGTTGGTGGAGCAGTTGTTCATGTAGAAGGTTTACCTATGAATG
TTTCGGTGGACATGTCCATTGCTTTCCTTTCAAAAGCTAAGCTTGGTGAGGAGCTGGAGA
TAACATCGAGAGTGATGGGAGAGAGAGGAGGTTATAAAGGAACGATCGTTGTTGTGAGAA
ACAAGGTGACCGGAGAGATTATTGCTGAAGGTCGCCATTCTTTGTTTGGCCGACAACCTA
GTAAGCTCTGAGCTCGAATCTTTCTCTCTTGGTATTACTTTGTAAAAGATTATCTTAAAA
CTTGTTTCCCCTTTTGTGTTGGGTTATTTTCTCTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTCGGA
TTGTGAAAATGAAACCTTTGTATGTAGATAGTTTATAAAAGCTAAAACCTTTGTGGACTT
GTTGAATCATCTTATAAAGTAGAATAATTTGTGTTGCGTCC

QA 1 701 1 701
DS 



AS 1 2

CO CL9039Contig1 740 2 2 U
GACACCGCAAACCATTTGCAGTCCTCAGGCCTAATTTCAAGAAATCTTCTCCTTCTTCTG
AGAAAAAAACTAATAATTTTGCTCCTTCAAAGAACCTCAGCCCATCTCACAAAATGATTA
GAGCCTTCAAAAAGAGAGAACTCCACAAGTTTCCCGATTCTGTTAAACCAACATTTGAAG
GCACTCTACCTCTTGGCCCAGCTAATAATGGAAGCAATGATAACCCTCTGATCAACTCTC
CTTGTGATGGAAAGTCTGGTGCTGATTTAAGCCGCCGAGAGATTGACGAGTTTAGCAAGG
ACGTTCCTCCACGTAGGCCTTTACGTGATGTAAATCAAATACTCTCCATGCTTCGGAGAC
CGAATGCTACAGCCACATGTTCTGACATTAACCCGACGACGCCAATGTCCTCAACAAAAG
TACCTCCAGAATCTGATACCAGCCAAAAAATCATAGTGGAGCCTATATCACCGAGAGCAG
CATCTAGAGATTCACTTCCCCAGCAGTTCGTGGTGCGTGAAACCTCTTCACTGGCCAAGA
CAAGTGCACGCACAATGACTCATCTGAACTCGGCCTCTCCTCCGAGTTTTGACCTTGGAA
TATGAAACCCCCACTCTCTCATTTTACGCAAGTTCCTCCCTGAACTGTATAACTTTTTCT
TTTATGAAATGAACTATACGGGAACAAAGATATGTAGTTTTATGTCCGACTGAAAAAAAC
TGACGAGCCAGATCCAAAGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DV85TF U 1
AF RS1DV85JQ C 69
BS 1 676 RS1DV85TF
BS 677 740 RS1DV85JQ

RD RS1DV85TF 676 0 0
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CGAATGCTACAGCCACATGTTCTGACATTAACCCGACGACGCCAATGTCCTCAACAAAAG
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CAAGTGCACGCACAATGACTCATCTGAACTCGGCCTCTCCTCCGAGTTTTGACCTTGGAA
TATGAAACCCCCACTCTCTCATTTTACGCAAGTTCCTCCCTGAACTGTATAACTTTTTCT
TTTATGAAATGAACTA

QA 1 676 1 676
DS 

RD RS1DV85JQ 672 0 0
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AAAAAGAGAGAACTCCACAAGTTTCCCGATTCTGTTAAACCAACATTTGAAGGCACTCTA
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GGAAAGTCTGGTGCTGATTTAAGCCGCCGAGAGATTGACGAGTTTAGCAAGGACGTTCCT
CCACGTAGGCCTTTACGTGATGTAAATCAAATACTCTCCATGCTTCGGAGACCGAATGCT
ACAGCCACATGTTCTGACATTAACCCGACGACGCCAATGTCCTCAACAAAAGTACCTCCA
GAATCTGATACCAGCCAAAAAATCATAGTGGAGCCTATATCACCGAGAGCAGCATCTAGA
GATTCACTTCCCCAGCAGTTCGTGGTGCGTGAAACCTCTTCACTGGCCAAGACAAGTGCA
CGCACAATGACTCATCTGAACTCGGCCTCTCCTCCGAGTTTTGACCTTGGAATATGAAAC
CCCCACTCTCTCATTTTACGCAAGTTCCTCCCTGAACTGTATAACTTTTTCTTTTATGAA
ATGAACTATACGGGAACAAAGATATGTAGTTTTATGTCCGACTGAAAAAAACTGACGAGC
CAGATCCAAAGC

QA 1 672 1 672
DS 



AS 1 2

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AAGGCAAGTACTCAAGTACCTTCCTTTTGGTGGGGGAAGGAGAGGATGTCCTGCATCAAG
TCTAGCTTATACGATAGTAGGAACAACAATAGGAATGTTGGTGCAGTGCTTTGACTGGAG
AATCAAACGAGAGAAGGTCAACATGGATGAGTGCTTTAAAGAATTCACCCAAACCATGGC
TTATCCTCTTACGTTCACTCCTGTTACTCGAATATCCACCTTTGACTTGGATAATTCACT
GAATTTGCAGACACAACAGCGATCAGTGATATAGTAGAGTTTGTAAGAGTAGAAAAGATA
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TATAGTTTGGTAGTGATTCTCTTTTAGAACATCTCTAATGTATTTTGCTACTACTTTATT
ATGATGAATTATCATCATCCGTCCGTGTTATGGTAGTACTTTAACATAACACATACATTT


BQ
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AF RS1E832TF U 1
AF RS1E832JQ C 133
BS 1 720 RS1E832TF

RD RS1E832TF 720 0 0
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TTATCCTCTTACGTTCACTCCTGTTACTCGAATATCCACCTTTGACTTGGATAATTCACT
GAATTTGCAGACACAACAGCGATCAGTGATATAGTAGAGTTTGTAAGAGTAGAAAAGATA
ACTCTGCTCTATTGATTTTTCATCTTCACCTACATCAGACATAATCTTTTCCTGTTTTAG
TATAGTTTGGTAGTGATTCTCTTTTAGAACATCTCTAATGTATTTTGCTACTACTTTATT
ATGATGAATTATCATCATCCGTCCGTGTTATGGTAGTACTTTAACATAACACATACATTT

QA 1 720 1 720
DS 

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GATAGTAGGAACAACAATAGGAATGTTGGTGCAGTGCTTTGACTGGAGAATCAAACGAGA
GAAGGTCAACATGGATGAGTGCTTTAAAGAATTCACCCAAACCATGGCTTATCCTCTTAC
GTTCACTCCTGTTACTCGAATATCCACCTTTGACTTGGATAATTCACTGAATTTGCAGAC
ACAACAGCGATCAGTGATATAGTAGAGTTTGTAAGAGTAGAAAAGATAACTCTGCTCTAT
TGATTTTTCATCTTCACCTACATCAGACATAATCTTTTCCTGTTTTAGTATAGTTTGGTA
GTGATTCTCTTTTAGAACATCTCTAATGTATTTTGCTACTACTTTATTATGATGAATTAT
CATCATCCGTCCGTGTTATGGTAGTACTTTAACATAACACATACATTT

QA 1 588 1 588
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GGAGCTGGAACAGGAAGATTAGACCGGAGTATGGGTTAGATGAGGATTATGGAGAAGACG
AAGACGAGCAGGAGGAGGATGAAGAGGAAGAAGATAGAAGCTTGGATCTTTTGCTTAGGT
TCGTCGAGAATGTCTTCAGAAAAGTCTCCAAGAGAGCTAGGAAAGCCGTCCGATCTGTTT
TGCCTGTTTCCATCTCCACCAAGCTGGTGGGATTCTCAGTGAACGGTGTACCTATACTTG
CATTTCTGTGGATCTTGAAGGCCTTTCTCAAGGTAGCTTGCACACTTGGGACTATTGTAT
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TCTGATGATTTAGTAAGTAAAAGAATGTAATGTTTGTAGCATTGTCCAATTAAATGGGAT
TCGGTGACACTGTATGCTTAGTTTTCCAAATAAACAAAACCATAATACAGAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1A586TF U 1
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BS 746 894 RS1A586JQ

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TGCCTGTTTCCATCTCCACCAAGCTGGTGGGATTCTCAGTGAACGGTGTACCTATACTTG
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AAGGCCTTTCTCAAGGTAGCTTGCACACTTGGGACTATTGTATTTACGAGCATTCTACTT
ATACGGGGACTTTGGGCTGGTGTAGCATACGTACAAGAAAGCCGCAACAACAGGATCAAT
GAACTTGCTGATGACCCCCGTGCATGGAACGGGGTGCAACCAGCGTCATGATTAATTCAC
TTAGTGCTTCAAAAAACCAAGTTTCTGACTTCTTGGAAGACAATAAAACCACAGATGATT
ATACAATCAGAAAGGAGTGAGTATATGATGTCCTTTGGCATTGTCTGATGATTTAGTAAG
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TTAGTTTTCCAAATAAACAAAACCATAATACAGAATC

QA 1 757 1 757
DS 



AS 1 2

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TCTGGTTGTGGCTCTCGAACTACGTACATGCCTACAATGCCTGCACTCACACGATGTACA
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AGAAACTCTCAGCACACCGTTGCTAATGGAGAGGGTTCCTTTGGGGTCACGCAGATATGT
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TTAGCTTACAAAGTCGTCTTCCATGACCTAAGCCACGCTTTATGGGACGGGTTGTACATC
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GTCATAGCAGAGACGGTACATGAAAGAGTCCGTACACGCATCATAACCGATATTATGAGA
GCCTCTTTCGACGGCTTCTTGCTTGTCCTACTCGCTGGTGGACCCTCTAGGGCTTTTACA
ATACAAGACTCTCAGATTATGGAGCAAGATTTTAAATCTCTGAAGGATTTGTTCTGGGCG
AATGGAGATGGTCTGGCCATGGACCTGATCGATAAGTTCTCGACCACGGTTAGAGGTGTG
CTTCCTCTGTTCAGTACAGACACTGACAGTTTGATAGAGAGGTTTAAGGGAATGCTCGAA
GCATACGGTTCTTCAGCTAAGTCTAGGCTTCCGTTGCCTCCGACTTCAGGCCAGTGGAAT
GGTATGGAACCAAACACGCTCTTACGAGTTTTGTGTTATCGCAACGACGAATCTGCGACG
AGGTTTCTTAAGAAAACTTATAGTCTACCGAAGAAGCTCTAGTGGAATCTACTGGTGAAC
AGTTAATAACCTCACAAGATTATGAGTGTGTTACACTGCAGGGAGTATCCGAGATTTGTA
TAGTGAGTTTCATTTTTTTTGTTTAATAATTATTTGTTTTGTGGTTTTTTGTATACATTT
TCCTATACGTATTATATTCATTTATATCGTTTGTC


BQ
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AF RS1B712TF U 1
AF RS1B712JQ C 566
BS 1 635 RS1B712TF
BS 636 1295 RS1B712JQ

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TTACCTGATTTGATCATTGGTTTAGACAAATATCTTCAGTATTATGTCTCAAAGGCGAAA
TCTGGTTGTGGCTCTCGAACTACGTACATGCCTACAATGCCTGCACTCACACGATGTACA
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AGAAACTCTCAGCACACCGTTGCTAATGGAGAGGGTTCCTTTGGGGTCACGCAGATATGT
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ATCACACATTTGAGGAACTGTGAGTCAGCTCACACCGACGACTTCTCCAACGGTTTAGGA
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TTAGCTTACAAAGTCGTCTTCCATGACCTAAGCCACGCTTTATGGGACGGGTTGTACATC
GGCGACCTCTCCTCCTCTAGAATCGAGCCTTTCCT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1B712JQ 730 0 0
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AAGATTTTAAATCTCTGAAGGATTTGTTCTGGGCGAATGGAGATGGTCTGGCCATGGACC
TGATCGATAAGTTCTCGACCACGGTTAGAGGTGTGCTTCCTCTGTTCAGTACAGACACTG
ACAGTTTGATAGAGAGGTTTAAGGGAATGCTCGAAGCATACGGTTCTTCAGCTAAGTCTA
GGCTTCCGTTGCCTCCGACTTCAGGCCAGTGGAATGGTATGGAACCAAACACGCTCTTAC
GAGTTTTGTGTTATCGCAACGACGAATCTGCGACGAGGTTTCTTAAGAAAACTTATAGTC
TACCGAAGAAGCTCTAGTGGAATCTACTGGTGAACAGTTAATAACCTCACAAGATTATGA
GTGTGTTACACTGCAGGGAGTATCCGAGATTTGTATAGTGAGTTTCATTTTTTTTGTTTA
ATAATTATTTGTTTTGTGGTTTTTTGTATACATTTTCCTATACGTATTATATTCATTTAT
ATCGTTTGTC

QA 1 730 1 730
DS 



AS 1 2

CO CL9044Contig1 1252 2 2 U
GGATATTATCCACAGTTTATGTCTCTCTCTCTCTGTGGTTCATAATCATAAAGTTCATTC
CTTATTTCTTCGCTGCGTCGTCTGTTTTTTAACTCTTTGAGTTTGAATTCACACTTGTAA
GACTCGATCTCTCTGCCTCATTTTCCCCTATGGTCTTTGGATCGTTCTTCTCTTCTCTCA
AGTTCTGGGGAAATTCCCAGGAACAAGAACCGCAGAGAGGGAGGATGCCGGAGATAGATC
TCAGCATTCACACGATAGGAAGCCATGGAGGCAGCGTCGCCTCTAAACACAAGCACGACT
GGATCATACTCGTGATCTTGGTGGCCATCGAGATCGGTCTGCAGCTCATATCTCCTTTCT
ACAGATACGTCGGGAGAGATATGATGACCGATCTCAAATACCCTTTCAACGACAACACCG
TCCCTATCTGGTCAGTACCGATCTACGCAGTCCTCCTCCCGATCGTAGTGTTCGTCTGCT
TCTACATGAAGAGAACATGCGTTTACGATCTTCACCACAGCATTCTCGGTTTGCTCTTCA
CGGTTTTGATAACCGGTATCATCACCGACTCCATCAAGCTCGCCACGGGACGCCCTCGTC
CTAACTTCTACTGGCGTTGCTTCCCTGACGGCAAAGAGGTGTTCGACGCGTTGGGTGGTG
TGATATGCCATGGTAAACCAGGAGAGGTCAAAGAAGGTCACAAAAGCTTTCCCAGTGGAC
ACACGTCTTGGTCTTTCGCTGGACTTGGTTACCTCTCGCTTTACTTGTCTGGTAAAGTCA
AGGCTTTCAACAGAGAAGGGCATGTGGCTAAGCTCTGCCTTGTGTTCGCTCCTCTCCTCG
CGGCTTGCCTCGTGGGGATATCGCGTGTGGATGACTACTGGCATCATTGGCAAGACGTGT
TTGCTGGAGCTCTTATTGGTCTCTTTGTGGCTGCCTTTTGTTACCGTCAGTTTTACCCCA
ACCCTTACCATGAAGAAGGGTGGGGTCCTTATGCGTGGACAAGCGCAGAACGGAGGTGCG
TTGAGGACAATGTCTCTGCAGGTGGAATCAACTTCTCTTGAAAACATGGAATCTGGTACT
AACTCCGTTAGAAGATGATTAGTTCTTCCTCTTCTTTCAGCATTTTGATTCTTTATTTGG
TATTCTTTTTTTGTAACCTTTACTTGTACTCTTACCATTGTAAGTAAATCTACTCCTCAT
ATTTTGGTTTTGGCATTTTTTTTAGCAGACAATAAGATGACAGTATATTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1F676TF U 1
AF RS1F676JQ C 431
BS 1 692 RS1F676TF
BS 693 1252 RS1F676JQ

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CTTATTTCTTCGCTGCGTCGTCTGTTTTTTAACTCTTTGAGTTTGAATTCACACTTGTAA
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AGTTCTGGGGAAATTCCCAGGAACAAGAACCGCAGAGAGGGAGGATGCCGGAGATAGATC
TCAGCATTCACACGATAGGAAGCCATGGAGGCAGCGTCGCCTCTAAACACAAGCACGACT
GGATCATACTCGTGATCTTGGTGGCCATCGAGATCGGTCTGCAGCTCATATCTCCTTTCT
ACAGATACGTCGGGAGAGATATGATGACCGATCTCAAATACCCTTTCAACGACAACACCG
TCCCTATCTGGTCAGTACCGATCTACGCAGTCCTCCTCCCGATCGTAGTGTTCGTCTGCT
TCTACATGAAGAGAACATGCGTTTACGATCTTCACCACAGCATTCTCGGTTTGCTCTTCA
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TGATATGCCATGGTAAACCAGGAGAGGTCAAA

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DS 

RD RS1F676JQ 822 0 0
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TGGTAAACCAGGAGAGGTCAAAGAAGGTCACAAAAGCTTTCCCAGTGGACACACGTCTTG
GTCTTTCGCTGGACTTGGTTACCTCTCGCTTTACTTGTCTGGTAAAGTCAAGGCTTTCAA
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TCTTATTGGTCTCTTTGTGGCTGCCTTTTGTTACCGTCAGTTTTACCCCAACCCTTACCA
TGAAGAAGGGTGGGGTCCTTATGCGTGGACAAGCGCAGAACGGAGGTGCGTTGAGGACAA
TGTCTCTGCAGGTGGAATCAACTTCTCTTGAAAACATGGAATCTGGTACTAACTCCGTTA
GAAGATGATTAGTTCTTCCTCTTCTTTCAGCATTTTGATTCTTTATTTGGTATTCTTTTT
TTGTAACCTTTACTTGTACTCTTACCATTGTAAGTAAATCTACTCCTCATATTTTGGTTT
TGGCATTTTTTTTAGCAGACAATAAGATGACAGTATATTCAT

QA 1 822 1 822
DS 



AS 1 2

CO CL9045Contig1 906 2 2 U
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CCCTTCGAACGATCATGGAGGAACATCATTGCTGCTTTTACTCCAAGATGCTCTCAAGAT
TCAGCATCGGTTCCCTCATGCTTAGTTTGGTGATTGTTCTAGTTGTCCGCGTGCTAGATG
TTTTGTACCGGTGTGGCAAACCCTTTCCCAAAGGAGCTTCACGATCGTTTACTACTCTCA
TTGTTCTTGGTTCTGGGGGACACACGGCGGAGATGTTGAGCCTCCTCTCTGTTTTGCGCA
TGGACAGATTCGCACCAAGGTTTTACATTGCTGCAGCTACTGATAACATGAGTCTCCACA
AAGCTCGTTCCTTTGAAGATTCTCTACTACCTGACAAGCCTGCTCTTAAGGAAGACGTCT
CCTTACAGTTCACGCAAATTTACCGGAGTCGAGAAGTTGGTCAGCCTTATGTTACTTCTG
TTTGGACTACCATTCTTGCCACTCTTCACGCTCTCTGCCTAATGATCCGGATCAGACCCC
AAGTGATTATTTGTAATGGTCCTGGGACATGTATTCCTCTCTGTGTCATCGCTTTCTTGT
TCAAGGTGGTGGGAATCAGATGGTCATCGATCTTTTACGTTGAGAGTGTAGCAAGAGTTA
AGAAGCTCTCATTAAGTGGTTTGCTTCTTTACAAGTTAAGGATAGCTGATCAGTTCTTTG
TTCAATGGCCACAACTGCAAAACAAGTATCCTCGGGCTCACTATGTTGGTTTCCTGATGT
AAGCTGAATTTTTGGGAACTATCCTTATACATAGATTTGCATTACAATAACTTAGAAAAG
CTACAAAGTTTTACACAGTGTTGAAATACATTTTTCGTAATACGACTCATCTTTTTGGTT
GCTCCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1GN17TF U 1
AF RS1GN17JQ C 383
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TTTTGTACCGGTGTGGCAAACCCTTTCCCAAAGGAGCTTCACGATCGTTTACTACTCTCA
TTGTTCTTGGTTCTGGGGGACACACGGCGGAGATGTTGAGCCTCCTCTCTGTTTTGCGCA
TGGACAGATTCGCACCAAGGTTTTACATTGCTGCAGCTACTGATAACATGAGTCTCCACA
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CCTTACAGTTCACGCAAATTTACCGGAGTCGAGAAGTTGGTCAGCCTTATGTTACTTCTG
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TCAAG
TGGTGGGA

QA 1 605 1 605
DS 

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TGGGACATGTATTCCTCTCTGTGTCATCGCTTTCTTGTTCAAGGTGGTGGGAATCAGATG
GTCATCGATCTTTTACGTTGAGAGTGTAGCAAGAGTTAAGAAGCTCTCATTAAGTGGTTT
GCTTCTTTACAAGTTAAGGATAGCTGATCAGTTCTTTGTTCAATGGCCACAACTGCAAAA
CAAGTATCCTCGGGCTCACTATGTTGGTTTCCTGATGTAAGCTGAATTTTTGGGAACTAT
CCTTATACATAGATTTGCATTACAATAACTTAGAAAAGCTACAAAGTTTTACACAGTGTT
GAAATACATTTTTCGTAATACGACTCATCTTTTTGGTTGCTCCC

QA 1 524 1 524
DS 



AS 1 2

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TCGAGGTCACCATCGCTGATTCTTAGATGCATGCTCTTTAATTTACAAAACTTGTCTTTG
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TTAGATATGTTATCCTTTTGAGTTTTACTTTTTGTTGAACATGCGACTTCTGGTTCTGTT
TTGCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 

AF RS1DT73JQ C 1
AF RS1DT73TF U 1
BS 1 605 RS1DT73TF

RD RS1DT73JQ 605 0 0
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TTGCC

QA 1 605 1 605
DS 

RD RS1DT73TF 605 0 0
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GTTGAAGAAAAGCTATGGCTTACGCACCACCGATGAAGCAAGGAAAGGCAGGATTTGAGG
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GACCAGTGAGGATGCCAACTAAGGTTCTCAAGATCACCACCAGAAAAGCTCCTTGTGGTG
AAGGAACAAACACATGGGACAGATTTGAGCTCCGTGTGCACAAGCGTGTGATCGATCTCT
TCAGCTCTCCTGATGTTGTGAAGCAGATCACTTCCATCACCATCGAGCCTGGTGTTGAGG
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AATTCCAGCTACTTCTCGGTTCCTTTTTTGTTGCAAGGTTCAGACTTCTTGTTCTCTTCC
TTAGATATGTTATCCTTTTGAGTTTTACTTTTTGTTGAACATGCGACTTCTGGTTCTGTT
TTGCC

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 2

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CTTGGACTGCATCCTGGTGGCCATGGTAGGTGTGGACGCAGTTTCCTAATAAGCTGTCCC
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CCCAGATGACAAGCTTCTTGTCCATCCCACCTGTTGCAGCCATAGGGATAGTAGCGGAGC
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TTCCAGTGACTATATTGACAATGTGAACAGAACCGTCTTTTGAGCCACTGATAGCAAGAC
TGGAGTTGGAGTTAATGTCCAAGCATATCAACCCTTCAGTATGATACGGATGACCTTTAA
CCGCATGAATGCTTTCAAAAGTCTTCGGGTTCCATACTATCAGACTAGCATCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1H311JQB U 8
AF RS1E577JQ U 1
BS 1 19 RS1E577JQ
BS 20 20 RS1H311JQB
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BS 370 370 RS1H311JQB
BS 371 714 RS1E577JQ

RD RS1H311JQB 517 0 0
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QA 1 517 1 517
DS 

RD RS1E577JQ 714 0 0
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GAGCAGTGTTGTCAACAGAGACAGAAACAATGAAGTCGGTGTTGGTGGAGACTGAGATGG
CTTGGACTGCATCCTGGTGGCCATGGTAGGTGTGGACGCAGTTTCCTAATAAGCTGTCCC
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TCACGCATGTCACACCTTCCGCGTGCTCGCAGATGAACCTAGGAGTTGAATGTTGAAGAT
CCCAGATGACAAGCTTCTTGTCCATCCCACCTGTTGCAGCCATAGGGATAGTAGCGGAGC
TTGGTGAAAACTTCACGCATTCAACTGACTCTGTATGAGAACTCAGAGAGCTCACAACCT
TTCCAGTGACTATATTGACAATGTGAACAGAACCGTCTTTTGAGCCACTGATAGCAAGAC
TGGAGTTGGAGTTAATGTCCAAGCATATCAACCCTTCAGTATGATACGGATGACCTTTAA
CCGCATGAATGCTTTCAAAAGTCTTCGGGTTCCATACTATCAGACTAGCATCAT

QA 1 714 1 714
DS 



AS 1 2

CO CL9048Contig1 841 2 4 U
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TCAGCTCACAACCTGTGGCAAAACCCTGACAACACAAAAACCGCGAGGCTCTCAGAGTTT
GGAGAAATGATCAGATCATCATTCGGTTTCCCTGTGAACAGACACCGCTCGACAGAAAAA
CCGCTGTCGTCTTCATCATCCCCTGTTTACAACGTTCTCTTTGTCCGACGTGAAGACTAC
TTAGCACACCCTCGTCACGGAGGTAAAGTCCAGTCACGGCTCGTCAACGAGGAAGAAGTG
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TTTTCTTCGTCTTTAGGTGGGGGTTAATGTCAATGTCAAGTGTTGTAGATTGGCTTTTGC
TATTTTGTACCAAACATGCTTTTTGACACGGGATAATTATTATACCACTCTCACTTTTCT
C


BQ
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10 

AF RS1F990TF U 1
AF RS1F990JQ C 104
BS 1 656 RS1F990TF
BS 657 657 RS1F990JQ
BS 658 709 RS1F990TF
BS 710 841 RS1F990JQ

RD RS1F990TF 716 0 0
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TCAGCTCACAACCTGTGGCAAAACCCTGACAACACAAAAACCGCGAGGCTCTCAGAGTTT
GGAGAAATGATCAGATCATCATTCGGTTTCCCTGTGAACAGACACCGCTCGACAGAAAAA
CCGCTGTCGTCTTCATCATCCCCTGTTTACAACGTTCTCTTTGTCCGACGTGAAGACTAC
TTAGCACACCCTCGTCACGGAGGTAAAGTCCAGTCACGGCTCGTCAACGAGGAAGAAGTG
TTCGAGTCGCTGCGCCAGTGGGTGGCGTCTGGCTCCACGGGTCTGACGAAATGCGGGATT
AACCTTGTGAACGGGCTGTTTGCGCACATGTCGATGAAAGATCAAGTCAAAGCCATCCAA
GACGCGTCGGTGATCAGGGAGCTCACGGAGCGGGACTGGCGCACATAGTCTCTGCAACAC
CAAACACAACGATATTTGAGATTATAAGCGTCGAGTTTCGGAGGCCGCATTTCGAGCTTA
TAGCTAAGTGGAAAGGTTTGGAGTATCATCCGATGCATCTGGCGAATTCACGGGCGGATC
CGACAGCTGTGATTGAGAAGTTAAAAGAGATAATGAGAAGTTTTGGCTGCTGAAAA*GAA
GTCTCGGGTGACCCCGTGAGTTCGAACCTTAGCAGCCACGGGATGTTTT
GTATTAT

QA 1 709 1 709
DS 

RD RS1F990JQ 738 0 0
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ACCGCTCGACAGAAAAACCGCTGTCGTCTTCATCATCCCCTGTTTACAACGTTCTCTTTG
TCCGACGTGAAGACTACTTAGCACACCCTCGTCACGGAGGTAAAGTCCAGTCACGGCTCG
TCAACGAGGAAGAAGTGTTCGAGTCGCTGCGCCAGTGGGTGGCGTCTGGCTCCACGGGTC
TGACGAAATGCGGGATTAACCTTGTGAACGGGCTGTTTGCGCACATGTCGATGAAAGATC
AAGTCAAAGCCATCCAAGACGCGTCGGTGATCAGGGAGCTCACGGAGCGGGACTGGCGCA
CATAGTCTCTGCAACACCAAACACAACGATATTTGAGATTATAAGCGTCGAGTTTCGGAG
GCCGCATTTCGAGCTTATAGCTAAGTGGAAAGGTTTGGAGTATCATCCGATGCATCTGGC
GAATTCACGGGCGGATCCGACAGCTGTGATTGAGAAGTTAAAAGAGATAATGAGAAGTTT
TGGCTGCTGAAAAAGAAGTCTCGGGTGACCCCGTGAGTTCGAACCTTAGCAGCCACGGGA
TGTTTTTGTATTATTATTTTTCTTCGTCTTTAGGTGGGGGTTAATGTCAATGTCAAGTGT
TGTAGATTGGCTTTTGCTATTTTGTACCAAACATGCTTTTTGACACGGGATAATTATTAT
ACCACTCTCACTTTTCTC

QA 1 738 1 738
DS 



AS 1 2

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TTCTCCGGCCACCAAAACCGGACCACCACTTCTTGCTCTCCTCGTGCATCCACCGAACTA
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GCCGATGCCGCTAAAGTTGCTCAAATCCTCTCCTCACTTGGCTGGCTTCCCCAGCTCATC
CTCTCAAGCGACGCGACTCGGACTAAGGAGACGCTGAAGTCAATGCAAGCGCAAGTTGAT
GGCTTTATGGAGGCGAATGTACATTTCATCCCTAGCTTTTACTCCATTGCTGCTATGGAC
GGCCAAACCGCCGACCATCTCCACCACGTCATCTCCAAATACTCATCCCCTGACATCACC
ACCGTCATGTGTATGGGGCATAACAAAGGGTGGGAAGAAGCAGCCTCCGTGCTCTCTGGT
GCTTCCGTGAAGCTGAAAACTTGCAATGCTGCTTTGCTTCATGCTTTTGGCAACTCCTGG
GATGATGCTTTCGCTCTGGCTGGACCTGGTGGTTGGAAACTTGAGGGTATTGTGGCTCCA
GATAGCACCATTTGTGTCTAAGAGATCCCATAGCTTCAAGTTGGTTTACTTTCTTCTCCT
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CGTGTGTCAACTAGTTATGAATGATGATAAACATGTCAAGAGCACAGACTAGTGCATCTC
TTTATTGGATGGTTTGCCTTTGTGTAAGATCCTATAGCATCGTAGATATGTTTC


BQ
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AF RS1BG24TF U 1
AF RS1BG24JQ C 196
BS 1 708 RS1BG24TF
BS 709 894 RS1BG24JQ

RD RS1BG24TF 708 0 0
GATGAAATGAGATAAGAATATGCGATGCTGAGCTTCCAGTCTCCACCATCTCCTTTCTTC
TTCTCCGGCCACCAAAACCGGACCACCACTTCTTGCTCTCCTCGTGCATCCACCGAACTA
ACTTCTTCTCCTTCTCCGTCGCTAATCTCTCGCCGTCTCATCCTTCTACGTCACGCTCAC
AGTTCCTGGGACCATCTTTCCCTCAAAGACCATGATCGTCCTCTAACTAAGTCCGGTCAA
GCCGATGCCGCTAAAGTTGCTCAAATCCTCTCCTCACTTGGCTGGCTTCCCCAGCTCATC
CTCTCAAGCGACGCGACTCGGACTAAGGAGACGCTGAAGTCAATGCAAGCGCAAGTTGAT
GGCTTTATGGAGGCGAATGTACATTTCATCCCTAGCTTTTACTCCATTGCTGCTATGGAC
GGCCAAACCGCCGACCATCTCCACCACGTCATCTCCAAATACTCATCCCCTGACATCACC
ACCGTCATGTGTATGGGGCATAACAAAGGGTGGGAAGAAGCAGCCTCCGTGCTCTCTGGT
GCTTCCGTGAAGCTGAAAACTTGCAATGCTGCTTTGCTTCATGCTTTTGGCAACTCCTGG
GATGATGCTTTCGCTCTGGCTGGACCTGGTGGTTGGAAACTTGAGGGTATTGTGGCTCCA
GATAGCACCATTTGTGTCTAAGAGATCCCATAGCTTCAAGTTGGTTTA

QA 1 708 1 708
DS 

RD RS1BG24JQ 699 0 0
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GTTGCTCAAATCCTCTCCTCACTTGGCTGGCTTCCCCAGCTCATCCTCTCAAGCGACGCG
ACTCGGACTAAGGAGACGCTGAAGTCAATGCAAGCGCAAGTTGATGGCTTTATGGAGGCG
AATGTACATTTCATCCCTAGCTTTTACTCCATTGCTGCTATGGACGGCCAAACCGCCGAC
CATCTCCACCACGTCATCTCCAAATACTCATCCCCTGACATCACCACCGTCATGTGTATG
GGGCATAACAAAGGGTGGGAAGAAGCAGCCTCCGTGCTCTCTGGTGCTTCCGTGAAGCTG
AAAACTTGCAATGCTGCTTTGCTTCATGCTTTTGGCAACTCCTGGGATGATGCTTTCGCT
CTGGCTGGACCTGGTGGTTGGAAACTTGAGGGTATTGTGGCTCCAGATAGCACCATTTGT
GTCTAAGAGATCCCATAGCTTCAAGTTGGTTTACTTTCTTCTCCTCTATCCTTTGTAACT
TTTGCTACAACACGATATACAAAAGGCTGTGTAGTTTCATCCTTTCGTGTGTCAACTAGT
TATGAATGATGATAAACATGTCAAGAGCACAGACTAGTGCATCTCTTTATTGGATGGTTT
GCCTTTGTGTAAGATCCTATAGCATCGTAGATATGTTTC

QA 1 699 1 699
DS 



AS 1 2

CO CL9050Contig1 696 2 4 U
CGCATCAAACTGCTCATAATATTAAGAGAGAACATAGTTCAAAATTGACAAATACAAAAA
CAAAAGAAGCAGCCGTTATTGTTCTGCAGGTTGCATATTTAAATTCCAATGAATAGATAG
ATAAAGAGACCTTCTCTTTCTCTCTATCTACTCAAAGCCCTGTCTTCTTCTGTGTATTTT
CCTCAAAACTACCAAACTAAGCTAGCAGCTAAGAGACGTAACACACTTCTCTTCTCAAAG
CTCGTCCTTAACTTCCTCGGTTATCTTTTCATCCATCTTAGTCTCTGCAGCTGTGTCCTT
GTTCTTGTCAATAAAGCTTATGATATCTTCCTTTGTCCTGTCTCCTACATAAAGCACAGT
GTTTCCACTCGTTGTTCTTAAGTAAACGGTCGGGAAACCCTTCACATCAAAGGTGTCACG
TGGGAAGTCGTTTGCGGTTGCGTCAAACTTAGCTATGACTACACTTGGATCGCTTTGGTA
CGAAACAGCTACCTCGTCCAAGATTGGAACAAGGTTTTGGCAGTGTCCACACCATGGAGC
ATAGAACTCAAGCAAGACGTTCTTTCCAGAGTTGAATACCATCTCGTCAAGGCTCTCAGC
AACAACAACCTTCACTGGCTCGTTGTTTTCAGTTGGTATAGGTTGAGATTTTTTGTGCTG
TGGAACTTTTCCATCATTGAAGTCATTGATCCAAGA


BQ
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BQ
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20 20 20 20 20 

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QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1CE58TF C 1
AF RS1CE58JQ U 8
BS 1 7 RS1CE58TF
BS 8 611 RS1CE58JQ

RD RS1CE58TF 611 0 0
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GGGGGGAGATTTGGGGTTTTATTTGAAGATCAAATGGGGCAAGTATCTTCACGGGAACCG
TAACCAGAGGAAAAAGTATCAAACTTTCGAGACGATAGAGAAGAAGATGAAAGAGATGAA
TAAGACGATCC

QA 1 611 1 611
DS 

RD RS1CE58JQ 604 0 0
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GAGTCAATGACACCCAAACGAGCAACGATAAGTTCACAGTATATACCAACGAGCTCATAG
GCAGCCACTGTCTTCTCTTCTCTCACTACATTCTCCACCCGGATTAGAGCGGTCTGGGTC
TGACCGGATTCGAGCAACTGAGCCAGCTCTCTCCTCAACTGCTTGATCTGTGAGTCCTTT
TTGTTCTTCAGTATTTTCAGCCGCGAAGCCGCCATTTGCAATGTGATTTTGCATTTCGCA
GGCTTAAAGCTTCGATGAAGAACCTTCTTCATGGAGACAAGAGACAACGAAAACTAAAAA
AAAAAAAGTTAAGGCTTTAAGGTCTGGGAGTCTCTGATCAGGCAACTGAATGGGGGGGGA
GATTTGGGGTTTTATTTGAAGATCAAATGGGGCAAGTATCTTCACGGGAACCGTAACCAG
AGGAAAAAGTATCAAACTTTCGAGACGATAGAGAAGAAGATGAAAGAGATGAATAAGACG
ATCC

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 2

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GGAGTTCGATTCAGAGATCACCCCGCATGTTAGCGCAGAAGAAGTACATTAGCTACGGTG
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GAAGGGGAAGATGATGAGTACAATTCCTGTTTTGCCCTTGCGTGTTTCGTTTTATTTTTT
TACTTTTTTTATTTCATGGGATATATGGGTTTGATTGACACATTGAAAACTATAGTATTT
GTTACAACC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1C032JQ C 1
AF RS1C032TF U 1
BS 1 609 RS1C032TF

RD RS1C032JQ 609 0 0
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GTTACAACC

QA 1 609 1 609
DS 

RD RS1C032TF 609 0 0
GGGTTGTCTTAAGCTGTGTACAGAATCAAGTTTCAGGCAGAGAGAGAGAAACAAATTCAC
AAAGACGACTAAAGAAATCTCAAAAGCCTCTGATATAGACAGAAGGTTTTTGTCAAAGAA
GAAGATGAACTCTCGCGCGATCTACGCCGTCATCGCGATCCTCGCGCTCGTAATCTCAGC
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GGAGTTCGATTCAGAGATCACCCCGCATGTTAGCGCAGAAGAAGTACATTAGCTACGGTG
CAATGAGGAAGAACAGTGTGCCTTGCTCGCGACGTGGAGCTTCCTATTACAACTGCCAGC
GTGGCGCTCAGGCGAATCCTTACAGCCGTGGATGCAGCACCATTACCAGGTGCAGGCGTT
GAAGGGGAAGATGATGAGTACAATTCCTGTTTTGCCCTTGCGTGTTTCGTTTTATTTTTT
TACTTTTTTTATTTCATGGGATATATGGGTTTGATTGACACATTGAAAACTATAGTATTT
GTTACAACC

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 2

CO CL9054Contig1 763 2 2 U
GGATCGCCGTTTGTTTCTTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCTTGAAGTTGGCGTG
ATCGACTTCTTTGTGCAAATTCAGACATGCAGCAATCACGAGCTAGACTGTTCAAGGAGT
ACAAAGAGGTTCAGCGAGAGAAAGTAGCTGATCCTGATATTCAGTTGGTGTGTGATGATA
CCAACATTTTCAAATGGACTGCACTTATCAAGGGACCATCCGAGACTCCCTATGAAGGCG
GAGTGTTTCAGCTTGCATTTGCTGTTCCTGAACCGTATCCTCTGCAGCCTCCTCAAGTGC
GGTTCTTGACCAAAATATTCCATCCCAATGTGCATTTCAGACTGGGGAAATATGTCTTGA
CATATTGAAGAACGCCTGGAGCCCTGCATGGACGCTTCAGTCGGTGTGTAGAGCTATCAT
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AAGGTCTGGGGATGTCAGAGGCTTCAATTCAATGGCGCGCATGTACACACGCCTCGCCGC
TATGCCCAAGAAAGGATGATCCTCTCTTTGCTCTCTTTTCGGGTTATAACTCGTTTTCTG
TGAAATGTAATGGAAAAATGATTTGGGAAAACGAATACATTATTAACTATTCATATGTAA
GGCTGCAGAAGAGAATTTTCTTCTTGAACATGGTTTACAATGTTATTGCTGATACATATG
AGCATGGTCCACCGGTTTTTATAAGAAGTGATGTCTACTTGTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1D376TF U 1
AF RS1D376JQ C 281
BS 1 602 RS1D376TF
BS 603 763 RS1D376JQ

RD RS1D376TF 602 0 0
GGATCGCCGTTTGTTTCTTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCTTGAAGTTGGCGTG
ATCGACTTCTTTGTGCAAATTCAGACATGCAGCAATCACGAGCTAGACTGTTCAAGGAGT
ACAAAGAGGTTCAGCGAGAGAAAGTAGCTGATCCTGATATTCAGTTGGTGTGTGATGATA
CCAACATTTTCAAATGGACTGCACTTATCAAGGGACCATCCGAGACTCCCTATGAAGGCG
GAGTGTTTCAGCTTGCATTTGCTGTTCCTGAACCGTATCCTCTGCAGCCTCCTCAAGTGC
GGTTCTTGACCAAAATATTCCATCCCAATGTGCATTTCAGACTGGGGAAATATGTCTTGA
CATATTGAAGAACGCCTGGAGCCCTGCATGGACGCTTCAGTCGGTGTGTAGAGCTATCAT
AGCATTGATGGCTCATCCTGAGGCAGACAGTCCTCTCAACTGCGACTCAGGAAACCTTCT
AAGGTCTGGGGATGTCAGAGGCTTCAATTCAATGGCGCGCATGTACACACGCCTCGCCGC
TATGCCCAAGAAAGGATGATCCTCTCTTTGCTCTCTTTTCGGGTTATAACTCGTTTTCTG
TG

QA 1 602 1 602
DS 

RD RS1D376JQ 483 0 0
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TGGGACTCAGGAAACCTTTTAAGGTCTGGGGATGTCAGAGGCTTCAATTCAATGGCGCGC
ATGTACACACGCCTCGCCGCTATGCCCAAGAAAGGATGATCCTCTCTTTGCTCTCTTTTC
GGGTTATAACTCGTTTTTTGTGAAATGTAATGGAAAAATGATTTGGGAAAACGAATACAT
TATTAACTATTCATATGTAAGGCTGCAGAAGAGAATTTTCTTCTTGAACATGGTTTACAA
TGTTATTGCTGATACATATGAGCATGGTCCACCGGTTTTTATAAGAAGTGATGTCTACTT
GTC

QA 1 483 1 483
DS 



AS 1 2

CO CL9055Contig1 1104 2 6 U
CTTGACGTCTCTCTCTCTCTCCATCTCCTCGGTAACTCGGAGAAATGGCGGTGGATTCTC
CTGCAGGAGTAATCATCGCTTTTGCCGTGTTGCTACATGCTGCGACGACCATTGTTTGCG
GCTCCGACTCGGTTCTCAAGCTGGAGAGGTTGATTCCTCCGAGCCACGAACTTAGCTTGG
CTCAGCTCAGAGCTTTTGATTCAGCTCGCCATGGAAGGTTACTTCAGTCTCCTGTCGGTG
GAGTTGTTGATTTTCCCGTTTATGGAGCCTCCGATCCGTTTCTCGTTGGACTTTACTATA
CAAAGGTTAAACTTGGGACACCCCCAAGAGAGTTCAATGTTCAAATCGACACGGGAAGTG
ATGTTTTATGGGTTAGCTGCACTCCTTGCAACGGTTGCCCCAAGACTAGTGAACTCCAAG
TATATATGATCTCTTGGTTTTATCTTTATGACATCACTTTTTGTTTGTTTTTGAACTCTC
TTTTGTGTGTGTTTCCAGATTCAGCTGAGTTTCTTTGATCCCGGAGCCTCATCCTCAGCT
TCAACGGTTTCGTGTTCGGATAGGAGATGTTACTCTAATTTCCAGACGGAATCTGGCTGT
TCTCCTAACAATCTTTGTTCGTATACGTTTAAGTATGGTGATGGAAGTGGTACTTCTGGT
TACTACATCTCAGATTTCATGTTCTTTGACACTGTTGTCACCAGTACCTTGGCTATAAAC
TCTTCTGCTCCCTTTGTCTTCGGGTGTAGCAATTTACAAACCGGGGATTTACAGCGGCCT
AGGCGAGCGGTAGATGGCATATTTGGGTTAGGCCAGGGGCGTTTATCTGTAATTTCACAG
CTTGCTACGCAAGGCCTCGCACCACGAGTGTTCTCGCATTGTCTGAAGGGAGATAAAAGC
GGCGGGGGTGTCATGGTTCTTGGTCAAATCAAGAGACCTGATACTGTCTACACTCCTCTT
GTTCCATCACAGTGAGTTGTTCTCTGAACTTGTTTACATAAGACCAGGAGGTAGATTCAA
GGCTTGGAATATAAAACGTGTGATTTTTTGTTTAGCTTAGAATAGAAAAAAAAGGAACTA
AAAATATATATAAAACACCACATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CD86TF U 1
AF RS1CD86JQ C 404
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AGACGGAATCTGGCTGTTCTCCTAACAATCTTTGTTCGTATACGTTTAAGTATGGTGATG
GAAGTGGTACTTCTGGTTACTACATCTCAGATTTCATGTTCTTTGACACTGTTGTCACCA
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TATCTGTAATTTCACAGCTTGCTACGCAAGGCCTCGCACCACGAGTGTTCTCGCATTGTC
TGAAGGGAGATAAAAGCGGCGGGGGTGTCATGGTTCTTGGTCAAATCAAGAGACCTGATA
CTGTCTACACTCCTCTTGTTCCATCACAGTGAGTTGTTCTCTGAACTTGTTTACATAAGA
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AGAAAAAAAAGGAACTAAAAATATATATAAAACACCACATC

QA 1 701 1 701
DS 



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BQ
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AF RS1EA25TF U 1
AF RS1EA25JQ C 125
BS 1 745 RS1EA25TF

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TATCTGATACTGTATCAGATGCCTGCGTTTGCCTCCAGAACAACAACATTCCTTTCAACA
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AGGCACTAGGTGAAGTAAGCCCCGAGGTGTTGGAAACGCAAGTGAACCCAGCTGTGTGGG
AGATAAGCGGTCACATGGTGCTGAAGAGGAAAGAGGATTACGAAGGAGCTTCGGAGGAGA
ACGCATGGAGGCTCCTCGCAGAAGCTTCTCTGTCGGAGGAAAGGTTCAAGGAGGTTTATG
CTCTCATCTTTGAAGCCATAGGTTGTAGTTACCAAGAGGAGGAGGTTGAAGGAACCATAG
TTGAACAGGACAACCCTAGTGGCAGTGTTAACCAGAAAAGCAACCGAACCACCCATGGAG
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GGCTGGGGTTTTATGTATAATTAGAGTCCATAATGCATAAAATAAGCAAACTCTCTTGGT
AGTTGCATTTGAAACTTGTTGGTGTTCTTATGGTTGTTGTGGCCTAGACTTGCTGGCTCT
CTTTCTTGGTTGTAAGTTTATGTTTGGGATGATACATATGTTCTCCCCTTGTTGGTGATT
ATTATCTTAATAATTTCGAACAATT

QA 1 745 1 745
DS 

RD RS1EA25JQ 621 0 0
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ATGGAGGCTCCTCGCAGAAGCTTTTCTGTCGGAGGAAAGGTTCAAGGAGGTTTATGCTTT
CATCTTTGAAGCCATAGGTTGTAGTTACCAAGAGGAGGAGGTTGAAGGAACCATAGTTGA
ACAGGACAACCCTAGTGGCAGTGTTAACCAGAAAAGCAACCGAACCACCCATGGAGGTCC
TATCACGAACGGGACTGCCTTTGAGTGCCTTGTCCTTCAGTGAAAAACTCCGGCTTGGCT
GGGGTTTTATGTATAATTAGAGTCCATAATGCATAAAATAAGCAAACTCTCTTGGTAGTT
GCATTTGAAACTTGTTGGTGTTTTTATGGTTGTTGTGGCCTAGACTTGCTGGCTCTCTTT
CTTGGTTGTAAGTTTATGTTTGGGATGATACATATGTTCTCCCCTTGTTGGTGATTATTA
TCTTAATAATTTCGAACAATT

QA 1 621 1 621
DS 



AS 1 2

CO CL9057Contig1 606 2 1 U
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AGAGAAGATCATACCATTGGAAACATCGTTCGCATGCAACTTCACAGCGACGAGAATGTT
TTGTTTGCTGGGTACCAACTTCCTCATCCTCTCAAGTACAAAATCATAGTCAGGATTCAC
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AACCAGATGACTTATAATGAGCTTGTTGCTACTTGCTTTTCTAAATTAGAAACAAATTTT
CATGTTATTTATTTTAACTCTATGTTTTGTACACCATTCCGGCTGCTAAGAAGTACTATT
TGGAAT


BQ
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QA 1 606 1 606
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BQ
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AF RS1CJ77JQ C 1
AF RS1CJ77TF U 1
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QA 1 606 1 606
DS 



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BQ
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AF RS1EP29TF U 1
AF RS1EP29JQ C 108
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BS 730 820 RS1EP29JQ

RD RS1EP29TF 729 0 0
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CATTTTTGTCGGTCTCAACCGCTCTAGGCACACCACCTTACTTTGCAGCCTTGGTTCTTG
CATTCCTCTCGAACCTGATGGGAGGACTGACCCATTACGGTATCGGGTCTGCGCCTATCT
TCTACGGGGCTAACTACGTGCCGCTGGCCAAATGGTGGGGCTATGGATTCTTGATATCGA
TAGTCAACATTCTTATCTGGCTTGGTGTAGGTGGTGCCTGGTGGAAGTTCATTGGCTTGT
GGTGAGGACAACTGTACACCAATTGATCTCATTCTTTTCTTTACTGATATGTAATCTCTT
AGAATGGCT

QA 1 729 1 729
DS 

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GTTGTGACATGGAAAGAGTGCTTAGCTGAGTCAGTTGCATGGGACACGCTCACTTGGTTT
GCTGCTCTCATTGCAATGGCGGGTTATCTTAACAAATACGGTCTCATTGAGTGGTTCAGC
CAGACTGTTGTCAAGTTTGTGGGAGGATTGGGTTTGTCATGGCAACTATCGTTTGGAATC
CTCGTCCTCTTGTACTTCTACACTCACTACTTTTTTGCGAGTGGAGCGGCTCACATCGGG
GCTATGTTCACTGCATTTTTGTCGGTCTCAACCGCTCTAGGCACACCACCTTACTTTGCA
GCCTTGGTTCTTGCATTCCTCTCGAACCTGATGGGAGGACTGACCCATTACGGTATCGGG
TTTGCGCCTATTTTTTACGGGGCTAACTACGTGCCGCTGGCCAAATGGTGGGGCTATGGA
TTCTTGATATCGATAGTCAACATTTTTATCTGGCTTGGTGTAGGTGGTGCCTGGTGGAAG
TTCATTGGCTTGTGGTGAGGACAACTGTACACCAATTGATCTCATTCTTTTCTTTACTGA
TATGTAATCTCTTAGAATGGCTTCGAGATTAGATTGATAAGGAACAAGGATTTTTAAGAG
TTTGAGCTGGTGATTTTTTGCGATAATTTATTCTCTCGCACACATTTTGAGTT

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

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AGCCAACGACTATGTAGGAAAGGGAATGGCCGGAGGTGAAGTTGTGATATTACCAGTGGA
GTCGACTGGCTTTCTTCCTGAAGACGCAACTATTGTAGGAAACACTTGTCTGTATGGTGC
AACCGGTGGTTTACTATTTGTCAGAGGCAAAGCAGGAGAGAGATTCGCTGTTAGAAACTC
TCTAGCTCAAGCTGTTGTTGAAGGCACTGGAGATCACTGCTGTGAATATATGACTGGTGG
TTGTGTAGTCGTACTTGGGAAAGTCGGTAGAAATGTAGCTGCAGGGATGACAGGTGGACT
GGCGTATATTCTTGACGAGGACAACACTCTCCTCCCTAAGGTGAACAAAGAGATAGTGAA
GATCCAAAGAGTGACTTCACAAGTGGGACAAATACAGCTAAAGAGCCTGATCCAAGCCCA
TGTGGAGAAAACAGGGAGTAGTAAAGGAGCAACGATTGTGGAGGAATGGGACAAGTATCT
TGCAATGTTCTGGCAACTCGTTACCGCCGAGTGAAGAAGATACGCCGGAAGCTAACTCCG
ACCACCAGGTGAAAACAACCACCGGGGAAGAAGAGCAAGTATCGAACACATTTGCAGTGT
AGTTGCGAGAAGTAAACTCTTCTTTGTACAGTCAGAAGTCATGGCGGACATAAGTTTCAG
TTTCTGAGTGTTGTTGCTACATTACAACAAGTTCGCCATTTGCTTTTGACATGATGATTT
GTTTTTTAATTCGGTCTGGATTCGGTTATCTTCCGGTCGTTAAATAATAAAAGGAAGTCC
TCCATGTTTGTACTTTCGTATGCATATAGTCTTCAACCGCCGATTATGAAAACATAGCAT
TTTCAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FS01TF U 1
AF RS1AK84JQ C 142
BS 1 561 RS1FS01TF
BS 562 562 RS1AK84JQ
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RD RS1FS01TF 780 0 0
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TTTCTGAGTGTTGTTGCTACATTACAACAAGTTCGCCATTTGCTTT*GACATGATGATTT

QA 1 780 1 780
DS 

RD RS1AK84JQ 767 0 0
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AGTCGGTAGAAATGTAGCTGCAGGGATGACAGGTGGACTGGCGTATATTCTTGACGAGGA
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AGTGGGACAAATACAGCTAAAGAGCCTGATCCAAGCCCATGTGGAGATAACAGGGAGTAG
TAAAGGAGCAACGATTGTGGAGGAATGGGACAAGTATCTTGCAATGTTTTGGCAACTCGT
TACCGCCGAGTGAAGAAGATACGCCGGAAGCTAACTCCGACCACCAGGTGAAAACAACCA
CCGGGGAAGAAGAGCAAGTATCGAACACATTTGCAGTGTAGTTGCGAGAAGTAAACTTTT
CTTTGTACAGTCAGAAGTCATGGCGGACATAAGTTTCAGTTTTTGAGTGTTGTTGCTACA
TTACAACAAGTTCGCCATTTGCTTTTGACATGATGATTTGTTTTTTAATTCGGTCTGGAT
TCGGTTATCTTCCGGTCGTTAAATAATAAAAGGAAGTCCTCCATGTTTGTACTTTCGTAT
GCATATAGTCTTCAACCGCCGATTATGAAAACATAGCATTTTCAATT

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

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ATGATCACAATCATTCTTCTCTGCCTTTTGGTTACATCATCTTCAGAGACTGCTCCACAA
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TCATCAACTGGACTCAACCAACCGATTCTTGGTCAACCATCTTCTTCTGTAAACCAACCT
TTAACCGGGTTTAATCAACCATCATCAACTGGATTCAACCAACCAATTTCTTCTTCATCC
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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1C037TF U 1
AF RS1C037JQ C 121
BS 1 730 RS1C037TF
BS 731 761 RS1C037JQ

RD RS1C037TF 730 0 0
GGGCACTTAGAAAAAAACAAATCAAAAATAAACATGAAATTCGCCAAAATCCAAAAGAGG
ATGATCACAATCATTCTTCTCTGCCTTTTGGTTACATCATCTTCAGAGACTGCTCCACAA
ACTCAATTGGCCGCACCATTGGAACCTACAGGAGATGTCACCAATTCACCAACAAAGCCA
CAAGGTTTTCCAGCTGAGAACCAGAACCAACCAATTCTTGGTCAACCTTCTTCTGCTTCT
TCTGTAAACCAGCCTTTAACCGGGTTAAATCAACCATTAACCGGATTTAATCAGCCATCC
TCATCAACTGGACTCAACCAACCGATTCTTGGTCAACCATCTTCTTCTGTAAACCAACCT
TTAACCGGGTTTAATCAACCATCATCAACTGGATTCAACCAACCAATTTCTTCTTCATCC
TCTAATTCTGCTCTCAACCAGCCATTTGGGAATCGAATCAACCAAAACAGTCTCACGGGA
AGCAACGTTCCATTTCTTAATGGAAACTCGAAGCTACAAGTCTCCATTACAAAGATTGTC
TTCATCTGCATTGCTCTTCTCCTTGCTTTGCACGGTACAGACAGGAACTGAACCAAACTT
ATATATCATGTGGCACTTCTGTATAATTTGGTTTTCATCATATTTGTTCTATAACTTGTC
CTTTTTGCTCATTTTGGATTCTACTGAAATGTTTGTTCTATAAGAGTGTGTAGTGTGTTA
TGTGTATATT

QA 1 730 1 730
DS 

RD RS1C037JQ 641 0 0
ACTCAATTGGCCGCACCATTGGAACCTACAGGAGATGTCACCAATTCACCAACAAAGCCA
CAAGGTTTTCCAGCTGAGAACCAGAACCAACCAATTCTTGGTCAACCTTCTTCTGCTTCT
TCTGTAAACCAGCCTTTAACCGGGTTAAATCAACCATTAACCGGATTTAATCAGCCATCC
TCATCAACTGGACTCAACCAACCGATTCTTGGTCAACCATCTTCTTCTGTAAACCAACCT
TTAACCGGGTTTAATCAACCATCATCAACTGGATTCAACCAACCAATTTCTTCTTCATCC
TCTAATTCTGCTCTCAACCAGCCATTTGGGAATCGAATCAACCAAAACAGTCTCACGGGA
AGCAACGTTCCATTTCTTAATGGAAACTGGAAGCTACAAGTCTCCATTACAAAGATTGTC
TTCATCTGCATTGCTCTTCTCCTTGCTTTGCACGGTACAGACAGGAACTGAACCAAACTT
ATATATCATGTGGCACTTCTGTATAATTTGGTTTTCATCATATTTGTTCTATAACTTGTC
CTTTTTGCTCATTTTGGATTCTACTGAAATGTTTGTTCTATAAGAGTGTGTAGTGTGTTA
TGTGTATATTACTACTGAATGTTTTTACTTTTTGTTATTTT

QA 1 641 1 641
DS 



AS 1 2

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TGCAGGGAGGAGGCTTTTGTCTCTTCAGCAGAGATCTTCCACTGCCACCTCCTTCCTCCT
TTCCCGAGATCATACCATCTCCAAAGAAGGCGACGAAGACTCCACCAGATCTGCTCCCTC
TGCAGATCTTTCTTGTTTCAATTCTTACCACCGGAGCCTTTTAAGAGGTTTCTCTTCTCA
AGTCATTGCACAAGGAAATGAGATTGGTTTCGCTTCTGAAGTCCCAGCCACCGTCGAGGC
CGTCAAGACACCTAACTCAAAGATTGTCTATGACGACCACAACCATGAGCGTTACCCACC
TGGTGACCCTAGCAAGCGTGCCTTTGCCTATTTCGTCCTGTCTGGTGGTAGGTTTGTCTA
CGCCTCTGTTCTCCGCCTTCTAGTCCTGAAGCTCATTGTCAGCATGTCCGCAAGTAAAGA
TGTCCTTGCACTTGCGTCCCTCGAGGTTGACCTCGGGAGCATCGAGCCAGGAACTACTGT
CACAGTGAAGTGGCGTGGAAAGCCTGTCTTCATCAGGCGAAGAACTGAAGACGACATCAA
GCTGGCGAACAGCGTGGATCTTGGATCACTGAGGGACCCACAAGAGGACTCGGTGAGGGT
CGAGAATCCCGAATGGTTGGTGGTGGTGGGAGTTTGCACTCACTTGGGGTGCATCCCTTT
GCCGAATGCTGGTGATTACGGTGGTTGGTTTTGCCCCTGTCACGGATCGCATTACGATAT
CTCTGGAAGGATCAGGAAAGGTCCTGCACCATACAACCTGGAAGTACCGACTTACAGCTT
CTTGGAAGAGAATAAGTTACTCATTGGTTAATGATGGAATAAAAGCACATCAGACAGTGT
TTTTGTGTCTTAAAGATCCTCATATGTTTTTGTTTTTCTTTGATATATATTTTCCGGCTG
CAAATGTAGCGTGCAAGTTCGCTTTCCTTACACTTGGTTGGGTCTTCTCAGCAAGGAAAG
AAAAAGATTGTTTTGGTTTTGCTGAATAATACAAACTTGTCATTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AE07JQ C 222
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BS 682 1065 RS1AE07JQ

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TTCCCGAGATCATACCATCTCCAAAGAAGGCGACGAAGACTCCACCAGATCTGCTCCCTC
TGCAGATCTTTCTTGTTTCAATTCTTACCACCGGAGCCTTTTAAGAGGTTTCTCTTCTCA
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CGCCTCTGTTCTCCGCCTTCTAGTCCTGAAGCTCATTGTCAGCATGTCCGCAAGTAAAGA
TGTCCTTGCACTTGCGTCCCTCGAGGTTGACCTCGGGAGCATCGAGCCAGGAACTACTGT
CACAGTGAAGTGGCGTGGAAAGCCTGTCTTCATCAGGCGAAGAACTGAAGACGACATCAA
GCTGGCGAACAGCGTGGATCTTGGATCACTGAGGGACCCACAAGAGGACTCGGTGAGGGT
CGAGAATCCCGAATGGTTGGT

QA 1 681 1 681
DS 

RD RS1AE07JQ 844 0 0
TAAGAGGTTTCTCTTCTCAAGTCATTGCACAAGGAAATGAGATTGGTTTCGCTTCTGAAG
TCCCAGCCACCGTCGAGGCCGTCAAGACACCTAACTCAAAGATTGTCTATGACGACCACA
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CTGGTGGTAGGTTTGTTTACGCCTCTGTTCTCCGCCTTCTAGTCCTGAAGCTCATTGTCA
GCATGTCCGCAAGTAAAGATGTCCTTGCACTTGCGTCCCTCGAGGTTGACCTCGGGAGCA
TCGAGCCAGGAACTACTGTCACAGTGAAGTGGCGTGGAAAGCCTGTCTTCATCAGGGGAA
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AAGAGGACTCGGTGAGGGTCGAGAATCCCGAATGGTTGGTGGTGGTGGGAGTTTGCACTC
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ACGGATCGCATTACGATATCTCTGGAAGGATCAGGAAAGGTCCTGCACCATACAACCTGG
AAGTACCGACTTACAGCTTCTTGGAAGAGAATAAGTTACTCATTGGTTAATGATGGAATA
AAAGCACATCAGACAGTGTTTTTGTGTCTTAAAGATCCTCATATGTTTTTGTTTTTCTTT
GATATATATTTTCCGGCTGCAAATGTAGCGTGCAAGTTCGCTTTCCTTACACTTGGTTGG
GTCTTCTCAGCAAGGAAAGAAAAAGATTGTTTTGGTTTTGCTGAATAATACAAACTTGTC
ATTG

QA 1 844 1 844
DS 



AS 1 2

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GCTGAGTGCCACTGGAACGGAATTTGTGGCGACAGGTTTGCAGAAGGATGATTTATTTCT
TGGCGACATAAGCACACAATATAAAGGTCAAAACACCATTGTTGATGTCAAAATCGACAG
CCACTCAAGTGTGTCGACGAAAGTAACTGTCAAAAATCTCATGCCGTCTGCTAAAGCTGT
TATCAGCTTCAAAATACCTGATCACAAGTCTGGCAAGCTGGATGTGCAATATGTTCATCC
TCATGCTACCCTCAATTCCAGCATTGGCCTCAACCCAACTCCTCTGCTCGATCTGTCAGC
AACTATAGGAAGCCAGACTGTTAGCCTCGGTGGTGAAGTTGGTTTCGACACAGCTTCCTC
TTCGCTAACCAAGTACAACGCCGGAATCAGTTTCAACAAGCCAGACTTCTCTGCTGCTCT
CATGCTGGAGGATAAAGGGGAGAGTCTAAGAGCCACTTACGTACACACGGTGAATCCAAC
CACATCCGTTGCTGCAGAACTGATCCGTCGCTTCTCGAATCATGCCAACAGTTTCACCAT
CGGAAGCTCTTACTCTGTGGATCCTCTTACAACGGTGAAGACGAGACTCTCTAACAATGG
GAAAGCAGGGATGGTGGTACAAAGGGAATGGAGACCCAAGTCGCTTATCACTCTTTCAGC
TGAGTATGACTCCAAGGCTGTGAGCTCTTCACCCAGGGTTGGTCTCGCTCTCGCCCTCAA
ACCATAAAAGAAGCAAAGTGTTCTCTCAGTTTGGAATACAATTTTTTTTCAACATGCCCA
AAGGAATGTATTTTGGGTTTATTAAATAACTTTTTGCACTAATCTTTTGTTTTCATTGTG
TGATGTGAAAGAAAAGGGAGTGATAAAAAAACCCCAATTTTTGGAAAAGAGAGTTGTTTT
CTTTTTGTTTCTTTAGACTTTTGTTTCAAGTTGATCCGTTTGTAGAGATACAAACAGTAG
GCCAATGTAGTCCATCAGGATGGACTGACATATGCAGGCTGATATTATCATTCAATCAAT
AAAAGATTTTGGTTAAGACTAATTCTGC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1BW88TF U 1
AF RS1BW88JQ C 344
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TATCAGCTTCAAAATACCTGATCACAAGTCTGGCAAGCTGGATGTGCAATATGTTCATCC
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GAAAGCAGGGATGGTGGTAC

QA 1 740 1 740
DS 

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CACACGGTGAATCCAACCACATCCGTTGCTGCAGAACTGATCCGTCGCTTCTCGAATCAT
GCCAACAGTTTCACCATCGGAAGCTCTTACTCTGTGGATCCTCTTACAACGGTGAAGACG
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CTTATCACTCTTTCAGCTGAGTATGACTCCAAGGCTGTGAGCTCTTCACCCAGGGTTGGT
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TTTTTTCAACATGCCCAAAGGAATGTATTTTGGGTTTATTAAATAACTTTTTGCACTAAT
CTTTTGTTTTCATTGTGTGATGTGAAAGAAAAGGGAGTGATAAAAAAACCCCAATTTTTG
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QA 1 825 1 825
DS 



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TTTCT


BQ
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20 20 20 20 20 

AF RS1G630JQ C 1
AF RS1G630TF U 1
BS 1 605 RS1G630TF

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GTGTAATTTGGGGATTATGGTTTCTTTTACTTGAAGAAAACATATATGAAAGTTCTTAAT
TTTCT

QA 1 605 1 605
DS 

RD RS1G630TF 605 0 0
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CGGAGGGGACCAAGGCGGTTACCAAGTTCACGAGCTCTTAGATTTGGAATTTATTTGTAA
TGGTTTTTAAGTTTTAACTAGTTGTCGGTAGTTTTAAGCGTTTGGGTTTGGCAACAGGTT
GTGTAATTTGGGGATTATGGTTTCTTTTACTTGAAGAAAACATATATGAAAGTTCTTAAT
TTTCT

QA 1 605 1 605
DS 



AS 1 2

CO CL9065Contig1 824 2 4 U
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CTCAGGCTAAGGCCCATCGTCTCCTCCGCCACGTCACTATCCTCCTCATCTTCCTCCGGC
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GTAGGGAAGGATACAGCAGTATGTGGGAGAGCTGATGTGTGGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1DH05TF U 1
AF RS1FQ08TF U 10
BS 1 494 RS1DH05TF
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BS 499 594 RS1DH05TF
BS 595 824 RS1FQ08TF

RD RS1DH05TF 594 0 0
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CTCAGGCTAAGGCCCATCGTCTCCTCCGCCACGTCACTATCCTCCTCATCTTCCTCCGGC
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AGGCTCGATTGGTTTAGAAATGCAGCCGGTTTGGTTGATCCTGCCTACTGGCGCGGCACT
CTACGCCCTCGTCCTGTTCTTGATTGGTATTTGAAAAGAATAGATGATGCCGTCCGTGAA
GCCAATGAGTTAGCCCAAGGTAAAGGATTGTCTTTGATTGGACACTCGGCTGGAGGATGG
CTTGCTAGAGTTTACATGGAAGAATACGGAAACGCTGATATCTCTTTGTTGCTGACACTT
GGTACGCCTCACTT****ACCACCACCGAGAGGACTATCAGGGGTTATTGATCAAACAAG
AGGTCTTCTTTATTATGTCGAAGAGAATTGTGCAAAAGCTGTTTATACCCCTGA

QA 1 594 1 594
DS 

RD RS1FQ08TF 815 0 0
GG
ACATATCCACTGAACAACAAAAAGGATGGCCTCGGCGATTTTTCCATCGCTCAGGCTAAG
GCCCATCGTCTCCTCCGCCACGTCACTATCCTCCTCATCTTCCTCCGGCGATTTCAAACC
CCGTCCCGCCGTCATTCTCCCGGGTTTAGGCAACAATTCAGGAGACTACAAGAAGCTGGA
GCTAACATTGGGTGAGTATGGTGTTCCTTCAGTGGTTGCAGATGTGTCAAGGCTCGATTG
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TCCTGTTCTTGATTGGTATTTGAAAAGAATAGATGATGCCGTCCGTGAAGCCAATGAGTT
AGCCCAAGGTAAAGGATTGTCTTTGATTGGACACTCGGCTGGAGGATGGCTTGCTCGAGT
TTACATGGAAGAATACGGAAACGCTGATATCTCTTTGTTGCTGACACTTGGTACGCCTCA
CTTGTAGACCACCACCGAGAGGACTATCAGGGGTTATTGATCAAACAAGAGGTCTTCTTT
ATTATGTCGAAGAGAATTGTGCAAAAGCTGTTTATACCCCTGAGCTGAGATATGTCTGCA
TCGCCGGGAGATACATTCGTGGAGCTCCTTTAGTGGACAAGGCAGATGCAAATCTTGATT
CTAATGTGACTGTTGGAATCGACGTGGTGAACCATCTCAGAGCTGGCTATAGCAAGCAAC
AAGACTGGGGACTCGCAGTTTCTTCAAGTCCTAGTTCCGTGCTCGTTTTGTAGGGAAGGA
TACAGCAGTATGTGGGAGAGCTGATGTGTGGGG

QA 3 815 3 815
DS 



AS 1 2

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AAATGGCCTCATCACTTTGGATAACATCCGAACGGCACTCGCTACAAATGCAACAGAAGC
GATGAAGGAGTCACGCATCCCAGACTTTCTTGCATTGTTAAATGGACTACAATACAAAGG
AATGGATTTTGAAGAGTTTTGTGCAGCTTCGATTAGTGTTCATCAGCATGAGTCTCTTGA
TTGTTAGGAGCAGAGCGTTCGCCATGCTTATGAGCTTTTTGATATGAATGGAAACCGAGT
TATTGCCATTGAAGAACTTGCTTCTGAGCTCGGCGTTGGATCATCAATCCCAGTCCACAC
CATTCTACATGATTGGATAAGGCACAGTGATGGGAAGCTGAGCTTCTTAGGTTTTGTCAA
ATTGTTGCGCGGTGTATCTACTCGTCAGCCTTTAGCCAAGACACGGTGAAAAGGGTAACT
TGGTGATATAGCAGAGGTGAAAGAGGATGATGAACATTCCACACACAGCTAATGGATGTC
AAGAACAATTTTATAGTGTCCAAAAAAAGGAAATCTAAATTTCCTATAAAAGGAAAAAAG
TATCAAAATATTAGACATGCCTGAAAAGTTGTAATGAGATGATGTTAAACTGAACACTTT
CTTCTCTAATGTTTTTTATCTAAACACTTCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1DF72TF U 1
AF RS1DF72JQ C 86
BS 1 691 RS1DF72TF

RD RS1DF72TF 691 0 0
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TATTGCCATTGAAGAACTTGCTTCTGAGCTCGGCGTTGGATCATCAATCCCAGTCCACAC
CATTCTACATGATTGGATAAGGCACAGTGATGGGAAGCTGAGCTTCTTAGGTTTTGTCAA
ATTGTTGCGCGGTGTATCTACTCGTCAGCCTTTAGCCAAGACACGGTGAAAAGGGTAACT
TGGTGATATAGCAGAGGTGAAAGAGGATGATGAACATTCCACACACAGCTAATGGATGTC
AAGAACAATTTTATAGTGTCCAAAAAAAGGAAATCTAAATTTCCTATAAAAGGAAAAAAG
TATCAAAATATTAGACATGCCTGAAAAGTTGTAATGAGATGATGTTAAACTGAACACTTT
CTTCTCTAATGTTTTTTATCTAAACACTTCT

QA 1 691 1 691
DS 

RD RS1DF72JQ 606 0 0
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AGTGATGGGAAGCTGAGCTTCTTAGGTTTTGTCAAATTGTTGCGCGGTGTATCTACTCGT
CAGCCTTTAGCCAAGACACGGTGAAAAGGGTAACTTGGTGATATAGCAGAGGTGAAAGAG
GATGATGAACATTCCACACACAGCTAATGGATGTCAAGAACAATTTTATAGTGTCCAAAA
AAAGGAAATCTAAATTTCCTATAAAAGGAAAAAAGTATCAAAATATTAGACATGCCTGAA
AAGTTGTAATGAGATGATGTTAAACTGAACACTTTCTTCTCTAATGTTTTTTATCTAAAC
ACTTCT

QA 1 606 1 606
DS 



AS 1 2

CO CL9067Contig1 889 2 4 U
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EF79TF U 1
AF RS1DZ28TF U 126
BS 1 673 RS1EF79TF
BS 674 674 RS1DZ28TF
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GAAACGCCTCTTCAAACTCGCCTACATGATCCTCACTCTCTTCCTCACCATTTTCTGGTT
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GGTGGCATTAGAGATTTGT

QA 1 739 1 739
DS 

RD RS1DZ28TF 764 0 0
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CTAGGAGAGGAAGAGAAAGAGAAAGAGAGAGAGGGATGGGAGATGTGTGGACATGGATTA
TTTCATTCTTAATCCTTATCACTCTTGTCGGATTCATCGTCTACCAGCTTATTTGCTTAG
CTGATCTGGAATTTGATTACATCAACCCTTACGACTCTGCATCAAGAATAAACTTTTTGG
TATTACCTGAGTTCATTCTTCAAGGCTTCCTATGTTTCTTCTACCTCGTCACTGGTCACT
GGTTCATGTCACTACTTGGCGTCCCTTATCTCTACTACAACTTCCAACTTTACTCGAAAG
GACAGCATTTGGTAGATGTGACAGAGATCTTCAACTTGCTTGATTGGGAAAAGAAGAAAC
GCCTCTTCAAACTCGCCTACATGATCCTCACTCTCTTCCTCACCATTTTCTGGTTAATCT
ATTCAACATTGGATGATCACGAGGATTGAAGGCAAAACACACTACCGCCATGTGACATGG
AAAGAAAGGTTTATGATATATGTTTATTACTGAAGAGTATGTTGTTAGGGTCTATGGTGG
CATTAGAGATTTGTGTAACCAGATTTTAGTCTGTAGTGAAACATTCTTCTGATCTTGTGG
TGATGATCAAGTTAAGTGCTAACATTACATTTGGAACCCTCTACTTGTCGAGAGTTTTGT
TTATTGTTTAGCTCCAACTATCTGAGTCCAGACGAAATTAAAAA

QA 1 764 1 764
DS 



AS 1 2

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AAAAAAAAAAGAACTTATTACAGGAACAGTTGCACTGCCCGCTGTTTTTATGACAAGTTC
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TCCCTGAGTTCCCGATCCTCCTCCTGGTGCAGAACCTCCACCACCAGACATGTGCTCTCC
GATCTTTGAAACAGCTTTGTTTGCCGCATCGATCTTAGCCTTAATCTCATTGACATCATC
TCCAGCCGAAGCGCTCCTCAGATCCGTGACAGCGTCTTCGATCTCCTTGGCCACTTCACT
CGGGATCTTCTCTCTGTACTCACCGAGGCTCTTCTCTATGCTGTAAATTGTTGTGTCCCC
CGCGTTCTTGGTATCGATCAAGTCTTTTCTTTCTTTGTTTTTCTGAGCATGCAACTCTGC
GTCTCTCACCATCT


BQ
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15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1AE32JQ U 1
AF RS1CS32JQ U 31
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QA 1 524 1 524
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1DU67JQ C 1
AF RS1DU67TF U 1
BS 1 596 RS1DU67TF

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DS 

RD RS1DU67TF 596 0 0
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AAGATGAAGAACAAGGTTCAGCACAAGTTTAAAGCCATCGGCAAAAACGTATCATATGAT
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TTTATCTGCATCTTTTGTTTTCATAATTTTATTAAATTTACAATGACTGAATGGTC

QA 1 596 1 596
DS 



AS 1 2

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C


BQ
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20 

AF RS1DK31JQ C 1
AF RS1DK31TF U 1
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C

QA 1 601 1 601
DS 

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C

QA 1 601 1 601
DS 



AS 1 2

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TGTGGCGGAGCTGTGAAATCAAAATCCTAATAGACGTTATGAGTGTCGGGGGGTTTGATT
CGGGATGCAATCAAATATTGGATTCGAATTGTATATGGCGAAATGATACTTGTACAGACT
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BQ
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QA 1 597 1 597
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BQ
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AF RS1DM35TF U 1
AF RS1BL47TF U 40
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AF RS1BK26TF U 1
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BS 726 984 RS1BK26JQ

RD RS1BK26TF 725 0 0
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AGCTCCTTAACTTAGGCTTCAAATATGAGTTTTAACTTCAGGGTGCTCTCAGTGGTGGAG
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GCAAATCAAAGAATAGTAACAAACCAAATAAATATACACATGAGAATCAGACAAGAAGCT
AGCTAGCACAAACCATAGGAAAGTCTCTAATCAGCTAATGTGTGAGTGCCTAAGAAGCTT
AAAAGAGACTTCATTGCTTTGCCCCCATAGCCTTTTAACTGTACTACACAGACTCATTAA
CACTTGGTTCTCAATCTACAAACTAAACATAAAGGAAAGAAGCAAAGTACCCGGACAATC
TCCTCGTACGTCTCATCATCAATCTCAACTGTTGTGATAACTTCTTCAACATCTCCCAGA
ATCAT

QA 1 725 1 725
DS 

RD RS1BK26JQ 551 0 0
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TTGCTTTGCCCCCATAGCCTTTTAACTGTACTACACAGACTCATTAACACTTGGTTCTCA
ATCTACAAACTAAACATAAAGGAAAGAAGCAAAGTACCCGGACAATCTCCTCGTACGTCT
CATCATCAATCTCAACTGTTGTGATAACTTTTTCAACATCTCCCAGAATCATATTCAAAT
GCTGATCAAACGCCTGCCCCGCACAAACAAAACAAAACCAACTTTTAAAAAAAAGAGGTT
TTCGATAAACCCTTTTACTAAAAATTGAAACTTTCAAACCCCACGAGAGAGACAGAAAAC
AACGTACGTGAAGCTTGCCGCGAAGCTCGCGGTCTGAGCGGAGTTTGACGTAGATTCTTT
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ACATCGTTTCC

QA 1 551 1 551
DS 



AS 1 2

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GCTCATGACCATGACTGTTGCCACGTCAATGGCGGCTCGCCAAGGAGCTTTTGGTATGGC
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TATATTTGATGGACTGCACTATGGAATGTCGGACTTCCCGTATGCAGCTTGGTCGATGAT
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ATTAATGTGGAAGAAGGGACCATGGTGGTTCATGCATACAAGTGACAAGCGTCTTGCTTA
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TAATGTTAATTACGTTGTAGTCTCATTATTAGCTTCATTTGTTAGACACAACACTCATTC
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ATTTCGGTTAAAATAGGC


BQ
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AF RS1DS41TF U 1
AF RS1DS41JQ C 261
BS 1 635 RS1DS41TF
BS 636 918 RS1DS41JQ

RD RS1DS41TF 635 0 0
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GTTGGGGATGTCATTCAGTTCAATAGCTGGTTTGTTCTCCAAAGACCCTGAAGTTCTGCA
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GGTGGTGGGAGGAATATCATCAGCGTTCATGCTGTATGCATCAGCAGGGATGGGGCTAAG
TGGAGTGTGAGTGGGGCTGAGTATGTTCATGGGGT

QA 1 635 1 635
DS 

RD RS1DS41JQ 658 0 0
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TGTTTGTAGCGGCAACTCAACCAATCACAGCGCTAGCGTTTATATTTGATGGACTGCACT
ATGGAATGTCGGACTTCCCGTATGCAGCTTGGTCGATGATGGTGGTGGGAGGAATATCAT
CAGCGTTCATGCTGTATGCATCAGCAGGGATGGGGCTAAGTGGAGTGTGGGTGGGGCTGA
GTATGTTCATGGGGTTTAGGATGGTGGCTGGATTCGGCATATTAATGTGGAAGAAGGGAC
CATGGTGGTTCATGCATACAAGTGACAAGCGTCTTGCTTAAAAGCTGCGTGCGAGAGAGA
GACGTGCCCCGCGTTCAACTTGTTACAGACGTGCCCCCCTTAATGTTAATTACGTTGTAG
TCTCATTATTAGCTTCATTTGTTAGACACAACACTCATTCTTCGATTTCGCCCTTGTAGT
AAAATCATTACTAGTATTGTGTTATGTTAGCTTTTATAGAATTTCGGTTAAAATAGGC

QA 1 658 1 658
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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GACTATTCCTCTCTACTTTCTCCATGGTTTCAGCTGCTTTACTCGAGAAGAAACGTAGAG
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TCTTTGGGGTCTCAGAAATGTTTACTGCCGTTGGATTGATTGAGTTCTTTTACAAACAAT
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TTTACTTGAGCTCTGTGCTCGTTCCGATCGTGAACAAGATAACTTCCACGTCAGTCAACT
CCAAAGGGTGGCTCGGGGACAACGATCTGAACAAGGACAGGCTCGATCTGTTTTATTGGC
TTTTAGCAGTTCTCAGTCTACTGAACTTTCTTAGCTATCTCTTCTGGTCTCGTTGGAACA
TTAAGTCTTCGAGAAGCAACAACTCTAATGTGGTGGGAGATGATAACATTTAGCTTGATG
CATATTACATTTTTAAAACTCCAGCATATAATTAATAATGAATAAGTTTATTGACG


BQ
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AF RS1GH06JQ C 1
AF RS1GH06TF U 1
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DS 

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CTGCAAAGGGCATGGAGTCATTCCTGATGGCTTTGACTTATTGTTCGTATTCCTTTGGGT
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CCAAAGGGTGGCTCGGGGACAACGATCTGAACAAGGACAGGCTCGATCTGTTTTATTGGC
TTTTAGCAGTTCTCAGTCTACTGAACTTTCTTAGCTATCTCTTCTGGTCTCGTTGGAACA
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CATATTACATTTTTAAAACTCCAGCATATAATTAATAATGAATAAGTTTATTGACG

QA 1 596 1 596
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TTGGCATGAAGCAGAGAAGAAGCATCCATGGCATAATGCATCTCCTAAGATCAAGGTGAC
ACATGAAAATGGTTTTTACCATATGAACATAGAAATGACCGTAGGGCTCATCCAGAATTG
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BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
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AF RS1EJ56TF U 1
AF RS1EJ56JQ C 119
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BS 578 900 RS1EJ56JQ

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QA 1 577 1 577
DS 

RD RS1EJ56JQ 782 0 0
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TTATGCAAAAATAAGATACCAATGACTCGAGAAGAGTATAAAAAATGTAGTGGTGGCCAA
GGAAAGATTGCGTCAAAACTGACAATAGACCAATACTATAAGCCATATCCTCCTTTTAAT
CT

QA 1 782 1 782
DS 



AS 1 2

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AGACTTCGTTATTAGGCATCACGGTTTCATCCGCCTTTACAAATATGTTTTCTTCTGTTG
ACGCGTTACTATTGCTTCTGCTGATCCCTTCCACGTTAAGTTTTGCTCTTAGCTCTTTAA
TCTCTGCACGGAGAGAATCGTTATCAAGCTGAAGCGAGTCGCGGCTGCGTTTTGAGTAAG
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BQ
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AF RS1A854JQ U 316
AF RS1A854TF C 1
BS 1 315 RS1A854TF
BS 316 423 RS1A854JQ
BS 424 424 RS1A854TF
BS 425 439 RS1A854JQ
BS 440 713 RS1A854TF

RD RS1A854JQ 124 0 0
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AGAACGCCGTAATCACGTTCGAGCTGCTTTGTCTTCCACCGAGCACGGGGATTCTGAAAC
CATA

QA 1 124 1 124
DS 

RD RS1A854TF 713 0 0
AGCCGCTGTGGGACTATACTCTTCGTTCAGAATAGCGCTTGAGTCGCTACTATCAGCAGG
ATCTTCTCTGAAGATCTCGGTACGTGGGAAAATGCTAAACAATCTCGTATGCGAGCTCCG
ATGCCGGAGCTTCCGTTTGAATATGTGGCAGCGGTTGAGAAGGAAGCTGGTTTAGCTCTA
AGACTTCGTTATTAGGCATCACGGTTTCATCCGCCTTTACAAATATGTTTTCTTCTGTTG
ACGCGTTACTATTGCTTCTGCTGATCCCTTCCACGTTAAGTTTTGCTCTTAGCTCTTTAA
TCTCTGCACGGAGAGAATCGTTATCAAGCTGAAGCGAGTCGCGGCTGCGTTT*GAGTAAG
TCAAAGTTTGACTTAAGAACGCCGTAATCACGTTCGAGCTGCTTTGTCTTCCACCGAGCA
CGGCGATTCTGAAACCATATCGCCACTTGTCGCGGTTGGAGCCCGAGTTCTTGAGCCAGC
TTCACTTTTCTCTCGGGCTCTAACTTGTTATCAATCTCGAAATTCTTTTCTAATGCTTTC
ACTTGCTCTACACTCAACCGCCGCTTTTTCTCCGTTGCCGCCGTACACGACGCGTGTCCG
ACTGCGATATCCTCTAGACTTCATCTTCTAGACAGTCGAACATCGGGGAGTAGTCTCCGG
CGCCGGAATAGAGAAATCCGGTGGCTGTTGGTCTTGGACTTAATTGTTTGTCC

QA 1 713 1 713
DS 



AS 1 2

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TGTTTTCTTACCTCAAGATCAATCTCCGGTGTCAAAGAGCTTGTCCCGTTCATCAAACCT
AGAATCTTTTCGTGCCCCAAGAGAAGTTCCTGCCAGTTCCTCACCAGAAAGTTTGCTTCT
CCGTTCTCTGTAAATTGTTCACTTTCGGATTCATGGAAGCCACTGGATGATGATTGTGTC
TCCTAATCGCTACAGAGAAGCTAGATGGAGTCCACATCTTCGAAAAGACAGTGATCCTCA
TCCTCTTCTTTGGTGGGCCTTTAGAAGAAGGGTTGTTCCTGGTGAGTCCGAGGAGTGGCG
GGGACAACGAGGTTGCGAAGAGCGGAGTGTTCAGACAAGTGATGAAAGGATTGTACTATG
GAACGAGTGAGAGCGTGGGATTGGCTGCAGAGATGGTGAAGAGGAAGTTGGTGGGAAGAA
GTGAGCTAAGATTCTTTGATGGGTATTGCGGTTGGGAAAAGGAGCAGTTGAAAGCAGAGA
TCTTGGGAGGGTACTGGACTGTGGCTGCTTGTAGCTCGAGTGTTGTTGAGCTTGGTTCTG
CTGTTCAGAGTCATGGTCTTTGGGATGAGGTTCTTGGACTCATTGGTCCTCAAACTGGCT
CTGTTATCTAAACTCTAGCTTCTGTAATGGTTTGTGTTTTTACTAATGGTTTGTGTTTTT
ACTAATGGTTTGTATCAATGAGTCATGACTATTGTGTATGTTTTATTGATGTATGTATGT
ATTAAGGATTCATCACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CH62TF U 1
AF RS1CH62JQ C 163
BS 1 167 RS1CH62TF
BS 168 168 RS1CH62JQ
BS 169 671 RS1CH62TF
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BS 738 738 RS1CH62JQ
BS 739 782 RS1CH62TF
BS 783 797 RS1CH62JQ

RD RS1CH62TF 783 0 0
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GGGACAACGAGGTTGCGAAGAGCGGAGTGTTCAGACAAGTGATGAAAGGATTGTACTATG
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CTGTTCAGAGTCATGGTCTTTGGGATGAGGTTCTTGGACTCATTGGTCCTCAAACTGGCT
CTGTTATCTAA*CTCTAGCTTCTGTAATGGTTTGTGTTTT*ACTAATGGTTTGTGTTTT*
ACTAATGGTTTGTATCA*TGAGTCATGACTATTGTGTATGTTTTATTGATGTATGTATGT
AT
A

QA 1 782 1 782
DS 

RD RS1CH62JQ 635 0 0
ACCAGAAAGTTTGCTTCTCCGTTCTCTGTAAATTGTTCACTTTCGGATTCATGGAAGCCA
CTGGATGATGATTGTGTCTCCTAATCGCTACAGAGAAGCTAGATGGAGTCCACATCTTCG
AAAAGACAGTGATCCTCATCCTCTTCTTTGGTGGGCCTTTAGAAGAAGGGTTGTTCCTGG
TGAGTCCGAGGAGTGGCGGGGACAACGAGGTTGCGAAGAGCGGAGTGTTCAGACAAGTGA
TGAAAGGATTGTACTATGGAACGAGTGAGAGCGTGGGATTGGCTGCAGAGATGGTGAAGA
GGAAGTTGGTGGGAAGAAGTGAGCTAAGATTCTTTGATGGGTATTGCGGTTGGGAAAAGG
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TTGTTGAGCTTGGTTCTGCTGTTCAGAGTCATGGTCTTTGGGATGAGGTTCTTGGACTCA
TTGGTCCTCAAACTGGCTCTGTTATCTAAACTCTAGCTTCTGTAATGGTTTGTGTTTTTA
CTAATGGTTTGTGTTTTTACTAATGGTTTGTATCAATGAGTCATGACTATTGTGTATGTT
TTATTGATGTATGTATGTATTAAGGATTCATCACC

QA 1 635 1 635
DS 



AS 1 2

CO CL9082Contig1 977 2 2 U
ATCGACAGCGACATCCGTCGTCCTTTCCCGAGATTATACCATCATCTCCAATGGAGGCGA
CTTGTCTTCCACCCGTAGATCTATTCCTTTTGCAGATCTTTCATCTTTCAATTCTTACCA
CCGGAGCCTTATAAGAGGTTTCTCATCTCAAGTCCTTGCTCCAGGGAATGAGATAGGTTT
TGCCTCTGAAGTCCCAGCCACCGTCGAGGCTGTCAAGACACCTAACTCCAAGATCGTCTA
CGATGACCATAACCATGAGCGTTACCCACCTGGAGACCCTAGCAAGCGTGCCTTCGCCTA
CTTTGTCTTATCGGGTGGGAGGTTTGTTTATGCCTCTGTTCTCCGCCTTCTTGTTCTGAA
GCTCATTGTCAGCATGTCCGCAACTAAAAGACGTCCTTGCCCTCGCATCCCTCGAGGTCG
ACCTCGGGAGCATCGAACCAGGAACCACTGTTACCGTGAAGTGGCGTGGTAAGCCCGTGT
TCATCAGGAGGAGAACAGAAGATGATATCAAGCTGGCCAATAGCGTGGATCTCGGATCTC
TGAGAGACCCTCAAGAAGATGCGGTCAGGGTTAAGAATCCGGAATGGTTAGTCGTGGTTG
GAGTCTGCACTCACCTGGGGTGCATCTCTTTGCCGAATGCTGGTGACTACGGTGGTTGGT
TTTGTCCGTGTCACGGTTCGCATTACGATATTTTTGGAAGGATAAGGAAAGGTCCTGCAC
CTTATAACCTGGAAGTACCGACCTACAGCTTCTTGGAAGGGAACAAGTTACTCATTGGTT
GATGATGATGAATAAAAAAGCACGAAAATAGACTGTGTCTCTGTGTTTGAAAGATCCTCA
TACGTTTTTTTAATATAGTTTCACGCCAAAAATAGTATTAGCGGTTTTCCTCACACTTTT
GGTTTCAGCAAGTAAAAGATTGTCTTGGTTTTGCTCGATAATACTTTGCAAAACCGTTGT
AATTTTCTATCACTTAG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 0 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1EF58TF U 1
AF RS1EF58JQ C 302
BS 1 564 RS1EF58TF
BS 565 977 RS1EF58JQ

RD RS1EF58TF 564 0 0
ATCGACAGCGACATCCGTCGTCCTTTCCCGAGATTATACCATCATCTCCAATGGAGGCGA
CTTGTCTTCCACCCGTAGATCTATTCCTTTTGCAGATCTTTCATCTTTCAATTCTTACCA
CCGGAGCCTTATAAGAGGTTTCTCATCTCAAGTCCTTGCTCCAGGGAATGAGATAGGTTT
TGCCTCTGAAGTCCCAGCCACCGTCGAGGCTGTCAAGACACCTAACTCCAAGATCGTCTA
CGATGACCATAACCATGAGCGTTACCCACCTGGAGACCCTAGCAAGCGTGCCTTCGCCTA
CTTTGTCTTATCGGGTGGGAGGTTTGTTTATGCCTCTGTTCTCCGCCTTCTTGTTCTGAA
GCTCATTGTCAGCATGTCCGCAACTAAAAGACGTCCTTGCCCTCGCATCCCTCGAGGTCG
ACCTCGGGAGCATCGAACCAGGAACCACTGTTACCGTGAAGTGGCGTGGTAAGCCCGTGT
TCATCAGGAGGAGAACAGAAGATGATATCAAGCTGGCCAATAGCGTGGATCTCGGATCTC
TGAGAGACCCTCAAGAAGATGCGG

QA 1 564 1 564
DS 

RD RS1EF58JQ 676 0 0
TTTGTCTTATCGGGTGGGAGGTTTGTTTATGCCTCTGTTCTCCGCCTTCTTGTTCTGAAG
CTCATTGTCAGCATGTCCGCAACTAAA*GACGTCCTTGCCCTCGCATCCCTCGAGGTCGA
CCTCGGGAGCATCGAACCAGGAACCACTGTTACCGTGAAGTGGCGTGGTAAGCCCGTGTT
CATCAGGAGGAGAACAGAAGATGATATCAAGCTGGCCAATAGCGTGGATCTCGGATTTTT
GAGAGACCCTCAAGAAGATGCGGTCAGGGTTAAGAATCCGGAATGGTTAGTCGTGGTTGG
AGTCTGCACTCACCTGGGGTGCATCTCTTTGCCGAATGCTGGTGACTACGGTGGTTGGTT
TTGTCCGTGTCACGGTTCGCATTACGATATTTTTGGAAGGATAAGGAAAGGTCCTGCACC
TTATAACCTGGAAGTACCGACCTACAGCTTCTTGGAAGGGAACAAGTTACTCATTGGTTG
ATGATGATGAATAAAAAAGCACGAAAATAGACTGTGTCTCTGTGTTTGAAAGATCCTCAT
ACGTTTTTTTAATATAGTTTCACGCCAAAAATAGTATTAGCGGTTTTCCTCACACTTTTG
GTTTCAGCAAGTAAAAGATTGTCTTGGTTTTGCTCGATAATACTTTGCAAAACCGTTGTA
ATTTTCTATCACTTAG

QA 1 676 1 676
DS 



AS 1 2

CO CL9083Contig1 788 2 7 U
GGGAGACTTTCCCCTTTGGATATTTTCAGACAAGATTTTTATCTATCTCCTGTTCTTCTT
TTGTTTTTCTTTATCATCTGCTTGAGCATTTTGTGTTCTTGTCCTCTCGAATTCTGATCC
GATTTTATCTCTAATCAAAGCTTAGCGATTTTCAGGAAATTCGATCTCTCTCTTTCTCTG
TTGCCCTAGATTTAGAATTTTTCTTATAATTGGTCTTCCCTTTCTATTCATCGTAATTCG
ATGAGTTATCGGGTCTCCGTGTTCCTCCTCCTCCTATGTGCGATAGCTGGATCATGCTTG
CCTTCCGGGCTCGCTTCCTCCGTTGACGTTTGCGATCATCATGATGAGTTCGAGGTGTTC
CGATTCGGAATCGAGAGAAAGTGTCCTCCTTTTCTCTATCCCAGACCTCCTTTAAAGGTG
GATGGAGACTTGCTAGACAGACTCATGGATGCACATAACCATGGAAATGCTTATACTTCC
ATACTATTTTATTCCTCTCGGTGCCCCTTCTCAACTTCAGTACGCCCAAAGTTTGATGCT
CTGAGTTCAATGTTCCCCCACATAGGTCACCTGGTTGTTGAGCAATCTCAGGCTTTACCA
TCGTACGAACCAACTTCTGCTATAGAGGTCTTTTCTAGGTATGGTATCCATAGCTTGCCT
TCAGTCCTGATGGTGAATCAAACACTGAGATGCGATACATGGTCAAAAGATCTTGCATCC
CTTGTTCACTGATACAACTAACACAGTCTAAACCTGTCAGTATGTGGATGAAGCTGACCA
GCAGCTGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DQ57TF U 36
AF RS1E837TF U 1
BS 1 270 RS1E837TF
BS 271 273 RS1DQ57TF
BS 274 290 RS1E837TF
BS 291 291 RS1DQ57TF
BS 292 509 RS1E837TF
BS 510 510 RS1DQ57TF
BS 511 788 RS1E837TF

RD RS1DQ57TF 526 0 0
TTTTTATCTATCTCCTGTTCTTCTTTTGTTTTTCTTTATCATCTGCTTGAGCATTTTGTG
TTCTTGTCCTCTCGAATTCTGATCCGATTTTATCTCTAATCAAAGCTTAGCGATTTTCAG
GAAATTCGATCTCTCTCTTTCTCTTTTGCCCTAGATTTAGAATTTTTCTTATAATTGGTC
TTTCCTTTCTATTCATCGTAATTCGATGAGTTATCGGGTCTCCGTGTTCCTCCTCCTCCT
ATGTGCGATAGCTGGATCATGCTTGCCTTCCGGGCTCGCTTCCTCCGTTGACGTTTGCGA
TCATCATGATGAGTTCGAGGTGTTCCGATTCGGAATCGAGAGAAAGTGTCCTCCTTTTCT
CTATCCCAGACCTCCTTTAAAGGTGGATGGAGACTTGCTAGACAGACTCATGGATGCACA
TAACCATGGAAATGCTTATACTTCCATACTATTTTATTCCTCTCGGTGCCCCTTCTCAAC
TTCAGTACGCCCAAAGTTTGATGCTCTGAGTTCAATGTTCCCCCAC

QA 1 526 1 526
DS 

RD RS1E837TF 788 0 0
GGGAGACTTTCCCCTTTGGATATTTTCAGACAAGATTTTTATCTATCTCCTGTTCTTCTT
TTGTTTTTCTTTATCATCTGCTTGAGCATTTTGTGTTCTTGTCCTCTCGAATTCTGATCC
GATTTTATCTCTAATCAAAGCTTAGCGATTTTCAGGAAATTCGATCTCTCTCTTTCTCTG
TTGCCCTAGATTTAGAATTTTTCTTATAATTGGTCTTCCCTTTCTATTCATCGTAATTCG
ATGAGTTATCGGGTCTCCGTGTTCCTCCTC***CTATGTGCGATAGCTGGGTCATGCTTG
CCTTCCGGGCTCGCTTCCTCCGTTGACGTTTGCGATCATCATGATGAGTTCGAGGTGTTC
CGATTCGGAATCGAGAGAAAGTGTCCTCCTTTTCTCTATCCCAGACCTCCTTTAAAGGTG
GATGGAGACTTGCTAGACAGACTCATGGATGCACATAACCATGGAAATGCTTATACTTCC
ATACTATTTTATTCCTCTCGGTGCCCCTTTTCAACTTCAGTACGCCCAAAGTTTGATGCT
CTGAGTTCAATGTTCCCCCACATAGGTCACCTGGTTGTTGAGCAATCTCAGGCTTTACCA
TCGTACGAACCAACTTCTGCTATAGAGGTCTTTTCTAGGTATGGTATCCATAGCTTGCCT
TCAGTCCTGATGGTGAATCAAACACTGAGATGCGATACATGGTCAAAAGATCTTGCATCC
CTTGTTCACTGATACAACTAACACAGTCTAAACCTGTCAGTATGTGGATGAAGCTGACCA
GCAGCTGG

QA 1 788 1 788
DS 



AS 1 2

CO CL9084Contig1 955 2 4 U
GGAAGATAATCAAAAAAATGAGGAATGTGATGATTCATCGTGGAGGAGTCTTCTTCTTCT
GCGCAAAACCACTCTCTATCCTCCCCTCCCTCCTCACTCCTCCCCACCTCCGTCTCTGCT
ACTCCGCCGTCGCCGCCGCAGCAGCTTCATCCCCGAATCGATCGATTCACTGCATGCCCA
ACGATTCCACACTCCCTCAGCCGTTAACCGGCGGAGATGGCTCCGTCTCCGTCCCTCCTC
CTTCTTCCGCTTCGTCCGCCATCGATTTCCTCTCCCTCTGCTCTCGCCTCAAGACAACTC
CAAGAGCTGGATGGGGTAAAAGAGATGTTAAAAATCCAGAATCAATTGCTGATCACATGT
ATCGGATGGGTCTTATGGCGCTTATCGCTTCAGATATTCCAGGTGTAAACAGAGACAAAT
GCATTAAAATGGCAATTGTTCATGACATTGCAGAAGCCATTGTAGGAGACGTTACACCTT
CTTGTGGGGTCTCTAAAGAAGAGAAAAATCGAAGAGAAAGTGAAGCGCTTGAACACATGT
GCAAGCTCTTGGGTGGAGGAGAAAGAGCTGAAGAAATCGCTGAGCTATGGAGGGAATATG
AAGCAAACGCGTCACCAGAAGCCAAAGTAGTTAAAGATTTCGATAAGCTTGAGTTGATAC
TACAAGCTTTGGAATATGAACAAGAGCAAGGTAAAGATCTCGAAGAGTTTTTCGAATCAA
CCGCAGGGAAGTTCCAGACAGATATAGGCAAGGCTTGGGCGTTGGAGATTGCTTCAAGAA
GAAGAAAGCCACAACATTAGTTAGTTCTCACTTGAGCTAAAATACTCTCTTCCTTTCAAC
TTTAAATCATTCAAGATATTTTGATGTGGAATTGTGGATCTACACTACTTATGTAGTCTA
CATTCTTTGAGGGAGAAATCCGAATCCAACCCGACCCAATAAGTCAGTTCAGATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1B343TF U 1
AF RS1B343JQ C 160
BS 1 176 RS1B343TF
BS 177 177 RS1B343JQ
BS 178 272 RS1B343TF
BS 273 955 RS1B343JQ

RD RS1B343TF 272 0 0
GGAAGATAATCAAAAAAATGAGGAATGTGATGATTCATCGTGGAGGAGTCTTCTTCTTCT
GCGCAAAACCACTCTCTATCCTCCCCTCCCTCCTCACTCCTCCCCACCTCCGTCTCTGCT
ACTCCGCCGTCGCCGCCGCAGCAGCTTCATCCCCGAATCGATCGATTCACTGCATGGCCA
ACGATTCCACACTCCCTCAGCCGTTAACCGGCGGAGATGGCTCCGTCTCCGTCCCTCCTC
CTTCTTCCGCTTCGTCCGCCATCGATTTCCTC

QA 1 272 1 272
DS 

RD RS1B343JQ 796 0 0
CGATCGA
TCACTGCATGCCCA*CGATTCCACACTCCCTCAGCCGT*AACCGGCGGAGATGGCTCCGT
CTCCGTCCCTCCTCCTTCTTCCGCTTCGTCCGCCATCGATTTCCTCTCCCTCTGCTCTCG
CCTCAAGACAACTCCAAGAGCTGGATGGGGTAAAAGAGATGTTAAAAATCCAGAATCAAT
TGCTGATCACATGTATCGGATGGGTCTTATGGCGCTTATCGCTTCAGATATTCCAGGTGT
AAACAGAGACAAATGCATTAAAATGGCAATTGTTCATGACATTGCAGAAGCCATTGTAGG
AGACGTTACACCTTCTTGTGGGGTCTCTAAAGAAGAGAAAAATCGAAGAGAAAGTGAAGC
GCTTGAACACATGTGCAAGCTCTTGGGTGGAGGAGAAAGAGCTGAAGAAATCGCTGAGCT
ATGGAGGGAATATGAAGCAAACGCGTCACCAGAAGCCAAAGTAGTTAAAGATTTCGATAA
GCTTGAGTTGATACTACAAGCTTTGGAATATGAACAAGAGCAAGGTAAAGATCTCGAAGA
GTTTTTCGAATCAACCGCAGGGAAGTTCCAGACAGATATAGGCAAGGCTTGGGCGTTGGA
GATTGCTTCAAGAAGAAGAAAGCCACAACATTAGTTAGTTCTCACTTGAGCTAAAATACT
CTCTTCCTTTCAACTTTAAATCATTCAAGATATTTTGATGTGGAATTGTGGATCTACACT
ACTTATGTAGTCTACATTCTTTGAGGGAGAAATCCGAATCCAACCCGACCCAATAAGTCA
GTTCAGATT

QA 8 796 8 796
DS 



AS 1 2

CO CL9085Contig1 998 2 8 U
GGTAAATATCCCCCAAATGTAGTTTCCAGTTTGCTGCTTTTGCTCCACTTCTTGACGCTT
CCTTTTGTATAATAACTTCAAAACCACACTCGAAACACCCCAAAGCAAATTTTATACAGA
ACAATATCTAATAATTAGAAGCATACGTAGACAATTTTGTCTGGTATCAAGAAGCAACCA
CGGCACCACTAGTACCACCTGAAACTAAGAGAAACAAAAAAACAGGATTTGGTGTTCTGT
CTTTTCATTACTCTCTTAAGGCTTTTATATCTTTAACAGATTCTTCAAAGAAAATACTGC
ACCTTGGGTTTCTTCCTCTTTCTCTACGTCGATTGTTTTCCAAACAATGTCCTTAAGACC
CGTGGTGAGGTTCTTGTAAAACTAAAAATAGAGACCAAGAAAAAAAGACAAAAGATTTAT
CAACTTGTTTATGAACCTAAATACCCACAAAGATTAGATAGAGAGCCTTGGATGCATATA
TACCTTGTGGAATTCCAAGGTATCACCCCCTGATTTCCTCATTTCAACCATATATAGCGA
TGGAGCAACTTGAAAAACCTGAACAGTATAATATGTCCGTTAACTTAAAAGAGATTAGGG
GCTCATCCAACACCGTGACATCATCACGACAAGAAAAGGACTAACCTCAGTCGTGATTGC
TAATTGACCCTTGCGGCCTGATTTCTCTCCTAGAAGCTTCATCTTTGGATGAAATCAAAA
AGAAAACGGTGTAATCAGAAGAATTAAAATACAAAATTTTCAACAGGAAACGTGAGTGAG
AATATGATGCAACAGAAAATTACTCAAAACCTTGTAGTTGTTTTTCCTGACATCAAATCC
CATAGGTGCTGCTGCTGCCTCAATTTTTGTGACTATCTCATTAGCAGGATATTTTGAAGT
AAACTGAGTTTTCCGTTTAACAAGCCCCTGAAGAAATTAAACATGCTTATCAATCAGTAA
GAACGTCTACTTTCCCACTAACAAAATACAGGATTCTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AQ47TFB U 1
AF RS1AQ47JQ C 246
BS 1 808 RS1AQ47TFB
BS 809 809 RS1AQ47JQ
BS 810 824 RS1AQ47TFB
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BS 847 860 RS1AQ47TFB
BS 861 998 RS1AQ47JQ

RD RS1AQ47TFB 860 0 0
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CCTTTTGTATAATAACTTCAAAACCACACTCGAAACACCCCAAAGCAAATTTTATACAGA
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CGGCACCACTAGTACCACCTGAAACTAAGAGAAACAAAAAAACAGGATTTGGTGTTCTGT
CTTTTCATTACTCTCTTAAGGCTTTTATATCTTTAACAGATTCTTCAAAGAAAATACTGC
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CATAG*TGCTGCTGCTGCCT

QA 1 860 1 860
DS 

RD RS1AQ47JQ 753 0 0
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TGTTTATGAACCTAAATACCCACAAAGATTAGATAGAGAGCCTTGGATGCATATATACCT
TGTGGAATTCCAAGGTATCACCCCCTGATTTCCTCATTTCAACCATATATAGCGATGGAG
CAACTTGAAAAACCTGAACAGTATAATATGTCCGTTAACTTAAAAGAGATTAGGGGCTCA
TCCAACACCGTGACATCATCACGACAAGAAAAGGACTAACCTCAGTCGTGATTGCTAATT
GACCCTTGCGGCCTGATTTCTCTCCTAGAAGCTTCATCTTTGGATGAAATCAAAAAGAAA
ACGGTGTAATCAGAAGAATTAAAATACAAAATTTTCAACAGGAAACGTGAGTGAGAATAT
GATGCAACAGAAAATTACTCAAAACCTTGTAGTTGTTTTTCTTGACATCAAATCCCATAG
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GAGTTTTCCGTTTAACAAGCCCCTGAAGAAATTAAACATGCTTATCAATCAGTAAGAACG
TCTACTTTCCCACTAACAAAATACAGGATTCTC

QA 1 753 1 753
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL9087Contig1 829 2 2 U
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CTTTCATCTCTATCTCTTTCACGAGGAAGAAGACGAAGGAGATCGATTCCGAAACTTGTT
TCGTGAGGCCTGATGATTCAATCAGCTATTCTGACTCTTCTTCTTGATTTCTCTTCGATG
ATGACAGAATTGGCGTCTCTCTCGGCAGTGTTGAATACAACGTGTCGTATGTGTATCACG
GTTTGTACCGGTGACAACGTTGCTCTCAAAGGTCTTTGCCAAGTTTTTCAAGGATTCGAG
TGAGGAGGAACGAGACCATGCCGAGATGTTGATGGAGTATCAGAATAAAACAAAACCAAA
CGTGGTGGGAGGGTTAAGTCACAGCCTATGGTGACGCCTCAGTCTGAATTTGACCACGCT
GAGAAAGGAGATGATCTCTACGCCATGGAACTGGTTCTATCATTGGAGAAACTGGTTAAT
GAGAAACTCTTAAACTTGTATGGTTCATGAAGGATGGAGTTTCTTCTAGTGCCAAAACCC
GTCTCAGTTGTGTTTGGCAGATGAACGTGTGCCTACTGAGTTGAAGAAAGCAATTATGCA
AGCCCGAGGGGAGAAGAAGCTCACACAGTCCCAACTCGTTCAAGTACACTACTTCACTCT
TCACTCTGTTTCTTTTTTTTCTCTTGTAATGATGCTAATATGAAGATGTGTTGGTTGTGT
GCTTGAAATGTTGTGTCTCAATGTATAATTTTTGTTAAGAACCCCTAAATAAGATATTTG
CATTGGAGGACAAAATTTAGAGGTTGCTTAATTAAAGTGCTTAACATCC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1AB36TF U 1
AF RS1AB36JQ C 180
BS 1 785 RS1AB36TF
BS 786 829 RS1AB36JQ

RD RS1AB36TF 785 0 0
GGACACGCGTCATAACAATGATGTCTCTCTCTCTCATCTCTTTTCTCTTGCGTATTCTTT
CTTTCATCTCTATCTCTTTCACGAGGAAGAAGACGAAGGAGATCGATTCCGAAACTTGTT
TCGTGAGGCCTGATGATTCAATCAGCTATTCTGACTCTTCTTCTTGATTTCTCTTCGATG
ATGACAGAATTGGCGTCTCTCTCGGCAGTGTTGAATACAACGTGTCGTATGTGTATCACG
GTTTGTACCGGTGACAACGTTGCTCTCAAAGGTCTTTGCCAAGTTTTTCAAGGATTCGAG
TGAGGAGGAACGAGACCATGCCGAGATGTTGATGGAGTATCAGAATAAAACAAAACCAAA
CGTGGTGGGAGGGTTAAGTCACAGCCTATGGTGACGCCTCAGTCTGAATTTGACCACGCT
GAGAAAGGAGATGATCTCTACGCCATGGAACTGGTTCTATCATTGGAGAAACTGGTTAAT
GAGAAACTCTTAAACTTGTATGGTTCATGAAGGATGGAGTTTCTTCTAGTGCCAAAACCC
GTCTCAGTTGTGTTTGGCAGATGAACGTGTGCCTACTGAGTTGAAGAAAGCAATTATGCA
AGCCCGAGGGGAGAAGAAGCTCACACAGTCCCAACTCGTTCAAGTACACTACTTCACTCT
TCACTCTGTTTCTTTTTTTTCTCTTGTAATGATGCTAATATGAAGATGTGTTGGTTGTGT
GCTTGAAATGTTGTGTCTCAATGTATAATTTTTGTTAAGAACCCCTAAATAAGATATTTG
CATTG

QA 1 785 1 785
DS 

RD RS1AB36JQ 650 0 0
GATGACAGAATTGGCGTCTCTCTCGGCAGTGTTGAATACAACGTGTCGTATGTGTATCAC
GGTTTGTACCGGTGACAACGTTGCTCTCAAAGGTCTTTGCCAAGTTTTTCAAGGATTCGA
GTGAGGAGGAACGAGACCATGCCGAGATGTTGATGGAGTATCAGAATAAAACAAAACCAA
ACGTGGTGGGAGGGTTAAGTCACAGCCTATGGTGACGCCTCAGTCTGAATTTGACCACGC
TGAGAAAGGAGATGATCTTTACGCCATGGAACTGGTTCTATCATTGGAGAAACTGGTTAA
TGAGAAACTCTTAAACTTGTATGGTTCATGAAGGATGGAGTTTCTTCTAGTGCCAAAACC
CGTCTCAGTTGTGTTTGGCAGATGAACGTGTGCCTACTGAGTTGAAGAAAGCAATTATGC
AAGCCCGAGGGGAGAAGAAGCTCACACAGTCCCAACTCGTTCAAGTACACTACTTCACTC
TTCACTCTGTTTCTTTTTTTTCTCTTGTAATGATGCTAATATGAAGATGTGTTGGTTGTG
TGCTTGAAATGTTGTGTCTCAATGTATAATTTTTGTTAAGACCCCCTAAATAAGATATTT
GCATTGGAGGACAAAATTTAGAGGTTGCTTAATTAAAGTGCTTAACATCC

QA 1 650 1 650
DS 



AS 1 2

CO CL9088Contig1 918 2 2 U
TCTTCTATCGCCTCTCGAAAAACCTAACCTAGCGCAGCAGTCACGCCATGGAAGTATCCG
CGAACAATGGCGTGGAATTGAACGGTGGGATTCGAAATAGCAGTATTATTAGCCGGATGG
TGGTTGAGGGATACGACACCTCCCCTCCTAGGAAGGATGTCGAAGAGGCTCTGAAACAAC
ACTTCGCATCACGTGGAATAAAGTTAATACATGCCTCTGTTAACATGGACGACAATTTTT
GTAGTCGCAGACGCGCCTTAATCTATGTTAATGGAGAATGTGAAGCAGAGGCGTTGAAGC
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GTAGCCTTGAGCATGTCTTTGCTCCTACCGAAGTCATAGACGAATACCGACCGCGCACTT
TGAAAGTTACAGGATTTGGCACTTCCCTCTCTCCGAATGATATCAAGAAGATGCTATGTA
GGGTTTTCCCCGGATCCAGTTGTGCTTCTGTCAGTGACGGCTCAGCTTTGCTTTCTCTCC
GTGGACCATATGCTATGGACGAGGCTCTGAAACTTAGCGGAGGTTCTGTTGAAGGCTTTG
AATTTGCAGTTACTGAGGTCTTCCCAGAAATTGTGATGCAGGCTGGCATCTCTCGCGCAA
GCTTTTTCGGATCCTAAAGCCAATCAGATCAGATCAAGACTACGCACTAGAAGTCTCTCC
CTCTTTCTCTCTCAAATGCTGTCTCGTGTTATTAACTTGCGTCATGCAATGCCACCTTCT
TCTTTTCTCTTGTCTGTATCTTGAATGTTATGTTTTTATTCGTGTGTGTTGTTTTTTATG
ATAAAACTCTGTAAAAACACGATGACAAACTTGGTTGTCCAATCAATAATCATTATGGTA
ACTTGGTTTGTTAATGTG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1G003TF U 1
AF RS1G003JQ C 404
BS 1 637 RS1G003TF
BS 638 918 RS1G003JQ

RD RS1G003TF 637 0 0
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DS 

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ATGCAATGCCACCTTCTTCTTTTCTCTTGTCTGTATCTTGAATGTTATGTTTTTATTCGT
GTGTGTTGTTTTTTATGATAAAACTCTGTAAAAACACGATGACAAACTTGGTTGTCCAAT
CAATAATCATTATGGTAACTTGGTTTGTTAATGTG

QA 1 515 1 515
DS 



AS 1 2

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TTTCCTTTTCTTTTTGTATTTGTTTTCTACAATTCAACTTATGAACAAAAAAATGAAAGA
AACAAAAAAAAAGACACCCTCAAGCTCCCACCATTGCATTGCAGAGCCTTTCAGCGGAGA
TTCCTCCACAGGCAAGTTGGTCCGTTTTGTTTGTTCTAGTATTATAGTCTGAGTATGCAT
TATATGATTTTGCTGGTACAAAGGTTTGTGATTGAAGGGAGAGAGAGAGAGAGGGTGTTG
GGCAAATGTTGGGAGAATGTAATTGCTTTTCGTTTCTGAATTGGTATGAATAATTTAATT
TACT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 

AF RS1FN38TF U 1
AF RS1FN38JQ C 114
BS 1 533 RS1FN38TF
BS 534 784 RS1FN38JQ

RD RS1FN38TF 533 0 0
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CGTTTCTTCTTGGTTAATCAAATCTCAGGTAAAAAGATGCAAGCTGCGATTCGTTCGTTT
GTGTCCGGTGGAAACGTTGTGAAAGCGTCTCTGCTGCAACATGTCCGTGAGGAACTGCTG
GCACTAGAAGAGCGGATTGGAGATGTTTGTACGGGTGTAAACGAAGAAACCATATCAAAC
CGGTTGAAGCAGAGTAAATACAAAAGCAGCACAAAATCTCCACAAGATGCAGAGCCATGC
TGTATTTGTCAGGAGGAATACACTGAGGGAGAAGACATGGGGACTTTAGAATGTGGGCAT
GAATTCCATAGCCAATGCATAAAAGAATGGCTGAAACAGAAGAATCTCTGCCCAATTTGC
AAGACGACAGGCTTGAACACTGCCAAGAAGCGGAAAATAGGATGAATCATAGCTCCTTTT
TTTCCTTTTCTTTTTGTATTTGTTTTCTACAATTCAACTTATGAACAAAAAAA

QA 1 533 1 533
DS 

RD RS1FN38JQ 671 0 0
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ATCAAACCGGTTGAAGCAGAGTAAATACAAAAGCAGCACAAAATCTCCACAAGATGCAGA
GCCATGCTGTATTTGTCAGGAGGAATACACTGAGGGAGAAGACATGGGGACTTTAGAATG
TGGGCATGAATTCCATAGCCAATGCATAAAAGAATGGCTGAAACAGAAGAATCTCTGCCC
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TCCTTTTTTTCCTTTTCTTTTTGTATTTGTTTTCTACAATTCAACTTATGAACAAAAAAA
TGAAAGAAACAAAAAAAAAGACACCCTCAAGCTCCCACCATTGCATTGCAGAGCCTTTCA
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TATGCATTATATGATTTTGCTGGTACAAAGGTTTGTGATTGAAGGGAGAGAGAGAGAGAG
GGTGTTGGGCAAATGTTGGGAGAATGTAATTGCTTTTCGTTTCTGAATTGGTATGAATAA
TTTAATTTACT

QA 1 671 1 671
DS 



AS 1 2

CO CL9090Contig1 599 2 1 U
TTTTTTGCCGCCGCCTTCAGGTAAAGTCAAACAGGTAAACTAAACTTAAAAGATGGGGCG
TGTCCGAACCAAGACCGTGAAGAAATCATCACGTCAAGTGATCGAGAAGTACTACTCTCG
CATGACGCTCGACTTCCACACCAACAAGAAGATCCTCGAAGAAGTAGCCATCATCCCTTC
TAAGCGTCTCCGCAACAAGATTGCTGGGTTCTCCACTCATCTCATGAAGAGGATCCAGAA
GGGACCGGTCCGCGGCATCTCGCTCAAGCTTCAAGAGGAGGAGCGTGAGCGCCGCATGGA
CTTTGTGCCCGATGAGTCTGCTATCAAGACCGATGAGATCAAGGTCGACAAGGAGACTCT
TGAGATGCTTGCTTCCCTTGGTATGTCTGACGTTGCTGGCGTCTCTGTGGTTGAGCCTCT
GACTGTGGCTCCTGCTTTTGGTGGCAGGCCACAAAGAAGGTTCTAAAGGAGTTTATTATC
ACTATTATGAGTCAATCAAAGAGAAACCTGCTGTTCTTATAGTGTTTATTGTTTCTTTTG
ATTCGAGATTTTTATGTCCCAAGCTGAAAGTGAGACTACTTTTCTACTATATGAGTTTT


BQ
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QA 1 599 1 599
DS 



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BQ
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AS 0 0

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AF RS1BQ43TF U 1
AF RS1BQ43JQ C 591
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BS 643 643 RS1BQ43JQ
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RD RS1BQ43TF 763 0 0
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AAATCGGGGACCAAGCGTCCCAGCGAAGTGACTTCAAAGGAGACGAACTCGAAGCGAGCC
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AATGCTTACTACGATTACATCAAGGGATCCATCAGCTTTGAG*TTAATAAGAACCAGTTT
ATGGATAAGCTCAG*AGTTTGAAGAAGAAGTATATGGGTAAAGAGAAGAAGACTTCTTTC
ACCAAGCCTCATGAACACA*GTCTTACAG*TTGTGCAAGTATA

QA 1 763 1 763
DS 

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TTAGGATTTACTTTTTCTTCTTTATGATCTACTTACTATGTAATTTAATTTCTGGTTTAT
TTTGATGGCTTTCTCTCATATGAAACTCTCTATATTGGATTTGTTGCT

QA 1 708 1 708
DS 



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ATTATTTCCCCTTCTCATCGATGGTCTAGATTTGCGAGGTGACTCTAATAGTGGTAAAGA
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BQ
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AF RS1GJ65TF U 1
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BS 526 581 RS1GJ65JQ

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ATTATTTCCCCTTCTCATCGATGGTCTAGATTTGCGAGGTGACTCTAATAGTGGTAAAGA
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GGCAAAGTGGACGGGTGGTGTTACCTTTTGACTTGTTGCCATCATTCTCTCGTTCATTCA
TTTCATTTTCATTTTATTTGTAGTTCTTGAGATTTCACATAGGTC

QA 1 525 1 525
DS 

RD RS1GJ65JQ 581 0 0
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ATGCCAAACTTCTGTCTAGAGTGGAGCTTTCTCGTGATAGCTCATAATTTGTAGCTTGCA
CAACTTAAGCTACACTAGTTTACTTGATAAAAAAATTGAGTGGAGTGGGGGAGGTGCTGG
ATTATTTCCCCTTCTCATCGATGGTCTAGATTTGCGAGGTGACTCTAATAGTGGTAAAGA
GAAACAGTGATCTCGGGAAGCATCCACAATAATGATATTCCTGAATAAGGTTTAGTAACA
TCATGCCATTATTCAAACTTAACGTGAACGATAGCTGCAGAAGCAAGTAGCTATGACTTT
GTTGCAATGTCCTTTGCAAGAACTAAAGAAGTCAGAAAAAGAAGGATTTATCGATGAAAG
GGCAAAGTGGACGGGTGGTGTTACCTTTTGACTTGTTGCCATCATTCTCTCGTTCATTCA
TTTCATTTTCATTTTATTTGTAGTTCTTGAGATTTCACATAGGTCAAGAAAACTATCAAA
AACTTACTATTATATTCCTAACTAATACATTGTTTCATTCG

QA 1 581 1 581
DS 



AS 1 2

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TATGTTTACATATTCCAAAGAGGATACGCTGTCGTGAACCCAGCGCTTGTTGATTTCGTT
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TATGAAGACGTGGACATAAAAAATGGTGGTGGTGGTGGTGACTATGCTAAACCAGAGGGT
TACTCATTTCCTTTGTGTTGCAAATTAGTAGAAACTTTGCACAAGAGAAGAGAAAACTTT
CACATTCAAACCCTATTTGTTCTTGGGCACAACACCAAGCTGGATGCTCAAGGGAACACG
TGCCCCATTTTTAATGGATGCCTGGTGAATACCTCCACCGGTGCAATTCACCAGCCAGTT
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TCGAAGATCCTAGCTGGAGGGGGAAGTTACTTGACACATATGACACAAAAACTGATAGAT
TCATCATCGCACCATGCTGCTGGACAATGCGGCTGGTTGAATACGTTTGGGAACTTAATC
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ACTTCGTAGATAATGAAAGAAGGATTTGGAAGTATTTACTAAAATATCCAGAATGGAGCA
AAACTTTCCCAAAGAGACAACCACGCGTGTTTAAAAGGACTGCAAATGGAAGCTGGAAAA
TATACTGACTTCCTCTCTCACACACTTCTTGTAAATAATAAATGTTTTAAAAACTCGTGT
GGTTTGATTCTTGGAAGACAAGAGTGTAAGAAAAAAGTTTCAGCTTTGTAAGATTCGGAC
CTAACGATCGTCTTAAAAGATGGGCTCAATCCGGCGAGGCCCATGGATTAATTTATTCC


BQ
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BQ
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BQ
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AF RS1CT09TF C 1
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TCATCGATTCTCGCTTTCAACTCCACGTCCGGTATTAACATATCCGATGTCAAATGCGCC
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TCTTCTCCACTTGCCCGTTTCTTAAACTGATGCGACCTCACAAACTCATCGATTCTCGCT
TTCAACTCCACGTCCGGTATTAACATATCCGATGTCAAATGCGCCCGGTTAAAGGGATCG
TGATTGTCACTAAAAAGATGGCGTTGAATGATGGCTCGATCAACTGTGGTTTTTGAGCTT
GGAAGTATCACTGGATCTCTCATTAGCGTGTACTGAATAGGGTCGAGGAACTCTTCTGGT
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CCCAACTCCATAAACTCTTGAATGATTCTTCCATCTTCGCCTATTCTCCTAAGCACATCT
GCTCCTGCCTTGAACAGCTGCAAAAAAAAACAAGCAACTTGTTTTGTTCAGTAGAGAGAA
AGACAC

QA 1 606 1 606
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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BQ
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AF RS1AW09JQ C 1
AF RS1AW09TF U 1
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QA 1 595 1 595
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RD RS1AW09TF 595 0 0
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TCGAATCATCCGACACGATCGACAATGTCAAGGCCAAGATTCAGGACAAGGAATGGATCC
CACCGGACCAGCAGCGTCTGATCTTCGCCGGGAAGCAGCTCGAAGACGGGAGGACGCTCG
CGGACTACAACATCCAGAAGGAGTCGACGCTTCACTTGGTGCTCCGCCTGAGAGGAGGAG
CGAAGAAGAGGAAGAAGAAGACGTACACGAAGCCGAAGAAGATCAAGCACAAGCACAAGA
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TGAGGAAAGAGTGTCCTTCGGTTAGTTGTGGTCCGGGAACTTTCATGGCGAGTCATTTCG
ATAGGCATTACTGTGGCAAGTGTGGAACCACTTATGTCTTCAAGAAGCCTGATGAAGAGT
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ACGTATAATTGGCTTAATTCGGATTGGTTTCGTTTTATTGAGGTTTGCAACTCTT

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 2

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BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1EA65TF U 1
AF RS1EA65JQ C 31
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DS 

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QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 2

CO CL9101Contig1 767 2 2 U
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BQ
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AF RS1CT18TF U 1
AF RS1CT18JQ C 1
BS 1 601 RS1CT18TF
BS 602 767 RS1CT18JQ

RD RS1CT18TF 601 0 0
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CTCACTTTGAAATTGTTTTTGATGAGCTGTGTGGCTAGGATTCAAAACATGAGCAGTAGA
G

QA 1 601 1 601
DS 

RD RS1CT18JQ 767 0 0
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GTCTAAACAATAGTCACAATGTAAGGGTCAAGTGAATCATGATTTAGAGGCTGCCTTAAC
TATCTTTCTTTTAAGGCAGTCTAATACTTGTAAAATTCACTTTAAACTCTTCTTATTTCT
TCTTAAACTCTAGCTTACTGATTCTAGATCCCATTCATCTTAAGTGCATAAACTCTAAAG
TGTTGTGTTACTTCTCAAGGATTAGATTCGAACTAGAGATTCTTAGCTTTCTATAACCAG
TTTACTCTCTAGGATCTTGGTTATAGTATAGGCTGTGTGAGAGGATTCAACCACCAGTTG
GTTGTCTCTTCCATTGTTGAGTGAGTTCCTGTTGTATGGTTGAAGGGGTTCAGTTACAAG
TTAACTGAATACTCTCTTGACTTGAGACAAACACTCATGAATTCCAACATGGTATCAGAG
CCTAGTTGCTCTCTTGGGCTGAACTCACTCTGTTCTACTTCATCCTGAAGCTCTTTCTCT
CTCACTTTGAAATTGTTTTTGATGAGCTGTGTGGCTAGGATTCAAAACATGAGCAGTAGA
GAGGTTAGATGAAGTATGTGTTTCAAAATTCAGGATGCAATCTTTAAATGTTTTTTTTTA
AATCAATGACTCTCCCCTTGATCTCCTCATTGTTTAAGGTTTGGATGAAAGACTGAAATA
TGTTATTACCAGCCTGAGGGAGGGAGAAAAGATTATTCTTGCATCTT

QA 1 767 1 767
DS 



AS 1 2

CO CL9102Contig1 1081 2 2 U
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CACTCAGACCAACTTCCACGAGAAGCTTTCCGCAATCATCGAAGAGTTCCCCCGCCTCAA
TCAGATCCATCCTTTCTACGGAGATCTTCTCCACGTCCTCTACAACAAGGATCACTACAA
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CGTGAAGCTGCTAAAGTATGGTGATTCTCTGTACAGGTGCAAGTGTCTGAAAGTGGCTGC
TCTTGGTCGTATGTGCACTGTTTTGAAGCGGATCACTCCTAGTTTGGCTTACCTCGAGCA
GATCAGGCAGCACATGGCGAGGCTTCCTTCTATTGACCCCAACACTCGTACTGTTTTGAT
TTGTGGGTATCCTAATGTTGGGAAGAGTTCTTTCATGAACAAAGTTACCAGAGCTGATGT
TGATGTCCAGCCTTATGCTTTCACCACTAAGTCTCTGTTCGTTGGTCATACTGATTACAA
GTACTTGAGGTATCAGGTCATTGACACCCCTGGGATTTTGGACAGGCCTTTTGAGGACAG
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CTTCCTGGACATTTCGGGGTCGTGTGGTTACACAATTGCTCAGCAGGCTGCGCTTTTCCA
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GATGCCCATGGAGAACATATCTGAAGAAGATAGGAAACTGATTGAAGAGATGAAGGCTGA
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G


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 

AF RS1GI95TF U 1
AF RS1ED07TF U 439
BS 1 711 RS1GI95TF
BS 712 1081 RS1ED07TF

RD RS1GI95TF 715 0 0
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TTCTCAACACCGATAAGCAAAGATGGTGCAGTATAATTTCAAGAAGATCACGGTCGTTCC
CAATGGCAAAGACTTCATCGACATCATCCTCTCACGTACCCAGCGTCAGACCCCAACCGT
AGTCCACAAGGGCTACAAGATCAACCGTCTTCGTCAGTTCTACATGAGGAAAGTCAAGTA
CACTCAGACCAACTTCCACGAGAAGCTTTCCGCAATCATCGAAGAGTTCCCCCGCCTCAA
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GCTCGCCCTAGGGCAAGTCAACACCGCCAGGAACTTGATCAGCAAGATTGCGAAAGATTA
CGTGAAGCTGCTAAAGTATGGTGATTCTCTGTACAGGTGCAAGTGTCTGAAAGTGGCTGC
TCTTGGTCGTATGTGCACTGTTTTGAAGCGGATCACTCCTAGTTTGGCTTACCTCGAGCA
GATCAGGCAGCACATGGCGAGGCTTCCTTCTATTGACCCCAACACTCGTACTGTTTTGAT
TTGTGGGTATCCTAATGTTGGGAAGAGTTCTTTCATGAACAAAGTTACCAGAGCTGATGT
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GGAT

QA 1 711 1 711
DS 

RD RS1ED07TF 643 0 0
G
GGTGATTCTCTGTACAGGTGCAAGTGTCTGAAAGTGGCTGCTCTTGGTCGTATGTGCACT
GTTTTGAAGCGGATCACTCCTAGTTTGGCTTACCTCGAGCAGATCAGGCAGCACATGGCG
AGGCTTCCTTCTATTGACCCCAACACTCGTACTGTTTTGATTTGTGGGTATCCTAATGTT
GGGAAGAGTTCTTTCATGAACAAAGTTACCAGAGCTGATGTTGATGTCCAGCCTTATGCT
TTCACCACTAAGTCTCTGTTCGTTGGTCATACTGATTACAAGTACTTGAGGTATCAGGTC
ATTGACACCCCTGGGATTTTGGACAGGCCTTTTGAGGACAGGAACATCATTGAGATGTGT
AGTATCACTGCCTTGGCGCATCTTCGAGCTGCTGTTTTGTTCTTCCTGGACATTTCGGGG
TCGTGTGGTTACACAATTGCTCAGCAGGCTGCGCTTTTCCACAGCATTAAGTCTCTGTTT
ATGAACAAGCCTTTGGTGATTGTGTGCAACAAGACTGATTTGATGCCCATGGAGAACATA
TCTGAAGAAGATAGGAAACTGATTGAAGAGATGAAGGCTGAAGCTATGAAGACTGCCATG
GGAGCGAGCGAGGAAGCCGTGCTGTTGAAGATGAGTACACTG

QA 2 643 2 643
DS 



AS 1 2

CO CL9103Contig1 857 2 4 U
GGAGACCATTTCTCTTATCTTTCTTTTGTCTTCTTGGAGTTTCGGGATCTTACACCACAC
CAAACAACCAAACAACAACAACCATATCTTTGTCTTATTTGTATCATTTGTCCCCTTTTC
TATACATTTTCAGCAATTAACAAGGAAAGTAAAGTTTGAATCTGAGTAATAATGGGAGAC
AATGAAGGGAAAAGAACATTAATGAATCTTAAGGTTCAAGTGTCGATGAGAGTGTTAACC
GTCGGCGCTGCACTAGCCTCCATGGGGCTCATGATCACTAACCGTGAAGTGGCCTCTGTT
TAGGGCATTGCTTTTGAAGCTAAATACAGCGACTCCTCTGCCTTTAGGTATTTGGTCTAC
GCATATATAGCTATCGCCGCCGTGACGTTGTTTACGCTCGCATGGGCTTGTTCGGCTGTC
CGTAGAGGAGGATTTATTTTTGCACTCTTCGTCATTGATTTGCTTATGGCTTTGACGGCG
TTATCGGCTTTCTCTGCGTCCATGTCGGAGGGTTACATCGGAAAGTATGGTAATACACAC
GCCGGTTGGCTTCCGATCTGCGGCTATGTTCATAACTATTGCAATCGTGTTACACTCTCA
CTCGCTTTTTCCTTCGTCTCTTTTCTACTCTTGTTCATCCTTACAGTCTTAACTGCCTCC
GTTGCTCGCCGTTCCTGAATATTCTCTTTACATTTTTTTACTATACAATTGCTTATTCGT
ACTGCTTAAGATCTTTTAATCTTTCTTGTATACTTAGATTTTATCAGAAGAGAAGCATAA
AAAGAATTATATTGATTTCGTTTATTTATCTTTGAGACTCTTGTTACTTGTTATGTATGT
GTGTTCATCTGTAAAAA


BQ
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15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1GJ43TF U 1
AF RS1BN43TF U 2
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AATGAAGGGAAAAGAACATTAATGAATCTTAAGGTTCAAGTGTCGATGAGAGTGTTAACC
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GCCGGTTGGCTTCCGATCTGCGGCTATGTTCATAACTATTGCAAT

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ATACATTTTCAGCAATTAACAAGGAAAGTAAAGTTTGAATCTGAGTAATAATGGGAGACA
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TCGGCGCTGCACTAGCCTCCATGGGGCTCATGATCACTAACCGTGAAGTGGCCTCTGTTT
ATGGCATTGCTTTTGAAGCTAAATACAGCGACTCCTCTGCCTTTAGGTATTTGGTCTACG
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GTAGAGGAGGATTTATTTTTGCACTCTTCGTCATTGATTTGCTTATGGCTTTGACGGCGT
TATCGGCTTTCTCTGCGTCCATGTCGGAGGGTTACATCGGAAAGTATGGTAATACACACG
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TCGCTTTTTCCTTCGTCTCTTTTCTACTCTTGTTCATCCTTACAGTCTTAACTGCCTCCG
TTGCTCGCCGTTCCTGAATATTCTCTTTACATTTTTTTACTATACAATTGCTTATTCGTA
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BQ
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AF RS1DX82TF U 1
AF RS1EM04TF U 48
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ACATACAGTCCCCAGGTTGGACACTAGGCTGGGCATGGGCAAAGAAAGAAGTGATATGGT
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CTCACTGCTGTAAGAAAGCCCCGACCGTCGTTGATCTCTTGCCAGGTGTCCCTTACAATC
AACAGATCTCAAACTGCTGCAAAGGCGGTGTGGTTGGAGCCTGGGGTCAAGATCCTTCAT
CCGCTGTGTCACAGTTTCAGGTCAGCGTTGGTGTGGCTGGTACCACGAACAAGACCGTCA
AGCTCCCTAAGAACTTCACGTTGCTTGGTCCTGGTCCTGGTTACACTTGCGGTCCTGCCA
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TGACG

QA 1 665 1 665
DS 

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GG
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GGACATCATGTCATGGACAGCAGATGGTTATGTGGCTGTTGTAACCATGAACAACTTCCA
AATCTACCGGCACATACAGTCCCCAGGTTGGACACTAGGCTGGGCATGAGCAAAGAAAGA
AGTGATATGGTCAATGGTCGGCGCACAAGCAACAGAGCAAGGAGACTGTTCCAAGTTCAA
AGGAAACGTACCTCACTGCTGTAAGAAAGCCCCGACCGTCGTTGATCTCTTGCCAGGTGT
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AGATCCTTCATCCGCTGTGTCACAGTTTCAGGTCAGCGTTGGTGTGGCTGGTACCACGAA
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CGGTCCTGCCAAAATCGTGCCGTCTACTGTTTTTCTCACCACTGACAAACGAAGAAAGAC
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TTGTGCTTGTGGCTGCGAGAACAAAAGGAGCTGCGTCAAGGCTGATTCTAAGAT

QA 3 776 3 776
DS 



AS 1 2

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GACCGTTACCGCCTCATATGGTGCTCAGAGCTGAGCGCTCTGAGAGATACTTCAGGCGAG
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TTAGTTGCCTTATATAAAGATCATTAAAAAAACAGAGTGGTGTACAGACTTTCTATCTAT
TACATGTTAAATTGTTTT


BQ
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AF RS1GR90JQ C 1
AF RS1GR90TF U 1
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QA 1 558 1 558
DS 

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TACATGTTAAATTGTTTT

QA 1 558 1 558
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1FQ62TF U 1
AF RS1FQ62JQ C 135
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QA 1 738 1 738
DS 

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QA 1 756 1 756
DS 



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BQ
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AF RS1DK06JQ C 1
AF RS1DK06TF U 1
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GAAGAGGAAGAGGAAATGGACTCAGAGATCAACAGAAGAATATTGGCGACAACGAAATAT
ATAAGCTATCAATCTTTGAAGCGGAACAGTGTGCCTTGTTCAAGAAGAGGGGCGTCATAT
TACAATTGCCAGAACGGAGCTCAGGCTAATCCTTATAGTCGTGGTTGCAGCGCTATTGCT
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TTCTCTATGGTTTCTTATAATTTGTACGGTACACATATAAGTTGGATTTGGATGTGAATA
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DS 

RD RS1DK06TF 595 0 0
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TCCTCTACGGGAGTCCATGGCTCCTCAGGCTGCCACGGTTCCATAGCTGACTGTATCGGA
GAAGAGGAAGAGGAAATGGACTCAGAGATCAACAGAAGAATATTGGCGACAACGAAATAT
ATAAGCTATCAATCTTTGAAGCGGAACAGTGTGCCTTGTTCAAGAAGAGGGGCGTCATAT
TACAATTGCCAGAACGGAGCTCAGGCTAATCCTTATAGTCGTGGTTGCAGCGCTATTGCT
CGTTGCAGGAGTTAGGTGTGAAGAATAAGCTCTCTTTTTTTTTTAACAAGCTCTTTTCTC
TTCTCTATGGTTTCTTATAATTTGTACGGTACACATATAAGTTGGATTTGGATGTGAATA
ATCTTGGGTTGTTGTATGATCCATTAACTGTTTAGTTGTGCTATAAGCCTATAAGCTTTG
AATATTTCATGTGTATTCTCTTGCACAAATAATAGTACAAGGCCTATGTTTATTC

QA 1 595 1 595
DS 



AS 1 2

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CTTTTAGATTTCCGTTTCAAAAGACATGAATACGTTATTAAGTTTATCAAATAGATTGAT
GGAGGGTGTGGGTAAATTACTTGCT


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 

AF RS1FE13TF U 1
AF RS1GV58TF U 1
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GGAGGGTGTGGGTAAATTACTTG

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AGAATCAATGAGCTGGAGCAAAGCATCAATGACCTAAGAGCCGAGATGGGAGTTGAAGGC
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CTTTTAGATTTCCGTTTCAAAAGACATGAATACGTTATTAAGTTTATCAAATAGATTGAT
GGAGGGTGTGGGTAAATTACTTGCT

QA 1 505 1 505
DS 



AS 1 2

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TTTGTATGTCACTGAAAGCTTTCAATATTGAGGGTGTACAAACATTGTAAATGGAAATGG
TTAAGGCC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F848TF U 1
AF RS1F848JQ C 157
BS 1 677 RS1F848TF
BS 678 679 RS1F848JQ
BS 680 764 RS1F848TF
BS 765 788 RS1F848JQ

RD RS1F848TF 764 0 0
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ATGGTTATGCTGCACGACCAAGTGATCTTCCAAGTCTGAACTTCATTCATCCAACAGAAA
TACAGTTTGTTACCATTTCATTTCCCCTCTCGATCTTTCTGAGAAAACCCTAATTAGTAG
ATTTTGGGGAAACACTAATTGGATCTCGATGGAGGAAGACAAACAAACGCACGAAGGGAA
GCGATCATCCTCGGTCGCAGAAGAAGAACCGATTCGGAGAGAGGATCCCGAAACTGAGAA
ACCGACGGAAGCATCGCCGGAGAACACTGGTGGATGGGGCTGGGGCTTCTCTGTGCTCTC
AGATCTTCAAAAAGCTGCGGAAGATTTATCTCGTAATGCTGCAGCAGTTGCAGAGAAAGC
AGCGAAAAGCATTGTGGAACTGCAAGAAGCGGATGAAGACTCAGAATCTTCTGCCAAGGA
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GTTGAAGAAGTTAGCTTTAGGCAAATTGGAGGATGCAAGTGAAGAGTCACTTCTTAGCCA
GGGTTTGAAGGTTTTCGATGATTCAGTTGAGAGTTTCACTTCTGGTGCTTGGCTGGCGCT
AGGAAGTGCGTTAAAAG**AGCACAAGTTTTGTGCAAAAGTATGTTAATTTTATTTTCTT
TTTGTATGTCACTGAAAGCTTTCAATATTGAGGGTGTACAAACA

QA 1 764 1 764
DS 

RD RS1F848JQ 632 0 0
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AGACAAACAAACGCACGAAGGGAAGCGATCATCCTCGGTCGCAGAAGAAGAACCGATTCG
GAGAGAGGATCCCGAAACTGAGAAACCGACGGAAGCATCGCCGGAGAACACTGGTGGATG
GGGCTGGGGCTTCTCTGTGCTCTCAGATCTTCAAAAAGCTGCGGAAGATTTATCTCGTAA
TGCTGCAGCAGTTGCAGAGAAAGCAGCGAAAAGCATTGTGGAACTGCAAGAAGCGGATGA
AGACTCAGAATCTTCTGCCAAGGAAGAAGAGAGAACTGAAGGACCTGATACAGAGCAGGA
GGATAGTGATGATGAGAGTCACAAGTTGAAGAAGTTAGCTTTAGGCAAATTGGAGGATGC
AAGTGAAGAGTCACTTTTTAGCCAGGGTTTGAAGGTTTTCGATGATTCAGTTGAGAGTTT
CACTTCTGGTGCTTGGCTGGCGCTAGGAAGTGCGTTAAAAGGAGGCACAAGTTTTGTGCA
AAAGTATGTTAATTTTATTTTCTTTTTGTATGTCACTGAAAGCTTTCAATATTGAGGGTG
TACAAACATTGTAAATGGAAATGGTTAAGGCC

QA 1 632 1 632
DS 



AS 1 2

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GCGTATCTTATCACAGCGTAGTTCTAAAACAAGCGAGAGTCTTTTGTATACAGATAAAAT
GCCTTTTCTTGCAACAACAAATTTAAAACACAAACCCAGAAACATCTGAAAGACTTGAAT
CGCATTCTCTTTTCACTTCTTGTCGAATTCCCAAACGACTCCTCCATCTTCTTTGACCTT
TTTGTTGATCCAAGCTTCTATAAGCATACCAGCACCGATCCCACCAAGTATGAAGCTTCC
GTAGAAGGCAAGAGTCGACGGCCATGGCTTTCTCGGCAGGAAGTAAGCTTCGTACTTCTC
TTCGAGTCCCCTCGGCATCTGTTTTCTCGCTCTCGCCACCATTTTTACACCACTTGGCTT
CTTCTGATTCTGATTATGATTCTCACCCGTCCCCCACTCTTCTCCTTTCCATGGATCCTT
CGCCCCTTCACTTGCCATCTTCGATCGCACCAACGAAAAA


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CA40TF C 1
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CGCATTCTCTTTTCACTTCTTGTCGAATTCCCAAACGACTCCTCCATCTTCTTTGACCTT
TTTGTTGATCCAAGCTTCTATAAGCATACCAGCACCGATCCCACCAAGTATGAAGCTTCC
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TTCGAGTCCCCTCGGCATCTGTTTTCTCGCTCTCGCCACCATTTTTACACCACTTGGCTT
CTTCTGATTCTGATTATGATTCTCACCCGTCCCCCACTCTTCTCCTTTCCATGGATCCTT
CGCCCCTTCACTTGCCATCTTCGATCGCACCAACGAAAAA

QA 1 520 1 520
DS 

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GCCTTTTCTTGCAACAACAAATTTAAAACACAAACCCAGAAACATCTGAAAGACTTGAAT
CGCATTCTCTTTTCACTTCTTGTCGAATTCCCAAACGACTCCTCCATCTTCTTTGACCTT
TTTGTTGATCCAAGCTTCTATAAGCATACCAGCACCGATCCCACCAAGTATGAAGCTTCC
GTAGAAGGCAAGAGTCGACGGCCATGGCTTTCTCGGCAGGAAGTAAGCTTCGTACTTCTC
TTCGAGTCCCCTCGGCATCTGTTTTCTCGCTCTCGCCACCATTTTTACACCACTTGGCTT
CTTCTGATTCTGATTATGATTCTCACCCGTCCCCCACTCTTCTCCTTTCCATGGATCCTT
CGCCCCTTCACTTGCCATCTTCGATCGCACCAACGAAAAA

QA 1 460 1 460
DS 



AS 1 2

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TTTCTTCCAAATAATAAAATAGTGGTTTTATGTTCCAAATATCTTGAAGGACAAACCCAC
TTTTCTCTTCCTTTTTACTTTGTACTTCTAAATGTGTAGGATTTGTGGCTCCATATTGTC
AATTGAAAATCAACCTTTGTCTTACAGGTTTGCGTATTGAAAGAGTTATTCTTGTGTTTT
TATTCGC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AM87JQ C 1
AF RS1AM87TF U 1
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AATTGAAAATCAACCTTTGTCTTACAGGTTTGCGTATTGAAAGAGTTATTCTTGTGTTTT
TATTCGC

QA 1 307 1 307
DS 

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TTTCTTCCAAATAATAAAATAGTGGTTTTATGTTCCAAATATCTTGAAGGACAAACCCAC
TTTTCTCTTCCTTTTTACTTTGTACTTCTAAATGTGTAGGATTTGTGGCTCCATATTGTC
AATTGAAAATCAACCTTTGTCTTACAGGTTTGCGTATTGAAAGAGTTATTCTTGTGTTTT
TATTCGC

QA 1 307 1 307
DS 



AS 1 2

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TTTTATGTAGTCGTTTTC


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1B488TF U 1
AF RS1B488JQ C 609
BS 1 663 RS1B488TF
BS 664 664 RS1B488JQ
BS 665 694 RS1B488TF
BS 695 1218 RS1B488JQ

RD RS1B488TF 698 0 0
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GCCGAAGATAGATAAGAGCGGTCGATTAAGCAGTCCCCGCGCCGCACGCGAGCTCGCTCT
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GATCAATGCAAGAAGAGAGCCTGGATACGAGTTTGACAAGGCTTCTTTGTTGGAATACAA
CCACATGAGCTTTGGGGGACCTCCGGTTAAAACAGAGACTAGTGAAGAGGAAGATGAGCT
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TCTGGTCTACAGCAAACTTGTTTTACGGTTTGCAAAGAAACTCTTGGCTGCAGTGGCTGA
AAA*TGGGATAGTCATGTCGTCGTCATCGAGAAA
TTTC

QA 1 694 1 694
DS 

RD RS1B488JQ 610 0 0
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GAAGAATACTAGAGTTTTCGATTCTTCACTTAGCAATGTCTGAAATGGCAGTCCTTGAAA
CCCGACACCCTATTGTCATCAACGAGGCTGTTGATCTTGCAAAACGGTTCTGTGATGGAT
CAGCACCACGCATAATCAACAGATGTCTAAGGACATTTGTCAAAGATAGATCAGCAGCAG
CCACACCAACACCTCAAGCTTTAAAATTGAAGCAAGAGGTGTCAGTTTAAATTAGAACAA
ACCCGCATGTACGTTTGGAGGCAGGCAGGCAGGCAAACCTCAGGTTTTTGTCGTCGTGAA
TAGCTCGTAAGCAAAGTATTGATCCACTGATCCTCACAGGCAGCTTCTGGTCCGAAGCAT
TTGGTACCTGAGACTGAATCTATCTTATCAATTGCAGCTCAACATGATTATTGCTAAGAA
CACAACATTGCCCAATGTCTGTATAATGTATTTTGTCCTAAGAAATATACATTTTTATGT
AGTCGTTTTC

QA 1 610 1 610
DS 



AS 1 2

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AAAAACTGTGTTGTTTATGCTGTGGTTTGGTTAAGGAAAGACTAATTTGAGTAAAGATTC
TCTC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 

AF RS1CI33TF U 1
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AAAAA

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DS 

RD RS1CI33JQ 664 0 0
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GGATCTGGTGTCTTATAGAGAGACAAAGAAAGGGAAGAAGAAGAGTGTTGTGTTTTATAT
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AAAAACTGTGTTGTTTATGCTGTGGTTTGGTTAAGGAAAGACTAATTTGAGTAAAGATTC
TCTC

QA 1 664 1 664
DS 



AS 1 2

CO CL9114Contig1 1094 2 4 U
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CATGGAACTAATGAAGGTTCCACGTATAGAAGCAAAGTTACGAGTGTTTGGCTTCAAGAT
TACCTTTGCTTCTCAGTCGGAAGAATTAAAAAGCTGCCTCAATACAATAAACGTTGCTGC
TAAAGAGGTGAGGGAGTCTGCAAAGTTGCGTCAGATTATGCAAACAATTTTAACACTAGG
AAATGCTCTGAATCAGGGAACTGCAAGAGGGTCTGCCGTGGGATTCAAACTGGATAGTCT
TCTAAAATTATCTGATACTCGTGCAAGAAATAACAAAATGACTTTGATGCATTACTTATG
CAAGCTTGTTGGTGAAAAAATGCCAGAGTTGCTGGATTTTCCCAGTGACCTTGTTCACTT
GGAAGCTGCCTCGAAGATAGAATTGAAAACGTTGGCTGAAGAAATGCAGGCGGCGGCTAA
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GGGTTTCCGAAAGGTCTTGAAGGAGTTTCTTGATATCGCTGAAGAAGAAGTGAGGTTGCT
TACTTCTTTATATACAGAATCGGGAAGAAATGCAGATTCCTTGTGCCACTACTTCGGTGA
GGATCCAGCTCGGTGTCCTTTCGAACAAGTGACCAAGATTCTGACTCTTTTCATGAAAAC
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GAACGTGAGCTAAGGTCGGTCTTTAACCAAAGACCCGAGGGTTTCAGATTGATGAAAGCT
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CTCAAAGTTATATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1F454TF U 1
AF RS1F454JQ C 539
BS 1 646 RS1F454TF
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RD RS1F454TF 713 0 0
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CATGGAACTAATGAAGGTTCCACGTATAGAAGCAAAGTTACGAGTGTTTGGCTTCAAGAT
TACCTTTGCTTCTCAGTCGGAAGAATTAAAAAGCTGCCTCAATACAATAAACGTTGCTGC
TAAAGAGGTGAGGGAGTCTGCAAAGTTGCGTCAGATTATGCAAACAATTTTAACACTAGG
AAATGCTCTGAATCAGGGAACTGCAAGAGGGTCTGCCGTGGGATTCAAACTGGATAGTCT
TCTAAAATTATCTGATACTCGTGCAAGAAATAACAAAATGACTTTGATGCATTACTTATG
CAAGCTTGTTGGTGAAAAAATGCCAGAGTTGCTGGATTTTCCCAGTGACCTTGTTCACTT
GGAAGCTGCCTCGAAGATAGAATTGAAAACGTTGGCTGAAGAAATGCAGGCGGCGGCTAA
AGGCCTTGGAAAGGTTGAACACTAACTCAGTGCTTCAGAAAACGATGGTGCAATATCTCT
GGGTTTCCGAAAGGTCTTGAAGGAGTTTCTTGATATCGCTGAAGAAGAAGTGAGGTTGCT
TACTTCTTTATATACAGAATCGGGAAGAAATGCAGATTCCTTGTGC*ACTACTTCGGTGA
GGATCCAGCTCGGTGTCCTTTCGAACAAGTGACCAAGATTCTGACTCTTTTCA

QA 1 713 1 713
DS 

RD RS1F454JQ 556 0 0
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CTTACTTCTTTATATACAGAATCGGGAAGAAATGCAGATTCCTTGTGCCACTACTTCGGT
GAGGATCCAGCTCGGTGTCCTTTCGAACAAGTGACCAAGATTTTGACTCTTTTCATGAAA
ACTTTCATCAAATCACGAGAGGAGAATGAAAAACAAGCGGAGGCTGACAAGAAGAAACTG
GAGAAAGAAGCAATGAAAGAGAAGCCGTTGGTAAAGAAAGACGGTGCTGATCCATAGACA
TAGAACGTGAGCTAAGGTCGGTCTTTAACCAAAGACCCGAGGGTTTCAGATTGATGAAAG
CTTTGTTTTTCAGTGTTGCACATACCAGACAGGAGCAGACATCTTTCCAAGATTTTAGAC
AAAGTAGACGTCTTTTATGATGTTTATATGGAAGTGTAAACTCTTTGATCATCACTTCAT
TGATGTAAAATCAGAGGGTCTTGTCAGTGTTGTAGAAAATATTTGAACTTTTATAGAACC
CACTCAAAGTTATATT

QA 1 556 1 556
DS 



AS 1 2

CO CL9115Contig1 846 2 2 U
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GAGCAATGTCTGCGAAGCAAAACCTGGATGTCTCCCCTAGCTTCACCAACGAGCTTCTCC
ATGTAAATTTTAGTTGCATGCAGAGATTGGGCGATCCGGTTCTCAGACCATTTCTTCAGG
ATGTAATACAGTTTGGTCCTCTAACAAAGACACTAGGCCTTGTCATGCTGACCAAACCTC
AGATAATTCCATCCATATTCAGACAGGTCGGGATACCTGTGTTGCTCGACTGGTCAGTTC
ATTTTTTCATGCTGGGCTTGTATACGTTCCTCTCTGCATACATTGATCCAGTAATAAGGC
CATCTTTGGAAGAACTTCCATTAAAGACCAAGTTCCAGTGGAAGAGACGTCTTGAGGCCT
GGAAATATGGAGCTGGCCTCGATTACGAGTTGTGATTCTGTCCATCTTTCTCAAGAGTGA
TACCCTAATCTCTTTTTGGTGCCATCTCAAGTTTAAAAGTTCATCATATCTTCCATCTTC
AAGACGTTATCGTCCATAGTACATATCTATCTTCACAAGCCTTATAGATATCTGCCTTCT
CTAGCTCTTGATTCATACATACACAGAATCAACATGTTAGTCCTTAGATTTGGTTCACAG
GGTTCTAGAAAACTCCTTTGATATCAACTTTACATAAAGGTCCAAAGGCTTTGTTTACTG
GACGGC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 

AF RS1EH11TF U 1
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BS 650 846 RS1EH11JQ

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DS 

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ATTTCTTCAGGATGTAATACAGTTTGGTCCTCTAACAAAGACACTAGGCCTTGTCATGCT
GACCAAACCTCAGATAATTCCATCCATATTCAGACAGGTCGGGATACCTGTGTTGCTCGA
CTGGTCAGTTCATTTTTTCATGCTGGGCTTGTATACGTTCCTCTCTGCATACATTGATCC
AGTAATAAGGCCATCTTTGGAAGAACTTCCATTAAAGACCAAGTTCCAGTGGAAGAGACG
TCTTGAGGCCTGGAAATATGGAGCTGGCCTCGATTACGAGTTGTGATTCTGTCCATCTTT
CTCAAGAGTGATACCCTAATCTCTTTTTGGTGCCATCTCAAGTTTAAAAGTTCATCATAT
CTTCCATCTTCAAGACGTTATCGTCCATAGTACATATCTATCTTCACAAGCCTTATAGAT
ATCTGCCTTCTCTAGCTCTTGATTCATACATACACAGAATCAACATGTTAGTCCTTAGAT
TTGGTTCACAGGGTTCTAGAAAACTCCTTTGATATCAACTTTACATAAAGGTCCAAAGGC
TTTGTTTACTGGACGGC

QA 1 797 1 797
DS 



AS 1 2

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ATTTCCAATGTGGGATCTTTATCTTCCTTATATCTTGAATGAGTTCAGGCCGTGCTTGAG
CTTCCTTGGGGAGAAGGTCGAGCTCCATCACTTCGATCGCCAGTTTGGCTATTCCGGATG
TATGTCGAGGGGAGCGACGTTTCAGACTGCTGGGTCAACTCAAGGGAAAGAGGTCGTGTC
GACTCGTCATTGGTTTCGATCCTGATTACCAAGAGGAACAAGGAACAACGTTCTTTTGGA
CAAAGGTCTCCAGTTTCTCTAATCTCGAATTCCAATCCACCAAGTGTGCCTAGACGTACC
GAGCTAGAACACCGAAGGTCATGTCTCCTGCTTCTTTTGTGGGTGACATAGAGGCTCGTG
ACTCGGTGAAGTGGCAGTTCAGTAAAGGTCGTGTCTCCTGCTTCTTTAATGGAAAACTTT
ATATTCAAGCAAACCCTGTTTTGTTTATAGAAAACGTCTATTTGTCATCAAACACATATC
TTTTTTTTCTTTTACCAAGTTTATCAAGCCAAACTCATCATAAAACATGAATTCCCATTC
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GAACATCTCAACAAATTGCATCTTAGATCTCCTCTTTTTGACTATGCATATGTACTCATC
ATAACTGGTTTGAAAATCT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1DE18TF U 1
AF RS1DE18JQ C 131
BS 1 698 RS1DE18TF
BS 699 699 RS1DE18JQ
BS 700 735 RS1DE18TF
BS 736 739 RS1DE18JQ

RD RS1DE18TF 738 0 0
GGGGCAGAGTGGCCATACGGCCGGGGGAAGTCTCTTATATATTATTCATGTCCCATTCAT
ATTTCCAATGTGGGATCTTTATCTTCCTTATATCTTGAATGAGTTCAGGCCGTGCTTGAG
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TATGTCGAGGGGAGCGACGTTTCAGACTGCTGGGTCAACTCAAGGGAAAGAGGTCGTGTC
GACTCGTCATTGGTTTCGATCCTGATTACCAAGAGGAACAAGGAACAACGTTCTTTTGGA
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GAGCTAGAACACCGAAGGTCATGTCTCCTGCTTCTTTTGTGGGTGACATAGAGGCTCGTG
ACTCGGTGAAGTGGCAGTTCAGTAAAGGTCGTGTCTCCTGCTTCTTTAATGGAAAACTTT
ATATTCAAGCAAACCCTGTTTTGTTTATAGAAAACGTCTATTTGTCATCAAACACATATC
TTTTTTTTCTTTTACCAAGTTTATCAAGCCAAACTCATCATAAAACATGAATTCCCATTC
AGCTCCATTTTCGTATCACACGTCTTTATTACCTCATATAATACTTCACAAACTGATACA
GAACATCTCAACAAATTGCATCTTAGATCTCCTCTTTT*GACTATGCATATGTACTCATC
ATAACTGGTTTGAAA
TCT

QA 1 735 1 735
DS 

RD RS1DE18JQ 609 0 0
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GGAGCGACGTTTCAGACTGCTGGGTCAACTCAAGGGAAAGAGGTCGTGTCGACTCGTCAT
TGGTTTCGATCCTGATTACCAAGAGGAACAAGGAACAACGTTCTTTTGGACAAAGGTCTC
CAGTTTCTCTAATCTCGAATTCCAATCCACCAAGTGTGCCTAGACGTACCGAGCTAGAAC
ACCGAAGGTCATGTCTCCTGCTTCTTTTGTGGGTGACATAGAGGCTCGTGACTCGGTGAA
GTGGCAGTTCAGTAAAGGTCGTGTCTCCTGCTTCTTTAATGGAAAACTTTATATTCAAGC
AAACCCTGTTTTGTTTATAGAAAACGTCTATTTGTCATCAAACACATATCTTTTTTTTCT
TTTACCAAGTTTATCAAGCCAAACTCATCATAAAACATGAATTCCCATTCAGCTCCATTT
TCGTATCACACGTCTTTATTACCTCATATAATACTTCACAAACTGATACAGAACATCTCA
ACAAATTGCATCTTAGATCTCCTCTTTTTGACTATGCATATGTACTCATCATAACTGGTT
TGAAAATCT

QA 1 609 1 609
DS 



AS 1 2

CO CL9117Contig1 1172 2 2 U
GGAAATCATTTCTGAACATTCATCTTCTTCCTCTCTGTTTTCCACAAAGCTTCCTCCTTT
CAATGGCGACTCTAAGCTTCAACACCACTGTATGCGAACACCTTCACTCCCCAGAATCTC
CAGATCATCTTCTTTCACCAAACCCATCAAAACCCATCTCTCCTCCTCCTCCTCTTCCCA
AACCTTATCCAAACGCCACCGTTTCATCTCCCGTTCCTTACCGGAGAGCTTCACAAAAGA
AGAGGAGACCGTCGTCATCACTGAAGACGACGACGACCCTACATCGGAGCTGAGTTATCT
TGATCCGGAAACAGATGCAGAGAGCATAAAAGAGTGGGAGTTAGATTTCTGCTCGAGGCC
GATACTCGATTCACGAGGGAAGAAGATATGGGAGCTTGTGGTTTGCGATGCTTCGCTTTC
GCTTCAAGTCACCAAGTACTTCCCAAACAATGTCATCAACAGTATCACACTCAAAGACGC
TATTGTTTCCATCACACAAGACTTGGGTGTTCCTCTCCCTGAGAAGATTCGTTTCTTCAG
GTCACAGATGCAAACCATTATCACAAAAGCTTGCAAAGAGCTTGCTATTAAGGAAGTGCC
TAGTAAACGGTGTCTGTCTCTGTTTCTATGGTTGCAAGAACGTTATGACACTGTGTACAC
GCGTCATCCCGGTTTCCAGAAGGGATCACTGCCTCTTCTGTCTCTAGACAACCCCTTTCC
AATGAATCTTCCTGAGAATTTGTTTGGGGAGAAATGGGCGTTTGTTCAGTTACCTTACTC
AGCTGTTAGAGAAGAGATCTCAGACTTTGAGGAGAAGTTTGTGTTTGGTGCAACCTTAGA
TTTGGATTTACTTGGCATTGACGTTGATGAGAACACACTGATCCCTGGTCTCTCTGTTGC
TTCTTCACGTGCAAAACCTCTAGCAGCTTGGATGAATGGTCTTGAGGTGTGTTCGATTGA
AGCAGACAGTACAAAAGGATGTTTGATTCTGGCCGTTGGGATCTCGACAAGGTATGTCTA
CGCAACGTACAAGAAAACACCTGTTACTACTGATGAAGCTGAAGCTTGGGAGTCTGCGAA
GAAAGCAAGTGGAGGTTTGCATTTTCTTGCAATTCAAGATGACTTGGATTCTGATGACTG
TGTTGGCTTTTGGCTTCTTATTGATTTGCCAC


BQ
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AF RS1E894TF U 1
AF RS1E894JQ C 530
BS 1 678 RS1E894TF
BS 679 1172 RS1E894JQ

RD RS1E894TF 678 0 0
GGAAATCATTTCTGAACATTCATCTTCTTCCTCTCTGTTTTCCACAAAGCTTCCTCCTTT
CAATGGCGACTCTAAGCTTCAACACCACTGTATGCGAACACCTTCACTCCCCAGAATCTC
CAGATCATCTTCTTTCACCAAACCCATCAAAACCCATCTCTCCTCCTCCTCCTCTTCCCA
AACCTTATCCAAACGCCACCGTTTCATCTCCCGTTCCTTACCGGAGAGCTTCACAAAAGA
AGAGGAGACCGTCGTCATCACTGAAGACGACGACGACCCTACATCGGAGCTGAGTTATCT
TGATCCGGAAACAGATGCAGAGAGCATAAAAGAGTGGGAGTTAGATTTCTGCTCGAGGCC
GATACTCGATTCACGAGGGAAGAAGATATGGGAGCTTGTGGTTTGCGATGCTTCGCTTTC
GCTTCAAGTCACCAAGTACTTCCCAAACAATGTCATCAACAGTATCACACTCAAAGACGC
TATTGTTTCCATCACACAAGACTTGGGTGTTCCTCTCCCTGAGAAGATTCGTTTCTTCAG
GTCACAGATGCAAACCATTATCACAAAAGCTTGCAAAGAGCTTGCTATTAAGGAAGTGCC
TAGTAAACGGTGTCTGTCTCTGTTTCTATGGTTGCAAGAACGTTATGACACTGTGTACAC
GCGTCATCCCGGTTTCCA

QA 1 678 1 678
DS 

RD RS1E894JQ 643 0 0
CGTTTCTTCAGGTCACAGATGCAAACCATTATCACAAAAGCTTGCAAAGAGCTTGCTATT
AAGGAAGTGC*TAGTAAACGGTGTCTGTCTCTGTTTCTATGGTTGCAAGAACGTTATGAC
ACTGTGTACACGCGTCATCCCGGTTTCCAGAAGGGATCACTGCCTCTTCTGTCTCTAGAC
AACCCCTTTCCAATGAATCTTCCTGAGAATTTGTTTGGGGAGAAATGGGCGTTTGTTCAG
TTACCTTACTCAGCTGTTAGAGAAGAGATCTCAGACTTTGAGGAGAAGTTTGTGTTTGGT
GCAACCTTAGATTTGGATTTACTTGGCATTGACGTTGATGAGAACACACTGATCCCTGGT
CTCTCTGTTGCTTCTTCACGTGCAAAACCTCTAGCAGCTTGGATGAATGGTCTTGAGGTG
TGTTCGATTGAAGCAGACAGTACAAAAGGATGTTTGATTCTGGCCGTTGGGATCTCGACA
AGGTATGTCTACGCAACGTACAAGAAAACACCTGTTACTACTGATGAAGCTGAAGCTTGG
GAGTCTGCGAAGAAAGCAAGTGGAGGTTTGCATTTTCTTGCAATTCAAGATGACTTGGAT
TCTGATGACTGTGTTGGCTTTTGGCTTCTTATTGATTTGCCAC

QA 1 643 1 643
DS 



AS 1 2

CO CL9118Contig1 779 2 7 U
GGCACTGTCCAACGTGCGTGCCACCCAACGAAGGCCACGGCGTCGTTTCCTCGTGCCTAA
ACTGTTTCCTAGCCGGCGGCGTCTTGTACCGCTTCGAGTACTCCGTCAACGCCGCTCACT
TCCTCGCCAAAGCCCGAGGAGGAACCTGCACGCTCGCCGTCTCCGACCCTAACGACGTAG
TCGTCCACCGGGCCAACCACCTCCTTCGAAACGGGTTCGGATGCTACGACGTTTTCAAGA
ACAACTGCGAGGATTTCGCCATATATTGCAAAACGGGGTTGCTTGTTCTCGAAGGAAGGA
CGATGGGACAGAGCGGTCAGGCTGTTTCGATCATCGGCGGGCCGATCGCTGCTGTTTTGT
CCACGCCGATGAGGCTTGTGACGACGAATATCTATGGGATGGCTGCGACGGCGGTCGGTG
TGTACTGTGCGAGTAGGTACGCTACTGATATCGGAATGAGAGCTGACGTAGCGAAAGTTG
AAGTGGAGGATCTCACAAGGAGGCTCTCTGTAGGGTTGTTCCAAGTGATTGAGCCTACGG
TGGCAGCCGTAGCTTTGCCAAACGCAAGTTGATAGATAAAGCTTAAGCTTCATCTGTTGC
TTTCTTGTTTCAGTGATTGTATCATGTGTATCCAGTTGCCTTTCCTTTCTAAACACATTC
TAATAAGCAAACTCTACTTGTATACTTATATGTTTCTCATGAACAAGTGATCGTTGTGTG
TCATATTGTGTTGATGCCGGTTTTATATAAATTCTTATCAAATATAAACCATTGGTGCC


BQ
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AF RS1GO45TF U 1
AF RS1GO45JQ C 231
BS 1 743 RS1GO45TF
BS 744 744 RS1GO45JQ
BS 745 750 RS1GO45TF
BS 751 751 RS1GO45JQ
BS 752 761 RS1GO45TF
BS 762 762 RS1GO45JQ
BS 763 779 RS1GO45TF

RD RS1GO45TF 779 0 0
GGCACTGTCCAACGTGCGTGCCACCCAACGAAGGCCACGGCGTCGTTTCCTCGTGCCTAA
ACTGTTTCCTAGCCGGCGGCGTCTTGTACCGCTTCGAGTACTCCGTCAACGCCGCTCACT
TCCTCGCCAAAGCCCGAGGAGGAACCTGCACGCTCGCCGTCTCCGACCCTAACGACGTAG
TCGTCCACCGGGCCAACCACCTCCTTCGAAACGGGTTCGGATGCTACGACGTTTTCAAGA
ACAACTGCGAGGATTTCGCCATATATTGCAAAACGGGGTTGCTTGTTCTCGAAGGAAGGA
CGATGGGACAGAGCGGTCAGGCTGTTTCGATCATCGGCGGGCCGATCGCTGCTGTTTTGT
CCACGCCGATGAGGCTTGTGACGACGAATATCTATGGGATGGCTGCGACGGCGGTCGGTG
TGTACTGTGCGAGTAGGTACGCTACTGATATCGGAATGAGAGCTGACGTAGCGAAAGTTG
AAGTGGAGGATCTCACAAGGAGGCTCTCTGTAGGGTTGTTCCAAGTGATTGAGCCTACGG
TGGCAGCCGTAGCTTTGCCAAACGCAAGTTGATAGATAAAGCTTAAGCTTCATCTGTTGC
TTTCTTGTTTCAGTGATTGTATCATGTGTATCCAGTTGCCTTTCCTTTCTAAACACATTC
TAATAAGCAAACTCTACTTGTATACTTATATGTTTCTCATGAACAAGTGATCGTTGTGTG
TCATATTGTGTTGATGCCGGTTT*ATATAA*TTCTTATCAA*TATAAACCATTGGTGCC

QA 1 779 1 779
DS 

RD RS1GO45JQ 549 0 0
GTTTTCAAGAACAACTGCGAGGATTTCGCCATATATTGCAAAACGGGGTTGCTTGTTCTC
GAAGGAAGGACGATGGGACAGAGCGGTCAGGCTGTTTCGATCATCGGCGGGCCGATCGCT
GCTGTTTTGTCCACGCCGATGAGGCTTGTGACGACGAATATCTATGGGATGGCTGCGACG
GCGGTCGGTGTGTACTGTGCGAGTAGGTACGCTACTGATATCGGAATGAGAGCTGACGTA
GCGAAAGTTGAAGTGGAGGATCTCACAAGGAGGCTCTCTGTAGGGTTGTTCCAAGTGATT
GAGCCTACGGTGGCAGCCGTAGCTTTGCCAAACGCAAGTTGATAGATAAAGCTTAAGCTT
CATCTGTTGCTTTCTTGTTTCAGTGATTGTATCATGTGTATCCAGTTGCCTTTCCTTTCT
AAACACATTCTAATAAGCAAACTCTACTTGTATACTTATATGTTTCTCATGAACAAGTGA
TCGTTGTGTGTCATATTGTGTTGATGCCGGTTTTATATAAATTCTTATCAAATATAAACC
ATTGGTGCC

QA 1 549 1 549
DS 



AS 1 2

CO CL9119Contig1 910 2 8 U
TCCGAAGTCACTGAGAGAGAGAGAGAGAAGAAGAAAAGTTTGAGTTCCGATGAGTTCTGG
AGGAGGAGGAATCGTGGCGGGACCAACAGCAGCTCCTGCAAGCGGCGGTGGAAACGTGGA
GTGGCACGTCAGACCACCCAACCCTAAAAACCCAGTCGTCTTCTTCGACGTCTCTATTGG
TGGTATCCCCGCTGGTCGTATCAAGATGGAGCTTTTCGCCGACATTGCCCCCAAAACTGC
TGAAAACTTCAGGCAGTTCTGTACTGGTGAACTCAGAAAGGCTGGGAAGCCACTTGGTTA
CAAAGAATGTCAGTTTCACAGAGTCATCAAGGATTTTATGATTCAAAGTGGTGATTTTCT
TAAGAATGATGGTAGTGGATGCATGTCAATCTATGGCCACCAGTTCGCTGATGAGAATTT
TACTGCCAAACATACTAGACCTGGATTGCTCTCCATGGCAAATAGTGGGCCAGACACTAA
TGGTTGCCAGTTCTTCATCAGCTGTGCAAAATGCGAGTGGCTTGACAACAAGCATGTTGT
CTTTGGGAGAGTGCTGGGAGATGGGTTTATTGGTGGTGCGGAAGATTGAGAACGTGGCTG
TTGGACCAAACAACCGTCCTAAGCTTGCTGTTGTTATTACAGAGTGTGGGGGAGATGTGA
GAAATGCTATTAGCCATGAGATGACTTGAAGAACATTGTCTTCTGAAGAAGGAATGTAGT
GTGAGGCCAAAGCTTTAATTTATAGTTGTAAACGTTACGCATATGTGACCTAAGCTTTAA
ACATTTTGTCATTTAGTTTTCTTTTTCTTTCACTTTGGTTGGTTGGTCAACATTTCCGAA
AGCAAAAGCCACTTGTAAACTTTGGTTTTGGAGATCATTAACTTGTGAGTGAAAATGAGA
CCCTTTTCAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1AF44TF U 1
AF RS1AF44JQ C 151
BS 1 709 RS1AF44TF
BS 710 711 RS1AF44JQ
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RD RS1AF44TF 785 0 0
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TGAAAACTTCAGGCAGTTCTGTACTGGTGAACTCAGAAAGGCTGGGAAGCCACTTGGTTA
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TAAGAATGATGGTAGTGGATGCATGTCAATCTATGGCCACCAGTTCGCTGATGAGAATTT
TACTGCCAAACATACTAGACCTGGATTGCTCTCCATGGCAAATAGTGGGCCAGACACTAA
TGGTTGCCAGTTCTTCATCAGCTGTGCAAAATGCGAGTGGCTTGACAACAAGCATGTTGT
CTTTGGGAGAGTGCTGGGAGATGGGTTTATTGGTGGTGCGGAAGATTGAGAACGTGGCTG
TTGGACCAAACAACCGTCCTAAGCTTGCTGTTGTTATTACAGAGTGTGGGGGAGATGTGA
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GTGAG*CCAAAGCTTTA*TTTATAGTTGTAAACGTTACGCATATGTGACCTAAGCTTTAA
CATTT

QA 1 780 1 780
DS 

RD RS1AF44JQ 760 0 0
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GCTTTTCGCCGACATTGCCCCCAAAACTGCTGAAAACTTCAGGCAGTTCTGTACTGGTGA
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GGATTTTATGATTCAAAGTGGTGATTTTTTTAAGAATGATGGTAGTGGATGCATGTCAAT
CTATGGCCACCAGTTCGCTGATGAGAATTTTACTGCCAAACATACTAGACCTGGATTGCT
CTCCATGGCAAATAGTGGGCCAGACACTAATGGTTGCCAGTTCTTCATCAGCTGTGCAAA
ATGCGAGTGGCTTGACAACAAGCATGTTGTCTTTGGGAGAGTGCTGGGAGATGGGTT*AT
TGGTGGTGCGGAAGATTGAGAACGTGGCTGTTGGACCAAACAACCGTCCTAAGCTTGCTG
TTGTTATTACAGAGTGTGGGG*AGATGTGAGAAATGCTATTAGCCATGAGATGACTTGAA
GAACATTGTCTTCTGAAGGAGGAATGTAGTGTGAGGCCAAAGCTTTAATTTATAGTTGTA
AACGTTACGCATATGTGACCTAAGCTTTAAACATTTTGTCATTTAGTTTTCTTTTTCTTT
CACTTTGGTTGGTTGGTCAACATTTCCGAAAGCAAAAGCCACTTGTAAACTTTGGTTTTG
GAGATCATTAACTTGTGAGTGAAAATGAGACCCTTTTCAT

QA 1 760 1 760
DS 



AS 1 2

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AGTGCTCGTGGAGATTTACAAGTCCATATTGATGGCGCAGGCGCAGGGGAATCTCGTGCA
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TCAGTAATTTTTAAAATCACAACAATTCTCCTTTTTCCTTATAATAAAAGATAATTATAA
TTCTTGACTTGTTTGATATATACATTTCGAGATTGCCGATATGAAAGTTTGTGATCTTGG
TCCG


BQ
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10 10 10 10 

AF RS1DJ53TF U 1
AF RS1DJ53JQ C 1
BS 1 600 RS1DJ53TF
BS 601 604 RS1DJ53JQ

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GCCGAAGAGGTATTGGAGAAGGTGGAGAGGATACGAGAAGCTTGATGGGTCATCAACGGT
GGAAAGAAGGAATGGAAAACGGGTCAAAATGGATCCGACCCGCAAGAAACGCTTATGGAG
GATCAAGATAATGCCGAAACTGAGGATCCTCAGAAGAGCGTCCCCTAAGAAGCTTCTCAT
TTGGTTACGCGATTCTTATGTTAATATGATGATGAGGTTGGCGAACTCACGGGTCGTAGG
AGCTTCTGGATACGGTGGATCCGGTTTTGGATCGGGTCGGATGAAAGAGTATGATGAGAA
AGTGCTCGTGGAGATTTACAAGTCCATATTGATGGCGCAGGCGCAGGGGAATCTCGTGCA
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TTCTTGACTTGTTTGATATATACATTTCGAGATTGCCGATATGAAAGTTTGTGATCTTGG

QA 1 600 1 600
DS 

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GGAGAAACAAATAAACTTACATATTGATCAAAGAGATTGTGTGTCTGTGATGGAGATAAC
GCCGAAGAGGTATTGGAGAAGGTGGAGAGGATACGAGAAGCTTGATGGGTCATCAACGGT
GGAAAGAAGGAATGGAAAACGGGTCAAAATGGATCCGACCCGCAAGAAACGCTTATGGAG
GATCAAGATAATGCCGAAACTGAGGATCCTCAGAAGAGCGTCCCCTAAGAAGCTTCTCAT
TTGGTTACGCGATTCTTATGTTAATATGATGATGAGGTTGGCGAACTCACGGGTCGTAGG
AGCTTCTGGATACGGTGGATCCGGTTTTGGATCGGGTCGGATGAAAGAGTATGATGAGAA
AGTGCTCGTGGAGATTTACAAGTCCATATTGATGGCGCAGGCGCAGGGGAATCTCGTGCA
ACGCGACACGGCTAGCAAGCTTCCTTTTGAACCAGTGGTTGTATCTGTCTCTCCTGTTGT
TCAGTAATTTTTAAAATCACAACAATTCTCCTTTTTCCTTATAATAAAAGATAATTATAA
TTCTTGACTTGTTTGATATATACATTTCGAGATTGCCGATATGAAAGTTTGTGATCTTGG
TCCG

QA 1 604 1 604
DS 



AS 0 0

AS 1 2

CO CL9122Contig1 606 2 2 U
CTCTAAAGAAAAGGGCTTTAAAGTCAAAATTTTCTTCTCTCTCTTAAACAATGTAACTCT
CAAGTGAATTGTGTTCTTTTTTGTAAAGAAAATAGAGAATGTGTCTAAATGAGTAAAGCA
CTCAAAGTAAAATTAGATATTCTTCGTCTTCCAGTTCTTCATTCGTGCCTCCAACGCTGC
TTCGGTTTCATCACAGCTTTTCGATACTTCCAGCAGTCTCTCCTCAACTCCCTGAACTTG
CGCCGAGACAGAGTTTGTTGTTAAGCCACCTTAAACAAACCAGACGAACATGTTAAAAAA
GGAACAAGGTTATCAACAAACAAAATGCTAACAAATCAACATCATACCAATCACGTATCC
AATACCACAAAACGCCCCTTTATAGGCGTATCCAACAACTTTCGAGCCGCGCTTAGTCAC
AACAACTAACACACAAAATTTGATTGCAAAATACCAAATTTTAAATACAAGTCAGATAAT
ACATAATTGATTGACGGTGATAGATATTGCTGTGCAAATAAATGAGATACCTTTCTCACC
GACGGATGAAAAATCACGACACTGCAGCCTCCCCTTGCCACAAGACTTAGCCAACGTGCT
TCCCAG


BQ
10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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ATAATTGATTGACGGTGATAGATATTGCTGTGCAAATAAATGAGATACCTTTCTCACCGA
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CCAG

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DS 



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BQ
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AF RS1CF52TF U 1
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QA 1 756 1 756
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1G348JQ U 1
AF RS1EF51JQ U 81
BS 1 236 RS1G348JQ
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BS 343 448 RS1G348JQ
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AGAAATATAAACATCTTAAAAAAAGAAGTGAACAATAACGCCCTTTGCCCAGGATCTCTC
TCCTCCACTTCAATGCTCGAAAACAACCACTGATTTAATCAGGCACTTGTGTCTTTCCAT
CTTAATGAAACCCTCATCATCTCCATACTTCTTTCCCCAAGTCTCTTGGAGTTGAAAATA
CTCTATCCCATTCTCATCAATATCGCTTCCAGTCAAGAAGAGACAATGCACAGGAAACTT
TTCGAAAGTCCTCAAATAACAATCTATGTCATTTGGTCGATATATTCCCCGTCCATCAAA
TGACTGAAAACCAGGAACACACTCAACGGTCACCATGACAGGTATTTTTGACGCAATGTC
AATGAGAAATCTCTCAAAATCTTCAAACAGCGTCACATCACCACCCCTAGGACGCCTGTG
AACAACCATCTTCTTGCAATACTGCTCCATGAACGTAGATGCAAGCTTAGAACTGCGGAT
CCCTTCCCCTGATACTTGATGAGCAGCATCAACCCCCTCAAGAATCTCTGGGATTGTAGG
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QA 1 711 1 711
DS 

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AAACAACCACTGATTTAATCAGGCACTTGTGTCTTTACATCTTAATGAAACCCTCATCAT
CTCCATACTTCTTTCCCCAAGTCTCTTGGAGTTGAAAATACTCTATCCCATTCTCATCAA
TATCGCTTCCAGTCAAAAAAAAACAATGCACAGGAAACTTTTCGAAAGTCCTCAAATAAC
AATCTATGTCATTTGGTCGATATATTCCCCGTCCATCAAATGACTGAAAACCAGGAACAC
ACTCAACGATCACCATGACAGGTATTTTTGACGCAATGTCAATGAAAAATCTCTCAAAAT
CTTCAAACAGCGTCACATCACCACCCCTAGGACGCCTGTGAACAACCATCTTCTTGCAAT
ACTGCTCCATGAACGTAAATGCAAGCTTAAAACTGCGGATCCCTTCCCCTGATACTTGAT
GAGCAGCATCAACCCCCTCAAGAATCTCTGGGATTGTAGGAACTGGTCCATTTATCCCTG
CTTGTTTACAAGATGCTGAATGACCTCTGTGAAGGCCAATAGCCCAGCACTCAGA

QA 1 655 1 655
DS 



AS 1 2

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TCTCTTCTTCAACAGCTTTGTCATTATCTTTGTGGTGACTGTTCTTCTTGCGGCACTTGA
CTTCTGGGTGGTTAAGAATGTGAGTGGGCGTATACTGGTTGGTCTCAGGTGGTGGAACGA
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TCGGATGAACAAGAAAGACTCGTGGCTTTTCTGGTGGACGCTTTACCTTGCAGCAGCTGC
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CGGCGTTTGCTTGTCCCTCAACGTGGCTAATATCATCGGTTTCACAAAGTGCAAGAAAGA
TGCAAAGAAACAGTTTCAGCAGTTTGCCTCACAGACAATCGCATCACGGTTCCAATCCAC
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TCGATATACTATTTTGTAAGGGATTAAGAAAGAGATTTATTATATTATGTCTTCTTACAT
GTATTATCATTTTCGACTTACCCTGTTTAAGATACTTCTTGAGGTTGTAAAACATTTTCA
AAAGATCTCGATGTAGCTTTC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1CO38TF U 1
AF RS1CO38JQ C 93
BS 1 693 RS1CO38TF
BS 694 861 RS1CO38JQ

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QA 1 693 1 693
DS 

RD RS1CO38JQ 769 0 0
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TCATCGGTTTCACAAAGTGCAAGAAAGATGCAAAGAAACAGTTTCAGCAGTTTGCCTCAC
AGACAATCGCATCACGGTTCCAATCCACAGTACAATCTGCCTTCACCCTTGTCTGAAAAG
AAGAAAAGGTCATAGTGAGAGCAAAGACAGTGTACAAAAGAAGATTCGCCATAAGCCACA
CCATGTTTTTTTTGACTGATTCGTTTTCTCGATATACTATTTTGTAAGGGATTAAGAAAG
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QA 1 769 1 769
DS 



AS 1 2

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CTTATTCTTATGGTTTCGCTATCATTCTACTTACCGTGCTTGTTAAGGCTGCTACCTTCC
CATTGACCAAAAAGCAGGTCGAATCTGCAATGGCTATGAAGTCTTTGCAGCCTCAGATTA
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BQ
10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1G008TF U 3
AF RS1CC92TF U 1
BS 1 587 RS1CC92TF
BS 588 588 RS1G008TF
BS 589 758 RS1CC92TF

RD RS1G008TF 605 0 0
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CTGAATCCAAAAACCCTAAATCTCCTTTACCTTTCTTTGTCGCTGGAGAAGATGGCTTCT
TCGATATACTTAAAGCCAACGAACCTCCTCCTCCTCTCTTCTTTCTCCACAGGCAGAGTC
CTCCATCTCCGCCGCCGCTCCCGTTTCAGCCACAGACCGTCTTCTTCGCCTCGGACTCTG
GTGGCTCAATTCGGGTTCAGTCAAGGCCCCCTTTCTCTCGATTTGATCAAGGAACATGCG
GAGAGCCTCCTCTACACGATCGCTGATGCCGCTGTCTCCTCCTCAGAGACCTTTGATTCT
GTTTCCGGCACTACCACCACGACCACGAGCCAGAACAGTGATTGGTTCACTGGTATCGCC
AATTACATGGAAACCATTCTCAAGGTTTTGAAAGATGGGTTATCAACTGTGAATGTTCCT
TATTCTTATGGTTTCGCTATCATTCTACTTACCGTGCTTGTTAAGGCTGCTACCTTCCCA
TTGACCAAAAAGCAGGTCGAATCTGCAATGGCTATGAAGTCTTTGCAGCCTCAGATTAAG
GCTAT

QA 1 605 1 605
DS 

RD RS1CC92TF 758 0 0
GGGGCTTCACTTGTCTCTCTGGCGCACTGGAGACGTGAAGCAAGCAACAACAACAATACT
TTCTGAATCCAAAAACCCTAAATCTCCTTTACCTTTCTTTGTCGCTGGAGAAGATGGCTT
CTTCGATATACTTAAAGCCAACGAACCTCCTCCTCCTCTCTTCTTTCTCCACAGGCAGAG
TCCTCCATCTCCGCCGCCGCTCCCGTTTCAGCCACAGACCGTCTTCTTCGCCTCGGACTC
TGGTGGCTCAATTCGGGTTCAGTCAAGGCCCCCTTTCTCTCGATTTGATCAAGGAACATG
CGGAGAGCCTCCTCTACACGATCGCTGATGCCGCTGTCTCCTCCTCAGAGACCTTTGATT
CTGTTTCCGGCACTACCACCACGACCACGAGCCAGAACAGTGATTGGTTCACTGGTATCG
CCAATTACATGGAAACCATTCTCAAGGTTTTGAAAGATGGGTTATCAACTGTGAATGTTC
CTTATTCTTATGGTTTCGCTATCATTCTACTTACCGTGCTTGTTAAGGCTGCTACCTTCC
CATTGACCAAAAAGCAGGTCGAATCTGCAATGGCTATGAAGTCTTTGTAGCCTCAGATTA
AGGCTATTCAGGAACGGTATGCTGGTGATCAGGAGAAAATTCAGCTTGAAACTGCAGATT
GTATAAACTTGCTGGAATCAATCCCTTTGCAGCTGCCTCCCCACACTAGCTACGATACCA
GTCTGGATGGCCTATATAGAGCCCTCTCAAATGTTGCG

QA 1 758 1 758
DS 



AS 1 2

CO CL9127Contig1 705 2 3 U
TTTTTTTTTCTTATATAAATTTTCCAGTTTTATTGAATAATCATATATAAAGTTTACAAC
AAGGCCGGATAGTTTCCAAATAAACCAATTCCTTTAAAAATTGTTTTCATATATTTAATA
TATAGATTTAAAACCGCATCCAAATGTAAGCCGGCCACGTATATTTGTTATTTAAGAAAT
ATATTCAATTAATACCTAATAAGCTCCTTTTGAAGAGCGACACCGTTCTTGGGTTCTCCG
GTGAGAAGTAGCACCAAAGCCAGTAGTAACACCATAACTGTCAGTGCCTTTGCCCATACT
CTCCATCACCCAATCACTACTAGCTTTTCACACCGGCTCTCGCCGTCTCCGACAGCTCCA
CCTTCACACCGTTTCCAAGGGTCGAGATTGCTGCCACTTGTCCGATCGTGAGAGTCTCTC
CTCCGAGATTCACCACAGGCCTCCTAAACTCCTTCACCATTCTCTTCACCTCATCCAAAT
GGCTCCCTTTCATTTGCTCCGCCGCAGCTCCCCAGTTGAGAGGATCCGTTCCAACCACTG
TGACATTCTTCTTGATCTCTCCACCGCATAACATAGCGTCTACATCTCCTACGTGTGATG
ATCCGTTAACCTCCATTGCAATATCGATCGAGATTATGAATTAATTAAAAGGATAAGATT
ATAGCTAGAGAGATCTTTTATATTATTTTTGTTGGTTTAAGGAAT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C445JQ U 11
AF RS1C445TF C 1
BS 1 10 RS1C445TF
BS 11 361 RS1C445JQ
BS 362 705 RS1C445TF

RD RS1C445JQ 351 0 0
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AGTTTCCAAATAAACCAATTCCTTTAAAAATTGTTTTCATATATTTAATATATAGATTTA
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GCACCAAAGCCAGTAGTAACACCATAACTGTCAGTGCCTTTGCCCATACTCTCCATCACC
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QA 1 351 1 351
DS 

RD RS1C445TF 705 0 0
TTTTTTTTTCTTATATAAATTT*CCAGTTTTATTGAATAATCATATATAAAGTTTACAAC
AAGGCCGGATAGTTTCCAAATAAACCAAT*CCTTTAAAAATTGTTTTCATATATTTAATA
TATAGATTTAAAACCGCATCCAAATGTAAGCCGGCCACGTATATTTGTTATTTAAGAAAT
ATATTCAATTAATACCTAATAAGCTCCTTTTGAAGAGCGACACCGTTCTTGG*TTCTCCG
GTGAGAAGTAGCACCAAAGCCAGTAGTAACACCATAACTGTCAGTGCCTTTGCCCATACT
CTCCATCACCCAATCACTACTAGCTTT*CACACCGGCTCTCGCCGTCTCCGACAGCTCCA
CCTTCACACCGTTTCCAAGGGTCGAGATTGCTGCCACTTGTCCGATCGTGAGAGTCTCTC
CTCCGAGATTCACCACAGGCCTCCTAAACTCCTTCACCATTCTCTTCACCTCATCCAAAT
GGCTCCCTTTCATTTGCTCCGCCGCAGCTCCCCAGTTGAGAGGATCCGTTCCAACCACTG
TGACATTCTTCTTGATCTCTCCACCGCATAACATAGCGTCTACATCTCCTACGTGTGATG
ATCCGTTAACCTCCATTGCAATATCGATCGAGATTATGAATTAATTAAAAGGATAAGATT
ATAGCTAGAGAGATCTTTTATATTATTTTTGTTGGTTTAAGGAAT

QA 1 705 1 705
DS 



AS 1 2

CO CL9128Contig1 1111 2 6 U
GCATTATTGAAGATGTTAAGCCTACTGGCCAAACCAGACCAGCTGTTGCGGCTCCAACTG
ATCCTTTCACATTAACTGTTGAAGAGAAGCTCAATGTCGCATTGAGACGAGATGGTGGAA
TCAGTAGCTTTGACATGCAGGGAACCCTGTCGCTTCAAATTCTTAACCAAGAAGATGGGT
TTGTCCAAGTTCAGATTGAAACCGGTGGAAATCCTGAAATTCTTTTCAAGACACATCCCA
ACATCAACAGGGAACTCTTTAATAGCGAGAGTAGGGCTGAAGAGACCTGATCAGCCATTT
CCCACTGGTCAAGGTGGAGATGGTGTTGGTCTTCTGAGGTGGAGAATGCAAAGAGCAGAT
GAGTCGATGGTGCCACTAACAATCAACTGCTGGCCTTCAGTGTCTGGAAACGAGACATAT
GTGAGCATCGAGTATGAAGCCTCGTCCATGTTTGATCTGACTAATGTTATCATCTCGGTT
CCTCTTCCTGCTCTGAGAGATGCACCGATCGTTAAACAATGCGATGGGGACTGGAGGTAC
GACTCAAGAAATTCTGTTGTGGAATGGTCTATACTTCTCATTGACAACTCCAACCGCAGT
GGGTCAATGGAGTTTGTTGTGCCACCAGTTGATTCGTCGGTGTTCTTCCCTATCTCTGTT
CAGTTTGCAGCCACCACTACATACAGTGGCTTGAAAGTGAACGGAATGATTCCTCTCAGA
GGTGGTGGTGGTACGACTCCAAGGTTTGTGCAGAGGACGCAGCTAATAACACAGAATTAC
CAAGTCGTATGAGAAGGCTGTTCGAGTTACTCCGTTTGGTACCGCTGTTTCTTTTAGTTT
ATTGCTGCTTCTCTACTATCTCTGTGGTCTGGTAAAAAATCTTAAATCTTCTGGGATTTT
ACTAGTTTCTTTATCAGACTTACTTCTAAGACGCATTCTTATCATTGTTTCTTTTTTTTG
ACTTGTTTGCTTTGTTTTCCCCCACAATGTACTCATTTGATGAGCCTTCACTTATAGGGT
TTATGTGTGGATCATATTATTTTTGTTATCGTGTTCTTGCATGTGAAGTTATAAGCGAAA
ACGGTGATTTTAATCAACTAAATTGGTAATC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1A720TF U 1
AF RS1A720JQ C 218
BS 1 743 RS1A720TF
BS 744 744 RS1A720JQ
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RD RS1A720TF 830 0 0
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ATCCTTTCACATTAACTGTTGAAGAGAAGCTCAATGTCGCATTGAGACGAGATGGTGGAA
TCAGTAGCTTTGACATGCAGGGAACCCTGTCGCTTCAAATTCTTAACCAAGAAGATGGGT
TTGTCCAAGTTCAGATTGAAACCGGTGGAAATCCTGAAATTCTTTTCAAGACACATCCCA
ACATCAACAGGGAACTCTTTAATAGCGAGAGTAGGGCTGAAGAGACCTGATCAGCCATTT
CCCACTGGTCAAGGTGGAGATGGTGTTGGTCTTCTGAGGTGGAGAATGCAAAGAGCAGAT
GAGTCGATGGTGCCACTAACAATCAACTGCTGGCCTTCAGTGTCTGGAAACGAGACATAT
GTGAGCATCGAGTATGAAGCCTCGTCCATGTTTGATCTGACTAATGTTATCATCTCGGTT
CCTCTTCCTGCTCTGAGAGATGCACCGATCGTTAAACAATGCGATGGGGACTGGAGGTAC
GACTCAAGAAATTCTGTTGTGGAATGGTCTATACTTCTCATTGACAACTCCAACCGCAGT
GGGTCAATGGAGTTTGTTGTGCCACCAGTTGATTCGTCGGTGTTCTTCCCTATCTCTGTT
CAGTTTGCAGCCACCACTACATACAGTGGCTTGAAAGTGAACGGAATGATTCCTCTCAGA
GGTGGTGGTGGTACGACTCCAAG*TTTGTGCAGAGGACGCAGCTAATAACACAGAATTAC
CAAGTCGTATGAGAAG*CTGTTCGAGTTACTCCGTTTGGTACCGCTGTTT

QA 1 830 1 830
DS 

RD RS1A720JQ 894 0 0
AATTCTTTTCAAGACACATCCCAACATCAACAGGGAACTCTTTAATAGCGAGAGTAGGGC
TGAAGAGACCTGATCAGCCATTTCCCACTGGTCAAGGTGGAGATGGTGTTGGTCTTCTGA
GGTGGAGAATGCAAAGAGCAGATGAGTCGATGGTGCCACTAACAATCAACTGCTGGCCTT
CAGTGTCTGGAAACGAGACATATGTGAGCATCGAGTATGAAGCCTCGTCCATGTTTGATC
TGACTAATGTTATCATCTCGGTTCCTCTTCCTGCTCTGAGAGATGCACCGATCGTTAAAC
AATGCGATGGGGACTGGAGGTACGACTCAAGAAATTCTGTTGTGGAATGGTCTATACTTC
TCATTGACAACTCCAACCGCAGTGGGTCAATGGAGTTTGTTGTGCCACCAGTTGATTCGT
CGGTGTTCTTCCCTATCTCTGTTCAGTTTGCAGCCACCACTACATACAGTGGCTTGAAGG
TGAACGGAATGATTCCTCTCAGAGGTGGTGGTGGTACGACTCCAAGGTTTGTGCAGAGGA
CGCAGCTAATAACACAGAATTACCAAGTCGTATGAGAAGGCTGTTCGAGTTACTCCGTTT
GGTACCGCTGTTTCTTTTAGTTTATTGCTGCTTCTCTACTATCTCTGTGGTCTGGTAAAA
AATCTTAAATCTTCTGGGATTTTACTAGTTTCTTTATCAGACTTACTTCTAAGACGCATT
CTTATCATTGTTTCTTTTTTTTGACTTGTTTGCTTTGTTTTCCCCCACAATGTACTCATT
TGATGAGCCTTCACTTATAGGGTTTATGTGTGGATCATATTATTTTTGTTATCGTGTTCT
TGCATGTGAAGTTATAAGCGAAAACGGTGATTTTAATCAACTAAATTGGTAATC

QA 1 894 1 894
DS 



AS 1 2

CO CL9129Contig1 673 2 2 U
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TTTCTATATTCTCAGAGTACTACAAGAGTTACGATGCATTCGTTGATGCTCTCTTCAAAA
CTGGCCGAAGTGCTGATCTACAGTGGAAAAACGGTAAGGAGTTTTCCACTCTGTAGGGCA
TTCGTTTCCGCGTCACCAAGGCCCTTACAAGGAAAAGAAGAGGCAGATCAATGCAAAAAT
GTGAAAGAAGCAGCAGATGCAGTGAAGGACGGAGCGAAGCAAGTGAAGGAAACCACTGAG
CATATCCAAGATGTCGCTTCCACTACGTCTGGCCGGGTAAGTAAGATGACAAAAGATGTG
ACGGAAAAGGTTACTGAAACGACGGATTCTGTCACTGAAAAGGCTAAAGGATCTGTATCT
GGAGTCGTGGATACAGTTAAAAATGCTACTGATATCATTAAGAACAAGACTAGTCGCGAT
TAGTTACTAGCACATCCAAATATTTGATATATTTATATATATTTCAATAAATTAAATAGT
ATTCAAAGTAATGATCGGATTAGTAATAGTCTGACTAAATTTTGAATATGAACTAAAACC
GTAATTTAAAGTAATGCTCGGAAAACCTCTGGACTATGTAGATACTATCTCAGCTCTTGT
AGCATAACAATGG


BQ
10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1DR96TF U 1
AF RS1E571TF U 5
BS 1 610 RS1DR96TF
BS 611 673 RS1E571TF

RD RS1DR96TF 610 0 0
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TTCGTTTCCGCGTCACCAAGGCCCTTACAAGGAAAAGAAGAGGCAGATCAATGCAAAAAT
GTGAAAGAAGCAGCAGATGCAGTGAAGGACGGAGCGAAGCAAGTGAAGGAAACCACTGAG
CATATCCAAGATGTCGCTTCCACTACGTCTGGCCGGGTAAGTAAGATGACAAAAGATGTG
ACGGAAAAGGTTACTGAAACGACGGATTCTGTCACTGAAAAGGCTAAAGGATCTGTATCT
GGAGTCGTGGATACAGTTAAAAATGCTACTGATATCATTAAGAACAAGACTAGTCGCGAT
TAGTTACTAGCACATCCAAATATTTGATATATTTATATATATTTCAATAAATTAAATAGT
ATTCAAAGTAATGATCGGATTAGTAATAGTCTGACTAAATTTTGAATATGAACTAAAACC
GTAATTTAAA

QA 1 610 1 610
DS 

RD RS1E571TF 669 0 0
GG
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TATTCTCAGAGTACTACAAGAGTTACGATGCATTCGTTGATGCTCTCTTCAAAACTGGCC
GAAGTGCTGATCTACAGTGGAAAAACGGTAAGGAGTTTTCCACTCTGTAGGGCATTCGTT
TCCGCGTCACCAAGGCCCTTACAAGGAAAAGAAGAGGCAGATCAATGCAAAAATGTGAAA
GAAGCAGCAGATGCAGTGAAGGACGGAGCGAAGCAAGTGAAGGAAACCACTGAGTATATC
CAAGATGTCGCTTCCACTACGTCTGGCCGGGTAAGTAAGATGACAAAAGATGTGACGGAA
AAGGTTACTGAAACGACGGATTCTGTCACTGAAAAGGCTAAAGGATCTGTATCTGGAGTC
GTGGATACAGTTAAAAATGCTACTGATATCATTAAGAACAAGACTAGTCGCGATTAGTTA
CTAGCACATCCAAATATTTGATATATTTATATATATTTCAATAAATTAAATAGTATTCAA
AGTAATGATCGGATTAGTAATAGTCTGACTAAATTTTGAATATGAACTAAAACCGTAATT
TAAAGTAATGCTCGGAAAACCTCTGGACTATGTAGATACTATCTCAGCTCTTGTAGCATA
ACAATGG

QA 3 669 3 669
DS 



AS 1 2

CO CL9130Contig1 752 2 1 U
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TTACGAATCAGTGATTGTTTCACGGGTTGAAACATATATGATTCAGGGAGTTTAATTGCA
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GGGAATTACCTAGAGATGAAAGAGGAGTCTGAGACCTCGCAGTCAAGGTTTACGGTAACC
GTGAAGAACGTGAAGAATCAGAAGTCGTAAGGTATATTTTTTTGGTTCAAGGTGGAGCTT
GAAAAAAAAATAAAAAAAAAATCAAGTAGTTCTCGAGGAGTAACTAGTACGTGAGATAAT
GTTCCAGGTTCAAGAGGGTTACCTGGAGTTATTAGAACAGAGGCAGAAGATGATACATAG
TTCAGAGGCTACATGTGATCATCGAGGCTGAGAATGGGCACGGGTCTGTTGTTCGTCGCG
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AAAATGAGGCAGAGTCGCCAATGGATACCGACGGAGTATGTGGTGATGGTCTGACAAGAG
GGCACTGGAGAGATACATAAGAACGTCTTAGA


BQ
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GP11TF U 1
AF RS1G778TF U 1
BS 1 752 RS1G778TF

RD RS1GP11TF 600 0 0
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GCGTGAGGCAAACATGATTCTGTTTTGTACTAAATTTAAAGTGCAAAAGTGTATGGTAAA
GGGAATTACCTAGAGATGAAAGAGGAGTCTGAGACCTCGCAGTCAAGGTTTACGGTAACC
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GAAAAAAAAATAAAAAAAAAATCAAGTAGTTCTCGAGGAGTAACTAGTACGTGAGATAAT
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TTCAGAGGCTACATGTGATCATCGAGGCTGAGAATGGGCACGGGTCTGTTGTTCGTCGCG

QA 1 600 1 600
DS 

RD RS1G778TF 752 0 0
GGTTAACGGCGGTACAATAAGAAAAAGGATCTGAAGCTGTGGGGGTTAAACGGAAAAGCA
TTACGAATCAGTGATTGTTTCACGGGTTGAAACATATATGATTCAGGGAGTTTAATTGCA
TTTGGTTAAAGGAAATCAAAGATGCAGAGGGAAGATGAGTTCAATCAACAACAGATTCAT
GATGGTCATGGAGGAGGCTGTGTGATTGATTGGCTAATAGTAGAATCAATGTAGCTTTGG
GCGTGAGGCAAACATGATTCTGTTTTGTACTAAATTTAAAGTGCAAAAGTGTATGGTAAA
GGGAATTACCTAGAGATGAAAGAGGAGTCTGAGACCTCGCAGTCAAGGTTTACGGTAACC
GTGAAGAACGTGAAGAATCAGAAGTCGTAAGGTATATTTTTTTGGTTCAAGGTGGAGCTT
GAAAAAAAAATAAAAAAAAAATCAAGTAGTTCTCGAGGAGTAACTAGTACGTGAGATAAT
GTTCCAGGTTCAAGAGGGTTACCTGGAGTTATTAGAACAGAGGCAGAAGATGATACATAG
TTCAGAGGCTACATGTGATCATCGAGGCTGAGAATGGGCACGGGTCTGTTGTTCGTCGCG
TACAAAGCTGCAGAGATGATTCCATGTTCAAGGTGGAGCTGTGGGAGCTGTGAAGAAAAA
AAAATGAGGCAGAGTCGCCAATGGATACCGACGGAGTATGTGGTGATGGTCTGACAAGAG
GGCACTGGAGAGATACATAAGAACGTCTTAGA

QA 1 752 1 752
DS 



AS 1 2

CO CL9131Contig1 765 2 2 U
GGGCCGTTGAAGTCGATCGTGTCTGTTCGCCTTTTTCTGTCTCACTGTCATACCCTAATT
ACAGTCTGTTTATCTCCCTCTCTCACTTTTGTTCACTGTTCTATTTAAGTGAGGAATCAA
AAACTCTCAGGTAATAGAAAAACTAGATGGCTACTCAGCTCTCTCTCAGATCAGAATTGA
AAGATTCACCATTAGTCGAGATTAGTGCGTCAACAGAGATGGGGTCACCCGATCTAATTA
CTTCCTCGAAATCTTATTACAAGGAGAAGATCGATGCTCCTTGGAGAGGACATGTTCAAA
GGTGGGATCAGAAGAAAAATCAAAGTCCTGCTCATGACCCTCAGAGATCGGATCTTTCTA
CGCTGTTGCTCCTCCTAGAGCAGAACACTCGCATTTCACCGGGACGAAGAGAACAATATA
TAGAGGTGATTGATTCTGAATTTACTTGTGGTCAAGATGAGCCACTACCTCGCCTCCTGG
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GGTTTTGGTTCTTTCGTTGGTGATTGCCATGAGCGTCCAGAACGGAAATGACCTATCCAG
ATATCACCTTTAGAGAGAGAAGCACAATTTCTAAATGAGTGGAAGGTGTAAGAGATTAGA
AAGAGGATATGAGAAAGAGGCGGAATCACAACAGACTAGGATATTTGTATAATGCTGAAC
CGGATGCAGAGATCGCTTGCTGATTGAAAGTCTTATTAAAGAATT


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1FA34TF U 1
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BS 642 765 RS1FA34JQ

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ACAGTCTGTTTATCTCCCTCTCTCACTTTTGTTCACTGTTCTATTTAAGTGAGGAATCAA
AAACTCTCAGGTAATAGAAAAACTAGATGGCTACTCAGCTCTCTCTCAGATCAGAATTGA
AAGATTCACCATTAGTCGAGATTAGTGCGTCAACAGAGATGGGGTCACCCGATCTAATTA
CTTCCTCGAAATCTTATTACAAGGAGAAGATCGATGCTCCTTGGAGAGGACATGTTCAAA
GGTGGGATCAGAAGAAAAATCAAAGTCCTGCTCATGACCCTCAGAGATCGGATCTTTCTA
CGCTGTTGCTCCTCCTAGAGCAGAACACTCGCATTTCACCGGGACGAAGAGAACAATATA
TAGAGGTGATTGATTCTGAATTTACTTGTGGTCAAGATGAGCCACTACCTCGCCTCCTGG
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GGTTTTGGTTCTTTCGTTGGTGATTGCCATGAGCGTCCAGAACGGAAATGACCTATCCAG
ATATCACCTTTAGAGAGAGAAGCACAATTTCTAAATGAGTG

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DS 

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GTTCTATTTAAGTGAGGAATCAAAAACTCTCAGGTAATAGAAAAACTAGATGGCTACTCA
GCTCTCTCTCAGATCAGAATTGAAAGATTCACCATTAGTCGAGATTAGTGCGTCAACAGA
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ACCGGGACGAAGAGAACAATATATAGAGGTGATTGATTCTGAATTTACTTGTGGTCAAGA
TGAGCCACTACCTCGCCTCCTGGGATTGATGCTTTGGTAGCTTCAGTTGCTGCTTTGATT
GATTGATTCCAAGTTCCTCTCCAGGTTTTGGTTCTTTCGTTGGTGATTGCCATGAGCGTC
CAGAACGGAAATGACCTATCCAGATATCACCTTTAGAGAGAGAAGCACAATTTCTAAATG
AGTGGAAGGTGTAAGAGATTAGAAAGAGGATATGAGAAAGAGGCGGAATCACAACAGACT
AGGATATTTGTATAATGCTGAACCGGATGCAGAGATCGCTTGCTGATTGAAAGTCTTATT
AAAGAATT

QA 1 728 1 728
DS 



AS 1 2

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TGAAGTCAGCGGTGCAGAGAGGACTGTGCAACCATGGTGATGCAGTCGTGGCGCTGCACC
GTATTGGAGTCGCCTCCGTTATTAAGATCTGTGTGGTGAAGTAAAGGAAATAAAGAATGG
CTTATTGGTGGCTCTTTTATGATTGTTGGTAATCATAACTGAGAGTTAAAGCTTCGTTGC
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BQ
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AF RS1H074JQB C 1
AF RS1H074TF U 1
BS 1 599 RS1H074TF
BS 600 600 RS1H074JQB

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GTATTGGAGTCGCCTCCGTTATTAAGATCTGTGTGGTGAAGTAAAGGAAATAAAGAATGG
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DS 

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GTAGTGATGAGTCGTCTGCGAGGCACAGTTTGATATACAGAGGTTTGATCCCTATGCTGG
CTGAAGGATCCGCAAAGGCGACGGATATAGAGTCCACTGAGGTTATCATTGAAGCCGCTT
TGAAGTCAGCGGTGCAGAGAGGACTGTGCAACCATGGTGATGCAGTCGTGGCGCTGCACC
GTATTGGAGTCGCCTCCGTTATTAAGATCTGTGTGGTGAAGTAAAGGAAATAAAGAATGG
CTTATTGGTGGCTCTTTTATGATTGTTGGTAATCATAACTGAGAGTTAAAGCTTCGTTGC
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ATGTAATAAGATAAGACTGTTTCTTTGCATAAGCTTTGCTTATAAAAGATTAATTAAGC

QA 1 599 1 599
DS 



AS 1 2

CO CL9133Contig1 1332 2 6 U
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GAAGAGTCGTTTCTCTCTGGTTTGGATTCTAATCTCATCTCATCTTACAAGAGAGCATTG
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GTTGTCTCTTCGAGTCCATTGAGTCCTCAGGCTTTGGAAGAGCAAGAGAAACCAAGATTG
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CAAGTTGCGGTAGAGGAACGTGACATCTCAATGGACTCTGAATACAGAAAAGAGGTTCAG
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AGAGGGTTTCCTGTTTGTGAATCCGTGGGAGCTTGTGAATGCTGTGGGGATGCAAGGTTT
GTGCCGTGTGGTATTTGTGGTGGTAGTACTAAAGTGTTTGAGGAACAAGAAGATGGGTTT
AAGAGATGCAGTGGATGCAATGAGAATGGATTGGTACGTTGTAACAAATGTTGTCTCTAG
TGATTGGATTCTTTTTTTTTATTGATGTTTGATGTGAAGAGAAGAAAAACATTTAGGGGT
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TTGTGTTTTTGT


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1FH25TF U 1
AF RS1FH25JQ C 567
BS 1 690 RS1FH25TF
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BS 700 734 RS1FH25TF
BS 735 1332 RS1FH25JQ

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TTCAAAGCTATGGGTTCTTCTGCTTCCAAAACCACCACTTCTTCTTCTTGTTCAAACTCT
TCTTGCTCGGCGTCACGTTCACCACCGGAGAAGAAACTAAACTCAACGACGGTTCCGAGA
GCTTTCTCATTCCCGATGCCGTCGGTTCATCACCCGCCGGTTAAAAAAGGCGACACGCAC
CACTTCGTCTCCCTCACGTCCACCACCTACGGTTCTCTCGATCTCGACGTTCGAACACTA
CCTCATATCTCTGTTCCCGTTAACAACACGGCTAAGCCAGAGGAGTCATGTGACTCCTCC
TCGGTGTCTCCTGACTCGGTGATCAACACGTGGGAGCTCATGAACGATCTCGAAGAAGAC
GAGTTTGGTTGGACGAAACGTGACGTGGACGTTAGTGGGTCTTACGAGTTCGTGAGGGTC
GAAGAAGATTGGGTTCCTTTGCCTTCTAAACCTAAGCAGCCTCTGTGGAAACATATGGCT
GAAGAGTCGTTTCTCTCTGGTTTGGATTCTAATCTCATCTCATCTTACAAGAGAGCATTG
TCGTCTAGACAACTAGGCAAGAACACCGAACCAGTCTCTTGCAGCCACTCAGATCAATCG
GTTGTCTCTTCGAGTCCATTGAGTCCTCAG*CTTTGGA*GAGCAAGAGAAACCAAGATTG
TCTGAAACAGAAGA
GACA

QA 1 734 1 734
DS 

RD RS1FH25JQ 766 0 0
TTCTAATCTCATCTCATCTTACAAGAGAGCATTGTCGTCTAGACAACTAGGCAAGAACAC
CGAACCAGTCTCTTGCAGCCACTCAGATCAATCGGTTGTCTCTTCGAGTCCATTGAGTCC
TCAGGCTTTGGAAGAGCAAGAGAAACCAAGATTGTCTGAAACAGAAGAAGACAACAAGGA
CAAGAACAAGACAGTATTATACTTCACTAGCCTCAGAGGTATTCGAAAGACTTATGAGGA
TTGTTGCTACGTGAGAACGGTATTGAGAGGGTTTCAAGTTGCGGTAGAGGAACGTGACAT
CTCAATGGACTCTGAATACAGAAAAGAGGTTCAGATATTACTCGGCGAAGAGAAACCAGT
TTGCTTGCCTCAGGTGTTCATAAGAGGCGTCCATGTTGGTGGAGTTGAGGAGATCAAGAG
ACTCAACGATGGAGGTGAACTGGGAGAGATGTTAAGAGGGTTTCCTGTTTGTGAATCCGT
GGGAGCTTGTGAATGCTGTGGGGATGCAAGGTTTGTGCCGTGTGGTATTTGTGGTGGTAG
TACTAAAGTGTTTGAGGAACAAGAAGATGGGTTTAAGAGATGCAGTGGATGCAATGAGAA
TGGATTGGTACGTTGTAACAAATGTTGTCTCTAGTGATTGGATTCTTTTTTTTTATTGAT
GTTTGATGTGAAGAGAAGAAAAACATTTAGGGGTATACTTGTGACTTGGGATATGTTTTG
GTTGGGTTGTGTTATTTTGAATGAATTAATTGGCTTGTGTTTTTGT

QA 1 766 1 766
DS 



AS 1 2

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GCACTCGCCTGGGATAATAAAATATCTTCGTCTCCTCCTCCTCTTCAGATCCCATCCAAC
TTCCGCCGCAGAATCCTCGCCTCTCTCCGCGACTGGATCAACCTCCTCCTCTTCTGGCAA
TACTCCGTCCCTTTCCTCGTAAACCTCTCCGCCTCCGCCACGTTCTTCGCCCTCCTCGGT
GACTCCCCGATCTCCATCGCCGTCCCCGTCACCAACGCGACGACCTTCGCCGCAACCGCC
GCGTTCGGGGTTCTTCTGGGGGAAGAAACTCAGATCGGACTTGCTTTGTTAGGTACGAGC
TTCATTGTATTTGGAATCTGGCTTTGTGTTGGTCACTGATCAGATCACTACTGATCTCGT
CTCTATGTGATTCGAATAATGTAGAAGCATCACTCTGTTTCTTGCTGAGATTATAGAATT
GATTCATTCCTGTTCTAGCAAAGTAGATAGCGAGAGTGCTTATTAGAACTGATAAGTGAT
GAGACTGATAAGTGATTAGGTGATGAGTAGCTGATGGAACTGATAAGTGATGAATAGTGT
ATGTTGTAATGGTAATATTATGCATCAAATGATTGATG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
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AF RS1CO72TF U 1
AF RS1BM40TF U 106
BS 1 638 RS1CO72TF

RD RS1CO72TF 638 0 0
CAGAAAATGGTTGCCGTAGGGCTCGTGTGGGGAGCCACCAACGCCCTCATTCGCCGCGGC
GCACTCGCCTGGGATAATAAAATATCTTCGTCTCCTCCTCCTCTTCAGATCCCATCCAAC
TTCCGCCGCAGAATCCTCGCCTCTCTCCGCGACTGGATCAACCTCCTCCTCTTCTGGCAA
TACTCCGTCCCTTTCCTCGTAAACCTCTCCGCCTCCGCCACGTTCTTCGCCCTCCTCGGT
GACTCCCCGATCTCCATCGCCGTCCCCGTCACCAACGCGACGACCTTCGCCGCAACCGCC
GCGTTCGGGGTTCTTCTGGGGGAAGAAACTCAGATCGGACTTGCTTTGTTAGGTACGAGC
TTCATTGTATTTGGAATCTGGCTTTGTGTTGGTCACTGATCAGATCACTACTGATCTCGT
CTCTATGTGATTCGAATAATGTAGAAGCATCACTCTGTTTCTTGCTGAGATTATAGAATT
GATTCATTCCTGTTCTAGCAAAGTAGATAGCGAGAGTGCTTATTAGAACTGATAAGTGAT
GAGACTGATAAGTGATTAGGTGATGAGTAGCTGATGGAACTGATAAGTGATGAATAGTGT
ATGTTGTAATGGTAATATTATGCATCAAATGATTGATG

QA 1 638 1 638
DS 

RD RS1BM40TF 532 0 0
CAGATCCCATCCAACTTCCGCCGCAGAATCCTCGCCTCTCTCCGCGACTGGATCAACCTC
CTCCTCTTCTGGCAATACTCCGTCCCTTTCCTCGTAAACCTCTCCGCCTCCGCCACGTTC
TTCGCCCTCCTCGGTGACTCCCCGATTTCCATCGCCGTCCCCGTCACCAACGCGACGACC
TTCGCCGCAACCGCCGCGTTCGGGGTTCTTCTGGGGGAAGAAACTCAGATCGGACTTGCT
TTGTTAGGTACGAGCTTCATTGTATTTGGAATCTGGCTTTGTGTTGGTCACTGATCAGAT
CACTACTGATCTCGTCTCTATGTGATTCGAATAATGTAGAAGCATCACTCTGTTTCTTGC
TGAGATTATAGAATTGATTCATTCCTGTTCTAGCAAAGTAGATAGCGAGAGTGCTTATTA
GAACTGATAAGTGATGAGACTGATAAGTGATTAGGTGATGAGTAGCTGATGGAACTGATA
AGTGATGAATAGTGTATGTTGTAATGGTAATATTATGCATCAAATGATTGAT

QA 1 532 1 532
DS 



AS 1 2

CO CL9135Contig1 698 2 3 U
TTTTTTTGGAGGTAAATTTGATGAATGCTTGAAGCAGAAAAATTACTATTACAGATGTAT
GTATGTATGAGCAGGCTACTAAAATGAAGCGAAAAAGGTGTAAAGATCTCGTCTTGTGGG
ATGAGATTTCAATTTGTTTCTTTCTTTCTTTCAAATGACCTTTTAGAAACTGGGACTCGT
TAGTTAGTCGATGGACACCTCAAGTAGTACCTTGGTCTATTGGCGAGAACCTGAGTCCAC
CTCCTTACGTTCGACCTTTCACGTCGTTTTGTGGTTCGCGGGTTAGACACGTGTGGTGTC
CCTCCCAGTGGTGGCCCACCATGTCTCACTTGCCGGCCTGCTATGCATATGTTTAGTCGT
CTTCTTTGTATTCTTTGTGAATGTTGCCAGTGACGAGGATTACCAGAGAGCGGTGCGTGG
TTTCGGGTCCAAGTGGCTTCTCTTTTTTTTAACGCTCGTTCTTTTCTTTCCATTTATGTA
GTTTTAGAGGAAAGGACGATGCATCAATGGGAGCTGGAGGAAAGATGAAAGAGGCGGTCA
CAAGGAGCTTCGAGCATAGTAAAGATACGGTGGAGGAAGTTGCCAGATCAGCAGCGGAGG
TGGCGTGTGATGCGGCAGAAGCGGTTAAAGAGAAGGTGAAGAGGAGCTTTTCCGGCAGCG
AGACGACGCAGCAGCACTCGGATGGTACTGATGAGCCC


BQ
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1C311JQ U 8
AF RS1C311TF C 1
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TTCAATTTGTTTCTTTCTTTCTTTCAAATGACCTTTTAGAAACTGGGACTCGTTAGTTAG
TCGATGGACACCTCAAGTAGTACCTTGGTCTATTGGCGAGAACCTGAGTCCACCTCCTTA
CGTTCGACCTTTCACGTCGTTTTGTGGTTCGCGGGTTAGACACGTGTGGTGTCCCTCCCA
GTGGTGGCCCACCATGTCTCACTTGCCGGCCTGCTATGCATATGTTTAGTCGTCTTCTTT
GTATTCTTTGTGAATGTTGCCAGTGACGAGGATTACCAGAGAGCGGTGCGTGGTTTCGGG
TCCAAGTGGCTTCTCTTTTTTTTAACGCTCGTTCTTTTCTTTCCATTTATGTAGTTTTAG
AGGAAAGGACGATGCATCAATGGGAGCTGGAGGAAAGATGAAAGAGGCGGTCACAAGGAG
CTTCGAGCATAGTAAAGATACGGTGGAGGAAGTTGCCAGATCAGCAGCGGAGGTGGCGTG
TGA

QA 1 603 1 603
DS 

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GTATGTATGAGCAGGCTACTAAAATGAAGCGAAAAAGGTGTAAAGATCTCGTCTTGTGGG
ATGAGATTTCAATTTGTTTCTTTCTTTCTTTCAAATGACCTTTTAGAAACTGGGACTCGT
TAGTTAGTCGATGGACACCTCAAGTAGTACCTTGGTCTATTGGCGAGAACCTGAGTCCAC
CTCCTTACGTTCGACCTTTCACGTCGTTTTGTGGTTCGCGGGTTAGACACGTGTGGTGTC
CCTCCCAGTGGTGGCCCACCATGTCTCACTTGCCGGCCTGCTATGCATATGTTTAGTCGT
CTTCTTTGTATTCTTTGTGAATGTTGCCAGTGACGAGGATTACCAGAGAGCGGTGCGTGG
TTTCGGGTCCAAGTGGCTTCTCTTTTTTTTAACGCTCGTTCTTTTCTTTCCATTTATGTA
GTTTTAGAGGAAAGGACGATGCATCAATGGGAGCTGGAGGAAAGATGAAAGAGGCGGTCA
CAAGGAGCTTCGAGCATAGTAAAGATACGGTGGAGGAAGTTGCCAGATCAGCAGCGGAGG
TGGCGTGTGATGCGGCAGAAGCGGTTAAAGAGAAGGTGAAGAGGAGCTTTTCCGGCAGCG
AGACGACGCAGCAGCACTCGGATGGTACTGATGAGCCC

QA 1 698 1 698
DS 



AS 1 2

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GAAATAAGATTCCTTGCAATCCTTGCATATGCCTTACATCATGAAACAAAAATGTGGTAC
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CCATTCTGACCTTTCGTGAACTTGTCTCTTGTAAGTTGATAAACACATCCTTCCTTGATG
ACATATGAAACGAGCATCCAGTATCTAGTACCAATTCTTCTAGATTGTTTTGATTCTGAA
AAAGATTAACCTCGCAGACTATGAGACCCACCAAATCTTGAGCATCATCTCTGGCTAGTG
ACGACTCAGGCTGGTTCTGGGACTGAAACTTCCCTTTGTTGCGCCCTAACCATTTGTAGC
ACTATTTCTTGAAGTGTCCTTCCTTGCCACAAATCCAGAAAATCTTCTTTCCATCTGCAG
ATTTTTCGACCTCGATTTGCCATACTTCTTCCCTTTGTTTCCTGATCCATTACGATTATC
TGACCTTC


BQ
10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1AO15TFB C 1
AF RS1AO15JQ U 6
BS 1 5 RS1AO15TFB
BS 6 608 RS1AO15JQ

RD RS1AO15TFB 608 0 0
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ATTTTTATTACTCCTCCAGAACCTCTTAACTCGCAACCTTTTTCTTCAAGAGTACCCAGA
GAAATAAGATTCCTTGCAATCCTTGCATATGCCTTACATCATGAAACAAAAATGTGGTAC
CATCTTGATTTCTGAACCTCACTGAACTGATTCATTTTACTTCAGTATGACTGTTGTTAG
CCATTCTGACCTTTCGTGAACTTGTCTCTTGTAAGTTGATAAACACATCCTTCCTTGATG
ACATATGAAACGAGCATCCAGTATCTAGTACCAATTCTTCTAGATTGTTTTGATTCTGAG
AAAGATTAACCTCGCAGACTATGAGACCCACCAAATCTTGAGCATCATCTCTGGCTAGTG
ACGACTCAGGCTGGTTCTGGGACTGAAACTTCCCTTTGTTGCGCCCTAACCATTTGTAGC
ACTATTTCTTGAAGTGTCCTTCCTTGCCACAAATCCAGAAAATCTTCTTTCCATCTGCAG
ATTTTTCGACCTCGATTTGCCATACTTCTTCCCTTTGTTTCCTGATCCATTACGATTATC
TGACCTTC

QA 1 608 1 608
DS 

RD RS1AO15JQ 603 0 0
CAGAGTATCATTCCCTCTACGCTCCCCTCGTGTTATCACAACACAGCCTTTGATGATTTT
TATTACTCCTCCAGAACCTCTTAACTCGCAACCTTTTTCTTCAAGAGTACCCAGAGAAAT
AAGATTCCTTGCAATCCTTGCATATGCCTTACATCATGAAACAAAAATGTGGTACCATCT
TGATTTCTGAACCTCACTGAACTGATTCATTTTACTTCAGTATGACTGTTGTTAGCCATT
CTGACCTTTCGTGAACTTGTCTCTTGTAAGTTGATAAACACATCCTTCCTTGATGACATA
TGAAACGAGCATCCAGTATCTAGTACCAATTCTTCTAGATTGTTTTGATTCTGAAAAAGA
TTAACCTCGCAGACTATGAGACCCACCAAATCTTGAGCATCATCTCTGGCTAGTGACGAC
TCAGGCTGGTTCTGGGACTGAAACTTCCCTTTGTTGCGCCCTAACCATTTGTAGCACTAT
TTCTTGAAGTGTCCTTCCTTGCCACAAATCCAGAAAATCTTCTTTCCATCTGCAGATTTT
TCGACCTCGATTTGCCATACTTCTTCCCTTTGTTTCCTGATCCATTACGATTATCTGACC
TTC

QA 1 603 1 603
DS 



AS 1 2

CO CL9137Contig1 726 2 3 U
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CTTGAAAATGGAGAAACGAAACAAGAGACGAGCGATTCTCTTCCCTCTACCATTACAAGG
CTGCATAAACCCTATGCTTCAGCTAGCAAAGATCCTGTTCTCAAGAGGCTTCTCAATCAC
CATCATCCACACGCGCCTCAACGCGCCCAAATCATCAGACCACCCTCTCTTCACTTTCCT
ACAGCTCCCCGACGGCCTGTCCGAAACCCAGACCCAGTCTCGCGACGTCCTGCTTCAGCT
CACCCTTCTCAACAACAACTGCGAGAACCCGTTACGACAGTGTCTGACTAACCTCATCAA
ACCTGGTACAGAGGAAAGTGAGATCAGCTGTTTGATCGATGATTCTGGTTGGGTTTTCAC
ACAGTCCGTTGCGGATAGTTTCAATCTTCCGAGATTCGTCCTCTGTGCGTATAAGTTCAC
GTTCTTTCTCGGACATCTCCTTGTCCCTCAGCTTCGCCGTGAAGGTTTTCTTCCGTTTCC
AGATTCCGAAGCAGAGGACTCTGTTCCGGTGTTTCAACCGCTTCGAAAGAAAGATCTCGC
GAGAATCATGGGAAACAAAGATCAGGCTGAGCCGCTGGATGCTTACTTGGTTAAGATACT
CGAAACGATGAAGCAAGCTTCAGGCTCATAGTCATGTCCTGCGAAGAGCTCGACAGAGAT
TCGATC


BQ
10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 

AF RS1DV14TF U 4
AF RS1D611TF U 1
BS 1 92 RS1D611TF
BS 93 93 RS1DV14TF
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RD RS1DV14TF 618 0 0
GG
AACTAGAAAGATAATCAAACTGCAAAAAGAGAGGAAGAAGGAAGAATCTTGAATTCTTGA
AAATGGAGAAACGAAACAAGAGACGAGCGATTCTCTTCCCTCTACCATTACAAGGCTGCA
TAAACCCTATGCTTCAGCTAGCAAAGATCCTGTTCTCAAGAGGCTTCTCAATCACCATCA
TCCACACGCGCTTCAACGCGCCCAAATCATCAGACCACCCTCTCTTCACTTTCCTACAGC
*CCCCGACGGCTTGTCCGAAACCCAGACCCAGTCTCGCGACGTCCTGCTTCAGCTCACCC
TTCTCAACAACAACTGCGAGAACCCGTTACGACAGTGTCTGACTAACCTCATCAAACCTG
GTACAGAGGAAAGTGAGATCAGCTGTTTGATCGATGATTCTGGTTGGGTTTTCACACAGT
CCGTTGCGGATAGTTTCAATCTTCCGAGATTCGTCCTCTGTGCGTATAAGTTCACGTTCT
TTCTCGGACATCTCCTTGTCCCTCAGCTTCGCCGTGAAGGTTTTCTTCCGTTTCCAGATT
CCGAAGCAGAGGACTCTGTTCCGGTGTTTCAACCGCTTCGAAAGAAAGATCTCGCGAGAA
TCATGGGAAACAAAGA

QA 3 618 3 618
DS 

RD RS1D611TF 726 0 0
GGGTTAACTAGAAAGATAATCAAACTGCAAAAAGAGAGGAAGAAGGAAGAATCTTGAATT
CTTGAAAATGGAGAAACGAAACAAGAGACGAGTGATTCTCTTCCCTCTACCATTACAAGG
CTGCATAAACCCTATGCTTCAGCTAGCAAAGATCCTGTTCTCAAGAGGCTTCTCAATCAC
CATCATCCACACGCGCCTCAACGCGCCCAAATCATCAGACCACCCTCTCTTCACTTTCCT
ACAGCTCCCCGACGGCCTGTCCGAAACCCAGACCCAGTCTCGCGACGTCCTGCTTCAGCT
CACCCTTCTCAACAACAACTGCGAGAACCCGTTACGACAGTGTCTGACTAACCTCATCAA
ACCTGGTACAGAGGAAAGTGAGATCAGCTGTTTGATCGATGATTCTGGTTGGGTTTTCAC
ACAGTCCGTTGCGGATAGTTTCAATCTTCCGAGATTCGTCCTCTGTGCGTATAAGTTCAC
GTTCTTTCTCGGACATCTCCTTGTCCCTCAGCTTCGCCGTGAAGGTTTTCTTCCGTTTCC
AGATTCCGAAGCAGAGGACTCTGTTCCGGTGTTTCAACCGCTTCGAAAGAAAGATCTCGC
GAGAATCATGGGAAACAAAGATCAGGCTGAGCCGCTGGATGCTTACTTGGTTAAGATACT
CGAAACGATGAAGCAAGCTTCAGGCTCATAGTCATGTCCTGCGAAGAGCTCGACAGAGAT
TCGATC

QA 1 726 1 726
DS 



AS 1 2

CO CL9138Contig1 724 2 5 U
GGGAGAACGCAAAGTTTCGGAAGAATGATCCAAAGGACACACAAGTATCAGGGCTTAAGA
GTCTCGTTGACAATGCAAAGCAGCACCACAATGTGAAACAAGTCTATGCGTGGCATGCTT
TAGCTGGCTACTGGGGTGGAGTGAAACCCGCTGCTTCCGGAATGGAACACTACGACAGTG
CATTAGCGTACCCAGTTCAGTCCCCTGGTGTCTTAGGGAACCAACCAGATATCGTTATGG
ACAGCCTCGCTGTTCACGGTCTCGGTCTTGTCAACCCTAAGAAAGTGTTCAACTTCTACA
ACGAGCTGCATTCGTACCTGGCTTCGTGTGGTATAGACGGAGTCAAAGTTGATGTCCAGA
ACATCATCGAAACCCTCGGTGCCGGTCTTGGCGGGAGAGTCGCTCTGACACGCAGCTACC
ACCAAGCGTTAGAAGCTTCCATCGCTAGGAACTTTAAAGACAACGGGTGCATTTCTTGCA
TGTGTCACAACACGGATGGGTTGTACAGCGCGAAACAGACTGCTATTGTTAGAGCGCCTG
ATGATTACTATCCTAGAGATCCTGCTTCTCACACTATTCACATAGCATCAGTTGCGTATA
ATACTCTTTTCCTTGGAGAGTTCATGCAACCTGACTGGGACATGTTCCATAGTTTACACC
CAACGGCAGAGTACCATGCTGCAGCACGTGCAGTAGTGGATGTGCAATCTATGTCAGTGA
CAAG


BQ
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10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 
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AF RS1GK12TF U 72
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G
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ACCATGCTGCAGCACGTG

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DS 

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CAAG

QA 1 724 1 724
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1AK54JQ C 1
AF RS1AK54TF U 1
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DS 

RD RS1AK54TF 598 0 0
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GCCGTTAACGAAACACTTCAAGAAATCCGACACGTGGCAAGAGAGGTCAAAGGAGAATAA
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GCGCGTGGAGGCGTTTATCAAGAAGTTCAACGAAGAGATGAGACTGCAAAGATTAGAATC
TTTGGCCAAGTATAACGAATTGGTGGTAAATGGAGGGACTCGTTTGTAAATTATTTATGT
TATTTTTTTTCTTAGCTGTAGGAAAAGAAGAGGACGGCACCGGCACGGTCGCAATTGTTG
GCTCTTTTTTAGAACCACTTAAAGGTTCTTTTTGTCTTCATGGGAAGATGAAGATAAATT
GTATGTTTGTGTATGTATGATTGTTCTATTTATTACTTTAAAAAAAATCACATTAATCAT
GTGGTTTAAAATGAAAGATGTTGTGTAAACAGAGTAGACAGTGACTAGTGTGATTGAATT
CATTGTATGTTTGGTTTTTCAGATTTTACATTCAATAAACAATATTACTATTTATAAC

QA 1 598 1 598
DS 



AS 1 2

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GGTGTTATGTTTTTGTCTCTTATTTAAAACTGAATTATCGTTTATTCAGATAACTTTTAG
ATGTTTTGTTATAACGAAGGTTAAATTTCTTTTATGA


BQ
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AF RS1G622TF U 1
AF RS1G622JQ C 5
BS 1 602 RS1G622TF
BS 603 637 RS1G622JQ

RD RS1G622TF 602 0 0
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AACCCTAACGGGGAAGACGATAACCCTAGAGGTCGAATCATCCGACACGATCGACAATGT
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GGTGTTATGTTTTTGTCTCTTATTTAAAACTGAATTATCGTTTATTCAGATAACTTTTAG
AT

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TTATGTTTTTGTCTCTTATTTAAAACTGAATTATCGTTTATTCAGATAACTTTTAGATGT
TTTGTTATAACGAAGGTTAAATTTCTTTTATGA

QA 1 633 1 633
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1AI10TF U 1
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GTTTTTAAACTGAGAATCTTGGTTCAAATTCAACCGAACAAACCCATGCC

QA 1 590 1 590
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1DV44TF U 1
AF RS1DV44JQ C 21
BS 1 626 RS1DV44TF
BS 627 691 RS1DV44JQ

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TGGTCCGTACG

QA 1 671 1 671
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TACTTAT


BQ
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AF RS1BM39JQ C 1
AF RS1BM39TF U 1
BS 1 607 RS1BM39TF

RD RS1BM39JQ 607 0 0
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TGTGTGGGGCTTGGGTTTTAGGATATGGTTGATTCTTGGACTAACATTGTACCTCTGCTC
TACTTAT

QA 1 607 1 607
DS 

RD RS1BM39TF 607 0 0
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CAACACTCCTTCCCAAAAGAAAGAAAGCAATCAATGGAGAGGCTAAACTCGAAGCTGTAT
GTGGAGAACTGTTACATAATGAAAGAGAATGAGAGGCTGAGGAAGAAAGCTGAGCTTCTG
AACCAAGAAAATCAACAGCTTCTGGTTCAACTCAAACAGAAACTCTCCAAGACTAACAAG
AACCCTAATGGATCAAACAATGACAACAATATCTCTTCATCAAGCTCTGCTTCTGGACAA
TCCTGAATTATAATTAAGAAATGTTAGAGCAGTTCTGGAATTTTAAGAAAAAAGACTCAA
CCGTATGGACTTTTTCTTTGGTTATTTGGTGTTAATTTAGGGAAGATAGTAGTAGTAGTA
TTTTGTTAATGAAAGAAGATTCTCTTCTATTACAAGAAGACAGTGTCTCTGTGTTTGGCT
TCTCAGTCATATTTTACTTTTCCATTTTCGATGTTAATTAAAGATCTTTCTTTGCTTTCT
TGTGTGGGGCTTGGGTTTTAGGATATGGTTGATTCTTGGACTAACATTGTACCTCTGCTC
TACTTAT

QA 1 607 1 607
DS 



AS 1 2

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GAATAGAACTGAATCATAATTTCCAGAATGCAACTCTGAAGTTGACAGAGGCGCTTCTTG
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GGTTTACGGAACCGACGAATATCCCTTCACGATTTTGACGGTATTAACACTGAAGGCCAT
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BQ
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AF RS1AW08TF U 1
AF RS1AW08JQ C 73
BS 1 576 RS1AW08TF
BS 577 882 RS1AW08JQ

RD RS1AW08TF 576 0 0
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QA 1 576 1 576
DS 

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QA 1 810 1 810
DS 



AS 1 2

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BQ
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AF RS1DJ41TF U 34
AF RS1GC25TF U 1
BS 1 342 RS1GC25TF
BS 343 343 RS1DJ41TF
BS 344 349 RS1GC25TF
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BS 351 402 RS1GC25TF
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RD RS1DJ41TF 658 0 0
GG
ACAGATCCCATCACCACAACTCCCCTTTCCCACCGTCTCCAGCTCCTCCCTCTTCATATT
CACCTTCCGCTCCCCACATTACGGTTGAACCTTATTGCGGCGTAGACTCAAGCCTCCGCT
CCCTCGCCGGGAAGGCCGAAGGTTTCGGCCGCGGCGCCGTTGGTGGTCTTAATGGTCCGA
TTTGCCACGTCACTTCTTTAGCTGATGAAGGTCCAGGATCGTTAAGAGAGGCTTGTAAGA
G*CCAGAACCGTTATGGATTGTGTTTGATGTGTCGGGAACGATCAATCTATCTTCGTTTG
TGAACGTATCATCGAACAAAACGGTAGACGGGAGAGGTCAGAGGGTGAAGATAACGGGGA
AAGGGTTAAGGCTAAAACAGAGTGAAAACGTTATAATATGTAACCTTGAATTCGAAGGCG
GTGTAGGACCAGACGCAGACGCTATTCAGATCAAACCAAAATCAAGCACCATTTGGATCG
ATCGTTGTACTCTCAAGAATTACCATGATGGTTTGATTGATATCACACGAGAAAGCACTG
ACATTACTGTCTCGAGATGCCATTTCGTGAACCACAACAAGACAATGCTGATTGGCGCGG
ACCCAAGTCACGTGACGGACCGATGCATTAGAGTTACGATTCAC*ACTGCTTCTTC

QA 3 658 3 658
DS 

RD RS1GC25TF 825 0 0
GTATAAGTAAGCTATGGGAAACTTACATGGTCTTCACAGATCCCATCACCACAACTCCCC
TTTCCCACCGTCTACAGCTCCTCCATCTTCATATTCACCTTCCGCTCCCCACATGACGGT
GGAACCTTATTGCGGCGTAGACTCAAGCCTCCGCTCCCTCGCCGGGAAGGCCGAAGGTTT
CGGCCGCGGCGCCGTTGGTGGTCTTAATGGTCCGATTTGCCACGTCACTTCTTTAGCTGA
TGAAGGTCCAGGATCGTTAAGAGAGGCTTGTAAGAGGCCAGAACCGTTATGGATTGTGTT
CGATGTGTCGGGAACGATCAATCTATCTTCGTTTGTGAACGTGTCATCGCACAAAACGGT
AGACGGGAGAGGTCAAAGGGTGAAGATAACGGGGAAAGGGTTGAGGCTAAAACAAAGTGA
AAACGTTATAATATGTAACCTTGAATTCGAAGGAGGTGTAGGACCAGACGCAGACGCTAT
TCAGATCAAACCAAAATCAAGCACCATTTGGATCGATCGTTGTACTCTCAAGAATTACCA
TGATGGTTTGATTGATATCACACGAGAAAGCACTGACATTACTGTCTCAAGATGCCATTT
CGTGAACCACAACAAGACAATGCTGATTGGCGCGGACCCAAGTCACGTGACGGACCGATG
CATTAGAGTTACGATTCACCACTGCTTCTTCGACGTACACGTCAGCGACACCCTCGTGTT
CGCTTCGCAAAGTCCATCTCTTCAACAACTACACTCGTCATTGGTCCATCTACGCCGTTG
GAGCCGGTGTTGAGTCTCAGTATATTCTCAGTGCACATATATGAA

QA 1 825 1 825
DS 



AS 1 2

CO CL9146Contig1 643 2 2 U
AAAGCAATTCTCCATTTTACAAACAGAACACAAAGCTAAGAGTTTCTGCAATTAAGCCAA
AAAAAAAAAAAACAGAGAGAAAAGATGAGTTCAAGGAGCAAAGCATGGTTAGTGGCAGCA
ACCATCGGAGCGGTGGAGGCCTCCAAAGACCAGTTGGGACTATGCAGGTGGAATTACATG
ATCCGATCTGTGAATCAACGTATCCGAAACAATGTGAAATCCGCTACTCAGACGAACAGG
TTCTCTTCCTCGTCCACCACTATCGTTGCTTCCGGTAAGGATGGTGACAAGGCAAAGCAA
GCTGAGGAGTCTCTCAGAACGGTCATGTACTTGAGCTGTTGGGGTCCTAATTGATGAAGA
CAGGATCCAGACCCGACATGTTTGCATCTATGAGCGGTGCAATGAGAAGCCTAAGAAGTA
AAAACCCTAAATAGACGATATGAGTTTTGATGGGTTGTTTCGGGATTAAATTAAATGACG
GATCCGAAATGTCGAAGGGAAAAATGATTTGTACAGAATGTAGAGATGATTTTAGCAGTT
TTATGTTCATGTTACTGGAAAAGATAGAAAGAAGCTTCCATGATCCATTCGTGGGACACA
TCATGCTTGTTCATTGTTTTTTAATATCGAACTTTTTTGCGCC


BQ
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AF RS1FQ88TF U 1
AF RS1FQ88JQ C 40
BS 1 609 RS1FQ88TF
BS 610 643 RS1FQ88JQ

RD RS1FQ88TF 609 0 0
AAAGCAATTCTCCATTTTACAAACAGAACACAAAGCTAAGAGTTTCTGCAATTAAGCCAA
AAAAAAAAAAAACAGAGAGAAAAGATGAGTTCAAGGAGCAAAGCATGGTTAGTGGCAGCA
ACCATCGGAGCGGTGGAGGCCTCCAAAGACCAGTTGGGACTATGCAGGTGGAATTACATG
ATCCGATCTGTGAATCAACGTATCCGAAACAATGTGAAATCCGCTACTCAGACGAACAGG
TTCTCTTCCTCGTCCACCACTATCGTTGCTTCCGGTAAGGATGGTGACAAGGCAAAGCAA
GCTGAGGAGTCTCTCAGAACGGTCATGTACTTGAGCTGTTGGGGTCCTAATTGATGAAGA
CAGGATCCAGACCCGACATGTTTGCATCTATGAGCGGTGCAATGAGAAGCCTAAGAAGTA
AAAACCCTAAATAGACGATATGAGTTTTGATGGGTTGTTTCGGGATTAAATTAAATGACG
GATCCGAAATGTCGAAGGGAAAAATGATTTGTACAGAATGTAGAGATGATTTTAGCAGTT
TTATGTTCATGTTACTGGAAAAGATAGAAAGAAGCTTCCATGATCCATTCGTGGGACACA
TCATGCTTG

QA 1 609 1 609
DS 

RD RS1FQ88JQ 604 0 0
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AAAGCATGGTTAGTGGCAGCAACCATCGGAGCGGTGGAGGCCTCCAAAGACCAGTTGGGA
CTATGCAGGTGGAATTACATGATCCGATCTGTGAATCAACGTATCCGAAACAATGTGAAA
TCCGCTACTCAGACGAACAGGTTTTCTTCCTCGTCCACCACTATCGTTGCTTCCGGTAAG
GATGGTGACAAGGCAAAGCAAGCTGAGGAGTCTCTCAGAACGGTCATGTACTTGAGCTGT
TGGGGTCCTAATTGATGAAGACAGGATCCAGACCCGACATGTTTGCATCTATGAGCGGTG
CAATGAGAAGCCTAAGAAGTAAAAACCCTAAATAGACGATATGAGTTTTGATGGGTTGTT
TCGGGATTAAATTAAATGACGGATCCGAAATGTCGAAGGGAAAAATGATTTGTACAGAAT
GTAGAGATGATTTTAGCAGTTTTATGTTCATGTTACTGGAAAAGATAGAAAGAAGCTTCC
ATGATCCATTCGTGGGACACATCATGCTTGTTCATTGTTTTTTAATATCGAACTTTTTTG
CGCC

QA 1 604 1 604
DS 



AS 1 2

CO CL9147Contig1 1122 2 2 U
GGGACACTGCATCAAGCAAAAAAAGAGTTCTGTGAGGGGGAGAGAGATAGAGAGAGATGC
AAGCTATCTCGAAAGTTTCTTATGCAGCCTCCTTTTTTCTTTGTTCTATGCTAACAAGTC
AGCAATCGTGAGCCAGCTTAGCCTCAGAAAAGGTTTTGTCTCTGGCGTCATGATGAAGTT
GTTCTCTTCGCCTCTCAATACTTTGTGCGATGCTGCTGGTAGATCTGTTCACGTGTCAAG
ATTCTGCAGTGTCCCCAATATATCTTCCTCACTGCAAATTGAACTGGTGCCATGTCTTGA
GGACAACTACGCTTATTTATTACACGACGAAGATACTGGTACGGTTGGTGTGGTTGACCC
TTCTGAAGCTGCACCTGTTATGAATGCCTTAAAGAAGAATGGTCGAAACCTAACGTATAT
ATTGAATACACATCACCATTATGATCACACTGGTGGGAACTTGGAATTAAAAGACAAGTA
CGGTGCAAAGGTGGTCGGTTCAGCTGTAGATAAGGAACGGATTCCTGGAATTGATGTAGC
TCTGAAAGATGGTGACAAGTGGGGGTTTGCTGGCCATGAAGTAAATGTTATGGAAACTCC
TGGCCACACAATACGCCATATTAGTTTCTACTTTCCAGGGGCACGAGCAGTTTTCACAGG
GGACACCTTATTTAGCTTATCATGTGGTAAGCTCTTCGAAGGTACTCCAGAGCAGATGCT
AGCTTCGCTACAGAGGATAGTTGCTTTGCCAGATGACACAAGCATATATTGTGGACATGA
ATACACACTGAGTAACTCCAAGTTTGCGTTATCTGTAGAACCAGCTAACGAGGTACTCCA
GTCTTACGCAGCCTACGTTGCAGAACTCCGTGACAAGAAGTTACCTACGATTCCAACAAC
GATGAAGATGGAGAAAGCGTGTAACCCGTTTCTCCGCACTGCGAATATGGATATTCGCCG
GGTACTAGGTATTCCAGAGACTGCTGATGAAGCAGAAGCTCTGGGTGTTATTAGAAGAGC
AAAGGACATTTTTAAAGCTTAAGCAAAAACATTAGATAATTTTATCTTCGTATAGAACTA
CAGATCATGAATAGTTTGGCTTAATAATGTTTTCATTGTCCC


BQ
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AF RS1DQ53TF U 1
AF RS1DQ53JQ C 414
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GTTCTCTTCGCCTCTCAATACTTTGTGCGATGCTGCTGGTAGATCTGTTCACGTGTCAAG
ATTCTGCAGTGTCCCCAATATATCTTCCTCACTGCAAATTGAACTGGTGCCATGTCTTGA
GGACAACTACGCTTATTTATTACACGACGAAGATACTGGTACGGTTGGTGTGGTTGACCC
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ATTGAATACACATCACCATTATGATCACACTGGTGGGAACTTGGAATTAAAAGACAAGTA
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TCTGAAAGATGGTGACAAGTGGGGGTTTGCTGGCCATGAAGTAAATGTTATGGAAACTCC
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AAACTCCTGGCCACACAATAGGCCATATTAGTTTCTACTTTCCAGGGGCACGAGCAGTTT
TCACAGGGGACACCTTATTTAGCTTATCATGTGGTAAGCTCTTCGAAGGTACTCCAGAGC
AGATGCTAGCTTCGCTACAGAGGATAGTTGCTTTGCCAGATGACACAAGCATATATTGTG
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QA 1 709 1 709
DS 



AS 0 0

AS 1 2

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TTTCAATTCCTCTGGCTTAACCCTCTGGTTATTTTTTCAATCTCTTTTGATTGTTGCTGA
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TGC


BQ
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20 20 20 

AF RS1CP25JQ C 1
AF RS1CP25TF U 1
BS 1 603 RS1CP25TF

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TGC

QA 1 603 1 603
DS 

RD RS1CP25TF 603 0 0
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ACAATCAGCCACTCCTAGGGGCCGGTGAGACGGCAACGCCATGGTGGAAGAGCTGTTGTG
AAATACTAGAACTTCTCAAGGCATCCTCATCATCTAACTAGATGAAGATCAGCCTTCCAT
GTGAAGTAAACAGAGAAGATATCCCACCAAGTTTTTCAAGTTATGTTTTTATATCCTTTC
TTTCAATTCCTCTGGCTTAACCCTCTGGTTATTTTTTCAATCTCTTTTGATTGTTGCTGA
GAATATTTGTATCGAAAGATGTAAACAAACACATAATATAAAGAAAAGACTCCTAAGTTG
TGC

QA 1 603 1 603
DS 



AS 1 2

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GGTTTTGATCCCCCTCTCCGTAGTGATGGTTCTCATTGGTGTTCTCCGCTACTTCGTCTC
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AAATCTGTCAATGATTATACCACAGACGCTCACTTTTGCATGGGTCAACTTCTTCTTCTC
TGGATTTGTTGCAGCCTCATTCTTGGAGACGAAAATGCAATTGATGACACGCAAAGAATG
ATGCAAATGGGTGAATTTGGTTTTGATGCATCAAAGAACTTGAGCGCAGAGAAGGACGGT
CTCGACGTTATTCAACATGAATGGGCCTTACCACGATTCGAGCACCGTGCAGAATCCGTT
TTGAGAAAACTCGTGCACTAGAAACATTCTTGCCTCTGGTCCCCCCCTAGTTCTCTGCTG
GTAGCTAGACTCTTCTGTGTGTCTAATGTCCTCCATTGTTTTCATAAACATCGTCTACCA
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TTCCAATTTACTTTGGTCCAAAGCAGAGCTGGTTATATATTGGTGCTTATAAGACTTGCT
TTTATTTTAAAATGGATCATTAGAAGATTGGG


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
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AF RS1CG57TF U 1
AF RS1CG57JQ C 19
BS 1 641 RS1CG57TF
BS 642 872 RS1CG57JQ

RD RS1CG57TF 641 0 0
GGAGAGAAGAGAATCATCAATGGCGGAAGATCTGGTTCTCGACACGGCGATCAGAGACTG
GGTTTTGATCCCCCTCTCCGTAGTGATGGTTCTCATTGGTGTTCTCCGCTACTTCGTCTC
CAAGCTCATGCGTTCGTCTCCGACTCCCGATGCGAAGATGGTCAAAGAAGGACAAGTTGT
GATTAGGGCACGGAATCTCAAGGCAGGTGCCAATTTCATCCCGCCTAAGTCCTTTCGAGC
TCGGAGATTCTACTTCAGCAACGAGGAAAACGGATTGTTGCATGTTCCTAAGGACCTTGC
TCAAAACCCACAAGCTCAGATGTTTTCTGATCCTAACATGGCCATGGATATGATGAAGAA
AAATCTGTCAATGATTATACCACAGACGCTCACTTTTGCATGGGTCAACTTCTTCTTCTC
TGGATTTGTTGCAGCCTCATTCTTGGAGACGAAAATGCAATTGATGACACGCAAAGAATG
ATGCAAATGGGTGAATTTGGTTTTGATGCATCAAAGAACTTGAGCGCAGAGAAGGACGGT
CTCGACGTTATTCAACATGAATGGGCCTTACCACGATTCGAGCACCGTGCAGAATCCGTT
TTGAGAAAACTCGTGCACTAGAAACATTCTTGCCTCTGGTC

QA 1 641 1 641
DS 

RD RS1CG57JQ 854 0 0
ATCAATGCGGAGATCT
GTTCTCGACACGGCGATCAGAGACTGGGTTT*GATCCCCCTCTCCGTAGTGATGGT*CTC
ATTGGTGT*CTCCGCTACTTCGTCTCCAAGCTCATGCGTTCGTCTCCGACTCCCGATGCG
AAGATGGTCAAAGAAGGACAAGTTGTGATTAGGGCACGGAATCTCAAGGCAGGTGCCAAT
TTCATCCCGCCTAAGTCCTTTCGAGCTCGGAGATTCTACTTCAGCAACGAGGAAAACGGA
TTGTTGCATGTTCCTAAGGACCTTGCTCAAAACCCACAAGCTCAGATGTTTTCTGATCCT
AACATGGCCATGGATATGATGAAGAAAAATCTGTCAATGATTATACCACAGACGCTCACT
TTTGCATGGGTCAACTTCTTCTTCTCTGGATTTGTTGCAGCCTCATTCTTGGAGACGAAA
ATGCAATTGATGACACGCAAAGAATGATGCAAATGGGTGAATTTGGTTTTGATGCATCAA
AGAACTTGAGCGCAGAGAAGGACGGTCTCGACGTTATTCAACATGAATGGGCCTTACCAC
GATTCGAGCACCGTGCAGAATCCGTTTTGAGAAAACTCGTGCACTAGAAACATTCTTGCC
TCTGGTCCCCCCCTAGTTCTCTGCTGGTAGCTAGACTCTTCTGTGTGTCTAATGTCCTCC
ATTGTTTTCATAAACATCGTCTACCATATTTTCTTCAGTGACACCATTTGGTTTAGATCT
CTACTGTTATTACATATAGCTGGTGGTTCCAATTTACTTTGGTCCAAAGCAGAGCTGGTT
ATATATTGGTGCTTATAAGACTTGCTTTTATTTTAAAATGGATCATTAGAAGATTGGG

QA 17 854 17 854
DS 



AS 1 2

CO CL9151Contig1 442 2 1 U
GCGTGAAGAAAGCCAAGAAAACAGCTTACGACAAGGGCTATCTCGAGGAAGAGCTAAAGA
ATACGGAGAGATTGATGGGGATAATGCAAAATTTGAAGGGGTGAGTGATGGACTATTGTT
CCTCACTGACTGGAGGAATATTGGGTGGTTCGGATCAATGGATTTTGGTTGGAATGAGCC
AGTGAATCTGCGGCCGTTGACCGAGCAGAAGACTGCAGTGCATATAGGGGTGATCTTGAG
ACCTTCACAACTAGATCCATCAATGGAAGGTGGTTAAAGTGATCATGACGTTGCCAAGAG
TTGCAATGGTTGACTTCAAGCGAGAGATGGATGCTATGAACAAACTTTACTATTAATATT
ATTAGTACCTGGATTAGTTTTCTATGTGTGTGAGTGAATGTTTCAAACATGAATAATGGG
CGAATAAGATAATTATGCTTGT


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 

AF RS1EG26JQ C 1
AF RS1EG26TF U 1
BS 1 442 RS1EG26TF

RD RS1EG26JQ 442 0 0
GCGTGAAGAAAGCCAAGAAAACAGCTTACGACAAGGGCTATTTCGAGGAAGAGCTAAAGA
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CCTCACTGACTGGAGGAATATTGGGTGGTTCGGATCAATGGATTTTGGTTGGAATGAGCC
AGTGAATTTGCGGCCGTTGACCGAGCAGAAGACTGCAGTGCATATAGGGGTGATCTTGAG
ACCTTCACAACTAGATCCATCAATGGAAGGTGGTTAAAGTGATCATGACGTTGCCAAGAG
TTGCAATGGTTGACTTCAAGCGAGAGATGGATGCTATGAACAAACTTTACTATTAATATT
ATTAGTACCTGGATTAGTTTTCTATGTGTGTGAGTGAATGTTTCAAACATGAATAATGGG
GGAATAAGATAATTATGCTTGT

QA 1 442 1 442
DS 

RD RS1EG26TF 442 0 0
GCGTGAAGAAAGCCAAGAAAACAGCTTACGACAAGGGCTATCTCGAGGAAGAGCTAAAGA
ATACGGAGAGATTGATGGGGATAATGCAAAATTTGAAGGGGTGAGTGATGGACTATTGTT
CCTCACTGACTGGAGGAATATTGGGTGGTTCGGATCAATGGATTTTGGTTGGAATGAGCC
AGTGAATCTGCGGCCGTTGACCGAGCAGAAGACTGCAGTGCATATAGGGGTGATCTTGAG
ACCTTCACAACTAGATCCATCAATGGAAGGTGGTTAAAGTGATCATGACGTTGCCAAGAG
TTGCAATGGTTGACTTCAAGCGAGAGATGGATGCTATGAACAAACTTTACTATTAATATT
ATTAGTACCTGGATTAGTTTTCTATGTGTGTGAGTGAATGTTTCAAACATGAATAATGGG
CGAATAAGATAATTATGCTTGT

QA 1 442 1 442
DS 



AS 1 2

CO CL9152Contig1 716 2 2 U
GGGTCTTTACCTTTTGATCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCCGCTAGGTTTCTCTCAAACG
AACAGATCCTCCATTTGTCTCAAAGTTACCTTGTGCGATGAAGACAGCTAAGGGGAAAGG
TAAAGCTAAGACCACTAAGGAAGCCTTGAAGCCAGTTGATGACAGAAAGGTGGGGAAGAG
GAAGGCACCGGCTGAGAAGCCTAGCAAGAGGGAGACTCGTAGAGAGAAGAAAGCCAAGAA
GGACCCCAACAAACCCAAGAGAGCTCCTAGTGCTTTCTTTGTCTTCTTAGAAGATTTTAG
GCAAACGTTCAAGAAAGAGAATCCAGATGTGAAGGCTGTCTCTGCTGTTGGGAAAGCAGG
AGGACAGAAATGGAGGTCAATGTCTCAGGCTGAAAAAGCTCCATATGAAGAGAAAGCTGC
AGAGGAAAGGCAGGTGAGGATGACGATGATGATGATGATGAAGATGACGATGATGATGAT
GATGATGAAGATGACGAGGAAGAAGACTAAACTGGAGATAGAGATCAGAGTTTGGATCTC
GCGGATAAGTACAGGTTCAGAAGGCAGAAGTCAGTATATTTTGTATTTTGTGTGTTGGCA
ACTATAGATCGAAATGGTGTGTTGTGCTTTTTTTTCTTTTCCTAAGAAAGCCAAACAGTT
TCTTAGCGGTTCATGTAAGTTTATTTCAGCTTTCTATCCACAACGTACACTGTACC


BQ
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 

AF RS1GW14TF U 1
AF RS1GW14JQ C 92
BS 1 694 RS1GW14TF
BS 695 716 RS1GW14JQ

RD RS1GW14TF 694 0 0
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AACAGATCCTCCATTTGTCTCAAAGTTACCTTGTGCGATGAAGACAGCTAAGGGGAAAGG
TAAAGCTAAGACCACTAAGGAAGCCTTGAAGCCAGTTGATGACAGAAAGGTGGGGAAGAG
GAAGGCACCGGCTGAGAAGCCTAGCAAGAGGGAGACTCGTAGAGAGAAGAAAGCCAAGAA
GGACCCCAACAAACCCAAGAGAGCTCCTAGTGCTTTCTTTGTCTTCTTAGAAGATTTTAG
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AGGACAGAAATGGAGGTCAATGTCTCAGGCTGAAAAAGCTCCATATGAAGAGAAAGCTGC
AGAGGAAAGGCAGGTGAGGATGACGATGATGATGATGATGAAGATGACGATGATGATGAT
GATGATGAAGATGACGAGGAAGAAGACTAAACTGGAGATAGAGATCAGAGTTTGGATCTC
GCGGATAAGTACAGGTTCAGAAGGCAGAAGTCAGTATATTTTGTATTTTGTGTGTTGGCA
ACTATAGATCGAAATGGTGTGTTGTGCTTTTTTTTCTTTTCCTAAGAAAGCCAAACAGTT
TCTTAGCGGTTCATGTAAGTTTATTTCAGCTTTC

QA 1 694 1 694
DS 

RD RS1GW14JQ 625 0 0
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GAGACTCGTAGAGAGAAGAAAGCCAAGAAGGACCCCAACAAACCCAAGAGAGCTCCTAGT
GCTTTCTTTGTCTTCTTAGAAGATTTTAGGCAAACGTTCAAGAAAGAGAATCCAGATGTG
AAGGCTGTTTCTGCTGTTGGGAAAGCAGGAGGACAGAAATGGAGGTCAATGTCTCAGGCT
GAAAAAGCTCCATATGAAGAGAAAGCTGCAGAGGAAAGGCAGGTGAGGATGACGATGATG
ATGATGATGAAGATGACGATGATGATGATGATGATGAAGATGACGAGGAAGAAGACTAAA
CTGGAGATAGAGATCAGAGTTTGGATCTCGCGGATAAGTACAGGTTCAGAAGGCAGAAGT
CAGTATATTTTGTATTTTGTGTGTTGGCAACTATAGATCGAAATGGTGTGTTGTGCTTTT
TTTTCTTTTCCTAAGAAAGCCAAACAGTTTCTTAGCGGTTCATGTAAGTTTATTTCAGCT
TTCTATCCACAACGTACACTGTACC

QA 1 625 1 625
DS 



AS 1 2

CO CL9153Contig1 603 2 1 U
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AAGAAGAAGAGAGAGGCGAAAGCGGATAGAAAGCGAGCTATCCACGGAGATCCACCCACC
AATAAACTGAAGAGCAGAGCTCCGGTTGTCTCCGTCTCCGGAAAACGTCAGAGAAAACTC
CTCCGAAAATGGCGCCGAGAGCAGAAAGAGATGGTGGAGAAGGGTCTTGTAACCATGGAG
GATGTCGAGATGGCTTCTGCTGATGCTGCATCAGAAGAATCAAAGAGATCCCCTAGAAAG
TTTAGCGTGAAGAAGACCTTGAAGCTTAATAAACTAAAGAATAAAGGCAAGAATAAGAGA
AGCCAGGGAGCCGCTGCTGGCCAAGTATCTACTGCTGATCAGATGCTGGAATGAGTGTAA
ATCTTTGAATCATCGTAGGATCTCTTTTTTTTTTAATAAGTTTTCCGAATCTAGTTTCTC
TAATGTTTTTCTTAAAAAGATCTCATTTTGTATTCTGGCCGGGAATCGGGTTCTGTTATA
TGTCAAATTTACAATACTACTACTTACTTGTCTCAGGACCTGTTCTATGACTTCTATTCT
TCC


BQ
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 
20 20 20 

AF RS1AY36JQ C 1
AF RS1AY36TF U 1
BS 1 603 RS1AY36TF

RD RS1AY36JQ 603 0 0
AGGTTTGAGCTTTGGAGGAGTCAACTTTTGGTAAAGATGGCGAAATACAACGAGATAGCG
AAGAAGAAGAGAGAGGCGAAAGCGGATAGAAAGCGAGCTATCCACGGAGATCCACCCACC
AATAAACTGAAGAGCAGAGCTCCGGTTGTCTCCGTTTCCGGAAAACGTCAGAGAAAACTC
CTCCGAAAATGGCGCCGAGAGCAGAAAGAGATGGTGGAGAAGGGTCTTGTAACCATGGAG
GATGTCGAGATGGCTTCTGCTGATGCTGCATCAGAAGAATCAAAGAGATCCCCTAGAAAG
TTTAGCGTGAAGAAGACCTTGAAGCTTAATAAACTAAAGAATAAAGGCAAGAATAAGAGA
AGCCAGGGAGCCGCTGCTGGCCAAGTATCTACTGCTGATCAGATGCTGGAATGAGTGTAA
ATCTTTGAATCATCGTAGGATCTCTTTTTTTTTTAATAAGTTTTCCGAATCTAGTTTCTC
TAATGTTTTTCTTAAAAAGATCTCATTTTGTATTCTGGCCGGGAATCGGGTTCTGTTATA
TGTCAAATTTACAATACTACTACTTACTTGTCTCAGGACCTGTTCTATGACTTCTATTCT
TCC

QA 1 603 1 603
DS 

RD RS1AY36TF 603 0 0
AGGTTTGAGCTTTGGAGGAGTCAACTTTTGGTAAAGATGGCGAAATACAACGAGATAGCG
AAGAAGAAGAGAGAGGCGAAAGCGGATAGAAAGCGAGCTATCCACGGAGATCCACCCACC
AATAAACTGAAGAGCAGAGCTCCGGTTGTCTCCGTCTCCGGAAAACGTCAGAGAAAACTC
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GATGTCGAGATGGCTTCTGCTGATGCTGCATCAGAAGAATCAAAGAGATCCCCTAGAAAG
TTTAGCGTGAAGAAGACCTTGAAGCTTAATAAACTAAAGAATAAAGGCAAGAATAAGAGA
AGCCAGGGAGCCGCTGCTGGCCAAGTATCTACTGCTGATCAGATGCTGGAATGAGTGTAA
ATCTTTGAATCATCGTAGGATCTCTTTTTTTTTTAATAAGTTTTCCGAATCTAGTTTCTC
TAATGTTTTTCTTAAAAAGATCTCATTTTGTATTCTGGCCGGGAATCGGGTTCTGTTATA
TGTCAAATTTACAATACTACTACTTACTTGTCTCAGGACCTGTTCTATGACTTCTATTCT
TCC

QA 1 603 1 603
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